
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31766416,31790625] =>     24210 nucs '22 dna:chromosome chromosome:GRCh37:22:1:51304566:1'
Second seq [       1,    3528] =>      3528 nucs 'mol-32-1e71-018645_3528'

Score:        3483
Aligned:      3531        nucs
Identic:      3525 (100%) nucs =>      3230 (100%)       295 (100%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31777184,31780417] EXCISED REGION [31780421,31780715]
 second seq =>  [       1,    3233] EXCISED REGION [    3234,    3528]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         3 nucs [31780418,31780420]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        18 nucs [31780418,31780435] to [31780421,31780438]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [31780418,31780418] to [31780420,31780420]
 second seq =>         0 nucs

 31777184 CACACACACACATTTATATGTACAAGCAATTGTCCTGCCTTAGCCTCTGAGTAGCTGGGA 31777243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CACACACACACATTTATATGTACAAGCAATTGTCCTGCCTTAGCCTCTGAGTAGCTGGGA 60

 31777244 TTACAGGCATGCACCACCACACCCAGCTAATATTTTTGTATGTTTTTAGTAGAGACAAGG 31777303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTACAGGCATGCACCACCACACCCAGCTAATATTTTTGTATGTTTTTAGTAGAGACAAGG 120

 31777304 TTTCACCATGTTGGTCAGACTGGTCTCAAATTCTTGACCTCAGGTGATCCACCTGCCTCA 31777363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTCACCATGTTGGTCAGACTGGTCTCAAATTCTTGACCTCAGGTGATCCACCTGCCTCA 180

 31777364 GCCTTCCAAAGTGCTGTGATTACAGGTGTGAGCCACCACGTCCAGCTGAGCTCCCACTTA 31777423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCCTTCCAAAGTGCTGTGATTACAGGTGTGAGCCACCACGTCCAGCTGAGCTCCCACTTA 240

 31777424 TAAGTGAGAACATATGGTATTTGTTTTTCTGTTCCTGTGTTAGTTTGCTAAGGATAATGG 31777483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TAAGTGAGAACATATGGTATTTGTTTTTCTGTTCCTGTGTTAGTTTGCTAAGGATAATGG 300

 31777484 CCTCCAGTTTCATCCATGTTCCTGCAAAGGACATGATCTTCTTTTTTGTGGCTGCATAGT 31777543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCTCCAGTTTCATCCATGTTCCTGCAAAGGACATGATCTTCTTTTTTGTGGCTGCATAGT 360

 31777544 ATTACATGGTGTATATGTACCACATTTTCTTTATCCAGTCTGTCATTGATGGGCATTTAG 31777603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATTACATGGTGTATATGTACCACATTTTCTTTATCCAGTCTGTCATTGATGGGCATTTAG 420

 31777604 GTGATTCCACGTCTTTGCTATTGTGGATGGTGCTGTGATGAATATATGCATGCATGTATC 31777663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTGATTCCACGTCTTTGCTATTGTGGATGGTGCTGTGATGAATATATGCATGCATGTATC 480

 31777664 TTTATGGTGGAATGATATATATTCCTTTGGGTATCTACCCTGTAATGGGATTGCTGGGTC 31777723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTATGGTGGAATGATATATATTCCTTTGGGTATCTACCCTGTAATGGGATTGCTGGGTC 540

 31777724 AAATGGTAGTTCTGTTTGTAGCTCTTTCAGGAATCACCAGACTACTTTCCATAGTGGTTG 31777783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAATGGTAGTTCTGTTTGTAGCTCTTTCAGGAATCACCAGACTACTTTCCATAGTGGTTG 600

 31777784 AACTAATTTACATTCCCACCAACAGTGCATAAGTGTTCCCTTTTCTCCACAACCTCACCA 31777843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AACTAATTTACATTCCCACCAACAGTGCATAAGTGTTCCCTTTTCTCCACAACCTCACCA 660

 31777844 GTATCTGTGGGGTTTTTTCACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCGCTCTGT 31777903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GTATCTGTGGGGTTTTTTCACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCGCTCTGT 720

 31777904 CGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTTGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTTTTGGGTT 31777963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTTGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTTTTGGGTT 780

 31777964 CAAGTCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGTACTACAGGCGCCCGCCATGACG 31778023
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CAAGTCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGTACTACAGGCGCCCGCCATGACG 840

 31778024 CCCAACTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGT 31778083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CCCAACTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGT 900

 31778084 CTTGATCTCCTGACCTTGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGG 31778143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTTGATCTCCTGACCTTGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGG 960

 31778144 CGTGAGCCACCACGTCTGGCCCCCTTTTTTTTTTTTTAAGACAGAGTTTCGCTCTTGCTG 31778203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CGTGAGCCACCACGTCTGGCCCCCTTTTTTTTTTTTTAAGACAGAGTTTCGCTCTTGCTG 1020

 31778204 TCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCAATCTCGGCTCACTGCAACCTCTTCCTCCTGGGTTCA 31778263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCAATCTCGGCTCACTGCAACCTCTTCCTCCTGGGTTCA 1080

 31778264 AGCGATTATCCTGCTTCAGCCTCCCAGAGTAGCTGGGATTACAGGCAAGGGCCACCACGC 31778323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AGCGATTATCCTGCTTCAGCCTCCCAGAGTAGCTGGGATTACAGGCAAGGGCCACCACGC 1140

 31778324 CTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAAAGACGGGGTTTCAACATGTTGGCCAGGCTGGTCT 31778383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAAAGACGGGGTTTCAACATGTTGGCCAGGCTGGTCT 1200

 31778384 CGAACTTCTGACTTCAGGTGATCCACCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATAACAGG 31778443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CGAACTTCTGACTTCAGGTGATCCACCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATAACAGG 1260

 31778444 CATGAGCACTGCACCTGGCCTTGACTTTTTATTAATAGCCATTCTGACTAGTATGAGGGA 31778503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CATGAGCACTGCACCTGGCCTTGACTTTTTATTAATAGCCATTCTGACTAGTATGAGGGA 1320

 31778504 GTATCTCATTGTGGTTTTGATTTGCATTTCTCAAATGATCAGTGATATTGAGCCATTTTT 31778563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GTATCTCATTGTGGTTTTGATTTGCATTTCTCAAATGATCAGTGATATTGAGCCATTTTT 1380

 31778564 CATATACTTGTTGGCCACATCTCTGTCTTCTTTTGAAAATTGTCGGCACATGTCCTTTGC 31778623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CATATACTTGTTGGCCACATCTCTGTCTTCTTTTGAAAATTGTCGGCACATGTCCTTTGC 1440

 31778624 CCACTTTTTAACGGGGTTGGGTTTTTTCCCTTGTAAATTTGTTCAAGTTCCAGCCCAGCA 31778683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CCACTTTTTAACGGGGTTGGGTTTTTTCCCTTGTAAATTTGTTCAAGTTCCAGCCCAGCA 1500

 31778684 CTCAGTCTCAAAACTCAGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAA--GTCTTCAATTTCCTTAT 31778741
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||
     1501 CTCAGTCTCAAAACTCAGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTCTTCAATTTCCTTAT 1560

 31778742 ACATGCTGGATATTAGACCTTTTTTTCAGATGCATAGCTTGCGAATATTTTCTCTCATTC 31778801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ACATGCTGGATATTAGACCTTTTTTTCAGATGCATAGCTTGCGAATATTTTCTCTCATTC 1620

 31778802 TGTAGGTTGTTCATTTACTGTGTTGATAGTTTCTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTT 31778861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TGTAGGTTGTTCATTTACTGTGTTGATAGTTTCTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTT 1680

 31778862 AACTAGATCTTGTCAATTTTTGCTTTTGTTGTGATTGCTTTCAGTGTCTTTGTCATGAAA 31778921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AACTAGATCTTGTCAATTTTTGCTTTTGTTGTGATTGCTTTCAGTGTCTTTGTCATGAAA 1740

 31778922 TCTTTGCCAGTTTCTACATCCCCAATGGTATTGCCTAGGTTGTCATCCAGGGTTGTTATA 31778981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TCTTTGCCAGTTTCTACATCCCCAATGGTATTGCCTAGGTTGTCATCCAGGGTTGTTATA 1800

 31778982 CTTTTGGGTTTTACAATTAAGTCTTTATCCTGAGTTGATTTTTTTTTTTTTTTAAGATGG 31779041
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
     1801 CTTTTGGGTTTTACAATTAAGTCTTTATCCTGAGTTGATTTTTTTTTTTTTT-AAGATGG 1859

 31779042 AGTTTCGCTCTTGTTGCCGTTGCTGGAGTGCAATGGCGCTATCTTGGCTCGCTGCAACCT 31779101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 AGTTTCGCTCTTGTTGCCGTTGCTGGAGTGCAATGGCGCTATCTTGGCTCGCTGCAACCT 1919

 31779102 CCACCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAAG 31779161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 CCACCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAAG 1979

 31779162 TGTGTGCCACCATACCCAGCTCATTTTTGTACTTTTAGTAGAGACAAGGTTTCACGATGT 31779221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 TGTGTGCCACCATACCCAGCTCATTTTTGTACTTTTAGTAGAGACAAGGTTTCACGATGT 2039

 31779222 TGGTCAGGCTCGTCTTGAACTCCTGATCTCAGGTGATCCACCCGACTCAGCCTCCCAAAG 31779281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 TGGTCAGGCTCGTCTTGAACTCCTGATCTCAGGTGATCCACCCGACTCAGCCTCCCAAAG 2099

 31779282 TGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCTCACCCGGCCCTGAGTTGGTTTTTGCATATGGTG 31779341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 TGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCTCACCCGGCCCTGAGTTGGTTTTTGCATATGGTG 2159

 31779342 TAAGAAAAGGGTCCAGTTTCGGGGCCGGGCGCAGTGGCTTACGCCTGTAATTCCAGCACT 31779401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 TAAGAAAAGGGTCCAGTTTCGGGGCCGGGCGCAGTGGCTTACGCCTGTAATTCCAGCACT 2219

 31779402 TTGGGAGGCGGAGGCGGAGGCGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTACC 31779461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 TTGGGAGGCGGAGGCGGAGGCGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTACC 2279

 31779462 TAACACGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAGTTAGCCGGGCGTGGTGGCGG 31779521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 TAACACGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAGTTAGCCGGGCGTGGTGGCGG 2339

 31779522 GCGCCTGTAGTCCCAGCTGCTCAGGAGGCTGAAGCAGGAGAATGACGTGAACTTAGAAGG 31779581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 GCGCCTGTAGTCCCAGCTGCTCAGGAGGCTGAAGCAGGAGAATGACGTGAACTTAGAAGG 2399

 31779582 CGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATGGAGCCACTGCACTCCAGTCTGGGCGACAGAGCGAGA 31779641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 CGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATGGAGCCACTGCACTCCAGTCTGGGCGACAGAGCGAGA 2459

 31779642 CTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAAGAAAAGGGTCCAGTTTCA 31779701
          |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 CTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAA--GAAAGAAAGAAAAGAAAAGGGTCCAGTTTCA 2517

 31779702 ATCTTCCGCATATGGCTAGCCAGTTATCCCAGCCCCTTTCATTGAATAGGGAGTTCTTTT 31779761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2518 ATCTTCCGCATATGGCTAGCCAGTTATCCCAGCCCCTTTCATTGAATAGGGAGTTCTTTT 2577

 31779762 CCCACCGCTTGTTTTTTCAGCTTTGTCAAAGATCAAACGGTTGTAGGTGAGTGTGCAGCC 31779821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2578 CCCACCGCTTGTTTTTTCAGCTTTGTCAAAGATCAAACGGTTGTAGGTGAGTGTGCAGCC 2637

 31779822 TCATTTCTGGGCTCCCTATTATATTCCATTGGCCTATCGGTCTGTTTTTGTACCCAGTAC 31779881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2638 TCATTTCTGGGCTCCCTATTATATTCCATTGGCCTATCGGTCTGTTTTTGTACCCAGTAC 2697

 31779882 CATGCTATTTTGGTTACTGTAGCCCTGTAGTATAGTTTGAAGTTGGGTAGTTTGAAGCCT 31779941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2698 CATGCTATTTTGGTTACTGTAGCCCTGTAGTATAGTTTGAAGTTGGGTAGTTTGAAGCCT 2757

 31779942 CCAGCTTTGTTCTTTTTGTTTAAGATTGCCTTGGTATTCAGGCTGTTTTTTGGTCCCATA 31780001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2758 CCAGCTTTGTTCTTTTTGTTTAAGATTGCCTTGGTATTCAGGCTGTTTTTTGGTCCCATA 2817

 31780002 TGAATTTTAAAATAGTTTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAGAATATTAGTGGTAGTTTGATAG 31780061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2818 TGAATTTTAAAATAGTTTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAGAATATTAGTGGTAGTTTGATAG 2877

 31780062 GAATAGCATTGAATCTGTAAATTGCTTTGGGCTATATGGCTATTTTAATGATACTGATTT 31780121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2878 GAATAGCATTGAATCTGTAAATTGCTTTGGGCTATATGGCTATTTTAATGATACTGATTT 2937

 31780122 TTTCCTATCCATGAGCATGGAATGTTTTTCCATTCATTTGTGTCATCTCTGATTTCTTTG 31780181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2938 TTTCCTATCCATGAGCATGGAATGTTTTTCCATTCATTTGTGTCATCTCTGATTTCTTTG 2997

 31780182 AGCAGTGTTTTGTAATTATCATTGTAGAGATCTCTCACCTCCCTGGTTAGCTGTATTCAT 31780241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2998 AGCAGTGTTTTGTAATTATCATTGTAGAGATCTCTCACCTCCCTGGTTAGCTGTATTCAT 3057

 31780242 AGGCATTTTATTTATTTATTTATTTTTTGAAACTGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTG 31780301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3058 AGGCATTTTATTTATTTATTTATTTTTTGAAACTGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTG 3117

 31780302 GAGTGCAATGGCTCAATCTCGGCTCACCGCAACCTCCATCCTGGGTTCAAGCGATTTTCC 31780361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3118 GAGTGCAATGGCTCAATCTCGGCTCACCGCAACCTCCATCCTGGGTTCAAGCGATTTTCC 3177

 31780362 TGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGTGCCACCACGCCCTACTAA 31780417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3178 TGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGTGCCACCACGCCCTACTAA 3233

EXCISED REGION

 31780421 TTTTTTTTTTTTTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTAGGTCAGGCT 31780480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3234 TTTTTTTTTTTTTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTAGGTCAGGCT 3293

 31780481 GGTCTCGAACTCCCAACCTCAGGTGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATT 31780540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3294 GGTCTCGAACTCCCAACCTCAGGTGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATT 3353

 31780541 ACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGCGGCATTTTATTATTTTTGTGGCAGTTGTGAATGGG 31780600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3354 ACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGCGGCATTTTATTATTTTTGTGGCAGTTGTGAATGGG 3413

 31780601 ATTTTGTCATTTGTGTCTTGGCTTGGCTGTTGTTGGTATATAGGCATGCTAGTGATTTTT 31780660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3414 ATTTTGTCATTTGTGTCTTGGCTTGGCTGTTGTTGGTATATAGGCATGCTAGTGATTTTT 3473

 31780661 GTACATTGATTTTGTATCCTGAAACTGCTGAAGTTTATCAGCTGAAGAATCTTTT 31780715
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3474 GTACATTGATTTTGTATCCTGAAACTGCTGAAGTTTATCAGCTGAAGAATCTTTT 3528

Alignment time is 3.39773 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31766416,31790625] =>     24210 nucs '22 dna:chromosome chromosome:GRCh37:22:1:51304566:1'
Second seq [       1,    4986] =>      4986 nucs 'mol-32-1e87-137205_4986'

Score:        4939
Aligned:      4967        nucs
Identic:      4962 (100%) nucs =>      1244 (100%)      3718 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31775168,31776416] EXCISED REGION [31780626,31784343]
 second seq =>  [      24,    1268] EXCISED REGION [    1269,    4986]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      4209 nucs [31776417,31780625]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [31776417,31776419] to [31780626,31780628]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [31776417,31776417] to [31780625,31780625]
 second seq =>         0 nucs

 31775168 GGCGTGGTGGCATGCACCTGTAATCCCAGCTGCTCAGGAGGCTAAGGAGAATCGCTTGAA 31775227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       24 GGCGTGGTGGCATGCACCTGTAATCCCAGCTGCTCAGGAGGCTAAGGAGAATCGCTTGAA 83

 31775228 CCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGTCGAGATGGTGCCACTGCACTCCAGCCCGGGCAAC 31775287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       84 CCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGTCGAGATGGTGCCACTGCACTCCAGCCCGGGCAAC 143

 31775288 AGAGTGAGACTCCGTCTTAAACAAACAAACAAACAAACAAACAAACAAACAAACAAAACA 31775347
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||
      144 AGAGTGAGACTCCGTCTTAAACAAACAAACAAACAAACAAACAAACAAACAAA----ACA 199

 31775348 AGACTCAGCTGTAAAACCATCTAAGCCTGATGCCTTTTAAAATGAAGACTTACTTTTCTA 31775407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      200 AGACTCAGCTGTAAAACCATCTAAGCCTGATGCCTTTTAAAATGAAGACTTACTTTTCTA 259

 31775408 ATTTCTTTTATTTCTATTTTGTTTTATTTATTTATCTATCTATCTATTTTTGAGATGGAG 31775467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      260 ATTTCTTTTATTTCTATTTTGTTTTATTTATTTATCTATCTATCTATTTTTGAGATGGAG 319

 31775468 ACTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACCATCTTGGCTCACTGCAACCTCCA 31775527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      320 ACTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACCATCTTGGCTCACTGCAACCTCCA 379

 31775528 CCTCCCCAGTTGAAATGATTCTTGTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATACAGGCGCA 31775587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      380 CCTCCCCAGTTGAAATGATTCTTGTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATACAGGCGCA 439

 31775588 AGCCACGAGACCTGGCTAAGTTTTGTCTTTTTGGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGC 31775647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      440 AGCCACGAGACCTGGCTAAGTTTTGTCTTTTTGGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGC 499

 31775648 CAGCCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTATCCGCCTCAGTCTCCCACAGTGCT 31775707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      500 CAGCCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTATCCGCCTCAGTCTCCCACAGTGCT 559

 31775708 AGGATTATAGGTGTGAGACACCGTTTCCGGCTTCTAATTTCTTTTATACTTATTAGTGTA 31775767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      560 AGGATTATAGGTGTGAGACACCGTTTCCGGCTTCTAATTTCTTTTATACTTATTAGTGTA 619

 31775768 TTTACATCTTATCTCTCTTCTTGGGAAAATTGTAACATTTTATTTTATTTTTTATATGGA 31775827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      620 TTTACATCTTATCTCTCTTCTTGGGAAAATTGTAACATTTTATTTTATTTTTTATATGGA 679

 31775828 AGTCATTATTTCTCCTATATTTCCTTTTCTTTTCCTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACT 31775887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      680 AGTCATTATTTCTCCTATATTTCCTTTTCTTTTCCTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACT 739

 31775888 CTCGCCCAGGCTAGAGTGTGATGACGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGG 31775947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      740 CTCGCCCAGGCTAGAGTGTGATGACGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGG 799

 31775948 TTCAAGCGATTCTCATGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTCTGAGCCACCA 31776007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      800 TTCAAGCGATTCTCATGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTCTGAGCCACCA 859

 31776008 TGCCTGGCTAACTTTTGTATTTTTAGTACAGATGGGGTTTTGCCATGTTACCCAGGCTGG 31776067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      860 TGCCTGGCTAACTTTTGTATTTTTAGTACAGATGGGGTTTTGCCATGTTACCCAGGCTGG 919

 31776068 TCTCAAACTCCTGGCCTCAAGCAATCCCCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAC 31776127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      920 TCTCAAACTCCTGGCCTCAAGCAATCCCCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAC 979

 31776128 AGGTTCCGCTAGATTTTCTAAGTATTTGGCAGAGAGTTACATGTAATAGTCTTTTGTAAT 31776187
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
      980 AGGTTCCGCTAGATTTTCTAAGTATTTGGCAGAGAGTTACATGTAATAGCCTTTTGTAAT 1039

 31776188 TCTTTTTTTCTTTTTTTAAATAAGATCTTGCTCTGTTGTCCAGGCTGGAGTGCAGTGACG 31776247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1040 TCTTTTTTTCTTTTTTTAAATAAGATCTTGCTCTGTTGTCCAGGCTGGAGTGCAGTGACG 1099

 31776248 TGATGTCGGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCTGGGTTGAAGCGATTCTCATGCCTCAGCCT 31776307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1100 TGATGTCGGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCTGGGTTGAAGCGATTCTCATGCCTCAGCCT 1159

 31776308 CCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGCACCACCACACCCAGCTAAGTTTTGTATTTTTAG 31776367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1160 CCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGCACCACCACACCCAGCTAAGTTTTGTATTTTTAG 1219

 31776368 TAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGCCCAGGCTTGTAATTCTTTTAATTT 31776416
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1220 TAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGCCCAGGCTTGTAATTCTTTTAATTT 1268

EXCISED REGION

 31780626 GCTGTTGTTGGTATATAGGCATGCTAGTGATTTTTGTACATTGATTTTGTATCCTGAAAC 31780685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1269 GCTGTTGTTGGTATATAGGCATGCTAGTGATTTTTGTACATTGATTTTGTATCCTGAAAC 1328

 31780686 TGCTGAAGTTTATCAGCTGAAGAATCTTTTGTACAGGGACTATAGGGTTTTCTAGATGTA 31780745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1329 TGCTGAAGTTTATCAGCTGAAGAATCTTTTGTACAGGGACTATAGGGTTTTCTAGATGTA 1388

 31780746 GAATCATGTCTTCTGCAAAGAGAGATACTCTGACCTCCTGTCTTCCTATTTGGTTGCCCT 31780805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1389 GAATCATGTCTTCTGCAAAGAGAGATACTCTGACCTCCTGTCTTCCTATTTGGTTGCCCT 1448

 31780806 TTATTTCTTTCTCTTGCCTGACTGCTCTGACCAGGACTTCCAACCCTGTGTTGAATAGGA 31780865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1449 TTATTTCTTTCTCTTGCCTGACTGCTCTGACCAGGACTTCCAACCCTGTGTTGAATAGGA 1508

 31780866 GTGGTGAGAAAGGGCACCCGGGTCTTGTGCCAGTTTTCAAAGAGAATGCTTTCAGCTTTT 31780925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1509 GTGGTGAGAAAGGGCACCCGGGTCTTGTGCCAGTTTTCAAAGAGAATGCTTTCAGCTTTT 1568

 31780926 GCCCATTCAGTATGATGTTGGCTTTGGGTCTGTCACAGATAGCTGTTATTATTTTGAGGT 31780985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1569 GCCCATTCAGTATGATGTTGGCTTTGGGTCTGTCACAGATAGCTGTTATTATTTTGAGGT 1628

 31780986 ATGTTCCTTCAAAATCTAGTTTACTGACAGTTTTTAATACGAAGCGATGTTGAATTTTAT 31781045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1629 ATGTTCCTTCAAAATCTAGTTTACTGACAGTTTTTAATACGAAGCGATGTTGAATTTTAT 1688

 31781046 CGAAAGACTTTTCTGCATCTATTGAGATAATCATGTGGTTTTTGTCTTTAGTTCTGTTTA 31781105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1689 CGAAAGACTTTTCTGCATCTATTGAGATAATCATGTGGTTTTTGTCTTTAGTTCTGTTTA 1748

 31781106 TGTGATGAATCACTTTTATTGATTTGTGGATGTAAAACCAACCTTGCATCCCAGGAATAA 31781165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1749 TGTGATGAATCACTTTTATTGATTTGTGGATGTAAAACCAACCTTGCATCCCAGGAATAA 1808

 31781166 ACCCTATTTGATCGTGGTGGATTTGCTTTTTGATGTGCTGCTGGATTCAATTTGCAAGTA 31781225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1809 ACCCTATTTGATCGTGGTGGATTTGCTTTTTGATGTGCTGCTGGATTCAATTTGCAAGTA 1868

 31781226 TTTTGTTGAGGATTTCTGCATCGATGTTCATCAAGGATATTGGCTTGAAGTTTTCTATTT 31781285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1869 TTTTGTTGAGGATTTCTGCATCGATGTTCATCAAGGATATTGGCTTGAAGTTTTCTATTT 1928

 31781286 TGGGTGTGTCTCTGCCAGGTTTTAGTGTCAGGATGATGCCGGGCTCACAGAATGAGTTGG 31781345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1929 TGGGTGTGTCTCTGCCAGGTTTTAGTGTCAGGATGATGCCGGGCTCACAGAATGAGTTGG 1988

 31781346 GGAGGAGTCCCTCTGCCTCAATTTTTTGAAATAGTTTCAGAAGAAATAGTACTATCCCGT 31781405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1989 GGAGGAGTCCCTCTGCCTCAATTTTTTGAAATAGTTTCAGAAGAAATAGTACTATCCCGT 2048

 31781406 CTTTGTACATCTGGTGGAATTCGGCTGTGACTTCATCTGGTCCTGGGCTTTTCTTTGTTA 31781465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2049 CTTTGTACATCTGGTGGAATTCGGCTGTGACTTCATCTGGTCCTGGGCTTTTCTTTGTTA 2108

 31781466 GTAGGCTATTTATTACTGATTTCATTTTGGAGCTCATTATTGTTCTGTTCAGGGAATCTA 31781525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2109 GTAGGCTATTTATTACTGATTTCATTTTGGAGCTCATTATTGTTCTGTTCAGGGAATCTA 2168

 31781526 TTTCTTCTTGTTTCAGTTTTGGGAAGGTGTATGTGTCCAGGAATGTATCCATCTCTTCTA 31781585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2169 TTTCTTCTTGTTTCAGTTTTGGGAAGGTGTATGTGTCCAGGAATGTATCCATCTCTTCTA 2228

 31781586 GGTTTTTATTATTATTCTTTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGTGTGGGGTGC 31781645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2229 GGTTTTTATTATTATTCTTTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGTGTGGGGTGC 2288

 31781646 AGTGGCGCAATCTCGGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCTGAGTTTAAGCAATTCTCCTGAC 31781705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2289 AGTGGCGCAATCTCGGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCTGAGTTTAAGCAATTCTCCTGAC 2348

 31781706 TCAGCCTCCCAAGTACCTGGGATTAAAGGCATGTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTA 31781765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2349 TCAGCCTCCCAAGTACCTGGGATTAAAGGCATGTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTA 2408

 31781766 TTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGTTCTTGAACTCCTGACCTCA 31781825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2409 TTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGTTCTTGAACTCCTGACCTCA 2468

 31781826 GGTGATCTGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGTATGAGCCACTGTGCC 31781885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2469 GGTGATCTGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGTATGAGCCACTGTGCC 2528

 31781886 TGGCCGCTTCTAGGTTTCCTAGTTTGTGTGCATAGAGGTGTTCATAGTAGCCTGCGATGG 31781945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2529 TGGCCGCTTCTAGGTTTCCTAGTTTGTGTGCATAGAGGTGTTCATAGTAGCCTGCGATGG 2588

 31781946 TTATTTTTATTTCTGTGGGGTCACTGGTAACATCCCCTTTGTCATTTCTAACTATGTTTA 31782005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2589 TTATTTTTATTTCTGTGGGGTCACTGGTAACATCCCCTTTGTCATTTCTAACTATGTTTA 2648

 31782006 TTTATTTTTTGTTTATTTATTTATTTATTTATTTTTTGAGATGGAGTCTCGTTCTGTTGT 31782065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2649 TTTATTTTTTGTTTATTTATTTATTTATTTATTTTTTGAGATGGAGTCTCGTTCTGTTGT 2708

 31782066 TCCGATTGTAGTGAAGTGGCACCATTTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCTCAGGTTCAA 31782125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2709 TCCGATTGTAGTGAAGTGGCACCATTTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCTCAGGTTCAA 2768

 31782126 GAGATTCTCGTGGCTCCGCCTACCAAGTAGCAGGGATTATAGGCATATGTCACCATGCCC 31782185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2769 GAGATTCTCGTGGCTCCGCCTACCAAGTAGCAGGGATTATAGGCATATGTCACCATGCCC 2828

 31782186 GGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGATTTTACCATGTTGGCCAGACTGGTCTCG 31782245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2829 GGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGATTTTACCATGTTGGCCAGACTGGTCTCG 2888

 31782246 AACTCCTGACCTCAAGTGATCACCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCAT 31782305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2889 AACTCCTGACCTCAAGTGATCACCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCAT 2948

 31782306 GAGCCATATTTACTTATTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGTTAGAGTGCAG 31782365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2949 GAGCCATATTTACTTATTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGTTAGAGTGCAG 3008

 31782366 TGGCGTGATCTGGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCTGGATTCAGGTGATTCTCCTGCCTC 31782425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3009 TGGCGTGATCTGGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCTGGATTCAGGTGATTCTCCTGCCTC 3068

 31782426 AGCATCTCAAGTAGCTGGGATTGCAGGCGCCCACCAGCACGCCTGGCTAATTTTTGTATC 31782485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3069 AGCATCTCAAGTAGCTGGGATTGCAGGCGCCCACCAGCACGCCTGGCTAATTTTTGTATC 3128

 31782486 TTTAGTAGAGACAAGATTTTGCCGTGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAAT 31782545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3129 TTTAGTAGAGACAAGATTTTGCCGTGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAAT 3188

 31782546 GATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACATGAGCCACCGTGCCCTG 31782605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3189 GATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACATGAGCCACCGTGCCCTG 3248

 31782606 CCTTAATTGTGTTTATTTGGATCTTCTCTCTTTCTTCATTAGTCCAGCTAGTGGCCTATC 31782665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3249 CCTTAATTGTGTTTATTTGGATCTTCTCTCTTTCTTCATTAGTCCAGCTAGTGGCCTATC 3308

 31782666 TTACTAATTTTTCAAAAAAAAAAAACAAACAAACAACCAACTCCTGGATTCATTGATCTT 31782725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3309 TTACTAATTTTTCAAAAAAAAAAAACAAACAAACAACCAACTCCTGGATTCATTGATCTT 3368

 31782726 TTGAATGGCTTTTTGTGTCTTGATTTCCTTCAGTTCAGCTCTGATTTTGGTTATTTTTCT 31782785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3369 TTGAATGGCTTTTTGTGTCTTGATTTCCTTCAGTTCAGCTCTGATTTTGGTTATTTTTCT 3428

 31782786 GCTAGCTTTGGGGTTGGTTTGCTCTTGCTTCTCTAGTTCTTTTTTTTTTTTTGAGACAAA 31782845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3429 GCTAGCTTTGGGGTTGGTTTGCTCTTGCTTCTCTAGTTCTTTTTTTTTTTTTGAGACAAA 3488

 31782846 GTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGGTCACTGCAACCTCC 31782905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3489 GTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGGTCACTGCAACCTCC 3548

 31782906 GCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTG 31782965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3549 GCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTG 3608

 31782966 CCGGCCACCACACCCAGCTAACTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATATTG 31783025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3609 CCGGCCACCACACCCAGCTAACTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATATTG 3668

 31783026 ACCAGGCTGGTGTCAAACTCCTAACCTTGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCT 31783085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3669 ACCAGGCTGGTGTCAAACTCCTAACCTTGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCT 3728

 31783086 GGGATTACAGGCATGAGCCACTGAGCCTAGCCTCTAGTTCTTTTTTTTTGAGATGGAGTC 31783145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3729 GGGATTACAGGCATGAGCCACTGAGCCTAGCCTCTAGTTCTTTTTTTTTGAGATGGAGTC 3788

 31783146 TCATCCTGTTGCCCAGACAGGAATGCAGTGATGCAGTCTCGGCTCTCTGCAACCTCAGCC 31783205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3789 TCATCCTGTTGCCCAGACAGGAATGCAGTGATGCAGTCTCGGCTCTCTGCAACCTCAGCC 3848

 31783206 TCCCAGGTTCAAGCGATTCCCCTGCCTCCACCTCCCAAGTAGCTGAGATTACAGGCGCAT 31783265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3849 TCCCAGGTTCAAGCGATTCCCCTGCCTCCACCTCCCAAGTAGCTGAGATTACAGGCGCAT 3908

 31783266 GTTACCACACCCAGCTAATTTTTATATTTTTAGTAGAGATGAGGCTTCACCATGTTGGCC 31783325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3909 GTTACCACACCCAGCTAATTTTTATATTTTTAGTAGAGATGAGGCTTCACCATGTTGGCC 3968

 31783326 ATGCTGGTCTCGACCTCCTGACCTCAAGTGATCCACCTGCCTCGGCCTCCCACAGTGCTG 31783385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3969 ATGCTGGTCTCGACCTCCTGACCTCAAGTGATCCACCTGCCTCGGCCTCCCACAGTGCTG 4028

 31783386 AGATTACAGGCATGAGCCATTGTGCCCGGCCTCTTCTCTAGTTTCTTTTAGTTATGATAT 31783445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4029 AGATTACAGGCATGAGCCATTGTGCCCGGCCTCTTCTCTAGTTTCTTTTAGTTATGATAT 4088

 31783446 TAGGCTGAATATATATGACCCAACACAGCAGCACCCAGATTCATAAAGCAAGTTATTAGC 31783505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4089 TAGGCTGAATATATATGACCCAACACAGCAGCACCCAGATTCATAAAGCAAGTTATTAGC 4148

 31783506 GCTCTTCAAAGAGACTTAGACTCCCACACAGTAATAGTAGGAGACTTCAACACTCCTACT 31783565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4149 GCTCTTCAAAGAGACTTAGACTCCCACACAGTAATAGTAGGAGACTTCAACACTCCTACT 4208

 31783566 ATTTTATGGTTCTCTTTCTAAGTTTTTGAGACCTTTCTAACTTTTTTTTTTTTTTTTTGA 31783625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4209 ATTTTATGGTTCTCTTTCTAAGTTTTTGAGACCTTTCTAACTTTTTTTTTTTTTTTTTGA 4268

 31783626 GGTGGAGTCTTGCTTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGGTCTCGGCTCACCACA 31783685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4269 GGTGGAGTCTTGCTTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGGTCTCGGCTCACCACA 4328

 31783686 ACCTTCGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTTTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTA 31783745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4329 ACCTTCGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTTTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTA 4388

 31783746 CAGGTGCGCGCCACCAAGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACT 31783805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4389 CAGGTGCGCGCCACCAAGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACT 4448

 31783806 ATGTTGACCCGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCATGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAG 31783865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4449 ATGTTGACCCGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCATGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAG 4508

 31783866 TGTGCTGGGATTACAGGTGTGAACCACCGTGCCGGCAAGATCTTTCTAACTTTTTGATGT 31783925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4509 TGTGCTGGGATTACAGGTGTGAACCACCGTGCCGGCAAGATCTTTCTAACTTTTTGATGT 4568

 31783926 TGGTGTTTCGTGCTATAATTTCCCTCTTAACACTGCCTTAGCTGTGTCCCAGAGATTCTA 31783985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4569 TGGTGTTTCGTGCTATAATTTCCCTCTTAACACTGCCTTAGCTGTGTCCCAGAGATTCTA 4628

 31783986 ATATGTTGTATCTTTTTTCTCATTAGTTTCAAAGAACTACTTGATTTCTGCCTTAATTTC 31784045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4629 ATATGTTGTATCTTTTTTCTCATTAGTTTCAAAGAACTACTTGATTTCTGCCTTAATTTC 4688

 31784046 ATTACTTACACAAAAGTCATTCAGGAGCATGTAATTGTATGGTTTTGGGCAATTTTTAAT 31784105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4689 ATTACTTACACAAAAGTCATTCAGGAGCATGTAATTGTATGGTTTTGGGCAATTTTTAAT 4748

 31784106 GTCTTGATTTTTGTTTTTATTGCATTGTGGTTCAAGAGTATGTTTGGTATGATTTTGGTT 31784165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4749 GTCTTGATTTTTGTTTTTATTGCATTGTGGTTCAAGAGTATGTTTGGTATGATTTTGGTT 4808

 31784166 CTTTTGCATTTGCTAAGGATTGTTTTATGTCCAATTGTGTGGTCAATTTTAGATTATGTT 31784225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4809 CTTTTGCATTTGCTAAGGATTGTTTTATGTCCAATTGTGTGGTCAATTTTAGATTATGTT 4868

 31784226 GCATGTGGTAATGAGAAGAATGTATATTCTGTTGTTTTGCAGAGGAGAGCTCTGTAGAGG 31784285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4869 GCATGTGGTAATGAGAAGAATGTATATTCTGTTGTTTTGCAGAGGAGAGCTCTGTAGAGG 4928

 31784286 TCTATCAGATCCATTTGGTCCAATGTTGAGTTCAGGTCCTGAATATCTTTGTTAAGTT 31784343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4929 TCTATCAGATCCATTTGGTCCAATGTTGAGTTCAGGTCCTGAATATCTTTGTTAAGTT 4986

Alignment time is 4.32864 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31766416,31790625] =>     24210 nucs '22 dna:chromosome chromosome:GRCh37:22:1:51304566:1'
Second seq [       1,    5170] =>      5170 nucs 'mol-32-1eea-087384_5170'

Score:        5149
Aligned:      5171        nucs
Identic:      5169 (100%) nucs =>       944 (100%)      4225 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31775472,31776416] EXCISED REGION [31780626,31784851]
 second seq =>  [       1,     945] EXCISED REGION [     946,    5170]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      4209 nucs [31776417,31780625]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [31776417,31776419] to [31780626,31780628]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [31776417,31776417] to [31780625,31780625]
 second seq =>         0 nucs

 31775472 GCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACCATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTC 31775531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACCATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTC 60

 31775532 CCCAGTTGAAATGATTCTTGTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATACAGGCGCAAGCC 31775591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCCAGTTGAAATGATTCTTGTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATACAGGCGCAAGCC 120

 31775592 ACGAGACCTGGCTAAGTTTTGTCTTTTTGGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGC 31775651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACGAGACCTGGCTAAGTTTTGTCTTTTTGGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGC 180

 31775652 CTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTATCCGCCTCAGTCTCCCACAGTGCTAGGA 31775711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTATCCGCCTCAGTCTCCCACAGTGCTAGGA 240

 31775712 TTATAGGTGTGAGACACCGTTTCCGGCTTCTAATTTCTTTTATACTTATTAGTGTATTTA 31775771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTATAGGTGTGAGACACCGTTTCCGGCTTCTAATTTCTTTTATACTTATTAGTGTATTTA 300

 31775772 CATCTTATCTCTCTTCTTGGGAAAATTGTAACATTTTATTTTATTTTTTATATGGAAGTC 31775831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CATCTTATCTCTCTTCTTGGGAAAATTGTAACATTTTATTTTATTTTTTATATGGAAGTC 360

 31775832 ATTATTTCTCCTATATTTCCTTTTCTTTTCCTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTCG 31775891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATTATTTCTCCTATATTTCCTTTTCTTTTCCTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTCG 420

 31775892 CCCAGGCTAGAGTGTGATGACGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCA 31775951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCCAGGCTAGAGTGTGATGACGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCA 480

 31775952 AGCGATTCTCATGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTCTGAGCCACCATGCC 31776011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGCGATTCTCATGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTCTGAGCCACCATGCC 540

 31776012 TGGCTAACTTTTGTATTTTTAGTACAGATGGGGTTTTGCCATGTTACCCAGGCTGGTCTC 31776071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGGCTAACTTTTGTATTTTTAGTACAGATGGGGTTTTGCCATGTTACCCAGGCTGGTCTC 600

 31776072 AAACTCCTGGCCTCAAGCAATCCCCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGT 31776131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAACTCCTGGCCTCAAGCAATCCCCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGT 660

 31776132 TCCGCTAGATTTTCTAAGTATTTGGCAGAGAGTTACATGTAATAGTCTTTTGTAATTCTT 31776191
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
      661 TCCGCTAGATTTTCTAAGTATTTGGCAGAGAGTTACATGTAATAGCCTTTTGTAATTCTT 720

 31776192 TTTTTCTTTTTTTAAATAAGATCTTGCTCTGTTGTCCAGGCTGGAGTGCAGTGACGTGAT 31776251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTTTTCTTTTTTTAAATAAGATCTTGCTCTGTTGTCCAGGCTGGAGTGCAGTGACGTGAT 780

 31776252 GTCGGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCTGGGTTGAAGCGATTCTCATGCCTCAGCCTCCCG 31776311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GTCGGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCTGGGTTGAAGCGATTCTCATGCCTCAGCCTCCCG 840

 31776312 AGTAGCTGGGACTACAGGCATGCACCACCACACCCAGCTAAGTTTTGTATTTTTAGTAGA 31776371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGTAGCTGGGACTACAGGCATGCACCACCACACCCAGCTAAGTTTTGTATTTTTAGTAGA 900

 31776372 GACAGGGTTTCACCATGTTGCCCAGGCTTGTAATTCTTTTAATTT 31776416
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GACAGGGTTTCACCATGTTGCCCAGGCTTGTAATTCTTTTAATTT 945

EXCISED REGION

 31780626 GCTGTTGTTGGTATATAGGCATGCTAGTGATTTTTGTACATTGATTTTGTATCCTGAAAC 31780685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      946 GCTGTTGTTGGTATATAGGCATGCTAGTGATTTTTGTACATTGATTTTGTATCCTGAAAC 1005

 31780686 TGCTGAAGTTTATCAGCTGAAGAATCTTTTGTACAGGGACTATAGGGTTTTCTAGATGTA 31780745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1006 TGCTGAAGTTTATCAGCTGAAGAATCTTTTGTACAGGGACTATAGGGTTTTCTAGATGTA 1065

 31780746 GAATCATGTCTTCTGCAAAGAGAGATACTCTGACCTCCTGTCTTCCTATTTGGTTGCCCT 31780805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1066 GAATCATGTCTTCTGCAAAGAGAGATACTCTGACCTCCTGTCTTCCTATTTGGTTGCCCT 1125

 31780806 TTATTTCTTTCTCTTGCCTGACTGCTCTGACCAGGACTTCCAACCCTGTGTTGAATAGGA 31780865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1126 TTATTTCTTTCTCTTGCCTGACTGCTCTGACCAGGACTTCCAACCCTGTGTTGAATAGGA 1185

 31780866 GTGGTGAGAAAGGGCACCCGGGTCTTGTGCCAGTTTTCAAAGAGAATGCTTTCAGCTTTT 31780925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1186 GTGGTGAGAAAGGGCACCCGGGTCTTGTGCCAGTTTTCAAAGAGAATGCTTTCAGCTTTT 1245

 31780926 GCCCATTCAGTATGATGTTGGCTTTGGGTCTGTCACAGATAGCTGTTATTATTTTGAGGT 31780985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1246 GCCCATTCAGTATGATGTTGGCTTTGGGTCTGTCACAGATAGCTGTTATTATTTTGAGGT 1305

 31780986 ATGTTCCTTCAAAATCTAGTTTACTGACAGTTTTTAATACGAAGCGATGTTGAATTTTAT 31781045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1306 ATGTTCCTTCAAAATCTAGTTTACTGACAGTTTTTAATACGAAGCGATGTTGAATTTTAT 1365

 31781046 CGAAAGACTTTTCTGCATCTATTGAGATAATCATGTGGTTTTTGTCTTTAGTTCTGTTTA 31781105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1366 CGAAAGACTTTTCTGCATCTATTGAGATAATCATGTGGTTTTTGTCTTTAGTTCTGTTTA 1425

 31781106 TGTGATGAATCACTTTTATTGATTTGTGGATGTAAAACCAACCTTGCATCCCAGGAATAA 31781165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1426 TGTGATGAATCACTTTTATTGATTTGTGGATGTAAAACCAACCTTGCATCCCAGGAATAA 1485

 31781166 ACCCTATTTGATCGTGGTGGATTTGCTTTTTGATGTGCTGCTGGATTCAATTTGCAAGTA 31781225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1486 ACCCTATTTGATCGTGGTGGATTTGCTTTTTGATGTGCTGCTGGATTCAATTTGCAAGTA 1545

 31781226 TTTTGTTGAGGATTTCTGCATCGATGTTCATCAAGGATATTGGCTTGAAGTTTTCTATTT 31781285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1546 TTTTGTTGAGGATTTCTGCATCGATGTTCATCAAGGATATTGGCTTGAAGTTTTCTATTT 1605

 31781286 TGGGTGTGTCTCTGCCAGGTTTTAGTGTCAGGATGATGCCGGGCTCACAGAATGAGTTGG 31781345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1606 TGGGTGTGTCTCTGCCAGGTTTTAGTGTCAGGATGATGCCGGGCTCACAGAATGAGTTGG 1665

 31781346 GGAGGAGTCCCTCTGCCTCAATTTTTTGAAATAGTTTCAGAAGAAATAGTACTATCCCGT 31781405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1666 GGAGGAGTCCCTCTGCCTCAATTTTTTGAAATAGTTTCAGAAGAAATAGTACTATCCCGT 1725

 31781406 CTTTGTACATCTGGTGGAATTCGGCTGTGACTTCATCTGGTCCTGGGCTTTTCTTTGTTA 31781465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1726 CTTTGTACATCTGGTGGAATTCGGCTGTGACTTCATCTGGTCCTGGGCTTTTCTTTGTTA 1785

 31781466 GTAGGCTATTTATTACTGATTTCATTTTGGAGCTCATTATTGTTCTGTTCAGGGAATCTA 31781525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1786 GTAGGCTATTTATTACTGATTTCATTTTGGAGCTCATTATTGTTCTGTTCAGGGAATCTA 1845

 31781526 TTTCTTCTTGTTTCAGTTTTGGGAAGGTGTATGTGTCCAGGAATGTATCCATCTCTTCTA 31781585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1846 TTTCTTCTTGTTTCAGTTTTGGGAAGGTGTATGTGTCCAGGAATGTATCCATCTCTTCTA 1905

 31781586 GGTTTTTATTATTATTCTTTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGTGTGGGGTGC 31781645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1906 GGTTTTTATTATTATTCTTTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGTGTGGGGTGC 1965

 31781646 AGTGGCGCAATCTCGGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCTGAGTTTAAGCAATTCTCCTGAC 31781705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1966 AGTGGCGCAATCTCGGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCTGAGTTTAAGCAATTCTCCTGAC 2025

 31781706 TCAGCCTCCCAAGTACCTGGGATTAAAGGCATGTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTA 31781765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2026 TCAGCCTCCCAAGTACCTGGGATTAAAGGCATGTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTA 2085

 31781766 TTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGTTCTTGAACTCCTGACCTCA 31781825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2086 TTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGTTCTTGAACTCCTGACCTCA 2145

 31781826 GGTGATCTGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGTATGAGCCACTGTGCC 31781885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2146 GGTGATCTGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGTATGAGCCACTGTGCC 2205

 31781886 TGGCCGCTTCTAGGTTTCCTAGTTTGTGTGCATAGAGGTGTTCATAGTAGCCTGCGATGG 31781945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2206 TGGCCGCTTCTAGGTTTCCTAGTTTGTGTGCATAGAGGTGTTCATAGTAGCCTGCGATGG 2265

 31781946 TTATTTTTATTTCTGTGGGGTCACTGGTAACATCCCCTTTGTCATTTCTAACTATGTTTA 31782005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2266 TTATTTTTATTTCTGTGGGGTCACTGGTAACATCCCCTTTGTCATTTCTAACTATGTTTA 2325

 31782006 TTTATTTTTTGTTTATTTATTTATTTATTTATTTTTTGAGATGGAGTCTCGTTCTGTTGT 31782065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2326 TTTATTTTTTGTTTATTTATTTATTTATTTATTTTTTGAGATGGAGTCTCGTTCTGTTGT 2385

