
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [104268199,104289046] =>     20848 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     9277] =>      9277 nucs 'mol-32-1e66-055038_9277'

Score:        9146
Aligned:      9278        nucs
Identic:      9266 (100%) nucs =>      8584 (100%)       682 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [104269604,104278199] EXCISED REGION [104279047,104279728]
 second seq =>  [        1,     8595] EXCISED REGION [     8596,     9277]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       847 nucs [104278200,104279046]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [104278200,104278200] to [104279047,104279047]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [104278199,104278199] to [104279047,104279047]
 second seq =>         1 nucs [8595,8595] to [8596,8596]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

104269604 GAACCACATATTCCTGTAACTGTAAGGAAGGGTTGTCAAGTTTTTATCTAATATCTTTGC 104269663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GAACCACATATTCCTGTAACTGTAAGGAAGGGTTGTCAAGTTTTTATCTAATATCTTTGC 60

104269664 ATAGGAAAGTTCTATACCAGCTTTACAACTGTCATTCAGCATATTTACATAACTTTGAGC 104269723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATAGGAAAGTTCTATACCAGCTTTACAACTGTCATTCAGCATATTTACATAACTTTGAGC 120

104269724 ATACTATATGGAATCCACTTGGTGGTCCTCTCCCCAACTTTGCATTTTTAATGCCAAAAT 104269783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATACTATATGGAATCCACTTGGTGGTCCTCTCCCCAACTTTGCATTTTTAATGCCAAAAT 180

104269784 TTACAAAGAAAAAAAAGTTAATTTGTAGAAGGTAGATTAGCAATATGTTCAGAGAAAAAG 104269843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTACAAAGAAAAAAAAGTTAATTTGTAGAAGGTAGATTAGCAATATGTTCAGAGAAAAAG 240

104269844 ACCTGGCTTGGATAAAAAGGTACCTCAGAACTCAAGTCTGAATCAACGTAGTTTTGAAAT 104269903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACCTGGCTTGGATAAAAAGGTACCTCAGAACTCAAGTCTGAATCAACGTAGTTTTGAAAT 300

104269904 CAGTAATCACTTCAGTAACTAGGAAAGCAAATTACATATTTTTAAAAATCTGAAATGACC 104269963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CAGTAATCACTTCAGTAACTAGGAAAGCAAATTACATATTTTTAAAAATCTGAAATGACC 360

104269964 AGTAAAAGACTGATGTAACAAAGGATGCTATTAGAGTTTCAGAGACTGTCAAGCTAACAG 104270023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
      361 AGTAAAAGACTGATGTAACAAAGGATGCTATTAGAGTTTCAGAGACTGTCAAGCTAACGG 420

104270024 TTTCAAACACTCCTTAGAAAAATGAAACAGCCAGGCACAGTGACTTACTCCTGTAATCCC 104270083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTTCAAACACTCCTTAGAAAAATGAAACAGCCAGGCACAGTGACTTACTCCTGTAATCCC 480

104270084 AACATTTTGTGAGGCCAAGAAGGGAGAATCAGTTCAGCCCAAGAGTTCAAGATCAGTCTG 104270143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AACATTTTGTGAGGCCAAGAAGGGAGAATCAGTTCAGCCCAAGAGTTCAAGATCAGTCTG 540

104270144 GGTGACATAGGGAGACCCCAACTCTACAAAAAAAATTTAAAAAATTAACCAGACATCGTG 104270203
          |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
      541 GGTGACATAGGGAGACCCCAACTCTACAAAAAAA-TTTAAAAAATTAACCAGACATCGTG 599

104270204 GAGCGCACTTACAGTCCCATCTACTCGGGAGGCTGAGGTAAGAGGATCACTTGCAGCTGG 104270263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      600 GAGCGCACTTACAGTCCCATCTACTCGGGAGGCTGAGGTAAGAGGATCACTTGCAGCTGG 659

104270264 GAGGTCAAGGCTGCAGTGAGCTATGATCACACCACTGCACTCCAGCCTGGGAGACAGTGA 104270323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      660 GAGGTCAAGGCTGCAGTGAGCTATGATCACACCACTGCACTCCAGCCTGGGAGACAGTGA 719

104270324 GACTGACTAAAAAAAAAAGGAAAAGAAATGAAACTCTCAAGGATTTTTTACCTACCGGTT 104270383
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      720 GACTGACTGAAAAAAAAAGGAAAAGAAATGAAACTCTCAAGGATTTTTTACCTACCGGTT 779

104270384 AGGACCAAAAGAATTAAAGTAAACTGGTTTATTCTGACTTAGCTGATCTTTAACAATATA 104270443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||||
      780 AGGACCAAAAGAATTAAAGTAAACTGGTTTATTCTGACTTGGCTGATCTTTAAGAATATA 839

104270444 CATCTGAAACAAATTGCTCTGATTTGGTCAACTGAATCTCTTAACATAGATAAAAACTTT 104270503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 CATCTGAAACAAATTGCTCTGATTTGGTCAACTGAATCTCTTAACATAGATAAAAACTTT 899

104270504 TTAACCAGTGATATTTCTTTCAATTTACATTTTTCTTTTTATACATAATGTGGCAGGAAA 104270563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 TTAACCAGTGATATTTCTTTCAATTTACATTTTTCTTTTTATACATAATGTGGCAGGAAA 959

104270564 TGGTTAATTTAATGGCTATTCAATTACCTAACTTTAGATGTATGTAAAATGCTAATATGC 104270623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 TGGTTAATTTAATGGCTATTCAATTACCTAACTTTAGATGTATGTAAAATGCTAATATGC 1019

104270624 TAATTCCTAGATCCTTAATCTTCTGCAATAAGATTCACACTAGTGACATGTCTTCTGTTT 104270683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 TAATTCCTAGATCCTTAATCTTCTGCAATAAGATTCACACTAGTGACATGTCTTCTGTTT 1079

104270684 ATTATTTTTGTTTTTTTCAAAACTGCATAATTCAAACATTTGAAATGTCCATCTATGACC 104270743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 ATTATTTTTGTTTTTTTCAAAACTGCATAATTCAAACATTTGAAATGTCCATCTATGACC 1139

104270744 TCAAAAGTAAGGATGAAGTAGAAATGTTCACTTGTTTCAAGAGCAAAGAGAAATGAGAGT 104270803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 TCAAAAGTAAGGATGAAGTAGAAATGTTCACTTGTTTCAAGAGCAAAGAGAAATGAGAGT 1199

104270804 ATATGTTACTTACCAAAAATTTACTTATTGTGTGATAAGTAAATGAAAACACCCTAATTG 104270863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 ATATGTTACTTACCAAAAATTTACTTATTGTGTGATAAGTAAATGAAAACACCCTAATTG 1259

104270864 CTCTTCATATTTAGGGGAAGATAGGATATTATATGTTTTATCAGTTAGCTTTGGAATAAT 104270923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 CTCTTCATATTTAGGGGAAGATAGGATATTATATGTTTTATCAGTTAGCTTTGGAATAAT 1319

104270924 TAAAAGTATAGATCAGAAAAATATATAGTTTATTTGTTTGAAATGGATCATCCCTGAATA 104270983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 TAAAAGTATAGATCAGAAAAATATATAGTTTATTTGTTTGAAATGGATCATCCCTGAATA 1379

104270984 TACAGCTAATCTAACATATTTGTGATACACATTAGGTAAAAGATTAGTTGTAAGAAGTAA 104271043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 TACAGCTAATCTAACATATTTGTGATACACATTAGGTAAAAGATTAGTTGTAAGAAGTAA 1439

104271044 TTTGAAAACAGTATCTTATAGGGTTTCAATGAGATTTTTCTGAAAAGGATATTTTATGCA 104271103
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 TTTGAAAACAGTATCTTATAGGGTTTCAACGAGATTTTTCTGAAAAGGATATTTTATGCA 1499

104271104 TGGACTTGAGCAAACCTGGATACAAAGATGTCAGATTTTATGTCTTTACTAGAGAAAATG 104271163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 TGGACTTGAGCAAACCTGGATACAAAGATGTCAGATTTTATGTCTTTACTAGAGAAAATG 1559

104271164 ATGCCAGTTCAGAAAGGACAGAATATTTTTCTTTAGGATATATTCCTTATTCTCAGAATA 104271223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 ATGCCAGTTCAGAAAGGACAGAATATTTTTCTTTAGGATATATTCCTTATTCTCAGAATA 1619

104271224 AAACAAGAATCTGGGGAATATCTAAACATATTGAAAAAAACTCTTCCTTTTACAGTTTTT 104271283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 AAACAAGAATCTGGGGAATATCTAAACATATTGAAAAAAACTCTTCCTTTTACAGTTTTT 1679

104271284 GATCTCTGTGAGAACTATCTTACTATTGTTTTTAGTAGCCACAGAAACCAATGTTCCCTT 104271343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 GATCTCTGTGAGAACTATCTTACTATTGTTTTTAGTAGCCACAGAAACCAATGTTCCCTT 1739

104271344 TTTCTTCTTATCTCTTCTCTTAAAAATAACAAAAGACACAACATTAACTTTTGTGGATCA 104271403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 TTTCTTCTTATCTCTTCTCTTAAAAATAACAAAAGACACAACATTAACTTTTGTGGATCA 1799

104271404 TATTTGATTTACCTCTTTCCAGATATCAAAAGGTTGTGAATTTATTTTTTAAATCAATTA 104271463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 TATTTGATTTACCTCTTTCCAGATATCAAAAGGTTGTGAATTTATTTTTTAAATCAATTA 1859

104271464 AAACTACATGAAAATCCTATCCCTTCTGTTCATATGGTGAGGAATGCCTAAAGCCAAAGG 104271523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 AAACTACATGAAAATCCTATCCCTTCTGTTCATATGGTGAGGAATGCCTAAAGCCAAAGG 1919

104271524 ATATGGGGAATATTAGATATGCTTTTCTAAGGAAAAAATAGTAAGACAAAATGGCCTGCC 104271583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     1920 ATATGGGGAATATTAGATATGCTTTTCTAAGGAAAAAATAGTGAGACAAAATGGCCTGCC 1979

104271584 TGAAGTTAACAGTTTATAGATTGCAAAAAGGCACAGACAATTAAAAGATGGAGCTACTTA 104271643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 TGAAGTTAACAGTTTATAGATTGCAAAAAGGCACAGACAATTAAAAGATGGAGCTACTTA 2039

104271644 GGGCAAATTACTTGCAATCAAGCTGCAGCTAAATGAGCTTCTTGATGAGGAAGCCAAATT 104271703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 GGGCAAATTACTTGCAATCAAGCTGCAGCTAAATGAGCTTCTTGATGAGGAAGCCAAATT 2099

104271704 TATGTTGTTTCAAACCAGGGAGAAACATTAAAGAAGTTGAAAGGTGAGCAAAATGTTAGT 104271763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 TATGTTGTTTCAAACCAGGGAGAAACATTAAAGAAGTTGAAAGGTGAGCAAAATGTTAGT 2159

104271764 ACAATTGGATCCAGATAGGTTGATAAGGGAAGCTGTAGAGGCAATTAAAACGCTGCCTCT 104271823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 ACAATTGGATCCAGATAGGTTGATAAGGGAAGCTGTAGAGGCAATTAAAACGCTGCCTCT 2219

104271824 GAAATACATACACATAGGTACAGACACAGACATACACGCACACAAACCAATACACACAAA 104271883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 GAAATACATACACATAGGTACAGACACAGACATACACGCACACAAACCAATACACACAAA 2279

104271884 ACATCCTCAAATAGAAGACTGTATGATTACATACACCTTCAGCCTTCATTTATGTTTTAT 104271943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 ACATCCTCAAATAGAAGACTGTATGATTACATACACCTTCAGCCTTCATTTATGTTTTAT 2339

104271944 GTGGATGCCCCTTCTTATCACAAAAACACTGCGGCCTGAGAAGCTCAATCACAGAATATA 104272003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 GTGGATGCCCCTTCTTATCACAAAAACACTGCGGCCTGAGAAGCTCAATCACAGAATATA 2399

104272004 ATCATTTTCCTTTTCAATCTGCAATTTACTACAGACATTTTATTTGAAAATGAGGTATTG 104272063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 ATCATTTTCCTTTTCAATCTGCAATTTACTACAGACATTTTATTTGAAAATGAGGTATTG 2459

104272064 TTTAAACTCTAAACCACAGTGTTTTCATTTTTTCCCCTGCCCTAAATTATCCCTTGGCAG 104272123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 TTTAAACTCTAAACCACAGTGTTTTCATTTTTTCCCCTGCCCTAAATTATCCCTTGGCAG 2519

104272124 CTCTCTGAGTTGATTTTTAAAGAATATGTTTTATAATGAATTCAGAACTTCCACAAAGCA 104272183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 CTCTCTGAGTTGATTTTTAAAGAATATGTTTTATAATGAATTCAGAACTTCCACAAAGCA 2579

104272184 CAAAAGCCATGTGAAAGCTTCAAATGTGAAATATCACATTTCTTTCTTTGTTGCTCAATA 104272243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 CAAAAGCCATGTGAAAGCTTCAAATGTGAAATATCACATTTCTTTCTTTGTTGCTCAATA 2639

104272244 TCCATTTTTGCATTCAGGGCTGTATGCATCAATTTCACTGAAAGCAGGGTATTGTCTACA 104272303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 TCCATTTTTGCATTCAGGGCTGTATGCATCAATTTCACTGAAAGCAGGGTATTGTCTACA 2699

104272304 TCTATCTGTCTGAATGAGATGACTTTCAGGACTTTGTAATTTTGAAAAGGTCTTCAAGCC 104272363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 TCTATCTGTCTGAATGAGATGACTTTCAGGACTTTGTAATTTTGAAAAGGTCTTCAAGCC 2759

104272364 AGGCTATCCTTCATCCCATTTCTGTTGCATTGGAATGTTAGACATAACAAGGTAGACAAA 104272423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 AGGCTATCCTTCATCCCATTTCTGTTGCATTGGAATGTTAGACATAACAAGGTAGACAAA 2819

104272424 GGAAAGATATAATACAGATCCTTATTGACAGTCAGCAAGTACAAGTATATGTAGAAAGAG 104272483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2820 GGAAAGATATAATACAGATCCTTATTGACAGTCAGCAAGTACAAGTATATGTAGAAAGAG 2879

104272484 ATAATTTTCTGCTGGCATTTTCCCTTATCTCGATTCTCTTATCCTTTCATGCATTATGTT 104272543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2880 ATAATTTTCTGCTGGCATTTTCCCTTATCTCGATTCTCTTATCCTTTCATGCATTATGTT 2939

104272544 TTGCATGAACAGAATCGGAAAAAAATTGACAGCCTTGTATGAAGTACACCAAGAAAGCTT 104272603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2940 TTGCATGAACAGAATCGGAAAAAAATTGACAGCCTTGTATGAAGTACACCAAGAAAGCTT 2999

104272604 TCTCCTTCAAAGATCTTTTTAGGATATAAAAACTCTCTAAGATTTAGTAACTAAGAAGGA 104272663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3000 TCTCCTTCAAAGATCTTTTTAGGATATAAAAACTCTCTAAGATTTAGTAACTAAGAAGGA 3059

104272664 CAATAAATGTCCATACTTAGAGCAACAAATAAAAATGTGATTCTGATGCTGACATAGTTT 104272723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3060 CAATAAATGTCCATACTTAGAGCAACAAATAAAAATGTGATTCTGATGCTGACATAGTTT 3119

104272724 TTTTATAGTTGAAATGTAACCTTGTCAACACTGCCTGGCCAGTTCTGCCATTGAAAAATG 104272783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3120 TTTTATAGTTGAAATGTAACCTTGTCAACACTGCCTGGCCAGTTCTGCCATTGAAAAATG 3179

104272784 GCCCAGGAAAATGCCCAAATGCCAACAGTGGTAGTTATGGATTATTTTCCTATCTGATAT 104272843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3180 GCCCAGGAAAATGCCCAAATGCCAACAGTGGTAGTTATGGATTATTTTCCTATCTGATAT 3239

104272844 TATTCAGCTACATCTGCTGTTTAGTGGAAGCTAAACAGAAAATACTCCATAGGATACTGA 104272903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3240 TATTCAGCTACATCTGCTGTTTAGTGGAAGCTAAACAGAAAATACTCCATAGGATACTGA 3299

104272904 GAAAAAATTGGGCATTGAAAATATATTTGTGTCTTTTTTTTCTTCCTGTGAGTTATAAAT 104272963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3300 GAAAAAATTGGGCATTGAAAATATATTTGTGTCTTTTTTTTCTTCCTGTGAGTTATAAAT 3359

104272964 TTTAAATGGCATATGTAAAGCATTTAGAAAAGGTGTCTCAATATATTGAACATTGGCCAA 104273023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3360 TTTAAATGGCATATGTAAAGCATTTAGAAAAGGTGTCTCAATATATTGAACATTGGCCAA 3419

104273024 AGAGGCCTCCAACAGCTAAAGTCATATCACCTGAACGTGATGGGATTTCCAAATTCCCCC 104273083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3420 AGAGGCCTCCAACAGCTAAAGTCATATCACCTGAACGTGATGGGATTTCCAAATTCCCCC 3479

104273084 TAAATCAGTCTGGTTAGGAGAGCTTAAAGGAAATAGGAATATACATACACAAGAAAAAGT 104273143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3480 TAAATCAGTCTGGTTAGGAGAGCTTAAAGGAAATAGGAATATACATACACAAGAAAAAGT 3539

104273144 TCATTGTTAACCACCCTATTAACTGTTAACTGCATGCCAAAAATTGGGCATAAGAGTGAC 104273203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3540 TCATTGTTAACCACCCTATTAACTGTTAACTGCATGCCAAAAATTGGGCATAAGAGTGAC 3599

104273204 TTAAGTCTTAATGACATTTTCAAATATAAGCTTAATAAGGCAAGCCTGCTTTTAAAGATT 104273263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3600 TTAAGTCTTAATGACATTTTCAAATATAAGCTTAATAAGGCAAGCCTGCTTTTAAAGATT 3659

104273264 AGTGAGAAGTAACTGTATTAGTGAATTTTCATACTGCTATAAAGAAATACCCAAGACTGG 104273323
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3660 AGTGAGAAGTAACTGGATTAGTGAATTTTCATACTGCTATAAAGAAATACCCAAGACTGG 3719

104273324 GTAATTTATGAAGTAAAAGAGGTTTAATGGAATCATGGTTCCACATGGCTGGGGTGGCCT 104273383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3720 GTAATTTATGAAGTAAAAGAGGTTTAATGGAATCATGGTTCCACATGGCTGGGGTGGCCT 3779

104273384 CACAGTCATGACGGAAGGTGAAGGAGGAGCAAAAGCACATCTTACGTGGCAGCAGGCAGG 104273443
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3780 CACAGTCATGACGGAAGGTGAAGGAAGAGCAAAAGCACATCTTACGTGGCAGCAGGCAGG 3839

104273444 AGAGCGTGTACAGGGAAACTACCCTTTATAGAAACCATTGGATCTCGTGAGACTTATTCA 104273503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3840 AGAGCGTGTACAGGGAAACTACCCTTTATAGAAACCATTGGATCTCGTGAGACTTATTCA 3899

104273504 CTATATCACAAGAACAGCATGGGAAAAACCCATCCTCATGATTCAGTTGCCTCCCACTAG 104273563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3900 CTATATCACAAGAACAGCATGGGAAAAACCCATCCTCATGATTCAGTTGCCTCCCACTAG 3959

104273564 GTCCCTCCCATGACACATGGAGTATGTGGGAGTTACAATTCAAGATGAGATTTGGGTGGA 104273623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3960 GTCCCTCCCATGACACATGGAGTATGTGGGAGTTACAATTCAAGATGAGATTTGGGTGGA 4019

104273624 GACACAGCCAAACCATATCTGTACCTGACCAAGTACCTCTCAAGTTTGAGGCAGCTACAT 104273683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4020 GACACAGCCAAACCATATCTGTACCTGACCAAGTACCTCTCAAGTTTGAGGCAGCTACAT 4079

104273684 AACCAACAGATGAAGTCTTAGTAAAAGCACAGAACTAGAGTTCAAGTGACCTGGTTTGCA 104273743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4080 AACCAACAGATGAAGTCTTAGTAAAAGCACAGAACTAGAGTTCAAGTGACCTGGTTTGCA 4139

104273744 CCCTGAGTGCCATCATCATCAAGCATGAAAACCTTATGCAGATCAGTTCACCTTTTTTGG 104273803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4140 CCCTGAGTGCCATCATCATCAAGCATGAAAACCTTATGCAGATCAGTTCACCTTTTTTGG 4199

104273804 GATGCTTCCTCATTTATAAAATGAAAGATTTTAACTGAGTAATTGCTCAGATTCCTAGAA 104273863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4200 GATGCTTCCTCATTTATAAAATGAAAGATTTTAACTGAGTAATTGCTCAGATTCCTAGAA 4259

104273864 CTGTGTAACTCTAAAAAGATTTCCATAACCCTAGGTTATTTTTTCCTGGTTAACAAATTT 104273923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4260 CTGTGTAACTCTAAAAAGATTTCCATAACCCTAGGTTATTTTTTCCTGGTTAACAAATTT 4319

104273924 TTTGGTTAGACAAAAACAACAATAGCTTATACATCATGTAAATCGTTGTTTCTTTGTGCA 104273983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4320 TTTGGTTAGACAAAAACAACAATAGCTTATACATCATGTAAATCGTTGTTTCTTTGTGCA 4379

104273984 GAATTAGGGGCTATATCTACCATAGGAGTAGTTGGCTCAGTGGCTAGGCCCTTGAGTCTG 104274043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4380 GAATTAGGGGCTATATCTACCATAGGAGTAGTTGGCTCAGTGGCTAGGCCCTTGAGTCTG 4439

104274044 GAGTAAAAGGCTACAGCCGAGACAGTCTCATAGTCATGTGATAAATTGCTTCTGTCTTCT 104274103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4440 GAGTAAAAGGCTACAGCCGAGACAGTCTCATAGTCATGTGATAAATTGCTTCTGTCTTCT 4499

104274104 ATACTATTAAAGCTCTTAGAAGTTATGGCAAACTACTTATTTCACTCAGGTTTGTATTAT 104274163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4500 ATACTATTAAAGCTCTTAGAAGTTATGGCAAACTACTTATTTCACTCAGGTTTGTATTAT 4559

104274164 ATTATGTCAAAACATATCTATCCTTCTCCTATCACTGTGCTACTATAATGTACTTCTTTA 104274223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4560 ATTATGTCAAAACATATCTATCCTTCTCCTATCACTGTGCTACTATAATGTACTTCTTTA 4619

104274224 GGGACATGACCATGCCGTTTAACTTACATCTCTCTCGCTGTACCAAATAAGACTCCCCTC 104274283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4620 GGGACATGACCATGCCGTTTAACTTACATCTCTCTCGCTGTACCAAATAAGACTCCCCTC 4679

104274284 ACAATTTACTCAGTAAATGTTTGTGGAGTAAGATTTTCACTGGCCTCATTTCTCCAACTA 104274343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4680 ACAATTTACTCAGTAAATGTTTGTGGAGTAAGATTTTCACTGGCCTCATTTCTCCAACTA 4739

104274344 TCCTGCTTGGCAACTAATCCACAGTCATATAGGCCTCTTTTCACTTCTTTTAGTTTCTTA 104274403
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4740 TCCTGCTTGGCAGCTAATCCACAGTCATATAGGCCTCTTTTCACTTCTTTTAGTTTCTTA 4799

104274404 AATTTGGGCCTCCGCACCCCCACTCCAGCTCATGCTATTTATTCTACTTTTAATGATATA 104274463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4800 AATTTGGGCCTCCGCACCCCCACTCCAGCTCATGCTATTTATTCTACTTTTAATGATATA 4859

104274464 CTGCCTGCTCGATTCCCATTCCCAGCTCCAACATTCACACTCTTCATCTTGCCCATCTTT 104274523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4860 CTGCCTGCTCGATTCCCATTCCCAGCTCCAACATTCACACTCTTCATCTTGCCCATCTTT 4919

104274524 CAGAACTCAGCTTCACTATCTCTTAGGTGACCTTGAATAAGATCTTAATACTTTTCCTTT 104274583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4920 CAGAACTCAGCTTCACTATCTCTTAGGTGACCTTGAATAAGATCTTAATACTTTTCCTTT 4979

104274584 CCAACAAATAACCCAGTTTTAATTATCTAATTGATTATGATATCACTTATTCATCACTGT 104274643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4980 CCAACAAATAACCCAGTTTTAATTATCTAATTGATTATGATATCACTTATTCATCACTGT 5039

104274644 GTATCAACTCATCCCAGATTCAATGGCTTCAAACAGAGAAACAAAAAAATACATTTTACT 104274703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5040 GTATCAACTCATCCCAGATTCAATGGCTTCAAACAGAGAAACAAAAAAATACATTTTACT 5099

104274704 GCTTACATTCAGTAGGTTGGCCAGGTATTACATCAGCTGCTCTCTCCTGGGTTCACTCAA 104274763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5100 GCTTACATTCAGTAGGTTGGCCAGGTATTACATCAGCTGCTCTCTCCTGGGTTCACTCAA 5159

104274764 CTGGAAGGATGAAAATGGCTTTATTCACATGTCTGGCAGTTGGTGCTTTTGCTGATTGAT 104274823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5160 CTGGAAGGATGAAAATGGCTTTATTCACATGTCTGGCAGTTGGTGCTTTTGCTGATTGAT 5219

104274824 GGCCTCTCATTCTCCAGTACGTTAGACAAGTTTTCTTATGTTGTAGTCTCAGGACATTAT 104274883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5220 GGCCTCTCATTCTCCAGTACGTTAGACAAGTTTTCTTATGTTGTAGTCTCAGGACATTAT 5279

104274884 TACAACTGGCAAAAACAGAAACTGTAAGGTGTCTAAAACCTAGGATCCAGAATTTACACA 104274943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5280 TACAACTGGCAAAAACAGAAACTGTAAGGTGTCTAAAACCTAGGATCCAGAATTTACACA 5339

104274944 CTAAGCTTCTGTCTCATTCTATTAATTAAAGCAATTTATAAGGCCAGCCCAAATTCAAGA 104275003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5340 CTAAGCTTCTGTCTCATTCTATTAATTAAAGCAATTTATAAGGCCAGCCCAAATTCAAGA 5399

104275004 GAGTGGAGGAACAGACTCCACTTTTTGTTGGAAGGAACAAAAACATTACATTGCTCTGGG 104275063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5400 GAGTGGAGGAACAGACTCCACTTTTTGTTGGAAGGAACAAAAACATTACATTGCTCTGGG 5459

104275064 ACATGGACACAAGGAGGCTTGACTCATGGGGACCATATTATAACTCTCTACTACATTATG 104275123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5460 ACATGGACACAAGGAGGCTTGACTCATGGGGACCATATTATAACTCTCTACTACATTATG 5519

104275124 TAAAATTACTAATTTAATTTCTATATTCCCCACTAGACTATCTGTGTATATGAATAGGGA 104275183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5520 TAAAATTACTAATTTAATTTCTATATTCCCCACTAGACTATCTGTGTATATGAATAGGGA 5579

104275184 CCATGCATTTCCTAATTTATGTTATATTGCCAGCATTTAATGCAGTCTTTATATGTGCTA 104275243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5580 CCATGCATTTCCTAATTTATGTTATATTGCCAGCATTTAATGCAGTCTTTATATGTGCTA 5639

104275244 GGCATTAATAAATATTTGTTGAATGAATAATTAAATGGCTAAATTAATAACAGAGTGGAT 104275303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5640 GGCATTAATAAATATTTGTTGAATGAATAATTAAATGGCTAAATTAATAACAGAGTGGAT 5699

104275304 GAATTAACTTGAAAAAAGATTTCATGAACTATCAGCATGAAGATTTATCCACAAAAATAG 104275363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5700 GAATTAACTTGAAAAAAGATTTCATGAACTATCAGCATGAAGATTTATCCACAAAAATAG 5759

104275364 AGAAGTGTTTCTTTTTTTGACCACATGAAAAACTAGAAACCATGTAAGCAGAAGTTATCT 104275423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5760 AGAAGTGTTTCTTTTTTTGACCACATGAAAAACTAGAAACCATGTAAGCAGAAGTTATCT 5819

104275424 AAGTTAACTTTTATTGAGTAACTGGACACAGAATTCAGGTGCTCTGTTGTTTTCTATTGC 104275483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5820 AAGTTAACTTTTATTGAGTAACTGGACACAGAATTCAGGTGCTCTGTTGTTTTCTATTGC 5879

104275484 TGCTATAACAAAACGTCACAAACAGCAAATTACTGCAACATGAATTTATTAGCTCACAGT 104275543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5880 TGCTATAACAAAACGTCACAAACAGCAAATTACTGCAACATGAATTTATTAGCTCACAGT 5939

104275544 TCTACCAGTCAGAATTCTGGTGTGGTTTAATTTAGTTCTCTGCTCAGGTTTCTCACAAGC 104275603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5940 TCTACCAGTCAGAATTCTGGTGTGGTTTAATTTAGTTCTCTGCTCAGGTTTCTCACAAGC 5999

104275604 CAGAAATTAAAATAGCAACTGACTAGGCTCTTATCTGTAAGATCTGATGTCGAAACAATT 104275663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     6000 CAGAAATTAAAATAGCAACTGACTAGGCTCTTATCTGTAAGATCTGATGTTGAAACAATT 6059

104275664 TCCAAGCTGAATGATGTTTTTAGTAGAACTTAGCTCCTTGCAGTTGCAGAACTAAGGTTC 104275723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6060 TCCAAGCTGAATGATGTTTTTAGTAGAACTTAGCTCCTTGCAGTTGCAGAACTAAGGTTC 6119

104275724 TCCCTTCTTGCTGGCTGGTGGCTGGGAGTCACCCTCAGCTCCTCCAGTGAGCCCACATTC 104275783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6120 TCCCTTCTTGCTGGCTGGTGGCTGGGAGTCACCCTCAGCTCCTCCAGTGAGCCCACATTC 6179

104275784 TTTCCGCATGTCTTCCTTTATCTTCAAGCCAGCAACAATGCATCGGGCCCTTCTCTGCTC 104275843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6180 TTTCCGCATGTCTTCCTTTATCTTCAAGCCAGCAACAATGCATCGGGCCCTTCTCTGCTC 6239

104275844 AGATCTCCCTGACTTCCTCTGCTGTCCTCACCAAGGAGAATACTTTGATTTAAGGACTCC 104275903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6240 AGATCTCCCTGACTTCCTCTGCTGTCCTCACCAAGGAGAATACTTTGATTTAAGGACTCC 6299

104275904 TGTAATTACATTGGCCCACCTGGGAAATCTAGGCTAATCTCTGTATCTTAAACTCAATTG 104275963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6300 TGTAATTACATTGGCCCACCTGGGAAATCTAGGCTAATCTCTGTATCTTAAACTCAATTG 6359

104275964 ATTCTTAACCTTAATTACCTCTGCAATGTCATTTTGCCATGTAATATAACATATTCACAG 104276023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6360 ATTCTTAACCTTAATTACCTCTGCAATGTCATTTTGCCATGTAATATAACATATTCACAG 6419

104276024 GTGTAACACCAGGGAGCAAAGGTCAGAGAGCCAAAATTCTGTCTACCGTTGATACTCAAC 104276083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6420 GTGTAACACCAGGGAGCAAAGGTCAGAGAGCCAAAATTCTGTCTACCGTTGATACTCAAC 6479

104276084 AGCAATAAACATTCAGCTGTAGGAAACCTGAAGTCTCCAGAGAGATAATTTAGATAAAAT 104276143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6480 AGCAATAAACATTCAGCTGTAGGAAACCTGAAGTCTCCAGAGAGATAATTTAGATAAAAT 6539

104276144 ACAGCCTTAAGTATAGGACAGACCTGCTTAGAATCAGGAGTCTAAATTTTTTTGGTTACA 104276203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6540 ACAGCCTTAAGTATAGGACAGACCTGCTTAGAATCAGGAGTCTAAATTTTTTTGGTTACA 6599

104276204 CAAATATAGCCAATTCTCTTTACCATTATAAATCTCAGCTTTATTTTTTTAATCTGAAAA 104276263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6600 CAAATATAGCCAATTCTCTTTACCATTATAAATCTCAGCTTTATTTTTTTAATCTGAAAA 6659

104276264 ATGCAAATATTGCTGCATCTCTATCATGTTGCTTTTAACATTAATATAAGAAACATACAT 104276323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6660 ATGCAAATATTGCTGCATCTCTATCATGTTGCTTTTAACATTAATATAAGAAACATACAT 6719

104276324 ATAATCAGCAAAAAAGATTTTTAAAACCTTACATATCAAAGATTACAAAAGAGAATTAGG 104276383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6720 ATAATCAGCAAAAAAGATTTTTAAAACCTTACATATCAAAGATTACAAAAGAGAATTAGG 6779

104276384 AGAAAGAACAAAGTCTAAAGATGTTGAGAGAGTACCCTAAAGTTATCTATTTATTTATTC 104276443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6780 AGAAAGAACAAAGTCTAAAGATGTTGAGAGAGTACCCTAAAGTTATCTATTTATTTATTC 6839

104276444 ACTTGTTCAAAAATATTTAGGACTAGGCCAGCCACAGTGGCTCATGCCTGTAATTCCAGC 104276503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6840 ACTTGTTCAAAAATATTTAGGACTAGGCCAGCCACAGTGGCTCATGCCTGTAATTCCAGC 6899

104276504 ACTTTGGGGGGCCAAGGTGGGTGGATCACTTGAAGTCAGGAGTTTGAGATCAACCTGGCC 104276563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6900 ACTTTGGGGGGCCAAGGTGGGTGGATCACTTGAAGTCAGGAGTTTGAGATCAACCTGGCC 6959

104276564 AACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCACGT 104276623
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     6960 AACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACGAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCACGT 7019

104276624 GCCTGTAATCCCAGCTATTTGGGAGACTGCATCAGGAAAATTGCTTGAATCCAGGAGGCG 104276683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7020 GCCTGTAATCCCAGCTATTTGGGAGACTGCATCAGGAAAATTGCTTGAATCCAGGAGGCG 7079

104276684 GAGGGTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGACAACAGAGCGAGACT 104276743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7080 GAGGGTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGACAACAGAGCGAGACT 7139

104276744 CCGTCTCAAAAATATATATATATATATATATATTTAGGACTAGGTTTCGATGAAATTAAC 104276803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7140 CCGTCTCAAAAATATATATATATATATATATATTTAGGACTAGGTTTCGATGAAATTAAC 7199

104276804 CTAACAACCAACACTTAATCCTTTGAGAAACTACTTTCTCAACTGCATGGAACTTACCTA 104276863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7200 CTAACAACCAACACTTAATCCTTTGAGAAACTACTTTCTCAACTGCATGGAACTTACCTA 7259

104276864 GGATAAAAATTAAAATTTAGGAGAAAGTGATTTCAGAGCTCCAAATCTGTCCTGTCTGCC 104276923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7260 GGATAAAAATTAAAATTTAGGAGAAAGTGATTTCAGAGCTCCAAATCTGTCCTGTCTGCC 7319

104276924 CTCATTTCCATAATCTGCTTTGACTGCCATTTTGTATATCCCCTATAATTTAACCTACTT 104276983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7320 CTCATTTCCATAATCTGCTTTGACTGCCATTTTGTATATCCCCTATAATTTAACCTACTT 7379

104276984 ATTGATCCCATGATCTCTGAAAATATTCTTTTTAATTTAATTTAATTTTTAGTTCTGGGA 104277043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7380 ATTGATCCCATGATCTCTGAAAATATTCTTTTTAATTTAATTTAATTTTTAGTTCTGGGA 7439

104277044 TACATGGGCAGGATATGCAGCCTTGTTATATGGGTAAATGTGTTCCATGGTGGTTTGCTG 104277103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7440 TACATGGGCAGGATATGCAGCCTTGTTATATGGGTAAATGTGTTCCATGGTGGTTTGCTG 7499

104277104 CACCTATCAAACCATCACCTAGGTATTAAGCCCCGCATGCATTAGCTACTCTTTCTGATG 104277163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7500 CACCTATCAAACCATCACCTAGGTATTAAGCCCCGCATGCATTAGCTACTCTTTCTGATG 7559

104277164 CGCTCCCTCCCACCACATCCCCAACCAACGGGCCCCATTATGTGTTGTTCCTTTCTCTGT 104277223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7560 CGCTCCCTCCCACCACATCCCCAACCAACGGGCCCCATTATGTGTTGTTCCTTTCTCTGT 7619

104277224 TTTTATGTGTTCTCATTGTTCAGCTTCCACTTATAAGTGAGAACATGTAGTGTTTAATTT 104277283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7620 TTTTATGTGTTCTCATTGTTCAGCTTCCACTTATAAGTGAGAACATGTAGTGTTTAATTT 7679

104277284 TCTGTTCCTGTGTTAGTTTGCTGAGGATAATGGCTTCCAGCTCCATCCCTTTTCCTGCAA 104277343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7680 TCTGTTCCTGTGTTAGTTTGCTGAGGATAATGGCTTCCAGCTCCATCCCTTTTCCTGCAA 7739

104277344 AGGACATGATCTCATTACTTTTTATGACTGCATAGTGTTCCATGGTGTAAATATATCACA 104277403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7740 AGGACATGATCTCATTACTTTTTATGACTGCATAGTGTTCCATGGTGTAAATATATCACA 7799

104277404 TTTTCATTTTCCAGTCTATCATTGATGGGCATTTGGGTTAATTCCATGTCTTTTCTACAG 104277463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7800 TTTTCATTTTCCAGTCTATCATTGATGGGCATTTGGGTTAATTCCATGTCTTTTCTACAG 7859

104277464 TGAATAGTGCTCCAGTGAACATACATGTGCAGGTATCTTTATAATAGAATGATTTATATT 104277523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7860 TGAATAGTGCTCCAGTGAACATACATGTGCAGGTATCTTTATAATAGAATGATTTATATT 7919

104277524 CTTTTGGGTACATACCCAGTAATGGGATTGCTGGGTCAAATGGTATTTCTGGTTCTAGGT 104277583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7920 CTTTTGGGTACATACCCAGTAATGGGATTGCTGGGTCAAATGGTATTTCTGGTTCTAGGT 7979

104277584 CTTTGAGGAATTGCTACACTGTCTTCCACAAGTAAAACCCAGAACTATAAAAACCCTAGA 104277643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7980 CTTTGAGGAATTGCTACACTGTCTTCCACAAGTAAAACCCAGAACTATAAAAACCCTAGA 8039

104277644 AGAAAAGCTAGACAGTACCATTCAGGACATCGGCACAGGCAAAGATTTCATGACAAAAAT 104277703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8040 AGAAAAGCTAGACAGTACCATTCAGGACATCGGCACAGGCAAAGATTTCATGACAAAAAT 8099

104277704 GTCAAAAGCAATTGCAACAAACACAAAACTTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAGAGCT 104277763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8100 GTCAAAAGCAATTGCAACAAACACAAAACTTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAGAGCT 8159

104277764 TCTGCACAGCAAAAGAAACTATCATCAGAGTGGACAGACAACCTACAGAATGGGAGAAAA 104277823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8160 TCTGCACAGCAAAAGAAACTATCATCAGAGTGGACAGACAACCTACAGAATGGGAGAAAA 8219

104277824 GTTTGCAGTCTATTCATCCGACAAAGGTTGAATATCCAGAATCTACAAGGAACTTAGTTC 104277883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8220 GTTTGCAGTCTATTCATCCGACAAAGGTTGAATATCCAGAATCTACAAGGAACTTAGTTC 8279

104277884 CAATTTACAAGAAAAAAAAAAAACACCATTAAAAAGTCGGCAAAGGACATAAACAGACAC 104277943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8280 CAATTTACAAGAAAAAAAAAAAACACCATTAAAAAGTCGGCAAAGGACATAAACAGACAC 8339

104277944 TTCTCAAAAGAAGACATTACGTGGCCACCAAACATATGAAAAAAAACTCAACCTCACTGA 104278003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8340 TTCTCAAAAGAAGACATTACGTGGCCACCAAACATATGAAAAAAAACTCAACCTCACTGA 8399

104278004 TCATTAGAGAAATACAAATCAAAACCACCAAGAGATACCATCGCATGCCAGTCAGAATGG 104278063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8400 TCATTAGAGAAATACAAATCAAAACCACCAAGAGATACCATCGCATGCCAGTCAGAATGG 8459

104278064 TGATTATTAAAAAGTCAAGGAACAATAGATGCTGGTGAGGCTGTGGAGAAATAGGAATGC 104278123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8460 TGATTATTAAAAAGTCAAGGAACAATAGATGCTGGTGAGGCTGTGGAGAAATAGGAATGC 8519

104278124 TCTTTTGCACTGTTGATGGGAATCTCTGAAAATATTTATTCCTTTGAATGAGTTTAGCAT 104278183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8520 TCTTTTGCACTGTTGATGGGAATCTCTGAAAATATTTATTCCTTTGAATGAGTTTAGCAT 8579

104278184 AGGATGTTACCCTTAA 104278199
          ||||||||||||||||
     8580 AGGATGTTACCCTTAA 8595

EXCISED REGION

104279047 ATGCTTGTTATAACAATGTACTTTTTTGTATACCTCTACTTGGAAATGTATTATAGTTAA 104279106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8596 ATGCTTGTTATAACAATGTACTTTTTTGTATACCTCTACTTGGAAATGTATTATAGTTAA 8655

104279107 GATTCATTCATTCGACTAATATGTATTGAGTGCCTACTATGTGCCAGGCACATGTTTTAG 104279166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8656 GATTCATTCATTCGACTAATATGTATTGAGTGCCTACTATGTGCCAGGCACATGTTTTAG 8715

104279167 CTAATGTTGATGAATGGTATGGATAAAGGCCTTGACACATTCATATTTAGAAAGATGGAA 104279226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8716 CTAATGTTGATGAATGGTATGGATAAAGGCCTTGACACATTCATATTTAGAAAGATGGAA 8775

104279227 ATAAATACATCAACAACATGCAATCTAATAGAGTTAGTAATGATAAAGATAAAACAGAAT 104279286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8776 ATAAATACATCAACAACATGCAATCTAATAGAGTTAGTAATGATAAAGATAAAACAGAAT 8835

104279287 ATAGAGAGTAAATAAGGGACCTATTTTCTATATGGTGGTCAAAAATGGACCCTGTGATTA 104279346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8836 ATAGAGAGTAAATAAGGGACCTATTTTCTATATGGTGGTCAAAAATGGACCCTGTGATTA 8895

104279347 CAGCTGAATACAGACTTGAATAAAACGAGAAAGCAAGTAATTCACATATCTGAGGAGAAA 104279406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8896 CAGCTGAATACAGACTTGAATAAAACGAGAAAGCAAGTAATTCACATATCTGAGGAGAAA 8955

104279407 ACTCTTTAGACACAGGGACCAGAAAGTTCAGGGGCCTTCAGCCAGAAATATTATTGACAT 104279466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8956 ACTCTTTAGACACAGGGACCAGAAAGTTCAGGGGCCTTCAGCCAGAAATATTATTGACAT 9015

104279467 GTGTAAATGAAGTAGCAAAGATAGTTGTTTGAGGAGGTGAAAAGGAAAATAGTGAAGATC 104279526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9016 GTGTAAATGAAGTAGCAAAGATAGTTGTTTGAGGAGGTGAAAAGGAAAATAGTGAAGATC 9075

104279527 AAATTGAAGAGACAATCAAGGCCATGCAGACTGTGGCAAGAACTTTGGAACTTCTGTTTA 104279586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9076 AAATTGAAGAGACAATCAAGGCCATGCAGACTGTGGCAAGAACTTTGGAACTTCTGTTTA 9135

104279587 TTATCCGAAGAGGCCATTGGAAGGTTATAAACAAGATATAAACATGATCTGACCTGTGTT 104279646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9136 TTATCCGAAGAGGCCATTGGAAGGTTATAAACAAGATATAAACATGATCTGACCTGTGTT 9195

104279647 TTGAAAGGATTTTTCTGGATAGGGAGTGAAAATTATATTGAAAGTGAAAAGATTGTAGAT 104279706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9196 TTGAAAGGATTTTTCTGGATAGGGAGTGAAAATTATATTGAAAGTGAAAAGATTGTAGAT 9255

104279707 ATAGTAGCAGTGGTAGGACTTG 104279728
          ||||||||||||||||||||||
     9256 ATAGTAGCAGTGGTAGGACTTG 9277

Alignment time is 7.30603 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [104268199,104289046] =>     20848 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     2916] =>      2916 nucs 'mol-32-1f21-037904_2916'

Score:        2904
Aligned:      2915        nucs
Identic:      2914 (100%) nucs =>      2232 (100%)       682 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [104276770,104279001] EXCISED REGION [104279003,104279685]
 second seq =>  [        1,     2232] EXCISED REGION [     2234,     2916]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [104279002,104279002]
 second seq =>         1 nucs [2233,2233]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [104279002,104279002] to [104279003,104279003]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

104276770 TATATATTTAGGACTAGGTTTCGATGAAATTAACCTAACAACCAACACTTAATCCTTTGA 104276829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TATATATTTAGGACTAGGTTTCGATGAAATTAACCTAACAACCAACACTTAATCCTTTGA 60

104276830 GAAACTACTTTCTCAACTGCATGGAACTTACCTAGGATAAAAATTAAAATTTAGGAGAAA 104276889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAAACTACTTTCTCAACTGCATGGAACTTACCTAGGATAAAAATTAAAATTTAGGAGAAA 120

104276890 GTGATTTCAGAGCTCCAAATCTGTCCTGTCTGCCCTCATTTCCATAATCTGCTTTGACTG 104276949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTGATTTCAGAGCTCCAAATCTGTCCTGTCTGCCCTCATTTCCATAATCTGCTTTGACTG 180

104276950 CCATTTTGTATATCCCCTATAATTTAACCTACTTATTGATCCCATGATCTCTGAAAATAT 104277009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCATTTTGTATATCCCCTATAATTTAACCTACTTATTGATCCCATGATCTCTGAAAATAT 240

104277010 TCTTTTTAATTTAATTTAATTTTTAGTTCTGGGATACATGGGCAGGATATGCAGCCTTGT 104277069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCTTTTTAATTTAATTTAATTTTTAGTTCTGGGATACATGGGCAGGATATGCAGCCTTGT 300

104277070 TATATGGGTAAATGTGTTCCATGGTGGTTTGCTGCACCTATCAAACCATCACCTAGGTAT 104277129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TATATGGGTAAATGTGTTCCATGGTGGTTTGCTGCACCTATCAAACCATCACCTAGGTAT 360

104277130 TAAGCCCCGCATGCATTAGCTACTCTTTCTGATGCGCTCCCTCCCACCACATCCCCAACC 104277189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TAAGCCCCGCATGCATTAGCTACTCTTTCTGATGCGCTCCCTCCCACCACATCCCCAACC 420

104277190 AACGGGCCCCATTATGTGTTGTTCCTTTCTCTGTTTTTATGTGTTCTCATTGTTCAGCTT 104277249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AACGGGCCCCATTATGTGTTGTTCCTTTCTCTGTTTTTATGTGTTCTCATTGTTCAGCTT 480

104277250 CCACTTATAAGTGAGAACATGTAGTGTTTAATTTTCTGTTCCTGTGTTAGTTTGCTGAGG 104277309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCACTTATAAGTGAGAACATGTAGTGTTTAATTTTCTGTTCCTGTGTTAGTTTGCTGAGG 540

104277310 ATAATGGCTTCCAGCTCCATCCCTTTTCCTGCAAAGGACATGATCTCATTACTTTTTATG 104277369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATAATGGCTTCCAGCTCCATCCCTTTTCCTGCAAAGGACATGATCTCATTACTTTTTATG 600

104277370 ACTGCATAGTGTTCCATGGTGTAAATATATCACATTTTCATTTTCCAGTCTATCATTGAT 104277429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ACTGCATAGTGTTCCATGGTGTAAATATATCACATTTTCATTTTCCAGTCTATCATTGAT 660

104277430 GGGCATTTGGGTTAATTCCATGTCTTTTCTACAGTGAATAGTGCTCCAGTGAACATACAT 104277489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGGCATTTGGGTTAATTCCATGTCTTTTCTACAGTGAATAGTGCTCCAGTGAACATACAT 720

104277490 GTGCAGGTATCTTTATAATAGAATGATTTATATTCTTTTGGGTACATACCCAGTAATGGG 104277549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GTGCAGGTATCTTTATAATAGAATGATTTATATTCTTTTGGGTACATACCCAGTAATGGG 780

104277550 ATTGCTGGGTCAAATGGTATTTCTGGTTCTAGGTCTTTGAGGAATTGCTACACTGTCTTC 104277609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATTGCTGGGTCAAATGGTATTTCTGGTTCTAGGTCTTTGAGGAATTGCTACACTGTCTTC 840

104277610 CACAAGTAAAACCCAGAACTATAAAAACCCTAGAAGAAAAGCTAGACAGTACCATTCAGG 104277669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CACAAGTAAAACCCAGAACTATAAAAACCCTAGAAGAAAAGCTAGACAGTACCATTCAGG 900

104277670 ACATCGGCACAGGCAAAGATTTCATGACAAAAATGTCAAAAGCAATTGCAACAAACACAA 104277729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ACATCGGCACAGGCAAAGATTTCATGACAAAAATGTCAAAAGCAATTGCAACAAACACAA 960

104277730 AACTTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAGAGCTTCTGCACAGCAAAAGAAACTATCATC 104277789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AACTTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAGAGCTTCTGCACAGCAAAAGAAACTATCATC 1020

104277790 AGAGTGGACAGACAACCTACAGAATGGGAGAAAAGTTTGCAGTCTATTCATCCGACAAAG 104277849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGAGTGGACAGACAACCTACAGAATGGGAGAAAAGTTTGCAGTCTATTCATCCGACAAAG 1080

104277850 GTTGAATATCCAGAATCTACAAGGAACTTAGTTCCAATTTACAAGAAAAAAAAAAAACAC 104277909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GTTGAATATCCAGAATCTACAAGGAACTTAGTTCCAATTTACAAGAAAAAAAAAAAACAC 1140

104277910 CATTAAAAAGTCGGCAAAGGACATAAACAGACACTTCTCAAAAGAAGACATTACGTGGCC 104277969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CATTAAAAAGTCGGCAAAGGACATAAACAGACACTTCTCAAAAGAAGACATTACGTGGCC 1200

104277970 ACCAAACATATGAAAAAAAACTCAACCTCACTGATCATTAGAGAAATACAAATCAAAACC 104278029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ACCAAACATATGAAAAAAAACTCAACCTCACTGATCATTAGAGAAATACAAATCAAAACC 1260

104278030 ACCAAGAGATACCATCGCATGCCAGTCAGAATGGTGATTATTAAAAAGTCAAGGAACAAT 104278089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ACCAAGAGATACCATCGCATGCCAGTCAGAATGGTGATTATTAAAAAGTCAAGGAACAAT 1320

104278090 AGATGCTGGTGAGGCTGTGGAGAAATAGGAATGCTCTTTTGCACTGTTGATGGGAATCTC 104278149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AGATGCTGGTGAGGCTGTGGAGAAATAGGAATGCTCTTTTGCACTGTTGATGGGAATCTC 1380

104278150 TGAAAATATTTATTCCTTTGAATGAGTTTAGCATAGGATGTTACCCTTAAAAGGATATTT 104278209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TGAAAATATTTATTCCTTTGAATGAGTTTAGCATAGGATGTTACCCTTAAAAGGATATTT 1440

104278210 GCATTCTAGAACACAGAGAGAAAGCTGAAGTAAAACACAAAATCAGTTCCAGTGCTTACA 104278269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GCATTCTAGAACACAGAGAGAAAGCTGAAGTAAAACACAAAATCAGTTCCAGTGCTTACA 1500

104278270 GAATTTGGATTATAGAGTGTGATGGAATGCATTATATCTCTTCAAATTCATATGCTGAAA 104278329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GAATTTGGATTATAGAGTGTGATGGAATGCATTATATCTCTTCAAATTCATATGCTGAAA 1560

104278330 CCCTAACCCTAAGTGGGACTGTACTTGTAAACAGGGCCTTTAAAAGAAGTAAGCACATTA 104278389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CCCTAACCCTAAGTGGGACTGTACTTGTAAACAGGGCCTTTAAAAGAAGTAAGCACATTA 1620

104278390 AAGTGAAACTGGTAAGAGTGTGCCTTGATCCAATCTGATTGGTGTCCTTATAAGAAGTGG 104278449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AAGTGAAACTGGTAAGAGTGTGCCTTGATCCAATCTGATTGGTGTCCTTATAAGAAGTGG 1680

104278450 AAATTTGAACACACAAAGAGAAACATCAGGGGAGCTTACACACAGAGAAAATCCCATATA 104278509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AAATTTGAACACACAAAGAGAAACATCAGGGGAGCTTACACACAGAGAAAATCCCATATA 1740

104278510 AGGACACAGCGAGAAAGCAGCCATGTGCAAGCTAAGGAAAGACTCCGAAGAAACCAAATG 104278569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AGGACACAGCGAGAAAGCAGCCATGTGCAAGCTAAGGAAAGACTCCGAAGAAACCAAATG 1800

104278570 TGCTGACTCTTTGAGCTTGAACTTCTAGCCTCCAGAACTGTGTGTAAATCAATTTCTGTT 104278629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TGCTGACTCTTTGAGCTTGAACTTCTAGCCTCCAGAACTGTGTGTAAATCAATTTCTGTT 1860

104278630 ATTTAAACCTCTATGTGGTATTTTGTAATGGCATGACCAGAAAACTAATACATAGATAAA 104278689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ATTTAAACCTCTATGTGGTATTTTGTAATGGCATGACCAGAAAACTAATACATAGATAAA 1920

104278690 ATAACATTAAAAATAATCATCTTATAAGTGGTCAGTGGTAAAAATTTGTCAGCAACTTTT 104278749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ATAACATTAAAAATAATCATCTTATAAGTGGTCAGTGGTAAAAATTTGTCAGCAACTTTT 1980

104278750 ACCCACAATTAGACCTTTTAAAAAAATAATTTCAAAATCAGGGAAAAAATTCAGATTGAT 104278809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ACCCACAATTAGACCTTTTAAAAAAATAATTTCAAAATCAGGGAAAAAATTCAGATTGAT 2040

104278810 TAGTCCTCATGATTTTAAGGTTATCAGTGTCAGAACAAGGAAAGCAGGAGAATAGATAGT 104278869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TAGTCCTCATGATTTTAAGGTTATCAGTGTCAGAACAAGGAAAGCAGGAGAATAGATAGT 2100

104278870 TATATAATGTAATAATTATAATGGCTGAGAAAAGTGAAAGACTAATTTTACTTGCTTATT 104278929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TATATAATGTAATAATTATAATGGCTGAGAAAAGTGAAAGACTAATTTTACTTGCTTATT 2160

104278930 CACATAAAATTTCTCAGAATGATAAAATAATGGTACTTTTATTGACAAAACTACAGAGAA 104278989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CACATAAAATTTCTCAGAATGATAAAATAATGGTACTTTTATTGACAAAACTACAGAGAA 2220

104278990 CTGCTATAATTG 104279001
          ||||||||||||
     2221 CTGCTATAATTG 2232

EXCISED REGION

104279003 TAAGTTACATGTGGCTACCTATATGTTACATTGGTTATCTATATATGCTTGTTATAACAA 104279062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2234 TAAGTTACATGTGGCTACCTATATGTTACATTGGTTATCTATATATGCTTGTTATAACAA 2293

104279063 TGTACTTTTTTGTATACCTCTACTTGGAAATGTATTATAGTTAAGATTCATTCATTCGAC 104279122
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2294 TGTACTTTTTTGTATACCTTTACTTGGAAATGTATTATAGTTAAGATTCATTCATTCGAC 2353

104279123 TAATATGTATTGAGTGCCTACTATGTGCCAGGCACATGTTTTAGCTAATGTTGATGAATG 104279182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2354 TAATATGTATTGAGTGCCTACTATGTGCCAGGCACATGTTTTAGCTAATGTTGATGAATG 2413

104279183 GTATGGATAAAGGCCTTGACACATTCATATTTAGAAAGATGGAAATAAATACATCAACAA 104279242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2414 GTATGGATAAAGGCCTTGACACATTCATATTTAGAAAGATGGAAATAAATACATCAACAA 2473

104279243 CATGCAATCTAATAGAGTTAGTAATGATAAAGATAAAACAGAATATAGAGAGTAAATAAG 104279302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2474 CATGCAATCTAATAGAGTTAGTAATGATAAAGATAAAACAGAATATAGAGAGTAAATAAG 2533

104279303 GGACCTATTTTCTATATGGTGGTCAAAAATGGACCCTGTGATTACAGCTGAATACAGACT 104279362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2534 GGACCTATTTTCTATATGGTGGTCAAAAATGGACCCTGTGATTACAGCTGAATACAGACT 2593

104279363 TGAATAAAACGAGAAAGCAAGTAATTCACATATCTGAGGAGAAAACTCTTTAGACACAGG 104279422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2594 TGAATAAAACGAGAAAGCAAGTAATTCACATATCTGAGGAGAAAACTCTTTAGACACAGG 2653

104279423 GACCAGAAAGTTCAGGGGCCTTCAGCCAGAAATATTATTGACATGTGTAAATGAAGTAGC 104279482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2654 GACCAGAAAGTTCAGGGGCCTTCAGCCAGAAATATTATTGACATGTGTAAATGAAGTAGC 2713

104279483 AAAGATAGTTGTTTGAGGAGGTGAAAAGGAAAATAGTGAAGATCAAATTGAAGAGACAAT 104279542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2714 AAAGATAGTTGTTTGAGGAGGTGAAAAGGAAAATAGTGAAGATCAAATTGAAGAGACAAT 2773

104279543 CAAGGCCATGCAGACTGTGGCAAGAACTTTGGAACTTCTGTTTATTATCCGAAGAGGCCA 104279602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2774 CAAGGCCATGCAGACTGTGGCAAGAACTTTGGAACTTCTGTTTATTATCCGAAGAGGCCA 2833

104279603 TTGGAAGGTTATAAACAAGATATAAACATGATCTGACCTGTGTTTTGAAAGGATTTTTCT 104279662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2834 TTGGAAGGTTATAAACAAGATATAAACATGATCTGACCTGTGTTTTGAAAGGATTTTTCT 2893

104279663 GGATAGGGAGTGAAAATTATATT 104279685
          |||||||||||||||||||||||
     2894 GGATAGGGAGTGAAAATTATATT 2916

Alignment time is 2.29233 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [104268199,104289046] =>     20848 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     4751] =>      4751 nucs 'mol-32-1f63-127480_4751'

Score:        4729
Aligned:      4751        nucs
Identic:      4749 (100%) nucs =>      2599 (100%)      2150 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [104275599,104278199] EXCISED REGION [104279047,104281196]
 second seq =>  [        1,     2601] EXCISED REGION [     2602,     4751]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       847 nucs [104278200,104279046]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [104278200,104278200] to [104279047,104279047]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [104278199,104278199] to [104279047,104279047]
 second seq =>         1 nucs [2601,2601] to [2602,2602]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

104275599 CAAGCCAGAAATTAAAATAGCAACTGACTAGGCTCTTATCTGTAAGATCTGATGTCGAAA 104275658
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
        1 CAAGCCAGAAATTAAAATAGCAACTGACTAGGCTCTTATCTGTAAGATCTGATGTTGAAA 60

104275659 CAATTTCCAAGCTGAATGATGTTTTTAGTAGAACTTAGCTCCTTGCAGTTGCAGAACTAA 104275718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAATTTCCAAGCTGAATGATGTTTTTAGTAGAACTTAGCTCCTTGCAGTTGCAGAACTAA 120

104275719 GGTTCTCCCTTCTTGCTGGCTGGTGGCTGGGAGTCACCCTCAGCTCCTCCAGTGAGCCCA 104275778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGTTCTCCCTTCTTGCTGGCTGGTGGCTGGGAGTCACCCTCAGCTCCTCCAGTGAGCCCA 180

104275779 CATTCTTTCCGCATGTCTTCCTTTATCTTCAAGCCAGCAACAATGCATCGGGCCCTTCTC 104275838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CATTCTTTCCGCATGTCTTCCTTTATCTTCAAGCCAGCAACAATGCATCGGGCCCTTCTC 240

104275839 TGCTCAGATCTCCCTGACTTCCTCTGCTGTCCTCACCAAGGAGAATACTTTGATTTAAGG 104275898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGCTCAGATCTCCCTGACTTCCTCTGCTGTCCTCACCAAGGAGAATACTTTGATTTAAGG 300

104275899 ACTCCTGTAATTACATTGGCCCACCTGGGAAATCTAGGCTAATCTCTGTATCTTAAACTC 104275958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACTCCTGTAATTACATTGGCCCACCTGGGAAATCTAGGCTAATCTCTGTATCTTAAACTC 360

104275959 AATTGATTCTTAACCTTAATTACCTCTGCAATGTCATTTTGCCATGTAATATAACATATT 104276018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AATTGATTCTTAACCTTAATTACCTCTGCAATGTCATTTTGCCATGTAATATAACATATT 420

104276019 CACAGGTGTAACACCAGGGAGCAAAGGTCAGAGAGCCAAAATTCTGTCTACCGTTGATAC 104276078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CACAGGTGTAACACCAGGGAGCAAAGGTCAGAGAGCCAAAATTCTGTCTACCGTTGATAC 480

104276079 TCAACAGCAATAAACATTCAGCTGTAGGAAACCTGAAGTCTCCAGAGAGATAATTTAGAT 104276138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCAACAGCAATAAACATTCAGCTGTAGGAAACCTGAAGTCTCCAGAGAGATAATTTAGAT 540

104276139 AAAATACAGCCTTAAGTATAGGACAGACCTGCTTAGAATCAGGAGTCTAAATTTTTTTGG 104276198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAAATACAGCCTTAAGTATAGGACAGACCTGCTTAGAATCAGGAGTCTAAATTTTTTTGG 600

104276199 TTACACAAATATAGCCAATTCTCTTTACCATTATAAATCTCAGCTTTATTTTTTTAATCT 104276258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTACACAAATATAGCCAATTCTCTTTACCATTATAAATCTCAGCTTTATTTTTTTAATCT 660

104276259 GAAAAATGCAAATATTGCTGCATCTCTATCATGTTGCTTTTAACATTAATATAAGAAACA 104276318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GAAAAATGCAAATATTGCTGCATCTCTATCATGTTGCTTTTAACATTAATATAAGAAACA 720

104276319 TACATATAATCAGCAAAAAAGATTTTTAAAACCTTACATATCAAAGATTACAAAAGAGAA 104276378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TACATATAATCAGCAAAAAAGATTTTTAAAACCTTACATATCAAAGATTACAAAAGAGAA 780

104276379 TTAGGAGAAAGAACAAAGTCTAAAGATGTTGAGAGAGTACCCTAAAGTTATCTATTTATT 104276438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTAGGAGAAAGAACAAAGTCTAAAGATGTTGAGAGAGTACCCTAAAGTTATCTATTTATT 840

104276439 TATTCACTTGTTCAAAAATATTTAGGACTAGGCCAGCCACAGTGGCTCATGCCTGTAATT 104276498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TATTCACTTGTTCAAAAATATTTAGGACTAGGCCAGCCACAGTGGCTCATGCCTGTAATT 900

104276499 CCAGCACTTTGGGGGGCCAAGGTGGGTGGATCACTTGAAGTCAGGAGTTTGAGATCAACC 104276558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CCAGCACTTTGGGGGGCCAAGGTGGGTGGATCACTTGAAGTCAGGAGTTTGAGATCAACC 960

104276559 TGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGG 104276618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
      961 TGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACGAAAATTAGCCAGGTGTGGTGG 1020

104276619 CACGTGCCTGTAATCCCAGCTATTTGGGAGACTGCATCAGGAAAATTGCTTGAATCCAGG 104276678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CACGTGCCTGTAATCCCAGCTATTTGGGAGACTGCATCAGGAAAATTGCTTGAATCCAGG 1080

104276679 AGGCGGAGGGTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGACAACAGAGCG 104276738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AGGCGGAGGGTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGACAACAGAGCG 1140

104276739 AGACTCCGTCTCAAAAATATATATATATATATATATATTTAGGACTAGGTTTCGATGAAA 104276798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGACTCCGTCTCAAAAATATATATATATATATATATATTTAGGACTAGGTTTCGATGAAA 1200

104276799 TTAACCTAACAACCAACACTTAATCCTTTGAGAAACTACTTTCTCAACTGCATGGAACTT 104276858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTAACCTAACAACCAACACTTAATCCTTTGAGAAACTACTTTCTCAACTGCATGGAACTT 1260

104276859 ACCTAGGATAAAAATTAAAATTTAGGAGAAAGTGATTTCAGAGCTCCAAATCTGTCCTGT 104276918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ACCTAGGATAAAAATTAAAATTTAGGAGAAAGTGATTTCAGAGCTCCAAATCTGTCCTGT 1320

104276919 CTGCCCTCATTTCCATAATCTGCTTTGACTGCCATTTTGTATATCCCCTATAATTTAACC 104276978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CTGCCCTCATTTCCATAATCTGCTTTGACTGCCATTTTGTATATCCCCTATAATTTAACC 1380

104276979 TACTTATTGATCCCATGATCTCTGAAAATATTCTTTTTAATTTAATTTAATTTTTAGTTC 104277038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TACTTATTGATCCCATGATCTCTGAAAATATTCTTTTTAATTTAATTTAATTTTTAGTTC 1440

104277039 TGGGATACATGGGCAGGATATGCAGCCTTGTTATATGGGTAAATGTGTTCCATGGTGGTT 104277098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TGGGATACATGGGCAGGATATGCAGCCTTGTTATATGGGTAAATGTGTTCCATGGTGGTT 1500

104277099 TGCTGCACCTATCAAACCATCACCTAGGTATTAAGCCCCGCATGCATTAGCTACTCTTTC 104277158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TGCTGCACCTATCAAACCATCACCTAGGTATTAAGCCCCGCATGCATTAGCTACTCTTTC 1560

104277159 TGATGCGCTCCCTCCCACCACATCCCCAACCAACGGGCCCCATTATGTGTTGTTCCTTTC 104277218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TGATGCGCTCCCTCCCACCACATCCCCAACCAACGGGCCCCATTATGTGTTGTTCCTTTC 1620

104277219 TCTGTTTTTATGTGTTCTCATTGTTCAGCTTCCACTTATAAGTGAGAACATGTAGTGTTT 104277278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TCTGTTTTTATGTGTTCTCATTGTTCAGCTTCCACTTATAAGTGAGAACATGTAGTGTTT 1680

104277279 AATTTTCTGTTCCTGTGTTAGTTTGCTGAGGATAATGGCTTCCAGCTCCATCCCTTTTCC 104277338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AATTTTCTGTTCCTGTGTTAGTTTGCTGAGGATAATGGCTTCCAGCTCCATCCCTTTTCC 1740

104277339 TGCAAAGGACATGATCTCATTACTTTTTATGACTGCATAGTGTTCCATGGTGTAAATATA 104277398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGCAAAGGACATGATCTCATTACTTTTTATGACTGCATAGTGTTCCATGGTGTAAATATA 1800

104277399 TCACATTTTCATTTTCCAGTCTATCATTGATGGGCATTTGGGTTAATTCCATGTCTTTTC 104277458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TCACATTTTCATTTTCCAGTCTATCATTGATGGGCATTTGGGTTAATTCCATGTCTTTTC 1860

104277459 TACAGTGAATAGTGCTCCAGTGAACATACATGTGCAGGTATCTTTATAATAGAATGATTT 104277518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TACAGTGAATAGTGCTCCAGTGAACATACATGTGCAGGTATCTTTATAATAGAATGATTT 1920

104277519 ATATTCTTTTGGGTACATACCCAGTAATGGGATTGCTGGGTCAAATGGTATTTCTGGTTC 104277578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ATATTCTTTTGGGTACATACCCAGTAATGGGATTGCTGGGTCAAATGGTATTTCTGGTTC 1980

104277579 TAGGTCTTTGAGGAATTGCTACACTGTCTTCCACAAGTAAAACCCAGAACTATAAAAACC 104277638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TAGGTCTTTGAGGAATTGCTACACTGTCTTCCACAAGTAAAACCCAGAACTATAAAAACC 2040

104277639 CTAGAAGAAAAGCTAGACAGTACCATTCAGGACATCGGCACAGGCAAAGATTTCATGACA 104277698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CTAGAAGAAAAGCTAGACAGTACCATTCAGGACATCGGCACAGGCAAAGATTTCATGACA 2100

104277699 AAAATGTCAAAAGCAATTGCAACAAACACAAAACTTGACAAATGGGATCTAATTAAACTA 104277758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AAAATGTCAAAAGCAATTGCAACAAACACAAAACTTGACAAATGGGATCTAATTAAACTA 2160

104277759 GAGCTTCTGCACAGCAAAAGAAACTATCATCAGAGTGGACAGACAACCTACAGAATGGGA 104277818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GAGCTTCTGCACAGCAAAAGAAACTATCATCAGAGTGGACAGACAACCTACAGAATGGGA 2220

104277819 GAAAAGTTTGCAGTCTATTCATCCGACAAAGGTTGAATATCCAGAATCTACAAGGAACTT 104277878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GAAAAGTTTGCAGTCTATTCATCCGACAAAGGTTGAATATCCAGAATCTACAAGGAACTT 2280

104277879 AGTTCCAATTTACAAGAAAAAAAAAAAACACCATTAAAAAGTCGGCAAAGGACATAAACA 104277938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AGTTCCAATTTACAAGAAAAAAAAAAAACACCATTAAAAAGTCGGCAAAGGACATAAACA 2340

104277939 GACACTTCTCAAAAGAAGACATTACGTGGCCACCAAACATATGAAAAAAAACTCAACCTC 104277998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GACACTTCTCAAAAGAAGACATTACGTGGCCACCAAACATATGAAAAAAAACTCAACCTC 2400

104277999 ACTGATCATTAGAGAAATACAAATCAAAACCACCAAGAGATACCATCGCATGCCAGTCAG 104278058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ACTGATCATTAGAGAAATACAAATCAAAACCACCAAGAGATACCATCGCATGCCAGTCAG 2460

104278059 AATGGTGATTATTAAAAAGTCAAGGAACAATAGATGCTGGTGAGGCTGTGGAGAAATAGG 104278118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AATGGTGATTATTAAAAAGTCAAGGAACAATAGATGCTGGTGAGGCTGTGGAGAAATAGG 2520

104278119 AATGCTCTTTTGCACTGTTGATGGGAATCTCTGAAAATATTTATTCCTTTGAATGAGTTT 104278178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 AATGCTCTTTTGCACTGTTGATGGGAATCTCTGAAAATATTTATTCCTTTGAATGAGTTT 2580

104278179 AGCATAGGATGTTACCCTTAA 104278199
          |||||||||||||||||||||
     2581 AGCATAGGATGTTACCCTTAA 2601

EXCISED REGION

104279047 ATGCTTGTTATAACAATGTACTTTTTTGTATACCTCTACTTGGAAATGTATTATAGTTAA 104279106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2602 ATGCTTGTTATAACAATGTACTTTTTTGTATACCTCTACTTGGAAATGTATTATAGTTAA 2661

104279107 GATTCATTCATTCGACTAATATGTATTGAGTGCCTACTATGTGCCAGGCACATGTTTTAG 104279166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2662 GATTCATTCATTCGACTAATATGTATTGAGTGCCTACTATGTGCCAGGCACATGTTTTAG 2721

104279167 CTAATGTTGATGAATGGTATGGATAAAGGCCTTGACACATTCATATTTAGAAAGATGGAA 104279226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2722 CTAATGTTGATGAATGGTATGGATAAAGGCCTTGACACATTCATATTTAGAAAGATGGAA 2781

104279227 ATAAATACATCAACAACATGCAATCTAATAGAGTTAGTAATGATAAAGATAAAACAGAAT 104279286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2782 ATAAATACATCAACAACATGCAATCTAATAGAGTTAGTAATGATAAAGATAAAACAGAAT 2841

104279287 ATAGAGAGTAAATAAGGGACCTATTTTCTATATGGTGGTCAAAAATGGACCCTGTGATTA 104279346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2842 ATAGAGAGTAAATAAGGGACCTATTTTCTATATGGTGGTCAAAAATGGACCCTGTGATTA 2901

104279347 CAGCTGAATACAGACTTGAATAAAACGAGAAAGCAAGTAATTCACATATCTGAGGAGAAA 104279406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2902 CAGCTGAATACAGACTTGAATAAAACGAGAAAGCAAGTAATTCACATATCTGAGGAGAAA 2961

104279407 ACTCTTTAGACACAGGGACCAGAAAGTTCAGGGGCCTTCAGCCAGAAATATTATTGACAT 104279466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2962 ACTCTTTAGACACAGGGACCAGAAAGTTCAGGGGCCTTCAGCCAGAAATATTATTGACAT 3021

104279467 GTGTAAATGAAGTAGCAAAGATAGTTGTTTGAGGAGGTGAAAAGGAAAATAGTGAAGATC 104279526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3022 GTGTAAATGAAGTAGCAAAGATAGTTGTTTGAGGAGGTGAAAAGGAAAATAGTGAAGATC 3081

104279527 AAATTGAAGAGACAATCAAGGCCATGCAGACTGTGGCAAGAACTTTGGAACTTCTGTTTA 104279586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3082 AAATTGAAGAGACAATCAAGGCCATGCAGACTGTGGCAAGAACTTTGGAACTTCTGTTTA 3141

104279587 TTATCCGAAGAGGCCATTGGAAGGTTATAAACAAGATATAAACATGATCTGACCTGTGTT 104279646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3142 TTATCCGAAGAGGCCATTGGAAGGTTATAAACAAGATATAAACATGATCTGACCTGTGTT 3201

104279647 TTGAAAGGATTTTTCTGGATAGGGAGTGAAAATTATATTGAAAGTGAAAAGATTGTAGAT 104279706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3202 TTGAAAGGATTTTTCTGGATAGGGAGTGAAAATTATATTGAAAGTGAAAAGATTGTAGAT 3261

104279707 ATAGTAGCAGTGGTAGGACTTGGGATATATATTACATACATTAGAGCTATCCTTAACTGT 104279766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3262 ATAGTAGCAGTGGTAGGACTTGGGATATATATTACATACATTAGAGCTATCCTTAACTGT 3321

104279767 ATCAACTGGTCTCATTGGGTATGAGAAGAAGATCAAAGTCAAGGCCAATTTTAATATGTT 104279826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3322 ATCAACTGGTCTCATTGGGTATGAGAAGAAGATCAAAGTCAAGGCCAATTTTAATATGTT 3381

104279827 TGGCCTGAGCAAGAAGGTGATATCCTTTCATGAAATGGGGATCAGTGAGAGGGGAGAAAT 104279886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3382 TGGCCTGAGCAAGAAGGTGATATCCTTTCATGAAATGGGGATCAGTGAGAGGGGAGAAAT 3441

104279887 TTACAGAGAAAAATTAAGAGTTTGGTTTTGGACCTATTAAAATTTGAGAAACCTGTGAGA 104279946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3442 TTACAGAGAAAAATTAAGAGTTTGGTTTTGGACCTATTAAAATTTGAGAAACCTGTGAGA 3501

104279947 AGTTTAAGAGGAAATGTTGATGAAGAGGAAGTTCGAAATAAGAGTCGAGAGTCCAGGGAA 104280006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3502 AGTTTAAGAGGAAATGTTGATGAAGAGGAAGTTCGAAATAAGAGTCGAGAGTCCAGGGAA 3561

104280007 TTGGTTTGGAGCTGGAGATTTTTTAAATTGAGAAGTTATTGGTAGATACAAGATATTTGC 104280066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3562 TTGGTTTGGAGCTGGAGATTTTTTAAATTGAGAAGTTATTGGTAGATACAAGATATTTGC 3621

104280067 AGTCATGAGAGCTAACAGTTACCTAGGGAGGGAGTAAAGATGAAGAGCTGAAATTTAAGG 104280126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3622 AGTCATGAGAGCTAACAGTTACCTAGGGAGGGAGTAAAGATGAAGAGCTGAAATTTAAGG 3681

104280127 ATAAAATTCCAGGGATCTAGAAATTTGGAAAATTGGAAGAAGAGGTGAAGCCAGAAAAGA 104280186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3682 ATAAAATTCCAGGGATCTAGAAATTTGGAAAATTGGAAGAAGAGGTGAAGCCAGAAAAGA 3741

104280187 CTAAGAAGGAGAGGTCAAGGAAGTAGGTGGGACAATAAAAGGATGTAGAATCTTGGCAAC 104280246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3742 CTAAGAAGGAGAGGTCAAGGAAGTAGGTGGGACAATAAAAGGATGTAGAATCTTGGCAAC 3801

104280247 TGAGTGATGAAAAAATTCTTTAAAGAATCAGAAAGTGACTGGTAAACTGGGTCAAAAGCT 104280306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3802 TGAGTGATGAAAAAATTCTTTAAAGAATCAGAAAGTGACTGGTAAACTGGGTCAAAAGCT 3861

104280307 AGAGATTGAGTAAAAACTGAAACTTTTCTTCATTTTAACATACTTTCGCTTTCAAGAAAA 104280366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3862 AGAGATTGAGTAAAAACTGAAACTTTTCTTCATTTTAACATACTTTCGCTTTCAAGAAAA 3921

104280367 TTATTACACTAAGGGGGAATAGCAGAGCAATCTATTAGTGTTGCAGAGGACAGATGTGGC 104280426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3922 TTATTACACTAAGGGGGAATAGCAGAGCAATCTATTAGTGTTGCAGAGGACAGATGTGGC 3981

104280427 TTTTTCAGATGCTCAGAAGCACCCAATAAATTTGAAGAACAGACAGGTGTTCCTGAGAAC 104280486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3982 TTTTTCAGATGCTCAGAAGCACCCAATAAATTTGAAGAACAGACAGGTGTTCCTGAGAAC 4041

104280487 TCAGGGAAGAATTTGGCCAATGAAGGTCACAGGACACCTGTTCTGAAAATGTCCTACTGA 104280546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4042 TCAGGGAAGAATTTGGCCAATGAAGGTCACAGGACACCTGTTCTGAAAATGTCCTACTGA 4101

104280547 AAATGTTCTTTAGAAGTTACAGTGTTTTCATCAAGACAATGAGATTTCACTTTATAACTT 104280606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4102 AAATGTTCTTTAGAAGTTACAGTGTTTTCATCAAGACAATGAGATTTCACTTTATAACTT 4161

104280607 TACTCAGTGCCCAGGTTACCTAAAAAGTATTTTTTCATCTTCAAGGGAGAAAAAAACTTT 104280666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4162 TACTCAGTGCCCAGGTTACCTAAAAAGTATTTTTTCATCTTCAAGGGAGAAAAAAACTTT 4221

104280667 GTTATTAGGTGATATAATTAGAATGTTTTAAAGAATGACATTAGTTTGCATTTCACAGCC 104280726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4222 GTTATTAGGTGATATAATTAGAATGTTTTAAAGAATGACATTAGTTTGCATTTCACAGCC 4281

104280727 TTACTAGGTAATATGAGAAGAAAATTCCAGTTTTATATTCTCTCGTATCTCTGAATTTCT 104280786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4282 TTACTAGGTAATATGAGAAGAAAATTCCAGTTTTATATTCTCTCGTATCTCTGAATTTCT 4341

104280787 TTCTAATTTATGGAAACAGTCTAATTTATGGAAACAGAATAATTAAATGCCCATGATAAA 104280846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4342 TTCTAATTTATGGAAACAGTCTAATTTATGGAAACAGAATAATTAAATGCCCATGATAAA 4401

104280847 TTTTCAAAGTTTATGACTTTCACTTGCATGGAATTAAAAATTATTTGCTGTTTTGTTAGT 104280906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4402 TTTTCAAAGTTTATGACTTTCACTTGCATGGAATTAAAAATTATTTGCTGTTTTGTTAGT 4461

104280907 ATTACTGTTAAGTGCCTTCCATGCTGCAGTAAGAAAACAGAAAAGTGAAATTCAAGAGCT 104280966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4462 ATTACTGTTAAGTGCCTTCCATGCTGCAGTAAGAAAACAGAAAAGTGAAATTCAAGAGCT 4521

104280967 AATCCAGGAGTATAAATGGGAAGTTTTTTTTTTATTAACTTGACAAATCTACATAAGCCA 104281026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4522 AATCCAGGAGTATAAATGGGAAGTTTTTTTTTTATTAACTTGACAAATCTACATAAGCCA 4581

104281027 TATTTAACTTCTTCAAAAGGAAAAGTATTTGAAACATGCATGTGAATCATGGGATGATAT 104281086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4582 TATTTAACTTCTTCAAAAGGAAAAGTATTTGAAACATGCATGTGAATCATGGGATGATAT 4641

104281087 GTAAAATTTGACCAATCCACTGGGTCATTCTATGAGTTAATACTTGTCCTAAGTGTTCAG 104281146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4642 GTAAAATTTGACCAATCCACTGGGTCATTCTATGAGTTAATACTTGTCCTAAGTGTTCAG 4701

104281147 TTGTACCTGCTTAGTCTTTAAAATTATAGAGTTGTTTGAAAGGTCTAATC 104281196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4702 TTGTACCTGCTTAGTCTTTAAAATTATAGAGTTGTTTGAAAGGTCTAATC 4751

