
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [13131433,13152582] =>     21150 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    8031] =>      8031 nucs 'mol-32-1eea-035226_8031'

Score:        7892
Aligned:      8032        nucs
Identic:      8016 (100%) nucs =>      1596 (100%)      6420 (100%)
Gaps:            6 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [13139831,13141433] EXCISED REGION [13142583,13149006]
 second seq =>  [       1,    1602] EXCISED REGION [    1603,    8031]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1149 nucs [13141434,13142582]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         9 nucs [13141434,13141442] to [13142583,13142591]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [13141434,13141434] to [13142582,13142582]
 second seq =>         0 nucs

 13139831 GGCGAAATCTAACTTAGCATTGGGAAGGTACCACAGAGGAGGCGCCATCTTAAGTGGGTT 13139890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGCGAAATCTAACTTAGCATTGGGAAGGTACCACAGAGGAGGCGCCATCTTAAGTGGGTT 60

 13139891 TTGAAGGATGCAGAGGAGTTCTCTGGGGGTTGGGGGGATAAGTAAAGAAAGCACAACCCC 13139950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTGAAGGATGCAGAGGAGTTCTCTGGGGGTTGGGGGGATAAGTAAAGAAAGCACAACCCC 120

 13139951 AGAAAGGGAACGGTCTACAAAGAAAAGAAAAGCCAGTAAGAATCAGGAGGGTCAAGAGGA 13140010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGAAAGGGAACGGTCTACAAAGAAAAGAAAAGCCAGTAAGAATCAGGAGGGTCAAGAGGA 180

 13140011 GGGTGAGGGTTTCCACTAAAATAGGAGGATGGAGAGGGCCTCACTGAGAAGGGGGTGAGG 13140070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGGTGAGGGTTTCCACTAAAATAGGAGGATGGAGAGGGCCTCACTGAGAAGGGGGTGAGG 240

 13140071 GAGGGAGCCAAGGAGATACCTGGAGAAGAGTGTCTGAGGCAGAGGAAACAGCAGTGGAAA 13140130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GAGGGAGCCAAGGAGATACCTGGAGAAGAGTGTCTGAGGCAGAGGAAACAGCAGTGGAAA 300

 13140131 GGCTCTGAGCTAGGGGAAAATGGATGGCTAAAAATAACATTATACAATGTGAAAGAAGCC 13140190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GGCTCTGAGCTAGGGGAAAATGGATGGCTAAAAATAACATTATACAATGTGAAAGAAGCC 360

 13140191 AGTCACACAAGGCCAGTGTATATGGTTCCATTTGTATGGAGAGTCCAGAATGGGCAATTC 13140250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGTCACACAAGGCCAGTGTATATGGTTCCATTTGTATGGAGAGTCCAGAATGGGCAATTC 420

 13140251 ACTAGAAAAAAGAAAGTAAATTCAAGGTTACCAGGGACTTAGGGGAAGAGGAAGTGGGAA 13140310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACTAGAAAAAAGAAAGTAAATTCAAGGTTACCAGGGACTTAGGGGAAGAGGAAGTGGGAA 480

 13140311 ATGACTGCTACTGGGTATACGGTTTCTTTCTGGATGATGAAAATGTCCTAAAACCGACTG 13140370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATGACTGCTACTGGGTATACGGTTTCTTTCTGGATGATGAAAATGTCCTAAAACCGACTG 540

 13140371 TGAAATGGATTCACAACTCTGTGAATACACTAACATCCACGGAATGATACACTTTAAATG 13140430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGAAATGGATTCACAACTCTGTGAATACACTAACATCCACGGAATGATACACTTTAAATG 600

 13140431 AATGAACTTTACAGTATGTAAATTCCAGTAAAGCTGTTACAGAATAACTTTGTCATATGT 13140490
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
      601 AATGAACTTTACAGTATGTAAATTCCAGTAAAGCTGTTACAAAATAACTTTGTCATATGT 660

 13140491 CAGGTAGCGATCAGTTCCAGAAAAGACATTGGGATAAGAGGACTTTCGGGGGATGGGGGG 13140550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CAGGTAGCGATCAGTTCCAGAAAAGACATTGGGATAAGAGGACTTTCGGGGGATGGGGGG 720

 13140551 AACAGGCCGGGTGTCCCCAAAGAGGTGATATTGAAGCAGAGACCTGGGCTGAGCTACAGG 13140610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
      721 AACAGGCCGGGTGTCCCCAAAGAGGTGATATTTAAGCAGAGACCTGGGCTGAGCTACAGG 780

 13140611 TCCAGGAATAGGGTGGTGGCTAGACTAGCCTGTCCCGCACCTGCCACCTGGGGCACCACT 13140670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCCAGGAATAGGGTGGTGGCTAGACTAGCCTGTCCCGCACCTGCCACCTGGGGCACCACT 840

 13140671 GAGTGTAGCCCTGGGGGCCATAGCCCCTGGAGAGGGGTGAGGAGAGGCAAGTGAGACCTT 13140730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GAGTGTAGCCCTGGGGGCCATAGCCCCTGGAGAGGGGTGAGGAGAGGCAAGTGAGACCTT 900

 13140731 CAGGGAAGTTGAGGCCACAGTGAGGCACATCGGCTATATCAGGGTCCACTAGGGGCACCA 13140790
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CGGGGAAGTTGAGGCCACAGTGAGGCACATCGGCTATATCAGGGTCCACTAGGGGCACCA 960

 13140791 GAATATAGCTGGTGGGGCATGGGCAAATGAGGTTTCGGGTGTGCAGGATTGCATTTTATG 13140850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
      961 GAATATAGCTGGTGGGGCATGGGCAAATGAGGTTTCGGGTGTGCCGGATTGCATTTTATG 1020

 13140851 AGAATTTGACAAATTTAAATCAGCAAGAGTTGCAACATCTCAAAGCTGGTAGGAAAAATG 13140910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGAATTTGACAAATTTAAATCAGCAAGAGTTGCAACATCTCAAAGCTGGTAGGAAAAATG 1080

 13140911 GTTTTTAGGCTCAGGCTACTTTCGAAAGAGTGAAGGTGGTGCTGCTCAGGGCTTACAGGC 13140970
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GCTTTTAGGCTCAGGCTACTTTCGAAAGAGTGAAGGTGGTGCTGCTCAGGGCTTACAGGC 1140

 13140971 AATGGTGGACTCCTCCCCCGAGCTGGGTGTCCCCGGGTGCATCTGTGGCCCTCAGAAGCG 13141030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AATGGTGGACTCCTCCCCCGAGCTGGGTGTCCCCGGGTGCATCTGTGGCCCTCAGAAGCG 1200

 13141031 CCCACCTCACTCAGGCTGGCAGAGCGCGGTGGCCATGGAAACGCAAGCCAGAGTGTGCAA 13141090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CCCACCTCACTCAGGCTGGCAGAGCGCGGTGGCCATGGAAACGCAAGCCAGAGTGTGCAA 1260

 13141091 GAATCAAACAGACAGAAGTAAAAGGACCTTACCTATTGCCCGGGGCTGGGGCTCCCTCCT 13141150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GAATCAAACAGACAGAAGTAAAAGGACCTTACCTATTGCCCGGGGCTGGGGCTCCCTCCT 1320

 13141151 TCATTCTGGGTTTTAGGAAAACAGCCATCATTATTTCCTAAAAGGTGCCCCCTACTCCCC 13141210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TCATTCTGGGTTTTAGGAAAACAGCCATCATTATTTCCTAAAAGGTGCCCCCTACTCCCC 1380

 13141211 GCCAACCCGGGACAACTTCACATGCCAGGAAAGCCCTCTCTACCTCAAAGCAGTCCCTGT 13141270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GCCAACCCGGGACAACTTCACATGCCAGGAAAGCCCTCTCTACCTCAAAGCAGTCCCTGT 1440

 13141271 TCAAGCCCCTACCCCCAGCTCCTCTCTCTGTGAAACCACAGCCATCAGTGAAGGGGGCAG 13141330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TCAAGCCCCTACCCCCAGCTCCTCTCTCTGTGAAACCACAGCCATCAGTGAAGGGGGCAG 1500

 13141331 TTGCACCTCAGCACCCCTGGCAGAGGGCACGGCATGTGCAAAGGCCCCAAGGGAGCAGTG 13141390
          ||||||||||||||||| |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     1501 TTGCACCTCAGCACCCC-GGCAGAGGGCACGGCATCTGCAAAGGCCCCAAGGGAGCAGTG 1559

 13141391 TGCCTGGTGTGATCCAGGAACAAGGAATCAGGGTGGCTGGAAC 13141433
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 TGCCTGGTGTGATCCAGGAACAAGGAATCAGGGTGGCTGGAAC 1602

EXCISED REGION

 13142583 AGAGGGAGGCTGCTGAGGGGAGTGTGGATTTTCTGCTAAGCGCAGCGAGGAGCCATGGGA 13142642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1603 AGAGGGAGGCTGCTGAGGGGAGTGTGGATTTTCTGCTAAGCGCAGCGAGGAGCCATGGGA 1662

 13142643 GGGCTTCAAGCCTGACAGTGACACGATGCGACTTCTGTTTTTAAAAGCACCCTTCTAGGC 13142702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1663 GGGCTTCAAGCCTGACAGTGACACGATGCGACTTCTGTTTTTAAAAGCACCCTTCTAGGC 1722

 13142703 TGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCA 13142762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1723 TGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCA 1782

 13142763 TGAGGTCAGAAGATTGAGACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAA 13142822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1783 TGAGGTCAGAAGATTGAGACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAA 1842

 13142823 TACAAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGGGCGTCTCCAATGAGCCGAGATTGAGCCACTG 13142882
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1843 TACAAAAAATTAGCCGGGCATGGTGGCGGGCGTCTCCAATGAGCCGAGATTGAGCCACTG 1902

 13142883 CACTCCAGCCTGGGAGACAGGGTGAGATTCCATCTCC-----AAAAAAAAAAAAAATGCA 13142937
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||
     1903 CACTCCAGCCTGGGAGACAGGGTGAGATTCCATCTCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAATGCA 1962

 13142938 CCCTTCTACTGTTGAGAGGGCAGAAAGGAACAGAAAGGAAACAAGGAGGTCTGGGAAGGC 13142997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1963 CCCTTCTACTGTTGAGAGGGCAGAAAGGAACAGAAAGGAAACAAGGAGGTCTGGGAAGGC 2022

 13142998 CCCGGGAAGATGAGCGATGGTGGTGCCTGGCTAGATGGTGGGCTGGCAGGGAGAGGTGCT 13143057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2023 CCCGGGAAGATGAGCGATGGTGGTGCCTGGCTAGATGGTGGGCTGGCAGGGAGAGGTGCT 2082

 13143058 CAGGCCCAAGTCTGTCTGGAGGGAGCTCCCGGTTTCCACGACAGATTGCAGTGGGTGGGA 13143117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2083 CAGGCCCAAGTCTGTCTGGAGGGAGCTCCCGGTTTCCACGACAGATTGCAGTGGGTGGGA 2142

 13143118 GAGGAAGGGGAGTCAGGCTGGGCTGCAGGCGGAAGGGCTGGGAAGAGACTCAGAGTCCTG 13143177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2143 GAGGAAGGGGAGTCAGGCTGGGCTGCAGGCGGAAGGGCTGGGAAGAGACTCAGAGTCCTG 2202

 13143178 TTTTGGCTGTGTCCAGTATGATGTCTGTGGGGCCTCCAGGTAGAAACATGGAGGAGGCAG 13143237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2203 TTTTGGCTGTGTCCAGTATGATGTCTGTGGGGCCTCCAGGTAGAAACATGGAGGAGGCAG 2262

 13143238 CTGGATGGGTAGCAGTGGAGTGGTGAGTGGTACAGGCTGGAGATATAAATTTGGGGCCAT 13143297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2263 CTGGATGGGTAGCAGTGGAGTGGTGAGTGGTACAGGCTGGAGATATAAATTTGGGGCCAT 2322

 13143298 CTTTCAATTTTATTGTTTCAGAGATAAACCCTGATGAAGTCCAGGAATCAATAAACAGAG 13143357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2323 CTTTCAATTTTATTGTTTCAGAGATAAACCCTGATGAAGTCCAGGAATCAATAAACAGAG 2382

 13143358 ACTAACACTGGCCTCCTTCCCCATCCAGATCCTGGGAGAGGATTTCACGAGTTAAGTGCT 13143417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2383 ACTAACACTGGCCTCCTTCCCCATCCAGATCCTGGGAGAGGATTTCACGAGTTAAGTGCT 2442

 13143418 TTGAAACTGACTCTGGCCTTGCAGGGGTGGGAGGGAGGGTGTGCAGTGAGCCAGGGGCCC 13143477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2443 TTGAAACTGACTCTGGCCTTGCAGGGGTGGGAGGGAGGGTGTGCAGTGAGCCAGGGGCCC 2502

 13143478 ACTCATGAGCCATCGATTAATAAACTCTGCCCGCTCATGCCTGTAATCTCAGCACTTTGG 13143537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2503 ACTCATGAGCCATCGATTAATAAACTCTGCCCGCTCATGCCTGTAATCTCAGCACTTTGG 2562

 13143538 GAGGCTGAGGCAAGTGGATCGCTTGAGCCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAATGTGG 13143597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2563 GAGGCTGAGGCAAGTGGATCGCTTGAGCCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAATGTGG 2622

 13143598 CGAGACCCTGTCTCTACAAAAAATGCAAAAATTAGTCAGGCATGGTGATGTGCATCTGTA 13143657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2623 CGAGACCCTGTCTCTACAAAAAATGCAAAAATTAGTCAGGCATGGTGATGTGCATCTGTA 2682

 13143658 GTCCTGGCTACTCAGGAGGCTGAGGTGGAAGGATTGCTTGAGCCCAGGAGATCAATGATG 13143717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2683 GTCCTGGCTACTCAGGAGGCTGAGGTGGAAGGATTGCTTGAGCCCAGGAGATCAATGATG 2742

 13143718 GAGCCCAGGAGTCAGTGATGGAGCCACTGACTCCAGCCTGGGTGATGGAGCAAGAACTTG 13143777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2743 GAGCCCAGGAGTCAGTGATGGAGCCACTGACTCCAGCCTGGGTGATGGAGCAAGAACTTG 2802

 13143778 TCTCAAAATAATAATAATAATAATAAATAACCTCTGCCTTCCATGCGAACAAACACCCAT 13143837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2803 TCTCAAAATAATAATAATAATAATAAATAACCTCTGCCTTCCATGCGAACAAACACCCAT 2862

 13143838 CCTAGAGCCTGAGACTGGGATGGGCTGGGGAGCGGAGGCCTGGGCCCAGCCCCATGTTGG 13143897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2863 CCTAGAGCCTGAGACTGGGATGGGCTGGGGAGCGGAGGCCTGGGCCCAGCCCCATGTTGG 2922

 13143898 GGCTGCCGGGGTTGGTGTTGGTGGGGGGCTGGATTAGAGGCTGGATTTCCTCACCCGTGT 13143957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2923 GGCTGCCGGGGTTGGTGTTGGTGGGGGGCTGGATTAGAGGCTGGATTTCCTCACCCGTGT 2982

 13143958 GGTTTGGGCCCATGGTTTCCTTCTCTGAGCTTCTGTTTGCTCATCTGAGTAATAGGCGTG 13144017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2983 GGTTTGGGCCCATGGTTTCCTTCTCTGAGCTTCTGTTTGCTCATCTGAGTAATAGGCGTG 3042

 13144018 AAAACCTGTGCTTCACGGGGGTCTGGCAGGAGGAAAGGAGCAGGTGTGAGCCCATGGTTC 13144077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3043 AAAACCTGTGCTTCACGGGGGTCTGGCAGGAGGAAAGGAGCAGGTGTGAGCCCATGGTTC 3102

 13144078 TCCACAGCACTGTCCTTCCCCGGTCGGGTGGGGATTGGGGATTTGAAGATATTTATTGGT 13144137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3103 TCCACAGCACTGTCCTTCCCCGGTCGGGTGGGGATTGGGGATTTGAAGATATTTATTGGT 3162

 13144138 AACCACGGAGCTCCCCTCACGTCACATGCTCCCACTGTCAACTGCAGGCCACAGGTCCCA 13144197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3163 AACCACGGAGCTCCCCTCACGTCACATGCTCCCACTGTCAACTGCAGGCCACAGGTCCCA 3222

 13144198 CCCTCCAGGCCTTTGCATGTGCAGCCTTCCCTGCTTGGATGCCCTCCCTGGCACTCCACT 13144257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3223 CCCTCCAGGCCTTTGCATGTGCAGCCTTCCCTGCTTGGATGCCCTCCCTGGCACTCCACT 3282

 13144258 GTCAGCAGACTTGCTTGCTTGCCACTAAAATGTAAGCTCCAGGAGGCGGGTACTGAGCAC 13144317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3283 GTCAGCAGACTTGCTTGCTTGCCACTAAAATGTAAGCTCCAGGAGGCGGGTACTGAGCAC 3342

 13144318 AGCTCGTTCACGGCTGCACCCCTGGTGCTGAGGGCTGTGCCTGCCACGGCCCACATATTA 13144377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3343 AGCTCGTTCACGGCTGCACCCCTGGTGCTGAGGGCTGTGCCTGCCACGGCCCACATATTA 3402

 13144378 CTGCATTTAGTCCTTACAACCACCCTGGGAGGTCGGAAGTTTCCAGATGAGAAAACTGAG 13144437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3403 CTGCATTTAGTCCTTACAACCACCCTGGGAGGTCGGAAGTTTCCAGATGAGAAAACTGAG 3462

 13144438 AGCTGAAGACAATTGGCACCTTGTCCAGCTCAGCCCCGTCAGAGGTGGCAGAGAGGGGCT 13144497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3463 AGCTGAAGACAATTGGCACCTTGTCCAGCTCAGCCCCGTCAGAGGTGGCAGAGAGGGGCT 3522

 13144498 CAGATCAGGTGCTTGGTGCCCCCCTACCTCAACCTGTGGGCTGGATGTCGGAAGGGACTC 13144557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3523 CAGATCAGGTGCTTGGTGCCCCCCTACCTCAACCTGTGGGCTGGATGTCGGAAGGGACTC 3582

 13144558 TGACTTCTGCGCAGGGATGCAGCTTGCTCCCATGCTCTGAAGTAGAGCCAGGGCCCCAGG 13144617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3583 TGACTTCTGCGCAGGGATGCAGCTTGCTCCCATGCTCTGAAGTAGAGCCAGGGCCCCAGG 3642

 13144618 GCTCTGCCCCAGCCCCTCCCTGGCCCATGTCCCCGGCTGGCCCCAGGCAGGTCAGTTCAG 13144677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3643 GCTCTGCCCCAGCCCCTCCCTGGCCCATGTCCCCGGCTGGCCCCAGGCAGGTCAGTTCAG 3702

 13144678 GGAAGGGGCCTGCATCGAACTCTCGCCACCTCCCTAAGCCAGAGCTGTCTGCTTGCTCAG 13144737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3703 GGAAGGGGCCTGCATCGAACTCTCGCCACCTCCCTAAGCCAGAGCTGTCTGCTTGCTCAG 3762

 13144738 ATATCATCAGCTTCCCATTAAGCAGATCAATAGCTTCCACTGGTTTCCAATTTGTGTTTC 13144797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3763 ATATCATCAGCTTCCCATTAAGCAGATCAATAGCTTCCACTGGTTTCCAATTTGTGTTTC 3822

 13144798 CAGAAATTCATCTCCCAGCCACCTTTTTAATTAACCGCCCCCGCCAACACACCCGAGGCA 13144857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3823 CAGAAATTCATCTCCCAGCCACCTTTTTAATTAACCGCCCCCGCCAACACACCCGAGGCA 3882

 13144858 CCAATAGATCACCCTCTCCCCTCCACCTCTGTGGACCACAGACCACTAGCTCCACCAGCC 13144917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3883 CCAATAGATCACCCTCTCCCCTCCACCTCTGTGGACCACAGACCACTAGCTCCACCAGCC 3942

 13144918 TCGGGGGAGTGGCAGGTGTGTTTAAAGCTGTATGATCACCATCCTCAGTCACTGGAAGAG 13144977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3943 TCGGGGGAGTGGCAGGTGTGTTTAAAGCTGTATGATCACCATCCTCAGTCACTGGAAGAG 4002

 13144978 CTGGCCGTGCTGCCTGGATGCCATCCACACCTGTCCCCGAGGAAGGGGCTGGGCCCTTCA 13145037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4003 CTGGCCGTGCTGCCTGGATGCCATCCACACCTGTCCCCGAGGAAGGGGCTGGGCCCTTCA 4062

 13145038 CCATGAGGAAAACCAAGAATCAGGGAGGCCAAGCAGCAGCTGGCAAGAGCCAGAGCCGAG 13145097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4063 CCATGAGGAAAACCAAGAATCAGGGAGGCCAAGCAGCAGCTGGCAAGAGCCAGAGCCGAG 4122

 13145098 TGTGCCATTGGGGTGGGCAATTTGCAGGATGAGCTTCACATGCAGCACGCACTGGGGGTC 13145157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4123 TGTGCCATTGGGGTGGGCAATTTGCAGGATGAGCTTCACATGCAGCACGCACTGGGGGTC 4182

 13145158 TGGCTGGCAGGGGAGCGGGGCTGGCAGCTGTGATTTCAGAGCAGGGGAAGGTTGGAGGCC 13145217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4183 TGGCTGGCAGGGGAGCGGGGCTGGCAGCTGTGATTTCAGAGCAGGGGAAGGTTGGAGGCC 4242

 13145218 TGACCCCCAGAGGGTGCGCCTCCTACCCCTGGGAGCTCCCCGGTATTCCATGTTGCCTAC 13145277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4243 TGACCCCCAGAGGGTGCGCCTCCTACCCCTGGGAGCTCCCCGGTATTCCATGTTGCCTAC 4302

 13145278 CACCCTACGAGGGCAGGGGCTGTGTCTGCCTCCATCACTGCTCTCTCCCCAGCGTGCGGC 13145337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4303 CACCCTACGAGGGCAGGGGCTGTGTCTGCCTCCATCACTGCTCTCTCCCCAGCGTGCGGC 4362

 13145338 ACATAGTAGGTGCTCAGTAAGTCACTAAATGAGCAGCAATATTTGCCAAAACTTAGGACA 13145397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4363 ACATAGTAGGTGCTCAGTAAGTCACTAAATGAGCAGCAATATTTGCCAAAACTTAGGACA 4422

 13145398 TTACCTTTGTGCCAGGTATTCTTCTATTTAATCTTCACGGCACTCCCTGAGGTGGGTGCT 13145457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4423 TTACCTTTGTGCCAGGTATTCTTCTATTTAATCTTCACGGCACTCCCTGAGGTGGGTGCT 4482

 13145458 ACTAGTATCTTCATTTTATAGATGGGAAAACTCAGGCACAGAGAGTTTCAATGACTTGCC 13145517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4483 ACTAGTATCTTCATTTTATAGATGGGAAAACTCAGGCACAGAGAGTTTCAATGACTTGCC 4542

 13145518 CAAGGTCACACAACTAGTTAGTCATGGAGCTGAGATTCGAACCCAGGCCATCTGTCTCTA 13145577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4543 CAAGGTCACACAACTAGTTAGTCATGGAGCTGAGATTCGAACCCAGGCCATCTGTCTCTA 4602

 13145578 GAGCTGTTGCTACTAATCGCCCCACTCTTCCTTACCTGCTCCCCATGGCCTGTCAGCTCC 13145637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4603 GAGCTGTTGCTACTAATCGCCCCACTCTTCCTTACCTGCTCCCCATGGCCTGTCAGCTCC 4662

 13145638 GATGGGCAAGGACTGGGTCCTGTGCCTGGTGTAACTTCTGTCACACACAAACATAGCATG 13145697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4663 GATGGGCAAGGACTGGGTCCTGTGCCTGGTGTAACTTCTGTCACACACAAACATAGCATG 4722

 13145698 TTTGCTGAGTGAATAAATGGTGACTTCTGCACTCCCTGCTTCCCAAAACAACCTAGTTGA 13145757
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4723 TTTGCTGAGTGAATAAATGGCGACTTCTGCACTCCCTGCTTCCCAAAACAACCTAGTTGA 4782

 13145758 CCAGTCTGTTGGGGCAAATCTAGAGTATTTCATCTGGAAATGAAGGGAAGAGATGGGGTG 13145817
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4783 CCAGTCTGTTGGGGCAAATCTGGAGTATTTCATCTGGAAATGAAGGGAAGAGATGGGGTG 4842

 13145818 AGTCCCCTGGGTGACCCTGGGGTGACAAGCCTCCCAGTGAGTACACTGCTGGGGCCAACA 13145877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4843 AGTCCCCTGGGTGACCCTGGGGTGACAAGCCTCCCAGTGAGTACACTGCTGGGGCCAACA 4902

 13145878 TTAGGGACCCTCTAATTCCACTTCCATCTTCCTTTTCACCCATCCCTTACATTTCTGGGC 13145937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4903 TTAGGGACCCTCTAATTCCACTTCCATCTTCCTTTTCACCCATCCCTTACATTTCTGGGC 4962

 13145938 TCTCTGTAGTCTATACAAAAATACATTCACAGCCATGATGTTGTTATTCTGCGGACTCTT 13145997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4963 TCTCTGTAGTCTATACAAAAATACATTCACAGCCATGATGTTGTTATTCTGCGGACTCTT 5022

 13145998 GCAGCTTTCCAGCCAGGCAAGTAGATTTCCACCGCTGACCCAGCACTCGGAACAGGGACC 13146057
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     5023 GCAGCTTTCCAGCCAGGCAAGTAGATTTCCACCGCCGACCCAGCACTCGGAACAGGGACC 5082

 13146058 ACCTGGGTGCCATCCTCTTTCCCCTGTGCACGCTGGGGCCACATCTTAGCAGTTTCATCT 13146117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5083 ACCTGGGTGCCATCCTCTTTCCCCTGTGCACGCTGGGGCCACATCTTAGCAGTTTCATCT 5142

 13146118 CCAAGTCTCCCTCCCCCACCTCTCCCCCTCCGGTGGCCCTGGCTCCGGACTCAGCTGCTC 13146177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5143 CCAAGTCTCCCTCCCCCACCTCTCCCCCTCCGGTGGCCCTGGCTCCGGACTCAGCTGCTC 5202

 13146178 TCACGGGACCCCAGGTGCAGGGCCCATCATGGCCCCTTCCTCTTCACCCCTCACTCCGGC 13146237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5203 TCACGGGACCCCAGGTGCAGGGCCCATCATGGCCCCTTCCTCTTCACCCCTCACTCCGGC 5262

 13146238 CACTAGCGGACGCTAACCCAACAACCAACTAGGTCCTGCCTGGCCCCTGACCCATGTGAG 13146297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5263 CACTAGCGGACGCTAACCCAACAACCAACTAGGTCCTGCCTGGCCCCTGACCCATGTGAG 5322

 13146298 GGGCTGTAGGAGCCAGGTCTGCAGGGGTTGGTCGGGGGGTGAAACAAGCAGCGTGTGCTG 13146357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5323 GGGCTGTAGGAGCCAGGTCTGCAGGGGTTGGTCGGGGGGTGAAACAAGCAGCGTGTGCTG 5382

 13146358 CGGCAGGACCAGGATGAAGATCATGGCTCTCTTCTAACCAGGAAGGAACCAGCCCAGGGC 13146417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5383 CGGCAGGACCAGGATGAAGATCATGGCTCTCTTCTAACCAGGAAGGAACCAGCCCAGGGC 5442

 13146418 TGCTAGATTTTCTCAGCTGTGGAGAGAAGACGAAGCCCAGTGTTTAACCTGAAATCTTCC 13146477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5443 TGCTAGATTTTCTCAGCTGTGGAGAGAAGACGAAGCCCAGTGTTTAACCTGAAATCTTCC 5502

 13146478 GGTTTGCCAATGCTAGTAGTTGATTACATGATCACATTTAAAAAGTCATTTTACTTTTAA 13146537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5503 GGTTTGCCAATGCTAGTAGTTGATTACATGATCACATTTAAAAAGTCATTTTACTTTTAA 5562

 13146538 AACACATGCTGCAGGCCAGGGGCAGTCTGTCGGCTGCTAGTTTGTGACTTCTGCCCTGTG 13146597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5563 AACACATGCTGCAGGCCAGGGGCAGTCTGTCGGCTGCTAGTTTGTGACTTCTGCCCTGTG 5622

 13146598 CAGTGTGAACTCTCTGGCTCGGCATTCAAGGTCTTTCATGGTCTGGCCCCTTTGAGCCCA 13146657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5623 CAGTGTGAACTCTCTGGCTCGGCATTCAAGGTCTTTCATGGTCTGGCCCCTTTGAGCCCA 5682

 13146658 CAAGGAACCTCTACACGGGACAACACTTCTGTGTCTCCAACACCCTCTACTCAGAACAGC 13146717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5683 CAAGGAACCTCTACACGGGACAACACTTCTGTGTCTCCAACACCCTCTACTCAGAACAGC 5742

 13146718 ACTGTTCCTCTAGGAAGTGGGCCCTGATCCCCTCCCCTCCAGGGGACTCTACCACTCTCT 13146777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5743 ACTGTTCCTCTAGGAAGTGGGCCCTGATCCCCTCCCCTCCAGGGGACTCTACCACTCTCT 5802

 13146778 ACTTCACACCCATCTGGTCTCCTGACCAGGCCTCCACAGCCAGGGGCAGAGCGAGGCCTG 13146837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5803 ACTTCACACCCATCTGGTCTCCTGACCAGGCCTCCACAGCCAGGGGCAGAGCGAGGCCTG 5862

 13146838 GAGTCCAGGGTCCTGGCCACACATCCCAGGGTTCTCCCGCTGTCCTCTGGGATGGCCAGC 13146897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5863 GAGTCCAGGGTCCTGGCCACACATCCCAGGGTTCTCCCGCTGTCCTCTGGGATGGCCAGC 5922

 13146898 AGACAGATGCCGCTCAGGGACAGCCACCCGCTCCCACCAGTCCCACCCCTGCCGGCAGGG 13146957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5923 AGACAGATGCCGCTCAGGGACAGCCACCCGCTCCCACCAGTCCCACCCCTGCCGGCAGGG 5982

 13146958 ACAGAACCTCTGGCTTTGAGAAAACCAAGAAAAATCAGGGGCATGGTGAATCCTGAAAAA 13147017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5983 ACAGAACCTCTGGCTTTGAGAAAACCAAGAAAAATCAGGGGCATGGTGAATCCTGAAAAA 6042

 13147018 CACGTGGAAGCTGGCAGTTGCATTTTAAAATATTACCCAGTTAACAAAATCAACAGCCTC 13147077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6043 CACGTGGAAGCTGGCAGTTGCATTTTAAAATATTACCCAGTTAACAAAATCAACAGCCTC 6102

 13147078 CATGCACACACACACACTCTCCTTCCCTCCACTGCCCCTCCATCCCCTCCTCTCTGTATC 13147137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6103 CATGCACACACACACACTCTCCTTCCCTCCACTGCCCCTCCATCCCCTCCTCTCTGTATC 6162

 13147138 ACGGGCATCTAAGAGTCCCCCTAGAGCCATTCTCCCTCCTCTAGCCTCAGCAGGGCCCAT 13147197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6163 ACGGGCATCTAAGAGTCCCCCTAGAGCCATTCTCCCTCCTCTAGCCTCAGCAGGGCCCAT 6222

 13147198 GACTGACCAGTGAAAGACTGCATTTCCCAGCCTCCCTCCTCGTGAAGAGTAGCCATGAGA 13147257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6223 GACTGACCAGTGAAAGACTGCATTTCCCAGCCTCCCTCCTCGTGAAGAGTAGCCATGAGA 6282

 13147258 CTGAATTCTGGCCATGGGGATGTGTGCAGCATCTGAGTCACACCCTCTGTCCCCTCTCCA 13147317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6283 CTGAATTCTGGCCATGGGGATGTGTGCAGCATCTGAGTCACACCCTCTGTCCCCTCTCCA 6342