 31782066 TCCGATTGTAGTGAAGTGGCACCATTTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCTCAGGTTCAA 31782125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2386 TCCGATTGTAGTGAAGTGGCACCATTTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCTCAGGTTCAA 2445

 31782126 GAGATTCTCGTGGCTCCGCCTACCAAGTAGCAGGGATTATAGGCATATGTCACCATGCCC 31782185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2446 GAGATTCTCGTGGCTCCGCCTACCAAGTAGCAGGGATTATAGGCATATGTCACCATGCCC 2505

 31782186 GGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGATTTTACCATGTTGGCCAGACTGGTCTCG 31782245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2506 GGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGATTTTACCATGTTGGCCAGACTGGTCTCG 2565

 31782246 AACTCCTGACCTCAAGTGATCACCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCAT 31782305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2566 AACTCCTGACCTCAAGTGATCACCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCAT 2625

 31782306 GAGCCATATTTACTTATTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGTTAGAGTGCAG 31782365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2626 GAGCCATATTTACTTATTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGTTAGAGTGCAG 2685

 31782366 TGGCGTGATCTGGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCTGGATTCAGGTGATTCTCCTGCCTC 31782425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2686 TGGCGTGATCTGGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCTGGATTCAGGTGATTCTCCTGCCTC 2745

 31782426 AGCATCTCAAGTAGCTGGGATTGCAGGCGCCCACCAGCACGCCTGGCTAATTTTTGTATC 31782485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2746 AGCATCTCAAGTAGCTGGGATTGCAGGCGCCCACCAGCACGCCTGGCTAATTTTTGTATC 2805

 31782486 TTTAGTAGAGACAAGATTTTGCCGTGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAAT 31782545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2806 TTTAGTAGAGACAAGATTTTGCCGTGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAAT 2865

 31782546 GATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACATGAGCCACCGTGCCCTG 31782605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2866 GATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACATGAGCCACCGTGCCCTG 2925

 31782606 CCTTAATTGTGTTTATTTGGATCTTCTCTCTTTCTTCATTAGTCCAGCTAGTGGCCTATC 31782665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2926 CCTTAATTGTGTTTATTTGGATCTTCTCTCTTTCTTCATTAGTCCAGCTAGTGGCCTATC 2985

 31782666 TTACTAATTTTTCAAAAAAAAAAAACAAACAAACAACCAACTCCTGGATTCATTGATCTT 31782725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2986 TTACTAATTTTTCAAAAAAAAAAAACAAACAAACAACCAACTCCTGGATTCATTGATCTT 3045

 31782726 TTGAATGGCTTTTTGTGTCTTGATTTCCTTCAGTTCAGCTCTGATTTTGGTTATTTTTCT 31782785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3046 TTGAATGGCTTTTTGTGTCTTGATTTCCTTCAGTTCAGCTCTGATTTTGGTTATTTTTCT 3105

 31782786 GCTAGCTTTGGGGTTGGTTTGCTCTTGCTTCTCTAGTTCTTTTTTTTTTTTTGAGACAAA 31782845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3106 GCTAGCTTTGGGGTTGGTTTGCTCTTGCTTCTCTAGTTCTTTTTTTTTTTTTGAGACAAA 3165

 31782846 GTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGGTCACTGCAACCTCC 31782905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3166 GTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGGTCACTGCAACCTCC 3225

 31782906 GCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTG 31782965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3226 GCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTG 3285

 31782966 CCGGCCACCACACCCAGCTAACTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATATTG 31783025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3286 CCGGCCACCACACCCAGCTAACTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATATTG 3345

 31783026 ACCAGGCTGGTGTCAAACTCCTAACCTTGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCT 31783085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3346 ACCAGGCTGGTGTCAAACTCCTAACCTTGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCT 3405

 31783086 GGGATTACAGGCATGAGCCACTGAGCCTAGCCTCTAGTTCTTTTTTTTTGAGATGGAGTC 31783145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3406 GGGATTACAGGCATGAGCCACTGAGCCTAGCCTCTAGTTCTTTTTTTTTGAGATGGAGTC 3465

 31783146 TCATCCTGTTGCCCAGACAGGAATGCAGTGATGCAGTCTCGGCTCTCTGCAACCTCAGCC 31783205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3466 TCATCCTGTTGCCCAGACAGGAATGCAGTGATGCAGTCTCGGCTCTCTGCAACCTCAGCC 3525

 31783206 TCCCAGGTTCAAGCGATTCCCCTGCCTCCACCTCCCAAGTAGCTGAGATTACAGGCGCAT 31783265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3526 TCCCAGGTTCAAGCGATTCCCCTGCCTCCACCTCCCAAGTAGCTGAGATTACAGGCGCAT 3585

 31783266 GTTACCACACCCAGCTAATTTTTATATTTTTAGTAGAGATGAGGCTTCACCATGTTGGCC 31783325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3586 GTTACCACACCCAGCTAATTTTTATATTTTTAGTAGAGATGAGGCTTCACCATGTTGGCC 3645

 31783326 ATGCTGGTCTCGACCTCCTGACCTCAAGTGATCCACCTGCCTCGGCCTCCCACAGTGCTG 31783385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3646 ATGCTGGTCTCGACCTCCTGACCTCAAGTGATCCACCTGCCTCGGCCTCCCACAGTGCTG 3705

 31783386 AGATTACAGGCATGAGCCATTGTGCCCGGCCTCTTCTCTAGTTTCTTTTAGTTATGATAT 31783445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3706 AGATTACAGGCATGAGCCATTGTGCCCGGCCTCTTCTCTAGTTTCTTTTAGTTATGATAT 3765

 31783446 TAGGCTGAATATATATGACCCAACACAGCAGCACCCAGATTCATAAAGCAAGTTATTAGC 31783505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3766 TAGGCTGAATATATATGACCCAACACAGCAGCACCCAGATTCATAAAGCAAGTTATTAGC 3825

 31783506 GCTCTTCAAAGAGACTTAGACTCCCACACAGTAATAGTAGGAGACTTCAACACTCCTACT 31783565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3826 GCTCTTCAAAGAGACTTAGACTCCCACACAGTAATAGTAGGAGACTTCAACACTCCTACT 3885

 31783566 ATTTTATGGTTCTCTTTCTAAGTTTTTGAGACCTTTCTAACTTTTTTTTTTTTTTTTTGA 31783625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
     3886 ATTTTATGGTTCTCTTTCTAAGTTTTTGAGACCTTTCTAAC-TTTTTTTTTTTTTTTTGA 3944

 31783626 GGTGGAGTCTTGCTTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGGTCTCGGCTCACCACA 31783685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3945 GGTGGAGTCTTGCTTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGGTCTCGGCTCACCACA 4004

 31783686 ACCTTCGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTTTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTA 31783745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4005 ACCTTCGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTTTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTA 4064

 31783746 CAGGTGCGCGCCACCAAGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACT 31783805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4065 CAGGTGCGCGCCACCAAGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACT 4124

 31783806 ATGTTGACCCGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCATGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAG 31783865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4125 ATGTTGACCCGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCATGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAG 4184

 31783866 TGTGCTGGGATTACAGGTGTGAACCACCGTGCCGGCAAGATCTTTCTAACTTTTTGATGT 31783925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4185 TGTGCTGGGATTACAGGTGTGAACCACCGTGCCGGCAAGATCTTTCTAACTTTTTGATGT 4244

 31783926 TGGTGTTTCGTGCTATAATTTCCCTCTTAACACTGCCTTAGCTGTGTCCCAGAGATTCTA 31783985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4245 TGGTGTTTCGTGCTATAATTTCCCTCTTAACACTGCCTTAGCTGTGTCCCAGAGATTCTA 4304

 31783986 ATATGTTGTATCTTTTTTCTCATTAGTTTCAAAGAACTACTTGATTTCTGCCTTAATTTC 31784045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4305 ATATGTTGTATCTTTTTTCTCATTAGTTTCAAAGAACTACTTGATTTCTGCCTTAATTTC 4364

 31784046 ATTACTTACACAAAAGTCATTCAGGAGCATGTAATTGTATGGTTTTGGGCAATTTTTAAT 31784105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4365 ATTACTTACACAAAAGTCATTCAGGAGCATGTAATTGTATGGTTTTGGGCAATTTTTAAT 4424

 31784106 GTCTTGATTTTTGTTTTTATTGCATTGTGGTTCAAGAGTATGTTTGGTATGATTTTGGTT 31784165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4425 GTCTTGATTTTTGTTTTTATTGCATTGTGGTTCAAGAGTATGTTTGGTATGATTTTGGTT 4484

 31784166 CTTTTGCATTTGCTAAGGATTGTTTTATGTCCAATTGTGTGGTCAATTTTAGATTATGTT 31784225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4485 CTTTTGCATTTGCTAAGGATTGTTTTATGTCCAATTGTGTGGTCAATTTTAGATTATGTT 4544

 31784226 GCATGTGGTAATGAGAAGAATGTATATTCTGTTGTTTTGCAGAGGAGAGCTCTGTAGAGG 31784285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4545 GCATGTGGTAATGAGAAGAATGTATATTCTGTTGTTTTGCAGAGGAGAGCTCTGTAGAGG 4604

 31784286 TCTATCAGATCCATTTGGTCCAATGTTGAGTTCAGGTCCTGAATATCTTTGTTAAGTTTC 31784345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4605 TCTATCAGATCCATTTGGTCCAATGTTGAGTTCAGGTCCTGAATATCTTTGTTAAGTTTC 4664

 31784346 TGTTTCGATGATCTGTCTAATACTGTTAGTGAAGTGTTCTACTATTACTGTGTGGGAGTC 31784405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4665 TGTTTCGATGATCTGTCTAATACTGTTAGTGAAGTGTTCTACTATTACTGTGTGGGAGTC 4724

 31784406 TAAGTCTCTTTGAAGAGCCCTAATAACTTGCTTTATGAATCTGGGTGCTTCTGTGTTGGG 31784465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4725 TAAGTCTCTTTGAAGAGCCCTAATAACTTGCTTTATGAATCTGGGTGCTTCTGTGTTGGG 4784

 31784466 TCATATATATTTAAGACAGTTAGGTCTTCTTGTTGAATTGAACCCTTTACCACTATAATG 31784525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4785 TCATATATATTTAAGACAGTTAGGTCTTCTTGTTGAATTGAACCCTTTACCACTATAATG 4844

 31784526 TCCTTTGTCTTTTTTGACCTTTGTTGGTTTAAAGTCTGTTTTATCTGAAATTAGGATTGC 31784585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4845 TCCTTTGTCTTTTTTGACCTTTGTTGGTTTAAAGTCTGTTTTATCTGAAATTAGGATTGC 4904

 31784586 AACTCCTGCTTTTTTCTGATTTCCATTTGCTTGGTACTTTTTCCTCCATCCTTTTTATTT 31784645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4905 AACTCCTGCTTTTTTCTGATTTCCATTTGCTTGGTACTTTTTCCTCCATCCTTTTTATTT 4964

 31784646 TATTTTTTTGAGACTATGGATGAGATAGGGCTGTTGAAGACAGAATACCATTGAGTTTTG 31784705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4965 TATTTTTTTGAGACTATGGATGAGATAGGGCTGTTGAAGACAGAATACCATTGAGTTTTG 5024

 31784706 TTTTTTGATCCAGAAAAATATGGAACATTTCATGAATTTGCATCATCCTTGCACAGGGGC 31784765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5025 TTTTTTGATCCAGAAAAATATGGAACATTTCATGAATTTGCATCATCCTTGCACAGGGGC 5084

 31784766 CATGCTAATCTTCTCTGTATCATTCCAATTTTAGTATATGTGCTGCTGAAGCAAGCACAC 31784825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5085 CATGCTAATCTTCTCTGTATCATTCCAATTTTAGTATATGTGCTGCTGAAGCAAGCACAC 5144

 31784826 CAAGCTCATTTTTATTTTTATTTTTA 31784851
          ||||||||||||||||||||||||||
     5145 CAAGCTCATTTTTATTTTTATTTTTA 5170

Alignment time is 4.38696 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31766416,31790625] =>     24210 nucs '22 dna:chromosome chromosome:GRCh37:22:1:51304566:1'
Second seq [       1,    2741] =>      2741 nucs 'mol-32-1f0b-048140_2741'

Score:        2708
Aligned:      2741        nucs
Identic:      2738 (100%) nucs =>       127 (100%)      2611 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31775179,31775305] EXCISED REGION [31775310,31777922]
 second seq =>  [       1,     127] EXCISED REGION [     128,    2741]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         4 nucs [31775306,31775309]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        35 nucs [31775306,31775340] to [31775310,31775344]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31775179 ATGCACCTGTAATCCCAGCTGCTCAGGAGGCTAAGGAGAATCGCTTGAACCCAGGAGGCA 31775238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATGCACCTGTAATCCCAGCTGCTCAGGAGGCTAAGGAGAATCGCTTGAACCCAGGAGGCA 60

 31775239 GAGGTTGCAGTGAGTCGAGATGGTGCCACTGCACTCCAGCCCGGGCAACAGAGTGAGACT 31775298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAGGTTGCAGTGAGTCGAGATGGTGCCACTGCACTCCAGCCCGGGCAACAGAGTGAGACT 120

 31775299 CCGTCTT 31775305
          |||||||
      121 CCGTCTT 127

EXCISED REGION

 31775310 AAACAAACAAACAAACAAACAAACAAACAAACAAAACAAGACTCAGCTGTAAAACCATCT 31775369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      128 AAACAAACAAACAAACAAACAAACAAACAAACAAAACAAGACTCAGCTGTAAAACCATCT 187

 31775370 AAGCCTGATGCCTTTTAAAATGAAGACTTACTTTTCTAATTTCTTTTATTTCTATTTTGT 31775429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      188 AAGCCTGATGCCTTTTAAAATGAAGACTTACTTTTCTAATTTCTTTTATTTCTATTTTGT 247

 31775430 TTTATTTATTTATCTATCTATCTATTTTTGAGATGGAGACTCGCTCTGTCGCCCAGGCTG 31775489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      248 TTTATTTATTTATCTATCTATCTATTTTTGAGATGGAGACTCGCTCTGTCGCCCAGGCTG 307

 31775490 GAGTGCAGTGGCACCATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCCAGTTGAAATGATTCT 31775549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      308 GAGTGCAGTGGCACCATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCCAGTTGAAATGATTCT 367

 31775550 TGTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATACAGGCGCAAGCCACGAGACCTGGCTAAGTT 31775609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      368 TGTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATACAGGCGCAAGCCACGAGACCTGGCTAAGTT 427

 31775610 TTGTCTTTTTGGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGCCTGGTCTTGAACTCCTGA 31775669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      428 TTGTCTTTTTGGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGCCTGGTCTTGAACTCCTGA 487

 31775670 CCTCAGGTGATCTATCCGCCTCAGTCTCCCACAGTGCTAGGATTATAGGTGTGAGACACC 31775729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      488 CCTCAGGTGATCTATCCGCCTCAGTCTCCCACAGTGCTAGGATTATAGGTGTGAGACACC 547

 31775730 GTTTCCGGCTTCTAATTTCTTTTATACTTATTAGTGTATTTACATCTTATCTCTCTTCTT 31775789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      548 GTTTCCGGCTTCTAATTTCTTTTATACTTATTAGTGTATTTACATCTTATCTCTCTTCTT 607

 31775790 GGGAAAATTGTAACATTTTATTTTATTTTTTATATGGAAGTCATTATTTCTCCTATATTT 31775849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      608 GGGAAAATTGTAACATTTTATTTTATTTTTTATATGGAAGTCATTATTTCTCCTATATTT 667

 31775850 CCTTTTCTTTTCCTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTCGCCCAGGCTAGAGTGTGAT 31775909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      668 CCTTTTCTTTTCCTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTCGCCCAGGCTAGAGTGTGAT 727

 31775910 GACGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCGATTCTCATGCCTCA 31775969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      728 GACGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCGATTCTCATGCCTCA 787

 31775970 GCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTCTGAGCCACCATGCCTGGCTAACTTTTGTATTT 31776029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      788 GCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTCTGAGCCACCATGCCTGGCTAACTTTTGTATTT 847

 31776030 TTAGTACAGATGGGGTTTTGCCATGTTACCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGC 31776089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      848 TTAGTACAGATGGGGTTTTGCCATGTTACCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGC 907

 31776090 AATCCCCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTTCCGCTAGATTTTCTAAG 31776149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      908 AATCCCCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTTCCGCTAGATTTTCTAAG 967

 31776150 TATTTGGCAGAGAGTTACATGTAATAGTCTTTTGTAATTCTTTTTTTCTTTTTTTAAATA 31776209
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
      968 TATTTGGCAGAGAGTTACATGTAATAGCCTTTTGTAATTCTTTTTTTCTTTTTTTAAATA 1027

 31776210 AGATCTTGCTCTGTTGTCCAGGCTGGAGTGCAGTGACGTGATGTCGGCTCACTGCAGCCT 31776269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1028 AGATCTTGCTCTGTTGTCCAGGCTGGAGTGCAGTGATGTGATGTCGGCTCACTGCAGCCT 1087

 31776270 CTGCCTCCTGGGTTGAAGCGATTCTCATGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGG 31776329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1088 CTGCCTCCTGGGTTGAAGCGATTCTCATGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGG 1147

 31776330 CATGCACCACCACACCCAGCTAAGTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGT 31776389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1148 CATGCACCACCACACCCAGCTAAGTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGT 1207

 31776390 TGCCCAGGCTTGTAATTCTTTTAATTTGCTATTATCAGTGGTTGTATGTCCTTTCTTACT 31776449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1208 TGCCCAGGCTTGTAATTCTTTTAATTTGCTATTATCAGTGGTTGTATGTCCTTTCTTACT 1267

 31776450 CAAGATTGCTATTTATTTATTTTATTTTATTTTTTGAGACGGAATCTCACTCTGTTGCCC 31776509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1268 CAAGATTGCTATTTATTTATTTTATTTTATTTTTTGAGACGGAATCTCACTCTGTTGCCC 1327

 31776510 AGACTGGAGTGCAGTGGCATGCGCCACCACACCCAGCTAATTTTTGTGTTTTTAGTAGAG 31776569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1328 AGACTGGAGTGCAGTGGCATGCGCCACCACACCCAGCTAATTTTTGTGTTTTTAGTAGAG 1387

 31776570 ACAGCATTTTGCCATATTGGCCAGGCTGGTCTCTAACTCCTGATCTCAAGTGATCTGCCC 31776629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1388 ACAGCATTTTGCCATATTGGCCAGGCTGGTCTCTAACTCCTGATCTCAAGTGATCTGCCC 1447

 31776630 ACCTTGGCCCCTCCAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCTGGCCTATTTTT 31776689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1448 ACCTTGGCCCCTCCAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCTGGCCTATTTTT 1507

 31776690 TCTTTCTATCCTTATTCAAGCATTTTGAGATATTTTTCCTTTCTGTTTTACTGATCCTTT 31776749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1508 TCTTTCTATCCTTATTCAAGCATTTTGAGATATTTTTCCTTTCTGTTTTACTGATCCTTT 1567

 31776750 CATCTTTTCAAGTTCTTCTTTCTTTCTTTCTTTC-TTTTTTTTTTTTAAGACAGGGTCTC 31776808
          |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
     1568 CATCTTTTCAAGTTCTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTAAGACAGGGTCTC 1627

 31776809 GCTCTATTGCCTAGGCTAGAGAATACTGGCATGATTATAGCTCACTGCAACCTCCTGGGC 31776868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1628 GCTCTATTGCCTAGGCTAGAGAATACTGGCATGATTATAGCTCACTGCAACCTCCTGGGC 1687

 31776869 TCAAGGTATCTTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCCAAGACTACAGGTGTGCACCACTAC 31776928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1688 TCAAGGTATCTTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCCAAGACTACAGGTGTGCACCACTAC 1747

 31776929 ATCAAGCTAAATTTTTTTTTTTTTACTTTTATTTTAGGTTCAGGAACAGCTGTGCAAGTT 31776988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1748 ATCAAGCTAAATTTTTTTTTTTTTACTTTTATTTTAGGTTCAGGAACAGCTGTGCAAGTT 1807

 31776989 TGTTATATAGGTAAGCTCGTGTTATGGGGGTTTATTGTACAGATTATTTCATCACTCAGG 31777048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1808 TGTTATATAGGTAAGCTCGTGTTATGGGGGTTTATTGTACAGATTATTTCATCACTCAGG 1867

 31777049 TACAAAGCCTGGTAACCAATAGTTATTTTTTCTGATCATTTCCTTTCTCCCGCCCTGCAC 31777108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1868 TACAAAGCCTGGTAACCAATAGTTATTTTTTCTGATCATTTCCTTTCTCCCGCCCTGCAC 1927

 31777109 CCTCAAGTAGGTCCCAGTGTCTGTTGTTCCCCTCTTTGTGTCCATGTGTTCTTATTGAGC 31777168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1928 CCTCAAGTAGGTCCCAGTGTCTGTTGTTCCCCTCTTTGTGTCCATGTGTTCTTATTGAGC 1987

 31777169 GCGCGCACACACACACACACACACACATTTATATGTACAAGCAATTGTCCTGCCTTAGCC 31777228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1988 GCGCGCACACACACACACACACACACATTTATATGTACAAGCAATTGTCCTGCCTTAGCC 2047

 31777229 TCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCACCACACCCAGCTAATATTTTTGTATGTTT 31777288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2048 TCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCACCACACCCAGCTAATATTTTTGTATGTTT 2107

 31777289 TTAGTAGAGACAAGGTTTCACCATGTTGGTCAGACTGGTCTCAAATTCTTGACCTCAGGT 31777348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2108 TTAGTAGAGACAAGGTTTCACCATGTTGGTCAGACTGGTCTCAAATTCTTGACCTCAGGT 2167

 31777349 GATCCACCTGCCTCAGCCTTCCAAAGTGCTGTGATTACAGGTGTGAGCCACCACGTCCAG 31777408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2168 GATCCACCTGCCTCAGCCTTCCAAAGTGCTGTGATTACAGGTGTGAGCCACCACGTCCAG 2227

 31777409 CTGAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACATATGGTATTTGTTTTTCTGTTCCTGTGTTAGTT 31777468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2228 CTGAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACATATGGTATTTGTTTTTCTGTTCCTGTGTTAGTT 2287

 31777469 TGCTAAGGATAATGGCCTCCAGTTTCATCCATGTTCCTGCAAAGGACATGATCTTCTTTT 31777528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2288 TGCTAAGGATAATGGCCTCCAGTTTCATCCATGTTCCTGCAAAGGACATGATCTTCTTTT 2347

 31777529 TTGTGGCTGCATAGTATTACATGGTGTATATGTACCACATTTTCTTTATCCAGTCTGTCA 31777588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2348 TTGTGGCTGCATAGTATTACATGGTGTATATGTACCACATTTTCTTTATCCAGTCTGTCA 2407

 31777589 TTGATGGGCATTTAGGTGATTCCACGTCTTTGCTATTGTGGATGGTGCTGTGATGAATAT 31777648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2408 TTGATGGGCATTTAGGTGATTCCACGTCTTTGCTATTGTGGATGGTGCTGTGATGAATAT 2467

 31777649 ATGCATGCATGTATCTTTATGGTGGAATGATATATATTCCTTTGGGTATCTACCCTGTAA 31777708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2468 ATGCATGCATGTATCTTTATGGTGGAATGATATATATTCCTTTGGGTATCTACCCTGTAA 2527

 31777709 TGGGATTGCTGGGTCAAATGGTAGTTCTGTTTGTAGCTCTTTCAGGAATCACCAGACTAC 31777768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2528 TGGGATTGCTGGGTCAAATGGTAGTTCTGTTTGTAGCTCTTTCAGGAATCACCAGACTAC 2587

 31777769 TTTCCATAGTGGTTGAACTAATTTACATTCCCACCAACAGTGCATAAGTGTTCCCTTTTC 31777828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2588 TTTCCATAGTGGTTGAACTAATTTACATTCCCACCAACAGTGCATAAGTGTTCCCTTTTC 2647

 31777829 TCCACAACCTCACCAGTATCTGTGGGGTTTTTTCACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAC 31777888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2648 TCCACAACCTCACCAGTATCTGTGGGGTTTTTTCACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAC 2707

 31777889 AGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAG 31777922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2708 AGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAG 2741

Alignment time is 2.34679 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31766416,31790625] =>     24210 nucs '22 dna:chromosome chromosome:GRCh37:22:1:51304566:1'
Second seq [       1,    4926] =>      4926 nucs 'mol-32-2076-107632_4926'

Score:        4887
Aligned:      4920        nucs
Identic:      4917 (100%) nucs =>       239 (100%)      4678 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31776178,31776416] EXCISED REGION [31780626,31785305]
 second seq =>  [       7,     245] EXCISED REGION [     246,    4926]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      4209 nucs [31776417,31780625]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [31776417,31776419] to [31780626,31780628]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [31776417,31776417] to [31780625,31780625]
 second seq =>         0 nucs

 31776178 CTTTTGTAATTCTTTTTTTCTTTTTTTAAATAAGATCTTGCTCTGTTGTCCAGGCTGGAG 31776237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        7 CTTTTGTAATTCTTTTTTTCTTTTTTTAAATAAGATCTTGCTCTGTTGTCCAGGCTGGAG 66

 31776238 TGCAGTGACGTGATGTCGGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCTGGGTTGAAGCGATTCTCAT 31776297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       67 TGCAGTGACGTGATGTCGGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCTGGGTTGAAGCGATTCTCAT 126

 31776298 GCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGCACCACCACACCCAGCTAAGTTTT 31776357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      127 GCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGCACCACCACACCCAGCTAAGTTTT 186

 31776358 GTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGCCCAGGCTTGTAATTCTTTTAATTT 31776416
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      187 GTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGCCCAGGCTTGTAATTCTTTTAATTT 245

EXCISED REGION

 31780626 GCTGTTGTTGGTATATAGGCATGCTAGTGATTTTTGTACATTGATTTTGTATCCTGAAAC 31780685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      246 GCTGTTGTTGGTATATAGGCATGCTAGTGATTTTTGTACATTGATTTTGTATCCTGAAAC 305

 31780686 TGCTGAAGTTTATCAGCTGAAGAATCTTTTGTACAGGGACTATAGGGTTTTCTAGATGTA 31780745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      306 TGCTGAAGTTTATCAGCTGAAGAATCTTTTGTACAGGGACTATAGGGTTTTCTAGATGTA 365

 31780746 GAATCATGTCTTCTGCAAAGAGAGATACTCTGACCTCCTGTCTTCCTATTTGGTTGCCCT 31780805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      366 GAATCATGTCTTCTGCAAAGAGAGATACTCTGACCTCCTGTCTTCCTATTTGGTTGCCCT 425

 31780806 TTATTTCTTTCTCTTGCCTGACTGCTCTGACCAGGACTTCCAACCCTGTGTTGAATAGGA 31780865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      426 TTATTTCTTTCTCTTGCCTGACTGCTCTGACCAGGACTTCCAACCCTGTGTTGAATAGGA 485

 31780866 GTGGTGAGAAAGGGCACCCGGGTCTTGTGCCAGTTTTCAAAGAGAATGCTTTCAGCTTTT 31780925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      486 GTGGTGAGAAAGGGCACCCGGGTCTTGTGCCAGTTTTCAAAGAGAATGCTTTCAGCTTTT 545

 31780926 GCCCATTCAGTATGATGTTGGCTTTGGGTCTGTCACAGATAGCTGTTATTATTTTGAGGT 31780985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      546 GCCCATTCAGTATGATGTTGGCTTTGGGTCTGTCACAGATAGCTGTTATTATTTTGAGGT 605

 31780986 ATGTTCCTTCAAAATCTAGTTTACTGACAGTTTTTAATACGAAGCGATGTTGAATTTTAT 31781045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      606 ATGTTCCTTCAAAATCTAGTTTACTGACAGTTTTTAATACGAAGCGATGTTGAATTTTAT 665

 31781046 CGAAAGACTTTTCTGCATCTATTGAGATAATCATGTGGTTTTTGTCTTTAGTTCTGTTTA 31781105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      666 CGAAAGACTTTTCTGCATCTATTGAGATAATCATGTGGTTTTTGTCTTTAGTTCTGTTTA 725

 31781106 TGTGATGAATCACTTTTATTGATTTGTGGATGTAAAACCAACCTTGCATCCCAGGAATAA 31781165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      726 TGTGATGAATCACTTTTATTGATTTGTGGATGTAAAACCAACCTTGCATCCCAGGAATAA 785

 31781166 ACCCTATTTGATCGTGGTGGATTTGCTTTTTGATGTGCTGCTGGATTCAATTTGCAAGTA 31781225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      786 ACCCTATTTGATCGTGGTGGATTTGCTTTTTGATGTGCTGCTGGATTCAATTTGCAAGTA 845

 31781226 TTTTGTTGAGGATTTCTGCATCGATGTTCATCAAGGATATTGGCTTGAAGTTTTCTATTT 31781285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      846 TTTTGTTGAGGATTTCTGCATCGATGTTCATCAAGGATATTGGCTTGAAGTTTTCTATTT 905

 31781286 TGGGTGTGTCTCTGCCAGGTTTTAGTGTCAGGATGATGCCGGGCTCACAGAATGAGTTGG 31781345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      906 TGGGTGTGTCTCTGCCAGGTTTTAGTGTCAGGATGATGCCGGGCTCACAGAATGAGTTGG 965

 31781346 GGAGGAGTCCCTCTGCCTCAATTTTTTGAAATAGTTTCAGAAGAAATAGTACTATCCCGT 31781405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      966 GGAGGAGTCCCTCTGCCTCAATTTTTTGAAATAGTTTCAGAAGAAATAGTACTATCCCGT 1025

 31781406 CTTTGTACATCTGGTGGAATTCGGCTGTGACTTCATCTGGTCCTGGGCTTTTCTTTGTTA 31781465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1026 CTTTGTACATCTGGTGGAATTCGGCTGTGACTTCATCTGGTCCTGGGCTTTTCTTTGTTA 1085

 31781466 GTAGGCTATTTATTACTGATTTCATTTTGGAGCTCATTATTGTTCTGTTCAGGGAATCTA 31781525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1086 GTAGGCTATTTATTACTGATTTCATTTTGGAGCTCATTATTGTTCTGTTCAGGGAATCTA 1145

 31781526 TTTCTTCTTGTTTCAGTTTTGGGAAGGTGTATGTGTCCAGGAATGTATCCATCTCTTCTA 31781585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1146 TTTCTTCTTGTTTCAGTTTTGGGAAGGTGTATGTGTCCAGGAATGTATCCATCTCTTCTA 1205

 31781586 GGTTTTTATTATTATTCTTTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGTGTGGGGTGC 31781645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1206 GGTTTTTATTATTATTCTTTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGTGTGGGGTGC 1265

 31781646 AGTGGCGCAATCTCGGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCTGAGTTTAAGCAATTCTCCTGAC 31781705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1266 AGTGGCGCAATCTCGGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCTGAGTTTAAGCAATTCTCCTGAC 1325

 31781706 TCAGCCTCCCAAGTACCTGGGATTAAAGGCATGTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTA 31781765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1326 TCAGCCTCCCAAGTACCTGGGATTAAAGGCATGTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTA 1385

 31781766 TTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGTTCTTGAACTCCTGACCTCA 31781825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1386 TTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGTTCTTGAACTCCTGACCTCA 1445

 31781826 GGTGATCTGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGTATGAGCCACTGTGCC 31781885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1446 GGTGATCTGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGTATGAGCCACTGTGCC 1505

 31781886 TGGCCGCTTCTAGGTTTCCTAGTTTGTGTGCATAGAGGTGTTCATAGTAGCCTGCGATGG 31781945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1506 TGGCCGCTTCTAGGTTTCCTAGTTTGTGTGCATAGAGGTGTTCATAGTAGCCTGCGATGG 1565

 31781946 TTATTTTTATTTCTGTGGGGTCACTGGTAACATCCCCTTTGTCATTTCTAACTATGTTTA 31782005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1566 TTATTTTTATTTCTGTGGGGTCACTGGTAACATCCCCTTTGTCATTTCTAACTATGTTTA 1625

 31782006 TTTATTTTTTGTTTATTTATTTATTTATTTATTTTTTGAGATGGAGTCTCGTTCTGTTGT 31782065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1626 TTTATTTTTTGTTTATTTATTTATTTATTTATTTTTTGAGATGGAGTCTCGTTCTGTTGT 1685

 31782066 TCCGATTGTAGTGAAGTGGCACCATTTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCTCAGGTTCAA 31782125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1686 TCCGATTGTAGTGAAGTGGCACCATTTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCTCAGGTTCAA 1745

 31782126 GAGATTCTCGTGGCTCCGCCTACCAAGTAGCAGGGATTATAGGCATATGTCACCATGCCC 31782185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1746 GAGATTCTCGTGGCTCCGCCTACCAAGTAGCAGGGATTATAGGCATATGTCACCATGCCC 1805

 31782186 GGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGATTTTACCATGTTGGCCAGACTGGTCTCG 31782245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1806 GGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGATTTTACCATGTTGGCCAGACTGGTCTCG 1865

 31782246 AACTCCTGACCTCAAGTGATCACCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCAT 31782305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1866 AACTCCTGACCTCAAGTGATCACCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCAT 1925

 31782306 GAGCCATATTTACTTATTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGTTAGAGTGCAG 31782365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1926 GAGCCATATTTACTTATTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGTTAGAGTGCAG 1985

 31782366 TGGCGTGATCTGGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCTGGATTCAGGTGATTCTCCTGCCTC 31782425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1986 TGGCGTGATCTGGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCTGGATTCAGGTGATTCTCCTGCCTC 2045

 31782426 AGCATCTCAAGTAGCTGGGATTGCAGGCGCCCACCAGCACGCCTGGCTAATTTTTGTATC 31782485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2046 AGCATCTCAAGTAGCTGGGATTGCAGGCGCCCACCAGCACGCCTGGCTAATTTTTGTATC 2105

 31782486 TTTAGTAGAGACAAGATTTTGCCGTGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAAT 31782545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2106 TTTAGTAGAGACAAGATTTTGCCGTGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAAT 2165

 31782546 GATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACATGAGCCACCGTGCCCTG 31782605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2166 GATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACATGAGCCACCGTGCCCTG 2225

 31782606 CCTTAATTGTGTTTATTTGGATCTTCTCTCTTTCTTCATTAGTCCAGCTAGTGGCCTATC 31782665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2226 CCTTAATTGTGTTTATTTGGATCTTCTCTCTTTCTTCATTAGTCCAGCTAGTGGCCTATC 2285

 31782666 TTACTAATTTTTCAAAAAAAAAAAACAAACAAACAACCAACTCCTGGATTCATTGATCTT 31782725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2286 TTACTAATTTTTCAAAAAAAAAAAACAAACAAACAACCAACTCCTGGATTCATTGATCTT 2345

 31782726 TTGAATGGCTTTTTGTGTCTTGATTTCCTTCAGTTCAGCTCTGATTTTGGTTATTTTTCT 31782785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2346 TTGAATGGCTTTTTGTGTCTTGATTTCCTTCAGTTCAGCTCTGATTTTGGTTATTTTTCT 2405

 31782786 GCTAGCTTTGGGGTTGGTTTGCTCTTGCTTCTCTAGTTCTTTTTTTTTTTTTGAGACAAA 31782845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2406 GCTAGCTTTGGGGTTGGTTTGCTCTTGCTTCTCTAGTTCTTTTTTTTTTTTTGAGACAAA 2465

 31782846 GTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGGTCACTGCAACCTCC 31782905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2466 GTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGGTCACTGCAACCTCC 2525

 31782906 GCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTG 31782965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2526 GCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTG 2585

 31782966 CCGGCCACCACACCCAGCTAACTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATATTG 31783025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2586 CCGGCCACCACACCCAGCTAACTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATATTG 2645

 31783026 ACCAGGCTGGTGTCAAACTCCTAACCTTGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCT 31783085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2646 ACCAGGCTGGTGTCAAACTCCTAACCTTGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCT 2705

 31783086 GGGATTACAGGCATGAGCCACTGAGCCTAGCCTCTAGTTCTTTTTTTTTGAGATGGAGTC 31783145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2706 GGGATTACAGGCATGAGCCACTGAGCCTAGCCTCTAGTTCTTTTTTTTTGAGATGGAGTC 2765

 31783146 TCATCCTGTTGCCCAGACAGGAATGCAGTGATGCAGTCTCGGCTCTCTGCAACCTCAGCC 31783205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2766 TCATCCTGTTGCCCAGACAGGAATGCAGTGATGCAGTCTCGGCTCTCTGCAACCTCAGCC 2825

 31783206 TCCCAGGTTCAAGCGATTCCCCTGCCTCCACCTCCCAAGTAGCTGAGATTACAGGCGCAT 31783265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2826 TCCCAGGTTCAAGCGATTCCCCTGCCTCCACCTCCCAAGTAGCTGAGATTACAGGCGCAT 2885

 31783266 GTTACCACACCCAGCTAATTTTTATATTTTTAGTAGAGATGAGGCTTCACCATGTTGGCC 31783325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2886 GTTACCACACCCAGCTAATTTTTATATTTTTAGTAGAGATGAGGCTTCACCATGTTGGCC 2945

 31783326 ATGCTGGTCTCGACCTCCTGACCTCAAGTGATCCACCTGCCTCGGCCTCCCACAGTGCTG 31783385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2946 ATGCTGGTCTCGACCTCCTGACCTCAAGTGATCCACCTGCCTCGGCCTCCCACAGTGCTG 3005

 31783386 AGATTACAGGCATGAGCCATTGTGCCCGGCCTCTTCTCTAGTTTCTTTTAGTTATGATAT 31783445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3006 AGATTACAGGCATGAGCCATTGTGCCCGGCCTCTTCTCTAGTTTCTTTTAGTTATGATAT 3065

 31783446 TAGGCTGAATATATATGACCCAACACAGCAGCACCCAGATTCATAAAGCAAGTTATTAGC 31783505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3066 TAGGCTGAATATATATGACCCAACACAGCAGCACCCAGATTCATAAAGCAAGTTATTAGC 3125

 31783506 GCTCTTCAAAGAGACTTAGACTCCCACACAGTAATAGTAGGAGACTTCAACACTCCTACT 31783565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3126 GCTCTTCAAAGAGACTTAGACTCCCACACAGTAATAGTAGGAGACTTCAACACTCCTACT 3185

 31783566 ATTTTATGGTTCTCTTTCTAAGTTTTTGAGACCTTTCTAACTTTTTTTTTTTTTTTTTGA 31783625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3186 ATTTTATGGTTCTCTTTCTAAGTTTTTGAGACCTTTCTAACTTTTTTTTTTTTTTTTTGA 3245

 31783626 GGTGGAGTCTTGCTTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGGTCTCGGCTCACCACA 31783685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3246 GGTGGAGTCTTGCTTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGGTCTCGGCTCACCACA 3305

 31783686 ACCTTCGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTTTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTA 31783745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3306 ACCTTCGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTTTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTA 3365

 31783746 CAGGTGCGCGCCACCAAGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACT 31783805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3366 CAGGTGCGCGCCACCAAGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACT 3425

 31783806 ATGTTGACCCGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCATGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAG 31783865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3426 ATGTTGACCCGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCATGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAG 3485

 31783866 TGTGCTGGGATTACAGGTGTGAACCACCGTGCCGGCAAGATCTTTCTAACTTTTTGATGT 31783925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3486 TGTGCTGGGATTACAGGTGTGAACCACCGTGCCGGCAAGATCTTTCTAACTTTTTGATGT 3545

 31783926 TGGTGTTTCGTGCTATAATTTCCCTCTTAACACTGCCTTAGCTGTGTCCCAGAGATTCTA 31783985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3546 TGGTGTTTCGTGCTATAATTTCCCTCTTAACACTGCCTTAGCTGTGTCCCAGAGATTCTA 3605

 31783986 ATATGTTGTATCTTTTTTCTCATTAGTTTCAAAGAACTACTTGATTTCTGCCTTAATTTC 31784045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3606 ATATGTTGTATCTTTTTTCTCATTAGTTTCAAAGAACTACTTGATTTCTGCCTTAATTTC 3665

 31784046 ATTACTTACACAAAAGTCATTCAGGAGCATGTAATTGTATGGTTTTGGGCAATTTTTAAT 31784105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3666 ATTACTTACACAAAAGTCATTCAGGAGCATGTAATTGTATGGTTTTGGGCAATTTTTAAT 3725

 31784106 GTCTTGATTTTTGTTTTTATTGCATTGTGGTTCAAGAGTATGTTTGGTATGATTTTGGTT 31784165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3726 GTCTTGATTTTTGTTTTTATTGCATTGTGGTTCAAGAGTATGTTTGGTATGATTTTGGTT 3785

 31784166 CTTTTGCATTTGCTAAGGATTGTTTTATGTCCAATTGTGTGGTCAATTTTAGATTATGTT 31784225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3786 CTTTTGCATTTGCTAAGGATTGTTTTATGTCCAATTGTGTGGTCAATTTTAGATTATGTT 3845

 31784226 GCATGTGGTAATGAGAAGAATGTATATTCTGTTGTTTTGCAGAGGAGAGCTCTGTAGAGG 31784285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3846 GCATGTGGTAATGAGAAGAATGTATATTCTGTTGTTTTGCAGAGGAGAGCTCTGTAGAGG 3905

 31784286 TCTATCAGATCCATTTGGTCCAATGTTGAGTTCAGGTCCTGAATATCTTTGTTAAGTTTC 31784345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3906 TCTATCAGATCCATTTGGTCCAATGTTGAGTTCAGGTCCTGAATATCTTTGTTAAGTTTC 3965

 31784346 TGTTTCGATGATCTGTCTAATACTGTTAGTGAAGTGTTCTACTATTACTGTGTGGGAGTC 31784405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3966 TGTTTCGATGATCTGTCTAATACTGTTAGTGAAGTGTTCTACTATTACTGTGTGGGAGTC 4025

 31784406 TAAGTCTCTTTGAAGAGCCCTAATAACTTGCTTTATGAATCTGGGTGCTTCTGTGTTGGG 31784465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4026 TAAGTCTCTTTGAAGAGCCCTAATAACTTGCTTTATGAATCTGGGTGCTTCTGTGTTGGG 4085

 31784466 TCATATATATTTAAGACAGTTAGGTCTTCTTGTTGAATTGAACCCTTTACCACTATAATG 31784525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4086 TCATATATATTTAAGACAGTTAGGTCTTCTTGTTGAATTGAACCCTTTACCACTATAATG 4145

 31784526 TCCTTTGTCTTTTTTGACCTTTGTTGGTTTAAAGTCTGTTTTATCTGAAATTAGGATTGC 31784585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4146 TCCTTTGTCTTTTTTGACCTTTGTTGGTTTAAAGTCTGTTTTATCTGAAATTAGGATTGC 4205

 31784586 AACTCCTGCTTTTTTCTGATTTCCATTTGCTTGGTACTTTTTCCTCCATCCTTTTTATTT 31784645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4206 AACTCCTGCTTTTTTCTGATTTCCATTTGCTTGGTACTTTTTCCTCCATCCTTTTTATTT 4265

 31784646 TATTTTTTTGAGACTATGGATGAGATAGGGCTGTTGAAGACAGAATACCATTGAGTTTTG 31784705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4266 TATTTTTTTGAGACTATGGATGAGATAGGGCTGTTGAAGACAGAATACCATTGAGTTTTG 4325

 31784706 TTTTTTGATCCAGAAAAATATGGAACATTTCATGAATTTGCATCATCCTTGCACAGGGGC 31784765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4326 TTTTTTGATCCAGAAAAATATGGAACATTTCATGAATTTGCATCATCCTTGCACAGGGGC 4385

 31784766 CATGCTAATCTTCTCTGTATCATTCCAATTTTAGTATATGTGCTGCTGAAGCAAGCACAC 31784825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4386 CATGCTAATCTTCTCTGTATCATTCCAATTTTAGTATATGTGCTGCTGAAGCAAGCACAC 4445

 31784826 CAAGCTCATTTTTATTTTTATTTTTATTTTTTTGTAGAGACAAGGTCTTGCTATGTTGCC 31784885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4446 CAAGCTCATTTTTATTTTTATTTTTATTTTTTTGTAGAGACAAGGTCTTGCTATGTTGCC 4505

 31784886 CAGGCTGGTCTCCAACTCCTGGCCTGCAGTGATCTCCCTACTTTGGCCTCCCAAAGTGCT 31784945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4506 CAGGCTGGTCTCCAACTCCTGGCCTGCAGTGATCTCCCTACTTTGGCCTCCCAAAGTGCT 4565

 31784946 GGGAGTACAGGTGTGAGCCACCTTGTCCAACCCTTTCAAGTAAC-TTTTTTTTTTTTTTT 31785004
          |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
     4566 GAGAGTACAGGTGTGAGCCACCTTGTCCAACCCTTTCAAGTAACTTTTTTTTTTTTTTTT 4625

 31785005 TCCGGATACAGGGTTTCACTCCATTACCTAGTCTGGAGTGCAGTGGCATGATCCTGGCTC 31785064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4626 TCCGGATACAGGGTTTCACTCCATTACCTAGTCTGGAGTGCAGTGGCATGATCCTGGCTC 4685

 31785065 ACTGCAACCTTGAATTCCTGGCCTTAAGTAATCCTCCCACCTCAGCCTCCCCAGTAGCTG 31785124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     4686 ACTGCAACCTTGAATTCCTGGCCTTAAGTAATCCTCCCACCTCAGCCTCCCCAGTAGCGG 4745

 31785125 GAAACACAGGCATGCACCACCAACCCAGCTAATTTTTTAATTTTTTGTAGAGATAAGGTC 31785184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4746 GAAACACAGGCATGCACCACCAACCCAGCTAATTTTTTAATTTTTTGTAGAGATAAGGTC 4805

 31785185 TCCCTATATTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGCAGTTCTTCTACCTCAGC 31785244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4806 TCCCTATATTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGCAGTTCTTCTACCTCAGC 4865

 31785245 CTCCCAAAGTGTTGCGATTATACATGCCTGGCCTATTATTGACAAATTGTTATTTTATTA 31785304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4866 CTCCCAAAGTGTTGCGATTATACATGCCTGGCCTATTATTGACAAATTGTTATTTTATTA 4925

 31785305 A 31785305
          |
     4926 A 4926

Alignment time is 4.18088 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31766416,31790625] =>     24210 nucs '22 dna:chromosome chromosome:GRCh37:22:1:51304566:1'
Second seq [       1,    5364] =>      5364 nucs 'mol-32-220d-044940_5364'

Score:        5321
Aligned:      5362        nucs
Identic:      5355 (100%) nucs =>      4256 (100%)      1099 (100%)
Gaps:            7 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31779636,31783898] EXCISED REGION [31783907,31785005]
 second seq =>  [       1,    4256] EXCISED REGION [    4266,    5364]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         8 nucs [31783899,31783906]
 second seq =>         9 nucs [4257,4265]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [4257,4257] to [4266,4266]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [31783898,31783898] to [31783907,31783907]
 second seq =>         1 nucs [4256,4256] to [4266,4266]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31779636 GCGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAAGAAAAGGGTCCA 31779695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||
        1 GCGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAA---GAAAGAAAGAAAAGAAAAGGGTCCA 57

 31779696 GTTTCAATCTTCCGCATATGGCTAGCCAGTTATCCCAGCCCCTTTCATTGAATAGGGAGT 31779755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       58 GTTTCAATCTTCCGCATATGGCTAGCCAGTTATCCCAGCCCCTTTCATTGAATAGGGAGT 117

