
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [16229408,16251209] =>     21802 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    4604] =>      4604 nucs 'mol-32-1e7c-211341_4604'

Score:        4530
Aligned:      4616        nucs
Identic:      4600 (100%) nucs =>       264 (100%)      4336 (100%)
Gaps:           12 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [16239145,16239408] EXCISED REGION [16241210,16245561]
 second seq =>  [       1,     264] EXCISED REGION [     265,    4604]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1801 nucs [16239409,16241209]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [16239409,16239409] to [16241210,16241210]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [16239409,16239410] to [16241208,16241209]
 second seq =>         0 nucs

 16239145 CATAGTGTAGTGTGATAGAATCAGCTAGATGGGTTTCAGGGTATTCGTCTGGGGTGGTGA 16239204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CATAGTGTAGTGTGATAGAATCAGCTAGATGGGTTTCAGGGTATTCGTCTGGGGTGGTGA 60

 16239205 TGCCCACACCAAATCATTAAATCAGAAAATGCTTGCGATGACCAGCCCATGATGACCCTT 16239264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGCCCACACCAAATCATTAAATCAGAAAATGCTTGCGATGACCAGCCCATGATGACCCTT 120

 16239265 TACAAGTGGAAGTCAGTATTACTGCTGTTTTCTGGAGGGAAGGAGTTGAGGATCATACCA 16239324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TACAAGTGGAAGTCAGTATTACTGCTGTTTTCTGGAGGGAAGGAGTTGAGGATCATACCA 180

 16239325 GCTTTTTCCGAGCACTATACCACTCAGACATGGGTGCTCTTACCCACTTCAAAACCCTCT 16239384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCTTTTTCCGAGCACTATACCACTCAGACATGGGTGCTCTTACCCACTTCAAAACCCTCT 240

 16239385 GAGAATGCCAAACAACCATCGCAG 16239408
          ||||||||||||||||||||||||
      241 GAGAATGCCAAACAACCATCGCAG 264

EXCISED REGION

 16241210 TGGAGCACAGGCTGCACTGCGGGGTCTGTCTTGCTTTTTACCCTGCAATGGTCAGTCATT 16241269
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      265 TGGAGCACAGGCTGCACTGCGGGTTCTGTCTTGCTTTTTACCCTGCAATGGTCAGTCATT 324

 16241270 GACCATGACTGGGGCTGGGGGCAGCATCCTGCATGACTGTCTGGCACCTGCAGCAGAGAC 16241329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      325 GACCATGACTGGGGCTGGGGGCAGCATCCTGCATGACTGTCTGGCACCTGCAGCAGAGAC 384

 16241330 CGTTTTAATACCCCAAGGCAAGTCTCCAGGGAAGGGTTAAGATTTCAGTTAGCACCCACA 16241389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      385 CGTTTTAATACCCCAAGGCAAGTCTCCAGGGAAGGGTTAAGATTTCAGTTAGCACCCACA 444

 16241390 GCAGCTGGGGACATGCAAACCAAACCAAAACAGTTAAGGGGAGCTCAGGGAATCTGAGTA 16241449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      445 GCAGCTGGGGACATGCAAACCAAACCAAAACAGTTAAGGGGAGCTCAGGGAATCTGAGTA 504

 16241450 GGACACTATATTAGTCTGTTCTCACACTGCTATAAAGAACTGCCTGAGACTAGGTAATTT 16241509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      505 GGACACTATATTAGTCTGTTCTCACACTGCTATAAAGAACTGCCTGAGACTAGGTAATTT 564

 16241510 ATAAAGAAAGGAGGTTTAATTGACTCACAGTTTCGCATGGCTGGGGAGGCCTCAGGAAAC 16241569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      565 ATAAAGAAAGGAGGTTTAATTGACTCACAGTTTCGCATGGCTGGGGAGGCCTCAGGAAAC 624

 16241570 TTACAATCATGGTGGAAGGGGAAGCATGTCTTACATGGCAGCAAGTGAGAGAAAGAGAGA 16241629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      625 TTACAATCATGGTGGAAGGGGAAGCATGTCTTACATGGCAGCAAGTGAGAGAAAGAGAGA 684

 16241630 GAGAGAGGAGGAAAAACTATCAAACACTTATATAATCATCAGATCTCATGAGAACTCACT 16241689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      685 GAGAGAGGAGGAAAAACTATCAAACACTTATATAATCATCAGATCTCATGAGAACTCACT 744

 16241690 ATCACGAGAACAGCATGGGGGAAACTGCCCACATGATCCAATCACCTCCCACCAGGTCCC 16241749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      745 ATCACGAGAACAGCATGGGGGAAACTGCCCACATGATCCAATCACCTCCCACCAGGTCCC 804

 16241750 TCCCTCGCCACATAGGGATTATGGGGATTACCACTCAAGATGAGATCTGGGTGGGGACAA 16241809
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
      805 TCCCTCGCCACATAGGGATTATGGGGATTACAACTCAAGATGAGATCTGGGTGGGGACAA 864

 16241810 AGAGCCAAACCATATCAGACACCAACAGTATCTGCTACATTCTTGCTGCTGCATTTGGAG 16241869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      865 AGAGCCAAACCATATCAGACACCAACAGTATCTGCTACATTCTTGCTGCTGCATTTGGAG 924

 16241870 AATGTTAGCAAGTTCTCCCCTTTCCTGGTTTTCTGACACCATCCCTCTAATTTTTACTGG 16241929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      925 AATGTTAGCAAGTTCTCCCCTTTCCTGGTTTTCTGACACCATCCCTCTAATTTTTACTGG 984

 16241930 AGAGAATCATGGCCCACCCCAACCTAACCAAGCATCTTACATCTCAGCAACAACCACACT 16241989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      985 AGAGAATCATGGCCCACCCCAACCTAACCAAGCATCTTACATCTCAGCAACAACCACACT 1044

 16241990 GTAGTAATGTTTTCGGTTCTTAGGACCCAGGTGCTCACCACAGCTTCCAAAAGAGAGTTG 16242049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1045 GTAGTAATGTTTTCGGTTCTTAGGACCCAGGTGCTCACCACAGCTTCCAAAAGAGAGTTG 1104

 16242050 CTGACGATTGTCTTAGTCACAATCTCATCGGTTGTGGCATTTGTCATTCCACTGACCACA 16242109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1105 CTGACGATTGTCTTAGTCACAATCTCATCGGTTGTGGCATTTGTCATTCCACTGACCACA 1164

 16242110 ACCCTGTTGATTCCAGGACAACTCAAGTCTGCTCTCAGCGAATATGTGGCCAGGCTGGAG 16242169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1165 ACCCTGTTGATTCCAGGACAACTCAAGTCTGCTCTCAGCGAATATGTGGCCAGGCTGGAG 1224

 16242170 GGGGTGAAGTTACTCAGGAGCAACAAGAGGCTGGGTGCCATCAGGGCCCGGATGCTGGGG 16242229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1225 GGGGTGAAGTTACTCAGGAGCAACAAGAGGCTGGGTGCCATCAGGGCCCGGATGCTGGGG 1284

 16242230 GCCACCAGAGCCACCGGGGATGTGCTCGTCTTCATGGATGCCCACTGCGAGTGCCACCCA 16242289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1285 GCCACCAGAGCCACCGGGGATGTGCTCGTCTTCATGGATGCCCACTGCGAGTGCCACCCA 1344

 16242290 GGCTGGCTGGAGCCCCTCCTCAGCAGAATAGCTGGTGACAGGTAACTTATTCCCTGGGCT 16242349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1345 GGCTGGCTGGAGCCCCTCCTCAGCAGAATAGCTGGTGACAGGTAACTTATTCCCTGGGCT 1404

 16242350 TGCAAAGCAAGACATGGAACTGGGAGAAACAGTCTACAGCATCAGCCACTCACAGAGCAA 16242409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1405 TGCAAAGCAAGACATGGAACTGGGAGAAACAGTCTACAGCATCAGCCACTCACAGAGCAA 1464

 16242410 CCCACCTATTAATTCCTGAATCTCCATTAGAGAGTGATATATTCCCTTCGGGTTTTCAGA 16242469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1465 CCCACCTATTAATTCCTGAATCTCCATTAGAGAGTGATATATTCCCTTCGGGTTTTCAGA 1524

 16242470 TGTGTAAGTTTTTTAAGACTATAGAGTTAGAGTTGGAAAGGAGGTTAGAGGTCTTCATCT 16242529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1525 TGTGTAAGTTTTTTAAGACTATAGAGTTAGAGTTGGAAAGGAGGTTAGAGGTCTTCATCT 1584

 16242530 ACCTTGCTTTATAGATAAAGAAACCGAGGCCTGGAGAACAGCTTCTATGAGGTTGCAAAT 16242589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1585 ACCTTGCTTTATAGATAAAGAAACCGAGGCCTGGAGAACAGCTTCTATGAGGTTGCAAAT 1644

 16242590 ACTTAAAATTGTATTAAATTGCATGACGAGGGTAACACCTTACCATAGCTATCATTGCCT 16242649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1645 ACTTAAAATTGTATTAAATTGCATGACGAGGGTAACACCTTACCATAGCTATCATTGCCT 1704

 16242650 TTGGTGAAAATTTGGCAATTTTTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTGTG 16242709
          ||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||
     1705 TTGGTGAAAATTTGGCAATTTT------TTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTGTG 1758

 16242710 ATGGCGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGCGGGGCGATCTCGGCTCACTGCAA 16242769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1759 ATGGCGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGCGGGGCGATCTCGGCTCACTGCAA 1818

 16242770 GCTGCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTAC 16242829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1819 GCTGCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTAC 1878

 16242830 AGGCGCCCGCCACCACACCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGAAGGGGTTTCACC 16242889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1879 AGGCGCCCGCCACCACACCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGAAGGGGTTTCACC 1938

 16242890 GTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACTTCGTGATCCGCCCTCCTCAGCCTCCCAA 16242949
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1939 GTGTTAGCCAGGATGGTCTCAATCTCCTGACTTCGTGATCCGCCCTCCTCAGCCTCCCAA 1998

 16242950 AGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCTGGCCGAAAATTCGTCAATTTTAATCA 16243009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1999 AGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCTGGCCGAAAATTCGTCAATTTTAATCA 2058

 16243010 AGCTTGTAACATAACCTGGGGAAAAAGTCTCTGAACTACACTAGGCCGTAGATTACTCAC 16243069
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2059 AGCTTGTAACATAAACTGGGGAAAAAGTCTCTGAACTACACTAGGCCGTAGATTACTCAC 2118

 16243070 CCATAAAAAGAAAACATTATGTTCTCTGATCACTAAACAGCATTCTTTGTTTCCCCAGTT 16243129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2119 CCATAAAAAGAAAACATTATGTTCTCTGATCACTAAACAGCATTCTTTGTTTCCCCAGTT 2178

 16243130 TATATAAGGGGTCCCTAATTTTCTACCTAAGGCCAGTCCTTGGAAATGTGAAGTTGGAGA 16243189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2179 TATATAAGGGGTCCCTAATTTTCTACCTAAGGCCAGTCCTTGGAAATGTGAAGTTGGAGA 2238

 16243190 GGACTGCATTACATTACCCTGTAGACAAGCATCTTAACATTTTTCTTGATCATTTCTCTG 16243249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2239 GGACTGCATTACATTACCCTGTAGACAAGCATCTTAACATTTTTCTTGATCATTTCTCTG 2298

 16243250 CTCTCCTTCCCCCATCTGACCGTCAATCTCTTTCTCACTTCCTTGCTCAAGACAAACAGT 16243309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2299 CTCTCCTTCCCCCATCTGACCGTCAATCTCTTTCTCACTTCCTTGCTCAAGACAAACAGT 2358

 16243310 TCCTAAACATGTCTAGTCAAACATTACCCTCAATCTGAATATCCTACCCAGGAAAACTGA 16243369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2359 TCCTAAACATGTCTAGTCAAACATTACCCTCAATCTGAATATCCTACCCAGGAAAACTGA 2418

 16243370 AACCTGGTGGCTGGCCCACCTTGGACCACCTCAGGCATACCACTTGGAGCTCATGTAGGC 16243429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2419 AACCTGGTGGCTGGCCCACCTTGGACCACCTCAGGCATACCACTTGGAGCTCATGTAGGC 2478

 16243430 ATGTAGCAGAGTAGAACCACAATCAATAATTGTTTGATGGTGCCCAGCAAGACAGGACCA 16243489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2479 ATGTAGCAGAGTAGAACCACAATCAATAATTGTTTGATGGTGCCCAGCAAGACAGGACCA 2538

 16243490 ATGCTAGAACCAAGCCTTATGACTTCTACCCATGATGAATGTTTATTATCTCACCTGAAG 16243549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2539 ATGCTAGAACCAAGCCTTATGACTTCTACCCATGATGAATGTTTATTATCTCACCTGAAG 2598

 16243550 TTAGGGATGATCAATCAAATATAAGAAAAAATTCCTGGACCAGATCGGAATGAATCCTGG 16243609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2599 TTAGGGATGATCAATCAAATATAAGAAAAAATTCCTGGACCAGATCGGAATGAATCCTGG 2658

 16243610 AGACATAGGAGTTACCATCAGCCAAATGGAGATGGTTTCAAACGTTCAAATGACAGAAAG 16243669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2659 AGACATAGGAGTTACCATCAGCCAAATGGAGATGGTTTCAAACGTTCAAATGACAGAAAG 2718

 16243670 TAAATTGTTAATAGTTCAGCATTCCATTTTAACAAAGAAGAACAATCGGAACTCAAGTGA 16243729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2719 TAAATTGTTAATAGTTCAGCATTCCATTTTAACAAAGAAGAACAATCGGAACTCAAGTGA 2778

 16243730 GATCAAGACAGATTAATGTTTCCCAGTTTCATGAGACAGATTGTCTCTTGACTCACATCT 16243789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2779 GATCAAGACAGATTAATGTTTCCCAGTTTCATGAGACAGATTGTCTCTTGACTCACATCT 2838

 16243790 CATAAGAAAAGAAGACACACATAAATTCAGCACTAGGACAAGAACTAGGACACAAAAATG 16243849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2839 CATAAGAAAAGAAGACACACATAAATTCAGCACTAGGACAAGAACTAGGACACAAAAATG 2898

 16243850 CACAAGCTGGCCAGGCACGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGG 16243909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2899 CACAAGCTGGCCAGGCACGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGG 2958

 16243910 CAGACGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCA 16243969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2959 CAGACGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCA 3018

 16243970 TCTCTACTAAAAATACAAAAATTAACTGGGTGTGGTAGCGTGCGCCTGTAATCCCAGCTA 16244029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3019 TCTCTACTAAAAATACAAAAATTAACTGGGTGTGGTAGCGTGCGCCTGTAATCCCAGCTA 3078

 16244030 CTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTAAAGTGAGCCA 16244089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3079 CTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTAAAGTGAGCCA 3138

 16244090 AGATCGTGCTACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCCATCCCGAAAAGAAAA 16244149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3139 AGATCGTGCTACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCCATCCCGAAAAGAAAA 3198

 16244150 GAAAATGCACAAGCCCTCCAAAGCTGCCATTTTTGATTCTGTTTCATGCAAAGGGCCATC 16244209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3199 GAAAATGCACAAGCCCTCCAAAGCTGCCATTTTTGATTCTGTTTCATGCAAAGGGCCATC 3258

 16244210 TTGAAATCAGAGCGATGTCTATCATTGGAGTCAGACTCTGAAGTTGATCTTGCCCATTTC 16244269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3259 TTGAAATCAGAGCGATGTCTATCATTGGAGTCAGACTCTGAAGTTGATCTTGCCCATTTC 3318

 16244270 CCATCTGATTCCCATTCTGGTATCACAGACAGGTGGCTCTCAGAGGGACCATGAAGATCA 16244329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3319 CCATCTGATTCCCATTCTGGTATCACAGACAGGTGGCTCTCAGAGGGACCATGAAGATCA 3378

 16244330 TCTTGTCTTACCTCATGATTTCGCTATCGAGAACCCTGAGTTCCAGGAAAGTAAAAAAGA 16244389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3379 TCTTGTCTTACCTCATGATTTCGCTATCGAGAACCCTGAGTTCCAGGAAAGTAAAAAAGA 3438

 16244390 CCCCTCAGGGTCACACAGCCATTTGACAACTGGGCTGTTTTCTATGCTGCTTTTATGCAG 16244449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3439 CCCCTCAGGGTCACACAGCCATTTGACAACTGGGCTGTTTTCTATGCTGCTTTTATGCAG 3498

 16244450 ACATTTAGAAATGCAGTAATTAACATCATTAAACTTTATGTATGTGTAACCCTCGCAGAC 16244509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3499 ACATTTAGAAATGCAGTAATTAACATCATTAAACTTTATGTATGTGTAACCCTCGCAGAC 3558

 16244510 TTCTTTCATATGCCTTCTTTAATGACCCCCATGAGAGGCCTCAGGCAGGTATTTTAGCTT 16244569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3559 TTCTTTCATATGCCTTCTTTAATGACCCCCATGAGAGGCCTCAGGCAGGTATTTTAGCTT 3618

 16244570 CTGTTTTATAGGGGGAGAAATTGAGGCTCAGAGAGGTGACATGATATGTAAGGGCAGATA 16244629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3619 CTGTTTTATAGGGGGAGAAATTGAGGCTCAGAGAGGTGACATGATATGTAAGGGCAGATA 3678

 16244630 ATTCGTAGCTGAGTCAGATTTTCTGACTCTGGGTCCAGTGCTGTTTTTATTGTGTACATT 16244689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3679 ATTCGTAGCTGAGTCAGATTTTCTGACTCTGGGTCCAGTGCTGTTTTTATTGTGTACATT 3738

 16244690 TTCTTTTTAAGAGTTGGAGAAGCTGGTCAGGGAGGAACATTAGTCATCCCTAACCCCACA 16244749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3739 TTCTTTTTAAGAGTTGGAGAAGCTGGTCAGGGAGGAACATTAGTCATCCCTAACCCCACA 3798

 16244750 ACTGGTTATGAGACATGTGTTACCTGCTGCTGTGAGTCCCTCGTATCTGCTTCTCACATC 16244809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3799 ACTGGTTATGAGACATGTGTTACCTGCTGCTGTGAGTCCCTCGTATCTGCTTCTCACATC 3858

 16244810 GGGGCCCCATTTCCCAGAGCTAGGTGAAGGTAGAAAGACGTGGCACTACCTCAGTGTCCT 16244869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3859 GGGGCCCCATTTCCCAGAGCTAGGTGAAGGTAGAAAGACGTGGCACTACCTCAGTGTCCT 3918

 16244870 AGGCTAGAAAGAAAATGAGGCTCCCTGGGAAGCCCTTTGTGATTAAGAGACATTCTAGTT 16244929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3919 AGGCTAGAAAGAAAATGAGGCTCCCTGGGAAGCCCTTTGTGATTAAGAGACATTCTAGTT 3978

 16244930 TCCTGTGCCCTTCCCCTCTCCTCTTTTCCTCTCCTGTCTGTCTCTGCCTCTCTACCTCTC 16244989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3979 TCCTGTGCCCTTCCCCTCTCCTCTTTTCCTCTCCTGTCTGTCTCTGCCTCTCTACCTCTC 4038

 16244990 TCACGGTCTTTGTCTCTCTCTGTCTCTTGGTCACTCATTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC 16245049
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   
     4039 TCACGGTCTTTGTCTCTCTCTGTCTCTTGGTCACTCATTCTCTCTCTCTCTCTCTCT--- 4095

 16245050 TCACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAGTGGGCCTCTGAT 16245109
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4096 ---CACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAGTGGGCCTCTGAT 4152

 16245110 CCTGGTGTGTTACTGGCTTGCCTTCCTCTTTGGGTTCCATCTCTTCTGCGTGATGTGACC 16245169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4153 CCTGGTGTGTTACTGGCTTGCCTTCCTCTTTGGGTTCCATCTCTTCTGCGTGATGTGACC 4212

 16245170 ACATTTTCATCATCTCTACACCTCATTCATGGCTTCTTGTCCACTGTGTTTTCTCTGGGC 16245229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4213 ACATTTTCATCATCTCTACACCTCATTCATGGCTTCTTGTCCACTGTGTTTTCTCTGGGC 4272

 16245230 CCTAGTGTCCAGCTTTTAGGCACTGGCAGGTGAGGATCTGGAAGAAAAGCCACCTTTCTG 16245289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4273 CCTAGTGTCCAGCTTTTAGGCACTGGCAGGTGAGGATCTGGAAGAAAAGCCACCTTTCTG 4332

 16245290 GTATCTGAGTCCCACTCTCTCCACTCCACCTGGCAACGCTCTATGAGCTGTGGCAGGGAG 16245349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4333 GTATCTGAGTCCCACTCTCTCCACTCCACCTGGCAACGCTCTATGAGCTGTGGCAGGGAG 4392

 16245350 AGCAGCCTCATTCAGTGTGTGCTTTACTCCCCCAGGGACGTCGCCCACGTGCCTCATACA 16245409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4393 AGCAGCCTCATTCAGTGTGTGCTTTACTCCCCCAGGGACGTCGCCCACGTGCCTCATACA 4452

 16245410 AAGCCAAGCTGTGGAAGGCATTTGGTGCAGCTCCTCACATGGAGAGGAGAGGGGGCCCAG 16245469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4453 AAGCCAAGCTGTGGAAGGCATTTGGTGCAGCTCCTCACATGGAGAGGAGAGGGGGCCCAG 4512

 16245470 CTGTCTCCAAGGCTTGTGTCAGGAGACATTCTGTCACCAGATGAGGACACAGTGCCCAAA 16245529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4513 CTGTCTCCAAGGCTTGTGTCAGGAGACATTCTGTCACCAGATGAGGACACAGTGCCCAAA 4572

 16245530 AGACAGAAAAGGGTCTTTAAGAGCTCTTATAA 16245561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||
     4573 AGACAGAAAAGGGTCTTTAAGAGCTCTTATAA 4604

Alignment time is 5.81224 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [16229408,16251209] =>     21802 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    3692] =>      3692 nucs 'mol-32-1f00-098796_3692'

Score:        3554
Aligned:      3686        nucs
Identic:      3674 (100%) nucs =>       850 (100%)      2824 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [16238297,16239149] EXCISED REGION [16239157,16241989]
 second seq =>  [       1,     853] EXCISED REGION [     861,    3692]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         7 nucs [16239150,16239156]
 second seq =>         7 nucs [854,860]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [16239149,16239151] to [16239156,16239158]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [16239150,16239151] to [16239155,16239156]
 second seq =>         1 nucs [854,854] to [860,860]

 16238297 CTGGCACAACTAAATGACCTAGGGACACCCCTCCTGGCCTTCTGGGAAGATCAGAACGCT 16238356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTGGCACAACTAAATGACCTAGGGACACCCCTCCTGGCCTTCTGGGAAGATCAGAACGCT 60

 16238357 CTGAGGGAAGCCGAGCATTCACGTTTTTCTAAGGGGAATAATGGAGAAGGGCTAGGGTAG 16238416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTGAGGGAAGCCGAGCATTCACGTTTTTCTAAGGGGAATAATGGAGAAGGGCTAGGGTAG 120

 16238417 CCAGGTGCCTCTGTTAGTTCTTTCTACGGTCCTCACTCCAGGGATGGGCCTAGCCTGGCC 16238476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCAGGTGCCTCTGTTAGTTCTTTCTACGGTCCTCACTCCAGGGATGGGCCTAGCCTGGCC 180

 16238477 ATAGCAGTGAGTCAGATTAGCCAGAGGCTCTGGGAACACCTGGGGTTCCTGGGTGCAGCT 16238536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
      181 ATAGCAGTGAGTCAGATTAGCCAGAGGCTCTGGGAACACCTGGGGTTCCTGGGTACAGCT 240

 16238537 GGCTGCATATTAGGCAGGACTAATGAACAGGTGCAGGACAGGGCTGGGTTGGCGGGTAAA 16238596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGCTGCATATTAGGCAGGACTAATGAACAGGTGCAGGACAGGGCTGGGTTGGCGGGTAAA 300

 16238597 GTGCCCAGAGACTCTCCAAACCCTCAAGTGGGGCGGGGTCCGCCCAAGAGCACACCTGTG 16238656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTGCCCAGAGACTCTCCAAACCCTCAAGTGGGGCGGGGTCCGCCCAAGAGCACACCTGTG 360

 16238657 GTGAGGCCCCCACCATCTGATGAGCTGTGTTACGTCTGTGCCCCTCGGGAGTACGGAAAG 16238716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTGAGGCCCCCACCATCTGATGAGCTGTGTTACGTCTGTGCCCCTCGGGAGTACGGAAAG 420

 16238717 TGGAGGAGCTGGGCCCCAGAGAAATGGGCTACCCCAGAGCTGGCAGCCCCACCAGAGGGG 16238776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGGAGGAGCTGGGCCCCAGAGAAATGGGCTACCCCAGAGCTGGCAGCCCCACCAGAGGGG 480

 16238777 ATCTGGATCCCCTGCCAAGCAATTAAGCTGCCCCCTCCTGGCCAACTCCCCTTCTGCCCC 16238836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATCTGGATCCCCTGCCAAGCAATTAAGCTGCCCCCTCCTGGCCAACTCCCCTTCTGCCCC 540

 16238837 TCACCACTGGGTTGGCTCTCCATCCAGTGGCCCCATATTTCCTGTTGACATTGGGGTGCA 16238896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCACCACTGGGTTGGCTCTCCATCCAGTGGCCCCATATTTCCTGTTGACATTGGGGTGCA 600

 16238897 AGGCCTTTTCCACAACCAAGGGCAGCACTGGTTCTATTTCTGCAGGTCCCTCTCCTCTGT 16238956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGGCCTTTTCCACAACCAAGGGCAGCACTGGTTCTATTTCTGCAGGTCCCTCTCCTCTGT 660

 16238957 GTGCTTGCCAAGACCCAGATCCCAGACAAGCACCACCCTGCACACTGTTTTTATTTAATC 16239016
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
      661 GTGCTTGCCAAGACCCAGATCCCAGACAAGCACCACCTTGCACACTGTTTTTATTTAATC 720

 16239017 CTCTTGGCCACCCAGAGAGGCAGGGCTTATCAACCCTACTCTACCTGTGAGGAAAACTGA 16239076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
      721 CTCTTGGCCACCCAGAGAGGCAGGGCTTATCAACCCTACTCTACCTATGAGGAAAACTGA 780

 16239077 GACAGAAAAAGATGCTGCGGGTTGCCCTGAGCCACCTTGATGGGCTTCCAAGCCGATGGT 16239136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GACAGAAAAAGATGCTGCGGGTTGCCCTGAGCCACCTTGATGGGCTTCCAAGCCGATGGT 840

 16239137 CATGACAGCATAG 16239149
          |||||||||||||
      841 CATGACAGCATAG 853

EXCISED REGION

 16239157 TGATAGAATCAGCTAGATGGGTTTCAGGGTATTCGTCTGGGGTGGTGATGCCCACACCAA 16239216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      861 TGATAGAATCAGCTAGATGGGTTTCAGGGTATTCGTCTGGGGTGGTGATGCCCACACCAA 920

 16239217 ATCATTAAATCAGAAAATGCTTGCGATGACCAGCCCATGATGACCCTTTACAAGTGGAAG 16239276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      921 ATCATTAAATCAGAAAATGCTTGCGATGACCAGCCCATGATGACCCTTTACAAGTGGAAG 980

 16239277 TCAGTATTACTGCTGTTTTCTGGAGGGAAGGAGTTGAGGATCATACCAGCTTTTTCCGAG 16239336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      981 TCAGTATTACTGCTGTTTTCTGGAGGGAAGGAGTTGAGGATCATACCAGCTTTTTCCGAG 1040

 16239337 CACTATACCACTCAGACATGGGTGCTCTTACCCACTTCAAAACCCTCTGAGAATGCCAAA 16239396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1041 CACTATACCACTCAGACATGGGTGCTCTTACCCACTTCAAAACCCTCTGAGAATGCCAAA 1100

 16239397 CAACCATCGCAGTCTGGAAGTTCTTCCTTATCTATTCCGAAGCTCTCTTGCTAGAAGTCT 16239456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1101 CAACCATCGCAGTCTGGAAGTTCTTCCTTATCTATTCCGAAGCTCTCTTGCTAGAAGTCT 1160

 16239457 GTCCTAAATAATACTAACAAGGGTTAGAGGTATAGCTGAAGAGACCAGCAGTCAGCCCAA 16239516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1161 GTCCTAAATAATACTAACAAGGGTTAGAGGTATAGCTGAAGAGACCAGCAGTCAGCCCAA 1220

 16239517 GGAGGGCTTCATAAATTAATGTTTGGTGGGAATATCAGTGAAGGACTATATTTGGCTGCA 16239576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1221 GGAGGGCTTCATAAATTAATGTTTGGTGGGAATATCAGTGAAGGACTATATTTGGCTGCA 1280

 16239577 CAGAACAGAAACCTGCTGCAGTGACTTAACCAATGAATAGAGATTTATTTTTCCTTATAG 16239636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1281 CAGAACAGAAACCTGCTGCAGTGACTTAACCAATGAATAGAGATTTATTTTTCCTTATAG 1340

 16239637 TATAGAAAGCTCACAGGGTGGCAATGCAGTATTGGTGTGACAGCTCCACAATGCCATTGG 16239696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1341 TATAGAAAGCTCACAGGGTGGCAATGCAGTATTGGTGTGACAGCTCCACAATGCCATTGG 1400

 16239697 ACACCCACCTTCATCTGCTTTCCACTTCAACATGCTTAGAGAGTAGTTTTGGCCTCATAA 16239756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1401 ACACCCACCTTCATCTGCTTTCCACTTCAACATGCTTAGAGAGTAGTTTTGGCCTCATAA 1460

 16239757 TCACAACAGGGCTGCTCTACCTCTGGACATCACATACATATTTCAAATAGGGAAAAGGCG 16239816
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1461 TCACAACAGGGCTGTTCTACCTCTGGACATCACATACATATTTCAAATAGGGAAAAGGCG 1520

 16239817 AAGAAGAGATAGGCAGAGGCCAGTCCGGTTTGTGCTCTTCGGAAAAAAAAAATTAGTAAA 16239876
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
     1521 AAGAAGAGATAGGCAGAGGCCAGTCCGGTTTGTGCTCTTCGG-AAAAAAAAATTAGTAAA 1579

 16239877 ATAATAGTTTTCCCAGAATCCTTTCATTCATTTTATTTCTACCAGAGCTGCTGCCAGCAG 16239936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1580 ATAATAGTTTTCCCAGAATCCTTTCATTCATTTTATTTCTACCAGAGCTGCTGCCAGCAG 1639

 16239937 TGACAGGAAGTCTCGAGAGATACGTGTTTTTAGCTGTCCCGAGAAACATCAAAGTTCTGT 16239996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1640 TGACAGGAAGTCTCGAGAGATACGTGTTTTTAGCTGCCCCGAGAAACATCAAAGTTCTGT 1699

 16239997 CAGTACAGTGGAAGGGGAGAATGAATGGTGAGGAAGATGTTACATTTAGCAATGTTAAAG 16240056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1700 CAGTACAGTGGAAGGGGAGAATGAATGGTGAGGAAGATGTTACATTTAGCAATGTTAAAG 1759

 16240057 CCAATGAAGTCACTGAGGGGCTGCTTCTCAGATATGCAAGTCCAGAAATGTTAATAGCTT 16240116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1760 CCAATGAAGTCACTGAGGGGCTGCTTCTCAGATATGCAAGTCCAGAAATGTTAATAGCTT 1819

 16240117 GACTAACAGAGATTCCTCTCTAGGGAGTGGACCAGGGCTGACAGTCTTACCAGAAAAATA 16240176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1820 GACTAACAGAGATTCCTCTCTAGGGAGTGGACCAGGGCTGACAGTCTTACCAGAAAAATA 1879

 16240177 ATTATAAAGTAACACATCAACGAAGCATTTTACCAGTGAGAATTGCAACAGCCCAGTGAC 16240236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1880 ATTATAAAGTAACACATCAACGAAGCATTTTACCAGTGAGAATTGCAACAGCCCAGTGAC 1939

 16240237 TGGGACTCCTTTCCTCTACTGCTCAGGACATTGTTCACCCTGCAGAAAATCCATGGTGCT 16240296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1940 TGGGACTCCTTTCCTCTACTGCTCAGGACATTGTTCTCCCTGCAGAAAATCCATGGTGCT 1999

 16240297 TAGAAGACAGATTCCCAGGGAAGGAGTGTATGAAGTCTGCTGGGGGCTCTCGGGTGGGGC 16240356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2000 TAGAAGACAGATTCCCAGGGAAGGAGTGTATGAAGTCTGCTGGGGGCTCTCGGGTGGGGC 2059

 16240357 TGCCTTAACCTTCTCCAGCCTCCCCAGAGATCCAGCTACCAAAGCAGCCAGGCTACTTGT 16240416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2060 TGCCTTAACCTTCTCCAGCCTCCCCAGAGATCCAGCTACCAAAGCAGCCAGGCTACTTGT 2119

 16240417 ATCCACAGTTAAGGCCACCTCTGGGCTGGGGAACTGGGGGGGAAATTCTTGCTTTTTGGC 16240476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2120 ATCCACAGTTAAGGCCACCTCTGGGCTGGGGAACTGGGGGGGAAATTCTTGCTTTTTGGC 2179

 16240477 TCAGTTCTGTTCAATGCACATGTACTGAGTGCCTACTGTGGGCCAGGCCCTGCACTAAGG 16240536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2180 TCAGTTCTGTTCAATGCACATGTACTGAGTGCCTACTGTGGGCCAGGCCCTGCACTAAGG 2239

 16240537 GTTAGAGCAGAAGAGATGCATTAGGTACAACCCCTGTCCTTGGGGAGATCTTAGTCCACT 16240596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2240 GTTAGAGCAGAAGAGATGCATTAGGTACAACCCCTGTCCTTGGGGAGATCTTAGTCCACT 2299

 16240597 GGCCTGGGGGGACTCCCCATTTCCAAGACTTCATGGAGACCACTGCTTCTCTGTGAACAC 16240656
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2300 GGCCTGGGGGGACTCCCCGTTTCCAAGACTTCATGGAGACCACTGCTTCTCTGTGAACAC 2359

 16240657 ATTGTTCCTTCCATCTCCACTGGCTTGTTCCTCTTGGTGTGTGTGTACACAGACATGCAC 16240716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2360 ATTGTTCCTTCCATCTCCACTGGCTTGTTCCTCTTGGTGTGTGTGTACACAGACATGCAC 2419

 16240717 ACACACACACACATGCACTCACACACACAATCAAGTTATTCTTATCTTAAACACAAAACC 16240776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2420 ACACACACACACATGCACTCACACACACAATCAAGTTATTCTTATCTTAAACACAAAACC 2479

 16240777 TAACAAGCTTCTCTCATCCTTTCCGTCATCTTCTTAGGCCTCTTTTTCTCCCTTCCCCTA 16240836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2480 TAACAAGCTTCTCTCATCCTTTCCGTCATCTTCTTAGGCCTCTTTTTCTCCCTTCCCCTA 2539

 16240837 TAGAATCAACCTTCCTAACCGTCTGGACTCTTGGTCTCAGTTTTTCATCTTCCGTTTTCT 16240896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2540 TAGAATCAACCTTCCTAACCGTCTGGACTCTTGGTCTCAGTTTTTCATCTTCCGTTTTCT 2599

 16240897 CTCCCGGACCCACTGTGTTGCAGACTCCCCTATCAACTGCAATGAGATCTCTTTGACCAG 16240956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2600 CTCCCGGACCCACTGTGTTGCAGACTCCCCTATCAACTGCAATGAGATCTCTTTGACCAG 2659

 16240957 CACCACCAATCTCCTACCAGCTGCCAAATTTAATGGAGCCTTTTGCCTTTGACTTCCTTG 16241016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2660 CACCACCAATCTCCTACCAGCTGCCAAATTTAATGGAGCCTTTTGCCTTTGACTTCCTTG 2719

 16241017 ACCACTGTCTTAGGTCAGGTTTCCTGAAAGCAGGGCCTGAGATGGAGATTCACGTGCATT 16241076
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     2720 ACCACTGTCTTAGGTCAGGTTTCCTGAAAGCAGGGCCTGAGATGGAGATTCACGTGCATG 2779

 16241077 TGATTTTTTTGAGGGTGTACTCTCAGGGGAAATCTGTAGGGGAGTGAGTGATACAGAAGA 16241136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2780 TGATTTTTTTGAGGGTGTACTCTCAGGGGAAATCTGTAGGGGAGTGAGTGATACAGAAGA 2839

 16241137 GAGAGAGGGAAGAGCTGAACAAATATGTGGTTTCAGGTGAAGTCCAGCCATAGCCTGATC 16241196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2840 GAGAGAGGGAAGAGCTGAACAAATATGTGGTTTCAGGTGAAGTCCAGCCATAGCCTGATC 2899

 16241197 CCATGGGGGACTCTGGAGCACAGGCTGCACTGCGGGGTCTGTCTTGCTTTTTACCCTGCA 16241256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2900 CCATGGGGGACTCTGGAGCACAGGCTGCACTGCGGGGTCTGTCTTGCTTTTTACCCTGCA 2959

 16241257 ATGGTCAGTCATTGACCATGACTGGGGCTGGGGGCAGCATCCTGCATGACTGTCTGGCAC 16241316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2960 ATGGTCAGTCATTGACCATGACTGGGGCTGGGGGCAGCATCCTGCATGACTGTCTGGCAC 3019

 16241317 CTGCAGCAGAGACCGTTTTAATACCCCAAGGCAAGTCTCCAGGGAAGGGTTAAGATTTCA 16241376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3020 CTGCAGCAGAGACCGTTTTAATACCCCAAGGCAAGTCTCCAGGGAAGGGTTAAGATTTCA 3079

 16241377 GTTAGCACCCACAGCAGCTGGGGACATGCAAACCAAACCAAAACAGTTAAGGGGAGCTCA 16241436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3080 GTTAGCACCCACAGCAGCTGGGGACATGCAAACCAAACCAAAACAGTTAAGGGGAGCTCA 3139

 16241437 GGGAATCTGAGTAGGACACTATATTAGTCTGTTCTCACACTGCTATAAAGAACTGCCTGA 16241496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3140 GGGAATCTGAGTAGGACACTATATTAGTCTGTTCTCACACTGCTATAAAGAACTGCCTGA 3199

 16241497 GACTAGGTAATTTATAAAGAAAGGAGGTTTAATTGACTCACAGTTTCGCATGGCTGGGGA 16241556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3200 GACTAGGTAATTTATAAAGAAAGGAGGTTTAATTGACTCACAGTTTCGCATGGCTGGGGA 3259

 16241557 GGCCTCAGGAAACTTACAATCATGGTGGAAGGGGAAGCATGTCTTACATGGCAGCAAGTG 16241616
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3260 GGCCTCAGGAAACTTACAATCACGGTGGAAGGGGAAGCATGTCTTACATGGCAGCAAGTG 3319

 16241617 AGAGAAAGAGAGAGAGAGAGGAGGAAAAACTATCAAACACTTATATAATCATCAGATCTC 16241676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3320 AGAGAAAGAGAGAGAGAGAGGAGGAAAAACTATCAAACACTTATATAATCATCAGATCTC 3379

 16241677 ATGAGAACTCACTATCACGAGAACAGCATGGGGGAAACTGCCCACATGATCCAATCACCT 16241736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3380 ATGAGAACTCACTATCACGAGAACAGCATGGGGGAAACTGCCCACATGATCCAATCACCT 3439

 16241737 CCCACCAGGTCCCTCCCTCGCCACATAGGGATTATGGGGATTACCACTCAAGATGAGATC 16241796
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     3440 CCCACCAGGTCCCTCCCTCGACACATAGGGATTATGGGGATTACAACTCAAGATGAGATC 3499

 16241797 TGGGTGGGGACAAAGAGCCAAACCATATCAGACACCAACAGTATCTGCTACATTCTTGCT 16241856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3500 TGGGTGGGGACAAAGAGCCAAACCATATCAGACACCAACAGTATCTGCTACATTCTTGCT 3559

 16241857 GCTGCATTTGGAGAATGTTAGCAAGTTCTCCCCTTTCCTGGTTTTCTGACACCATCCCTC 16241916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3560 GCTGCATTTGGAGAATGTTAGCAAGTTCTCCCCTTTCCTGGTTTTCTGACACCATCCCTC 3619

 16241917 TAATTTTTACTGGAGAGAATCATGGCCCACCCCAACCTAACCAAGCATCTTACATCTCAG 16241976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3620 TAATTTTTACTGGAGAGAATCATGGCCCACCCCAACCTAACCAAGCATCTTACATCTCAG 3679

 16241977 CAACAACCACACT 16241989
          |||||||||||||
     3680 CAACAACCACACT 3692

Alignment time is 4.61595 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [16229408,16251209] =>     21802 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    2625] =>      2625 nucs 'mol-32-1f00-185871_2625'

Score:        2570
Aligned:      2625        nucs
Identic:      2620 (100%) nucs =>      1245 (100%)      1375 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [16238162,16239408] EXCISED REGION [16241210,16242587]
 second seq =>  [       1,    1247] EXCISED REGION [    1248,    2625]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1801 nucs [16239409,16241209]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [16239409,16239409] to [16241210,16241210]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [16239409,16239410] to [16241208,16241209]
 second seq =>         0 nucs

 16238162 TTCTGGTGATGGAGTGGGGCCGAAGAATTTGCATTTCTAACAAGCTCCCAGGTGATGCTG 16238221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTCTGGTGATGGAGTGGGGCCGAAGAATTTGCATTTCTAACAAGCTCCCAGGTGATGCTG 60

 16238222 ATGCTGCTGTTTTCTGTGGACCACACTCTGAGAACCTCTGCTCTAGTCTTTGGCTTGGGC 16238281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATGCTGCTGTTTTCTGTGGACCACACTCTGAGAACCTCTGCTCTAGTCTTTGGCTTGGGC 120

 16238282 GTGAGGCCTACATTTCTGGCACAACTAAATGACCTAGGGACACCCCTCCTGGCCTTCTGG 16238341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTGAGGCCTACATTTCTGGCACAACTAAATGACCTAGGGACACCCCTCCTGGCCTTCTGG 180

 16238342 GAAGATCAGAACGCTCTGAGGGAAGCCGAGCATTCACGTTTTTCTAAGGGGAATAATGGA 16238401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GAAGATCAGAACGCTCTGAGGGAAGCCGAGCATTCACGTTTTTCTAAGGGGAATAATGGA 240

 16238402 GAAGGGCTAGGGTAGCCAGGTGCCTCTGTTAGTTCTTTCTACGGTCCTCACTCCAGGGAT 16238461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GAAGGGCTAGGGTAGCCAGGTGCCTCTGTTAGTTCTTTCTACGGTCCTCACTCCAGGGAT 300

 16238462 GGGCCTAGCCTGGCCATAGCAGTGAGTCAGATTAGCCAGAGGCTCTGGGAACACCTGGGG 16238521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GGGCCTAGCCTGGCCATAGCAGTGAGTCAGATTAGCCAGAGGCTCTGGGAACACCTGGGG 360

 16238522 TTCCTGGGTGCAGCTGGCTGCATATTAGGCAGGACTAATGAACAGGTGCAGGACAGGGCT 16238581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTCCTGGGTGCAGCTGGCTGCATATTAGGCAGGACTAATGAACAGGTGCAGGACAGGGCT 420

 16238582 GGGTTGGCGGGTAAAGTGCCCAGAGACTCTCCAAACCCTCAAGTGGGGCGGGGTCCGCCC 16238641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGGTTGGCGGGTAAAGTGCCCAGAGACTCTCCAAACCCTCAAGTGGGGCGGGGTCCGCCC 480

 16238642 AAGAGCACACCTGTGGTGAGGCCCCCACCATCTGATGAGCTGTGTTACGTCTGTGCCCCT 16238701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAGAGCACACCTGTGGTGAGGCCCCCACCATCTGATGAGCTGTGTTACGTCTGTGCCCCT 540

 16238702 CGGGAGTACGGAAAGTGGAGGAGCTGGGCCCCAGAGAAATGGGCTACCCCAGAGCTGGCA 16238761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CGGGAGTACGGAAAGTGGAGGAGCTGGGCCCCAGAGAAATGGGCTACCCCAGAGCTGGCA 600

 16238762 GCCCCACCAGAGGGGATCTGGATCCCCTGCCAAGCAATTAAGCTGCCCCCTCCTGGCCAA 16238821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GCCCCACCAGAGGGGATCTGGATCCCCTGCCAAGCAATTAAGCTGCCCCCTCCTGGCCAA 660

 16238822 CTCCCCTTCTGCCCCTCACCACTGGGTTGGCTCTCCATCCAGTGGCCCCATATTTCCTGT 16238881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTCCCCTTCTGCCCCTCACCACTGGGTTGGCTCTCCATCCAGTGGCCCCATATTTCCTGT 720

 16238882 TGACATTGGGGTGCAAGGCCTTTTCCACAACCAAGGGCAGCACTGGTTCTATTTCTGCAG 16238941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGACATTGGGGTGCAAGGCCTTTTCCACAACCAAGGGCAGCACTGGTTCTATTTCTGCAG 780

 16238942 GTCCCTCTCCTCTGTGTGCTTGCCAAGACCCAGATCCCAGACAAGCACCACCCTGCACAC 16239001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
      781 GTCCCTCTCCTCTGTGTGCTTGCCAAGACCCAGATCCCAGACAAGCACCACCTTGCACAC 840

 16239002 TGTTTTTATTTAATCCTCTTGGCCACCCAGAGAGGCAGGGCTTATCAACCCTACTCTACC 16239061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGTTTTTATTTAATCCTCTTGGCCACCCAGAGAGGCAGGGCTTATCAACCCTACTCTACC 900

 16239062 TGTGAGGAAAACTGAGACAGAAAAAGATGCTGCGGGTTGCCCTGAGCCACCTTGATGGGC 16239121
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
      901 TGTGAGGAAAACTGAGACAGAAAAAGATGCTGCGGGTTGCCCTGAGCCATCTTGATGGGC 960

 16239122 TTCCAAGCCGATGGTCATGACAGCATAGTGTAGTGTGATAGAATCAGCTAGATGGGTTTC 16239181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTCCAAGCCGATGGTCATGACAGCATAGTGTAGTGTGATAGAATCAGCTAGATGGGTTTC 1020

 16239182 AGGGTATTCGTCTGGGGTGGTGATGCCCACACCAAATCATTAAATCAGAAAATGCTTGCG 16239241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGGGTATTCGTCTGGGGTGGTGATGCCCACACCAAATCATTAAATCAGAAAATGCTTGCG 1080

 16239242 ATGACCAGCCCATGATGACCCTTTACAAGTGGAAGTCAGTATTACTGCTGTTTTCTGGAG 16239301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATGACCAGCCCATGATGACCCTTTACAAGTGGAAGTCAGTATTACTGCTGTTTTCTGGAG 1140

 16239302 GGAAGGAGTTGAGGATCATACCAGCTTTTTCCGAGCACTATACCACTCAGACATGGGTGC 16239361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GGAAGGAGTTGAGGATCATACCAGCTTTTTCCGAGCACTATACCACTCAGACATGGGTGC 1200

 16239362 TCTTACCCACTTCAAAACCCTCTGAGAATGCCAAACAACCATCGCAG 16239408
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TCTTACCCACTTCAAAACCCTCTGAGAATGCCAAACAACCATCGCAG 1247

EXCISED REGION

 16241210 TGGAGCACAGGCTGCACTGCGGGGTCTGTCTTGCTTTTTACCCTGCAATGGTCAGTCATT 16241269
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1248 TGGAGCACAGGCTGCACTGCGGGTTCTGTCTTGCTTTTTACCCTGCAATGGTCAGTCATT 1307

 16241270 GACCATGACTGGGGCTGGGGGCAGCATCCTGCATGACTGTCTGGCACCTGCAGCAGAGAC 16241329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1308 GACCATGACTGGGGCTGGGGGCAGCATCCTGCATGACTGTCTGGCACCTGCAGCAGAGAC 1367

 16241330 CGTTTTAATACCCCAAGGCAAGTCTCCAGGGAAGGGTTAAGATTTCAGTTAGCACCCACA 16241389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1368 CGTTTTAATACCCCAAGGCAAGTCTCCAGGGAAGGGTTAAGATTTCAGTTAGCACCCACA 1427

 16241390 GCAGCTGGGGACATGCAAACCAAACCAAAACAGTTAAGGGGAGCTCAGGGAATCTGAGTA 16241449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1428 GCAGCTGGGGACATGCAAACCAAACCAAAACAGTTAAGGGGAGCTCAGGGAATCTGAGTA 1487

 16241450 GGACACTATATTAGTCTGTTCTCACACTGCTATAAAGAACTGCCTGAGACTAGGTAATTT 16241509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1488 GGACACTATATTAGTCTGTTCTCACACTGCTATAAAGAACTGCCTGAGACTAGGTAATTT 1547

 16241510 ATAAAGAAAGGAGGTTTAATTGACTCACAGTTTCGCATGGCTGGGGAGGCCTCAGGAAAC 16241569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1548 ATAAAGAAAGGAGGTTTAATTGACTCACAGTTTCGCATGGCTGGGGAGGCCTCAGGAAAC 1607

 16241570 TTACAATCATGGTGGAAGGGGAAGCATGTCTTACATGGCAGCAAGTGAGAGAAAGAGAGA 16241629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1608 TTACAATCATGGTGGAAGGGGAAGCATGTCTTACATGGCAGCAAGTGAGAGAAAGAGAGA 1667

 16241630 GAGAGAGGAGGAAAAACTATCAAACACTTATATAATCATCAGATCTCATGAGAACTCACT 16241689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1668 GAGAGAGGAGGAAAAACTATCAAACACTTATATAATCATCAGATCTCATGAGAACTCACT 1727

 16241690 ATCACGAGAACAGCATGGGGGAAACTGCCCACATGATCCAATCACCTCCCACCAGGTCCC 16241749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1728 ATCACGAGAACAGCATGGGGGAAACTGCCCACATGATCCAATCACCTCCCACCAGGTCCC 1787

 16241750 TCCCTCGCCACATAGGGATTATGGGGATTACCACTCAAGATGAGATCTGGGTGGGGACAA 16241809
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     1788 TCCCTCGCCACATAGGGATTATGGGGATTACAACTCAAGATGAGATCTGGGTGGGGACAA 1847

 16241810 AGAGCCAAACCATATCAGACACCAACAGTATCTGCTACATTCTTGCTGCTGCATTTGGAG 16241869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1848 AGAGCCAAACCATATCAGACACCAACAGTATCTGCTACATTCTTGCTGCTGCATTTGGAG 1907

 16241870 AATGTTAGCAAGTTCTCCCCTTTCCTGGTTTTCTGACACCATCCCTCTAATTTTTACTGG 16241929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1908 AATGTTAGCAAGTTCTCCCCTTTCCTGGTTTTCTGACACCATCCCTCTAATTTTTACTGG 1967

 16241930 AGAGAATCATGGCCCACCCCAACCTAACCAAGCATCTTACATCTCAGCAACAACCACACT 16241989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1968 AGAGAATCATGGCCCACCCCAACCTAACCAAGCATCTTACATCTCAGCAACAACCACACT 2027

 16241990 GTAGTAATGTTTTCGGTTCTTAGGACCCAGGTGCTCACCACAGCTTCCAAAAGAGAGTTG 16242049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2028 GTAGTAATGTTTTCGGTTCTTAGGACCCAGGTGCTCACCACAGCTTCCAAAAGAGAGTTG 2087

 16242050 CTGACGATTGTCTTAGTCACAATCTCATCGGTTGTGGCATTTGTCATTCCACTGACCACA 16242109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2088 CTGACGATTGTCTTAGTCACAATCTCATCGGTTGTGGCATTTGTCATTCCACTGACCACA 2147

 16242110 ACCCTGTTGATTCCAGGACAACTCAAGTCTGCTCTCAGCGAATATGTGGCCAGGCTGGAG 16242169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2148 ACCCTGTTGATTCCAGGACAACTCAAGTCTGCTCTCAGCGAATATGTGGCCAGGCTGGAG 2207

 16242170 GGGGTGAAGTTACTCAGGAGCAACAAGAGGCTGGGTGCCATCAGGGCCCGGATGCTGGGG 16242229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2208 GGGGTGAAGTTACTCAGGAGCAACAAGAGGCTGGGTGCCATCAGGGCCCGGATGCTGGGG 2267

 16242230 GCCACCAGAGCCACCGGGGATGTGCTCGTCTTCATGGATGCCCACTGCGAGTGCCACCCA 16242289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2268 GCCACCAGAGCCACCGGGGATGTGCTCGTCTTCATGGATGCCCACTGCGAGTGCCACCCA 2327

 16242290 GGCTGGCTGGAGCCCCTCCTCAGCAGAATAGCTGGTGACAGGTAACTTATTCCCTGGGCT 16242349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2328 GGCTGGCTGGAGCCCCTCCTCAGCAGAATAGCTGGTGACAGGTAACTTATTCCCTGGGCT 2387

 16242350 TGCAAAGCAAGACATGGAACTGGGAGAAACAGTCTACAGCATCAGCCACTCACAGAGCAA 16242409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2388 TGCAAAGCAAGACATGGAACTGGGAGAAACAGTCTACAGCATCAGCCACTCACAGAGCAA 2447

 16242410 CCCACCTATTAATTCCTGAATCTCCATTAGAGAGTGATATATTCCCTTCGGGTTTTCAGA 16242469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2448 CCCACCTATTAATTCCTGAATCTCCATTAGAGAGTGATATATTCCCTTCGGGTTTTCAGA 2507

 16242470 TGTGTAAGTTTTTTAAGACTATAGAGTTAGAGTTGGAAAGGAGGTTAGAGGTCTTCATCT 16242529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2508 TGTGTAAGTTTTTTAAGACTATAGAGTTAGAGTTGGAAAGGAGGTTAGAGGTCTTCATCT 2567

 16242530 ACCTTGCTTTATAGATAAAGAAACCGAGGCCTGGAGAACAGCTTCTATGAGGTTGCAA 16242587
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2568 ACCTTGCTTTATAGATAAAGAAGCCGAGGCCTGGAGAACAGCTTCTATGAGGTTGCAA 2625

Alignment time is 3.36045 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [16229408,16251209] =>     21802 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    2196] =>      2196 nucs 'mol-32-1f0b-003718_2196'

Score:        2152
Aligned:      2196        nucs
Identic:      2192 (100%) nucs =>      1110 (100%)      1082 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [16238297,16239408] EXCISED REGION [16241210,16242293]
 second seq =>  [       1,    1112] EXCISED REGION [    1113,    2196]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1801 nucs [16239409,16241209]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [16239409,16239409] to [16241210,16241210]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [16239409,16239410] to [16241208,16241209]
 second seq =>         0 nucs

 16238297 CTGGCACAACTAAATGACCTAGGGACACCCCTCCTGGCCTTCTGGGAAGATCAGAACGCT 16238356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTGGCACAACTAAATGACCTAGGGACACCCCTCCTGGCCTTCTGGGAAGATCAGAACGCT 60

 16238357 CTGAGGGAAGCCGAGCATTCACGTTTTTCTAAGGGGAATAATGGAGAAGGGCTAGGGTAG 16238416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTGAGGGAAGCCGAGCATTCACGTTTTTCTAAGGGGAATAATGGAGAAGGGCTAGGGTAG 120

 16238417 CCAGGTGCCTCTGTTAGTTCTTTCTACGGTCCTCACTCCAGGGATGGGCCTAGCCTGGCC 16238476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCAGGTGCCTCTGTTAGTTCTTTCTACGGTCCTCACTCCAGGGATGGGCCTAGCCTGGCC 180

 16238477 ATAGCAGTGAGTCAGATTAGCCAGAGGCTCTGGGAACACCTGGGGTTCCTGGGTGCAGCT 16238536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATAGCAGTGAGTCAGATTAGCCAGAGGCTCTGGGAACACCTGGGGTTCCTGGGTGCAGCT 240

 16238537 GGCTGCATATTAGGCAGGACTAATGAACAGGTGCAGGACAGGGCTGGGTTGGCGGGTAAA 16238596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGCTGCATATTAGGCAGGACTAATGAACAGGTGCAGGACAGGGCTGGGTTGGCGGGTAAA 300

 16238597 GTGCCCAGAGACTCTCCAAACCCTCAAGTGGGGCGGGGTCCGCCCAAGAGCACACCTGTG 16238656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTGCCCAGAGACTCTCCAAACCCTCAAGTGGGGCGGGGTCCGCCCAAGAGCACACCTGTG 360

 16238657 GTGAGGCCCCCACCATCTGATGAGCTGTGTTACGTCTGTGCCCCTCGGGAGTACGGAAAG 16238716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTGAGGCCCCCACCATCTGATGAGCTGTGTTACGTCTGTGCCCCTCGGGAGTACGGAAAG 420

 16238717 TGGAGGAGCTGGGCCCCAGAGAAATGGGCTACCCCAGAGCTGGCAGCCCCACCAGAGGGG 16238776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGGAGGAGCTGGGCCCCAGAGAAATGGGCTACCCCAGAGCTGGCAGCCCCACCAGAGGGG 480

 16238777 ATCTGGATCCCCTGCCAAGCAATTAAGCTGCCCCCTCCTGGCCAACTCCCCTTCTGCCCC 16238836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATCTGGATCCCCTGCCAAGCAATTAAGCTGCCCCCTCCTGGCCAACTCCCCTTCTGCCCC 540

 16238837 TCACCACTGGGTTGGCTCTCCATCCAGTGGCCCCATATTTCCTGTTGACATTGGGGTGCA 16238896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCACCACTGGGTTGGCTCTCCATCCAGTGGCCCCATATTTCCTGTTGACATTGGGGTGCA 600

 16238897 AGGCCTTTTCCACAACCAAGGGCAGCACTGGTTCTATTTCTGCAGGTCCCTCTCCTCTGT 16238956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGGCCTTTTCCACAACCAAGGGCAGCACTGGTTCTATTTCTGCAGGTCCCTCTCCTCTGT 660

 16238957 GTGCTTGCCAAGACCCAGATCCCAGACAAGCACCACCCTGCACACTGTTTTTATTTAATC 16239016
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
      661 GTGCTTGCCAAGACCCAGATCCCAGACAAGCACCACCTTGCACACTGTTTTTATTTAATC 720

 16239017 CTCTTGGCCACCCAGAGAGGCAGGGCTTATCAACCCTACTCTACCTGTGAGGAAAACTGA 16239076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTCTTGGCCACCCAGAGAGGCAGGGCTTATCAACCCTACTCTACCTGTGAGGAAAACTGA 780

 16239077 GACAGAAAAAGATGCTGCGGGTTGCCCTGAGCCACCTTGATGGGCTTCCAAGCCGATGGT 16239136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
      781 GACAGAAAAAGATGCTGCGGGTTGCCCTGAGCCATCTTGATGGGCTTCCAAGCCGATGGT 840

 16239137 CATGACAGCATAGTGTAGTGTGATAGAATCAGCTAGATGGGTTTCAGGGTATTCGTCTGG 16239196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CATGACAGCATAGTGTAGTGTGATAGAATCAGCTAGATGGGTTTCAGGGTATTCGTCTGG 900

 16239197 GGTGGTGATGCCCACACCAAATCATTAAATCAGAAAATGCTTGCGATGACCAGCCCATGA 16239256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GGTGGTGATGCCCACACCAAATCATTAAATCAGAAAATGCTTGCGATGACCAGCCCATGA 960

 16239257 TGACCCTTTACAAGTGGAAGTCAGTATTACTGCTGTTTTCTGGAGGGAAGGAGTTGAGGA 16239316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGACCCTTTACAAGTGGAAGTCAGTATTACTGCTGTTTTCTGGAGGGAAGGAGTTGAGGA 1020

 16239317 TCATACCAGCTTTTTCCGAGCACTATACCACTCAGACATGGGTGCTCTTACCCACTTCAA 16239376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TCATACCAGCTTTTTCCGAGCACTATACCACTCAGACATGGGTGCTCTTACCCACTTCAA 1080

 16239377 AACCCTCTGAGAATGCCAAACAACCATCGCAG 16239408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AACCCTCTGAGAATGCCAAACAACCATCGCAG 1112

EXCISED REGION

 16241210 TGGAGCACAGGCTGCACTGCGGGGTCTGTCTTGCTTTTTACCCTGCAATGGTCAGTCATT 16241269
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1113 TGGAGCACAGGCTGCACTGCGGGTTCTGTCTTGCTTTTTACCCTGCAATGGTCAGTCATT 1172

 16241270 GACCATGACTGGGGCTGGGGGCAGCATCCTGCATGACTGTCTGGCACCTGCAGCAGAGAC 16241329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1173 GACCATGACTGGGGCTGGGGGCAGCATCCTGCATGACTGTCTGGCACCTGCAGCAGAGAC 1232

 16241330 CGTTTTAATACCCCAAGGCAAGTCTCCAGGGAAGGGTTAAGATTTCAGTTAGCACCCACA 16241389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1233 CGTTTTAATACCCCAAGGCAAGTCTCCAGGGAAGGGTTAAGATTTCAGTTAGCACCCACA 1292

 16241390 GCAGCTGGGGACATGCAAACCAAACCAAAACAGTTAAGGGGAGCTCAGGGAATCTGAGTA 16241449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1293 GCAGCTGGGGACATGCAAACCAAACCAAAACAGTTAAGGGGAGCTCAGGGAATCTGAGTA 1352

 16241450 GGACACTATATTAGTCTGTTCTCACACTGCTATAAAGAACTGCCTGAGACTAGGTAATTT 16241509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1353 GGACACTATATTAGTCTGTTCTCACACTGCTATAAAGAACTGCCTGAGACTAGGTAATTT 1412

 16241510 ATAAAGAAAGGAGGTTTAATTGACTCACAGTTTCGCATGGCTGGGGAGGCCTCAGGAAAC 16241569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1413 ATAAAGAAAGGAGGTTTAATTGACTCACAGTTTCGCATGGCTGGGGAGGCCTCAGGAAAC 1472

 16241570 TTACAATCATGGTGGAAGGGGAAGCATGTCTTACATGGCAGCAAGTGAGAGAAAGAGAGA 16241629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1473 TTACAATCATGGTGGAAGGGGAAGCATGTCTTACATGGCAGCAAGTGAGAGAAAGAGAGA 1532

 16241630 GAGAGAGGAGGAAAAACTATCAAACACTTATATAATCATCAGATCTCATGAGAACTCACT 16241689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1533 GAGAGAGGAGGAAAAACTATCAAACACTTATATAATCATCAGATCTCATGAGAACTCACT 1592

 16241690 ATCACGAGAACAGCATGGGGGAAACTGCCCACATGATCCAATCACCTCCCACCAGGTCCC 16241749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1593 ATCACGAGAACAGCATGGGGGAAACTGCCCACATGATCCAATCACCTCCCACCAGGTCCC 1652

 16241750 TCCCTCGCCACATAGGGATTATGGGGATTACCACTCAAGATGAGATCTGGGTGGGGACAA 16241809
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     1653 TCCCTCGCCACATAGGGATTATGGGGATTACAACTCAAGATGAGATCTGGGTGGGGACAA 1712

 16241810 AGAGCCAAACCATATCAGACACCAACAGTATCTGCTACATTCTTGCTGCTGCATTTGGAG 16241869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1713 AGAGCCAAACCATATCAGACACCAACAGTATCTGCTACATTCTTGCTGCTGCATTTGGAG 1772

 16241870 AATGTTAGCAAGTTCTCCCCTTTCCTGGTTTTCTGACACCATCCCTCTAATTTTTACTGG 16241929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1773 AATGTTAGCAAGTTCTCCCCTTTCCTGGTTTTCTGACACCATCCCTCTAATTTTTACTGG 1832

 16241930 AGAGAATCATGGCCCACCCCAACCTAACCAAGCATCTTACATCTCAGCAACAACCACACT 16241989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1833 AGAGAATCATGGCCCACCCCAACCTAACCAAGCATCTTACATCTCAGCAACAACCACACT 1892

 16241990 GTAGTAATGTTTTCGGTTCTTAGGACCCAGGTGCTCACCACAGCTTCCAAAAGAGAGTTG 16242049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1893 GTAGTAATGTTTTCGGTTCTTAGGACCCAGGTGCTCACCACAGCTTCCAAAAGAGAGTTG 1952

 16242050 CTGACGATTGTCTTAGTCACAATCTCATCGGTTGTGGCATTTGTCATTCCACTGACCACA 16242109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1953 CTGACGATTGTCTTAGTCACAATCTCATCGGTTGTGGCATTTGTCATTCCACTGACCACA 2012

 16242110 ACCCTGTTGATTCCAGGACAACTCAAGTCTGCTCTCAGCGAATATGTGGCCAGGCTGGAG 16242169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2013 ACCCTGTTGATTCCAGGACAACTCAAGTCTGCTCTCAGCGAATATGTGGCCAGGCTGGAG 2072

 16242170 GGGGTGAAGTTACTCAGGAGCAACAAGAGGCTGGGTGCCATCAGGGCCCGGATGCTGGGG 16242229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2073 GGGGTGAAGTTACTCAGGAGCAACAAGAGGCTGGGTGCCATCAGGGCCCGGATGCTGGGG 2132

 16242230 GCCACCAGAGCCACCGGGGATGTGCTCGTCTTCATGGATGCCCACTGCGAGTGCCACCCA 16242289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2133 GCCACCAGAGCCACCGGGGATGTGCTCGTCTTCATGGATGCCCACTGCGAGTGCCACCCA 2192

 16242290 GGCT 16242293
          ||||
     2193 GGCT 2196

Alignment time is 2.75297 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [16229408,16251209] =>     21802 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,   10075] =>     10075 nucs 'mol-32-1f0b-048824_10075'

Score:        9970
Aligned:     10085        nucs
Identic:     10068 (100%) nucs =>      3372 (100%)      6696 (100%)
Gaps:           10 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [16236035,16239408] EXCISED REGION [16241210,16247920]
 second seq =>  [       1,    3374] EXCISED REGION [    3375,   10075]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1801 nucs [16239409,16241209]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [16239409,16239409] to [16241210,16241210]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [16239409,16239410] to [16241208,16241209]
 second seq =>         0 nucs

 16236035 CATGTATGTTTGTTGCAGCACTATTCATAGTAGTGAAGTCACGGAATCAACCCAAATGCC 16236094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CATGTATGTTTGTTGCAGCACTATTCATAGTAGTGAAGTCACGGAATCAACCCAAATGCC 60

 16236095 CATCAATGATAGACTAGATAAAGAAAATGTGGTACATATGTACCATGGAGTACTACGCAG 16236154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CATCAATGATAGACTAGATAAAGAAAATGTGGTACATATGTACCATGGAGTACTACGCAG 120

 16236155 CCATAAAAAGGAATGAGATCCTGTCCTTTCCAGGGACATGGATGGAGCTGGAAAACATTA 16236214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCATAAAAAGGAATGAGATCCTGTCCTTTCCAGGGACATGGATGGAGCTGGAAAACATTA 180

 16236215 TCCTCAGCAAATGAACACAGGAACAGAAAACCAAACACCGCATGTTCTCACTTATAAGTG 16236274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCCTCAGCAAATGAACACAGGAACAGAAAACCAAACACCGCATGTTCTCACTTATAAGTG 240

 16236275 GGAGCTGAACAGTGAGAACACATGGACACAGGGAGGGGAGCAACACACACTGGGGCCTGT 16236334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGAGCTGAACAGTGAGAACACATGGACACAGGGAGGGGAGCAACACACACTGGGGCCTGT 300

 16236335 TGTGGGGGCATGGGGAGGGAGAGCATCAGGATAAATAACTAATGCATGTGGGGCTGAATA 16236394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGTGGGGGCATGGGGAGGGAGAGCATCAGGATAAATAACTAATGCATGTGGGGCTGAATA 360

 16236395 CCTAGGTGATGGGTTGATGGTGGCAGCAAACCACTATGGCACATGTTTACCTATGTAGCA 16236454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CCTAGGTGATGGGTTGATGGTGGCAGCAAACCACTATGGCACATGTTTACCTATGTAGCA 420

 16236455 AACCTGCACGTCCTGCACATGTATCCTGGAACTTAAAATAAAATTTTAAAAAATAGTAAG 16236514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AACCTGCACGTCCTGCACATGTATCCTGGAACTTAAAATAAAATTTTAAAAAATAGTAAG 480

 16236515 TGCTAACATTTAAAAATTGTGTGCCAGGTGCTATGCTAGGTTGTAGGAACATAAAAATAA 16236574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGCTAACATTTAAAAATTGTGTGCCAGGTGCTATGCTAGGTTGTAGGAACATAAAAATAA 540

 16236575 AGAAAATAGTGTCCCTGACCTTGAATGGATGACAGAGATTACTGGACACTTAACTACACG 16236634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGAAAATAGTGTCCCTGACCTTGAATGGATGACAGAGATTACTGGACACTTAACTACACG 600

 16236635 CATCATCCTATCCAAGCCTCACCACAGCCTCGGGGAGTCCTGATCTTCCCAGAAGGCCAG 16236694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CATCATCCTATCCAAGCCTCACCACAGCCTCGGGGAGTCCTGATCTTCCCAGAAGGCCAG 660

 16236695 GAGGGGTGTCCCTAGGTCATTTAGTTGTGCCAGAAATGTAGGCCTCAGGCCCAAGCCAAA 16236754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GAGGGGTGTCCCTAGGTCATTTAGTTGTGCCAGAAATGTAGGCCTCAGGCCCAAGCCAAA 720

 16236755 GACTAGAGCAGAGGTTCTCAAAGTGTGGTCCACAGAAAACAGCAGCATCGGCATCACCTG 16236814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GACTAGAGCAGAGGTTCTCAAAGTGTGGTCCACAGAAAACAGCAGCATCGGCATCACCTG 780

 16236815 GGAGCTTGTTAGAAATGCAAATTCTTCAGCCCCACTCCATCTCCAGAAACTCTGGGGGTG 16236874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GGAGCTTGTTAGAAATGCAAATTCTTCAGCCCCACTCCATCTCCAGAAACTCTGGGGGTG 840

 16236875 GGCCCTGCAGTCAGTATTTTAAAAATCCCACCAGGTGATTCTGATGCATGCTCAAGTGTG 16236934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GGCCCTGCAGTCAGTATTTTAAAAATCCCACCAGGTGATTCTGATGCATGCTCAAGTGTG 900

 16236935 AGCGCTGTGAGGGTGATAATATTGTCATTCATTCTCATTTTACAGATGAGGACAGTCATT 16236994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGCGCTGTGAGGGTGATAATATTGTCATTCATTCTCATTTTACAGATGAGGACAGTCATT 960

 16236995 TGCTGAGGATGACGGCAACGCTTCTCAATTGCAATGAGAGGGACTTTGGATTAAATGATA 16237054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGCTGAGGATGACGGCAACGCTTCTCAATTGCAATGAGAGGGACTTTGGATTAAATGATA 1020

 16237055 AAGGAGCTCTTGAGATCTGAGAATTGGGAGATAGTAGACAGCACCACTATGAGGCGTAAC 16237114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AAGGAGCTCTTGAGATCTGAGAATTGGGAGATAGTAGACAGCACCACTATGAGGCGTAAC 1080

 16237115 AGGTTCTTTTTATATGGGAATTTTAAGAGATCCCATAGGACAGCCATATAATGGGGGCAG 16237174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AGGTTCTTTTTATATGGGAATTTTAAGAGATCCCATAGGACAGCCATATAATGGGGGCAG 1140

 16237175 CTCCAGCCAGAGCAAAGGAAGCGAGTTAGAGGGTGTGGAGTGTTTCTTGTGGCCTTCTCT 16237234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTCCAGCCAGAGCAAAGGAAGCGAGTTAGAGGGTGTGGAGTGTTTCTTGTGGCCTTCTCT 1200

 16237235 TCCCCATGGCTCTCTGGCTCTCTTCCCTGCAGGTGTCTGCAGCAGCACCCTCAGGACAGC 16237294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TCCCCATGGCTCTCTGGCTCTCTTCCCTGCAGGTGTCTGCAGCAGCACCCTCAGGACAGC 1260

 16237295 CTGCCCACAGCCAGCGTCATCCTCTGTTTCCATGATGAGGCCTGGTCCACTCTCCTGCGG 16237354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTGCCCACAGCCAGCGTCATCCTCTGTTTCCATGATGAGGCCTGGTCCACTCTCCTGCGG 1320

 16237355 ACTGTACACAGCATCCTCGACACAGTGCCCAGGGCCTTCCTGAAGGAGATCATCCTCGTG 16237414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ACTGTACACAGCATCCTCGACACAGTGCCCAGGGCCTTCCTGAAGGAGATCATCCTCGTG 1380

 16237415 GACGACCTCAGCCAGCAAGGTAGCCACGGCTTTCCTCCAGGCTCGTCTGGGTGAGCCTTA 16237474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GACGACCTCAGCCAGCAAGGTAGCCACGGCTTTCCTCCAGGCTCGTCTGGGTGAGCCTTA 1440

 16237475 CCCCCTGGCGGGTGGAGTTCTCAAGCAAAAGATTGAAGTTTGGAACTATTTTAGGCAAGA 16237534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CCCCCTGGCGGGTGGAGTTCTCAAGCAAAAGATTGAAGTTTGGAACTATTTTAGGCAAGA 1500

 16237535 TTCCCCAACTACAGACCTCCAGATGAGGATTAATGGGCAAGTAACTTATGAATGAAGAGC 16237594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTCCCCAACTACAGACCTCCAGATGAGGATTAATGGGCAAGTAACTTATGAATGAAGAGC 1560

 16237595 CACTGGGGAAACCAGTAAGGCAGTGGGGGCTGCAAGACAGAGAAGGAGAAAGAGCCCTGC 16237654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CACTGGGGAAACCAGTAAGGCAGTGGGGGCTGCAAGACAGAGAAGGAGAAAGAGCCCTGC 1620

 16237655 AGGGGAAACAGCCCTGGGGAGGGTCTTGAGGGGTGTCGCCTCAGCCTGATCCCGTGGGGA 16237714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AGGGGAAACAGCCCTGGGGAGGGTCTTGAGGGGTGTCGCCTCAGCCTGATCCCGTGGGGA 1680

 16237715 TCTCTCTCCCAGGTGCCACCCAGTCCAACAATCCTCTCTCCAAGACACTGAAGAATCACA 16237774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TCTCTCTCCCAGGTGCCACCCAGTCCAACAATCCTCTCTCCAAGACACTGAAGAATCACA 1740

 16237775 TAGGGCGGCCCTGTTGTGAGTGCTCACTGCCTCCTAGACCCTGGTGCAGCACTTTACACA 16237834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TAGGGCGGCCCTGTTGTGAGTGCTCACTGCCTCCTAGACCCTGGTGCAGCACTTTACACA 1800

 16237835 TACGCACATATGTGTATCGGTCCTTCACTCATCATGGCTTAGACAGACCCACTCACTTTC 16237894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TACGCACATATGTGTATCGGTCCTTCACTCATCATGGCTTAGACAGACCCACTCACTTTC 1860

 16237895 CAGAGGAGGAAACTGGGGCCCAGAGAAGACAGCAGACTGGAGCGGAGTCAGCCAAAAGCA 16237954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CAGAGGAGGAAACTGGGGCCCAGAGAAGACAGCAGACTGGAGCGGAGTCAGCCAAAAGCA 1920

 16237955 GCAGAGTCAGGCCCAGAGCCCAGACTTGCAGAACCTGCCTGTGTGCTTCCTCTCACAGGA 16238014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GCAGAGTCAGGCCCAGAGCCCAGACTTGCAGAACCTGCCTGTGTGCTTCCTCTCACAGGA 1980

 16238015 ACCTGGCTACTAGGGACAGCCCTAAAAGAAGATGGAGACAGAGAAGCCCCCACTTGACTC 16238074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ACCTGGCTACTAGGGACAGCCCTAAAAGAAGATGGAGACAGAGAAGCCCCCACTTGACTC 2040

 16238075 GTAGGTCAGTGGCTCTCACGCTTGAGCATGCATCGGAATCACCTGGTGCGATTTTTAAAA 16238134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GTAGGTCAGTGGCTCTCACGCTTGAGCATGCATCGGAATCACCTGGTGCGATTTTTAAAA 2100

 16238135 TACTACTGCAGGGCCCACCCCCAGAGTTTCTGGTGATGGAGTGGGGCCGAAGAATTTGCA 16238194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TACTACTGCAGGGCCCACCCCCAGAGTTTCTGGTGATGGAGTGGGGCCGAAGAATTTGCA 2160

 16238195 TTTCTAACAAGCTCCCAGGTGATGCTGATGCTGCTGTTTTCTGTGGACCACACTCTGAGA 16238254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TTTCTAACAAGCTCCCAGGTGATGCTGATGCTGCTGTTTTCTGTGGACCACACTCTGAGA 2220

 16238255 ACCTCTGCTCTAGTCTTTGGCTTGGGCGTGAGGCCTACATTTCTGGCACAACTAAATGAC 16238314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ACCTCTGCTCTAGTCTTTGGCTTGGGCGTGAGGCCTACATTTCTGGCACAACTAAATGAC 2280

 16238315 CTAGGGACACCCCTCCTGGCCTTCTGGGAAGATCAGAACGCTCTGAGGGAAGCCGAGCAT 16238374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CTAGGGACACCCCTCCTGGCCTTCTGGGAAGATCAGAACGCTCTGAGGGAAGCCGAGCAT 2340

 16238375 TCACGTTTTTCTAAGGGGAATAATGGAGAAGGGCTAGGGTAGCCAGGTGCCTCTGTTAGT 16238434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TCACGTTTTTCTAAGGGGAATAATGGAGAAGGGCTAGGGTAGCCAGGTGCCTCTGTTAGT 2400

 16238435 TCTTTCTACGGTCCTCACTCCAGGGATGGGCCTAGCCTGGCCATAGCAGTGAGTCAGATT 16238494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TCTTTCTACGGTCCTCACTCCAGGGATGGGCCTAGCCTGGCCATAGCAGTGAGTCAGATT 2460

 16238495 AGCCAGAGGCTCTGGGAACACCTGGGGTTCCTGGGTGCAGCTGGCTGCATATTAGGCAGG 16238554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AGCCAGAGGCTCTGGGAACACCTGGGGTTCCTGGGTGCAGCTGGCTGCATATTAGGCAGG 2520

 16238555 ACTAATGAACAGGTGCAGGACAGGGCTGGGTTGGCGGGTAAAGTGCCCAGAGACTCTCCA 16238614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 ACTAATGAACAGGTGCAGGACAGGGCTGGGTTGGCGGGTAAAGTGCCCAGAGACTCTCCA 2580

 16238615 AACCCTCAAGTGGGGCGGGGTCCGCCCAAGAGCACACCTGTGGTGAGGCCCCCACCATCT 16238674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AACCCTCAAGTGGGGCGGGGTCCGCCCAAGAGCACACCTGTGGTGAGGCCCCCACCATCT 2640

 16238675 GATGAGCTGTGTTACGTCTGTGCCCCTCGGGAGTACGGAAAGTGGAGGAGCTGGGCCCCA 16238734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GATGAGCTGTGTTACGTCTGTGCCCCTCGGGAGTACGGAAAGTGGAGGAGCTGGGCCCCA 2700

 16238735 GAGAAATGGGCTACCCCAGAGCTGGCAGCCCCACCAGAGGGGATCTGGATCCCCTGCCAA 16238794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GAGAAATGGGCTACCCCAGAGCTGGCAGCCCCACCAGAGGGGATCTGGATCCCCTGCCAA 2760

 16238795 GCAATTAAGCTGCCCCCTCCTGGCCAACTCCCCTTCTGCCCCTCACCACTGGGTTGGCTC 16238854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GCAATTAAGCTGCCCCCTCCTGGCCAACTCCCCTTCTGCCCCTCACCACTGGGTTGGCTC 2820

 16238855 TCCATCCAGTGGCCCCATATTTCCTGTTGACATTGGGGTGCAAGGCCTTTTCCACAACCA 16238914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TCCATCCAGTGGCCCCATATTTCCTGTTGACATTGGGGTGCAAGGCCTTTTCCACAACCA 2880

 16238915 AGGGCAGCACTGGTTCTATTTCTGCAGGTCCCTCTCCTCTGTGTGCTTGCCAAGACCCAG 16238974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 AGGGCAGCACTGGTTCTATTTCTGCAGGTCCCTCTCCTCTGTGTGCTTGCCAAGACCCAG 2940

 16238975 ATCCCAGACAAGCACCACCCTGCACACTGTTTTTATTTAATCCTCTTGGCCACCCAGAGA 16239034
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 ATCCCAGACAAGCACCACCTTGCACACTGTTTTTATTTAATCCTCTTGGCCACCCAGAGA 3000

 16239035 GGCAGGGCTTATCAACCCTACTCTACCTGTGAGGAAAACTGAGACAGAAAAAGATGCTGC 16239094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GGCAGGGCTTATCAACCCTACTCTACCTGTGAGGAAAACTGAGACAGAAAAAGATGCTGC 3060

 16239095 GGGTTGCCCTGAGCCACCTTGATGGGCTTCCAAGCCGATGGTCATGACAGCATAGTGTAG 16239154
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 GGGTTGCCCTGAGCCATCTTGATGGGCTTCCAAGCCGATGGTCATGACAGCATAGTGTAG 3120

 16239155 TGTGATAGAATCAGCTAGATGGGTTTCAGGGTATTCGTCTGGGGTGGTGATGCCCACACC 16239214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TGTGATAGAATCAGCTAGATGGGTTTCAGGGTATTCGTCTGGGGTGGTGATGCCCACACC 3180

 16239215 AAATCATTAAATCAGAAAATGCTTGCGATGACCAGCCCATGATGACCCTTTACAAGTGGA 16239274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 AAATCATTAAATCAGAAAATGCTTGCGATGACCAGCCCATGATGACCCTTTACAAGTGGA 3240

 16239275 AGTCAGTATTACTGCTGTTTTCTGGAGGGAAGGAGTTGAGGATCATACCAGCTTTTTCCG 16239334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 AGTCAGTATTACTGCTGTTTTCTGGAGGGAAGGAGTTGAGGATCATACCAGCTTTTTCCG 3300

 16239335 AGCACTATACCACTCAGACATGGGTGCTCTTACCCACTTCAAAACCCTCTGAGAATGCCA 16239394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 AGCACTATACCACTCAGACATGGGTGCTCTTACCCACTTCAAAACCCTCTGAGAATGCCA 3360

 16239395 AACAACCATCGCAG 16239408
          ||||||||||||||
     3361 AACAACCATCGCAG 3374

EXCISED REGION

 16241210 TGGAGCACAGGCTGCACTGCGGGGTCTGTCTTGCTTTTTACCCTGCAATGGTCAGTCATT 16241269
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3375 TGGAGCACAGGCTGCACTGCGGGTTCTGTCTTGCTTTTTACCCTGCAATGGTCAGTCATT 3434

 16241270 GACCATGACTGGGGCTGGGGGCAGCATCCTGCATGACTGTCTGGCACCTGCAGCAGAGAC 16241329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3435 GACCATGACTGGGGCTGGGGGCAGCATCCTGCATGACTGTCTGGCACCTGCAGCAGAGAC 3494

 16241330 CGTTTTAATACCCCAAGGCAAGTCTCCAGGGAAGGGTTAAGATTTCAGTTAGCACCCACA 16241389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3495 CGTTTTAATACCCCAAGGCAAGTCTCCAGGGAAGGGTTAAGATTTCAGTTAGCACCCACA 3554

 16241390 GCAGCTGGGGACATGCAAACCAAACCAAAACAGTTAAGGGGAGCTCAGGGAATCTGAGTA 16241449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3555 GCAGCTGGGGACATGCAAACCAAACCAAAACAGTTAAGGGGAGCTCAGGGAATCTGAGTA 3614

 16241450 GGACACTATATTAGTCTGTTCTCACACTGCTATAAAGAACTGCCTGAGACTAGGTAATTT 16241509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3615 GGACACTATATTAGTCTGTTCTCACACTGCTATAAAGAACTGCCTGAGACTAGGTAATTT 3674

 16241510 ATAAAGAAAGGAGGTTTAATTGACTCACAGTTTCGCATGGCTGGGGAGGCCTCAGGAAAC 16241569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3675 ATAAAGAAAGGAGGTTTAATTGACTCACAGTTTCGCATGGCTGGGGAGGCCTCAGGAAAC 3734

 16241570 TTACAATCATGGTGGAAGGGGAAGCATGTCTTACATGGCAGCAAGTGAGAGAAAGAGAGA 16241629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3735 TTACAATCATGGTGGAAGGGGAAGCATGTCTTACATGGCAGCAAGTGAGAGAAAGAGAGA 3794

 16241630 GAGAGAGGAGGAAAAACTATCAAACACTTATATAATCATCAGATCTCATGAGAACTCACT 16241689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3795 GAGAGAGGAGGAAAAACTATCAAACACTTATATAATCATCAGATCTCATGAGAACTCACT 3854

 16241690 ATCACGAGAACAGCATGGGGGAAACTGCCCACATGATCCAATCACCTCCCACCAGGTCCC 16241749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3855 ATCACGAGAACAGCATGGGGGAAACTGCCCACATGATCCAATCACCTCCCACCAGGTCCC 3914

 16241750 TCCCTCGCCACATAGGGATTATGGGGATTACCACTCAAGATGAGATCTGGGTGGGGACAA 16241809
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     3915 TCCCTCGCCACATAGGGATTATGGGGATTACAACTCAAGATGAGATCTGGGTGGGGACAA 3974

 16241810 AGAGCCAAACCATATCAGACACCAACAGTATCTGCTACATTCTTGCTGCTGCATTTGGAG 16241869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3975 AGAGCCAAACCATATCAGACACCAACAGTATCTGCTACATTCTTGCTGCTGCATTTGGAG 4034

 16241870 AATGTTAGCAAGTTCTCCCCTTTCCTGGTTTTCTGACACCATCCCTCTAATTTTTACTGG 16241929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4035 AATGTTAGCAAGTTCTCCCCTTTCCTGGTTTTCTGACACCATCCCTCTAATTTTTACTGG 4094

 16241930 AGAGAATCATGGCCCACCCCAACCTAACCAAGCATCTTACATCTCAGCAACAACCACACT 16241989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4095 AGAGAATCATGGCCCACCCCAACCTAACCAAGCATCTTACATCTCAGCAACAACCACACT 4154

 16241990 GTAGTAATGTTTTCGGTTCTTAGGACCCAGGTGCTCACCACAGCTTCCAAAAGAGAGTTG 16242049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4155 GTAGTAATGTTTTCGGTTCTTAGGACCCAGGTGCTCACCACAGCTTCCAAAAGAGAGTTG 4214

 16242050 CTGACGATTGTCTTAGTCACAATCTCATCGGTTGTGGCATTTGTCATTCCACTGACCACA 16242109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4215 CTGACGATTGTCTTAGTCACAATCTCATCGGTTGTGGCATTTGTCATTCCACTGACCACA 4274

 16242110 ACCCTGTTGATTCCAGGACAACTCAAGTCTGCTCTCAGCGAATATGTGGCCAGGCTGGAG 16242169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4275 ACCCTGTTGATTCCAGGACAACTCAAGTCTGCTCTCAGCGAATATGTGGCCAGGCTGGAG 4334

 16242170 GGGGTGAAGTTACTCAGGAGCAACAAGAGGCTGGGTGCCATCAGGGCCCGGATGCTGGGG 16242229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4335 GGGGTGAAGTTACTCAGGAGCAACAAGAGGCTGGGTGCCATCAGGGCCCGGATGCTGGGG 4394

 16242230 GCCACCAGAGCCACCGGGGATGTGCTCGTCTTCATGGATGCCCACTGCGAGTGCCACCCA 16242289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4395 GCCACCAGAGCCACCGGGGATGTGCTCGTCTTCATGGATGCCCACTGCGAGTGCCACCCA 4454

 16242290 GGCTGGCTGGAGCCCCTCCTCAGCAGAATAGCTGGTGACAGGTAACTTATTCCCTGGGCT 16242349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4455 GGCTGGCTGGAGCCCCTCCTCAGCAGAATAGCTGGTGACAGGTAACTTATTCCCTGGGCT 4514

 16242350 TGCAAAGCAAGACATGGAACTGGGAGAAACAGTCTACAGCATCAGCCACTCACAGAGCAA 16242409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4515 TGCAAAGCAAGACATGGAACTGGGAGAAACAGTCTACAGCATCAGCCACTCACAGAGCAA 4574

 16242410 CCCACCTATTAATTCCTGAATCTCCATTAGAGAGTGATATATTCCCTTCGGGTTTTCAGA 16242469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4575 CCCACCTATTAATTCCTGAATCTCCATTAGAGAGTGATATATTCCCTTCGGGTTTTCAGA 4634

 16242470 TGTGTAAGTTTTTTAAGACTATAGAGTTAGAGTTGGAAAGGAGGTTAGAGGTCTTCATCT 16242529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4635 TGTGTAAGTTTTTTAAGACTATAGAGTTAGAGTTGGAAAGGAGGTTAGAGGTCTTCATCT 4694

 16242530 ACCTTGCTTTATAGATAAAGAAACCGAGGCCTGGAGAACAGCTTCTATGAGGTTGCAAAT 16242589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4695 ACCTTGCTTTATAGATAAAGAAACCGAGGCCTGGAGAACAGCTTCTATGAGGTTGCAAAT 4754

 16242590 ACTTAAAATTGTATTAAATTGCATGACGAGGGTAACACCTTACCATAGCTATCATTGCCT 16242649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4755 ACTTAAAATTGTATTAAATTGCATGACGAGGGTAACACCTTACCATAGCTATCATTGCCT 4814

 16242650 TTGGTGAAAATTTGGCAATTTTTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTGTG 16242709
          ||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||
     4815 TTGGTGAAAATTTGGCAATTTT------TTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTGTG 4868

 16242710 ATGGCGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGCGGGGCGATCTCGGCTCACTGCAA 16242769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4869 ATGGCGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGCGGGGCGATCTCGGCTCACTGCAA 4928

 16242770 GCTGCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTAC 16242829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4929 GCTGCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTAC 4988

 16242830 AGGCGCCCGCCACCACACCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGAAGGGGTTTCACC 16242889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4989 AGGCGCCCGCCACCACACCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGAAGGGGTTTCACC 5048

 16242890 GTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACTTCGTGATCCGCCCTCCTCAGCCTCCCAA 16242949
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5049 GTGTTAGCCAGGATGGTCTCAATCTCCTGACTTCGTGATCCGCCCTCCTCAGCCTCCCAA 5108

 16242950 AGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCTGGCCGAAAATTCGTCAATTTTAATCA 16243009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5109 AGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCTGGCCGAAAATTCGTCAATTTTAATCA 5168

 16243010 AGCTTGTAACATAACCTGGGGAAAAAGTCTCTGAACTACACTAGGCCGTAGATTACTCAC 16243069
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5169 AGCTTGTAACATAAACTGGGGAAAAAGTCTCTGAACTACACTAGGCCGTAGATTACTCAC 5228

 16243070 CCATAAAAAGAAAACATTATGTTCTCTGATCACTAAACAGCATTCTTTGTTTCCCCAGTT 16243129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5229 CCATAAAAAGAAAACATTATGTTCTCTGATCACTAAACAGCATTCTTTGTTTCCCCAGTT 5288

 16243130 TATATAAGGGGTCCCTAATTTTCTACCTAAGGCCAGTCCTTGGAAATGTGAAGTTGGAGA 16243189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5289 TATATAAGGGGTCCCTAATTTTCTACCTAAGGCCAGTCCTTGGAAATGTGAAGTTGGAGA 5348

 16243190 GGACTGCATTACATTACCCTGTAGACAAGCATCTTAACATTTTTCTTGATCATTTCTCTG 16243249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5349 GGACTGCATTACATTACCCTGTAGACAAGCATCTTAACATTTTTCTTGATCATTTCTCTG 5408

 16243250 CTCTCCTTCCCCCATCTGACCGTCAATCTCTTTCTCACTTCCTTGCTCAAGACAAACAGT 16243309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5409 CTCTCCTTCCCCCATCTGACCGTCAATCTCTTTCTCACTTCCTTGCTCAAGACAAACAGT 5468

 16243310 TCCTAAACATGTCTAGTCAAACATTACCCTCAATCTGAATATCCTACCCAGGAAAACTGA 16243369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5469 TCCTAAACATGTCTAGTCAAACATTACCCTCAATCTGAATATCCTACCCAGGAAAACTGA 5528

 16243370 AACCTGGTGGCTGGCCCACCTTGGACCACCTCAGGCATACCACTTGGAGCTCATGTAGGC 16243429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5529 AACCTGGTGGCTGGCCCACCTTGGACCACCTCAGGCATACCACTTGGAGCTCATGTAGGC 5588

 16243430 ATGTAGCAGAGTAGAACCACAATCAATAATTGTTTGATGGTGCCCAGCAAGACAGGACCA 16243489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5589 ATGTAGCAGAGTAGAACCACAATCAATAATTGTTTGATGGTGCCCAGCAAGACAGGACCA 5648

 16243490 ATGCTAGAACCAAGCCTTATGACTTCTACCCATGATGAATGTTTATTATCTCACCTGAAG 16243549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5649 ATGCTAGAACCAAGCCTTATGACTTCTACCCATGATGAATGTTTATTATCTCACCTGAAG 5708

 16243550 TTAGGGATGATCAATCAAATATAAGAAAAAATTCCTGGACCAGATCGGAATGAATCCTGG 16243609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5709 TTAGGGATGATCAATCAAATATAAGAAAAAATTCCTGGACCAGATCGGAATGAATCCTGG 5768

 16243610 AGACATAGGAGTTACCATCAGCCAAATGGAGATGGTTTCAAACGTTCAAATGACAGAAAG 16243669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5769 AGACATAGGAGTTACCATCAGCCAAATGGAGATGGTTTCAAACGTTCAAATGACAGAAAG 5828

 16243670 TAAATTGTTAATAGTTCAGCATTCCATTTTAACAAAGAAGAACAATCGGAACTCAAGTGA 16243729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5829 TAAATTGTTAATAGTTCAGCATTCCATTTTAACAAAGAAGAACAATCGGAACTCAAGTGA 5888

 16243730 GATCAAGACAGATTAATGTTTCCCAGTTTCATGAGACAGATTGTCTCTTGACTCACATCT 16243789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5889 GATCAAGACAGATTAATGTTTCCCAGTTTCATGAGACAGATTGTCTCTTGACTCACATCT 5948

 16243790 CATAAGAAAAGAAGACACACATAAATTCAGCACTAGGACAAGAACTAGGACACAAAAATG 16243849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5949 CATAAGAAAAGAAGACACACATAAATTCAGCACTAGGACAAGAACTAGGACACAAAAATG 6008

 16243850 CACAAGCTGGCCAGGCACGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGG 16243909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6009 CACAAGCTGGCCAGGCACGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGG 6068

 16243910 CAGACGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCA 16243969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6069 CAGACGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCA 6128

 16243970 TCTCTACTAAAAATACAAAAATTAACTGGGTGTGGTAGCGTGCGCCTGTAATCCCAGCTA 16244029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6129 TCTCTACTAAAAATACAAAAATTAACTGGGTGTGGTAGCGTGCGCCTGTAATCCCAGCTA 6188

 16244030 CTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTAAAGTGAGCCA 16244089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6189 CTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTAAAGTGAGCCA 6248

 16244090 AGATCGTGCTACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCCATCCCGAAAAGAAAA 16244149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6249 AGATCGTGCTACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCCATCCCGAAAAGAAAA 6308

 16244150 GAAAATGCACAAGCCCTCCAAAGCTGCCATTTTTGATTCTGTTTCATGCAAAGGGCCATC 16244209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6309 GAAAATGCACAAGCCCTCCAAAGCTGCCATTTTTGATTCTGTTTCATGCAAAGGGCCATC 6368

 16244210 TTGAAATCAGAGCGATGTCTATCATTGGAGTCAGACTCTGAAGTTGATCTTGCCCATTTC 16244269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6369 TTGAAATCAGAGCGATGTCTATCATTGGAGTCAGACTCTGAAGTTGATCTTGCCCATTTC 6428

 16244270 CCATCTGATTCCCATTCTGGTATCACAGACAGGTGGCTCTCAGAGGGACCATGAAGATCA 16244329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6429 CCATCTGATTCCCATTCTGGTATCACAGACAGGTGGCTCTCAGAGGGACCATGAAGATCA 6488

 16244330 TCTTGTCTTACCTCATGATTTCGCTATCGAGAACCCTGAGTTCCAGGAAAGTAAAAAAGA 16244389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6489 TCTTGTCTTACCTCATGATTTCGCTATCGAGAACCCTGAGTTCCAGGAAAGTAAAAAAGA 6548

 16244390 CCCCTCAGGGTCACACAGCCATTTGACAACTGGGCTGTTTTCTATGCTGCTTTTATGCAG 16244449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6549 CCCCTCAGGGTCACACAGCCATTTGACAACTGGGCTGTTTTCTATGCTGCTTTTATGCAG 6608

 16244450 ACATTTAGAAATGCAGTAATTAACATCATTAAACTTTATGTATGTGTAACCCTCGCAGAC 16244509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6609 ACATTTAGAAATGCAGTAATTAACATCATTAAACTTTATGTATGTGTAACCCTCGCAGAC 6668

 16244510 TTCTTTCATATGCCTTCTTTAATGACCCCCATGAGAGGCCTCAGGCAGGTATTTTAGCTT 16244569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6669 TTCTTTCATATGCCTTCTTTAATGACCCCCATGAGAGGCCTCAGGCAGGTATTTTAGCTT 6728

 16244570 CTGTTTTATAGGGGGAGAAATTGAGGCTCAGAGAGGTGACATGATATGTAAGGGCAGATA 16244629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6729 CTGTTTTATAGGGGGAGAAATTGAGGCTCAGAGAGGTGACATGATATGTAAGGGCAGATA 6788

 16244630 ATTCGTAGCTGAGTCAGATTTTCTGACTCTGGGTCCAGTGCTGTTTTTATTGTGTACATT 16244689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6789 ATTCGTAGCTGAGTCAGATTTTCTGACTCTGGGTCCAGTGCTGTTTTTATTGTGTACATT 6848

 16244690 TTCTTTTTAAGAGTTGGAGAAGCTGGTCAGGGAGGAACATTAGTCATCCCTAACCCCACA 16244749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6849 TTCTTTTTAAGAGTTGGAGAAGCTGGTCAGGGAGGAACATTAGTCATCCCTAACCCCACA 6908

 16244750 ACTGGTTATGAGACATGTGTTACCTGCTGCTGTGAGTCCCTCGTATCTGCTTCTCACATC 16244809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6909 ACTGGTTATGAGACATGTGTTACCTGCTGCTGTGAGTCCCTCGTATCTGCTTCTCACATC 6968

 16244810 GGGGCCCCATTTCCCAGAGCTAGGTGAAGGTAGAAAGACGTGGCACTACCTCAGTGTCCT 16244869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6969 GGGGCCCCATTTCCCAGAGCTAGGTGAAGGTAGAAAGACGTGGCACTACCTCAGTGTCCT 7028

 16244870 AGGCTAGAAAGAAAATGAGGCTCCCTGGGAAGCCCTTTGTGATTAAGAGACATTCTAGTT 16244929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7029 AGGCTAGAAAGAAAATGAGGCTCCCTGGGAAGCCCTTTGTGATTAAGAGACATTCTAGTT 7088

 16244930 TCCTGTGCCCTTCCCCTCTCCTCTTTTCCTCTCCTGTCTGTCTCTGCCTCTCTACCTCTC 16244989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7089 TCCTGTGCCCTTCCCCTCTCCTCTTTTCCTCTCCTGTCTGTCTCTGCCTCTCTACCTCTC 7148

 16244990 TCACGGTCTTTGTCTCTCTCTGTCTCTTGGTCACTCATTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC 16245049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
     7149 TCACGGTCTTTGTCTCTCTCTGTCTCTTGGTCACTCATTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT- 7207

 16245050 TCACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAGTGGGCCTCTGAT 16245109
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7208 ---CACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAGTGGGCCTCTGAT 7264

 16245110 CCTGGTGTGTTACTGGCTTGCCTTCCTCTTTGGGTTCCATCTCTTCTGCGTGATGTGACC 16245169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7265 CCTGGTGTGTTACTGGCTTGCCTTCCTCTTTGGGTTCCATCTCTTCTGCGTGATGTGACC 7324

 16245170 ACATTTTCATCATCTCTACACCTCATTCATGGCTTCTTGTCCACTGTGTTTTCTCTGGGC 16245229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7325 ACATTTTCATCATCTCTACACCTCATTCATGGCTTCTTGTCCACTGTGTTTTCTCTGGGC 7384

 16245230 CCTAGTGTCCAGCTTTTAGGCACTGGCAGGTGAGGATCTGGAAGAAAAGCCACCTTTCTG 16245289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7385 CCTAGTGTCCAGCTTTTAGGCACTGGCAGGTGAGGATCTGGAAGAAAAGCCACCTTTCTG 7444

 16245290 GTATCTGAGTCCCACTCTCTCCACTCCACCTGGCAACGCTCTATGAGCTGTGGCAGGGAG 16245349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7445 GTATCTGAGTCCCACTCTCTCCACTCCACCTGGCAACGCTCTATGAGCTGTGGCAGGGAG 7504

 16245350 AGCAGCCTCATTCAGTGTGTGCTTTACTCCCCCAGGGACGTCGCCCACGTGCCTCATACA 16245409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7505 AGCAGCCTCATTCAGTGTGTGCTTTACTCCCCCAGGGACGTCGCCCACGTGCCTCATACA 7564

 16245410 AAGCCAAGCTGTGGAAGGCATTTGGTGCAGCTCCTCACATGGAGAGGAGAGGGGGCCCAG 16245469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7565 AAGCCAAGCTGTGGAAGGCATTTGGTGCAGCTCCTCACATGGAGAGGAGAGGGGGCCCAG 7624

 16245470 CTGTCTCCAAGGCTTGTGTCAGGAGACATTCTGTCACCAGATGAGGACACAGTGCCCAAA 16245529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7625 CTGTCTCCAAGGCTTGTGTCAGGAGACATTCTGTCACCAGATGAGGACACAGTGCCCAAA 7684

 16245530 AGACAGAAAAGGGTCTTTAAGAGCTCTTATAAAAAAAAAAAAGTGGGGTGGGAGTGGTGA 16245589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7685 AGACAGAAAAGGGTCTTTAAGAGCTCTTATAAAAAAAAAAAAGTGGGGTGGGAGTGGTGA 7744

 16245590 GTGAACAGTGCAGTAAGCCACAAATCAGCTCTTTCAAAGAGCCGTAGCCTCCTCCACACC 16245649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7745 GTGAACAGTGCAGTAAGCCACAAATCAGCTCTTTCAAAGAGCCGTAGCCTCCTCCACACC 7804

 16245650 CTGGCCAAGGAATTCAGAGCCTGCTGACCAGCCTTTGTTCCCTGTCCCTGCCTAGCAGGT 16245709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     7805 CTGGCCAAGGAATTCAGAGCCTGCTGACCAGCCTTTGTTCTCTGTCCCTGCCTAGCAGGT 7864

 16245710 TCCCACTAGCCATGTGGCAACTTTATTTGAATTGGTAGAAATCCCTTCCTCATGACCATT 16245769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7865 TCCCACTAGCCATGTGGCAACTTTATTTGAATTGGTAGAAATCCCTTCCTCATGACCATT 7924

 16245770 CCTCCTGACTCCCATTCCTCAGAAAATTGGTCATAATATACTGATTTTATTAGAATAAGA 16245829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7925 CCTCCTGACTCCCATTCCTCAGAAAATTGGTCATAATATACTGATTTTATTAGAATAAGA 7984

 16245830 CATCTTAATGCCAACTGTCAGCAAGTTGTTGAAATAAAAATGCAAATTTACAGTAATGAT 16245889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7985 CATCTTAATGCCAACTGTCAGCAAGTTGTTGAAATAAAAATGCAAATTTACAGTAATGAT 8044

 16245890 AATATTAGAGATGTTCTCTTGGGTTGCACAGTGCGCAACTCCTGTAACTGTTCATAGCAA 16245949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8045 AATATTAGAGATGTTCTCTTGGGTTGCACAGTGCGCAACTCCTGTAACTGTTCATAGCAA 8104

 16245950 CCCTACATAGAGTCTCCCTATGGGCAACTGATTTTAGGGCAGCCCTGGGAGATGCTGATT 16246009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8105 CCCTACATAGAGTCTCCCTATGGGCAACTGATTTTAGGGCAGCCCTGGGAGATGCTGATT 8164

 16246010 GATGGCCAGTTTCTACACAAAGTAACAATGATGGGAATCAAGACTAGCTGTTGTATCCAG 16246069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8165 GATGGCCAGTTTCTACACAAAGTAACAATGATGGGAATCAAGACTAGCTGTTGTATCCAG 8224

 16246070 CTCTCAGCTGACTTGTGTTGACTGCCAGCTCTCATACCCAAGCCAAGCAGTGGAAGCCAT 16246129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8225 CTCTCAGCTGACTTGTGTTGACTGCCAGCTCTCATACCCAAGCCAAGCAGTGGAAGCCAT 8284

 16246130 ACCCCTGGAAGGATGAAGGTTTCTAAGGGGAAAGGGACAGTCTTGAAAGGGGCTGAAAGA 16246189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8285 ACCCCTGGAAGGATGAAGGTTTCTAAGGGGAAAGGGACAGTCTTGAAAGGGGCTGAAAGA 8344

 16246190 TGATATCATCTCAAGAAGCTGAACAAGTTATCTCTTACTTGAAAATGGGTCTGGTCCCTA 16246249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8345 TGATATCATCTCAAGAAGCTGAACAAGTTATCTCTTACTTGAAAATGGGTCTGGTCCCTA 8404

 16246250 TCTGCGAGACATCCGGTCCTTCAGGATCAGCCAGGGGTGCTATGGGGAGAAGCAATGTGG 16246309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8405 TCTGCGAGACATCCGGTCCTTCAGGATCAGCCAGGGGTGCTATGGGGAGAAGCAATGTGG 8464

 16246310 GGCAGGGAGAAGAACACCTCCCACTCTGCCCTTTGAAGGGTTAAATGATGGAAAGCAGTG 16246369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8465 GGCAGGGAGAAGAACACCTCCCACTCTGCCCTTTGAAGGGTTAAATGATGGAAAGCAGTG 8524

 16246370 TAAGAACCCCTTGTGCTTGTGCATGTGAGTCAGTGTGTGTGTGTAAGCATGTGAGAGTCT 16246429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8525 TAAGAACCCCTTGTGCTTGTGCATGTGAGTCAGTGTGTGTGTGTAAGCATGTGAGAGTCT 8584

 16246430 GAGTGTGGGGGGGAGCGAGCATGTGCGTGCGTGTGTGTGTGCGCGCGCATGTGCGCGTCA 16246489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8585 GAGTGTGGGGGGGAGCGAGCATGTGCGTGCGTGTGTGTGTGCGCGCGCATGTGCGCGTCA 8644

 16246490 AGGAGCAGCAGGAGGTCAGGATGCCTCCTGCCCCCCCAGAGGGAGCAGCCTTCTTTGGCT 16246549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8645 AGGAGCAGCAGGAGGTCAGGATGCCTCCTGCCCCCCCAGAGGGAGCAGCCTTCTTTGGCT 8704

 16246550 CAGGTGCCCCAAGGAAACTCTCCAGCAACCATCGTACTTCATACCCTTCAGCATGACACG 16246609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8705 CAGGTGCCCCAAGGAAACTCTCCAGCAACCATCGTACTTCATACCCTTCAGCATGACACG 8764

 16246610 TCCTCGTATCTGCCCCTGGAAAAGCCGATGCCAGTCCTGCGGTCACAACTGAGCAGCAAG 16246669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8765 TCCTCGTATCTGCCCCTGGAAAAGCCGATGCCAGTCCTGCGGTCACAACTGAGCAGCAAG 8824

 16246670 AGCACTGGGAAGGGAGAATTCAGAGCCTTCTGCTTCTAGTATAAGAGACTTTCCACAAAC 16246729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8825 AGCACTGGGAAGGGAGAATTCAGAGCCTTCTGCTTCTAGTATAAGAGACTTTCCACAAAC 8884

 16246730 ACCAAGAATACGCATGAACTTTCAAAATGGCTTGTGTATCATGGACCTTGAGGAACATCC 16246789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8885 ACCAAGAATACGCATGAACTTTCAAAATGGCTTGTGTATCATGGACCTTGAGGAACATCC 8944

 16246790 AGGCTCACGAGAATTAACAAGGAATGAGATAAACGAGGGCTTATTCTTTATTGTGGTAAA 16246849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8945 AGGCTCACGAGAATTAACAAGGAATGAGATAAACGAGGGCTTATTCTTTATTGTGGTAAA 9004

 16246850 AGGTTATGGGAAGCTTGAAACTACAGTTAGCTCTTGAATATCTGGACAGTAATGTATTCG 16246909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9005 AGGTTATGGGAAGCTTGAAACTACAGTTAGCTCTTGAATATCTGGACAGTAATGTATTCG 9064

 16246910 TTGATCTCACGTATTTCAGTGAACCAGTCTTTGTTGGCAGCTTGACTCCTTCTGTTTGCC 16246969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9065 TTGATCTCACGTATTTCAGTGAACCAGTCTTTGTTGGCAGCTTGACTCCTTCTGTTTGCC 9124

 16246970 TTTTGAAACATAAGCACTTGATCTCCTGGAACTTAGGCTCAACATAGGATCAACCTTGTA 16247029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9125 TTTTGAAACATAAGCACTTGATCTCCTGGAACTTAGGCTCAACATAGGATCAACCTTGTA 9184

 16247030 CCTGCCTGAGGGTTAAAACTCAATTCACAGGTGAGGGACTGACGAAGTAAGCAGACACTT 16247089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9185 CCTGCCTGAGGGTTAAAACTCAATTCACAGGTGAGGGACTGACGAAGTAAGCAGACACTT 9244

 16247090 CCAGCTCCTTCCAAGTCAAACGAGGTCAGCTCGCTATTTTGCTTGACGTGAATTCCAAGA 16247149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9245 CCAGCTCCTTCCAAGTCAAACGAGGTCAGCTCGCTATTTTGCTTGACGTGAATTCCAAGA 9304