 13147318 TGTGGGGAGGTGGCAAATCAGCCTCCACCCCTAAGGGATGGCTGGCCTGCAGCATGTGGC 13147377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6343 TGTGGGGAGGTGGCAAATCAGCCTCCACCCCTAAGGGATGGCTGGCCTGCAGCATGTGGC 6402

 13147378 TTAAAATTAAAATGATTTTTAAATGTGATCATGTTATCACCTACTAGCACTGGCAAATAG 13147437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6403 TTAAAATTAAAATGATTTTTAAATGTGATCATGTTATCACCTACTAGCACTGGCAAATAG 6462

 13147438 AAGATTTCAGGCGAAACGCTGGGCTTTGTCTTCTCTCCATAGCTGAGAAAATCCGGCAGC 13147497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6463 AAGATTTCAGGCGAAACGCTGGGCTTTGTCTTCTCTCCATAGCTGAGAAAATCCGGCAGC 6522

 13147498 CCTGGGCTGGTTCCTTCCTGGTTAGAGGAGCGCTATGATGGAGGTGGAGCCACCAATAGA 13147557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6523 CCTGGGCTGGTTCCTTCCTGGTTAGAGGAGCGCTATGATGGAGGTGGAGCCACCAATAGA 6582

 13147558 GGGAGCCTGGGTTCCTGGGTGACTCTGTGGAGCAGAGCCCCCCAGCTTCCCAGGCTGCCT 13147617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6583 GGGAGCCTGGGTTCCTGGGTGACTCTGTGGAGCAGAGCCCCCCAGCTTCCCAGGCTGCCT 6642

 13147618 GCTTCCTCTGCATTCTGAACAGAGAGAGGAATCCATATCCAGCTACTGCCCAGAAGCCTT 13147677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6643 GCTTCCTCTGCATTCTGAACAGAGAGAGGAATCCATATCCAGCTACTGCCCAGAAGCCTT 6702

 13147678 CCATAATCTCAGCCTGGGAAAGCTCAACCCATGAAACTAGACTTCTCCAGGAAGCCTCCC 13147737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6703 CCATAATCTCAGCCTGGGAAAGCTCAACCCATGAAACTAGACTTCTCCAGGAAGCCTCCC 6762

 13147738 CGTTTCCCCTCCCCTCCCCAGCACCTTCCTGGGCTCCCACTGCCCACACTCCATTGTGAC 13147797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6763 CGTTTCCCCTCCCCTCCCCAGCACCTTCCTGGGCTCCCACTGCCCACACTCCATTGTGAC 6822

 13147798 TCTCTACCTCCCCCAGGCCTCAGCCACTGCCTGCTTGGCAGCTCCTTGGGACCCAGGACC 13147857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6823 TCTCTACCTCCCCCAGGCCTCAGCCACTGCCTGCTTGGCAGCTCCTTGGGACCCAGGACC 6882

 13147858 CTGGAGTCCCCTTCTTATTTGGGGACTCAGCTTGAGACCTGGGGTAATCAGAGTCTCTGT 13147917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6883 CTGGAGTCCCCTTCTTATTTGGGGACTCAGCTTGAGACCTGGGGTAATCAGAGTCTCTGT 6942

 13147918 TCCGAGCACTTGCTATATGTCAGGTGTGGTTCTAAGCTCTTTATCTCATGTAATCCTGAG 13147977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6943 TCCGAGCACTTGCTATATGTCAGGTGTGGTTCTAAGCTCTTTATCTCATGTAATCCTGAG 7002

 13147978 GCCAAGCCCATGAAATTGTACAGATGAGGGAACCTGAGGCCAAGTGACATGCCCCGAATC 13148037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7003 GCCAAGCCCATGAAATTGTACAGATGAGGGAACCTGAGGCCAAGTGACATGCCCCGAATC 7062

 13148038 ACATAGGAGTAGGAGACAGAGAAGACTTAAACTTAGGCCATCTGGTGTCAGAGCTCCCTG 13148097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7063 ACATAGGAGTAGGAGACAGAGAAGACTTAAACTTAGGCCATCTGGTGTCAGAGCTCCCTG 7122

 13148098 CCCTTAACCCTTAGGCAGCACTGCCTCTCCACAGAACAAGGCTGATCCACATTGAGTGGA 13148157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7123 CCCTTAACCCTTAGGCAGCACTGCCTCTCCACAGAACAAGGCTGATCCACATTGAGTGGA 7182

 13148158 TGAATAATAAATAGTGCATGAATCAATGAATGGGCACTGCCCTCCTCCTGCGGCTCCATG 13148217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7183 TGAATAATAAATAGTGCATGAATCAATGAATGGGCACTGCCCTCCTCCTGCGGCTCCATG 7242

 13148218 GGTTAGTGCAGGGCTGAACCCTGAGTACACACTCAAAACATGCTTATAAAGTGAGCAACT 13148277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7243 GGTTAGTGCAGGGCTGAACCCTGAGTACACACTCAAAACATGCTTATAAAGTGAGCAACT 7302

 13148278 GAGCAAACATCCTGGGTGGACGATTGTTTTTGGAAGATATCATCTCTTTGGAGTTTATGA 13148337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7303 GAGCAAACATCCTGGGTGGACGATTGTTTTTGGAAGATATCATCTCTTTGGAGTTTATGA 7362

 13148338 CCTTAAAATCGTTAACATACATTTTTCTATCCAAAATACATCATTTTAAGACTGTTTGAG 13148397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7363 CCTTAAAATCGTTAACATACATTTTTCTATCCAAAATACATCATTTTAAGACTGTTTGAG 7422

 13148398 AAGAGACACCACATGCCAGCTCCACGGCCCATTAAAGTTAACCAACTGTGCAGATTTTGT 13148457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7423 AAGAGACACCACATGCCAGCTCCACGGCCCATTAAAGTTAACCAACTGTGCAGATTTTGT 7482

 13148458 GGGAATGATGAAAATAGTAAAAGACTTGGGTGGTTTTCTAGAATGGCTTAAATCATCATG 13148517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7483 GGGAATGATGAAAATAGTAAAAGACTTGGGTGGTTTTCTAGAATGGCTTAAATCATCATG 7542

 13148518 AAATGCCAAGGAAAAGTAACAGTGAACTTGTGAGACACCACAAAGCTGGCAGAACCCTGG 13148577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7543 AAATGCCAAGGAAAAGTAACAGTGAACTTGTGAGACACCACAAAGCTGGCAGAACCCTGG 7602

 13148578 CCGTATCTCATGGCCCGTGTCCTTTTTGATGTGGAGAAGGCACAGAGTGGCTCTGGTGAC 13148637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7603 CCGTATCTCATGGCCCGTGTCCTTTTTGATGTGGAGAAGGCACAGAGTGGCTCTGGTGAC 7662

 13148638 CACCAGGGACAGAAACCTGGGGGCCTCCATCCACTCCCGAGAGATGTCTATAGACTGTAG 13148697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7663 CACCAGGGACAGAAACCTGGGGGCCTCCATCCACTCCCGAGAGATGTCTATAGACTGTAG 7722

 13148698 GATCTGCACAAGAGGTATTCCTGAAACCAGAAGACCCATGCACAGATGGTCAGGGCAGAG 13148757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7723 GATCTGCACAAGAGGTATTCCTGAAACCAGAAGACCCATGCACAGATGGTCAGGGCAGAG 7782

 13148758 GCTAGAGAAAAACAAAGCCCTTTCCTACTTACAAGCTTTGAGGTCTAGATCCTCTATAAA 13148817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7783 GCTAGAGAAAAACAAAGCCCTTTCCTACTTACAAGCTTTGAGGTCTAGATCCTCTATAAA 7842

 13148818 TTATTCAGGCAAGTTAAGGCAGCGGCCATTGCCAACAGGACCATGCCCCCTGCGGTTGCT 13148877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7843 TTATTCAGGCAAGTTAAGGCAGCGGCCATTGCCAACAGGACCATGCCCCCTGCGGTTGCT 7902

 13148878 ATAGTTAATTAAGTGCCTACTATACAGCACGCAGTGTTAGATGCTTCCGAGATGTTTAAT 13148937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7903 ATAGTTAATTAAGTGCCTACTATACAGCACGCAGTGTTAGATGCTTCCGAGATGTTTAAT 7962

 13148938 CTTTCCAGTACCAGTTCTGGCAAGTGTCATCTCCATATTACACATGGAGAAACAGGCTCA 13148997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7963 CTTTCCAGTACCAGTTCTGGCAAGTGTCATCTCCATATTACACATGGAGAAACAGGCTCA 8022

 13148998 GAGCGGTTA 13149006
          |||||||||
     8023 GAGCGGTTA 8031

Alignment time is 6.07988 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [13131433,13152582] =>     21150 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    6359] =>      6359 nucs 'mol-32-1ef5-098499_6359'

Score:        6112
Aligned:      6360        nucs
Identic:      6317 ( 99%) nucs =>      2901 (100%)      3416 ( 99%)
Gaps:           27 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [13138520,13141433] EXCISED REGION [13142583,13146002]
 second seq =>  [       1,    2913] EXCISED REGION [    2914,    6359]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1149 nucs [13141434,13142582]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         9 nucs [13141434,13141442] to [13142583,13142591]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [13141434,13141434] to [13142582,13142582]
 second seq =>         0 nucs

 13138520 CTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTC 13138579
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTC 60

 13138580 TCAATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGC 13138639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCAATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGC 120

 13138640 ATGAGCCACCGCGCCCGGCCTAGGCCTTTCTTTACATGGCATCCCTTCGCCTCTGCAAAC 13138699
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
      121 ATGAGCCACCGCGCCCGGCCTAGGCCTTTCTTTACATGGCATCCCTTTGCCTCTGCAAAC 180

 13138700 CTTCCAGAGGGAAGCGATCGCCCCTGGTTCACAGAAGAGGAAAGCAAGGCTCAGAGAGGG 13138759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTTCCAGAGGGAAGCGATCGCCCCTGGTTCACAGAAGAGGAAAGCAAGGCTCAGAGAGGG 240

 13138760 AAGGTACCTTGCCTCCCACACGATTGGAAGAGCTGGGATTCGAATCCAGATCTGCCTGAC 13138819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAGGTACCTTGCCTCCCACACGATTGGAAGAGCTGGGATTCGAATCCAGATCTGCCTGAC 300

 13138820 TCCAGAACAATGCCTTTTTCCCTCCCTGCTTCCAGACGTGGCTCTGGTCCCCTCCAGTCA 13138879
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
      301 TCCAGAACAATGCCTTTTTCCCTCCCTGCTTCCAGACGTGGCTCTAGTCCCCTCCAGTCA 360

 13138880 CTGAGTCTCCAGCTTGGCAGCCATACTCCACCTGGCTGTCCACCATAAGCCCTGCAGGTC 13138939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTGAGTCTCCAGCTTGGCAGCCATACTCCACCTGGCTGTCCACCATAAGCCCTGCAGGTC 420

 13138940 CTGTGCCCAAGGCTCCCAGACCCTGGCCATGCTCCTGTGTTGGCGTCAACTTTCTGGATT 13138999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTGTGCCCAAGGCTCCCAGACCCTGGCCATGCTCCTGTGTTGGCGTCAACTTTCTGGATT 480

 13139000 TCACACGGCCTGCCAGCTCGAGCCTCAGTCTTTCCATCTGTGAACCGGGGCTGGGCCCCT 13139059
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
      481 TCACACGGCCTGCCAGATCGAGCCTCAGTCTTTCCATCCGTGAACCGGGGCTGGGCCCCT 540

 13139060 CAGCTCTGCAGCCGCCAGCCCCCACCTCCCAACTCCCGCACTCATGCTGTGAACGCCTGA 13139119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CAGCTCTGCAGCCGCCAGCCCCCACCTCCCAACTCCCGCACTCATGCTGTGAACGCCTGA 600

 13139120 TAAACCTCCTCTGGGCCTTTAAGGGCCTTTTATTTCTCCAGCCATGCTTTTCTCTACATT 13139179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TAAACCTCCTCTGGGCCTTTAAGGGCCTTTTATTTCTCCAGCCATGCTTTTCTCTACATT 660

 13139180 TTAATAAGCTGCTTACAAAATTGGTGATTGATGAGTAAGAATGAGGAGGATGCAGGGCTG 13139239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTAATAAGCTGCTTACAAAATTGGTGATTGATGAGTAAGAATGAGGAGGATGCAGGGCTG 720

 13139240 AACATTTTTTTTTTCCTGGAATCGCTTCTGGCTGCGCATTCAACTTTAAATTGATTAATA 13139299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AACATTTTTTTTTTCCTGGAATCGCTTCTGGCTGCGCATTCAACTTTAAATTGATTAATA 780

 13139300 ACGTGCAGACCCAACATTAATTATCAACCATTTGTCACTGGGGAAGGCTGGAGCCTGCGC 13139359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ACGTGCAGACCCAACATTAATTATCAACCATTTGTCACTGGGGAAGGCTGGAGCCTGCGC 840

 13139360 CTGTGTGCAGCCCCTTTCTTCATGACCAGCTCAGTGGTATAGGAGGTGCCCATCTGTCCC 13139419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTGTGTGCAGCCCCTTTCTTCATGACCAGCTCAGTGGTATAGGAGGTGCCCATCTGTCCC 900

 13139420 ACAGGGGTGCATGGAAGGCCCTGGACACTTAAAGCCCTGGCAGCCTCAGCCCACTGTGCC 13139479
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ACAGGGGTGCATGGAAGGTCCTGGACACTTAAAGCCCTGGCAGCCTCAGCCCACTGTGCC 960

 13139480 CTGGGCATGTGAGGGCTTCTGAAGGCCAAGCCTGAGCATCTCAGGGCCGACCCCAGATGT 13139539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTGGGCATGTGAGGGCTTCTGAAGGCCAAGCCTGAGCATCTCAGGGCCGACCCCAGATGT 1020

 13139540 CTGGGGCAGTGGTGCCCTCAATGTCTGTCCTGCCCTGTGCTGGCTCATGGCCTTACCTGA 13139599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTGGGGCAGTGGTGCCCTCAATGTCTGTCCTGCCCTGTGCTGGCTCATGGCCTTACCTGA 1080

 13139600 CCCTAGGTCAGGTCTTCAGGTCCCCAGCAGACCCCAGCATTTCTTCATTAATTCAACAAA 13139659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CCCTAGGTCAGGTCTTCAGGTCCCCAGCAGACCCCAGCATTTCTTCATTAATTCAACAAA 1140

 13139660 CATTTATTGAGCAACTATGATGTGCAGCCTTCTTTCTGGAGGCTGACGGCACAGCAGAGA 13139719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CATTTATTGAGCAACTATGATGTGCAGCCTTCTTTCTGGAGGCTGACGGCACAGCAGAGA 1200

 13139720 TCAAAACAAGGTCCTTGACTTTTTGCAGGGGCAGCCTGGCAATCAATGGAACCAACGAGG 13139779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TCAAAACAAGGTCCTTGACTTTTTGCAGGGGCAGCCTGGCAATCAATGGAACCAACGAGG 1260

 13139780 AAGCAAACAAATTACAGTCTAGCAAGAATCAGGAATTTTTGGAGCATAGACGGCGAAATC 13139839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AAGCAAACAAATTACAGTCTAGCAAGAATCAGGAATTTTTGGAGCATAGACGGCGAAATC 1320

 13139840 TAACTTAGCATTGGGAAGGTACCACAGAGGAGGCGCCATCTTAAGTGGGTTTTGAAGGAT 13139899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TAACTTAGCATTGGGAAGGTACCACAGAGGAGGCGCCATCTTAAGTGGGTTTTGAAGGAT 1380

 13139900 GCAGAGGAGTTCTCTGGGGGTTGGGGGGATAAGTAAAGAAAGCACAACCCCAGAAAGGGA 13139959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GCAGAGGAGTTCTCTGGGGGTTGGGGGGATAAGTAAAGAAAGCACAACCCCAGAAAGGGA 1440

 13139960 ACGGTCTACAAAGAAAAGAAAAGCCAGTAAGAATCAGGAGGGTCAAGAGGAGGGTGAGGG 13140019
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ACGGTCTATAAAGAAAAGAAAAGCCAGTAAGAATCAGGAGGGTCAAGAGGAGGGTGAGGG 1500

 13140020 TTTCCACTAAAATAGGAGGATGGAGAGGGCCTCACTGAGAAGGGGGTGAGGGAGGGAGCC 13140079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTTCCACTAAAATAGGAGGATGGAGAGGGCCTCACTGAGAAGGGGGTGAGGGAGGGAGCC 1560

 13140080 AAGGAGATACCTGGAGAAGAGTGTCTGAGGCAGAGGAAACAGCAGTGGAAAGGCTCTGAG 13140139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AAGGAGATACCTGGAGAAGAGTGTCTGAGGCAGAGGAAACAGCAGTGGAAAGGCTCTGAG 1620

 13140140 CTAGGGGAAAATGGATGGCTAAAAATAACATTATACAATGTGAAAGAAGCCAGTCACACA 13140199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CTAGGGGAAAATGGATGGCTAAAAATAACATTATACAATGTGAAAGAAGCCAGTCACACA 1680

 13140200 AGGCCAGTGTATATGGTTCCATTTGTATGGAGAGTCCAGAATGGGCAATTCACTAGAAAA 13140259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AGGCCAGTGTATATGGTTCCATTTGTATGGAGAGTCCAGAATGGGCAATTCACTAGAAAA 1740

 13140260 AAGAAAGTAAATTCAAGGTTACCAGGGACTTAGGGGAAGAGGAAGTGGGAAATGACTGCT 13140319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AAGAAAGTAAATTCAAGGTTACCAGGGACTTAGGGGAAGAGGAAGTGGGAAATGACTGCT 1800

 13140320 ACTGGGTATACGGTTTCTTTCTGGATGATGAAAATGTCCTAAAACCGACTGTGAAATGGA 13140379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ACTGGGTATACGGTTTCTTTCTGGATGATGAAAATGTCCTAAAACCGACTGTGAAATGGA 1860

 13140380 TTCACAACTCTGTGAATACACTAACATCCACGGAATGATACACTTTAAATGAATGAACTT 13140439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTCACAACTCTGTGAATACACTAACATCCACGGAATGATACACTTTAAATGAATGAACTT 1920

 13140440 TACAGTATGTAAATTCCAGTAAAGCTGTTACAGAATAACTTTGTCATATGTCAGGTAGCG 13140499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     1921 TACAGTATGTAAATTCCAGTAAAGCTGTTACAAAATAACTTTGTCATATGTCAGGTAGCG 1980

 13140500 ATCAGTTCCAGAAAAGACATTGGGATAAGAGGACTTTCGGGGGATGGGGGGAACAGGCCG 13140559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ATCAGTTCCAGAAAAGACATTGGGATAAGAGGACTTTCGGGGGATGGGGGGAACAGGCCG 2040

 13140560 GGTGTCCCCAAAGAGGTGATATTGAAGCAGAGACCTGGGCTGAGCTACAGGTCCAGGAAT 13140619
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GGTGTCCCCAAAGAGGTGATATTTAAGCAGAGACCTGGGCTGAGCTACAGGTCCAGGAAT 2100

 13140620 AGGGTGGTGGCTAGACTAGCCTGTCCCGCACCTGCCACCTGGGGCACCACTGAGTGTAGC 13140679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AGGGTGGTGGCTAGACTAGCCTGTCCCGCACCTGCCACCTGGGGCACCACTGAGTGTAGC 2160

 13140680 CCTGGGGGCCATAGCCCCTGGAGAGGGGTGAGGAGAGGCAAGTGAGACCTTCAGGGAAGT 13140739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     2161 CCTGGGGGCCATAGCCCCTGGAGAGGGGTGAGGAGAGGCAAGTGAGACCTTCGGGGAAGT 2220

 13140740 TGAGGCCACAGTGAGGCACATCGGCTATATCAGGGTCCACTAGGGGCACCAGAATATAGC 13140799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TGAGGCCACAGTGAGGCACATCGGCTATATCAGGGTCCACTAGGGGCACCAGAATATAGC 2280

 13140800 TGGTGGGGCATGGGCAAATGAGGTTTCGGGTGTGCAGGATTGCATTTTATGAGAATTTGA 13140859
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     2281 TGGTGGGGCATGGGCAAATGAGGTTTCGGGTGTGCCGGATTGCATTTTATGAGAATTTGA 2340

 13140860 CAAATTTAAATCAGCAAGAGTTGCAACATCTCAAAGCTGGTAGGAAAAATGGTTTTTAGG 13140919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CAAATTTAAATCAGCAAGAGTTGCAACATCTCAAAGCTGGTAGGAAAAATGGTTTTTAGG 2400

 13140920 CTCAGGCTACTTTCGAAAGAGTGAAGGTGGTGCTGCTCAGGGCTTACAGGCAATGGTGGA 13140979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CTCAGGCTACTTTCGAAAGAGTGAAGGTGGTGCTGCTCAGGGCTTACAGGCAATGGTGGA 2460

 13140980 CTCCTCCCCCGAGCTGGGTGTCCCCGGGTGCATCTGTGGCCCTCAGAAGCGCCCACCTCA 13141039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CTCCTCCCCCGAGCTGGGTGTCCCCGGGTGCATCTGTGGCCCTCAGAAGCGCCCACCTCA 2520

 13141040 CTCAGGCTGGCAGAGCGCGGTGGCCATGGAAACGCAAGCCAGAGTGTGCAAGAATCAAAC 13141099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CTCAGGCTGGCAGAGCGCGGTGGCCATGGAAACGCAAGCCAGAGTGTGCAAGAATCAAAC 2580

 13141100 AGACAGAAGTAAAAGGACCTTACCTATTGCCCGGGGCTGGGGCTCCCTCCTTCATTCTGG 13141159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AGACAGAAGTAAAAGGACCTTACCTATTGCCCGGGGCTGGGGCTCCCTCCTTCATTCTGG 2640

 13141160 GTTTTAGGAAAACAGCCATCATTATTTCCTAAAAGGTGCCCCCTACTCCCCGCCAACCCG 13141219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GTTTTAGGAAAACAGCCATCATTATTTCCTAAAAGGTGCCCCCTACTCCCCGCCAACCCG 2700

 13141220 GGACAACTTCACATGCCAGGAAAGCCCTCTCTACCTCAAAGCAGTCCCTGTTCAAGCCCC 13141279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GGACAACTTCACATGCCAGGAAAGCCCTCTCTACCTCAAAGCAGTCCCTGTTCAAGCCCC 2760

 13141280 TACCCCCAGCTCCTCTCTCTGTGAAACCACAGCCATCAGTGAAGGGGGCAGTTGCACCTC 13141339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TACCCCCAGCTCCTCTCTCTGTGAAACCACAGCCATCAGTGAAGGGGGCAGTTGCACCTC 2820

 13141340 AGCACCCCTGGCAGAGGGCACGGCATGTGCAAAGGCCCCAAGGGAGCAGTGTGCCTGGTG 13141399
          |||||||| |||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 AGCACCCC-GGCAGAGGGCACGGCATCTGCAAAGGCCCCAAGGGAGCAGTGTGCCTGGTG 2879

 13141400 TGATCCAGGAACAAGGAATCAGGGTGGCTGGAAC 13141433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2880 TGATCCAGGAACAAGGAATCAGGGTGGCTGGAAC 2913

EXCISED REGION

 13142583 AGAGGGAGGCTGCTGAGGGGAGTGTGGATTTTCTGCTAAGCGCAGCGAGGAGCCATGGGA 13142642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2914 AGAGGGAGGCTGCTGAGGGGAGTGTGGATTTTCTGCTAAGCGCAGCGAGGAGCCATGGGA 2973

 13142643 GGGCTTCAAGCCTGACAGTGACACGATGCGACTTCTGTTTTTAAAAGCACCCTTCTAGGC 13142702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2974 GGGCTTCAAGCCTGACAGTGACACGATGCGACTTCTGTTTTTAAAAGCACCCTTCTAGGC 3033

 13142703 TGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCA 13142762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3034 TGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCA 3093

 13142763 TGAGGTCAGAAGATTGAGACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAA 13142822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3094 TGAGGTCAGAAGATTGAGACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAA 3153

 13142823 TACAAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGGGCGTCTCCAATGAGCCGAGATTGAGCCACTG 13142882
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3154 TACAAAAAATTAGCCGGGCATGGTGGCGGGCGTCTCCAATGAGCCGAGATTGAGCCACTG 3213

 13142883 CACTCCAGCCTGGGAGACAGGGTGAGATTCCATCTCC----------------------- 13142919
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||                       
     3214 CACTCCAGCCTGGGAGACAGGGTGAGATTCCATCTCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 3273

 13142920 ---AAAAAAAAAAAAAATGCACCCTTCTACTGTTGAGAGGGCAGAAAGGAACAGAAAGGA 13142976
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3274 AAAAAAAAAAAAAAAAATGCACCCTTCTACTGTTGAGAGGGCAGAAAGGAACAGAAAGGA 3333

 13142977 AACAAGGAGGTCTGGGAAGGCCCCGGGAAGATGAGCGATGGTGGTGCCTGGCTAGATGGT 13143036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3334 AACAAGGAGGTCTGGGAAGGCCCCGGGAAGATGAGCGATGGTGGTGCCTGGCTAGATGGT 3393

 13143037 GGGCTGGCAGGGAGAGGTGCTCAGGCCCAAGTCTGTCTGGAGGGAGCTCCCGGTTTCCAC 13143096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3394 GGGCTGGCAGGGAGAGGTGCTCAGGCCCAAGTCTGTCTGGAGGGAGCTCCCGGTTTCCAC 3453

 13143097 GACAGATTGCAGTGGGTGGGAGAGGAAGGGGAGTCAGGCTGGGCTGCAGGCGGAAGGGCT 13143156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3454 GACAGATTGCAGTGGGTGGGAGAGGAAGGGGAGTCAGGCTGGGCTGCAGGCGGAAGGGCT 3513

 13143157 GGGAAGAGACTCAGAGTCCTGTTTTGGCTGTGTCCAGTATGATGTCTGTGGGGCCTCCAG 13143216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3514 GGGAAGAGACTCAGAGTCCTGTTTTGGCTGTGTCCAGTATGATGTCTGTGGGGCCTCCAG 3573

 13143217 GTAGAAACATGGAGGAGGCAGCTGGATGGGTAGCAGTGGAGTGGTGAGTGGTACAGGCTG 13143276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3574 GTAGAAACATGGAGGAGGCAGCTGGATGGGTAGCAGTGGAGTGGTGAGTGGTACAGGCTG 3633

 13143277 GAGATATAAATTTGGGGCCATCTTTCAATTTTATTGTTTCAGAGATAAACCCTGATGAAG 13143336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3634 GAGATATAAATTTGGGGCCATCTTTCAATTTTATTGTTTCAGAGATAAACCCTGATGAAG 3693

 13143337 TCCAGGAATCAATAAACAGAGACTAACACTGGCCTCCTTCCCCATCCAGATCCTGGGAGA 13143396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3694 TCCAGGAATCAATAAACAGAGACTAACACTGGCCTCCTTCCCCATCCAGATCCTGGGAGA 3753

 13143397 GGATTTCACGAGTTAAGTGCTTTGAAACTGACTCTGGCCTTGCAGGGGTGGGAGGGAGGG 13143456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3754 GGATTTCACGAGTTAAGTGCTTTGAAACTGACTCTGGCCTTGCAGGGGTGGGAGGGAGGG 3813

 13143457 TGTGCAGTGAGCCAGGGGCCCACTCATGAGCCATCGATTAATAAACTCTGCCCGCTCATG 13143516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3814 TGTGCAGTGAGCCAGGGGCCCACTCATGAGCCATCGATTAATAAACTCTGCCCGCTCATG 3873

 13143517 CCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAAGTGGATCGCTTGAGCCCAGGAGTTTG 13143576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     3874 CCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAAGTGGATCGCTTGAGCCCAAGAGTTTG 3933

 13143577 AGACCAGCCTGGGCAATGTGGCGAGACCCTGTCTCTACAAAAAATGCAAAAATTAGTCAG 13143636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3934 AGACCAGCCTGGGCAATGTGGCGAGACCCTGTCTCTACAAAAAATGCAAAAATTAGTCAG 3993

 13143637 GCATGGTGATGTGCATCTGTAGTCCTGGCTACTCAGGAGGCTGAGGTGGAAGGATTGCTT 13143696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3994 GCATGGTGATGTGCATCTGTAGTCCTGGCTACTCAGGAGGCTGAGGTGGAAGGATTGCTT 4053

 13143697 GAGCCCAGGAGATCAATGATGGAGCCCAGGAGTCAGTGATGGAGCCACTGACTCCAGCCT 13143756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4054 GAGCCCAGGAGATCAATGATGGAGCCCAGGAGTCAGTGATGGAGCCACTGACTCCAGCCT 4113

 13143757 GGGTGATGGAGCAAGAACTTGTCTCAAAATAATAATAATAATAATAAATAACCTCTGCCT 13143816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4114 GGGTGATGGAGCAAGAACTTGTCTCAAAATAATAATAATAATAATAAATAACCTCTGCCT 4173

 13143817 TCCATGCGAACAAACACCCATCCTAGAGCCTGAGACTGGGATGGGCTGGGGAGCGGAGGC 13143876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4174 TCCATGCGAACAAACACCCATCCTAGAGCCTGAGACTGGGATGGGCTGGGGAGCGGAGGC 4233

 13143877 CTGGGCCCAGCCCCATGTTGGGGCTGCCGGGGTTGGTGTTGGTGGGGGGCTGGATTAGAG 13143936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4234 CTGGGCCCAGCCCCATGTTGGGGCTGCCGGGGTTGGTGTTGGTGGGGGGCTGGATTAGAG 4293

 13143937 GCTGGATTTCCTCACCCGTGTGGTTTGGGCCCATGGTTTCCTTCTCTGAGCTTCTGTTTG 13143996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4294 GCTGGATTTCCTCACCCGTGTGGTTTGGGCCCATGGTTTCCTTCTCTGAGCTTCTGTTTG 4353

 13143997 CTCATCTGAGTAATAGGCGTGAAAACCTGTGCTTCACGGGGGTCTGGCAGGAGGAAAGGA 13144056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4354 CTCATCTGAGTAATAGGCGTGAAAACCTGTGCTTCACGGGGGTCTGGCAGGAGGAAAGGA 4413

 13144057 GCAGGTGTGAGCCCATGGTTCTCCACAGCACTGTCCTTCCCCGGTCGGGTGGGGATTGGG 13144116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4414 GCAGGTGTGAGCCCATGGTTCTCCACAGCACTGTCCTTCCCCGGTCGGGTGGGGATTGGG 4473

 13144117 GATTTGAAGATATTTATTGGTAACCACGGAGCTCCCCTCACGTCACATGCTCCCACTGTC 13144176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4474 GATTTGAAGATATTTATTGGTAACCACGGAGCTCCCCTCACGTCACATGCTCCCACTGTC 4533

 13144177 AACTGCAGGCCACAGGTCCCACCCTCCAGGCCTTTGCATGTGCAGCCTTCCCTGCTTGGA 13144236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4534 AACTGCAGGCCACAGGTCCCACCCTCCAGGCCTTTGCATGTGCAGCCTTCCCTGCTTGGA 4593

 13144237 TGCCCTCCCTGGCACTCCACTGTCAGCAGACTTGCTTGCTTGCCACTAAAATGTAAGCTC 13144296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4594 TGCCCTCCCTGGCACTCCACTGTCAGCAGACTTGCTTGCTTGCCACTAAAATGTAAGCTC 4653

 13144297 CAGGAGGCGGGTACTGAGCACAGCTCGTTCACGGCTGCACCCCTGGTGCTGAGGGCTGTG 13144356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4654 CAGGAGGCGGGTACTGAGCACAGCTCGTTCACGGCTGCACCCCTGGTGCTGAGGGCTGTG 4713

 13144357 CCTGCCACGGCCCACATATTACTGCATTTAGTCCTTACAACCACCCTGGGAGGTCGGAAG 13144416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4714 CCTGCCACGGCCCACATATTACTGCATTTAGTCCTTACAACCACCCTGGGAGGTCGGAAG 4773