 31779756 TCTTTTCCCACCGCTTGTTTTTTCAGCTTTGTCAAAGATCAAACGGTTGTAGGTGAGTGT 31779815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      118 TCTTTTCCCACCGCTTGTTTTTTCAGCTTTGTCAAAGATCAAACGGTTGTAGGTGAGTGT 177

 31779816 GCAGCCTCATTTCTGGGCTCCCTATTATATTCCATTGGCCTATCGGTCTGTTTTTGTACC 31779875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      178 GCAGCCTCATTTCTGGGCTCCCTATTATATTCCATTGGCCTATCGGTCTGTTTTTGTACC 237

 31779876 CAGTACCATGCTATTTTGGTTACTGTAGCCCTGTAGTATAGTTTGAAGTTGGGTAGTTTG 31779935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      238 CAGTACCATGCTATTTTGGTTACTGTAGCCCTGTAGTATAGTTTGAAGTTGGGTAGTTTG 297

 31779936 AAGCCTCCAGCTTTGTTCTTTTTGTTTAAGATTGCCTTGGTATTCAGGCTGTTTTTTGGT 31779995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      298 AAGCCTCCAGCTTTGTTCTTTTTGTTTAAGATTGCCTTGGTATTCAGGCTGTTTTTTGGT 357

 31779996 CCCATATGAATTTTAAAATAGTTTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAGAATATTAGTGGTAGTT 31780055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      358 CCCATATGAATTTTAAAATAGTTTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAGAATATTAGTGGTAGTT 417

 31780056 TGATAGGAATAGCATTGAATCTGTAAATTGCTTTGGGCTATATGGCTATTTTAATGATAC 31780115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      418 TGATAGGAATAGCATTGAATCTGTAAATTGCTTTGGGCTATATGGCTATTTTAATGATAC 477

 31780116 TGATTTTTTCCTATCCATGAGCATGGAATGTTTTTCCATTCATTTGTGTCATCTCTGATT 31780175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      478 TGATTTTTTCCTATCCATGAGCATGGAATGTTTTTCCATTCATTTGTGTCATCTCTGATT 537

 31780176 TCTTTGAGCAGTGTTTTGTAATTATCATTGTAGAGATCTCTCACCTCCCTGGTTAGCTGT 31780235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      538 TCTTTGAGCAGTGTTTTGTAATTATCATTGTAGAGATCTCTCACCTCCCTGGTTAGCTGT 597

 31780236 ATTCATAGGCATTTTATTTATTTATTTATTTTTTGAAACTGAGTTTCACTCTTGTTGCCC 31780295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      598 ATTCATAGGCATTTTATTTATTTATTTATTTTTTGAAACTGAGTTTCACTCTTGTTGCCC 657

 31780296 AGGCTGGAGTGCAATGGCTCAATCTCGGCTCACCGCAACCTCCATCCTGGGTTCAAGCGA 31780355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      658 AGGCTGGAGTGCAATGGCTCAATCTCGGCTCACCGCAACCTCCATCCTGGGTTCAAGCGA 717

 31780356 TTTTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGTGCCACCACGCCCTACT 31780415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      718 TTTTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGTGCCACCACGCCCTACT 777

 31780416 AATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTAGGTC 31780475
          |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      778 AATTTTTTTTTTTTTTTTTTT--GTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTAGGTC 835

 31780476 AGGCTGGTCTCGAACTCCCAACCTCAGGTGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTG 31780535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      836 AGGCTGGTCTCGAACTCCCAACCTCAGGTGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTG 895

 31780536 AGATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGCGGCATTTTATTATTTTTGTGGCAGTTGTGA 31780595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      896 AGATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGCGGCATTTTATTATTTTTGTGGCAGTTGTGA 955

 31780596 ATGGGATTTTGTCATTTGTGTCTTGGCTTGGCTGTTGTTGGTATATAGGCATGCTAGTGA 31780655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      956 ATGGGATTTTGTCATTTGTGTCTTGGCTTGGCTGTTGTTGGTATATAGGCATGCTAGTGA 1015

 31780656 TTTTTGTACATTGATTTTGTATCCTGAAACTGCTGAAGTTTATCAGCTGAAGAATCTTTT 31780715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1016 TTTTTGTACATTGATTTTGTATCCTGAAACTGCTGAAGTTTATCAGCTGAAGAATCTTTT 1075

 31780716 GTACAGGGACTATAGGGTTTTCTAGATGTAGAATCATGTCTTCTGCAAAGAGAGATACTC 31780775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1076 GTACAGGGACTATAGGGTTTTCTAGATGTAGAATCATGTCTTCTGCAAAGAGAGATACTC 1135

 31780776 TGACCTCCTGTCTTCCTATTTGGTTGCCCTTTATTTCTTTCTCTTGCCTGACTGCTCTGA 31780835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1136 TGACCTCCTGTCTTCCTATTTGGTTGCCCTTTATTTCTTTCTCTTGCCTGACTGCTCTGA 1195

 31780836 CCAGGACTTCCAACCCTGTGTTGAATAGGAGTGGTGAGAAAGGGCACCCGGGTCTTGTGC 31780895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1196 CCAGGACTTCCAACCCTGTGTTGAATAGGAGTGGTGAGAAAGGGCACCCGGGTCTTGTGC 1255

 31780896 CAGTTTTCAAAGAGAATGCTTTCAGCTTTTGCCCATTCAGTATGATGTTGGCTTTGGGTC 31780955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1256 CAGTTTTCAAAGAGAATGCTTTCAGCTTTTGCCCATTCAGTATGATGTTGGCTTTGGGTC 1315

 31780956 TGTCACAGATAGCTGTTATTATTTTGAGGTATGTTCCTTCAAAATCTAGTTTACTGACAG 31781015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1316 TGTCACAGATAGCTGTTATTATTTTGAGGTATGTTCCTTCAAAATCTAGTTTACTGACAG 1375

 31781016 TTTTTAATACGAAGCGATGTTGAATTTTATCGAAAGACTTTTCTGCATCTATTGAGATAA 31781075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1376 TTTTTAATACGAAGCGATGTTGAATTTTATCGAAAGACTTTTCTGCATCTATTGAGATAA 1435

 31781076 TCATGTGGTTTTTGTCTTTAGTTCTGTTTATGTGATGAATCACTTTTATTGATTTGTGGA 31781135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1436 TCATGTGGTTTTTGTCTTTAGTTCTGTTTATGTGATGAATCACTTTTATTGATTTGTGGA 1495

 31781136 TGTAAAACCAACCTTGCATCCCAGGAATAAACCCTATTTGATCGTGGTGGATTTGCTTTT 31781195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1496 TGTAAAACCAACCTTGCATCCCAGGAATAAACCCTATTTGATCGTGGTGGATTTGCTTTT 1555

 31781196 TGATGTGCTGCTGGATTCAATTTGCAAGTATTTTGTTGAGGATTTCTGCATCGATGTTCA 31781255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1556 TGATGTGCTGCTGGATTCAATTTGCAAGTATTTTGTTGAGGATTTCTGCATCGATGTTCA 1615

 31781256 TCAAGGATATTGGCTTGAAGTTTTCTATTTTGGGTGTGTCTCTGCCAGGTTTTAGTGTCA 31781315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1616 TCAAGGATATTGGCTTGAAGTTTTCTATTTTGGGTGTGTCTCTGCCAGGTTTTAGTGTCA 1675

 31781316 GGATGATGCCGGGCTCACAGAATGAGTTGGGGAGGAGTCCCTCTGCCTCAATTTTTTGAA 31781375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1676 GGATGATGCCGGGCTCACAGAATGAGTTGGGGAGGAGTCCCTCTGCCTCAATTTTTTGAA 1735

 31781376 ATAGTTTCAGAAGAAATAGTACTATCCCGTCTTTGTACATCTGGTGGAATTCGGCTGTGA 31781435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1736 ATAGTTTCAGAAGAAATAGTACTATCCCGTCTTTGTACATCTGGTGGAATTCGGCTGTGA 1795

 31781436 CTTCATCTGGTCCTGGGCTTTTCTTTGTTAGTAGGCTATTTATTACTGATTTCATTTTGG 31781495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1796 CTTCATCTGGTCCTGGGCTTTTCTTTGTTAGTAGGCTATTTATTACTGATTTCATTTTGG 1855

 31781496 AGCTCATTATTGTTCTGTTCAGGGAATCTATTTCTTCTTGTTTCAGTTTTGGGAAGGTGT 31781555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1856 AGCTCATTATTGTTCTGTTCAGGGAATCTATTTCTTCTTGTTTCAGTTTTGGGAAGGTGT 1915

 31781556 ATGTGTCCAGGAATGTATCCATCTCTTCTAGGTTTTTATTATTATTCTTTTTTGAGATGG 31781615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1916 ATGTGTCCAGGAATGTATCCATCTCTTCTAGGTTTTTATTATTATTCTTTTTTGAGATGG 1975

 31781616 AGTCTCACTCTGTCACCCAGTGTGGGGTGCAGTGGCGCAATCTCGGCTCACTGCAGCCTC 31781675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1976 AGTCTCACTCTGTCACCCAGTGTGGGGTGCAGTGGCGCAATCTCGGCTCACTGCAGCCTC 2035

 31781676 TGCCTCCTGAGTTTAAGCAATTCTCCTGACTCAGCCTCCCAAGTACCTGGGATTAAAGGC 31781735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2036 TGCCTCCTGAGTTTAAGCAATTCTCCTGACTCAGCCTCCCAAGTACCTGGGATTAAAGGC 2095

 31781736 ATGTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTT 31781795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2096 ATGTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTT 2155

 31781796 GGCCAGGCTGTTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGT 31781855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2156 GGCCAGGCTGTTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGT 2215

 31781856 GCTAGGATTACAGGTATGAGCCACTGTGCCTGGCCGCTTCTAGGTTTCCTAGTTTGTGTG 31781915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2216 GCTAGGATTACAGGTATGAGCCACTGTGCCTGGCCGCTTCTAGGTTTCCTAGTTTGTGTG 2275

 31781916 CATAGAGGTGTTCATAGTAGCCTGCGATGGTTATTTTTATTTCTGTGGGGTCACTGGTAA 31781975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2276 CATAGAGGTGTTCATAGTAGCCTGCGATGGTTATTTTTATTTCTGTGGGGTCACTGGTAA 2335

 31781976 CATCCCCTTTGTCATTTCTAACTATGTTTATTTATTTTTTGTTTATTTATTTATTTATTT 31782035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2336 CATCCCCTTTGTCATTTCTAACTATGTTTATTTATTTTTTGTTTATTTATTTATTTATTT 2395

 31782036 ATTTTTTGAGATGGAGTCTCGTTCTGTTGTTCCGATTGTAGTGAAGTGGCACCATTTTGG 31782095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2396 ATTTTTTGAGATGGAGTCTCGTTCTGTTGTTCCGATTGTAGTGAAGTGGCACCATTTTGG 2455

 31782096 CTCACTGCAACCTCTGCCTCTCAGGTTCAAGAGATTCTCGTGGCTCCGCCTACCAAGTAG 31782155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2456 CTCACTGCAACCTCTGCCTCTCAGGTTCAAGAGATTCTCGTGGCTCCGCCTACCAAGTAG 2515

 31782156 CAGGGATTATAGGCATATGTCACCATGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGG 31782215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2516 CAGGGATTATAGGCATATGTCACCATGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGG 2575

 31782216 GATTTTACCATGTTGGCCAGACTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAAGTGATCACCCACCTT 31782275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2576 GATTTTACCATGTTGGCCAGACTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAAGTGATCACCCACCTT 2635

 31782276 GGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCATATTTACTTATTTTTGAGATGGAG 31782335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2636 GGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCATATTTACTTATTTTTGAGATGGAG 2695

 31782336 TCTTGCTCTGTCGCCCAGGTTAGAGTGCAGTGGCGTGATCTGGGCTCACTGCAACCTCCA 31782395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2696 TCTTGCTCTGTCGCCCAGGTTAGAGTGCAGTGGCGTGATCTGGGCTCACTGCAACCTCCA 2755

 31782396 CCTCCTGGATTCAGGTGATTCTCCTGCCTCAGCATCTCAAGTAGCTGGGATTGCAGGCGC 31782455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2756 CCTCCTGGATTCAGGTGATTCTCCTGCCTCAGCATCTCAAGTAGCTGGGATTGCAGGCGC 2815

 31782456 CCACCAGCACGCCTGGCTAATTTTTGTATCTTTAGTAGAGACAAGATTTTGCCGTGTTGG 31782515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2816 CCACCAGCACGCCTGGCTAATTTTTGTATCTTTAGTAGAGACAAGATTTTGCCGTGTTGG 2875

 31782516 CCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAATGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCT 31782575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2876 CCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAATGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCT 2935

 31782576 GGGATTACAGACATGAGCCACCGTGCCCTGCCTTAATTGTGTTTATTTGGATCTTCTCTC 31782635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2936 GGGATTACAGACATGAGCCACCGTGCCCTGCCTTAATTGTGTTTATTTGGATCTTCTCTC 2995

 31782636 TTTCTTCATTAGTCCAGCTAGTGGCCTATCTTACTAATTTTTCAAAAAAAAAAAACAAAC 31782695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2996 TTTCTTCATTAGTCCAGCTAGTGGCCTATCTTACTAATTTTTCAAAAAAAAAAAACAAAC 3055

 31782696 AAACAACCAACTCCTGGATTCATTGATCTTTTGAATGGCTTTTTGTGTCTTGATTTCCTT 31782755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3056 AAACAACCAACTCCTGGATTCATTGATCTTTTGAATGGCTTTTTGTGTCTTGATTTCCTT 3115

 31782756 CAGTTCAGCTCTGATTTTGGTTATTTTTCTGCTAGCTTTGGGGTTGGTTTGCTCTTGCTT 31782815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3116 CAGTTCAGCTCTGATTTTGGTTATTTTTCTGCTAGCTTTGGGGTTGGTTTGCTCTTGCTT 3175

 31782816 CTCTAGTTCTTTTTTTTTTTTTGAGACAAAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCA 31782875
          ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3176 CTCTAGTTCTTTTTTTTTTT--GAGACAAAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCA 3233

 31782876 GTGGCGTGATCTTGGGTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCT 31782935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3234 GTGGCGTGATCTTGGGTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCT 3293

 31782936 CAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTGCCGGCCACCACACCCAGCTAACTTTTGTAT 31782995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3294 CAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTGCCGGCCACCACACCCAGCTAACTTTTGTAT 3353

 31782996 TTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATATTGACCAGGCTGGTGTCAAACTCCTAACCTTGT 31783055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3354 TTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATATTGACCAGGCTGGTGTCAAACTCCTAACCTTGT 3413

 31783056 GATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGAGCCTAG 31783115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3414 GATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGAGCCTAG 3473

 31783116 CCTCTAGTTCTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTCATCCTGTTGCCCAGACAGGAATGCAGTG 31783175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3474 CCTCTAGTTCTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTCATCCTGTTGCCCAGACAGGAATGCAGTG 3533

 31783176 ATGCAGTCTCGGCTCTCTGCAACCTCAGCCTCCCAGGTTCAAGCGATTCCCCTGCCTCCA 31783235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3534 ATGCAGTCTCGGCTCTCTGCAACCTCAGCCTCCCAGGTTCAAGCGATTCCCCTGCCTCCA 3593

 31783236 CCTCCCAAGTAGCTGAGATTACAGGCGCATGTTACCACACCCAGCTAATTTTTATATTTT 31783295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3594 CCTCCCAAGTAGCTGAGATTACAGGCGCATGTTACCACACCCAGCTAATTTTTATATTTT 3653

 31783296 TAGTAGAGATGAGGCTTCACCATGTTGGCCATGCTGGTCTCGACCTCCTGACCTCAAGTG 31783355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3654 TAGTAGAGATGAGGCTTCACCATGTTGGCCATGCTGGTCTCGACCTCCTGACCTCAAGTG 3713

 31783356 ATCCACCTGCCTCGGCCTCCCACAGTGCTGAGATTACAGGCATGAGCCATTGTGCCCGGC 31783415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3714 ATCCACCTGCCTCGGCCTCCCACAGTGCTGAGATTACAGGCATGAGCCATTGTGCCCGGC 3773

 31783416 CTCTTCTCTAGTTTCTTTTAGTTATGATATTAGGCTGAATATATATGACCCAACACAGCA 31783475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3774 CTCTTCTCTAGTTTCTTTTAGTTATGATATTAGGCTGAATATATATGACCCAACACAGCA 3833

 31783476 GCACCCAGATTCATAAAGCAAGTTATTAGCGCTCTTCAAAGAGACTTAGACTCCCACACA 31783535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3834 GCACCCAGATTCATAAAGCAAGTTATTAGCGCTCTTCAAAGAGACTTAGACTCCCACACA 3893

 31783536 GTAATAGTAGGAGACTTCAACACTCCTACTATTTTATGGTTCTCTTTCTAAGTTTTTGAG 31783595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3894 GTAATAGTAGGAGACTTCAACACTCCTACTATTTTATGGTTCTCTTTCTAAGTTTTTGAG 3953

 31783596 ACCTTTCTAACTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGGTGGAGTCTTGCTTTGTTGCCCAGGCTGG 31783655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3954 ACCTTTCTAACTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGGTGGAGTCTTGCTTTGTTGCCCAGGCTGG 4013

 31783656 AGTGCAGTGGCGTGGTCTCGGCTCACCACAACCTTCGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTTTC 31783715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4014 AGTGCAGTGGCGTGGTCTCGGCTCACCACAACCTTCGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTTTC 4073

 31783716 CTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCGCCACCAAGCCTGGCTAATTT 31783775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4074 CTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCGCCACCAAGCCTGGCTAATTT 4133

 31783776 TTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTATGTTGACCCGGCTGGTCTTGAACTCCTGA 31783835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4134 TTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTATGTTGACCCGGCTGGTCTTGAACTCCTGA 4193

 31783836 CCTCATGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAGTGTGCTGGGATTACAGGTGTGAACCACCGT 31783895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4194 CCTCATGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAGTGTGCTGGGATTACAGGTGTGAACCACCGT 4253

 31783896 GCC 31783898
          |||
     4254 GCC 4256

EXCISED REGION

 31783907 CTTTCTAACTTTTTGATGTTGGTGTTTCGTGCTATAATTTCCCTCTTAACACTGCCTTAG 31783966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4266 CTTTCTAACTTTTTGATGTTGGTGTTTCGTGCTATAATTTCCCTCTTAACACTGCCTTAG 4325

 31783967 CTGTGTCCCAGAGATTCTAATATGTTGTATCTTTTTTCTCATTAGTTTCAAAGAACTACT 31784026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4326 CTGTGTCCCAGAGATTCTAATATGTTGTATCTTTTTTCTCATTAGTTTCAAAGAACTACT 4385

 31784027 TGATTTCTGCCTTAATTTCATTACTTACACAAAAGTCATTCAGGAGCATGTAATTGTATG 31784086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4386 TGATTTCTGCCTTAATTTCATTACTTACACAAAAGTCATTCAGGAGCATGTAATTGTATG 4445

 31784087 GTTTTGGGCAATTTTTAATGTCTTGATTTTTGTTTTTATTGCATTGTGGTTCAAGAGTAT 31784146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4446 GTTTTGGGCAATTTTTAATGTCTTGATTTTTGTTTTTATTGCATTGTGGTTCAAGAGTAT 4505

 31784147 GTTTGGTATGATTTTGGTTCTTTTGCATTTGCTAAGGATTGTTTTATGTCCAATTGTGTG 31784206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4506 GTTTGGTATGATTTTGGTTCTTTTGCATTTGCTAAGGATTGTTTTATGTCCAATTGTGTG 4565

 31784207 GTCAATTTTAGATTATGTTGCATGTGGTAATGAGAAGAATGTATATTCTGTTGTTTTGCA 31784266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4566 GTCAATTTTAGATTATGTTGCATGTGGTAATGAGAAGAATGTATATTCTGTTGTTTTGCA 4625

 31784267 GAGGAGAGCTCTGTAGAGGTCTATCAGATCCATTTGGTCCAATGTTGAGTTCAGGTCCTG 31784326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4626 GAGGAGAGCTCTGTAGAGGTCTATCAGATCCATTTGGTCCAATGTTGAGTTCAGGTCCTG 4685

 31784327 AATATCTTTGTTAAGTTTCTGTTTCGATGATCTGTCTAATACTGTTAGTGAAGTGTTCTA 31784386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4686 AATATCTTTGTTAAGTTTCTGTTTCGATGATCTGTCTAATACTGTTAGTGAAGTGTTCTA 4745

 31784387 CTATTACTGTGTGGGAGTCTAAGTCTCTTTGAAGAGCCCTAATAACTTGCTTTATGAATC 31784446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4746 CTATTACTGTGTGGGAGTCTAAGTCTCTTTGAAGAGCCCTAATAACTTGCTTTATGAATC 4805

 31784447 TGGGTGCTTCTGTGTTGGGTCATATATATTTAAGACAGTTAGGTCTTCTTGTTGAATTGA 31784506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4806 TGGGTGCTTCTGTGTTGGGTCATATATATTTAAGACAGTTAGGTCTTCTTGTTGAATTGA 4865

 31784507 ACCCTTTACCACTATAATGTCCTTTGTCTTTTTTGACCTTTGTTGGTTTAAAGTCTGTTT 31784566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4866 ACCCTTTACCACTATAATGTCCTTTGTCTTTTTTGACCTTTGTTGGTTTAAAGTCTGTTT 4925

 31784567 TATCTGAAATTAGGATTGCAACTCCTGCTTTTTTCTGATTTCCATTTGCTTGGTACTTTT 31784626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4926 TATCTGAAATTAGGATTGCAACTCCTGCTTTTTTCTGATTTCCATTTGCTTGGTACTTTT 4985

 31784627 TCCTCCATCCTTTTTATTTTATTTTTTTGAGACTATGGATGAGATAGGGCTGTTGAAGAC 31784686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4986 TCCTCCATCCTTTTTATTTTATTTTTTTGAGACTATGGATGAGATAGGGCTGTTGAAGAC 5045

 31784687 AGAATACCATTGAGTTTTGTTTTTTGATCCAGAAAAATATGGAACATTTCATGAATTTGC 31784746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5046 AGAATACCATTGAGTTTTGTTTTTTGATCCAGAAAAATATGGAACATTTCATGAATTTGC 5105

 31784747 ATCATCCTTGCACAGGGGCCATGCTAATCTTCTCTGTATCATTCCAATTTTAGTATATGT 31784806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5106 ATCATCCTTGCACAGGGGCCATGCTAATCTTCTCTGTATCATTCCAATTTTAGTATATGT 5165

 31784807 GCTGCTGAAGCAAGCACACCAAGCTCATTTTTATTTTTATTTTTATTTTTTTGTAGAGAC 31784866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5166 GCTGCTGAAGCAAGCACACCAAGCTCATTTTTATTTTTATTTTTATTTTTTTGTAGAGAC 5225

 31784867 AAGGTCTTGCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTCCAACTCCTGGCCTGCAGTGATCTCCCTAC 31784926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5226 AAGGTCTTGCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTCCAACTCCTGGCCTGCAGTGATCTCCCTAC 5285

 31784927 TTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGAGTACAGGTGTGAGCCACCTTGTCCAACCCTTTCAAGT 31784986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5286 TTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGAGTACAGGTGTGAGCCACCTTGTCCAACCCTTTCAAGT 5345

 31784987 AACTTTTTTTTTTTTTTTT 31785005
          |||||||||||||||||||
     5346 AACTTTTTTTTTTTTTTTT 5364

Alignment time is 4.50637 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31766416,31790625] =>     24210 nucs '22 dna:chromosome chromosome:GRCh37:22:1:51304566:1'
Second seq [       1,    3347] =>      3347 nucs 'mol-32-22d3-007476_3347'

Score:        3326
Aligned:      3348        nucs
Identic:      3346 (100%) nucs =>      1089 (100%)      2257 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31775327,31776416] EXCISED REGION [31780626,31782883]
 second seq =>  [       1,    1090] EXCISED REGION [    1091,    3347]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      4209 nucs [31776417,31780625]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [31776417,31776419] to [31780626,31780628]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [31776417,31776417] to [31780625,31780625]
 second seq =>         0 nucs

 31775327 AACAAACAAACAAACAAAACAAGACTCAGCTGTAAAACCATCTAAGCCTGATGCCTTTTA 31775386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AACAAACAAACAAACAAAACAAGACTCAGCTGTAAAACCATCTAAGCCTGATGCCTTTTA 60

 31775387 AAATGAAGACTTACTTTTCTAATTTCTTTTATTTCTATTTTGTTTTATTTATTTATCTAT 31775446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAATGAAGACTTACTTTTCTAATTTCTTTTATTTCTATTTTGTTTTATTTATTTATCTAT 120

 31775447 CTATCTATTTTTGAGATGGAGACTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACCAT 31775506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTATCTATTTTTGAGATGGAGACTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACCAT 180

 31775507 CTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCCAGTTGAAATGATTCTTGTGCCTCAGCCTCCCA 31775566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCCAGTTGAAATGATTCTTGTGCCTCAGCCTCCCA 240

 31775567 AGTAGCTGGGATACAGGCGCAAGCCACGAGACCTGGCTAAGTTTTGTCTTTTTGGTAGAG 31775626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGTAGCTGGGATACAGGCGCAAGCCACGAGACCTGGCTAAGTTTTGTCTTTTTGGTAGAG 300

 31775627 ATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGCCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTATCC 31775686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGCCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTATCC 360

 31775687 GCCTCAGTCTCCCACAGTGCTAGGATTATAGGTGTGAGACACCGTTTCCGGCTTCTAATT 31775746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GCCTCAGTCTCCCACAGTGCTAGGATTATAGGTGTGAGACACCGTTTCCGGCTTCTAATT 420

 31775747 TCTTTTATACTTATTAGTGTATTTACATCTTATCTCTCTTCTTGGGAAAATTGTAACATT 31775806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCTTTTATACTTATTAGTGTATTTACATCTTATCTCTCTTCTTGGGAAAATTGTAACATT 480

 31775807 TTATTTTATTTTTTATATGGAAGTCATTATTTCTCCTATATTTCCTTTTCTTTTCCTTTT 31775866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTATTTTATTTTTTATATGGAAGTCATTATTTCTCCTATATTTCCTTTTCTTTTCCTTTT 540

 31775867 TTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTCGCCCAGGCTAGAGTGTGATGACGCGATCTTGGCTCA 31775926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTCGCCCAGGCTAGAGTGTGATGACGCGATCTTGGCTCA 600

 31775927 CTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCGATTCTCATGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGG 31775986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCGATTCTCATGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGG 660

 31775987 GACTACAGGTCTGAGCCACCATGCCTGGCTAACTTTTGTATTTTTAGTACAGATGGGGTT 31776046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GACTACAGGTCTGAGCCACCATGCCTGGCTAACTTTTGTATTTTTAGTACAGATGGGGTT 720

 31776047 TTGCCATGTTACCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGCAATCCCCCTGCCTCAGC 31776106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTGCCATGTTACCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGCAATCCCCCTGCCTCAGC 780

 31776107 CTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTTCCGCTAGATTTTCTAAGTATTTGGCAGAGAGTTA 31776166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTTCCGCTAGATTTTCTAAGTATTTGGCAGAGAGTTA 840

 31776167 CATGTAATAGTCTTTTGTAATTCTTTTTTTCTTTTTTTAAATAAGATCTTGCTCTGTTGT 31776226
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CATGTAATAGCCTTTTGTAATTCTTTTTTTCTTTTTTTAAATAAGATCTTGCTCTGTTGT 900

 31776227 CCAGGCTGGAGTGCAGTGACGTGATGTCGGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCTGGGTTGAA 31776286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CCAGGCTGGAGTGCAGTGACGTGATGTCGGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCTGGGTTGAA 960

 31776287 GCGATTCTCATGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGCACCACCACACCC 31776346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GCGATTCTCATGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGCACCACCACACCC 1020

 31776347 AGCTAAGTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGCCCAGGCTTGTAATT 31776406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGCTAAGTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGCCCAGGCTTGTAATT 1080

 31776407 CTTTTAATTT 31776416
          ||||||||||
     1081 CTTTTAATTT 1090

EXCISED REGION

 31780626 GCTGTTGTTGGTATATAGGCATGCTAGTGATTTTTGTACATTGATTTTGTATCCTGAAAC 31780685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1091 GCTGTTGTTGGTATATAGGCATGCTAGTGATTTTTGTACATTGATTTTGTATCCTGAAAC 1150

 31780686 TGCTGAAGTTTATCAGCTGAAGAATCTTTTGTACAGGGACTATAGGGTTTTCTAGATGTA 31780745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1151 TGCTGAAGTTTATCAGCTGAAGAATCTTTTGTACAGGGACTATAGGGTTTTCTAGATGTA 1210

 31780746 GAATCATGTCTTCTGCAAAGAGAGATACTCTGACCTCCTGTCTTCCTATTTGGTTGCCCT 31780805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1211 GAATCATGTCTTCTGCAAAGAGAGATACTCTGACCTCCTGTCTTCCTATTTGGTTGCCCT 1270

 31780806 TTATTTCTTTCTCTTGCCTGACTGCTCTGACCAGGACTTCCAACCCTGTGTTGAATAGGA 31780865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1271 TTATTTCTTTCTCTTGCCTGACTGCTCTGACCAGGACTTCCAACCCTGTGTTGAATAGGA 1330

 31780866 GTGGTGAGAAAGGGCACCCGGGTCTTGTGCCAGTTTTCAAAGAGAATGCTTTCAGCTTTT 31780925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1331 GTGGTGAGAAAGGGCACCCGGGTCTTGTGCCAGTTTTCAAAGAGAATGCTTTCAGCTTTT 1390

 31780926 GCCCATTCAGTATGATGTTGGCTTTGGGTCTGTCACAGATAGCTGTTATTATTTTGAGGT 31780985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1391 GCCCATTCAGTATGATGTTGGCTTTGGGTCTGTCACAGATAGCTGTTATTATTTTGAGGT 1450

 31780986 ATGTTCCTTCAAAATCTAGTTTACTGACAGTTTTTAATACGAAGCGATGTTGAATTTTAT 31781045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1451 ATGTTCCTTCAAAATCTAGTTTACTGACAGTTTTTAATACGAAGCGATGTTGAATTTTAT 1510

 31781046 CGAAAGACTTTTCTGCATCTATTGAGATAATCATGTGGTTTTTGTCTTTAGTTCTGTTTA 31781105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1511 CGAAAGACTTTTCTGCATCTATTGAGATAATCATGTGGTTTTTGTCTTTAGTTCTGTTTA 1570

 31781106 TGTGATGAATCACTTTTATTGATTTGTGGATGTAAAACCAACCTTGCATCCCAGGAATAA 31781165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1571 TGTGATGAATCACTTTTATTGATTTGTGGATGTAAAACCAACCTTGCATCCCAGGAATAA 1630

 31781166 ACCCTATTTGATCGTGGTGGATTTGCTTTTTGATGTGCTGCTGGATTCAATTTGCAAGTA 31781225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1631 ACCCTATTTGATCGTGGTGGATTTGCTTTTTGATGTGCTGCTGGATTCAATTTGCAAGTA 1690

 31781226 TTTTGTTGAGGATTTCTGCATCGATGTTCATCAAGGATATTGGCTTGAAGTTTTCTATTT 31781285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1691 TTTTGTTGAGGATTTCTGCATCGATGTTCATCAAGGATATTGGCTTGAAGTTTTCTATTT 1750

 31781286 TGGGTGTGTCTCTGCCAGGTTTTAGTGTCAGGATGATGCCGGGCTCACAGAATGAGTTGG 31781345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1751 TGGGTGTGTCTCTGCCAGGTTTTAGTGTCAGGATGATGCCGGGCTCACAGAATGAGTTGG 1810

 31781346 GGAGGAGTCCCTCTGCCTCAATTTTTTGAAATAGTTTCAGAAGAAATAGTACTATCCCGT 31781405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1811 GGAGGAGTCCCTCTGCCTCAATTTTTTGAAATAGTTTCAGAAGAAATAGTACTATCCCGT 1870

 31781406 CTTTGTACATCTGGTGGAATTCGGCTGTGACTTCATCTGGTCCTGGGCTTTTCTTTGTTA 31781465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1871 CTTTGTACATCTGGTGGAATTCGGCTGTGACTTCATCTGGTCCTGGGCTTTTCTTTGTTA 1930

 31781466 GTAGGCTATTTATTACTGATTTCATTTTGGAGCTCATTATTGTTCTGTTCAGGGAATCTA 31781525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1931 GTAGGCTATTTATTACTGATTTCATTTTGGAGCTCATTATTGTTCTGTTCAGGGAATCTA 1990

 31781526 TTTCTTCTTGTTTCAGTTTTGGGAAGGTGTATGTGTCCAGGAATGTATCCATCTCTTCTA 31781585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1991 TTTCTTCTTGTTTCAGTTTTGGGAAGGTGTATGTGTCCAGGAATGTATCCATCTCTTCTA 2050

 31781586 GGTTTTTATTATTATTCTTTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGTGTGGGGTGC 31781645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2051 GGTTTTTATTATTATTCTTTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGTGTGGGGTGC 2110

 31781646 AGTGGCGCAATCTCGGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCTGAGTTTAAGCAATTCTCCTGAC 31781705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2111 AGTGGCGCAATCTCGGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCTGAGTTTAAGCAATTCTCCTGAC 2170

 31781706 TCAGCCTCCCAAGTACCTGGGATTAAAGGCATGTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTA 31781765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2171 TCAGCCTCCCAAGTACCTGGGATTAAAGGCATGTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTA 2230

 31781766 TTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGTTCTTGAACTCCTGACCTCA 31781825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2231 TTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGTTCTTGAACTCCTGACCTCA 2290

 31781826 GGTGATCTGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGTATGAGCCACTGTGCC 31781885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2291 GGTGATCTGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGTATGAGCCACTGTGCC 2350

 31781886 TGGCCGCTTCTAGGTTTCCTAGTTTGTGTGCATAGAGGTGTTCATAGTAGCCTGCGATGG 31781945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2351 TGGCCGCTTCTAGGTTTCCTAGTTTGTGTGCATAGAGGTGTTCATAGTAGCCTGCGATGG 2410

 31781946 TTATTTTTATTTCTGTGGGGTCACTGGTAACATCCCCTTTGTCATTTCTAACTATGTTTA 31782005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2411 TTATTTTTATTTCTGTGGGGTCACTGGTAACATCCCCTTTGTCATTTCTAACTATGTTTA 2470

 31782006 TTTATTTTTTGTTTATTTATTTATTTATTTATTTTTTGAGATGGAGTCTCGTTCTGTTGT 31782065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2471 TTTATTTTTTGTTTATTTATTTATTTATTTATTTTTTGAGATGGAGTCTCGTTCTGTTGT 2530

 31782066 TCCGATTGTAGTGAAGTGGCACCATTTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCTCAGGTTCAA 31782125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2531 TCCGATTGTAGTGAAGTGGCACCATTTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCTCAGGTTCAA 2590

 31782126 GAGATTCTCGTGGCTCCGCCTACCAAGTAGCAGGGATTATAGGCATATGTCACCATGCCC 31782185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2591 GAGATTCTCGTGGCTCCGCCTACCAAGTAGCAGGGATTATAGGCATATGTCACCATGCCC 2650

 31782186 GGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGATTTTACCATGTTGGCCAGACTGGTCTCG 31782245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2651 GGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGATTTTACCATGTTGGCCAGACTGGTCTCG 2710

 31782246 AACTCCTGACCTCAAGTGATCACCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCAT 31782305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2711 AACTCCTGACCTCAAGTGATCACCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCAT 2770

 31782306 GAGCCATATTTACTTATTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGTTAGAGTGCAG 31782365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2771 GAGCCATATTTACTTATTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGTTAGAGTGCAG 2830

 31782366 TGGCGTGATCTGGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCTGGATTCAGGTGATTCTCCTGCCTC 31782425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2831 TGGCGTGATCTGGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCTGGATTCAGGTGATTCTCCTGCCTC 2890

 31782426 AGCATCTCAAGTAGCTGGGATTGCAGGCGCCCACCAGCACGCCTGGCTAATTTTTGTATC 31782485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2891 AGCATCTCAAGTAGCTGGGATTGCAGGCGCCCACCAGCACGCCTGGCTAATTTTTGTATC 2950

 31782486 TTTAGTAGAGACAAGATTTTGCCGTGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAAT 31782545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2951 TTTAGTAGAGACAAGATTTTGCCGTGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAAT 3010

 31782546 GATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACATGAGCCACCGTGCCCTG 31782605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3011 GATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACATGAGCCACCGTGCCCTG 3070

 31782606 CCTTAATTGTGTTTATTTGGATCTTCTCTCTTTCTTCATTAGTCCAGCTAGTGGCCTATC 31782665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3071 CCTTAATTGTGTTTATTTGGATCTTCTCTCTTTCTTCATTAGTCCAGCTAGTGGCCTATC 3130

 31782666 TTACTAATTTTTCAAAAAAAAAAAACAAACAAACAACCAACTCCTGGATTCATTGATCTT 31782725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3131 TTACTAATTTTTCAAAAAAAAAAAACAAACAAACAACCAACTCCTGGATTCATTGATCTT 3190

 31782726 TTGAATGGCTTTTTGTGTCTTGATTTCCTTCAGTTCAGCTCTGATTTTGGTTATTTTTCT 31782785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3191 TTGAATGGCTTTTTGTGTCTTGATTTCCTTCAGTTCAGCTCTGATTTTGGTTATTTTTCT 3250

 31782786 GCTAGCTTTGGGGTTGGTTTGCTCTTGCTTCTCTAGTTCTTTTTTTTTTTTTGAGACAAA 31782845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
     3251 GCTAGCTTTGGGGTTGGTTTGCTCTTGCTTCTCTAGTTC-TTTTTTTTTTTTGAGACAAA 3309

 31782846 GTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTG 31782883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3310 GTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTG 3347

Alignment time is 2.88265 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31766416,31790625] =>     24210 nucs '22 dna:chromosome chromosome:GRCh37:22:1:51304566:1'
Second seq [       1,    4642] =>      4642 nucs 'mol-32-22e9-052866_4642'

Score:        4599
Aligned:      4643        nucs
Identic:      4639 (100%) nucs =>       588 (100%)      4051 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31775828,31776416] EXCISED REGION [31780626,31784679]
 second seq =>  [       1,     589] EXCISED REGION [     590,    4642]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      4209 nucs [31776417,31780625]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [31776417,31776419] to [31780626,31780628]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [31776417,31776417] to [31780625,31780625]
 second seq =>         0 nucs

 31775828 AGTCATTATTTCTCCTATATTTCCTTTTCTTTTCCTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACT 31775887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGTCATTATTTCTCCTATATTTCCTTTTCTTTTCCTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACT 60

 31775888 CTCGCCCAGGCTAGAGTGTGATGACGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGG 31775947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTCGCCCAGGCTAGAGTGTGATGACGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGG 120

 31775948 TTCAAGCGATTCTCATGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTCTGAGCCACCA 31776007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTCAAGCGATTCTCATGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTCTGAGCCACCA 180

 31776008 TGCCTGGCTAACTTTTGTATTTTTAGTACAGATGGGGTTTTGCCATGTTACCCAGGCTGG 31776067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGCCTGGCTAACTTTTGTATTTTTAGTACAGATGGGGTTTTGCCATGTTACCCAGGCTGG 240

 31776068 TCTCAAACTCCTGGCCTCAAGCAATCCCCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAC 31776127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCTCAAACTCCTGGCCTCAAGCAATCCCCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAC 300

 31776128 AGGTTCCGCTAGATTTTCTAAGTATTTGGCAGAGAGTTACATGTAATAGTCTTTTGTAAT 31776187
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
      301 AGGTTCCGCTAGATTTTCTAAGTATTTGGCAGAGAGTTACATGTAATAGCCTTTTGTAAT 360

 31776188 TCTTTTTTTCTTTTTTTAAATAAGATCTTGCTCTGTTGTCCAGGCTGGAGTGCAGTGACG 31776247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCTTTTTTTCTTTTTTTAAATAAGATCTTGCTCTGTTGTCCAGGCTGGAGTGCAGTGACG 420

 31776248 TGATGTCGGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCTGGGTTGAAGCGATTCTCATGCCTCAGCCT 31776307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGATGTCGGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCTGGGTTGAAGCGATTCTCATGCCTCAGCCT 480

 31776308 CCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGCACCACCACACCCAGCTAAGTTTTGTATTTTTAG 31776367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGCACCACCACACCCAGCTAAGTTTTGTATTTTTAG 540

 31776368 TAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGCCCAGGCTTGTAATTCTTTTAATTT 31776416
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGCCCAGGCTTGTAATTCTTTTAATTT 589

EXCISED REGION

 31780626 GCTGTTGTTGGTATATAGGCATGCTAGTGATTTTTGTACATTGATTTTGTATCCTGAAAC 31780685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      590 GCTGTTGTTGGTATATAGGCATGCTAGTGATTTTTGTACATTGATTTTGTATCCTGAAAC 649

 31780686 TGCTGAAGTTTATCAGCTGAAGAATCTTTTGTACAGGGACTATAGGGTTTTCTAGATGTA 31780745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      650 TGCTGAAGTTTATCAGCTGAAGAATCTTTTGTACAGGGACTATAGGGTTTTCTAGATGTA 709

 31780746 GAATCATGTCTTCTGCAAAGAGAGATACTCTGACCTCCTGTCTTCCTATTTGGTTGCCCT 31780805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      710 GAATCATGTCTTCTGCAAAGAGAGATACTCTGACCTCCTGTCTTCCTATTTGGTTGCCCT 769

 31780806 TTATTTCTTTCTCTTGCCTGACTGCTCTGACCAGGACTTCCAACCCTGTGTTGAATAGGA 31780865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      770 TTATTTCTTTCTCTTGCCTGACTGCTCTGACCAGGACTTCCAACCCTGTGTTGAATAGGA 829

 31780866 GTGGTGAGAAAGGGCACCCGGGTCTTGTGCCAGTTTTCAAAGAGAATGCTTTCAGCTTTT 31780925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      830 GTGGTGAGAAAGGGCACCCGGGTCTTGTGCCAGTTTTCAAAGAGAATGCTTTCAGCTTTT 889

 31780926 GCCCATTCAGTATGATGTTGGCTTTGGGTCTGTCACAGATAGCTGTTATTATTTTGAGGT 31780985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      890 GCCCATTCAGTATGATGTTGGCTTTGGGTCTGTCACAGATAGCTGTTATTATTTTGAGGT 949

 31780986 ATGTTCCTTCAAAATCTAGTTTACTGACAGTTTTTAATACGAAGCGATGTTGAATTTTAT 31781045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      950 ATGTTCCTTCAAAATCTAGTTTACTGACAGTTTTTAATACGAAGCGATGTTGAATTTTAT 1009

 31781046 CGAAAGACTTTTCTGCATCTATTGAGATAATCATGTGGTTTTTGTCTTTAGTTCTGTTTA 31781105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1010 CGAAAGACTTTTCTGCATCTATTGAGATAATCATGTGGTTTTTGTCTTTAGTTCTGTTTA 1069

 31781106 TGTGATGAATCACTTTTATTGATTTGTGGATGTAAAACCAACCTTGCATCCCAGGAATAA 31781165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1070 TGTGATGAATCACTTTTATTGATTTGTGGATGTAAAACCAACCTTGCATCCCAGGAATAA 1129

 31781166 ACCCTATTTGATCGTGGTGGATTTGCTTTTTGATGTGCTGCTGGATTCAATTTGCAAGTA 31781225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1130 ACCCTATTTGATCGTGGTGGATTTGCTTTTTGATGTGCTGCTGGATTCAATTTGCAAGTA 1189

 31781226 TTTTGTTGAGGATTTCTGCATCGATGTTCATCAAGGATATTGGCTTGAAGTTTTCTATTT 31781285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1190 TTTTGTTGAGGATTTCTGCATCGATGTTCATCAAGGATATTGGCTTGAAGTTTTCTATTT 1249

 31781286 TGGGTGTGTCTCTGCCAGGTTTTAGTGTCAGGATGATGCCGGGCTCACAGAATGAGTTGG 31781345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1250 TGGGTGTGTCTCTGCCAGGTTTTAGTGTCAGGATGATGCCGGGCTCACAGAATGAGTTGG 1309

 31781346 GGAGGAGTCCCTCTGCCTCAATTTTTTGAAATAGTTTCAGAAGAAATAGTACTATCCCGT 31781405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1310 GGAGGAGTCCCTCTGCCTCAATTTTTTGAAATAGTTTCAGAAGAAATAGTACTATCCCGT 1369

 31781406 CTTTGTACATCTGGTGGAATTCGGCTGTGACTTCATCTGGTCCTGGGCTTTTCTTTGTTA 31781465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1370 CTTTGTACATCTGGTGGAATTCGGCTGTGACTTCATCTGGTCCTGGGCTTTTCTTTGTTA 1429

 31781466 GTAGGCTATTTATTACTGATTTCATTTTGGAGCTCATTATTGTTCTGTTCAGGGAATCTA 31781525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1430 GTAGGCTATTTATTACTGATTTCATTTTGGAGCTCATTATTGTTCTGTTCAGGGAATCTA 1489

 31781526 TTTCTTCTTGTTTCAGTTTTGGGAAGGTGTATGTGTCCAGGAATGTATCCATCTCTTCTA 31781585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1490 TTTCTTCTTGTTTCAGTTTTGGGAAGGTGTATGTGTCCAGGAATGTATCCATCTCTTCTA 1549

 31781586 GGTTTTTATTATTATTCTTTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGTGTGGGGTGC 31781645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1550 GGTTTTTATTATTATTCTTTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGTGTGGGGTGC 1609

 31781646 AGTGGCGCAATCTCGGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCTGAGTTTAAGCAATTCTCCTGAC 31781705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1610 AGTGGCGCAATCTCGGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCTGAGTTTAAGCAATTCTCCTGAC 1669

 31781706 TCAGCCTCCCAAGTACCTGGGATTAAAGGCATGTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTA 31781765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1670 TCAGCCTCCCAAGTACCTGGGATTAAAGGCATGTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTA 1729

 31781766 TTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGTTCTTGAACTCCTGACCTCA 31781825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1730 TTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGTTCTTGAACTCCTGACCTCA 1789

 31781826 GGTGATCTGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGTATGAGCCACTGTGCC 31781885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1790 GGTGATCTGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGTATGAGCCACTGTGCC 1849

 31781886 TGGCCGCTTCTAGGTTTCCTAGTTTGTGTGCATAGAGGTGTTCATAGTAGCCTGCGATGG 31781945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1850 TGGCCGCTTCTAGGTTTCCTAGTTTGTGTGCATAGAGGTGTTCATAGTAGCCTGCGATGG 1909

 31781946 TTATTTTTATTTCTGTGGGGTCACTGGTAACATCCCCTTTGTCATTTCTAACTATGTTTA 31782005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1910 TTATTTTTATTTCTGTGGGGTCACTGGTAACATCCCCTTTGTCATTTCTAACTATGTTTA 1969

 31782006 TTTATTTTTTGTTTATTTATTTATTTATTTATTTTTTGAGATGGAGTCTCGTTCTGTTGT 31782065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1970 TTTATTTTTTGTTTATTTATTTATTTATTTATTTTTTGAGATGGAGTCTCGTTCTGTTGT 2029

 31782066 TCCGATTGTAGTGAAGTGGCACCATTTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCTCAGGTTCAA 31782125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2030 TCCGATTGTAGTGAAGTGGCACCATTTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCTCAGGTTCAA 2089

 31782126 GAGATTCTCGTGGCTCCGCCTACCAAGTAGCAGGGATTATAGGCATATGTCACCATGCCC 31782185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2090 GAGATTCTCGTGGCTCCGCCTACCAAGTAGCAGGGATTATAGGCATATGTCACCATGCCC 2149

