
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [20940623,20963850] =>     23228 nucs '22 dna:chromosome chromosome:GRCh37:22:1:51304566:1'
Second seq [       1,    7922] =>      7922 nucs 'mol-32-1e71-040784_7922'

Score:        7729
Aligned:      7934        nucs
Identic:      7908 (100%) nucs =>      6402 (100%)      1506 (100%)
Gaps:           16 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [20946549,20952969] EXCISED REGION [20952973,20954483]
 second seq =>  [       1,    6412] EXCISED REGION [    6415,    7922]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         3 nucs [20952970,20952972]
 second seq =>         2 nucs [6413,6414]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [20952968,20952969] to [20952971,20952972]
 second seq =>         1 nucs [6413,6413] to [6415,6415]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>        10 nucs [20952960,20952969] to [20952973,20952982]
 second seq =>        10 nucs [6403,6412] to [6415,6424]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 20946549 GTGGGCAGCTGGGGCAGGGCCTGTGGCTGGCTCTTCCTGGGTGAGTACAGTCTGATTTAA 20946608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTGGGCAGCTGGGGCAGGGCCTGTGGCTGGCTCTTCCTGGGTGAGTACAGTCTGATTTAA 60

 20946609 AAGGCACCCAGGGCTGGGCACGGTGGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCC 20946668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAGGCACCCAGGGCTGGGCACGGTGGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCC 120

 20946669 AGGTGGGCGGATTACTTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCTAACATGGTGAAACC 20946728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGGTGGGCGGATTACTTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCTAACATGGTGAAACC 180

 20946729 CCTTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGAACGTGGTGGCACGTGCCTGTAGTCCAAG 20946788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCTTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGAACGTGGTGGCACGTGCCTGTAGTCCAAG 240

 20946789 CTACTTGGGAGGCTGAGGCCGGAGAATGGCTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAG 20946848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTACTTGGGAGGCTGAGGCCGGAGAATGGCTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAG 300

 20946849 CAGAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGGGAGACTCTGTCTCAAAAAAG 20946908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CAGAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGGGAGACTCTGTCTCAAAAAAG 360

 20946909 AAAAAATAAAATAATAAAACGCATTCAGGCATTCTCTACAGCCTGGGCAACATAGTGAGA 20946968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAAAAATAAAATAATAAAACGCATTCAGGCATTCTCTACAGCCTGGGCAACATAGTGAGA 420

 20946969 CCCTGTCTCTATAAAAAGTAAAAGAAAAAAAATTAGCCGGGCTTGGTGCTGTGCTCCTGT 20947028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCCTGTCTCTATAAAAAGTAAAAGAAAAAAAATTAGCCGGGCTTGGTGCTGTGCTCCTGT 480

 20947029 AGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGGACTGCTGGAATCCCGGAGGTCAAGGCC 20947088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
      481 AGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGGACTGCTGGAATCCCGGAGGTCGAGGCC 540

 20947089 GCAGTGAGCTATGATGGCACCACTGAACTCCAGGCTAGGTGACACAGTGAGATGCTGCCT 20947148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GCAGTGAGCTATGATGGCACCACTGAACTCCAGGCTAGGTGACACAGTGAGATGCTGCCT 600

 20947149 AAAAGAAAAAAAAAAAAA-GAAATATGTCTTTCTTTACAAGGCCTGCCCTAAAAAAAAAA 20947207
          |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAAAGAAAAAAAAAAAAAAGAAATATGTCTTTCTTTACAAGGCCTGCCCTAAAAAAAAAA 660

 20947208 AAAAAAAAAAATGTTCGCCAGAGCCAGGCCAACTGTGATTTTACCAGATGCCAACATACC 20947267
          |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAAAAAAAAA-TGTTCGCCAGAGCCAGGCCAACTGTGATTTTACCAGATGCCAACATACC 719

 20947268 CAACCCAAGGGAGGAAGGGAACATACCCAATCCCAGCCTGTTCTAGCTCCTCTTCCCCAC 20947327
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      720 CAACCCGAGGGAGGAAGGGAACATACCCAATCCCAGCCTGTTCTAGCTCCTCTTCCCCAC 779

 20947328 ATCTTCCTGCCACATCAATAGGGCTCCTGTATAATAACAGGGGATACAAGTGAAAGAACA 20947387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      780 ATCTTCCTGCCACATCAATAGGGCTCCTGTATAATAACAGGGGATACAAGTGAAAGAACA 839

 20947388 GCCCATCTCAGAACTTATTTGAGAAATGTCTAGGAAACCCTAAAGACAACAGGGAGACAA 20947447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 GCCCATCTCAGAACTTATTTGAGAAATGTCTAGGAAACCCTAAAGACAACAGGGAGACAA 899

 20947448 AAACTAAGACACCAGAGGAAGTTTATGCCTCTGACACTTACAGTTAGAACAAACAGCACA 20947507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 AAACTAAGACACCAGAGGAAGTTTATGCCTCTGACACTTACAGTTAGAACAAACAGCACA 959

 20947508 CATGGCCCAACCCCTAACCAGAGCAAAATAAAACCTCACACAGGCCGGGCGCTGTGGCTC 20947567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 CATGGCCCAACCCCTAACCAGAGCAAAATAAAACCTCACACAGGCCGGGCGCTGTGGCTC 1019

 20947568 ACCCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGTGGATCACGAGGTCAGGAGTTC 20947627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 ACCCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGTGGATCACGAGGTCAGGAGTTC 1079

 20947628 AAGACCACCCTGGCCAAGATGGTGAAACCCCATCTACTAAAAATACAAAAATTAGCGGGC 20947687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 AAGACCACCCTGGCCAAGATGGTGAAACCCCATCTACTAAAAATACAAAAATTAGCGGGC 1139

 20947688 GTGGTGGCAGGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGGTGAGGCAGAGAATTGCTTGAA 20947747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 GTGGTGGCAGGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGGTGAGGCAGAGAATTGCTTGAA 1199

 20947748 GCCAGGAGGTAGAGCTTGCAGTGAGCGGAGATTGCGGCACCGCACTCCAGCCTGGGTGAC 20947807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 GCCAGGAGGTAGAGCTTGCAGTGAGCGGAGATTGCGGCACCGCACTCCAGCCTGGGTGAC 1259

 20947808 AAAGTGAGACTCTGTCTCAAAAAACAAAAACAAACAAACAAAAACTTCACACAGAAAGCC 20947867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||
     1260 AAAGTGAGACTCTGTCTCAAAAAACAAAAACAAACAAA----AACTTCACACAGAAAGCC 1315

 20947868 CATTTATCACGTACCCCGTACAGCATGTCCAGCTCCCCACAAAAAATTTCAAGGCATAAT 20947927
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     1316 CATTTATCACGTACCCCGTACAGCATGTCCAGCTCGCCACAAAAAATTTCAAGGCATAAT 1375

 20947928 AAAAACCAAAAAATGCAGTTTGAAGAGACAGCAAGCATCAGAGCCAGACTCAAATATGGC 20947987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1376 AAAAACCAAAAAATGCAGTTTGAAGAGACAGCAAGCATCAGAGCCAGACTCAAATATGGC 1435

 20947988 AGAGATGTCGGAATTATCAGACCAAGAAATGGAATACAACTATGATTAATATGCTAAGGG 20948047
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1436 AGAGATGTTGGAATTATCAGACCAAGAAATGGAATACAACTATGATTAATATGCTAAGGG 1495

 20948048 CTCTAATGGAAAAGTGGACAACATGAGATTACAGACAGAAAATGGAAACAGGGATAGACA 20948107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1496 CTCTAATGGAAAAGTGGACAACATGAGATTACAGACAGAAAATGGAAACAGGGATAGACA 1555

 20948108 CTCTGAGAAAGAATCTAAAGAATATGTGAAGGCCGGGCACAGTGGCTTATGCCTGTAATC 20948167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1556 CTCTGAGAAAGAATCTAAAGAATATGTGAAGGCCGGGCACAGTGGCTTATGCCTGTAATC 1615

 20948168 CCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGCGGATCACTTGAAGTCAGGAGTTCGAAGACCAGCC 20948227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1616 CCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGCGGATCACTTGAAGTCAGGAGTTCGAAGACCAGCC 1675

 20948228 CAGTTCGAGACCAGATGGCAAAACCCCATCTCTACTAAAAAATACAAAAATTAGCCAGGT 20948287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1676 CAGTTCGAGACCAGATGGCAAAACCCCATCTCTACTAAAAAATACAAAAATTAGCCAGGT 1735

 20948288 GTGGTGGCATGAACCTGTAATTCCAGCTATTCAGGAGGCTGAGGTGGGAGGACTGCTTGG 20948347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1736 GTGGTGGCATGAACCTGTAATTCCAGCTATTCAGGAGGCTGAGGTGGGAGGACTGCTTGG 1795

 20948348 ACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGTGCCACTGCCCTCAAATCTGGGTGA 20948407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1796 ACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGTGCCACTGCCCTCAAATCTGGGTGA 1855

 20948408 CAGAGTGAGACACCACCAAAAAAAAGAAAAGAAAAGAAAGGAAACAAGGAGAGGAAAGAA 20948467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1856 CAGAGTGAGACACCACCAAAAAAAAGAAAAGAAAAGAAAGGAAACAAGGAGAGGAAAGAA 1915

 20948468 AGGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAAGAAAGAAAGAAAGAGAAAGAGAAAATAAAGAAAAAGA 20948527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1916 AGGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAAGAAAGAAAGAAAGAGAAAGAGAAAATAAAGAAAAAGA 1975

 20948528 AAGAAAGAAGGAGAATATGTGAGAAGTCAGCCAGGTAGTGACTCATGACTGTAATCCCAA 20948587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1976 AAGAAAGAAGGAGAATATGTGAGAAGTCAGCCAGGTAGTGACTCATGACTGTAATCCCAA 2035

 20948588 CACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCACTTGAGGTCAGCAGTTCAAGACCAGCCTGGG 20948647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2036 CACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCACTTGAGGTCAGCAGTTCAAGACCAGCCTGGG 2095

 20948648 CAACATGGTGATAACCCATCTCTACTAAAAATAAAAAAATTAGCTGGATGTGGTGTCATG 20948707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2096 CAACATGGTGATAACCCATCTCTACTAAAAATAAAAAAATTAGCTGGATGTGGTGTCATG 2155

 20948708 CACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGT 20948767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2156 CACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGT 2215

 20948768 GGAGGTTGCAGTAAGCTGAGATTATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAGTAAGACTCCGT 20948827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2216 GGAGGTTGCAGTAAGCTGAGATTATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAGTAAGACTCCGT 2275

 20948828 CTCAAAAAACAAAAAGAAAATATAAGAAGTCAAAAACACAACAGAATGAAAGATCAGGGC 20948887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2276 CTCAAAAAACAAAAAGAAAATATAAGAAGTCAAAAACACAACAGAATGAAAGATCAGGGC 2335

 20948888 TGGCAGCAGTGGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGTTGGGTGGATCA 20948947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2336 TGGCAGCAGTGGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGTTGGGTGGATCA 2395

 20948948 CCTGAGGTTAGGAGTTGGAGACCAGCCTGGCCAACATGGAGAAACCCCGTCTCTACTCAA 20949007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2396 CCTGAGGTTAGGAGTTGGAGACCAGCCTGGCCAACATGGAGAAACCCCGTCTCTACTCAA 2455

 20949008 AATACAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCGCATGCCTGTAATCCCAACTACACAGAAGGAT 20949067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2456 AATACAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCGCATGCCTGTAATCCCAACTACACAGAAGGAT 2515

 20949068 GAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGATGTAGTGAGCCGAGATCATGCCA 20949127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2516 GAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGATGTAGTGAGCCGAGATCATGCCA 2575

 20949128 CTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAAGGAGACTCTGTCTCAAAAAAGAAAGAAAGAAAGGT 20949187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2576 CTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAAGGAGACTCTGTCTCAAAAAAGAAAGAAAGAAAGGT 2635

 20949188 CAGGTGCATGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGAGAGGCCAAAGTAGAAGGATCGT 20949247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2636 CAGGTGCATGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGAGAGGCCAAAGTAGAAGGATCGT 2695

 20949248 TTGAGCCCAGGAGTTGGAGACCAGCCTGGGCAATATAGCCAGACCCTGTCTCTACAAAAA 20949307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2696 TTGAGCCCAGGAGTTGGAGACCAGCCTGGGCAATATAGCCAGACCCTGTCTCTACAAAAA 2755

 20949308 A-TTAAAAAAATTGCCAGCATGGTGGTGCACATCTGCAGTCCCTGCTACTCAGGAGGCCA 20949366
          | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     2756 AATTAAAAAAATTGCCAGCATGGTGGTGCACATCTGCAGTCCCTGCTACTCAGGAGGCCG 2815

 20949367 AGGCTGCAGTGAGCTGTGATTGTACTACTGCACTCTGGCCTGGGTAACAGAGAGAGACCC 20949426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2816 AGGCTGCAGTGAGCTGTGATTGTACTACTGCACTCTGGCCTGGGTAACAGAGAGAGACCC 2875

 20949427 TGTCTCAAAAATGGGGTAAAATGGTATAGGAAATTTGGATCTAAAAAAAAAAAAAAGGAA 20949486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2876 TGTCTCAAAAATGGGGTAAAATGGTATAGGAAATTTGGATCTAAAAAAAAAAAAAAGGAA 2935

 20949487 GTGCATTAGATAAGAAATAAATGAAGATAAAATAGAATCTTTTTTTTGGTGGGGGTGGGG 20949546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2936 GTGCATTAGATAAGAAATAAATGAAGATAAAATAGAATCTTTTTTTTGGTGGGGGTGGGG 2995

 20949547 AACGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCACGATCTTGGCTCACCAC 20949606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2996 AACGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCACGATCTTGGCTCACCAC 3055

 20949607 AACATCCGCCTACTGGGTTCAGGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATT 20949666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3056 AACATCCGCCTACTGGGTTCAGGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATT 3115

 20949667 ACAGGCATGTGCCACCACGTCCAGCTAATTTTGTATTTTTATTAGAGTCGGGGGTTACTC 20949726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3116 ACAGGCATGTGCCACCACGTCCAGCTAATTTTGTATTTTTATTAGAGTCGGGGGTTACTC 3175

 20949727 CACGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTAACCTCAGGCGATCTGCCTGCCTCGGCCTCC 20949786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3176 CACGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTAACCTCAGGCGATCTGCCTGCCTCGGCCTCC 3235

 20949787 CAAAGTGCTGGAATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGCCAGAATCTTGTATTGTTCTT 20949846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3236 CAAAGTGCTGGAATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGCCAGAATCTTGTATTGTTCTT 3295

 20949847 ATTTTTAGTTGAACAGATGGCAGGTTATTCAAAATAATTATATCAACATGTATTCAGTAA 20949906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3296 ATTTTTAGTTGAACAGATGGCAGGTTATTCAAAATAATTATATCAACATGTATTCAGTAA 3355

 20949907 TTATAGCTTATGGATAGCTGGAATGAATGGCAGCAATGTTATAAGGGATGGGAAGGAGGA 20949966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3356 TTATAGCTTATGGATAGCTGGAATGAATGGCAGCAATGTTATAAGGGATGGGAAGGAGGA 3415

 20949967 TATCCTGAGTGGAAAGAAAGTCACCCAGGCTGGAGTGAAGTGGCACAATTATAGCCCACT 20950026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3416 TATCCTGAGTGGAAAGAAAGTCACCCAGGCTGGAGTGAAGTGGCACAATTATAGCCCACT 3475

 20950027 TGCAGCCTGCAACTCCTGGGCTCAAGCCATCCTTCTGCTTCAGCCTCCCTGGTAACTGGG 20950086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3476 TGCAGCCTGCAACTCCTGGGCTCAAGCCATCCTTCTGCTTCAGCCTCCCTGGTAACTGGG 3535

 20950087 ATTACAGACACACACCACCATGCCTGGCTAATTTTTAAATTTTTTGTCTCGCTGTGTTGC 20950146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3536 ATTACAGACACACACCACCATGCCTGGCTAATTTTTAAATTTTTTGTCTCGCTGTGTTGC 3595

 20950147 CCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGGCTCAAGAAATCCTCCTGCCTTAGCCTCCCAAAGTGT 20950206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3596 CCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGGCTCAAGAAATCCTCCTGCCTTAGCCTCCCAAAGTGT 3655

 20950207 TGAGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCTGGTTTATGGTTGCTTTTGAATGTCCTAGTCC 20950266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3656 TGAGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCTGGTTTATGGTTGCTTTTGAATGTCCTAGTCC 3715

 20950267 TACATAAGTGGCTTCCAAGAAGGGAAAAAGAAAAATGCAGGCAGGAAAAGGTGCTGATCC 20950326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3716 TACATAAGTGGCTTCCAAGAAGGGAAAAAGAAAAATGCAGGCAGGAAAAGGTGCTGATCC 3775

 20950327 ATAAAAACCTCTGGAAGGTATGTCTCTAGGGAGGGGGTGAGTGTTGAGGAGGGATGTTGC 20950386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3776 ATAAAAACCTCTGGAAGGTATGTCTCTAGGGAGGGGGTGAGTGTTGAGGAGGGATGTTGC 3835

 20950387 AAACATGGTAGTGGAGATGGCAAGAGTGGCTGCCTGCCTCTTCGTCTGCACTTCCACAAT 20950446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3836 AAACATGGTAGTGGAGATGGCAAGAGTGGCTGCCTGCCTCTTCGTCTGCACTTCCACAAT 3895

 20950447 CTGAAGCAGCCATCATCAATCGGAACACAGATCCCCAGTATTTGGAGGATGGGGCTCTTA 20950506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3896 CTGAAGCAGCCATCATCAATCGGAACACAGATCCCCAGTATTTGGAGGATGGGGCTCTTA 3955

 20950507 TTGCCTGCTGTGGCTCCTGCAAGCTATAGGGAAGCTACCCCAGAAGTATAGGCATGGCTG 20950566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3956 TTGCCTGCTGTGGCTCCTGCAAGCTATAGGGAAGCTACCCCAGAAGTATAGGCATGGCTG 4015

 20950567 CTTGCACCACCAATTTAAATGCTAATTACTTCTGAAAACACCCTCACACACATGCCCAGA 20950626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4016 CTTGCACCACCAATTTAAATGCTAATTACTTCTGAAAACACCCTCACACACATGCCCAGA 4075

 20950627 AATAATGTGTAACCAGATATGTGTGCATCCAGTGGCCCAGACAAGTTGACATATAGAATT 20950686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4076 AATAATGTGTAACCAGATATGTGTGCATCCAGTGGCCCAGACAAGTTGACATATAGAATT 4135

 20950687 AACCATCACAAGTCCACCCCTTGTCAACCTGGTACCTACACACATCTCCTTAAACCATAC 20950746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4136 AACCATCACAAGTCCACCCCTTGTCAACCTGGTACCTACACACATCTCCTTAAACCATAC 4195

 20950747 TTAACCTCCAAATAAACACAATAACAAAGTCAGTGTTAGCAGTGGAAGGTGTCTGAGTTA 20950806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4196 TTAACCTCCAAATAAACACAATAACAAAGTCAGTGTTAGCAGTGGAAGGTGTCTGAGTTA 4255

 20950807 GTGGCAGCGAATCCGTATGGGTCTGCAGCAACCTCAATTCTTGCCTCCTCAGAAAAAAGA 20950866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4256 GTGGCAGCGAATCCGTATGGGTCTGCAGCAACCTCAATTCTTGCCTCCTCAGAAAAAAGA 4315

 20950867 ATTCAACTGGCCGGGCATGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGG 20950926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4316 ATTCAACTGGCCGGGCATGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGG 4375

 20950927 CGGGCAGACCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCTCGTC 20950986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4376 CGGGCAGACCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCTCGTC 4435

 20950987 TTTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCATGGTGGTGGGTGCCTGTTGTCCCAGCTACA 20951046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4436 TTTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCATGGTGGTGGGTGCCTGTTGTCCCAGCTACA 4495

 20951047 TGAGAGACTGAGGCAGGAGAATGGCAGGAACCCAGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAG 20951106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4496 TGAGAGACTGAGGCAGGAGAATGGCAGGAACCCAGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAG 4555

 20951107 ATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCAAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAG 20951166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4556 ATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCAAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAG 4615

 20951167 AATTCAACTGAGGGGCATAAGGCAGAAAAAGAGACCGAGGCAAGTTTTGGAGGAGGAGTG 20951226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4616 AATTCAACTGAGGGGCATAAGGCAGAAAAAGAGACCGAGGCAAGTTTTGGAGGAGGAGTG 4675

 20951227 AAAGTTTATTTAAAAAAGCTTTACAACAGGAAAGAAAGTATTCTTGGAAGAGACCTAAAC 20951286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     4676 AAAGTTTATTTAAAAAAGCTTTACAACAGGAAAGGAAGTATTCTTGGAAGAGACCTAAAC 4735

 20951287 AGGCACATAAAGGTCAAGTGCGGTGTTTAACCTTGATTCTAGGACTTTATAGACTGACCC 20951346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4736 AGGCACATAAAGGTCAAGTGCGGTGTTTAACCTTGATTCTAGGACTTTATAGACTGACCC 4795

 20951347 CTTTCCCAAGATTCTTCCCCTAGGGTGGGCTGCCTACATGCACAGTGTCCTCCTTACCCT 20951406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4796 CTTTCCCAAGATTCTTCCCCTAGGGTGGGCTGCCTACATGCACAGTGTCCTCCTTACCCT 4855

 20951407 TGGGAGATGAGCACACGCAGTGTGTTTAGGAAACTGTACGCATGCCCATCTGAAGATTTC 20951466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4856 TGGGAGATGAGCACACGCAGTGTGTTTAGGAAACTGTACGCATGCCCATCTGAAGATTTC 4915

 20951467 TTCCGTCCCAGAAGGTCATACTCTGCCATTGTCTCTTAATGCACATGGCCGGGGAAATTG 20951526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4916 TTCCGTCCCAGAAGGTCATACTCTGCCATTGTCTCTTAATGCACATGGCCGGGGAAATTG 4975

 20951527 CTTCTCCCTGGTGCCTGCATTCAATTAACACTTTAATGAAACAGGTGTGACCCATCAGGA 20951586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4976 CTTCTCCCTGGTGCCTGCATTCAATTAACACTTTAATGAAACAGGTGTGACCCATCAGGA 5035

 20951587 ACTGGCCTCTCCCTGATGCCAGCTGCCAATTTATCACTTTCATTTTTAATTTATTTTTTA 20951646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5036 ACTGGCCTCTCCCTGATGCCAGCTGCCAATTTATCACTTTCATTTTTAATTTATTTTTTA 5095

 20951647 GAAGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGACTGGAGAGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACTGTA 20951706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5096 GAAGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGACTGGAGAGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACTGTA 5155

 20951707 ACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTGGCTGGGATTA 20951766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5156 ACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTGGCTGGGATTA 5215

 20951767 GAGGCATGCACCAACATGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGCTTTCACC 20951826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5216 GAGGCATGCACCAACATGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGCTTTCACC 5275

 20951827 ATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACCCCTGATGTCAAGTGACCCACCCACCTTGACCTCAC 20951886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5276 ATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACCCCTGATGTCAAGTGACCCACCCACCTTGACCTCAC 5335

 20951887 AAAGTGCTAGGATTACAGGCATGAGACACCATGCCCAGCCCTGGCTTTTTTTTTTTTTTT 20951946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5336 AAAGTGCTAGGATTACAGGCATGAGACACCATGCCCAGCCCTGGCTTTTTTTTTTTTTTT 5395

 20951947 TTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTGGCCCAGGCTGTAGTGCAGTGGCATGATCT 20952006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5396 TTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTGGCCCAGGCTGTAGTGCAGTGGCATGATCT 5455

 20952007 CGCCTCGCTGCAAGCTCCGCCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCAGAG 20952066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5456 CGCCTCGCTGCAAGCTCCGCCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCAGAG 5515

 20952067 CAGCTGGGACCACAGGCGCCCACCACCACGCCCAGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAG 20952126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5516 CAGCTGGGACCACAGGCGCCCACCACCACGCCCAGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAG 5575

 20952127 ACGGGATTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTGACCTCATGATCCGCCCGCCTT 20952186
          |||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5576 ACGGGGTTTCGCTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTGACCTCATGATCCGCCCGCCTT 5635

 20952187 GGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCCAGCCGCTAATTTTTTA 20952246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5636 GGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCCAGCCGCTAATTTTTTA 5695

 20952247 TTTTTTATTGTTTGTAGAGAGGGGGTCTCCCTATGTTGCCTAGGCTGTTTTGTTTTTTTT 20952306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5696 TTTTTTATTGTTTGTAGAGAGGGGGTCTCCCTATGTTGCCTAGGCTGTTTTGTTTTTTTT 5755

 20952307 TTTAAACAGAGACAGGGTCTTGCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGGGCTCAA 20952366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5756 TTTAAACAGAGACAGGGTCTTGCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGGGCTCAA 5815

 20952367 GCAGTCCTCCCATCTTGGTTTTCCAAAGTGCTAGGATTACAGGCATGAACCACCAGGCCC 20952426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5816 GCAGTCCTCCCATCTTGGTTTTCCAAAGTGCTAGGATTACAGGCATGAACCACCAGGCCC 5875

 20952427 GGTCTCCACTGTGAATCTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACTGAGTTTCACTCTTGTTGCCCA 20952486
          |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
     5876 GGTCTCCACTGTGAATCTTTTTTTTTTTTTTT-GAGACTGAGTTTCACTCTTGTTGCCCA 5934

 20952487 GGCTGGAGTGCAGTGGCACCATCTCGGCTCACCGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCA 20952546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5935 GGCTGGAGTGCAGTGGCACCATCTCGGCTCACCGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCA 5994

 20952547 ATTCTGCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTCAGATTACAGGCATGCACCACTACGCCCAGC 20952606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5995 ATTCTGCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTCAGATTACAGGCATGCACCACTACGCCCAGC 6054

 20952607 TAATTTTTTGTATTTTTAATAGATACAGGTTTTCACCATGCTACCCAGGATAGTCTTGAT 20952666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6055 TAATTTTTTGTATTTTTAATAGATACAGGTTTTCACCATGCTACCCAGGATAGTCTTGAT 6114

 20952667 CTCCTGACCTCATGATCCACCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGATGTGAG 20952726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6115 CTCCTGACCTCATGATCCACCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGATGTGAG 6174

 20952727 CCACCGCACCCGGCCGCTAATGTTTTATTTTTTATTGTTTGTAGAGACAGGGTCTCCCCA 20952786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6175 CCACCGCACCCGGCCGCTAATGTTTTATTTTTTATTGTTTGTAGAGACAGGGTCTCCCCA 6234

 20952787 TGTTGCCTAGGCTGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTAACAGAGACAGGATCTTGCTA 20952846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||
     6235 TGTTGCCTAGGCTGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTT-----AACAGAGACAGGATCTTGCTA 6289

 20952847 TGTTGCCAAGGCTGGTCTTGAACTCCTGGGTTCAAGCAGTCCTCCCATCTTGGTCTCCCA 20952906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6290 TGTTGCCAAGGCTGGTCTTGAACTCCTGGGTTCAAGCAGTCCTCCCATCTTGGTCTCCCA 6349

 20952907 CCCAAAATGCTAGGATAGGCGTGAACCGCCAGGCCCGGTCTCCATTGTGAATCTTTTTTT 20952966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6350 CCCAAAATGCTAGGATAGGCGTGAACCGCCAGGCCCGGTCTCCATTGTGAATCTTTTTTT 6409

 20952967 TTT 20952969
          |||
     6410 TTT 6412

EXCISED REGION

 20952973 TTTTTTTTTTTGAGACTGTGTTTTGCTCTTGTTGCCCAGGCGGGAGTACAGTGGTGCGAT 20953032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6415 TTTTTTTTTTTGAGACTGTGTTTTGCTCTTGTTGCCCAGGCGGGAGTACAGTGGTGCGAT 6474

 20953033 CTCGGCTCACCGCAACCTCCGTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCT 20953092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6475 CTCGGCTCACCGCAACCTCCGTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCT 6534

 20953093 TCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCGCCACCATGCCTGGCTAATTTTGTATTTTTAG 20953152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6535 TCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCGCCACCATGCCTGGCTAATTTTGTATTTTTAG 6594

 20953153 TAGAGATGGGGTTTCCCCATGTTGGTCAAGCTGATCACGAACTCCCGACCTCAGATGATC 20953212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6595 TAGAGATGGGGTTTCCCCATGTTGGTCAAGCTGATCACGAACTCCCGACCTCAGATGATC 6654

 20953213 CACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCTACCGCGCCCGGTTTA 20953272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6655 CACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCTACCGCGCCCGGTTTA 6714

 20953273 CCATTTTGAATCTTAAGAGGACAAAGTCTGGTTCTCTAGAAGGCCCGAGTAGCTTTTCCC 20953332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6715 CCATTTTGAATCTTAAGAGGACAAAGTCTGGTTCTCTAGAAGGCCCGAGTAGCTTTTCCC 6774

 20953333 CTGAGCATCTTGAGAAAAAAGTGCTCTGAGCACTCCTTGGGAAGTCCGAGACAGCACATG 20953392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6775 CTGAGCATCTTGAGAAAAAAGTGCTCTGAGCACTCCTTGGGAAGTCCGAGACAGCACATG 6834

 20953393 CAGCCAGGTGCTCCCTGGCTGCTCTCCCAGAGGTCAGCACAGCTGGAGGCAGCTGGAGGG 20953452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6835 CAGCCAGGTGCTCCCTGGCTGCTCTCCCAGAGGTCAGCACAGCTGGAGGCAGCTGGAGGG 6894

 20953453 AGGAGGCTGCAGAGGCGCTGAAGCCAGGAAGACCCAACAGTGGAGAGAGAAGTTGCCTGG 20953512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6895 AGGAGGCTGCAGAGGCGCTGAAGCCAGGAAGACCCAACAGTGGAGAGAGAAGTTGCCTGG 6954

 20953513 TGACTGACCCTCGGCTTGACCCTGTGCTCCCCTGGGCTGAGCTGGGTGTCAAAAGGCCTC 20953572
          |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6955 TGACTGA---TCGGCTTGACCCTGTGCTCCCCTGGGCTGAGCTGGGTGTCAAAAGGCCTC 7011

 20953573 CACCCTCCAAAGTGCCAGCCTCCTGCTGTGGCTGGAAAGCATTTGCTCCTCCTCCTCTTC 20953632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7012 CACCCTCCAAAGTGCCAGCCTCCTGCTGTGGCTGGAAAGCATTTGCTCCTCCTCCTCTTC 7071

 20953633 TCACTTCTTTGCATTCTTCTGATCTCTTAAGGGCGTACAAAGATTCACATGGATATTAAA 20953692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7072 TCACTTCTTTGCATTCTTCTGATCTCTTAAGGGCGTACAAAGATTCACATGGATATTAAA 7131

 20953693 GTCAATGGTGATTTTCATAGCTGGAATACTCGTTGGGAGAAAGTAGGAATTCTTTTTTTT 20953752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7132 GTCAATGGTGATTTTCATAGCTGGAATACTCGTTGGGAGAAAGTAGGAATTCTTTTTTTT 7191

 20953753 TTTTTTTTCTCCCAAGCTCAAGCGATCCTCCCACCTCAGCCTTCTGAGTAGCTGGGACCA 20953812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7192 TTTTTTTTCTCCCAAGCTCAAGCGATCCTCCCACCTCAGCCTTCTGAGTAGCTGGGACCA 7251

 20953813 CAGGTGTGAGCCTCCATGATGGCCTGGCTAATTTTTTATATTTTTAGTAGAGATGGGGTT 20953872
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     7252 CAGGTGTGAGCCTCCATGATGGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTT 7311

 20953873 TCACCATGTTGCTCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAGCTCAGGCGATCCACCTGCCTCGGC 20953932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7312 TCACCATGTTGCTCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAGCTCAGGCGATCCACCTGCCTCGGC 7371

 20953933 TTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCTGGCCAAAAGTAGAAATTCT 20953992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7372 TTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCTGGCCAAAAGTAGAAATTCT 7431

 20953993 TGATTGGGAAATAATTTTATATATTTCGGCCCCTTCTCACTTGGGAAAATTCTGCTAAGA 20954052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7432 TGATTGGGAAATAATTTTATATATTTCGGCCCCTTCTCACTTGGGAAAATTCTGCTAAGA 7491

 20954053 ATTCTGGTTTTGAGAGTCAAGGGAAGCTAGCTTAATTTTTAAAGTGAAGGCTACATAAGA 20954112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7492 ATTCTGGTTTTGAGAGTCAAGGGAAGCTAGCTTAATTTTTAAAGTGAAGGCTACATAAGA 7551

 20954113 GTCCTCTCTCCAGTGTGGTGGCTCACACCTATAAACCCAGCGCTTCGGGCAAATCACTTG 20954172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7552 GTCCTCTCTCCAGTGTGGTGGCTCACACCTATAAACCCAGCGCTTCGGGCAAATCACTTG 7611

 20954173 AGCCCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCAATGTAGTGAGACCCCTATCTCTACAAAAAAAT 20954232
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     7612 AGCCCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCAATGTAGTGAGACCTCTATCTCTACAAAAAAAT 7671

 20954233 TTAAAAATTAGCAGGGTGTGGTGGTGCGTGCCTGTAGTCCTGGCTACTTGGGTGGGATGC 20954292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7672 TTAAAAATTAGCAGGGTGTGGTGGTGCGTGCCTGTAGTCCTGGCTACTTGGGTGGGATGC 7731

 20954293 TGATGTGGGAGGATTGCTTGAGCCCAGGATTTGGAGGTTGCAGCGAGCCATGATGGTGCA 20954352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7732 TGATGTGGGAGGATTGCTTGAGCCCAGGATTTGGAGGTTGCAGCGAGCCATGATGGTGCA 7791

 20954353 TTGCACTCCAGCCTGGGCAACATGGCAAGACCTCGTCTCAAAAAAATACAAAGAGTCCTC 20954412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7792 TTGCACTCCAGCCTGGGCAACATGGCAAGACCTCGTCTCAAAAAAATACAAAGAGTCCTC 7851

 20954413 TCTATGTTGGAAATGTCAGAGTTATTGGCCATTTAGGGGATCTAACTTGCTCTTTGATGT 20954472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7852 TCTATGTTGGAAATGTCAGAGTTATTGGCCATTTAGGGGATCTAACTTGCTCTTTGATGT 7911

 20954473 CCAAGAGGAAA 20954483
          |||||||||||
     7912 CCAAGAGGAAA 7922

Alignment time is 6.55145 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [20940623,20963850] =>     23228 nucs '22 dna:chromosome chromosome:GRCh37:22:1:51304566:1'
Second seq [       1,    3078] =>      3078 nucs 'mol-32-2081-039885_3078'

Score:        3034
Aligned:      3078        nucs
Identic:      3074 (100%) nucs =>       115 (100%)      2959 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [20948460,20948574] EXCISED REGION [20948576,20951537]
 second seq =>  [       1,     115] EXCISED REGION [     117,    3078]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [20948575,20948575]
 second seq =>         1 nucs [116,116]
ALTERNATIVE REGION(S): 2
 first  seq =>         1 nucs [20949469,20949469]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [115,115] to [116,116]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 20948460 GGAAAGAAAGGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAAGAAAGAAAGAAAGAGAAAGAGAAAATAAA 20948519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGAAAGAAAGGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAAGAAAGAAAGAAAGAGAAAGAGAAAATAAA 60

 20948520 GAAAAAGAAAGAAAGAAGGAGAATATGTGAGAAGTCAGCCAGGTAGTGACTCATG 20948574
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAAAAAGAAAGAAAGAAGGAGAATATGTGAGAAGTCAGCCAGGTAGTGACTCATG 115

EXCISED REGION

 20948576 CTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCACTTGAGGTCAGCAGTTCAA 20948635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      117 CTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCACTTGAGGTCAGCAGTTCAA 176

 20948636 GACCAGCCTGGGCAACATGGTGATAACCCATCTCTACTAAAAATAAAAAAATTAGCTGGA 20948695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      177 GACCAGCCTGGGCAACATGGTGATAACCCATCTCTACTAAAAATAAAAAAATTAGCTGGA 236

 20948696 TGTGGTGTCATGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTG 20948755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      237 TGTGGTGTCATGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTG 296

 20948756 AACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTAAGCTGAGATTATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCA 20948815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      297 AACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTAAGCTGAGATTATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCA 356

 20948816 GTAAGACTCCGTCTCAAAAAACAAAAAGAAAATATAAGAAGTCAAAAACACAACAGAATG 20948875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      357 GTAAGACTCCGTCTCAAAAAACAAAAAGAAAATATAAGAAGTCAAAAACACAACAGAATG 416

 20948876 AAAGATCAGGGCTGGCAGCAGTGGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAG 20948935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      417 AAAGATCAGGGCTGGCAGCAGTGGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAG 476

 20948936 TTGGGTGGATCACCTGAGGTTAGGAGTTGGAGACCAGCCTGGCCAACATGGAGAAACCCC 20948995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      477 TTGGGTGGATCACCTGAGGTTAGGAGTTGGAGACCAGCCTGGCCAACATGGAGAAACCCC 536

 20948996 GTCTCTACTCAAAATACAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCGCATGCCTGTAATCCCAACT 20949055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      537 GTCTCTACTCAAAATACAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCGCATGCCTGTAATCCCAACT 596

 20949056 ACACAGAAGGATGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGATGTAGTGAGCC 20949115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      597 ACACAGAAGGATGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGATGTAGTGAGCC 656

 20949116 GAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAAGGAGACTCTGTCTCAAAAAAGAA 20949175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      657 GAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAAGGAGACTCTGTCTCAAAAAAGAA 716

 20949176 AGAAAGAAAGGTCAGGTGCATGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGAGAGGCCAAAG 20949235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      717 AGAAAGAAAGGTCAGGTGCATGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGAGAGGCCAAAG 776

 20949236 TAGAAGGATCGTTTGAGCCCAGGAGTTGGAGACCAGCCTGGGCAATATAGCCAGACCCTG 20949295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      777 TAGAAGGATCGTTTGAGCCCAGGAGTTGGAGACCAGCCTGGGCAATATAGCCAGACCCTG 836

 20949296 TCTCTAC-AAAAAATTAAAAAAATTGCCAGCATGGTGGTGCACATCTGCAGTCCCTGCTA 20949354
          ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      837 TCTCTACAAAAAAATTAAAAAAATTGCCAGCATGGTGGTGCACATCTGCAGTCCCTGCTA 896

 20949355 CTCAGGAGGCCAAGGCTGCAGTGAGCTGTGATTGTACTACTGCACTCTGGCCTGGGTAAC 20949414
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      897 CTCAGGAGGCCGAGGCTGCAGTGAGCTGTGATTGTACTACTGCACTCTGGCCTGGGTAAC 956

 20949415 AGAGAGAGACCCTGTCTCAAAAATGGGGTAAAATGGTATAGGAAATTTGGATCTAAAAAA 20949474
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
      957 AGAGAGAGACCCTGTCTCAAAAATGGGGTAAAATGGTATAGGAAATTTGGATCT-AAAAA 1015

 20949475 AAAAAAAAGGAAGTGCATTAGATAAGAAATAAATGAAGATAAAATAGAATCTTTTTTTTG 20949534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1016 AAAAAAAAGGAAGTGCATTAGATAAGAAATAAATGAAGATAAAATAGAATCTTTTTTTTG 1075

 20949535 GTGGGGGTGGGGAACGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCACGATC 20949594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1076 GTGGGGGTGGGGAACGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCACGATC 1135

 20949595 TTGGCTCACCACAACATCCGCCTACTGGGTTCAGGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGA 20949654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1136 TTGGCTCACCACAACATCCGCCTACTGGGTTCAGGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGA 1195

 20949655 GTAGCTGGGATTACAGGCATGTGCCACCACGTCCAGCTAATTTTGTATTTTTATTAGAGT 20949714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1196 GTAGCTGGGATTACAGGCATGTGCCACCACGTCCAGCTAATTTTGTATTTTTATTAGAGT 1255

 20949715 CGGGGGTTACTCCACGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTAACCTCAGGCGATCTGCCT 20949774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1256 CGGGGGTTACTCCACGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTAACCTCAGGCGATCTGCCT 1315

 20949775 GCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGAATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGCCAGAATCT 20949834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1316 GCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGAATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGCCAGAATCT 1375

 20949835 TGTATTGTTCTTATTTTTAGTTGAACAGATGGCAGGTTATTCAAAATAATTATATCAACA 20949894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1376 TGTATTGTTCTTATTTTTAGTTGAACAGATGGCAGGTTATTCAAAATAATTATATCAACA 1435

 20949895 TGTATTCAGTAATTATAGCTTATGGATAGCTGGAATGAATGGCAGCAATGTTATAAGGGA 20949954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1436 TGTATTCAGTAATTATAGCTTATGGATAGCTGGAATGAATGGCAGCAATGTTATAAGGGA 1495

 20949955 TGGGAAGGAGGATATCCTGAGTGGAAAGAAAGTCACCCAGGCTGGAGTGAAGTGGCACAA 20950014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1496 TGGGAAGGAGGATATCCTGAGTGGAAAGAAAGTCACCCAGGCTGGAGTGAAGTGGCACAA 1555

 20950015 TTATAGCCCACTTGCAGCCTGCAACTCCTGGGCTCAAGCCATCCTTCTGCTTCAGCCTCC 20950074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1556 TTATAGCCCACTTGCAGCCTGCAACTCCTGGGCTCAAGCCATCCTTCTGCTTCAGCCTCC 1615

 20950075 CTGGTAACTGGGATTACAGACACACACCACCATGCCTGGCTAATTTTTAAATTTTTTGTC 20950134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1616 CTGGTAACTGGGATTACAGACACACACCACCATGCCTGGCTAATTTTTAAATTTTTTGTC 1675

 20950135 TCGCTGTGTTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGGCTCAAGAAATCCTCCTGCCTTAGC 20950194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1676 TCGCTGTGTTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGGCTCAAGAAATCCTCCTGCCTTAGC 1735

 20950195 CTCCCAAAGTGTTGAGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCTGGTTTATGGTTGCTTTTGA 20950254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1736 CTCCCAAAGTGTTGAGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCTGGTTTATGGTTGCTTTTGA 1795

 20950255 ATGTCCTAGTCCTACATAAGTGGCTTCCAAGAAGGGAAAAAGAAAAATGCAGGCAGGAAA 20950314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1796 ATGTCCTAGTCCTACATAAGTGGCTTCCAAGAAGGGAAAAAGAAAAATGCAGGCAGGAAA 1855