 13144417 TTTCCAGATGAGAAAACTGAGAGCTGAAGACAATTGGCACCTTGTCCAGCTCAGCCCCGT 13144476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4774 TTTCCAGATGAGAAAACTGAGAGCTGAAGACAATTGGCACCTTGTCCAGCTCAGCCCCGT 4833

 13144477 CAGAGGTGGCAGAGAGGGGCTCAGATCAGGTGCTTGGTGCCCCCCTACCTCAACCTGTGG 13144536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4834 CAGAGGTGGCAGAGAGGGGCTCAGATCAGGTGCTTGGTGCCCCCCTACCTCAACCTGTGG 4893

 13144537 GCTGGATGTCGGAAGGGACTCTGACTTCTGCGCAGGGATGCAGCTTGCTCCCATGCTCTG 13144596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4894 GCTGGATGTCGGAAGGGACTCTGACTTCTGCGCAGGGATGCAGCTTGCTCCCATGCTCTG 4953

 13144597 AAGTAGAGCCAGGGCCCCAGGGCTCTGCCCCAGCCCCTCCCTGGCCCATGTCCCCGGCTG 13144656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4954 AAGTAGAGCCAGGGCCCCAGGGCTCTGCCCCAGCCCCTCCCTGGCCCATGTCCCCGGCTG 5013

 13144657 GCCCCAGGCAGGTCAGTTCAGGGAAGGGGCCTGCATCGAACTCTCGCCACCTCCCTAAGC 13144716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5014 GCCCCAGGCAGGTCAGTTCAGGGAAGGGGCCTGCATCGAACTCTCGCCACCTCCCTAAGC 5073

 13144717 CAGAGCTGTCTGCTTGCTCAGATATCATCAGCTTCCCATTAAGCAGATCAATAGCTTCCA 13144776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5074 CAGAGCTGTCTGCTTGCTCAGATATCATCAGCTTCCCATTAAGCAGATCAATAGCTTCCA 5133

 13144777 CTGGTTTCCAATTTGTGTTTCCAGAAATTCATCTCCCAGCCACCTTTTTAATTAACCGCC 13144836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5134 CTGGTTTCCAATTTGTGTTTCCAGAAATTCATCTCCCAGCCACCTTTTTAATTAACCGCC 5193

 13144837 CCCGCCAACACACCCGAGGCACCAATAGATCACCCTCTCCCCTCCACCTCTGTGGACCAC 13144896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5194 CCCGCCAACACACCCGAGGCACCAATAGATCACCCTCTCCCCTCCACCTCTGTGGACCAC 5253

 13144897 AGACCACTAGCTCCACCAGCCTCGGGGGAGTGGCAGGTGTGTTTAAAGCTGTATGATCAC 13144956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5254 AGACCACTAGCTCCACCAGCCTCGGGGGAGTGGCAGGTGTGTTTAAAGCTGTATGATCAC 5313

 13144957 CATCCTCAGTCACTGGAAGAGCTGGCCGTGCTGCCTGGATGCCATCCACACCTGTCCCCG 13145016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5314 CATCCTCAGTCACTGGAAGAGCTGGCCGTGCTGCCTGGATGCCATCCACACCTGTCCCCG 5373

 13145017 AGGAAGGGGCTGGGCCCTTCACCATGAGGAAAACCAAGAATCAGGGAGGCCAAGCAGCAG 13145076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5374 AGGAAGGGGCTGGGCCCTTCACCATGAGGAAAACCAAGAATCAGGGAGGCCAAGCAGCAG 5433

 13145077 CTGGCAAGAGCCAGAGCCGAGTGTGCCATTGGGGTGGGCAATTTGCAGGATGAGCTTCAC 13145136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5434 CTGGCAAGAGCCAGAGCCGAGTGTGCCATTGGGGTGGGCAATTTGCAGGATGAGCTTCAC 5493

 13145137 ATGCAGCACGCACTGGGGGTCTGGCTGGCAGGGGAGCGGGGCTGGCAGCTGTGATTTCAG 13145196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5494 ATGCAGCACGCACTGGGGGTCTGGCTGGCAGGGGAGCGGGGCTGGCAGCTGTGATTTCAG 5553

 13145197 AGCAGGGGAAGGTTGGAGGCCTGACCCCCAGAGGGTGCGCCTCCTACCCCTGGGAGCTCC 13145256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5554 AGCAGGGGAAGGTTGGAGGCCTGACCCCCAGAGGGTGCGCCTCCTACCCCTGGGAGCTCC 5613

 13145257 CCGGTATTCCATGTTGCCTACCACCCTACGAGGGCAGGGGCTGTGTCTGCCTCCATCACT 13145316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5614 CCGGTATTCCATGTTGCCTACCACCCTACGAGGGCAGGGGCTGTGTCTGCCTCCATCACT 5673

 13145317 GCTCTCTCCCCAGCGTGCGGCACATAGTAGGTGCTCAGTAAGTCACTAAATGAGCAGCAA 13145376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5674 GCTCTCTCCCCAGCGTGCGGCACATAGTAGGTGCTCAGTAAGTCACTAAATGAGCAGCAA 5733

 13145377 TATTTGCCAAAACTTAGGACATTACCTTTGTGCCAGGTATTCTTCTATTTAATCTTCACG 13145436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5734 TATTTGCCAAAACTTAGGACATTACCTTTGTGCCAGGTATTCTTCTATTTAATCTTCACG 5793

 13145437 GCACTCCCTGAGGTGGGTGCTACTAGTATCTTCATTTTATAGATGGGAAAACTCAGGCAC 13145496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5794 GCACTCCCTGAGGTGGGTGCTACTAGTATCTTCATTTTATAGATGGGAAAACTCAGGCAC 5853

 13145497 AGAGAGTTTCAATGACTTGCCCAAGGTCACACAACTAGTTAGTCATGGAGCTGAGATTCG 13145556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5854 AGAGAGTTTCAATGACTTGCCCAAGGTCACACAACTAGTTAGTCATGGAGCTGAGATTCG 5913

 13145557 AACCCAGGCCATCTGTCTCTAGAGCTGTTGCTACTAATCGCCCCACTCTTCCTTACCTGC 13145616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5914 AACCCAGGCCATCTGTCTCTAGAGCTGTTGCTACTAATCGCCCCACTCTTCCTTACCTGC 5973

 13145617 TCCCCATGGCCTGTCAGCTCCGATGGGCAAGGACTGGGTCCTGTGCCTGGTGTAACTTCT 13145676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5974 TCCCCATGGCCTGTCAGCTCCGATGGGCAAGGACTGGGTCCTGTGCCTGGTGTAACTTCT 6033

 13145677 GTCACACACAAACATAGCATGTTTGCTGAGTGAATAAATGGTGACTTCTGCACTCCCTGC 13145736
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     6034 GTCACACACAAACATAGCATGTTTGCTGAGTGAATAAATGGCGACTTCTGCACTCCCTGC 6093

 13145737 TTCCCAAAACAACCTAGTTGACCAGTCTGTTGGGGCAAATCTAGAGTATTTCATCTGGAA 13145796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     6094 TTCCCAAAACAACCTAGTTGACCAGTCTGTTGGGGCAAATCTGGAGTATTTCATCTGGAA 6153

 13145797 ATGAAGGGAAGAGATGGGGTGAGTCCCCTGGGTGACCCTGGGGTGACAAGCCTCCCAGTG 13145856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6154 ATGAAGGGAAGAGATGGGGTGAGTCCCCTGGGTGACCCTGGGGTGACAAGCCTCCCAGTG 6213

 13145857 AGTACACTGCTGGGGCCAACATTAGGGACCCTCTAATTCCACTTCCATCTTCCTTTTCAC 13145916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6214 AGTACACTGCTGGGGCCAACATTAGGGACCCTCTAATTCCACTTCCATCTTCCTTTTCAC 6273

 13145917 CCATCCCTTACATTTCTGGGCTCTCTGTAGTCTATACAAAAATACATTCACAGCCATGAT 13145976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6274 CCATCCCTTACATTTCTGGGCTCTCTGTAGTCTATACAAAAATACATTCACAGCCATGAT 6333

 13145977 GTTGTTATTCTGCGGACTCTTGCAGC 13146002
          ||||||||||||||||||||||||||
     6334 GTTGTTATTCTGCGGACTCTTGCAGC 6359

Alignment time is 5.15642 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [13131433,13152582] =>     21150 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    2922] =>      2922 nucs 'mol-32-1ef5-098499_2922'

Score:        2790
Aligned:      2922        nucs
Identic:      2910 (100%) nucs =>        30 (100%)      2880 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [13138520,13138549] EXCISED REGION [13138551,13141442]
 second seq =>  [       1,      30] EXCISED REGION [      32,    2922]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [13138550,13138550]
 second seq =>         1 nucs [31,31]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [13141348,13141348]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 13138520 CTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGA 13138549
          ||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGA 30

EXCISED REGION

 13138551 GGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCAATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCACCT 13138610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       32 GGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCAATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCACCT 91

 13138611 CGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGCCCGGCCTAGGCCTTTCT 13138670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       92 CGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGCCCGGCCTAGGCCTTTCT 151

 13138671 TTACATGGCATCCCTTCGCCTCTGCAAACCTTCCAGAGGGAAGCGATCGCCCCTGGTTCA 13138730
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      152 TTACATGGCATCCCTTTGCCTCTGCAAACCTTCCAGAGGGAAGCGATCGCCCCTGGTTCA 211

 13138731 CAGAAGAGGAAAGCAAGGCTCAGAGAGGGAAGGTACCTTGCCTCCCACACGATTGGAAGA 13138790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      212 CAGAAGAGGAAAGCAAGGCTCAGAGAGGGAAGGTACCTTGCCTCCCACACGATTGGAAGA 271

 13138791 GCTGGGATTCGAATCCAGATCTGCCTGACTCCAGAACAATGCCTTTTTCCCTCCCTGCTT 13138850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      272 GCTGGGATTCGAATCCAGATCTGCCTGACTCCAGAACAATGCCTTTTTCCCTCCCTGCTT 331

 13138851 CCAGACGTGGCTCTGGTCCCCTCCAGTCACTGAGTCTCCAGCTTGGCAGCCATACTCCAC 13138910
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      332 CCAGACGTGGCTCTAGTCCCCTCCAGTCACTGAGTCTCCAGCTTGGCAGCCATACTCCAC 391

 13138911 CTGGCTGTCCACCATAAGCCCTGCAGGTCCTGTGCCCAAGGCTCCCAGACCCTGGCCATG 13138970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      392 CTGGCTGTCCACCATAAGCCCTGCAGGTCCTGTGCCCAAGGCTCCCAGACCCTGGCCATG 451

 13138971 CTCCTGTGTTGGCGTCAACTTTCTGGATTTCACACGGCCTGCCAGCTCGAGCCTCAGTCT 13139030
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
      452 CTCCTGTGTTGGCGTCAACTTTCTGGATTTCACACGGCCTGCCAGATCGAGCCTCAGTCT 511

 13139031 TTCCATCTGTGAACCGGGGCTGGGCCCCTCAGCTCTGCAGCCGCCAGCCCCCACCTCCCA 13139090
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      512 TTCCATCCGTGAACCGGGGCTGGGCCCCTCAGCTCTGCAGCCGCCAGCCCCCACCTCCCA 571

 13139091 ACTCCCGCACTCATGCTGTGAACGCCTGATAAACCTCCTCTGGGCCTTTAAGGGCCTTTT 13139150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      572 ACTCCCGCACTCATGCTGTGAACGCCTGATAAACCTCCTCTGGGCCTTTAAGGGCCTTTT 631

 13139151 ATTTCTCCAGCCATGCTTTTCTCTACATTTTAATAAGCTGCTTACAAAATTGGTGATTGA 13139210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      632 ATTTCTCCAGCCATGCTTTTCTCTACATTTTAATAAGCTGCTTACAAAATTGGTGATTGA 691

 13139211 TGAGTAAGAATGAGGAGGATGCAGGGCTGAACATTTTTTTTTTCCTGGAATCGCTTCTGG 13139270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      692 TGAGTAAGAATGAGGAGGATGCAGGGCTGAACATTTTTTTTTTCCTGGAATCGCTTCTGG 751

 13139271 CTGCGCATTCAACTTTAAATTGATTAATAACGTGCAGACCCAACATTAATTATCAACCAT 13139330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      752 CTGCGCATTCAACTTTAAATTGATTAATAACGTGCAGACCCAACATTAATTATCAACCAT 811

 13139331 TTGTCACTGGGGAAGGCTGGAGCCTGCGCCTGTGTGCAGCCCCTTTCTTCATGACCAGCT 13139390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      812 TTGTCACTGGGGAAGGCTGGAGCCTGCGCCTGTGTGCAGCCCCTTTCTTCATGACCAGCT 871

 13139391 CAGTGGTATAGGAGGTGCCCATCTGTCCCACAGGGGTGCATGGAAGGCCCTGGACACTTA 13139450
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
      872 CAGTGGTATAGGAGGTGCCCATCTGTCCCACAGGGGTGCATGGAAGGTCCTGGACACTTA 931

 13139451 AAGCCCTGGCAGCCTCAGCCCACTGTGCCCTGGGCATGTGAGGGCTTCTGAAGGCCAAGC 13139510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      932 AAGCCCTGGCAGCCTCAGCCCACTGTGCCCTGGGCATGTGAGGGCTTCTGAAGGCCAAGC 991

 13139511 CTGAGCATCTCAGGGCCGACCCCAGATGTCTGGGGCAGTGGTGCCCTCAATGTCTGTCCT 13139570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      992 CTGAGCATCTCAGGGCCGACCCCAGATGTCTGGGGCAGTGGTGCCCTCAATGTCTGTCCT 1051

 13139571 GCCCTGTGCTGGCTCATGGCCTTACCTGACCCTAGGTCAGGTCTTCAGGTCCCCAGCAGA 13139630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1052 GCCCTGTGCTGGCTCATGGCCTTACCTGACCCTAGGTCAGGTCTTCAGGTCCCCAGCAGA 1111

 13139631 CCCCAGCATTTCTTCATTAATTCAACAAACATTTATTGAGCAACTATGATGTGCAGCCTT 13139690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1112 CCCCAGCATTTCTTCATTAATTCAACAAACATTTATTGAGCAACTATGATGTGCAGCCTT 1171

 13139691 CTTTCTGGAGGCTGACGGCACAGCAGAGATCAAAACAAGGTCCTTGACTTTTTGCAGGGG 13139750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1172 CTTTCTGGAGGCTGACGGCACAGCAGAGATCAAAACAAGGTCCTTGACTTTTTGCAGGGG 1231

 13139751 CAGCCTGGCAATCAATGGAACCAACGAGGAAGCAAACAAATTACAGTCTAGCAAGAATCA 13139810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1232 CAGCCTGGCAATCAATGGAACCAACGAGGAAGCAAACAAATTACAGTCTAGCAAGAATCA 1291

 13139811 GGAATTTTTGGAGCATAGACGGCGAAATCTAACTTAGCATTGGGAAGGTACCACAGAGGA 13139870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1292 GGAATTTTTGGAGCATAGACGGCGAAATCTAACTTAGCATTGGGAAGGTACCACAGAGGA 1351

 13139871 GGCGCCATCTTAAGTGGGTTTTGAAGGATGCAGAGGAGTTCTCTGGGGGTTGGGGGGATA 13139930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1352 GGCGCCATCTTAAGTGGGTTTTGAAGGATGCAGAGGAGTTCTCTGGGGGTTGGGGGGATA 1411

 13139931 AGTAAAGAAAGCACAACCCCAGAAAGGGAACGGTCTACAAAGAAAAGAAAAGCCAGTAAG 13139990
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     1412 AGTAAAGAAAGCACAACCCCAGAAAGGGAACGGTCTATAAAGAAAAGAAAAGCCAGTAAG 1471

 13139991 AATCAGGAGGGTCAAGAGGAGGGTGAGGGTTTCCACTAAAATAGGAGGATGGAGAGGGCC 13140050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1472 AATCAGGAGGGTCAAGAGGAGGGTGAGGGTTTCCACTAAAATAGGAGGATGGAGAGGGCC 1531

 13140051 TCACTGAGAAGGGGGTGAGGGAGGGAGCCAAGGAGATACCTGGAGAAGAGTGTCTGAGGC 13140110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1532 TCACTGAGAAGGGGGTGAGGGAGGGAGCCAAGGAGATACCTGGAGAAGAGTGTCTGAGGC 1591

 13140111 AGAGGAAACAGCAGTGGAAAGGCTCTGAGCTAGGGGAAAATGGATGGCTAAAAATAACAT 13140170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1592 AGAGGAAACAGCAGTGGAAAGGCTCTGAGCTAGGGGAAAATGGATGGCTAAAAATAACAT 1651

 13140171 TATACAATGTGAAAGAAGCCAGTCACACAAGGCCAGTGTATATGGTTCCATTTGTATGGA 13140230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1652 TATACAATGTGAAAGAAGCCAGTCACACAAGGCCAGTGTATATGGTTCCATTTGTATGGA 1711

 13140231 GAGTCCAGAATGGGCAATTCACTAGAAAAAAGAAAGTAAATTCAAGGTTACCAGGGACTT 13140290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1712 GAGTCCAGAATGGGCAATTCACTAGAAAAAAGAAAGTAAATTCAAGGTTACCAGGGACTT 1771

 13140291 AGGGGAAGAGGAAGTGGGAAATGACTGCTACTGGGTATACGGTTTCTTTCTGGATGATGA 13140350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1772 AGGGGAAGAGGAAGTGGGAAATGACTGCTACTGGGTATACGGTTTCTTTCTGGATGATGA 1831

 13140351 AAATGTCCTAAAACCGACTGTGAAATGGATTCACAACTCTGTGAATACACTAACATCCAC 13140410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1832 AAATGTCCTAAAACCGACTGTGAAATGGATTCACAACTCTGTGAATACACTAACATCCAC 1891

 13140411 GGAATGATACACTTTAAATGAATGAACTTTACAGTATGTAAATTCCAGTAAAGCTGTTAC 13140470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1892 GGAATGATACACTTTAAATGAATGAACTTTACAGTATGTAAATTCCAGTAAAGCTGTTAC 1951

 13140471 AGAATAACTTTGTCATATGTCAGGTAGCGATCAGTTCCAGAAAAGACATTGGGATAAGAG 13140530
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1952 AAAATAACTTTGTCATATGTCAGGTAGCGATCAGTTCCAGAAAAGACATTGGGATAAGAG 2011

 13140531 GACTTTCGGGGGATGGGGGGAACAGGCCGGGTGTCCCCAAAGAGGTGATATTGAAGCAGA 13140590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     2012 GACTTTCGGGGGATGGGGGGAACAGGCCGGGTGTCCCCAAAGAGGTGATATTTAAGCAGA 2071

 13140591 GACCTGGGCTGAGCTACAGGTCCAGGAATAGGGTGGTGGCTAGACTAGCCTGTCCCGCAC 13140650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2072 GACCTGGGCTGAGCTACAGGTCCAGGAATAGGGTGGTGGCTAGACTAGCCTGTCCCGCAC 2131

 13140651 CTGCCACCTGGGGCACCACTGAGTGTAGCCCTGGGGGCCATAGCCCCTGGAGAGGGGTGA 13140710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2132 CTGCCACCTGGGGCACCACTGAGTGTAGCCCTGGGGGCCATAGCCCCTGGAGAGGGGTGA 2191

 13140711 GGAGAGGCAAGTGAGACCTTCAGGGAAGTTGAGGCCACAGTGAGGCACATCGGCTATATC 13140770
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2192 GGAGAGGCAAGTGAGACCTTCGGGGAAGTTGAGGCCACAGTGAGGCACATCGGCTATATC 2251

 13140771 AGGGTCCACTAGGGGCACCAGAATATAGCTGGTGGGGCATGGGCAAATGAGGTTTCGGGT 13140830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2252 AGGGTCCACTAGGGGCACCAGAATATAGCTGGTGGGGCATGGGCAAATGAGGTTTCGGGT 2311

 13140831 GTGCAGGATTGCATTTTATGAGAATTTGACAAATTTAAATCAGCAAGAGTTGCAACATCT 13140890
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2312 GTGCCGGATTGCATTTTATGAGAATTTGACAAATTTAAATCAGCAAGAGTTGCAACATCT 2371

 13140891 CAAAGCTGGTAGGAAAAATGGTTTTTAGGCTCAGGCTACTTTCGAAAGAGTGAAGGTGGT 13140950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2372 CAAAGCTGGTAGGAAAAATGGTTTTTAGGCTCAGGCTACTTTCGAAAGAGTGAAGGTGGT 2431

 13140951 GCTGCTCAGGGCTTACAGGCAATGGTGGACTCCTCCCCCGAGCTGGGTGTCCCCGGGTGC 13141010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2432 GCTGCTCAGGGCTTACAGGCAATGGTGGACTCCTCCCCCGAGCTGGGTGTCCCCGGGTGC 2491

 13141011 ATCTGTGGCCCTCAGAAGCGCCCACCTCACTCAGGCTGGCAGAGCGCGGTGGCCATGGAA 13141070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2492 ATCTGTGGCCCTCAGAAGCGCCCACCTCACTCAGGCTGGCAGAGCGCGGTGGCCATGGAA 2551

 13141071 ACGCAAGCCAGAGTGTGCAAGAATCAAACAGACAGAAGTAAAAGGACCTTACCTATTGCC 13141130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2552 ACGCAAGCCAGAGTGTGCAAGAATCAAACAGACAGAAGTAAAAGGACCTTACCTATTGCC 2611

 13141131 CGGGGCTGGGGCTCCCTCCTTCATTCTGGGTTTTAGGAAAACAGCCATCATTATTTCCTA 13141190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2612 CGGGGCTGGGGCTCCCTCCTTCATTCTGGGTTTTAGGAAAACAGCCATCATTATTTCCTA 2671

 13141191 AAAGGTGCCCCCTACTCCCCGCCAACCCGGGACAACTTCACATGCCAGGAAAGCCCTCTC 13141250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2672 AAAGGTGCCCCCTACTCCCCGCCAACCCGGGACAACTTCACATGCCAGGAAAGCCCTCTC 2731

 13141251 TACCTCAAAGCAGTCCCTGTTCAAGCCCCTACCCCCAGCTCCTCTCTCTGTGAAACCACA 13141310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2732 TACCTCAAAGCAGTCCCTGTTCAAGCCCCTACCCCCAGCTCCTCTCTCTGTGAAACCACA 2791

 13141311 GCCATCAGTGAAGGGGGCAGTTGCACCTCAGCACCCCTGGCAGAGGGCACGGCATGTGCA 13141370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||.||||
     2792 GCCATCAGTGAAGGGGGCAGTTGCACCTCAGCACCCC-GGCAGAGGGCACGGCATCTGCA 2850

 13141371 AAGGCCCCAAGGGAGCAGTGTGCCTGGTGTGATCCAGGAACAAGGAATCAGGGTGGCTGG 13141430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2851 AAGGCCCCAAGGGAGCAGTGTGCCTGGTGTGATCCAGGAACAAGGAATCAGGGTGGCTGG 2910

 13141431 AACAGAGGGAGG 13141442
          ||||||||||||
     2911 AACAGAGGGAGG 2922

Alignment time is 2.22346 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [13131433,13152582] =>     21150 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    2953] =>      2953 nucs 'mol-32-1f0b-088754_2953'

Score:        2833
Aligned:      2954        nucs
Identic:      2943 (100%) nucs =>      2775 (100%)       168 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [13138648,13141433] EXCISED REGION [13142583,13142750]
 second seq =>  [       1,    2785] EXCISED REGION [    2786,    2953]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1149 nucs [13141434,13142582]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         9 nucs [13141434,13141442] to [13142583,13142591]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [13141434,13141434] to [13142582,13142582]
 second seq =>         0 nucs

 13138648 CCGCGCCCGGCCTAGGCCTTTCTTTACATGGCATCCCTTCGCCTCTGCAAACCTTCCAGA 13138707
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
        1 CCGCGCCCGGCCTAGGCCTTTCTTTACATGGCATCCCTTTGCCTCTGCAAACCTTCCAGA 60

 13138708 GGGAAGCGATCGCCCCTGGTTCACAGAAGAGGAAAGCAAGGCTCAGAGAGGGAAGGTACC 13138767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGGAAGCGATCGCCCCTGGTTCACAGAAGAGGAAAGCAAGGCTCAGAGAGGGAAGGTACC 120

 13138768 TTGCCTCCCACACGATTGGAAGAGCTGGGATTCGAATCCAGATCTGCCTGACTCCAGAAC 13138827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTGCCTCCCACACGATTGGAAGAGCTGGGATTCGAATCCAGATCTGCCTGACTCCAGAAC 180

 13138828 AATGCCTTTTTCCCTCCCTGCTTCCAGACGTGGCTCTGGTCCCCTCCAGTCACTGAGTCT 13138887
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
      181 AATGCCTTTTTCCCTCCCTGCTTCCAGACGTGGCTCTAGTCCCCTCCAGTCACTGAGTCT 240

 13138888 CCAGCTTGGCAGCCATACTCCACCTGGCTGTCCACCATAAGCCCTGCAGGTCCTGTGCCC 13138947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCAGCTTGGCAGCCATACTCCACCTGGCTGTCCACCATAAGCCCTGCAGGTCCTGTGCCC 300

 13138948 AAGGCTCCCAGACCCTGGCCATGCTCCTGTGTTGGCGTCAACTTTCTGGATTTCACACGG 13139007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAGGCTCCCAGACCCTGGCCATGCTCCTGTGTTGGCGTCAACTTTCTGGATTTCACACGG 360

 13139008 CCTGCCAGCTCGAGCCTCAGTCTTTCCATCTGTGAACCGGGGCTGGGCCCCTCAGCTCTG 13139067
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
      361 CCTGCCAGCTCGAGCCTCAGTCTTTCCATCCGTGAACCGGGGCTGGGCCCCTCAGCTCTG 420

 13139068 CAGCCGCCAGCCCCCACCTCCCAACTCCCGCACTCATGCTGTGAACGCCTGATAAACCTC 13139127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CAGCCGCCAGCCCCCACCTCCCAACTCCCGCACTCATGCTGTGAACGCCTGATAAACCTC 480

 13139128 CTCTGGGCCTTTAAGGGCCTTTTATTTCTCCAGCCATGCTTTTCTCTACATTTTAATAAG 13139187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTCTGGGCCTTTAAGGGCCTTTTATTTCTCCAGCCATGCTTTTCTCTACATTTTAATAAG 540

 13139188 CTGCTTACAAAATTGGTGATTGATGAGTAAGAATGAGGAGGATGCAGGGCTGAACATTTT 13139247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTGCTTACAAAATTGGTGATTGATGAGTAAGAATGAGGAGGATGCAGGGCTGAACATTTT 600

 13139248 TTTTTTCCTGGAATCGCTTCTGGCTGCGCATTCAACTTTAAATTGATTAATAACGTGCAG 13139307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTTTTTCCTGGAATCGCTTCTGGCTGCGCATTCAACTTTAAATTGATTAATAACGTGCAG 660

 13139308 ACCCAACATTAATTATCAACCATTTGTCACTGGGGAAGGCTGGAGCCTGCGCCTGTGTGC 13139367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ACCCAACATTAATTATCAACCATTTGTCACTGGGGAAGGCTGGAGCCTGCGCCTGTGTGC 720

 13139368 AGCCCCTTTCTTCATGACCAGCTCAGTGGTATAGGAGGTGCCCATCTGTCCCACAGGGGT 13139427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGCCCCTTTCTTCATGACCAGCTCAGTGGTATAGGAGGTGCCCATCTGTCCCACAGGGGT 780

 13139428 GCATGGAAGGCCCTGGACACTTAAAGCCCTGGCAGCCTCAGCCCACTGTGCCCTGGGCAT 13139487
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GCATGGAAGGTCCTGGACACTTAAAGCCCTGGCAGCCTCAGCCCACTGTGCCCTGGGCAT 840

 13139488 GTGAGGGCTTCTGAAGGCCAAGCCTGAGCATCTCAGGGCCGACCCCAGATGTCTGGGGCA 13139547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GTGAGGGCTTCTGAAGGCCAAGCCTGAGCATCTCAGGGCCGACCCCAGATGTCTGGGGCA 900

 13139548 GTGGTGCCCTCAATGTCTGTCCTGCCCTGTGCTGGCTCATGGCCTTACCTGACCCTAGGT 13139607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GTGGTGCCCTCAATGTCTGTCCTGCCCTGTGCTGGCTCATGGCCTTACCTGACCCTAGGT 960

 13139608 CAGGTCTTCAGGTCCCCAGCAGACCCCAGCATTTCTTCATTAATTCAACAAACATTTATT 13139667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CAGGTCTTCAGGTCCCCAGCAGACCCCAGCATTTCTTCATTAATTCAACAAACATTTATT 1020

 13139668 GAGCAACTATGATGTGCAGCCTTCTTTCTGGAGGCTGACGGCACAGCAGAGATCAAAACA 13139727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GAGCAACTATGATGTGCAGCCTTCTTTCTGGAGGCTGACGGCACAGCAGAGATCAAAACA 1080

 13139728 AGGTCCTTGACTTTTTGCAGGGGCAGCCTGGCAATCAATGGAACCAACGAGGAAGCAAAC 13139787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AGGTCCTTGACTTTTTGCAGGGGCAGCCTGGCAATCAATGGAACCAACGAGGAAGCAAAC 1140

 13139788 AAATTACAGTCTAGCAAGAATCAGGAATTTTTGGAGCATAGACGGCGAAATCTAACTTAG 13139847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AAATTACAGTCTAGCAAGAATCAGGAATTTTTGGAGCATAGACGGCGAAATCTAACTTAG 1200

 13139848 CATTGGGAAGGTACCACAGAGGAGGCGCCATCTTAAGTGGGTTTTGAAGGATGCAGAGGA 13139907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CATTGGGAAGGTACCACAGAGGAGGCGCCATCTTAAGTGGGTTTTGAAGGATGCAGAGGA 1260

 13139908 GTTCTCTGGGGGTTGGGGGGATAAGTAAAGAAAGCACAACCCCAGAAAGGGAACGGTCTA 13139967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GTTCTCTGGGGGTTGGGGGGATAAGTAAAGAAAGCACAACCCCAGAAAGGGAACGGTCTA 1320

 13139968 CAAAGAAAAGAAAAGCCAGTAAGAATCAGGAGGGTCAAGAGGAGGGTGAGGGTTTCCACT 13140027
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TAAAGAAAAGAAAAGCCAGTAAGAATCAGGAGGGTCAAGAGGAGGGTGAGGGTTTCCACT 1380

 13140028 AAAATAGGAGGATGGAGAGGGCCTCACTGAGAAGGGGGTGAGGGAGGGAGCCAAGGAGAT 13140087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AAAATAGGAGGATGGAGAGGGCCTCACTGAGAAGGGGGTGAGGGAGGGAGCCAAGGAGAT 1440

 13140088 ACCTGGAGAAGAGTGTCTGAGGCAGAGGAAACAGCAGTGGAAAGGCTCTGAGCTAGGGGA 13140147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ACCTGGAGAAGAGTGTCTGAGGCAGAGGAAACAGCAGTGGAAAGGCTCTGAGCTAGGGGA 1500

 13140148 AAATGGATGGCTAAAAATAACATTATACAATGTGAAAGAAGCCAGTCACACAAGGCCAGT 13140207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AAATGGATGGCTAAAAATAACATTATACAATGTGAAAGAAGCCAGTCACACAAGGCCAGT 1560

 13140208 GTATATGGTTCCATTTGTATGGAGAGTCCAGAATGGGCAATTCACTAGAAAAAAGAAAGT 13140267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GTATATGGTTCCATTTGTATGGAGAGTCCAGAATGGGCAATTCACTAGAAAAAAGAAAGT 1620

 13140268 AAATTCAAGGTTACCAGGGACTTAGGGGAAGAGGAAGTGGGAAATGACTGCTACTGGGTA 13140327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AAATTCAAGGTTACCAGGGACTTAGGGGAAGAGGAAGTGGGAAATGACTGCTACTGGGTA 1680