 31782186 GGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGATTTTACCATGTTGGCCAGACTGGTCTCG 31782245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2150 GGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGATTTTACCATGTTGGCCAGACTGGTCTCG 2209

 31782246 AACTCCTGACCTCAAGTGATCACCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCAT 31782305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2210 AACTCCTGACCTCAAGTGATCACCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCAT 2269

 31782306 GAGCCATATTTACTTATTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGTTAGAGTGCAG 31782365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2270 GAGCCATATTTACTTATTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGTTAGAGTGCAG 2329

 31782366 TGGCGTGATCTGGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCTGGATTCAGGTGATTCTCCTGCCTC 31782425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2330 TGGCGTGATCTGGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCTGGATTCAGGTGATTCTCCTGCCTC 2389

 31782426 AGCATCTCAAGTAGCTGGGATTGCAGGCGCCCACCAGCACGCCTGGCTAATTTTTGTATC 31782485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2390 AGCATCTCAAGTAGCTGGGATTGCAGGCGCCCACCAGCACGCCTGGCTAATTTTTGTATC 2449

 31782486 TTTAGTAGAGACAAGATTTTGCCGTGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAAT 31782545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2450 TTTAGTAGAGACAAGATTTTGCCGTGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAAT 2509

 31782546 GATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACATGAGCCACCGTGCCCTG 31782605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2510 GATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACATGAGCCACCGTGCCCTG 2569

 31782606 CCTTAATTGTGTTTATTTGGATCTTCTCTCTTTCTTCATTAGTCCAGCTAGTGGCCTATC 31782665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2570 CCTTAATTGTGTTTATTTGGATCTTCTCTCTTTCTTCATTAGTCCAGCTAGTGGCCTATC 2629

 31782666 TTACTAATTTTTCAAAAAAAAAAAACAAACAAACAACCAACTCCTGGATTCATTGATCTT 31782725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2630 TTACTAATTTTTCAAAAAAAAAAAACAAACAAACAACCAACTCCTGGATTCATTGATCTT 2689

 31782726 TTGAATGGCTTTTTGTGTCTTGATTTCCTTCAGTTCAGCTCTGATTTTGGTTATTTTTCT 31782785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2690 TTGAATGGCTTTTTGTGTCTTGATTTCCTTCAGTTCAGCTCTGATTTTGGTTATTTTTCT 2749

 31782786 GCTAGCTTTGGGGTTGGTTTGCTCTTGCTTCTCTAGTTCTTTTTTTTTTTTTGAGACAAA 31782845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2750 GCTAGCTTTGGGGTTGGTTTGCTCTTGCTTCTCTAGTTCTTTTTTTTTTTTTGAGACAAA 2809

 31782846 GTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGGTCACTGCAACCTCC 31782905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2810 GTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGGTCACTGCAACCTCC 2869

 31782906 GCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTG 31782965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2870 GCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTG 2929

 31782966 CCGGCCACCACACCCAGCTAACTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATATTG 31783025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2930 CCGGCCACCACACCCAGCTAACTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATATTG 2989

 31783026 ACCAGGCTGGTGTCAAACTCCTAACCTTGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCT 31783085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2990 ACCAGGCTGGTGTCAAACTCCTAACCTTGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCT 3049

 31783086 GGGATTACAGGCATGAGCCACTGAGCCTAGCCTCTAGTTCTTTTTTTTTGAGATGGAGTC 31783145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3050 GGGATTACAGGCATGAGCCACTGAGCCTAGCCTCTAGTTCTTTTTTTTTGAGATGGAGTC 3109

 31783146 TCATCCTGTTGCCCAGACAGGAATGCAGTGATGCAGTCTCGGCTCTCTGCAACCTCAGCC 31783205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3110 TCATCCTGTTGCCCAGACAGGAATGCAGTGATGCAGTCTCGGCTCTCTGCAACCTCAGCC 3169

 31783206 TCCCAGGTTCAAGCGATTCCCCTGCCTCCACCTCCCAAGTAGCTGAGATTACAGGCGCAT 31783265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3170 TCCCAGGTTCAAGCGATTCCCCTGCCTCCACCTCCCAAGTAGCTGAGATTACAGGCGCAT 3229

 31783266 GTTACCACACCCAGCTAATTTTTATATTTTTAGTAGAGATGAGGCTTCACCATGTTGGCC 31783325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3230 GTTACCACACCCAGCTAATTTTTATATTTTTAGTAGAGATGAGGCTTCACCATGTTGGCC 3289

 31783326 ATGCTGGTCTCGACCTCCTGACCTCAAGTGATCCACCTGCCTCGGCCTCCCACAGTGCTG 31783385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3290 ATGCTGGTCTCGACCTCCTGACCTCAAGTGATCCACCTGCCTCGGCCTCCCACAGTGCTG 3349

 31783386 AGATTACAGGCATGAGCCATTGTGCCCGGCCTCTTCTCTAGTTTCTTTTAGTTATGATAT 31783445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3350 AGATTACAGGCATGAGCCATTGTGCCCGGCCTCTTCTCTAGTTTCTTTTAGTTATGATAT 3409

 31783446 TAGGCTGAATATATATGACCCAACACAGCAGCACCCAGATTCATAAAGCAAGTTATTAGC 31783505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3410 TAGGCTGAATATATATGACCCAACACAGCAGCACCCAGATTCATAAAGCAAGTTATTAGC 3469

 31783506 GCTCTTCAAAGAGACTTAGACTCCCACACAGTAATAGTAGGAGACTTCAACACTCCTACT 31783565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3470 GCTCTTCAAAGAGACTTAGACTCCCACACAGTAATAGTAGGAGACTTCAACACTCCTACT 3529

 31783566 ATTTTATGGTTCTCTTTCTAAGTTTTTGAGACCTTTCTAACTTTTTTTTTTTTTTTTTGA 31783625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
     3530 ATTTTATGGTTCTCTTTCTAAGTTTTTGAGACCTTTCTAAC-TTTTTTTTTTTTTTTTGA 3588

 31783626 GGTGGAGTCTTGCTTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGGTCTCGGCTCACCACA 31783685
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3589 GGTGGGGTCTTGCTTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGGTCTCGGCTCACCACA 3648

 31783686 ACCTTCGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTTTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTA 31783745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3649 ACCTTCGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTTTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTA 3708

 31783746 CAGGTGCGCGCCACCAAGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACT 31783805
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     3709 CAGGTGCGCGCCACCAAGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGGTGGGGTTTCACT 3768

 31783806 ATGTTGACCCGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCATGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAG 31783865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3769 ATGTTGACCCGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCATGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAG 3828

 31783866 TGTGCTGGGATTACAGGTGTGAACCACCGTGCCGGCAAGATCTTTCTAACTTTTTGATGT 31783925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3829 TGTGCTGGGATTACAGGTGTGAACCACCGTGCCGGCAAGATCTTTCTAACTTTTTGATGT 3888

 31783926 TGGTGTTTCGTGCTATAATTTCCCTCTTAACACTGCCTTAGCTGTGTCCCAGAGATTCTA 31783985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3889 TGGTGTTTCGTGCTATAATTTCCCTCTTAACACTGCCTTAGCTGTGTCCCAGAGATTCTA 3948

 31783986 ATATGTTGTATCTTTTTTCTCATTAGTTTCAAAGAACTACTTGATTTCTGCCTTAATTTC 31784045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3949 ATATGTTGTATCTTTTTTCTCATTAGTTTCAAAGAACTACTTGATTTCTGCCTTAATTTC 4008

 31784046 ATTACTTACACAAAAGTCATTCAGGAGCATGTAATTGTATGGTTTTGGGCAATTTTTAAT 31784105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4009 ATTACTTACACAAAAGTCATTCAGGAGCATGTAATTGTATGGTTTTGGGCAATTTTTAAT 4068

 31784106 GTCTTGATTTTTGTTTTTATTGCATTGTGGTTCAAGAGTATGTTTGGTATGATTTTGGTT 31784165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4069 GTCTTGATTTTTGTTTTTATTGCATTGTGGTTCAAGAGTATGTTTGGTATGATTTTGGTT 4128

 31784166 CTTTTGCATTTGCTAAGGATTGTTTTATGTCCAATTGTGTGGTCAATTTTAGATTATGTT 31784225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4129 CTTTTGCATTTGCTAAGGATTGTTTTATGTCCAATTGTGTGGTCAATTTTAGATTATGTT 4188

 31784226 GCATGTGGTAATGAGAAGAATGTATATTCTGTTGTTTTGCAGAGGAGAGCTCTGTAGAGG 31784285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4189 GCATGTGGTAATGAGAAGAATGTATATTCTGTTGTTTTGCAGAGGAGAGCTCTGTAGAGG 4248

 31784286 TCTATCAGATCCATTTGGTCCAATGTTGAGTTCAGGTCCTGAATATCTTTGTTAAGTTTC 31784345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4249 TCTATCAGATCCATTTGGTCCAATGTTGAGTTCAGGTCCTGAATATCTTTGTTAAGTTTC 4308

 31784346 TGTTTCGATGATCTGTCTAATACTGTTAGTGAAGTGTTCTACTATTACTGTGTGGGAGTC 31784405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4309 TGTTTCGATGATCTGTCTAATACTGTTAGTGAAGTGTTCTACTATTACTGTGTGGGAGTC 4368

 31784406 TAAGTCTCTTTGAAGAGCCCTAATAACTTGCTTTATGAATCTGGGTGCTTCTGTGTTGGG 31784465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4369 TAAGTCTCTTTGAAGAGCCCTAATAACTTGCTTTATGAATCTGGGTGCTTCTGTGTTGGG 4428

 31784466 TCATATATATTTAAGACAGTTAGGTCTTCTTGTTGAATTGAACCCTTTACCACTATAATG 31784525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4429 TCATATATATTTAAGACAGTTAGGTCTTCTTGTTGAATTGAACCCTTTACCACTATAATG 4488

 31784526 TCCTTTGTCTTTTTTGACCTTTGTTGGTTTAAAGTCTGTTTTATCTGAAATTAGGATTGC 31784585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4489 TCCTTTGTCTTTTTTGACCTTTGTTGGTTTAAAGTCTGTTTTATCTGAAATTAGGATTGC 4548

 31784586 AACTCCTGCTTTTTTCTGATTTCCATTTGCTTGGTACTTTTTCCTCCATCCTTTTTATTT 31784645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4549 AACTCCTGCTTTTTTCTGATTTCCATTTGCTTGGTACTTTTTCCTCCATCCTTTTTATTT 4608

 31784646 TATTTTTTTGAGACTATGGATGAGATAGGGCTGT 31784679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4609 TATTTTTTTGAGACTATGGATGAGATAGGGCTGT 4642

Alignment time is 3.91673 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31766416,31790625] =>     24210 nucs '22 dna:chromosome chromosome:GRCh37:22:1:51304566:1'
Second seq [       1,    2657] =>      2657 nucs 'mol-32-2383-111805_2657'

Score:        2624
Aligned:      2657        nucs
Identic:      2654 (100%) nucs =>       120 (100%)      2534 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31775186,31775305] EXCISED REGION [31775310,31777845]
 second seq =>  [       1,     120] EXCISED REGION [     121,    2657]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         4 nucs [31775306,31775309]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        35 nucs [31775306,31775340] to [31775310,31775344]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31775186 TGTAATCCCAGCTGCTCAGGAGGCTAAGGAGAATCGCTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTG 31775245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGTAATCCCAGCTGCTCAGGAGGCTAAGGAGAATCGCTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTG 60

 31775246 CAGTGAGTCGAGATGGTGCCACTGCACTCCAGCCCGGGCAACAGAGTGAGACTCCGTCTT 31775305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAGTGAGTCGAGATGGTGCCACTGCACTCCAGCCCGGGCAACAGAGTGAGACTCCGTCTT 120

EXCISED REGION

 31775310 AAACAAACAAACAAACAAACAAACAAACAAACAAAACAAGACTCAGCTGTAAAACCATCT 31775369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAACAAACAAACAAACAAACAAACAAACAAACAAAACAAGACTCAGCTGTAAAACCATCT 180

 31775370 AAGCCTGATGCCTTTTAAAATGAAGACTTACTTTTCTAATTTCTTTTATTTCTATTTTGT 31775429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAGCCTGATGCCTTTTAAAATGAAGACTTACTTTTCTAATTTCTTTTATTTCTATTTTGT 240

 31775430 TTTATTTATTTATCTATCTATCTATTTTTGAGATGGAGACTCGCTCTGTCGCCCAGGCTG 31775489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTTATTTATTTATCTATCTATCTATTTTTGAGATGGAGACTCGCTCTGTCGCCCAGGCTG 300

 31775490 GAGTGCAGTGGCACCATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCCAGTTGAAATGATTCT 31775549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GAGTGCAGTGGCACCATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCCAGTTGAAATGATTCT 360

 31775550 TGTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATACAGGCGCAAGCCACGAGACCTGGCTAAGTT 31775609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATACAGGCGCAAGCCACGAGACCTGGCTAAGTT 420

 31775610 TTGTCTTTTTGGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGCCTGGTCTTGAACTCCTGA 31775669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTGTCTTTTTGGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGCCTGGTCTTGAACTCCTGA 480

 31775670 CCTCAGGTGATCTATCCGCCTCAGTCTCCCACAGTGCTAGGATTATAGGTGTGAGACACC 31775729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCTCAGGTGATCTATCCGCCTCAGTCTCCCACAGTGCTAGGATTATAGGTGTGAGACACC 540

 31775730 GTTTCCGGCTTCTAATTTCTTTTATACTTATTAGTGTATTTACATCTTATCTCTCTTCTT 31775789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GTTTCCGGCTTCTAATTTCTTTTATACTTATTAGTGTATTTACATCTTATCTCTCTTCTT 600

 31775790 GGGAAAATTGTAACATTTTATTTTATTTTTTATATGGAAGTCATTATTTCTCCTATATTT 31775849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GGGAAAATTGTAACATTTTATTTTATTTTTTATATGGAAGTCATTATTTCTCCTATATTT 660

 31775850 CCTTTTCTTTTCCTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTCGCCCAGGCTAGAGTGTGAT 31775909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCTTTTCTTTTCCTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTCGCCCAGGCTAGAGTGTGAT 720

 31775910 GACGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCGATTCTCATGCCTCA 31775969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GACGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCGATTCTCATGCCTCA 780

 31775970 GCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTCTGAGCCACCATGCCTGGCTAACTTTTGTATTT 31776029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTCTGAGCCACCATGCCTGGCTAACTTTTGTATTT 840

 31776030 TTAGTACAGATGGGGTTTTGCCATGTTACCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGC 31776089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTAGTACAGATGGGGTTTTGCCATGTTACCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGC 900

 31776090 AATCCCCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTTCCGCTAGATTTTCTAAG 31776149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AATCCCCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTTCCGCTAGATTTTCTAAG 960

 31776150 TATTTGGCAGAGAGTTACATGTAATAGTCTTTTGTAATTCTTTTTTTCTTTTTTTAAATA 31776209
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TATTTGGCAGAGAGTTACATGTAATAGCCTTTTGTAATTCTTTTTTTCTTTTTTTAAATA 1020

 31776210 AGATCTTGCTCTGTTGTCCAGGCTGGAGTGCAGTGACGTGATGTCGGCTCACTGCAGCCT 31776269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1021 AGATCTTGCTCTGTTGTCCAGGCTGGAGTGCAGTGATGTGATGTCGGCTCACTGCAGCCT 1080

 31776270 CTGCCTCCTGGGTTGAAGCGATTCTCATGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGG 31776329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTGCCTCCTGGGTTGAAGCGATTCTCATGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGG 1140

 31776330 CATGCACCACCACACCCAGCTAAGTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGT 31776389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CATGCACCACCACACCCAGCTAAGTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGT 1200

 31776390 TGCCCAGGCTTGTAATTCTTTTAATTTGCTATTATCAGTGGTTGTATGTCCTTTCTTACT 31776449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TGCCCAGGCTTGTAATTCTTTTAATTTGCTATTATCAGTGGTTGTATGTCCTTTCTTACT 1260

 31776450 CAAGATTGCTATTTATTTATTTTATTTTATTTTTTGAGACGGAATCTCACTCTGTTGCCC 31776509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CAAGATTGCTATTTATTTATTTTATTTTATTTTTTGAGACGGAATCTCACTCTGTTGCCC 1320

 31776510 AGACTGGAGTGCAGTGGCATGCGCCACCACACCCAGCTAATTTTTGTGTTTTTAGTAGAG 31776569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AGACTGGAGTGCAGTGGCATGCGCCACCACACCCAGCTAATTTTTGTGTTTTTAGTAGAG 1380

 31776570 ACAGCATTTTGCCATATTGGCCAGGCTGGTCTCTAACTCCTGATCTCAAGTGATCTGCCC 31776629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ACAGCATTTTGCCATATTGGCCAGGCTGGTCTCTAACTCCTGATCTCAAGTGATCTGCCC 1440

 31776630 ACCTTGGCCCCTCCAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCTGGCCTATTTTT 31776689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ACCTTGGCCCCTCCAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCTGGCCTATTTTT 1500

 31776690 TCTTTCTATCCTTATTCAAGCATTTTGAGATATTTTTCCTTTCTGTTTTACTGATCCTTT 31776749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TCTTTCTATCCTTATTCAAGCATTTTGAGATATTTTTCCTTTCTGTTTTACTGATCCTTT 1560

 31776750 CATCTTTTCAAGTTCTTCTTTCTTTCTTTCTTTC-TTTTTTTTTTTTAAGACAGGGTCTC 31776808
          |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
     1561 CATCTTTTCAAGTTCTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTAAGACAGGGTCTC 1620

 31776809 GCTCTATTGCCTAGGCTAGAGAATACTGGCATGATTATAGCTCACTGCAACCTCCTGGGC 31776868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GCTCTATTGCCTAGGCTAGAGAATACTGGCATGATTATAGCTCACTGCAACCTCCTGGGC 1680

 31776869 TCAAGGTATCTTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCCAAGACTACAGGTGTGCACCACTAC 31776928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TCAAGGTATCTTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCCAAGACTACAGGTGTGCACCACTAC 1740

 31776929 ATCAAGCTAAATTTTTTTTTTTTTACTTTTATTTTAGGTTCAGGAACAGCTGTGCAAGTT 31776988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ATCAAGCTAAATTTTTTTTTTTTTACTTTTATTTTAGGTTCAGGAACAGCTGTGCAAGTT 1800

 31776989 TGTTATATAGGTAAGCTCGTGTTATGGGGGTTTATTGTACAGATTATTTCATCACTCAGG 31777048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TGTTATATAGGTAAGCTCGTGTTATGGGGGTTTATTGTACAGATTATTTCATCACTCAGG 1860

 31777049 TACAAAGCCTGGTAACCAATAGTTATTTTTTCTGATCATTTCCTTTCTCCCGCCCTGCAC 31777108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TACAAAGCCTGGTAACCAATAGTTATTTTTTCTGATCATTTCCTTTCTCCCGCCCTGCAC 1920

 31777109 CCTCAAGTAGGTCCCAGTGTCTGTTGTTCCCCTCTTTGTGTCCATGTGTTCTTATTGAGC 31777168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CCTCAAGTAGGTCCCAGTGTCTGTTGTTCCCCTCTTTGTGTCCATGTGTTCTTATTGAGC 1980

 31777169 GCGCGCACACACACACACACACACACATTTATATGTACAAGCAATTGTCCTGCCTTAGCC 31777228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GCGCGCACACACACACACACACACACATTTATATGTACAAGCAATTGTCCTGCCTTAGCC 2040

 31777229 TCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCACCACACCCAGCTAATATTTTTGTATGTTT 31777288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCACCACACCCAGCTAATATTTTTGTATGTTT 2100

 31777289 TTAGTAGAGACAAGGTTTCACCATGTTGGTCAGACTGGTCTCAAATTCTTGACCTCAGGT 31777348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TTAGTAGAGACAAGGTTTCACCATGTTGGTCAGACTGGTCTCAAATTCTTGACCTCAGGT 2160

 31777349 GATCCACCTGCCTCAGCCTTCCAAAGTGCTGTGATTACAGGTGTGAGCCACCACGTCCAG 31777408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GATCCACCTGCCTCAGCCTTCCAAAGTGCTGTGATTACAGGTGTGAGCCACCACGTCCAG 2220

 31777409 CTGAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACATATGGTATTTGTTTTTCTGTTCCTGTGTTAGTT 31777468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CTGAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACATATGGTATTTGTTTTTCTGTTCCTGTGTTAGTT 2280

 31777469 TGCTAAGGATAATGGCCTCCAGTTTCATCCATGTTCCTGCAAAGGACATGATCTTCTTTT 31777528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TGCTAAGGATAATGGCCTCCAGTTTCATCCATGTTCCTGCAAAGGACATGATCTTCTTTT 2340

 31777529 TTGTGGCTGCATAGTATTACATGGTGTATATGTACCACATTTTCTTTATCCAGTCTGTCA 31777588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TTGTGGCTGCATAGTATTACATGGTGTATATGTACCACATTTTCTTTATCCAGTCTGTCA 2400

 31777589 TTGATGGGCATTTAGGTGATTCCACGTCTTTGCTATTGTGGATGGTGCTGTGATGAATAT 31777648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TTGATGGGCATTTAGGTGATTCCACGTCTTTGCTATTGTGGATGGTGCTGTGATGAATAT 2460

 31777649 ATGCATGCATGTATCTTTATGGTGGAATGATATATATTCCTTTGGGTATCTACCCTGTAA 31777708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 ATGCATGCATGTATCTTTATGGTGGAATGATATATATTCCTTTGGGTATCTACCCTGTAA 2520

 31777709 TGGGATTGCTGGGTCAAATGGTAGTTCTGTTTGTAGCTCTTTCAGGAATCACCAGACTAC 31777768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TGGGATTGCTGGGTCAAATGGTAGTTCTGTTTGTAGCTCTTTCAGGAATCACCAGACTAC 2580

 31777769 TTTCCATAGTGGTTGAACTAATTTACATTCCCACCAACAGTGCATAAGTGTTCCCTTTTC 31777828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TTTCCATAGTGGTTGAACTAATTTACATTCCCACCAACAGTGCATAAGTGTTCCCTTTTC 2640

 31777829 TCCACAACCTCACCAGT 31777845
          |||||||||||||||||
     2641 TCCACAACCTCACCAGT 2657

Alignment time is 2.26626 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31766416,31790625] =>     24210 nucs '22 dna:chromosome chromosome:GRCh37:22:1:51304566:1'
Second seq [       1,    3190] =>      3190 nucs 'mol-32-2874-008240_3190'

Score:        3155
Aligned:      3194        nucs
Identic:      3188 (100%) nucs =>      1236 (100%)      1952 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31775176,31776416] EXCISED REGION [31780626,31782578]
 second seq =>  [       1,    1237] EXCISED REGION [    1238,    3190]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      4209 nucs [31776417,31780625]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [31776417,31776419] to [31780626,31780628]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [31776417,31776417] to [31780625,31780625]
 second seq =>         0 nucs

 31775176 GGCATGCACCTGTAATCCCAGCTGCTCAGGAGGCTAAGGAGAATCGCTTGAACCCAGGAG 31775235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGCATGCACCTGTAATCCCAGCTGCTCAGGAGGCTAAGGAGAATCGCTTGAACCCAGGAG 60

 31775236 GCAGAGGTTGCAGTGAGTCGAGATGGTGCCACTGCACTCCAGCCCGGGCAACAGAGTGAG 31775295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCAGAGGTTGCAGTGAGTCGAGATGGTGCCACTGCACTCCAGCCCGGGCAACAGAGTGAG 120

 31775296 ACTCCGTCTTAAACAAACAAACAAACAAACAAACAAACAAACAAACAAAACAAGACTCAG 31775355
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||
      121 ACTCCGTCTTAAACAAACAAACAAACAAACAAACAAACAAACAAA----ACAAGACTCAG 176

 31775356 CTGTAAAACCATCTAAGCCTGATGCCTTTTAAAATGAAGACTTACTTTTCTAATTTCTTT 31775415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      177 CTGTAAAACCATCTAAGCCTGATGCCTTTTAAAATGAAGACTTACTTTTCTAATTTCTTT 236

 31775416 TATTTCTATTTTGTTTTATTTATTTATCTATCTATCTATTTTTGAGATGGAGACTCGCTC 31775475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      237 TATTTCTATTTTGTTTTATTTATTTATCTATCTATCTATTTTTGAGATGGAGACTCGCTC 296

 31775476 TGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACCATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCCA 31775535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      297 TGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACCATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCCA 356

 31775536 GTTGAAATGATTCTTGTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATACAGGCGCAAGCCACGA 31775595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      357 GTTGAAATGATTCTTGTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATACAGGCGCAAGCCACGA 416

 31775596 GACCTGGCTAAGTTTTGTCTTTTTGGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGCCTGG 31775655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      417 GACCTGGCTAAGTTTTGTCTTTTTGGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGCCTGG 476

 31775656 TCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTATCCGCCTCAGTCTCCCACAGTGCTAGGATTAT 31775715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      477 TCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTATCCGCCTCAGTCTCCCACAGTGCTAGGATTAT 536

 31775716 AGGTGTGAGACACCGTTTCCGGCTTCTAATTTCTTTTATACTTATTAGTGTATTTACATC 31775775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      537 AGGTGTGAGACACCGTTTCCGGCTTCTAATTTCTTTTATACTTATTAGTGTATTTACATC 596

 31775776 TTATCTCTCTTCTTGGGAAAATTGTAACATTTTATTTTATTTTTTATATGGAAGTCATTA 31775835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      597 TTATCTCTCTTCTTGGGAAAATTGTAACATTTTATTTTATTTTTTATATGGAAGTCATTA 656

 31775836 TTTCTCCTATATTTCCTTTTCTTTTCCTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTCGCCCA 31775895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      657 TTTCTCCTATATTTCCTTTTCTTTTCCTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTCGCCCA 716

 31775896 GGCTAGAGTGTGATGACGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCG 31775955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      717 GGCTAGAGTGTGATGACGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCG 776

 31775956 ATTCTCATGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTCTGAGCCACCATGCCTGGC 31776015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      777 ATTCTCATGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTCTGAGCCACCATGCCTGGC 836

 31776016 TAACTTTTGTATTTTTAGTACAGATGGGGTTTTGCCATGTTACCCAGGCTGGTCTCAAAC 31776075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      837 TAACTTTTGTATTTTTAGTACAGATGGGGTTTTGCCATGTTACCCAGGCTGGTCTCAAAC 896

 31776076 TCCTGGCCTCAAGCAATCCCCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTTCCG 31776135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      897 TCCTGGCCTCAAGCAATCCCCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTTCCG 956

 31776136 CTAGATTTTCTAAGTATTTGGCAGAGAGTTACATGTAATAGTCTTTTGTAATTCTTTTTT 31776195
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
      957 CTAGATTTTCTAAGTATTTGGCAGAGAGTTACATGTAATAGCCTTTTGTAATTCTTTTTT 1016

 31776196 TCTTTTTTTAAATAAGATCTTGCTCTGTTGTCCAGGCTGGAGTGCAGTGACGTGATGTCG 31776255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1017 TCTTTTTTTAAATAAGATCTTGCTCTGTTGTCCAGGCTGGAGTGCAGTGACGTGATGTCG 1076

 31776256 GCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCTGGGTTGAAGCGATTCTCATGCCTCAGCCTCCCGAGTA 31776315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1077 GCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCTGGGTTGAAGCGATTCTCATGCCTCAGCCTCCCGAGTA 1136

 31776316 GCTGGGACTACAGGCATGCACCACCACACCCAGCTAAGTTTTGTATTTTTAGTAGAGACA 31776375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1137 GCTGGGACTACAGGCATGCACCACCACACCCAGCTAAGTTTTGTATTTTTAGTAGAGACA 1196

 31776376 GGGTTTCACCATGTTGCCCAGGCTTGTAATTCTTTTAATTT 31776416
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1197 GGGTTTCACCATGTTGCCCAGGCTTGTAATTCTTTTAATTT 1237

EXCISED REGION

 31780626 GCTGTTGTTGGTATATAGGCATGCTAGTGATTTTTGTACATTGATTTTGTATCCTGAAAC 31780685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1238 GCTGTTGTTGGTATATAGGCATGCTAGTGATTTTTGTACATTGATTTTGTATCCTGAAAC 1297

 31780686 TGCTGAAGTTTATCAGCTGAAGAATCTTTTGTACAGGGACTATAGGGTTTTCTAGATGTA 31780745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1298 TGCTGAAGTTTATCAGCTGAAGAATCTTTTGTACAGGGACTATAGGGTTTTCTAGATGTA 1357

 31780746 GAATCATGTCTTCTGCAAAGAGAGATACTCTGACCTCCTGTCTTCCTATTTGGTTGCCCT 31780805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1358 GAATCATGTCTTCTGCAAAGAGAGATACTCTGACCTCCTGTCTTCCTATTTGGTTGCCCT 1417

 31780806 TTATTTCTTTCTCTTGCCTGACTGCTCTGACCAGGACTTCCAACCCTGTGTTGAATAGGA 31780865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1418 TTATTTCTTTCTCTTGCCTGACTGCTCTGACCAGGACTTCCAACCCTGTGTTGAATAGGA 1477

 31780866 GTGGTGAGAAAGGGCACCCGGGTCTTGTGCCAGTTTTCAAAGAGAATGCTTTCAGCTTTT 31780925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1478 GTGGTGAGAAAGGGCACCCGGGTCTTGTGCCAGTTTTCAAAGAGAATGCTTTCAGCTTTT 1537

 31780926 GCCCATTCAGTATGATGTTGGCTTTGGGTCTGTCACAGATAGCTGTTATTATTTTGAGGT 31780985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1538 GCCCATTCAGTATGATGTTGGCTTTGGGTCTGTCACAGATAGCTGTTATTATTTTGAGGT 1597

 31780986 ATGTTCCTTCAAAATCTAGTTTACTGACAGTTTTTAATACGAAGCGATGTTGAATTTTAT 31781045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1598 ATGTTCCTTCAAAATCTAGTTTACTGACAGTTTTTAATACGAAGCGATGTTGAATTTTAT 1657

 31781046 CGAAAGACTTTTCTGCATCTATTGAGATAATCATGTGGTTTTTGTCTTTAGTTCTGTTTA 31781105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1658 CGAAAGACTTTTCTGCATCTATTGAGATAATCATGTGGTTTTTGTCTTTAGTTCTGTTTA 1717

 31781106 TGTGATGAATCACTTTTATTGATTTGTGGATGTAAAACCAACCTTGCATCCCAGGAATAA 31781165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1718 TGTGATGAATCACTTTTATTGATTTGTGGATGTAAAACCAACCTTGCATCCCAGGAATAA 1777

 31781166 ACCCTATTTGATCGTGGTGGATTTGCTTTTTGATGTGCTGCTGGATTCAATTTGCAAGTA 31781225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1778 ACCCTATTTGATCGTGGTGGATTTGCTTTTTGATGTGCTGCTGGATTCAATTTGCAAGTA 1837

 31781226 TTTTGTTGAGGATTTCTGCATCGATGTTCATCAAGGATATTGGCTTGAAGTTTTCTATTT 31781285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1838 TTTTGTTGAGGATTTCTGCATCGATGTTCATCAAGGATATTGGCTTGAAGTTTTCTATTT 1897

 31781286 TGGGTGTGTCTCTGCCAGGTTTTAGTGTCAGGATGATGCCGGGCTCACAGAATGAGTTGG 31781345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1898 TGGGTGTGTCTCTGCCAGGTTTTAGTGTCAGGATGATGCCGGGCTCACAGAATGAGTTGG 1957

 31781346 GGAGGAGTCCCTCTGCCTCAATTTTTTGAAATAGTTTCAGAAGAAATAGTACTATCCCGT 31781405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1958 GGAGGAGTCCCTCTGCCTCAATTTTTTGAAATAGTTTCAGAAGAAATAGTACTATCCCGT 2017

 31781406 CTTTGTACATCTGGTGGAATTCGGCTGTGACTTCATCTGGTCCTGGGCTTTTCTTTGTTA 31781465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2018 CTTTGTACATCTGGTGGAATTCGGCTGTGACTTCATCTGGTCCTGGGCTTTTCTTTGTTA 2077

 31781466 GTAGGCTATTTATTACTGATTTCATTTTGGAGCTCATTATTGTTCTGTTCAGGGAATCTA 31781525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2078 GTAGGCTATTTATTACTGATTTCATTTTGGAGCTCATTATTGTTCTGTTCAGGGAATCTA 2137

 31781526 TTTCTTCTTGTTTCAGTTTTGGGAAGGTGTATGTGTCCAGGAATGTATCCATCTCTTCTA 31781585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2138 TTTCTTCTTGTTTCAGTTTTGGGAAGGTGTATGTGTCCAGGAATGTATCCATCTCTTCTA 2197

 31781586 GGTTTTTATTATTATTCTTTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGTGTGGGGTGC 31781645
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     2198 GGTTTTTATTATTATTCTTTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGTGTGGCGTGC 2257

 31781646 AGTGGCGCAATCTCGGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCTGAGTTTAAGCAATTCTCCTGAC 31781705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2258 AGTGGCGCAATCTCGGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCTGAGTTTAAGCAATTCTCCTGAC 2317

 31781706 TCAGCCTCCCAAGTACCTGGGATTAAAGGCATGTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTA 31781765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2318 TCAGCCTCCCAAGTACCTGGGATTAAAGGCATGTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTA 2377

 31781766 TTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGTTCTTGAACTCCTGACCTCA 31781825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2378 TTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGTTCTTGAACTCCTGACCTCA 2437

 31781826 GGTGATCTGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGTATGAGCCACTGTGCC 31781885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2438 GGTGATCTGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGTATGAGCCACTGTGCC 2497

 31781886 TGGCCGCTTCTAGGTTTCCTAGTTTGTGTGCATAGAGGTGTTCATAGTAGCCTGCGATGG 31781945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2498 TGGCCGCTTCTAGGTTTCCTAGTTTGTGTGCATAGAGGTGTTCATAGTAGCCTGCGATGG 2557

 31781946 TTATTTTTATTTCTGTGGGGTCACTGGTAACATCCCCTTTGTCATTTCTAACTATGTTTA 31782005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2558 TTATTTTTATTTCTGTGGGGTCACTGGTAACATCCCCTTTGTCATTTCTAACTATGTTTA 2617

 31782006 TTTATTTTTTGTTTATTTATTTATTTATTTATTTTTTGAGATGGAGTCTCGTTCTGTTGT 31782065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2618 TTTATTTTTTGTTTATTTATTTATTTATTTATTTTTTGAGATGGAGTCTCGTTCTGTTGT 2677

 31782066 TCCGATTGTAGTGAAGTGGCACCATTTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCTCAGGTTCAA 31782125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2678 TCCGATTGTAGTGAAGTGGCACCATTTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCTCAGGTTCAA 2737

 31782126 GAGATTCTCGTGGCTCCGCCTACCAAGTAGCAGGGATTATAGGCATATGTCACCATGCCC 31782185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2738 GAGATTCTCGTGGCTCCGCCTACCAAGTAGCAGGGATTATAGGCATATGTCACCATGCCC 2797

 31782186 GGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGATTTTACCATGTTGGCCAGACTGGTCTCG 31782245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2798 GGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGATTTTACCATGTTGGCCAGACTGGTCTCG 2857

 31782246 AACTCCTGACCTCAAGTGATCACCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCAT 31782305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2858 AACTCCTGACCTCAAGTGATCACCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCAT 2917

 31782306 GAGCCATATTTACTTATTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGTTAGAGTGCAG 31782365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2918 GAGCCATATTTACTTATTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGTTAGAGTGCAG 2977

 31782366 TGGCGTGATCTGGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCTGGATTCAGGTGATTCTCCTGCCTC 31782425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2978 TGGCGTGATCTGGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCTGGATTCAGGTGATTCTCCTGCCTC 3037

 31782426 AGCATCTCAAGTAGCTGGGATTGCAGGCGCCCACCAGCACGCCTGGCTAATTTTTGTATC 31782485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3038 AGCATCTCAAGTAGCTGGGATTGCAGGCGCCCACCAGCACGCCTGGCTAATTTTTGTATC 3097

 31782486 TTTAGTAGAGACAAGATTTTGCCGTGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAAT 31782545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3098 TTTAGTAGAGACAAGATTTTGCCGTGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAAT 3157

 31782546 GATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGG 31782578
          |||||||||||||||||||||||||||||||||
     3158 GATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGG 3190

Alignment time is 2.77146 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31766416,31790625] =>     24210 nucs '22 dna:chromosome chromosome:GRCh37:22:1:51304566:1'
Second seq [       1,    2070] =>      2070 nucs 'mol-32-29be-085702_2070'

Score:        1997
Aligned:      2038        nucs
Identic:      2031 (100%) nucs =>        22 (100%)      2009 (100%)
Gaps:            6 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31779578,31779599] EXCISED REGION [31779609,31781623]
 second seq =>  [      29,      50] EXCISED REGION [      60,    2070]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         9 nucs [31779600,31779608]
 second seq =>         9 nucs [51,59]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [31779598,31779599] to [31779609,31779610]
 second seq =>         2 nucs [49,50] to [60,61]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [31779600,31779602] to [31779606,31779608]
 second seq =>         1 nucs [51,51] to [59,59]

 31779578 AAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCC 31779599
          ||||||||||||||||||||||
       29 AAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCC 50

EXCISED REGION

 31779609 CCACTGCACTCCAGTCTGGGCGACAGAGCGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAA 31779668
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       60 CCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAA 119

 31779669 AA-GAAAGAAAGAAAAGAAAAGGGTCCAGTTTCAATCTTCCGCATATGGCTAGCCAGTTA 31779727
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      120 --GGAAAGAAAGAAAAGAAAAGGGTCCAGTTTCAATCTTCCGCATATGGCTAGCCAGTTA 177

 31779728 TCCCAGCCCCTTTCATTGAATAGGGAGTTCTTTTCCCACCGCTTGTTTTTTCAGCTTTGT 31779787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      178 TCCCAGCCCCTTTCATTGAATAGGGAGTTCTTTTCCCACCGCTTGTTTTTTCAGCTTTGT 237

 31779788 CAAAGATCAAACGGTTGTAGGTGAGTGTGCAGCCTCATTTCTGGGCTCCCTATTATATTC 31779847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      238 CAAAGATCAAACGGTTGTAGGTGAGTGTGCAGCCTCATTTCTGGGCTCCCTATTATATTC 297

 31779848 CATTGGCCTATCGGTCTGTTTTTGTACCCAGTACCATGCTATTTTGGTTACTGTAGCCCT 31779907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      298 CATTGGCCTATCGGTCTGTTTTTGTACCCAGTACCATGCTATTTTGGTTACTGTAGCCCT 357

 31779908 GTAGTATAGTTTGAAGTTGGGTAGTTTGAAGCCTCCAGCTTTGTTCTTTTTGTTTAAGAT 31779967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      358 GTAGTATAGTTTGAAGTTGGGTAGTTTGAAGCCTCCAGCTTTGTTCTTTTTGTTTAAGAT 417

 31779968 TGCCTTGGTATTCAGGCTGTTTTTTGGTCCCATATGAATTTTAAAATAGTTTTTTTTTCT 31780027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      418 TGCCTTGGTATTCAGGCTGTTTTTTGGTCCCATATGAATTTTAAAATAGTTTTTTTTTCT 477

 31780028 AGTTCTGTGAAGAATATTAGTGGTAGTTTGATAGGAATAGCATTGAATCTGTAAATTGCT 31780087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      478 AGTTCTGTGAAGAATATTAGTGGTAGTTTGATAGGAATAGCATTGAATCTGTAAATTGCT 537

 31780088 TTGGGCTATATGGCTATTTTAATGATACTGATTTTTTCCTATCCATGAGCATGGAATGTT 31780147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      538 TTGGGCTATATGGCTATTTTAATGATACTGATTTTTTCCTATCCATGAGCATGGAATGTT 597

 31780148 TTTCCATTCATTTGTGTCATCTCTGATTTCTTTGAGCAGTGTTTTGTAATTATCATTGTA 31780207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      598 TTTCCATTCATTTGTGTCATCTCTGATTTCTTTGAGCAGTGTTTTGTAATTATCATTGTA 657

 31780208 GAGATCTCTCACCTCCCTGGTTAGCTGTATTCATAGGCATTTTATTTATTTATTTATTTT 31780267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      658 GAGATCTCTCACCTCCCTGGTTAGCTGTATTCATAGGCATTTTATTTATTTATTTATTTT 717

 31780268 TTGAAACTGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCTCAATCTCGGCTCA 31780327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      718 TTGAAACTGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCTCAATCTCGGCTCA 777

 31780328 CCGCAACCTCCATCCTGGGTTCAAGCGATTTTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGA 31780387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      778 CCGCAACCTCCATCCTGGGTTCAAGCGATTTTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGA 837

 31780388 TTACAGGCATGTGCCACCACGCCCTACTAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTATTTTTA 31780447
          ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||
      838 TTACAGGCATGTGCCACCACGCCCTACTAA---TTTTTTTTTTTTTTTTTTGTATTTTTA 894

 31780448 GTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTAGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCCAACCTCAGGTGAT 31780507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      895 GTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTAGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCCAACCTCAGGTGAT 954

 31780508 CCACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGCGG 31780567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      955 CCACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGCGG 1014

 31780568 CATTTTATTATTTTTGTGGCAGTTGTGAATGGGATTTTGTCATTTGTGTCTTGGCTTGGC 31780627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1015 CATTTTATTATTTTTGTGGCAGTTGTGAATGGGATTTTGTCATTTGTGTCTTGGCTTGGC 1074

 31780628 TGTTGTTGGTATATAGGCATGCTAGTGATTTTTGTACATTGATTTTGTATCCTGAAACTG 31780687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1075 TGTTGTTGGTATATAGGCATGCTAGTGATTTTTGTACATTGATTTTGTATCCTGAAACTG 1134

 31780688 CTGAAGTTTATCAGCTGAAGAATCTTTTGTACAGGGACTATAGGGTTTTCTAGATGTAGA 31780747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1135 CTGAAGTTTATCAGCTGAAGAATCTTTTGTACAGGGACTATAGGGTTTTCTAGATGTAGA 1194

 31780748 ATCATGTCTTCTGCAAAGAGAGATACTCTGACCTCCTGTCTTCCTATTTGGTTGCCCTTT 31780807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1195 ATCATGTCTTCTGCAAAGAGAGATACTCTGACCTCCTGTCTTCCTATTTGGTTGCCCTTT 1254

 31780808 ATTTCTTTCTCTTGCCTGACTGCTCTGACCAGGACTTCCAACCCTGTGTTGAATAGGAGT 31780867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1255 ATTTCTTTCTCTTGCCTGACTGCTCTGACCAGGACTTCCAACCCTGTGTTGAATAGGAGT 1314

 31780868 GGTGAGAAAGGGCACCCGGGTCTTGTGCCAGTTTTCAAAGAGAATGCTTTCAGCTTTTGC 31780927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1315 GGTGAGAAAGGGCACCCGGGTCTTGTGCCAGTTTTCAAAGAGAATGCTTTCAGCTTTTGC 1374

 31780928 CCATTCAGTATGATGTTGGCTTTGGGTCTGTCACAGATAGCTGTTATTATTTTGAGGTAT 31780987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1375 CCATTCAGTATGATGTTGGCTTTGGGTCTGTCACAGATAGCTGTTATTATTTTGAGGTAT 1434

 31780988 GTTCCTTCAAAATCTAGTTTACTGACAGTTTTTAATACGAAGCGATGTTGAATTTTATCG 31781047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1435 GTTCCTTCAAAATCTAGTTTACTGACAGTTTTTAATACGAAGCGATGTTGAATTTTATCG 1494

 31781048 AAAGACTTTTCTGCATCTATTGAGATAATCATGTGGTTTTTGTCTTTAGTTCTGTTTATG 31781107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1495 AAAGACTTTTCTGCATCTATTGAGATAATCATGTGGTTTTTGTCTTTAGTTCTGTTTATG 1554

 31781108 TGATGAATCACTTTTATTGATTTGTGGATGTAAAACCAACCTTGCATCCCAGGAATAAAC 31781167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1555 TGATGAATCACTTTTATTGATTTGTGGATGTAAAACCAACCTTGCATCCCAGGAATAAAC 1614

 31781168 CCTATTTGATCGTGGTGGATTTGCTTTTTGATGTGCTGCTGGATTCAATTTGCAAGTATT 31781227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1615 CCTATTTGATCGTGGTGGATTTGCTTTTTGATGTGCTGCTGGATTCAATTTGCAAGTATT 1674

 31781228 TTGTTGAGGATTTCTGCATCGATGTTCATCAAGGATATTGGCTTGAAGTTTTCTATTTTG 31781287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1675 TTGTTGAGGATTTCTGCATCGATGTTCATCAAGGATATTGGCTTGAAGTTTTCTATTTTG 1734

 31781288 GGTGTGTCTCTGCCAGGTTTTAGTGTCAGGATGATGCCGGGCTCACAGAATGAGTTGGGG 31781347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1735 GGTGTGTCTCTGCCAGGTTTTAGTGTCAGGATGATGCCGGGCTCACAGAATGAGTTGGGG 1794

 31781348 AGGAGTCCCTCTGCCTCAATTTTTTGAAATAGTTTCAGAAGAAATAGTACTATCCCGTCT 31781407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1795 AGGAGTCCCTCTGCCTCAATTTTTTGAAATAGTTTCAGAAGAAATAGTACTATCCCGTCT 1854

 31781408 TTGTACATCTGGTGGAATTCGGCTGTGACTTCATCTGGTCCTGGGCTTTTCTTTGTTAGT 31781467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1855 TTGTACATCTGGTGGAATTCGGCTGTGACTTCATCTGGTCCTGGGCTTTTCTTTGTTAGT 1914

 31781468 AGGCTATTTATTACTGATTTCATTTTGGAGCTCATTATTGTTCTGTTCAGGGAATCTATT 31781527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1915 AGGCTATTTATTACTGATTTCATTTTGGAGCTCATTATTGTTCTGTTCAGGGAATCTATT 1974

 31781528 TCTTCTTGTTTCAGTTTTGGGAAGGTGTATGTGTCCAGGAATGTATCCATCTCTTCTAGG 31781587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1975 TCTTCTTGTTTCAGTTTTGGGAAGGTGTATGTGTCCAGGAATGTATCCATCTCTTCTAGG 2034

 31781588 TTTTTATTATTATTCTTTTTTGAGATGGAGTCTCAC 31781623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2035 TTTTTATTATTATTCTTTTTTGAGATGGAGTCTCAC 2070

Alignment time is 1.79366 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31766416,31790625] =>     24210 nucs '22 dna:chromosome chromosome:GRCh37:22:1:51304566:1'
Second seq [       1,    2401] =>      2401 nucs 'mol-32-2fc2-124939_2401'

Score:        2371
Aligned:      2393        nucs
Identic:      2391 (100%) nucs =>       867 (100%)      1524 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31775310,31776176] EXCISED REGION [31776178,31777702]
 second seq =>  [       8,     874] EXCISED REGION [     876,    2401]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [31776177,31776177]
 second seq =>         1 nucs [875,875]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [1482,1482]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [875,875] to [876,876]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31775310 AAACAAACAAACAAACAAACAAACAAACAAACAAAACAAGACTCAGCTGTAAAACCATCT 31775369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        8 AAACAAACAAACAAACAAACAAACAAACAAACAAAACAAGACTCAGCTGTAAAACCATCT 67