 16247150 ACACCAGACACATCGGTAGGTACAAAACCACAAAGCTAAATAGAAGACTGTGGGTTTTTT 16247209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9305 ACACCAGACACATCGGTAGGTACAAAACCACAAAGCTAAATAGAAGACTGTGGGTTTTTT 9364

 16247210 ATTTGAATTAATCACCGTTTTTGAGTCAGTAGACTACAGTTAGTAATTTAGTCCTGCTAG 16247269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9365 ATTTGAATTAATCACCGTTTTTGAGTCAGTAGACTACAGTTAGTAATTTAGTCCTGCTAG 9424

 16247270 GCAGCCACTGTGGTCCATGGGAATAAAGACCAAAATAGAAAACACTCCTCACTTCATTCA 16247329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9425 GCAGCCACTGTGGTCCATGGGAATAAAGACCAAAATAGAAAACACTCCTCACTTCATTCA 9484

 16247330 CTGACATTTTATTCTTTATCTCTATCCAAAATGTACTCAGGGAAGCTCATGATTAATCAC 16247389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9485 CTGACATTTTATTCTTTATCTCTATCCAAAATGTACTCAGGGAAGCTCATGATTAATCAC 9544

 16247390 TCTTGTATACAGTTAAAATAGAGGAAAAAGAAGATTTCAGAAAGGAAAAGAGGGTATTGG 16247449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9545 TCTTGTATACAGTTAAAATAGAGGAAAAAGAAGATTTCAGAAAGGAAAAGAGGGTATTGG 9604

 16247450 GAATCAGGGGTAATACAGTTATTAGAAGTGAGTTTTACATGTGACTCTGAGCTTCCAGAA 16247509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9605 GAATCAGGGGTAATACAGTTATTAGAAGTGAGTTTTACATGTGACTCTGAGCTTCCAGAA 9664

 16247510 AGACAAAACAAAAAGAGAAACATAATGAATTTTAGAATTCTCATTTTCTAATAAAAAGCA 16247569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9665 AGACAAAACAAAAAGAGAAACATAATGAATTTTAGAATTCTCATTTTCTAATAAAAAGCA 9724

 16247570 ACGTACTCCTTTGTTAAGAAGTACACAGCACAGGCTGGGTGCAGTGGCTCATACCTGTAA 16247629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9725 ACGTACTCCTTTGTTAAGAAGTACACAGCACAGGCTGGGTGCAGTGGCTCATACCTGTAA 9784

 16247630 TCTCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCTGGCAGATCACTTTGAGCTCAGGAGTTCGAGACTA 16247689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9785 TCTCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCTGGCAGATCACTTTGAGCTCAGGAGTTCGAGACTA 9844

 16247690 GCCTCAACAACATGGCGAAATCCCATTTCTACACGCACACACACCCCCACACTAGCCGGG 16247749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9845 GCCTCAACAACATGGCGAAATCCCATTTCTACACGCACACACACCCCCACACTAGCCGGG 9904

 16247750 CATGGTGGCTCATGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGGAGCTGAGGCTGAAGAATCCTTGG 16247809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9905 CATGGTGGCTCATGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGGAGCTGAGGCTGAAGAATCCTTGG 9964

 16247810 GCCTGGGAAGTGGAGGTTGCAGTGAGCGCAGATTGTGCCACTGCACTCCAGTCTGGGCGA 16247869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9965 GCCTGGGAAGTGGAGGTTGCAGTGAGCGCAGATTGTGCCACTGCACTCCAGTCTGGGCGA 10024

 16247870 CAGAGTGAGACCATTTAAAAAAAAAAAAAGGCCGGGCGCGATGGTTCACGC 16247920
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10025 CAGAGTGAGACCATTTAAAAAAAAAAAAAGGCCGGGCGCGATGGTTCACGC 10075

Alignment time is 12.3853 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [16229408,16251209] =>     21802 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    3375] =>      3375 nucs 'mol-32-1f0b-048824_3375'

Score:        3363
Aligned:      3374        nucs
Identic:      3373 (100%) nucs =>      2959 (100%)       414 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [16236035,16238993] EXCISED REGION [16238995,16239409]
 second seq =>  [       1,    2959] EXCISED REGION [    2961,    3375]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [16238994,16238994]
 second seq =>         1 nucs [2960,2960]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [16238992,16238993] to [16238993,16238994]
 second seq =>         1 nucs [2960,2960] to [2961,2961]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 16236035 CATGTATGTTTGTTGCAGCACTATTCATAGTAGTGAAGTCACGGAATCAACCCAAATGCC 16236094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CATGTATGTTTGTTGCAGCACTATTCATAGTAGTGAAGTCACGGAATCAACCCAAATGCC 60

 16236095 CATCAATGATAGACTAGATAAAGAAAATGTGGTACATATGTACCATGGAGTACTACGCAG 16236154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CATCAATGATAGACTAGATAAAGAAAATGTGGTACATATGTACCATGGAGTACTACGCAG 120

 16236155 CCATAAAAAGGAATGAGATCCTGTCCTTTCCAGGGACATGGATGGAGCTGGAAAACATTA 16236214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCATAAAAAGGAATGAGATCCTGTCCTTTCCAGGGACATGGATGGAGCTGGAAAACATTA 180

 16236215 TCCTCAGCAAATGAACACAGGAACAGAAAACCAAACACCGCATGTTCTCACTTATAAGTG 16236274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCCTCAGCAAATGAACACAGGAACAGAAAACCAAACACCGCATGTTCTCACTTATAAGTG 240

 16236275 GGAGCTGAACAGTGAGAACACATGGACACAGGGAGGGGAGCAACACACACTGGGGCCTGT 16236334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGAGCTGAACAGTGAGAACACATGGACACAGGGAGGGGAGCAACACACACTGGGGCCTGT 300

 16236335 TGTGGGGGCATGGGGAGGGAGAGCATCAGGATAAATAACTAATGCATGTGGGGCTGAATA 16236394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGTGGGGGCATGGGGAGGGAGAGCATCAGGATAAATAACTAATGCATGTGGGGCTGAATA 360

 16236395 CCTAGGTGATGGGTTGATGGTGGCAGCAAACCACTATGGCACATGTTTACCTATGTAGCA 16236454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CCTAGGTGATGGGTTGATGGTGGCAGCAAACCACTATGGCACATGTTTACCTATGTAGCA 420

 16236455 AACCTGCACGTCCTGCACATGTATCCTGGAACTTAAAATAAAATTTTAAAAAATAGTAAG 16236514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AACCTGCACGTCCTGCACATGTATCCTGGAACTTAAAATAAAATTTTAAAAAATAGTAAG 480

 16236515 TGCTAACATTTAAAAATTGTGTGCCAGGTGCTATGCTAGGTTGTAGGAACATAAAAATAA 16236574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGCTAACATTTAAAAATTGTGTGCCAGGTGCTATGCTAGGTTGTAGGAACATAAAAATAA 540

 16236575 AGAAAATAGTGTCCCTGACCTTGAATGGATGACAGAGATTACTGGACACTTAACTACACG 16236634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGAAAATAGTGTCCCTGACCTTGAATGGATGACAGAGATTACTGGACACTTAACTACACG 600

 16236635 CATCATCCTATCCAAGCCTCACCACAGCCTCGGGGAGTCCTGATCTTCCCAGAAGGCCAG 16236694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CATCATCCTATCCAAGCCTCACCACAGCCTCGGGGAGTCCTGATCTTCCCAGAAGGCCAG 660

 16236695 GAGGGGTGTCCCTAGGTCATTTAGTTGTGCCAGAAATGTAGGCCTCAGGCCCAAGCCAAA 16236754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GAGGGGTGTCCCTAGGTCATTTAGTTGTGCCAGAAATGTAGGCCTCAGGCCCAAGCCAAA 720

 16236755 GACTAGAGCAGAGGTTCTCAAAGTGTGGTCCACAGAAAACAGCAGCATCGGCATCACCTG 16236814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GACTAGAGCAGAGGTTCTCAAAGTGTGGTCCACAGAAAACAGCAGCATCGGCATCACCTG 780

 16236815 GGAGCTTGTTAGAAATGCAAATTCTTCAGCCCCACTCCATCTCCAGAAACTCTGGGGGTG 16236874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GGAGCTTGTTAGAAATGCAAATTCTTCAGCCCCACTCCATCTCCAGAAACTCTGGGGGTG 840

 16236875 GGCCCTGCAGTCAGTATTTTAAAAATCCCACCAGGTGATTCTGATGCATGCTCAAGTGTG 16236934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GGCCCTGCAGTCAGTATTTTAAAAATCCCACCAGGTGATTCTGATGCATGCTCAAGTGTG 900

 16236935 AGCGCTGTGAGGGTGATAATATTGTCATTCATTCTCATTTTACAGATGAGGACAGTCATT 16236994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGCGCTGTGAGGGTGATAATATTGTCATTCATTCTCATTTTACAGATGAGGACAGTCATT 960

 16236995 TGCTGAGGATGACGGCAACGCTTCTCAATTGCAATGAGAGGGACTTTGGATTAAATGATA 16237054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGCTGAGGATGACGGCAACGCTTCTCAATTGCAATGAGAGGGACTTTGGATTAAATGATA 1020

 16237055 AAGGAGCTCTTGAGATCTGAGAATTGGGAGATAGTAGACAGCACCACTATGAGGCGTAAC 16237114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AAGGAGCTCTTGAGATCTGAGAATTGGGAGATAGTAGACAGCACCACTATGAGGCGTAAC 1080

 16237115 AGGTTCTTTTTATATGGGAATTTTAAGAGATCCCATAGGACAGCCATATAATGGGGGCAG 16237174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AGGTTCTTTTTATATGGGAATTTTAAGAGATCCCATAGGACAGCCATATAATGGGGGCAG 1140

 16237175 CTCCAGCCAGAGCAAAGGAAGCGAGTTAGAGGGTGTGGAGTGTTTCTTGTGGCCTTCTCT 16237234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTCCAGCCAGAGCAAAGGAAGCGAGTTAGAGGGTGTGGAGTGTTTCTTGTGGCCTTCTCT 1200

 16237235 TCCCCATGGCTCTCTGGCTCTCTTCCCTGCAGGTGTCTGCAGCAGCACCCTCAGGACAGC 16237294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TCCCCATGGCTCTCTGGCTCTCTTCCCTGCAGGTGTCTGCAGCAGCACCCTCAGGACAGC 1260

 16237295 CTGCCCACAGCCAGCGTCATCCTCTGTTTCCATGATGAGGCCTGGTCCACTCTCCTGCGG 16237354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTGCCCACAGCCAGCGTCATCCTCTGTTTCCATGATGAGGCCTGGTCCACTCTCCTGCGG 1320

 16237355 ACTGTACACAGCATCCTCGACACAGTGCCCAGGGCCTTCCTGAAGGAGATCATCCTCGTG 16237414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ACTGTACACAGCATCCTCGACACAGTGCCCAGGGCCTTCCTGAAGGAGATCATCCTCGTG 1380

 16237415 GACGACCTCAGCCAGCAAGGTAGCCACGGCTTTCCTCCAGGCTCGTCTGGGTGAGCCTTA 16237474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GACGACCTCAGCCAGCAAGGTAGCCACGGCTTTCCTCCAGGCTCGTCTGGGTGAGCCTTA 1440

 16237475 CCCCCTGGCGGGTGGAGTTCTCAAGCAAAAGATTGAAGTTTGGAACTATTTTAGGCAAGA 16237534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CCCCCTGGCGGGTGGAGTTCTCAAGCAAAAGATTGAAGTTTGGAACTATTTTAGGCAAGA 1500

 16237535 TTCCCCAACTACAGACCTCCAGATGAGGATTAATGGGCAAGTAACTTATGAATGAAGAGC 16237594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTCCCCAACTACAGACCTCCAGATGAGGATTAATGGGCAAGTAACTTATGAATGAAGAGC 1560

 16237595 CACTGGGGAAACCAGTAAGGCAGTGGGGGCTGCAAGACAGAGAAGGAGAAAGAGCCCTGC 16237654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CACTGGGGAAACCAGTAAGGCAGTGGGGGCTGCAAGACAGAGAAGGAGAAAGAGCCCTGC 1620

 16237655 AGGGGAAACAGCCCTGGGGAGGGTCTTGAGGGGTGTCGCCTCAGCCTGATCCCGTGGGGA 16237714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AGGGGAAACAGCCCTGGGGAGGGTCTTGAGGGGTGTCGCCTCAGCCTGATCCCGTGGGGA 1680

 16237715 TCTCTCTCCCAGGTGCCACCCAGTCCAACAATCCTCTCTCCAAGACACTGAAGAATCACA 16237774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TCTCTCTCCCAGGTGCCACCCAGTCCAACAATCCTCTCTCCAAGACACTGAAGAATCACA 1740

 16237775 TAGGGCGGCCCTGTTGTGAGTGCTCACTGCCTCCTAGACCCTGGTGCAGCACTTTACACA 16237834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TAGGGCGGCCCTGTTGTGAGTGCTCACTGCCTCCTAGACCCTGGTGCAGCACTTTACACA 1800

 16237835 TACGCACATATGTGTATCGGTCCTTCACTCATCATGGCTTAGACAGACCCACTCACTTTC 16237894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TACGCACATATGTGTATCGGTCCTTCACTCATCATGGCTTAGACAGACCCACTCACTTTC 1860

 16237895 CAGAGGAGGAAACTGGGGCCCAGAGAAGACAGCAGACTGGAGCGGAGTCAGCCAAAAGCA 16237954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CAGAGGAGGAAACTGGGGCCCAGAGAAGACAGCAGACTGGAGCGGAGTCAGCCAAAAGCA 1920

 16237955 GCAGAGTCAGGCCCAGAGCCCAGACTTGCAGAACCTGCCTGTGTGCTTCCTCTCACAGGA 16238014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GCAGAGTCAGGCCCAGAGCCCAGACTTGCAGAACCTGCCTGTGTGCTTCCTCTCACAGGA 1980

 16238015 ACCTGGCTACTAGGGACAGCCCTAAAAGAAGATGGAGACAGAGAAGCCCCCACTTGACTC 16238074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ACCTGGCTACTAGGGACAGCCCTAAAAGAAGATGGAGACAGAGAAGCCCCCACTTGACTC 2040

 16238075 GTAGGTCAGTGGCTCTCACGCTTGAGCATGCATCGGAATCACCTGGTGCGATTTTTAAAA 16238134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GTAGGTCAGTGGCTCTCACGCTTGAGCATGCATCGGAATCACCTGGTGCGATTTTTAAAA 2100

 16238135 TACTACTGCAGGGCCCACCCCCAGAGTTTCTGGTGATGGAGTGGGGCCGAAGAATTTGCA 16238194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TACTACTGCAGGGCCCACCCCCAGAGTTTCTGGTGATGGAGTGGGGCCGAAGAATTTGCA 2160

 16238195 TTTCTAACAAGCTCCCAGGTGATGCTGATGCTGCTGTTTTCTGTGGACCACACTCTGAGA 16238254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TTTCTAACAAGCTCCCAGGTGATGCTGATGCTGCTGTTTTCTGTGGACCACACTCTGAGA 2220

 16238255 ACCTCTGCTCTAGTCTTTGGCTTGGGCGTGAGGCCTACATTTCTGGCACAACTAAATGAC 16238314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ACCTCTGCTCTAGTCTTTGGCTTGGGCGTGAGGCCTACATTTCTGGCACAACTAAATGAC 2280

 16238315 CTAGGGACACCCCTCCTGGCCTTCTGGGAAGATCAGAACGCTCTGAGGGAAGCCGAGCAT 16238374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CTAGGGACACCCCTCCTGGCCTTCTGGGAAGATCAGAACGCTCTGAGGGAAGCCGAGCAT 2340

 16238375 TCACGTTTTTCTAAGGGGAATAATGGAGAAGGGCTAGGGTAGCCAGGTGCCTCTGTTAGT 16238434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TCACGTTTTTCTAAGGGGAATAATGGAGAAGGGCTAGGGTAGCCAGGTGCCTCTGTTAGT 2400

 16238435 TCTTTCTACGGTCCTCACTCCAGGGATGGGCCTAGCCTGGCCATAGCAGTGAGTCAGATT 16238494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TCTTTCTACGGTCCTCACTCCAGGGATGGGCCTAGCCTGGCCATAGCAGTGAGTCAGATT 2460

 16238495 AGCCAGAGGCTCTGGGAACACCTGGGGTTCCTGGGTGCAGCTGGCTGCATATTAGGCAGG 16238554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AGCCAGAGGCTCTGGGAACACCTGGGGTTCCTGGGTGCAGCTGGCTGCATATTAGGCAGG 2520

 16238555 ACTAATGAACAGGTGCAGGACAGGGCTGGGTTGGCGGGTAAAGTGCCCAGAGACTCTCCA 16238614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 ACTAATGAACAGGTGCAGGACAGGGCTGGGTTGGCGGGTAAAGTGCCCAGAGACTCTCCA 2580

 16238615 AACCCTCAAGTGGGGCGGGGTCCGCCCAAGAGCACACCTGTGGTGAGGCCCCCACCATCT 16238674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AACCCTCAAGTGGGGCGGGGTCCGCCCAAGAGCACACCTGTGGTGAGGCCCCCACCATCT 2640

 16238675 GATGAGCTGTGTTACGTCTGTGCCCCTCGGGAGTACGGAAAGTGGAGGAGCTGGGCCCCA 16238734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GATGAGCTGTGTTACGTCTGTGCCCCTCGGGAGTACGGAAAGTGGAGGAGCTGGGCCCCA 2700

 16238735 GAGAAATGGGCTACCCCAGAGCTGGCAGCCCCACCAGAGGGGATCTGGATCCCCTGCCAA 16238794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GAGAAATGGGCTACCCCAGAGCTGGCAGCCCCACCAGAGGGGATCTGGATCCCCTGCCAA 2760

 16238795 GCAATTAAGCTGCCCCCTCCTGGCCAACTCCCCTTCTGCCCCTCACCACTGGGTTGGCTC 16238854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GCAATTAAGCTGCCCCCTCCTGGCCAACTCCCCTTCTGCCCCTCACCACTGGGTTGGCTC 2820

 16238855 TCCATCCAGTGGCCCCATATTTCCTGTTGACATTGGGGTGCAAGGCCTTTTCCACAACCA 16238914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TCCATCCAGTGGCCCCATATTTCCTGTTGACATTGGGGTGCAAGGCCTTTTCCACAACCA 2880

 16238915 AGGGCAGCACTGGTTCTATTTCTGCAGGTCCCTCTCCTCTGTGTGCTTGCCAAGACCCAG 16238974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 AGGGCAGCACTGGTTCTATTTCTGCAGGTCCCTCTCCTCTGTGTGCTTGCCAAGACCCAG 2940

 16238975 ATCCCAGACAAGCACCACC 16238993
          |||||||||||||||||||
     2941 ATCCCAGACAAGCACCACC 2959

EXCISED REGION

 16238995 TGCACACTGTTTTTATTTAATCCTCTTGGCCACCCAGAGAGGCAGGGCTTATCAACCCTA 16239054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2961 TGCACACTGTTTTTATTTAATCCTCTTGGCCACCCAGAGAGGCAGGGCTTATCAACCCTA 3020

 16239055 CTCTACCTGTGAGGAAAACTGAGACAGAAAAAGATGCTGCGGGTTGCCCTGAGCCACCTT 16239114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     3021 CTCTACCTGTGAGGAAAACTGAGACAGAAAAAGATGCTGCGGGTTGCCCTGAGCCATCTT 3080

 16239115 GATGGGCTTCCAAGCCGATGGTCATGACAGCATAGTGTAGTGTGATAGAATCAGCTAGAT 16239174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3081 GATGGGCTTCCAAGCCGATGGTCATGACAGCATAGTGTAGTGTGATAGAATCAGCTAGAT 3140

 16239175 GGGTTTCAGGGTATTCGTCTGGGGTGGTGATGCCCACACCAAATCATTAAATCAGAAAAT 16239234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3141 GGGTTTCAGGGTATTCGTCTGGGGTGGTGATGCCCACACCAAATCATTAAATCAGAAAAT 3200

 16239235 GCTTGCGATGACCAGCCCATGATGACCCTTTACAAGTGGAAGTCAGTATTACTGCTGTTT 16239294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3201 GCTTGCGATGACCAGCCCATGATGACCCTTTACAAGTGGAAGTCAGTATTACTGCTGTTT 3260

 16239295 TCTGGAGGGAAGGAGTTGAGGATCATACCAGCTTTTTCCGAGCACTATACCACTCAGACA 16239354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3261 TCTGGAGGGAAGGAGTTGAGGATCATACCAGCTTTTTCCGAGCACTATACCACTCAGACA 3320

 16239355 TGGGTGCTCTTACCCACTTCAAAACCCTCTGAGAATGCCAAACAACCATCGCAGT 16239409
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3321 TGGGTGCTCTTACCCACTTCAAAACCCTCTGAGAATGCCAAACAACCATCGCAGT 3375

Alignment time is 4.17673 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [16229408,16251209] =>     21802 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    4578] =>      4578 nucs 'mol-32-2081-012258_4578'

Score:        4440
Aligned:      4572        nucs
Identic:      4560 (100%) nucs =>      2104 (100%)      2456 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [16237041,16239149] EXCISED REGION [16239157,16241619]
 second seq =>  [       1,    2109] EXCISED REGION [    2117,    4578]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         7 nucs [16239150,16239156]
 second seq =>         7 nucs [2110,2116]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [16239149,16239151] to [16239156,16239158]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [16239150,16239151] to [16239155,16239156]
 second seq =>         1 nucs [2110,2110] to [2116,2116]

 16237041 TGGATTAAATGATAAAGGAGCTCTTGAGATCTGAGAATTGGGAGATAGTAGACAGCACCA 16237100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGGATTAAATGATAAAGGAGCTCTTGAGATCTGAGAATTGGGAGATAGTAGACAGCACCA 60

 16237101 CTATGAGGCGTAACAGGTTCTTTTTATATGGGAATTTTAAGAGATCCCATAGGACAGCCA 16237160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
       61 CTATGAGGCGTAACAGGTTCTTTTTATATGGGAATTTTAAGAGATCCCATAGGACAACCA 120

 16237161 TATAATGGGGGCAGCTCCAGCCAGAGCAAAGGAAGCGAGTTAGAGGGTGTGGAGTGTTTC 16237220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TATAATGGGGGCAGCTCCAGCCAGAGCAAAGGAAGCGAGTTAGAGGGTGTGGAGTGTTTC 180

 16237221 TTGTGGCCTTCTCTTCCCCATGGCTCTCTGGCTCTCTTCCCTGCAGGTGTCTGCAGCAGC 16237280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTGTGGCCTTCTCTTCCCCATGGCTCTCTGGCTCTCTTCCCTGCAGGTGTCTGCAGCAGC 240

 16237281 ACCCTCAGGACAGCCTGCCCACAGCCAGCGTCATCCTCTGTTTCCATGATGAGGCCTGGT 16237340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACCCTCAGGACAGCCTGCCCACAGCCAGCGTCATCCTCTGTTTCCATGATGAGGCCTGGT 300

 16237341 CCACTCTCCTGCGGACTGTACACAGCATCCTCGACACAGTGCCCAGGGCCTTCCTGAAGG 16237400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCACTCTCCTGCGGACTGTACACAGCATCCTCGACACAGTGCCCAGGGCCTTCCTGAAGG 360

 16237401 AGATCATCCTCGTGGACGACCTCAGCCAGCAAGGTAGCCACGGCTTTCCTCCAGGCTCGT 16237460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGATCATCCTCGTGGACGACCTCAGCCAGCAAGGTAGCCACGGCTTTCCTCCAGGCTCGT 420

 16237461 CTGGGTGAGCCTTACCCCCTGGCGGGTGGAGTTCTCAAGCAAAAGATTGAAGTTTGGAAC 16237520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTGGGTGAGCCTTACCCCCTGGCGGGTGGAGTTCTCAAGCAAAAGATTGAAGTTTGGAAC 480

 16237521 TATTTTAGGCAAGATTCCCCAACTACAGACCTCCAGATGAGGATTAATGGGCAAGTAACT 16237580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TATTTTAGGCAAGATTCCCCAACTACAGACCTCCAGATGAGGATTAATGGGCAAGTAACT 540

 16237581 TATGAATGAAGAGCCACTGGGGAAACCAGTAAGGCAGTGGGGGCTGCAAGACAGAGAAGG 16237640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TATGAATGAAGAGCCACTGGGGAAACCAGTAAGGCAGTGGGGGCTGCAAGACAGAGAAGG 600

 16237641 AGAAAGAGCCCTGCAGGGGAAACAGCCCTGGGGAGGGTCTTGAGGGGTGTCGCCTCAGCC 16237700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGAAAGAGCCCTGCAGGGGAAACAGCCCTGGGGAGGGTCTTGAGGGGTGTCGCCTCAGCC 660

 16237701 TGATCCCGTGGGGATCTCTCTCCCAGGTGCCACCCAGTCCAACAATCCTCTCTCCAAGAC 16237760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGATCCCGTGGGGATCTCTCTCCCAGGTGCCACCCAGTCCAACAATCCTCTCTCCAAGAC 720

 16237761 ACTGAAGAATCACATAGGGCGGCCCTGTTGTGAGTGCTCACTGCCTCCTAGACCCTGGTG 16237820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ACTGAAGAATCACATAGGGCGGCCCTGTTGTGAGTGCTCACTGCCTCCTAGACCCTGGTG 780

 16237821 CAGCACTTTACACATACGCACATATGTGTATCGGTCCTTCACTCATCATGGCTTAGACAG 16237880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CAGCACTTTACACATACGCACATATGTGTATCGGTCCTTCACTCATCATGGCTTAGACAG 840

 16237881 ACCCACTCACTTTCCAGAGGAGGAAACTGGGGCCCAGAGAAGACAGCAGACTGGAGCGGA 16237940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ACCCACTCACTTTCCAGAGGAGGAAACTGGGGCCCAGAGAAGACAGCAGACTGGAGCGGA 900

 16237941 GTCAGCCAAAAGCAGCAGAGTCAGGCCCAGAGCCCAGACTTGCAGAACCTGCCTGTGTGC 16238000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GTCAGCCAAAAGCAGCAGAGTCAGGCCCAGAGCCCAGACTTGCAGAACCTGCCTGTGTGC 960

 16238001 TTCCTCTCACAGGAACCTGGCTACTAGGGACAGCCCTAAAAGAAGATGGAGACAGAGAAG 16238060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTCCTCTCACAGGAACCTGGCTACTAGGGACAGCCCTAAAAGAAGATGGAGACAGAGAAG 1020

 16238061 CCCCCACTTGACTCGTAGGTCAGTGGCTCTCACGCTTGAGCATGCATCGGAATCACCTGG 16238120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CCCCCACTTGACTCGTAGGTCAGTGGCTCTCACGCTTGAGCATGCATCGGAATCACCTGG 1080

 16238121 TGCGATTTTTAAAATACTACTGCAGGGCCCACCCCCAGAGTTTCTGGTGATGGAGTGGGG 16238180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGCGATTTTTAAAATACTACTGCAGGGCCCACCCCCAGAGTTTCTGGTGATGGAGTGGGG 1140

 16238181 CCGAAGAATTTGCATTTCTAACAAGCTCCCAGGTGATGCTGATGCTGCTGTTTTCTGTGG 16238240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CCGAAGAATTTGCATTTCTAACAAGCTCCCAGGTGATGCTGATGCTGCTGTTTTCTGTGG 1200

 16238241 ACCACACTCTGAGAACCTCTGCTCTAGTCTTTGGCTTGGGCGTGAGGCCTACATTTCTGG 16238300
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ACCACACTTTGAGAACCTCTGCTCTAGTCTTTGGCTTGGGCGTGAGGCCTACATTTCTGG 1260

 16238301 CACAACTAAATGACCTAGGGACACCCCTCCTGGCCTTCTGGGAAGATCAGAACGCTCTGA 16238360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CACAACTAAATGACCTAGGGACACCCCTCCTGGCCTTCTGGGAAGATCAGAACGCTCTGA 1320

 16238361 GGGAAGCCGAGCATTCACGTTTTTCTAAGGGGAATAATGGAGAAGGGCTAGGGTAGCCAG 16238420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GGGAAGCCGAGCATTCACGTTTTTCTAAGGGGAATAATGGAGAAGGGCTAGGGTAGCCAG 1380

 16238421 GTGCCTCTGTTAGTTCTTTCTACGGTCCTCACTCCAGGGATGGGCCTAGCCTGGCCATAG 16238480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GTGCCTCTGTTAGTTCTTTCTACGGTCCTCACTCCAGGGATGGGCCTAGCCTGGCCATAG 1440

 16238481 CAGTGAGTCAGATTAGCCAGAGGCTCTGGGAACACCTGGGGTTCCTGGGTGCAGCTGGCT 16238540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     1441 CAGTGAGTCAGATTAGCCAGAGGCTCTGGGAACACCTGGGGTTCCTGGGTACAGCTGGCT 1500

 16238541 GCATATTAGGCAGGACTAATGAACAGGTGCAGGACAGGGCTGGGTTGGCGGGTAAAGTGC 16238600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GCATATTAGGCAGGACTAATGAACAGGTGCAGGACAGGGCTGGGTTGGCGGGTAAAGTGC 1560

 16238601 CCAGAGACTCTCCAAACCCTCAAGTGGGGCGGGGTCCGCCCAAGAGCACACCTGTGGTGA 16238660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CCAGAGACTCTCCAAACCCTCAAGTGGGGCGGGGTCCGCCCAAGAGCACACCTGTGGTGA 1620

 16238661 GGCCCCCACCATCTGATGAGCTGTGTTACGTCTGTGCCCCTCGGGAGTACGGAAAGTGGA 16238720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GGCCCCCACCATCTGATGAGCTGTGTTACGTCTGTGCCCCTCGGGAGTACGGAAAGTGGA 1680

 16238721 GGAGCTGGGCCCCAGAGAAATGGGCTACCCCAGAGCTGGCAGCCCCACCAGAGGGGATCT 16238780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GGAGCTGGGCCCCAGAGAAATGGGCTACCCCAGAGCTGGCAGCCCCACCAGAGGGGATCT 1740

 16238781 GGATCCCCTGCCAAGCAATTAAGCTGCCCCCTCCTGGCCAACTCCCCTTCTGCCCCTCAC 16238840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GGATCCCCTGCCAAGCAATTAAGCTGCCCCCTCCTGGCCAACTCCCCTTCTGCCCCTCAC 1800

 16238841 CACTGGGTTGGCTCTCCATCCAGTGGCCCCATATTTCCTGTTGACATTGGGGTGCAAGGC 16238900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CACTGGGTTGGCTCTCCATCCAGTGGCCCCATATTTCCTGTTGACATTGGGGTGCAAGGC 1860

 16238901 CTTTTCCACAACCAAGGGCAGCACTGGTTCTATTTCTGCAGGTCCCTCTCCTCTGTGTGC 16238960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CTTTTCCACAACCAAGGGCAGCACTGGTTCTATTTCTGCAGGTCCCTCTCCTCTGTGTGC 1920

 16238961 TTGCCAAGACCCAGATCCCAGACAAGCACCACCCTGCACACTGTTTTTATTTAATCCTCT 16239020
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTGCCAAGACCCAGATCCCAGACAAGCACCACCTTGCACACTGTTTTTATTTAATCCTCT 1980

 16239021 TGGCCACCCAGAGAGGCAGGGCTTATCAACCCTACTCTACCTGTGAGGAAAACTGAGACA 16239080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     1981 TGGCCACCCAGAGAGGCAGGGCTTATCAACCCTACTCTACCTATGAGGAAAACTGAGACA 2040

 16239081 GAAAAAGATGCTGCGGGTTGCCCTGAGCCACCTTGATGGGCTTCCAAGCCGATGGTCATG 16239140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GAAAAAGATGCTGCGGGTTGCCCTGAGCCACCTTGATGGGCTTCCAAGCCGATGGTCATG 2100

 16239141 ACAGCATAG 16239149
          |||||||||
     2101 ACAGCATAG 2109

EXCISED REGION

 16239157 TGATAGAATCAGCTAGATGGGTTTCAGGGTATTCGTCTGGGGTGGTGATGCCCACACCAA 16239216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2117 TGATAGAATCAGCTAGATGGGTTTCAGGGTATTCGTCTGGGGTGGTGATGCCCACACCAA 2176

 16239217 ATCATTAAATCAGAAAATGCTTGCGATGACCAGCCCATGATGACCCTTTACAAGTGGAAG 16239276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2177 ATCATTAAATCAGAAAATGCTTGCGATGACCAGCCCATGATGACCCTTTACAAGTGGAAG 2236

 16239277 TCAGTATTACTGCTGTTTTCTGGAGGGAAGGAGTTGAGGATCATACCAGCTTTTTCCGAG 16239336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2237 TCAGTATTACTGCTGTTTTCTGGAGGGAAGGAGTTGAGGATCATACCAGCTTTTTCCGAG 2296

 16239337 CACTATACCACTCAGACATGGGTGCTCTTACCCACTTCAAAACCCTCTGAGAATGCCAAA 16239396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2297 CACTATACCACTCAGACATGGGTGCTCTTACCCACTTCAAAACCCTCTGAGAATGCCAAA 2356

 16239397 CAACCATCGCAGTCTGGAAGTTCTTCCTTATCTATTCCGAAGCTCTCTTGCTAGAAGTCT 16239456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2357 CAACCATCGCAGTCTGGAAGTTCTTCCTTATCTATTCCGAAGCTCTCTTGCTAGAAGTCT 2416

 16239457 GTCCTAAATAATACTAACAAGGGTTAGAGGTATAGCTGAAGAGACCAGCAGTCAGCCCAA 16239516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2417 GTCCTAAATAATACTAACAAGGGTTAGAGGTATAGCTGAAGAGACCAGCAGTCAGCCCAA 2476

 16239517 GGAGGGCTTCATAAATTAATGTTTGGTGGGAATATCAGTGAAGGACTATATTTGGCTGCA 16239576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2477 GGAGGGCTTCATAAATTAATGTTTGGTGGGAATATCAGTGAAGGACTATATTTGGCTGCA 2536

 16239577 CAGAACAGAAACCTGCTGCAGTGACTTAACCAATGAATAGAGATTTATTTTTCCTTATAG 16239636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2537 CAGAACAGAAACCTGCTGCAGTGACTTAACCAATGAATAGAGATTTATTTTTCCTTATAG 2596

 16239637 TATAGAAAGCTCACAGGGTGGCAATGCAGTATTGGTGTGACAGCTCCACAATGCCATTGG 16239696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2597 TATAGAAAGCTCACAGGGTGGCAATGCAGTATTGGTGTGACAGCTCCACAATGCCATTGG 2656

 16239697 ACACCCACCTTCATCTGCTTTCCACTTCAACATGCTTAGAGAGTAGTTTTGGCCTCATAA 16239756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2657 ACACCCACCTTCATCTGCTTTCCACTTCAACATGCTTAGAGAGTAGTTTTGGCCTCATAA 2716

 16239757 TCACAACAGGGCTGCTCTACCTCTGGACATCACATACATATTTCAAATAGGGAAAAGGCG 16239816
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2717 TCACAACAGGGCTGTTCTACCTCTGGACATCACATACATATTTCAAATAGGGAAAAGGCG 2776

 16239817 AAGAAGAGATAGGCAGAGGCCAGTCCGGTTTGTGCTCTTCGGAAAAAAAAAATTAGTAAA 16239876
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
     2777 AAGAAGAGATAGGCAGAGGCCAGTCCGGTTTGTGCTCTTCGG-AAAAAAAAATTAGTAAA 2835

 16239877 ATAATAGTTTTCCCAGAATCCTTTCATTCATTTTATTTCTACCAGAGCTGCTGCCAGCAG 16239936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2836 ATAATAGTTTTCCCAGAATCCTTTCATTCATTTTATTTCTACCAGAGCTGCTGCCAGCAG 2895

 16239937 TGACAGGAAGTCTCGAGAGATACGTGTTTTTAGCTGTCCCGAGAAACATCAAAGTTCTGT 16239996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     2896 TGACAGGAAGTCTCGAGAGATACGTGTTTTTAGCTGCCCCGAGAAACATCAAAGTTCTGT 2955

 16239997 CAGTACAGTGGAAGGGGAGAATGAATGGTGAGGAAGATGTTACATTTAGCAATGTTAAAG 16240056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2956 CAGTACAGTGGAAGGGGAGAATGAATGGTGAGGAAGATGTTACATTTAGCAATGTTAAAG 3015

 16240057 CCAATGAAGTCACTGAGGGGCTGCTTCTCAGATATGCAAGTCCAGAAATGTTAATAGCTT 16240116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3016 CCAATGAAGTCACTGAGGGGCTGCTTCTCAGATATGCAAGTCCAGAAATGTTAATAGCTT 3075

 16240117 GACTAACAGAGATTCCTCTCTAGGGAGTGGACCAGGGCTGACAGTCTTACCAGAAAAATA 16240176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3076 GACTAACAGAGATTCCTCTCTAGGGAGTGGACCAGGGCTGACAGTCTTACCAGAAAAATA 3135

 16240177 ATTATAAAGTAACACATCAACGAAGCATTTTACCAGTGAGAATTGCAACAGCCCAGTGAC 16240236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3136 ATTATAAAGTAACACATCAACGAAGCATTTTACCAGTGAGAATTGCAACAGCCCAGTGAC 3195

 16240237 TGGGACTCCTTTCCTCTACTGCTCAGGACATTGTTCACCCTGCAGAAAATCCATGGTGCT 16240296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     3196 TGGGACTCCTTTCCTCTACTGCTCAGGACATTGTTCTCCCTGCAGAAAATCCATGGTGCT 3255

 16240297 TAGAAGACAGATTCCCAGGGAAGGAGTGTATGAAGTCTGCTGGGGGCTCTCGGGTGGGGC 16240356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3256 TAGAAGACAGATTCCCAGGGAAGGAGTGTATGAAGTCTGCTGGGGGCTCTCGGGTGGGGC 3315

 16240357 TGCCTTAACCTTCTCCAGCCTCCCCAGAGATCCAGCTACCAAAGCAGCCAGGCTACTTGT 16240416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3316 TGCCTTAACCTTCTCCAGCCTCCCCAGAGATCCAGCTACCAAAGCAGCCAGGCTACTTGT 3375

 16240417 ATCCACAGTTAAGGCCACCTCTGGGCTGGGGAACTGGGGGGGAAATTCTTGCTTTTTGGC 16240476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3376 ATCCACAGTTAAGGCCACCTCTGGGCTGGGGAACTGGGGGGGAAATTCTTGCTTTTTGGC 3435

 16240477 TCAGTTCTGTTCAATGCACATGTACTGAGTGCCTACTGTGGGCCAGGCCCTGCACTAAGG 16240536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3436 TCAGTTCTGTTCAATGCACATGTACTGAGTGCCTACTGTGGGCCAGGCCCTGCACTAAGG 3495

 16240537 GTTAGAGCAGAAGAGATGCATTAGGTACAACCCCTGTCCTTGGGGAGATCTTAGTCCACT 16240596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3496 GTTAGAGCAGAAGAGATGCATTAGGTACAACCCCTGTCCTTGGGGAGATCTTAGTCCACT 3555

 16240597 GGCCTGGGGGGACTCCCCATTTCCAAGACTTCATGGAGACCACTGCTTCTCTGTGAACAC 16240656
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3556 GGCCTGGGGGGACTCCCCGTTTCCAAGACTTCATGGAGACCACTGCTTCTCTGTGAACAC 3615

 16240657 ATTGTTCCTTCCATCTCCACTGGCTTGTTCCTCTTGGTGTGTGTGTACACAGACATGCAC 16240716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3616 ATTGTTCCTTCCATCTCCACTGGCTTGTTCCTCTTGGTGTGTGTGTACACAGACATGCAC 3675

 16240717 ACACACACACACATGCACTCACACACACAATCAAGTTATTCTTATCTTAAACACAAAACC 16240776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3676 ACACACACACACATGCACTCACACACACAATCAAGTTATTCTTATCTTAAACACAAAACC 3735

 16240777 TAACAAGCTTCTCTCATCCTTTCCGTCATCTTCTTAGGCCTCTTTTTCTCCCTTCCCCTA 16240836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3736 TAACAAGCTTCTCTCATCCTTTCCGTCATCTTCTTAGGCCTCTTTTTCTCCCTTCCCCTA 3795

 16240837 TAGAATCAACCTTCCTAACCGTCTGGACTCTTGGTCTCAGTTTTTCATCTTCCGTTTTCT 16240896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3796 TAGAATCAACCTTCCTAACCGTCTGGACTCTTGGTCTCAGTTTTTCATCTTCCGTTTTCT 3855

 16240897 CTCCCGGACCCACTGTGTTGCAGACTCCCCTATCAACTGCAATGAGATCTCTTTGACCAG 16240956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3856 CTCCCGGACCCACTGTGTTGCAGACTCCCCTATCAACTGCAATGAGATCTCTTTGACCAG 3915

 16240957 CACCACCAATCTCCTACCAGCTGCCAAATTTAATGGAGCCTTTTGCCTTTGACTTCCTTG 16241016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3916 CACCACCAATCTCCTACCAGCTGCCAAATTTAATGGAGCCTTTTGCCTTTGACTTCCTTG 3975

 16241017 ACCACTGTCTTAGGTCAGGTTTCCTGAAAGCAGGGCCTGAGATGGAGATTCACGTGCATT 16241076
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     3976 ACCACTGTCTTAGGTCAGGTTTCCTGAAAGCAGGGCCTGAGATGGAGATTCACGTGCATG 4035

 16241077 TGATTTTTTTGAGGGTGTACTCTCAGGGGAAATCTGTAGGGGAGTGAGTGATACAGAAGA 16241136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4036 TGATTTTTTTGAGGGTGTACTCTCAGGGGAAATCTGTAGGGGAGTGAGTGATACAGAAGA 4095

 16241137 GAGAGAGGGAAGAGCTGAACAAATATGTGGTTTCAGGTGAAGTCCAGCCATAGCCTGATC 16241196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4096 GAGAGAGGGAAGAGCTGAACAAATATGTGGTTTCAGGTGAAGTCCAGCCATAGCCTGATC 4155

 16241197 CCATGGGGGACTCTGGAGCACAGGCTGCACTGCGGGGTCTGTCTTGCTTTTTACCCTGCA 16241256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4156 CCATGGGGGACTCTGGAGCACAGGCTGCACTGCGGGGTCTGTCTTGCTTTTTACCCTGCA 4215

 16241257 ATGGTCAGTCATTGACCATGACTGGGGCTGGGGGCAGCATCCTGCATGACTGTCTGGCAC 16241316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4216 ATGGTCAGTCATTGACCATGACTGGGGCTGGGGGCAGCATCCTGCATGACTGTCTGGCAC 4275

 16241317 CTGCAGCAGAGACCGTTTTAATACCCCAAGGCAAGTCTCCAGGGAAGGGTTAAGATTTCA 16241376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4276 CTGCAGCAGAGACCGTTTTAATACCCCAAGGCAAGTCTCCAGGGAAGGGTTAAGATTTCA 4335

 16241377 GTTAGCACCCACAGCAGCTGGGGACATGCAAACCAAACCAAAACAGTTAAGGGGAGCTCA 16241436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4336 GTTAGCACCCACAGCAGCTGGGGACATGCAAACCAAACCAAAACAGTTAAGGGGAGCTCA 4395

 16241437 GGGAATCTGAGTAGGACACTATATTAGTCTGTTCTCACACTGCTATAAAGAACTGCCTGA 16241496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4396 GGGAATCTGAGTAGGACACTATATTAGTCTGTTCTCACACTGCTATAAAGAACTGCCTGA 4455

 16241497 GACTAGGTAATTTATAAAGAAAGGAGGTTTAATTGACTCACAGTTTCGCATGGCTGGGGA 16241556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4456 GACTAGGTAATTTATAAAGAAAGGAGGTTTAATTGACTCACAGTTTCGCATGGCTGGGGA 4515

 16241557 GGCCTCAGGAAACTTACAATCATGGTGGAAGGGGAAGCATGTCTTACATGGCAGCAAGTG 16241616
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4516 GGCCTCAGGAAACTTACAATCACGGTGGAAGGGGAAGCATGTCTTACATGGCAGCAAGTG 4575

 16241617 AGA 16241619
          |||
     4576 AGA 4578

Alignment time is 5.64466 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [16229408,16251209] =>     21802 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    3042] =>      3042 nucs 'mol-32-2110-130407_3042'

Score:        2937
Aligned:      3036        nucs
Identic:      3027 (100%) nucs =>       851 (100%)      2176 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [16238296,16239149] EXCISED REGION [16239157,16241338]
 second seq =>  [       1,     854] EXCISED REGION [     862,    3042]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         7 nucs [16239150,16239156]
 second seq =>         7 nucs [855,861]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [16239149,16239151] to [16239156,16239158]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [16239150,16239151] to [16239155,16239156]
 second seq =>         1 nucs [855,855] to [861,861]

 16238296 TCTGGCACAACTAAATGACCTAGGGACACCCCTCCTGGCCTTCTGGGAAGATCAGAACGC 16238355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCTGGCACAACTAAATGACCTAGGGACACCCCTCCTGGCCTTCTGGGAAGATCAGAACGC 60

 16238356 TCTGAGGGAAGCCGAGCATTCACGTTTTTCTAAGGGGAATAATGGAGAAGGGCTAGGGTA 16238415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCTGAGGGAAGCCGAGCATTCACGTTTTTCTAAGGGGAATAATGGAGAAGGGCTAGGGTA 120

 16238416 GCCAGGTGCCTCTGTTAGTTCTTTCTACGGTCCTCACTCCAGGGATGGGCCTAGCCTGGC 16238475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GCCAGGTGCCTCTGTTAGTTCTTTCTACGGTCCTCACTCCAGGGATGGGCCTAGCCTGGC 180

 16238476 CATAGCAGTGAGTCAGATTAGCCAGAGGCTCTGGGAACACCTGGGGTTCCTGGGTGCAGC 16238535
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
      181 CATAGCAGTGAGTCAGATTAGCCAGAGGCTCTGGGAACACCTGGGGTTCCTGGGTACAGC 240

 16238536 TGGCTGCATATTAGGCAGGACTAATGAACAGGTGCAGGACAGGGCTGGGTTGGCGGGTAA 16238595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGGCTGCATATTAGGCAGGACTAATGAACAGGTGCAGGACAGGGCTGGGTTGGCGGGTAA 300

 16238596 AGTGCCCAGAGACTCTCCAAACCCTCAAGTGGGGCGGGGTCCGCCCAAGAGCACACCTGT 16238655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGTGCCCAGAGACTCTCCAAACCCTCAAGTGGGGCGGGGTCCGCCCAAGAGCACACCTGT 360

 16238656 GGTGAGGCCCCCACCATCTGATGAGCTGTGTTACGTCTGTGCCCCTCGGGAGTACGGAAA 16238715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGTGAGGCCCCCACCATCTGATGAGCTGTGTTACGTCTGTGCCCCTCGGGAGTACGGAAA 420

 16238716 GTGGAGGAGCTGGGCCCCAGAGAAATGGGCTACCCCAGAGCTGGCAGCCCCACCAGAGGG 16238775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTGGAGGAGCTGGGCCCCAGAGAAATGGGCTACCCCAGAGCTGGCAGCCCCACCAGAGGG 480

 16238776 GATCTGGATCCCCTGCCAAGCAATTAAGCTGCCCCCTCCTGGCCAACTCCCCTTCTGCCC 16238835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GATCTGGATCCCCTGCCAAGCAATTAAGCTGCCCCCTCCTGGCCAACTCCCCTTCTGCCC 540

 16238836 CTCACCACTGGGTTGGCTCTCCATCCAGTGGCCCCATATTTCCTGTTGACATTGGGGTGC 16238895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTCACCACTGGGTTGGCTCTCCATCCAGTGGCCCCATATTTCCTGTTGACATTGGGGTGC 600

 16238896 AAGGCCTTTTCCACAACCAAGGGCAGCACTGGTTCTATTTCTGCAGGTCCCTCTCCTCTG 16238955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAGGCCTTTTCCACAACCAAGGGCAGCACTGGTTCTATTTCTGCAGGTCCCTCTCCTCTG 660

 16238956 TGTGCTTGCCAAGACCCAGATCCCAGACAAGCACCACCCTGCACACTGTTTTTATTTAAT 16239015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
      661 TGTGCTTGCCAAGACCCAGATCCCAGACAAGCACCACCTTGCACACTGTTTTTATTTAAT 720

 16239016 CCTCTTGGCCACCCAGAGAGGCAGGGCTTATCAACCCTACTCTACCTGTGAGGAAAACTG 16239075
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
      721 CCTCTTGGCCACCCAGAGAGGCAGGGCTTATCAACCCTACTCTACCTATGAGGAAAACTG 780

 16239076 AGACAGAAAAAGATGCTGCGGGTTGCCCTGAGCCACCTTGATGGGCTTCCAAGCCGATGG 16239135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGACAGAAAAAGATGCTGCGGGTTGCCCTGAGCCACCTTGATGGGCTTCCAAGCCGATGG 840

 16239136 TCATGACAGCATAG 16239149
          ||||||||||||||
      841 TCATGACAGCATAG 854

EXCISED REGION

 16239157 TGATAGAATCAGCTAGATGGGTTTCAGGGTATTCGTCTGGGGTGGTGATGCCCACACCAA 16239216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      862 TGATAGAATCAGCTAGATGGGTTTCAGGGTATTCGTCTGGGGTGGTGATGCCCACACCAA 921

 16239217 ATCATTAAATCAGAAAATGCTTGCGATGACCAGCCCATGATGACCCTTTACAAGTGGAAG 16239276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      922 ATCATTAAATCAGAAAATGCTTGCGATGACCAGCCCATGATGACCCTTTACAAGTGGAAG 981

 16239277 TCAGTATTACTGCTGTTTTCTGGAGGGAAGGAGTTGAGGATCATACCAGCTTTTTCCGAG 16239336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      982 TCAGTATTACTGCTGTTTTCTGGAGGGAAGGAGTTGAGGATCATACCAGCTTTTTCCGAG 1041

 16239337 CACTATACCACTCAGACATGGGTGCTCTTACCCACTTCAAAACCCTCTGAGAATGCCAAA 16239396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1042 CACTATACCACTCAGACATGGGTGCTCTTACCCACTTCAAAACCCTCTGAGAATGCCAAA 1101

 16239397 CAACCATCGCAGTCTGGAAGTTCTTCCTTATCTATTCCGAAGCTCTCTTGCTAGAAGTCT 16239456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1102 CAACCATCGCAGTCTGGAAGTTCTTCCTTATCTATTCCGAAGCTCTCTTGCTAGAAGTCT 1161

 16239457 GTCCTAAATAATACTAACAAGGGTTAGAGGTATAGCTGAAGAGACCAGCAGTCAGCCCAA 16239516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1162 GTCCTAAATAATACTAACAAGGGTTAGAGGTATAGCTGAAGAGACCAGCAGTCAGCCCAA 1221

 16239517 GGAGGGCTTCATAAATTAATGTTTGGTGGGAATATCAGTGAAGGACTATATTTGGCTGCA 16239576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1222 GGAGGGCTTCATAAATTAATGTTTGGTGGGAATATCAGTGAAGGACTATATTTGGCTGCA 1281

 16239577 CAGAACAGAAACCTGCTGCAGTGACTTAACCAATGAATAGAGATTTATTTTTCCTTATAG 16239636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1282 CAGAACAGAAACCTGCTGCAGTGACTTAACCAATGAATAGAGATTTATTTTTCCTTATAG 1341

 16239637 TATAGAAAGCTCACAGGGTGGCAATGCAGTATTGGTGTGACAGCTCCACAATGCCATTGG 16239696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1342 TATAGAAAGCTCACAGGGTGGCAATGCAGTATTGGTGTGACAGCTCCACAATGCCATTGG 1401

 16239697 ACACCCACCTTCATCTGCTTTCCACTTCAACATGCTTAGAGAGTAGTTTTGGCCTCATAA 16239756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1402 ACACCCACCTTCATCTGCTTTCCACTTCAACATGCTTAGAGAGTAGTTTTGGCCTCATAA 1461

 16239757 TCACAACAGGGCTGCTCTACCTCTGGACATCACATACATATTTCAAATAGGGAAAAGGCG 16239816
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1462 TCACAACAGGGCTGTTCTACCTCTGGACATCACATACATATTTCAAATAGGGAAAAGGCG 1521

 16239817 AAGAAGAGATAGGCAGAGGCCAGTCCGGTTTGTGCTCTTCGGAAAAAAAAAATTAGTAAA 16239876
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
     1522 AAGAAGAGATAGGCAGAGGCCAGTCCGGTTTGTGCTCTTCGG-AAAAAAAAATTAGTAAA 1580

 16239877 ATAATAGTTTTCCCAGAATCCTTTCATTCATTTTATTTCTACCAGAGCTGCTGCCAGCAG 16239936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1581 ATAATAGTTTTCCCAGAATCCTTTCATTCATTTTATTTCTACCAGAGCTGCTGCCAGCAG 1640

 16239937 TGACAGGAAGTCTCGAGAGATACGTGTTTTTAGCTGTCCCGAGAAACATCAAAGTTCTGT 16239996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1641 TGACAGGAAGTCTCGAGAGATACGTGTTTTTAGCTGCCCCGAGAAACATCAAAGTTCTGT 1700

 16239997 CAGTACAGTGGAAGGGGAGAATGAATGGTGAGGAAGATGTTACATTTAGCAATGTTAAAG 16240056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1701 CAGTACAGTGGAAGGGGAGAATGAATGGTGAGGAAGATGTTACATTTAGCAATGTTAAAG 1760

 16240057 CCAATGAAGTCACTGAGGGGCTGCTTCTCAGATATGCAAGTCCAGAAATGTTAATAGCTT 16240116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1761 CCAATGAAGTCACTGAGGGGCTGCTTCTCAGATATGCAAGTCCAGAAATGTTAATAGCTT 1820

 16240117 GACTAACAGAGATTCCTCTCTAGGGAGTGGACCAGGGCTGACAGTCTTACCAGAAAAATA 16240176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1821 GACTAACAGAGATTCCTCTCTAGGGAGTGGACCAGGGCTGACAGTCTTACCAGAAAAATA 1880

 16240177 ATTATAAAGTAACACATCAACGAAGCATTTTACCAGTGAGAATTGCAACAGCCCAGTGAC 16240236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1881 ATTATAAAGTAACACATCAACGAAGCATTTTACCAGTGAGAATTGCAACAGCCCAGTGAC 1940

 16240237 TGGGACTCCTTTCCTCTACTGCTCAGGACATTGTTCACCCTGCAGAAAATCCATGGTGCT 16240296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1941 TGGGACTCCTTTCCTCTACTGCTCAGGACATTGTTCTCCCTGCAGAAAATCCATGGTGCT 2000

 16240297 TAGAAGACAGATTCCCAGGGAAGGAGTGTATGAAGTCTGCTGGGGGCTCTCGGGTGGGGC 16240356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2001 TAGAAGACAGATTCCCAGGGAAGGAGTGTATGAAGTCTGCTGGGGGCTCTCGGGTGGGGC 2060

 16240357 TGCCTTAACCTTCTCCAGCCTCCCCAGAGATCCAGCTACCAAAGCAGCCAGGCTACTTGT 16240416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2061 TGCCTTAACCTTCTCCAGCCTCCCCAGAGATCCAGCTACCAAAGCAGCCAGGCTACTTGT 2120

 16240417 ATCCACAGTTAAGGCCACCTCTGGGCTGGGGAACTGGGGGGGAAATTCTTGCTTTTTGGC 16240476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2121 ATCCACAGTTAAGGCCACCTCTGGGCTGGGGAACTGGGGGGGAAATTCTTGCTTTTTGGC 2180

 16240477 TCAGTTCTGTTCAATGCACATGTACTGAGTGCCTACTGTGGGCCAGGCCCTGCACTAAGG 16240536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2181 TCAGTTCTGTTCAATGCACATGTACTGAGTGCCTACTGTGGGCCAGGCCCTGCACTAAGG 2240

 16240537 GTTAGAGCAGAAGAGATGCATTAGGTACAACCCCTGTCCTTGGGGAGATCTTAGTCCACT 16240596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2241 GTTAGAGCAGAAGAGATGCATTAGGTACAACCCCTGTCCTTGGGGAGATCTTAGTCCACT 2300

 16240597 GGCCTGGGGGGACTCCCCATTTCCAAGACTTCATGGAGACCACTGCTTCTCTGTGAACAC 16240656
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2301 GGCCTGGGGGGACTCCCCGTTTCCAAGACTTCATGGAGACCACTGCTTCTCTGTGAACAC 2360

 16240657 ATTGTTCCTTCCATCTCCACTGGCTTGTTCCTCTTGGTGTGTGTGTACACAGACATGCAC 16240716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2361 ATTGTTCCTTCCATCTCCACTGGCTTGTTCCTCTTGGTGTGTGTGTACACAGACATGCAC 2420

 16240717 ACACACACACACATGCACTCACACACACAATCAAGTTATTCTTATCTTAAACACAAAACC 16240776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2421 ACACACACACACATGCACTCACACACACAATCAAGTTATTCTTATCTTAAACACAAAACC 2480

 16240777 TAACAAGCTTCTCTCATCCTTTCCGTCATCTTCTTAGGCCTCTTTTTCTCCCTTCCCCTA 16240836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2481 TAACAAGCTTCTCTCATCCTTTCCGTCATCTTCTTAGGCCTCTTTTTCTCCCTTCCCCTA 2540

 16240837 TAGAATCAACCTTCCTAACCGTCTGGACTCTTGGTCTCAGTTTTTCATCTTCCGTTTTCT 16240896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2541 TAGAATCAACCTTCCTAACCGTCTGGACTCTTGGTCTCAGTTTTTCATCTTCCGTTTTCT 2600

 16240897 CTCCCGGACCCACTGTGTTGCAGACTCCCCTATCAACTGCAATGAGATCTCTTTGACCAG 16240956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2601 CTCCCGGACCCACTGTGTTGCAGACTCCCCTATCAACTGCAATGAGATCTCTTTGACCAG 2660

 16240957 CACCACCAATCTCCTACCAGCTGCCAAATTTAATGGAGCCTTTTGCCTTTGACTTCCTTG 16241016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2661 CACCACCAATCTCCTACCAGCTGCCAAATTTAATGGAGCCTTTTGCCTTTGACTTCCTTG 2720

 16241017 ACCACTGTCTTAGGTCAGGTTTCCTGAAAGCAGGGCCTGAGATGGAGATTCACGTGCATT 16241076
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     2721 ACCACTGTCTTAGGTCAGGTTTCCTGAAAGCAGGGCCTGAGATGGAGATTCACGTGCATG 2780

 16241077 TGATTTTTTTGAGGGTGTACTCTCAGGGGAAATCTGTAGGGGAGTGAGTGATACAGAAGA 16241136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2781 TGATTTTTTTGAGGGTGTACTCTCAGGGGAAATCTGTAGGGGAGTGAGTGATACAGAAGA 2840

 16241137 GAGAGAGGGAAGAGCTGAACAAATATGTGGTTTCAGGTGAAGTCCAGCCATAGCCTGATC 16241196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2841 GAGAGAGGGAAGAGCTGAACAAATATGTGGTTTCAGGTGAAGTCCAGCCATAGCCTGATC 2900

 16241197 CCATGGGGGACTCTGGAGCACAGGCTGCACTGCGGGGTCTGTCTTGCTTTTTACCCTGCA 16241256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2901 CCATGGGGGACTCTGGAGCACAGGCTGCACTGCGGGGTCTGTCTTGCTTTTTACCCTGCA 2960

 16241257 ATGGTCAGTCATTGACCATGACTGGGGCTGGGGGCAGCATCCTGCATGACTGTCTGGCAC 16241316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2961 ATGGTCAGTCATTGACCATGACTGGGGCTGGGGGCAGCATCCTGCATGACTGTCTGGCAC 3020

 16241317 CTGCAGCAGAGACCGTTTTAAT 16241338
          ||||||||||||||||||||||
     3021 CTGCAGCAGAGACCGTTTTAAT 3042

Alignment time is 3.93351 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [16229408,16251209] =>     21802 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    3140] =>      3140 nucs 'mol-32-2291-081010_3140'

Score:        3059
Aligned:      3146        nucs
Identic:      3134 (100%) nucs =>       496 (100%)      2638 (100%)
Gaps:            6 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [16238911,16239408] EXCISED REGION [16241210,16243857]
 second seq =>  [       1,     498] EXCISED REGION [     499,    3140]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1801 nucs [16239409,16241209]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [16239409,16239409] to [16241210,16241210]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [16239409,16239410] to [16241208,16241209]
 second seq =>         0 nucs

 16238911 ACCAAGGGCAGCACTGGTTCTATTTCTGCAGGTCCCTCTCCTCTGTGTGCTTGCCAAGAC 16238970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACCAAGGGCAGCACTGGTTCTATTTCTGCAGGTCCCTCTCCTCTGTGTGCTTGCCAAGAC 60

 16238971 CCAGATCCCAGACAAGCACCACCCTGCACACTGTTTTTATTTAATCCTCTTGGCCACCCA 16239030
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCAGATCCCAGACAAGCACCACCTTGCACACTGTTTTTATTTAATCCTCTTGGCCACCCA 120

 16239031 GAGAGGCAGGGCTTATCAACCCTACTCTACCTGTGAGGAAAACTGAGACAGAAAAAGATG 16239090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GAGAGGCAGGGCTTATCAACCCTACTCTACCTGTGAGGAAAACTGAGACAGAAAAAGATG 180

 16239091 CTGCGGGTTGCCCTGAGCCACCTTGATGGGCTTCCAAGCCGATGGTCATGACAGCATAGT 16239150
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTGCGGGTTGCCCTGAGCCATCTTGATGGGCTTCCAAGCCGATGGTCATGACAGCATAGT 240

 16239151 GTAGTGTGATAGAATCAGCTAGATGGGTTTCAGGGTATTCGTCTGGGGTGGTGATGCCCA 16239210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTAGTGTGATAGAATCAGCTAGATGGGTTTCAGGGTATTCGTCTGGGGTGGTGATGCCCA 300

 16239211 CACCAAATCATTAAATCAGAAAATGCTTGCGATGACCAGCCCATGATGACCCTTTACAAG 16239270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CACCAAATCATTAAATCAGAAAATGCTTGCGATGACCAGCCCATGATGACCCTTTACAAG 360

 16239271 TGGAAGTCAGTATTACTGCTGTTTTCTGGAGGGAAGGAGTTGAGGATCATACCAGCTTTT 16239330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGGAAGTCAGTATTACTGCTGTTTTCTGGAGGGAAGGAGTTGAGGATCATACCAGCTTTT 420

 16239331 TCCGAGCACTATACCACTCAGACATGGGTGCTCTTACCCACTTCAAAACCCTCTGAGAAT 16239390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCCGAGCACTATACCACTCAGACATGGGTGCTCTTACCCACTTCAAAACCCTCTGAGAAT 480

 16239391 GCCAAACAACCATCGCAG 16239408
          ||||||||||||||||||
      481 GCCAAACAACCATCGCAG 498

EXCISED REGION

 16241210 TGGAGCACAGGCTGCACTGCGGGGTCTGTCTTGCTTTTTACCCTGCAATGGTCAGTCATT 16241269
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      499 TGGAGCACAGGCTGCACTGCGGGTTCTGTCTTGCTTTTTACCCTGCAATGGTCAGTCATT 558

 16241270 GACCATGACTGGGGCTGGGGGCAGCATCCTGCATGACTGTCTGGCACCTGCAGCAGAGAC 16241329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      559 GACCATGACTGGGGCTGGGGGCAGCATCCTGCATGACTGTCTGGCACCTGCAGCAGAGAC 618

 16241330 CGTTTTAATACCCCAAGGCAAGTCTCCAGGGAAGGGTTAAGATTTCAGTTAGCACCCACA 16241389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      619 CGTTTTAATACCCCAAGGCAAGTCTCCAGGGAAGGGTTAAGATTTCAGTTAGCACCCACA 678

 16241390 GCAGCTGGGGACATGCAAACCAAACCAAAACAGTTAAGGGGAGCTCAGGGAATCTGAGTA 16241449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      679 GCAGCTGGGGACATGCAAACCAAACCAAAACAGTTAAGGGGAGCTCAGGGAATCTGAGTA 738

 16241450 GGACACTATATTAGTCTGTTCTCACACTGCTATAAAGAACTGCCTGAGACTAGGTAATTT 16241509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      739 GGACACTATATTAGTCTGTTCTCACACTGCTATAAAGAACTGCCTGAGACTAGGTAATTT 798

 16241510 ATAAAGAAAGGAGGTTTAATTGACTCACAGTTTCGCATGGCTGGGGAGGCCTCAGGAAAC 16241569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      799 ATAAAGAAAGGAGGTTTAATTGACTCACAGTTTCGCATGGCTGGGGAGGCCTCAGGAAAC 858

 16241570 TTACAATCATGGTGGAAGGGGAAGCATGTCTTACATGGCAGCAAGTGAGAGAAAGAGAGA 16241629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      859 TTACAATCATGGTGGAAGGGGAAGCATGTCTTACATGGCAGCAAGTGAGAGAAAGAGAGA 918

 16241630 GAGAGAGGAGGAAAAACTATCAAACACTTATATAATCATCAGATCTCATGAGAACTCACT 16241689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      919 GAGAGAGGAGGAAAAACTATCAAACACTTATATAATCATCAGATCTCATGAGAACTCACT 978

 16241690 ATCACGAGAACAGCATGGGGGAAACTGCCCACATGATCCAATCACCTCCCACCAGGTCCC 16241749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      979 ATCACGAGAACAGCATGGGGGAAACTGCCCACATGATCCAATCACCTCCCACCAGGTCCC 1038

 16241750 TCCCTCGCCACATAGGGATTATGGGGATTACCACTCAAGATGAGATCTGGGTGGGGACAA 16241809
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     1039 TCCCTCGCCACATAGGGATTATGGGGATTACAACTCAAGATGAGATCTGGGTGGGGACAA 1098

 16241810 AGAGCCAAACCATATCAGACACCAACAGTATCTGCTACATTCTTGCTGCTGCATTTGGAG 16241869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1099 AGAGCCAAACCATATCAGACACCAACAGTATCTGCTACATTCTTGCTGCTGCATTTGGAG 1158

 16241870 AATGTTAGCAAGTTCTCCCCTTTCCTGGTTTTCTGACACCATCCCTCTAATTTTTACTGG 16241929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1159 AATGTTAGCAAGTTCTCCCCTTTCCTGGTTTTCTGACACCATCCCTCTAATTTTTACTGG 1218

 16241930 AGAGAATCATGGCCCACCCCAACCTAACCAAGCATCTTACATCTCAGCAACAACCACACT 16241989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1219 AGAGAATCATGGCCCACCCCAACCTAACCAAGCATCTTACATCTCAGCAACAACCACACT 1278

 16241990 GTAGTAATGTTTTCGGTTCTTAGGACCCAGGTGCTCACCACAGCTTCCAAAAGAGAGTTG 16242049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1279 GTAGTAATGTTTTCGGTTCTTAGGACCCAGGTGCTCACCACAGCTTCCAAAAGAGAGTTG 1338

 16242050 CTGACGATTGTCTTAGTCACAATCTCATCGGTTGTGGCATTTGTCATTCCACTGACCACA 16242109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1339 CTGACGATTGTCTTAGTCACAATCTCATCGGTTGTGGCATTTGTCATTCCACTGACCACA 1398

 16242110 ACCCTGTTGATTCCAGGACAACTCAAGTCTGCTCTCAGCGAATATGTGGCCAGGCTGGAG 16242169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1399 ACCCTGTTGATTCCAGGACAACTCAAGTCTGCTCTCAGCGAATATGTGGCCAGGCTGGAG 1458

 16242170 GGGGTGAAGTTACTCAGGAGCAACAAGAGGCTGGGTGCCATCAGGGCCCGGATGCTGGGG 16242229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1459 GGGGTGAAGTTACTCAGGAGCAACAAGAGGCTGGGTGCCATCAGGGCCCGGATGCTGGGG 1518

 16242230 GCCACCAGAGCCACCGGGGATGTGCTCGTCTTCATGGATGCCCACTGCGAGTGCCACCCA 16242289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1519 GCCACCAGAGCCACCGGGGATGTGCTCGTCTTCATGGATGCCCACTGCGAGTGCCACCCA 1578

 16242290 GGCTGGCTGGAGCCCCTCCTCAGCAGAATAGCTGGTGACAGGTAACTTATTCCCTGGGCT 16242349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1579 GGCTGGCTGGAGCCCCTCCTCAGCAGAATAGCTGGTGACAGGTAACTTATTCCCTGGGCT 1638

 16242350 TGCAAAGCAAGACATGGAACTGGGAGAAACAGTCTACAGCATCAGCCACTCACAGAGCAA 16242409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1639 TGCAAAGCAAGACATGGAACTGGGAGAAACAGTCTACAGCATCAGCCACTCACAGAGCAA 1698

 16242410 CCCACCTATTAATTCCTGAATCTCCATTAGAGAGTGATATATTCCCTTCGGGTTTTCAGA 16242469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1699 CCCACCTATTAATTCCTGAATCTCCATTAGAGAGTGATATATTCCCTTCGGGTTTTCAGA 1758

 16242470 TGTGTAAGTTTTTTAAGACTATAGAGTTAGAGTTGGAAAGGAGGTTAGAGGTCTTCATCT 16242529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1759 TGTGTAAGTTTTTTAAGACTATAGAGTTAGAGTTGGAAAGGAGGTTAGAGGTCTTCATCT 1818

 16242530 ACCTTGCTTTATAGATAAAGAAACCGAGGCCTGGAGAACAGCTTCTATGAGGTTGCAAAT 16242589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1819 ACCTTGCTTTATAGATAAAGAAACCGAGGCCTGGAGAACAGCTTCTATGAGGTTGCAAAT 1878

 16242590 ACTTAAAATTGTATTAAATTGCATGACGAGGGTAACACCTTACCATAGCTATCATTGCCT 16242649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1879 ACTTAAAATTGTATTAAATTGCATGACGAGGGTAACACCTTACCATAGCTATCATTGCCT 1938

 16242650 TTGGTGAAAATTTGGCAATTTTTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTGTG 16242709
          ||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||
     1939 TTGGTGAAAATTTGGCAATTTT------TTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTGTG 1992

 16242710 ATGGCGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGCGGGGCGATCTCGGCTCACTGCAA 16242769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1993 ATGGCGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGCGGGGCGATCTCGGCTCACTGCAA 2052

 16242770 GCTGCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTAC 16242829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2053 GCTGCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTAC 2112

 16242830 AGGCGCCCGCCACCACACCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGAAGGGGTTTCACC 16242889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2113 AGGCGCCCGCCACCACACCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGAAGGGGTTTCACC 2172

 16242890 GTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACTTCGTGATCCGCCCTCCTCAGCCTCCCAA 16242949
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2173 GTGTTAGCCAGGATGGTCTCAATCTCCTGACTTCGTGATCCGCCCTCCTCAGCCTCCCAA 2232

 16242950 AGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCTGGCCGAAAATTCGTCAATTTTAATCA 16243009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2233 AGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCTGGCCGAAAATTCGTCAATTTTAATCA 2292

 16243010 AGCTTGTAACATAACCTGGGGAAAAAGTCTCTGAACTACACTAGGCCGTAGATTACTCAC 16243069
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2293 AGCTTGTAACATAAACTGGGGAAAAAGTCTCTGAACTACACTAGGCCGTAGATTACTCAC 2352

 16243070 CCATAAAAAGAAAACATTATGTTCTCTGATCACTAAACAGCATTCTTTGTTTCCCCAGTT 16243129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2353 CCATAAAAAGAAAACATTATGTTCTCTGATCACTAAACAGCATTCTTTGTTTCCCCAGTT 2412

 16243130 TATATAAGGGGTCCCTAATTTTCTACCTAAGGCCAGTCCTTGGAAATGTGAAGTTGGAGA 16243189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2413 TATATAAGGGGTCCCTAATTTTCTACCTAAGGCCAGTCCTTGGAAATGTGAAGTTGGAGA 2472

 16243190 GGACTGCATTACATTACCCTGTAGACAAGCATCTTAACATTTTTCTTGATCATTTCTCTG 16243249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2473 GGACTGCATTACATTACCCTGTAGACAAGCATCTTAACATTTTTCTTGATCATTTCTCTG 2532

 16243250 CTCTCCTTCCCCCATCTGACCGTCAATCTCTTTCTCACTTCCTTGCTCAAGACAAACAGT 16243309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2533 CTCTCCTTCCCCCATCTGACCGTCAATCTCTTTCTCACTTCCTTGCTCAAGACAAACAGT 2592

 16243310 TCCTAAACATGTCTAGTCAAACATTACCCTCAATCTGAATATCCTACCCAGGAAAACTGA 16243369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2593 TCCTAAACATGTCTAGTCAAACATTACCCTCAATCTGAATATCCTACCCAGGAAAACTGA 2652

 16243370 AACCTGGTGGCTGGCCCACCTTGGACCACCTCAGGCATACCACTTGGAGCTCATGTAGGC 16243429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2653 AACCTGGTGGCTGGCCCACCTTGGACCACCTCAGGCATACCACTTGGAGCTCATGTAGGC 2712

 16243430 ATGTAGCAGAGTAGAACCACAATCAATAATTGTTTGATGGTGCCCAGCAAGACAGGACCA 16243489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2713 ATGTAGCAGAGTAGAACCACAATCAATAATTGTTTGATGGTGCCCAGCAAGACAGGACCA 2772

 16243490 ATGCTAGAACCAAGCCTTATGACTTCTACCCATGATGAATGTTTATTATCTCACCTGAAG 16243549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2773 ATGCTAGAACCAAGCCTTATGACTTCTACCCATGATGAATGTTTATTATCTCACCTGAAG 2832

 16243550 TTAGGGATGATCAATCAAATATAAGAAAAAATTCCTGGACCAGATCGGAATGAATCCTGG 16243609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2833 TTAGGGATGATCAATCAAATATAAGAAAAAATTCCTGGACCAGATCGGAATGAATCCTGG 2892

 16243610 AGACATAGGAGTTACCATCAGCCAAATGGAGATGGTTTCAAACGTTCAAATGACAGAAAG 16243669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2893 AGACATAGGAGTTACCATCAGCCAAATGGAGATGGTTTCAAACGTTCAAATGACAGAAAG 2952

 16243670 TAAATTGTTAATAGTTCAGCATTCCATTTTAACAAAGAAGAACAATCGGAACTCAAGTGA 16243729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2953 TAAATTGTTAATAGTTCAGCATTCCATTTTAACAAAGAAGAACAATCGGAACTCAAGTGA 3012

 16243730 GATCAAGACAGATTAATGTTTCCCAGTTTCATGAGACAGATTGTCTCTTGACTCACATCT 16243789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3013 GATCAAGACAGATTAATGTTTCCCAGTTTCATGAGACAGATTGTCTCTTGACTCACATCT 3072

 16243790 CATAAGAAAAGAAGACACACATAAATTCAGCACTAGGACAAGAACTAGGACACAAAAATG 16243849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3073 CATAAGAAAAGAAGACACACATAAATTCAGCACTAGGACAAGAACTAGGACACAAAAATG 3132

 16243850 CACAAGCT 16243857
          ||||||||
     3133 CACAAGCT 3140

Alignment time is 3.87794 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [16229408,16251209] =>     21802 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    4017] =>      4017 nucs 'mol-32-22b2-111607_4017'

Score:        3890
Aligned:      4011        nucs
Identic:      4000 (100%) nucs =>      1882 (100%)      2118 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [16237264,16239149] EXCISED REGION [16239157,16241281]
 second seq =>  [       1,    1886] EXCISED REGION [    1894,    4017]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         7 nucs [16239150,16239156]
 second seq =>         7 nucs [1887,1893]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [16239149,16239151] to [16239156,16239158]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [16239150,16239151] to [16239155,16239156]
 second seq =>         1 nucs [1887,1887] to [1893,1893]

 16237264 CAGGTGTCTGCAGCAGCACCCTCAGGACAGCCTGCCCACAGCCAGCGTCATCCTCTGTTT 16237323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CAGGTGTCTGCAGCAGCACCCTCAGGACAGCCTGCCCACAGCCAGCGTCATCCTCTGTTT 60

 16237324 CCATGATGAGGCCTGGTCCACTCTCCTGCGGACTGTACACAGCATCCTCGACACAGTGCC 16237383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCATGATGAGGCCTGGTCCACTCTCCTGCGGACTGTACACAGCATCCTCGACACAGTGCC 120

 16237384 CAGGGCCTTCCTGAAGGAGATCATCCTCGTGGACGACCTCAGCCAGCAAGGTAGCCACGG 16237443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAGGGCCTTCCTGAAGGAGATCATCCTCGTGGACGACCTCAGCCAGCAAGGTAGCCACGG 180

 16237444 CTTTCCTCCAGGCTCGTCTGGGTGAGCCTTACCCCCTGGCGGGTGGAGTTCTCAAGCAAA 16237503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTTTCCTCCAGGCTCGTCTGGGTGAGCCTTACCCCCTGGCGGGTGGAGTTCTCAAGCAAA 240

 16237504 AGATTGAAGTTTGGAACTATTTTAGGCAAGATTCCCCAACTACAGACCTCCAGATGAGGA 16237563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGATTGAAGTTTGGAACTATTTTAGGCAAGATTCCCCAACTACAGACCTCCAGATGAGGA 300

 16237564 TTAATGGGCAAGTAACTTATGAATGAAGAGCCACTGGGGAAACCAGTAAGGCAGTGGGGG 16237623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTAATGGGCAAGTAACTTATGAATGAAGAGCCACTGGGGAAACCAGTAAGGCAGTGGGGG 360

 16237624 CTGCAAGACAGAGAAGGAGAAAGAGCCCTGCAGGGGAAACAGCCCTGGGGAGGGTCTTGA 16237683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTGCAAGACAGAGAAGGAGAAAGAGCCCTGCAGGGGAAACAGCCCTGGGGAGGGTCTTGA 420

 16237684 GGGGTGTCGCCTCAGCCTGATCCCGTGGGGATCTCTCTCCCAGGTGCCACCCAGTCCAAC 16237743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGGGTGTCGCCTCAGCCTGATCCCGTGGGGATCTCTCTCCCAGGTGCCACCCAGTCCAAC 480

 16237744 AATCCTCTCTCCAAGACACTGAAGAATCACATAGGGCGGCCCTGTTGTGAGTGCTCACTG 16237803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AATCCTCTCTCCAAGACACTGAAGAATCACATAGGGCGGCCCTGTTGTGAGTGCTCACTG 540

 16237804 CCTCCTAGACCCTGGTGCAGCACTTTACACATACGCACATATGTGTATCGGTCCTTCACT 16237863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CCTCCTAGACCCTGGTGCAGCACTTTACACATACGCACATATGTGTATCGGTCCTTCACT 600

 16237864 CATCATGGCTTAGACAGACCCACTCACTTTCCAGAGGAGGAAACTGGGGCCCAGAGAAGA 16237923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CATCATGGCTTAGACAGACCCACTCACTTTCCAGAGGAGGAAACTGGGGCCCAGAGAAGA 660

 16237924 CAGCAGACTGGAGCGGAGTCAGCCAAAAGCAGCAGAGTCAGGCCCAGAGCCCAGACTTGC 16237983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CAGCAGACTGGAGCGGAGTCAGCCAAAAGCAGCAGAGTCAGGCCCAGAGCCCAGACTTGC 720

 16237984 AGAACCTGCCTGTGTGCTTCCTCTCACAGGAACCTGGCTACTAGGGACAGCCCTAAAAGA 16238043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGAACCTGCCTGTGTGCTTCCTCTCACAGGAACCTGGCTACTAGGGACAGCCCTAAAAGA 780

 16238044 AGATGGAGACAGAGAAGCCCCCACTTGACTCGTAGGTCAGTGGCTCTCACGCTTGAGCAT 16238103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGATGGAGACAGAGAAGCCCCCACTTGACTCGTAGGTCAGTGGCTCTCACGCTTGAGCAT 840

 16238104 GCATCGGAATCACCTGGTGCGATTTTTAAAATACTACTGCAGGGCCCACCCCCAGAGTTT 16238163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GCATCGGAATCACCTGGTGCGATTTTTAAAATACTACTGCAGGGCCCACCCCCAGAGTTT 900

 16238164 CTGGTGATGGAGTGGGGCCGAAGAATTTGCATTTCTAACAAGCTCCCAGGTGATGCTGAT 16238223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTGGTGATGGAGTGGGGCCGAAGAATTTGCATTTCTAACAAGCTCCCAGGTGATGCTGAT 960

 16238224 GCTGCTGTTTTCTGTGGACCACACTCTGAGAACCTCTGCTCTAGTCTTTGGCTTGGGCGT 16238283
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GCTGCTGTTTTCTGTGGACCACACTTTGAGAACCTCTGCTCTAGTCTTTGGCTTGGGCGT 1020

 16238284 GAGGCCTACATTTCTGGCACAACTAAATGACCTAGGGACACCCCTCCTGGCCTTCTGGGA 16238343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GAGGCCTACATTTCTGGCACAACTAAATGACCTAGGGACACCCCTCCTGGCCTTCTGGGA 1080

 16238344 AGATCAGAACGCTCTGAGGGAAGCCGAGCATTCACGTTTTTCTAAGGGGAATAATGGAGA 16238403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AGATCAGAACGCTCTGAGGGAAGCCGAGCATTCACGTTTTTCTAAGGGGAATAATGGAGA 1140

 16238404 AGGGCTAGGGTAGCCAGGTGCCTCTGTTAGTTCTTTCTACGGTCCTCACTCCAGGGATGG 16238463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGGGCTAGGGTAGCCAGGTGCCTCTGTTAGTTCTTTCTACGGTCCTCACTCCAGGGATGG 1200

 16238464 GCCTAGCCTGGCCATAGCAGTGAGTCAGATTAGCCAGAGGCTCTGGGAACACCTGGGGTT 16238523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GCCTAGCCTGGCCATAGCAGTGAGTCAGATTAGCCAGAGGCTCTGGGAACACCTGGGGTT 1260

 16238524 CCTGGGTGCAGCTGGCTGCATATTAGGCAGGACTAATGAACAGGTGCAGGACAGGGCTGG 16238583
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CCTGGGTACAGCTGGCTGCATATTAGGCAGGACTAATGAACAGGTGCAGGACAGGGCTGG 1320

 16238584 GTTGGCGGGTAAAGTGCCCAGAGACTCTCCAAACCCTCAAGTGGGGCGGGGTCCGCCCAA 16238643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GTTGGCGGGTAAAGTGCCCAGAGACTCTCCAAACCCTCAAGTGGGGCGGGGTCCGCCCAA 1380

 16238644 GAGCACACCTGTGGTGAGGCCCCCACCATCTGATGAGCTGTGTTACGTCTGTGCCCCTCG 16238703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GAGCACACCTGTGGTGAGGCCCCCACCATCTGATGAGCTGTGTTACGTCTGTGCCCCTCG 1440

 16238704 GGAGTACGGAAAGTGGAGGAGCTGGGCCCCAGAGAAATGGGCTACCCCAGAGCTGGCAGC 16238763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GGAGTACGGAAAGTGGAGGAGCTGGGCCCCAGAGAAATGGGCTACCCCAGAGCTGGCAGC 1500

 16238764 CCCACCAGAGGGGATCTGGATCCCCTGCCAAGCAATTAAGCTGCCCCCTCCTGGCCAACT 16238823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CCCACCAGAGGGGATCTGGATCCCCTGCCAAGCAATTAAGCTGCCCCCTCCTGGCCAACT 1560

 16238824 CCCCTTCTGCCCCTCACCACTGGGTTGGCTCTCCATCCAGTGGCCCCATATTTCCTGTTG 16238883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CCCCTTCTGCCCCTCACCACTGGGTTGGCTCTCCATCCAGTGGCCCCATATTTCCTGTTG 1620

 16238884 ACATTGGGGTGCAAGGCCTTTTCCACAACCAAGGGCAGCACTGGTTCTATTTCTGCAGGT 16238943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ACATTGGGGTGCAAGGCCTTTTCCACAACCAAGGGCAGCACTGGTTCTATTTCTGCAGGT 1680

 16238944 CCCTCTCCTCTGTGTGCTTGCCAAGACCCAGATCCCAGACAAGCACCACCCTGCACACTG 16239003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     1681 CCCTCTCCTCTGTGTGCTTGCCAAGACCCAGATCCCAGACAAGCACCACCTTGCACACTG 1740

 16239004 TTTTTATTTAATCCTCTTGGCCACCCAGAGAGGCAGGGCTTATCAACCCTACTCTACCTG 16239063
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     1741 TTTTTATTTAATCCTCTTGGCCACCCAGAGAGGCAGGGCTTATCAACCCTACTCTACCTA 1800

 16239064 TGAGGAAAACTGAGACAGAAAAAGATGCTGCGGGTTGCCCTGAGCCACCTTGATGGGCTT 16239123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TGAGGAAAACTGAGACAGAAAAAGATGCTGCGGGTTGCCCTGAGCCACCTTGATGGGCTT 1860

 16239124 CCAAGCCGATGGTCATGACAGCATAG 16239149
          ||||||||||||||||||||||||||
     1861 CCAAGCCGATGGTCATGACAGCATAG 1886

EXCISED REGION

 16239157 TGATAGAATCAGCTAGATGGGTTTCAGGGTATTCGTCTGGGGTGGTGATGCCCACACCAA 16239216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1894 TGATAGAATCAGCTAGATGGGTTTCAGGGTATTCGTCTGGGGTGGTGATGCCCACACCAA 1953

 16239217 ATCATTAAATCAGAAAATGCTTGCGATGACCAGCCCATGATGACCCTTTACAAGTGGAAG 16239276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1954 ATCATTAAATCAGAAAATGCTTGCGATGACCAGCCCATGATGACCCTTTACAAGTGGAAG 2013

 16239277 TCAGTATTACTGCTGTTTTCTGGAGGGAAGGAGTTGAGGATCATACCAGCTTTTTCCGAG 16239336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2014 TCAGTATTACTGCTGTTTTCTGGAGGGAAGGAGTTGAGGATCATACCAGCTTTTTCCGAG 2073

 16239337 CACTATACCACTCAGACATGGGTGCTCTTACCCACTTCAAAACCCTCTGAGAATGCCAAA 16239396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2074 CACTATACCACTCAGACATGGGTGCTCTTACCCACTTCAAAACCCTCTGAGAATGCCAAA 2133

 16239397 CAACCATCGCAGTCTGGAAGTTCTTCCTTATCTATTCCGAAGCTCTCTTGCTAGAAGTCT 16239456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2134 CAACCATCGCAGTCTGGAAGTTCTTCCTTATCTATTCCGAAGCTCTCTTGCTAGAAGTCT 2193

 16239457 GTCCTAAATAATACTAACAAGGGTTAGAGGTATAGCTGAAGAGACCAGCAGTCAGCCCAA 16239516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2194 GTCCTAAATAATACTAACAAGGGTTAGAGGTATAGCTGAAGAGACCAGCAGTCAGCCCAA 2253

 16239517 GGAGGGCTTCATAAATTAATGTTTGGTGGGAATATCAGTGAAGGACTATATTTGGCTGCA 16239576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2254 GGAGGGCTTCATAAATTAATGTTTGGTGGGAATATCAGTGAAGGACTATATTTGGCTGCA 2313

 16239577 CAGAACAGAAACCTGCTGCAGTGACTTAACCAATGAATAGAGATTTATTTTTCCTTATAG 16239636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2314 CAGAACAGAAACCTGCTGCAGTGACTTAACCAATGAATAGAGATTTATTTTTCCTTATAG 2373

 16239637 TATAGAAAGCTCACAGGGTGGCAATGCAGTATTGGTGTGACAGCTCCACAATGCCATTGG 16239696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2374 TATAGAAAGCTCACAGGGTGGCAATGCAGTATTGGTGTGACAGCTCCACAATGCCATTGG 2433

 16239697 ACACCCACCTTCATCTGCTTTCCACTTCAACATGCTTAGAGAGTAGTTTTGGCCTCATAA 16239756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2434 ACACCCACCTTCATCTGCTTTCCACTTCAACATGCTTAGAGAGTAGTTTTGGCCTCATAA 2493

 16239757 TCACAACAGGGCTGCTCTACCTCTGGACATCACATACATATTTCAAATAGGGAAAAGGCG 16239816
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2494 TCACAACAGGGCTGTTCTACCTCTGGACATCACATACATATTTCAAATAGGGAAAAGGCG 2553

 16239817 AAGAAGAGATAGGCAGAGGCCAGTCCGGTTTGTGCTCTTCGGAAAAAAAAAATTAGTAAA 16239876
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
     2554 AAGAAGAGATAGGCAGAGGCCAGTCCGGTTTGTGCTCTTCGG-AAAAAAAAATTAGTAAA 2612

 16239877 ATAATAGTTTTCCCAGAATCCTTTCATTCATTTTATTTCTACCAGAGCTGCTGCCAGCAG 16239936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2613 ATAATAGTTTTCCCAGAATCCTTTCATTCATTTTATTTCTACCAGAGCTGCTGCCAGCAG 2672

 16239937 TGACAGGAAGTCTCGAGAGATACGTGTTTTTAGCTGTCCCGAGAAACATCAAAGTTCTGT 16239996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     2673 TGACAGGAAGTCTCGAGAGATACGTGTTTTTAGCTGCCCCGAGAAACATCAAAGTTCTGT 2732

 16239997 CAGTACAGTGGAAGGGGAGAATGAATGGTGAGGAAGATGTTACATTTAGCAATGTTAAAG 16240056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2733 CAGTACAGTGGAAGGGGAGAATGAATGGTGAGGAAGATGTTACATTTAGCAATGTTAAAG 2792

 16240057 CCAATGAAGTCACTGAGGGGCTGCTTCTCAGATATGCAAGTCCAGAAATGTTAATAGCTT 16240116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2793 CCAATGAAGTCACTGAGGGGCTGCTTCTCAGATATGCAAGTCCAGAAATGTTAATAGCTT 2852

 16240117 GACTAACAGAGATTCCTCTCTAGGGAGTGGACCAGGGCTGACAGTCTTACCAGAAAAATA 16240176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2853 GACTAACAGAGATTCCTCTCTAGGGAGTGGACCAGGGCTGACAGTCTTACCAGAAAAATA 2912

 16240177 ATTATAAAGTAACACATCAACGAAGCATTTTACCAGTGAGAATTGCAACAGCCCAGTGAC 16240236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2913 ATTATAAAGTAACACATCAACGAAGCATTTTACCAGTGAGAATTGCAACAGCCCAGTGAC 2972

 16240237 TGGGACTCCTTTCCTCTACTGCTCAGGACATTGTTCACCCTGCAGAAAATCCATGGTGCT 16240296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     2973 TGGGACTCCTTTCCTCTACTGCTCAGGACATTGTTCTCCCTGCAGAAAATCCATGGTGCT 3032

 16240297 TAGAAGACAGATTCCCAGGGAAGGAGTGTATGAAGTCTGCTGGGGGCTCTCGGGTGGGGC 16240356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3033 TAGAAGACAGATTCCCAGGGAAGGAGTGTATGAAGTCTGCTGGGGGCTCTCGGGTGGGGC 3092

 16240357 TGCCTTAACCTTCTCCAGCCTCCCCAGAGATCCAGCTACCAAAGCAGCCAGGCTACTTGT 16240416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3093 TGCCTTAACCTTCTCCAGCCTCCCCAGAGATCCAGCTACCAAAGCAGCCAGGCTACTTGT 3152

 16240417 ATCCACAGTTAAGGCCACCTCTGGGCTGGGGAACTGGGGGGGAAATTCTTGCTTTTTGGC 16240476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3153 ATCCACAGTTAAGGCCACCTCTGGGCTGGGGAACTGGGGGGGAAATTCTTGCTTTTTGGC 3212

 16240477 TCAGTTCTGTTCAATGCACATGTACTGAGTGCCTACTGTGGGCCAGGCCCTGCACTAAGG 16240536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3213 TCAGTTCTGTTCAATGCACATGTACTGAGTGCCTACTGTGGGCCAGGCCCTGCACTAAGG 3272

 16240537 GTTAGAGCAGAAGAGATGCATTAGGTACAACCCCTGTCCTTGGGGAGATCTTAGTCCACT 16240596
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3273 GTTAGGGCAGAAGAGATGCATTAGGTACAACCCCTGTCCTTGGGGAGATCTTAGTCCACT 3332

 16240597 GGCCTGGGGGGACTCCCCATTTCCAAGACTTCATGGAGACCACTGCTTCTCTGTGAACAC 16240656
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3333 GGCCTGGGGGGACTCCCCGTTTCCAAGACTTCATGGAGACCACTGCTTCTCTGTGAACAC 3392

 16240657 ATTGTTCCTTCCATCTCCACTGGCTTGTTCCTCTTGGTGTGTGTGTACACAGACATGCAC 16240716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3393 ATTGTTCCTTCCATCTCCACTGGCTTGTTCCTCTTGGTGTGTGTGTACACAGACATGCAC 3452

 16240717 ACACACACACACATGCACTCACACACACAATCAAGTTATTCTTATCTTAAACACAAAACC 16240776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3453 ACACACACACACATGCACTCACACACACAATCAAGTTATTCTTATCTTAAACACAAAACC 3512

 16240777 TAACAAGCTTCTCTCATCCTTTCCGTCATCTTCTTAGGCCTCTTTTTCTCCCTTCCCCTA 16240836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3513 TAACAAGCTTCTCTCATCCTTTCCGTCATCTTCTTAGGCCTCTTTTTCTCCCTTCCCCTA 3572

 16240837 TAGAATCAACCTTCCTAACCGTCTGGACTCTTGGTCTCAGTTTTTCATCTTCCGTTTTCT 16240896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3573 TAGAATCAACCTTCCTAACCGTCTGGACTCTTGGTCTCAGTTTTTCATCTTCCGTTTTCT 3632

 16240897 CTCCCGGACCCACTGTGTTGCAGACTCCCCTATCAACTGCAATGAGATCTCTTTGACCAG 16240956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3633 CTCCCGGACCCACTGTGTTGCAGACTCCCCTATCAACTGCAATGAGATCTCTTTGACCAG 3692

 16240957 CACCACCAATCTCCTACCAGCTGCCAAATTTAATGGAGCCTTTTGCCTTTGACTTCCTTG 16241016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3693 CACCACCAATCTCCTACCAGCTGCCAAATTTAATGGAGCCTTTTGCCTTTGACTTCCTTG 3752

 16241017 ACCACTGTCTTAGGTCAGGTTTCCTGAAAGCAGGGCCTGAGATGGAGATTCACGTGCATT 16241076
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     3753 ACCACTGTCTTAGGTCAGGTTTCCTGAAAGCAGGGCCTGAGATGGAGATTCACGTGCATG 3812

 16241077 TGATTTTTTTGAGGGTGTACTCTCAGGGGAAATCTGTAGGGGAGTGAGTGATACAGAAGA 16241136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3813 TGATTTTTTTGAGGGTGTACTCTCAGGGGAAATCTGTAGGGGAGTGAGTGATACAGAAGA 3872

 16241137 GAGAGAGGGAAGAGCTGAACAAATATGTGGTTTCAGGTGAAGTCCAGCCATAGCCTGATC 16241196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3873 GAGAGAGGGAAGAGCTGAACAAATATGTGGTTTCAGGTGAAGTCCAGCCATAGCCTGATC 3932

 16241197 CCATGGGGGACTCTGGAGCACAGGCTGCACTGCGGGGTCTGTCTTGCTTTTTACCCTGCA 16241256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3933 CCATGGGGGACTCTGGAGCACAGGCTGCACTGCGGGGTCTGTCTTGCTTTTTACCCTGCA 3992

 16241257 ATGGTCAGTCATTGACCATGACTGG 16241281
          |||||||||||||||||||||||||
     3993 ATGGTCAGTCATTGACCATGACTGG 4017

Alignment time is 5.09871 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [16229408,16251209] =>     21802 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    2545] =>      2545 nucs 'mol-32-2383-062816_2545'

Score:        2491
Aligned:      2546        nucs
Identic:      2541 (100%) nucs =>      1634 (100%)       907 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [16241034,16242671] EXCISED REGION [16242678,16243585]
 second seq =>  [       1,    1638] EXCISED REGION [    1639,    2545]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         6 nucs [16242672,16242677]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        29 nucs [16242672,16242700] to [16242678,16242706]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [16242668,16242671] to [16242678,16242681]
 second seq =>         4 nucs [1635,1638] to [1639,1642]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 16241034 GGTTTCCTGAAAGCAGGGCCTGAGATGGAGATTCACGTGCATTTGATTTTTTTGAGGGTG 16241093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
        1 GGTTTCCTGAAAGCAGGGCCTGAGATGGAGATTCACGTGCATGTGATTTTTTTGAGGGTG 60

 16241094 TACTCTCAGGGGAAATCTGTAGGGGAGTGAGTGATACAGAAGAGAGAGAGGGAAGAGCTG 16241153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TACTCTCAGGGGAAATCTGTAGGGGAGTGAGTGATACAGAAGAGAGAGAGGGAAGAGCTG 120

 16241154 AACAAATATGTGGTTTCAGGTGAAGTCCAGCCATAGCCTGATCCCATGGGGGACTCTGGA 16241213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AACAAATATGTGGTTTCAGGTGAAGTCCAGCCATAGCCTGATCCCATGGGGGACTCTGGA 180

 16241214 GCACAGGCTGCACTGCGGGGTCTGTCTTGCTTTTTACCCTGCAATGGTCAGTCATTGACC 16241273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCACAGGCTGCACTGCGGGGTCTGTCTTGCTTTTTACCCTGCAATGGTCAGTCATTGACC 240

 16241274 ATGACTGGGGCTGGGGGCAGCATCCTGCATGACTGTCTGGCACCTGCAGCAGAGACCGTT 16241333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATGACTGGGGCTGGGGGCAGCATCCTGCATGACTGTCTGGCACCTGCAGCAGAGACCGTT 300

 16241334 TTAATACCCCAAGGCAAGTCTCCAGGGAAGGGTTAAGATTTCAGTTAGCACCCACAGCAG 16241393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTAATACCCCAAGGCAAGTCTCCAGGGAAGGGTTAAGATTTCAGTTAGCACCCACAGCAG 360

 16241394 CTGGGGACATGCAAACCAAACCAAAACAGTTAAGGGGAGCTCAGGGAATCTGAGTAGGAC 16241453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTGGGGACATGCAAACCAAACCAAAACAGTTAAGGGGAGCTCAGGGAATCTGAGTAGGAC 420

 16241454 ACTATATTAGTCTGTTCTCACACTGCTATAAAGAACTGCCTGAGACTAGGTAATTTATAA 16241513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACTATATTAGTCTGTTCTCACACTGCTATAAAGAACTGCCTGAGACTAGGTAATTTATAA 480

 16241514 AGAAAGGAGGTTTAATTGACTCACAGTTTCGCATGGCTGGGGAGGCCTCAGGAAACTTAC 16241573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGAAAGGAGGTTTAATTGACTCACAGTTTCGCATGGCTGGGGAGGCCTCAGGAAACTTAC 540

 16241574 AATCATGGTGGAAGGGGAAGCATGTCTTACATGGCAGCAAGTGAGAGAAAGAGAGAGAGA 16241633
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AATCACGGTGGAAGGGGAAGCATGTCTTACATGGCAGCAAGTGAGAGAAAGAGAGAGAGA 600

 16241634 GAGGAGGAAAAACTATCAAACACTTATATAATCATCAGATCTCATGAGAACTCACTATCA 16241693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GAGGAGGAAAAACTATCAAACACTTATATAATCATCAGATCTCATGAGAACTCACTATCA 660

 16241694 CGAGAACAGCATGGGGGAAACTGCCCACATGATCCAATCACCTCCCACCAGGTCCCTCCC 16241753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CGAGAACAGCATGGGGGAAACTGCCCACATGATCCAATCACCTCCCACCAGGTCCCTCCC 720

 16241754 TCGCCACATAGGGATTATGGGGATTACCACTCAAGATGAGATCTGGGTGGGGACAAAGAG 16241813
          |||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCGACACATAGGGATTATGGGGATTACAACTCAAGATGAGATCTGGGTGGGGACAAAGAG 780

 16241814 CCAAACCATATCAGACACCAACAGTATCTGCTACATTCTTGCTGCTGCATTTGGAGAATG 16241873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CCAAACCATATCAGACACCAACAGTATCTGCTACATTCTTGCTGCTGCATTTGGAGAATG 840

 16241874 TTAGCAAGTTCTCCCCTTTCCTGGTTTTCTGACACCATCCCTCTAATTTTTACTGGAGAG 16241933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTAGCAAGTTCTCCCCTTTCCTGGTTTTCTGACACCATCCCTCTAATTTTTACTGGAGAG 900

 16241934 AATCATGGCCCACCCCAACCTAACCAAGCATCTTACATCTCAGCAACAACCACACTGTAG 16241993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AATCATGGCCCACCCCAACCTAACCAAGCATCTTACATCTCAGCAACAACCACACTGTAG 960

 16241994 TAATGTTTTCGGTTCTTAGGACCCAGGTGCTCACCACAGCTTCCAAAAGAGAGTTGCTGA 16242053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TAATGTTTTCGGTTCTTAGGACCCAGGTGCTCACCACAGCTTCCAAAAGAGAGTTGCTGA 1020

 16242054 CGATTGTCTTAGTCACAATCTCATCGGTTGTGGCATTTGTCATTCCACTGACCACAACCC 16242113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CGATTGTCTTAGTCACAATCTCATCGGTTGTGGCATTTGTCATTCCACTGACCACAACCC 1080

 16242114 TGTTGATTCCAGGACAACTCAAGTCTGCTCTCAGCGAATATGTGGCCAGGCTGGAGGGGG 16242173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGTTGATTCCAGGACAACTCAAGTCTGCTCTCAGCGAATATGTGGCCAGGCTGGAGGGGG 1140

 16242174 TGAAGTTACTCAGGAGCAACAAGAGGCTGGGTGCCATCAGGGCCCGGATGCTGGGGGCCA 16242233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGAAGTTACTCAGGAGCAACAAGAGGCTGGGTGCCATCAGGGCCCGGATGCTGGGGGCCA 1200

 16242234 CCAGAGCCACCGGGGATGTGCTCGTCTTCATGGATGCCCACTGCGAGTGCCACCCAGGCT 16242293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CCAGAGCCACCGGGGATGTGCTCGTCTTCATGGATGCCCACTGCGAGTGCCACCCAGGCT 1260

 16242294 GGCTGGAGCCCCTCCTCAGCAGAATAGCTGGTGACAGGTAACTTATTCCCTGGGCTTGCA 16242353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GGCTGGAGCCCCTCCTCAGCAGAATAGCTGGTGACAGGTAACTTATTCCCTGGGCTTGCA 1320

 16242354 AAGCAAGACATGGAACTGGGAGAAACAGTCTACAGCATCAGCCACTCACAGAGCAACCCA 16242413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AAGCAAGACATGGAACTGGGAGAAACAGTCTACAGCATCAGCCACTCACAGAGCAACCCA 1380

 16242414 CCTATTAATTCCTGAATCTCCATTAGAGAGTGATATATTCCCTTCGGGTTTTCAGATGTG 16242473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CCTATTAATTCCTGAATCTCCATTAGAGAGTGATATATTCCCTTCGGGTTTTCAGATGTG 1440

 16242474 TAAGTTTTTTAAGACTATAGAGTTAGAGTTGGAAAGGAGGTTAGAGGTCTTCATCTACCT 16242533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TAAGTTTTTTAAGACTATAGAGTTAGAGTTGGAAAGGAGGTTAGAGGTCTTCATCTACCT 1500

 16242534 TGCTTTATAGATAAAGAAACCGAGGCCTGGAGAACAGCTTCTATGAGGTTGCAAATACTT 16242593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TGCTTTATAGATAAAGAAACCGAGGCCTGGAGAACAGCTTCTATGAGGTTGCAAATACTT 1560

 16242594 AAAATTGTATTAAATTGCATGACGAGGGTAACACCTTACCATAGCTATCATTGCCTTTGG 16242653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AAAATTGTATTAAATTGCATGACGAGGGTAACACCTTACCATAGCTATCATTGCCTTTGG 1620

 16242654 TGAAAATTTGGCAATTTT 16242671
          ||||||||||||||||||
     1621 TGAAAATTTGGCAATTTT 1638

EXCISED REGION

 16242678 TTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTGTGATGGCGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTG 16242737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1639 TTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTGTGATGGCGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTG 1698

 16242738 GAGTGCAGCGGGGCGATCTCGGCTCACTGCAAGCTGCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCT 16242797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1699 GAGTGCAGCGGGGCGATCTCGGCTCACTGCAAGCTGCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCT 1758

 16242798 CCTGCTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACCACACCCGGCTAATT 16242857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1759 CCTGCTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACCACACCCGGCTAATT 1818

 16242858 TTTTGTATTTTTAGTAGAGAAGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCT 16242917
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
     1819 TTTTGTATTTTTAGTAGAGAAGGGGTTTCACCGTGTTAGCCA-GATGGTCTCGATCTCCT 1877

 16242918 GACTTCGTGATCCGCCCTCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACC 16242977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1878 GACTTCGTGATCCGCCCTCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACC 1937

 16242978 GCGCCTGGCCGAAAATTCGTCAATTTTAATCAAGCTTGTAACATAACCTGGGGAAAAAGT 16243037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1938 GCGCCTGGCCGAAAATTCGTCAATTTTAATCAAGCTTGTAACATAACCTGGGGAAAAAGT 1997

 16243038 CTCTGAACTACACTAGGCCGTAGATTACTCACCCATAAAAAGAAAACATTATGTTCTCTG 16243097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1998 CTCTGAACTACACTAGGCCGTAGATTACTCACCCATAAAAAGAAAACATTATGTTCTCTG 2057

 16243098 ATCACTAAACAGCATTCTTTGTTTCCCCAGTTTATATAAGGGGTCCCTAATTTTCTACCT 16243157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2058 ATCACTAAACAGCATTCTTTGTTTCCCCAGTTTATATAAGGGGTCCCTAATTTTCTACCT 2117

 16243158 AAGGCCAGTCCTTGGAAATGTGAAGTTGGAGAGGACTGCATTACATTACCCTGTAGACAA 16243217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2118 AAGGCCAGTCCTTGGAAATGTGAAGTTGGAGAGGACTGCATTACATTACCCTGTAGACAA 2177

 16243218 GCATCTTAACATTTTTCTTGATCATTTCTCTGCTCTCCTTCCCCCATCTGACCGTCAATC 16243277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2178 GCATCTTAACATTTTTCTTGATCATTTCTCTGCTCTCCTTCCCCCATCTGACCGTCAATC 2237

 16243278 TCTTTCTCACTTCCTTGCTCAAGACAAACAGTTCCTAAACATGTCTAGTCAAACATTACC 16243337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2238 TCTTTCTCACTTCCTTGCTCAAGACAAACAGTTCCTAAACATGTCTAGTCAAACATTACC 2297

 16243338 CTCAATCTGAATATCCTACCCAGGAAAACTGAAACCTGGTGGCTGGCCCACCTTGGACCA 16243397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2298 CTCAATCTGAATATCCTACCCAGGAAAACTGAAACCTGGTGGCTGGCCCACCTTGGACCA 2357

 16243398 CCTCAGGCATACCACTTGGAGCTCATGTAGGCATGTAGCAGAGTAGAACCACAATCAATA 16243457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2358 CCTCAGGCATACCACTTGGAGCTCATGTAGGCATGTAGCAGAGTAGAACCACAATCAATA 2417

 16243458 ATTGTTTGATGGTGCCCAGCAAGACAGGACCAATGCTAGAACCAAGCCTTATGACTTCTA 16243517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2418 ATTGTTTGATGGTGCCCAGCAAGACAGGACCAATGCTAGAACCAAGCCTTATGACTTCTA 2477

 16243518 CCCATGATGAATGTTTATTATCTCACCTGAAGTTAGGGATGATCAATCAAATATAAGAAA 16243577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2478 CCCATGATGAATGTTTATTATCTCACCTGAAGTTAGGGATGATCAATCAAATATAAGAAA 2537

 16243578 AAATTCCT 16243585
          ||||||||
     2538 AAATTCCT 2545

Alignment time is 3.15656 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [16229408,16251209] =>     21802 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    3955] =>      3955 nucs 'mol-32-2874-137699_3955'

Score:        3813
Aligned:      3955        nucs
Identic:      3938 (100%) nucs =>       237 ( 99%)      3701 (100%)
Gaps:            7 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [16238911,16239149] EXCISED REGION [16239157,16242872]
 second seq =>  [       1,     239] EXCISED REGION [     247,    3955]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         7 nucs [16239150,16239156]
 second seq =>         7 nucs [240,246]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         6 nucs [16242672,16242677]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [16239149,16239151] to [16239156,16239158]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [16239150,16239151] to [16239155,16239156]
 second seq =>         1 nucs [240,240] to [246,246]

 16238911 ACCAAGGGCAGCACTGGTTCTATTTCTGCAGGTCCCTCTCCTCTGTGTGCTTGCCAAGAC 16238970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACCAAGGGCAGCACTGGTTCTATTTCTGCAGGTCCCTCTCCTCTGTGTGCTTGCCAAGAC 60

 16238971 CCAGATCCCAGACAAGCACCACCCTGCACACTGTTTTTATTTAATCCTCTTGGCCACCCA 16239030
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCAGATCCCAGACAAGCACCACCTTGCACACTGTTTTTATTTAATCCTCTTGGCCACCCA 120

 16239031 GAGAGGCAGGGCTTATCAACCCTACTCTACCTGTGAGGAAAACTGAGACAGAAAAAGATG 16239090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
      121 GAGAGGCAGGGCTTATCAACCCTACTCTACCTATGAGGAAAACTGAGACAGAAAAAGATG 180

 16239091 CTGCGGGTTGCCCTGAGCCACCTTGATGGGCTTCCAAGCCGATGGTCATGACAGCATAG 16239149
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTGCGGGTTGCCCTGAGCCACCTTGATGGGCTTCCAAGCCGATGGTCATGACAGCATAG 239

EXCISED REGION

 16239157 TGATAGAATCAGCTAGATGGGTTTCAGGGTATTCGTCTGGGGTGGTGATGCCCACACCAA 16239216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      247 TGATAGAATCAGCTAGATGGGTTTCAGGGTATTCGTCTGGGGTGGTGATGCCCACACCAA 306

 16239217 ATCATTAAATCAGAAAATGCTTGCGATGACCAGCCCATGATGACCCTTTACAAGTGGAAG 16239276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      307 ATCATTAAATCAGAAAATGCTTGCGATGACCAGCCCATGATGACCCTTTACAAGTGGAAG 366