Alignment time is 3.74495 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [104268199,104289046] =>     20848 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     2150] =>      2150 nucs 'mol-32-1f63-127480_2150'

Score:        2150
Aligned:      2150        nucs
Identic:      2150 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [104279047,104281196]
 second seq =>  [        1,     2150]

104279047 ATGCTTGTTATAACAATGTACTTTTTTGTATACCTCTACTTGGAAATGTATTATAGTTAA 104279106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATGCTTGTTATAACAATGTACTTTTTTGTATACCTCTACTTGGAAATGTATTATAGTTAA 60

104279107 GATTCATTCATTCGACTAATATGTATTGAGTGCCTACTATGTGCCAGGCACATGTTTTAG 104279166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GATTCATTCATTCGACTAATATGTATTGAGTGCCTACTATGTGCCAGGCACATGTTTTAG 120

104279167 CTAATGTTGATGAATGGTATGGATAAAGGCCTTGACACATTCATATTTAGAAAGATGGAA 104279226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTAATGTTGATGAATGGTATGGATAAAGGCCTTGACACATTCATATTTAGAAAGATGGAA 180

104279227 ATAAATACATCAACAACATGCAATCTAATAGAGTTAGTAATGATAAAGATAAAACAGAAT 104279286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATAAATACATCAACAACATGCAATCTAATAGAGTTAGTAATGATAAAGATAAAACAGAAT 240

104279287 ATAGAGAGTAAATAAGGGACCTATTTTCTATATGGTGGTCAAAAATGGACCCTGTGATTA 104279346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATAGAGAGTAAATAAGGGACCTATTTTCTATATGGTGGTCAAAAATGGACCCTGTGATTA 300

104279347 CAGCTGAATACAGACTTGAATAAAACGAGAAAGCAAGTAATTCACATATCTGAGGAGAAA 104279406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CAGCTGAATACAGACTTGAATAAAACGAGAAAGCAAGTAATTCACATATCTGAGGAGAAA 360

104279407 ACTCTTTAGACACAGGGACCAGAAAGTTCAGGGGCCTTCAGCCAGAAATATTATTGACAT 104279466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACTCTTTAGACACAGGGACCAGAAAGTTCAGGGGCCTTCAGCCAGAAATATTATTGACAT 420

104279467 GTGTAAATGAAGTAGCAAAGATAGTTGTTTGAGGAGGTGAAAAGGAAAATAGTGAAGATC 104279526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTGTAAATGAAGTAGCAAAGATAGTTGTTTGAGGAGGTGAAAAGGAAAATAGTGAAGATC 480

104279527 AAATTGAAGAGACAATCAAGGCCATGCAGACTGTGGCAAGAACTTTGGAACTTCTGTTTA 104279586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAATTGAAGAGACAATCAAGGCCATGCAGACTGTGGCAAGAACTTTGGAACTTCTGTTTA 540

104279587 TTATCCGAAGAGGCCATTGGAAGGTTATAAACAAGATATAAACATGATCTGACCTGTGTT 104279646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTATCCGAAGAGGCCATTGGAAGGTTATAAACAAGATATAAACATGATCTGACCTGTGTT 600

104279647 TTGAAAGGATTTTTCTGGATAGGGAGTGAAAATTATATTGAAAGTGAAAAGATTGTAGAT 104279706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTGAAAGGATTTTTCTGGATAGGGAGTGAAAATTATATTGAAAGTGAAAAGATTGTAGAT 660

104279707 ATAGTAGCAGTGGTAGGACTTGGGATATATATTACATACATTAGAGCTATCCTTAACTGT 104279766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATAGTAGCAGTGGTAGGACTTGGGATATATATTACATACATTAGAGCTATCCTTAACTGT 720

104279767 ATCAACTGGTCTCATTGGGTATGAGAAGAAGATCAAAGTCAAGGCCAATTTTAATATGTT 104279826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATCAACTGGTCTCATTGGGTATGAGAAGAAGATCAAAGTCAAGGCCAATTTTAATATGTT 780

104279827 TGGCCTGAGCAAGAAGGTGATATCCTTTCATGAAATGGGGATCAGTGAGAGGGGAGAAAT 104279886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGGCCTGAGCAAGAAGGTGATATCCTTTCATGAAATGGGGATCAGTGAGAGGGGAGAAAT 840

104279887 TTACAGAGAAAAATTAAGAGTTTGGTTTTGGACCTATTAAAATTTGAGAAACCTGTGAGA 104279946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTACAGAGAAAAATTAAGAGTTTGGTTTTGGACCTATTAAAATTTGAGAAACCTGTGAGA 900

104279947 AGTTTAAGAGGAAATGTTGATGAAGAGGAAGTTCGAAATAAGAGTCGAGAGTCCAGGGAA 104280006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGTTTAAGAGGAAATGTTGATGAAGAGGAAGTTCGAAATAAGAGTCGAGAGTCCAGGGAA 960

104280007 TTGGTTTGGAGCTGGAGATTTTTTAAATTGAGAAGTTATTGGTAGATACAAGATATTTGC 104280066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTGGTTTGGAGCTGGAGATTTTTTAAATTGAGAAGTTATTGGTAGATACAAGATATTTGC 1020

104280067 AGTCATGAGAGCTAACAGTTACCTAGGGAGGGAGTAAAGATGAAGAGCTGAAATTTAAGG 104280126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGTCATGAGAGCTAACAGTTACCTAGGGAGGGAGTAAAGATGAAGAGCTGAAATTTAAGG 1080

104280127 ATAAAATTCCAGGGATCTAGAAATTTGGAAAATTGGAAGAAGAGGTGAAGCCAGAAAAGA 104280186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATAAAATTCCAGGGATCTAGAAATTTGGAAAATTGGAAGAAGAGGTGAAGCCAGAAAAGA 1140

104280187 CTAAGAAGGAGAGGTCAAGGAAGTAGGTGGGACAATAAAAGGATGTAGAATCTTGGCAAC 104280246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTAAGAAGGAGAGGTCAAGGAAGTAGGTGGGACAATAAAAGGATGTAGAATCTTGGCAAC 1200

104280247 TGAGTGATGAAAAAATTCTTTAAAGAATCAGAAAGTGACTGGTAAACTGGGTCAAAAGCT 104280306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TGAGTGATGAAAAAATTCTTTAAAGAATCAGAAAGTGACTGGTAAACTGGGTCAAAAGCT 1260

104280307 AGAGATTGAGTAAAAACTGAAACTTTTCTTCATTTTAACATACTTTCGCTTTCAAGAAAA 104280366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AGAGATTGAGTAAAAACTGAAACTTTTCTTCATTTTAACATACTTTCGCTTTCAAGAAAA 1320

104280367 TTATTACACTAAGGGGGAATAGCAGAGCAATCTATTAGTGTTGCAGAGGACAGATGTGGC 104280426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTATTACACTAAGGGGGAATAGCAGAGCAATCTATTAGTGTTGCAGAGGACAGATGTGGC 1380

104280427 TTTTTCAGATGCTCAGAAGCACCCAATAAATTTGAAGAACAGACAGGTGTTCCTGAGAAC 104280486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTTTTCAGATGCTCAGAAGCACCCAATAAATTTGAAGAACAGACAGGTGTTCCTGAGAAC 1440

104280487 TCAGGGAAGAATTTGGCCAATGAAGGTCACAGGACACCTGTTCTGAAAATGTCCTACTGA 104280546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TCAGGGAAGAATTTGGCCAATGAAGGTCACAGGACACCTGTTCTGAAAATGTCCTACTGA 1500

104280547 AAATGTTCTTTAGAAGTTACAGTGTTTTCATCAAGACAATGAGATTTCACTTTATAACTT 104280606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AAATGTTCTTTAGAAGTTACAGTGTTTTCATCAAGACAATGAGATTTCACTTTATAACTT 1560

104280607 TACTCAGTGCCCAGGTTACCTAAAAAGTATTTTTTCATCTTCAAGGGAGAAAAAAACTTT 104280666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TACTCAGTGCCCAGGTTACCTAAAAAGTATTTTTTCATCTTCAAGGGAGAAAAAAACTTT 1620

104280667 GTTATTAGGTGATATAATTAGAATGTTTTAAAGAATGACATTAGTTTGCATTTCACAGCC 104280726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GTTATTAGGTGATATAATTAGAATGTTTTAAAGAATGACATTAGTTTGCATTTCACAGCC 1680

104280727 TTACTAGGTAATATGAGAAGAAAATTCCAGTTTTATATTCTCTCGTATCTCTGAATTTCT 104280786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTACTAGGTAATATGAGAAGAAAATTCCAGTTTTATATTCTCTCGTATCTCTGAATTTCT 1740

104280787 TTCTAATTTATGGAAACAGTCTAATTTATGGAAACAGAATAATTAAATGCCCATGATAAA 104280846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TTCTAATTTATGGAAACAGTCTAATTTATGGAAACAGAATAATTAAATGCCCATGATAAA 1800

104280847 TTTTCAAAGTTTATGACTTTCACTTGCATGGAATTAAAAATTATTTGCTGTTTTGTTAGT 104280906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTTTCAAAGTTTATGACTTTCACTTGCATGGAATTAAAAATTATTTGCTGTTTTGTTAGT 1860

104280907 ATTACTGTTAAGTGCCTTCCATGCTGCAGTAAGAAAACAGAAAAGTGAAATTCAAGAGCT 104280966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ATTACTGTTAAGTGCCTTCCATGCTGCAGTAAGAAAACAGAAAAGTGAAATTCAAGAGCT 1920

104280967 AATCCAGGAGTATAAATGGGAAGTTTTTTTTTTATTAACTTGACAAATCTACATAAGCCA 104281026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AATCCAGGAGTATAAATGGGAAGTTTTTTTTTTATTAACTTGACAAATCTACATAAGCCA 1980

104281027 TATTTAACTTCTTCAAAAGGAAAAGTATTTGAAACATGCATGTGAATCATGGGATGATAT 104281086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TATTTAACTTCTTCAAAAGGAAAAGTATTTGAAACATGCATGTGAATCATGGGATGATAT 2040

104281087 GTAAAATTTGACCAATCCACTGGGTCATTCTATGAGTTAATACTTGTCCTAAGTGTTCAG 104281146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GTAAAATTTGACCAATCCACTGGGTCATTCTATGAGTTAATACTTGTCCTAAGTGTTCAG 2100

104281147 TTGTACCTGCTTAGTCTTTAAAATTATAGAGTTGTTTGAAAGGTCTAATC 104281196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TTGTACCTGCTTAGTCTTTAAAATTATAGAGTTGTTTGAAAGGTCTAATC 2150

Alignment time is 1.52438 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [104268199,104289046] =>     20848 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     7072] =>      7072 nucs 'mol-32-23c5-024579_7072'

Score:        6993
Aligned:      7070        nucs
Identic:      7063 (100%) nucs =>      3580 (100%)      3483 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [104273171,104276754] EXCISED REGION [104276755,104280240]
 second seq =>  [        1,     3584] EXCISED REGION [     3587,     7072]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [3585,3586]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        22 nucs [3585,3606] to [3587,3608]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [104276754,104276754] to [104276755,104276755]
 second seq =>         1 nucs [3584,3584] to [3587,3587]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

104273171 AACTGCATGCCAAAAATTGGGCATAAGAGTGACTTAAGTCTTAATGACATTTTCAAATAT 104273230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AACTGCATGCCAAAAATTGGGCATAAGAGTGACTTAAGTCTTAATGACATTTTCAAATAT 60

104273231 AAGCTTAATAAGGCAAGCCTGCTTTTAAAGATTAGTGAGAAGTAACTGTATTAGTGAATT 104273290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
       61 AAGCTTAATAAGGCAAGCCTGCTTTTAAAGATTAGTGAGAAGTAACTGGATTAGTGAATT 120

104273291 TTCATACTGCTATAAAGAAATACCCAAGACTGGGTAATTTATGAAGTAAAAGAGGTTTAA 104273350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTCATACTGCTATAAAGAAATACCCAAGACTGGGTAATTTATGAAGTAAAAGAGGTTTAA 180

104273351 TGGAATCATGGTTCCACATGGCTGGGGTGGCCTCACAGTCATGACGGAAGGTGAAGGAGG 104273410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
      181 TGGAATCATGGTTCCACATGGCTGGGGTGGCCTCACAGTCATGACGGAAGGTGAAGGAAG 240

104273411 AGCAAAAGCACATCTTACGTGGCAGCAGGCAGGAGAGCGTGTACAGGGAAACTACCCTTT 104273470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGCAAAAGCACATCTTACGTGGCAGCAGGCAGGAGAGCGTGTACAGGGAAACTACCCTTT 300

104273471 ATAGAAACCATTGGATCTCGTGAGACTTATTCACTATATCACAAGAACAGCATGGGAAAA 104273530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATAGAAACCATTGGATCTCGTGAGACTTATTCACTATATCACAAGAACAGCATGGGAAAA 360

104273531 ACCCATCCTCATGATTCAGTTGCCTCCCACTAGGTCCCTCCCATGACACATGGAGTATGT 104273590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACCCATCCTCATGATTCAGTTGCCTCCCACTAGGTCCCTCCCATGACACATGGAGTATGT 420

104273591 GGGAGTTACAATTCAAGATGAGATTTGGGTGGAGACACAGCCAAACCATATCTGTACCTG 104273650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGGAGTTACAATTCAAGATGAGATTTGGGTGGAGACACAGCCAAACCATATCTGTACCTG 480

104273651 ACCAAGTACCTCTCAAGTTTGAGGCAGCTACATAACCAACAGATGAAGTCTTAGTAAAAG 104273710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACCAAGTACCTCTCAAGTTTGAGGCAGCTACATAACCAACAGATGAAGTCTTAGTAAAAG 540

104273711 CACAGAACTAGAGTTCAAGTGACCTGGTTTGCACCCTGAGTGCCATCATCATCAAGCATG 104273770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CACAGAACTAGAGTTCAAGTGACCTGGTTTGCACCCTGAGTGCCATCATCATCAAGCATG 600

104273771 AAAACCTTATGCAGATCAGTTCACCTTTTTTGGGATGCTTCCTCATTTATAAAATGAAAG 104273830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAAACCTTATGCAGATCAGTTCACCTTTTTTGGGATGCTTCCTCATTTATAAAATGAAAG 660

104273831 ATTTTAACTGAGTAATTGCTCAGATTCCTAGAACTGTGTAACTCTAAAAAGATTTCCATA 104273890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATTTTAACTGAGTAATTGCTCAGATTCCTAGAACTGTGTAACTCTAAAAAGATTTCCATA 720

104273891 ACCCTAGGTTATTTTTTCCTGGTTAACAAATTTTTTGGTTAGACAAAAACAACAATAGCT 104273950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ACCCTAGGTTATTTTTTCCTGGTTAACAAATTTTTTGGTTAGACAAAAACAACAATAGCT 780

104273951 TATACATCATGTAAATCGTTGTTTCTTTGTGCAGAATTAGGGGCTATATCTACCATAGGA 104274010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TATACATCATGTAAATCGTTGTTTCTTTGTGCAGAATTAGGGGCTATATCTACCATAGGA 840

104274011 GTAGTTGGCTCAGTGGCTAGGCCCTTGAGTCTGGAGTAAAAGGCTACAGCCGAGACAGTC 104274070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GTAGTTGGCTCAGTGGCTAGGCCCTTGAGTCTGGAGTAAAAGGCTACAGCCGAGACAGTC 900

104274071 TCATAGTCATGTGATAAATTGCTTCTGTCTTCTATACTATTAAAGCTCTTAGAAGTTATG 104274130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TCATAGTCATGTGATAAATTGCTTCTGTCTTCTATACTATTAAAGCTCTTAGAAGTTATG 960

104274131 GCAAACTACTTATTTCACTCAGGTTTGTATTATATTATGTCAAAACATATCTATCCTTCT 104274190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GCAAACTACTTATTTCACTCAGGTTTGTATTATATTATGTCAAAACATATCTATCCTTCT 1020

104274191 CCTATCACTGTGCTACTATAATGTACTTCTTTAGGGACATGACCATGCCGTTTAACTTAC 104274250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CCTATCACTGTGCTACTATAATGTACTTCTTTAGGGACATGACCATGCCGTTTAACTTAC 1080

104274251 ATCTCTCTCGCTGTACCAAATAAGACTCCCCTCACAATTTACTCAGTAAATGTTTGTGGA 104274310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATCTCTCTCGCTGTACCAAATAAGACTCCCCTCACAATTTACTCAGTAAATGTTTGTGGA 1140

104274311 GTAAGATTTTCACTGGCCTCATTTCTCCAACTATCCTGCTTGGCAACTAATCCACAGTCA 104274370
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     1141 GTAAGATTTTCACTGGCCTCATTTCTCCAACTATCCTGCTTGGCAACTAATCCACGGTCA 1200

104274371 TATAGGCCTCTTTTCACTTCTTTTAGTTTCTTAAATTTGGGCCTCCGCACCCCCACTCCA 104274430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TATAGGCCTCTTTTCACTTCTTTTAGTTTCTTAAATTTGGGCCTCCGCACCCCCACTCCA 1260

104274431 GCTCATGCTATTTATTCTACTTTTAATGATATACTGCCTGCTCGATTCCCATTCCCAGCT 104274490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GCTCATGCTATTTATTCTACTTTTAATGATATACTGCCTGCTCGATTCCCATTCCCAGCT 1320

104274491 CCAACATTCACACTCTTCATCTTGCCCATCTTTCAGAACTCAGCTTCACTATCTCTTAGG 104274550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CCAACATTCACACTCTTCATCTTGCCCATCTTTCAGAACTCAGCTTCACTATCTCTTAGG 1380

104274551 TGACCTTGAATAAGATCTTAATACTTTTCCTTTCCAACAAATAACCCAGTTTTAATTATC 104274610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TGACCTTGAATAAGATCTTAATACTTTTCCTTTCCAACAAATAACCCAGTTTTAATTATC 1440

104274611 TAATTGATTATGATATCACTTATTCATCACTGTGTATCAACTCATCCCAGATTCAATGGC 104274670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TAATTGATTATGATATCACTTATTCATCACTGTGTATCAACTCATCCCAGATTCAATGGC 1500

104274671 TTCAAACAGAGAAACAAAAAAATACATTTTACTGCTTACATTCAGTAGGTTGGCCAGGTA 104274730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTCAAACAGAGAAACAAAAAAATACATTTTACTGCTTACATTCAGTAGGTTGGCCAGGTA 1560

104274731 TTACATCAGCTGCTCTCTCCTGGGTTCACTCAACTGGAAGGATGAAAATGGCTTTATTCA 104274790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTACATCAGCTGCTCTCTCCTGGGTTCACTCAACTGGAAGGATGAAAATGGCTTTATTCA 1620

104274791 CATGTCTGGCAGTTGGTGCTTTTGCTGATTGATGGCCTCTCATTCTCCAGTACGTTAGAC 104274850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CATGTCTGGCAGTTGGTGCTTTTGCTGATTGATGGCCTCTCATTCTCCAGTACGTTAGAC 1680

104274851 AAGTTTTCTTATGTTGTAGTCTCAGGACATTATTACAACTGGCAAAAACAGAAACTGTAA 104274910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AAGTTTTCTTATGTTGTAGTCTCAGGACATTATTACAACTGGCAAAAACAGAAACTGTAA 1740

104274911 GGTGTCTAAAACCTAGGATCCAGAATTTACACACTAAGCTTCTGTCTCATTCTATTAATT 104274970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GGTGTCTAAAACCTAGGATCCAGAATTTACACACTAAGCTTCTGTCTCATTCTATTAATT 1800

104274971 AAAGCAATTTATAAGGCCAGCCCAAATTCAAGAGAGTGGAGGAACAGACTCCACTTTTTG 104275030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AAAGCAATTTATAAGGCCAGCCCAAATTCAAGAGAGTGGAGGAACAGACTCCACTTTTTG 1860

104275031 TTGGAAGGAACAAAAACATTACATTGCTCTGGGACATGGACACAAGGAGGCTTGACTCAT 104275090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTGGAAGGAACAAAAACATTACATTGCTCTGGGACATGGACACAAGGAGGCTTGACTCAT 1920

104275091 GGGGACCATATTATAACTCTCTACTACATTATGTAAAATTACTAATTTAATTTCTATATT 104275150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GGGGACCATATTATAACTCTCTACTACATTATGTAAAATTACTAATTTAATTTCTATATT 1980

104275151 CCCCACTAGACTATCTGTGTATATGAATAGGGACCATGCATTTCCTAATTTATGTTATAT 104275210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CCCCACTAGACTATCTGTGTATATGAATAGGGACCATGCATTTCCTAATTTATGTTATAT 2040

104275211 TGCCAGCATTTAATGCAGTCTTTATATGTGCTAGGCATTAATAAATATTTGTTGAATGAA 104275270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TGCCAGCATTTAATGCAGTCTTTATATGTGCTAGGCATTAATAAATATTTGTTGAATGAA 2100

104275271 TAATTAAATGGCTAAATTAATAACAGAGTGGATGAATTAACTTGAAAAAAGATTTCATGA 104275330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TAATTAAATGGCTAAATTAATAACAGAGTGGATGAATTAACTTGAAAAAAGATTTCATGA 2160

104275331 ACTATCAGCATGAAGATTTATCCACAAAAATAGAGAAGTGTTTCTTTTTTTGACCACATG 104275390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ACTATCAGCATGAAGATTTATCCACAAAAATAGAGAAGTGTTTCTTTTTTTGACCACATG 2220

104275391 AAAAACTAGAAACCATGTAAGCAGAAGTTATCTAAGTTAACTTTTATTGAGTAACTGGAC 104275450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AAAAACTAGAAACCATGTAAGCAGAAGTTATCTAAGTTAACTTTTATTGAGTAACTGGAC 2280

104275451 ACAGAATTCAGGTGCTCTGTTGTTTTCTATTGCTGCTATAACAAAACGTCACAAACAGCA 104275510
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TCAGAATTCAGGTGCTCTGTTGTTTTCTATTGCTGCTATAACAAAACGTCACAAACAGCA 2340

104275511 AATTACTGCAACATGAATTTATTAGCTCACAGTTCTACCAGTCAGAATTCTGGTGTGGTT 104275570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AATTACTGCAACATGAATTTATTAGCTCACAGTTCTACCAGTCAGAATTCTGGTGTGGTT 2400

104275571 TAATTTAGTTCTCTGCTCAGGTTTCTCACAAGCCAGAAATTAAAATAGCAACTGACTAGG 104275630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TAATTTAGTTCTCTGCTCAGGTTTCTCACAAGCCAGAAATTAAAATAGCAACTGACTAGG 2460

104275631 CTCTTATCTGTAAGATCTGATGTCGAAACAATTTCCAAGCTGAATGATGTTTTTAGTAGA 104275690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CTCTTATCTGTAAGATCTGATGTCGAAACAATTTCCAAGCTGAATGATGTTTTTAGTAGA 2520

104275691 ACTTAGCTCCTTGCAGTTGCAGAACTAAGGTTCTCCCTTCTTGCTGGCTGGTGGCTGGGA 104275750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 ACTTAGCTCCTTGCAGTTGCAGAACTAAGGTTCTCCCTTCTTGCTGGCTGGTGGCTGGGA 2580

104275751 GTCACCCTCAGCTCCTCCAGTGAGCCCACATTCTTTCCGCATGTCTTCCTTTATCTTCAA 104275810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GTCACCCTCAGCTCCTCCAGTGAGCCCACATTCTTTCCGCATGTCTTCCTTTATCTTCAA 2640

104275811 GCCAGCAACAATGCATCGGGCCCTTCTCTGCTCAGATCTCCCTGACTTCCTCTGCTGTCC 104275870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GCCAGCAACAATGCATCGGGCCCTTCTCTGCTCAGATCTCCCTGACTTCCTCTGCTGTCC 2700

104275871 TCACCAAGGAGAATACTTTGATTTAAGGACTCCTGTAATTACATTGGCCCACCTGGGAAA 104275930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TCACCAAGGAGAATACTTTGATTTAAGGACTCCTGTAATTACATTGGCCCACCTGGGAAA 2760

104275931 TCTAGGCTAATCTCTGTATCTTAAACTCAATTGATTCTTAACCTTAATTACCTCTGCAAT 104275990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TCTAGGCTAATCTCTGTATCTTAAACTCAATTGATTCTTAACCTTAATTACCTCTGCAAT 2820

104275991 GTCATTTTGCCATGTAATATAACATATTCACAGGTGTAACACCAGGGAGCAAAGGTCAGA 104276050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GTCATTTTGCCATGTAATATAACATATTCACAGGTGTAACACCAGGGAGCAAAGGTCAGA 2880

104276051 GAGCCAAAATTCTGTCTACCGTTGATACTCAACAGCAATAAACATTCAGCTGTAGGAAAC 104276110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 GAGCCAAAATTCTGTCTACCGTTGATACTCAACAGCAATAAACATTCAGCTGTAGGAAAC 2940

104276111 CTGAAGTCTCCAGAGAGATAATTTAGATAAAATACAGCCTTAAGTATAGGACAGACCTGC 104276170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CTGAAGTCTCCAGAGAGATAATTTAGATAAAATACAGCCTTAAGTATAGGACAGACCTGC 3000

104276171 TTAGAATCAGGAGTCTAAATTTTTTTGGTTACACAAATATAGCCAATTCTCTTTACCATT 104276230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TTAGAATCAGGAGTCTAAATTTTTTTGGTTACACAAATATAGCCAATTCTCTTTACCATT 3060

104276231 ATAAATCTCAGCTTTATTTTTTTAATCTGAAAAATGCAAATATTGCTGCATCTCTATCAT 104276290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 ATAAATCTCAGCTTTATTTTTTTAATCTGAAAAATGCAAATATTGCTGCATCTCTATCAT 3120

104276291 GTTGCTTTTAACATTAATATAAGAAACATACATATAATCAGCAAAAAAGATTTTTAAAAC 104276350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 GTTGCTTTTAACATTAATATAAGAAACATACATATAATCAGCAAAAAAGATTTTTAAAAC 3180

104276351 CTTACATATCAAAGATTACAAAAGAGAATTAGGAGAAAGAACAAAGTCTAAAGATGTTGA 104276410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 CTTACATATCAAAGATTACAAAAGAGAATTAGGAGAAAGAACAAAGTCTAAAGATGTTGA 3240

104276411 GAGAGTACCCTAAAGTTATCTATTTATTTATTCACTTGTTCAAAAATATTTAGGACTAGG 104276470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 GAGAGTACCCTAAAGTTATCTATTTATTTATTCACTTGTTCAAAAATATTTAGGACTAGG 3300

104276471 CCAGCCACAGTGGCTCATGCCTGTAATTCCAGCACTTTGGGGGGCCAAGGTGGGTGGATC 104276530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 CCAGCCACAGTGGCTCATGCCTGTAATTCCAGCACTTTGGGGGGCCAAGGTGGGTGGATC 3360

104276531 ACTTGAAGTCAGGAGTTTGAGATCAACCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAA 104276590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 ACTTGAAGTCAGGAGTTTGAGATCAACCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAA 3420

104276591 AAATACAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCACGTGCCTGTAATCCCAGCTATTTGGGAGAC 104276650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 AAATACAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCACGTGCCTGTAATCCCAGCTATTTGGGAGAC 3480

104276651 TGCATCAGGAAAATTGCTTGAATCCAGGAGGCGGAGGGTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCC 104276710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TGCATCAGGAAAATTGCTTGAATCCAGGAGGCGGAGGGTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCC 3540

104276711 ACTGCACTCCAGCCTGGACAACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAA 104276754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 ACTGCACTCCAGCCTGGACAACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAA 3584

EXCISED REGION

104276755 ATATATATATATATATATATATTTAGGACTAGGTTTCGATGAAATTAACCTAACAACCAA 104276814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3587 ATATATATATATATATATATATTTAGGACTAGGTTTCGATGAAATTAACCTAACAACCAA 3646

104276815 CACTTAATCCTTTGAGAAACTACTTTCTCAACTGCATGGAACTTACCTAGGATAAAAATT 104276874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3647 CACTTAATCCTTTGAGAAACTACTTTCTCAACTGCATGGAACTTACCTAGGATAAAAATT 3706

104276875 AAAATTTAGGAGAAAGTGATTTCAGAGCTCCAAATCTGTCCTGTCTGCCCTCATTTCCAT 104276934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3707 AAAATTTAGGAGAAAGTGATTTCAGAGCTCCAAATCTGTCCTGTCTGCCCTCATTTCCAT 3766

104276935 AATCTGCTTTGACTGCCATTTTGTATATCCCCTATAATTTAACCTACTTATTGATCCCAT 104276994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3767 AATCTGCTTTGACTGCCATTTTGTATATCCCCTATAATTTAACCTACTTATTGATCCCAT 3826

104276995 GATCTCTGAAAATATTCTTTTTAATTTAATTTAATTTTTAGTTCTGGGATACATGGGCAG 104277054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3827 GATCTCTGAAAATATTCTTTTTAATTTAATTTAATTTTTAGTTCTGGGATACATGGGCAG 3886

104277055 GATATGCAGCCTTGTTATATGGGTAAATGTGTTCCATGGTGGTTTGCTGCACCTATCAAA 104277114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3887 GATATGCAGCCTTGTTATATGGGTAAATGTGTTCCATGGTGGTTTGCTGCACCTATCAAA 3946

104277115 CCATCACCTAGGTATTAAGCCCCGCATGCATTAGCTACTCTTTCTGATGCGCTCCCTCCC 104277174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3947 CCATCACCTAGGTATTAAGCCCCGCATGCATTAGCTACTCTTTCTGATGCGCTCCCTCCC 4006

104277175 ACCACATCCCCAACCAACGGGCCCCATTATGTGTTGTTCCTTTCTCTGTTTTTATGTGTT 104277234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4007 ACCACATCCCCAACCAACGGGCCCCATTATGTGTTGTTCCTTTCTCTGTTTTTATGTGTT 4066

104277235 CTCATTGTTCAGCTTCCACTTATAAGTGAGAACATGTAGTGTTTAATTTTCTGTTCCTGT 104277294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4067 CTCATTGTTCAGCTTCCACTTATAAGTGAGAACATGTAGTGTTTAATTTTCTGTTCCTGT 4126

104277295 GTTAGTTTGCTGAGGATAATGGCTTCCAGCTCCATCCCTTTTCCTGCAAAGGACATGATC 104277354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4127 GTTAGTTTGCTGAGGATAATGGCTTCCAGCTCCATCCCTTTTCCTGCAAAGGACATGATC 4186

104277355 TCATTACTTTTTATGACTGCATAGTGTTCCATGGTGTAAATATATCACATTTTCATTTTC 104277414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4187 TCATTACTTTTTATGACTGCATAGTGTTCCATGGTGTAAATATATCACATTTTCATTTTC 4246

104277415 CAGTCTATCATTGATGGGCATTTGGGTTAATTCCATGTCTTTTCTACAGTGAATAGTGCT 104277474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4247 CAGTCTATCATTGATGGGCATTTGGGTTAATTCCATGTCTTTTCTACAGTGAATAGTGCT 4306

104277475 CCAGTGAACATACATGTGCAGGTATCTTTATAATAGAATGATTTATATTCTTTTGGGTAC 104277534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4307 CCAGTGAACATACATGTGCAGGTATCTTTATAATAGAATGATTTATATTCTTTTGGGTAC 4366

104277535 ATACCCAGTAATGGGATTGCTGGGTCAAATGGTATTTCTGGTTCTAGGTCTTTGAGGAAT 104277594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4367 ATACCCAGTAATGGGATTGCTGGGTCAAATGGTATTTCTGGTTCTAGGTCTTTGAGGAAT 4426

104277595 TGCTACACTGTCTTCCACAAGTAAAACCCAGAACTATAAAAACCCTAGAAGAAAAGCTAG 104277654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4427 TGCTACACTGTCTTCCACAAGTAAAACCCAGAACTATAAAAACCCTAGAAGAAAAGCTAG 4486

104277655 ACAGTACCATTCAGGACATCGGCACAGGCAAAGATTTCATGACAAAAATGTCAAAAGCAA 104277714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4487 ACAGTACCATTCAGGACATCGGCACAGGCAAAGATTTCATGACAAAAATGTCAAAAGCAA 4546

104277715 TTGCAACAAACACAAAACTTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAGAGCTTCTGCACAGCA 104277774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4547 TTGCAACAAACACAAAACTTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAGAGCTTCTGCACAGCA 4606

104277775 AAAGAAACTATCATCAGAGTGGACAGACAACCTACAGAATGGGAGAAAAGTTTGCAGTCT 104277834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4607 AAAGAAACTATCATCAGAGTGGACAGACAACCTACAGAATGGGAGAAAAGTTTGCAGTCT 4666

104277835 ATTCATCCGACAAAGGTTGAATATCCAGAATCTACAAGGAACTTAGTTCCAATTTACAAG 104277894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4667 ATTCATCCGACAAAGGTTGAATATCCAGAATCTACAAGGAACTTAGTTCCAATTTACAAG 4726

104277895 AAAAAAAAAAAACACCATTAAAAAGTCGGCAAAGGACATAAACAGACACTTCTCAAAAGA 104277954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4727 AAAAAAAAAAAACACCATTAAAAAGTCGGCAAAGGACATAAACAGACACTTCTCAAAAGA 4786

104277955 AGACATTACGTGGCCACCAAACATATGAAAAAAAACTCAACCTCACTGATCATTAGAGAA 104278014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4787 AGACATTACGTGGCCACCAAACATATGAAAAAAAACTCAACCTCACTGATCATTAGAGAA 4846

104278015 ATACAAATCAAAACCACCAAGAGATACCATCGCATGCCAGTCAGAATGGTGATTATTAAA 104278074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4847 ATACAAATCAAAACCACCAAGAGATACCATCGCATGCCAGTCAGAATGGTGATTATTAAA 4906

104278075 AAGTCAAGGAACAATAGATGCTGGTGAGGCTGTGGAGAAATAGGAATGCTCTTTTGCACT 104278134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4907 AAGTCAAGGAACAATAGATGCTGGTGAGGCTGTGGAGAAATAGGAATGCTCTTTTGCACT 4966

104278135 GTTGATGGGAATCTCTGAAAATATTTATTCCTTTGAATGAGTTTAGCATAGGATGTTACC 104278194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4967 GTTGATGGGAATCTCTGAAAATATTTATTCCTTTGAATGAGTTTAGCATAGGATGTTACC 5026

104278195 CTTAAAAGGATATTTGCATTCTAGAACACAGAGAGAAAGCTGAAGTAAAACACAAAATCA 104278254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5027 CTTAAAAGGATATTTGCATTCTAGAACACAGAGAGAAAGCTGAAGTAAAACACAAAATCA 5086

104278255 GTTCCAGTGCTTACAGAATTTGGATTATAGAGTGTGATGGAATGCATTATATCTCTTCAA 104278314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5087 GTTCCAGTGCTTACAGAATTTGGATTATAGAGTGTGATGGAATGCATTATATCTCTTCAA 5146

104278315 ATTCATATGCTGAAACCCTAACCCTAAGTGGGACTGTACTTGTAAACAGGGCCTTTAAAA 104278374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5147 ATTCATATGCTGAAACCCTAACCCTAAGTGGGACTGTACTTGTAAACAGGGCCTTTAAAA 5206

104278375 GAAGTAAGCACATTAAAGTGAAACTGGTAAGAGTGTGCCTTGATCCAATCTGATTGGTGT 104278434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5207 GAAGTAAGCACATTAAAGTGAAACTGGTAAGAGTGTGCCTTGATCCAATCTGATTGGTGT 5266

104278435 CCTTATAAGAAGTGGAAATTTGAACACACAAAGAGAAACATCAGGGGAGCTTACACACAG 104278494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5267 CCTTATAAGAAGTGGAAATTTGAACACACAAAGAGAAACATCAGGGGAGCTTACACACAG 5326

104278495 AGAAAATCCCATATAAGGACACAGCGAGAAAGCAGCCATGTGCAAGCTAAGGAAAGACTC 104278554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5327 AGAAAATCCCATATAAGGACACAGCGAGAAAGCAGCCATGTGCAAGCTAAGGAAAGACTC 5386

104278555 CGAAGAAACCAAATGTGCTGACTCTTTGAGCTTGAACTTCTAGCCTCCAGAACTGTGTGT 104278614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5387 CGAAGAAACCAAATGTGCTGACTCTTTGAGCTTGAACTTCTAGCCTCCAGAACTGTGTGT 5446

104278615 AAATCAATTTCTGTTATTTAAACCTCTATGTGGTATTTTGTAATGGCATGACCAGAAAAC 104278674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5447 AAATCAATTTCTGTTATTTAAACCTCTATGTGGTATTTTGTAATGGCATGACCAGAAAAC 5506

104278675 TAATACATAGATAAAATAACATTAAAAATAATCATCTTATAAGTGGTCAGTGGTAAAAAT 104278734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5507 TAATACATAGATAAAATAACATTAAAAATAATCATCTTATAAGTGGTCAGTGGTAAAAAT 5566

104278735 TTGTCAGCAACTTTTACCCACAATTAGACCTTTTAAAAAAATAATTTCAAAATCAGGGAA 104278794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5567 TTGTCAGCAACTTTTACCCACAATTAGACCTTTTAAAAAAATAATTTCAAAATCAGGGAA 5626

104278795 AAAATTCAGATTGATTAGTCCTCATGATTTTAAGGTTATCAGTGTCAGAACAAGGAAAGC 104278854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5627 AAAATTCAGATTGATTAGTCCTCATGATTTTAAGGTTATCAGTGTCAGAACAAGGAAAGC 5686

104278855 AGGAGAATAGATAGTTATATAATGTAATAATTATAATGGCTGAGAAAAGTGAAAGACTAA 104278914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5687 AGGAGAATAGATAGTTATATAATGTAATAATTATAATGGCTGAGAAAAGTGAAAGACTAA 5746

104278915 TTTTACTTGCTTATTCACATAAAATTTCTCAGAATGATAAAATAATGGTACTTTTATTGA 104278974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5747 TTTTACTTGCTTATTCACATAAAATTTCTCAGAATGATAAAATAATGGTACTTTTATTGA 5806

104278975 CAAAACTACAGAGAACTGCTATAATTGTTAAGTTACATGTGGCTACCTATATGTTACATT 104279034
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     5807 CAAAACTACAGAGAACTGCTATAATTGCTAAGTTACATGTGGCTACCTATATGTTACATT 5866

104279035 GGTTATCTATATATGCTTGTTATAACAATGTACTTTTTTGTATACCTCTACTTGGAAATG 104279094
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     5867 GGTTATCTATATATGCTTGTTATAACAATGTACTTTTTTGTATACCTTTACTTGGAAATG 5926

104279095 TATTATAGTTAAGATTCATTCATTCGACTAATATGTATTGAGTGCCTACTATGTGCCAGG 104279154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5927 TATTATAGTTAAGATTCATTCATTCGACTAATATGTATTGAGTGCCTACTATGTGCCAGG 5986

104279155 CACATGTTTTAGCTAATGTTGATGAATGGTATGGATAAAGGCCTTGACACATTCATATTT 104279214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5987 CACATGTTTTAGCTAATGTTGATGAATGGTATGGATAAAGGCCTTGACACATTCATATTT 6046

104279215 AGAAAGATGGAAATAAATACATCAACAACATGCAATCTAATAGAGTTAGTAATGATAAAG 104279274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6047 AGAAAGATGGAAATAAATACATCAACAACATGCAATCTAATAGAGTTAGTAATGATAAAG 6106

104279275 ATAAAACAGAATATAGAGAGTAAATAAGGGACCTATTTTCTATATGGTGGTCAAAAATGG 104279334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6107 ATAAAACAGAATATAGAGAGTAAATAAGGGACCTATTTTCTATATGGTGGTCAAAAATGG 6166

104279335 ACCCTGTGATTACAGCTGAATACAGACTTGAATAAAACGAGAAAGCAAGTAATTCACATA 104279394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6167 ACCCTGTGATTACAGCTGAATACAGACTTGAATAAAACGAGAAAGCAAGTAATTCACATA 6226

104279395 TCTGAGGAGAAAACTCTTTAGACACAGGGACCAGAAAGTTCAGGGGCCTTCAGCCAGAAA 104279454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6227 TCTGAGGAGAAAACTCTTTAGACACAGGGACCAGAAAGTTCAGGGGCCTTCAGCCAGAAA 6286

104279455 TATTATTGACATGTGTAAATGAAGTAGCAAAGATAGTTGTTTGAGGAGGTGAAAAGGAAA 104279514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6287 TATTATTGACATGTGTAAATGAAGTAGCAAAGATAGTTGTTTGAGGAGGTGAAAAGGAAA 6346

104279515 ATAGTGAAGATCAAATTGAAGAGACAATCAAGGCCATGCAGACTGTGGCAAGAACTTTGG 104279574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6347 ATAGTGAAGATCAAATTGAAGAGACAATCAAGGCCATGCAGACTGTGGCAAGAACTTTGG 6406

104279575 AACTTCTGTTTATTATCCGAAGAGGCCATTGGAAGGTTATAAACAAGATATAAACATGAT 104279634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6407 AACTTCTGTTTATTATCCGAAGAGGCCATTGGAAGGTTATAAACAAGATATAAACATGAT 6466

104279635 CTGACCTGTGTTTTGAAAGGATTTTTCTGGATAGGGAGTGAAAATTATATTGAAAGTGAA 104279694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6467 CTGACCTGTGTTTTGAAAGGATTTTTCTGGATAGGGAGTGAAAATTATATTGAAAGTGAA 6526

104279695 AAGATTGTAGATATAGTAGCAGTGGTAGGACTTGGGATATATATTACATACATTAGAGCT 104279754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6527 AAGATTGTAGATATAGTAGCAGTGGTAGGACTTGGGATATATATTACATACATTAGAGCT 6586

104279755 ATCCTTAACTGTATCAACTGGTCTCATTGGGTATGAGAAGAAGATCAAAGTCAAGGCCAA 104279814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6587 ATCCTTAACTGTATCAACTGGTCTCATTGGGTATGAGAAGAAGATCAAAGTCAAGGCCAA 6646

104279815 TTTTAATATGTTTGGCCTGAGCAAGAAGGTGATATCCTTTCATGAAATGGGGATCAGTGA 104279874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6647 TTTTAATATGTTTGGCCTGAGCAAGAAGGTGATATCCTTTCATGAAATGGGGATCAGTGA 6706

104279875 GAGGGGAGAAATTTACAGAGAAAAATTAAGAGTTTGGTTTTGGACCTATTAAAATTTGAG 104279934
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6707 GAGAGGAGAAATTTACAGAGAAAAATTAAGAGTTTGGTTTTGGACCTATTAAAATTTGAG 6766

104279935 AAACCTGTGAGAAGTTTAAGAGGAAATGTTGATGAAGAGGAAGTTCGAAATAAGAGTCGA 104279994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6767 AAACCTGTGAGAAGTTTAAGAGGAAATGTTGATGAAGAGGAAGTTCGAAATAAGAGTCGA 6826

104279995 GAGTCCAGGGAATTGGTTTGGAGCTGGAGATTTTTTAAATTGAGAAGTTATTGGTAGATA 104280054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6827 GAGTCCAGGGAATTGGTTTGGAGCTGGAGATTTTTTAAATTGAGAAGTTATTGGTAGATA 6886

104280055 CAAGATATTTGCAGTCATGAGAGCTAACAGTTACCTAGGGAGGGAGTAAAGATGAAGAGC 104280114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6887 CAAGATATTTGCAGTCATGAGAGCTAACAGTTACCTAGGGAGGGAGTAAAGATGAAGAGC 6946

104280115 TGAAATTTAAGGATAAAATTCCAGGGATCTAGAAATTTGGAAAATTGGAAGAAGAGGTGA 104280174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6947 TGAAATTTAAGGATAAAATTCCAGGGATCTAGAAATTTGGAAAATTGGAAGAAGAGGTGA 7006

104280175 AGCCAGAAAAGACTAAGAAGGAGAGGTCAAGGAAGTAGGTGGGACAATAAAAGGATGTAG 104280234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7007 AGCCAGAAAAGACTAAGAAGGAGAGGTCAAGGAAGTAGGTGGGACAATAAAAGGATGTAG 7066

104280235 AATCTT 104280240
          ||||||
     7067 AATCTT 7072

Alignment time is 5.60545 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [104268199,104289046] =>     20848 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     2121] =>      2121 nucs 'mol-32-2b55-008277_2121'

Score:        2099
Aligned:      2121        nucs
Identic:      2119 (100%) nucs =>       648 (100%)      1471 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [104277552,104278199] EXCISED REGION [104279047,104280519]
 second seq =>  [        1,      648] EXCISED REGION [      649,     2121]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       847 nucs [104278200,104279046]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [104278200,104278200] to [104279047,104279047]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [104278199,104278199] to [104279047,104279047]
 second seq =>         1 nucs [648,648] to [649,649]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

104277552 TGCTGGGTCAAATGGTATTTCTGGTTCTAGGTCTTTGAGGAATTGCTACACTGTCTTCCA 104277611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGCTGGGTCAAATGGTATTTCTGGTTCTAGGTCTTTGAGGAATTGCTACACTGTCTTCCA 60

104277612 CAAGTAAAACCCAGAACTATAAAAACCCTAGAAGAAAAGCTAGACAGTACCATTCAGGAC 104277671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAAGTAAAACCCAGAACTATAAAAACCCTAGAAGAAAAGCTAGACAGTACCATTCAGGAC 120

104277672 ATCGGCACAGGCAAAGATTTCATGACAAAAATGTCAAAAGCAATTGCAACAAACACAAAA 104277731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATCGGCACAGGCAAAGATTTCATGACAAAAATGTCAAAAGCAATTGCAACAAACACAAAA 180

104277732 CTTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAGAGCTTCTGCACAGCAAAAGAAACTATCATCAG 104277791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAGAGCTTCTGCACAGCAAAAGAAACTATCATCAG 240

104277792 AGTGGACAGACAACCTACAGAATGGGAGAAAAGTTTGCAGTCTATTCATCCGACAAAGGT 104277851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGTGGACAGACAACCTACAGAATGGGAGAAAAGTTTGCAGTCTATTCATCCGACAAAGGT 300

104277852 TGAATATCCAGAATCTACAAGGAACTTAGTTCCAATTTACAAGAAAAAAAAAAAACACCA 104277911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGAATATCCAGAATCTACAAGGAACTTAGTTCCAATTTACAAGAAAAAAAAAAAACACCA 360

104277912 TTAAAAAGTCGGCAAAGGACATAAACAGACACTTCTCAAAAGAAGACATTACGTGGCCAC 104277971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTAAAAAGTCGGCAAAGGACATAAACAGACACTTCTCAAAAGAAGACATTACGTGGCCAC 420

104277972 CAAACATATGAAAAAAAACTCAACCTCACTGATCATTAGAGAAATACAAATCAAAACCAC 104278031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CAAACATATGAAAAAAAACTCAACCTCACTGATCATTAGAGAAATACAAATCAAAACCAC 480

104278032 CAAGAGATACCATCGCATGCCAGTCAGAATGGTGATTATTAAAAAGTCAAGGAACAATAG 104278091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CAAGAGATACCATCGCATGCCAGTCAGAATGGTGATTATTAAAAAGTCAAGGAACAATAG 540

104278092 ATGCTGGTGAGGCTGTGGAGAAATAGGAATGCTCTTTTGCACTGTTGATGGGAATCTCTG 104278151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATGCTGGTGAGGCTGTGGAGAAATAGGAATGCTCTTTTGCACTGTTGATGGGAATCTCTG 600

104278152 AAAATATTTATTCCTTTGAATGAGTTTAGCATAGGATGTTACCCTTAA 104278199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAAATATTTATTCCTTTGAATGAGTTTAGCATAGGATGTTACCCTTAA 648

EXCISED REGION

104279047 ATGCTTGTTATAACAATGTACTTTTTTGTATACCTCTACTTGGAAATGTATTATAGTTAA 104279106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      649 ATGCTTGTTATAACAATGTACTTTTTTGTATACCTCTACTTGGAAATGTATTATAGTTAA 708

104279107 GATTCATTCATTCGACTAATATGTATTGAGTGCCTACTATGTGCCAGGCACATGTTTTAG 104279166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      709 GATTCATTCATTCGACTAATATGTATTGAGTGCCTACTATGTGCCAGGCACATGTTTTAG 768

104279167 CTAATGTTGATGAATGGTATGGATAAAGGCCTTGACACATTCATATTTAGAAAGATGGAA 104279226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      769 CTAATGTTGATGAATGGTATGGATAAAGGCCTTGACACATTCATATTTAGAAAGATGGAA 828

104279227 ATAAATACATCAACAACATGCAATCTAATAGAGTTAGTAATGATAAAGATAAAACAGAAT 104279286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      829 ATAAATACATCAACAACATGCAATCTAATAGAGTTAGTAATGATAAAGATAAAACAGAAT 888

104279287 ATAGAGAGTAAATAAGGGACCTATTTTCTATATGGTGGTCAAAAATGGACCCTGTGATTA 104279346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      889 ATAGAGAGTAAATAAGGGACCTATTTTCTATATGGTGGTCAAAAATGGACCCTGTGATTA 948

104279347 CAGCTGAATACAGACTTGAATAAAACGAGAAAGCAAGTAATTCACATATCTGAGGAGAAA 104279406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      949 CAGCTGAATACAGACTTGAATAAAACGAGAAAGCAAGTAATTCACATATCTGAGGAGAAA 1008

104279407 ACTCTTTAGACACAGGGACCAGAAAGTTCAGGGGCCTTCAGCCAGAAATATTATTGACAT 104279466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1009 ACTCTTTAGACACAGGGACCAGAAAGTTCAGGGGCCTTCAGCCAGAAATATTATTGACAT 1068

104279467 GTGTAAATGAAGTAGCAAAGATAGTTGTTTGAGGAGGTGAAAAGGAAAATAGTGAAGATC 104279526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     1069 GTGTAAATGAAGTAGCAAAGATAGTTGTTTGAGGAGGTGAAAAGGATAATAGTGAAGATC 1128

104279527 AAATTGAAGAGACAATCAAGGCCATGCAGACTGTGGCAAGAACTTTGGAACTTCTGTTTA 104279586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1129 AAATTGAAGAGACAATCAAGGCCATGCAGACTGTGGCAAGAACTTTGGAACTTCTGTTTA 1188

104279587 TTATCCGAAGAGGCCATTGGAAGGTTATAAACAAGATATAAACATGATCTGACCTGTGTT 104279646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1189 TTATCCGAAGAGGCCATTGGAAGGTTATAAACAAGATATAAACATGATCTGACCTGTGTT 1248

104279647 TTGAAAGGATTTTTCTGGATAGGGAGTGAAAATTATATTGAAAGTGAAAAGATTGTAGAT 104279706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1249 TTGAAAGGATTTTTCTGGATAGGGAGTGAAAATTATATTGAAAGTGAAAAGATTGTAGAT 1308

104279707 ATAGTAGCAGTGGTAGGACTTGGGATATATATTACATACATTAGAGCTATCCTTAACTGT 104279766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1309 ATAGTAGCAGTGGTAGGACTTGGGATATATATTACATACATTAGAGCTATCCTTAACTGT 1368

104279767 ATCAACTGGTCTCATTGGGTATGAGAAGAAGATCAAAGTCAAGGCCAATTTTAATATGTT 104279826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1369 ATCAACTGGTCTCATTGGGTATGAGAAGAAGATCAAAGTCAAGGCCAATTTTAATATGTT 1428

104279827 TGGCCTGAGCAAGAAGGTGATATCCTTTCATGAAATGGGGATCAGTGAGAGGGGAGAAAT 104279886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1429 TGGCCTGAGCAAGAAGGTGATATCCTTTCATGAAATGGGGATCAGTGAGAGGGGAGAAAT 1488

104279887 TTACAGAGAAAAATTAAGAGTTTGGTTTTGGACCTATTAAAATTTGAGAAACCTGTGAGA 104279946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1489 TTACAGAGAAAAATTAAGAGTTTGGTTTTGGACCTATTAAAATTTGAGAAACCTGTGAGA 1548

104279947 AGTTTAAGAGGAAATGTTGATGAAGAGGAAGTTCGAAATAAGAGTCGAGAGTCCAGGGAA 104280006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1549 AGTTTAAGAGGAAATGTTGATGAAGAGGAAGTTCGAAATAAGAGTCGAGAGTCCAGGGAA 1608

104280007 TTGGTTTGGAGCTGGAGATTTTTTAAATTGAGAAGTTATTGGTAGATACAAGATATTTGC 104280066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1609 TTGGTTTGGAGCTGGAGATTTTTTAAATTGAGAAGTTATTGGTAGATACAAGATATTTGC 1668

104280067 AGTCATGAGAGCTAACAGTTACCTAGGGAGGGAGTAAAGATGAAGAGCTGAAATTTAAGG 104280126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1669 AGTCATGAGAGCTAACAGTTACCTAGGGAGGGAGTAAAGATGAAGAGCTGAAATTTAAGG 1728

104280127 ATAAAATTCCAGGGATCTAGAAATTTGGAAAATTGGAAGAAGAGGTGAAGCCAGAAAAGA 104280186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1729 ATAAAATTCCAGGGATCTAGAAATTTGGAAAATTGGAAGAAGAGGTGAAGCCAGAAAAGA 1788

104280187 CTAAGAAGGAGAGGTCAAGGAAGTAGGTGGGACAATAAAAGGATGTAGAATCTTGGCAAC 104280246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1789 CTAAGAAGGAGAGGTCAAGGAAGTAGGTGGGACAATAAAAGGATGTAGAATCTTGGCAAC 1848

104280247 TGAGTGATGAAAAAATTCTTTAAAGAATCAGAAAGTGACTGGTAAACTGGGTCAAAAGCT 104280306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1849 TGAGTGATGAAAAAATTCTTTAAAGAATCAGAAAGTGACTGGTAAACTGGGTCAAAAGCT 1908

104280307 AGAGATTGAGTAAAAACTGAAACTTTTCTTCATTTTAACATACTTTCGCTTTCAAGAAAA 104280366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1909 AGAGATTGAGTAAAAACTGAAACTTTTCTTCATTTTAACATACTTTCGCTTTCAAGAAAA 1968

104280367 TTATTACACTAAGGGGGAATAGCAGAGCAATCTATTAGTGTTGCAGAGGACAGATGTGGC 104280426
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     1969 TTATTACACTAAGGGGGAATAGCAGAGCAATCTATTAGTGTCGCAGAGGACAGATGTGGC 2028

104280427 TTTTTCAGATGCTCAGAAGCACCCAATAAATTTGAAGAACAGACAGGTGTTCCTGAGAAC 104280486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2029 TTTTTCAGATGCTCAGAAGCACCCAATAAATTTGAAGAACAGACAGGTGTTCCTGAGAAC 2088

104280487 TCAGGGAAGAATTTGGCCAATGAAGGTCACAGG 104280519
          |||||||||||||||||||||||||||||||||
     2089 TCAGGGAAGAATTTGGCCAATGAAGGTCACAGG 2121

Alignment time is 1.70408 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [104268199,104289046] =>     20848 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     4135] =>      4135 nucs 'mol-32-2b55-024465_4135'

Score:        4123
Aligned:      4134        nucs
Identic:      4133 (100%) nucs =>      2226 (100%)      1907 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [104276776,104279001] EXCISED REGION [104279003,104280910]
 second seq =>  [        1,     2226] EXCISED REGION [     2228,     4135]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [104279002,104279002]
 second seq =>         1 nucs [2227,2227]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [104279002,104279002] to [104279003,104279003]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

104276776 TTTAGGACTAGGTTTCGATGAAATTAACCTAACAACCAACACTTAATCCTTTGAGAAACT 104276835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTAGGACTAGGTTTCGATGAAATTAACCTAACAACCAACACTTAATCCTTTGAGAAACT 60

104276836 ACTTTCTCAACTGCATGGAACTTACCTAGGATAAAAATTAAAATTTAGGAGAAAGTGATT 104276895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACTTTCTCAACTGCATGGAACTTACCTAGGATAAAAATTAAAATTTAGGAGAAAGTGATT 120

104276896 TCAGAGCTCCAAATCTGTCCTGTCTGCCCTCATTTCCATAATCTGCTTTGACTGCCATTT 104276955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCAGAGCTCCAAATCTGTCCTGTCTGCCCTCATTTCCATAATCTGCTTTGACTGCCATTT 180

104276956 TGTATATCCCCTATAATTTAACCTACTTATTGATCCCATGATCTCTGAAAATATTCTTTT 104277015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGTATATCCCCTATAATTTAACCTACTTATTGATCCCATGATCTCTGAAAATATTCTTTT 240

104277016 TAATTTAATTTAATTTTTAGTTCTGGGATACATGGGCAGGATATGCAGCCTTGTTATATG 104277075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TAATTTAATTTAATTTTTAGTTCTGGGATACATGGGCAGGATATGCAGCCTTGTTATATG 300

104277076 GGTAAATGTGTTCCATGGTGGTTTGCTGCACCTATCAAACCATCACCTAGGTATTAAGCC 104277135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GGTAAATGTGTTCCATGGTGGTTTGCTGCACCTATCAAACCATCACCTAGGTATTAAGCC 360

104277136 CCGCATGCATTAGCTACTCTTTCTGATGCGCTCCCTCCCACCACATCCCCAACCAACGGG 104277195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CCGCATGCATTAGCTACTCTTTCTGATGCGCTCCCTCCCACCACATCCCCAACCAACGGG 420

104277196 CCCCATTATGTGTTGTTCCTTTCTCTGTTTTTATGTGTTCTCATTGTTCAGCTTCCACTT 104277255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCCCATTATGTGTTGTTCCTTTCTCTGTTTTTATGTGTTCTCATTGTTCAGCTTCCACTT 480

104277256 ATAAGTGAGAACATGTAGTGTTTAATTTTCTGTTCCTGTGTTAGTTTGCTGAGGATAATG 104277315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATAAGTGAGAACATGTAGTGTTTAATTTTCTGTTCCTGTGTTAGTTTGCTGAGGATAATG 540

104277316 GCTTCCAGCTCCATCCCTTTTCCTGCAAAGGACATGATCTCATTACTTTTTATGACTGCA 104277375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GCTTCCAGCTCCATCCCTTTTCCTGCAAAGGACATGATCTCATTACTTTTTATGACTGCA 600

104277376 TAGTGTTCCATGGTGTAAATATATCACATTTTCATTTTCCAGTCTATCATTGATGGGCAT 104277435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TAGTGTTCCATGGTGTAAATATATCACATTTTCATTTTCCAGTCTATCATTGATGGGCAT 660

104277436 TTGGGTTAATTCCATGTCTTTTCTACAGTGAATAGTGCTCCAGTGAACATACATGTGCAG 104277495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTGGGTTAATTCCATGTCTTTTCTACAGTGAATAGTGCTCCAGTGAACATACATGTGCAG 720

104277496 GTATCTTTATAATAGAATGATTTATATTCTTTTGGGTACATACCCAGTAATGGGATTGCT 104277555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GTATCTTTATAATAGAATGATTTATATTCTTTTGGGTACATACCCAGTAATGGGATTGCT 780

104277556 GGGTCAAATGGTATTTCTGGTTCTAGGTCTTTGAGGAATTGCTACACTGTCTTCCACAAG 104277615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GGGTCAAATGGTATTTCTGGTTCTAGGTCTTTGAGGAATTGCTACACTGTCTTCCACAAG 840

104277616 TAAAACCCAGAACTATAAAAACCCTAGAAGAAAAGCTAGACAGTACCATTCAGGACATCG 104277675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TAAAACCCAGAACTATAAAAACCCTAGAAGAAAAGCTAGACAGTACCATTCAGGACATCG 900

104277676 GCACAGGCAAAGATTTCATGACAAAAATGTCAAAAGCAATTGCAACAAACACAAAACTTG 104277735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GCACAGGCAAAGATTTCATGACAAAAATGTCAAAAGCAATTGCAACAAACACAAAACTTG 960

104277736 ACAAATGGGATCTAATTAAACTAGAGCTTCTGCACAGCAAAAGAAACTATCATCAGAGTG 104277795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ACAAATGGGATCTAATTAAACTAGAGCTTCTGCACAGCAAAAGAAACTATCATCAGAGTG 1020

104277796 GACAGACAACCTACAGAATGGGAGAAAAGTTTGCAGTCTATTCATCCGACAAAGGTTGAA 104277855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GACAGACAACCTACAGAATGGGAGAAAAGTTTGCAGTCTATTCATCCGACAAAGGTTGAA 1080

104277856 TATCCAGAATCTACAAGGAACTTAGTTCCAATTTACAAGAAAAAAAAAAAACACCATTAA 104277915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TATCCAGAATCTACAAGGAACTTAGTTCCAATTTACAAGAAAAAAAAAAAACACCATTAA 1140

104277916 AAAGTCGGCAAAGGACATAAACAGACACTTCTCAAAAGAAGACATTACGTGGCCACCAAA 104277975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AAAGTCGGCAAAGGACATAAACAGACACTTCTCAAAAGAAGACATTACGTGGCCACCAAA 1200

104277976 CATATGAAAAAAAACTCAACCTCACTGATCATTAGAGAAATACAAATCAAAACCACCAAG 104278035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CATATGAAAAAAAACTCAACCTCACTGATCATTAGAGAAATACAAATCAAAACCACCAAG 1260

104278036 AGATACCATCGCATGCCAGTCAGAATGGTGATTATTAAAAAGTCAAGGAACAATAGATGC 104278095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AGATACCATCGCATGCCAGTCAGAATGGTGATTATTAAAAAGTCAAGGAACAATAGATGC 1320

104278096 TGGTGAGGCTGTGGAGAAATAGGAATGCTCTTTTGCACTGTTGATGGGAATCTCTGAAAA 104278155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGGTGAGGCTGTGGAGAAATAGGAATGCTCTTTTGCACTGTTGATGGGAATCTCTGAAAA 1380

104278156 TATTTATTCCTTTGAATGAGTTTAGCATAGGATGTTACCCTTAAAAGGATATTTGCATTC 104278215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TATTTATTCCTTTGAATGAGTTTAGCATAGGATGTTACCCTTAAAAGGATATTTGCATTC 1440

104278216 TAGAACACAGAGAGAAAGCTGAAGTAAAACACAAAATCAGTTCCAGTGCTTACAGAATTT 104278275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TAGAACACAGAGAGAAAGCTGAAGTAAAACACAAAATCAGTTCCAGTGCTTACAGAATTT 1500

104278276 GGATTATAGAGTGTGATGGAATGCATTATATCTCTTCAAATTCATATGCTGAAACCCTAA 104278335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GGATTATAGAGTGTGATGGAATGCATTATATCTCTTCAAATTCATATGCTGAAACCCTAA 1560

104278336 CCCTAAGTGGGACTGTACTTGTAAACAGGGCCTTTAAAAGAAGTAAGCACATTAAAGTGA 104278395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CCCTAAGTGGGACTGTACTTGTAAACAGGGCCTTTAAAAGAAGTAAGCACATTAAAGTGA 1620

104278396 AACTGGTAAGAGTGTGCCTTGATCCAATCTGATTGGTGTCCTTATAAGAAGTGGAAATTT 104278455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AACTGGTAAGAGTGTGCCTTGATCCAATCTGATTGGTGTCCTTATAAGAAGTGGAAATTT 1680

104278456 GAACACACAAAGAGAAACATCAGGGGAGCTTACACACAGAGAAAATCCCATATAAGGACA 104278515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GAACACACAAAGAGAAACATCAGGGGAGCTTACACACAGAGAAAATCCCATATAAGGACA 1740

104278516 CAGCGAGAAAGCAGCCATGTGCAAGCTAAGGAAAGACTCCGAAGAAACCAAATGTGCTGA 104278575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CAGCGAGAAAGCAGCCATGTGCAAGCTAAGGAAAGACTCCGAAGAAACCAAATGTGCTGA 1800

104278576 CTCTTTGAGCTTGAACTTCTAGCCTCCAGAACTGTGTGTAAATCAATTTCTGTTATTTAA 104278635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CTCTTTGAGCTTGAACTTCTAGCCTCCAGAACTGTGTGTAAATCAATTTCTGTTATTTAA 1860

104278636 ACCTCTATGTGGTATTTTGTAATGGCATGACCAGAAAACTAATACATAGATAAAATAACA 104278695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ACCTCTATGTGGTATTTTGTAATGGCATGACCAGAAAACTAATACATAGATAAAATAACA 1920

104278696 TTAAAAATAATCATCTTATAAGTGGTCAGTGGTAAAAATTTGTCAGCAACTTTTACCCAC 104278755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTAAAAATAATCATCTTATAAGTGGTCAGTGGTAAAAATTTGTCAGCAACTTTTACCCAC 1980

104278756 AATTAGACCTTTTAAAAAAATAATTTCAAAATCAGGGAAAAAATTCAGATTGATTAGTCC 104278815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AATTAGACCTTTTAAAAAAATAATTTCAAAATCAGGGAAAAAATTCAGATTGATTAGTCC 2040

104278816 TCATGATTTTAAGGTTATCAGTGTCAGAACAAGGAAAGCAGGAGAATAGATAGTTATATA 104278875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TCATGATTTTAAGGTTATCAGTGTCAGAACAAGGAAAGCAGGAGAATAGATAGTTATATA 2100

104278876 ATGTAATAATTATAATGGCTGAGAAAAGTGAAAGACTAATTTTACTTGCTTATTCACATA 104278935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ATGTAATAATTATAATGGCTGAGAAAAGTGAAAGACTAATTTTACTTGCTTATTCACATA 2160

104278936 AAATTTCTCAGAATGATAAAATAATGGTACTTTTATTGACAAAACTACAGAGAACTGCTA 104278995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AAATTTCTCAGAATGATAAAATAATGGTACTTTTATTGACAAAACTACAGAGAACTGCTA 2220

104278996 TAATTG 104279001
          ||||||
     2221 TAATTG 2226

EXCISED REGION

104279003 TAAGTTACATGTGGCTACCTATATGTTACATTGGTTATCTATATATGCTTGTTATAACAA 104279062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2228 TAAGTTACATGTGGCTACCTATATGTTACATTGGTTATCTATATATGCTTGTTATAACAA 2287

104279063 TGTACTTTTTTGTATACCTCTACTTGGAAATGTATTATAGTTAAGATTCATTCATTCGAC 104279122
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2288 TGTACTTTTTTGTATACCTTTACTTGGAAATGTATTATAGTTAAGATTCATTCATTCGAC 2347

104279123 TAATATGTATTGAGTGCCTACTATGTGCCAGGCACATGTTTTAGCTAATGTTGATGAATG 104279182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2348 TAATATGTATTGAGTGCCTACTATGTGCCAGGCACATGTTTTAGCTAATGTTGATGAATG 2407

104279183 GTATGGATAAAGGCCTTGACACATTCATATTTAGAAAGATGGAAATAAATACATCAACAA 104279242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2408 GTATGGATAAAGGCCTTGACACATTCATATTTAGAAAGATGGAAATAAATACATCAACAA 2467

104279243 CATGCAATCTAATAGAGTTAGTAATGATAAAGATAAAACAGAATATAGAGAGTAAATAAG 104279302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2468 CATGCAATCTAATAGAGTTAGTAATGATAAAGATAAAACAGAATATAGAGAGTAAATAAG 2527

104279303 GGACCTATTTTCTATATGGTGGTCAAAAATGGACCCTGTGATTACAGCTGAATACAGACT 104279362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2528 GGACCTATTTTCTATATGGTGGTCAAAAATGGACCCTGTGATTACAGCTGAATACAGACT 2587

104279363 TGAATAAAACGAGAAAGCAAGTAATTCACATATCTGAGGAGAAAACTCTTTAGACACAGG 104279422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2588 TGAATAAAACGAGAAAGCAAGTAATTCACATATCTGAGGAGAAAACTCTTTAGACACAGG 2647

104279423 GACCAGAAAGTTCAGGGGCCTTCAGCCAGAAATATTATTGACATGTGTAAATGAAGTAGC 104279482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2648 GACCAGAAAGTTCAGGGGCCTTCAGCCAGAAATATTATTGACATGTGTAAATGAAGTAGC 2707

104279483 AAAGATAGTTGTTTGAGGAGGTGAAAAGGAAAATAGTGAAGATCAAATTGAAGAGACAAT 104279542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2708 AAAGATAGTTGTTTGAGGAGGTGAAAAGGAAAATAGTGAAGATCAAATTGAAGAGACAAT 2767

104279543 CAAGGCCATGCAGACTGTGGCAAGAACTTTGGAACTTCTGTTTATTATCCGAAGAGGCCA 104279602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2768 CAAGGCCATGCAGACTGTGGCAAGAACTTTGGAACTTCTGTTTATTATCCGAAGAGGCCA 2827

104279603 TTGGAAGGTTATAAACAAGATATAAACATGATCTGACCTGTGTTTTGAAAGGATTTTTCT 104279662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2828 TTGGAAGGTTATAAACAAGATATAAACATGATCTGACCTGTGTTTTGAAAGGATTTTTCT 2887

104279663 GGATAGGGAGTGAAAATTATATTGAAAGTGAAAAGATTGTAGATATAGTAGCAGTGGTAG 104279722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2888 GGATAGGGAGTGAAAATTATATTGAAAGTGAAAAGATTGTAGATATAGTAGCAGTGGTAG 2947

104279723 GACTTGGGATATATATTACATACATTAGAGCTATCCTTAACTGTATCAACTGGTCTCATT 104279782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2948 GACTTGGGATATATATTACATACATTAGAGCTATCCTTAACTGTATCAACTGGTCTCATT 3007

104279783 GGGTATGAGAAGAAGATCAAAGTCAAGGCCAATTTTAATATGTTTGGCCTGAGCAAGAAG 104279842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3008 GGGTATGAGAAGAAGATCAAAGTCAAGGCCAATTTTAATATGTTTGGCCTGAGCAAGAAG 3067

104279843 GTGATATCCTTTCATGAAATGGGGATCAGTGAGAGGGGAGAAATTTACAGAGAAAAATTA 104279902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3068 GTGATATCCTTTCATGAAATGGGGATCAGTGAGAGGGGAGAAATTTACAGAGAAAAATTA 3127

104279903 AGAGTTTGGTTTTGGACCTATTAAAATTTGAGAAACCTGTGAGAAGTTTAAGAGGAAATG 104279962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3128 AGAGTTTGGTTTTGGACCTATTAAAATTTGAGAAACCTGTGAGAAGTTTAAGAGGAAATG 3187

104279963 TTGATGAAGAGGAAGTTCGAAATAAGAGTCGAGAGTCCAGGGAATTGGTTTGGAGCTGGA 104280022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3188 TTGATGAAGAGGAAGTTCGAAATAAGAGTCGAGAGTCCAGGGAATTGGTTTGGAGCTGGA 3247

104280023 GATTTTTTAAATTGAGAAGTTATTGGTAGATACAAGATATTTGCAGTCATGAGAGCTAAC 104280082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3248 GATTTTTTAAATTGAGAAGTTATTGGTAGATACAAGATATTTGCAGTCATGAGAGCTAAC 3307

104280083 AGTTACCTAGGGAGGGAGTAAAGATGAAGAGCTGAAATTTAAGGATAAAATTCCAGGGAT 104280142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3308 AGTTACCTAGGGAGGGAGTAAAGATGAAGAGCTGAAATTTAAGGATAAAATTCCAGGGAT 3367

104280143 CTAGAAATTTGGAAAATTGGAAGAAGAGGTGAAGCCAGAAAAGACTAAGAAGGAGAGGTC 104280202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3368 CTAGAAATTTGGAAAATTGGAAGAAGAGGTGAAGCCAGAAAAGACTAAGAAGGAGAGGTC 3427

104280203 AAGGAAGTAGGTGGGACAATAAAAGGATGTAGAATCTTGGCAACTGAGTGATGAAAAAAT 104280262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3428 AAGGAAGTAGGTGGGACAATAAAAGGATGTAGAATCTTGGCAACTGAGTGATGAAAAAAT 3487

104280263 TCTTTAAAGAATCAGAAAGTGACTGGTAAACTGGGTCAAAAGCTAGAGATTGAGTAAAAA 104280322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3488 TCTTTAAAGAATCAGAAAGTGACTGGTAAACTGGGTCAAAAGCTAGAGATTGAGTAAAAA 3547

104280323 CTGAAACTTTTCTTCATTTTAACATACTTTCGCTTTCAAGAAAATTATTACACTAAGGGG 104280382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3548 CTGAAACTTTTCTTCATTTTAACATACTTTCGCTTTCAAGAAAATTATTACACTAAGGGG 3607

104280383 GAATAGCAGAGCAATCTATTAGTGTTGCAGAGGACAGATGTGGCTTTTTCAGATGCTCAG 104280442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3608 GAATAGCAGAGCAATCTATTAGTGTTGCAGAGGACAGATGTGGCTTTTTCAGATGCTCAG 3667

104280443 AAGCACCCAATAAATTTGAAGAACAGACAGGTGTTCCTGAGAACTCAGGGAAGAATTTGG 104280502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3668 AAGCACCCAATAAATTTGAAGAACAGACAGGTGTTCCTGAGAACTCAGGGAAGAATTTGG 3727

104280503 CCAATGAAGGTCACAGGACACCTGTTCTGAAAATGTCCTACTGAAAATGTTCTTTAGAAG 104280562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3728 CCAATGAAGGTCACAGGACACCTGTTCTGAAAATGTCCTACTGAAAATGTTCTTTAGAAG 3787

104280563 TTACAGTGTTTTCATCAAGACAATGAGATTTCACTTTATAACTTTACTCAGTGCCCAGGT 104280622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3788 TTACAGTGTTTTCATCAAGACAATGAGATTTCACTTTATAACTTTACTCAGTGCCCAGGT 3847

104280623 TACCTAAAAAGTATTTTTTCATCTTCAAGGGAGAAAAAAACTTTGTTATTAGGTGATATA 104280682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3848 TACCTAAAAAGTATTTTTTCATCTTCAAGGGAGAAAAAAACTTTGTTATTAGGTGATATA 3907

104280683 ATTAGAATGTTTTAAAGAATGACATTAGTTTGCATTTCACAGCCTTACTAGGTAATATGA 104280742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3908 ATTAGAATGTTTTAAAGAATGACATTAGTTTGCATTTCACAGCCTTACTAGGTAATATGA 3967

104280743 GAAGAAAATTCCAGTTTTATATTCTCTCGTATCTCTGAATTTCTTTCTAATTTATGGAAA 104280802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3968 GAAGAAAATTCCAGTTTTATATTCTCTCGTATCTCTGAATTTCTTTCTAATTTATGGAAA 4027

104280803 CAGTCTAATTTATGGAAACAGAATAATTAAATGCCCATGATAAATTTTCAAAGTTTATGA 104280862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4028 CAGTCTAATTTATGGAAACAGAATAATTAAATGCCCATGATAAATTTTCAAAGTTTATGA 4087

104280863 CTTTCACTTGCATGGAATTAAAAATTATTTGCTGTTTTGTTAGTATTA 104280910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4088 CTTTCACTTGCATGGAATTAAAAATTATTTGCTGTTTTGTTAGTATTA 4135

Alignment time is 3.29656 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [104268199,104289046] =>     20848 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     8879] =>      8879 nucs 'mol-32-2e15-015256_8879'

Score:        8778
Aligned:      8877        nucs
Identic:      8868 (100%) nucs =>      5229 (100%)      3639 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [104271520,104276754] EXCISED REGION [104276755,104280396]
 second seq =>  [        1,     5235] EXCISED REGION [     5238,     8879]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [5236,5237]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        22 nucs [5236,5257] to [5238,5259]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [104276754,104276754] to [104276755,104276755]
 second seq =>         1 nucs [5235,5235] to [5238,5238]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

104271520 AAGGATATGGGGAATATTAGATATGCTTTTCTAAGGAAAAAATAGTAAGACAAAATGGCC 104271579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
        1 AAGGATATGGGGAATATTAGATATGCTTTTCTAAGGAAAAAATAGTGAGACAAAATGGCC 60

104271580 TGCCTGAAGTTAACAGTTTATAGATTGCAAAAAGGCACAGACAATTAAAAGATGGAGCTA 104271639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGCCTGAAGTTAACAGTTTATAGATTGCAAAAAGGCACAGACAATTAAAAGATGGAGCTA 120

104271640 CTTAGGGCAAATTACTTGCAATCAAGCTGCAGCTAAATGAGCTTCTTGATGAGGAAGCCA 104271699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTTAGGGCAAATTACTTGCAATCAAGCTGCAGCTAAATGAGCTTCTTGATGAGGAAGCCA 180

104271700 AATTTATGTTGTTTCAAACCAGGGAGAAACATTAAAGAAGTTGAAAGGTGAGCAAAATGT 104271759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AATTTATGTTGTTTCAAACCAGGGAGAAACATTAAAGAAGTTGAAAGGTGAGCAAAATGT 240

104271760 TAGTACAATTGGATCCAGATAGGTTGATAAGGGAAGCTGTAGAGGCAATTAAAACGCTGC 104271819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TAGTACAATTGGATCCAGATAGGTTGATAAGGGAAGCTGTAGAGGCAATTAAAACGCTGC 300

104271820 CTCTGAAATACATACACATAGGTACAGACACAGACATACACGCACACAAACCAATACACA 104271879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTCTGAAATACATACACATAGGTACAGACACAGACATACACGCACACAAACCAATACACA 360

104271880 CAAAACATCCTCAAATAGAAGACTGTATGATTACATACACCTTCAGCCTTCATTTATGTT 104271939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CAAAACATCCTCAAATAGAAGACTGTATGATTACATACACCTTCAGCCTTCATTTATGTT 420

104271940 TTATGTGGATGCCCCTTCTTATCACAAAAACACTGCGGCCTGAGAAGCTCAATCACAGAA 104271999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTATGTGGATGCCCCTTCTTATCACAAAAACACTGCGGCCTGAGAAGCTCAATCACAGAA 480

104272000 TATAATCATTTTCCTTTTCAATCTGCAATTTACTACAGACATTTTATTTGAAAATGAGGT 104272059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TATAATCATTTTCCTTTTCAATCTGCAATTTACTACAGACATTTTATTTGAAAATGAGGT 540

104272060 ATTGTTTAAACTCTAAACCACAGTGTTTTCATTTTTTCCCCTGCCCTAAATTATCCCTTG 104272119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATTGTTTAAACTCTAAACCACAGTGTTTTCATTTTTTCCCCTGCCCTAAATTATCCCTTG 600

104272120 GCAGCTCTCTGAGTTGATTTTTAAAGAATATGTTTTATAATGAATTCAGAACTTCCACAA 104272179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GCAGCTCTCTGAGTTGATTTTTAAAGAATATGTTTTATAATGAATTCAGAACTTCCACAA 660

104272180 AGCACAAAAGCCATGTGAAAGCTTCAAATGTGAAATATCACATTTCTTTCTTTGTTGCTC 104272239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGCACAAAAGCCATGTGAAAGCTTCAAATGTGAAATATCACATTTCTTTCTTTGTTGCTC 720

104272240 AATATCCATTTTTGCATTCAGGGCTGTATGCATCAATTTCACTGAAAGCAGGGTATTGTC 104272299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AATATCCATTTTTGCATTCAGGGCTGTATGCATCAATTTCACTGAAAGCAGGGTATTGTC 780

104272300 TACATCTATCTGTCTGAATGAGATGACTTTCAGGACTTTGTAATTTTGAAAAGGTCTTCA 104272359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TACATCTATCTGTCTGAATGAGATGACTTTCAGGACTTTGTAATTTTGAAAAGGTCTTCA 840

104272360 AGCCAGGCTATCCTTCATCCCATTTCTGTTGCATTGGAATGTTAGACATAACAAGGTAGA 104272419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGCCAGGCTATCCTTCATCCCATTTCTGTTGCATTGGAATGTTAGACATAACAAGGTAGA 900

104272420 CAAAGGAAAGATATAATACAGATCCTTATTGACAGTCAGCAAGTACAAGTATATGTAGAA 104272479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
      901 CAAAGGAAAGATATAATACAGATCCTTATTGACAGTCAGCAAGTACAAATATATGTAGAA 960

104272480 AGAGATAATTTTCTGCTGGCATTTTCCCTTATCTCGATTCTCTTATCCTTTCATGCATTA 104272539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AGAGATAATTTTCTGCTGGCATTTTCCCTTATCTCGATTCTCTTATCCTTTCATGCATTA 1020

104272540 TGTTTTGCATGAACAGAATCGGAAAAAAATTGACAGCCTTGTATGAAGTACACCAAGAAA 104272599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGTTTTGCATGAACAGAATCGGAAAAAAATTGACAGCCTTGTATGAAGTACACCAAGAAA 1080

104272600 GCTTTCTCCTTCAAAGATCTTTTTAGGATATAAAAACTCTCTAAGATTTAGTAACTAAGA 104272659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GCTTTCTCCTTCAAAGATCTTTTTAGGATATAAAAACTCTCTAAGATTTAGTAACTAAGA 1140

104272660 AGGACAATAAATGTCCATACTTAGAGCAACAAATAAAAATGTGATTCTGATGCTGACATA 104272719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGGACAATAAATGTCCATACTTAGAGCAACAAATAAAAATGTGATTCTGATGCTGACATA 1200

104272720 GTTTTTTTATAGTTGAAATGTAACCTTGTCAACACTGCCTGGCCAGTTCTGCCATTGAAA 104272779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GTTTTTTTATAGTTGAAATGTAACCTTGTCAACACTGCCTGGCCAGTTCTGCCATTGAAA 1260