 31775370 AAGCCTGATGCCTTTTAAAATGAAGACTTACTTTTCTAATTTCTTTTATTTCTATTTTGT 31775429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       68 AAGCCTGATGCCTTTTAAAATGAAGACTTACTTTTCTAATTTCTTTTATTTCTATTTTGT 127

 31775430 TTTATTTATTTATCTATCTATCTATTTTTGAGATGGAGACTCGCTCTGTCGCCCAGGCTG 31775489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      128 TTTATTTATTTATCTATCTATCTATTTTTGAGATGGAGACTCGCTCTGTCGCCCAGGCTG 187

 31775490 GAGTGCAGTGGCACCATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCCAGTTGAAATGATTCT 31775549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      188 GAGTGCAGTGGCACCATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCCAGTTGAAATGATTCT 247

 31775550 TGTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATACAGGCGCAAGCCACGAGACCTGGCTAAGTT 31775609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      248 TGTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATACAGGCGCAAGCCACGAGACCTGGCTAAGTT 307

 31775610 TTGTCTTTTTGGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGCCTGGTCTTGAACTCCTGA 31775669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      308 TTGTCTTTTTGGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGCCTGGTCTTGAACTCCTGA 367

 31775670 CCTCAGGTGATCTATCCGCCTCAGTCTCCCACAGTGCTAGGATTATAGGTGTGAGACACC 31775729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      368 CCTCAGGTGATCTATCCGCCTCAGTCTCCCACAGTGCTAGGATTATAGGTGTGAGACACC 427

 31775730 GTTTCCGGCTTCTAATTTCTTTTATACTTATTAGTGTATTTACATCTTATCTCTCTTCTT 31775789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      428 GTTTCCGGCTTCTAATTTCTTTTATACTTATTAGTGTATTTACATCTTATCTCTCTTCTT 487

 31775790 GGGAAAATTGTAACATTTTATTTTATTTTTTATATGGAAGTCATTATTTCTCCTATATTT 31775849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      488 GGGAAAATTGTAACATTTTATTTTATTTTTTATATGGAAGTCATTATTTCTCCTATATTT 547

 31775850 CCTTTTCTTTTCCTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTCGCCCAGGCTAGAGTGTGAT 31775909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      548 CCTTTTCTTTTCCTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTCGCCCAGGCTAGAGTGTGAT 607

 31775910 GACGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCGATTCTCATGCCTCA 31775969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      608 GACGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCGATTCTCATGCCTCA 667

 31775970 GCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTCTGAGCCACCATGCCTGGCTAACTTTTGTATTT 31776029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      668 GCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTCTGAGCCACCATGCCTGGCTAACTTTTGTATTT 727

 31776030 TTAGTACAGATGGGGTTTTGCCATGTTACCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGC 31776089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      728 TTAGTACAGATGGGGTTTTGCCATGTTACCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGC 787

 31776090 AATCCCCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTTCCGCTAGATTTTCTAAG 31776149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      788 AATCCCCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTTCCGCTAGATTTTCTAAG 847

 31776150 TATTTGGCAGAGAGTTACATGTAATAG 31776176
          |||||||||||||||||||||||||||
      848 TATTTGGCAGAGAGTTACATGTAATAG 874

EXCISED REGION

 31776178 CTTTTGTAATTCTTTTTTTCTTTTTTTAAATAAGATCTTGCTCTGTTGTCCAGGCTGGAG 31776237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      876 CTTTTGTAATTCTTTTTTTCTTTTTTTAAATAAGATCTTGCTCTGTTGTCCAGGCTGGAG 935

 31776238 TGCAGTGACGTGATGTCGGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCTGGGTTGAAGCGATTCTCAT 31776297
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      936 TGCAGTGATGTGATGTCGGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCTGGGTTGAAGCGATTCTCAT 995

 31776298 GCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGCACCACCACACCCAGCTAAGTTTT 31776357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      996 GCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGCACCACCACACCCAGCTAAGTTTT 1055

 31776358 GTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGCCCAGGCTTGTAATTCTTTTAATTTG 31776417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1056 GTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGCCCAGGCTTGTAATTCTTTTAATTTG 1115

 31776418 CTATTATCAGTGGTTGTATGTCCTTTCTTACTCAAGATTGCTATTTATTTATTTTATTTT 31776477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1116 CTATTATCAGTGGTTGTATGTCCTTTCTTACTCAAGATTGCTATTTATTTATTTTATTTT 1175

 31776478 ATTTTTTGAGACGGAATCTCACTCTGTTGCCCAGACTGGAGTGCAGTGGCATGCGCCACC 31776537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1176 ATTTTTTGAGACGGAATCTCACTCTGTTGCCCAGACTGGAGTGCAGTGGCATGCGCCACC 1235

 31776538 ACACCCAGCTAATTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACAGCATTTTGCCATATTGGCCAGGCTG 31776597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1236 ACACCCAGCTAATTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACAGCATTTTGCCATATTGGCCAGGCTG 1295

 31776598 GTCTCTAACTCCTGATCTCAAGTGATCTGCCCACCTTGGCCCCTCCAAGTGCTGGGATTA 31776657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1296 GTCTCTAACTCCTGATCTCAAGTGATCTGCCCACCTTGGCCCCTCCAAGTGCTGGGATTA 1355

 31776658 CAGGCGTGAGCCACTGTGCCTGGCCTATTTTTTCTTTCTATCCTTATTCAAGCATTTTGA 31776717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1356 CAGGCGTGAGCCACTGTGCCTGGCCTATTTTTTCTTTCTATCCTTATTCAAGCATTTTGA 1415

 31776718 GATATTTTTCCTTTCTGTTTTACTGATCCTTTCATCTTTTCAAGTTCTTCTTTCTTTCTT 31776777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1416 GATATTTTTCCTTTCTGTTTTACTGATCCTTTCATCTTTTCAAGTTCTTCTTTCTTTCTT 1475

 31776778 TCTTTC-TTTTTTTTTTTTAAGACAGGGTCTCGCTCTATTGCCTAGGCTAGAGAATACTG 31776836
          |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1476 TCTTTCTTTTTTTTTTTTTAAGACAGGGTCTCGCTCTATTGCCTAGGCTAGAGAATACTG 1535

 31776837 GCATGATTATAGCTCACTGCAACCTCCTGGGCTCAAGGTATCTTCCTGCCTCAGCCTCCT 31776896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1536 GCATGATTATAGCTCACTGCAACCTCCTGGGCTCAAGGTATCTTCCTGCCTCAGCCTCCT 1595

 31776897 GAGTAGCCAAGACTACAGGTGTGCACCACTACATCAAGCTAAATTTTTTTTTTTTTACTT 31776956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1596 GAGTAGCCAAGACTACAGGTGTGCACCACTACATCAAGCTAAATTTTTTTTTTTTTACTT 1655

 31776957 TTATTTTAGGTTCAGGAACAGCTGTGCAAGTTTGTTATATAGGTAAGCTCGTGTTATGGG 31777016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1656 TTATTTTAGGTTCAGGAACAGCTGTGCAAGTTTGTTATATAGGTAAGCTCGTGTTATGGG 1715

 31777017 GGTTTATTGTACAGATTATTTCATCACTCAGGTACAAAGCCTGGTAACCAATAGTTATTT 31777076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1716 GGTTTATTGTACAGATTATTTCATCACTCAGGTACAAAGCCTGGTAACCAATAGTTATTT 1775

 31777077 TTTCTGATCATTTCCTTTCTCCCGCCCTGCACCCTCAAGTAGGTCCCAGTGTCTGTTGTT 31777136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1776 TTTCTGATCATTTCCTTTCTCCCGCCCTGCACCCTCAAGTAGGTCCCAGTGTCTGTTGTT 1835

 31777137 CCCCTCTTTGTGTCCATGTGTTCTTATTGAGCGCGCGCACACACACACACACACACACAT 31777196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1836 CCCCTCTTTGTGTCCATGTGTTCTTATTGAGCGCGCGCACACACACACACACACACACAT 1895

 31777197 TTATATGTACAAGCAATTGTCCTGCCTTAGCCTCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCA 31777256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1896 TTATATGTACAAGCAATTGTCCTGCCTTAGCCTCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCA 1955

 31777257 CCACCACACCCAGCTAATATTTTTGTATGTTTTTAGTAGAGACAAGGTTTCACCATGTTG 31777316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1956 CCACCACACCCAGCTAATATTTTTGTATGTTTTTAGTAGAGACAAGGTTTCACCATGTTG 2015

 31777317 GTCAGACTGGTCTCAAATTCTTGACCTCAGGTGATCCACCTGCCTCAGCCTTCCAAAGTG 31777376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2016 GTCAGACTGGTCTCAAATTCTTGACCTCAGGTGATCCACCTGCCTCAGCCTTCCAAAGTG 2075

 31777377 CTGTGATTACAGGTGTGAGCCACCACGTCCAGCTGAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACAT 31777436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2076 CTGTGATTACAGGTGTGAGCCACCACGTCCAGCTGAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACAT 2135

 31777437 ATGGTATTTGTTTTTCTGTTCCTGTGTTAGTTTGCTAAGGATAATGGCCTCCAGTTTCAT 31777496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2136 ATGGTATTTGTTTTTCTGTTCCTGTGTTAGTTTGCTAAGGATAATGGCCTCCAGTTTCAT 2195

 31777497 CCATGTTCCTGCAAAGGACATGATCTTCTTTTTTGTGGCTGCATAGTATTACATGGTGTA 31777556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2196 CCATGTTCCTGCAAAGGACATGATCTTCTTTTTTGTGGCTGCATAGTATTACATGGTGTA 2255

 31777557 TATGTACCACATTTTCTTTATCCAGTCTGTCATTGATGGGCATTTAGGTGATTCCACGTC 31777616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2256 TATGTACCACATTTTCTTTATCCAGTCTGTCATTGATGGGCATTTAGGTGATTCCACGTC 2315

 31777617 TTTGCTATTGTGGATGGTGCTGTGATGAATATATGCATGCATGTATCTTTATGGTGGAAT 31777676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2316 TTTGCTATTGTGGATGGTGCTGTGATGAATATATGCATGCATGTATCTTTATGGTGGAAT 2375

 31777677 GATATATATTCCTTTGGGTATCTACC 31777702
          ||||||||||||||||||||||||||
     2376 GATATATATTCCTTTGGGTATCTACC 2401

Alignment time is 2.04621 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31766416,31790625] =>     24210 nucs '22 dna:chromosome chromosome:GRCh37:22:1:51304566:1'
Second seq [       1,    3991] =>      3991 nucs 'mol-32-2ff9-173054_3991'

Score:        3945
Aligned:      3997        nucs
Identic:      3989 (100%) nucs =>      2798 (100%)      1191 (100%)
Gaps:            6 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31773611,31776416] EXCISED REGION [31780626,31781816]
 second seq =>  [       1,    2800] EXCISED REGION [    2801,    3991]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      4209 nucs [31776417,31780625]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [31776417,31776419] to [31780626,31780628]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [31776417,31776417] to [31780625,31780625]
 second seq =>         0 nucs

 31773611 GACCTTATTCTAGCACTTAGTCCTTACTCCTGACGCATGGCCTTTTGAGGATCTCAACTG 31773670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GACCTTATTCTAGCACTTAGTCCTTACTCCTGACGCATGGCCTTTTGAGGATCTCAACTG 60

 31773671 AATGCCCAAGATATTTGGCATGTTCTTTTCACTCTGGCTGGATTTGAACTCCCACATGTC 31773730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AATGCCCAAGATATTTGGCATGTTCTTTTCACTCTGGCTGGATTTGAACTCCCACATGTC 120

 31773731 CCAACACTGAGCAAAAGCTGTTATCTCTGTTCAGCTGTCAATCCTGCAACAGTTGTTCTC 31773790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCAACACTGAGCAAAAGCTGTTATCTCTGTTCAGCTGTCAATCCTGCAACAGTTGTTCTC 180

 31773791 TGCTGGGCCTCGCAGAGTCCCACTCTGTACATGCATAGCCCACAGCCCAGCCTTTTTTGG 31773850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGCTGGGCCTCGCAGAGTCCCACTCTGTACATGCATAGCCCACAGCCCAGCCTTTTTTGG 240

 31773851 CTAGAGAGGCAAGAGGAATTCCCATGTAAACCTAACCTCCCCCTCCCTCTTCCCCTCCCC 31773910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTAGAGAGGCAAGAGGAATTCCCATGTAAACCTAACCTCCCCCTCCCTCTTCCCCTCCCC 300

 31773911 TCCCCTTCCATCCCAAGTCTTATTCTGTTGCCCAGGCTTGAGTGCAAAGGGACGATCTCA 31773970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCCCCTTCCATCCCAAGTCTTATTCTGTTGCCCAGGCTTGAGTGCAAAGGGACGATCTCA 360

 31773971 GCTCACTGCAACCTTCACCTCCCAGGTTCAGGTGATTCTCCTGCTTCACCCTCTGAAGTA 31774030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GCTCACTGCAACCTTCACCTCCCAGGTTCAGGTGATTCTCCTGCTTCACCCTCTGAAGTA 420

 31774031 GCTGGGATTACAGGCATGCGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACG 31774090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GCTGGGATTACAGGCATGCGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACG 480

 31774091 GGGTTTCAGCATGTTGGCCAGCATGGTGTCCAACTCCTGACCTCAAGTGATCAGCGCACC 31774150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GGGTTTCAGCATGTTGGCCAGCATGGTGTCCAACTCCTGACCTCAAGTGATCAGCGCACC 540

 31774151 CGGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCCACATGTAAACTTCTGTCTCTTCCCACTCCC 31774210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CGGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCCACATGTAAACTTCTGTCTCTTCCCACTCCC 600

 31774211 TATGGTGCTGCTCCCTTCTTTTCTGTGCCCTGTCCTACACATTCCAGCTACTTCAGCAGC 31774270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TATGGTGCTGCTCCCTTCTTTTCTGTGCCCTGTCCTACACATTCCAGCTACTTCAGCAGC 660

 31774271 CCCAAACACTGATTTCTGCCTCTGCAGCTCAGGAAGAATTCTCCTTTGCTTGGAATCCAC 31774330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCCAAACACTGATTTCTGCCTCTGCAGCTCAGGAAGAATTCTCCTTTGCTTGGAATCCAC 720

 31774331 TTTCCTCCACTGTAATTGGGAAATTGTCCCCAGGCAGAAAGCCAGGACAAACATAGGGCT 31774390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
      721 TTTCCTCCACTGTAATTGGGAAATTGTCCCCAGGCAGAAAGCCAGGACAAACATGGGGCT 780

 31774391 TATCTTTTCTATTTCCCTTTTTCTCAAGAATCATAGTCTATTTTGCCTTTTTTTAAATAA 31774450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TATCTTTTCTATTTCCCTTTTTCTCAAGAATCATAGTCTATTTTGCCTTTTTTTAAATAA 840

 31774451 CTGAAAACATCTGCCTCTGATTTTGTCCAGTTTTATAGTTCTTTAATATTGTTGGGCGGG 31774510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTGAAAACATCTGCCTCTGATTTTGTCCAGTTTTATAGTTCTTTAATATTGTTGGGCGGG 900

 31774511 GCGCGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGCGGATCACTT 31774570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GCGCGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGCGGATCACTT 960

 31774571 GAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCACATGGTGAAACCCCATCTCCACTAAAATAA 31774630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCACATGGTGAAACCCCATCTCCACTAAAATAA 1020

 31774631 AAAAAATAGCTGGGCATGGTGGCACACGCTTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGG 31774690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AAAAAATAGCTGGGCATGGTGGCACACGCTTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGG 1080

 31774691 AGGAGAATCTCTTGAACCTGTGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCATGCCACTGTA 31774750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AGGAGAATCTCTTGAACCTGTGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCATGCCACTGTA 1140

 31774751 CTCCAGCCTGGATGACAGAACGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAGATTGTTGGATGAG 31774810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTCCAGCCTGGATGACAGAACGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAGATTGTTGGATGAG 1200

 31774811 TTCATCATCACTGAAAGTGGAAGTCTTACTTTCATTTTCATCATGTAAACATCTTTTCAG 31774870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTCATCATCACTGAAAGTGGAAGTCTTACTTTCATTTTCATCATGTAAACATCTTTTCAG 1260

 31774871 AAGTATAATTGACATATAAGAAATTGTTCATACTTAAAGTGTACAATTTGATGAGTTTTG 31774930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AAGTATAATTGACATATAAGAAATTGTTCATACTTAAAGTGTACAATTTGATGAGTTTTG 1320

 31774931 ACTTACGTGTATACCCATGGAACTATTAGCACAATGAAGAAATTAAGATAAGGCTCCACC 31774990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ACTTACGTGTATACCCATGGAACTATTAGCACAATGAAGAAATTAAGATAAGGCTCCACC 1380

 31774991 TGTTCTTTACAATCGGAGACAACTGGCTGCGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCA 31775050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TGTTCTTTACAATCGGAGACAACTGGCTGCGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCA 1440

 31775051 CTTTGGGAGGCCAAGCCGGGTGGATCACTTAAGGTCAGGAGTTCGAGGCCAGCCTGGCCA 31775110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTTTGGGAGGCCAAGCCGGGTGGATCACTTAAGGTCAGGAGTTCGAGGCCAGCCTGGCCA 1500

 31775111 ACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAGCTGGGC 31775170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||
     1501 ACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA--TTAGCTGGGC 1558

 31775171 GTGGTGGCATGCACCTGTAATCCCAGCTGCTCAGGAGGCTAAGGAGAATCGCTTGAACCC 31775230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1559 GTGGTGGCATGCACCTGTAATCCCAGCTGCTCAGGAGGCTAAGGAGAATCGCTTGAACCC 1618

 31775231 AGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGTCGAGATGGTGCCACTGCACTCCAGCCCGGGCAACAGA 31775290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1619 AGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGTCGAGATGGTGCCACTGCACTCCAGCCCGGGCAACAGA 1678

 31775291 GTGAGACTCCGTCTTAAACAAACAAACAAACAAACAAACAAACAAACAAACAAAACAAGA 31775350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||
     1679 GTGAGACTCCGTCTTAAACAAACAAACAAACAAACAAACAAACAAACAAA----ACAAGA 1734

 31775351 CTCAGCTGTAAAACCATCTAAGCCTGATGCCTTTTAAAATGAAGACTTACTTTTCTAATT 31775410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1735 CTCAGCTGTAAAACCATCTAAGCCTGATGCCTTTTAAAATGAAGACTTACTTTTCTAATT 1794

 31775411 TCTTTTATTTCTATTTTGTTTTATTTATTTATCTATCTATCTATTTTTGAGATGGAGACT 31775470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1795 TCTTTTATTTCTATTTTGTTTTATTTATTTATCTATCTATCTATTTTTGAGATGGAGACT 1854

 31775471 CGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACCATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCT 31775530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1855 CGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACCATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCT 1914

 31775531 CCCCAGTTGAAATGATTCTTGTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATACAGGCGCAAGC 31775590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1915 CCCCAGTTGAAATGATTCTTGTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATACAGGCGCAAGC 1974

 31775591 CACGAGACCTGGCTAAGTTTTGTCTTTTTGGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAG 31775650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1975 CACGAGACCTGGCTAAGTTTTGTCTTTTTGGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAG 2034

 31775651 CCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTATCCGCCTCAGTCTCCCACAGTGCTAGG 31775710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2035 CCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTATCCGCCTCAGTCTCCCACAGTGCTAGG 2094

 31775711 ATTATAGGTGTGAGACACCGTTTCCGGCTTCTAATTTCTTTTATACTTATTAGTGTATTT 31775770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2095 ATTATAGGTGTGAGACACCGTTTCCGGCTTCTAATTTCTTTTATACTTATTAGTGTATTT 2154

 31775771 ACATCTTATCTCTCTTCTTGGGAAAATTGTAACATTTTATTTTATTTTTTATATGGAAGT 31775830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2155 ACATCTTATCTCTCTTCTTGGGAAAATTGTAACATTTTATTTTATTTTTTATATGGAAGT 2214

 31775831 CATTATTTCTCCTATATTTCCTTTTCTTTTCCTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTC 31775890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2215 CATTATTTCTCCTATATTTCCTTTTCTTTTCCTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTC 2274

 31775891 GCCCAGGCTAGAGTGTGATGACGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTC 31775950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2275 GCCCAGGCTAGAGTGTGATGACGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTC 2334

 31775951 AAGCGATTCTCATGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTCTGAGCCACCATGC 31776010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2335 AAGCGATTCTCATGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTCTGAGCCACCATGC 2394

 31776011 CTGGCTAACTTTTGTATTTTTAGTACAGATGGGGTTTTGCCATGTTACCCAGGCTGGTCT 31776070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2395 CTGGCTAACTTTTGTATTTTTAGTACAGATGGGGTTTTGCCATGTTACCCAGGCTGGTCT 2454

 31776071 CAAACTCCTGGCCTCAAGCAATCCCCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGG 31776130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2455 CAAACTCCTGGCCTCAAGCAATCCCCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGG 2514

 31776131 TTCCGCTAGATTTTCTAAGTATTTGGCAGAGAGTTACATGTAATAGTCTTTTGTAATTCT 31776190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     2515 TTCCGCTAGATTTTCTAAGTATTTGGCAGAGAGTTACATGTAATAGCCTTTTGTAATTCT 2574

 31776191 TTTTTTCTTTTTTTAAATAAGATCTTGCTCTGTTGTCCAGGCTGGAGTGCAGTGACGTGA 31776250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2575 TTTTTTCTTTTTTTAAATAAGATCTTGCTCTGTTGTCCAGGCTGGAGTGCAGTGACGTGA 2634

 31776251 TGTCGGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCTGGGTTGAAGCGATTCTCATGCCTCAGCCTCCC 31776310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2635 TGTCGGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCTGGGTTGAAGCGATTCTCATGCCTCAGCCTCCC 2694

 31776311 GAGTAGCTGGGACTACAGGCATGCACCACCACACCCAGCTAAGTTTTGTATTTTTAGTAG 31776370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2695 GAGTAGCTGGGACTACAGGCATGCACCACCACACCCAGCTAAGTTTTGTATTTTTAGTAG 2754

 31776371 AGACAGGGTTTCACCATGTTGCCCAGGCTTGTAATTCTTTTAATTT 31776416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2755 AGACAGGGTTTCACCATGTTGCCCAGGCTTGTAATTCTTTTAATTT 2800

EXCISED REGION

 31780626 GCTGTTGTTGGTATATAGGCATGCTAGTGATTTTTGTACATTGATTTTGTATCCTGAAAC 31780685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2801 GCTGTTGTTGGTATATAGGCATGCTAGTGATTTTTGTACATTGATTTTGTATCCTGAAAC 2860

 31780686 TGCTGAAGTTTATCAGCTGAAGAATCTTTTGTACAGGGACTATAGGGTTTTCTAGATGTA 31780745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2861 TGCTGAAGTTTATCAGCTGAAGAATCTTTTGTACAGGGACTATAGGGTTTTCTAGATGTA 2920

 31780746 GAATCATGTCTTCTGCAAAGAGAGATACTCTGACCTCCTGTCTTCCTATTTGGTTGCCCT 31780805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2921 GAATCATGTCTTCTGCAAAGAGAGATACTCTGACCTCCTGTCTTCCTATTTGGTTGCCCT 2980

 31780806 TTATTTCTTTCTCTTGCCTGACTGCTCTGACCAGGACTTCCAACCCTGTGTTGAATAGGA 31780865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2981 TTATTTCTTTCTCTTGCCTGACTGCTCTGACCAGGACTTCCAACCCTGTGTTGAATAGGA 3040

 31780866 GTGGTGAGAAAGGGCACCCGGGTCTTGTGCCAGTTTTCAAAGAGAATGCTTTCAGCTTTT 31780925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3041 GTGGTGAGAAAGGGCACCCGGGTCTTGTGCCAGTTTTCAAAGAGAATGCTTTCAGCTTTT 3100

 31780926 GCCCATTCAGTATGATGTTGGCTTTGGGTCTGTCACAGATAGCTGTTATTATTTTGAGGT 31780985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3101 GCCCATTCAGTATGATGTTGGCTTTGGGTCTGTCACAGATAGCTGTTATTATTTTGAGGT 3160

 31780986 ATGTTCCTTCAAAATCTAGTTTACTGACAGTTTTTAATACGAAGCGATGTTGAATTTTAT 31781045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3161 ATGTTCCTTCAAAATCTAGTTTACTGACAGTTTTTAATACGAAGCGATGTTGAATTTTAT 3220

 31781046 CGAAAGACTTTTCTGCATCTATTGAGATAATCATGTGGTTTTTGTCTTTAGTTCTGTTTA 31781105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3221 CGAAAGACTTTTCTGCATCTATTGAGATAATCATGTGGTTTTTGTCTTTAGTTCTGTTTA 3280

 31781106 TGTGATGAATCACTTTTATTGATTTGTGGATGTAAAACCAACCTTGCATCCCAGGAATAA 31781165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3281 TGTGATGAATCACTTTTATTGATTTGTGGATGTAAAACCAACCTTGCATCCCAGGAATAA 3340

 31781166 ACCCTATTTGATCGTGGTGGATTTGCTTTTTGATGTGCTGCTGGATTCAATTTGCAAGTA 31781225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3341 ACCCTATTTGATCGTGGTGGATTTGCTTTTTGATGTGCTGCTGGATTCAATTTGCAAGTA 3400

 31781226 TTTTGTTGAGGATTTCTGCATCGATGTTCATCAAGGATATTGGCTTGAAGTTTTCTATTT 31781285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3401 TTTTGTTGAGGATTTCTGCATCGATGTTCATCAAGGATATTGGCTTGAAGTTTTCTATTT 3460

 31781286 TGGGTGTGTCTCTGCCAGGTTTTAGTGTCAGGATGATGCCGGGCTCACAGAATGAGTTGG 31781345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3461 TGGGTGTGTCTCTGCCAGGTTTTAGTGTCAGGATGATGCCGGGCTCACAGAATGAGTTGG 3520

 31781346 GGAGGAGTCCCTCTGCCTCAATTTTTTGAAATAGTTTCAGAAGAAATAGTACTATCCCGT 31781405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3521 GGAGGAGTCCCTCTGCCTCAATTTTTTGAAATAGTTTCAGAAGAAATAGTACTATCCCGT 3580

 31781406 CTTTGTACATCTGGTGGAATTCGGCTGTGACTTCATCTGGTCCTGGGCTTTTCTTTGTTA 31781465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3581 CTTTGTACATCTGGTGGAATTCGGCTGTGACTTCATCTGGTCCTGGGCTTTTCTTTGTTA 3640

 31781466 GTAGGCTATTTATTACTGATTTCATTTTGGAGCTCATTATTGTTCTGTTCAGGGAATCTA 31781525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3641 GTAGGCTATTTATTACTGATTTCATTTTGGAGCTCATTATTGTTCTGTTCAGGGAATCTA 3700

 31781526 TTTCTTCTTGTTTCAGTTTTGGGAAGGTGTATGTGTCCAGGAATGTATCCATCTCTTCTA 31781585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3701 TTTCTTCTTGTTTCAGTTTTGGGAAGGTGTATGTGTCCAGGAATGTATCCATCTCTTCTA 3760

 31781586 GGTTTTTATTATTATTCTTTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGTGTGGGGTGC 31781645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3761 GGTTTTTATTATTATTCTTTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGTGTGGGGTGC 3820

 31781646 AGTGGCGCAATCTCGGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCTGAGTTTAAGCAATTCTCCTGAC 31781705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3821 AGTGGCGCAATCTCGGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCTGAGTTTAAGCAATTCTCCTGAC 3880

 31781706 TCAGCCTCCCAAGTACCTGGGATTAAAGGCATGTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTA 31781765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3881 TCAGCCTCCCAAGTACCTGGGATTAAAGGCATGTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTA 3940

 31781766 TTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGTTCTTGAACTC 31781816
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3941 TTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGTTCTTGAACTC 3991

Alignment time is 3.41997 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31766416,31790625] =>     24210 nucs '22 dna:chromosome chromosome:GRCh37:22:1:51304566:1'
Second seq [       1,    2523] =>      2523 nucs 'mol-32-2ff9-271053_2523'

Score:        2490
Aligned:      2523        nucs
Identic:      2520 (100%) nucs =>       129 (100%)      2391 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31775177,31775305] EXCISED REGION [31775310,31777702]
 second seq =>  [       1,     129] EXCISED REGION [     130,    2523]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         4 nucs [31775306,31775309]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        35 nucs [31775306,31775340] to [31775310,31775344]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31775177 GCATGCACCTGTAATCCCAGCTGCTCAGGAGGCTAAGGAGAATCGCTTGAACCCAGGAGG 31775236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCATGCACCTGTAATCCCAGCTGCTCAGGAGGCTAAGGAGAATCGCTTGAACCCAGGAGG 60

 31775237 CAGAGGTTGCAGTGAGTCGAGATGGTGCCACTGCACTCCAGCCCGGGCAACAGAGTGAGA 31775296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAGAGGTTGCAGTGAGTCGAGATGGTGCCACTGCACTCCAGCCCGGGCAACAGAGTGAGA 120

 31775297 CTCCGTCTT 31775305
          |||||||||
      121 CTCCGTCTT 129

EXCISED REGION

 31775310 AAACAAACAAACAAACAAACAAACAAACAAACAAAACAAGACTCAGCTGTAAAACCATCT 31775369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      130 AAACAAACAAACAAACAAACAAACAAACAAACAAAACAAGACTCAGCTGTAAAACCATCT 189

 31775370 AAGCCTGATGCCTTTTAAAATGAAGACTTACTTTTCTAATTTCTTTTATTTCTATTTTGT 31775429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      190 AAGCCTGATGCCTTTTAAAATGAAGACTTACTTTTCTAATTTCTTTTATTTCTATTTTGT 249

 31775430 TTTATTTATTTATCTATCTATCTATTTTTGAGATGGAGACTCGCTCTGTCGCCCAGGCTG 31775489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      250 TTTATTTATTTATCTATCTATCTATTTTTGAGATGGAGACTCGCTCTGTCGCCCAGGCTG 309

 31775490 GAGTGCAGTGGCACCATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCCAGTTGAAATGATTCT 31775549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      310 GAGTGCAGTGGCACCATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCCAGTTGAAATGATTCT 369

 31775550 TGTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATACAGGCGCAAGCCACGAGACCTGGCTAAGTT 31775609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      370 TGTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATACAGGCGCAAGCCACGAGACCTGGCTAAGTT 429

 31775610 TTGTCTTTTTGGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGCCTGGTCTTGAACTCCTGA 31775669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      430 TTGTCTTTTTGGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGCCTGGTCTTGAACTCCTGA 489

 31775670 CCTCAGGTGATCTATCCGCCTCAGTCTCCCACAGTGCTAGGATTATAGGTGTGAGACACC 31775729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      490 CCTCAGGTGATCTATCCGCCTCAGTCTCCCACAGTGCTAGGATTATAGGTGTGAGACACC 549

 31775730 GTTTCCGGCTTCTAATTTCTTTTATACTTATTAGTGTATTTACATCTTATCTCTCTTCTT 31775789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      550 GTTTCCGGCTTCTAATTTCTTTTATACTTATTAGTGTATTTACATCTTATCTCTCTTCTT 609

 31775790 GGGAAAATTGTAACATTTTATTTTATTTTTTATATGGAAGTCATTATTTCTCCTATATTT 31775849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      610 GGGAAAATTGTAACATTTTATTTTATTTTTTATATGGAAGTCATTATTTCTCCTATATTT 669

 31775850 CCTTTTCTTTTCCTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTCGCCCAGGCTAGAGTGTGAT 31775909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      670 CCTTTTCTTTTCCTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTCGCCCAGGCTAGAGTGTGAT 729

 31775910 GACGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCGATTCTCATGCCTCA 31775969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      730 GACGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCGATTCTCATGCCTCA 789

 31775970 GCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTCTGAGCCACCATGCCTGGCTAACTTTTGTATTT 31776029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      790 GCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTCTGAGCCACCATGCCTGGCTAACTTTTGTATTT 849

 31776030 TTAGTACAGATGGGGTTTTGCCATGTTACCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGC 31776089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      850 TTAGTACAGATGGGGTTTTGCCATGTTACCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGC 909

 31776090 AATCCCCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTTCCGCTAGATTTTCTAAG 31776149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      910 AATCCCCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTTCCGCTAGATTTTCTAAG 969

 31776150 TATTTGGCAGAGAGTTACATGTAATAGTCTTTTGTAATTCTTTTTTTCTTTTTTTAAATA 31776209
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
      970 TATTTGGCAGAGAGTTACATGTAATAGCCTTTTGTAATTCTTTTTTTCTTTTTTTAAATA 1029

 31776210 AGATCTTGCTCTGTTGTCCAGGCTGGAGTGCAGTGACGTGATGTCGGCTCACTGCAGCCT 31776269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1030 AGATCTTGCTCTGTTGTCCAGGCTGGAGTGCAGTGATGTGATGTCGGCTCACTGCAGCCT 1089

 31776270 CTGCCTCCTGGGTTGAAGCGATTCTCATGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGG 31776329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1090 CTGCCTCCTGGGTTGAAGCGATTCTCATGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGG 1149

 31776330 CATGCACCACCACACCCAGCTAAGTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGT 31776389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1150 CATGCACCACCACACCCAGCTAAGTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGT 1209

 31776390 TGCCCAGGCTTGTAATTCTTTTAATTTGCTATTATCAGTGGTTGTATGTCCTTTCTTACT 31776449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1210 TGCCCAGGCTTGTAATTCTTTTAATTTGCTATTATCAGTGGTTGTATGTCCTTTCTTACT 1269

 31776450 CAAGATTGCTATTTATTTATTTTATTTTATTTTTTGAGACGGAATCTCACTCTGTTGCCC 31776509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1270 CAAGATTGCTATTTATTTATTTTATTTTATTTTTTGAGACGGAATCTCACTCTGTTGCCC 1329

 31776510 AGACTGGAGTGCAGTGGCATGCGCCACCACACCCAGCTAATTTTTGTGTTTTTAGTAGAG 31776569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1330 AGACTGGAGTGCAGTGGCATGCGCCACCACACCCAGCTAATTTTTGTGTTTTTAGTAGAG 1389

 31776570 ACAGCATTTTGCCATATTGGCCAGGCTGGTCTCTAACTCCTGATCTCAAGTGATCTGCCC 31776629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1390 ACAGCATTTTGCCATATTGGCCAGGCTGGTCTCTAACTCCTGATCTCAAGTGATCTGCCC 1449

 31776630 ACCTTGGCCCCTCCAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCTGGCCTATTTTT 31776689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1450 ACCTTGGCCCCTCCAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCTGGCCTATTTTT 1509

 31776690 TCTTTCTATCCTTATTCAAGCATTTTGAGATATTTTTCCTTTCTGTTTTACTGATCCTTT 31776749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1510 TCTTTCTATCCTTATTCAAGCATTTTGAGATATTTTTCCTTTCTGTTTTACTGATCCTTT 1569

 31776750 CATCTTTTCAAGTTCTTCTTTCTTTCTTTCTTTC-TTTTTTTTTTTTAAGACAGGGTCTC 31776808
          |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
     1570 CATCTTTTCAAGTTCTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTAAGACAGGGTCTC 1629

 31776809 GCTCTATTGCCTAGGCTAGAGAATACTGGCATGATTATAGCTCACTGCAACCTCCTGGGC 31776868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1630 GCTCTATTGCCTAGGCTAGAGAATACTGGCATGATTATAGCTCACTGCAACCTCCTGGGC 1689

 31776869 TCAAGGTATCTTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCCAAGACTACAGGTGTGCACCACTAC 31776928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1690 TCAAGGTATCTTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCCAAGACTACAGGTGTGCACCACTAC 1749

 31776929 ATCAAGCTAAATTTTTTTTTTTTTACTTTTATTTTAGGTTCAGGAACAGCTGTGCAAGTT 31776988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1750 ATCAAGCTAAATTTTTTTTTTTTTACTTTTATTTTAGGTTCAGGAACAGCTGTGCAAGTT 1809

 31776989 TGTTATATAGGTAAGCTCGTGTTATGGGGGTTTATTGTACAGATTATTTCATCACTCAGG 31777048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1810 TGTTATATAGGTAAGCTCGTGTTATGGGGGTTTATTGTACAGATTATTTCATCACTCAGG 1869

 31777049 TACAAAGCCTGGTAACCAATAGTTATTTTTTCTGATCATTTCCTTTCTCCCGCCCTGCAC 31777108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1870 TACAAAGCCTGGTAACCAATAGTTATTTTTTCTGATCATTTCCTTTCTCCCGCCCTGCAC 1929

 31777109 CCTCAAGTAGGTCCCAGTGTCTGTTGTTCCCCTCTTTGTGTCCATGTGTTCTTATTGAGC 31777168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1930 CCTCAAGTAGGTCCCAGTGTCTGTTGTTCCCCTCTTTGTGTCCATGTGTTCTTATTGAGC 1989

 31777169 GCGCGCACACACACACACACACACACATTTATATGTACAAGCAATTGTCCTGCCTTAGCC 31777228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1990 GCGCGCACACACACACACACACACACATTTATATGTACAAGCAATTGTCCTGCCTTAGCC 2049

 31777229 TCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCACCACACCCAGCTAATATTTTTGTATGTTT 31777288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2050 TCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCACCACACCCAGCTAATATTTTTGTATGTTT 2109

 31777289 TTAGTAGAGACAAGGTTTCACCATGTTGGTCAGACTGGTCTCAAATTCTTGACCTCAGGT 31777348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2110 TTAGTAGAGACAAGGTTTCACCATGTTGGTCAGACTGGTCTCAAATTCTTGACCTCAGGT 2169

 31777349 GATCCACCTGCCTCAGCCTTCCAAAGTGCTGTGATTACAGGTGTGAGCCACCACGTCCAG 31777408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2170 GATCCACCTGCCTCAGCCTTCCAAAGTGCTGTGATTACAGGTGTGAGCCACCACGTCCAG 2229

 31777409 CTGAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACATATGGTATTTGTTTTTCTGTTCCTGTGTTAGTT 31777468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2230 CTGAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACATATGGTATTTGTTTTTCTGTTCCTGTGTTAGTT 2289

 31777469 TGCTAAGGATAATGGCCTCCAGTTTCATCCATGTTCCTGCAAAGGACATGATCTTCTTTT 31777528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2290 TGCTAAGGATAATGGCCTCCAGTTTCATCCATGTTCCTGCAAAGGACATGATCTTCTTTT 2349

 31777529 TTGTGGCTGCATAGTATTACATGGTGTATATGTACCACATTTTCTTTATCCAGTCTGTCA 31777588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2350 TTGTGGCTGCATAGTATTACATGGTGTATATGTACCACATTTTCTTTATCCAGTCTGTCA 2409

 31777589 TTGATGGGCATTTAGGTGATTCCACGTCTTTGCTATTGTGGATGGTGCTGTGATGAATAT 31777648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2410 TTGATGGGCATTTAGGTGATTCCACGTCTTTGCTATTGTGGATGGTGCTGTGATGAATAT 2469

 31777649 ATGCATGCATGTATCTTTATGGTGGAATGATATATATTCCTTTGGGTATCTACC 31777702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2470 ATGCATGCATGTATCTTTATGGTGGAATGATATATATTCCTTTGGGTATCTACC 2523

Alignment time is 2.13912 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31766416,31790625] =>     24210 nucs '22 dna:chromosome chromosome:GRCh37:22:1:51304566:1'
Second seq [       1,    3171] =>      3171 nucs 'mol-32-2ff9-271749_3171'

Score:        3160
Aligned:      3173        nucs
Identic:      3171 (100%) nucs =>       722 (100%)      2449 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31779696,31780417] EXCISED REGION [31780420,31782870]
 second seq =>  [       1,     722] EXCISED REGION [     723,    3171]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [31780418,31780419]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        19 nucs [31780418,31780436] to [31780420,31780438]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [31780418,31780418] to [31780419,31780419]
 second seq =>         0 nucs

 31779696 GTTTCAATCTTCCGCATATGGCTAGCCAGTTATCCCAGCCCCTTTCATTGAATAGGGAGT 31779755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTTTCAATCTTCCGCATATGGCTAGCCAGTTATCCCAGCCCCTTTCATTGAATAGGGAGT 60

 31779756 TCTTTTCCCACCGCTTGTTTTTTCAGCTTTGTCAAAGATCAAACGGTTGTAGGTGAGTGT 31779815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCTTTTCCCACCGCTTGTTTTTTCAGCTTTGTCAAAGATCAAACGGTTGTAGGTGAGTGT 120

 31779816 GCAGCCTCATTTCTGGGCTCCCTATTATATTCCATTGGCCTATCGGTCTGTTTTTGTACC 31779875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GCAGCCTCATTTCTGGGCTCCCTATTATATTCCATTGGCCTATCGGTCTGTTTTTGTACC 180

 31779876 CAGTACCATGCTATTTTGGTTACTGTAGCCCTGTAGTATAGTTTGAAGTTGGGTAGTTTG 31779935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CAGTACCATGCTATTTTGGTTACTGTAGCCCTGTAGTATAGTTTGAAGTTGGGTAGTTTG 240

 31779936 AAGCCTCCAGCTTTGTTCTTTTTGTTTAAGATTGCCTTGGTATTCAGGCTGTTTTTTGGT 31779995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAGCCTCCAGCTTTGTTCTTTTTGTTTAAGATTGCCTTGGTATTCAGGCTGTTTTTTGGT 300

 31779996 CCCATATGAATTTTAAAATAGTTTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAGAATATTAGTGGTAGTT 31780055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCCATATGAATTTTAAAATAGTTTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAGAATATTAGTGGTAGTT 360

 31780056 TGATAGGAATAGCATTGAATCTGTAAATTGCTTTGGGCTATATGGCTATTTTAATGATAC 31780115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGATAGGAATAGCATTGAATCTGTAAATTGCTTTGGGCTATATGGCTATTTTAATGATAC 420

 31780116 TGATTTTTTCCTATCCATGAGCATGGAATGTTTTTCCATTCATTTGTGTCATCTCTGATT 31780175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGATTTTTTCCTATCCATGAGCATGGAATGTTTTTCCATTCATTTGTGTCATCTCTGATT 480

 31780176 TCTTTGAGCAGTGTTTTGTAATTATCATTGTAGAGATCTCTCACCTCCCTGGTTAGCTGT 31780235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCTTTGAGCAGTGTTTTGTAATTATCATTGTAGAGATCTCTCACCTCCCTGGTTAGCTGT 540

 31780236 ATTCATAGGCATTTTATTTATTTATTTATTTTTTGAAACTGAGTTTCACTCTTGTTGCCC 31780295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATTCATAGGCATTTTATTTATTTATTTATTTTTTGAAACTGAGTTTCACTCTTGTTGCCC 600

 31780296 AGGCTGGAGTGCAATGGCTCAATCTCGGCTCACCGCAACCTCCATCCTGGGTTCAAGCGA 31780355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGGCTGGAGTGCAATGGCTCAATCTCGGCTCACCGCAACCTCCATCCTGGGTTCAAGCGA 660

 31780356 TTTTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGTGCCACCACGCCCTACT 31780415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTTTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGTGCCACCACGCCCTACT 720

 31780416 AA 31780417
          ||
      721 AA 722

EXCISED REGION

 31780420 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTAGGTCAGGC 31780479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      723 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTAGGTCAGGC 782

 31780480 TGGTCTCGAACTCCCAACCTCAGGTGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGAT 31780539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      783 TGGTCTCGAACTCCCAACCTCAGGTGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGAT 842

 31780540 TACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGCGGCATTTTATTATTTTTGTGGCAGTTGTGAATGG 31780599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      843 TACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGCGGCATTTTATTATTTTTGTGGCAGTTGTGAATGG 902

 31780600 GATTTTGTCATTTGTGTCTTGGCTTGGCTGTTGTTGGTATATAGGCATGCTAGTGATTTT 31780659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      903 GATTTTGTCATTTGTGTCTTGGCTTGGCTGTTGTTGGTATATAGGCATGCTAGTGATTTT 962

 31780660 TGTACATTGATTTTGTATCCTGAAACTGCTGAAGTTTATCAGCTGAAGAATCTTTTGTAC 31780719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      963 TGTACATTGATTTTGTATCCTGAAACTGCTGAAGTTTATCAGCTGAAGAATCTTTTGTAC 1022

 31780720 AGGGACTATAGGGTTTTCTAGATGTAGAATCATGTCTTCTGCAAAGAGAGATACTCTGAC 31780779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1023 AGGGACTATAGGGTTTTCTAGATGTAGAATCATGTCTTCTGCAAAGAGAGATACTCTGAC 1082

 31780780 CTCCTGTCTTCCTATTTGGTTGCCCTTTATTTCTTTCTCTTGCCTGACTGCTCTGACCAG 31780839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1083 CTCCTGTCTTCCTATTTGGTTGCCCTTTATTTCTTTCTCTTGCCTGACTGCTCTGACCAG 1142

 31780840 GACTTCCAACCCTGTGTTGAATAGGAGTGGTGAGAAAGGGCACCCGGGTCTTGTGCCAGT 31780899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1143 GACTTCCAACCCTGTGTTGAATAGGAGTGGTGAGAAAGGGCACCCGGGTCTTGTGCCAGT 1202

 31780900 TTTCAAAGAGAATGCTTTCAGCTTTTGCCCATTCAGTATGATGTTGGCTTTGGGTCTGTC 31780959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1203 TTTCAAAGAGAATGCTTTCAGCTTTTGCCCATTCAGTATGATGTTGGCTTTGGGTCTGTC 1262

 31780960 ACAGATAGCTGTTATTATTTTGAGGTATGTTCCTTCAAAATCTAGTTTACTGACAGTTTT 31781019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1263 ACAGATAGCTGTTATTATTTTGAGGTATGTTCCTTCAAAATCTAGTTTACTGACAGTTTT 1322

 31781020 TAATACGAAGCGATGTTGAATTTTATCGAAAGACTTTTCTGCATCTATTGAGATAATCAT 31781079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1323 TAATACGAAGCGATGTTGAATTTTATCGAAAGACTTTTCTGCATCTATTGAGATAATCAT 1382

 31781080 GTGGTTTTTGTCTTTAGTTCTGTTTATGTGATGAATCACTTTTATTGATTTGTGGATGTA 31781139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1383 GTGGTTTTTGTCTTTAGTTCTGTTTATGTGATGAATCACTTTTATTGATTTGTGGATGTA 1442

 31781140 AAACCAACCTTGCATCCCAGGAATAAACCCTATTTGATCGTGGTGGATTTGCTTTTTGAT 31781199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1443 AAACCAACCTTGCATCCCAGGAATAAACCCTATTTGATCGTGGTGGATTTGCTTTTTGAT 1502

 31781200 GTGCTGCTGGATTCAATTTGCAAGTATTTTGTTGAGGATTTCTGCATCGATGTTCATCAA 31781259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1503 GTGCTGCTGGATTCAATTTGCAAGTATTTTGTTGAGGATTTCTGCATCGATGTTCATCAA 1562

 31781260 GGATATTGGCTTGAAGTTTTCTATTTTGGGTGTGTCTCTGCCAGGTTTTAGTGTCAGGAT 31781319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1563 GGATATTGGCTTGAAGTTTTCTATTTTGGGTGTGTCTCTGCCAGGTTTTAGTGTCAGGAT 1622

 31781320 GATGCCGGGCTCACAGAATGAGTTGGGGAGGAGTCCCTCTGCCTCAATTTTTTGAAATAG 31781379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1623 GATGCCGGGCTCACAGAATGAGTTGGGGAGGAGTCCCTCTGCCTCAATTTTTTGAAATAG 1682