 13140328 TACGGTTTCTTTCTGGATGATGAAAATGTCCTAAAACCGACTGTGAAATGGATTCACAAC 13140387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TACGGTTTCTTTCTGGATGATGAAAATGTCCTAAAACCGACTGTGAAATGGATTCACAAC 1740

 13140388 TCTGTGAATACACTAACATCCACGGAATGATACACTTTAAATGAATGAACTTTACAGTAT 13140447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TCTGTGAATACACTAACATCCACGGAATGATACACTTTAAATGAATGAACTTTACAGTAT 1800

 13140448 GTAAATTCCAGTAAAGCTGTTACAGAATAACTTTGTCATATGTCAGGTAGCGATCAGTTC 13140507
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GTAAATTCCAGTAAAGCTGTTACAAAATAACTTTGTCATATGTCAGGTAGCGATCAGTTC 1860

 13140508 CAGAAAAGACATTGGGATAAGAGGACTTTCGGGGGATGGGGGGAACAGGCCGGGTGTCCC 13140567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CAGAAAAGACATTGGGATAAGAGGACTTTCGGGGGATGGGGGGAACAGGCCGGGTGTCCC 1920

 13140568 CAAAGAGGTGATATTGAAGCAGAGACCTGGGCTGAGCTACAGGTCCAGGAATAGGGTGGT 13140627
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CAAAGAGGTGATATTTAAGCAGAGACCTGGGCTGAGCTACAGGTCCAGGAATAGGGTGGT 1980

 13140628 GGCTAGACTAGCCTGTCCCGCACCTGCCACCTGGGGCACCACTGAGTGTAGCCCTGGGGG 13140687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GGCTAGACTAGCCTGTCCCGCACCTGCCACCTGGGGCACCACTGAGTGTAGCCCTGGGGG 2040

 13140688 CCATAGCCCCTGGAGAGGGGTGAGGAGAGGCAAGTGAGACCTTCAGGGAAGTTGAGGCCA 13140747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     2041 CCATAGCCCCTGGAGAGGGGTGAGGAGAGGCAAGTGAGACCTTCGGGGAAGTTGAGGCCA 2100

 13140748 CAGTGAGGCACATCGGCTATATCAGGGTCCACTAGGGGCACCAGAATATAGCTGGTGGGG 13140807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CAGTGAGGCACATCGGCTATATCAGGGTCCACTAGGGGCACCAGAATATAGCTGGTGGGG 2160

 13140808 CATGGGCAAATGAGGTTTCGGGTGTGCAGGATTGCATTTTATGAGAATTTGACAAATTTA 13140867
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CATGGGCAAATGAGGTTTCGGGTGTGCCGGATTGCATTTTATGAGAATTTGACAAATTTA 2220

 13140868 AATCAGCAAGAGTTGCAACATCTCAAAGCTGGTAGGAAAAATGGTTTTTAGGCTCAGGCT 13140927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AATCAGCAAGAGTTGCAACATCTCAAAGCTGGTAGGAAAAATGGTTTTTAGGCTCAGGCT 2280

 13140928 ACTTTCGAAAGAGTGAAGGTGGTGCTGCTCAGGGCTTACAGGCAATGGTGGACTCCTCCC 13140987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 ACTTTCGAAAGAGTGAAGGTGGTGCTGCTCAGGGCTTACAGGCAATGGTGGACTCCTCCC 2340

 13140988 CCGAGCTGGGTGTCCCCGGGTGCATCTGTGGCCCTCAGAAGCGCCCACCTCACTCAGGCT 13141047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CCGAGCTGGGTGTCCCCGGGTGCATCTGTGGCCCTCAGAAGCGCCCACCTCACTCAGGCT 2400

 13141048 GGCAGAGCGCGGTGGCCATGGAAACGCAAGCCAGAGTGTGCAAGAATCAAACAGACAGAA 13141107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GGCAGAGCGCGGTGGCCATGGAAACGCAAGCCAGAGTGTGCAAGAATCAAACAGACAGAA 2460

 13141108 GTAAAAGGACCTTACCTATTGCCCGGGGCTGGGGCTCCCTCCTTCATTCTGGGTTTTAGG 13141167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GTAAAAGGACCTTACCTATTGCCCGGGGCTGGGGCTCCCTCCTTCATTCTGGGTTTTAGG 2520

 13141168 AAAACAGCCATCATTATTTCCTAAAAGGTGCCCCCTACTCCCCGCCAACCCGGGACAACT 13141227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 AAAACAGCCATCATTATTTCCTAAAAGGTGCCCCCTACTCCCCGCCAACCCGGGACAACT 2580

 13141228 TCACATGCCAGGAAAGCCCTCTCTACCTCAAAGCAGTCCCTGTTCAAGCCCCTACCCCCA 13141287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TCACATGCCAGGAAAGCCCTCTCTACCTCAAAGCAGTCCCTGTTCAAGCCCCTACCCCCA 2640

 13141288 GCTCCTCTCTCTGTGAAACCACAGCCATCAGTGAAGGGGGCAGTTGCACCTCAGCACCCC 13141347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GCTCCTCTCTCTGTGAAACCACAGCCATCAGTGAAGGGGGCAGTTGCACCTCAGCACCCC 2700

 13141348 TGGCAGAGGGCACGGCATGTGCAAAGGCCCCAAGGGAGCAGTGTGCCTGGTGTGATCCAG 13141407
           |||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 -GGCAGAGGGCACGGCATCTGCAAAGGCCCCAAGGGAGCAGTGTGCCTGGTGTGATCCAG 2759

 13141408 GAACAAGGAATCAGGGTGGCTGGAAC 13141433
          ||||||||||||||||||||||||||
     2760 GAACAAGGAATCAGGGTGGCTGGAAC 2785

EXCISED REGION

 13142583 AGAGGGAGGCTGCTGAGGGGAGTGTGGATTTTCTGCTAAGCGCAGCGAGGAGCCATGGGA 13142642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2786 AGAGGGAGGCTGCTGAGGGGAGTGTGGATTTTCTGCTAAGCGCAGCGAGGAGCCATGGGA 2845

 13142643 GGGCTTCAAGCCTGACAGTGACACGATGCGACTTCTGTTTTTAAAAGCACCCTTCTAGGC 13142702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2846 GGGCTTCAAGCCTGACAGTGACACGATGCGACTTCTGTTTTTAAAAGCACCCTTCTAGGC 2905

 13142703 TGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAG 13142750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2906 TGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAG 2953

Alignment time is 2.24047 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [13131433,13152582] =>     21150 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    3003] =>      3003 nucs 'mol-32-1f0b-217659_3003'

Score:        2883
Aligned:      3004        nucs
Identic:      2993 (100%) nucs =>      2846 (100%)       147 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [13138577,13141433] EXCISED REGION [13142583,13142729]
 second seq =>  [       1,    2856] EXCISED REGION [    2857,    3003]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1149 nucs [13141434,13142582]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         9 nucs [13141434,13141442] to [13142583,13142591]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [13141434,13141434] to [13142582,13142582]
 second seq =>         0 nucs

 13138577 GTCTCAATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACA 13138636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTCTCAATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACA 60

 13138637 GGCATGAGCCACCGCGCCCGGCCTAGGCCTTTCTTTACATGGCATCCCTTCGCCTCTGCA 13138696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
       61 GGCATGAGCCACCGCGCCCGGCCTAGGCCTTTCTTTACATGGCATCCCTTTGCCTCTGCA 120

 13138697 AACCTTCCAGAGGGAAGCGATCGCCCCTGGTTCACAGAAGAGGAAAGCAAGGCTCAGAGA 13138756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AACCTTCCAGAGGGAAGCGATCGCCCCTGGTTCACAGAAGAGGAAAGCAAGGCTCAGAGA 180

 13138757 GGGAAGGTACCTTGCCTCCCACACGATTGGAAGAGCTGGGATTCGAATCCAGATCTGCCT 13138816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGGAAGGTACCTTGCCTCCCACACGATTGGAAGAGCTGGGATTCGAATCCAGATCTGCCT 240

 13138817 GACTCCAGAACAATGCCTTTTTCCCTCCCTGCTTCCAGACGTGGCTCTGGTCCCCTCCAG 13138876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
      241 GACTCCAGAACAATGCCTTTTTCCCTCCCTGCTTCCAGACGTGGCTCTAGTCCCCTCCAG 300

 13138877 TCACTGAGTCTCCAGCTTGGCAGCCATACTCCACCTGGCTGTCCACCATAAGCCCTGCAG 13138936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCACTGAGTCTCCAGCTTGGCAGCCATACTCCACCTGGCTGTCCACCATAAGCCCTGCAG 360

 13138937 GTCCTGTGCCCAAGGCTCCCAGACCCTGGCCATGCTCCTGTGTTGGCGTCAACTTTCTGG 13138996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTCCTGTGCCCAAGGCTCCCAGACCCTGGCCATGCTCCTGTGTTGGCGTCAACTTTCTGG 420

 13138997 ATTTCACACGGCCTGCCAGCTCGAGCCTCAGTCTTTCCATCTGTGAACCGGGGCTGGGCC 13139056
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
      421 ATTTCACACGGCCTGCCAGCTCGAGCCTCAGTCTTTCCATCCGTGAACCGGGGCTGGGCC 480

 13139057 CCTCAGCTCTGCAGCCGCCAGCCCCCACCTCCCAACTCCCGCACTCATGCTGTGAACGCC 13139116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCTCAGCTCTGCAGCCGCCAGCCCCCACCTCCCAACTCCCGCACTCATGCTGTGAACGCC 540

 13139117 TGATAAACCTCCTCTGGGCCTTTAAGGGCCTTTTATTTCTCCAGCCATGCTTTTCTCTAC 13139176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGATAAACCTCCTCTGGGCCTTTAAGGGCCTTTTATTTCTCCAGCCATGCTTTTCTCTAC 600

 13139177 ATTTTAATAAGCTGCTTACAAAATTGGTGATTGATGAGTAAGAATGAGGAGGATGCAGGG 13139236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATTTTAATAAGCTGCTTACAAAATTGGTGATTGATGAGTAAGAATGAGGAGGATGCAGGG 660

 13139237 CTGAACATTTTTTTTTTCCTGGAATCGCTTCTGGCTGCGCATTCAACTTTAAATTGATTA 13139296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTGAACATTTTTTTTTTCCTGGAATCGCTTCTGGCTGCGCATTCAACTTTAAATTGATTA 720

 13139297 ATAACGTGCAGACCCAACATTAATTATCAACCATTTGTCACTGGGGAAGGCTGGAGCCTG 13139356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATAACGTGCAGACCCAACATTAATTATCAACCATTTGTCACTGGGGAAGGCTGGAGCCTG 780

 13139357 CGCCTGTGTGCAGCCCCTTTCTTCATGACCAGCTCAGTGGTATAGGAGGTGCCCATCTGT 13139416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CGCCTGTGTGCAGCCCCTTTCTTCATGACCAGCTCAGTGGTATAGGAGGTGCCCATCTGT 840

 13139417 CCCACAGGGGTGCATGGAAGGCCCTGGACACTTAAAGCCCTGGCAGCCTCAGCCCACTGT 13139476
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CCCACAGGGGTGCATGGAAGGTCCTGGACACTTAAAGCCCTGGCAGCCTCAGCCCACTGT 900

 13139477 GCCCTGGGCATGTGAGGGCTTCTGAAGGCCAAGCCTGAGCATCTCAGGGCCGACCCCAGA 13139536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GCCCTGGGCATGTGAGGGCTTCTGAAGGCCAAGCCTGAGCATCTCAGGGCCGACCCCAGA 960

 13139537 TGTCTGGGGCAGTGGTGCCCTCAATGTCTGTCCTGCCCTGTGCTGGCTCATGGCCTTACC 13139596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGTCTGGGGCAGTGGTGCCCTCAATGTCTGTCCTGCCCTGTGCTGGCTCATGGCCTTACC 1020

 13139597 TGACCCTAGGTCAGGTCTTCAGGTCCCCAGCAGACCCCAGCATTTCTTCATTAATTCAAC 13139656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGACCCTAGGTCAGGTCTTCAGGTCCCCAGCAGACCCCAGCATTTCTTCATTAATTCAAC 1080

 13139657 AAACATTTATTGAGCAACTATGATGTGCAGCCTTCTTTCTGGAGGCTGACGGCACAGCAG 13139716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAACATTTATTGAGCAACTATGATGTGCAGCCTTCTTTCTGGAGGCTGACGGCACAGCAG 1140

 13139717 AGATCAAAACAAGGTCCTTGACTTTTTGCAGGGGCAGCCTGGCAATCAATGGAACCAACG 13139776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGATCAAAACAAGGTCCTTGACTTTTTGCAGGGGCAGCCTGGCAATCAATGGAACCAACG 1200

 13139777 AGGAAGCAAACAAATTACAGTCTAGCAAGAATCAGGAATTTTTGGAGCATAGACGGCGAA 13139836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AGGAAGCAAACAAATTACAGTCTAGCAAGAATCAGGAATTTTTGGAGCATAGACGGCGAA 1260

 13139837 ATCTAACTTAGCATTGGGAAGGTACCACAGAGGAGGCGCCATCTTAAGTGGGTTTTGAAG 13139896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATCTAACTTAGCATTGGGAAGGTACCACAGAGGAGGCGCCATCTTAAGTGGGTTTTGAAG 1320

 13139897 GATGCAGAGGAGTTCTCTGGGGGTTGGGGGGATAAGTAAAGAAAGCACAACCCCAGAAAG 13139956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GATGCAGAGGAGTTCTCTGGGGGTTGGGGGGATAAGTAAAGAAAGCACAACCCCAGAAAG 1380

 13139957 GGAACGGTCTACAAAGAAAAGAAAAGCCAGTAAGAATCAGGAGGGTCAAGAGGAGGGTGA 13140016
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GGAACGGTCTATAAAGAAAAGAAAAGCCAGTAAGAATCAGGAGGGTCAAGAGGAGGGTGA 1440

 13140017 GGGTTTCCACTAAAATAGGAGGATGGAGAGGGCCTCACTGAGAAGGGGGTGAGGGAGGGA 13140076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GGGTTTCCACTAAAATAGGAGGATGGAGAGGGCCTCACTGAGAAGGGGGTGAGGGAGGGA 1500

 13140077 GCCAAGGAGATACCTGGAGAAGAGTGTCTGAGGCAGAGGAAACAGCAGTGGAAAGGCTCT 13140136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GCCAAGGAGATACCTGGAGAAGAGTGTCTGAGGCAGAGGAAACAGCAGTGGAAAGGCTCT 1560

 13140137 GAGCTAGGGGAAAATGGATGGCTAAAAATAACATTATACAATGTGAAAGAAGCCAGTCAC 13140196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GAGCTAGGGGAAAATGGATGGCTAAAAATAACATTATACAATGTGAAAGAAGCCAGTCAC 1620

 13140197 ACAAGGCCAGTGTATATGGTTCCATTTGTATGGAGAGTCCAGAATGGGCAATTCACTAGA 13140256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ACAAGGCCAGTGTATATGGTTCCATTTGTATGGAGAGTCCAGAATGGGCAATTCACTAGA 1680

 13140257 AAAAAGAAAGTAAATTCAAGGTTACCAGGGACTTAGGGGAAGAGGAAGTGGGAAATGACT 13140316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AAAAAGAAAGTAAATTCAAGGTTACCAGGGACTTAGGGGAAGAGGAAGTGGGAAATGACT 1740

 13140317 GCTACTGGGTATACGGTTTCTTTCTGGATGATGAAAATGTCCTAAAACCGACTGTGAAAT 13140376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GCTACTGGGTATACGGTTTCTTTCTGGATGATGAAAATGTCCTAAAACCGACTGTGAAAT 1800

 13140377 GGATTCACAACTCTGTGAATACACTAACATCCACGGAATGATACACTTTAAATGAATGAA 13140436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GGATTCACAACTCTGTGAATACACTAACATCCACGGAATGATACACTTTAAATGAATGAA 1860

 13140437 CTTTACAGTATGTAAATTCCAGTAAAGCTGTTACAGAATAACTTTGTCATATGTCAGGTA 13140496
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     1861 CTTTACAGTATGTAAATTCCAGTAAAGCTGTTACAAAATAACTTTGTCATATGTCAGGTA 1920

 13140497 GCGATCAGTTCCAGAAAAGACATTGGGATAAGAGGACTTTCGGGGGATGGGGGGAACAGG 13140556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GCGATCAGTTCCAGAAAAGACATTGGGATAAGAGGACTTTCGGGGGATGGGGGGAACAGG 1980

 13140557 CCGGGTGTCCCCAAAGAGGTGATATTGAAGCAGAGACCTGGGCTGAGCTACAGGTCCAGG 13140616
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CCGGGTGTCCCCAAAGAGGTGATATTTAAGCAGAGACCTGGGCTGAGCTACAGGTCCAGG 2040

 13140617 AATAGGGTGGTGGCTAGACTAGCCTGTCCCGCACCTGCCACCTGGGGCACCACTGAGTGT 13140676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AATAGGGTGGTGGCTAGACTAGCCTGTCCCGCACCTGCCACCTGGGGCACCACTGAGTGT 2100

 13140677 AGCCCTGGGGGCCATAGCCCCTGGAGAGGGGTGAGGAGAGGCAAGTGAGACCTTCAGGGA 13140736
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     2101 AGCCCTGGGGGCCATAGCCCCTGGAGAGGGGTGAGGAGAGGCAAGTGAGACCTTCGGGGA 2160

 13140737 AGTTGAGGCCACAGTGAGGCACATCGGCTATATCAGGGTCCACTAGGGGCACCAGAATAT 13140796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AGTTGAGGCCACAGTGAGGCACATCGGCTATATCAGGGTCCACTAGGGGCACCAGAATAT 2220

 13140797 AGCTGGTGGGGCATGGGCAAATGAGGTTTCGGGTGTGCAGGATTGCATTTTATGAGAATT 13140856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     2221 AGCTGGTGGGGCATGGGCAAATGAGGTTTCGGGTGTGCCGGATTGCATTTTATGAGAATT 2280

 13140857 TGACAAATTTAAATCAGCAAGAGTTGCAACATCTCAAAGCTGGTAGGAAAAATGGTTTTT 13140916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TGACAAATTTAAATCAGCAAGAGTTGCAACATCTCAAAGCTGGTAGGAAAAATGGTTTTT 2340

 13140917 AGGCTCAGGCTACTTTCGAAAGAGTGAAGGTGGTGCTGCTCAGGGCTTACAGGCAATGGT 13140976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AGGCTCAGGCTACTTTCGAAAGAGTGAAGGTGGTGCTGCTCAGGGCTTACAGGCAATGGT 2400

 13140977 GGACTCCTCCCCCGAGCTGGGTGTCCCCGGGTGCATCTGTGGCCCTCAGAAGCGCCCACC 13141036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GGACTCCTCCCCCGAGCTGGGTGTCCCCGGGTGCATCTGTGGCCCTCAGAAGCGCCCACC 2460

 13141037 TCACTCAGGCTGGCAGAGCGCGGTGGCCATGGAAACGCAAGCCAGAGTGTGCAAGAATCA 13141096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TCACTCAGGCTGGCAGAGCGCGGTGGCCATGGAAACGCAAGCCAGAGTGTGCAAGAATCA 2520

 13141097 AACAGACAGAAGTAAAAGGACCTTACCTATTGCCCGGGGCTGGGGCTCCCTCCTTCATTC 13141156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 AACAGACAGAAGTAAAAGGACCTTACCTATTGCCCGGGGCTGGGGCTCCCTCCTTCATTC 2580

 13141157 TGGGTTTTAGGAAAACAGCCATCATTATTTCCTAAAAGGTGCCCCCTACTCCCCGCCAAC 13141216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TGGGTTTTAGGAAAACAGCCATCATTATTTCCTAAAAGGTGCCCCCTACTCCCCGCCAAC 2640

 13141217 CCGGGACAACTTCACATGCCAGGAAAGCCCTCTCTACCTCAAAGCAGTCCCTGTTCAAGC 13141276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CCGGGACAACTTCACATGCCAGGAAAGCCCTCTCTACCTCAAAGCAGTCCCTGTTCAAGC 2700

 13141277 CCCTACCCCCAGCTCCTCTCTCTGTGAAACCACAGCCATCAGTGAAGGGGGCAGTTGCAC 13141336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CCCTACCCCCAGCTCCTCTCTCTGTGAAACCACAGCCATCAGTGAAGGGGGCAGTTGCAC 2760

 13141337 CTCAGCACCCCTGGCAGAGGGCACGGCATGTGCAAAGGCCCCAAGGGAGCAGTGTGCCTG 13141396
          ||||||||||| |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CTCAGCACCCC-GGCAGAGGGCACGGCATCTGCAAAGGCCCCAAGGGAGCAGTGTGCCTG 2819

 13141397 GTGTGATCCAGGAACAAGGAATCAGGGTGGCTGGAAC 13141433
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2820 GTGTGATCCAGGAACAAGGAATCAGGGTGGCTGGAAC 2856

EXCISED REGION

 13142583 AGAGGGAGGCTGCTGAGGGGAGTGTGGATTTTCTGCTAAGCGCAGCGAGGAGCCATGGGA 13142642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2857 AGAGGGAGGCTGCTGAGGGGAGTGTGGATTTTCTGCTAAGCGCAGCGAGGAGCCATGGGA 2916

 13142643 GGGCTTCAAGCCTGACAGTGACACGATGCGACTTCTGTTTTTAAAAGCACCCTTCTAGGC 13142702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2917 GGGCTTCAAGCCTGACAGTGACACGATGCGACTTCTGTTTTTAAAAGCACCCTTCTAGGC 2976

 13142703 TGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATC 13142729
          |||||||||||||||||||||||||||
     2977 TGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATC 3003

Alignment time is 2.26845 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [13131433,13152582] =>     21150 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    3063] =>      3063 nucs 'mol-32-1f21-133270_3063'

Score:        2921
Aligned:      3064        nucs
Identic:      3051 (100%) nucs =>      2907 (100%)       144 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [13138514,13141433] EXCISED REGION [13142583,13142726]
 second seq =>  [       1,    2919] EXCISED REGION [    2920,    3063]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1149 nucs [13141434,13142582]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         9 nucs [13141434,13141442] to [13142583,13142591]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [13141434,13141434] to [13142582,13142582]
 second seq =>         0 nucs

 13138514 CCACGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGG 13138573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
        1 CCACGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGG 60

 13138574 ATGGTCTCAATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATT 13138633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATGGTCTCAATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATT 120

 13138634 ACAGGCATGAGCCACCGCGCCCGGCCTAGGCCTTTCTTTACATGGCATCCCTTCGCCTCT 13138693
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
      121 ACAGGCATGAGCCACCGCGCCCGGCCTAGGCCTTTCTTTACATGGCATCCCTTTGCCTCT 180

 13138694 GCAAACCTTCCAGAGGGAAGCGATCGCCCCTGGTTCACAGAAGAGGAAAGCAAGGCTCAG 13138753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCAAACCTTCCAGAGGGAAGCGATCGCCCCTGGTTCACAGAAGAGGAAAGCAAGGCTCAG 240

 13138754 AGAGGGAAGGTACCTTGCCTCCCACACGATTGGAAGAGCTGGGATTCGAATCCAGATCTG 13138813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGAGGGAAGGTACCTTGCCTCCCACACGATTGGAAGAGCTGGGATTCGAATCCAGATCTG 300

 13138814 CCTGACTCCAGAACAATGCCTTTTTCCCTCCCTGCTTCCAGACGTGGCTCTGGTCCCCTC 13138873
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
      301 CCTGACTCCAGAACAATGCCTTTTTCCCTCCCTGCTTCCAGACGTGGCTCTAGTCCCCTC 360

 13138874 CAGTCACTGAGTCTCCAGCTTGGCAGCCATACTCCACCTGGCTGTCCACCATAAGCCCTG 13138933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CAGTCACTGAGTCTCCAGCTTGGCAGCCATACTCCACCTGGCTGTCCACCATAAGCCCTG 420

 13138934 CAGGTCCTGTGCCCAAGGCTCCCAGACCCTGGCCATGCTCCTGTGTTGGCGTCAACTTTC 13138993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CAGGTCCTGTGCCCAAGGCTCCCAGACCCTGGCCATGCTCCTGTGTTGGCGTCAACTTTC 480

 13138994 TGGATTTCACACGGCCTGCCAGCTCGAGCCTCAGTCTTTCCATCTGTGAACCGGGGCTGG 13139053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
      481 TGGATTTCACACGGCCTGCCAGCTCGAGCCTCAGTCTTTCCATCCGTGAACCGGGGCTGG 540

 13139054 GCCCCTCAGCTCTGCAGCCGCCAGCCCCCACCTCCCAACTCCCGCACTCATGCTGTGAAC 13139113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GCCCCTCAGCTCTGCAGCCGCCAGCCCCCACCTCCCAACTCCCGCACTCATGCTGTGAAC 600

 13139114 GCCTGATAAACCTCCTCTGGGCCTTTAAGGGCCTTTTATTTCTCCAGCCATGCTTTTCTC 13139173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GCCTGATAAACCTCCTCTGGGCCTTTAAGGGCCTTTTATTTCTCCAGCCATGCTTTTCTC 660

 13139174 TACATTTTAATAAGCTGCTTACAAAATTGGTGATTGATGAGTAAGAATGAGGAGGATGCA 13139233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TACATTTTAATAAGCTGCTTACAAAATTGGTGATTGATGAGTAAGAATGAGGAGGATGCA 720

 13139234 GGGCTGAACATTTTTTTTTTCCTGGAATCGCTTCTGGCTGCGCATTCAACTTTAAATTGA 13139293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GGGCTGAACATTTTTTTTTTCCTGGAATCGCTTCTGGCTGCGCATTCAACTTTAAATTGA 780

 13139294 TTAATAACGTGCAGACCCAACATTAATTATCAACCATTTGTCACTGGGGAAGGCTGGAGC 13139353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTAATAACGTGCAGACCCAACATTAATTATCAACCATTTGTCACTGGGGAAGGCTGGAGC 840

 13139354 CTGCGCCTGTGTGCAGCCCCTTTCTTCATGACCAGCTCAGTGGTATAGGAGGTGCCCATC 13139413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTGCGCCTGTGTGCAGCCCCTTTCTTCATGACCAGCTCAGTGGTATAGGAGGTGCCCATC 900

 13139414 TGTCCCACAGGGGTGCATGGAAGGCCCTGGACACTTAAAGCCCTGGCAGCCTCAGCCCAC 13139473
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGTCCCACAGGGGTGCATGGAAGGTCCTGGACACTTAAAGCCCTGGCAGCCTCAGCCCAC 960

 13139474 TGTGCCCTGGGCATGTGAGGGCTTCTGAAGGCCAAGCCTGAGCATCTCAGGGCCGACCCC 13139533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGTGCCCTGGGCATGTGAGGGCTTCTGAAGGCCAAGCCTGAGCATCTCAGGGCCGACCCC 1020

 13139534 AGATGTCTGGGGCAGTGGTGCCCTCAATGTCTGTCCTGCCCTGTGCTGGCTCATGGCCTT 13139593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGATGTCTGGGGCAGTGGTGCCCTCAATGTCTGTCCTGCCCTGTGCTGGCTCATGGCCTT 1080

 13139594 ACCTGACCCTAGGTCAGGTCTTCAGGTCCCCAGCAGACCCCAGCATTTCTTCATTAATTC 13139653
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     1081 ACCTGACCCTAGGTCAGGTCTTCAGGTCCCCAGCAGACCTCAGCATTTCTTCATTAATTC 1140

 13139654 AACAAACATTTATTGAGCAACTATGATGTGCAGCCTTCTTTCTGGAGGCTGACGGCACAG 13139713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AACAAACATTTATTGAGCAACTATGATGTGCAGCCTTCTTTCTGGAGGCTGACGGCACAG 1200

 13139714 CAGAGATCAAAACAAGGTCCTTGACTTTTTGCAGGGGCAGCCTGGCAATCAATGGAACCA 13139773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CAGAGATCAAAACAAGGTCCTTGACTTTTTGCAGGGGCAGCCTGGCAATCAATGGAACCA 1260

 13139774 ACGAGGAAGCAAACAAATTACAGTCTAGCAAGAATCAGGAATTTTTGGAGCATAGACGGC 13139833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ACGAGGAAGCAAACAAATTACAGTCTAGCAAGAATCAGGAATTTTTGGAGCATAGACGGC 1320

 13139834 GAAATCTAACTTAGCATTGGGAAGGTACCACAGAGGAGGCGCCATCTTAAGTGGGTTTTG 13139893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GAAATCTAACTTAGCATTGGGAAGGTACCACAGAGGAGGCGCCATCTTAAGTGGGTTTTG 1380

 13139894 AAGGATGCAGAGGAGTTCTCTGGGGGTTGGGGGGATAAGTAAAGAAAGCACAACCCCAGA 13139953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AAGGATGCAGAGGAGTTCTCTGGGGGTTGGGGGGATAAGTAAAGAAAGCACAACCCCAGA 1440

 13139954 AAGGGAACGGTCTACAAAGAAAAGAAAAGCCAGTAAGAATCAGGAGGGTCAAGAGGAGGG 13140013
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AAGGGAACGGTCTATAAAGAAAAGAAAAGCCAGTAAGAATCAGGAGGGTCAAGAGGAGGG 1500

 13140014 TGAGGGTTTCCACTAAAATAGGAGGATGGAGAGGGCCTCACTGAGAAGGGGGTGAGGGAG 13140073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TGAGGGTTTCCACTAAAATAGGAGGATGGAGAGGGCCTCACTGAGAAGGGGGTGAGGGAG 1560

 13140074 GGAGCCAAGGAGATACCTGGAGAAGAGTGTCTGAGGCAGAGGAAACAGCAGTGGAAAGGC 13140133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GGAGCCAAGGAGATACCTGGAGAAGAGTGTCTGAGGCAGAGGAAACAGCAGTGGAAAGGC 1620

 13140134 TCTGAGCTAGGGGAAAATGGATGGCTAAAAATAACATTATACAATGTGAAAGAAGCCAGT 13140193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TCTGAGCTAGGGGAAAATGGATGGCTAAAAATAACATTATACAATGTGAAAGAAGCCAGT 1680

 13140194 CACACAAGGCCAGTGTATATGGTTCCATTTGTATGGAGAGTCCAGAATGGGCAATTCACT 13140253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CACACAAGGCCAGTGTATATGGTTCCATTTGTATGGAGAGTCCAGAATGGGCAATTCACT 1740

 13140254 AGAAAAAAGAAAGTAAATTCAAGGTTACCAGGGACTTAGGGGAAGAGGAAGTGGGAAATG 13140313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AGAAAAAAGAAAGTAAATTCAAGGTTACCAGGGACTTAGGGGAAGAGGAAGTGGGAAATG 1800

 13140314 ACTGCTACTGGGTATACGGTTTCTTTCTGGATGATGAAAATGTCCTAAAACCGACTGTGA 13140373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ACTGCTACTGGGTATACGGTTTCTTTCTGGATGATGAAAATGTCCTAAAACCGACTGTGA 1860

 13140374 AATGGATTCACAACTCTGTGAATACACTAACATCCACGGAATGATACACTTTAAATGAAT 13140433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AATGGATTCACAACTCTGTGAATACACTAACATCCACGGAATGATACACTTTAAATGAAT 1920

 13140434 GAACTTTACAGTATGTAAATTCCAGTAAAGCTGTTACAGAATAACTTTGTCATATGTCAG 13140493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     1921 GAACTTTACAGTATGTAAATTCCAGTAAAGCTGTTACAAAATAACTTTGTCATATGTCAG 1980

 13140494 GTAGCGATCAGTTCCAGAAAAGACATTGGGATAAGAGGACTTTCGGGGGATGGGGGGAAC 13140553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GTAGCGATCAGTTCCAGAAAAGACATTGGGATAAGAGGACTTTCGGGGGATGGGGGGAAC 2040

 13140554 AGGCCGGGTGTCCCCAAAGAGGTGATATTGAAGCAGAGACCTGGGCTGAGCTACAGGTCC 13140613
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AGGCCGGGTGTCCCCAAAGAGGTGATATTTAAGCAGAGACCTGGGCTGAGCTACAGGTCC 2100