104272780 AATGGCCCAGGAAAATGCCCAAATGCCAACAGTGGTAGTTATGGATTATTTTCCTATCTG 104272839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AATGGCCCAGGAAAATGCCCAAATGCCAACAGTGGTAGTTATGGATTATTTTCCTATCTG 1320

104272840 ATATTATTCAGCTACATCTGCTGTTTAGTGGAAGCTAAACAGAAAATACTCCATAGGATA 104272899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ATATTATTCAGCTACATCTGCTGTTTAGTGGAAGCTAAACAGAAAATACTCCATAGGATA 1380

104272900 CTGAGAAAAAATTGGGCATTGAAAATATATTTGTGTCTTTTTTTTCTTCCTGTGAGTTAT 104272959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CTGAGAAAAAATTGGGCATTGAAAATATATTTGTGTCTTTTTTTTCTTCCTGTGAGTTAT 1440

104272960 AAATTTTAAATGGCATATGTAAAGCATTTAGAAAAGGTGTCTCAATATATTGAACATTGG 104273019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AAATTTTAAATGGCATATGTAAAGCATTTAGAAAAGGTGTCTCAATATATTGAACATTGG 1500

104273020 CCAAAGAGGCCTCCAACAGCTAAAGTCATATCACCTGAACGTGATGGGATTTCCAAATTC 104273079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CCAAAGAGGCCTCCAACAGCTAAAGTCATATCACCTGAACGTGATGGGATTTCCAAATTC 1560

104273080 CCCCTAAATCAGTCTGGTTAGGAGAGCTTAAAGGAAATAGGAATATACATACACAAGAAA 104273139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CCCCTAAATCAGTCTGGTTAGGAGAGCTTAAAGGAAATAGGAATATACATACACAAGAAA 1620

104273140 AAGTTCATTGTTAACCACCCTATTAACTGTTAACTGCATGCCAAAAATTGGGCATAAGAG 104273199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AAGTTCATTGTTAACCACCCTATTAACTGTTAACTGCATGCCAAAAATTGGGCATAAGAG 1680

104273200 TGACTTAAGTCTTAATGACATTTTCAAATATAAGCTTAATAAGGCAAGCCTGCTTTTAAA 104273259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TGACTTAAGTCTTAATGACATTTTCAAATATAAGCTTAATAAGGCAAGCCTGCTTTTAAA 1740

104273260 GATTAGTGAGAAGTAACTGTATTAGTGAATTTTCATACTGCTATAAAGAAATACCCAAGA 104273319
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GATTAGTGAGAAGTAACTGGATTAGTGAATTTTCATACTGCTATAAAGAAATACCCAAGA 1800

104273320 CTGGGTAATTTATGAAGTAAAAGAGGTTTAATGGAATCATGGTTCCACATGGCTGGGGTG 104273379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CTGGGTAATTTATGAAGTAAAAGAGGTTTAATGGAATCATGGTTCCACATGGCTGGGGTG 1860

104273380 GCCTCACAGTCATGACGGAAGGTGAAGGAGGAGCAAAAGCACATCTTACGTGGCAGCAGG 104273439
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GCCTCACAGTCATGACGGAAGGTGAAGGAAGAGCAAAAGCACATCTTACGTGGCAGCAGG 1920

104273440 CAGGAGAGCGTGTACAGGGAAACTACCCTTTATAGAAACCATTGGATCTCGTGAGACTTA 104273499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CAGGAGAGCGTGTACAGGGAAACTACCCTTTATAGAAACCATTGGATCTCGTGAGACTTA 1980

104273500 TTCACTATATCACAAGAACAGCATGGGAAAAACCCATCCTCATGATTCAGTTGCCTCCCA 104273559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TTCACTATATCACAAGAACAGCATGGGAAAAACCCATCCTCATGATTCAGTTGCCTCCCA 2040

104273560 CTAGGTCCCTCCCATGACACATGGAGTATGTGGGAGTTACAATTCAAGATGAGATTTGGG 104273619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CTAGGTCCCTCCCATGACACATGGAGTATGTGGGAGTTACAATTCAAGATGAGATTTGGG 2100

104273620 TGGAGACACAGCCAAACCATATCTGTACCTGACCAAGTACCTCTCAAGTTTGAGGCAGCT 104273679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TGGAGACACAGCCAAACCATATCTGTACCTGACCAAGTACCTCTCAAGTTTGAGGCAGCT 2160

104273680 ACATAACCAACAGATGAAGTCTTAGTAAAAGCACAGAACTAGAGTTCAAGTGACCTGGTT 104273739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ACATAACCAACAGATGAAGTCTTAGTAAAAGCACAGAACTAGAGTTCAAGTGACCTGGTT 2220

104273740 TGCACCCTGAGTGCCATCATCATCAAGCATGAAAACCTTATGCAGATCAGTTCACCTTTT 104273799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TGCACCCTGAGTGCCATCATCATCAAGCATGAAAACCTTATGCAGATCAGTTCACCTTTT 2280

104273800 TTGGGATGCTTCCTCATTTATAAAATGAAAGATTTTAACTGAGTAATTGCTCAGATTCCT 104273859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TTGGGATGCTTCCTCATTTATAAAATGAAAGATTTTAACTGAGTAATTGCTCAGATTCCT 2340

104273860 AGAACTGTGTAACTCTAAAAAGATTTCCATAACCCTAGGTTATTTTTTCCTGGTTAACAA 104273919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AGAACTGTGTAACTCTAAAAAGATTTCCATAACCCTAGGTTATTTTTTCCTGGTTAACAA 2400

104273920 ATTTTTTGGTTAGACAAAAACAACAATAGCTTATACATCATGTAAATCGTTGTTTCTTTG 104273979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ATTTTTTGGTTAGACAAAAACAACAATAGCTTATACATCATGTAAATCGTTGTTTCTTTG 2460

104273980 TGCAGAATTAGGGGCTATATCTACCATAGGAGTAGTTGGCTCAGTGGCTAGGCCCTTGAG 104274039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TGCAGAATTAGGGGCTATATCTACCATAGGAGTAGTTGGCTCAGTGGCTAGGCCCTTGAG 2520

104274040 TCTGGAGTAAAAGGCTACAGCCGAGACAGTCTCATAGTCATGTGATAAATTGCTTCTGTC 104274099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TCTGGAGTAAAAGGCTACAGCCGAGACAGTCTCATAGTCATGTGATAAATTGCTTCTGTC 2580

104274100 TTCTATACTATTAAAGCTCTTAGAAGTTATGGCAAACTACTTATTTCACTCAGGTTTGTA 104274159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TTCTATACTATTAAAGCTCTTAGAAGTTATGGCAAACTACTTATTTCACTCAGGTTTGTA 2640

104274160 TTATATTATGTCAAAACATATCTATCCTTCTCCTATCACTGTGCTACTATAATGTACTTC 104274219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TTATATTATGTCAAAACATATCTATCCTTCTCCTATCACTGTGCTACTATAATGTACTTC 2700

104274220 TTTAGGGACATGACCATGCCGTTTAACTTACATCTCTCTCGCTGTACCAAATAAGACTCC 104274279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TTTAGGGACATGACCATGCCGTTTAACTTACATCTCTCTCGCTGTACCAAATAAGACTCC 2760

104274280 CCTCACAATTTACTCAGTAAATGTTTGTGGAGTAAGATTTTCACTGGCCTCATTTCTCCA 104274339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CCTCACAATTTACTCAGTAAATGTTTGTGGAGTAAGATTTTCACTGGCCTCATTTCTCCA 2820

104274340 ACTATCCTGCTTGGCAACTAATCCACAGTCATATAGGCCTCTTTTCACTTCTTTTAGTTT 104274399
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 ACTATCCTGCTTGGCAACTAATCCACGGTCATATAGGCCTCTTTTCACTTCTTTTAGTTT 2880

104274400 CTTAAATTTGGGCCTCCGCACCCCCACTCCAGCTCATGCTATTTATTCTACTTTTAATGA 104274459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CTTAAATTTGGGCCTCCGCACCCCCACTCCAGCTCATGCTATTTATTCTACTTTTAATGA 2940

104274460 TATACTGCCTGCTCGATTCCCATTCCCAGCTCCAACATTCACACTCTTCATCTTGCCCAT 104274519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TATACTGCCTGCTCGATTCCCATTCCCAGCTCCAACATTCACACTCTTCATCTTGCCCAT 3000

104274520 CTTTCAGAACTCAGCTTCACTATCTCTTAGGTGACCTTGAATAAGATCTTAATACTTTTC 104274579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CTTTCAGAACTCAGCTTCACTATCTCTTAGGTGACCTTGAATAAGATCTTAATACTTTTC 3060

104274580 CTTTCCAACAAATAACCCAGTTTTAATTATCTAATTGATTATGATATCACTTATTCATCA 104274639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 CTTTCCAACAAATAACCCAGTTTTAATTATCTAATTGATTATGATATCACTTATTCATCA 3120

104274640 CTGTGTATCAACTCATCCCAGATTCAATGGCTTCAAACAGAGAAACAAAAAAATACATTT 104274699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 CTGTGTATCAACTCATCCCAGATTCAATGGCTTCAAACAGAGAAACAAAAAAATACATTT 3180

104274700 TACTGCTTACATTCAGTAGGTTGGCCAGGTATTACATCAGCTGCTCTCTCCTGGGTTCAC 104274759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TACTGCTTACATTCAGTAGGTTGGCCAGGTATTACATCAGCTGCTCTCTCCTGGGTTCAC 3240

104274760 TCAACTGGAAGGATGAAAATGGCTTTATTCACATGTCTGGCAGTTGGTGCTTTTGCTGAT 104274819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TCAACTGGAAGGATGAAAATGGCTTTATTCACATGTCTGGCAGTTGGTGCTTTTGCTGAT 3300

104274820 TGATGGCCTCTCATTCTCCAGTACGTTAGACAAGTTTTCTTATGTTGTAGTCTCAGGACA 104274879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TGATGGCCTCTCATTCTCCAGTACGTTAGACAAGTTTTCTTATGTTGTAGTCTCAGGACA 3360

104274880 TTATTACAACTGGCAAAAACAGAAACTGTAAGGTGTCTAAAACCTAGGATCCAGAATTTA 104274939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TTATTACAACTGGCAAAAACAGAAACTGTAAGGTGTCTAAAACCTAGGATCCAGAATTTA 3420

104274940 CACACTAAGCTTCTGTCTCATTCTATTAATTAAAGCAATTTATAAGGCCAGCCCAAATTC 104274999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 CACACTAAGCTTCTGTCTCATTCTATTAATTAAAGCAATTTATAAGGCCAGCCCAAATTC 3480

104275000 AAGAGAGTGGAGGAACAGACTCCACTTTTTGTTGGAAGGAACAAAAACATTACATTGCTC 104275059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 AAGAGAGTGGAGGAACAGACTCCACTTTTTGTTGGAAGGAACAAAAACATTACATTGCTC 3540

104275060 TGGGACATGGACACAAGGAGGCTTGACTCATGGGGACCATATTATAACTCTCTACTACAT 104275119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 TGGGACATGGACACAAGGAGGCTTGACTCATGGGGACCATATTATAACTCTCTACTACAT 3600

104275120 TATGTAAAATTACTAATTTAATTTCTATATTCCCCACTAGACTATCTGTGTATATGAATA 104275179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 TATGTAAAATTACTAATTTAATTTCTATATTCCCCACTAGACTATCTGTGTATATGAATA 3660

104275180 GGGACCATGCATTTCCTAATTTATGTTATATTGCCAGCATTTAATGCAGTCTTTATATGT 104275239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 GGGACCATGCATTTCCTAATTTATGTTATATTGCCAGCATTTAATGCAGTCTTTATATGT 3720

104275240 GCTAGGCATTAATAAATATTTGTTGAATGAATAATTAAATGGCTAAATTAATAACAGAGT 104275299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 GCTAGGCATTAATAAATATTTGTTGAATGAATAATTAAATGGCTAAATTAATAACAGAGT 3780

104275300 GGATGAATTAACTTGAAAAAAGATTTCATGAACTATCAGCATGAAGATTTATCCACAAAA 104275359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 GGATGAATTAACTTGAAAAAAGATTTCATGAACTATCAGCATGAAGATTTATCCACAAAA 3840

104275360 ATAGAGAAGTGTTTCTTTTTTTGACCACATGAAAAACTAGAAACCATGTAAGCAGAAGTT 104275419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 ATAGAGAAGTGTTTCTTTTTTTGACCACATGAAAAACTAGAAACCATGTAAGCAGAAGTT 3900

104275420 ATCTAAGTTAACTTTTATTGAGTAACTGGACACAGAATTCAGGTGCTCTGTTGTTTTCTA 104275479
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     3901 ATCTAAGTTAACTTTTATTGAGTAACTGGACTCAGAATTCAGGTGCTCTGTTGTTTTCTA 3960

104275480 TTGCTGCTATAACAAAACGTCACAAACAGCAAATTACTGCAACATGAATTTATTAGCTCA 104275539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 TTGCTGCTATAACAAAACGTCACAAACAGCAAATTACTGCAACATGAATTTATTAGCTCA 4020

104275540 CAGTTCTACCAGTCAGAATTCTGGTGTGGTTTAATTTAGTTCTCTGCTCAGGTTTCTCAC 104275599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 CAGTTCTACCAGTCAGAATTCTGGTGTGGTTTAATTTAGTTCTCTGCTCAGGTTTCTCAC 4080

104275600 AAGCCAGAAATTAAAATAGCAACTGACTAGGCTCTTATCTGTAAGATCTGATGTCGAAAC 104275659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 AAGCCAGAAATTAAAATAGCAACTGACTAGGCTCTTATCTGTAAGATCTGATGTCGAAAC 4140

104275660 AATTTCCAAGCTGAATGATGTTTTTAGTAGAACTTAGCTCCTTGCAGTTGCAGAACTAAG 104275719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 AATTTCCAAGCTGAATGATGTTTTTAGTAGAACTTAGCTCCTTGCAGTTGCAGAACTAAG 4200

104275720 GTTCTCCCTTCTTGCTGGCTGGTGGCTGGGAGTCACCCTCAGCTCCTCCAGTGAGCCCAC 104275779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 GTTCTCCCTTCTTGCTGGCTGGTGGCTGGGAGTCACCCTCAGCTCCTCCAGTGAGCCCAC 4260

104275780 ATTCTTTCCGCATGTCTTCCTTTATCTTCAAGCCAGCAACAATGCATCGGGCCCTTCTCT 104275839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 ATTCTTTCCGCATGTCTTCCTTTATCTTCAAGCCAGCAACAATGCATCGGGCCCTTCTCT 4320

104275840 GCTCAGATCTCCCTGACTTCCTCTGCTGTCCTCACCAAGGAGAATACTTTGATTTAAGGA 104275899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 GCTCAGATCTCCCTGACTTCCTCTGCTGTCCTCACCAAGGAGAATACTTTGATTTAAGGA 4380

104275900 CTCCTGTAATTACATTGGCCCACCTGGGAAATCTAGGCTAATCTCTGTATCTTAAACTCA 104275959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 CTCCTGTAATTACATTGGCCCACCTGGGAAATCTAGGCTAATCTCTGTATCTTAAACTCA 4440

104275960 ATTGATTCTTAACCTTAATTACCTCTGCAATGTCATTTTGCCATGTAATATAACATATTC 104276019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 ATTGATTCTTAACCTTAATTACCTCTGCAATGTCATTTTGCCATGTAATATAACATATTC 4500

104276020 ACAGGTGTAACACCAGGGAGCAAAGGTCAGAGAGCCAAAATTCTGTCTACCGTTGATACT 104276079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 ACAGGTGTAACACCAGGGAGCAAAGGTCAGAGAGCCAAAATTCTGTCTACCGTTGATACT 4560

104276080 CAACAGCAATAAACATTCAGCTGTAGGAAACCTGAAGTCTCCAGAGAGATAATTTAGATA 104276139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 CAACAGCAATAAACATTCAGCTGTAGGAAACCTGAAGTCTCCAGAGAGATAATTTAGATA 4620

104276140 AAATACAGCCTTAAGTATAGGACAGACCTGCTTAGAATCAGGAGTCTAAATTTTTTTGGT 104276199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 AAATACAGCCTTAAGTATAGGACAGACCTGCTTAGAATCAGGAGTCTAAATTTTTTTGGT 4680

104276200 TACACAAATATAGCCAATTCTCTTTACCATTATAAATCTCAGCTTTATTTTTTTAATCTG 104276259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 TACACAAATATAGCCAATTCTCTTTACCATTATAAATCTCAGCTTTATTTTTTTAATCTG 4740

104276260 AAAAATGCAAATATTGCTGCATCTCTATCATGTTGCTTTTAACATTAATATAAGAAACAT 104276319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 AAAAATGCAAATATTGCTGCATCTCTATCATGTTGCTTTTAACATTAATATAAGAAACAT 4800

104276320 ACATATAATCAGCAAAAAAGATTTTTAAAACCTTACATATCAAAGATTACAAAAGAGAAT 104276379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 ACATATAATCAGCAAAAAAGATTTTTAAAACCTTACATATCAAAGATTACAAAAGAGAAT 4860

104276380 TAGGAGAAAGAACAAAGTCTAAAGATGTTGAGAGAGTACCCTAAAGTTATCTATTTATTT 104276439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 TAGGAGAAAGAACAAAGTCTAAAGATGTTGAGAGAGTACCCTAAAGTTATCTATTTATTT 4920

104276440 ATTCACTTGTTCAAAAATATTTAGGACTAGGCCAGCCACAGTGGCTCATGCCTGTAATTC 104276499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 ATTCACTTGTTCAAAAATATTTAGGACTAGGCCAGCCACAGTGGCTCATGCCTGTAATTC 4980

104276500 CAGCACTTTGGGGGGCCAAGGTGGGTGGATCACTTGAAGTCAGGAGTTTGAGATCAACCT 104276559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 CAGCACTTTGGGGGGCCAAGGTGGGTGGATCACTTGAAGTCAGGAGTTTGAGATCAACCT 5040

104276560 GGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGC 104276619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 GGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGC 5100

104276620 ACGTGCCTGTAATCCCAGCTATTTGGGAGACTGCATCAGGAAAATTGCTTGAATCCAGGA 104276679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 ACGTGCCTGTAATCCCAGCTATTTGGGAGACTGCATCAGGAAAATTGCTTGAATCCAGGA 5160

104276680 GGCGGAGGGTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGACAACAGAGCGA 104276739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 GGCGGAGGGTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGACAACAGAGCGA 5220

104276740 GACTCCGTCTCAAAA 104276754
          |||||||||||||||
     5221 GACTCCGTCTCAAAA 5235

EXCISED REGION

104276755 ATATATATATATATATATATATTTAGGACTAGGTTTCGATGAAATTAACCTAACAACCAA 104276814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5238 ATATATATATATATATATATATTTAGGACTAGGTTTCGATGAAATTAACCTAACAACCAA 5297

104276815 CACTTAATCCTTTGAGAAACTACTTTCTCAACTGCATGGAACTTACCTAGGATAAAAATT 104276874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5298 CACTTAATCCTTTGAGAAACTACTTTCTCAACTGCATGGAACTTACCTAGGATAAAAATT 5357

104276875 AAAATTTAGGAGAAAGTGATTTCAGAGCTCCAAATCTGTCCTGTCTGCCCTCATTTCCAT 104276934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5358 AAAATTTAGGAGAAAGTGATTTCAGAGCTCCAAATCTGTCCTGTCTGCCCTCATTTCCAT 5417

104276935 AATCTGCTTTGACTGCCATTTTGTATATCCCCTATAATTTAACCTACTTATTGATCCCAT 104276994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5418 AATCTGCTTTGACTGCCATTTTGTATATCCCCTATAATTTAACCTACTTATTGATCCCAT 5477

104276995 GATCTCTGAAAATATTCTTTTTAATTTAATTTAATTTTTAGTTCTGGGATACATGGGCAG 104277054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5478 GATCTCTGAAAATATTCTTTTTAATTTAATTTAATTTTTAGTTCTGGGATACATGGGCAG 5537

104277055 GATATGCAGCCTTGTTATATGGGTAAATGTGTTCCATGGTGGTTTGCTGCACCTATCAAA 104277114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5538 GATATGCAGCCTTGTTATATGGGTAAATGTGTTCCATGGTGGTTTGCTGCACCTATCAAA 5597

104277115 CCATCACCTAGGTATTAAGCCCCGCATGCATTAGCTACTCTTTCTGATGCGCTCCCTCCC 104277174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5598 CCATCACCTAGGTATTAAGCCCCGCATGCATTAGCTACTCTTTCTGATGCGCTCCCTCCC 5657

104277175 ACCACATCCCCAACCAACGGGCCCCATTATGTGTTGTTCCTTTCTCTGTTTTTATGTGTT 104277234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5658 ACCACATCCCCAACCAACGGGCCCCATTATGTGTTGTTCCTTTCTCTGTTTTTATGTGTT 5717

104277235 CTCATTGTTCAGCTTCCACTTATAAGTGAGAACATGTAGTGTTTAATTTTCTGTTCCTGT 104277294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5718 CTCATTGTTCAGCTTCCACTTATAAGTGAGAACATGTAGTGTTTAATTTTCTGTTCCTGT 5777

104277295 GTTAGTTTGCTGAGGATAATGGCTTCCAGCTCCATCCCTTTTCCTGCAAAGGACATGATC 104277354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5778 GTTAGTTTGCTGAGGATAATGGCTTCCAGCTCCATCCCTTTTCCTGCAAAGGACATGATC 5837

104277355 TCATTACTTTTTATGACTGCATAGTGTTCCATGGTGTAAATATATCACATTTTCATTTTC 104277414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5838 TCATTACTTTTTATGACTGCATAGTGTTCCATGGTGTAAATATATCACATTTTCATTTTC 5897

104277415 CAGTCTATCATTGATGGGCATTTGGGTTAATTCCATGTCTTTTCTACAGTGAATAGTGCT 104277474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5898 CAGTCTATCATTGATGGGCATTTGGGTTAATTCCATGTCTTTTCTACAGTGAATAGTGCT 5957

104277475 CCAGTGAACATACATGTGCAGGTATCTTTATAATAGAATGATTTATATTCTTTTGGGTAC 104277534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5958 CCAGTGAACATACATGTGCAGGTATCTTTATAATAGAATGATTTATATTCTTTTGGGTAC 6017

104277535 ATACCCAGTAATGGGATTGCTGGGTCAAATGGTATTTCTGGTTCTAGGTCTTTGAGGAAT 104277594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6018 ATACCCAGTAATGGGATTGCTGGGTCAAATGGTATTTCTGGTTCTAGGTCTTTGAGGAAT 6077

104277595 TGCTACACTGTCTTCCACAAGTAAAACCCAGAACTATAAAAACCCTAGAAGAAAAGCTAG 104277654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6078 TGCTACACTGTCTTCCACAAGTAAAACCCAGAACTATAAAAACCCTAGAAGAAAAGCTAG 6137

104277655 ACAGTACCATTCAGGACATCGGCACAGGCAAAGATTTCATGACAAAAATGTCAAAAGCAA 104277714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6138 ACAGTACCATTCAGGACATCGGCACAGGCAAAGATTTCATGACAAAAATGTCAAAAGCAA 6197

104277715 TTGCAACAAACACAAAACTTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAGAGCTTCTGCACAGCA 104277774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6198 TTGCAACAAACACAAAACTTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAGAGCTTCTGCACAGCA 6257

104277775 AAAGAAACTATCATCAGAGTGGACAGACAACCTACAGAATGGGAGAAAAGTTTGCAGTCT 104277834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6258 AAAGAAACTATCATCAGAGTGGACAGACAACCTACAGAATGGGAGAAAAGTTTGCAGTCT 6317

104277835 ATTCATCCGACAAAGGTTGAATATCCAGAATCTACAAGGAACTTAGTTCCAATTTACAAG 104277894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6318 ATTCATCCGACAAAGGTTGAATATCCAGAATCTACAAGGAACTTAGTTCCAATTTACAAG 6377

104277895 AAAAAAAAAAAACACCATTAAAAAGTCGGCAAAGGACATAAACAGACACTTCTCAAAAGA 104277954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6378 AAAAAAAAAAAACACCATTAAAAAGTCGGCAAAGGACATAAACAGACACTTCTCAAAAGA 6437

104277955 AGACATTACGTGGCCACCAAACATATGAAAAAAAACTCAACCTCACTGATCATTAGAGAA 104278014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6438 AGACATTACGTGGCCACCAAACATATGAAAAAAAACTCAACCTCACTGATCATTAGAGAA 6497

104278015 ATACAAATCAAAACCACCAAGAGATACCATCGCATGCCAGTCAGAATGGTGATTATTAAA 104278074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6498 ATACAAATCAAAACCACCAAGAGATACCATCGCATGCCAGTCAGAATGGTGATTATTAAA 6557

104278075 AAGTCAAGGAACAATAGATGCTGGTGAGGCTGTGGAGAAATAGGAATGCTCTTTTGCACT 104278134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6558 AAGTCAAGGAACAATAGATGCTGGTGAGGCTGTGGAGAAATAGGAATGCTCTTTTGCACT 6617

104278135 GTTGATGGGAATCTCTGAAAATATTTATTCCTTTGAATGAGTTTAGCATAGGATGTTACC 104278194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6618 GTTGATGGGAATCTCTGAAAATATTTATTCCTTTGAATGAGTTTAGCATAGGATGTTACC 6677

104278195 CTTAAAAGGATATTTGCATTCTAGAACACAGAGAGAAAGCTGAAGTAAAACACAAAATCA 104278254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6678 CTTAAAAGGATATTTGCATTCTAGAACACAGAGAGAAAGCTGAAGTAAAACACAAAATCA 6737

104278255 GTTCCAGTGCTTACAGAATTTGGATTATAGAGTGTGATGGAATGCATTATATCTCTTCAA 104278314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6738 GTTCCAGTGCTTACAGAATTTGGATTATAGAGTGTGATGGAATGCATTATATCTCTTCAA 6797

104278315 ATTCATATGCTGAAACCCTAACCCTAAGTGGGACTGTACTTGTAAACAGGGCCTTTAAAA 104278374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6798 ATTCATATGCTGAAACCCTAACCCTAAGTGGGACTGTACTTGTAAACAGGGCCTTTAAAA 6857

104278375 GAAGTAAGCACATTAAAGTGAAACTGGTAAGAGTGTGCCTTGATCCAATCTGATTGGTGT 104278434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6858 GAAGTAAGCACATTAAAGTGAAACTGGTAAGAGTGTGCCTTGATCCAATCTGATTGGTGT 6917

104278435 CCTTATAAGAAGTGGAAATTTGAACACACAAAGAGAAACATCAGGGGAGCTTACACACAG 104278494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6918 CCTTATAAGAAGTGGAAATTTGAACACACAAAGAGAAACATCAGGGGAGCTTACACACAG 6977

104278495 AGAAAATCCCATATAAGGACACAGCGAGAAAGCAGCCATGTGCAAGCTAAGGAAAGACTC 104278554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6978 AGAAAATCCCATATAAGGACACAGCGAGAAAGCAGCCATGTGCAAGCTAAGGAAAGACTC 7037

104278555 CGAAGAAACCAAATGTGCTGACTCTTTGAGCTTGAACTTCTAGCCTCCAGAACTGTGTGT 104278614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7038 CGAAGAAACCAAATGTGCTGACTCTTTGAGCTTGAACTTCTAGCCTCCAGAACTGTGTGT 7097

104278615 AAATCAATTTCTGTTATTTAAACCTCTATGTGGTATTTTGTAATGGCATGACCAGAAAAC 104278674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7098 AAATCAATTTCTGTTATTTAAACCTCTATGTGGTATTTTGTAATGGCATGACCAGAAAAC 7157

104278675 TAATACATAGATAAAATAACATTAAAAATAATCATCTTATAAGTGGTCAGTGGTAAAAAT 104278734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7158 TAATACATAGATAAAATAACATTAAAAATAATCATCTTATAAGTGGTCAGTGGTAAAAAT 7217

104278735 TTGTCAGCAACTTTTACCCACAATTAGACCTTTTAAAAAAATAATTTCAAAATCAGGGAA 104278794
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     7218 TTGTCAGCAACTTTTACCCACAATTAGACCTCTTAAAAAAATAATTTCAAAATCAGGGAA 7277

104278795 AAAATTCAGATTGATTAGTCCTCATGATTTTAAGGTTATCAGTGTCAGAACAAGGAAAGC 104278854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7278 AAAATTCAGATTGATTAGTCCTCATGATTTTAAGGTTATCAGTGTCAGAACAAGGAAAGC 7337

104278855 AGGAGAATAGATAGTTATATAATGTAATAATTATAATGGCTGAGAAAAGTGAAAGACTAA 104278914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7338 AGGAGAATAGATAGTTATATAATGTAATAATTATAATGGCTGAGAAAAGTGAAAGACTAA 7397

104278915 TTTTACTTGCTTATTCACATAAAATTTCTCAGAATGATAAAATAATGGTACTTTTATTGA 104278974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7398 TTTTACTTGCTTATTCACATAAAATTTCTCAGAATGATAAAATAATGGTACTTTTATTGA 7457

104278975 CAAAACTACAGAGAACTGCTATAATTGTTAAGTTACATGTGGCTACCTATATGTTACATT 104279034
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     7458 CAAAACTACAGAGAACTGCTATAATTGCTAAGTTACATGTGGCTACCTATATGTTACATT 7517

104279035 GGTTATCTATATATGCTTGTTATAACAATGTACTTTTTTGTATACCTCTACTTGGAAATG 104279094
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     7518 GGTTATCTATATATGCTTGTTATAACAATGTACTTTTTTGTATACCTTTACTTGGAAATG 7577

104279095 TATTATAGTTAAGATTCATTCATTCGACTAATATGTATTGAGTGCCTACTATGTGCCAGG 104279154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7578 TATTATAGTTAAGATTCATTCATTCGACTAATATGTATTGAGTGCCTACTATGTGCCAGG 7637

104279155 CACATGTTTTAGCTAATGTTGATGAATGGTATGGATAAAGGCCTTGACACATTCATATTT 104279214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7638 CACATGTTTTAGCTAATGTTGATGAATGGTATGGATAAAGGCCTTGACACATTCATATTT 7697

104279215 AGAAAGATGGAAATAAATACATCAACAACATGCAATCTAATAGAGTTAGTAATGATAAAG 104279274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7698 AGAAAGATGGAAATAAATACATCAACAACATGCAATCTAATAGAGTTAGTAATGATAAAG 7757

104279275 ATAAAACAGAATATAGAGAGTAAATAAGGGACCTATTTTCTATATGGTGGTCAAAAATGG 104279334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7758 ATAAAACAGAATATAGAGAGTAAATAAGGGACCTATTTTCTATATGGTGGTCAAAAATGG 7817

104279335 ACCCTGTGATTACAGCTGAATACAGACTTGAATAAAACGAGAAAGCAAGTAATTCACATA 104279394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7818 ACCCTGTGATTACAGCTGAATACAGACTTGAATAAAACGAGAAAGCAAGTAATTCACATA 7877

104279395 TCTGAGGAGAAAACTCTTTAGACACAGGGACCAGAAAGTTCAGGGGCCTTCAGCCAGAAA 104279454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7878 TCTGAGGAGAAAACTCTTTAGACACAGGGACCAGAAAGTTCAGGGGCCTTCAGCCAGAAA 7937

104279455 TATTATTGACATGTGTAAATGAAGTAGCAAAGATAGTTGTTTGAGGAGGTGAAAAGGAAA 104279514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7938 TATTATTGACATGTGTAAATGAAGTAGCAAAGATAGTTGTTTGAGGAGGTGAAAAGGAAA 7997

104279515 ATAGTGAAGATCAAATTGAAGAGACAATCAAGGCCATGCAGACTGTGGCAAGAACTTTGG 104279574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7998 ATAGTGAAGATCAAATTGAAGAGACAATCAAGGCCATGCAGACTGTGGCAAGAACTTTGG 8057

104279575 AACTTCTGTTTATTATCCGAAGAGGCCATTGGAAGGTTATAAACAAGATATAAACATGAT 104279634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8058 AACTTCTGTTTATTATCCGAAGAGGCCATTGGAAGGTTATAAACAAGATATAAACATGAT 8117

104279635 CTGACCTGTGTTTTGAAAGGATTTTTCTGGATAGGGAGTGAAAATTATATTGAAAGTGAA 104279694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8118 CTGACCTGTGTTTTGAAAGGATTTTTCTGGATAGGGAGTGAAAATTATATTGAAAGTGAA 8177

104279695 AAGATTGTAGATATAGTAGCAGTGGTAGGACTTGGGATATATATTACATACATTAGAGCT 104279754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8178 AAGATTGTAGATATAGTAGCAGTGGTAGGACTTGGGATATATATTACATACATTAGAGCT 8237

104279755 ATCCTTAACTGTATCAACTGGTCTCATTGGGTATGAGAAGAAGATCAAAGTCAAGGCCAA 104279814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8238 ATCCTTAACTGTATCAACTGGTCTCATTGGGTATGAGAAGAAGATCAAAGTCAAGGCCAA 8297

104279815 TTTTAATATGTTTGGCCTGAGCAAGAAGGTGATATCCTTTCATGAAATGGGGATCAGTGA 104279874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8298 TTTTAATATGTTTGGCCTGAGCAAGAAGGTGATATCCTTTCATGAAATGGGGATCAGTGA 8357

104279875 GAGGGGAGAAATTTACAGAGAAAAATTAAGAGTTTGGTTTTGGACCTATTAAAATTTGAG 104279934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8358 GAGGGGAGAAATTTACAGAGAAAAATTAAGAGTTTGGTTTTGGACCTATTAAAATTTGAG 8417

104279935 AAACCTGTGAGAAGTTTAAGAGGAAATGTTGATGAAGAGGAAGTTCGAAATAAGAGTCGA 104279994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8418 AAACCTGTGAGAAGTTTAAGAGGAAATGTTGATGAAGAGGAAGTTCGAAATAAGAGTCGA 8477

104279995 GAGTCCAGGGAATTGGTTTGGAGCTGGAGATTTTTTAAATTGAGAAGTTATTGGTAGATA 104280054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8478 GAGTCCAGGGAATTGGTTTGGAGCTGGAGATTTTTTAAATTGAGAAGTTATTGGTAGATA 8537

104280055 CAAGATATTTGCAGTCATGAGAGCTAACAGTTACCTAGGGAGGGAGTAAAGATGAAGAGC 104280114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8538 CAAGATATTTGCAGTCATGAGAGCTAACAGTTACCTAGGGAGGGAGTAAAGATGAAGAGC 8597

104280115 TGAAATTTAAGGATAAAATTCCAGGGATCTAGAAATTTGGAAAATTGGAAGAAGAGGTGA 104280174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8598 TGAAATTTAAGGATAAAATTCCAGGGATCTAGAAATTTGGAAAATTGGAAGAAGAGGTGA 8657

104280175 AGCCAGAAAAGACTAAGAAGGAGAGGTCAAGGAAGTAGGTGGGACAATAAAAGGATGTAG 104280234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8658 AGCCAGAAAAGACTAAGAAGGAGAGGTCAAGGAAGTAGGTGGGACAATAAAAGGATGTAG 8717

104280235 AATCTTGGCAACTGAGTGATGAAAAAATTCTTTAAAGAATCAGAAAGTGACTGGTAAACT 104280294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8718 AATCTTGGCAACTGAGTGATGAAAAAATTCTTTAAAGAATCAGAAAGTGACTGGTAAACT 8777

104280295 GGGTCAAAAGCTAGAGATTGAGTAAAAACTGAAACTTTTCTTCATTTTAACATACTTTCG 104280354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8778 GGGTCAAAAGCTAGAGATTGAGTAAAAACTGAAACTTTTCTTCATTTTAACATACTTTCG 8837

104280355 CTTTCAAGAAAATTATTACACTAAGGGGGAATAGCAGAGCAA 104280396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8838 CTTTCAAGAAAATTATTACACTAAGGGGGAATAGCAGAGCAA 8879

Alignment time is 7.04671 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [104268199,104289046] =>     20848 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     2029] =>      2029 nucs 'mol-32-2e15-190726_2029'

Score:        2029
Aligned:      2029        nucs
Identic:      2029 (100%) nucs =>       101 (100%)      1928 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [104278099,104278199] EXCISED REGION [104279047,104280974]
 second seq =>  [        1,      101] EXCISED REGION [      102,     2029]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       847 nucs [104278200,104279046]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [104278200,104278200] to [104279047,104279047]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [104278199,104278199] to [104279047,104279047]
 second seq =>         1 nucs [101,101] to [102,102]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

104278099 TGAGGCTGTGGAGAAATAGGAATGCTCTTTTGCACTGTTGATGGGAATCTCTGAAAATAT 104278158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGAGGCTGTGGAGAAATAGGAATGCTCTTTTGCACTGTTGATGGGAATCTCTGAAAATAT 60

104278159 TTATTCCTTTGAATGAGTTTAGCATAGGATGTTACCCTTAA 104278199
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTATTCCTTTGAATGAGTTTAGCATAGGATGTTACCCTTAA 101

EXCISED REGION

104279047 ATGCTTGTTATAACAATGTACTTTTTTGTATACCTCTACTTGGAAATGTATTATAGTTAA 104279106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      102 ATGCTTGTTATAACAATGTACTTTTTTGTATACCTCTACTTGGAAATGTATTATAGTTAA 161

104279107 GATTCATTCATTCGACTAATATGTATTGAGTGCCTACTATGTGCCAGGCACATGTTTTAG 104279166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      162 GATTCATTCATTCGACTAATATGTATTGAGTGCCTACTATGTGCCAGGCACATGTTTTAG 221

104279167 CTAATGTTGATGAATGGTATGGATAAAGGCCTTGACACATTCATATTTAGAAAGATGGAA 104279226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      222 CTAATGTTGATGAATGGTATGGATAAAGGCCTTGACACATTCATATTTAGAAAGATGGAA 281

104279227 ATAAATACATCAACAACATGCAATCTAATAGAGTTAGTAATGATAAAGATAAAACAGAAT 104279286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      282 ATAAATACATCAACAACATGCAATCTAATAGAGTTAGTAATGATAAAGATAAAACAGAAT 341

104279287 ATAGAGAGTAAATAAGGGACCTATTTTCTATATGGTGGTCAAAAATGGACCCTGTGATTA 104279346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      342 ATAGAGAGTAAATAAGGGACCTATTTTCTATATGGTGGTCAAAAATGGACCCTGTGATTA 401

104279347 CAGCTGAATACAGACTTGAATAAAACGAGAAAGCAAGTAATTCACATATCTGAGGAGAAA 104279406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      402 CAGCTGAATACAGACTTGAATAAAACGAGAAAGCAAGTAATTCACATATCTGAGGAGAAA 461

104279407 ACTCTTTAGACACAGGGACCAGAAAGTTCAGGGGCCTTCAGCCAGAAATATTATTGACAT 104279466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      462 ACTCTTTAGACACAGGGACCAGAAAGTTCAGGGGCCTTCAGCCAGAAATATTATTGACAT 521

104279467 GTGTAAATGAAGTAGCAAAGATAGTTGTTTGAGGAGGTGAAAAGGAAAATAGTGAAGATC 104279526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      522 GTGTAAATGAAGTAGCAAAGATAGTTGTTTGAGGAGGTGAAAAGGAAAATAGTGAAGATC 581

104279527 AAATTGAAGAGACAATCAAGGCCATGCAGACTGTGGCAAGAACTTTGGAACTTCTGTTTA 104279586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      582 AAATTGAAGAGACAATCAAGGCCATGCAGACTGTGGCAAGAACTTTGGAACTTCTGTTTA 641

104279587 TTATCCGAAGAGGCCATTGGAAGGTTATAAACAAGATATAAACATGATCTGACCTGTGTT 104279646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      642 TTATCCGAAGAGGCCATTGGAAGGTTATAAACAAGATATAAACATGATCTGACCTGTGTT 701

104279647 TTGAAAGGATTTTTCTGGATAGGGAGTGAAAATTATATTGAAAGTGAAAAGATTGTAGAT 104279706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      702 TTGAAAGGATTTTTCTGGATAGGGAGTGAAAATTATATTGAAAGTGAAAAGATTGTAGAT 761

104279707 ATAGTAGCAGTGGTAGGACTTGGGATATATATTACATACATTAGAGCTATCCTTAACTGT 104279766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      762 ATAGTAGCAGTGGTAGGACTTGGGATATATATTACATACATTAGAGCTATCCTTAACTGT 821

104279767 ATCAACTGGTCTCATTGGGTATGAGAAGAAGATCAAAGTCAAGGCCAATTTTAATATGTT 104279826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      822 ATCAACTGGTCTCATTGGGTATGAGAAGAAGATCAAAGTCAAGGCCAATTTTAATATGTT 881

104279827 TGGCCTGAGCAAGAAGGTGATATCCTTTCATGAAATGGGGATCAGTGAGAGGGGAGAAAT 104279886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      882 TGGCCTGAGCAAGAAGGTGATATCCTTTCATGAAATGGGGATCAGTGAGAGGGGAGAAAT 941

104279887 TTACAGAGAAAAATTAAGAGTTTGGTTTTGGACCTATTAAAATTTGAGAAACCTGTGAGA 104279946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      942 TTACAGAGAAAAATTAAGAGTTTGGTTTTGGACCTATTAAAATTTGAGAAACCTGTGAGA 1001

104279947 AGTTTAAGAGGAAATGTTGATGAAGAGGAAGTTCGAAATAAGAGTCGAGAGTCCAGGGAA 104280006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1002 AGTTTAAGAGGAAATGTTGATGAAGAGGAAGTTCGAAATAAGAGTCGAGAGTCCAGGGAA 1061

104280007 TTGGTTTGGAGCTGGAGATTTTTTAAATTGAGAAGTTATTGGTAGATACAAGATATTTGC 104280066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1062 TTGGTTTGGAGCTGGAGATTTTTTAAATTGAGAAGTTATTGGTAGATACAAGATATTTGC 1121

104280067 AGTCATGAGAGCTAACAGTTACCTAGGGAGGGAGTAAAGATGAAGAGCTGAAATTTAAGG 104280126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1122 AGTCATGAGAGCTAACAGTTACCTAGGGAGGGAGTAAAGATGAAGAGCTGAAATTTAAGG 1181

104280127 ATAAAATTCCAGGGATCTAGAAATTTGGAAAATTGGAAGAAGAGGTGAAGCCAGAAAAGA 104280186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1182 ATAAAATTCCAGGGATCTAGAAATTTGGAAAATTGGAAGAAGAGGTGAAGCCAGAAAAGA 1241

104280187 CTAAGAAGGAGAGGTCAAGGAAGTAGGTGGGACAATAAAAGGATGTAGAATCTTGGCAAC 104280246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1242 CTAAGAAGGAGAGGTCAAGGAAGTAGGTGGGACAATAAAAGGATGTAGAATCTTGGCAAC 1301

104280247 TGAGTGATGAAAAAATTCTTTAAAGAATCAGAAAGTGACTGGTAAACTGGGTCAAAAGCT 104280306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1302 TGAGTGATGAAAAAATTCTTTAAAGAATCAGAAAGTGACTGGTAAACTGGGTCAAAAGCT 1361

104280307 AGAGATTGAGTAAAAACTGAAACTTTTCTTCATTTTAACATACTTTCGCTTTCAAGAAAA 104280366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1362 AGAGATTGAGTAAAAACTGAAACTTTTCTTCATTTTAACATACTTTCGCTTTCAAGAAAA 1421

104280367 TTATTACACTAAGGGGGAATAGCAGAGCAATCTATTAGTGTTGCAGAGGACAGATGTGGC 104280426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1422 TTATTACACTAAGGGGGAATAGCAGAGCAATCTATTAGTGTTGCAGAGGACAGATGTGGC 1481

104280427 TTTTTCAGATGCTCAGAAGCACCCAATAAATTTGAAGAACAGACAGGTGTTCCTGAGAAC 104280486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1482 TTTTTCAGATGCTCAGAAGCACCCAATAAATTTGAAGAACAGACAGGTGTTCCTGAGAAC 1541

104280487 TCAGGGAAGAATTTGGCCAATGAAGGTCACAGGACACCTGTTCTGAAAATGTCCTACTGA 104280546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1542 TCAGGGAAGAATTTGGCCAATGAAGGTCACAGGACACCTGTTCTGAAAATGTCCTACTGA 1601

104280547 AAATGTTCTTTAGAAGTTACAGTGTTTTCATCAAGACAATGAGATTTCACTTTATAACTT 104280606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1602 AAATGTTCTTTAGAAGTTACAGTGTTTTCATCAAGACAATGAGATTTCACTTTATAACTT 1661

104280607 TACTCAGTGCCCAGGTTACCTAAAAAGTATTTTTTCATCTTCAAGGGAGAAAAAAACTTT 104280666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1662 TACTCAGTGCCCAGGTTACCTAAAAAGTATTTTTTCATCTTCAAGGGAGAAAAAAACTTT 1721

104280667 GTTATTAGGTGATATAATTAGAATGTTTTAAAGAATGACATTAGTTTGCATTTCACAGCC 104280726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1722 GTTATTAGGTGATATAATTAGAATGTTTTAAAGAATGACATTAGTTTGCATTTCACAGCC 1781

104280727 TTACTAGGTAATATGAGAAGAAAATTCCAGTTTTATATTCTCTCGTATCTCTGAATTTCT 104280786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1782 TTACTAGGTAATATGAGAAGAAAATTCCAGTTTTATATTCTCTCGTATCTCTGAATTTCT 1841

104280787 TTCTAATTTATGGAAACAGTCTAATTTATGGAAACAGAATAATTAAATGCCCATGATAAA 104280846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1842 TTCTAATTTATGGAAACAGTCTAATTTATGGAAACAGAATAATTAAATGCCCATGATAAA 1901

104280847 TTTTCAAAGTTTATGACTTTCACTTGCATGGAATTAAAAATTATTTGCTGTTTTGTTAGT 104280906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1902 TTTTCAAAGTTTATGACTTTCACTTGCATGGAATTAAAAATTATTTGCTGTTTTGTTAGT 1961

104280907 ATTACTGTTAAGTGCCTTCCATGCTGCAGTAAGAAAACAGAAAAGTGAAATTCAAGAGCT 104280966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1962 ATTACTGTTAAGTGCCTTCCATGCTGCAGTAAGAAAACAGAAAAGTGAAATTCAAGAGCT 2021

104280967 AATCCAGG 104280974
          ||||||||
     2022 AATCCAGG 2029

Alignment time is 1.64641 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [104268199,104289046] =>     20848 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     2239] =>      2239 nucs 'mol-32-2e57-055348_2239'

Score:        2239
Aligned:      2239        nucs
Identic:      2239 (100%) nucs =>       179 (100%)      2060 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [104278021,104278199] EXCISED REGION [104279047,104281106]
 second seq =>  [        1,      179] EXCISED REGION [      180,     2239]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       847 nucs [104278200,104279046]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [104278200,104278200] to [104279047,104279047]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [104278199,104278199] to [104279047,104279047]
 second seq =>         1 nucs [179,179] to [180,180]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

104278021 ATCAAAACCACCAAGAGATACCATCGCATGCCAGTCAGAATGGTGATTATTAAAAAGTCA 104278080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATCAAAACCACCAAGAGATACCATCGCATGCCAGTCAGAATGGTGATTATTAAAAAGTCA 60

104278081 AGGAACAATAGATGCTGGTGAGGCTGTGGAGAAATAGGAATGCTCTTTTGCACTGTTGAT 104278140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGGAACAATAGATGCTGGTGAGGCTGTGGAGAAATAGGAATGCTCTTTTGCACTGTTGAT 120

104278141 GGGAATCTCTGAAAATATTTATTCCTTTGAATGAGTTTAGCATAGGATGTTACCCTTAA 104278199
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGGAATCTCTGAAAATATTTATTCCTTTGAATGAGTTTAGCATAGGATGTTACCCTTAA 179

EXCISED REGION

104279047 ATGCTTGTTATAACAATGTACTTTTTTGTATACCTCTACTTGGAAATGTATTATAGTTAA 104279106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      180 ATGCTTGTTATAACAATGTACTTTTTTGTATACCTCTACTTGGAAATGTATTATAGTTAA 239

104279107 GATTCATTCATTCGACTAATATGTATTGAGTGCCTACTATGTGCCAGGCACATGTTTTAG 104279166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      240 GATTCATTCATTCGACTAATATGTATTGAGTGCCTACTATGTGCCAGGCACATGTTTTAG 299

104279167 CTAATGTTGATGAATGGTATGGATAAAGGCCTTGACACATTCATATTTAGAAAGATGGAA 104279226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      300 CTAATGTTGATGAATGGTATGGATAAAGGCCTTGACACATTCATATTTAGAAAGATGGAA 359

104279227 ATAAATACATCAACAACATGCAATCTAATAGAGTTAGTAATGATAAAGATAAAACAGAAT 104279286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      360 ATAAATACATCAACAACATGCAATCTAATAGAGTTAGTAATGATAAAGATAAAACAGAAT 419

104279287 ATAGAGAGTAAATAAGGGACCTATTTTCTATATGGTGGTCAAAAATGGACCCTGTGATTA 104279346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      420 ATAGAGAGTAAATAAGGGACCTATTTTCTATATGGTGGTCAAAAATGGACCCTGTGATTA 479

104279347 CAGCTGAATACAGACTTGAATAAAACGAGAAAGCAAGTAATTCACATATCTGAGGAGAAA 104279406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      480 CAGCTGAATACAGACTTGAATAAAACGAGAAAGCAAGTAATTCACATATCTGAGGAGAAA 539

104279407 ACTCTTTAGACACAGGGACCAGAAAGTTCAGGGGCCTTCAGCCAGAAATATTATTGACAT 104279466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      540 ACTCTTTAGACACAGGGACCAGAAAGTTCAGGGGCCTTCAGCCAGAAATATTATTGACAT 599

104279467 GTGTAAATGAAGTAGCAAAGATAGTTGTTTGAGGAGGTGAAAAGGAAAATAGTGAAGATC 104279526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      600 GTGTAAATGAAGTAGCAAAGATAGTTGTTTGAGGAGGTGAAAAGGAAAATAGTGAAGATC 659

104279527 AAATTGAAGAGACAATCAAGGCCATGCAGACTGTGGCAAGAACTTTGGAACTTCTGTTTA 104279586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      660 AAATTGAAGAGACAATCAAGGCCATGCAGACTGTGGCAAGAACTTTGGAACTTCTGTTTA 719

104279587 TTATCCGAAGAGGCCATTGGAAGGTTATAAACAAGATATAAACATGATCTGACCTGTGTT 104279646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      720 TTATCCGAAGAGGCCATTGGAAGGTTATAAACAAGATATAAACATGATCTGACCTGTGTT 779

104279647 TTGAAAGGATTTTTCTGGATAGGGAGTGAAAATTATATTGAAAGTGAAAAGATTGTAGAT 104279706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      780 TTGAAAGGATTTTTCTGGATAGGGAGTGAAAATTATATTGAAAGTGAAAAGATTGTAGAT 839

104279707 ATAGTAGCAGTGGTAGGACTTGGGATATATATTACATACATTAGAGCTATCCTTAACTGT 104279766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 ATAGTAGCAGTGGTAGGACTTGGGATATATATTACATACATTAGAGCTATCCTTAACTGT 899

104279767 ATCAACTGGTCTCATTGGGTATGAGAAGAAGATCAAAGTCAAGGCCAATTTTAATATGTT 104279826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 ATCAACTGGTCTCATTGGGTATGAGAAGAAGATCAAAGTCAAGGCCAATTTTAATATGTT 959

104279827 TGGCCTGAGCAAGAAGGTGATATCCTTTCATGAAATGGGGATCAGTGAGAGGGGAGAAAT 104279886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 TGGCCTGAGCAAGAAGGTGATATCCTTTCATGAAATGGGGATCAGTGAGAGGGGAGAAAT 1019

104279887 TTACAGAGAAAAATTAAGAGTTTGGTTTTGGACCTATTAAAATTTGAGAAACCTGTGAGA 104279946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 TTACAGAGAAAAATTAAGAGTTTGGTTTTGGACCTATTAAAATTTGAGAAACCTGTGAGA 1079

104279947 AGTTTAAGAGGAAATGTTGATGAAGAGGAAGTTCGAAATAAGAGTCGAGAGTCCAGGGAA 104280006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 AGTTTAAGAGGAAATGTTGATGAAGAGGAAGTTCGAAATAAGAGTCGAGAGTCCAGGGAA 1139

104280007 TTGGTTTGGAGCTGGAGATTTTTTAAATTGAGAAGTTATTGGTAGATACAAGATATTTGC 104280066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 TTGGTTTGGAGCTGGAGATTTTTTAAATTGAGAAGTTATTGGTAGATACAAGATATTTGC 1199

104280067 AGTCATGAGAGCTAACAGTTACCTAGGGAGGGAGTAAAGATGAAGAGCTGAAATTTAAGG 104280126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 AGTCATGAGAGCTAACAGTTACCTAGGGAGGGAGTAAAGATGAAGAGCTGAAATTTAAGG 1259

104280127 ATAAAATTCCAGGGATCTAGAAATTTGGAAAATTGGAAGAAGAGGTGAAGCCAGAAAAGA 104280186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 ATAAAATTCCAGGGATCTAGAAATTTGGAAAATTGGAAGAAGAGGTGAAGCCAGAAAAGA 1319

104280187 CTAAGAAGGAGAGGTCAAGGAAGTAGGTGGGACAATAAAAGGATGTAGAATCTTGGCAAC 104280246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 CTAAGAAGGAGAGGTCAAGGAAGTAGGTGGGACAATAAAAGGATGTAGAATCTTGGCAAC 1379

104280247 TGAGTGATGAAAAAATTCTTTAAAGAATCAGAAAGTGACTGGTAAACTGGGTCAAAAGCT 104280306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 TGAGTGATGAAAAAATTCTTTAAAGAATCAGAAAGTGACTGGTAAACTGGGTCAAAAGCT 1439

104280307 AGAGATTGAGTAAAAACTGAAACTTTTCTTCATTTTAACATACTTTCGCTTTCAAGAAAA 104280366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 AGAGATTGAGTAAAAACTGAAACTTTTCTTCATTTTAACATACTTTCGCTTTCAAGAAAA 1499

104280367 TTATTACACTAAGGGGGAATAGCAGAGCAATCTATTAGTGTTGCAGAGGACAGATGTGGC 104280426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 TTATTACACTAAGGGGGAATAGCAGAGCAATCTATTAGTGTTGCAGAGGACAGATGTGGC 1559

104280427 TTTTTCAGATGCTCAGAAGCACCCAATAAATTTGAAGAACAGACAGGTGTTCCTGAGAAC 104280486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 TTTTTCAGATGCTCAGAAGCACCCAATAAATTTGAAGAACAGACAGGTGTTCCTGAGAAC 1619

104280487 TCAGGGAAGAATTTGGCCAATGAAGGTCACAGGACACCTGTTCTGAAAATGTCCTACTGA 104280546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 TCAGGGAAGAATTTGGCCAATGAAGGTCACAGGACACCTGTTCTGAAAATGTCCTACTGA 1679

104280547 AAATGTTCTTTAGAAGTTACAGTGTTTTCATCAAGACAATGAGATTTCACTTTATAACTT 104280606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 AAATGTTCTTTAGAAGTTACAGTGTTTTCATCAAGACAATGAGATTTCACTTTATAACTT 1739

104280607 TACTCAGTGCCCAGGTTACCTAAAAAGTATTTTTTCATCTTCAAGGGAGAAAAAAACTTT 104280666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 TACTCAGTGCCCAGGTTACCTAAAAAGTATTTTTTCATCTTCAAGGGAGAAAAAAACTTT 1799

104280667 GTTATTAGGTGATATAATTAGAATGTTTTAAAGAATGACATTAGTTTGCATTTCACAGCC 104280726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 GTTATTAGGTGATATAATTAGAATGTTTTAAAGAATGACATTAGTTTGCATTTCACAGCC 1859

104280727 TTACTAGGTAATATGAGAAGAAAATTCCAGTTTTATATTCTCTCGTATCTCTGAATTTCT 104280786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 TTACTAGGTAATATGAGAAGAAAATTCCAGTTTTATATTCTCTCGTATCTCTGAATTTCT 1919

104280787 TTCTAATTTATGGAAACAGTCTAATTTATGGAAACAGAATAATTAAATGCCCATGATAAA 104280846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 TTCTAATTTATGGAAACAGTCTAATTTATGGAAACAGAATAATTAAATGCCCATGATAAA 1979

104280847 TTTTCAAAGTTTATGACTTTCACTTGCATGGAATTAAAAATTATTTGCTGTTTTGTTAGT 104280906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 TTTTCAAAGTTTATGACTTTCACTTGCATGGAATTAAAAATTATTTGCTGTTTTGTTAGT 2039

104280907 ATTACTGTTAAGTGCCTTCCATGCTGCAGTAAGAAAACAGAAAAGTGAAATTCAAGAGCT 104280966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 ATTACTGTTAAGTGCCTTCCATGCTGCAGTAAGAAAACAGAAAAGTGAAATTCAAGAGCT 2099

104280967 AATCCAGGAGTATAAATGGGAAGTTTTTTTTTTATTAACTTGACAAATCTACATAAGCCA 104281026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 AATCCAGGAGTATAAATGGGAAGTTTTTTTTTTATTAACTTGACAAATCTACATAAGCCA 2159

104281027 TATTTAACTTCTTCAAAAGGAAAAGTATTTGAAACATGCATGTGAATCATGGGATGATAT 104281086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 TATTTAACTTCTTCAAAAGGAAAAGTATTTGAAACATGCATGTGAATCATGGGATGATAT 2219

104281087 GTAAAATTTGACCAATCCAC 104281106
          ||||||||||||||||||||
     2220 GTAAAATTTGACCAATCCAC 2239

Alignment time is 1.81202 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [104268199,104289046] =>     20848 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     2834] =>      2834 nucs 'mol-32-2f07-099002_2834'

Score:        2825
Aligned:      2825        nucs
Identic:      2825 (100%) nucs =>      1324 (100%)      1501 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [104276876,104278199] EXCISED REGION [104279047,104280547]
 second seq =>  [       10,     1333] EXCISED REGION [     1334,     2834]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       847 nucs [104278200,104279046]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [104278200,104278200] to [104279047,104279047]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [104278199,104278199] to [104279047,104279047]
 second seq =>         1 nucs [1333,1333] to [1334,1334]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

104276876 AAATTTAGGAGAAAGTGATTTCAGAGCTCCAAATCTGTCCTGTCTGCCCTCATTTCCATA 104276935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       10 AAATTTAGGAGAAAGTGATTTCAGAGCTCCAAATCTGTCCTGTCTGCCCTCATTTCCATA 69

104276936 ATCTGCTTTGACTGCCATTTTGTATATCCCCTATAATTTAACCTACTTATTGATCCCATG 104276995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       70 ATCTGCTTTGACTGCCATTTTGTATATCCCCTATAATTTAACCTACTTATTGATCCCATG 129

104276996 ATCTCTGAAAATATTCTTTTTAATTTAATTTAATTTTTAGTTCTGGGATACATGGGCAGG 104277055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      130 ATCTCTGAAAATATTCTTTTTAATTTAATTTAATTTTTAGTTCTGGGATACATGGGCAGG 189

104277056 ATATGCAGCCTTGTTATATGGGTAAATGTGTTCCATGGTGGTTTGCTGCACCTATCAAAC 104277115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      190 ATATGCAGCCTTGTTATATGGGTAAATGTGTTCCATGGTGGTTTGCTGCACCTATCAAAC 249

104277116 CATCACCTAGGTATTAAGCCCCGCATGCATTAGCTACTCTTTCTGATGCGCTCCCTCCCA 104277175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      250 CATCACCTAGGTATTAAGCCCCGCATGCATTAGCTACTCTTTCTGATGCGCTCCCTCCCA 309

104277176 CCACATCCCCAACCAACGGGCCCCATTATGTGTTGTTCCTTTCTCTGTTTTTATGTGTTC 104277235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      310 CCACATCCCCAACCAACGGGCCCCATTATGTGTTGTTCCTTTCTCTGTTTTTATGTGTTC 369

104277236 TCATTGTTCAGCTTCCACTTATAAGTGAGAACATGTAGTGTTTAATTTTCTGTTCCTGTG 104277295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      370 TCATTGTTCAGCTTCCACTTATAAGTGAGAACATGTAGTGTTTAATTTTCTGTTCCTGTG 429

104277296 TTAGTTTGCTGAGGATAATGGCTTCCAGCTCCATCCCTTTTCCTGCAAAGGACATGATCT 104277355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      430 TTAGTTTGCTGAGGATAATGGCTTCCAGCTCCATCCCTTTTCCTGCAAAGGACATGATCT 489

104277356 CATTACTTTTTATGACTGCATAGTGTTCCATGGTGTAAATATATCACATTTTCATTTTCC 104277415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      490 CATTACTTTTTATGACTGCATAGTGTTCCATGGTGTAAATATATCACATTTTCATTTTCC 549

104277416 AGTCTATCATTGATGGGCATTTGGGTTAATTCCATGTCTTTTCTACAGTGAATAGTGCTC 104277475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      550 AGTCTATCATTGATGGGCATTTGGGTTAATTCCATGTCTTTTCTACAGTGAATAGTGCTC 609

104277476 CAGTGAACATACATGTGCAGGTATCTTTATAATAGAATGATTTATATTCTTTTGGGTACA 104277535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      610 CAGTGAACATACATGTGCAGGTATCTTTATAATAGAATGATTTATATTCTTTTGGGTACA 669

104277536 TACCCAGTAATGGGATTGCTGGGTCAAATGGTATTTCTGGTTCTAGGTCTTTGAGGAATT 104277595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      670 TACCCAGTAATGGGATTGCTGGGTCAAATGGTATTTCTGGTTCTAGGTCTTTGAGGAATT 729

104277596 GCTACACTGTCTTCCACAAGTAAAACCCAGAACTATAAAAACCCTAGAAGAAAAGCTAGA 104277655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      730 GCTACACTGTCTTCCACAAGTAAAACCCAGAACTATAAAAACCCTAGAAGAAAAGCTAGA 789

104277656 CAGTACCATTCAGGACATCGGCACAGGCAAAGATTTCATGACAAAAATGTCAAAAGCAAT 104277715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      790 CAGTACCATTCAGGACATCGGCACAGGCAAAGATTTCATGACAAAAATGTCAAAAGCAAT 849

104277716 TGCAACAAACACAAAACTTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAGAGCTTCTGCACAGCAA 104277775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      850 TGCAACAAACACAAAACTTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAGAGCTTCTGCACAGCAA 909

104277776 AAGAAACTATCATCAGAGTGGACAGACAACCTACAGAATGGGAGAAAAGTTTGCAGTCTA 104277835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      910 AAGAAACTATCATCAGAGTGGACAGACAACCTACAGAATGGGAGAAAAGTTTGCAGTCTA 969

104277836 TTCATCCGACAAAGGTTGAATATCCAGAATCTACAAGGAACTTAGTTCCAATTTACAAGA 104277895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      970 TTCATCCGACAAAGGTTGAATATCCAGAATCTACAAGGAACTTAGTTCCAATTTACAAGA 1029

104277896 AAAAAAAAAAACACCATTAAAAAGTCGGCAAAGGACATAAACAGACACTTCTCAAAAGAA 104277955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1030 AAAAAAAAAAACACCATTAAAAAGTCGGCAAAGGACATAAACAGACACTTCTCAAAAGAA 1089

104277956 GACATTACGTGGCCACCAAACATATGAAAAAAAACTCAACCTCACTGATCATTAGAGAAA 104278015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1090 GACATTACGTGGCCACCAAACATATGAAAAAAAACTCAACCTCACTGATCATTAGAGAAA 1149

104278016 TACAAATCAAAACCACCAAGAGATACCATCGCATGCCAGTCAGAATGGTGATTATTAAAA 104278075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1150 TACAAATCAAAACCACCAAGAGATACCATCGCATGCCAGTCAGAATGGTGATTATTAAAA 1209

104278076 AGTCAAGGAACAATAGATGCTGGTGAGGCTGTGGAGAAATAGGAATGCTCTTTTGCACTG 104278135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1210 AGTCAAGGAACAATAGATGCTGGTGAGGCTGTGGAGAAATAGGAATGCTCTTTTGCACTG 1269

104278136 TTGATGGGAATCTCTGAAAATATTTATTCCTTTGAATGAGTTTAGCATAGGATGTTACCC 104278195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1270 TTGATGGGAATCTCTGAAAATATTTATTCCTTTGAATGAGTTTAGCATAGGATGTTACCC 1329

104278196 TTAA 104278199
          ||||
     1330 TTAA 1333

EXCISED REGION

104279047 ATGCTTGTTATAACAATGTACTTTTTTGTATACCTCTACTTGGAAATGTATTATAGTTAA 104279106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1334 ATGCTTGTTATAACAATGTACTTTTTTGTATACCTCTACTTGGAAATGTATTATAGTTAA 1393

104279107 GATTCATTCATTCGACTAATATGTATTGAGTGCCTACTATGTGCCAGGCACATGTTTTAG 104279166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1394 GATTCATTCATTCGACTAATATGTATTGAGTGCCTACTATGTGCCAGGCACATGTTTTAG 1453

104279167 CTAATGTTGATGAATGGTATGGATAAAGGCCTTGACACATTCATATTTAGAAAGATGGAA 104279226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1454 CTAATGTTGATGAATGGTATGGATAAAGGCCTTGACACATTCATATTTAGAAAGATGGAA 1513

104279227 ATAAATACATCAACAACATGCAATCTAATAGAGTTAGTAATGATAAAGATAAAACAGAAT 104279286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1514 ATAAATACATCAACAACATGCAATCTAATAGAGTTAGTAATGATAAAGATAAAACAGAAT 1573

104279287 ATAGAGAGTAAATAAGGGACCTATTTTCTATATGGTGGTCAAAAATGGACCCTGTGATTA 104279346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1574 ATAGAGAGTAAATAAGGGACCTATTTTCTATATGGTGGTCAAAAATGGACCCTGTGATTA 1633

104279347 CAGCTGAATACAGACTTGAATAAAACGAGAAAGCAAGTAATTCACATATCTGAGGAGAAA 104279406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1634 CAGCTGAATACAGACTTGAATAAAACGAGAAAGCAAGTAATTCACATATCTGAGGAGAAA 1693

104279407 ACTCTTTAGACACAGGGACCAGAAAGTTCAGGGGCCTTCAGCCAGAAATATTATTGACAT 104279466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1694 ACTCTTTAGACACAGGGACCAGAAAGTTCAGGGGCCTTCAGCCAGAAATATTATTGACAT 1753

104279467 GTGTAAATGAAGTAGCAAAGATAGTTGTTTGAGGAGGTGAAAAGGAAAATAGTGAAGATC 104279526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1754 GTGTAAATGAAGTAGCAAAGATAGTTGTTTGAGGAGGTGAAAAGGAAAATAGTGAAGATC 1813

104279527 AAATTGAAGAGACAATCAAGGCCATGCAGACTGTGGCAAGAACTTTGGAACTTCTGTTTA 104279586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1814 AAATTGAAGAGACAATCAAGGCCATGCAGACTGTGGCAAGAACTTTGGAACTTCTGTTTA 1873

104279587 TTATCCGAAGAGGCCATTGGAAGGTTATAAACAAGATATAAACATGATCTGACCTGTGTT 104279646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1874 TTATCCGAAGAGGCCATTGGAAGGTTATAAACAAGATATAAACATGATCTGACCTGTGTT 1933

104279647 TTGAAAGGATTTTTCTGGATAGGGAGTGAAAATTATATTGAAAGTGAAAAGATTGTAGAT 104279706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1934 TTGAAAGGATTTTTCTGGATAGGGAGTGAAAATTATATTGAAAGTGAAAAGATTGTAGAT 1993

104279707 ATAGTAGCAGTGGTAGGACTTGGGATATATATTACATACATTAGAGCTATCCTTAACTGT 104279766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1994 ATAGTAGCAGTGGTAGGACTTGGGATATATATTACATACATTAGAGCTATCCTTAACTGT 2053

104279767 ATCAACTGGTCTCATTGGGTATGAGAAGAAGATCAAAGTCAAGGCCAATTTTAATATGTT 104279826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2054 ATCAACTGGTCTCATTGGGTATGAGAAGAAGATCAAAGTCAAGGCCAATTTTAATATGTT 2113

104279827 TGGCCTGAGCAAGAAGGTGATATCCTTTCATGAAATGGGGATCAGTGAGAGGGGAGAAAT 104279886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2114 TGGCCTGAGCAAGAAGGTGATATCCTTTCATGAAATGGGGATCAGTGAGAGGGGAGAAAT 2173

104279887 TTACAGAGAAAAATTAAGAGTTTGGTTTTGGACCTATTAAAATTTGAGAAACCTGTGAGA 104279946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2174 TTACAGAGAAAAATTAAGAGTTTGGTTTTGGACCTATTAAAATTTGAGAAACCTGTGAGA 2233

104279947 AGTTTAAGAGGAAATGTTGATGAAGAGGAAGTTCGAAATAAGAGTCGAGAGTCCAGGGAA 104280006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2234 AGTTTAAGAGGAAATGTTGATGAAGAGGAAGTTCGAAATAAGAGTCGAGAGTCCAGGGAA 2293

104280007 TTGGTTTGGAGCTGGAGATTTTTTAAATTGAGAAGTTATTGGTAGATACAAGATATTTGC 104280066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2294 TTGGTTTGGAGCTGGAGATTTTTTAAATTGAGAAGTTATTGGTAGATACAAGATATTTGC 2353

104280067 AGTCATGAGAGCTAACAGTTACCTAGGGAGGGAGTAAAGATGAAGAGCTGAAATTTAAGG 104280126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2354 AGTCATGAGAGCTAACAGTTACCTAGGGAGGGAGTAAAGATGAAGAGCTGAAATTTAAGG 2413

104280127 ATAAAATTCCAGGGATCTAGAAATTTGGAAAATTGGAAGAAGAGGTGAAGCCAGAAAAGA 104280186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2414 ATAAAATTCCAGGGATCTAGAAATTTGGAAAATTGGAAGAAGAGGTGAAGCCAGAAAAGA 2473

104280187 CTAAGAAGGAGAGGTCAAGGAAGTAGGTGGGACAATAAAAGGATGTAGAATCTTGGCAAC 104280246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2474 CTAAGAAGGAGAGGTCAAGGAAGTAGGTGGGACAATAAAAGGATGTAGAATCTTGGCAAC 2533

104280247 TGAGTGATGAAAAAATTCTTTAAAGAATCAGAAAGTGACTGGTAAACTGGGTCAAAAGCT 104280306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2534 TGAGTGATGAAAAAATTCTTTAAAGAATCAGAAAGTGACTGGTAAACTGGGTCAAAAGCT 2593

104280307 AGAGATTGAGTAAAAACTGAAACTTTTCTTCATTTTAACATACTTTCGCTTTCAAGAAAA 104280366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2594 AGAGATTGAGTAAAAACTGAAACTTTTCTTCATTTTAACATACTTTCGCTTTCAAGAAAA 2653

104280367 TTATTACACTAAGGGGGAATAGCAGAGCAATCTATTAGTGTTGCAGAGGACAGATGTGGC 104280426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2654 TTATTACACTAAGGGGGAATAGCAGAGCAATCTATTAGTGTTGCAGAGGACAGATGTGGC 2713

104280427 TTTTTCAGATGCTCAGAAGCACCCAATAAATTTGAAGAACAGACAGGTGTTCCTGAGAAC 104280486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2714 TTTTTCAGATGCTCAGAAGCACCCAATAAATTTGAAGAACAGACAGGTGTTCCTGAGAAC 2773

104280487 TCAGGGAAGAATTTGGCCAATGAAGGTCACAGGACACCTGTTCTGAAAATGTCCTACTGA 104280546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2774 TCAGGGAAGAATTTGGCCAATGAAGGTCACAGGACACCTGTTCTGAAAATGTCCTACTGA 2833

104280547 A 104280547
          |
     2834 A 2834

Alignment time is 2.28063 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [104268199,104289046] =>     20848 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     2360] =>      2360 nucs 'mol-32-2fb7-093479_2360'

Score:        2337
Aligned:      2359        nucs
Identic:      2357 (100%) nucs =>       639 (100%)      1718 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [104278363,104279001] EXCISED REGION [104279003,104280722]
 second seq =>  [        1,      639] EXCISED REGION [      641,     2360]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [104279002,104279002]
 second seq =>         1 nucs [640,640]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [104279002,104279002] to [104279003,104279003]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

104278363 GGGCCTTTAAAAGAAGTAAGCACATTAAAGTGAAACTGGTAAGAGTGTGCCTTGATCCAA 104278422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGGCCTTTAAAAGAAGTAAGCACATTAAAGTGAAACTGGTAAGAGTGTGCCTTGATCCAA 60

104278423 TCTGATTGGTGTCCTTATAAGAAGTGGAAATTTGAACACACAAAGAGAAACATCAGGGGA 104278482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCTGATTGGTGTCCTTATAAGAAGTGGAAATTTGAACACACAAAGAGAAACATCAGGGGA 120

104278483 GCTTACACACAGAGAAAATCCCATATAAGGACACAGCGAGAAAGCAGCCATGTGCAAGCT 104278542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GCTTACACACAGAGAAAATCCCATATAAGGACACAGCGAGAAAGCAGCCATGTGCAAGCT 180

104278543 AAGGAAAGACTCCGAAGAAACCAAATGTGCTGACTCTTTGAGCTTGAACTTCTAGCCTCC 104278602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAGGAAAGACTCCGAAGAAACCAAATGTGCTGACTCTTTGAGCTTGAACTTCTAGCCTCC 240

104278603 AGAACTGTGTGTAAATCAATTTCTGTTATTTAAACCTCTATGTGGTATTTTGTAATGGCA 104278662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGAACTGTGTGTAAATCAATTTCTGTTATTTAAACCTCTATGTGGTATTTTGTAATGGCA 300

104278663 TGACCAGAAAACTAATACATAGATAAAATAACATTAAAAATAATCATCTTATAAGTGGTC 104278722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGACCAGAAAACTAATACATAGATAAAATAACATTAAAAATAATCATCTTATAAGTGGTC 360

104278723 AGTGGTAAAAATTTGTCAGCAACTTTTACCCACAATTAGACCTTTTAAAAAAATAATTTC 104278782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGTGGTAAAAATTTGTCAGCAACTTTTACCCACAATTAGACCTTTTAAAAAAATAATTTC 420

104278783 AAAATCAGGGAAAAAATTCAGATTGATTAGTCCTCATGATTTTAAGGTTATCAGTGTCAG 104278842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAAATCAGGGAAAAAATTCAGATTGATTAGTCCTCATGATTTTAAGGTTATCAGTGTCAG 480

104278843 AACAAGGAAAGCAGGAGAATAGATAGTTATATAATGTAATAATTATAATGGCTGAGAAAA 104278902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AACAAGGAAAGCAGGAGAATAGATAGTTATATAATGTAATAATTATAATGGCTGAGAAAA 540

104278903 GTGAAAGACTAATTTTACTTGCTTATTCACATAAAATTTCTCAGAATGATAAAATAATGG 104278962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GTGAAAGACTAATTTTACTTGCTTATTCACATAAAATTTCTCAGAATGATAAAATAATGG 600

104278963 TACTTTTATTGACAAAACTACAGAGAACTGCTATAATTG 104279001
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TACTTTTATTGACAAAACTACAGAGAACTGCTATAATTG 639

EXCISED REGION

104279003 TAAGTTACATGTGGCTACCTATATGTTACATTGGTTATCTATATATGCTTGTTATAACAA 104279062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      641 TAAGTTACATGTGGCTACCTATATGTTACATTGGTTATCTATATATGCTTGTTATAACAA 700

104279063 TGTACTTTTTTGTATACCTCTACTTGGAAATGTATTATAGTTAAGATTCATTCATTCGAC 104279122
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      701 TGTACTTTTTTGTATACCTTTACTTGGAAATGTATTATAGTTAAGATTCATTCATTCGAC 760

104279123 TAATATGTATTGAGTGCCTACTATGTGCCAGGCACATGTTTTAGCTAATGTTGATGAATG 104279182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      761 TAATATGTATTGAGTGCCTACTATGTGCCAGGCACATGTTTTAGCTAATGTTGATGAATG 820

104279183 GTATGGATAAAGGCCTTGACACATTCATATTTAGAAAGATGGAAATAAATACATCAACAA 104279242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      821 GTATGGATAAAGGCCTTGACACATTCATATTTAGAAAGATGGAAATAAATACATCAACAA 880

104279243 CATGCAATCTAATAGAGTTAGTAATGATAAAGATAAAACAGAATATAGAGAGTAAATAAG 104279302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      881 CATGCAATCTAATAGAGTTAGTAATGATAAAGATAAAACAGAATATAGAGAGTAAATAAG 940

104279303 GGACCTATTTTCTATATGGTGGTCAAAAATGGACCCTGTGATTACAGCTGAATACAGACT 104279362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      941 GGACCTATTTTCTATATGGTGGTCAAAAATGGACCCTGTGATTACAGCTGAATACAGACT 1000

104279363 TGAATAAAACGAGAAAGCAAGTAATTCACATATCTGAGGAGAAAACTCTTTAGACACAGG 104279422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1001 TGAATAAAACGAGAAAGCAAGTAATTCACATATCTGAGGAGAAAACTCTTTAGACACAGG 1060

104279423 GACCAGAAAGTTCAGGGGCCTTCAGCCAGAAATATTATTGACATGTGTAAATGAAGTAGC 104279482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1061 GACCAGAAAGTTCAGGGGCCTTCAGCCAGAAATATTATTGACATGTGTAAATGAAGTAGC 1120

104279483 AAAGATAGTTGTTTGAGGAGGTGAAAAGGAAAATAGTGAAGATCAAATTGAAGAGACAAT 104279542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1121 AAAGATAGTTGTTTGAGGAGGTGAAAAGGAAAATAGTGAAGATCAAATTGAAGAGACAAT 1180

104279543 CAAGGCCATGCAGACTGTGGCAAGAACTTTGGAACTTCTGTTTATTATCCGAAGAGGCCA 104279602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1181 CAAGGCCATGCAGACTGTGGCAAGAACTTTGGAACTTCTGTTTATTATCCGAAGAGGCCA 1240

104279603 TTGGAAGGTTATAAACAAGATATAAACATGATCTGACCTGTGTTTTGAAAGGATTTTTCT 104279662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1241 TTGGAAGGTTATAAACAAGATATAAACATGATCTGACCTGTGTTTTGAAAGGATTTTTCT 1300

104279663 GGATAGGGAGTGAAAATTATATTGAAAGTGAAAAGATTGTAGATATAGTAGCAGTGGTAG 104279722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1301 GGATAGGGAGTGAAAATTATATTGAAAGTGAAAAGATTGTAGATATAGTAGCAGTGGTAG 1360

104279723 GACTTGGGATATATATTACATACATTAGAGCTATCCTTAACTGTATCAACTGGTCTCATT 104279782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1361 GACTTGGGATATATATTACATACATTAGAGCTATCCTTAACTGTATCAACTGGTCTCATT 1420

104279783 GGGTATGAGAAGAAGATCAAAGTCAAGGCCAATTTTAATATGTTTGGCCTGAGCAAGAAG 104279842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1421 GGGTATGAGAAGAAGATCAAAGTCAAGGCCAATTTTAATATGTTTGGCCTGAGCAAGAAG 1480

104279843 GTGATATCCTTTCATGAAATGGGGATCAGTGAGAGGGGAGAAATTTACAGAGAAAAATTA 104279902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1481 GTGATATCCTTTCATGAAATGGGGATCAGTGAGAGGGGAGAAATTTACAGAGAAAAATTA 1540

104279903 AGAGTTTGGTTTTGGACCTATTAAAATTTGAGAAACCTGTGAGAAGTTTAAGAGGAAATG 104279962
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1541 AGAGTTCGGTTTTGGACCTATTAAAATTTGAGAAACCTGTGAGAAGTTTAAGAGGAAATG 1600

104279963 TTGATGAAGAGGAAGTTCGAAATAAGAGTCGAGAGTCCAGGGAATTGGTTTGGAGCTGGA 104280022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1601 TTGATGAAGAGGAAGTTCGAAATAAGAGTCGAGAGTCCAGGGAATTGGTTTGGAGCTGGA 1660

104280023 GATTTTTTAAATTGAGAAGTTATTGGTAGATACAAGATATTTGCAGTCATGAGAGCTAAC 104280082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1661 GATTTTTTAAATTGAGAAGTTATTGGTAGATACAAGATATTTGCAGTCATGAGAGCTAAC 1720

104280083 AGTTACCTAGGGAGGGAGTAAAGATGAAGAGCTGAAATTTAAGGATAAAATTCCAGGGAT 104280142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1721 AGTTACCTAGGGAGGGAGTAAAGATGAAGAGCTGAAATTTAAGGATAAAATTCCAGGGAT 1780

104280143 CTAGAAATTTGGAAAATTGGAAGAAGAGGTGAAGCCAGAAAAGACTAAGAAGGAGAGGTC 104280202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1781 CTAGAAATTTGGAAAATTGGAAGAAGAGGTGAAGCCAGAAAAGACTAAGAAGGAGAGGTC 1840

104280203 AAGGAAGTAGGTGGGACAATAAAAGGATGTAGAATCTTGGCAACTGAGTGATGAAAAAAT 104280262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1841 AAGGAAGTAGGTGGGACAATAAAAGGATGTAGAATCTTGGCAACTGAGTGATGAAAAAAT 1900