 31781380 TTTCAGAAGAAATAGTACTATCCCGTCTTTGTACATCTGGTGGAATTCGGCTGTGACTTC 31781439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1683 TTTCAGAAGAAATAGTACTATCCCGTCTTTGTACATCTGGTGGAATTCGGCTGTGACTTC 1742

 31781440 ATCTGGTCCTGGGCTTTTCTTTGTTAGTAGGCTATTTATTACTGATTTCATTTTGGAGCT 31781499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1743 ATCTGGTCCTGGGCTTTTCTTTGTTAGTAGGCTATTTATTACTGATTTCATTTTGGAGCT 1802

 31781500 CATTATTGTTCTGTTCAGGGAATCTATTTCTTCTTGTTTCAGTTTTGGGAAGGTGTATGT 31781559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1803 CATTATTGTTCTGTTCAGGGAATCTATTTCTTCTTGTTTCAGTTTTGGGAAGGTGTATGT 1862

 31781560 GTCCAGGAATGTATCCATCTCTTCTAGGTTTTTATTATTATTCTTTTTTGAGATGGAGTC 31781619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1863 GTCCAGGAATGTATCCATCTCTTCTAGGTTTTTATTATTATTCTTTTTTGAGATGGAGTC 1922

 31781620 TCACTCTGTCACCCAGTGTGGGGTGCAGTGGCGCAATCTCGGCTCACTGCAGCCTCTGCC 31781679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1923 TCACTCTGTCACCCAGTGTGGGGTGCAGTGGCGCAATCTCGGCTCACTGCAGCCTCTGCC 1982

 31781680 TCCTGAGTTTAAGCAATTCTCCTGACTCAGCCTCCCAAGTACCTGGGATTAAAGGCATGT 31781739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1983 TCCTGAGTTTAAGCAATTCTCCTGACTCAGCCTCCCAAGTACCTGGGATTAAAGGCATGT 2042

 31781740 GCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCC 31781799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2043 GCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCC 2102

 31781800 AGGCTGTTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTA 31781859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2103 AGGCTGTTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTA 2162

 31781860 GGATTACAGGTATGAGCCACTGTGCCTGGCCGCTTCTAGGTTTCCTAGTTTGTGTGCATA 31781919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2163 GGATTACAGGTATGAGCCACTGTGCCTGGCCGCTTCTAGGTTTCCTAGTTTGTGTGCATA 2222

 31781920 GAGGTGTTCATAGTAGCCTGCGATGGTTATTTTTATTTCTGTGGGGTCACTGGTAACATC 31781979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2223 GAGGTGTTCATAGTAGCCTGCGATGGTTATTTTTATTTCTGTGGGGTCACTGGTAACATC 2282

 31781980 CCCTTTGTCATTTCTAACTATGTTTATTTATTTTTTGTTTATTTATTTATTTATTTATTT 31782039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2283 CCCTTTGTCATTTCTAACTATGTTTATTTATTTTTTGTTTATTTATTTATTTATTTATTT 2342

 31782040 TTTGAGATGGAGTCTCGTTCTGTTGTTCCGATTGTAGTGAAGTGGCACCATTTTGGCTCA 31782099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2343 TTTGAGATGGAGTCTCGTTCTGTTGTTCCGATTGTAGTGAAGTGGCACCATTTTGGCTCA 2402

 31782100 CTGCAACCTCTGCCTCTCAGGTTCAAGAGATTCTCGTGGCTCCGCCTACCAAGTAGCAGG 31782159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2403 CTGCAACCTCTGCCTCTCAGGTTCAAGAGATTCTCGTGGCTCCGCCTACCAAGTAGCAGG 2462

 31782160 GATTATAGGCATATGTCACCATGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGATT 31782219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2463 GATTATAGGCATATGTCACCATGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGATT 2522

 31782220 TTACCATGTTGGCCAGACTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAAGTGATCACCCACCTTGGCC 31782279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2523 TTACCATGTTGGCCAGACTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAAGTGATCACCCACCTTGGCC 2582

 31782280 TCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCATATTTACTTATTTTTGAGATGGAGTCTT 31782339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2583 TCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCATATTTACTTATTTTTGAGATGGAGTCTT 2642

 31782340 GCTCTGTCGCCCAGGTTAGAGTGCAGTGGCGTGATCTGGGCTCACTGCAACCTCCACCTC 31782399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2643 GCTCTGTCGCCCAGGTTAGAGTGCAGTGGCGTGATCTGGGCTCACTGCAACCTCCACCTC 2702

 31782400 CTGGATTCAGGTGATTCTCCTGCCTCAGCATCTCAAGTAGCTGGGATTGCAGGCGCCCAC 31782459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2703 CTGGATTCAGGTGATTCTCCTGCCTCAGCATCTCAAGTAGCTGGGATTGCAGGCGCCCAC 2762

 31782460 CAGCACGCCTGGCTAATTTTTGTATCTTTAGTAGAGACAAGATTTTGCCGTGTTGGCCAG 31782519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2763 CAGCACGCCTGGCTAATTTTTGTATCTTTAGTAGAGACAAGATTTTGCCGTGTTGGCCAG 2822

 31782520 GCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAATGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGA 31782579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2823 GCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAATGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGA 2882

 31782580 TTACAGACATGAGCCACCGTGCCCTGCCTTAATTGTGTTTATTTGGATCTTCTCTCTTTC 31782639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2883 TTACAGACATGAGCCACCGTGCCCTGCCTTAATTGTGTTTATTTGGATCTTCTCTCTTTC 2942

 31782640 TTCATTAGTCCAGCTAGTGGCCTATCTTACTAATTTTTCAAAAAAAAAAAACAAACAAAC 31782699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2943 TTCATTAGTCCAGCTAGTGGCCTATCTTACTAATTTTTCAAAAAAAAAAAACAAACAAAC 3002

 31782700 AACCAACTCCTGGATTCATTGATCTTTTGAATGGCTTTTTGTGTCTTGATTTCCTTCAGT 31782759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3003 AACCAACTCCTGGATTCATTGATCTTTTGAATGGCTTTTTGTGTCTTGATTTCCTTCAGT 3062

 31782760 TCAGCTCTGATTTTGGTTATTTTTCTGCTAGCTTTGGGGTTGGTTTGCTCTTGCTTCTCT 31782819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3063 TCAGCTCTGATTTTGGTTATTTTTCTGCTAGCTTTGGGGTTGGTTTGCTCTTGCTTCTCT 3122

 31782820 AGTTCTTTTTTTTTTTTTGAGACAAAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGA 31782870
          |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3123 AGTTC--TTTTTTTTTTTGAGACAAAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGA 3171

Alignment time is 2.67816 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31766416,31790625] =>     24210 nucs '22 dna:chromosome chromosome:GRCh37:22:1:51304566:1'
Second seq [       1,    2119] =>      2119 nucs 'mol-32-3101-117285_2119'

Score:        2087
Aligned:      2120        nucs
Identic:      2117 (100%) nucs =>       940 (100%)      1177 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31775475,31776416] EXCISED REGION [31780626,31781803]
 second seq =>  [       1,     941] EXCISED REGION [     942,    2119]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      4209 nucs [31776417,31780625]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [31776417,31776419] to [31780626,31780628]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [31776417,31776417] to [31780625,31780625]
 second seq =>         0 nucs

 31775475 CTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACCATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCC 31775534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACCATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCC 60

 31775535 AGTTGAAATGATTCTTGTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATACAGGCGCAAGCCACG 31775594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGTTGAAATGATTCTTGTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATACAGGCGCAAGCCACG 120

 31775595 AGACCTGGCTAAGTTTTGTCTTTTTGGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGCCTG 31775654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGACCTGGCTAAGTTTTGTCTTTTTGGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGCCTG 180

 31775655 GTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTATCCGCCTCAGTCTCCCACAGTGCTAGGATTA 31775714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTATCCGCCTCAGTCTCCCACAGTGCTAGGATTA 240

 31775715 TAGGTGTGAGACACCGTTTCCGGCTTCTAATTTCTTTTATACTTATTAGTGTATTTACAT 31775774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TAGGTGTGAGACACCGTTTCCGGCTTCTAATTTCTTTTATACTTATTAGTGTATTTACAT 300

 31775775 CTTATCTCTCTTCTTGGGAAAATTGTAACATTTTATTTTATTTTTTATATGGAAGTCATT 31775834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTTATCTCTCTTCTTGGGAAAATTGTAACATTTTATTTTATTTTTTATATGGAAGTCATT 360

 31775835 ATTTCTCCTATATTTCCTTTTCTTTTCCTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTCGCCC 31775894
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
      361 ATTTCTCCTATATTTCCTTTTCTTTTCCTTTTTTTT-GAGACAGAGTCTCACTCTCGCCC 419

 31775895 AGGCTAGAGTGTGATGACGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGC 31775954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      420 AGGCTAGAGTGTGATGACGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGC 479

 31775955 GATTCTCATGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTCTGAGCCACCATGCCTGG 31776014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      480 GATTCTCATGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTCTGAGCCACCATGCCTGG 539

 31776015 CTAACTTTTGTATTTTTAGTACAGATGGGGTTTTGCCATGTTACCCAGGCTGGTCTCAAA 31776074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      540 CTAACTTTTGTATTTTTAGTACAGATGGGGTTTTGCCATGTTACCCAGGCTGGTCTCAAA 599

 31776075 CTCCTGGCCTCAAGCAATCCCCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTTCC 31776134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      600 CTCCTGGCCTCAAGCAATCCCCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTTCC 659

 31776135 GCTAGATTTTCTAAGTATTTGGCAGAGAGTTACATGTAATAGTCTTTTGTAATTCTTTTT 31776194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
      660 GCTAGATTTTCTAAGTATTTGGCAGAGAGTTACATGTAATAGCCTTTTGTAATTCTTTTT 719

 31776195 TTCTTTTTTTAAATAAGATCTTGCTCTGTTGTCCAGGCTGGAGTGCAGTGACGTGATGTC 31776254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      720 TTCTTTTTTTAAATAAGATCTTGCTCTGTTGTCCAGGCTGGAGTGCAGTGACGTGATGTC 779

 31776255 GGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCTGGGTTGAAGCGATTCTCATGCCTCAGCCTCCCGAGT 31776314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      780 GGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCTGGGTTGAAGCGATTCTCATGCCTCAGCCTCCCGAGT 839

 31776315 AGCTGGGACTACAGGCATGCACCACCACACCCAGCTAAGTTTTGTATTTTTAGTAGAGAC 31776374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 AGCTGGGACTACAGGCATGCACCACCACACCCAGCTAAGTTTTGTATTTTTAGTAGAGAC 899

 31776375 AGGGTTTCACCATGTTGCCCAGGCTTGTAATTCTTTTAATTT 31776416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 AGGGTTTCACCATGTTGCCCAGGCTTGTAATTCTTTTAATTT 941

EXCISED REGION

 31780626 GCTGTTGTTGGTATATAGGCATGCTAGTGATTTTTGTACATTGATTTTGTATCCTGAAAC 31780685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      942 GCTGTTGTTGGTATATAGGCATGCTAGTGATTTTTGTACATTGATTTTGTATCCTGAAAC 1001

 31780686 TGCTGAAGTTTATCAGCTGAAGAATCTTTTGTACAGGGACTATAGGGTTTTCTAGATGTA 31780745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1002 TGCTGAAGTTTATCAGCTGAAGAATCTTTTGTACAGGGACTATAGGGTTTTCTAGATGTA 1061

 31780746 GAATCATGTCTTCTGCAAAGAGAGATACTCTGACCTCCTGTCTTCCTATTTGGTTGCCCT 31780805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1062 GAATCATGTCTTCTGCAAAGAGAGATACTCTGACCTCCTGTCTTCCTATTTGGTTGCCCT 1121

 31780806 TTATTTCTTTCTCTTGCCTGACTGCTCTGACCAGGACTTCCAACCCTGTGTTGAATAGGA 31780865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1122 TTATTTCTTTCTCTTGCCTGACTGCTCTGACCAGGACTTCCAACCCTGTGTTGAATAGGA 1181

 31780866 GTGGTGAGAAAGGGCACCCGGGTCTTGTGCCAGTTTTCAAAGAGAATGCTTTCAGCTTTT 31780925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1182 GTGGTGAGAAAGGGCACCCGGGTCTTGTGCCAGTTTTCAAAGAGAATGCTTTCAGCTTTT 1241

 31780926 GCCCATTCAGTATGATGTTGGCTTTGGGTCTGTCACAGATAGCTGTTATTATTTTGAGGT 31780985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1242 GCCCATTCAGTATGATGTTGGCTTTGGGTCTGTCACAGATAGCTGTTATTATTTTGAGGT 1301

 31780986 ATGTTCCTTCAAAATCTAGTTTACTGACAGTTTTTAATACGAAGCGATGTTGAATTTTAT 31781045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1302 ATGTTCCTTCAAAATCTAGTTTACTGACAGTTTTTAATACGAAGCGATGTTGAATTTTAT 1361

 31781046 CGAAAGACTTTTCTGCATCTATTGAGATAATCATGTGGTTTTTGTCTTTAGTTCTGTTTA 31781105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1362 CGAAAGACTTTTCTGCATCTATTGAGATAATCATGTGGTTTTTGTCTTTAGTTCTGTTTA 1421

 31781106 TGTGATGAATCACTTTTATTGATTTGTGGATGTAAAACCAACCTTGCATCCCAGGAATAA 31781165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1422 TGTGATGAATCACTTTTATTGATTTGTGGATGTAAAACCAACCTTGCATCCCAGGAATAA 1481

 31781166 ACCCTATTTGATCGTGGTGGATTTGCTTTTTGATGTGCTGCTGGATTCAATTTGCAAGTA 31781225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1482 ACCCTATTTGATCGTGGTGGATTTGCTTTTTGATGTGCTGCTGGATTCAATTTGCAAGTA 1541

 31781226 TTTTGTTGAGGATTTCTGCATCGATGTTCATCAAGGATATTGGCTTGAAGTTTTCTATTT 31781285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1542 TTTTGTTGAGGATTTCTGCATCGATGTTCATCAAGGATATTGGCTTGAAGTTTTCTATTT 1601

 31781286 TGGGTGTGTCTCTGCCAGGTTTTAGTGTCAGGATGATGCCGGGCTCACAGAATGAGTTGG 31781345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1602 TGGGTGTGTCTCTGCCAGGTTTTAGTGTCAGGATGATGCCGGGCTCACAGAATGAGTTGG 1661

 31781346 GGAGGAGTCCCTCTGCCTCAATTTTTTGAAATAGTTTCAGAAGAAATAGTACTATCCCGT 31781405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1662 GGAGGAGTCCCTCTGCCTCAATTTTTTGAAATAGTTTCAGAAGAAATAGTACTATCCCGT 1721

 31781406 CTTTGTACATCTGGTGGAATTCGGCTGTGACTTCATCTGGTCCTGGGCTTTTCTTTGTTA 31781465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1722 CTTTGTACATCTGGTGGAATTCGGCTGTGACTTCATCTGGTCCTGGGCTTTTCTTTGTTA 1781

 31781466 GTAGGCTATTTATTACTGATTTCATTTTGGAGCTCATTATTGTTCTGTTCAGGGAATCTA 31781525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1782 GTAGGCTATTTATTACTGATTTCATTTTGGAGCTCATTATTGTTCTGTTCAGGGAATCTA 1841

 31781526 TTTCTTCTTGTTTCAGTTTTGGGAAGGTGTATGTGTCCAGGAATGTATCCATCTCTTCTA 31781585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1842 TTTCTTCTTGTTTCAGTTTTGGGAAGGTGTATGTGTCCAGGAATGTATCCATCTCTTCTA 1901

 31781586 GGTTTTTATTATTATTCTTTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGTGTGGGGTGC 31781645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1902 GGTTTTTATTATTATTCTTTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGTGTGGGGTGC 1961

 31781646 AGTGGCGCAATCTCGGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCTGAGTTTAAGCAATTCTCCTGAC 31781705
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     1962 AGTGGCGCAATCTCGGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCTGAGTTTAAGCAGTTCTCCTGAC 2021

 31781706 TCAGCCTCCCAAGTACCTGGGATTAAAGGCATGTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTA 31781765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2022 TCAGCCTCCCAAGTACCTGGGATTAAAGGCATGTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTA 2081

 31781766 TTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGC 31781803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2082 TTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGC 2119

Alignment time is 1.76606 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31766416,31790625] =>     24210 nucs '22 dna:chromosome chromosome:GRCh37:22:1:51304566:1'
Second seq [       1,    2062] =>      2062 nucs 'mol-32-3101-185310_2062'

Score:        2051
Aligned:      2062        nucs
Identic:      2061 (100%) nucs =>       937 (100%)      1124 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31775479,31776416] EXCISED REGION [31780626,31781749]
 second seq =>  [       1,     938] EXCISED REGION [     939,    2062]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      4209 nucs [31776417,31780625]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [31776417,31776419] to [31780626,31780628]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [31776417,31776417] to [31780625,31780625]
 second seq =>         0 nucs

 31775479 CGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACCATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCCAGTT 31775538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACCATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCCAGTT 60

 31775539 GAAATGATTCTTGTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATACAGGCGCAAGCCACGAGAC 31775598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAAATGATTCTTGTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATACAGGCGCAAGCCACGAGAC 120

 31775599 CTGGCTAAGTTTTGTCTTTTTGGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGCCTGGTCT 31775658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTGGCTAAGTTTTGTCTTTTTGGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGCCTGGTCT 180

 31775659 TGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTATCCGCCTCAGTCTCCCACAGTGCTAGGATTATAGG 31775718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTATCCGCCTCAGTCTCCCACAGTGCTAGGATTATAGG 240

 31775719 TGTGAGACACCGTTTCCGGCTTCTAATTTCTTTTATACTTATTAGTGTATTTACATCTTA 31775778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGTGAGACACCGTTTCCGGCTTCTAATTTCTTTTATACTTATTAGTGTATTTACATCTTA 300

 31775779 TCTCTCTTCTTGGGAAAATTGTAACATTTTATTTTATTTTTTATATGGAAGTCATTATTT 31775838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCTCTCTTCTTGGGAAAATTGTAACATTTTATTTTATTTTTTATATGGAAGTCATTATTT 360

 31775839 CTCCTATATTTCCTTTTCTTTTCCTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTCGCCCAGGC 31775898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTCCTATATTTCCTTTTCTTTTCCTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTCGCCCAGGC 420

 31775899 TAGAGTGTGATGACGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCGATT 31775958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TAGAGTGTGATGACGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCGATT 480

 31775959 CTCATGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTCTGAGCCACCATGCCTGGCTAA 31776018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTCATGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTCTGAGCCACCATGCCTGGCTAA 540

 31776019 CTTTTGTATTTTTAGTACAGATGGGGTTTTGCCATGTTACCCAGGCTGGTCTCAAACTCC 31776078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTTTTGTATTTTTAGTACAGATGGGGTTTTGCCATGTTACCCAGGCTGGTCTCAAACTCC 600

 31776079 TGGCCTCAAGCAATCCCCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTTCCGCTA 31776138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGGCCTCAAGCAATCCCCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTTCCGCTA 660

 31776139 GATTTTCTAAGTATTTGGCAGAGAGTTACATGTAATAGTCTTTTGTAATTCTTTTTTTCT 31776198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
      661 GATTTTCTAAGTATTTGGCAGAGAGTTACATGTAATAGCCTTTTGTAATTCTTTTTTTCT 720

 31776199 TTTTTTAAATAAGATCTTGCTCTGTTGTCCAGGCTGGAGTGCAGTGACGTGATGTCGGCT 31776258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTTTTTAAATAAGATCTTGCTCTGTTGTCCAGGCTGGAGTGCAGTGACGTGATGTCGGCT 780

 31776259 CACTGCAGCCTCTGCCTCCTGGGTTGAAGCGATTCTCATGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCT 31776318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CACTGCAGCCTCTGCCTCCTGGGTTGAAGCGATTCTCATGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCT 840

 31776319 GGGACTACAGGCATGCACCACCACACCCAGCTAAGTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGG 31776378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GGGACTACAGGCATGCACCACCACACCCAGCTAAGTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGG 900

 31776379 TTTCACCATGTTGCCCAGGCTTGTAATTCTTTTAATTT 31776416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTTCACCATGTTGCCCAGGCTTGTAATTCTTTTAATTT 938

EXCISED REGION

 31780626 GCTGTTGTTGGTATATAGGCATGCTAGTGATTTTTGTACATTGATTTTGTATCCTGAAAC 31780685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      939 GCTGTTGTTGGTATATAGGCATGCTAGTGATTTTTGTACATTGATTTTGTATCCTGAAAC 998

 31780686 TGCTGAAGTTTATCAGCTGAAGAATCTTTTGTACAGGGACTATAGGGTTTTCTAGATGTA 31780745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      999 TGCTGAAGTTTATCAGCTGAAGAATCTTTTGTACAGGGACTATAGGGTTTTCTAGATGTA 1058

 31780746 GAATCATGTCTTCTGCAAAGAGAGATACTCTGACCTCCTGTCTTCCTATTTGGTTGCCCT 31780805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1059 GAATCATGTCTTCTGCAAAGAGAGATACTCTGACCTCCTGTCTTCCTATTTGGTTGCCCT 1118

 31780806 TTATTTCTTTCTCTTGCCTGACTGCTCTGACCAGGACTTCCAACCCTGTGTTGAATAGGA 31780865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1119 TTATTTCTTTCTCTTGCCTGACTGCTCTGACCAGGACTTCCAACCCTGTGTTGAATAGGA 1178

 31780866 GTGGTGAGAAAGGGCACCCGGGTCTTGTGCCAGTTTTCAAAGAGAATGCTTTCAGCTTTT 31780925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1179 GTGGTGAGAAAGGGCACCCGGGTCTTGTGCCAGTTTTCAAAGAGAATGCTTTCAGCTTTT 1238

 31780926 GCCCATTCAGTATGATGTTGGCTTTGGGTCTGTCACAGATAGCTGTTATTATTTTGAGGT 31780985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1239 GCCCATTCAGTATGATGTTGGCTTTGGGTCTGTCACAGATAGCTGTTATTATTTTGAGGT 1298

 31780986 ATGTTCCTTCAAAATCTAGTTTACTGACAGTTTTTAATACGAAGCGATGTTGAATTTTAT 31781045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1299 ATGTTCCTTCAAAATCTAGTTTACTGACAGTTTTTAATACGAAGCGATGTTGAATTTTAT 1358

 31781046 CGAAAGACTTTTCTGCATCTATTGAGATAATCATGTGGTTTTTGTCTTTAGTTCTGTTTA 31781105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1359 CGAAAGACTTTTCTGCATCTATTGAGATAATCATGTGGTTTTTGTCTTTAGTTCTGTTTA 1418

 31781106 TGTGATGAATCACTTTTATTGATTTGTGGATGTAAAACCAACCTTGCATCCCAGGAATAA 31781165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1419 TGTGATGAATCACTTTTATTGATTTGTGGATGTAAAACCAACCTTGCATCCCAGGAATAA 1478

 31781166 ACCCTATTTGATCGTGGTGGATTTGCTTTTTGATGTGCTGCTGGATTCAATTTGCAAGTA 31781225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1479 ACCCTATTTGATCGTGGTGGATTTGCTTTTTGATGTGCTGCTGGATTCAATTTGCAAGTA 1538

 31781226 TTTTGTTGAGGATTTCTGCATCGATGTTCATCAAGGATATTGGCTTGAAGTTTTCTATTT 31781285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1539 TTTTGTTGAGGATTTCTGCATCGATGTTCATCAAGGATATTGGCTTGAAGTTTTCTATTT 1598

 31781286 TGGGTGTGTCTCTGCCAGGTTTTAGTGTCAGGATGATGCCGGGCTCACAGAATGAGTTGG 31781345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1599 TGGGTGTGTCTCTGCCAGGTTTTAGTGTCAGGATGATGCCGGGCTCACAGAATGAGTTGG 1658

 31781346 GGAGGAGTCCCTCTGCCTCAATTTTTTGAAATAGTTTCAGAAGAAATAGTACTATCCCGT 31781405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1659 GGAGGAGTCCCTCTGCCTCAATTTTTTGAAATAGTTTCAGAAGAAATAGTACTATCCCGT 1718

 31781406 CTTTGTACATCTGGTGGAATTCGGCTGTGACTTCATCTGGTCCTGGGCTTTTCTTTGTTA 31781465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1719 CTTTGTACATCTGGTGGAATTCGGCTGTGACTTCATCTGGTCCTGGGCTTTTCTTTGTTA 1778

 31781466 GTAGGCTATTTATTACTGATTTCATTTTGGAGCTCATTATTGTTCTGTTCAGGGAATCTA 31781525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1779 GTAGGCTATTTATTACTGATTTCATTTTGGAGCTCATTATTGTTCTGTTCAGGGAATCTA 1838

 31781526 TTTCTTCTTGTTTCAGTTTTGGGAAGGTGTATGTGTCCAGGAATGTATCCATCTCTTCTA 31781585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1839 TTTCTTCTTGTTTCAGTTTTGGGAAGGTGTATGTGTCCAGGAATGTATCCATCTCTTCTA 1898

 31781586 GGTTTTTATTATTATTCTTTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGTGTGGGGTGC 31781645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1899 GGTTTTTATTATTATTCTTTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGTGTGGGGTGC 1958

 31781646 AGTGGCGCAATCTCGGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCTGAGTTTAAGCAATTCTCCTGAC 31781705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1959 AGTGGCGCAATCTCGGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCTGAGTTTAAGCAATTCTCCTGAC 2018

 31781706 TCAGCCTCCCAAGTACCTGGGATTAAAGGCATGTGCCACCACGC 31781749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2019 TCAGCCTCCCAAGTACCTGGGATTAAAGGCATGTGCCACCACGC 2062

Alignment time is 1.77773 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31766416,31790625] =>     24210 nucs '22 dna:chromosome chromosome:GRCh37:22:1:51304566:1'
Second seq [       1,    4416] =>      4416 nucs 'mol-32-32f0-055967_4416'

Score:        4339
Aligned:      4418        nucs
Identic:      4410 (100%) nucs =>       134 (100%)      4276 (100%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31775172,31775305] EXCISED REGION [31775310,31779590]
 second seq =>  [       1,     134] EXCISED REGION [     135,    4416]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         4 nucs [31775306,31775309]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        35 nucs [31775306,31775340] to [31775310,31775344]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31775172 TGGTGGCATGCACCTGTAATCCCAGCTGCTCAGGAGGCTAAGGAGAATCGCTTGAACCCA 31775231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGGTGGCATGCACCTGTAATCCCAGCTGCTCAGGAGGCTAAGGAGAATCGCTTGAACCCA 60

 31775232 GGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGTCGAGATGGTGCCACTGCACTCCAGCCCGGGCAACAGAG 31775291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGTCGAGATGGTGCCACTGCACTCCAGCCCGGGCAACAGAG 120

 31775292 TGAGACTCCGTCTT 31775305
          ||||||||||||||
      121 TGAGACTCCGTCTT 134

EXCISED REGION

 31775310 AAACAAACAAACAAACAAACAAACAAACAAACAAAACAAGACTCAGCTGTAAAACCATCT 31775369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      135 AAACAAACAAACAAACAAACAAACAAACAAACAAAACAAGACTCAGCTGTAAAACCATCT 194

 31775370 AAGCCTGATGCCTTTTAAAATGAAGACTTACTTTTCTAATTTCTTTTATTTCTATTTTGT 31775429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      195 AAGCCTGATGCCTTTTAAAATGAAGACTTACTTTTCTAATTTCTTTTATTTCTATTTTGT 254

 31775430 TTTATTTATTTATCTATCTATCTATTTTTGAGATGGAGACTCGCTCTGTCGCCCAGGCTG 31775489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      255 TTTATTTATTTATCTATCTATCTATTTTTGAGATGGAGACTCGCTCTGTCGCCCAGGCTG 314

 31775490 GAGTGCAGTGGCACCATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCCAGTTGAAATGATTCT 31775549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      315 GAGTGCAGTGGCACCATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCCAGTTGAAATGATTCT 374

 31775550 TGTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATACAGGCGCAAGCCACGAGACCTGGCTAAGTT 31775609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      375 TGTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATACAGGCGCAAGCCACGAGACCTGGCTAAGTT 434

 31775610 TTGTCTTTTTGGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGCCTGGTCTTGAACTCCTGA 31775669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      435 TTGTCTTTTTGGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGCCTGGTCTTGAACTCCTGA 494

 31775670 CCTCAGGTGATCTATCCGCCTCAGTCTCCCACAGTGCTAGGATTATAGGTGTGAGACACC 31775729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      495 CCTCAGGTGATCTATCCGCCTCAGTCTCCCACAGTGCTAGGATTATAGGTGTGAGACACC 554

 31775730 GTTTCCGGCTTCTAATTTCTTTTATACTTATTAGTGTATTTACATCTTATCTCTCTTCTT 31775789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      555 GTTTCCGGCTTCTAATTTCTTTTATACTTATTAGTGTATTTACATCTTATCTCTCTTCTT 614

 31775790 GGGAAAATTGTAACATTTTATTTTATTTTTTATATGGAAGTCATTATTTCTCCTATATTT 31775849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      615 GGGAAAATTGTAACATTTTATTTTATTTTTTATATGGAAGTCATTATTTCTCCTATATTT 674

 31775850 CCTTTTCTTTTCCTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTCGCCCAGGCTAGAGTGTGAT 31775909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      675 CCTTTTCTTTTCCTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTCGCCCAGGCTAGAGTGTGAT 734

 31775910 GACGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCGATTCTCATGCCTCA 31775969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      735 GACGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCGATTCTCATGCCTCA 794

 31775970 GCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTCTGAGCCACCATGCCTGGCTAACTTTTGTATTT 31776029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      795 GCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTCTGAGCCACCATGCCTGGCTAACTTTTGTATTT 854

 31776030 TTAGTACAGATGGGGTTTTGCCATGTTACCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGC 31776089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      855 TTAGTACAGATGGGGTTTTGCCATGTTACCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGC 914

 31776090 AATCCCCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTTCCGCTAGATTTTCTAAG 31776149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      915 AATCCCCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTTCCGCTAGATTTTCTAAG 974

 31776150 TATTTGGCAGAGAGTTACATGTAATAGTCTTTTGTAATTCTTTTTTTCTTTTTTTAAATA 31776209
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
      975 TATTTGGCAGAGAGTTACATGTAATAGCCTTTTGTAATTCTTTTTTTCTTTTTTTAAATA 1034

 31776210 AGATCTTGCTCTGTTGTCCAGGCTGGAGTGCAGTGACGTGATGTCGGCTCACTGCAGCCT 31776269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1035 AGATCTTGCTCTGTTGTCCAGGCTGGAGTGCAGTGATGTGATGTCGGCTCACTGCAGCCT 1094

 31776270 CTGCCTCCTGGGTTGAAGCGATTCTCATGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGG 31776329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1095 CTGCCTCCTGGGTTGAAGCGATTCTCATGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGG 1154

 31776330 CATGCACCACCACACCCAGCTAAGTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGT 31776389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1155 CATGCACCACCACACCCAGCTAAGTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGT 1214

 31776390 TGCCCAGGCTTGTAATTCTTTTAATTTGCTATTATCAGTGGTTGTATGTCCTTTCTTACT 31776449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1215 TGCCCAGGCTTGTAATTCTTTTAATTTGCTATTATCAGTGGTTGTATGTCCTTTCTTACT 1274

 31776450 CAAGATTGCTATTTATTTATTTTATTTTATTTTTTGAGACGGAATCTCACTCTGTTGCCC 31776509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1275 CAAGATTGCTATTTATTTATTTTATTTTATTTTTTGAGACGGAATCTCACTCTGTTGCCC 1334

 31776510 AGACTGGAGTGCAGTGGCATGCGCCACCACACCCAGCTAATTTTTGTGTTTTTAGTAGAG 31776569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1335 AGACTGGAGTGCAGTGGCATGCGCCACCACACCCAGCTAATTTTTGTGTTTTTAGTAGAG 1394

 31776570 ACAGCATTTTGCCATATTGGCCAGGCTGGTCTCTAACTCCTGATCTCAAGTGATCTGCCC 31776629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1395 ACAGCATTTTGCCATATTGGCCAGGCTGGTCTCTAACTCCTGATCTCAAGTGATCTGCCC 1454

 31776630 ACCTTGGCCCCTCCAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCTGGCCTATTTTT 31776689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1455 ACCTTGGCCCCTCCAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCTGGCCTATTTTT 1514

 31776690 TCTTTCTATCCTTATTCAAGCATTTTGAGATATTTTTCCTTTCTGTTTTACTGATCCTTT 31776749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1515 TCTTTCTATCCTTATTCAAGCATTTTGAGATATTTTTCCTTTCTGTTTTACTGATCCTTT 1574

 31776750 CATCTTTTCAAGTTCTTCTTTCTTTCTTTCTTTC-TTTTTTTTTTTTAAGACAGGGTCTC 31776808
          |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
     1575 CATCTTTTCAAGTTCTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTAAGACAGGGTCTC 1634

 31776809 GCTCTATTGCCTAGGCTAGAGAATACTGGCATGATTATAGCTCACTGCAACCTCCTGGGC 31776868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1635 GCTCTATTGCCTAGGCTAGAGAATACTGGCATGATTATAGCTCACTGCAACCTCCTGGGC 1694

 31776869 TCAAGGTATCTTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCCAAGACTACAGGTGTGCACCACTAC 31776928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1695 TCAAGGTATCTTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCCAAGACTACAGGTGTGCACCACTAC 1754

 31776929 ATCAAGCTAAATTTTTTTTTTTTTACTTTTATTTTAGGTTCAGGAACAGCTGTGCAAGTT 31776988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1755 ATCAAGCTAAATTTTTTTTTTTTTACTTTTATTTTAGGTTCAGGAACAGCTGTGCAAGTT 1814

 31776989 TGTTATATAGGTAAGCTCGTGTTATGGGGGTTTATTGTACAGATTATTTCATCACTCAGG 31777048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1815 TGTTATATAGGTAAGCTCGTGTTATGGGGGTTTATTGTACAGATTATTTCATCACTCAGG 1874

 31777049 TACAAAGCCTGGTAACCAATAGTTATTTTTTCTGATCATTTCCTTTCTCCCGCCCTGCAC 31777108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1875 TACAAAGCCTGGTAACCAATAGTTATTTTTTCTGATCATTTCCTTTCTCCCGCCCTGCAC 1934

 31777109 CCTCAAGTAGGTCCCAGTGTCTGTTGTTCCCCTCTTTGTGTCCATGTGTTCTTATTGAGC 31777168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1935 CCTCAAGTAGGTCCCAGTGTCTGTTGTTCCCCTCTTTGTGTCCATGTGTTCTTATTGAGC 1994

 31777169 GCGCGCACACACACACACACACACACATTTATATGTACAAGCAATTGTCCTGCCTTAGCC 31777228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1995 GCGCGCACACACACACACACACACACATTTATATGTACAAGCAATTGTCCTGCCTTAGCC 2054

 31777229 TCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCACCACACCCAGCTAATATTTTTGTATGTTT 31777288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2055 TCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCACCACACCCAGCTAATATTTTTGTATGTTT 2114

 31777289 TTAGTAGAGACAAGGTTTCACCATGTTGGTCAGACTGGTCTCAAATTCTTGACCTCAGGT 31777348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2115 TTAGTAGAGACAAGGTTTCACCATGTTGGTCAGACTGGTCTCAAATTCTTGACCTCAGGT 2174

 31777349 GATCCACCTGCCTCAGCCTTCCAAAGTGCTGTGATTACAGGTGTGAGCCACCACGTCCAG 31777408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2175 GATCCACCTGCCTCAGCCTTCCAAAGTGCTGTGATTACAGGTGTGAGCCACCACGTCCAG 2234

 31777409 CTGAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACATATGGTATTTGTTTTTCTGTTCCTGTGTTAGTT 31777468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2235 CTGAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACATATGGTATTTGTTTTTCTGTTCCTGTGTTAGTT 2294

 31777469 TGCTAAGGATAATGGCCTCCAGTTTCATCCATGTTCCTGCAAAGGACATGATCTTCTTTT 31777528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2295 TGCTAAGGATAATGGCCTCCAGTTTCATCCATGTTCCTGCAAAGGACATGATCTTCTTTT 2354

 31777529 TTGTGGCTGCATAGTATTACATGGTGTATATGTACCACATTTTCTTTATCCAGTCTGTCA 31777588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2355 TTGTGGCTGCATAGTATTACATGGTGTATATGTACCACATTTTCTTTATCCAGTCTGTCA 2414

 31777589 TTGATGGGCATTTAGGTGATTCCACGTCTTTGCTATTGTGGATGGTGCTGTGATGAATAT 31777648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2415 TTGATGGGCATTTAGGTGATTCCACGTCTTTGCTATTGTGGATGGTGCTGTGATGAATAT 2474

 31777649 ATGCATGCATGTATCTTTATGGTGGAATGATATATATTCCTTTGGGTATCTACCCTGTAA 31777708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2475 ATGCATGCATGTATCTTTATGGTGGAATGATATATATTCCTTTGGGTATCTACCCTGTAA 2534

 31777709 TGGGATTGCTGGGTCAAATGGTAGTTCTGTTTGTAGCTCTTTCAGGAATCACCAGACTAC 31777768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2535 TGGGATTGCTGGGTCAAATGGTAGTTCTGTTTGTAGCTCTTTCAGGAATCACCAGACTAC 2594

 31777769 TTTCCATAGTGGTTGAACTAATTTACATTCCCACCAACAGTGCATAAGTGTTCCCTTTTC 31777828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2595 TTTCCATAGTGGTTGAACTAATTTACATTCCCACCAACAGTGCATAAGTGTTCCCTTTTC 2654

 31777829 TCCACAACCTCACCAGTATCTGTGGGGTTTTTTCACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAC 31777888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
     2655 TCCACAACCTCACCAGTATCTGTGGGGTTTTTTCACTTTTTTTTTTTTTTTTTTT-AGAC 2713

 31777889 AGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTTGGCTCACTGCAAGC 31777948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2714 AGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTTGGCTCACTGCAAGC 2773

 31777949 TCCGCCTTTTGGGTTCAAGTCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGTACTACAG 31778008
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     2774 TCCGCCTTTTGGGTTCAAGTCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGTACTACAG 2833

 31778009 GCGCCCGCCATGACGCCCAACTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACTGT 31778068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2834 GCGCCCGCCATGACGCCCAACTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACTGT 2893

 31778069 GTTAGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTTGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAG 31778128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2894 GTTAGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTTGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAG 2953

 31778129 TGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACGTCTGGCCCCCTTTTTTTTTTTTTAAGACAGA 31778188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2954 TGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACGTCTGGCCCCCTTTTTTTTTTTTTAAGACAGA 3013

 31778189 GTTTCGCTCTTGCTGTCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCAATCTCGGCTCACTGCAACCTC 31778248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3014 GTTTCGCTCTTGCTGTCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCAATCTCGGCTCACTGCAACCTC 3073

 31778249 TTCCTCCTGGGTTCAAGCGATTATCCTGCTTCAGCCTCCCAGAGTAGCTGGGATTACAGG 31778308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3074 TTCCTCCTGGGTTCAAGCGATTATCCTGCTTCAGCCTCCCAGAGTAGCTGGGATTACAGG 3133

 31778309 CAAGGGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAAAGACGGGGTTTCAACATGT 31778368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3134 CAAGGGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAAAGACGGGGTTTCAACATGT 3193

 31778369 TGGCCAGGCTGGTCTCGAACTTCTGACTTCAGGTGATCCACCTGCCTCGGCCTCCCAAAG 31778428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3194 TGGCCAGGCTGGTCTCGAACTTCTGACTTCAGGTGATCCACCTGCCTCGGCCTCCCAAAG 3253

 31778429 TGCTGGGATAACAGGCATGAGCACTGCACCTGGCCTTGACTTTTTATTAATAGCCATTCT 31778488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3254 TGCTGGGATAACAGGCATGAGCACTGCACCTGGCCTTGACTTTTTATTAATAGCCATTCT 3313

 31778489 GACTAGTATGAGGGAGTATCTCATTGTGGTTTTGATTTGCATTTCTCAAATGATCAGTGA 31778548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3314 GACTAGTATGAGGGAGTATCTCATTGTGGTTTTGATTTGCATTTCTCAAATGATCAGTGA 3373

 31778549 TATTGAGCCATTTTTCATATACTTGTTGGCCACATCTCTGTCTTCTTTTGAAAATTGTCG 31778608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3374 TATTGAGCCATTTTTCATATACTTGTTGGCCACATCTCTGTCTTCTTTTGAAAATTGTCG 3433

 31778609 GCACATGTCCTTTGCCCACTTTTTAACGGGGTTGGGTTTTTTCCCTTGTAAATTTGTTCA 31778668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3434 GCACATGTCCTTTGCCCACTTTTTAACGGGGTTGGGTTTTTTCCCTTGTAAATTTGTTCA 3493

 31778669 AGTTCCAGCCCAGCACTCAGTCTCAAAACTCAGTCTC--AAAAAAAAAAAAAAAAAAAGT 31778726
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||
     3494 AGTTCCAGCCCAGCACTCAGTCTCAAAACTCAGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGT 3553

 31778727 CTTCAATTTCCTTATACATGCTGGATATTAGACCTTTTTTTCAGATGCATAGCTTGCGAA 31778786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3554 CTTCAATTTCCTTATACATGCTGGATATTAGACCTTTTTTTCAGATGCATAGCTTGCGAA 3613

 31778787 TATTTTCTCTCATTCTGTAGGTTGTTCATTTACTGTGTTGATAGTTTCTTTTGCTGTGCA 31778846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3614 TATTTTCTCTCATTCTGTAGGTTGTTCATTTACTGTGTTGATAGTTTCTTTTGCTGTGCA 3673

 31778847 GAAGCTCTTTAGTTTAACTAGATCTTGTCAATTTTTGCTTTTGTTGTGATTGCTTTCAGT 31778906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3674 GAAGCTCTTTAGTTTAACTAGATCTTGTCAATTTTTGCTTTTGTTGTGATTGCTTTCAGT 3733

 31778907 GTCTTTGTCATGAAATCTTTGCCAGTTTCTACATCCCCAATGGTATTGCCTAGGTTGTCA 31778966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3734 GTCTTTGTCATGAAATCTTTGCCAGTTTCTACATCCCCAATGGTATTGCCTAGGTTGTCA 3793

 31778967 TCCAGGGTTGTTATACTTTTGGGTTTTACAATTAAGTCTTTATCCTGAGTTGATTTTTTT 31779026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
     3794 TCCAGGGTTGTTATACTTTTGGGTTTTACAATTAAGTCTTTATCCTGAGTTGA-TTTTTT 3852

 31779027 TTTTTTTTAAGATGGAGTTTCGCTCTTGTTGCCGTTGCTGGAGTGCAATGGCGCTATCTT 31779086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3853 TTTTTTTTAAGATGGAGTTTCGCTCTTGTTGCCGTTGCTGGAGTGCAATGGCGCTATCTT 3912

 31779087 GGCTCGCTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGT 31779146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3913 GGCTCGCTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGT 3972

 31779147 AGCTGGGATTACAAGTGTGTGCCACCATACCCAGCTCATTTTTGTACTTTTAGTAGAGAC 31779206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3973 AGCTGGGATTACAAGTGTGTGCCACCATACCCAGCTCATTTTTGTACTTTTAGTAGAGAC 4032

 31779207 AAGGTTTCACGATGTTGGTCAGGCTCGTCTTGAACTCCTGATCTCAGGTGATCCACCCGA 31779266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4033 AAGGTTTCACGATGTTGGTCAGGCTCGTCTTGAACTCCTGATCTCAGGTGATCCACCCGA 4092

 31779267 CTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCTCACCCGGCCCTGAGTTGG 31779326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4093 CTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCTCACCCGGCCCTGAGTTGG 4152

 31779327 TTTTTGCATATGGTGTAAGAAAAGGGTCCAGTTTCGGGGCCGGGCGCAGTGGCTTACGCC 31779386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4153 TTTTTGCATATGGTGTAAGAAAAGGGTCCAGTTTCGGGGCCGGGCGCAGTGGCTTACGCC 4212

 31779387 TGTAATTCCAGCACTTTGGGAGGCGGAGGCGGAGGCGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGAT 31779446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4213 TGTAATTCCAGCACTTTGGGAGGCGGAGGCGGAGGCGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGAT 4272

 31779447 CGAGACCATCCTACCTAACACGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAGTTAGC 31779506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4273 CGAGACCATCCTACCTAACACGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAGTTAGC 4332

 31779507 CGGGCGTGGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTGCTCAGGAGGCTGAAGCAGGAGAATGA 31779566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4333 CGGGCGTGGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTGCTCAGGAGGCTGAAGCAGGAGAATGA 4392

 31779567 CGTGAACTTAGAAGGCGGAGCTTG 31779590
          ||||||||||||||||||||||||
     4393 CGTGAACTTAGAAGGCGGAGCTTG 4416

Alignment time is 3.73021 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31766416,31790625] =>     24210 nucs '22 dna:chromosome chromosome:GRCh37:22:1:51304566:1'
Second seq [       1,    4780] =>      4780 nucs 'mol-32-3327-002343_4780'

Score:        4735
Aligned:      4787        nucs
Identic:      4779 (100%) nucs =>      1882 (100%)      2897 (100%)
Gaps:            7 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31774527,31776416] EXCISED REGION [31780626,31783522]
 second seq =>  [       1,    1883] EXCISED REGION [    1884,    4780]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      4209 nucs [31776417,31780625]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [31776417,31776419] to [31780626,31780628]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [31776417,31776417] to [31780625,31780625]
 second seq =>         0 nucs

 31774527 CTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGCGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTTGA 31774586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGCGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTTGA 60

 31774587 GACCAGCCTGGCCACATGGTGAAACCCCATCTCCACTAAAATAAAAAAAATAGCTGGGCA 31774646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GACCAGCCTGGCCACATGGTGAAACCCCATCTCCACTAAAATAAAAAAAATAGCTGGGCA 120

 31774647 TGGTGGCACACGCTTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGGAGGAGAATCTCTTGAA 31774706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGGTGGCACACGCTTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGGAGGAGAATCTCTTGAA 180

 31774707 CCTGTGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCATGCCACTGTACTCCAGCCTGGATGAC 31774766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCTGTGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCATGCCACTGTACTCCAGCCTGGATGAC 240

 31774767 AGAACGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAGATTGTTGGATGAGTTCATCATCACTGAAA 31774826
          ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGAACGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAA-GATTGTTGGATGAGTTCATCATCACTGAAA 299

 31774827 GTGGAAGTCTTACTTTCATTTTCATCATGTAAACATCTTTTCAGAAGTATAATTGACATA 31774886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      300 GTGGAAGTCTTACTTTCATTTTCATCATGTAAACATCTTTTCAGAAGTATAATTGACATA 359

 31774887 TAAGAAATTGTTCATACTTAAAGTGTACAATTTGATGAGTTTTGACTTACGTGTATACCC 31774946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      360 TAAGAAATTGTTCATACTTAAAGTGTACAATTTGATGAGTTTTGACTTACGTGTATACCC 419

 31774947 ATGGAACTATTAGCACAATGAAGAAATTAAGATAAGGCTCCACCTGTTCTTTACAATCGG 31775006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      420 ATGGAACTATTAGCACAATGAAGAAATTAAGATAAGGCTCCACCTGTTCTTTACAATCGG 479

 31775007 AGACAACTGGCTGCGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGC 31775066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      480 AGACAACTGGCTGCGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGC 539

 31775067 CGGGTGGATCACTTAAGGTCAGGAGTTCGAGGCCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTG 31775126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      540 CGGGTGGATCACTTAAGGTCAGGAGTTCGAGGCCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTG 599