 13140614 AGGAATAGGGTGGTGGCTAGACTAGCCTGTCCCGCACCTGCCACCTGGGGCACCACTGAG 13140673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AGGAATAGGGTGGTGGCTAGACTAGCCTGTCCCGCACCTGCCACCTGGGGCACCACTGAG 2160

 13140674 TGTAGCCCTGGGGGCCATAGCCCCTGGAGAGGGGTGAGGAGAGGCAAGTGAGACCTTCAG 13140733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     2161 TGTAGCCCTGGGGGCCATAGCCCCTGGAGAGGGGTGAGGAGAGGCAAGTGAGACCTTCGG 2220

 13140734 GGAAGTTGAGGCCACAGTGAGGCACATCGGCTATATCAGGGTCCACTAGGGGCACCAGAA 13140793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GGAAGTTGAGGCCACAGTGAGGCACATCGGCTATATCAGGGTCCACTAGGGGCACCAGAA 2280

 13140794 TATAGCTGGTGGGGCATGGGCAAATGAGGTTTCGGGTGTGCAGGATTGCATTTTATGAGA 13140853
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     2281 TATAGCTGGTGGGGCATGGGCAAATGAGGTTTCGGGTGTGCCGGATTGCATTTTATGAGA 2340

 13140854 ATTTGACAAATTTAAATCAGCAAGAGTTGCAACATCTCAAAGCTGGTAGGAAAAATGGTT 13140913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 ATTTGACAAATTTAAATCAGCAAGAGTTGCAACATCTCAAAGCTGGTAGGAAAAATGGTT 2400

 13140914 TTTAGGCTCAGGCTACTTTCGAAAGAGTGAAGGTGGTGCTGCTCAGGGCTTACAGGCAAT 13140973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TTTAGGCTCAGGCTACTTTCGAAAGAGTGAAGGTGGTGCTGCTCAGGGCTTACAGGCAAT 2460

 13140974 GGTGGACTCCTCCCCCGAGCTGGGTGTCCCCGGGTGCATCTGTGGCCCTCAGAAGCGCCC 13141033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GGTGGACTCCTCCCCCGAGCTGGGTGTCCCCGGGTGCATCTGTGGCCCTCAGAAGCGCCC 2520

 13141034 ACCTCACTCAGGCTGGCAGAGCGCGGTGGCCATGGAAACGCAAGCCAGAGTGTGCAAGAA 13141093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 ACCTCACTCAGGCTGGCAGAGCGCGGTGGCCATGGAAACGCAAGCCAGAGTGTGCAAGAA 2580

 13141094 TCAAACAGACAGAAGTAAAAGGACCTTACCTATTGCCCGGGGCTGGGGCTCCCTCCTTCA 13141153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TCAAACAGACAGAAGTAAAAGGACCTTACCTATTGCCCGGGGCTGGGGCTCCCTCCTTCA 2640

 13141154 TTCTGGGTTTTAGGAAAACAGCCATCATTATTTCCTAAAAGGTGCCCCCTACTCCCCGCC 13141213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TTCTGGGTTTTAGGAAAACAGCCATCATTATTTCCTAAAAGGTGCCCCCTACTCCCCGCC 2700

 13141214 AACCCGGGACAACTTCACATGCCAGGAAAGCCCTCTCTACCTCAAAGCAGTCCCTGTTCA 13141273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AACCCGGGACAACTTCACATGCCAGGAAAGCCCTCTCTACCTCAAAGCAGTCCCTGTTCA 2760

 13141274 AGCCCCTACCCCCAGCTCCTCTCTCTGTGAAACCACAGCCATCAGTGAAGGGGGCAGTTG 13141333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 AGCCCCTACCCCCAGCTCCTCTCTCTGTGAAACCACAGCCATCAGTGAAGGGGGCAGTTG 2820

 13141334 CACCTCAGCACCCCTGGCAGAGGGCACGGCATGTGCAAAGGCCCCAAGGGAGCAGTGTGC 13141393
          |||||||||||||| |||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     2821 CACCTCAGCACCCC-GGCAGAGGGCACGGCATCTGCAAAGGCCCCAAGGGAGCAGTGTGC 2879

 13141394 CTGGTGTGATCCAGGAACAAGGAATCAGGGTGGCTGGAAC 13141433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2880 CTGGTGTGATCCAGGAACAAGGAATCAGGGTGGCTGGAAC 2919

EXCISED REGION

 13142583 AGAGGGAGGCTGCTGAGGGGAGTGTGGATTTTCTGCTAAGCGCAGCGAGGAGCCATGGGA 13142642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2920 AGAGGGAGGCTGCTGAGGGGAGTGTGGATTTTCTGCTAAGCGCAGCGAGGAGCCATGGGA 2979

 13142643 GGGCTTCAAGCCTGACAGTGACACGATGCGACTTCTGTTTTTAAAAGCACCCTTCTAGGC 13142702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2980 GGGCTTCAAGCCTGACAGTGACACGATGCGACTTCTGTTTTTAAAAGCACCCTTCTAGGC 3039

 13142703 TGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTA 13142726
          ||||||||||||||||||||||||
     3040 TGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTA 3063

Alignment time is 2.32032 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [13131433,13152582] =>     21150 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    3112] =>      3112 nucs 'mol-32-2110-034272_3112'

Score:        2992
Aligned:      3113        nucs
Identic:      3102 (100%) nucs =>      2847 (100%)       255 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [13138576,13141433] EXCISED REGION [13142583,13142837]
 second seq =>  [       1,    2857] EXCISED REGION [    2858,    3112]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1149 nucs [13141434,13142582]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         9 nucs [13141434,13141442] to [13142583,13142591]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [13141434,13141434] to [13142582,13142582]
 second seq =>         0 nucs

 13138576 GGTCTCAATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAC 13138635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGTCTCAATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAC 60

 13138636 AGGCATGAGCCACCGCGCCCGGCCTAGGCCTTTCTTTACATGGCATCCCTTCGCCTCTGC 13138695
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
       61 AGGCATGAGCCACCGCGCCCGGCCTAGGCCTTTCTTTACATGGCATCCCTTTGCCTCTGC 120

 13138696 AAACCTTCCAGAGGGAAGCGATCGCCCCTGGTTCACAGAAGAGGAAAGCAAGGCTCAGAG 13138755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAACCTTCCAGAGGGAAGCGATCGCCCCTGGTTCACAGAAGAGGAAAGCAAGGCTCAGAG 180

 13138756 AGGGAAGGTACCTTGCCTCCCACACGATTGGAAGAGCTGGGATTCGAATCCAGATCTGCC 13138815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGGGAAGGTACCTTGCCTCCCACACGATTGGAAGAGCTGGGATTCGAATCCAGATCTGCC 240

 13138816 TGACTCCAGAACAATGCCTTTTTCCCTCCCTGCTTCCAGACGTGGCTCTGGTCCCCTCCA 13138875
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
      241 TGACTCCAGAACAATGCCTTTTTCCCTCCCTGCTTCCAGACGTGGCTCTAGTCCCCTCCA 300

 13138876 GTCACTGAGTCTCCAGCTTGGCAGCCATACTCCACCTGGCTGTCCACCATAAGCCCTGCA 13138935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTCACTGAGTCTCCAGCTTGGCAGCCATACTCCACCTGGCTGTCCACCATAAGCCCTGCA 360

 13138936 GGTCCTGTGCCCAAGGCTCCCAGACCCTGGCCATGCTCCTGTGTTGGCGTCAACTTTCTG 13138995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGTCCTGTGCCCAAGGCTCCCAGACCCTGGCCATGCTCCTGTGTTGGCGTCAACTTTCTG 420

 13138996 GATTTCACACGGCCTGCCAGCTCGAGCCTCAGTCTTTCCATCTGTGAACCGGGGCTGGGC 13139055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
      421 GATTTCACACGGCCTGCCAGCTCGAGCCTCAGTCTTTCCATCCGTGAACCGGGGCTGGGC 480

 13139056 CCCTCAGCTCTGCAGCCGCCAGCCCCCACCTCCCAACTCCCGCACTCATGCTGTGAACGC 13139115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCCTCAGCTCTGCAGCCGCCAGCCCCCACCTCCCAACTCCCGCACTCATGCTGTGAACGC 540

 13139116 CTGATAAACCTCCTCTGGGCCTTTAAGGGCCTTTTATTTCTCCAGCCATGCTTTTCTCTA 13139175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTGATAAACCTCCTCTGGGCCTTTAAGGGCCTTTTATTTCTCCAGCCATGCTTTTCTCTA 600

 13139176 CATTTTAATAAGCTGCTTACAAAATTGGTGATTGATGAGTAAGAATGAGGAGGATGCAGG 13139235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CATTTTAATAAGCTGCTTACAAAATTGGTGATTGATGAGTAAGAATGAGGAGGATGCAGG 660

 13139236 GCTGAACATTTTTTTTTTCCTGGAATCGCTTCTGGCTGCGCATTCAACTTTAAATTGATT 13139295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GCTGAACATTTTTTTTTTCCTGGAATCGCTTCTGGCTGCGCATTCAACTTTAAATTGATT 720

 13139296 AATAACGTGCAGACCCAACATTAATTATCAACCATTTGTCACTGGGGAAGGCTGGAGCCT 13139355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AATAACGTGCAGACCCAACATTAATTATCAACCATTTGTCACTGGGGAAGGCTGGAGCCT 780

 13139356 GCGCCTGTGTGCAGCCCCTTTCTTCATGACCAGCTCAGTGGTATAGGAGGTGCCCATCTG 13139415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GCGCCTGTGTGCAGCCCCTTTCTTCATGACCAGCTCAGTGGTATAGGAGGTGCCCATCTG 840

 13139416 TCCCACAGGGGTGCATGGAAGGCCCTGGACACTTAAAGCCCTGGCAGCCTCAGCCCACTG 13139475
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCCCACAGGGGTGCATGGAAGGTCCTGGACACTTAAAGCCCTGGCAGCCTCAGCCCACTG 900

 13139476 TGCCCTGGGCATGTGAGGGCTTCTGAAGGCCAAGCCTGAGCATCTCAGGGCCGACCCCAG 13139535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGCCCTGGGCATGTGAGGGCTTCTGAAGGCCAAGCCTGAGCATCTCAGGGCCGACCCCAG 960

 13139536 ATGTCTGGGGCAGTGGTGCCCTCAATGTCTGTCCTGCCCTGTGCTGGCTCATGGCCTTAC 13139595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATGTCTGGGGCAGTGGTGCCCTCAATGTCTGTCCTGCCCTGTGCTGGCTCATGGCCTTAC 1020

 13139596 CTGACCCTAGGTCAGGTCTTCAGGTCCCCAGCAGACCCCAGCATTTCTTCATTAATTCAA 13139655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTGACCCTAGGTCAGGTCTTCAGGTCCCCAGCAGACCCCAGCATTTCTTCATTAATTCAA 1080

 13139656 CAAACATTTATTGAGCAACTATGATGTGCAGCCTTCTTTCTGGAGGCTGACGGCACAGCA 13139715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CAAACATTTATTGAGCAACTATGATGTGCAGCCTTCTTTCTGGAGGCTGACGGCACAGCA 1140

 13139716 GAGATCAAAACAAGGTCCTTGACTTTTTGCAGGGGCAGCCTGGCAATCAATGGAACCAAC 13139775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GAGATCAAAACAAGGTCCTTGACTTTTTGCAGGGGCAGCCTGGCAATCAATGGAACCAAC 1200

 13139776 GAGGAAGCAAACAAATTACAGTCTAGCAAGAATCAGGAATTTTTGGAGCATAGACGGCGA 13139835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GAGGAAGCAAACAAATTACAGTCTAGCAAGAATCAGGAATTTTTGGAGCATAGACGGCGA 1260

 13139836 AATCTAACTTAGCATTGGGAAGGTACCACAGAGGAGGCGCCATCTTAAGTGGGTTTTGAA 13139895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AATCTAACTTAGCATTGGGAAGGTACCACAGAGGAGGCGCCATCTTAAGTGGGTTTTGAA 1320

 13139896 GGATGCAGAGGAGTTCTCTGGGGGTTGGGGGGATAAGTAAAGAAAGCACAACCCCAGAAA 13139955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GGATGCAGAGGAGTTCTCTGGGGGTTGGGGGGATAAGTAAAGAAAGCACAACCCCAGAAA 1380

 13139956 GGGAACGGTCTACAAAGAAAAGAAAAGCCAGTAAGAATCAGGAGGGTCAAGAGGAGGGTG 13140015
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GGGAACGGTCTATAAAGAAAAGAAAAGCCAGTAAGAATCAGGAGGGTCAAGAGGAGGGTG 1440

 13140016 AGGGTTTCCACTAAAATAGGAGGATGGAGAGGGCCTCACTGAGAAGGGGGTGAGGGAGGG 13140075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AGGGTTTCCACTAAAATAGGAGGATGGAGAGGGCCTCACTGAGAAGGGGGTGAGGGAGGG 1500

 13140076 AGCCAAGGAGATACCTGGAGAAGAGTGTCTGAGGCAGAGGAAACAGCAGTGGAAAGGCTC 13140135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AGCCAAGGAGATACCTGGAGAAGAGTGTCTGAGGCAGAGGAAACAGCAGTGGAAAGGCTC 1560

 13140136 TGAGCTAGGGGAAAATGGATGGCTAAAAATAACATTATACAATGTGAAAGAAGCCAGTCA 13140195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TGAGCTAGGGGAAAATGGATGGCTAAAAATAACATTATACAATGTGAAAGAAGCCAGTCA 1620

 13140196 CACAAGGCCAGTGTATATGGTTCCATTTGTATGGAGAGTCCAGAATGGGCAATTCACTAG 13140255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CACAAGGCCAGTGTATATGGTTCCATTTGTATGGAGAGTCCAGAATGGGCAATTCACTAG 1680

 13140256 AAAAAAGAAAGTAAATTCAAGGTTACCAGGGACTTAGGGGAAGAGGAAGTGGGAAATGAC 13140315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AAAAAAGAAAGTAAATTCAAGGTTACCAGGGACTTAGGGGAAGAGGAAGTGGGAAATGAC 1740

 13140316 TGCTACTGGGTATACGGTTTCTTTCTGGATGATGAAAATGTCCTAAAACCGACTGTGAAA 13140375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGCTACTGGGTATACGGTTTCTTTCTGGATGATGAAAATGTCCTAAAACCGACTGTGAAA 1800

 13140376 TGGATTCACAACTCTGTGAATACACTAACATCCACGGAATGATACACTTTAAATGAATGA 13140435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TGGATTCACAACTCTGTGAATACACTAACATCCACGGAATGATACACTTTAAATGAATGA 1860

 13140436 ACTTTACAGTATGTAAATTCCAGTAAAGCTGTTACAGAATAACTTTGTCATATGTCAGGT 13140495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1861 ACTTTACAGTATGTAAATTCCAGTAAAGCTGTTACAAAATAACTTTGTCATATGTCAGGT 1920

 13140496 AGCGATCAGTTCCAGAAAAGACATTGGGATAAGAGGACTTTCGGGGGATGGGGGGAACAG 13140555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AGCGATCAGTTCCAGAAAAGACATTGGGATAAGAGGACTTTCGGGGGATGGGGGGAACAG 1980

 13140556 GCCGGGTGTCCCCAAAGAGGTGATATTGAAGCAGAGACCTGGGCTGAGCTACAGGTCCAG 13140615
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GCCGGGTGTCCCCAAAGAGGTGATATTTAAGCAGAGACCTGGGCTGAGCTACAGGTCCAG 2040

 13140616 GAATAGGGTGGTGGCTAGACTAGCCTGTCCCGCACCTGCCACCTGGGGCACCACTGAGTG 13140675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GAATAGGGTGGTGGCTAGACTAGCCTGTCCCGCACCTGCCACCTGGGGCACCACTGAGTG 2100

 13140676 TAGCCCTGGGGGCCATAGCCCCTGGAGAGGGGTGAGGAGAGGCAAGTGAGACCTTCAGGG 13140735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     2101 TAGCCCTGGGGGCCATAGCCCCTGGAGAGGGGTGAGGAGAGGCAAGTGAGACCTTCGGGG 2160

 13140736 AAGTTGAGGCCACAGTGAGGCACATCGGCTATATCAGGGTCCACTAGGGGCACCAGAATA 13140795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AAGTTGAGGCCACAGTGAGGCACATCGGCTATATCAGGGTCCACTAGGGGCACCAGAATA 2220

 13140796 TAGCTGGTGGGGCATGGGCAAATGAGGTTTCGGGTGTGCAGGATTGCATTTTATGAGAAT 13140855
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     2221 TAGCTGGTGGGGCATGGGCAAATGAGGTTTCGGGTGTGCCGGATTGCATTTTATGAGAAT 2280

 13140856 TTGACAAATTTAAATCAGCAAGAGTTGCAACATCTCAAAGCTGGTAGGAAAAATGGTTTT 13140915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TTGACAAATTTAAATCAGCAAGAGTTGCAACATCTCAAAGCTGGTAGGAAAAATGGTTTT 2340

 13140916 TAGGCTCAGGCTACTTTCGAAAGAGTGAAGGTGGTGCTGCTCAGGGCTTACAGGCAATGG 13140975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TAGGCTCAGGCTACTTTCGAAAGAGTGAAGGTGGTGCTGCTCAGGGCTTACAGGCAATGG 2400

 13140976 TGGACTCCTCCCCCGAGCTGGGTGTCCCCGGGTGCATCTGTGGCCCTCAGAAGCGCCCAC 13141035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TGGACTCCTCCCCCGAGCTGGGTGTCCCCGGGTGCATCTGTGGCCCTCAGAAGCGCCCAC 2460

 13141036 CTCACTCAGGCTGGCAGAGCGCGGTGGCCATGGAAACGCAAGCCAGAGTGTGCAAGAATC 13141095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CTCACTCAGGCTGGCAGAGCGCGGTGGCCATGGAAACGCAAGCCAGAGTGTGCAAGAATC 2520

 13141096 AAACAGACAGAAGTAAAAGGACCTTACCTATTGCCCGGGGCTGGGGCTCCCTCCTTCATT 13141155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 AAACAGACAGAAGTAAAAGGACCTTACCTATTGCCCGGGGCTGGGGCTCCCTCCTTCATT 2580

 13141156 CTGGGTTTTAGGAAAACAGCCATCATTATTTCCTAAAAGGTGCCCCCTACTCCCCGCCAA 13141215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CTGGGTTTTAGGAAAACAGCCATCATTATTTCCTAAAAGGTGCCCCCTACTCCCCGCCAA 2640

 13141216 CCCGGGACAACTTCACATGCCAGGAAAGCCCTCTCTACCTCAAAGCAGTCCCTGTTCAAG 13141275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CCCGGGACAACTTCACATGCCAGGAAAGCCCTCTCTACCTCAAAGCAGTCCCTGTTCAAG 2700

 13141276 CCCCTACCCCCAGCTCCTCTCTCTGTGAAACCACAGCCATCAGTGAAGGGGGCAGTTGCA 13141335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CCCCTACCCCCAGCTCCTCTCTCTGTGAAACCACAGCCATCAGTGAAGGGGGCAGTTGCA 2760

 13141336 CCTCAGCACCCCTGGCAGAGGGCACGGCATGTGCAAAGGCCCCAAGGGAGCAGTGTGCCT 13141395
          |||||||||||| |||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CCTCAGCACCCC-GGCAGAGGGCACGGCATCTGCAAAGGCCCCAAGGGAGCAGTGTGCCT 2819

 13141396 GGTGTGATCCAGGAACAAGGAATCAGGGTGGCTGGAAC 13141433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2820 GGTGTGATCCAGGAACAAGGAATCAGGGTGGCTGGAAC 2857

EXCISED REGION

 13142583 AGAGGGAGGCTGCTGAGGGGAGTGTGGATTTTCTGCTAAGCGCAGCGAGGAGCCATGGGA 13142642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2858 AGAGGGAGGCTGCTGAGGGGAGTGTGGATTTTCTGCTAAGCGCAGCGAGGAGCCATGGGA 2917

 13142643 GGGCTTCAAGCCTGACAGTGACACGATGCGACTTCTGTTTTTAAAAGCACCCTTCTAGGC 13142702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2918 GGGCTTCAAGCCTGACAGTGACACGATGCGACTTCTGTTTTTAAAAGCACCCTTCTAGGC 2977

 13142703 TGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCA 13142762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2978 TGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCA 3037

 13142763 TGAGGTCAGAAGATTGAGACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAA 13142822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3038 TGAGGTCAGAAGATTGAGACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAA 3097

 13142823 TACAAAAAATTAGCC 13142837
          |||||||||||||||
     3098 TACAAAAAATTAGCC 3112

Alignment time is 2.38226 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [13131433,13152582] =>     21150 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    3155] =>      3155 nucs 'mol-32-22de-026684_3155'

Score:        3024
Aligned:      3156        nucs
Identic:      3144 (100%) nucs =>      2890 (100%)       254 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [13138532,13141433] EXCISED REGION [13142583,13142836]
 second seq =>  [       1,    2901] EXCISED REGION [    2902,    3155]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1149 nucs [13141434,13142582]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         9 nucs [13141434,13141442] to [13142583,13142591]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [13141434,13141434] to [13142582,13142582]
 second seq =>         0 nucs

 13138532 TTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCAATCTCCTGA 13138591
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCAATCTCCTGA 60

 13138592 CCTCGTGATCCGCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGC 13138651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCTCGTGATCCGCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGC 120

 13138652 GCCCGGCCTAGGCCTTTCTTTACATGGCATCCCTTCGCCTCTGCAAACCTTCCAGAGGGA 13138711
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
      121 GCCCGGCCTAGGCCTTTCTTTACATGGCATCCCTTTGCCTCTGCAAACCTTCCAGAGGGA 180

 13138712 AGCGATCGCCCCTGGTTCACAGAAGAGGAAAGCAAGGCTCAGAGAGGGAAGGTACCTTGC 13138771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGCGATCGCCCCTGGTTCACAGAAGAGGAAAGCAAGGCTCAGAGAGGGAAGGTACCTTGC 240

 13138772 CTCCCACACGATTGGAAGAGCTGGGATTCGAATCCAGATCTGCCTGACTCCAGAACAATG 13138831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTCCCACACGATTGGAAGAGCTGGGATTCGAATCCAGATCTGCCTGACTCCAGAACAATG 300

 13138832 CCTTTTTCCCTCCCTGCTTCCAGACGTGGCTCTGGTCCCCTCCAGTCACTGAGTCTCCAG 13138891
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
      301 CCTTTTTCCCTCCCTGCTTCCAGACGTGGCTCTAGTCCCCTCCAGTCACTGAGTCTCCAG 360

 13138892 CTTGGCAGCCATACTCCACCTGGCTGTCCACCATAAGCCCTGCAGGTCCTGTGCCCAAGG 13138951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTTGGCAGCCATACTCCACCTGGCTGTCCACCATAAGCCCTGCAGGTCCTGTGCCCAAGG 420

 13138952 CTCCCAGACCCTGGCCATGCTCCTGTGTTGGCGTCAACTTTCTGGATTTCACACGGCCTG 13139011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTCCCAGACCCTGGCCATGCTCCTGTGTTGGCGTCAACTTTCTGGATTTCACACGGCCTG 480

 13139012 CCAGCTCGAGCCTCAGTCTTTCCATCTGTGAACCGGGGCTGGGCCCCTCAGCTCTGCAGC 13139071
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCAGCTCGAGCCTCAGTCTTTCCATCCGTGAACCGGGGCTGGGCCCCTCAGCTCTGCAGC 540

 13139072 CGCCAGCCCCCACCTCCCAACTCCCGCACTCATGCTGTGAACGCCTGATAAACCTCCTCT 13139131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CGCCAGCCCCCACCTCCCAACTCCCGCACTCATGCTGTGAACGCCTGATAAACCTCCTCT 600

 13139132 GGGCCTTTAAGGGCCTTTTATTTCTCCAGCCATGCTTTTCTCTACATTTTAATAAGCTGC 13139191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GGGCCTTTAAGGGCCTTTTATTTCTCCAGCCATGCTTTTCTCTACATTTTAATAAGCTGC 660

 13139192 TTACAAAATTGGTGATTGATGAGTAAGAATGAGGAGGATGCAGGGCTGAACATTTTTTTT 13139251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTACAAAATTGGTGATTGATGAGTAAGAATGAGGAGGATGCAGGGCTGAACATTTTTTTT 720

 13139252 TTCCTGGAATCGCTTCTGGCTGCGCATTCAACTTTAAATTGATTAATAACGTGCAGACCC 13139311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTCCTGGAATCGCTTCTGGCTGCGCATTCAACTTTAAATTGATTAATAACGTGCAGACCC 780

 13139312 AACATTAATTATCAACCATTTGTCACTGGGGAAGGCTGGAGCCTGCGCCTGTGTGCAGCC 13139371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AACATTAATTATCAACCATTTGTCACTGGGGAAGGCTGGAGCCTGCGCCTGTGTGCAGCC 840

 13139372 CCTTTCTTCATGACCAGCTCAGTGGTATAGGAGGTGCCCATCTGTCCCACAGGGGTGCAT 13139431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CCTTTCTTCATGACCAGCTCAGTGGTATAGGAGGTGCCCATCTGTCCCACAGGGGTGCAT 900

 13139432 GGAAGGCCCTGGACACTTAAAGCCCTGGCAGCCTCAGCCCACTGTGCCCTGGGCATGTGA 13139491
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GGAAGGTCCTGGACACTTAAAGCCCTGGCAGCCTCAGCCCACTGTGCCCTGGGCATGTGA 960

 13139492 GGGCTTCTGAAGGCCAAGCCTGAGCATCTCAGGGCCGACCCCAGATGTCTGGGGCAGTGG 13139551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GGGCTTCTGAAGGCCAAGCCTGAGCATCTCAGGGCCGACCCCAGATGTCTGGGGCAGTGG 1020

 13139552 TGCCCTCAATGTCTGTCCTGCCCTGTGCTGGCTCATGGCCTTACCTGACCCTAGGTCAGG 13139611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGCCCTCAATGTCTGTCCTGCCCTGTGCTGGCTCATGGCCTTACCTGACCCTAGGTCAGG 1080

 13139612 TCTTCAGGTCCCCAGCAGACCCCAGCATTTCTTCATTAATTCAACAAACATTTATTGAGC 13139671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TCTTCAGGTCCCCAGCAGACCCCAGCATTTCTTCATTAATTCAACAAACATTTATTGAGC 1140

 13139672 AACTATGATGTGCAGCCTTCTTTCTGGAGGCTGACGGCACAGCAGAGATCAAAACAAGGT 13139731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AACTATGATGTGCAGCCTTCTTTCTGGAGGCTGACGGCACAGCAGAGATCAAAACAAGGT 1200

 13139732 CCTTGACTTTTTGCAGGGGCAGCCTGGCAATCAATGGAACCAACGAGGAAGCAAACAAAT 13139791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CCTTGACTTTTTGCAGGGGCAGCCTGGCAATCAATGGAACCAACGAGGAAGCAAACAAAT 1260

 13139792 TACAGTCTAGCAAGAATCAGGAATTTTTGGAGCATAGACGGCGAAATCTAACTTAGCATT 13139851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TACAGTCTAGCAAGAATCAGGAATTTTTGGAGCATAGACGGCGAAATCTAACTTAGCATT 1320

 13139852 GGGAAGGTACCACAGAGGAGGCGCCATCTTAAGTGGGTTTTGAAGGATGCAGAGGAGTTC 13139911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GGGAAGGTACCACAGAGGAGGCGCCATCTTAAGTGGGTTTTGAAGGATGCAGAGGAGTTC 1380

 13139912 TCTGGGGGTTGGGGGGATAAGTAAAGAAAGCACAACCCCAGAAAGGGAACGGTCTACAAA 13139971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     1381 TCTGGGGGTTGGGGGGATAAGTAAAGAAAGCACAACCCCAGAAAGGGAACGGTCTATAAA 1440

 13139972 GAAAAGAAAAGCCAGTAAGAATCAGGAGGGTCAAGAGGAGGGTGAGGGTTTCCACTAAAA 13140031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GAAAAGAAAAGCCAGTAAGAATCAGGAGGGTCAAGAGGAGGGTGAGGGTTTCCACTAAAA 1500

 13140032 TAGGAGGATGGAGAGGGCCTCACTGAGAAGGGGGTGAGGGAGGGAGCCAAGGAGATACCT 13140091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TAGGAGGATGGAGAGGGCCTCACTGAGAAGGGGGTGAGGGAGGGAGCCAAGGAGATACCT 1560

 13140092 GGAGAAGAGTGTCTGAGGCAGAGGAAACAGCAGTGGAAAGGCTCTGAGCTAGGGGAAAAT 13140151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GGAGAAGAGTGTCTGAGGCAGAGGAAACAGCAGTGGAAAGGCTCTGAGCTAGGGGAAAAT 1620

 13140152 GGATGGCTAAAAATAACATTATACAATGTGAAAGAAGCCAGTCACACAAGGCCAGTGTAT 13140211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GGATGGCTAAAAATAACATTATACAATGTGAAAGAAGCCAGTCACACAAGGCCAGTGTAT 1680

 13140212 ATGGTTCCATTTGTATGGAGAGTCCAGAATGGGCAATTCACTAGAAAAAAGAAAGTAAAT 13140271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ATGGTTCCATTTGTATGGAGAGTCCAGAATGGGCAATTCACTAGAAAAAAGAAAGTAAAT 1740

 13140272 TCAAGGTTACCAGGGACTTAGGGGAAGAGGAAGTGGGAAATGACTGCTACTGGGTATACG 13140331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TCAAGGTTACCAGGGACTTAGGGGAAGAGGAAGTGGGAAATGACTGCTACTGGGTATACG 1800

 13140332 GTTTCTTTCTGGATGATGAAAATGTCCTAAAACCGACTGTGAAATGGATTCACAACTCTG 13140391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GTTTCTTTCTGGATGATGAAAATGTCCTAAAACCGACTGTGAAATGGATTCACAACTCTG 1860

 13140392 TGAATACACTAACATCCACGGAATGATACACTTTAAATGAATGAACTTTACAGTATGTAA 13140451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TGAATACACTAACATCCACGGAATGATACACTTTAAATGAATGAACTTTACAGTATGTAA 1920

 13140452 ATTCCAGTAAAGCTGTTACAGAATAACTTTGTCATATGTCAGGTAGCGATCAGTTCCAGA 13140511
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ATTCCAGTAAAGCTGTTACAAAATAACTTTGTCATATGTCAGGTAGCGATCAGTTCCAGA 1980

 13140512 AAAGACATTGGGATAAGAGGACTTTCGGGGGATGGGGGGAACAGGCCGGGTGTCCCCAAA 13140571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AAAGACATTGGGATAAGAGGACTTTCGGGGGATGGGGGGAACAGGCCGGGTGTCCCCAAA 2040

 13140572 GAGGTGATATTGAAGCAGAGACCTGGGCTGAGCTACAGGTCCAGGAATAGGGTGGTGGCT 13140631
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GAGGTGATATTTAAGCAGAGACCTGGGCTGAGCTACAGGTCCAGGAATAGGGTGGTGGCT 2100

 13140632 AGACTAGCCTGTCCCGCACCTGCCACCTGGGGCACCACTGAGTGTAGCCCTGGGGGCCAT 13140691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AGACTAGCCTGTCCCGCACCTGCCACCTGGGGCACCACTGAGTGTAGCCCTGGGGGCCAT 2160

 13140692 AGCCCCTGGAGAGGGGTGAGGAGAGGCAAGTGAGACCTTCAGGGAAGTTGAGGCCACAGT 13140751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     2161 AGCCCCTGGAGAGGGGTGAGGAGAGGCAAGTGAGACCTTCGGGGAAGTTGAGGCCACAGT 2220

 13140752 GAGGCACATCGGCTATATCAGGGTCCACTAGGGGCACCAGAATATAGCTGGTGGGGCATG 13140811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GAGGCACATCGGCTATATCAGGGTCCACTAGGGGCACCAGAATATAGCTGGTGGGGCATG 2280

 13140812 GGCAAATGAGGTTTCGGGTGTGCAGGATTGCATTTTATGAGAATTTGACAAATTTAAATC 13140871
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GGCAAATGAGGTTTCGGGTGTGCCGGATTGCATTTTATGAGAATTTGACAAATTTAAATC 2340