 20950315 AGGTGCTGATCCATAAAAACCTCTGGAAGGTATGTCTCTAGGGAGGGGGTGAGTGTTGAG 20950374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1856 AGGTGCTGATCCATAAAAACCTCTGGAAGGTATGTCTCTAGGGAGGGGGTGAGTGTTGAG 1915

 20950375 GAGGGATGTTGCAAACATGGTAGTGGAGATGGCAAGAGTGGCTGCCTGCCTCTTCGTCTG 20950434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1916 GAGGGATGTTGCAAACATGGTAGTGGAGATGGCAAGAGTGGCTGCCTGCCTCTTCGTCTG 1975

 20950435 CACTTCCACAATCTGAAGCAGCCATCATCAATCGGAACACAGATCCCCAGTATTTGGAGG 20950494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1976 CACTTCCACAATCTGAAGCAGCCATCATCAATCGGAACACAGATCCCCAGTATTTGGAGG 2035

 20950495 ATGGGGCTCTTATTGCCTGCTGTGGCTCCTGCAAGCTATAGGGAAGCTACCCCAGAAGTA 20950554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2036 ATGGGGCTCTTATTGCCTGCTGTGGCTCCTGCAAGCTATAGGGAAGCTACCCCAGAAGTA 2095

 20950555 TAGGCATGGCTGCTTGCACCACCAATTTAAATGCTAATTACTTCTGAAAACACCCTCACA 20950614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2096 TAGGCATGGCTGCTTGCACCACCAATTTAAATGCTAATTACTTCTGAAAACACCCTCACA 2155

 20950615 CACATGCCCAGAAATAATGTGTAACCAGATATGTGTGCATCCAGTGGCCCAGACAAGTTG 20950674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2156 CACATGCCCAGAAATAATGTGTAACCAGATATGTGTGCATCCAGTGGCCCAGACAAGTTG 2215

 20950675 ACATATAGAATTAACCATCACAAGTCCACCCCTTGTCAACCTGGTACCTACACACATCTC 20950734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2216 ACATATAGAATTAACCATCACAAGTCCACCCCTTGTCAACCTGGTACCTACACACATCTC 2275

 20950735 CTTAAACCATACTTAACCTCCAAATAAACACAATAACAAAGTCAGTGTTAGCAGTGGAAG 20950794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2276 CTTAAACCATACTTAACCTCCAAATAAACACAATAACAAAGTCAGTGTTAGCAGTGGAAG 2335

 20950795 GTGTCTGAGTTAGTGGCAGCGAATCCGTATGGGTCTGCAGCAACCTCAATTCTTGCCTCC 20950854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2336 GTGTCTGAGTTAGTGGCAGCGAATCCGTATGGGTCTGCAGCAACCTCAATTCTTGCCTCC 2395

 20950855 TCAGAAAAAAGAATTCAACTGGCCGGGCATGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTT 20950914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2396 TCAGAAAAAAGAATTCAACTGGCCGGGCATGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTT 2455

 20950915 GGGAGGCCAAGGCGGGCAGACCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACACGG 20950974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2456 GGGAGGCCAAGGCGGGCAGACCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACACGG 2515

 20950975 TGAAACCTCGTCTTTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCATGGTGGTGGGTGCCTGTT 20951034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2516 TGAAACCTCGTCTTTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCATGGTGGTGGGTGCCTGTT 2575

 20951035 GTCCCAGCTACATGAGAGACTGAGGCAGGAGAATGGCAGGAACCCAGGAGGCGGAGCTTG 20951094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2576 GTCCCAGCTACATGAGAGACTGAGGCAGGAGAATGGCAGGAACCCAGGAGGCGGAGCTTG 2635

 20951095 CAGTGAGCCGAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCAAGACTCCGTCTC 20951154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2636 CAGTGAGCCGAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCAAGACTCCGTCTC 2695

 20951155 AAAAAAAAAAAGAATTCAACTGAGGGGCATAAGGCAGAAAAAGAGACCGAGGCAAGTTTT 20951214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2696 AAAAAAAAAAAGAATTCAACTGAGGGGCATAAGGCAGAAAAAGAGACCGAGGCAAGTTTT 2755

 20951215 GGAGGAGGAGTGAAAGTTTATTTAAAAAAGCTTTACAACAGGAAAGAAAGTATTCTTGGA 20951274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     2756 GGAGGAGGAGTGAAAGTTTATTTAAAAAAGCTTTACAACAGGAAAGGAAGTATTCTTGGA 2815

 20951275 AGAGACCTAAACAGGCACATAAAGGTCAAGTGCGGTGTTTAACCTTGATTCTAGGACTTT 20951334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2816 AGAGACCTAAACAGGCACATAAAGGTCAAGTGCGGTGTTTAACCTTGATTCTAGGACTTT 2875

 20951335 ATAGACTGACCCCTTTCCCAAGATTCTTCCCCTAGGGTGGGCTGCCTACATGCACAGTGT 20951394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2876 ATAGACTGACCCCTTTCCCAAGATTCTTCCCCTAGGGTGGGCTGCCTACATGCACAGTGT 2935

 20951395 CCTCCTTACCCTTGGGAGATGAGCACACGCAGTGTGTTTAGGAAACTGTACGCATGCCCA 20951454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2936 CCTCCTTACCCTTGGGAGATGAGCACACGCAGTGTGTTTAGGAAACTGTACGCATGCCCA 2995

 20951455 TCTGAAGATTTCTTCCGTCCCAGAAGGTCATACTCTGCCATTGTCTCTTAATGCACATGG 20951514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2996 TCTGAAGATTTCTTCCGTCCCAGAAGGTCATACTCTGCCATTGTCTCTTAATGCACATGG 3055

 20951515 CCGGGGAAATTGCTTCTCCCTGG 20951537
          |||||||||||||||||||||||
     3056 CCGGGGAAATTGCTTCTCCCTGG 3078

Alignment time is 2.64408 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [20940623,20963850] =>     23228 nucs '22 dna:chromosome chromosome:GRCh37:22:1:51304566:1'
Second seq [       1,    3092] =>      3092 nucs 'mol-32-22de-028463_3092'

Score:        3025
Aligned:      3071        nucs
Identic:      3066 (100%) nucs =>       414 (100%)      2652 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [20950210,20950623] EXCISED REGION [20953851,20956507]
 second seq =>  [      14,     427] EXCISED REGION [     438,    3092]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3227 nucs [20950624,20953850]
 second seq =>        10 nucs [428,437]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [428,429] to [438,439]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [20950624,20950624] to [20953850,20953850]
 second seq =>         0 nucs

 20950210 GATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCTGGTTTATGGTTGCTTTTGAATGTCCTAGTCCTAC 20950269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       14 GATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCTGGTTTATGGTTGCTTTTGAATGTCCTAGTCCTAC 73

 20950270 ATAAGTGGCTTCCAAGAAGGGAAAAAGAAAAATGCAGGCAGGAAAAGGTGCTGATCCATA 20950329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       74 ATAAGTGGCTTCCAAGAAGGGAAAAAGAAAAATGCAGGCAGGAAAAGGTGCTGATCCATA 133

 20950330 AAAACCTCTGGAAGGTATGTCTCTAGGGAGGGGGTGAGTGTTGAGGAGGGATGTTGCAAA 20950389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      134 AAAACCTCTGGAAGGTATGTCTCTAGGGAGGGGGTGAGTGTTGAGGAGGGATGTTGCAAA 193

 20950390 CATGGTAGTGGAGATGGCAAGAGTGGCTGCCTGCCTCTTCGTCTGCACTTCCACAATCTG 20950449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      194 CATGGTAGTGGAGATGGCAAGAGTGGCTGCCTGCCTCTTCGTCTGCACTTCCACAATCTG 253

 20950450 AAGCAGCCATCATCAATCGGAACACAGATCCCCAGTATTTGGAGGATGGGGCTCTTATTG 20950509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      254 AAGCAGCCATCATCAATCGGAACACAGATCCCCAGTATTTGGAGGATGGGGCTCTTATTG 313

 20950510 CCTGCTGTGGCTCCTGCAAGCTATAGGGAAGCTACCCCAGAAGTATAGGCATGGCTGCTT 20950569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      314 CCTGCTGTGGCTCCTGCAAGCTATAGGGAAGCTACCCCAGAAGTATAGGCATGGCTGCTT 373

 20950570 GCACCACCAATTTAAATGCTAATTACTTCTGAAAACACCCTCACACACATGCCC 20950623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      374 GCACCACCAATTTAAATGCTAATTACTTCTGAAAACACCCTCACACACATGCCC 427

EXCISED REGION

 20953851 TATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGCTCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAGCT 20953910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      438 TATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGCTCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAGCT 497

 20953911 CAGGCGATCCACCTGCCTCGGCTTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTG 20953970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      498 CAGGCGATCCACCTGCCTCGGCTTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTG 557

 20953971 CCTGGCCAAAAGTAGAAATTCTTGATTGGGAAATAATTTTATATATTTCGGCCCCTTCTC 20954030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      558 CCTGGCCAAAAGTAGAAATTCTTGATTGGGAAATAATTTTATATATTTCGGCCCCTTCTC 617

 20954031 ACTTGGGAAAATTCTGCTAAGAATTCTGGTTTTGAGAGTCAAGGGAAGCTAGCTTAATTT 20954090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      618 ACTTGGGAAAATTCTGCTAAGAATTCTGGTTTTGAGAGTCAAGGGAAGCTAGCTTAATTT 677

 20954091 TTAAAGTGAAGGCTACATAAGAGTCCTCTCTCCAGTGTGGTGGCTCACACCTATAAACCC 20954150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      678 TTAAAGTGAAGGCTACATAAGAGTCCTCTCTCCAGTGTGGTGGCTCACACCTATAAACCC 737

 20954151 AGCGCTTCGGGCAAATCACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCAATGTAGTGAG 20954210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      738 AGCGCTTCGGGCAAATCACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCAATGTAGTGAG 797

 20954211 ACCCCTATCTCTACAAAAAAATTTAAAAATTAGCAGGGTGTGGTGGTGCGTGCCTGTAGT 20954270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      798 ACCCCTATCTCTACAAAAAAATTTAAAAATTAGCAGGGTGTGGTGGTGCGTGCCTGTAGT 857

 20954271 CCTGGCTACTTGGGTGGGATGCTGATGTGGGAGGATTGCTTGAGCCCAGGATTTGGAGGT 20954330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      858 CCTGGCTACTTGGGTGGGATGCTGATGTGGGAGGATTGCTTGAGCCCAGGATTTGGAGGT 917

 20954331 TGCAGCGAGCCATGATGGTGCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACATGGCAAGACCTCGTCT 20954390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      918 TGCAGCGAGCCATGATGGTGCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACATGGCAAGACCTCGTCT 977

 20954391 CAAAAAAATACAAAGAGTCCTCTCTATGTTGGAAATGTCAGAGTTATTGGCCATTTAGGG 20954450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      978 CAAAAAAATACAAAGAGTCCTCTCTATGTTGGAAATGTCAGAGTTATTGGCCATTTAGGG 1037

 20954451 GATCTAACTTGCTCTTTGATGTCCAAGAGGAAAGGTATAGAGTTCTCCTGATTACACAGG 20954510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1038 GATCTAACTTGCTCTTTGATGTCCAAGAGGAAAGGTATAGAGTTCTCCTGATTACACAGG 1097

 20954511 GCCTCTGCTTGTGGGTCGCCTGCATGAGGCGATCAGAATCTGAGTCACCTGGGATCATGT 20954570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1098 GCCTCTGCTTGTGGGTCGCCTGCATGAGGCGATCAGAATCTGAGTCACCTGGGATCATGT 1157

 20954571 GGGTGCTGGTACATCCTAGAGATAGGATGTGTTGGTCATGGAAGAGAGTGGGCCACAAAT 20954630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1158 GGGTGCTGGTACATCCTAGAGATAGGATGTGTTGGTCATGGAAGAGAGTGGGCCACAAAT 1217

 20954631 GGGTTCCAGGGGAATAGCGTTGCCTGGTGCAAGGAGGGGGATGTGGAGGTGCAGGGAGCA 20954690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1218 GGGTTCCAGGGGAATAGCGTTGCCTGGTGCAAGGAGGGGGATGTGGAGGTGCAGGGAGCA 1277

 20954691 GGGGTGGTGTCTGGAGAGCCTGAAGCTGTGCTGCCAGAGGCTCCAGGCCATGAGGTCTGA 20954750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1278 GGGGTGGTGTCTGGAGAGCCTGAAGCTGTGCTGCCAGAGGCTCCAGGCCATGAGGTCTGA 1337

 20954751 GAAGCATCTAGATTTGGCCTGTTCACAGCAGGGAAGTGTGGTCCAGTGGCAAAAAGTTGA 20954810
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1338 GAAGCATCTGGATTTGGCCTGTTCACAGCAGGGAAGTGTGGTCCAGTGGCAAAAAGTTGA 1397

 20954811 GGGCATCCTAGGAGTTGAGGAGGTGGTGGCGGTTAGAGTAAACCACTCTGGAGGCGTCCG 20954870
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     1398 GGGCATCCTAGGAGTTGAGGAGGTGGTGGCGGTTAGAGTAAACCACTCTGGAGGCATCCG 1457

 20954871 GGGTGGAGAGACGAGAATGTGCAAGAACTCCTGCCTCTAGCCTGGCCTCCTCAGGACCCC 20954930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1458 GGGTGGAGAGACGAGAATGTGCAAGAACTCCTGCCTCTAGCCTGGCCTCCTCAGGACCCC 1517

 20954931 GGCCACCAGCCTCCCTCCTAGAAGTCCCCAGAGCTTCCTCCTCCTTGTGCCCCAGAACTG 20954990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1518 GGCCACCAGCCTCCCTCCTAGAAGTCCCCAGAGCTTCCTCCTCCTTGTGCCCCAGAACTG 1577

 20954991 GTTCCTGGGTTGCTCCAACCCCAGACCTTCCCTGGAAGTCCCCCCCAGTGCCTCCTGGCT 20955050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1578 GTTCCTGGGTTGCTCCAACCCCAGACCTTCCCTGGAAGTCCCCCCCAGTGCCTCCTGGCT 1637

 20955051 GGGAACCCCCAACTGCATTTTGCTTCTGCTCTCGTGCCAGTAGTCCCCTTTTCTCTCCAG 20955110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1638 GGGAACCCCCAACTGCATTTTGCTTCTGCTCTCGTGCCAGTAGTCCCCTTTTCTCTCCAG 1697

 20955111 TGTCCAGGCCCCAACCACCAAGACCCTGCCTCCTCACTTGGCTTTGCTGTTCTTAGTTCT 20955170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1698 TGTCCAGGCCCCAACCACCAAGACCCTGCCTCCTCACTTGGCTTTGCTGTTCTTAGTTCT 1757

 20955171 CTACTCAGTAGGTTGTGTCTGCCTCCATTCCTGGCCAGACGCTGCCCTGGGGCTGAGTGC 20955230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1758 CTACTCAGTAGGTTGTGTCTGCCTCCATTCCTGGCCAGACGCTGCCCTGGGGCTGAGTGC 1817

 20955231 ACAGTCCCCAGCCACTCCCGAGATCCTCAGAGCTTCTGGAAGCCACAGACATGGTGGCAT 20955290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1818 ACAGTCCCCAGCCACTCCCGAGATCCTCAGAGCTTCTGGAAGCCACAGACATGGTGGCAT 1877

 20955291 ATGTTTCAGGTCGTCAGCTTGTTTTTTTTTGGAGACAGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGC 20955350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1878 ATGTTTCAGGTCGTCAGCTTGTTTTTTTTTGGAGACAGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGC 1937

 20955351 TGGAGTGCGGTGACGTGATCATTCACTGCAGCCTTGACCTTCTGAGCCCGGGTGATCCTC 20955410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1938 TGGAGTGCGGTGACGTGATCATTCACTGCAGCCTTGACCTTCTGAGCCCGGGTGATCCTC 1997

 20955411 CCACCTCAGCCTGTCAAGTAGCTGAGACCACATGTGTGAGCCACCACACCTAGCTTTTTG 20955470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1998 CCACCTCAGCCTGTCAAGTAGCTGAGACCACATGTGTGAGCCACCACACCTAGCTTTTTG 2057

 20955471 AATCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCA 20955530
          ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2058 AATC--TTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCA 2115

 20955531 GTGGCACAATCTTGGCTTACTGCAACCTCCAGCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCT 20955590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2116 GTGGCACAATCTTGGCTTACTGCAACCTCCAGCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCT 2175

 20955591 CTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGTAGGTGGCACCACACCTAGCTAATTTTTATGTCTTT 20955650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2176 CTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGTAGGTGGCACCACACCTAGCTAATTTTTATGTCTTT 2235

 20955651 AGTAGAGACAAAGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGATCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGA 20955710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2236 AGTAGAGACAAAGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGATCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGA 2295

 20955711 TCTGCCTGTCTTGACCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGGGCCACGCGCCCAGCCA 20955770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2296 TCTGCCTGTCTTGACCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGGGCCACGCGCCCAGCCA 2355

 20955771 ACTTTTTGAATCTTTTGTAGGGATGGGGTCTTGCTGTGTTGCCCAGGCTGGGCTTAAACT 20955830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2356 ACTTTTTGAATCTTTTGTAGGGATGGGGTCTTGCTGTGTTGCCCAGGCTGGGCTTAAACT 2415

 20955831 CCTGGACTCAAGTGATCCTCCCTGCCTTGGTTTCTCAAACTTCTGGGATTACAGGCCAAT 20955890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2416 CCTGGACTCAAGTGATCCTCCCTGCCTTGGTTTCTCAAACTTCTGGGATTACAGGCCAAT 2475

 20955891 CTACTCAACGTTGATATTGAGTAGAAGGCAAAATTCACATGGCTCCGGCCCAGCCCCTTT 20955950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2476 CTACTCAACGTTGATATTGAGTAGAAGGCAAAATTCACATGGCTCCGGCCCAGCCCCTTT 2535

 20955951 CTGTCTCAGGCACTTCAGTGTTAATATGCGCCTTGGTTTTGCTGCTGCCGAGTCTACTGT 20956010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2536 CTGTCTCAGGCACTTCAGTGTTAATATGCGCCTTGGTTTTGCTGCTGCCGAGTCTACTGT 2595

 20956011 GCCCCTGGGCAAGGAAAGCAAAGGAAACCAGAGGGCCAGGCCCGTGGACACTGGGGTGAG 20956070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2596 GCCCCTGGGCAAGGAAAGCAAAGGAAACCAGAGGGCCAGGCCCGTGGACACTGGGGTGAG 2655

 20956071 GGGCCAACAGGGTGCCCAGCAGTTGTTTCCACAGCCCCCACGTGGTCAGGGACCCTGTAT 20956130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2656 GGGCCAACAGGGTGCCCAGCAGTTGTTTCCACAGCCCCCACGTGGTCAGGGACCCTGTAT 2715

 20956131 GGGTGAACCGCCTGGATACTGAGCCTAGGCGGCGGAAAACTCAAAAGCAAGGGCAGGTTT 20956190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2716 GGGTGAACCGCCTGGATACTGAGCCTAGGCGGCGGAAAACTCAAAAGCAAGGGCAGGTTT 2775

 20956191 ATTCAGATCCCTGGTGGAGTTACAAGCTTGGTTTGGTTTTTGGTCACAGGCCCTAAAATA 20956250
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     2776 ATTCAGATCCCTGGTGGAGTTACAAGCTTGGTTTGGTTTTTGGTCACAGGCCCTAAAATG 2835

 20956251 CCTGTATTCTGAGTTTACATAAAAATACAAAGCACTGGCCGGGCGCGCTGGCTCACACCT 20956310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2836 CCTGTATTCTGAGTTTACATAAAAATACAAAGCACTGGCCGGGCGCGCTGGCTCACACCT 2895

 20956311 GTAAGCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTGGCTAACATGAGGTCAGGAATTTGAAA 20956370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2896 GTAAGCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTGGCTAACATGAGGTCAGGAATTTGAAA 2955

 20956371 CCAGCCTGACTAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCA 20956430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2956 CCAGCCTGACTAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCA 3015

 20956431 TGGTGGCGCATGCCTGTAATCCCAGCTATTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAA 20956490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3016 TGGTGGCGCATGCCTGTAATCCCAGCTATTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAA 3075

 20956491 CCTGGGAGGCGGAGGTT 20956507
          |||||||||||||||||
     3076 CCTGGGAGGCGGAGGTT 3092

Alignment time is 2.58183 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [20940623,20963850] =>     23228 nucs '22 dna:chromosome chromosome:GRCh37:22:1:51304566:1'
Second seq [       1,    2482] =>      2482 nucs 'mol-32-2b34-052591_2482'

Score:        2423
Aligned:      2456        nucs
Identic:      2453 (100%) nucs =>      1428 (100%)      1025 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [20949196,20950623] EXCISED REGION [20953851,20954878]
 second seq =>  [      17,    1444] EXCISED REGION [    1455,    2482]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3227 nucs [20950624,20953850]
 second seq =>        10 nucs [1445,1454]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [1445,1446] to [1455,1456]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [20950624,20950624] to [20953850,20953850]
 second seq =>         0 nucs

 20949196 TGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGAGAGGCCAAAGTAGAAGGATCGTTTGAGCCC 20949255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       17 TGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGAGAGGCCAAAGTAGAAGGATCGTTTGAGCCC 76

 20949256 AGGAGTTGGAGACCAGCCTGGGCAATATAGCCAGACCCTGTCTCTACAAAAAATTAAAAA 20949315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       77 AGGAGTTGGAGACCAGCCTGGGCAATATAGCCAGACCCTGTCTCTACAAAAAATTAAAAA 136

 20949316 AATTGCCAGCATGGTGGTGCACATCTGCAGTCCCTGCTACTCAGGAGGCCAAGGCTGCAG 20949375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      137 AATTGCCAGCATGGTGGTGCACATCTGCAGTCCCTGCTACTCAGGAGGCCAAGGCTGCAG 196

 20949376 TGAGCTGTGATTGTACTACTGCACTCTGGCCTGGGTAACAGAGAGAGACCCTGTCTCAAA 20949435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      197 TGAGCTGTGATTGTACTACTGCACTCTGGCCTGGGTAACAGAGAGAGACCCTGTCTCAAA 256

 20949436 AATGGGGTAAAATGGTATAGGAAATTTGGATCTAAAAAAAAAAAAAAGGAAGTGCATTAG 20949495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      257 AATGGGGTAAAATGGTATAGGAAATTTGGATCTAAAAAAAAAAAAAAGGAAGTGCATTAG 316

 20949496 ATAAGAAATAAATGAAGATAAAATAGAATCTTTTTTTTGGTGGGGGTGGGGAACGGAGTT 20949555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      317 ATAAGAAATAAATGAAGATAAAATAGAATCTTTTTTTTGGTGGGGGTGGGGAACGGAGTT 376

 20949556 TCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCACGATCTTGGCTCACCACAACATCCGC 20949615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      377 TCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCACGATCTTGGCTCACCACAACATCCGC 436

 20949616 CTACTGGGTTCAGGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATG 20949675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      437 CTACTGGGTTCAGGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATG 496

 20949676 TGCCACCACGTCCAGCTAATTTTGTATTTTTATTAGAGTCGGGGGTTACTCCACGTTGGT 20949735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      497 TGCCACCACGTCCAGCTAATTTTGTATTTTTATTAGAGTCGGGGGTTACTCCACGTTGGT 556

 20949736 CAGGCTGGTCTTGAACTCCTAACCTCAGGCGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCT 20949795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      557 CAGGCTGGTCTTGAACTCCTAACCTCAGGCGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCT 616

 20949796 GGAATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGCCAGAATCTTGTATTGTTCTTATTTTTAGT 20949855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      617 GGAATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGCCAGAATCTTGTATTGTTCTTATTTTTAGT 676

 20949856 TGAACAGATGGCAGGTTATTCAAAATAATTATATCAACATGTATTCAGTAATTATAGCTT 20949915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      677 TGAACAGATGGCAGGTTATTCAAAATAATTATATCAACATGTATTCAGTAATTATAGCTT 736

 20949916 ATGGATAGCTGGAATGAATGGCAGCAATGTTATAAGGGATGGGAAGGAGGATATCCTGAG 20949975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      737 ATGGATAGCTGGAATGAATGGCAGCAATGTTATAAGGGATGGGAAGGAGGATATCCTGAG 796

 20949976 TGGAAAGAAAGTCACCCAGGCTGGAGTGAAGTGGCACAATTATAGCCCACTTGCAGCCTG 20950035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      797 TGGAAAGAAAGTCACCCAGGCTGGAGTGAAGTGGCACAATTATAGCCCACTTGCAGCCTG 856

 20950036 CAACTCCTGGGCTCAAGCCATCCTTCTGCTTCAGCCTCCCTGGTAACTGGGATTACAGAC 20950095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      857 CAACTCCTGGGCTCAAGCCATCCTTCTGCTTCAGCCTCCCTGGTAACTGGGATTACAGAC 916

 20950096 ACACACCACCATGCCTGGCTAATTTTTAAATTTTTTGTCTCGCTGTGTTGCCCAGGCTGG 20950155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      917 ACACACCACCATGCCTGGCTAATTTTTAAATTTTTTGTCTCGCTGTGTTGCCCAGGCTGG 976

 20950156 TCTCAAACTCCTGGGCTCAAGAAATCCTCCTGCCTTAGCCTCCCAAAGTGTTGAGATTAC 20950215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      977 TCTCAAACTCCTGGGCTCAAGAAATCCTCCTGCCTTAGCCTCCCAAAGTGTTGAGATTAC 1036

 20950216 AGGCGTGAGCCACTGTGCCTGGTTTATGGTTGCTTTTGAATGTCCTAGTCCTACATAAGT 20950275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1037 AGGCGTGAGCCACTGTGCCTGGTTTATGGTTGCTTTTGAATGTCCTAGTCCTACATAAGT 1096

 20950276 GGCTTCCAAGAAGGGAAAAAGAAAAATGCAGGCAGGAAAAGGTGCTGATCCATAAAAACC 20950335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1097 GGCTTCCAAGAAGGGAAAAAGAAAAATGCAGGCAGGAAAAGGTGCTGATCCATAAAAACC 1156

 20950336 TCTGGAAGGTATGTCTCTAGGGAGGGGGTGAGTGTTGAGGAGGGATGTTGCAAACATGGT 20950395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1157 TCTGGAAGGTATGTCTCTAGGGAGGGGGTGAGTGTTGAGGAGGGATGTTGCAAACATGGT 1216

 20950396 AGTGGAGATGGCAAGAGTGGCTGCCTGCCTCTTCGTCTGCACTTCCACAATCTGAAGCAG 20950455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1217 AGTGGAGATGGCAAGAGTGGCTGCCTGCCTCTTCGTCTGCACTTCCACAATCTGAAGCAG 1276

 20950456 CCATCATCAATCGGAACACAGATCCCCAGTATTTGGAGGATGGGGCTCTTATTGCCTGCT 20950515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1277 CCATCATCAATCGGAACACAGATCCCCAGTATTTGGAGGATGGGGCTCTTATTGCCTGCT 1336

 20950516 GTGGCTCCTGCAAGCTATAGGGAAGCTACCCCAGAAGTATAGGCATGGCTGCTTGCACCA 20950575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1337 GTGGCTCCTGCAAGCTATAGGGAAGCTACCCCAGAAGTATAGGCATGGCTGCTTGCACCA 1396

 20950576 CCAATTTAAATGCTAATTACTTCTGAAAACACCCTCACACACATGCCC 20950623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1397 CCAATTTAAATGCTAATTACTTCTGAAAACACCCTCACACACATGCCC 1444

EXCISED REGION

 20953851 TATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGCTCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAGCT 20953910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1455 TATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGCTCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAGCT 1514

 20953911 CAGGCGATCCACCTGCCTCGGCTTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTG 20953970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1515 CAGGCGATCCACCTGCCTCGGCTTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTG 1574

 20953971 CCTGGCCAAAAGTAGAAATTCTTGATTGGGAAATAATTTTATATATTTCGGCCCCTTCTC 20954030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1575 CCTGGCCAAAAGTAGAAATTCTTGATTGGGAAATAATTTTATATATTTCGGCCCCTTCTC 1634

 20954031 ACTTGGGAAAATTCTGCTAAGAATTCTGGTTTTGAGAGTCAAGGGAAGCTAGCTTAATTT 20954090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1635 ACTTGGGAAAATTCTGCTAAGAATTCTGGTTTTGAGAGTCAAGGGAAGCTAGCTTAATTT 1694

 20954091 TTAAAGTGAAGGCTACATAAGAGTCCTCTCTCCAGTGTGGTGGCTCACACCTATAAACCC 20954150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1695 TTAAAGTGAAGGCTACATAAGAGTCCTCTCTCCAGTGTGGTGGCTCACACCTATAAACCC 1754

 20954151 AGCGCTTCGGGCAAATCACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCAATGTAGTGAG 20954210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1755 AGCGCTTCGGGCAAATCACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCAATGTAGTGAG 1814

 20954211 ACCCCTATCTCTACAAAAAAATTTAAAAATTAGCAGGGTGTGGTGGTGCGTGCCTGTAGT 20954270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1815 ACCCCTATCTCTACAAAAAAATTTAAAAATTAGCAGGGTGTGGTGGTGCGTGCCTGTAGT 1874

 20954271 CCTGGCTACTTGGGTGGGATGCTGATGTGGGAGGATTGCTTGAGCCCAGGATTTGGAGGT 20954330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1875 CCTGGCTACTTGGGTGGGATGCTGATGTGGGAGGATTGCTTGAGCCCAGGATTTGGAGGT 1934

 20954331 TGCAGCGAGCCATGATGGTGCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACATGGCAAGACCTCGTCT 20954390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1935 TGCAGCGAGCCATGATGGTGCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACATGGCAAGACCTCGTCT 1994

 20954391 CAAAAAAATACAAAGAGTCCTCTCTATGTTGGAAATGTCAGAGTTATTGGCCATTTAGGG 20954450
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1995 CAAAAAAATACAAAAAGTCCTCTCTATGTTGGAAATGTCAGAGTTATTGGCCATTTAGGG 2054

 20954451 GATCTAACTTGCTCTTTGATGTCCAAGAGGAAAGGTATAGAGTTCTCCTGATTACACAGG 20954510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2055 GATCTAACTTGCTCTTTGATGTCCAAGAGGAAAGGTATAGAGTTCTCCTGATTACACAGG 2114

 20954511 GCCTCTGCTTGTGGGTCGCCTGCATGAGGCGATCAGAATCTGAGTCACCTGGGATCATGT 20954570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2115 GCCTCTGCTTGTGGGTCGCCTGCATGAGGCGATCAGAATCTGAGTCACCTGGGATCATGT 2174

 20954571 GGGTGCTGGTACATCCTAGAGATAGGATGTGTTGGTCATGGAAGAGAGTGGGCCACAAAT 20954630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2175 GGGTGCTGGTACATCCTAGAGATAGGATGTGTTGGTCATGGAAGAGAGTGGGCCACAAAT 2234

 20954631 GGGTTCCAGGGGAATAGCGTTGCCTGGTGCAAGGAGGGGGATGTGGAGGTGCAGGGAGCA 20954690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2235 GGGTTCCAGGGGAATAGCGTTGCCTGGTGCAAGGAGGGGGATGTGGAGGTGCAGGGAGCA 2294

 20954691 GGGGTGGTGTCTGGAGAGCCTGAAGCTGTGCTGCCAGAGGCTCCAGGCCATGAGGTCTGA 20954750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2295 GGGGTGGTGTCTGGAGAGCCTGAAGCTGTGCTGCCAGAGGCTCCAGGCCATGAGGTCTGA 2354

 20954751 GAAGCATCTAGATTTGGCCTGTTCACAGCAGGGAAGTGTGGTCCAGTGGCAAAAAGTTGA 20954810
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2355 GAAGCATCTGGATTTGGCCTGTTCACAGCAGGGAAGTGTGGTCCAGTGGCAAAAAGTTGA 2414

 20954811 GGGCATCCTAGGAGTTGAGGAGGTGGTGGCGGTTAGAGTAAACCACTCTGGAGGCGTCCG 20954870
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     2415 GGGCATCCTAGGAGTTGAGGAGGTGGTGGCGGTTAGAGTAAACCACTCTGGAGGCATCCG 2474

 20954871 GGGTGGAG 20954878
          ||||||||
     2475 GGGTGGAG 2482

Alignment time is 2.08064 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [20940623,20963850] =>     23228 nucs '22 dna:chromosome chromosome:GRCh37:22:1:51304566:1'
Second seq [       1,    7515] =>      7515 nucs 'mol-32-2f07-051330_7515'

Score:        7367
Aligned:      7524        nucs
Identic:      7504 (100%) nucs =>      1498 ( 99%)      6006 (100%)
Gaps:           11 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [20951464,20952969] EXCISED REGION [20952973,20958990]
 second seq =>  [       1,    1500] EXCISED REGION [    1503,    7515]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         3 nucs [20952970,20952972]
 second seq =>         2 nucs [1501,1502]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [20952968,20952969] to [20952971,20952972]
 second seq =>         1 nucs [1501,1501] to [1503,1503]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>        10 nucs [20952960,20952969] to [20952973,20952982]
 second seq =>        10 nucs [1491,1500] to [1503,1512]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 20951464 TTCTTCCGTCCCAGAAGGTCATACTCTGCCATTGTCTCTTAATGCACATGGCCGGGGAAA 20951523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTCTTCCGTCCCAGAAGGTCATACTCTGCCATTGTCTCTTAATGCACATGGCCGGGGAAA 60

 20951524 TTGCTTCTCCCTGGTGCCTGCATTCAATTAACACTTTAATGAAACAGGTGTGACCCATCA 20951583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTGCTTCTCCCTGGTGCCTGCATTCAATTAACACTTTAATGAAACAGGTGTGACCCATCA 120

 20951584 GGAACTGGCCTCTCCCTGATGCCAGCTGCCAATTTATCACTTTCATTTTTAATTTATTTT 20951643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGAACTGGCCTCTCCCTGATGCCAGCTGCCAATTTATCACTTTCATTTTTAATTTATTTT 180

 20951644 TTAGAAGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGACTGGAGAGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACT 20951703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTAGAAGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGACTGGAGAGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACT 240

 20951704 GTAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTGGCTGGGA 20951763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTGGCTGGGA 300

 20951764 TTAGAGGCATGCACCAACATGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGCTTTC 20951823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTAGAGGCATGCACCAACATGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGCTTTC 360

 20951824 ACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACCCCTGATGTCAAGTGACCCACCCACCTTGACCT 20951883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACCCCTGATGTCAAGTGACCCACCCACCTTGACCT 420

 20951884 CACAAAGTGCTAGGATTACAGGCATGAGACACCATGCCCAGCCCTGGCTTTTTTTTTTTT 20951943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CACAAAGTGCTAGGATTACAGGCATGAGACACCATGCCCAGCCCTGGCTTTTTTTTTTTT 480

 20951944 TTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTGGCCCAGGCTGTAGTGCAGTGGCATGA 20952003
          |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTTTTTTTTTT-GAGACGGAGTCTCGCTCTGTGGCCCAGGCTGTAGTGCAGTGGCATGA 539

 20952004 TCTCGCCTCGCTGCAAGCTCCGCCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCA 20952063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      540 TCTCGCCTCGCTGCAAGCTCCGCCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCA 599

 20952064 GAGCAGCTGGGACCACAGGCGCCCACCACCACGCCCAGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTA 20952123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      600 GAGCAGCTGGGACCACAGGCGCCCACCACCACGCCCAGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTA 659

 20952124 GAGACGGGATTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTGACCTCATGATCCGCCCGC 20952183
          ||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      660 GAGACGGGGTTTCGCTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTGACCTCATGATCCGCCCGC 719

 20952184 CTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCCAGCCGCTAATTTT 20952243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      720 CTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCCAGCCGCTAATTTT 779

 20952244 TTATTTTTTATTGTTTGTAGAGAGGGGGTCTCCCTATGTTGCCTAGGCTGTTTTGTTTTT 20952303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      780 TTATTTTTTATTGTTTGTAGAGAGGGGGTCTCCCTATGTTGCCTAGGCTGTTTTGTTTTT 839

 20952304 TTTTTTAAACAGAGACAGGGTCTTGCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGGGCT 20952363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 TTTTTTAAACAGAGACAGGGTCTTGCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGGGCT 899

 20952364 CAAGCAGTCCTCCCATCTTGGTTTTCCAAAGTGCTAGGATTACAGGCATGAACCACCAGG 20952423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 CAAGCAGTCCTCCCATCTTGGTTTTCCAAAGTGCTAGGATTACAGGCATGAACCACCAGG 959

 20952424 CCCGGTCTCCACTGTGAATCTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACTGAGTTTCACTCTTGTTGC 20952483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 CCCGGTCTCCACTGTGAATCTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACTGAGTTTCACTCTTGTTGC 1019

 20952484 CCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACCATCTCGGCTCACCGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAA 20952543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 CCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACCATCTCGGCTCACCGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAA 1079

 20952544 GCAATTCTGCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTCAGATTACAGGCATGCACCACTACGCCC 20952603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 GCAATTCTGCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTCAGATTACAGGCATGCACCACTACGCCC 1139

 20952604 AGCTAATTTTTTGTATTTTTAATAGATACAGGTTTTCACCATGCTACCCAGGATAGTCTT 20952663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 AGCTAATTTTTTGTATTTTTAATAGATACAGGTTTTCACCATGCTACCCAGGATAGTCTT 1199

 20952664 GATCTCCTGACCTCATGATCCACCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGATGT 20952723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 GATCTCCTGACCTCATGATCCACCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGATGT 1259

 20952724 GAGCCACCGCACCCGGCCGCTAATGTTTTATTTTTTATTGTTTGTAGAGACAGGGTCTCC 20952783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 GAGCCACCGCACCCGGCCGCTAATGTTTTATTTTTTATTGTTTGTAGAGACAGGGTCTCC 1319

 20952784 CCATGTTGCCTAGGCTGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTAACAGAGACAGGATCTTG 20952843
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||
     1320 CCATGTTGCCTAGGCTGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTT-----AACAGAGACAGGATCTTG 1374

 20952844 CTATGTTGCCAAGGCTGGTCTTGAACTCCTGGGTTCAAGCAGTCCTCCCATCTTGGTCTC 20952903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1375 CTATGTTGCCAAGGCTGGTCTTGAACTCCTGGGTTCAAGCAGTCCTCCCATCTTGGTCTC 1434

 20952904 CCACCCAAAATGCTAGGATAGGCGTGAACCGCCAGGCCCGGTCTCCATTGTGAATCTTTT 20952963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1435 CCACCCAAAATGCTAGGATAGGCGTGAACCGCCAGGCCCGGTCTCCATTGTGAATCTTTT 1494

 20952964 TTTTTT 20952969
          ||||||
     1495 TTTTTT 1500

EXCISED REGION

 20952973 TTTTTTTTTTTGAGACTGTGTTTTGCTCTTGTTGCCCAGGCGGGAGTACAGTGGTGCGAT 20953032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1503 TTTTTTTTTTTGAGACTGTGTTTTGCTCTTGTTGCCCAGGCGGGAGTACAGTGGTGCGAT 1562

 20953033 CTCGGCTCACCGCAACCTCCGTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCT 20953092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1563 CTCGGCTCACCGCAACCTCCGTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCT 1622

 20953093 TCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCGCCACCATGCCTGGCTAATTTTGTATTTTTAG 20953152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1623 TCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCGCCACCATGCCTGGCTAATTTTGTATTTTTAG 1682

 20953153 TAGAGATGGGGTTTCCCCATGTTGGTCAAGCTGATCACGAACTCCCGACCTCAGATGATC 20953212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1683 TAGAGATGGGGTTTCCCCATGTTGGTCAAGCTGATCACGAACTCCCGACCTCAGATGATC 1742

 20953213 CACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCTACCGCGCCCGGTTTA 20953272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1743 CACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCTACCGCGCCCGGTTTA 1802

 20953273 CCATTTTGAATCTTAAGAGGACAAAGTCTGGTTCTCTAGAAGGCCCGAGTAGCTTTTCCC 20953332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1803 CCATTTTGAATCTTAAGAGGACAAAGTCTGGTTCTCTAGAAGGCCCGAGTAGCTTTTCCC 1862

 20953333 CTGAGCATCTTGAGAAAAAAGTGCTCTGAGCACTCCTTGGGAAGTCCGAGACAGCACATG 20953392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1863 CTGAGCATCTTGAGAAAAAAGTGCTCTGAGCACTCCTTGGGAAGTCCGAGACAGCACATG 1922

 20953393 CAGCCAGGTGCTCCCTGGCTGCTCTCCCAGAGGTCAGCACAGCTGGAGGCAGCTGGAGGG 20953452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1923 CAGCCAGGTGCTCCCTGGCTGCTCTCCCAGAGGTCAGCACAGCTGGAGGCAGCTGGAGGG 1982

 20953453 AGGAGGCTGCAGAGGCGCTGAAGCCAGGAAGACCCAACAGTGGAGAGAGAAGTTGCCTGG 20953512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1983 AGGAGGCTGCAGAGGCGCTGAAGCCAGGAAGACCCAACAGTGGAGAGAGAAGTTGCCTGG 2042

 20953513 TGACTGACCCTCGGCTTGACCCTGTGCTCCCCTGGGCTGAGCTGGGTGTCAAAAGGCCTC 20953572
          |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2043 TGACTGA---TCGGCTTGACCCTGTGCTCCCCTGGGCTGAGCTGGGTGTCAAAAGGCCTC 2099

 20953573 CACCCTCCAAAGTGCCAGCCTCCTGCTGTGGCTGGAAAGCATTTGCTCCTCCTCCTCTTC 20953632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 CACCCTCCAAAGTGCCAGCCTCCTGCTGTGGCTGGAAAGCATTTGCTCCTCCTCCTCTTC 2159

 20953633 TCACTTCTTTGCATTCTTCTGATCTCTTAAGGGCGTACAAAGATTCACATGGATATTAAA 20953692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 TCACTTCTTTGCATTCTTCTGATCTCTTAAGGGCGTACAAAGATTCACATGGATATTAAA 2219

 20953693 GTCAATGGTGATTTTCATAGCTGGAATACTCGTTGGGAGAAAGTAGGAATTCTTTTTTTT 20953752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 GTCAATGGTGATTTTCATAGCTGGAATACTCGTTGGGAGAAAGTAGGAATTCTTTTTTTT 2279