104280263 TCTTTAAAGAATCAGAAAGTGACTGGTAAACTGGGTCAAAAGCTAGAGATTGAGTAAAAA 104280322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1901 TCTTTAAAGAATCAGAAAGTGACTGGTAAACTGGGTCAAAAGCTAGAGATTGAGTAAAAA 1960

104280323 CTGAAACTTTTCTTCATTTTAACATACTTTCGCTTTCAAGAAAATTATTACACTAAGGGG 104280382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1961 CTGAAACTTTTCTTCATTTTAACATACTTTCGCTTTCAAGAAAATTATTACACTAAGGGG 2020

104280383 GAATAGCAGAGCAATCTATTAGTGTTGCAGAGGACAGATGTGGCTTTTTCAGATGCTCAG 104280442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2021 GAATAGCAGAGCAATCTATTAGTGTTGCAGAGGACAGATGTGGCTTTTTCAGATGCTCAG 2080

104280443 AAGCACCCAATAAATTTGAAGAACAGACAGGTGTTCCTGAGAACTCAGGGAAGAATTTGG 104280502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2081 AAGCACCCAATAAATTTGAAGAACAGACAGGTGTTCCTGAGAACTCAGGGAAGAATTTGG 2140

104280503 CCAATGAAGGTCACAGGACACCTGTTCTGAAAATGTCCTACTGAAAATGTTCTTTAGAAG 104280562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2141 CCAATGAAGGTCACAGGACACCTGTTCTGAAAATGTCCTACTGAAAATGTTCTTTAGAAG 2200

104280563 TTACAGTGTTTTCATCAAGACAATGAGATTTCACTTTATAACTTTACTCAGTGCCCAGGT 104280622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2201 TTACAGTGTTTTCATCAAGACAATGAGATTTCACTTTATAACTTTACTCAGTGCCCAGGT 2260

104280623 TACCTAAAAAGTATTTTTTCATCTTCAAGGGAGAAAAAAACTTTGTTATTAGGTGATATA 104280682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2261 TACCTAAAAAGTATTTTTTCATCTTCAAGGGAGAAAAAAACTTTGTTATTAGGTGATATA 2320

104280683 ATTAGAATGTTTTAAAGAATGACATTAGTTTGCATTTCAC 104280722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2321 ATTAGAATGTTTTAAAGAATGACATTAGTTTGCATTTCAC 2360

Alignment time is 1.85175 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [104268199,104289046] =>     20848 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     4569] =>      4569 nucs 'mol-32-2fe3-095081_4569'

Score:        4504
Aligned:      4572        nucs
Identic:      4565 (100%) nucs =>      2562 (100%)      2003 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [104275632,104278199] EXCISED REGION [104279047,104281050]
 second seq =>  [        1,     2565] EXCISED REGION [     2566,     4569]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       847 nucs [104278200,104279046]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [104278200,104278200] to [104279047,104279047]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [104278199,104278199] to [104279047,104279047]
 second seq =>         1 nucs [2565,2565] to [2566,2566]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

104275632 TCTTATCTGTAAGATCTGATGTCGAAACAATTTCCAAGCTGAATGATGTTTTTAGTAGAA 104275691
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCTTATCTGTAAGATCTGATGTTGAAACAATTTCCAAGCTGAATGATGTTTTTAGTAGAA 60

104275692 CTTAGCTCCTTGCAGTTGCAGAACTAAGGTTCTCCCTTCTTGCTGGCTGGTGGCTGGGAG 104275751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTTAGCTCCTTGCAGTTGCAGAACTAAGGTTCTCCCTTCTTGCTGGCTGGTGGCTGGGAG 120

104275752 TCACCCTCAGCTCCTCCAGTGAGCCCACATTCTTTCCGCATGTCTTCCTTTATCTTCAAG 104275811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCACCCTCAGCTCCTCCAGTGAGCCCACATTCTTTCCGCATGTCTTCCTTTATCTTCAAG 180

104275812 CCAGCAACAATGCATCGGGCCCTTCTCTGCTCAGATCTCCCTGACTTCCTCTGCTGTCCT 104275871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCAGCAACAATGCATCGGGCCCTTCTCTGCTCAGATCTCCCTGACTTCCTCTGCTGTCCT 240

104275872 CACCAAGGAGAATACTTTGATTTAAGGACTCCTGTAATTACATTGGCCCACCTGGGAAAT 104275931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CACCAAGGAGAATACTTTGATTTAAGGACTCCTGTAATTACATTGGCCCACCTGGGAAAT 300

104275932 CTAGGCTAATCTCTGTATCTTAAACTCAATTGATTCTTAACCTTAATTACCTCTGCAATG 104275991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTAGGCTAATCTCTGTATCTTAAACTCAATTGATTCTTAACCTTAATTACCTCTGCAATG 360

104275992 TCATTTTGCCATGTAATATAACATATTCACAGGTGTAACACCAGGGAGCAAAGGTCAGAG 104276051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
      361 TCATTTTGCCATGTAATATAACATATTCACAGGTGTAACACCAGGGGGCAAAGGTCAGAG 420

104276052 AGCCAAAATTCTGTCTACCGTTGATACTCAACAGCAATAAACATTCAGCTGTAGGAAACC 104276111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGCCAAAATTCTGTCTACCGTTGATACTCAACAGCAATAAACATTCAGCTGTAGGAAACC 480

104276112 TGAAGTCTCCAGAGAGATAATTTAGATAAAATACAGCCTTAAGTATAGGACAGACCTGCT 104276171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGAAGTCTCCAGAGAGATAATTTAGATAAAATACAGCCTTAAGTATAGGACAGACCTGCT 540

104276172 TAGAATCAGGAGTCTAAATTTTTTTGGTTACACAAATATAGCCAATTCTCTTTACCATTA 104276231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TAGAATCAGGAGTCTAAATTTTTTTGGTTACACAAATATAGCCAATTCTCTTTACCATTA 600

104276232 TAAATCTCAGCTTTATTTTTTTAATCTGAAAAATGCAAATATTGCTGCATCTCTATCATG 104276291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TAAATCTCAGCTTTATTTTTTTAATCTGAAAAATGCAAATATTGCTGCATCTCTATCATG 660

104276292 TTGCTTTTAACATTAATATAAGAAACATACATATAATCAGCAAAAAAGATTTTTAAAACC 104276351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTGCTTTTAACATTAATATAAGAAACATACATATAATCAGCAAAAAAGATTTTTAAAACC 720

104276352 TTACATATCAAAGATTACAAAAGAGAATTAGGAGAAAGAACAAAGTCTAAAGATGTTGAG 104276411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTACATATCAAAGATTACAAAAGAGAATTAGGAGAAAGAACAAAGTCTAAAGATGTTGAG 780

104276412 AGAGTACCCTAAAGTTATCTATTTATTTATTCACTTGTTCAAAAATATTTAGGACTAGGC 104276471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGAGTACCCTAAAGTTATCTATTTATTTATTCACTTGTTCAAAAATATTTAGGACTAGGC 840

104276472 CAGCCACAGTGGCTCATGCCTGTAATTCCAGCACTTTGGGGGGCCAAGGTGGGTGGATCA 104276531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CAGCCACAGTGGCTCATGCCTGTAATTCCAGCACTTTGGGGGGCCAAGGTGGGTGGATCA 900

104276532 CTTGAAGTCAGGAGTTTGAGATCAACCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAA 104276591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTTGAAGTCAGGAGTTTGAGATCAACCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAA 960

104276592 AATACAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCACGTGCCTGTAATCCCAGCTATTTGGGAGACT 104276651
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AATACGAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCACGTGCCTGTAATCCCAGCTATTTGGGAGACT 1020

104276652 GCATCAGGAAAATTGCTTGAATCCAGGAGGCGGAGGGTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCA 104276711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GCATCAGGAAAATTGCTTGAATCCAGGAGGCGGAGGGTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCA 1080

104276712 CTGCACTCCAGCCTGGACAACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAATATATATATATATATA 104276771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTGCACTCCAGCCTGGACAACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAATATATATATATATATA 1140

104276772 TATATTTAGGACTAGGTTTCGATGAAATTAACCTAACAACCAACACTTAATCCTTTGAGA 104276831
          |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TAT--TTAGGACTAGGTTTCGATGAAATTAACCTAACAACCAACACTTAATCCTTTGAGA 1198

104276832 AACTACTTTCTCAACTGCATGGAACTTACCTAGGATAAAAATTAAAATTTAGGAGAAAGT 104276891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1199 AACTACTTTCTCAACTGCATGGAACTTACCTAGGATAAAAATTAAAATTTAGGAGAAAGT 1258

104276892 GATTTCAGAGCTCCAAATCTGTCCTGTCTGCCCTCATTTCCATAATCTGCTTTGACTGCC 104276951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1259 GATTTCAGAGCTCCAAATCTGTCCTGTCTGCCCTCATTTCCATAATCTGCTTTGACTGCC 1318

104276952 ATTTTGTATATCCCCTATAATTTAACCTACTTATTGATCCCATGATCTCTGAAAATATTC 104277011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1319 ATTTTGTATATCCCCTATAATTTAACCTACTTATTGATCCCATGATCTCTGAAAATATTC 1378

104277012 TTTTTAATTTAATTTAATTTTTAGTTCTGGGATACATGGGCAGGATATGCAGCCTTGTTA 104277071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1379 TTTTTAATTTAATTTAATTTTTAGTTCTGGGATACATGGGCAGGATATGCAGCCTTGTTA 1438

104277072 TATGGGTAAATGTGTTCCATGGTGGTTTGCTGCACCTATCAAACCATCACCTAGGTATTA 104277131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1439 TATGGGTAAATGTGTTCCATGGTGGTTTGCTGCACCTATCAAACCATCACCTAGGTATTA 1498

104277132 AGCCCCGCATGCATTAGCTACTCTTTCTGATGCGCTCCCTCCCACCACATCCCCAACCAA 104277191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1499 AGCCCCGCATGCATTAGCTACTCTTTCTGATGCGCTCCCTCCCACCACATCCCCAACCAA 1558

104277192 CGGGCCCCATTATGTGTTGTTCCTTTCTCTGTTTTTATGTGTTCTCATTGTTCAGCTTCC 104277251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1559 CGGGCCCCATTATGTGTTGTTCCTTTCTCTGTTTTTATGTGTTCTCATTGTTCAGCTTCC 1618

104277252 ACTTATAAGTGAGAACATGTAGTGTTTAATTTTCTGTTCCTGTGTTAGTTTGCTGAGGAT 104277311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1619 ACTTATAAGTGAGAACATGTAGTGTTTAATTTTCTGTTCCTGTGTTAGTTTGCTGAGGAT 1678

104277312 AATGGCTTCCAGCTCCATCCCTTTTCCTGCAAAGGACATGATCTCATTACTTTTTATGAC 104277371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1679 AATGGCTTCCAGCTCCATCCCTTTTCCTGCAAAGGACATGATCTCATTACTTTTTATGAC 1738

104277372 TGCATAGTGTTCCATGGTGTAAATATATCACATTTTCATTTTCCAGTCTATCATTGATGG 104277431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1739 TGCATAGTGTTCCATGGTGTAAATATATCACATTTTCATTTTCCAGTCTATCATTGATGG 1798

104277432 GCATTTGGGTTAATTCCATGTCTTTTCTACAGTGAATAGTGCTCCAGTGAACATACATGT 104277491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1799 GCATTTGGGTTAATTCCATGTCTTTTCTACAGTGAATAGTGCTCCAGTGAACATACATGT 1858

104277492 GCAGGTATCTTTATAATAGAATGATTTATATTCTTTTGGGTACATACCCAGTAATGGGAT 104277551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 GCAGGTATCTTTATAATAGAATGATTTATATTCTTTTGGGTACATACCCAGTAATGGGAT 1918

104277552 TGCTGGGTCAAATGGTATTTCTGGTTCTAGGTCTTTGAGGAATTGCTACACTGTCTTCCA 104277611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 TGCTGGGTCAAATGGTATTTCTGGTTCTAGGTCTTTGAGGAATTGCTACACTGTCTTCCA 1978

104277612 CAAGTAAAACCCAGAACTATAAAAACCCTAGAAGAAAAGCTAGACAGTACCATTCAGGAC 104277671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 CAAGTAAAACCCAGAACTATAAAAACCCTAGAAGAAAAGCTAGACAGTACCATTCAGGAC 2038

104277672 ATCGGCACAGGCAAAGATTTCATGACAAAAATGTCAAAAGCAATTGCAACAAACACAAAA 104277731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 ATCGGCACAGGCAAAGATTTCATGACAAAAATGTCAAAAGCAATTGCAACAAACACAAAA 2098

104277732 CTTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAGAGCTTCTGCACAGCAAAAGAAACTATCATCAG 104277791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 CTTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAGAGCTTCTGCACAGCAAAAGAAACTATCATCAG 2158

104277792 AGTGGACAGACAACCTACAGAATGGGAGAAAAGTTTGCAGTCTATTCATCCGACAAAGGT 104277851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 AGTGGACAGACAACCTACAGAATGGGAGAAAAGTTTGCAGTCTATTCATCCGACAAAGGT 2218

104277852 TGAATATCCAGAATCTACAAGGAACTTAGTTCCAATTTACAAGAAAAAAAAAAAACACCA 104277911
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
     2219 TGAATATCCAGAATCTACAAGGAACTTAGTTCCAATTTACAAGAAAAAAAAAAA-CACCA 2277

104277912 TTAAAAAGTCGGCAAAGGACATAAACAGACACTTCTCAAAAGAAGACATTACGTGGCCAC 104277971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2278 TTAAAAAGTCGGCAAAGGACATAAACAGACACTTCTCAAAAGAAGACATTACGTGGCCAC 2337

104277972 CAAACATATGAAAAAAAACTCAACCTCACTGATCATTAGAGAAATACAAATCAAAACCAC 104278031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2338 CAAACATATGAAAAAAAACTCAACCTCACTGATCATTAGAGAAATACAAATCAAAACCAC 2397

104278032 CAAGAGATACCATCGCATGCCAGTCAGAATGGTGATTATTAAAAAGTCAAGGAACAATAG 104278091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2398 CAAGAGATACCATCGCATGCCAGTCAGAATGGTGATTATTAAAAAGTCAAGGAACAATAG 2457

104278092 ATGCTGGTGAGGCTGTGGAGAAATAGGAATGCTCTTTTGCACTGTTGATGGGAATCTCTG 104278151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2458 ATGCTGGTGAGGCTGTGGAGAAATAGGAATGCTCTTTTGCACTGTTGATGGGAATCTCTG 2517

104278152 AAAATATTTATTCCTTTGAATGAGTTTAGCATAGGATGTTACCCTTAA 104278199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2518 AAAATATTTATTCCTTTGAATGAGTTTAGCATAGGATGTTACCCTTAA 2565

EXCISED REGION

104279047 ATGCTTGTTATAACAATGTACTTTTTTGTATACCTCTACTTGGAAATGTATTATAGTTAA 104279106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2566 ATGCTTGTTATAACAATGTACTTTTTTGTATACCTCTACTTGGAAATGTATTATAGTTAA 2625

104279107 GATTCATTCATTCGACTAATATGTATTGAGTGCCTACTATGTGCCAGGCACATGTTTTAG 104279166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2626 GATTCATTCATTCGACTAATATGTATTGAGTGCCTACTATGTGCCAGGCACATGTTTTAG 2685

104279167 CTAATGTTGATGAATGGTATGGATAAAGGCCTTGACACATTCATATTTAGAAAGATGGAA 104279226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2686 CTAATGTTGATGAATGGTATGGATAAAGGCCTTGACACATTCATATTTAGAAAGATGGAA 2745

104279227 ATAAATACATCAACAACATGCAATCTAATAGAGTTAGTAATGATAAAGATAAAACAGAAT 104279286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2746 ATAAATACATCAACAACATGCAATCTAATAGAGTTAGTAATGATAAAGATAAAACAGAAT 2805

104279287 ATAGAGAGTAAATAAGGGACCTATTTTCTATATGGTGGTCAAAAATGGACCCTGTGATTA 104279346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2806 ATAGAGAGTAAATAAGGGACCTATTTTCTATATGGTGGTCAAAAATGGACCCTGTGATTA 2865

104279347 CAGCTGAATACAGACTTGAATAAAACGAGAAAGCAAGTAATTCACATATCTGAGGAGAAA 104279406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2866 CAGCTGAATACAGACTTGAATAAAACGAGAAAGCAAGTAATTCACATATCTGAGGAGAAA 2925

104279407 ACTCTTTAGACACAGGGACCAGAAAGTTCAGGGGCCTTCAGCCAGAAATATTATTGACAT 104279466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2926 ACTCTTTAGACACAGGGACCAGAAAGTTCAGGGGCCTTCAGCCAGAAATATTATTGACAT 2985

104279467 GTGTAAATGAAGTAGCAAAGATAGTTGTTTGAGGAGGTGAAAAGGAAAATAGTGAAGATC 104279526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2986 GTGTAAATGAAGTAGCAAAGATAGTTGTTTGAGGAGGTGAAAAGGAAAATAGTGAAGATC 3045

104279527 AAATTGAAGAGACAATCAAGGCCATGCAGACTGTGGCAAGAACTTTGGAACTTCTGTTTA 104279586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3046 AAATTGAAGAGACAATCAAGGCCATGCAGACTGTGGCAAGAACTTTGGAACTTCTGTTTA 3105

104279587 TTATCCGAAGAGGCCATTGGAAGGTTATAAACAAGATATAAACATGATCTGACCTGTGTT 104279646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3106 TTATCCGAAGAGGCCATTGGAAGGTTATAAACAAGATATAAACATGATCTGACCTGTGTT 3165

104279647 TTGAAAGGATTTTTCTGGATAGGGAGTGAAAATTATATTGAAAGTGAAAAGATTGTAGAT 104279706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3166 TTGAAAGGATTTTTCTGGATAGGGAGTGAAAATTATATTGAAAGTGAAAAGATTGTAGAT 3225

104279707 ATAGTAGCAGTGGTAGGACTTGGGATATATATTACATACATTAGAGCTATCCTTAACTGT 104279766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3226 ATAGTAGCAGTGGTAGGACTTGGGATATATATTACATACATTAGAGCTATCCTTAACTGT 3285

104279767 ATCAACTGGTCTCATTGGGTATGAGAAGAAGATCAAAGTCAAGGCCAATTTTAATATGTT 104279826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3286 ATCAACTGGTCTCATTGGGTATGAGAAGAAGATCAAAGTCAAGGCCAATTTTAATATGTT 3345

104279827 TGGCCTGAGCAAGAAGGTGATATCCTTTCATGAAATGGGGATCAGTGAGAGGGGAGAAAT 104279886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3346 TGGCCTGAGCAAGAAGGTGATATCCTTTCATGAAATGGGGATCAGTGAGAGGGGAGAAAT 3405

104279887 TTACAGAGAAAAATTAAGAGTTTGGTTTTGGACCTATTAAAATTTGAGAAACCTGTGAGA 104279946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3406 TTACAGAGAAAAATTAAGAGTTTGGTTTTGGACCTATTAAAATTTGAGAAACCTGTGAGA 3465

104279947 AGTTTAAGAGGAAATGTTGATGAAGAGGAAGTTCGAAATAAGAGTCGAGAGTCCAGGGAA 104280006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3466 AGTTTAAGAGGAAATGTTGATGAAGAGGAAGTTCGAAATAAGAGTCGAGAGTCCAGGGAA 3525

104280007 TTGGTTTGGAGCTGGAGATTTTTTAAATTGAGAAGTTATTGGTAGATACAAGATATTTGC 104280066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3526 TTGGTTTGGAGCTGGAGATTTTTTAAATTGAGAAGTTATTGGTAGATACAAGATATTTGC 3585

104280067 AGTCATGAGAGCTAACAGTTACCTAGGGAGGGAGTAAAGATGAAGAGCTGAAATTTAAGG 104280126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3586 AGTCATGAGAGCTAACAGTTACCTAGGGAGGGAGTAAAGATGAAGAGCTGAAATTTAAGG 3645

104280127 ATAAAATTCCAGGGATCTAGAAATTTGGAAAATTGGAAGAAGAGGTGAAGCCAGAAAAGA 104280186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3646 ATAAAATTCCAGGGATCTAGAAATTTGGAAAATTGGAAGAAGAGGTGAAGCCAGAAAAGA 3705

104280187 CTAAGAAGGAGAGGTCAAGGAAGTAGGTGGGACAATAAAAGGATGTAGAATCTTGGCAAC 104280246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3706 CTAAGAAGGAGAGGTCAAGGAAGTAGGTGGGACAATAAAAGGATGTAGAATCTTGGCAAC 3765

104280247 TGAGTGATGAAAAAATTCTTTAAAGAATCAGAAAGTGACTGGTAAACTGGGTCAAAAGCT 104280306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3766 TGAGTGATGAAAAAATTCTTTAAAGAATCAGAAAGTGACTGGTAAACTGGGTCAAAAGCT 3825

104280307 AGAGATTGAGTAAAAACTGAAACTTTTCTTCATTTTAACATACTTTCGCTTTCAAGAAAA 104280366
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     3826 AGAGATTGAGTAAAAACTGAAACTTTTCTTCATTTTAACATACTTTCGCTTTCAAGAAAG 3885

104280367 TTATTACACTAAGGGGGAATAGCAGAGCAATCTATTAGTGTTGCAGAGGACAGATGTGGC 104280426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3886 TTATTACACTAAGGGGGAATAGCAGAGCAATCTATTAGTGTTGCAGAGGACAGATGTGGC 3945

104280427 TTTTTCAGATGCTCAGAAGCACCCAATAAATTTGAAGAACAGACAGGTGTTCCTGAGAAC 104280486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3946 TTTTTCAGATGCTCAGAAGCACCCAATAAATTTGAAGAACAGACAGGTGTTCCTGAGAAC 4005

104280487 TCAGGGAAGAATTTGGCCAATGAAGGTCACAGGACACCTGTTCTGAAAATGTCCTACTGA 104280546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4006 TCAGGGAAGAATTTGGCCAATGAAGGTCACAGGACACCTGTTCTGAAAATGTCCTACTGA 4065

104280547 AAATGTTCTTTAGAAGTTACAGTGTTTTCATCAAGACAATGAGATTTCACTTTATAACTT 104280606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4066 AAATGTTCTTTAGAAGTTACAGTGTTTTCATCAAGACAATGAGATTTCACTTTATAACTT 4125

104280607 TACTCAGTGCCCAGGTTACCTAAAAAGTATTTTTTCATCTTCAAGGGAGAAAAAAACTTT 104280666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4126 TACTCAGTGCCCAGGTTACCTAAAAAGTATTTTTTCATCTTCAAGGGAGAAAAAAACTTT 4185

104280667 GTTATTAGGTGATATAATTAGAATGTTTTAAAGAATGACATTAGTTTGCATTTCACAGCC 104280726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4186 GTTATTAGGTGATATAATTAGAATGTTTTAAAGAATGACATTAGTTTGCATTTCACAGCC 4245

104280727 TTACTAGGTAATATGAGAAGAAAATTCCAGTTTTATATTCTCTCGTATCTCTGAATTTCT 104280786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4246 TTACTAGGTAATATGAGAAGAAAATTCCAGTTTTATATTCTCTCGTATCTCTGAATTTCT 4305

104280787 TTCTAATTTATGGAAACAGTCTAATTTATGGAAACAGAATAATTAAATGCCCATGATAAA 104280846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4306 TTCTAATTTATGGAAACAGTCTAATTTATGGAAACAGAATAATTAAATGCCCATGATAAA 4365

104280847 TTTTCAAAGTTTATGACTTTCACTTGCATGGAATTAAAAATTATTTGCTGTTTTGTTAGT 104280906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4366 TTTTCAAAGTTTATGACTTTCACTTGCATGGAATTAAAAATTATTTGCTGTTTTGTTAGT 4425

104280907 ATTACTGTTAAGTGCCTTCCATGCTGCAGTAAGAAAACAGAAAAGTGAAATTCAAGAGCT 104280966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4426 ATTACTGTTAAGTGCCTTCCATGCTGCAGTAAGAAAACAGAAAAGTGAAATTCAAGAGCT 4485

104280967 AATCCAGGAGTATAAATGGGAAGTTTTTTTTTTATTAACTTGACAAATCTACATAAGCCA 104281026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4486 AATCCAGGAGTATAAATGGGAAGTTTTTTTTTTATTAACTTGACAAATCTACATAAGCCA 4545

104281027 TATTTAACTTCTTCAAAAGGAAAA 104281050
          ||||||||||||||||||||||||
     4546 TATTTAACTTCTTCAAAAGGAAAA 4569

Alignment time is 3.49365 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [104268199,104289046] =>     20848 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     2004] =>      2004 nucs 'mol-32-2fe3-095081_2004'

Score:        2003
Aligned:      2003        nucs
Identic:      2003 (100%) nucs =>      1319 (100%)       684 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [104279047,104280365] EXCISED REGION [104280367,104281050]
 second seq =>  [        1,     1319] EXCISED REGION [     1321,     2004]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [104280366,104280366]
 second seq =>         1 nucs [1320,1320]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [104280363,104280365] to [104280364,104280366]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

104279047 ATGCTTGTTATAACAATGTACTTTTTTGTATACCTCTACTTGGAAATGTATTATAGTTAA 104279106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATGCTTGTTATAACAATGTACTTTTTTGTATACCTCTACTTGGAAATGTATTATAGTTAA 60

104279107 GATTCATTCATTCGACTAATATGTATTGAGTGCCTACTATGTGCCAGGCACATGTTTTAG 104279166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GATTCATTCATTCGACTAATATGTATTGAGTGCCTACTATGTGCCAGGCACATGTTTTAG 120

104279167 CTAATGTTGATGAATGGTATGGATAAAGGCCTTGACACATTCATATTTAGAAAGATGGAA 104279226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTAATGTTGATGAATGGTATGGATAAAGGCCTTGACACATTCATATTTAGAAAGATGGAA 180

104279227 ATAAATACATCAACAACATGCAATCTAATAGAGTTAGTAATGATAAAGATAAAACAGAAT 104279286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATAAATACATCAACAACATGCAATCTAATAGAGTTAGTAATGATAAAGATAAAACAGAAT 240

104279287 ATAGAGAGTAAATAAGGGACCTATTTTCTATATGGTGGTCAAAAATGGACCCTGTGATTA 104279346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATAGAGAGTAAATAAGGGACCTATTTTCTATATGGTGGTCAAAAATGGACCCTGTGATTA 300

104279347 CAGCTGAATACAGACTTGAATAAAACGAGAAAGCAAGTAATTCACATATCTGAGGAGAAA 104279406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CAGCTGAATACAGACTTGAATAAAACGAGAAAGCAAGTAATTCACATATCTGAGGAGAAA 360

104279407 ACTCTTTAGACACAGGGACCAGAAAGTTCAGGGGCCTTCAGCCAGAAATATTATTGACAT 104279466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACTCTTTAGACACAGGGACCAGAAAGTTCAGGGGCCTTCAGCCAGAAATATTATTGACAT 420

104279467 GTGTAAATGAAGTAGCAAAGATAGTTGTTTGAGGAGGTGAAAAGGAAAATAGTGAAGATC 104279526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTGTAAATGAAGTAGCAAAGATAGTTGTTTGAGGAGGTGAAAAGGAAAATAGTGAAGATC 480

104279527 AAATTGAAGAGACAATCAAGGCCATGCAGACTGTGGCAAGAACTTTGGAACTTCTGTTTA 104279586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAATTGAAGAGACAATCAAGGCCATGCAGACTGTGGCAAGAACTTTGGAACTTCTGTTTA 540

104279587 TTATCCGAAGAGGCCATTGGAAGGTTATAAACAAGATATAAACATGATCTGACCTGTGTT 104279646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTATCCGAAGAGGCCATTGGAAGGTTATAAACAAGATATAAACATGATCTGACCTGTGTT 600

104279647 TTGAAAGGATTTTTCTGGATAGGGAGTGAAAATTATATTGAAAGTGAAAAGATTGTAGAT 104279706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTGAAAGGATTTTTCTGGATAGGGAGTGAAAATTATATTGAAAGTGAAAAGATTGTAGAT 660

104279707 ATAGTAGCAGTGGTAGGACTTGGGATATATATTACATACATTAGAGCTATCCTTAACTGT 104279766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATAGTAGCAGTGGTAGGACTTGGGATATATATTACATACATTAGAGCTATCCTTAACTGT 720

104279767 ATCAACTGGTCTCATTGGGTATGAGAAGAAGATCAAAGTCAAGGCCAATTTTAATATGTT 104279826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATCAACTGGTCTCATTGGGTATGAGAAGAAGATCAAAGTCAAGGCCAATTTTAATATGTT 780

104279827 TGGCCTGAGCAAGAAGGTGATATCCTTTCATGAAATGGGGATCAGTGAGAGGGGAGAAAT 104279886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGGCCTGAGCAAGAAGGTGATATCCTTTCATGAAATGGGGATCAGTGAGAGGGGAGAAAT 840

104279887 TTACAGAGAAAAATTAAGAGTTTGGTTTTGGACCTATTAAAATTTGAGAAACCTGTGAGA 104279946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTACAGAGAAAAATTAAGAGTTTGGTTTTGGACCTATTAAAATTTGAGAAACCTGTGAGA 900

104279947 AGTTTAAGAGGAAATGTTGATGAAGAGGAAGTTCGAAATAAGAGTCGAGAGTCCAGGGAA 104280006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGTTTAAGAGGAAATGTTGATGAAGAGGAAGTTCGAAATAAGAGTCGAGAGTCCAGGGAA 960

104280007 TTGGTTTGGAGCTGGAGATTTTTTAAATTGAGAAGTTATTGGTAGATACAAGATATTTGC 104280066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTGGTTTGGAGCTGGAGATTTTTTAAATTGAGAAGTTATTGGTAGATACAAGATATTTGC 1020

104280067 AGTCATGAGAGCTAACAGTTACCTAGGGAGGGAGTAAAGATGAAGAGCTGAAATTTAAGG 104280126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGTCATGAGAGCTAACAGTTACCTAGGGAGGGAGTAAAGATGAAGAGCTGAAATTTAAGG 1080

104280127 ATAAAATTCCAGGGATCTAGAAATTTGGAAAATTGGAAGAAGAGGTGAAGCCAGAAAAGA 104280186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATAAAATTCCAGGGATCTAGAAATTTGGAAAATTGGAAGAAGAGGTGAAGCCAGAAAAGA 1140

104280187 CTAAGAAGGAGAGGTCAAGGAAGTAGGTGGGACAATAAAAGGATGTAGAATCTTGGCAAC 104280246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTAAGAAGGAGAGGTCAAGGAAGTAGGTGGGACAATAAAAGGATGTAGAATCTTGGCAAC 1200

104280247 TGAGTGATGAAAAAATTCTTTAAAGAATCAGAAAGTGACTGGTAAACTGGGTCAAAAGCT 104280306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TGAGTGATGAAAAAATTCTTTAAAGAATCAGAAAGTGACTGGTAAACTGGGTCAAAAGCT 1260

104280307 AGAGATTGAGTAAAAACTGAAACTTTTCTTCATTTTAACATACTTTCGCTTTCAAGAAA 104280365
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AGAGATTGAGTAAAAACTGAAACTTTTCTTCATTTTAACATACTTTCGCTTTCAAGAAA 1319

EXCISED REGION

104280367 TTATTACACTAAGGGGGAATAGCAGAGCAATCTATTAGTGTTGCAGAGGACAGATGTGGC 104280426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTATTACACTAAGGGGGAATAGCAGAGCAATCTATTAGTGTTGCAGAGGACAGATGTGGC 1380

104280427 TTTTTCAGATGCTCAGAAGCACCCAATAAATTTGAAGAACAGACAGGTGTTCCTGAGAAC 104280486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTTTTCAGATGCTCAGAAGCACCCAATAAATTTGAAGAACAGACAGGTGTTCCTGAGAAC 1440

104280487 TCAGGGAAGAATTTGGCCAATGAAGGTCACAGGACACCTGTTCTGAAAATGTCCTACTGA 104280546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TCAGGGAAGAATTTGGCCAATGAAGGTCACAGGACACCTGTTCTGAAAATGTCCTACTGA 1500

104280547 AAATGTTCTTTAGAAGTTACAGTGTTTTCATCAAGACAATGAGATTTCACTTTATAACTT 104280606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AAATGTTCTTTAGAAGTTACAGTGTTTTCATCAAGACAATGAGATTTCACTTTATAACTT 1560

104280607 TACTCAGTGCCCAGGTTACCTAAAAAGTATTTTTTCATCTTCAAGGGAGAAAAAAACTTT 104280666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TACTCAGTGCCCAGGTTACCTAAAAAGTATTTTTTCATCTTCAAGGGAGAAAAAAACTTT 1620

104280667 GTTATTAGGTGATATAATTAGAATGTTTTAAAGAATGACATTAGTTTGCATTTCACAGCC 104280726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GTTATTAGGTGATATAATTAGAATGTTTTAAAGAATGACATTAGTTTGCATTTCACAGCC 1680

104280727 TTACTAGGTAATATGAGAAGAAAATTCCAGTTTTATATTCTCTCGTATCTCTGAATTTCT 104280786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTACTAGGTAATATGAGAAGAAAATTCCAGTTTTATATTCTCTCGTATCTCTGAATTTCT 1740

104280787 TTCTAATTTATGGAAACAGTCTAATTTATGGAAACAGAATAATTAAATGCCCATGATAAA 104280846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TTCTAATTTATGGAAACAGTCTAATTTATGGAAACAGAATAATTAAATGCCCATGATAAA 1800

104280847 TTTTCAAAGTTTATGACTTTCACTTGCATGGAATTAAAAATTATTTGCTGTTTTGTTAGT 104280906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTTTCAAAGTTTATGACTTTCACTTGCATGGAATTAAAAATTATTTGCTGTTTTGTTAGT 1860

104280907 ATTACTGTTAAGTGCCTTCCATGCTGCAGTAAGAAAACAGAAAAGTGAAATTCAAGAGCT 104280966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ATTACTGTTAAGTGCCTTCCATGCTGCAGTAAGAAAACAGAAAAGTGAAATTCAAGAGCT 1920

104280967 AATCCAGGAGTATAAATGGGAAGTTTTTTTTTTATTAACTTGACAAATCTACATAAGCCA 104281026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AATCCAGGAGTATAAATGGGAAGTTTTTTTTTTATTAACTTGACAAATCTACATAAGCCA 1980

104281027 TATTTAACTTCTTCAAAAGGAAAA 104281050
          ||||||||||||||||||||||||
     1981 TATTTAACTTCTTCAAAAGGAAAA 2004

Alignment time is 1.48187 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [104268199,104289046] =>     20848 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     3327] =>      3327 nucs 'mol-32-2fee-303143_3327'

Score:        3316
Aligned:      3327        nucs
Identic:      3326 (100%) nucs =>      1436 (100%)      1890 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [104276764,104278199] EXCISED REGION [104279047,104280937]
 second seq =>  [        1,     1436] EXCISED REGION [     1437,     3327]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       847 nucs [104278200,104279046]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [104278200,104278200] to [104279047,104279047]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [104278199,104278199] to [104279047,104279047]
 second seq =>         1 nucs [1436,1436] to [1437,1437]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

104276764 TATATATATATATTTAGGACTAGGTTTCGATGAAATTAACCTAACAACCAACACTTAATC 104276823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TATATATATATATTTAGGACTAGGTTTCGATGAAATTAACCTAACAACCAACACTTAATC 60

104276824 CTTTGAGAAACTACTTTCTCAACTGCATGGAACTTACCTAGGATAAAAATTAAAATTTAG 104276883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTTTGAGAAACTACTTTCTCAACTGCATGGAACTTACCTAGGATAAAAATTAAAATTTAG 120

104276884 GAGAAAGTGATTTCAGAGCTCCAAATCTGTCCTGTCTGCCCTCATTTCCATAATCTGCTT 104276943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GAGAAAGTGATTTCAGAGCTCCAAATCTGTCCTGTCTGCCCTCATTTCCATAATCTGCTT 180

104276944 TGACTGCCATTTTGTATATCCCCTATAATTTAACCTACTTATTGATCCCATGATCTCTGA 104277003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGACTGCCATTTTGTATATCCCCTATAATTTAACCTACTTATTGATCCCATGATCTCTGA 240

104277004 AAATATTCTTTTTAATTTAATTTAATTTTTAGTTCTGGGATACATGGGCAGGATATGCAG 104277063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAATATTCTTTTTAATTTAATTTAATTTTTAGTTCTGGGATACATGGGCAGGATATGCAG 300

104277064 CCTTGTTATATGGGTAAATGTGTTCCATGGTGGTTTGCTGCACCTATCAAACCATCACCT 104277123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCTTGTTATATGGGTAAATGTGTTCCATGGTGGTTTGCTGCACCTATCAAACCATCACCT 360

104277124 AGGTATTAAGCCCCGCATGCATTAGCTACTCTTTCTGATGCGCTCCCTCCCACCACATCC 104277183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGGTATTAAGCCCCGCATGCATTAGCTACTCTTTCTGATGCGCTCCCTCCCACCACATCC 420

104277184 CCAACCAACGGGCCCCATTATGTGTTGTTCCTTTCTCTGTTTTTATGTGTTCTCATTGTT 104277243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCAACCAACGGGCCCCATTATGTGTTGTTCCTTTCTCTGTTTTTATGTGTTCTCATTGTT 480

104277244 CAGCTTCCACTTATAAGTGAGAACATGTAGTGTTTAATTTTCTGTTCCTGTGTTAGTTTG 104277303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CAGCTTCCACTTATAAGTGAGAACATGTAGTGTTTAATTTTCTGTTCCTGTGTTAGTTTG 540

104277304 CTGAGGATAATGGCTTCCAGCTCCATCCCTTTTCCTGCAAAGGACATGATCTCATTACTT 104277363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTGAGGATAATGGCTTCCAGCTCCATCCCTTTTCCTGCAAAGGACATGATCTCATTACTT 600

104277364 TTTATGACTGCATAGTGTTCCATGGTGTAAATATATCACATTTTCATTTTCCAGTCTATC 104277423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTTATGACTGCATAGTGTTCCATGGTGTAAATATATCACATTTTCATTTTCCAGTCTATC 660

104277424 ATTGATGGGCATTTGGGTTAATTCCATGTCTTTTCTACAGTGAATAGTGCTCCAGTGAAC 104277483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATTGATGGGCATTTGGGTTAATTCCATGTCTTTTCTACAGTGAATAGTGCTCCAGTGAAC 720

104277484 ATACATGTGCAGGTATCTTTATAATAGAATGATTTATATTCTTTTGGGTACATACCCAGT 104277543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATACATGTGCAGGTATCTTTATAATAGAATGATTTATATTCTTTTGGGTACATACCCAGT 780

104277544 AATGGGATTGCTGGGTCAAATGGTATTTCTGGTTCTAGGTCTTTGAGGAATTGCTACACT 104277603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AATGGGATTGCTGGGTCAAATGGTATTTCTGGTTCTAGGTCTTTGAGGAATTGCTACACT 840

104277604 GTCTTCCACAAGTAAAACCCAGAACTATAAAAACCCTAGAAGAAAAGCTAGACAGTACCA 104277663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GTCTTCCACAAGTAAAACCCAGAACTATAAAAACCCTAGAAGAAAAGCTAGACAGTACCA 900

104277664 TTCAGGACATCGGCACAGGCAAAGATTTCATGACAAAAATGTCAAAAGCAATTGCAACAA 104277723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTCAGGACATCGGCACAGGCAAAGATTTCATGACAAAAATGTCAAAAGCAATTGCAACAA 960

104277724 ACACAAAACTTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAGAGCTTCTGCACAGCAAAAGAAACT 104277783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ACACAAAACTTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAGAGCTTCTGCACAGCAAAAGAAACT 1020

104277784 ATCATCAGAGTGGACAGACAACCTACAGAATGGGAGAAAAGTTTGCAGTCTATTCATCCG 104277843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATCATCAGAGTGGACAGACAACCTACAGAATGGGAGAAAAGTTTGCAGTCTATTCATCCG 1080

104277844 ACAAAGGTTGAATATCCAGAATCTACAAGGAACTTAGTTCCAATTTACAAGAAAAAAAAA 104277903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ACAAAGGTTGAATATCCAGAATCTACAAGGAACTTAGTTCCAATTTACAAGAAAAAAAAA 1140

104277904 AAACACCATTAAAAAGTCGGCAAAGGACATAAACAGACACTTCTCAAAAGAAGACATTAC 104277963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AAACACCATTAAAAAGTCGGCAAAGGACATAAACAGACACTTCTCAAAAGAAGACATTAC 1200

104277964 GTGGCCACCAAACATATGAAAAAAAACTCAACCTCACTGATCATTAGAGAAATACAAATC 104278023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GTGGCCACCAAACATATGAAAAAAAACTCAACCTCACTGATCATTAGAGAAATACAAATC 1260

104278024 AAAACCACCAAGAGATACCATCGCATGCCAGTCAGAATGGTGATTATTAAAAAGTCAAGG 104278083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AAAACCACCAAGAGATACCATCGCATGCCAGTCAGAATGGTGATTATTAAAAAGTCAAGG 1320

104278084 AACAATAGATGCTGGTGAGGCTGTGGAGAAATAGGAATGCTCTTTTGCACTGTTGATGGG 104278143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AACAATAGATGCTGGTGAGGCTGTGGAGAAATAGGAATGCTCTTTTGCACTGTTGATGGG 1380

104278144 AATCTCTGAAAATATTTATTCCTTTGAATGAGTTTAGCATAGGATGTTACCCTTAA 104278199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AATCTCTGAAAATATTTATTCCTTTGAATGAGTTTAGCATAGGATGTTACCCTTAA 1436

EXCISED REGION

104279047 ATGCTTGTTATAACAATGTACTTTTTTGTATACCTCTACTTGGAAATGTATTATAGTTAA 104279106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1437 ATGCTTGTTATAACAATGTACTTTTTTGTATACCTCTACTTGGAAATGTATTATAGTTAA 1496

104279107 GATTCATTCATTCGACTAATATGTATTGAGTGCCTACTATGTGCCAGGCACATGTTTTAG 104279166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1497 GATTCATTCATTCGACTAATATGTATTGAGTGCCTACTATGTGCCAGGCACATGTTTTAG 1556

104279167 CTAATGTTGATGAATGGTATGGATAAAGGCCTTGACACATTCATATTTAGAAAGATGGAA 104279226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1557 CTAATGTTGATGAATGGTATGGATAAAGGCCTTGACACATTCATATTTAGAAAGATGGAA 1616

104279227 ATAAATACATCAACAACATGCAATCTAATAGAGTTAGTAATGATAAAGATAAAACAGAAT 104279286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1617 ATAAATACATCAACAACATGCAATCTAATAGAGTTAGTAATGATAAAGATAAAACAGAAT 1676

104279287 ATAGAGAGTAAATAAGGGACCTATTTTCTATATGGTGGTCAAAAATGGACCCTGTGATTA 104279346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1677 ATAGAGAGTAAATAAGGGACCTATTTTCTATATGGTGGTCAAAAATGGACCCTGTGATTA 1736

104279347 CAGCTGAATACAGACTTGAATAAAACGAGAAAGCAAGTAATTCACATATCTGAGGAGAAA 104279406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1737 CAGCTGAATACAGACTTGAATAAAACGAGAAAGCAAGTAATTCACATATCTGAGGAGAAA 1796

104279407 ACTCTTTAGACACAGGGACCAGAAAGTTCAGGGGCCTTCAGCCAGAAATATTATTGACAT 104279466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1797 ACTCTTTAGACACAGGGACCAGAAAGTTCAGGGGCCTTCAGCCAGAAATATTATTGACAT 1856

104279467 GTGTAAATGAAGTAGCAAAGATAGTTGTTTGAGGAGGTGAAAAGGAAAATAGTGAAGATC 104279526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1857 GTGTAAATGAAGTAGCAAAGATAGTTGTTTGAGGAGGTGAAAAGGAAAATAGTGAAGATC 1916

104279527 AAATTGAAGAGACAATCAAGGCCATGCAGACTGTGGCAAGAACTTTGGAACTTCTGTTTA 104279586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1917 AAATTGAAGAGACAATCAAGGCCATGCAGACTGTGGCAAGAACTTTGGAACTTCTGTTTA 1976

104279587 TTATCCGAAGAGGCCATTGGAAGGTTATAAACAAGATATAAACATGATCTGACCTGTGTT 104279646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1977 TTATCCGAAGAGGCCATTGGAAGGTTATAAACAAGATATAAACATGATCTGACCTGTGTT 2036

104279647 TTGAAAGGATTTTTCTGGATAGGGAGTGAAAATTATATTGAAAGTGAAAAGATTGTAGAT 104279706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2037 TTGAAAGGATTTTTCTGGATAGGGAGTGAAAATTATATTGAAAGTGAAAAGATTGTAGAT 2096

104279707 ATAGTAGCAGTGGTAGGACTTGGGATATATATTACATACATTAGAGCTATCCTTAACTGT 104279766
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2097 ATGGTAGCAGTGGTAGGACTTGGGATATATATTACATACATTAGAGCTATCCTTAACTGT 2156

104279767 ATCAACTGGTCTCATTGGGTATGAGAAGAAGATCAAAGTCAAGGCCAATTTTAATATGTT 104279826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2157 ATCAACTGGTCTCATTGGGTATGAGAAGAAGATCAAAGTCAAGGCCAATTTTAATATGTT 2216

104279827 TGGCCTGAGCAAGAAGGTGATATCCTTTCATGAAATGGGGATCAGTGAGAGGGGAGAAAT 104279886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2217 TGGCCTGAGCAAGAAGGTGATATCCTTTCATGAAATGGGGATCAGTGAGAGGGGAGAAAT 2276

104279887 TTACAGAGAAAAATTAAGAGTTTGGTTTTGGACCTATTAAAATTTGAGAAACCTGTGAGA 104279946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2277 TTACAGAGAAAAATTAAGAGTTTGGTTTTGGACCTATTAAAATTTGAGAAACCTGTGAGA 2336

104279947 AGTTTAAGAGGAAATGTTGATGAAGAGGAAGTTCGAAATAAGAGTCGAGAGTCCAGGGAA 104280006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2337 AGTTTAAGAGGAAATGTTGATGAAGAGGAAGTTCGAAATAAGAGTCGAGAGTCCAGGGAA 2396

104280007 TTGGTTTGGAGCTGGAGATTTTTTAAATTGAGAAGTTATTGGTAGATACAAGATATTTGC 104280066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2397 TTGGTTTGGAGCTGGAGATTTTTTAAATTGAGAAGTTATTGGTAGATACAAGATATTTGC 2456

104280067 AGTCATGAGAGCTAACAGTTACCTAGGGAGGGAGTAAAGATGAAGAGCTGAAATTTAAGG 104280126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2457 AGTCATGAGAGCTAACAGTTACCTAGGGAGGGAGTAAAGATGAAGAGCTGAAATTTAAGG 2516

104280127 ATAAAATTCCAGGGATCTAGAAATTTGGAAAATTGGAAGAAGAGGTGAAGCCAGAAAAGA 104280186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2517 ATAAAATTCCAGGGATCTAGAAATTTGGAAAATTGGAAGAAGAGGTGAAGCCAGAAAAGA 2576

104280187 CTAAGAAGGAGAGGTCAAGGAAGTAGGTGGGACAATAAAAGGATGTAGAATCTTGGCAAC 104280246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2577 CTAAGAAGGAGAGGTCAAGGAAGTAGGTGGGACAATAAAAGGATGTAGAATCTTGGCAAC 2636

104280247 TGAGTGATGAAAAAATTCTTTAAAGAATCAGAAAGTGACTGGTAAACTGGGTCAAAAGCT 104280306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2637 TGAGTGATGAAAAAATTCTTTAAAGAATCAGAAAGTGACTGGTAAACTGGGTCAAAAGCT 2696

104280307 AGAGATTGAGTAAAAACTGAAACTTTTCTTCATTTTAACATACTTTCGCTTTCAAGAAAA 104280366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2697 AGAGATTGAGTAAAAACTGAAACTTTTCTTCATTTTAACATACTTTCGCTTTCAAGAAAA 2756

104280367 TTATTACACTAAGGGGGAATAGCAGAGCAATCTATTAGTGTTGCAGAGGACAGATGTGGC 104280426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2757 TTATTACACTAAGGGGGAATAGCAGAGCAATCTATTAGTGTTGCAGAGGACAGATGTGGC 2816

104280427 TTTTTCAGATGCTCAGAAGCACCCAATAAATTTGAAGAACAGACAGGTGTTCCTGAGAAC 104280486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2817 TTTTTCAGATGCTCAGAAGCACCCAATAAATTTGAAGAACAGACAGGTGTTCCTGAGAAC 2876

104280487 TCAGGGAAGAATTTGGCCAATGAAGGTCACAGGACACCTGTTCTGAAAATGTCCTACTGA 104280546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2877 TCAGGGAAGAATTTGGCCAATGAAGGTCACAGGACACCTGTTCTGAAAATGTCCTACTGA 2936

104280547 AAATGTTCTTTAGAAGTTACAGTGTTTTCATCAAGACAATGAGATTTCACTTTATAACTT 104280606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2937 AAATGTTCTTTAGAAGTTACAGTGTTTTCATCAAGACAATGAGATTTCACTTTATAACTT 2996

104280607 TACTCAGTGCCCAGGTTACCTAAAAAGTATTTTTTCATCTTCAAGGGAGAAAAAAACTTT 104280666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2997 TACTCAGTGCCCAGGTTACCTAAAAAGTATTTTTTCATCTTCAAGGGAGAAAAAAACTTT 3056

104280667 GTTATTAGGTGATATAATTAGAATGTTTTAAAGAATGACATTAGTTTGCATTTCACAGCC 104280726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3057 GTTATTAGGTGATATAATTAGAATGTTTTAAAGAATGACATTAGTTTGCATTTCACAGCC 3116

104280727 TTACTAGGTAATATGAGAAGAAAATTCCAGTTTTATATTCTCTCGTATCTCTGAATTTCT 104280786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3117 TTACTAGGTAATATGAGAAGAAAATTCCAGTTTTATATTCTCTCGTATCTCTGAATTTCT 3176

104280787 TTCTAATTTATGGAAACAGTCTAATTTATGGAAACAGAATAATTAAATGCCCATGATAAA 104280846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3177 TTCTAATTTATGGAAACAGTCTAATTTATGGAAACAGAATAATTAAATGCCCATGATAAA 3236

104280847 TTTTCAAAGTTTATGACTTTCACTTGCATGGAATTAAAAATTATTTGCTGTTTTGTTAGT 104280906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3237 TTTTCAAAGTTTATGACTTTCACTTGCATGGAATTAAAAATTATTTGCTGTTTTGTTAGT 3296

104280907 ATTACTGTTAAGTGCCTTCCATGCTGCAGTA 104280937
          |||||||||||||||||||||||||||||||
     3297 ATTACTGTTAAGTGCCTTCCATGCTGCAGTA 3327

Alignment time is 2.42398 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [104268199,104289046] =>     20848 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     3209] =>      3209 nucs 'mol-32-2ff9-226933_3209'

Score:        3197
Aligned:      3208        nucs
Identic:      3207 (100%) nucs =>      1456 (100%)      1751 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [104277546,104279001] EXCISED REGION [104279003,104280754]
 second seq =>  [        1,     1456] EXCISED REGION [     1458,     3209]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [104279002,104279002]
 second seq =>         1 nucs [1457,1457]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [104279002,104279002] to [104279003,104279003]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

104277546 TGGGATTGCTGGGTCAAATGGTATTTCTGGTTCTAGGTCTTTGAGGAATTGCTACACTGT 104277605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGGGATTGCTGGGTCAAATGGTATTTCTGGTTCTAGGTCTTTGAGGAATTGCTACACTGT 60

104277606 CTTCCACAAGTAAAACCCAGAACTATAAAAACCCTAGAAGAAAAGCTAGACAGTACCATT 104277665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTTCCACAAGTAAAACCCAGAACTATAAAAACCCTAGAAGAAAAGCTAGACAGTACCATT 120

104277666 CAGGACATCGGCACAGGCAAAGATTTCATGACAAAAATGTCAAAAGCAATTGCAACAAAC 104277725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAGGACATCGGCACAGGCAAAGATTTCATGACAAAAATGTCAAAAGCAATTGCAACAAAC 180

104277726 ACAAAACTTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAGAGCTTCTGCACAGCAAAAGAAACTAT 104277785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACAAAACTTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAGAGCTTCTGCACAGCAAAAGAAACTAT 240

104277786 CATCAGAGTGGACAGACAACCTACAGAATGGGAGAAAAGTTTGCAGTCTATTCATCCGAC 104277845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CATCAGAGTGGACAGACAACCTACAGAATGGGAGAAAAGTTTGCAGTCTATTCATCCGAC 300

104277846 AAAGGTTGAATATCCAGAATCTACAAGGAACTTAGTTCCAATTTACAAGAAAAAAAAAAA 104277905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAAGGTTGAATATCCAGAATCTACAAGGAACTTAGTTCCAATTTACAAGAAAAAAAAAAA 360

104277906 ACACCATTAAAAAGTCGGCAAAGGACATAAACAGACACTTCTCAAAAGAAGACATTACGT 104277965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACACCATTAAAAAGTCGGCAAAGGACATAAACAGACACTTCTCAAAAGAAGACATTACGT 420

104277966 GGCCACCAAACATATGAAAAAAAACTCAACCTCACTGATCATTAGAGAAATACAAATCAA 104278025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGCCACCAAACATATGAAAAAAAACTCAACCTCACTGATCATTAGAGAAATACAAATCAA 480

104278026 AACCACCAAGAGATACCATCGCATGCCAGTCAGAATGGTGATTATTAAAAAGTCAAGGAA 104278085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AACCACCAAGAGATACCATCGCATGCCAGTCAGAATGGTGATTATTAAAAAGTCAAGGAA 540

104278086 CAATAGATGCTGGTGAGGCTGTGGAGAAATAGGAATGCTCTTTTGCACTGTTGATGGGAA 104278145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CAATAGATGCTGGTGAGGCTGTGGAGAAATAGGAATGCTCTTTTGCACTGTTGATGGGAA 600

104278146 TCTCTGAAAATATTTATTCCTTTGAATGAGTTTAGCATAGGATGTTACCCTTAAAAGGAT 104278205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCTCTGAAAATATTTATTCCTTTGAATGAGTTTAGCATAGGATGTTACCCTTAAAAGGAT 660

104278206 ATTTGCATTCTAGAACACAGAGAGAAAGCTGAAGTAAAACACAAAATCAGTTCCAGTGCT 104278265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATTTGCATTCTAGAACACAGAGAGAAAGCTGAAGTAAAACACAAAATCAGTTCCAGTGCT 720

104278266 TACAGAATTTGGATTATAGAGTGTGATGGAATGCATTATATCTCTTCAAATTCATATGCT 104278325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TACAGAATTTGGATTATAGAGTGTGATGGAATGCATTATATCTCTTCAAATTCATATGCT 780

104278326 GAAACCCTAACCCTAAGTGGGACTGTACTTGTAAACAGGGCCTTTAAAAGAAGTAAGCAC 104278385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GAAACCCTAACCCTAAGTGGGACTGTACTTGTAAACAGGGCCTTTAAAAGAAGTAAGCAC 840

104278386 ATTAAAGTGAAACTGGTAAGAGTGTGCCTTGATCCAATCTGATTGGTGTCCTTATAAGAA 104278445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATTAAAGTGAAACTGGTAAGAGTGTGCCTTGATCCAATCTGATTGGTGTCCTTATAAGAA 900

104278446 GTGGAAATTTGAACACACAAAGAGAAACATCAGGGGAGCTTACACACAGAGAAAATCCCA 104278505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GTGGAAATTTGAACACACAAAGAGAAACATCAGGGGAGCTTACACACAGAGAAAATCCCA 960

104278506 TATAAGGACACAGCGAGAAAGCAGCCATGTGCAAGCTAAGGAAAGACTCCGAAGAAACCA 104278565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TATAAGGACACAGCGAGAAAGCAGCCATGTGCAAGCTAAGGAAAGACTCCGAAGAAACCA 1020

104278566 AATGTGCTGACTCTTTGAGCTTGAACTTCTAGCCTCCAGAACTGTGTGTAAATCAATTTC 104278625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AATGTGCTGACTCTTTGAGCTTGAACTTCTAGCCTCCAGAACTGTGTGTAAATCAATTTC 1080

104278626 TGTTATTTAAACCTCTATGTGGTATTTTGTAATGGCATGACCAGAAAACTAATACATAGA 104278685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGTTATTTAAACCTCTATGTGGTATTTTGTAATGGCATGACCAGAAAACTAATACATAGA 1140

104278686 TAAAATAACATTAAAAATAATCATCTTATAAGTGGTCAGTGGTAAAAATTTGTCAGCAAC 104278745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TAAAATAACATTAAAAATAATCATCTTATAAGTGGTCAGTGGTAAAAATTTGTCAGCAAC 1200

104278746 TTTTACCCACAATTAGACCTTTTAAAAAAATAATTTCAAAATCAGGGAAAAAATTCAGAT 104278805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTTTACCCACAATTAGACCTTTTAAAAAAATAATTTCAAAATCAGGGAAAAAATTCAGAT 1260

104278806 TGATTAGTCCTCATGATTTTAAGGTTATCAGTGTCAGAACAAGGAAAGCAGGAGAATAGA 104278865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGATTAGTCCTCATGATTTTAAGGTTATCAGTGTCAGAACAAGGAAAGCAGGAGAATAGA 1320

104278866 TAGTTATATAATGTAATAATTATAATGGCTGAGAAAAGTGAAAGACTAATTTTACTTGCT 104278925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TAGTTATATAATGTAATAATTATAATGGCTGAGAAAAGTGAAAGACTAATTTTACTTGCT 1380

104278926 TATTCACATAAAATTTCTCAGAATGATAAAATAATGGTACTTTTATTGACAAAACTACAG 104278985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TATTCACATAAAATTTCTCAGAATGATAAAATAATGGTACTTTTATTGACAAAACTACAG 1440

104278986 AGAACTGCTATAATTG 104279001
          ||||||||||||||||
     1441 AGAACTGCTATAATTG 1456

EXCISED REGION

104279003 TAAGTTACATGTGGCTACCTATATGTTACATTGGTTATCTATATATGCTTGTTATAACAA 104279062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1458 TAAGTTACATGTGGCTACCTATATGTTACATTGGTTATCTATATATGCTTGTTATAACAA 1517

104279063 TGTACTTTTTTGTATACCTCTACTTGGAAATGTATTATAGTTAAGATTCATTCATTCGAC 104279122
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1518 TGTACTTTTTTGTATACCTTTACTTGGAAATGTATTATAGTTAAGATTCATTCATTCGAC 1577

104279123 TAATATGTATTGAGTGCCTACTATGTGCCAGGCACATGTTTTAGCTAATGTTGATGAATG 104279182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1578 TAATATGTATTGAGTGCCTACTATGTGCCAGGCACATGTTTTAGCTAATGTTGATGAATG 1637

104279183 GTATGGATAAAGGCCTTGACACATTCATATTTAGAAAGATGGAAATAAATACATCAACAA 104279242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1638 GTATGGATAAAGGCCTTGACACATTCATATTTAGAAAGATGGAAATAAATACATCAACAA 1697

104279243 CATGCAATCTAATAGAGTTAGTAATGATAAAGATAAAACAGAATATAGAGAGTAAATAAG 104279302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1698 CATGCAATCTAATAGAGTTAGTAATGATAAAGATAAAACAGAATATAGAGAGTAAATAAG 1757

104279303 GGACCTATTTTCTATATGGTGGTCAAAAATGGACCCTGTGATTACAGCTGAATACAGACT 104279362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1758 GGACCTATTTTCTATATGGTGGTCAAAAATGGACCCTGTGATTACAGCTGAATACAGACT 1817

104279363 TGAATAAAACGAGAAAGCAAGTAATTCACATATCTGAGGAGAAAACTCTTTAGACACAGG 104279422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1818 TGAATAAAACGAGAAAGCAAGTAATTCACATATCTGAGGAGAAAACTCTTTAGACACAGG 1877

104279423 GACCAGAAAGTTCAGGGGCCTTCAGCCAGAAATATTATTGACATGTGTAAATGAAGTAGC 104279482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1878 GACCAGAAAGTTCAGGGGCCTTCAGCCAGAAATATTATTGACATGTGTAAATGAAGTAGC 1937

104279483 AAAGATAGTTGTTTGAGGAGGTGAAAAGGAAAATAGTGAAGATCAAATTGAAGAGACAAT 104279542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1938 AAAGATAGTTGTTTGAGGAGGTGAAAAGGAAAATAGTGAAGATCAAATTGAAGAGACAAT 1997

104279543 CAAGGCCATGCAGACTGTGGCAAGAACTTTGGAACTTCTGTTTATTATCCGAAGAGGCCA 104279602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1998 CAAGGCCATGCAGACTGTGGCAAGAACTTTGGAACTTCTGTTTATTATCCGAAGAGGCCA 2057

104279603 TTGGAAGGTTATAAACAAGATATAAACATGATCTGACCTGTGTTTTGAAAGGATTTTTCT 104279662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2058 TTGGAAGGTTATAAACAAGATATAAACATGATCTGACCTGTGTTTTGAAAGGATTTTTCT 2117

104279663 GGATAGGGAGTGAAAATTATATTGAAAGTGAAAAGATTGTAGATATAGTAGCAGTGGTAG 104279722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2118 GGATAGGGAGTGAAAATTATATTGAAAGTGAAAAGATTGTAGATATAGTAGCAGTGGTAG 2177

104279723 GACTTGGGATATATATTACATACATTAGAGCTATCCTTAACTGTATCAACTGGTCTCATT 104279782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2178 GACTTGGGATATATATTACATACATTAGAGCTATCCTTAACTGTATCAACTGGTCTCATT 2237

104279783 GGGTATGAGAAGAAGATCAAAGTCAAGGCCAATTTTAATATGTTTGGCCTGAGCAAGAAG 104279842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2238 GGGTATGAGAAGAAGATCAAAGTCAAGGCCAATTTTAATATGTTTGGCCTGAGCAAGAAG 2297

104279843 GTGATATCCTTTCATGAAATGGGGATCAGTGAGAGGGGAGAAATTTACAGAGAAAAATTA 104279902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2298 GTGATATCCTTTCATGAAATGGGGATCAGTGAGAGGGGAGAAATTTACAGAGAAAAATTA 2357

104279903 AGAGTTTGGTTTTGGACCTATTAAAATTTGAGAAACCTGTGAGAAGTTTAAGAGGAAATG 104279962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2358 AGAGTTTGGTTTTGGACCTATTAAAATTTGAGAAACCTGTGAGAAGTTTAAGAGGAAATG 2417

104279963 TTGATGAAGAGGAAGTTCGAAATAAGAGTCGAGAGTCCAGGGAATTGGTTTGGAGCTGGA 104280022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2418 TTGATGAAGAGGAAGTTCGAAATAAGAGTCGAGAGTCCAGGGAATTGGTTTGGAGCTGGA 2477

104280023 GATTTTTTAAATTGAGAAGTTATTGGTAGATACAAGATATTTGCAGTCATGAGAGCTAAC 104280082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2478 GATTTTTTAAATTGAGAAGTTATTGGTAGATACAAGATATTTGCAGTCATGAGAGCTAAC 2537

104280083 AGTTACCTAGGGAGGGAGTAAAGATGAAGAGCTGAAATTTAAGGATAAAATTCCAGGGAT 104280142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2538 AGTTACCTAGGGAGGGAGTAAAGATGAAGAGCTGAAATTTAAGGATAAAATTCCAGGGAT 2597

104280143 CTAGAAATTTGGAAAATTGGAAGAAGAGGTGAAGCCAGAAAAGACTAAGAAGGAGAGGTC 104280202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2598 CTAGAAATTTGGAAAATTGGAAGAAGAGGTGAAGCCAGAAAAGACTAAGAAGGAGAGGTC 2657

104280203 AAGGAAGTAGGTGGGACAATAAAAGGATGTAGAATCTTGGCAACTGAGTGATGAAAAAAT 104280262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2658 AAGGAAGTAGGTGGGACAATAAAAGGATGTAGAATCTTGGCAACTGAGTGATGAAAAAAT 2717

104280263 TCTTTAAAGAATCAGAAAGTGACTGGTAAACTGGGTCAAAAGCTAGAGATTGAGTAAAAA 104280322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2718 TCTTTAAAGAATCAGAAAGTGACTGGTAAACTGGGTCAAAAGCTAGAGATTGAGTAAAAA 2777

104280323 CTGAAACTTTTCTTCATTTTAACATACTTTCGCTTTCAAGAAAATTATTACACTAAGGGG 104280382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2778 CTGAAACTTTTCTTCATTTTAACATACTTTCGCTTTCAAGAAAATTATTACACTAAGGGG 2837

104280383 GAATAGCAGAGCAATCTATTAGTGTTGCAGAGGACAGATGTGGCTTTTTCAGATGCTCAG 104280442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2838 GAATAGCAGAGCAATCTATTAGTGTTGCAGAGGACAGATGTGGCTTTTTCAGATGCTCAG 2897

104280443 AAGCACCCAATAAATTTGAAGAACAGACAGGTGTTCCTGAGAACTCAGGGAAGAATTTGG 104280502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2898 AAGCACCCAATAAATTTGAAGAACAGACAGGTGTTCCTGAGAACTCAGGGAAGAATTTGG 2957

104280503 CCAATGAAGGTCACAGGACACCTGTTCTGAAAATGTCCTACTGAAAATGTTCTTTAGAAG 104280562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2958 CCAATGAAGGTCACAGGACACCTGTTCTGAAAATGTCCTACTGAAAATGTTCTTTAGAAG 3017

104280563 TTACAGTGTTTTCATCAAGACAATGAGATTTCACTTTATAACTTTACTCAGTGCCCAGGT 104280622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3018 TTACAGTGTTTTCATCAAGACAATGAGATTTCACTTTATAACTTTACTCAGTGCCCAGGT 3077

104280623 TACCTAAAAAGTATTTTTTCATCTTCAAGGGAGAAAAAAACTTTGTTATTAGGTGATATA 104280682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3078 TACCTAAAAAGTATTTTTTCATCTTCAAGGGAGAAAAAAACTTTGTTATTAGGTGATATA 3137

104280683 ATTAGAATGTTTTAAAGAATGACATTAGTTTGCATTTCACAGCCTTACTAGGTAATATGA 104280742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3138 ATTAGAATGTTTTAAAGAATGACATTAGTTTGCATTTCACAGCCTTACTAGGTAATATGA 3197

104280743 GAAGAAAATTCC 104280754
          ||||||||||||
     3198 GAAGAAAATTCC 3209

Alignment time is 2.36699 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [104268199,104289046] =>     20848 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     5249] =>      5249 nucs 'mol-32-3004-159093_5249'

Score:        5227
Aligned:      5249        nucs
Identic:      5247 (100%) nucs =>      3320 (100%)      1927 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [104274878,104278199] EXCISED REGION [104279047,104280973]
 second seq =>  [        1,     3322] EXCISED REGION [     3323,     5249]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       847 nucs [104278200,104279046]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [104278200,104278200] to [104279047,104279047]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [104278199,104278199] to [104279047,104279047]
 second seq =>         1 nucs [3322,3322] to [3323,3323]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

104274878 CATTATTACAACTGGCAAAAACAGAAACTGTAAGGTGTCTAAAACCTAGGATCCAGAATT 104274937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CATTATTACAACTGGCAAAAACAGAAACTGTAAGGTGTCTAAAACCTAGGATCCAGAATT 60

104274938 TACACACTAAGCTTCTGTCTCATTCTATTAATTAAAGCAATTTATAAGGCCAGCCCAAAT 104274997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TACACACTAAGCTTCTGTCTCATTCTATTAATTAAAGCAATTTATAAGGCCAGCCCAAAT 120

104274998 TCAAGAGAGTGGAGGAACAGACTCCACTTTTTGTTGGAAGGAACAAAAACATTACATTGC 104275057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCAAGAGAGTGGAGGAACAGACTCCACTTTTTGTTGGAAGGAACAAAAACATTACATTGC 180

104275058 TCTGGGACATGGACACAAGGAGGCTTGACTCATGGGGACCATATTATAACTCTCTACTAC 104275117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCTGGGACATGGACACAAGGAGGCTTGACTCATGGGGACCATATTATAACTCTCTACTAC 240

104275118 ATTATGTAAAATTACTAATTTAATTTCTATATTCCCCACTAGACTATCTGTGTATATGAA 104275177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATTATGTAAAATTACTAATTTAATTTCTATATTCCCCACTAGACTATCTGTGTATATGAA 300

104275178 TAGGGACCATGCATTTCCTAATTTATGTTATATTGCCAGCATTTAATGCAGTCTTTATAT 104275237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TAGGGACCATGCATTTCCTAATTTATGTTATATTGCCAGCATTTAATGCAGTCTTTATAT 360

104275238 GTGCTAGGCATTAATAAATATTTGTTGAATGAATAATTAAATGGCTAAATTAATAACAGA 104275297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTGCTAGGCATTAATAAATATTTGTTGAATGAATAATTAAATGGCTAAATTAATAACAGA 420

104275298 GTGGATGAATTAACTTGAAAAAAGATTTCATGAACTATCAGCATGAAGATTTATCCACAA 104275357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTGGATGAATTAACTTGAAAAAAGATTTCATGAACTATCAGCATGAAGATTTATCCACAA 480

104275358 AAATAGAGAAGTGTTTCTTTTTTTGACCACATGAAAAACTAGAAACCATGTAAGCAGAAG 104275417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAATAGAGAAGTGTTTCTTTTTTTGACCACATGAAAAACTAGAAACCATGTAAGCAGAAG 540

104275418 TTATCTAAGTTAACTTTTATTGAGTAACTGGACACAGAATTCAGGTGCTCTGTTGTTTTC 104275477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTATCTAAGTTAACTTTTATTGAGTAACTGGACACAGAATTCAGGTGCTCTGTTGTTTTC 600

104275478 TATTGCTGCTATAACAAAACGTCACAAACAGCAAATTACTGCAACATGAATTTATTAGCT 104275537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TATTGCTGCTATAACAAAACGTCACAAACAGCAAATTACTGCAACATGAATTTATTAGCT 660

104275538 CACAGTTCTACCAGTCAGAATTCTGGTGTGGTTTAATTTAGTTCTCTGCTCAGGTTTCTC 104275597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CACAGTTCTACCAGTCAGAATTCTGGTGTGGTTTAATTTAGTTCTCTGCTCAGGTTTCTC 720

104275598 ACAAGCCAGAAATTAAAATAGCAACTGACTAGGCTCTTATCTGTAAGATCTGATGTCGAA 104275657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
      721 ACAAGCCAGAAATTAAAATAGCAACTGACTAGGCTCTTATCTGTAAGATCTGATGTTGAA 780

104275658 ACAATTTCCAAGCTGAATGATGTTTTTAGTAGAACTTAGCTCCTTGCAGTTGCAGAACTA 104275717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ACAATTTCCAAGCTGAATGATGTTTTTAGTAGAACTTAGCTCCTTGCAGTTGCAGAACTA 840

104275718 AGGTTCTCCCTTCTTGCTGGCTGGTGGCTGGGAGTCACCCTCAGCTCCTCCAGTGAGCCC 104275777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGGTTCTCCCTTCTTGCTGGCTGGTGGCTGGGAGTCACCCTCAGCTCCTCCAGTGAGCCC 900

104275778 ACATTCTTTCCGCATGTCTTCCTTTATCTTCAAGCCAGCAACAATGCATCGGGCCCTTCT 104275837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ACATTCTTTCCGCATGTCTTCCTTTATCTTCAAGCCAGCAACAATGCATCGGGCCCTTCT 960

104275838 CTGCTCAGATCTCCCTGACTTCCTCTGCTGTCCTCACCAAGGAGAATACTTTGATTTAAG 104275897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTGCTCAGATCTCCCTGACTTCCTCTGCTGTCCTCACCAAGGAGAATACTTTGATTTAAG 1020

104275898 GACTCCTGTAATTACATTGGCCCACCTGGGAAATCTAGGCTAATCTCTGTATCTTAAACT 104275957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GACTCCTGTAATTACATTGGCCCACCTGGGAAATCTAGGCTAATCTCTGTATCTTAAACT 1080

104275958 CAATTGATTCTTAACCTTAATTACCTCTGCAATGTCATTTTGCCATGTAATATAACATAT 104276017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CAATTGATTCTTAACCTTAATTACCTCTGCAATGTCATTTTGCCATGTAATATAACATAT 1140

104276018 TCACAGGTGTAACACCAGGGAGCAAAGGTCAGAGAGCCAAAATTCTGTCTACCGTTGATA 104276077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TCACAGGTGTAACACCAGGGAGCAAAGGTCAGAGAGCCAAAATTCTGTCTACCGTTGATA 1200

104276078 CTCAACAGCAATAAACATTCAGCTGTAGGAAACCTGAAGTCTCCAGAGAGATAATTTAGA 104276137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CTCAACAGCAATAAACATTCAGCTGTAGGAAACCTGAAGTCTCCAGAGAGATAATTTAGA 1260

104276138 TAAAATACAGCCTTAAGTATAGGACAGACCTGCTTAGAATCAGGAGTCTAAATTTTTTTG 104276197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TAAAATACAGCCTTAAGTATAGGACAGACCTGCTTAGAATCAGGAGTCTAAATTTTTTTG 1320

104276198 GTTACACAAATATAGCCAATTCTCTTTACCATTATAAATCTCAGCTTTATTTTTTTAATC 104276257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GTTACACAAATATAGCCAATTCTCTTTACCATTATAAATCTCAGCTTTATTTTTTTAATC 1380

104276258 TGAAAAATGCAAATATTGCTGCATCTCTATCATGTTGCTTTTAACATTAATATAAGAAAC 104276317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TGAAAAATGCAAATATTGCTGCATCTCTATCATGTTGCTTTTAACATTAATATAAGAAAC 1440

104276318 ATACATATAATCAGCAAAAAAGATTTTTAAAACCTTACATATCAAAGATTACAAAAGAGA 104276377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATACATATAATCAGCAAAAAAGATTTTTAAAACCTTACATATCAAAGATTACAAAAGAGA 1500

104276378 ATTAGGAGAAAGAACAAAGTCTAAAGATGTTGAGAGAGTACCCTAAAGTTATCTATTTAT 104276437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATTAGGAGAAAGAACAAAGTCTAAAGATGTTGAGAGAGTACCCTAAAGTTATCTATTTAT 1560

104276438 TTATTCACTTGTTCAAAAATATTTAGGACTAGGCCAGCCACAGTGGCTCATGCCTGTAAT 104276497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTATTCACTTGTTCAAAAATATTTAGGACTAGGCCAGCCACAGTGGCTCATGCCTGTAAT 1620

104276498 TCCAGCACTTTGGGGGGCCAAGGTGGGTGGATCACTTGAAGTCAGGAGTTTGAGATCAAC 104276557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TCCAGCACTTTGGGGGGCCAAGGTGGGTGGATCACTTGAAGTCAGGAGTTTGAGATCAAC 1680

104276558 CTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGTGTGGTG 104276617
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     1681 CTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACGAAAATTAGCCAGGTGTGGTG 1740

104276618 GCACGTGCCTGTAATCCCAGCTATTTGGGAGACTGCATCAGGAAAATTGCTTGAATCCAG 104276677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GCACGTGCCTGTAATCCCAGCTATTTGGGAGACTGCATCAGGAAAATTGCTTGAATCCAG 1800

104276678 GAGGCGGAGGGTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGACAACAGAGC 104276737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GAGGCGGAGGGTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGACAACAGAGC 1860

104276738 GAGACTCCGTCTCAAAAATATATATATATATATATATATTTAGGACTAGGTTTCGATGAA 104276797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GAGACTCCGTCTCAAAAATATATATATATATATATATATTTAGGACTAGGTTTCGATGAA 1920

104276798 ATTAACCTAACAACCAACACTTAATCCTTTGAGAAACTACTTTCTCAACTGCATGGAACT 104276857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ATTAACCTAACAACCAACACTTAATCCTTTGAGAAACTACTTTCTCAACTGCATGGAACT 1980

104276858 TACCTAGGATAAAAATTAAAATTTAGGAGAAAGTGATTTCAGAGCTCCAAATCTGTCCTG 104276917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TACCTAGGATAAAAATTAAAATTTAGGAGAAAGTGATTTCAGAGCTCCAAATCTGTCCTG 2040

104276918 TCTGCCCTCATTTCCATAATCTGCTTTGACTGCCATTTTGTATATCCCCTATAATTTAAC 104276977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TCTGCCCTCATTTCCATAATCTGCTTTGACTGCCATTTTGTATATCCCCTATAATTTAAC 2100

104276978 CTACTTATTGATCCCATGATCTCTGAAAATATTCTTTTTAATTTAATTTAATTTTTAGTT 104277037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CTACTTATTGATCCCATGATCTCTGAAAATATTCTTTTTAATTTAATTTAATTTTTAGTT 2160

104277038 CTGGGATACATGGGCAGGATATGCAGCCTTGTTATATGGGTAAATGTGTTCCATGGTGGT 104277097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CTGGGATACATGGGCAGGATATGCAGCCTTGTTATATGGGTAAATGTGTTCCATGGTGGT 2220

104277098 TTGCTGCACCTATCAAACCATCACCTAGGTATTAAGCCCCGCATGCATTAGCTACTCTTT 104277157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TTGCTGCACCTATCAAACCATCACCTAGGTATTAAGCCCCGCATGCATTAGCTACTCTTT 2280

104277158 CTGATGCGCTCCCTCCCACCACATCCCCAACCAACGGGCCCCATTATGTGTTGTTCCTTT 104277217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CTGATGCGCTCCCTCCCACCACATCCCCAACCAACGGGCCCCATTATGTGTTGTTCCTTT 2340

104277218 CTCTGTTTTTATGTGTTCTCATTGTTCAGCTTCCACTTATAAGTGAGAACATGTAGTGTT 104277277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CTCTGTTTTTATGTGTTCTCATTGTTCAGCTTCCACTTATAAGTGAGAACATGTAGTGTT 2400

104277278 TAATTTTCTGTTCCTGTGTTAGTTTGCTGAGGATAATGGCTTCCAGCTCCATCCCTTTTC 104277337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TAATTTTCTGTTCCTGTGTTAGTTTGCTGAGGATAATGGCTTCCAGCTCCATCCCTTTTC 2460

104277338 CTGCAAAGGACATGATCTCATTACTTTTTATGACTGCATAGTGTTCCATGGTGTAAATAT 104277397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CTGCAAAGGACATGATCTCATTACTTTTTATGACTGCATAGTGTTCCATGGTGTAAATAT 2520

104277398 ATCACATTTTCATTTTCCAGTCTATCATTGATGGGCATTTGGGTTAATTCCATGTCTTTT 104277457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 ATCACATTTTCATTTTCCAGTCTATCATTGATGGGCATTTGGGTTAATTCCATGTCTTTT 2580

104277458 CTACAGTGAATAGTGCTCCAGTGAACATACATGTGCAGGTATCTTTATAATAGAATGATT 104277517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CTACAGTGAATAGTGCTCCAGTGAACATACATGTGCAGGTATCTTTATAATAGAATGATT 2640

104277518 TATATTCTTTTGGGTACATACCCAGTAATGGGATTGCTGGGTCAAATGGTATTTCTGGTT 104277577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TATATTCTTTTGGGTACATACCCAGTAATGGGATTGCTGGGTCAAATGGTATTTCTGGTT 2700

104277578 CTAGGTCTTTGAGGAATTGCTACACTGTCTTCCACAAGTAAAACCCAGAACTATAAAAAC 104277637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CTAGGTCTTTGAGGAATTGCTACACTGTCTTCCACAAGTAAAACCCAGAACTATAAAAAC 2760

104277638 CCTAGAAGAAAAGCTAGACAGTACCATTCAGGACATCGGCACAGGCAAAGATTTCATGAC 104277697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CCTAGAAGAAAAGCTAGACAGTACCATTCAGGACATCGGCACAGGCAAAGATTTCATGAC 2820

104277698 AAAAATGTCAAAAGCAATTGCAACAAACACAAAACTTGACAAATGGGATCTAATTAAACT 104277757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 AAAAATGTCAAAAGCAATTGCAACAAACACAAAACTTGACAAATGGGATCTAATTAAACT 2880

104277758 AGAGCTTCTGCACAGCAAAAGAAACTATCATCAGAGTGGACAGACAACCTACAGAATGGG 104277817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 AGAGCTTCTGCACAGCAAAAGAAACTATCATCAGAGTGGACAGACAACCTACAGAATGGG 2940

104277818 AGAAAAGTTTGCAGTCTATTCATCCGACAAAGGTTGAATATCCAGAATCTACAAGGAACT 104277877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 AGAAAAGTTTGCAGTCTATTCATCCGACAAAGGTTGAATATCCAGAATCTACAAGGAACT 3000

104277878 TAGTTCCAATTTACAAGAAAAAAAAAAAACACCATTAAAAAGTCGGCAAAGGACATAAAC 104277937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TAGTTCCAATTTACAAGAAAAAAAAAAAACACCATTAAAAAGTCGGCAAAGGACATAAAC 3060

104277938 AGACACTTCTCAAAAGAAGACATTACGTGGCCACCAAACATATGAAAAAAAACTCAACCT 104277997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 AGACACTTCTCAAAAGAAGACATTACGTGGCCACCAAACATATGAAAAAAAACTCAACCT 3120