 16239277 TCAGTATTACTGCTGTTTTCTGGAGGGAAGGAGTTGAGGATCATACCAGCTTTTTCCGAG 16239336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      367 TCAGTATTACTGCTGTTTTCTGGAGGGAAGGAGTTGAGGATCATACCAGCTTTTTCCGAG 426

 16239337 CACTATACCACTCAGACATGGGTGCTCTTACCCACTTCAAAACCCTCTGAGAATGCCAAA 16239396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      427 CACTATACCACTCAGACATGGGTGCTCTTACCCACTTCAAAACCCTCTGAGAATGCCAAA 486

 16239397 CAACCATCGCAGTCTGGAAGTTCTTCCTTATCTATTCCGAAGCTCTCTTGCTAGAAGTCT 16239456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      487 CAACCATCGCAGTCTGGAAGTTCTTCCTTATCTATTCCGAAGCTCTCTTGCTAGAAGTCT 546

 16239457 GTCCTAAATAATACTAACAAGGGTTAGAGGTATAGCTGAAGAGACCAGCAGTCAGCCCAA 16239516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      547 GTCCTAAATAATACTAACAAGGGTTAGAGGTATAGCTGAAGAGACCAGCAGTCAGCCCAA 606

 16239517 GGAGGGCTTCATAAATTAATGTTTGGTGGGAATATCAGTGAAGGACTATATTTGGCTGCA 16239576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      607 GGAGGGCTTCATAAATTAATGTTTGGTGGGAATATCAGTGAAGGACTATATTTGGCTGCA 666

 16239577 CAGAACAGAAACCTGCTGCAGTGACTTAACCAATGAATAGAGATTTATTTTTCCTTATAG 16239636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      667 CAGAACAGAAACCTGCTGCAGTGACTTAACCAATGAATAGAGATTTATTTTTCCTTATAG 726

 16239637 TATAGAAAGCTCACAGGGTGGCAATGCAGTATTGGTGTGACAGCTCCACAATGCCATTGG 16239696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      727 TATAGAAAGCTCACAGGGTGGCAATGCAGTATTGGTGTGACAGCTCCACAATGCCATTGG 786

 16239697 ACACCCACCTTCATCTGCTTTCCACTTCAACATGCTTAGAGAGTAGTTTTGGCCTCATAA 16239756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      787 ACACCCACCTTCATCTGCTTTCCACTTCAACATGCTTAGAGAGTAGTTTTGGCCTCATAA 846

 16239757 TCACAACAGGGCTGCTCTACCTCTGGACATCACATACATATTTCAAATAGGGAAAAGGCG 16239816
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      847 TCACAACAGGGCTGTTCTACCTCTGGACATCACATACATATTTCAAATAGGGAAAAGGCG 906

 16239817 AAGAAGAGATAGGCAGAGGCCAGTCCGGTTTGTGCTCTTCGGAAAAAAAAAATTAGTAAA 16239876
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
      907 AAGAAGAGATAGGCAGAGGCCAGTCCGGTTTGTGCTCTTCGG-AAAAAAAAATTAGTAAA 965

 16239877 ATAATAGTTTTCCCAGAATCCTTTCATTCATTTTATTTCTACCAGAGCTGCTGCCAGCAG 16239936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      966 ATAATAGTTTTCCCAGAATCCTTTCATTCATTTTATTTCTACCAGAGCTGCTGCCAGCAG 1025

 16239937 TGACAGGAAGTCTCGAGAGATACGTGTTTTTAGCTGTCCCGAGAAACATCAAAGTTCTGT 16239996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1026 TGACAGGAAGTCTCGAGAGATACGTGTTTTTAGCTGCCCCGAGAAACATCAAAGTTCTGT 1085

 16239997 CAGTACAGTGGAAGGGGAGAATGAATGGTGAGGAAGATGTTACATTTAGCAATGTTAAAG 16240056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1086 CAGTACAGTGGAAGGGGAGAATGAATGGTGAGGAAGATGTTACATTTAGCAATGTTAAAG 1145

 16240057 CCAATGAAGTCACTGAGGGGCTGCTTCTCAGATATGCAAGTCCAGAAATGTTAATAGCTT 16240116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1146 CCAATGAAGTCACTGAGGGGCTGCTTCTCAGATATGCAAGTCCAGAAATGTTAATAGCTT 1205

 16240117 GACTAACAGAGATTCCTCTCTAGGGAGTGGACCAGGGCTGACAGTCTTACCAGAAAAATA 16240176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1206 GACTAACAGAGATTCCTCTCTAGGGAGTGGACCAGGGCTGACAGTCTTACCAGAAAAATA 1265

 16240177 ATTATAAAGTAACACATCAACGAAGCATTTTACCAGTGAGAATTGCAACAGCCCAGTGAC 16240236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1266 ATTATAAAGTAACACATCAACGAAGCATTTTACCAGTGAGAATTGCAACAGCCCAGTGAC 1325

 16240237 TGGGACTCCTTTCCTCTACTGCTCAGGACATTGTTCACCCTGCAGAAAATCCATGGTGCT 16240296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1326 TGGGACTCCTTTCCTCTACTGCTCAGGACATTGTTCTCCCTGCAGAAAATCCATGGTGCT 1385

 16240297 TAGAAGACAGATTCCCAGGGAAGGAGTGTATGAAGTCTGCTGGGGGCTCTCGGGTGGGGC 16240356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1386 TAGAAGACAGATTCCCAGGGAAGGAGTGTATGAAGTCTGCTGGGGGCTCTCGGGTGGGGC 1445

 16240357 TGCCTTAACCTTCTCCAGCCTCCCCAGAGATCCAGCTACCAAAGCAGCCAGGCTACTTGT 16240416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1446 TGCCTTAACCTTCTCCAGCCTCCCCAGAGATCCAGCTACCAAAGCAGCCAGGCTACTTGT 1505

 16240417 ATCCACAGTTAAGGCCACCTCTGGGCTGGGGAACTGGGGGGGAAATTCTTGCTTTTTGGC 16240476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1506 ATCCACAGTTAAGGCCACCTCTGGGCTGGGGAACTGGGGGGGAAATTCTTGCTTTTTGGC 1565

 16240477 TCAGTTCTGTTCAATGCACATGTACTGAGTGCCTACTGTGGGCCAGGCCCTGCACTAAGG 16240536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1566 TCAGTTCTGTTCAATGCACATGTACTGAGTGCCTACTGTGGGCCAGGCCCTGCACTAAGG 1625

 16240537 GTTAGAGCAGAAGAGATGCATTAGGTACAACCCCTGTCCTTGGGGAGATCTTAGTCCACT 16240596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1626 GTTAGAGCAGAAGAGATGCATTAGGTACAACCCCTGTCCTTGGGGAGATCTTAGTCCACT 1685

 16240597 GGCCTGGGGGGACTCCCCATTTCCAAGACTTCATGGAGACCACTGCTTCTCTGTGAACAC 16240656
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1686 GGCCTGGGGGGACTCCCCGTTTCCAAGACTTCATGGAGACCACTGCTTCTCTGTGAACAC 1745

 16240657 ATTGTTCCTTCCATCTCCACTGGCTTGTTCCTCTTGGTGTGTGTGTACACAGACATGCAC 16240716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1746 ATTGTTCCTTCCATCTCCACTGGCTTGTTCCTCTTGGTGTGTGTGTACACAGACATGCAC 1805

 16240717 ACACACACACACATGCACTCACACACACAATCAAGTTATTCTTATCTTAAACACAAAACC 16240776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1806 ACACACACACACATGCACTCACACACACAATCAAGTTATTCTTATCTTAAACACAAAACC 1865

 16240777 TAACAAGCTTCTCTCATCCTTTCCGTCATCTTCTTAGGCCTCTTTTTCTCCCTTCCCCTA 16240836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1866 TAACAAGCTTCTCTCATCCTTTCCGTCATCTTCTTAGGCCTCTTTTTCTCCCTTCCCCTA 1925

 16240837 TAGAATCAACCTTCCTAACCGTCTGGACTCTTGGTCTCAGTTTTTCATCTTCCGTTTTCT 16240896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1926 TAGAATCAACCTTCCTAACCGTCTGGACTCTTGGTCTCAGTTTTTCATCTTCCGTTTTCT 1985

 16240897 CTCCCGGACCCACTGTGTTGCAGACTCCCCTATCAACTGCAATGAGATCTCTTTGACCAG 16240956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1986 CTCCCGGACCCACTGTGTTGCAGACTCCCCTATCAACTGCAATGAGATCTCTTTGACCAG 2045

 16240957 CACCACCAATCTCCTACCAGCTGCCAAATTTAATGGAGCCTTTTGCCTTTGACTTCCTTG 16241016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2046 CACCACCAATCTCCTACCAGCTGCCAAATTTAATGGAGCCTTTTGCCTTTGACTTCCTTG 2105

 16241017 ACCACTGTCTTAGGTCAGGTTTCCTGAAAGCAGGGCCTGAGATGGAGATTCACGTGCATT 16241076
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     2106 ACCACTGTCTTAGGTCAGGTTTCCTGAAAGCAGGGCCTGAGATGGAGATTCACGTGCATG 2165

 16241077 TGATTTTTTTGAGGGTGTACTCTCAGGGGAAATCTGTAGGGGAGTGAGTGATACAGAAGA 16241136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2166 TGATTTTTTTGAGGGTGTACTCTCAGGGGAAATCTGTAGGGGAGTGAGTGATACAGAAGA 2225

 16241137 GAGAGAGGGAAGAGCTGAACAAATATGTGGTTTCAGGTGAAGTCCAGCCATAGCCTGATC 16241196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2226 GAGAGAGGGAAGAGCTGAACAAATATGTGGTTTCAGGTGAAGTCCAGCCATAGCCTGATC 2285

 16241197 CCATGGGGGACTCTGGAGCACAGGCTGCACTGCGGGGTCTGTCTTGCTTTTTACCCTGCA 16241256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2286 CCATGGGGGACTCTGGAGCACAGGCTGCACTGCGGGGTCTGTCTTGCTTTTTACCCTGCA 2345

 16241257 ATGGTCAGTCATTGACCATGACTGGGGCTGGGGGCAGCATCCTGCATGACTGTCTGGCAC 16241316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2346 ATGGTCAGTCATTGACCATGACTGGGGCTGGGGGCAGCATCCTGCATGACTGTCTGGCAC 2405

 16241317 CTGCAGCAGAGACCGTTTTAATACCCCAAGGCAAGTCTCCAGGGAAGGGTTAAGATTTCA 16241376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2406 CTGCAGCAGAGACCGTTTTAATACCCCAAGGCAAGTCTCCAGGGAAGGGTTAAGATTTCA 2465

 16241377 GTTAGCACCCACAGCAGCTGGGGACATGCAAACCAAACCAAAACAGTTAAGGGGAGCTCA 16241436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2466 GTTAGCACCCACAGCAGCTGGGGACATGCAAACCAAACCAAAACAGTTAAGGGGAGCTCA 2525

 16241437 GGGAATCTGAGTAGGACACTATATTAGTCTGTTCTCACACTGCTATAAAGAACTGCCTGA 16241496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2526 GGGAATCTGAGTAGGACACTATATTAGTCTGTTCTCACACTGCTATAAAGAACTGCCTGA 2585

 16241497 GACTAGGTAATTTATAAAGAAAGGAGGTTTAATTGACTCACAGTTTCGCATGGCTGGGGA 16241556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2586 GACTAGGTAATTTATAAAGAAAGGAGGTTTAATTGACTCACAGTTTCGCATGGCTGGGGA 2645

 16241557 GGCCTCAGGAAACTTACAATCATGGTGGAAGGGGAAGCATGTCTTACATGGCAGCAAGTG 16241616
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2646 GGCCTCAGGAAACTTACAATCACGGTGGAAGGGGAAGCATGTCTTACATGGCAGCAAGTG 2705

 16241617 AGAGAAAGAGAGAGAGAGAGGAGGAAAAACTATCAAACACTTATATAATCATCAGATCTC 16241676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2706 AGAGAAAGAGAGAGAGAGAGGAGGAAAAACTATCAAACACTTATATAATCATCAGATCTC 2765

 16241677 ATGAGAACTCACTATCACGAGAACAGCATGGGGGAAACTGCCCACATGATCCAATCACCT 16241736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2766 ATGAGAACTCACTATCACGAGAACAGCATGGGGGAAACTGCCCACATGATCCAATCACCT 2825

 16241737 CCCACCAGGTCCCTCCCTCGCCACATAGGGATTATGGGGATTACCACTCAAGATGAGATC 16241796
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     2826 CCCACCAGGTCCCTCCCTCGACACATAGGGATTATGGGGATTACAACTCAAGATGAGATC 2885

 16241797 TGGGTGGGGACAAAGAGCCAAACCATATCAGACACCAACAGTATCTGCTACATTCTTGCT 16241856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2886 TGGGTGGGGACAAAGAGCCAAACCATATCAGACACCAACAGTATCTGCTACATTCTTGCT 2945

 16241857 GCTGCATTTGGAGAATGTTAGCAAGTTCTCCCCTTTCCTGGTTTTCTGACACCATCCCTC 16241916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2946 GCTGCATTTGGAGAATGTTAGCAAGTTCTCCCCTTTCCTGGTTTTCTGACACCATCCCTC 3005

 16241917 TAATTTTTACTGGAGAGAATCATGGCCCACCCCAACCTAACCAAGCATCTTACATCTCAG 16241976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3006 TAATTTTTACTGGAGAGAATCATGGCCCACCCCAACCTAACCAAGCATCTTACATCTCAG 3065

 16241977 CAACAACCACACTGTAGTAATGTTTTCGGTTCTTAGGACCCAGGTGCTCACCACAGCTTC 16242036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3066 CAACAACCACACTGTAGTAATGTTTTCGGTTCTTAGGACCCAGGTGCTCACCACAGCTTC 3125

 16242037 CAAAAGAGAGTTGCTGACGATTGTCTTAGTCACAATCTCATCGGTTGTGGCATTTGTCAT 16242096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3126 CAAAAGAGAGTTGCTGACGATTGTCTTAGTCACAATCTCATCGGTTGTGGCATTTGTCAT 3185

 16242097 TCCACTGACCACAACCCTGTTGATTCCAGGACAACTCAAGTCTGCTCTCAGCGAATATGT 16242156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3186 TCCACTGACCACAACCCTGTTGATTCCAGGACAACTCAAGTCTGCTCTCAGCGAATATGT 3245

 16242157 GGCCAGGCTGGAGGGGGTGAAGTTACTCAGGAGCAACAAGAGGCTGGGTGCCATCAGGGC 16242216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3246 GGCCAGGCTGGAGGGGGTGAAGTTACTCAGGAGCAACAAGAGGCTGGGTGCCATCAGGGC 3305

 16242217 CCGGATGCTGGGGGCCACCAGAGCCACCGGGGATGTGCTCGTCTTCATGGATGCCCACTG 16242276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3306 CCGGATGCTGGGGGCCACCAGAGCCACCGGGGATGTGCTCGTCTTCATGGATGCCCACTG 3365

 16242277 CGAGTGCCACCCAGGCTGGCTGGAGCCCCTCCTCAGCAGAATAGCTGGTGACAGGTAACT 16242336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3366 CGAGTGCCACCCAGGCTGGCTGGAGCCCCTCCTCAGCAGAATAGCTGGTGACAGGTAACT 3425

 16242337 TATTCCCTGGGCTTGCAAAGCAAGACATGGAACTGGGAGAAACAGTCTACAGCATCAGCC 16242396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3426 TATTCCCTGGGCTTGCAAAGCAAGACATGGAACTGGGAGAAACAGTCTACAGCATCAGCC 3485

 16242397 ACTCACAGAGCAACCCACCTATTAATTCCTGAATCTCCATTAGAGAGTGATATATTCCCT 16242456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3486 ACTCACAGAGCAACCCACCTATTAATTCCTGAATCTCCATTAGAGAGTGATATATTCCCT 3545

 16242457 TCGGGTTTTCAGATGTGTAAGTTTTTTAAGACTATAGAGTTAGAGTTGGAAAGGAGGTTA 16242516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3546 TCGGGTTTTCAGATGTGTAAGTTTTTTAAGACTATAGAGTTAGAGTTGGAAAGGAGGTTA 3605

 16242517 GAGGTCTTCATCTACCTTGCTTTATAGATAAAGAAACCGAGGCCTGGAGAACAGCTTCTA 16242576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3606 GAGGTCTTCATCTACCTTGCTTTATAGATAAAGAAACCGAGGCCTGGAGAACAGCTTCTA 3665

 16242577 TGAGGTTGCAAATACTTAAAATTGTATTAAATTGCATGACGAGGGTAACACCTTACCATA 16242636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3666 TGAGGTTGCAAATACTTAAAATTGTATTAAATTGCATGACGAGGGTAACACCTTACCATA 3725

 16242637 GCTATCATTGCCTTTGGTGAAAATTTGGCAATTTTTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTCT 16242696
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||
     3726 GCTATCATTGCCTTTGGTGAAAATTTGGCAATTTT------TTTTTCTTTTTCTTTTTCT 3779

 16242697 TTTTCTTTTTGTGATGGCGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGCGGGGCGATCT 16242756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3780 TTTTCTTTTTGTGATGGCGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGCGGGGCGATCT 3839

 16242757 CGGCTCACTGCAAGCTGCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCTTCAGCCTCCCGAG 16242816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3840 CGGCTCACTGCAAGCTGCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCTTCAGCCTCCCGAG 3899

 16242817 TAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACCACACCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGT 16242872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3900 TAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACCACACCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGT 3955

Alignment time is 4.86219 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [16229408,16251209] =>     21802 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    7435] =>      7435 nucs 'mol-32-288a-103900_7435'

Score:        7311
Aligned:      7444        nucs
Identic:      7427 (100%) nucs =>       663 (100%)      6764 (100%)
Gaps:            9 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [16238743,16239408] EXCISED REGION [16241210,16247987]
 second seq =>  [       1,     666] EXCISED REGION [     667,    7435]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1801 nucs [16239409,16241209]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [16239409,16239409] to [16241210,16241210]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [16239409,16239410] to [16241208,16241209]
 second seq =>         0 nucs

 16238743 GGCTACCCCAGAGCTGGCAGCCCCACCAGAGGGGATCTGGATCCCCTGCCAAGCAATTAA 16238802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGCTACCCCAGAGCTGGCAGCCCCACCAGAGGGGATCTGGATCCCCTGCCAAGCAATTAA 60

 16238803 GCTGCCCCCTCCTGGCCAACTCCCCTTCTGCCCCTCACCACTGGGTTGGCTCTCCATCCA 16238862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCTGCCCCCTCCTGGCCAACTCCCCTTCTGCCCCTCACCACTGGGTTGGCTCTCCATCCA 120

 16238863 GTGGCCCCATATTTCCTGTTGACATTGGGGTGCAAGGCCTTTTCCACAACCAAGGGCAGC 16238922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTGGCCCCATATTTCCTGTTGACATTGGGGTGCAAGGCCTTTTCCACAACCAAGGGCAGC 180

 16238923 ACTGGTTCTATTTCTGCAGGTCCCTCTCCTCTGTGTGCTTGCCAAGACCCAGATCCCAGA 16238982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACTGGTTCTATTTCTGCAGGTCCCTCTCCTCTGTGTGCTTGCCAAGACCCAGATCCCAGA 240

 16238983 CAAGCACCACCCTGCACACTGTTTTTATTTAATCCTCTTGGCCACCCAGAGAGGCAGGGC 16239042
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CAAGCACCACCTTGCACACTGTTTTTATTTAATCCTCTTGGCCACCCAGAGAGGCAGGGC 300

 16239043 TTATCAACCCTACTCTACCTGTGAGGAAAACTGAGACAGAAAAAGATGCTGCGGGTTGCC 16239102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTATCAACCCTACTCTACCTGTGAGGAAAACTGAGACAGAAAAAGATGCTGCGGGTTGCC 360

 16239103 CTGAGCCACCTTGATGGGCTTCCAAGCCGATGGTCATGACAGCATAGTGTAGTGTGATAG 16239162
          ||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTGAGCCATCTTGAGGGGCTTCCAAGCCGATGGTCATGACAGCATAGTGTAGTGTGATAG 420

 16239163 AATCAGCTAGATGGGTTTCAGGGTATTCGTCTGGGGTGGTGATGCCCACACCAAATCATT 16239222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AATCAGCTAGATGGGTTTCAGGGTATTCGTCTGGGGTGGTGATGCCCACACCAAATCATT 480

 16239223 AAATCAGAAAATGCTTGCGATGACCAGCCCATGATGACCCTTTACAAGTGGAAGTCAGTA 16239282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAATCAGAAAATGCTTGCGATGACCAGCCCATGATGACCCTTTACAAGTGGAAGTCAGTA 540

 16239283 TTACTGCTGTTTTCTGGAGGGAAGGAGTTGAGGATCATACCAGCTTTTTCCGAGCACTAT 16239342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTACTGCTGTTTTCTGGAGGGAAGGAGTTGAGGATCATACCAGCTTTTTCCGAGCACTAT 600

 16239343 ACCACTCAGACATGGGTGCTCTTACCCACTTCAAAACCCTCTGAGAATGCCAAACAACCA 16239402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ACCACTCAGACATGGGTGCTCTTACCCACTTCAAAACCCTCTGAGAATGCCAAACAACCA 660

 16239403 TCGCAG 16239408
          ||||||
      661 TCGCAG 666

EXCISED REGION

 16241210 TGGAGCACAGGCTGCACTGCGGGGTCTGTCTTGCTTTTTACCCTGCAATGGTCAGTCATT 16241269
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      667 TGGAGCACAGGCTGCACTGCGGGTTCTGTCTTGCTTTTTACCCTGCAATGGTCAGTCATT 726

 16241270 GACCATGACTGGGGCTGGGGGCAGCATCCTGCATGACTGTCTGGCACCTGCAGCAGAGAC 16241329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      727 GACCATGACTGGGGCTGGGGGCAGCATCCTGCATGACTGTCTGGCACCTGCAGCAGAGAC 786

 16241330 CGTTTTAATACCCCAAGGCAAGTCTCCAGGGAAGGGTTAAGATTTCAGTTAGCACCCACA 16241389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      787 CGTTTTAATACCCCAAGGCAAGTCTCCAGGGAAGGGTTAAGATTTCAGTTAGCACCCACA 846

 16241390 GCAGCTGGGGACATGCAAACCAAACCAAAACAGTTAAGGGGAGCTCAGGGAATCTGAGTA 16241449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      847 GCAGCTGGGGACATGCAAACCAAACCAAAACAGTTAAGGGGAGCTCAGGGAATCTGAGTA 906

 16241450 GGACACTATATTAGTCTGTTCTCACACTGCTATAAAGAACTGCCTGAGACTAGGTAATTT 16241509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      907 GGACACTATATTAGTCTGTTCTCACACTGCTATAAAGAACTGCCTGAGACTAGGTAATTT 966

 16241510 ATAAAGAAAGGAGGTTTAATTGACTCACAGTTTCGCATGGCTGGGGAGGCCTCAGGAAAC 16241569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      967 ATAAAGAAAGGAGGTTTAATTGACTCACAGTTTCGCATGGCTGGGGAGGCCTCAGGAAAC 1026

 16241570 TTACAATCATGGTGGAAGGGGAAGCATGTCTTACATGGCAGCAAGTGAGAGAAAGAGAGA 16241629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1027 TTACAATCATGGTGGAAGGGGAAGCATGTCTTACATGGCAGCAAGTGAGAGAAAGAGAGA 1086

 16241630 GAGAGAGGAGGAAAAACTATCAAACACTTATATAATCATCAGATCTCATGAGAACTCACT 16241689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1087 GAGAGAGGAGGAAAAACTATCAAACACTTATATAATCATCAGATCTCATGAGAACTCACT 1146

 16241690 ATCACGAGAACAGCATGGGGGAAACTGCCCACATGATCCAATCACCTCCCACCAGGTCCC 16241749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1147 ATCACGAGAACAGCATGGGGGAAACTGCCCACATGATCCAATCACCTCCCACCAGGTCCC 1206

 16241750 TCCCTCGCCACATAGGGATTATGGGGATTACCACTCAAGATGAGATCTGGGTGGGGACAA 16241809
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     1207 TCCCTCGCCACATAGGGATTATGGGGATTACAACTCAAGATGAGATCTGGGTGGGGACAA 1266

 16241810 AGAGCCAAACCATATCAGACACCAACAGTATCTGCTACATTCTTGCTGCTGCATTTGGAG 16241869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1267 AGAGCCAAACCATATCAGACACCAACAGTATCTGCTACATTCTTGCTGCTGCATTTGGAG 1326

 16241870 AATGTTAGCAAGTTCTCCCCTTTCCTGGTTTTCTGACACCATCCCTCTAATTTTTACTGG 16241929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1327 AATGTTAGCAAGTTCTCCCCTTTCCTGGTTTTCTGACACCATCCCTCTAATTTTTACTGG 1386

 16241930 AGAGAATCATGGCCCACCCCAACCTAACCAAGCATCTTACATCTCAGCAACAACCACACT 16241989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1387 AGAGAATCATGGCCCACCCCAACCTAACCAAGCATCTTACATCTCAGCAACAACCACACT 1446

 16241990 GTAGTAATGTTTTCGGTTCTTAGGACCCAGGTGCTCACCACAGCTTCCAAAAGAGAGTTG 16242049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1447 GTAGTAATGTTTTCGGTTCTTAGGACCCAGGTGCTCACCACAGCTTCCAAAAGAGAGTTG 1506

 16242050 CTGACGATTGTCTTAGTCACAATCTCATCGGTTGTGGCATTTGTCATTCCACTGACCACA 16242109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1507 CTGACGATTGTCTTAGTCACAATCTCATCGGTTGTGGCATTTGTCATTCCACTGACCACA 1566

 16242110 ACCCTGTTGATTCCAGGACAACTCAAGTCTGCTCTCAGCGAATATGTGGCCAGGCTGGAG 16242169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1567 ACCCTGTTGATTCCAGGACAACTCAAGTCTGCTCTCAGCGAATATGTGGCCAGGCTGGAG 1626

 16242170 GGGGTGAAGTTACTCAGGAGCAACAAGAGGCTGGGTGCCATCAGGGCCCGGATGCTGGGG 16242229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1627 GGGGTGAAGTTACTCAGGAGCAACAAGAGGCTGGGTGCCATCAGGGCCCGGATGCTGGGG 1686

 16242230 GCCACCAGAGCCACCGGGGATGTGCTCGTCTTCATGGATGCCCACTGCGAGTGCCACCCA 16242289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1687 GCCACCAGAGCCACCGGGGATGTGCTCGTCTTCATGGATGCCCACTGCGAGTGCCACCCA 1746

 16242290 GGCTGGCTGGAGCCCCTCCTCAGCAGAATAGCTGGTGACAGGTAACTTATTCCCTGGGCT 16242349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1747 GGCTGGCTGGAGCCCCTCCTCAGCAGAATAGCTGGTGACAGGTAACTTATTCCCTGGGCT 1806

 16242350 TGCAAAGCAAGACATGGAACTGGGAGAAACAGTCTACAGCATCAGCCACTCACAGAGCAA 16242409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1807 TGCAAAGCAAGACATGGAACTGGGAGAAACAGTCTACAGCATCAGCCACTCACAGAGCAA 1866

 16242410 CCCACCTATTAATTCCTGAATCTCCATTAGAGAGTGATATATTCCCTTCGGGTTTTCAGA 16242469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1867 CCCACCTATTAATTCCTGAATCTCCATTAGAGAGTGATATATTCCCTTCGGGTTTTCAGA 1926

 16242470 TGTGTAAGTTTTTTAAGACTATAGAGTTAGAGTTGGAAAGGAGGTTAGAGGTCTTCATCT 16242529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1927 TGTGTAAGTTTTTTAAGACTATAGAGTTAGAGTTGGAAAGGAGGTTAGAGGTCTTCATCT 1986

 16242530 ACCTTGCTTTATAGATAAAGAAACCGAGGCCTGGAGAACAGCTTCTATGAGGTTGCAAAT 16242589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1987 ACCTTGCTTTATAGATAAAGAAACCGAGGCCTGGAGAACAGCTTCTATGAGGTTGCAAAT 2046

 16242590 ACTTAAAATTGTATTAAATTGCATGACGAGGGTAACACCTTACCATAGCTATCATTGCCT 16242649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2047 ACTTAAAATTGTATTAAATTGCATGACGAGGGTAACACCTTACCATAGCTATCATTGCCT 2106

 16242650 TTGGTGAAAATTTGGCAATTTTTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTGTG 16242709
          ||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||
     2107 TTGGTGAAAATTTGGCAATTTT------TTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTGTG 2160

 16242710 ATGGCGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGCGGGGCGATCTCGGCTCACTGCAA 16242769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ATGGCGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGCGGGGCGATCTCGGCTCACTGCAA 2220

 16242770 GCTGCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTAC 16242829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GCTGCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTAC 2280

 16242830 AGGCGCCCGCCACCACACCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGAAGGGGTTTCACC 16242889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AGGCGCCCGCCACCACACCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGAAGGGGTTTCACC 2340

 16242890 GTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACTTCGTGATCCGCCCTCCTCAGCCTCCCAA 16242949
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GTGTTAGCCAGGATGGTCTCAATCTCCTGACTTCGTGATCCGCCCTCCTCAGCCTCCCAA 2400

 16242950 AGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCTGGCCGAAAATTCGTCAATTTTAATCA 16243009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCTGGCCGAAAATTCGTCAATTTTAATCA 2460

 16243010 AGCTTGTAACATAACCTGGGGAAAAAGTCTCTGAACTACACTAGGCCGTAGATTACTCAC 16243069
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AGCTTGTAACATAAACTGGGGAAAAAGTCTCTGAACTACACTAGGCCGTAGATTACTCAC 2520

 16243070 CCATAAAAAGAAAACATTATGTTCTCTGATCACTAAACAGCATTCTTTGTTTCCCCAGTT 16243129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CCATAAAAAGAAAACATTATGTTCTCTGATCACTAAACAGCATTCTTTGTTTCCCCAGTT 2580

 16243130 TATATAAGGGGTCCCTAATTTTCTACCTAAGGCCAGTCCTTGGAAATGTGAAGTTGGAGA 16243189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TATATAAGGGGTCCCTAATTTTCTACCTAAGGCCAGTCCTTGGAAATGTGAAGTTGGAGA 2640

 16243190 GGACTGCATTACATTACCCTGTAGACAAGCATCTTAACATTTTTCTTGATCATTTCTCTG 16243249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GGACTGCATTACATTACCCTGTAGACAAGCATCTTAACATTTTTCTTGATCATTTCTCTG 2700

 16243250 CTCTCCTTCCCCCATCTGACCGTCAATCTCTTTCTCACTTCCTTGCTCAAGACAAACAGT 16243309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CTCTCCTTCCCCCATCTGACCGTCAATCTCTTTCTCACTTCCTTGCTCAAGACAAACAGT 2760

 16243310 TCCTAAACATGTCTAGTCAAACATTACCCTCAATCTGAATATCCTACCCAGGAAAACTGA 16243369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TCCTAAACATGTCTAGTCAAACATTACCCTCAATCTGAATATCCTACCCAGGAAAACTGA 2820

 16243370 AACCTGGTGGCTGGCCCACCTTGGACCACCTCAGGCATACCACTTGGAGCTCATGTAGGC 16243429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 AACCTGGTGGCTGGCCCACCTTGGACCACCTCAGGCATACCACTTGGAGCTCATGTAGGC 2880

 16243430 ATGTAGCAGAGTAGAACCACAATCAATAATTGTTTGATGGTGCCCAGCAAGACAGGACCA 16243489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 ATGTAGCAGAGTAGAACCACAATCAATAATTGTTTGATGGTGCCCAGCAAGACAGGACCA 2940

 16243490 ATGCTAGAACCAAGCCTTATGACTTCTACCCATGATGAATGTTTATTATCTCACCTGAAG 16243549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 ATGCTAGAACCAAGCCTTATGACTTCTACCCATGATGAATGTTTATTATCTCACCTGAAG 3000

 16243550 TTAGGGATGATCAATCAAATATAAGAAAAAATTCCTGGACCAGATCGGAATGAATCCTGG 16243609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TTAGGGATGATCAATCAAATATAAGAAAAAATTCCTGGACCAGATCGGAATGAATCCTGG 3060

 16243610 AGACATAGGAGTTACCATCAGCCAAATGGAGATGGTTTCAAACGTTCAAATGACAGAAAG 16243669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 AGACATAGGAGTTACCATCAGCCAAATGGAGATGGTTTCAAACGTTCAAATGACAGAAAG 3120

 16243670 TAAATTGTTAATAGTTCAGCATTCCATTTTAACAAAGAAGAACAATCGGAACTCAAGTGA 16243729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TAAATTGTTAATAGTTCAGCATTCCATTTTAACAAAGAAGAACAATCGGAACTCAAGTGA 3180

 16243730 GATCAAGACAGATTAATGTTTCCCAGTTTCATGAGACAGATTGTCTCTTGACTCACATCT 16243789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 GATCAAGACAGATTAATGTTTCCCAGTTTCATGAGACAGATTGTCTCTTGACTCACATCT 3240

 16243790 CATAAGAAAAGAAGACACACATAAATTCAGCACTAGGACAAGAACTAGGACACAAAAATG 16243849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 CATAAGAAAAGAAGACACACATAAATTCAGCACTAGGACAAGAACTAGGACACAAAAATG 3300

 16243850 CACAAGCTGGCCAGGCACGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGG 16243909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 CACAAGCTGGCCAGGCACGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGG 3360

 16243910 CAGACGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCA 16243969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 CAGACGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCA 3420

 16243970 TCTCTACTAAAAATACAAAAATTAACTGGGTGTGGTAGCGTGCGCCTGTAATCCCAGCTA 16244029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TCTCTACTAAAAATACAAAAATTAACTGGGTGTGGTAGCGTGCGCCTGTAATCCCAGCTA 3480

 16244030 CTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTAAAGTGAGCCA 16244089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 CTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTAAAGTGAGCCA 3540

 16244090 AGATCGTGCTACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCCATCCCGAAAAGAAAA 16244149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 AGATCGTGCTACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCCATCCCGAAAAGAAAA 3600

 16244150 GAAAATGCACAAGCCCTCCAAAGCTGCCATTTTTGATTCTGTTTCATGCAAAGGGCCATC 16244209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 GAAAATGCACAAGCCCTCCAAAGCTGCCATTTTTGATTCTGTTTCATGCAAAGGGCCATC 3660

 16244210 TTGAAATCAGAGCGATGTCTATCATTGGAGTCAGACTCTGAAGTTGATCTTGCCCATTTC 16244269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 TTGAAATCAGAGCGATGTCTATCATTGGAGTCAGACTCTGAAGTTGATCTTGCCCATTTC 3720

 16244270 CCATCTGATTCCCATTCTGGTATCACAGACAGGTGGCTCTCAGAGGGACCATGAAGATCA 16244329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 CCATCTGATTCCCATTCTGGTATCACAGACAGGTGGCTCTCAGAGGGACCATGAAGATCA 3780

 16244330 TCTTGTCTTACCTCATGATTTCGCTATCGAGAACCCTGAGTTCCAGGAAAGTAAAAAAGA 16244389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 TCTTGTCTTACCTCATGATTTCGCTATCGAGAACCCTGAGTTCCAGGAAAGTAAAAAAGA 3840

 16244390 CCCCTCAGGGTCACACAGCCATTTGACAACTGGGCTGTTTTCTATGCTGCTTTTATGCAG 16244449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 CCCCTCAGGGTCACACAGCCATTTGACAACTGGGCTGTTTTCTATGCTGCTTTTATGCAG 3900

 16244450 ACATTTAGAAATGCAGTAATTAACATCATTAAACTTTATGTATGTGTAACCCTCGCAGAC 16244509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 ACATTTAGAAATGCAGTAATTAACATCATTAAACTTTATGTATGTGTAACCCTCGCAGAC 3960

 16244510 TTCTTTCATATGCCTTCTTTAATGACCCCCATGAGAGGCCTCAGGCAGGTATTTTAGCTT 16244569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 TTCTTTCATATGCCTTCTTTAATGACCCCCATGAGAGGCCTCAGGCAGGTATTTTAGCTT 4020

 16244570 CTGTTTTATAGGGGGAGAAATTGAGGCTCAGAGAGGTGACATGATATGTAAGGGCAGATA 16244629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 CTGTTTTATAGGGGGAGAAATTGAGGCTCAGAGAGGTGACATGATATGTAAGGGCAGATA 4080

 16244630 ATTCGTAGCTGAGTCAGATTTTCTGACTCTGGGTCCAGTGCTGTTTTTATTGTGTACATT 16244689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 ATTCGTAGCTGAGTCAGATTTTCTGACTCTGGGTCCAGTGCTGTTTTTATTGTGTACATT 4140

 16244690 TTCTTTTTAAGAGTTGGAGAAGCTGGTCAGGGAGGAACATTAGTCATCCCTAACCCCACA 16244749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 TTCTTTTTAAGAGTTGGAGAAGCTGGTCAGGGAGGAACATTAGTCATCCCTAACCCCACA 4200

 16244750 ACTGGTTATGAGACATGTGTTACCTGCTGCTGTGAGTCCCTCGTATCTGCTTCTCACATC 16244809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 ACTGGTTATGAGACATGTGTTACCTGCTGCTGTGAGTCCCTCGTATCTGCTTCTCACATC 4260

 16244810 GGGGCCCCATTTCCCAGAGCTAGGTGAAGGTAGAAAGACGTGGCACTACCTCAGTGTCCT 16244869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 GGGGCCCCATTTCCCAGAGCTAGGTGAAGGTAGAAAGACGTGGCACTACCTCAGTGTCCT 4320

 16244870 AGGCTAGAAAGAAAATGAGGCTCCCTGGGAAGCCCTTTGTGATTAAGAGACATTCTAGTT 16244929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 AGGCTAGAAAGAAAATGAGGCTCCCTGGGAAGCCCTTTGTGATTAAGAGACATTCTAGTT 4380

 16244930 TCCTGTGCCCTTCCCCTCTCCTCTTTTCCTCTCCTGTCTGTCTCTGCCTCTCTACCTCTC 16244989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 TCCTGTGCCCTTCCCCTCTCCTCTTTTCCTCTCCTGTCTGTCTCTGCCTCTCTACCTCTC 4440

 16244990 TCACGGTCTTTGTCTCTCTCTGTCTCTTGGTCACTCATTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC 16245049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||
     4441 TCACGGTCTTTGTCTCTCTCTGTCTCTTGGTCACTCAT--TCTCTCTCTCTCTCTCTCTC 4498

 16245050 TCACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAGTGGGCCTCTGAT 16245109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4499 TCACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAGTGGGCCTCTGAT 4558

 16245110 CCTGGTGTGTTACTGGCTTGCCTTCCTCTTTGGGTTCCATCTCTTCTGCGTGATGTGACC 16245169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4559 CCTGGTGTGTTACTGGCTTGCCTTCCTCTTTGGGTTCCATCTCTTCTGCGTGATGTGACC 4618

 16245170 ACATTTTCATCATCTCTACACCTCATTCATGGCTTCTTGTCCACTGTGTTTTCTCTGGGC 16245229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4619 ACATTTTCATCATCTCTACACCTCATTCATGGCTTCTTGTCCACTGTGTTTTCTCTGGGC 4678

 16245230 CCTAGTGTCCAGCTTTTAGGCACTGGCAGGTGAGGATCTGGAAGAAAAGCCACCTTTCTG 16245289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4679 CCTAGTGTCCAGCTTTTAGGCACTGGCAGGTGAGGATCTGGAAGAAAAGCCACCTTTCTG 4738

 16245290 GTATCTGAGTCCCACTCTCTCCACTCCACCTGGCAACGCTCTATGAGCTGTGGCAGGGAG 16245349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4739 GTATCTGAGTCCCACTCTCTCCACTCCACCTGGCAACGCTCTATGAGCTGTGGCAGGGAG 4798

 16245350 AGCAGCCTCATTCAGTGTGTGCTTTACTCCCCCAGGGACGTCGCCCACGTGCCTCATACA 16245409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4799 AGCAGCCTCATTCAGTGTGTGCTTTACTCCCCCAGGGACGTCGCCCACGTGCCTCATACA 4858

 16245410 AAGCCAAGCTGTGGAAGGCATTTGGTGCAGCTCCTCACATGGAGAGGAGAGGGGGCCCAG 16245469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4859 AAGCCAAGCTGTGGAAGGCATTTGGTGCAGCTCCTCACATGGAGAGGAGAGGGGGCCCAG 4918

 16245470 CTGTCTCCAAGGCTTGTGTCAGGAGACATTCTGTCACCAGATGAGGACACAGTGCCCAAA 16245529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4919 CTGTCTCCAAGGCTTGTGTCAGGAGACATTCTGTCACCAGATGAGGACACAGTGCCCAAA 4978

 16245530 AGACAGAAAAGGGTCTTTAAGAGCTCTTATAAAAAAAAAAAAGTGGGGTGGGAGTGGTGA 16245589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4979 AGACAGAAAAGGGTCTTTAAGAGCTCTTATAAAAAAAAAAAAGTGGGGTGGGAGTGGTGA 5038

 16245590 GTGAACAGTGCAGTAAGCCACAAATCAGCTCTTTCAAAGAGCCGTAGCCTCCTCCACACC 16245649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5039 GTGAACAGTGCAGTAAGCCACAAATCAGCTCTTTCAAAGAGCCGTAGCCTCCTCCACACC 5098

 16245650 CTGGCCAAGGAATTCAGAGCCTGCTGACCAGCCTTTGTTCCCTGTCCCTGCCTAGCAGGT 16245709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     5099 CTGGCCAAGGAATTCAGAGCCTGCTGACCAGCCTTTGTTCTCTGTCCCTGCCTAGCAGGT 5158

 16245710 TCCCACTAGCCATGTGGCAACTTTATTTGAATTGGTAGAAATCCCTTCCTCATGACCATT 16245769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5159 TCCCACTAGCCATGTGGCAACTTTATTTGAATTGGTAGAAATCCCTTCCTCATGACCATT 5218

 16245770 CCTCCTGACTCCCATTCCTCAGAAAATTGGTCATAATATACTGATTTTATTAGAATAAGA 16245829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5219 CCTCCTGACTCCCATTCCTCAGAAAATTGGTCATAATATACTGATTTTATTAGAATAAGA 5278

 16245830 CATCTTAATGCCAACTGTCAGCAAGTTGTTGAAATAAAAATGCAAATTTACAGTAATGAT 16245889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5279 CATCTTAATGCCAACTGTCAGCAAGTTGTTGAAATAAAAATGCAAATTTACAGTAATGAT 5338

 16245890 AATATTAGAGATGTTCTCTTGGGTTGCACAGTGCGCAACTCCTGTAACTGTTCATAGCAA 16245949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5339 AATATTAGAGATGTTCTCTTGGGTTGCACAGTGCGCAACTCCTGTAACTGTTCATAGCAA 5398

 16245950 CCCTACATAGAGTCTCCCTATGGGCAACTGATTTTAGGGCAGCCCTGGGAGATGCTGATT 16246009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5399 CCCTACATAGAGTCTCCCTATGGGCAACTGATTTTAGGGCAGCCCTGGGAGATGCTGATT 5458

 16246010 GATGGCCAGTTTCTACACAAAGTAACAATGATGGGAATCAAGACTAGCTGTTGTATCCAG 16246069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5459 GATGGCCAGTTTCTACACAAAGTAACAATGATGGGAATCAAGACTAGCTGTTGTATCCAG 5518

 16246070 CTCTCAGCTGACTTGTGTTGACTGCCAGCTCTCATACCCAAGCCAAGCAGTGGAAGCCAT 16246129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5519 CTCTCAGCTGACTTGTGTTGACTGCCAGCTCTCATACCCAAGCCAAGCAGTGGAAGCCAT 5578

 16246130 ACCCCTGGAAGGATGAAGGTTTCTAAGGGGAAAGGGACAGTCTTGAAAGGGGCTGAAAGA 16246189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5579 ACCCCTGGAAGGATGAAGGTTTCTAAGGGGAAAGGGACAGTCTTGAAAGGGGCTGAAAGA 5638

 16246190 TGATATCATCTCAAGAAGCTGAACAAGTTATCTCTTACTTGAAAATGGGTCTGGTCCCTA 16246249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5639 TGATATCATCTCAAGAAGCTGAACAAGTTATCTCTTACTTGAAAATGGGTCTGGTCCCTA 5698

 16246250 TCTGCGAGACATCCGGTCCTTCAGGATCAGCCAGGGGTGCTATGGGGAGAAGCAATGTGG 16246309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5699 TCTGCGAGACATCCGGTCCTTCAGGATCAGCCAGGGGTGCTATGGGGAGAAGCAATGTGG 5758

 16246310 GGCAGGGAGAAGAACACCTCCCACTCTGCCCTTTGAAGGGTTAAATGATGGAAAGCAGTG 16246369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5759 GGCAGGGAGAAGAACACCTCCCACTCTGCCCTTTGAAGGGTTAAATGATGGAAAGCAGTG 5818

 16246370 TAAGAACCCCTTGTGCTTGTGCATGTGAGTCAGTGTGTGTGTGTAAGCATGTGAGAGTCT 16246429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5819 TAAGAACCCCTTGTGCTTGTGCATGTGAGTCAGTGTGTGTGTGTAAGCATGTGAGAGTCT 5878

 16246430 GAGTGTGGGGGGGAGCGAGCATGTGCGTGCGTGTGTGTGTGCGCGCGCATGTGCGCGTCA 16246489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5879 GAGTGTGGGGGGGAGCGAGCATGTGCGTGCGTGTGTGTGTGCGCGCGCATGTGCGCGTCA 5938

 16246490 AGGAGCAGCAGGAGGTCAGGATGCCTCCTGCCCCCCCAGAGGGAGCAGCCTTCTTTGGCT 16246549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5939 AGGAGCAGCAGGAGGTCAGGATGCCTCCTGCCCCCCCAGAGGGAGCAGCCTTCTTTGGCT 5998

 16246550 CAGGTGCCCCAAGGAAACTCTCCAGCAACCATCGTACTTCATACCCTTCAGCATGACACG 16246609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5999 CAGGTGCCCCAAGGAAACTCTCCAGCAACCATCGTACTTCATACCCTTCAGCATGACACG 6058

 16246610 TCCTCGTATCTGCCCCTGGAAAAGCCGATGCCAGTCCTGCGGTCACAACTGAGCAGCAAG 16246669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6059 TCCTCGTATCTGCCCCTGGAAAAGCCGATGCCAGTCCTGCGGTCACAACTGAGCAGCAAG 6118

 16246670 AGCACTGGGAAGGGAGAATTCAGAGCCTTCTGCTTCTAGTATAAGAGACTTTCCACAAAC 16246729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6119 AGCACTGGGAAGGGAGAATTCAGAGCCTTCTGCTTCTAGTATAAGAGACTTTCCACAAAC 6178

 16246730 ACCAAGAATACGCATGAACTTTCAAAATGGCTTGTGTATCATGGACCTTGAGGAACATCC 16246789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6179 ACCAAGAATACGCATGAACTTTCAAAATGGCTTGTGTATCATGGACCTTGAGGAACATCC 6238

 16246790 AGGCTCACGAGAATTAACAAGGAATGAGATAAACGAGGGCTTATTCTTTATTGTGGTAAA 16246849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6239 AGGCTCACGAGAATTAACAAGGAATGAGATAAACGAGGGCTTATTCTTTATTGTGGTAAA 6298

 16246850 AGGTTATGGGAAGCTTGAAACTACAGTTAGCTCTTGAATATCTGGACAGTAATGTATTCG 16246909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6299 AGGTTATGGGAAGCTTGAAACTACAGTTAGCTCTTGAATATCTGGACAGTAATGTATTCG 6358

 16246910 TTGATCTCACGTATTTCAGTGAACCAGTCTTTGTTGGCAGCTTGACTCCTTCTGTTTGCC 16246969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6359 TTGATCTCACGTATTTCAGTGAACCAGTCTTTGTTGGCAGCTTGACTCCTTCTGTTTGCC 6418

 16246970 TTTTGAAACATAAGCACTTGATCTCCTGGAACTTAGGCTCAACATAGGATCAACCTTGTA 16247029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6419 TTTTGAAACATAAGCACTTGATCTCCTGGAACTTAGGCTCAACATAGGATCAACCTTGTA 6478

 16247030 CCTGCCTGAGGGTTAAAACTCAATTCACAGGTGAGGGACTGACGAAGTAAGCAGACACTT 16247089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6479 CCTGCCTGAGGGTTAAAACTCAATTCACAGGTGAGGGACTGACGAAGTAAGCAGACACTT 6538

 16247090 CCAGCTCCTTCCAAGTCAAACGAGGTCAGCTCGCTATTTTGCTTGACGTGAATTCCAAGA 16247149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6539 CCAGCTCCTTCCAAGTCAAACGAGGTCAGCTCGCTATTTTGCTTGACGTGAATTCCAAGA 6598

 16247150 ACACCAGACACATCGGTAGGTACAAAACCACAAAGCTAAATAGAAGACTGTGGGTTTTTT 16247209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6599 ACACCAGACACATCGGTAGGTACAAAACCACAAAGCTAAATAGAAGACTGTGGGTTTTTT 6658

 16247210 ATTTGAATTAATCACCGTTTTTGAGTCAGTAGACTACAGTTAGTAATTTAGTCCTGCTAG 16247269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6659 ATTTGAATTAATCACCGTTTTTGAGTCAGTAGACTACAGTTAGTAATTTAGTCCTGCTAG 6718

 16247270 GCAGCCACTGTGGTCCATGGGAATAAAGACCAAAATAGAAAACACTCCTCACTTCATTCA 16247329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6719 GCAGCCACTGTGGTCCATGGGAATAAAGACCAAAATAGAAAACACTCCTCACTTCATTCA 6778

 16247330 CTGACATTTTATTCTTTATCTCTATCCAAAATGTACTCAGGGAAGCTCATGATTAATCAC 16247389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6779 CTGACATTTTATTCTTTATCTCTATCCAAAATGTACTCAGGGAAGCTCATGATTAATCAC 6838

 16247390 TCTTGTATACAGTTAAAATAGAGGAAAAAGAAGATTTCAGAAAGGAAAAGAGGGTATTGG 16247449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6839 TCTTGTATACAGTTAAAATAGAGGAAAAAGAAGATTTCAGAAAGGAAAAGAGGGTATTGG 6898

 16247450 GAATCAGGGGTAATACAGTTATTAGAAGTGAGTTTTACATGTGACTCTGAGCTTCCAGAA 16247509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6899 GAATCAGGGGTAATACAGTTATTAGAAGTGAGTTTTACATGTGACTCTGAGCTTCCAGAA 6958

 16247510 AGACAAAACAAAAAGAGAAACATAATGAATTTTAGAATTCTCATTTTCTAATAAAAAGCA 16247569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6959 AGACAAAACAAAAAGAGAAACATAATGAATTTTAGAATTCTCATTTTCTAATAAAAAGCA 7018

 16247570 ACGTACTCCTTTGTTAAGAAGTACACAGCACAGGCTGGGTGCAGTGGCTCATACCTGTAA 16247629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7019 ACGTACTCCTTTGTTAAGAAGTACACAGCACAGGCTGGGTGCAGTGGCTCATACCTGTAA 7078

 16247630 TCTCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCTGGCAGATCACTTTGAGCTCAGGAGTTCGAGACTA 16247689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7079 TCTCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCTGGCAGATCACTTTGAGCTCAGGAGTTCGAGACTA 7138

 16247690 GCCTCAACAACATGGCGAAATCCCATTTCTACACGCACACACACCCCCACACTAGCCGGG 16247749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7139 GCCTCAACAACATGGCGAAATCCCATTTCTACACGCACACACACCCCCACACTAGCCGGG 7198

 16247750 CATGGTGGCTCATGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGGAGCTGAGGCTGAAGAATCCTTGG 16247809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7199 CATGGTGGCTCATGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGGAGCTGAGGCTGAAGAATCCTTGG 7258

 16247810 GCCTGGGAAGTGGAGGTTGCAGTGAGCGCAGATTGTGCCACTGCACTCCAGTCTGGGCGA 16247869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7259 GCCTGGGAAGTGGAGGTTGCAGTGAGCGCAGATTGTGCCACTGCACTCCAGTCTGGGCGA 7318

 16247870 CAGAGTGAGACCATTTAAAAAAAAAAAAAGGCCGGGCGCGATGGTTCACGCCTGTAATCC 16247929
          |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7319 CAGAGTGAGACCATTT-AAAAAAAAAAAAGGCCGGGCGCGATGGTTCACGCCTGTAATCC 7377

 16247930 CCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTTGGGGGATCACTAGGTCAGGAGATCGAGACCATCC 16247987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7378 CCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTTGGGGGATCACTAGGTCAGGAGATCGAGACCATCC 7435

Alignment time is 9.13998 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [16229408,16251209] =>     21802 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    7620] =>      7620 nucs 'mol-32-288a-104357_7620'

Score:        7485
Aligned:      7629        nucs
Identic:      7611 (100%) nucs =>      4621 (100%)      2990 (100%)
Gaps:            9 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [16240410,16245044] EXCISED REGION [16245055,16248048]
 second seq =>  [       1,    4628] EXCISED REGION [    4629,    7620]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        10 nucs [16245045,16245054]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>        12 nucs [16245046,16245057]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [16245045,16245045] to [16245055,16245055]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 16240410 TACTTGTATCCACAGTTAAGGCCACCTCTGGGCTGGGGAACTGGGGGGGAAATTCTTGCT 16240469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TACTTGTATCCACAGTTAAGGCCACCTCTGGGCTGGGGAACTGGGGGGGAAATTCTTGCT 60

 16240470 TTTTGGCTCAGTTCTGTTCAATGCACATGTACTGAGTGCCTACTGTGGGCCAGGCCCTGC 16240529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTTGGCTCAGTTCTGTTCAATGCACATGTACTGAGTGCCTACTGTGGGCCAGGCCCTGC 120

 16240530 ACTAAGGGTTAGAGCAGAAGAGATGCATTAGGTACAACCCCTGTCCTTGGGGAGATCTTA 16240589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACTAAGGGTTAGAGCAGAAGAGATGCATTAGGTACAACCCCTGTCCTTGGGGAGATCTTA 180

 16240590 GTCCACTGGCCTGGGGGGACTCCCCATTTCCAAGACTTCATGGAGACCACTGCTTCTCTG 16240649
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTCCACTGGCCTGGGGGGACTCCCCGTTTCCAAGACTTCATGGAGACCACTGCTTCTCTG 240

 16240650 TGAACACATTGTTCCTTCCATCTCCACTGGCTTGTTCCTCTTGGTGTGTGTGTACACAGA 16240709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGAACACATTGTTCCTTCCATCTCCACTGGCTTGTTCCTCTTGGTGTGTGTGTACACAGA 300

 16240710 CATGCACACACACACACACATGCACTCACACACACAATCAAGTTATTCTTATCTTAAACA 16240769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CATGCACACACACACACACATGCACTCACACACACAATCAAGTTATTCTTATCTTAAACA 360

 16240770 CAAAACCTAACAAGCTTCTCTCATCCTTTCCGTCATCTTCTTAGGCCTCTTTTTCTCCCT 16240829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CAAAACCTAACAAGCTTCTCTCATCCTTTCCGTCATCTTCTTAGGCCTCTTTTTCTCCCT 420

 16240830 TCCCCTATAGAATCAACCTTCCTAACCGTCTGGACTCTTGGTCTCAGTTTTTCATCTTCC 16240889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCCCCTATAGAATCAACCTTCCTAACCGTCTGGACTCTTGGTCTCAGTTTTTCATCTTCC 480

 16240890 GTTTTCTCTCCCGGACCCACTGTGTTGCAGACTCCCCTATCAACTGCAATGAGATCTCTT 16240949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTTTTCTCTCCCGGACCCACTGTGTTGCAGACTCCCCTATCAACTGCAATGAGATCTCTT 540

 16240950 TGACCAGCACCACCAATCTCCTACCAGCTGCCAAATTTAATGGAGCCTTTTGCCTTTGAC 16241009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGACCAGCACCACCAATCTCCTACCAGCTGCCAAATTTAATGGAGCCTTTTGCCTTTGAC 600

 16241010 TTCCTTGACCACTGTCTTAGGTCAGGTTTCCTGAAAGCAGGGCCTGAGATGGAGATTCAC 16241069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTCCTTGACCACTGTCTTAGGTCAGGTTTCCTGAAAGCAGGGCCTGAGATGGAGATTCAC 660

 16241070 GTGCATTTGATTTTTTTGAGGGTGTACTCTCAGGGGAAATCTGTAGGGGAGTGAGTGATA 16241129
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GTGCATGTGATTTTTTTGAGGGTGTACTCTCAGGGGAAATCTGTAGGGGAGTGAGTGATA 720

 16241130 CAGAAGAGAGAGAGGGAAGAGCTGAACAAATATGTGGTTTCAGGTGAAGTCCAGCCATAG 16241189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CAGAAGAGAGAGAGGGAAGAGCTGAACAAATATGTGGTTTCAGGTGAAGTCCAGCCATAG 780

 16241190 CCTGATCCCATGGGGGACTCTGGAGCACAGGCTGCACTGCGGGGTCTGTCTTGCTTTTTA 16241249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CCTGATCCCATGGGGGACTCTGGAGCACAGGCTGCACTGCGGGGTCTGTCTTGCTTTTTA 840

 16241250 CCCTGCAATGGTCAGTCATTGACCATGACTGGGGCTGGGGGCAGCATCCTGCATGACTGT 16241309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CCCTGCAATGGTCAGTCATTGACCATGACTGGGGCTGGGGGCAGCATCCTGCATGACTGT 900

 16241310 CTGGCACCTGCAGCAGAGACCGTTTTAATACCCCAAGGCAAGTCTCCAGGGAAGGGTTAA 16241369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTGGCACCTGCAGCAGAGACCGTTTTAATACCCCAAGGCAAGTCTCCAGGGAAGGGTTAA 960

 16241370 GATTTCAGTTAGCACCCACAGCAGCTGGGGACATGCAAACCAAACCAAAACAGTTAAGGG 16241429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GATTTCAGTTAGCACCCACAGCAGCTGGGGACATGCAAACCAAACCAAAACAGTTAAGGG 1020

 16241430 GAGCTCAGGGAATCTGAGTAGGACACTATATTAGTCTGTTCTCACACTGCTATAAAGAAC 16241489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GAGCTCAGGGAATCTGAGTAGGACACTATATTAGTCTGTTCTCACACTGCTATAAAGAAC 1080

 16241490 TGCCTGAGACTAGGTAATTTATAAAGAAAGGAGGTTTAATTGACTCACAGTTTCGCATGG 16241549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGCCTGAGACTAGGTAATTTATAAAGAAAGGAGGTTTAATTGACTCACAGTTTCGCATGG 1140

 16241550 CTGGGGAGGCCTCAGGAAACTTACAATCATGGTGGAAGGGGAAGCATGTCTTACATGGCA 16241609
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTGGGGAGGCCTCAGGAAACTTACAATCACGGTGGAAGGGGAAGCATGTCTTACATGGCA 1200

 16241610 GCAAGTGAGAGAAAGAGAGAGAGAGAGGAGGAAAAACTATCAAACACTTATATAATCATC 16241669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GCAAGTGAGAGAAAGAGAGAGAGAGAGGAGGAAAAACTATCAAACACTTATATAATCATC 1260

 16241670 AGATCTCATGAGAACTCACTATCACGAGAACAGCATGGGGGAAACTGCCCACATGATCCA 16241729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AGATCTCATGAGAACTCACTATCACGAGAACAGCATGGGGGAAACTGCCCACATGATCCA 1320

 16241730 ATCACCTCCCACCAGGTCCCTCCCTCGCCACATAGGGATTATGGGGATTACCACTCAAGA 16241789
          |||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||
     1321 ATCACCTCCCACCAGGTCCCTCCCTCGACACATAGGGATTATGGGGATTACAACTCAAGA 1380

 16241790 TGAGATCTGGGTGGGGACAAAGAGCCAAACCATATCAGACACCAACAGTATCTGCTACAT 16241849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TGAGATCTGGGTGGGGACAAAGAGCCAAACCATATCAGACACCAACAGTATCTGCTACAT 1440

 16241850 TCTTGCTGCTGCATTTGGAGAATGTTAGCAAGTTCTCCCCTTTCCTGGTTTTCTGACACC 16241909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TCTTGCTGCTGCATTTGGAGAATGTTAGCAAGTTCTCCCCTTTCCTGGTTTTCTGACACC 1500

 16241910 ATCCCTCTAATTTTTACTGGAGAGAATCATGGCCCACCCCAACCTAACCAAGCATCTTAC 16241969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATCCCTCTAATTTTTACTGGAGAGAATCATGGCCCACCCCAACCTAACCAAGCATCTTAC 1560

 16241970 ATCTCAGCAACAACCACACTGTAGTAATGTTTTCGGTTCTTAGGACCCAGGTGCTCACCA 16242029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ATCTCAGCAACAACCACACTGTAGTAATGTTTTCGGTTCTTAGGACCCAGGTGCTCACCA 1620

 16242030 CAGCTTCCAAAAGAGAGTTGCTGACGATTGTCTTAGTCACAATCTCATCGGTTGTGGCAT 16242089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CAGCTTCCAAAAGAGAGTTGCTGACGATTGTCTTAGTCACAATCTCATCGGTTGTGGCAT 1680

 16242090 TTGTCATTCCACTGACCACAACCCTGTTGATTCCAGGACAACTCAAGTCTGCTCTCAGCG 16242149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTGTCATTCCACTGACCACAACCCTGTTGATTCCAGGACAACTCAAGTCTGCTCTCAGCG 1740

 16242150 AATATGTGGCCAGGCTGGAGGGGGTGAAGTTACTCAGGAGCAACAAGAGGCTGGGTGCCA 16242209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AATATGTGGCCAGGCTGGAGGGGGTGAAGTTACTCAGGAGCAACAAGAGGCTGGGTGCCA 1800

 16242210 TCAGGGCCCGGATGCTGGGGGCCACCAGAGCCACCGGGGATGTGCTCGTCTTCATGGATG 16242269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TCAGGGCCCGGATGCTGGGGGCCACCAGAGCCACCGGGGATGTGCTCGTCTTCATGGATG 1860

 16242270 CCCACTGCGAGTGCCACCCAGGCTGGCTGGAGCCCCTCCTCAGCAGAATAGCTGGTGACA 16242329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CCCACTGCGAGTGCCACCCAGGCTGGCTGGAGCCCCTCCTCAGCAGAATAGCTGGTGACA 1920

 16242330 GGTAACTTATTCCCTGGGCTTGCAAAGCAAGACATGGAACTGGGAGAAACAGTCTACAGC 16242389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GGTAACTTATTCCCTGGGCTTGCAAAGCAAGACATGGAACTGGGAGAAACAGTCTACAGC 1980

 16242390 ATCAGCCACTCACAGAGCAACCCACCTATTAATTCCTGAATCTCCATTAGAGAGTGATAT 16242449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ATCAGCCACTCACAGAGCAACCCACCTATTAATTCCTGAATCTCCATTAGAGAGTGATAT 2040

 16242450 ATTCCCTTCGGGTTTTCAGATGTGTAAGTTTTTTAAGACTATAGAGTTAGAGTTGGAAAG 16242509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ATTCCCTTCGGGTTTTCAGATGTGTAAGTTTTTTAAGACTATAGAGTTAGAGTTGGAAAG 2100

 16242510 GAGGTTAGAGGTCTTCATCTACCTTGCTTTATAGATAAAGAAACCGAGGCCTGGAGAACA 16242569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GAGGTTAGAGGTCTTCATCTACCTTGCTTTATAGATAAAGAAACCGAGGCCTGGAGAACA 2160

 16242570 GCTTCTATGAGGTTGCAAATACTTAAAATTGTATTAAATTGCATGACGAGGGTAACACCT 16242629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GCTTCTATGAGGTTGCAAATACTTAAAATTGTATTAAATTGCATGACGAGGGTAACACCT 2220

 16242630 TACCATAGCTATCATTGCCTTTGGTGAAAATTTGGCAATTTTTTTTTCTTTTTCTTTTTC 16242689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TACCATAGCTATCATTGCCTTTGGTGAAAATTTGGCAATTTTTTTTTCTTTTTCTTTTTC 2280

 16242690 TTTTTCTTTTTCTTTTTGTGATGGCGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGCGGG 16242749
          |||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TTTTTCTTTTT------GTGATGGCGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGCGGG 2334

 16242750 GCGATCTCGGCTCACTGCAAGCTGCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCTTCAGCC 16242809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2335 GCGATCTCGGCTCACTGCAAGCTGCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCTTCAGCC 2394

 16242810 TCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACCACACCCGGCTAATTTTTTGTATTTTT 16242869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2395 TCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACCACACCCGGCTAATTTTTTGTATTTTT 2454

 16242870 AGTAGAGAAGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACTTCGTGATC 16242929
          ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
     2455 AGTAGAGAAGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAG-ATGGTCTCGATCTCCTGACTTCGTGATC 2513

 16242930 CGCCCTCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCTGGCCGA 16242989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2514 CGCCCTCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCTGGCCGA 2573

 16242990 AAATTCGTCAATTTTAATCAAGCTTGTAACATAACCTGGGGAAAAAGTCTCTGAACTACA 16243049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2574 AAATTCGTCAATTTTAATCAAGCTTGTAACATAACCTGGGGAAAAAGTCTCTGAACTACA 2633

 16243050 CTAGGCCGTAGATTACTCACCCATAAAAAGAAAACATTATGTTCTCTGATCACTAAACAG 16243109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2634 CTAGGCCGTAGATTACTCACCCATAAAAAGAAAACATTATGTTCTCTGATCACTAAACAG 2693

 16243110 CATTCTTTGTTTCCCCAGTTTATATAAGGGGTCCCTAATTTTCTACCTAAGGCCAGTCCT 16243169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2694 CATTCTTTGTTTCCCCAGTTTATATAAGGGGTCCCTAATTTTCTACCTAAGGCCAGTCCT 2753

 16243170 TGGAAATGTGAAGTTGGAGAGGACTGCATTACATTACCCTGTAGACAAGCATCTTAACAT 16243229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2754 TGGAAATGTGAAGTTGGAGAGGACTGCATTACATTACCCTGTAGACAAGCATCTTAACAT 2813

 16243230 TTTTCTTGATCATTTCTCTGCTCTCCTTCCCCCATCTGACCGTCAATCTCTTTCTCACTT 16243289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2814 TTTTCTTGATCATTTCTCTGCTCTCCTTCCCCCATCTGACCGTCAATCTCTTTCTCACTT 2873

 16243290 CCTTGCTCAAGACAAACAGTTCCTAAACATGTCTAGTCAAACATTACCCTCAATCTGAAT 16243349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2874 CCTTGCTCAAGACAAACAGTTCCTAAACATGTCTAGTCAAACATTACCCTCAATCTGAAT 2933

 16243350 ATCCTACCCAGGAAAACTGAAACCTGGTGGCTGGCCCACCTTGGACCACCTCAGGCATAC 16243409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2934 ATCCTACCCAGGAAAACTGAAACCTGGTGGCTGGCCCACCTTGGACCACCTCAGGCATAC 2993

 16243410 CACTTGGAGCTCATGTAGGCATGTAGCAGAGTAGAACCACAATCAATAATTGTTTGATGG 16243469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2994 CACTTGGAGCTCATGTAGGCATGTAGCAGAGTAGAACCACAATCAATAATTGTTTGATGG 3053

 16243470 TGCCCAGCAAGACAGGACCAATGCTAGAACCAAGCCTTATGACTTCTACCCATGATGAAT 16243529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3054 TGCCCAGCAAGACAGGACCAATGCTAGAACCAAGCCTTATGACTTCTACCCATGATGAAT 3113

 16243530 GTTTATTATCTCACCTGAAGTTAGGGATGATCAATCAAATATAAGAAAAAATTCCTGGAC 16243589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3114 GTTTATTATCTCACCTGAAGTTAGGGATGATCAATCAAATATAAGAAAAAATTCCTGGAC 3173

 16243590 CAGATCGGAATGAATCCTGGAGACATAGGAGTTACCATCAGCCAAATGGAGATGGTTTCA 16243649
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3174 CAGATCAGAATGAATCCTGGAGACATAGGAGTTACCATCAGCCAAATGGAGATGGTTTCA 3233

 16243650 AACGTTCAAATGACAGAAAGTAAATTGTTAATAGTTCAGCATTCCATTTTAACAAAGAAG 16243709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3234 AACGTTCAAATGACAGAAAGTAAATTGTTAATAGTTCAGCATTCCATTTTAACAAAGAAG 3293

 16243710 AACAATCGGAACTCAAGTGAGATCAAGACAGATTAATGTTTCCCAGTTTCATGAGACAGA 16243769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3294 AACAATCGGAACTCAAGTGAGATCAAGACAGATTAATGTTTCCCAGTTTCATGAGACAGA 3353

 16243770 TTGTCTCTTGACTCACATCTCATAAGAAAAGAAGACACACATAAATTCAGCACTAGGACA 16243829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3354 TTGTCTCTTGACTCACATCTCATAAGAAAAGAAGACACACATAAATTCAGCACTAGGACA 3413

 16243830 AGAACTAGGACACAAAAATGCACAAGCTGGCCAGGCACGGTGGCTCATGCCTGTAATCCC 16243889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3414 AGAACTAGGACACAAAAATGCACAAGCTGGCCAGGCACGGTGGCTCATGCCTGTAATCCC 3473

 16243890 AGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGACGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTG 16243949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3474 AGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGACGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTG 3533

 16243950 GCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAACTGGGTGTGGTAGCG 16244009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3534 GCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAACTGGGTGTGGTAGCG 3593

 16244010 TGCGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGAATCACTTGAACCTGGGAG 16244069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3594 TGCGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGAATCACTTGAACCTGGGAG 3653

 16244070 GCAGAGGTTAAAGTGAGCCAAGATCGTGCTACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAG 16244129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3654 GCAGAGGTTAAAGTGAGCCAAGATCGTGCTACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAG 3713

 16244130 ACTCCATCCCGAAAAGAAAAGAAAATGCACAAGCCCTCCAAAGCTGCCATTTTTGATTCT 16244189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3714 ACTCCATCCCGAAAAGAAAAGAAAATGCACAAGCCCTCCAAAGCTGCCATTTTTGATTCT 3773

 16244190 GTTTCATGCAAAGGGCCATCTTGAAATCAGAGCGATGTCTATCATTGGAGTCAGACTCTG 16244249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3774 GTTTCATGCAAAGGGCCATCTTGAAATCAGAGCGATGTCTATCATTGGAGTCAGACTCTG 3833

 16244250 AAGTTGATCTTGCCCATTTCCCATCTGATTCCCATTCTGGTATCACAGACAGGTGGCTCT 16244309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3834 AAGTTGATCTTGCCCATTTCCCATCTGATTCCCATTCTGGTATCACAGACAGGTGGCTCT 3893

 16244310 CAGAGGGACCATGAAGATCATCTTGTCTTACCTCATGATTTCGCTATCGAGAACCCTGAG 16244369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3894 CAGAGGGACCATGAAGATCATCTTGTCTTACCTCATGATTTCGCTATCGAGAACCCTGAG 3953

 16244370 TTCCAGGAAAGTAAAAAAGACCCCTCAGGGTCACACAGCCATTTGACAACTGGGCTGTTT 16244429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3954 TTCCAGGAAAGTAAAAAAGACCCCTCAGGGTCACACAGCCATTTGACAACTGGGCTGTTT 4013

 16244430 TCTATGCTGCTTTTATGCAGACATTTAGAAATGCAGTAATTAACATCATTAAACTTTATG 16244489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4014 TCTATGCTGCTTTTATGCAGACATTTAGAAATGCAGTAATTAACATCATTAAACTTTATG 4073

 16244490 TATGTGTAACCCTCGCAGACTTCTTTCATATGCCTTCTTTAATGACCCCCATGAGAGGCC 16244549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4074 TATGTGTAACCCTCGCAGACTTCTTTCATATGCCTTCTTTAATGACCCCCATGAGAGGCC 4133

 16244550 TCAGGCAGGTATTTTAGCTTCTGTTTTATAGGGGGAGAAATTGAGGCTCAGAGAGGTGAC 16244609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4134 TCAGGCAGGTATTTTAGCTTCTGTTTTATAGGGGGAGAAATTGAGGCTCAGAGAGGTGAC 4193

 16244610 ATGATATGTAAGGGCAGATAATTCGTAGCTGAGTCAGATTTTCTGACTCTGGGTCCAGTG 16244669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4194 ATGATATGTAAGGGCAGATAATTCGTAGCTGAGTCAGATTTTCTGACTCTGGGTCCAGTG 4253

 16244670 CTGTTTTTATTGTGTACATTTTCTTTTTAAGAGTTGGAGAAGCTGGTCAGGGAGGAACAT 16244729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4254 CTGTTTTTATTGTGTACATTTTCTTTTTAAGAGTTGGAGAAGCTGGTCAGGGAGGAACAT 4313

 16244730 TAGTCATCCCTAACCCCACAACTGGTTATGAGACATGTGTTACCTGCTGCTGTGAGTCCC 16244789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4314 TAGTCATCCCTAACCCCACAACTGGTTATGAGACATGTGTTACCTGCTGCTGTGAGTCCC 4373

 16244790 TCGTATCTGCTTCTCACATCGGGGCCCCATTTCCCAGAGCTAGGTGAAGGTAGAAAGACG 16244849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4374 TCGTATCTGCTTCTCACATCGGGGCCCCATTTCCCAGAGCTAGGTGAAGGTAGAAAGACG 4433

 16244850 TGGCACTACCTCAGTGTCCTAGGCTAGAAAGAAAATGAGGCTCCCTGGGAAGCCCTTTGT 16244909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4434 TGGCACTACCTCAGTGTCCTAGGCTAGAAAGAAAATGAGGCTCCCTGGGAAGCCCTTTGT 4493

 16244910 GATTAAGAGACATTCTAGTTTCCTGTGCCCTTCCCCTCTCCTCTTTTCCTCTCCTGTCTG 16244969
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     4494 GATTAAGAGACATTCTAGTTTCCTGTGCCCTTCCCCTCTCCTCTTTTCCCCTCCTGTCTG 4553

 16244970 TCTCTGCCTCTCTACCTCTCTCACGGTCTTTGTCTCTCTCTGTCTCTTGGTCACTCATTC 16245029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4554 TCTCTGCCTCTCTACCTCTCTCACGGTCTTTGTCTCTCTCTGTCTCTTGGTCACTCATTC 4613

 16245030 TCTCTCTCTCTCTCT 16245044
          |||||||||||||||
     4614 TCTCTCTCTCTCTCT 4628

EXCISED REGION

 16245055 CACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAGTGGGCCTCTGATCCTGG 16245114
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||
     4629 CACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAC--TGGGCCTCTGATCCTGG 4686

 16245115 TGTGTTACTGGCTTGCCTTCCTCTTTGGGTTCCATCTCTTCTGCGTGATGTGACCACATT 16245174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4687 TGTGTTACTGGCTTGCCTTCCTCTTTGGGTTCCATCTCTTCTGCGTGATGTGACCACATT 4746

 16245175 TTCATCATCTCTACACCTCATTCATGGCTTCTTGTCCACTGTGTTTTCTCTGGGCCCTAG 16245234
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     4747 TTCATCATCTCTACACCTCATTCATGGCTTCTTGTCCACTGTGTTTTCTCTGGGCCCCAG 4806

 16245235 TGTCCAGCTTTTAGGCACTGGCAGGTGAGGATCTGGAAGAAAAGCCACCTTTCTGGTATC 16245294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4807 TGTCCAGCTTTTAGGCACTGGCAGGTGAGGATCTGGAAGAAAAGCCACCTTTCTGGTATC 4866

 16245295 TGAGTCCCACTCTCTCCACTCCACCTGGCAACGCTCTATGAGCTGTGGCAGGGAGAGCAG 16245354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4867 TGAGTCCCACTCTCTCCACTCCACCTGGCAACGCTCTATGAGCTGTGGCAGGGAGAGCAG 4926

 16245355 CCTCATTCAGTGTGTGCTTTACTCCCCCAGGGACGTCGCCCACGTGCCTCATACAAAGCC 16245414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4927 CCTCATTCAGTGTGTGCTTTACTCCCCCAGGGACGTCGCCCACGTGCCTCATACAAAGCC 4986

 16245415 AAGCTGTGGAAGGCATTTGGTGCAGCTCCTCACATGGAGAGGAGAGGGGGCCCAGCTGTC 16245474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4987 AAGCTGTGGAAGGCATTTGGTGCAGCTCCTCACATGGAGAGGAGAGGGGGCCCAGCTGTC 5046

 16245475 TCCAAGGCTTGTGTCAGGAGACATTCTGTCACCAGATGAGGACACAGTGCCCAAAAGACA 16245534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5047 TCCAAGGCTTGTGTCAGGAGACATTCTGTCACCAGATGAGGACACAGTGCCCAAAAGACA 5106

 16245535 GAAAAGGGTCTTTAAGAGCTCTTATAAAAAAAAAAAAGTGGGGTGGGAGTGGTGAGTGAA 16245594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5107 GAAAAGGGTCTTTAAGAGCTCTTATAAAAAAAAAAAAGTGGGGTGGGAGTGGTGAGTGAA 5166

 16245595 CAGTGCAGTAAGCCACAAATCAGCTCTTTCAAAGAGCCGTAGCCTCCTCCACACCCTGGC 16245654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5167 CAGTGCAGTAAGCCACAAATCAGCTCTTTCAAAGAGCCGTAGCCTCCTCCACACCCTGGC 5226

 16245655 CAAGGAATTCAGAGCCTGCTGACCAGCCTTTGTTCCCTGTCCCTGCCTAGCAGGTTCCCA 16245714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5227 CAAGGAATTCAGAGCCTGCTGACCAGCCTTTGTTCCCTGTCCCTGCCTAGCAGGTTCCCA 5286

 16245715 CTAGCCATGTGGCAACTTTATTTGAATTGGTAGAAATCCCTTCCTCATGACCATTCCTCC 16245774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5287 CTAGCCATGTGGCAACTTTATTTGAATTGGTAGAAATCCCTTCCTCATGACCATTCCTCC 5346

 16245775 TGACTCCCATTCCTCAGAAAATTGGTCATAATATACTGATTTTATTAGAATAAGACATCT 16245834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5347 TGACTCCCATTCCTCAGAAAATTGGTCATAATATACTGATTTTATTAGAATAAGACATCT 5406

 16245835 TAATGCCAACTGTCAGCAAGTTGTTGAAATAAAAATGCAAATTTACAGTAATGATAATAT 16245894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5407 TAATGCCAACTGTCAGCAAGTTGTTGAAATAAAAATGCAAATTTACAGTAATGATAATAT 5466

 16245895 TAGAGATGTTCTCTTGGGTTGCACAGTGCGCAACTCCTGTAACTGTTCATAGCAACCCTA 16245954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5467 TAGAGATGTTCTCTTGGGTTGCACAGTGCGCAACTCCTGTAACTGTTCATAGCAACCCTA 5526

 16245955 CATAGAGTCTCCCTATGGGCAACTGATTTTAGGGCAGCCCTGGGAGATGCTGATTGATGG 16246014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5527 CATAGAGTCTCCCTATGGGCAACTGATTTTAGGGCAGCCCTGGGAGATGCTGATTGATGG 5586

 16246015 CCAGTTTCTACACAAAGTAACAATGATGGGAATCAAGACTAGCTGTTGTATCCAGCTCTC 16246074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5587 CCAGTTTCTACACAAAGTAACAATGATGGGAATCAAGACTAGCTGTTGTATCCAGCTCTC 5646

 16246075 AGCTGACTTGTGTTGACTGCCAGCTCTCATACCCAAGCCAAGCAGTGGAAGCCATACCCC 16246134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5647 AGCTGACTTGTGTTGACTGCCAGCTCTCATACCCAAGCCAAGCAGTGGAAGCCATACCCC 5706

 16246135 TGGAAGGATGAAGGTTTCTAAGGGGAAAGGGACAGTCTTGAAAGGGGCTGAAAGATGATA 16246194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5707 TGGAAGGATGAAGGTTTCTAAGGGGAAAGGGACAGTCTTGAAAGGGGCTGAAAGATGATA 5766

 16246195 TCATCTCAAGAAGCTGAACAAGTTATCTCTTACTTGAAAATGGGTCTGGTCCCTATCTGC 16246254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5767 TCATCTCAAGAAGCTGAACAAGTTATCTCTTACTTGAAAATGGGTCTGGTCCCTATCTGC 5826

 16246255 GAGACATCCGGTCCTTCAGGATCAGCCAGGGGTGCTATGGGGAGAAGCAATGTGGGGCAG 16246314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5827 GAGACATCCGGTCCTTCAGGATCAGCCAGGGGTGCTATGGGGAGAAGCAATGTGGGGCAG 5886

 16246315 GGAGAAGAACACCTCCCACTCTGCCCTTTGAAGGGTTAAATGATGGAAAGCAGTGTAAGA 16246374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5887 GGAGAAGAACACCTCCCACTCTGCCCTTTGAAGGGTTAAATGATGGAAAGCAGTGTAAGA 5946

 16246375 ACCCCTTGTGCTTGTGCATGTGAGTCAGTGTGTGTGTGTAAGCATGTGAGAGTCTGAGTG 16246434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5947 ACCCCTTGTGCTTGTGCATGTGAGTCAGTGTGTGTGTGTAAGCATGTGAGAGTCTGAGTG 6006

 16246435 TGGGGGGGAGCGAGCATGTGCGTGCGTGTGTGTGTGCGCGCGCATGTGCGCGTCAAGGAG 16246494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     6007 TGGGGGGGAGCGAGCATGTGCGTGCGTGTGTGTGCGCGCGCGCATGTGCGCGTCAAGGAG 6066

 16246495 CAGCAGGAGGTCAGGATGCCTCCTGCCCCCCCAGAGGGAGCAGCCTTCTTTGGCTCAGGT 16246554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6067 CAGCAGGAGGTCAGGATGCCTCCTGCCCCCCCAGAGGGAGCAGCCTTCTTTGGCTCAGGT 6126

 16246555 GCCCCAAGGAAACTCTCCAGCAACCATCGTACTTCATACCCTTCAGCATGACACGTCCTC 16246614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6127 GCCCCAAGGAAACTCTCCAGCAACCATCGTACTTCATACCCTTCAGCATGACACGTCCTC 6186

 16246615 GTATCTGCCCCTGGAAAAGCCGATGCCAGTCCTGCGGTCACAACTGAGCAGCAAGAGCAC 16246674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6187 GTATCTGCCCCTGGAAAAGCCGATGCCAGTCCTGCGGTCACAACTGAGCAGCAAGAGCAC 6246

 16246675 TGGGAAGGGAGAATTCAGAGCCTTCTGCTTCTAGTATAAGAGACTTTCCACAAACACCAA 16246734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6247 TGGGAAGGGAGAATTCAGAGCCTTCTGCTTCTAGTATAAGAGACTTTCCACAAACACCAA 6306

 16246735 GAATACGCATGAACTTTCAAAATGGCTTGTGTATCATGGACCTTGAGGAACATCCAGGCT 16246794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6307 GAATACGCATGAACTTTCAAAATGGCTTGTGTATCATGGACCTTGAGGAACATCCAGGCT 6366

 16246795 CACGAGAATTAACAAGGAATGAGATAAACGAGGGCTTATTCTTTATTGTGGTAAAAGGTT 16246854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6367 CACGAGAATTAACAAGGAATGAGATAAACGAGGGCTTATTCTTTATTGTGGTAAAAGGTT 6426

 16246855 ATGGGAAGCTTGAAACTACAGTTAGCTCTTGAATATCTGGACAGTAATGTATTCGTTGAT 16246914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6427 ATGGGAAGCTTGAAACTACAGTTAGCTCTTGAATATCTGGACAGTAATGTATTCGTTGAT 6486

 16246915 CTCACGTATTTCAGTGAACCAGTCTTTGTTGGCAGCTTGACTCCTTCTGTTTGCCTTTTG 16246974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6487 CTCACGTATTTCAGTGAACCAGTCTTTGTTGGCAGCTTGACTCCTTCTGTTTGCCTTTTG 6546

 16246975 AAACATAAGCACTTGATCTCCTGGAACTTAGGCTCAACATAGGATCAACCTTGTACCTGC 16247034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6547 AAACATAAGCACTTGATCTCCTGGAACTTAGGCTCAACATAGGATCAACCTTGTACCTGC 6606

 16247035 CTGAGGGTTAAAACTCAATTCACAGGTGAGGGACTGACGAAGTAAGCAGACACTTCCAGC 16247094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6607 CTGAGGGTTAAAACTCAATTCACAGGTGAGGGACTGACGAAGTAAGCAGACACTTCCAGC 6666

 16247095 TCCTTCCAAGTCAAACGAGGTCAGCTCGCTATTTTGCTTGACGTGAATTCCAAGAACACC 16247154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6667 TCCTTCCAAGTCAAACGAGGTCAGCTCGCTATTTTGCTTGACGTGAATTCCAAGAACACC 6726

 16247155 AGACACATCGGTAGGTACAAAACCACAAAGCTAAATAGAAGACTGTGGGTTTTTTATTTG 16247214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6727 AGACACATCGGTAGGTACAAAACCACAAAGCTAAATAGAAGACTGTGGGTTTTTTATTTG 6786

 16247215 AATTAATCACCGTTTTTGAGTCAGTAGACTACAGTTAGTAATTTAGTCCTGCTAGGCAGC 16247274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6787 AATTAATCACCGTTTTTGAGTCAGTAGACTACAGTTAGTAATTTAGTCCTGCTAGGCAGC 6846

 16247275 CACTGTGGTCCATGGGAATAAAGACCAAAATAGAAAACACTCCTCACTTCATTCACTGAC 16247334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6847 CACTGTGGTCCATGGGAATAAAGACCAAAATAGAAAACACTCCTCACTTCATTCACTGAC 6906

 16247335 ATTTTATTCTTTATCTCTATCCAAAATGTACTCAGGGAAGCTCATGATTAATCACTCTTG 16247394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6907 ATTTTATTCTTTATCTCTATCCAAAATGTACTCAGGGAAGCTCATGATTAATCACTCTTG 6966

 16247395 TATACAGTTAAAATAGAGGAAAAAGAAGATTTCAGAAAGGAAAAGAGGGTATTGGGAATC 16247454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6967 TATACAGTTAAAATAGAGGAAAAAGAAGATTTCAGAAAGGAAAAGAGGGTATTGGGAATC 7026

 16247455 AGGGGTAATACAGTTATTAGAAGTGAGTTTTACATGTGACTCTGAGCTTCCAGAAAGACA 16247514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7027 AGGGGTAATACAGTTATTAGAAGTGAGTTTTACATGTGACTCTGAGCTTCCAGAAAGACA 7086

 16247515 AAACAAAAAGAGAAACATAATGAATTTTAGAATTCTCATTTTCTAATAAAAAGCAACGTA 16247574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7087 AAACAAAAAGAGAAACATAATGAATTTTAGAATTCTCATTTTCTAATAAAAAGCAACGTA 7146

 16247575 CTCCTTTGTTAAGAAGTACACAGCACAGGCTGGGTGCAGTGGCTCATACCTGTAATCTCA 16247634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7147 CTCCTTTGTTAAGAAGTACACAGCACAGGCTGGGTGCAGTGGCTCATACCTGTAATCTCA 7206

 16247635 GCACTTTGGGAGGCCAAGGCTGGCAGATCACTTTGAGCTCAGGAGTTCGAGACTAGCCTC 16247694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7207 GCACTTTGGGAGGCCAAGGCTGGCAGATCACTTTGAGCTCAGGAGTTCGAGACTAGCCTC 7266

 16247695 AACAACATGGCGAAATCCCATTTCTACACGCACACACACCCCCACACTAGCCGGGCATGG 16247754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7267 AACAACATGGCGAAATCCCATTTCTACACGCACACACACCCCCACACTAGCCGGGCATGG 7326

 16247755 TGGCTCATGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGGAGCTGAGGCTGAAGAATCCTTGGGCCTG 16247814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7327 TGGCTCATGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGGAGCTGAGGCTGAAGAATCCTTGGGCCTG 7386

 16247815 GGAAGTGGAGGTTGCAGTGAGCGCAGATTGTGCCACTGCACTCCAGTCTGGGCGACAGAG 16247874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7387 GGAAGTGGAGGTTGCAGTGAGCGCAGATTGTGCCACTGCACTCCAGTCTGGGCGACAGAG 7446

 16247875 TGAGACCATTTAAAAAAAAAAAAAGGCCGGGCGCGATGGTTCACGCCTGTAATCCCCAGC 16247934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7447 TGAGACCATTTAAAAAAAAAAAAAGGCCGGGCGCGATGGTTCACGCCTGTAATCCCCAGC 7506

 16247935 ACTTTGGGAGGCTGAGGTTGGGGGATCACTAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAA 16247994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7507 ACTTTGGGAGGCTGAGGTTGGGGGATCACTAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAA 7566

 16247995 CACGGTGAAAACCCGTGTATACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTTGTGGC 16248048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7567 CACGGTGAAAACCCGTGTATACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTTGTGGC 7620

Alignment time is 9.34488 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [16229408,16251209] =>     21802 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    4644] =>      4644 nucs 'mol-32-2ef1-134315_4644'

Score:        4495
Aligned:      4638        nucs
Identic:      4625 (100%) nucs =>      1596 (100%)      3029 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [16237550,16239149] EXCISED REGION [16239157,16242194]
 second seq =>  [       1,    1600] EXCISED REGION [    1608,    4644]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         7 nucs [16239150,16239156]
 second seq =>         7 nucs [1601,1607]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [16239149,16239151] to [16239156,16239158]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [16239150,16239151] to [16239155,16239156]
 second seq =>         1 nucs [1601,1601] to [1607,1607]

 16237550 CCTCCAGATGAGGATTAATGGGCAAGTAACTTATGAATGAAGAGCCACTGGGGAAACCAG 16237609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCTCCAGATGAGGATTAATGGGCAAGTAACTTATGAATGAAGAGCCACTGGGGAAACCAG 60

 16237610 TAAGGCAGTGGGGGCTGCAAGACAGAGAAGGAGAAAGAGCCCTGCAGGGGAAACAGCCCT 16237669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAAGGCAGTGGGGGCTGCAAGACAGAGAAGGAGAAAGAGCCCTGCAGGGGAAACAGCCCT 120

 16237670 GGGGAGGGTCTTGAGGGGTGTCGCCTCAGCCTGATCCCGTGGGGATCTCTCTCCCAGGTG 16237729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGGGAGGGTCTTGAGGGGTGTCGCCTCAGCCTGATCCCGTGGGGATCTCTCTCCCAGGTG 180

 16237730 CCACCCAGTCCAACAATCCTCTCTCCAAGACACTGAAGAATCACATAGGGCGGCCCTGTT 16237789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCACCCAGTCCAACAATCCTCTCTCCAAGACACTGAAGAATCACATAGGGCGGCCCTGTT 240

 16237790 GTGAGTGCTCACTGCCTCCTAGACCCTGGTGCAGCACTTTACACATACGCACATATGTGT 16237849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTGAGTGCTCACTGCCTCCTAGACCCTGGTGCAGCACTTTACACATACGCACATATGTGT 300

 16237850 ATCGGTCCTTCACTCATCATGGCTTAGACAGACCCACTCACTTTCCAGAGGAGGAAACTG 16237909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATCGGTCCTTCACTCATCATGGCTTAGACAGACCCACTCACTTTCCAGAGGAGGAAACTG 360

 16237910 GGGCCCAGAGAAGACAGCAGACTGGAGCGGAGTCAGCCAAAAGCAGCAGAGTCAGGCCCA 16237969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGGCCCAGAGAAGACAGCAGACTGGAGCGGAGTCAGCCAAAAGCAGCAGAGTCAGGCCCA 420

 16237970 GAGCCCAGACTTGCAGAACCTGCCTGTGTGCTTCCTCTCACAGGAACCTGGCTACTAGGG 16238029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GAGCCCAGACTTGCAGAACCTGCCTGTGTGCTTCCTCTCACAGGAACCTGGCTACTAGGG 480

 16238030 ACAGCCCTAAAAGAAGATGGAGACAGAGAAGCCCCCACTTGACTCGTAGGTCAGTGGCTC 16238089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACAGCCCTAAAAGAAGATGGAGACAGAGAAGCCCCCACTTGACTCGTAGGTCAGTGGCTC 540

 16238090 TCACGCTTGAGCATGCATCGGAATCACCTGGTGCGATTTTTAAAATACTACTGCAGGGCC 16238149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCACGCTTGAGCATGCATCGGAATCACCTGGTGCGATTTTTAAAATACTACTGCAGGGCC 600

 16238150 CACCCCCAGAGTTTCTGGTGATGGAGTGGGGCCGAAGAATTTGCATTTCTAACAAGCTCC 16238209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CACCCCCAGAGTTTCTGGTGATGGAGTGGGGCCGAAGAATTTGCATTTCTAACAAGCTCC 660

 16238210 CAGGTGATGCTGATGCTGCTGTTTTCTGTGGACCACACTCTGAGAACCTCTGCTCTAGTC 16238269
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
      661 CAGGTGATGCTGATGCTGCTGTTTTCTGTGGACCACACTTTGAGAACCTCTGCTCTAGTC 720

 16238270 TTTGGCTTGGGCGTGAGGCCTACATTTCTGGCACAACTAAATGACCTAGGGACACCCCTC 16238329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTTGGCTTGGGCGTGAGGCCTACATTTCTGGCACAACTAAATGACCTAGGGACACCCCTC 780

 16238330 CTGGCCTTCTGGGAAGATCAGAACGCTCTGAGGGAAGCCGAGCATTCACGTTTTTCTAAG 16238389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTGGCCTTCTGGGAAGATCAGAACGCTCTGAGGGAAGCCGAGCATTCACGTTTTTCTAAG 840

 16238390 GGGAATAATGGAGAAGGGCTAGGGTAGCCAGGTGCCTCTGTTAGTTCTTTCTACGGTCCT 16238449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GGGAATAATGGAGAAGGGCTAGGGTAGCCAGGTGCCTCTGTTAGTTCTTTCTACGGTCCT 900

 16238450 CACTCCAGGGATGGGCCTAGCCTGGCCATAGCAGTGAGTCAGATTAGCCAGAGGCTCTGG 16238509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CACTCCAGGGATGGGCCTAGCCTGGCCATAGCAGTGAGTCAGATTAGCCAGAGGCTCTGG 960

 16238510 GAACACCTGGGGTTCCTGGGTGCAGCTGGCTGCATATTAGGCAGGACTAATGAACAGGTG 16238569
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GAACACCTGGGGTTCCTGGGTACAGCTGGCTGCATATTAGGCAGGACTAATGAACAGGTG 1020

 16238570 CAGGACAGGGCTGGGTTGGCGGGTAAAGTGCCCAGAGACTCTCCAAACCCTCAAGTGGGG 16238629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CAGGACAGGGCTGGGTTGGCGGGTAAAGTGCCCAGAGACTCTCCAAACCCTCAAGTGGGG 1080

 16238630 CGGGGTCCGCCCAAGAGCACACCTGTGGTGAGGCCCCCACCATCTGATGAGCTGTGTTAC 16238689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CGGGGTCCGCCCAAGAGCACACCTGTGGTGAGGCCCCCACCATCTGATGAGCTGTGTTAC 1140

 16238690 GTCTGTGCCCCTCGGGAGTACGGAAAGTGGAGGAGCTGGGCCCCAGAGAAATGGGCTACC 16238749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GTCTGTGCCCCTCGGGAGTACGGAAAGTGGAGGAGCTGGGCCCCAGAGAAATGGGCTACC 1200

 16238750 CCAGAGCTGGCAGCCCCACCAGAGGGGATCTGGATCCCCTGCCAAGCAATTAAGCTGCCC 16238809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CCAGAGCTGGCAGCCCCACCAGAGGGGATCTGGATCCCCTGCCAAGCAATTAAGCTGCCC 1260

 16238810 CCTCCTGGCCAACTCCCCTTCTGCCCCTCACCACTGGGTTGGCTCTCCATCCAGTGGCCC 16238869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CCTCCTGGCCAACTCCCCTTCTGCCCCTCACCACTGGGTTGGCTCTCCATCCAGTGGCCC 1320

 16238870 CATATTTCCTGTTGACATTGGGGTGCAAGGCCTTTTCCACAACCAAGGGCAGCACTGGTT 16238929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CATATTTCCTGTTGACATTGGGGTGCAAGGCCTTTTCCACAACCAAGGGCAGCACTGGTT 1380

 16238930 CTATTTCTGCAGGTCCCTCTCCTCTGTGTGCTTGCCAAGACCCAGATCCCAGACAAGCAC 16238989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CTATTTCTGCAGGTCCCTCTCCTCTGTGTGCTTGCCAAGACCCAGATCCCAGACAAGCAC 1440

 16238990 CACCCTGCACACTGTTTTTATTTAATCCTCTTGGCCACCCAGAGAGGCAGGGCTTATCAA 16239049
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CACCTTGCACACTGTTTTTATTTAATCCTCTTGGCCACCCAGAGAGGCAGGGCTTATCAA 1500

 16239050 CCCTACTCTACCTGTGAGGAAAACTGAGACAGAAAAAGATGCTGCGGGTTGCCCTGAGCC 16239109
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CCCTACTCTACCTATGAGGAAAACTGAGACAGAAAAAGATGCTGCGGGTTGCCCTGAGCC 1560

 16239110 ACCTTGATGGGCTTCCAAGCCGATGGTCATGACAGCATAG 16239149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ACCTTGATGGGCTTCCAAGCCGATGGTCATGACAGCATAG 1600

EXCISED REGION

 16239157 TGATAGAATCAGCTAGATGGGTTTCAGGGTATTCGTCTGGGGTGGTGATGCCCACACCAA 16239216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1608 TGATAGAATCAGCTAGATGGGTTTCAGGGTATTCGTCTGGGGTGGTGATGCCCACACCAA 1667

 16239217 ATCATTAAATCAGAAAATGCTTGCGATGACCAGCCCATGATGACCCTTTACAAGTGGAAG 16239276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1668 ATCATTAAATCAGAAAATGCTTGCGATGACCAGCCCATGATGACCCTTTACAAGTGGAAG 1727

 16239277 TCAGTATTACTGCTGTTTTCTGGAGGGAAGGAGTTGAGGATCATACCAGCTTTTTCCGAG 16239336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1728 TCAGTATTACTGCTGTTTTCTGGAGGGAAGGAGTTGAGGATCATACCAGCTTTTTCCGAG 1787

 16239337 CACTATACCACTCAGACATGGGTGCTCTTACCCACTTCAAAACCCTCTGAGAATGCCAAA 16239396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1788 CACTATACCACTCAGACATGGGTGCTCTTACCCACTTCAAAACCCTCTGAGAATGCCAAA 1847

 16239397 CAACCATCGCAGTCTGGAAGTTCTTCCTTATCTATTCCGAAGCTCTCTTGCTAGAAGTCT 16239456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1848 CAACCATCGCAGTCTGGAAGTTCTTCCTTATCTATTCCGAAGCTCTCTTGCTAGAAGTCT 1907

 16239457 GTCCTAAATAATACTAACAAGGGTTAGAGGTATAGCTGAAGAGACCAGCAGTCAGCCCAA 16239516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1908 GTCCTAAATAATACTAACAAGGGTTAGAGGTATAGCTGAAGAGACCAGCAGTCAGCCCAA 1967

 16239517 GGAGGGCTTCATAAATTAATGTTTGGTGGGAATATCAGTGAAGGACTATATTTGGCTGCA 16239576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1968 GGAGGGCTTCATAAATTAATGTTTGGTGGGAATATCAGTGAAGGACTATATTTGGCTGCA 2027

 16239577 CAGAACAGAAACCTGCTGCAGTGACTTAACCAATGAATAGAGATTTATTTTTCCTTATAG 16239636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2028 CAGAACAGAAACCTGCTGCAGTGACTTAACCAATGAATAGAGATTTATTTTTCCTTATAG 2087

 16239637 TATAGAAAGCTCACAGGGTGGCAATGCAGTATTGGTGTGACAGCTCCACAATGCCATTGG 16239696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2088 TATAGAAAGCTCACAGGGTGGCAATGCAGTATTGGTGTGACAGCTCCACAATGCCATTGG 2147

 16239697 ACACCCACCTTCATCTGCTTTCCACTTCAACATGCTTAGAGAGTAGTTTTGGCCTCATAA 16239756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2148 ACACCCACCTTCATCTGCTTTCCACTTCAACATGCTTAGAGAGTAGTTTTGGCCTCATAA 2207

 16239757 TCACAACAGGGCTGCTCTACCTCTGGACATCACATACATATTTCAAATAGGGAAAAGGCG 16239816
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2208 TCACAACAGGGCTGTTCTACCTCTGGACATCACATACATATTTCAAATAGGGAAAAGGCG 2267

 16239817 AAGAAGAGATAGGCAGAGGCCAGTCCGGTTTGTGCTCTTCGGAAAAAAAAAATTAGTAAA 16239876
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
     2268 AAGAAGAGATAGGCAGAGGCCAGTCCGGTTTGTGCTCTTCGG-AAAAAAAAATTAGTAAA 2326

 16239877 ATAATAGTTTTCCCAGAATCCTTTCATTCATTTTATTTCTACCAGAGCTGCTGCCAGCAG 16239936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2327 ATAATAGTTTTCCCAGAATCCTTTCATTCATTTTATTTCTACCAGAGCTGCTGCCAGCAG 2386

 16239937 TGACAGGAAGTCTCGAGAGATACGTGTTTTTAGCTGTCCCGAGAAACATCAAAGTTCTGT 16239996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     2387 TGACAGGAAGTCTCGAGAGATACGTGTTTTTAGCTGCCCCGAGAAACATCAAAGTTCTGT 2446

 16239997 CAGTACAGTGGAAGGGGAGAATGAATGGTGAGGAAGATGTTACATTTAGCAATGTTAAAG 16240056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2447 CAGTACAGTGGAAGGGGAGAATGAATGGTGAGGAAGATGTTACATTTAGCAATGTTAAAG 2506

 16240057 CCAATGAAGTCACTGAGGGGCTGCTTCTCAGATATGCAAGTCCAGAAATGTTAATAGCTT 16240116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2507 CCAATGAAGTCACTGAGGGGCTGCTTCTCAGATATGCAAGTCCAGAAATGTTAATAGCTT 2566

 16240117 GACTAACAGAGATTCCTCTCTAGGGAGTGGACCAGGGCTGACAGTCTTACCAGAAAAATA 16240176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2567 GACTAACAGAGATTCCTCTCTAGGGAGTGGACCAGGGCTGACAGTCTTACCAGAAAAATA 2626

 16240177 ATTATAAAGTAACACATCAACGAAGCATTTTACCAGTGAGAATTGCAACAGCCCAGTGAC 16240236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2627 ATTATAAAGTAACACATCAACGAAGCATTTTACCAGTGAGAATTGCAACAGCCCAGTGAC 2686

 16240237 TGGGACTCCTTTCCTCTACTGCTCAGGACATTGTTCACCCTGCAGAAAATCCATGGTGCT 16240296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     2687 TGGGACTCCTTTCCTCTACTGCTCAGGACATTGTTCTCCCTGCAGAAAATCCATGGTGCT 2746

 16240297 TAGAAGACAGATTCCCAGGGAAGGAGTGTATGAAGTCTGCTGGGGGCTCTCGGGTGGGGC 16240356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2747 TAGAAGACAGATTCCCAGGGAAGGAGTGTATGAAGTCTGCTGGGGGCTCTCGGGTGGGGC 2806

 16240357 TGCCTTAACCTTCTCCAGCCTCCCCAGAGATCCAGCTACCAAAGCAGCCAGGCTACTTGT 16240416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2807 TGCCTTAACCTTCTCCAGCCTCCCCAGAGATCCAGCTACCAAAGCAGCCAGGCTACTTGT 2866

 16240417 ATCCACAGTTAAGGCCACCTCTGGGCTGGGGAACTGGGGGGGAAATTCTTGCTTTTTGGC 16240476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2867 ATCCACAGTTAAGGCCACCTCTGGGCTGGGGAACTGGGGGGGAAATTCTTGCTTTTTGGC 2926

 16240477 TCAGTTCTGTTCAATGCACATGTACTGAGTGCCTACTGTGGGCCAGGCCCTGCACTAAGG 16240536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2927 TCAGTTCTGTTCAATGCACATGTACTGAGTGCCTACTGTGGGCCAGGCCCTGCACTAAGG 2986

 16240537 GTTAGAGCAGAAGAGATGCATTAGGTACAACCCCTGTCCTTGGGGAGATCTTAGTCCACT 16240596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2987 GTTAGAGCAGAAGAGATGCATTAGGTACAACCCCTGTCCTTGGGGAGATCTTAGTCCACT 3046

 16240597 GGCCTGGGGGGACTCCCCATTTCCAAGACTTCATGGAGACCACTGCTTCTCTGTGAACAC 16240656
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3047 GGCCTGGGGGGACTCCCCGTTTCCAAGACTTCATGGAGACCACTGCTTCTCTGTGAACAC 3106

 16240657 ATTGTTCCTTCCATCTCCACTGGCTTGTTCCTCTTGGTGTGTGTGTACACAGACATGCAC 16240716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3107 ATTGTTCCTTCCATCTCCACTGGCTTGTTCCTCTTGGTGTGTGTGTACACAGACATGCAC 3166

 16240717 ACACACACACACATGCACTCACACACACAATCAAGTTATTCTTATCTTAAACACAAAACC 16240776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3167 ACACACACACACATGCACTCACACACACAATCAAGTTATTCTTATCTTAAACACAAAACC 3226

 16240777 TAACAAGCTTCTCTCATCCTTTCCGTCATCTTCTTAGGCCTCTTTTTCTCCCTTCCCCTA 16240836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3227 TAACAAGCTTCTCTCATCCTTTCCGTCATCTTCTTAGGCCTCTTTTTCTCCCTTCCCCTA 3286

 16240837 TAGAATCAACCTTCCTAACCGTCTGGACTCTTGGTCTCAGTTTTTCATCTTCCGTTTTCT 16240896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3287 TAGAATCAACCTTCCTAACCGTCTGGACTCTTGGTCTCAGTTTTTCATCTTCCGTTTTCT 3346

 16240897 CTCCCGGACCCACTGTGTTGCAGACTCCCCTATCAACTGCAATGAGATCTCTTTGACCAG 16240956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3347 CTCCCGGACCCACTGTGTTGCAGACTCCCCTATCAACTGCAATGAGATCTCTTTGACCAG 3406

 16240957 CACCACCAATCTCCTACCAGCTGCCAAATTTAATGGAGCCTTTTGCCTTTGACTTCCTTG 16241016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3407 CACCACCAATCTCCTACCAGCTGCCAAATTTAATGGAGCCTTTTGCCTTTGACTTCCTTG 3466

 16241017 ACCACTGTCTTAGGTCAGGTTTCCTGAAAGCAGGGCCTGAGATGGAGATTCACGTGCATT 16241076
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     3467 ACCACTGTCTTAGGTCAGGTTTCCTGAAAGCAGGGCCTGAGATGGAGATTCACGTGCATG 3526

 16241077 TGATTTTTTTGAGGGTGTACTCTCAGGGGAAATCTGTAGGGGAGTGAGTGATACAGAAGA 16241136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3527 TGATTTTTTTGAGGGTGTACTCTCAGGGGAAATCTGTAGGGGAGTGAGTGATACAGAAGA 3586

 16241137 GAGAGAGGGAAGAGCTGAACAAATATGTGGTTTCAGGTGAAGTCCAGCCATAGCCTGATC 16241196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3587 GAGAGAGGGAAGAGCTGAACAAATATGTGGTTTCAGGTGAAGTCCAGCCATAGCCTGATC 3646

 16241197 CCATGGGGGACTCTGGAGCACAGGCTGCACTGCGGGGTCTGTCTTGCTTTTTACCCTGCA 16241256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3647 CCATGGGGGACTCTGGAGCACAGGCTGCACTGCGGGGTCTGTCTTGCTTTTTACCCTGCA 3706

 16241257 ATGGTCAGTCATTGACCATGACTGGGGCTGGGGGCAGCATCCTGCATGACTGTCTGGCAC 16241316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3707 ATGGTCAGTCATTGACCATGACTGGGGCTGGGGGCAGCATCCTGCATGACTGTCTGGCAC 3766

 16241317 CTGCAGCAGAGACCGTTTTAATACCCCAAGGCAAGTCTCCAGGGAAGGGTTAAGATTTCA 16241376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3767 CTGCAGCAGAGACCGTTTTAATACCCCAAGGCAAGTCTCCAGGGAAGGGTTAAGATTTCA 3826

 16241377 GTTAGCACCCACAGCAGCTGGGGACATGCAAACCAAACCAAAACAGTTAAGGGGAGCTCA 16241436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3827 GTTAGCACCCACAGCAGCTGGGGACATGCAAACCAAACCAAAACAGTTAAGGGGAGCTCA 3886

 16241437 GGGAATCTGAGTAGGACACTATATTAGTCTGTTCTCACACTGCTATAAAGAACTGCCTGA 16241496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3887 GGGAATCTGAGTAGGACACTATATTAGTCTGTTCTCACACTGCTATAAAGAACTGCCTGA 3946

 16241497 GACTAGGTAATTTATAAAGAAAGGAGGTTTAATTGACTCACAGTTTCGCATGGCTGGGGA 16241556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3947 GACTAGGTAATTTATAAAGAAAGGAGGTTTAATTGACTCACAGTTTCGCATGGCTGGGGA 4006

 16241557 GGCCTCAGGAAACTTACAATCATGGTGGAAGGGGAAGCATGTCTTACATGGCAGCAAGTG 16241616
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4007 GGCCTCAGGAAACTTACAATCACGGTGGAAGGGGAAGCATGTCTTACATGGCAGCAAGTG 4066

 16241617 AGAGAAAGAGAGAGAGAGAGGAGGAAAAACTATCAAACACTTATATAATCATCAGATCTC 16241676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4067 AGAGAAAGAGAGAGAGAGAGGAGGAAAAACTATCAAACACTTATATAATCATCAGATCTC 4126

 16241677 ATGAGAACTCACTATCACGAGAACAGCATGGGGGAAACTGCCCACATGATCCAATCACCT 16241736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4127 ATGAGAACTCACTATCACGAGAACAGCATGGGGGAAACTGCCCACATGATCCAATCACCT 4186