 20953753 TTTTTTTTCTCCCAAGCTCAAGCGATCCTCCCACCTCAGCCTTCTGAGTAGCTGGGACCA 20953812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 TTTTTTTTCTCCCAAGCTCAAGCGATCCTCCCACCTCAGCCTTCTGAGTAGCTGGGACCA 2339

 20953813 CAGGTGTGAGCCTCCATGATGGCCTGGCTAATTTTTTATATTTTTAGTAGAGATGGGGTT 20953872
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     2340 CAGGTGTGAGCCTCCATGATGGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTT 2399

 20953873 TCACCATGTTGCTCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAGCTCAGGCGATCCACCTGCCTCGGC 20953932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 TCACCATGTTGCTCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAGCTCAGGCGATCCACCTGCCTCGGC 2459

 20953933 TTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCTGGCCAAAAGTAGAAATTCT 20953992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 TTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCTGGCCAAAAGTAGAAATTCT 2519

 20953993 TGATTGGGAAATAATTTTATATATTTCGGCCCCTTCTCACTTGGGAAAATTCTGCTAAGA 20954052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 TGATTGGGAAATAATTTTATATATTTCGGCCCCTTCTCACTTGGGAAAATTCTGCTAAGA 2579

 20954053 ATTCTGGTTTTGAGAGTCAAGGGAAGCTAGCTTAATTTTTAAAGTGAAGGCTACATAAGA 20954112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 ATTCTGGTTTTGAGAGTCAAGGGAAGCTAGCTTAATTTTTAAAGTGAAGGCTACATAAGA 2639

 20954113 GTCCTCTCTCCAGTGTGGTGGCTCACACCTATAAACCCAGCGCTTCGGGCAAATCACTTG 20954172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 GTCCTCTCTCCAGTGTGGTGGCTCACACCTATAAACCCAGCGCTTCGGGCAAATCACTTG 2699

 20954173 AGCCCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCAATGTAGTGAGACCCCTATCTCTACAAAAAAAT 20954232
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     2700 AGCCCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCAATGTAGTGAGACCTCTATCTCTACAAAAAAAT 2759

 20954233 TTAAAAATTAGCAGGGTGTGGTGGTGCGTGCCTGTAGTCCTGGCTACTTGGGTGGGATGC 20954292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 TTAAAAATTAGCAGGGTGTGGTGGTGCGTGCCTGTAGTCCTGGCTACTTGGGTGGGATGC 2819

 20954293 TGATGTGGGAGGATTGCTTGAGCCCAGGATTTGGAGGTTGCAGCGAGCCATGATGGTGCA 20954352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2820 TGATGTGGGAGGATTGCTTGAGCCCAGGATTTGGAGGTTGCAGCGAGCCATGATGGTGCA 2879

 20954353 TTGCACTCCAGCCTGGGCAACATGGCAAGACCTCGTCTCAAAAAAATACAAAGAGTCCTC 20954412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2880 TTGCACTCCAGCCTGGGCAACATGGCAAGACCTCGTCTCAAAAAAATACAAAGAGTCCTC 2939

 20954413 TCTATGTTGGAAATGTCAGAGTTATTGGCCATTTAGGGGATCTAACTTGCTCTTTGATGT 20954472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2940 TCTATGTTGGAAATGTCAGAGTTATTGGCCATTTAGGGGATCTAACTTGCTCTTTGATGT 2999

 20954473 CCAAGAGGAAAGGTATAGAGTTCTCCTGATTACACAGGGCCTCTGCTTGTGGGTCGCCTG 20954532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3000 CCAAGAGGAAAGGTATAGAGTTCTCCTGATTACACAGGGCCTCTGCTTGTGGGTCGCCTG 3059

 20954533 CATGAGGCGATCAGAATCTGAGTCACCTGGGATCATGTGGGTGCTGGTACATCCTAGAGA 20954592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3060 CATGAGGCGATCAGAATCTGAGTCACCTGGGATCATGTGGGTGCTGGTACATCCTAGAGA 3119

 20954593 TAGGATGTGTTGGTCATGGAAGAGAGTGGGCCACAAATGGGTTCCAGGGGAATAGCGTTG 20954652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3120 TAGGATGTGTTGGTCATGGAAGAGAGTGGGCCACAAATGGGTTCCAGGGGAATAGCGTTG 3179

 20954653 CCTGGTGCAAGGAGGGGGATGTGGAGGTGCAGGGAGCAGGGGTGGTGTCTGGAGAGCCTG 20954712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3180 CCTGGTGCAAGGAGGGGGATGTGGAGGTGCAGGGAGCAGGGGTGGTGTCTGGAGAGCCTG 3239

 20954713 AAGCTGTGCTGCCAGAGGCTCCAGGCCATGAGGTCTGAGAAGCATCTAGATTTGGCCTGT 20954772
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     3240 AAGCTGTGCTGCCAGAGGCTCCAGGCCATGAGGTCTGAGAAGCATCTGGATTTGGCCTGT 3299

 20954773 TCACAGCAGGGAAGTGTGGTCCAGTGGCAAAAAGTTGAGGGCATCCTAGGAGTTGAGGAG 20954832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3300 TCACAGCAGGGAAGTGTGGTCCAGTGGCAAAAAGTTGAGGGCATCCTAGGAGTTGAGGAG 3359

 20954833 GTGGTGGCGGTTAGAGTAAACCACTCTGGAGGCGTCCGGGGTGGAGAGACGAGAATGTGC 20954892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3360 GTGGTGGCGGTTAGAGTAAACCACTCTGGAGGCGTCCGGGGTGGAGAGACGAGAATGTGC 3419

 20954893 AAGAACTCCTGCCTCTAGCCTGGCCTCCTCAGGACCCCGGCCACCAGCCTCCCTCCTAGA 20954952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3420 AAGAACTCCTGCCTCTAGCCTGGCCTCCTCAGGACCCCGGCCACCAGCCTCCCTCCTAGA 3479

 20954953 AGTCCCCAGAGCTTCCTCCTCCTTGTGCCCCAGAACTGGTTCCTGGGTTGCTCCAACCCC 20955012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3480 AGTCCCCAGAGCTTCCTCCTCCTTGTGCCCCAGAACTGGTTCCTGGGTTGCTCCAACCCC 3539

 20955013 AGACCTTCCCTGGAAGTCCCCCCCAGTGCCTCCTGGCTGGGAACCCCCAACTGCATTTTG 20955072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3540 AGACCTTCCCTGGAAGTCCCCCCCAGTGCCTCCTGGCTGGGAACCCCCAACTGCATTTTG 3599

 20955073 CTTCTGCTCTCGTGCCAGTAGTCCCCTTTTCTCTCCAGTGTCCAGGCCCCAACCACCAAG 20955132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3600 CTTCTGCTCTCGTGCCAGTAGTCCCCTTTTCTCTCCAGTGTCCAGGCCCCAACCACCAAG 3659

 20955133 ACCCTGCCTCCTCACTTGGCTTTGCTGTTCTTAGTTCTCTACTCAGTAGGTTGTGTCTGC 20955192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3660 ACCCTGCCTCCTCACTTGGCTTTGCTGTTCTTAGTTCTCTACTCAGTAGGTTGTGTCTGC 3719

 20955193 CTCCATTCCTGGCCAGACGCTGCCCTGGGGCTGAGTGCACAGTCCCCAGCCACTCCCGAG 20955252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3720 CTCCATTCCTGGCCAGACGCTGCCCTGGGGCTGAGTGCACAGTCCCCAGCCACTCCCGAG 3779

 20955253 ATCCTCAGAGCTTCTGGAAGCCACAGACATGGTGGCATATGTTTCAGGTCGTCAGCTTGT 20955312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3780 ATCCTCAGAGCTTCTGGAAGCCACAGACATGGTGGCATATGTTTCAGGTCGTCAGCTTGT 3839

 20955313 TTTTTTTTGGAGACAGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCGGTGACGTGATCAT 20955372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3840 TTTTTTTTGGAGACAGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCGGTGACGTGATCAT 3899

 20955373 TCACTGCAGCCTTGACCTTCTGAGCCCGGGTGATCCTCCCACCTCAGCCTGTCAAGTAGC 20955432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3900 TCACTGCAGCCTTGACCTTCTGAGCCCGGGTGATCCTCCCACCTCAGCCTGTCAAGTAGC 3959

 20955433 TGAGACCACATGTGTGAGCCACCACACCTAGCTTTTTGAATCTTTTTTTTTTTTTTTTTT 20955492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3960 TGAGACCACATGTGTGAGCCACCACACCTAGCTTTTTGAATCTTTTTTTTTTTTTTTTTT 4019

 20955493 GAGACGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAATCTTGGCTTACTG 20955552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4020 GAGACGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAATCTTGGCTTACTG 4079

 20955553 CAACCTCCAGCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCTCCCGAGTAGCTGGGATTACA 20955612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4080 CAACCTCCAGCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCTCCCGAGTAGCTGGGATTACA 4139

 20955613 GGTAGGTGGCACCACACCTAGCTAATTTTTATGTCTTTAGTAGAGACAAAGTTTCACCAT 20955672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4140 GGTAGGTGGCACCACACCTAGCTAATTTTTATGTCTTTAGTAGAGACAAAGTTTCACCAT 4199

 20955673 GTTGGCCAGGCTGATCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCTGTCTTGACCTCCCAA 20955732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4200 GTTGGCCAGGCTGATCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCTGTCTTGACCTCCCAA 4259

 20955733 AGTGCTGGGATTACAGGCGTGGGCCACGCGCCCAGCCAACTTTTTGAATCTTTTGTAGGG 20955792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4260 AGTGCTGGGATTACAGGCGTGGGCCACGCGCCCAGCCAACTTTTTGAATCTTTTGTAGGG 4319

 20955793 ATGGGGTCTTGCTGTGTTGCCCAGGCTGGGCTTAAACTCCTGGACTCAAGTGATCCTCCC 20955852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4320 ATGGGGTCTTGCTGTGTTGCCCAGGCTGGGCTTAAACTCCTGGACTCAAGTGATCCTCCC 4379

 20955853 TGCCTTGGTTTCTCAAACTTCTGGGATTACAGGCCAATCTACTCAACGTTGATATTGAGT 20955912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4380 TGCCTTGGTTTCTCAAACTTCTGGGATTACAGGCCAATCTACTCAACGTTGATATTGAGT 4439

 20955913 AGAAGGCAAAATTCACATGGCTCCGGCCCAGCCCCTTTCTGTCTCAGGCACTTCAGTGTT 20955972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4440 AGAAGGCAAAATTCACATGGCTCCGGCCCAGCCCCTTTCTGTCTCAGGCACTTCAGTGTT 4499

 20955973 AATATGCGCCTTGGTTTTGCTGCTGCCGAGTCTACTGTGCCCCTGGGCAAGGAAAGCAAA 20956032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4500 AATATGCGCCTTGGTTTTGCTGCTGCCGAGTCTACTGTGCCCCTGGGCAAGGAAAGCAAA 4559

 20956033 GGAAACCAGAGGGCCAGGCCCGTGGACACTGGGGTGAGGGGCCAACAGGGTGCCCAGCAG 20956092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4560 GGAAACCAGAGGGCCAGGCCCGTGGACACTGGGGTGAGGGGCCAACAGGGTGCCCAGCAG 4619

 20956093 TTGTTTCCACAGCCCCCACGTGGTCAGGGACCCTGTATGGGTGAACCGCCTGGATACTGA 20956152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4620 TTGTTTCCACAGCCCCCACGTGGTCAGGGACCCTGTATGGGTGAACCGCCTGGATACTGA 4679

 20956153 GCCTAGGCGGCGGAAAACTCAAAAGCAAGGGCAGGTTTATTCAGATCCCTGGTGGAGTTA 20956212
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4680 GCCTAGGCTGCGGAAAACTCAAAAGCAAGGGCAGGTTTATTCAGATCCCTGGTGGAGTTA 4739

 20956213 CAAGCTTGGTTTGGTTTTTGGTCACAGGCCCTAAAATACCTGTATTCTGAGTTTACATAA 20956272
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     4740 CAAGCTTGGTTTGGTTTTTGGTCACAGGCCCTAAAATGCCTGTATTCTGAGTTTACATAA 4799

 20956273 AAATACAAAGCACTGGCCGGGCGCGCTGGCTCACACCTGTAAGCCCAGCACTTTGGGAGG 20956332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4800 AAATACAAAGCACTGGCCGGGCGCGCTGGCTCACACCTGTAAGCCCAGCACTTTGGGAGG 4859

 20956333 CTGAGGTGGGTGGCTAACATGAGGTCAGGAATTTGAAACCAGCCTGACTAACATGGTGAA 20956392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4860 CTGAGGTGGGTGGCTAACATGAGGTCAGGAATTTGAAACCAGCCTGACTAACATGGTGAA 4919

 20956393 ACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGCGCATGCCTGTAATCC 20956452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4920 ACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGCGCATGCCTGTAATCC 4979

 20956453 CAGCTATTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGT 20956512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4980 CAGCTATTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGT 5039

 20956513 GAGCCATGATCGCACCGCCGCACTGCAGCCTGGGCTACAGAGCAAGACTCTGTCTCAAAA 20956572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||
     5040 GAGCCATGATCGCACCGCCGCACTGCAGCCTGGGCTACAGAGCAAGACTCTGTCTC--AA 5097

 20956573 AAAAAAAAAAAAAAATCACCACCGAGACGCTGTTCTCCCTGGTGTGTCATCTGTGGGGTG 20956632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5098 AAAAAAAAAAAAAAATCACCACCGAGACGCTGTTCTCCCTGGTGTGTCATCTGTGGGGTG 5157

 20956633 AATGAAGGTGTGAGATACCCCGTGGTGGTTTCTGTCAGTGAATCTGTAGTTGTCATATAT 20956692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5158 AATGAAGGTGTGAGATACCCCGTGGTGGTTTCTGTCAGTGAATCTGTAGTTGTCATATAT 5217

 20956693 TTTGAATACTTCAATATCATCGAACAGTTGCTGTGTCTTTAAGCACTAGATTTTATTGAA 20956752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5218 TTTGAATACTTCAATATCATCGAACAGTTGCTGTGTCTTTAAGCACTAGATTTTATTGAA 5277

 20956753 GCTACCTTCTTCCCTTTTTAGTCCCATTTCCCCTAGATGCATCCACGACTGCAGGAACCC 20956812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5278 GCTACCTTCTTCCCTTTTTAGTCCCATTTCCCCTAGATGCATCCACGACTGCAGGAACCC 5337

 20956813 CCCTGCCCCCACCAGGAGCCCAAAGATAACCATGTTCCCACCTGGAGTGGCCTCCCACCT 20956872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5338 CCCTGCCCCCACCAGGAGCCCAAAGATAACCATGTTCCCACCTGGAGTGGCCTCCCACCT 5397

 20956873 CCAATGCCATCAGGGCTGGTGCAGCTTCCCCACCTGGTCAGCAACATCATGGCCAAGGAG 20956932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5398 CCAATGCCATCAGGGCTGGTGCAGCTTCCCCACCTGGTCAGCAACATCATGGCCAAGGAG 5457

 20956933 TAGAGGGCGTAGCCCAGGGTGAACAGCAGTGCACAGGTGAGGGGCCTGATGCAGAACAGA 20956992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5458 TAGAGGGCGTAGCCCAGGGTGAACAGCAGTGCACAGGTGAGGGGCCTGATGCAGAACAGA 5517

 20956993 GAGGCCATGAAGAAAGCCAGCAGTAGCCAGGGCAGTGTCAGGTAGCTGCCTAGGAAGTGC 20957052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     5518 GAGGCCATGAAGAAAGCCAGCAGTAGCCAGGGCAGTGTCAGGTAACTGCCTAGGAAGTGC 5577

 20957053 AGGTTGAGCCTGTGGCCGCTGGCCAGCGTGGGCTCTGTGAGGTGGTAGCAACAGAAGCTG 20957112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5578 AGGTTGAGCCTGTGGCCGCTGGCCAGCGTGGGCTCTGTGAGGTGGTAGCAACAGAAGCTG 5637

 20957113 GCAAGGAAGTCATCTCAGGAACACAGAGCCGCCATCTGGTCTGCAAACTGAAGCGCAGGC 20957172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5638 GCAAGGAAGTCATCTCAGGAACACAGAGCCGCCATCTGGTCTGCAAACTGAAGCGCAGGC 5697

 20957173 AGTGGCACGGGGGCATGGGGTGGTGGCACCACAGGCCTCAGGACAGCTGCACCCCACCCC 20957232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5698 AGTGGCACGGGGGCATGGGGTGGTGGCACCACAGGCCTCAGGACAGCTGCACCCCACCCC 5757

 20957233 CACAGGCCACCCTGAGACTGCACCCCAGGCAGGAGCACCCAGAACCCTCTCTGAAGAGGC 20957292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5758 CACAGGCCACCCTGAGACTGCACCCCAGGCAGGAGCACCCAGAACCCTCTCTGAAGAGGC 5817

 20957293 CAGGCCAGCCCTCCTGCCCACTCACTCTGTGTTTGATGGCAGATGACAGCCGGAAGGATG 20957352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5818 CAGGCCAGCCCTCCTGCCCACTCACTCTGTGTTTGATGGCAGATGACAGCCGGAAGGATG 5877

 20957353 CTCAGACCAAGCTGGTAATCTCATAACTCCAGAGGGGCTGCAGCTCCGGGTCCCCCTGGT 20957412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5878 CTCAGACCAAGCTGGTAATCTCATAACTCCAGAGGGGCTGCAGCTCCGGGTCCCCCTGGT 5937

 20957413 ACTCAATTTCAAACCTTTGCAGCCTGTTGATGATCTAGAAACCCAGGCTATAGGGTTGGG 20957472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5938 ACTCAATTTCAAACCTTTGCAGCCTGTTGATGATCTAGAAACCCAGGCTATAGGGTTGGG 5997

 20957473 CCAGAAAACATGGCCCTGGCCAGGTGCAGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTCCGGG 20957532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5998 CCAGAAAACATGGCCCTGGCCAGGTGCAGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTCCGGG 6057

 20957533 AGGCCGAGGCGGGCGGATCACAAGGTCGGGAGTTAGAGACCAGCCTGATCGATATGATGA 20957592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6058 AGGCCGAGGCGGGCGGATCACAAGGTCGGGAGTTAGAGACCAGCCTGATCGATATGATGA 6117

 20957593 AACCCCGTCTCTATTAAAAATACAAAAATTGGCCAGGTGCAGTGGCTCACACCTGTAATC 20957652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6118 AACCCCGTCTCTATTAAAAATACAAAAATTGGCCAGGTGCAGTGGCTCACACCTGTAATC 6177

 20957653 CCAGCACTCTGGGAGGCTGAGGCAGGTGGATCACGAGGTCGGGAGATCAGGACCATCCTG 20957712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6178 CCAGCACTCTGGGAGGCTGAGGCAGGTGGATCACGAGGTCGGGAGATCAGGACCATCCTG 6237

 20957713 GCTAACACTGCGAAACCCCGTCTCTACTAAAAAAAATACAAAAAAAAATTAGCTGGGCTT 20957772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6238 GCTAACACTGCGAAACCCCGTCTCTACTAAAAAAAATACAAAAAAAAATTAGCTGGGCTT 6297

 20957773 GGTGGCGGGCACCTGTAGTTCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATAGCGTGAAC 20957832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6298 GGTGGCGGGCACCTGTAGTTCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATAGCGTGAAC 6357

 20957833 CCAGGAGGTGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCTACA 20957892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6358 CCAGGAGGTGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCTACA 6417

 20957893 GAGCAAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAGTTAGCCAGGCATGGTGGCATGTGCCTGT 20957952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6418 GAGCAAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAGTTAGCCAGGCATGGTGGCATGTGCCTGT 6477

 20957953 AATCCCAGCTATTCAGGAGGCTGAGGTGGGAGAATCGCTTGAACCCAGGAGGTGGAAGTT 20958012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6478 AATCCCAGCTATTCAGGAGGCTGAGGTGGGAGAATCGCTTGAACCCAGGAGGTGGAAGTT 6537

 20958013 TCAGTGAGCCAAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAAGAGAGGGAAACCTTGTTT 20958072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6538 TCAGTGAGCCAAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAAGAGAGGGAAACCTTGTTT 6597

 20958073 CAAAAAAAAGAAAGAAGAGAAAAGGAAACATGGCCCCTGCACACAACTCAGAAGAGCCAA 20958132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6598 CAAAAAAAAGAAAGAAGAGAAAAGGAAACATGGCCCCTGCACACAACTCAGAAGAGCCAA 6657

 20958133 GCCATCTCTGCTCACAGGGGAGGAGGGAGCTGGGGACACGTCAGGGCCCAACCCATGCAC 20958192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6658 GCCATCTCTGCTCACAGGGGAGGAGGGAGCTGGGGACACGTCAGGGCCCAACCCATGCAC 6717

 20958193 CTCTGGGACTTGGGCCTCTCACCTGGTACTGGCCCAGGGGCGTGGGGATGAGTCTGTCCT 20958252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6718 CTCTGGGACTTGGGCCTCTCACCTGGTACTGGCCCAGGGGCGTGGGGATGAGTCTGTCCT 6777

 20958253 CACCCGCGATGCAGTCCGGAGCTGCTTCTTTCCATTCTCATCCTGGATGGTGTCCAAGGC 20958312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6778 CACCCGCGATGCAGTCCGGAGCTGCTTCTTTCCATTCTCATCCTGGATGGTGTCCAAGGC 6837

 20958313 AAGTGTGAGAGACTCTGCGTGAGCTGCACTTCACTGAGCTACCAGAGAGAGAGAAGCTCC 20958372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6838 AAGTGTGAGAGACTCTGCGTGAGCTGCACTTCACTGAGCTACCAGAGAGAGAGAAGCTCC 6897

 20958373 TCTGCCCTCAGTGTCAAGGCAAAGGAACACCAGTCTTCACCCCACCAGCCTCTAACAGTG 20958432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6898 TCTGCCCTCAGTGTCAAGGCAAAGGAACACCAGTCTTCACCCCACCAGCCTCTAACAGTG 6957

 20958433 GCAACGAGAGCACCCGGACATGACACTCGGGGTGTGGGCCTGCCTCCCACAACACCGGGT 20958492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6958 GCAACGAGAGCACCCGGACATGACACTCGGGGTGTGGGCCTGCCTCCCACAACACCGGGT 7017

 20958493 TCATCTGCATGGGGCCTGGGACGGATGCATGCTGACCATGGGCAAAGGGGGAGTGGATCC 20958552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7018 TCATCTGCATGGGGCCTGGGACGGATGCATGCTGACCATGGGCAAAGGGGGAGTGGATCC 7077

 20958553 TTCGGGGAAGGGGACCCTAACGGCCGTGGAACAGGCCCCATTGCTCATACTCGGAATATC 20958612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7078 TTCGGGGAAGGGGACCCTAACGGCCGTGGAACAGGCCCCATTGCTCATACTCGGAATATC 7137

 20958613 TGGCGCAGGTACGCCAGGGCCTCCTCCAGGCACTCGTCCATCTTCTGGACGCTGTCCTGC 20958672
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7138 TGGCGCAGGTACTCCAGGGCCTCCTCCAGGCACTCGTCCATCTTCTGGACGCTGTCCTGC 7197

 20958673 CCCATCTCGCCCAGGTCATGGCTGAATAGGAGCCGTTGGTGTCTGTGGGGCCAAAGCCCA 20958732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7198 CCCATCTCGCCCAGGTCATGGCTGAATAGGAGCCGTTGGTGTCTGTGGGGCCAAAGCCCA 7257

 20958733 GCCACAACAGGAAGGAGTGGCCAGCTGGAGTCTCCACACACTGGTCCGAGATGGACCTGG 20958792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7258 GCCACAACAGGAAGGAGTGGCCAGCTGGAGTCTCCACACACTGGTCCGAGATGGACCTGG 7317

 20958793 CCGTGTGCTTGGCCTGCGTGATGAGCTGAGTAAGGTGCAGGACCTGCAAGGGAGGCGAGG 20958852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7318 CCGTGTGCTTGGCCTGCGTGATGAGCTGAGTAAGGTGCAGGACCTGCAAGGGAGGCGAGG 7377

 20958853 GCAGGTCACCGGCAGGATACGCCTGTACTGCCACCCAGGCAGGCTGGCTGGGGGCCCTAA 20958912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7378 GCAGGTCACCGGCAGGATACGCCTGTACTGCCACCCAGGCAGGCTGGCTGGGGGCCCTAA 7437

 20958913 GATGGGTGCACAGCCAGATCACTGAGTGACGGGAGGAGCAGCTTCTGCTGGAGGACTTTT 20958972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7438 GATGGGTGCACAGCCAGATCACTGAGTGACGGGAGGAGCAGCTTCTGCTGGAGGACTTTT 7497

 20958973 AAAGACTAAAGAATGATC 20958990
          ||||||||||||||||||
     7498 AAAGACTAAAGAATGATC 7515

Alignment time is 6.15775 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [20940623,20963850] =>     23228 nucs '22 dna:chromosome chromosome:GRCh37:22:1:51304566:1'
Second seq [       1,    2804] =>      2804 nucs 'mol-32-2fe3-338142_2804'

Score:        2722
Aligned:      2811        nucs
Identic:      2798 (100%) nucs =>       789 ( 99%)      2009 (100%)
Gaps:            9 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [20952176,20952969] EXCISED REGION [20952973,20954989]
 second seq =>  [       1,     789] EXCISED REGION [     792,    2804]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         3 nucs [20952970,20952972]
 second seq =>         2 nucs [790,791]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [20952968,20952969] to [20952971,20952972]
 second seq =>         1 nucs [790,790] to [792,792]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>        10 nucs [20952960,20952969] to [20952973,20952982]
 second seq =>        10 nucs [780,789] to [792,801]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 20952176 CCGCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCCAGCCG 20952235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCGCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCCAGCCG 60

 20952236 CTAATTTTTTATTTTTTATTGTTTGTAGAGAGGGGGTCTCCCTATGTTGCCTAGGCTGTT 20952295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTAATTTTTTATTTTTTATTGTTTGTAGAGAGGGGGTCTCCCTATGTTGCCTAGGCTGTT 120

 20952296 TTGTTTTTTTTTTTAAACAGAGACAGGGTCTTGCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAACT 20952355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTGTTTTTTTTTTTAAACAGAGACAGGGTCTTGCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAACT 180

 20952356 CCTGGGCTCAAGCAGTCCTCCCATCTTGGTTTTCCAAAGTGCTAGGATTACAGGCATGAA 20952415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCTGGGCTCAAGCAGTCCTCCCATCTTGGTTTTCCAAAGTGCTAGGATTACAGGCATGAA 240

 20952416 CCACCAGGCCCGGTCTCCACTGTGAATCTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACTGAGTTTCACT 20952475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCACCAGGCCCGGTCTCCACTGTGAATCTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACTGAGTTTCACT 300

 20952476 CTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACCATCTCGGCTCACCGCAACCTCCGCCTCCT 20952535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACCATCTCGGCTCACCGCAACCTCCGCCTCCT 360

 20952536 GGGTTCAAGCAATTCTGCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTCAGATTACAGGCATGCACCA 20952595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGGTTCAAGCAATTCTGCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTCAGATTACAGGCATGCACCA 420

 20952596 CTACGCCCAGCTAATTTTTTGTATTTTTAATAGATACAGGTTTTCACCATGCTACCCAGG 20952655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTACGCCCAGCTAATTTTTTGTATTTTTAATAGATACAGGTTTTCACCATGCTACCCAGG 480

 20952656 ATAGTCTTGATCTCCTGACCTCATGATCCACCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATT 20952715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATAGTCTTGATCTCCTGACCTCATGATCCACCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATT 540

 20952716 ACAGATGTGAGCCACCGCACCCGGCCGCTAATGTTTTATTTTTTATTGTTTGTAGAGACA 20952775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACAGATGTGAGCCACCGCACCCGGCCGCTAATGTTTTATTTTTTATTGTTTGTAGAGACA 600

 20952776 GGGTCTCCCCATGTTGCCTAGGCTGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTAACAGAGACA 20952835
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||
      601 GGGTCTCCCCATGTTGCCTAGGCTGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTT-----AACAGAGACA 655

 20952836 GGATCTTGCTATGTTGCCAAGGCTGGTCTTGAACTCCTGGGTTCAAGCAGTCCTCCCATC 20952895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      656 GGATCTTGCTATGTTGCCAAGGCTGGTCTTGAACTCCTGGGTTCAAGCAGTCCTCCCATC 715

 20952896 TTGGTCTCCCACCCAAAATGCTAGGATAGGCGTGAACCGCCAGGCCCGGTCTCCATTGTG 20952955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      716 TTGGTCTCCCACCCAAAATGCTAGGATAGGCGTGAACCGCCAGGCCCGGTCTCCATTGTG 775

 20952956 AATCTTTTTTTTTT 20952969
          ||||||||||||||
      776 AATCTTTTTTTTTT 789

EXCISED REGION

 20952973 TTTTTTTTTTTGAGACTGTGTTTTGCTCTTGTTGCCCAGGCGGGAGTACAGTGGTGCGAT 20953032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      792 TTTTTTTTTTTGAGACTGTGTTTTGCTCTTGTTGCCCAGGCGGGAGTACAGTGGTGCGAT 851

 20953033 CTCGGCTCACCGCAACCTCCGTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCT 20953092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      852 CTCGGCTCACCGCAACCTCCGTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCT 911

 20953093 TCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCGCCACCATGCCTGGCTAATTTTGTATTTTTAG 20953152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      912 TCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCGCCACCATGCCTGGCTAATTTTGTATTTTTAG 971

 20953153 TAGAGATGGGGTTTCCCCATGTTGGTCAAGCTGATCACGAACTCCCGACCTCAGATGATC 20953212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      972 TAGAGATGGGGTTTCCCCATGTTGGTCAAGCTGATCACGAACTCCCGACCTCAGATGATC 1031

 20953213 CACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCTACCGCGCCCGGTTTA 20953272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1032 CACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCTACCGCGCCCGGTTTA 1091

 20953273 CCATTTTGAATCTTAAGAGGACAAAGTCTGGTTCTCTAGAAGGCCCGAGTAGCTTTTCCC 20953332
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1092 CCATTTTGAATCCTAAGAGGACAAAGTCTGGTTCTCTAGAAGGCCCGAGTAGCTTTTCCC 1151

 20953333 CTGAGCATCTTGAGAAAAAAGTGCTCTGAGCACTCCTTGGGAAGTCCGAGACAGCACATG 20953392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1152 CTGAGCATCTTGAGAAAAAAGTGCTCTGAGCACTCCTTGGGAAGTCCGAGACAGCACATG 1211

 20953393 CAGCCAGGTGCTCCCTGGCTGCTCTCCCAGAGGTCAGCACAGCTGGAGGCAGCTGGAGGG 20953452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1212 CAGCCAGGTGCTCCCTGGCTGCTCTCCCAGAGGTCAGCACAGCTGGAGGCAGCTGGAGGG 1271

 20953453 AGGAGGCTGCAGAGGCGCTGAAGCCAGGAAGACCCAACAGTGGAGAGAGAAGTTGCCTGG 20953512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1272 AGGAGGCTGCAGAGGCGCTGAAGCCAGGAAGACCCAACAGTGGAGAGAGAAGTTGCCTGG 1331

 20953513 TGACTGACCCTCGGCTTGACCCTGTGCTCCCCTGGGCTGAGCTGGGTGTCAAAAGGCCTC 20953572
          |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1332 TGACTGA---TCGGCTTGACCCTGTGCTCCCCTGGGCTGAGCTGGGTGTCAAAAGGCCTC 1388

 20953573 CACCCTCCAAAGTGCCAGCCTCCTGCTGTGGCTGGAAAGCATTTGCTCCTCCTCCTCTTC 20953632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1389 CACCCTCCAAAGTGCCAGCCTCCTGCTGTGGCTGGAAAGCATTTGCTCCTCCTCCTCTTC 1448

 20953633 TCACTTCTTTGCATTCTTCTGATCTCTTAAGGGCGTACAAAGATTCACATGGATATTAAA 20953692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1449 TCACTTCTTTGCATTCTTCTGATCTCTTAAGGGCGTACAAAGATTCACATGGATATTAAA 1508

 20953693 GTCAATGGTGATTTTCATAGCTGGAATACTCGTTGGGAGAAAGTAGGAATTCTTTTTTTT 20953752
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
     1509 GTCAATGGTGATTTTCATAGCTGGAATACTCGTTGGGAGAAAGTAGGAATTC-TTTTTTT 1567

 20953753 TTTTTTTTCTCCCAAGCTCAAGCGATCCTCCCACCTCAGCCTTCTGAGTAGCTGGGACCA 20953812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1568 TTTTTTTTCTCCCAAGCTCAAGCGATCCTCCCACCTCAGCCTTCTGAGTAGCTGGGACCA 1627

 20953813 CAGGTGTGAGCCTCCATGATGGCCTGGCTAATTTTTTATATTTTTAGTAGAGATGGGGTT 20953872
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     1628 CAGGTGTGAGCCTCCATGATGGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTT 1687

 20953873 TCACCATGTTGCTCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAGCTCAGGCGATCCACCTGCCTCGGC 20953932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1688 TCACCATGTTGCTCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAGCTCAGGCGATCCACCTGCCTCGGC 1747

 20953933 TTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCTGGCCAAAAGTAGAAATTCT 20953992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1748 TTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCTGGCCAAAAGTAGAAATTCT 1807

 20953993 TGATTGGGAAATAATTTTATATATTTCGGCCCCTTCTCACTTGGGAAAATTCTGCTAAGA 20954052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1808 TGATTGGGAAATAATTTTATATATTTCGGCCCCTTCTCACTTGGGAAAATTCTGCTAAGA 1867

 20954053 ATTCTGGTTTTGAGAGTCAAGGGAAGCTAGCTTAATTTTTAAAGTGAAGGCTACATAAGA 20954112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1868 ATTCTGGTTTTGAGAGTCAAGGGAAGCTAGCTTAATTTTTAAAGTGAAGGCTACATAAGA 1927

 20954113 GTCCTCTCTCCAGTGTGGTGGCTCACACCTATAAACCCAGCGCTTCGGGCAAATCACTTG 20954172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1928 GTCCTCTCTCCAGTGTGGTGGCTCACACCTATAAACCCAGCGCTTCGGGCAAATCACTTG 1987

 20954173 AGCCCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCAATGTAGTGAGACCCCTATCTCTACAAAAAAAT 20954232
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     1988 AGCCCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCAATGTAGTGAGACCTCTATCTCTACAAAAAAAT 2047

 20954233 TTAAAAATTAGCAGGGTGTGGTGGTGCGTGCCTGTAGTCCTGGCTACTTGGGTGGGATGC 20954292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2048 TTAAAAATTAGCAGGGTGTGGTGGTGCGTGCCTGTAGTCCTGGCTACTTGGGTGGGATGC 2107

 20954293 TGATGTGGGAGGATTGCTTGAGCCCAGGATTTGGAGGTTGCAGCGAGCCATGATGGTGCA 20954352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2108 TGATGTGGGAGGATTGCTTGAGCCCAGGATTTGGAGGTTGCAGCGAGCCATGATGGTGCA 2167

 20954353 TTGCACTCCAGCCTGGGCAACATGGCAAGACCTCGTCTCAAAAAAATACAAAGAGTCCTC 20954412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2168 TTGCACTCCAGCCTGGGCAACATGGCAAGACCTCGTCTCAAAAAAATACAAAGAGTCCTC 2227

 20954413 TCTATGTTGGAAATGTCAGAGTTATTGGCCATTTAGGGGATCTAACTTGCTCTTTGATGT 20954472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2228 TCTATGTTGGAAATGTCAGAGTTATTGGCCATTTAGGGGATCTAACTTGCTCTTTGATGT 2287

 20954473 CCAAGAGGAAAGGTATAGAGTTCTCCTGATTACACAGGGCCTCTGCTTGTGGGTCGCCTG 20954532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2288 CCAAGAGGAAAGGTATAGAGTTCTCCTGATTACACAGGGCCTCTGCTTGTGGGTCGCCTG 2347

 20954533 CATGAGGCGATCAGAATCTGAGTCACCTGGGATCATGTGGGTGCTGGTACATCCTAGAGA 20954592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2348 CATGAGGCGATCAGAATCTGAGTCACCTGGGATCATGTGGGTGCTGGTACATCCTAGAGA 2407

 20954593 TAGGATGTGTTGGTCATGGAAGAGAGTGGGCCACAAATGGGTTCCAGGGGAATAGCGTTG 20954652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2408 TAGGATGTGTTGGTCATGGAAGAGAGTGGGCCACAAATGGGTTCCAGGGGAATAGCGTTG 2467

 20954653 CCTGGTGCAAGGAGGGGGATGTGGAGGTGCAGGGAGCAGGGGTGGTGTCTGGAGAGCCTG 20954712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2468 CCTGGTGCAAGGAGGGGGATGTGGAGGTGCAGGGAGCAGGGGTGGTGTCTGGAGAGCCTG 2527

 20954713 AAGCTGTGCTGCCAGAGGCTCCAGGCCATGAGGTCTGAGAAGCATCTAGATTTGGCCTGT 20954772
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     2528 AAGCTGTGCTGCCAGAGGCTCCAGGCCATGAGGTCTGAGAAGCATCTGGATTTGGCCTGT 2587

 20954773 TCACAGCAGGGAAGTGTGGTCCAGTGGCAAAAAGTTGAGGGCATCCTAGGAGTTGAGGAG 20954832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2588 TCACAGCAGGGAAGTGTGGTCCAGTGGCAAAAAGTTGAGGGCATCCTAGGAGTTGAGGAG 2647

 20954833 GTGGTGGCGGTTAGAGTAAACCACTCTGGAGGCGTCCGGGGTGGAGAGACGAGAATGTGC 20954892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2648 GTGGTGGCGGTTAGAGTAAACCACTCTGGAGGCGTCCGGGGTGGAGAGACGAGAATGTGC 2707

 20954893 AAGAACTCCTGCCTCTAGCCTGGCCTCCTCAGGACCCCGGCCACCAGCCTCCCTCCTAGA 20954952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2708 AAGAACTCCTGCCTCTAGCCTGGCCTCCTCAGGACCCCGGCCACCAGCCTCCCTCCTAGA 2767

 20954953 AGTCCCCAGAGCTTCCTCCTCCTTGTGCCCCAGAACT 20954989
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2768 AGTCCCCAGAGCTTCCTCCTCCTTGTGCCCCAGAACT 2804

Alignment time is 2.36003 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [20940623,20963850] =>     23228 nucs '22 dna:chromosome chromosome:GRCh37:22:1:51304566:1'
Second seq [       1,    5727] =>      5727 nucs 'mol-32-3030-198850_5727'

Score:        5641
Aligned:      5729        nucs
Identic:      5721 (100%) nucs =>       260 (100%)      5461 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [20953260,20953519] EXCISED REGION [20953523,20958991]
 second seq =>  [       1,     260] EXCISED REGION [     261,    5727]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         3 nucs [20953520,20953522]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [20953520,20953520] to [20953522,20953522]
 second seq =>         0 nucs

 20953260 CGCGCCCGGTTTACCATTTTGAATCTTAAGAGGACAAAGTCTGGTTCTCTAGAAGGCCCG 20953319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CGCGCCCGGTTTACCATTTTGAATCTTAAGAGGACAAAGTCTGGTTCTCTAGAAGGCCCG 60

 20953320 AGTAGCTTTTCCCCTGAGCATCTTGAGAAAAAAGTGCTCTGAGCACTCCTTGGGAAGTCC 20953379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGTAGCTTTTCCCCTGAGCATCTTGAGAAAAAAGTGCTCTGAGCACTCCTTGGGAAGTCC 120

 20953380 GAGACAGCACATGCAGCCAGGTGCTCCCTGGCTGCTCTCCCAGAGGTCAGCACAGCTGGA 20953439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GAGACAGCACATGCAGCCAGGTGCTCCCTGGCTGCTCTCCCAGAGGTCAGCACAGCTGGA 180

 20953440 GGCAGCTGGAGGGAGGAGGCTGCAGAGGCGCTGAAGCCAGGAAGACCCAACAGTGGAGAG 20953499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGCAGCTGGAGGGAGGAGGCTGCAGAGGCGCTGAAGCCAGGAAGACCCAACAGTGGAGAG 240

 20953500 AGAAGTTGCCTGGTGACTGA 20953519
          ||||||||||||||||||||
      241 AGAAGTTGCCTGGTGACTGA 260

EXCISED REGION

 20953523 TCGGCTTGACCCTGTGCTCCCCTGGGCTGAGCTGGGTGTCAAAAGGCCTCCACCCTCCAA 20953582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      261 TCGGCTTGACCCTGTGCTCCCCTGGGCTGAGCTGGGTGTCAAAAGGCCTCCACCCTCCAA 320

 20953583 AGTGCCAGCCTCCTGCTGTGGCTGGAAAGCATTTGCTCCTCCTCCTCTTCTCACTTCTTT 20953642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      321 AGTGCCAGCCTCCTGCTGTGGCTGGAAAGCATTTGCTCCTCCTCCTCTTCTCACTTCTTT 380

 20953643 GCATTCTTCTGATCTCTTAAGGGCGTACAAAGATTCACATGGATATTAAAGTCAATGGTG 20953702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      381 GCATTCTTCTGATCTCTTAAGGGCGTACAAAGATTCACATGGATATTAAAGTCAATGGTG 440

 20953703 ATTTTCATAGCTGGAATACTCGTTGGGAGAAAGTAGGAATTCTTTTTTTTTTTTTTTTCT 20953762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      441 ATTTTCATAGCTGGAATACTCGTTGGGAGAAAGTAGGAATTCTTTTTTTTTTTTTTTTCT 500

 20953763 CCCAAGCTCAAGCGATCCTCCCACCTCAGCCTTCTGAGTAGCTGGGACCACAGGTGTGAG 20953822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      501 CCCAAGCTCAAGCGATCCTCCCACCTCAGCCTTCTGAGTAGCTGGGACCACAGGTGTGAG 560

 20953823 CCTCCATGATGGCCTGGCTAATTTTTTATATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTT 20953882
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
      561 CCTCCATGATGGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTT 620

 20953883 GCTCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAGCTCAGGCGATCCACCTGCCTCGGCTTCCCAAAGT 20953942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      621 GCTCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAGCTCAGGCGATCCACCTGCCTCGGCTTCCCAAAGT 680