104277998 CACTGATCATTAGAGAAATACAAATCAAAACCACCAAGAGATACCATCGCATGCCAGTCA 104278057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 CACTGATCATTAGAGAAATACAAATCAAAACCACCAAGAGATACCATCGCATGCCAGTCA 3180

104278058 GAATGGTGATTATTAAAAAGTCAAGGAACAATAGATGCTGGTGAGGCTGTGGAGAAATAG 104278117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 GAATGGTGATTATTAAAAAGTCAAGGAACAATAGATGCTGGTGAGGCTGTGGAGAAATAG 3240

104278118 GAATGCTCTTTTGCACTGTTGATGGGAATCTCTGAAAATATTTATTCCTTTGAATGAGTT 104278177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 GAATGCTCTTTTGCACTGTTGATGGGAATCTCTGAAAATATTTATTCCTTTGAATGAGTT 3300

104278178 TAGCATAGGATGTTACCCTTAA 104278199
          ||||||||||||||||||||||
     3301 TAGCATAGGATGTTACCCTTAA 3322

EXCISED REGION

104279047 ATGCTTGTTATAACAATGTACTTTTTTGTATACCTCTACTTGGAAATGTATTATAGTTAA 104279106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3323 ATGCTTGTTATAACAATGTACTTTTTTGTATACCTCTACTTGGAAATGTATTATAGTTAA 3382

104279107 GATTCATTCATTCGACTAATATGTATTGAGTGCCTACTATGTGCCAGGCACATGTTTTAG 104279166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3383 GATTCATTCATTCGACTAATATGTATTGAGTGCCTACTATGTGCCAGGCACATGTTTTAG 3442

104279167 CTAATGTTGATGAATGGTATGGATAAAGGCCTTGACACATTCATATTTAGAAAGATGGAA 104279226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3443 CTAATGTTGATGAATGGTATGGATAAAGGCCTTGACACATTCATATTTAGAAAGATGGAA 3502

104279227 ATAAATACATCAACAACATGCAATCTAATAGAGTTAGTAATGATAAAGATAAAACAGAAT 104279286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3503 ATAAATACATCAACAACATGCAATCTAATAGAGTTAGTAATGATAAAGATAAAACAGAAT 3562

104279287 ATAGAGAGTAAATAAGGGACCTATTTTCTATATGGTGGTCAAAAATGGACCCTGTGATTA 104279346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3563 ATAGAGAGTAAATAAGGGACCTATTTTCTATATGGTGGTCAAAAATGGACCCTGTGATTA 3622

104279347 CAGCTGAATACAGACTTGAATAAAACGAGAAAGCAAGTAATTCACATATCTGAGGAGAAA 104279406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3623 CAGCTGAATACAGACTTGAATAAAACGAGAAAGCAAGTAATTCACATATCTGAGGAGAAA 3682

104279407 ACTCTTTAGACACAGGGACCAGAAAGTTCAGGGGCCTTCAGCCAGAAATATTATTGACAT 104279466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3683 ACTCTTTAGACACAGGGACCAGAAAGTTCAGGGGCCTTCAGCCAGAAATATTATTGACAT 3742

104279467 GTGTAAATGAAGTAGCAAAGATAGTTGTTTGAGGAGGTGAAAAGGAAAATAGTGAAGATC 104279526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3743 GTGTAAATGAAGTAGCAAAGATAGTTGTTTGAGGAGGTGAAAAGGAAAATAGTGAAGATC 3802

104279527 AAATTGAAGAGACAATCAAGGCCATGCAGACTGTGGCAAGAACTTTGGAACTTCTGTTTA 104279586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3803 AAATTGAAGAGACAATCAAGGCCATGCAGACTGTGGCAAGAACTTTGGAACTTCTGTTTA 3862

104279587 TTATCCGAAGAGGCCATTGGAAGGTTATAAACAAGATATAAACATGATCTGACCTGTGTT 104279646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3863 TTATCCGAAGAGGCCATTGGAAGGTTATAAACAAGATATAAACATGATCTGACCTGTGTT 3922

104279647 TTGAAAGGATTTTTCTGGATAGGGAGTGAAAATTATATTGAAAGTGAAAAGATTGTAGAT 104279706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3923 TTGAAAGGATTTTTCTGGATAGGGAGTGAAAATTATATTGAAAGTGAAAAGATTGTAGAT 3982

104279707 ATAGTAGCAGTGGTAGGACTTGGGATATATATTACATACATTAGAGCTATCCTTAACTGT 104279766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3983 ATAGTAGCAGTGGTAGGACTTGGGATATATATTACATACATTAGAGCTATCCTTAACTGT 4042

104279767 ATCAACTGGTCTCATTGGGTATGAGAAGAAGATCAAAGTCAAGGCCAATTTTAATATGTT 104279826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4043 ATCAACTGGTCTCATTGGGTATGAGAAGAAGATCAAAGTCAAGGCCAATTTTAATATGTT 4102

104279827 TGGCCTGAGCAAGAAGGTGATATCCTTTCATGAAATGGGGATCAGTGAGAGGGGAGAAAT 104279886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4103 TGGCCTGAGCAAGAAGGTGATATCCTTTCATGAAATGGGGATCAGTGAGAGGGGAGAAAT 4162

104279887 TTACAGAGAAAAATTAAGAGTTTGGTTTTGGACCTATTAAAATTTGAGAAACCTGTGAGA 104279946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4163 TTACAGAGAAAAATTAAGAGTTTGGTTTTGGACCTATTAAAATTTGAGAAACCTGTGAGA 4222

104279947 AGTTTAAGAGGAAATGTTGATGAAGAGGAAGTTCGAAATAAGAGTCGAGAGTCCAGGGAA 104280006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4223 AGTTTAAGAGGAAATGTTGATGAAGAGGAAGTTCGAAATAAGAGTCGAGAGTCCAGGGAA 4282

104280007 TTGGTTTGGAGCTGGAGATTTTTTAAATTGAGAAGTTATTGGTAGATACAAGATATTTGC 104280066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4283 TTGGTTTGGAGCTGGAGATTTTTTAAATTGAGAAGTTATTGGTAGATACAAGATATTTGC 4342

104280067 AGTCATGAGAGCTAACAGTTACCTAGGGAGGGAGTAAAGATGAAGAGCTGAAATTTAAGG 104280126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4343 AGTCATGAGAGCTAACAGTTACCTAGGGAGGGAGTAAAGATGAAGAGCTGAAATTTAAGG 4402

104280127 ATAAAATTCCAGGGATCTAGAAATTTGGAAAATTGGAAGAAGAGGTGAAGCCAGAAAAGA 104280186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4403 ATAAAATTCCAGGGATCTAGAAATTTGGAAAATTGGAAGAAGAGGTGAAGCCAGAAAAGA 4462

104280187 CTAAGAAGGAGAGGTCAAGGAAGTAGGTGGGACAATAAAAGGATGTAGAATCTTGGCAAC 104280246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4463 CTAAGAAGGAGAGGTCAAGGAAGTAGGTGGGACAATAAAAGGATGTAGAATCTTGGCAAC 4522

104280247 TGAGTGATGAAAAAATTCTTTAAAGAATCAGAAAGTGACTGGTAAACTGGGTCAAAAGCT 104280306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4523 TGAGTGATGAAAAAATTCTTTAAAGAATCAGAAAGTGACTGGTAAACTGGGTCAAAAGCT 4582

104280307 AGAGATTGAGTAAAAACTGAAACTTTTCTTCATTTTAACATACTTTCGCTTTCAAGAAAA 104280366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4583 AGAGATTGAGTAAAAACTGAAACTTTTCTTCATTTTAACATACTTTCGCTTTCAAGAAAA 4642

104280367 TTATTACACTAAGGGGGAATAGCAGAGCAATCTATTAGTGTTGCAGAGGACAGATGTGGC 104280426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4643 TTATTACACTAAGGGGGAATAGCAGAGCAATCTATTAGTGTTGCAGAGGACAGATGTGGC 4702

104280427 TTTTTCAGATGCTCAGAAGCACCCAATAAATTTGAAGAACAGACAGGTGTTCCTGAGAAC 104280486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4703 TTTTTCAGATGCTCAGAAGCACCCAATAAATTTGAAGAACAGACAGGTGTTCCTGAGAAC 4762

104280487 TCAGGGAAGAATTTGGCCAATGAAGGTCACAGGACACCTGTTCTGAAAATGTCCTACTGA 104280546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4763 TCAGGGAAGAATTTGGCCAATGAAGGTCACAGGACACCTGTTCTGAAAATGTCCTACTGA 4822

104280547 AAATGTTCTTTAGAAGTTACAGTGTTTTCATCAAGACAATGAGATTTCACTTTATAACTT 104280606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4823 AAATGTTCTTTAGAAGTTACAGTGTTTTCATCAAGACAATGAGATTTCACTTTATAACTT 4882

104280607 TACTCAGTGCCCAGGTTACCTAAAAAGTATTTTTTCATCTTCAAGGGAGAAAAAAACTTT 104280666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4883 TACTCAGTGCCCAGGTTACCTAAAAAGTATTTTTTCATCTTCAAGGGAGAAAAAAACTTT 4942

104280667 GTTATTAGGTGATATAATTAGAATGTTTTAAAGAATGACATTAGTTTGCATTTCACAGCC 104280726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4943 GTTATTAGGTGATATAATTAGAATGTTTTAAAGAATGACATTAGTTTGCATTTCACAGCC 5002

104280727 TTACTAGGTAATATGAGAAGAAAATTCCAGTTTTATATTCTCTCGTATCTCTGAATTTCT 104280786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5003 TTACTAGGTAATATGAGAAGAAAATTCCAGTTTTATATTCTCTCGTATCTCTGAATTTCT 5062

104280787 TTCTAATTTATGGAAACAGTCTAATTTATGGAAACAGAATAATTAAATGCCCATGATAAA 104280846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5063 TTCTAATTTATGGAAACAGTCTAATTTATGGAAACAGAATAATTAAATGCCCATGATAAA 5122

104280847 TTTTCAAAGTTTATGACTTTCACTTGCATGGAATTAAAAATTATTTGCTGTTTTGTTAGT 104280906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5123 TTTTCAAAGTTTATGACTTTCACTTGCATGGAATTAAAAATTATTTGCTGTTTTGTTAGT 5182

104280907 ATTACTGTTAAGTGCCTTCCATGCTGCAGTAAGAAAACAGAAAAGTGAAATTCAAGAGCT 104280966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5183 ATTACTGTTAAGTGCCTTCCATGCTGCAGTAAGAAAACAGAAAAGTGAAATTCAAGAGCT 5242

104280967 AATCCAG 104280973
          |||||||
     5243 AATCCAG 5249

Alignment time is 3.84292 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [104268199,104289046] =>     20848 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     3232] =>      3232 nucs 'mol-32-3004-196720_3232'

Score:        3232
Aligned:      3232        nucs
Identic:      3232 (100%) nucs =>      1425 (100%)      1807 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [104276775,104278199] EXCISED REGION [104279047,104280853]
 second seq =>  [        1,     1425] EXCISED REGION [     1426,     3232]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       847 nucs [104278200,104279046]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [104278200,104278200] to [104279047,104279047]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [104278199,104278199] to [104279047,104279047]
 second seq =>         1 nucs [1425,1425] to [1426,1426]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

104276775 ATTTAGGACTAGGTTTCGATGAAATTAACCTAACAACCAACACTTAATCCTTTGAGAAAC 104276834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATTTAGGACTAGGTTTCGATGAAATTAACCTAACAACCAACACTTAATCCTTTGAGAAAC 60

104276835 TACTTTCTCAACTGCATGGAACTTACCTAGGATAAAAATTAAAATTTAGGAGAAAGTGAT 104276894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TACTTTCTCAACTGCATGGAACTTACCTAGGATAAAAATTAAAATTTAGGAGAAAGTGAT 120

104276895 TTCAGAGCTCCAAATCTGTCCTGTCTGCCCTCATTTCCATAATCTGCTTTGACTGCCATT 104276954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTCAGAGCTCCAAATCTGTCCTGTCTGCCCTCATTTCCATAATCTGCTTTGACTGCCATT 180

104276955 TTGTATATCCCCTATAATTTAACCTACTTATTGATCCCATGATCTCTGAAAATATTCTTT 104277014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTGTATATCCCCTATAATTTAACCTACTTATTGATCCCATGATCTCTGAAAATATTCTTT 240

104277015 TTAATTTAATTTAATTTTTAGTTCTGGGATACATGGGCAGGATATGCAGCCTTGTTATAT 104277074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTAATTTAATTTAATTTTTAGTTCTGGGATACATGGGCAGGATATGCAGCCTTGTTATAT 300

104277075 GGGTAAATGTGTTCCATGGTGGTTTGCTGCACCTATCAAACCATCACCTAGGTATTAAGC 104277134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GGGTAAATGTGTTCCATGGTGGTTTGCTGCACCTATCAAACCATCACCTAGGTATTAAGC 360

104277135 CCCGCATGCATTAGCTACTCTTTCTGATGCGCTCCCTCCCACCACATCCCCAACCAACGG 104277194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CCCGCATGCATTAGCTACTCTTTCTGATGCGCTCCCTCCCACCACATCCCCAACCAACGG 420

104277195 GCCCCATTATGTGTTGTTCCTTTCTCTGTTTTTATGTGTTCTCATTGTTCAGCTTCCACT 104277254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GCCCCATTATGTGTTGTTCCTTTCTCTGTTTTTATGTGTTCTCATTGTTCAGCTTCCACT 480

104277255 TATAAGTGAGAACATGTAGTGTTTAATTTTCTGTTCCTGTGTTAGTTTGCTGAGGATAAT 104277314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TATAAGTGAGAACATGTAGTGTTTAATTTTCTGTTCCTGTGTTAGTTTGCTGAGGATAAT 540

104277315 GGCTTCCAGCTCCATCCCTTTTCCTGCAAAGGACATGATCTCATTACTTTTTATGACTGC 104277374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGCTTCCAGCTCCATCCCTTTTCCTGCAAAGGACATGATCTCATTACTTTTTATGACTGC 600

104277375 ATAGTGTTCCATGGTGTAAATATATCACATTTTCATTTTCCAGTCTATCATTGATGGGCA 104277434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATAGTGTTCCATGGTGTAAATATATCACATTTTCATTTTCCAGTCTATCATTGATGGGCA 660

104277435 TTTGGGTTAATTCCATGTCTTTTCTACAGTGAATAGTGCTCCAGTGAACATACATGTGCA 104277494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTTGGGTTAATTCCATGTCTTTTCTACAGTGAATAGTGCTCCAGTGAACATACATGTGCA 720

104277495 GGTATCTTTATAATAGAATGATTTATATTCTTTTGGGTACATACCCAGTAATGGGATTGC 104277554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GGTATCTTTATAATAGAATGATTTATATTCTTTTGGGTACATACCCAGTAATGGGATTGC 780

104277555 TGGGTCAAATGGTATTTCTGGTTCTAGGTCTTTGAGGAATTGCTACACTGTCTTCCACAA 104277614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGGGTCAAATGGTATTTCTGGTTCTAGGTCTTTGAGGAATTGCTACACTGTCTTCCACAA 840

104277615 GTAAAACCCAGAACTATAAAAACCCTAGAAGAAAAGCTAGACAGTACCATTCAGGACATC 104277674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GTAAAACCCAGAACTATAAAAACCCTAGAAGAAAAGCTAGACAGTACCATTCAGGACATC 900

104277675 GGCACAGGCAAAGATTTCATGACAAAAATGTCAAAAGCAATTGCAACAAACACAAAACTT 104277734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GGCACAGGCAAAGATTTCATGACAAAAATGTCAAAAGCAATTGCAACAAACACAAAACTT 960

104277735 GACAAATGGGATCTAATTAAACTAGAGCTTCTGCACAGCAAAAGAAACTATCATCAGAGT 104277794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GACAAATGGGATCTAATTAAACTAGAGCTTCTGCACAGCAAAAGAAACTATCATCAGAGT 1020

104277795 GGACAGACAACCTACAGAATGGGAGAAAAGTTTGCAGTCTATTCATCCGACAAAGGTTGA 104277854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GGACAGACAACCTACAGAATGGGAGAAAAGTTTGCAGTCTATTCATCCGACAAAGGTTGA 1080

104277855 ATATCCAGAATCTACAAGGAACTTAGTTCCAATTTACAAGAAAAAAAAAAAACACCATTA 104277914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATATCCAGAATCTACAAGGAACTTAGTTCCAATTTACAAGAAAAAAAAAAAACACCATTA 1140

104277915 AAAAGTCGGCAAAGGACATAAACAGACACTTCTCAAAAGAAGACATTACGTGGCCACCAA 104277974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AAAAGTCGGCAAAGGACATAAACAGACACTTCTCAAAAGAAGACATTACGTGGCCACCAA 1200

104277975 ACATATGAAAAAAAACTCAACCTCACTGATCATTAGAGAAATACAAATCAAAACCACCAA 104278034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ACATATGAAAAAAAACTCAACCTCACTGATCATTAGAGAAATACAAATCAAAACCACCAA 1260

104278035 GAGATACCATCGCATGCCAGTCAGAATGGTGATTATTAAAAAGTCAAGGAACAATAGATG 104278094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GAGATACCATCGCATGCCAGTCAGAATGGTGATTATTAAAAAGTCAAGGAACAATAGATG 1320

104278095 CTGGTGAGGCTGTGGAGAAATAGGAATGCTCTTTTGCACTGTTGATGGGAATCTCTGAAA 104278154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CTGGTGAGGCTGTGGAGAAATAGGAATGCTCTTTTGCACTGTTGATGGGAATCTCTGAAA 1380

104278155 ATATTTATTCCTTTGAATGAGTTTAGCATAGGATGTTACCCTTAA 104278199
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ATATTTATTCCTTTGAATGAGTTTAGCATAGGATGTTACCCTTAA 1425

EXCISED REGION

104279047 ATGCTTGTTATAACAATGTACTTTTTTGTATACCTCTACTTGGAAATGTATTATAGTTAA 104279106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1426 ATGCTTGTTATAACAATGTACTTTTTTGTATACCTCTACTTGGAAATGTATTATAGTTAA 1485

104279107 GATTCATTCATTCGACTAATATGTATTGAGTGCCTACTATGTGCCAGGCACATGTTTTAG 104279166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1486 GATTCATTCATTCGACTAATATGTATTGAGTGCCTACTATGTGCCAGGCACATGTTTTAG 1545

104279167 CTAATGTTGATGAATGGTATGGATAAAGGCCTTGACACATTCATATTTAGAAAGATGGAA 104279226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1546 CTAATGTTGATGAATGGTATGGATAAAGGCCTTGACACATTCATATTTAGAAAGATGGAA 1605

104279227 ATAAATACATCAACAACATGCAATCTAATAGAGTTAGTAATGATAAAGATAAAACAGAAT 104279286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1606 ATAAATACATCAACAACATGCAATCTAATAGAGTTAGTAATGATAAAGATAAAACAGAAT 1665

104279287 ATAGAGAGTAAATAAGGGACCTATTTTCTATATGGTGGTCAAAAATGGACCCTGTGATTA 104279346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1666 ATAGAGAGTAAATAAGGGACCTATTTTCTATATGGTGGTCAAAAATGGACCCTGTGATTA 1725

104279347 CAGCTGAATACAGACTTGAATAAAACGAGAAAGCAAGTAATTCACATATCTGAGGAGAAA 104279406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1726 CAGCTGAATACAGACTTGAATAAAACGAGAAAGCAAGTAATTCACATATCTGAGGAGAAA 1785

104279407 ACTCTTTAGACACAGGGACCAGAAAGTTCAGGGGCCTTCAGCCAGAAATATTATTGACAT 104279466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1786 ACTCTTTAGACACAGGGACCAGAAAGTTCAGGGGCCTTCAGCCAGAAATATTATTGACAT 1845

104279467 GTGTAAATGAAGTAGCAAAGATAGTTGTTTGAGGAGGTGAAAAGGAAAATAGTGAAGATC 104279526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1846 GTGTAAATGAAGTAGCAAAGATAGTTGTTTGAGGAGGTGAAAAGGAAAATAGTGAAGATC 1905

104279527 AAATTGAAGAGACAATCAAGGCCATGCAGACTGTGGCAAGAACTTTGGAACTTCTGTTTA 104279586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1906 AAATTGAAGAGACAATCAAGGCCATGCAGACTGTGGCAAGAACTTTGGAACTTCTGTTTA 1965

104279587 TTATCCGAAGAGGCCATTGGAAGGTTATAAACAAGATATAAACATGATCTGACCTGTGTT 104279646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1966 TTATCCGAAGAGGCCATTGGAAGGTTATAAACAAGATATAAACATGATCTGACCTGTGTT 2025

104279647 TTGAAAGGATTTTTCTGGATAGGGAGTGAAAATTATATTGAAAGTGAAAAGATTGTAGAT 104279706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2026 TTGAAAGGATTTTTCTGGATAGGGAGTGAAAATTATATTGAAAGTGAAAAGATTGTAGAT 2085

104279707 ATAGTAGCAGTGGTAGGACTTGGGATATATATTACATACATTAGAGCTATCCTTAACTGT 104279766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2086 ATAGTAGCAGTGGTAGGACTTGGGATATATATTACATACATTAGAGCTATCCTTAACTGT 2145

104279767 ATCAACTGGTCTCATTGGGTATGAGAAGAAGATCAAAGTCAAGGCCAATTTTAATATGTT 104279826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2146 ATCAACTGGTCTCATTGGGTATGAGAAGAAGATCAAAGTCAAGGCCAATTTTAATATGTT 2205

104279827 TGGCCTGAGCAAGAAGGTGATATCCTTTCATGAAATGGGGATCAGTGAGAGGGGAGAAAT 104279886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2206 TGGCCTGAGCAAGAAGGTGATATCCTTTCATGAAATGGGGATCAGTGAGAGGGGAGAAAT 2265

104279887 TTACAGAGAAAAATTAAGAGTTTGGTTTTGGACCTATTAAAATTTGAGAAACCTGTGAGA 104279946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2266 TTACAGAGAAAAATTAAGAGTTTGGTTTTGGACCTATTAAAATTTGAGAAACCTGTGAGA 2325

104279947 AGTTTAAGAGGAAATGTTGATGAAGAGGAAGTTCGAAATAAGAGTCGAGAGTCCAGGGAA 104280006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2326 AGTTTAAGAGGAAATGTTGATGAAGAGGAAGTTCGAAATAAGAGTCGAGAGTCCAGGGAA 2385

104280007 TTGGTTTGGAGCTGGAGATTTTTTAAATTGAGAAGTTATTGGTAGATACAAGATATTTGC 104280066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2386 TTGGTTTGGAGCTGGAGATTTTTTAAATTGAGAAGTTATTGGTAGATACAAGATATTTGC 2445

104280067 AGTCATGAGAGCTAACAGTTACCTAGGGAGGGAGTAAAGATGAAGAGCTGAAATTTAAGG 104280126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2446 AGTCATGAGAGCTAACAGTTACCTAGGGAGGGAGTAAAGATGAAGAGCTGAAATTTAAGG 2505

104280127 ATAAAATTCCAGGGATCTAGAAATTTGGAAAATTGGAAGAAGAGGTGAAGCCAGAAAAGA 104280186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2506 ATAAAATTCCAGGGATCTAGAAATTTGGAAAATTGGAAGAAGAGGTGAAGCCAGAAAAGA 2565

104280187 CTAAGAAGGAGAGGTCAAGGAAGTAGGTGGGACAATAAAAGGATGTAGAATCTTGGCAAC 104280246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2566 CTAAGAAGGAGAGGTCAAGGAAGTAGGTGGGACAATAAAAGGATGTAGAATCTTGGCAAC 2625

104280247 TGAGTGATGAAAAAATTCTTTAAAGAATCAGAAAGTGACTGGTAAACTGGGTCAAAAGCT 104280306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2626 TGAGTGATGAAAAAATTCTTTAAAGAATCAGAAAGTGACTGGTAAACTGGGTCAAAAGCT 2685

104280307 AGAGATTGAGTAAAAACTGAAACTTTTCTTCATTTTAACATACTTTCGCTTTCAAGAAAA 104280366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2686 AGAGATTGAGTAAAAACTGAAACTTTTCTTCATTTTAACATACTTTCGCTTTCAAGAAAA 2745

104280367 TTATTACACTAAGGGGGAATAGCAGAGCAATCTATTAGTGTTGCAGAGGACAGATGTGGC 104280426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2746 TTATTACACTAAGGGGGAATAGCAGAGCAATCTATTAGTGTTGCAGAGGACAGATGTGGC 2805

104280427 TTTTTCAGATGCTCAGAAGCACCCAATAAATTTGAAGAACAGACAGGTGTTCCTGAGAAC 104280486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2806 TTTTTCAGATGCTCAGAAGCACCCAATAAATTTGAAGAACAGACAGGTGTTCCTGAGAAC 2865

104280487 TCAGGGAAGAATTTGGCCAATGAAGGTCACAGGACACCTGTTCTGAAAATGTCCTACTGA 104280546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2866 TCAGGGAAGAATTTGGCCAATGAAGGTCACAGGACACCTGTTCTGAAAATGTCCTACTGA 2925

104280547 AAATGTTCTTTAGAAGTTACAGTGTTTTCATCAAGACAATGAGATTTCACTTTATAACTT 104280606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2926 AAATGTTCTTTAGAAGTTACAGTGTTTTCATCAAGACAATGAGATTTCACTTTATAACTT 2985

104280607 TACTCAGTGCCCAGGTTACCTAAAAAGTATTTTTTCATCTTCAAGGGAGAAAAAAACTTT 104280666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2986 TACTCAGTGCCCAGGTTACCTAAAAAGTATTTTTTCATCTTCAAGGGAGAAAAAAACTTT 3045

104280667 GTTATTAGGTGATATAATTAGAATGTTTTAAAGAATGACATTAGTTTGCATTTCACAGCC 104280726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3046 GTTATTAGGTGATATAATTAGAATGTTTTAAAGAATGACATTAGTTTGCATTTCACAGCC 3105

104280727 TTACTAGGTAATATGAGAAGAAAATTCCAGTTTTATATTCTCTCGTATCTCTGAATTTCT 104280786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3106 TTACTAGGTAATATGAGAAGAAAATTCCAGTTTTATATTCTCTCGTATCTCTGAATTTCT 3165

104280787 TTCTAATTTATGGAAACAGTCTAATTTATGGAAACAGAATAATTAAATGCCCATGATAAA 104280846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3166 TTCTAATTTATGGAAACAGTCTAATTTATGGAAACAGAATAATTAAATGCCCATGATAAA 3225

104280847 TTTTCAA 104280853
          |||||||
     3226 TTTTCAA 3232

Alignment time is 2.38993 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [104268199,104289046] =>     20848 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     3170] =>      3170 nucs 'mol-32-303b-051033_3170'

Score:        3159
Aligned:      3170        nucs
Identic:      3169 (100%) nucs =>      1394 (100%)      1775 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [104276806,104278199] EXCISED REGION [104279047,104280821]
 second seq =>  [        1,     1395] EXCISED REGION [     1396,     3170]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       847 nucs [104278200,104279046]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [104278200,104278200] to [104279047,104279047]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [104278199,104278199] to [104279047,104279047]
 second seq =>         1 nucs [1395,1395] to [1396,1396]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

104276806 AACAACCAACACTTAATCCTTTGAGAAACTACTTTCTCAACTGCATGGAACTTACCTAGG 104276865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AACAACCAACACTTAATCCTTTGAGAAACTACTTTCTCAACTGCATGGAACTTACCTAGG 60

104276866 ATAAAAATTAAAATTTAGGAGAAAGTGATTTCAGAGCTCCAAATCTGTCCTGTCTGCCCT 104276925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATAAAAATTAAAATTTAGGAGAAAGTGATTTCAGAGCTCCAAATCTGTCCTGTCTGCCCT 120

104276926 CATTTCCATAATCTGCTTTGACTGCCATTTTGTATATCCCCTATAATTTAACCTACTTAT 104276985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CATTTCCATAATCTGCTTTGACTGCCATTTTGTATATCCCCTATAATTTAACCTACTTAT 180

104276986 TGATCCCATGATCTCTGAAAATATTCTTTTTAATTTAATTTAATTTTTAGTTCTGGGATA 104277045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGATCCCATGATCTCTGAAAATATTCTTTTTAATTTAATTTAATTTTTAGTTCTGGGATA 240

104277046 CATGGGCAGGATATGCAGCCTTGTTATATGGGTAAATGTGTTCCATGGTGGTTTGCTGCA 104277105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CATGGGCAGGATATGCAGCCTTGTTATATGGGTAAATGTGTTCCATGGTGGTTTGCTGCA 300

104277106 CCTATCAAACCATCACCTAGGTATTAAGCCCCGCATGCATTAGCTACTCTTTCTGATGCG 104277165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCTATCAAACCATCACCTAGGTATTAAGCCCCGCATGCATTAGCTACTCTTTCTGATGCG 360

104277166 CTCCCTCCCACCACATCCCCAACCAACGGGCCCCATTATGTGTTGTTCCTTTCTCTGTTT 104277225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTCCCTCCCACCACATCCCCAACCAACGGGCCCCATTATGTGTTGTTCCTTTCTCTGTTT 420

104277226 TTATGTGTTCTCATTGTTCAGCTTCCACTTATAAGTGAGAACATGTAGTGTTTAATTTTC 104277285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTATGTGTTCTCATTGTTCAGCTTCCACTTATAAGTGAGAACATGTAGTGTTTAATTTTC 480

104277286 TGTTCCTGTGTTAGTTTGCTGAGGATAATGGCTTCCAGCTCCATCCCTTTTCCTGCAAAG 104277345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGTTCCTGTGTTAGTTTGCTGAGGATAATGGCTTCCAGCTCCATCCCTTTTCCTGCAAAG 540

104277346 GACATGATCTCATTACTTTTTATGACTGCATAGTGTTCCATGGTGTAAATATATCACATT 104277405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GACATGATCTCATTACTTTTTATGACTGCATAGTGTTCCATGGTGTAAATATATCACATT 600

104277406 TTCATTTTCCAGTCTATCATTGATGGGCATTTGGGTTAATTCCATGTCTTTTCTACAGTG 104277465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTCATTTTCCAGTCTATCATTGATGGGCATTTGGGTTAATTCCATGTCTTTTCTACAGTG 660

104277466 AATAGTGCTCCAGTGAACATACATGTGCAGGTATCTTTATAATAGAATGATTTATATTCT 104277525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AATAGTGCTCCAGTGAACATACATGTGCAGGTATCTTTATAATAGAATGATTTATATTCT 720

104277526 TTTGGGTACATACCCAGTAATGGGATTGCTGGGTCAAATGGTATTTCTGGTTCTAGGTCT 104277585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTTGGGTACATACCCAGTAATGGGATTGCTGGGTCAAATGGTATTTCTGGTTCTAGGTCT 780

104277586 TTGAGGAATTGCTACACTGTCTTCCACAAGTAAAACCCAGAACTATAAAAACCCTAGAAG 104277645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTGAGGAATTGCTACACTGTCTTCCACAAGTAAAACCCAGAACTATAAAAACCCTAGAAG 840

104277646 AAAAGCTAGACAGTACCATTCAGGACATCGGCACAGGCAAAGATTTCATGACAAAAATGT 104277705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAAAGCTAGACAGTACCATTCAGGACATCGGCACAGGCAAAGATTTCATGACAAAAATGT 900

104277706 CAAAAGCAATTGCAACAAACACAAAACTTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAGAGCTTC 104277765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CAAAAGCAATTGCAACAAACACAAAACTTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAGAGCTTC 960

104277766 TGCACAGCAAAAGAAACTATCATCAGAGTGGACAGACAACCTACAGAATGGGAGAAAAGT 104277825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGCACAGCAAAAGAAACTATCATCAGAGTGGACAGACAACCTACAGAATGGGAGAAAAGT 1020

104277826 TTGCAGTCTATTCATCCGACAAAGGTTGAATATCCAGAATCTACAAGGAACTTAGTTCCA 104277885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTGCAGTCTATTCATCCGACAAAGGTTGAATATCCAGAATCTACAAGGAACTTAGTTCCA 1080

104277886 ATTTACAAGAAAAAAAAAAAA-CACCATTAAAAAGTCGGCAAAGGACATAAACAGACACT 104277944
          ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATTTACAAGAAAAAAAAAAAAACACCATTAAAAAGTCGGCAAAGGACATAAACAGACACT 1140

104277945 TCTCAAAAGAAGACATTACGTGGCCACCAAACATATGAAAAAAAACTCAACCTCACTGAT 104278004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TCTCAAAAGAAGACATTACGTGGCCACCAAACATATGAAAAAAAACTCAACCTCACTGAT 1200

104278005 CATTAGAGAAATACAAATCAAAACCACCAAGAGATACCATCGCATGCCAGTCAGAATGGT 104278064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CATTAGAGAAATACAAATCAAAACCACCAAGAGATACCATCGCATGCCAGTCAGAATGGT 1260

104278065 GATTATTAAAAAGTCAAGGAACAATAGATGCTGGTGAGGCTGTGGAGAAATAGGAATGCT 104278124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GATTATTAAAAAGTCAAGGAACAATAGATGCTGGTGAGGCTGTGGAGAAATAGGAATGCT 1320

104278125 CTTTTGCACTGTTGATGGGAATCTCTGAAAATATTTATTCCTTTGAATGAGTTTAGCATA 104278184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CTTTTGCACTGTTGATGGGAATCTCTGAAAATATTTATTCCTTTGAATGAGTTTAGCATA 1380

104278185 GGATGTTACCCTTAA 104278199
          |||||||||||||||
     1381 GGATGTTACCCTTAA 1395

EXCISED REGION

104279047 ATGCTTGTTATAACAATGTACTTTTTTGTATACCTCTACTTGGAAATGTATTATAGTTAA 104279106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1396 ATGCTTGTTATAACAATGTACTTTTTTGTATACCTCTACTTGGAAATGTATTATAGTTAA 1455

104279107 GATTCATTCATTCGACTAATATGTATTGAGTGCCTACTATGTGCCAGGCACATGTTTTAG 104279166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1456 GATTCATTCATTCGACTAATATGTATTGAGTGCCTACTATGTGCCAGGCACATGTTTTAG 1515

104279167 CTAATGTTGATGAATGGTATGGATAAAGGCCTTGACACATTCATATTTAGAAAGATGGAA 104279226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1516 CTAATGTTGATGAATGGTATGGATAAAGGCCTTGACACATTCATATTTAGAAAGATGGAA 1575

104279227 ATAAATACATCAACAACATGCAATCTAATAGAGTTAGTAATGATAAAGATAAAACAGAAT 104279286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1576 ATAAATACATCAACAACATGCAATCTAATAGAGTTAGTAATGATAAAGATAAAACAGAAT 1635

104279287 ATAGAGAGTAAATAAGGGACCTATTTTCTATATGGTGGTCAAAAATGGACCCTGTGATTA 104279346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1636 ATAGAGAGTAAATAAGGGACCTATTTTCTATATGGTGGTCAAAAATGGACCCTGTGATTA 1695

104279347 CAGCTGAATACAGACTTGAATAAAACGAGAAAGCAAGTAATTCACATATCTGAGGAGAAA 104279406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1696 CAGCTGAATACAGACTTGAATAAAACGAGAAAGCAAGTAATTCACATATCTGAGGAGAAA 1755

104279407 ACTCTTTAGACACAGGGACCAGAAAGTTCAGGGGCCTTCAGCCAGAAATATTATTGACAT 104279466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1756 ACTCTTTAGACACAGGGACCAGAAAGTTCAGGGGCCTTCAGCCAGAAATATTATTGACAT 1815

104279467 GTGTAAATGAAGTAGCAAAGATAGTTGTTTGAGGAGGTGAAAAGGAAAATAGTGAAGATC 104279526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1816 GTGTAAATGAAGTAGCAAAGATAGTTGTTTGAGGAGGTGAAAAGGAAAATAGTGAAGATC 1875

104279527 AAATTGAAGAGACAATCAAGGCCATGCAGACTGTGGCAAGAACTTTGGAACTTCTGTTTA 104279586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1876 AAATTGAAGAGACAATCAAGGCCATGCAGACTGTGGCAAGAACTTTGGAACTTCTGTTTA 1935

104279587 TTATCCGAAGAGGCCATTGGAAGGTTATAAACAAGATATAAACATGATCTGACCTGTGTT 104279646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1936 TTATCCGAAGAGGCCATTGGAAGGTTATAAACAAGATATAAACATGATCTGACCTGTGTT 1995

104279647 TTGAAAGGATTTTTCTGGATAGGGAGTGAAAATTATATTGAAAGTGAAAAGATTGTAGAT 104279706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1996 TTGAAAGGATTTTTCTGGATAGGGAGTGAAAATTATATTGAAAGTGAAAAGATTGTAGAT 2055

104279707 ATAGTAGCAGTGGTAGGACTTGGGATATATATTACATACATTAGAGCTATCCTTAACTGT 104279766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2056 ATAGTAGCAGTGGTAGGACTTGGGATATATATTACATACATTAGAGCTATCCTTAACTGT 2115

104279767 ATCAACTGGTCTCATTGGGTATGAGAAGAAGATCAAAGTCAAGGCCAATTTTAATATGTT 104279826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2116 ATCAACTGGTCTCATTGGGTATGAGAAGAAGATCAAAGTCAAGGCCAATTTTAATATGTT 2175

104279827 TGGCCTGAGCAAGAAGGTGATATCCTTTCATGAAATGGGGATCAGTGAGAGGGGAGAAAT 104279886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2176 TGGCCTGAGCAAGAAGGTGATATCCTTTCATGAAATGGGGATCAGTGAGAGGGGAGAAAT 2235

104279887 TTACAGAGAAAAATTAAGAGTTTGGTTTTGGACCTATTAAAATTTGAGAAACCTGTGAGA 104279946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2236 TTACAGAGAAAAATTAAGAGTTTGGTTTTGGACCTATTAAAATTTGAGAAACCTGTGAGA 2295

104279947 AGTTTAAGAGGAAATGTTGATGAAGAGGAAGTTCGAAATAAGAGTCGAGAGTCCAGGGAA 104280006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2296 AGTTTAAGAGGAAATGTTGATGAAGAGGAAGTTCGAAATAAGAGTCGAGAGTCCAGGGAA 2355

104280007 TTGGTTTGGAGCTGGAGATTTTTTAAATTGAGAAGTTATTGGTAGATACAAGATATTTGC 104280066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2356 TTGGTTTGGAGCTGGAGATTTTTTAAATTGAGAAGTTATTGGTAGATACAAGATATTTGC 2415

104280067 AGTCATGAGAGCTAACAGTTACCTAGGGAGGGAGTAAAGATGAAGAGCTGAAATTTAAGG 104280126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2416 AGTCATGAGAGCTAACAGTTACCTAGGGAGGGAGTAAAGATGAAGAGCTGAAATTTAAGG 2475

104280127 ATAAAATTCCAGGGATCTAGAAATTTGGAAAATTGGAAGAAGAGGTGAAGCCAGAAAAGA 104280186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2476 ATAAAATTCCAGGGATCTAGAAATTTGGAAAATTGGAAGAAGAGGTGAAGCCAGAAAAGA 2535

104280187 CTAAGAAGGAGAGGTCAAGGAAGTAGGTGGGACAATAAAAGGATGTAGAATCTTGGCAAC 104280246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2536 CTAAGAAGGAGAGGTCAAGGAAGTAGGTGGGACAATAAAAGGATGTAGAATCTTGGCAAC 2595

104280247 TGAGTGATGAAAAAATTCTTTAAAGAATCAGAAAGTGACTGGTAAACTGGGTCAAAAGCT 104280306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2596 TGAGTGATGAAAAAATTCTTTAAAGAATCAGAAAGTGACTGGTAAACTGGGTCAAAAGCT 2655

104280307 AGAGATTGAGTAAAAACTGAAACTTTTCTTCATTTTAACATACTTTCGCTTTCAAGAAAA 104280366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2656 AGAGATTGAGTAAAAACTGAAACTTTTCTTCATTTTAACATACTTTCGCTTTCAAGAAAA 2715

104280367 TTATTACACTAAGGGGGAATAGCAGAGCAATCTATTAGTGTTGCAGAGGACAGATGTGGC 104280426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2716 TTATTACACTAAGGGGGAATAGCAGAGCAATCTATTAGTGTTGCAGAGGACAGATGTGGC 2775

104280427 TTTTTCAGATGCTCAGAAGCACCCAATAAATTTGAAGAACAGACAGGTGTTCCTGAGAAC 104280486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2776 TTTTTCAGATGCTCAGAAGCACCCAATAAATTTGAAGAACAGACAGGTGTTCCTGAGAAC 2835

104280487 TCAGGGAAGAATTTGGCCAATGAAGGTCACAGGACACCTGTTCTGAAAATGTCCTACTGA 104280546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2836 TCAGGGAAGAATTTGGCCAATGAAGGTCACAGGACACCTGTTCTGAAAATGTCCTACTGA 2895

104280547 AAATGTTCTTTAGAAGTTACAGTGTTTTCATCAAGACAATGAGATTTCACTTTATAACTT 104280606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2896 AAATGTTCTTTAGAAGTTACAGTGTTTTCATCAAGACAATGAGATTTCACTTTATAACTT 2955

104280607 TACTCAGTGCCCAGGTTACCTAAAAAGTATTTTTTCATCTTCAAGGGAGAAAAAAACTTT 104280666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2956 TACTCAGTGCCCAGGTTACCTAAAAAGTATTTTTTCATCTTCAAGGGAGAAAAAAACTTT 3015

104280667 GTTATTAGGTGATATAATTAGAATGTTTTAAAGAATGACATTAGTTTGCATTTCACAGCC 104280726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3016 GTTATTAGGTGATATAATTAGAATGTTTTAAAGAATGACATTAGTTTGCATTTCACAGCC 3075

104280727 TTACTAGGTAATATGAGAAGAAAATTCCAGTTTTATATTCTCTCGTATCTCTGAATTTCT 104280786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3076 TTACTAGGTAATATGAGAAGAAAATTCCAGTTTTATATTCTCTCGTATCTCTGAATTTCT 3135

104280787 TTCTAATTTATGGAAACAGTCTAATTTATGGAAAC 104280821
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3136 TTCTAATTTATGGAAACAGTCTAATTTATGGAAAC 3170

Alignment time is 2.43425 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [104268199,104289046] =>     20848 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     2817] =>      2817 nucs 'mol-32-314e-136273_2817'

Score:        2817
Aligned:      2817        nucs
Identic:      2817 (100%) nucs =>      1141 (100%)      1676 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [104277059,104278199] EXCISED REGION [104279047,104280722]
 second seq =>  [        1,     1141] EXCISED REGION [     1142,     2817]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       847 nucs [104278200,104279046]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [104278200,104278200] to [104279047,104279047]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [104278199,104278199] to [104279047,104279047]
 second seq =>         1 nucs [1141,1141] to [1142,1142]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

104277059 TGCAGCCTTGTTATATGGGTAAATGTGTTCCATGGTGGTTTGCTGCACCTATCAAACCAT 104277118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGCAGCCTTGTTATATGGGTAAATGTGTTCCATGGTGGTTTGCTGCACCTATCAAACCAT 60

104277119 CACCTAGGTATTAAGCCCCGCATGCATTAGCTACTCTTTCTGATGCGCTCCCTCCCACCA 104277178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CACCTAGGTATTAAGCCCCGCATGCATTAGCTACTCTTTCTGATGCGCTCCCTCCCACCA 120

104277179 CATCCCCAACCAACGGGCCCCATTATGTGTTGTTCCTTTCTCTGTTTTTATGTGTTCTCA 104277238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CATCCCCAACCAACGGGCCCCATTATGTGTTGTTCCTTTCTCTGTTTTTATGTGTTCTCA 180

104277239 TTGTTCAGCTTCCACTTATAAGTGAGAACATGTAGTGTTTAATTTTCTGTTCCTGTGTTA 104277298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTGTTCAGCTTCCACTTATAAGTGAGAACATGTAGTGTTTAATTTTCTGTTCCTGTGTTA 240

104277299 GTTTGCTGAGGATAATGGCTTCCAGCTCCATCCCTTTTCCTGCAAAGGACATGATCTCAT 104277358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTTTGCTGAGGATAATGGCTTCCAGCTCCATCCCTTTTCCTGCAAAGGACATGATCTCAT 300

104277359 TACTTTTTATGACTGCATAGTGTTCCATGGTGTAAATATATCACATTTTCATTTTCCAGT 104277418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TACTTTTTATGACTGCATAGTGTTCCATGGTGTAAATATATCACATTTTCATTTTCCAGT 360

104277419 CTATCATTGATGGGCATTTGGGTTAATTCCATGTCTTTTCTACAGTGAATAGTGCTCCAG 104277478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTATCATTGATGGGCATTTGGGTTAATTCCATGTCTTTTCTACAGTGAATAGTGCTCCAG 420

104277479 TGAACATACATGTGCAGGTATCTTTATAATAGAATGATTTATATTCTTTTGGGTACATAC 104277538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGAACATACATGTGCAGGTATCTTTATAATAGAATGATTTATATTCTTTTGGGTACATAC 480

104277539 CCAGTAATGGGATTGCTGGGTCAAATGGTATTTCTGGTTCTAGGTCTTTGAGGAATTGCT 104277598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCAGTAATGGGATTGCTGGGTCAAATGGTATTTCTGGTTCTAGGTCTTTGAGGAATTGCT 540

104277599 ACACTGTCTTCCACAAGTAAAACCCAGAACTATAAAAACCCTAGAAGAAAAGCTAGACAG 104277658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACACTGTCTTCCACAAGTAAAACCCAGAACTATAAAAACCCTAGAAGAAAAGCTAGACAG 600

104277659 TACCATTCAGGACATCGGCACAGGCAAAGATTTCATGACAAAAATGTCAAAAGCAATTGC 104277718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TACCATTCAGGACATCGGCACAGGCAAAGATTTCATGACAAAAATGTCAAAAGCAATTGC 660

104277719 AACAAACACAAAACTTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAGAGCTTCTGCACAGCAAAAG 104277778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AACAAACACAAAACTTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAGAGCTTCTGCACAGCAAAAG 720

104277779 AAACTATCATCAGAGTGGACAGACAACCTACAGAATGGGAGAAAAGTTTGCAGTCTATTC 104277838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAACTATCATCAGAGTGGACAGACAACCTACAGAATGGGAGAAAAGTTTGCAGTCTATTC 780

104277839 ATCCGACAAAGGTTGAATATCCAGAATCTACAAGGAACTTAGTTCCAATTTACAAGAAAA 104277898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATCCGACAAAGGTTGAATATCCAGAATCTACAAGGAACTTAGTTCCAATTTACAAGAAAA 840

104277899 AAAAAAAACACCATTAAAAAGTCGGCAAAGGACATAAACAGACACTTCTCAAAAGAAGAC 104277958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAAAAAAACACCATTAAAAAGTCGGCAAAGGACATAAACAGACACTTCTCAAAAGAAGAC 900

104277959 ATTACGTGGCCACCAAACATATGAAAAAAAACTCAACCTCACTGATCATTAGAGAAATAC 104278018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATTACGTGGCCACCAAACATATGAAAAAAAACTCAACCTCACTGATCATTAGAGAAATAC 960

104278019 AAATCAAAACCACCAAGAGATACCATCGCATGCCAGTCAGAATGGTGATTATTAAAAAGT 104278078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AAATCAAAACCACCAAGAGATACCATCGCATGCCAGTCAGAATGGTGATTATTAAAAAGT 1020

104278079 CAAGGAACAATAGATGCTGGTGAGGCTGTGGAGAAATAGGAATGCTCTTTTGCACTGTTG 104278138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CAAGGAACAATAGATGCTGGTGAGGCTGTGGAGAAATAGGAATGCTCTTTTGCACTGTTG 1080

104278139 ATGGGAATCTCTGAAAATATTTATTCCTTTGAATGAGTTTAGCATAGGATGTTACCCTTA 104278198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATGGGAATCTCTGAAAATATTTATTCCTTTGAATGAGTTTAGCATAGGATGTTACCCTTA 1140

104278199 A 104278199
          |
     1141 A 1141

EXCISED REGION

104279047 ATGCTTGTTATAACAATGTACTTTTTTGTATACCTCTACTTGGAAATGTATTATAGTTAA 104279106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1142 ATGCTTGTTATAACAATGTACTTTTTTGTATACCTCTACTTGGAAATGTATTATAGTTAA 1201

104279107 GATTCATTCATTCGACTAATATGTATTGAGTGCCTACTATGTGCCAGGCACATGTTTTAG 104279166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1202 GATTCATTCATTCGACTAATATGTATTGAGTGCCTACTATGTGCCAGGCACATGTTTTAG 1261

104279167 CTAATGTTGATGAATGGTATGGATAAAGGCCTTGACACATTCATATTTAGAAAGATGGAA 104279226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1262 CTAATGTTGATGAATGGTATGGATAAAGGCCTTGACACATTCATATTTAGAAAGATGGAA 1321

104279227 ATAAATACATCAACAACATGCAATCTAATAGAGTTAGTAATGATAAAGATAAAACAGAAT 104279286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1322 ATAAATACATCAACAACATGCAATCTAATAGAGTTAGTAATGATAAAGATAAAACAGAAT 1381

104279287 ATAGAGAGTAAATAAGGGACCTATTTTCTATATGGTGGTCAAAAATGGACCCTGTGATTA 104279346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1382 ATAGAGAGTAAATAAGGGACCTATTTTCTATATGGTGGTCAAAAATGGACCCTGTGATTA 1441

104279347 CAGCTGAATACAGACTTGAATAAAACGAGAAAGCAAGTAATTCACATATCTGAGGAGAAA 104279406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1442 CAGCTGAATACAGACTTGAATAAAACGAGAAAGCAAGTAATTCACATATCTGAGGAGAAA 1501

104279407 ACTCTTTAGACACAGGGACCAGAAAGTTCAGGGGCCTTCAGCCAGAAATATTATTGACAT 104279466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1502 ACTCTTTAGACACAGGGACCAGAAAGTTCAGGGGCCTTCAGCCAGAAATATTATTGACAT 1561

104279467 GTGTAAATGAAGTAGCAAAGATAGTTGTTTGAGGAGGTGAAAAGGAAAATAGTGAAGATC 104279526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1562 GTGTAAATGAAGTAGCAAAGATAGTTGTTTGAGGAGGTGAAAAGGAAAATAGTGAAGATC 1621

104279527 AAATTGAAGAGACAATCAAGGCCATGCAGACTGTGGCAAGAACTTTGGAACTTCTGTTTA 104279586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1622 AAATTGAAGAGACAATCAAGGCCATGCAGACTGTGGCAAGAACTTTGGAACTTCTGTTTA 1681

104279587 TTATCCGAAGAGGCCATTGGAAGGTTATAAACAAGATATAAACATGATCTGACCTGTGTT 104279646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1682 TTATCCGAAGAGGCCATTGGAAGGTTATAAACAAGATATAAACATGATCTGACCTGTGTT 1741

104279647 TTGAAAGGATTTTTCTGGATAGGGAGTGAAAATTATATTGAAAGTGAAAAGATTGTAGAT 104279706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1742 TTGAAAGGATTTTTCTGGATAGGGAGTGAAAATTATATTGAAAGTGAAAAGATTGTAGAT 1801

104279707 ATAGTAGCAGTGGTAGGACTTGGGATATATATTACATACATTAGAGCTATCCTTAACTGT 104279766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1802 ATAGTAGCAGTGGTAGGACTTGGGATATATATTACATACATTAGAGCTATCCTTAACTGT 1861

104279767 ATCAACTGGTCTCATTGGGTATGAGAAGAAGATCAAAGTCAAGGCCAATTTTAATATGTT 104279826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1862 ATCAACTGGTCTCATTGGGTATGAGAAGAAGATCAAAGTCAAGGCCAATTTTAATATGTT 1921

104279827 TGGCCTGAGCAAGAAGGTGATATCCTTTCATGAAATGGGGATCAGTGAGAGGGGAGAAAT 104279886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1922 TGGCCTGAGCAAGAAGGTGATATCCTTTCATGAAATGGGGATCAGTGAGAGGGGAGAAAT 1981

104279887 TTACAGAGAAAAATTAAGAGTTTGGTTTTGGACCTATTAAAATTTGAGAAACCTGTGAGA 104279946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1982 TTACAGAGAAAAATTAAGAGTTTGGTTTTGGACCTATTAAAATTTGAGAAACCTGTGAGA 2041

104279947 AGTTTAAGAGGAAATGTTGATGAAGAGGAAGTTCGAAATAAGAGTCGAGAGTCCAGGGAA 104280006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2042 AGTTTAAGAGGAAATGTTGATGAAGAGGAAGTTCGAAATAAGAGTCGAGAGTCCAGGGAA 2101

104280007 TTGGTTTGGAGCTGGAGATTTTTTAAATTGAGAAGTTATTGGTAGATACAAGATATTTGC 104280066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2102 TTGGTTTGGAGCTGGAGATTTTTTAAATTGAGAAGTTATTGGTAGATACAAGATATTTGC 2161

104280067 AGTCATGAGAGCTAACAGTTACCTAGGGAGGGAGTAAAGATGAAGAGCTGAAATTTAAGG 104280126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2162 AGTCATGAGAGCTAACAGTTACCTAGGGAGGGAGTAAAGATGAAGAGCTGAAATTTAAGG 2221

104280127 ATAAAATTCCAGGGATCTAGAAATTTGGAAAATTGGAAGAAGAGGTGAAGCCAGAAAAGA 104280186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2222 ATAAAATTCCAGGGATCTAGAAATTTGGAAAATTGGAAGAAGAGGTGAAGCCAGAAAAGA 2281

104280187 CTAAGAAGGAGAGGTCAAGGAAGTAGGTGGGACAATAAAAGGATGTAGAATCTTGGCAAC 104280246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2282 CTAAGAAGGAGAGGTCAAGGAAGTAGGTGGGACAATAAAAGGATGTAGAATCTTGGCAAC 2341

104280247 TGAGTGATGAAAAAATTCTTTAAAGAATCAGAAAGTGACTGGTAAACTGGGTCAAAAGCT 104280306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2342 TGAGTGATGAAAAAATTCTTTAAAGAATCAGAAAGTGACTGGTAAACTGGGTCAAAAGCT 2401

104280307 AGAGATTGAGTAAAAACTGAAACTTTTCTTCATTTTAACATACTTTCGCTTTCAAGAAAA 104280366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2402 AGAGATTGAGTAAAAACTGAAACTTTTCTTCATTTTAACATACTTTCGCTTTCAAGAAAA 2461

104280367 TTATTACACTAAGGGGGAATAGCAGAGCAATCTATTAGTGTTGCAGAGGACAGATGTGGC 104280426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2462 TTATTACACTAAGGGGGAATAGCAGAGCAATCTATTAGTGTTGCAGAGGACAGATGTGGC 2521

104280427 TTTTTCAGATGCTCAGAAGCACCCAATAAATTTGAAGAACAGACAGGTGTTCCTGAGAAC 104280486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2522 TTTTTCAGATGCTCAGAAGCACCCAATAAATTTGAAGAACAGACAGGTGTTCCTGAGAAC 2581

104280487 TCAGGGAAGAATTTGGCCAATGAAGGTCACAGGACACCTGTTCTGAAAATGTCCTACTGA 104280546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2582 TCAGGGAAGAATTTGGCCAATGAAGGTCACAGGACACCTGTTCTGAAAATGTCCTACTGA 2641

104280547 AAATGTTCTTTAGAAGTTACAGTGTTTTCATCAAGACAATGAGATTTCACTTTATAACTT 104280606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2642 AAATGTTCTTTAGAAGTTACAGTGTTTTCATCAAGACAATGAGATTTCACTTTATAACTT 2701

104280607 TACTCAGTGCCCAGGTTACCTAAAAAGTATTTTTTCATCTTCAAGGGAGAAAAAAACTTT 104280666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2702 TACTCAGTGCCCAGGTTACCTAAAAAGTATTTTTTCATCTTCAAGGGAGAAAAAAACTTT 2761

104280667 GTTATTAGGTGATATAATTAGAATGTTTTAAAGAATGACATTAGTTTGCATTTCAC 104280722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2762 GTTATTAGGTGATATAATTAGAATGTTTTAAAGAATGACATTAGTTTGCATTTCAC 2817

Alignment time is 2.22957 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [104268199,104289046] =>     20848 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     2715] =>      2715 nucs 'mol-32-317a-093934_2715'

Score:        2705
Aligned:      2716        nucs
Identic:      2715 (100%) nucs =>       841 (100%)      1874 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [104277358,104278199] EXCISED REGION [104279047,104280920]
 second seq =>  [        1,      841] EXCISED REGION [      842,     2715]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       847 nucs [104278200,104279046]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [104278200,104278200] to [104279047,104279047]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [104278199,104278199] to [104279047,104279047]
 second seq =>         1 nucs [841,841] to [842,842]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

104277358 TTACTTTTTATGACTGCATAGTGTTCCATGGTGTAAATATATCACATTTTCATTTTCCAG 104277417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTACTTTTTATGACTGCATAGTGTTCCATGGTGTAAATATATCACATTTTCATTTTCCAG 60

104277418 TCTATCATTGATGGGCATTTGGGTTAATTCCATGTCTTTTCTACAGTGAATAGTGCTCCA 104277477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCTATCATTGATGGGCATTTGGGTTAATTCCATGTCTTTTCTACAGTGAATAGTGCTCCA 120

104277478 GTGAACATACATGTGCAGGTATCTTTATAATAGAATGATTTATATTCTTTTGGGTACATA 104277537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTGAACATACATGTGCAGGTATCTTTATAATAGAATGATTTATATTCTTTTGGGTACATA 180

104277538 CCCAGTAATGGGATTGCTGGGTCAAATGGTATTTCTGGTTCTAGGTCTTTGAGGAATTGC 104277597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCCAGTAATGGGATTGCTGGGTCAAATGGTATTTCTGGTTCTAGGTCTTTGAGGAATTGC 240

104277598 TACACTGTCTTCCACAAGTAAAACCCAGAACTATAAAAACCCTAGAAGAAAAGCTAGACA 104277657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TACACTGTCTTCCACAAGTAAAACCCAGAACTATAAAAACCCTAGAAGAAAAGCTAGACA 300

104277658 GTACCATTCAGGACATCGGCACAGGCAAAGATTTCATGACAAAAATGTCAAAAGCAATTG 104277717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTACCATTCAGGACATCGGCACAGGCAAAGATTTCATGACAAAAATGTCAAAAGCAATTG 360

104277718 CAACAAACACAAAACTTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAGAGCTTCTGCACAGCAAAA 104277777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CAACAAACACAAAACTTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAGAGCTTCTGCACAGCAAAA 420

104277778 GAAACTATCATCAGAGTGGACAGACAACCTACAGAATGGGAGAAAAGTTTGCAGTCTATT 104277837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GAAACTATCATCAGAGTGGACAGACAACCTACAGAATGGGAGAAAAGTTTGCAGTCTATT 480

104277838 CATCCGACAAAGGTTGAATATCCAGAATCTACAAGGAACTTAGTTCCAATTTACAAGAAA 104277897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CATCCGACAAAGGTTGAATATCCAGAATCTACAAGGAACTTAGTTCCAATTTACAAGAAA 540

104277898 AAAAAAAAACACCATTAAAAAGTCGGCAAAGGACATAAACAGACACTTCTCAAAAGAAGA 104277957
          |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAAAAAAA-CACCATTAAAAAGTCGGCAAAGGACATAAACAGACACTTCTCAAAAGAAGA 599

104277958 CATTACGTGGCCACCAAACATATGAAAAAAAACTCAACCTCACTGATCATTAGAGAAATA 104278017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      600 CATTACGTGGCCACCAAACATATGAAAAAAAACTCAACCTCACTGATCATTAGAGAAATA 659

104278018 CAAATCAAAACCACCAAGAGATACCATCGCATGCCAGTCAGAATGGTGATTATTAAAAAG 104278077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      660 CAAATCAAAACCACCAAGAGATACCATCGCATGCCAGTCAGAATGGTGATTATTAAAAAG 719

104278078 TCAAGGAACAATAGATGCTGGTGAGGCTGTGGAGAAATAGGAATGCTCTTTTGCACTGTT 104278137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      720 TCAAGGAACAATAGATGCTGGTGAGGCTGTGGAGAAATAGGAATGCTCTTTTGCACTGTT 779

104278138 GATGGGAATCTCTGAAAATATTTATTCCTTTGAATGAGTTTAGCATAGGATGTTACCCTT 104278197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      780 GATGGGAATCTCTGAAAATATTTATTCCTTTGAATGAGTTTAGCATAGGATGTTACCCTT 839

104278198 AA 104278199
          ||
      840 AA 841

EXCISED REGION

104279047 ATGCTTGTTATAACAATGTACTTTTTTGTATACCTCTACTTGGAAATGTATTATAGTTAA 104279106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      842 ATGCTTGTTATAACAATGTACTTTTTTGTATACCTCTACTTGGAAATGTATTATAGTTAA 901

104279107 GATTCATTCATTCGACTAATATGTATTGAGTGCCTACTATGTGCCAGGCACATGTTTTAG 104279166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      902 GATTCATTCATTCGACTAATATGTATTGAGTGCCTACTATGTGCCAGGCACATGTTTTAG 961

104279167 CTAATGTTGATGAATGGTATGGATAAAGGCCTTGACACATTCATATTTAGAAAGATGGAA 104279226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      962 CTAATGTTGATGAATGGTATGGATAAAGGCCTTGACACATTCATATTTAGAAAGATGGAA 1021

104279227 ATAAATACATCAACAACATGCAATCTAATAGAGTTAGTAATGATAAAGATAAAACAGAAT 104279286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1022 ATAAATACATCAACAACATGCAATCTAATAGAGTTAGTAATGATAAAGATAAAACAGAAT 1081

104279287 ATAGAGAGTAAATAAGGGACCTATTTTCTATATGGTGGTCAAAAATGGACCCTGTGATTA 104279346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1082 ATAGAGAGTAAATAAGGGACCTATTTTCTATATGGTGGTCAAAAATGGACCCTGTGATTA 1141

104279347 CAGCTGAATACAGACTTGAATAAAACGAGAAAGCAAGTAATTCACATATCTGAGGAGAAA 104279406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1142 CAGCTGAATACAGACTTGAATAAAACGAGAAAGCAAGTAATTCACATATCTGAGGAGAAA 1201

104279407 ACTCTTTAGACACAGGGACCAGAAAGTTCAGGGGCCTTCAGCCAGAAATATTATTGACAT 104279466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1202 ACTCTTTAGACACAGGGACCAGAAAGTTCAGGGGCCTTCAGCCAGAAATATTATTGACAT 1261

104279467 GTGTAAATGAAGTAGCAAAGATAGTTGTTTGAGGAGGTGAAAAGGAAAATAGTGAAGATC 104279526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1262 GTGTAAATGAAGTAGCAAAGATAGTTGTTTGAGGAGGTGAAAAGGAAAATAGTGAAGATC 1321

104279527 AAATTGAAGAGACAATCAAGGCCATGCAGACTGTGGCAAGAACTTTGGAACTTCTGTTTA 104279586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1322 AAATTGAAGAGACAATCAAGGCCATGCAGACTGTGGCAAGAACTTTGGAACTTCTGTTTA 1381

104279587 TTATCCGAAGAGGCCATTGGAAGGTTATAAACAAGATATAAACATGATCTGACCTGTGTT 104279646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1382 TTATCCGAAGAGGCCATTGGAAGGTTATAAACAAGATATAAACATGATCTGACCTGTGTT 1441

104279647 TTGAAAGGATTTTTCTGGATAGGGAGTGAAAATTATATTGAAAGTGAAAAGATTGTAGAT 104279706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1442 TTGAAAGGATTTTTCTGGATAGGGAGTGAAAATTATATTGAAAGTGAAAAGATTGTAGAT 1501

104279707 ATAGTAGCAGTGGTAGGACTTGGGATATATATTACATACATTAGAGCTATCCTTAACTGT 104279766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1502 ATAGTAGCAGTGGTAGGACTTGGGATATATATTACATACATTAGAGCTATCCTTAACTGT 1561

104279767 ATCAACTGGTCTCATTGGGTATGAGAAGAAGATCAAAGTCAAGGCCAATTTTAATATGTT 104279826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1562 ATCAACTGGTCTCATTGGGTATGAGAAGAAGATCAAAGTCAAGGCCAATTTTAATATGTT 1621

104279827 TGGCCTGAGCAAGAAGGTGATATCCTTTCATGAAATGGGGATCAGTGAGAGGGGAGAAAT 104279886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1622 TGGCCTGAGCAAGAAGGTGATATCCTTTCATGAAATGGGGATCAGTGAGAGGGGAGAAAT 1681

104279887 TTACAGAGAAAAATTAAGAGTTTGGTTTTGGACCTATTAAAATTTGAGAAACCTGTGAGA 104279946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1682 TTACAGAGAAAAATTAAGAGTTTGGTTTTGGACCTATTAAAATTTGAGAAACCTGTGAGA 1741

104279947 AGTTTAAGAGGAAATGTTGATGAAGAGGAAGTTCGAAATAAGAGTCGAGAGTCCAGGGAA 104280006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1742 AGTTTAAGAGGAAATGTTGATGAAGAGGAAGTTCGAAATAAGAGTCGAGAGTCCAGGGAA 1801

104280007 TTGGTTTGGAGCTGGAGATTTTTTAAATTGAGAAGTTATTGGTAGATACAAGATATTTGC 104280066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1802 TTGGTTTGGAGCTGGAGATTTTTTAAATTGAGAAGTTATTGGTAGATACAAGATATTTGC 1861

104280067 AGTCATGAGAGCTAACAGTTACCTAGGGAGGGAGTAAAGATGAAGAGCTGAAATTTAAGG 104280126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1862 AGTCATGAGAGCTAACAGTTACCTAGGGAGGGAGTAAAGATGAAGAGCTGAAATTTAAGG 1921

104280127 ATAAAATTCCAGGGATCTAGAAATTTGGAAAATTGGAAGAAGAGGTGAAGCCAGAAAAGA 104280186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1922 ATAAAATTCCAGGGATCTAGAAATTTGGAAAATTGGAAGAAGAGGTGAAGCCAGAAAAGA 1981

104280187 CTAAGAAGGAGAGGTCAAGGAAGTAGGTGGGACAATAAAAGGATGTAGAATCTTGGCAAC 104280246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1982 CTAAGAAGGAGAGGTCAAGGAAGTAGGTGGGACAATAAAAGGATGTAGAATCTTGGCAAC 2041

104280247 TGAGTGATGAAAAAATTCTTTAAAGAATCAGAAAGTGACTGGTAAACTGGGTCAAAAGCT 104280306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2042 TGAGTGATGAAAAAATTCTTTAAAGAATCAGAAAGTGACTGGTAAACTGGGTCAAAAGCT 2101

104280307 AGAGATTGAGTAAAAACTGAAACTTTTCTTCATTTTAACATACTTTCGCTTTCAAGAAAA 104280366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2102 AGAGATTGAGTAAAAACTGAAACTTTTCTTCATTTTAACATACTTTCGCTTTCAAGAAAA 2161

104280367 TTATTACACTAAGGGGGAATAGCAGAGCAATCTATTAGTGTTGCAGAGGACAGATGTGGC 104280426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2162 TTATTACACTAAGGGGGAATAGCAGAGCAATCTATTAGTGTTGCAGAGGACAGATGTGGC 2221

104280427 TTTTTCAGATGCTCAGAAGCACCCAATAAATTTGAAGAACAGACAGGTGTTCCTGAGAAC 104280486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2222 TTTTTCAGATGCTCAGAAGCACCCAATAAATTTGAAGAACAGACAGGTGTTCCTGAGAAC 2281

104280487 TCAGGGAAGAATTTGGCCAATGAAGGTCACAGGACACCTGTTCTGAAAATGTCCTACTGA 104280546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2282 TCAGGGAAGAATTTGGCCAATGAAGGTCACAGGACACCTGTTCTGAAAATGTCCTACTGA 2341

104280547 AAATGTTCTTTAGAAGTTACAGTGTTTTCATCAAGACAATGAGATTTCACTTTATAACTT 104280606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2342 AAATGTTCTTTAGAAGTTACAGTGTTTTCATCAAGACAATGAGATTTCACTTTATAACTT 2401

104280607 TACTCAGTGCCCAGGTTACCTAAAAAGTATTTTTTCATCTTCAAGGGAGAAAAAAACTTT 104280666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2402 TACTCAGTGCCCAGGTTACCTAAAAAGTATTTTTTCATCTTCAAGGGAGAAAAAAACTTT 2461

104280667 GTTATTAGGTGATATAATTAGAATGTTTTAAAGAATGACATTAGTTTGCATTTCACAGCC 104280726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2462 GTTATTAGGTGATATAATTAGAATGTTTTAAAGAATGACATTAGTTTGCATTTCACAGCC 2521

104280727 TTACTAGGTAATATGAGAAGAAAATTCCAGTTTTATATTCTCTCGTATCTCTGAATTTCT 104280786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2522 TTACTAGGTAATATGAGAAGAAAATTCCAGTTTTATATTCTCTCGTATCTCTGAATTTCT 2581

104280787 TTCTAATTTATGGAAACAGTCTAATTTATGGAAACAGAATAATTAAATGCCCATGATAAA 104280846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2582 TTCTAATTTATGGAAACAGTCTAATTTATGGAAACAGAATAATTAAATGCCCATGATAAA 2641

104280847 TTTTCAAAGTTTATGACTTTCACTTGCATGGAATTAAAAATTATTTGCTGTTTTGTTAGT 104280906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2642 TTTTCAAAGTTTATGACTTTCACTTGCATGGAATTAAAAATTATTTGCTGTTTTGTTAGT 2701

104280907 ATTACTGTTAAGTG 104280920
          ||||||||||||||
     2702 ATTACTGTTAAGTG 2715

Alignment time is 2.16353 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [104268199,104289046] =>     20848 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     3028] =>      3028 nucs 'mol-32-317a-213240_3028'

Score:        3018
Aligned:      3029        nucs
Identic:      3028 (100%) nucs =>      1421 (100%)      1607 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [104276778,104278199] EXCISED REGION [104279047,104280653]
 second seq =>  [        1,     1421] EXCISED REGION [     1422,     3028]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       847 nucs [104278200,104279046]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [104278200,104278200] to [104279047,104279047]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [104278199,104278199] to [104279047,104279047]
 second seq =>         1 nucs [1421,1421] to [1422,1422]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

104276778 TAGGACTAGGTTTCGATGAAATTAACCTAACAACCAACACTTAATCCTTTGAGAAACTAC 104276837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TAGGACTAGGTTTCGATGAAATTAACCTAACAACCAACACTTAATCCTTTGAGAAACTAC 60

104276838 TTTCTCAACTGCATGGAACTTACCTAGGATAAAAATTAAAATTTAGGAGAAAGTGATTTC 104276897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTCTCAACTGCATGGAACTTACCTAGGATAAAAATTAAAATTTAGGAGAAAGTGATTTC 120

104276898 AGAGCTCCAAATCTGTCCTGTCTGCCCTCATTTCCATAATCTGCTTTGACTGCCATTTTG 104276957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGAGCTCCAAATCTGTCCTGTCTGCCCTCATTTCCATAATCTGCTTTGACTGCCATTTTG 180

104276958 TATATCCCCTATAATTTAACCTACTTATTGATCCCATGATCTCTGAAAATATTCTTTTTA 104277017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TATATCCCCTATAATTTAACCTACTTATTGATCCCATGATCTCTGAAAATATTCTTTTTA 240

104277018 ATTTAATTTAATTTTTAGTTCTGGGATACATGGGCAGGATATGCAGCCTTGTTATATGGG 104277077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATTTAATTTAATTTTTAGTTCTGGGATACATGGGCAGGATATGCAGCCTTGTTATATGGG 300

104277078 TAAATGTGTTCCATGGTGGTTTGCTGCACCTATCAAACCATCACCTAGGTATTAAGCCCC 104277137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TAAATGTGTTCCATGGTGGTTTGCTGCACCTATCAAACCATCACCTAGGTATTAAGCCCC 360

104277138 GCATGCATTAGCTACTCTTTCTGATGCGCTCCCTCCCACCACATCCCCAACCAACGGGCC 104277197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GCATGCATTAGCTACTCTTTCTGATGCGCTCCCTCCCACCACATCCCCAACCAACGGGCC 420

104277198 CCATTATGTGTTGTTCCTTTCTCTGTTTTTATGTGTTCTCATTGTTCAGCTTCCACTTAT 104277257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCATTATGTGTTGTTCCTTTCTCTGTTTTTATGTGTTCTCATTGTTCAGCTTCCACTTAT 480

104277258 AAGTGAGAACATGTAGTGTTTAATTTTCTGTTCCTGTGTTAGTTTGCTGAGGATAATGGC 104277317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAGTGAGAACATGTAGTGTTTAATTTTCTGTTCCTGTGTTAGTTTGCTGAGGATAATGGC 540

104277318 TTCCAGCTCCATCCCTTTTCCTGCAAAGGACATGATCTCATTACTTTTTATGACTGCATA 104277377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTCCAGCTCCATCCCTTTTCCTGCAAAGGACATGATCTCATTACTTTTTATGACTGCATA 600

104277378 GTGTTCCATGGTGTAAATATATCACATTTTCATTTTCCAGTCTATCATTGATGGGCATTT 104277437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTGTTCCATGGTGTAAATATATCACATTTTCATTTTCCAGTCTATCATTGATGGGCATTT 660

104277438 GGGTTAATTCCATGTCTTTTCTACAGTGAATAGTGCTCCAGTGAACATACATGTGCAGGT 104277497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGGTTAATTCCATGTCTTTTCTACAGTGAATAGTGCTCCAGTGAACATACATGTGCAGGT 720

104277498 ATCTTTATAATAGAATGATTTATATTCTTTTGGGTACATACCCAGTAATGGGATTGCTGG 104277557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATCTTTATAATAGAATGATTTATATTCTTTTGGGTACATACCCAGTAATGGGATTGCTGG 780

104277558 GTCAAATGGTATTTCTGGTTCTAGGTCTTTGAGGAATTGCTACACTGTCTTCCACAAGTA 104277617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GTCAAATGGTATTTCTGGTTCTAGGTCTTTGAGGAATTGCTACACTGTCTTCCACAAGTA 840

104277618 AAACCCAGAACTATAAAAACCCTAGAAGAAAAGCTAGACAGTACCATTCAGGACATCGGC 104277677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAACCCAGAACTATAAAAACCCTAGAAGAAAAGCTAGACAGTACCATTCAGGACATCGGC 900

104277678 ACAGGCAAAGATTTCATGACAAAAATGTCAAAAGCAATTGCAACAAACACAAAACTTGAC 104277737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ACAGGCAAAGATTTCATGACAAAAATGTCAAAAGCAATTGCAACAAACACAAAACTTGAC 960

104277738 AAATGGGATCTAATTAAACTAGAGCTTCTGCACAGCAAAAGAAACTATCATCAGAGTGGA 104277797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AAATGGGATCTAATTAAACTAGAGCTTCTGCACAGCAAAAGAAACTATCATCAGAGTGGA 1020

104277798 CAGACAACCTACAGAATGGGAGAAAAGTTTGCAGTCTATTCATCCGACAAAGGTTGAATA 104277857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CAGACAACCTACAGAATGGGAGAAAAGTTTGCAGTCTATTCATCCGACAAAGGTTGAATA 1080

104277858 TCCAGAATCTACAAGGAACTTAGTTCCAATTTACAAGAAAAAAAAAAAACACCATTAAAA 104277917
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
     1081 TCCAGAATCTACAAGGAACTTAGTTCCAATTTACAAGAAAAAAAAAAA-CACCATTAAAA 1139

104277918 AGTCGGCAAAGGACATAAACAGACACTTCTCAAAAGAAGACATTACGTGGCCACCAAACA 104277977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 AGTCGGCAAAGGACATAAACAGACACTTCTCAAAAGAAGACATTACGTGGCCACCAAACA 1199

104277978 TATGAAAAAAAACTCAACCTCACTGATCATTAGAGAAATACAAATCAAAACCACCAAGAG 104278037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 TATGAAAAAAAACTCAACCTCACTGATCATTAGAGAAATACAAATCAAAACCACCAAGAG 1259

104278038 ATACCATCGCATGCCAGTCAGAATGGTGATTATTAAAAAGTCAAGGAACAATAGATGCTG 104278097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 ATACCATCGCATGCCAGTCAGAATGGTGATTATTAAAAAGTCAAGGAACAATAGATGCTG 1319

104278098 GTGAGGCTGTGGAGAAATAGGAATGCTCTTTTGCACTGTTGATGGGAATCTCTGAAAATA 104278157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 GTGAGGCTGTGGAGAAATAGGAATGCTCTTTTGCACTGTTGATGGGAATCTCTGAAAATA 1379

104278158 TTTATTCCTTTGAATGAGTTTAGCATAGGATGTTACCCTTAA 104278199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 TTTATTCCTTTGAATGAGTTTAGCATAGGATGTTACCCTTAA 1421

EXCISED REGION

104279047 ATGCTTGTTATAACAATGTACTTTTTTGTATACCTCTACTTGGAAATGTATTATAGTTAA 104279106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1422 ATGCTTGTTATAACAATGTACTTTTTTGTATACCTCTACTTGGAAATGTATTATAGTTAA 1481

104279107 GATTCATTCATTCGACTAATATGTATTGAGTGCCTACTATGTGCCAGGCACATGTTTTAG 104279166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1482 GATTCATTCATTCGACTAATATGTATTGAGTGCCTACTATGTGCCAGGCACATGTTTTAG 1541

104279167 CTAATGTTGATGAATGGTATGGATAAAGGCCTTGACACATTCATATTTAGAAAGATGGAA 104279226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1542 CTAATGTTGATGAATGGTATGGATAAAGGCCTTGACACATTCATATTTAGAAAGATGGAA 1601

104279227 ATAAATACATCAACAACATGCAATCTAATAGAGTTAGTAATGATAAAGATAAAACAGAAT 104279286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1602 ATAAATACATCAACAACATGCAATCTAATAGAGTTAGTAATGATAAAGATAAAACAGAAT 1661

104279287 ATAGAGAGTAAATAAGGGACCTATTTTCTATATGGTGGTCAAAAATGGACCCTGTGATTA 104279346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1662 ATAGAGAGTAAATAAGGGACCTATTTTCTATATGGTGGTCAAAAATGGACCCTGTGATTA 1721

104279347 CAGCTGAATACAGACTTGAATAAAACGAGAAAGCAAGTAATTCACATATCTGAGGAGAAA 104279406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1722 CAGCTGAATACAGACTTGAATAAAACGAGAAAGCAAGTAATTCACATATCTGAGGAGAAA 1781

104279407 ACTCTTTAGACACAGGGACCAGAAAGTTCAGGGGCCTTCAGCCAGAAATATTATTGACAT 104279466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1782 ACTCTTTAGACACAGGGACCAGAAAGTTCAGGGGCCTTCAGCCAGAAATATTATTGACAT 1841

104279467 GTGTAAATGAAGTAGCAAAGATAGTTGTTTGAGGAGGTGAAAAGGAAAATAGTGAAGATC 104279526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1842 GTGTAAATGAAGTAGCAAAGATAGTTGTTTGAGGAGGTGAAAAGGAAAATAGTGAAGATC 1901

104279527 AAATTGAAGAGACAATCAAGGCCATGCAGACTGTGGCAAGAACTTTGGAACTTCTGTTTA 104279586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1902 AAATTGAAGAGACAATCAAGGCCATGCAGACTGTGGCAAGAACTTTGGAACTTCTGTTTA 1961

104279587 TTATCCGAAGAGGCCATTGGAAGGTTATAAACAAGATATAAACATGATCTGACCTGTGTT 104279646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1962 TTATCCGAAGAGGCCATTGGAAGGTTATAAACAAGATATAAACATGATCTGACCTGTGTT 2021

104279647 TTGAAAGGATTTTTCTGGATAGGGAGTGAAAATTATATTGAAAGTGAAAAGATTGTAGAT 104279706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2022 TTGAAAGGATTTTTCTGGATAGGGAGTGAAAATTATATTGAAAGTGAAAAGATTGTAGAT 2081

104279707 ATAGTAGCAGTGGTAGGACTTGGGATATATATTACATACATTAGAGCTATCCTTAACTGT 104279766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2082 ATAGTAGCAGTGGTAGGACTTGGGATATATATTACATACATTAGAGCTATCCTTAACTGT 2141

104279767 ATCAACTGGTCTCATTGGGTATGAGAAGAAGATCAAAGTCAAGGCCAATTTTAATATGTT 104279826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2142 ATCAACTGGTCTCATTGGGTATGAGAAGAAGATCAAAGTCAAGGCCAATTTTAATATGTT 2201

104279827 TGGCCTGAGCAAGAAGGTGATATCCTTTCATGAAATGGGGATCAGTGAGAGGGGAGAAAT 104279886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2202 TGGCCTGAGCAAGAAGGTGATATCCTTTCATGAAATGGGGATCAGTGAGAGGGGAGAAAT 2261

104279887 TTACAGAGAAAAATTAAGAGTTTGGTTTTGGACCTATTAAAATTTGAGAAACCTGTGAGA 104279946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2262 TTACAGAGAAAAATTAAGAGTTTGGTTTTGGACCTATTAAAATTTGAGAAACCTGTGAGA 2321