 16241737 CCCACCAGGTCCCTCCCTCGCCACATAGGGATTATGGGGATTACCACTCAAGATGAGATC 16241796
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     4187 CCCACCAGGTCCCTCCCTCGACACATAGGGATTATGGGGATTACAACTCAAGATGAGATC 4246

 16241797 TGGGTGGGGACAAAGAGCCAAACCATATCAGACACCAACAGTATCTGCTACATTCTTGCT 16241856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4247 TGGGTGGGGACAAAGAGCCAAACCATATCAGACACCAACAGTATCTGCTACATTCTTGCT 4306

 16241857 GCTGCATTTGGAGAATGTTAGCAAGTTCTCCCCTTTCCTGGTTTTCTGACACCATCCCTC 16241916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4307 GCTGCATTTGGAGAATGTTAGCAAGTTCTCCCCTTTCCTGGTTTTCTGACACCATCCCTC 4366

 16241917 TAATTTTTACTGGAGAGAATCATGGCCCACCCCAACCTAACCAAGCATCTTACATCTCAG 16241976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4367 TAATTTTTACTGGAGAGAATCATGGCCCACCCCAACCTAACCAAGCATCTTACATCTCAG 4426

 16241977 CAACAACCACACTGTAGTAATGTTTTCGGTTCTTAGGACCCAGGTGCTCACCACAGCTTC 16242036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4427 CAACAACCACACTGTAGTAATGTTTTCGGTTCTTAGGACCCAGGTGCTCACCACAGCTTC 4486

 16242037 CAAAAGAGAGTTGCTGACGATTGTCTTAGTCACAATCTCATCGGTTGTGGCATTTGTCAT 16242096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4487 CAAAAGAGAGTTGCTGACGATTGTCTTAGTCACAATCTCATCGGTTGTGGCATTTGTCAT 4546

 16242097 TCCACTGACCACAACCCTGTTGATTCCAGGACAACTCAAGTCTGCTCTCAGCGAATATGT 16242156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4547 TCCACTGACCACAACCCTGTTGATTCCAGGACAACTCAAGTCTGCTCTCAGCGAATATGT 4606

 16242157 GGCCAGGCTGGAGGGGGTGAAGTTACTCAGGAGCAACA 16242194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4607 GGCCAGGCTGGAGGGGGTGAAGTTACTCAGGAGCAACA 4644

Alignment time is 5.71382 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [16229408,16251209] =>     21802 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    3514] =>      3514 nucs 'mol-32-2f1d-066730_3514'

Score:        3405
Aligned:      3515        nucs
Identic:      3505 (100%) nucs =>      3457 (100%)        48 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [16239205,16242671] EXCISED REGION [16242678,16242725]
 second seq =>  [       1,    3466] EXCISED REGION [    3467,    3514]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         6 nucs [16242672,16242677]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        29 nucs [16242672,16242700] to [16242678,16242706]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [16242668,16242671] to [16242678,16242681]
 second seq =>         4 nucs [3463,3466] to [3467,3470]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 16239205 TGCCCACACCAAATCATTAAATCAGAAAATGCTTGCGATGACCAGCCCATGATGACCCTT 16239264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGCCCACACCAAATCATTAAATCAGAAAATGCTTGCGATGACCAGCCCATGATGACCCTT 60

 16239265 TACAAGTGGAAGTCAGTATTACTGCTGTTTTCTGGAGGGAAGGAGTTGAGGATCATACCA 16239324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TACAAGTGGAAGTCAGTATTACTGCTGTTTTCTGGAGGGAAGGAGTTGAGGATCATACCA 120

 16239325 GCTTTTTCCGAGCACTATACCACTCAGACATGGGTGCTCTTACCCACTTCAAAACCCTCT 16239384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GCTTTTTCCGAGCACTATACCACTCAGACATGGGTGCTCTTACCCACTTCAAAACCCTCT 180

 16239385 GAGAATGCCAAACAACCATCGCAGTCTGGAAGTTCTTCCTTATCTATTCCGAAGCTCTCT 16239444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GAGAATGCCAAACAACCATCGCAGTCTGGAAGTTCTTCCTTATCTATTCCGAAGCTCTCT 240

 16239445 TGCTAGAAGTCTGTCCTAAATAATACTAACAAGGGTTAGAGGTATAGCTGAAGAGACCAG 16239504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGCTAGAAGTCTGTCCTAAATAATACTAACAAGGGTTAGAGGTATAGCTGAAGAGACCAG 300

 16239505 CAGTCAGCCCAAGGAGGGCTTCATAAATTAATGTTTGGTGGGAATATCAGTGAAGGACTA 16239564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CAGTCAGCCCAAGGAGGGCTTCATAAATTAATGTTTGGTGGGAATATCAGTGAAGGACTA 360

 16239565 TATTTGGCTGCACAGAACAGAAACCTGCTGCAGTGACTTAACCAATGAATAGAGATTTAT 16239624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TATTTGGCTGCACAGAACAGAAACCTGCTGCAGTGACTTAACCAATGAATAGAGATTTAT 420

 16239625 TTTTCCTTATAGTATAGAAAGCTCACAGGGTGGCAATGCAGTATTGGTGTGACAGCTCCA 16239684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTTTCCTTATAGTATAGAAAGCTCACAGGGTGGCAATGCAGTATTGGTGTGACAGCTCCA 480

 16239685 CAATGCCATTGGACACCCACCTTCATCTGCTTTCCACTTCAACATGCTTAGAGAGTAGTT 16239744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CAATGCCATTGGACACCCACCTTCATCTGCTTTCCACTTCAACATGCTTAGAGAGTAGTT 540

 16239745 TTGGCCTCATAATCACAACAGGGCTGCTCTACCTCTGGACATCACATACATATTTCAAAT 16239804
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTGGCCTCATAATCACAACAGGGCTGTTCTACCTCTGGACATCACATACATATTTCAAAT 600

 16239805 AGGGAAAAGGCGAAGAAGAGATAGGCAGAGGCCAGTCCGGTTTGTGCTCTTCGGAAAAAA 16239864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGGGAAAAGGCGAAGAAGAGATAGGCAGAGGCCAGTCCGGTTTGTGCTCTTCGGAAAAAA 660

 16239865 AAAATTAGTAAAATAATAGTTTTCCCAGAATCCTTTCATTCATTTTATTTCTACCAGAGC 16239924
          ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAA-TTAGTAAAATAATAGTTTTCCCAGAATCCTTTCATTCATTTTATTTCTACCAGAGC 719

 16239925 TGCTGCCAGCAGTGACAGGAAGTCTCGAGAGATACGTGTTTTTAGCTGTCCCGAGAAACA 16239984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
      720 TGCTGCCAGCAGTGACAGGAAGTCTCGAGAGATACGTGTTTTTAGCTGCCCCGAGAAACA 779

 16239985 TCAAAGTTCTGTCAGTACAGTGGAAGGGGAGAATGAATGGTGAGGAAGATGTTACATTTA 16240044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      780 TCAAAGTTCTGTCAGTACAGTGGAAGGGGAGAATGAATGGTGAGGAAGATGTTACATTTA 839

 16240045 GCAATGTTAAAGCCAATGAAGTCACTGAGGGGCTGCTTCTCAGATATGCAAGTCCAGAAA 16240104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 GCAATGTTAAAGCCAATGAAGTCACTGAGGGGCTGCTTCTCAGATATGCAAGTCCAGAAA 899

 16240105 TGTTAATAGCTTGACTAACAGAGATTCCTCTCTAGGGAGTGGACCAGGGCTGACAGTCTT 16240164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 TGTTAATAGCTTGACTAACAGAGATTCCTCTCTAGGGAGTGGACCAGGGCTGACAGTCTT 959

 16240165 ACCAGAAAAATAATTATAAAGTAACACATCAACGAAGCATTTTACCAGTGAGAATTGCAA 16240224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 ACCAGAAAAATAATTATAAAGTAACACATCAACGAAGCATTTTACCAGTGAGAATTGCAA 1019

 16240225 CAGCCCAGTGACTGGGACTCCTTTCCTCTACTGCTCAGGACATTGTTCACCCTGCAGAAA 16240284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     1020 CAGCCCAGTGACTGGGACTCCTTTCCTCTACTGCTCAGGACATTGTTCTCCCTGCAGAAA 1079

 16240285 ATCCATGGTGCTTAGAAGACAGATTCCCAGGGAAGGAGTGTATGAAGTCTGCTGGGGGCT 16240344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 ATCCATGGTGCTTAGAAGACAGATTCCCAGGGAAGGAGTGTATGAAGTCTGCTGGGGGCT 1139

 16240345 CTCGGGTGGGGCTGCCTTAACCTTCTCCAGCCTCCCCAGAGATCCAGCTACCAAAGCAGC 16240404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 CTCGGGTGGGGCTGCCTTAACCTTCTCCAGCCTCCCCAGAGATCCAGCTACCAAAGCAGC 1199

 16240405 CAGGCTACTTGTATCCACAGTTAAGGCCACCTCTGGGCTGGGGAACTGGGGGGGAAATTC 16240464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 CAGGCTACTTGTATCCACAGTTAAGGCCACCTCTGGGCTGGGGAACTGGGGGGGAAATTC 1259

 16240465 TTGCTTTTTGGCTCAGTTCTGTTCAATGCACATGTACTGAGTGCCTACTGTGGGCCAGGC 16240524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 TTGCTTTTTGGCTCAGTTCTGTTCAATGCACATGTACTGAGTGCCTACTGTGGGCCAGGC 1319

 16240525 CCTGCACTAAGGGTTAGAGCAGAAGAGATGCATTAGGTACAACCCCTGTCCTTGGGGAGA 16240584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 CCTGCACTAAGGGTTAGAGCAGAAGAGATGCATTAGGTACAACCCCTGTCCTTGGGGAGA 1379

 16240585 TCTTAGTCCACTGGCCTGGGGGGACTCCCCATTTCCAAGACTTCATGGAGACCACTGCTT 16240644
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     1380 TCTTAGTCCACTGGCCTGGGGGGACTCCCCGTTTCCAAGACTTCATGGAGACCACTGCTT 1439

 16240645 CTCTGTGAACACATTGTTCCTTCCATCTCCACTGGCTTGTTCCTCTTGGTGTGTGTGTAC 16240704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 CTCTGTGAACACATTGTTCCTTCCATCTCCACTGGCTTGTTCCTCTTGGTGTGTGTGTAC 1499

 16240705 ACAGACATGCACACACACACACACATGCACTCACACACACAATCAAGTTATTCTTATCTT 16240764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 ACAGACATGCACACACACACACACATGCACTCACACACACAATCAAGTTATTCTTATCTT 1559

 16240765 AAACACAAAACCTAACAAGCTTCTCTCATCCTTTCCGTCATCTTCTTAGGCCTCTTTTTC 16240824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 AAACACAAAACCTAACAAGCTTCTCTCATCCTTTCCGTCATCTTCTTAGGCCTCTTTTTC 1619

 16240825 TCCCTTCCCCTATAGAATCAACCTTCCTAACCGTCTGGACTCTTGGTCTCAGTTTTTCAT 16240884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 TCCCTTCCCCTATAGAATCAACCTTCCTAACCGTCTGGACTCTTGGTCTCAGTTTTTCAT 1679

 16240885 CTTCCGTTTTCTCTCCCGGACCCACTGTGTTGCAGACTCCCCTATCAACTGCAATGAGAT 16240944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 CTTCCGTTTTCTCTCCCGGACCCACTGTGTTGCAGACTCCCCTATCAACTGCAATGAGAT 1739

 16240945 CTCTTTGACCAGCACCACCAATCTCCTACCAGCTGCCAAATTTAATGGAGCCTTTTGCCT 16241004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 CTCTTTGACCAGCACCACCAATCTCCTACCAGCTGCCAAATTTAATGGAGCCTTTTGCCT 1799

 16241005 TTGACTTCCTTGACCACTGTCTTAGGTCAGGTTTCCTGAAAGCAGGGCCTGAGATGGAGA 16241064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 TTGACTTCCTTGACCACTGTCTTAGGTCAGGTTTCCTGAAAGCAGGGCCTGAGATGGAGA 1859

 16241065 TTCACGTGCATTTGATTTTTTTGAGGGTGTACTCTCAGGGGAAATCTGTAGGGGAGTGAG 16241124
          |||||||||||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     1860 TTCACGTGCATGTGATTTTTTTGAGGGTGTATTCTCAGGGGAAATCTGTAGGGGAGTGAG 1919

 16241125 TGATACAGAAGAGAGAGAGGGAAGAGCTGAACAAATATGTGGTTTCAGGTGAAGTCCAGC 16241184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 TGATACAGAAGAGAGAGAGGGAAGAGCTGAACAAATATGTGGTTTCAGGTGAAGTCCAGC 1979

 16241185 CATAGCCTGATCCCATGGGGGACTCTGGAGCACAGGCTGCACTGCGGGGTCTGTCTTGCT 16241244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 CATAGCCTGATCCCATGGGGGACTCTGGAGCACAGGCTGCACTGCGGGGTCTGTCTTGCT 2039

 16241245 TTTTACCCTGCAATGGTCAGTCATTGACCATGACTGGGGCTGGGGGCAGCATCCTGCATG 16241304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 TTTTACCCTGCAATGGTCAGTCATTGACCATGACTGGGGCTGGGGGCAGCATCCTGCATG 2099

 16241305 ACTGTCTGGCACCTGCAGCAGAGACCGTTTTAATACCCCAAGGCAAGTCTCCAGGGAAGG 16241364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 ACTGTCTGGCACCTGCAGCAGAGACCGTTTTAATACCCCAAGGCAAGTCTCCAGGGAAGG 2159

 16241365 GTTAAGATTTCAGTTAGCACCCACAGCAGCTGGGGACATGCAAACCAAACCAAAACAGTT 16241424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 GTTAAGATTTCAGTTAGCACCCACAGCAGCTGGGGACATGCAAACCAAACCAAAACAGTT 2219

 16241425 AAGGGGAGCTCAGGGAATCTGAGTAGGACACTATATTAGTCTGTTCTCACACTGCTATAA 16241484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 AAGGGGAGCTCAGGGAATCTGAGTAGGACACTATATTAGTCTGTTCTCACACTGCTATAA 2279

 16241485 AGAACTGCCTGAGACTAGGTAATTTATAAAGAAAGGAGGTTTAATTGACTCACAGTTTCG 16241544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 AGAACTGCCTGAGACTAGGTAATTTATAAAGAAAGGAGGTTTAATTGACTCACAGTTTCG 2339

 16241545 CATGGCTGGGGAGGCCTCAGGAAACTTACAATCATGGTGGAAGGGGAAGCATGTCTTACA 16241604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     2340 CATGGCTGGGGAGGCCTCAGGAAACTTACAATCACGGTGGAAGGGGAAGCATGTCTTACA 2399

 16241605 TGGCAGCAAGTGAGAGAAAGAGAGAGAGAGAGGAGGAAAAACTATCAAACACTTATATAA 16241664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 TGGCAGCAAGTGAGAGAAAGAGAGAGAGAGAGGAGGAAAAACTATCAAACACTTATATAA 2459

 16241665 TCATCAGATCTCATGAGAACTCACTATCACGAGAACAGCATGGGGGAAACTGCCCACATG 16241724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 TCATCAGATCTCATGAGAACTCACTATCACGAGAACAGCATGGGGGAAACTGCCCACATG 2519

 16241725 ATCCAATCACCTCCCACCAGGTCCCTCCCTCGCCACATAGGGATTATGGGGATTACCACT 16241784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||
     2520 ATCCAATCACCTCCCACCAGGTCCCTCCCTCGACACATAGGGATTATGGGGATTACAACT 2579

 16241785 CAAGATGAGATCTGGGTGGGGACAAAGAGCCAAACCATATCAGACACCAACAGTATCTGC 16241844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 CAAGATGAGATCTGGGTGGGGACAAAGAGCCAAACCATATCAGACACCAACAGTATCTGC 2639

 16241845 TACATTCTTGCTGCTGCATTTGGAGAATGTTAGCAAGTTCTCCCCTTTCCTGGTTTTCTG 16241904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 TACATTCTTGCTGCTGCATTTGGAGAATGTTAGCAAGTTCTCCCCTTTCCTGGTTTTCTG 2699

 16241905 ACACCATCCCTCTAATTTTTACTGGAGAGAATCATGGCCCACCCCAACCTAACCAAGCAT 16241964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 ACACCATCCCTCTAATTTTTACTGGAGAGAATCATGGCCCACCCCAACCTAACCAAGCAT 2759

 16241965 CTTACATCTCAGCAACAACCACACTGTAGTAATGTTTTCGGTTCTTAGGACCCAGGTGCT 16242024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 CTTACATCTCAGCAACAACCACACTGTAGTAATGTTTTCGGTTCTTAGGACCCAGGTGCT 2819

 16242025 CACCACAGCTTCCAAAAGAGAGTTGCTGACGATTGTCTTAGTCACAATCTCATCGGTTGT 16242084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2820 CACCACAGCTTCCAAAAGAGAGTTGCTGACGATTGTCTTAGTCACAATCTCATCGGTTGT 2879

 16242085 GGCATTTGTCATTCCACTGACCACAACCCTGTTGATTCCAGGACAACTCAAGTCTGCTCT 16242144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2880 GGCATTTGTCATTCCACTGACCACAACCCTGTTGATTCCAGGACAACTCAAGTCTGCTCT 2939

 16242145 CAGCGAATATGTGGCCAGGCTGGAGGGGGTGAAGTTACTCAGGAGCAACAAGAGGCTGGG 16242204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2940 CAGCGAATATGTGGCCAGGCTGGAGGGGGTGAAGTTACTCAGGAGCAACAAGAGGCTGGG 2999

 16242205 TGCCATCAGGGCCCGGATGCTGGGGGCCACCAGAGCCACCGGGGATGTGCTCGTCTTCAT 16242264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3000 TGCCATCAGGGCCCGGATGCTGGGGGCCACCAGAGCCACCGGGGATGTGCTCGTCTTCAT 3059

 16242265 GGATGCCCACTGCGAGTGCCACCCAGGCTGGCTGGAGCCCCTCCTCAGCAGAATAGCTGG 16242324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3060 GGATGCCCACTGCGAGTGCCACCCAGGCTGGCTGGAGCCCCTCCTCAGCAGAATAGCTGG 3119

 16242325 TGACAGGTAACTTATTCCCTGGGCTTGCAAAGCAAGACATGGAACTGGGAGAAACAGTCT 16242384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3120 TGACAGGTAACTTATTCCCTGGGCTTGCAAAGCAAGACATGGAACTGGGAGAAACAGTCT 3179

 16242385 ACAGCATCAGCCACTCACAGAGCAACCCACCTATTAATTCCTGAATCTCCATTAGAGAGT 16242444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3180 ACAGCATCAGCCACTCACAGAGCAACCCACCTATTAATTCCTGAATCTCCATTAGAGAGT 3239

 16242445 GATATATTCCCTTCGGGTTTTCAGATGTGTAAGTTTTTTAAGACTATAGAGTTAGAGTTG 16242504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3240 GATATATTCCCTTCGGGTTTTCAGATGTGTAAGTTTTTTAAGACTATAGAGTTAGAGTTG 3299

 16242505 GAAAGGAGGTTAGAGGTCTTCATCTACCTTGCTTTATAGATAAAGAAACCGAGGCCTGGA 16242564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3300 GAAAGGAGGTTAGAGGTCTTCATCTACCTTGCTTTATAGATAAAGAAACCGAGGCCTGGA 3359

 16242565 GAACAGCTTCTATGAGGTTGCAAATACTTAAAATTGTATTAAATTGCATGACGAGGGTAA 16242624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3360 GAACAGCTTCTATGAGGTTGCAAATACTTAAAATTGTATTAAATTGCATGACGAGGGTAA 3419

 16242625 CACCTTACCATAGCTATCATTGCCTTTGGTGAAAATTTGGCAATTTT 16242671
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3420 CACCTTACCATAGCTATCATTGCCTTTGGTGAAAATTTGGCAATTTT 3466

EXCISED REGION

 16242678 TTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTGTGATGGCGTCTCGCTCTG 16242725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3467 TTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTGTGATGGCGTCTCGCTCTG 3514

Alignment time is 4.88011 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [16229408,16251209] =>     21802 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    3198] =>      3198 nucs 'mol-32-2fcd-034905_3198'

Score:        3133
Aligned:      3199        nucs
Identic:      3193 (100%) nucs =>      2047 (100%)      1146 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [16240621,16242671] EXCISED REGION [16242678,16243825]
 second seq =>  [       1,    2051] EXCISED REGION [    2052,    3198]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         6 nucs [16242672,16242677]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        29 nucs [16242672,16242700] to [16242678,16242706]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [16242668,16242671] to [16242678,16242681]
 second seq =>         4 nucs [2048,2051] to [2052,2055]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 16240621 AAGACTTCATGGAGACCACTGCTTCTCTGTGAACACATTGTTCCTTCCATCTCCACTGGC 16240680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAGACTTCATGGAGACCACTGCTTCTCTGTGAACACATTGTTCCTTCCATCTCCACTGGC 60

 16240681 TTGTTCCTCTTGGTGTGTGTGTACACAGACATGCACACACACACACACATGCACTCACAC 16240740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTGTTCCTCTTGGTGTGTGTGTACACAGACATGCACACACACACACACATGCACTCACAC 120

 16240741 ACACAATCAAGTTATTCTTATCTTAAACACAAAACCTAACAAGCTTCTCTCATCCTTTCC 16240800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACACAATCAAGTTATTCTTATCTTAAACACAAAACCTAACAAGCTTCTCTCATCCTTTCC 180

 16240801 GTCATCTTCTTAGGCCTCTTTTTCTCCCTTCCCCTATAGAATCAACCTTCCTAACCGTCT 16240860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTCATCTTCTTAGGCCTCTTTTTCTCCCTTCCCCTATAGAATCAACCTTCCTAACCGTCT 240

 16240861 GGACTCTTGGTCTCAGTTTTTCATCTTCCGTTTTCTCTCCCGGACCCACTGTGTTGCAGA 16240920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGACTCTTGGTCTCAGTTTTTCATCTTCCGTTTTCTCTCCCGGACCCACTGTGTTGCAGA 300

 16240921 CTCCCCTATCAACTGCAATGAGATCTCTTTGACCAGCACCACCAATCTCCTACCAGCTGC 16240980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTCCCCTATCAACTGCAATGAGATCTCTTTGACCAGCACCACCAATCTCCTACCAGCTGC 360

 16240981 CAAATTTAATGGAGCCTTTTGCCTTTGACTTCCTTGACCACTGTCTTAGGTCAGGTTTCC 16241040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CAAATTTAATGGAGCCTTTTGCCTTTGACTTCCTTGACCACTGTCTTAGGTCAGGTTTCC 420

 16241041 TGAAAGCAGGGCCTGAGATGGAGATTCACGTGCATTTGATTTTTTTGAGGGTGTACTCTC 16241100
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
      421 TGAAAGCAGGGCCTGAGATGGAGATTCACGTGCATGTGATTTTTTTGAGGGTGTACTCTC 480

 16241101 AGGGGAAATCTGTAGGGGAGTGAGTGATACAGAAGAGAGAGAGGGAAGAGCTGAACAAAT 16241160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGGGGAAATCTGTAGGGGAGTGAGTGATACAGAAGAGAGAGAGGGAAGAGCTGAACAAAT 540

 16241161 ATGTGGTTTCAGGTGAAGTCCAGCCATAGCCTGATCCCATGGGGGACTCTGGAGCACAGG 16241220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATGTGGTTTCAGGTGAAGTCCAGCCATAGCCTGATCCCATGGGGGACTCTGGAGCACAGG 600

 16241221 CTGCACTGCGGGGTCTGTCTTGCTTTTTACCCTGCAATGGTCAGTCATTGACCATGACTG 16241280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTGCACTGCGGGGTCTGTCTTGCTTTTTACCCTGCAATGGTCAGTCATTGACCATGACTG 660

 16241281 GGGCTGGGGGCAGCATCCTGCATGACTGTCTGGCACCTGCAGCAGAGACCGTTTTAATAC 16241340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGGCTGGGGGCAGCATCCTGCATGACTGTCTGGCACCTGCAGCAGAGACCGTTTTAATAC 720

 16241341 CCCAAGGCAAGTCTCCAGGGAAGGGTTAAGATTTCAGTTAGCACCCACAGCAGCTGGGGA 16241400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CCCAAGGCAAGTCTCCAGGGAAGGGTTAAGATTTCAGTTAGCACCCACAGCAGCTGGGGA 780

 16241401 CATGCAAACCAAACCAAAACAGTTAAGGGGAGCTCAGGGAATCTGAGTAGGACACTATAT 16241460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CATGCAAACCAAACCAAAACAGTTAAGGGGAGCTCAGGGAATCTGAGTAGGACACTATAT 840

 16241461 TAGTCTGTTCTCACACTGCTATAAAGAACTGCCTGAGACTAGGTAATTTATAAAGAAAGG 16241520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TAGTCTGTTCTCACACTGCTATAAAGAACTGCCTGAGACTAGGTAATTTATAAAGAAAGG 900

 16241521 AGGTTTAATTGACTCACAGTTTCGCATGGCTGGGGAGGCCTCAGGAAACTTACAATCATG 16241580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
      901 AGGTTTAATTGACTCACAGTTTCGCATGGCTGGGGAGGCCTCAGGAAACTTACAATCACG 960

 16241581 GTGGAAGGGGAAGCATGTCTTACATGGCAGCAAGTGAGAGAAAGAGAGAGAGAGAGGAGG 16241640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GTGGAAGGGGAAGCATGTCTTACATGGCAGCAAGTGAGAGAAAGAGAGAGAGAGAGGAGG 1020

 16241641 AAAAACTATCAAACACTTATATAATCATCAGATCTCATGAGAACTCACTATCACGAGAAC 16241700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AAAAACTATCAAACACTTATATAATCATCAGATCTCATGAGAACTCACTATCACGAGAAC 1080

 16241701 AGCATGGGGGAAACTGCCCACATGATCCAATCACCTCCCACCAGGTCCCTCCCTCGCCAC 16241760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     1081 AGCATGGGGGAAACTGCCCACATGATCCAATCACCTCCCACCAGGTCCCTCCCTCGACAC 1140

 16241761 ATAGGGATTATGGGGATTACCACTCAAGATGAGATCTGGGTGGGGACAAAGAGCCAAACC 16241820
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATAGGGATTATGGGGATTACAACTCAAGATGAGATCTGGGTGGGGACAAAGAGCCAAACC 1200

 16241821 ATATCAGACACCAACAGTATCTGCTACATTCTTGCTGCTGCATTTGGAGAATGTTAGCAA 16241880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATATCAGACACCAACAGTATCTGCTACATTCTTGCTGCTGCATTTGGAGAATGTTAGCAA 1260

 16241881 GTTCTCCCCTTTCCTGGTTTTCTGACACCATCCCTCTAATTTTTACTGGAGAGAATCATG 16241940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GTTCTCCCCTTTCCTGGTTTTCTGACACCATCCCTCTAATTTTTACTGGAGAGAATCATG 1320

 16241941 GCCCACCCCAACCTAACCAAGCATCTTACATCTCAGCAACAACCACACTGTAGTAATGTT 16242000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GCCCACCCCAACCTAACCAAGCATCTTACATCTCAGCAACAACCACACTGTAGTAATGTT 1380

 16242001 TTCGGTTCTTAGGACCCAGGTGCTCACCACAGCTTCCAAAAGAGAGTTGCTGACGATTGT 16242060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTCGGTTCTTAGGACCCAGGTGCTCACCACAGCTTCCAAAAGAGAGTTGCTGACGATTGT 1440

 16242061 CTTAGTCACAATCTCATCGGTTGTGGCATTTGTCATTCCACTGACCACAACCCTGTTGAT 16242120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTTAGTCACAATCTCATCGGTTGTGGCATTTGTCATTCCACTGACCACAACCCTGTTGAT 1500

 16242121 TCCAGGACAACTCAAGTCTGCTCTCAGCGAATATGTGGCCAGGCTGGAGGGGGTGAAGTT 16242180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TCCAGGACAACTCAAGTCTGCTCTCAGCGAATATGTGGCCAGGCTGGAGGGGGTGAAGTT 1560

 16242181 ACTCAGGAGCAACAAGAGGCTGGGTGCCATCAGGGCCCGGATGCTGGGGGCCACCAGAGC 16242240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ACTCAGGAGCAACAAGAGGCTGGGTGCCATCAGGGCCCGGATGCTGGGGGCCACCAGAGC 1620

 16242241 CACCGGGGATGTGCTCGTCTTCATGGATGCCCACTGCGAGTGCCACCCAGGCTGGCTGGA 16242300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CACCGGGGATGTGCTCGTCTTCATGGATGCCCACTGCGAGTGCCACCCAGGCTGGCTGGA 1680

 16242301 GCCCCTCCTCAGCAGAATAGCTGGTGACAGGTAACTTATTCCCTGGGCTTGCAAAGCAAG 16242360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GCCCCTCCTCAGCAGAATAGCTGGTGACAGGTAACTTATTCCCTGGGCTTGCAAAGCAAG 1740

 16242361 ACATGGAACTGGGAGAAACAGTCTACAGCATCAGCCACTCACAGAGCAACCCACCTATTA 16242420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ACATGGAACTGGGAGAAACAGTCTACAGCATCAGCCACTCACAGAGCAACCCACCTATTA 1800

 16242421 ATTCCTGAATCTCCATTAGAGAGTGATATATTCCCTTCGGGTTTTCAGATGTGTAAGTTT 16242480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ATTCCTGAATCTCCATTAGAGAGTGATATATTCCCTTCGGGTTTTCAGATGTGTAAGTTT 1860

 16242481 TTTAAGACTATAGAGTTAGAGTTGGAAAGGAGGTTAGAGGTCTTCATCTACCTTGCTTTA 16242540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTTAAGACTATAGAGTTAGAGTTGGAAAGGAGGTTAGAGGTCTTCATCTACCTTGCTTTA 1920

 16242541 TAGATAAAGAAACCGAGGCCTGGAGAACAGCTTCTATGAGGTTGCAAATACTTAAAATTG 16242600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TAGATAAAGAAACCGAGGCCTGGAGAACAGCTTCTATGAGGTTGCAAATACTTAAAATTG 1980

 16242601 TATTAAATTGCATGACGAGGGTAACACCTTACCATAGCTATCATTGCCTTTGGTGAAAAT 16242660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TATTAAATTGCATGACGAGGGTAACACCTTACCATAGCTATCATTGCCTTTGGTGAAAAT 2040

 16242661 TTGGCAATTTT 16242671
          |||||||||||
     2041 TTGGCAATTTT 2051

EXCISED REGION

 16242678 TTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTGTGATGGCGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTG 16242737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2052 TTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTGTGATGGCGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTG 2111

 16242738 GAGTGCAGCGGGGCGATCTCGGCTCACTGCAAGCTGCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCT 16242797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2112 GAGTGCAGCGGGGCGATCTCGGCTCACTGCAAGCTGCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCT 2171

 16242798 CCTGCTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACCACACCCGGCTAATT 16242857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2172 CCTGCTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACCACACCCGGCTAATT 2231

 16242858 TTTTGTATTTTTAGTAGAGAAGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCT 16242917
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
     2232 TTTTGTATTTTTAGTAGAGAAGGGGTTTCACCGTGTTAGCCA-GATGGTCTCGATCTCCT 2290

 16242918 GACTTCGTGATCCGCCCTCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACC 16242977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2291 GACTTCGTGATCCGCCCTCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACC 2350

 16242978 GCGCCTGGCCGAAAATTCGTCAATTTTAATCAAGCTTGTAACATAACCTGGGGAAAAAGT 16243037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2351 GCGCCTGGCCGAAAATTCGTCAATTTTAATCAAGCTTGTAACATAACCTGGGGAAAAAGT 2410

 16243038 CTCTGAACTACACTAGGCCGTAGATTACTCACCCATAAAAAGAAAACATTATGTTCTCTG 16243097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2411 CTCTGAACTACACTAGGCCGTAGATTACTCACCCATAAAAAGAAAACATTATGTTCTCTG 2470

 16243098 ATCACTAAACAGCATTCTTTGTTTCCCCAGTTTATATAAGGGGTCCCTAATTTTCTACCT 16243157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2471 ATCACTAAACAGCATTCTTTGTTTCCCCAGTTTATATAAGGGGTCCCTAATTTTCTACCT 2530

 16243158 AAGGCCAGTCCTTGGAAATGTGAAGTTGGAGAGGACTGCATTACATTACCCTGTAGACAA 16243217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2531 AAGGCCAGTCCTTGGAAATGTGAAGTTGGAGAGGACTGCATTACATTACCCTGTAGACAA 2590

 16243218 GCATCTTAACATTTTTCTTGATCATTTCTCTGCTCTCCTTCCCCCATCTGACCGTCAATC 16243277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2591 GCATCTTAACATTTTTCTTGATCATTTCTCTGCTCTCCTTCCCCCATCTGACCGTCAATC 2650

 16243278 TCTTTCTCACTTCCTTGCTCAAGACAAACAGTTCCTAAACATGTCTAGTCAAACATTACC 16243337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2651 TCTTTCTCACTTCCTTGCTCAAGACAAACAGTTCCTAAACATGTCTAGTCAAACATTACC 2710

 16243338 CTCAATCTGAATATCCTACCCAGGAAAACTGAAACCTGGTGGCTGGCCCACCTTGGACCA 16243397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2711 CTCAATCTGAATATCCTACCCAGGAAAACTGAAACCTGGTGGCTGGCCCACCTTGGACCA 2770

 16243398 CCTCAGGCATACCACTTGGAGCTCATGTAGGCATGTAGCAGAGTAGAACCACAATCAATA 16243457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2771 CCTCAGGCATACCACTTGGAGCTCATGTAGGCATGTAGCAGAGTAGAACCACAATCAATA 2830

 16243458 ATTGTTTGATGGTGCCCAGCAAGACAGGACCAATGCTAGAACCAAGCCTTATGACTTCTA 16243517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2831 ATTGTTTGATGGTGCCCAGCAAGACAGGACCAATGCTAGAACCAAGCCTTATGACTTCTA 2890

 16243518 CCCATGATGAATGTTTATTATCTCACCTGAAGTTAGGGATGATCAATCAAATATAAGAAA 16243577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2891 CCCATGATGAATGTTTATTATCTCACCTGAAGTTAGGGATGATCAATCAAATATAAGAAA 2950

 16243578 AAATTCCTGGACCAGATCGGAATGAATCCTGGAGACATAGGAGTTACCATCAGCCAAATG 16243637
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2951 AAATTCCTGGACCAGATCAGAATGAATCCTGGAGACATAGGAGTTACCATCAGCCAAATG 3010

 16243638 GAGATGGTTTCAAACGTTCAAATGACAGAAAGTAAATTGTTAATAGTTCAGCATTCCATT 16243697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3011 GAGATGGTTTCAAACGTTCAAATGACAGAAAGTAAATTGTTAATAGTTCAGCATTCCATT 3070

 16243698 TTAACAAAGAAGAACAATCGGAACTCAAGTGAGATCAAGACAGATTAATGTTTCCCAGTT 16243757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3071 TTAACAAAGAAGAACAATCGGAACTCAAGTGAGATCAAGACAGATTAATGTTTCCCAGTT 3130

 16243758 TCATGAGACAGATTGTCTCTTGACTCACATCTCATAAGAAAAGAAGACACACATAAATTC 16243817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3131 TCATGAGACAGATTGTCTCTTGACTCACATCTCATAAGAAAAGAAGACACACATAAATTC 3190

 16243818 AGCACTAG 16243825
          ||||||||
     3191 AGCACTAG 3198

Alignment time is 4.19981 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [16229408,16251209] =>     21802 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    4842] =>      4842 nucs 'mol-32-2fe3-273066_4842'

Score:        4761
Aligned:      4848        nucs
Identic:      4836 (100%) nucs =>      2092 (100%)      2744 (100%)
Gaps:            6 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [16237315,16239408] EXCISED REGION [16241210,16243963]
 second seq =>  [       1,    2094] EXCISED REGION [    2095,    4842]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1801 nucs [16239409,16241209]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [16239409,16239409] to [16241210,16241210]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [16239409,16239410] to [16241208,16241209]
 second seq =>         0 nucs

 16237315 CCTCTGTTTCCATGATGAGGCCTGGTCCACTCTCCTGCGGACTGTACACAGCATCCTCGA 16237374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCTCTGTTTCCATGATGAGGCCTGGTCCACTCTCCTGCGGACTGTACACAGCATCCTCGA 60

 16237375 CACAGTGCCCAGGGCCTTCCTGAAGGAGATCATCCTCGTGGACGACCTCAGCCAGCAAGG 16237434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CACAGTGCCCAGGGCCTTCCTGAAGGAGATCATCCTCGTGGACGACCTCAGCCAGCAAGG 120

 16237435 TAGCCACGGCTTTCCTCCAGGCTCGTCTGGGTGAGCCTTACCCCCTGGCGGGTGGAGTTC 16237494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TAGCCACGGCTTTCCTCCAGGCTCGTCTGGGTGAGCCTTACCCCCTGGCGGGTGGAGTTC 180

 16237495 TCAAGCAAAAGATTGAAGTTTGGAACTATTTTAGGCAAGATTCCCCAACTACAGACCTCC 16237554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCAAGCAAAAGATTGAAGTTTGGAACTATTTTAGGCAAGATTCCCCAACTACAGACCTCC 240

 16237555 AGATGAGGATTAATGGGCAAGTAACTTATGAATGAAGAGCCACTGGGGAAACCAGTAAGG 16237614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGATGAGGATTAATGGGCAAGTAACTTATGAATGAAGAGCCACTGGGGAAACCAGTAAGG 300

 16237615 CAGTGGGGGCTGCAAGACAGAGAAGGAGAAAGAGCCCTGCAGGGGAAACAGCCCTGGGGA 16237674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CAGTGGGGGCTGCAAGACAGAGAAGGAGAAAGAGCCCTGCAGGGGAAACAGCCCTGGGGA 360

 16237675 GGGTCTTGAGGGGTGTCGCCTCAGCCTGATCCCGTGGGGATCTCTCTCCCAGGTGCCACC 16237734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGGTCTTGAGGGGTGTCGCCTCAGCCTGATCCCGTGGGGATCTCTCTCCCAGGTGCCACC 420

 16237735 CAGTCCAACAATCCTCTCTCCAAGACACTGAAGAATCACATAGGGCGGCCCTGTTGTGAG 16237794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CAGTCCAACAATCCTCTCTCCAAGACACTGAAGAATCACATAGGGCGGCCCTGTTGTGAG 480

 16237795 TGCTCACTGCCTCCTAGACCCTGGTGCAGCACTTTACACATACGCACATATGTGTATCGG 16237854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGCTCACTGCCTCCTAGACCCTGGTGCAGCACTTTACACATACGCACATATGTGTATCGG 540

 16237855 TCCTTCACTCATCATGGCTTAGACAGACCCACTCACTTTCCAGAGGAGGAAACTGGGGCC 16237914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCCTTCACTCATCATGGCTTAGACAGACCCACTCACTTTCCAGAGGAGGAAACTGGGGCC 600

 16237915 CAGAGAAGACAGCAGACTGGAGCGGAGTCAGCCAAAAGCAGCAGAGTCAGGCCCAGAGCC 16237974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CAGAGAAGACAGCAGACTGGAGCGGAGTCAGCCAAAAGCAGCAGAGTCAGGCCCAGAGCC 660

 16237975 CAGACTTGCAGAACCTGCCTGTGTGCTTCCTCTCACAGGAACCTGGCTACTAGGGACAGC 16238034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CAGACTTGCAGAACCTGCCTGTGTGCTTCCTCTCACAGGAACCTGGCTACTAGGGACAGC 720

 16238035 CCTAAAAGAAGATGGAGACAGAGAAGCCCCCACTTGACTCGTAGGTCAGTGGCTCTCACG 16238094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CCTAAAAGAAGATGGAGACAGAGAAGCCCCCACTTGACTCGTAGGTCAGTGGCTCTCACG 780

 16238095 CTTGAGCATGCATCGGAATCACCTGGTGCGATTTTTAAAATACTACTGCAGGGCCCACCC 16238154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTTGAGCATGCATCGGAATCACCTGGTGCGATTTTTAAAATACTACTGCAGGGCCCACCC 840

 16238155 CCAGAGTTTCTGGTGATGGAGTGGGGCCGAAGAATTTGCATTTCTAACAAGCTCCCAGGT 16238214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CCAGAGTTTCTGGTGATGGAGTGGGGCCGAAGAATTTGCATTTCTAACAAGCTCCCAGGT 900

 16238215 GATGCTGATGCTGCTGTTTTCTGTGGACCACACTCTGAGAACCTCTGCTCTAGTCTTTGG 16238274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GATGCTGATGCTGCTGTTTTCTGTGGACCACACTCTGAGAACCTCTGCTCTAGTCTTTGG 960

 16238275 CTTGGGCGTGAGGCCTACATTTCTGGCACAACTAAATGACCTAGGGACACCCCTCCTGGC 16238334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTTGGGCGTGAGGCCTACATTTCTGGCACAACTAAATGACCTAGGGACACCCCTCCTGGC 1020

 16238335 CTTCTGGGAAGATCAGAACGCTCTGAGGGAAGCCGAGCATTCACGTTTTTCTAAGGGGAA 16238394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTTCTGGGAAGATCAGAACGCTCTGAGGGAAGCCGAGCATTCACGTTTTTCTAAGGGGAA 1080

 16238395 TAATGGAGAAGGGCTAGGGTAGCCAGGTGCCTCTGTTAGTTCTTTCTACGGTCCTCACTC 16238454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TAATGGAGAAGGGCTAGGGTAGCCAGGTGCCTCTGTTAGTTCTTTCTACGGTCCTCACTC 1140

 16238455 CAGGGATGGGCCTAGCCTGGCCATAGCAGTGAGTCAGATTAGCCAGAGGCTCTGGGAACA 16238514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CAGGGATGGGCCTAGCCTGGCCATAGCAGTGAGTCAGATTAGCCAGAGGCTCTGGGAACA 1200

 16238515 CCTGGGGTTCCTGGGTGCAGCTGGCTGCATATTAGGCAGGACTAATGAACAGGTGCAGGA 16238574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CCTGGGGTTCCTGGGTGCAGCTGGCTGCATATTAGGCAGGACTAATGAACAGGTGCAGGA 1260

 16238575 CAGGGCTGGGTTGGCGGGTAAAGTGCCCAGAGACTCTCCAAACCCTCAAGTGGGGCGGGG 16238634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CAGGGCTGGGTTGGCGGGTAAAGTGCCCAGAGACTCTCCAAACCCTCAAGTGGGGCGGGG 1320

 16238635 TCCGCCCAAGAGCACACCTGTGGTGAGGCCCCCACCATCTGATGAGCTGTGTTACGTCTG 16238694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TCCGCCCAAGAGCACACCTGTGGTGAGGCCCCCACCATCTGATGAGCTGTGTTACGTCTG 1380

 16238695 TGCCCCTCGGGAGTACGGAAAGTGGAGGAGCTGGGCCCCAGAGAAATGGGCTACCCCAGA 16238754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TGCCCCTCGGGAGTACGGAAAGTGGAGGAGCTGGGCCCCAGAGAAATGGGCTACCCCAGA 1440

 16238755 GCTGGCAGCCCCACCAGAGGGGATCTGGATCCCCTGCCAAGCAATTAAGCTGCCCCCTCC 16238814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GCTGGCAGCCCCACCAGAGGGGATCTGGATCCCCTGCCAAGCAATTAAGCTGCCCCCTCC 1500

 16238815 TGGCCAACTCCCCTTCTGCCCCTCACCACTGGGTTGGCTCTCCATCCAGTGGCCCCATAT 16238874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TGGCCAACTCCCCTTCTGCCCCTCACCACTGGGTTGGCTCTCCATCCAGTGGCCCCATAT 1560

 16238875 TTCCTGTTGACATTGGGGTGCAAGGCCTTTTCCACAACCAAGGGCAGCACTGGTTCTATT 16238934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTCCTGTTGACATTGGGGTGCAAGGCCTTTTCCACAACCAAGGGCAGCACTGGTTCTATT 1620

 16238935 TCTGCAGGTCCCTCTCCTCTGTGTGCTTGCCAAGACCCAGATCCCAGACAAGCACCACCC 16238994
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     1621 TCTGCAGGTCCCTCTCCTCTGTGTGCTTGCCAAGACCCAGATCCCAGACAAGCACCACCT 1680

 16238995 TGCACACTGTTTTTATTTAATCCTCTTGGCCACCCAGAGAGGCAGGGCTTATCAACCCTA 16239054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TGCACACTGTTTTTATTTAATCCTCTTGGCCACCCAGAGAGGCAGGGCTTATCAACCCTA 1740

 16239055 CTCTACCTGTGAGGAAAACTGAGACAGAAAAAGATGCTGCGGGTTGCCCTGAGCCACCTT 16239114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     1741 CTCTACCTGTGAGGAAAACTGAGACAGAAAAAGATGCTGCGGGTTGCCCTGAGCCATCTT 1800

 16239115 GATGGGCTTCCAAGCCGATGGTCATGACAGCATAGTGTAGTGTGATAGAATCAGCTAGAT 16239174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GATGGGCTTCCAAGCCGATGGTCATGACAGCATAGTGTAGTGTGATAGAATCAGCTAGAT 1860

 16239175 GGGTTTCAGGGTATTCGTCTGGGGTGGTGATGCCCACACCAAATCATTAAATCAGAAAAT 16239234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GGGTTTCAGGGTATTCGTCTGGGGTGGTGATGCCCACACCAAATCATTAAATCAGAAAAT 1920

 16239235 GCTTGCGATGACCAGCCCATGATGACCCTTTACAAGTGGAAGTCAGTATTACTGCTGTTT 16239294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GCTTGCGATGACCAGCCCATGATGACCCTTTACAAGTGGAAGTCAGTATTACTGCTGTTT 1980

 16239295 TCTGGAGGGAAGGAGTTGAGGATCATACCAGCTTTTTCCGAGCACTATACCACTCAGACA 16239354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TCTGGAGGGAAGGAGTTGAGGATCATACCAGCTTTTTCCGAGCACTATACCACTCAGACA 2040

 16239355 TGGGTGCTCTTACCCACTTCAAAACCCTCTGAGAATGCCAAACAACCATCGCAG 16239408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TGGGTGCTCTTACCCACTTCAAAACCCTCTGAGAATGCCAAACAACCATCGCAG 2094

EXCISED REGION

 16241210 TGGAGCACAGGCTGCACTGCGGGGTCTGTCTTGCTTTTTACCCTGCAATGGTCAGTCATT 16241269
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2095 TGGAGCACAGGCTGCACTGCGGGTTCTGTCTTGCTTTTTACCCTGCAATGGTCAGTCATT 2154

 16241270 GACCATGACTGGGGCTGGGGGCAGCATCCTGCATGACTGTCTGGCACCTGCAGCAGAGAC 16241329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2155 GACCATGACTGGGGCTGGGGGCAGCATCCTGCATGACTGTCTGGCACCTGCAGCAGAGAC 2214

 16241330 CGTTTTAATACCCCAAGGCAAGTCTCCAGGGAAGGGTTAAGATTTCAGTTAGCACCCACA 16241389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2215 CGTTTTAATACCCCAAGGCAAGTCTCCAGGGAAGGGTTAAGATTTCAGTTAGCACCCACA 2274

 16241390 GCAGCTGGGGACATGCAAACCAAACCAAAACAGTTAAGGGGAGCTCAGGGAATCTGAGTA 16241449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2275 GCAGCTGGGGACATGCAAACCAAACCAAAACAGTTAAGGGGAGCTCAGGGAATCTGAGTA 2334

 16241450 GGACACTATATTAGTCTGTTCTCACACTGCTATAAAGAACTGCCTGAGACTAGGTAATTT 16241509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2335 GGACACTATATTAGTCTGTTCTCACACTGCTATAAAGAACTGCCTGAGACTAGGTAATTT 2394

 16241510 ATAAAGAAAGGAGGTTTAATTGACTCACAGTTTCGCATGGCTGGGGAGGCCTCAGGAAAC 16241569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2395 ATAAAGAAAGGAGGTTTAATTGACTCACAGTTTCGCATGGCTGGGGAGGCCTCAGGAAAC 2454

 16241570 TTACAATCATGGTGGAAGGGGAAGCATGTCTTACATGGCAGCAAGTGAGAGAAAGAGAGA 16241629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2455 TTACAATCATGGTGGAAGGGGAAGCATGTCTTACATGGCAGCAAGTGAGAGAAAGAGAGA 2514

 16241630 GAGAGAGGAGGAAAAACTATCAAACACTTATATAATCATCAGATCTCATGAGAACTCACT 16241689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2515 GAGAGAGGAGGAAAAACTATCAAACACTTATATAATCATCAGATCTCATGAGAACTCACT 2574

 16241690 ATCACGAGAACAGCATGGGGGAAACTGCCCACATGATCCAATCACCTCCCACCAGGTCCC 16241749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2575 ATCACGAGAACAGCATGGGGGAAACTGCCCACATGATCCAATCACCTCCCACCAGGTCCC 2634

 16241750 TCCCTCGCCACATAGGGATTATGGGGATTACCACTCAAGATGAGATCTGGGTGGGGACAA 16241809
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     2635 TCCCTCGCCACATAGGGATTATGGGGATTACAACTCAAGATGAGATCTGGGTGGGGACAA 2694

 16241810 AGAGCCAAACCATATCAGACACCAACAGTATCTGCTACATTCTTGCTGCTGCATTTGGAG 16241869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2695 AGAGCCAAACCATATCAGACACCAACAGTATCTGCTACATTCTTGCTGCTGCATTTGGAG 2754

 16241870 AATGTTAGCAAGTTCTCCCCTTTCCTGGTTTTCTGACACCATCCCTCTAATTTTTACTGG 16241929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2755 AATGTTAGCAAGTTCTCCCCTTTCCTGGTTTTCTGACACCATCCCTCTAATTTTTACTGG 2814

 16241930 AGAGAATCATGGCCCACCCCAACCTAACCAAGCATCTTACATCTCAGCAACAACCACACT 16241989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2815 AGAGAATCATGGCCCACCCCAACCTAACCAAGCATCTTACATCTCAGCAACAACCACACT 2874

 16241990 GTAGTAATGTTTTCGGTTCTTAGGACCCAGGTGCTCACCACAGCTTCCAAAAGAGAGTTG 16242049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2875 GTAGTAATGTTTTCGGTTCTTAGGACCCAGGTGCTCACCACAGCTTCCAAAAGAGAGTTG 2934

 16242050 CTGACGATTGTCTTAGTCACAATCTCATCGGTTGTGGCATTTGTCATTCCACTGACCACA 16242109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2935 CTGACGATTGTCTTAGTCACAATCTCATCGGTTGTGGCATTTGTCATTCCACTGACCACA 2994

 16242110 ACCCTGTTGATTCCAGGACAACTCAAGTCTGCTCTCAGCGAATATGTGGCCAGGCTGGAG 16242169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2995 ACCCTGTTGATTCCAGGACAACTCAAGTCTGCTCTCAGCGAATATGTGGCCAGGCTGGAG 3054

 16242170 GGGGTGAAGTTACTCAGGAGCAACAAGAGGCTGGGTGCCATCAGGGCCCGGATGCTGGGG 16242229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3055 GGGGTGAAGTTACTCAGGAGCAACAAGAGGCTGGGTGCCATCAGGGCCCGGATGCTGGGG 3114

 16242230 GCCACCAGAGCCACCGGGGATGTGCTCGTCTTCATGGATGCCCACTGCGAGTGCCACCCA 16242289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3115 GCCACCAGAGCCACCGGGGATGTGCTCGTCTTCATGGATGCCCACTGCGAGTGCCACCCA 3174

 16242290 GGCTGGCTGGAGCCCCTCCTCAGCAGAATAGCTGGTGACAGGTAACTTATTCCCTGGGCT 16242349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3175 GGCTGGCTGGAGCCCCTCCTCAGCAGAATAGCTGGTGACAGGTAACTTATTCCCTGGGCT 3234

 16242350 TGCAAAGCAAGACATGGAACTGGGAGAAACAGTCTACAGCATCAGCCACTCACAGAGCAA 16242409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3235 TGCAAAGCAAGACATGGAACTGGGAGAAACAGTCTACAGCATCAGCCACTCACAGAGCAA 3294

 16242410 CCCACCTATTAATTCCTGAATCTCCATTAGAGAGTGATATATTCCCTTCGGGTTTTCAGA 16242469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3295 CCCACCTATTAATTCCTGAATCTCCATTAGAGAGTGATATATTCCCTTCGGGTTTTCAGA 3354

 16242470 TGTGTAAGTTTTTTAAGACTATAGAGTTAGAGTTGGAAAGGAGGTTAGAGGTCTTCATCT 16242529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3355 TGTGTAAGTTTTTTAAGACTATAGAGTTAGAGTTGGAAAGGAGGTTAGAGGTCTTCATCT 3414

 16242530 ACCTTGCTTTATAGATAAAGAAACCGAGGCCTGGAGAACAGCTTCTATGAGGTTGCAAAT 16242589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3415 ACCTTGCTTTATAGATAAAGAAACCGAGGCCTGGAGAACAGCTTCTATGAGGTTGCAAAT 3474

 16242590 ACTTAAAATTGTATTAAATTGCATGACGAGGGTAACACCTTACCATAGCTATCATTGCCT 16242649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3475 ACTTAAAATTGTATTAAATTGCATGACGAGGGTAACACCTTACCATAGCTATCATTGCCT 3534

 16242650 TTGGTGAAAATTTGGCAATTTTTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTGTG 16242709
          ||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||
     3535 TTGGTGAAAATTTGGCAATTTT------TTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTGTG 3588

 16242710 ATGGCGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGCGGGGCGATCTCGGCTCACTGCAA 16242769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3589 ATGGCGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGCGGGGCGATCTCGGCTCACTGCAA 3648

 16242770 GCTGCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTAC 16242829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3649 GCTGCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTAC 3708

 16242830 AGGCGCCCGCCACCACACCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGAAGGGGTTTCACC 16242889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3709 AGGCGCCCGCCACCACACCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGAAGGGGTTTCACC 3768

 16242890 GTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACTTCGTGATCCGCCCTCCTCAGCCTCCCAA 16242949
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3769 GTGTTAGCCAGGATGGTCTCAATCTCCTGACTTCGTGATCCGCCCTCCTCAGCCTCCCAA 3828

 16242950 AGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCTGGCCGAAAATTCGTCAATTTTAATCA 16243009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3829 AGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCTGGCCGAAAATTCGTCAATTTTAATCA 3888

 16243010 AGCTTGTAACATAACCTGGGGAAAAAGTCTCTGAACTACACTAGGCCGTAGATTACTCAC 16243069
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3889 AGCTTGTAACATAAACTGGGGAAAAAGTCTCTGAACTACACTAGGCCGTAGATTACTCAC 3948

 16243070 CCATAAAAAGAAAACATTATGTTCTCTGATCACTAAACAGCATTCTTTGTTTCCCCAGTT 16243129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3949 CCATAAAAAGAAAACATTATGTTCTCTGATCACTAAACAGCATTCTTTGTTTCCCCAGTT 4008

 16243130 TATATAAGGGGTCCCTAATTTTCTACCTAAGGCCAGTCCTTGGAAATGTGAAGTTGGAGA 16243189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4009 TATATAAGGGGTCCCTAATTTTCTACCTAAGGCCAGTCCTTGGAAATGTGAAGTTGGAGA 4068

 16243190 GGACTGCATTACATTACCCTGTAGACAAGCATCTTAACATTTTTCTTGATCATTTCTCTG 16243249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4069 GGACTGCATTACATTACCCTGTAGACAAGCATCTTAACATTTTTCTTGATCATTTCTCTG 4128

 16243250 CTCTCCTTCCCCCATCTGACCGTCAATCTCTTTCTCACTTCCTTGCTCAAGACAAACAGT 16243309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4129 CTCTCCTTCCCCCATCTGACCGTCAATCTCTTTCTCACTTCCTTGCTCAAGACAAACAGT 4188

 16243310 TCCTAAACATGTCTAGTCAAACATTACCCTCAATCTGAATATCCTACCCAGGAAAACTGA 16243369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4189 TCCTAAACATGTCTAGTCAAACATTACCCTCAATCTGAATATCCTACCCAGGAAAACTGA 4248

 16243370 AACCTGGTGGCTGGCCCACCTTGGACCACCTCAGGCATACCACTTGGAGCTCATGTAGGC 16243429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4249 AACCTGGTGGCTGGCCCACCTTGGACCACCTCAGGCATACCACTTGGAGCTCATGTAGGC 4308

 16243430 ATGTAGCAGAGTAGAACCACAATCAATAATTGTTTGATGGTGCCCAGCAAGACAGGACCA 16243489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4309 ATGTAGCAGAGTAGAACCACAATCAATAATTGTTTGATGGTGCCCAGCAAGACAGGACCA 4368

 16243490 ATGCTAGAACCAAGCCTTATGACTTCTACCCATGATGAATGTTTATTATCTCACCTGAAG 16243549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4369 ATGCTAGAACCAAGCCTTATGACTTCTACCCATGATGAATGTTTATTATCTCACCTGAAG 4428

 16243550 TTAGGGATGATCAATCAAATATAAGAAAAAATTCCTGGACCAGATCGGAATGAATCCTGG 16243609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4429 TTAGGGATGATCAATCAAATATAAGAAAAAATTCCTGGACCAGATCGGAATGAATCCTGG 4488

 16243610 AGACATAGGAGTTACCATCAGCCAAATGGAGATGGTTTCAAACGTTCAAATGACAGAAAG 16243669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4489 AGACATAGGAGTTACCATCAGCCAAATGGAGATGGTTTCAAACGTTCAAATGACAGAAAG 4548

 16243670 TAAATTGTTAATAGTTCAGCATTCCATTTTAACAAAGAAGAACAATCGGAACTCAAGTGA 16243729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4549 TAAATTGTTAATAGTTCAGCATTCCATTTTAACAAAGAAGAACAATCGGAACTCAAGTGA 4608

 16243730 GATCAAGACAGATTAATGTTTCCCAGTTTCATGAGACAGATTGTCTCTTGACTCACATCT 16243789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4609 GATCAAGACAGATTAATGTTTCCCAGTTTCATGAGACAGATTGTCTCTTGACTCACATCT 4668

 16243790 CATAAGAAAAGAAGACACACATAAATTCAGCACTAGGACAAGAACTAGGACACAAAAATG 16243849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4669 CATAAGAAAAGAAGACACACATAAATTCAGCACTAGGACAAGAACTAGGACACAAAAATG 4728

 16243850 CACAAGCTGGCCAGGCACGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGG 16243909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4729 CACAAGCTGGCCAGGCACGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGG 4788

 16243910 CAGACGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAA 16243963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4789 CAGACGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAA 4842

Alignment time is 6.4066 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [16229408,16251209] =>     21802 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    2095] =>      2095 nucs 'mol-32-2fe3-273066_2095'

Score:        2083
Aligned:      2094        nucs
Identic:      2093 (100%) nucs =>      1679 (100%)       414 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [16237315,16238993] EXCISED REGION [16238995,16239409]
 second seq =>  [       1,    1679] EXCISED REGION [    1681,    2095]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [16238994,16238994]
 second seq =>         1 nucs [1680,1680]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [16238992,16238993] to [16238993,16238994]
 second seq =>         1 nucs [1680,1680] to [1681,1681]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 16237315 CCTCTGTTTCCATGATGAGGCCTGGTCCACTCTCCTGCGGACTGTACACAGCATCCTCGA 16237374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCTCTGTTTCCATGATGAGGCCTGGTCCACTCTCCTGCGGACTGTACACAGCATCCTCGA 60

 16237375 CACAGTGCCCAGGGCCTTCCTGAAGGAGATCATCCTCGTGGACGACCTCAGCCAGCAAGG 16237434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CACAGTGCCCAGGGCCTTCCTGAAGGAGATCATCCTCGTGGACGACCTCAGCCAGCAAGG 120

 16237435 TAGCCACGGCTTTCCTCCAGGCTCGTCTGGGTGAGCCTTACCCCCTGGCGGGTGGAGTTC 16237494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TAGCCACGGCTTTCCTCCAGGCTCGTCTGGGTGAGCCTTACCCCCTGGCGGGTGGAGTTC 180

 16237495 TCAAGCAAAAGATTGAAGTTTGGAACTATTTTAGGCAAGATTCCCCAACTACAGACCTCC 16237554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCAAGCAAAAGATTGAAGTTTGGAACTATTTTAGGCAAGATTCCCCAACTACAGACCTCC 240

 16237555 AGATGAGGATTAATGGGCAAGTAACTTATGAATGAAGAGCCACTGGGGAAACCAGTAAGG 16237614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGATGAGGATTAATGGGCAAGTAACTTATGAATGAAGAGCCACTGGGGAAACCAGTAAGG 300

 16237615 CAGTGGGGGCTGCAAGACAGAGAAGGAGAAAGAGCCCTGCAGGGGAAACAGCCCTGGGGA 16237674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CAGTGGGGGCTGCAAGACAGAGAAGGAGAAAGAGCCCTGCAGGGGAAACAGCCCTGGGGA 360

 16237675 GGGTCTTGAGGGGTGTCGCCTCAGCCTGATCCCGTGGGGATCTCTCTCCCAGGTGCCACC 16237734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGGTCTTGAGGGGTGTCGCCTCAGCCTGATCCCGTGGGGATCTCTCTCCCAGGTGCCACC 420

 16237735 CAGTCCAACAATCCTCTCTCCAAGACACTGAAGAATCACATAGGGCGGCCCTGTTGTGAG 16237794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CAGTCCAACAATCCTCTCTCCAAGACACTGAAGAATCACATAGGGCGGCCCTGTTGTGAG 480

 16237795 TGCTCACTGCCTCCTAGACCCTGGTGCAGCACTTTACACATACGCACATATGTGTATCGG 16237854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGCTCACTGCCTCCTAGACCCTGGTGCAGCACTTTACACATACGCACATATGTGTATCGG 540

 16237855 TCCTTCACTCATCATGGCTTAGACAGACCCACTCACTTTCCAGAGGAGGAAACTGGGGCC 16237914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCCTTCACTCATCATGGCTTAGACAGACCCACTCACTTTCCAGAGGAGGAAACTGGGGCC 600

 16237915 CAGAGAAGACAGCAGACTGGAGCGGAGTCAGCCAAAAGCAGCAGAGTCAGGCCCAGAGCC 16237974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CAGAGAAGACAGCAGACTGGAGCGGAGTCAGCCAAAAGCAGCAGAGTCAGGCCCAGAGCC 660

 16237975 CAGACTTGCAGAACCTGCCTGTGTGCTTCCTCTCACAGGAACCTGGCTACTAGGGACAGC 16238034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CAGACTTGCAGAACCTGCCTGTGTGCTTCCTCTCACAGGAACCTGGCTACTAGGGACAGC 720

 16238035 CCTAAAAGAAGATGGAGACAGAGAAGCCCCCACTTGACTCGTAGGTCAGTGGCTCTCACG 16238094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CCTAAAAGAAGATGGAGACAGAGAAGCCCCCACTTGACTCGTAGGTCAGTGGCTCTCACG 780

 16238095 CTTGAGCATGCATCGGAATCACCTGGTGCGATTTTTAAAATACTACTGCAGGGCCCACCC 16238154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTTGAGCATGCATCGGAATCACCTGGTGCGATTTTTAAAATACTACTGCAGGGCCCACCC 840

 16238155 CCAGAGTTTCTGGTGATGGAGTGGGGCCGAAGAATTTGCATTTCTAACAAGCTCCCAGGT 16238214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CCAGAGTTTCTGGTGATGGAGTGGGGCCGAAGAATTTGCATTTCTAACAAGCTCCCAGGT 900

 16238215 GATGCTGATGCTGCTGTTTTCTGTGGACCACACTCTGAGAACCTCTGCTCTAGTCTTTGG 16238274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GATGCTGATGCTGCTGTTTTCTGTGGACCACACTCTGAGAACCTCTGCTCTAGTCTTTGG 960

 16238275 CTTGGGCGTGAGGCCTACATTTCTGGCACAACTAAATGACCTAGGGACACCCCTCCTGGC 16238334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTTGGGCGTGAGGCCTACATTTCTGGCACAACTAAATGACCTAGGGACACCCCTCCTGGC 1020

 16238335 CTTCTGGGAAGATCAGAACGCTCTGAGGGAAGCCGAGCATTCACGTTTTTCTAAGGGGAA 16238394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTTCTGGGAAGATCAGAACGCTCTGAGGGAAGCCGAGCATTCACGTTTTTCTAAGGGGAA 1080

 16238395 TAATGGAGAAGGGCTAGGGTAGCCAGGTGCCTCTGTTAGTTCTTTCTACGGTCCTCACTC 16238454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TAATGGAGAAGGGCTAGGGTAGCCAGGTGCCTCTGTTAGTTCTTTCTACGGTCCTCACTC 1140

 16238455 CAGGGATGGGCCTAGCCTGGCCATAGCAGTGAGTCAGATTAGCCAGAGGCTCTGGGAACA 16238514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CAGGGATGGGCCTAGCCTGGCCATAGCAGTGAGTCAGATTAGCCAGAGGCTCTGGGAACA 1200

 16238515 CCTGGGGTTCCTGGGTGCAGCTGGCTGCATATTAGGCAGGACTAATGAACAGGTGCAGGA 16238574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CCTGGGGTTCCTGGGTGCAGCTGGCTGCATATTAGGCAGGACTAATGAACAGGTGCAGGA 1260

 16238575 CAGGGCTGGGTTGGCGGGTAAAGTGCCCAGAGACTCTCCAAACCCTCAAGTGGGGCGGGG 16238634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CAGGGCTGGGTTGGCGGGTAAAGTGCCCAGAGACTCTCCAAACCCTCAAGTGGGGCGGGG 1320

 16238635 TCCGCCCAAGAGCACACCTGTGGTGAGGCCCCCACCATCTGATGAGCTGTGTTACGTCTG 16238694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TCCGCCCAAGAGCACACCTGTGGTGAGGCCCCCACCATCTGATGAGCTGTGTTACGTCTG 1380

 16238695 TGCCCCTCGGGAGTACGGAAAGTGGAGGAGCTGGGCCCCAGAGAAATGGGCTACCCCAGA 16238754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TGCCCCTCGGGAGTACGGAAAGTGGAGGAGCTGGGCCCCAGAGAAATGGGCTACCCCAGA 1440

 16238755 GCTGGCAGCCCCACCAGAGGGGATCTGGATCCCCTGCCAAGCAATTAAGCTGCCCCCTCC 16238814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GCTGGCAGCCCCACCAGAGGGGATCTGGATCCCCTGCCAAGCAATTAAGCTGCCCCCTCC 1500

 16238815 TGGCCAACTCCCCTTCTGCCCCTCACCACTGGGTTGGCTCTCCATCCAGTGGCCCCATAT 16238874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TGGCCAACTCCCCTTCTGCCCCTCACCACTGGGTTGGCTCTCCATCCAGTGGCCCCATAT 1560

 16238875 TTCCTGTTGACATTGGGGTGCAAGGCCTTTTCCACAACCAAGGGCAGCACTGGTTCTATT 16238934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTCCTGTTGACATTGGGGTGCAAGGCCTTTTCCACAACCAAGGGCAGCACTGGTTCTATT 1620

 16238935 TCTGCAGGTCCCTCTCCTCTGTGTGCTTGCCAAGACCCAGATCCCAGACAAGCACCACC 16238993
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TCTGCAGGTCCCTCTCCTCTGTGTGCTTGCCAAGACCCAGATCCCAGACAAGCACCACC 1679

EXCISED REGION

 16238995 TGCACACTGTTTTTATTTAATCCTCTTGGCCACCCAGAGAGGCAGGGCTTATCAACCCTA 16239054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TGCACACTGTTTTTATTTAATCCTCTTGGCCACCCAGAGAGGCAGGGCTTATCAACCCTA 1740

 16239055 CTCTACCTGTGAGGAAAACTGAGACAGAAAAAGATGCTGCGGGTTGCCCTGAGCCACCTT 16239114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     1741 CTCTACCTGTGAGGAAAACTGAGACAGAAAAAGATGCTGCGGGTTGCCCTGAGCCATCTT 1800

 16239115 GATGGGCTTCCAAGCCGATGGTCATGACAGCATAGTGTAGTGTGATAGAATCAGCTAGAT 16239174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GATGGGCTTCCAAGCCGATGGTCATGACAGCATAGTGTAGTGTGATAGAATCAGCTAGAT 1860

 16239175 GGGTTTCAGGGTATTCGTCTGGGGTGGTGATGCCCACACCAAATCATTAAATCAGAAAAT 16239234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GGGTTTCAGGGTATTCGTCTGGGGTGGTGATGCCCACACCAAATCATTAAATCAGAAAAT 1920

 16239235 GCTTGCGATGACCAGCCCATGATGACCCTTTACAAGTGGAAGTCAGTATTACTGCTGTTT 16239294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GCTTGCGATGACCAGCCCATGATGACCCTTTACAAGTGGAAGTCAGTATTACTGCTGTTT 1980

 16239295 TCTGGAGGGAAGGAGTTGAGGATCATACCAGCTTTTTCCGAGCACTATACCACTCAGACA 16239354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TCTGGAGGGAAGGAGTTGAGGATCATACCAGCTTTTTCCGAGCACTATACCACTCAGACA 2040

 16239355 TGGGTGCTCTTACCCACTTCAAAACCCTCTGAGAATGCCAAACAACCATCGCAGT 16239409
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TGGGTGCTCTTACCCACTTCAAAACCCTCTGAGAATGCCAAACAACCATCGCAGT 2095

Alignment time is 2.63456 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [16229408,16251209] =>     21802 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    2392] =>      2392 nucs 'mol-32-2fee-195134_2392'

Score:        2298
Aligned:      2386        nucs
Identic:      2378 (100%) nucs =>       661 (100%)      1717 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [16238486,16239149] EXCISED REGION [16239157,16240878]
 second seq =>  [       1,     664] EXCISED REGION [     672,    2392]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         7 nucs [16239150,16239156]
 second seq =>         7 nucs [665,671]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [16239149,16239151] to [16239156,16239158]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [16239150,16239151] to [16239155,16239156]
 second seq =>         1 nucs [665,665] to [671,671]

 16238486 AGTCAGATTAGCCAGAGGCTCTGGGAACACCTGGGGTTCCTGGGTGCAGCTGGCTGCATA 16238545
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
        1 AGTCAGATTAGCCAGAGGCTCTGGGAACACCTGGGGTTCCTGGGTACAGCTGGCTGCATA 60

 16238546 TTAGGCAGGACTAATGAACAGGTGCAGGACAGGGCTGGGTTGGCGGGTAAAGTGCCCAGA 16238605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTAGGCAGGACTAATGAACAGGTGCAGGACAGGGCTGGGTTGGCGGGTAAAGTGCCCAGA 120

 16238606 GACTCTCCAAACCCTCAAGTGGGGCGGGGTCCGCCCAAGAGCACACCTGTGGTGAGGCCC 16238665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GACTCTCCAAACCCTCAAGTGGGGCGGGGTCCGCCCAAGAGCACACCTGTGGTGAGGCCC 180

 16238666 CCACCATCTGATGAGCTGTGTTACGTCTGTGCCCCTCGGGAGTACGGAAAGTGGAGGAGC 16238725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCACCATCTGATGAGCTGTGTTACGTCTGTGCCCCTCGGGAGTACGGAAAGTGGAGGAGC 240

 16238726 TGGGCCCCAGAGAAATGGGCTACCCCAGAGCTGGCAGCCCCACCAGAGGGGATCTGGATC 16238785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGGGCCCCAGAGAAATGGGCTACCCCAGAGCTGGCAGCCCCACCAGAGGGGATCTGGATC 300

 16238786 CCCTGCCAAGCAATTAAGCTGCCCCCTCCTGGCCAACTCCCCTTCTGCCCCTCACCACTG 16238845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCCTGCCAAGCAATTAAGCTGCCCCCTCCTGGCCAACTCCCCTTCTGCCCCTCACCACTG 360

 16238846 GGTTGGCTCTCCATCCAGTGGCCCCATATTTCCTGTTGACATTGGGGTGCAAGGCCTTTT 16238905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGTTGGCTCTCCATCCAGTGGCCCCATATTTCCTGTTGACATTGGGGTGCAAGGCCTTTT 420

 16238906 CCACAACCAAGGGCAGCACTGGTTCTATTTCTGCAGGTCCCTCTCCTCTGTGTGCTTGCC 16238965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCACAACCAAGGGCAGCACTGGTTCTATTTCTGCAGGTCCCTCTCCTCTGTGTGCTTGCC 480

 16238966 AAGACCCAGATCCCAGACAAGCACCACCCTGCACACTGTTTTTATTTAATCCTCTTGGCC 16239025
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAGACCCAGATCCCAGACAAGCACCACCTTGCACACTGTTTTTATTTAATCCTCTTGGCC 540

 16239026 ACCCAGAGAGGCAGGGCTTATCAACCCTACTCTACCTGTGAGGAAAACTGAGACAGAAAA 16239085
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
      541 ACCCAGAGAGGCAGGGCTTATCAACCCTACTCTACCTATGAGGAAAACTGAGACAGAAAA 600

 16239086 AGATGCTGCGGGTTGCCCTGAGCCACCTTGATGGGCTTCCAAGCCGATGGTCATGACAGC 16239145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGATGCTGCGGGTTGCCCTGAGCCACCTTGATGGGCTTCCAAGCCGATGGTCATGACAGC 660

 16239146 ATAG 16239149
          ||||
      661 ATAG 664

EXCISED REGION

 16239157 TGATAGAATCAGCTAGATGGGTTTCAGGGTATTCGTCTGGGGTGGTGATGCCCACACCAA 16239216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      672 TGATAGAATCAGCTAGATGGGTTTCAGGGTATTCGTCTGGGGTGGTGATGCCCACACCAA 731

 16239217 ATCATTAAATCAGAAAATGCTTGCGATGACCAGCCCATGATGACCCTTTACAAGTGGAAG 16239276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      732 ATCATTAAATCAGAAAATGCTTGCGATGACCAGCCCATGATGACCCTTTACAAGTGGAAG 791

 16239277 TCAGTATTACTGCTGTTTTCTGGAGGGAAGGAGTTGAGGATCATACCAGCTTTTTCCGAG 16239336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      792 TCAGTATTACTGCTGTTTTCTGGAGGGAAGGAGTTGAGGATCATACCAGCTTTTTCCGAG 851

 16239337 CACTATACCACTCAGACATGGGTGCTCTTACCCACTTCAAAACCCTCTGAGAATGCCAAA 16239396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      852 CACTATACCACTCAGACATGGGTGCTCTTACCCACTTCAAAACCCTCTGAGAATGCCAAA 911

 16239397 CAACCATCGCAGTCTGGAAGTTCTTCCTTATCTATTCCGAAGCTCTCTTGCTAGAAGTCT 16239456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      912 CAACCATCGCAGTCTGGAAGTTCTTCCTTATCTATTCCGAAGCTCTCTTGCTAGAAGTCT 971

 16239457 GTCCTAAATAATACTAACAAGGGTTAGAGGTATAGCTGAAGAGACCAGCAGTCAGCCCAA 16239516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      972 GTCCTAAATAATACTAACAAGGGTTAGAGGTATAGCTGAAGAGACCAGCAGTCAGCCCAA 1031

 16239517 GGAGGGCTTCATAAATTAATGTTTGGTGGGAATATCAGTGAAGGACTATATTTGGCTGCA 16239576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1032 GGAGGGCTTCATAAATTAATGTTTGGTGGGAATATCAGTGAAGGACTATATTTGGCTGCA 1091

 16239577 CAGAACAGAAACCTGCTGCAGTGACTTAACCAATGAATAGAGATTTATTTTTCCTTATAG 16239636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1092 CAGAACAGAAACCTGCTGCAGTGACTTAACCAATGAATAGAGATTTATTTTTCCTTATAG 1151

 16239637 TATAGAAAGCTCACAGGGTGGCAATGCAGTATTGGTGTGACAGCTCCACAATGCCATTGG 16239696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1152 TATAGAAAGCTCACAGGGTGGCAATGCAGTATTGGTGTGACAGCTCCACAATGCCATTGG 1211

 16239697 ACACCCACCTTCATCTGCTTTCCACTTCAACATGCTTAGAGAGTAGTTTTGGCCTCATAA 16239756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1212 ACACCCACCTTCATCTGCTTTCCACTTCAACATGCTTAGAGAGTAGTTTTGGCCTCATAA 1271

 16239757 TCACAACAGGGCTGCTCTACCTCTGGACATCACATACATATTTCAAATAGGGAAAAGGCG 16239816
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1272 TCACAACAGGGCTGTTCTACCTCTGGACATCACATACATATTTCAAATAGGGAAAAGGCG 1331

 16239817 AAGAAGAGATAGGCAGAGGCCAGTCCGGTTTGTGCTCTTCGGAAAAAAAAAATTAGTAAA 16239876
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
     1332 AAGAAGAGATAGGCAGAGGCCAGTCCGGTTTGTGCTCTTCGG-AAAAAAAAATTAGTAAA 1390

 16239877 ATAATAGTTTTCCCAGAATCCTTTCATTCATTTTATTTCTACCAGAGCTGCTGCCAGCAG 16239936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1391 ATAATAGTTTTCCCAGAATCCTTTCATTCATTTTATTTCTACCAGAGCTGCTGCCAGCAG 1450

 16239937 TGACAGGAAGTCTCGAGAGATACGTGTTTTTAGCTGTCCCGAGAAACATCAAAGTTCTGT 16239996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1451 TGACAGGAAGTCTCGAGAGATACGTGTTTTTAGCTGCCCCGAGAAACATCAAAGTTCTGT 1510

 16239997 CAGTACAGTGGAAGGGGAGAATGAATGGTGAGGAAGATGTTACATTTAGCAATGTTAAAG 16240056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1511 CAGTACAGTGGAAGGGGAGAATGAATGGTGAGGAAGATGTTACATTTAGCAATGTTAAAG 1570

 16240057 CCAATGAAGTCACTGAGGGGCTGCTTCTCAGATATGCAAGTCCAGAAATGTTAATAGCTT 16240116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1571 CCAATGAAGTCACTGAGGGGCTGCTTCTCAGATATGCAAGTCCAGAAATGTTAATAGCTT 1630

 16240117 GACTAACAGAGATTCCTCTCTAGGGAGTGGACCAGGGCTGACAGTCTTACCAGAAAAATA 16240176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1631 GACTAACAGAGATTCCTCTCTAGGGAGTGGACCAGGGCTGACAGTCTTACCAGAAAAATA 1690

 16240177 ATTATAAAGTAACACATCAACGAAGCATTTTACCAGTGAGAATTGCAACAGCCCAGTGAC 16240236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1691 ATTATAAAGTAACACATCAACGAAGCATTTTACCAGTGAGAATTGCAACAGCCCAGTGAC 1750

 16240237 TGGGACTCCTTTCCTCTACTGCTCAGGACATTGTTCACCCTGCAGAAAATCCATGGTGCT 16240296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1751 TGGGACTCCTTTCCTCTACTGCTCAGGACATTGTTCTCCCTGCAGAAAATCCATGGTGCT 1810

 16240297 TAGAAGACAGATTCCCAGGGAAGGAGTGTATGAAGTCTGCTGGGGGCTCTCGGGTGGGGC 16240356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1811 TAGAAGACAGATTCCCAGGGAAGGAGTGTATGAAGTCTGCTGGGGGCTCTCGGGTGGGGC 1870

 16240357 TGCCTTAACCTTCTCCAGCCTCCCCAGAGATCCAGCTACCAAAGCAGCCAGGCTACTTGT 16240416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1871 TGCCTTAACCTTCTCCAGCCTCCCCAGAGATCCAGCTACCAAAGCAGCCAGGCTACTTGT 1930

 16240417 ATCCACAGTTAAGGCCACCTCTGGGCTGGGGAACTGGGGGGGAAATTCTTGCTTTTTGGC 16240476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1931 ATCCACAGTTAAGGCCACCTCTGGGCTGGGGAACTGGGGGGGAAATTCTTGCTTTTTGGC 1990

 16240477 TCAGTTCTGTTCAATGCACATGTACTGAGTGCCTACTGTGGGCCAGGCCCTGCACTAAGG 16240536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1991 TCAGTTCTGTTCAATGCACATGTACTGAGTGCCTACTGTGGGCCAGGCCCTGCACTAAGG 2050

 16240537 GTTAGAGCAGAAGAGATGCATTAGGTACAACCCCTGTCCTTGGGGAGATCTTAGTCCACT 16240596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2051 GTTAGAGCAGAAGAGATGCATTAGGTACAACCCCTGTCCTTGGGGAGATCTTAGTCCACT 2110

 16240597 GGCCTGGGGGGACTCCCCATTTCCAAGACTTCATGGAGACCACTGCTTCTCTGTGAACAC 16240656
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2111 GGCCTGGGGGGACTCCCCGTTTCCAAGACTTCATGGAGACCACTGCTTCTCTGTGAACAC 2170

 16240657 ATTGTTCCTTCCATCTCCACTGGCTTGTTCCTCTTGGTGTGTGTGTACACAGACATGCAC 16240716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2171 ATTGTTCCTTCCATCTCCACTGGCTTGTTCCTCTTGGTGTGTGTGTACACAGACATGCAC 2230

 16240717 ACACACACACACATGCACTCACACACACAATCAAGTTATTCTTATCTTAAACACAAAACC 16240776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2231 ACACACACACACATGCACTCACACACACAATCAAGTTATTCTTATCTTAAACACAAAACC 2290

 16240777 TAACAAGCTTCTCTCATCCTTTCCGTCATCTTCTTAGGCCTCTTTTTCTCCCTTCCCCTA 16240836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2291 TAACAAGCTTCTCTCATCCTTTCCGTCATCTTCTTAGGCCTCTTTTTCTCCCTTCCCCTA 2350

 16240837 TAGAATCAACCTTCCTAACCGTCTGGACTCTTGGTCTCAGTT 16240878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2351 TAGAATCAACCTTCCTAACCGTCTGGACTCTTGGTCTCAGTT 2392

Alignment time is 2.98001 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [16229408,16251209] =>     21802 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    3873] =>      3873 nucs 'mol-32-2fee-247179_3873'

Score:        3746
Aligned:      3867        nucs
Identic:      3856 (100%) nucs =>       351 ( 99%)      3505 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [16238797,16239149] EXCISED REGION [16239157,16242670]
 second seq =>  [       1,     353] EXCISED REGION [     361,    3873]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         7 nucs [16239150,16239156]
 second seq =>         7 nucs [354,360]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [16239149,16239151] to [16239156,16239158]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [16239150,16239151] to [16239155,16239156]
 second seq =>         1 nucs [354,354] to [360,360]

 16238797 AATTAAGCTGCCCCCTCCTGGCCAACTCCCCTTCTGCCCCTCACCACTGGGTTGGCTCTC 16238856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AATTAAGCTGCCCCCTCCTGGCCAACTCCCCTTCTGCCCCTCACCACTGGGTTGGCTCTC 60

 16238857 CATCCAGTGGCCCCATATTTCCTGTTGACATTGGGGTGCAAGGCCTTTTCCACAACCAAG 16238916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CATCCAGTGGCCCCATATTTCCTGTTGACATTGGGGTGCAAGGCCTTTTCCACAACCAAG 120

 16238917 GGCAGCACTGGTTCTATTTCTGCAGGTCCCTCTCCTCTGTGTGCTTGCCAAGACCCAGAT 16238976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGCAGCACTGGTTCTATTTCTGCAGGTCCCTCTCCTCTGTGTGCTTGCCAAGACCCAGAT 180

 16238977 CCCAGACAAGCACCACCCTGCACACTGTTTTTATTTAATCCTCTTGGCCACCCAGAGAGG 16239036
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCCAGACAAGCACCACCTTGCACACTGTTTTTATTTAATCCTCTTGGCCACCCAGAGAGG 240

 16239037 CAGGGCTTATCAACCCTACTCTACCTGTGAGGAAAACTGAGACAGAAAAAGATGCTGCGG 16239096
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CAGGGCTTATCAACCCTACTCTACCTATGAGGAAAACTGAGACAGAAAAAGATGCTGCGG 300

 16239097 GTTGCCCTGAGCCACCTTGATGGGCTTCCAAGCCGATGGTCATGACAGCATAG 16239149
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTTGCCCTGAGCCACCTTGATGGGCTTCCAAGCCGATGGTCATGACAGCATAG 353

EXCISED REGION

 16239157 TGATAGAATCAGCTAGATGGGTTTCAGGGTATTCGTCTGGGGTGGTGATGCCCACACCAA 16239216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGATAGAATCAGCTAGATGGGTTTCAGGGTATTCGTCTGGGGTGGTGATGCCCACACCAA 420

 16239217 ATCATTAAATCAGAAAATGCTTGCGATGACCAGCCCATGATGACCCTTTACAAGTGGAAG 16239276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATCATTAAATCAGAAAATGCTTGCGATGACCAGCCCATGATGACCCTTTACAAGTGGAAG 480

 16239277 TCAGTATTACTGCTGTTTTCTGGAGGGAAGGAGTTGAGGATCATACCAGCTTTTTCCGAG 16239336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCAGTATTACTGCTGTTTTCTGGAGGGAAGGAGTTGAGGATCATACCAGCTTTTTCCGAG 540

 16239337 CACTATACCACTCAGACATGGGTGCTCTTACCCACTTCAAAACCCTCTGAGAATGCCAAA 16239396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CACTATACCACTCAGACATGGGTGCTCTTACCCACTTCAAAACCCTCTGAGAATGCCAAA 600

 16239397 CAACCATCGCAGTCTGGAAGTTCTTCCTTATCTATTCCGAAGCTCTCTTGCTAGAAGTCT 16239456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CAACCATCGCAGTCTGGAAGTTCTTCCTTATCTATTCCGAAGCTCTCTTGCTAGAAGTCT 660

 16239457 GTCCTAAATAATACTAACAAGGGTTAGAGGTATAGCTGAAGAGACCAGCAGTCAGCCCAA 16239516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GTCCTAAATAATACTAACAAGGGTTAGAGGTATAGCTGAAGAGACCAGCAGTCAGCCCAA 720

 16239517 GGAGGGCTTCATAAATTAATGTTTGGTGGGAATATCAGTGAAGGACTATATTTGGCTGCA 16239576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GGAGGGCTTCATAAATTAATGTTTGGTGGGAATATCAGTGAAGGACTATATTTGGCTGCA 780

 16239577 CAGAACAGAAACCTGCTGCAGTGACTTAACCAATGAATAGAGATTTATTTTTCCTTATAG 16239636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CAGAACAGAAACCTGCTGCAGTGACTTAACCAATGAATAGAGATTTATTTTTCCTTATAG 840

 16239637 TATAGAAAGCTCACAGGGTGGCAATGCAGTATTGGTGTGACAGCTCCACAATGCCATTGG 16239696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TATAGAAAGCTCACAGGGTGGCAATGCAGTATTGGTGTGACAGCTCCACAATGCCATTGG 900

 16239697 ACACCCACCTTCATCTGCTTTCCACTTCAACATGCTTAGAGAGTAGTTTTGGCCTCATAA 16239756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ACACCCACCTTCATCTGCTTTCCACTTCAACATGCTTAGAGAGTAGTTTTGGCCTCATAA 960

 16239757 TCACAACAGGGCTGCTCTACCTCTGGACATCACATACATATTTCAAATAGGGAAAAGGCG 16239816
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TCACAACAGGGCTGTTCTACCTCTGGACATCACATACATATTTCAAATAGGGAAAAGGCG 1020

 16239817 AAGAAGAGATAGGCAGAGGCCAGTCCGGTTTGTGCTCTTCGGAAAAAAAAAATTAGTAAA 16239876
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
     1021 AAGAAGAGATAGGCAGAGGCCAGTCCGGTTTGTGCTCTTCGG-AAAAAAAAATTAGTAAA 1079

 16239877 ATAATAGTTTTCCCAGAATCCTTTCATTCATTTTATTTCTACCAGAGCTGCTGCCAGCAG 16239936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 ATAATAGTTTTCCCAGAATCCTTTCATTCATTTTATTTCTACCAGAGCTGCTGCCAGCAG 1139

 16239937 TGACAGGAAGTCTCGAGAGATACGTGTTTTTAGCTGTCCCGAGAAACATCAAAGTTCTGT 16239996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1140 TGACAGGAAGTCTCGAGAGATACGTGTTTTTAGCTGCCCCGAGAAACATCAAAGTTCTGT 1199

 16239997 CAGTACAGTGGAAGGGGAGAATGAATGGTGAGGAAGATGTTACATTTAGCAATGTTAAAG 16240056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 CAGTACAGTGGAAGGGGAGAATGAATGGTGAGGAAGATGTTACATTTAGCAATGTTAAAG 1259

 16240057 CCAATGAAGTCACTGAGGGGCTGCTTCTCAGATATGCAAGTCCAGAAATGTTAATAGCTT 16240116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 CCAATGAAGTCACTGAGGGGCTGCTTCTCAGATATGCAAGTCCAGAAATGTTAATAGCTT 1319

 16240117 GACTAACAGAGATTCCTCTCTAGGGAGTGGACCAGGGCTGACAGTCTTACCAGAAAAATA 16240176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 GACTAACAGAGATTCCTCTCTAGGGAGTGGACCAGGGCTGACAGTCTTACCAGAAAAATA 1379

 16240177 ATTATAAAGTAACACATCAACGAAGCATTTTACCAGTGAGAATTGCAACAGCCCAGTGAC 16240236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 ATTATAAAGTAACACATCAACGAAGCATTTTACCAGTGAGAATTGCAACAGCCCAGTGAC 1439

 16240237 TGGGACTCCTTTCCTCTACTGCTCAGGACATTGTTCACCCTGCAGAAAATCCATGGTGCT 16240296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1440 TGGGACTCCTTTCCTCTACTGCTCAGGACATTGTTCTCCCTGCAGAAAATCCATGGTGCT 1499

 16240297 TAGAAGACAGATTCCCAGGGAAGGAGTGTATGAAGTCTGCTGGGGGCTCTCGGGTGGGGC 16240356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 TAGAAGACAGATTCCCAGGGAAGGAGTGTATGAAGTCTGCTGGGGGCTCTCGGGTGGGGC 1559

 16240357 TGCCTTAACCTTCTCCAGCCTCCCCAGAGATCCAGCTACCAAAGCAGCCAGGCTACTTGT 16240416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 TGCCTTAACCTTCTCCAGCCTCCCCAGAGATCCAGCTACCAAAGCAGCCAGGCTACTTGT 1619

 16240417 ATCCACAGTTAAGGCCACCTCTGGGCTGGGGAACTGGGGGGGAAATTCTTGCTTTTTGGC 16240476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 ATCCACAGTTAAGGCCACCTCTGGGCTGGGGAACTGGGGGGGAAATTCTTGCTTTTTGGC 1679

 16240477 TCAGTTCTGTTCAATGCACATGTACTGAGTGCCTACTGTGGGCCAGGCCCTGCACTAAGG 16240536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 TCAGTTCTGTTCAATGCACATGTACTGAGTGCCTACTGTGGGCCAGGCCCTGCACTAAGG 1739

 16240537 GTTAGAGCAGAAGAGATGCATTAGGTACAACCCCTGTCCTTGGGGAGATCTTAGTCCACT 16240596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 GTTAGAGCAGAAGAGATGCATTAGGTACAACCCCTGTCCTTGGGGAGATCTTAGTCCACT 1799

 16240597 GGCCTGGGGGGACTCCCCATTTCCAAGACTTCATGGAGACCACTGCTTCTCTGTGAACAC 16240656
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 GGCCTGGGGGGACTCCCCGTTTCCAAGACTTCATGGAGACCACTGCTTCTCTGTGAACAC 1859

 16240657 ATTGTTCCTTCCATCTCCACTGGCTTGTTCCTCTTGGTGTGTGTGTACACAGACATGCAC 16240716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 ATTGTTCCTTCCATCTCCACTGGCTTGTTCCTCTTGGTGTGTGTGTACACAGACATGCAC 1919

 16240717 ACACACACACACATGCACTCACACACACAATCAAGTTATTCTTATCTTAAACACAAAACC 16240776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 ACACACACACACATGCACTCACACACACAATCAAGTTATTCTTATCTTAAACACAAAACC 1979

 16240777 TAACAAGCTTCTCTCATCCTTTCCGTCATCTTCTTAGGCCTCTTTTTCTCCCTTCCCCTA 16240836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 TAACAAGCTTCTCTCATCCTTTCCGTCATCTTCTTAGGCCTCTTTTTCTCCCTTCCCCTA 2039

 16240837 TAGAATCAACCTTCCTAACCGTCTGGACTCTTGGTCTCAGTTTTTCATCTTCCGTTTTCT 16240896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 TAGAATCAACCTTCCTAACCGTCTGGACTCTTGGTCTCAGTTTTTCATCTTCCGTTTTCT 2099

 16240897 CTCCCGGACCCACTGTGTTGCAGACTCCCCTATCAACTGCAATGAGATCTCTTTGACCAG 16240956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 CTCCCGGACCCACTGTGTTGCAGACTCCCCTATCAACTGCAATGAGATCTCTTTGACCAG 2159

 16240957 CACCACCAATCTCCTACCAGCTGCCAAATTTAATGGAGCCTTTTGCCTTTGACTTCCTTG 16241016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 CACCACCAATCTCCTACCAGCTGCCAAATTTAATGGAGCCTTTTGCCTTTGACTTCCTTG 2219

 16241017 ACCACTGTCTTAGGTCAGGTTTCCTGAAAGCAGGGCCTGAGATGGAGATTCACGTGCATT 16241076
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     2220 ACCACTGTCTTAGGTCAGGTTTCCTGAAAGCAGGGCCTGAGATGGAGATTCACGTGCATG 2279

 16241077 TGATTTTTTTGAGGGTGTACTCTCAGGGGAAATCTGTAGGGGAGTGAGTGATACAGAAGA 16241136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 TGATTTTTTTGAGGGTGTACTCTCAGGGGAAATCTGTAGGGGAGTGAGTGATACAGAAGA 2339

 16241137 GAGAGAGGGAAGAGCTGAACAAATATGTGGTTTCAGGTGAAGTCCAGCCATAGCCTGATC 16241196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 GAGAGAGGGAAGAGCTGAACAAATATGTGGTTTCAGGTGAAGTCCAGCCATAGCCTGATC 2399

 16241197 CCATGGGGGACTCTGGAGCACAGGCTGCACTGCGGGGTCTGTCTTGCTTTTTACCCTGCA 16241256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 CCATGGGGGACTCTGGAGCACAGGCTGCACTGCGGGGTCTGTCTTGCTTTTTACCCTGCA 2459

 16241257 ATGGTCAGTCATTGACCATGACTGGGGCTGGGGGCAGCATCCTGCATGACTGTCTGGCAC 16241316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 ATGGTCAGTCATTGACCATGACTGGGGCTGGGGGCAGCATCCTGCATGACTGTCTGGCAC 2519

 16241317 CTGCAGCAGAGACCGTTTTAATACCCCAAGGCAAGTCTCCAGGGAAGGGTTAAGATTTCA 16241376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 CTGCAGCAGAGACCGTTTTAATACCCCAAGGCAAGTCTCCAGGGAAGGGTTAAGATTTCA 2579

 16241377 GTTAGCACCCACAGCAGCTGGGGACATGCAAACCAAACCAAAACAGTTAAGGGGAGCTCA 16241436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 GTTAGCACCCACAGCAGCTGGGGACATGCAAACCAAACCAAAACAGTTAAGGGGAGCTCA 2639

 16241437 GGGAATCTGAGTAGGACACTATATTAGTCTGTTCTCACACTGCTATAAAGAACTGCCTGA 16241496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 GGGAATCTGAGTAGGACACTATATTAGTCTGTTCTCACACTGCTATAAAGAACTGCCTGA 2699

 16241497 GACTAGGTAATTTATAAAGAAAGGAGGTTTAATTGACTCACAGTTTCGCATGGCTGGGGA 16241556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 GACTAGGTAATTTATAAAGAAAGGAGGTTTAATTGACTCACAGTTTCGCATGGCTGGGGA 2759

 16241557 GGCCTCAGGAAACTTACAATCATGGTGGAAGGGGAAGCATGTCTTACATGGCAGCAAGTG 16241616
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 GGCCTCAGGAAACTTACAATCACGGTGGAAGGGGAAGCATGTCTTACATGGCAGCAAGTG 2819

 16241617 AGAGAAAGAGAGAGAGAGAGGAGGAAAAACTATCAAACACTTATATAATCATCAGATCTC 16241676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2820 AGAGAAAGAGAGAGAGAGAGGAGGAAAAACTATCAAACACTTATATAATCATCAGATCTC 2879

 16241677 ATGAGAACTCACTATCACGAGAACAGCATGGGGGAAACTGCCCACATGATCCAATCACCT 16241736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2880 ATGAGAACTCACTATCACGAGAACAGCATGGGGGAAACTGCCCACATGATCCAATCACCT 2939

 16241737 CCCACCAGGTCCCTCCCTCGCCACATAGGGATTATGGGGATTACCACTCAAGATGAGATC 16241796
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     2940 CCCACCAGGTCCCTCCCTCGACACATAGGGATTATGGGGATTACAACTCAAGATGAGATC 2999

 16241797 TGGGTGGGGACAAAGAGCCAAACCATATCAGACACCAACAGTATCTGCTACATTCTTGCT 16241856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3000 TGGGTGGGGACAAAGAGCCAAACCATATCAGACACCAACAGTATCTGCTACATTCTTGCT 3059

 16241857 GCTGCATTTGGAGAATGTTAGCAAGTTCTCCCCTTTCCTGGTTTTCTGACACCATCCCTC 16241916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3060 GCTGCATTTGGAGAATGTTAGCAAGTTCTCCCCTTTCCTGGTTTTCTGACACCATCCCTC 3119

 16241917 TAATTTTTACTGGAGAGAATCATGGCCCACCCCAACCTAACCAAGCATCTTACATCTCAG 16241976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3120 TAATTTTTACTGGAGAGAATCATGGCCCACCCCAACCTAACCAAGCATCTTACATCTCAG 3179

 16241977 CAACAACCACACTGTAGTAATGTTTTCGGTTCTTAGGACCCAGGTGCTCACCACAGCTTC 16242036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3180 CAACAACCACACTGTAGTAATGTTTTCGGTTCTTAGGACCCAGGTGCTCACCACAGCTTC 3239

 16242037 CAAAAGAGAGTTGCTGACGATTGTCTTAGTCACAATCTCATCGGTTGTGGCATTTGTCAT 16242096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3240 CAAAAGAGAGTTGCTGACGATTGTCTTAGTCACAATCTCATCGGTTGTGGCATTTGTCAT 3299

 16242097 TCCACTGACCACAACCCTGTTGATTCCAGGACAACTCAAGTCTGCTCTCAGCGAATATGT 16242156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3300 TCCACTGACCACAACCCTGTTGATTCCAGGACAACTCAAGTCTGCTCTCAGCGAATATGT 3359

 16242157 GGCCAGGCTGGAGGGGGTGAAGTTACTCAGGAGCAACAAGAGGCTGGGTGCCATCAGGGC 16242216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3360 GGCCAGGCTGGAGGGGGTGAAGTTACTCAGGAGCAACAAGAGGCTGGGTGCCATCAGGGC 3419

 16242217 CCGGATGCTGGGGGCCACCAGAGCCACCGGGGATGTGCTCGTCTTCATGGATGCCCACTG 16242276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3420 CCGGATGCTGGGGGCCACCAGAGCCACCGGGGATGTGCTCGTCTTCATGGATGCCCACTG 3479

 16242277 CGAGTGCCACCCAGGCTGGCTGGAGCCCCTCCTCAGCAGAATAGCTGGTGACAGGTAACT 16242336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3480 CGAGTGCCACCCAGGCTGGCTGGAGCCCCTCCTCAGCAGAATAGCTGGTGACAGGTAACT 3539

 16242337 TATTCCCTGGGCTTGCAAAGCAAGACATGGAACTGGGAGAAACAGTCTACAGCATCAGCC 16242396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3540 TATTCCCTGGGCTTGCAAAGCAAGACATGGAACTGGGAGAAACAGTCTACAGCATCAGCC 3599

 16242397 ACTCACAGAGCAACCCACCTATTAATTCCTGAATCTCCATTAGAGAGTGATATATTCCCT 16242456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3600 ACTCACAGAGCAACCCACCTATTAATTCCTGAATCTCCATTAGAGAGTGATATATTCCCT 3659

 16242457 TCGGGTTTTCAGATGTGTAAGTTTTTTAAGACTATAGAGTTAGAGTTGGAAAGGAGGTTA 16242516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3660 TCGGGTTTTCAGATGTGTAAGTTTTTTAAGACTATAGAGTTAGAGTTGGAAAGGAGGTTA 3719

 16242517 GAGGTCTTCATCTACCTTGCTTTATAGATAAAGAAACCGAGGCCTGGAGAACAGCTTCTA 16242576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3720 GAGGTCTTCATCTACCTTGCTTTATAGATAAAGAAACCGAGGCCTGGAGAACAGCTTCTA 3779

 16242577 TGAGGTTGCAAATACTTAAAATTGTATTAAATTGCATGACGAGGGTAACACCTTACCATA 16242636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3780 TGAGGTTGCAAATACTTAAAATTGTATTAAATTGCATGACGAGGGTAACACCTTACCATA 3839

 16242637 GCTATCATTGCCTTTGGTGAAAATTTGGCAATTT 16242670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3840 GCTATCATTGCCTTTGGTGAAAATTTGGCAATTT 3873

Alignment time is 4.78547 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [16229408,16251209] =>     21802 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    3655] =>      3655 nucs 'mol-32-3004-297142_3655'

Score:        3585
Aligned:      3661        nucs
Identic:      3650 (100%) nucs =>      2045 (100%)      1605 (100%)
Gaps:            6 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [16237361,16239408] EXCISED REGION [16241210,16242822]
 second seq =>  [       1,    2048] EXCISED REGION [    2049,    3655]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1801 nucs [16239409,16241209]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [16239409,16239409] to [16241210,16241210]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [16239409,16239410] to [16241208,16241209]
 second seq =>         0 nucs

 16237361 CACAGCATCCTCGACACAGTGCCCAGGGCCTTCCTGAAGGAGATCATCCTCGTGGACGAC 16237420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CACAGCATCCTCGACACAGTGCCCAGGGCCTTCCTGAAGGAGATCATCCTCGTGGACGAC 60

 16237421 CTCAGCCAGCAAGGTAGCCACGGCTTTCCTCCAGGCTCGTCTGGGTGAGCCTTACCCCCT 16237480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTCAGCCAGCAAGGTAGCCACGGCTTTCCTCCAGGCTCGTCTGGGTGAGCCTTACCCCCT 120

 16237481 GGCGGGTGGAGTTCTCAAGCAAAAGATTGAAGTTTGGAACTATTTTAGGCAAGATTCCCC 16237540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGCGGGTGGAGTTCTCAAGCAAAAGATTGAAGTTTGGAACTATTTTAGGCAAGATTCCCC 180

 16237541 AACTACAGACCTCCAGATGAGGATTAATGGGCAAGTAACTTATGAATGAAGAGCCACTGG 16237600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AACTACAGACCTCCAGATGAGGATTAATGGGCAAGTAACTTATGAATGAAGAGCCACTGG 240

 16237601 GGAAACCAGTAAGGCAGTGGGGGCTGCAAGACAGAGAAGGAGAAAGAGCCCTGCAGGGGA 16237660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGAAACCAGTAAGGCAGTGGGGGCTGCAAGACAGAGAAGGAGAAAGAGCCCTGCAGGGGA 300

 16237661 AACAGCCCTGGGGAGGGTCTTGAGGGGTGTCGCCTCAGCCTGATCCCGTGGGGATCTCTC 16237720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AACAGCCCTGGGGAGGGTCTTGAGGGGTGTCGCCTCAGCCTGATCCCGTGGGGATCTCTC 360

 16237721 TCCCAGGTGCCACCCAGTCCAACAATCCTCTCTCCAAGACACTGAAGAATCACATAGGGC 16237780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCCCAGGTGCCACCCAGTCCAACAATCCTCTCTCCAAGACACTGAAGAATCACATAGGGC 420

 16237781 GGCCCTGTTGTGAGTGCTCACTGCCTCCTAGACCCTGGTGCAGCACTTTACACATACGCA 16237840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGCCCTGTTGTGAGTGCTCACTGCCTCCTAGACCCTGGTGCAGCACTTTACACATACGCA 480

 16237841 CATATGTGTATCGGTCCTTCACTCATCATGGCTTAGACAGACCCACTCACTTTCCAGAGG 16237900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CATATGTGTATCGGTCCTTCACTCATCATGGCTTAGACAGACCCACTCACTTTCCAGAGG 540

 16237901 AGGAAACTGGGGCCCAGAGAAGACAGCAGACTGGAGCGGAGTCAGCCAAAAGCAGCAGAG 16237960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGGAAACTGGGGCCCAGAGAAGACAGCAGACTGGAGCGGAGTCAGCCAAAAGCAGCAGAG 600

 16237961 TCAGGCCCAGAGCCCAGACTTGCAGAACCTGCCTGTGTGCTTCCTCTCACAGGAACCTGG 16238020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCAGGCCCAGAGCCCAGACTTGCAGAACCTGCCTGTGTGCTTCCTCTCACAGGAACCTGG 660

 16238021 CTACTAGGGACAGCCCTAAAAGAAGATGGAGACAGAGAAGCCCCCACTTGACTCGTAGGT 16238080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTACTAGGGACAGCCCTAAAAGAAGATGGAGACAGAGAAGCCCCCACTTGACTCGTAGGT 720

 16238081 CAGTGGCTCTCACGCTTGAGCATGCATCGGAATCACCTGGTGCGATTTTTAAAATACTAC 16238140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CAGTGGCTCTCACGCTTGAGCATGCATCGGAATCACCTGGTGCGATTTTTAAAATACTAC 780

 16238141 TGCAGGGCCCACCCCCAGAGTTTCTGGTGATGGAGTGGGGCCGAAGAATTTGCATTTCTA 16238200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGCAGGGCCCACCCCCAGAGTTTCTGGTGATGGAGTGGGGCCGAAGAATTTGCATTTCTA 840

 16238201 ACAAGCTCCCAGGTGATGCTGATGCTGCTGTTTTCTGTGGACCACACTCTGAGAACCTCT 16238260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ACAAGCTCCCAGGTGATGCTGATGCTGCTGTTTTCTGTGGACCACACTCTGAGAACCTCT 900

 16238261 GCTCTAGTCTTTGGCTTGGGCGTGAGGCCTACATTTCTGGCACAACTAAATGACCTAGGG 16238320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GCTCTAGTCTTTGGCTTGGGCGTGAGGCCTACATTTCTGGCACAACTAAATGACCTAGGG 960

 16238321 ACACCCCTCCTGGCCTTCTGGGAAGATCAGAACGCTCTGAGGGAAGCCGAGCATTCACGT 16238380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ACACCCCTCCTGGCCTTCTGGGAAGATCAGAACGCTCTGAGGGAAGCCGAGCATTCACGT 1020

 16238381 TTTTCTAAGGGGAATAATGGAGAAGGGCTAGGGTAGCCAGGTGCCTCTGTTAGTTCTTTC 16238440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTTTCTAAGGGGAATAATGGAGAAGGGCTAGGGTAGCCAGGTGCCTCTGTTAGTTCTTTC 1080

 16238441 TACGGTCCTCACTCCAGGGATGGGCCTAGCCTGGCCATAGCAGTGAGTCAGATTAGCCAG 16238500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TACGGTCCTCACTCCAGGGATGGGCCTAGCCTGGCCATAGCAGTGAGTCAGATTAGCCAG 1140

 16238501 AGGCTCTGGGAACACCTGGGGTTCCTGGGTGCAGCTGGCTGCATATTAGGCAGGACTAAT 16238560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGGCTCTGGGAACACCTGGGGTTCCTGGGTGCAGCTGGCTGCATATTAGGCAGGACTAAT 1200

 16238561 GAACAGGTGCAGGACAGGGCTGGGTTGGCGGGTAAAGTGCCCAGAGACTCTCCAAACCCT 16238620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GAACAGGTGCAGGACAGGGCTGGGTTGGCGGGTAAAGTGCCCAGAGACTCTCCAAACCCT 1260

 16238621 CAAGTGGGGCGGGGTCCGCCCAAGAGCACACCTGTGGTGAGGCCCCCACCATCTGATGAG 16238680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CAAGTGGGGCGGGGTCCGCCCAAGAGCACACCTGTGGTGAGGCCCCCACCATCTGATGAG 1320

 16238681 CTGTGTTACGTCTGTGCCCCTCGGGAGTACGGAAAGTGGAGGAGCTGGGCCCCAGAGAAA 16238740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CTGTGTTACGTCTGTGCCCCTCGGGAGTACGGAAAGTGGAGGAGCTGGGCCCCAGAGAAA 1380

 16238741 TGGGCTACCCCAGAGCTGGCAGCCCCACCAGAGGGGATCTGGATCCCCTGCCAAGCAATT 16238800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TGGGCTACCCCAGAGCTGGCAGCCCCACCAGAGGGGATCTGGATCCCCTGCCAAGCAATT 1440

 16238801 AAGCTGCCCCCTCCTGGCCAACTCCCCTTCTGCCCCTCACCACTGGGTTGGCTCTCCATC 16238860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AAGCTGCCCCCTCCTGGCCAACTCCCCTTCTGCCCCTCACCACTGGGTTGGCTCTCCATC 1500

 16238861 CAGTGGCCCCATATTTCCTGTTGACATTGGGGTGCAAGGCCTTTTCCACAACCAAGGGCA 16238920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CAGTGGCCCCATATTTCCTGTTGACATTGGGGTGCAAGGCCTTTTCCACAACCAAGGGCA 1560

 16238921 GCACTGGTTCTATTTCTGCAGGTCCCTCTCCTCTGTGTGCTTGCCAAGACCCAGATCCCA 16238980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GCACTGGTTCTATTTCTGCAGGTCCCTCTCCTCTGTGTGCTTGCCAAGACCCAGATCCCA 1620

 16238981 GACAAGCACCACCCTGCACACTGTTTTTATTTAATCCTCTTGGCCACCCAGAGAGGCAGG 16239040
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GACAAGCACCACCTTGCACACTGTTTTTATTTAATCCTCTTGGCCACCCAGAGAGGCAGG 1680