 20953943 GCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCTGGCCAAAAGTAGAAATTCTTGATTGGGAA 20954002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      681 GCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCTGGCCAAAAGTAGAAATTCTTGATTGGGAA 740

 20954003 ATAATTTTATATATTTCGGCCCCTTCTCACTTGGGAAAATTCTGCTAAGAATTCTGGTTT 20954062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      741 ATAATTTTATATATTTCGGCCCCTTCTCACTTGGGAAAATTCTGCTAAGAATTCTGGTTT 800

 20954063 TGAGAGTCAAGGGAAGCTAGCTTAATTTTTAAAGTGAAGGCTACATAAGAGTCCTCTCTC 20954122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      801 TGAGAGTCAAGGGAAGCTAGCTTAATTTTTAAAGTGAAGGCTACATAAGAGTCCTCTCTC 860

 20954123 CAGTGTGGTGGCTCACACCTATAAACCCAGCGCTTCGGGCAAATCACTTGAGCCCAGGAG 20954182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      861 CAGTGTGGTGGCTCACACCTATAAACCCAGCGCTTCGGGCAAATCACTTGAGCCCAGGAG 920

 20954183 TTCAAGACCAGCCTGGCAATGTAGTGAGACCCCTATCTCTACAAAAAAATTTAAAAATTA 20954242
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
      921 TTCAAGACCAGCCTGGCAATGTAGTGAGACCTCTATCTCTACAAAAAAATTTAAAAATTA 980

 20954243 GCAGGGTGTGGTGGTGCGTGCCTGTAGTCCTGGCTACTTGGGTGGGATGCTGATGTGGGA 20954302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      981 GCAGGGTGTGGTGGTGCGTGCCTGTAGTCCTGGCTACTTGGGTGGGATGCTGATGTGGGA 1040

 20954303 GGATTGCTTGAGCCCAGGATTTGGAGGTTGCAGCGAGCCATGATGGTGCATTGCACTCCA 20954362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1041 GGATTGCTTGAGCCCAGGATTTGGAGGTTGCAGCGAGCCATGATGGTGCATTGCACTCCA 1100

 20954363 GCCTGGGCAACATGGCAAGACCTCGTCTCAAAAAAATACAAAGAGTCCTCTCTATGTTGG 20954422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1101 GCCTGGGCAACATGGCAAGACCTCGTCTCAAAAAAATACAAAGAGTCCTCTCTATGTTGG 1160

 20954423 AAATGTCAGAGTTATTGGCCATTTAGGGGATCTAACTTGCTCTTTGATGTCCAAGAGGAA 20954482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1161 AAATGTCAGAGTTATTGGCCATTTAGGGGATCTAACTTGCTCTTTGATGTCCAAGAGGAA 1220

 20954483 AGGTATAGAGTTCTCCTGATTACACAGGGCCTCTGCTTGTGGGTCGCCTGCATGAGGCGA 20954542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1221 AGGTATAGAGTTCTCCTGATTACACAGGGCCTCTGCTTGTGGGTCGCCTGCATGAGGCGA 1280

 20954543 TCAGAATCTGAGTCACCTGGGATCATGTGGGTGCTGGTACATCCTAGAGATAGGATGTGT 20954602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1281 TCAGAATCTGAGTCACCTGGGATCATGTGGGTGCTGGTACATCCTAGAGATAGGATGTGT 1340

 20954603 TGGTCATGGAAGAGAGTGGGCCACAAATGGGTTCCAGGGGAATAGCGTTGCCTGGTGCAA 20954662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1341 TGGTCATGGAAGAGAGTGGGCCACAAATGGGTTCCAGGGGAATAGCGTTGCCTGGTGCAA 1400

 20954663 GGAGGGGGATGTGGAGGTGCAGGGAGCAGGGGTGGTGTCTGGAGAGCCTGAAGCTGTGCT 20954722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1401 GGAGGGGGATGTGGAGGTGCAGGGAGCAGGGGTGGTGTCTGGAGAGCCTGAAGCTGTGCT 1460

 20954723 GCCAGAGGCTCCAGGCCATGAGGTCTGAGAAGCATCTAGATTTGGCCTGTTCACAGCAGG 20954782
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     1461 GCCAGAGGCTCCAGGCCATGAGGTCTGAGAAGCATCTGGATTTGGCCTGTTCACAGCAGG 1520

 20954783 GAAGTGTGGTCCAGTGGCAAAAAGTTGAGGGCATCCTAGGAGTTGAGGAGGTGGTGGCGG 20954842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1521 GAAGTGTGGTCCAGTGGCAAAAAGTTGAGGGCATCCTAGGAGTTGAGGAGGTGGTGGCGG 1580

 20954843 TTAGAGTAAACCACTCTGGAGGCGTCCGGGGTGGAGAGACGAGAATGTGCAAGAACTCCT 20954902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1581 TTAGAGTAAACCACTCTGGAGGCGTCCGGGGTGGAGAGACGAGAATGTGCAAGAACTCCT 1640

 20954903 GCCTCTAGCCTGGCCTCCTCAGGACCCCGGCCACCAGCCTCCCTCCTAGAAGTCCCCAGA 20954962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1641 GCCTCTAGCCTGGCCTCCTCAGGACCCCGGCCACCAGCCTCCCTCCTAGAAGTCCCCAGA 1700

 20954963 GCTTCCTCCTCCTTGTGCCCCAGAACTGGTTCCTGGGTTGCTCCAACCCCAGACCTTCCC 20955022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1701 GCTTCCTCCTCCTTGTGCCCCAGAACTGGTTCCTGGGTTGCTCCAACCCCAGACCTTCCC 1760

 20955023 TGGAAGTCCCCCCCAGTGCCTCCTGGCTGGGAACCCCCAACTGCATTTTGCTTCTGCTCT 20955082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1761 TGGAAGTCCCCCCCAGTGCCTCCTGGCTGGGAACCCCCAACTGCATTTTGCTTCTGCTCT 1820

 20955083 CGTGCCAGTAGTCCCCTTTTCTCTCCAGTGTCCAGGCCCCAACCACCAAGACCCTGCCTC 20955142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1821 CGTGCCAGTAGTCCCCTTTTCTCTCCAGTGTCCAGGCCCCAACCACCAAGACCCTGCCTC 1880

 20955143 CTCACTTGGCTTTGCTGTTCTTAGTTCTCTACTCAGTAGGTTGTGTCTGCCTCCATTCCT 20955202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1881 CTCACTTGGCTTTGCTGTTCTTAGTTCTCTACTCAGTAGGTTGTGTCTGCCTCCATTCCT 1940

 20955203 GGCCAGACGCTGCCCTGGGGCTGAGTGCACAGTCCCCAGCCACTCCCGAGATCCTCAGAG 20955262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1941 GGCCAGACGCTGCCCTGGGGCTGAGTGCACAGTCCCCAGCCACTCCCGAGATCCTCAGAG 2000

 20955263 CTTCTGGAAGCCACAGACATGGTGGCATATGTTTCAGGTCGTCAGCTTGTTTTTTTTTGG 20955322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2001 CTTCTGGAAGCCACAGACATGGTGGCATATGTTTCAGGTCGTCAGCTTGTTTTTTTTTGG 2060

 20955323 AGACAGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCGGTGACGTGATCATTCACTGCAGC 20955382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2061 AGACAGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCGGTGACGTGATCATTCACTGCAGC 2120

 20955383 CTTGACCTTCTGAGCCCGGGTGATCCTCCCACCTCAGCCTGTCAAGTAGCTGAGACCACA 20955442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2121 CTTGACCTTCTGAGCCCGGGTGATCCTCCCACCTCAGCCTGTCAAGTAGCTGAGACCACA 2180

 20955443 TGTGTGAGCCACCACACCTAGCTTTTTGAATCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGT 20955502
          |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
     2181 TGTGTGAGCCACCACACCTAGCTTTTTGAATC-TTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGT 2239

 20955503 CTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAATCTTGGCTTACTGCAACCTCCAG 20955562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2240 CTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAATCTTGGCTTACTGCAACCTCCAG 2299

 20955563 CTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGTAGGTGGC 20955622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2300 CTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGTAGGTGGC 2359

 20955623 ACCACACCTAGCTAATTTTTATGTCTTTAGTAGAGACAAAGTTTCACCATGTTGGCCAGG 20955682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2360 ACCACACCTAGCTAATTTTTATGTCTTTAGTAGAGACAAAGTTTCACCATGTTGGCCAGG 2419

 20955683 CTGATCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCTGTCTTGACCTCCCAAAGTGCTGGGA 20955742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2420 CTGATCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCTGTCTTGACCTCCCAAAGTGCTGGGA 2479

 20955743 TTACAGGCGTGGGCCACGCGCCCAGCCAACTTTTTGAATCTTTTGTAGGGATGGGGTCTT 20955802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2480 TTACAGGCGTGGGCCACGCGCCCAGCCAACTTTTTGAATCTTTTGTAGGGATGGGGTCTT 2539

 20955803 GCTGTGTTGCCCAGGCTGGGCTTAAACTCCTGGACTCAAGTGATCCTCCCTGCCTTGGTT 20955862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2540 GCTGTGTTGCCCAGGCTGGGCTTAAACTCCTGGACTCAAGTGATCCTCCCTGCCTTGGTT 2599

 20955863 TCTCAAACTTCTGGGATTACAGGCCAATCTACTCAACGTTGATATTGAGTAGAAGGCAAA 20955922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2600 TCTCAAACTTCTGGGATTACAGGCCAATCTACTCAACGTTGATATTGAGTAGAAGGCAAA 2659

 20955923 ATTCACATGGCTCCGGCCCAGCCCCTTTCTGTCTCAGGCACTTCAGTGTTAATATGCGCC 20955982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2660 ATTCACATGGCTCCGGCCCAGCCCCTTTCTGTCTCAGGCACTTCAGTGTTAATATGCGCC 2719

 20955983 TTGGTTTTGCTGCTGCCGAGTCTACTGTGCCCCTGGGCAAGGAAAGCAAAGGAAACCAGA 20956042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2720 TTGGTTTTGCTGCTGCCGAGTCTACTGTGCCCCTGGGCAAGGAAAGCAAAGGAAACCAGA 2779

 20956043 GGGCCAGGCCCGTGGACACTGGGGTGAGGGGCCAACAGGGTGCCCAGCAGTTGTTTCCAC 20956102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2780 GGGCCAGGCCCGTGGACACTGGGGTGAGGGGCCAACAGGGTGCCCAGCAGTTGTTTCCAC 2839

 20956103 AGCCCCCACGTGGTCAGGGACCCTGTATGGGTGAACCGCCTGGATACTGAGCCTAGGCGG 20956162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2840 AGCCCCCACGTGGTCAGGGACCCTGTATGGGTGAACCGCCTGGATACTGAGCCTAGGCGG 2899

 20956163 CGGAAAACTCAAAAGCAAGGGCAGGTTTATTCAGATCCCTGGTGGAGTTACAAGCTTGGT 20956222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2900 CGGAAAACTCAAAAGCAAGGGCAGGTTTATTCAGATCCCTGGTGGAGTTACAAGCTTGGT 2959

 20956223 TTGGTTTTTGGTCACAGGCCCTAAAATACCTGTATTCTGAGTTTACATAAAAATACAAAG 20956282
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     2960 TTGGTTTTTGGTCACAGGCCCTAAAATGCCTGTATTCTGAGTTTACATAAAAATACAAAG 3019

 20956283 CACTGGCCGGGCGCGCTGGCTCACACCTGTAAGCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGG 20956342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3020 CACTGGCCGGGCGCGCTGGCTCACACCTGTAAGCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGG 3079

 20956343 TGGCTAACATGAGGTCAGGAATTTGAAACCAGCCTGACTAACATGGTGAAACCCCATCTC 20956402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3080 TGGCTAACATGAGGTCAGGAATTTGAAACCAGCCTGACTAACATGGTGAAACCCCATCTC 3139

 20956403 TACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGCGCATGCCTGTAATCCCAGCTATTCG 20956462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3140 TACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGCGCATGCCTGTAATCCCAGCTATTCG 3199

 20956463 GGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCATGAT 20956522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3200 GGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCATGAT 3259

 20956523 CGCACCGCCGCACTGCAGCCTGGGCTACAGAGCAAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAA 20956582
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
     3260 CGCACCGCCGCACTGCAGCCTGGGCTACAGAGCAAGACTCTGTCTC-AAAAAAAAAAAAA 3318

 20956583 AAAAATCACCACCGAGACGCTGTTCTCCCTGGTGTGTCATCTGTGGGGTGAATGAAGGTG 20956642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3319 AAAAATCACCACCGAGACGCTGTTCTCCCTGGTGTGTCATCTGTGGGGTGAATGAAGGTG 3378

 20956643 TGAGATACCCCGTGGTGGTTTCTGTCAGTGAATCTGTAGTTGTCATATATTTTGAATACT 20956702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3379 TGAGATACCCCGTGGTGGTTTCTGTCAGTGAATCTGTAGTTGTCATATATTTTGAATACT 3438

 20956703 TCAATATCATCGAACAGTTGCTGTGTCTTTAAGCACTAGATTTTATTGAAGCTACCTTCT 20956762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3439 TCAATATCATCGAACAGTTGCTGTGTCTTTAAGCACTAGATTTTATTGAAGCTACCTTCT 3498

 20956763 TCCCTTTTTAGTCCCATTTCCCCTAGATGCATCCACGACTGCAGGAACCCCCCTGCCCCC 20956822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3499 TCCCTTTTTAGTCCCATTTCCCCTAGATGCATCCACGACTGCAGGAACCCCCCTGCCCCC 3558

 20956823 ACCAGGAGCCCAAAGATAACCATGTTCCCACCTGGAGTGGCCTCCCACCTCCAATGCCAT 20956882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3559 ACCAGGAGCCCAAAGATAACCATGTTCCCACCTGGAGTGGCCTCCCACCTCCAATGCCAT 3618

 20956883 CAGGGCTGGTGCAGCTTCCCCACCTGGTCAGCAACATCATGGCCAAGGAGTAGAGGGCGT 20956942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3619 CAGGGCTGGTGCAGCTTCCCCACCTGGTCAGCAACATCATGGCCAAGGAGTAGAGGGCGT 3678

 20956943 AGCCCAGGGTGAACAGCAGTGCACAGGTGAGGGGCCTGATGCAGAACAGAGAGGCCATGA 20957002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3679 AGCCCAGGGTGAACAGCAGTGCACAGGTGAGGGGCCTGATGCAGAACAGAGAGGCCATGA 3738

 20957003 AGAAAGCCAGCAGTAGCCAGGGCAGTGTCAGGTAGCTGCCTAGGAAGTGCAGGTTGAGCC 20957062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     3739 AGAAAGCCAGCAGTAGCCAGGGCAGTGTCAGGTAACTGCCTAGGAAGTGCAGGTTGAGCC 3798

 20957063 TGTGGCCGCTGGCCAGCGTGGGCTCTGTGAGGTGGTAGCAACAGAAGCTGGCAAGGAAGT 20957122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3799 TGTGGCCGCTGGCCAGCGTGGGCTCTGTGAGGTGGTAGCAACAGAAGCTGGCAAGGAAGT 3858

 20957123 CATCTCAGGAACACAGAGCCGCCATCTGGTCTGCAAACTGAAGCGCAGGCAGTGGCACGG 20957182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3859 CATCTCAGGAACACAGAGCCGCCATCTGGTCTGCAAACTGAAGCGCAGGCAGTGGCACGG 3918

 20957183 GGGCATGGGGTGGTGGCACCACAGGCCTCAGGACAGCTGCACCCCACCCCCACAGGCCAC 20957242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3919 GGGCATGGGGTGGTGGCACCACAGGCCTCAGGACAGCTGCACCCCACCCCCACAGGCCAC 3978

 20957243 CCTGAGACTGCACCCCAGGCAGGAGCACCCAGAACCCTCTCTGAAGAGGCCAGGCCAGCC 20957302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3979 CCTGAGACTGCACCCCAGGCAGGAGCACCCAGAACCCTCTCTGAAGAGGCCAGGCCAGCC 4038

 20957303 CTCCTGCCCACTCACTCTGTGTTTGATGGCAGATGACAGCCGGAAGGATGCTCAGACCAA 20957362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4039 CTCCTGCCCACTCACTCTGTGTTTGATGGCAGATGACAGCCGGAAGGATGCTCAGACCAA 4098

 20957363 GCTGGTAATCTCATAACTCCAGAGGGGCTGCAGCTCCGGGTCCCCCTGGTACTCAATTTC 20957422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4099 GCTGGTAATCTCATAACTCCAGAGGGGCTGCAGCTCCGGGTCCCCCTGGTACTCAATTTC 4158

 20957423 AAACCTTTGCAGCCTGTTGATGATCTAGAAACCCAGGCTATAGGGTTGGGCCAGAAAACA 20957482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4159 AAACCTTTGCAGCCTGTTGATGATCTAGAAACCCAGGCTATAGGGTTGGGCCAGAAAACA 4218

 20957483 TGGCCCTGGCCAGGTGCAGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTCCGGGAGGCCGAGGC 20957542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4219 TGGCCCTGGCCAGGTGCAGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTCCGGGAGGCCGAGGC 4278

 20957543 GGGCGGATCACAAGGTCGGGAGTTAGAGACCAGCCTGATCGATATGATGAAACCCCGTCT 20957602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4279 GGGCGGATCACAAGGTCGGGAGTTAGAGACCAGCCTGATCGATATGATGAAACCCCGTCT 4338

 20957603 CTATTAAAAATACAAAAATTGGCCAGGTGCAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTCT 20957662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4339 CTATTAAAAATACAAAAATTGGCCAGGTGCAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTCT 4398

 20957663 GGGAGGCTGAGGCAGGTGGATCACGAGGTCGGGAGATCAGGACCATCCTGGCTAACACTG 20957722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4399 GGGAGGCTGAGGCAGGTGGATCACGAGGTCGGGAGATCAGGACCATCCTGGCTAACACTG 4458

 20957723 CGAAACCCCGTCTCTACTAAAAAAAATACAAAAAAAAATTAGCTGGGCTTGGTGGCGGGC 20957782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4459 CGAAACCCCGTCTCTACTAAAAAAAATACAAAAAAAAATTAGCTGGGCTTGGTGGCGGGC 4518

 20957783 ACCTGTAGTTCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATAGCGTGAACCCAGGAGGTG 20957842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4519 ACCTGTAGTTCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATAGCGTGAACCCAGGAGGTG 4578

 20957843 GAGCTTGCAGTGAGCCGAGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCTACAGAGCAAGACT 20957902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4579 GAGCTTGCAGTGAGCCGAGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCTACAGAGCAAGACT 4638

 20957903 CCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAGTTAGCCAGGCATGGTGGCATGTGCCTGTAATCCCAGCT 20957962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4639 CCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAGTTAGCCAGGCATGGTGGCATGTGCCTGTAATCCCAGCT 4698

 20957963 ATTCAGGAGGCTGAGGTGGGAGAATCGCTTGAACCCAGGAGGTGGAAGTTTCAGTGAGCC 20958022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4699 ATTCAGGAGGCTGAGGTGGGAGAATCGCTTGAACCCAGGAGGTGGAAGTTTCAGTGAGCC 4758

 20958023 AAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAAGAGAGGGAAACCTTGTTTCAAAAAAAAG 20958082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4759 AAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAAGAGAGGGAAACCTTGTTTCAAAAAAAAG 4818

 20958083 AAAGAAGAGAAAAGGAAACATGGCCCCTGCACACAACTCAGAAGAGCCAAGCCATCTCTG 20958142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4819 AAAGAAGAGAAAAGGAAACATGGCCCCTGCACACAACTCAGAAGAGCCAAGCCATCTCTG 4878

 20958143 CTCACAGGGGAGGAGGGAGCTGGGGACACGTCAGGGCCCAACCCATGCACCTCTGGGACT 20958202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4879 CTCACAGGGGAGGAGGGAGCTGGGGACACGTCAGGGCCCAACCCATGCACCTCTGGGACT 4938

 20958203 TGGGCCTCTCACCTGGTACTGGCCCAGGGGCGTGGGGATGAGTCTGTCCTCACCCGCGAT 20958262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4939 TGGGCCTCTCACCTGGTACTGGCCCAGGGGCGTGGGGATGAGTCTGTCCTCACCCGCGAT 4998

 20958263 GCAGTCCGGAGCTGCTTCTTTCCATTCTCATCCTGGATGGTGTCCAAGGCAAGTGTGAGA 20958322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4999 GCAGTCCGGAGCTGCTTCTTTCCATTCTCATCCTGGATGGTGTCCAAGGCAAGTGTGAGA 5058

 20958323 GACTCTGCGTGAGCTGCACTTCACTGAGCTACCAGAGAGAGAGAAGCTCCTCTGCCCTCA 20958382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5059 GACTCTGCGTGAGCTGCACTTCACTGAGCTACCAGAGAGAGAGAAGCTCCTCTGCCCTCA 5118

 20958383 GTGTCAAGGCAAAGGAACACCAGTCTTCACCCCACCAGCCTCTAACAGTGGCAACGAGAG 20958442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5119 GTGTCAAGGCAAAGGAACACCAGTCTTCACCCCACCAGCCTCTAACAGTGGCAACGAGAG 5178

 20958443 CACCCGGACATGACACTCGGGGTGTGGGCCTGCCTCCCACAACACCGGGTTCATCTGCAT 20958502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5179 CACCCGGACATGACACTCGGGGTGTGGGCCTGCCTCCCACAACACCGGGTTCATCTGCAT 5238

 20958503 GGGGCCTGGGACGGATGCATGCTGACCATGGGCAAAGGGGGAGTGGATCCTTCGGGGAAG 20958562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5239 GGGGCCTGGGACGGATGCATGCTGACCATGGGCAAAGGGGGAGTGGATCCTTCGGGGAAG 5298

 20958563 GGGACCCTAACGGCCGTGGAACAGGCCCCATTGCTCATACTCGGAATATCTGGCGCAGGT 20958622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5299 GGGACCCTAACGGCCGTGGAACAGGCCCCATTGCTCATACTCGGAATATCTGGCGCAGGT 5358

 20958623 ACGCCAGGGCCTCCTCCAGGCACTCGTCCATCTTCTGGACGCTGTCCTGCCCCATCTCGC 20958682
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5359 ACTCCAGGGCCTCCTCCAGGCACTCGTCCATCTTCTGGACGCTGTCCTGCCCCATCTCGC 5418

 20958683 CCAGGTCATGGCTGAATAGGAGCCGTTGGTGTCTGTGGGGCCAAAGCCCAGCCACAACAG 20958742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5419 CCAGGTCATGGCTGAATAGGAGCCGTTGGTGTCTGTGGGGCCAAAGCCCAGCCACAACAG 5478

 20958743 GAAGGAGTGGCCAGCTGGAGTCTCCACACACTGGTCCGAGATGGACCTGGCCGTGTGCTT 20958802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5479 GAAGGAGTGGCCAGCTGGAGTCTCCACACACTGGTCCGAGATGGACCTGGCCGTGTGCTT 5538

 20958803 GGCCTGCGTGATGAGCTGAGTAAGGTGCAGGACCTGCAAGGGAGGCGAGGGCAGGTCACC 20958862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5539 GGCCTGCGTGATGAGCTGAGTAAGGTGCAGGACCTGCAAGGGAGGCGAGGGCAGGTCACC 5598

 20958863 GGCAGGATACGCCTGTACTGCCACCCAGGCAGGCTGGCTGGGGGCCCTAAGATGGGTGCA 20958922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5599 GGCAGGATACGCCTGTACTGCCACCCAGGCAGGCTGGCTGGGGGCCCTAAGATGGGTGCA 5658

 20958923 CAGCCAGATCACTGAGTGACGGGAGGAGCAGCTTCTGCTGGAGGACTTTTAAAGACTAAA 20958982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5659 CAGCCAGATCACTGAGTGACGGGAGGAGCAGCTTCTGCTGGAGGACTTTTAAAGACTAAA 5718

 20958983 GAATGATCT 20958991
          |||||||||
     5719 GAATGATCT 5727

Alignment time is 4.73695 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [20940623,20963850] =>     23228 nucs '22 dna:chromosome chromosome:GRCh37:22:1:51304566:1'
Second seq [       1,    2498] =>      2498 nucs 'mol-32-3101-043187_2498'

Score:        2475
Aligned:      2497        nucs
Identic:      2495 (100%) nucs =>       310 (100%)      2185 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [20953540,20953849] EXCISED REGION [20953851,20956037]
 second seq =>  [       1,     310] EXCISED REGION [     312,    2498]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [20953850,20953850]
 second seq =>         1 nucs [311,311]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [20953849,20953849] to [20953851,20953851]
 second seq =>         1 nucs [310,310] to [312,312]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 20953540 TCCCCTGGGCTGAGCTGGGTGTCAAAAGGCCTCCACCCTCCAAAGTGCCAGCCTCCTGCT 20953599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCCCCTGGGCTGAGCTGGGTGTCAAAAGGCCTCCACCCTCCAAAGTGCCAGCCTCCTGCT 60

 20953600 GTGGCTGGAAAGCATTTGCTCCTCCTCCTCTTCTCACTTCTTTGCATTCTTCTGATCTCT 20953659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTGGCTGGAAAGCATTTGCTCCTCCTCCTCTTCTCACTTCTTTGCATTCTTCTGATCTCT 120

 20953660 TAAGGGCGTACAAAGATTCACATGGATATTAAAGTCAATGGTGATTTTCATAGCTGGAAT 20953719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TAAGGGCGTACAAAGATTCACATGGATATTAAAGTCAATGGTGATTTTCATAGCTGGAAT 180

 20953720 ACTCGTTGGGAGAAAGTAGGAATTCTTTTTTTTTTTTTTTTCTCCCAAGCTCAAGCGATC 20953779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACTCGTTGGGAGAAAGTAGGAATTCTTTTTTTTTTTTTTTTCTCCCAAGCTCAAGCGATC 240

 20953780 CTCCCACCTCAGCCTTCTGAGTAGCTGGGACCACAGGTGTGAGCCTCCATGATGGCCTGG 20953839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTCCCACCTCAGCCTTCTGAGTAGCTGGGACCACAGGTGTGAGCCTCCATGATGGCCTGG 300

 20953840 CTAATTTTTT 20953849
          ||||||||||
      301 CTAATTTTTT 310

EXCISED REGION

 20953851 TATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGCTCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAGCT 20953910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      312 TATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGCTCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAGCT 371

 20953911 CAGGCGATCCACCTGCCTCGGCTTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTG 20953970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      372 CAGGCGATCCACCTGCCTCGGCTTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTG 431

 20953971 CCTGGCCAAAAGTAGAAATTCTTGATTGGGAAATAATTTTATATATTTCGGCCCCTTCTC 20954030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      432 CCTGGCCAAAAGTAGAAATTCTTGATTGGGAAATAATTTTATATATTTCGGCCCCTTCTC 491

 20954031 ACTTGGGAAAATTCTGCTAAGAATTCTGGTTTTGAGAGTCAAGGGAAGCTAGCTTAATTT 20954090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      492 ACTTGGGAAAATTCTGCTAAGAATTCTGGTTTTGAGAGTCAAGGGAAGCTAGCTTAATTT 551

 20954091 TTAAAGTGAAGGCTACATAAGAGTCCTCTCTCCAGTGTGGTGGCTCACACCTATAAACCC 20954150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      552 TTAAAGTGAAGGCTACATAAGAGTCCTCTCTCCAGTGTGGTGGCTCACACCTATAAACCC 611

 20954151 AGCGCTTCGGGCAAATCACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCAATGTAGTGAG 20954210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      612 AGCGCTTCGGGCAAATCACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCAATGTAGTGAG 671

 20954211 ACCCCTATCTCTACAAAAAAATTTAAAAATTAGCAGGGTGTGGTGGTGCGTGCCTGTAGT 20954270
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      672 ACCTCTATCTCTACAAAAAAATTTAAAAATTAGCAGGGTGTGGTGGTGCGTGCCTGTAGT 731

 20954271 CCTGGCTACTTGGGTGGGATGCTGATGTGGGAGGATTGCTTGAGCCCAGGATTTGGAGGT 20954330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      732 CCTGGCTACTTGGGTGGGATGCTGATGTGGGAGGATTGCTTGAGCCCAGGATTTGGAGGT 791

 20954331 TGCAGCGAGCCATGATGGTGCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACATGGCAAGACCTCGTCT 20954390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      792 TGCAGCGAGCCATGATGGTGCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACATGGCAAGACCTCGTCT 851

 20954391 CAAAAAAATACAAAGAGTCCTCTCTATGTTGGAAATGTCAGAGTTATTGGCCATTTAGGG 20954450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      852 CAAAAAAATACAAAGAGTCCTCTCTATGTTGGAAATGTCAGAGTTATTGGCCATTTAGGG 911

 20954451 GATCTAACTTGCTCTTTGATGTCCAAGAGGAAAGGTATAGAGTTCTCCTGATTACACAGG 20954510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      912 GATCTAACTTGCTCTTTGATGTCCAAGAGGAAAGGTATAGAGTTCTCCTGATTACACAGG 971

 20954511 GCCTCTGCTTGTGGGTCGCCTGCATGAGGCGATCAGAATCTGAGTCACCTGGGATCATGT 20954570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      972 GCCTCTGCTTGTGGGTCGCCTGCATGAGGCGATCAGAATCTGAGTCACCTGGGATCATGT 1031

 20954571 GGGTGCTGGTACATCCTAGAGATAGGATGTGTTGGTCATGGAAGAGAGTGGGCCACAAAT 20954630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1032 GGGTGCTGGTACATCCTAGAGATAGGATGTGTTGGTCATGGAAGAGAGTGGGCCACAAAT 1091

 20954631 GGGTTCCAGGGGAATAGCGTTGCCTGGTGCAAGGAGGGGGATGTGGAGGTGCAGGGAGCA 20954690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1092 GGGTTCCAGGGGAATAGCGTTGCCTGGTGCAAGGAGGGGGATGTGGAGGTGCAGGGAGCA 1151

 20954691 GGGGTGGTGTCTGGAGAGCCTGAAGCTGTGCTGCCAGAGGCTCCAGGCCATGAGGTCTGA 20954750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1152 GGGGTGGTGTCTGGAGAGCCTGAAGCTGTGCTGCCAGAGGCTCCAGGCCATGAGGTCTGA 1211

 20954751 GAAGCATCTAGATTTGGCCTGTTCACAGCAGGGAAGTGTGGTCCAGTGGCAAAAAGTTGA 20954810
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1212 GAAGCATCTGGATTTGGCCTGTTCACAGCAGGGAAGTGTGGTCCAGTGGCAAAAAGTTGA 1271

 20954811 GGGCATCCTAGGAGTTGAGGAGGTGGTGGCGGTTAGAGTAAACCACTCTGGAGGCGTCCG 20954870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1272 GGGCATCCTAGGAGTTGAGGAGGTGGTGGCGGTTAGAGTAAACCACTCTGGAGGCGTCCG 1331

 20954871 GGGTGGAGAGACGAGAATGTGCAAGAACTCCTGCCTCTAGCCTGGCCTCCTCAGGACCCC 20954930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1332 GGGTGGAGAGACGAGAATGTGCAAGAACTCCTGCCTCTAGCCTGGCCTCCTCAGGACCCC 1391

 20954931 GGCCACCAGCCTCCCTCCTAGAAGTCCCCAGAGCTTCCTCCTCCTTGTGCCCCAGAACTG 20954990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1392 GGCCACCAGCCTCCCTCCTAGAAGTCCCCAGAGCTTCCTCCTCCTTGTGCCCCAGAACTG 1451

 20954991 GTTCCTGGGTTGCTCCAACCCCAGACCTTCCCTGGAAGTCCCCCCCAGTGCCTCCTGGCT 20955050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1452 GTTCCTGGGTTGCTCCAACCCCAGACCTTCCCTGGAAGTCCCCCCCAGTGCCTCCTGGCT 1511

 20955051 GGGAACCCCCAACTGCATTTTGCTTCTGCTCTCGTGCCAGTAGTCCCCTTTTCTCTCCAG 20955110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1512 GGGAACCCCCAACTGCATTTTGCTTCTGCTCTCGTGCCAGTAGTCCCCTTTTCTCTCCAG 1571

 20955111 TGTCCAGGCCCCAACCACCAAGACCCTGCCTCCTCACTTGGCTTTGCTGTTCTTAGTTCT 20955170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1572 TGTCCAGGCCCCAACCACCAAGACCCTGCCTCCTCACTTGGCTTTGCTGTTCTTAGTTCT 1631

 20955171 CTACTCAGTAGGTTGTGTCTGCCTCCATTCCTGGCCAGACGCTGCCCTGGGGCTGAGTGC 20955230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1632 CTACTCAGTAGGTTGTGTCTGCCTCCATTCCTGGCCAGACGCTGCCCTGGGGCTGAGTGC 1691

 20955231 ACAGTCCCCAGCCACTCCCGAGATCCTCAGAGCTTCTGGAAGCCACAGACATGGTGGCAT 20955290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1692 ACAGTCCCCAGCCACTCCCGAGATCCTCAGAGCTTCTGGAAGCCACAGACATGGTGGCAT 1751

 20955291 ATGTTTCAGGTCGTCAGCTTGTTTTTTTTTGGAGACAGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGC 20955350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1752 ATGTTTCAGGTCGTCAGCTTGTTTTTTTTTGGAGACAGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGC 1811

 20955351 TGGAGTGCGGTGACGTGATCATTCACTGCAGCCTTGACCTTCTGAGCCCGGGTGATCCTC 20955410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1812 TGGAGTGCGGTGACGTGATCATTCACTGCAGCCTTGACCTTCTGAGCCCGGGTGATCCTC 1871

 20955411 CCACCTCAGCCTGTCAAGTAGCTGAGACCACATGTGTGAGCCACCACACCTAGCTTTTTG 20955470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1872 CCACCTCAGCCTGTCAAGTAGCTGAGACCACATGTGTGAGCCACCACACCTAGCTTTTTG 1931

 20955471 AATCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCA 20955530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1932 AATCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCA 1991

 20955531 GTGGCACAATCTTGGCTTACTGCAACCTCCAGCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCT 20955590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1992 GTGGCACAATCTTGGCTTACTGCAACCTCCAGCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCT 2051

 20955591 CTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGTAGGTGGCACCACACCTAGCTAATTTTTATGTCTTT 20955650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2052 CTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGTAGGTGGCACCACACCTAGCTAATTTTTATGTCTTT 2111

 20955651 AGTAGAGACAAAGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGATCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGA 20955710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2112 AGTAGAGACAAAGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGATCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGA 2171

 20955711 TCTGCCTGTCTTGACCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGGGCCACGCGCCCAGCCA 20955770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2172 TCTGCCTGTCTTGACCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGGGCCACGCGCCCAGCCA 2231

 20955771 ACTTTTTGAATCTTTTGTAGGGATGGGGTCTTGCTGTGTTGCCCAGGCTGGGCTTAAACT 20955830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2232 ACTTTTTGAATCTTTTGTAGGGATGGGGTCTTGCTGTGTTGCCCAGGCTGGGCTTAAACT 2291

 20955831 CCTGGACTCAAGTGATCCTCCCTGCCTTGGTTTCTCAAACTTCTGGGATTACAGGCCAAT 20955890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2292 CCTGGACTCAAGTGATCCTCCCTGCCTTGGTTTCTCAAACTTCTGGGATTACAGGCCAAT 2351

 20955891 CTACTCAACGTTGATATTGAGTAGAAGGCAAAATTCACATGGCTCCGGCCCAGCCCCTTT 20955950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2352 CTACTCAACGTTGATATTGAGTAGAAGGCAAAATTCACATGGCTCCGGCCCAGCCCCTTT 2411

 20955951 CTGTCTCAGGCACTTCAGTGTTAATATGCGCCTTGGTTTTGCTGCTGCCGAGTCTACTGT 20956010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2412 CTGTCTCAGGCACTTCAGTGTTAATATGCGCCTTGGTTTTGCTGCTGCCGAGTCTACTGT 2471

 20956011 GCCCCTGGGCAAGGAAAGCAAAGGAAA 20956037
          |||||||||||||||||||||||||||
     2472 GCCCCTGGGCAAGGAAAGCAAAGGAAA 2498

Alignment time is 1.98293 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [20940623,20963850] =>     23228 nucs '22 dna:chromosome chromosome:GRCh37:22:1:51304566:1'
Second seq [       1,    3062] =>      3062 nucs 'mol-32-310c-016863_3062'

Score:        2997
Aligned:      3052        nucs
Identic:      3047 (100%) nucs =>      1903 (100%)      1144 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [20948720,20950623] EXCISED REGION [20953851,20954998]
 second seq =>  [       1,    1904] EXCISED REGION [    1915,    3062]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3227 nucs [20950624,20953850]
 second seq =>        10 nucs [1905,1914]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [1905,1906] to [1915,1916]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [20950624,20950624] to [20953850,20953850]
 second seq =>         0 nucs

 20948720 CAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGT 20948779
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
        1 CAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGT 60

 20948780 AAGCTGAGATTATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAGTAAGACTCCGTCTCAAAAAACAA 20948839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAGCTGAGATTATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAGTAAGACTCCGTCTCAAAAAACAA 120

 20948840 AAAGAAAATATAAGAAGTCAAAAACACAACAGAATGAAAGATCAGGGCTGGCAGCAGTGG 20948899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAAGAAAATATAAGAAGTCAAAAACACAACAGAATGAAAGATCAGGGCTGGCAGCAGTGG 180

 20948900 CTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGTTGGGTGGATCACCTGAGGTTAGG 20948959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGTTGGGTGGATCACCTGAGGTTAGG 240

 20948960 AGTTGGAGACCAGCCTGGCCAACATGGAGAAACCCCGTCTCTACTCAAAATACAAAAATT 20949019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGTTGGAGACCAGCCTGGCCAACATGGAGAAACCCCGTCTCTACTCAAAATACAAAAATT 300

 20949020 AGCTGGGTGTGGTGGCGCATGCCTGTAATCCCAACTACACAGAAGGATGAGGCAGGAGAA 20949079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGCTGGGTGTGGTGGCGCATGCCTGTAATCCCAACTACACAGAAGGATGAGGCAGGAGAA 360

 20949080 TTGCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGATGTAGTGAGCCGAGATCATGCCACTGCACTCCAGC 20949139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTGCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGATGTAGTGAGCCGAGATCATGCCACTGCACTCCAGC 420

 20949140 CTGGGTGACAGAAGGAGACTCTGTCTCAAAAAAGAAAGAAAGAAAGGTCAGGTGCATGGC 20949199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTGGGTGACAGAAGGAGACTCTGTCTCAAAAAAGAAAGAAAGAAAGGTCAGGTGCATGGC 480

 20949200 TCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGAGAGGCCAAAGTAGAAGGATCGTTTGAGCCCAGGA 20949259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGAGAGGCCAAAGTAGAAGGATCGTTTGAGCCCAGGA 540

 20949260 GTTGGAGACCAGCCTGGGCAATATAGCCAGACCCTGTCTCTACAAAAAATTAAAAAAATT 20949319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GTTGGAGACCAGCCTGGGCAATATAGCCAGACCCTGTCTCTACAAAAAATTAAAAAAATT 600

 20949320 GCCAGCATGGTGGTGCACATCTGCAGTCCCTGCTACTCAGGAGGCCAAGGCTGCAGTGAG 20949379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GCCAGCATGGTGGTGCACATCTGCAGTCCCTGCTACTCAGGAGGCCAAGGCTGCAGTGAG 660

 20949380 CTGTGATTGTACTACTGCACTCTGGCCTGGGTAACAGAGAGAGACCCTGTCTCAAAAATG 20949439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTGTGATTGTACTACTGCACTCTGGCCTGGGTAACAGAGAGAGACCCTGTCTCAAAAATG 720

 20949440 GGGTAAAATGGTATAGGAAATTTGGATCTAAAAAAAAAAAAAAGGAAGTGCATTAGATAA 20949499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GGGTAAAATGGTATAGGAAATTTGGATCTAAAAAAAAAAAAAAGGAAGTGCATTAGATAA 780

 20949500 GAAATAAATGAAGATAAAATAGAATCTTTTTTTTGGTGGGGGTGGGGAACGGAGTTTCAC 20949559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GAAATAAATGAAGATAAAATAGAATCTTTTTTTTGGTGGGGGTGGGGAACGGAGTTTCAC 840

 20949560 TCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCACGATCTTGGCTCACCACAACATCCGCCTAC 20949619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCACGATCTTGGCTCACCACAACATCCGCCTAC 900

 20949620 TGGGTTCAGGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGTGCC 20949679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGGGTTCAGGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGTGCC 960

 20949680 ACCACGTCCAGCTAATTTTGTATTTTTATTAGAGTCGGGGGTTACTCCACGTTGGTCAGG 20949739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ACCACGTCCAGCTAATTTTGTATTTTTATTAGAGTCGGGGGTTACTCCACGTTGGTCAGG 1020

 20949740 CTGGTCTTGAACTCCTAACCTCAGGCGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGAA 20949799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTGGTCTTGAACTCCTAACCTCAGGCGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGAA 1080

 20949800 TTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGCCAGAATCTTGTATTGTTCTTATTTTTAGTTGAA 20949859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGCCAGAATCTTGTATTGTTCTTATTTTTAGTTGAA 1140

 20949860 CAGATGGCAGGTTATTCAAAATAATTATATCAACATGTATTCAGTAATTATAGCTTATGG 20949919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CAGATGGCAGGTTATTCAAAATAATTATATCAACATGTATTCAGTAATTATAGCTTATGG 1200

 20949920 ATAGCTGGAATGAATGGCAGCAATGTTATAAGGGATGGGAAGGAGGATATCCTGAGTGGA 20949979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATAGCTGGAATGAATGGCAGCAATGTTATAAGGGATGGGAAGGAGGATATCCTGAGTGGA 1260

 20949980 AAGAAAGTCACCCAGGCTGGAGTGAAGTGGCACAATTATAGCCCACTTGCAGCCTGCAAC 20950039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AAGAAAGTCACCCAGGCTGGAGTGAAGTGGCACAATTATAGCCCACTTGCAGCCTGCAAC 1320

 20950040 TCCTGGGCTCAAGCCATCCTTCTGCTTCAGCCTCCCTGGTAACTGGGATTACAGACACAC 20950099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TCCTGGGCTCAAGCCATCCTTCTGCTTCAGCCTCCCTGGTAACTGGGATTACAGACACAC 1380