 13140872 AGCAAGAGTTGCAACATCTCAAAGCTGGTAGGAAAAATGGTTTTTAGGCTCAGGCTACTT 13140931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AGCAAGAGTTGCAACATCTCAAAGCTGGTAGGAAAAATGGTTTTTAGGCTCAGGCTACTT 2400

 13140932 TCGAAAGAGTGAAGGTGGTGCTGCTCAGGGCTTACAGGCAATGGTGGACTCCTCCCCCGA 13140991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TCGAAAGAGTGAAGGTGGTGCTGCTCAGGGCTTACAGGCAATGGTGGACTCCTCCCCCGA 2460

 13140992 GCTGGGTGTCCCCGGGTGCATCTGTGGCCCTCAGAAGCGCCCACCTCACTCAGGCTGGCA 13141051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GCTGGGTGTCCCCGGGTGCATCTGTGGCCCTCAGAAGCGCCCACCTCACTCAGGCTGGCA 2520

 13141052 GAGCGCGGTGGCCATGGAAACGCAAGCCAGAGTGTGCAAGAATCAAACAGACAGAAGTAA 13141111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GAGCGCGGTGGCCATGGAAACGCAAGCCAGAGTGTGCAAGAATCAAACAGACAGAAGTAA 2580

 13141112 AAGGACCTTACCTATTGCCCGGGGCTGGGGCTCCCTCCTTCATTCTGGGTTTTAGGAAAA 13141171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AAGGACCTTACCTATTGCCCGGGGCTGGGGCTCCCTCCTTCATTCTGGGTTTTAGGAAAA 2640

 13141172 CAGCCATCATTATTTCCTAAAAGGTGCCCCCTACTCCCCGCCAACCCGGGACAACTTCAC 13141231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CAGCCATCATTATTTCCTAAAAGGTGCCCCCTACTCCCCGCCAACCCGGGACAACTTCAC 2700

 13141232 ATGCCAGGAAAGCCCTCTCTACCTCAAAGCAGTCCCTGTTCAAGCCCCTACCCCCAGCTC 13141291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 ATGCCAGGAAAGCCCTCTCTACCTCAAAGCAGTCCCTGTTCAAGCCCCTACCCCCAGCTC 2760

 13141292 CTCTCTCTGTGAAACCACAGCCATCAGTGAAGGGGGCAGTTGCACCTCAGCACCCCTGGC 13141351
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
     2761 CTCTCTCTGTGAAACCACAGCCATCAGTGAAGGGGGCAGTTGCACCTCAGCACCCC-GGC 2819

 13141352 AGAGGGCACGGCATGTGCAAAGGCCCCAAGGGAGCAGTGTGCCTGGTGTGATCCAGGAAC 13141411
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2820 AGAGGGCACGGCATCTGCAAAGGCCCCAAGGGAGCAGTGTGCCTGGTGTGATCCAGGAAC 2879

 13141412 AAGGAATCAGGGTGGCTGGAAC 13141433
          ||||||||||||||||||||||
     2880 AAGGAATCAGGGTGGCTGGAAC 2901

EXCISED REGION

 13142583 AGAGGGAGGCTGCTGAGGGGAGTGTGGATTTTCTGCTAAGCGCAGCGAGGAGCCATGGGA 13142642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2902 AGAGGGAGGCTGCTGAGGGGAGTGTGGATTTTCTGCTAAGCGCAGCGAGGAGCCATGGGA 2961

 13142643 GGGCTTCAAGCCTGACAGTGACACGATGCGACTTCTGTTTTTAAAAGCACCCTTCTAGGC 13142702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2962 GGGCTTCAAGCCTGACAGTGACACGATGCGACTTCTGTTTTTAAAAGCACCCTTCTAGGC 3021

 13142703 TGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCA 13142762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3022 TGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCA 3081

 13142763 TGAGGTCAGAAGATTGAGACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAA 13142822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3082 TGAGGTCAGAAGATTGAGACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAA 3141

 13142823 TACAAAAAATTAGC 13142836
          ||||||||||||||
     3142 TACAAAAAATTAGC 3155

Alignment time is 2.47259 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [13131433,13152582] =>     21150 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    4668] =>      4668 nucs 'mol-32-3327-008901_4668'

Score:        4519
Aligned:      4673        nucs
Identic:      4650 (100%) nucs =>      1102 ( 99%)      3548 (100%)
Gaps:           13 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [13140325,13141433] EXCISED REGION [13142583,13146138]
 second seq =>  [       1,    1108] EXCISED REGION [    1109,    4668]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1149 nucs [13141434,13142582]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         9 nucs [13141434,13141442] to [13142583,13142591]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [13141434,13141434] to [13142582,13142582]
 second seq =>         0 nucs

 13140325 GTATACGGTTTCTTTCTGGATGATGAAAATGTCCTAAAACCGACTGTGAAATGGATTCAC 13140384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTATACGGTTTCTTTCTGGATGATGAAAATGTCCTAAAACCGACTGTGAAATGGATTCAC 60

 13140385 AACTCTGTGAATACACTAACATCCACGGAATGATACACTTTAAATGAATGAACTTTACAG 13140444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AACTCTGTGAATACACTAACATCCACGGAATGATACACTTTAAATGAATGAACTTTACAG 120

 13140445 TATGTAAATTCCAGTAAAGCTGTTACAGAATAACTTTGTCATATGTCAGGTAGCGATCAG 13140504
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TATGTAAATTCCAGTAAAGCTGTTACAAAATAACTTTGTCATATGTCAGGTAGCGATCAG 180

 13140505 TTCCAGAAAAGACATTGGGATAAGAGGACTTTCGGGGGATGGGGGGAACAGGCCGGGTGT 13140564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTCCAGAAAAGACATTGGGATAAGAGGACTTTCGGGGGATGGGGGGAACAGGCCGGGTGT 240

 13140565 CCCCAAAGAGGTGATATTGAAGCAGAGACCTGGGCTGAGCTACAGGTCCAGGAATAGGGT 13140624
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCCCAAAGAGGTGATATTTAAGCAGAGACCTGGGCTGAGCTACAGGTCCAGGAATAGGGT 300

 13140625 GGTGGCTAGACTAGCCTGTCCCGCACCTGCCACCTGGGGCACCACTGAGTGTAGCCCTGG 13140684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GGTGGCTAGACTAGCCTGTCCCGCACCTGCCACCTGGGGCACCACTGAGTGTAGCCCTGG 360

 13140685 GGGCCATAGCCCCTGGAGAGGGGTGAGGAGAGGCAAGTGAGACCTTCAGGGAAGTTGAGG 13140744
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
      361 GGGCCATAGCCCCTGGAGAGGGGTGAGGAGAGGCAAGTGAGACCTTCGGGGAAGTTGAGG 420

 13140745 CCACAGTGAGGCACATCGGCTATATCAGGGTCCACTAGGGGCACCAGAATATAGCTGGTG 13140804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCACAGTGAGGCACATCGGCTATATCAGGGTCCACTAGGGGCACCAGAATATAGCTGGTG 480

 13140805 GGGCATGGGCAAATGAGGTTTCGGGTGTGCAGGATTGCATTTTATGAGAATTTGACAAAT 13140864
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
      481 GGGCATGGGCAAATGAGGTTTCGGGTGTGCCGGATTGCATTTTATGAGAATTTGACAAAT 540

 13140865 TTAAATCAGCAAGAGTTGCAACATCTCAAAGCTGGTAGGAAAAATGGTTTTTAGGCTCAG 13140924
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
      541 TTAAATCAGCAAGAGTTGCAACATCTCAAAGCTGGTAGGAAAAATGGCTTTTAGGCTCAG 600

 13140925 GCTACTTTCGAAAGAGTGAAGGTGGTGCTGCTCAGGGCTTACAGGCAATGGTGGACTCCT 13140984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GCTACTTTCGAAAGAGTGAAGGTGGTGCTGCTCAGGGCTTACAGGCAATGGTGGACTCCT 660

 13140985 CCCCCGAGCTGGGTGTCCCCGGGTGCATCTGTGGCCCTCAGAAGCGCCCACCTCACTCAG 13141044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCCCCGAGCTGGGTGTCCCCGGGTGCATCTGTGGCCCTCAGAAGCGCCCACCTCACTCAG 720

 13141045 GCTGGCAGAGCGCGGTGGCCATGGAAACGCAAGCCAGAGTGTGCAAGAATCAAACAGACA 13141104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GCTGGCAGAGCGCGGTGGCCATGGAAACGCAAGCCAGAGTGTGCAAGAATCAAACAGACA 780

 13141105 GAAGTAAAAGGACCTTACCTATTGCCCGGGGCTGGGGCTCCCTCCTTCATTCTGGGTTTT 13141164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GAAGTAAAAGGACCTTACCTATTGCCCGGGGCTGGGGCTCCCTCCTTCATTCTGGGTTTT 840

 13141165 AGGAAAACAGCCATCATTATTTCCTAAAAGGTGCCCCCTACTCCCCGCCAACCCGGGACA 13141224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGGAAAACAGCCATCATTATTTCCTAAAAGGTGCCCCCTACTCCCCGCCAACCCGGGACA 900

 13141225 ACTTCACATGCCAGGAAAGCCCTCTCTACCTCAAAGCAGTCCCTGTTCAAGCCCCTACCC 13141284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ACTTCACATGCCAGGAAAGCCCTCTCTACCTCAAAGCAGTCCCTGTTCAAGCCCCTACCC 960

 13141285 CCAGCTCCTCTCTCTGTGAAACCACAGCCATCAGTGAAGGGGGCAGTTGCACCTCAGCAC 13141344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CCAGCTCCTCTCTCTGTGAAACCACAGCCATCAGTGAAGGGGGCAGTTGCACCTCAGCAC 1020

 13141345 CCCTGGCAGAGGGCACGGCATGTGCAAAGGCCCCAAGGGAGCAGTGTGCCTGGTGTGATC 13141404
          ||| |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CCC-GGCAGAGGGCACGGCATCTGCAAAGGCCCCAAGGGAGCAGTGTGCCTGGTGTGATC 1079

 13141405 CAGGAACAAGGAATCAGGGTGGCTGGAAC 13141433
          |||||||||||||||||||||||||||||
     1080 CAGGAACAAGGAATCAGGGTGGCTGGAAC 1108

EXCISED REGION

 13142583 AGAGGGAGGCTGCTGAGGGGAGTGTGGATTTTCTGCTAAGCGCAGCGAGGAGCCATGGGA 13142642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1109 AGAGGGAGGCTGCTGAGGGGAGTGTGGATTTTCTGCTAAGCGCAGCGAGGAGCCATGGGA 1168

 13142643 GGGCTTCAAGCCTGACAGTGACACGATGCGACTTCTGTTTTTAAAAGCACCCTTCTAGGC 13142702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1169 GGGCTTCAAGCCTGACAGTGACACGATGCGACTTCTGTTTTTAAAAGCACCCTTCTAGGC 1228

 13142703 TGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCA 13142762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1229 TGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCA 1288

 13142763 TGAGGTCAGAAGATTGAGACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAA 13142822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1289 TGAGGTCAGAAGATTGAGACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAA 1348

 13142823 TACAAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGGGCGTCTCCAATGAGCCGAGATTGAGCCACTG 13142882
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1349 TACAAAAAATTAGCCGGGCATGGTGGCGGGCGTCTCCAATGAGCCGAGATTGAGCCACTG 1408

 13142883 CACTCCAGCCTGGGAGACAGGGTGAGATTCCATCTCCAAAAAAAAAAAAAATGCA----- 13142937
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         
     1409 CACTCCAGCCTGGGAGACAGGGTGAGATTCCATCTCCAAAAAAAAAAAAAA----AAAAA 1464

 13142938 ---CCCTTCTACTGTTGAGAGGGCAGAAAGGAACAGAAAGGAAACAAGGAGGTCTGGGAA 13142994
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1465 AATCCCTTCTACTGTTGAGAGGGCAGAAAGGAACAGAAAGGAAACAAGGAGGTCTGGGAA 1524

 13142995 GGCCCCGGGAAGATGAGCGATGGTGGTGCCTGGCTAGATGGTGGGCTGGCAGGGAGAGGT 13143054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1525 GGCCCCGGGAAGATGAGCGATGGTGGTGCCTGGCTAGATGGTGGGCTGGCAGGGAGAGGT 1584

 13143055 GCTCAGGCCCAAGTCTGTCTGGAGGGAGCTCCCGGTTTCCACGACAGATTGCAGTGGGTG 13143114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1585 GCTCAGGCCCAAGTCTGTCTGGAGGGAGCTCCCGGTTTCCACGACAGATTGCAGTGGGTG 1644

 13143115 GGAGAGGAAGGGGAGTCAGGCTGGGCTGCAGGCGGAAGGGCTGGGAAGAGACTCAGAGTC 13143174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1645 GGAGAGGAAGGGGAGTCAGGCTGGGCTGCAGGCGGAAGGGCTGGGAAGAGACTCAGAGTC 1704

 13143175 CTGTTTTGGCTGTGTCCAGTATGATGTCTGTGGGGCCTCCAGGTAGAAACATGGAGGAGG 13143234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1705 CTGTTTTGGCTGTGTCCAGTATGATGTCTGTGGGGCCTCCAGGTAGAAACATGGAGGAGG 1764

 13143235 CAGCTGGATGGGTAGCAGTGGAGTGGTGAGTGGTACAGGCTGGAGATATAAATTTGGGGC 13143294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1765 CAGCTGGATGGGTAGCAGTGGAGTGGTGAGTGGTACAGGCTGGAGATATAAATTTGGGGC 1824

 13143295 CATCTTTCAATTTTATTGTTTCAGAGATAAACCCTGATGAAGTCCAGGAATCAATAAACA 13143354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1825 CATCTTTCAATTTTATTGTTTCAGAGATAAACCCTGATGAAGTCCAGGAATCAATAAACA 1884

 13143355 GAGACTAACACTGGCCTCCTTCCCCATCCAGATCCTGGGAGAGGATTTCACGAGTTAAGT 13143414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1885 GAGACTAACACTGGCCTCCTTCCCCATCCAGATCCTGGGAGAGGATTTCACGAGTTAAGT 1944

 13143415 GCTTTGAAACTGACTCTGGCCTTGCAGGGGTGGGAGGGAGGGTGTGCAGTGAGCCAGGGG 13143474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1945 GCTTTGAAACTGACTCTGGCCTTGCAGGGGTGGGAGGGAGGGTGTGCAGTGAGCCAGGGG 2004

 13143475 CCCACTCATGAGCCATCGATTAATAAACTCTGCCCGCTCATGCCTGTAATCTCAGCACTT 13143534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2005 CCCACTCATGAGCCATCGATTAATAAACTCTGCCCGCTCATGCCTGTAATCTCAGCACTT 2064

 13143535 TGGGAGGCTGAGGCAAGTGGATCGCTTGAGCCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAATG 13143594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2065 TGGGAGGCTGAGGCAAGTGGATCGCTTGAGCCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAATG 2124

 13143595 TGGCGAGACCCTGTCTCTACAAAAAATGCAAAAATTAGTCAGGCATGGTGATGTGCATCT 13143654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2125 TGGCGAGACCCTGTCTCTACAAAAAATGCAAAAATTAGTCAGGCATGGTGATGTGCATCT 2184

 13143655 GTAGTCCTGGCTACTCAGGAGGCTGAGGTGGAAGGATTGCTTGAGCCCAGGAGATCAATG 13143714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2185 GTAGTCCTGGCTACTCAGGAGGCTGAGGTGGAAGGATTGCTTGAGCCCAGGAGATCAATG 2244

 13143715 ATGGAGCCCAGGAGTCAGTGATGGAGCCACTGACTCCAGCCTGGGTGATGGAGCAAGAAC 13143774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2245 ATGGAGCCCAGGAGTCAGTGATGGAGCCACTGACTCCAGCCTGGGTGATGGAGCAAGAAC 2304

 13143775 TTGTCTCAAAATAATAATAATAATAATAAATAACCTCTGCCTTCCATGCGAACAAACACC 13143834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2305 TTGTCTCAAAATAATAATAATAATAATAAATAACCTCTGCCTTCCATGCGAACAAACACC 2364

 13143835 CATCCTAGAGCCTGAGACTGGGATGGGCTGGGGAGCGGAGGCCTGGGCCCAGCCCCATGT 13143894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2365 CATCCTAGAGCCTGAGACTGGGATGGGCTGGGGAGCGGAGGCCTGGGCCCAGCCCCATGT 2424

 13143895 TGGGGCTGCCGGGGTTGGTGTTGGTGGGGGGCTGGATTAGAGGCTGGATTTCCTCACCCG 13143954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2425 TGGGGCTGCCGGGGTTGGTGTTGGTGGGGGGCTGGATTAGAGGCTGGATTTCCTCACCCG 2484

 13143955 TGTGGTTTGGGCCCATGGTTTCCTTCTCTGAGCTTCTGTTTGCTCATCTGAGTAATAGGC 13144014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2485 TGTGGTTTGGGCCCATGGTTTCCTTCTCTGAGCTTCTGTTTGCTCATCTGAGTAATAGGC 2544

 13144015 GTGAAAACCTGTGCTTCACGGGGGTCTGGCAGGAGGAAAGGAGCAGGTGTGAGCCCATGG 13144074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2545 GTGAAAACCTGTGCTTCACGGGGGTCTGGCAGGAGGAAAGGAGCAGGTGTGAGCCCATGG 2604

 13144075 TTCTCCACAGCACTGTCCTTCCCCGGTCGGGTGGGGATTGGGGATTTGAAGATATTTATT 13144134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2605 TTCTCCACAGCACTGTCCTTCCCCGGTCGGGTGGGGATTGGGGATTTGAAGATATTTATT 2664

 13144135 GGTAACCACGGAGCTCCCCTCACGTCACATGCTCCCACTGTCAACTGCAGGCCACAGGTC 13144194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2665 GGTAACCACGGAGCTCCCCTCACGTCACATGCTCCCACTGTCAACTGCAGGCCACAGGTC 2724

 13144195 CCACCCTCCAGGCCTTTGCATGTGCAGCCTTCCCTGCTTGGATGCCCTCCCTGGCACTCC 13144254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2725 CCACCCTCCAGGCCTTTGCATGTGCAGCCTTCCCTGCTTGGATGCCCTCCCTGGCACTCC 2784

 13144255 ACTGTCAGCAGACTTGCTTGCTTGCCACTAAAATGTAAGCTCCAGGAGGCGGGTACTGAG 13144314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2785 ACTGTCAGCAGACTTGCTTGCTTGCCACTAAAATGTAAGCTCCAGGAGGCGGGTACTGAG 2844

 13144315 CACAGCTCGTTCACGGCTGCACCCCTGGTGCTGAGGGCTGTGCCTGCCACGGCCCACATA 13144374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2845 CACAGCTCGTTCACGGCTGCACCCCTGGTGCTGAGGGCTGTGCCTGCCACGGCCCACATA 2904

 13144375 TTACTGCATTTAGTCCTTACAACCACCCTGGGAGGTCGGAAGTTTCCAGATGAGAAAACT 13144434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2905 TTACTGCATTTAGTCCTTACAACCACCCTGGGAGGTCGGAAGTTTCCAGATGAGAAAACT 2964

 13144435 GAGAGCTGAAGACAATTGGCACCTTGTCCAGCTCAGCCCCGTCAGAGGTGGCAGAGAGGG 13144494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2965 GAGAGCTGAAGACAATTGGCACCTTGTCCAGCTCAGCCCCGTCAGAGGTGGCAGAGAGGG 3024

 13144495 GCTCAGATCAGGTGCTTGGTGCCCCCCTACCTCAACCTGTGGGCTGGATGTCGGAAGGGA 13144554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3025 GCTCAGATCAGGTGCTTGGTGCCCCCCTACCTCAACCTGTGGGCTGGATGTCGGAAGGGA 3084

 13144555 CTCTGACTTCTGCGCAGGGATGCAGCTTGCTCCCATGCTCTGAAGTAGAGCCAGGGCCCC 13144614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3085 CTCTGACTTCTGCGCAGGGATGCAGCTTGCTCCCATGCTCTGAAGTAGAGCCAGGGCCCC 3144

 13144615 AGGGCTCTGCCCCAGCCCCTCCCTGGCCCATGTCCCCGGCTGGCCCCAGGCAGGTCAGTT 13144674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3145 AGGGCTCTGCCCCAGCCCCTCCCTGGCCCATGTCCCCGGCTGGCCCCAGGCAGGTCAGTT 3204

 13144675 CAGGGAAGGGGCCTGCATCGAACTCTCGCCACCTCCCTAAGCCAGAGCTGTCTGCTTGCT 13144734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3205 CAGGGAAGGGGCCTGCATCGAACTCTCGCCACCTCCCTAAGCCAGAGCTGTCTGCTTGCT 3264

 13144735 CAGATATCATCAGCTTCCCATTAAGCAGATCAATAGCTTCCACTGGTTTCCAATTTGTGT 13144794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3265 CAGATATCATCAGCTTCCCATTAAGCAGATCAATAGCTTCCACTGGTTTCCAATTTGTGT 3324

 13144795 TTCCAGAAATTCATCTCCCAGCCACCTTTTTAATTAACCGCCCCCGCCAACACACCCGAG 13144854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3325 TTCCAGAAATTCATCTCCCAGCCACCTTTTTAATTAACCGCCCCCGCCAACACACCCGAG 3384

 13144855 GCACCAATAGATCACCCTCTCCCCTCCACCTCTGTGGACCACAGACCACTAGCTCCACCA 13144914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3385 GCACCAATAGATCACCCTCTCCCCTCCACCTCTGTGGACCACAGACCACTAGCTCCACCA 3444

 13144915 GCCTCGGGGGAGTGGCAGGTGTGTTTAAAGCTGTATGATCACCATCCTCAGTCACTGGAA 13144974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3445 GCCTCGGGGGAGTGGCAGGTGTGTTTAAAGCTGTATGATCACCATCCTCAGTCACTGGAA 3504

 13144975 GAGCTGGCCGTGCTGCCTGGATGCCATCCACACCTGTCCCCGAGGAAGGGGCTGGGCCCT 13145034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3505 GAGCTGGCCGTGCTGCCTGGATGCCATCCACACCTGTCCCCGAGGAAGGGGCTGGGCCCT 3564

 13145035 TCACCATGAGGAAAACCAAGAATCAGGGAGGCCAAGCAGCAGCTGGCAAGAGCCAGAGCC 13145094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3565 TCACCATGAGGAAAACCAAGAATCAGGGAGGCCAAGCAGCAGCTGGCAAGAGCCAGAGCC 3624

 13145095 GAGTGTGCCATTGGGGTGGGCAATTTGCAGGATGAGCTTCACATGCAGCACGCACTGGGG 13145154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3625 GAGTGTGCCATTGGGGTGGGCAATTTGCAGGATGAGCTTCACATGCAGCACGCACTGGGG 3684

 13145155 GTCTGGCTGGCAGGGGAGCGGGGCTGGCAGCTGTGATTTCAGAGCAGGGGAAGGTTGGAG 13145214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3685 GTCTGGCTGGCAGGGGAGCGGGGCTGGCAGCTGTGATTTCAGAGCAGGGGAAGGTTGGAG 3744

 13145215 GCCTGACCCCCAGAGGGTGCGCCTCCTACCCCTGGGAGCTCCCCGGTATTCCATGTTGCC 13145274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3745 GCCTGACCCCCAGAGGGTGCGCCTCCTACCCCTGGGAGCTCCCCGGTATTCCATGTTGCC 3804

 13145275 TACCACCCTACGAGGGCAGGGGCTGTGTCTGCCTCCATCACTGCTCTCTCCCCAGCGTGC 13145334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3805 TACCACCCTACGAGGGCAGGGGCTGTGTCTGCCTCCATCACTGCTCTCTCCCCAGCGTGC 3864

 13145335 GGCACATAGTAGGTGCTCAGTAAGTCACTAAATGAGCAGCAATATTTGCCAAAACTTAGG 13145394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3865 GGCACATAGTAGGTGCTCAGTAAGTCACTAAATGAGCAGCAATATTTGCCAAAACTTAGG 3924

 13145395 ACATTACCTTTGTGCCAGGTATTCTTCTATTTAATCTTCACGGCACTCCCTGAGGTGGGT 13145454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3925 ACATTACCTTTGTGCCAGGTATTCTTCTATTTAATCTTCACGGCACTCCCTGAGGTGGGT 3984

 13145455 GCTACTAGTATCTTCATTTTATAGATGGGAAAACTCAGGCACAGAGAGTTTCAATGACTT 13145514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3985 GCTACTAGTATCTTCATTTTATAGATGGGAAAACTCAGGCACAGAGAGTTTCAATGACTT 4044

 13145515 GCCCAAGGTCACACAACTAGTTAGTCATGGAGCTGAGATTCGAACCCAGGCCATCTGTCT 13145574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4045 GCCCAAGGTCACACAACTAGTTAGTCATGGAGCTGAGATTCGAACCCAGGCCATCTGTCT 4104

 13145575 CTAGAGCTGTTGCTACTAATCGCCCCACTCTTCCTTACCTGCTCCCCATGGCCTGTCAGC 13145634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4105 CTAGAGCTGTTGCTACTAATCGCCCCACTCTTCCTTACCTGCTCCCCATGGCCTGTCAGC 4164

 13145635 TCCGATGGGCAAGGACTGGGTCCTGTGCCTGGTGTAACTTCTGTCACACACAAACATAGC 13145694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4165 TCCGATGGGCAAGGACTGGGTCCTGTGCCTGGTGTAACTTCTGTCACACACAAACATAGC 4224

 13145695 ATGTTTGCTGAGTGAATAAATGGTGACTTCTGCACTCCCTGCTTCCCAAAACAACCTAGT 13145754
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4225 ATGTTTGCTGAGTGAATAAATGGCGACTTCTGCACTCCCTGCTTCCCAAAACAACCTAGT 4284

 13145755 TGACCAGTCTGTTGGGGCAAATCTAGAGTATTTCATCTGGAAATGAAGGGAAGAGATGGG 13145814
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4285 TGACCAGTCTGTTGGGGCAAATCTGGAGTATTTCATCTGGAAATGAAGGGAAGAGATGGG 4344

 13145815 GTGAGTCCCCTGGGTGACCCTGGGGTGACAAGCCTCCCAGTGAGTACACTGCTGGGGCCA 13145874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4345 GTGAGTCCCCTGGGTGACCCTGGGGTGACAAGCCTCCCAGTGAGTACACTGCTGGGGCCA 4404

 13145875 ACATTAGGGACCCTCTAATTCCACTTCCATCTTCCTTTTCACCCATCCCTTACATTTCTG 13145934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4405 ACATTAGGGACCCTCTAATTCCACTTCCATCTTCCTTTTCACCCATCCCTTACATTTCTG 4464

 13145935 GGCTCTCTGTAGTCTATACAAAAATACATTCACAGCCATGATGTTGTTATTCTGCGGACT 13145994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4465 GGCTCTCTGTAGTCTATACAAAAATACATTCACAGCCATGATGTTGTTATTCTGCGGACT 4524

 13145995 CTTGCAGCTTTCCAGCCAGGCAAGTAGATTTCCACCGCTGACCCAGCACTCGGAACAGGG 13146054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     4525 CTTGCAGCTTTCCAGCCAGGCAAGTAGATTTCCACCGCCGACCCAGCACTCGGAACAGGG 4584

 13146055 ACCACCTGGGTGCCATCCTCTTTCCCCTGTGCACGCTGGGGCCACATCTTAGCAGTTTCA 13146114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4585 ACCACCTGGGTGCCATCCTCTTTCCCCTGTGCACGCTGGGGCCACATCTTAGCAGTTTCA 4644

 13146115 TCTCCAAGTCTCCCTCCCCCACCT 13146138
          ||||||||||||||||||||||||
     4645 TCTCCAAGTCTCCCTCCCCCACCT 4668

Alignment time is 3.56337 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [13131433,13152582] =>     21150 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    3012] =>      3012 nucs 'mol-32-3332-027690_3012'

Score:        2892
Aligned:      3013        nucs
Identic:      3002 (100%) nucs =>      2773 (100%)       229 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [13138650,13141433] EXCISED REGION [13142583,13142811]
 second seq =>  [       1,    2783] EXCISED REGION [    2784,    3012]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1149 nucs [13141434,13142582]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         9 nucs [13141434,13141442] to [13142583,13142591]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [13141434,13141434] to [13142582,13142582]
 second seq =>         0 nucs

 13138650 GCGCCCGGCCTAGGCCTTTCTTTACATGGCATCCCTTCGCCTCTGCAAACCTTCCAGAGG 13138709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCGCCCGGCCTAGGCCTTTCTTTACATGGCATCCCTTCGCCTCTGCAAACCTTCCAGAGG 60

 13138710 GAAGCGATCGCCCCTGGTTCACAGAAGAGGAAAGCAAGGCTCAGAGAGGGAAGGTACCTT 13138769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAAGCGATCGCCCCTGGTTCACAGAAGAGGAAAGCAAGGCTCAGAGAGGGAAGGTACCTT 120

 13138770 GCCTCCCACACGATTGGAAGAGCTGGGATTCGAATCCAGATCTGCCTGACTCCAGAACAA 13138829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GCCTCCCACACGATTGGAAGAGCTGGGATTCGAATCCAGATCTGCCTGACTCCAGAACAA 180

 13138830 TGCCTTTTTCCCTCCCTGCTTCCAGACGTGGCTCTGGTCCCCTCCAGTCACTGAGTCTCC 13138889
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
      181 TGCCTTTTTCCCTCCCTGCTTCCAGACGTGGCTCTAGTCCCCTCCAGTCACTGAGTCTCC 240

 13138890 AGCTTGGCAGCCATACTCCACCTGGCTGTCCACCATAAGCCCTGCAGGTCCTGTGCCCAA 13138949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGCTTGGCAGCCATACTCCACCTGGCTGTCCACCATAAGCCCTGCAGGTCCTGTGCCCAA 300

 13138950 GGCTCCCAGACCCTGGCCATGCTCCTGTGTTGGCGTCAACTTTCTGGATTTCACACGGCC 13139009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GGCTCCCAGACCCTGGCCATGCTCCTGTGTTGGCGTCAACTTTCTGGATTTCACACGGCC 360

 13139010 TGCCAGCTCGAGCCTCAGTCTTTCCATCTGTGAACCGGGGCTGGGCCCCTCAGCTCTGCA 13139069
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGCCAGCTCGAGCCTCAGTCTTTCCATCCGTGAACCGGGGCTGGGCCCCTCAGCTCTGCA 420

 13139070 GCCGCCAGCCCCCACCTCCCAACTCCCGCACTCATGCTGTGAACGCCTGATAAACCTCCT 13139129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GCCGCCAGCCCCCACCTCCCAACTCCCGCACTCATGCTGTGAACGCCTGATAAACCTCCT 480

 13139130 CTGGGCCTTTAAGGGCCTTTTATTTCTCCAGCCATGCTTTTCTCTACATTTTAATAAGCT 13139189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTGGGCCTTTAAGGGCCTTTTATTTCTCCAGCCATGCTTTTCTCTACATTTTAATAAGCT 540

 13139190 GCTTACAAAATTGGTGATTGATGAGTAAGAATGAGGAGGATGCAGGGCTGAACATTTTTT 13139249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GCTTACAAAATTGGTGATTGATGAGTAAGAATGAGGAGGATGCAGGGCTGAACATTTTTT 600

 13139250 TTTTCCTGGAATCGCTTCTGGCTGCGCATTCAACTTTAAATTGATTAATAACGTGCAGAC 13139309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTTTCCTGGAATCGCTTCTGGCTGCGCATTCAACTTTAAATTGATTAATAACGTGCAGAC 660

 13139310 CCAACATTAATTATCAACCATTTGTCACTGGGGAAGGCTGGAGCCTGCGCCTGTGTGCAG 13139369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCAACATTAATTATCAACCATTTGTCACTGGGGAAGGCTGGAGCCTGCGCCTGTGTGCAG 720