 16239041 GCTTATCAACCCTACTCTACCTGTGAGGAAAACTGAGACAGAAAAAGATGCTGCGGGTTG 16239100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GCTTATCAACCCTACTCTACCTGTGAGGAAAACTGAGACAGAAAAAGATGCTGCGGGTTG 1740

 16239101 CCCTGAGCCACCTTGATGGGCTTCCAAGCCGATGGTCATGACAGCATAGTGTAGTGTGAT 16239160
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CCCTGAGCCATCTTGATGGGCTTCCAAGCCGATGGTCATGACAGCATAGTGTAGTGTGAT 1800

 16239161 AGAATCAGCTAGATGGGTTTCAGGGTATTCGTCTGGGGTGGTGATGCCCACACCAAATCA 16239220
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AGAATCAGCTAGATGAGTTTCAGGGTATTCGTCTGGGGTGGTGATGCCCACACCAAATCA 1860

 16239221 TTAAATCAGAAAATGCTTGCGATGACCAGCCCATGATGACCCTTTACAAGTGGAAGTCAG 16239280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTAAATCAGAAAATGCTTGCGATGACCAGCCCATGATGACCCTTTACAAGTGGAAGTCAG 1920

 16239281 TATTACTGCTGTTTTCTGGAGGGAAGGAGTTGAGGATCATACCAGCTTTTTCCGAGCACT 16239340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TATTACTGCTGTTTTCTGGAGGGAAGGAGTTGAGGATCATACCAGCTTTTTCCGAGCACT 1980

 16239341 ATACCACTCAGACATGGGTGCTCTTACCCACTTCAAAACCCTCTGAGAATGCCAAACAAC 16239400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ATACCACTCAGACATGGGTGCTCTTACCCACTTCAAAACCCTCTGAGAATGCCAAACAAC 2040

 16239401 CATCGCAG 16239408
          ||||||||
     2041 CATCGCAG 2048

EXCISED REGION

 16241210 TGGAGCACAGGCTGCACTGCGGGGTCTGTCTTGCTTTTTACCCTGCAATGGTCAGTCATT 16241269
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2049 TGGAGCACAGGCTGCACTGCGGGTTCTGTCTTGCTTTTTACCCTGCAATGGTCAGTCATT 2108

 16241270 GACCATGACTGGGGCTGGGGGCAGCATCCTGCATGACTGTCTGGCACCTGCAGCAGAGAC 16241329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2109 GACCATGACTGGGGCTGGGGGCAGCATCCTGCATGACTGTCTGGCACCTGCAGCAGAGAC 2168

 16241330 CGTTTTAATACCCCAAGGCAAGTCTCCAGGGAAGGGTTAAGATTTCAGTTAGCACCCACA 16241389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2169 CGTTTTAATACCCCAAGGCAAGTCTCCAGGGAAGGGTTAAGATTTCAGTTAGCACCCACA 2228

 16241390 GCAGCTGGGGACATGCAAACCAAACCAAAACAGTTAAGGGGAGCTCAGGGAATCTGAGTA 16241449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2229 GCAGCTGGGGACATGCAAACCAAACCAAAACAGTTAAGGGGAGCTCAGGGAATCTGAGTA 2288

 16241450 GGACACTATATTAGTCTGTTCTCACACTGCTATAAAGAACTGCCTGAGACTAGGTAATTT 16241509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2289 GGACACTATATTAGTCTGTTCTCACACTGCTATAAAGAACTGCCTGAGACTAGGTAATTT 2348

 16241510 ATAAAGAAAGGAGGTTTAATTGACTCACAGTTTCGCATGGCTGGGGAGGCCTCAGGAAAC 16241569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2349 ATAAAGAAAGGAGGTTTAATTGACTCACAGTTTCGCATGGCTGGGGAGGCCTCAGGAAAC 2408

 16241570 TTACAATCATGGTGGAAGGGGAAGCATGTCTTACATGGCAGCAAGTGAGAGAAAGAGAGA 16241629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2409 TTACAATCATGGTGGAAGGGGAAGCATGTCTTACATGGCAGCAAGTGAGAGAAAGAGAGA 2468

 16241630 GAGAGAGGAGGAAAAACTATCAAACACTTATATAATCATCAGATCTCATGAGAACTCACT 16241689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2469 GAGAGAGGAGGAAAAACTATCAAACACTTATATAATCATCAGATCTCATGAGAACTCACT 2528

 16241690 ATCACGAGAACAGCATGGGGGAAACTGCCCACATGATCCAATCACCTCCCACCAGGTCCC 16241749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2529 ATCACGAGAACAGCATGGGGGAAACTGCCCACATGATCCAATCACCTCCCACCAGGTCCC 2588

 16241750 TCCCTCGCCACATAGGGATTATGGGGATTACCACTCAAGATGAGATCTGGGTGGGGACAA 16241809
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     2589 TCCCTCGCCACATAGGGATTATGGGGATTACAACTCAAGATGAGATCTGGGTGGGGACAA 2648

 16241810 AGAGCCAAACCATATCAGACACCAACAGTATCTGCTACATTCTTGCTGCTGCATTTGGAG 16241869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2649 AGAGCCAAACCATATCAGACACCAACAGTATCTGCTACATTCTTGCTGCTGCATTTGGAG 2708

 16241870 AATGTTAGCAAGTTCTCCCCTTTCCTGGTTTTCTGACACCATCCCTCTAATTTTTACTGG 16241929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2709 AATGTTAGCAAGTTCTCCCCTTTCCTGGTTTTCTGACACCATCCCTCTAATTTTTACTGG 2768

 16241930 AGAGAATCATGGCCCACCCCAACCTAACCAAGCATCTTACATCTCAGCAACAACCACACT 16241989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2769 AGAGAATCATGGCCCACCCCAACCTAACCAAGCATCTTACATCTCAGCAACAACCACACT 2828

 16241990 GTAGTAATGTTTTCGGTTCTTAGGACCCAGGTGCTCACCACAGCTTCCAAAAGAGAGTTG 16242049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2829 GTAGTAATGTTTTCGGTTCTTAGGACCCAGGTGCTCACCACAGCTTCCAAAAGAGAGTTG 2888

 16242050 CTGACGATTGTCTTAGTCACAATCTCATCGGTTGTGGCATTTGTCATTCCACTGACCACA 16242109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2889 CTGACGATTGTCTTAGTCACAATCTCATCGGTTGTGGCATTTGTCATTCCACTGACCACA 2948

 16242110 ACCCTGTTGATTCCAGGACAACTCAAGTCTGCTCTCAGCGAATATGTGGCCAGGCTGGAG 16242169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2949 ACCCTGTTGATTCCAGGACAACTCAAGTCTGCTCTCAGCGAATATGTGGCCAGGCTGGAG 3008

 16242170 GGGGTGAAGTTACTCAGGAGCAACAAGAGGCTGGGTGCCATCAGGGCCCGGATGCTGGGG 16242229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3009 GGGGTGAAGTTACTCAGGAGCAACAAGAGGCTGGGTGCCATCAGGGCCCGGATGCTGGGG 3068

 16242230 GCCACCAGAGCCACCGGGGATGTGCTCGTCTTCATGGATGCCCACTGCGAGTGCCACCCA 16242289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3069 GCCACCAGAGCCACCGGGGATGTGCTCGTCTTCATGGATGCCCACTGCGAGTGCCACCCA 3128

 16242290 GGCTGGCTGGAGCCCCTCCTCAGCAGAATAGCTGGTGACAGGTAACTTATTCCCTGGGCT 16242349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3129 GGCTGGCTGGAGCCCCTCCTCAGCAGAATAGCTGGTGACAGGTAACTTATTCCCTGGGCT 3188

 16242350 TGCAAAGCAAGACATGGAACTGGGAGAAACAGTCTACAGCATCAGCCACTCACAGAGCAA 16242409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3189 TGCAAAGCAAGACATGGAACTGGGAGAAACAGTCTACAGCATCAGCCACTCACAGAGCAA 3248

 16242410 CCCACCTATTAATTCCTGAATCTCCATTAGAGAGTGATATATTCCCTTCGGGTTTTCAGA 16242469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3249 CCCACCTATTAATTCCTGAATCTCCATTAGAGAGTGATATATTCCCTTCGGGTTTTCAGA 3308

 16242470 TGTGTAAGTTTTTTAAGACTATAGAGTTAGAGTTGGAAAGGAGGTTAGAGGTCTTCATCT 16242529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3309 TGTGTAAGTTTTTTAAGACTATAGAGTTAGAGTTGGAAAGGAGGTTAGAGGTCTTCATCT 3368

 16242530 ACCTTGCTTTATAGATAAAGAAACCGAGGCCTGGAGAACAGCTTCTATGAGGTTGCAAAT 16242589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3369 ACCTTGCTTTATAGATAAAGAAACCGAGGCCTGGAGAACAGCTTCTATGAGGTTGCAAAT 3428

 16242590 ACTTAAAATTGTATTAAATTGCATGACGAGGGTAACACCTTACCATAGCTATCATTGCCT 16242649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3429 ACTTAAAATTGTATTAAATTGCATGACGAGGGTAACACCTTACCATAGCTATCATTGCCT 3488

 16242650 TTGGTGAAAATTTGGCAATTTTTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTGTG 16242709
          ||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||
     3489 TTGGTGAAAATTTGGCAATTTT------TTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTGTG 3542

 16242710 ATGGCGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGCGGGGCGATCTCGGCTCACTGCAA 16242769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3543 ATGGCGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGCGGGGCGATCTCGGCTCACTGCAA 3602

 16242770 GCTGCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCTTCAGCCTCCCGAGTAGCTG 16242822
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3603 GCTGCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCTTCAGCCTCCCGAGTAGCTG 3655

Alignment time is 4.5446 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [16229408,16251209] =>     21802 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    6232] =>      6232 nucs 'mol-32-301a-199108_6232'

Score:        5556
Aligned:      5786        nucs
Identic:      5761 (100%) nucs =>      5732 (100%)        29 (100%)
Gaps:            9 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [16238237,16243993] EXCISED REGION [16244102,16244130]
 second seq =>  [       1,    5748] EXCISED REGION [    5857,    5885]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       108 nucs [16243994,16244101]
 second seq =>       108 nucs [5749,5856]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [5748,5748] to [5856,5856]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [16243994,16243995] to [16244100,16244101]
 second seq =>         0 nucs

 16238237 GTGGACCACACTCTGAGAACCTCTGCTCTAGTCTTTGGCTTGGGCGTGAGGCCTACATTT 16238296
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTGGACCACACTTTGAGAACCTCTGCTCTAGTCTTTGGCTTGGGCGTGAGGCCTACATTT 60

 16238297 CTGGCACAACTAAATGACCTAGGGACACCCCTCCTGGCCTTCTGGGAAGATCAGAACGCT 16238356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTGGCACAACTAAATGACCTAGGGACACCCCTCCTGGCCTTCTGGGAAGATCAGAACGCT 120

 16238357 CTGAGGGAAGCCGAGCATTCACGTTTTTCTAAGGGGAATAATGGAGAAGGGCTAGGGTAG 16238416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTGAGGGAAGCCGAGCATTCACGTTTTTCTAAGGGGAATAATGGAGAAGGGCTAGGGTAG 180

 16238417 CCAGGTGCCTCTGTTAGTTCTTTCTACGGTCCTCACTCCAGGGATGGGCCTAGCCTGGCC 16238476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCAGGTGCCTCTGTTAGTTCTTTCTACGGTCCTCACTCCAGGGATGGGCCTAGCCTGGCC 240

 16238477 ATAGCAGTGAGTCAGATTAGCCAGAGGCTCTGGGAACACCTGGGGTTCCTGGGTGCAGCT 16238536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
      241 ATAGCAGTGAGTCAGATTAGCCAGAGGCTCTGGGAACACCTGGGGTTCCTGGGTACAGCT 300

 16238537 GGCTGCATATTAGGCAGGACTAATGAACAGGTGCAGGACAGGGCTGGGTTGGCGGGTAAA 16238596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GGCTGCATATTAGGCAGGACTAATGAACAGGTGCAGGACAGGGCTGGGTTGGCGGGTAAA 360

 16238597 GTGCCCAGAGACTCTCCAAACCCTCAAGTGGGGCGGGGTCCGCCCAAGAGCACACCTGTG 16238656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTGCCCAGAGACTCTCCAAACCCTCAAGTGGGGCGGGGTCCGCCCAAGAGCACACCTGTG 420

 16238657 GTGAGGCCCCCACCATCTGATGAGCTGTGTTACGTCTGTGCCCCTCGGGAGTACGGAAAG 16238716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTGAGGCCCCCACCATCTGATGAGCTGTGTTACGTCTGTGCCCCTCGGGAGTACGGAAAG 480

 16238717 TGGAGGAGCTGGGCCCCAGAGAAATGGGCTACCCCAGAGCTGGCAGCCCCACCAGAGGGG 16238776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGGAGGAGCTGGGCCCCAGAGAAATGGGCTACCCCAGAGCTGGCAGCCCCACCAGAGGGG 540

 16238777 ATCTGGATCCCCTGCCAAGCAATTAAGCTGCCCCCTCCTGGCCAACTCCCCTTCTGCCCC 16238836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATCTGGATCCCCTGCCAAGCAATTAAGCTGCCCCCTCCTGGCCAACTCCCCTTCTGCCCC 600

 16238837 TCACCACTGGGTTGGCTCTCCATCCAGTGGCCCCATATTTCCTGTTGACATTGGGGTGCA 16238896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCACCACTGGGTTGGCTCTCCATCCAGTGGCCCCATATTTCCTGTTGACATTGGGGTGCA 660

 16238897 AGGCCTTTTCCACAACCAAGGGCAGCACTGGTTCTATTTCTGCAGGTCCCTCTCCTCTGT 16238956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGGCCTTTTCCACAACCAAGGGCAGCACTGGTTCTATTTCTGCAGGTCCCTCTCCTCTGT 720

 16238957 GTGCTTGCCAAGACCCAGATCCCAGACAAGCACCACCCTGCACACTGTTTTTATTTAATC 16239016
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
      721 GTGCTTGCCAAGACCCAGATCCCAGACAAGCACCACCTTGCACACTGTTTTTATTTAATC 780

 16239017 CTCTTGGCCACCCAGAGAGGCAGGGCTTATCAACCCTACTCTACCTGTGAGGAAAACTGA 16239076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
      781 CTCTTGGCCACCCAGAGAGGCAGGGCTTATCAACCCTACTCTACCTATGAGGAAAACTGA 840

 16239077 GACAGAAAAAGATGCTGCGGGTTGCCCTGAGCCACCTTGATGGGCTTCCAAGCCGATGGT 16239136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GACAGAAAAAGATGCTGCGGGTTGCCCTGAGCCACCTTGATGGGCTTCCAAGCCGATGGT 900

 16239137 CATGACAGCATAGTGTAGTGTGATAGAATCAGCTAGATGGGTTTCAGGGTATTCGTCTGG 16239196
          |||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CATGACAGCATAGAGTAGTATGATAGAATCAGCTAGATGGGTTTCAGGGTATTCGTCTGG 960

 16239197 GGTGGTGATGCCCACACCAAATCATTAAATCAGAAAATGCTTGCGATGACCAGCCCATGA 16239256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GGTGGTGATGCCCACACCAAATCATTAAATCAGAAAATGCTTGCGATGACCAGCCCATGA 1020

 16239257 TGACCCTTTACAAGTGGAAGTCAGTATTACTGCTGTTTTCTGGAGGGAAGGAGTTGAGGA 16239316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGACCCTTTACAAGTGGAAGTCAGTATTACTGCTGTTTTCTGGAGGGAAGGAGTTGAGGA 1080

 16239317 TCATACCAGCTTTTTCCGAGCACTATACCACTCAGACATGGGTGCTCTTACCCACTTCAA 16239376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TCATACCAGCTTTTTCCGAGCACTATACCACTCAGACATGGGTGCTCTTACCCACTTCAA 1140

 16239377 AACCCTCTGAGAATGCCAAACAACCATCGCAGTCTGGAAGTTCTTCCTTATCTATTCCGA 16239436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AACCCTCTGAGAATGCCAAACAACCATCGCAGTCTGGAAGTTCTTCCTTATCTATTCCGA 1200

 16239437 AGCTCTCTTGCTAGAAGTCTGTCCTAAATAATACTAACAAGGGTTAGAGGTATAGCTGAA 16239496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AGCTCTCTTGCTAGAAGTCTGTCCTAAATAATACTAACAAGGGTTAGAGGTATAGCTGAA 1260

 16239497 GAGACCAGCAGTCAGCCCAAGGAGGGCTTCATAAATTAATGTTTGGTGGGAATATCAGTG 16239556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GAGACCAGCAGTCAGCCCAAGGAGGGCTTCATAAATTAATGTTTGGTGGGAATATCAGTG 1320

 16239557 AAGGACTATATTTGGCTGCACAGAACAGAAACCTGCTGCAGTGACTTAACCAATGAATAG 16239616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AAGGACTATATTTGGCTGCACAGAACAGAAACCTGCTGCAGTGACTTAACCAATGAATAG 1380

 16239617 AGATTTATTTTTCCTTATAGTATAGAAAGCTCACAGGGTGGCAATGCAGTATTGGTGTGA 16239676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AGATTTATTTTTCCTTATAGTATAGAAAGCTCACAGGGTGGCAATGCAGTATTGGTGTGA 1440

 16239677 CAGCTCCACAATGCCATTGGACACCCACCTTCATCTGCTTTCCACTTCAACATGCTTAGA 16239736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CAGCTCCACAATGCCATTGGACACCCACCTTCATCTGCTTTCCACTTCAACATGCTTAGA 1500

 16239737 GAGTAGTTTTGGCCTCATAATCACAACAGGGCTGCTCTACCTCTGGACATCACATACATA 16239796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     1501 GAGTAGTTTTGGCCTCATAATCACAACAGGGCTGTTCTACCTCTGGACATCACATACATA 1560

 16239797 TTTCAAATAGGGAAAAGGCGAAGAAGAGATAGGCAGAGGCCAGTCCGGTTTGTGCTCTTC 16239856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTTCAAATAGGGAAAAGGCGAAGAAGAGATAGGCAGAGGCCAGTCCGGTTTGTGCTCTTC 1620

 16239857 GGAAAAAAAAAATTAGTAAAATAATAGTTTTCCCAGAATCCTTTCATTCATTTTATTTCT 16239916
          ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GGAAAAAAAAA-TTAGTAAAATAATAGTTTTCCCAGAATCCTTTCATTCATTTTATTTCT 1679

 16239917 ACCAGAGCTGCTGCCAGCAGTGACAGGAAGTCTCGAGAGATACGTGTTTTTAGCTGTCCC 16239976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     1680 ACCAGAGCTGCTGCCAGCAGTGACAGGAAGTCTCGAGAGATACGTGTTTTTAGCTGCCCC 1739

 16239977 GAGAAACATCAAAGTTCTGTCAGTACAGTGGAAGGGGAGAATGAATGGTGAGGAAGATGT 16240036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 GAGAAACATCAAAGTTCTGTCAGTACAGTGGAAGGGGAGAATGAATGGTGAGGAAGATGT 1799

 16240037 TACATTTAGCAATGTTAAAGCCAATGAAGTCACTGAGGGGCTGCTTCTCAGATATGCAAG 16240096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 TACATTTAGCAATGTTAAAGCCAATGAAGTCACTGAGGGGCTGCTTCTCAGATATGCAAG 1859

 16240097 TCCAGAAATGTTAATAGCTTGACTAACAGAGATTCCTCTCTAGGGAGTGGACCAGGGCTG 16240156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 TCCAGAAATGTTAATAGCTTGACTAACAGAGATTCCTCTCTAGGGAGTGGACCAGGGCTG 1919

 16240157 ACAGTCTTACCAGAAAAATAATTATAAAGTAACACATCAACGAAGCATTTTACCAGTGAG 16240216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 ACAGTCTTACCAGAAAAATAATTATAAAGTAACACATCAACGAAGCATTTTACCAGTGAG 1979

 16240217 AATTGCAACAGCCCAGTGACTGGGACTCCTTTCCTCTACTGCTCAGGACATTGTTCACCC 16240276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     1980 AATTGCAACAGCCCAGTGACTGGGACTCCTTTCCTCTACTGCTCAGGACATTGTTCTCCC 2039

 16240277 TGCAGAAAATCCATGGTGCTTAGAAGACAGATTCCCAGGGAAGGAGTGTATGAAGTCTGC 16240336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 TGCAGAAAATCCATGGTGCTTAGAAGACAGATTCCCAGGGAAGGAGTGTATGAAGTCTGC 2099

 16240337 TGGGGGCTCTCGGGTGGGGCTGCCTTAACCTTCTCCAGCCTCCCCAGAGATCCAGCTACC 16240396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 TGGGGGCTCTCGGGTGGGGCTGCCTTAACCTTCTCCAGCCTCCCCAGAGATCCAGCTACC 2159

 16240397 AAAGCAGCCAGGCTACTTGTATCCACAGTTAAGGCCACCTCTGGGCTGGGGAACTGGGGG 16240456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 AAAGCAGCCAGGCTACTTGTATCCACAGTTAAGGCCACCTCTGGGCTGGGGAACTGGGGG 2219

 16240457 GGAAATTCTTGCTTTTTGGCTCAGTTCTGTTCAATGCACATGTACTGAGTGCCTACTGTG 16240516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 GGAAATTCTTGCTTTTTGGCTCAGTTCTGTTCAATGCACATGTACTGAGTGCCTACTGTG 2279

 16240517 GGCCAGGCCCTGCACTAAGGGTTAGAGCAGAAGAGATGCATTAGGTACAACCCCTGTCCT 16240576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 GGCCAGGCCCTGCACTAAGGGTTAGAGCAGAAGAGATGCATTAGGTACAACCCCTGTCCT 2339

 16240577 TGGGGAGATCTTAGTCCACTGGCCTGGGGGGACTCCCCATTTCCAAGACTTCATGGAGAC 16240636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     2340 TGGGGAGATCTTAGTCCACTGGCCTGGGGGGACTCCCCGTTTCCAAGACTTCATGGAGAC 2399

 16240637 CACTGCTTCTCTGTGAACACATTGTTCCTTCCATCTCCACTGGCTTGTTCCTCTTGGTGT 16240696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 CACTGCTTCTCTGTGAACACATTGTTCCTTCCATCTCCACTGGCTTGTTCCTCTTGGTGT 2459

 16240697 GTGTGTACACAGACATGCACACACACACACACATGCACTCACACACACAATCAAGTTATT 16240756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 GTGTGTACACAGACATGCACACACACACACACATGCACTCACACACACAATCAAGTTATT 2519

 16240757 CTTATCTTAAACACAAAACCTAACAAGCTTCTCTCATCCTTTCCGTCATCTTCTTAGGCC 16240816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 CTTATCTTAAACACAAAACCTAACAAGCTTCTCTCATCCTTTCCGTCATCTTCTTAGGCC 2579

 16240817 TCTTTTTCTCCCTTCCCCTATAGAATCAACCTTCCTAACCGTCTGGACTCTTGGTCTCAG 16240876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 TCTTTTTCTCCCTTCCCCTATAGAATCAACCTTCCTAACCGTCTGGACTCTTGGTCTCAG 2639

 16240877 TTTTTCATCTTCCGTTTTCTCTCCCGGACCCACTGTGTTGCAGACTCCCCTATCAACTGC 16240936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 TTTTTCATCTTCCGTTTTCTCTCCCGGACCCACTGTGTTGCAGACTCCCCTATCAACTGC 2699

 16240937 AATGAGATCTCTTTGACCAGCACCACCAATCTCCTACCAGCTGCCAAATTTAATGGAGCC 16240996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 AATGAGATCTCTTTGACCAGCACCACCAATCTCCTACCAGCTGCCAAATTTAATGGAGCC 2759

 16240997 TTTTGCCTTTGACTTCCTTGACCACTGTCTTAGGTCAGGTTTCCTGAAAGCAGGGCCTGA 16241056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 TTTTGCCTTTGACTTCCTTGACCACTGTCTTAGGTCAGGTTTCCTGAAAGCAGGGCCTGA 2819

 16241057 GATGGAGATTCACGTGCATTTGATTTTTTTGAGGGTGTACTCTCAGGGGAAATCTGTAGG 16241116
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2820 GATGGAGATTCACGTGCATGTGATTTTTTTGAGGGTGTACTCTCAGGGGAAATCTGTAGG 2879

 16241117 GGAGTGAGTGATACAGAAGAGAGAGAGGGAAGAGCTGAACAAATATGTGGTTTCAGGTGA 16241176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2880 GGAGTGAGTGATACAGAAGAGAGAGAGGGAAGAGCTGAACAAATATGTGGTTTCAGGTGA 2939

 16241177 AGTCCAGCCATAGCCTGATCCCATGGGGGACTCTGGAGCACAGGCTGCACTGCGGGGTCT 16241236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2940 AGTCCAGCCATAGCCTGATCCCATGGGGGACTCTGGAGCACAGGCTGCACTGCGGGGTCT 2999

 16241237 GTCTTGCTTTTTACCCTGCAATGGTCAGTCATTGACCATGACTGGGGCTGGGGGCAGCAT 16241296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3000 GTCTTGCTTTTTACCCTGCAATGGTCAGTCATTGACCATGACTGGGGCTGGGGGCAGCAT 3059

 16241297 CCTGCATGACTGTCTGGCACCTGCAGCAGAGACCGTTTTAATACCCCAAGGCAAGTCTCC 16241356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3060 CCTGCATGACTGTCTGGCACCTGCAGCAGAGACCGTTTTAATACCCCAAGGCAAGTCTCC 3119

 16241357 AGGGAAGGGTTAAGATTTCAGTTAGCACCCACAGCAGCTGGGGACATGCAAACCAAACCA 16241416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3120 AGGGAAGGGTTAAGATTTCAGTTAGCACCCACAGCAGCTGGGGACATGCAAACCAAACCA 3179

 16241417 AAACAGTTAAGGGGAGCTCAGGGAATCTGAGTAGGACACTATATTAGTCTGTTCTCACAC 16241476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3180 AAACAGTTAAGGGGAGCTCAGGGAATCTGAGTAGGACACTATATTAGTCTGTTCTCACAC 3239

 16241477 TGCTATAAAGAACTGCCTGAGACTAGGTAATTTATAAAGAAAGGAGGTTTAATTGACTCA 16241536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3240 TGCTATAAAGAACTGCCTGAGACTAGGTAATTTATAAAGAAAGGAGGTTTAATTGACTCA 3299

 16241537 CAGTTTCGCATGGCTGGGGAGGCCTCAGGAAACTTACAATCATGGTGGAAGGGGAAGCAT 16241596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     3300 CAGTTTCGCATGGCTGGGGAGGCCTCAGGAAACTTACAATCACGGTGGAAGGGGAAGCAT 3359

 16241597 GTCTTACATGGCAGCAAGTGAGAGAAAGAGAGAGAGAGAGGAGGAAAAACTATCAAACAC 16241656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3360 GTCTTACATGGCAGCAAGTGAGAGAAAGAGAGAGAGAGAGGAGGAAAAACTATCAAACAC 3419

 16241657 TTATATAATCATCAGATCTCATGAGAACTCACTATCACGAGAACAGCATGGGGGAAACTG 16241716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3420 TTATATAATCATCAGATCTCATGAGAACTCACTATCACGAGAACAGCATGGGGGAAACTG 3479

 16241717 CCCACATGATCCAATCACCTCCCACCAGGTCCCTCCCTCGCCACATAGGGATTATGGGGA 16241776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     3480 CCCACATGATCCAATCACCTCCCACCAGGTCCCTCCCTCGACACATAGGGATTATGGGGA 3539

 16241777 TTACCACTCAAGATGAGATCTGGGTGGGGACAAAGAGCCAAACCATATCAGACACCAACA 16241836
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3540 TTACAACTCAAGATGAGATCTGGGTGGGGACAAAGAGCCAAACCATATCAGACACCAACA 3599

 16241837 GTATCTGCTACATTCTTGCTGCTGCATTTGGAGAATGTTAGCAAGTTCTCCCCTTTCCTG 16241896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3600 GTATCTGCTACATTCTTGCTGCTGCATTTGGAGAATGTTAGCAAGTTCTCCCCTTTCCTG 3659

 16241897 GTTTTCTGACACCATCCCTCTAATTTTTACTGGAGAGAATCATGGCCCACCCCAACCTAA 16241956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3660 GTTTTCTGACACCATCCCTCTAATTTTTACTGGAGAGAATCATGGCCCACCCCAACCTAA 3719

 16241957 CCAAGCATCTTACATCTCAGCAACAACCACACTGTAGTAATGTTTTCGGTTCTTAGGACC 16242016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3720 CCAAGCATCTTACATCTCAGCAACAACCACACTGTAGTAATGTTTTCGGTTCTTAGGACC 3779

 16242017 CAGGTGCTCACCACAGCTTCCAAAAGAGAGTTGCTGACGATTGTCTTAGTCACAATCTCA 16242076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3780 CAGGTGCTCACCACAGCTTCCAAAAGAGAGTTGCTGACGATTGTCTTAGTCACAATCTCA 3839

 16242077 TCGGTTGTGGCATTTGTCATTCCACTGACCACAACCCTGTTGATTCCAGGACAACTCAAG 16242136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3840 TCGGTTGTGGCATTTGTCATTCCACTGACCACAACCCTGTTGATTCCAGGACAACTCAAG 3899

 16242137 TCTGCTCTCAGCGAATATGTGGCCAGGCTGGAGGGGGTGAAGTTACTCAGGAGCAACAAG 16242196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3900 TCTGCTCTCAGCGAATATGTGGCCAGGCTGGAGGGGGTGAAGTTACTCAGGAGCAACAAG 3959

 16242197 AGGCTGGGTGCCATCAGGGCCCGGATGCTGGGGGCCACCAGAGCCACCGGGGATGTGCTC 16242256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3960 AGGCTGGGTGCCATCAGGGCCCGGATGCTGGGGGCCACCAGAGCCACCGGGGATGTGCTC 4019

 16242257 GTCTTCATGGATGCCCACTGCGAGTGCCACCCAGGCTGGCTGGAGCCCCTCCTCAGCAGA 16242316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4020 GTCTTCATGGATGCCCACTGCGAGTGCCACCCAGGCTGGCTGGAGCCCCTCCTCAGCAGA 4079

 16242317 ATAGCTGGTGACAGGTAACTTATTCCCTGGGCTTGCAAAGCAAGACATGGAACTGGGAGA 16242376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4080 ATAGCTGGTGACAGGTAACTTATTCCCTGGGCTTGCAAAGCAAGACATGGAACTGGGAGA 4139

 16242377 AACAGTCTACAGCATCAGCCACTCACAGAGCAACCCACCTATTAATTCCTGAATCTCCAT 16242436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4140 AACAGTCTACAGCATCAGCCACTCACAGAGCAACCCACCTATTAATTCCTGAATCTCCAT 4199

 16242437 TAGAGAGTGATATATTCCCTTCGGGTTTTCAGATGTGTAAGTTTTTTAAGACTATAGAGT 16242496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4200 TAGAGAGTGATATATTCCCTTCGGGTTTTCAGATGTGTAAGTTTTTTAAGACTATAGAGT 4259

 16242497 TAGAGTTGGAAAGGAGGTTAGAGGTCTTCATCTACCTTGCTTTATAGATAAAGAAACCGA 16242556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4260 TAGAGTTGGAAAGGAGGTTAGAGGTCTTCATCTACCTTGCTTTATAGATAAAGAAACCGA 4319

 16242557 GGCCTGGAGAACAGCTTCTATGAGGTTGCAAATACTTAAAATTGTATTAAATTGCATGAC 16242616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4320 GGCCTGGAGAACAGCTTCTATGAGGTTGCAAATACTTAAAATTGTATTAAATTGCATGAC 4379

 16242617 GAGGGTAACACCTTACCATAGCTATCATTGCCTTTGGTGAAAATTTGGCAATTTTTTTTT 16242676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4380 GAGGGTAACACCTTACCATAGCTATCATTGCCTTTGGTGAAAATTTGGCAATTTTTTTTT 4439

 16242677 CTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTGTGATGGCGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCT 16242736
          ||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||
     4440 CTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTT------GTGATGGCGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCT 4493

 16242737 GGAGTGCAGCGGGGCGATCTCGGCTCACTGCAAGCTGCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTC 16242796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4494 GGAGTGCAGCGGGGCGATCTCGGCTCACTGCAAGCTGCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTC 4553

 16242797 TCCTGCTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACCACACCCGGCTAAT 16242856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4554 TCCTGCTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACCACACCCGGCTAAT 4613

 16242857 TTTTTGTATTTTTAGTAGAGAAGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCC 16242916
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
     4614 TTTTTGTATTTTTAGTAGAGAAGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAG-ATGGTCTCGATCTCC 4672

 16242917 TGACTTCGTGATCCGCCCTCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCAC 16242976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4673 TGACTTCGTGATCCGCCCTCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCAC 4732

 16242977 CGCGCCTGGCCGAAAATTCGTCAATTTTAATCAAGCTTGTAACATAACCTGGGGAAAAAG 16243036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4733 CGCGCCTGGCCGAAAATTCGTCAATTTTAATCAAGCTTGTAACATAACCTGGGGAAAAAG 4792

 16243037 TCTCTGAACTACACTAGGCCGTAGATTACTCACCCATAAAAAGAAAACATTATGTTCTCT 16243096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4793 TCTCTGAACTACACTAGGCCGTAGATTACTCACCCATAAAAAGAAAACATTATGTTCTCT 4852

 16243097 GATCACTAAACAGCATTCTTTGTTTCCCCAGTTTATATAAGGGGTCCCTAATTTTCTACC 16243156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4853 GATCACTAAACAGCATTCTTTGTTTCCCCAGTTTATATAAGGGGTCCCTAATTTTCTACC 4912

 16243157 TAAGGCCAGTCCTTGGAAATGTGAAGTTGGAGAGGACTGCATTACATTACCCTGTAGACA 16243216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4913 TAAGGCCAGTCCTTGGAAATGTGAAGTTGGAGAGGACTGCATTACATTACCCTGTAGACA 4972

 16243217 AGCATCTTAACATTTTTCTTGATCATTTCTCTGCTCTCCTTCCCCCATCTGACCGTCAAT 16243276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4973 AGCATCTTAACATTTTTCTTGATCATTTCTCTGCTCTCCTTCCCCCATCTGACCGTCAAT 5032

 16243277 CTCTTTCTCACTTCCTTGCTCAAGACAAACAGTTCCTAAACATGTCTAGTCAAACATTAC 16243336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5033 CTCTTTCTCACTTCCTTGCTCAAGACAAACAGTTCCTAAACATGTCTAGTCAAACATTAC 5092

 16243337 CCTCAATCTGAATATCCTACCCAGGAAAACTGAAACCTGGTGGCTGGCCCACCTTGGACC 16243396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5093 CCTCAATCTGAATATCCTACCCAGGAAAACTGAAACCTGGTGGCTGGCCCACCTTGGACC 5152

 16243397 ACCTCAGGCATACCACTTGGAGCTCATGTAGGCATGTAGCAGAGTAGAACCACAATCAAT 16243456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5153 ACCTCAGGCATACCACTTGGAGCTCATGTAGGCATGTAGCAGAGTAGAACCACAATCAAT 5212

 16243457 AATTGTTTGATGGTGCCCAGCAAGACAGGACCAATGCTAGAACCAAGCCTTATGACTTCT 16243516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5213 AATTGTTTGATGGTGCCCAGCAAGACAGGACCAATGCTAGAACCAAGCCTTATGACTTCT 5272

 16243517 ACCCATGATGAATGTTTATTATCTCACCTGAAGTTAGGGATGATCAATCAAATATAAGAA 16243576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5273 ACCCATGATGAATGTTTATTATCTCACCTGAAGTTAGGGATGATCAATCAAATATAAGAA 5332

 16243577 AAAATTCCTGGACCAGATCGGAATGAATCCTGGAGACATAGGAGTTACCATCAGCCAAAT 16243636
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5333 AAAATTCCTGGACCAGATCAGAATGAATCCTGGAGACATAGGAGTTACCATCAGCCAAAT 5392

 16243637 GGAGATGGTTTCAAACGTTCAAATGACAGAAAGTAAATTGTTAATAGTTCAGCATTCCAT 16243696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5393 GGAGATGGTTTCAAACGTTCAAATGACAGAAAGTAAATTGTTAATAGTTCAGCATTCCAT 5452

 16243697 TTTAACAAAGAAGAACAATCGGAACTCAAGTGAGATCAAGACAGATTAATGTTTCCCAGT 16243756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5453 TTTAACAAAGAAGAACAATCGGAACTCAAGTGAGATCAAGACAGATTAATGTTTCCCAGT 5512

 16243757 TTCATGAGACAGATTGTCTCTTGACTCACATCTCATAAGAAAAGAAGACACACATAAATT 16243816
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5513 TTCATGAGACAGATTGTCTCTTGGCTCACATCTCATAAGAAAAGAAGACACACATAAATT 5572

 16243817 CAGCACTAGGACAAGAACTAGGACACAAAAATGCACAAGCTGGCCAGGCACGGTGGCTCA 16243876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5573 CAGCACTAGGACAAGAACTAGGACACAAAAATGCACAAGCTGGCCAGGCACGGTGGCTCA 5632

 16243877 TGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGACGGATCACCTGAGGTCAGGAGTT 16243936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5633 TGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGACGGATCACCTGAGGTCAGGAGTT 5692

 16243937 CGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTA 16243993
          ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
     5693 CGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCC-ATCTCTACTAAAAATACAAAAATTA 5748

EXCISED REGION

 16244102 TGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGA 16244130
          |||||||||||||||||||||||||||||
     5857 TGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGA 5885

Alignment time is 7.81564 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [16229408,16251209] =>     21802 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    8639] =>      8639 nucs 'mol-32-3025-100648_8639'

Score:        8439
Aligned:      8649        nucs
Identic:      8625 (100%) nucs =>      5728 (100%)      2897 (100%)
Gaps:           10 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [16239297,16245044] EXCISED REGION [16245053,16247953]
 second seq =>  [       1,    5740] EXCISED REGION [    5741,    8639]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         8 nucs [16245045,16245052]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>        10 nucs [16245046,16245055]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [16245045,16245045] to [16245053,16245053]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 16239297 TGGAGGGAAGGAGTTGAGGATCATACCAGCTTTTTCCGAGCACTATACCACTCAGACATG 16239356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGGAGGGAAGGAGTTGAGGATCATACCAGCTTTTTCCGAGCACTATACCACTCAGACATG 60

 16239357 GGTGCTCTTACCCACTTCAAAACCCTCTGAGAATGCCAAACAACCATCGCAGTCTGGAAG 16239416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGTGCTCTTACCCACTTCAAAACCCTCTGAGAATGCCAAACAACCATCGCAGTCTGGAAG 120

 16239417 TTCTTCCTTATCTATTCCGAAGCTCTCTTGCTAGAAGTCTGTCCTAAATAATACTAACAA 16239476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTCTTCCTTATCTATTCCGAAGCTCTCTTGCTAGAAGTCTGTCCTAAATAATACTAACAA 180

 16239477 GGGTTAGAGGTATAGCTGAAGAGACCAGCAGTCAGCCCAAGGAGGGCTTCATAAATTAAT 16239536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGGTTAGAGGTATAGCTGAAGAGACCAGCAGTCAGCCCAAGGAGGGCTTCATAAATTAAT 240

 16239537 GTTTGGTGGGAATATCAGTGAAGGACTATATTTGGCTGCACAGAACAGAAACCTGCTGCA 16239596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTTTGGTGGGAATATCAGTGAAGGACTATATTTGGCTGCACAGAACAGAAACCTGCTGCA 300

 16239597 GTGACTTAACCAATGAATAGAGATTTATTTTTCCTTATAGTATAGAAAGCTCACAGGGTG 16239656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTGACTTAACCAATGAATAGAGATTTATTTTTCCTTATAGTATAGAAAGCTCACAGGGTG 360

 16239657 GCAATGCAGTATTGGTGTGACAGCTCCACAATGCCATTGGACACCCACCTTCATCTGCTT 16239716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GCAATGCAGTATTGGTGTGACAGCTCCACAATGCCATTGGACACCCACCTTCATCTGCTT 420

 16239717 TCCACTTCAACATGCTTAGAGAGTAGTTTTGGCCTCATAATCACAACAGGGCTGCTCTAC 16239776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
      421 TCCACTTCAACATGCTTAGAGAGTAGTTTTGGCCTCATAATCACAACAGGGCTGTTCTAC 480

 16239777 CTCTGGACATCACATACATATTTCAAATAGGGAAAAGGCGAAGAAGAGATAGGCAGAGGC 16239836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTCTGGACATCACATACATATTTCAAATAGGGAAAAGGCGAAGAAGAGATAGGCAGAGGC 540

 16239837 CAGTCCGGTTTGTGCTCTTCGGAAAAAAAAAATTAGTAAAATAATAGTTTTCCCAGAATC 16239896
          ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
      541 CAGTCCGGTTTGTGCTCTTCGGAAAAAAAAA-TTAGTAAAATAATAGTTTTCCCAGAATC 599

 16239897 CTTTCATTCATTTTATTTCTACCAGAGCTGCTGCCAGCAGTGACAGGAAGTCTCGAGAGA 16239956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      600 CTTTCATTCATTTTATTTCTACCAGAGCTGCTGCCAGCAGTGACAGGAAGTCTCGAGAGA 659

 16239957 TACGTGTTTTTAGCTGTCCCGAGAAACATCAAAGTTCTGTCAGTACAGTGGAAGGGGAGA 16240016
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      660 TACGTGTTTTTAGCTGCCCCGAGAAACATCAAAGTTCTGTCAGTACAGTGGAAGGGGAGA 719

 16240017 ATGAATGGTGAGGAAGATGTTACATTTAGCAATGTTAAAGCCAATGAAGTCACTGAGGGG 16240076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      720 ATGAATGGTGAGGAAGATGTTACATTTAGCAATGTTAAAGCCAATGAAGTCACTGAGGGG 779

 16240077 CTGCTTCTCAGATATGCAAGTCCAGAAATGTTAATAGCTTGACTAACAGAGATTCCTCTC 16240136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      780 CTGCTTCTCAGATATGCAAGTCCAGAAATGTTAATAGCTTGACTAACAGAGATTCCTCTC 839

 16240137 TAGGGAGTGGACCAGGGCTGACAGTCTTACCAGAAAAATAATTATAAAGTAACACATCAA 16240196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 TAGGGAGTGGACCAGGGCTGACAGTCTTACCAGAAAAATAATTATAAAGTAACACATCAA 899

 16240197 CGAAGCATTTTACCAGTGAGAATTGCAACAGCCCAGTGACTGGGACTCCTTTCCTCTACT 16240256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 CGAAGCATTTTACCAGTGAGAATTGCAACAGCCCAGTGACTGGGACTCCTTTCCTCTACT 959

 16240257 GCTCAGGACATTGTTCACCCTGCAGAAAATCCATGGTGCTTAGAAGACAGATTCCCAGGG 16240316
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 GCTCAGGACATTGTTCTCCCTGCAGAAAATCCATGGTGCTTAGAAGACAGATTCCCAGGG 1019

 16240317 AAGGAGTGTATGAAGTCTGCTGGGGGCTCTCGGGTGGGGCTGCCTTAACCTTCTCCAGCC 16240376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 AAGGAGTGTATGAAGTCTGCTGGGGGCTCTCGGGTGGGGCTGCCTTAACCTTCTCCAGCC 1079

 16240377 TCCCCAGAGATCCAGCTACCAAAGCAGCCAGGCTACTTGTATCCACAGTTAAGGCCACCT 16240436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 TCCCCAGAGATCCAGCTACCAAAGCAGCCAGGCTACTTGTATCCACAGTTAAGGCCACCT 1139

 16240437 CTGGGCTGGGGAACTGGGGGGGAAATTCTTGCTTTTTGGCTCAGTTCTGTTCAATGCACA 16240496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 CTGGGCTGGGGAACTGGGGGGGAAATTCTTGCTTTTTGGCTCAGTTCTGTTCAATGCACA 1199

 16240497 TGTACTGAGTGCCTACTGTGGGCCAGGCCCTGCACTAAGGGTTAGAGCAGAAGAGATGCA 16240556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 TGTACTGAGTGCCTACTGTGGGCCAGGCCCTGCACTAAGGGTTAGAGCAGAAGAGATGCA 1259

 16240557 TTAGGTACAACCCCTGTCCTTGGGGAGATCTTAGTCCACTGGCCTGGGGGGACTCCCCAT 16240616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     1260 TTAGGTACAACCCCTGTCCTTGGGGAGATCTTAGTCCACTGGCCTGGGGGGACTCCCCGT 1319

 16240617 TTCCAAGACTTCATGGAGACCACTGCTTCTCTGTGAACACATTGTTCCTTCCATCTCCAC 16240676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 TTCCAAGACTTCATGGAGACCACTGCTTCTCTGTGAACACATTGTTCCTTCCATCTCCAC 1379

 16240677 TGGCTTGTTCCTCTTGGTGTGTGTGTACACAGACATGCACACACACACACACATGCACTC 16240736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 TGGCTTGTTCCTCTTGGTGTGTGTGTACACAGACATGCACACACACACACACATGCACTC 1439

 16240737 ACACACACAATCAAGTTATTCTTATCTTAAACACAAAACCTAACAAGCTTCTCTCATCCT 16240796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 ACACACACAATCAAGTTATTCTTATCTTAAACACAAAACCTAACAAGCTTCTCTCATCCT 1499

 16240797 TTCCGTCATCTTCTTAGGCCTCTTTTTCTCCCTTCCCCTATAGAATCAACCTTCCTAACC 16240856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 TTCCGTCATCTTCTTAGGCCTCTTTTTCTCCCTTCCCCTATAGAATCAACCTTCCTAACC 1559

 16240857 GTCTGGACTCTTGGTCTCAGTTTTTCATCTTCCGTTTTCTCTCCCGGACCCACTGTGTTG 16240916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 GTCTGGACTCTTGGTCTCAGTTTTTCATCTTCCGTTTTCTCTCCCGGACCCACTGTGTTG 1619

 16240917 CAGACTCCCCTATCAACTGCAATGAGATCTCTTTGACCAGCACCACCAATCTCCTACCAG 16240976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 CAGACTCCCCTATCAACTGCAATGAGATCTCTTTGACCAGCACCACCAATCTCCTACCAG 1679

 16240977 CTGCCAAATTTAATGGAGCCTTTTGCCTTTGACTTCCTTGACCACTGTCTTAGGTCAGGT 16241036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 CTGCCAAATTTAATGGAGCCTTTTGCCTTTGACTTCCTTGACCACTGTCTTAGGTCAGGT 1739

 16241037 TTCCTGAAAGCAGGGCCTGAGATGGAGATTCACGTGCATTTGATTTTTTTGAGGGTGTAC 16241096
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     1740 TTCCTGAAAGCAGGGCCTGAGATGGAGATTCACGTGCATGTGATTTTTTTGAGGGTGTAC 1799

 16241097 TCTCAGGGGAAATCTGTAGGGGAGTGAGTGATACAGAAGAGAGAGAGGGAAGAGCTGAAC 16241156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 TCTCAGGGGAAATCTGTAGGGGAGTGAGTGATACAGAAGAGAGAGAGGGAAGAGCTGAAC 1859

 16241157 AAATATGTGGTTTCAGGTGAAGTCCAGCCATAGCCTGATCCCATGGGGGACTCTGGAGCA 16241216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 AAATATGTGGTTTCAGGTGAAGTCCAGCCATAGCCTGATCCCATGGGGGACTCTGGAGCA 1919

 16241217 CAGGCTGCACTGCGGGGTCTGTCTTGCTTTTTACCCTGCAATGGTCAGTCATTGACCATG 16241276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 CAGGCTGCACTGCGGGGTCTGTCTTGCTTTTTACCCTGCAATGGTCAGTCATTGACCATG 1979

 16241277 ACTGGGGCTGGGGGCAGCATCCTGCATGACTGTCTGGCACCTGCAGCAGAGACCGTTTTA 16241336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 ACTGGGGCTGGGGGCAGCATCCTGCATGACTGTCTGGCACCTGCAGCAGAGACCGTTTTA 2039

 16241337 ATACCCCAAGGCAAGTCTCCAGGGAAGGGTTAAGATTTCAGTTAGCACCCACAGCAGCTG 16241396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 ATACCCCAAGGCAAGTCTCCAGGGAAGGGTTAAGATTTCAGTTAGCACCCACAGCAGCTG 2099

 16241397 GGGACATGCAAACCAAACCAAAACAGTTAAGGGGAGCTCAGGGAATCTGAGTAGGACACT 16241456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 GGGACATGCAAACCAAACCAAAACAGTTAAGGGGAGCTCAGGGAATCTGAGTAGGACACT 2159

 16241457 ATATTAGTCTGTTCTCACACTGCTATAAAGAACTGCCTGAGACTAGGTAATTTATAAAGA 16241516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 ATATTAGTCTGTTCTCACACTGCTATAAAGAACTGCCTGAGACTAGGTAATTTATAAAGA 2219

 16241517 AAGGAGGTTTAATTGACTCACAGTTTCGCATGGCTGGGGAGGCCTCAGGAAACTTACAAT 16241576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 AAGGAGGTTTAATTGACTCACAGTTTCGCATGGCTGGGGAGGCCTCAGGAAACTTACAAT 2279

 16241577 CATGGTGGAAGGGGAAGCATGTCTTACATGGCAGCAAGTGAGAGAAAGAGAGAGAGAGAG 16241636
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 CACGGTGGAAGGGGAAGCATGTCTTACATGGCAGCAAGTGAGAGAAAGAGAGAGAGAGAG 2339

 16241637 GAGGAAAAACTATCAAACACTTATATAATCATCAGATCTCATGAGAACTCACTATCACGA 16241696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 GAGGAAAAACTATCAAACACTTATATAATCATCAGATCTCATGAGAACTCACTATCACGA 2399

 16241697 GAACAGCATGGGGGAAACTGCCCACATGATCCAATCACCTCCCACCAGGTCCCTCCCTCG 16241756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 GAACAGCATGGGGGAAACTGCCCACATGATCCAATCACCTCCCACCAGGTCCCTCCCTCG 2459

 16241757 CCACATAGGGATTATGGGGATTACCACTCAAGATGAGATCTGGGTGGGGACAAAGAGCCA 16241816
          .|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 ACACATAGGGATTATGGGGATTACAACTCAAGATGAGATCTGGGTGGGGACAAAGAGCCA 2519

 16241817 AACCATATCAGACACCAACAGTATCTGCTACATTCTTGCTGCTGCATTTGGAGAATGTTA 16241876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 AACCATATCAGACACCAACAGTATCTGCTACATTCTTGCTGCTGCATTTGGAGAATGTTA 2579

 16241877 GCAAGTTCTCCCCTTTCCTGGTTTTCTGACACCATCCCTCTAATTTTTACTGGAGAGAAT 16241936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 GCAAGTTCTCCCCTTTCCTGGTTTTCTGACACCATCCCTCTAATTTTTACTGGAGAGAAT 2639

 16241937 CATGGCCCACCCCAACCTAACCAAGCATCTTACATCTCAGCAACAACCACACTGTAGTAA 16241996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 CATGGCCCACCCCAACCTAACCAAGCATCTTACATCTCAGCAACAACCACACTGTAGTAA 2699

 16241997 TGTTTTCGGTTCTTAGGACCCAGGTGCTCACCACAGCTTCCAAAAGAGAGTTGCTGACGA 16242056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 TGTTTTCGGTTCTTAGGACCCAGGTGCTCACCACAGCTTCCAAAAGAGAGTTGCTGACGA 2759

 16242057 TTGTCTTAGTCACAATCTCATCGGTTGTGGCATTTGTCATTCCACTGACCACAACCCTGT 16242116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 TTGTCTTAGTCACAATCTCATCGGTTGTGGCATTTGTCATTCCACTGACCACAACCCTGT 2819

 16242117 TGATTCCAGGACAACTCAAGTCTGCTCTCAGCGAATATGTGGCCAGGCTGGAGGGGGTGA 16242176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2820 TGATTCCAGGACAACTCAAGTCTGCTCTCAGCGAATATGTGGCCAGGCTGGAGGGGGTGA 2879

 16242177 AGTTACTCAGGAGCAACAAGAGGCTGGGTGCCATCAGGGCCCGGATGCTGGGGGCCACCA 16242236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2880 AGTTACTCAGGAGCAACAAGAGGCTGGGTGCCATCAGGGCCCGGATGCTGGGGGCCACCA 2939

 16242237 GAGCCACCGGGGATGTGCTCGTCTTCATGGATGCCCACTGCGAGTGCCACCCAGGCTGGC 16242296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2940 GAGCCACCGGGGATGTGCTCGTCTTCATGGATGCCCACTGCGAGTGCCACCCAGGCTGGC 2999

 16242297 TGGAGCCCCTCCTCAGCAGAATAGCTGGTGACAGGTAACTTATTCCCTGGGCTTGCAAAG 16242356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3000 TGGAGCCCCTCCTCAGCAGAATAGCTGGTGACAGGTAACTTATTCCCTGGGCTTGCAAAG 3059

 16242357 CAAGACATGGAACTGGGAGAAACAGTCTACAGCATCAGCCACTCACAGAGCAACCCACCT 16242416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3060 CAAGACATGGAACTGGGAGAAACAGTCTACAGCATCAGCCACTCACAGAGCAACCCACCT 3119

 16242417 ATTAATTCCTGAATCTCCATTAGAGAGTGATATATTCCCTTCGGGTTTTCAGATGTGTAA 16242476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3120 ATTAATTCCTGAATCTCCATTAGAGAGTGATATATTCCCTTCGGGTTTTCAGATGTGTAA 3179

 16242477 GTTTTTTAAGACTATAGAGTTAGAGTTGGAAAGGAGGTTAGAGGTCTTCATCTACCTTGC 16242536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3180 GTTTTTTAAGACTATAGAGTTAGAGTTGGAAAGGAGGTTAGAGGTCTTCATCTACCTTGC 3239

 16242537 TTTATAGATAAAGAAACCGAGGCCTGGAGAACAGCTTCTATGAGGTTGCAAATACTTAAA 16242596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3240 TTTATAGATAAAGAAACCGAGGCCTGGAGAACAGCTTCTATGAGGTTGCAAATACTTAAA 3299

 16242597 ATTGTATTAAATTGCATGACGAGGGTAACACCTTACCATAGCTATCATTGCCTTTGGTGA 16242656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3300 ATTGTATTAAATTGCATGACGAGGGTAACACCTTACCATAGCTATCATTGCCTTTGGTGA 3359

 16242657 AAATTTGGCAATTTTTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTGTGATGGCGT 16242716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||
     3360 AAATTTGGCAATTTTTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTT------GTGATGGCGT 3413

 16242717 CTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGCGGGGCGATCTCGGCTCACTGCAAGCTGCGC 16242776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3414 CTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGCGGGGCGATCTCGGCTCACTGCAAGCTGCGC 3473

 16242777 CTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCC 16242836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3474 CTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCC 3533

 16242837 CGCCACCACACCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGAAGGGGTTTCACCGTGTTAG 16242896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3534 CGCCACCACACCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGAAGGGGTTTCACCGTGTTAG 3593

 16242897 CCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACTTCGTGATCCGCCCTCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTG 16242956
          |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3594 CCAG-ATGGTCTCGATCTCCTGACTTCGTGATCCGCCCTCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTG 3652

 16242957 GGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCTGGCCGAAAATTCGTCAATTTTAATCAAGCTTGT 16243016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3653 GGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCTGGCCGAAAATTCGTCAATTTTAATCAAGCTTGT 3712

 16243017 AACATAACCTGGGGAAAAAGTCTCTGAACTACACTAGGCCGTAGATTACTCACCCATAAA 16243076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3713 AACATAACCTGGGGAAAAAGTCTCTGAACTACACTAGGCCGTAGATTACTCACCCATAAA 3772

 16243077 AAGAAAACATTATGTTCTCTGATCACTAAACAGCATTCTTTGTTTCCCCAGTTTATATAA 16243136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3773 AAGAAAACATTATGTTCTCTGATCACTAAACAGCATTCTTTGTTTCCCCAGTTTATATAA 3832

 16243137 GGGGTCCCTAATTTTCTACCTAAGGCCAGTCCTTGGAAATGTGAAGTTGGAGAGGACTGC 16243196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3833 GGGGTCCCTAATTTTCTACCTAAGGCCAGTCCTTGGAAATGTGAAGTTGGAGAGGACTGC 3892

 16243197 ATTACATTACCCTGTAGACAAGCATCTTAACATTTTTCTTGATCATTTCTCTGCTCTCCT 16243256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3893 ATTACATTACCCTGTAGACAAGCATCTTAACATTTTTCTTGATCATTTCTCTGCTCTCCT 3952

 16243257 TCCCCCATCTGACCGTCAATCTCTTTCTCACTTCCTTGCTCAAGACAAACAGTTCCTAAA 16243316
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3953 TCCCCCATCTGACCGGCAATCTCTTTCTCACTTCCTTGCTCAAGACAAACAGTTCCTAAA 4012

 16243317 CATGTCTAGTCAAACATTACCCTCAATCTGAATATCCTACCCAGGAAAACTGAAACCTGG 16243376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4013 CATGTCTAGTCAAACATTACCCTCAATCTGAATATCCTACCCAGGAAAACTGAAACCTGG 4072

 16243377 TGGCTGGCCCACCTTGGACCACCTCAGGCATACCACTTGGAGCTCATGTAGGCATGTAGC 16243436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4073 TGGCTGGCCCACCTTGGACCACCTCAGGCATACCACTTGGAGCTCATGTAGGCATGTAGC 4132

 16243437 AGAGTAGAACCACAATCAATAATTGTTTGATGGTGCCCAGCAAGACAGGACCAATGCTAG 16243496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4133 AGAGTAGAACCACAATCAATAATTGTTTGATGGTGCCCAGCAAGACAGGACCAATGCTAG 4192

 16243497 AACCAAGCCTTATGACTTCTACCCATGATGAATGTTTATTATCTCACCTGAAGTTAGGGA 16243556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4193 AACCAAGCCTTATGACTTCTACCCATGATGAATGTTTATTATCTCACCTGAAGTTAGGGA 4252

 16243557 TGATCAATCAAATATAAGAAAAAATTCCTGGACCAGATCGGAATGAATCCTGGAGACATA 16243616
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     4253 TGATCAATCAAATATAAGAAAAAATTCCTGGACCAGATCAGAATGAATCCTGGAGACATA 4312

 16243617 GGAGTTACCATCAGCCAAATGGAGATGGTTTCAAACGTTCAAATGACAGAAAGTAAATTG 16243676
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     4313 GGAGTTACCATCAGCCAAATGGAGATGGTTCCAAACGTTCAAATGACAGAAAGTAAATTG 4372

 16243677 TTAATAGTTCAGCATTCCATTTTAACAAAGAAGAACAATCGGAACTCAAGTGAGATCAAG 16243736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4373 TTAATAGTTCAGCATTCCATTTTAACAAAGAAGAACAATCGGAACTCAAGTGAGATCAAG 4432

 16243737 ACAGATTAATGTTTCCCAGTTTCATGAGACAGATTGTCTCTTGACTCACATCTCATAAGA 16243796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4433 ACAGATTAATGTTTCCCAGTTTCATGAGACAGATTGTCTCTTGACTCACATCTCATAAGA 4492

 16243797 AAAGAAGACACACATAAATTCAGCACTAGGACAAGAACTAGGACACAAAAATGCACAAGC 16243856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4493 AAAGAAGACACACATAAATTCAGCACTAGGACAAGAACTAGGACACAAAAATGCACAAGC 4552

 16243857 TGGCCAGGCACGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGACGG 16243916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4553 TGGCCAGGCACGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGACGG 4612

 16243917 ATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTAC 16243976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4613 ATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTAC 4672

 16243977 TAAAAATACAAAAATTAACTGGGTGTGGTAGCGTGCGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGA 16244036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4673 TAAAAATACAAAAATTAACTGGGTGTGGTAGCGTGCGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGA 4732

 16244037 GGCTGAGGTGGGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTAAAGTGAGCCAAGATCGT 16244096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4733 GGCTGAGGTGGGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTAAAGTGAGCCAAGATCGT 4792

 16244097 GCTACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCCATCCCGAAAAGAAAAGAAAATG 16244156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4793 GCTACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCCATCCCGAAAAGAAAAGAAAATG 4852

 16244157 CACAAGCCCTCCAAAGCTGCCATTTTTGATTCTGTTTCATGCAAAGGGCCATCTTGAAAT 16244216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4853 CACAAGCCCTCCAAAGCTGCCATTTTTGATTCTGTTTCATGCAAAGGGCCATCTTGAAAT 4912

 16244217 CAGAGCGATGTCTATCATTGGAGTCAGACTCTGAAGTTGATCTTGCCCATTTCCCATCTG 16244276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4913 CAGAGCGATGTCTATCATTGGAGTCAGACTCTGAAGTTGATCTTGCCCATTTCCCATCTG 4972

 16244277 ATTCCCATTCTGGTATCACAGACAGGTGGCTCTCAGAGGGACCATGAAGATCATCTTGTC 16244336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4973 ATTCCCATTCTGGTATCACAGACAGGTGGCTCTCAGAGGGACCATGAAGATCATCTTGTC 5032

 16244337 TTACCTCATGATTTCGCTATCGAGAACCCTGAGTTCCAGGAAAGTAAAAAAGACCCCTCA 16244396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5033 TTACCTCATGATTTCGCTATCGAGAACCCTGAGTTCCAGGAAAGTAAAAAAGACCCCTCA 5092

 16244397 GGGTCACACAGCCATTTGACAACTGGGCTGTTTTCTATGCTGCTTTTATGCAGACATTTA 16244456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5093 GGGTCACACAGCCATTTGACAACTGGGCTGTTTTCTATGCTGCTTTTATGCAGACATTTA 5152

 16244457 GAAATGCAGTAATTAACATCATTAAACTTTATGTATGTGTAACCCTCGCAGACTTCTTTC 16244516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5153 GAAATGCAGTAATTAACATCATTAAACTTTATGTATGTGTAACCCTCGCAGACTTCTTTC 5212

 16244517 ATATGCCTTCTTTAATGACCCCCATGAGAGGCCTCAGGCAGGTATTTTAGCTTCTGTTTT 16244576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5213 ATATGCCTTCTTTAATGACCCCCATGAGAGGCCTCAGGCAGGTATTTTAGCTTCTGTTTT 5272

 16244577 ATAGGGGGAGAAATTGAGGCTCAGAGAGGTGACATGATATGTAAGGGCAGATAATTCGTA 16244636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5273 ATAGGGGGAGAAATTGAGGCTCAGAGAGGTGACATGATATGTAAGGGCAGATAATTCGTA 5332

 16244637 GCTGAGTCAGATTTTCTGACTCTGGGTCCAGTGCTGTTTTTATTGTGTACATTTTCTTTT 16244696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5333 GCTGAGTCAGATTTTCTGACTCTGGGTCCAGTGCTGTTTTTATTGTGTACATTTTCTTTT 5392

 16244697 TAAGAGTTGGAGAAGCTGGTCAGGGAGGAACATTAGTCATCCCTAACCCCACAACTGGTT 16244756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5393 TAAGAGTTGGAGAAGCTGGTCAGGGAGGAACATTAGTCATCCCTAACCCCACAACTGGTT 5452

 16244757 ATGAGACATGTGTTACCTGCTGCTGTGAGTCCCTCGTATCTGCTTCTCACATCGGGGCCC 16244816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5453 ATGAGACATGTGTTACCTGCTGCTGTGAGTCCCTCGTATCTGCTTCTCACATCGGGGCCC 5512

 16244817 CATTTCCCAGAGCTAGGTGAAGGTAGAAAGACGTGGCACTACCTCAGTGTCCTAGGCTAG 16244876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5513 CATTTCCCAGAGCTAGGTGAAGGTAGAAAGACGTGGCACTACCTCAGTGTCCTAGGCTAG 5572

 16244877 AAAGAAAATGAGGCTCCCTGGGAAGCCCTTTGTGATTAAGAGACATTCTAGTTTCCTGTG 16244936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5573 AAAGAAAATGAGGCTCCCTGGGAAGCCCTTTGTGATTAAGAGACATTCTAGTTTCCTGTG 5632

 16244937 CCCTTCCCCTCTCCTCTTTTCCTCTCCTGTCTGTCTCTGCCTCTCTACCTCTCTCACGGT 16244996
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5633 CCCTTCCCCTCTCCTCTTTTCCCCTCCTGTCTGTCTCTGCCTCTCTACCTCTCTCACGGT 5692

 16244997 CTTTGTCTCTCTCTGTCTCTTGGTCACTCATTCTCTCTCTCTCTCTCT 16245044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5693 CTTTGTCTCTCTCTGTCTCTTGGTCACTCATTCTCTCTCTCTCTCTCT 5740

EXCISED REGION

 16245053 CACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAGTGGGCCTCTGATCCT 16245112
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||
     5741 CACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAC--TGGGCCTCTGATCCT 5798

 16245113 GGTGTGTTACTGGCTTGCCTTCCTCTTTGGGTTCCATCTCTTCTGCGTGATGTGACCACA 16245172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5799 GGTGTGTTACTGGCTTGCCTTCCTCTTTGGGTTCCATCTCTTCTGCGTGATGTGACCACA 5858

 16245173 TTTTCATCATCTCTACACCTCATTCATGGCTTCTTGTCCACTGTGTTTTCTCTGGGCCCT 16245232
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     5859 TTTTCATCATCTCTACACCTCATTCATGGCTTCTTGTCCACTGTGTTTTCTCTGGGCCCC 5918

 16245233 AGTGTCCAGCTTTTAGGCACTGGCAGGTGAGGATCTGGAAGAAAAGCCACCTTTCTGGTA 16245292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5919 AGTGTCCAGCTTTTAGGCACTGGCAGGTGAGGATCTGGAAGAAAAGCCACCTTTCTGGTA 5978

 16245293 TCTGAGTCCCACTCTCTCCACTCCACCTGGCAACGCTCTATGAGCTGTGGCAGGGAGAGC 16245352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5979 TCTGAGTCCCACTCTCTCCACTCCACCTGGCAACGCTCTATGAGCTGTGGCAGGGAGAGC 6038

 16245353 AGCCTCATTCAGTGTGTGCTTTACTCCCCCAGGGACGTCGCCCACGTGCCTCATACAAAG 16245412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6039 AGCCTCATTCAGTGTGTGCTTTACTCCCCCAGGGACGTCGCCCACGTGCCTCATACAAAG 6098

 16245413 CCAAGCTGTGGAAGGCATTTGGTGCAGCTCCTCACATGGAGAGGAGAGGGGGCCCAGCTG 16245472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6099 CCAAGCTGTGGAAGGCATTTGGTGCAGCTCCTCACATGGAGAGGAGAGGGGGCCCAGCTG 6158

 16245473 TCTCCAAGGCTTGTGTCAGGAGACATTCTGTCACCAGATGAGGACACAGTGCCCAAAAGA 16245532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6159 TCTCCAAGGCTTGTGTCAGGAGACATTCTGTCACCAGATGAGGACACAGTGCCCAAAAGA 6218

 16245533 CAGAAAAGGGTCTTTAAGAGCTCTTATAAAAAAAAAAAAGTGGGGTGGGAGTGGTGAGTG 16245592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6219 CAGAAAAGGGTCTTTAAGAGCTCTTATAAAAAAAAAAAAGTGGGGTGGGAGTGGTGAGTG 6278

 16245593 AACAGTGCAGTAAGCCACAAATCAGCTCTTTCAAAGAGCCGTAGCCTCCTCCACACCCTG 16245652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6279 AACAGTGCAGTAAGCCACAAATCAGCTCTTTCAAAGAGCCGTAGCCTCCTCCACACCCTG 6338

 16245653 GCCAAGGAATTCAGAGCCTGCTGACCAGCCTTTGTTCCCTGTCCCTGCCTAGCAGGTTCC 16245712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6339 GCCAAGGAATTCAGAGCCTGCTGACCAGCCTTTGTTCCCTGTCCCTGCCTAGCAGGTTCC 6398

 16245713 CACTAGCCATGTGGCAACTTTATTTGAATTGGTAGAAATCCCTTCCTCATGACCATTCCT 16245772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6399 CACTAGCCATGTGGCAACTTTATTTGAATTGGTAGAAATCCCTTCCTCATGACCATTCCT 6458

 16245773 CCTGACTCCCATTCCTCAGAAAATTGGTCATAATATACTGATTTTATTAGAATAAGACAT 16245832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6459 CCTGACTCCCATTCCTCAGAAAATTGGTCATAATATACTGATTTTATTAGAATAAGACAT 6518

 16245833 CTTAATGCCAACTGTCAGCAAGTTGTTGAAATAAAAATGCAAATTTACAGTAATGATAAT 16245892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6519 CTTAATGCCAACTGTCAGCAAGTTGTTGAAATAAAAATGCAAATTTACAGTAATGATAAT 6578

 16245893 ATTAGAGATGTTCTCTTGGGTTGCACAGTGCGCAACTCCTGTAACTGTTCATAGCAACCC 16245952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6579 ATTAGAGATGTTCTCTTGGGTTGCACAGTGCGCAACTCCTGTAACTGTTCATAGCAACCC 6638

 16245953 TACATAGAGTCTCCCTATGGGCAACTGATTTTAGGGCAGCCCTGGGAGATGCTGATTGAT 16246012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6639 TACATAGAGTCTCCCTATGGGCAACTGATTTTAGGGCAGCCCTGGGAGATGCTGATTGAT 6698

 16246013 GGCCAGTTTCTACACAAAGTAACAATGATGGGAATCAAGACTAGCTGTTGTATCCAGCTC 16246072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6699 GGCCAGTTTCTACACAAAGTAACAATGATGGGAATCAAGACTAGCTGTTGTATCCAGCTC 6758

 16246073 TCAGCTGACTTGTGTTGACTGCCAGCTCTCATACCCAAGCCAAGCAGTGGAAGCCATACC 16246132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6759 TCAGCTGACTTGTGTTGACTGCCAGCTCTCATACCCAAGCCAAGCAGTGGAAGCCATACC 6818

 16246133 CCTGGAAGGATGAAGGTTTCTAAGGGGAAAGGGACAGTCTTGAAAGGGGCTGAAAGATGA 16246192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6819 CCTGGAAGGATGAAGGTTTCTAAGGGGAAAGGGACAGTCTTGAAAGGGGCTGAAAGATGA 6878

 16246193 TATCATCTCAAGAAGCTGAACAAGTTATCTCTTACTTGAAAATGGGTCTGGTCCCTATCT 16246252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6879 TATCATCTCAAGAAGCTGAACAAGTTATCTCTTACTTGAAAATGGGTCTGGTCCCTATCT 6938

 16246253 GCGAGACATCCGGTCCTTCAGGATCAGCCAGGGGTGCTATGGGGAGAAGCAATGTGGGGC 16246312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6939 GCGAGACATCCGGTCCTTCAGGATCAGCCAGGGGTGCTATGGGGAGAAGCAATGTGGGGC 6998

 16246313 AGGGAGAAGAACACCTCCCACTCTGCCCTTTGAAGGGTTAAATGATGGAAAGCAGTGTAA 16246372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6999 AGGGAGAAGAACACCTCCCACTCTGCCCTTTGAAGGGTTAAATGATGGAAAGCAGTGTAA 7058

 16246373 GAACCCCTTGTGCTTGTGCATGTGAGTCAGTGTGTGTGTGTAAGCATGTGAGAGTCTGAG 16246432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7059 GAACCCCTTGTGCTTGTGCATGTGAGTCAGTGTGTGTGTGTAAGCATGTGAGAGTCTGAG 7118

 16246433 TGTGGGGGGGAGCGAGCATGTGCGTGCGTGTGTGTGTGCGCGCGCATGTGCGCGTCAAGG 16246492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     7119 TGTGGGGGGGAGCGAGCATGTGCGTGCGTGTGTGTGCGCGCGCGCATGTGCGCGTCAAGG 7178

 16246493 AGCAGCAGGAGGTCAGGATGCCTCCTGCCCCCCCAGAGGGAGCAGCCTTCTTTGGCTCAG 16246552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7179 AGCAGCAGGAGGTCAGGATGCCTCCTGCCCCCCCAGAGGGAGCAGCCTTCTTTGGCTCAG 7238

 16246553 GTGCCCCAAGGAAACTCTCCAGCAACCATCGTACTTCATACCCTTCAGCATGACACGTCC 16246612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7239 GTGCCCCAAGGAAACTCTCCAGCAACCATCGTACTTCATACCCTTCAGCATGACACGTCC 7298

 16246613 TCGTATCTGCCCCTGGAAAAGCCGATGCCAGTCCTGCGGTCACAACTGAGCAGCAAGAGC 16246672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7299 TCGTATCTGCCCCTGGAAAAGCCGATGCCAGTCCTGCGGTCACAACTGAGCAGCAAGAGC 7358

 16246673 ACTGGGAAGGGAGAATTCAGAGCCTTCTGCTTCTAGTATAAGAGACTTTCCACAAACACC 16246732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7359 ACTGGGAAGGGAGAATTCAGAGCCTTCTGCTTCTAGTATAAGAGACTTTCCACAAACACC 7418

 16246733 AAGAATACGCATGAACTTTCAAAATGGCTTGTGTATCATGGACCTTGAGGAACATCCAGG 16246792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7419 AAGAATACGCATGAACTTTCAAAATGGCTTGTGTATCATGGACCTTGAGGAACATCCAGG 7478

 16246793 CTCACGAGAATTAACAAGGAATGAGATAAACGAGGGCTTATTCTTTATTGTGGTAAAAGG 16246852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7479 CTCACGAGAATTAACAAGGAATGAGATAAACGAGGGCTTATTCTTTATTGTGGTAAAAGG 7538

 16246853 TTATGGGAAGCTTGAAACTACAGTTAGCTCTTGAATATCTGGACAGTAATGTATTCGTTG 16246912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7539 TTATGGGAAGCTTGAAACTACAGTTAGCTCTTGAATATCTGGACAGTAATGTATTCGTTG 7598

 16246913 ATCTCACGTATTTCAGTGAACCAGTCTTTGTTGGCAGCTTGACTCCTTCTGTTTGCCTTT 16246972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7599 ATCTCACGTATTTCAGTGAACCAGTCTTTGTTGGCAGCTTGACTCCTTCTGTTTGCCTTT 7658

 16246973 TGAAACATAAGCACTTGATCTCCTGGAACTTAGGCTCAACATAGGATCAACCTTGTACCT 16247032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7659 TGAAACATAAGCACTTGATCTCCTGGAACTTAGGCTCAACATAGGATCAACCTTGTACCT 7718

 16247033 GCCTGAGGGTTAAAACTCAATTCACAGGTGAGGGACTGACGAAGTAAGCAGACACTTCCA 16247092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7719 GCCTGAGGGTTAAAACTCAATTCACAGGTGAGGGACTGACGAAGTAAGCAGACACTTCCA 7778

 16247093 GCTCCTTCCAAGTCAAACGAGGTCAGCTCGCTATTTTGCTTGACGTGAATTCCAAGAACA 16247152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7779 GCTCCTTCCAAGTCAAACGAGGTCAGCTCGCTATTTTGCTTGACGTGAATTCCAAGAACA 7838

 16247153 CCAGACACATCGGTAGGTACAAAACCACAAAGCTAAATAGAAGACTGTGGGTTTTTTATT 16247212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7839 CCAGACACATCGGTAGGTACAAAACCACAAAGCTAAATAGAAGACTGTGGGTTTTTTATT 7898

 16247213 TGAATTAATCACCGTTTTTGAGTCAGTAGACTACAGTTAGTAATTTAGTCCTGCTAGGCA 16247272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7899 TGAATTAATCACCGTTTTTGAGTCAGTAGACTACAGTTAGTAATTTAGTCCTGCTAGGCA 7958

 16247273 GCCACTGTGGTCCATGGGAATAAAGACCAAAATAGAAAACACTCCTCACTTCATTCACTG 16247332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7959 GCCACTGTGGTCCATGGGAATAAAGACCAAAATAGAAAACACTCCTCACTTCATTCACTG 8018

 16247333 ACATTTTATTCTTTATCTCTATCCAAAATGTACTCAGGGAAGCTCATGATTAATCACTCT 16247392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8019 ACATTTTATTCTTTATCTCTATCCAAAATGTACTCAGGGAAGCTCATGATTAATCACTCT 8078

 16247393 TGTATACAGTTAAAATAGAGGAAAAAGAAGATTTCAGAAAGGAAAAGAGGGTATTGGGAA 16247452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8079 TGTATACAGTTAAAATAGAGGAAAAAGAAGATTTCAGAAAGGAAAAGAGGGTATTGGGAA 8138

 16247453 TCAGGGGTAATACAGTTATTAGAAGTGAGTTTTACATGTGACTCTGAGCTTCCAGAAAGA 16247512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8139 TCAGGGGTAATACAGTTATTAGAAGTGAGTTTTACATGTGACTCTGAGCTTCCAGAAAGA 8198

 16247513 CAAAACAAAAAGAGAAACATAATGAATTTTAGAATTCTCATTTTCTAATAAAAAGCAACG 16247572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8199 CAAAACAAAAAGAGAAACATAATGAATTTTAGAATTCTCATTTTCTAATAAAAAGCAACG 8258

 16247573 TACTCCTTTGTTAAGAAGTACACAGCACAGGCTGGGTGCAGTGGCTCATACCTGTAATCT 16247632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8259 TACTCCTTTGTTAAGAAGTACACAGCACAGGCTGGGTGCAGTGGCTCATACCTGTAATCT 8318

 16247633 CAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCTGGCAGATCACTTTGAGCTCAGGAGTTCGAGACTAGCC 16247692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8319 CAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCTGGCAGATCACTTTGAGCTCAGGAGTTCGAGACTAGCC 8378

 16247693 TCAACAACATGGCGAAATCCCATTTCTACACGCACACACACCCCCACACTAGCCGGGCAT 16247752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8379 TCAACAACATGGCGAAATCCCATTTCTACACGCACACACACCCCCACACTAGCCGGGCAT 8438

 16247753 GGTGGCTCATGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGGAGCTGAGGCTGAAGAATCCTTGGGCC 16247812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8439 GGTGGCTCATGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGGAGCTGAGGCTGAAGAATCCTTGGGCC 8498

 16247813 TGGGAAGTGGAGGTTGCAGTGAGCGCAGATTGTGCCACTGCACTCCAGTCTGGGCGACAG 16247872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8499 TGGGAAGTGGAGGTTGCAGTGAGCGCAGATTGTGCCACTGCACTCCAGTCTGGGCGACAG 8558

 16247873 AGTGAGACCATTTAAAAAAAAAAAAAGGCCGGGCGCGATGGTTCACGCCTGTAATCCCCA 16247932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8559 AGTGAGACCATTTAAAAAAAAAAAAAGGCCGGGCGCGATGGTTCACGCCTGTAATCCCCA 8618

 16247933 GCACTTTGGGAGGCTGAGGTT 16247953
          |||||||||||||||||||||
     8619 GCACTTTGGGAGGCTGAGGTT 8639

Alignment time is 10.7689 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [16229408,16251209] =>     21802 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    2634] =>      2634 nucs 'mol-32-3025-176682_2634'

Score:        2540
Aligned:      2628        nucs
Identic:      2620 (100%) nucs =>       293 ( 99%)      2327 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [16238855,16239149] EXCISED REGION [16239157,16241489]
 second seq =>  [       1,     295] EXCISED REGION [     303,    2634]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         7 nucs [16239150,16239156]
 second seq =>         7 nucs [296,302]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [16239149,16239151] to [16239156,16239158]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [16239150,16239151] to [16239155,16239156]
 second seq =>         1 nucs [296,296] to [302,302]

 16238855 TCCATCCAGTGGCCCCATATTTCCTGTTGACATTGGGGTGCAAGGCCTTTTCCACAACCA 16238914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCCATCCAGTGGCCCCATATTTCCTGTTGACATTGGGGTGCAAGGCCTTTTCCACAACCA 60

 16238915 AGGGCAGCACTGGTTCTATTTCTGCAGGTCCCTCTCCTCTGTGTGCTTGCCAAGACCCAG 16238974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGGGCAGCACTGGTTCTATTTCTGCAGGTCCCTCTCCTCTGTGTGCTTGCCAAGACCCAG 120

 16238975 ATCCCAGACAAGCACCACCCTGCACACTGTTTTTATTTAATCCTCTTGGCCACCCAGAGA 16239034
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATCCCAGACAAGCACCACCTTGCACACTGTTTTTATTTAATCCTCTTGGCCACCCAGAGA 180

 16239035 GGCAGGGCTTATCAACCCTACTCTACCTGTGAGGAAAACTGAGACAGAAAAAGATGCTGC 16239094
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGCAGGGCTTATCAACCCTACTCTACCTATGAGGAAAACTGAGACAGAAAAAGATGCTGC 240

 16239095 GGGTTGCCCTGAGCCACCTTGATGGGCTTCCAAGCCGATGGTCATGACAGCATAG 16239149
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGGTTGCCCTGAGCCACCTTGATGGGCTTCCAAGCCGATGGTCATGACAGCATAG 295

EXCISED REGION

 16239157 TGATAGAATCAGCTAGATGGGTTTCAGGGTATTCGTCTGGGGTGGTGATGCCCACACCAA 16239216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      303 TGATAGAATCAGCTAGATGGGTTTCAGGGTATTCGTCTGGGGTGGTGATGCCCACACCAA 362

 16239217 ATCATTAAATCAGAAAATGCTTGCGATGACCAGCCCATGATGACCCTTTACAAGTGGAAG 16239276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      363 ATCATTAAATCAGAAAATGCTTGCGATGACCAGCCCATGATGACCCTTTACAAGTGGAAG 422

 16239277 TCAGTATTACTGCTGTTTTCTGGAGGGAAGGAGTTGAGGATCATACCAGCTTTTTCCGAG 16239336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      423 TCAGTATTACTGCTGTTTTCTGGAGGGAAGGAGTTGAGGATCATACCAGCTTTTTCCGAG 482

 16239337 CACTATACCACTCAGACATGGGTGCTCTTACCCACTTCAAAACCCTCTGAGAATGCCAAA 16239396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      483 CACTATACCACTCAGACATGGGTGCTCTTACCCACTTCAAAACCCTCTGAGAATGCCAAA 542

 16239397 CAACCATCGCAGTCTGGAAGTTCTTCCTTATCTATTCCGAAGCTCTCTTGCTAGAAGTCT 16239456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      543 CAACCATCGCAGTCTGGAAGTTCTTCCTTATCTATTCCGAAGCTCTCTTGCTAGAAGTCT 602

 16239457 GTCCTAAATAATACTAACAAGGGTTAGAGGTATAGCTGAAGAGACCAGCAGTCAGCCCAA 16239516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      603 GTCCTAAATAATACTAACAAGGGTTAGAGGTATAGCTGAAGAGACCAGCAGTCAGCCCAA 662

 16239517 GGAGGGCTTCATAAATTAATGTTTGGTGGGAATATCAGTGAAGGACTATATTTGGCTGCA 16239576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      663 GGAGGGCTTCATAAATTAATGTTTGGTGGGAATATCAGTGAAGGACTATATTTGGCTGCA 722

 16239577 CAGAACAGAAACCTGCTGCAGTGACTTAACCAATGAATAGAGATTTATTTTTCCTTATAG 16239636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      723 CAGAACAGAAACCTGCTGCAGTGACTTAACCAATGAATAGAGATTTATTTTTCCTTATAG 782

 16239637 TATAGAAAGCTCACAGGGTGGCAATGCAGTATTGGTGTGACAGCTCCACAATGCCATTGG 16239696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      783 TATAGAAAGCTCACAGGGTGGCAATGCAGTATTGGTGTGACAGCTCCACAATGCCATTGG 842

 16239697 ACACCCACCTTCATCTGCTTTCCACTTCAACATGCTTAGAGAGTAGTTTTGGCCTCATAA 16239756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      843 ACACCCACCTTCATCTGCTTTCCACTTCAACATGCTTAGAGAGTAGTTTTGGCCTCATAA 902

 16239757 TCACAACAGGGCTGCTCTACCTCTGGACATCACATACATATTTCAAATAGGGAAAAGGCG 16239816
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      903 TCACAACAGGGCTGTTCTACCTCTGGACATCACATACATATTTCAAATAGGGAAAAGGCG 962

 16239817 AAGAAGAGATAGGCAGAGGCCAGTCCGGTTTGTGCTCTTCGGAAAAAAAAAATTAGTAAA 16239876
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
      963 AAGAAGAGATAGGCAGAGGCCAGTCCGGTTTGTGCTCTTCGG-AAAAAAAAATTAGTAAA 1021

 16239877 ATAATAGTTTTCCCAGAATCCTTTCATTCATTTTATTTCTACCAGAGCTGCTGCCAGCAG 16239936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1022 ATAATAGTTTTCCCAGAATCCTTTCATTCATTTTATTTCTACCAGAGCTGCTGCCAGCAG 1081

 16239937 TGACAGGAAGTCTCGAGAGATACGTGTTTTTAGCTGTCCCGAGAAACATCAAAGTTCTGT 16239996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1082 TGACAGGAAGTCTCGAGAGATACGTGTTTTTAGCTGCCCCGAGAAACATCAAAGTTCTGT 1141

 16239997 CAGTACAGTGGAAGGGGAGAATGAATGGTGAGGAAGATGTTACATTTAGCAATGTTAAAG 16240056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1142 CAGTACAGTGGAAGGGGAGAATGAATGGTGAGGAAGATGTTACATTTAGCAATGTTAAAG 1201

 16240057 CCAATGAAGTCACTGAGGGGCTGCTTCTCAGATATGCAAGTCCAGAAATGTTAATAGCTT 16240116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1202 CCAATGAAGTCACTGAGGGGCTGCTTCTCAGATATGCAAGTCCAGAAATGTTAATAGCTT 1261

 16240117 GACTAACAGAGATTCCTCTCTAGGGAGTGGACCAGGGCTGACAGTCTTACCAGAAAAATA 16240176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1262 GACTAACAGAGATTCCTCTCTAGGGAGTGGACCAGGGCTGACAGTCTTACCAGAAAAATA 1321

 16240177 ATTATAAAGTAACACATCAACGAAGCATTTTACCAGTGAGAATTGCAACAGCCCAGTGAC 16240236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1322 ATTATAAAGTAACACATCAACGAAGCATTTTACCAGTGAGAATTGCAACAGCCCAGTGAC 1381

 16240237 TGGGACTCCTTTCCTCTACTGCTCAGGACATTGTTCACCCTGCAGAAAATCCATGGTGCT 16240296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1382 TGGGACTCCTTTCCTCTACTGCTCAGGACATTGTTCTCCCTGCAGAAAATCCATGGTGCT 1441

 16240297 TAGAAGACAGATTCCCAGGGAAGGAGTGTATGAAGTCTGCTGGGGGCTCTCGGGTGGGGC 16240356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1442 TAGAAGACAGATTCCCAGGGAAGGAGTGTATGAAGTCTGCTGGGGGCTCTCGGGTGGGGC 1501

 16240357 TGCCTTAACCTTCTCCAGCCTCCCCAGAGATCCAGCTACCAAAGCAGCCAGGCTACTTGT 16240416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1502 TGCCTTAACCTTCTCCAGCCTCCCCAGAGATCCAGCTACCAAAGCAGCCAGGCTACTTGT 1561

 16240417 ATCCACAGTTAAGGCCACCTCTGGGCTGGGGAACTGGGGGGGAAATTCTTGCTTTTTGGC 16240476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1562 ATCCACAGTTAAGGCCACCTCTGGGCTGGGGAACTGGGGGGGAAATTCTTGCTTTTTGGC 1621

 16240477 TCAGTTCTGTTCAATGCACATGTACTGAGTGCCTACTGTGGGCCAGGCCCTGCACTAAGG 16240536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1622 TCAGTTCTGTTCAATGCACATGTACTGAGTGCCTACTGTGGGCCAGGCCCTGCACTAAGG 1681

 16240537 GTTAGAGCAGAAGAGATGCATTAGGTACAACCCCTGTCCTTGGGGAGATCTTAGTCCACT 16240596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1682 GTTAGAGCAGAAGAGATGCATTAGGTACAACCCCTGTCCTTGGGGAGATCTTAGTCCACT 1741

 16240597 GGCCTGGGGGGACTCCCCATTTCCAAGACTTCATGGAGACCACTGCTTCTCTGTGAACAC 16240656
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1742 GGCCTGGGGGGACTCCCCGTTTCCAAGACTTCATGGAGACCACTGCTTCTCTGTGAACAC 1801

 16240657 ATTGTTCCTTCCATCTCCACTGGCTTGTTCCTCTTGGTGTGTGTGTACACAGACATGCAC 16240716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1802 ATTGTTCCTTCCATCTCCACTGGCTTGTTCCTCTTGGTGTGTGTGTACACAGACATGCAC 1861

 16240717 ACACACACACACATGCACTCACACACACAATCAAGTTATTCTTATCTTAAACACAAAACC 16240776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1862 ACACACACACACATGCACTCACACACACAATCAAGTTATTCTTATCTTAAACACAAAACC 1921

 16240777 TAACAAGCTTCTCTCATCCTTTCCGTCATCTTCTTAGGCCTCTTTTTCTCCCTTCCCCTA 16240836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1922 TAACAAGCTTCTCTCATCCTTTCCGTCATCTTCTTAGGCCTCTTTTTCTCCCTTCCCCTA 1981

 16240837 TAGAATCAACCTTCCTAACCGTCTGGACTCTTGGTCTCAGTTTTTCATCTTCCGTTTTCT 16240896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1982 TAGAATCAACCTTCCTAACCGTCTGGACTCTTGGTCTCAGTTTTTCATCTTCCGTTTTCT 2041

 16240897 CTCCCGGACCCACTGTGTTGCAGACTCCCCTATCAACTGCAATGAGATCTCTTTGACCAG 16240956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2042 CTCCCGGACCCACTGTGTTGCAGACTCCCCTATCAACTGCAATGAGATCTCTTTGACCAG 2101

 16240957 CACCACCAATCTCCTACCAGCTGCCAAATTTAATGGAGCCTTTTGCCTTTGACTTCCTTG 16241016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2102 CACCACCAATCTCCTACCAGCTGCCAAATTTAATGGAGCCTTTTGCCTTTGACTTCCTTG 2161

 16241017 ACCACTGTCTTAGGTCAGGTTTCCTGAAAGCAGGGCCTGAGATGGAGATTCACGTGCATT 16241076
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     2162 ACCACTGTCTTAGGTCAGGTTTCCTGAAAGCAGGGCCTGAGATGGAGATTCACGTGCATG 2221

 16241077 TGATTTTTTTGAGGGTGTACTCTCAGGGGAAATCTGTAGGGGAGTGAGTGATACAGAAGA 16241136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2222 TGATTTTTTTGAGGGTGTACTCTCAGGGGAAATCTGTAGGGGAGTGAGTGATACAGAAGA 2281

 16241137 GAGAGAGGGAAGAGCTGAACAAATATGTGGTTTCAGGTGAAGTCCAGCCATAGCCTGATC 16241196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2282 GAGAGAGGGAAGAGCTGAACAAATATGTGGTTTCAGGTGAAGTCCAGCCATAGCCTGATC 2341

 16241197 CCATGGGGGACTCTGGAGCACAGGCTGCACTGCGGGGTCTGTCTTGCTTTTTACCCTGCA 16241256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2342 CCATGGGGGACTCTGGAGCACAGGCTGCACTGCGGGGTCTGTCTTGCTTTTTACCCTGCA 2401

 16241257 ATGGTCAGTCATTGACCATGACTGGGGCTGGGGGCAGCATCCTGCATGACTGTCTGGCAC 16241316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2402 ATGGTCAGTCATTGACCATGACTGGGGCTGGGGGCAGCATCCTGCATGACTGTCTGGCAC 2461

 16241317 CTGCAGCAGAGACCGTTTTAATACCCCAAGGCAAGTCTCCAGGGAAGGGTTAAGATTTCA 16241376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2462 CTGCAGCAGAGACCGTTTTAATACCCCAAGGCAAGTCTCCAGGGAAGGGTTAAGATTTCA 2521

 16241377 GTTAGCACCCACAGCAGCTGGGGACATGCAAACCAAACCAAAACAGTTAAGGGGAGCTCA 16241436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2522 GTTAGCACCCACAGCAGCTGGGGACATGCAAACCAAACCAAAACAGTTAAGGGGAGCTCA 2581

 16241437 GGGAATCTGAGTAGGACACTATATTAGTCTGTTCTCACACTGCTATAAAGAAC 16241489
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2582 GGGAATCTGAGTAGGACACTATATTAGTCTGTTCTCACACTGCTATAAAGAAC 2634

Alignment time is 3.26391 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [16229408,16251209] =>     21802 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    3458] =>      3458 nucs 'mol-32-3030-128767_3458'

Score:        3331
Aligned:      3452        nucs
Identic:      3441 (100%) nucs =>       227 ( 99%)      3214 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [16238921,16239149] EXCISED REGION [16239157,16242379]
 second seq =>  [       1,     229] EXCISED REGION [     237,    3458]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         7 nucs [16239150,16239156]
 second seq =>         7 nucs [230,236]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [16239149,16239151] to [16239156,16239158]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [16239150,16239151] to [16239155,16239156]
 second seq =>         1 nucs [230,230] to [236,236]

 16238921 GCACTGGTTCTATTTCTGCAGGTCCCTCTCCTCTGTGTGCTTGCCAAGACCCAGATCCCA 16238980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCACTGGTTCTATTTCTGCAGGTCCCTCTCCTCTGTGTGCTTGCCAAGACCCAGATCCCA 60

 16238981 GACAAGCACCACCCTGCACACTGTTTTTATTTAATCCTCTTGGCCACCCAGAGAGGCAGG 16239040
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GACAAGCACCACCTTGCACACTGTTTTTATTTAATCCTCTTGGCCACCCAGAGAGGCAGG 120

 16239041 GCTTATCAACCCTACTCTACCTGTGAGGAAAACTGAGACAGAAAAAGATGCTGCGGGTTG 16239100
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GCTTATCAACCCTACTCTACCTATGAGGAAAACTGAGACAGAAAAAGATGCTGCGGGTTG 180

 16239101 CCCTGAGCCACCTTGATGGGCTTCCAAGCCGATGGTCATGACAGCATAG 16239149
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCCTGAGCCACCTTGATGGGCTTCCAAGCCGATGGTCATGACAGCATAG 229

EXCISED REGION

 16239157 TGATAGAATCAGCTAGATGGGTTTCAGGGTATTCGTCTGGGGTGGTGATGCCCACACCAA 16239216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      237 TGATAGAATCAGCTAGATGGGTTTCAGGGTATTCGTCTGGGGTGGTGATGCCCACACCAA 296

 16239217 ATCATTAAATCAGAAAATGCTTGCGATGACCAGCCCATGATGACCCTTTACAAGTGGAAG 16239276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      297 ATCATTAAATCAGAAAATGCTTGCGATGACCAGCCCATGATGACCCTTTACAAGTGGAAG 356

 16239277 TCAGTATTACTGCTGTTTTCTGGAGGGAAGGAGTTGAGGATCATACCAGCTTTTTCCGAG 16239336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      357 TCAGTATTACTGCTGTTTTCTGGAGGGAAGGAGTTGAGGATCATACCAGCTTTTTCCGAG 416

 16239337 CACTATACCACTCAGACATGGGTGCTCTTACCCACTTCAAAACCCTCTGAGAATGCCAAA 16239396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      417 CACTATACCACTCAGACATGGGTGCTCTTACCCACTTCAAAACCCTCTGAGAATGCCAAA 476

 16239397 CAACCATCGCAGTCTGGAAGTTCTTCCTTATCTATTCCGAAGCTCTCTTGCTAGAAGTCT 16239456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      477 CAACCATCGCAGTCTGGAAGTTCTTCCTTATCTATTCCGAAGCTCTCTTGCTAGAAGTCT 536

 16239457 GTCCTAAATAATACTAACAAGGGTTAGAGGTATAGCTGAAGAGACCAGCAGTCAGCCCAA 16239516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      537 GTCCTAAATAATACTAACAAGGGTTAGAGGTATAGCTGAAGAGACCAGCAGTCAGCCCAA 596

 16239517 GGAGGGCTTCATAAATTAATGTTTGGTGGGAATATCAGTGAAGGACTATATTTGGCTGCA 16239576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      597 GGAGGGCTTCATAAATTAATGTTTGGTGGGAATATCAGTGAAGGACTATATTTGGCTGCA 656

 16239577 CAGAACAGAAACCTGCTGCAGTGACTTAACCAATGAATAGAGATTTATTTTTCCTTATAG 16239636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      657 CAGAACAGAAACCTGCTGCAGTGACTTAACCAATGAATAGAGATTTATTTTTCCTTATAG 716

 16239637 TATAGAAAGCTCACAGGGTGGCAATGCAGTATTGGTGTGACAGCTCCACAATGCCATTGG 16239696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      717 TATAGAAAGCTCACAGGGTGGCAATGCAGTATTGGTGTGACAGCTCCACAATGCCATTGG 776

 16239697 ACACCCACCTTCATCTGCTTTCCACTTCAACATGCTTAGAGAGTAGTTTTGGCCTCATAA 16239756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      777 ACACCCACCTTCATCTGCTTTCCACTTCAACATGCTTAGAGAGTAGTTTTGGCCTCATAA 836

 16239757 TCACAACAGGGCTGCTCTACCTCTGGACATCACATACATATTTCAAATAGGGAAAAGGCG 16239816
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      837 TCACAACAGGGCTGTTCTACCTCTGGACATCACATACATATTTCAAATAGGGAAAAGGCG 896

 16239817 AAGAAGAGATAGGCAGAGGCCAGTCCGGTTTGTGCTCTTCGGAAAAAAAAAATTAGTAAA 16239876
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
      897 AAGAAGAGATAGGCAGAGGCCAGTCCGGTTTGTGCTCTTCGG-AAAAAAAAATTAGTAAA 955

 16239877 ATAATAGTTTTCCCAGAATCCTTTCATTCATTTTATTTCTACCAGAGCTGCTGCCAGCAG 16239936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      956 ATAATAGTTTTCCCAGAATCCTTTCATTCATTTTATTTCTACCAGAGCTGCTGCCAGCAG 1015

 16239937 TGACAGGAAGTCTCGAGAGATACGTGTTTTTAGCTGTCCCGAGAAACATCAAAGTTCTGT 16239996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1016 TGACAGGAAGTCTCGAGAGATACGTGTTTTTAGCTGCCCCGAGAAACATCAAAGTTCTGT 1075

 16239997 CAGTACAGTGGAAGGGGAGAATGAATGGTGAGGAAGATGTTACATTTAGCAATGTTAAAG 16240056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1076 CAGTACAGTGGAAGGGGAGAATGAATGGTGAGGAAGATGTTACATTTAGCAATGTTAAAG 1135

 16240057 CCAATGAAGTCACTGAGGGGCTGCTTCTCAGATATGCAAGTCCAGAAATGTTAATAGCTT 16240116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1136 CCAATGAAGTCACTGAGGGGCTGCTTCTCAGATATGCAAGTCCAGAAATGTTAATAGCTT 1195

 16240117 GACTAACAGAGATTCCTCTCTAGGGAGTGGACCAGGGCTGACAGTCTTACCAGAAAAATA 16240176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1196 GACTAACAGAGATTCCTCTCTAGGGAGTGGACCAGGGCTGACAGTCTTACCAGAAAAATA 1255

 16240177 ATTATAAAGTAACACATCAACGAAGCATTTTACCAGTGAGAATTGCAACAGCCCAGTGAC 16240236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1256 ATTATAAAGTAACACATCAACGAAGCATTTTACCAGTGAGAATTGCAACAGCCCAGTGAC 1315

 16240237 TGGGACTCCTTTCCTCTACTGCTCAGGACATTGTTCACCCTGCAGAAAATCCATGGTGCT 16240296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1316 TGGGACTCCTTTCCTCTACTGCTCAGGACATTGTTCTCCCTGCAGAAAATCCATGGTGCT 1375

 16240297 TAGAAGACAGATTCCCAGGGAAGGAGTGTATGAAGTCTGCTGGGGGCTCTCGGGTGGGGC 16240356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1376 TAGAAGACAGATTCCCAGGGAAGGAGTGTATGAAGTCTGCTGGGGGCTCTCGGGTGGGGC 1435

 16240357 TGCCTTAACCTTCTCCAGCCTCCCCAGAGATCCAGCTACCAAAGCAGCCAGGCTACTTGT 16240416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1436 TGCCTTAACCTTCTCCAGCCTCCCCAGAGATCCAGCTACCAAAGCAGCCAGGCTACTTGT 1495

 16240417 ATCCACAGTTAAGGCCACCTCTGGGCTGGGGAACTGGGGGGGAAATTCTTGCTTTTTGGC 16240476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1496 ATCCACAGTTAAGGCCACCTCTGGGCTGGGGAACTGGGGGGGAAATTCTTGCTTTTTGGC 1555

 16240477 TCAGTTCTGTTCAATGCACATGTACTGAGTGCCTACTGTGGGCCAGGCCCTGCACTAAGG 16240536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1556 TCAGTTCTGTTCAATGCACATGTACTGAGTGCCTACTGTGGGCCAGGCCCTGCACTAAGG 1615

 16240537 GTTAGAGCAGAAGAGATGCATTAGGTACAACCCCTGTCCTTGGGGAGATCTTAGTCCACT 16240596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1616 GTTAGAGCAGAAGAGATGCATTAGGTACAACCCCTGTCCTTGGGGAGATCTTAGTCCACT 1675

 16240597 GGCCTGGGGGGACTCCCCATTTCCAAGACTTCATGGAGACCACTGCTTCTCTGTGAACAC 16240656
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1676 GGCCTGGGGGGACTCCCCGTTTCCAAGACTTCATGGAGACCACTGCTTCTCTGTGAACAC 1735

 16240657 ATTGTTCCTTCCATCTCCACTGGCTTGTTCCTCTTGGTGTGTGTGTACACAGACATGCAC 16240716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1736 ATTGTTCCTTCCATCTCCACTGGCTTGTTCCTCTTGGTGTGTGTGTACACAGACATGCAC 1795

 16240717 ACACACACACACATGCACTCACACACACAATCAAGTTATTCTTATCTTAAACACAAAACC 16240776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1796 ACACACACACACATGCACTCACACACACAATCAAGTTATTCTTATCTTAAACACAAAACC 1855

 16240777 TAACAAGCTTCTCTCATCCTTTCCGTCATCTTCTTAGGCCTCTTTTTCTCCCTTCCCCTA 16240836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1856 TAACAAGCTTCTCTCATCCTTTCCGTCATCTTCTTAGGCCTCTTTTTCTCCCTTCCCCTA 1915

 16240837 TAGAATCAACCTTCCTAACCGTCTGGACTCTTGGTCTCAGTTTTTCATCTTCCGTTTTCT 16240896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1916 TAGAATCAACCTTCCTAACCGTCTGGACTCTTGGTCTCAGTTTTTCATCTTCCGTTTTCT 1975

 16240897 CTCCCGGACCCACTGTGTTGCAGACTCCCCTATCAACTGCAATGAGATCTCTTTGACCAG 16240956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1976 CTCCCGGACCCACTGTGTTGCAGACTCCCCTATCAACTGCAATGAGATCTCTTTGACCAG 2035

 16240957 CACCACCAATCTCCTACCAGCTGCCAAATTTAATGGAGCCTTTTGCCTTTGACTTCCTTG 16241016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2036 CACCACCAATCTCCTACCAGCTGCCAAATTTAATGGAGCCTTTTGCCTTTGACTTCCTTG 2095

 16241017 ACCACTGTCTTAGGTCAGGTTTCCTGAAAGCAGGGCCTGAGATGGAGATTCACGTGCATT 16241076
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     2096 ACCACTGTCTTAGGTCAGGTTTCCTGAAAGCAGGGCCTGAGATGGAGATTCACGTGCATG 2155

 16241077 TGATTTTTTTGAGGGTGTACTCTCAGGGGAAATCTGTAGGGGAGTGAGTGATACAGAAGA 16241136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2156 TGATTTTTTTGAGGGTGTACTCTCAGGGGAAATCTGTAGGGGAGTGAGTGATACAGAAGA 2215

 16241137 GAGAGAGGGAAGAGCTGAACAAATATGTGGTTTCAGGTGAAGTCCAGCCATAGCCTGATC 16241196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2216 GAGAGAGGGAAGAGCTGAACAAATATGTGGTTTCAGGTGAAGTCCAGCCATAGCCTGATC 2275

 16241197 CCATGGGGGACTCTGGAGCACAGGCTGCACTGCGGGGTCTGTCTTGCTTTTTACCCTGCA 16241256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2276 CCATGGGGGACTCTGGAGCACAGGCTGCACTGCGGGGTCTGTCTTGCTTTTTACCCTGCA 2335

 16241257 ATGGTCAGTCATTGACCATGACTGGGGCTGGGGGCAGCATCCTGCATGACTGTCTGGCAC 16241316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2336 ATGGTCAGTCATTGACCATGACTGGGGCTGGGGGCAGCATCCTGCATGACTGTCTGGCAC 2395

 16241317 CTGCAGCAGAGACCGTTTTAATACCCCAAGGCAAGTCTCCAGGGAAGGGTTAAGATTTCA 16241376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2396 CTGCAGCAGAGACCGTTTTAATACCCCAAGGCAAGTCTCCAGGGAAGGGTTAAGATTTCA 2455

 16241377 GTTAGCACCCACAGCAGCTGGGGACATGCAAACCAAACCAAAACAGTTAAGGGGAGCTCA 16241436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2456 GTTAGCACCCACAGCAGCTGGGGACATGCAAACCAAACCAAAACAGTTAAGGGGAGCTCA 2515

 16241437 GGGAATCTGAGTAGGACACTATATTAGTCTGTTCTCACACTGCTATAAAGAACTGCCTGA 16241496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2516 GGGAATCTGAGTAGGACACTATATTAGTCTGTTCTCACACTGCTATAAAGAACTGCCTGA 2575

 16241497 GACTAGGTAATTTATAAAGAAAGGAGGTTTAATTGACTCACAGTTTCGCATGGCTGGGGA 16241556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2576 GACTAGGTAATTTATAAAGAAAGGAGGTTTAATTGACTCACAGTTTCGCATGGCTGGGGA 2635

 16241557 GGCCTCAGGAAACTTACAATCATGGTGGAAGGGGAAGCATGTCTTACATGGCAGCAAGTG 16241616
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2636 GGCCTCAGGAAACTTACAATCACGGTGGAAGGGGAAGCATGTCTTACATGGCAGCAAGTG 2695

 16241617 AGAGAAAGAGAGAGAGAGAGGAGGAAAAACTATCAAACACTTATATAATCATCAGATCTC 16241676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2696 AGAGAAAGAGAGAGAGAGAGGAGGAAAAACTATCAAACACTTATATAATCATCAGATCTC 2755

 16241677 ATGAGAACTCACTATCACGAGAACAGCATGGGGGAAACTGCCCACATGATCCAATCACCT 16241736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2756 ATGAGAACTCACTATCACGAGAACAGCATGGGGGAAACTGCCCACATGATCCAATCACCT 2815

 16241737 CCCACCAGGTCCCTCCCTCGCCACATAGGGATTATGGGGATTACCACTCAAGATGAGATC 16241796
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     2816 CCCACCAGGTCCCTCCCTCGACACATAGGGATTATGGGGATTACAACTCAAGATGAGATC 2875

 16241797 TGGGTGGGGACAAAGAGCCAAACCATATCAGACACCAACAGTATCTGCTACATTCTTGCT 16241856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2876 TGGGTGGGGACAAAGAGCCAAACCATATCAGACACCAACAGTATCTGCTACATTCTTGCT 2935

 16241857 GCTGCATTTGGAGAATGTTAGCAAGTTCTCCCCTTTCCTGGTTTTCTGACACCATCCCTC 16241916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2936 GCTGCATTTGGAGAATGTTAGCAAGTTCTCCCCTTTCCTGGTTTTCTGACACCATCCCTC 2995

 16241917 TAATTTTTACTGGAGAGAATCATGGCCCACCCCAACCTAACCAAGCATCTTACATCTCAG 16241976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2996 TAATTTTTACTGGAGAGAATCATGGCCCACCCCAACCTAACCAAGCATCTTACATCTCAG 3055

 16241977 CAACAACCACACTGTAGTAATGTTTTCGGTTCTTAGGACCCAGGTGCTCACCACAGCTTC 16242036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3056 CAACAACCACACTGTAGTAATGTTTTCGGTTCTTAGGACCCAGGTGCTCACCACAGCTTC 3115

 16242037 CAAAAGAGAGTTGCTGACGATTGTCTTAGTCACAATCTCATCGGTTGTGGCATTTGTCAT 16242096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3116 CAAAAGAGAGTTGCTGACGATTGTCTTAGTCACAATCTCATCGGTTGTGGCATTTGTCAT 3175

 16242097 TCCACTGACCACAACCCTGTTGATTCCAGGACAACTCAAGTCTGCTCTCAGCGAATATGT 16242156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3176 TCCACTGACCACAACCCTGTTGATTCCAGGACAACTCAAGTCTGCTCTCAGCGAATATGT 3235

 16242157 GGCCAGGCTGGAGGGGGTGAAGTTACTCAGGAGCAACAAGAGGCTGGGTGCCATCAGGGC 16242216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3236 GGCCAGGCTGGAGGGGGTGAAGTTACTCAGGAGCAACAAGAGGCTGGGTGCCATCAGGGC 3295

 16242217 CCGGATGCTGGGGGCCACCAGAGCCACCGGGGATGTGCTCGTCTTCATGGATGCCCACTG 16242276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3296 CCGGATGCTGGGGGCCACCAGAGCCACCGGGGATGTGCTCGTCTTCATGGATGCCCACTG 3355

 16242277 CGAGTGCCACCCAGGCTGGCTGGAGCCCCTCCTCAGCAGAATAGCTGGTGACAGGTAACT 16242336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3356 CGAGTGCCACCCAGGCTGGCTGGAGCCCCTCCTCAGCAGAATAGCTGGTGACAGGTAACT 3415

 16242337 TATTCCCTGGGCTTGCAAAGCAAGACATGGAACTGGGAGAAAC 16242379
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3416 TATTCCCTGGGCTTGCAAAGCAAGACATGGAACTGGGAGAAAC 3458

Alignment time is 4.28093 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [16229408,16251209] =>     21802 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    4594] =>      4594 nucs 'mol-32-3030-175630_4594'