 20950100 ACCACCATGCCTGGCTAATTTTTAAATTTTTTGTCTCGCTGTGTTGCCCAGGCTGGTCTC 20950159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ACCACCATGCCTGGCTAATTTTTAAATTTTTTGTCTCGCTGTGTTGCCCAGGCTGGTCTC 1440

 20950160 AAACTCCTGGGCTCAAGAAATCCTCCTGCCTTAGCCTCCCAAAGTGTTGAGATTACAGGC 20950219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AAACTCCTGGGCTCAAGAAATCCTCCTGCCTTAGCCTCCCAAAGTGTTGAGATTACAGGC 1500

 20950220 GTGAGCCACTGTGCCTGGTTTATGGTTGCTTTTGAATGTCCTAGTCCTACATAAGTGGCT 20950279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GTGAGCCACTGTGCCTGGTTTATGGTTGCTTTTGAATGTCCTAGTCCTACATAAGTGGCT 1560

 20950280 TCCAAGAAGGGAAAAAGAAAAATGCAGGCAGGAAAAGGTGCTGATCCATAAAAACCTCTG 20950339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TCCAAGAAGGGAAAAAGAAAAATGCAGGCAGGAAAAGGTGCTGATCCATAAAAACCTCTG 1620

 20950340 GAAGGTATGTCTCTAGGGAGGGGGTGAGTGTTGAGGAGGGATGTTGCAAACATGGTAGTG 20950399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GAAGGTATGTCTCTAGGGAGGGGGTGAGTGTTGAGGAGGGATGTTGCAAACATGGTAGTG 1680

 20950400 GAGATGGCAAGAGTGGCTGCCTGCCTCTTCGTCTGCACTTCCACAATCTGAAGCAGCCAT 20950459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GAGATGGCAAGAGTGGCTGCCTGCCTCTTCGTCTGCACTTCCACAATCTGAAGCAGCCAT 1740

 20950460 CATCAATCGGAACACAGATCCCCAGTATTTGGAGGATGGGGCTCTTATTGCCTGCTGTGG 20950519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CATCAATCGGAACACAGATCCCCAGTATTTGGAGGATGGGGCTCTTATTGCCTGCTGTGG 1800

 20950520 CTCCTGCAAGCTATAGGGAAGCTACCCCAGAAGTATAGGCATGGCTGCTTGCACCACCAA 20950579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CTCCTGCAAGCTATAGGGAAGCTACCCCAGAAGTATAGGCATGGCTGCTTGCACCACCAA 1860

 20950580 TTTAAATGCTAATTACTTCTGAAAACACCCTCACACACATGCCC 20950623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTTAAATGCTAATTACTTCTGAAAACACCCTCACACACATGCCC 1904

EXCISED REGION

 20953851 TATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGCTCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAGCT 20953910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1915 TATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGCTCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAGCT 1974

 20953911 CAGGCGATCCACCTGCCTCGGCTTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTG 20953970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1975 CAGGCGATCCACCTGCCTCGGCTTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTG 2034

 20953971 CCTGGCCAAAAGTAGAAATTCTTGATTGGGAAATAATTTTATATATTTCGGCCCCTTCTC 20954030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2035 CCTGGCCAAAAGTAGAAATTCTTGATTGGGAAATAATTTTATATATTTCGGCCCCTTCTC 2094

 20954031 ACTTGGGAAAATTCTGCTAAGAATTCTGGTTTTGAGAGTCAAGGGAAGCTAGCTTAATTT 20954090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2095 ACTTGGGAAAATTCTGCTAAGAATTCTGGTTTTGAGAGTCAAGGGAAGCTAGCTTAATTT 2154

 20954091 TTAAAGTGAAGGCTACATAAGAGTCCTCTCTCCAGTGTGGTGGCTCACACCTATAAACCC 20954150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2155 TTAAAGTGAAGGCTACATAAGAGTCCTCTCTCCAGTGTGGTGGCTCACACCTATAAACCC 2214

 20954151 AGCGCTTCGGGCAAATCACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCAATGTAGTGAG 20954210
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2215 AGCGCTTCGAGCAAATCACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCAATGTAGTGAG 2274

 20954211 ACCCCTATCTCTACAAAAAAATTTAAAAATTAGCAGGGTGTGGTGGTGCGTGCCTGTAGT 20954270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2275 ACCCCTATCTCTACAAAAAAATTTAAAAATTAGCAGGGTGTGGTGGTGCGTGCCTGTAGT 2334

 20954271 CCTGGCTACTTGGGTGGGATGCTGATGTGGGAGGATTGCTTGAGCCCAGGATTTGGAGGT 20954330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2335 CCTGGCTACTTGGGTGGGATGCTGATGTGGGAGGATTGCTTGAGCCCAGGATTTGGAGGT 2394

 20954331 TGCAGCGAGCCATGATGGTGCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACATGGCAAGACCTCGTCT 20954390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2395 TGCAGCGAGCCATGATGGTGCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACATGGCAAGACCTCGTCT 2454

 20954391 CAAAAAAATACAAAGAGTCCTCTCTATGTTGGAAATGTCAGAGTTATTGGCCATTTAGGG 20954450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2455 CAAAAAAATACAAAGAGTCCTCTCTATGTTGGAAATGTCAGAGTTATTGGCCATTTAGGG 2514

 20954451 GATCTAACTTGCTCTTTGATGTCCAAGAGGAAAGGTATAGAGTTCTCCTGATTACACAGG 20954510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2515 GATCTAACTTGCTCTTTGATGTCCAAGAGGAAAGGTATAGAGTTCTCCTGATTACACAGG 2574

 20954511 GCCTCTGCTTGTGGGTCGCCTGCATGAGGCGATCAGAATCTGAGTCACCTGGGATCATGT 20954570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2575 GCCTCTGCTTGTGGGTCGCCTGCATGAGGCGATCAGAATCTGAGTCACCTGGGATCATGT 2634

 20954571 GGGTGCTGGTACATCCTAGAGATAGGATGTGTTGGTCATGGAAGAGAGTGGGCCACAAAT 20954630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2635 GGGTGCTGGTACATCCTAGAGATAGGATGTGTTGGTCATGGAAGAGAGTGGGCCACAAAT 2694

 20954631 GGGTTCCAGGGGAATAGCGTTGCCTGGTGCAAGGAGGGGGATGTGGAGGTGCAGGGAGCA 20954690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2695 GGGTTCCAGGGGAATAGCGTTGCCTGGTGCAAGGAGGGGGATGTGGAGGTGCAGGGAGCA 2754

 20954691 GGGGTGGTGTCTGGAGAGCCTGAAGCTGTGCTGCCAGAGGCTCCAGGCCATGAGGTCTGA 20954750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2755 GGGGTGGTGTCTGGAGAGCCTGAAGCTGTGCTGCCAGAGGCTCCAGGCCATGAGGTCTGA 2814

 20954751 GAAGCATCTAGATTTGGCCTGTTCACAGCAGGGAAGTGTGGTCCAGTGGCAAAAAGTTGA 20954810
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2815 GAAGCATCTGGATTTGGCCTGTTCACAGCAGGGAAGTGTGGTCCAGTGGCAAAAAGTTGA 2874

 20954811 GGGCATCCTAGGAGTTGAGGAGGTGGTGGCGGTTAGAGTAAACCACTCTGGAGGCGTCCG 20954870
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     2875 GGGCATCCTAGGAGTTGAGGAGGTGGTGGCGGTTAGAGTAAACCACTCTGGAGGCATCCG 2934

 20954871 GGGTGGAGAGACGAGAATGTGCAAGAACTCCTGCCTCTAGCCTGGCCTCCTCAGGACCCC 20954930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2935 GGGTGGAGAGACGAGAATGTGCAAGAACTCCTGCCTCTAGCCTGGCCTCCTCAGGACCCC 2994

 20954931 GGCCACCAGCCTCCCTCCTAGAAGTCCCCAGAGCTTCCTCCTCCTTGTGCCCCAGAACTG 20954990
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2995 GGCCACCAGCCCCCCTCCTAGAAGTCCCCAGAGCTTCCTCCTCCTTGTGCCCCAGAACTG 3054

 20954991 GTTCCTGG 20954998
          ||||||||
     3055 GTTCCTGG 3062

Alignment time is 2.44577 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [20940623,20963850] =>     23228 nucs '22 dna:chromosome chromosome:GRCh37:22:1:51304566:1'
Second seq [       1,    6538] =>      6538 nucs 'mol-32-3164-191114_6538'

Score:        6416
Aligned:      6538        nucs
Identic:      6522 (100%) nucs =>      3886 (100%)      2636 (100%)
Gaps:           10 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [20946731,20950623] EXCISED REGION [20953851,20956495]
 second seq =>  [       1,    3887] EXCISED REGION [    3898,    6538]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3227 nucs [20950624,20953850]
 second seq =>        10 nucs [3888,3897]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [3888,3889] to [3898,3899]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [20950624,20950624] to [20953850,20953850]
 second seq =>         0 nucs

 20946731 TTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGAACGTGGTGGCACGTGCCTGTAGTCCAAGCT 20946790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGAACGTGGTGGCACGTGCCTGTAGTCCAAGCT 60

 20946791 ACTTGGGAGGCTGAGGCCGGAGAATGGCTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCA 20946850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACTTGGGAGGCTGAGGCCGGAGAATGGCTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCA 120

 20946851 GAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGGGAGACTCTGTCTCAAAAAAGAA 20946910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGGGAGACTCTGTCTCAAAAAAGAA 180

 20946911 AAAATAAAATAATAAAACGCATTCAGGCATTCTCTACAGCCTGGGCAACATAGTGAGACC 20946970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAAATAAAATAATAAAACGCATTCAGGCATTCTCTACAGCCTGGGCAACATAGTGAGACC 240

 20946971 CTGTCTCTATAAAAAGTAAAAGAAAAAAAATTAGCCGGGCTTGGTGCTGTGCTCCTGTAG 20947030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTGTCTCTATAAAAAGTAAAAGAAAAAAAATTAGCCGGGCTTGGTGCTGTGCTCCTGTAG 300

 20947031 TCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGGACTGCTGGAATCCCGGAGGTCAAGGCCGC 20947090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGGACTGCTGGAATCCCGGAGGTCAAGGCCGC 360

 20947091 AGTGAGCTATGATGGCACCACTGAACTCCAGGCTAGGTGACACAGTGAGATGCTGCCTAA 20947150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGTGAGCTATGATGGCACCACTGAACTCCAGGCTAGGTGACACAGTGAGATGCTGCCTAA 420

 20947151 AAGAAAAAAAAAAAAAGAAATATGTCTTTCTTTACAAGGCCTGCCCTAAAAAAAAAAAAA 20947210
          ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAGAAAAAAAAAAAA-GAAATATGTCTTTCTTTACAAGGCCTGCCCTAAAAAAAAAAAAA 479

 20947211 AAAAAAAATGTTCGCCAGAGCCAGGCCAACTGTGATTTTACCAGATGCCAACATACCCAA 20947270
          ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      480 AAAAAAA-TGTTCGCCAGAGCCAGGCCAACTGTGATTTTACCAGATGCCAACATACCCAA 538

 20947271 CCCAAGGGAGGAAGGGAACATACCCAATCCCAGCCTGTTCTAGCTCCTCTTCCCCACATC 20947330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      539 CCCAAGGGAGGAAGGGAACATACCCAATCCCAGCCTGTTCTAGCTCCTCTTCCCCACATC 598

 20947331 TTCCTGCCACATCAATAGGGCTCCTGTATAATAACAGGGGATACAAGTGAAAGAACAGCC 20947390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      599 TTCCTGCCACATCAATAGGGCTCCTGTATAATAACAGGGGATACAAGTGAAAGAACAGCC 658

 20947391 CATCTCAGAACTTATTTGAGAAATGTCTAGGAAACCCTAAAGACAACAGGGAGACAAAAA 20947450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      659 CATCTCAGAACTTATTTGAGAAATGTCTAGGAAACCCTAAAGACAACAGGGAGACAAAAA 718

 20947451 CTAAGACACCAGAGGAAGTTTATGCCTCTGACACTTACAGTTAGAACAAACAGCACACAT 20947510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      719 CTAAGACACCAGAGGAAGTTTATGCCTCTGACACTTACAGTTAGAACAAACAGCACACAT 778

 20947511 GGCCCAACCCCTAACCAGAGCAAAATAAAACCTCACACAGGCCGGGCGCTGTGGCTCACC 20947570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      779 GGCCCAACCCCTAACCAGAGCAAAATAAAACCTCACACAGGCCGGGCGCTGTGGCTCACC 838

 20947571 CCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGTGGATCACGAGGTCAGGAGTTCAAG 20947630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      839 CCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGTGGATCACGAGGTCAGGAGTTCAAG 898

 20947631 ACCACCCTGGCCAAGATGGTGAAACCCCATCTACTAAAAATACAAAAATTAGCGGGCGTG 20947690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      899 ACCACCCTGGCCAAGATGGTGAAACCCCATCTACTAAAAATACAAAAATTAGCGGGCGTG 958

 20947691 GTGGCAGGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGGTGAGGCAGAGAATTGCTTGAAGCC 20947750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      959 GTGGCAGGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGGTGAGGCAGAGAATTGCTTGAAGCC 1018

 20947751 AGGAGGTAGAGCTTGCAGTGAGCGGAGATTGCGGCACCGCACTCCAGCCTGGGTGACAAA 20947810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1019 AGGAGGTAGAGCTTGCAGTGAGCGGAGATTGCGGCACCGCACTCCAGCCTGGGTGACAAA 1078

 20947811 GTGAGACTCTGTCTCAAAAAACAAAAACAAACAAACAAAAACTTCACACAGAAAGCCCAT 20947870
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||
     1079 GTGAGACTCTGTCTCAAAAAACAAAAACAAACAAA----AACTTCACACAGAAAGCCCAT 1134

 20947871 TTATCACGTACCCCGTACAGCATGTCCAGCTCCCCACAAAAAATTTCAAGGCATAATAAA 20947930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     1135 TTATCACGTACCCCGTACAGCATGTCCAGCTCGCCACAAAAAATTTCAAGGCATAATAAA 1194

 20947931 AACCAAAAAATGCAGTTTGAAGAGACAGCAAGCATCAGAGCCAGACTCAAATATGGCAGA 20947990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1195 AACCAAAAAATGCAGTTTGAAGAGACAGCAAGCATCAGAGCCAGACTCAAATATGGCAGA 1254

 20947991 GATGTCGGAATTATCAGACCAAGAAATGGAATACAACTATGATTAATATGCTAAGGGCTC 20948050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1255 GATGTCGGAATTATCAGACCAAGAAATGGAATACAACTATGATTAATATGCTAAGGGCTC 1314

 20948051 TAATGGAAAAGTGGACAACATGAGATTACAGACAGAAAATGGAAACAGGGATAGACACTC 20948110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1315 TAATGGAAAAGTGGACAACATGAGATTACAGACAGAAAATGGAAACAGGGATAGACACTC 1374

 20948111 TGAGAAAGAATCTAAAGAATATGTGAAGGCCGGGCACAGTGGCTTATGCCTGTAATCCCA 20948170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1375 TGAGAAAGAATCTAAAGAATATGTGAAGGCCGGGCACAGTGGCTTATGCCTGTAATCCCA 1434

 20948171 GCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGCGGATCACTTGAAGTCAGGAGTTCGAAGACCAGCCCAG 20948230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1435 GCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGCGGATCACTTGAAGTCAGGAGTTCGAAGACCAGCCCAG 1494

 20948231 TTCGAGACCAGATGGCAAAACCCCATCTCTACTAAAAAATACAAAAATTAGCCAGGTGTG 20948290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1495 TTCGAGACCAGATGGCAAAACCCCATCTCTACTAAAAAATACAAAAATTAGCCAGGTGTG 1554

 20948291 GTGGCATGAACCTGTAATTCCAGCTATTCAGGAGGCTGAGGTGGGAGGACTGCTTGGACC 20948350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1555 GTGGCATGAACCTGTAATTCCAGCTATTCAGGAGGCTGAGGTGGGAGGACTGCTTGGACC 1614

 20948351 CAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGTGCCACTGCCCTCAAATCTGGGTGACAG 20948410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1615 CAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGTGCCACTGCCCTCAAATCTGGGTGACAG 1674

 20948411 AGTGAGACACCACCAAAAAAAAGAAAAGAAAAGAAAGGAAACAAGGAGAGGAAAGAAAGG 20948470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1675 AGTGAGACACCACCAAAAAAAAGAAAAGAAAAGAAAGGAAACAAGGAGAGGAAAGAAAGG 1734

 20948471 AAAGAAAGAAAGAAAGAAAAGAAAGAAAGAAAGAGAAAGAGAAAATAAAGAAAAAGAAAG 20948530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1735 AAAGAAAGAAAGAAAGAAAAGAAAGAAAGAAAGAGAAAGAGAAAATAAAGAAAAAGAAAG 1794

 20948531 AAAGAAGGAGAATATGTGAGAAGTCAGCCAGGTAGTGACTCATGACTGTAATCCCAACAC 20948590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1795 AAAGAAGGAGAATATGTGAGAAGTCAGCCAGGTAGTGACTCATGACTGTAATCCCAACAC 1854

 20948591 TTTGGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCACTTGAGGTCAGCAGTTCAAGACCAGCCTGGGCAA 20948650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1855 TTTGGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCACTTGAGGTCAGCAGTTCAAGACCAGCCTGGGCAA 1914

 20948651 CATGGTGATAACCCATCTCTACTAAAAATAAAAAAATTAGCTGGATGTGGTGTCATGCAC 20948710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1915 CATGGTGATAACCCATCTCTACTAAAAATAAAAAAATTAGCTGGATGTGGTGTCATGCAC 1974

 20948711 CTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGTGGA 20948770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1975 CTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGTGGA 2034

 20948771 GGTTGCAGTAAGCTGAGATTATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAGTAAGACTCCGTCTC 20948830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2035 GGTTGCAGTAAGCTGAGATTATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAGTAAGACTCCGTCTC 2094

 20948831 AAAAAACAAAAAGAAAATATAAGAAGTCAAAAACACAACAGAATGAAAGATCAGGGCTGG 20948890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2095 AAAAAACAAAAAGAAAATATAAGAAGTCAAAAACACAACAGAATGAAAGATCAGGGCTGG 2154

 20948891 CAGCAGTGGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGTTGGGTGGATCACCT 20948950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2155 CAGCAGTGGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGTTGGGTGGATCACCT 2214

 20948951 GAGGTTAGGAGTTGGAGACCAGCCTGGCCAACATGGAGAAACCCCGTCTCTACTCAAAAT 20949010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2215 GAGGTTAGGAGTTGGAGACCAGCCTGGCCAACATGGAGAAACCCCGTCTCTACTCAAAAT 2274

 20949011 ACAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCGCATGCCTGTAATCCCAACTACACAGAAGGATGAG 20949070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2275 ACAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCGCATGCCTGTAATCCCAACTACACAGAAGGATGAG 2334

 20949071 GCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGATGTAGTGAGCCGAGATCATGCCACTG 20949130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2335 GCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGATGTAGTGAGCCGAGATCATGCCACTG 2394

 20949131 CACTCCAGCCTGGGTGACAGAAGGAGACTCTGTCTCAAAAAAGAAAGAAAGAAAGGTCAG 20949190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2395 CACTCCAGCCTGGGTGACAGAAGGAGACTCTGTCTCAAAAAAGAAAGAAAGAAAGGTCAG 2454

 20949191 GTGCATGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGAGAGGCCAAAGTAGAAGGATCGTTTG 20949250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2455 GTGCATGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGAGAGGCCAAAGTAGAAGGATCGTTTG 2514

 20949251 AGCCCAGGAGTTGGAGACCAGCCTGGGCAATATAGCCAGACCCTGTCTCTACAAAAAATT 20949310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2515 AGCCCAGGAGTTGGAGACCAGCCTGGGCAATATAGCCAGACCCTGTCTCTACAAAAAATT 2574

 20949311 AAAAAAATTGCCAGCATGGTGGTGCACATCTGCAGTCCCTGCTACTCAGGAGGCCAAGGC 20949370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2575 AAAAAAATTGCCAGCATGGTGGTGCACATCTGCAGTCCCTGCTACTCAGGAGGCCAAGGC 2634

 20949371 TGCAGTGAGCTGTGATTGTACTACTGCACTCTGGCCTGGGTAACAGAGAGAGACCCTGTC 20949430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2635 TGCAGTGAGCTGTGATTGTACTACTGCACTCTGGCCTGGGTAACAGAGAGAGACCCTGTC 2694

 20949431 TCAAAAATGGGGTAAAATGGTATAGGAAATTTGGATCTAAAAAAAAAAAAAAGGAAGTGC 20949490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2695 TCAAAAATGGGGTAAAATGGTATAGGAAATTTGGATCTAAAAAAAAAAAAAAGGAAGTGC 2754

 20949491 ATTAGATAAGAAATAAATGAAGATAAAATAGAATCTTTTTTTTGGTGGGGGTGGGGAACG 20949550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2755 ATTAGATAAGAAATAAATGAAGATAAAATAGAATCTTTTTTTTGGTGGGGGTGGGGAACG 2814

 20949551 GAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCACGATCTTGGCTCACCACAACA 20949610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2815 GAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCACGATCTTGGCTCACCACAACA 2874

 20949611 TCCGCCTACTGGGTTCAGGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAG 20949670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2875 TCCGCCTACTGGGTTCAGGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAG 2934

 20949671 GCATGTGCCACCACGTCCAGCTAATTTTGTATTTTTATTAGAGTCGGGGGTTACTCCACG 20949730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2935 GCATGTGCCACCACGTCCAGCTAATTTTGTATTTTTATTAGAGTCGGGGGTTACTCCACG 2994

 20949731 TTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTAACCTCAGGCGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAA 20949790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2995 TTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTAACCTCAGGCGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAA 3054

 20949791 GTGCTGGAATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGCCAGAATCTTGTATTGTTCTTATTT 20949850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3055 GTGCTGGAATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGCCAGAATCTTGTATTGTTCTTATTT 3114

 20949851 TTAGTTGAACAGATGGCAGGTTATTCAAAATAATTATATCAACATGTATTCAGTAATTAT 20949910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3115 TTAGTTGAACAGATGGCAGGTTATTCAAAATAATTATATCAACATGTATTCAGTAATTAT 3174

 20949911 AGCTTATGGATAGCTGGAATGAATGGCAGCAATGTTATAAGGGATGGGAAGGAGGATATC 20949970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3175 AGCTTATGGATAGCTGGAATGAATGGCAGCAATGTTATAAGGGATGGGAAGGAGGATATC 3234

 20949971 CTGAGTGGAAAGAAAGTCACCCAGGCTGGAGTGAAGTGGCACAATTATAGCCCACTTGCA 20950030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3235 CTGAGTGGAAAGAAAGTCACCCAGGCTGGAGTGAAGTGGCACAATTATAGCCCACTTGCA 3294

 20950031 GCCTGCAACTCCTGGGCTCAAGCCATCCTTCTGCTTCAGCCTCCCTGGTAACTGGGATTA 20950090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3295 GCCTGCAACTCCTGGGCTCAAGCCATCCTTCTGCTTCAGCCTCCCTGGTAACTGGGATTA 3354

 20950091 CAGACACACACCACCATGCCTGGCTAATTTTTAAATTTTTTGTCTCGCTGTGTTGCCCAG 20950150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3355 CAGACACACACCACCATGCCTGGCTAATTTTTAAATTTTTTGTCTCGCTGTGTTGCCCAG 3414

 20950151 GCTGGTCTCAAACTCCTGGGCTCAAGAAATCCTCCTGCCTTAGCCTCCCAAAGTGTTGAG 20950210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3415 GCTGGTCTCAAACTCCTGGGCTCAAGAAATCCTCCTGCCTTAGCCTCCCAAAGTGTTGAG 3474

 20950211 ATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCTGGTTTATGGTTGCTTTTGAATGTCCTAGTCCTACA 20950270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3475 ATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCTGGTTTATGGTTGCTTTTGAATGTCCTAGTCCTACA 3534

 20950271 TAAGTGGCTTCCAAGAAGGGAAAAAGAAAAATGCAGGCAGGAAAAGGTGCTGATCCATAA 20950330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3535 TAAGTGGCTTCCAAGAAGGGAAAAAGAAAAATGCAGGCAGGAAAAGGTGCTGATCCATAA 3594

 20950331 AAACCTCTGGAAGGTATGTCTCTAGGGAGGGGGTGAGTGTTGAGGAGGGATGTTGCAAAC 20950390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3595 AAACCTCTGGAAGGTATGTCTCTAGGGAGGGGGTGAGTGTTGAGGAGGGATGTTGCAAAC 3654

 20950391 ATGGTAGTGGAGATGGCAAGAGTGGCTGCCTGCCTCTTCGTCTGCACTTCCACAATCTGA 20950450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3655 ATGGTAGTGGAGATGGCAAGAGTGGCTGCCTGCCTCTTCGTCTGCACTTCCACAATCTGA 3714

 20950451 AGCAGCCATCATCAATCGGAACACAGATCCCCAGTATTTGGAGGATGGGGCTCTTATTGC 20950510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3715 AGCAGCCATCATCAATCGGAACACAGATCCCCAGTATTTGGAGGATGGGGCTCTTATTGC 3774

 20950511 CTGCTGTGGCTCCTGCAAGCTATAGGGAAGCTACCCCAGAAGTATAGGCATGGCTGCTTG 20950570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3775 CTGCTGTGGCTCCTGCAAGCTATAGGGAAGCTACCCCAGAAGTATAGGCATGGCTGCTTG 3834

 20950571 CACCACCAATTTAAATGCTAATTACTTCTGAAAACACCCTCACACACATGCCC 20950623
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3835 CACCACCAATTTAAATGCTAATTACTTCTGAAAACACCCTCACACACATGCCC 3887

EXCISED REGION

 20953851 TATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGCTCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAGCT 20953910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3898 TATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGCTCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAGCT 3957

 20953911 CAGGCGATCCACCTGCCTCGGCTTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTG 20953970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3958 CAGGCGATCCACCTGCCTCGGCTTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTG 4017

 20953971 CCTGGCCAAAAGTAGAAATTCTTGATTGGGAAATAATTTTATATATTTCGGCCCCTTCTC 20954030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4018 CCTGGCCAAAAGTAGAAATTCTTGATTGGGAAATAATTTTATATATTTCGGCCCCTTCTC 4077

 20954031 ACTTGGGAAAATTCTGCTAAGAATTCTGGTTTTGAGAGTCAAGGGAAGCTAGCTTAATTT 20954090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4078 ACTTGGGAAAATTCTGCTAAGAATTCTGGTTTTGAGAGTCAAGGGAAGCTAGCTTAATTT 4137

 20954091 TTAAAGTGAAGGCTACATAAGAGTCCTCTCTCCAGTGTGGTGGCTCACACCTATAAACCC 20954150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4138 TTAAAGTGAAGGCTACATAAGAGTCCTCTCTCCAGTGTGGTGGCTCACACCTATAAACCC 4197

 20954151 AGCGCTTCGGGCAAATCACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCAATGTAGTGAG 20954210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4198 AGCGCTTCGGGCAAATCACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCAATGTAGTGAG 4257

 20954211 ACCCCTATCTCTACAAAAAAATTTAAAAATTAGCAGGGTGTGGTGGTGCGTGCCTGTAGT 20954270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4258 ACCCCTATCTCTACAAAAAAATTTAAAAATTAGCAGGGTGTGGTGGTGCGTGCCTGTAGT 4317

 20954271 CCTGGCTACTTGGGTGGGATGCTGATGTGGGAGGATTGCTTGAGCCCAGGATTTGGAGGT 20954330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4318 CCTGGCTACTTGGGTGGGATGCTGATGTGGGAGGATTGCTTGAGCCCAGGATTTGGAGGT 4377

 20954331 TGCAGCGAGCCATGATGGTGCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACATGGCAAGACCTCGTCT 20954390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4378 TGCAGCGAGCCATGATGGTGCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACATGGCAAGACCTCGTCT 4437

 20954391 CAAAAAAATACAAAGAGTCCTCTCTATGTTGGAAATGTCAGAGTTATTGGCCATTTAGGG 20954450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4438 CAAAAAAATACAAAGAGTCCTCTCTATGTTGGAAATGTCAGAGTTATTGGCCATTTAGGG 4497

 20954451 GATCTAACTTGCTCTTTGATGTCCAAGAGGAAAGGTATAGAGTTCTCCTGATTACACAGG 20954510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4498 GATCTAACTTGCTCTTTGATGTCCAAGAGGAAAGGTATAGAGTTCTCCTGATTACACAGG 4557

 20954511 GCCTCTGCTTGTGGGTCGCCTGCATGAGGCGATCAGAATCTGAGTCACCTGGGATCATGT 20954570
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     4558 GCCTCTGCTTGTGGGTCGCCTGCATGAGGCGATCAGAATCTGAGTCACCCGGGATCATGT 4617

 20954571 GGGTGCTGGTACATCCTAGAGATAGGATGTGTTGGTCATGGAAGAGAGTGGGCCACAAAT 20954630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4618 GGGTGCTGGTACATCCTAGAGATAGGATGTGTTGGTCATGGAAGAGAGTGGGCCACAAAT 4677

 20954631 GGGTTCCAGGGGAATAGCGTTGCCTGGTGCAAGGAGGGGGATGTGGAGGTGCAGGGAGCA 20954690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4678 GGGTTCCAGGGGAATAGCGTTGCCTGGTGCAAGGAGGGGGATGTGGAGGTGCAGGGAGCA 4737

 20954691 GGGGTGGTGTCTGGAGAGCCTGAAGCTGTGCTGCCAGAGGCTCCAGGCCATGAGGTCTGA 20954750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4738 GGGGTGGTGTCTGGAGAGCCTGAAGCTGTGCTGCCAGAGGCTCCAGGCCATGAGGTCTGA 4797

 20954751 GAAGCATCTAGATTTGGCCTGTTCACAGCAGGGAAGTGTGGTCCAGTGGCAAAAAGTTGA 20954810
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4798 GAAGCATCTGGATTTGGCCTGTTCACAGCAGGGAAGTGTGGTCCAGTGGCAAAAAGTTGA 4857

 20954811 GGGCATCCTAGGAGTTGAGGAGGTGGTGGCGGTTAGAGTAAACCACTCTGGAGGCGTCCG 20954870
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     4858 GGGCATCCTAGGAGTTGAGGAGGTGGTGGCGGTTAGAGTAAACCACTCTGGAGGCATCCG 4917

 20954871 GGGTGGAGAGACGAGAATGTGCAAGAACTCCTGCCTCTAGCCTGGCCTCCTCAGGACCCC 20954930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4918 GGGTGGAGAGACGAGAATGTGCAAGAACTCCTGCCTCTAGCCTGGCCTCCTCAGGACCCC 4977

 20954931 GGCCACCAGCCTCCCTCCTAGAAGTCCCCAGAGCTTCCTCCTCCTTGTGCCCCAGAACTG 20954990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4978 GGCCACCAGCCTCCCTCCTAGAAGTCCCCAGAGCTTCCTCCTCCTTGTGCCCCAGAACTG 5037

 20954991 GTTCCTGGGTTGCTCCAACCCCAGACCTTCCCTGGAAGTCCCCCCCAGTGCCTCCTGGCT 20955050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5038 GTTCCTGGGTTGCTCCAACCCCAGACCTTCCCTGGAAGTCCCCCCCAGTGCCTCCTGGCT 5097

 20955051 GGGAACCCCCAACTGCATTTTGCTTCTGCTCTCGTGCCAGTAGTCCCCTTTTCTCTCCAG 20955110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5098 GGGAACCCCCAACTGCATTTTGCTTCTGCTCTCGTGCCAGTAGTCCCCTTTTCTCTCCAG 5157

 20955111 TGTCCAGGCCCCAACCACCAAGACCCTGCCTCCTCACTTGGCTTTGCTGTTCTTAGTTCT 20955170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5158 TGTCCAGGCCCCAACCACCAAGACCCTGCCTCCTCACTTGGCTTTGCTGTTCTTAGTTCT 5217

 20955171 CTACTCAGTAGGTTGTGTCTGCCTCCATTCCTGGCCAGACGCTGCCCTGGGGCTGAGTGC 20955230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5218 CTACTCAGTAGGTTGTGTCTGCCTCCATTCCTGGCCAGACGCTGCCCTGGGGCTGAGTGC 5277

 20955231 ACAGTCCCCAGCCACTCCCGAGATCCTCAGAGCTTCTGGAAGCCACAGACATGGTGGCAT 20955290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5278 ACAGTCCCCAGCCACTCCCGAGATCCTCAGAGCTTCTGGAAGCCACAGACATGGTGGCAT 5337

 20955291 ATGTTTCAGGTCGTCAGCTTGTTTTTTTTTGGAGACAGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGC 20955350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5338 ATGTTTCAGGTCGTCAGCTTGTTTTTTTTTGGAGACAGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGC 5397

 20955351 TGGAGTGCGGTGACGTGATCATTCACTGCAGCCTTGACCTTCTGAGCCCGGGTGATCCTC 20955410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5398 TGGAGTGCGGTGACGTGATCATTCACTGCAGCCTTGACCTTCTGAGCCCGGGTGATCCTC 5457

 20955411 CCACCTCAGCCTGTCAAGTAGCTGAGACCACATGTGTGAGCCACCACACCTAGCTTTTTG 20955470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5458 CCACCTCAGCCTGTCAAGTAGCTGAGACCACATGTGTGAGCCACCACACCTAGCTTTTTG 5517

 20955471 AATCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCA 20955530
          ||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5518 AATC----TTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCA 5573

 20955531 GTGGCACAATCTTGGCTTACTGCAACCTCCAGCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCT 20955590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5574 GTGGCACAATCTTGGCTTACTGCAACCTCCAGCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCT 5633

 20955591 CTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGTAGGTGGCACCACACCTAGCTAATTTTTATGTCTTT 20955650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5634 CTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGTAGGTGGCACCACACCTAGCTAATTTTTATGTCTTT 5693

 20955651 AGTAGAGACAAAGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGATCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGA 20955710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5694 AGTAGAGACAAAGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGATCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGA 5753

 20955711 TCTGCCTGTCTTGACCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGGGCCACGCGCCCAGCCA 20955770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5754 TCTGCCTGTCTTGACCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGGGCCACGCGCCCAGCCA 5813

 20955771 ACTTTTTGAATCTTTTGTAGGGATGGGGTCTTGCTGTGTTGCCCAGGCTGGGCTTAAACT 20955830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5814 ACTTTTTGAATCTTTTGTAGGGATGGGGTCTTGCTGTGTTGCCCAGGCTGGGCTTAAACT 5873

 20955831 CCTGGACTCAAGTGATCCTCCCTGCCTTGGTTTCTCAAACTTCTGGGATTACAGGCCAAT 20955890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5874 CCTGGACTCAAGTGATCCTCCCTGCCTTGGTTTCTCAAACTTCTGGGATTACAGGCCAAT 5933

 20955891 CTACTCAACGTTGATATTGAGTAGAAGGCAAAATTCACATGGCTCCGGCCCAGCCCCTTT 20955950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5934 CTACTCAACGTTGATATTGAGTAGAAGGCAAAATTCACATGGCTCCGGCCCAGCCCCTTT 5993

 20955951 CTGTCTCAGGCACTTCAGTGTTAATATGCGCCTTGGTTTTGCTGCTGCCGAGTCTACTGT 20956010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5994 CTGTCTCAGGCACTTCAGTGTTAATATGCGCCTTGGTTTTGCTGCTGCCGAGTCTACTGT 6053

 20956011 GCCCCTGGGCAAGGAAAGCAAAGGAAACCAGAGGGCCAGGCCCGTGGACACTGGGGTGAG 20956070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6054 GCCCCTGGGCAAGGAAAGCAAAGGAAACCAGAGGGCCAGGCCCGTGGACACTGGGGTGAG 6113

 20956071 GGGCCAACAGGGTGCCCAGCAGTTGTTTCCACAGCCCCCACGTGGTCAGGGACCCTGTAT 20956130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6114 GGGCCAACAGGGTGCCCAGCAGTTGTTTCCACAGCCCCCACGTGGTCAGGGACCCTGTAT 6173

 20956131 GGGTGAACCGCCTGGATACTGAGCCTAGGCGGCGGAAAACTCAAAAGCAAGGGCAGGTTT 20956190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6174 GGGTGAACCGCCTGGATACTGAGCCTAGGCGGCGGAAAACTCAAAAGCAAGGGCAGGTTT 6233

 20956191 ATTCAGATCCCTGGTGGAGTTACAAGCTTGGTTTGGTTTTTGGTCACAGGCCCTAAAATA 20956250
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     6234 ATTCAGATCCCTGGTGGAGTTACAAGCTTGGTTTGGTTTTTGGTCACAGGCCCTAAAATG 6293

 20956251 CCTGTATTCTGAGTTTACATAAAAATACAAAGCACTGGCCGGGCGCGCTGGCTCACACCT 20956310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     6294 CCTGTATTCTGAGTTTACATAAAAATACAAAGCACTGGCCGGGCGCGCTGGCCCACACCT 6353

 20956311 GTAAGCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTGGCTAACATGAGGTCAGGAATTTGAAA 20956370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6354 GTAAGCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTGGCTAACATGAGGTCAGGAATTTGAAA 6413

 20956371 CCAGCCTGACTAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCA 20956430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6414 CCAGCCTGACTAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCA 6473

 20956431 TGGTGGCGCATGCCTGTAATCCCAGCTATTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAA 20956490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6474 TGGTGGCGCATGCCTGTAATCCCAGCTATTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAA 6533

 20956491 CCTGG 20956495
          |||||
     6534 CCTGG 6538

Alignment time is 5.92459 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [20940623,20963850] =>     23228 nucs '22 dna:chromosome chromosome:GRCh37:22:1:51304566:1'
Second seq [       1,    2652] =>      2652 nucs 'mol-32-3164-191114_2652'

Score:        2586
Aligned:      2652        nucs
Identic:      2646 (100%) nucs =>      1631 (100%)      1015 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [20953840,20955474] EXCISED REGION [20955479,20956495]
 second seq =>  [       1,    1635] EXCISED REGION [    1636,    2652]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         4 nucs [20955475,20955478]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        14 nucs [20955475,20955488] to [20955479,20955492]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [20955475,20955476] to [20955477,20955478]
 second seq =>         0 nucs

 20953840 CTAATTTTTTATATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGCTCAGGCTGGTCTCAA 20953899
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGCTCAGGCTGGTCTCAA 60

 20953900 ACTCCTGAGCTCAGGCGATCCACCTGCCTCGGCTTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGT 20953959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACTCCTGAGCTCAGGCGATCCACCTGCCTCGGCTTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGT 120

 20953960 GAGCCACTGTGCCTGGCCAAAAGTAGAAATTCTTGATTGGGAAATAATTTTATATATTTC 20954019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GAGCCACTGTGCCTGGCCAAAAGTAGAAATTCTTGATTGGGAAATAATTTTATATATTTC 180

 20954020 GGCCCCTTCTCACTTGGGAAAATTCTGCTAAGAATTCTGGTTTTGAGAGTCAAGGGAAGC 20954079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGCCCCTTCTCACTTGGGAAAATTCTGCTAAGAATTCTGGTTTTGAGAGTCAAGGGAAGC 240

 20954080 TAGCTTAATTTTTAAAGTGAAGGCTACATAAGAGTCCTCTCTCCAGTGTGGTGGCTCACA 20954139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TAGCTTAATTTTTAAAGTGAAGGCTACATAAGAGTCCTCTCTCCAGTGTGGTGGCTCACA 300

 20954140 CCTATAAACCCAGCGCTTCGGGCAAATCACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGC 20954199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCTATAAACCCAGCGCTTCGGGCAAATCACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGC 360

 20954200 AATGTAGTGAGACCCCTATCTCTACAAAAAAATTTAAAAATTAGCAGGGTGTGGTGGTGC 20954259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AATGTAGTGAGACCCCTATCTCTACAAAAAAATTTAAAAATTAGCAGGGTGTGGTGGTGC 420

 20954260 GTGCCTGTAGTCCTGGCTACTTGGGTGGGATGCTGATGTGGGAGGATTGCTTGAGCCCAG 20954319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTGCCTGTAGTCCTGGCTACTTGGGTGGGATGCTGATGTGGGAGGATTGCTTGAGCCCAG 480

 20954320 GATTTGGAGGTTGCAGCGAGCCATGATGGTGCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACATGGCA 20954379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GATTTGGAGGTTGCAGCGAGCCATGATGGTGCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACATGGCA 540

 20954380 AGACCTCGTCTCAAAAAAATACAAAGAGTCCTCTCTATGTTGGAAATGTCAGAGTTATTG 20954439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGACCTCGTCTCAAAAAAATACAAAGAGTCCTCTCTATGTTGGAAATGTCAGAGTTATTG 600

 20954440 GCCATTTAGGGGATCTAACTTGCTCTTTGATGTCCAAGAGGAAAGGTATAGAGTTCTCCT 20954499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GCCATTTAGGGGATCTAACTTGCTCTTTGATGTCCAAGAGGAAAGGTATAGAGTTCTCCT 660

 20954500 GATTACACAGGGCCTCTGCTTGTGGGTCGCCTGCATGAGGCGATCAGAATCTGAGTCACC 20954559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GATTACACAGGGCCTCTGCTTGTGGGTCGCCTGCATGAGGCGATCAGAATCTGAGTCACC 720

 20954560 TGGGATCATGTGGGTGCTGGTACATCCTAGAGATAGGATGTGTTGGTCATGGAAGAGAGT 20954619
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CGGGATCATGTGGGTGCTGGTACATCCTAGAGATAGGATGTGTTGGTCATGGAAGAGAGT 780

 20954620 GGGCCACAAATGGGTTCCAGGGGAATAGCGTTGCCTGGTGCAAGGAGGGGGATGTGGAGG 20954679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GGGCCACAAATGGGTTCCAGGGGAATAGCGTTGCCTGGTGCAAGGAGGGGGATGTGGAGG 840

 20954680 TGCAGGGAGCAGGGGTGGTGTCTGGAGAGCCTGAAGCTGTGCTGCCAGAGGCTCCAGGCC 20954739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGCAGGGAGCAGGGGTGGTGTCTGGAGAGCCTGAAGCTGTGCTGCCAGAGGCTCCAGGCC 900

 20954740 ATGAGGTCTGAGAAGCATCTAGATTTGGCCTGTTCACAGCAGGGAAGTGTGGTCCAGTGG 20954799
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATGAGGTCTGAGAAGCATCTGGATTTGGCCTGTTCACAGCAGGGAAGTGTGGTCCAGTGG 960