104279947 AGTTTAAGAGGAAATGTTGATGAAGAGGAAGTTCGAAATAAGAGTCGAGAGTCCAGGGAA 104280006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2322 AGTTTAAGAGGAAATGTTGATGAAGAGGAAGTTCGAAATAAGAGTCGAGAGTCCAGGGAA 2381

104280007 TTGGTTTGGAGCTGGAGATTTTTTAAATTGAGAAGTTATTGGTAGATACAAGATATTTGC 104280066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2382 TTGGTTTGGAGCTGGAGATTTTTTAAATTGAGAAGTTATTGGTAGATACAAGATATTTGC 2441

104280067 AGTCATGAGAGCTAACAGTTACCTAGGGAGGGAGTAAAGATGAAGAGCTGAAATTTAAGG 104280126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2442 AGTCATGAGAGCTAACAGTTACCTAGGGAGGGAGTAAAGATGAAGAGCTGAAATTTAAGG 2501

104280127 ATAAAATTCCAGGGATCTAGAAATTTGGAAAATTGGAAGAAGAGGTGAAGCCAGAAAAGA 104280186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2502 ATAAAATTCCAGGGATCTAGAAATTTGGAAAATTGGAAGAAGAGGTGAAGCCAGAAAAGA 2561

104280187 CTAAGAAGGAGAGGTCAAGGAAGTAGGTGGGACAATAAAAGGATGTAGAATCTTGGCAAC 104280246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2562 CTAAGAAGGAGAGGTCAAGGAAGTAGGTGGGACAATAAAAGGATGTAGAATCTTGGCAAC 2621

104280247 TGAGTGATGAAAAAATTCTTTAAAGAATCAGAAAGTGACTGGTAAACTGGGTCAAAAGCT 104280306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2622 TGAGTGATGAAAAAATTCTTTAAAGAATCAGAAAGTGACTGGTAAACTGGGTCAAAAGCT 2681

104280307 AGAGATTGAGTAAAAACTGAAACTTTTCTTCATTTTAACATACTTTCGCTTTCAAGAAAA 104280366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2682 AGAGATTGAGTAAAAACTGAAACTTTTCTTCATTTTAACATACTTTCGCTTTCAAGAAAA 2741

104280367 TTATTACACTAAGGGGGAATAGCAGAGCAATCTATTAGTGTTGCAGAGGACAGATGTGGC 104280426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2742 TTATTACACTAAGGGGGAATAGCAGAGCAATCTATTAGTGTTGCAGAGGACAGATGTGGC 2801

104280427 TTTTTCAGATGCTCAGAAGCACCCAATAAATTTGAAGAACAGACAGGTGTTCCTGAGAAC 104280486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2802 TTTTTCAGATGCTCAGAAGCACCCAATAAATTTGAAGAACAGACAGGTGTTCCTGAGAAC 2861

104280487 TCAGGGAAGAATTTGGCCAATGAAGGTCACAGGACACCTGTTCTGAAAATGTCCTACTGA 104280546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2862 TCAGGGAAGAATTTGGCCAATGAAGGTCACAGGACACCTGTTCTGAAAATGTCCTACTGA 2921

104280547 AAATGTTCTTTAGAAGTTACAGTGTTTTCATCAAGACAATGAGATTTCACTTTATAACTT 104280606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2922 AAATGTTCTTTAGAAGTTACAGTGTTTTCATCAAGACAATGAGATTTCACTTTATAACTT 2981

104280607 TACTCAGTGCCCAGGTTACCTAAAAAGTATTTTTTCATCTTCAAGGG 104280653
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2982 TACTCAGTGCCCAGGTTACCTAAAAAGTATTTTTTCATCTTCAAGGG 3028

Alignment time is 2.25698 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [104268199,104289046] =>     20848 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     5997] =>      5997 nucs 'mol-32-321f-115048_5997'

Score:        5964
Aligned:      5997        nucs
Identic:      5994 (100%) nucs =>      4030 (100%)      1964 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [104274167,104278199] EXCISED REGION [104279047,104281010]
 second seq =>  [        1,     4033] EXCISED REGION [     4034,     5997]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       847 nucs [104278200,104279046]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [104278200,104278200] to [104279047,104279047]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [104278199,104278199] to [104279047,104279047]
 second seq =>         1 nucs [4033,4033] to [4034,4034]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

104274167 ATGTCAAAACATATCTATCCTTCTCCTATCACTGTGCTACTATAATGTACTTCTTTAGGG 104274226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATGTCAAAACATATCTATCCTTCTCCTATCACTGTGCTACTATAATGTACTTCTTTAGGG 60

104274227 ACATGACCATGCCGTTTAACTTACATCTCTCTCGCTGTACCAAATAAGACTCCCCTCACA 104274286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACATGACCATGCCGTTTAACTTACATCTCTCTCGCTGTACCAAATAAGACTCCCCTCACA 120

104274287 ATTTACTCAGTAAATGTTTGTGGAGTAAGATTTTCACTGGCCTCATTTCTCCAACTATCC 104274346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATTTACTCAGTAAATGTTTGTGGAGTAAGATTTTCACTGGCCTCATTTCTCCAACTATCC 180

104274347 TGCTTGGCAACTAATCCACAGTCATATAGGCCTCTTTTCACTTCTTTTAGTTTCTTAAAT 104274406
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGCTTGGCAGCTAATCCACAGTCATATAGGCCTCTTTTCACTTCTTTTAGTTTCTTAAAT 240

104274407 TTGGGCCTCCGCACCCCCACTCCAGCTCATGCTATTTATTCTACTTTTAATGATATACTG 104274466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTGGGCCTCCGCACCCCCACTCCAGCTCATGCTATTTATTCTACTTTTAATGATATACTG 300

104274467 CCTGCTCGATTCCCATTCCCAGCTCCAACATTCACACTCTTCATCTTGCCCATCTTTCAG 104274526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCTGCTCGATTCCCATTCCCAGCTCCAACATTCACACTCTTCATCTTGCCCATCTTTCAG 360

104274527 AACTCAGCTTCACTATCTCTTAGGTGACCTTGAATAAGATCTTAATACTTTTCCTTTCCA 104274586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AACTCAGCTTCACTATCTCTTAGGTGACCTTGAATAAGATCTTAATACTTTTCCTTTCCA 420

104274587 ACAAATAACCCAGTTTTAATTATCTAATTGATTATGATATCACTTATTCATCACTGTGTA 104274646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACAAATAACCCAGTTTTAATTATCTAATTGATTATGATATCACTTATTCATCACTGTGTA 480

104274647 TCAACTCATCCCAGATTCAATGGCTTCAAACAGAGAAACAAAAAAATACATTTTACTGCT 104274706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCAACTCATCCCAGATTCAATGGCTTCAAACAGAGAAACAAAAAAATACATTTTACTGCT 540

104274707 TACATTCAGTAGGTTGGCCAGGTATTACATCAGCTGCTCTCTCCTGGGTTCACTCAACTG 104274766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TACATTCAGTAGGTTGGCCAGGTATTACATCAGCTGCTCTCTCCTGGGTTCACTCAACTG 600

104274767 GAAGGATGAAAATGGCTTTATTCACATGTCTGGCAGTTGGTGCTTTTGCTGATTGATGGC 104274826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GAAGGATGAAAATGGCTTTATTCACATGTCTGGCAGTTGGTGCTTTTGCTGATTGATGGC 660

104274827 CTCTCATTCTCCAGTACGTTAGACAAGTTTTCTTATGTTGTAGTCTCAGGACATTATTAC 104274886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTCTCATTCTCCAGTACGTTAGACAAGTTTTCTTATGTTGTAGTCTCAGGACATTATTAC 720

104274887 AACTGGCAAAAACAGAAACTGTAAGGTGTCTAAAACCTAGGATCCAGAATTTACACACTA 104274946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AACTGGCAAAAACAGAAACTGTAAGGTGTCTAAAACCTAGGATCCAGAATTTACACACTA 780

104274947 AGCTTCTGTCTCATTCTATTAATTAAAGCAATTTATAAGGCCAGCCCAAATTCAAGAGAG 104275006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGCTTCTGTCTCATTCTATTAATTAAAGCAATTTATAAGGCCAGCCCAAATTCAAGAGAG 840

104275007 TGGAGGAACAGACTCCACTTTTTGTTGGAAGGAACAAAAACATTACATTGCTCTGGGACA 104275066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGGAGGAACAGACTCCACTTTTTGTTGGAAGGAACAAAAACATTACATTGCTCTGGGACA 900

104275067 TGGACACAAGGAGGCTTGACTCATGGGGACCATATTATAACTCTCTACTACATTATGTAA 104275126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGGACACAAGGAGGCTTGACTCATGGGGACCATATTATAACTCTCTACTACATTATGTAA 960

104275127 AATTACTAATTTAATTTCTATATTCCCCACTAGACTATCTGTGTATATGAATAGGGACCA 104275186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AATTACTAATTTAATTTCTATATTCCCCACTAGACTATCTGTGTATATGAATAGGGACCA 1020

104275187 TGCATTTCCTAATTTATGTTATATTGCCAGCATTTAATGCAGTCTTTATATGTGCTAGGC 104275246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGCATTTCCTAATTTATGTTATATTGCCAGCATTTAATGCAGTCTTTATATGTGCTAGGC 1080

104275247 ATTAATAAATATTTGTTGAATGAATAATTAAATGGCTAAATTAATAACAGAGTGGATGAA 104275306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATTAATAAATATTTGTTGAATGAATAATTAAATGGCTAAATTAATAACAGAGTGGATGAA 1140

104275307 TTAACTTGAAAAAAGATTTCATGAACTATCAGCATGAAGATTTATCCACAAAAATAGAGA 104275366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTAACTTGAAAAAAGATTTCATGAACTATCAGCATGAAGATTTATCCACAAAAATAGAGA 1200

104275367 AGTGTTTCTTTTTTTGACCACATGAAAAACTAGAAACCATGTAAGCAGAAGTTATCTAAG 104275426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AGTGTTTCTTTTTTTGACCACATGAAAAACTAGAAACCATGTAAGCAGAAGTTATCTAAG 1260

104275427 TTAACTTTTATTGAGTAACTGGACACAGAATTCAGGTGCTCTGTTGTTTTCTATTGCTGC 104275486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTAACTTTTATTGAGTAACTGGACACAGAATTCAGGTGCTCTGTTGTTTTCTATTGCTGC 1320

104275487 TATAACAAAACGTCACAAACAGCAAATTACTGCAACATGAATTTATTAGCTCACAGTTCT 104275546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TATAACAAAACGTCACAAACAGCAAATTACTGCAACATGAATTTATTAGCTCACAGTTCT 1380

104275547 ACCAGTCAGAATTCTGGTGTGGTTTAATTTAGTTCTCTGCTCAGGTTTCTCACAAGCCAG 104275606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ACCAGTCAGAATTCTGGTGTGGTTTAATTTAGTTCTCTGCTCAGGTTTCTCACAAGCCAG 1440

104275607 AAATTAAAATAGCAACTGACTAGGCTCTTATCTGTAAGATCTGATGTCGAAACAATTTCC 104275666
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     1441 AAATTAAAATAGCAACTGACTAGGCTCTTATCTGTAAGATCTGATGTTGAAACAATTTCC 1500

104275667 AAGCTGAATGATGTTTTTAGTAGAACTTAGCTCCTTGCAGTTGCAGAACTAAGGTTCTCC 104275726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AAGCTGAATGATGTTTTTAGTAGAACTTAGCTCCTTGCAGTTGCAGAACTAAGGTTCTCC 1560

104275727 CTTCTTGCTGGCTGGTGGCTGGGAGTCACCCTCAGCTCCTCCAGTGAGCCCACATTCTTT 104275786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CTTCTTGCTGGCTGGTGGCTGGGAGTCACCCTCAGCTCCTCCAGTGAGCCCACATTCTTT 1620

104275787 CCGCATGTCTTCCTTTATCTTCAAGCCAGCAACAATGCATCGGGCCCTTCTCTGCTCAGA 104275846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CCGCATGTCTTCCTTTATCTTCAAGCCAGCAACAATGCATCGGGCCCTTCTCTGCTCAGA 1680

104275847 TCTCCCTGACTTCCTCTGCTGTCCTCACCAAGGAGAATACTTTGATTTAAGGACTCCTGT 104275906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TCTCCCTGACTTCCTCTGCTGTCCTCACCAAGGAGAATACTTTGATTTAAGGACTCCTGT 1740

104275907 AATTACATTGGCCCACCTGGGAAATCTAGGCTAATCTCTGTATCTTAAACTCAATTGATT 104275966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AATTACATTGGCCCACCTGGGAAATCTAGGCTAATCTCTGTATCTTAAACTCAATTGATT 1800

104275967 CTTAACCTTAATTACCTCTGCAATGTCATTTTGCCATGTAATATAACATATTCACAGGTG 104276026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CTTAACCTTAATTACCTCTGCAATGTCATTTTGCCATGTAATATAACATATTCACAGGTG 1860

104276027 TAACACCAGGGAGCAAAGGTCAGAGAGCCAAAATTCTGTCTACCGTTGATACTCAACAGC 104276086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TAACACCAGGGAGCAAAGGTCAGAGAGCCAAAATTCTGTCTACCGTTGATACTCAACAGC 1920

104276087 AATAAACATTCAGCTGTAGGAAACCTGAAGTCTCCAGAGAGATAATTTAGATAAAATACA 104276146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AATAAACATTCAGCTGTAGGAAACCTGAAGTCTCCAGAGAGATAATTTAGATAAAATACA 1980

104276147 GCCTTAAGTATAGGACAGACCTGCTTAGAATCAGGAGTCTAAATTTTTTTGGTTACACAA 104276206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GCCTTAAGTATAGGACAGACCTGCTTAGAATCAGGAGTCTAAATTTTTTTGGTTACACAA 2040

104276207 ATATAGCCAATTCTCTTTACCATTATAAATCTCAGCTTTATTTTTTTAATCTGAAAAATG 104276266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ATATAGCCAATTCTCTTTACCATTATAAATCTCAGCTTTATTTTTTTAATCTGAAAAATG 2100

104276267 CAAATATTGCTGCATCTCTATCATGTTGCTTTTAACATTAATATAAGAAACATACATATA 104276326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CAAATATTGCTGCATCTCTATCATGTTGCTTTTAACATTAATATAAGAAACATACATATA 2160

104276327 ATCAGCAAAAAAGATTTTTAAAACCTTACATATCAAAGATTACAAAAGAGAATTAGGAGA 104276386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ATCAGCAAAAAAGATTTTTAAAACCTTACATATCAAAGATTACAAAAGAGAATTAGGAGA 2220

104276387 AAGAACAAAGTCTAAAGATGTTGAGAGAGTACCCTAAAGTTATCTATTTATTTATTCACT 104276446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AAGAACAAAGTCTAAAGATGTTGAGAGAGTACCCTAAAGTTATCTATTTATTTATTCACT 2280

104276447 TGTTCAAAAATATTTAGGACTAGGCCAGCCACAGTGGCTCATGCCTGTAATTCCAGCACT 104276506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TGTTCAAAAATATTTAGGACTAGGCCAGCCACAGTGGCTCATGCCTGTAATTCCAGCACT 2340

104276507 TTGGGGGGCCAAGGTGGGTGGATCACTTGAAGTCAGGAGTTTGAGATCAACCTGGCCAAC 104276566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TTGGGGGGCCAAGGTGGGTGGATCACTTGAAGTCAGGAGTTTGAGATCAACCTGGCCAAC 2400

104276567 ATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCACGTGCC 104276626
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACGAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCACGTGCC 2460

104276627 TGTAATCCCAGCTATTTGGGAGACTGCATCAGGAAAATTGCTTGAATCCAGGAGGCGGAG 104276686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TGTAATCCCAGCTATTTGGGAGACTGCATCAGGAAAATTGCTTGAATCCAGGAGGCGGAG 2520

104276687 GGTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGACAACAGAGCGAGACTCCG 104276746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GGTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGACAACAGAGCGAGACTCCG 2580

104276747 TCTCAAAAATATATATATATATATATATATTTAGGACTAGGTTTCGATGAAATTAACCTA 104276806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TCTCAAAAATATATATATATATATATATATTTAGGACTAGGTTTCGATGAAATTAACCTA 2640

104276807 ACAACCAACACTTAATCCTTTGAGAAACTACTTTCTCAACTGCATGGAACTTACCTAGGA 104276866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 ACAACCAACACTTAATCCTTTGAGAAACTACTTTCTCAACTGCATGGAACTTACCTAGGA 2700

104276867 TAAAAATTAAAATTTAGGAGAAAGTGATTTCAGAGCTCCAAATCTGTCCTGTCTGCCCTC 104276926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TAAAAATTAAAATTTAGGAGAAAGTGATTTCAGAGCTCCAAATCTGTCCTGTCTGCCCTC 2760

104276927 ATTTCCATAATCTGCTTTGACTGCCATTTTGTATATCCCCTATAATTTAACCTACTTATT 104276986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 ATTTCCATAATCTGCTTTGACTGCCATTTTGTATATCCCCTATAATTTAACCTACTTATT 2820

104276987 GATCCCATGATCTCTGAAAATATTCTTTTTAATTTAATTTAATTTTTAGTTCTGGGATAC 104277046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GATCCCATGATCTCTGAAAATATTCTTTTTAATTTAATTTAATTTTTAGTTCTGGGATAC 2880

104277047 ATGGGCAGGATATGCAGCCTTGTTATATGGGTAAATGTGTTCCATGGTGGTTTGCTGCAC 104277106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 ATGGGCAGGATATGCAGCCTTGTTATATGGGTAAATGTGTTCCATGGTGGTTTGCTGCAC 2940

104277107 CTATCAAACCATCACCTAGGTATTAAGCCCCGCATGCATTAGCTACTCTTTCTGATGCGC 104277166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CTATCAAACCATCACCTAGGTATTAAGCCCCGCATGCATTAGCTACTCTTTCTGATGCGC 3000

104277167 TCCCTCCCACCACATCCCCAACCAACGGGCCCCATTATGTGTTGTTCCTTTCTCTGTTTT 104277226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TCCCTCCCACCACATCCCCAACCAACGGGCCCCATTATGTGTTGTTCCTTTCTCTGTTTT 3060

104277227 TATGTGTTCTCATTGTTCAGCTTCCACTTATAAGTGAGAACATGTAGTGTTTAATTTTCT 104277286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TATGTGTTCTCATTGTTCAGCTTCCACTTATAAGTGAGAACATGTAGTGTTTAATTTTCT 3120

104277287 GTTCCTGTGTTAGTTTGCTGAGGATAATGGCTTCCAGCTCCATCCCTTTTCCTGCAAAGG 104277346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 GTTCCTGTGTTAGTTTGCTGAGGATAATGGCTTCCAGCTCCATCCCTTTTCCTGCAAAGG 3180

104277347 ACATGATCTCATTACTTTTTATGACTGCATAGTGTTCCATGGTGTAAATATATCACATTT 104277406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 ACATGATCTCATTACTTTTTATGACTGCATAGTGTTCCATGGTGTAAATATATCACATTT 3240

104277407 TCATTTTCCAGTCTATCATTGATGGGCATTTGGGTTAATTCCATGTCTTTTCTACAGTGA 104277466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TCATTTTCCAGTCTATCATTGATGGGCATTTGGGTTAATTCCATGTCTTTTCTACAGTGA 3300

104277467 ATAGTGCTCCAGTGAACATACATGTGCAGGTATCTTTATAATAGAATGATTTATATTCTT 104277526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 ATAGTGCTCCAGTGAACATACATGTGCAGGTATCTTTATAATAGAATGATTTATATTCTT 3360

104277527 TTGGGTACATACCCAGTAATGGGATTGCTGGGTCAAATGGTATTTCTGGTTCTAGGTCTT 104277586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TTGGGTACATACCCAGTAATGGGATTGCTGGGTCAAATGGTATTTCTGGTTCTAGGTCTT 3420

104277587 TGAGGAATTGCTACACTGTCTTCCACAAGTAAAACCCAGAACTATAAAAACCCTAGAAGA 104277646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TGAGGAATTGCTACACTGTCTTCCACAAGTAAAACCCAGAACTATAAAAACCCTAGAAGA 3480

104277647 AAAGCTAGACAGTACCATTCAGGACATCGGCACAGGCAAAGATTTCATGACAAAAATGTC 104277706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 AAAGCTAGACAGTACCATTCAGGACATCGGCACAGGCAAAGATTTCATGACAAAAATGTC 3540

104277707 AAAAGCAATTGCAACAAACACAAAACTTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAGAGCTTCT 104277766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 AAAAGCAATTGCAACAAACACAAAACTTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAGAGCTTCT 3600

104277767 GCACAGCAAAAGAAACTATCATCAGAGTGGACAGACAACCTACAGAATGGGAGAAAAGTT 104277826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 GCACAGCAAAAGAAACTATCATCAGAGTGGACAGACAACCTACAGAATGGGAGAAAAGTT 3660

104277827 TGCAGTCTATTCATCCGACAAAGGTTGAATATCCAGAATCTACAAGGAACTTAGTTCCAA 104277886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 TGCAGTCTATTCATCCGACAAAGGTTGAATATCCAGAATCTACAAGGAACTTAGTTCCAA 3720

104277887 TTTACAAGAAAAAAAAAAAACACCATTAAAAAGTCGGCAAAGGACATAAACAGACACTTC 104277946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 TTTACAAGAAAAAAAAAAAACACCATTAAAAAGTCGGCAAAGGACATAAACAGACACTTC 3780

104277947 TCAAAAGAAGACATTACGTGGCCACCAAACATATGAAAAAAAACTCAACCTCACTGATCA 104278006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 TCAAAAGAAGACATTACGTGGCCACCAAACATATGAAAAAAAACTCAACCTCACTGATCA 3840

104278007 TTAGAGAAATACAAATCAAAACCACCAAGAGATACCATCGCATGCCAGTCAGAATGGTGA 104278066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 TTAGAGAAATACAAATCAAAACCACCAAGAGATACCATCGCATGCCAGTCAGAATGGTGA 3900

104278067 TTATTAAAAAGTCAAGGAACAATAGATGCTGGTGAGGCTGTGGAGAAATAGGAATGCTCT 104278126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 TTATTAAAAAGTCAAGGAACAATAGATGCTGGTGAGGCTGTGGAGAAATAGGAATGCTCT 3960

104278127 TTTGCACTGTTGATGGGAATCTCTGAAAATATTTATTCCTTTGAATGAGTTTAGCATAGG 104278186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 TTTGCACTGTTGATGGGAATCTCTGAAAATATTTATTCCTTTGAATGAGTTTAGCATAGG 4020

104278187 ATGTTACCCTTAA 104278199
          |||||||||||||
     4021 ATGTTACCCTTAA 4033

EXCISED REGION

104279047 ATGCTTGTTATAACAATGTACTTTTTTGTATACCTCTACTTGGAAATGTATTATAGTTAA 104279106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4034 ATGCTTGTTATAACAATGTACTTTTTTGTATACCTCTACTTGGAAATGTATTATAGTTAA 4093

104279107 GATTCATTCATTCGACTAATATGTATTGAGTGCCTACTATGTGCCAGGCACATGTTTTAG 104279166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4094 GATTCATTCATTCGACTAATATGTATTGAGTGCCTACTATGTGCCAGGCACATGTTTTAG 4153

104279167 CTAATGTTGATGAATGGTATGGATAAAGGCCTTGACACATTCATATTTAGAAAGATGGAA 104279226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4154 CTAATGTTGATGAATGGTATGGATAAAGGCCTTGACACATTCATATTTAGAAAGATGGAA 4213

104279227 ATAAATACATCAACAACATGCAATCTAATAGAGTTAGTAATGATAAAGATAAAACAGAAT 104279286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4214 ATAAATACATCAACAACATGCAATCTAATAGAGTTAGTAATGATAAAGATAAAACAGAAT 4273

104279287 ATAGAGAGTAAATAAGGGACCTATTTTCTATATGGTGGTCAAAAATGGACCCTGTGATTA 104279346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4274 ATAGAGAGTAAATAAGGGACCTATTTTCTATATGGTGGTCAAAAATGGACCCTGTGATTA 4333

104279347 CAGCTGAATACAGACTTGAATAAAACGAGAAAGCAAGTAATTCACATATCTGAGGAGAAA 104279406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4334 CAGCTGAATACAGACTTGAATAAAACGAGAAAGCAAGTAATTCACATATCTGAGGAGAAA 4393

104279407 ACTCTTTAGACACAGGGACCAGAAAGTTCAGGGGCCTTCAGCCAGAAATATTATTGACAT 104279466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4394 ACTCTTTAGACACAGGGACCAGAAAGTTCAGGGGCCTTCAGCCAGAAATATTATTGACAT 4453

104279467 GTGTAAATGAAGTAGCAAAGATAGTTGTTTGAGGAGGTGAAAAGGAAAATAGTGAAGATC 104279526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4454 GTGTAAATGAAGTAGCAAAGATAGTTGTTTGAGGAGGTGAAAAGGAAAATAGTGAAGATC 4513

104279527 AAATTGAAGAGACAATCAAGGCCATGCAGACTGTGGCAAGAACTTTGGAACTTCTGTTTA 104279586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4514 AAATTGAAGAGACAATCAAGGCCATGCAGACTGTGGCAAGAACTTTGGAACTTCTGTTTA 4573

104279587 TTATCCGAAGAGGCCATTGGAAGGTTATAAACAAGATATAAACATGATCTGACCTGTGTT 104279646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4574 TTATCCGAAGAGGCCATTGGAAGGTTATAAACAAGATATAAACATGATCTGACCTGTGTT 4633

104279647 TTGAAAGGATTTTTCTGGATAGGGAGTGAAAATTATATTGAAAGTGAAAAGATTGTAGAT 104279706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4634 TTGAAAGGATTTTTCTGGATAGGGAGTGAAAATTATATTGAAAGTGAAAAGATTGTAGAT 4693

104279707 ATAGTAGCAGTGGTAGGACTTGGGATATATATTACATACATTAGAGCTATCCTTAACTGT 104279766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4694 ATAGTAGCAGTGGTAGGACTTGGGATATATATTACATACATTAGAGCTATCCTTAACTGT 4753

104279767 ATCAACTGGTCTCATTGGGTATGAGAAGAAGATCAAAGTCAAGGCCAATTTTAATATGTT 104279826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4754 ATCAACTGGTCTCATTGGGTATGAGAAGAAGATCAAAGTCAAGGCCAATTTTAATATGTT 4813

104279827 TGGCCTGAGCAAGAAGGTGATATCCTTTCATGAAATGGGGATCAGTGAGAGGGGAGAAAT 104279886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4814 TGGCCTGAGCAAGAAGGTGATATCCTTTCATGAAATGGGGATCAGTGAGAGGGGAGAAAT 4873

104279887 TTACAGAGAAAAATTAAGAGTTTGGTTTTGGACCTATTAAAATTTGAGAAACCTGTGAGA 104279946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4874 TTACAGAGAAAAATTAAGAGTTTGGTTTTGGACCTATTAAAATTTGAGAAACCTGTGAGA 4933

104279947 AGTTTAAGAGGAAATGTTGATGAAGAGGAAGTTCGAAATAAGAGTCGAGAGTCCAGGGAA 104280006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4934 AGTTTAAGAGGAAATGTTGATGAAGAGGAAGTTCGAAATAAGAGTCGAGAGTCCAGGGAA 4993

104280007 TTGGTTTGGAGCTGGAGATTTTTTAAATTGAGAAGTTATTGGTAGATACAAGATATTTGC 104280066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4994 TTGGTTTGGAGCTGGAGATTTTTTAAATTGAGAAGTTATTGGTAGATACAAGATATTTGC 5053

104280067 AGTCATGAGAGCTAACAGTTACCTAGGGAGGGAGTAAAGATGAAGAGCTGAAATTTAAGG 104280126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5054 AGTCATGAGAGCTAACAGTTACCTAGGGAGGGAGTAAAGATGAAGAGCTGAAATTTAAGG 5113

104280127 ATAAAATTCCAGGGATCTAGAAATTTGGAAAATTGGAAGAAGAGGTGAAGCCAGAAAAGA 104280186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5114 ATAAAATTCCAGGGATCTAGAAATTTGGAAAATTGGAAGAAGAGGTGAAGCCAGAAAAGA 5173

104280187 CTAAGAAGGAGAGGTCAAGGAAGTAGGTGGGACAATAAAAGGATGTAGAATCTTGGCAAC 104280246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5174 CTAAGAAGGAGAGGTCAAGGAAGTAGGTGGGACAATAAAAGGATGTAGAATCTTGGCAAC 5233

104280247 TGAGTGATGAAAAAATTCTTTAAAGAATCAGAAAGTGACTGGTAAACTGGGTCAAAAGCT 104280306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5234 TGAGTGATGAAAAAATTCTTTAAAGAATCAGAAAGTGACTGGTAAACTGGGTCAAAAGCT 5293

104280307 AGAGATTGAGTAAAAACTGAAACTTTTCTTCATTTTAACATACTTTCGCTTTCAAGAAAA 104280366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5294 AGAGATTGAGTAAAAACTGAAACTTTTCTTCATTTTAACATACTTTCGCTTTCAAGAAAA 5353

104280367 TTATTACACTAAGGGGGAATAGCAGAGCAATCTATTAGTGTTGCAGAGGACAGATGTGGC 104280426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5354 TTATTACACTAAGGGGGAATAGCAGAGCAATCTATTAGTGTTGCAGAGGACAGATGTGGC 5413

104280427 TTTTTCAGATGCTCAGAAGCACCCAATAAATTTGAAGAACAGACAGGTGTTCCTGAGAAC 104280486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5414 TTTTTCAGATGCTCAGAAGCACCCAATAAATTTGAAGAACAGACAGGTGTTCCTGAGAAC 5473

104280487 TCAGGGAAGAATTTGGCCAATGAAGGTCACAGGACACCTGTTCTGAAAATGTCCTACTGA 104280546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5474 TCAGGGAAGAATTTGGCCAATGAAGGTCACAGGACACCTGTTCTGAAAATGTCCTACTGA 5533

104280547 AAATGTTCTTTAGAAGTTACAGTGTTTTCATCAAGACAATGAGATTTCACTTTATAACTT 104280606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5534 AAATGTTCTTTAGAAGTTACAGTGTTTTCATCAAGACAATGAGATTTCACTTTATAACTT 5593

104280607 TACTCAGTGCCCAGGTTACCTAAAAAGTATTTTTTCATCTTCAAGGGAGAAAAAAACTTT 104280666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5594 TACTCAGTGCCCAGGTTACCTAAAAAGTATTTTTTCATCTTCAAGGGAGAAAAAAACTTT 5653

104280667 GTTATTAGGTGATATAATTAGAATGTTTTAAAGAATGACATTAGTTTGCATTTCACAGCC 104280726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5654 GTTATTAGGTGATATAATTAGAATGTTTTAAAGAATGACATTAGTTTGCATTTCACAGCC 5713

104280727 TTACTAGGTAATATGAGAAGAAAATTCCAGTTTTATATTCTCTCGTATCTCTGAATTTCT 104280786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5714 TTACTAGGTAATATGAGAAGAAAATTCCAGTTTTATATTCTCTCGTATCTCTGAATTTCT 5773

104280787 TTCTAATTTATGGAAACAGTCTAATTTATGGAAACAGAATAATTAAATGCCCATGATAAA 104280846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5774 TTCTAATTTATGGAAACAGTCTAATTTATGGAAACAGAATAATTAAATGCCCATGATAAA 5833

104280847 TTTTCAAAGTTTATGACTTTCACTTGCATGGAATTAAAAATTATTTGCTGTTTTGTTAGT 104280906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5834 TTTTCAAAGTTTATGACTTTCACTTGCATGGAATTAAAAATTATTTGCTGTTTTGTTAGT 5893

104280907 ATTACTGTTAAGTGCCTTCCATGCTGCAGTAAGAAAACAGAAAAGTGAAATTCAAGAGCT 104280966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5894 ATTACTGTTAAGTGCCTTCCATGCTGCAGTAAGAAAACAGAAAAGTGAAATTCAAGAGCT 5953

104280967 AATCCAGGAGTATAAATGGGAAGTTTTTTTTTTATTAACTTGAC 104281010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5954 AATCCAGGAGTATAAATGGGAAGTTTTTTTTTTATTAACTTGAC 5997

Alignment time is 4.39943 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [104268199,104289046] =>     20848 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     3185] =>      3185 nucs 'mol-32-321f-117853_3185'

Score:        3185
Aligned:      3185        nucs
Identic:      3185 (100%) nucs =>      1410 (100%)      1775 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [104276790,104278199] EXCISED REGION [104279047,104280821]
 second seq =>  [        1,     1410] EXCISED REGION [     1411,     3185]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       847 nucs [104278200,104279046]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [104278200,104278200] to [104279047,104279047]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [104278199,104278199] to [104279047,104279047]
 second seq =>         1 nucs [1410,1410] to [1411,1411]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

104276790 TCGATGAAATTAACCTAACAACCAACACTTAATCCTTTGAGAAACTACTTTCTCAACTGC 104276849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCGATGAAATTAACCTAACAACCAACACTTAATCCTTTGAGAAACTACTTTCTCAACTGC 60

104276850 ATGGAACTTACCTAGGATAAAAATTAAAATTTAGGAGAAAGTGATTTCAGAGCTCCAAAT 104276909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATGGAACTTACCTAGGATAAAAATTAAAATTTAGGAGAAAGTGATTTCAGAGCTCCAAAT 120

104276910 CTGTCCTGTCTGCCCTCATTTCCATAATCTGCTTTGACTGCCATTTTGTATATCCCCTAT 104276969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTGTCCTGTCTGCCCTCATTTCCATAATCTGCTTTGACTGCCATTTTGTATATCCCCTAT 180

104276970 AATTTAACCTACTTATTGATCCCATGATCTCTGAAAATATTCTTTTTAATTTAATTTAAT 104277029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AATTTAACCTACTTATTGATCCCATGATCTCTGAAAATATTCTTTTTAATTTAATTTAAT 240

104277030 TTTTAGTTCTGGGATACATGGGCAGGATATGCAGCCTTGTTATATGGGTAAATGTGTTCC 104277089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTTTAGTTCTGGGATACATGGGCAGGATATGCAGCCTTGTTATATGGGTAAATGTGTTCC 300

104277090 ATGGTGGTTTGCTGCACCTATCAAACCATCACCTAGGTATTAAGCCCCGCATGCATTAGC 104277149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATGGTGGTTTGCTGCACCTATCAAACCATCACCTAGGTATTAAGCCCCGCATGCATTAGC 360

104277150 TACTCTTTCTGATGCGCTCCCTCCCACCACATCCCCAACCAACGGGCCCCATTATGTGTT 104277209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TACTCTTTCTGATGCGCTCCCTCCCACCACATCCCCAACCAACGGGCCCCATTATGTGTT 420

104277210 GTTCCTTTCTCTGTTTTTATGTGTTCTCATTGTTCAGCTTCCACTTATAAGTGAGAACAT 104277269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTTCCTTTCTCTGTTTTTATGTGTTCTCATTGTTCAGCTTCCACTTATAAGTGAGAACAT 480

104277270 GTAGTGTTTAATTTTCTGTTCCTGTGTTAGTTTGCTGAGGATAATGGCTTCCAGCTCCAT 104277329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTAGTGTTTAATTTTCTGTTCCTGTGTTAGTTTGCTGAGGATAATGGCTTCCAGCTCCAT 540

104277330 CCCTTTTCCTGCAAAGGACATGATCTCATTACTTTTTATGACTGCATAGTGTTCCATGGT 104277389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CCCTTTTCCTGCAAAGGACATGATCTCATTACTTTTTATGACTGCATAGTGTTCCATGGT 600

104277390 GTAAATATATCACATTTTCATTTTCCAGTCTATCATTGATGGGCATTTGGGTTAATTCCA 104277449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTAAATATATCACATTTTCATTTTCCAGTCTATCATTGATGGGCATTTGGGTTAATTCCA 660

104277450 TGTCTTTTCTACAGTGAATAGTGCTCCAGTGAACATACATGTGCAGGTATCTTTATAATA 104277509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGTCTTTTCTACAGTGAATAGTGCTCCAGTGAACATACATGTGCAGGTATCTTTATAATA 720

104277510 GAATGATTTATATTCTTTTGGGTACATACCCAGTAATGGGATTGCTGGGTCAAATGGTAT 104277569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GAATGATTTATATTCTTTTGGGTACATACCCAGTAATGGGATTGCTGGGTCAAATGGTAT 780

104277570 TTCTGGTTCTAGGTCTTTGAGGAATTGCTACACTGTCTTCCACAAGTAAAACCCAGAACT 104277629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTCTGGTTCTAGGTCTTTGAGGAATTGCTACACTGTCTTCCACAAGTAAAACCCAGAACT 840

104277630 ATAAAAACCCTAGAAGAAAAGCTAGACAGTACCATTCAGGACATCGGCACAGGCAAAGAT 104277689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATAAAAACCCTAGAAGAAAAGCTAGACAGTACCATTCAGGACATCGGCACAGGCAAAGAT 900

104277690 TTCATGACAAAAATGTCAAAAGCAATTGCAACAAACACAAAACTTGACAAATGGGATCTA 104277749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTCATGACAAAAATGTCAAAAGCAATTGCAACAAACACAAAACTTGACAAATGGGATCTA 960

104277750 ATTAAACTAGAGCTTCTGCACAGCAAAAGAAACTATCATCAGAGTGGACAGACAACCTAC 104277809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATTAAACTAGAGCTTCTGCACAGCAAAAGAAACTATCATCAGAGTGGACAGACAACCTAC 1020

104277810 AGAATGGGAGAAAAGTTTGCAGTCTATTCATCCGACAAAGGTTGAATATCCAGAATCTAC 104277869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGAATGGGAGAAAAGTTTGCAGTCTATTCATCCGACAAAGGTTGAATATCCAGAATCTAC 1080

104277870 AAGGAACTTAGTTCCAATTTACAAGAAAAAAAAAAAACACCATTAAAAAGTCGGCAAAGG 104277929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAGGAACTTAGTTCCAATTTACAAGAAAAAAAAAAAACACCATTAAAAAGTCGGCAAAGG 1140

104277930 ACATAAACAGACACTTCTCAAAAGAAGACATTACGTGGCCACCAAACATATGAAAAAAAA 104277989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ACATAAACAGACACTTCTCAAAAGAAGACATTACGTGGCCACCAAACATATGAAAAAAAA 1200

104277990 CTCAACCTCACTGATCATTAGAGAAATACAAATCAAAACCACCAAGAGATACCATCGCAT 104278049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CTCAACCTCACTGATCATTAGAGAAATACAAATCAAAACCACCAAGAGATACCATCGCAT 1260

104278050 GCCAGTCAGAATGGTGATTATTAAAAAGTCAAGGAACAATAGATGCTGGTGAGGCTGTGG 104278109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GCCAGTCAGAATGGTGATTATTAAAAAGTCAAGGAACAATAGATGCTGGTGAGGCTGTGG 1320

104278110 AGAAATAGGAATGCTCTTTTGCACTGTTGATGGGAATCTCTGAAAATATTTATTCCTTTG 104278169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AGAAATAGGAATGCTCTTTTGCACTGTTGATGGGAATCTCTGAAAATATTTATTCCTTTG 1380

104278170 AATGAGTTTAGCATAGGATGTTACCCTTAA 104278199
          ||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AATGAGTTTAGCATAGGATGTTACCCTTAA 1410

EXCISED REGION

104279047 ATGCTTGTTATAACAATGTACTTTTTTGTATACCTCTACTTGGAAATGTATTATAGTTAA 104279106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1411 ATGCTTGTTATAACAATGTACTTTTTTGTATACCTCTACTTGGAAATGTATTATAGTTAA 1470

104279107 GATTCATTCATTCGACTAATATGTATTGAGTGCCTACTATGTGCCAGGCACATGTTTTAG 104279166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1471 GATTCATTCATTCGACTAATATGTATTGAGTGCCTACTATGTGCCAGGCACATGTTTTAG 1530

104279167 CTAATGTTGATGAATGGTATGGATAAAGGCCTTGACACATTCATATTTAGAAAGATGGAA 104279226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1531 CTAATGTTGATGAATGGTATGGATAAAGGCCTTGACACATTCATATTTAGAAAGATGGAA 1590

104279227 ATAAATACATCAACAACATGCAATCTAATAGAGTTAGTAATGATAAAGATAAAACAGAAT 104279286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1591 ATAAATACATCAACAACATGCAATCTAATAGAGTTAGTAATGATAAAGATAAAACAGAAT 1650

104279287 ATAGAGAGTAAATAAGGGACCTATTTTCTATATGGTGGTCAAAAATGGACCCTGTGATTA 104279346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1651 ATAGAGAGTAAATAAGGGACCTATTTTCTATATGGTGGTCAAAAATGGACCCTGTGATTA 1710

104279347 CAGCTGAATACAGACTTGAATAAAACGAGAAAGCAAGTAATTCACATATCTGAGGAGAAA 104279406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1711 CAGCTGAATACAGACTTGAATAAAACGAGAAAGCAAGTAATTCACATATCTGAGGAGAAA 1770

104279407 ACTCTTTAGACACAGGGACCAGAAAGTTCAGGGGCCTTCAGCCAGAAATATTATTGACAT 104279466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1771 ACTCTTTAGACACAGGGACCAGAAAGTTCAGGGGCCTTCAGCCAGAAATATTATTGACAT 1830

104279467 GTGTAAATGAAGTAGCAAAGATAGTTGTTTGAGGAGGTGAAAAGGAAAATAGTGAAGATC 104279526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1831 GTGTAAATGAAGTAGCAAAGATAGTTGTTTGAGGAGGTGAAAAGGAAAATAGTGAAGATC 1890

104279527 AAATTGAAGAGACAATCAAGGCCATGCAGACTGTGGCAAGAACTTTGGAACTTCTGTTTA 104279586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1891 AAATTGAAGAGACAATCAAGGCCATGCAGACTGTGGCAAGAACTTTGGAACTTCTGTTTA 1950

104279587 TTATCCGAAGAGGCCATTGGAAGGTTATAAACAAGATATAAACATGATCTGACCTGTGTT 104279646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1951 TTATCCGAAGAGGCCATTGGAAGGTTATAAACAAGATATAAACATGATCTGACCTGTGTT 2010

104279647 TTGAAAGGATTTTTCTGGATAGGGAGTGAAAATTATATTGAAAGTGAAAAGATTGTAGAT 104279706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2011 TTGAAAGGATTTTTCTGGATAGGGAGTGAAAATTATATTGAAAGTGAAAAGATTGTAGAT 2070

104279707 ATAGTAGCAGTGGTAGGACTTGGGATATATATTACATACATTAGAGCTATCCTTAACTGT 104279766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2071 ATAGTAGCAGTGGTAGGACTTGGGATATATATTACATACATTAGAGCTATCCTTAACTGT 2130

104279767 ATCAACTGGTCTCATTGGGTATGAGAAGAAGATCAAAGTCAAGGCCAATTTTAATATGTT 104279826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2131 ATCAACTGGTCTCATTGGGTATGAGAAGAAGATCAAAGTCAAGGCCAATTTTAATATGTT 2190

104279827 TGGCCTGAGCAAGAAGGTGATATCCTTTCATGAAATGGGGATCAGTGAGAGGGGAGAAAT 104279886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2191 TGGCCTGAGCAAGAAGGTGATATCCTTTCATGAAATGGGGATCAGTGAGAGGGGAGAAAT 2250

104279887 TTACAGAGAAAAATTAAGAGTTTGGTTTTGGACCTATTAAAATTTGAGAAACCTGTGAGA 104279946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2251 TTACAGAGAAAAATTAAGAGTTTGGTTTTGGACCTATTAAAATTTGAGAAACCTGTGAGA 2310

104279947 AGTTTAAGAGGAAATGTTGATGAAGAGGAAGTTCGAAATAAGAGTCGAGAGTCCAGGGAA 104280006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2311 AGTTTAAGAGGAAATGTTGATGAAGAGGAAGTTCGAAATAAGAGTCGAGAGTCCAGGGAA 2370

104280007 TTGGTTTGGAGCTGGAGATTTTTTAAATTGAGAAGTTATTGGTAGATACAAGATATTTGC 104280066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2371 TTGGTTTGGAGCTGGAGATTTTTTAAATTGAGAAGTTATTGGTAGATACAAGATATTTGC 2430

104280067 AGTCATGAGAGCTAACAGTTACCTAGGGAGGGAGTAAAGATGAAGAGCTGAAATTTAAGG 104280126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2431 AGTCATGAGAGCTAACAGTTACCTAGGGAGGGAGTAAAGATGAAGAGCTGAAATTTAAGG 2490

104280127 ATAAAATTCCAGGGATCTAGAAATTTGGAAAATTGGAAGAAGAGGTGAAGCCAGAAAAGA 104280186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2491 ATAAAATTCCAGGGATCTAGAAATTTGGAAAATTGGAAGAAGAGGTGAAGCCAGAAAAGA 2550

104280187 CTAAGAAGGAGAGGTCAAGGAAGTAGGTGGGACAATAAAAGGATGTAGAATCTTGGCAAC 104280246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2551 CTAAGAAGGAGAGGTCAAGGAAGTAGGTGGGACAATAAAAGGATGTAGAATCTTGGCAAC 2610

104280247 TGAGTGATGAAAAAATTCTTTAAAGAATCAGAAAGTGACTGGTAAACTGGGTCAAAAGCT 104280306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2611 TGAGTGATGAAAAAATTCTTTAAAGAATCAGAAAGTGACTGGTAAACTGGGTCAAAAGCT 2670

104280307 AGAGATTGAGTAAAAACTGAAACTTTTCTTCATTTTAACATACTTTCGCTTTCAAGAAAA 104280366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2671 AGAGATTGAGTAAAAACTGAAACTTTTCTTCATTTTAACATACTTTCGCTTTCAAGAAAA 2730

104280367 TTATTACACTAAGGGGGAATAGCAGAGCAATCTATTAGTGTTGCAGAGGACAGATGTGGC 104280426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2731 TTATTACACTAAGGGGGAATAGCAGAGCAATCTATTAGTGTTGCAGAGGACAGATGTGGC 2790

104280427 TTTTTCAGATGCTCAGAAGCACCCAATAAATTTGAAGAACAGACAGGTGTTCCTGAGAAC 104280486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2791 TTTTTCAGATGCTCAGAAGCACCCAATAAATTTGAAGAACAGACAGGTGTTCCTGAGAAC 2850

104280487 TCAGGGAAGAATTTGGCCAATGAAGGTCACAGGACACCTGTTCTGAAAATGTCCTACTGA 104280546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2851 TCAGGGAAGAATTTGGCCAATGAAGGTCACAGGACACCTGTTCTGAAAATGTCCTACTGA 2910

104280547 AAATGTTCTTTAGAAGTTACAGTGTTTTCATCAAGACAATGAGATTTCACTTTATAACTT 104280606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2911 AAATGTTCTTTAGAAGTTACAGTGTTTTCATCAAGACAATGAGATTTCACTTTATAACTT 2970

104280607 TACTCAGTGCCCAGGTTACCTAAAAAGTATTTTTTCATCTTCAAGGGAGAAAAAAACTTT 104280666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2971 TACTCAGTGCCCAGGTTACCTAAAAAGTATTTTTTCATCTTCAAGGGAGAAAAAAACTTT 3030

104280667 GTTATTAGGTGATATAATTAGAATGTTTTAAAGAATGACATTAGTTTGCATTTCACAGCC 104280726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3031 GTTATTAGGTGATATAATTAGAATGTTTTAAAGAATGACATTAGTTTGCATTTCACAGCC 3090

104280727 TTACTAGGTAATATGAGAAGAAAATTCCAGTTTTATATTCTCTCGTATCTCTGAATTTCT 104280786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3091 TTACTAGGTAATATGAGAAGAAAATTCCAGTTTTATATTCTCTCGTATCTCTGAATTTCT 3150

104280787 TTCTAATTTATGGAAACAGTCTAATTTATGGAAAC 104280821
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3151 TTCTAATTTATGGAAACAGTCTAATTTATGGAAAC 3185

Alignment time is 2.37059 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [104268199,104289046] =>     20848 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     2100] =>      2100 nucs 'mol-32-321f-190744_2100'

Score:        2099
Aligned:      2099        nucs
Identic:      2099 (100%) nucs =>      2065 (100%)        34 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [104276937,104279001] EXCISED REGION [104279003,104279036]
 second seq =>  [        1,     2065] EXCISED REGION [     2067,     2100]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [104279002,104279002]
 second seq =>         1 nucs [2066,2066]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [104279002,104279002] to [104279003,104279003]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

104276937 TCTGCTTTGACTGCCATTTTGTATATCCCCTATAATTTAACCTACTTATTGATCCCATGA 104276996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCTGCTTTGACTGCCATTTTGTATATCCCCTATAATTTAACCTACTTATTGATCCCATGA 60

104276997 TCTCTGAAAATATTCTTTTTAATTTAATTTAATTTTTAGTTCTGGGATACATGGGCAGGA 104277056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCTCTGAAAATATTCTTTTTAATTTAATTTAATTTTTAGTTCTGGGATACATGGGCAGGA 120

104277057 TATGCAGCCTTGTTATATGGGTAAATGTGTTCCATGGTGGTTTGCTGCACCTATCAAACC 104277116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TATGCAGCCTTGTTATATGGGTAAATGTGTTCCATGGTGGTTTGCTGCACCTATCAAACC 180

104277117 ATCACCTAGGTATTAAGCCCCGCATGCATTAGCTACTCTTTCTGATGCGCTCCCTCCCAC 104277176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATCACCTAGGTATTAAGCCCCGCATGCATTAGCTACTCTTTCTGATGCGCTCCCTCCCAC 240

104277177 CACATCCCCAACCAACGGGCCCCATTATGTGTTGTTCCTTTCTCTGTTTTTATGTGTTCT 104277236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CACATCCCCAACCAACGGGCCCCATTATGTGTTGTTCCTTTCTCTGTTTTTATGTGTTCT 300

104277237 CATTGTTCAGCTTCCACTTATAAGTGAGAACATGTAGTGTTTAATTTTCTGTTCCTGTGT 104277296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CATTGTTCAGCTTCCACTTATAAGTGAGAACATGTAGTGTTTAATTTTCTGTTCCTGTGT 360

104277297 TAGTTTGCTGAGGATAATGGCTTCCAGCTCCATCCCTTTTCCTGCAAAGGACATGATCTC 104277356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TAGTTTGCTGAGGATAATGGCTTCCAGCTCCATCCCTTTTCCTGCAAAGGACATGATCTC 420

104277357 ATTACTTTTTATGACTGCATAGTGTTCCATGGTGTAAATATATCACATTTTCATTTTCCA 104277416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATTACTTTTTATGACTGCATAGTGTTCCATGGTGTAAATATATCACATTTTCATTTTCCA 480

104277417 GTCTATCATTGATGGGCATTTGGGTTAATTCCATGTCTTTTCTACAGTGAATAGTGCTCC 104277476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTCTATCATTGATGGGCATTTGGGTTAATTCCATGTCTTTTCTACAGTGAATAGTGCTCC 540

104277477 AGTGAACATACATGTGCAGGTATCTTTATAATAGAATGATTTATATTCTTTTGGGTACAT 104277536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGTGAACATACATGTGCAGGTATCTTTATAATAGAATGATTTATATTCTTTTGGGTACAT 600

104277537 ACCCAGTAATGGGATTGCTGGGTCAAATGGTATTTCTGGTTCTAGGTCTTTGAGGAATTG 104277596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ACCCAGTAATGGGATTGCTGGGTCAAATGGTATTTCTGGTTCTAGGTCTTTGAGGAATTG 660

104277597 CTACACTGTCTTCCACAAGTAAAACCCAGAACTATAAAAACCCTAGAAGAAAAGCTAGAC 104277656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTACACTGTCTTCCACAAGTAAAACCCAGAACTATAAAAACCCTAGAAGAAAAGCTAGAC 720

104277657 AGTACCATTCAGGACATCGGCACAGGCAAAGATTTCATGACAAAAATGTCAAAAGCAATT 104277716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGTACCATTCAGGACATCGGCACAGGCAAAGATTTCATGACAAAAATGTCAAAAGCAATT 780

104277717 GCAACAAACACAAAACTTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAGAGCTTCTGCACAGCAAA 104277776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GCAACAAACACAAAACTTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAGAGCTTCTGCACAGCAAA 840

104277777 AGAAACTATCATCAGAGTGGACAGACAACCTACAGAATGGGAGAAAAGTTTGCAGTCTAT 104277836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGAAACTATCATCAGAGTGGACAGACAACCTACAGAATGGGAGAAAAGTTTGCAGTCTAT 900

104277837 TCATCCGACAAAGGTTGAATATCCAGAATCTACAAGGAACTTAGTTCCAATTTACAAGAA 104277896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TCATCCGACAAAGGTTGAATATCCAGAATCTACAAGGAACTTAGTTCCAATTTACAAGAA 960

104277897 AAAAAAAAAACACCATTAAAAAGTCGGCAAAGGACATAAACAGACACTTCTCAAAAGAAG 104277956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AAAAAAAAAACACCATTAAAAAGTCGGCAAAGGACATAAACAGACACTTCTCAAAAGAAG 1020

104277957 ACATTACGTGGCCACCAAACATATGAAAAAAAACTCAACCTCACTGATCATTAGAGAAAT 104278016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ACATTACGTGGCCACCAAACATATGAAAAAAAACTCAACCTCACTGATCATTAGAGAAAT 1080

104278017 ACAAATCAAAACCACCAAGAGATACCATCGCATGCCAGTCAGAATGGTGATTATTAAAAA 104278076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ACAAATCAAAACCACCAAGAGATACCATCGCATGCCAGTCAGAATGGTGATTATTAAAAA 1140

104278077 GTCAAGGAACAATAGATGCTGGTGAGGCTGTGGAGAAATAGGAATGCTCTTTTGCACTGT 104278136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GTCAAGGAACAATAGATGCTGGTGAGGCTGTGGAGAAATAGGAATGCTCTTTTGCACTGT 1200

104278137 TGATGGGAATCTCTGAAAATATTTATTCCTTTGAATGAGTTTAGCATAGGATGTTACCCT 104278196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TGATGGGAATCTCTGAAAATATTTATTCCTTTGAATGAGTTTAGCATAGGATGTTACCCT 1260

104278197 TAAAAGGATATTTGCATTCTAGAACACAGAGAGAAAGCTGAAGTAAAACACAAAATCAGT 104278256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TAAAAGGATATTTGCATTCTAGAACACAGAGAGAAAGCTGAAGTAAAACACAAAATCAGT 1320

104278257 TCCAGTGCTTACAGAATTTGGATTATAGAGTGTGATGGAATGCATTATATCTCTTCAAAT 104278316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TCCAGTGCTTACAGAATTTGGATTATAGAGTGTGATGGAATGCATTATATCTCTTCAAAT 1380

104278317 TCATATGCTGAAACCCTAACCCTAAGTGGGACTGTACTTGTAAACAGGGCCTTTAAAAGA 104278376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TCATATGCTGAAACCCTAACCCTAAGTGGGACTGTACTTGTAAACAGGGCCTTTAAAAGA 1440

104278377 AGTAAGCACATTAAAGTGAAACTGGTAAGAGTGTGCCTTGATCCAATCTGATTGGTGTCC 104278436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AGTAAGCACATTAAAGTGAAACTGGTAAGAGTGTGCCTTGATCCAATCTGATTGGTGTCC 1500

104278437 TTATAAGAAGTGGAAATTTGAACACACAAAGAGAAACATCAGGGGAGCTTACACACAGAG 104278496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTATAAGAAGTGGAAATTTGAACACACAAAGAGAAACATCAGGGGAGCTTACACACAGAG 1560

104278497 AAAATCCCATATAAGGACACAGCGAGAAAGCAGCCATGTGCAAGCTAAGGAAAGACTCCG 104278556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AAAATCCCATATAAGGACACAGCGAGAAAGCAGCCATGTGCAAGCTAAGGAAAGACTCCG 1620

104278557 AAGAAACCAAATGTGCTGACTCTTTGAGCTTGAACTTCTAGCCTCCAGAACTGTGTGTAA 104278616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AAGAAACCAAATGTGCTGACTCTTTGAGCTTGAACTTCTAGCCTCCAGAACTGTGTGTAA 1680

104278617 ATCAATTTCTGTTATTTAAACCTCTATGTGGTATTTTGTAATGGCATGACCAGAAAACTA 104278676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ATCAATTTCTGTTATTTAAACCTCTATGTGGTATTTTGTAATGGCATGACCAGAAAACTA 1740

104278677 ATACATAGATAAAATAACATTAAAAATAATCATCTTATAAGTGGTCAGTGGTAAAAATTT 104278736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ATACATAGATAAAATAACATTAAAAATAATCATCTTATAAGTGGTCAGTGGTAAAAATTT 1800

104278737 GTCAGCAACTTTTACCCACAATTAGACCTTTTAAAAAAATAATTTCAAAATCAGGGAAAA 104278796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GTCAGCAACTTTTACCCACAATTAGACCTTTTAAAAAAATAATTTCAAAATCAGGGAAAA 1860

104278797 AATTCAGATTGATTAGTCCTCATGATTTTAAGGTTATCAGTGTCAGAACAAGGAAAGCAG 104278856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AATTCAGATTGATTAGTCCTCATGATTTTAAGGTTATCAGTGTCAGAACAAGGAAAGCAG 1920

104278857 GAGAATAGATAGTTATATAATGTAATAATTATAATGGCTGAGAAAAGTGAAAGACTAATT 104278916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GAGAATAGATAGTTATATAATGTAATAATTATAATGGCTGAGAAAAGTGAAAGACTAATT 1980

104278917 TTACTTGCTTATTCACATAAAATTTCTCAGAATGATAAAATAATGGTACTTTTATTGACA 104278976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TTACTTGCTTATTCACATAAAATTTCTCAGAATGATAAAATAATGGTACTTTTATTGACA 2040

104278977 AAACTACAGAGAACTGCTATAATTG 104279001
          |||||||||||||||||||||||||
     2041 AAACTACAGAGAACTGCTATAATTG 2065

EXCISED REGION

104279003 TAAGTTACATGTGGCTACCTATATGTTACATTGG 104279036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2067 TAAGTTACATGTGGCTACCTATATGTTACATTGG 2100

Alignment time is 1.56852 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [104268199,104289046] =>     20848 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     2097] =>      2097 nucs 'mol-32-3235-086520_2097'

Score:        2097
Aligned:      2097        nucs
Identic:      2097 (100%) nucs =>      1126 (100%)       971 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [104276769,104277894] EXCISED REGION [104277896,104278866]
 second seq =>  [        1,     1126] EXCISED REGION [     1127,     2097]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [104277895,104277895]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        11 nucs [104277895,104277905] to [104277896,104277906]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

104276769 ATATATATTTAGGACTAGGTTTCGATGAAATTAACCTAACAACCAACACTTAATCCTTTG 104276828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATATATATTTAGGACTAGGTTTCGATGAAATTAACCTAACAACCAACACTTAATCCTTTG 60

104276829 AGAAACTACTTTCTCAACTGCATGGAACTTACCTAGGATAAAAATTAAAATTTAGGAGAA 104276888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGAAACTACTTTCTCAACTGCATGGAACTTACCTAGGATAAAAATTAAAATTTAGGAGAA 120

104276889 AGTGATTTCAGAGCTCCAAATCTGTCCTGTCTGCCCTCATTTCCATAATCTGCTTTGACT 104276948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGTGATTTCAGAGCTCCAAATCTGTCCTGTCTGCCCTCATTTCCATAATCTGCTTTGACT 180

104276949 GCCATTTTGTATATCCCCTATAATTTAACCTACTTATTGATCCCATGATCTCTGAAAATA 104277008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCCATTTTGTATATCCCCTATAATTTAACCTACTTATTGATCCCATGATCTCTGAAAATA 240

104277009 TTCTTTTTAATTTAATTTAATTTTTAGTTCTGGGATACATGGGCAGGATATGCAGCCTTG 104277068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTCTTTTTAATTTAATTTAATTTTTAGTTCTGGGATACATGGGCAGGATATGCAGCCTTG 300

104277069 TTATATGGGTAAATGTGTTCCATGGTGGTTTGCTGCACCTATCAAACCATCACCTAGGTA 104277128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTATATGGGTAAATGTGTTCCATGGTGGTTTGCTGCACCTATCAAACCATCACCTAGGTA 360

104277129 TTAAGCCCCGCATGCATTAGCTACTCTTTCTGATGCGCTCCCTCCCACCACATCCCCAAC 104277188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTAAGCCCCGCATGCATTAGCTACTCTTTCTGATGCGCTCCCTCCCACCACATCCCCAAC 420

104277189 CAACGGGCCCCATTATGTGTTGTTCCTTTCTCTGTTTTTATGTGTTCTCATTGTTCAGCT 104277248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CAACGGGCCCCATTATGTGTTGTTCCTTTCTCTGTTTTTATGTGTTCTCATTGTTCAGCT 480

104277249 TCCACTTATAAGTGAGAACATGTAGTGTTTAATTTTCTGTTCCTGTGTTAGTTTGCTGAG 104277308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCCACTTATAAGTGAGAACATGTAGTGTTTAATTTTCTGTTCCTGTGTTAGTTTGCTGAG 540

104277309 GATAATGGCTTCCAGCTCCATCCCTTTTCCTGCAAAGGACATGATCTCATTACTTTTTAT 104277368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GATAATGGCTTCCAGCTCCATCCCTTTTCCTGCAAAGGACATGATCTCATTACTTTTTAT 600

104277369 GACTGCATAGTGTTCCATGGTGTAAATATATCACATTTTCATTTTCCAGTCTATCATTGA 104277428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GACTGCATAGTGTTCCATGGTGTAAATATATCACATTTTCATTTTCCAGTCTATCATTGA 660

104277429 TGGGCATTTGGGTTAATTCCATGTCTTTTCTACAGTGAATAGTGCTCCAGTGAACATACA 104277488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGGGCATTTGGGTTAATTCCATGTCTTTTCTACAGTGAATAGTGCTCCAGTGAACATACA 720

104277489 TGTGCAGGTATCTTTATAATAGAATGATTTATATTCTTTTGGGTACATACCCAGTAATGG 104277548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGTGCAGGTATCTTTATAATAGAATGATTTATATTCTTTTGGGTACATACCCAGTAATGG 780

104277549 GATTGCTGGGTCAAATGGTATTTCTGGTTCTAGGTCTTTGAGGAATTGCTACACTGTCTT 104277608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GATTGCTGGGTCAAATGGTATTTCTGGTTCTAGGTCTTTGAGGAATTGCTACACTGTCTT 840

104277609 CCACAAGTAAAACCCAGAACTATAAAAACCCTAGAAGAAAAGCTAGACAGTACCATTCAG 104277668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CCACAAGTAAAACCCAGAACTATAAAAACCCTAGAAGAAAAGCTAGACAGTACCATTCAG 900

104277669 GACATCGGCACAGGCAAAGATTTCATGACAAAAATGTCAAAAGCAATTGCAACAAACACA 104277728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GACATCGGCACAGGCAAAGATTTCATGACAAAAATGTCAAAAGCAATTGCAACAAACACA 960

104277729 AAACTTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAGAGCTTCTGCACAGCAAAAGAAACTATCAT 104277788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AAACTTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAGAGCTTCTGCACAGCAAAAGAAACTATCAT 1020

104277789 CAGAGTGGACAGACAACCTACAGAATGGGAGAAAAGTTTGCAGTCTATTCATCCGACAAA 104277848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CAGAGTGGACAGACAACCTACAGAATGGGAGAAAAGTTTGCAGTCTATTCATCCGACAAA 1080

104277849 GGTTGAATATCCAGAATCTACAAGGAACTTAGTTCCAATTTACAAG 104277894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GGTTGAATATCCAGAATCTACAAGGAACTTAGTTCCAATTTACAAG 1126

EXCISED REGION

104277896 AAAAAAAAAAACACCATTAAAAAGTCGGCAAAGGACATAAACAGACACTTCTCAAAAGAA 104277955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1127 AAAAAAAAAAACACCATTAAAAAGTCGGCAAAGGACATAAACAGACACTTCTCAAAAGAA 1186

104277956 GACATTACGTGGCCACCAAACATATGAAAAAAAACTCAACCTCACTGATCATTAGAGAAA 104278015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1187 GACATTACGTGGCCACCAAACATATGAAAAAAAACTCAACCTCACTGATCATTAGAGAAA 1246

104278016 TACAAATCAAAACCACCAAGAGATACCATCGCATGCCAGTCAGAATGGTGATTATTAAAA 104278075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1247 TACAAATCAAAACCACCAAGAGATACCATCGCATGCCAGTCAGAATGGTGATTATTAAAA 1306

104278076 AGTCAAGGAACAATAGATGCTGGTGAGGCTGTGGAGAAATAGGAATGCTCTTTTGCACTG 104278135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1307 AGTCAAGGAACAATAGATGCTGGTGAGGCTGTGGAGAAATAGGAATGCTCTTTTGCACTG 1366

104278136 TTGATGGGAATCTCTGAAAATATTTATTCCTTTGAATGAGTTTAGCATAGGATGTTACCC 104278195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1367 TTGATGGGAATCTCTGAAAATATTTATTCCTTTGAATGAGTTTAGCATAGGATGTTACCC 1426

104278196 TTAAAAGGATATTTGCATTCTAGAACACAGAGAGAAAGCTGAAGTAAAACACAAAATCAG 104278255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1427 TTAAAAGGATATTTGCATTCTAGAACACAGAGAGAAAGCTGAAGTAAAACACAAAATCAG 1486

104278256 TTCCAGTGCTTACAGAATTTGGATTATAGAGTGTGATGGAATGCATTATATCTCTTCAAA 104278315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1487 TTCCAGTGCTTACAGAATTTGGATTATAGAGTGTGATGGAATGCATTATATCTCTTCAAA 1546

104278316 TTCATATGCTGAAACCCTAACCCTAAGTGGGACTGTACTTGTAAACAGGGCCTTTAAAAG 104278375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1547 TTCATATGCTGAAACCCTAACCCTAAGTGGGACTGTACTTGTAAACAGGGCCTTTAAAAG 1606

104278376 AAGTAAGCACATTAAAGTGAAACTGGTAAGAGTGTGCCTTGATCCAATCTGATTGGTGTC 104278435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1607 AAGTAAGCACATTAAAGTGAAACTGGTAAGAGTGTGCCTTGATCCAATCTGATTGGTGTC 1666

104278436 CTTATAAGAAGTGGAAATTTGAACACACAAAGAGAAACATCAGGGGAGCTTACACACAGA 104278495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1667 CTTATAAGAAGTGGAAATTTGAACACACAAAGAGAAACATCAGGGGAGCTTACACACAGA 1726

104278496 GAAAATCCCATATAAGGACACAGCGAGAAAGCAGCCATGTGCAAGCTAAGGAAAGACTCC 104278555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1727 GAAAATCCCATATAAGGACACAGCGAGAAAGCAGCCATGTGCAAGCTAAGGAAAGACTCC 1786

104278556 GAAGAAACCAAATGTGCTGACTCTTTGAGCTTGAACTTCTAGCCTCCAGAACTGTGTGTA 104278615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1787 GAAGAAACCAAATGTGCTGACTCTTTGAGCTTGAACTTCTAGCCTCCAGAACTGTGTGTA 1846

104278616 AATCAATTTCTGTTATTTAAACCTCTATGTGGTATTTTGTAATGGCATGACCAGAAAACT 104278675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1847 AATCAATTTCTGTTATTTAAACCTCTATGTGGTATTTTGTAATGGCATGACCAGAAAACT 1906

104278676 AATACATAGATAAAATAACATTAAAAATAATCATCTTATAAGTGGTCAGTGGTAAAAATT 104278735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1907 AATACATAGATAAAATAACATTAAAAATAATCATCTTATAAGTGGTCAGTGGTAAAAATT 1966

104278736 TGTCAGCAACTTTTACCCACAATTAGACCTTTTAAAAAAATAATTTCAAAATCAGGGAAA 104278795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1967 TGTCAGCAACTTTTACCCACAATTAGACCTTTTAAAAAAATAATTTCAAAATCAGGGAAA 2026

104278796 AAATTCAGATTGATTAGTCCTCATGATTTTAAGGTTATCAGTGTCAGAACAAGGAAAGCA 104278855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2027 AAATTCAGATTGATTAGTCCTCATGATTTTAAGGTTATCAGTGTCAGAACAAGGAAAGCA 2086

104278856 GGAGAATAGAT 104278866
          |||||||||||
     2087 GGAGAATAGAT 2097

Alignment time is 1.54547 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [104268199,104289046] =>     20848 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     2842] =>      2842 nucs 'mol-32-3235-107073_2842'

Score:        2830
Aligned:      2841        nucs
Identic:      2840 (100%) nucs =>       909 (100%)      1931 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [104278093,104279001] EXCISED REGION [104279003,104280934]
 second seq =>  [        1,      909] EXCISED REGION [      911,     2842]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [104279002,104279002]
 second seq =>         1 nucs [910,910]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [104279002,104279002] to [104279003,104279003]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

104278093 TGCTGGTGAGGCTGTGGAGAAATAGGAATGCTCTTTTGCACTGTTGATGGGAATCTCTGA 104278152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGCTGGTGAGGCTGTGGAGAAATAGGAATGCTCTTTTGCACTGTTGATGGGAATCTCTGA 60

104278153 AAATATTTATTCCTTTGAATGAGTTTAGCATAGGATGTTACCCTTAAAAGGATATTTGCA 104278212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAATATTTATTCCTTTGAATGAGTTTAGCATAGGATGTTACCCTTAAAAGGATATTTGCA 120

104278213 TTCTAGAACACAGAGAGAAAGCTGAAGTAAAACACAAAATCAGTTCCAGTGCTTACAGAA 104278272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTCTAGAACACAGAGAGAAAGCTGAAGTAAAACACAAAATCAGTTCCAGTGCTTACAGAA 180

104278273 TTTGGATTATAGAGTGTGATGGAATGCATTATATCTCTTCAAATTCATATGCTGAAACCC 104278332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTTGGATTATAGAGTGTGATGGAATGCATTATATCTCTTCAAATTCATATGCTGAAACCC 240

104278333 TAACCCTAAGTGGGACTGTACTTGTAAACAGGGCCTTTAAAAGAAGTAAGCACATTAAAG 104278392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TAACCCTAAGTGGGACTGTACTTGTAAACAGGGCCTTTAAAAGAAGTAAGCACATTAAAG 300

104278393 TGAAACTGGTAAGAGTGTGCCTTGATCCAATCTGATTGGTGTCCTTATAAGAAGTGGAAA 104278452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGAAACTGGTAAGAGTGTGCCTTGATCCAATCTGATTGGTGTCCTTATAAGAAGTGGAAA 360

104278453 TTTGAACACACAAAGAGAAACATCAGGGGAGCTTACACACAGAGAAAATCCCATATAAGG 104278512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTTGAACACACAAAGAGAAACATCAGGGGAGCTTACACACAGAGAAAATCCCATATAAGG 420

104278513 ACACAGCGAGAAAGCAGCCATGTGCAAGCTAAGGAAAGACTCCGAAGAAACCAAATGTGC 104278572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACACAGCGAGAAAGCAGCCATGTGCAAGCTAAGGAAAGACTCCGAAGAAACCAAATGTGC 480

104278573 TGACTCTTTGAGCTTGAACTTCTAGCCTCCAGAACTGTGTGTAAATCAATTTCTGTTATT 104278632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGACTCTTTGAGCTTGAACTTCTAGCCTCCAGAACTGTGTGTAAATCAATTTCTGTTATT 540

104278633 TAAACCTCTATGTGGTATTTTGTAATGGCATGACCAGAAAACTAATACATAGATAAAATA 104278692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TAAACCTCTATGTGGTATTTTGTAATGGCATGACCAGAAAACTAATACATAGATAAAATA 600

104278693 ACATTAAAAATAATCATCTTATAAGTGGTCAGTGGTAAAAATTTGTCAGCAACTTTTACC 104278752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ACATTAAAAATAATCATCTTATAAGTGGTCAGTGGTAAAAATTTGTCAGCAACTTTTACC 660

104278753 CACAATTAGACCTTTTAAAAAAATAATTTCAAAATCAGGGAAAAAATTCAGATTGATTAG 104278812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CACAATTAGACCTTTTAAAAAAATAATTTCAAAATCAGGGAAAAAATTCAGATTGATTAG 720

104278813 TCCTCATGATTTTAAGGTTATCAGTGTCAGAACAAGGAAAGCAGGAGAATAGATAGTTAT 104278872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCCTCATGATTTTAAGGTTATCAGTGTCAGAACAAGGAAAGCAGGAGAATAGATAGTTAT 780

104278873 ATAATGTAATAATTATAATGGCTGAGAAAAGTGAAAGACTAATTTTACTTGCTTATTCAC 104278932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATAATGTAATAATTATAATGGCTGAGAAAAGTGAAAGACTAATTTTACTTGCTTATTCAC 840

104278933 ATAAAATTTCTCAGAATGATAAAATAATGGTACTTTTATTGACAAAACTACAGAGAACTG 104278992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATAAAATTTCTCAGAATGATAAAATAATGGTACTTTTATTGACAAAACTACAGAGAACTG 900

104278993 CTATAATTG 104279001
          |||||||||
      901 CTATAATTG 909

EXCISED REGION

104279003 TAAGTTACATGTGGCTACCTATATGTTACATTGGTTATCTATATATGCTTGTTATAACAA 104279062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      911 TAAGTTACATGTGGCTACCTATATGTTACATTGGTTATCTATATATGCTTGTTATAACAA 970

104279063 TGTACTTTTTTGTATACCTCTACTTGGAAATGTATTATAGTTAAGATTCATTCATTCGAC 104279122
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      971 TGTACTTTTTTGTATACCTTTACTTGGAAATGTATTATAGTTAAGATTCATTCATTCGAC 1030

104279123 TAATATGTATTGAGTGCCTACTATGTGCCAGGCACATGTTTTAGCTAATGTTGATGAATG 104279182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1031 TAATATGTATTGAGTGCCTACTATGTGCCAGGCACATGTTTTAGCTAATGTTGATGAATG 1090

104279183 GTATGGATAAAGGCCTTGACACATTCATATTTAGAAAGATGGAAATAAATACATCAACAA 104279242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1091 GTATGGATAAAGGCCTTGACACATTCATATTTAGAAAGATGGAAATAAATACATCAACAA 1150

104279243 CATGCAATCTAATAGAGTTAGTAATGATAAAGATAAAACAGAATATAGAGAGTAAATAAG 104279302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1151 CATGCAATCTAATAGAGTTAGTAATGATAAAGATAAAACAGAATATAGAGAGTAAATAAG 1210

104279303 GGACCTATTTTCTATATGGTGGTCAAAAATGGACCCTGTGATTACAGCTGAATACAGACT 104279362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1211 GGACCTATTTTCTATATGGTGGTCAAAAATGGACCCTGTGATTACAGCTGAATACAGACT 1270

104279363 TGAATAAAACGAGAAAGCAAGTAATTCACATATCTGAGGAGAAAACTCTTTAGACACAGG 104279422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1271 TGAATAAAACGAGAAAGCAAGTAATTCACATATCTGAGGAGAAAACTCTTTAGACACAGG 1330

104279423 GACCAGAAAGTTCAGGGGCCTTCAGCCAGAAATATTATTGACATGTGTAAATGAAGTAGC 104279482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1331 GACCAGAAAGTTCAGGGGCCTTCAGCCAGAAATATTATTGACATGTGTAAATGAAGTAGC 1390

104279483 AAAGATAGTTGTTTGAGGAGGTGAAAAGGAAAATAGTGAAGATCAAATTGAAGAGACAAT 104279542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1391 AAAGATAGTTGTTTGAGGAGGTGAAAAGGAAAATAGTGAAGATCAAATTGAAGAGACAAT 1450

104279543 CAAGGCCATGCAGACTGTGGCAAGAACTTTGGAACTTCTGTTTATTATCCGAAGAGGCCA 104279602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1451 CAAGGCCATGCAGACTGTGGCAAGAACTTTGGAACTTCTGTTTATTATCCGAAGAGGCCA 1510

104279603 TTGGAAGGTTATAAACAAGATATAAACATGATCTGACCTGTGTTTTGAAAGGATTTTTCT 104279662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1511 TTGGAAGGTTATAAACAAGATATAAACATGATCTGACCTGTGTTTTGAAAGGATTTTTCT 1570

104279663 GGATAGGGAGTGAAAATTATATTGAAAGTGAAAAGATTGTAGATATAGTAGCAGTGGTAG 104279722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1571 GGATAGGGAGTGAAAATTATATTGAAAGTGAAAAGATTGTAGATATAGTAGCAGTGGTAG 1630

104279723 GACTTGGGATATATATTACATACATTAGAGCTATCCTTAACTGTATCAACTGGTCTCATT 104279782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1631 GACTTGGGATATATATTACATACATTAGAGCTATCCTTAACTGTATCAACTGGTCTCATT 1690

104279783 GGGTATGAGAAGAAGATCAAAGTCAAGGCCAATTTTAATATGTTTGGCCTGAGCAAGAAG 104279842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1691 GGGTATGAGAAGAAGATCAAAGTCAAGGCCAATTTTAATATGTTTGGCCTGAGCAAGAAG 1750

104279843 GTGATATCCTTTCATGAAATGGGGATCAGTGAGAGGGGAGAAATTTACAGAGAAAAATTA 104279902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1751 GTGATATCCTTTCATGAAATGGGGATCAGTGAGAGGGGAGAAATTTACAGAGAAAAATTA 1810

104279903 AGAGTTTGGTTTTGGACCTATTAAAATTTGAGAAACCTGTGAGAAGTTTAAGAGGAAATG 104279962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1811 AGAGTTTGGTTTTGGACCTATTAAAATTTGAGAAACCTGTGAGAAGTTTAAGAGGAAATG 1870

104279963 TTGATGAAGAGGAAGTTCGAAATAAGAGTCGAGAGTCCAGGGAATTGGTTTGGAGCTGGA 104280022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1871 TTGATGAAGAGGAAGTTCGAAATAAGAGTCGAGAGTCCAGGGAATTGGTTTGGAGCTGGA 1930

104280023 GATTTTTTAAATTGAGAAGTTATTGGTAGATACAAGATATTTGCAGTCATGAGAGCTAAC 104280082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1931 GATTTTTTAAATTGAGAAGTTATTGGTAGATACAAGATATTTGCAGTCATGAGAGCTAAC 1990

104280083 AGTTACCTAGGGAGGGAGTAAAGATGAAGAGCTGAAATTTAAGGATAAAATTCCAGGGAT 104280142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1991 AGTTACCTAGGGAGGGAGTAAAGATGAAGAGCTGAAATTTAAGGATAAAATTCCAGGGAT 2050

104280143 CTAGAAATTTGGAAAATTGGAAGAAGAGGTGAAGCCAGAAAAGACTAAGAAGGAGAGGTC 104280202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2051 CTAGAAATTTGGAAAATTGGAAGAAGAGGTGAAGCCAGAAAAGACTAAGAAGGAGAGGTC 2110

104280203 AAGGAAGTAGGTGGGACAATAAAAGGATGTAGAATCTTGGCAACTGAGTGATGAAAAAAT 104280262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2111 AAGGAAGTAGGTGGGACAATAAAAGGATGTAGAATCTTGGCAACTGAGTGATGAAAAAAT 2170

104280263 TCTTTAAAGAATCAGAAAGTGACTGGTAAACTGGGTCAAAAGCTAGAGATTGAGTAAAAA 104280322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2171 TCTTTAAAGAATCAGAAAGTGACTGGTAAACTGGGTCAAAAGCTAGAGATTGAGTAAAAA 2230

104280323 CTGAAACTTTTCTTCATTTTAACATACTTTCGCTTTCAAGAAAATTATTACACTAAGGGG 104280382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2231 CTGAAACTTTTCTTCATTTTAACATACTTTCGCTTTCAAGAAAATTATTACACTAAGGGG 2290

104280383 GAATAGCAGAGCAATCTATTAGTGTTGCAGAGGACAGATGTGGCTTTTTCAGATGCTCAG 104280442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2291 GAATAGCAGAGCAATCTATTAGTGTTGCAGAGGACAGATGTGGCTTTTTCAGATGCTCAG 2350

104280443 AAGCACCCAATAAATTTGAAGAACAGACAGGTGTTCCTGAGAACTCAGGGAAGAATTTGG 104280502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2351 AAGCACCCAATAAATTTGAAGAACAGACAGGTGTTCCTGAGAACTCAGGGAAGAATTTGG 2410

104280503 CCAATGAAGGTCACAGGACACCTGTTCTGAAAATGTCCTACTGAAAATGTTCTTTAGAAG 104280562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2411 CCAATGAAGGTCACAGGACACCTGTTCTGAAAATGTCCTACTGAAAATGTTCTTTAGAAG 2470

104280563 TTACAGTGTTTTCATCAAGACAATGAGATTTCACTTTATAACTTTACTCAGTGCCCAGGT 104280622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2471 TTACAGTGTTTTCATCAAGACAATGAGATTTCACTTTATAACTTTACTCAGTGCCCAGGT 2530

104280623 TACCTAAAAAGTATTTTTTCATCTTCAAGGGAGAAAAAAACTTTGTTATTAGGTGATATA 104280682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2531 TACCTAAAAAGTATTTTTTCATCTTCAAGGGAGAAAAAAACTTTGTTATTAGGTGATATA 2590