Score:        4550
Aligned:      4594        nucs
Identic:      4590 (100%) nucs =>      3268 (100%)      1322 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [16236139,16239408] EXCISED REGION [16241210,16242533]
 second seq =>  [       1,    3270] EXCISED REGION [    3271,    4594]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1801 nucs [16239409,16241209]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [16239409,16239409] to [16241210,16241210]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [16239409,16239410] to [16241208,16241209]
 second seq =>         0 nucs

 16236139 ATGGAGTACTACGCAGCCATAAAAAGGAATGAGATCCTGTCCTTTCCAGGGACATGGATG 16236198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATGGAGTACTACGCAGCCATAAAAAGGAATGAGATCCTGTCCTTTCCAGGGACATGGATG 60

 16236199 GAGCTGGAAAACATTATCCTCAGCAAATGAACACAGGAACAGAAAACCAAACACCGCATG 16236258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAGCTGGAAAACATTATCCTCAGCAAATGAACACAGGAACAGAAAACCAAACACCGCATG 120

 16236259 TTCTCACTTATAAGTGGGAGCTGAACAGTGAGAACACATGGACACAGGGAGGGGAGCAAC 16236318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTCTCACTTATAAGTGGGAGCTGAACAGTGAGAACACATGGACACAGGGAGGGGAGCAAC 180

 16236319 ACACACTGGGGCCTGTTGTGGGGGCATGGGGAGGGAGAGCATCAGGATAAATAACTAATG 16236378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACACACTGGGGCCTGTTGTGGGGGCATGGGGAGGGAGAGCATCAGGATAAATAACTAATG 240

 16236379 CATGTGGGGCTGAATACCTAGGTGATGGGTTGATGGTGGCAGCAAACCACTATGGCACAT 16236438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CATGTGGGGCTGAATACCTAGGTGATGGGTTGATGGTGGCAGCAAACCACTATGGCACAT 300

 16236439 GTTTACCTATGTAGCAAACCTGCACGTCCTGCACATGTATCCTGGAACTTAAAATAAAAT 16236498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTTTACCTATGTAGCAAACCTGCACGTCCTGCACATGTATCCTGGAACTTAAAATAAAAT 360

 16236499 TTTAAAAAATAGTAAGTGCTAACATTTAAAAATTGTGTGCCAGGTGCTATGCTAGGTTGT 16236558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTTAAAAAATAGTAAGTGCTAACATTTAAAAATTGTGTGCCAGGTGCTATGCTAGGTTGT 420

 16236559 AGGAACATAAAAATAAAGAAAATAGTGTCCCTGACCTTGAATGGATGACAGAGATTACTG 16236618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGGAACATAAAAATAAAGAAAATAGTGTCCCTGACCTTGAATGGATGACAGAGATTACTG 480

 16236619 GACACTTAACTACACGCATCATCCTATCCAAGCCTCACCACAGCCTCGGGGAGTCCTGAT 16236678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GACACTTAACTACACGCATCATCCTATCCAAGCCTCACCACAGCCTCGGGGAGTCCTGAT 540

 16236679 CTTCCCAGAAGGCCAGGAGGGGTGTCCCTAGGTCATTTAGTTGTGCCAGAAATGTAGGCC 16236738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTTCCCAGAAGGCCAGGAGGGGTGTCCCTAGGTCATTTAGTTGTGCCAGAAATGTAGGCC 600

 16236739 TCAGGCCCAAGCCAAAGACTAGAGCAGAGGTTCTCAAAGTGTGGTCCACAGAAAACAGCA 16236798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCAGGCCCAAGCCAAAGACTAGAGCAGAGGTTCTCAAAGTGTGGTCCACAGAAAACAGCA 660

 16236799 GCATCGGCATCACCTGGGAGCTTGTTAGAAATGCAAATTCTTCAGCCCCACTCCATCTCC 16236858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GCATCGGCATCACCTGGGAGCTTGTTAGAAATGCAAATTCTTCAGCCCCACTCCATCTCC 720

 16236859 AGAAACTCTGGGGGTGGGCCCTGCAGTCAGTATTTTAAAAATCCCACCAGGTGATTCTGA 16236918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGAAACTCTGGGGGTGGGCCCTGCAGTCAGTATTTTAAAAATCCCACCAGGTGATTCTGA 780

 16236919 TGCATGCTCAAGTGTGAGCGCTGTGAGGGTGATAATATTGTCATTCATTCTCATTTTACA 16236978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGCATGCTCAAGTGTGAGCGCTGTGAGGGTGATAATATTGTCATTCATTCTCATTTTACA 840

 16236979 GATGAGGACAGTCATTTGCTGAGGATGACGGCAACGCTTCTCAATTGCAATGAGAGGGAC 16237038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GATGAGGACAGTCATTTGCTGAGGATGACGGCAACGCTTCTCAATTGCAATGAGAGGGAC 900

 16237039 TTTGGATTAAATGATAAAGGAGCTCTTGAGATCTGAGAATTGGGAGATAGTAGACAGCAC 16237098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTTGGATTAAATGATAAAGGAGCTCTTGAGATCTGAGAATTGGGAGATAGTAGACAGCAC 960

 16237099 CACTATGAGGCGTAACAGGTTCTTTTTATATGGGAATTTTAAGAGATCCCATAGGACAGC 16237158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CACTATGAGGCGTAACAGGTTCTTTTTATATGGGAATTTTAAGAGATCCCATAGGACAGC 1020

 16237159 CATATAATGGGGGCAGCTCCAGCCAGAGCAAAGGAAGCGAGTTAGAGGGTGTGGAGTGTT 16237218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CATATAATGGGGGCAGCTCCAGCCAGAGCAAAGGAAGCGAGTTAGAGGGTGTGGAGTGTT 1080

 16237219 TCTTGTGGCCTTCTCTTCCCCATGGCTCTCTGGCTCTCTTCCCTGCAGGTGTCTGCAGCA 16237278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TCTTGTGGCCTTCTCTTCCCCATGGCTCTCTGGCTCTCTTCCCTGCAGGTGTCTGCAGCA 1140

 16237279 GCACCCTCAGGACAGCCTGCCCACAGCCAGCGTCATCCTCTGTTTCCATGATGAGGCCTG 16237338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GCACCCTCAGGACAGCCTGCCCACAGCCAGCGTCATCCTCTGTTTCCATGATGAGGCCTG 1200

 16237339 GTCCACTCTCCTGCGGACTGTACACAGCATCCTCGACACAGTGCCCAGGGCCTTCCTGAA 16237398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GTCCACTCTCCTGCGGACTGTACACAGCATCCTCGACACAGTGCCCAGGGCCTTCCTGAA 1260

 16237399 GGAGATCATCCTCGTGGACGACCTCAGCCAGCAAGGTAGCCACGGCTTTCCTCCAGGCTC 16237458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GGAGATCATCCTCGTGGACGACCTCAGCCAGCAAGGTAGCCACGGCTTTCCTCCAGGCTC 1320

 16237459 GTCTGGGTGAGCCTTACCCCCTGGCGGGTGGAGTTCTCAAGCAAAAGATTGAAGTTTGGA 16237518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GTCTGGGTGAGCCTTACCCCCTGGCGGGTGGAGTTCTCAAGCAAAAGATTGAAGTTTGGA 1380

 16237519 ACTATTTTAGGCAAGATTCCCCAACTACAGACCTCCAGATGAGGATTAATGGGCAAGTAA 16237578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ACTATTTTAGGCAAGATTCCCCAACTACAGACCTCCAGATGAGGATTAATGGGCAAGTAA 1440

 16237579 CTTATGAATGAAGAGCCACTGGGGAAACCAGTAAGGCAGTGGGGGCTGCAAGACAGAGAA 16237638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTTATGAATGAAGAGCCACTGGGGAAACCAGTAAGGCAGTGGGGGCTGCAAGACAGAGAA 1500

 16237639 GGAGAAAGAGCCCTGCAGGGGAAACAGCCCTGGGGAGGGTCTTGAGGGGTGTCGCCTCAG 16237698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GGAGAAAGAGCCCTGCAGGGGAAACAGCCCTGGGGAGGGTCTTGAGGGGTGTCGCCTCAG 1560

 16237699 CCTGATCCCGTGGGGATCTCTCTCCCAGGTGCCACCCAGTCCAACAATCCTCTCTCCAAG 16237758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CCTGATCCCGTGGGGATCTCTCTCCCAGGTGCCACCCAGTCCAACAATCCTCTCTCCAAG 1620

 16237759 ACACTGAAGAATCACATAGGGCGGCCCTGTTGTGAGTGCTCACTGCCTCCTAGACCCTGG 16237818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ACACTGAAGAATCACATAGGGCGGCCCTGTTGTGAGTGCTCACTGCCTCCTAGACCCTGG 1680

 16237819 TGCAGCACTTTACACATACGCACATATGTGTATCGGTCCTTCACTCATCATGGCTTAGAC 16237878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TGCAGCACTTTACACATACGCACATATGTGTATCGGTCCTTCACTCATCATGGCTTAGAC 1740

 16237879 AGACCCACTCACTTTCCAGAGGAGGAAACTGGGGCCCAGAGAAGACAGCAGACTGGAGCG 16237938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AGACCCACTCACTTTCCAGAGGAGGAAACTGGGGCCCAGAGAAGACAGCAGACTGGAGCG 1800

 16237939 GAGTCAGCCAAAAGCAGCAGAGTCAGGCCCAGAGCCCAGACTTGCAGAACCTGCCTGTGT 16237998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GAGTCAGCCAAAAGCAGCAGAGTCAGGCCCAGAGCCCAGACTTGCAGAACCTGCCTGTGT 1860

 16237999 GCTTCCTCTCACAGGAACCTGGCTACTAGGGACAGCCCTAAAAGAAGATGGAGACAGAGA 16238058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GCTTCCTCTCACAGGAACCTGGCTACTAGGGACAGCCCTAAAAGAAGATGGAGACAGAGA 1920

 16238059 AGCCCCCACTTGACTCGTAGGTCAGTGGCTCTCACGCTTGAGCATGCATCGGAATCACCT 16238118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AGCCCCCACTTGACTCGTAGGTCAGTGGCTCTCACGCTTGAGCATGCATCGGAATCACCT 1980

 16238119 GGTGCGATTTTTAAAATACTACTGCAGGGCCCACCCCCAGAGTTTCTGGTGATGGAGTGG 16238178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GGTGCGATTTTTAAAATACTACTGCAGGGCCCACCCCCAGAGTTTCTGGTGATGGAGTGG 2040

 16238179 GGCCGAAGAATTTGCATTTCTAACAAGCTCCCAGGTGATGCTGATGCTGCTGTTTTCTGT 16238238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GGCCGAAGAATTTGCATTTCTAACAAGCTCCCAGGTGATGCTGATGCTGCTGTTTTCTGT 2100

 16238239 GGACCACACTCTGAGAACCTCTGCTCTAGTCTTTGGCTTGGGCGTGAGGCCTACATTTCT 16238298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GGACCACACTCTGAGAACCTCTGCTCTAGTCTTTGGCTTGGGCGTGAGGCCTACATTTCT 2160

 16238299 GGCACAACTAAATGACCTAGGGACACCCCTCCTGGCCTTCTGGGAAGATCAGAACGCTCT 16238358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GGCACAACTAAATGACCTAGGGACACCCCTCCTGGCCTTCTGGGAAGATCAGAACGCTCT 2220

 16238359 GAGGGAAGCCGAGCATTCACGTTTTTCTAAGGGGAATAATGGAGAAGGGCTAGGGTAGCC 16238418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GAGGGAAGCCGAGCATTCACGTTTTTCTAAGGGGAATAATGGAGAAGGGCTAGGGTAGCC 2280

 16238419 AGGTGCCTCTGTTAGTTCTTTCTACGGTCCTCACTCCAGGGATGGGCCTAGCCTGGCCAT 16238478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AGGTGCCTCTGTTAGTTCTTTCTACGGTCCTCACTCCAGGGATGGGCCTAGCCTGGCCAT 2340

 16238479 AGCAGTGAGTCAGATTAGCCAGAGGCTCTGGGAACACCTGGGGTTCCTGGGTGCAGCTGG 16238538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AGCAGTGAGTCAGATTAGCCAGAGGCTCTGGGAACACCTGGGGTTCCTGGGTGCAGCTGG 2400

 16238539 CTGCATATTAGGCAGGACTAATGAACAGGTGCAGGACAGGGCTGGGTTGGCGGGTAAAGT 16238598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CTGCATATTAGGCAGGACTAATGAACAGGTGCAGGACAGGGCTGGGTTGGCGGGTAAAGT 2460

 16238599 GCCCAGAGACTCTCCAAACCCTCAAGTGGGGCGGGGTCCGCCCAAGAGCACACCTGTGGT 16238658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GCCCAGAGACTCTCCAAACCCTCAAGTGGGGCGGGGTCCGCCCAAGAGCACACCTGTGGT 2520

 16238659 GAGGCCCCCACCATCTGATGAGCTGTGTTACGTCTGTGCCCCTCGGGAGTACGGAAAGTG 16238718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GAGGCCCCCACCATCTGATGAGCTGTGTTACGTCTGTGCCCCTCGGGAGTACGGAAAGTG 2580

 16238719 GAGGAGCTGGGCCCCAGAGAAATGGGCTACCCCAGAGCTGGCAGCCCCACCAGAGGGGAT 16238778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GAGGAGCTGGGCCCCAGAGAAATGGGCTACCCCAGAGCTGGCAGCCCCACCAGAGGGGAT 2640

 16238779 CTGGATCCCCTGCCAAGCAATTAAGCTGCCCCCTCCTGGCCAACTCCCCTTCTGCCCCTC 16238838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CTGGATCCCCTGCCAAGCAATTAAGCTGCCCCCTCCTGGCCAACTCCCCTTCTGCCCCTC 2700

 16238839 ACCACTGGGTTGGCTCTCCATCCAGTGGCCCCATATTTCCTGTTGACATTGGGGTGCAAG 16238898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 ACCACTGGGTTGGCTCTCCATCCAGTGGCCCCATATTTCCTGTTGACATTGGGGTGCAAG 2760

 16238899 GCCTTTTCCACAACCAAGGGCAGCACTGGTTCTATTTCTGCAGGTCCCTCTCCTCTGTGT 16238958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GCCTTTTCCACAACCAAGGGCAGCACTGGTTCTATTTCTGCAGGTCCCTCTCCTCTGTGT 2820

 16238959 GCTTGCCAAGACCCAGATCCCAGACAAGCACCACCCTGCACACTGTTTTTATTTAATCCT 16239018
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     2821 GCTTGCCAAGACCCAGATCCCAGACAAGCACCACCTTGCACACTGTTTTTATTTAATCCT 2880

 16239019 CTTGGCCACCCAGAGAGGCAGGGCTTATCAACCCTACTCTACCTGTGAGGAAAACTGAGA 16239078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CTTGGCCACCCAGAGAGGCAGGGCTTATCAACCCTACTCTACCTGTGAGGAAAACTGAGA 2940

 16239079 CAGAAAAAGATGCTGCGGGTTGCCCTGAGCCACCTTGATGGGCTTCCAAGCCGATGGTCA 16239138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     2941 CAGAAAAAGATGCTGCGGGTTGCCCTGAGCCATCTTGATGGGCTTCCAAGCCGATGGTCA 3000

 16239139 TGACAGCATAGTGTAGTGTGATAGAATCAGCTAGATGGGTTTCAGGGTATTCGTCTGGGG 16239198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TGACAGCATAGTGTAGTGTGATAGAATCAGCTAGATGGGTTTCAGGGTATTCGTCTGGGG 3060

 16239199 TGGTGATGCCCACACCAAATCATTAAATCAGAAAATGCTTGCGATGACCAGCCCATGATG 16239258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TGGTGATGCCCACACCAAATCATTAAATCAGAAAATGCTTGCGATGACCAGCCCATGATG 3120

 16239259 ACCCTTTACAAGTGGAAGTCAGTATTACTGCTGTTTTCTGGAGGGAAGGAGTTGAGGATC 16239318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 ACCCTTTACAAGTGGAAGTCAGTATTACTGCTGTTTTCTGGAGGGAAGGAGTTGAGGATC 3180

 16239319 ATACCAGCTTTTTCCGAGCACTATACCACTCAGACATGGGTGCTCTTACCCACTTCAAAA 16239378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 ATACCAGCTTTTTCCGAGCACTATACCACTCAGACATGGGTGCTCTTACCCACTTCAAAA 3240

 16239379 CCCTCTGAGAATGCCAAACAACCATCGCAG 16239408
          ||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 CCCTCTGAGAATGCCAAACAACCATCGCAG 3270

EXCISED REGION

 16241210 TGGAGCACAGGCTGCACTGCGGGGTCTGTCTTGCTTTTTACCCTGCAATGGTCAGTCATT 16241269
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3271 TGGAGCACAGGCTGCACTGCGGGTTCTGTCTTGCTTTTTACCCTGCAATGGTCAGTCATT 3330

 16241270 GACCATGACTGGGGCTGGGGGCAGCATCCTGCATGACTGTCTGGCACCTGCAGCAGAGAC 16241329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3331 GACCATGACTGGGGCTGGGGGCAGCATCCTGCATGACTGTCTGGCACCTGCAGCAGAGAC 3390

 16241330 CGTTTTAATACCCCAAGGCAAGTCTCCAGGGAAGGGTTAAGATTTCAGTTAGCACCCACA 16241389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3391 CGTTTTAATACCCCAAGGCAAGTCTCCAGGGAAGGGTTAAGATTTCAGTTAGCACCCACA 3450

 16241390 GCAGCTGGGGACATGCAAACCAAACCAAAACAGTTAAGGGGAGCTCAGGGAATCTGAGTA 16241449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3451 GCAGCTGGGGACATGCAAACCAAACCAAAACAGTTAAGGGGAGCTCAGGGAATCTGAGTA 3510

 16241450 GGACACTATATTAGTCTGTTCTCACACTGCTATAAAGAACTGCCTGAGACTAGGTAATTT 16241509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3511 GGACACTATATTAGTCTGTTCTCACACTGCTATAAAGAACTGCCTGAGACTAGGTAATTT 3570

 16241510 ATAAAGAAAGGAGGTTTAATTGACTCACAGTTTCGCATGGCTGGGGAGGCCTCAGGAAAC 16241569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3571 ATAAAGAAAGGAGGTTTAATTGACTCACAGTTTCGCATGGCTGGGGAGGCCTCAGGAAAC 3630

 16241570 TTACAATCATGGTGGAAGGGGAAGCATGTCTTACATGGCAGCAAGTGAGAGAAAGAGAGA 16241629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3631 TTACAATCATGGTGGAAGGGGAAGCATGTCTTACATGGCAGCAAGTGAGAGAAAGAGAGA 3690

 16241630 GAGAGAGGAGGAAAAACTATCAAACACTTATATAATCATCAGATCTCATGAGAACTCACT 16241689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3691 GAGAGAGGAGGAAAAACTATCAAACACTTATATAATCATCAGATCTCATGAGAACTCACT 3750

 16241690 ATCACGAGAACAGCATGGGGGAAACTGCCCACATGATCCAATCACCTCCCACCAGGTCCC 16241749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3751 ATCACGAGAACAGCATGGGGGAAACTGCCCACATGATCCAATCACCTCCCACCAGGTCCC 3810

 16241750 TCCCTCGCCACATAGGGATTATGGGGATTACCACTCAAGATGAGATCTGGGTGGGGACAA 16241809
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     3811 TCCCTCGCCACATAGGGATTATGGGGATTACAACTCAAGATGAGATCTGGGTGGGGACAA 3870

 16241810 AGAGCCAAACCATATCAGACACCAACAGTATCTGCTACATTCTTGCTGCTGCATTTGGAG 16241869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3871 AGAGCCAAACCATATCAGACACCAACAGTATCTGCTACATTCTTGCTGCTGCATTTGGAG 3930

 16241870 AATGTTAGCAAGTTCTCCCCTTTCCTGGTTTTCTGACACCATCCCTCTAATTTTTACTGG 16241929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3931 AATGTTAGCAAGTTCTCCCCTTTCCTGGTTTTCTGACACCATCCCTCTAATTTTTACTGG 3990

 16241930 AGAGAATCATGGCCCACCCCAACCTAACCAAGCATCTTACATCTCAGCAACAACCACACT 16241989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3991 AGAGAATCATGGCCCACCCCAACCTAACCAAGCATCTTACATCTCAGCAACAACCACACT 4050

 16241990 GTAGTAATGTTTTCGGTTCTTAGGACCCAGGTGCTCACCACAGCTTCCAAAAGAGAGTTG 16242049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4051 GTAGTAATGTTTTCGGTTCTTAGGACCCAGGTGCTCACCACAGCTTCCAAAAGAGAGTTG 4110

 16242050 CTGACGATTGTCTTAGTCACAATCTCATCGGTTGTGGCATTTGTCATTCCACTGACCACA 16242109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4111 CTGACGATTGTCTTAGTCACAATCTCATCGGTTGTGGCATTTGTCATTCCACTGACCACA 4170

 16242110 ACCCTGTTGATTCCAGGACAACTCAAGTCTGCTCTCAGCGAATATGTGGCCAGGCTGGAG 16242169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4171 ACCCTGTTGATTCCAGGACAACTCAAGTCTGCTCTCAGCGAATATGTGGCCAGGCTGGAG 4230

 16242170 GGGGTGAAGTTACTCAGGAGCAACAAGAGGCTGGGTGCCATCAGGGCCCGGATGCTGGGG 16242229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4231 GGGGTGAAGTTACTCAGGAGCAACAAGAGGCTGGGTGCCATCAGGGCCCGGATGCTGGGG 4290

 16242230 GCCACCAGAGCCACCGGGGATGTGCTCGTCTTCATGGATGCCCACTGCGAGTGCCACCCA 16242289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4291 GCCACCAGAGCCACCGGGGATGTGCTCGTCTTCATGGATGCCCACTGCGAGTGCCACCCA 4350

 16242290 GGCTGGCTGGAGCCCCTCCTCAGCAGAATAGCTGGTGACAGGTAACTTATTCCCTGGGCT 16242349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4351 GGCTGGCTGGAGCCCCTCCTCAGCAGAATAGCTGGTGACAGGTAACTTATTCCCTGGGCT 4410

 16242350 TGCAAAGCAAGACATGGAACTGGGAGAAACAGTCTACAGCATCAGCCACTCACAGAGCAA 16242409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4411 TGCAAAGCAAGACATGGAACTGGGAGAAACAGTCTACAGCATCAGCCACTCACAGAGCAA 4470

 16242410 CCCACCTATTAATTCCTGAATCTCCATTAGAGAGTGATATATTCCCTTCGGGTTTTCAGA 16242469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4471 CCCACCTATTAATTCCTGAATCTCCATTAGAGAGTGATATATTCCCTTCGGGTTTTCAGA 4530

 16242470 TGTGTAAGTTTTTTAAGACTATAGAGTTAGAGTTGGAAAGGAGGTTAGAGGTCTTCATCT 16242529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4531 TGTGTAAGTTTTTTAAGACTATAGAGTTAGAGTTGGAAAGGAGGTTAGAGGTCTTCATCT 4590

 16242530 ACCT 16242533
          ||||
     4591 ACCT 4594

Alignment time is 5.67821 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [16229408,16251209] =>     21802 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    3923] =>      3923 nucs 'mol-32-303b-181566_3923'

Score:        3864
Aligned:      3929        nucs
Identic:      3919 (100%) nucs =>      2406 (100%)      1513 ( 99%)
Gaps:            6 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [16237001,16239408] EXCISED REGION [16241210,16242730]
 second seq =>  [       1,    2408] EXCISED REGION [    2409,    3923]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1801 nucs [16239409,16241209]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [16239409,16239409] to [16241210,16241210]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [16239409,16239410] to [16241208,16241209]
 second seq =>         0 nucs

 16237001 GGATGACGGCAACGCTTCTCAATTGCAATGAGAGGGACTTTGGATTAAATGATAAAGGAG 16237060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGATGACGGCAACGCTTCTCAATTGCAATGAGAGGGACTTTGGATTAAATGATAAAGGAG 60

 16237061 CTCTTGAGATCTGAGAATTGGGAGATAGTAGACAGCACCACTATGAGGCGTAACAGGTTC 16237120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTCTTGAGATCTGAGAATTGGGAGATAGTAGACAGCACCACTATGAGGCGTAACAGGTTC 120

 16237121 TTTTTATATGGGAATTTTAAGAGATCCCATAGGACAGCCATATAATGGGGGCAGCTCCAG 16237180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTTTATATGGGAATTTTAAGAGATCCCATAGGACAGCCATATAATGGGGGCAGCTCCAG 180

 16237181 CCAGAGCAAAGGAAGCGAGTTAGAGGGTGTGGAGTGTTTCTTGTGGCCTTCTCTTCCCCA 16237240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCAGAGCAAAGGAAGCGAGTTAGAGGGTGTGGAGTGTTTCTTGTGGCCTTCTCTTCCCCA 240

 16237241 TGGCTCTCTGGCTCTCTTCCCTGCAGGTGTCTGCAGCAGCACCCTCAGGACAGCCTGCCC 16237300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGGCTCTCTGGCTCTCTTCCCTGCAGGTGTCTGCAGCAGCACCCTCAGGACAGCCTGCCC 300

 16237301 ACAGCCAGCGTCATCCTCTGTTTCCATGATGAGGCCTGGTCCACTCTCCTGCGGACTGTA 16237360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACAGCCAGCGTCATCCTCTGTTTCCATGATGAGGCCTGGTCCACTCTCCTGCGGACTGTA 360

 16237361 CACAGCATCCTCGACACAGTGCCCAGGGCCTTCCTGAAGGAGATCATCCTCGTGGACGAC 16237420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CACAGCATCCTCGACACAGTGCCCAGGGCCTTCCTGAAGGAGATCATCCTCGTGGACGAC 420

 16237421 CTCAGCCAGCAAGGTAGCCACGGCTTTCCTCCAGGCTCGTCTGGGTGAGCCTTACCCCCT 16237480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTCAGCCAGCAAGGTAGCCACGGCTTTCCTCCAGGCTCGTCTGGGTGAGCCTTACCCCCT 480

 16237481 GGCGGGTGGAGTTCTCAAGCAAAAGATTGAAGTTTGGAACTATTTTAGGCAAGATTCCCC 16237540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GGCGGGTGGAGTTCTCAAGCAAAAGATTGAAGTTTGGAACTATTTTAGGCAAGATTCCCC 540

 16237541 AACTACAGACCTCCAGATGAGGATTAATGGGCAAGTAACTTATGAATGAAGAGCCACTGG 16237600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AACTACAGACCTCCAGATGAGGATTAATGGGCAAGTAACTTATGAATGAAGAGCCACTGG 600

 16237601 GGAAACCAGTAAGGCAGTGGGGGCTGCAAGACAGAGAAGGAGAAAGAGCCCTGCAGGGGA 16237660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GGAAACCAGTAAGGCAGTGGGGGCTGCAAGACAGAGAAGGAGAAAGAGCCCTGCAGGGGA 660

 16237661 AACAGCCCTGGGGAGGGTCTTGAGGGGTGTCGCCTCAGCCTGATCCCGTGGGGATCTCTC 16237720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AACAGCCCTGGGGAGGGTCTTGAGGGGTGTCGCCTCAGCCTGATCCCGTGGGGATCTCTC 720

 16237721 TCCCAGGTGCCACCCAGTCCAACAATCCTCTCTCCAAGACACTGAAGAATCACATAGGGC 16237780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCCCAGGTGCCACCCAGTCCAACAATCCTCTCTCCAAGACACTGAAGAATCACATAGGGC 780

 16237781 GGCCCTGTTGTGAGTGCTCACTGCCTCCTAGACCCTGGTGCAGCACTTTACACATACGCA 16237840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GGCCCTGTTGTGAGTGCTCACTGCCTCCTAGACCCTGGTGCAGCACTTTACACATACGCA 840

 16237841 CATATGTGTATCGGTCCTTCACTCATCATGGCTTAGACAGACCCACTCACTTTCCAGAGG 16237900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CATATGTGTATCGGTCCTTCACTCATCATGGCTTAGACAGACCCACTCACTTTCCAGAGG 900

 16237901 AGGAAACTGGGGCCCAGAGAAGACAGCAGACTGGAGCGGAGTCAGCCAAAAGCAGCAGAG 16237960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGGAAACTGGGGCCCAGAGAAGACAGCAGACTGGAGCGGAGTCAGCCAAAAGCAGCAGAG 960

 16237961 TCAGGCCCAGAGCCCAGACTTGCAGAACCTGCCTGTGTGCTTCCTCTCACAGGAACCTGG 16238020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TCAGGCCCAGAGCCCAGACTTGCAGAACCTGCCTGTGTGCTTCCTCTCACAGGAACCTGG 1020

 16238021 CTACTAGGGACAGCCCTAAAAGAAGATGGAGACAGAGAAGCCCCCACTTGACTCGTAGGT 16238080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTACTAGGGACAGCCCTAAAAGAAGATGGAGACAGAGAAGCCCCCACTTGACTCGTAGGT 1080

 16238081 CAGTGGCTCTCACGCTTGAGCATGCATCGGAATCACCTGGTGCGATTTTTAAAATACTAC 16238140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CAGTGGCTCTCACGCTTGAGCATGCATCGGAATCACCTGGTGCGATTTTTAAAATACTAC 1140

 16238141 TGCAGGGCCCACCCCCAGAGTTTCTGGTGATGGAGTGGGGCCGAAGAATTTGCATTTCTA 16238200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGCAGGGCCCACCCCCAGAGTTTCTGGTGATGGAGTGGGGCCGAAGAATTTGCATTTCTA 1200

 16238201 ACAAGCTCCCAGGTGATGCTGATGCTGCTGTTTTCTGTGGACCACACTCTGAGAACCTCT 16238260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ACAAGCTCCCAGGTGATGCTGATGCTGCTGTTTTCTGTGGACCACACTCTGAGAACCTCT 1260

 16238261 GCTCTAGTCTTTGGCTTGGGCGTGAGGCCTACATTTCTGGCACAACTAAATGACCTAGGG 16238320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GCTCTAGTCTTTGGCTTGGGCGTGAGGCCTACATTTCTGGCACAACTAAATGACCTAGGG 1320

 16238321 ACACCCCTCCTGGCCTTCTGGGAAGATCAGAACGCTCTGAGGGAAGCCGAGCATTCACGT 16238380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ACACCCCTCCTGGCCTTCTGGGAAGATCAGAACGCTCTGAGGGAAGCCGAGCATTCACGT 1380

 16238381 TTTTCTAAGGGGAATAATGGAGAAGGGCTAGGGTAGCCAGGTGCCTCTGTTAGTTCTTTC 16238440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTTTCTAAGGGGAATAATGGAGAAGGGCTAGGGTAGCCAGGTGCCTCTGTTAGTTCTTTC 1440

 16238441 TACGGTCCTCACTCCAGGGATGGGCCTAGCCTGGCCATAGCAGTGAGTCAGATTAGCCAG 16238500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TACGGTCCTCACTCCAGGGATGGGCCTAGCCTGGCCATAGCAGTGAGTCAGATTAGCCAG 1500

 16238501 AGGCTCTGGGAACACCTGGGGTTCCTGGGTGCAGCTGGCTGCATATTAGGCAGGACTAAT 16238560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AGGCTCTGGGAACACCTGGGGTTCCTGGGTGCAGCTGGCTGCATATTAGGCAGGACTAAT 1560

 16238561 GAACAGGTGCAGGACAGGGCTGGGTTGGCGGGTAAAGTGCCCAGAGACTCTCCAAACCCT 16238620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GAACAGGTGCAGGACAGGGCTGGGTTGGCGGGTAAAGTGCCCAGAGACTCTCCAAACCCT 1620

 16238621 CAAGTGGGGCGGGGTCCGCCCAAGAGCACACCTGTGGTGAGGCCCCCACCATCTGATGAG 16238680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CAAGTGGGGCGGGGTCCGCCCAAGAGCACACCTGTGGTGAGGCCCCCACCATCTGATGAG 1680

 16238681 CTGTGTTACGTCTGTGCCCCTCGGGAGTACGGAAAGTGGAGGAGCTGGGCCCCAGAGAAA 16238740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CTGTGTTACGTCTGTGCCCCTCGGGAGTACGGAAAGTGGAGGAGCTGGGCCCCAGAGAAA 1740

 16238741 TGGGCTACCCCAGAGCTGGCAGCCCCACCAGAGGGGATCTGGATCCCCTGCCAAGCAATT 16238800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGGGCTACCCCAGAGCTGGCAGCCCCACCAGAGGGGATCTGGATCCCCTGCCAAGCAATT 1800

 16238801 AAGCTGCCCCCTCCTGGCCAACTCCCCTTCTGCCCCTCACCACTGGGTTGGCTCTCCATC 16238860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AAGCTGCCCCCTCCTGGCCAACTCCCCTTCTGCCCCTCACCACTGGGTTGGCTCTCCATC 1860

 16238861 CAGTGGCCCCATATTTCCTGTTGACATTGGGGTGCAAGGCCTTTTCCACAACCAAGGGCA 16238920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CAGTGGCCCCATATTTCCTGTTGACATTGGGGTGCAAGGCCTTTTCCACAACCAAGGGCA 1920

 16238921 GCACTGGTTCTATTTCTGCAGGTCCCTCTCCTCTGTGTGCTTGCCAAGACCCAGATCCCA 16238980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GCACTGGTTCTATTTCTGCAGGTCCCTCTCCTCTGTGTGCTTGCCAAGACCCAGATCCCA 1980

 16238981 GACAAGCACCACCCTGCACACTGTTTTTATTTAATCCTCTTGGCCACCCAGAGAGGCAGG 16239040
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GACAAGCACCACCTTGCACACTGTTTTTATTTAATCCTCTTGGCCACCCAGAGAGGCAGG 2040

 16239041 GCTTATCAACCCTACTCTACCTGTGAGGAAAACTGAGACAGAAAAAGATGCTGCGGGTTG 16239100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GCTTATCAACCCTACTCTACCTGTGAGGAAAACTGAGACAGAAAAAGATGCTGCGGGTTG 2100

 16239101 CCCTGAGCCACCTTGATGGGCTTCCAAGCCGATGGTCATGACAGCATAGTGTAGTGTGAT 16239160
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CCCTGAGCCATCTTGATGGGCTTCCAAGCCGATGGTCATGACAGCATAGTGTAGTGTGAT 2160

 16239161 AGAATCAGCTAGATGGGTTTCAGGGTATTCGTCTGGGGTGGTGATGCCCACACCAAATCA 16239220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AGAATCAGCTAGATGGGTTTCAGGGTATTCGTCTGGGGTGGTGATGCCCACACCAAATCA 2220

 16239221 TTAAATCAGAAAATGCTTGCGATGACCAGCCCATGATGACCCTTTACAAGTGGAAGTCAG 16239280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TTAAATCAGAAAATGCTTGCGATGACCAGCCCATGATGACCCTTTACAAGTGGAAGTCAG 2280

 16239281 TATTACTGCTGTTTTCTGGAGGGAAGGAGTTGAGGATCATACCAGCTTTTTCCGAGCACT 16239340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TATTACTGCTGTTTTCTGGAGGGAAGGAGTTGAGGATCATACCAGCTTTTTCCGAGCACT 2340

 16239341 ATACCACTCAGACATGGGTGCTCTTACCCACTTCAAAACCCTCTGAGAATGCCAAACAAC 16239400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 ATACCACTCAGACATGGGTGCTCTTACCCACTTCAAAACCCTCTGAGAATGCCAAACAAC 2400

 16239401 CATCGCAG 16239408
          ||||||||
     2401 CATCGCAG 2408

EXCISED REGION

 16241210 TGGAGCACAGGCTGCACTGCGGGGTCTGTCTTGCTTTTTACCCTGCAATGGTCAGTCATT 16241269
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2409 TGGAGCACAGGCTGCACTGCGGGTTCTGTCTTGCTTTTTACCCTGCAATGGTCAGTCATT 2468

 16241270 GACCATGACTGGGGCTGGGGGCAGCATCCTGCATGACTGTCTGGCACCTGCAGCAGAGAC 16241329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2469 GACCATGACTGGGGCTGGGGGCAGCATCCTGCATGACTGTCTGGCACCTGCAGCAGAGAC 2528

 16241330 CGTTTTAATACCCCAAGGCAAGTCTCCAGGGAAGGGTTAAGATTTCAGTTAGCACCCACA 16241389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2529 CGTTTTAATACCCCAAGGCAAGTCTCCAGGGAAGGGTTAAGATTTCAGTTAGCACCCACA 2588

 16241390 GCAGCTGGGGACATGCAAACCAAACCAAAACAGTTAAGGGGAGCTCAGGGAATCTGAGTA 16241449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2589 GCAGCTGGGGACATGCAAACCAAACCAAAACAGTTAAGGGGAGCTCAGGGAATCTGAGTA 2648

 16241450 GGACACTATATTAGTCTGTTCTCACACTGCTATAAAGAACTGCCTGAGACTAGGTAATTT 16241509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2649 GGACACTATATTAGTCTGTTCTCACACTGCTATAAAGAACTGCCTGAGACTAGGTAATTT 2708

 16241510 ATAAAGAAAGGAGGTTTAATTGACTCACAGTTTCGCATGGCTGGGGAGGCCTCAGGAAAC 16241569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2709 ATAAAGAAAGGAGGTTTAATTGACTCACAGTTTCGCATGGCTGGGGAGGCCTCAGGAAAC 2768

 16241570 TTACAATCATGGTGGAAGGGGAAGCATGTCTTACATGGCAGCAAGTGAGAGAAAGAGAGA 16241629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2769 TTACAATCATGGTGGAAGGGGAAGCATGTCTTACATGGCAGCAAGTGAGAGAAAGAGAGA 2828

 16241630 GAGAGAGGAGGAAAAACTATCAAACACTTATATAATCATCAGATCTCATGAGAACTCACT 16241689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2829 GAGAGAGGAGGAAAAACTATCAAACACTTATATAATCATCAGATCTCATGAGAACTCACT 2888

 16241690 ATCACGAGAACAGCATGGGGGAAACTGCCCACATGATCCAATCACCTCCCACCAGGTCCC 16241749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2889 ATCACGAGAACAGCATGGGGGAAACTGCCCACATGATCCAATCACCTCCCACCAGGTCCC 2948

 16241750 TCCCTCGCCACATAGGGATTATGGGGATTACCACTCAAGATGAGATCTGGGTGGGGACAA 16241809
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     2949 TCCCTCGCCACATAGGGATTATGGGGATTACAACTCAAGATGAGATCTGGGTGGGGACAA 3008

 16241810 AGAGCCAAACCATATCAGACACCAACAGTATCTGCTACATTCTTGCTGCTGCATTTGGAG 16241869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3009 AGAGCCAAACCATATCAGACACCAACAGTATCTGCTACATTCTTGCTGCTGCATTTGGAG 3068

 16241870 AATGTTAGCAAGTTCTCCCCTTTCCTGGTTTTCTGACACCATCCCTCTAATTTTTACTGG 16241929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3069 AATGTTAGCAAGTTCTCCCCTTTCCTGGTTTTCTGACACCATCCCTCTAATTTTTACTGG 3128

 16241930 AGAGAATCATGGCCCACCCCAACCTAACCAAGCATCTTACATCTCAGCAACAACCACACT 16241989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3129 AGAGAATCATGGCCCACCCCAACCTAACCAAGCATCTTACATCTCAGCAACAACCACACT 3188

 16241990 GTAGTAATGTTTTCGGTTCTTAGGACCCAGGTGCTCACCACAGCTTCCAAAAGAGAGTTG 16242049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3189 GTAGTAATGTTTTCGGTTCTTAGGACCCAGGTGCTCACCACAGCTTCCAAAAGAGAGTTG 3248

 16242050 CTGACGATTGTCTTAGTCACAATCTCATCGGTTGTGGCATTTGTCATTCCACTGACCACA 16242109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3249 CTGACGATTGTCTTAGTCACAATCTCATCGGTTGTGGCATTTGTCATTCCACTGACCACA 3308

 16242110 ACCCTGTTGATTCCAGGACAACTCAAGTCTGCTCTCAGCGAATATGTGGCCAGGCTGGAG 16242169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3309 ACCCTGTTGATTCCAGGACAACTCAAGTCTGCTCTCAGCGAATATGTGGCCAGGCTGGAG 3368

 16242170 GGGGTGAAGTTACTCAGGAGCAACAAGAGGCTGGGTGCCATCAGGGCCCGGATGCTGGGG 16242229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3369 GGGGTGAAGTTACTCAGGAGCAACAAGAGGCTGGGTGCCATCAGGGCCCGGATGCTGGGG 3428

 16242230 GCCACCAGAGCCACCGGGGATGTGCTCGTCTTCATGGATGCCCACTGCGAGTGCCACCCA 16242289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3429 GCCACCAGAGCCACCGGGGATGTGCTCGTCTTCATGGATGCCCACTGCGAGTGCCACCCA 3488

 16242290 GGCTGGCTGGAGCCCCTCCTCAGCAGAATAGCTGGTGACAGGTAACTTATTCCCTGGGCT 16242349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3489 GGCTGGCTGGAGCCCCTCCTCAGCAGAATAGCTGGTGACAGGTAACTTATTCCCTGGGCT 3548

 16242350 TGCAAAGCAAGACATGGAACTGGGAGAAACAGTCTACAGCATCAGCCACTCACAGAGCAA 16242409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3549 TGCAAAGCAAGACATGGAACTGGGAGAAACAGTCTACAGCATCAGCCACTCACAGAGCAA 3608

 16242410 CCCACCTATTAATTCCTGAATCTCCATTAGAGAGTGATATATTCCCTTCGGGTTTTCAGA 16242469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3609 CCCACCTATTAATTCCTGAATCTCCATTAGAGAGTGATATATTCCCTTCGGGTTTTCAGA 3668

 16242470 TGTGTAAGTTTTTTAAGACTATAGAGTTAGAGTTGGAAAGGAGGTTAGAGGTCTTCATCT 16242529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3669 TGTGTAAGTTTTTTAAGACTATAGAGTTAGAGTTGGAAAGGAGGTTAGAGGTCTTCATCT 3728

 16242530 ACCTTGCTTTATAGATAAAGAAACCGAGGCCTGGAGAACAGCTTCTATGAGGTTGCAAAT 16242589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3729 ACCTTGCTTTATAGATAAAGAAACCGAGGCCTGGAGAACAGCTTCTATGAGGTTGCAAAT 3788

 16242590 ACTTAAAATTGTATTAAATTGCATGACGAGGGTAACACCTTACCATAGCTATCATTGCCT 16242649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3789 ACTTAAAATTGTATTAAATTGCATGACGAGGGTAACACCTTACCATAGCTATCATTGCCT 3848

 16242650 TTGGTGAAAATTTGGCAATTTTTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTGTG 16242709
          ||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||
     3849 TTGGTGAAAATTTGGCAATTTT------TTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTGTG 3902

 16242710 ATGGCGTCTCGCTCTGTCACC 16242730
          |||||||||||||||||||||
     3903 ATGGCGTCTCGCTCTGTCACC 3923

Alignment time is 4.86167 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [16229408,16251209] =>     21802 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    2169] =>      2169 nucs 'mol-32-30eb-257346_2169'

Score:        2110
Aligned:      2175        nucs
Identic:      2165 (100%) nucs =>       560 (100%)      1605 (100%)
Gaps:            6 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [16238847,16239408] EXCISED REGION [16241210,16242822]
 second seq =>  [       1,     562] EXCISED REGION [     563,    2169]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1801 nucs [16239409,16241209]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [16239409,16239409] to [16241210,16241210]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [16239409,16239410] to [16241208,16241209]
 second seq =>         0 nucs

 16238847 GTTGGCTCTCCATCCAGTGGCCCCATATTTCCTGTTGACATTGGGGTGCAAGGCCTTTTC 16238906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTTGGCTCTCCATCCAGTGGCCCCATATTTCCTGTTGACATTGGGGTGCAAGGCCTTTTC 60

 16238907 CACAACCAAGGGCAGCACTGGTTCTATTTCTGCAGGTCCCTCTCCTCTGTGTGCTTGCCA 16238966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CACAACCAAGGGCAGCACTGGTTCTATTTCTGCAGGTCCCTCTCCTCTGTGTGCTTGCCA 120

 16238967 AGACCCAGATCCCAGACAAGCACCACCCTGCACACTGTTTTTATTTAATCCTCTTGGCCA 16239026
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGACCCAGATCCCAGACAAGCACCACCTTGCACACTGTTTTTATTTAATCCTCTTGGCCA 180

 16239027 CCCAGAGAGGCAGGGCTTATCAACCCTACTCTACCTGTGAGGAAAACTGAGACAGAAAAA 16239086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCCAGAGAGGCAGGGCTTATCAACCCTACTCTACCTGTGAGGAAAACTGAGACAGAAAAA 240

 16239087 GATGCTGCGGGTTGCCCTGAGCCACCTTGATGGGCTTCCAAGCCGATGGTCATGACAGCA 16239146
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GATGCTGCGGGTTGCCCTGAGCCATCTTGATGGGCTTCCAAGCCGATGGTCATGACAGCA 300

 16239147 TAGTGTAGTGTGATAGAATCAGCTAGATGGGTTTCAGGGTATTCGTCTGGGGTGGTGATG 16239206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TAGTGTAGTGTGATAGAATCAGCTAGATGGGTTTCAGGGTATTCGTCTGGGGTGGTGATG 360

 16239207 CCCACACCAAATCATTAAATCAGAAAATGCTTGCGATGACCAGCCCATGATGACCCTTTA 16239266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CCCACACCAAATCATTAAATCAGAAAATGCTTGCGATGACCAGCCCATGATGACCCTTTA 420

 16239267 CAAGTGGAAGTCAGTATTACTGCTGTTTTCTGGAGGGAAGGAGTTGAGGATCATACCAGC 16239326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CAAGTGGAAGTCAGTATTACTGCTGTTTTCTGGAGGGAAGGAGTTGAGGATCATACCAGC 480

 16239327 TTTTTCCGAGCACTATACCACTCAGACATGGGTGCTCTTACCCACTTCAAAACCCTCTGA 16239386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTTTCCGAGCACTATACCACTCAGACATGGGTGCTCTTACCCACTTCAAAACCCTCTGA 540

 16239387 GAATGCCAAACAACCATCGCAG 16239408
          ||||||||||||||||||||||
      541 GAATGCCAAACAACCATCGCAG 562

EXCISED REGION

 16241210 TGGAGCACAGGCTGCACTGCGGGGTCTGTCTTGCTTTTTACCCTGCAATGGTCAGTCATT 16241269
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      563 TGGAGCACAGGCTGCACTGCGGGTTCTGTCTTGCTTTTTACCCTGCAATGGTCAGTCATT 622

 16241270 GACCATGACTGGGGCTGGGGGCAGCATCCTGCATGACTGTCTGGCACCTGCAGCAGAGAC 16241329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      623 GACCATGACTGGGGCTGGGGGCAGCATCCTGCATGACTGTCTGGCACCTGCAGCAGAGAC 682

 16241330 CGTTTTAATACCCCAAGGCAAGTCTCCAGGGAAGGGTTAAGATTTCAGTTAGCACCCACA 16241389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      683 CGTTTTAATACCCCAAGGCAAGTCTCCAGGGAAGGGTTAAGATTTCAGTTAGCACCCACA 742

 16241390 GCAGCTGGGGACATGCAAACCAAACCAAAACAGTTAAGGGGAGCTCAGGGAATCTGAGTA 16241449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      743 GCAGCTGGGGACATGCAAACCAAACCAAAACAGTTAAGGGGAGCTCAGGGAATCTGAGTA 802

 16241450 GGACACTATATTAGTCTGTTCTCACACTGCTATAAAGAACTGCCTGAGACTAGGTAATTT 16241509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      803 GGACACTATATTAGTCTGTTCTCACACTGCTATAAAGAACTGCCTGAGACTAGGTAATTT 862

 16241510 ATAAAGAAAGGAGGTTTAATTGACTCACAGTTTCGCATGGCTGGGGAGGCCTCAGGAAAC 16241569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      863 ATAAAGAAAGGAGGTTTAATTGACTCACAGTTTCGCATGGCTGGGGAGGCCTCAGGAAAC 922

 16241570 TTACAATCATGGTGGAAGGGGAAGCATGTCTTACATGGCAGCAAGTGAGAGAAAGAGAGA 16241629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      923 TTACAATCATGGTGGAAGGGGAAGCATGTCTTACATGGCAGCAAGTGAGAGAAAGAGAGA 982

 16241630 GAGAGAGGAGGAAAAACTATCAAACACTTATATAATCATCAGATCTCATGAGAACTCACT 16241689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      983 GAGAGAGGAGGAAAAACTATCAAACACTTATATAATCATCAGATCTCATGAGAACTCACT 1042

 16241690 ATCACGAGAACAGCATGGGGGAAACTGCCCACATGATCCAATCACCTCCCACCAGGTCCC 16241749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1043 ATCACGAGAACAGCATGGGGGAAACTGCCCACATGATCCAATCACCTCCCACCAGGTCCC 1102

 16241750 TCCCTCGCCACATAGGGATTATGGGGATTACCACTCAAGATGAGATCTGGGTGGGGACAA 16241809
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     1103 TCCCTCGCCACATAGGGATTATGGGGATTACAACTCAAGATGAGATCTGGGTGGGGACAA 1162

 16241810 AGAGCCAAACCATATCAGACACCAACAGTATCTGCTACATTCTTGCTGCTGCATTTGGAG 16241869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1163 AGAGCCAAACCATATCAGACACCAACAGTATCTGCTACATTCTTGCTGCTGCATTTGGAG 1222

 16241870 AATGTTAGCAAGTTCTCCCCTTTCCTGGTTTTCTGACACCATCCCTCTAATTTTTACTGG 16241929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1223 AATGTTAGCAAGTTCTCCCCTTTCCTGGTTTTCTGACACCATCCCTCTAATTTTTACTGG 1282

 16241930 AGAGAATCATGGCCCACCCCAACCTAACCAAGCATCTTACATCTCAGCAACAACCACACT 16241989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1283 AGAGAATCATGGCCCACCCCAACCTAACCAAGCATCTTACATCTCAGCAACAACCACACT 1342

 16241990 GTAGTAATGTTTTCGGTTCTTAGGACCCAGGTGCTCACCACAGCTTCCAAAAGAGAGTTG 16242049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1343 GTAGTAATGTTTTCGGTTCTTAGGACCCAGGTGCTCACCACAGCTTCCAAAAGAGAGTTG 1402

 16242050 CTGACGATTGTCTTAGTCACAATCTCATCGGTTGTGGCATTTGTCATTCCACTGACCACA 16242109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1403 CTGACGATTGTCTTAGTCACAATCTCATCGGTTGTGGCATTTGTCATTCCACTGACCACA 1462

 16242110 ACCCTGTTGATTCCAGGACAACTCAAGTCTGCTCTCAGCGAATATGTGGCCAGGCTGGAG 16242169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1463 ACCCTGTTGATTCCAGGACAACTCAAGTCTGCTCTCAGCGAATATGTGGCCAGGCTGGAG 1522

 16242170 GGGGTGAAGTTACTCAGGAGCAACAAGAGGCTGGGTGCCATCAGGGCCCGGATGCTGGGG 16242229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1523 GGGGTGAAGTTACTCAGGAGCAACAAGAGGCTGGGTGCCATCAGGGCCCGGATGCTGGGG 1582

 16242230 GCCACCAGAGCCACCGGGGATGTGCTCGTCTTCATGGATGCCCACTGCGAGTGCCACCCA 16242289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1583 GCCACCAGAGCCACCGGGGATGTGCTCGTCTTCATGGATGCCCACTGCGAGTGCCACCCA 1642

 16242290 GGCTGGCTGGAGCCCCTCCTCAGCAGAATAGCTGGTGACAGGTAACTTATTCCCTGGGCT 16242349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1643 GGCTGGCTGGAGCCCCTCCTCAGCAGAATAGCTGGTGACAGGTAACTTATTCCCTGGGCT 1702

 16242350 TGCAAAGCAAGACATGGAACTGGGAGAAACAGTCTACAGCATCAGCCACTCACAGAGCAA 16242409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1703 TGCAAAGCAAGACATGGAACTGGGAGAAACAGTCTACAGCATCAGCCACTCACAGAGCAA 1762

 16242410 CCCACCTATTAATTCCTGAATCTCCATTAGAGAGTGATATATTCCCTTCGGGTTTTCAGA 16242469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1763 CCCACCTATTAATTCCTGAATCTCCATTAGAGAGTGATATATTCCCTTCGGGTTTTCAGA 1822

 16242470 TGTGTAAGTTTTTTAAGACTATAGAGTTAGAGTTGGAAAGGAGGTTAGAGGTCTTCATCT 16242529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1823 TGTGTAAGTTTTTTAAGACTATAGAGTTAGAGTTGGAAAGGAGGTTAGAGGTCTTCATCT 1882

 16242530 ACCTTGCTTTATAGATAAAGAAACCGAGGCCTGGAGAACAGCTTCTATGAGGTTGCAAAT 16242589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1883 ACCTTGCTTTATAGATAAAGAAACCGAGGCCTGGAGAACAGCTTCTATGAGGTTGCAAAT 1942

 16242590 ACTTAAAATTGTATTAAATTGCATGACGAGGGTAACACCTTACCATAGCTATCATTGCCT 16242649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1943 ACTTAAAATTGTATTAAATTGCATGACGAGGGTAACACCTTACCATAGCTATCATTGCCT 2002

 16242650 TTGGTGAAAATTTGGCAATTTTTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTGTG 16242709
          ||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||
     2003 TTGGTGAAAATTTGGCAATTTT------TTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTGTG 2056

 16242710 ATGGCGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGCGGGGCGATCTCGGCTCACTGCAA 16242769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2057 ATGGCGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGCGGGGCGATCTCGGCTCACTGCAA 2116

 16242770 GCTGCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCTTCAGCCTCCCGAGTAGCTG 16242822
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2117 GCTGCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCTTCAGCCTCCCGAGTAGCTG 2169

Alignment time is 2.68148 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [16229408,16251209] =>     21802 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    2210] =>      2210 nucs 'mol-32-3159-075486_2210'

Score:        2127
Aligned:      2204        nucs
Identic:      2197 (100%) nucs =>       834 (100%)      1363 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [16238313,16239149] EXCISED REGION [16239157,16240523]
 second seq =>  [       1,     837] EXCISED REGION [     845,    2210]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         7 nucs [16239150,16239156]
 second seq =>         7 nucs [838,844]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [16239149,16239151] to [16239156,16239158]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [16239150,16239151] to [16239155,16239156]
 second seq =>         1 nucs [838,838] to [844,844]

 16238313 ACCTAGGGACACCCCTCCTGGCCTTCTGGGAAGATCAGAACGCTCTGAGGGAAGCCGAGC 16238372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACCTAGGGACACCCCTCCTGGCCTTCTGGGAAGATCAGAACGCTCTGAGGGAAGCCGAGC 60

 16238373 ATTCACGTTTTTCTAAGGGGAATAATGGAGAAGGGCTAGGGTAGCCAGGTGCCTCTGTTA 16238432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATTCACGTTTTTCTAAGGGGAATAATGGAGAAGGGCTAGGGTAGCCAGGTGCCTCTGTTA 120

 16238433 GTTCTTTCTACGGTCCTCACTCCAGGGATGGGCCTAGCCTGGCCATAGCAGTGAGTCAGA 16238492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTTCTTTCTACGGTCCTCACTCCAGGGATGGGCCTAGCCTGGCCATAGCAGTGAGTCAGA 180

 16238493 TTAGCCAGAGGCTCTGGGAACACCTGGGGTTCCTGGGTGCAGCTGGCTGCATATTAGGCA 16238552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
      181 TTAGCCAGAGGCTCTGGGAACACCTGGGGTTCCTGGGTACAGCTGGCTGCATATTAGGCA 240

 16238553 GGACTAATGAACAGGTGCAGGACAGGGCTGGGTTGGCGGGTAAAGTGCCCAGAGACTCTC 16238612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGACTAATGAACAGGTGCAGGACAGGGCTGGGTTGGCGGGTAAAGTGCCCAGAGACTCTC 300

 16238613 CAAACCCTCAAGTGGGGCGGGGTCCGCCCAAGAGCACACCTGTGGTGAGGCCCCCACCAT 16238672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CAAACCCTCAAGTGGGGCGGGGTCCGCCCAAGAGCACACCTGTGGTGAGGCCCCCACCAT 360

 16238673 CTGATGAGCTGTGTTACGTCTGTGCCCCTCGGGAGTACGGAAAGTGGAGGAGCTGGGCCC 16238732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTGATGAGCTGTGTTACGTCTGTGCCCCTCGGGAGTACGGAAAGTGGAGGAGCTGGGCCC 420

 16238733 CAGAGAAATGGGCTACCCCAGAGCTGGCAGCCCCACCAGAGGGGATCTGGATCCCCTGCC 16238792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CAGAGAAATGGGCTACCCCAGAGCTGGCAGCCCCACCAGAGGGGATCTGGATCCCCTGCC 480

 16238793 AAGCAATTAAGCTGCCCCCTCCTGGCCAACTCCCCTTCTGCCCCTCACCACTGGGTTGGC 16238852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAGCAATTAAGCTGCCCCCTCCTGGCCAACTCCCCTTCTGCCCCTCACCACTGGGTTGGC 540

 16238853 TCTCCATCCAGTGGCCCCATATTTCCTGTTGACATTGGGGTGCAAGGCCTTTTCCACAAC 16238912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCTCCATCCAGTGGCCCCATATTTCCTGTTGACATTGGGGTGCAAGGCCTTTTCCACAAC 600

 16238913 CAAGGGCAGCACTGGTTCTATTTCTGCAGGTCCCTCTCCTCTGTGTGCTTGCCAAGACCC 16238972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CAAGGGCAGCACTGGTTCTATTTCTGCAGGTCCCTCTCCTCTGTGTGCTTGCCAAGACCC 660

 16238973 AGATCCCAGACAAGCACCACCCTGCACACTGTTTTTATTTAATCCTCTTGGCCACCCAGA 16239032
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGATCCCAGACAAGCACCACCTTGCACACTGTTTTTATTTAATCCTCTTGGCCACCCAGA 720

 16239033 GAGGCAGGGCTTATCAACCCTACTCTACCTGTGAGGAAAACTGAGACAGAAAAAGATGCT 16239092
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
      721 GAGGCAGGGCTTATCAACCCTACTCTACCTATGAGGAAAACTGAGACAGAAAAAGATGCT 780

 16239093 GCGGGTTGCCCTGAGCCACCTTGATGGGCTTCCAAGCCGATGGTCATGACAGCATAG 16239149
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GCGGGTTGCCCTGAGCCACCTTGATGGGCTTCCAAGCCGATGGTCATGACAGCATAG 837

EXCISED REGION

 16239157 TGATAGAATCAGCTAGATGGGTTTCAGGGTATTCGTCTGGGGTGGTGATGCCCACACCAA 16239216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      845 TGATAGAATCAGCTAGATGGGTTTCAGGGTATTCGTCTGGGGTGGTGATGCCCACACCAA 904

 16239217 ATCATTAAATCAGAAAATGCTTGCGATGACCAGCCCATGATGACCCTTTACAAGTGGAAG 16239276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      905 ATCATTAAATCAGAAAATGCTTGCGATGACCAGCCCATGATGACCCTTTACAAGTGGAAG 964

 16239277 TCAGTATTACTGCTGTTTTCTGGAGGGAAGGAGTTGAGGATCATACCAGCTTTTTCCGAG 16239336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      965 TCAGTATTACTGCTGTTTTCTGGAGGGAAGGAGTTGAGGATCATACCAGCTTTTTCCGAG 1024

 16239337 CACTATACCACTCAGACATGGGTGCTCTTACCCACTTCAAAACCCTCTGAGAATGCCAAA 16239396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1025 CACTATACCACTCAGACATGGGTGCTCTTACCCACTTCAAAACCCTCTGAGAATGCCAAA 1084

 16239397 CAACCATCGCAGTCTGGAAGTTCTTCCTTATCTATTCCGAAGCTCTCTTGCTAGAAGTCT 16239456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1085 CAACCATCGCAGTCTGGAAGTTCTTCCTTATCTATTCCGAAGCTCTCTTGCTAGAAGTCT 1144

 16239457 GTCCTAAATAATACTAACAAGGGTTAGAGGTATAGCTGAAGAGACCAGCAGTCAGCCCAA 16239516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1145 GTCCTAAATAATACTAACAAGGGTTAGAGGTATAGCTGAAGAGACCAGCAGTCAGCCCAA 1204

 16239517 GGAGGGCTTCATAAATTAATGTTTGGTGGGAATATCAGTGAAGGACTATATTTGGCTGCA 16239576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1205 GGAGGGCTTCATAAATTAATGTTTGGTGGGAATATCAGTGAAGGACTATATTTGGCTGCA 1264

 16239577 CAGAACAGAAACCTGCTGCAGTGACTTAACCAATGAATAGAGATTTATTTTTCCTTATAG 16239636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1265 CAGAACAGAAACCTGCTGCAGTGACTTAACCAATGAATAGAGATTTATTTTTCCTTATAG 1324

 16239637 TATAGAAAGCTCACAGGGTGGCAATGCAGTATTGGTGTGACAGCTCCACAATGCCATTGG 16239696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1325 TATAGAAAGCTCACAGGGTGGCAATGCAGTATTGGTGTGACAGCTCCACAATGCCATTGG 1384

 16239697 ACACCCACCTTCATCTGCTTTCCACTTCAACATGCTTAGAGAGTAGTTTTGGCCTCATAA 16239756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1385 ACACCCACCTTCATCTGCTTTCCACTTCAACATGCTTAGAGAGTAGTTTTGGCCTCATAA 1444

 16239757 TCACAACAGGGCTGCTCTACCTCTGGACATCACATACATATTTCAAATAGGGAAAAGGCG 16239816
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1445 TCACAACAGGGCTGTTCTACCTCTGGACATCACATACATATTTCAAATAGGGAAAAGGCG 1504

 16239817 AAGAAGAGATAGGCAGAGGCCAGTCCGGTTTGTGCTCTTCGGAAAAAAAAAATTAGTAAA 16239876
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
     1505 AAGAAGAGATAGGCAGAGGCCAGTCCGGTTTGTGCTCTTCGG-AAAAAAAAATTAGTAAA 1563

 16239877 ATAATAGTTTTCCCAGAATCCTTTCATTCATTTTATTTCTACCAGAGCTGCTGCCAGCAG 16239936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1564 ATAATAGTTTTCCCAGAATCCTTTCATTCATTTTATTTCTACCAGAGCTGCTGCCAGCAG 1623

 16239937 TGACAGGAAGTCTCGAGAGATACGTGTTTTTAGCTGTCCCGAGAAACATCAAAGTTCTGT 16239996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1624 TGACAGGAAGTCTCGAGAGATACGTGTTTTTAGCTGCCCCGAGAAACATCAAAGTTCTGT 1683

 16239997 CAGTACAGTGGAAGGGGAGAATGAATGGTGAGGAAGATGTTACATTTAGCAATGTTAAAG 16240056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1684 CAGTACAGTGGAAGGGGAGAATGAATGGTGAGGAAGATGTTACATTTAGCAATGTTAAAG 1743

 16240057 CCAATGAAGTCACTGAGGGGCTGCTTCTCAGATATGCAAGTCCAGAAATGTTAATAGCTT 16240116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1744 CCAATGAAGTCACTGAGGGGCTGCTTCTCAGATATGCAAGTCCAGAAATGTTAATAGCTT 1803

 16240117 GACTAACAGAGATTCCTCTCTAGGGAGTGGACCAGGGCTGACAGTCTTACCAGAAAAATA 16240176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1804 GACTAACAGAGATTCCTCTCTAGGGAGTGGACCAGGGCTGACAGTCTTACCAGAAAAATA 1863

 16240177 ATTATAAAGTAACACATCAACGAAGCATTTTACCAGTGAGAATTGCAACAGCCCAGTGAC 16240236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1864 ATTATAAAGTAACACATCAACGAAGCATTTTACCAGTGAGAATTGCAACAGCCCAGTGAC 1923

 16240237 TGGGACTCCTTTCCTCTACTGCTCAGGACATTGTTCACCCTGCAGAAAATCCATGGTGCT 16240296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1924 TGGGACTCCTTTCCTCTACTGCTCAGGACATTGTTCTCCCTGCAGAAAATCCATGGTGCT 1983

 16240297 TAGAAGACAGATTCCCAGGGAAGGAGTGTATGAAGTCTGCTGGGGGCTCTCGGGTGGGGC 16240356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1984 TAGAAGACAGATTCCCAGGGAAGGAGTGTATGAAGTCTGCTGGGGGCTCTCGGGTGGGGC 2043

 16240357 TGCCTTAACCTTCTCCAGCCTCCCCAGAGATCCAGCTACCAAAGCAGCCAGGCTACTTGT 16240416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2044 TGCCTTAACCTTCTCCAGCCTCCCCAGAGATCCAGCTACCAAAGCAGCCAGGCTACTTGT 2103

 16240417 ATCCACAGTTAAGGCCACCTCTGGGCTGGGGAACTGGGGGGGAAATTCTTGCTTTTTGGC 16240476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2104 ATCCACAGTTAAGGCCACCTCTGGGCTGGGGAACTGGGGGGGAAATTCTTGCTTTTTGGC 2163

 16240477 TCAGTTCTGTTCAATGCACATGTACTGAGTGCCTACTGTGGGCCAGG 16240523
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2164 TCAGTTCTGTTCAATGCACATGTACTGAGTGCCTACTGTGGGCCAGG 2210

Alignment time is 2.95203 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [16229408,16251209] =>     21802 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    2354] =>      2354 nucs 'mol-32-321f-080654_2354'

Score:        2267
Aligned:      2355        nucs
Identic:      2347 (100%) nucs =>      1285 (100%)      1062 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [16239424,16240713] EXCISED REGION [16240716,16241780]
 second seq =>  [       1,    1289] EXCISED REGION [    1290,    2354]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [16240714,16240715]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        14 nucs [16240714,16240727] to [16240716,16240729]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 16239424 TTATCTATTCCGAAGCTCTCTTGCTAGAAGTCTGTCCTAAATAATACTAACAAGGGTTAG 16239483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTATCTATTCCGAAGCTCTCTTGCTAGAAGTCTGTCCTAAATAATACTAACAAGGGTTAG 60

 16239484 AGGTATAGCTGAAGAGACCAGCAGTCAGCCCAAGGAGGGCTTCATAAATTAATGTTTGGT 16239543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGGTATAGCTGAAGAGACCAGCAGTCAGCCCAAGGAGGGCTTCATAAATTAATGTTTGGT 120

 16239544 GGGAATATCAGTGAAGGACTATATTTGGCTGCACAGAACAGAAACCTGCTGCAGTGACTT 16239603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGGAATATCAGTGAAGGACTATATTTGGCTGCACAGAACAGAAACCTGCTGCAGTGACTT 180

 16239604 AACCAATGAATAGAGATTTATTTTTCCTTATAGTATAGAAAGCTCACAGGGTGGCAATGC 16239663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AACCAATGAATAGAGATTTATTTTTCCTTATAGTATAGAAAGCTCACAGGGTGGCAATGC 240

 16239664 AGTATTGGTGTGACAGCTCCACAATGCCATTGGACACCCACCTTCATCTGCTTTCCACTT 16239723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGTATTGGTGTGACAGCTCCACAATGCCATTGGACACCCACCTTCATCTGCTTTCCACTT 300

 16239724 CAACATGCTTAGAGAGTAGTTTTGGCCTCATAATCACAACAGGGCTGCTCTACCTCTGGA 16239783
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
      301 CAACATGCTTAGAGAGTAGTTTTGGCCTCATAATCACAACAGGGCTGTTCTACCTCTGGA 360

 16239784 CATCACATACATATTTCAAATAGGGAAAAGGCGAAGAAGAGATAGGCAGAGGCCAGTCCG 16239843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CATCACATACATATTTCAAATAGGGAAAAGGCGAAGAAGAGATAGGCAGAGGCCAGTCCG 420

 16239844 GTTTGTGCTCTTCGGAAAAAAAAAATTAGTAAAATAATAGTTTTCCCAGAATCCTTTCAT 16239903
          |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTTTGTGCTCTTCGGAAAAAAAAA-TTAGTAAAATAATAGTTTTCCCAGAATCCTTTCAT 479

 16239904 TCATTTTATTTCTACCAGAGCTGCTGCCAGCAGTGACAGGAAGTCTCGAGAGATACGTGT 16239963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      480 TCATTTTATTTCTACCAGAGCTGCTGCCAGCAGTGACAGGAAGTCTCGAGAGATACGTGT 539

 16239964 TTTTAGCTGTCCCGAGAAACATCAAAGTTCTGTCAGTACAGTGGAAGGGGAGAATGAATG 16240023
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      540 TTTTAGCTGCCCCGAGAAACATCAAAGTTCTGTCAGTACAGTGGAAGGGGAGAATGAATG 599

 16240024 GTGAGGAAGATGTTACATTTAGCAATGTTAAAGCCAATGAAGTCACTGAGGGGCTGCTTC 16240083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      600 GTGAGGAAGATGTTACATTTAGCAATGTTAAAGCCAATGAAGTCACTGAGGGGCTGCTTC 659

 16240084 TCAGATATGCAAGTCCAGAAATGTTAATAGCTTGACTAACAGAGATTCCTCTCTAGGGAG 16240143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      660 TCAGATATGCAAGTCCAGAAATGTTAATAGCTTGACTAACAGAGATTCCTCTCTAGGGAG 719

 16240144 TGGACCAGGGCTGACAGTCTTACCAGAAAAATAATTATAAAGTAACACATCAACGAAGCA 16240203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      720 TGGACCAGGGCTGACAGTCTTACCAGAAAAATAATTATAAAGTAACACATCAACGAAGCA 779

 16240204 TTTTACCAGTGAGAATTGCAACAGCCCAGTGACTGGGACTCCTTTCCTCTACTGCTCAGG 16240263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      780 TTTTACCAGTGAGAATTGCAACAGCCCAGTGACTGGGACTCCTTTCCTCTACTGCTCAGG 839

 16240264 ACATTGTTCACCCTGCAGAAAATCCATGGTGCTTAGAAGACAGATTCCCAGGGAAGGAGT 16240323
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 ACATTGTTCTCCCTGCAGAAAATCCATGGTGCTTAGAAGACAGATTCCCAGGGAAGGAGT 899

 16240324 GTATGAAGTCTGCTGGGGGCTCTCGGGTGGGGCTGCCTTAACCTTCTCCAGCCTCCCCAG 16240383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 GTATGAAGTCTGCTGGGGGCTCTCGGGTGGGGCTGCCTTAACCTTCTCCAGCCTCCCCAG 959

 16240384 AGATCCAGCTACCAAAGCAGCCAGGCTACTTGTATCCACAGTTAAGGCCACCTCTGGGCT 16240443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 AGATCCAGCTACCAAAGCAGCCAGGCTACTTGTATCCACAGTTAAGGCCACCTCTGGGCT 1019

 16240444 GGGGAACTGGGGGGGAAATTCTTGCTTTTTGGCTCAGTTCTGTTCAATGCACATGTACTG 16240503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 GGGGAACTGGGGGGGAAATTCTTGCTTTTTGGCTCAGTTCTGTTCAATGCACATGTACTG 1079

 16240504 AGTGCCTACTGTGGGCCAGGCCCTGCACTAAGGGTTAGAGCAGAAGAGATGCATTAGGTA 16240563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 AGTGCCTACTGTGGGCCAGGCCCTGCACTAAGGGTTAGAGCAGAAGAGATGCATTAGGTA 1139

 16240564 CAACCCCTGTCCTTGGGGAGATCTTAGTCCACTGGCCTGGGGGGACTCCCCATTTCCAAG 16240623
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     1140 CAACCCCTGTCCTTGGGGAGATCTTAGTCCACTGGCCTGGGGGGACTCCCCGTTTCCAAG 1199

 16240624 ACTTCATGGAGACCACTGCTTCTCTGTGAACACATTGTTCCTTCCATCTCCACTGGCTTG 16240683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 ACTTCATGGAGACCACTGCTTCTCTGTGAACACATTGTTCCTTCCATCTCCACTGGCTTG 1259

 16240684 TTCCTCTTGGTGTGTGTGTACACAGACATG 16240713
          ||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 TTCCTCTTGGTGTGTGTGTACACAGACATG 1289

EXCISED REGION

 16240716 CACACACACACACATGCACTCACACACACAATCAAGTTATTCTTATCTTAAACACAAAAC 16240775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1290 CACACACACACACATGCACTCACACACACAATCAAGTTATTCTTATCTTAAACACAAAAC 1349

 16240776 CTAACAAGCTTCTCTCATCCTTTCCGTCATCTTCTTAGGCCTCTTTTTCTCCCTTCCCCT 16240835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1350 CTAACAAGCTTCTCTCATCCTTTCCGTCATCTTCTTAGGCCTCTTTTTCTCCCTTCCCCT 1409

 16240836 ATAGAATCAACCTTCCTAACCGTCTGGACTCTTGGTCTCAGTTTTTCATCTTCCGTTTTC 16240895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1410 ATAGAATCAACCTTCCTAACCGTCTGGACTCTTGGTCTCAGTTTTTCATCTTCCGTTTTC 1469

 16240896 TCTCCCGGACCCACTGTGTTGCAGACTCCCCTATCAACTGCAATGAGATCTCTTTGACCA 16240955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1470 TCTCCCGGACCCACTGTGTTGCAGACTCCCCTATCAACTGCAATGAGATCTCTTTGACCA 1529

 16240956 GCACCACCAATCTCCTACCAGCTGCCAAATTTAATGGAGCCTTTTGCCTTTGACTTCCTT 16241015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1530 GCACCACCAATCTCCTACCAGCTGCCAAATTTAATGGAGCCTTTTGCCTTTGACTTCCTT 1589

 16241016 GACCACTGTCTTAGGTCAGGTTTCCTGAAAGCAGGGCCTGAGATGGAGATTCACGTGCAT 16241075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1590 GACCACTGTCTTAGGTCAGGTTTCCTGAAAGCAGGGCCTGAGATGGAGATTCACGTGCAT 1649

 16241076 TTGATTTTTTTGAGGGTGTACTCTCAGGGGAAATCTGTAGGGGAGTGAGTGATACAGAAG 16241135
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1650 GTGATTTTTTTGAGGGTGTACTCTCAGGGGAAATCTGTAGGGGAGTGAGTGATACAGAAG 1709

 16241136 AGAGAGAGGGAAGAGCTGAACAAATATGTGGTTTCAGGTGAAGTCCAGCCATAGCCTGAT 16241195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1710 AGAGAGAGGGAAGAGCTGAACAAATATGTGGTTTCAGGTGAAGTCCAGCCATAGCCTGAT 1769

 16241196 CCCATGGGGGACTCTGGAGCACAGGCTGCACTGCGGGGTCTGTCTTGCTTTTTACCCTGC 16241255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1770 CCCATGGGGGACTCTGGAGCACAGGCTGCACTGCGGGGTCTGTCTTGCTTTTTACCCTGC 1829

 16241256 AATGGTCAGTCATTGACCATGACTGGGGCTGGGGGCAGCATCCTGCATGACTGTCTGGCA 16241315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1830 AATGGTCAGTCATTGACCATGACTGGGGCTGGGGGCAGCATCCTGCATGACTGTCTGGCA 1889

 16241316 CCTGCAGCAGAGACCGTTTTAATACCCCAAGGCAAGTCTCCAGGGAAGGGTTAAGATTTC 16241375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1890 CCTGCAGCAGAGACCGTTTTAATACCCCAAGGCAAGTCTCCAGGGAAGGGTTAAGATTTC 1949

 16241376 AGTTAGCACCCACAGCAGCTGGGGACATGCAAACCAAACCAAAACAGTTAAGGGGAGCTC 16241435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1950 AGTTAGCACCCACAGCAGCTGGGGACATGCAAACCAAACCAAAACAGTTAAGGGGAGCTC 2009

 16241436 AGGGAATCTGAGTAGGACACTATATTAGTCTGTTCTCACACTGCTATAAAGAACTGCCTG 16241495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2010 AGGGAATCTGAGTAGGACACTATATTAGTCTGTTCTCACACTGCTATAAAGAACTGCCTG 2069

 16241496 AGACTAGGTAATTTATAAAGAAAGGAGGTTTAATTGACTCACAGTTTCGCATGGCTGGGG 16241555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2070 AGACTAGGTAATTTATAAAGAAAGGAGGTTTAATTGACTCACAGTTTCGCATGGCTGGGG 2129

 16241556 AGGCCTCAGGAAACTTACAATCATGGTGGAAGGGGAAGCATGTCTTACATGGCAGCAAGT 16241615
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2130 AGGCCTCAGGAAACTTACAATCACGGTGGAAGGGGAAGCATGTCTTACATGGCAGCAAGT 2189

 16241616 GAGAGAAAGAGAGAGAGAGAGGAGGAAAAACTATCAAACACTTATATAATCATCAGATCT 16241675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2190 GAGAGAAAGAGAGAGAGAGAGGAGGAAAAACTATCAAACACTTATATAATCATCAGATCT 2249

 16241676 CATGAGAACTCACTATCACGAGAACAGCATGGGGGAAACTGCCCACATGATCCAATCACC 16241735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2250 CATGAGAACTCACTATCACGAGAACAGCATGGGGGAAACTGCCCACATGATCCAATCACC 2309

 16241736 TCCCACCAGGTCCCTCCCTCGCCACATAGGGATTATGGGGATTAC 16241780
          |||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     2310 TCCCACCAGGTCCCTCCCTCGACACATAGGGATTATGGGGATTAC 2354

Alignment time is 3.13145 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [16229408,16251209] =>     21802 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    2100] =>      2100 nucs 'mol-32-321f-280210_2100'

Score:        2041
Aligned:      2106        nucs
Identic:      2096 (100%) nucs =>       578 (100%)      1518 ( 99%)
Gaps:            6 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [16238829,16239408] EXCISED REGION [16241210,16242735]
 second seq =>  [       1,     580] EXCISED REGION [     581,    2100]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1801 nucs [16239409,16241209]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [16239409,16239409] to [16241210,16241210]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [16239409,16239410] to [16241208,16241209]
 second seq =>         0 nucs

 16238829 TCTGCCCCTCACCACTGGGTTGGCTCTCCATCCAGTGGCCCCATATTTCCTGTTGACATT 16238888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCTGCCCCTCACCACTGGGTTGGCTCTCCATCCAGTGGCCCCATATTTCCTGTTGACATT 60

 16238889 GGGGTGCAAGGCCTTTTCCACAACCAAGGGCAGCACTGGTTCTATTTCTGCAGGTCCCTC 16238948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGGGTGCAAGGCCTTTTCCACAACCAAGGGCAGCACTGGTTCTATTTCTGCAGGTCCCTC 120

 16238949 TCCTCTGTGTGCTTGCCAAGACCCAGATCCCAGACAAGCACCACCCTGCACACTGTTTTT 16239008
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
      121 TCCTCTGTGTGCTTGCCAAGACCCAGATCCCAGACAAGCACCACCTTGCACACTGTTTTT 180

 16239009 ATTTAATCCTCTTGGCCACCCAGAGAGGCAGGGCTTATCAACCCTACTCTACCTGTGAGG 16239068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATTTAATCCTCTTGGCCACCCAGAGAGGCAGGGCTTATCAACCCTACTCTACCTGTGAGG 240

 16239069 AAAACTGAGACAGAAAAAGATGCTGCGGGTTGCCCTGAGCCACCTTGATGGGCTTCCAAG 16239128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
      241 AAAACTGAGACAGAAAAAGATGCTGCGGGTTGCCCTGAGCCATCTTGATGGGCTTCCAAG 300

 16239129 CCGATGGTCATGACAGCATAGTGTAGTGTGATAGAATCAGCTAGATGGGTTTCAGGGTAT 16239188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCGATGGTCATGACAGCATAGTGTAGTGTGATAGAATCAGCTAGATGGGTTTCAGGGTAT 360

 16239189 TCGTCTGGGGTGGTGATGCCCACACCAAATCATTAAATCAGAAAATGCTTGCGATGACCA 16239248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCGTCTGGGGTGGTGATGCCCACACCAAATCATTAAATCAGAAAATGCTTGCGATGACCA 420

 16239249 GCCCATGATGACCCTTTACAAGTGGAAGTCAGTATTACTGCTGTTTTCTGGAGGGAAGGA 16239308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GCCCATGATGACCCTTTACAAGTGGAAGTCAGTATTACTGCTGTTTTCTGGAGGGAAGGA 480

 16239309 GTTGAGGATCATACCAGCTTTTTCCGAGCACTATACCACTCAGACATGGGTGCTCTTACC 16239368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTTGAGGATCATACCAGCTTTTTCCGAGCACTATACCACTCAGACATGGGTGCTCTTACC 540

 16239369 CACTTCAAAACCCTCTGAGAATGCCAAACAACCATCGCAG 16239408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CACTTCAAAACCCTCTGAGAATGCCAAACAACCATCGCAG 580

EXCISED REGION

 16241210 TGGAGCACAGGCTGCACTGCGGGGTCTGTCTTGCTTTTTACCCTGCAATGGTCAGTCATT 16241269
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      581 TGGAGCACAGGCTGCACTGCGGGTTCTGTCTTGCTTTTTACCCTGCAATGGTCAGTCATT 640

 16241270 GACCATGACTGGGGCTGGGGGCAGCATCCTGCATGACTGTCTGGCACCTGCAGCAGAGAC 16241329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      641 GACCATGACTGGGGCTGGGGGCAGCATCCTGCATGACTGTCTGGCACCTGCAGCAGAGAC 700

 16241330 CGTTTTAATACCCCAAGGCAAGTCTCCAGGGAAGGGTTAAGATTTCAGTTAGCACCCACA 16241389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      701 CGTTTTAATACCCCAAGGCAAGTCTCCAGGGAAGGGTTAAGATTTCAGTTAGCACCCACA 760

 16241390 GCAGCTGGGGACATGCAAACCAAACCAAAACAGTTAAGGGGAGCTCAGGGAATCTGAGTA 16241449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      761 GCAGCTGGGGACATGCAAACCAAACCAAAACAGTTAAGGGGAGCTCAGGGAATCTGAGTA 820

 16241450 GGACACTATATTAGTCTGTTCTCACACTGCTATAAAGAACTGCCTGAGACTAGGTAATTT 16241509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      821 GGACACTATATTAGTCTGTTCTCACACTGCTATAAAGAACTGCCTGAGACTAGGTAATTT 880

 16241510 ATAAAGAAAGGAGGTTTAATTGACTCACAGTTTCGCATGGCTGGGGAGGCCTCAGGAAAC 16241569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      881 ATAAAGAAAGGAGGTTTAATTGACTCACAGTTTCGCATGGCTGGGGAGGCCTCAGGAAAC 940

 16241570 TTACAATCATGGTGGAAGGGGAAGCATGTCTTACATGGCAGCAAGTGAGAGAAAGAGAGA 16241629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      941 TTACAATCATGGTGGAAGGGGAAGCATGTCTTACATGGCAGCAAGTGAGAGAAAGAGAGA 1000

 16241630 GAGAGAGGAGGAAAAACTATCAAACACTTATATAATCATCAGATCTCATGAGAACTCACT 16241689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1001 GAGAGAGGAGGAAAAACTATCAAACACTTATATAATCATCAGATCTCATGAGAACTCACT 1060

 16241690 ATCACGAGAACAGCATGGGGGAAACTGCCCACATGATCCAATCACCTCCCACCAGGTCCC 16241749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1061 ATCACGAGAACAGCATGGGGGAAACTGCCCACATGATCCAATCACCTCCCACCAGGTCCC 1120

 16241750 TCCCTCGCCACATAGGGATTATGGGGATTACCACTCAAGATGAGATCTGGGTGGGGACAA 16241809
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     1121 TCCCTCGCCACATAGGGATTATGGGGATTACAACTCAAGATGAGATCTGGGTGGGGACAA 1180

 16241810 AGAGCCAAACCATATCAGACACCAACAGTATCTGCTACATTCTTGCTGCTGCATTTGGAG 16241869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1181 AGAGCCAAACCATATCAGACACCAACAGTATCTGCTACATTCTTGCTGCTGCATTTGGAG 1240

 16241870 AATGTTAGCAAGTTCTCCCCTTTCCTGGTTTTCTGACACCATCCCTCTAATTTTTACTGG 16241929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1241 AATGTTAGCAAGTTCTCCCCTTTCCTGGTTTTCTGACACCATCCCTCTAATTTTTACTGG 1300

 16241930 AGAGAATCATGGCCCACCCCAACCTAACCAAGCATCTTACATCTCAGCAACAACCACACT 16241989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1301 AGAGAATCATGGCCCACCCCAACCTAACCAAGCATCTTACATCTCAGCAACAACCACACT 1360

 16241990 GTAGTAATGTTTTCGGTTCTTAGGACCCAGGTGCTCACCACAGCTTCCAAAAGAGAGTTG 16242049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1361 GTAGTAATGTTTTCGGTTCTTAGGACCCAGGTGCTCACCACAGCTTCCAAAAGAGAGTTG 1420

 16242050 CTGACGATTGTCTTAGTCACAATCTCATCGGTTGTGGCATTTGTCATTCCACTGACCACA 16242109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1421 CTGACGATTGTCTTAGTCACAATCTCATCGGTTGTGGCATTTGTCATTCCACTGACCACA 1480

 16242110 ACCCTGTTGATTCCAGGACAACTCAAGTCTGCTCTCAGCGAATATGTGGCCAGGCTGGAG 16242169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1481 ACCCTGTTGATTCCAGGACAACTCAAGTCTGCTCTCAGCGAATATGTGGCCAGGCTGGAG 1540

 16242170 GGGGTGAAGTTACTCAGGAGCAACAAGAGGCTGGGTGCCATCAGGGCCCGGATGCTGGGG 16242229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1541 GGGGTGAAGTTACTCAGGAGCAACAAGAGGCTGGGTGCCATCAGGGCCCGGATGCTGGGG 1600

 16242230 GCCACCAGAGCCACCGGGGATGTGCTCGTCTTCATGGATGCCCACTGCGAGTGCCACCCA 16242289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1601 GCCACCAGAGCCACCGGGGATGTGCTCGTCTTCATGGATGCCCACTGCGAGTGCCACCCA 1660

 16242290 GGCTGGCTGGAGCCCCTCCTCAGCAGAATAGCTGGTGACAGGTAACTTATTCCCTGGGCT 16242349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1661 GGCTGGCTGGAGCCCCTCCTCAGCAGAATAGCTGGTGACAGGTAACTTATTCCCTGGGCT 1720

 16242350 TGCAAAGCAAGACATGGAACTGGGAGAAACAGTCTACAGCATCAGCCACTCACAGAGCAA 16242409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1721 TGCAAAGCAAGACATGGAACTGGGAGAAACAGTCTACAGCATCAGCCACTCACAGAGCAA 1780

 16242410 CCCACCTATTAATTCCTGAATCTCCATTAGAGAGTGATATATTCCCTTCGGGTTTTCAGA 16242469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1781 CCCACCTATTAATTCCTGAATCTCCATTAGAGAGTGATATATTCCCTTCGGGTTTTCAGA 1840

 16242470 TGTGTAAGTTTTTTAAGACTATAGAGTTAGAGTTGGAAAGGAGGTTAGAGGTCTTCATCT 16242529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1841 TGTGTAAGTTTTTTAAGACTATAGAGTTAGAGTTGGAAAGGAGGTTAGAGGTCTTCATCT 1900

 16242530 ACCTTGCTTTATAGATAAAGAAACCGAGGCCTGGAGAACAGCTTCTATGAGGTTGCAAAT 16242589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1901 ACCTTGCTTTATAGATAAAGAAACCGAGGCCTGGAGAACAGCTTCTATGAGGTTGCAAAT 1960

 16242590 ACTTAAAATTGTATTAAATTGCATGACGAGGGTAACACCTTACCATAGCTATCATTGCCT 16242649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1961 ACTTAAAATTGTATTAAATTGCATGACGAGGGTAACACCTTACCATAGCTATCATTGCCT 2020

 16242650 TTGGTGAAAATTTGGCAATTTTTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTGTG 16242709
          ||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||
     2021 TTGGTGAAAATTTGGCAATTTT------TTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTGTG 2074

 16242710 ATGGCGTCTCGCTCTGTCACCCAGGC 16242735
          ||||||||||||||||||||||||||
     2075 ATGGCGTCTCGCTCTGTCACCCAGGC 2100

Alignment time is 2.63408 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [16229408,16251209] =>     21802 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    7284] =>      7284 nucs 'mol-32-32f0-002175_7284'

Score:        7155
Aligned:      7294        nucs
Identic:      7274 (100%) nucs =>      2047 (100%)      5227 (100%)
Gaps:           12 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [16237359,16239408] EXCISED REGION [16241210,16246451]
 second seq =>  [       1,    2050] EXCISED REGION [    2051,    7284]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1801 nucs [16239409,16241209]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [16239409,16239409] to [16241210,16241210]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [16239409,16239410] to [16241208,16241209]
 second seq =>         0 nucs

 16237359 TACACAGCATCCTCGACACAGTGCCCAGGGCCTTCCTGAAGGAGATCATCCTCGTGGACG 16237418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TACACAGCATCCTCGACACAGTGCCCAGGGCCTTCCTGAAGGAGATCATCCTCGTGGACG 60

 16237419 ACCTCAGCCAGCAAGGTAGCCACGGCTTTCCTCCAGGCTCGTCTGGGTGAGCCTTACCCC 16237478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACCTCAGCCAGCAAGGTAGCCACGGCTTTCCTCCAGGCTCGTCTGGGTGAGCCTTACCCC 120

 16237479 CTGGCGGGTGGAGTTCTCAAGCAAAAGATTGAAGTTTGGAACTATTTTAGGCAAGATTCC 16237538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTGGCGGGTGGAGTTCTCAAGCAAAAGATTGAAGTTTGGAACTATTTTAGGCAAGATTCC 180

 16237539 CCAACTACAGACCTCCAGATGAGGATTAATGGGCAAGTAACTTATGAATGAAGAGCCACT 16237598
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
      181 CCAACTACAGACCTCCAGATGAGGATTAATGGGTAAGTAACTTATGAATGAAGAGCCACT 240

 16237599 GGGGAAACCAGTAAGGCAGTGGGGGCTGCAAGACAGAGAAGGAGAAAGAGCCCTGCAGGG 16237658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGGGAAACCAGTAAGGCAGTGGGGGCTGCAAGACAGAGAAGGAGAAAGAGCCCTGCAGGG 300

 16237659 GAAACAGCCCTGGGGAGGGTCTTGAGGGGTGTCGCCTCAGCCTGATCCCGTGGGGATCTC 16237718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GAAACAGCCCTGGGGAGGGTCTTGAGGGGTGTCGCCTCAGCCTGATCCCGTGGGGATCTC 360

 16237719 TCTCCCAGGTGCCACCCAGTCCAACAATCCTCTCTCCAAGACACTGAAGAATCACATAGG 16237778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCTCCCAGGTGCCACCCAGTCCAACAATCCTCTCTCCAAGACACTGAAGAATCACATAGG 420

 16237779 GCGGCCCTGTTGTGAGTGCTCACTGCCTCCTAGACCCTGGTGCAGCACTTTACACATACG 16237838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GCGGCCCTGTTGTGAGTGCTCACTGCCTCCTAGACCCTGGTGCAGCACTTTACACATACG 480

 16237839 CACATATGTGTATCGGTCCTTCACTCATCATGGCTTAGACAGACCCACTCACTTTCCAGA 16237898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CACATATGTGTATCGGTCCTTCACTCATCATGGCTTAGACAGACCCACTCACTTTCCAGA 540

 16237899 GGAGGAAACTGGGGCCCAGAGAAGACAGCAGACTGGAGCGGAGTCAGCCAAAAGCAGCAG 16237958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGAGGAAACTGGGGCCCAGAGAAGACAGCAGACTGGAGCGGAGTCAGCCAAAAGCAGCAG 600

 16237959 AGTCAGGCCCAGAGCCCAGACTTGCAGAACCTGCCTGTGTGCTTCCTCTCACAGGAACCT 16238018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGTCAGGCCCAGAGCCCAGACTTGCAGAACCTGCCTGTGTGCTTCCTCTCACAGGAACCT 660

 16238019 GGCTACTAGGGACAGCCCTAAAAGAAGATGGAGACAGAGAAGCCCCCACTTGACTCGTAG 16238078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGCTACTAGGGACAGCCCTAAAAGAAGATGGAGACAGAGAAGCCCCCACTTGACTCGTAG 720

 16238079 GTCAGTGGCTCTCACGCTTGAGCATGCATCGGAATCACCTGGTGCGATTTTTAAAATACT 16238138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GTCAGTGGCTCTCACGCTTGAGCATGCATCGGAATCACCTGGTGCGATTTTTAAAATACT 780

 16238139 ACTGCAGGGCCCACCCCCAGAGTTTCTGGTGATGGAGTGGGGCCGAAGAATTTGCATTTC 16238198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ACTGCAGGGCCCACCCCCAGAGTTTCTGGTGATGGAGTGGGGCCGAAGAATTTGCATTTC 840

 16238199 TAACAAGCTCCCAGGTGATGCTGATGCTGCTGTTTTCTGTGGACCACACTCTGAGAACCT 16238258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TAACAAGCTCCCAGGTGATGCTGATGCTGCTGTTTTCTGTGGACCACACTCTGAGAACCT 900

 16238259 CTGCTCTAGTCTTTGGCTTGGGCGTGAGGCCTACATTTCTGGCACAACTAAATGACCTAG 16238318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTGCTCTAGTCTTTGGCTTGGGCGTGAGGCCTACATTTCTGGCACAACTAAATGACCTAG 960

 16238319 GGACACCCCTCCTGGCCTTCTGGGAAGATCAGAACGCTCTGAGGGAAGCCGAGCATTCAC 16238378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GGACACCCCTCCTGGCCTTCTGGGAAGATCAGAACGCTCTGAGGGAAGCCGAGCATTCAC 1020

 16238379 GTTTTTCTAAGGGGAATAATGGAGAAGGGCTAGGGTAGCCAGGTGCCTCTGTTAGTTCTT 16238438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GTTTTTCTAAGGGGAATAATGGAGAAGGGCTAGGGTAGCCAGGTGCCTCTGTTAGTTCTT 1080

 16238439 TCTACGGTCCTCACTCCAGGGATGGGCCTAGCCTGGCCATAGCAGTGAGTCAGATTAGCC 16238498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TCTACGGTCCTCACTCCAGGGATGGGCCTAGCCTGGCCATAGCAGTGAGTCAGATTAGCC 1140

 16238499 AGAGGCTCTGGGAACACCTGGGGTTCCTGGGTGCAGCTGGCTGCATATTAGGCAGGACTA 16238558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGAGGCTCTGGGAACACCTGGGGTTCCTGGGTGCAGCTGGCTGCATATTAGGCAGGACTA 1200

 16238559 ATGAACAGGTGCAGGACAGGGCTGGGTTGGCGGGTAAAGTGCCCAGAGACTCTCCAAACC 16238618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATGAACAGGTGCAGGACAGGGCTGGGTTGGCGGGTAAAGTGCCCAGAGACTCTCCAAACC 1260

 16238619 CTCAAGTGGGGCGGGGTCCGCCCAAGAGCACACCTGTGGTGAGGCCCCCACCATCTGATG 16238678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTCAAGTGGGGCGGGGTCCGCCCAAGAGCACACCTGTGGTGAGGCCCCCACCATCTGATG 1320

 16238679 AGCTGTGTTACGTCTGTGCCCCTCGGGAGTACGGAAAGTGGAGGAGCTGGGCCCCAGAGA 16238738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AGCTGTGTTACGTCTGTGCCCCTCGGGAGTACGGAAAGTGGAGGAGCTGGGCCCCAGAGA 1380

 16238739 AATGGGCTACCCCAGAGCTGGCAGCCCCACCAGAGGGGATCTGGATCCCCTGCCAAGCAA 16238798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AATGGGCTACCCCAGAGCTGGCAGCCCCACCAGAGGGGATCTGGATCCCCTGCCAAGCAA 1440

 16238799 TTAAGCTGCCCCCTCCTGGCCAACTCCCCTTCTGCCCCTCACCACTGGGTTGGCTCTCCA 16238858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTAAGCTGCCCCCTCCTGGCCAACTCCCCTTCTGCCCCTCACCACTGGGTTGGCTCTCCA 1500

 16238859 TCCAGTGGCCCCATATTTCCTGTTGACATTGGGGTGCAAGGCCTTTTCCACAACCAAGGG 16238918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TCCAGTGGCCCCATATTTCCTGTTGACATTGGGGTGCAAGGCCTTTTCCACAACCAAGGG 1560

 16238919 CAGCACTGGTTCTATTTCTGCAGGTCCCTCTCCTCTGTGTGCTTGCCAAGACCCAGATCC 16238978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CAGCACTGGTTCTATTTCTGCAGGTCCCTCTCCTCTGTGTGCTTGCCAAGACCCAGATCC 1620

 16238979 CAGACAAGCACCACCCTGCACACTGTTTTTATTTAATCCTCTTGGCCACCCAGAGAGGCA 16239038
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CAGACAAGCACCACCTTGCACACTGTTTTTATTTAATCCTCTTGGCCACCCAGAGAGGCA 1680

 16239039 GGGCTTATCAACCCTACTCTACCTGTGAGGAAAACTGAGACAGAAAAAGATGCTGCGGGT 16239098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GGGCTTATCAACCCTACTCTACCTGTGAGGAAAACTGAGACAGAAAAAGATGCTGCGGGT 1740

 16239099 TGCCCTGAGCCACCTTGATGGGCTTCCAAGCCGATGGTCATGACAGCATAGTGTAGTGTG 16239158
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGCCCTGAGCCATCTTGATGGGCTTCCAAGCCGATGGTCATGACAGCATAGTGTAGTGTG 1800

 16239159 ATAGAATCAGCTAGATGGGTTTCAGGGTATTCGTCTGGGGTGGTGATGCCCACACCAAAT 16239218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ATAGAATCAGCTAGATGGGTTTCAGGGTATTCGTCTGGGGTGGTGATGCCCACACCAAAT 1860

 16239219 CATTAAATCAGAAAATGCTTGCGATGACCAGCCCATGATGACCCTTTACAAGTGGAAGTC 16239278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CATTAAATCAGAAAATGCTTGCGATGACCAGCCCATGATGACCCTTTACAAGTGGAAGTC 1920

 16239279 AGTATTACTGCTGTTTTCTGGAGGGAAGGAGTTGAGGATCATACCAGCTTTTTCCGAGCA 16239338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AGTATTACTGCTGTTTTCTGGAGGGAAGGAGTTGAGGATCATACCAGCTTTTTCCGAGCA 1980

 16239339 CTATACCACTCAGACATGGGTGCTCTTACCCACTTCAAAACCCTCTGAGAATGCCAAACA 16239398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CTATACCACTCAGACATGGGTGCTCTTACCCACTTCAAAACCCTCTGAGAATGCCAAACA 2040

 16239399 ACCATCGCAG 16239408
          ||||||||||
     2041 ACCATCGCAG 2050

EXCISED REGION

 16241210 TGGAGCACAGGCTGCACTGCGGGGTCTGTCTTGCTTTTTACCCTGCAATGGTCAGTCATT 16241269
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2051 TGGAGCACAGGCTGCACTGCGGGTTCTGTCTTGCTTTTTACCCTGCAATGGTCAGTCATT 2110

 16241270 GACCATGACTGGGGCTGGGGGCAGCATCCTGCATGACTGTCTGGCACCTGCAGCAGAGAC 16241329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2111 GACCATGACTGGGGCTGGGGGCAGCATCCTGCATGACTGTCTGGCACCTGCAGCAGAGAC 2170

 16241330 CGTTTTAATACCCCAAGGCAAGTCTCCAGGGAAGGGTTAAGATTTCAGTTAGCACCCACA 16241389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2171 CGTTTTAATACCCCAAGGCAAGTCTCCAGGGAAGGGTTAAGATTTCAGTTAGCACCCACA 2230

 16241390 GCAGCTGGGGACATGCAAACCAAACCAAAACAGTTAAGGGGAGCTCAGGGAATCTGAGTA 16241449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2231 GCAGCTGGGGACATGCAAACCAAACCAAAACAGTTAAGGGGAGCTCAGGGAATCTGAGTA 2290

 16241450 GGACACTATATTAGTCTGTTCTCACACTGCTATAAAGAACTGCCTGAGACTAGGTAATTT 16241509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2291 GGACACTATATTAGTCTGTTCTCACACTGCTATAAAGAACTGCCTGAGACTAGGTAATTT 2350

 16241510 ATAAAGAAAGGAGGTTTAATTGACTCACAGTTTCGCATGGCTGGGGAGGCCTCAGGAAAC 16241569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2351 ATAAAGAAAGGAGGTTTAATTGACTCACAGTTTCGCATGGCTGGGGAGGCCTCAGGAAAC 2410

 16241570 TTACAATCATGGTGGAAGGGGAAGCATGTCTTACATGGCAGCAAGTGAGAGAA--AGAGA 16241627
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||
     2411 TTACAATCATGGTGGAAGGGGAAGCATGTCTTACATGGCAGCAAGTGAGAGAAAGAGAGA 2470

 16241628 GAGAGAGAGGAGGAAAAACTATCAAACACTTATATAATCATCAGATCTCATGAGAACTCA 16241687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2471 GAGAGAGAGGAGGAAAAACTATCAAACACTTATATAATCATCAGATCTCATGAGAACTCA 2530

 16241688 CTATCACGAGAACAGCATGGGGGAAACTGCCCACATGATCCAATCACCTCCCACCAGGTC 16241747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2531 CTATCACGAGAACAGCATGGGGGAAACTGCCCACATGATCCAATCACCTCCCACCAGGTC 2590

 16241748 CCTCCCTCGCCACATAGGGATTATGGGGATTACCACTCAAGATGAGATCTGGGTGGGGAC 16241807
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     2591 CCTCCCTCGCCACATAGGGATTATGGGGATTACAACTCAAGATGAGATCTGGGTGGGGAC 2650

 16241808 AAAGAGCCAAACCATATCAGACACCAACAGTATCTGCTACATTCTTGCTGCTGCATTTGG 16241867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2651 AAAGAGCCAAACCATATCAGACACCAACAGTATCTGCTACATTCTTGCTGCTGCATTTGG 2710

 16241868 AGAATGTTAGCAAGTTCTCCCCTTTCCTGGTTTTCTGACACCATCCCTCTAATTTTTACT 16241927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2711 AGAATGTTAGCAAGTTCTCCCCTTTCCTGGTTTTCTGACACCATCCCTCTAATTTTTACT 2770

 16241928 GGAGAGAATCATGGCCCACCCCAACCTAACCAAGCATCTTACATCTCAGCAACAACCACA 16241987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2771 GGAGAGAATCATGGCCCACCCCAACCTAACCAAGCATCTTACATCTCAGCAACAACCACA 2830

 16241988 CTGTAGTAATGTTTTCGGTTCTTAGGACCCAGGTGCTCACCACAGCTTCCAAAAGAGAGT 16242047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2831 CTGTAGTAATGTTTTCGGTTCTTAGGACCCAGGTGCTCACCACAGCTTCCAAAAGAGAGT 2890

 16242048 TGCTGACGATTGTCTTAGTCACAATCTCATCGGTTGTGGCATTTGTCATTCCACTGACCA 16242107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2891 TGCTGACGATTGTCTTAGTCACAATCTCATCGGTTGTGGCATTTGTCATTCCACTGACCA 2950

 16242108 CAACCCTGTTGATTCCAGGACAACTCAAGTCTGCTCTCAGCGAATATGTGGCCAGGCTGG 16242167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2951 CAACCCTGTTGATTCCAGGACAACTCAAGTCTGCTCTCAGCGAATATGTGGCCAGGCTGG 3010

 16242168 AGGGGGTGAAGTTACTCAGGAGCAACAAGAGGCTGGGTGCCATCAGGGCCCGGATGCTGG 16242227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3011 AGGGGGTGAAGTTACTCAGGAGCAACAAGAGGCTGGGTGCCATCAGGGCCCGGATGCTGG 3070

 16242228 GGGCCACCAGAGCCACCGGGGATGTGCTCGTCTTCATGGATGCCCACTGCGAGTGCCACC 16242287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3071 GGGCCACCAGAGCCACCGGGGATGTGCTCGTCTTCATGGATGCCCACTGCGAGTGCCACC 3130

 16242288 CAGGCTGGCTGGAGCCCCTCCTCAGCAGAATAGCTGGTGACAGGTAACTTATTCCCTGGG 16242347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3131 CAGGCTGGCTGGAGCCCCTCCTCAGCAGAATAGCTGGTGACAGGTAACTTATTCCCTGGG 3190

 16242348 CTTGCAAAGCAAGACATGGAACTGGGAGAAACAGTCTACAGCATCAGCCACTCACAGAGC 16242407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3191 CTTGCAAAGCAAGACATGGAACTGGGAGAAACAGTCTACAGCATCAGCCACTCACAGAGC 3250

 16242408 AACCCACCTATTAATTCCTGAATCTCCATTAGAGAGTGATATATTCCCTTCGGGTTTTCA 16242467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3251 AACCCACCTATTAATTCCTGAATCTCCATTAGAGAGTGATATATTCCCTTCGGGTTTTCA 3310

 16242468 GATGTGTAAGTTTTTTAAGACTATAGAGTTAGAGTTGGAAAGGAGGTTAGAGGTCTTCAT 16242527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3311 GATGTGTAAGTTTTTTAAGACTATAGAGTTAGAGTTGGAAAGGAGGTTAGAGGTCTTCAT 3370

 16242528 CTACCTTGCTTTATAGATAAAGAAACCGAGGCCTGGAGAACAGCTTCTATGAGGTTGCAA 16242587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3371 CTACCTTGCTTTATAGATAAAGAAACCGAGGCCTGGAGAACAGCTTCTATGAGGTTGCAA 3430

 16242588 ATACTTAAAATTGTATTAAATTGCATGACGAGGGTAACACCTTACCATAGCTATCATTGC 16242647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3431 ATACTTAAAATTGTATTAAATTGCATGACGAGGGTAACACCTTACCATAGCTATCATTGC 3490

 16242648 CTTTGGTGAAAATTTGGCAATTTTTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTG 16242707
          ||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||
     3491 CTTTGGTGAAAATTTGGCAATTTT------TTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTG 3544

 16242708 TGATGGCGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGCGGGGCGATCTCGGCTCACTGC 16242767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3545 TGATGGCGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGCGGGGCGATCTCGGCTCACTGC 3604

 16242768 AAGCTGCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACT 16242827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3605 AAGCTGCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACT 3664

 16242828 ACAGGCGCCCGCCACCACACCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGAAGGGGTTTCA 16242887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3665 ACAGGCGCCCGCCACCACACCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGAAGGGGTTTCA 3724

 16242888 CCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACTTCGTGATCCGCCCTCCTCAGCCTCCC 16242947
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3725 CCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCAATCTCCTGACTTCGTGATCCGCCCTCCTCAGCCTCCC 3784

 16242948 AAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCTGGCCGAAAATTCGTCAATTTTAAT 16243007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3785 AAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCTGGCCGAAAATTCGTCAATTTTAAT 3844

 16243008 CAAGCTTGTAACATAACCTGGGGAAAAAGTCTCTGAACTACACTAGGCCGTAGATTACTC 16243067
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3845 CAAGCTTGTAACATAAACTGGGGAAAAAGTCTCTGAACTACACTAGGCCGTAGATTACTC 3904

 16243068 ACCCATAAAAAGAAAACATTATGTTCTCTGATCACTAAACAGCATTCTTTGTTTCCCCAG 16243127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3905 ACCCATAAAAAGAAAACATTATGTTCTCTGATCACTAAACAGCATTCTTTGTTTCCCCAG 3964

 16243128 TTTATATAAGGGGTCCCTAATTTTCTACCTAAGGCCAGTCCTTGGAAATGTGAAGTTGGA 16243187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3965 TTTATATAAGGGGTCCCTAATTTTCTACCTAAGGCCAGTCCTTGGAAATGTGAAGTTGGA 4024

 16243188 GAGGACTGCATTACATTACCCTGTAGACAAGCATCTTAACATTTTTCTTGATCATTTCTC 16243247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4025 GAGGACTGCATTACATTACCCTGTAGACAAGCATCTTAACATTTTTCTTGATCATTTCTC 4084

 16243248 TGCTCTCCTTCCCCCATCTGACCGTCAATCTCTTTCTCACTTCCTTGCTCAAGACAAACA 16243307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4085 TGCTCTCCTTCCCCCATCTGACCGTCAATCTCTTTCTCACTTCCTTGCTCAAGACAAACA 4144

 16243308 GTTCCTAAACATGTCTAGTCAAACATTACCCTCAATCTGAATATCCTACCCAGGAAAACT 16243367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4145 GTTCCTAAACATGTCTAGTCAAACATTACCCTCAATCTGAATATCCTACCCAGGAAAACT 4204

 16243368 GAAACCTGGTGGCTGGCCCACCTTGGACCACCTCAGGCATACCACTTGGAGCTCATGTAG 16243427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4205 GAAACCTGGTGGCTGGCCCACCTTGGACCACCTCAGGCATACCACTTGGAGCTCATGTAG 4264

 16243428 GCATGTAGCAGAGTAGAACCACAATCAATAATTGTTTGATGGTGCCCAGCAAGACAGGAC 16243487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4265 GCATGTAGCAGAGTAGAACCACAATCAATAATTGTTTGATGGTGCCCAGCAAGACAGGAC 4324

 16243488 CAATGCTAGAACCAAGCCTTATGACTTCTACCCATGATGAATGTTTATTATCTCACCTGA 16243547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4325 CAATGCTAGAACCAAGCCTTATGACTTCTACCCATGATGAATGTTTATTATCTCACCTGA 4384

 16243548 AGTTAGGGATGATCAATCAAATATAAGAAAAAATTCCTGGACCAGATCGGAATGAATCCT 16243607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4385 AGTTAGGGATGATCAATCAAATATAAGAAAAAATTCCTGGACCAGATCGGAATGAATCCT 4444

 16243608 GGAGACATAGGAGTTACCATCAGCCAAATGGAGATGGTTTCAAACGTTCAAATGACAGAA 16243667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4445 GGAGACATAGGAGTTACCATCAGCCAAATGGAGATGGTTTCAAACGTTCAAATGACAGAA 4504

 16243668 AGTAAATTGTTAATAGTTCAGCATTCCATTTTAACAAAGAAGAACAATCGGAACTCAAGT 16243727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4505 AGTAAATTGTTAATAGTTCAGCATTCCATTTTAACAAAGAAGAACAATCGGAACTCAAGT 4564