 20954800 CAAAAAGTTGAGGGCATCCTAGGAGTTGAGGAGGTGGTGGCGGTTAGAGTAAACCACTCT 20954859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CAAAAAGTTGAGGGCATCCTAGGAGTTGAGGAGGTGGTGGCGGTTAGAGTAAACCACTCT 1020

 20954860 GGAGGCGTCCGGGGTGGAGAGACGAGAATGTGCAAGAACTCCTGCCTCTAGCCTGGCCTC 20954919
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GGAGGCATCCGGGGTGGAGAGACGAGAATGTGCAAGAACTCCTGCCTCTAGCCTGGCCTC 1080

 20954920 CTCAGGACCCCGGCCACCAGCCTCCCTCCTAGAAGTCCCCAGAGCTTCCTCCTCCTTGTG 20954979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTCAGGACCCCGGCCACCAGCCTCCCTCCTAGAAGTCCCCAGAGCTTCCTCCTCCTTGTG 1140

 20954980 CCCCAGAACTGGTTCCTGGGTTGCTCCAACCCCAGACCTTCCCTGGAAGTCCCCCCCAGT 20955039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CCCCAGAACTGGTTCCTGGGTTGCTCCAACCCCAGACCTTCCCTGGAAGTCCCCCCCAGT 1200

 20955040 GCCTCCTGGCTGGGAACCCCCAACTGCATTTTGCTTCTGCTCTCGTGCCAGTAGTCCCCT 20955099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GCCTCCTGGCTGGGAACCCCCAACTGCATTTTGCTTCTGCTCTCGTGCCAGTAGTCCCCT 1260

 20955100 TTTCTCTCCAGTGTCCAGGCCCCAACCACCAAGACCCTGCCTCCTCACTTGGCTTTGCTG 20955159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTTCTCTCCAGTGTCCAGGCCCCAACCACCAAGACCCTGCCTCCTCACTTGGCTTTGCTG 1320

 20955160 TTCTTAGTTCTCTACTCAGTAGGTTGTGTCTGCCTCCATTCCTGGCCAGACGCTGCCCTG 20955219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTCTTAGTTCTCTACTCAGTAGGTTGTGTCTGCCTCCATTCCTGGCCAGACGCTGCCCTG 1380

 20955220 GGGCTGAGTGCACAGTCCCCAGCCACTCCCGAGATCCTCAGAGCTTCTGGAAGCCACAGA 20955279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GGGCTGAGTGCACAGTCCCCAGCCACTCCCGAGATCCTCAGAGCTTCTGGAAGCCACAGA 1440

 20955280 CATGGTGGCATATGTTTCAGGTCGTCAGCTTGTTTTTTTTTGGAGACAGAGTCTCGCTCT 20955339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CATGGTGGCATATGTTTCAGGTCGTCAGCTTGTTTTTTTTTGGAGACAGAGTCTCGCTCT 1500

 20955340 GTCGCCCAGGCTGGAGTGCGGTGACGTGATCATTCACTGCAGCCTTGACCTTCTGAGCCC 20955399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GTCGCCCAGGCTGGAGTGCGGTGACGTGATCATTCACTGCAGCCTTGACCTTCTGAGCCC 1560

 20955400 GGGTGATCCTCCCACCTCAGCCTGTCAAGTAGCTGAGACCACATGTGTGAGCCACCACAC 20955459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GGGTGATCCTCCCACCTCAGCCTGTCAAGTAGCTGAGACCACATGTGTGAGCCACCACAC 1620

 20955460 CTAGCTTTTTGAATC 20955474
          |||||||||||||||
     1621 CTAGCTTTTTGAATC 1635

EXCISED REGION

 20955479 TTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACA 20955538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1636 TTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACA 1695

 20955539 ATCTTGGCTTACTGCAACCTCCAGCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCTCCCGAG 20955598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1696 ATCTTGGCTTACTGCAACCTCCAGCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCTCCCGAG 1755

 20955599 TAGCTGGGATTACAGGTAGGTGGCACCACACCTAGCTAATTTTTATGTCTTTAGTAGAGA 20955658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1756 TAGCTGGGATTACAGGTAGGTGGCACCACACCTAGCTAATTTTTATGTCTTTAGTAGAGA 1815

 20955659 CAAAGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGATCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCTG 20955718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1816 CAAAGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGATCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCTG 1875

 20955719 TCTTGACCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGGGCCACGCGCCCAGCCAACTTTTTG 20955778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1876 TCTTGACCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGGGCCACGCGCCCAGCCAACTTTTTG 1935

 20955779 AATCTTTTGTAGGGATGGGGTCTTGCTGTGTTGCCCAGGCTGGGCTTAAACTCCTGGACT 20955838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1936 AATCTTTTGTAGGGATGGGGTCTTGCTGTGTTGCCCAGGCTGGGCTTAAACTCCTGGACT 1995

 20955839 CAAGTGATCCTCCCTGCCTTGGTTTCTCAAACTTCTGGGATTACAGGCCAATCTACTCAA 20955898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1996 CAAGTGATCCTCCCTGCCTTGGTTTCTCAAACTTCTGGGATTACAGGCCAATCTACTCAA 2055

 20955899 CGTTGATATTGAGTAGAAGGCAAAATTCACATGGCTCCGGCCCAGCCCCTTTCTGTCTCA 20955958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2056 CGTTGATATTGAGTAGAAGGCAAAATTCACATGGCTCCGGCCCAGCCCCTTTCTGTCTCA 2115

 20955959 GGCACTTCAGTGTTAATATGCGCCTTGGTTTTGCTGCTGCCGAGTCTACTGTGCCCCTGG 20956018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2116 GGCACTTCAGTGTTAATATGCGCCTTGGTTTTGCTGCTGCCGAGTCTACTGTGCCCCTGG 2175

 20956019 GCAAGGAAAGCAAAGGAAACCAGAGGGCCAGGCCCGTGGACACTGGGGTGAGGGGCCAAC 20956078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2176 GCAAGGAAAGCAAAGGAAACCAGAGGGCCAGGCCCGTGGACACTGGGGTGAGGGGCCAAC 2235

 20956079 AGGGTGCCCAGCAGTTGTTTCCACAGCCCCCACGTGGTCAGGGACCCTGTATGGGTGAAC 20956138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2236 AGGGTGCCCAGCAGTTGTTTCCACAGCCCCCACGTGGTCAGGGACCCTGTATGGGTGAAC 2295

 20956139 CGCCTGGATACTGAGCCTAGGCGGCGGAAAACTCAAAAGCAAGGGCAGGTTTATTCAGAT 20956198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2296 CGCCTGGATACTGAGCCTAGGCGGCGGAAAACTCAAAAGCAAGGGCAGGTTTATTCAGAT 2355

 20956199 CCCTGGTGGAGTTACAAGCTTGGTTTGGTTTTTGGTCACAGGCCCTAAAATACCTGTATT 20956258
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     2356 CCCTGGTGGAGTTACAAGCTTGGTTTGGTTTTTGGTCACAGGCCCTAAAATGCCTGTATT 2415

 20956259 CTGAGTTTACATAAAAATACAAAGCACTGGCCGGGCGCGCTGGCTCACACCTGTAAGCCC 20956318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     2416 CTGAGTTTACATAAAAATACAAAGCACTGGCCGGGCGCGCTGGCCCACACCTGTAAGCCC 2475

 20956319 AGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTGGCTAACATGAGGTCAGGAATTTGAAACCAGCCTG 20956378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2476 AGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTGGCTAACATGAGGTCAGGAATTTGAAACCAGCCTG 2535

 20956379 ACTAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGCG 20956438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2536 ACTAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGCG 2595

 20956439 CATGCCTGTAATCCCAGCTATTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCTGG 20956495
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2596 CATGCCTGTAATCCCAGCTATTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCTGG 2652

Alignment time is 2.25277 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [20940623,20963850] =>     23228 nucs '22 dna:chromosome chromosome:GRCh37:22:1:51304566:1'
Second seq [       1,    3608] =>      3608 nucs 'mol-32-3164-243439_3608'

Score:        3548
Aligned:      3604        nucs
Identic:      3594 (100%) nucs =>      2962 (100%)       632 (100%)
Gaps:            8 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [20947654,20950623] EXCISED REGION [20953851,20954482]
 second seq =>  [       1,    2966] EXCISED REGION [    2977,    3608]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3227 nucs [20950624,20953850]
 second seq =>        10 nucs [2967,2976]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [2967,2968] to [2977,2978]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [20950624,20950624] to [20953850,20953850]
 second seq =>         0 nucs

 20947654 ACCCCATCTACTAAAAATACAAAAATTAGCGGGCGTGGTGGCAGGCACCTGTAATCCCAG 20947713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACCCCATCTACTAAAAATACAAAAATTAGCGGGCGTGGTGGCAGGCACCTGTAATCCCAG 60

 20947714 CTACTTGGGAGGGTGAGGCAGAGAATTGCTTGAAGCCAGGAGGTAGAGCTTGCAGTGAGC 20947773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTACTTGGGAGGGTGAGGCAGAGAATTGCTTGAAGCCAGGAGGTAGAGCTTGCAGTGAGC 120

 20947774 GGAGATTGCGGCACCGCACTCCAGCCTGGGTGACAAAGTGAGACTCTGTCTCAAAAAACA 20947833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGAGATTGCGGCACCGCACTCCAGCCTGGGTGACAAAGTGAGACTCTGTCTCAAAAAACA 180

 20947834 AAAACAAACAAACAAAAACTTCACACAGAAAGCCCATTTATCACGTACCCCGTACAGCAT 20947893
          ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAAACAAACAAA----AACTTCACACAGAAAGCCCATTTATCACGTACCCCGTACAGCAT 236

 20947894 GTCCAGCTCCCCACAAAAAATTTCAAGGCATAATAAAAACCAAAAAATGCAGTTTGAAGA 20947953
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      237 GTCCAGCTCGCCACAAAAAATTTCAAGGCATAATAAAAACCAAAAAATGCAGTTTGAAGA 296

 20947954 GACAGCAAGCATCAGAGCCAGACTCAAATATGGCAGAGATGTCGGAATTATCAGACCAAG 20948013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      297 GACAGCAAGCATCAGAGCCAGACTCAAATATGGCAGAGATGTCGGAATTATCAGACCAAG 356

 20948014 AAATGGAATACAACTATGATTAATATGCTAAGGGCTCTAATGGAAAAGTGGACAACATGA 20948073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      357 AAATGGAATACAACTATGATTAATATGCTAAGGGCTCTAATGGAAAAGTGGACAACATGA 416

 20948074 GATTACAGACAGAAAATGGAAACAGGGATAGACACTCTGAGAAAGAATCTAAAGAATATG 20948133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      417 GATTACAGACAGAAAATGGAAACAGGGATAGACACTCTGAGAAAGAATCTAAAGAATATG 476

 20948134 TGAAGGCCGGGCACAGTGGCTTATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGC 20948193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      477 TGAAGGCCGGGCACAGTGGCTTATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGC 536

 20948194 GGATCACTTGAAGTCAGGAGTTCGAAGACCAGCCCAGTTCGAGACCAGATGGCAAAACCC 20948253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      537 GGATCACTTGAAGTCAGGAGTTCGAAGACCAGCCCAGTTCGAGACCAGATGGCAAAACCC 596

 20948254 CATCTCTACTAAAAAATACAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCATGAACCTGTAATTCCAG 20948313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      597 CATCTCTACTAAAAAATACAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCATGAACCTGTAATTCCAG 656

 20948314 CTATTCAGGAGGCTGAGGTGGGAGGACTGCTTGGACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAG 20948373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      657 CTATTCAGGAGGCTGAGGTGGGAGGACTGCTTGGACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAG 716

 20948374 CTGAGATTGTGCCACTGCCCTCAAATCTGGGTGACAGAGTGAGACACCACCAAAAAAAAG 20948433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      717 CTGAGATTGTGCCACTGCCCTCAAATCTGGGTGACAGAGTGAGACACCACCAAAAAAAAG 776

 20948434 AAAAGAAAAGAAAGGAAACAAGGAGAGGAAAGAAAGGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAAGAA 20948493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      777 AAAAGAAAAGAAAGGAAACAAGGAGAGGAAAGAAAGGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAAGAA 836

 20948494 AGAAAGAAAGAGAAAGAGAAAATAAAGAAAAAGAAAGAAAGAAGGAGAATATGTGAGAAG 20948553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      837 AGAAAGAAAGAGAAAGAGAAAATAAAGAAAAAGAAAGAAAGAAGGAGAATATGTGAGAAG 896

 20948554 TCAGCCAGGTAGTGACTCATGACTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTGGA 20948613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      897 TCAGCCAGGTAGTGACTCATGACTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTGGA 956

 20948614 TCACTTGAGGTCAGCAGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACATGGTGATAACCCATCTCTACT 20948673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      957 TCACTTGAGGTCAGCAGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACATGGTGATAACCCATCTCTACT 1016

 20948674 AAAAATAAAAAAATTAGCTGGATGTGGTGTCATGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAG 20948733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1017 AAAAATAAAAAAATTAGCTGGATGTGGTGTCATGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAG 1076

 20948734 GCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTAAGCTGAGATTATG 20948793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1077 GCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTAAGCTGAGATTATG 1136

 20948794 CCACTGCACTCCAGCCTGGGCAGTAAGACTCCGTCTCAAAAAACAAAAAGAAAATATAAG 20948853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1137 CCACTGCACTCCAGCCTGGGCAGTAAGACTCCGTCTCAAAAAACAAAAAGAAAATATAAG 1196

 20948854 AAGTCAAAAACACAACAGAATGAAAGATCAGGGCTGGCAGCAGTGGCTCATGCCTATAAT 20948913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1197 AAGTCAAAAACACAACAGAATGAAAGATCAGGGCTGGCAGCAGTGGCTCATGCCTATAAT 1256

 20948914 CCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGTTGGGTGGATCACCTGAGGTTAGGAGTTGGAGACCAGC 20948973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1257 CCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGTTGGGTGGATCACCTGAGGTTAGGAGTTGGAGACCAGC 1316

 20948974 CTGGCCAACATGGAGAAACCCCGTCTCTACTCAAAATACAAAAATTAGCTGGGTGTGGTG 20949033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1317 CTGGCCAACATGGAGAAACCCCGTCTCTACTCAAAATACAAAAATTAGCTGGGTGTGGTG 1376

 20949034 GCGCATGCCTGTAATCCCAACTACACAGAAGGATGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGG 20949093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1377 GCGCATGCCTGTAATCCCAACTACACAGAAGGATGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGG 1436

 20949094 GAGGTGGAGGA--TGTAGTGAGCCGAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGA 20949151
          |||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1437 GAGGTGGAG--ATTGTAGTGAGCCGAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGA 1494

 20949152 AGGAGACTCTGTCTCAAAAAAGAAAGAAAGAAAGGTCAGGTGCATGGCTCATGCCTGTAA 20949211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1495 AGGAGACTCTGTCTCAAAAAAGAAAGAAAGAAAGGTCAGGTGCATGGCTCATGCCTGTAA 1554

 20949212 TCCCAGCACTTTGAGAGGCCAAAGTAGAAGGATCGTTTGAGCCCAGGAGTTGGAGACCAG 20949271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1555 TCCCAGCACTTTGAGAGGCCAAAGTAGAAGGATCGTTTGAGCCCAGGAGTTGGAGACCAG 1614

 20949272 CCTGGGCAATATAGCCAGACCCTGTCTCTACAAAAAATTAAAAAAATTGCCAGCATGGTG 20949331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1615 CCTGGGCAATATAGCCAGACCCTGTCTCTACAAAAAATTAAAAAAATTGCCAGCATGGTG 1674

 20949332 GTGCACATCTGCAGTCCCTGCTACTCAGGAGGCCAAGGCTGCAGTGAGCTGTGATTGTAC 20949391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1675 GTGCACATCTGCAGTCCCTGCTACTCAGGAGGCCAAGGCTGCAGTGAGCTGTGATTGTAC 1734

 20949392 TACTGCACTCTGGCCTGGGTAACAGAGAGAGACCCTGTCTCAAAAATGGGGTAAAATGGT 20949451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1735 TACTGCACTCTGGCCTGGGTAACAGAGAGAGACCCTGTCTCAAAAATGGGGTAAAATGGT 1794

 20949452 ATAGGAAATTTGGATCTAAAAAAAAAAAAAAGGAAGTGCATTAGATAAGAAATAAATGAA 20949511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1795 ATAGGAAATTTGGATCTAAAAAAAAAAAAAAGGAAGTGCATTAGATAAGAAATAAATGAA 1854

 20949512 GATAAAATAGAATCTTTTTTTTGGTGGGGGTGGGGAACGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCA 20949571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1855 GATAAAATAGAATCTTTTTTTTGGTGGGGGTGGGGAACGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCA 1914

 20949572 GGCTGGAGTGCAATGGCACGATCTTGGCTCACCACAACATCCGCCTACTGGGTTCAGGCG 20949631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1915 GGCTGGAGTGCAATGGCACGATCTTGGCTCACCACAACATCCGCCTACTGGGTTCAGGCG 1974

 20949632 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGTGCCACCACGTCCAGC 20949691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1975 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGTGCCACCACGTCCAGC 2034

 20949692 TAATTTTGTATTTTTATTAGAGTCGGGGGTTACTCCACGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAAC 20949751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2035 TAATTTTGTATTTTTATTAGAGTCGGGGGTTACTCCACGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAAC 2094

 20949752 TCCTAACCTCAGGCGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGAATTACAGGCATGA 20949811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2095 TCCTAACCTCAGGCGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGAATTACAGGCATGA 2154

 20949812 GCCACTGCACCTGGCCAGAATCTTGTATTGTTCTTATTTTTAGTTGAACAGATGGCAGGT 20949871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2155 GCCACTGCACCTGGCCAGAATCTTGTATTGTTCTTATTTTTAGTTGAACAGATGGCAGGT 2214

 20949872 TATTCAAAATAATTATATCAACATGTATTCAGTAATTATAGCTTATGGATAGCTGGAATG 20949931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2215 TATTCAAAATAATTATATCAACATGTATTCAGTAATTATAGCTTATGGATAGCTGGAATG 2274

 20949932 AATGGCAGCAATGTTATAAGGGATGGGAAGGAGGATATCCTGAGTGGAAAGAAAGTCACC 20949991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2275 AATGGCAGCAATGTTATAAGGGATGGGAAGGAGGATATCCTGAGTGGAAAGAAAGTCACC 2334

 20949992 CAGGCTGGAGTGAAGTGGCACAATTATAGCCCACTTGCAGCCTGCAACTCCTGGGCTCAA 20950051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2335 CAGGCTGGAGTGAAGTGGCACAATTATAGCCCACTTGCAGCCTGCAACTCCTGGGCTCAA 2394

 20950052 GCCATCCTTCTGCTTCAGCCTCCCTGGTAACTGGGATTACAGACACACACCACCATGCCT 20950111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2395 GCCATCCTTCTGCTTCAGCCTCCCTGGTAACTGGGATTACAGACACACACCACCATGCCT 2454

 20950112 GGCTAATTTTTAAATTTTTTGTCTCGCTGTGTTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGGC 20950171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2455 GGCTAATTTTTAAATTTTTTGTCTCGCTGTGTTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGGC 2514

 20950172 TCAAGAAATCCTCCTGCCTTAGCCTCCCAAAGTGTTGAGATTACAGGCGTGAGCCACTGT 20950231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2515 TCAAGAAATCCTCCTGCCTTAGCCTCCCAAAGTGTTGAGATTACAGGCGTGAGCCACTGT 2574

 20950232 GCCTGGTTTATGGTTGCTTTTGAATGTCCTAGTCCTACATAAGTGGCTTCCAAGAAGGGA 20950291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2575 GCCTGGTTTATGGTTGCTTTTGAATGTCCTAGTCCTACATAAGTGGCTTCCAAGAAGGGA 2634

 20950292 AAAAGAAAAATGCAGGCAGGAAAAGGTGCTGATCCATAAAAACCTCTGGAAGGTATGTCT 20950351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2635 AAAAGAAAAATGCAGGCAGGAAAAGGTGCTGATCCATAAAAACCTCTGGAAGGTATGTCT 2694

 20950352 CTAGGGAGGGGGTGAGTGTTGAGGAGGGATGTTGCAAACATGGTAGTGGAGATGGCAAGA 20950411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2695 CTAGGGAGGGGGTGAGTGTTGAGGAGGGATGTTGCAAACATGGTAGTGGAGATGGCAAGA 2754

 20950412 GTGGCTGCCTGCCTCTTCGTCTGCACTTCCACAATCTGAAGCAGCCATCATCAATCGGAA 20950471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     2755 GTGGCTGCCTGCCTCTTCGTCTGCACTTCCACAATCCGAAGCAGCCATCATCAATCGGAA 2814

 20950472 CACAGATCCCCAGTATTTGGAGGATGGGGCTCTTATTGCCTGCTGTGGCTCCTGCAAGCT 20950531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2815 CACAGATCCCCAGTATTTGGAGGATGGGGCTCTTATTGCCTGCTGTGGCTCCTGCAAGCT 2874

 20950532 ATAGGGAAGCTACCCCAGAAGTATAGGCATGGCTGCTTGCACCACCAATTTAAATGCTAA 20950591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2875 ATAGGGAAGCTACCCCAGAAGTATAGGCATGGCTGCTTGCACCACCAATTTAAATGCTAA 2934

 20950592 TTACTTCTGAAAACACCCTCACACACATGCCC 20950623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||
     2935 TTACTTCTGAAAACACCCTCACACACATGCCC 2966

EXCISED REGION

 20953851 TATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGCTCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAGCT 20953910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2977 TATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGCTCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAGCT 3036

 20953911 CAGGCGATCCACCTGCCTCGGCTTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTG 20953970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3037 CAGGCGATCCACCTGCCTCGGCTTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTG 3096

 20953971 CCTGGCCAAAAGTAGAAATTCTTGATTGGGAAATAATTTTATATATTTCGGCCCCTTCTC 20954030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3097 CCTGGCCAAAAGTAGAAATTCTTGATTGGGAAATAATTTTATATATTTCGGCCCCTTCTC 3156

 20954031 ACTTGGGAAAATTCTGCTAAGAATTCTGGTTTTGAGAGTCAAGGGAAGCTAGCTTAATTT 20954090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3157 ACTTGGGAAAATTCTGCTAAGAATTCTGGTTTTGAGAGTCAAGGGAAGCTAGCTTAATTT 3216

 20954091 TTAAAGTGAAGGCTACATAAGAGTCCTCTCTCCAGTGTGGTGGCTCACACCTATAAACCC 20954150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3217 TTAAAGTGAAGGCTACATAAGAGTCCTCTCTCCAGTGTGGTGGCTCACACCTATAAACCC 3276

 20954151 AGCGCTTCGGGCAAATCACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCAATGTAGTGAG 20954210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3277 AGCGCTTCGGGCAAATCACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCAATGTAGTGAG 3336

 20954211 ACCCCTATCTCTACAAAAAAATTTAAAAATTAGCAGGGTGTGGTGGTGCGTGCCTGTAGT 20954270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3337 ACCCCTATCTCTACAAAAAAATTTAAAAATTAGCAGGGTGTGGTGGTGCGTGCCTGTAGT 3396

 20954271 CCTGGCTACTTGGGTGGGATGCTGATGTGGGAGGATTGCTTGAGCCCAGGATTTGGAGGT 20954330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3397 CCTGGCTACTTGGGTGGGATGCTGATGTGGGAGGATTGCTTGAGCCCAGGATTTGGAGGT 3456

 20954331 TGCAGCGAGCCATGATGGTGCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACATGGCAAGACCTCGTCT 20954390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3457 TGCAGCGAGCCATGATGGTGCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACATGGCAAGACCTCGTCT 3516

 20954391 CAAAAAAATACAAAGAGTCCTCTCTATGTTGGAAATGTCAGAGTTATTGGCCATTTAGGG 20954450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3517 CAAAAAAATACAAAGAGTCCTCTCTATGTTGGAAATGTCAGAGTTATTGGCCATTTAGGG 3576

 20954451 GATCTAACTTGCTCTTTGATGTCCAAGAGGAA 20954482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||
     3577 GATCTAACTTGCTCTTTGATGTCCAAGAGGAA 3608

Alignment time is 2.91179 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [20940623,20963850] =>     23228 nucs '22 dna:chromosome chromosome:GRCh37:22:1:51304566:1'
Second seq [       1,    2707] =>      2707 nucs 'mol-32-3235-179821_2707'

Score:        2651
Aligned:      2662        nucs
Identic:      2661 (100%) nucs =>      1831 (100%)       830 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [20948792,20950623] EXCISED REGION [20953851,20954680]
 second seq =>  [      37,    1867] EXCISED REGION [    1878,    2707]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3227 nucs [20950624,20953850]
 second seq =>        10 nucs [1868,1877]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [1868,1869] to [1878,1879]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [20950624,20950624] to [20953850,20953850]
 second seq =>         0 nucs

 20948792 TGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAGTAAGACTCCGTCTCAAAAAACAAAAAGAAAATATA 20948851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       37 TGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAGTAAGACTCCGTCTCAAAAAACAAAAAGAAAATATA 96

 20948852 AGAAGTCAAAAACACAACAGAATGAAAGATCAGGGCTGGCAGCAGTGGCTCATGCCTATA 20948911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       97 AGAAGTCAAAAACACAACAGAATGAAAGATCAGGGCTGGCAGCAGTGGCTCATGCCTATA 156

 20948912 ATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGTTGGGTGGATCACCTGAGGTTAGGAGTTGGAGACCA 20948971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      157 ATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGTTGGGTGGATCACCTGAGGTTAGGAGTTGGAGACCA 216

 20948972 GCCTGGCCAACATGGAGAAACCCCGTCTCTACTCAAAATACAAAAATTAGCTGGGTGTGG 20949031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      217 GCCTGGCCAACATGGAGAAACCCCGTCTCTACTCAAAATACAAAAATTAGCTGGGTGTGG 276

 20949032 TGGCGCATGCCTGTAATCCCAACTACACAGAAGGATGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCT 20949091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      277 TGGCGCATGCCTGTAATCCCAACTACACAGAAGGATGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCT 336

 20949092 GGGAGGTGGAGGATGTAGTGAGCCGAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGA 20949151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      337 GGGAGGTGGAGGATGTAGTGAGCCGAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGA 396

 20949152 AGGAGACTCTGTCTCAAAAAAGAAAGAAAGAAAGGTCAGGTGCATGGCTCATGCCTGTAA 20949211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      397 AGGAGACTCTGTCTCAAAAAAGAAAGAAAGAAAGGTCAGGTGCATGGCTCATGCCTGTAA 456

 20949212 TCCCAGCACTTTGAGAGGCCAAAGTAGAAGGATCGTTTGAGCCCAGGAGTTGGAGACCAG 20949271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      457 TCCCAGCACTTTGAGAGGCCAAAGTAGAAGGATCGTTTGAGCCCAGGAGTTGGAGACCAG 516

 20949272 CCTGGGCAATATAGCCAGACCCTGTCTCTACAAAAAATTAAAAAAATTGCCAGCATGGTG 20949331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      517 CCTGGGCAATATAGCCAGACCCTGTCTCTACAAAAAATTAAAAAAATTGCCAGCATGGTG 576

 20949332 GTGCACATCTGCAGTCCCTGCTACTCAGGAGGCCAAGGCTGCAGTGAGCTGTGATTGTAC 20949391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      577 GTGCACATCTGCAGTCCCTGCTACTCAGGAGGCCAAGGCTGCAGTGAGCTGTGATTGTAC 636

 20949392 TACTGCACTCTGGCCTGGGTAACAGAGAGAGACCCTGTCTCAAAAATGGGGTAAAATGGT 20949451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      637 TACTGCACTCTGGCCTGGGTAACAGAGAGAGACCCTGTCTCAAAAATGGGGTAAAATGGT 696

 20949452 ATAGGAAATTTGGATCTAAAAAAAAAAAAAAGGAAGTGCATTAGATAAGAAATAAATGAA 20949511
          |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
      697 ATAGGAAATTTGGATCTAAAAAAAAAAAAA-GGAAGTGCATTAGATAAGAAATAAATGAA 755

 20949512 GATAAAATAGAATCTTTTTTTTGGTGGGGGTGGGGAACGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCA 20949571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      756 GATAAAATAGAATCTTTTTTTTGGTGGGGGTGGGGAACGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCA 815

 20949572 GGCTGGAGTGCAATGGCACGATCTTGGCTCACCACAACATCCGCCTACTGGGTTCAGGCG 20949631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      816 GGCTGGAGTGCAATGGCACGATCTTGGCTCACCACAACATCCGCCTACTGGGTTCAGGCG 875

 20949632 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGTGCCACCACGTCCAGC 20949691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      876 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGTGCCACCACGTCCAGC 935

 20949692 TAATTTTGTATTTTTATTAGAGTCGGGGGTTACTCCACGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAAC 20949751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      936 TAATTTTGTATTTTTATTAGAGTCGGGGGTTACTCCACGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAAC 995

 20949752 TCCTAACCTCAGGCGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGAATTACAGGCATGA 20949811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      996 TCCTAACCTCAGGCGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGAATTACAGGCATGA 1055

 20949812 GCCACTGCACCTGGCCAGAATCTTGTATTGTTCTTATTTTTAGTTGAACAGATGGCAGGT 20949871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1056 GCCACTGCACCTGGCCAGAATCTTGTATTGTTCTTATTTTTAGTTGAACAGATGGCAGGT 1115

 20949872 TATTCAAAATAATTATATCAACATGTATTCAGTAATTATAGCTTATGGATAGCTGGAATG 20949931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1116 TATTCAAAATAATTATATCAACATGTATTCAGTAATTATAGCTTATGGATAGCTGGAATG 1175

 20949932 AATGGCAGCAATGTTATAAGGGATGGGAAGGAGGATATCCTGAGTGGAAAGAAAGTCACC 20949991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1176 AATGGCAGCAATGTTATAAGGGATGGGAAGGAGGATATCCTGAGTGGAAAGAAAGTCACC 1235

 20949992 CAGGCTGGAGTGAAGTGGCACAATTATAGCCCACTTGCAGCCTGCAACTCCTGGGCTCAA 20950051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1236 CAGGCTGGAGTGAAGTGGCACAATTATAGCCCACTTGCAGCCTGCAACTCCTGGGCTCAA 1295

 20950052 GCCATCCTTCTGCTTCAGCCTCCCTGGTAACTGGGATTACAGACACACACCACCATGCCT 20950111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1296 GCCATCCTTCTGCTTCAGCCTCCCTGGTAACTGGGATTACAGACACACACCACCATGCCT 1355

 20950112 GGCTAATTTTTAAATTTTTTGTCTCGCTGTGTTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGGC 20950171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1356 GGCTAATTTTTAAATTTTTTGTCTCGCTGTGTTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGGC 1415

 20950172 TCAAGAAATCCTCCTGCCTTAGCCTCCCAAAGTGTTGAGATTACAGGCGTGAGCCACTGT 20950231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1416 TCAAGAAATCCTCCTGCCTTAGCCTCCCAAAGTGTTGAGATTACAGGCGTGAGCCACTGT 1475

 20950232 GCCTGGTTTATGGTTGCTTTTGAATGTCCTAGTCCTACATAAGTGGCTTCCAAGAAGGGA 20950291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1476 GCCTGGTTTATGGTTGCTTTTGAATGTCCTAGTCCTACATAAGTGGCTTCCAAGAAGGGA 1535

 20950292 AAAAGAAAAATGCAGGCAGGAAAAGGTGCTGATCCATAAAAACCTCTGGAAGGTATGTCT 20950351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1536 AAAAGAAAAATGCAGGCAGGAAAAGGTGCTGATCCATAAAAACCTCTGGAAGGTATGTCT 1595

 20950352 CTAGGGAGGGGGTGAGTGTTGAGGAGGGATGTTGCAAACATGGTAGTGGAGATGGCAAGA 20950411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1596 CTAGGGAGGGGGTGAGTGTTGAGGAGGGATGTTGCAAACATGGTAGTGGAGATGGCAAGA 1655

 20950412 GTGGCTGCCTGCCTCTTCGTCTGCACTTCCACAATCTGAAGCAGCCATCATCAATCGGAA 20950471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1656 GTGGCTGCCTGCCTCTTCGTCTGCACTTCCACAATCTGAAGCAGCCATCATCAATCGGAA 1715

 20950472 CACAGATCCCCAGTATTTGGAGGATGGGGCTCTTATTGCCTGCTGTGGCTCCTGCAAGCT 20950531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1716 CACAGATCCCCAGTATTTGGAGGATGGGGCTCTTATTGCCTGCTGTGGCTCCTGCAAGCT 1775

 20950532 ATAGGGAAGCTACCCCAGAAGTATAGGCATGGCTGCTTGCACCACCAATTTAAATGCTAA 20950591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1776 ATAGGGAAGCTACCCCAGAAGTATAGGCATGGCTGCTTGCACCACCAATTTAAATGCTAA 1835

 20950592 TTACTTCTGAAAACACCCTCACACACATGCCC 20950623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||
     1836 TTACTTCTGAAAACACCCTCACACACATGCCC 1867

EXCISED REGION

 20953851 TATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGCTCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAGCT 20953910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1878 TATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGCTCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAGCT 1937

 20953911 CAGGCGATCCACCTGCCTCGGCTTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTG 20953970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1938 CAGGCGATCCACCTGCCTCGGCTTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTG 1997

 20953971 CCTGGCCAAAAGTAGAAATTCTTGATTGGGAAATAATTTTATATATTTCGGCCCCTTCTC 20954030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1998 CCTGGCCAAAAGTAGAAATTCTTGATTGGGAAATAATTTTATATATTTCGGCCCCTTCTC 2057

 20954031 ACTTGGGAAAATTCTGCTAAGAATTCTGGTTTTGAGAGTCAAGGGAAGCTAGCTTAATTT 20954090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2058 ACTTGGGAAAATTCTGCTAAGAATTCTGGTTTTGAGAGTCAAGGGAAGCTAGCTTAATTT 2117

 20954091 TTAAAGTGAAGGCTACATAAGAGTCCTCTCTCCAGTGTGGTGGCTCACACCTATAAACCC 20954150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2118 TTAAAGTGAAGGCTACATAAGAGTCCTCTCTCCAGTGTGGTGGCTCACACCTATAAACCC 2177

 20954151 AGCGCTTCGGGCAAATCACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCAATGTAGTGAG 20954210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2178 AGCGCTTCGGGCAAATCACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCAATGTAGTGAG 2237

 20954211 ACCCCTATCTCTACAAAAAAATTTAAAAATTAGCAGGGTGTGGTGGTGCGTGCCTGTAGT 20954270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2238 ACCCCTATCTCTACAAAAAAATTTAAAAATTAGCAGGGTGTGGTGGTGCGTGCCTGTAGT 2297

 20954271 CCTGGCTACTTGGGTGGGATGCTGATGTGGGAGGATTGCTTGAGCCCAGGATTTGGAGGT 20954330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2298 CCTGGCTACTTGGGTGGGATGCTGATGTGGGAGGATTGCTTGAGCCCAGGATTTGGAGGT 2357

 20954331 TGCAGCGAGCCATGATGGTGCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACATGGCAAGACCTCGTCT 20954390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2358 TGCAGCGAGCCATGATGGTGCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACATGGCAAGACCTCGTCT 2417

 20954391 CAAAAAAATACAAAGAGTCCTCTCTATGTTGGAAATGTCAGAGTTATTGGCCATTTAGGG 20954450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2418 CAAAAAAATACAAAGAGTCCTCTCTATGTTGGAAATGTCAGAGTTATTGGCCATTTAGGG 2477

 20954451 GATCTAACTTGCTCTTTGATGTCCAAGAGGAAAGGTATAGAGTTCTCCTGATTACACAGG 20954510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2478 GATCTAACTTGCTCTTTGATGTCCAAGAGGAAAGGTATAGAGTTCTCCTGATTACACAGG 2537

 20954511 GCCTCTGCTTGTGGGTCGCCTGCATGAGGCGATCAGAATCTGAGTCACCTGGGATCATGT 20954570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2538 GCCTCTGCTTGTGGGTCGCCTGCATGAGGCGATCAGAATCTGAGTCACCTGGGATCATGT 2597

 20954571 GGGTGCTGGTACATCCTAGAGATAGGATGTGTTGGTCATGGAAGAGAGTGGGCCACAAAT 20954630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2598 GGGTGCTGGTACATCCTAGAGATAGGATGTGTTGGTCATGGAAGAGAGTGGGCCACAAAT 2657

 20954631 GGGTTCCAGGGGAATAGCGTTGCCTGGTGCAAGGAGGGGGATGTGGAGGT 20954680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2658 GGGTTCCAGGGGAATAGCGTTGCCTGGTGCAAGGAGGGGGATGTGGAGGT 2707

Alignment time is 2.14772 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [20940623,20963850] =>     23228 nucs '22 dna:chromosome chromosome:GRCh37:22:1:51304566:1'
Second seq [       1,    3857] =>      3857 nucs 'mol-32-32fb-047963_3857'

Score:        3804
Aligned:      3848        nucs
Identic:      3844 (100%) nucs =>      2333 (100%)      1511 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [20948290,20950623] EXCISED REGION [20953851,20955364]
 second seq =>  [       1,    2333] EXCISED REGION [    2344,    3857]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3227 nucs [20950624,20953850]
 second seq =>        10 nucs [2334,2343]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [2334,2335] to [2344,2345]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [20950624,20950624] to [20953850,20953850]
 second seq =>         0 nucs

 20948290 GGTGGCATGAACCTGTAATTCCAGCTATTCAGGAGGCTGAGGTGGGAGGACTGCTTGGAC 20948349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGTGGCATGAACCTGTAATTCCAGCTATTCAGGAGGCTGAGGTGGGAGGACTGCTTGGAC 60

 20948350 CCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGTGCCACTGCCCTCAAATCTGGGTGACA 20948409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGTGCCACTGCCCTCAAATCTGGGTGACA 120

 20948410 GAGTGAGACACCACCAAAAAAAAGAAAAGAAAAGAAAGGAAACAAGGAGAGGAAAGAAAG 20948469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GAGTGAGACACCACCAAAAAAAAGAAAAGAAAAGAAAGGAAACAAGGAGAGGAAAGAAAG 180

 20948470 GAAAGAAAGAAAGAAAGAAAAGAAAGAAAGAAAGAGAAAGAGAAAATAAAGAAAAAGAAA 20948529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GAAAGAAAGAAAGAAAGAAAAGAAAGAAAGAAAGAGAAAGAGAAAATAAAGAAAAAGAAA 240

 20948530 GAAAGAAGGAGAATATGTGAGAAGTCAGCCAGGTAGTGACTCATGACTGTAATCCCAACA 20948589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GAAAGAAGGAGAATATGTGAGAAGTCAGCCAGGTAGTGACTCATGACTGTAATCCCAACA 300

 20948590 CTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCACTTGAGGTCAGCAGTTCAAGACCAGCCTGGGCA 20948649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCACTTGAGGTCAGCAGTTCAAGACCAGCCTGGGCA 360

 20948650 ACATGGTGATAACCCATCTCTACTAAAAATAAAAAAATTAGCTGGATGTGGTGTCATGCA 20948709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACATGGTGATAACCCATCTCTACTAAAAATAAAAAAATTAGCTGGATGTGGTGTCATGCA 420

 20948710 CCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGTGG 20948769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGTGG 480

 20948770 AGGTTGCAGTAAGCTGAGATTATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAGTAAGACTCCGTCT 20948829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGGTTGCAGTAAGCTGAGATTATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAGTAAGACTCCGTCT 540

 20948830 CAAAAAACAAAAAGAAAATATAAGAAGTCAAAAACACAACAGAATGAAAGATCAGGGCTG 20948889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CAAAAAACAAAAAGAAAATATAAGAAGTCAAAAACACAACAGAATGAAAGATCAGGGCTG 600

 20948890 GCAGCAGTGGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGTTGGGTGGATCACC 20948949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GCAGCAGTGGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGTTGGGTGGATCACC 660

 20948950 TGAGGTTAGGAGTTGGAGACCAGCCTGGCCAACATGGAGAAACCCCGTCTCTACTCAAAA 20949009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGAGGTTAGGAGTTGGAGACCAGCCTGGCCAACATGGAGAAACCCCGTCTCTACTCAAAA 720

 20949010 TACAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCGCATGCCTGTAATCCCAACTACACAGAAGGATGA 20949069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TACAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCGCATGCCTGTAATCCCAACTACACAGAAGGATGA 780

 20949070 GGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGATGTAGTGAGCCGAGATCATGCCACT 20949129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGATGTAGTGAGCCGAGATCATGCCACT 840

 20949130 GCACTCCAGCCTGGGTGACAGAAGGAGACTCTGTCTCAAAAAAGAAAGAAAGAAAGGTCA 20949189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GCACTCCAGCCTGGGTGACAGAAGGAGACTCTGTCTCAAAAAAGAAAGAAAGAAAGGTCA 900

 20949190 GGTGCATGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGAGAGGCCAAAGTAGAAGGATCGTTT 20949249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GGTGCATGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGAGAGGCCAAAGTAGAAGGATCGTTT 960

 20949250 GAGCCCAGGAGTTGGAGACCAGCCTGGGCAATATAGCCAGACCCTGTCTCTACAAAAAAT 20949309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GAGCCCAGGAGTTGGAGACCAGCCTGGGCAATATAGCCAGACCCTGTCTCTACAAAAAAT 1020

 20949310 TAAAAAAATTGCCAGCATGGTGGTGCACATCTGCAGTCCCTGCTACTCAGGAGGCCAAGG 20949369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TAAAAAAATTGCCAGCATGGTGGTGCACATCTGCAGTCCCTGCTACTCAGGAGGCCAAGG 1080

 20949370 CTGCAGTGAGCTGTGATTGTACTACTGCACTCTGGCCTGGGTAACAGAGAGAGACCCTGT 20949429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTGCAGTGAGCTGTGATTGTACTACTGCACTCTGGCCTGGGTAACAGAGAGAGACCCTGT 1140

 20949430 CTCAAAAATGGGGTAAAATGGTATAGGAAATTTGGATCTAAAAAAAAAAAAAAGGAAGTG 20949489
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
     1141 CTCAAAAATGGGGTAAAATGGTATAGGAAATTTGGATCTAAAAAAAAAAAAA-GGAAGTG 1199