104280683 ATTAGAATGTTTTAAAGAATGACATTAGTTTGCATTTCACAGCCTTACTAGGTAATATGA 104280742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2591 ATTAGAATGTTTTAAAGAATGACATTAGTTTGCATTTCACAGCCTTACTAGGTAATATGA 2650

104280743 GAAGAAAATTCCAGTTTTATATTCTCTCGTATCTCTGAATTTCTTTCTAATTTATGGAAA 104280802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2651 GAAGAAAATTCCAGTTTTATATTCTCTCGTATCTCTGAATTTCTTTCTAATTTATGGAAA 2710

104280803 CAGTCTAATTTATGGAAACAGAATAATTAAATGCCCATGATAAATTTTCAAAGTTTATGA 104280862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2711 CAGTCTAATTTATGGAAACAGAATAATTAAATGCCCATGATAAATTTTCAAAGTTTATGA 2770

104280863 CTTTCACTTGCATGGAATTAAAAATTATTTGCTGTTTTGTTAGTATTACTGTTAAGTGCC 104280922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2771 CTTTCACTTGCATGGAATTAAAAATTATTTGCTGTTTTGTTAGTATTACTGTTAAGTGCC 2830

104280923 TTCCATGCTGCA 104280934
          ||||||||||||
     2831 TTCCATGCTGCA 2842

Alignment time is 2.16512 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [104268199,104289046] =>     20848 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     5068] =>      5068 nucs 'mol-32-3240-021785_5068'

Score:        5033
Aligned:      5066        nucs
Identic:      5063 (100%) nucs =>      3457 (100%)      1606 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [104273295,104276754] EXCISED REGION [104276755,104278360]
 second seq =>  [        1,     3460] EXCISED REGION [     3463,     5068]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [3461,3462]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        22 nucs [3461,3482] to [3463,3484]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [104276754,104276754] to [104276755,104276755]
 second seq =>         1 nucs [3460,3460] to [3463,3463]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

104273295 TACTGCTATAAAGAAATACCCAAGACTGGGTAATTTATGAAGTAAAAGAGGTTTAATGGA 104273354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TACTGCTATAAAGAAATACCCAAGACTGGGTAATTTATGAAGTAAAAGAGGTTTAATGGA 60

104273355 ATCATGGTTCCACATGGCTGGGGTGGCCTCACAGTCATGACGGAAGGTGAAGGAGGAGCA 104273414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
       61 ATCATGGTTCCACATGGCTGGGGTGGCCTCACAGTCATGACGGAAGGTGAAGGAAGAGCA 120

104273415 AAAGCACATCTTACGTGGCAGCAGGCAGGAGAGCGTGTACAGGGAAACTACCCTTTATAG 104273474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAAGCACATCTTACGTGGCAGCAGGCAGGAGAGCGTGTACAGGGAAACTACCCTTTATAG 180

104273475 AAACCATTGGATCTCGTGAGACTTATTCACTATATCACAAGAACAGCATGGGAAAAACCC 104273534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAACCATTGGATCTCGTGAGACTTATTCACTATATCACAAGAACAGCATGGGAAAAACCC 240

104273535 ATCCTCATGATTCAGTTGCCTCCCACTAGGTCCCTCCCATGACACATGGAGTATGTGGGA 104273594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATCCTCATGATTCAGTTGCCTCCCACTAGGTCCCTCCCATGACACATGGAGTATGTGGGA 300

104273595 GTTACAATTCAAGATGAGATTTGGGTGGAGACACAGCCAAACCATATCTGTACCTGACCA 104273654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTTACAATTCAAGATGAGATTTGGGTGGAGACACAGCCAAACCATATCTGTACCTGACCA 360

104273655 AGTACCTCTCAAGTTTGAGGCAGCTACATAACCAACAGATGAAGTCTTAGTAAAAGCACA 104273714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGTACCTCTCAAGTTTGAGGCAGCTACATAACCAACAGATGAAGTCTTAGTAAAAGCACA 420

104273715 GAACTAGAGTTCAAGTGACCTGGTTTGCACCCTGAGTGCCATCATCATCAAGCATGAAAA 104273774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GAACTAGAGTTCAAGTGACCTGGTTTGCACCCTGAGTGCCATCATCATCAAGCATGAAAA 480

104273775 CCTTATGCAGATCAGTTCACCTTTTTTGGGATGCTTCCTCATTTATAAAATGAAAGATTT 104273834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCTTATGCAGATCAGTTCACCTTTTTTGGGATGCTTCCTCATTTATAAAATGAAAGATTT 540

104273835 TAACTGAGTAATTGCTCAGATTCCTAGAACTGTGTAACTCTAAAAAGATTTCCATAACCC 104273894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TAACTGAGTAATTGCTCAGATTCCTAGAACTGTGTAACTCTAAAAAGATTTCCATAACCC 600

104273895 TAGGTTATTTTTTCCTGGTTAACAAATTTTTTGGTTAGACAAAAACAACAATAGCTTATA 104273954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TAGGTTATTTTTTCCTGGTTAACAAATTTTTTGGTTAGACAAAAACAACAATAGCTTATA 660

104273955 CATCATGTAAATCGTTGTTTCTTTGTGCAGAATTAGGGGCTATATCTACCATAGGAGTAG 104274014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CATCATGTAAATCGTTGTTTCTTTGTGCAGAATTAGGGGCTATATCTACCATAGGAGTAG 720

104274015 TTGGCTCAGTGGCTAGGCCCTTGAGTCTGGAGTAAAAGGCTACAGCCGAGACAGTCTCAT 104274074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTGGCTCAGTGGCTAGGCCCTTGAGTCTGGAGTAAAAGGCTACAGCCGAGACAGTCTCAT 780

104274075 AGTCATGTGATAAATTGCTTCTGTCTTCTATACTATTAAAGCTCTTAGAAGTTATGGCAA 104274134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGTCATGTGATAAATTGCTTCTGTCTTCTATACTATTAAAGCTCTTAGAAGTTATGGCAA 840

104274135 ACTACTTATTTCACTCAGGTTTGTATTATATTATGTCAAAACATATCTATCCTTCTCCTA 104274194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ACTACTTATTTCACTCAGGTTTGTATTATATTATGTCAAAACATATCTATCCTTCTCCTA 900

104274195 TCACTGTGCTACTATAATGTACTTCTTTAGGGACATGACCATGCCGTTTAACTTACATCT 104274254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TCACTGTGCTACTATAATGTACTTCTTTAGGGACATGACCATGCCGTTTAACTTACATCT 960

104274255 CTCTCGCTGTACCAAATAAGACTCCCCTCACAATTTACTCAGTAAATGTTTGTGGAGTAA 104274314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTCTCGCTGTACCAAATAAGACTCCCCTCACAATTTACTCAGTAAATGTTTGTGGAGTAA 1020

104274315 GATTTTCACTGGCCTCATTTCTCCAACTATCCTGCTTGGCAACTAATCCACAGTCATATA 104274374
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     1021 GATTTTCACTGGCCTCATTTCTCCAACTATCCTGCTTGGCAACTAATCCACGGTCATATA 1080

104274375 GGCCTCTTTTCACTTCTTTTAGTTTCTTAAATTTGGGCCTCCGCACCCCCACTCCAGCTC 104274434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GGCCTCTTTTCACTTCTTTTAGTTTCTTAAATTTGGGCCTCCGCACCCCCACTCCAGCTC 1140

104274435 ATGCTATTTATTCTACTTTTAATGATATACTGCCTGCTCGATTCCCATTCCCAGCTCCAA 104274494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATGCTATTTATTCTACTTTTAATGATATACTGCCTGCTCGATTCCCATTCCCAGCTCCAA 1200

104274495 CATTCACACTCTTCATCTTGCCCATCTTTCAGAACTCAGCTTCACTATCTCTTAGGTGAC 104274554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CATTCACACTCTTCATCTTGCCCATCTTTCAGAACTCAGCTTCACTATCTCTTAGGTGAC 1260

104274555 CTTGAATAAGATCTTAATACTTTTCCTTTCCAACAAATAACCCAGTTTTAATTATCTAAT 104274614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTTGAATAAGATCTTAATACTTTTCCTTTCCAACAAATAACCCAGTTTTAATTATCTAAT 1320

104274615 TGATTATGATATCACTTATTCATCACTGTGTATCAACTCATCCCAGATTCAATGGCTTCA 104274674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGATTATGATATCACTTATTCATCACTGTGTATCAACTCATCCCAGATTCAATGGCTTCA 1380

104274675 AACAGAGAAACAAAAAAATACATTTTACTGCTTACATTCAGTAGGTTGGCCAGGTATTAC 104274734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AACAGAGAAACAAAAAAATACATTTTACTGCTTACATTCAGTAGGTTGGCCAGGTATTAC 1440

104274735 ATCAGCTGCTCTCTCCTGGGTTCACTCAACTGGAAGGATGAAAATGGCTTTATTCACATG 104274794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATCAGCTGCTCTCTCCTGGGTTCACTCAACTGGAAGGATGAAAATGGCTTTATTCACATG 1500

104274795 TCTGGCAGTTGGTGCTTTTGCTGATTGATGGCCTCTCATTCTCCAGTACGTTAGACAAGT 104274854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TCTGGCAGTTGGTGCTTTTGCTGATTGATGGCCTCTCATTCTCCAGTACGTTAGACAAGT 1560

104274855 TTTCTTATGTTGTAGTCTCAGGACATTATTACAACTGGCAAAAACAGAAACTGTAAGGTG 104274914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTTCTTATGTTGTAGTCTCAGGACATTATTACAACTGGCAAAAACAGAAACTGTAAGGTG 1620

104274915 TCTAAAACCTAGGATCCAGAATTTACACACTAAGCTTCTGTCTCATTCTATTAATTAAAG 104274974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TCTAAAACCTAGGATCCAGAATTTACACACTAAGCTTCTGTCTCATTCTATTAATTAAAG 1680

104274975 CAATTTATAAGGCCAGCCCAAATTCAAGAGAGTGGAGGAACAGACTCCACTTTTTGTTGG 104275034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CAATTTATAAGGCCAGCCCAAATTCAAGAGAGTGGAGGAACAGACTCCACTTTTTGTTGG 1740

104275035 AAGGAACAAAAACATTACATTGCTCTGGGACATGGACACAAGGAGGCTTGACTCATGGGG 104275094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AAGGAACAAAAACATTACATTGCTCTGGGACATGGACACAAGGAGGCTTGACTCATGGGG 1800

104275095 ACCATATTATAACTCTCTACTACATTATGTAAAATTACTAATTTAATTTCTATATTCCCC 104275154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ACCATATTATAACTCTCTACTACATTATGTAAAATTACTAATTTAATTTCTATATTCCCC 1860

104275155 ACTAGACTATCTGTGTATATGAATAGGGACCATGCATTTCCTAATTTATGTTATATTGCC 104275214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ACTAGACTATCTGTGTATATGAATAGGGACCATGCATTTCCTAATTTATGTTATATTGCC 1920

104275215 AGCATTTAATGCAGTCTTTATATGTGCTAGGCATTAATAAATATTTGTTGAATGAATAAT 104275274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AGCATTTAATGCAGTCTTTATATGTGCTAGGCATTAATAAATATTTGTTGAATGAATAAT 1980

104275275 TAAATGGCTAAATTAATAACAGAGTGGATGAATTAACTTGAAAAAAGATTTCATGAACTA 104275334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TAAATGGCTAAATTAATAACAGAGTGGATGAATTAACTTGAAAAAAGATTTCATGAACTA 2040

104275335 TCAGCATGAAGATTTATCCACAAAAATAGAGAAGTGTTTCTTTTTTTGACCACATGAAAA 104275394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TCAGCATGAAGATTTATCCACAAAAATAGAGAAGTGTTTCTTTTTTTGACCACATGAAAA 2100

104275395 ACTAGAAACCATGTAAGCAGAAGTTATCTAAGTTAACTTTTATTGAGTAACTGGACACAG 104275454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     2101 ACTAGAAACCATGTAAGCAGAAGTTATCTAAGTTAACTTTTATTGAGTAACTGGACTCAG 2160

104275455 AATTCAGGTGCTCTGTTGTTTTCTATTGCTGCTATAACAAAACGTCACAAACAGCAAATT 104275514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AATTCAGGTGCTCTGTTGTTTTCTATTGCTGCTATAACAAAACGTCACAAACAGCAAATT 2220

104275515 ACTGCAACATGAATTTATTAGCTCACAGTTCTACCAGTCAGAATTCTGGTGTGGTTTAAT 104275574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ACTGCAACATGAATTTATTAGCTCACAGTTCTACCAGTCAGAATTCTGGTGTGGTTTAAT 2280

104275575 TTAGTTCTCTGCTCAGGTTTCTCACAAGCCAGAAATTAAAATAGCAACTGACTAGGCTCT 104275634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TTAGTTCTCTGCTCAGGTTTCTCACAAGCCAGAAATTAAAATAGCAACTGACTAGGCTCT 2340

104275635 TATCTGTAAGATCTGATGTCGAAACAATTTCCAAGCTGAATGATGTTTTTAGTAGAACTT 104275694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TATCTGTAAGATCTGATGTCGAAACAATTTCCAAGCTGAATGATGTTTTTAGTAGAACTT 2400

104275695 AGCTCCTTGCAGTTGCAGAACTAAGGTTCTCCCTTCTTGCTGGCTGGTGGCTGGGAGTCA 104275754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AGCTCCTTGCAGTTGCAGAACTAAGGTTCTCCCTTCTTGCTGGCTGGTGGCTGGGAGTCA 2460

104275755 CCCTCAGCTCCTCCAGTGAGCCCACATTCTTTCCGCATGTCTTCCTTTATCTTCAAGCCA 104275814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CCCTCAGCTCCTCCAGTGAGCCCACATTCTTTCCGCATGTCTTCCTTTATCTTCAAGCCA 2520

104275815 GCAACAATGCATCGGGCCCTTCTCTGCTCAGATCTCCCTGACTTCCTCTGCTGTCCTCAC 104275874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GCAACAATGCATCGGGCCCTTCTCTGCTCAGATCTCCCTGACTTCCTCTGCTGTCCTCAC 2580

104275875 CAAGGAGAATACTTTGATTTAAGGACTCCTGTAATTACATTGGCCCACCTGGGAAATCTA 104275934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CAAGGAGAATACTTTGATTTAAGGACTCCTGTAATTACATTGGCCCACCTGGGAAATCTA 2640

104275935 GGCTAATCTCTGTATCTTAAACTCAATTGATTCTTAACCTTAATTACCTCTGCAATGTCA 104275994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GGCTAATCTCTGTATCTTAAACTCAATTGATTCTTAACCTTAATTACCTCTGCAATGTCA 2700

104275995 TTTTGCCATGTAATATAACATATTCACAGGTGTAACACCAGGGAGCAAAGGTCAGAGAGC 104276054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TTTTGCCATGTAATATAACATATTCACAGGTGTAACACCAGGGAGCAAAGGTCAGAGAGC 2760

104276055 CAAAATTCTGTCTACCGTTGATACTCAACAGCAATAAACATTCAGCTGTAGGAAACCTGA 104276114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CAAAATTCTGTCTACCGTTGATACTCAACAGCAATAAACATTCAGCTGTAGGAAACCTGA 2820

104276115 AGTCTCCAGAGAGATAATTTAGATAAAATACAGCCTTAAGTATAGGACAGACCTGCTTAG 104276174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 AGTCTCCAGAGAGATAATTTAGATAAAATACAGCCTTAAGTATAGGACAGACCTGCTTAG 2880

104276175 AATCAGGAGTCTAAATTTTTTTGGTTACACAAATATAGCCAATTCTCTTTACCATTATAA 104276234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 AATCAGGAGTCTAAATTTTTTTGGTTACACAAATATAGCCAATTCTCTTTACCATTATAA 2940

104276235 ATCTCAGCTTTATTTTTTTAATCTGAAAAATGCAAATATTGCTGCATCTCTATCATGTTG 104276294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 ATCTCAGCTTTATTTTTTTAATCTGAAAAATGCAAATATTGCTGCATCTCTATCATGTTG 3000

104276295 CTTTTAACATTAATATAAGAAACATACATATAATCAGCAAAAAAGATTTTTAAAACCTTA 104276354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CTTTTAACATTAATATAAGAAACATACATATAATCAGCAAAAAAGATTTTTAAAACCTTA 3060

104276355 CATATCAAAGATTACAAAAGAGAATTAGGAGAAAGAACAAAGTCTAAAGATGTTGAGAGA 104276414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 CATATCAAAGATTACAAAAGAGAATTAGGAGAAAGAACAAAGTCTAAAGATGTTGAGAGA 3120

104276415 GTACCCTAAAGTTATCTATTTATTTATTCACTTGTTCAAAAATATTTAGGACTAGGCCAG 104276474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 GTACCCTAAAGTTATCTATTTATTTATTCACTTGTTCAAAAATATTTAGGACTAGGCCAG 3180

104276475 CCACAGTGGCTCATGCCTGTAATTCCAGCACTTTGGGGGGCCAAGGTGGGTGGATCACTT 104276534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 CCACAGTGGCTCATGCCTGTAATTCCAGCACTTTGGGGGGCCAAGGTGGGTGGATCACTT 3240

104276535 GAAGTCAGGAGTTTGAGATCAACCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAAT 104276594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 GAAGTCAGGAGTTTGAGATCAACCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAAT 3300

104276595 ACAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCACGTGCCTGTAATCCCAGCTATTTGGGAGACTGCA 104276654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 ACAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCACGTGCCTGTAATCCCAGCTATTTGGGAGACTGCA 3360

104276655 TCAGGAAAATTGCTTGAATCCAGGAGGCGGAGGGTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCACTG 104276714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TCAGGAAAATTGCTTGAATCCAGGAGGCGGAGGGTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCACTG 3420

104276715 CACTCCAGCCTGGACAACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAA 104276754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 CACTCCAGCCTGGACAACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAA 3460

EXCISED REGION

104276755 ATATATATATATATATATATATTTAGGACTAGGTTTCGATGAAATTAACCTAACAACCAA 104276814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3463 ATATATATATATATATATATATTTAGGACTAGGTTTCGATGAAATTAACCTAACAACCAA 3522

104276815 CACTTAATCCTTTGAGAAACTACTTTCTCAACTGCATGGAACTTACCTAGGATAAAAATT 104276874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3523 CACTTAATCCTTTGAGAAACTACTTTCTCAACTGCATGGAACTTACCTAGGATAAAAATT 3582

104276875 AAAATTTAGGAGAAAGTGATTTCAGAGCTCCAAATCTGTCCTGTCTGCCCTCATTTCCAT 104276934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3583 AAAATTTAGGAGAAAGTGATTTCAGAGCTCCAAATCTGTCCTGTCTGCCCTCATTTCCAT 3642

104276935 AATCTGCTTTGACTGCCATTTTGTATATCCCCTATAATTTAACCTACTTATTGATCCCAT 104276994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3643 AATCTGCTTTGACTGCCATTTTGTATATCCCCTATAATTTAACCTACTTATTGATCCCAT 3702

104276995 GATCTCTGAAAATATTCTTTTTAATTTAATTTAATTTTTAGTTCTGGGATACATGGGCAG 104277054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3703 GATCTCTGAAAATATTCTTTTTAATTTAATTTAATTTTTAGTTCTGGGATACATGGGCAG 3762

104277055 GATATGCAGCCTTGTTATATGGGTAAATGTGTTCCATGGTGGTTTGCTGCACCTATCAAA 104277114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3763 GATATGCAGCCTTGTTATATGGGTAAATGTGTTCCATGGTGGTTTGCTGCACCTATCAAA 3822

104277115 CCATCACCTAGGTATTAAGCCCCGCATGCATTAGCTACTCTTTCTGATGCGCTCCCTCCC 104277174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3823 CCATCACCTAGGTATTAAGCCCCGCATGCATTAGCTACTCTTTCTGATGCGCTCCCTCCC 3882

104277175 ACCACATCCCCAACCAACGGGCCCCATTATGTGTTGTTCCTTTCTCTGTTTTTATGTGTT 104277234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3883 ACCACATCCCCAACCAACGGGCCCCATTATGTGTTGTTCCTTTCTCTGTTTTTATGTGTT 3942

104277235 CTCATTGTTCAGCTTCCACTTATAAGTGAGAACATGTAGTGTTTAATTTTCTGTTCCTGT 104277294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3943 CTCATTGTTCAGCTTCCACTTATAAGTGAGAACATGTAGTGTTTAATTTTCTGTTCCTGT 4002

104277295 GTTAGTTTGCTGAGGATAATGGCTTCCAGCTCCATCCCTTTTCCTGCAAAGGACATGATC 104277354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4003 GTTAGTTTGCTGAGGATAATGGCTTCCAGCTCCATCCCTTTTCCTGCAAAGGACATGATC 4062

104277355 TCATTACTTTTTATGACTGCATAGTGTTCCATGGTGTAAATATATCACATTTTCATTTTC 104277414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4063 TCATTACTTTTTATGACTGCATAGTGTTCCATGGTGTAAATATATCACATTTTCATTTTC 4122

104277415 CAGTCTATCATTGATGGGCATTTGGGTTAATTCCATGTCTTTTCTACAGTGAATAGTGCT 104277474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4123 CAGTCTATCATTGATGGGCATTTGGGTTAATTCCATGTCTTTTCTACAGTGAATAGTGCT 4182

104277475 CCAGTGAACATACATGTGCAGGTATCTTTATAATAGAATGATTTATATTCTTTTGGGTAC 104277534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4183 CCAGTGAACATACATGTGCAGGTATCTTTATAATAGAATGATTTATATTCTTTTGGGTAC 4242

104277535 ATACCCAGTAATGGGATTGCTGGGTCAAATGGTATTTCTGGTTCTAGGTCTTTGAGGAAT 104277594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4243 ATACCCAGTAATGGGATTGCTGGGTCAAATGGTATTTCTGGTTCTAGGTCTTTGAGGAAT 4302

104277595 TGCTACACTGTCTTCCACAAGTAAAACCCAGAACTATAAAAACCCTAGAAGAAAAGCTAG 104277654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4303 TGCTACACTGTCTTCCACAAGTAAAACCCAGAACTATAAAAACCCTAGAAGAAAAGCTAG 4362

104277655 ACAGTACCATTCAGGACATCGGCACAGGCAAAGATTTCATGACAAAAATGTCAAAAGCAA 104277714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4363 ACAGTACCATTCAGGACATCGGCACAGGCAAAGATTTCATGACAAAAATGTCAAAAGCAA 4422

104277715 TTGCAACAAACACAAAACTTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAGAGCTTCTGCACAGCA 104277774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4423 TTGCAACAAACACAAAACTTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAGAGCTTCTGCACAGCA 4482

104277775 AAAGAAACTATCATCAGAGTGGACAGACAACCTACAGAATGGGAGAAAAGTTTGCAGTCT 104277834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4483 AAAGAAACTATCATCAGAGTGGACAGACAACCTACAGAATGGGAGAAAAGTTTGCAGTCT 4542

104277835 ATTCATCCGACAAAGGTTGAATATCCAGAATCTACAAGGAACTTAGTTCCAATTTACAAG 104277894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4543 ATTCATCCGACAAAGGTTGAATATCCAGAATCTACAAGGAACTTAGTTCCAATTTACAAG 4602

104277895 AAAAAAAAAAAACACCATTAAAAAGTCGGCAAAGGACATAAACAGACACTTCTCAAAAGA 104277954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4603 AAAAAAAAAAAACACCATTAAAAAGTCGGCAAAGGACATAAACAGACACTTCTCAAAAGA 4662

104277955 AGACATTACGTGGCCACCAAACATATGAAAAAAAACTCAACCTCACTGATCATTAGAGAA 104278014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4663 AGACATTACGTGGCCACCAAACATATGAAAAAAAACTCAACCTCACTGATCATTAGAGAA 4722

104278015 ATACAAATCAAAACCACCAAGAGATACCATCGCATGCCAGTCAGAATGGTGATTATTAAA 104278074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4723 ATACAAATCAAAACCACCAAGAGATACCATCGCATGCCAGTCAGAATGGTGATTATTAAA 4782

104278075 AAGTCAAGGAACAATAGATGCTGGTGAGGCTGTGGAGAAATAGGAATGCTCTTTTGCACT 104278134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4783 AAGTCAAGGAACAATAGATGCTGGTGAGGCTGTGGAGAAATAGGAATGCTCTTTTGCACT 4842

104278135 GTTGATGGGAATCTCTGAAAATATTTATTCCTTTGAATGAGTTTAGCATAGGATGTTACC 104278194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4843 GTTGATGGGAATCTCTGAAAATATTTATTCCTTTGAATGAGTTTAGCATAGGATGTTACC 4902

104278195 CTTAAAAGGATATTTGCATTCTAGAACACAGAGAGAAAGCTGAAGTAAAACACAAAATCA 104278254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4903 CTTAAAAGGATATTTGCATTCTAGAACACAGAGAGAAAGCTGAAGTAAAACACAAAATCA 4962

104278255 GTTCCAGTGCTTACAGAATTTGGATTATAGAGTGTGATGGAATGCATTATATCTCTTCAA 104278314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4963 GTTCCAGTGCTTACAGAATTTGGATTATAGAGTGTGATGGAATGCATTATATCTCTTCAA 5022

104278315 ATTCATATGCTGAAACCCTAACCCTAAGTGGGACTGTACTTGTAAA 104278360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5023 ATTCATATGCTGAAACCCTAACCCTAAGTGGGACTGTACTTGTAAA 5068

Alignment time is 3.82402 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [104268199,104289046] =>     20848 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     3357] =>      3357 nucs 'mol-32-32f0-011264_3357'

Score:        3346
Aligned:      3357        nucs
Identic:      3356 (100%) nucs =>       530 (100%)      2826 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [104277670,104278199] EXCISED REGION [104279047,104281873]
 second seq =>  [        1,      530] EXCISED REGION [      531,     3357]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       847 nucs [104278200,104279046]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [104278200,104278200] to [104279047,104279047]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [104278199,104278199] to [104279047,104279047]
 second seq =>         1 nucs [530,530] to [531,531]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

104277670 ACATCGGCACAGGCAAAGATTTCATGACAAAAATGTCAAAAGCAATTGCAACAAACACAA 104277729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACATCGGCACAGGCAAAGATTTCATGACAAAAATGTCAAAAGCAATTGCAACAAACACAA 60

104277730 AACTTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAGAGCTTCTGCACAGCAAAAGAAACTATCATC 104277789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AACTTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAGAGCTTCTGCACAGCAAAAGAAACTATCATC 120

104277790 AGAGTGGACAGACAACCTACAGAATGGGAGAAAAGTTTGCAGTCTATTCATCCGACAAAG 104277849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGAGTGGACAGACAACCTACAGAATGGGAGAAAAGTTTGCAGTCTATTCATCCGACAAAG 180

104277850 GTTGAATATCCAGAATCTACAAGGAACTTAGTTCCAATTTACAAGAAAAAAAAAAAACAC 104277909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTTGAATATCCAGAATCTACAAGGAACTTAGTTCCAATTTACAAGAAAAAAAAAAAACAC 240

104277910 CATTAAAAAGTCGGCAAAGGACATAAACAGACACTTCTCAAAAGAAGACATTACGTGGCC 104277969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CATTAAAAAGTCGGCAAAGGACATAAACAGACACTTCTCAAAAGAAGACATTACGTGGCC 300

104277970 ACCAAACATATGAAAAAAAACTCAACCTCACTGATCATTAGAGAAATACAAATCAAAACC 104278029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACCAAACATATGAAAAAAAACTCAACCTCACTGATCATTAGAGAAATACAAATCAAAACC 360

104278030 ACCAAGAGATACCATCGCATGCCAGTCAGAATGGTGATTATTAAAAAGTCAAGGAACAAT 104278089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACCAAGAGATACCATCGCATGCCAGTCAGAATGGTGATTATTAAAAAGTCAAGGAACAAT 420

104278090 AGATGCTGGTGAGGCTGTGGAGAAATAGGAATGCTCTTTTGCACTGTTGATGGGAATCTC 104278149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGATGCTGGTGAGGCTGTGGAGAAATAGGAATGCTCTTTTGCACTGTTGATGGGAATCTC 480

104278150 TGAAAATATTTATTCCTTTGAATGAGTTTAGCATAGGATGTTACCCTTAA 104278199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGAAAATATTTATTCCTTTGAATGAGTTTAGCATAGGATGTTACCCTTAA 530

EXCISED REGION

104279047 ATGCTTGTTATAACAATGTACTTTTTTGTATACCTCTACTTGGAAATGTATTATAGTTAA 104279106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      531 ATGCTTGTTATAACAATGTACTTTTTTGTATACCTCTACTTGGAAATGTATTATAGTTAA 590

104279107 GATTCATTCATTCGACTAATATGTATTGAGTGCCTACTATGTGCCAGGCACATGTTTTAG 104279166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      591 GATTCATTCATTCGACTAATATGTATTGAGTGCCTACTATGTGCCAGGCACATGTTTTAG 650

104279167 CTAATGTTGATGAATGGTATGGATAAAGGCCTTGACACATTCATATTTAGAAAGATGGAA 104279226
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
      651 CTAATGTTGATGAATGGTATGGATAAAGGCCTTGACACATTCATATTTAGAAAAATGGAA 710

104279227 ATAAATACATCAACAACATGCAATCTAATAGAGTTAGTAATGATAAAGATAAAACAGAAT 104279286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      711 ATAAATACATCAACAACATGCAATCTAATAGAGTTAGTAATGATAAAGATAAAACAGAAT 770

104279287 ATAGAGAGTAAATAAGGGACCTATTTTCTATATGGTGGTCAAAAATGGACCCTGTGATTA 104279346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      771 ATAGAGAGTAAATAAGGGACCTATTTTCTATATGGTGGTCAAAAATGGACCCTGTGATTA 830

104279347 CAGCTGAATACAGACTTGAATAAAACGAGAAAGCAAGTAATTCACATATCTGAGGAGAAA 104279406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      831 CAGCTGAATACAGACTTGAATAAAACGAGAAAGCAAGTAATTCACATATCTGAGGAGAAA 890

104279407 ACTCTTTAGACACAGGGACCAGAAAGTTCAGGGGCCTTCAGCCAGAAATATTATTGACAT 104279466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      891 ACTCTTTAGACACAGGGACCAGAAAGTTCAGGGGCCTTCAGCCAGAAATATTATTGACAT 950

104279467 GTGTAAATGAAGTAGCAAAGATAGTTGTTTGAGGAGGTGAAAAGGAAAATAGTGAAGATC 104279526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      951 GTGTAAATGAAGTAGCAAAGATAGTTGTTTGAGGAGGTGAAAAGGAAAATAGTGAAGATC 1010

104279527 AAATTGAAGAGACAATCAAGGCCATGCAGACTGTGGCAAGAACTTTGGAACTTCTGTTTA 104279586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1011 AAATTGAAGAGACAATCAAGGCCATGCAGACTGTGGCAAGAACTTTGGAACTTCTGTTTA 1070

104279587 TTATCCGAAGAGGCCATTGGAAGGTTATAAACAAGATATAAACATGATCTGACCTGTGTT 104279646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1071 TTATCCGAAGAGGCCATTGGAAGGTTATAAACAAGATATAAACATGATCTGACCTGTGTT 1130

104279647 TTGAAAGGATTTTTCTGGATAGGGAGTGAAAATTATATTGAAAGTGAAAAGATTGTAGAT 104279706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1131 TTGAAAGGATTTTTCTGGATAGGGAGTGAAAATTATATTGAAAGTGAAAAGATTGTAGAT 1190

104279707 ATAGTAGCAGTGGTAGGACTTGGGATATATATTACATACATTAGAGCTATCCTTAACTGT 104279766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1191 ATAGTAGCAGTGGTAGGACTTGGGATATATATTACATACATTAGAGCTATCCTTAACTGT 1250

104279767 ATCAACTGGTCTCATTGGGTATGAGAAGAAGATCAAAGTCAAGGCCAATTTTAATATGTT 104279826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1251 ATCAACTGGTCTCATTGGGTATGAGAAGAAGATCAAAGTCAAGGCCAATTTTAATATGTT 1310

104279827 TGGCCTGAGCAAGAAGGTGATATCCTTTCATGAAATGGGGATCAGTGAGAGGGGAGAAAT 104279886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1311 TGGCCTGAGCAAGAAGGTGATATCCTTTCATGAAATGGGGATCAGTGAGAGGGGAGAAAT 1370

104279887 TTACAGAGAAAAATTAAGAGTTTGGTTTTGGACCTATTAAAATTTGAGAAACCTGTGAGA 104279946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1371 TTACAGAGAAAAATTAAGAGTTTGGTTTTGGACCTATTAAAATTTGAGAAACCTGTGAGA 1430

104279947 AGTTTAAGAGGAAATGTTGATGAAGAGGAAGTTCGAAATAAGAGTCGAGAGTCCAGGGAA 104280006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1431 AGTTTAAGAGGAAATGTTGATGAAGAGGAAGTTCGAAATAAGAGTCGAGAGTCCAGGGAA 1490

104280007 TTGGTTTGGAGCTGGAGATTTTTTAAATTGAGAAGTTATTGGTAGATACAAGATATTTGC 104280066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1491 TTGGTTTGGAGCTGGAGATTTTTTAAATTGAGAAGTTATTGGTAGATACAAGATATTTGC 1550

104280067 AGTCATGAGAGCTAACAGTTACCTAGGGAGGGAGTAAAGATGAAGAGCTGAAATTTAAGG 104280126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1551 AGTCATGAGAGCTAACAGTTACCTAGGGAGGGAGTAAAGATGAAGAGCTGAAATTTAAGG 1610

104280127 ATAAAATTCCAGGGATCTAGAAATTTGGAAAATTGGAAGAAGAGGTGAAGCCAGAAAAGA 104280186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1611 ATAAAATTCCAGGGATCTAGAAATTTGGAAAATTGGAAGAAGAGGTGAAGCCAGAAAAGA 1670

104280187 CTAAGAAGGAGAGGTCAAGGAAGTAGGTGGGACAATAAAAGGATGTAGAATCTTGGCAAC 104280246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1671 CTAAGAAGGAGAGGTCAAGGAAGTAGGTGGGACAATAAAAGGATGTAGAATCTTGGCAAC 1730

104280247 TGAGTGATGAAAAAATTCTTTAAAGAATCAGAAAGTGACTGGTAAACTGGGTCAAAAGCT 104280306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1731 TGAGTGATGAAAAAATTCTTTAAAGAATCAGAAAGTGACTGGTAAACTGGGTCAAAAGCT 1790

104280307 AGAGATTGAGTAAAAACTGAAACTTTTCTTCATTTTAACATACTTTCGCTTTCAAGAAAA 104280366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1791 AGAGATTGAGTAAAAACTGAAACTTTTCTTCATTTTAACATACTTTCGCTTTCAAGAAAA 1850

104280367 TTATTACACTAAGGGGGAATAGCAGAGCAATCTATTAGTGTTGCAGAGGACAGATGTGGC 104280426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1851 TTATTACACTAAGGGGGAATAGCAGAGCAATCTATTAGTGTTGCAGAGGACAGATGTGGC 1910

104280427 TTTTTCAGATGCTCAGAAGCACCCAATAAATTTGAAGAACAGACAGGTGTTCCTGAGAAC 104280486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1911 TTTTTCAGATGCTCAGAAGCACCCAATAAATTTGAAGAACAGACAGGTGTTCCTGAGAAC 1970

104280487 TCAGGGAAGAATTTGGCCAATGAAGGTCACAGGACACCTGTTCTGAAAATGTCCTACTGA 104280546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1971 TCAGGGAAGAATTTGGCCAATGAAGGTCACAGGACACCTGTTCTGAAAATGTCCTACTGA 2030

104280547 AAATGTTCTTTAGAAGTTACAGTGTTTTCATCAAGACAATGAGATTTCACTTTATAACTT 104280606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2031 AAATGTTCTTTAGAAGTTACAGTGTTTTCATCAAGACAATGAGATTTCACTTTATAACTT 2090

104280607 TACTCAGTGCCCAGGTTACCTAAAAAGTATTTTTTCATCTTCAAGGGAGAAAAAAACTTT 104280666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2091 TACTCAGTGCCCAGGTTACCTAAAAAGTATTTTTTCATCTTCAAGGGAGAAAAAAACTTT 2150

104280667 GTTATTAGGTGATATAATTAGAATGTTTTAAAGAATGACATTAGTTTGCATTTCACAGCC 104280726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2151 GTTATTAGGTGATATAATTAGAATGTTTTAAAGAATGACATTAGTTTGCATTTCACAGCC 2210

104280727 TTACTAGGTAATATGAGAAGAAAATTCCAGTTTTATATTCTCTCGTATCTCTGAATTTCT 104280786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2211 TTACTAGGTAATATGAGAAGAAAATTCCAGTTTTATATTCTCTCGTATCTCTGAATTTCT 2270

104280787 TTCTAATTTATGGAAACAGTCTAATTTATGGAAACAGAATAATTAAATGCCCATGATAAA 104280846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2271 TTCTAATTTATGGAAACAGTCTAATTTATGGAAACAGAATAATTAAATGCCCATGATAAA 2330

104280847 TTTTCAAAGTTTATGACTTTCACTTGCATGGAATTAAAAATTATTTGCTGTTTTGTTAGT 104280906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2331 TTTTCAAAGTTTATGACTTTCACTTGCATGGAATTAAAAATTATTTGCTGTTTTGTTAGT 2390

104280907 ATTACTGTTAAGTGCCTTCCATGCTGCAGTAAGAAAACAGAAAAGTGAAATTCAAGAGCT 104280966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2391 ATTACTGTTAAGTGCCTTCCATGCTGCAGTAAGAAAACAGAAAAGTGAAATTCAAGAGCT 2450

104280967 AATCCAGGAGTATAAATGGGAAGTTTTTTTTTTATTAACTTGACAAATCTACATAAGCCA 104281026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2451 AATCCAGGAGTATAAATGGGAAGTTTTTTTTTTATTAACTTGACAAATCTACATAAGCCA 2510

104281027 TATTTAACTTCTTCAAAAGGAAAAGTATTTGAAACATGCATGTGAATCATGGGATGATAT 104281086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2511 TATTTAACTTCTTCAAAAGGAAAAGTATTTGAAACATGCATGTGAATCATGGGATGATAT 2570

104281087 GTAAAATTTGACCAATCCACTGGGTCATTCTATGAGTTAATACTTGTCCTAAGTGTTCAG 104281146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2571 GTAAAATTTGACCAATCCACTGGGTCATTCTATGAGTTAATACTTGTCCTAAGTGTTCAG 2630

104281147 TTGTACCTGCTTAGTCTTTAAAATTATAGAGTTGTTTGAAAGGTCTAATCCATATAGATA 104281206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2631 TTGTACCTGCTTAGTCTTTAAAATTATAGAGTTGTTTGAAAGGTCTAATCCATATAGATA 2690

104281207 TTAAAGGAATCATTTACTTTGCAAAGTGGGCATTCCTTTTATGTGTAGAATGTACAATGA 104281266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2691 TTAAAGGAATCATTTACTTTGCAAAGTGGGCATTCCTTTTATGTGTAGAATGTACAATGA 2750

104281267 AACTGAATTTTTTGTTTATTGTAATCCATGTTTTATTTTTGGTGGTGAAATTTCTTTAGT 104281326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2751 AACTGAATTTTTTGTTTATTGTAATCCATGTTTTATTTTTGGTGGTGAAATTTCTTTAGT 2810

104281327 AAATGCTTTACGGATAGTTTTGGAACAGTGCATTTTGACATCTTCCATTTATTTAAGCCA 104281386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2811 AAATGCTTTACGGATAGTTTTGGAACAGTGCATTTTGACATCTTCCATTTATTTAAGCCA 2870

104281387 CTCTTGCATTCTAAAATGTACAGTATTTATCAAGCAAAGTTGGGTAGATTTGAGGGGGCC 104281446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2871 CTCTTGCATTCTAAAATGTACAGTATTTATCAAGCAAAGTTGGGTAGATTTGAGGGGGCC 2930

104281447 CATAAAATTTTTGTGTTACAATGATTTTAAAGAAGAGGCTTCATAGCTTTCTTCACTGAC 104281506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2931 CATAAAATTTTTGTGTTACAATGATTTTAAAGAAGAGGCTTCATAGCTTTCTTCACTGAC 2990

104281507 TCATAAACTTCGAGACTGTGGTAATTTCATCCATAAAAAAATAAAATAACTTAATGCCCC 104281566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2991 TCATAAACTTCGAGACTGTGGTAATTTCATCCATAAAAAAATAAAATAACTTAATGCCCC 3050

104281567 AATACCATCAAATTCCTAAAATGGAATTGTATTCAATAACAGTGTTTGATTATTAACAGT 104281626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3051 AATACCATCAAATTCCTAAAATGGAATTGTATTCAATAACAGTGTTTGATTATTAACAGT 3110

104281627 AAATTGCACACACCACTGCTGTTCAATTTCAATATATTTTTTCTGATATAATTGAATAGG 104281686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3111 AAATTGCACACACCACTGCTGTTCAATTTCAATATATTTTTTCTGATATAATTGAATAGG 3170

104281687 ACCCTCATTCAGGGGACAAAATTGTGTATTATTTTTATTTGAGGAAAAAGCAGAGACCAG 104281746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3171 ACCCTCATTCAGGGGACAAAATTGTGTATTATTTTTATTTGAGGAAAAAGCAGAGACCAG 3230

104281747 AAAAAGAATTATTTCAGAAAAAGTAATTTAAATATTTATATGTTTTTTTGCAATTTGATT 104281806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3231 AAAAAGAATTATTTCAGAAAAAGTAATTTAAATATTTATATGTTTTTTTGCAATTTGATT 3290

104281807 CATTACATATTCAGTATATTTCATTAAAAAGCAAAAAAAAAACATATTTTTTTCTTCCTT 104281866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3291 CATTACATATTCAGTATATTTCATTAAAAAGCAAAAAAAAAACATATTTTTTTCTTCCTT 3350

104281867 AAAGAAA 104281873
          |||||||
     3351 AAAGAAA 3357

Alignment time is 2.59184 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [104268199,104289046] =>     20848 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     7259] =>      7259 nucs 'mol-32-32fb-022130_7259'

Score:        7180
Aligned:      7257        nucs
Identic:      7250 (100%) nucs =>      5409 (100%)      1841 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [104271339,104276754] EXCISED REGION [104276755,104278595]
 second seq =>  [        1,     5416] EXCISED REGION [     5419,     7259]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [5417,5418]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        22 nucs [5417,5438] to [5419,5440]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [104276754,104276754] to [104276755,104276755]
 second seq =>         1 nucs [5416,5416] to [5419,5419]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

104271339 CCCTTTTTCTTCTTATCTCTTCTCTTAAAAATAACAAAAGACACAACATTAACTTTTGTG 104271398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCCTTTTTCTTCTTATCTCTTCTCTTAAAAATAACAAAAGACACAACATTAACTTTTGTG 60

104271399 GATCATATTTGATTTACCTCTTTCCAGATATCAAAAGGTTGTGAATTTATTTTTTAAATC 104271458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GATCATATTTGATTTACCTCTTTCCAGATATCAAAAGGTTGTGAATTTATTTTTTAAATC 120

104271459 AATTAAAACTACATGAAAATCCTATCCCTTCTGTTCATATGGTGAGGAATGCCTAAAGCC 104271518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AATTAAAACTACATGAAAATCCTATCCCTTCTGTTCATATGGTGAGGAATGCCTAAAGCC 180

104271519 AAAGGATATGGGGAATATTAGATATGCTTTTCTAAGGAAAAAATAGTAAGACAAAATGGC 104271578
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
      181 AAAGGATATGGGGAATATTAGATATGCTTTTCTAAGGAAAAAATAGTGAGACAAAATGGC 240

104271579 CTGCCTGAAGTTAACAGTTTATAGATTGCAAAAAGGCACAGACAATTAAAAGATGGAGCT 104271638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTGCCTGAAGTTAACAGTTTATAGATTGCAAAAAGGCACAGACAATTAAAAGATGGAGCT 300

104271639 ACTTAGGGCAAATTACTTGCAATCAAGCTGCAGCTAAATGAGCTTCTTGATGAGGAAGCC 104271698
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACTTGGGGCAAATTACTTGCAATCAAGCTGCAGCTAAATGAGCTTCTTGATGAGGAAGCC 360

104271699 AAATTTATGTTGTTTCAAACCAGGGAGAAACATTAAAGAAGTTGAAAGGTGAGCAAAATG 104271758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAATTTATGTTGTTTCAAACCAGGGAGAAACATTAAAGAAGTTGAAAGGTGAGCAAAATG 420

104271759 TTAGTACAATTGGATCCAGATAGGTTGATAAGGGAAGCTGTAGAGGCAATTAAAACGCTG 104271818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTAGTACAATTGGATCCAGATAGGTTGATAAGGGAAGCTGTAGAGGCAATTAAAACGCTG 480

104271819 CCTCTGAAATACATACACATAGGTACAGACACAGACATACACGCACACAAACCAATACAC 104271878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCTCTGAAATACATACACATAGGTACAGACACAGACATACACGCACACAAACCAATACAC 540

104271879 ACAAAACATCCTCAAATAGAAGACTGTATGATTACATACACCTTCAGCCTTCATTTATGT 104271938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACAAAACATCCTCAAATAGAAGACTGTATGATTACATACACCTTCAGCCTTCATTTATGT 600

104271939 TTTATGTGGATGCCCCTTCTTATCACAAAAACACTGCGGCCTGAGAAGCTCAATCACAGA 104271998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTTATGTGGATGCCCCTTCTTATCACAAAAACACTGCGGCCTGAGAAGCTCAATCACAGA 660

104271999 ATATAATCATTTTCCTTTTCAATCTGCAATTTACTACAGACATTTTATTTGAAAATGAGG 104272058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATATAATCATTTTCCTTTTCAATCTGCAATTTACTACAGACATTTTATTTGAAAATGAGG 720

104272059 TATTGTTTAAACTCTAAACCACAGTGTTTTCATTTTTTCCCCTGCCCTAAATTATCCCTT 104272118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TATTGTTTAAACTCTAAACCACAGTGTTTTCATTTTTTCCCCTGCCCTAAATTATCCCTT 780

104272119 GGCAGCTCTCTGAGTTGATTTTTAAAGAATATGTTTTATAATGAATTCAGAACTTCCACA 104272178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GGCAGCTCTCTGAGTTGATTTTTAAAGAATATGTTTTATAATGAATTCAGAACTTCCACA 840

104272179 AAGCACAAAAGCCATGTGAAAGCTTCAAATGTGAAATATCACATTTCTTTCTTTGTTGCT 104272238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAGCACAAAAGCCATGTGAAAGCTTCAAATGTGAAATATCACATTTCTTTCTTTGTTGCT 900

104272239 CAATATCCATTTTTGCATTCAGGGCTGTATGCATCAATTTCACTGAAAGCAGGGTATTGT 104272298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CAATATCCATTTTTGCATTCAGGGCTGTATGCATCAATTTCACTGAAAGCAGGGTATTGT 960

104272299 CTACATCTATCTGTCTGAATGAGATGACTTTCAGGACTTTGTAATTTTGAAAAGGTCTTC 104272358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTACATCTATCTGTCTGAATGAGATGACTTTCAGGACTTTGTAATTTTGAAAAGGTCTTC 1020

104272359 AAGCCAGGCTATCCTTCATCCCATTTCTGTTGCATTGGAATGTTAGACATAACAAGGTAG 104272418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AAGCCAGGCTATCCTTCATCCCATTTCTGTTGCATTGGAATGTTAGACATAACAAGGTAG 1080

104272419 ACAAAGGAAAGATATAATACAGATCCTTATTGACAGTCAGCAAGTACAAGTATATGTAGA 104272478
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     1081 ACAAAGGAAAGATATAATACAGATCCTTATTGACAGTCAGCAAGTACAAATATATGTAGA 1140

104272479 AAGAGATAATTTTCTGCTGGCATTTTCCCTTATCTCGATTCTCTTATCCTTTCATGCATT 104272538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AAGAGATAATTTTCTGCTGGCATTTTCCCTTATCTCGATTCTCTTATCCTTTCATGCATT 1200

104272539 ATGTTTTGCATGAACAGAATCGGAAAAAAATTGACAGCCTTGTATGAAGTACACCAAGAA 104272598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATGTTTTGCATGAACAGAATCGGAAAAAAATTGACAGCCTTGTATGAAGTACACCAAGAA 1260

104272599 AGCTTTCTCCTTCAAAGATCTTTTTAGGATATAAAAACTCTCTAAGATTTAGTAACTAAG 104272658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AGCTTTCTCCTTCAAAGATCTTTTTAGGATATAAAAACTCTCTAAGATTTAGTAACTAAG 1320

104272659 AAGGACAATAAATGTCCATACTTAGAGCAACAAATAAAAATGTGATTCTGATGCTGACAT 104272718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AAGGACAATAAATGTCCATACTTAGAGCAACAAATAAAAATGTGATTCTGATGCTGACAT 1380

104272719 AGTTTTTTTATAGTTGAAATGTAACCTTGTCAACACTGCCTGGCCAGTTCTGCCATTGAA 104272778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AGTTTTTTTATAGTTGAAATGTAACCTTGTCAACACTGCCTGGCCAGTTCTGCCATTGAA 1440

104272779 AAATGGCCCAGGAAAATGCCCAAATGCCAACAGTGGTAGTTATGGATTATTTTCCTATCT 104272838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AAATGGCCCAGGAAAATGCCCAAATGCCAACAGTGGTAGTTATGGATTATTTTCCTATCT 1500

104272839 GATATTATTCAGCTACATCTGCTGTTTAGTGGAAGCTAAACAGAAAATACTCCATAGGAT 104272898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GATATTATTCAGCTACATCTGCTGTTTAGTGGAAGCTAAACAGAAAATACTCCATAGGAT 1560

104272899 ACTGAGAAAAAATTGGGCATTGAAAATATATTTGTGTCTTTTTTTTCTTCCTGTGAGTTA 104272958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ACTGAGAAAAAATTGGGCATTGAAAATATATTTGTGTCTTTTTTTTCTTCCTGTGAGTTA 1620

104272959 TAAATTTTAAATGGCATATGTAAAGCATTTAGAAAAGGTGTCTCAATATATTGAACATTG 104273018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TAAATTTTAAATGGCATATGTAAAGCATTTAGAAAAGGTGTCTCAATATATTGAACATTG 1680

104273019 GCCAAAGAGGCCTCCAACAGCTAAAGTCATATCACCTGAACGTGATGGGATTTCCAAATT 104273078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GCCAAAGAGGCCTCCAACAGCTAAAGTCATATCACCTGAACGTGATGGGATTTCCAAATT 1740

104273079 CCCCCTAAATCAGTCTGGTTAGGAGAGCTTAAAGGAAATAGGAATATACATACACAAGAA 104273138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CCCCCTAAATCAGTCTGGTTAGGAGAGCTTAAAGGAAATAGGAATATACATACACAAGAA 1800

104273139 AAAGTTCATTGTTAACCACCCTATTAACTGTTAACTGCATGCCAAAAATTGGGCATAAGA 104273198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AAAGTTCATTGTTAACCACCCTATTAACTGTTAACTGCATGCCAAAAATTGGGCATAAGA 1860

104273199 GTGACTTAAGTCTTAATGACATTTTCAAATATAAGCTTAATAAGGCAAGCCTGCTTTTAA 104273258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GTGACTTAAGTCTTAATGACATTTTCAAATATAAGCTTAATAAGGCAAGCCTGCTTTTAA 1920

104273259 AGATTAGTGAGAAGTAACTGTATTAGTGAATTTTCATACTGCTATAAAGAAATACCCAAG 104273318
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AGATTAGTGAGAAGTAACTGGATTAGTGAATTTTCATACTGCTATAAAGAAATACCCAAG 1980

104273319 ACTGGGTAATTTATGAAGTAAAAGAGGTTTAATGGAATCATGGTTCCACATGGCTGGGGT 104273378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ACTGGGTAATTTATGAAGTAAAAGAGGTTTAATGGAATCATGGTTCCACATGGCTGGGGT 2040

104273379 GGCCTCACAGTCATGACGGAAGGTGAAGGAGGAGCAAAAGCACATCTTACGTGGCAGCAG 104273438
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GGCCTCACAGTCATGACGGAAGGTGAAGGAAGAGCAAAAGCACATCTTACGTGGCAGCAG 2100

104273439 GCAGGAGAGCGTGTACAGGGAAACTACCCTTTATAGAAACCATTGGATCTCGTGAGACTT 104273498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GCAGGAGAGCGTGTACAGGGAAACTACCCTTTATAGAAACCATTGGATCTCGTGAGACTT 2160

104273499 ATTCACTATATCACAAGAACAGCATGGGAAAAACCCATCCTCATGATTCAGTTGCCTCCC 104273558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ATTCACTATATCACAAGAACAGCATGGGAAAAACCCATCCTCATGATTCAGTTGCCTCCC 2220

104273559 ACTAGGTCCCTCCCATGACACATGGAGTATGTGGGAGTTACAATTCAAGATGAGATTTGG 104273618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ACTAGGTCCCTCCCATGACACATGGAGTATGTGGGAGTTACAATTCAAGATGAGATTTGG 2280

104273619 GTGGAGACACAGCCAAACCATATCTGTACCTGACCAAGTACCTCTCAAGTTTGAGGCAGC 104273678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GTGGAGACACAGCCAAACCATATCTGTACCTGACCAAGTACCTCTCAAGTTTGAGGCAGC 2340

104273679 TACATAACCAACAGATGAAGTCTTAGTAAAAGCACAGAACTAGAGTTCAAGTGACCTGGT 104273738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TACATAACCAACAGATGAAGTCTTAGTAAAAGCACAGAACTAGAGTTCAAGTGACCTGGT 2400

104273739 TTGCACCCTGAGTGCCATCATCATCAAGCATGAAAACCTTATGCAGATCAGTTCACCTTT 104273798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TTGCACCCTGAGTGCCATCATCATCAAGCATGAAAACCTTATGCAGATCAGTTCACCTTT 2460

104273799 TTTGGGATGCTTCCTCATTTATAAAATGAAAGATTTTAACTGAGTAATTGCTCAGATTCC 104273858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TTTGGGATGCTTCCTCATTTATAAAATGAAAGATTTTAACTGAGTAATTGCTCAGATTCC 2520

104273859 TAGAACTGTGTAACTCTAAAAAGATTTCCATAACCCTAGGTTATTTTTTCCTGGTTAACA 104273918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TAGAACTGTGTAACTCTAAAAAGATTTCCATAACCCTAGGTTATTTTTTCCTGGTTAACA 2580

104273919 AATTTTTTGGTTAGACAAAAACAACAATAGCTTATACATCATGTAAATCGTTGTTTCTTT 104273978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AATTTTTTGGTTAGACAAAAACAACAATAGCTTATACATCATGTAAATCGTTGTTTCTTT 2640

104273979 GTGCAGAATTAGGGGCTATATCTACCATAGGAGTAGTTGGCTCAGTGGCTAGGCCCTTGA 104274038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GTGCAGAATTAGGGGCTATATCTACCATAGGAGTAGTTGGCTCAGTGGCTAGGCCCTTGA 2700

104274039 GTCTGGAGTAAAAGGCTACAGCCGAGACAGTCTCATAGTCATGTGATAAATTGCTTCTGT 104274098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GTCTGGAGTAAAAGGCTACAGCCGAGACAGTCTCATAGTCATGTGATAAATTGCTTCTGT 2760

104274099 CTTCTATACTATTAAAGCTCTTAGAAGTTATGGCAAACTACTTATTTCACTCAGGTTTGT 104274158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CTTCTATACTATTAAAGCTCTTAGAAGTTATGGCAAACTACTTATTTCACTCAGGTTTGT 2820

104274159 ATTATATTATGTCAAAACATATCTATCCTTCTCCTATCACTGTGCTACTATAATGTACTT 104274218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 ATTATATTATGTCAAAACATATCTATCCTTCTCCTATCACTGTGCTACTATAATGTACTT 2880

104274219 CTTTAGGGACATGACCATGCCGTTTAACTTACATCTCTCTCGCTGTACCAAATAAGACTC 104274278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CTTTAGGGACATGACCATGCCGTTTAACTTACATCTCTCTCGCTGTACCAAATAAGACTC 2940

104274279 CCCTCACAATTTACTCAGTAAATGTTTGTGGAGTAAGATTTTCACTGGCCTCATTTCTCC 104274338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CCCTCACAATTTACTCAGTAAATGTTTGTGGAGTAAGATTTTCACTGGCCTCATTTCTCC 3000

104274339 AACTATCCTGCTTGGCAACTAATCCACAGTCATATAGGCCTCTTTTCACTTCTTTTAGTT 104274398
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 AACTATCCTGCTTGGCAACTAATCCACGGTCATATAGGCCTCTTTTCACTTCTTTTAGTT 3060

104274399 TCTTAAATTTGGGCCTCCGCACCCCCACTCCAGCTCATGCTATTTATTCTACTTTTAATG 104274458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TCTTAAATTTGGGCCTCCGCACCCCCACTCCAGCTCATGCTATTTATTCTACTTTTAATG 3120

104274459 ATATACTGCCTGCTCGATTCCCATTCCCAGCTCCAACATTCACACTCTTCATCTTGCCCA 104274518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 ATATACTGCCTGCTCGATTCCCATTCCCAGCTCCAACATTCACACTCTTCATCTTGCCCA 3180

104274519 TCTTTCAGAACTCAGCTTCACTATCTCTTAGGTGACCTTGAATAAGATCTTAATACTTTT 104274578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TCTTTCAGAACTCAGCTTCACTATCTCTTAGGTGACCTTGAATAAGATCTTAATACTTTT 3240

104274579 CCTTTCCAACAAATAACCCAGTTTTAATTATCTAATTGATTATGATATCACTTATTCATC 104274638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 CCTTTCCAACAAATAACCCAGTTTTAATTATCTAATTGATTATGATATCACTTATTCATC 3300

104274639 ACTGTGTATCAACTCATCCCAGATTCAATGGCTTCAAACAGAGAAACAAAAAAATACATT 104274698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 ACTGTGTATCAACTCATCCCAGATTCAATGGCTTCAAACAGAGAAACAAAAAAATACATT 3360

104274699 TTACTGCTTACATTCAGTAGGTTGGCCAGGTATTACATCAGCTGCTCTCTCCTGGGTTCA 104274758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TTACTGCTTACATTCAGTAGGTTGGCCAGGTATTACATCAGCTGCTCTCTCCTGGGTTCA 3420

104274759 CTCAACTGGAAGGATGAAAATGGCTTTATTCACATGTCTGGCAGTTGGTGCTTTTGCTGA 104274818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 CTCAACTGGAAGGATGAAAATGGCTTTATTCACATGTCTGGCAGTTGGTGCTTTTGCTGA 3480

104274819 TTGATGGCCTCTCATTCTCCAGTACGTTAGACAAGTTTTCTTATGTTGTAGTCTCAGGAC 104274878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TTGATGGCCTCTCATTCTCCAGTACGTTAGACAAGTTTTCTTATGTTGTAGTCTCAGGAC 3540

104274879 ATTATTACAACTGGCAAAAACAGAAACTGTAAGGTGTCTAAAACCTAGGATCCAGAATTT 104274938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 ATTATTACAACTGGCAAAAACAGAAACTGTAAGGTGTCTAAAACCTAGGATCCAGAATTT 3600

104274939 ACACACTAAGCTTCTGTCTCATTCTATTAATTAAAGCAATTTATAAGGCCAGCCCAAATT 104274998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 ACACACTAAGCTTCTGTCTCATTCTATTAATTAAAGCAATTTATAAGGCCAGCCCAAATT 3660

104274999 CAAGAGAGTGGAGGAACAGACTCCACTTTTTGTTGGAAGGAACAAAAACATTACATTGCT 104275058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 CAAGAGAGTGGAGGAACAGACTCCACTTTTTGTTGGAAGGAACAAAAACATTACATTGCT 3720

104275059 CTGGGACATGGACACAAGGAGGCTTGACTCATGGGGACCATATTATAACTCTCTACTACA 104275118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 CTGGGACATGGACACAAGGAGGCTTGACTCATGGGGACCATATTATAACTCTCTACTACA 3780

104275119 TTATGTAAAATTACTAATTTAATTTCTATATTCCCCACTAGACTATCTGTGTATATGAAT 104275178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 TTATGTAAAATTACTAATTTAATTTCTATATTCCCCACTAGACTATCTGTGTATATGAAT 3840

104275179 AGGGACCATGCATTTCCTAATTTATGTTATATTGCCAGCATTTAATGCAGTCTTTATATG 104275238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 AGGGACCATGCATTTCCTAATTTATGTTATATTGCCAGCATTTAATGCAGTCTTTATATG 3900

104275239 TGCTAGGCATTAATAAATATTTGTTGAATGAATAATTAAATGGCTAAATTAATAACAGAG 104275298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 TGCTAGGCATTAATAAATATTTGTTGAATGAATAATTAAATGGCTAAATTAATAACAGAG 3960

104275299 TGGATGAATTAACTTGAAAAAAGATTTCATGAACTATCAGCATGAAGATTTATCCACAAA 104275358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 TGGATGAATTAACTTGAAAAAAGATTTCATGAACTATCAGCATGAAGATTTATCCACAAA 4020

104275359 AATAGAGAAGTGTTTCTTTTTTTGACCACATGAAAAACTAGAAACCATGTAAGCAGAAGT 104275418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 AATAGAGAAGTGTTTCTTTTTTTGACCACATGAAAAACTAGAAACCATGTAAGCAGAAGT 4080

104275419 TATCTAAGTTAACTTTTATTGAGTAACTGGACACAGAATTCAGGTGCTCTGTTGTTTTCT 104275478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     4081 TATCTAAGTTAACTTTTATTGAGTAACTGGACTCAGAATTCAGGTGCTCTGTTGTTTTCT 4140

104275479 ATTGCTGCTATAACAAAACGTCACAAACAGCAAATTACTGCAACATGAATTTATTAGCTC 104275538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 ATTGCTGCTATAACAAAACGTCACAAACAGCAAATTACTGCAACATGAATTTATTAGCTC 4200

104275539 ACAGTTCTACCAGTCAGAATTCTGGTGTGGTTTAATTTAGTTCTCTGCTCAGGTTTCTCA 104275598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 ACAGTTCTACCAGTCAGAATTCTGGTGTGGTTTAATTTAGTTCTCTGCTCAGGTTTCTCA 4260

104275599 CAAGCCAGAAATTAAAATAGCAACTGACTAGGCTCTTATCTGTAAGATCTGATGTCGAAA 104275658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 CAAGCCAGAAATTAAAATAGCAACTGACTAGGCTCTTATCTGTAAGATCTGATGTCGAAA 4320

104275659 CAATTTCCAAGCTGAATGATGTTTTTAGTAGAACTTAGCTCCTTGCAGTTGCAGAACTAA 104275718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 CAATTTCCAAGCTGAATGATGTTTTTAGTAGAACTTAGCTCCTTGCAGTTGCAGAACTAA 4380

104275719 GGTTCTCCCTTCTTGCTGGCTGGTGGCTGGGAGTCACCCTCAGCTCCTCCAGTGAGCCCA 104275778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 GGTTCTCCCTTCTTGCTGGCTGGTGGCTGGGAGTCACCCTCAGCTCCTCCAGTGAGCCCA 4440

104275779 CATTCTTTCCGCATGTCTTCCTTTATCTTCAAGCCAGCAACAATGCATCGGGCCCTTCTC 104275838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 CATTCTTTCCGCATGTCTTCCTTTATCTTCAAGCCAGCAACAATGCATCGGGCCCTTCTC 4500

104275839 TGCTCAGATCTCCCTGACTTCCTCTGCTGTCCTCACCAAGGAGAATACTTTGATTTAAGG 104275898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 TGCTCAGATCTCCCTGACTTCCTCTGCTGTCCTCACCAAGGAGAATACTTTGATTTAAGG 4560

104275899 ACTCCTGTAATTACATTGGCCCACCTGGGAAATCTAGGCTAATCTCTGTATCTTAAACTC 104275958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 ACTCCTGTAATTACATTGGCCCACCTGGGAAATCTAGGCTAATCTCTGTATCTTAAACTC 4620

104275959 AATTGATTCTTAACCTTAATTACCTCTGCAATGTCATTTTGCCATGTAATATAACATATT 104276018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 AATTGATTCTTAACCTTAATTACCTCTGCAATGTCATTTTGCCATGTAATATAACATATT 4680

104276019 CACAGGTGTAACACCAGGGAGCAAAGGTCAGAGAGCCAAAATTCTGTCTACCGTTGATAC 104276078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 CACAGGTGTAACACCAGGGAGCAAAGGTCAGAGAGCCAAAATTCTGTCTACCGTTGATAC 4740

104276079 TCAACAGCAATAAACATTCAGCTGTAGGAAACCTGAAGTCTCCAGAGAGATAATTTAGAT 104276138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 TCAACAGCAATAAACATTCAGCTGTAGGAAACCTGAAGTCTCCAGAGAGATAATTTAGAT 4800

104276139 AAAATACAGCCTTAAGTATAGGACAGACCTGCTTAGAATCAGGAGTCTAAATTTTTTTGG 104276198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 AAAATACAGCCTTAAGTATAGGACAGACCTGCTTAGAATCAGGAGTCTAAATTTTTTTGG 4860

104276199 TTACACAAATATAGCCAATTCTCTTTACCATTATAAATCTCAGCTTTATTTTTTTAATCT 104276258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 TTACACAAATATAGCCAATTCTCTTTACCATTATAAATCTCAGCTTTATTTTTTTAATCT 4920

104276259 GAAAAATGCAAATATTGCTGCATCTCTATCATGTTGCTTTTAACATTAATATAAGAAACA 104276318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 GAAAAATGCAAATATTGCTGCATCTCTATCATGTTGCTTTTAACATTAATATAAGAAACA 4980

104276319 TACATATAATCAGCAAAAAAGATTTTTAAAACCTTACATATCAAAGATTACAAAAGAGAA 104276378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 TACATATAATCAGCAAAAAAGATTTTTAAAACCTTACATATCAAAGATTACAAAAGAGAA 5040

104276379 TTAGGAGAAAGAACAAAGTCTAAAGATGTTGAGAGAGTACCCTAAAGTTATCTATTTATT 104276438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 TTAGGAGAAAGAACAAAGTCTAAAGATGTTGAGAGAGTACCCTAAAGTTATCTATTTATT 5100

104276439 TATTCACTTGTTCAAAAATATTTAGGACTAGGCCAGCCACAGTGGCTCATGCCTGTAATT 104276498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 TATTCACTTGTTCAAAAATATTTAGGACTAGGCCAGCCACAGTGGCTCATGCCTGTAATT 5160

104276499 CCAGCACTTTGGGGGGCCAAGGTGGGTGGATCACTTGAAGTCAGGAGTTTGAGATCAACC 104276558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 CCAGCACTTTGGGGGGCCAAGGTGGGTGGATCACTTGAAGTCAGGAGTTTGAGATCAACC 5220

104276559 TGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGG 104276618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 TGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGG 5280

104276619 CACGTGCCTGTAATCCCAGCTATTTGGGAGACTGCATCAGGAAAATTGCTTGAATCCAGG 104276678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 CACGTGCCTGTAATCCCAGCTATTTGGGAGACTGCATCAGGAAAATTGCTTGAATCCAGG 5340

104276679 AGGCGGAGGGTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGACAACAGAGCG 104276738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 AGGCGGAGGGTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGACAACAGAGCG 5400

104276739 AGACTCCGTCTCAAAA 104276754
          ||||||||||||||||
     5401 AGACTCCGTCTCAAAA 5416

EXCISED REGION

104276755 ATATATATATATATATATATATTTAGGACTAGGTTTCGATGAAATTAACCTAACAACCAA 104276814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5419 ATATATATATATATATATATATTTAGGACTAGGTTTCGATGAAATTAACCTAACAACCAA 5478

104276815 CACTTAATCCTTTGAGAAACTACTTTCTCAACTGCATGGAACTTACCTAGGATAAAAATT 104276874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5479 CACTTAATCCTTTGAGAAACTACTTTCTCAACTGCATGGAACTTACCTAGGATAAAAATT 5538

104276875 AAAATTTAGGAGAAAGTGATTTCAGAGCTCCAAATCTGTCCTGTCTGCCCTCATTTCCAT 104276934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5539 AAAATTTAGGAGAAAGTGATTTCAGAGCTCCAAATCTGTCCTGTCTGCCCTCATTTCCAT 5598

104276935 AATCTGCTTTGACTGCCATTTTGTATATCCCCTATAATTTAACCTACTTATTGATCCCAT 104276994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5599 AATCTGCTTTGACTGCCATTTTGTATATCCCCTATAATTTAACCTACTTATTGATCCCAT 5658

104276995 GATCTCTGAAAATATTCTTTTTAATTTAATTTAATTTTTAGTTCTGGGATACATGGGCAG 104277054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5659 GATCTCTGAAAATATTCTTTTTAATTTAATTTAATTTTTAGTTCTGGGATACATGGGCAG 5718

104277055 GATATGCAGCCTTGTTATATGGGTAAATGTGTTCCATGGTGGTTTGCTGCACCTATCAAA 104277114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5719 GATATGCAGCCTTGTTATATGGGTAAATGTGTTCCATGGTGGTTTGCTGCACCTATCAAA 5778

104277115 CCATCACCTAGGTATTAAGCCCCGCATGCATTAGCTACTCTTTCTGATGCGCTCCCTCCC 104277174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5779 CCATCACCTAGGTATTAAGCCCCGCATGCATTAGCTACTCTTTCTGATGCGCTCCCTCCC 5838

104277175 ACCACATCCCCAACCAACGGGCCCCATTATGTGTTGTTCCTTTCTCTGTTTTTATGTGTT 104277234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5839 ACCACATCCCCAACCAACGGGCCCCATTATGTGTTGTTCCTTTCTCTGTTTTTATGTGTT 5898

104277235 CTCATTGTTCAGCTTCCACTTATAAGTGAGAACATGTAGTGTTTAATTTTCTGTTCCTGT 104277294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5899 CTCATTGTTCAGCTTCCACTTATAAGTGAGAACATGTAGTGTTTAATTTTCTGTTCCTGT 5958

104277295 GTTAGTTTGCTGAGGATAATGGCTTCCAGCTCCATCCCTTTTCCTGCAAAGGACATGATC 104277354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5959 GTTAGTTTGCTGAGGATAATGGCTTCCAGCTCCATCCCTTTTCCTGCAAAGGACATGATC 6018

104277355 TCATTACTTTTTATGACTGCATAGTGTTCCATGGTGTAAATATATCACATTTTCATTTTC 104277414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6019 TCATTACTTTTTATGACTGCATAGTGTTCCATGGTGTAAATATATCACATTTTCATTTTC 6078

104277415 CAGTCTATCATTGATGGGCATTTGGGTTAATTCCATGTCTTTTCTACAGTGAATAGTGCT 104277474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6079 CAGTCTATCATTGATGGGCATTTGGGTTAATTCCATGTCTTTTCTACAGTGAATAGTGCT 6138

104277475 CCAGTGAACATACATGTGCAGGTATCTTTATAATAGAATGATTTATATTCTTTTGGGTAC 104277534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6139 CCAGTGAACATACATGTGCAGGTATCTTTATAATAGAATGATTTATATTCTTTTGGGTAC 6198

104277535 ATACCCAGTAATGGGATTGCTGGGTCAAATGGTATTTCTGGTTCTAGGTCTTTGAGGAAT 104277594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6199 ATACCCAGTAATGGGATTGCTGGGTCAAATGGTATTTCTGGTTCTAGGTCTTTGAGGAAT 6258

104277595 TGCTACACTGTCTTCCACAAGTAAAACCCAGAACTATAAAAACCCTAGAAGAAAAGCTAG 104277654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6259 TGCTACACTGTCTTCCACAAGTAAAACCCAGAACTATAAAAACCCTAGAAGAAAAGCTAG 6318

104277655 ACAGTACCATTCAGGACATCGGCACAGGCAAAGATTTCATGACAAAAATGTCAAAAGCAA 104277714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6319 ACAGTACCATTCAGGACATCGGCACAGGCAAAGATTTCATGACAAAAATGTCAAAAGCAA 6378

104277715 TTGCAACAAACACAAAACTTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAGAGCTTCTGCACAGCA 104277774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6379 TTGCAACAAACACAAAACTTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAGAGCTTCTGCACAGCA 6438

104277775 AAAGAAACTATCATCAGAGTGGACAGACAACCTACAGAATGGGAGAAAAGTTTGCAGTCT 104277834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6439 AAAGAAACTATCATCAGAGTGGACAGACAACCTACAGAATGGGAGAAAAGTTTGCAGTCT 6498

104277835 ATTCATCCGACAAAGGTTGAATATCCAGAATCTACAAGGAACTTAGTTCCAATTTACAAG 104277894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6499 ATTCATCCGACAAAGGTTGAATATCCAGAATCTACAAGGAACTTAGTTCCAATTTACAAG 6558

104277895 AAAAAAAAAAAACACCATTAAAAAGTCGGCAAAGGACATAAACAGACACTTCTCAAAAGA 104277954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6559 AAAAAAAAAAAACACCATTAAAAAGTCGGCAAAGGACATAAACAGACACTTCTCAAAAGA 6618

104277955 AGACATTACGTGGCCACCAAACATATGAAAAAAAACTCAACCTCACTGATCATTAGAGAA 104278014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6619 AGACATTACGTGGCCACCAAACATATGAAAAAAAACTCAACCTCACTGATCATTAGAGAA 6678

104278015 ATACAAATCAAAACCACCAAGAGATACCATCGCATGCCAGTCAGAATGGTGATTATTAAA 104278074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6679 ATACAAATCAAAACCACCAAGAGATACCATCGCATGCCAGTCAGAATGGTGATTATTAAA 6738

104278075 AAGTCAAGGAACAATAGATGCTGGTGAGGCTGTGGAGAAATAGGAATGCTCTTTTGCACT 104278134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6739 AAGTCAAGGAACAATAGATGCTGGTGAGGCTGTGGAGAAATAGGAATGCTCTTTTGCACT 6798

104278135 GTTGATGGGAATCTCTGAAAATATTTATTCCTTTGAATGAGTTTAGCATAGGATGTTACC 104278194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6799 GTTGATGGGAATCTCTGAAAATATTTATTCCTTTGAATGAGTTTAGCATAGGATGTTACC 6858

104278195 CTTAAAAGGATATTTGCATTCTAGAACACAGAGAGAAAGCTGAAGTAAAACACAAAATCA 104278254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6859 CTTAAAAGGATATTTGCATTCTAGAACACAGAGAGAAAGCTGAAGTAAAACACAAAATCA 6918

104278255 GTTCCAGTGCTTACAGAATTTGGATTATAGAGTGTGATGGAATGCATTATATCTCTTCAA 104278314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6919 GTTCCAGTGCTTACAGAATTTGGATTATAGAGTGTGATGGAATGCATTATATCTCTTCAA 6978

104278315 ATTCATATGCTGAAACCCTAACCCTAAGTGGGACTGTACTTGTAAACAGGGCCTTTAAAA 104278374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6979 ATTCATATGCTGAAACCCTAACCCTAAGTGGGACTGTACTTGTAAACAGGGCCTTTAAAA 7038

104278375 GAAGTAAGCACATTAAAGTGAAACTGGTAAGAGTGTGCCTTGATCCAATCTGATTGGTGT 104278434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7039 GAAGTAAGCACATTAAAGTGAAACTGGTAAGAGTGTGCCTTGATCCAATCTGATTGGTGT 7098

104278435 CCTTATAAGAAGTGGAAATTTGAACACACAAAGAGAAACATCAGGGGAGCTTACACACAG 104278494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7099 CCTTATAAGAAGTGGAAATTTGAACACACAAAGAGAAACATCAGGGGAGCTTACACACAG 7158

104278495 AGAAAATCCCATATAAGGACACAGCGAGAAAGCAGCCATGTGCAAGCTAAGGAAAGACTC 104278554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7159 AGAAAATCCCATATAAGGACACAGCGAGAAAGCAGCCATGTGCAAGCTAAGGAAAGACTC 7218

104278555 CGAAGAAACCAAATGTGCTGACTCTTTGAGCTTGAACTTCT 104278595
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7219 CGAAGAAACCAAATGTGCTGACTCTTTGAGCTTGAACTTCT 7259

Alignment time is 5.36943 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [104268199,104289046] =>     20848 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     2083] =>      2083 nucs 'mol-32-3311-125907_2083'

Score:        2083
Aligned:      2083        nucs
Identic:      2083 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [104276790,104278872]
 second seq =>  [        1,     2083]

104276790 TCGATGAAATTAACCTAACAACCAACACTTAATCCTTTGAGAAACTACTTTCTCAACTGC 104276849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCGATGAAATTAACCTAACAACCAACACTTAATCCTTTGAGAAACTACTTTCTCAACTGC 60

104276850 ATGGAACTTACCTAGGATAAAAATTAAAATTTAGGAGAAAGTGATTTCAGAGCTCCAAAT 104276909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATGGAACTTACCTAGGATAAAAATTAAAATTTAGGAGAAAGTGATTTCAGAGCTCCAAAT 120

104276910 CTGTCCTGTCTGCCCTCATTTCCATAATCTGCTTTGACTGCCATTTTGTATATCCCCTAT 104276969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTGTCCTGTCTGCCCTCATTTCCATAATCTGCTTTGACTGCCATTTTGTATATCCCCTAT 180

104276970 AATTTAACCTACTTATTGATCCCATGATCTCTGAAAATATTCTTTTTAATTTAATTTAAT 104277029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AATTTAACCTACTTATTGATCCCATGATCTCTGAAAATATTCTTTTTAATTTAATTTAAT 240

104277030 TTTTAGTTCTGGGATACATGGGCAGGATATGCAGCCTTGTTATATGGGTAAATGTGTTCC 104277089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTTTAGTTCTGGGATACATGGGCAGGATATGCAGCCTTGTTATATGGGTAAATGTGTTCC 300

104277090 ATGGTGGTTTGCTGCACCTATCAAACCATCACCTAGGTATTAAGCCCCGCATGCATTAGC 104277149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATGGTGGTTTGCTGCACCTATCAAACCATCACCTAGGTATTAAGCCCCGCATGCATTAGC 360

104277150 TACTCTTTCTGATGCGCTCCCTCCCACCACATCCCCAACCAACGGGCCCCATTATGTGTT 104277209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TACTCTTTCTGATGCGCTCCCTCCCACCACATCCCCAACCAACGGGCCCCATTATGTGTT 420

104277210 GTTCCTTTCTCTGTTTTTATGTGTTCTCATTGTTCAGCTTCCACTTATAAGTGAGAACAT 104277269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTTCCTTTCTCTGTTTTTATGTGTTCTCATTGTTCAGCTTCCACTTATAAGTGAGAACAT 480

104277270 GTAGTGTTTAATTTTCTGTTCCTGTGTTAGTTTGCTGAGGATAATGGCTTCCAGCTCCAT 104277329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTAGTGTTTAATTTTCTGTTCCTGTGTTAGTTTGCTGAGGATAATGGCTTCCAGCTCCAT 540

104277330 CCCTTTTCCTGCAAAGGACATGATCTCATTACTTTTTATGACTGCATAGTGTTCCATGGT 104277389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CCCTTTTCCTGCAAAGGACATGATCTCATTACTTTTTATGACTGCATAGTGTTCCATGGT 600

104277390 GTAAATATATCACATTTTCATTTTCCAGTCTATCATTGATGGGCATTTGGGTTAATTCCA 104277449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTAAATATATCACATTTTCATTTTCCAGTCTATCATTGATGGGCATTTGGGTTAATTCCA 660

104277450 TGTCTTTTCTACAGTGAATAGTGCTCCAGTGAACATACATGTGCAGGTATCTTTATAATA 104277509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGTCTTTTCTACAGTGAATAGTGCTCCAGTGAACATACATGTGCAGGTATCTTTATAATA 720

104277510 GAATGATTTATATTCTTTTGGGTACATACCCAGTAATGGGATTGCTGGGTCAAATGGTAT 104277569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GAATGATTTATATTCTTTTGGGTACATACCCAGTAATGGGATTGCTGGGTCAAATGGTAT 780

104277570 TTCTGGTTCTAGGTCTTTGAGGAATTGCTACACTGTCTTCCACAAGTAAAACCCAGAACT 104277629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTCTGGTTCTAGGTCTTTGAGGAATTGCTACACTGTCTTCCACAAGTAAAACCCAGAACT 840

104277630 ATAAAAACCCTAGAAGAAAAGCTAGACAGTACCATTCAGGACATCGGCACAGGCAAAGAT 104277689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATAAAAACCCTAGAAGAAAAGCTAGACAGTACCATTCAGGACATCGGCACAGGCAAAGAT 900

104277690 TTCATGACAAAAATGTCAAAAGCAATTGCAACAAACACAAAACTTGACAAATGGGATCTA 104277749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTCATGACAAAAATGTCAAAAGCAATTGCAACAAACACAAAACTTGACAAATGGGATCTA 960

104277750 ATTAAACTAGAGCTTCTGCACAGCAAAAGAAACTATCATCAGAGTGGACAGACAACCTAC 104277809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATTAAACTAGAGCTTCTGCACAGCAAAAGAAACTATCATCAGAGTGGACAGACAACCTAC 1020

104277810 AGAATGGGAGAAAAGTTTGCAGTCTATTCATCCGACAAAGGTTGAATATCCAGAATCTAC 104277869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGAATGGGAGAAAAGTTTGCAGTCTATTCATCCGACAAAGGTTGAATATCCAGAATCTAC 1080