 16243728 GAGATCAAGACAGATTAATGTTTCCCAGTTTCATGAGACAGATTGTCTCTTGACTCACAT 16243787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4565 GAGATCAAGACAGATTAATGTTTCCCAGTTTCATGAGACAGATTGTCTCTTGACTCACAT 4624

 16243788 CTCATAAGAAAAGAAGACACACATAAATTCAGCACTAGGACAAGAACTAGGACACAAAAA 16243847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4625 CTCATAAGAAAAGAAGACACACATAAATTCAGCACTAGGACAAGAACTAGGACACAAAAA 4684

 16243848 TGCACAAGCTGGCCAGGCACGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGA 16243907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4685 TGCACAAGCTGGCCAGGCACGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGA 4744

 16243908 GGCAGACGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCC 16243967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4745 GGCAGACGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCC 4804

 16243968 CATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAACTGGGTGTGGTAGCGTGCGCCTGTAATCCCAGC 16244027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4805 CATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAACTGGGTGTGGTAGCGTGCGCCTGTAATCCCAGC 4864

 16244028 TACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTAAAGTGAGC 16244087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4865 TACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTAAAGTGAGC 4924

 16244088 CAAGATCGTGCTACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCCATCCCGAAAAGAA 16244147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4925 CAAGATCGTGCTACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCCATCCCGAAAAGAA 4984

 16244148 AAGAAAATGCACAAGCCCTCCAAAGCTGCCATTTTTGATTCTGTTTCATGCAAAGGGCCA 16244207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4985 AAGAAAATGCACAAGCCCTCCAAAGCTGCCATTTTTGATTCTGTTTCATGCAAAGGGCCA 5044

 16244208 TCTTGAAATCAGAGCGATGTCTATCATTGGAGTCAGACTCTGAAGTTGATCTTGCCCATT 16244267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5045 TCTTGAAATCAGAGCGATGTCTATCATTGGAGTCAGACTCTGAAGTTGATCTTGCCCATT 5104

 16244268 TCCCATCTGATTCCCATTCTGGTATCACAGACAGGTGGCTCTCAGAGGGACCATGAAGAT 16244327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5105 TCCCATCTGATTCCCATTCTGGTATCACAGACAGGTGGCTCTCAGAGGGACCATGAAGAT 5164

 16244328 CATCTTGTCTTACCTCATGATTTCGCTATCGAGAACCCTGAGTTCCAGGAAAGTAAAAAA 16244387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5165 CATCTTGTCTTACCTCATGATTTCGCTATCGAGAACCCTGAGTTCCAGGAAAGTAAAAAA 5224

 16244388 GACCCCTCAGGGTCACACAGCCATTTGACAACTGGGCTGTTTTCTATGCTGCTTTTATGC 16244447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5225 GACCCCTCAGGGTCACACAGCCATTTGACAACTGGGCTGTTTTCTATGCTGCTTTTATGC 5284

 16244448 AGACATTTAGAAATGCAGTAATTAACATCATTAAACTTTATGTATGTGTAACCCTCGCAG 16244507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5285 AGACATTTAGAAATGCAGTAATTAACATCATTAAACTTTATGTATGTGTAACCCTCGCAG 5344

 16244508 ACTTCTTTCATATGCCTTCTTTAATGACCCCCATGAGAGGCCTCAGGCAGGTATTTTAGC 16244567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5345 ACTTCTTTCATATGCCTTCTTTAATGACCCCCATGAGAGGCCTCAGGCAGGTATTTTAGC 5404

 16244568 TTCTGTTTTATAGGGGGAGAAATTGAGGCTCAGAGAGGTGACATGATATGTAAGGGCAGA 16244627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5405 TTCTGTTTTATAGGGGGAGAAATTGAGGCTCAGAGAGGTGACATGATATGTAAGGGCAGA 5464

 16244628 TAATTCGTAGCTGAGTCAGATTTTCTGACTCTGGGTCCAGTGCTGTTTTTATTGTGTACA 16244687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5465 TAATTCGTAGCTGAGTCAGATTTTCTGACTCTGGGTCCAGTGCTGTTTTTATTGTGTACA 5524

 16244688 TTTTCTTTTTAAGAGTTGGAGAAGCTGGTCAGGGAGGAACATTAGTCATCCCTAACCCCA 16244747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5525 TTTTCTTTTTAAGAGTTGGAGAAGCTGGTCAGGGAGGAACATTAGTCATCCCTAACCCCA 5584

 16244748 CAACTGGTTATGAGACATGTGTTACCTGCTGCTGTGAGTCCCTCGTATCTGCTTCTCACA 16244807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5585 CAACTGGTTATGAGACATGTGTTACCTGCTGCTGTGAGTCCCTCGTATCTGCTTCTCACA 5644

 16244808 TCGGGGCCCCATTTCCCAGAGCTAGGTGAAGGTAGAAAGACGTGGCACTACCTCAGTGTC 16244867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5645 TCGGGGCCCCATTTCCCAGAGCTAGGTGAAGGTAGAAAGACGTGGCACTACCTCAGTGTC 5704

 16244868 CTAGGCTAGAAAGAAAATGAGGCTCCCTGGGAAGCCCTTTGTGATTAAGAGACATTCTAG 16244927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5705 CTAGGCTAGAAAGAAAATGAGGCTCCCTGGGAAGCCCTTTGTGATTAAGAGACATTCTAG 5764

 16244928 TTTCCTGTGCCCTTCCCCTCTCCTCTTTTCCTCTCCTGTCTGTCTCTGCCTCTCTACCTC 16244987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5765 TTTCCTGTGCCCTTCCCCTCTCCTCTTTTCCTCTCCTGTCTGTCTCTGCCTCTCTACCTC 5824

 16244988 TCTCACGGTCTTTGTCTCTCTCTGTCTCTTGGTCACTCATTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC 16245047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5825 TCTCACGGTCTTTGTCTCTCTCTGTCTCTTGGTCACTCATTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC 5884

 16245048 TCTCACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAGTGGGCCTCTG 16245107
          |    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5885 T----CACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAGTGGGCCTCTG 5940

 16245108 ATCCTGGTGTGTTACTGGCTTGCCTTCCTCTTTGGGTTCCATCTCTTCTGCGTGATGTGA 16245167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5941 ATCCTGGTGTGTTACTGGCTTGCCTTCCTCTTTGGGTTCCATCTCTTCTGCGTGATGTGA 6000

 16245168 CCACATTTTCATCATCTCTACACCTCATTCATGGCTTCTTGTCCACTGTGTTTTCTCTGG 16245227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6001 CCACATTTTCATCATCTCTACACCTCATTCATGGCTTCTTGTCCACTGTGTTTTCTCTGG 6060

 16245228 GCCCTAGTGTCCAGCTTTTAGGCACTGGCAGGTGAGGATCTGGAAGAAAAGCCACCTTTC 16245287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6061 GCCCTAGTGTCCAGCTTTTAGGCACTGGCAGGTGAGGATCTGGAAGAAAAGCCACCTTTC 6120

 16245288 TGGTATCTGAGTCCCACTCTCTCCACTCCACCTGGCAACGCTCTATGAGCTGTGGCAGGG 16245347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6121 TGGTATCTGAGTCCCACTCTCTCCACTCCACCTGGCAACGCTCTATGAGCTGTGGCAGGG 6180

 16245348 AGAGCAGCCTCATTCAGTGTGTGCTTTACTCCCCCAGGGACGTCGCCCACGTGCCTCATA 16245407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6181 AGAGCAGCCTCATTCAGTGTGTGCTTTACTCCCCCAGGGACGTCGCCCACGTGCCTCATA 6240

 16245408 CAAAGCCAAGCTGTGGAAGGCATTTGGTGCAGCTCCTCACATGGAGAGGAGAGGGGGCCC 16245467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6241 CAAAGCCAAGCTGTGGAAGGCATTTGGTGCAGCTCCTCACATGGAGAGGAGAGGGGGCCC 6300

 16245468 AGCTGTCTCCAAGGCTTGTGTCAGGAGACATTCTGTCACCAGATGAGGACACAGTGCCCA 16245527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6301 AGCTGTCTCCAAGGCTTGTGTCAGGAGACATTCTGTCACCAGATGAGGACACAGTGCCCA 6360

 16245528 AAAGACAGAAAAGGGTCTTTAAGAGCTCTTATAAAAAAAAAAAAGTGGGGTGGGAGTGGT 16245587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6361 AAAGACAGAAAAGGGTCTTTAAGAGCTCTTATAAAAAAAAAAAAGTGGGGTGGGAGTGGT 6420

 16245588 GAGTGAACAGTGCAGTAAGCCACAAATCAGCTCTTTCAAAGAGCCGTAGCCTCCTCCACA 16245647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6421 GAGTGAACAGTGCAGTAAGCCACAAATCAGCTCTTTCAAAGAGCCGTAGCCTCCTCCACA 6480

 16245648 CCCTGGCCAAGGAATTCAGAGCCTGCTGACCAGCCTTTGTTCCCTGTCCCTGCCTAGCAG 16245707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     6481 CCCTGGCCAAGGAATTCAGAGCCTGCTGACCAGCCTTTGTTCTCTGTCCCTGCCTAGCAG 6540

 16245708 GTTCCCACTAGCCATGTGGCAACTTTATTTGAATTGGTAGAAATCCCTTCCTCATGACCA 16245767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6541 GTTCCCACTAGCCATGTGGCAACTTTATTTGAATTGGTAGAAATCCCTTCCTCATGACCA 6600

 16245768 TTCCTCCTGACTCCCATTCCTCAGAAAATTGGTCATAATATACTGATTTTATTAGAATAA 16245827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6601 TTCCTCCTGACTCCCATTCCTCAGAAAATTGGTCATAATATACTGATTTTATTAGAATAA 6660

 16245828 GACATCTTAATGCCAACTGTCAGCAAGTTGTTGAAATAAAAATGCAAATTTACAGTAATG 16245887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6661 GACATCTTAATGCCAACTGTCAGCAAGTTGTTGAAATAAAAATGCAAATTTACAGTAATG 6720

 16245888 ATAATATTAGAGATGTTCTCTTGGGTTGCACAGTGCGCAACTCCTGTAACTGTTCATAGC 16245947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6721 ATAATATTAGAGATGTTCTCTTGGGTTGCACAGTGCGCAACTCCTGTAACTGTTCATAGC 6780

 16245948 AACCCTACATAGAGTCTCCCTATGGGCAACTGATTTTAGGGCAGCCCTGGGAGATGCTGA 16246007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6781 AACCCTACATAGAGTCTCCCTATGGGCAACTGATTTTAGGGCAGCCCTGGGAGATGCTGA 6840

 16246008 TTGATGGCCAGTTTCTACACAAAGTAACAATGATGGGAATCAAGACTAGCTGTTGTATCC 16246067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6841 TTGATGGCCAGTTTCTACACAAAGTAACAATGATGGGAATCAAGACTAGCTGTTGTATCC 6900

 16246068 AGCTCTCAGCTGACTTGTGTTGACTGCCAGCTCTCATACCCAAGCCAAGCAGTGGAAGCC 16246127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6901 AGCTCTCAGCTGACTTGTGTTGACTGCCAGCTCTCATACCCAAGCCAAGCAGTGGAAGCC 6960

 16246128 ATACCCCTGGAAGGATGAAGGTTTCTAAGGGGAAAGGGACAGTCTTGAAAGGGGCTGAAA 16246187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6961 ATACCCCTGGAAGGATGAAGGTTTCTAAGGGGAAAGGGACAGTCTTGAAAGGGGCTGAAA 7020

 16246188 GATGATATCATCTCAAGAAGCTGAACAAGTTATCTCTTACTTGAAAATGGGTCTGGTCCC 16246247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7021 GATGATATCATCTCAAGAAGCTGAACAAGTTATCTCTTACTTGAAAATGGGTCTGGTCCC 7080

 16246248 TATCTGCGAGACATCCGGTCCTTCAGGATCAGCCAGGGGTGCTATGGGGAGAAGCAATGT 16246307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7081 TATCTGCGAGACATCCGGTCCTTCAGGATCAGCCAGGGGTGCTATGGGGAGAAGCAATGT 7140

 16246308 GGGGCAGGGAGAAGAACACCTCCCACTCTGCCCTTTGAAGGGTTAAATGATGGAAAGCAG 16246367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7141 GGGGCAGGGAGAAGAACACCTCCCACTCTGCCCTTTGAAGGGTTAAATGATGGAAAGCAG 7200

 16246368 TGTAAGAACCCCTTGTGCTTGTGCATGTGAGTCAGTGTGTGTGTGTAAGCATGTGAGAGT 16246427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7201 TGTAAGAACCCCTTGTGCTTGTGCATGTGAGTCAGTGTGTGTGTGTAAGCATGTGAGAGT 7260

 16246428 CTGAGTGTGGGGGGGAGCGAGCAT 16246451
          ||||||||||||||||||||||||
     7261 CTGAGTGTGGGGGGGAGCGAGCAT 7284

Alignment time is 9.05434 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [16229408,16251209] =>     21802 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    2051] =>      2051 nucs 'mol-32-32f0-002175_2051'

Score:        2028
Aligned:      2050        nucs
Identic:      2048 (100%) nucs =>       213 (100%)      1835 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [16237359,16237571] EXCISED REGION [16237573,16239409]
 second seq =>  [       1,     213] EXCISED REGION [     215,    2051]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [16237572,16237572]
 second seq =>         1 nucs [214,214]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 16237359 TACACAGCATCCTCGACACAGTGCCCAGGGCCTTCCTGAAGGAGATCATCCTCGTGGACG 16237418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TACACAGCATCCTCGACACAGTGCCCAGGGCCTTCCTGAAGGAGATCATCCTCGTGGACG 60

 16237419 ACCTCAGCCAGCAAGGTAGCCACGGCTTTCCTCCAGGCTCGTCTGGGTGAGCCTTACCCC 16237478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACCTCAGCCAGCAAGGTAGCCACGGCTTTCCTCCAGGCTCGTCTGGGTGAGCCTTACCCC 120

 16237479 CTGGCGGGTGGAGTTCTCAAGCAAAAGATTGAAGTTTGGAACTATTTTAGGCAAGATTCC 16237538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTGGCGGGTGGAGTTCTCAAGCAAAAGATTGAAGTTTGGAACTATTTTAGGCAAGATTCC 180

 16237539 CCAACTACAGACCTCCAGATGAGGATTAATGGG 16237571
          |||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCAACTACAGACCTCCAGATGAGGATTAATGGG 213

EXCISED REGION

 16237573 AAGTAACTTATGAATGAAGAGCCACTGGGGAAACCAGTAAGGCAGTGGGGGCTGCAAGAC 16237632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      215 AAGTAACTTATGAATGAAGAGCCACTGGGGAAACCAGTAAGGCAGTGGGGGCTGCAAGAC 274

 16237633 AGAGAAGGAGAAAGAGCCCTGCAGGGGAAACAGCCCTGGGGAGGGTCTTGAGGGGTGTCG 16237692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      275 AGAGAAGGAGAAAGAGCCCTGCAGGGGAAACAGCCCTGGGGAGGGTCTTGAGGGGTGTCG 334

 16237693 CCTCAGCCTGATCCCGTGGGGATCTCTCTCCCAGGTGCCACCCAGTCCAACAATCCTCTC 16237752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      335 CCTCAGCCTGATCCCGTGGGGATCTCTCTCCCAGGTGCCACCCAGTCCAACAATCCTCTC 394

 16237753 TCCAAGACACTGAAGAATCACATAGGGCGGCCCTGTTGTGAGTGCTCACTGCCTCCTAGA 16237812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      395 TCCAAGACACTGAAGAATCACATAGGGCGGCCCTGTTGTGAGTGCTCACTGCCTCCTAGA 454

 16237813 CCCTGGTGCAGCACTTTACACATACGCACATATGTGTATCGGTCCTTCACTCATCATGGC 16237872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      455 CCCTGGTGCAGCACTTTACACATACGCACATATGTGTATCGGTCCTTCACTCATCATGGC 514

 16237873 TTAGACAGACCCACTCACTTTCCAGAGGAGGAAACTGGGGCCCAGAGAAGACAGCAGACT 16237932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      515 TTAGACAGACCCACTCACTTTCCAGAGGAGGAAACTGGGGCCCAGAGAAGACAGCAGACT 574

 16237933 GGAGCGGAGTCAGCCAAAAGCAGCAGAGTCAGGCCCAGAGCCCAGACTTGCAGAACCTGC 16237992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      575 GGAGCGGAGTCAGCCAAAAGCAGCAGAGTCAGGCCCAGAGCCCAGACTTGCAGAACCTGC 634

 16237993 CTGTGTGCTTCCTCTCACAGGAACCTGGCTACTAGGGACAGCCCTAAAAGAAGATGGAGA 16238052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      635 CTGTGTGCTTCCTCTCACAGGAACCTGGCTACTAGGGACAGCCCTAAAAGAAGATGGAGA 694

 16238053 CAGAGAAGCCCCCACTTGACTCGTAGGTCAGTGGCTCTCACGCTTGAGCATGCATCGGAA 16238112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      695 CAGAGAAGCCCCCACTTGACTCGTAGGTCAGTGGCTCTCACGCTTGAGCATGCATCGGAA 754

 16238113 TCACCTGGTGCGATTTTTAAAATACTACTGCAGGGCCCACCCCCAGAGTTTCTGGTGATG 16238172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      755 TCACCTGGTGCGATTTTTAAAATACTACTGCAGGGCCCACCCCCAGAGTTTCTGGTGATG 814

 16238173 GAGTGGGGCCGAAGAATTTGCATTTCTAACAAGCTCCCAGGTGATGCTGATGCTGCTGTT 16238232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      815 GAGTGGGGCCGAAGAATTTGCATTTCTAACAAGCTCCCAGGTGATGCTGATGCTGCTGTT 874

 16238233 TTCTGTGGACCACACTCTGAGAACCTCTGCTCTAGTCTTTGGCTTGGGCGTGAGGCCTAC 16238292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      875 TTCTGTGGACCACACTCTGAGAACCTCTGCTCTAGTCTTTGGCTTGGGCGTGAGGCCTAC 934

 16238293 ATTTCTGGCACAACTAAATGACCTAGGGACACCCCTCCTGGCCTTCTGGGAAGATCAGAA 16238352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      935 ATTTCTGGCACAACTAAATGACCTAGGGACACCCCTCCTGGCCTTCTGGGAAGATCAGAA 994

 16238353 CGCTCTGAGGGAAGCCGAGCATTCACGTTTTTCTAAGGGGAATAATGGAGAAGGGCTAGG 16238412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      995 CGCTCTGAGGGAAGCCGAGCATTCACGTTTTTCTAAGGGGAATAATGGAGAAGGGCTAGG 1054

 16238413 GTAGCCAGGTGCCTCTGTTAGTTCTTTCTACGGTCCTCACTCCAGGGATGGGCCTAGCCT 16238472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1055 GTAGCCAGGTGCCTCTGTTAGTTCTTTCTACGGTCCTCACTCCAGGGATGGGCCTAGCCT 1114

 16238473 GGCCATAGCAGTGAGTCAGATTAGCCAGAGGCTCTGGGAACACCTGGGGTTCCTGGGTGC 16238532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1115 GGCCATAGCAGTGAGTCAGATTAGCCAGAGGCTCTGGGAACACCTGGGGTTCCTGGGTGC 1174

 16238533 AGCTGGCTGCATATTAGGCAGGACTAATGAACAGGTGCAGGACAGGGCTGGGTTGGCGGG 16238592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1175 AGCTGGCTGCATATTAGGCAGGACTAATGAACAGGTGCAGGACAGGGCTGGGTTGGCGGG 1234

 16238593 TAAAGTGCCCAGAGACTCTCCAAACCCTCAAGTGGGGCGGGGTCCGCCCAAGAGCACACC 16238652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1235 TAAAGTGCCCAGAGACTCTCCAAACCCTCAAGTGGGGCGGGGTCCGCCCAAGAGCACACC 1294

 16238653 TGTGGTGAGGCCCCCACCATCTGATGAGCTGTGTTACGTCTGTGCCCCTCGGGAGTACGG 16238712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1295 TGTGGTGAGGCCCCCACCATCTGATGAGCTGTGTTACGTCTGTGCCCCTCGGGAGTACGG 1354

 16238713 AAAGTGGAGGAGCTGGGCCCCAGAGAAATGGGCTACCCCAGAGCTGGCAGCCCCACCAGA 16238772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1355 AAAGTGGAGGAGCTGGGCCCCAGAGAAATGGGCTACCCCAGAGCTGGCAGCCCCACCAGA 1414

 16238773 GGGGATCTGGATCCCCTGCCAAGCAATTAAGCTGCCCCCTCCTGGCCAACTCCCCTTCTG 16238832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1415 GGGGATCTGGATCCCCTGCCAAGCAATTAAGCTGCCCCCTCCTGGCCAACTCCCCTTCTG 1474

 16238833 CCCCTCACCACTGGGTTGGCTCTCCATCCAGTGGCCCCATATTTCCTGTTGACATTGGGG 16238892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1475 CCCCTCACCACTGGGTTGGCTCTCCATCCAGTGGCCCCATATTTCCTGTTGACATTGGGG 1534

 16238893 TGCAAGGCCTTTTCCACAACCAAGGGCAGCACTGGTTCTATTTCTGCAGGTCCCTCTCCT 16238952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1535 TGCAAGGCCTTTTCCACAACCAAGGGCAGCACTGGTTCTATTTCTGCAGGTCCCTCTCCT 1594

 16238953 CTGTGTGCTTGCCAAGACCCAGATCCCAGACAAGCACCACCCTGCACACTGTTTTTATTT 16239012
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     1595 CTGTGTGCTTGCCAAGACCCAGATCCCAGACAAGCACCACCTTGCACACTGTTTTTATTT 1654

 16239013 AATCCTCTTGGCCACCCAGAGAGGCAGGGCTTATCAACCCTACTCTACCTGTGAGGAAAA 16239072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1655 AATCCTCTTGGCCACCCAGAGAGGCAGGGCTTATCAACCCTACTCTACCTGTGAGGAAAA 1714

 16239073 CTGAGACAGAAAAAGATGCTGCGGGTTGCCCTGAGCCACCTTGATGGGCTTCCAAGCCGA 16239132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     1715 CTGAGACAGAAAAAGATGCTGCGGGTTGCCCTGAGCCATCTTGATGGGCTTCCAAGCCGA 1774

 16239133 TGGTCATGACAGCATAGTGTAGTGTGATAGAATCAGCTAGATGGGTTTCAGGGTATTCGT 16239192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1775 TGGTCATGACAGCATAGTGTAGTGTGATAGAATCAGCTAGATGGGTTTCAGGGTATTCGT 1834

 16239193 CTGGGGTGGTGATGCCCACACCAAATCATTAAATCAGAAAATGCTTGCGATGACCAGCCC 16239252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1835 CTGGGGTGGTGATGCCCACACCAAATCATTAAATCAGAAAATGCTTGCGATGACCAGCCC 1894

 16239253 ATGATGACCCTTTACAAGTGGAAGTCAGTATTACTGCTGTTTTCTGGAGGGAAGGAGTTG 16239312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1895 ATGATGACCCTTTACAAGTGGAAGTCAGTATTACTGCTGTTTTCTGGAGGGAAGGAGTTG 1954

 16239313 AGGATCATACCAGCTTTTTCCGAGCACTATACCACTCAGACATGGGTGCTCTTACCCACT 16239372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1955 AGGATCATACCAGCTTTTTCCGAGCACTATACCACTCAGACATGGGTGCTCTTACCCACT 2014

 16239373 TCAAAACCCTCTGAGAATGCCAAACAACCATCGCAGT 16239409
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2015 TCAAAACCCTCTGAGAATGCCAAACAACCATCGCAGT 2051

Alignment time is 2.90219 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [16229408,16251209] =>     21802 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    7732] =>      7732 nucs 'mol-32-338a-077326_7732'

Score:        7597
Aligned:      7741        nucs
Identic:      7723 (100%) nucs =>      4661 (100%)      3062 (100%)
Gaps:            9 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [16240370,16245044] EXCISED REGION [16245057,16248122]
 second seq =>  [       1,    4668] EXCISED REGION [    4669,    7732]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        12 nucs [16245045,16245056]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>        14 nucs [16245046,16245059]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [16245045,16245045] to [16245057,16245057]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 16240370 TCCAGCCTCCCCAGAGATCCAGCTACCAAAGCAGCCAGGCTACTTGTATCCACAGTTAAG 16240429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCCAGCCTCCCCAGAGATCCAGCTACCAAAGCAGCCAGGCTACTTGTATCCACAGTTAAG 60

 16240430 GCCACCTCTGGGCTGGGGAACTGGGGGGGAAATTCTTGCTTTTTGGCTCAGTTCTGTTCA 16240489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCCACCTCTGGGCTGGGGAACTGGGGGGGAAATTCTTGCTTTTTGGCTCAGTTCTGTTCA 120

 16240490 ATGCACATGTACTGAGTGCCTACTGTGGGCCAGGCCCTGCACTAAGGGTTAGAGCAGAAG 16240549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATGCACATGTACTGAGTGCCTACTGTGGGCCAGGCCCTGCACTAAGGGTTAGAGCAGAAG 180

 16240550 AGATGCATTAGGTACAACCCCTGTCCTTGGGGAGATCTTAGTCCACTGGCCTGGGGGGAC 16240609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGATGCATTAGGTACAACCCCTGTCCTTGGGGAGATCTTAGTCCACTGGCCTGGGGGGAC 240

 16240610 TCCCCATTTCCAAGACTTCATGGAGACCACTGCTTCTCTGTGAACACATTGTTCCTTCCA 16240669
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCCCCGTTTCCAAGACTTCATGGAGACCACTGCTTCTCTGTGAACACATTGTTCCTTCCA 300

 16240670 TCTCCACTGGCTTGTTCCTCTTGGTGTGTGTGTACACAGACATGCACACACACACACACA 16240729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCTCCACTGGCTTGTTCCTCTTGGTGTGTGTGTACACAGACATGCACACACACACACACA 360

 16240730 TGCACTCACACACACAATCAAGTTATTCTTATCTTAAACACAAAACCTAACAAGCTTCTC 16240789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGCACTCACACACACAATCAAGTTATTCTTATCTTAAACACAAAACCTAACAAGCTTCTC 420

 16240790 TCATCCTTTCCGTCATCTTCTTAGGCCTCTTTTTCTCCCTTCCCCTATAGAATCAACCTT 16240849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCATCCTTTCCGTCATCTTCTTAGGCCTCTTTTTCTCCCTTCCCCTATAGAATCAACCTT 480

 16240850 CCTAACCGTCTGGACTCTTGGTCTCAGTTTTTCATCTTCCGTTTTCTCTCCCGGACCCAC 16240909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCTAACCGTCTGGACTCTTGGTCTCAGTTTTTCATCTTCCGTTTTCTCTCCCGGACCCAC 540

 16240910 TGTGTTGCAGACTCCCCTATCAACTGCAATGAGATCTCTTTGACCAGCACCACCAATCTC 16240969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGTGTTGCAGACTCCCCTATCAACTGCAATGAGATCTCTTTGACCAGCACCACCAATCTC 600

 16240970 CTACCAGCTGCCAAATTTAATGGAGCCTTTTGCCTTTGACTTCCTTGACCACTGTCTTAG 16241029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTACCAGCTGCCAAATTTAATGGAGCCTTTTGCCTTTGACTTCCTTGACCACTGTCTTAG 660

 16241030 GTCAGGTTTCCTGAAAGCAGGGCCTGAGATGGAGATTCACGTGCATTTGATTTTTTTGAG 16241089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
      661 GTCAGGTTTCCTGAAAGCAGGGCCTGAGATGGAGATTCACGTGCATGTGATTTTTTTGAG 720

 16241090 GGTGTACTCTCAGGGGAAATCTGTAGGGGAGTGAGTGATACAGAAGAGAGAGAGGGAAGA 16241149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GGTGTACTCTCAGGGGAAATCTGTAGGGGAGTGAGTGATACAGAAGAGAGAGAGGGAAGA 780

 16241150 GCTGAACAAATATGTGGTTTCAGGTGAAGTCCAGCCATAGCCTGATCCCATGGGGGACTC 16241209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GCTGAACAAATATGTGGTTTCAGGTGAAGTCCAGCCATAGCCTGATCCCATGGGGGACTC 840

 16241210 TGGAGCACAGGCTGCACTGCGGGGTCTGTCTTGCTTTTTACCCTGCAATGGTCAGTCATT 16241269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGGAGCACAGGCTGCACTGCGGGGTCTGTCTTGCTTTTTACCCTGCAATGGTCAGTCATT 900

 16241270 GACCATGACTGGGGCTGGGGGCAGCATCCTGCATGACTGTCTGGCACCTGCAGCAGAGAC 16241329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GACCATGACTGGGGCTGGGGGCAGCATCCTGCATGACTGTCTGGCACCTGCAGCAGAGAC 960

 16241330 CGTTTTAATACCCCAAGGCAAGTCTCCAGGGAAGGGTTAAGATTTCAGTTAGCACCCACA 16241389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CGTTTTAATACCCCAAGGCAAGTCTCCAGGGAAGGGTTAAGATTTCAGTTAGCACCCACA 1020

 16241390 GCAGCTGGGGACATGCAAACCAAACCAAAACAGTTAAGGGGAGCTCAGGGAATCTGAGTA 16241449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GCAGCTGGGGACATGCAAACCAAACCAAAACAGTTAAGGGGAGCTCAGGGAATCTGAGTA 1080

 16241450 GGACACTATATTAGTCTGTTCTCACACTGCTATAAAGAACTGCCTGAGACTAGGTAATTT 16241509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GGACACTATATTAGTCTGTTCTCACACTGCTATAAAGAACTGCCTGAGACTAGGTAATTT 1140

 16241510 ATAAAGAAAGGAGGTTTAATTGACTCACAGTTTCGCATGGCTGGGGAGGCCTCAGGAAAC 16241569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATAAAGAAAGGAGGTTTAATTGACTCACAGTTTCGCATGGCTGGGGAGGCCTCAGGAAAC 1200

 16241570 TTACAATCATGGTGGAAGGGGAAGCATGTCTTACATGGCAGCAAGTGAGAGAAAGAGAGA 16241629
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTACAATCACGGTGGAAGGGGAAGCATGTCTTACATGGCAGCAAGTGAGAGAAAGAGAGA 1260

 16241630 GAGAGAGGAGGAAAAACTATCAAACACTTATATAATCATCAGATCTCATGAGAACTCACT 16241689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GAGAGAGGAGGAAAAACTATCAAACACTTATATAATCATCAGATCTCATGAGAACTCACT 1320

 16241690 ATCACGAGAACAGCATGGGGGAAACTGCCCACATGATCCAATCACCTCCCACCAGGTCCC 16241749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ATCACGAGAACAGCATGGGGGAAACTGCCCACATGATCCAATCACCTCCCACCAGGTCCC 1380

 16241750 TCCCTCGCCACATAGGGATTATGGGGATTACCACTCAAGATGAGATCTGGGTGGGGACAA 16241809
          |||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TCCCTCGACACATAGGGATTATGGGGATTACAACTCAAGATGAGATCTGGGTGGGGACAA 1440

 16241810 AGAGCCAAACCATATCAGACACCAACAGTATCTGCTACATTCTTGCTGCTGCATTTGGAG 16241869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AGAGCCAAACCATATCAGACACCAACAGTATCTGCTACATTCTTGCTGCTGCATTTGGAG 1500

 16241870 AATGTTAGCAAGTTCTCCCCTTTCCTGGTTTTCTGACACCATCCCTCTAATTTTTACTGG 16241929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AATGTTAGCAAGTTCTCCCCTTTCCTGGTTTTCTGACACCATCCCTCTAATTTTTACTGG 1560

 16241930 AGAGAATCATGGCCCACCCCAACCTAACCAAGCATCTTACATCTCAGCAACAACCACACT 16241989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AGAGAATCATGGCCCACCCCAACCTAACCAAGCATCTTACATCTCAGCAACAACCACACT 1620

 16241990 GTAGTAATGTTTTCGGTTCTTAGGACCCAGGTGCTCACCACAGCTTCCAAAAGAGAGTTG 16242049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GTAGTAATGTTTTCGGTTCTTAGGACCCAGGTGCTCACCACAGCTTCCAAAAGAGAGTTG 1680

 16242050 CTGACGATTGTCTTAGTCACAATCTCATCGGTTGTGGCATTTGTCATTCCACTGACCACA 16242109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CTGACGATTGTCTTAGTCACAATCTCATCGGTTGTGGCATTTGTCATTCCACTGACCACA 1740

 16242110 ACCCTGTTGATTCCAGGACAACTCAAGTCTGCTCTCAGCGAATATGTGGCCAGGCTGGAG 16242169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ACCCTGTTGATTCCAGGACAACTCAAGTCTGCTCTCAGCGAATATGTGGCCAGGCTGGAG 1800

 16242170 GGGGTGAAGTTACTCAGGAGCAACAAGAGGCTGGGTGCCATCAGGGCCCGGATGCTGGGG 16242229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GGGGTGAAGTTACTCAGGAGCAACAAGAGGCTGGGTGCCATCAGGGCCCGGATGCTGGGG 1860

 16242230 GCCACCAGAGCCACCGGGGATGTGCTCGTCTTCATGGATGCCCACTGCGAGTGCCACCCA 16242289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GCCACCAGAGCCACCGGGGATGTGCTCGTCTTCATGGATGCCCACTGCGAGTGCCACCCA 1920

 16242290 GGCTGGCTGGAGCCCCTCCTCAGCAGAATAGCTGGTGACAGGTAACTTATTCCCTGGGCT 16242349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GGCTGGCTGGAGCCCCTCCTCAGCAGAATAGCTGGTGACAGGTAACTTATTCCCTGGGCT 1980

 16242350 TGCAAAGCAAGACATGGAACTGGGAGAAACAGTCTACAGCATCAGCCACTCACAGAGCAA 16242409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TGCAAAGCAAGACATGGAACTGGGAGAAACAGTCTACAGCATCAGCCACTCACAGAGCAA 2040

 16242410 CCCACCTATTAATTCCTGAATCTCCATTAGAGAGTGATATATTCCCTTCGGGTTTTCAGA 16242469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CCCACCTATTAATTCCTGAATCTCCATTAGAGAGTGATATATTCCCTTCGGGTTTTCAGA 2100

 16242470 TGTGTAAGTTTTTTAAGACTATAGAGTTAGAGTTGGAAAGGAGGTTAGAGGTCTTCATCT 16242529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TGTGTAAGTTTTTTAAGACTATAGAGTTAGAGTTGGAAAGGAGGTTAGAGGTCTTCATCT 2160

 16242530 ACCTTGCTTTATAGATAAAGAAACCGAGGCCTGGAGAACAGCTTCTATGAGGTTGCAAAT 16242589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ACCTTGCTTTATAGATAAAGAAACCGAGGCCTGGAGAACAGCTTCTATGAGGTTGCAAAT 2220

 16242590 ACTTAAAATTGTATTAAATTGCATGACGAGGGTAACACCTTACCATAGCTATCATTGCCT 16242649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ACTTAAAATTGTATTAAATTGCATGACGAGGGTAACACCTTACCATAGCTATCATTGCCT 2280

 16242650 TTGGTGAAAATTTGGCAATTTTTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTGTG 16242709
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||
     2281 TTGGTGAAAATTTGGCAATTTTTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTT------GTG 2334

 16242710 ATGGCGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGCGGGGCGATCTCGGCTCACTGCAA 16242769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2335 ATGGCGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGCGGGGCGATCTCGGCTCACTGCAA 2394

 16242770 GCTGCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTAC 16242829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2395 GCTGCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTAC 2454

 16242830 AGGCGCCCGCCACCACACCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGAAGGGGTTTCACC 16242889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2455 AGGCGCCCGCCACCACACCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGAAGGGGTTTCACC 2514

 16242890 GTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACTTCGTGATCCGCCCTCCTCAGCCTCCCAA 16242949
          ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2515 GTGTTAGCCAG-ATGGTCTCGATCTCCTGACTTCGTGATCCGCCCTCCTCAGCCTCCCAA 2573

 16242950 AGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCTGGCCGAAAATTCGTCAATTTTAATCA 16243009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2574 AGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCTGGCCGAAAATTCGTCAATTTTAATCA 2633

 16243010 AGCTTGTAACATAACCTGGGGAAAAAGTCTCTGAACTACACTAGGCCGTAGATTACTCAC 16243069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2634 AGCTTGTAACATAACCTGGGGAAAAAGTCTCTGAACTACACTAGGCCGTAGATTACTCAC 2693

 16243070 CCATAAAAAGAAAACATTATGTTCTCTGATCACTAAACAGCATTCTTTGTTTCCCCAGTT 16243129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2694 CCATAAAAAGAAAACATTATGTTCTCTGATCACTAAACAGCATTCTTTGTTTCCCCAGTT 2753

 16243130 TATATAAGGGGTCCCTAATTTTCTACCTAAGGCCAGTCCTTGGAAATGTGAAGTTGGAGA 16243189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2754 TATATAAGGGGTCCCTAATTTTCTACCTAAGGCCAGTCCTTGGAAATGTGAAGTTGGAGA 2813

 16243190 GGACTGCATTACATTACCCTGTAGACAAGCATCTTAACATTTTTCTTGATCATTTCTCTG 16243249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2814 GGACTGCATTACATTACCCTGTAGACAAGCATCTTAACATTTTTCTTGATCATTTCTCTG 2873

 16243250 CTCTCCTTCCCCCATCTGACCGTCAATCTCTTTCTCACTTCCTTGCTCAAGACAAACAGT 16243309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2874 CTCTCCTTCCCCCATCTGACCGTCAATCTCTTTCTCACTTCCTTGCTCAAGACAAACAGT 2933

 16243310 TCCTAAACATGTCTAGTCAAACATTACCCTCAATCTGAATATCCTACCCAGGAAAACTGA 16243369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2934 TCCTAAACATGTCTAGTCAAACATTACCCTCAATCTGAATATCCTACCCAGGAAAACTGA 2993

 16243370 AACCTGGTGGCTGGCCCACCTTGGACCACCTCAGGCATACCACTTGGAGCTCATGTAGGC 16243429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2994 AACCTGGTGGCTGGCCCACCTTGGACCACCTCAGGCATACCACTTGGAGCTCATGTAGGC 3053

 16243430 ATGTAGCAGAGTAGAACCACAATCAATAATTGTTTGATGGTGCCCAGCAAGACAGGACCA 16243489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3054 ATGTAGCAGAGTAGAACCACAATCAATAATTGTTTGATGGTGCCCAGCAAGACAGGACCA 3113

 16243490 ATGCTAGAACCAAGCCTTATGACTTCTACCCATGATGAATGTTTATTATCTCACCTGAAG 16243549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3114 ATGCTAGAACCAAGCCTTATGACTTCTACCCATGATGAATGTTTATTATCTCACCTGAAG 3173

 16243550 TTAGGGATGATCAATCAAATATAAGAAAAAATTCCTGGACCAGATCGGAATGAATCCTGG 16243609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     3174 TTAGGGATGATCAATCAAATATAAGAAAAAATTCCTGGACCAGATCAGAATGAATCCTGG 3233

 16243610 AGACATAGGAGTTACCATCAGCCAAATGGAGATGGTTTCAAACGTTCAAATGACAGAAAG 16243669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3234 AGACATAGGAGTTACCATCAGCCAAATGGAGATGGTTTCAAACGTTCAAATGACAGAAAG 3293

 16243670 TAAATTGTTAATAGTTCAGCATTCCATTTTAACAAAGAAGAACAATCGGAACTCAAGTGA 16243729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3294 TAAATTGTTAATAGTTCAGCATTCCATTTTAACAAAGAAGAACAATCGGAACTCAAGTGA 3353

 16243730 GATCAAGACAGATTAATGTTTCCCAGTTTCATGAGACAGATTGTCTCTTGACTCACATCT 16243789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3354 GATCAAGACAGATTAATGTTTCCCAGTTTCATGAGACAGATTGTCTCTTGACTCACATCT 3413

 16243790 CATAAGAAAAGAAGACACACATAAATTCAGCACTAGGACAAGAACTAGGACACAAAAATG 16243849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3414 CATAAGAAAAGAAGACACACATAAATTCAGCACTAGGACAAGAACTAGGACACAAAAATG 3473

 16243850 CACAAGCTGGCCAGGCACGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGG 16243909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3474 CACAAGCTGGCCAGGCACGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGG 3533

 16243910 CAGACGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCA 16243969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3534 CAGACGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCA 3593

 16243970 TCTCTACTAAAAATACAAAAATTAACTGGGTGTGGTAGCGTGCGCCTGTAATCCCAGCTA 16244029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3594 TCTCTACTAAAAATACAAAAATTAACTGGGTGTGGTAGCGTGCGCCTGTAATCCCAGCTA 3653

 16244030 CTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTAAAGTGAGCCA 16244089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3654 CTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTAAAGTGAGCCA 3713

 16244090 AGATCGTGCTACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCCATCCCGAAAAGAAAA 16244149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3714 AGATCGTGCTACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCCATCCCGAAAAGAAAA 3773

 16244150 GAAAATGCACAAGCCCTCCAAAGCTGCCATTTTTGATTCTGTTTCATGCAAAGGGCCATC 16244209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3774 GAAAATGCACAAGCCCTCCAAAGCTGCCATTTTTGATTCTGTTTCATGCAAAGGGCCATC 3833

 16244210 TTGAAATCAGAGCGATGTCTATCATTGGAGTCAGACTCTGAAGTTGATCTTGCCCATTTC 16244269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3834 TTGAAATCAGAGCGATGTCTATCATTGGAGTCAGACTCTGAAGTTGATCTTGCCCATTTC 3893

 16244270 CCATCTGATTCCCATTCTGGTATCACAGACAGGTGGCTCTCAGAGGGACCATGAAGATCA 16244329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3894 CCATCTGATTCCCATTCTGGTATCACAGACAGGTGGCTCTCAGAGGGACCATGAAGATCA 3953

 16244330 TCTTGTCTTACCTCATGATTTCGCTATCGAGAACCCTGAGTTCCAGGAAAGTAAAAAAGA 16244389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3954 TCTTGTCTTACCTCATGATTTCGCTATCGAGAACCCTGAGTTCCAGGAAAGTAAAAAAGA 4013

 16244390 CCCCTCAGGGTCACACAGCCATTTGACAACTGGGCTGTTTTCTATGCTGCTTTTATGCAG 16244449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4014 CCCCTCAGGGTCACACAGCCATTTGACAACTGGGCTGTTTTCTATGCTGCTTTTATGCAG 4073

 16244450 ACATTTAGAAATGCAGTAATTAACATCATTAAACTTTATGTATGTGTAACCCTCGCAGAC 16244509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4074 ACATTTAGAAATGCAGTAATTAACATCATTAAACTTTATGTATGTGTAACCCTCGCAGAC 4133

 16244510 TTCTTTCATATGCCTTCTTTAATGACCCCCATGAGAGGCCTCAGGCAGGTATTTTAGCTT 16244569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4134 TTCTTTCATATGCCTTCTTTAATGACCCCCATGAGAGGCCTCAGGCAGGTATTTTAGCTT 4193

 16244570 CTGTTTTATAGGGGGAGAAATTGAGGCTCAGAGAGGTGACATGATATGTAAGGGCAGATA 16244629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4194 CTGTTTTATAGGGGGAGAAATTGAGGCTCAGAGAGGTGACATGATATGTAAGGGCAGATA 4253

 16244630 ATTCGTAGCTGAGTCAGATTTTCTGACTCTGGGTCCAGTGCTGTTTTTATTGTGTACATT 16244689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4254 ATTCGTAGCTGAGTCAGATTTTCTGACTCTGGGTCCAGTGCTGTTTTTATTGTGTACATT 4313

 16244690 TTCTTTTTAAGAGTTGGAGAAGCTGGTCAGGGAGGAACATTAGTCATCCCTAACCCCACA 16244749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4314 TTCTTTTTAAGAGTTGGAGAAGCTGGTCAGGGAGGAACATTAGTCATCCCTAACCCCACA 4373

 16244750 ACTGGTTATGAGACATGTGTTACCTGCTGCTGTGAGTCCCTCGTATCTGCTTCTCACATC 16244809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4374 ACTGGTTATGAGACATGTGTTACCTGCTGCTGTGAGTCCCTCGTATCTGCTTCTCACATC 4433

 16244810 GGGGCCCCATTTCCCAGAGCTAGGTGAAGGTAGAAAGACGTGGCACTACCTCAGTGTCCT 16244869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4434 GGGGCCCCATTTCCCAGAGCTAGGTGAAGGTAGAAAGACGTGGCACTACCTCAGTGTCCT 4493

 16244870 AGGCTAGAAAGAAAATGAGGCTCCCTGGGAAGCCCTTTGTGATTAAGAGACATTCTAGTT 16244929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4494 AGGCTAGAAAGAAAATGAGGCTCCCTGGGAAGCCCTTTGTGATTAAGAGACATTCTAGTT 4553

 16244930 TCCTGTGCCCTTCCCCTCTCCTCTTTTCCTCTCCTGTCTGTCTCTGCCTCTCTACCTCTC 16244989
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     4554 TCCTGTGCCCTTCCCCTCTCCTCTTTTCCCCTCCTGTCTGTCTCTGCCTCTCTACCTCTC 4613

 16244990 TCACGGTCTTTGTCTCTCTCTGTCTCTTGGTCACTCATTCTCTCTCTCTCTCTCT 16245044
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4614 TCACGGTCTTTGTCTCTCTCTGTCTCTTGGTCACTCATTCTCTCTCTCTCTCTCT 4668

EXCISED REGION

 16245057 CACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAGTGGGCCTCTGATCCTGGTG 16245116
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||
     4669 CACACACACACACACACACACACACACACACACACACAC--TGGGCCTCTGATCCTGGTG 4726

 16245117 TGTTACTGGCTTGCCTTCCTCTTTGGGTTCCATCTCTTCTGCGTGATGTGACCACATTTT 16245176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4727 TGTTACTGGCTTGCCTTCCTCTTTGGGTTCCATCTCTTCTGCGTGATGTGACCACATTTT 4786

 16245177 CATCATCTCTACACCTCATTCATGGCTTCTTGTCCACTGTGTTTTCTCTGGGCCCTAGTG 16245236
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     4787 CATCATCTCTACACCTCATTCATGGCTTCTTGTCCACTGTGTTTTCTCTGGGCCCCAGTG 4846

 16245237 TCCAGCTTTTAGGCACTGGCAGGTGAGGATCTGGAAGAAAAGCCACCTTTCTGGTATCTG 16245296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4847 TCCAGCTTTTAGGCACTGGCAGGTGAGGATCTGGAAGAAAAGCCACCTTTCTGGTATCTG 4906

 16245297 AGTCCCACTCTCTCCACTCCACCTGGCAACGCTCTATGAGCTGTGGCAGGGAGAGCAGCC 16245356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4907 AGTCCCACTCTCTCCACTCCACCTGGCAACGCTCTATGAGCTGTGGCAGGGAGAGCAGCC 4966

 16245357 TCATTCAGTGTGTGCTTTACTCCCCCAGGGACGTCGCCCACGTGCCTCATACAAAGCCAA 16245416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4967 TCATTCAGTGTGTGCTTTACTCCCCCAGGGACGTCGCCCACGTGCCTCATACAAAGCCAA 5026

 16245417 GCTGTGGAAGGCATTTGGTGCAGCTCCTCACATGGAGAGGAGAGGGGGCCCAGCTGTCTC 16245476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5027 GCTGTGGAAGGCATTTGGTGCAGCTCCTCACATGGAGAGGAGAGGGGGCCCAGCTGTCTC 5086

 16245477 CAAGGCTTGTGTCAGGAGACATTCTGTCACCAGATGAGGACACAGTGCCCAAAAGACAGA 16245536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5087 CAAGGCTTGTGTCAGGAGACATTCTGTCACCAGATGAGGACACAGTGCCCAAAAGACAGA 5146

 16245537 AAAGGGTCTTTAAGAGCTCTTATAAAAAAAAAAAAGTGGGGTGGGAGTGGTGAGTGAACA 16245596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5147 AAAGGGTCTTTAAGAGCTCTTATAAAAAAAAAAAAGTGGGGTGGGAGTGGTGAGTGAACA 5206

 16245597 GTGCAGTAAGCCACAAATCAGCTCTTTCAAAGAGCCGTAGCCTCCTCCACACCCTGGCCA 16245656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5207 GTGCAGTAAGCCACAAATCAGCTCTTTCAAAGAGCCGTAGCCTCCTCCACACCCTGGCCA 5266

 16245657 AGGAATTCAGAGCCTGCTGACCAGCCTTTGTTCCCTGTCCCTGCCTAGCAGGTTCCCACT 16245716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5267 AGGAATTCAGAGCCTGCTGACCAGCCTTTGTTCCCTGTCCCTGCCTAGCAGGTTCCCACT 5326

 16245717 AGCCATGTGGCAACTTTATTTGAATTGGTAGAAATCCCTTCCTCATGACCATTCCTCCTG 16245776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5327 AGCCATGTGGCAACTTTATTTGAATTGGTAGAAATCCCTTCCTCATGACCATTCCTCCTG 5386

 16245777 ACTCCCATTCCTCAGAAAATTGGTCATAATATACTGATTTTATTAGAATAAGACATCTTA 16245836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5387 ACTCCCATTCCTCAGAAAATTGGTCATAATATACTGATTTTATTAGAATAAGACATCTTA 5446

 16245837 ATGCCAACTGTCAGCAAGTTGTTGAAATAAAAATGCAAATTTACAGTAATGATAATATTA 16245896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5447 ATGCCAACTGTCAGCAAGTTGTTGAAATAAAAATGCAAATTTACAGTAATGATAATATTA 5506

 16245897 GAGATGTTCTCTTGGGTTGCACAGTGCGCAACTCCTGTAACTGTTCATAGCAACCCTACA 16245956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5507 GAGATGTTCTCTTGGGTTGCACAGTGCGCAACTCCTGTAACTGTTCATAGCAACCCTACA 5566

 16245957 TAGAGTCTCCCTATGGGCAACTGATTTTAGGGCAGCCCTGGGAGATGCTGATTGATGGCC 16246016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5567 TAGAGTCTCCCTATGGGCAACTGATTTTAGGGCAGCCCTGGGAGATGCTGATTGATGGCC 5626

 16246017 AGTTTCTACACAAAGTAACAATGATGGGAATCAAGACTAGCTGTTGTATCCAGCTCTCAG 16246076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5627 AGTTTCTACACAAAGTAACAATGATGGGAATCAAGACTAGCTGTTGTATCCAGCTCTCAG 5686

 16246077 CTGACTTGTGTTGACTGCCAGCTCTCATACCCAAGCCAAGCAGTGGAAGCCATACCCCTG 16246136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5687 CTGACTTGTGTTGACTGCCAGCTCTCATACCCAAGCCAAGCAGTGGAAGCCATACCCCTG 5746

 16246137 GAAGGATGAAGGTTTCTAAGGGGAAAGGGACAGTCTTGAAAGGGGCTGAAAGATGATATC 16246196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5747 GAAGGATGAAGGTTTCTAAGGGGAAAGGGACAGTCTTGAAAGGGGCTGAAAGATGATATC 5806

 16246197 ATCTCAAGAAGCTGAACAAGTTATCTCTTACTTGAAAATGGGTCTGGTCCCTATCTGCGA 16246256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5807 ATCTCAAGAAGCTGAACAAGTTATCTCTTACTTGAAAATGGGTCTGGTCCCTATCTGCGA 5866

 16246257 GACATCCGGTCCTTCAGGATCAGCCAGGGGTGCTATGGGGAGAAGCAATGTGGGGCAGGG 16246316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5867 GACATCCGGTCCTTCAGGATCAGCCAGGGGTGCTATGGGGAGAAGCAATGTGGGGCAGGG 5926

 16246317 AGAAGAACACCTCCCACTCTGCCCTTTGAAGGGTTAAATGATGGAAAGCAGTGTAAGAAC 16246376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5927 AGAAGAACACCTCCCACTCTGCCCTTTGAAGGGTTAAATGATGGAAAGCAGTGTAAGAAC 5986

 16246377 CCCTTGTGCTTGTGCATGTGAGTCAGTGTGTGTGTGTAAGCATGTGAGAGTCTGAGTGTG 16246436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5987 CCCTTGTGCTTGTGCATGTGAGTCAGTGTGTGTGTGTAAGCATGTGAGAGTCTGAGTGTG 6046

 16246437 GGGGGGAGCGAGCATGTGCGTGCGTGTGTGTGTGCGCGCGCATGTGCGCGTCAAGGAGCA 16246496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     6047 GGGGGGAGCGAGCATGTGCGTGCGTGTGTGTGCGCGCGCGCATGTGCGCGTCAAGGAGCA 6106

 16246497 GCAGGAGGTCAGGATGCCTCCTGCCCCCCCAGAGGGAGCAGCCTTCTTTGGCTCAGGTGC 16246556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6107 GCAGGAGGTCAGGATGCCTCCTGCCCCCCCAGAGGGAGCAGCCTTCTTTGGCTCAGGTGC 6166

 16246557 CCCAAGGAAACTCTCCAGCAACCATCGTACTTCATACCCTTCAGCATGACACGTCCTCGT 16246616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6167 CCCAAGGAAACTCTCCAGCAACCATCGTACTTCATACCCTTCAGCATGACACGTCCTCGT 6226

 16246617 ATCTGCCCCTGGAAAAGCCGATGCCAGTCCTGCGGTCACAACTGAGCAGCAAGAGCACTG 16246676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6227 ATCTGCCCCTGGAAAAGCCGATGCCAGTCCTGCGGTCACAACTGAGCAGCAAGAGCACTG 6286

 16246677 GGAAGGGAGAATTCAGAGCCTTCTGCTTCTAGTATAAGAGACTTTCCACAAACACCAAGA 16246736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6287 GGAAGGGAGAATTCAGAGCCTTCTGCTTCTAGTATAAGAGACTTTCCACAAACACCAAGA 6346

 16246737 ATACGCATGAACTTTCAAAATGGCTTGTGTATCATGGACCTTGAGGAACATCCAGGCTCA 16246796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6347 ATACGCATGAACTTTCAAAATGGCTTGTGTATCATGGACCTTGAGGAACATCCAGGCTCA 6406

 16246797 CGAGAATTAACAAGGAATGAGATAAACGAGGGCTTATTCTTTATTGTGGTAAAAGGTTAT 16246856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6407 CGAGAATTAACAAGGAATGAGATAAACGAGGGCTTATTCTTTATTGTGGTAAAAGGTTAT 6466

 16246857 GGGAAGCTTGAAACTACAGTTAGCTCTTGAATATCTGGACAGTAATGTATTCGTTGATCT 16246916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6467 GGGAAGCTTGAAACTACAGTTAGCTCTTGAATATCTGGACAGTAATGTATTCGTTGATCT 6526

 16246917 CACGTATTTCAGTGAACCAGTCTTTGTTGGCAGCTTGACTCCTTCTGTTTGCCTTTTGAA 16246976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6527 CACGTATTTCAGTGAACCAGTCTTTGTTGGCAGCTTGACTCCTTCTGTTTGCCTTTTGAA 6586

 16246977 ACATAAGCACTTGATCTCCTGGAACTTAGGCTCAACATAGGATCAACCTTGTACCTGCCT 16247036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6587 ACATAAGCACTTGATCTCCTGGAACTTAGGCTCAACATAGGATCAACCTTGTACCTGCCT 6646

 16247037 GAGGGTTAAAACTCAATTCACAGGTGAGGGACTGACGAAGTAAGCAGACACTTCCAGCTC 16247096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6647 GAGGGTTAAAACTCAATTCACAGGTGAGGGACTGACGAAGTAAGCAGACACTTCCAGCTC 6706

 16247097 CTTCCAAGTCAAACGAGGTCAGCTCGCTATTTTGCTTGACGTGAATTCCAAGAACACCAG 16247156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6707 CTTCCAAGTCAAACGAGGTCAGCTCGCTATTTTGCTTGACGTGAATTCCAAGAACACCAG 6766

 16247157 ACACATCGGTAGGTACAAAACCACAAAGCTAAATAGAAGACTGTGGGTTTTTTATTTGAA 16247216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6767 ACACATCGGTAGGTACAAAACCACAAAGCTAAATAGAAGACTGTGGGTTTTTTATTTGAA 6826

 16247217 TTAATCACCGTTTTTGAGTCAGTAGACTACAGTTAGTAATTTAGTCCTGCTAGGCAGCCA 16247276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6827 TTAATCACCGTTTTTGAGTCAGTAGACTACAGTTAGTAATTTAGTCCTGCTAGGCAGCCA 6886

 16247277 CTGTGGTCCATGGGAATAAAGACCAAAATAGAAAACACTCCTCACTTCATTCACTGACAT 16247336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6887 CTGTGGTCCATGGGAATAAAGACCAAAATAGAAAACACTCCTCACTTCATTCACTGACAT 6946

 16247337 TTTATTCTTTATCTCTATCCAAAATGTACTCAGGGAAGCTCATGATTAATCACTCTTGTA 16247396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6947 TTTATTCTTTATCTCTATCCAAAATGTACTCAGGGAAGCTCATGATTAATCACTCTTGTA 7006

 16247397 TACAGTTAAAATAGAGGAAAAAGAAGATTTCAGAAAGGAAAAGAGGGTATTGGGAATCAG 16247456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7007 TACAGTTAAAATAGAGGAAAAAGAAGATTTCAGAAAGGAAAAGAGGGTATTGGGAATCAG 7066

 16247457 GGGTAATACAGTTATTAGAAGTGAGTTTTACATGTGACTCTGAGCTTCCAGAAAGACAAA 16247516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7067 GGGTAATACAGTTATTAGAAGTGAGTTTTACATGTGACTCTGAGCTTCCAGAAAGACAAA 7126

 16247517 ACAAAAAGAGAAACATAATGAATTTTAGAATTCTCATTTTCTAATAAAAAGCAACGTACT 16247576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7127 ACAAAAAGAGAAACATAATGAATTTTAGAATTCTCATTTTCTAATAAAAAGCAACGTACT 7186

 16247577 CCTTTGTTAAGAAGTACACAGCACAGGCTGGGTGCAGTGGCTCATACCTGTAATCTCAGC 16247636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7187 CCTTTGTTAAGAAGTACACAGCACAGGCTGGGTGCAGTGGCTCATACCTGTAATCTCAGC 7246

 16247637 ACTTTGGGAGGCCAAGGCTGGCAGATCACTTTGAGCTCAGGAGTTCGAGACTAGCCTCAA 16247696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7247 ACTTTGGGAGGCCAAGGCTGGCAGATCACTTTGAGCTCAGGAGTTCGAGACTAGCCTCAA 7306

 16247697 CAACATGGCGAAATCCCATTTCTACACGCACACACACCCCCACACTAGCCGGGCATGGTG 16247756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7307 CAACATGGCGAAATCCCATTTCTACACGCACACACACCCCCACACTAGCCGGGCATGGTG 7366

 16247757 GCTCATGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGGAGCTGAGGCTGAAGAATCCTTGGGCCTGGG 16247816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7367 GCTCATGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGGAGCTGAGGCTGAAGAATCCTTGGGCCTGGG 7426

 16247817 AAGTGGAGGTTGCAGTGAGCGCAGATTGTGCCACTGCACTCCAGTCTGGGCGACAGAGTG 16247876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7427 AAGTGGAGGTTGCAGTGAGCGCAGATTGTGCCACTGCACTCCAGTCTGGGCGACAGAGTG 7486

 16247877 AGACCATTTAAAAAAAAAAAAAGGCCGGGCGCGATGGTTCACGCCTGTAATCCCCAGCAC 16247936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7487 AGACCATTTAAAAAAAAAAAAAGGCCGGGCGCGATGGTTCACGCCTGTAATCCCCAGCAC 7546

 16247937 TTTGGGAGGCTGAGGTTGGGGGATCACTAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACA 16247996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7547 TTTGGGAGGCTGAGGTTGGGGGATCACTAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACA 7606

 16247997 CGGTGAAAACCCGTGTATACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTTGTGGCGGGCACCT 16248056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7607 CGGTGAAAACCCGTGTATACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTTGTGGCGGGCACCT 7666

 16248057 GTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCTGGGAGGCGGAGC 16248116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7667 GTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCTGGGAGGCGGAGC 7726

 16248117 TTGCAG 16248122
          ||||||
     7727 TTGCAG 7732

Alignment time is 9.6158 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [16229408,16251209] =>     21802 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    2618] =>      2618 nucs 'mol-32-33ab-008732_2618'

Score:        2559
Aligned:      2624        nucs
Identic:      2614 (100%) nucs =>      1110 (100%)      1504 ( 99%)
Gaps:            6 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [16238297,16239408] EXCISED REGION [16241210,16242721]
 second seq =>  [       1,    1112] EXCISED REGION [    1113,    2618]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1801 nucs [16239409,16241209]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [16239409,16239409] to [16241210,16241210]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [16239409,16239410] to [16241208,16241209]
 second seq =>         0 nucs

 16238297 CTGGCACAACTAAATGACCTAGGGACACCCCTCCTGGCCTTCTGGGAAGATCAGAACGCT 16238356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTGGCACAACTAAATGACCTAGGGACACCCCTCCTGGCCTTCTGGGAAGATCAGAACGCT 60

 16238357 CTGAGGGAAGCCGAGCATTCACGTTTTTCTAAGGGGAATAATGGAGAAGGGCTAGGGTAG 16238416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTGAGGGAAGCCGAGCATTCACGTTTTTCTAAGGGGAATAATGGAGAAGGGCTAGGGTAG 120

 16238417 CCAGGTGCCTCTGTTAGTTCTTTCTACGGTCCTCACTCCAGGGATGGGCCTAGCCTGGCC 16238476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCAGGTGCCTCTGTTAGTTCTTTCTACGGTCCTCACTCCAGGGATGGGCCTAGCCTGGCC 180

 16238477 ATAGCAGTGAGTCAGATTAGCCAGAGGCTCTGGGAACACCTGGGGTTCCTGGGTGCAGCT 16238536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATAGCAGTGAGTCAGATTAGCCAGAGGCTCTGGGAACACCTGGGGTTCCTGGGTGCAGCT 240

 16238537 GGCTGCATATTAGGCAGGACTAATGAACAGGTGCAGGACAGGGCTGGGTTGGCGGGTAAA 16238596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGCTGCATATTAGGCAGGACTAATGAACAGGTGCAGGACAGGGCTGGGTTGGCGGGTAAA 300

 16238597 GTGCCCAGAGACTCTCCAAACCCTCAAGTGGGGCGGGGTCCGCCCAAGAGCACACCTGTG 16238656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTGCCCAGAGACTCTCCAAACCCTCAAGTGGGGCGGGGTCCGCCCAAGAGCACACCTGTG 360

 16238657 GTGAGGCCCCCACCATCTGATGAGCTGTGTTACGTCTGTGCCCCTCGGGAGTACGGAAAG 16238716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTGAGGCCCCCACCATCTGATGAGCTGTGTTACGTCTGTGCCCCTCGGGAGTACGGAAAG 420

 16238717 TGGAGGAGCTGGGCCCCAGAGAAATGGGCTACCCCAGAGCTGGCAGCCCCACCAGAGGGG 16238776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGGAGGAGCTGGGCCCCAGAGAAATGGGCTACCCCAGAGCTGGCAGCCCCACCAGAGGGG 480

 16238777 ATCTGGATCCCCTGCCAAGCAATTAAGCTGCCCCCTCCTGGCCAACTCCCCTTCTGCCCC 16238836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATCTGGATCCCCTGCCAAGCAATTAAGCTGCCCCCTCCTGGCCAACTCCCCTTCTGCCCC 540

 16238837 TCACCACTGGGTTGGCTCTCCATCCAGTGGCCCCATATTTCCTGTTGACATTGGGGTGCA 16238896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCACCACTGGGTTGGCTCTCCATCCAGTGGCCCCATATTTCCTGTTGACATTGGGGTGCA 600

 16238897 AGGCCTTTTCCACAACCAAGGGCAGCACTGGTTCTATTTCTGCAGGTCCCTCTCCTCTGT 16238956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGGCCTTTTCCACAACCAAGGGCAGCACTGGTTCTATTTCTGCAGGTCCCTCTCCTCTGT 660

 16238957 GTGCTTGCCAAGACCCAGATCCCAGACAAGCACCACCCTGCACACTGTTTTTATTTAATC 16239016
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
      661 GTGCTTGCCAAGACCCAGATCCCAGACAAGCACCACCTTGCACACTGTTTTTATTTAATC 720

 16239017 CTCTTGGCCACCCAGAGAGGCAGGGCTTATCAACCCTACTCTACCTGTGAGGAAAACTGA 16239076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTCTTGGCCACCCAGAGAGGCAGGGCTTATCAACCCTACTCTACCTGTGAGGAAAACTGA 780

 16239077 GACAGAAAAAGATGCTGCGGGTTGCCCTGAGCCACCTTGATGGGCTTCCAAGCCGATGGT 16239136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
      781 GACAGAAAAAGATGCTGCGGGTTGCCCTGAGCCATCTTGATGGGCTTCCAAGCCGATGGT 840

 16239137 CATGACAGCATAGTGTAGTGTGATAGAATCAGCTAGATGGGTTTCAGGGTATTCGTCTGG 16239196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CATGACAGCATAGTGTAGTGTGATAGAATCAGCTAGATGGGTTTCAGGGTATTCGTCTGG 900

 16239197 GGTGGTGATGCCCACACCAAATCATTAAATCAGAAAATGCTTGCGATGACCAGCCCATGA 16239256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GGTGGTGATGCCCACACCAAATCATTAAATCAGAAAATGCTTGCGATGACCAGCCCATGA 960

 16239257 TGACCCTTTACAAGTGGAAGTCAGTATTACTGCTGTTTTCTGGAGGGAAGGAGTTGAGGA 16239316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGACCCTTTACAAGTGGAAGTCAGTATTACTGCTGTTTTCTGGAGGGAAGGAGTTGAGGA 1020

 16239317 TCATACCAGCTTTTTCCGAGCACTATACCACTCAGACATGGGTGCTCTTACCCACTTCAA 16239376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TCATACCAGCTTTTTCCGAGCACTATACCACTCAGACATGGGTGCTCTTACCCACTTCAA 1080

 16239377 AACCCTCTGAGAATGCCAAACAACCATCGCAG 16239408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AACCCTCTGAGAATGCCAAACAACCATCGCAG 1112

EXCISED REGION

 16241210 TGGAGCACAGGCTGCACTGCGGGGTCTGTCTTGCTTTTTACCCTGCAATGGTCAGTCATT 16241269
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1113 TGGAGCACAGGCTGCACTGCGGGTTCTGTCTTGCTTTTTACCCTGCAATGGTCAGTCATT 1172

 16241270 GACCATGACTGGGGCTGGGGGCAGCATCCTGCATGACTGTCTGGCACCTGCAGCAGAGAC 16241329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1173 GACCATGACTGGGGCTGGGGGCAGCATCCTGCATGACTGTCTGGCACCTGCAGCAGAGAC 1232

 16241330 CGTTTTAATACCCCAAGGCAAGTCTCCAGGGAAGGGTTAAGATTTCAGTTAGCACCCACA 16241389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1233 CGTTTTAATACCCCAAGGCAAGTCTCCAGGGAAGGGTTAAGATTTCAGTTAGCACCCACA 1292

 16241390 GCAGCTGGGGACATGCAAACCAAACCAAAACAGTTAAGGGGAGCTCAGGGAATCTGAGTA 16241449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1293 GCAGCTGGGGACATGCAAACCAAACCAAAACAGTTAAGGGGAGCTCAGGGAATCTGAGTA 1352

 16241450 GGACACTATATTAGTCTGTTCTCACACTGCTATAAAGAACTGCCTGAGACTAGGTAATTT 16241509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1353 GGACACTATATTAGTCTGTTCTCACACTGCTATAAAGAACTGCCTGAGACTAGGTAATTT 1412

 16241510 ATAAAGAAAGGAGGTTTAATTGACTCACAGTTTCGCATGGCTGGGGAGGCCTCAGGAAAC 16241569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1413 ATAAAGAAAGGAGGTTTAATTGACTCACAGTTTCGCATGGCTGGGGAGGCCTCAGGAAAC 1472

 16241570 TTACAATCATGGTGGAAGGGGAAGCATGTCTTACATGGCAGCAAGTGAGAGAAAGAGAGA 16241629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1473 TTACAATCATGGTGGAAGGGGAAGCATGTCTTACATGGCAGCAAGTGAGAGAAAGAGAGA 1532

 16241630 GAGAGAGGAGGAAAAACTATCAAACACTTATATAATCATCAGATCTCATGAGAACTCACT 16241689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1533 GAGAGAGGAGGAAAAACTATCAAACACTTATATAATCATCAGATCTCATGAGAACTCACT 1592

 16241690 ATCACGAGAACAGCATGGGGGAAACTGCCCACATGATCCAATCACCTCCCACCAGGTCCC 16241749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1593 ATCACGAGAACAGCATGGGGGAAACTGCCCACATGATCCAATCACCTCCCACCAGGTCCC 1652

 16241750 TCCCTCGCCACATAGGGATTATGGGGATTACCACTCAAGATGAGATCTGGGTGGGGACAA 16241809
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     1653 TCCCTCGCCACATAGGGATTATGGGGATTACAACTCAAGATGAGATCTGGGTGGGGACAA 1712

 16241810 AGAGCCAAACCATATCAGACACCAACAGTATCTGCTACATTCTTGCTGCTGCATTTGGAG 16241869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1713 AGAGCCAAACCATATCAGACACCAACAGTATCTGCTACATTCTTGCTGCTGCATTTGGAG 1772

 16241870 AATGTTAGCAAGTTCTCCCCTTTCCTGGTTTTCTGACACCATCCCTCTAATTTTTACTGG 16241929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1773 AATGTTAGCAAGTTCTCCCCTTTCCTGGTTTTCTGACACCATCCCTCTAATTTTTACTGG 1832

 16241930 AGAGAATCATGGCCCACCCCAACCTAACCAAGCATCTTACATCTCAGCAACAACCACACT 16241989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1833 AGAGAATCATGGCCCACCCCAACCTAACCAAGCATCTTACATCTCAGCAACAACCACACT 1892

 16241990 GTAGTAATGTTTTCGGTTCTTAGGACCCAGGTGCTCACCACAGCTTCCAAAAGAGAGTTG 16242049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1893 GTAGTAATGTTTTCGGTTCTTAGGACCCAGGTGCTCACCACAGCTTCCAAAAGAGAGTTG 1952

 16242050 CTGACGATTGTCTTAGTCACAATCTCATCGGTTGTGGCATTTGTCATTCCACTGACCACA 16242109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1953 CTGACGATTGTCTTAGTCACAATCTCATCGGTTGTGGCATTTGTCATTCCACTGACCACA 2012

 16242110 ACCCTGTTGATTCCAGGACAACTCAAGTCTGCTCTCAGCGAATATGTGGCCAGGCTGGAG 16242169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2013 ACCCTGTTGATTCCAGGACAACTCAAGTCTGCTCTCAGCGAATATGTGGCCAGGCTGGAG 2072

 16242170 GGGGTGAAGTTACTCAGGAGCAACAAGAGGCTGGGTGCCATCAGGGCCCGGATGCTGGGG 16242229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2073 GGGGTGAAGTTACTCAGGAGCAACAAGAGGCTGGGTGCCATCAGGGCCCGGATGCTGGGG 2132

 16242230 GCCACCAGAGCCACCGGGGATGTGCTCGTCTTCATGGATGCCCACTGCGAGTGCCACCCA 16242289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2133 GCCACCAGAGCCACCGGGGATGTGCTCGTCTTCATGGATGCCCACTGCGAGTGCCACCCA 2192

 16242290 GGCTGGCTGGAGCCCCTCCTCAGCAGAATAGCTGGTGACAGGTAACTTATTCCCTGGGCT 16242349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2193 GGCTGGCTGGAGCCCCTCCTCAGCAGAATAGCTGGTGACAGGTAACTTATTCCCTGGGCT 2252

 16242350 TGCAAAGCAAGACATGGAACTGGGAGAAACAGTCTACAGCATCAGCCACTCACAGAGCAA 16242409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2253 TGCAAAGCAAGACATGGAACTGGGAGAAACAGTCTACAGCATCAGCCACTCACAGAGCAA 2312

 16242410 CCCACCTATTAATTCCTGAATCTCCATTAGAGAGTGATATATTCCCTTCGGGTTTTCAGA 16242469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2313 CCCACCTATTAATTCCTGAATCTCCATTAGAGAGTGATATATTCCCTTCGGGTTTTCAGA 2372

 16242470 TGTGTAAGTTTTTTAAGACTATAGAGTTAGAGTTGGAAAGGAGGTTAGAGGTCTTCATCT 16242529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2373 TGTGTAAGTTTTTTAAGACTATAGAGTTAGAGTTGGAAAGGAGGTTAGAGGTCTTCATCT 2432

 16242530 ACCTTGCTTTATAGATAAAGAAACCGAGGCCTGGAGAACAGCTTCTATGAGGTTGCAAAT 16242589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2433 ACCTTGCTTTATAGATAAAGAAACCGAGGCCTGGAGAACAGCTTCTATGAGGTTGCAAAT 2492

 16242590 ACTTAAAATTGTATTAAATTGCATGACGAGGGTAACACCTTACCATAGCTATCATTGCCT 16242649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2493 ACTTAAAATTGTATTAAATTGCATGACGAGGGTAACACCTTACCATAGCTATCATTGCCT 2552

 16242650 TTGGTGAAAATTTGGCAATTTTTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTGTG 16242709
          ||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||
     2553 TTGGTGAAAATTTGGCAATTTT------TTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTGTG 2606

 16242710 ATGGCGTCTCGC 16242721
          ||||||||||||
     2607 ATGGCGTCTCGC 2618

Alignment time is 3.62337 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [16229408,16251209] =>     21802 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    7117] =>      7117 nucs 'mol-32-33b6-061625_7117'

Score:        7015
Aligned:      7126        nucs
Identic:      7111 (100%) nucs =>       330 (100%)      6781 (100%)
Gaps:            9 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [16239078,16239408] EXCISED REGION [16241210,16248004]
 second seq =>  [       1,     331] EXCISED REGION [     332,    7117]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1801 nucs [16239409,16241209]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [16239409,16239409] to [16241210,16241210]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [16239409,16239410] to [16241208,16241209]
 second seq =>         0 nucs

 16239078 ACAGAAAAAGATGCTGCGGGTTGCCCTGAGCCACCTTGATGGGCTTCCAAGCCGATGGTC 16239137
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
        1 ACAGAAAAAGATGCTGCGGGTTGCCCTGAGCCATCTTGATGGGCTTCCAAGCCGATGGTC 60

 16239138 ATGACAGCATAGTGTAGTGTGATAGAATCAGCTAGATGGGTTTCAGGGTATTCGTCTGGG 16239197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATGACAGCATAGTGTAGTGTGATAGAATCAGCTAGATGGGTTTCAGGGTATTCGTCTGGG 120

 16239198 GTGGTGATGCCCACACCAAATCATTAAATCAGAAAATGCTTGCGATGACCAGCCCATGAT 16239257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTGGTGATGCCCACACCAAATCATTAAATCAGAAAATGCTTGCGATGACCAGCCCATGAT 180

 16239258 GACCCTTTACAAGTGGAAGTCAGTATTACTGCTGTTTTCTGGAGGGAAGGAGTTGAGGAT 16239317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GACCCTTTACAAGTGGAAGTCAGTATTACTGCTGTTTTCTGGAGGGAAGGAGTTGAGGAT 240

 16239318 CATACCAGCTTTTTCCGAGCACTATACCACTCAGACATGGGTGCTCTTACCCACTTCAAA 16239377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CATACCAGCTTTTTCCGAGCACTATACCACTCAGACATGGGTGCTCTTACCCACTTCAAA 300

 16239378 ACCCTCTGAGAATGCCAAACAACCATCGCAG 16239408
          |||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACCCTCTGAGAATGCCAAACAACCATCGCAG 331

EXCISED REGION

 16241210 TGGAGCACAGGCTGCACTGCGGGGTCTGTCTTGCTTTTTACCCTGCAATGGTCAGTCATT 16241269
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      332 TGGAGCACAGGCTGCACTGCGGGTTCTGTCTTGCTTTTTACCCTGCAATGGTCAGTCATT 391

 16241270 GACCATGACTGGGGCTGGGGGCAGCATCCTGCATGACTGTCTGGCACCTGCAGCAGAGAC 16241329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      392 GACCATGACTGGGGCTGGGGGCAGCATCCTGCATGACTGTCTGGCACCTGCAGCAGAGAC 451

 16241330 CGTTTTAATACCCCAAGGCAAGTCTCCAGGGAAGGGTTAAGATTTCAGTTAGCACCCACA 16241389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      452 CGTTTTAATACCCCAAGGCAAGTCTCCAGGGAAGGGTTAAGATTTCAGTTAGCACCCACA 511

 16241390 GCAGCTGGGGACATGCAAACCAAACCAAAACAGTTAAGGGGAGCTCAGGGAATCTGAGTA 16241449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      512 GCAGCTGGGGACATGCAAACCAAACCAAAACAGTTAAGGGGAGCTCAGGGAATCTGAGTA 571

 16241450 GGACACTATATTAGTCTGTTCTCACACTGCTATAAAGAACTGCCTGAGACTAGGTAATTT 16241509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      572 GGACACTATATTAGTCTGTTCTCACACTGCTATAAAGAACTGCCTGAGACTAGGTAATTT 631

 16241510 ATAAAGAAAGGAGGTTTAATTGACTCACAGTTTCGCATGGCTGGGGAGGCCTCAGGAAAC 16241569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      632 ATAAAGAAAGGAGGTTTAATTGACTCACAGTTTCGCATGGCTGGGGAGGCCTCAGGAAAC 691

 16241570 TTACAATCATGGTGGAAGGGGAAGCATGTCTTACATGGCAGCAAGTGAGAGAAAGAGAGA 16241629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      692 TTACAATCATGGTGGAAGGGGAAGCATGTCTTACATGGCAGCAAGTGAGAGAAAGAGAGA 751

 16241630 GAGAGAGGAGGAAAAACTATCAAACACTTATATAATCATCAGATCTCATGAGAACTCACT 16241689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      752 GAGAGAGGAGGAAAAACTATCAAACACTTATATAATCATCAGATCTCATGAGAACTCACT 811

 16241690 ATCACGAGAACAGCATGGGGGAAACTGCCCACATGATCCAATCACCTCCCACCAGGTCCC 16241749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      812 ATCACGAGAACAGCATGGGGGAAACTGCCCACATGATCCAATCACCTCCCACCAGGTCCC 871

 16241750 TCCCTCGCCACATAGGGATTATGGGGATTACCACTCAAGATGAGATCTGGGTGGGGACAA 16241809
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
      872 TCCCTCGCCACATAGGGATTATGGGGATTACAACTCAAGATGAGATCTGGGTGGGGACAA 931

 16241810 AGAGCCAAACCATATCAGACACCAACAGTATCTGCTACATTCTTGCTGCTGCATTTGGAG 16241869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      932 AGAGCCAAACCATATCAGACACCAACAGTATCTGCTACATTCTTGCTGCTGCATTTGGAG 991

 16241870 AATGTTAGCAAGTTCTCCCCTTTCCTGGTTTTCTGACACCATCCCTCTAATTTTTACTGG 16241929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      992 AATGTTAGCAAGTTCTCCCCTTTCCTGGTTTTCTGACACCATCCCTCTAATTTTTACTGG 1051

 16241930 AGAGAATCATGGCCCACCCCAACCTAACCAAGCATCTTACATCTCAGCAACAACCACACT 16241989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1052 AGAGAATCATGGCCCACCCCAACCTAACCAAGCATCTTACATCTCAGCAACAACCACACT 1111

 16241990 GTAGTAATGTTTTCGGTTCTTAGGACCCAGGTGCTCACCACAGCTTCCAAAAGAGAGTTG 16242049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1112 GTAGTAATGTTTTCGGTTCTTAGGACCCAGGTGCTCACCACAGCTTCCAAAAGAGAGTTG 1171

 16242050 CTGACGATTGTCTTAGTCACAATCTCATCGGTTGTGGCATTTGTCATTCCACTGACCACA 16242109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1172 CTGACGATTGTCTTAGTCACAATCTCATCGGTTGTGGCATTTGTCATTCCACTGACCACA 1231

 16242110 ACCCTGTTGATTCCAGGACAACTCAAGTCTGCTCTCAGCGAATATGTGGCCAGGCTGGAG 16242169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1232 ACCCTGTTGATTCCAGGACAACTCAAGTCTGCTCTCAGCGAATATGTGGCCAGGCTGGAG 1291

 16242170 GGGGTGAAGTTACTCAGGAGCAACAAGAGGCTGGGTGCCATCAGGGCCCGGATGCTGGGG 16242229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1292 GGGGTGAAGTTACTCAGGAGCAACAAGAGGCTGGGTGCCATCAGGGCCCGGATGCTGGGG 1351

 16242230 GCCACCAGAGCCACCGGGGATGTGCTCGTCTTCATGGATGCCCACTGCGAGTGCCACCCA 16242289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1352 GCCACCAGAGCCACCGGGGATGTGCTCGTCTTCATGGATGCCCACTGCGAGTGCCACCCA 1411

 16242290 GGCTGGCTGGAGCCCCTCCTCAGCAGAATAGCTGGTGACAGGTAACTTATTCCCTGGGCT 16242349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1412 GGCTGGCTGGAGCCCCTCCTCAGCAGAATAGCTGGTGACAGGTAACTTATTCCCTGGGCT 1471

 16242350 TGCAAAGCAAGACATGGAACTGGGAGAAACAGTCTACAGCATCAGCCACTCACAGAGCAA 16242409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1472 TGCAAAGCAAGACATGGAACTGGGAGAAACAGTCTACAGCATCAGCCACTCACAGAGCAA 1531

 16242410 CCCACCTATTAATTCCTGAATCTCCATTAGAGAGTGATATATTCCCTTCGGGTTTTCAGA 16242469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1532 CCCACCTATTAATTCCTGAATCTCCATTAGAGAGTGATATATTCCCTTCGGGTTTTCAGA 1591

 16242470 TGTGTAAGTTTTTTAAGACTATAGAGTTAGAGTTGGAAAGGAGGTTAGAGGTCTTCATCT 16242529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1592 TGTGTAAGTTTTTTAAGACTATAGAGTTAGAGTTGGAAAGGAGGTTAGAGGTCTTCATCT 1651

 16242530 ACCTTGCTTTATAGATAAAGAAACCGAGGCCTGGAGAACAGCTTCTATGAGGTTGCAAAT 16242589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1652 ACCTTGCTTTATAGATAAAGAAACCGAGGCCTGGAGAACAGCTTCTATGAGGTTGCAAAT 1711

 16242590 ACTTAAAATTGTATTAAATTGCATGACGAGGGTAACACCTTACCATAGCTATCATTGCCT 16242649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1712 ACTTAAAATTGTATTAAATTGCATGACGAGGGTAACACCTTACCATAGCTATCATTGCCT 1771

 16242650 TTGGTGAAAATTTGGCAATTTTTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTGTG 16242709
          ||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||
     1772 TTGGTGAAAATTTGGCAATTTT------TTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTGTG 1825

 16242710 ATGGCGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGCGGGGCGATCTCGGCTCACTGCAA 16242769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1826 ATGGCGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGCGGGGCGATCTCGGCTCACTGCAA 1885

 16242770 GCTGCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTAC 16242829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1886 GCTGCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTAC 1945

 16242830 AGGCGCCCGCCACCACACCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGAAGGGGTTTCACC 16242889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1946 AGGCGCCCGCCACCACACCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGAAGGGGTTTCACC 2005

 16242890 GTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACTTCGTGATCCGCCCTCCTCAGCCTCCCAA 16242949
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2006 GTGTTAGCCAGGATGGTCTCAATCTCCTGACTTCGTGATCCGCCCTCCTCAGCCTCCCAA 2065

 16242950 AGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCTGGCCGAAAATTCGTCAATTTTAATCA 16243009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2066 AGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCTGGCCGAAAATTCGTCAATTTTAATCA 2125

 16243010 AGCTTGTAACATAACCTGGGGAAAAAGTCTCTGAACTACACTAGGCCGTAGATTACTCAC 16243069
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2126 AGCTTGTAACATAAACTGGGGAAAAAGTCTCTGAACTACACTAGGCCGTAGATTACTCAC 2185

 16243070 CCATAAAAAGAAAACATTATGTTCTCTGATCACTAAACAGCATTCTTTGTTTCCCCAGTT 16243129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2186 CCATAAAAAGAAAACATTATGTTCTCTGATCACTAAACAGCATTCTTTGTTTCCCCAGTT 2245

 16243130 TATATAAGGGGTCCCTAATTTTCTACCTAAGGCCAGTCCTTGGAAATGTGAAGTTGGAGA 16243189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2246 TATATAAGGGGTCCCTAATTTTCTACCTAAGGCCAGTCCTTGGAAATGTGAAGTTGGAGA 2305

 16243190 GGACTGCATTACATTACCCTGTAGACAAGCATCTTAACATTTTTCTTGATCATTTCTCTG 16243249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2306 GGACTGCATTACATTACCCTGTAGACAAGCATCTTAACATTTTTCTTGATCATTTCTCTG 2365

 16243250 CTCTCCTTCCCCCATCTGACCGTCAATCTCTTTCTCACTTCCTTGCTCAAGACAAACAGT 16243309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2366 CTCTCCTTCCCCCATCTGACCGTCAATCTCTTTCTCACTTCCTTGCTCAAGACAAACAGT 2425

 16243310 TCCTAAACATGTCTAGTCAAACATTACCCTCAATCTGAATATCCTACCCAGGAAAACTGA 16243369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2426 TCCTAAACATGTCTAGTCAAACATTACCCTCAATCTGAATATCCTACCCAGGAAAACTGA 2485

 16243370 AACCTGGTGGCTGGCCCACCTTGGACCACCTCAGGCATACCACTTGGAGCTCATGTAGGC 16243429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2486 AACCTGGTGGCTGGCCCACCTTGGACCACCTCAGGCATACCACTTGGAGCTCATGTAGGC 2545

 16243430 ATGTAGCAGAGTAGAACCACAATCAATAATTGTTTGATGGTGCCCAGCAAGACAGGACCA 16243489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2546 ATGTAGCAGAGTAGAACCACAATCAATAATTGTTTGATGGTGCCCAGCAAGACAGGACCA 2605

 16243490 ATGCTAGAACCAAGCCTTATGACTTCTACCCATGATGAATGTTTATTATCTCACCTGAAG 16243549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2606 ATGCTAGAACCAAGCCTTATGACTTCTACCCATGATGAATGTTTATTATCTCACCTGAAG 2665

 16243550 TTAGGGATGATCAATCAAATATAAGAAAAAATTCCTGGACCAGATCGGAATGAATCCTGG 16243609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2666 TTAGGGATGATCAATCAAATATAAGAAAAAATTCCTGGACCAGATCGGAATGAATCCTGG 2725

 16243610 AGACATAGGAGTTACCATCAGCCAAATGGAGATGGTTTCAAACGTTCAAATGACAGAAAG 16243669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2726 AGACATAGGAGTTACCATCAGCCAAATGGAGATGGTTTCAAACGTTCAAATGACAGAAAG 2785

 16243670 TAAATTGTTAATAGTTCAGCATTCCATTTTAACAAAGAAGAACAATCGGAACTCAAGTGA 16243729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2786 TAAATTGTTAATAGTTCAGCATTCCATTTTAACAAAGAAGAACAATCGGAACTCAAGTGA 2845

 16243730 GATCAAGACAGATTAATGTTTCCCAGTTTCATGAGACAGATTGTCTCTTGACTCACATCT 16243789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2846 GATCAAGACAGATTAATGTTTCCCAGTTTCATGAGACAGATTGTCTCTTGACTCACATCT 2905

 16243790 CATAAGAAAAGAAGACACACATAAATTCAGCACTAGGACAAGAACTAGGACACAAAAATG 16243849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2906 CATAAGAAAAGAAGACACACATAAATTCAGCACTAGGACAAGAACTAGGACACAAAAATG 2965

 16243850 CACAAGCTGGCCAGGCACGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGG 16243909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2966 CACAAGCTGGCCAGGCACGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGG 3025

 16243910 CAGACGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCA 16243969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3026 CAGACGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCA 3085

 16243970 TCTCTACTAAAAATACAAAAATTAACTGGGTGTGGTAGCGTGCGCCTGTAATCCCAGCTA 16244029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3086 TCTCTACTAAAAATACAAAAATTAACTGGGTGTGGTAGCGTGCGCCTGTAATCCCAGCTA 3145

 16244030 CTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTAAAGTGAGCCA 16244089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3146 CTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTAAAGTGAGCCA 3205

 16244090 AGATCGTGCTACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCCATCCCGAAAAGAAAA 16244149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3206 AGATCGTGCTACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCCATCCCGAAAAGAAAA 3265

 16244150 GAAAATGCACAAGCCCTCCAAAGCTGCCATTTTTGATTCTGTTTCATGCAAAGGGCCATC 16244209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3266 GAAAATGCACAAGCCCTCCAAAGCTGCCATTTTTGATTCTGTTTCATGCAAAGGGCCATC 3325

 16244210 TTGAAATCAGAGCGATGTCTATCATTGGAGTCAGACTCTGAAGTTGATCTTGCCCATTTC 16244269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3326 TTGAAATCAGAGCGATGTCTATCATTGGAGTCAGACTCTGAAGTTGATCTTGCCCATTTC 3385

 16244270 CCATCTGATTCCCATTCTGGTATCACAGACAGGTGGCTCTCAGAGGGACCATGAAGATCA 16244329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3386 CCATCTGATTCCCATTCTGGTATCACAGACAGGTGGCTCTCAGAGGGACCATGAAGATCA 3445

 16244330 TCTTGTCTTACCTCATGATTTCGCTATCGAGAACCCTGAGTTCCAGGAAAGTAAAAAAGA 16244389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3446 TCTTGTCTTACCTCATGATTTCGCTATCGAGAACCCTGAGTTCCAGGAAAGTAAAAAAGA 3505

 16244390 CCCCTCAGGGTCACACAGCCATTTGACAACTGGGCTGTTTTCTATGCTGCTTTTATGCAG 16244449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3506 CCCCTCAGGGTCACACAGCCATTTGACAACTGGGCTGTTTTCTATGCTGCTTTTATGCAG 3565

 16244450 ACATTTAGAAATGCAGTAATTAACATCATTAAACTTTATGTATGTGTAACCCTCGCAGAC 16244509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3566 ACATTTAGAAATGCAGTAATTAACATCATTAAACTTTATGTATGTGTAACCCTCGCAGAC 3625

 16244510 TTCTTTCATATGCCTTCTTTAATGACCCCCATGAGAGGCCTCAGGCAGGTATTTTAGCTT 16244569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3626 TTCTTTCATATGCCTTCTTTAATGACCCCCATGAGAGGCCTCAGGCAGGTATTTTAGCTT 3685

 16244570 CTGTTTTATAGGGGGAGAAATTGAGGCTCAGAGAGGTGACATGATATGTAAGGGCAGATA 16244629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3686 CTGTTTTATAGGGGGAGAAATTGAGGCTCAGAGAGGTGACATGATATGTAAGGGCAGATA 3745

 16244630 ATTCGTAGCTGAGTCAGATTTTCTGACTCTGGGTCCAGTGCTGTTTTTATTGTGTACATT 16244689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3746 ATTCGTAGCTGAGTCAGATTTTCTGACTCTGGGTCCAGTGCTGTTTTTATTGTGTACATT 3805

 16244690 TTCTTTTTAAGAGTTGGAGAAGCTGGTCAGGGAGGAACATTAGTCATCCCTAACCCCACA 16244749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3806 TTCTTTTTAAGAGTTGGAGAAGCTGGTCAGGGAGGAACATTAGTCATCCCTAACCCCACA 3865

 16244750 ACTGGTTATGAGACATGTGTTACCTGCTGCTGTGAGTCCCTCGTATCTGCTTCTCACATC 16244809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3866 ACTGGTTATGAGACATGTGTTACCTGCTGCTGTGAGTCCCTCGTATCTGCTTCTCACATC 3925

 16244810 GGGGCCCCATTTCCCAGAGCTAGGTGAAGGTAGAAAGACGTGGCACTACCTCAGTGTCCT 16244869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3926 GGGGCCCCATTTCCCAGAGCTAGGTGAAGGTAGAAAGACGTGGCACTACCTCAGTGTCCT 3985

 16244870 AGGCTAGAAAGAAAATGAGGCTCCCTGGGAAGCCCTTTGTGATTAAGAGACATTCTAGTT 16244929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3986 AGGCTAGAAAGAAAATGAGGCTCCCTGGGAAGCCCTTTGTGATTAAGAGACATTCTAGTT 4045

 16244930 TCCTGTGCCCTTCCCCTCTCCTCTTTTCCTCTCCTGTCTGTCTCTGCCTCTCTACCTCTC 16244989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4046 TCCTGTGCCCTTCCCCTCTCCTCTTTTCCTCTCCTGTCTGTCTCTGCCTCTCTACCTCTC 4105

 16244990 TCACGGTCTTTGTCTCTCTCTGTCTCTTGGTCACTCATTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC 16245049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||
     4106 TCACGGTCTTTGTCTCTCTCTGTCTCTTGGTCACTCAT--TCTCTCTCTCTCTCTCTCTC 4163

 16245050 TCACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAGTGGGCCTCTGAT 16245109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4164 TCACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAGTGGGCCTCTGAT 4223

 16245110 CCTGGTGTGTTACTGGCTTGCCTTCCTCTTTGGGTTCCATCTCTTCTGCGTGATGTGACC 16245169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4224 CCTGGTGTGTTACTGGCTTGCCTTCCTCTTTGGGTTCCATCTCTTCTGCGTGATGTGACC 4283

 16245170 ACATTTTCATCATCTCTACACCTCATTCATGGCTTCTTGTCCACTGTGTTTTCTCTGGGC 16245229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4284 ACATTTTCATCATCTCTACACCTCATTCATGGCTTCTTGTCCACTGTGTTTTCTCTGGGC 4343

 16245230 CCTAGTGTCCAGCTTTTAGGCACTGGCAGGTGAGGATCTGGAAGAAAAGCCACCTTTCTG 16245289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4344 CCTAGTGTCCAGCTTTTAGGCACTGGCAGGTGAGGATCTGGAAGAAAAGCCACCTTTCTG 4403

 16245290 GTATCTGAGTCCCACTCTCTCCACTCCACCTGGCAACGCTCTATGAGCTGTGGCAGGGAG 16245349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4404 GTATCTGAGTCCCACTCTCTCCACTCCACCTGGCAACGCTCTATGAGCTGTGGCAGGGAG 4463

 16245350 AGCAGCCTCATTCAGTGTGTGCTTTACTCCCCCAGGGACGTCGCCCACGTGCCTCATACA 16245409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4464 AGCAGCCTCATTCAGTGTGTGCTTTACTCCCCCAGGGACGTCGCCCACGTGCCTCATACA 4523

 16245410 AAGCCAAGCTGTGGAAGGCATTTGGTGCAGCTCCTCACATGGAGAGGAGAGGGGGCCCAG 16245469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4524 AAGCCAAGCTGTGGAAGGCATTTGGTGCAGCTCCTCACATGGAGAGGAGAGGGGGCCCAG 4583

 16245470 CTGTCTCCAAGGCTTGTGTCAGGAGACATTCTGTCACCAGATGAGGACACAGTGCCCAAA 16245529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4584 CTGTCTCCAAGGCTTGTGTCAGGAGACATTCTGTCACCAGATGAGGACACAGTGCCCAAA 4643

 16245530 AGACAGAAAAGGGTCTTTAAGAGCTCTTATAAAAAAAAAAAAGTGGGGTGGGAGTGGTGA 16245589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4644 AGACAGAAAAGGGTCTTTAAGAGCTCTTATAAAAAAAAAAAAGTGGGGTGGGAGTGGTGA 4703

 16245590 GTGAACAGTGCAGTAAGCCACAAATCAGCTCTTTCAAAGAGCCGTAGCCTCCTCCACACC 16245649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4704 GTGAACAGTGCAGTAAGCCACAAATCAGCTCTTTCAAAGAGCCGTAGCCTCCTCCACACC 4763

 16245650 CTGGCCAAGGAATTCAGAGCCTGCTGACCAGCCTTTGTTCCCTGTCCCTGCCTAGCAGGT 16245709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     4764 CTGGCCAAGGAATTCAGAGCCTGCTGACCAGCCTTTGTTCTCTGTCCCTGCCTAGCAGGT 4823

 16245710 TCCCACTAGCCATGTGGCAACTTTATTTGAATTGGTAGAAATCCCTTCCTCATGACCATT 16245769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4824 TCCCACTAGCCATGTGGCAACTTTATTTGAATTGGTAGAAATCCCTTCCTCATGACCATT 4883

 16245770 CCTCCTGACTCCCATTCCTCAGAAAATTGGTCATAATATACTGATTTTATTAGAATAAGA 16245829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4884 CCTCCTGACTCCCATTCCTCAGAAAATTGGTCATAATATACTGATTTTATTAGAATAAGA 4943

 16245830 CATCTTAATGCCAACTGTCAGCAAGTTGTTGAAATAAAAATGCAAATTTACAGTAATGAT 16245889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4944 CATCTTAATGCCAACTGTCAGCAAGTTGTTGAAATAAAAATGCAAATTTACAGTAATGAT 5003

 16245890 AATATTAGAGATGTTCTCTTGGGTTGCACAGTGCGCAACTCCTGTAACTGTTCATAGCAA 16245949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5004 AATATTAGAGATGTTCTCTTGGGTTGCACAGTGCGCAACTCCTGTAACTGTTCATAGCAA 5063

 16245950 CCCTACATAGAGTCTCCCTATGGGCAACTGATTTTAGGGCAGCCCTGGGAGATGCTGATT 16246009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5064 CCCTACATAGAGTCTCCCTATGGGCAACTGATTTTAGGGCAGCCCTGGGAGATGCTGATT 5123

 16246010 GATGGCCAGTTTCTACACAAAGTAACAATGATGGGAATCAAGACTAGCTGTTGTATCCAG 16246069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5124 GATGGCCAGTTTCTACACAAAGTAACAATGATGGGAATCAAGACTAGCTGTTGTATCCAG 5183

 16246070 CTCTCAGCTGACTTGTGTTGACTGCCAGCTCTCATACCCAAGCCAAGCAGTGGAAGCCAT 16246129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5184 CTCTCAGCTGACTTGTGTTGACTGCCAGCTCTCATACCCAAGCCAAGCAGTGGAAGCCAT 5243

 16246130 ACCCCTGGAAGGATGAAGGTTTCTAAGGGGAAAGGGACAGTCTTGAAAGGGGCTGAAAGA 16246189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5244 ACCCCTGGAAGGATGAAGGTTTCTAAGGGGAAAGGGACAGTCTTGAAAGGGGCTGAAAGA 5303

 16246190 TGATATCATCTCAAGAAGCTGAACAAGTTATCTCTTACTTGAAAATGGGTCTGGTCCCTA 16246249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5304 TGATATCATCTCAAGAAGCTGAACAAGTTATCTCTTACTTGAAAATGGGTCTGGTCCCTA 5363

 16246250 TCTGCGAGACATCCGGTCCTTCAGGATCAGCCAGGGGTGCTATGGGGAGAAGCAATGTGG 16246309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5364 TCTGCGAGACATCCGGTCCTTCAGGATCAGCCAGGGGTGCTATGGGGAGAAGCAATGTGG 5423

 16246310 GGCAGGGAGAAGAACACCTCCCACTCTGCCCTTTGAAGGGTTAAATGATGGAAAGCAGTG 16246369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5424 GGCAGGGAGAAGAACACCTCCCACTCTGCCCTTTGAAGGGTTAAATGATGGAAAGCAGTG 5483

 16246370 TAAGAACCCCTTGTGCTTGTGCATGTGAGTCAGTGTGTGTGTGTAAGCATGTGAGAGTCT 16246429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5484 TAAGAACCCCTTGTGCTTGTGCATGTGAGTCAGTGTGTGTGTGTAAGCATGTGAGAGTCT 5543

 16246430 GAGTGTGGGGGGGAGCGAGCATGTGCGTGCGTGTGTGTGTGCGCGCGCATGTGCGCGTCA 16246489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5544 GAGTGTGGGGGGGAGCGAGCATGTGCGTGCGTGTGTGTGTGCGCGCGCATGTGCGCGTCA 5603

 16246490 AGGAGCAGCAGGAGGTCAGGATGCCTCCTGCCCCCCCAGAGGGAGCAGCCTTCTTTGGCT 16246549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5604 AGGAGCAGCAGGAGGTCAGGATGCCTCCTGCCCCCCCAGAGGGAGCAGCCTTCTTTGGCT 5663

 16246550 CAGGTGCCCCAAGGAAACTCTCCAGCAACCATCGTACTTCATACCCTTCAGCATGACACG 16246609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5664 CAGGTGCCCCAAGGAAACTCTCCAGCAACCATCGTACTTCATACCCTTCAGCATGACACG 5723

 16246610 TCCTCGTATCTGCCCCTGGAAAAGCCGATGCCAGTCCTGCGGTCACAACTGAGCAGCAAG 16246669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5724 TCCTCGTATCTGCCCCTGGAAAAGCCGATGCCAGTCCTGCGGTCACAACTGAGCAGCAAG 5783

 16246670 AGCACTGGGAAGGGAGAATTCAGAGCCTTCTGCTTCTAGTATAAGAGACTTTCCACAAAC 16246729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5784 AGCACTGGGAAGGGAGAATTCAGAGCCTTCTGCTTCTAGTATAAGAGACTTTCCACAAAC 5843

 16246730 ACCAAGAATACGCATGAACTTTCAAAATGGCTTGTGTATCATGGACCTTGAGGAACATCC 16246789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5844 ACCAAGAATACGCATGAACTTTCAAAATGGCTTGTGTATCATGGACCTTGAGGAACATCC 5903

 16246790 AGGCTCACGAGAATTAACAAGGAATGAGATAAACGAGGGCTTATTCTTTATTGTGGTAAA 16246849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5904 AGGCTCACGAGAATTAACAAGGAATGAGATAAACGAGGGCTTATTCTTTATTGTGGTAAA 5963

 16246850 AGGTTATGGGAAGCTTGAAACTACAGTTAGCTCTTGAATATCTGGACAGTAATGTATTCG 16246909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5964 AGGTTATGGGAAGCTTGAAACTACAGTTAGCTCTTGAATATCTGGACAGTAATGTATTCG 6023

 16246910 TTGATCTCACGTATTTCAGTGAACCAGTCTTTGTTGGCAGCTTGACTCCTTCTGTTTGCC 16246969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6024 TTGATCTCACGTATTTCAGTGAACCAGTCTTTGTTGGCAGCTTGACTCCTTCTGTTTGCC 6083

 16246970 TTTTGAAACATAAGCACTTGATCTCCTGGAACTTAGGCTCAACATAGGATCAACCTTGTA 16247029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6084 TTTTGAAACATAAGCACTTGATCTCCTGGAACTTAGGCTCAACATAGGATCAACCTTGTA 6143

 16247030 CCTGCCTGAGGGTTAAAACTCAATTCACAGGTGAGGGACTGACGAAGTAAGCAGACACTT 16247089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6144 CCTGCCTGAGGGTTAAAACTCAATTCACAGGTGAGGGACTGACGAAGTAAGCAGACACTT 6203

 16247090 CCAGCTCCTTCCAAGTCAAACGAGGTCAGCTCGCTATTTTGCTTGACGTGAATTCCAAGA 16247149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6204 CCAGCTCCTTCCAAGTCAAACGAGGTCAGCTCGCTATTTTGCTTGACGTGAATTCCAAGA 6263

 16247150 ACACCAGACACATCGGTAGGTACAAAACCACAAAGCTAAATAGAAGACTGTGGGTTTTTT 16247209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6264 ACACCAGACACATCGGTAGGTACAAAACCACAAAGCTAAATAGAAGACTGTGGGTTTTTT 6323

 16247210 ATTTGAATTAATCACCGTTTTTGAGTCAGTAGACTACAGTTAGTAATTTAGTCCTGCTAG 16247269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6324 ATTTGAATTAATCACCGTTTTTGAGTCAGTAGACTACAGTTAGTAATTTAGTCCTGCTAG 6383

 16247270 GCAGCCACTGTGGTCCATGGGAATAAAGACCAAAATAGAAAACACTCCTCACTTCATTCA 16247329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6384 GCAGCCACTGTGGTCCATGGGAATAAAGACCAAAATAGAAAACACTCCTCACTTCATTCA 6443

 16247330 CTGACATTTTATTCTTTATCTCTATCCAAAATGTACTCAGGGAAGCTCATGATTAATCAC 16247389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6444 CTGACATTTTATTCTTTATCTCTATCCAAAATGTACTCAGGGAAGCTCATGATTAATCAC 6503

 16247390 TCTTGTATACAGTTAAAATAGAGGAAAAAGAAGATTTCAGAAAGGAAAAGAGGGTATTGG 16247449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6504 TCTTGTATACAGTTAAAATAGAGGAAAAAGAAGATTTCAGAAAGGAAAAGAGGGTATTGG 6563

 16247450 GAATCAGGGGTAATACAGTTATTAGAAGTGAGTTTTACATGTGACTCTGAGCTTCCAGAA 16247509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6564 GAATCAGGGGTAATACAGTTATTAGAAGTGAGTTTTACATGTGACTCTGAGCTTCCAGAA 6623

 16247510 AGACAAAACAAAAAGAGAAACATAATGAATTTTAGAATTCTCATTTTCTAATAAAAAGCA 16247569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6624 AGACAAAACAAAAAGAGAAACATAATGAATTTTAGAATTCTCATTTTCTAATAAAAAGCA 6683

 16247570 ACGTACTCCTTTGTTAAGAAGTACACAGCACAGGCTGGGTGCAGTGGCTCATACCTGTAA 16247629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6684 ACGTACTCCTTTGTTAAGAAGTACACAGCACAGGCTGGGTGCAGTGGCTCATACCTGTAA 6743

 16247630 TCTCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCTGGCAGATCACTTTGAGCTCAGGAGTTCGAGACTA 16247689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6744 TCTCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCTGGCAGATCACTTTGAGCTCAGGAGTTCGAGACTA 6803

 16247690 GCCTCAACAACATGGCGAAATCCCATTTCTACACGCACACACACCCCCACACTAGCCGGG 16247749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6804 GCCTCAACAACATGGCGAAATCCCATTTCTACACGCACACACACCCCCACACTAGCCGGG 6863

 16247750 CATGGTGGCTCATGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGGAGCTGAGGCTGAAGAATCCTTGG 16247809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6864 CATGGTGGCTCATGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGGAGCTGAGGCTGAAGAATCCTTGG 6923

 16247810 GCCTGGGAAGTGGAGGTTGCAGTGAGCGCAGATTGTGCCACTGCACTCCAGTCTGGGCGA 16247869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6924 GCCTGGGAAGTGGAGGTTGCAGTGAGCGCAGATTGTGCCACTGCACTCCAGTCTGGGCGA 6983

 16247870 CAGAGTGAGACCATTTAAAAAAAAAAAAAGGCCGGGCGCGATGGTTCACGCCTGTAATCC 16247929
          |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6984 CAGAGTGAGACCATTT-AAAAAAAAAAAAGGCCGGGCGCGATGGTTCACGCCTGTAATCC 7042

 16247930 CCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTTGGGGGATCACTAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTG 16247989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7043 CCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTTGGGGGATCACTAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTG 7102

 16247990 GCTAACACGGTGAAA 16248004
          |||||||||||||||
     7103 GCTAACACGGTGAAA 7117

Alignment time is 8.72408 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [16229408,16251209] =>     21802 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    7532] =>      7532 nucs 'mol-32-3492-117539_7532'

Score:        7440
Aligned:      7538        nucs
Identic:      7525 (100%) nucs =>      5928 (100%)      1597 (100%)
Gaps:            6 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [16233476,16239408] EXCISED REGION [16241210,16242814]
 second seq =>  [       1,    5933] EXCISED REGION [    5934,    7532]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1801 nucs [16239409,16241209]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [16239409,16239409] to [16241210,16241210]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [16239409,16239410] to [16241208,16241209]
 second seq =>         0 nucs

 16233476 ACAGTCACTGTCTATTGGGTGCCTATTATTATTCTTTGATTCTCTCAATGGGCCTAAAGG 16233535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACAGTCACTGTCTATTGGGTGCCTATTATTATTCTTTGATTCTCTCAATGGGCCTAAAGG 60

 16233536 GTAATTATGGTTACCCTTACCTTCCAAATGAGGAAACTGATACCTATAAATATTGAGTGA 16233595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTAATTATGGTTACCCTTACCTTCCAAATGAGGAAACTGATACCTATAAATATTGAGTGA 120

 16233596 ATTACCCAAGGAAACTTAGGAAGCAACGGAGTGAACATTCAAATCTAAATATGTCTGATT 16233655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
      121 ATTACCCAAGGAAACTTAGGAAGCAACGGAGTGAACATTCAAATCTAAATATGTGTGATT 180

 16233656 CTGAAGTCTAAGTTCTTTTGACCATCTTACTACAAGGATACATACACCACACGCACACAC 16233715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTGAAGTCTAAGTTCTTTTGACCATCTTACTACAAGGATACATACACCACACGCACACAC 240

 16233716 ACGTGCACATGTGTGTGCATAACACACACTTGTGTTGTTTCCAATTCTCATAGTCTATGA 16233775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACGTGCACATGTGTGTGCATAACACACACTTGTGTTGTTTCCAATTCTCATAGTCTATGA 300

 16233776 ATTGAGACAGAGAAAGGAGCCAGGCATGGCTGGCAGGCATAGCCGTGCTCTCTTCTTGGA 16233835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATTGAGACAGAGAAAGGAGCCAGGCATGGCTGGCAGGCATAGCCGTGCTCTCTTCTTGGA 360

 16233836 GCAGACAGGACTGACTTTGGTAAACTATTAAACTGTCCCCACAGGAATTCCAAACCCAGG 16233895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GCAGACAGGACTGACTTTGGTAAACTATTAAACTGTCCCCACAGGAATTCCAAACCCAGG 420

 16233896 GCTCTCTGTCCCAAACTCCTTTCCTATCTCAGTTGGCAAATAGCCAGCCTCCCGGCAACA 16233955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GCTCTCTGTCCCAAACTCCTTTCCTATCTCAGTTGGCAAATAGCCAGCCTCCCGGCAACA 480