 31775127 TCTCTACTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCATGCACCT 31775186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||
      600 TCTCTACTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA--TTAGCTGGGCGTGGTGGCATGCACCT 657

 31775187 GTAATCCCAGCTGCTCAGGAGGCTAAGGAGAATCGCTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGC 31775246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      658 GTAATCCCAGCTGCTCAGGAGGCTAAGGAGAATCGCTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGC 717

 31775247 AGTGAGTCGAGATGGTGCCACTGCACTCCAGCCCGGGCAACAGAGTGAGACTCCGTCTTA 31775306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      718 AGTGAGTCGAGATGGTGCCACTGCACTCCAGCCCGGGCAACAGAGTGAGACTCCGTCTTA 777

 31775307 AACAAACAAACAAACAAACAAACAAACAAACAAACAAAACAAGACTCAGCTGTAAAACCA 31775366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||
      778 AACAAACAAACAAACAAACAAACAAACAAACAAA----ACAAGACTCAGCTGTAAAACCA 833

 31775367 TCTAAGCCTGATGCCTTTTAAAATGAAGACTTACTTTTCTAATTTCTTTTATTTCTATTT 31775426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      834 TCTAAGCCTGATGCCTTTTAAAATGAAGACTTACTTTTCTAATTTCTTTTATTTCTATTT 893

 31775427 TGTTTTATTTATTTATCTATCTATCTATTTTTGAGATGGAGACTCGCTCTGTCGCCCAGG 31775486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      894 TGTTTTATTTATTTATCTATCTATCTATTTTTGAGATGGAGACTCGCTCTGTCGCCCAGG 953

 31775487 CTGGAGTGCAGTGGCACCATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCCAGTTGAAATGAT 31775546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      954 CTGGAGTGCAGTGGCACCATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCCAGTTGAAATGAT 1013

 31775547 TCTTGTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATACAGGCGCAAGCCACGAGACCTGGCTAA 31775606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1014 TCTTGTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATACAGGCGCAAGCCACGAGACCTGGCTAA 1073

 31775607 GTTTTGTCTTTTTGGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGCCTGGTCTTGAACTCC 31775666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1074 GTTTTGTCTTTTTGGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGCCTGGTCTTGAACTCC 1133

 31775667 TGACCTCAGGTGATCTATCCGCCTCAGTCTCCCACAGTGCTAGGATTATAGGTGTGAGAC 31775726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1134 TGACCTCAGGTGATCTATCCGCCTCAGTCTCCCACAGTGCTAGGATTATAGGTGTGAGAC 1193

 31775727 ACCGTTTCCGGCTTCTAATTTCTTTTATACTTATTAGTGTATTTACATCTTATCTCTCTT 31775786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1194 ACCGTTTCCGGCTTCTAATTTCTTTTATACTTATTAGTGTATTTACATCTTATCTCTCTT 1253

 31775787 CTTGGGAAAATTGTAACATTTTATTTTATTTTTTATATGGAAGTCATTATTTCTCCTATA 31775846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1254 CTTGGGAAAATTGTAACATTTTATTTTATTTTTTATATGGAAGTCATTATTTCTCCTATA 1313

 31775847 TTTCCTTTTCTTTTCCTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTCGCCCAGGCTAGAGTGT 31775906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1314 TTTCCTTTTCTTTTCCTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTCGCCCAGGCTAGAGTGT 1373

 31775907 GATGACGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCGATTCTCATGCC 31775966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1374 GATGACGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCGATTCTCATGCC 1433

 31775967 TCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTCTGAGCCACCATGCCTGGCTAACTTTTGTA 31776026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1434 TCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTCTGAGCCACCATGCCTGGCTAACTTTTGTA 1493

 31776027 TTTTTAGTACAGATGGGGTTTTGCCATGTTACCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCA 31776086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1494 TTTTTAGTACAGATGGGGTTTTGCCATGTTACCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCA 1553

 31776087 AGCAATCCCCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTTCCGCTAGATTTTCT 31776146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1554 AGCAATCCCCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTTCCGCTAGATTTTCT 1613

 31776147 AAGTATTTGGCAGAGAGTTACATGTAATAGTCTTTTGTAATTCTTTTTTTCTTTTTTTAA 31776206
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     1614 AAGTATTTGGCAGAGAGTTACATGTAATAGCCTTTTGTAATTCTTTTTTTCTTTTTTTAA 1673

 31776207 ATAAGATCTTGCTCTGTTGTCCAGGCTGGAGTGCAGTGACGTGATGTCGGCTCACTGCAG 31776266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1674 ATAAGATCTTGCTCTGTTGTCCAGGCTGGAGTGCAGTGACGTGATGTCGGCTCACTGCAG 1733

 31776267 CCTCTGCCTCCTGGGTTGAAGCGATTCTCATGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTAC 31776326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1734 CCTCTGCCTCCTGGGTTGAAGCGATTCTCATGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTAC 1793

 31776327 AGGCATGCACCACCACACCCAGCTAAGTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCA 31776386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1794 AGGCATGCACCACCACACCCAGCTAAGTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCA 1853

 31776387 TGTTGCCCAGGCTTGTAATTCTTTTAATTT 31776416
          ||||||||||||||||||||||||||||||
     1854 TGTTGCCCAGGCTTGTAATTCTTTTAATTT 1883

EXCISED REGION

 31780626 GCTGTTGTTGGTATATAGGCATGCTAGTGATTTTTGTACATTGATTTTGTATCCTGAAAC 31780685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1884 GCTGTTGTTGGTATATAGGCATGCTAGTGATTTTTGTACATTGATTTTGTATCCTGAAAC 1943

 31780686 TGCTGAAGTTTATCAGCTGAAGAATCTTTTGTACAGGGACTATAGGGTTTTCTAGATGTA 31780745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1944 TGCTGAAGTTTATCAGCTGAAGAATCTTTTGTACAGGGACTATAGGGTTTTCTAGATGTA 2003

 31780746 GAATCATGTCTTCTGCAAAGAGAGATACTCTGACCTCCTGTCTTCCTATTTGGTTGCCCT 31780805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2004 GAATCATGTCTTCTGCAAAGAGAGATACTCTGACCTCCTGTCTTCCTATTTGGTTGCCCT 2063

 31780806 TTATTTCTTTCTCTTGCCTGACTGCTCTGACCAGGACTTCCAACCCTGTGTTGAATAGGA 31780865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2064 TTATTTCTTTCTCTTGCCTGACTGCTCTGACCAGGACTTCCAACCCTGTGTTGAATAGGA 2123

 31780866 GTGGTGAGAAAGGGCACCCGGGTCTTGTGCCAGTTTTCAAAGAGAATGCTTTCAGCTTTT 31780925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2124 GTGGTGAGAAAGGGCACCCGGGTCTTGTGCCAGTTTTCAAAGAGAATGCTTTCAGCTTTT 2183

 31780926 GCCCATTCAGTATGATGTTGGCTTTGGGTCTGTCACAGATAGCTGTTATTATTTTGAGGT 31780985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2184 GCCCATTCAGTATGATGTTGGCTTTGGGTCTGTCACAGATAGCTGTTATTATTTTGAGGT 2243

 31780986 ATGTTCCTTCAAAATCTAGTTTACTGACAGTTTTTAATACGAAGCGATGTTGAATTTTAT 31781045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2244 ATGTTCCTTCAAAATCTAGTTTACTGACAGTTTTTAATACGAAGCGATGTTGAATTTTAT 2303

 31781046 CGAAAGACTTTTCTGCATCTATTGAGATAATCATGTGGTTTTTGTCTTTAGTTCTGTTTA 31781105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2304 CGAAAGACTTTTCTGCATCTATTGAGATAATCATGTGGTTTTTGTCTTTAGTTCTGTTTA 2363

 31781106 TGTGATGAATCACTTTTATTGATTTGTGGATGTAAAACCAACCTTGCATCCCAGGAATAA 31781165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2364 TGTGATGAATCACTTTTATTGATTTGTGGATGTAAAACCAACCTTGCATCCCAGGAATAA 2423

 31781166 ACCCTATTTGATCGTGGTGGATTTGCTTTTTGATGTGCTGCTGGATTCAATTTGCAAGTA 31781225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2424 ACCCTATTTGATCGTGGTGGATTTGCTTTTTGATGTGCTGCTGGATTCAATTTGCAAGTA 2483

 31781226 TTTTGTTGAGGATTTCTGCATCGATGTTCATCAAGGATATTGGCTTGAAGTTTTCTATTT 31781285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2484 TTTTGTTGAGGATTTCTGCATCGATGTTCATCAAGGATATTGGCTTGAAGTTTTCTATTT 2543

 31781286 TGGGTGTGTCTCTGCCAGGTTTTAGTGTCAGGATGATGCCGGGCTCACAGAATGAGTTGG 31781345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2544 TGGGTGTGTCTCTGCCAGGTTTTAGTGTCAGGATGATGCCGGGCTCACAGAATGAGTTGG 2603

 31781346 GGAGGAGTCCCTCTGCCTCAATTTTTTGAAATAGTTTCAGAAGAAATAGTACTATCCCGT 31781405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2604 GGAGGAGTCCCTCTGCCTCAATTTTTTGAAATAGTTTCAGAAGAAATAGTACTATCCCGT 2663

 31781406 CTTTGTACATCTGGTGGAATTCGGCTGTGACTTCATCTGGTCCTGGGCTTTTCTTTGTTA 31781465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2664 CTTTGTACATCTGGTGGAATTCGGCTGTGACTTCATCTGGTCCTGGGCTTTTCTTTGTTA 2723

 31781466 GTAGGCTATTTATTACTGATTTCATTTTGGAGCTCATTATTGTTCTGTTCAGGGAATCTA 31781525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2724 GTAGGCTATTTATTACTGATTTCATTTTGGAGCTCATTATTGTTCTGTTCAGGGAATCTA 2783

 31781526 TTTCTTCTTGTTTCAGTTTTGGGAAGGTGTATGTGTCCAGGAATGTATCCATCTCTTCTA 31781585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2784 TTTCTTCTTGTTTCAGTTTTGGGAAGGTGTATGTGTCCAGGAATGTATCCATCTCTTCTA 2843

 31781586 GGTTTTTATTATTATTCTTTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGTGTGGGGTGC 31781645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2844 GGTTTTTATTATTATTCTTTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGTGTGGGGTGC 2903

 31781646 AGTGGCGCAATCTCGGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCTGAGTTTAAGCAATTCTCCTGAC 31781705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2904 AGTGGCGCAATCTCGGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCTGAGTTTAAGCAATTCTCCTGAC 2963

 31781706 TCAGCCTCCCAAGTACCTGGGATTAAAGGCATGTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTA 31781765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2964 TCAGCCTCCCAAGTACCTGGGATTAAAGGCATGTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTA 3023

 31781766 TTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGTTCTTGAACTCCTGACCTCA 31781825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3024 TTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGTTCTTGAACTCCTGACCTCA 3083

 31781826 GGTGATCTGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGTATGAGCCACTGTGCC 31781885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3084 GGTGATCTGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGTATGAGCCACTGTGCC 3143

 31781886 TGGCCGCTTCTAGGTTTCCTAGTTTGTGTGCATAGAGGTGTTCATAGTAGCCTGCGATGG 31781945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3144 TGGCCGCTTCTAGGTTTCCTAGTTTGTGTGCATAGAGGTGTTCATAGTAGCCTGCGATGG 3203

 31781946 TTATTTTTATTTCTGTGGGGTCACTGGTAACATCCCCTTTGTCATTTCTAACTATGTTTA 31782005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3204 TTATTTTTATTTCTGTGGGGTCACTGGTAACATCCCCTTTGTCATTTCTAACTATGTTTA 3263

 31782006 TTTATTTTTTGTTTATTTATTTATTTATTTATTTTTTGAGATGGAGTCTCGTTCTGTTGT 31782065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3264 TTTATTTTTTGTTTATTTATTTATTTATTTATTTTTTGAGATGGAGTCTCGTTCTGTTGT 3323

 31782066 TCCGATTGTAGTGAAGTGGCACCATTTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCTCAGGTTCAA 31782125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3324 TCCGATTGTAGTGAAGTGGCACCATTTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCTCAGGTTCAA 3383

 31782126 GAGATTCTCGTGGCTCCGCCTACCAAGTAGCAGGGATTATAGGCATATGTCACCATGCCC 31782185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3384 GAGATTCTCGTGGCTCCGCCTACCAAGTAGCAGGGATTATAGGCATATGTCACCATGCCC 3443

 31782186 GGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGATTTTACCATGTTGGCCAGACTGGTCTCG 31782245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3444 GGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGATTTTACCATGTTGGCCAGACTGGTCTCG 3503

 31782246 AACTCCTGACCTCAAGTGATCACCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCAT 31782305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3504 AACTCCTGACCTCAAGTGATCACCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCAT 3563

 31782306 GAGCCATATTTACTTATTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGTTAGAGTGCAG 31782365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3564 GAGCCATATTTACTTATTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGTTAGAGTGCAG 3623

 31782366 TGGCGTGATCTGGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCTGGATTCAGGTGATTCTCCTGCCTC 31782425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3624 TGGCGTGATCTGGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCTGGATTCAGGTGATTCTCCTGCCTC 3683

 31782426 AGCATCTCAAGTAGCTGGGATTGCAGGCGCCCACCAGCACGCCTGGCTAATTTTTGTATC 31782485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3684 AGCATCTCAAGTAGCTGGGATTGCAGGCGCCCACCAGCACGCCTGGCTAATTTTTGTATC 3743

 31782486 TTTAGTAGAGACAAGATTTTGCCGTGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAAT 31782545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3744 TTTAGTAGAGACAAGATTTTGCCGTGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAAT 3803

 31782546 GATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACATGAGCCACCGTGCCCTG 31782605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3804 GATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACATGAGCCACCGTGCCCTG 3863

 31782606 CCTTAATTGTGTTTATTTGGATCTTCTCTCTTTCTTCATTAGTCCAGCTAGTGGCCTATC 31782665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3864 CCTTAATTGTGTTTATTTGGATCTTCTCTCTTTCTTCATTAGTCCAGCTAGTGGCCTATC 3923

 31782666 TTACTAATTTTTCAAAAAAAAAAAACAAACAAACAACCAACTCCTGGATTCATTGATCTT 31782725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3924 TTACTAATTTTTCAAAAAAAAAAAACAAACAAACAACCAACTCCTGGATTCATTGATCTT 3983

 31782726 TTGAATGGCTTTTTGTGTCTTGATTTCCTTCAGTTCAGCTCTGATTTTGGTTATTTTTCT 31782785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3984 TTGAATGGCTTTTTGTGTCTTGATTTCCTTCAGTTCAGCTCTGATTTTGGTTATTTTTCT 4043

 31782786 GCTAGCTTTGGGGTTGGTTTGCTCTTGCTTCTCTAGTTCTTTTTTTTTTTTTGAGACAAA 31782845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4044 GCTAGCTTTGGGGTTGGTTTGCTCTTGCTTCTCTAGTTCTTTTTTTTTTTTTGAGACAAA 4103

 31782846 GTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGGTCACTGCAACCTCC 31782905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4104 GTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGGTCACTGCAACCTCC 4163

 31782906 GCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTG 31782965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4164 GCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTG 4223

 31782966 CCGGCCACCACACCCAGCTAACTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATATTG 31783025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4224 CCGGCCACCACACCCAGCTAACTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATATTG 4283

 31783026 ACCAGGCTGGTGTCAAACTCCTAACCTTGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCT 31783085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4284 ACCAGGCTGGTGTCAAACTCCTAACCTTGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCT 4343

 31783086 GGGATTACAGGCATGAGCCACTGAGCCTAGCCTCTAGTTCTTTTTTTTTGAGATGGAGTC 31783145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4344 GGGATTACAGGCATGAGCCACTGAGCCTAGCCTCTAGTTCTTTTTTTTTGAGATGGAGTC 4403

 31783146 TCATCCTGTTGCCCAGACAGGAATGCAGTGATGCAGTCTCGGCTCTCTGCAACCTCAGCC 31783205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4404 TCATCCTGTTGCCCAGACAGGAATGCAGTGATGCAGTCTCGGCTCTCTGCAACCTCAGCC 4463

 31783206 TCCCAGGTTCAAGCGATTCCCCTGCCTCCACCTCCCAAGTAGCTGAGATTACAGGCGCAT 31783265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4464 TCCCAGGTTCAAGCGATTCCCCTGCCTCCACCTCCCAAGTAGCTGAGATTACAGGCGCAT 4523

 31783266 GTTACCACACCCAGCTAATTTTTATATTTTTAGTAGAGATGAGGCTTCACCATGTTGGCC 31783325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4524 GTTACCACACCCAGCTAATTTTTATATTTTTAGTAGAGATGAGGCTTCACCATGTTGGCC 4583

 31783326 ATGCTGGTCTCGACCTCCTGACCTCAAGTGATCCACCTGCCTCGGCCTCCCACAGTGCTG 31783385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4584 ATGCTGGTCTCGACCTCCTGACCTCAAGTGATCCACCTGCCTCGGCCTCCCACAGTGCTG 4643

 31783386 AGATTACAGGCATGAGCCATTGTGCCCGGCCTCTTCTCTAGTTTCTTTTAGTTATGATAT 31783445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4644 AGATTACAGGCATGAGCCATTGTGCCCGGCCTCTTCTCTAGTTTCTTTTAGTTATGATAT 4703

 31783446 TAGGCTGAATATATATGACCCAACACAGCAGCACCCAGATTCATAAAGCAAGTTATTAGC 31783505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4704 TAGGCTGAATATATATGACCCAACACAGCAGCACCCAGATTCATAAAGCAAGTTATTAGC 4763

 31783506 GCTCTTCAAAGAGACTT 31783522
          |||||||||||||||||
     4764 GCTCTTCAAAGAGACTT 4780

Alignment time is 4.07258 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31766416,31790625] =>     24210 nucs '22 dna:chromosome chromosome:GRCh37:22:1:51304566:1'
Second seq [       1,    3303] =>      3303 nucs 'mol-32-3395-113734_3303'

Score:        3245
Aligned:      3293        nucs
Identic:      3287 (100%) nucs =>       713 (100%)      2574 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31774593,31775305] EXCISED REGION [31775310,31777885]
 second seq =>  [       1,     716] EXCISED REGION [     717,    3293]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         4 nucs [31775306,31775309]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        35 nucs [31775306,31775340] to [31775310,31775344]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31774593 CCTGGCCACATGGTGAAACCCCATCTCCACTAAAATAAAAAAAATAGCTGGGCATGGTGG 31774652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCTGGCCACATGGTGAAACCCCATCTCCACTAAAATAAAAAAAATAGCTGGGCATGGTGG 60

 31774653 CACACGCTTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGGAGGAGAATCTCTTGAACCTGTG 31774712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CACACGCTTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGGAGGAGAATCTCTTGAACCTGTG 120

 31774713 AGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCATGCCACTGTACTCCAGCCTGGATGACAGAACG 31774772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCATGCCACTGTACTCCAGCCTGGATGACAGAACG 180

 31774773 AGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAGATTGTTGGATGAGTTCATCATCACTGAAAGTGGAA 31774832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAGATTGTTGGATGAGTTCATCATCACTGAAAGTGGAA 240

 31774833 GTCTTACTTTCATTTTCATCATGTAAACATCTTTTCAGAAGTATAATTGACATATAAGAA 31774892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTCTTACTTTCATTTTCATCATGTAAACATCTTTTCAGAAGTATAATTGACATATAAGAA 300

 31774893 ATTGTTCATACTTAAAGTGTACAATTTGATGAGTTTTGACTTACGTGTATACCCATGGAA 31774952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATTGTTCATACTTAAAGTGTACAATTTGATGAGTTTTGACTTACGTGTATACCCATGGAA 360

 31774953 CTATTAGCACAATGAAGAAATTAAGATAAGGCTCCACCTGTTCTTTACAATCGGAGACAA 31775012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTATTAGCACAATGAAGAAATTAAGATAAGGCTCCACCTGTTCTTTACAATCGGAGACAA 420

 31775013 CTGGCTGCGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGCCGGGTG 31775072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTGGCTGCGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGCCGGGTG 480

 31775073 GATCACTTAAGGTCAGGAGTTCGAGGCCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTA 31775132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GATCACTTAAGGTCAGGAGTTCGAGGCCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTA 540

 31775133 CTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA---TTAGCTGGGCGTGGTGGCATGCACCTGTA 31775189
          ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCATGCACCTGTA 600

 31775190 ATCCCAGCTGCTCAGGAGGCTAAGGAGAATCGCTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGT 31775249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATCCCAGCTGCTCAGGAGGCTAAGGAGAATCGCTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGT 660

 31775250 GAGTCGAGATGGTGCCACTGCACTCCAGCCCGGGCAACAGAGTGAGACTCCGTCTT 31775305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GAGTCGAGATGGTGCCACTGCACTCCAGCCCGGGCAACAGAGTGAGACTCCGTCTT 716

EXCISED REGION

 31775310 AAACAAACAAACAAACAAACAAACAAACAAACAAAACAAGACTCAGCTGTAAAACCATCT 31775369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      717 AAACAAACAAACAAACAAACAAACAAACAAACAAAACAAGACTCAGCTGTAAAACCATCT 776

 31775370 AAGCCTGATGCCTTTTAAAATGAAGACTTACTTTTCTAATTTCTTTTATTTCTATTTTGT 31775429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      777 AAGCCTGATGCCTTTTAAAATGAAGACTTACTTTTCTAATTTCTTTTATTTCTATTTTGT 836

 31775430 TTTATTTATTTATCTATCTATCTATTTTTGAGATGGAGACTCGCTCTGTCGCCCAGGCTG 31775489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      837 TTTATTTATTTATCTATCTATCTATTTTTGAGATGGAGACTCGCTCTGTCGCCCAGGCTG 896

 31775490 GAGTGCAGTGGCACCATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCCAGTTGAAATGATTCT 31775549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      897 GAGTGCAGTGGCACCATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCCAGTTGAAATGATTCT 956

 31775550 TGTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATACAGGCGCAAGCCACGAGACCTGGCTAAGTT 31775609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      957 TGTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATACAGGCGCAAGCCACGAGACCTGGCTAAGTT 1016

 31775610 TTGTCTTTTTGGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGCCTGGTCTTGAACTCCTGA 31775669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1017 TTGTCTTTTTGGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGCCTGGTCTTGAACTCCTGA 1076

 31775670 CCTCAGGTGATCTATCCGCCTCAGTCTCCCACAGTGCTAGGATTATAGGTGTGAGACACC 31775729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1077 CCTCAGGTGATCTATCCGCCTCAGTCTCCCACAGTGCTAGGATTATAGGTGTGAGACACC 1136

 31775730 GTTTCCGGCTTCTAATTTCTTTTATACTTATTAGTGTATTTACATCTTATCTCTCTTCTT 31775789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1137 GTTTCCGGCTTCTAATTTCTTTTATACTTATTAGTGTATTTACATCTTATCTCTCTTCTT 1196

 31775790 GGGAAAATTGTAACATTTTATTTTATTTTTTATATGGAAGTCATTATTTCTCCTATATTT 31775849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1197 GGGAAAATTGTAACATTTTATTTTATTTTTTATATGGAAGTCATTATTTCTCCTATATTT 1256

 31775850 CCTTTTCTTTTCCTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTCGCCCAGGCTAGAGTGTGAT 31775909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1257 CCTTTTCTTTTCCTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTCGCCCAGGCTAGAGTGTGAT 1316

 31775910 GACGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCGATTCTCATGCCTCA 31775969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1317 GACGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCGATTCTCATGCCTCA 1376

 31775970 GCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTCTGAGCCACCATGCCTGGCTAACTTTTGTATTT 31776029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1377 GCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTCTGAGCCACCATGCCTGGCTAACTTTTGTATTT 1436

 31776030 TTAGTACAGATGGGGTTTTGCCATGTTACCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGC 31776089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1437 TTAGTACAGATGGGGTTTTGCCATGTTACCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGC 1496

 31776090 AATCCCCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTTCCGCTAGATTTTCTAAG 31776149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1497 AATCCCCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTTCCGCTAGATTTTCTAAG 1556

 31776150 TATTTGGCAGAGAGTTACATGTAATAGTCTTTTGTAATTCTTTTTTTCTTTTTTTAAATA 31776209
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     1557 TATTTGGCAGAGAGTTACATGTAATAGCCTTTTGTAATTCTTTTTTTCTTTTTTTAAATA 1616

 31776210 AGATCTTGCTCTGTTGTCCAGGCTGGAGTGCAGTGACGTGATGTCGGCTCACTGCAGCCT 31776269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1617 AGATCTTGCTCTGTTGTCCAGGCTGGAGTGCAGTGATGTGATGTCGGCTCACTGCAGCCT 1676

 31776270 CTGCCTCCTGGGTTGAAGCGATTCTCATGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGG 31776329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1677 CTGCCTCCTGGGTTGAAGCGATTCTCATGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGG 1736

 31776330 CATGCACCACCACACCCAGCTAAGTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGT 31776389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1737 CATGCACCACCACACCCAGCTAAGTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGT 1796

 31776390 TGCCCAGGCTTGTAATTCTTTTAATTTGCTATTATCAGTGGTTGTATGTCCTTTCTTACT 31776449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1797 TGCCCAGGCTTGTAATTCTTTTAATTTGCTATTATCAGTGGTTGTATGTCCTTTCTTACT 1856

 31776450 CAAGATTGCTATTTATTTATTTTATTTTATTTTTTGAGACGGAATCTCACTCTGTTGCCC 31776509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1857 CAAGATTGCTATTTATTTATTTTATTTTATTTTTTGAGACGGAATCTCACTCTGTTGCCC 1916

 31776510 AGACTGGAGTGCAGTGGCATGCGCCACCACACCCAGCTAATTTTTGTGTTTTTAGTAGAG 31776569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1917 AGACTGGAGTGCAGTGGCATGCGCCACCACACCCAGCTAATTTTTGTGTTTTTAGTAGAG 1976

 31776570 ACAGCATTTTGCCATATTGGCCAGGCTGGTCTCTAACTCCTGATCTCAAGTGATCTGCCC 31776629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1977 ACAGCATTTTGCCATATTGGCCAGGCTGGTCTCTAACTCCTGATCTCAAGTGATCTGCCC 2036

 31776630 ACCTTGGCCCCTCCAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCTGGCCTATTTTT 31776689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2037 ACCTTGGCCCCTCCAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCTGGCCTATTTTT 2096

 31776690 TCTTTCTATCCTTATTCAAGCATTTTGAGATATTTTTCCTTTCTGTTTTACTGATCCTTT 31776749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2097 TCTTTCTATCCTTATTCAAGCATTTTGAGATATTTTTCCTTTCTGTTTTACTGATCCTTT 2156

 31776750 CATCTTTTCAAGTTCTTCTTTCTTTCTTTCTTTC-TTTTTTTTTTTTAAGACAGGGTCTC 31776808
          |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
     2157 CATCTTTTCAAGTTCTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTAAGACAGGGTCTC 2216

 31776809 GCTCTATTGCCTAGGCTAGAGAATACTGGCATGATTATAGCTCACTGCAACCTCCTGGGC 31776868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2217 GCTCTATTGCCTAGGCTAGAGAATACTGGCATGATTATAGCTCACTGCAACCTCCTGGGC 2276

 31776869 TCAAGGTATCTTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCCAAGACTACAGGTGTGCACCACTAC 31776928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2277 TCAAGGTATCTTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCCAAGACTACAGGTGTGCACCACTAC 2336

 31776929 ATCAAGCTAAATTTTTTTTTTTTTACTTTTATTTTAGGTTCAGGAACAGCTGTGCAAGTT 31776988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2337 ATCAAGCTAAATTTTTTTTTTTTTACTTTTATTTTAGGTTCAGGAACAGCTGTGCAAGTT 2396

 31776989 TGTTATATAGGTAAGCTCGTGTTATGGGGGTTTATTGTACAGATTATTTCATCACTCAGG 31777048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2397 TGTTATATAGGTAAGCTCGTGTTATGGGGGTTTATTGTACAGATTATTTCATCACTCAGG 2456

 31777049 TACAAAGCCTGGTAACCAATAGTTATTTTTTCTGATCATTTCCTTTCTCCCGCCCTGCAC 31777108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2457 TACAAAGCCTGGTAACCAATAGTTATTTTTTCTGATCATTTCCTTTCTCCCGCCCTGCAC 2516

 31777109 CCTCAAGTAGGTCCCAGTGTCTGTTGTTCCCCTCTTTGTGTCCATGTGTTCTTATTGAGC 31777168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2517 CCTCAAGTAGGTCCCAGTGTCTGTTGTTCCCCTCTTTGTGTCCATGTGTTCTTATTGAGC 2576

 31777169 GCGCGCACACACACACACACACACACATTTATATGTACAAGCAATTGTCCTGCCTTAGCC 31777228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2577 GCGCGCACACACACACACACACACACATTTATATGTACAAGCAATTGTCCTGCCTTAGCC 2636

 31777229 TCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCACCACACCCAGCTAATATTTTTGTATGTTT 31777288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2637 TCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCACCACACCCAGCTAATATTTTTGTATGTTT 2696

 31777289 TTAGTAGAGACAAGGTTTCACCATGTTGGTCAGACTGGTCTCAAATTCTTGACCTCAGGT 31777348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2697 TTAGTAGAGACAAGGTTTCACCATGTTGGTCAGACTGGTCTCAAATTCTTGACCTCAGGT 2756

 31777349 GATCCACCTGCCTCAGCCTTCCAAAGTGCTGTGATTACAGGTGTGAGCCACCACGTCCAG 31777408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2757 GATCCACCTGCCTCAGCCTTCCAAAGTGCTGTGATTACAGGTGTGAGCCACCACGTCCAG 2816

 31777409 CTGAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACATATGGTATTTGTTTTTCTGTTCCTGTGTTAGTT 31777468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2817 CTGAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACATATGGTATTTGTTTTTCTGTTCCTGTGTTAGTT 2876

 31777469 TGCTAAGGATAATGGCCTCCAGTTTCATCCATGTTCCTGCAAAGGACATGATCTTCTTTT 31777528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2877 TGCTAAGGATAATGGCCTCCAGTTTCATCCATGTTCCTGCAAAGGACATGATCTTCTTTT 2936

 31777529 TTGTGGCTGCATAGTATTACATGGTGTATATGTACCACATTTTCTTTATCCAGTCTGTCA 31777588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2937 TTGTGGCTGCATAGTATTACATGGTGTATATGTACCACATTTTCTTTATCCAGTCTGTCA 2996

 31777589 TTGATGGGCATTTAGGTGATTCCACGTCTTTGCTATTGTGGATGGTGCTGTGATGAATAT 31777648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2997 TTGATGGGCATTTAGGTGATTCCACGTCTTTGCTATTGTGGATGGTGCTGTGATGAATAT 3056

 31777649 ATGCATGCATGTATCTTTATGGTGGAATGATATATATTCCTTTGGGTATCTACCCTGTAA 31777708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3057 ATGCATGCATGTATCTTTATGGTGGAATGATATATATTCCTTTGGGTATCTACCCTGTAA 3116

 31777709 TGGGATTGCTGGGTCAAATGGTAGTTCTGTTTGTAGCTCTTTCAGGAATCACCAGACTAC 31777768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3117 TGGGATTGCTGGGTCAAATGGTAGTTCTGTTTGTAGCTCTTTCAGGAATCACCAGACTAC 3176

 31777769 TTTCCATAGTGGTTGAACTAATTTACATTCCCACCAACAGTGCATAAGTGTTCCCTTTTC 31777828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3177 TTTCCATAGTGGTTGAACTAATTTACATTCCCACCAACAGTGCATAAGTGTTCCCTTTTC 3236

 31777829 TCCACAACCTCACCAGTATCTGTGGGGTTTTTTCACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGA 31777885
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3237 TCCACAACCTCACCAGTATCTGTGGGGTTTTTTCACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGA 3293

Alignment time is 2.80655 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31766416,31790625] =>     24210 nucs '22 dna:chromosome chromosome:GRCh37:22:1:51304566:1'
Second seq [       1,    4496] =>      4496 nucs 'mol-32-3395-113735_4496'

Score:        4466
Aligned:      4494        nucs
Identic:      4489 (100%) nucs =>       686 (100%)      3803 (100%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31778039,31778724] EXCISED REGION [31778727,31782534]
 second seq =>  [       1,     686] EXCISED REGION [     694,    4496]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [31778725,31778726]
 second seq =>         7 nucs [687,693]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31778039 GTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACC 31778098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACC 60

 31778099 TTGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACGT 31778158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACGT 120

 31778159 CTGGCCCCCTTTTTTTTTTTTTAAGACAGAGTTTCGCTCTTGCTGTCCAGGCTGGAGTGC 31778218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTGGCCCCCTTTTTTTTTTTTTAAGACAGAGTTTCGCTCTTGCTGTCCAGGCTGGAGTGC 180

 31778219 AATGGCGCAATCTCGGCTCACTGCAACCTCTTCCTCCTGGGTTCAAGCGATTATCCTGCT 31778278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AATGGCGCAATCTCGGCTCACTGCAACCTCTTCCTCCTGGGTTCAAGCGATTATCCTGCT 240

 31778279 TCAGCCTCCCAGAGTAGCTGGGATTACAGGCAAGGGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTGT 31778338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCAGCCTCCCAGAGTAGCTGGGATTACAGGCAAGGGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTGT 300

 31778339 ATTTTTAGTAAAGACGGGGTTTCAACATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTTCTGACTTC 31778398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATTTTTAGTAAAGACGGGGTTTCAACATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTTCTGACTTC 360

 31778399 AGGTGATCCACCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATAACAGGCATGAGCACTGCACC 31778458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGGTGATCCACCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATAACAGGCATGAGCACTGCACC 420

 31778459 TGGCCTTGACTTTTTATTAATAGCCATTCTGACTAGTATGAGGGAGTATCTCATTGTGGT 31778518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGGCCTTGACTTTTTATTAATAGCCATTCTGACTAGTATGAGGGAGTATCTCATTGTGGT 480

 31778519 TTTGATTTGCATTTCTCAAATGATCAGTGATATTGAGCCATTTTTCATATACTTGTTGGC 31778578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTGATTTGCATTTCTCAAATGATCAGTGATATTGAGCCATTTTTCATATACTTGTTGGC 540

 31778579 CACATCTCTGTCTTCTTTTGAAAATTGTCGGCACATGTCCTTTGCCCACTTTTTAACGGG 31778638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CACATCTCTGTCTTCTTTTGAAAATTGTCGGCACATGTCCTTTGCCCACTTTTTAACGGG 600

 31778639 GTTGGGTTTTTTCCCTTGTAAATTTGTTCAAGTTCCAGCCCAGCACTCAGTCTCAAAACT 31778698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTTGGGTTTTTTCCCTTGTAAATTTGTTCAAGTTCCAGCCCAGCACTCAGTCTCAAAACT 660

 31778699 CAGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 31778724
          ||||||||||||||||||||||||||
      661 CAGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 686

EXCISED REGION

 31778727 CTTCAATTTCCTTATACATGCTGGATATTAGACCTTTTTTTCAGATGCATAGCTTGCGAA 31778786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      694 CTTCAATTTCCTTATACATGCTGGATATTAGACCTTTTTTTCAGATGCATAGCTTGCGAA 753

 31778787 TATTTTCTCTCATTCTGTAGGTTGTTCATTTACTGTGTTGATAGTTTCTTTTGCTGTGCA 31778846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      754 TATTTTCTCTCATTCTGTAGGTTGTTCATTTACTGTGTTGATAGTTTCTTTTGCTGTGCA 813

 31778847 GAAGCTCTTTAGTTTAACTAGATCTTGTCAATTTTTGCTTTTGTTGTGATTGCTTTCAGT 31778906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      814 GAAGCTCTTTAGTTTAACTAGATCTTGTCAATTTTTGCTTTTGTTGTGATTGCTTTCAGT 873

 31778907 GTCTTTGTCATGAAATCTTTGCCAGTTTCTACATCCCCAATGGTATTGCCTAGGTTGTCA 31778966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      874 GTCTTTGTCATGAAATCTTTGCCAGTTTCTACATCCCCAATGGTATTGCCTAGGTTGTCA 933

 31778967 TCCAGGGTTGTTATACTTTTGGGTTTTACAATTAAGTCTTTATCCTGAGTTGATTTTTTT 31779026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      934 TCCAGGGTTGTTATACTTTTGGGTTTTACAATTAAGTCTTTATCCTGAGTTGATTTTTTT 993

 31779027 TTTTTTTTAAGATGGAGTTTCGCTCTTGTTGCCGTTGCTGGAGTGCAATGGCGCTATCTT 31779086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      994 TTTTTTTTAAGATGGAGTTTCGCTCTTGTTGCCGTTGCTGGAGTGCAATGGCGCTATCTT 1053

 31779087 GGCTCGCTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGT 31779146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1054 GGCTCGCTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGT 1113

 31779147 AGCTGGGATTACAAGTGTGTGCCACCATACCCAGCTCATTTTTGTACTTTTAGTAGAGAC 31779206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1114 AGCTGGGATTACAAGTGTGTGCCACCATACCCAGCTCATTTTTGTACTTTTAGTAGAGAC 1173

 31779207 AAGGTTTCACGATGTTGGTCAGGCTCGTCTTGAACTCCTGATCTCAGGTGATCCACCCGA 31779266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1174 AAGGTTTCACGATGTTGGTCAGGCTCGTCTTGAACTCCTGATCTCAGGTGATCCACCCGA 1233

 31779267 CTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCTCACCCGGCCCTGAGTTGG 31779326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1234 CTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCTCACCCGGCCCTGAGTTGG 1293

 31779327 TTTTTGCATATGGTGTAAGAAAAGGGTCCAGTTTCGGGGCCGGGCGCAGTGGCTTACGCC 31779386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1294 TTTTTGCATATGGTGTAAGAAAAGGGTCCAGTTTCGGGGCCGGGCGCAGTGGCTTACGCC 1353

 31779387 TGTAATTCCAGCACTTTGGGAGGCGGAGGCGGAGGCGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGAT 31779446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1354 TGTAATTCCAGCACTTTGGGAGGCGGAGGCGGAGGCGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGAT 1413

 31779447 CGAGACCATCCTACCTAACACGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAGTTAGC 31779506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1414 CGAGACCATCCTACCTAACACGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAGTTAGC 1473

 31779507 CGGGCGTGGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTGCTCAGGAGGCTGAAGCAGGAGAATGA 31779566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1474 CGGGCGTGGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTGCTCAGGAGGCTGAAGCAGGAGAATGA 1533

 31779567 CGTGAACTTAGAAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATGGAGCCACTGCACTCCAGTCTG 31779626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1534 CGTGAACTTAGAAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATGGAGCCACTGCACTCCAGTCTG 1593

 31779627 GGCGACAGAGCGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAAGAA 31779686
          |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1594 GGCGACAGAGCGAGACTCTGTCT--AAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAAGAA 1651

 31779687 AAGGGTCCAGTTTCAATCTTCCGCATATGGCTAGCCAGTTATCCCAGCCCCTTTCATTGA 31779746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1652 AAGGGTCCAGTTTCAATCTTCCGCATATGGCTAGCCAGTTATCCCAGCCCCTTTCATTGA 1711

 31779747 ATAGGGAGTTCTTTTCCCACCGCTTGTTTTTTCAGCTTTGTCAAAGATCAAACGGTTGTA 31779806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1712 ATAGGGAGTTCTTTTCCCACCGCTTGTTTTTTCAGCTTTGTCAAAGATCAAACGGTTGTA 1771

 31779807 GGTGAGTGTGCAGCCTCATTTCTGGGCTCCCTATTATATTCCATTGGCCTATCGGTCTGT 31779866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1772 GGTGAGTGTGCAGCCTCATTTCTGGGCTCCCTATTATATTCCATTGGCCTATCGGTCTGT 1831

 31779867 TTTTGTACCCAGTACCATGCTATTTTGGTTACTGTAGCCCTGTAGTATAGTTTGAAGTTG 31779926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1832 TTTTGTACCCAGTACCATGCTATTTTGGTTACTGTAGCCCTGTAGTATAGTTTGAAGTTG 1891

 31779927 GGTAGTTTGAAGCCTCCAGCTTTGTTCTTTTTGTTTAAGATTGCCTTGGTATTCAGGCTG 31779986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1892 GGTAGTTTGAAGCCTCCAGCTTTGTTCTTTTTGTTTAAGATTGCCTTGGTATTCAGGCTG 1951

 31779987 TTTTTTGGTCCCATATGAATTTTAAAATAGTTTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAGAATATTA 31780046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1952 TTTTTTGGTCCCATATGAATTTTAAAATAGTTTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAGAATATTA 2011

 31780047 GTGGTAGTTTGATAGGAATAGCATTGAATCTGTAAATTGCTTTGGGCTATATGGCTATTT 31780106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2012 GTGGTAGTTTGATAGGAATAGCATTGAATCTGTAAATTGCTTTGGGCTATATGGCTATTT 2071

 31780107 TAATGATACTGATTTTTTCCTATCCATGAGCATGGAATGTTTTTCCATTCATTTGTGTCA 31780166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2072 TAATGATACTGATTTTTTCCTATCCATGAGCATGGAATGTTTTTCCATTCATTTGTGTCA 2131

 31780167 TCTCTGATTTCTTTGAGCAGTGTTTTGTAATTATCATTGTAGAGATCTCTCACCTCCCTG 31780226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2132 TCTCTGATTTCTTTGAGCAGTGTTTTGTAATTATCATTGTAGAGATCTCTCACCTCCCTG 2191

 31780227 GTTAGCTGTATTCATAGGCATTTTATTTATTTATTTATTTTTTGAAACTGAGTTTCACTC 31780286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2192 GTTAGCTGTATTCATAGGCATTTTATTTATTTATTTATTTTTTGAAACTGAGTTTCACTC 2251

 31780287 TTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCTCAATCTCGGCTCACCGCAACCTCCATCCTGGG 31780346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2252 TTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCTCAATCTCGGCTCACCGCAACCTCCATCCTGGG 2311

 31780347 TTCAAGCGATTTTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGTGCCACCA 31780406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2312 TTCAAGCGATTTTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGTGCCACCA 2371

 31780407 CGCCCTACTAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCC 31780466
          |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2372 CGCCCTACTAA---TTTTTTTTTTTTTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCC 2428

 31780467 ATGTAGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCCAACCTCAGGTGATCCACCCGCCTCGGCCTCCC 31780526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2429 ATGTAGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCCAACCTCAGGTGATCCACCCGCCTCGGCCTCCC 2488

 31780527 AAAGTGCTGAGATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGCGGCATTTTATTATTTTTGTGG 31780586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2489 AAAGTGCTGAGATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGCGGCATTTTATTATTTTTGTGG 2548

 31780587 CAGTTGTGAATGGGATTTTGTCATTTGTGTCTTGGCTTGGCTGTTGTTGGTATATAGGCA 31780646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2549 CAGTTGTGAATGGGATTTTGTCATTTGTGTCTTGGCTTGGCTGTTGTTGGTATATAGGCA 2608

 31780647 TGCTAGTGATTTTTGTACATTGATTTTGTATCCTGAAACTGCTGAAGTTTATCAGCTGAA 31780706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2609 TGCTAGTGATTTTTGTACATTGATTTTGTATCCTGAAACTGCTGAAGTTTATCAGCTGAA 2668

 31780707 GAATCTTTTGTACAGGGACTATAGGGTTTTCTAGATGTAGAATCATGTCTTCTGCAAAGA 31780766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2669 GAATCTTTTGTACAGGGACTATAGGGTTTTCTAGATGTAGAATCATGTCTTCTGCAAAGA 2728

 31780767 GAGATACTCTGACCTCCTGTCTTCCTATTTGGTTGCCCTTTATTTCTTTCTCTTGCCTGA 31780826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2729 GAGATACTCTGACCTCCTGTCTTCCTATTTGGTTGCCCTTTATTTCTTTCTCTTGCCTGA 2788

 31780827 CTGCTCTGACCAGGACTTCCAACCCTGTGTTGAATAGGAGTGGTGAGAAAGGGCACCCGG 31780886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2789 CTGCTCTGACCAGGACTTCCAACCCTGTGTTGAATAGGAGTGGTGAGAAAGGGCACCCGG 2848

 31780887 GTCTTGTGCCAGTTTTCAAAGAGAATGCTTTCAGCTTTTGCCCATTCAGTATGATGTTGG 31780946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2849 GTCTTGTGCCAGTTTTCAAAGAGAATGCTTTCAGCTTTTGCCCATTCAGTATGATGTTGG 2908

 31780947 CTTTGGGTCTGTCACAGATAGCTGTTATTATTTTGAGGTATGTTCCTTCAAAATCTAGTT 31781006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2909 CTTTGGGTCTGTCACAGATAGCTGTTATTATTTTGAGGTATGTTCCTTCAAAATCTAGTT 2968

 31781007 TACTGACAGTTTTTAATACGAAGCGATGTTGAATTTTATCGAAAGACTTTTCTGCATCTA 31781066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2969 TACTGACAGTTTTTAATACGAAGCGATGTTGAATTTTATCGAAAGACTTTTCTGCATCTA 3028

 31781067 TTGAGATAATCATGTGGTTTTTGTCTTTAGTTCTGTTTATGTGATGAATCACTTTTATTG 31781126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3029 TTGAGATAATCATGTGGTTTTTGTCTTTAGTTCTGTTTATGTGATGAATCACTTTTATTG 3088

 31781127 ATTTGTGGATGTAAAACCAACCTTGCATCCCAGGAATAAACCCTATTTGATCGTGGTGGA 31781186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3089 ATTTGTGGATGTAAAACCAACCTTGCATCCCAGGAATAAACCCTATTTGATCGTGGTGGA 3148

 31781187 TTTGCTTTTTGATGTGCTGCTGGATTCAATTTGCAAGTATTTTGTTGAGGATTTCTGCAT 31781246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3149 TTTGCTTTTTGATGTGCTGCTGGATTCAATTTGCAAGTATTTTGTTGAGGATTTCTGCAT 3208

 31781247 CGATGTTCATCAAGGATATTGGCTTGAAGTTTTCTATTTTGGGTGTGTCTCTGCCAGGTT 31781306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3209 CGATGTTCATCAAGGATATTGGCTTGAAGTTTTCTATTTTGGGTGTGTCTCTGCCAGGTT 3268

 31781307 TTAGTGTCAGGATGATGCCGGGCTCACAGAATGAGTTGGGGAGGAGTCCCTCTGCCTCAA 31781366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3269 TTAGTGTCAGGATGATGCCGGGCTCACAGAATGAGTTGGGGAGGAGTCCCTCTGCCTCAA 3328

 31781367 TTTTTTGAAATAGTTTCAGAAGAAATAGTACTATCCCGTCTTTGTACATCTGGTGGAATT 31781426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3329 TTTTTTGAAATAGTTTCAGAAGAAATAGTACTATCCCGTCTTTGTACATCTGGTGGAATT 3388

 31781427 CGGCTGTGACTTCATCTGGTCCTGGGCTTTTCTTTGTTAGTAGGCTATTTATTACTGATT 31781486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3389 CGGCTGTGACTTCATCTGGTCCTGGGCTTTTCTTTGTTAGTAGGCTATTTATTACTGATT 3448

 31781487 TCATTTTGGAGCTCATTATTGTTCTGTTCAGGGAATCTATTTCTTCTTGTTTCAGTTTTG 31781546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3449 TCATTTTGGAGCTCATTATTGTTCTGTTCAGGGAATCTATTTCTTCTTGTTTCAGTTTTG 3508