104277870 AAGGAACTTAGTTCCAATTTACAAGAAAAAAAAAAAACACCATTAAAAAGTCGGCAAAGG 104277929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAGGAACTTAGTTCCAATTTACAAGAAAAAAAAAAAACACCATTAAAAAGTCGGCAAAGG 1140

104277930 ACATAAACAGACACTTCTCAAAAGAAGACATTACGTGGCCACCAAACATATGAAAAAAAA 104277989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ACATAAACAGACACTTCTCAAAAGAAGACATTACGTGGCCACCAAACATATGAAAAAAAA 1200

104277990 CTCAACCTCACTGATCATTAGAGAAATACAAATCAAAACCACCAAGAGATACCATCGCAT 104278049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CTCAACCTCACTGATCATTAGAGAAATACAAATCAAAACCACCAAGAGATACCATCGCAT 1260

104278050 GCCAGTCAGAATGGTGATTATTAAAAAGTCAAGGAACAATAGATGCTGGTGAGGCTGTGG 104278109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GCCAGTCAGAATGGTGATTATTAAAAAGTCAAGGAACAATAGATGCTGGTGAGGCTGTGG 1320

104278110 AGAAATAGGAATGCTCTTTTGCACTGTTGATGGGAATCTCTGAAAATATTTATTCCTTTG 104278169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AGAAATAGGAATGCTCTTTTGCACTGTTGATGGGAATCTCTGAAAATATTTATTCCTTTG 1380

104278170 AATGAGTTTAGCATAGGATGTTACCCTTAAAAGGATATTTGCATTCTAGAACACAGAGAG 104278229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AATGAGTTTAGCATAGGATGTTACCCTTAAAAGGATATTTGCATTCTAGAACACAGAGAG 1440

104278230 AAAGCTGAAGTAAAACACAAAATCAGTTCCAGTGCTTACAGAATTTGGATTATAGAGTGT 104278289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AAAGCTGAAGTAAAACACAAAATCAGTTCCAGTGCTTACAGAATTTGGATTATAGAGTGT 1500

104278290 GATGGAATGCATTATATCTCTTCAAATTCATATGCTGAAACCCTAACCCTAAGTGGGACT 104278349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GATGGAATGCATTATATCTCTTCAAATTCATATGCTGAAACCCTAACCCTAAGTGGGACT 1560

104278350 GTACTTGTAAACAGGGCCTTTAAAAGAAGTAAGCACATTAAAGTGAAACTGGTAAGAGTG 104278409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GTACTTGTAAACAGGGCCTTTAAAAGAAGTAAGCACATTAAAGTGAAACTGGTAAGAGTG 1620

104278410 TGCCTTGATCCAATCTGATTGGTGTCCTTATAAGAAGTGGAAATTTGAACACACAAAGAG 104278469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TGCCTTGATCCAATCTGATTGGTGTCCTTATAAGAAGTGGAAATTTGAACACACAAAGAG 1680

104278470 AAACATCAGGGGAGCTTACACACAGAGAAAATCCCATATAAGGACACAGCGAGAAAGCAG 104278529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AAACATCAGGGGAGCTTACACACAGAGAAAATCCCATATAAGGACACAGCGAGAAAGCAG 1740

104278530 CCATGTGCAAGCTAAGGAAAGACTCCGAAGAAACCAAATGTGCTGACTCTTTGAGCTTGA 104278589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CCATGTGCAAGCTAAGGAAAGACTCCGAAGAAACCAAATGTGCTGACTCTTTGAGCTTGA 1800

104278590 ACTTCTAGCCTCCAGAACTGTGTGTAAATCAATTTCTGTTATTTAAACCTCTATGTGGTA 104278649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ACTTCTAGCCTCCAGAACTGTGTGTAAATCAATTTCTGTTATTTAAACCTCTATGTGGTA 1860

104278650 TTTTGTAATGGCATGACCAGAAAACTAATACATAGATAAAATAACATTAAAAATAATCAT 104278709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTTTGTAATGGCATGACCAGAAAACTAATACATAGATAAAATAACATTAAAAATAATCAT 1920

104278710 CTTATAAGTGGTCAGTGGTAAAAATTTGTCAGCAACTTTTACCCACAATTAGACCTTTTA 104278769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CTTATAAGTGGTCAGTGGTAAAAATTTGTCAGCAACTTTTACCCACAATTAGACCTTTTA 1980

104278770 AAAAAATAATTTCAAAATCAGGGAAAAAATTCAGATTGATTAGTCCTCATGATTTTAAGG 104278829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AAAAAATAATTTCAAAATCAGGGAAAAAATTCAGATTGATTAGTCCTCATGATTTTAAGG 2040

104278830 TTATCAGTGTCAGAACAAGGAAAGCAGGAGAATAGATAGTTAT 104278872
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TTATCAGTGTCAGAACAAGGAAAGCAGGAGAATAGATAGTTAT 2083

Alignment time is 1.35838 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [104268199,104289046] =>     20848 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     6970] =>      6970 nucs 'mol-32-3311-180935_6970'

Score:        6924
Aligned:      6968        nucs
Identic:      6964 (100%) nucs =>      2989 (100%)      3975 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [104273764,104276754] EXCISED REGION [104276755,104280731]
 second seq =>  [        1,     2991] EXCISED REGION [     2994,     6970]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [2992,2993]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        22 nucs [2992,3013] to [2994,3015]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [104276754,104276754] to [104276755,104276755]
 second seq =>         1 nucs [2991,2991] to [2994,2994]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

104273764 AAGCATGAAAACCTTATGCAGATCAGTTCACCTTTTTTGGGATGCTTCCTCATTTATAAA 104273823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAGCATGAAAACCTTATGCAGATCAGTTCACCTTTTTTGGGATGCTTCCTCATTTATAAA 60

104273824 ATGAAAGATTTTAACTGAGTAATTGCTCAGATTCCTAGAACTGTGTAACTCTAAAAAGAT 104273883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATGAAAGATTTTAACTGAGTAATTGCTCAGATTCCTAGAACTGTGTAACTCTAAAAAGAT 120

104273884 TTCCATAACCCTAGGTTATTTTTTCCTGGTTAACAAATTTTTTGGTTAGACAAAAACAAC 104273943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTCCATAACCCTAGGTTATTTTTTCCTGGTTAACAAATTTTTTGGTTAGACAAAAACAAC 180

104273944 AATAGCTTATACATCATGTAAATCGTTGTTTCTTTGTGCAGAATTAGGGGCTATATCTAC 104274003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AATAGCTTATACATCATGTAAATCGTTGTTTCTTTGTGCAGAATTAGGGGCTATATCTAC 240

104274004 CATAGGAGTAGTTGGCTCAGTGGCTAGGCCCTTGAGTCTGGAGTAAAAGGCTACAGCCGA 104274063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CATAGGAGTAGTTGGCTCAGTGGCTAGGCCCTTGAGTCTGGAGTAAAAGGCTACAGCCGA 300

104274064 GACAGTCTCATAGTCATGTGATAAATTGCTTCTGTCTTCTATACTATTAAAGCTCTTAGA 104274123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GACAGTCTCATAGTCATGTGATAAATTGCTTCTGTCTTCTATACTATTAAAGCTCTTAGA 360

104274124 AGTTATGGCAAACTACTTATTTCACTCAGGTTTGTATTATATTATGTCAAAACATATCTA 104274183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGTTATGGCAAACTACTTATTTCACTCAGGTTTGTATTATATTATGTCAAAACATATCTA 420

104274184 TCCTTCTCCTATCACTGTGCTACTATAATGTACTTCTTTAGGGACATGACCATGCCGTTT 104274243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCCTTCTCCTATCACTGTGCTACTATAATGTACTTCTTTAGGGACATGACCATGCCGTTT 480

104274244 AACTTACATCTCTCTCGCTGTACCAAATAAGACTCCCCTCACAATTTACTCAGTAAATGT 104274303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AACTTACATCTCTCTCGCTGTACCAAATAAGACTCCCCTCACAATTTACTCAGTAAATGT 540

104274304 TTGTGGAGTAAGATTTTCACTGGCCTCATTTCTCCAACTATCCTGCTTGGCAACTAATCC 104274363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTGTGGAGTAAGATTTTCACTGGCCTCATTTCTCCAACTATCCTGCTTGGCAACTAATCC 600

104274364 ACAGTCATATAGGCCTCTTTTCACTTCTTTTAGTTTCTTAAATTTGGGCCTCCGCACCCC 104274423
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ACGGTCATATAGGCCTCTTTTCACTTCTTTTAGTTTCTTAAATTTGGGCCTCCGCACCCC 660

104274424 CACTCCAGCTCATGCTATTTATTCTACTTTTAATGATATACTGCCTGCTCGATTCCCATT 104274483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CACTCCAGCTCATGCTATTTATTCTACTTTTAATGATATACTGCCTGCTCGATTCCCATT 720

104274484 CCCAGCTCCAACATTCACACTCTTCATCTTGCCCATCTTTCAGAACTCAGCTTCACTATC 104274543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CCCAGCTCCAACATTCACACTCTTCATCTTGCCCATCTTTCAGAACTCAGCTTCACTATC 780

104274544 TCTTAGGTGACCTTGAATAAGATCTTAATACTTTTCCTTTCCAACAAATAACCCAGTTTT 104274603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCTTAGGTGACCTTGAATAAGATCTTAATACTTTTCCTTTCCAACAAATAACCCAGTTTT 840

104274604 AATTATCTAATTGATTATGATATCACTTATTCATCACTGTGTATCAACTCATCCCAGATT 104274663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AATTATCTAATTGATTATGATATCACTTATTCATCACTGTGTATCAACTCATCCCAGATT 900

104274664 CAATGGCTTCAAACAGAGAAACAAAAAAATACATTTTACTGCTTACATTCAGTAGGTTGG 104274723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CAATGGCTTCAAACAGAGAAACAAAAAAATACATTTTACTGCTTACATTCAGTAGGTTGG 960

104274724 CCAGGTATTACATCAGCTGCTCTCTCCTGGGTTCACTCAACTGGAAGGATGAAAATGGCT 104274783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CCAGGTATTACATCAGCTGCTCTCTCCTGGGTTCACTCAACTGGAAGGATGAAAATGGCT 1020

104274784 TTATTCACATGTCTGGCAGTTGGTGCTTTTGCTGATTGATGGCCTCTCATTCTCCAGTAC 104274843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTATTCACATGTCTGGCAGTTGGTGCTTTTGCTGATTGATGGCCTCTCATTCTCCAGTAC 1080

104274844 GTTAGACAAGTTTTCTTATGTTGTAGTCTCAGGACATTATTACAACTGGCAAAAACAGAA 104274903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GTTAGACAAGTTTTCTTATGTTGTAGTCTCAGGACATTATTACAACTGGCAAAAACAGAA 1140

104274904 ACTGTAAGGTGTCTAAAACCTAGGATCCAGAATTTACACACTAAGCTTCTGTCTCATTCT 104274963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ACTGTAAGGTGTCTAAAACCTAGGATCCAGAATTTACACACTAAGCTTCTGTCTCATTCT 1200

104274964 ATTAATTAAAGCAATTTATAAGGCCAGCCCAAATTCAAGAGAGTGGAGGAACAGACTCCA 104275023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATTAATTAAAGCAATTTATAAGGCCAGCCCAAATTCAAGAGAGTGGAGGAACAGACTCCA 1260

104275024 CTTTTTGTTGGAAGGAACAAAAACATTACATTGCTCTGGGACATGGACACAAGGAGGCTT 104275083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTTTTTGTTGGAAGGAACAAAAACATTACATTGCTCTGGGACATGGACACAAGGAGGCTT 1320

104275084 GACTCATGGGGACCATATTATAACTCTCTACTACATTATGTAAAATTACTAATTTAATTT 104275143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GACTCATGGGGACCATATTATAACTCTCTACTACATTATGTAAAATTACTAATTTAATTT 1380

104275144 CTATATTCCCCACTAGACTATCTGTGTATATGAATAGGGACCATGCATTTCCTAATTTAT 104275203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CTATATTCCCCACTAGACTATCTGTGTATATGAATAGGGACCATGCATTTCCTAATTTAT 1440

104275204 GTTATATTGCCAGCATTTAATGCAGTCTTTATATGTGCTAGGCATTAATAAATATTTGTT 104275263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GTTATATTGCCAGCATTTAATGCAGTCTTTATATGTGCTAGGCATTAATAAATATTTGTT 1500

104275264 GAATGAATAATTAAATGGCTAAATTAATAACAGAGTGGATGAATTAACTTGAAAAAAGAT 104275323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GAATGAATAATTAAATGGCTAAATTAATAACAGAGTGGATGAATTAACTTGAAAAAAGAT 1560

104275324 TTCATGAACTATCAGCATGAAGATTTATCCACAAAAATAGAGAAGTGTTTCTTTTTTTGA 104275383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTCATGAACTATCAGCATGAAGATTTATCCACAAAAATAGAGAAGTGTTTCTTTTTTTGA 1620

104275384 CCACATGAAAAACTAGAAACCATGTAAGCAGAAGTTATCTAAGTTAACTTTTATTGAGTA 104275443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CCACATGAAAAACTAGAAACCATGTAAGCAGAAGTTATCTAAGTTAACTTTTATTGAGTA 1680

104275444 ACTGGACACAGAATTCAGGTGCTCTGTTGTTTTCTATTGCTGCTATAACAAAACGTCACA 104275503
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ACTGGACTCAGAATTCAGGTGCTCTGTTGTTTTCTATTGCTGCTATAACAAAACGTCACA 1740

104275504 AACAGCAAATTACTGCAACATGAATTTATTAGCTCACAGTTCTACCAGTCAGAATTCTGG 104275563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AACAGCAAATTACTGCAACATGAATTTATTAGCTCACAGTTCTACCAGTCAGAATTCTGG 1800

104275564 TGTGGTTTAATTTAGTTCTCTGCTCAGGTTTCTCACAAGCCAGAAATTAAAATAGCAACT 104275623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TGTGGTTTAATTTAGTTCTCTGCTCAGGTTTCTCACAAGCCAGAAATTAAAATAGCAACT 1860

104275624 GACTAGGCTCTTATCTGTAAGATCTGATGTCGAAACAATTTCCAAGCTGAATGATGTTTT 104275683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GACTAGGCTCTTATCTGTAAGATCTGATGTCGAAACAATTTCCAAGCTGAATGATGTTTT 1920

104275684 TAGTAGAACTTAGCTCCTTGCAGTTGCAGAACTAAGGTTCTCCCTTCTTGCTGGCTGGTG 104275743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TAGTAGAACTTAGCTCCTTGCAGTTGCAGAACTAAGGTTCTCCCTTCTTGCTGGCTGGTG 1980

104275744 GCTGGGAGTCACCCTCAGCTCCTCCAGTGAGCCCACATTCTTTCCGCATGTCTTCCTTTA 104275803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GCTGGGAGTCACCCTCAGCTCCTCCAGTGAGCCCACATTCTTTCCGCATGTCTTCCTTTA 2040

104275804 TCTTCAAGCCAGCAACAATGCATCGGGCCCTTCTCTGCTCAGATCTCCCTGACTTCCTCT 104275863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TCTTCAAGCCAGCAACAATGCATCGGGCCCTTCTCTGCTCAGATCTCCCTGACTTCCTCT 2100

104275864 GCTGTCCTCACCAAGGAGAATACTTTGATTTAAGGACTCCTGTAATTACATTGGCCCACC 104275923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GCTGTCCTCACCAAGGAGAATACTTTGATTTAAGGACTCCTGTAATTACATTGGCCCACC 2160

104275924 TGGGAAATCTAGGCTAATCTCTGTATCTTAAACTCAATTGATTCTTAACCTTAATTACCT 104275983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TGGGAAATCTAGGCTAATCTCTGTATCTTAAACTCAATTGATTCTTAACCTTAATTACCT 2220

104275984 CTGCAATGTCATTTTGCCATGTAATATAACATATTCACAGGTGTAACACCAGGGAGCAAA 104276043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CTGCAATGTCATTTTGCCATGTAATATAACATATTCACAGGTGTAACACCAGGGAGCAAA 2280

104276044 GGTCAGAGAGCCAAAATTCTGTCTACCGTTGATACTCAACAGCAATAAACATTCAGCTGT 104276103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GGTCAGAGAGCCAAAATTCTGTCTACCGTTGATACTCAACAGCAATAAACATTCAGCTGT 2340

104276104 AGGAAACCTGAAGTCTCCAGAGAGATAATTTAGATAAAATACAGCCTTAAGTATAGGACA 104276163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AGGAAACCTGAAGTCTCCAGAGAGATAATTTAGATAAAATACAGCCTTAAGTATAGGACA 2400

104276164 GACCTGCTTAGAATCAGGAGTCTAAATTTTTTTGGTTACACAAATATAGCCAATTCTCTT 104276223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GACCTGCTTAGAATCAGGAGTCTAAATTTTTTTGGTTACACAAATATAGCCAATTCTCTT 2460

104276224 TACCATTATAAATCTCAGCTTTATTTTTTTAATCTGAAAAATGCAAATATTGCTGCATCT 104276283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TACCATTATAAATCTCAGCTTTATTTTTTTAATCTGAAAAATGCAAATATTGCTGCATCT 2520

104276284 CTATCATGTTGCTTTTAACATTAATATAAGAAACATACATATAATCAGCAAAAAAGATTT 104276343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CTATCATGTTGCTTTTAACATTAATATAAGAAACATACATATAATCAGCAAAAAAGATTT 2580

104276344 TTAAAACCTTACATATCAAAGATTACAAAAGAGAATTAGGAGAAAGAACAAAGTCTAAAG 104276403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TTAAAACCTTACATATCAAAGATTACAAAAGAGAATTAGGAGAAAGAACAAAGTCTAAAG 2640

104276404 ATGTTGAGAGAGTACCCTAAAGTTATCTATTTATTTATTCACTTGTTCAAAAATATTTAG 104276463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 ATGTTGAGAGAGTACCCTAAAGTTATCTATTTATTTATTCACTTGTTCAAAAATATTTAG 2700

104276464 GACTAGGCCAGCCACAGTGGCTCATGCCTGTAATTCCAGCACTTTGGGGGGCCAAGGTGG 104276523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GACTAGGCCAGCCACAGTGGCTCATGCCTGTAATTCCAGCACTTTGGGGGGCCAAGGTGG 2760

104276524 GTGGATCACTTGAAGTCAGGAGTTTGAGATCAACCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCT 104276583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GTGGATCACTTGAAGTCAGGAGTTTGAGATCAACCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCT 2820

104276584 CTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCACGTGCCTGTAATCCCAGCTATTT 104276643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCACGTGCCTGTAATCCCAGCTATTT 2880

104276644 GGGAGACTGCATCAGGAAAATTGCTTGAATCCAGGAGGCGGAGGGTGCAGTGAGCCAAGA 104276703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 GGGAGACTGCATCAGGAAAATTGCTTGAATCCAGGAGGCGGAGGGTGCAGTGAGCCAAGA 2940

104276704 TTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGACAACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAA 104276754
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGACAACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAA 2991

EXCISED REGION

104276755 ATATATATATATATATATATATTTAGGACTAGGTTTCGATGAAATTAACCTAACAACCAA 104276814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2994 ATATATATATATATATATATATTTAGGACTAGGTTTCGATGAAATTAACCTAACAACCAA 3053

104276815 CACTTAATCCTTTGAGAAACTACTTTCTCAACTGCATGGAACTTACCTAGGATAAAAATT 104276874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3054 CACTTAATCCTTTGAGAAACTACTTTCTCAACTGCATGGAACTTACCTAGGATAAAAATT 3113

104276875 AAAATTTAGGAGAAAGTGATTTCAGAGCTCCAAATCTGTCCTGTCTGCCCTCATTTCCAT 104276934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3114 AAAATTTAGGAGAAAGTGATTTCAGAGCTCCAAATCTGTCCTGTCTGCCCTCATTTCCAT 3173

104276935 AATCTGCTTTGACTGCCATTTTGTATATCCCCTATAATTTAACCTACTTATTGATCCCAT 104276994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3174 AATCTGCTTTGACTGCCATTTTGTATATCCCCTATAATTTAACCTACTTATTGATCCCAT 3233

104276995 GATCTCTGAAAATATTCTTTTTAATTTAATTTAATTTTTAGTTCTGGGATACATGGGCAG 104277054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3234 GATCTCTGAAAATATTCTTTTTAATTTAATTTAATTTTTAGTTCTGGGATACATGGGCAG 3293

104277055 GATATGCAGCCTTGTTATATGGGTAAATGTGTTCCATGGTGGTTTGCTGCACCTATCAAA 104277114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3294 GATATGCAGCCTTGTTATATGGGTAAATGTGTTCCATGGTGGTTTGCTGCACCTATCAAA 3353

104277115 CCATCACCTAGGTATTAAGCCCCGCATGCATTAGCTACTCTTTCTGATGCGCTCCCTCCC 104277174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3354 CCATCACCTAGGTATTAAGCCCCGCATGCATTAGCTACTCTTTCTGATGCGCTCCCTCCC 3413

104277175 ACCACATCCCCAACCAACGGGCCCCATTATGTGTTGTTCCTTTCTCTGTTTTTATGTGTT 104277234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3414 ACCACATCCCCAACCAACGGGCCCCATTATGTGTTGTTCCTTTCTCTGTTTTTATGTGTT 3473

104277235 CTCATTGTTCAGCTTCCACTTATAAGTGAGAACATGTAGTGTTTAATTTTCTGTTCCTGT 104277294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3474 CTCATTGTTCAGCTTCCACTTATAAGTGAGAACATGTAGTGTTTAATTTTCTGTTCCTGT 3533

104277295 GTTAGTTTGCTGAGGATAATGGCTTCCAGCTCCATCCCTTTTCCTGCAAAGGACATGATC 104277354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3534 GTTAGTTTGCTGAGGATAATGGCTTCCAGCTCCATCCCTTTTCCTGCAAAGGACATGATC 3593

104277355 TCATTACTTTTTATGACTGCATAGTGTTCCATGGTGTAAATATATCACATTTTCATTTTC 104277414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3594 TCATTACTTTTTATGACTGCATAGTGTTCCATGGTGTAAATATATCACATTTTCATTTTC 3653

104277415 CAGTCTATCATTGATGGGCATTTGGGTTAATTCCATGTCTTTTCTACAGTGAATAGTGCT 104277474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3654 CAGTCTATCATTGATGGGCATTTGGGTTAATTCCATGTCTTTTCTACAGTGAATAGTGCT 3713

104277475 CCAGTGAACATACATGTGCAGGTATCTTTATAATAGAATGATTTATATTCTTTTGGGTAC 104277534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3714 CCAGTGAACATACATGTGCAGGTATCTTTATAATAGAATGATTTATATTCTTTTGGGTAC 3773

104277535 ATACCCAGTAATGGGATTGCTGGGTCAAATGGTATTTCTGGTTCTAGGTCTTTGAGGAAT 104277594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3774 ATACCCAGTAATGGGATTGCTGGGTCAAATGGTATTTCTGGTTCTAGGTCTTTGAGGAAT 3833

104277595 TGCTACACTGTCTTCCACAAGTAAAACCCAGAACTATAAAAACCCTAGAAGAAAAGCTAG 104277654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3834 TGCTACACTGTCTTCCACAAGTAAAACCCAGAACTATAAAAACCCTAGAAGAAAAGCTAG 3893

104277655 ACAGTACCATTCAGGACATCGGCACAGGCAAAGATTTCATGACAAAAATGTCAAAAGCAA 104277714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3894 ACAGTACCATTCAGGACATCGGCACAGGCAAAGATTTCATGACAAAAATGTCAAAAGCAA 3953

104277715 TTGCAACAAACACAAAACTTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAGAGCTTCTGCACAGCA 104277774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3954 TTGCAACAAACACAAAACTTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAGAGCTTCTGCACAGCA 4013

104277775 AAAGAAACTATCATCAGAGTGGACAGACAACCTACAGAATGGGAGAAAAGTTTGCAGTCT 104277834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4014 AAAGAAACTATCATCAGAGTGGACAGACAACCTACAGAATGGGAGAAAAGTTTGCAGTCT 4073

104277835 ATTCATCCGACAAAGGTTGAATATCCAGAATCTACAAGGAACTTAGTTCCAATTTACAAG 104277894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4074 ATTCATCCGACAAAGGTTGAATATCCAGAATCTACAAGGAACTTAGTTCCAATTTACAAG 4133

104277895 AAAAAAAAAAAACACCATTAAAAAGTCGGCAAAGGACATAAACAGACACTTCTCAAAAGA 104277954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4134 AAAAAAAAAAAACACCATTAAAAAGTCGGCAAAGGACATAAACAGACACTTCTCAAAAGA 4193

104277955 AGACATTACGTGGCCACCAAACATATGAAAAAAAACTCAACCTCACTGATCATTAGAGAA 104278014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4194 AGACATTACGTGGCCACCAAACATATGAAAAAAAACTCAACCTCACTGATCATTAGAGAA 4253

104278015 ATACAAATCAAAACCACCAAGAGATACCATCGCATGCCAGTCAGAATGGTGATTATTAAA 104278074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4254 ATACAAATCAAAACCACCAAGAGATACCATCGCATGCCAGTCAGAATGGTGATTATTAAA 4313

104278075 AAGTCAAGGAACAATAGATGCTGGTGAGGCTGTGGAGAAATAGGAATGCTCTTTTGCACT 104278134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4314 AAGTCAAGGAACAATAGATGCTGGTGAGGCTGTGGAGAAATAGGAATGCTCTTTTGCACT 4373

104278135 GTTGATGGGAATCTCTGAAAATATTTATTCCTTTGAATGAGTTTAGCATAGGATGTTACC 104278194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4374 GTTGATGGGAATCTCTGAAAATATTTATTCCTTTGAATGAGTTTAGCATAGGATGTTACC 4433

104278195 CTTAAAAGGATATTTGCATTCTAGAACACAGAGAGAAAGCTGAAGTAAAACACAAAATCA 104278254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4434 CTTAAAAGGATATTTGCATTCTAGAACACAGAGAGAAAGCTGAAGTAAAACACAAAATCA 4493

104278255 GTTCCAGTGCTTACAGAATTTGGATTATAGAGTGTGATGGAATGCATTATATCTCTTCAA 104278314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4494 GTTCCAGTGCTTACAGAATTTGGATTATAGAGTGTGATGGAATGCATTATATCTCTTCAA 4553

104278315 ATTCATATGCTGAAACCCTAACCCTAAGTGGGACTGTACTTGTAAACAGGGCCTTTAAAA 104278374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4554 ATTCATATGCTGAAACCCTAACCCTAAGTGGGACTGTACTTGTAAACAGGGCCTTTAAAA 4613

104278375 GAAGTAAGCACATTAAAGTGAAACTGGTAAGAGTGTGCCTTGATCCAATCTGATTGGTGT 104278434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4614 GAAGTAAGCACATTAAAGTGAAACTGGTAAGAGTGTGCCTTGATCCAATCTGATTGGTGT 4673

104278435 CCTTATAAGAAGTGGAAATTTGAACACACAAAGAGAAACATCAGGGGAGCTTACACACAG 104278494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4674 CCTTATAAGAAGTGGAAATTTGAACACACAAAGAGAAACATCAGGGGAGCTTACACACAG 4733

104278495 AGAAAATCCCATATAAGGACACAGCGAGAAAGCAGCCATGTGCAAGCTAAGGAAAGACTC 104278554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4734 AGAAAATCCCATATAAGGACACAGCGAGAAAGCAGCCATGTGCAAGCTAAGGAAAGACTC 4793

104278555 CGAAGAAACCAAATGTGCTGACTCTTTGAGCTTGAACTTCTAGCCTCCAGAACTGTGTGT 104278614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4794 CGAAGAAACCAAATGTGCTGACTCTTTGAGCTTGAACTTCTAGCCTCCAGAACTGTGTGT 4853

104278615 AAATCAATTTCTGTTATTTAAACCTCTATGTGGTATTTTGTAATGGCATGACCAGAAAAC 104278674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4854 AAATCAATTTCTGTTATTTAAACCTCTATGTGGTATTTTGTAATGGCATGACCAGAAAAC 4913

104278675 TAATACATAGATAAAATAACATTAAAAATAATCATCTTATAAGTGGTCAGTGGTAAAAAT 104278734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4914 TAATACATAGATAAAATAACATTAAAAATAATCATCTTATAAGTGGTCAGTGGTAAAAAT 4973

104278735 TTGTCAGCAACTTTTACCCACAATTAGACCTTTTAAAAAAATAATTTCAAAATCAGGGAA 104278794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4974 TTGTCAGCAACTTTTACCCACAATTAGACCTTTTAAAAAAATAATTTCAAAATCAGGGAA 5033

104278795 AAAATTCAGATTGATTAGTCCTCATGATTTTAAGGTTATCAGTGTCAGAACAAGGAAAGC 104278854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5034 AAAATTCAGATTGATTAGTCCTCATGATTTTAAGGTTATCAGTGTCAGAACAAGGAAAGC 5093

104278855 AGGAGAATAGATAGTTATATAATGTAATAATTATAATGGCTGAGAAAAGTGAAAGACTAA 104278914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5094 AGGAGAATAGATAGTTATATAATGTAATAATTATAATGGCTGAGAAAAGTGAAAGACTAA 5153

104278915 TTTTACTTGCTTATTCACATAAAATTTCTCAGAATGATAAAATAATGGTACTTTTATTGA 104278974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5154 TTTTACTTGCTTATTCACATAAAATTTCTCAGAATGATAAAATAATGGTACTTTTATTGA 5213

104278975 CAAAACTACAGAGAACTGCTATAATTGTTAAGTTACATGTGGCTACCTATATGTTACATT 104279034
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     5214 CAAAACTACAGAGAACTGCTATAATTGCTAAGTTACATGTGGCTACCTATATGTTACATT 5273

104279035 GGTTATCTATATATGCTTGTTATAACAATGTACTTTTTTGTATACCTCTACTTGGAAATG 104279094
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     5274 GGTTATCTATATATGCTTGTTATAACAATGTACTTTTTTGTATACCTTTACTTGGAAATG 5333

104279095 TATTATAGTTAAGATTCATTCATTCGACTAATATGTATTGAGTGCCTACTATGTGCCAGG 104279154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5334 TATTATAGTTAAGATTCATTCATTCGACTAATATGTATTGAGTGCCTACTATGTGCCAGG 5393

104279155 CACATGTTTTAGCTAATGTTGATGAATGGTATGGATAAAGGCCTTGACACATTCATATTT 104279214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5394 CACATGTTTTAGCTAATGTTGATGAATGGTATGGATAAAGGCCTTGACACATTCATATTT 5453

104279215 AGAAAGATGGAAATAAATACATCAACAACATGCAATCTAATAGAGTTAGTAATGATAAAG 104279274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5454 AGAAAGATGGAAATAAATACATCAACAACATGCAATCTAATAGAGTTAGTAATGATAAAG 5513

104279275 ATAAAACAGAATATAGAGAGTAAATAAGGGACCTATTTTCTATATGGTGGTCAAAAATGG 104279334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5514 ATAAAACAGAATATAGAGAGTAAATAAGGGACCTATTTTCTATATGGTGGTCAAAAATGG 5573

104279335 ACCCTGTGATTACAGCTGAATACAGACTTGAATAAAACGAGAAAGCAAGTAATTCACATA 104279394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5574 ACCCTGTGATTACAGCTGAATACAGACTTGAATAAAACGAGAAAGCAAGTAATTCACATA 5633

104279395 TCTGAGGAGAAAACTCTTTAGACACAGGGACCAGAAAGTTCAGGGGCCTTCAGCCAGAAA 104279454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5634 TCTGAGGAGAAAACTCTTTAGACACAGGGACCAGAAAGTTCAGGGGCCTTCAGCCAGAAA 5693

104279455 TATTATTGACATGTGTAAATGAAGTAGCAAAGATAGTTGTTTGAGGAGGTGAAAAGGAAA 104279514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5694 TATTATTGACATGTGTAAATGAAGTAGCAAAGATAGTTGTTTGAGGAGGTGAAAAGGAAA 5753

104279515 ATAGTGAAGATCAAATTGAAGAGACAATCAAGGCCATGCAGACTGTGGCAAGAACTTTGG 104279574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5754 ATAGTGAAGATCAAATTGAAGAGACAATCAAGGCCATGCAGACTGTGGCAAGAACTTTGG 5813

104279575 AACTTCTGTTTATTATCCGAAGAGGCCATTGGAAGGTTATAAACAAGATATAAACATGAT 104279634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5814 AACTTCTGTTTATTATCCGAAGAGGCCATTGGAAGGTTATAAACAAGATATAAACATGAT 5873

104279635 CTGACCTGTGTTTTGAAAGGATTTTTCTGGATAGGGAGTGAAAATTATATTGAAAGTGAA 104279694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5874 CTGACCTGTGTTTTGAAAGGATTTTTCTGGATAGGGAGTGAAAATTATATTGAAAGTGAA 5933

104279695 AAGATTGTAGATATAGTAGCAGTGGTAGGACTTGGGATATATATTACATACATTAGAGCT 104279754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5934 AAGATTGTAGATATAGTAGCAGTGGTAGGACTTGGGATATATATTACATACATTAGAGCT 5993

104279755 ATCCTTAACTGTATCAACTGGTCTCATTGGGTATGAGAAGAAGATCAAAGTCAAGGCCAA 104279814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5994 ATCCTTAACTGTATCAACTGGTCTCATTGGGTATGAGAAGAAGATCAAAGTCAAGGCCAA 6053

104279815 TTTTAATATGTTTGGCCTGAGCAAGAAGGTGATATCCTTTCATGAAATGGGGATCAGTGA 104279874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6054 TTTTAATATGTTTGGCCTGAGCAAGAAGGTGATATCCTTTCATGAAATGGGGATCAGTGA 6113

104279875 GAGGGGAGAAATTTACAGAGAAAAATTAAGAGTTTGGTTTTGGACCTATTAAAATTTGAG 104279934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6114 GAGGGGAGAAATTTACAGAGAAAAATTAAGAGTTTGGTTTTGGACCTATTAAAATTTGAG 6173

104279935 AAACCTGTGAGAAGTTTAAGAGGAAATGTTGATGAAGAGGAAGTTCGAAATAAGAGTCGA 104279994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6174 AAACCTGTGAGAAGTTTAAGAGGAAATGTTGATGAAGAGGAAGTTCGAAATAAGAGTCGA 6233

104279995 GAGTCCAGGGAATTGGTTTGGAGCTGGAGATTTTTTAAATTGAGAAGTTATTGGTAGATA 104280054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6234 GAGTCCAGGGAATTGGTTTGGAGCTGGAGATTTTTTAAATTGAGAAGTTATTGGTAGATA 6293

104280055 CAAGATATTTGCAGTCATGAGAGCTAACAGTTACCTAGGGAGGGAGTAAAGATGAAGAGC 104280114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6294 CAAGATATTTGCAGTCATGAGAGCTAACAGTTACCTAGGGAGGGAGTAAAGATGAAGAGC 6353

104280115 TGAAATTTAAGGATAAAATTCCAGGGATCTAGAAATTTGGAAAATTGGAAGAAGAGGTGA 104280174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6354 TGAAATTTAAGGATAAAATTCCAGGGATCTAGAAATTTGGAAAATTGGAAGAAGAGGTGA 6413

104280175 AGCCAGAAAAGACTAAGAAGGAGAGGTCAAGGAAGTAGGTGGGACAATAAAAGGATGTAG 104280234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6414 AGCCAGAAAAGACTAAGAAGGAGAGGTCAAGGAAGTAGGTGGGACAATAAAAGGATGTAG 6473

104280235 AATCTTGGCAACTGAGTGATGAAAAAATTCTTTAAAGAATCAGAAAGTGACTGGTAAACT 104280294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6474 AATCTTGGCAACTGAGTGATGAAAAAATTCTTTAAAGAATCAGAAAGTGACTGGTAAACT 6533

104280295 GGGTCAAAAGCTAGAGATTGAGTAAAAACTGAAACTTTTCTTCATTTTAACATACTTTCG 104280354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6534 GGGTCAAAAGCTAGAGATTGAGTAAAAACTGAAACTTTTCTTCATTTTAACATACTTTCG 6593

104280355 CTTTCAAGAAAATTATTACACTAAGGGGGAATAGCAGAGCAATCTATTAGTGTTGCAGAG 104280414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6594 CTTTCAAGAAAATTATTACACTAAGGGGGAATAGCAGAGCAATCTATTAGTGTTGCAGAG 6653

104280415 GACAGATGTGGCTTTTTCAGATGCTCAGAAGCACCCAATAAATTTGAAGAACAGACAGGT 104280474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6654 GACAGATGTGGCTTTTTCAGATGCTCAGAAGCACCCAATAAATTTGAAGAACAGACAGGT 6713

104280475 GTTCCTGAGAACTCAGGGAAGAATTTGGCCAATGAAGGTCACAGGACACCTGTTCTGAAA 104280534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6714 GTTCCTGAGAACTCAGGGAAGAATTTGGCCAATGAAGGTCACAGGACACCTGTTCTGAAA 6773

104280535 ATGTCCTACTGAAAATGTTCTTTAGAAGTTACAGTGTTTTCATCAAGACAATGAGATTTC 104280594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6774 ATGTCCTACTGAAAATGTTCTTTAGAAGTTACAGTGTTTTCATCAAGACAATGAGATTTC 6833

104280595 ACTTTATAACTTTACTCAGTGCCCAGGTTACCTAAAAAGTATTTTTTCATCTTCAAGGGA 104280654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6834 ACTTTATAACTTTACTCAGTGCCCAGGTTACCTAAAAAGTATTTTTTCATCTTCAAGGGA 6893

104280655 GAAAAAAACTTTGTTATTAGGTGATATAATTAGAATGTTTTAAAGAATGACATTAGTTTG 104280714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6894 GAAAAAAACTTTGTTATTAGGTGATATAATTAGAATGTTTTAAAGAATGACATTAGTTTG 6953

104280715 CATTTCACAGCCTTACT 104280731
          |||||||||||||||||
     6954 CATTTCACAGCCTTACT 6970

Alignment time is 5.10134 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [104268199,104289046] =>     20848 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     5449] =>      5449 nucs 'mol-32-33b6-080734_5449'

Score:        5417
Aligned:      5450        nucs
Identic:      5447 (100%) nucs =>      3518 (100%)      1929 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [104274679,104278199] EXCISED REGION [104279047,104280975]
 second seq =>  [        1,     3520] EXCISED REGION [     3521,     5449]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       847 nucs [104278200,104279046]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [104278200,104278200] to [104279047,104279047]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [104278199,104278199] to [104279047,104279047]
 second seq =>         1 nucs [3520,3520] to [3521,3521]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

104274679 GAGAAACAAAAAAATACATTTTACTGCTTACATTCAGTAGGTTGGCCAGGTATTACATCA 104274738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GAGAAACAAAAAAATACATTTTACTGCTTACATTCAGTAGGTTGGCCAGGTATTACATCA 60

104274739 GCTGCTCTCTCCTGGGTTCACTCAACTGGAAGGATGAAAATGGCTTTATTCACATGTCTG 104274798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCTGCTCTCTCCTGGGTTCACTCAACTGGAAGGATGAAAATGGCTTTATTCACATGTCTG 120

104274799 GCAGTTGGTGCTTTTGCTGATTGATGGCCTCTCATTCTCCAGTACGTTAGACAAGTTTTC 104274858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GCAGTTGGTGCTTTTGCTGATTGATGGCCTCTCATTCTCCAGTACGTTAGACAAGTTTTC 180

104274859 TTATGTTGTAGTCTCAGGACATTATTACAACTGGCAAAAACAGAAACTGTAAGGTGTCTA 104274918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTATGTTGTAGTCTCAGGACATTATTACAACTGGCAAAAACAGAAACTGTAAGGTGTCTA 240

104274919 AAACCTAGGATCCAGAATTTACACACTAAGCTTCTGTCTCATTCTATTAATTAAAGCAAT 104274978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAACCTAGGATCCAGAATTTACACACTAAGCTTCTGTCTCATTCTATTAATTAAAGCAAT 300

104274979 TTATAAGGCCAGCCCAAATTCAAGAGAGTGGAGGAACAGACTCCACTTTTTGTTGGAAGG 104275038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTATAAGGCCAGCCCAAATTCAAGAGAGTGGAGGAACAGACTCCACTTTTTGTTGGAAGG 360

104275039 AACAAAAACATTACATTGCTCTGGGACATGGACACAAGGAGGCTTGACTCATGGGGACCA 104275098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AACAAAAACATTACATTGCTCTGGGACATGGACACAAGGAGGCTTGACTCATGGGGACCA 420

104275099 TATTATAACTCTCTACTACATTATGTAAAATTACTAATTTAATTTCTATATTCCCCACTA 104275158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TATTATAACTCTCTACTACATTATGTAAAATTACTAATTTAATTTCTATATTCCCCACTA 480

104275159 GACTATCTGTGTATATGAATAGGGACCATGCATTTCCTAATTTATGTTATATTGCCAGCA 104275218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GACTATCTGTGTATATGAATAGGGACCATGCATTTCCTAATTTATGTTATATTGCCAGCA 540

104275219 TTTAATGCAGTCTTTATATGTGCTAGGCATTAATAAATATTTGTTGAATGAATAATTAAA 104275278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTTAATGCAGTCTTTATATGTGCTAGGCATTAATAAATATTTGTTGAATGAATAATTAAA 600

104275279 TGGCTAAATTAATAACAGAGTGGATGAATTAACTTGAAAAAAGATTTCATGAACTATCAG 104275338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGGCTAAATTAATAACAGAGTGGATGAATTAACTTGAAAAAAGATTTCATGAACTATCAG 660

104275339 CATGAAGATTTATCCACAAAAATAGAGAAGTGTTTCTTTTTTTGACCACATGAAAAACTA 104275398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CATGAAGATTTATCCACAAAAATAGAGAAGTGTTTCTTTTTTTGACCACATGAAAAACTA 720

104275399 GAAACCATGTAAGCAGAAGTTATCTAAGTTAACTTTTATTGAGTAACTGGACACAGAATT 104275458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GAAACCATGTAAGCAGAAGTTATCTAAGTTAACTTTTATTGAGTAACTGGACACAGAATT 780

104275459 CAGGTGCTCTGTTGTTTTCTATTGCTGCTATAACAAAACGTCACAAACAGCAAATTACTG 104275518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CAGGTGCTCTGTTGTTTTCTATTGCTGCTATAACAAAACGTCACAAACAGCAAATTACTG 840

104275519 CAACATGAATTTATTAGCTCACAGTTCTACCAGTCAGAATTCTGGTGTGGTTTAATTTAG 104275578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CAACATGAATTTATTAGCTCACAGTTCTACCAGTCAGAATTCTGGTGTGGTTTAATTTAG 900

104275579 TTCTCTGCTCAGGTTTCTCACAAGCCAGAAATTAAAATAGCAACTGACTAGGCTCTTATC 104275638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTCTCTGCTCAGGTTTCTCACAAGCCAGAAATTAAAATAGCAACTGACTAGGCTCTTATC 960

104275639 TGTAAGATCTGATGTCGAAACAATTTCCAAGCTGAATGATGTTTTTAGTAGAACTTAGCT 104275698
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGTAAGATCTGATGTTGAAACAATTTCCAAGCTGAATGATGTTTTTAGTAGAACTTAGCT 1020

104275699 CCTTGCAGTTGCAGAACTAAGGTTCTCCCTTCTTGCTGGCTGGTGGCTGGGAGTCACCCT 104275758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CCTTGCAGTTGCAGAACTAAGGTTCTCCCTTCTTGCTGGCTGGTGGCTGGGAGTCACCCT 1080

104275759 CAGCTCCTCCAGTGAGCCCACATTCTTTCCGCATGTCTTCCTTTATCTTCAAGCCAGCAA 104275818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CAGCTCCTCCAGTGAGCCCACATTCTTTCCGCATGTCTTCCTTTATCTTCAAGCCAGCAA 1140

104275819 CAATGCATCGGGCCCTTCTCTGCTCAGATCTCCCTGACTTCCTCTGCTGTCCTCACCAAG 104275878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CAATGCATCGGGCCCTTCTCTGCTCAGATCTCCCTGACTTCCTCTGCTGTCCTCACCAAG 1200

104275879 GAGAATACTTTGATTTAAGGACTCCTGTAATTACATTGGCCCACCTGGGAAATCTAGGCT 104275938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GAGAATACTTTGATTTAAGGACTCCTGTAATTACATTGGCCCACCTGGGAAATCTAGGCT 1260

104275939 AATCTCTGTATCTTAAACTCAATTGATTCTTAACCTTAATTACCTCTGCAATGTCATTTT 104275998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AATCTCTGTATCTTAAACTCAATTGATTCTTAACCTTAATTACCTCTGCAATGTCATTTT 1320

104275999 GCCATGTAATATAACATATTCACAGGTGTAACACCAGGGAGCAAAGGTCAGAGAGCCAAA 104276058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GCCATGTAATATAACATATTCACAGGTGTAACACCAGGGAGCAAAGGTCAGAGAGCCAAA 1380

104276059 ATTCTGTCTACCGTTGATACTCAACAGCAATAAACATTCAGCTGTAGGAAACCTGAAGTC 104276118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ATTCTGTCTACCGTTGATACTCAACAGCAATAAACATTCAGCTGTAGGAAACCTGAAGTC 1440

104276119 TCCAGAGAGATAATTTAGATAAAATACAGCCTTAAGTATAGGACAGACCTGCTTAGAATC 104276178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TCCAGAGAGATAATTTAGATAAAATACAGCCTTAAGTATAGGACAGACCTGCTTAGAATC 1500

104276179 AGGAGTCTAAATTTTTTTGGTTACACAAATATAGCCAATTCTCTTTACCATTATAAATCT 104276238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AGGAGTCTAAATTTTTTTGGTTACACAAATATAGCCAATTCTCTTTACCATTATAAATCT 1560

104276239 CAGCTTTATTTTTTTAATCTGAAAAATGCAAATATTGCTGCATCTCTATCATGTTGCTTT 104276298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CAGCTTTATTTTTTTAATCTGAAAAATGCAAATATTGCTGCATCTCTATCATGTTGCTTT 1620

104276299 TAACATTAATATAAGAAACATACATATAATCAGCAAAAAAGATTTTTAAAACCTTACATA 104276358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TAACATTAATATAAGAAACATACATATAATCAGCAAAAAAGATTTTTAAAACCTTACATA 1680

104276359 TCAAAGATTACAAAAGAGAATTAGGAGAAAGAACAAAGTCTAAAGATGTTGAGAGAGTAC 104276418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TCAAAGATTACAAAAGAGAATTAGGAGAAAGAACAAAGTCTAAAGATGTTGAGAGAGTAC 1740

104276419 CCTAAAGTTATCTATTTATTTATTCACTTGTTCAAAAATATTTAGGACTAGGCCAGCCAC 104276478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CCTAAAGTTATCTATTTATTTATTCACTTGTTCAAAAATATTTAGGACTAGGCCAGCCAC 1800

104276479 AGTGGCTCATGCCTGTAATTCCAGCACTTTGGGGGGCCAAGGTGGGTGGATCACTTGAAG 104276538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AGTGGCTCATGCCTGTAATTCCAGCACTTTGGGGGGCCAAGGTGGGTGGATCACTTGAAG 1860

104276539 TCAGGAGTTTGAGATCAACCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAA 104276598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     1861 TCAGGAGTTTGAGATCAACCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACGA 1920

104276599 AAATTAGCCAGGTGTGGTGGCACGTGCCTGTAATCCCAGCTATTTGGGAGACTGCATCAG 104276658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AAATTAGCCAGGTGTGGTGGCACGTGCCTGTAATCCCAGCTATTTGGGAGACTGCATCAG 1980

104276659 GAAAATTGCTTGAATCCAGGAGGCGGAGGGTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCACTGCACT 104276718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GAAAATTGCTTGAATCCAGGAGGCGGAGGGTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCACTGCACT 2040

104276719 CCAGCCTGGACAACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAATATATATATATATATATATATTT 104276778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CCAGCCTGGACAACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAATATATATATATATATATATATTT 2100

104276779 AGGACTAGGTTTCGATGAAATTAACCTAACAACCAACACTTAATCCTTTGAGAAACTACT 104276838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AGGACTAGGTTTCGATGAAATTAACCTAACAACCAACACTTAATCCTTTGAGAAACTACT 2160

104276839 TTCTCAACTGCATGGAACTTACCTAGGATAAAAATTAAAATTTAGGAGAAAGTGATTTCA 104276898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TTCTCAACTGCATGGAACTTACCTAGGATAAAAATTAAAATTTAGGAGAAAGTGATTTCA 2220

104276899 GAGCTCCAAATCTGTCCTGTCTGCCCTCATTTCCATAATCTGCTTTGACTGCCATTTTGT 104276958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GAGCTCCAAATCTGTCCTGTCTGCCCTCATTTCCATAATCTGCTTTGACTGCCATTTTGT 2280

104276959 ATATCCCCTATAATTTAACCTACTTATTGATCCCATGATCTCTGAAAATATTCTTTTTAA 104277018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 ATATCCCCTATAATTTAACCTACTTATTGATCCCATGATCTCTGAAAATATTCTTTTTAA 2340

104277019 TTTAATTTAATTTTTAGTTCTGGGATACATGGGCAGGATATGCAGCCTTGTTATATGGGT 104277078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TTTAATTTAATTTTTAGTTCTGGGATACATGGGCAGGATATGCAGCCTTGTTATATGGGT 2400

104277079 AAATGTGTTCCATGGTGGTTTGCTGCACCTATCAAACCATCACCTAGGTATTAAGCCCCG 104277138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AAATGTGTTCCATGGTGGTTTGCTGCACCTATCAAACCATCACCTAGGTATTAAGCCCCG 2460

104277139 CATGCATTAGCTACTCTTTCTGATGCGCTCCCTCCCACCACATCCCCAACCAACGGGCCC 104277198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CATGCATTAGCTACTCTTTCTGATGCGCTCCCTCCCACCACATCCCCAACCAACGGGCCC 2520

104277199 CATTATGTGTTGTTCCTTTCTCTGTTTTTATGTGTTCTCATTGTTCAGCTTCCACTTATA 104277258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CATTATGTGTTGTTCCTTTCTCTGTTTTTATGTGTTCTCATTGTTCAGCTTCCACTTATA 2580

104277259 AGTGAGAACATGTAGTGTTTAATTTTCTGTTCCTGTGTTAGTTTGCTGAGGATAATGGCT 104277318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AGTGAGAACATGTAGTGTTTAATTTTCTGTTCCTGTGTTAGTTTGCTGAGGATAATGGCT 2640

104277319 TCCAGCTCCATCCCTTTTCCTGCAAAGGACATGATCTCATTACTTTTTATGACTGCATAG 104277378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TCCAGCTCCATCCCTTTTCCTGCAAAGGACATGATCTCATTACTTTTTATGACTGCATAG 2700

104277379 TGTTCCATGGTGTAAATATATCACATTTTCATTTTCCAGTCTATCATTGATGGGCATTTG 104277438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TGTTCCATGGTGTAAATATATCACATTTTCATTTTCCAGTCTATCATTGATGGGCATTTG 2760

104277439 GGTTAATTCCATGTCTTTTCTACAGTGAATAGTGCTCCAGTGAACATACATGTGCAGGTA 104277498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GGTTAATTCCATGTCTTTTCTACAGTGAATAGTGCTCCAGTGAACATACATGTGCAGGTA 2820

104277499 TCTTTATAATAGAATGATTTATATTCTTTTGGGTACATACCCAGTAATGGGATTGCTGGG 104277558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TCTTTATAATAGAATGATTTATATTCTTTTGGGTACATACCCAGTAATGGGATTGCTGGG 2880

104277559 TCAAATGGTATTTCTGGTTCTAGGTCTTTGAGGAATTGCTACACTGTCTTCCACAAGTAA 104277618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TCAAATGGTATTTCTGGTTCTAGGTCTTTGAGGAATTGCTACACTGTCTTCCACAAGTAA 2940

104277619 AACCCAGAACTATAAAAACCCTAGAAGAAAAGCTAGACAGTACCATTCAGGACATCGGCA 104277678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 AACCCAGAACTATAAAAACCCTAGAAGAAAAGCTAGACAGTACCATTCAGGACATCGGCA 3000

104277679 CAGGCAAAGATTTCATGACAAAAATGTCAAAAGCAATTGCAACAAACACAAAACTTGACA 104277738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CAGGCAAAGATTTCATGACAAAAATGTCAAAAGCAATTGCAACAAACACAAAACTTGACA 3060

104277739 AATGGGATCTAATTAAACTAGAGCTTCTGCACAGCAAAAGAAACTATCATCAGAGTGGAC 104277798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 AATGGGATCTAATTAAACTAGAGCTTCTGCACAGCAAAAGAAACTATCATCAGAGTGGAC 3120

104277799 AGACAACCTACAGAATGGGAGAAAAGTTTGCAGTCTATTCATCCGACAAAGGTTGAATAT 104277858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 AGACAACCTACAGAATGGGAGAAAAGTTTGCAGTCTATTCATCCGACAAAGGTTGAATAT 3180

104277859 CCAGAATCTACAAGGAACTTAGTTCCAATTTACAAGAAAAAAAAAAAACACCATTAAAAA 104277918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
     3181 CCAGAATCTACAAGGAACTTAGTTCCAATTTACAAGAAAAAAAAAAA-CACCATTAAAAA 3239

104277919 GTCGGCAAAGGACATAAACAGACACTTCTCAAAAGAAGACATTACGTGGCCACCAAACAT 104277978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3240 GTCGGCAAAGGACATAAACAGACACTTCTCAAAAGAAGACATTACGTGGCCACCAAACAT 3299

104277979 ATGAAAAAAAACTCAACCTCACTGATCATTAGAGAAATACAAATCAAAACCACCAAGAGA 104278038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3300 ATGAAAAAAAACTCAACCTCACTGATCATTAGAGAAATACAAATCAAAACCACCAAGAGA 3359

104278039 TACCATCGCATGCCAGTCAGAATGGTGATTATTAAAAAGTCAAGGAACAATAGATGCTGG 104278098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3360 TACCATCGCATGCCAGTCAGAATGGTGATTATTAAAAAGTCAAGGAACAATAGATGCTGG 3419

104278099 TGAGGCTGTGGAGAAATAGGAATGCTCTTTTGCACTGTTGATGGGAATCTCTGAAAATAT 104278158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3420 TGAGGCTGTGGAGAAATAGGAATGCTCTTTTGCACTGTTGATGGGAATCTCTGAAAATAT 3479

104278159 TTATTCCTTTGAATGAGTTTAGCATAGGATGTTACCCTTAA 104278199
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3480 TTATTCCTTTGAATGAGTTTAGCATAGGATGTTACCCTTAA 3520

EXCISED REGION

104279047 ATGCTTGTTATAACAATGTACTTTTTTGTATACCTCTACTTGGAAATGTATTATAGTTAA 104279106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3521 ATGCTTGTTATAACAATGTACTTTTTTGTATACCTCTACTTGGAAATGTATTATAGTTAA 3580

104279107 GATTCATTCATTCGACTAATATGTATTGAGTGCCTACTATGTGCCAGGCACATGTTTTAG 104279166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3581 GATTCATTCATTCGACTAATATGTATTGAGTGCCTACTATGTGCCAGGCACATGTTTTAG 3640

104279167 CTAATGTTGATGAATGGTATGGATAAAGGCCTTGACACATTCATATTTAGAAAGATGGAA 104279226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3641 CTAATGTTGATGAATGGTATGGATAAAGGCCTTGACACATTCATATTTAGAAAGATGGAA 3700

104279227 ATAAATACATCAACAACATGCAATCTAATAGAGTTAGTAATGATAAAGATAAAACAGAAT 104279286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3701 ATAAATACATCAACAACATGCAATCTAATAGAGTTAGTAATGATAAAGATAAAACAGAAT 3760

104279287 ATAGAGAGTAAATAAGGGACCTATTTTCTATATGGTGGTCAAAAATGGACCCTGTGATTA 104279346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3761 ATAGAGAGTAAATAAGGGACCTATTTTCTATATGGTGGTCAAAAATGGACCCTGTGATTA 3820

104279347 CAGCTGAATACAGACTTGAATAAAACGAGAAAGCAAGTAATTCACATATCTGAGGAGAAA 104279406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3821 CAGCTGAATACAGACTTGAATAAAACGAGAAAGCAAGTAATTCACATATCTGAGGAGAAA 3880

104279407 ACTCTTTAGACACAGGGACCAGAAAGTTCAGGGGCCTTCAGCCAGAAATATTATTGACAT 104279466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3881 ACTCTTTAGACACAGGGACCAGAAAGTTCAGGGGCCTTCAGCCAGAAATATTATTGACAT 3940

104279467 GTGTAAATGAAGTAGCAAAGATAGTTGTTTGAGGAGGTGAAAAGGAAAATAGTGAAGATC 104279526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3941 GTGTAAATGAAGTAGCAAAGATAGTTGTTTGAGGAGGTGAAAAGGAAAATAGTGAAGATC 4000

104279527 AAATTGAAGAGACAATCAAGGCCATGCAGACTGTGGCAAGAACTTTGGAACTTCTGTTTA 104279586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4001 AAATTGAAGAGACAATCAAGGCCATGCAGACTGTGGCAAGAACTTTGGAACTTCTGTTTA 4060

104279587 TTATCCGAAGAGGCCATTGGAAGGTTATAAACAAGATATAAACATGATCTGACCTGTGTT 104279646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4061 TTATCCGAAGAGGCCATTGGAAGGTTATAAACAAGATATAAACATGATCTGACCTGTGTT 4120

104279647 TTGAAAGGATTTTTCTGGATAGGGAGTGAAAATTATATTGAAAGTGAAAAGATTGTAGAT 104279706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4121 TTGAAAGGATTTTTCTGGATAGGGAGTGAAAATTATATTGAAAGTGAAAAGATTGTAGAT 4180

104279707 ATAGTAGCAGTGGTAGGACTTGGGATATATATTACATACATTAGAGCTATCCTTAACTGT 104279766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4181 ATAGTAGCAGTGGTAGGACTTGGGATATATATTACATACATTAGAGCTATCCTTAACTGT 4240

104279767 ATCAACTGGTCTCATTGGGTATGAGAAGAAGATCAAAGTCAAGGCCAATTTTAATATGTT 104279826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4241 ATCAACTGGTCTCATTGGGTATGAGAAGAAGATCAAAGTCAAGGCCAATTTTAATATGTT 4300

104279827 TGGCCTGAGCAAGAAGGTGATATCCTTTCATGAAATGGGGATCAGTGAGAGGGGAGAAAT 104279886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4301 TGGCCTGAGCAAGAAGGTGATATCCTTTCATGAAATGGGGATCAGTGAGAGGGGAGAAAT 4360

104279887 TTACAGAGAAAAATTAAGAGTTTGGTTTTGGACCTATTAAAATTTGAGAAACCTGTGAGA 104279946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4361 TTACAGAGAAAAATTAAGAGTTTGGTTTTGGACCTATTAAAATTTGAGAAACCTGTGAGA 4420

104279947 AGTTTAAGAGGAAATGTTGATGAAGAGGAAGTTCGAAATAAGAGTCGAGAGTCCAGGGAA 104280006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4421 AGTTTAAGAGGAAATGTTGATGAAGAGGAAGTTCGAAATAAGAGTCGAGAGTCCAGGGAA 4480

104280007 TTGGTTTGGAGCTGGAGATTTTTTAAATTGAGAAGTTATTGGTAGATACAAGATATTTGC 104280066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4481 TTGGTTTGGAGCTGGAGATTTTTTAAATTGAGAAGTTATTGGTAGATACAAGATATTTGC 4540

104280067 AGTCATGAGAGCTAACAGTTACCTAGGGAGGGAGTAAAGATGAAGAGCTGAAATTTAAGG 104280126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4541 AGTCATGAGAGCTAACAGTTACCTAGGGAGGGAGTAAAGATGAAGAGCTGAAATTTAAGG 4600

104280127 ATAAAATTCCAGGGATCTAGAAATTTGGAAAATTGGAAGAAGAGGTGAAGCCAGAAAAGA 104280186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4601 ATAAAATTCCAGGGATCTAGAAATTTGGAAAATTGGAAGAAGAGGTGAAGCCAGAAAAGA 4660

104280187 CTAAGAAGGAGAGGTCAAGGAAGTAGGTGGGACAATAAAAGGATGTAGAATCTTGGCAAC 104280246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4661 CTAAGAAGGAGAGGTCAAGGAAGTAGGTGGGACAATAAAAGGATGTAGAATCTTGGCAAC 4720

104280247 TGAGTGATGAAAAAATTCTTTAAAGAATCAGAAAGTGACTGGTAAACTGGGTCAAAAGCT 104280306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4721 TGAGTGATGAAAAAATTCTTTAAAGAATCAGAAAGTGACTGGTAAACTGGGTCAAAAGCT 4780

104280307 AGAGATTGAGTAAAAACTGAAACTTTTCTTCATTTTAACATACTTTCGCTTTCAAGAAAA 104280366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4781 AGAGATTGAGTAAAAACTGAAACTTTTCTTCATTTTAACATACTTTCGCTTTCAAGAAAA 4840

104280367 TTATTACACTAAGGGGGAATAGCAGAGCAATCTATTAGTGTTGCAGAGGACAGATGTGGC 104280426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4841 TTATTACACTAAGGGGGAATAGCAGAGCAATCTATTAGTGTTGCAGAGGACAGATGTGGC 4900

104280427 TTTTTCAGATGCTCAGAAGCACCCAATAAATTTGAAGAACAGACAGGTGTTCCTGAGAAC 104280486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4901 TTTTTCAGATGCTCAGAAGCACCCAATAAATTTGAAGAACAGACAGGTGTTCCTGAGAAC 4960

104280487 TCAGGGAAGAATTTGGCCAATGAAGGTCACAGGACACCTGTTCTGAAAATGTCCTACTGA 104280546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4961 TCAGGGAAGAATTTGGCCAATGAAGGTCACAGGACACCTGTTCTGAAAATGTCCTACTGA 5020

104280547 AAATGTTCTTTAGAAGTTACAGTGTTTTCATCAAGACAATGAGATTTCACTTTATAACTT 104280606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5021 AAATGTTCTTTAGAAGTTACAGTGTTTTCATCAAGACAATGAGATTTCACTTTATAACTT 5080

104280607 TACTCAGTGCCCAGGTTACCTAAAAAGTATTTTTTCATCTTCAAGGGAGAAAAAAACTTT 104280666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5081 TACTCAGTGCCCAGGTTACCTAAAAAGTATTTTTTCATCTTCAAGGGAGAAAAAAACTTT 5140

104280667 GTTATTAGGTGATATAATTAGAATGTTTTAAAGAATGACATTAGTTTGCATTTCACAGCC 104280726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5141 GTTATTAGGTGATATAATTAGAATGTTTTAAAGAATGACATTAGTTTGCATTTCACAGCC 5200

104280727 TTACTAGGTAATATGAGAAGAAAATTCCAGTTTTATATTCTCTCGTATCTCTGAATTTCT 104280786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5201 TTACTAGGTAATATGAGAAGAAAATTCCAGTTTTATATTCTCTCGTATCTCTGAATTTCT 5260

104280787 TTCTAATTTATGGAAACAGTCTAATTTATGGAAACAGAATAATTAAATGCCCATGATAAA 104280846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5261 TTCTAATTTATGGAAACAGTCTAATTTATGGAAACAGAATAATTAAATGCCCATGATAAA 5320

104280847 TTTTCAAAGTTTATGACTTTCACTTGCATGGAATTAAAAATTATTTGCTGTTTTGTTAGT 104280906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5321 TTTTCAAAGTTTATGACTTTCACTTGCATGGAATTAAAAATTATTTGCTGTTTTGTTAGT 5380

104280907 ATTACTGTTAAGTGCCTTCCATGCTGCAGTAAGAAAACAGAAAAGTGAAATTCAAGAGCT 104280966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5381 ATTACTGTTAAGTGCCTTCCATGCTGCAGTAAGAAAACAGAAAAGTGAAATTCAAGAGCT 5440

104280967 AATCCAGGA 104280975
          |||||||||
     5441 AATCCAGGA 5449

Alignment time is 4.0317 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [104268199,104289046] =>     20848 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     3495] =>      3495 nucs 'mol-32-34b3-036192_3495'

Score:        3473
Aligned:      3495        nucs
Identic:      3493 (100%) nucs =>       296 (100%)      3197 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [104277599,104277894] EXCISED REGION [104277896,104281094]
 second seq =>  [        1,      296] EXCISED REGION [      297,     3495]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [104277895,104277895]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [104279002,104279002]
 second seq =>         1 nucs [1403,1403]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        11 nucs [104277895,104277905] to [104277896,104277906]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

104277599 ACACTGTCTTCCACAAGTAAAACCCAGAACTATAAAAACCCTAGAAGAAAAGCTAGACAG 104277658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACACTGTCTTCCACAAGTAAAACCCAGAACTATAAAAACCCTAGAAGAAAAGCTAGACAG 60

104277659 TACCATTCAGGACATCGGCACAGGCAAAGATTTCATGACAAAAATGTCAAAAGCAATTGC 104277718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TACCATTCAGGACATCGGCACAGGCAAAGATTTCATGACAAAAATGTCAAAAGCAATTGC 120

104277719 AACAAACACAAAACTTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAGAGCTTCTGCACAGCAAAAG 104277778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AACAAACACAAAACTTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAGAGCTTCTGCACAGCAAAAG 180

104277779 AAACTATCATCAGAGTGGACAGACAACCTACAGAATGGGAGAAAAGTTTGCAGTCTATTC 104277838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAACTATCATCAGAGTGGACAGACAACCTACAGAATGGGAGAAAAGTTTGCAGTCTATTC 240

104277839 ATCCGACAAAGGTTGAATATCCAGAATCTACAAGGAACTTAGTTCCAATTTACAAG 104277894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATCCGACAAAGGTTGAATATCCAGAATCTACAAGGAACTTAGTTCCAATTTACAAG 296

EXCISED REGION

104277896 AAAAAAAAAAACACCATTAAAAAGTCGGCAAAGGACATAAACAGACACTTCTCAAAAGAA 104277955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      297 AAAAAAAAAAACACCATTAAAAAGTCGGCAAAGGACATAAACAGACACTTCTCAAAAGAA 356

104277956 GACATTACGTGGCCACCAAACATATGAAAAAAAACTCAACCTCACTGATCATTAGAGAAA 104278015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      357 GACATTACGTGGCCACCAAACATATGAAAAAAAACTCAACCTCACTGATCATTAGAGAAA 416

104278016 TACAAATCAAAACCACCAAGAGATACCATCGCATGCCAGTCAGAATGGTGATTATTAAAA 104278075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      417 TACAAATCAAAACCACCAAGAGATACCATCGCATGCCAGTCAGAATGGTGATTATTAAAA 476

104278076 AGTCAAGGAACAATAGATGCTGGTGAGGCTGTGGAGAAATAGGAATGCTCTTTTGCACTG 104278135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      477 AGTCAAGGAACAATAGATGCTGGTGAGGCTGTGGAGAAATAGGAATGCTCTTTTGCACTG 536

104278136 TTGATGGGAATCTCTGAAAATATTTATTCCTTTGAATGAGTTTAGCATAGGATGTTACCC 104278195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      537 TTGATGGGAATCTCTGAAAATATTTATTCCTTTGAATGAGTTTAGCATAGGATGTTACCC 596

104278196 TTAAAAGGATATTTGCATTCTAGAACACAGAGAGAAAGCTGAAGTAAAACACAAAATCAG 104278255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      597 TTAAAAGGATATTTGCATTCTAGAACACAGAGAGAAAGCTGAAGTAAAACACAAAATCAG 656

104278256 TTCCAGTGCTTACAGAATTTGGATTATAGAGTGTGATGGAATGCATTATATCTCTTCAAA 104278315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      657 TTCCAGTGCTTACAGAATTTGGATTATAGAGTGTGATGGAATGCATTATATCTCTTCAAA 716

104278316 TTCATATGCTGAAACCCTAACCCTAAGTGGGACTGTACTTGTAAACAGGGCCTTTAAAAG 104278375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      717 TTCATATGCTGAAACCCTAACCCTAAGTGGGACTGTACTTGTAAACAGGGCCTTTAAAAG 776

104278376 AAGTAAGCACATTAAAGTGAAACTGGTAAGAGTGTGCCTTGATCCAATCTGATTGGTGTC 104278435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      777 AAGTAAGCACATTAAAGTGAAACTGGTAAGAGTGTGCCTTGATCCAATCTGATTGGTGTC 836

104278436 CTTATAAGAAGTGGAAATTTGAACACACAAAGAGAAACATCAGGGGAGCTTACACACAGA 104278495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      837 CTTATAAGAAGTGGAAATTTGAACACACAAAGAGAAACATCAGGGGAGCTTACACACAGA 896

104278496 GAAAATCCCATATAAGGACACAGCGAGAAAGCAGCCATGTGCAAGCTAAGGAAAGACTCC 104278555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      897 GAAAATCCCATATAAGGACACAGCGAGAAAGCAGCCATGTGCAAGCTAAGGAAAGACTCC 956

104278556 GAAGAAACCAAATGTGCTGACTCTTTGAGCTTGAACTTCTAGCCTCCAGAACTGTGTGTA 104278615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      957 GAAGAAACCAAATGTGCTGACTCTTTGAGCTTGAACTTCTAGCCTCCAGAACTGTGTGTA 1016

104278616 AATCAATTTCTGTTATTTAAACCTCTATGTGGTATTTTGTAATGGCATGACCAGAAAACT 104278675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1017 AATCAATTTCTGTTATTTAAACCTCTATGTGGTATTTTGTAATGGCATGACCAGAAAACT 1076

104278676 AATACATAGATAAAATAACATTAAAAATAATCATCTTATAAGTGGTCAGTGGTAAAAATT 104278735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1077 AATACATAGATAAAATAACATTAAAAATAATCATCTTATAAGTGGTCAGTGGTAAAAATT 1136

104278736 TGTCAGCAACTTTTACCCACAATTAGACCTTTTAAAAAAATAATTTCAAAATCAGGGAAA 104278795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1137 TGTCAGCAACTTTTACCCACAATTAGACCTTTTAAAAAAATAATTTCAAAATCAGGGAAA 1196

104278796 AAATTCAGATTGATTAGTCCTCATGATTTTAAGGTTATCAGTGTCAGAACAAGGAAAGCA 104278855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1197 AAATTCAGATTGATTAGTCCTCATGATTTTAAGGTTATCAGTGTCAGAACAAGGAAAGCA 1256

104278856 GGAGAATAGATAGTTATATAATGTAATAATTATAATGGCTGAGAAAAGTGAAAGACTAAT 104278915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1257 GGAGAATAGATAGTTATATAATGTAATAATTATAATGGCTGAGAAAAGTGAAAGACTAAT 1316

104278916 TTTACTTGCTTATTCACATAAAATTTCTCAGAATGATAAAATAATGGTACTTTTATTGAC 104278975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1317 TTTACTTGCTTATTCACATAAAATTTCTCAGAATGATAAAATAATGGTACTTTTATTGAC 1376

104278976 AAAACTACAGAGAACTGCTATAATTGTTAAGTTACATGTGGCTACCTATATGTTACATTG 104279035
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     1377 AAAACTACAGAGAACTGCTATAATTGCTAAGTTACATGTGGCTACCTATATGTTACATTG 1436

104279036 GTTATCTATATATGCTTGTTATAACAATGTACTTTTTTGTATACCTCTACTTGGAAATGT 104279095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     1437 GTTATCTATATATGCTTGTTATAACAATGTACTTTTTTGTATACCTTTACTTGGAAATGT 1496

104279096 ATTATAGTTAAGATTCATTCATTCGACTAATATGTATTGAGTGCCTACTATGTGCCAGGC 104279155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1497 ATTATAGTTAAGATTCATTCATTCGACTAATATGTATTGAGTGCCTACTATGTGCCAGGC 1556

104279156 ACATGTTTTAGCTAATGTTGATGAATGGTATGGATAAAGGCCTTGACACATTCATATTTA 104279215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1557 ACATGTTTTAGCTAATGTTGATGAATGGTATGGATAAAGGCCTTGACACATTCATATTTA 1616

104279216 GAAAGATGGAAATAAATACATCAACAACATGCAATCTAATAGAGTTAGTAATGATAAAGA 104279275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1617 GAAAGATGGAAATAAATACATCAACAACATGCAATCTAATAGAGTTAGTAATGATAAAGA 1676

104279276 TAAAACAGAATATAGAGAGTAAATAAGGGACCTATTTTCTATATGGTGGTCAAAAATGGA 104279335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1677 TAAAACAGAATATAGAGAGTAAATAAGGGACCTATTTTCTATATGGTGGTCAAAAATGGA 1736

104279336 CCCTGTGATTACAGCTGAATACAGACTTGAATAAAACGAGAAAGCAAGTAATTCACATAT 104279395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1737 CCCTGTGATTACAGCTGAATACAGACTTGAATAAAACGAGAAAGCAAGTAATTCACATAT 1796

104279396 CTGAGGAGAAAACTCTTTAGACACAGGGACCAGAAAGTTCAGGGGCCTTCAGCCAGAAAT 104279455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1797 CTGAGGAGAAAACTCTTTAGACACAGGGACCAGAAAGTTCAGGGGCCTTCAGCCAGAAAT 1856

104279456 ATTATTGACATGTGTAAATGAAGTAGCAAAGATAGTTGTTTGAGGAGGTGAAAAGGAAAA 104279515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1857 ATTATTGACATGTGTAAATGAAGTAGCAAAGATAGTTGTTTGAGGAGGTGAAAAGGAAAA 1916

104279516 TAGTGAAGATCAAATTGAAGAGACAATCAAGGCCATGCAGACTGTGGCAAGAACTTTGGA 104279575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1917 TAGTGAAGATCAAATTGAAGAGACAATCAAGGCCATGCAGACTGTGGCAAGAACTTTGGA 1976

104279576 ACTTCTGTTTATTATCCGAAGAGGCCATTGGAAGGTTATAAACAAGATATAAACATGATC 104279635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1977 ACTTCTGTTTATTATCCGAAGAGGCCATTGGAAGGTTATAAACAAGATATAAACATGATC 2036

104279636 TGACCTGTGTTTTGAAAGGATTTTTCTGGATAGGGAGTGAAAATTATATTGAAAGTGAAA 104279695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2037 TGACCTGTGTTTTGAAAGGATTTTTCTGGATAGGGAGTGAAAATTATATTGAAAGTGAAA 2096

104279696 AGATTGTAGATATAGTAGCAGTGGTAGGACTTGGGATATATATTACATACATTAGAGCTA 104279755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2097 AGATTGTAGATATAGTAGCAGTGGTAGGACTTGGGATATATATTACATACATTAGAGCTA 2156

104279756 TCCTTAACTGTATCAACTGGTCTCATTGGGTATGAGAAGAAGATCAAAGTCAAGGCCAAT 104279815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2157 TCCTTAACTGTATCAACTGGTCTCATTGGGTATGAGAAGAAGATCAAAGTCAAGGCCAAT 2216

104279816 TTTAATATGTTTGGCCTGAGCAAGAAGGTGATATCCTTTCATGAAATGGGGATCAGTGAG 104279875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2217 TTTAATATGTTTGGCCTGAGCAAGAAGGTGATATCCTTTCATGAAATGGGGATCAGTGAG 2276

104279876 AGGGGAGAAATTTACAGAGAAAAATTAAGAGTTTGGTTTTGGACCTATTAAAATTTGAGA 104279935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2277 AGGGGAGAAATTTACAGAGAAAAATTAAGAGTTTGGTTTTGGACCTATTAAAATTTGAGA 2336

104279936 AACCTGTGAGAAGTTTAAGAGGAAATGTTGATGAAGAGGAAGTTCGAAATAAGAGTCGAG 104279995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2337 AACCTGTGAGAAGTTTAAGAGGAAATGTTGATGAAGAGGAAGTTCGAAATAAGAGTCGAG 2396

104279996 AGTCCAGGGAATTGGTTTGGAGCTGGAGATTTTTTAAATTGAGAAGTTATTGGTAGATAC 104280055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2397 AGTCCAGGGAATTGGTTTGGAGCTGGAGATTTTTTAAATTGAGAAGTTATTGGTAGATAC 2456

104280056 AAGATATTTGCAGTCATGAGAGCTAACAGTTACCTAGGGAGGGAGTAAAGATGAAGAGCT 104280115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2457 AAGATATTTGCAGTCATGAGAGCTAACAGTTACCTAGGGAGGGAGTAAAGATGAAGAGCT 2516

104280116 GAAATTTAAGGATAAAATTCCAGGGATCTAGAAATTTGGAAAATTGGAAGAAGAGGTGAA 104280175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2517 GAAATTTAAGGATAAAATTCCAGGGATCTAGAAATTTGGAAAATTGGAAGAAGAGGTGAA 2576

104280176 GCCAGAAAAGACTAAGAAGGAGAGGTCAAGGAAGTAGGTGGGACAATAAAAGGATGTAGA 104280235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2577 GCCAGAAAAGACTAAGAAGGAGAGGTCAAGGAAGTAGGTGGGACAATAAAAGGATGTAGA 2636

104280236 ATCTTGGCAACTGAGTGATGAAAAAATTCTTTAAAGAATCAGAAAGTGACTGGTAAACTG 104280295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2637 ATCTTGGCAACTGAGTGATGAAAAAATTCTTTAAAGAATCAGAAAGTGACTGGTAAACTG 2696

104280296 GGTCAAAAGCTAGAGATTGAGTAAAAACTGAAACTTTTCTTCATTTTAACATACTTTCGC 104280355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2697 GGTCAAAAGCTAGAGATTGAGTAAAAACTGAAACTTTTCTTCATTTTAACATACTTTCGC 2756

104280356 TTTCAAGAAAATTATTACACTAAGGGGGAATAGCAGAGCAATCTATTAGTGTTGCAGAGG 104280415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2757 TTTCAAGAAAATTATTACACTAAGGGGGAATAGCAGAGCAATCTATTAGTGTTGCAGAGG 2816

104280416 ACAGATGTGGCTTTTTCAGATGCTCAGAAGCACCCAATAAATTTGAAGAACAGACAGGTG 104280475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2817 ACAGATGTGGCTTTTTCAGATGCTCAGAAGCACCCAATAAATTTGAAGAACAGACAGGTG 2876

104280476 TTCCTGAGAACTCAGGGAAGAATTTGGCCAATGAAGGTCACAGGACACCTGTTCTGAAAA 104280535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2877 TTCCTGAGAACTCAGGGAAGAATTTGGCCAATGAAGGTCACAGGACACCTGTTCTGAAAA 2936

104280536 TGTCCTACTGAAAATGTTCTTTAGAAGTTACAGTGTTTTCATCAAGACAATGAGATTTCA 104280595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2937 TGTCCTACTGAAAATGTTCTTTAGAAGTTACAGTGTTTTCATCAAGACAATGAGATTTCA 2996

104280596 CTTTATAACTTTACTCAGTGCCCAGGTTACCTAAAAAGTATTTTTTCATCTTCAAGGGAG 104280655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2997 CTTTATAACTTTACTCAGTGCCCAGGTTACCTAAAAAGTATTTTTTCATCTTCAAGGGAG 3056

104280656 AAAAAAACTTTGTTATTAGGTGATATAATTAGAATGTTTTAAAGAATGACATTAGTTTGC 104280715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3057 AAAAAAACTTTGTTATTAGGTGATATAATTAGAATGTTTTAAAGAATGACATTAGTTTGC 3116

104280716 ATTTCACAGCCTTACTAGGTAATATGAGAAGAAAATTCCAGTTTTATATTCTCTCGTATC 104280775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3117 ATTTCACAGCCTTACTAGGTAATATGAGAAGAAAATTCCAGTTTTATATTCTCTCGTATC 3176

104280776 TCTGAATTTCTTTCTAATTTATGGAAACAGTCTAATTTATGGAAACAGAATAATTAAATG 104280835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3177 TCTGAATTTCTTTCTAATTTATGGAAACAGTCTAATTTATGGAAACAGAATAATTAAATG 3236

104280836 CCCATGATAAATTTTCAAAGTTTATGACTTTCACTTGCATGGAATTAAAAATTATTTGCT 104280895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3237 CCCATGATAAATTTTCAAAGTTTATGACTTTCACTTGCATGGAATTAAAAATTATTTGCT 3296

104280896 GTTTTGTTAGTATTACTGTTAAGTGCCTTCCATGCTGCAGTAAGAAAACAGAAAAGTGAA 104280955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3297 GTTTTGTTAGTATTACTGTTAAGTGCCTTCCATGCTGCAGTAAGAAAACAGAAAAGTGAA 3356

104280956 ATTCAAGAGCTAATCCAGGAGTATAAATGGGAAGTTTTTTTTTTATTAACTTGACAAATC 104281015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3357 ATTCAAGAGCTAATCCAGGAGTATAAATGGGAAGTTTTTTTTTTATTAACTTGACAAATC 3416

104281016 TACATAAGCCATATTTAACTTCTTCAAAAGGAAAAGTATTTGAAACATGCATGTGAATCA 104281075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3417 TACATAAGCCATATTTAACTTCTTCAAAAGGAAAAGTATTTGAAACATGCATGTGAATCA 3476

104281076 TGGGATGATATGTAAAATT 104281094
          |||||||||||||||||||
     3477 TGGGATGATATGTAAAATT 3495

Alignment time is 2.7024 s