 13139370 CCCCTTTCTTCATGACCAGCTCAGTGGTATAGGAGGTGCCCATCTGTCCCACAGGGGTGC 13139429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CCCCTTTCTTCATGACCAGCTCAGTGGTATAGGAGGTGCCCATCTGTCCCACAGGGGTGC 780

 13139430 ATGGAAGGCCCTGGACACTTAAAGCCCTGGCAGCCTCAGCCCACTGTGCCCTGGGCATGT 13139489
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATGGAAGGTCCTGGACACTTAAAGCCCTGGCAGCCTCAGCCCACTGTGCCCTGGGCATGT 840

 13139490 GAGGGCTTCTGAAGGCCAAGCCTGAGCATCTCAGGGCCGACCCCAGATGTCTGGGGCAGT 13139549
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GAGGGCTTCTGAAGGCCAAACCTGAGCATCTCAGGGCCGACCCCAGATGTCTGGGGCAGT 900

 13139550 GGTGCCCTCAATGTCTGTCCTGCCCTGTGCTGGCTCATGGCCTTACCTGACCCTAGGTCA 13139609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GGTGCCCTCAATGTCTGTCCTGCCCTGTGCTGGCTCATGGCCTTACCTGACCCTAGGTCA 960

 13139610 GGTCTTCAGGTCCCCAGCAGACCCCAGCATTTCTTCATTAATTCAACAAACATTTATTGA 13139669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GGTCTTCAGGTCCCCAGCAGACCCCAGCATTTCTTCATTAATTCAACAAACATTTATTGA 1020

 13139670 GCAACTATGATGTGCAGCCTTCTTTCTGGAGGCTGACGGCACAGCAGAGATCAAAACAAG 13139729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GCAACTATGATGTGCAGCCTTCTTTCTGGAGGCTGACGGCACAGCAGAGATCAAAACAAG 1080

 13139730 GTCCTTGACTTTTTGCAGGGGCAGCCTGGCAATCAATGGAACCAACGAGGAAGCAAACAA 13139789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GTCCTTGACTTTTTGCAGGGGCAGCCTGGCAATCAATGGAACCAACGAGGAAGCAAACAA 1140

 13139790 ATTACAGTCTAGCAAGAATCAGGAATTTTTGGAGCATAGACGGCGAAATCTAACTTAGCA 13139849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATTACAGTCTAGCAAGAATCAGGAATTTTTGGAGCATAGACGGCGAAATCTAACTTAGCA 1200

 13139850 TTGGGAAGGTACCACAGAGGAGGCGCCATCTTAAGTGGGTTTTGAAGGATGCAGAGGAGT 13139909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTGGGAAGGTACCACAGAGGAGGCGCCATCTTAAGTGGGTTTTGAAGGATGCAGAGGAGT 1260

 13139910 TCTCTGGGGGTTGGGGGGATAAGTAAAGAAAGCACAACCCCAGAAAGGGAACGGTCTACA 13139969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TCTCTGGGGGTTGGGGGGATAAGTAAAGAAAGCACAACCCCAGAAAGGGAACGGTCTACA 1320

 13139970 AAGAAAAGAAAAGCCAGTAAGAATCAGGAGGGTCAAGAGGAGGGTGAGGGTTTCCACTAA 13140029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AAGAAAAGAAAAGCCAGTAAGAATCAGGAGGGTCAAGAGGAGGGTGAGGGTTTCCACTAA 1380

 13140030 AATAGGAGGATGGAGAGGGCCTCACTGAGAAGGGGGTGAGGGAGGGAGCCAAGGAGATAC 13140089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AATAGGAGGATGGAGAGGGCCTCACTGAGAAGGGGGTGAGGGAGGGAGCCAAGGAGATAC 1440

 13140090 CTGGAGAAGAGTGTCTGAGGCAGAGGAAACAGCAGTGGAAAGGCTCTGAGCTAGGGGAAA 13140149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTGGAGAAGAGTGTCTGAGGCAGAGGAAACAGCAGTGGAAAGGCTCTGAGCTAGGGGAAA 1500

 13140150 ATGGATGGCTAAAAATAACATTATACAATGTGAAAGAAGCCAGTCACACAAGGCCAGTGT 13140209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATGGATGGCTAAAAATAACATTATACAATGTGAAAGAAGCCAGTCACACAAGGCCAGTGT 1560

 13140210 ATATGGTTCCATTTGTATGGAGAGTCCAGAATGGGCAATTCACTAGAAAAAAGAAAGTAA 13140269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ATATGGTTCCATTTGTATGGAGAGTCCAGAATGGGCAATTCACTAGAAAAAAGAAAGTAA 1620

 13140270 ATTCAAGGTTACCAGGGACTTAGGGGAAGAGGAAGTGGGAAATGACTGCTACTGGGTATA 13140329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ATTCAAGGTTACCAGGGACTTAGGGGAAGAGGAAGTGGGAAATGACTGCTACTGGGTATA 1680

 13140330 CGGTTTCTTTCTGGATGATGAAAATGTCCTAAAACCGACTGTGAAATGGATTCACAACTC 13140389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CGGTTTCTTTCTGGATGATGAAAATGTCCTAAAACCGACTGTGAAATGGATTCACAACTC 1740

 13140390 TGTGAATACACTAACATCCACGGAATGATACACTTTAAATGAATGAACTTTACAGTATGT 13140449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGTGAATACACTAACATCCACGGAATGATACACTTTAAATGAATGAACTTTACAGTATGT 1800

 13140450 AAATTCCAGTAAAGCTGTTACAGAATAACTTTGTCATATGTCAGGTAGCGATCAGTTCCA 13140509
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AAATTCCAGTAAAGCTGTTACAAAATAACTTTGTCATATGTCAGGTAGCGATCAGTTCCA 1860

 13140510 GAAAAGACATTGGGATAAGAGGACTTTCGGGGGATGGGGGGAACAGGCCGGGTGTCCCCA 13140569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GAAAAGACATTGGGATAAGAGGACTTTCGGGGGATGGGGGGAACAGGCCGGGTGTCCCCA 1920

 13140570 AAGAGGTGATATTGAAGCAGAGACCTGGGCTGAGCTACAGGTCCAGGAATAGGGTGGTGG 13140629
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AAGAGGTGATATTTAAGCAGAGACCTGGGCTGAGCTACAGGTCCAGGAATAGGGTGGTGG 1980

 13140630 CTAGACTAGCCTGTCCCGCACCTGCCACCTGGGGCACCACTGAGTGTAGCCCTGGGGGCC 13140689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CTAGACTAGCCTGTCCCGCACCTGCCACCTGGGGCACCACTGAGTGTAGCCCTGGGGGCC 2040

 13140690 ATAGCCCCTGGAGAGGGGTGAGGAGAGGCAAGTGAGACCTTCAGGGAAGTTGAGGCCACA 13140749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     2041 ATAGCCCCTGGAGAGGGGTGAGGAGAGGCAAGTGAGACCTTCGGGGAAGTTGAGGCCACA 2100

 13140750 GTGAGGCACATCGGCTATATCAGGGTCCACTAGGGGCACCAGAATATAGCTGGTGGGGCA 13140809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GTGAGGCACATCGGCTATATCAGGGTCCACTAGGGGCACCAGAATATAGCTGGTGGGGCA 2160

 13140810 TGGGCAAATGAGGTTTCGGGTGTGCAGGATTGCATTTTATGAGAATTTGACAAATTTAAA 13140869
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TGGGCAAATGAGGTTTCGGGTGTGCCGGATTGCATTTTATGAGAATTTGACAAATTTAAA 2220

 13140870 TCAGCAAGAGTTGCAACATCTCAAAGCTGGTAGGAAAAATGGTTTTTAGGCTCAGGCTAC 13140929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     2221 TCAGCAAGAGTTGCAACATCTCAAAGCTGGTAGGAAAAATGGCTTTTAGGCTCAGGCTAC 2280

 13140930 TTTCGAAAGAGTGAAGGTGGTGCTGCTCAGGGCTTACAGGCAATGGTGGACTCCTCCCCC 13140989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TTTCGAAAGAGTGAAGGTGGTGCTGCTCAGGGCTTACAGGCAATGGTGGACTCCTCCCCC 2340

 13140990 GAGCTGGGTGTCCCCGGGTGCATCTGTGGCCCTCAGAAGCGCCCACCTCACTCAGGCTGG 13141049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GAGCTGGGTGTCCCCGGGTGCATCTGTGGCCCTCAGAAGCGCCCACCTCACTCAGGCTGG 2400

 13141050 CAGAGCGCGGTGGCCATGGAAACGCAAGCCAGAGTGTGCAAGAATCAAACAGACAGAAGT 13141109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CAGAGCGCGGTGGCCATGGAAACGCAAGCCAGAGTGTGCAAGAATCAAACAGACAGAAGT 2460

 13141110 AAAAGGACCTTACCTATTGCCCGGGGCTGGGGCTCCCTCCTTCATTCTGGGTTTTAGGAA 13141169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AAAAGGACCTTACCTATTGCCCGGGGCTGGGGCTCCCTCCTTCATTCTGGGTTTTAGGAA 2520

 13141170 AACAGCCATCATTATTTCCTAAAAGGTGCCCCCTACTCCCCGCCAACCCGGGACAACTTC 13141229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 AACAGCCATCATTATTTCCTAAAAGGTGCCCCCTACTCCCCGCCAACCCGGGACAACTTC 2580

 13141230 ACATGCCAGGAAAGCCCTCTCTACCTCAAAGCAGTCCCTGTTCAAGCCCCTACCCCCAGC 13141289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 ACATGCCAGGAAAGCCCTCTCTACCTCAAAGCAGTCCCTGTTCAAGCCCCTACCCCCAGC 2640

 13141290 TCCTCTCTCTGTGAAACCACAGCCATCAGTGAAGGGGGCAGTTGCACCTCAGCACCCCTG 13141349
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
     2641 TCCTCTCTCTGTGAAACCACAGCCATCAGTGAAGGGGGCAGTTGCACCTCAGCACCCC-G 2699

 13141350 GCAGAGGGCACGGCATGTGCAAAGGCCCCAAGGGAGCAGTGTGCCTGGTGTGATCCAGGA 13141409
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 GCAGAGGGCACGGCATCTGCAAAGGCCCCAAGGGAGCAGTGTGCCTGGTGTGATCCAGGA 2759

 13141410 ACAAGGAATCAGGGTGGCTGGAAC 13141433
          ||||||||||||||||||||||||
     2760 ACAAGGAATCAGGGTGGCTGGAAC 2783

EXCISED REGION

 13142583 AGAGGGAGGCTGCTGAGGGGAGTGTGGATTTTCTGCTAAGCGCAGCGAGGAGCCATGGGA 13142642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2784 AGAGGGAGGCTGCTGAGGGGAGTGTGGATTTTCTGCTAAGCGCAGCGAGGAGCCATGGGA 2843

 13142643 GGGCTTCAAGCCTGACAGTGACACGATGCGACTTCTGTTTTTAAAAGCACCCTTCTAGGC 13142702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2844 GGGCTTCAAGCCTGACAGTGACACGATGCGACTTCTGTTTTTAAAAGCACCCTTCTAGGC 2903

 13142703 TGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCA 13142762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2904 TGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCA 2963

 13142763 TGAGGTCAGAAGATTGAGACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATC 13142811
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2964 TGAGGTCAGAAGATTGAGACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATC 3012

Alignment time is 2.28554 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [13131433,13152582] =>     21150 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    2356] =>      2356 nucs 'mol-32-34a8-127572_2356'

Score:        2247
Aligned:      2357        nucs
Identic:      2347 (100%) nucs =>      2133 (100%)       214 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [13139292,13141433] EXCISED REGION [13142583,13142797]
 second seq =>  [       1,    2141] EXCISED REGION [    2142,    2356]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1149 nucs [13141434,13142582]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         9 nucs [13141434,13141442] to [13142583,13142591]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [13141434,13141434] to [13142582,13142582]
 second seq =>         0 nucs

 13139292 GATTAATAACGTGCAGACCCAACATTAATTATCAACCATTTGTCACTGGGGAAGGCTGGA 13139351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GATTAATAACGTGCAGACCCAACATTAATTATCAACCATTTGTCACTGGGGAAGGCTGGA 60

 13139352 GCCTGCGCCTGTGTGCAGCCCCTTTCTTCATGACCAGCTCAGTGGTATAGGAGGTGCCCA 13139411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCCTGCGCCTGTGTGCAGCCCCTTTCTTCATGACCAGCTCAGTGGTATAGGAGGTGCCCA 120

 13139412 TCTGTCCCACAGGGGTGCATGGAAGGCCCTGGACACTTAAAGCCCTGGCAGCCTCAGCCC 13139471
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCTGTCCCACAGGGGTGCATGGAAGGTCCTGGACACTTAAAGCCCTGGCAGCCTCAGCCC 180

 13139472 ACTGTGCCCTGGGCATGTGAGGGCTTCTGAAGGCCAAGCCTGAGCATCTCAGGGCCGACC 13139531
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
      181 ACTGTGCCCTGGGCATGTGAGGGCTTCTGAAGGCCAAACCTGAGCATCTCAGGGCCGACC 240

 13139532 CCAGATGTCTGGGGCAGTGGTGCCCTCAATGTCTGTCCTGCCCTGTGCTGGCTCATGGCC 13139591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCAGATGTCTGGGGCAGTGGTGCCCTCAATGTCTGTCCTGCCCTGTGCTGGCTCATGGCC 300

 13139592 TTACCTGACCCTAGGTCAGGTCTTCAGGTCCCCAGCAGACCCCAGCATTTCTTCATTAAT 13139651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTACCTGACCCTAGGTCAGGTCTTCAGGTCCCCAGCAGACCCCAGCATTTCTTCATTAAT 360

 13139652 TCAACAAACATTTATTGAGCAACTATGATGTGCAGCCTTCTTTCTGGAGGCTGACGGCAC 13139711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCAACAAACATTTATTGAGCAACTATGATGTGCAGCCTTCTTTCTGGAGGCTGACGGCAC 420

 13139712 AGCAGAGATCAAAACAAGGTCCTTGACTTTTTGCAGGGGCAGCCTGGCAATCAATGGAAC 13139771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGCAGAGATCAAAACAAGGTCCTTGACTTTTTGCAGGGGCAGCCTGGCAATCAATGGAAC 480

 13139772 CAACGAGGAAGCAAACAAATTACAGTCTAGCAAGAATCAGGAATTTTTGGAGCATAGACG 13139831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CAACGAGGAAGCAAACAAATTACAGTCTAGCAAGAATCAGGAATTTTTGGAGCATAGACG 540

 13139832 GCGAAATCTAACTTAGCATTGGGAAGGTACCACAGAGGAGGCGCCATCTTAAGTGGGTTT 13139891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GCGAAATCTAACTTAGCATTGGGAAGGTACCACAGAGGAGGCGCCATCTTAAGTGGGTTT 600

 13139892 TGAAGGATGCAGAGGAGTTCTCTGGGGGTTGGGGGGATAAGTAAAGAAAGCACAACCCCA 13139951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGAAGGATGCAGAGGAGTTCTCTGGGGGTTGGGGGGATAAGTAAAGAAAGCACAACCCCA 660

 13139952 GAAAGGGAACGGTCTACAAAGAAAAGAAAAGCCAGTAAGAATCAGGAGGGTCAAGAGGAG 13140011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GAAAGGGAACGGTCTACAAAGAAAAGAAAAGCCAGTAAGAATCAGGAGGGTCAAGAGGAG 720

 13140012 GGTGAGGGTTTCCACTAAAATAGGAGGATGGAGAGGGCCTCACTGAGAAGGGGGTGAGGG 13140071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GGTGAGGGTTTCCACTAAAATAGGAGGATGGAGAGGGCCTCACTGAGAAGGGGGTGAGGG 780

 13140072 AGGGAGCCAAGGAGATACCTGGAGAAGAGTGTCTGAGGCAGAGGAAACAGCAGTGGAAAG 13140131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGGGAGCCAAGGAGATACCTGGAGAAGAGTGTCTGAGGCAGAGGAAACAGCAGTGGAAAG 840

 13140132 GCTCTGAGCTAGGGGAAAATGGATGGCTAAAAATAACATTATACAATGTGAAAGAAGCCA 13140191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GCTCTGAGCTAGGGGAAAATGGATGGCTAAAAATAACATTATACAATGTGAAAGAAGCCA 900

 13140192 GTCACACAAGGCCAGTGTATATGGTTCCATTTGTATGGAGAGTCCAGAATGGGCAATTCA 13140251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GTCACACAAGGCCAGTGTATATGGTTCCATTTGTATGGAGAGTCCAGAATGGGCAATTCA 960

 13140252 CTAGAAAAAAGAAAGTAAATTCAAGGTTACCAGGGACTTAGGGGAAGAGGAAGTGGGAAA 13140311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTAGAAAAAAGAAAGTAAATTCAAGGTTACCAGGGACTTAGGGGAAGAGGAAGTGGGAAA 1020

 13140312 TGACTGCTACTGGGTATACGGTTTCTTTCTGGATGATGAAAATGTCCTAAAACCGACTGT 13140371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGACTGCTACTGGGTATACGGTTTCTTTCTGGATGATGAAAATGTCCTAAAACCGACTGT 1080

 13140372 GAAATGGATTCACAACTCTGTGAATACACTAACATCCACGGAATGATACACTTTAAATGA 13140431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GAAATGGATTCACAACTCTGTGAATACACTAACATCCACGGAATGATACACTTTAAATGA 1140

 13140432 ATGAACTTTACAGTATGTAAATTCCAGTAAAGCTGTTACAGAATAACTTTGTCATATGTC 13140491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     1141 ATGAACTTTACAGTATGTAAATTCCAGTAAAGCTGTTACAAAATAACTTTGTCATATGTC 1200

 13140492 AGGTAGCGATCAGTTCCAGAAAAGACATTGGGATAAGAGGACTTTCGGGGGATGGGGGGA 13140551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AGGTAGCGATCAGTTCCAGAAAAGACATTGGGATAAGAGGACTTTCGGGGGATGGGGGGA 1260

 13140552 ACAGGCCGGGTGTCCCCAAAGAGGTGATATTGAAGCAGAGACCTGGGCTGAGCTACAGGT 13140611
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ACAGGCCGGGTGTCCCCAAAGAGGTGATATTTAAGCAGAGACCTGGGCTGAGCTACAGGT 1320

 13140612 CCAGGAATAGGGTGGTGGCTAGACTAGCCTGTCCCGCACCTGCCACCTGGGGCACCACTG 13140671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CCAGGAATAGGGTGGTGGCTAGACTAGCCTGTCCCGCACCTGCCACCTGGGGCACCACTG 1380

 13140672 AGTGTAGCCCTGGGGGCCATAGCCCCTGGAGAGGGGTGAGGAGAGGCAAGTGAGACCTTC 13140731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AGTGTAGCCCTGGGGGCCATAGCCCCTGGAGAGGGGTGAGGAGAGGCAAGTGAGACCTTC 1440

 13140732 AGGGAAGTTGAGGCCACAGTGAGGCACATCGGCTATATCAGGGTCCACTAGGGGCACCAG 13140791
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GGGGAAGTTGAGGCCACAGTGAGGCACATCGGCTATATCAGGGTCCACTAGGGGCACCAG 1500

 13140792 AATATAGCTGGTGGGGCATGGGCAAATGAGGTTTCGGGTGTGCAGGATTGCATTTTATGA 13140851
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     1501 AATATAGCTGGTGGGGCATGGGCAAATGAGGTTTCGGGTGTGCCGGATTGCATTTTATGA 1560

 13140852 GAATTTGACAAATTTAAATCAGCAAGAGTTGCAACATCTCAAAGCTGGTAGGAAAAATGG 13140911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GAATTTGACAAATTTAAATCAGCAAGAGTTGCAACATCTCAAAGCTGGTAGGAAAAATGG 1620

 13140912 TTTTTAGGCTCAGGCTACTTTCGAAAGAGTGAAGGTGGTGCTGCTCAGGGCTTACAGGCA 13140971
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CTTTTAGGCTCAGGCTACTTTCGAAAGAGTGAAGGTGGTGCTGCTCAGGGCTTACAGGCA 1680

 13140972 ATGGTGGACTCCTCCCCCGAGCTGGGTGTCCCCGGGTGCATCTGTGGCCCTCAGAAGCGC 13141031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ATGGTGGACTCCTCCCCCGAGCTGGGTGTCCCCGGGTGCATCTGTGGCCCTCAGAAGCGC 1740

 13141032 CCACCTCACTCAGGCTGGCAGAGCGCGGTGGCCATGGAAACGCAAGCCAGAGTGTGCAAG 13141091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CCACCTCACTCAGGCTGGCAGAGCGCGGTGGCCATGGAAACGCAAGCCAGAGTGTGCAAG 1800

 13141092 AATCAAACAGACAGAAGTAAAAGGACCTTACCTATTGCCCGGGGCTGGGGCTCCCTCCTT 13141151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AATCAAACAGACAGAAGTAAAAGGACCTTACCTATTGCCCGGGGCTGGGGCTCCCTCCTT 1860

 13141152 CATTCTGGGTTTTAGGAAAACAGCCATCATTATTTCCTAAAAGGTGCCCCCTACTCCCCG 13141211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CATTCTGGGTTTTAGGAAAACAGCCATCATTATTTCCTAAAAGGTGCCCCCTACTCCCCG 1920

 13141212 CCAACCCGGGACAACTTCACATGCCAGGAAAGCCCTCTCTACCTCAAAGCAGTCCCTGTT 13141271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CCAACCCGGGACAACTTCACATGCCAGGAAAGCCCTCTCTACCTCAAAGCAGTCCCTGTT 1980

 13141272 CAAGCCCCTACCCCCAGCTCCTCTCTCTGTGAAACCACAGCCATCAGTGAAGGGGGCAGT 13141331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CAAGCCCCTACCCCCAGCTCCTCTCTCTGTGAAACCACAGCCATCAGTGAAGGGGGCAGT 2040

 13141332 TGCACCTCAGCACCCCTGGCAGAGGGCACGGCATGTGCAAAGGCCCCAAGGGAGCAGTGT 13141391
          |||||||||||||||| |||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     2041 TGCACCTCAGCACCCC-GGCAGAGGGCACGGCATCTGCAAAGGCCCCAAGGGAGCAGTGT 2099

 13141392 GCCTGGTGTGATCCAGGAACAAGGAATCAGGGTGGCTGGAAC 13141433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 GCCTGGTGTGATCCAGGAACAAGGAATCAGGGTGGCTGGAAC 2141

EXCISED REGION

 13142583 AGAGGGAGGCTGCTGAGGGGAGTGTGGATTTTCTGCTAAGCGCAGCGAGGAGCCATGGGA 13142642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2142 AGAGGGAGGCTGCTGAGGGGAGTGTGGATTTTCTGCTAAGCGCAGCGAGGAGCCATGGGA 2201

 13142643 GGGCTTCAAGCCTGACAGTGACACGATGCGACTTCTGTTTTTAAAAGCACCCTTCTAGGC 13142702
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2202 GGGCTTCAAGCCTGACAGTGACACTATGCGACTTCTGTTTTTAAAAGCACCCTTCTAGGC 2261

 13142703 TGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCA 13142762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2262 TGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCA 2321

 13142763 TGAGGTCAGAAGATTGAGACCATCCTGGCTAACAT 13142797
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2322 TGAGGTCAGAAGATTGAGACCATCCTGGCTAACAT 2356

Alignment time is 1.79719 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [13131433,13152582] =>     21150 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    5853] =>      5853 nucs 'mol-32-34a8-173918_5853'

Score:        5679
Aligned:      5854        nucs
Identic:      5834 (100%) nucs =>      3443 (100%)      2391 (100%)
Gaps:            7 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [13137978,13141433] EXCISED REGION [13142583,13144974]
 second seq =>  [       1,    3455] EXCISED REGION [    3456,    5853]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1149 nucs [13141434,13142582]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         9 nucs [13141434,13141442] to [13142583,13142591]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [13141434,13141434] to [13142582,13142582]
 second seq =>         0 nucs

 13137978 AATCAAGTATTTGGGGGGCATAGAGGGCAAGACGCTGACTTAGCATTGGGAAGACACCAC 13138037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AATCAAGTATTTGGGGGGCATAGAGGGCAAGACGCTGACTTAGCATTGGGAAGACACCAC 60

 13138038 AGAGGAGGTGCCATATGAGGTGAGTTTTGAAGGATGTATATGAGTTCGCTGTGGCCTGGG 13138097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGAGGAGGTGCCATATGAGGTGAGTTTTGAAGGATGTATATGAGTTCGCTGTGGCCTGGG 120

 13138098 GTTTATGTGAAGAAAACACACCCCAGAGAGGAAGGAACATGAGCAAAGGCACGGCAGCCT 13138157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTTTATGTGAAGAAAACACACCCCAGAGAGGAAGGAACATGAGCAAAGGCACGGCAGCCT 180

 13138158 CCTGGTGCTTCCGAAGACCATGCTGGCAAAGGGCAGCACAGTCCCAGCCACTTGGCTACA 13138217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCTGGTGCTTCCGAAGACCATGCTGGCAAAGGGCAGCACAGTCCCAGCCACTTGGCTACA 240

 13138218 TACCCAGAATAGCACTGTCACGCTTGAAGGAGGCACAGAAGCTGCCCCAGCTACCCTCCC 13138277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TACCCAGAATAGCACTGTCACGCTTGAAGGAGGCACAGAAGCTGCCCCAGCTACCCTCCC 300

 13138278 ACCAGTGCTGGGCCTTCGACAGACAACCATCATTTAATGAGCACCTGCTGTGCACCTAAG 13138337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACCAGTGCTGGGCCTTCGACAGACAACCATCATTTAATGAGCACCTGCTGTGCACCTAAG 360

 13138338 GCCCTCTCCTAGGCCTTTCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTGAAATGGAGTCTCGCTCTG 13138397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GCCCTCTCCTAGGCCTTTCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTGAAATGGAGTCTCGCTCTG 420

 13138398 TTGCCCAGGCTGGAGTGCGGTGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCACCTCCAGGGT 13138457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTGCCCAGGCTGGAGTGCGGTGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCACCTCCAGGGT 480

 13138458 TCACGCCATTCTCCTACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACCAC 13138517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCACGCCATTCTCCTACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACCAC 540

 13138518 GCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGG 13138577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
      541 GCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGG 600

 13138578 TCTCAATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAG 13138637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCTCAATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAG 660

 13138638 GCATGAGCCACCGCGCCCGGCCTAGGCCTTTCTTTACATGGCATCCCTTCGCCTCTGCAA 13138697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GCATGAGCCACCGCGCCCGGCCTAGGCCTTTCTTTACATGGCATCCCTTCGCCTCTGCAA 720

 13138698 ACCTTCCAGAGGGAAGCGATCGCCCCTGGTTCACAGAAGAGGAAAGCAAGGCTCAGAGAG 13138757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ACCTTCCAGAGGGAAGCGATCGCCCCTGGTTCACAGAAGAGGAAAGCAAGGCTCAGAGAG 780

 13138758 GGAAGGTACCTTGCCTCCCACACGATTGGAAGAGCTGGGATTCGAATCCAGATCTGCCTG 13138817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GGAAGGTACCTTGCCTCCCACACGATTGGAAGAGCTGGGATTCGAATCCAGATCTGCCTG 840

 13138818 ACTCCAGAACAATGCCTTTTTCCCTCCCTGCTTCCAGACGTGGCTCTGGTCCCCTCCAGT 13138877
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
      841 ACTCCAGAACAATGCCTTTTTCCCTCCCTGCTTCCAGACGTGGCTCTAGTCCCCTCCAGT 900

 13138878 CACTGAGTCTCCAGCTTGGCAGCCATACTCCACCTGGCTGTCCACCATAAGCCCTGCAGG 13138937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CACTGAGTCTCCAGCTTGGCAGCCATACTCCACCTGGCTGTCCACCATAAGCCCTGCAGG 960

 13138938 TCCTGTGCCCAAGGCTCCCAGACCCTGGCCATGCTCCTGTGTTGGCGTCAACTTTCTGGA 13138997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TCCTGTGCCCAAGGCTCCCAGACCCTGGCCATGCTCCTGTGTTGGCGTCAACTTTCTGGA 1020

 13138998 TTTCACACGGCCTGCCAGCTCGAGCCTCAGTCTTTCCATCTGTGAACCGGGGCTGGGCCC 13139057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     1021 TTTCACACGGCCTGCCAGCTCGAGCCTCAGTCTTTCCATCCGTGAACCGGGGCTGGGCCC 1080

 13139058 CTCAGCTCTGCAGCCGCCAGCCCCCACCTCCCAACTCCCGCACTCATGCTGTGAACGCCT 13139117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTCAGCTCTGCAGCCGCCAGCCCCCACCTCCCAACTCCCGCACTCATGCTGTGAACGCCT 1140

 13139118 GATAAACCTCCTCTGGGCCTTTAAGGGCCTTTTATTTCTCCAGCCATGCTTTTCTCTACA 13139177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GATAAACCTCCTCTGGGCCTTTAAGGGCCTTTTATTTCTCCAGCCATGCTTTTCTCTACA 1200

 13139178 TTTTAATAAGCTGCTTACAAAATTGGTGATTGATGAGTAAGAATGAGGAGGATGCAGGGC 13139237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTTTAATAAGCTGCTTACAAAATTGGTGATTGATGAGTAAGAATGAGGAGGATGCAGGGC 1260

 13139238 TGAACATTTTTTTTTTCCTGGAATCGCTTCTGGCTGCGCATTCAACTTTAAATTGATTAA 13139297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGAACATTTTTTTTTTCCTGGAATCGCTTCTGGCTGCGCATTCAACTTTAAATTGATTAA 1320

 13139298 TAACGTGCAGACCCAACATTAATTATCAACCATTTGTCACTGGGGAAGGCTGGAGCCTGC 13139357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TAACGTGCAGACCCAACATTAATTATCAACCATTTGTCACTGGGGAAGGCTGGAGCCTGC 1380

 13139358 GCCTGTGTGCAGCCCCTTTCTTCATGACCAGCTCAGTGGTATAGGAGGTGCCCATCTGTC 13139417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GCCTGTGTGCAGCCCCTTTCTTCATGACCAGCTCAGTGGTATAGGAGGTGCCCATCTGTC 1440

 13139418 CCACAGGGGTGCATGGAAGGCCCTGGACACTTAAAGCCCTGGCAGCCTCAGCCCACTGTG 13139477
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CCACAGGGGTGCATGGAAGGTCCTGGACACTTAAAGCCCTGGCAGCCTCAGCCCACTGTG 1500

 13139478 CCCTGGGCATGTGAGGGCTTCTGAAGGCCAAGCCTGAGCATCTCAGGGCCGACCCCAGAT 13139537
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CCCTGGGCATGTGAGGGCTTCTGAAGGCCAAACCTGAGCATCTCAGGGCCGACCCCAGAT 1560

 13139538 GTCTGGGGCAGTGGTGCCCTCAATGTCTGTCCTGCCCTGTGCTGGCTCATGGCCTTACCT 13139597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GTCTGGGGCAGTGGTGCCCTCAATGTCTGTCCTGCCCTGTGCTGGCTCATGGCCTTACCT 1620

 13139598 GACCCTAGGTCAGGTCTTCAGGTCCCCAGCAGACCCCAGCATTTCTTCATTAATTCAACA 13139657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GACCCTAGGTCAGGTCTTCAGGTCCCCAGCAGACCCCAGCATTTCTTCATTAATTCAACA 1680

 13139658 AACATTTATTGAGCAACTATGATGTGCAGCCTTCTTTCTGGAGGCTGACGGCACAGCAGA 13139717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AACATTTATTGAGCAACTATGATGTGCAGCCTTCTTTCTGGAGGCTGACGGCACAGCAGA 1740

 13139718 GATCAAAACAAGGTCCTTGACTTTTTGCAGGGGCAGCCTGGCAATCAATGGAACCAACGA 13139777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GATCAAAACAAGGTCCTTGACTTTTTGCAGGGGCAGCCTGGCAATCAATGGAACCAACGA 1800

 13139778 GGAAGCAAACAAATTACAGTCTAGCAAGAATCAGGAATTTTTGGAGCATAGACGGCGAAA 13139837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GGAAGCAAACAAATTACAGTCTAGCAAGAATCAGGAATTTTTGGAGCATAGACGGCGAAA 1860