 16233956 AGCCCAATTAATAGTTTAGGGTTTTTTTTTTCATACCCACTAAATTCACTGAGGCAAAAT 16234015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGCCCAATTAATAGTTTAGGGTTTTTTTTTTCATACCCACTAAATTCACTGAGGCAAAAT 540

 16234016 TTCTTTTCACAGCCACCAGTCCCTGTCTAGGACCCCTGGGTTTACCCAAATGCATGGCCA 16234075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTCTTTTCACAGCCACCAGTCCCTGTCTAGGACCCCTGGGTTTACCCAAATGCATGGCCA 600

 16234076 CAAAAGAAGTGGAGAGGATATGAGGAAATTTTGCACCTGTTTGTGAGCAGTCTAGAGCAA 16234135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CAAAAGAAGTGGAGAGGATATGAGGAAATTTTGCACCTGTTTGTGAGCAGTCTAGAGCAA 660

 16234136 GTCTGAGGGCAGAGCAGAAATTCTCAGCCCCACCAGGGGAGAAGGGGAGAGAATGAAGGG 16234195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GTCTGAGGGCAGAGCAGAAATTCTCAGCCCCACCAGGGGAGAAGGGGAGAGAATGAAGGG 720

 16234196 GGTGAAAGACCTCAGCAAAGACTATGCATGTGCTGGGGACGCAGTCATCTCCCTAAAACC 16234255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GGTGAAAGACCTCAGCAAAGACTATGCATGTGCTGGGGACGCAGTCATCTCCCTAAAACC 780

 16234256 TTACAGGGAAGCTGGTTCCATTTTGGACATGTTATTTGAGCAGCCCTGAACTCAGACTAT 16234315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTACAGGGAAGCTGGTTCCATTTTGGACATGTTATTTGAGCAGCCCTGAACTCAGACTAT 840

 16234316 AAAAGTTCATATAAAGTTCATTATTTTATTTGTTTTAAGAATGGTTCTCAGAATGCTGCC 16234375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAAAGTTCATATAAAGTTCATTATTTTATTTGTTTTAAGAATGGTTCTCAGAATGCTGCC 900

 16234376 ATGCATTTAGGGACTTCTTGCTAAAGTCCATAGGAATTTATCTTTCAAATAAGTGTTAGA 16234435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATGCATTTAGGGACTTCTTGCTAAAGTCCATAGGAATTTATCTTTCAAATAAGTGTTAGA 960

 16234436 TGGGTGTTAAATTTTCTCTTTAAAACTAATATGATATTTGAGTTAACAGTATTGAACCAT 16234495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGGGTGTTAAATTTTCTCTTTAAAACTAATATGATATTTGAGTTAACAGTATTGAACCAT 1020

 16234496 GTCGGATTCCTGGTTTTGCTCATTGTGGATGATTACGTGAGATATTTTCATGATGGGGAG 16234555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GTCGGATTCCTGGTTTTGCTCATTGTGGATGATTACGTGAGATATTTTCATGATGGGGAG 1080

 16234556 CTAGGTAAAGGGAACATAGGAACTCTCAGTTTCTTGTCAGTCTTAAACGATTTCAAAATA 16234615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTAGGTAAAGGGAACATAGGAACTCTCAGTTTCTTGTCAGTCTTAAACGATTTCAAAATA 1140

 16234616 AAAAGTGGTAAAGTGGGAATTGAAAGAAAAAATTACTAGAAAGAGTGTTGCTTTCCCCAA 16234675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AAAAGTGGTAAAGTGGGAATTGAAAGAAAAAATTACTAGAAAGAGTGTTGCTTTCCCCAA 1200

 16234676 AAACCTTGCATGTAACTTCTCTAATGGTGATAATTCTGTTGCAGAATAAACATTTTACTT 16234735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AAACCTTGCATGTAACTTCTCTAATGGTGATAATTCTGTTGCAGAATAAACATTTTACTT 1260

 16234736 TGGCTACCAGGGATCTCAGAGTCAAATTTAAATTCATTCTAGAAATACCTAGGCCCTTAT 16234795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGGCTACCAGGGATCTCAGAGTCAAATTTAAATTCATTCTAGAAATACCTAGGCCCTTAT 1320

 16234796 AACCTATATATTTATGTTCTTTCTCCAAATGCTGACTTTCTAAATTTACTTATATTCCTC 16234855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AACCTATATATTTATGTTCTTTCTCCAAATGCTGACTTTCTAAATTTACTTATATTCCTC 1380

 16234856 AGCTCCTGACTTTTCTTCCTTATTTTTATTTTACCATCATTTTAAGTATTTGTATTGTGT 16234915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AGCTCCTGACTTTTCTTCCTTATTTTTATTTTACCATCATTTTAAGTATTTGTATTGTGT 1440

 16234916 GTATTTTTTTGTGAGTGGCTTCAAATCATTTATGGAAATAAATAGCTTGTAAATTTATAA 16234975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GTATTTTTTTGTGAGTGGCTTCAAATCATTTATGGAAATAAATAGCTTGTAAATTTATAA 1500

 16234976 ACCAACAAAATAATTAGCTCCTTTATGAGATGTTTATGTGTTTTTAAAAATTATTTAGGA 16235035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ACCAACAAAATAATTAGCTCCTTTATGAGATGTTTATGTGTTTTTAAAAATTATTTAGGA 1560

 16235036 ATTCTGCTTACCATTACCTAGACTCAATTCTCCCTCTCTACACAGGATTTTGCCCTGAGA 16235095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ATTCTGCTTACCATTACCTAGACTCAATTCTCCCTCTCTACACAGGATTTTGCCCTGAGA 1620

 16235096 GTCACACACAGGTTTCCTGTGCATTGAGAGTTTTCTGCCTTTCTTAGGACTGGTACCAAG 16235155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GTCACACACAGGTTTCCTGTGCATTGAGAGTTTTCTGCCTTTCTTAGGACTGGTACCAAG 1680

 16235156 CTAGGGAGCAGCAAGAGTTGGCACATCTTAGAAGGTGTTTCCCTCAGACAGGGCCAGCCT 16235215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CTAGGGAGCAGCAAGAGTTGGCACATCTTAGAAGGTGTTTCCCTCAGACAGGGCCAGCCT 1740

 16235216 CAGCCTGGTTGTCACTCTGCCCGCAGTTCCACCTCACAGATTCCTTTAGGTGTCCGAAGT 16235275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CAGCCTGGTTGTCACTCTGCCCGCAGTTCCACCTCACAGATTCCTTTAGGTGTCCGAAGT 1800

 16235276 TTGGGGTCCTTGAGATGGCTCCTATTCAAATGTCCCTCTGAGGAGGAACATAGTTTGAGC 16235335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTGGGGTCCTTGAGATGGCTCCTATTCAAATGTCCCTCTGAGGAGGAACATAGTTTGAGC 1860

 16235336 AGCAGCTGCAACTCAGAAAGAGGCTCTTCAGAAACACACGTTAAGAAAGTGCCTTTTGTA 16235395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AGCAGCTGCAACTCAGAAAGAGGCTCTTCAGAAACACACGTTAAGAAAGTGCCTTTTGTA 1920

 16235396 AGCAAGTGTGAGCTATATACTGCTCCATGTATCAGGTTGTTATAATTCACTCCACCCTGG 16235455
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AGTAAGTGTGAGCTATATACTGCTCCATGTATCAGGTTGTTATAATTCACTCCACCCTGG 1980

 16235456 ACCCACTGATTCTCAACAGACCCAAAGCAAGGCAAACACCAAGCACCCTGTTCACAGACA 16235515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ACCCACTGATTCTCAACAGACCCAAAGCAAGGCAAACACCAAGCACCCTGTTCACAGACA 2040

 16235516 GCCCCTCAGCAGAGGGAAATGCAAACACCCCTGCTATCCAGCCATAAGCCAGCAAAGTGG 16235575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GCCCCTCAGCAGAGGGAAATGCAAACACCCCTGCTATCCAGCCATAAGCCAGCAAAGTGG 2100

 16235576 AAAGGGTGTGAGAGTTTTGAAGGTAGAACATTCAGCGCTGCCACTTGCCAGCAATGTGAG 16235635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AAAGGGTGTGAGAGTTTTGAAGGTAGAACATTCAGCGCTGCCACTTGCCAGCAATGTGAG 2160

 16235636 CTTTGATGTCTTCCCTTCCCTCGAAGCCTCCGTTTCCTTATCTGTAAAATGGGAGTAAGA 16235695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CTTTGATGTCTTCCCTTCCCTCGAAGCCTCCGTTTCCTTATCTGTAAAATGGGAGTAAGA 2220

 16235696 TAGCCCAACCCACGGATTAATTATCAGATGAATGTGCAGTGATATATTAAAGGCCTTGCA 16235755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TAGCCCAACCCACGGATTAATTATCAGATGAATGTGCAGTGATATATTAAAGGCCTTGCA 2280

 16235756 CGGTGTCTGGCATGTTGTTGGCACTCACAGACACTCCATCCTTGTTTTTTCTTCCATAAA 16235815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CGGTGTCTGGCATGTTGTTGGCACTCACAGACACTCCATCCTTGTTTTTTCTTCCATAAA 2340

 16235816 AATAATAAGAGCTTAAATGTCTTCTCTTTTAGAAGTGTCTGTTCATGTCCTTTGCCCTCT 16235875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AATAATAAGAGCTTAAATGTCTTCTCTTTTAGAAGTGTCTGTTCATGTCCTTTGCCCTCT 2400

 16235876 TTTTAATGGGGCTGTTTGTCTTTTTTCTTGTAAATTTGCATAAGTTCCTTGTAGATTCTG 16235935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TTTTAATGGGGCTGTTTGTCTTTTTTCTTGTAAATTTGCATAAGTTCCTTGTAGATTCTG 2460

 16235936 GATATTAGACCTTTGTCAGATGGATAGATTGCAAAAATTTTCTCCAATTTTGTAGGTTGT 16235995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GATATTAGACCTTTGTCAGATGGATAGATTGCAAAAATTTTCTCCAATTTTGTAGGTTGT 2520

 16235996 CTGTTCACTCTGATATTTCTTTTGCTGTGCAGAAGTGCACATGTATGTTTGTTGCAGCAC 16236055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CTGTTCACTCTGATATTTCTTTTGCTGTGCAGAAGTGCACATGTATGTTTGTTGCAGCAC 2580

 16236056 TATTCATAGTAGTGAAGTCACGGAATCAACCCAAATGCCCATCAATGATAGACTAGATAA 16236115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TATTCATAGTAGTGAAGTCACGGAATCAACCCAAATGCCCATCAATGATAGACTAGATAA 2640

 16236116 AGAAAATGTGGTACATATGTACCATGGAGTACTACGCAGCCATAAAAAGGAATGAGATCC 16236175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 AGAAAATGTGGTACATATGTACCATGGAGTACTACGCAGCCATAAAAAGGAATGAGATCC 2700

 16236176 TGTCCTTTCCAGGGACATGGATGGAGCTGGAAAACATTATCCTCAGCAAATGAACACAGG 16236235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TGTCCTTTCCAGGGACATGGATGGAGCTGGAAAACATTATCCTCAGCAAATGAACACAGG 2760

 16236236 AACAGAAAACCAAACACCGCATGTTCTCACTTATAAGTGGGAGCTGAACAGTGAGAACAC 16236295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 AACAGAAAACCAAACACCGCATGTTCTCACTTATAAGTGGGAGCTGAACAGTGAGAACAC 2820

 16236296 ATGGACACAGGGAGGGGAGCAACACACACTGGGGCCTGTTGTGGGGGCATGGGGAGGGAG 16236355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 ATGGACACAGGGAGGGGAGCAACACACACTGGGGCCTGTTGTGGGGGCATGGGGAGGGAG 2880

 16236356 AGCATCAGGATAAATAACTAATGCATGTGGGGCTGAATACCTAGGTGATGGGTTGATGGT 16236415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 AGCATCAGGATAAATAACTAATGCATGTGGGGCTGAATACCTAGGTGATGGGTTGATGGT 2940

 16236416 GGCAGCAAACCACTATGGCACATGTTTACCTATGTAGCAAACCTGCACGTCCTGCACATG 16236475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 GGCAGCAAACCACTATGGCACATGTTTACCTATGTAGCAAACCTGCACGTCCTGCACATG 3000

 16236476 TATCCTGGAACTTAAAATAAAATTTTAAAAAATAGTAAGTGCTAACATTTAAAAATTGTG 16236535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TATCCTGGAACTTAAAATAAAATTTTAAAAAATAGTAAGTGCTAACATTTAAAAATTGTG 3060

 16236536 TGCCAGGTGCTATGCTAGGTTGTAGGAACATAAAAATAAAGAAAATAGTGTCCCTGACCT 16236595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TGCCAGGTGCTATGCTAGGTTGTAGGAACATAAAAATAAAGAAAATAGTGTCCCTGACCT 3120

 16236596 TGAATGGATGACAGAGATTACTGGACACTTAACTACACGCATCATCCTATCCAAGCCTCA 16236655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TGAATGGATGACAGAGATTACTGGACACTTAACTACACGCATCATCCTATCCAAGCCTCA 3180

 16236656 CCACAGCCTCGGGGAGTCCTGATCTTCCCAGAAGGCCAGGAGGGGTGTCCCTAGGTCATT 16236715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 CCACAGCCTCGGGGAGTCCTGATCTTCCCAGAAGGCCAGGAGGGGTGTCCCTAGGTCATT 3240

 16236716 TAGTTGTGCCAGAAATGTAGGCCTCAGGCCCAAGCCAAAGACTAGAGCAGAGGTTCTCAA 16236775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TAGTTGTGCCAGAAATGTAGGCCTCAGGCCCAAGCCAAAGACTAGAGCAGAGGTTCTCAA 3300

 16236776 AGTGTGGTCCACAGAAAACAGCAGCATCGGCATCACCTGGGAGCTTGTTAGAAATGCAAA 16236835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 AGTGTGGTCCACAGAAAACAGCAGCATCGGCATCACCTGGGAGCTTGTTAGAAATGCAAA 3360

 16236836 TTCTTCAGCCCCACTCCATCTCCAGAAACTCTGGGGGTGGGCCCTGCAGTCAGTATTTTA 16236895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TTCTTCAGCCCCACTCCATCTCCAGAAACTCTGGGGGTGGGCCCTGCAGTCAGTATTTTA 3420

 16236896 AAAATCCCACCAGGTGATTCTGATGCATGCTCAAGTGTGAGCGCTGTGAGGGTGATAATA 16236955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 AAAATCCCACCAGGTGATTCTGATGCATGCTCAAGTGTGAGCGCTGTGAGGGTGATAATA 3480

 16236956 TTGTCATTCATTCTCATTTTACAGATGAGGACAGTCATTTGCTGAGGATGACGGCAACGC 16237015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TTGTCATTCATTCTCATTTTACAGATGAGGACAGTCATTTGCTGAGGATGACGGCAACGC 3540

 16237016 TTCTCAATTGCAATGAGAGGGACTTTGGATTAAATGATAAAGGAGCTCTTGAGATCTGAG 16237075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 TTCTCAATTGCAATGAGAGGGACTTTGGATTAAATGATAAAGGAGCTCTTGAGATCTGAG 3600

 16237076 AATTGGGAGATAGTAGACAGCACCACTATGAGGCGTAACAGGTTCTTTTTATATGGGAAT 16237135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 AATTGGGAGATAGTAGACAGCACCACTATGAGGCGTAACAGGTTCTTTTTATATGGGAAT 3660

 16237136 TTTAAGAGATCCCATAGGACAGCCATATAATGGGGGCAGCTCCAGCCAGAGCAAAGGAAG 16237195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 TTTAAGAGATCCCATAGGACAGCCATATAATGGGGGCAGCTCCAGCCAGAGCAAAGGAAG 3720

 16237196 CGAGTTAGAGGGTGTGGAGTGTTTCTTGTGGCCTTCTCTTCCCCATGGCTCTCTGGCTCT 16237255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 CGAGTTAGAGGGTGTGGAGTGTTTCTTGTGGCCTTCTCTTCCCCATGGCTCTCTGGCTCT 3780

 16237256 CTTCCCTGCAGGTGTCTGCAGCAGCACCCTCAGGACAGCCTGCCCACAGCCAGCGTCATC 16237315
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 CTTCCCTGCAGGTGTCTGCAGCAGCACCATCAGGACAGCCTGCCCACAGCCAGCGTCATC 3840

 16237316 CTCTGTTTCCATGATGAGGCCTGGTCCACTCTCCTGCGGACTGTACACAGCATCCTCGAC 16237375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 CTCTGTTTCCATGATGAGGCCTGGTCCACTCTCCTGCGGACTGTACACAGCATCCTCGAC 3900

 16237376 ACAGTGCCCAGGGCCTTCCTGAAGGAGATCATCCTCGTGGACGACCTCAGCCAGCAAGGT 16237435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 ACAGTGCCCAGGGCCTTCCTGAAGGAGATCATCCTCGTGGACGACCTCAGCCAGCAAGGT 3960

 16237436 AGCCACGGCTTTCCTCCAGGCTCGTCTGGGTGAGCCTTACCCCCTGGCGGGTGGAGTTCT 16237495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 AGCCACGGCTTTCCTCCAGGCTCGTCTGGGTGAGCCTTACCCCCTGGCGGGTGGAGTTCT 4020

 16237496 CAAGCAAAAGATTGAAGTTTGGAACTATTTTAGGCAAGATTCCCCAACTACAGACCTCCA 16237555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 CAAGCAAAAGATTGAAGTTTGGAACTATTTTAGGCAAGATTCCCCAACTACAGACCTCCA 4080

 16237556 GATGAGGATTAATGGGCAAGTAACTTATGAATGAAGAGCCACTGGGGAAACCAGTAAGGC 16237615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 GATGAGGATTAATGGGCAAGTAACTTATGAATGAAGAGCCACTGGGGAAACCAGTAAGGC 4140

 16237616 AGTGGGGGCTGCAAGACAGAGAAGGAGAAAGAGCCCTGCAGGGGAAACAGCCCTGGGGAG 16237675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 AGTGGGGGCTGCAAGACAGAGAAGGAGAAAGAGCCCTGCAGGGGAAACAGCCCTGGGGAG 4200

 16237676 GGTCTTGAGGGGTGTCGCCTCAGCCTGATCCCGTGGGGATCTCTCTCCCAGGTGCCACCC 16237735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 GGTCTTGAGGGGTGTCGCCTCAGCCTGATCCCGTGGGGATCTCTCTCCCAGGTGCCACCC 4260

 16237736 AGTCCAACAATCCTCTCTCCAAGACACTGAAGAATCACATAGGGCGGCCCTGTTGTGAGT 16237795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 AGTCCAACAATCCTCTCTCCAAGACACTGAAGAATCACATAGGGCGGCCCTGTTGTGAGT 4320

 16237796 GCTCACTGCCTCCTAGACCCTGGTGCAGCACTTTACACATACGCACATATGTGTATCGGT 16237855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 GCTCACTGCCTCCTAGACCCTGGTGCAGCACTTTACACATACGCACATATGTGTATCGGT 4380

 16237856 CCTTCACTCATCATGGCTTAGACAGACCCACTCACTTTCCAGAGGAGGAAACTGGGGCCC 16237915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 CCTTCACTCATCATGGCTTAGACAGACCCACTCACTTTCCAGAGGAGGAAACTGGGGCCC 4440

 16237916 AGAGAAGACAGCAGACTGGAGCGGAGTCAGCCAAAAGCAGCAGAGTCAGGCCCAGAGCCC 16237975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 AGAGAAGACAGCAGACTGGAGCGGAGTCAGCCAAAAGCAGCAGAGTCAGGCCCAGAGCCC 4500

 16237976 AGACTTGCAGAACCTGCCTGTGTGCTTCCTCTCACAGGAACCTGGCTACTAGGGACAGCC 16238035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 AGACTTGCAGAACCTGCCTGTGTGCTTCCTCTCACAGGAACCTGGCTACTAGGGACAGCC 4560

 16238036 CTAAAAGAAGATGGAGACAGAGAAGCCCCCACTTGACTCGTAGGTCAGTGGCTCTCACGC 16238095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 CTAAAAGAAGATGGAGACAGAGAAGCCCCCACTTGACTCGTAGGTCAGTGGCTCTCACGC 4620

 16238096 TTGAGCATGCATCGGAATCACCTGGTGCGATTTTTAAAATACTACTGCAGGGCCCACCCC 16238155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 TTGAGCATGCATCGGAATCACCTGGTGCGATTTTTAAAATACTACTGCAGGGCCCACCCC 4680

 16238156 CAGAGTTTCTGGTGATGGAGTGGGGCCGAAGAATTTGCATTTCTAACAAGCTCCCAGGTG 16238215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 CAGAGTTTCTGGTGATGGAGTGGGGCCGAAGAATTTGCATTTCTAACAAGCTCCCAGGTG 4740

 16238216 ATGCTGATGCTGCTGTTTTCTGTGGACCACACTCTGAGAACCTCTGCTCTAGTCTTTGGC 16238275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 ATGCTGATGCTGCTGTTTTCTGTGGACCACACTCTGAGAACCTCTGCTCTAGTCTTTGGC 4800

 16238276 TTGGGCGTGAGGCCTACATTTCTGGCACAACTAAATGACCTAGGGACACCCCTCCTGGCC 16238335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 TTGGGCGTGAGGCCTACATTTCTGGCACAACTAAATGACCTAGGGACACCCCTCCTGGCC 4860

 16238336 TTCTGGGAAGATCAGAACGCTCTGAGGGAAGCCGAGCATTCACGTTTTTCTAAGGGGAAT 16238395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 TTCTGGGAAGATCAGAACGCTCTGAGGGAAGCCGAGCATTCACGTTTTTCTAAGGGGAAT 4920

 16238396 AATGGAGAAGGGCTAGGGTAGCCAGGTGCCTCTGTTAGTTCTTTCTACGGTCCTCACTCC 16238455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 AATGGAGAAGGGCTAGGGTAGCCAGGTGCCTCTGTTAGTTCTTTCTACGGTCCTCACTCC 4980

 16238456 AGGGATGGGCCTAGCCTGGCCATAGCAGTGAGTCAGATTAGCCAGAGGCTCTGGGAACAC 16238515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 AGGGATGGGCCTAGCCTGGCCATAGCAGTGAGTCAGATTAGCCAGAGGCTCTGGGAACAC 5040

 16238516 CTGGGGTTCCTGGGTGCAGCTGGCTGCATATTAGGCAGGACTAATGAACAGGTGCAGGAC 16238575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 CTGGGGTTCCTGGGTGCAGCTGGCTGCATATTAGGCAGGACTAATGAACAGGTGCAGGAC 5100

 16238576 AGGGCTGGGTTGGCGGGTAAAGTGCCCAGAGACTCTCCAAACCCTCAAGTGGGGCGGGGT 16238635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 AGGGCTGGGTTGGCGGGTAAAGTGCCCAGAGACTCTCCAAACCCTCAAGTGGGGCGGGGT 5160

 16238636 CCGCCCAAGAGCACACCTGTGGTGAGGCCCCCACCATCTGATGAGCTGTGTTACGTCTGT 16238695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 CCGCCCAAGAGCACACCTGTGGTGAGGCCCCCACCATCTGATGAGCTGTGTTACGTCTGT 5220

 16238696 GCCCCTCGGGAGTACGGAAAGTGGAGGAGCTGGGCCCCAGAGAAATGGGCTACCCCAGAG 16238755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 GCCCCTCGGGAGTACGGAAAGTGGAGGAGCTGGGCCCCAGAGAAATGGGCTACCCCAGAG 5280

 16238756 CTGGCAGCCCCACCAGAGGGGATCTGGATCCCCTGCCAAGCAATTAAGCTGCCCCCTCCT 16238815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 CTGGCAGCCCCACCAGAGGGGATCTGGATCCCCTGCCAAGCAATTAAGCTGCCCCCTCCT 5340

 16238816 GGCCAACTCCCCTTCTGCCCCTCACCACTGGGTTGGCTCTCCATCCAGTGGCCCCATATT 16238875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 GGCCAACTCCCCTTCTGCCCCTCACCACTGGGTTGGCTCTCCATCCAGTGGCCCCATATT 5400

 16238876 TCCTGTTGACATTGGGGTGCAAGGCCTTTTCCACAACCAAGGGCAGCACTGGTTCTATTT 16238935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 TCCTGTTGACATTGGGGTGCAAGGCCTTTTCCACAACCAAGGGCAGCACTGGTTCTATTT 5460

 16238936 CTGCAGGTCCCTCTCCTCTGTGTGCTTGCCAAGACCCAGATCCCAGACAAGCACCACCCT 16238995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     5461 CTGCAGGTCCCTCTCCTCTGTGTGCTTGCCAAGACCCAGATCCCAGACAAGCACCACCTT 5520

 16238996 GCACACTGTTTTTATTTAATCCTCTTGGCCACCCAGAGAGGCAGGGCTTATCAACCCTAC 16239055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 GCACACTGTTTTTATTTAATCCTCTTGGCCACCCAGAGAGGCAGGGCTTATCAACCCTAC 5580

 16239056 TCTACCTGTGAGGAAAACTGAGACAGAAAAAGATGCTGCGGGTTGCCCTGAGCCACCTTG 16239115
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     5581 TCTACCTGTGAGGAAAACTGAGACAGAAAAAGATGCTGCGGGTTGCCCTGAGCCATCTTG 5640

 16239116 ATGGGCTTCCAAGCCGATGGTCATGACAGCATAGTGTAGTGTGATAGAATCAGCTAGATG 16239175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 ATGGGCTTCCAAGCCGATGGTCATGACAGCATAGTGTAGTGTGATAGAATCAGCTAGATG 5700

 16239176 GGTTTCAGGGTATTCGTCTGGGGTGGTGATGCCCACACCAAATCATTAAATCAGAAAATG 16239235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5701 GGTTTCAGGGTATTCGTCTGGGGTGGTGATGCCCACACCAAATCATTAAATCAGAAAATG 5760

 16239236 CTTGCGATGACCAGCCCATGATGACCCTTTACAAGTGGAAGTCAGTATTACTGCTGTTTT 16239295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5761 CTTGCGATGACCAGCCCATGATGACCCTTTACAAGTGGAAGTCAGTATTACTGCTGTTTT 5820

 16239296 CTGGAGGGAAGGAGTTGAGGATCATACCAGCTTTTTCCGAGCACTATACCACTCAGACAT 16239355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5821 CTGGAGGGAAGGAGTTGAGGATCATACCAGCTTTTTCCGAGCACTATACCACTCAGACAT 5880

 16239356 GGGTGCTCTTACCCACTTCAAAACCCTCTGAGAATGCCAAACAACCATCGCAG 16239408
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5881 GGGTGCTCTTACCCACTTCAAAACCCTCTGAGAATGCCAAACAACCATCGCAG 5933

EXCISED REGION

 16241210 TGGAGCACAGGCTGCACTGCGGGGTCTGTCTTGCTTTTTACCCTGCAATGGTCAGTCATT 16241269
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5934 TGGAGCACAGGCTGCACTGCGGGTTCTGTCTTGCTTTTTACCCTGCAATGGTCAGTCATT 5993

 16241270 GACCATGACTGGGGCTGGGGGCAGCATCCTGCATGACTGTCTGGCACCTGCAGCAGAGAC 16241329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5994 GACCATGACTGGGGCTGGGGGCAGCATCCTGCATGACTGTCTGGCACCTGCAGCAGAGAC 6053

 16241330 CGTTTTAATACCCCAAGGCAAGTCTCCAGGGAAGGGTTAAGATTTCAGTTAGCACCCACA 16241389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6054 CGTTTTAATACCCCAAGGCAAGTCTCCAGGGAAGGGTTAAGATTTCAGTTAGCACCCACA 6113

 16241390 GCAGCTGGGGACATGCAAACCAAACCAAAACAGTTAAGGGGAGCTCAGGGAATCTGAGTA 16241449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6114 GCAGCTGGGGACATGCAAACCAAACCAAAACAGTTAAGGGGAGCTCAGGGAATCTGAGTA 6173

 16241450 GGACACTATATTAGTCTGTTCTCACACTGCTATAAAGAACTGCCTGAGACTAGGTAATTT 16241509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6174 GGACACTATATTAGTCTGTTCTCACACTGCTATAAAGAACTGCCTGAGACTAGGTAATTT 6233

 16241510 ATAAAGAAAGGAGGTTTAATTGACTCACAGTTTCGCATGGCTGGGGAGGCCTCAGGAAAC 16241569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6234 ATAAAGAAAGGAGGTTTAATTGACTCACAGTTTCGCATGGCTGGGGAGGCCTCAGGAAAC 6293

 16241570 TTACAATCATGGTGGAAGGGGAAGCATGTCTTACATGGCAGCAAGTGAGAGAAAGAGAGA 16241629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6294 TTACAATCATGGTGGAAGGGGAAGCATGTCTTACATGGCAGCAAGTGAGAGAAAGAGAGA 6353

 16241630 GAGAGAGGAGGAAAAACTATCAAACACTTATATAATCATCAGATCTCATGAGAACTCACT 16241689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6354 GAGAGAGGAGGAAAAACTATCAAACACTTATATAATCATCAGATCTCATGAGAACTCACT 6413

 16241690 ATCACGAGAACAGCATGGGGGAAACTGCCCACATGATCCAATCACCTCCCACCAGGTCCC 16241749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6414 ATCACGAGAACAGCATGGGGGAAACTGCCCACATGATCCAATCACCTCCCACCAGGTCCC 6473

 16241750 TCCCTCGCCACATAGGGATTATGGGGATTACCACTCAAGATGAGATCTGGGTGGGGACAA 16241809
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     6474 TCCCTCGCCACATAGGGATTATGGGGATTACAACTCAAGATGAGATCTGGGTGGGGACAA 6533

 16241810 AGAGCCAAACCATATCAGACACCAACAGTATCTGCTACATTCTTGCTGCTGCATTTGGAG 16241869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6534 AGAGCCAAACCATATCAGACACCAACAGTATCTGCTACATTCTTGCTGCTGCATTTGGAG 6593

 16241870 AATGTTAGCAAGTTCTCCCCTTTCCTGGTTTTCTGACACCATCCCTCTAATTTTTACTGG 16241929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6594 AATGTTAGCAAGTTCTCCCCTTTCCTGGTTTTCTGACACCATCCCTCTAATTTTTACTGG 6653

 16241930 AGAGAATCATGGCCCACCCCAACCTAACCAAGCATCTTACATCTCAGCAACAACCACACT 16241989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6654 AGAGAATCATGGCCCACCCCAACCTAACCAAGCATCTTACATCTCAGCAACAACCACACT 6713

 16241990 GTAGTAATGTTTTCGGTTCTTAGGACCCAGGTGCTCACCACAGCTTCCAAAAGAGAGTTG 16242049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6714 GTAGTAATGTTTTCGGTTCTTAGGACCCAGGTGCTCACCACAGCTTCCAAAAGAGAGTTG 6773

 16242050 CTGACGATTGTCTTAGTCACAATCTCATCGGTTGTGGCATTTGTCATTCCACTGACCACA 16242109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6774 CTGACGATTGTCTTAGTCACAATCTCATCGGTTGTGGCATTTGTCATTCCACTGACCACA 6833

 16242110 ACCCTGTTGATTCCAGGACAACTCAAGTCTGCTCTCAGCGAATATGTGGCCAGGCTGGAG 16242169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6834 ACCCTGTTGATTCCAGGACAACTCAAGTCTGCTCTCAGCGAATATGTGGCCAGGCTGGAG 6893

 16242170 GGGGTGAAGTTACTCAGGAGCAACAAGAGGCTGGGTGCCATCAGGGCCCGGATGCTGGGG 16242229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6894 GGGGTGAAGTTACTCAGGAGCAACAAGAGGCTGGGTGCCATCAGGGCCCGGATGCTGGGG 6953

 16242230 GCCACCAGAGCCACCGGGGATGTGCTCGTCTTCATGGATGCCCACTGCGAGTGCCACCCA 16242289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6954 GCCACCAGAGCCACCGGGGATGTGCTCGTCTTCATGGATGCCCACTGCGAGTGCCACCCA 7013

 16242290 GGCTGGCTGGAGCCCCTCCTCAGCAGAATAGCTGGTGACAGGTAACTTATTCCCTGGGCT 16242349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7014 GGCTGGCTGGAGCCCCTCCTCAGCAGAATAGCTGGTGACAGGTAACTTATTCCCTGGGCT 7073

 16242350 TGCAAAGCAAGACATGGAACTGGGAGAAACAGTCTACAGCATCAGCCACTCACAGAGCAA 16242409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7074 TGCAAAGCAAGACATGGAACTGGGAGAAACAGTCTACAGCATCAGCCACTCACAGAGCAA 7133

 16242410 CCCACCTATTAATTCCTGAATCTCCATTAGAGAGTGATATATTCCCTTCGGGTTTTCAGA 16242469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7134 CCCACCTATTAATTCCTGAATCTCCATTAGAGAGTGATATATTCCCTTCGGGTTTTCAGA 7193

 16242470 TGTGTAAGTTTTTTAAGACTATAGAGTTAGAGTTGGAAAGGAGGTTAGAGGTCTTCATCT 16242529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7194 TGTGTAAGTTTTTTAAGACTATAGAGTTAGAGTTGGAAAGGAGGTTAGAGGTCTTCATCT 7253

 16242530 ACCTTGCTTTATAGATAAAGAAACCGAGGCCTGGAGAACAGCTTCTATGAGGTTGCAAAT 16242589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7254 ACCTTGCTTTATAGATAAAGAAACCGAGGCCTGGAGAACAGCTTCTATGAGGTTGCAAAT 7313

 16242590 ACTTAAAATTGTATTAAATTGCATGACGAGGGTAACACCTTACCATAGCTATCATTGCCT 16242649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7314 ACTTAAAATTGTATTAAATTGCATGACGAGGGTAACACCTTACCATAGCTATCATTGCCT 7373

 16242650 TTGGTGAAAATTTGGCAATTTTTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTGTG 16242709
          ||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||
     7374 TTGGTGAAAATTTGGCAATTTT------TTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTGTG 7427

 16242710 ATGGCGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGCGGGGCGATCTCGGCTCACTGCAA 16242769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7428 ATGGCGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGCGGGGCGATCTCGGCTCACTGCAA 7487

 16242770 GCTGCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCTTCAGCCTCCCG 16242814
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7488 GCTGCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCTTCAGCCTCCCG 7532

Alignment time is 9.21014 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [16229408,16251209] =>     21802 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    5611] =>      5611 nucs 'mol-32-349d-085074_5611'

Score:        5475
Aligned:      5607        nucs
Identic:      5595 (100%) nucs =>      5551 (100%)        44 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [16234706,16240268] EXCISED REGION [16240274,16240317]
 second seq =>  [       1,    5562] EXCISED REGION [    5568,    5611]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         5 nucs [16240269,16240273]
 second seq =>         5 nucs [5563,5567]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [5562,5562] to [5567,5567]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 16234706 TAATTCTGTTGCAGAATAAACATTTTACTTTGGCTACCAGGGATCTCAGAGTCAAATTTA 16234765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TAATTCTGTTGCAGAATAAACATTTTACTTTGGCTACCAGGGATCTCAGAGTCAAATTTA 60

 16234766 AATTCATTCTAGAAATACCTAGGCCCTTATAACCTATATATTTATGTTCTTTCTCCAAAT 16234825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AATTCATTCTAGAAATACCTAGGCCCTTATAACCTATATATTTATGTTCTTTCTCCAAAT 120

 16234826 GCTGACTTTCTAAATTTACTTATATTCCTCAGCTCCTGACTTTTCTTCCTTATTTTTATT 16234885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GCTGACTTTCTAAATTTACTTATATTCCTCAGCTCCTGACTTTTCTTCCTTATTTTTATT 180

 16234886 TTACCATCATTTTAAGTATTTGTATTGTGTGTATTTTTTTGTGAGTGGCTTCAAATCATT 16234945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTACCATCATTTTAAGTATTTGTATTGTGTGTATTTTTTTGTGAGTGGCTTCAAATCATT 240

 16234946 TATGGAAATAAATAGCTTGTAAATTTATAAACCAACAAAATAATTAGCTCCTTTATGAGA 16235005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TATGGAAATAAATAGCTTGTAAATTTATAAACCAACAAAATAATTAGCTCCTTTATGAGA 300

 16235006 TGTTTATGTGTTTTTAAAAATTATTTAGGAATTCTGCTTACCATTACCTAGACTCAATTC 16235065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
      301 TGTTTATGTGTTTTTAAAAATTATTTAGGAATTCTGTTTACCATTACCTAGACTCAATTC 360

 16235066 TCCCTCTCTACACAGGATTTTGCCCTGAGAGTCACACACAGGTTTCCTGTGCATTGAGAG 16235125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCCCTCTCTACACAGGATTTTGCCCTGAGAGTCACACACAGGTTTCCTGTGCATTGAGAG 420

 16235126 TTTTCTGCCTTTCTTAGGACTGGTACCAAGCTAGGGAGCAGCAAGAGTTGGCACATCTTA 16235185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTTTCTGCCTTTCTTAGGACTGGTACCAAGCTAGGGAGCAGCAAGAGTTGGCACATCTTA 480

 16235186 GAAGGTGTTTCCCTCAGACAGGGCCAGCCTCAGCCTGGTTGTCACTCTGCCCGCAGTTCC 16235245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GAAGGTGTTTCCCTCAGACAGGGCCAGCCTCAGCCTGGTTGTCACTCTGCCCGCAGTTCC 540

 16235246 ACCTCACAGATTCCTTTAGGTGTCCGAAGTTTGGGGTCCTTGAGATGGCTCCTATTCAAA 16235305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACCTCACAGATTCCTTTAGGTGTCCGAAGTTTGGGGTCCTTGAGATGGCTCCTATTCAAA 600

 16235306 TGTCCCTCTGAGGAGGAACATAGTTTGAGCAGCAGCTGCAACTCAGAAAGAGGCTCTTCA 16235365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGTCCCTCTGAGGAGGAACATAGTTTGAGCAGCAGCTGCAACTCAGAAAGAGGCTCTTCA 660

 16235366 GAAACACACGTTAAGAAAGTGCCTTTTGTAAGCAAGTGTGAGCTATATACTGCTCCATGT 16235425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GAAACACACGTTAAGAAAGTGCCTTTTGTAAGCAAGTGTGAGCTATATACTGCTCCATGT 720

 16235426 ATCAGGTTGTTATAATTCACTCCACCCTGGACCCACTGATTCTCAACAGACCCAAAGCAA 16235485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATCAGGTTGTTATAATTCACTCCACCCTGGACCCACTGATTCTCAACAGACCCAAAGCAA 780

 16235486 GGCAAACACCAAGCACCCTGTTCACAGACAGCCCCTCAGCAGAGGGAAATGCAAACACCC 16235545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GGCAAACACCAAGCACCCTGTTCACAGACAGCCCCTCAGCAGAGGGAAATGCAAACACCC 840

 16235546 CTGCTATCCAGCCATAAGCCAGCAAAGTGGAAAGGGTGTGAGAGTTTTGAAGGTAGAACA 16235605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTGCTATCCAGCCATAAGCCAGCAAAGTGGAAAGGGTGTGAGAGTTTTGAAGGTAGAACA 900

 16235606 TTCAGCGCTGCCACTTGCCAGCAATGTGAGCTTTGATGTCTTCCCTTCCCTCGAAGCCTC 16235665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTCAGCGCTGCCACTTGCCAGCAATGTGAGCTTTGATGTCTTCCCTTCCCTCGAAGCCTC 960

 16235666 CGTTTCCTTATCTGTAAAATGGGAGTAAGATAGCCCAACCCACGGATTAATTATCAGATG 16235725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CGTTTCCTTATCTGTAAAATGGGAGTAAGATAGCCCAACCCACGGATTAATTATCAGATG 1020

 16235726 AATGTGCAGTGATATATTAAAGGCCTTGCACGGTGTCTGGCATGTTGTTGGCACTCACAG 16235785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AATGTGCAGTGATATATTAAAGGCCTTGCACGGTGTCTGGCATGTTGTTGGCACTCACAG 1080

 16235786 ACACTCCATCCTTGTTTTTTCTTCCATAAAAATAATAAGAGCTTAAATGTCTTCTCTTTT 16235845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ACACTCCATCCTTGTTTTTTCTTCCATAAAAATAATAAGAGCTTAAATGTCTTCTCTTTT 1140

 16235846 AGAAGTGTCTGTTCATGTCCTTTGCCCTCTTTTTAATGGGGCTGTTTGTCTTTTTTCTTG 16235905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGAAGTGTCTGTTCATGTCCTTTGCCCTCTTTTTAATGGGGCTGTTTGTCTTTTTTCTTG 1200

 16235906 TAAATTTGCATAAGTTCCTTGTAGATTCTGGATATTAGACCTTTGTCAGATGGATAGATT 16235965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TAAATTTGCATAAGTTCCTTGTAGATTCTGGATATTAGACCTTTGTCAGATGGATAGATT 1260

 16235966 GCAAAAATTTTCTCCAATTTTGTAGGTTGTCTGTTCACTCTGATATTTCTTTTGCTGTGC 16236025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GCAAAAATTTTCTCCAATTTTGTAGGTTGTCTGTTCACTCTGATATTTCTTTTGCTGTGC 1320

 16236026 AGAAGTGCACATGTATGTTTGTTGCAGCACTATTCATAGTAGTGAAGTCACGGAATCAAC 16236085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AGAAGTGCACATGTATGTTTGTTGCAGCACTATTCATAGTAGTGAAGTCACGGAATCAAC 1380

 16236086 CCAAATGCCCATCAATGATAGACTAGATAAAGAAAATGTGGTACATATGTACCATGGAGT 16236145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CCAAATGCCCATCAATGATAGACTAGATAAAGAAAATGTGGTACATATGTACCATGGAGT 1440

 16236146 ACTACGCAGCCATAAAAAGGAATGAGATCCTGTCCTTTCCAGGGACATGGATGGAGCTGG 16236205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ACTACGCAGCCATAAAAAGGAATGAGATCCTGTCCTTTCCAGGGACATGGATGGAGCTGG 1500

 16236206 AAAACATTATCCTCAGCAAATGAACACAGGAACAGAAAACCAAACACCGCATGTTCTCAC 16236265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AAAACATTATCCTCAGCAAATGAACACAGGAACAGAAAACCAAACACCGCATGTTCTCAC 1560

 16236266 TTATAAGTGGGAGCTGAACAGTGAGAACACATGGACACAGGGAGGGGAGCAACACACACT 16236325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTATAAGTGGGAGCTGAACAGTGAGAACACATGGACACAGGGAGGGGAGCAACACACACT 1620

 16236326 GGGGCCTGTTGTGGGGGCATGGGGAGGGAGAGCATCAGGATAAATAACTAATGCATGTGG 16236385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GGGGCCTGTTGTGGGGGCATGGGGAGGGAGAGCATCAGGATAAATAACTAATGCATGTGG 1680

 16236386 GGCTGAATACCTAGGTGATGGGTTGATGGTGGCAGCAAACCACTATGGCACATGTTTACC 16236445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GGCTGAATACCTAGGTGATGGGTTGATGGTGGCAGCAAACCACTATGGCACATGTTTACC 1740

 16236446 TATGTAGCAAACCTGCACGTCCTGCACATGTATCCTGGAACTTAAAATAAAATTTTAAAA 16236505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TATGTAGCAAACCTGCACGTCCTGCACATGTATCCTGGAACTTAAAATAAAATTTTAAAA 1800

 16236506 AATAGTAAGTGCTAACATTTAAAAATTGTGTGCCAGGTGCTATGCTAGGTTGTAGGAACA 16236565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AATAGTAAGTGCTAACATTTAAAAATTGTGTGCCAGGTGCTATGCTAGGTTGTAGGAACA 1860

 16236566 TAAAAATAAAGAAAATAGTGTCCCTGACCTTGAATGGATGACAGAGATTACTGGACACTT 16236625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TAAAAATAAAGAAAATAGTGTCCCTGACCTTGAATGGATGACAGAGATTACTGGACACTT 1920

 16236626 AACTACACGCATCATCCTATCCAAGCCTCACCACAGCCTCGGGGAGTCCTGATCTTCCCA 16236685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AACTACACGCATCATCCTATCCAAGCCTCACCACAGCCTCGGGGAGTCCTGATCTTCCCA 1980

 16236686 GAAGGCCAGGAGGGGTGTCCCTAGGTCATTTAGTTGTGCCAGAAATGTAGGCCTCAGGCC 16236745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GAAGGCCAGGAGGGGTGTCCCTAGGTCATTTAGTTGTGCCAGAAATGTAGGCCTCAGGCC 2040

 16236746 CAAGCCAAAGACTAGAGCAGAGGTTCTCAAAGTGTGGTCCACAGAAAACAGCAGCATCGG 16236805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CAAGCCAAAGACTAGAGCAGAGGTTCTCAAAGTGTGGTCCACAGAAAACAGCAGCATCGG 2100

 16236806 CATCACCTGGGAGCTTGTTAGAAATGCAAATTCTTCAGCCCCACTCCATCTCCAGAAACT 16236865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CATCACCTGGGAGCTTGTTAGAAATGCAAATTCTTCAGCCCCACTCCATCTCCAGAAACT 2160

 16236866 CTGGGGGTGGGCCCTGCAGTCAGTATTTTAAAAATCCCACCAGGTGATTCTGATGCATGC 16236925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CTGGGGGTGGGCCCTGCAGTCAGTATTTTAAAAATCCCACCAGGTGATTCTGATGCATGC 2220

 16236926 TCAAGTGTGAGCGCTGTGAGGGTGATAATATTGTCATTCATTCTCATTTTACAGATGAGG 16236985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TCAAGTGTGAGCGCTGTGAGGGTGATAATATTGTCATTCATTCTCATTTTACAGATGAGG 2280

 16236986 ACAGTCATTTGCTGAGGATGACGGCAACGCTTCTCAATTGCAATGAGAGGGACTTTGGAT 16237045
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 ACAGTCATTTGCTGAGGATGACAGCAACGCTTCTCAATTGCAATGAGAGGGACTTTGGAT 2340

 16237046 TAAATGATAAAGGAGCTCTTGAGATCTGAGAATTGGGAGATAGTAGACAGCACCACTATG 16237105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TAAATGATAAAGGAGCTCTTGAGATCTGAGAATTGGGAGATAGTAGACAGCACCACTATG 2400

 16237106 AGGCGTAACAGGTTCTTTTTATATGGGAATTTTAAGAGATCCCATAGGACAGCCATATAA 16237165
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     2401 AGGCGTAACAGGTTCTTTTTATATGGGAATTTTAAGAGATCCCATAGGACAACCATATAA 2460

 16237166 TGGGGGCAGCTCCAGCCAGAGCAAAGGAAGCGAGTTAGAGGGTGTGGAGTGTTTCTTGTG 16237225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TGGGGGCAGCTCCAGCCAGAGCAAAGGAAGCGAGTTAGAGGGTGTGGAGTGTTTCTTGTG 2520

 16237226 GCCTTCTCTTCCCCATGGCTCTCTGGCTCTCTTCCCTGCAGGTGTCTGCAGCAGCACCCT 16237285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GCCTTCTCTTCCCCATGGCTCTCTGGCTCTCTTCCCTGCAGGTGTCTGCAGCAGCACCCT 2580

 16237286 CAGGACAGCCTGCCCACAGCCAGCGTCATCCTCTGTTTCCATGATGAGGCCTGGTCCACT 16237345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CAGGACAGCCTGCCCACAGCCAGCGTCATCCTCTGTTTCCATGATGAGGCCTGGTCCACT 2640

 16237346 CTCCTGCGGACTGTACACAGCATCCTCGACACAGTGCCCAGGGCCTTCCTGAAGGAGATC 16237405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CTCCTGCGGACTGTACACAGCATCCTCGACACAGTGCCCAGGGCCTTCCTGAAGGAGATC 2700

 16237406 ATCCTCGTGGACGACCTCAGCCAGCAAGGTAGCCACGGCTTTCCTCCAGGCTCGTCTGGG 16237465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 ATCCTCGTGGACGACCTCAGCCAGCAAGGTAGCCACGGCTTTCCTCCAGGCTCGTCTGGG 2760

 16237466 TGAGCCTTACCCCCTGGCGGGTGGAGTTCTCAAGCAAAAGATTGAAGTTTGGAACTATTT 16237525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TGAGCCTTACCCCCTGGCGGGTGGAGTTCTCAAGCAAAAGATTGAAGTTTGGAACTATTT 2820

 16237526 TAGGCAAGATTCCCCAACTACAGACCTCCAGATGAGGATTAATGGGCAAGTAACTTATGA 16237585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TAGGCAAGATTCCCCAACTACAGACCTCCAGATGAGGATTAATGGGCAAGTAACTTATGA 2880

 16237586 ATGAAGAGCCACTGGGGAAACCAGTAAGGCAGTGGGGGCTGCAAGACAGAGAAGGAGAAA 16237645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 ATGAAGAGCCACTGGGGAAACCAGTAAGGCAGTGGGGGCTGCAAGACAGAGAAGGAGAAA 2940

 16237646 GAGCCCTGCAGGGGAAACAGCCCTGGGGAGGGTCTTGAGGGGTGTCGCCTCAGCCTGATC 16237705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 GAGCCCTGCAGGGGAAACAGCCCTGGGGAGGGTCTTGAGGGGTGTCGCCTCAGCCTGATC 3000

 16237706 CCGTGGGGATCTCTCTCCCAGGTGCCACCCAGTCCAACAATCCTCTCTCCAAGACACTGA 16237765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CCGTGGGGATCTCTCTCCCAGGTGCCACCCAGTCCAACAATCCTCTCTCCAAGACACTGA 3060

 16237766 AGAATCACATAGGGCGGCCCTGTTGTGAGTGCTCACTGCCTCCTAGACCCTGGTGCAGCA 16237825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 AGAATCACATAGGGCGGCCCTGTTGTGAGTGCTCACTGCCTCCTAGACCCTGGTGCAGCA 3120

 16237826 CTTTACACATACGCACATATGTGTATCGGTCCTTCACTCATCATGGCTTAGACAGACCCA 16237885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 CTTTACACATACGCACATATGTGTATCGGTCCTTCACTCATCATGGCTTAGACAGACCCA 3180

 16237886 CTCACTTTCCAGAGGAGGAAACTGGGGCCCAGAGAAGACAGCAGACTGGAGCGGAGTCAG 16237945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 CTCACTTTCCAGAGGAGGAAACTGGGGCCCAGAGAAGACAGCAGACTGGAGCGGAGTCAG 3240

 16237946 CCAAAAGCAGCAGAGTCAGGCCCAGAGCCCAGACTTGCAGAACCTGCCTGTGTGCTTCCT 16238005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 CCAAAAGCAGCAGAGTCAGGCCCAGAGCCCAGACTTGCAGAACCTGCCTGTGTGCTTCCT 3300

 16238006 CTCACAGGAACCTGGCTACTAGGGACAGCCCTAAAAGAAGATGGAGACAGAGAAGCCCCC 16238065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 CTCACAGGAACCTGGCTACTAGGGACAGCCCTAAAAGAAGATGGAGACAGAGAAGCCCCC 3360

 16238066 ACTTGACTCGTAGGTCAGTGGCTCTCACGCTTGAGCATGCATCGGAATCACCTGGTGCGA 16238125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 ACTTGACTCGTAGGTCAGTGGCTCTCACGCTTGAGCATGCATCGGAATCACCTGGTGCGA 3420

 16238126 TTTTTAAAATACTACTGCAGGGCCCACCCCCAGAGTTTCTGGTGATGGAGTGGGGCCGAA 16238185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TTTTTAAAATACTACTGCAGGGCCCACCCCCAGAGTTTCTGGTGATGGAGTGGGGCCGAA 3480

 16238186 GAATTTGCATTTCTAACAAGCTCCCAGGTGATGCTGATGCTGCTGTTTTCTGTGGACCAC 16238245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 GAATTTGCATTTCTAACAAGCTCCCAGGTGATGCTGATGCTGCTGTTTTCTGTGGACCAC 3540

 16238246 ACTCTGAGAACCTCTGCTCTAGTCTTTGGCTTGGGCGTGAGGCCTACATTTCTGGCACAA 16238305
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 ACTTTGAGAACCTCTGCTCTAGTCTTTGGCTTGGGCGTGAGGCCTACATTTCTGGCACAA 3600

 16238306 CTAAATGACCTAGGGACACCCCTCCTGGCCTTCTGGGAAGATCAGAACGCTCTGAGGGAA 16238365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 CTAAATGACCTAGGGACACCCCTCCTGGCCTTCTGGGAAGATCAGAACGCTCTGAGGGAA 3660

 16238366 GCCGAGCATTCACGTTTTTCTAAGGGGAATAATGGAGAAGGGCTAGGGTAGCCAGGTGCC 16238425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 GCCGAGCATTCACGTTTTTCTAAGGGGAATAATGGAGAAGGGCTAGGGTAGCCAGGTGCC 3720

 16238426 TCTGTTAGTTCTTTCTACGGTCCTCACTCCAGGGATGGGCCTAGCCTGGCCATAGCAGTG 16238485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 TCTGTTAGTTCTTTCTACGGTCCTCACTCCAGGGATGGGCCTAGCCTGGCCATAGCAGTG 3780

 16238486 AGTCAGATTAGCCAGAGGCTCTGGGAACACCTGGGGTTCCTGGGTGCAGCTGGCTGCATA 16238545
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     3781 AGTCAGATTAGCCAGAGGCTCTGGGAACACCTGGGGTTCCTGGGTACAGCTGGCTGCATA 3840

 16238546 TTAGGCAGGACTAATGAACAGGTGCAGGACAGGGCTGGGTTGGCGGGTAAAGTGCCCAGA 16238605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 TTAGGCAGGACTAATGAACAGGTGCAGGACAGGGCTGGGTTGGCGGGTAAAGTGCCCAGA 3900

 16238606 GACTCTCCAAACCCTCAAGTGGGGCGGGGTCCGCCCAAGAGCACACCTGTGGTGAGGCCC 16238665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 GACTCTCCAAACCCTCAAGTGGGGCGGGGTCCGCCCAAGAGCACACCTGTGGTGAGGCCC 3960

 16238666 CCACCATCTGATGAGCTGTGTTACGTCTGTGCCCCTCGGGAGTACGGAAAGTGGAGGAGC 16238725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 CCACCATCTGATGAGCTGTGTTACGTCTGTGCCCCTCGGGAGTACGGAAAGTGGAGGAGC 4020

 16238726 TGGGCCCCAGAGAAATGGGCTACCCCAGAGCTGGCAGCCCCACCAGAGGGGATCTGGATC 16238785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 TGGGCCCCAGAGAAATGGGCTACCCCAGAGCTGGCAGCCCCACCAGAGGGGATCTGGATC 4080

 16238786 CCCTGCCAAGCAATTAAGCTGCCCCCTCCTGGCCAACTCCCCTTCTGCCCCTCACCACTG 16238845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 CCCTGCCAAGCAATTAAGCTGCCCCCTCCTGGCCAACTCCCCTTCTGCCCCTCACCACTG 4140

 16238846 GGTTGGCTCTCCATCCAGTGGCCCCATATTTCCTGTTGACATTGGGGTGCAAGGCCTTTT 16238905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 GGTTGGCTCTCCATCCAGTGGCCCCATATTTCCTGTTGACATTGGGGTGCAAGGCCTTTT 4200

 16238906 CCACAACCAAGGGCAGCACTGGTTCTATTTCTGCAGGTCCCTCTCCTCTGTGTGCTTGCC 16238965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 CCACAACCAAGGGCAGCACTGGTTCTATTTCTGCAGGTCCCTCTCCTCTGTGTGCTTGCC 4260

 16238966 AAGACCCAGATCCCAGACAAGCACCACCCTGCACACTGTTTTTATTTAATCCTCTTGGCC 16239025
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 AAGACCCAGATCCCAGACAAGCACCACCTTGCACACTGTTTTTATTTAATCCTCTTGGCC 4320

 16239026 ACCCAGAGAGGCAGGGCTTATCAACCCTACTCTACCTGTGAGGAAAACTGAGACAGAAAA 16239085
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     4321 ACCCAGAGAGGCAGGGCTTATCAACCCTACTCTACCTATGAGGAAAACTGAGACAGAAAA 4380

 16239086 AGATGCTGCGGGTTGCCCTGAGCCACCTTGATGGGCTTCCAAGCCGATGGTCATGACAGC 16239145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 AGATGCTGCGGGTTGCCCTGAGCCACCTTGATGGGCTTCCAAGCCGATGGTCATGACAGC 4440

 16239146 ATAGTGTAGTGTGATAGAATCAGCTAGATGGGTTTCAGGGTATTCGTCTGGGGTGGTGAT 16239205
          ||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 ATAGAGTAGTATGATAGAATCAGCTAGATGGGTTTCAGGGTATTCGTCTGGGGTGGTGAT 4500

 16239206 GCCCACACCAAATCATTAAATCAGAAAATGCTTGCGATGACCAGCCCATGATGACCCTTT 16239265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 GCCCACACCAAATCATTAAATCAGAAAATGCTTGCGATGACCAGCCCATGATGACCCTTT 4560

 16239266 ACAAGTGGAAGTCAGTATTACTGCTGTTTTCTGGAGGGAAGGAGTTGAGGATCATACCAG 16239325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 ACAAGTGGAAGTCAGTATTACTGCTGTTTTCTGGAGGGAAGGAGTTGAGGATCATACCAG 4620

 16239326 CTTTTTCCGAGCACTATACCACTCAGACATGGGTGCTCTTACCCACTTCAAAACCCTCTG 16239385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 CTTTTTCCGAGCACTATACCACTCAGACATGGGTGCTCTTACCCACTTCAAAACCCTCTG 4680

 16239386 AGAATGCCAAACAACCATCGCAGTCTGGAAGTTCTTCCTTATCTATTCCGAAGCTCTCTT 16239445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 AGAATGCCAAACAACCATCGCAGTCTGGAAGTTCTTCCTTATCTATTCCGAAGCTCTCTT 4740

 16239446 GCTAGAAGTCTGTCCTAAATAATACTAACAAGGGTTAGAGGTATAGCTGAAGAGACCAGC 16239505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 GCTAGAAGTCTGTCCTAAATAATACTAACAAGGGTTAGAGGTATAGCTGAAGAGACCAGC 4800

 16239506 AGTCAGCCCAAGGAGGGCTTCATAAATTAATGTTTGGTGGGAATATCAGTGAAGGACTAT 16239565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 AGTCAGCCCAAGGAGGGCTTCATAAATTAATGTTTGGTGGGAATATCAGTGAAGGACTAT 4860

 16239566 ATTTGGCTGCACAGAACAGAAACCTGCTGCAGTGACTTAACCAATGAATAGAGATTTATT 16239625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 ATTTGGCTGCACAGAACAGAAACCTGCTGCAGTGACTTAACCAATGAATAGAGATTTATT 4920

 16239626 TTTCCTTATAGTATAGAAAGCTCACAGGGTGGCAATGCAGTATTGGTGTGACAGCTCCAC 16239685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 TTTCCTTATAGTATAGAAAGCTCACAGGGTGGCAATGCAGTATTGGTGTGACAGCTCCAC 4980

 16239686 AATGCCATTGGACACCCACCTTCATCTGCTTTCCACTTCAACATGCTTAGAGAGTAGTTT 16239745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 AATGCCATTGGACACCCACCTTCATCTGCTTTCCACTTCAACATGCTTAGAGAGTAGTTT 5040

 16239746 TGGCCTCATAATCACAACAGGGCTGCTCTACCTCTGGACATCACATACATATTTCAAATA 16239805
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 TGGCCTCATAATCACAACAGGGCTGTTCTACCTCTGGACATCACATACATATTTCAAATA 5100

 16239806 GGGAAAAGGCGAAGAAGAGATAGGCAGAGGCCAGTCCGGTTTGTGCTCTTCGGAAAAAAA 16239865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 GGGAAAAGGCGAAGAAGAGATAGGCAGAGGCCAGTCCGGTTTGTGCTCTTCGGAAAAAAA 5160

 16239866 AAATTAGTAAAATAATAGTTTTCCCAGAATCCTTTCATTCATTTTATTTCTACCAGAGCT 16239925
          || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 AA-TTAGTAAAATAATAGTTTTCCCAGAATCCTTTCATTCATTTTATTTCTACCAGAGCT 5219

 16239926 GCTGCCAGCAGTGACAGGAAGTCTCGAGAGATACGTGTTTTTAGCTGTCCCGAGAAACAT 16239985
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     5220 GCTGCCAGCAGTGACAGGAAGTCTCGAGAGATACGTGTTTTTAGCTGCCCCGAGAAACAT 5279

 16239986 CAAAGTTCTGTCAGTACAGTGGAAGGGGAGAATGAATGGTGAGGAAGATGTTACATTTAG 16240045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5280 CAAAGTTCTGTCAGTACAGTGGAAGGGGAGAATGAATGGTGAGGAAGATGTTACATTTAG 5339

 16240046 CAATGTTAAAGCCAATGAAGTCACTGAGGGGCTGCTTCTCAGATATGCAAGTCCAGAAAT 16240105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5340 CAATGTTAAAGCCAATGAAGTCACTGAGGGGCTGCTTCTCAGATATGCAAGTCCAGAAAT 5399

 16240106 GTTAATAGCTTGACTAACAGAGATTCCTCTCTAGGGAGTGGACCAGGGCTGACAGTCTTA 16240165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5400 GTTAATAGCTTGACTAACAGAGATTCCTCTCTAGGGAGTGGACCAGGGCTGACAGTCTTA 5459

 16240166 CCAGAAAAATAATTATAAAGTAACACATCAACGAAGCATTTTACCAGTGAGAATTGCAAC 16240225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5460 CCAGAAAAATAATTATAAAGTAACACATCAACGAAGCATTTTACCAGTGAGAATTGCAAC 5519

 16240226 AGCCCAGTGACTGGGACTCCTTTCCTCTACTGCTCAGGACATT 16240268
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5520 AGCCCAGTGACTGGGACTCCTTTCCTCTACTGCTCAGGACATT 5562

EXCISED REGION

 16240274 CCCTGCAGAAAATCCATGGTGCTTAGAAGACAGATTCCCAGGGA 16240317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5568 CCCTGCAGAAAATCCATGGTGCTTAGAAGACAGATTCCCAGGGA 5611

Alignment time is 6.88039 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [16229408,16251209] =>     21802 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    5690] =>      5690 nucs 'mol-32-34b3-168823_5690'

Score:        5516
Aligned:      5691        nucs
Identic:      5671 (100%) nucs =>       849 (100%)      4822 (100%)
Gaps:            8 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [16238298,16239149] EXCISED REGION [16239157,16243995]
 second seq =>  [       1,     852] EXCISED REGION [     860,    5690]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         7 nucs [16239150,16239156]
 second seq =>         7 nucs [853,859]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         6 nucs [16242672,16242677]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [16239149,16239151] to [16239156,16239158]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [16239150,16239151] to [16239155,16239156]
 second seq =>         1 nucs [853,853] to [859,859]

 16238298 TGGCACAACTAAATGACCTAGGGACACCCCTCCTGGCCTTCTGGGAAGATCAGAACGCTC 16238357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGGCACAACTAAATGACCTAGGGACACCCCTCCTGGCCTTCTGGGAAGATCAGAACGCTC 60

 16238358 TGAGGGAAGCCGAGCATTCACGTTTTTCTAAGGGGAATAATGGAGAAGGGCTAGGGTAGC 16238417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGAGGGAAGCCGAGCATTCACGTTTTTCTAAGGGGAATAATGGAGAAGGGCTAGGGTAGC 120

 16238418 CAGGTGCCTCTGTTAGTTCTTTCTACGGTCCTCACTCCAGGGATGGGCCTAGCCTGGCCA 16238477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAGGTGCCTCTGTTAGTTCTTTCTACGGTCCTCACTCCAGGGATGGGCCTAGCCTGGCCA 180

 16238478 TAGCAGTGAGTCAGATTAGCCAGAGGCTCTGGGAACACCTGGGGTTCCTGGGTGCAGCTG 16238537
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
      181 TAGCAGTGAGTCAGATTAGCCAGAGGCTCTGGGAACACCTGGGGTTCCTGGGTACAGCTG 240

 16238538 GCTGCATATTAGGCAGGACTAATGAACAGGTGCAGGACAGGGCTGGGTTGGCGGGTAAAG 16238597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GCTGCATATTAGGCAGGACTAATGAACAGGTGCAGGACAGGGCTGGGTTGGCGGGTAAAG 300

 16238598 TGCCCAGAGACTCTCCAAACCCTCAAGTGGGGCGGGGTCCGCCCAAGAGCACACCTGTGG 16238657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGCCCAGAGACTCTCCAAACCCTCAAGTGGGGCGGGGTCCGCCCAAGAGCACACCTGTGG 360

 16238658 TGAGGCCCCCACCATCTGATGAGCTGTGTTACGTCTGTGCCCCTCGGGAGTACGGAAAGT 16238717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGAGGCCCCCACCATCTGATGAGCTGTGTTACGTCTGTGCCCCTCGGGAGTACGGAAAGT 420

 16238718 GGAGGAGCTGGGCCCCAGAGAAATGGGCTACCCCAGAGCTGGCAGCCCCACCAGAGGGGA 16238777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGAGGAGCTGGGCCCCAGAGAAATGGGCTACCCCAGAGCTGGCAGCCCCACCAGAGGGGA 480

 16238778 TCTGGATCCCCTGCCAAGCAATTAAGCTGCCCCCTCCTGGCCAACTCCCCTTCTGCCCCT 16238837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCTGGATCCCCTGCCAAGCAATTAAGCTGCCCCCTCCTGGCCAACTCCCCTTCTGCCCCT 540

 16238838 CACCACTGGGTTGGCTCTCCATCCAGTGGCCCCATATTTCCTGTTGACATTGGGGTGCAA 16238897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CACCACTGGGTTGGCTCTCCATCCAGTGGCCCCATATTTCCTGTTGACATTGGGGTGCAA 600

 16238898 GGCCTTTTCCACAACCAAGGGCAGCACTGGTTCTATTTCTGCAGGTCCCTCTCCTCTGTG 16238957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GGCCTTTTCCACAACCAAGGGCAGCACTGGTTCTATTTCTGCAGGTCCCTCTCCTCTGTG 660

 16238958 TGCTTGCCAAGACCCAGATCCCAGACAAGCACCACCCTGCACACTGTTTTTATTTAATCC 16239017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
      661 TGCTTGCCAAGACCCAGATCCCAGACAAGCACCACCTTGCACACTGTTTTTATTTAATCC 720

 16239018 TCTTGGCCACCCAGAGAGGCAGGGCTTATCAACCCTACTCTACCTGTGAGGAAAACTGAG 16239077
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
      721 TCTTGGCCACCCAGAGAGGCAGGGCTTATCAACCCTACTCTACCTATGAGGAAAACTGAG 780

 16239078 ACAGAAAAAGATGCTGCGGGTTGCCCTGAGCCACCTTGATGGGCTTCCAAGCCGATGGTC 16239137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ACAGAAAAAGATGCTGCGGGTTGCCCTGAGCCACCTTGATGGGCTTCCAAGCCGATGGTC 840

 16239138 ATGACAGCATAG 16239149
          ||||||||||||
      841 ATGACAGCATAG 852

EXCISED REGION

 16239157 TGATAGAATCAGCTAGATGGGTTTCAGGGTATTCGTCTGGGGTGGTGATGCCCACACCAA 16239216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      860 TGATAGAATCAGCTAGATGGGTTTCAGGGTATTCGTCTGGGGTGGTGATGCCCACACCAA 919

 16239217 ATCATTAAATCAGAAAATGCTTGCGATGACCAGCCCATGATGACCCTTTACAAGTGGAAG 16239276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      920 ATCATTAAATCAGAAAATGCTTGCGATGACCAGCCCATGATGACCCTTTACAAGTGGAAG 979

 16239277 TCAGTATTACTGCTGTTTTCTGGAGGGAAGGAGTTGAGGATCATACCAGCTTTTTCCGAG 16239336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      980 TCAGTATTACTGCTGTTTTCTGGAGGGAAGGAGTTGAGGATCATACCAGCTTTTTCCGAG 1039

 16239337 CACTATACCACTCAGACATGGGTGCTCTTACCCACTTCAAAACCCTCTGAGAATGCCAAA 16239396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1040 CACTATACCACTCAGACATGGGTGCTCTTACCCACTTCAAAACCCTCTGAGAATGCCAAA 1099

 16239397 CAACCATCGCAGTCTGGAAGTTCTTCCTTATCTATTCCGAAGCTCTCTTGCTAGAAGTCT 16239456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1100 CAACCATCGCAGTCTGGAAGTTCTTCCTTATCTATTCCGAAGCTCTCTTGCTAGAAGTCT 1159

 16239457 GTCCTAAATAATACTAACAAGGGTTAGAGGTATAGCTGAAGAGACCAGCAGTCAGCCCAA 16239516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1160 GTCCTAAATAATACTAACAAGGGTTAGAGGTATAGCTGAAGAGACCAGCAGTCAGCCCAA 1219

 16239517 GGAGGGCTTCATAAATTAATGTTTGGTGGGAATATCAGTGAAGGACTATATTTGGCTGCA 16239576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1220 GGAGGGCTTCATAAATTAATGTTTGGTGGGAATATCAGTGAAGGACTATATTTGGCTGCA 1279

 16239577 CAGAACAGAAACCTGCTGCAGTGACTTAACCAATGAATAGAGATTTATTTTTCCTTATAG 16239636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1280 CAGAACAGAAACCTGCTGCAGTGACTTAACCAATGAATAGAGATTTATTTTTCCTTATAG 1339

 16239637 TATAGAAAGCTCACAGGGTGGCAATGCAGTATTGGTGTGACAGCTCCACAATGCCATTGG 16239696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1340 TATAGAAAGCTCACAGGGTGGCAATGCAGTATTGGTGTGACAGCTCCACAATGCCATTGG 1399

 16239697 ACACCCACCTTCATCTGCTTTCCACTTCAACATGCTTAGAGAGTAGTTTTGGCCTCATAA 16239756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1400 ACACCCACCTTCATCTGCTTTCCACTTCAACATGCTTAGAGAGTAGTTTTGGCCTCATAA 1459

 16239757 TCACAACAGGGCTGCTCTACCTCTGGACATCACATACATATTTCAAATAGGGAAAAGGCG 16239816
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1460 TCACAACAGGGCTGTTCTACCTCTGGACATCACATACATATTTCAAATAGGGAAAAGGCG 1519

 16239817 AAGAAGAGATAGGCAGAGGCCAGTCCGGTTTGTGCTCTTCGGAAAAAAAAAATTAGTAAA 16239876
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
     1520 AAGAAGAGATAGGCAGAGGCCAGTCCGGTTTGTGCTCTTCGG-AAAAAAAAATTAGTAAA 1578

 16239877 ATAATAGTTTTCCCAGAATCCTTTCATTCATTTTATTTCTACCAGAGCTGCTGCCAGCAG 16239936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1579 ATAATAGTTTTCCCAGAATCCTTTCATTCATTTTATTTCTACCAGAGCTGCTGCCAGCAG 1638

 16239937 TGACAGGAAGTCTCGAGAGATACGTGTTTTTAGCTGTCCCGAGAAACATCAAAGTTCTGT 16239996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1639 TGACAGGAAGTCTCGAGAGATACGTGTTTTTAGCTGCCCCGAGAAACATCAAAGTTCTGT 1698

 16239997 CAGTACAGTGGAAGGGGAGAATGAATGGTGAGGAAGATGTTACATTTAGCAATGTTAAAG 16240056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1699 CAGTACAGTGGAAGGGGAGAATGAATGGTGAGGAAGATGTTACATTTAGCAATGTTAAAG 1758

 16240057 CCAATGAAGTCACTGAGGGGCTGCTTCTCAGATATGCAAGTCCAGAAATGTTAATAGCTT 16240116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1759 CCAATGAAGTCACTGAGGGGCTGCTTCTCAGATATGCAAGTCCAGAAATGTTAATAGCTT 1818

 16240117 GACTAACAGAGATTCCTCTCTAGGGAGTGGACCAGGGCTGACAGTCTTACCAGAAAAATA 16240176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1819 GACTAACAGAGATTCCTCTCTAGGGAGTGGACCAGGGCTGACAGTCTTACCAGAAAAATA 1878

 16240177 ATTATAAAGTAACACATCAACGAAGCATTTTACCAGTGAGAATTGCAACAGCCCAGTGAC 16240236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1879 ATTATAAAGTAACACATCAACGAAGCATTTTACCAGTGAGAATTGCAACAGCCCAGTGAC 1938

 16240237 TGGGACTCCTTTCCTCTACTGCTCAGGACATTGTTCACCCTGCAGAAAATCCATGGTGCT 16240296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1939 TGGGACTCCTTTCCTCTACTGCTCAGGACATTGTTCTCCCTGCAGAAAATCCATGGTGCT 1998

 16240297 TAGAAGACAGATTCCCAGGGAAGGAGTGTATGAAGTCTGCTGGGGGCTCTCGGGTGGGGC 16240356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1999 TAGAAGACAGATTCCCAGGGAAGGAGTGTATGAAGTCTGCTGGGGGCTCTCGGGTGGGGC 2058

 16240357 TGCCTTAACCTTCTCCAGCCTCCCCAGAGATCCAGCTACCAAAGCAGCCAGGCTACTTGT 16240416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2059 TGCCTTAACCTTCTCCAGCCTCCCCAGAGATCCAGCTACCAAAGCAGCCAGGCTACTTGT 2118

 16240417 ATCCACAGTTAAGGCCACCTCTGGGCTGGGGAACTGGGGGGGAAATTCTTGCTTTTTGGC 16240476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2119 ATCCACAGTTAAGGCCACCTCTGGGCTGGGGAACTGGGGGGGAAATTCTTGCTTTTTGGC 2178

 16240477 TCAGTTCTGTTCAATGCACATGTACTGAGTGCCTACTGTGGGCCAGGCCCTGCACTAAGG 16240536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2179 TCAGTTCTGTTCAATGCACATGTACTGAGTGCCTACTGTGGGCCAGGCCCTGCACTAAGG 2238

 16240537 GTTAGAGCAGAAGAGATGCATTAGGTACAACCCCTGTCCTTGGGGAGATCTTAGTCCACT 16240596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2239 GTTAGAGCAGAAGAGATGCATTAGGTACAACCCCTGTCCTTGGGGAGATCTTAGTCCACT 2298

 16240597 GGCCTGGGGGGACTCCCCATTTCCAAGACTTCATGGAGACCACTGCTTCTCTGTGAACAC 16240656
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2299 GGCCTGGGGGGACTCCCCGTTTCCAAGACTTCATGGAGACCACTGCTTCTCTGTGAACAC 2358

 16240657 ATTGTTCCTTCCATCTCCACTGGCTTGTTCCTCTTGGTGTGTGTGTACACAGACATGCAC 16240716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2359 ATTGTTCCTTCCATCTCCACTGGCTTGTTCCTCTTGGTGTGTGTGTACACAGACATGCAC 2418

 16240717 ACACACACACACATGCACTCACACACACAATCAAGTTATTCTTATCTTAAACACAAAACC 16240776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2419 ACACACACACACATGCACTCACACACACAATCAAGTTATTCTTATCTTAAACACAAAACC 2478

 16240777 TAACAAGCTTCTCTCATCCTTTCCGTCATCTTCTTAGGCCTCTTTTTCTCCCTTCCCCTA 16240836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2479 TAACAAGCTTCTCTCATCCTTTCCGTCATCTTCTTAGGCCTCTTTTTCTCCCTTCCCCTA 2538

 16240837 TAGAATCAACCTTCCTAACCGTCTGGACTCTTGGTCTCAGTTTTTCATCTTCCGTTTTCT 16240896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2539 TAGAATCAACCTTCCTAACCGTCTGGACTCTTGGTCTCAGTTTTTCATCTTCCGTTTTCT 2598

 16240897 CTCCCGGACCCACTGTGTTGCAGACTCCCCTATCAACTGCAATGAGATCTCTTTGACCAG 16240956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2599 CTCCCGGACCCACTGTGTTGCAGACTCCCCTATCAACTGCAATGAGATCTCTTTGACCAG 2658

 16240957 CACCACCAATCTCCTACCAGCTGCCAAATTTAATGGAGCCTTTTGCCTTTGACTTCCTTG 16241016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2659 CACCACCAATCTCCTACCAGCTGCCAAATTTAATGGAGCCTTTTGCCTTTGACTTCCTTG 2718

 16241017 ACCACTGTCTTAGGTCAGGTTTCCTGAAAGCAGGGCCTGAGATGGAGATTCACGTGCATT 16241076
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     2719 ACCACTGTCTTAGGTCAGGTTTCCTGAAAGCAGGGCCTGAGATGGAGATTCACGTGCATG 2778

 16241077 TGATTTTTTTGAGGGTGTACTCTCAGGGGAAATCTGTAGGGGAGTGAGTGATACAGAAGA 16241136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2779 TGATTTTTTTGAGGGTGTACTCTCAGGGGAAATCTGTAGGGGAGTGAGTGATACAGAAGA 2838

 16241137 GAGAGAGGGAAGAGCTGAACAAATATGTGGTTTCAGGTGAAGTCCAGCCATAGCCTGATC 16241196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2839 GAGAGAGGGAAGAGCTGAACAAATATGTGGTTTCAGGTGAAGTCCAGCCATAGCCTGATC 2898

 16241197 CCATGGGGGACTCTGGAGCACAGGCTGCACTGCGGGGTCTGTCTTGCTTTTTACCCTGCA 16241256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2899 CCATGGGGGACTCTGGAGCACAGGCTGCACTGCGGGGTCTGTCTTGCTTTTTACCCTGCA 2958

 16241257 ATGGTCAGTCATTGACCATGACTGGGGCTGGGGGCAGCATCCTGCATGACTGTCTGGCAC 16241316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2959 ATGGTCAGTCATTGACCATGACTGGGGCTGGGGGCAGCATCCTGCATGACTGTCTGGCAC 3018

 16241317 CTGCAGCAGAGACCGTTTTAATACCCCAAGGCAAGTCTCCAGGGAAGGGTTAAGATTTCA 16241376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3019 CTGCAGCAGAGACCGTTTTAATACCCCAAGGCAAGTCTCCAGGGAAGGGTTAAGATTTCA 3078

 16241377 GTTAGCACCCACAGCAGCTGGGGACATGCAAACCAAACCAAAACAGTTAAGGGGAGCTCA 16241436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3079 GTTAGCACCCACAGCAGCTGGGGACATGCAAACCAAACCAAAACAGTTAAGGGGAGCTCA 3138

 16241437 GGGAATCTGAGTAGGACACTATATTAGTCTGTTCTCACACTGCTATAAAGAACTGCCTGA 16241496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3139 GGGAATCTGAGTAGGACACTATATTAGTCTGTTCTCACACTGCTATAAAGAACTGCCTGA 3198

 16241497 GACTAGGTAATTTATAAAGAAAGGAGGTTTAATTGACTCACAGTTTCGCATGGCTGGGGA 16241556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3199 GACTAGGTAATTTATAAAGAAAGGAGGTTTAATTGACTCACAGTTTCGCATGGCTGGGGA 3258

 16241557 GGCCTCAGGAAACTTACAATCATGGTGGAAGGGGAAGCATGTCTTACATGGCAGCAAGTG 16241616
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3259 GGCCTCAGGAAACTTACAATCACGGTGGAAGGGGAAGCATGTCTTACATGGCAGCAAGTG 3318

 16241617 AGAGAAAGAGAGAGAGAGAGGAGGAAAAACTATCAAACACTTATATAATCATCAGATCTC 16241676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3319 AGAGAAAGAGAGAGAGAGAGGAGGAAAAACTATCAAACACTTATATAATCATCAGATCTC 3378

 16241677 ATGAGAACTCACTATCACGAGAACAGCATGGGGGAAACTGCCCACATGATCCAATCACCT 16241736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3379 ATGAGAACTCACTATCACGAGAACAGCATGGGGGAAACTGCCCACATGATCCAATCACCT 3438

 16241737 CCCACCAGGTCCCTCCCTCGCCACATAGGGATTATGGGGATTACCACTCAAGATGAGATC 16241796
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     3439 CCCACCAGGTCCCTCCCTCGACACATAGGGATTATGGGGATTACAACTCAAGATGAGATC 3498

 16241797 TGGGTGGGGACAAAGAGCCAAACCATATCAGACACCAACAGTATCTGCTACATTCTTGCT 16241856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3499 TGGGTGGGGACAAAGAGCCAAACCATATCAGACACCAACAGTATCTGCTACATTCTTGCT 3558

 16241857 GCTGCATTTGGAGAATGTTAGCAAGTTCTCCCCTTTCCTGGTTTTCTGACACCATCCCTC 16241916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3559 GCTGCATTTGGAGAATGTTAGCAAGTTCTCCCCTTTCCTGGTTTTCTGACACCATCCCTC 3618

 16241917 TAATTTTTACTGGAGAGAATCATGGCCCACCCCAACCTAACCAAGCATCTTACATCTCAG 16241976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3619 TAATTTTTACTGGAGAGAATCATGGCCCACCCCAACCTAACCAAGCATCTTACATCTCAG 3678

 16241977 CAACAACCACACTGTAGTAATGTTTTCGGTTCTTAGGACCCAGGTGCTCACCACAGCTTC 16242036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3679 CAACAACCACACTGTAGTAATGTTTTCGGTTCTTAGGACCCAGGTGCTCACCACAGCTTC 3738

 16242037 CAAAAGAGAGTTGCTGACGATTGTCTTAGTCACAATCTCATCGGTTGTGGCATTTGTCAT 16242096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3739 CAAAAGAGAGTTGCTGACGATTGTCTTAGTCACAATCTCATCGGTTGTGGCATTTGTCAT 3798

 16242097 TCCACTGACCACAACCCTGTTGATTCCAGGACAACTCAAGTCTGCTCTCAGCGAATATGT 16242156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3799 TCCACTGACCACAACCCTGTTGATTCCAGGACAACTCAAGTCTGCTCTCAGCGAATATGT 3858

 16242157 GGCCAGGCTGGAGGGGGTGAAGTTACTCAGGAGCAACAAGAGGCTGGGTGCCATCAGGGC 16242216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3859 GGCCAGGCTGGAGGGGGTGAAGTTACTCAGGAGCAACAAGAGGCTGGGTGCCATCAGGGC 3918

 16242217 CCGGATGCTGGGGGCCACCAGAGCCACCGGGGATGTGCTCGTCTTCATGGATGCCCACTG 16242276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3919 CCGGATGCTGGGGGCCACCAGAGCCACCGGGGATGTGCTCGTCTTCATGGATGCCCACTG 3978

 16242277 CGAGTGCCACCCAGGCTGGCTGGAGCCCCTCCTCAGCAGAATAGCTGGTGACAGGTAACT 16242336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3979 CGAGTGCCACCCAGGCTGGCTGGAGCCCCTCCTCAGCAGAATAGCTGGTGACAGGTAACT 4038

 16242337 TATTCCCTGGGCTTGCAAAGCAAGACATGGAACTGGGAGAAACAGTCTACAGCATCAGCC 16242396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4039 TATTCCCTGGGCTTGCAAAGCAAGACATGGAACTGGGAGAAACAGTCTACAGCATCAGCC 4098

 16242397 ACTCACAGAGCAACCCACCTATTAATTCCTGAATCTCCATTAGAGAGTGATATATTCCCT 16242456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4099 ACTCACAGAGCAACCCACCTATTAATTCCTGAATCTCCATTAGAGAGTGATATATTCCCT 4158

 16242457 TCGGGTTTTCAGATGTGTAAGTTTTTTAAGACTATAGAGTTAGAGTTGGAAAGGAGGTTA 16242516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4159 TCGGGTTTTCAGATGTGTAAGTTTTTTAAGACTATAGAGTTAGAGTTGGAAAGGAGGTTA 4218

 16242517 GAGGTCTTCATCTACCTTGCTTTATAGATAAAGAAACCGAGGCCTGGAGAACAGCTTCTA 16242576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4219 GAGGTCTTCATCTACCTTGCTTTATAGATAAAGAAACCGAGGCCTGGAGAACAGCTTCTA 4278

 16242577 TGAGGTTGCAAATACTTAAAATTGTATTAAATTGCATGACGAGGGTAACACCTTACCATA 16242636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4279 TGAGGTTGCAAATACTTAAAATTGTATTAAATTGCATGACGAGGGTAACACCTTACCATA 4338

 16242637 GCTATCATTGCCTTTGGTGAAAATTTGGCAATTTTTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTCT 16242696
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||
     4339 GCTATCATTGCCTTTGGTGAAAATTTGGCAATTTT------TTTTTCTTTTTCTTTTTCT 4392

 16242697 TTTTCTTTTTGTGATGGCGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGCGGGGCGATCT 16242756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4393 TTTTCTTTTTGTGATGGCGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGCGGGGCGATCT 4452

 16242757 CGGCTCACTGCAAGCTGCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCTTCAGCCTCCCGAG 16242816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4453 CGGCTCACTGCAAGCTGCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCTTCAGCCTCCCGAG 4512

 16242817 TAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACCACACCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAG 16242876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4513 TAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACCACACCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAG 4572

 16242877 AAGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACTTCGTGATCCGCCCTC 16242936
          ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4573 AAGGGGTTTCACCGTGTTAGCCA-GATGGTCTCGATCTCCTGACTTCGTGATCCGCCCTC 4631

 16242937 CTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCTGGCCGAAAATTCG 16242996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4632 CTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCTGGCCGAAAATTCG 4691

 16242997 TCAATTTTAATCAAGCTTGTAACATAACCTGGGGAAAAAGTCTCTGAACTACACTAGGCC 16243056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4692 TCAATTTTAATCAAGCTTGTAACATAACCTGGGGAAAAAGTCTCTGAACTACACTAGGCC 4751

 16243057 GTAGATTACTCACCCATAAAAAGAAAACATTATGTTCTCTGATCACTAAACAGCATTCTT 16243116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4752 GTAGATTACTCACCCATAAAAAGAAAACATTATGTTCTCTGATCACTAAACAGCATTCTT 4811

 16243117 TGTTTCCCCAGTTTATATAAGGGGTCCCTAATTTTCTACCTAAGGCCAGTCCTTGGAAAT 16243176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4812 TGTTTCCCCAGTTTATATAAGGGGTCCCTAATTTTCTACCTAAGGCCAGTCCTTGGAAAT 4871

 16243177 GTGAAGTTGGAGAGGACTGCATTACATTACCCTGTAGACAAGCATCTTAACATTTTTCTT 16243236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4872 GTGAAGTTGGAGAGGACTGCATTACATTACCCTGTAGACAAGCATCTTAACATTTTTCTT 4931

 16243237 GATCATTTCTCTGCTCTCCTTCCCCCATCTGACCGTCAATCTCTTTCTCACTTCCTTGCT 16243296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4932 GATCATTTCTCTGCTCTCCTTCCCCCATCTGACCGTCAATCTCTTTCTCACTTCCTTGCT 4991

 16243297 CAAGACAAACAGTTCCTAAACATGTCTAGTCAAACATTACCCTCAATCTGAATATCCTAC 16243356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4992 CAAGACAAACAGTTCCTAAACATGTCTAGTCAAACATTACCCTCAATCTGAATATCCTAC 5051

 16243357 CCAGGAAAACTGAAACCTGGTGGCTGGCCCACCTTGGACCACCTCAGGCATACCACTTGG 16243416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5052 CCAGGAAAACTGAAACCTGGTGGCTGGCCCACCTTGGACCACCTCAGGCATACCACTTGG 5111

 16243417 AGCTCATGTAGGCATGTAGCAGAGTAGAACCACAATCAATAATTGTTTGATGGTGCCCAG 16243476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5112 AGCTCATGTAGGCATGTAGCAGAGTAGAACCACAATCAATAATTGTTTGATGGTGCCCAG 5171

 16243477 CAAGACAGGACCAATGCTAGAACCAAGCCTTATGACTTCTACCCATGATGAATGTTTATT 16243536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5172 CAAGACAGGACCAATGCTAGAACCAAGCCTTATGACTTCTACCCATGATGAATGTTTATT 5231

 16243537 ATCTCACCTGAAGTTAGGGATGATCAATCAAATATAAGAAAAAATTCCTGGACCAGATCG 16243596
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     5232 ATCTCACCTGAAGTTAGGGATGATCAATCAAATATAAGAAAAAATTCCTGGACCAGATCA 5291

 16243597 GAATGAATCCTGGAGACATAGGAGTTACCATCAGCCAAATGGAGATGGTTTCAAACGTTC 16243656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5292 GAATGAATCCTGGAGACATAGGAGTTACCATCAGCCAAATGGAGATGGTTTCAAACGTTC 5351

 16243657 AAATGACAGAAAGTAAATTGTTAATAGTTCAGCATTCCATTTTAACAAAGAAGAACAATC 16243716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5352 AAATGACAGAAAGTAAATTGTTAATAGTTCAGCATTCCATTTTAACAAAGAAGAACAATC 5411

 16243717 GGAACTCAAGTGAGATCAAGACAGATTAATGTTTCCCAGTTTCATGAGACAGATTGTCTC 16243776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5412 GGAACTCAAGTGAGATCAAGACAGATTAATGTTTCCCAGTTTCATGAGACAGATTGTCTC 5471

 16243777 TTGACTCACATCTCATAAGAAAAGAAGACACACATAAATTCAGCACTAGGACAAGAACTA 16243836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5472 TTGACTCACATCTCATAAGAAAAGAAGACACACATAAATTCAGCACTAGGACAAGAACTA 5531

 16243837 GGACACAAAAATGCACAAGCTGGCCAGGCACGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTT 16243896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5532 GGACACAAAAATGCACAAGCTGGCCAGGCACGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTT 5591

 16243897 TGGGAGGCCGAGGCAGACGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACA 16243956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5592 TGGGAGGCCGAGGCAGACGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACA 5651

 16243957 TGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAAC 16243995
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5652 TGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAAC 5690

Alignment time is 7.00174 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [16229408,16251209] =>     21802 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    4157] =>      4157 nucs 'mol-32-34be-204230_4157'

Score:        4098
Aligned:      4163        nucs
Identic:      4153 (100%) nucs =>      2566 (100%)      1587 ( 99%)
Gaps:            6 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [16236841,16239408] EXCISED REGION [16241210,16242804]
 second seq =>  [       1,    2568] EXCISED REGION [    2569,    4157]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1801 nucs [16239409,16241209]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [16239409,16239409] to [16241210,16241210]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [16239409,16239410] to [16241208,16241209]
 second seq =>         0 nucs

 16236841 CAGCCCCACTCCATCTCCAGAAACTCTGGGGGTGGGCCCTGCAGTCAGTATTTTAAAAAT 16236900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CAGCCCCACTCCATCTCCAGAAACTCTGGGGGTGGGCCCTGCAGTCAGTATTTTAAAAAT 60

 16236901 CCCACCAGGTGATTCTGATGCATGCTCAAGTGTGAGCGCTGTGAGGGTGATAATATTGTC 16236960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCCACCAGGTGATTCTGATGCATGCTCAAGTGTGAGCGCTGTGAGGGTGATAATATTGTC 120

 16236961 ATTCATTCTCATTTTACAGATGAGGACAGTCATTTGCTGAGGATGACGGCAACGCTTCTC 16237020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATTCATTCTCATTTTACAGATGAGGACAGTCATTTGCTGAGGATGACGGCAACGCTTCTC 180

 16237021 AATTGCAATGAGAGGGACTTTGGATTAAATGATAAAGGAGCTCTTGAGATCTGAGAATTG 16237080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AATTGCAATGAGAGGGACTTTGGATTAAATGATAAAGGAGCTCTTGAGATCTGAGAATTG 240

 16237081 GGAGATAGTAGACAGCACCACTATGAGGCGTAACAGGTTCTTTTTATATGGGAATTTTAA 16237140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGAGATAGTAGACAGCACCACTATGAGGCGTAACAGGTTCTTTTTATATGGGAATTTTAA 300

 16237141 GAGATCCCATAGGACAGCCATATAATGGGGGCAGCTCCAGCCAGAGCAAAGGAAGCGAGT 16237200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GAGATCCCATAGGACAGCCATATAATGGGGGCAGCTCCAGCCAGAGCAAAGGAAGCGAGT 360

 16237201 TAGAGGGTGTGGAGTGTTTCTTGTGGCCTTCTCTTCCCCATGGCTCTCTGGCTCTCTTCC 16237260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TAGAGGGTGTGGAGTGTTTCTTGTGGCCTTCTCTTCCCCATGGCTCTCTGGCTCTCTTCC 420

 16237261 CTGCAGGTGTCTGCAGCAGCACCCTCAGGACAGCCTGCCCACAGCCAGCGTCATCCTCTG 16237320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTGCAGGTGTCTGCAGCAGCACCCTCAGGACAGCCTGCCCACAGCCAGCGTCATCCTCTG 480

 16237321 TTTCCATGATGAGGCCTGGTCCACTCTCCTGCGGACTGTACACAGCATCCTCGACACAGT 16237380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTCCATGATGAGGCCTGGTCCACTCTCCTGCGGACTGTACACAGCATCCTCGACACAGT 540

 16237381 GCCCAGGGCCTTCCTGAAGGAGATCATCCTCGTGGACGACCTCAGCCAGCAAGGTAGCCA 16237440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GCCCAGGGCCTTCCTGAAGGAGATCATCCTCGTGGACGACCTCAGCCAGCAAGGTAGCCA 600

 16237441 CGGCTTTCCTCCAGGCTCGTCTGGGTGAGCCTTACCCCCTGGCGGGTGGAGTTCTCAAGC 16237500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CGGCTTTCCTCCAGGCTCGTCTGGGTGAGCCTTACCCCCTGGCGGGTGGAGTTCTCAAGC 660

 16237501 AAAAGATTGAAGTTTGGAACTATTTTAGGCAAGATTCCCCAACTACAGACCTCCAGATGA 16237560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAAAGATTGAAGTTTGGAACTATTTTAGGCAAGATTCCCCAACTACAGACCTCCAGATGA 720

 16237561 GGATTAATGGGCAAGTAACTTATGAATGAAGAGCCACTGGGGAAACCAGTAAGGCAGTGG 16237620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GGATTAATGGGCAAGTAACTTATGAATGAAGAGCCACTGGGGAAACCAGTAAGGCAGTGG 780

 16237621 GGGCTGCAAGACAGAGAAGGAGAAAGAGCCCTGCAGGGGAAACAGCCCTGGGGAGGGTCT 16237680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GGGCTGCAAGACAGAGAAGGAGAAAGAGCCCTGCAGGGGAAACAGCCCTGGGGAGGGTCT 840

 16237681 TGAGGGGTGTCGCCTCAGCCTGATCCCGTGGGGATCTCTCTCCCAGGTGCCACCCAGTCC 16237740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGAGGGGTGTCGCCTCAGCCTGATCCCGTGGGGATCTCTCTCCCAGGTGCCACCCAGTCC 900

 16237741 AACAATCCTCTCTCCAAGACACTGAAGAATCACATAGGGCGGCCCTGTTGTGAGTGCTCA 16237800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AACAATCCTCTCTCCAAGACACTGAAGAATCACATAGGGCGGCCCTGTTGTGAGTGCTCA 960

 16237801 CTGCCTCCTAGACCCTGGTGCAGCACTTTACACATACGCACATATGTGTATCGGTCCTTC 16237860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTGCCTCCTAGACCCTGGTGCAGCACTTTACACATACGCACATATGTGTATCGGTCCTTC 1020

 16237861 ACTCATCATGGCTTAGACAGACCCACTCACTTTCCAGAGGAGGAAACTGGGGCCCAGAGA 16237920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ACTCATCATGGCTTAGACAGACCCACTCACTTTCCAGAGGAGGAAACTGGGGCCCAGAGA 1080

 16237921 AGACAGCAGACTGGAGCGGAGTCAGCCAAAAGCAGCAGAGTCAGGCCCAGAGCCCAGACT 16237980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AGACAGCAGACTGGAGCGGAGTCAGCCAAAAGCAGCAGAGTCAGGCCCAGAGCCCAGACT 1140

 16237981 TGCAGAACCTGCCTGTGTGCTTCCTCTCACAGGAACCTGGCTACTAGGGACAGCCCTAAA 16238040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGCAGAACCTGCCTGTGTGCTTCCTCTCACAGGAACCTGGCTACTAGGGACAGCCCTAAA 1200

 16238041 AGAAGATGGAGACAGAGAAGCCCCCACTTGACTCGTAGGTCAGTGGCTCTCACGCTTGAG 16238100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AGAAGATGGAGACAGAGAAGCCCCCACTTGACTCGTAGGTCAGTGGCTCTCACGCTTGAG 1260

 16238101 CATGCATCGGAATCACCTGGTGCGATTTTTAAAATACTACTGCAGGGCCCACCCCCAGAG 16238160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CATGCATCGGAATCACCTGGTGCGATTTTTAAAATACTACTGCAGGGCCCACCCCCAGAG 1320

 16238161 TTTCTGGTGATGGAGTGGGGCCGAAGAATTTGCATTTCTAACAAGCTCCCAGGTGATGCT 16238220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTTCTGGTGATGGAGTGGGGCCGAAGAATTTGCATTTCTAACAAGCTCCCAGGTGATGCT 1380

 16238221 GATGCTGCTGTTTTCTGTGGACCACACTCTGAGAACCTCTGCTCTAGTCTTTGGCTTGGG 16238280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GATGCTGCTGTTTTCTGTGGACCACACTCTGAGAACCTCTGCTCTAGTCTTTGGCTTGGG 1440

 16238281 CGTGAGGCCTACATTTCTGGCACAACTAAATGACCTAGGGACACCCCTCCTGGCCTTCTG 16238340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CGTGAGGCCTACATTTCTGGCACAACTAAATGACCTAGGGACACCCCTCCTGGCCTTCTG 1500

 16238341 GGAAGATCAGAACGCTCTGAGGGAAGCCGAGCATTCACGTTTTTCTAAGGGGAATAATGG 16238400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GGAAGATCAGAACGCTCTGAGGGAAGCCGAGCATTCACGTTTTTCTAAGGGGAATAATGG 1560

 16238401 AGAAGGGCTAGGGTAGCCAGGTGCCTCTGTTAGTTCTTTCTACGGTCCTCACTCCAGGGA 16238460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AGAAGGGCTAGGGTAGCCAGGTGCCTCTGTTAGTTCTTTCTACGGTCCTCACTCCAGGGA 1620

 16238461 TGGGCCTAGCCTGGCCATAGCAGTGAGTCAGATTAGCCAGAGGCTCTGGGAACACCTGGG 16238520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TGGGCCTAGCCTGGCCATAGCAGTGAGTCAGATTAGCCAGAGGCTCTGGGAACACCTGGG 1680

 16238521 GTTCCTGGGTGCAGCTGGCTGCATATTAGGCAGGACTAATGAACAGGTGCAGGACAGGGC 16238580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GTTCCTGGGTGCAGCTGGCTGCATATTAGGCAGGACTAATGAACAGGTGCAGGACAGGGC 1740

 16238581 TGGGTTGGCGGGTAAAGTGCCCAGAGACTCTCCAAACCCTCAAGTGGGGCGGGGTCCGCC 16238640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGGGTTGGCGGGTAAAGTGCCCAGAGACTCTCCAAACCCTCAAGTGGGGCGGGGTCCGCC 1800

 16238641 CAAGAGCACACCTGTGGTGAGGCCCCCACCATCTGATGAGCTGTGTTACGTCTGTGCCCC 16238700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CAAGAGCACACCTGTGGTGAGGCCCCCACCATCTGATGAGCTGTGTTACGTCTGTGCCCC 1860

 16238701 TCGGGAGTACGGAAAGTGGAGGAGCTGGGCCCCAGAGAAATGGGCTACCCCAGAGCTGGC 16238760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TCGGGAGTACGGAAAGTGGAGGAGCTGGGCCCCAGAGAAATGGGCTACCCCAGAGCTGGC 1920

 16238761 AGCCCCACCAGAGGGGATCTGGATCCCCTGCCAAGCAATTAAGCTGCCCCCTCCTGGCCA 16238820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AGCCCCACCAGAGGGGATCTGGATCCCCTGCCAAGCAATTAAGCTGCCCCCTCCTGGCCA 1980

 16238821 ACTCCCCTTCTGCCCCTCACCACTGGGTTGGCTCTCCATCCAGTGGCCCCATATTTCCTG 16238880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ACTCCCCTTCTGCCCCTCACCACTGGGTTGGCTCTCCATCCAGTGGCCCCATATTTCCTG 2040

 16238881 TTGACATTGGGGTGCAAGGCCTTTTCCACAACCAAGGGCAGCACTGGTTCTATTTCTGCA 16238940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TTGACATTGGGGTGCAAGGCCTTTTCCACAACCAAGGGCAGCACTGGTTCTATTTCTGCA 2100

 16238941 GGTCCCTCTCCTCTGTGTGCTTGCCAAGACCCAGATCCCAGACAAGCACCACCCTGCACA 16239000
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     2101 GGTCCCTCTCCTCTGTGTGCTTGCCAAGACCCAGATCCCAGACAAGCACCACCTTGCACA 2160

 16239001 CTGTTTTTATTTAATCCTCTTGGCCACCCAGAGAGGCAGGGCTTATCAACCCTACTCTAC 16239060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CTGTTTTTATTTAATCCTCTTGGCCACCCAGAGAGGCAGGGCTTATCAACCCTACTCTAC 2220

 16239061 CTGTGAGGAAAACTGAGACAGAAAAAGATGCTGCGGGTTGCCCTGAGCCACCTTGATGGG 16239120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     2221 CTGTGAGGAAAACTGAGACAGAAAAAGATGCTGCGGGTTGCCCTGAGCCATCTTGATGGG 2280

 16239121 CTTCCAAGCCGATGGTCATGACAGCATAGTGTAGTGTGATAGAATCAGCTAGATGGGTTT 16239180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CTTCCAAGCCGATGGTCATGACAGCATAGTGTAGTGTGATAGAATCAGCTAGATGGGTTT 2340

 16239181 CAGGGTATTCGTCTGGGGTGGTGATGCCCACACCAAATCATTAAATCAGAAAATGCTTGC 16239240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CAGGGTATTCGTCTGGGGTGGTGATGCCCACACCAAATCATTAAATCAGAAAATGCTTGC 2400

 16239241 GATGACCAGCCCATGATGACCCTTTACAAGTGGAAGTCAGTATTACTGCTGTTTTCTGGA 16239300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GATGACCAGCCCATGATGACCCTTTACAAGTGGAAGTCAGTATTACTGCTGTTTTCTGGA 2460

 16239301 GGGAAGGAGTTGAGGATCATACCAGCTTTTTCCGAGCACTATACCACTCAGACATGGGTG 16239360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GGGAAGGAGTTGAGGATCATACCAGCTTTTTCCGAGCACTATACCACTCAGACATGGGTG 2520

 16239361 CTCTTACCCACTTCAAAACCCTCTGAGAATGCCAAACAACCATCGCAG 16239408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CTCTTACCCACTTCAAAACCCTCTGAGAATGCCAAACAACCATCGCAG 2568

EXCISED REGION

 16241210 TGGAGCACAGGCTGCACTGCGGGGTCTGTCTTGCTTTTTACCCTGCAATGGTCAGTCATT 16241269
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2569 TGGAGCACAGGCTGCACTGCGGGTTCTGTCTTGCTTTTTACCCTGCAATGGTCAGTCATT 2628

 16241270 GACCATGACTGGGGCTGGGGGCAGCATCCTGCATGACTGTCTGGCACCTGCAGCAGAGAC 16241329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2629 GACCATGACTGGGGCTGGGGGCAGCATCCTGCATGACTGTCTGGCACCTGCAGCAGAGAC 2688

 16241330 CGTTTTAATACCCCAAGGCAAGTCTCCAGGGAAGGGTTAAGATTTCAGTTAGCACCCACA 16241389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2689 CGTTTTAATACCCCAAGGCAAGTCTCCAGGGAAGGGTTAAGATTTCAGTTAGCACCCACA 2748

 16241390 GCAGCTGGGGACATGCAAACCAAACCAAAACAGTTAAGGGGAGCTCAGGGAATCTGAGTA 16241449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2749 GCAGCTGGGGACATGCAAACCAAACCAAAACAGTTAAGGGGAGCTCAGGGAATCTGAGTA 2808

 16241450 GGACACTATATTAGTCTGTTCTCACACTGCTATAAAGAACTGCCTGAGACTAGGTAATTT 16241509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2809 GGACACTATATTAGTCTGTTCTCACACTGCTATAAAGAACTGCCTGAGACTAGGTAATTT 2868

 16241510 ATAAAGAAAGGAGGTTTAATTGACTCACAGTTTCGCATGGCTGGGGAGGCCTCAGGAAAC 16241569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2869 ATAAAGAAAGGAGGTTTAATTGACTCACAGTTTCGCATGGCTGGGGAGGCCTCAGGAAAC 2928

 16241570 TTACAATCATGGTGGAAGGGGAAGCATGTCTTACATGGCAGCAAGTGAGAGAAAGAGAGA 16241629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2929 TTACAATCATGGTGGAAGGGGAAGCATGTCTTACATGGCAGCAAGTGAGAGAAAGAGAGA 2988

 16241630 GAGAGAGGAGGAAAAACTATCAAACACTTATATAATCATCAGATCTCATGAGAACTCACT 16241689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2989 GAGAGAGGAGGAAAAACTATCAAACACTTATATAATCATCAGATCTCATGAGAACTCACT 3048

 16241690 ATCACGAGAACAGCATGGGGGAAACTGCCCACATGATCCAATCACCTCCCACCAGGTCCC 16241749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3049 ATCACGAGAACAGCATGGGGGAAACTGCCCACATGATCCAATCACCTCCCACCAGGTCCC 3108

 16241750 TCCCTCGCCACATAGGGATTATGGGGATTACCACTCAAGATGAGATCTGGGTGGGGACAA 16241809
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     3109 TCCCTCGCCACATAGGGATTATGGGGATTACAACTCAAGATGAGATCTGGGTGGGGACAA 3168

 16241810 AGAGCCAAACCATATCAGACACCAACAGTATCTGCTACATTCTTGCTGCTGCATTTGGAG 16241869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3169 AGAGCCAAACCATATCAGACACCAACAGTATCTGCTACATTCTTGCTGCTGCATTTGGAG 3228

 16241870 AATGTTAGCAAGTTCTCCCCTTTCCTGGTTTTCTGACACCATCCCTCTAATTTTTACTGG 16241929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3229 AATGTTAGCAAGTTCTCCCCTTTCCTGGTTTTCTGACACCATCCCTCTAATTTTTACTGG 3288

 16241930 AGAGAATCATGGCCCACCCCAACCTAACCAAGCATCTTACATCTCAGCAACAACCACACT 16241989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3289 AGAGAATCATGGCCCACCCCAACCTAACCAAGCATCTTACATCTCAGCAACAACCACACT 3348

 16241990 GTAGTAATGTTTTCGGTTCTTAGGACCCAGGTGCTCACCACAGCTTCCAAAAGAGAGTTG 16242049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3349 GTAGTAATGTTTTCGGTTCTTAGGACCCAGGTGCTCACCACAGCTTCCAAAAGAGAGTTG 3408

 16242050 CTGACGATTGTCTTAGTCACAATCTCATCGGTTGTGGCATTTGTCATTCCACTGACCACA 16242109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3409 CTGACGATTGTCTTAGTCACAATCTCATCGGTTGTGGCATTTGTCATTCCACTGACCACA 3468

 16242110 ACCCTGTTGATTCCAGGACAACTCAAGTCTGCTCTCAGCGAATATGTGGCCAGGCTGGAG 16242169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3469 ACCCTGTTGATTCCAGGACAACTCAAGTCTGCTCTCAGCGAATATGTGGCCAGGCTGGAG 3528

 16242170 GGGGTGAAGTTACTCAGGAGCAACAAGAGGCTGGGTGCCATCAGGGCCCGGATGCTGGGG 16242229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3529 GGGGTGAAGTTACTCAGGAGCAACAAGAGGCTGGGTGCCATCAGGGCCCGGATGCTGGGG 3588

 16242230 GCCACCAGAGCCACCGGGGATGTGCTCGTCTTCATGGATGCCCACTGCGAGTGCCACCCA 16242289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3589 GCCACCAGAGCCACCGGGGATGTGCTCGTCTTCATGGATGCCCACTGCGAGTGCCACCCA 3648

 16242290 GGCTGGCTGGAGCCCCTCCTCAGCAGAATAGCTGGTGACAGGTAACTTATTCCCTGGGCT 16242349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3649 GGCTGGCTGGAGCCCCTCCTCAGCAGAATAGCTGGTGACAGGTAACTTATTCCCTGGGCT 3708

 16242350 TGCAAAGCAAGACATGGAACTGGGAGAAACAGTCTACAGCATCAGCCACTCACAGAGCAA 16242409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3709 TGCAAAGCAAGACATGGAACTGGGAGAAACAGTCTACAGCATCAGCCACTCACAGAGCAA 3768

 16242410 CCCACCTATTAATTCCTGAATCTCCATTAGAGAGTGATATATTCCCTTCGGGTTTTCAGA 16242469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3769 CCCACCTATTAATTCCTGAATCTCCATTAGAGAGTGATATATTCCCTTCGGGTTTTCAGA 3828

 16242470 TGTGTAAGTTTTTTAAGACTATAGAGTTAGAGTTGGAAAGGAGGTTAGAGGTCTTCATCT 16242529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3829 TGTGTAAGTTTTTTAAGACTATAGAGTTAGAGTTGGAAAGGAGGTTAGAGGTCTTCATCT 3888

 16242530 ACCTTGCTTTATAGATAAAGAAACCGAGGCCTGGAGAACAGCTTCTATGAGGTTGCAAAT 16242589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3889 ACCTTGCTTTATAGATAAAGAAACCGAGGCCTGGAGAACAGCTTCTATGAGGTTGCAAAT 3948

 16242590 ACTTAAAATTGTATTAAATTGCATGACGAGGGTAACACCTTACCATAGCTATCATTGCCT 16242649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3949 ACTTAAAATTGTATTAAATTGCATGACGAGGGTAACACCTTACCATAGCTATCATTGCCT 4008

 16242650 TTGGTGAAAATTTGGCAATTTTTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTGTG 16242709
          ||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||
     4009 TTGGTGAAAATTTGGCAATTTT------TTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTGTG 4062

 16242710 ATGGCGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGCGGGGCGATCTCGGCTCACTGCAA 16242769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4063 ATGGCGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGCGGGGCGATCTCGGCTCACTGCAA 4122

 16242770 GCTGCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCTT 16242804
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4123 GCTGCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCTT 4157

Alignment time is 5.1612 s