 31781547 GGAAGGTGTATGTGTCCAGGAATGTATCCATCTCTTCTAGGTTTTTATTATTATTCTTTT 31781606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3509 GGAAGGTGTATGTGTCCAGGAATGTATCCATCTCTTCTAGGTTTTTATTATTATTCTTTT 3568

 31781607 TTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGTGTGGGGTGCAGTGGCGCAATCTCGGCTCAC 31781666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3569 TTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGTGTGGGGTGCAGTGGCGCAATCTCGGCTCAC 3628

 31781667 TGCAGCCTCTGCCTCCTGAGTTTAAGCAATTCTCCTGACTCAGCCTCCCAAGTACCTGGG 31781726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3629 TGCAGCCTCTGCCTCCTGAGTTTAAGCAATTCTCCTGACTCAGCCTCCCAAGTACCTGGG 3688

 31781727 ATTAAAGGCATGTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTT 31781786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3689 ATTAAAGGCATGTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTT 3748

 31781787 CACCATGTTGGCCAGGCTGTTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCGCCTCAGCC 31781846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3749 CACCATGTTGGCCAGGCTGTTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCGCCTCAGCC 3808

 31781847 TCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGTATGAGCCACTGTGCCTGGCCGCTTCTAGGTTTCCTA 31781906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3809 TCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGTATGAGCCACTGTGCCTGGCCGCTTCTAGGTTTCCTA 3868

 31781907 GTTTGTGTGCATAGAGGTGTTCATAGTAGCCTGCGATGGTTATTTTTATTTCTGTGGGGT 31781966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3869 GTTTGTGTGCATAGAGGTGTTCATAGTAGCCTGCGATGGTTATTTTTATTTCTGTGGGGT 3928

 31781967 CACTGGTAACATCCCCTTTGTCATTTCTAACTATGTTTATTTATTTTTTGTTTATTTATT 31782026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3929 CACTGGTAACATCCCCTTTGTCATTTCTAACTATGTTTATTTATTTTTTGTTTATTTATT 3988

 31782027 TATTTATTTATTTTTTGAGATGGAGTCTCGTTCTGTTGTTCCGATTGTAGTGAAGTGGCA 31782086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3989 TATTTATTTATTTTTTGAGATGGAGTCTCGTTCTGTTGTTCCGATTGTAGTGAAGTGGCA 4048

 31782087 CCATTTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCTCAGGTTCAAGAGATTCTCGTGGCTCCGCCT 31782146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4049 CCATTTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCTCAGGTTCAAGAGATTCTCGTGGCTCCGCCT 4108

 31782147 ACCAAGTAGCAGGGATTATAGGCATATGTCACCATGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAG 31782206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4109 ACCAAGTAGCAGGGATTATAGGCATATGTCACCATGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAG 4168

 31782207 TAGAGACGGGATTTTACCATGTTGGCCAGACTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAAGTGATC 31782266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4169 TAGAGACGGGATTTTACCATGTTGGCCAGACTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAAGTGATC 4228

 31782267 ACCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCATATTTACTTATTTTT 31782326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4229 ACCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCATATTTACTTATTTTT 4288

 31782327 GAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGTTAGAGTGCAGTGGCGTGATCTGGGCTCACTG 31782386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4289 GAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGTTAGAGTGCAGTGGCGTGATCTGGGCTCACTG 4348

 31782387 CAACCTCCACCTCCTGGATTCAGGTGATTCTCCTGCCTCAGCATCTCAAGTAGCTGGGAT 31782446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4349 CAACCTCCACCTCCTGGATTCAGGTGATTCTCCTGCCTCAGCATCTCAAGTAGCTGGGAT 4408

 31782447 TGCAGGCGCCCACCAGCACGCCTGGCTAATTTTTGTATCTTTAGTAGAGACAAGATTTTG 31782506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4409 TGCAGGCGCCCACCAGCACGCCTGGCTAATTTTTGTATCTTTAGTAGAGACAAGATTTTG 4468

 31782507 CCGTGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTC 31782534
          ||||||||||||||||||||||||||||
     4469 CCGTGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTC 4496

Alignment time is 3.82873 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31766416,31790625] =>     24210 nucs '22 dna:chromosome chromosome:GRCh37:22:1:51304566:1'
Second seq [       1,    2558] =>      2558 nucs 'mol-32-34a8-162025_2558'

Score:        2525
Aligned:      2558        nucs
Identic:      2555 (100%) nucs =>        14 (100%)      2541 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31775292,31775305] EXCISED REGION [31775310,31777852]
 second seq =>  [       1,      14] EXCISED REGION [      15,    2558]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         4 nucs [31775306,31775309]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        35 nucs [31775306,31775340] to [31775310,31775344]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31775292 TGAGACTCCGTCTT 31775305
          ||||||||||||||
        1 TGAGACTCCGTCTT 14

EXCISED REGION

 31775310 AAACAAACAAACAAACAAACAAACAAACAAACAAAACAAGACTCAGCTGTAAAACCATCT 31775369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       15 AAACAAACAAACAAACAAACAAACAAACAAACAAAACAAGACTCAGCTGTAAAACCATCT 74

 31775370 AAGCCTGATGCCTTTTAAAATGAAGACTTACTTTTCTAATTTCTTTTATTTCTATTTTGT 31775429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       75 AAGCCTGATGCCTTTTAAAATGAAGACTTACTTTTCTAATTTCTTTTATTTCTATTTTGT 134

 31775430 TTTATTTATTTATCTATCTATCTATTTTTGAGATGGAGACTCGCTCTGTCGCCCAGGCTG 31775489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      135 TTTATTTATTTATCTATCTATCTATTTTTGAGATGGAGACTCGCTCTGTCGCCCAGGCTG 194

 31775490 GAGTGCAGTGGCACCATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCCAGTTGAAATGATTCT 31775549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      195 GAGTGCAGTGGCACCATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCCAGTTGAAATGATTCT 254

 31775550 TGTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATACAGGCGCAAGCCACGAGACCTGGCTAAGTT 31775609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      255 TGTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATACAGGCGCAAGCCACGAGACCTGGCTAAGTT 314

 31775610 TTGTCTTTTTGGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGCCTGGTCTTGAACTCCTGA 31775669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      315 TTGTCTTTTTGGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGCCTGGTCTTGAACTCCTGA 374

 31775670 CCTCAGGTGATCTATCCGCCTCAGTCTCCCACAGTGCTAGGATTATAGGTGTGAGACACC 31775729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      375 CCTCAGGTGATCTATCCGCCTCAGTCTCCCACAGTGCTAGGATTATAGGTGTGAGACACC 434

 31775730 GTTTCCGGCTTCTAATTTCTTTTATACTTATTAGTGTATTTACATCTTATCTCTCTTCTT 31775789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      435 GTTTCCGGCTTCTAATTTCTTTTATACTTATTAGTGTATTTACATCTTATCTCTCTTCTT 494

 31775790 GGGAAAATTGTAACATTTTATTTTATTTTTTATATGGAAGTCATTATTTCTCCTATATTT 31775849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      495 GGGAAAATTGTAACATTTTATTTTATTTTTTATATGGAAGTCATTATTTCTCCTATATTT 554

 31775850 CCTTTTCTTTTCCTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTCGCCCAGGCTAGAGTGTGAT 31775909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      555 CCTTTTCTTTTCCTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTCGCCCAGGCTAGAGTGTGAT 614

 31775910 GACGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCGATTCTCATGCCTCA 31775969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      615 GACGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCGATTCTCATGCCTCA 674

 31775970 GCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTCTGAGCCACCATGCCTGGCTAACTTTTGTATTT 31776029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      675 GCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTCTGAGCCACCATGCCTGGCTAACTTTTGTATTT 734

 31776030 TTAGTACAGATGGGGTTTTGCCATGTTACCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGC 31776089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      735 TTAGTACAGATGGGGTTTTGCCATGTTACCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGC 794

 31776090 AATCCCCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTTCCGCTAGATTTTCTAAG 31776149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      795 AATCCCCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTTCCGCTAGATTTTCTAAG 854

 31776150 TATTTGGCAGAGAGTTACATGTAATAGTCTTTTGTAATTCTTTTTTTCTTTTTTTAAATA 31776209
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
      855 TATTTGGCAGAGAGTTACATGTAATAGCCTTTTGTAATTCTTTTTTTCTTTTTTTAAATA 914

 31776210 AGATCTTGCTCTGTTGTCCAGGCTGGAGTGCAGTGACGTGATGTCGGCTCACTGCAGCCT 31776269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
      915 AGATCTTGCTCTGTTGTCCAGGCTGGAGTGCAGTGATGTGATGTCGGCTCACTGCAGCCT 974

 31776270 CTGCCTCCTGGGTTGAAGCGATTCTCATGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGG 31776329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      975 CTGCCTCCTGGGTTGAAGCGATTCTCATGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGG 1034

 31776330 CATGCACCACCACACCCAGCTAAGTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGT 31776389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1035 CATGCACCACCACACCCAGCTAAGTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGT 1094

 31776390 TGCCCAGGCTTGTAATTCTTTTAATTTGCTATTATCAGTGGTTGTATGTCCTTTCTTACT 31776449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1095 TGCCCAGGCTTGTAATTCTTTTAATTTGCTATTATCAGTGGTTGTATGTCCTTTCTTACT 1154

 31776450 CAAGATTGCTATTTATTTATTTTATTTTATTTTTTGAGACGGAATCTCACTCTGTTGCCC 31776509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1155 CAAGATTGCTATTTATTTATTTTATTTTATTTTTTGAGACGGAATCTCACTCTGTTGCCC 1214

 31776510 AGACTGGAGTGCAGTGGCATGCGCCACCACACCCAGCTAATTTTTGTGTTTTTAGTAGAG 31776569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1215 AGACTGGAGTGCAGTGGCATGCGCCACCACACCCAGCTAATTTTTGTGTTTTTAGTAGAG 1274

 31776570 ACAGCATTTTGCCATATTGGCCAGGCTGGTCTCTAACTCCTGATCTCAAGTGATCTGCCC 31776629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1275 ACAGCATTTTGCCATATTGGCCAGGCTGGTCTCTAACTCCTGATCTCAAGTGATCTGCCC 1334

 31776630 ACCTTGGCCCCTCCAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCTGGCCTATTTTT 31776689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1335 ACCTTGGCCCCTCCAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCTGGCCTATTTTT 1394

 31776690 TCTTTCTATCCTTATTCAAGCATTTTGAGATATTTTTCCTTTCTGTTTTACTGATCCTTT 31776749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1395 TCTTTCTATCCTTATTCAAGCATTTTGAGATATTTTTCCTTTCTGTTTTACTGATCCTTT 1454

 31776750 CATCTTTTCAAGTTCTTCTTTCTTTCTTTCTTTC-TTTTTTTTTTTTAAGACAGGGTCTC 31776808
          |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
     1455 CATCTTTTCAAGTTCTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTAAGACAGGGTCTC 1514

 31776809 GCTCTATTGCCTAGGCTAGAGAATACTGGCATGATTATAGCTCACTGCAACCTCCTGGGC 31776868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1515 GCTCTATTGCCTAGGCTAGAGAATACTGGCATGATTATAGCTCACTGCAACCTCCTGGGC 1574

 31776869 TCAAGGTATCTTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCCAAGACTACAGGTGTGCACCACTAC 31776928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1575 TCAAGGTATCTTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCCAAGACTACAGGTGTGCACCACTAC 1634

 31776929 ATCAAGCTAAATTTTTTTTTTTTTACTTTTATTTTAGGTTCAGGAACAGCTGTGCAAGTT 31776988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1635 ATCAAGCTAAATTTTTTTTTTTTTACTTTTATTTTAGGTTCAGGAACAGCTGTGCAAGTT 1694

 31776989 TGTTATATAGGTAAGCTCGTGTTATGGGGGTTTATTGTACAGATTATTTCATCACTCAGG 31777048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1695 TGTTATATAGGTAAGCTCGTGTTATGGGGGTTTATTGTACAGATTATTTCATCACTCAGG 1754

 31777049 TACAAAGCCTGGTAACCAATAGTTATTTTTTCTGATCATTTCCTTTCTCCCGCCCTGCAC 31777108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1755 TACAAAGCCTGGTAACCAATAGTTATTTTTTCTGATCATTTCCTTTCTCCCGCCCTGCAC 1814

 31777109 CCTCAAGTAGGTCCCAGTGTCTGTTGTTCCCCTCTTTGTGTCCATGTGTTCTTATTGAGC 31777168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1815 CCTCAAGTAGGTCCCAGTGTCTGTTGTTCCCCTCTTTGTGTCCATGTGTTCTTATTGAGC 1874

 31777169 GCGCGCACACACACACACACACACACATTTATATGTACAAGCAATTGTCCTGCCTTAGCC 31777228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1875 GCGCGCACACACACACACACACACACATTTATATGTACAAGCAATTGTCCTGCCTTAGCC 1934

 31777229 TCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCACCACACCCAGCTAATATTTTTGTATGTTT 31777288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1935 TCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCACCACACCCAGCTAATATTTTTGTATGTTT 1994

 31777289 TTAGTAGAGACAAGGTTTCACCATGTTGGTCAGACTGGTCTCAAATTCTTGACCTCAGGT 31777348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1995 TTAGTAGAGACAAGGTTTCACCATGTTGGTCAGACTGGTCTCAAATTCTTGACCTCAGGT 2054

 31777349 GATCCACCTGCCTCAGCCTTCCAAAGTGCTGTGATTACAGGTGTGAGCCACCACGTCCAG 31777408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2055 GATCCACCTGCCTCAGCCTTCCAAAGTGCTGTGATTACAGGTGTGAGCCACCACGTCCAG 2114

 31777409 CTGAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACATATGGTATTTGTTTTTCTGTTCCTGTGTTAGTT 31777468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2115 CTGAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACATATGGTATTTGTTTTTCTGTTCCTGTGTTAGTT 2174

 31777469 TGCTAAGGATAATGGCCTCCAGTTTCATCCATGTTCCTGCAAAGGACATGATCTTCTTTT 31777528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2175 TGCTAAGGATAATGGCCTCCAGTTTCATCCATGTTCCTGCAAAGGACATGATCTTCTTTT 2234

 31777529 TTGTGGCTGCATAGTATTACATGGTGTATATGTACCACATTTTCTTTATCCAGTCTGTCA 31777588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2235 TTGTGGCTGCATAGTATTACATGGTGTATATGTACCACATTTTCTTTATCCAGTCTGTCA 2294

 31777589 TTGATGGGCATTTAGGTGATTCCACGTCTTTGCTATTGTGGATGGTGCTGTGATGAATAT 31777648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2295 TTGATGGGCATTTAGGTGATTCCACGTCTTTGCTATTGTGGATGGTGCTGTGATGAATAT 2354

 31777649 ATGCATGCATGTATCTTTATGGTGGAATGATATATATTCCTTTGGGTATCTACCCTGTAA 31777708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2355 ATGCATGCATGTATCTTTATGGTGGAATGATATATATTCCTTTGGGTATCTACCCTGTAA 2414

 31777709 TGGGATTGCTGGGTCAAATGGTAGTTCTGTTTGTAGCTCTTTCAGGAATCACCAGACTAC 31777768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2415 TGGGATTGCTGGGTCAAATGGTAGTTCTGTTTGTAGCTCTTTCAGGAATCACCAGACTAC 2474

 31777769 TTTCCATAGTGGTTGAACTAATTTACATTCCCACCAACAGTGCATAAGTGTTCCCTTTTC 31777828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2475 TTTCCATAGTGGTTGAACTAATTTACATTCCCACCAACAGTGCATAAGTGTTCCCTTTTC 2534

 31777829 TCCACAACCTCACCAGTATCTGTG 31777852
          ||||||||||||||||||||||||
     2535 TCCACAACCTCACCAGTATCTGTG 2558

Alignment time is 2.18892 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31766416,31790625] =>     24210 nucs '22 dna:chromosome chromosome:GRCh37:22:1:51304566:1'
Second seq [       1,    4952] =>      4952 nucs 'mol-32-34be-084582_4952'

Score:        4848
Aligned:      4955        nucs
Identic:      4942 (100%) nucs =>      1179 (100%)      3763 (100%)
Gaps:            9 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31774126,31775305] EXCISED REGION [31775310,31779078]
 second seq =>  [       1,    1183] EXCISED REGION [    1184,    4952]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         4 nucs [31775306,31775309]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        35 nucs [31775306,31775340] to [31775310,31775344]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31774126 CCTGACCTCAAGTGATCAGCGCACCCGGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCCACATG 31774185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCTGACCTCAAGTGATCAGCGCACCCGGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCCACATG 60

 31774186 TAAACTTCTGTCTCTTCCCACTCCCTATGGTGCTGCTCCCTTCTTTTCTGTGCCCTGTCC 31774245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAAACTTCTGTCTCTTCCCACTCCCTATGGTGCTGCTCCCTTCTTTTCTGTGCCCTGTCC 120

 31774246 TACACATTCCAGCTACTTCAGCAGCCCCAAACACTGATTTCTGCCTCTGCAGCTCAGGAA 31774305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TACACATTCCAGCTACTTCAGCAGCCCCAAACACTGATTTCTGCCTCTGCAGCTCAGGAA 180

 31774306 GAATTCTCCTTTGCTTGGAATCCACTTTCCTCCACTGTAATTGGGAAATTGTCCCCAGGC 31774365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GAATTCTCCTTTGCTTGGAATCCACTTTCCTCCACTGTAATTGGGAAATTGTCCCCAGGC 240

 31774366 AGAAAGCCAGGACAAACATAGGGCTTATCTTTTCTATTTCCCTTTTTCTCAAGAATCATA 31774425
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGAAAGCCAGGACAAACATGGGGCTTATCTTTTCTATTTCCCTTTTTCTCAAGAATCATA 300

 31774426 GTCTATTTTGCCTTTTTTTAAATAACTGAAAACATCTGCCTCTGATTTTGTCCAGTTTTA 31774485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTCTATTTTGCCTTTTTTTAAATAACTGAAAACATCTGCCTCTGATTTTGTCCAGTTTTA 360

 31774486 TAGTTCTTTAATATTGTTGGGCGGGGCGCGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTG 31774545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TAGTTCTTTAATATTGTTGGGCGGGGCGCGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTG 420

 31774546 GGAGGCTGAGGTGGGCGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCACATGG 31774605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGAGGCTGAGGTGGGCGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCACATGG 480

 31774606 TGAAACCCCATCTCCACTAAAATAAAAAAAATAGCTGGGCATGGTGGCACACGCTTGTAA 31774665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGAAACCCCATCTCCACTAAAATAAAAAAAATAGCTGGGCATGGTGGCACACGCTTGTAA 540

 31774666 TCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGGAGGAGAATCTCTTGAACCTGTGAGGCAGAGGTTGC 31774725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGGAGGAGAATCTCTTGAACCTGTGAGGCAGAGGTTGC 600

 31774726 AGTGAGCTGAGATCATGCCACTGTACTCCAGCCTGGATGACAGAACGAGACTCTGTCTCA 31774785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGTGAGCTGAGATCATGCCACTGTACTCCAGCCTGGATGACAGAACGAGACTCTGTCTCA 660

 31774786 AAAAAAAAAAAGATTGTTGGATGAGTTCATCATCACTGAAAGTGGAAGTCTTACTTTCAT 31774845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAAAAAAAAAAGATTGTTGGATGAGTTCATCATCACTGAAAGTGGAAGTCTTACTTTCAT 720

 31774846 TTTCATCATGTAAACATCTTTTCAGAAGTATAATTGACATATAAGAAATTGTTCATACTT 31774905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTTCATCATGTAAACATCTTTTCAGAAGTATAATTGACATATAAGAAATTGTTCATACTT 780

 31774906 AAAGTGTACAATTTGATGAGTTTTGACTTACGTGTATACCCATGGAACTATTAGCACAAT 31774965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAAGTGTACAATTTGATGAGTTTTGACTTACGTGTATACCCATGGAACTATTAGCACAAT 840

 31774966 GAAGAAATTAAGATAAGGCTCCACCTGTTCTTTACAATCGGAGACAACTGGCTGCGCATG 31775025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GAAGAAATTAAGATAAGGCTCCACCTGTTCTTTACAATCGGAGACAACTGGCTGCGCATG 900

 31775026 GTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGCCGGGTGGATCACTTAAGGT 31775085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGCCGGGTGGATCACTTAAGGT 960

 31775086 CAGGAGTTCGAGGCCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAAAAAAAA 31775145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CAGGAGTTCGAGGCCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAAAAAAAA 1020

 31775146 AAAAAAAAAAAAAAA---TTAGCTGGGCGTGGTGGCATGCACCTGTAATCCCAGCTGCTC 31775202
          |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AAAAAAAAAAAAAAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCATGCACCTGTAATCCCAGCTGCTC 1080

 31775203 AGGAGGCTAAGGAGAATCGCTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGTCGAGATGGT 31775262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AGGAGGCTAAGGAGAATCGCTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGTCGAGATGGT 1140

 31775263 GCCACTGCACTCCAGCCCGGGCAACAGAGTGAGACTCCGTCTT 31775305
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GCCACTGCACTCCAGCCCGGGCAACAGAGTGAGACTCCGTCTT 1183

EXCISED REGION

 31775310 AAACAAACAAACAAACAAACAAACAAACAAACAAAACAAGACTCAGCTGTAAAACCATCT 31775369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1184 AAACAAACAAACAAACAAACAAACAAACAAACAAAACAAGACTCAGCTGTAAAACCATCT 1243

 31775370 AAGCCTGATGCCTTTTAAAATGAAGACTTACTTTTCTAATTTCTTTTATTTCTATTTTGT 31775429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1244 AAGCCTGATGCCTTTTAAAATGAAGACTTACTTTTCTAATTTCTTTTATTTCTATTTTGT 1303

 31775430 TTTATTTATTTATCTATCTATCTATTTTTGAGATGGAGACTCGCTCTGTCGCCCAGGCTG 31775489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1304 TTTATTTATTTATCTATCTATCTATTTTTGAGATGGAGACTCGCTCTGTCGCCCAGGCTG 1363

 31775490 GAGTGCAGTGGCACCATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCCAGTTGAAATGATTCT 31775549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1364 GAGTGCAGTGGCACCATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCCAGTTGAAATGATTCT 1423

 31775550 TGTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATACAGGCGCAAGCCACGAGACCTGGCTAAGTT 31775609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1424 TGTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATACAGGCGCAAGCCACGAGACCTGGCTAAGTT 1483

 31775610 TTGTCTTTTTGGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGCCTGGTCTTGAACTCCTGA 31775669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1484 TTGTCTTTTTGGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGCCTGGTCTTGAACTCCTGA 1543

 31775670 CCTCAGGTGATCTATCCGCCTCAGTCTCCCACAGTGCTAGGATTATAGGTGTGAGACACC 31775729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1544 CCTCAGGTGATCTATCCGCCTCAGTCTCCCACAGTGCTAGGATTATAGGTGTGAGACACC 1603

 31775730 GTTTCCGGCTTCTAATTTCTTTTATACTTATTAGTGTATTTACATCTTATCTCTCTTCTT 31775789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1604 GTTTCCGGCTTCTAATTTCTTTTATACTTATTAGTGTATTTACATCTTATCTCTCTTCTT 1663

 31775790 GGGAAAATTGTAACATTTTATTTTATTTTTTATATGGAAGTCATTATTTCTCCTATATTT 31775849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1664 GGGAAAATTGTAACATTTTATTTTATTTTTTATATGGAAGTCATTATTTCTCCTATATTT 1723

 31775850 CCTTTTCTTTTCCTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTCGCCCAGGCTAGAGTGTGAT 31775909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1724 CCTTTTCTTTTCCTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTCGCCCAGGCTAGAGTGTGAT 1783

 31775910 GACGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCGATTCTCATGCCTCA 31775969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1784 GACGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCGATTCTCATGCCTCA 1843

 31775970 GCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTCTGAGCCACCATGCCTGGCTAACTTTTGTATTT 31776029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1844 GCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTCTGAGCCACCATGCCTGGCTAACTTTTGTATTT 1903

 31776030 TTAGTACAGATGGGGTTTTGCCATGTTACCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGC 31776089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1904 TTAGTACAGATGGGGTTTTGCCATGTTACCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGC 1963

 31776090 AATCCCCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTTCCGCTAGATTTTCTAAG 31776149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1964 AATCCCCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTTCCGCTAGATTTTCTAAG 2023

 31776150 TATTTGGCAGAGAGTTACATGTAATAGTCTTTTGTAATTCTTTTTTTCTTTTTTTAAATA 31776209
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     2024 TATTTGGCAGAGAGTTACATGTAATAGCCTTTTGTAATTCTTTTTTTCTTTTTTTAAATA 2083

 31776210 AGATCTTGCTCTGTTGTCCAGGCTGGAGTGCAGTGACGTGATGTCGGCTCACTGCAGCCT 31776269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     2084 AGATCTTGCTCTGTTGTCCAGGCTGGAGTGCAGTGATGTGATGTCGGCTCACTGCAGCCT 2143

 31776270 CTGCCTCCTGGGTTGAAGCGATTCTCATGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGG 31776329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2144 CTGCCTCCTGGGTTGAAGCGATTCTCATGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGG 2203

 31776330 CATGCACCACCACACCCAGCTAAGTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGT 31776389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2204 CATGCACCACCACACCCAGCTAAGTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGT 2263

 31776390 TGCCCAGGCTTGTAATTCTTTTAATTTGCTATTATCAGTGGTTGTATGTCCTTTCTTACT 31776449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2264 TGCCCAGGCTTGTAATTCTTTTAATTTGCTATTATCAGTGGTTGTATGTCCTTTCTTACT 2323

 31776450 CAAGATTGCTATTTATTTATTTTATTTTATTTTTTGAGACGGAATCTCACTCTGTTGCCC 31776509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2324 CAAGATTGCTATTTATTTATTTTATTTTATTTTTTGAGACGGAATCTCACTCTGTTGCCC 2383

 31776510 AGACTGGAGTGCAGTGGCATGCGCCACCACACCCAGCTAATTTTTGTGTTTTTAGTAGAG 31776569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2384 AGACTGGAGTGCAGTGGCATGCGCCACCACACCCAGCTAATTTTTGTGTTTTTAGTAGAG 2443

 31776570 ACAGCATTTTGCCATATTGGCCAGGCTGGTCTCTAACTCCTGATCTCAAGTGATCTGCCC 31776629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2444 ACAGCATTTTGCCATATTGGCCAGGCTGGTCTCTAACTCCTGATCTCAAGTGATCTGCCC 2503

 31776630 ACCTTGGCCCCTCCAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCTGGCCTATTTTT 31776689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2504 ACCTTGGCCCCTCCAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCTGGCCTATTTTT 2563

 31776690 TCTTTCTATCCTTATTCAAGCATTTTGAGATATTTTTCCTTTCTGTTTTACTGATCCTTT 31776749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2564 TCTTTCTATCCTTATTCAAGCATTTTGAGATATTTTTCCTTTCTGTTTTACTGATCCTTT 2623

 31776750 CATCTTTTCAAGTTCTTCTTTCTTTCTTTCTTTC-TTTTTTTTTTTTAAGACAGGGTCTC 31776808
          |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
     2624 CATCTTTTCAAGTTCTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTAAGACAGGGTCTC 2683

 31776809 GCTCTATTGCCTAGGCTAGAGAATACTGGCATGATTATAGCTCACTGCAACCTCCTGGGC 31776868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2684 GCTCTATTGCCTAGGCTAGAGAATACTGGCATGATTATAGCTCACTGCAACCTCCTGGGC 2743

 31776869 TCAAGGTATCTTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCCAAGACTACAGGTGTGCACCACTAC 31776928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2744 TCAAGGTATCTTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCCAAGACTACAGGTGTGCACCACTAC 2803

 31776929 ATCAAGCTAAATTTTTTTTTTTTTACTTTTATTTTAGGTTCAGGAACAGCTGTGCAAGTT 31776988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2804 ATCAAGCTAAATTTTTTTTTTTTTACTTTTATTTTAGGTTCAGGAACAGCTGTGCAAGTT 2863

 31776989 TGTTATATAGGTAAGCTCGTGTTATGGGGGTTTATTGTACAGATTATTTCATCACTCAGG 31777048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2864 TGTTATATAGGTAAGCTCGTGTTATGGGGGTTTATTGTACAGATTATTTCATCACTCAGG 2923

 31777049 TACAAAGCCTGGTAACCAATAGTTATTTTTTCTGATCATTTCCTTTCTCCCGCCCTGCAC 31777108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2924 TACAAAGCCTGGTAACCAATAGTTATTTTTTCTGATCATTTCCTTTCTCCCGCCCTGCAC 2983

 31777109 CCTCAAGTAGGTCCCAGTGTCTGTTGTTCCCCTCTTTGTGTCCATGTGTTCTTATTGAGC 31777168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2984 CCTCAAGTAGGTCCCAGTGTCTGTTGTTCCCCTCTTTGTGTCCATGTGTTCTTATTGAGC 3043

 31777169 GCGCGCACACACACACACACACACACATTTATATGTACAAGCAATTGTCCTGCCTTAGCC 31777228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3044 GCGCGCACACACACACACACACACACATTTATATGTACAAGCAATTGTCCTGCCTTAGCC 3103

 31777229 TCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCACCACACCCAGCTAATATTTTTGTATGTTT 31777288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3104 TCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCACCACACCCAGCTAATATTTTTGTATGTTT 3163

 31777289 TTAGTAGAGACAAGGTTTCACCATGTTGGTCAGACTGGTCTCAAATTCTTGACCTCAGGT 31777348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3164 TTAGTAGAGACAAGGTTTCACCATGTTGGTCAGACTGGTCTCAAATTCTTGACCTCAGGT 3223

 31777349 GATCCACCTGCCTCAGCCTTCCAAAGTGCTGTGATTACAGGTGTGAGCCACCACGTCCAG 31777408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3224 GATCCACCTGCCTCAGCCTTCCAAAGTGCTGTGATTACAGGTGTGAGCCACCACGTCCAG 3283

 31777409 CTGAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACATATGGTATTTGTTTTTCTGTTCCTGTGTTAGTT 31777468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3284 CTGAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACATATGGTATTTGTTTTTCTGTTCCTGTGTTAGTT 3343

 31777469 TGCTAAGGATAATGGCCTCCAGTTTCATCCATGTTCCTGCAAAGGACATGATCTTCTTTT 31777528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3344 TGCTAAGGATAATGGCCTCCAGTTTCATCCATGTTCCTGCAAAGGACATGATCTTCTTTT 3403

 31777529 TTGTGGCTGCATAGTATTACATGGTGTATATGTACCACATTTTCTTTATCCAGTCTGTCA 31777588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3404 TTGTGGCTGCATAGTATTACATGGTGTATATGTACCACATTTTCTTTATCCAGTCTGTCA 3463

 31777589 TTGATGGGCATTTAGGTGATTCCACGTCTTTGCTATTGTGGATGGTGCTGTGATGAATAT 31777648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3464 TTGATGGGCATTTAGGTGATTCCACGTCTTTGCTATTGTGGATGGTGCTGTGATGAATAT 3523

 31777649 ATGCATGCATGTATCTTTATGGTGGAATGATATATATTCCTTTGGGTATCTACCCTGTAA 31777708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3524 ATGCATGCATGTATCTTTATGGTGGAATGATATATATTCCTTTGGGTATCTACCCTGTAA 3583

 31777709 TGGGATTGCTGGGTCAAATGGTAGTTCTGTTTGTAGCTCTTTCAGGAATCACCAGACTAC 31777768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3584 TGGGATTGCTGGGTCAAATGGTAGTTCTGTTTGTAGCTCTTTCAGGAATCACCAGACTAC 3643

 31777769 TTTCCATAGTGGTTGAACTAATTTACATTCCCACCAACAGTGCATAAGTGTTCCCTTTTC 31777828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3644 TTTCCATAGTGGTTGAACTAATTTACATTCCCACCAACAGTGCATAAGTGTTCCCTTTTC 3703

 31777829 TCCACAACCTCACCAGTATCTGTGGGGTTTTTTCACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAC 31777888
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||
     3704 TCCACAACCTCACCAGTATCTGTGGGGTTTTTTCA--TTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAC 3761

 31777889 AGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTTGGCTCACTGCAAGC 31777948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3762 AGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTTGGCTCACTGCAAGC 3821

 31777949 TCCGCCTTTTGGGTTCAAGTCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGTACTACAG 31778008
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     3822 TCCGCCTTTTGGGTTCAAGTCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGTACTACAG 3881

 31778009 GCGCCCGCCATGACGCCCAACTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACTGT 31778068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3882 GCGCCCGCCATGACGCCCAACTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACTGT 3941

 31778069 GTTAGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTTGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAG 31778128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3942 GTTAGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTTGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAG 4001

 31778129 TGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACGTCTGGCCCCCTTTTTTTTTTTTTAAGACAGA 31778188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
     4002 TGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACGTCTGGCCCCC-TTTTTTTTTTTTAAGACAGA 4060

 31778189 GTTTCGCTCTTGCTGTCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCAATCTCGGCTCACTGCAACCTC 31778248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4061 GTTTCGCTCTTGCTGTCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCAATCTCGGCTCACTGCAACCTC 4120

 31778249 TTCCTCCTGGGTTCAAGCGATTATCCTGCTTCAGCCTCCCAGAGTAGCTGGGATTACAGG 31778308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4121 TTCCTCCTGGGTTCAAGCGATTATCCTGCTTCAGCCTCCCAGAGTAGCTGGGATTACAGG 4180

 31778309 CAAGGGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAAAGACGGGGTTTCAACATGT 31778368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4181 CAAGGGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAAAGACGGGGTTTCAACATGT 4240

 31778369 TGGCCAGGCTGGTCTCGAACTTCTGACTTCAGGTGATCCACCTGCCTCGGCCTCCCAAAG 31778428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4241 TGGCCAGGCTGGTCTCGAACTTCTGACTTCAGGTGATCCACCTGCCTCGGCCTCCCAAAG 4300

 31778429 TGCTGGGATAACAGGCATGAGCACTGCACCTGGCCTTGACTTTTTATTAATAGCCATTCT 31778488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4301 TGCTGGGATAACAGGCATGAGCACTGCACCTGGCCTTGACTTTTTATTAATAGCCATTCT 4360

 31778489 GACTAGTATGAGGGAGTATCTCATTGTGGTTTTGATTTGCATTTCTCAAATGATCAGTGA 31778548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4361 GACTAGTATGAGGGAGTATCTCATTGTGGTTTTGATTTGCATTTCTCAAATGATCAGTGA 4420

 31778549 TATTGAGCCATTTTTCATATACTTGTTGGCCACATCTCTGTCTTCTTTTGAAAATTGTCG 31778608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4421 TATTGAGCCATTTTTCATATACTTGTTGGCCACATCTCTGTCTTCTTTTGAAAATTGTCG 4480

 31778609 GCACATGTCCTTTGCCCACTTTTTAACGGGGTTGGGTTTTTTCCCTTGTAAATTTGTTCA 31778668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4481 GCACATGTCCTTTGCCCACTTTTTAACGGGGTTGGGTTTTTTCCCTTGTAAATTTGTTCA 4540

 31778669 AGTTCCAGCCCAGCACTCAGTCTCAAAACTCAGTCTC--AAAAAAAAAAAAAAAAAAAGT 31778726
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||
     4541 AGTTCCAGCCCAGCACTCAGTCTCAAAACTCAGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGT 4600

 31778727 CTTCAATTTCCTTATACATGCTGGATATTAGACCTTTTTTTCAGATGCATAGCTTGCGAA 31778786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4601 CTTCAATTTCCTTATACATGCTGGATATTAGACCTTTTTTTCAGATGCATAGCTTGCGAA 4660

 31778787 TATTTTCTCTCATTCTGTAGGTTGTTCATTTACTGTGTTGATAGTTTCTTTTGCTGTGCA 31778846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4661 TATTTTCTCTCATTCTGTAGGTTGTTCATTTACTGTGTTGATAGTTTCTTTTGCTGTGCA 4720

 31778847 GAAGCTCTTTAGTTTAACTAGATCTTGTCAATTTTTGCTTTTGTTGTGATTGCTTTCAGT 31778906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4721 GAAGCTCTTTAGTTTAACTAGATCTTGTCAATTTTTGCTTTTGTTGTGATTGCTTTCAGT 4780

 31778907 GTCTTTGTCATGAAATCTTTGCCAGTTTCTACATCCCCAATGGTATTGCCTAGGTTGTCA 31778966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4781 GTCTTTGTCATGAAATCTTTGCCAGTTTCTACATCCCCAATGGTATTGCCTAGGTTGTCA 4840

 31778967 TCCAGGGTTGTTATACTTTTGGGTTTTACAATTAAGTCTTTATCCTGAGTTGATTTTTTT 31779026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4841 TCCAGGGTTGTTATACTTTTGGGTTTTACAATTAAGTCTTTATCCTGAGTTGATTTTTTT 4900

 31779027 TTTTTTTTAAGATGGAGTTTCGCTCTTGTTGCCGTTGCTGGAGTGCAATGGC 31779078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4901 TTTTTTTTAAGATGGAGTTTCGCTCTTGTTGCCGTTGCTGGAGTGCAATGGC 4952

Alignment time is 4.24852 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31766416,31790625] =>     24210 nucs '22 dna:chromosome chromosome:GRCh37:22:1:51304566:1'
Second seq [       1,    2107] =>      2107 nucs 'mol-32-34be-084583_2107'

Score:        2107
Aligned:      2107        nucs
Identic:      2107 (100%) nucs =>       759 (100%)      1348 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31779659,31780417] EXCISED REGION [31780420,31781767]
 second seq =>  [       1,     759] EXCISED REGION [     760,    2107]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [31780418,31780419]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        19 nucs [31780418,31780436] to [31780420,31780438]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [31780418,31780418] to [31780419,31780419]
 second seq =>         0 nucs

 31779659 AAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAAGAAAAGGGTCCAGTTTCAATCTTCCGCATATGGCT 31779718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAAGAAAAGGGTCCAGTTTCAATCTTCCGCATATGGCT 60

 31779719 AGCCAGTTATCCCAGCCCCTTTCATTGAATAGGGAGTTCTTTTCCCACCGCTTGTTTTTT 31779778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGCCAGTTATCCCAGCCCCTTTCATTGAATAGGGAGTTCTTTTCCCACCGCTTGTTTTTT 120

 31779779 CAGCTTTGTCAAAGATCAAACGGTTGTAGGTGAGTGTGCAGCCTCATTTCTGGGCTCCCT 31779838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAGCTTTGTCAAAGATCAAACGGTTGTAGGTGAGTGTGCAGCCTCATTTCTGGGCTCCCT 180

 31779839 ATTATATTCCATTGGCCTATCGGTCTGTTTTTGTACCCAGTACCATGCTATTTTGGTTAC 31779898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATTATATTCCATTGGCCTATCGGTCTGTTTTTGTACCCAGTACCATGCTATTTTGGTTAC 240

 31779899 TGTAGCCCTGTAGTATAGTTTGAAGTTGGGTAGTTTGAAGCCTCCAGCTTTGTTCTTTTT 31779958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGTAGCCCTGTAGTATAGTTTGAAGTTGGGTAGTTTGAAGCCTCCAGCTTTGTTCTTTTT 300

 31779959 GTTTAAGATTGCCTTGGTATTCAGGCTGTTTTTTGGTCCCATATGAATTTTAAAATAGTT 31780018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTTTAAGATTGCCTTGGTATTCAGGCTGTTTTTTGGTCCCATATGAATTTTAAAATAGTT 360

 31780019 TTTTTTTCTAGTTCTGTGAAGAATATTAGTGGTAGTTTGATAGGAATAGCATTGAATCTG 31780078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTTTTTTCTAGTTCTGTGAAGAATATTAGTGGTAGTTTGATAGGAATAGCATTGAATCTG 420

 31780079 TAAATTGCTTTGGGCTATATGGCTATTTTAATGATACTGATTTTTTCCTATCCATGAGCA 31780138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TAAATTGCTTTGGGCTATATGGCTATTTTAATGATACTGATTTTTTCCTATCCATGAGCA 480

 31780139 TGGAATGTTTTTCCATTCATTTGTGTCATCTCTGATTTCTTTGAGCAGTGTTTTGTAATT 31780198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGGAATGTTTTTCCATTCATTTGTGTCATCTCTGATTTCTTTGAGCAGTGTTTTGTAATT 540

 31780199 ATCATTGTAGAGATCTCTCACCTCCCTGGTTAGCTGTATTCATAGGCATTTTATTTATTT 31780258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATCATTGTAGAGATCTCTCACCTCCCTGGTTAGCTGTATTCATAGGCATTTTATTTATTT 600

 31780259 ATTTATTTTTTGAAACTGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCTCAAT 31780318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATTTATTTTTTGAAACTGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCTCAAT 660

 31780319 CTCGGCTCACCGCAACCTCCATCCTGGGTTCAAGCGATTTTCCTGCCTCAGCCTCCCGAG 31780378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTCGGCTCACCGCAACCTCCATCCTGGGTTCAAGCGATTTTCCTGCCTCAGCCTCCCGAG 720

 31780379 TAGCTGGGATTACAGGCATGTGCCACCACGCCCTACTAA 31780417
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TAGCTGGGATTACAGGCATGTGCCACCACGCCCTACTAA 759

EXCISED REGION

 31780420 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTAGGTCAGGC 31780479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      760 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTAGGTCAGGC 819

 31780480 TGGTCTCGAACTCCCAACCTCAGGTGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGAT 31780539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      820 TGGTCTCGAACTCCCAACCTCAGGTGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGAT 879

 31780540 TACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGCGGCATTTTATTATTTTTGTGGCAGTTGTGAATGG 31780599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      880 TACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGCGGCATTTTATTATTTTTGTGGCAGTTGTGAATGG 939

 31780600 GATTTTGTCATTTGTGTCTTGGCTTGGCTGTTGTTGGTATATAGGCATGCTAGTGATTTT 31780659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      940 GATTTTGTCATTTGTGTCTTGGCTTGGCTGTTGTTGGTATATAGGCATGCTAGTGATTTT 999

 31780660 TGTACATTGATTTTGTATCCTGAAACTGCTGAAGTTTATCAGCTGAAGAATCTTTTGTAC 31780719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1000 TGTACATTGATTTTGTATCCTGAAACTGCTGAAGTTTATCAGCTGAAGAATCTTTTGTAC 1059

 31780720 AGGGACTATAGGGTTTTCTAGATGTAGAATCATGTCTTCTGCAAAGAGAGATACTCTGAC 31780779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1060 AGGGACTATAGGGTTTTCTAGATGTAGAATCATGTCTTCTGCAAAGAGAGATACTCTGAC 1119

 31780780 CTCCTGTCTTCCTATTTGGTTGCCCTTTATTTCTTTCTCTTGCCTGACTGCTCTGACCAG 31780839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1120 CTCCTGTCTTCCTATTTGGTTGCCCTTTATTTCTTTCTCTTGCCTGACTGCTCTGACCAG 1179

 31780840 GACTTCCAACCCTGTGTTGAATAGGAGTGGTGAGAAAGGGCACCCGGGTCTTGTGCCAGT 31780899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1180 GACTTCCAACCCTGTGTTGAATAGGAGTGGTGAGAAAGGGCACCCGGGTCTTGTGCCAGT 1239

 31780900 TTTCAAAGAGAATGCTTTCAGCTTTTGCCCATTCAGTATGATGTTGGCTTTGGGTCTGTC 31780959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1240 TTTCAAAGAGAATGCTTTCAGCTTTTGCCCATTCAGTATGATGTTGGCTTTGGGTCTGTC 1299

 31780960 ACAGATAGCTGTTATTATTTTGAGGTATGTTCCTTCAAAATCTAGTTTACTGACAGTTTT 31781019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1300 ACAGATAGCTGTTATTATTTTGAGGTATGTTCCTTCAAAATCTAGTTTACTGACAGTTTT 1359

 31781020 TAATACGAAGCGATGTTGAATTTTATCGAAAGACTTTTCTGCATCTATTGAGATAATCAT 31781079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1360 TAATACGAAGCGATGTTGAATTTTATCGAAAGACTTTTCTGCATCTATTGAGATAATCAT 1419

 31781080 GTGGTTTTTGTCTTTAGTTCTGTTTATGTGATGAATCACTTTTATTGATTTGTGGATGTA 31781139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1420 GTGGTTTTTGTCTTTAGTTCTGTTTATGTGATGAATCACTTTTATTGATTTGTGGATGTA 1479

 31781140 AAACCAACCTTGCATCCCAGGAATAAACCCTATTTGATCGTGGTGGATTTGCTTTTTGAT 31781199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1480 AAACCAACCTTGCATCCCAGGAATAAACCCTATTTGATCGTGGTGGATTTGCTTTTTGAT 1539

 31781200 GTGCTGCTGGATTCAATTTGCAAGTATTTTGTTGAGGATTTCTGCATCGATGTTCATCAA 31781259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1540 GTGCTGCTGGATTCAATTTGCAAGTATTTTGTTGAGGATTTCTGCATCGATGTTCATCAA 1599

 31781260 GGATATTGGCTTGAAGTTTTCTATTTTGGGTGTGTCTCTGCCAGGTTTTAGTGTCAGGAT 31781319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1600 GGATATTGGCTTGAAGTTTTCTATTTTGGGTGTGTCTCTGCCAGGTTTTAGTGTCAGGAT 1659

 31781320 GATGCCGGGCTCACAGAATGAGTTGGGGAGGAGTCCCTCTGCCTCAATTTTTTGAAATAG 31781379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1660 GATGCCGGGCTCACAGAATGAGTTGGGGAGGAGTCCCTCTGCCTCAATTTTTTGAAATAG 1719

 31781380 TTTCAGAAGAAATAGTACTATCCCGTCTTTGTACATCTGGTGGAATTCGGCTGTGACTTC 31781439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1720 TTTCAGAAGAAATAGTACTATCCCGTCTTTGTACATCTGGTGGAATTCGGCTGTGACTTC 1779

 31781440 ATCTGGTCCTGGGCTTTTCTTTGTTAGTAGGCTATTTATTACTGATTTCATTTTGGAGCT 31781499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1780 ATCTGGTCCTGGGCTTTTCTTTGTTAGTAGGCTATTTATTACTGATTTCATTTTGGAGCT 1839

 31781500 CATTATTGTTCTGTTCAGGGAATCTATTTCTTCTTGTTTCAGTTTTGGGAAGGTGTATGT 31781559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1840 CATTATTGTTCTGTTCAGGGAATCTATTTCTTCTTGTTTCAGTTTTGGGAAGGTGTATGT 1899

 31781560 GTCCAGGAATGTATCCATCTCTTCTAGGTTTTTATTATTATTCTTTTTTGAGATGGAGTC 31781619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1900 GTCCAGGAATGTATCCATCTCTTCTAGGTTTTTATTATTATTCTTTTTTGAGATGGAGTC 1959

 31781620 TCACTCTGTCACCCAGTGTGGGGTGCAGTGGCGCAATCTCGGCTCACTGCAGCCTCTGCC 31781679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1960 TCACTCTGTCACCCAGTGTGGGGTGCAGTGGCGCAATCTCGGCTCACTGCAGCCTCTGCC 2019

 31781680 TCCTGAGTTTAAGCAATTCTCCTGACTCAGCCTCCCAAGTACCTGGGATTAAAGGCATGT 31781739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2020 TCCTGAGTTTAAGCAATTCTCCTGACTCAGCCTCCCAAGTACCTGGGATTAAAGGCATGT 2079

 31781740 GCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATT 31781767
          ||||||||||||||||||||||||||||
     2080 GCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATT 2107

Alignment time is 1.83244 s