 13139838 TCTAACTTAGCATTGGGAAGGTACCACAGAGGAGGCGCCATCTTAAGTGGGTTTTGAAGG 13139897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TCTAACTTAGCATTGGGAAGGTACCACAGAGGAGGCGCCATCTTAAGTGGGTTTTGAAGG 1920

 13139898 ATGCAGAGGAGTTCTCTGGGGGTTGGGGGGATAAGTAAAGAAAGCACAACCCCAGAAAGG 13139957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ATGCAGAGGAGTTCTCTGGGGGTTGGGGGGATAAGTAAAGAAAGCACAACCCCAGAAAGG 1980

 13139958 GAACGGTCTACAAAGAAAAGAAAAGCCAGTAAGAATCAGGAGGGTCAAGAGGAGGGTGAG 13140017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GAACGGTCTACAAAGAAAAGAAAAGCCAGTAAGAATCAGGAGGGTCAAGAGGAGGGTGAG 2040

 13140018 GGTTTCCACTAAAATAGGAGGATGGAGAGGGCCTCACTGAGAAGGGGGTGAGGGAGGGAG 13140077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GGTTTCCACTAAAATAGGAGGATGGAGAGGGCCTCACTGAGAAGGGGGTGAGGGAGGGAG 2100

 13140078 CCAAGGAGATACCTGGAGAAGAGTGTCTGAGGCAGAGGAAACAGCAGTGGAAAGGCTCTG 13140137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CCAAGGAGATACCTGGAGAAGAGTGTCTGAGGCAGAGGAAACAGCAGTGGAAAGGCTCTG 2160

 13140138 AGCTAGGGGAAAATGGATGGCTAAAAATAACATTATACAATGTGAAAGAAGCCAGTCACA 13140197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AGCTAGGGGAAAATGGATGGCTAAAAATAACATTATACAATGTGAAAGAAGCCAGTCACA 2220

 13140198 CAAGGCCAGTGTATATGGTTCCATTTGTATGGAGAGTCCAGAATGGGCAATTCACTAGAA 13140257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CAAGGCCAGTGTATATGGTTCCATTTGTATGGAGAGTCCAGAATGGGCAATTCACTAGAA 2280

 13140258 AAAAGAAAGTAAATTCAAGGTTACCAGGGACTTAGGGGAAGAGGAAGTGGGAAATGACTG 13140317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AAAAGAAAGTAAATTCAAGGTTACCAGGGACTTAGGGGAAGAGGAAGTGGGAAATGACTG 2340

 13140318 CTACTGGGTATACGGTTTCTTTCTGGATGATGAAAATGTCCTAAAACCGACTGTGAAATG 13140377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CTACTGGGTATACGGTTTCTTTCTGGATGATGAAAATGTCCTAAAACCGACTGTGAAATG 2400

 13140378 GATTCACAACTCTGTGAATACACTAACATCCACGGAATGATACACTTTAAATGAATGAAC 13140437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GATTCACAACTCTGTGAATACACTAACATCCACGGAATGATACACTTTAAATGAATGAAC 2460

 13140438 TTTACAGTATGTAAATTCCAGTAAAGCTGTTACAGAATAACTTTGTCATATGTCAGGTAG 13140497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     2461 TTTACAGTATGTAAATTCCAGTAAAGCTGTTACAAAATAACTTTGTCATATGTCAGGTAG 2520

 13140498 CGATCAGTTCCAGAAAAGACATTGGGATAAGAGGACTTTCGGGGGATGGGGGGAACAGGC 13140557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CGATCAGTTCCAGAAAAGACATTGGGATAAGAGGACTTTCGGGGGATGGGGGGAACAGGC 2580

 13140558 CGGGTGTCCCCAAAGAGGTGATATTGAAGCAGAGACCTGGGCTGAGCTACAGGTCCAGGA 13140617
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CGGGTGTCCCCAAAGAGGTGATATTTAAGCAGAGACCTGGGCTGAGCTACAGGTCCAGGA 2640

 13140618 ATAGGGTGGTGGCTAGACTAGCCTGTCCCGCACCTGCCACCTGGGGCACCACTGAGTGTA 13140677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 ATAGGGTGGTGGCTAGACTAGCCTGTCCCGCACCTGCCACCTGGGGCACCACTGAGTGTA 2700

 13140678 GCCCTGGGGGCCATAGCCCCTGGAGAGGGGTGAGGAGAGGCAAGTGAGACCTTCAGGGAA 13140737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     2701 GCCCTGGGGGCCATAGCCCCTGGAGAGGGGTGAGGAGAGGCAAGTGAGACCTTCGGGGAA 2760

 13140738 GTTGAGGCCACAGTGAGGCACATCGGCTATATCAGGGTCCACTAGGGGCACCAGAATATA 13140797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GTTGAGGCCACAGTGAGGCACATCGGCTATATCAGGGTCCACTAGGGGCACCAGAATATA 2820

 13140798 GCTGGTGGGGCATGGGCAAATGAGGTTTCGGGTGTGCAGGATTGCATTTTATGAGAATTT 13140857
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     2821 GCTGGTGGGGCATGGGCAAATGAGGTTTCGGGTGTGCCGGATTGCATTTTATGAGAATTT 2880

 13140858 GACAAATTTAAATCAGCAAGAGTTGCAACATCTCAAAGCTGGTAGGAAAAATGGTTTTTA 13140917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     2881 GACAAATTTAAATCAGCAAGAGTTGCAACATCTCAAAGCTGGTAGGAAAAATGGCTTTTA 2940

 13140918 GGCTCAGGCTACTTTCGAAAGAGTGAAGGTGGTGCTGCTCAGGGCTTACAGGCAATGGTG 13140977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 GGCTCAGGCTACTTTCGAAAGAGTGAAGGTGGTGCTGCTCAGGGCTTACAGGCAATGGTG 3000

 13140978 GACTCCTCCCCCGAGCTGGGTGTCCCCGGGTGCATCTGTGGCCCTCAGAAGCGCCCACCT 13141037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GACTCCTCCCCCGAGCTGGGTGTCCCCGGGTGCATCTGTGGCCCTCAGAAGCGCCCACCT 3060

 13141038 CACTCAGGCTGGCAGAGCGCGGTGGCCATGGAAACGCAAGCCAGAGTGTGCAAGAATCAA 13141097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 CACTCAGGCTGGCAGAGCGCGGTGGCCATGGAAACGCAAGCCAGAGTGTGCAAGAATCAA 3120

 13141098 ACAGACAGAAGTAAAAGGACCTTACCTATTGCCCGGGGCTGGGGCTCCCTCCTTCATTCT 13141157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 ACAGACAGAAGTAAAAGGACCTTACCTATTGCCCGGGGCTGGGGCTCCCTCCTTCATTCT 3180

 13141158 GGGTTTTAGGAAAACAGCCATCATTATTTCCTAAAAGGTGCCCCCTACTCCCCGCCAACC 13141217
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     3181 GGGTTTTAGGAAAACAGCCATCATTATTTCCTAAAAGGTGCCCCCTACTCCCCGCCAACG 3240

 13141218 CGGGACAACTTCACATGCCAGGAAAGCCCTCTCTACCTCAAAGCAGTCCCTGTTCAAGCC 13141277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 CGGGACAACTTCACATGCCAGGAAAGCCCTCTCTACCTCAAAGCAGTCCCTGTTCAAGCC 3300

 13141278 CCTACCCCCAGCTCCTCTCTCTGTGAAACCACAGCCATCAGTGAAGGGGGCAGTTGCACC 13141337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 CCTACCCCCAGCTCCTCTCTCTGTGAAACCACAGCCATCAGTGAAGGGGGCAGTTGCACC 3360

 13141338 TCAGCACCCCTGGCAGAGGGCACGGCATGTGCAAAGGCCCCAAGGGAGCAGTGTGCCTGG 13141397
          |||||||||| |||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TCAGCACCCC-GGCAGAGGGCACGGCATCTGCAAAGGCCCCAAGGGAGCAGTGTGCCTGG 3419

 13141398 TGTGATCCAGGAACAAGGAATCAGGGTGGCTGGAAC 13141433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3420 TGTGATCCAGGAACAAGGAATCAGGGTGGCTGGAAC 3455

EXCISED REGION

 13142583 AGAGGGAGGCTGCTGAGGGGAGTGTGGATTTTCTGCTAAGCGCAGCGAGGAGCCATGGGA 13142642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3456 AGAGGGAGGCTGCTGAGGGGAGTGTGGATTTTCTGCTAAGCGCAGCGAGGAGCCATGGGA 3515

 13142643 GGGCTTCAAGCCTGACAGTGACACGATGCGACTTCTGTTTTTAAAAGCACCCTTCTAGGC 13142702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3516 GGGCTTCAAGCCTGACAGTGACACGATGCGACTTCTGTTTTTAAAAGCACCCTTCTAGGC 3575

 13142703 TGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCA 13142762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3576 TGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCA 3635

 13142763 TGAGGTCAGAAGATTGAGACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAA 13142822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3636 TGAGGTCAGAAGATTGAGACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAA 3695

 13142823 TACAAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGGGCGTCTCCAATGAGCCGAGATTGAGCCACTG 13142882
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3696 TACAAAAAATTAGCCGGGCATGGTGGCGGGCGTCTCCAATGAGCCGAGATTGAGCCACTG 3755

 13142883 CACTCCAGCCTGGGAGACAGGGTGAGATTCCATCTCC------AAAAAAAAAAAAAATGC 13142936
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||
     3756 CACTCCAGCCTGGGAGACAGGGTGAGATTCCATCTCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATGC 3815

 13142937 ACCCTTCTACTGTTGAGAGGGCAGAAAGGAACAGAAAGGAAACAAGGAGGTCTGGGAAGG 13142996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3816 ACCCTTCTACTGTTGAGAGGGCAGAAAGGAACAGAAAGGAAACAAGGAGGTCTGGGAAGG 3875

 13142997 CCCCGGGAAGATGAGCGATGGTGGTGCCTGGCTAGATGGTGGGCTGGCAGGGAGAGGTGC 13143056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3876 CCCCGGGAAGATGAGCGATGGTGGTGCCTGGCTAGATGGTGGGCTGGCAGGGAGAGGTGC 3935

 13143057 TCAGGCCCAAGTCTGTCTGGAGGGAGCTCCCGGTTTCCACGACAGATTGCAGTGGGTGGG 13143116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3936 TCAGGCCCAAGTCTGTCTGGAGGGAGCTCCCGGTTTCCACGACAGATTGCAGTGGGTGGG 3995

 13143117 AGAGGAAGGGGAGTCAGGCTGGGCTGCAGGCGGAAGGGCTGGGAAGAGACTCAGAGTCCT 13143176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3996 AGAGGAAGGGGAGTCAGGCTGGGCTGCAGGCGGAAGGGCTGGGAAGAGACTCAGAGTCCT 4055

 13143177 GTTTTGGCTGTGTCCAGTATGATGTCTGTGGGGCCTCCAGGTAGAAACATGGAGGAGGCA 13143236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4056 GTTTTGGCTGTGTCCAGTATGATGTCTGTGGGGCCTCCAGGTAGAAACATGGAGGAGGCA 4115

 13143237 GCTGGATGGGTAGCAGTGGAGTGGTGAGTGGTACAGGCTGGAGATATAAATTTGGGGCCA 13143296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4116 GCTGGATGGGTAGCAGTGGAGTGGTGAGTGGTACAGGCTGGAGATATAAATTTGGGGCCA 4175

 13143297 TCTTTCAATTTTATTGTTTCAGAGATAAACCCTGATGAAGTCCAGGAATCAATAAACAGA 13143356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4176 TCTTTCAATTTTATTGTTTCAGAGATAAACCCTGATGAAGTCCAGGAATCAATAAACAGA 4235

 13143357 GACTAACACTGGCCTCCTTCCCCATCCAGATCCTGGGAGAGGATTTCACGAGTTAAGTGC 13143416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4236 GACTAACACTGGCCTCCTTCCCCATCCAGATCCTGGGAGAGGATTTCACGAGTTAAGTGC 4295

 13143417 TTTGAAACTGACTCTGGCCTTGCAGGGGTGGGAGGGAGGGTGTGCAGTGAGCCAGGGGCC 13143476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4296 TTTGAAACTGACTCTGGCCTTGCAGGGGTGGGAGGGAGGGTGTGCAGTGAGCCAGGGGCC 4355

 13143477 CACTCATGAGCCATCGATTAATAAACTCTGCCCGCTCATGCCTGTAATCTCAGCACTTTG 13143536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4356 CACTCATGAGCCATCGATTAATAAACTCTGCCCGCTCATGCCTGTAATCTCAGCACTTTG 4415

 13143537 GGAGGCTGAGGCAAGTGGATCGCTTGAGCCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAATGTG 13143596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4416 GGAGGCTGAGGCAAGTGGATCGCTTGAGCCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAATGTG 4475

 13143597 GCGAGACCCTGTCTCTACAAAAAATGCAAAAATTAGTCAGGCATGGTGATGTGCATCTGT 13143656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4476 GCGAGACCCTGTCTCTACAAAAAATGCAAAAATTAGTCAGGCATGGTGATGTGCATCTGT 4535

 13143657 AGTCCTGGCTACTCAGGAGGCTGAGGTGGAAGGATTGCTTGAGCCCAGGAGATCAATGAT 13143716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4536 AGTCCTGGCTACTCAGGAGGCTGAGGTGGAAGGATTGCTTGAGCCCAGGAGATCAATGAT 4595

 13143717 GGAGCCCAGGAGTCAGTGATGGAGCCACTGACTCCAGCCTGGGTGATGGAGCAAGAACTT 13143776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4596 GGAGCCCAGGAGTCAGTGATGGAGCCACTGACTCCAGCCTGGGTGATGGAGCAAGAACTT 4655

 13143777 GTCTCAAAATAATAATAATAATAATAAATAACCTCTGCCTTCCATGCGAACAAACACCCA 13143836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4656 GTCTCAAAATAATAATAATAATAATAAATAACCTCTGCCTTCCATGCGAACAAACACCCA 4715

 13143837 TCCTAGAGCCTGAGACTGGGATGGGCTGGGGAGCGGAGGCCTGGGCCCAGCCCCATGTTG 13143896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4716 TCCTAGAGCCTGAGACTGGGATGGGCTGGGGAGCGGAGGCCTGGGCCCAGCCCCATGTTG 4775

 13143897 GGGCTGCCGGGGTTGGTGTTGGTGGGGGGCTGGATTAGAGGCTGGATTTCCTCACCCGTG 13143956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4776 GGGCTGCCGGGGTTGGTGTTGGTGGGGGGCTGGATTAGAGGCTGGATTTCCTCACCCGTG 4835

 13143957 TGGTTTGGGCCCATGGTTTCCTTCTCTGAGCTTCTGTTTGCTCATCTGAGTAATAGGCGT 13144016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4836 TGGTTTGGGCCCATGGTTTCCTTCTCTGAGCTTCTGTTTGCTCATCTGAGTAATAGGCGT 4895

 13144017 GAAAACCTGTGCTTCACGGGGGTCTGGCAGGAGGAAAGGAGCAGGTGTGAGCCCATGGTT 13144076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4896 GAAAACCTGTGCTTCACGGGGGTCTGGCAGGAGGAAAGGAGCAGGTGTGAGCCCATGGTT 4955

 13144077 CTCCACAGCACTGTCCTTCCCCGGTCGGGTGGGGATTGGGGATTTGAAGATATTTATTGG 13144136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4956 CTCCACAGCACTGTCCTTCCCCGGTCGGGTGGGGATTGGGGATTTGAAGATATTTATTGG 5015

 13144137 TAACCACGGAGCTCCCCTCACGTCACATGCTCCCACTGTCAACTGCAGGCCACAGGTCCC 13144196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5016 TAACCACGGAGCTCCCCTCACGTCACATGCTCCCACTGTCAACTGCAGGCCACAGGTCCC 5075

 13144197 ACCCTCCAGGCCTTTGCATGTGCAGCCTTCCCTGCTTGGATGCCCTCCCTGGCACTCCAC 13144256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5076 ACCCTCCAGGCCTTTGCATGTGCAGCCTTCCCTGCTTGGATGCCCTCCCTGGCACTCCAC 5135

 13144257 TGTCAGCAGACTTGCTTGCTTGCCACTAAAATGTAAGCTCCAGGAGGCGGGTACTGAGCA 13144316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5136 TGTCAGCAGACTTGCTTGCTTGCCACTAAAATGTAAGCTCCAGGAGGCGGGTACTGAGCA 5195

 13144317 CAGCTCGTTCACGGCTGCACCCCTGGTGCTGAGGGCTGTGCCTGCCACGGCCCACATATT 13144376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5196 CAGCTCGTTCACGGCTGCACCCCTGGTGCTGAGGGCTGTGCCTGCCACGGCCCACATATT 5255

 13144377 ACTGCATTTAGTCCTTACAACCACCCTGGGAGGTCGGAAGTTTCCAGATGAGAAAACTGA 13144436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5256 ACTGCATTTAGTCCTTACAACCACCCTGGGAGGTCGGAAGTTTCCAGATGAGAAAACTGA 5315

 13144437 GAGCTGAAGACAATTGGCACCTTGTCCAGCTCAGCCCCGTCAGAGGTGGCAGAGAGGGGC 13144496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5316 GAGCTGAAGACAATTGGCACCTTGTCCAGCTCAGCCCCGTCAGAGGTGGCAGAGAGGGGC 5375

 13144497 TCAGATCAGGTGCTTGGTGCCCCCCTACCTCAACCTGTGGGCTGGATGTCGGAAGGGACT 13144556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5376 TCAGATCAGGTGCTTGGTGCCCCCCTACCTCAACCTGTGGGCTGGATGTCGGAAGGGACT 5435

 13144557 CTGACTTCTGCGCAGGGATGCAGCTTGCTCCCATGCTCTGAAGTAGAGCCAGGGCCCCAG 13144616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5436 CTGACTTCTGCGCAGGGATGCAGCTTGCTCCCATGCTCTGAAGTAGAGCCAGGGCCCCAG 5495

 13144617 GGCTCTGCCCCAGCCCCTCCCTGGCCCATGTCCCCGGCTGGCCCCAGGCAGGTCAGTTCA 13144676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5496 GGCTCTGCCCCAGCCCCTCCCTGGCCCATGTCCCCGGCTGGCCCCAGGCAGGTCAGTTCA 5555

 13144677 GGGAAGGGGCCTGCATCGAACTCTCGCCACCTCCCTAAGCCAGAGCTGTCTGCTTGCTCA 13144736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5556 GGGAAGGGGCCTGCATCGAACTCTCGCCACCTCCCTAAGCCAGAGCTGTCTGCTTGCTCA 5615

 13144737 GATATCATCAGCTTCCCATTAAGCAGATCAATAGCTTCCACTGGTTTCCAATTTGTGTTT 13144796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5616 GATATCATCAGCTTCCCATTAAGCAGATCAATAGCTTCCACTGGTTTCCAATTTGTGTTT 5675

 13144797 CCAGAAATTCATCTCCCAGCCACCTTTTTAATTAACCGCCCCCGCCAACACACCCGAGGC 13144856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5676 CCAGAAATTCATCTCCCAGCCACCTTTTTAATTAACCGCCCCCGCCAACACACCCGAGGC 5735

 13144857 ACCAATAGATCACCCTCTCCCCTCCACCTCTGTGGACCACAGACCACTAGCTCCACCAGC 13144916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5736 ACCAATAGATCACCCTCTCCCCTCCACCTCTGTGGACCACAGACCACTAGCTCCACCAGC 5795

 13144917 CTCGGGGGAGTGGCAGGTGTGTTTAAAGCTGTATGATCACCATCCTCAGTCACTGGAA 13144974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5796 CTCGGGGGAGTGGCAGGTGTGTTTAAAGCTGTATGATCACCATCCTCAGTCACTGGAA 5853

Alignment time is 4.36146 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [13131433,13152582] =>     21150 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    2398] =>      2398 nucs 'mol-32-34a8-173918_2398'

Score:        2381
Aligned:      2392        nucs
Identic:      2391 (100%) nucs =>       336 (100%)      2055 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [13142583,13142919] EXCISED REGION [13142920,13144974]
 second seq =>  [       1,     337] EXCISED REGION [     344,    2398]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         6 nucs [338,343]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        14 nucs [338,351] to [344,357]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         3 nucs [338,340] to [341,343]

 13142583 AGAGGGAGGCTGCTGAGGGGAGTGTGGATTTTCTGCTAAGCGCAGCGAGGAGCCATGGGA 13142642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGAGGGAGGCTGCTGAGGGGAGTGTGGATTTTCTGCTAAGCGCAGCGAGGAGCCATGGGA 60

 13142643 GGGCTTCAAGCCTGACAGTGACACGATGCGACTTCTGTTTTTAAAAGCACCCTTCTAGGC 13142702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGGCTTCAAGCCTGACAGTGACACGATGCGACTTCTGTTTTTAAAAGCACCCTTCTAGGC 120

 13142703 TGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCA 13142762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCA 180

 13142763 TGAGGTCAGAAGATTGAGACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAA 13142822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGAGGTCAGAAGATTGAGACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAA 240

 13142823 TACAAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGGGCGTCTCCAATGAGCCGAGATTGAGCCACTG 13142882
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TACAAAAAATTAGCCGGGCATGGTGGCGGGCGTCTCCAATGAGCCGAGATTGAGCCACTG 300

 13142883 CACTCCAGCCTGGGAGACAGGGTGAGATTCCATCTCC 13142919
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CACTCCAGCCTGGGAGACAGGGTGAGATTCCATCTCC 337

EXCISED REGION

 13142920 AAAAAAAAAAAAAATGCACCCTTCTACTGTTGAGAGGGCAGAAAGGAACAGAAAGGAAAC 13142979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      344 AAAAAAAAAAAAAATGCACCCTTCTACTGTTGAGAGGGCAGAAAGGAACAGAAAGGAAAC 403

 13142980 AAGGAGGTCTGGGAAGGCCCCGGGAAGATGAGCGATGGTGGTGCCTGGCTAGATGGTGGG 13143039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      404 AAGGAGGTCTGGGAAGGCCCCGGGAAGATGAGCGATGGTGGTGCCTGGCTAGATGGTGGG 463

 13143040 CTGGCAGGGAGAGGTGCTCAGGCCCAAGTCTGTCTGGAGGGAGCTCCCGGTTTCCACGAC 13143099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      464 CTGGCAGGGAGAGGTGCTCAGGCCCAAGTCTGTCTGGAGGGAGCTCCCGGTTTCCACGAC 523

 13143100 AGATTGCAGTGGGTGGGAGAGGAAGGGGAGTCAGGCTGGGCTGCAGGCGGAAGGGCTGGG 13143159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      524 AGATTGCAGTGGGTGGGAGAGGAAGGGGAGTCAGGCTGGGCTGCAGGCGGAAGGGCTGGG 583

 13143160 AAGAGACTCAGAGTCCTGTTTTGGCTGTGTCCAGTATGATGTCTGTGGGGCCTCCAGGTA 13143219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      584 AAGAGACTCAGAGTCCTGTTTTGGCTGTGTCCAGTATGATGTCTGTGGGGCCTCCAGGTA 643

 13143220 GAAACATGGAGGAGGCAGCTGGATGGGTAGCAGTGGAGTGGTGAGTGGTACAGGCTGGAG 13143279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      644 GAAACATGGAGGAGGCAGCTGGATGGGTAGCAGTGGAGTGGTGAGTGGTACAGGCTGGAG 703

 13143280 ATATAAATTTGGGGCCATCTTTCAATTTTATTGTTTCAGAGATAAACCCTGATGAAGTCC 13143339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      704 ATATAAATTTGGGGCCATCTTTCAATTTTATTGTTTCAGAGATAAACCCTGATGAAGTCC 763

 13143340 AGGAATCAATAAACAGAGACTAACACTGGCCTCCTTCCCCATCCAGATCCTGGGAGAGGA 13143399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      764 AGGAATCAATAAACAGAGACTAACACTGGCCTCCTTCCCCATCCAGATCCTGGGAGAGGA 823

 13143400 TTTCACGAGTTAAGTGCTTTGAAACTGACTCTGGCCTTGCAGGGGTGGGAGGGAGGGTGT 13143459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      824 TTTCACGAGTTAAGTGCTTTGAAACTGACTCTGGCCTTGCAGGGGTGGGAGGGAGGGTGT 883

 13143460 GCAGTGAGCCAGGGGCCCACTCATGAGCCATCGATTAATAAACTCTGCCCGCTCATGCCT 13143519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      884 GCAGTGAGCCAGGGGCCCACTCATGAGCCATCGATTAATAAACTCTGCCCGCTCATGCCT 943

 13143520 GTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAAGTGGATCGCTTGAGCCCAGGAGTTTGAGA 13143579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      944 GTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAAGTGGATCGCTTGAGCCCAGGAGTTTGAGA 1003

 13143580 CCAGCCTGGGCAATGTGGCGAGACCCTGTCTCTACAAAAAATGCAAAAATTAGTCAGGCA 13143639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1004 CCAGCCTGGGCAATGTGGCGAGACCCTGTCTCTACAAAAAATGCAAAAATTAGTCAGGCA 1063

 13143640 TGGTGATGTGCATCTGTAGTCCTGGCTACTCAGGAGGCTGAGGTGGAAGGATTGCTTGAG 13143699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1064 TGGTGATGTGCATCTGTAGTCCTGGCTACTCAGGAGGCTGAGGTGGAAGGATTGCTTGAG 1123

 13143700 CCCAGGAGATCAATGATGGAGCCCAGGAGTCAGTGATGGAGCCACTGACTCCAGCCTGGG 13143759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1124 CCCAGGAGATCAATGATGGAGCCCAGGAGTCAGTGATGGAGCCACTGACTCCAGCCTGGG 1183

 13143760 TGATGGAGCAAGAACTTGTCTCAAAATAATAATAATAATAATAAATAACCTCTGCCTTCC 13143819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1184 TGATGGAGCAAGAACTTGTCTCAAAATAATAATAATAATAATAAATAACCTCTGCCTTCC 1243

 13143820 ATGCGAACAAACACCCATCCTAGAGCCTGAGACTGGGATGGGCTGGGGAGCGGAGGCCTG 13143879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1244 ATGCGAACAAACACCCATCCTAGAGCCTGAGACTGGGATGGGCTGGGGAGCGGAGGCCTG 1303

 13143880 GGCCCAGCCCCATGTTGGGGCTGCCGGGGTTGGTGTTGGTGGGGGGCTGGATTAGAGGCT 13143939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1304 GGCCCAGCCCCATGTTGGGGCTGCCGGGGTTGGTGTTGGTGGGGGGCTGGATTAGAGGCT 1363

 13143940 GGATTTCCTCACCCGTGTGGTTTGGGCCCATGGTTTCCTTCTCTGAGCTTCTGTTTGCTC 13143999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1364 GGATTTCCTCACCCGTGTGGTTTGGGCCCATGGTTTCCTTCTCTGAGCTTCTGTTTGCTC 1423

 13144000 ATCTGAGTAATAGGCGTGAAAACCTGTGCTTCACGGGGGTCTGGCAGGAGGAAAGGAGCA 13144059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1424 ATCTGAGTAATAGGCGTGAAAACCTGTGCTTCACGGGGGTCTGGCAGGAGGAAAGGAGCA 1483

 13144060 GGTGTGAGCCCATGGTTCTCCACAGCACTGTCCTTCCCCGGTCGGGTGGGGATTGGGGAT 13144119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1484 GGTGTGAGCCCATGGTTCTCCACAGCACTGTCCTTCCCCGGTCGGGTGGGGATTGGGGAT 1543

 13144120 TTGAAGATATTTATTGGTAACCACGGAGCTCCCCTCACGTCACATGCTCCCACTGTCAAC 13144179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1544 TTGAAGATATTTATTGGTAACCACGGAGCTCCCCTCACGTCACATGCTCCCACTGTCAAC 1603

 13144180 TGCAGGCCACAGGTCCCACCCTCCAGGCCTTTGCATGTGCAGCCTTCCCTGCTTGGATGC 13144239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1604 TGCAGGCCACAGGTCCCACCCTCCAGGCCTTTGCATGTGCAGCCTTCCCTGCTTGGATGC 1663

 13144240 CCTCCCTGGCACTCCACTGTCAGCAGACTTGCTTGCTTGCCACTAAAATGTAAGCTCCAG 13144299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1664 CCTCCCTGGCACTCCACTGTCAGCAGACTTGCTTGCTTGCCACTAAAATGTAAGCTCCAG 1723

 13144300 GAGGCGGGTACTGAGCACAGCTCGTTCACGGCTGCACCCCTGGTGCTGAGGGCTGTGCCT 13144359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1724 GAGGCGGGTACTGAGCACAGCTCGTTCACGGCTGCACCCCTGGTGCTGAGGGCTGTGCCT 1783

 13144360 GCCACGGCCCACATATTACTGCATTTAGTCCTTACAACCACCCTGGGAGGTCGGAAGTTT 13144419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1784 GCCACGGCCCACATATTACTGCATTTAGTCCTTACAACCACCCTGGGAGGTCGGAAGTTT 1843

 13144420 CCAGATGAGAAAACTGAGAGCTGAAGACAATTGGCACCTTGTCCAGCTCAGCCCCGTCAG 13144479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1844 CCAGATGAGAAAACTGAGAGCTGAAGACAATTGGCACCTTGTCCAGCTCAGCCCCGTCAG 1903

 13144480 AGGTGGCAGAGAGGGGCTCAGATCAGGTGCTTGGTGCCCCCCTACCTCAACCTGTGGGCT 13144539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1904 AGGTGGCAGAGAGGGGCTCAGATCAGGTGCTTGGTGCCCCCCTACCTCAACCTGTGGGCT 1963

 13144540 GGATGTCGGAAGGGACTCTGACTTCTGCGCAGGGATGCAGCTTGCTCCCATGCTCTGAAG 13144599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1964 GGATGTCGGAAGGGACTCTGACTTCTGCGCAGGGATGCAGCTTGCTCCCATGCTCTGAAG 2023

 13144600 TAGAGCCAGGGCCCCAGGGCTCTGCCCCAGCCCCTCCCTGGCCCATGTCCCCGGCTGGCC 13144659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2024 TAGAGCCAGGGCCCCAGGGCTCTGCCCCAGCCCCTCCCTGGCCCATGTCCCCGGCTGGCC 2083

 13144660 CCAGGCAGGTCAGTTCAGGGAAGGGGCCTGCATCGAACTCTCGCCACCTCCCTAAGCCAG 13144719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2084 CCAGGCAGGTCAGTTCAGGGAAGGGGCCTGCATCGAACTCTCGCCACCTCCCTAAGCCAG 2143

 13144720 AGCTGTCTGCTTGCTCAGATATCATCAGCTTCCCATTAAGCAGATCAATAGCTTCCACTG 13144779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2144 AGCTGTCTGCTTGCTCAGATATCATCAGCTTCCCATTAAGCAGATCAATAGCTTCCACTG 2203

 13144780 GTTTCCAATTTGTGTTTCCAGAAATTCATCTCCCAGCCACCTTTTTAATTAACCGCCCCC 13144839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2204 GTTTCCAATTTGTGTTTCCAGAAATTCATCTCCCAGCCACCTTTTTAATTAACCGCCCCC 2263

 13144840 GCCAACACACCCGAGGCACCAATAGATCACCCTCTCCCCTCCACCTCTGTGGACCACAGA 13144899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2264 GCCAACACACCCGAGGCACCAATAGATCACCCTCTCCCCTCCACCTCTGTGGACCACAGA 2323

 13144900 CCACTAGCTCCACCAGCCTCGGGGGAGTGGCAGGTGTGTTTAAAGCTGTATGATCACCAT 13144959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2324 CCACTAGCTCCACCAGCCTCGGGGGAGTGGCAGGTGTGTTTAAAGCTGTATGATCACCAT 2383

 13144960 CCTCAGTCACTGGAA 13144974
          |||||||||||||||
     2384 CCTCAGTCACTGGAA 2398

Alignment time is 1.80606 s