 20949490 CATTAGATAAGAAATAAATGAAGATAAAATAGAATCTTTTTTTTGGTGGGGGTGGGGAAC 20949549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 CATTAGATAAGAAATAAATGAAGATAAAATAGAATCTTTTTTTTGGTGGGGGTGGGGAAC 1259

 20949550 GGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCACGATCTTGGCTCACCACAAC 20949609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 GGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCACGATCTTGGCTCACCACAAC 1319

 20949610 ATCCGCCTACTGGGTTCAGGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACA 20949669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 ATCCGCCTACTGGGTTCAGGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACA 1379

 20949670 GGCATGTGCCACCACGTCCAGCTAATTTTGTATTTTTATTAGAGTCGGGGGTTACTCCAC 20949729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 GGCATGTGCCACCACGTCCAGCTAATTTTGTATTTTTATTAGAGTCGGGGGTTACTCCAC 1439

 20949730 GTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTAACCTCAGGCGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAA 20949789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 GTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTAACCTCAGGCGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAA 1499

 20949790 AGTGCTGGAATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGCCAGAATCTTGTATTGTTCTTATT 20949849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 AGTGCTGGAATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGCCAGAATCTTGTATTGTTCTTATT 1559

 20949850 TTTAGTTGAACAGATGGCAGGTTATTCAAAATAATTATATCAACATGTATTCAGTAATTA 20949909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 TTTAGTTGAACAGATGGCAGGTTATTCAAAATAATTATATCAACATGTATTCAGTAATTA 1619

 20949910 TAGCTTATGGATAGCTGGAATGAATGGCAGCAATGTTATAAGGGATGGGAAGGAGGATAT 20949969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 TAGCTTATGGATAGCTGGAATGAATGGCAGCAATGTTATAAGGGATGGGAAGGAGGATAT 1679

 20949970 CCTGAGTGGAAAGAAAGTCACCCAGGCTGGAGTGAAGTGGCACAATTATAGCCCACTTGC 20950029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 CCTGAGTGGAAAGAAAGTCACCCAGGCTGGAGTGAAGTGGCACAATTATAGCCCACTTGC 1739

 20950030 AGCCTGCAACTCCTGGGCTCAAGCCATCCTTCTGCTTCAGCCTCCCTGGTAACTGGGATT 20950089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 AGCCTGCAACTCCTGGGCTCAAGCCATCCTTCTGCTTCAGCCTCCCTGGTAACTGGGATT 1799

 20950090 ACAGACACACACCACCATGCCTGGCTAATTTTTAAATTTTTTGTCTCGCTGTGTTGCCCA 20950149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 ACAGACACACACCACCATGCCTGGCTAATTTTTAAATTTTTTGTCTCGCTGTGTTGCCCA 1859

 20950150 GGCTGGTCTCAAACTCCTGGGCTCAAGAAATCCTCCTGCCTTAGCCTCCCAAAGTGTTGA 20950209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 GGCTGGTCTCAAACTCCTGGGCTCAAGAAATCCTCCTGCCTTAGCCTCCCAAAGTGTTGA 1919

 20950210 GATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCTGGTTTATGGTTGCTTTTGAATGTCCTAGTCCTAC 20950269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 GATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCTGGTTTATGGTTGCTTTTGAATGTCCTAGTCCTAC 1979

 20950270 ATAAGTGGCTTCCAAGAAGGGAAAAAGAAAAATGCAGGCAGGAAAAGGTGCTGATCCATA 20950329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 ATAAGTGGCTTCCAAGAAGGGAAAAAGAAAAATGCAGGCAGGAAAAGGTGCTGATCCATA 2039

 20950330 AAAACCTCTGGAAGGTATGTCTCTAGGGAGGGGGTGAGTGTTGAGGAGGGATGTTGCAAA 20950389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 AAAACCTCTGGAAGGTATGTCTCTAGGGAGGGGGTGAGTGTTGAGGAGGGATGTTGCAAA 2099

 20950390 CATGGTAGTGGAGATGGCAAGAGTGGCTGCCTGCCTCTTCGTCTGCACTTCCACAATCTG 20950449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 CATGGTAGTGGAGATGGCAAGAGTGGCTGCCTGCCTCTTCGTCTGCACTTCCACAATCTG 2159

 20950450 AAGCAGCCATCATCAATCGGAACACAGATCCCCAGTATTTGGAGGATGGGGCTCTTATTG 20950509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 AAGCAGCCATCATCAATCGGAACACAGATCCCCAGTATTTGGAGGATGGGGCTCTTATTG 2219

 20950510 CCTGCTGTGGCTCCTGCAAGCTATAGGGAAGCTACCCCAGAAGTATAGGCATGGCTGCTT 20950569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 CCTGCTGTGGCTCCTGCAAGCTATAGGGAAGCTACCCCAGAAGTATAGGCATGGCTGCTT 2279

 20950570 GCACCACCAATTTAAATGCTAATTACTTCTGAAAACACCCTCACACACATGCCC 20950623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 GCACCACCAATTTAAATGCTAATTACTTCTGAAAACACCCTCACACACATGCCC 2333

EXCISED REGION

 20953851 TATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGCTCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAGCT 20953910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2344 TATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGCTCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAGCT 2403

 20953911 CAGGCGATCCACCTGCCTCGGCTTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTG 20953970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2404 CAGGCGATCCACCTGCCTCGGCTTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTG 2463

 20953971 CCTGGCCAAAAGTAGAAATTCTTGATTGGGAAATAATTTTATATATTTCGGCCCCTTCTC 20954030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2464 CCTGGCCAAAAGTAGAAATTCTTGATTGGGAAATAATTTTATATATTTCGGCCCCTTCTC 2523

 20954031 ACTTGGGAAAATTCTGCTAAGAATTCTGGTTTTGAGAGTCAAGGGAAGCTAGCTTAATTT 20954090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2524 ACTTGGGAAAATTCTGCTAAGAATTCTGGTTTTGAGAGTCAAGGGAAGCTAGCTTAATTT 2583

 20954091 TTAAAGTGAAGGCTACATAAGAGTCCTCTCTCCAGTGTGGTGGCTCACACCTATAAACCC 20954150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2584 TTAAAGTGAAGGCTACATAAGAGTCCTCTCTCCAGTGTGGTGGCTCACACCTATAAACCC 2643

 20954151 AGCGCTTCGGGCAAATCACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCAATGTAGTGAG 20954210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2644 AGCGCTTCGGGCAAATCACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCAATGTAGTGAG 2703

 20954211 ACCCCTATCTCTACAAAAAAATTTAAAAATTAGCAGGGTGTGGTGGTGCGTGCCTGTAGT 20954270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2704 ACCCCTATCTCTACAAAAAAATTTAAAAATTAGCAGGGTGTGGTGGTGCGTGCCTGTAGT 2763

 20954271 CCTGGCTACTTGGGTGGGATGCTGATGTGGGAGGATTGCTTGAGCCCAGGATTTGGAGGT 20954330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2764 CCTGGCTACTTGGGTGGGATGCTGATGTGGGAGGATTGCTTGAGCCCAGGATTTGGAGGT 2823

 20954331 TGCAGCGAGCCATGATGGTGCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACATGGCAAGACCTCGTCT 20954390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2824 TGCAGCGAGCCATGATGGTGCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACATGGCAAGACCTCGTCT 2883

 20954391 CAAAAAAATACAAAGAGTCCTCTCTATGTTGGAAATGTCAGAGTTATTGGCCATTTAGGG 20954450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2884 CAAAAAAATACAAAGAGTCCTCTCTATGTTGGAAATGTCAGAGTTATTGGCCATTTAGGG 2943

 20954451 GATCTAACTTGCTCTTTGATGTCCAAGAGGAAAGGTATAGAGTTCTCCTGATTACACAGG 20954510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2944 GATCTAACTTGCTCTTTGATGTCCAAGAGGAAAGGTATAGAGTTCTCCTGATTACACAGG 3003

 20954511 GCCTCTGCTTGTGGGTCGCCTGCATGAGGCGATCAGAATCTGAGTCACCTGGGATCATGT 20954570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3004 GCCTCTGCTTGTGGGTCGCCTGCATGAGGCGATCAGAATCTGAGTCACCTGGGATCATGT 3063

 20954571 GGGTGCTGGTACATCCTAGAGATAGGATGTGTTGGTCATGGAAGAGAGTGGGCCACAAAT 20954630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     3064 GGGTGCTGGTACATCCTAGAGATAGGATGTGTTGGTCATGGAGGAGAGTGGGCCACAAAT 3123

 20954631 GGGTTCCAGGGGAATAGCGTTGCCTGGTGCAAGGAGGGGGATGTGGAGGTGCAGGGAGCA 20954690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3124 GGGTTCCAGGGGAATAGCGTTGCCTGGTGCAAGGAGGGGGATGTGGAGGTGCAGGGAGCA 3183

 20954691 GGGGTGGTGTCTGGAGAGCCTGAAGCTGTGCTGCCAGAGGCTCCAGGCCATGAGGTCTGA 20954750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3184 GGGGTGGTGTCTGGAGAGCCTGAAGCTGTGCTGCCAGAGGCTCCAGGCCATGAGGTCTGA 3243

 20954751 GAAGCATCTAGATTTGGCCTGTTCACAGCAGGGAAGTGTGGTCCAGTGGCAAAAAGTTGA 20954810
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3244 GAAGCATCTGGATTTGGCCTGTTCACAGCAGGGAAGTGTGGTCCAGTGGCAAAAAGTTGA 3303

 20954811 GGGCATCCTAGGAGTTGAGGAGGTGGTGGCGGTTAGAGTAAACCACTCTGGAGGCGTCCG 20954870
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     3304 GGGCATCCTAGGAGTTGAGGAGGTGGTGGCGGTTAGAGTAAACCACTCTGGAGGCATCCG 3363

 20954871 GGGTGGAGAGACGAGAATGTGCAAGAACTCCTGCCTCTAGCCTGGCCTCCTCAGGACCCC 20954930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3364 GGGTGGAGAGACGAGAATGTGCAAGAACTCCTGCCTCTAGCCTGGCCTCCTCAGGACCCC 3423

 20954931 GGCCACCAGCCTCCCTCCTAGAAGTCCCCAGAGCTTCCTCCTCCTTGTGCCCCAGAACTG 20954990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3424 GGCCACCAGCCTCCCTCCTAGAAGTCCCCAGAGCTTCCTCCTCCTTGTGCCCCAGAACTG 3483

 20954991 GTTCCTGGGTTGCTCCAACCCCAGACCTTCCCTGGAAGTCCCCCCCAGTGCCTCCTGGCT 20955050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3484 GTTCCTGGGTTGCTCCAACCCCAGACCTTCCCTGGAAGTCCCCCCCAGTGCCTCCTGGCT 3543

 20955051 GGGAACCCCCAACTGCATTTTGCTTCTGCTCTCGTGCCAGTAGTCCCCTTTTCTCTCCAG 20955110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3544 GGGAACCCCCAACTGCATTTTGCTTCTGCTCTCGTGCCAGTAGTCCCCTTTTCTCTCCAG 3603

 20955111 TGTCCAGGCCCCAACCACCAAGACCCTGCCTCCTCACTTGGCTTTGCTGTTCTTAGTTCT 20955170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3604 TGTCCAGGCCCCAACCACCAAGACCCTGCCTCCTCACTTGGCTTTGCTGTTCTTAGTTCT 3663

 20955171 CTACTCAGTAGGTTGTGTCTGCCTCCATTCCTGGCCAGACGCTGCCCTGGGGCTGAGTGC 20955230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3664 CTACTCAGTAGGTTGTGTCTGCCTCCATTCCTGGCCAGACGCTGCCCTGGGGCTGAGTGC 3723

 20955231 ACAGTCCCCAGCCACTCCCGAGATCCTCAGAGCTTCTGGAAGCCACAGACATGGTGGCAT 20955290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3724 ACAGTCCCCAGCCACTCCCGAGATCCTCAGAGCTTCTGGAAGCCACAGACATGGTGGCAT 3783

 20955291 ATGTTTCAGGTCGTCAGCTTGTTTTTTTTTGGAGACAGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGC 20955350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3784 ATGTTTCAGGTCGTCAGCTTGTTTTTTTTTGGAGACAGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGC 3843

 20955351 TGGAGTGCGGTGAC 20955364
          ||||||||||||||
     3844 TGGAGTGCGGTGAC 3857

Alignment time is 3.11178 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [20940623,20963850] =>     23228 nucs '22 dna:chromosome chromosome:GRCh37:22:1:51304566:1'
Second seq [       1,    4459] =>      4459 nucs 'mol-32-3327-010085_4459'

Score:        4373
Aligned:      4454        nucs
Identic:      4445 (100%) nucs =>       221 (100%)      4224 (100%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [20950403,20950623] EXCISED REGION [20953851,20958083]
 second seq =>  [       1,     221] EXCISED REGION [     232,    4459]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3227 nucs [20950624,20953850]
 second seq =>        10 nucs [222,231]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [222,223] to [232,233]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [20950624,20950624] to [20953850,20953850]
 second seq =>         0 nucs

 20950403 ATGGCAAGAGTGGCTGCCTGCCTCTTCGTCTGCACTTCCACAATCTGAAGCAGCCATCAT 20950462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATGGCAAGAGTGGCTGCCTGCCTCTTCGTCTGCACTTCCACAATCTGAAGCAGCCATCAT 60

 20950463 CAATCGGAACACAGATCCCCAGTATTTGGAGGATGGGGCTCTTATTGCCTGCTGTGGCTC 20950522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAATCGGAACACAGATCCCCAGTATTTGGAGGATGGGGCTCTTATTGCCTGCTGTGGCTC 120

 20950523 CTGCAAGCTATAGGGAAGCTACCCCAGAAGTATAGGCATGGCTGCTTGCACCACCAATTT 20950582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTGCAAGCTATAGGGAAGCTACCCCAGAAGTATAGGCATGGCTGCTTGCACCACCAATTT 180

 20950583 AAATGCTAATTACTTCTGAAAACACCCTCACACACATGCCC 20950623
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAATGCTAATTACTTCTGAAAACACCCTCACACACATGCCC 221

EXCISED REGION

 20953851 TATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGCTCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAGCT 20953910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      232 TATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGCTCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAGCT 291

 20953911 CAGGCGATCCACCTGCCTCGGCTTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTG 20953970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      292 CAGGCGATCCACCTGCCTCGGCTTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTG 351

 20953971 CCTGGCCAAAAGTAGAAATTCTTGATTGGGAAATAATTTTATATATTTCGGCCCCTTCTC 20954030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      352 CCTGGCCAAAAGTAGAAATTCTTGATTGGGAAATAATTTTATATATTTCGGCCCCTTCTC 411

 20954031 ACTTGGGAAAATTCTGCTAAGAATTCTGGTTTTGAGAGTCAAGGGAAGCTAGCTTAATTT 20954090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      412 ACTTGGGAAAATTCTGCTAAGAATTCTGGTTTTGAGAGTCAAGGGAAGCTAGCTTAATTT 471

 20954091 TTAAAGTGAAGGCTACATAAGAGTCCTCTCTCCAGTGTGGTGGCTCACACCTATAAACCC 20954150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      472 TTAAAGTGAAGGCTACATAAGAGTCCTCTCTCCAGTGTGGTGGCTCACACCTATAAACCC 531

 20954151 AGCGCTTCGGGCAAATCACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCAATGTAGTGAG 20954210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
      532 AGCGCTTCGGGCAAATCACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCAGTGTAGTGAG 591

 20954211 ACCCCTATCTCTACAAAAAAATTTAAAAATTAGCAGGGTGTGGTGGTGCGTGCCTGTAGT 20954270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      592 ACCCCTATCTCTACAAAAAAATTTAAAAATTAGCAGGGTGTGGTGGTGCGTGCCTGTAGT 651

 20954271 CCTGGCTACTTGGGTGGGATGCTGATGTGGGAGGATTGCTTGAGCCCAGGATTTGGAGGT 20954330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      652 CCTGGCTACTTGGGTGGGATGCTGATGTGGGAGGATTGCTTGAGCCCAGGATTTGGAGGT 711

 20954331 TGCAGCGAGCCATGATGGTGCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACATGGCAAGACCTCGTCT 20954390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      712 TGCAGCGAGCCATGATGGTGCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACATGGCAAGACCTCGTCT 771

 20954391 CAAAAAAATACAAAGAGTCCTCTCTATGTTGGAAATGTCAGAGTTATTGGCCATTTAGGG 20954450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      772 CAAAAAAATACAAAGAGTCCTCTCTATGTTGGAAATGTCAGAGTTATTGGCCATTTAGGG 831

 20954451 GATCTAACTTGCTCTTTGATGTCCAAGAGGAAAGGTATAGAGTTCTCCTGATTACACAGG 20954510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      832 GATCTAACTTGCTCTTTGATGTCCAAGAGGAAAGGTATAGAGTTCTCCTGATTACACAGG 891

 20954511 GCCTCTGCTTGTGGGTCGCCTGCATGAGGCGATCAGAATCTGAGTCACCTGGGATCATGT 20954570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      892 GCCTCTGCTTGTGGGTCGCCTGCATGAGGCGATCAGAATCTGAGTCACCTGGGATCATGT 951

 20954571 GGGTGCTGGTACATCCTAGAGATAGGATGTGTTGGTCATGGAAGAGAGTGGGCCACAAAT 20954630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      952 GGGTGCTGGTACATCCTAGAGATAGGATGTGTTGGTCATGGAAGAGAGTGGGCCACAAAT 1011

 20954631 GGGTTCCAGGGGAATAGCGTTGCCTGGTGCAAGGAGGGGGATGTGGAGGTGCAGGGAGCA 20954690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1012 GGGTTCCAGGGGAATAGCGTTGCCTGGTGCAAGGAGGGGGATGTGGAGGTGCAGGGAGCA 1071

 20954691 GGGGTGGTGTCTGGAGAGCCTGAAGCTGTGCTGCCAGAGGCTCCAGGCCATGAGGTCTGA 20954750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1072 GGGGTGGTGTCTGGAGAGCCTGAAGCTGTGCTGCCAGAGGCTCCAGGCCATGAGGTCTGA 1131

 20954751 GAAGCATCTAGATTTGGCCTGTTCACAGCAGGGAAGTGTGGTCCAGTGGCAAAAAGTTGA 20954810
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1132 GAAGCATCTGGATTTGGCCTGTTCACAGCAGGGAAGTGTGGTCCAGTGGCAAAAAGTTGA 1191

 20954811 GGGCATCCTAGGAGTTGAGGAGGTGGTGGCGGTTAGAGTAAACCACTCTGGAGGCGTCCG 20954870
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     1192 GGGCATCCTAGGAGTTGAGGAGGTGGTGGCGGTTAGAGTAAACCACTCTGGAGGCATCCG 1251

 20954871 GGGTGGAGAGACGAGAATGTGCAAGAACTCCTGCCTCTAGCCTGGCCTCCTCAGGACCCC 20954930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1252 GGGTGGAGAGACGAGAATGTGCAAGAACTCCTGCCTCTAGCCTGGCCTCCTCAGGACCCC 1311

 20954931 GGCCACCAGCCTCCCTCCTAGAAGTCCCCAGAGCTTCCTCCTCCTTGTGCCCCAGAACTG 20954990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1312 GGCCACCAGCCTCCCTCCTAGAAGTCCCCAGAGCTTCCTCCTCCTTGTGCCCCAGAACTG 1371

 20954991 GTTCCTGGGTTGCTCCAACCCCAGACCTTCCCTGGAAGTCCCCCCCAGTGCCTCCTGGCT 20955050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1372 GTTCCTGGGTTGCTCCAACCCCAGACCTTCCCTGGAAGTCCCCCCCAGTGCCTCCTGGCT 1431

 20955051 GGGAACCCCCAACTGCATTTTGCTTCTGCTCTCGTGCCAGTAGTCCCCTTTTCTCTCCAG 20955110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1432 GGGAACCCCCAACTGCATTTTGCTTCTGCTCTCGTGCCAGTAGTCCCCTTTTCTCTCCAG 1491

 20955111 TGTCCAGGCCCCAACCACCAAGACCCTGCCTCCTCACTTGGCTTTGCTGTTCTTAGTTCT 20955170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1492 TGTCCAGGCCCCAACCACCAAGACCCTGCCTCCTCACTTGGCTTTGCTGTTCTTAGTTCT 1551

 20955171 CTACTCAGTAGGTTGTGTCTGCCTCCATTCCTGGCCAGACGCTGCCCTGGGGCTGAGTGC 20955230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1552 CTACTCAGTAGGTTGTGTCTGCCTCCATTCCTGGCCAGACGCTGCCCTGGGGCTGAGTGC 1611

 20955231 ACAGTCCCCAGCCACTCCCGAGATCCTCAGAGCTTCTGGAAGCCACAGACATGGTGGCAT 20955290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1612 ACAGTCCCCAGCCACTCCCGAGATCCTCAGAGCTTCTGGAAGCCACAGACATGGTGGCAT 1671

 20955291 ATGTTTCAGGTCGTCAGCTTGTTTTTTTTTGGAGACAGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGC 20955350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1672 ATGTTTCAGGTCGTCAGCTTGTTTTTTTTTGGAGACAGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGC 1731

 20955351 TGGAGTGCGGTGACGTGATCATTCACTGCAGCCTTGACCTTCTGAGCCCGGGTGATCCTC 20955410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1732 TGGAGTGCGGTGACGTGATCATTCACTGCAGCCTTGACCTTCTGAGCCCGGGTGATCCTC 1791

 20955411 CCACCTCAGCCTGTCAAGTAGCTGAGACCACATGTGTGAGCCACCACACCTAGCTTTTTG 20955470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1792 CCACCTCAGCCTGTCAAGTAGCTGAGACCACATGTGTGAGCCACCACACCTAGCTTTTTG 1851

 20955471 AATCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCA 20955530
          ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1852 AATC--TTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCA 1909

 20955531 GTGGCACAATCTTGGCTTACTGCAACCTCCAGCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCT 20955590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1910 GTGGCACAATCTTGGCTTACTGCAACCTCCAGCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCT 1969

 20955591 CTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGTAGGTGGCACCACACCTAGCTAATTTTTATGTCTTT 20955650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1970 CTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGTAGGTGGCACCACACCTAGCTAATTTTTATGTCTTT 2029

 20955651 AGTAGAGACAAAGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGATCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGA 20955710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2030 AGTAGAGACAAAGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGATCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGA 2089

 20955711 TCTGCCTGTCTTGACCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGGGCCACGCGCCCAGCCA 20955770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2090 TCTGCCTGTCTTGACCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGGGCCACGCGCCCAGCCA 2149

 20955771 ACTTTTTGAATCTTTTGTAGGGATGGGGTCTTGCTGTGTTGCCCAGGCTGGGCTTAAACT 20955830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2150 ACTTTTTGAATCTTTTGTAGGGATGGGGTCTTGCTGTGTTGCCCAGGCTGGGCTTAAACT 2209

 20955831 CCTGGACTCAAGTGATCCTCCCTGCCTTGGTTTCTCAAACTTCTGGGATTACAGGCCAAT 20955890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2210 CCTGGACTCAAGTGATCCTCCCTGCCTTGGTTTCTCAAACTTCTGGGATTACAGGCCAAT 2269

 20955891 CTACTCAACGTTGATATTGAGTAGAAGGCAAAATTCACATGGCTCCGGCCCAGCCCCTTT 20955950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2270 CTACTCAACGTTGATATTGAGTAGAAGGCAAAATTCACATGGCTCCGGCCCAGCCCCTTT 2329

 20955951 CTGTCTCAGGCACTTCAGTGTTAATATGCGCCTTGGTTTTGCTGCTGCCGAGTCTACTGT 20956010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2330 CTGTCTCAGGCACTTCAGTGTTAATATGCGCCTTGGTTTTGCTGCTGCCGAGTCTACTGT 2389

 20956011 GCCCCTGGGCAAGGAAAGCAAAGGAAACCAGAGGGCCAGGCCCGTGGACACTGGGGTGAG 20956070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2390 GCCCCTGGGCAAGGAAAGCAAAGGAAACCAGAGGGCCAGGCCCGTGGACACTGGGGTGAG 2449

 20956071 GGGCCAACAGGGTGCCCAGCAGTTGTTTCCACAGCCCCCACGTGGTCAGGGACCCTGTAT 20956130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2450 GGGCCAACAGGGTGCCCAGCAGTTGTTTCCACAGCCCCCACGTGGTCAGGGACCCTGTAT 2509

 20956131 GGGTGAACCGCCTGGATACTGAGCCTAGGCGGCGGAAAACTCAAAAGCAAGGGCAGGTTT 20956190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2510 GGGTGAACCGCCTGGATACTGAGCCTAGGCGGCGGAAAACTCAAAAGCAAGGGCAGGTTT 2569

 20956191 ATTCAGATCCCTGGTGGAGTTACAAGCTTGGTTTGGTTTTTGGTCACAGGCCCTAAAATA 20956250
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     2570 ATTCAGATCCCTGGTGGAGTTACAAGCTTGGTTTGGTTTTTGGTCACAGGCCCTAAAATG 2629

 20956251 CCTGTATTCTGAGTTTACATAAAAATACAAAGCACTGGCCGGGCGCGCTGGCTCACACCT 20956310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2630 CCTGTATTCTGAGTTTACATAAAAATACAAAGCACTGGCCGGGCGCGCTGGCTCACACCT 2689

 20956311 GTAAGCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTGGCTAACATGAGGTCAGGAATTTGAAA 20956370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2690 GTAAGCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTGGCTAACATGAGGTCAGGAATTTGAAA 2749

 20956371 CCAGCCTGACTAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCA 20956430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2750 CCAGCCTGACTAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCA 2809

 20956431 TGGTGGCGCATGCCTGTAATCCCAGCTATTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAA 20956490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2810 TGGTGGCGCATGCCTGTAATCCCAGCTATTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAA 2869

 20956491 CCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCATGATCGCACCGCCGCACTGCAGCCTGGGCTAC 20956550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2870 CCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCATGATCGCACCGCCGCACTGCAGCCTGGGCTAC 2929

 20956551 AGAGCAAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCACCACCGAGACGCTGTTCTCC 20956610
          ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2930 AGAGCAAGACTCTGTCTC--AAAAAAAAAAAAAAAAATCACCACCGAGACGCTGTTCTCC 2987

 20956611 CTGGTGTGTCATCTGTGGGGTGAATGAAGGTGTGAGATACCCCGTGGTGGTTTCTGTCAG 20956670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2988 CTGGTGTGTCATCTGTGGGGTGAATGAAGGTGTGAGATACCCCGTGGTGGTTTCTGTCAG 3047

 20956671 TGAATCTGTAGTTGTCATATATTTTGAATACTTCAATATCATCGAACAGTTGCTGTGTCT 20956730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3048 TGAATCTGTAGTTGTCATATATTTTGAATACTTCAATATCATCGAACAGTTGCTGTGTCT 3107

 20956731 TTAAGCACTAGATTTTATTGAAGCTACCTTCTTCCCTTTTTAGTCCCATTTCCCCTAGAT 20956790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3108 TTAAGCACTAGATTTTATTGAAGCTACCTTCTTCCCTTTTTAGTCCCATTTCCCCTAGAT 3167

 20956791 GCATCCACGACTGCAGGAACCCCCCTGCCCCCACCAGGAGCCCAAAGATAACCATGTTCC 20956850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3168 GCATCCACGACTGCAGGAACCCCCCTGCCCCCACCAGGAGCCCAAAGATAACCATGTTCC 3227

 20956851 CACCTGGAGTGGCCTCCCACCTCCAATGCCATCAGGGCTGGTGCAGCTTCCCCACCTGGT 20956910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3228 CACCTGGAGTGGCCTCCCACCTCCAATGCCATCAGGGCTGGTGCAGCTTCCCCACCTGGT 3287

 20956911 CAGCAACATCATGGCCAAGGAGTAGAGGGCGTAGCCCAGGGTGAACAGCAGTGCACAGGT 20956970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3288 CAGCAACATCATGGCCAAGGAGTAGAGGGCGTAGCCCAGGGTGAACAGCAGTGCACAGGT 3347

 20956971 GAGGGGCCTGATGCAGAACAGAGAGGCCATGAAGAAAGCCAGCAGTAGCCAGGGCAGTGT 20957030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3348 GAGGGGCCTGATGCAGAACAGAGAGGCCATGAAGAAAGCCAGCAGTAGCCAGGGCAGTGT 3407

 20957031 CAGGTAGCTGCCTAGGAAGTGCAGGTTGAGCCTGTGGCCGCTGGCCAGCGTGGGCTCTGT 20957090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3408 CAGGTAGCTGCCTAGGAAGTGCAGGTTGAGCCTGTGGCCGCTGGCCAGCGTGGGCTCTGT 3467

 20957091 GAGGTGGTAGCAACAGAAGCTGGCAAGGAAGTCATCTCAGGAACACAGAGCCGCCATCTG 20957150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3468 GAGGTGGTAGCAACAGAAGCTGGCAAGGAAGTCATCTCAGGAACACAGAGCCGCCATCTG 3527

 20957151 GTCTGCAAACTGAAGCGCAGGCAGTGGCACGGGGGCATGGGGTGGTGGCACCACAGGCCT 20957210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3528 GTCTGCAAACTGAAGCGCAGGCAGTGGCACGGGGGCATGGGGTGGTGGCACCACAGGCCT 3587

 20957211 CAGGACAGCTGCACCCCACCCCCACAGGCCACCCTGAGACTGCACCCCAGGCAGGAGCAC 20957270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3588 CAGGACAGCTGCACCCCACCCCCACAGGCCACCCTGAGACTGCACCCCAGGCAGGAGCAC 3647

 20957271 CCAGAACCCTCTCTGAAGAGGCCAGGCCAGCCCTCCTGCCCACTCACTCTGTGTTTGATG 20957330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3648 CCAGAACCCTCTCTGAAGAGGCCAGGCCAGCCCTCCTGCCCACTCACTCTGTGTTTGATG 3707

 20957331 GCAGATGACAGCCGGAAGGATGCTCAGACCAAGCTGGTAATCTCATAACTCCAGAGGGGC 20957390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3708 GCAGATGACAGCCGGAAGGATGCTCAGACCAAGCTGGTAATCTCATAACTCCAGAGGGGC 3767

 20957391 TGCAGCTCCGGGTCCCCCTGGTACTCAATTTCAAACCTTTGCAGCCTGTTGATGATCTAG 20957450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3768 TGCAGCTCCGGGTCCCCCTGGTACTCAATTTCAAACCTTTGCAGCCTGTTGATGATCTAG 3827

 20957451 AAACCCAGGCTATAGGGTTGGGCCAGAAAACATGGCCCTGGCCAGGTGCAGTGGCTCATG 20957510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3828 AAACCCAGGCTATAGGGTTGGGCCAGAAAACATGGCCCTGGCCAGGTGCAGTGGCTCATG 3887

 20957511 CCTGTAATCCCAGCACTCCGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACAAGGTCGGGAGTTAGAG 20957570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3888 CCTGTAATCCCAGCACTCCGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACAAGGTCGGGAGTTAGAG 3947

 20957571 ACCAGCCTGATCGATATGATGAAACCCCGTCTCTATTAAAAATACAAAAATTGGCCAGGT 20957630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3948 ACCAGCCTGATCGATATGATGAAACCCCGTCTCTATTAAAAATACAAAAATTGGCCAGGT 4007

 20957631 GCAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTCTGGGAGGCTGAGGCAGGTGGATCACGAGG 20957690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4008 GCAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTCTGGGAGGCTGAGGCAGGTGGATCACGAGG 4067

 20957691 TCGGGAGATCAGGACCATCCTGGCTAACACTGCGAAACCCCGTCTCTACTAAAAAAAATA 20957750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4068 TCGGGAGATCAGGACCATCCTGGCTAACACTGCGAAACCCCGTCTCTACTAAAAAAAATA 4127

 20957751 CAAAAAAAAATTAGCTGGGCTTGGTGGCGGGCACCTGTAGTTCCAGCTACTCAGGAGGCT 20957810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4128 CAAAAAAAAATTAGCTGGGCTTGGTGGCGGGCACCTGTAGTTCCAGCTACTCAGGAGGCT 4187

 20957811 GAGGCAGGAGAATAGCGTGAACCCAGGAGGTGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATTGCGCCA 20957870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4188 GAGGCAGGAGAATAGCGTGAACCCAGGAGGTGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATTGCGCCA 4247

 20957871 CTGCACTCCAGCCTGGGCTACAGAGCAAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAGTTAGCC 20957930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
     4248 CTGCACTCCAGCCTGGGCTACAGAGCAAGACTCCGTCTC-AAAAAAAAAAAAAGTTAGCC 4306

 20957931 AGGCATGGTGGCATGTGCCTGTAATCCCAGCTATTCAGGAGGCTGAGGTGGGAGAATCGC 20957990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4307 AGGCATGGTGGCATGTGCCTGTAATCCCAGCTATTCAGGAGGCTGAGGTGGGAGAATCGC 4366

 20957991 TTGAACCCAGGAGGTGGAAGTTTCAGTGAGCCAAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGG 20958050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4367 TTGAACCCAGGAGGTGGAAGTTTCAGTGAGCCAAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGG 4426

 20958051 GCAAGAGAGGGAAACCTTGTTTCAAAAAAAAGA 20958083
          |||||||||||||||||||||||||||||||||
     4427 GCAAGAGAGGGAAACCTTGTTTCAAAAAAAAGA 4459

Alignment time is 3.49625 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [20940623,20963850] =>     23228 nucs '22 dna:chromosome chromosome:GRCh37:22:1:51304566:1'
Second seq [       1,    6694] =>      6694 nucs 'mol-32-33ab-181681_6694'

Score:        6554
Aligned:      6691        nucs
Identic:      6672 (100%) nucs =>      3546 (100%)      3126 (100%)
Gaps:           15 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [20947071,20950623] EXCISED REGION [20953851,20956986]
 second seq =>  [       7,    3555] EXCISED REGION [    3566,    6694]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3227 nucs [20950624,20953850]
 second seq =>        10 nucs [3556,3565]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [3556,3557] to [3566,3567]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [20950624,20950624] to [20953850,20953850]
 second seq =>         0 nucs

 20947071 ATCCCGGAGGTCAAGGCCGCAGTGAGCTATGATGGCACCACTGAACTCCAGGCTAGGTGA 20947130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        7 ATCCCGGAGGTCAAGGCCGCAGTGAGCTATGATGGCACCACTGAACTCCAGGCTAGGTGA 66

 20947131 CACAGTGAGATGCTGCCTAAAAGAAAAAAAAAAAAAGAAATATGTCTTTCTTTACAAGGC 20947190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
       67 CACAGTGAGATGCTGCCTAAAAGAAAAAAAAAAAA-GAAATATGTCTTTCTTTACAAGGC 125

 20947191 CTGCCCTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA--TGTTCGCCAGAGCCAGGCCAACTGTGATTT 20947248
          ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||
      126 CTGCCCTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATGTTCGCCAGAGCCAGGCCAACTGTGATTT 185

 20947249 TACCAGATGCCAACATACCCAACCCAAGGGAGGAAGGGAACATACCCAATCCCAGCCTGT 20947308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      186 TACCAGATGCCAACATACCCAACCCAAGGGAGGAAGGGAACATACCCAATCCCAGCCTGT 245

 20947309 TCTAGCTCCTCTTCCCCACATCTTCCTGCCACATCAATAGGGCTCCTGTATAATAACAGG 20947368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      246 TCTAGCTCCTCTTCCCCACATCTTCCTGCCACATCAATAGGGCTCCTGTATAATAACAGG 305

 20947369 GGATACAAGTGAAAGAACAGCCCATCTCAGAACTTATTTGAGAAATGTCTAGGAAACCCT 20947428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      306 GGATACAAGTGAAAGAACAGCCCATCTCAGAACTTATTTGAGAAATGTCTAGGAAACCCT 365

 20947429 AAAGACAACAGGGAGACAAAAACTAAGACACCAGAGGAAGTTTATGCCTCTGACACTTAC 20947488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      366 AAAGACAACAGGGAGACAAAAACTAAGACACCAGAGGAAGTTTATGCCTCTGACACTTAC 425

 20947489 AGTTAGAACAAACAGCACACATGGCCCAACCCCTAACCAGAGCAAAATAAAACCTCACAC 20947548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      426 AGTTAGAACAAACAGCACACATGGCCCAACCCCTAACCAGAGCAAAATAAAACCTCACAC 485

 20947549 AGGCCGGGCGCTGTGGCTCACCCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGTGG 20947608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      486 AGGCCGGGCGCTGTGGCTCACCCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGTGG 545

 20947609 ATCACGAGGTCAGGAGTTCAAGACCACCCTGGCCAAGATGGTGAAACCCCATCTACTAAA 20947668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      546 ATCACGAGGTCAGGAGTTCAAGACCACCCTGGCCAAGATGGTGAAACCCCATCTACTAAA 605

 20947669 AATACAAAAATTAGCGGGCGTGGTGGCAGGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGGTG 20947728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      606 AATACAAAAATTAGCGGGCGTGGTGGCAGGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGGTG 665

 20947729 AGGCAGAGAATTGCTTGAAGCCAGGAGGTAGAGCTTGCAGTGAGCGGAGATTGCGGCACC 20947788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      666 AGGCAGAGAATTGCTTGAAGCCAGGAGGTAGAGCTTGCAGTGAGCGGAGATTGCGGCACC 725

 20947789 GCACTCCAGCCTGGGTGACAAAGTGAGACTCTGTCTCAAAAAACAAAAACAAACAAACAA 20947848
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   
      726 GCACTCCAGCCTGGGTGACAAAGTGAGACTCTGTCTCAAAAAACAAAAACAAACAAA--- 782

 20947849 AAACTTCACACAGAAAGCCCATTTATCACGTACCCCGTACAGCATGTCCAGCTCCCCACA 20947908
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
      783 -AACTTCACACAGAAAGCCCATTTATCACGTACCCCGTACAGCATGTCCAGCTCGCCACA 841

 20947909 AAAAATTTCAAGGCATAATAAAAACCAAAAAATGCAGTTTGAAGAGACAGCAAGCATCAG 20947968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      842 AAAAATTTCAAGGCATAATAAAAACCAAAAAATGCAGTTTGAAGAGACAGCAAGCATCAG 901

 20947969 AGCCAGACTCAAATATGGCAGAGATGTCGGAATTATCAGACCAAGAAATGGAATACAACT 20948028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      902 AGCCAGACTCAAATATGGCAGAGATGTCGGAATTATCAGACCAAGAAATGGAATACAACT 961

 20948029 ATGATTAATATGCTAAGGGCTCTAATGGAAAAGTGGACAACATGAGATTACAGACAGAAA 20948088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      962 ATGATTAATATGCTAAGGGCTCTAATGGAAAAGTGGACAACATGAGATTACAGACAGAAA 1021

 20948089 ATGGAAACAGGGATAGACACTCTGAGAAAGAATCTAAAGAATATGTGAAGGCCGGGCACA 20948148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1022 ATGGAAACAGGGATAGACACTCTGAGAAAGAATCTAAAGAATATGTGAAGGCCGGGCACA 1081

 20948149 GTGGCTTATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGCGGATCACTTGAAGTC 20948208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1082 GTGGCTTATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGCGGATCACTTGAAGTC 1141

 20948209 AGGAGTTCGAAGACCAGCCCAGTTCGAGACCAGATGGCAAAACCCCATCTCTACTAAAAA 20948268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1142 AGGAGTTCGAAGACCAGCCCAGTTCGAGACCAGATGGCAAAACCCCATCTCTACTAAAAA 1201

 20948269 ATACAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCATGAACCTGTAATTCCAGCTATTCAGGAGGCTG 20948328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1202 ATACAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCATGAACCTGTAATTCCAGCTATTCAGGAGGCTG 1261

 20948329 AGGTGGGAGGACTGCTTGGACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGTGCCAC 20948388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1262 AGGTGGGAGGACTGCTTGGACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGTGCCAC 1321

 20948389 TGCCCTCAAATCTGGGTGACAGAGTGAGACACCACCAAAAAAAAGAAAAGAAAAGAAAGG 20948448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1322 TGCCCTCAAATCTGGGTGACAGAGTGAGACACCACCAAAAAAAAGAAAAGAAAAGAAAGG 1381

 20948449 AAACAAGGAGAGGAAAGAAAGGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAAGAAAGAAAGAAAGAGAAA 20948508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1382 AAACAAGGAGAGGAAAGAAAGGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAAGAAAGAAAGAAAGAGAAA 1441

 20948509 GAGAAAATAAAGAAAAAGAAAGAAAGAAGGAGAATATGTGAGAAGTCAGCCAGGTAGTGA 20948568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1442 GAGAAAATAAAGAAAAAGAAAGAAAGAAGGAGAATATGTGAGAAGTCAGCCAGGTAGTGA 1501

 20948569 CTCATGACTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCACTTGAGGTCAGC 20948628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1502 CTCATGACTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCACTTGAGGTCAGC 1561

 20948629 AGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACATGGTGATAACCCATCTCTACTAAAAATAAAAAAATT 20948688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1562 AGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACATGGTGATAACCCATCTCTACTAAAAATAAAAAAATT 1621

 20948689 AGCTGGATGTGGTGTCATGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAA 20948748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1622 AGCTGGATGTGGTGTCATGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAA 1681

 20948749 TTGCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTAAGCTGAGATTATGCCACTGCACTCCAGC 20948808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1682 TTGCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTAAGCTGAGATTATGCCACTGCACTCCAGC 1741

 20948809 CTGGGCAGTAAGACTCCGTCTCAAAAAACAAAAAGAAAATATAAGAAGTCAAAAACACAA 20948868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1742 CTGGGCAGTAAGACTCCGTCTCAAAAAACAAAAAGAAAATATAAGAAGTCAAAAACACAA 1801

 20948869 CAGAATGAAAGATCAGGGCTGGCAGCAGTGGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGA 20948928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1802 CAGAATGAAAGATCAGGGCTGGCAGCAGTGGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGA 1861

 20948929 GGCCAAGTTGGGTGGATCACCTGAGGTTAGGAGTTGGAGACCAGCCTGGCCAACATGGAG 20948988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1862 GGCCAAGTTGGGTGGATCACCTGAGGTTAGGAGTTGGAGACCAGCCTGGCCAACATGGAG 1921

 20948989 AAACCCCGTCTCTACTCAAAATACAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCGCATGCCTGTAAT 20949048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1922 AAACCCCGTCTCTACTCAAAATACAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCGCATGCCTGTAAT 1981

 20949049 CCCAACTACACAGAAGGATGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGATGTA 20949108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1982 CCCAACTACACAGAAGGATGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGATGTA 2041

 20949109 GTGAGCCGAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAAGGAGACTCTGTCTCAA 20949168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2042 GTGAGCCGAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAAGGAGACTCTGTCTCAA 2101

 20949169 AAAAGAAAGAAAGAAAGGTCAGGTGCATGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGAGAG 20949228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2102 AAAAGAAAGAAAGAAAGGTCAGGTGCATGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGAGAG 2161

 20949229 GCCAAAGTAGAAGGATCGTTTGAGCCCAGGAGTTGGAGACCAGCCTGGGCAATATAGCCA 20949288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2162 GCCAAAGTAGAAGGATCGTTTGAGCCCAGGAGTTGGAGACCAGCCTGGGCAATATAGCCA 2221

 20949289 GACCCTGTCTCTACAAAAAATTAAAAAAATTGCCAGCATGGTGGTGCACATCTGCAGTCC 20949348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2222 GACCCTGTCTCTACAAAAAATTAAAAAAATTGCCAGCATGGTGGTGCACATCTGCAGTCC 2281

 20949349 CTGCTACTCAGGAGGCCAAGGCTGCAGTGAGCTGTGATTGTACTACTGCACTCTGGCCTG 20949408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2282 CTGCTACTCAGGAGGCCAAGGCTGCAGTGAGCTGTGATTGTACTACTGCACTCTGGCCTG 2341

 20949409 GGTAACAGAGAGAGACCCTGTCTCAAAAATGGGGTAAAATGGTATAGGAAATTTGGATCT 20949468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2342 GGTAACAGAGAGAGACCCTGTCTCAAAAATGGGGTAAAATGGTATAGGAAATTTGGATCT 2401

 20949469 AAAAAAAAAAAAAAGGAAGTGCATTAGATAAGAAATAAATGAAGATAAAATAGAATCTTT 20949528
          ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2402 AAAAAAAAAAAAA-GGAAGTGCATTAGATAAGAAATAAATGAAGATAAAATAGAATCTTT 2460

 20949529 TTTTTGGTGGGGGTGGGGAACGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGC 20949588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TTTTTGGTGGGGGTGGGGAACGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGC 2520

 20949589 ACGATCTTGGCTCACCACAACATCCGCCTACTGGGTTCAGGCGATTCTCCTGCCTCAGCC 20949648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 ACGATCTTGGCTCACCACAACATCCGCCTACTGGGTTCAGGCGATTCTCCTGCCTCAGCC 2580

 20949649 TCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGTGCCACCACGTCCAGCTAATTTTGTATTTTTAT 20949708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGTGCCACCACGTCCAGCTAATTTTGTATTTTTAT 2640

 20949709 TAGAGTCGGGGGTTACTCCACGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTAACCTCAGGCGAT 20949768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TAGAGTCGGGGGTTACTCCACGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTAACCTCAGGCGAT 2700

 20949769 CTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGAATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGCCA 20949828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGAATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGCCA 2760

 20949829 GAATCTTGTATTGTTCTTATTTTTAGTTGAACAGATGGCAGGTTATTCAAAATAATTATA 20949888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GAATCTTGTATTGTTCTTATTTTTAGTTGAACAGATGGCAGGTTATTCAAAATAATTATA 2820

 20949889 TCAACATGTATTCAGTAATTATAGCTTATGGATAGCTGGAATGAATGGCAGCAATGTTAT 20949948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TCAACATGTATTCAGTAATTATAGCTTATGGATAGCTGGAATGAATGGCAGCAATGTTAT 2880

 20949949 AAGGGATGGGAAGGAGGATATCCTGAGTGGAAAGAAAGTCACCCAGGCTGGAGTGAAGTG 20950008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 AAGGGATGGGAAGGAGGATATCCTGAGTGGAAAGAAAGTCACCCAGGCTGGAGTGAAGTG 2940

 20950009 GCACAATTATAGCCCACTTGCAGCCTGCAACTCCTGGGCTCAAGCCATCCTTCTGCTTCA 20950068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 GCACAATTATAGCCCACTTGCAGCCTGCAACTCCTGGGCTCAAGCCATCCTTCTGCTTCA 3000

 20950069 GCCTCCCTGGTAACTGGGATTACAGACACACACCACCATGCCTGGCTAATTTTTAAATTT 20950128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GCCTCCCTGGTAACTGGGATTACAGACACACACCACCATGCCTGGCTAATTTTTAAATTT 3060

 20950129 TTTGTCTCGCTGTGTTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGGCTCAAGAAATCCTCCTGC 20950188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TTTGTCTCGCTGTGTTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGGCTCAAGAAATCCTCCTGC 3120

 20950189 CTTAGCCTCCCAAAGTGTTGAGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCTGGTTTATGGTTGC 20950248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 CTTAGCCTCCCAAAGTGTTGAGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCTGGTTTATGGTTGC 3180

 20950249 TTTTGAATGTCCTAGTCCTACATAAGTGGCTTCCAAGAAGGGAAAAAGAAAAATGCAGGC 20950308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TTTTGAATGTCCTAGTCCTACATAAGTGGCTTCCAAGAAGGGAAAAAGAAAAATGCAGGC 3240

 20950309 AGGAAAAGGTGCTGATCCATAAAAACCTCTGGAAGGTATGTCTCTAGGGAGGGGGTGAGT 20950368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 AGGAAAAGGTGCTGATCCATAAAAACCTCTGGAAGGTATGTCTCTAGGGAGGGGGTGAGT 3300

 20950369 GTTGAGGAGGGATGTTGCAAACATGGTAGTGGAGATGGCAAGAGTGGCTGCCTGCCTCTT 20950428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 GTTGAGGAGGGATGTTGCAAACATGGTAGTGGAGATGGCAAGAGTGGCTGCCTGCCTCTT 3360

 20950429 CGTCTGCACTTCCACAATCTGAAGCAGCCATCATCAATCGGAACACAGATCCCCAGTATT 20950488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 CGTCTGCACTTCCACAATCTGAAGCAGCCATCATCAATCGGAACACAGATCCCCAGTATT 3420

 20950489 TGGAGGATGGGGCTCTTATTGCCTGCTGTGGCTCCTGCAAGCTATAGGGAAGCTACCCCA 20950548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TGGAGGATGGGGCTCTTATTGCCTGCTGTGGCTCCTGCAAGCTATAGGGAAGCTACCCCA 3480

 20950549 GAAGTATAGGCATGGCTGCTTGCACCACCAATTTAAATGCTAATTACTTCTGAAAACACC 20950608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 GAAGTATAGGCATGGCTGCTTGCACCACCAATTTAAATGCTAATTACTTCTGAAAACACC 3540

 20950609 CTCACACACATGCCC 20950623
          |||||||||||||||
     3541 CTCACACACATGCCC 3555

EXCISED REGION

 20953851 TATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGCTCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAGCT 20953910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3566 TATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGCTCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAGCT 3625

 20953911 CAGGCGATCCACCTGCCTCGGCTTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTG 20953970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3626 CAGGCGATCCACCTGCCTCGGCTTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTG 3685

 20953971 CCTGGCCAAAAGTAGAAATTCTTGATTGGGAAATAATTTTATATATTTCGGCCCCTTCTC 20954030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3686 CCTGGCCAAAAGTAGAAATTCTTGATTGGGAAATAATTTTATATATTTCGGCCCCTTCTC 3745

 20954031 ACTTGGGAAAATTCTGCTAAGAATTCTGGTTTTGAGAGTCAAGGGAAGCTAGCTTAATTT 20954090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3746 ACTTGGGAAAATTCTGCTAAGAATTCTGGTTTTGAGAGTCAAGGGAAGCTAGCTTAATTT 3805

 20954091 TTAAAGTGAAGGCTACATAAGAGTCCTCTCTCCAGTGTGGTGGCTCACACCTATAAACCC 20954150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3806 TTAAAGTGAAGGCTACATAAGAGTCCTCTCTCCAGTGTGGTGGCTCACACCTATAAACCC 3865

 20954151 AGCGCTTCGGGCAAATCACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCAATGTAGTGAG 20954210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3866 AGCGCTTCGGGCAAATCACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCAATGTAGTGAG 3925

 20954211 ACCCCTATCTCTACAAAAAAATTTAAAAATTAGCAGGGTGTGGTGGTGCGTGCCTGTAGT 20954270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3926 ACCCCTATCTCTACAAAAAAATTTAAAAATTAGCAGGGTGTGGTGGTGCGTGCCTGTAGT 3985

 20954271 CCTGGCTACTTGGGTGGGATGCTGATGTGGGAGGATTGCTTGAGCCCAGGATTTGGAGGT 20954330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3986 CCTGGCTACTTGGGTGGGATGCTGATGTGGGAGGATTGCTTGAGCCCAGGATTTGGAGGT 4045

 20954331 TGCAGCGAGCCATGATGGTGCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACATGGCAAGACCTCGTCT 20954390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4046 TGCAGCGAGCCATGATGGTGCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACATGGCAAGACCTCGTCT 4105

 20954391 CAAAAAAATACAAAGAGTCCTCTCTATGTTGGAAATGTCAGAGTTATTGGCCATTTAGGG 20954450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4106 CAAAAAAATACAAAGAGTCCTCTCTATGTTGGAAATGTCAGAGTTATTGGCCATTTAGGG 4165

 20954451 GATCTAACTTGCTCTTTGATGTCCAAGAGGAAAGGTATAGAGTTCTCCTGATTACACAGG 20954510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4166 GATCTAACTTGCTCTTTGATGTCCAAGAGGAAAGGTATAGAGTTCTCCTGATTACACAGG 4225

 20954511 GCCTCTGCTTGTGGGTCGCCTGCATGAGGCGATCAGAATCTGAGTCACCTGGGATCATGT 20954570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4226 GCCTCTGCTTGTGGGTCGCCTGCATGAGGCGATCAGAATCTGAGTCACCTGGGATCATGT 4285

 20954571 GGGTGCTGGTACATCCTAGAGATAGGATGTGTTGGTCATGGAAGAGAGTGGGCCACAAAT 20954630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4286 GGGTGCTGGTACATCCTAGAGATAGGATGTGTTGGTCATGGAAGAGAGTGGGCCACAAAT 4345

 20954631 GGGTTCCAGGGGAATAGCGTTGCCTGGTGCAAGGAGGGGGATGTGGAGGTGCAGGGAGCA 20954690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4346 GGGTTCCAGGGGAATAGCGTTGCCTGGTGCAAGGAGGGGGATGTGGAGGTGCAGGGAGCA 4405

 20954691 GGGGTGGTGTCTGGAGAGCCTGAAGCTGTGCTGCCAGAGGCTCCAGGCCATGAGGTCTGA 20954750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4406 GGGGTGGTGTCTGGAGAGCCTGAAGCTGTGCTGCCAGAGGCTCCAGGCCATGAGGTCTGA 4465

 20954751 GAAGCATCTAGATTTGGCCTGTTCACAGCAGGGAAGTGTGGTCCAGTGGCAAAAAGTTGA 20954810
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4466 GAAGCATCTGGATTTGGCCTGTTCACAGCAGGGAAGTGTGGTCCAGTGGCAAAAAGTTGA 4525

 20954811 GGGCATCCTAGGAGTTGAGGAGGTGGTGGCGGTTAGAGTAAACCACTCTGGAGGCGTCCG 20954870
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     4526 GGGCATCCTAGGAGTTGAGGAGGTGGTGGCGGTTAGAGTAAACCACTCTGGAGGCATCCG 4585

 20954871 GGGTGGAGAGACGAGAATGTGCAAGAACTCCTGCCTCTAGCCTGGCCTCCTCAGGACCCC 20954930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4586 GGGTGGAGAGACGAGAATGTGCAAGAACTCCTGCCTCTAGCCTGGCCTCCTCAGGACCCC 4645

 20954931 GGCCACCAGCCTCCCTCCTAGAAGTCCCCAGAGCTTCCTCCTCCTTGTGCCCCAGAACTG 20954990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4646 GGCCACCAGCCTCCCTCCTAGAAGTCCCCAGAGCTTCCTCCTCCTTGTGCCCCAGAACTG 4705

 20954991 GTTCCTGGGTTGCTCCAACCCCAGACCTTCCCTGGAAGTCCCCCCCAGTGCCTCCTGGCT 20955050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4706 GTTCCTGGGTTGCTCCAACCCCAGACCTTCCCTGGAAGTCCCCCCCAGTGCCTCCTGGCT 4765

 20955051 GGGAACCCCCAACTGCATTTTGCTTCTGCTCTCGTGCCAGTAGTCCCCTTTTCTCTCCAG 20955110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4766 GGGAACCCCCAACTGCATTTTGCTTCTGCTCTCGTGCCAGTAGTCCCCTTTTCTCTCCAG 4825

 20955111 TGTCCAGGCCCCAACCACCAAGACCCTGCCTCCTCACTTGGCTTTGCTGTTCTTAGTTCT 20955170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4826 TGTCCAGGCCCCAACCACCAAGACCCTGCCTCCTCACTTGGCTTTGCTGTTCTTAGTTCT 4885

 20955171 CTACTCAGTAGGTTGTGTCTGCCTCCATTCCTGGCCAGACGCTGCCCTGGGGCTGAGTGC 20955230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4886 CTACTCAGTAGGTTGTGTCTGCCTCCATTCCTGGCCAGACGCTGCCCTGGGGCTGAGTGC 4945

 20955231 ACAGTCCCCAGCCACTCCCGAGATCCTCAGAGCTTCTGGAAGCCACAGACATGGTGGCAT 20955290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4946 ACAGTCCCCAGCCACTCCCGAGATCCTCAGAGCTTCTGGAAGCCACAGACATGGTGGCAT 5005

 20955291 ATGTTTCAGGTCGTCAGCTTGTTTTTTTTTGGAGACAGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGC 20955350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5006 ATGTTTCAGGTCGTCAGCTTGTTTTTTTTTGGAGACAGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGC 5065

 20955351 TGGAGTGCGGTGACGTGATCATTCACTGCAGCCTTGACCTTCTGAGCCCGGGTGATCCTC 20955410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5066 TGGAGTGCGGTGACGTGATCATTCACTGCAGCCTTGACCTTCTGAGCCCGGGTGATCCTC 5125

 20955411 CCACCTCAGCCTGTCAAGTAGCTGAGACCACATGTGTGAGCCACCACACCTAGCTTTTTG 20955470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5126 CCACCTCAGCCTGTCAAGTAGCTGAGACCACATGTGTGAGCCACCACACCTAGCTTTTTG 5185

 20955471 AATCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCA 20955530
          ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5186 AATC---TTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCA 5242

 20955531 GTGGCACAATCTTGGCTTACTGCAACCTCCAGCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCT 20955590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5243 GTGGCACAATCTTGGCTTACTGCAACCTCCAGCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCT 5302

 20955591 CTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGTAGGTGGCACCACACCTAGCTAATTTTTATGTCTTT 20955650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5303 CTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGTAGGTGGCACCACACCTAGCTAATTTTTATGTCTTT 5362

 20955651 AGTAGAGACAAAGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGATCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGA 20955710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5363 AGTAGAGACAAAGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGATCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGA 5422

 20955711 TCTGCCTGTCTTGACCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGGGCCACGCGCCCAGCCA 20955770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5423 TCTGCCTGTCTTGACCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGGGCCACGCGCCCAGCCA 5482

 20955771 ACTTTTTGAATCTTTTGTAGGGATGGGGTCTTGCTGTGTTGCCCAGGCTGGGCTTAAACT 20955830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5483 ACTTTTTGAATCTTTTGTAGGGATGGGGTCTTGCTGTGTTGCCCAGGCTGGGCTTAAACT 5542

 20955831 CCTGGACTCAAGTGATCCTCCCTGCCTTGGTTTCTCAAACTTCTGGGATTACAGGCCAAT 20955890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5543 CCTGGACTCAAGTGATCCTCCCTGCCTTGGTTTCTCAAACTTCTGGGATTACAGGCCAAT 5602

 20955891 CTACTCAACGTTGATATTGAGTAGAAGGCAAAATTCACATGGCTCCGGCCCAGCCCCTTT 20955950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5603 CTACTCAACGTTGATATTGAGTAGAAGGCAAAATTCACATGGCTCCGGCCCAGCCCCTTT 5662

 20955951 CTGTCTCAGGCACTTCAGTGTTAATATGCGCCTTGGTTTTGCTGCTGCCGAGTCTACTGT 20956010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5663 CTGTCTCAGGCACTTCAGTGTTAATATGCGCCTTGGTTTTGCTGCTGCCGAGTCTACTGT 5722

 20956011 GCCCCTGGGCAAGGAAAGCAAAGGAAACCAGAGGGCCAGGCCCGTGGACACTGGGGTGAG 20956070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5723 GCCCCTGGGCAAGGAAAGCAAAGGAAACCAGAGGGCCAGGCCCGTGGACACTGGGGTGAG 5782

 20956071 GGGCCAACAGGGTGCCCAGCAGTTGTTTCCACAGCCCCCACGTGGTCAGGGACCCTGTAT 20956130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5783 GGGCCAACAGGGTGCCCAGCAGTTGTTTCCACAGCCCCCACGTGGTCAGGGACCCTGTAT 5842

 20956131 GGGTGAACCGCCTGGATACTGAGCCTAGGCGGCGGAAAACTCAAAAGCAAGGGCAGGTTT 20956190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5843 GGGTGAACCGCCTGGATACTGAGCCTAGGCGGCGGAAAACTCAAAAGCAAGGGCAGGTTT 5902

 20956191 ATTCAGATCCCTGGTGGAGTTACAAGCTTGGTTTGGTTTTTGGTCACAGGCCCTAAAATA 20956250
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     5903 ATTCAGATCCCTGGTGGAGTTACAAGCTTGGTTTGGTTTTTGGTCACAGGCCCTAAAATG 5962

 20956251 CCTGTATTCTGAGTTTACATAAAAATACAAAGCACTGGCCGGGCGCGCTGGCTCACACCT 20956310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5963 CCTGTATTCTGAGTTTACATAAAAATACAAAGCACTGGCCGGGCGCGCTGGCTCACACCT 6022

 20956311 GTAAGCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTGGCTAACATGAGGTCAGGAATTTGAAA 20956370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6023 GTAAGCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTGGCTAACATGAGGTCAGGAATTTGAAA 6082

 20956371 CCAGCCTGACTAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCA 20956430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6083 CCAGCCTGACTAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCA 6142

 20956431 TGGTGGCGCATGCCTGTAATCCCAGCTATTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAA 20956490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6143 TGGTGGCGCATGCCTGTAATCCCAGCTATTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAA 6202

 20956491 CCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCATGATCGCACCGCCGCACTGCAGCCTGGGCTAC 20956550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6203 CCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCATGATCGCACCGCCGCACTGCAGCCTGGGCTAC 6262

 20956551 AGAGCAAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCACCACCGAGACGCTGTTCTCC 20956610
          ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6263 AGAGCAAGACTCTGTCTC---AAAAAAAAAAAAAAAATCACCACCGAGACGCTGTTCTCC 6319

 20956611 CTGGTGTGTCATCTGTGGGGTGAATGAAGGTGTGAGATACCCCGTGGTGGTTTCTGTCAG 20956670
          |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
     6320 CTGGTGTGTCATCTGTGGGGTGAATG-AGGTGTGAGATACCCCGTGGTGGTTTCTGTCAG 6378

 20956671 TGAATCTGTAGTTGTCATATATTTTGAATACTTCAATATCATCGAACAGTTGCTGTGTCT 20956730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6379 TGAATCTGTAGTTGTCATATATTTTGAATACTTCAATATCATCGAACAGTTGCTGTGTCT 6438

 20956731 TTAAGCACTAGATTTTATTGAAGCTACCTTCTTCCCTTTTTAGTCCCATTTCCCCTAGAT 20956790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6439 TTAAGCACTAGATTTTATTGAAGCTACCTTCTTCCCTTTTTAGTCCCATTTCCCCTAGAT 6498

 20956791 GCATCCACGACTGCAGGAACCCCCCTGCCCCCACCAGGAGCCCAAAGATAACCATGTTCC 20956850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6499 GCATCCACGACTGCAGGAACCCCCCTGCCCCCACCAGGAGCCCAAAGATAACCATGTTCC 6558

 20956851 CACCTGGAGTGGCCTCCCACCTCCAATGCCATCAGGGCTGGTGCAGCTTCCCCACCTGGT 20956910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6559 CACCTGGAGTGGCCTCCCACCTCCAATGCCATCAGGGCTGGTGCAGCTTCCCCACCTGGT 6618

 20956911 CAGCAACATCATGGCCAAGGAGTAGAGGGCGTAGCCCAGGGTGAACAGCAGTGCACAGGT 20956970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6619 CAGCAACATCATGGCCAAGGAGTAGAGGGCGTAGCCCAGGGTGAACAGCAGTGCACAGGT 6678

 20956971 GAGGGGCCTGATGCAG 20956986
          ||||||||||||||||
     6679 GAGGGGCCTGATGCAG 6694

Alignment time is 5.33978 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [20940623,20963850] =>     23228 nucs '22 dna:chromosome chromosome:GRCh37:22:1:51304566:1'
Second seq [       1,    3140] =>      3140 nucs 'mol-32-33ab-181681_3140'

Score:        3074
Aligned:      3144        nucs
Identic:      3136 (100%) nucs =>      1632 (100%)      1504 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [20953840,20955474] EXCISED REGION [20955478,20956986]
 second seq =>  [       1,    1635] EXCISED REGION [    1636,    3140]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         3 nucs [20955475,20955477]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        15 nucs [20955475,20955489] to [20955478,20955492]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [20955475,20955475] to [20955477,20955477]
 second seq =>         0 nucs

 20953840 CTAATTTTTTATATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGCTCAGGCTGGTCTCAA 20953899
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGCTCAGGCTGGTCTCAA 60

 20953900 ACTCCTGAGCTCAGGCGATCCACCTGCCTCGGCTTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGT 20953959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACTCCTGAGCTCAGGCGATCCACCTGCCTCGGCTTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGT 120

 20953960 GAGCCACTGTGCCTGGCCAAAAGTAGAAATTCTTGATTGGGAAATAATTTTATATATTTC 20954019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GAGCCACTGTGCCTGGCCAAAAGTAGAAATTCTTGATTGGGAAATAATTTTATATATTTC 180

 20954020 GGCCCCTTCTCACTTGGGAAAATTCTGCTAAGAATTCTGGTTTTGAGAGTCAAGGGAAGC 20954079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGCCCCTTCTCACTTGGGAAAATTCTGCTAAGAATTCTGGTTTTGAGAGTCAAGGGAAGC 240

 20954080 TAGCTTAATTTTTAAAGTGAAGGCTACATAAGAGTCCTCTCTCCAGTGTGGTGGCTCACA 20954139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TAGCTTAATTTTTAAAGTGAAGGCTACATAAGAGTCCTCTCTCCAGTGTGGTGGCTCACA 300

 20954140 CCTATAAACCCAGCGCTTCGGGCAAATCACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGC 20954199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCTATAAACCCAGCGCTTCGGGCAAATCACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGC 360

 20954200 AATGTAGTGAGACCCCTATCTCTACAAAAAAATTTAAAAATTAGCAGGGTGTGGTGGTGC 20954259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AATGTAGTGAGACCCCTATCTCTACAAAAAAATTTAAAAATTAGCAGGGTGTGGTGGTGC 420

 20954260 GTGCCTGTAGTCCTGGCTACTTGGGTGGGATGCTGATGTGGGAGGATTGCTTGAGCCCAG 20954319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTGCCTGTAGTCCTGGCTACTTGGGTGGGATGCTGATGTGGGAGGATTGCTTGAGCCCAG 480

 20954320 GATTTGGAGGTTGCAGCGAGCCATGATGGTGCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACATGGCA 20954379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GATTTGGAGGTTGCAGCGAGCCATGATGGTGCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACATGGCA 540

 20954380 AGACCTCGTCTCAAAAAAATACAAAGAGTCCTCTCTATGTTGGAAATGTCAGAGTTATTG 20954439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGACCTCGTCTCAAAAAAATACAAAGAGTCCTCTCTATGTTGGAAATGTCAGAGTTATTG 600

 20954440 GCCATTTAGGGGATCTAACTTGCTCTTTGATGTCCAAGAGGAAAGGTATAGAGTTCTCCT 20954499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GCCATTTAGGGGATCTAACTTGCTCTTTGATGTCCAAGAGGAAAGGTATAGAGTTCTCCT 660

 20954500 GATTACACAGGGCCTCTGCTTGTGGGTCGCCTGCATGAGGCGATCAGAATCTGAGTCACC 20954559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GATTACACAGGGCCTCTGCTTGTGGGTCGCCTGCATGAGGCGATCAGAATCTGAGTCACC 720

 20954560 TGGGATCATGTGGGTGCTGGTACATCCTAGAGATAGGATGTGTTGGTCATGGAAGAGAGT 20954619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGGGATCATGTGGGTGCTGGTACATCCTAGAGATAGGATGTGTTGGTCATGGAAGAGAGT 780

 20954620 GGGCCACAAATGGGTTCCAGGGGAATAGCGTTGCCTGGTGCAAGGAGGGGGATGTGGAGG 20954679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GGGCCACAAATGGGTTCCAGGGGAATAGCGTTGCCTGGTGCAAGGAGGGGGATGTGGAGG 840

 20954680 TGCAGGGAGCAGGGGTGGTGTCTGGAGAGCCTGAAGCTGTGCTGCCAGAGGCTCCAGGCC 20954739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGCAGGGAGCAGGGGTGGTGTCTGGAGAGCCTGAAGCTGTGCTGCCAGAGGCTCCAGGCC 900

 20954740 ATGAGGTCTGAGAAGCATCTAGATTTGGCCTGTTCACAGCAGGGAAGTGTGGTCCAGTGG 20954799
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATGAGGTCTGAGAAGCATCTGGATTTGGCCTGTTCACAGCAGGGAAGTGTGGTCCAGTGG 960

 20954800 CAAAAAGTTGAGGGCATCCTAGGAGTTGAGGAGGTGGTGGCGGTTAGAGTAAACCACTCT 20954859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CAAAAAGTTGAGGGCATCCTAGGAGTTGAGGAGGTGGTGGCGGTTAGAGTAAACCACTCT 1020

 20954860 GGAGGCGTCCGGGGTGGAGAGACGAGAATGTGCAAGAACTCCTGCCTCTAGCCTGGCCTC 20954919
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GGAGGCATCCGGGGTGGAGAGACGAGAATGTGCAAGAACTCCTGCCTCTAGCCTGGCCTC 1080

 20954920 CTCAGGACCCCGGCCACCAGCCTCCCTCCTAGAAGTCCCCAGAGCTTCCTCCTCCTTGTG 20954979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTCAGGACCCCGGCCACCAGCCTCCCTCCTAGAAGTCCCCAGAGCTTCCTCCTCCTTGTG 1140

 20954980 CCCCAGAACTGGTTCCTGGGTTGCTCCAACCCCAGACCTTCCCTGGAAGTCCCCCCCAGT 20955039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CCCCAGAACTGGTTCCTGGGTTGCTCCAACCCCAGACCTTCCCTGGAAGTCCCCCCCAGT 1200

 20955040 GCCTCCTGGCTGGGAACCCCCAACTGCATTTTGCTTCTGCTCTCGTGCCAGTAGTCCCCT 20955099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GCCTCCTGGCTGGGAACCCCCAACTGCATTTTGCTTCTGCTCTCGTGCCAGTAGTCCCCT 1260

 20955100 TTTCTCTCCAGTGTCCAGGCCCCAACCACCAAGACCCTGCCTCCTCACTTGGCTTTGCTG 20955159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTTCTCTCCAGTGTCCAGGCCCCAACCACCAAGACCCTGCCTCCTCACTTGGCTTTGCTG 1320

 20955160 TTCTTAGTTCTCTACTCAGTAGGTTGTGTCTGCCTCCATTCCTGGCCAGACGCTGCCCTG 20955219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTCTTAGTTCTCTACTCAGTAGGTTGTGTCTGCCTCCATTCCTGGCCAGACGCTGCCCTG 1380

 20955220 GGGCTGAGTGCACAGTCCCCAGCCACTCCCGAGATCCTCAGAGCTTCTGGAAGCCACAGA 20955279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GGGCTGAGTGCACAGTCCCCAGCCACTCCCGAGATCCTCAGAGCTTCTGGAAGCCACAGA 1440

 20955280 CATGGTGGCATATGTTTCAGGTCGTCAGCTTGTTTTTTTTTGGAGACAGAGTCTCGCTCT 20955339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CATGGTGGCATATGTTTCAGGTCGTCAGCTTGTTTTTTTTTGGAGACAGAGTCTCGCTCT 1500

 20955340 GTCGCCCAGGCTGGAGTGCGGTGACGTGATCATTCACTGCAGCCTTGACCTTCTGAGCCC 20955399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GTCGCCCAGGCTGGAGTGCGGTGACGTGATCATTCACTGCAGCCTTGACCTTCTGAGCCC 1560

 20955400 GGGTGATCCTCCCACCTCAGCCTGTCAAGTAGCTGAGACCACATGTGTGAGCCACCACAC 20955459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GGGTGATCCTCCCACCTCAGCCTGTCAAGTAGCTGAGACCACATGTGTGAGCCACCACAC 1620

 20955460 CTAGCTTTTTGAATC 20955474
          |||||||||||||||
     1621 CTAGCTTTTTGAATC 1635

EXCISED REGION

 20955478 TTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCAC 20955537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1636 TTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCAC 1695

 20955538 AATCTTGGCTTACTGCAACCTCCAGCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCTCCCGA 20955597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1696 AATCTTGGCTTACTGCAACCTCCAGCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCTCCCGA 1755

 20955598 GTAGCTGGGATTACAGGTAGGTGGCACCACACCTAGCTAATTTTTATGTCTTTAGTAGAG 20955657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1756 GTAGCTGGGATTACAGGTAGGTGGCACCACACCTAGCTAATTTTTATGTCTTTAGTAGAG 1815

 20955658 ACAAAGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGATCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCT 20955717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1816 ACAAAGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGATCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCT 1875

 20955718 GTCTTGACCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGGGCCACGCGCCCAGCCAACTTTTT 20955777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1876 GTCTTGACCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGGGCCACGCGCCCAGCCAACTTTTT 1935

 20955778 GAATCTTTTGTAGGGATGGGGTCTTGCTGTGTTGCCCAGGCTGGGCTTAAACTCCTGGAC 20955837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1936 GAATCTTTTGTAGGGATGGGGTCTTGCTGTGTTGCCCAGGCTGGGCTTAAACTCCTGGAC 1995

 20955838 TCAAGTGATCCTCCCTGCCTTGGTTTCTCAAACTTCTGGGATTACAGGCCAATCTACTCA 20955897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1996 TCAAGTGATCCTCCCTGCCTTGGTTTCTCAAACTTCTGGGATTACAGGCCAATCTACTCA 2055

 20955898 ACGTTGATATTGAGTAGAAGGCAAAATTCACATGGCTCCGGCCCAGCCCCTTTCTGTCTC 20955957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2056 ACGTTGATATTGAGTAGAAGGCAAAATTCACATGGCTCCGGCCCAGCCCCTTTCTGTCTC 2115

 20955958 AGGCACTTCAGTGTTAATATGCGCCTTGGTTTTGCTGCTGCCGAGTCTACTGTGCCCCTG 20956017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2116 AGGCACTTCAGTGTTAATATGCGCCTTGGTTTTGCTGCTGCCGAGTCTACTGTGCCCCTG 2175

 20956018 GGCAAGGAAAGCAAAGGAAACCAGAGGGCCAGGCCCGTGGACACTGGGGTGAGGGGCCAA 20956077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2176 GGCAAGGAAAGCAAAGGAAACCAGAGGGCCAGGCCCGTGGACACTGGGGTGAGGGGCCAA 2235

 20956078 CAGGGTGCCCAGCAGTTGTTTCCACAGCCCCCACGTGGTCAGGGACCCTGTATGGGTGAA 20956137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2236 CAGGGTGCCCAGCAGTTGTTTCCACAGCCCCCACGTGGTCAGGGACCCTGTATGGGTGAA 2295

 20956138 CCGCCTGGATACTGAGCCTAGGCGGCGGAAAACTCAAAAGCAAGGGCAGGTTTATTCAGA 20956197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2296 CCGCCTGGATACTGAGCCTAGGCGGCGGAAAACTCAAAAGCAAGGGCAGGTTTATTCAGA 2355

 20956198 TCCCTGGTGGAGTTACAAGCTTGGTTTGGTTTTTGGTCACAGGCCCTAAAATACCTGTAT 20956257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     2356 TCCCTGGTGGAGTTACAAGCTTGGTTTGGTTTTTGGTCACAGGCCCTAAAATGCCTGTAT 2415

 20956258 TCTGAGTTTACATAAAAATACAAAGCACTGGCCGGGCGCGCTGGCTCACACCTGTAAGCC 20956317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2416 TCTGAGTTTACATAAAAATACAAAGCACTGGCCGGGCGCGCTGGCTCACACCTGTAAGCC 2475

 20956318 CAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTGGCTAACATGAGGTCAGGAATTTGAAACCAGCCT 20956377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2476 CAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTGGCTAACATGAGGTCAGGAATTTGAAACCAGCCT 2535

 20956378 GACTAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGC 20956437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2536 GACTAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGC 2595

 20956438 GCATGCCTGTAATCCCAGCTATTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCTGGGA 20956497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2596 GCATGCCTGTAATCCCAGCTATTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCTGGGA 2655

 20956498 GGCGGAGGTTGCAGTGAGCCATGATCGCACCGCCGCACTGCAGCCTGGGCTACAGAGCAA 20956557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2656 GGCGGAGGTTGCAGTGAGCCATGATCGCACCGCCGCACTGCAGCCTGGGCTACAGAGCAA 2715

 20956558 GACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCACCACCGAGACGCTGTTCTCCCTGGTGT 20956617
          |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2716 GACTCTGTCTC---AAAAAAAAAAAAAAAATCACCACCGAGACGCTGTTCTCCCTGGTGT 2772

 20956618 GTCATCTGTGGGGTGAATGAAGGTGTGAGATACCCCGTGGTGGTTTCTGTCAGTGAATCT 20956677
          ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2773 GTCATCTGTGGGGTGAATG-AGGTGTGAGATACCCCGTGGTGGTTTCTGTCAGTGAATCT 2831

 20956678 GTAGTTGTCATATATTTTGAATACTTCAATATCATCGAACAGTTGCTGTGTCTTTAAGCA 20956737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2832 GTAGTTGTCATATATTTTGAATACTTCAATATCATCGAACAGTTGCTGTGTCTTTAAGCA 2891

 20956738 CTAGATTTTATTGAAGCTACCTTCTTCCCTTTTTAGTCCCATTTCCCCTAGATGCATCCA 20956797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2892 CTAGATTTTATTGAAGCTACCTTCTTCCCTTTTTAGTCCCATTTCCCCTAGATGCATCCA 2951

 20956798 CGACTGCAGGAACCCCCCTGCCCCCACCAGGAGCCCAAAGATAACCATGTTCCCACCTGG 20956857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2952 CGACTGCAGGAACCCCCCTGCCCCCACCAGGAGCCCAAAGATAACCATGTTCCCACCTGG 3011

 20956858 AGTGGCCTCCCACCTCCAATGCCATCAGGGCTGGTGCAGCTTCCCCACCTGGTCAGCAAC 20956917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3012 AGTGGCCTCCCACCTCCAATGCCATCAGGGCTGGTGCAGCTTCCCCACCTGGTCAGCAAC 3071

 20956918 ATCATGGCCAAGGAGTAGAGGGCGTAGCCCAGGGTGAACAGCAGTGCACAGGTGAGGGGC 20956977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3072 ATCATGGCCAAGGAGTAGAGGGCGTAGCCCAGGGTGAACAGCAGTGCACAGGTGAGGGGC 3131

 20956978 CTGATGCAG 20956986
          |||||||||
     3132 CTGATGCAG 3140

Alignment time is 2.47419 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [20940623,20963850] =>     23228 nucs '22 dna:chromosome chromosome:GRCh37:22:1:51304566:1'
Second seq [       1,    4944] =>      4944 nucs 'mol-32-33b6-032499_4944'

Score:        4867
Aligned:      4941        nucs
Identic:      4931 (100%) nucs =>      3002 (100%)      1929 (100%)
Gaps:            7 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [20947616,20950623] EXCISED REGION [20953851,20955783]
 second seq =>  [       1,    3003] EXCISED REGION [    3014,    4944]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3227 nucs [20950624,20953850]
 second seq =>        10 nucs [3004,3013]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [3004,3005] to [3014,3015]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [20950624,20950624] to [20953850,20953850]
 second seq =>         0 nucs

 20947616 GGTCAGGAGTTCAAGACCACCCTGGCCAAGATGGTGAAACCCCATCTACTAAAAATACAA 20947675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGTCAGGAGTTCAAGACCACCCTGGCCAAGATGGTGAAACCCCATCTACTAAAAATACAA 60

 20947676 AAATTAGCGGGCGTGGTGGCAGGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGGTGAGGCAGA 20947735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAATTAGCGGGCGTGGTGGCAGGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGGTGAGGCAGA 120

 20947736 GAATTGCTTGAAGCCAGGAGGTAGAGCTTGCAGTGAGCGGAGATTGCGGCACCGCACTCC 20947795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GAATTGCTTGAAGCCAGGAGGTAGAGCTTGCAGTGAGCGGAGATTGCGGCACCGCACTCC 180

 20947796 AGCCTGGGTGACAAAGTGAGACTCTGTCTCAAAAAACAAAAACAAACAAACAAAAACTTC 20947855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||
      181 AGCCTGGGTGACAAAGTGAGACTCTGTCTCAAAAAACAAAAACAAACAAA----AACTTC 236

 20947856 ACACAGAAAGCCCATTTATCACGTACCCCGTACAGCATGTCCAGCTCCCCACAAAAAATT 20947915
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
      237 ACACAGAAAGCCCATTTATCACGTACCCCGTACAGCATGTCCAGCTCGCCACAAAAAATT 296

 20947916 TCAAGGCATAATAAAAACCAAAAAATGCAGTTTGAAGAGACAGCAAGCATCAGAGCCAGA 20947975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      297 TCAAGGCATAATAAAAACCAAAAAATGCAGTTTGAAGAGACAGCAAGCATCAGAGCCAGA 356

 20947976 CTCAAATATGGCAGAGATGTCGGAATTATCAGACCAAGAAATGGAATACAACTATGATTA 20948035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      357 CTCAAATATGGCAGAGATGTCGGAATTATCAGACCAAGAAATGGAATACAACTATGATTA 416

 20948036 ATATGCTAAGGGCTCTAATGGAAAAGTGGACAACATGAGATTACAGACAGAAAATGGAAA 20948095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      417 ATATGCTAAGGGCTCTAATGGAAAAGTGGACAACATGAGATTACAGACAGAAAATGGAAA 476

 20948096 CAGGGATAGACACTCTGAGAAAGAATCTAAAGAATATGTGAAGGCCGGGCACAGTGGCTT 20948155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      477 CAGGGATAGACACTCTGAGAAAGAATCTAAAGAATATGTGAAGGCCGGGCACAGTGGCTT 536

 20948156 ATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGCGGATCACTTGAAGTCAGGAGTT 20948215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      537 ATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGCGGATCACTTGAAGTCAGGAGTT 596

 20948216 CGAAGACCAGCCCAGTTCGAGACCAGATGGCAAAACCCCATCTCTACTAAAAAATACAAA 20948275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      597 CGAAGACCAGCCCAGTTCGAGACCAGATGGCAAAACCCCATCTCTACTAAAAAATACAAA 656

 20948276 AATTAGCCAGGTGTGGTGGCATGAACCTGTAATTCCAGCTATTCAGGAGGCTGAGGTGGG 20948335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      657 AATTAGCCAGGTGTGGTGGCATGAACCTGTAATTCCAGCTATTCAGGAGGCTGAGGTGGG 716

 20948336 AGGACTGCTTGGACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGTGCCACTGCCCTC 20948395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      717 AGGACTGCTTGGACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGTGCCACTGCCCTC 776

 20948396 AAATCTGGGTGACAGAGTGAGACACCACCAAAAAAAAGAAAAGAAAAGAAAGGAAACAAG 20948455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      777 AAATCTGGGTGACAGAGTGAGACACCACCAAAAAAAAGAAAAGAAAAGAAAGGAAACAAG 836

 20948456 GAGAGGAAAGAAAGGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAAGAAAGAAAGAAAGAGAAAGAGAAAA 20948515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      837 GAGAGGAAAGAAAGGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAAGAAAGAAAGAAAGAGAAAGAGAAAA 896

 20948516 TAAAGAAAAAGAAAGAAAGAAGGAGAATATGTGAGAAGTCAGCCAGGTAGTGACTCATGA 20948575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      897 TAAAGAAAAAGAAAGAAAGAAGGAGAATATGTGAGAAGTCAGCCAGGTAGTGACTCATGA 956

 20948576 CTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCACTTGAGGTCAGCAGTTCAA 20948635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      957 CTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCACTTGAGGTCAGCAGTTCAA 1016

 20948636 GACCAGCCTGGGCAACATGGTGATAACCCATCTCTACTAAAAATAAAAAAATTAGCTGGA 20948695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1017 GACCAGCCTGGGCAACATGGTGATAACCCATCTCTACTAAAAATAAAAAAATTAGCTGGA 1076

 20948696 TGTGGTGTCATGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTG 20948755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1077 TGTGGTGTCATGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTG 1136

 20948756 AACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTAAGCTGAGATTATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCA 20948815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1137 AACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTAAGCTGAGATTATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCA 1196

 20948816 GTAAGACTCCGTCTCAAAAAACAAAAAGAAAATATAAGAAGTCAAAAACACAACAGAATG 20948875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1197 GTAAGACTCCGTCTCAAAAAACAAAAAGAAAATATAAGAAGTCAAAAACACAACAGAATG 1256

 20948876 AAAGATCAGGGCTGGCAGCAGTGGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAG 20948935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1257 AAAGATCAGGGCTGGCAGCAGTGGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAG 1316

 20948936 TTGGGTGGATCACCTGAGGTTAGGAGTTGGAGACCAGCCTGGCCAACATGGAGAAACCCC 20948995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1317 TTGGGTGGATCACCTGAGGTTAGGAGTTGGAGACCAGCCTGGCCAACATGGAGAAACCCC 1376

 20948996 GTCTCTACTCAAAATACAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCGCATGCCTGTAATCCCAACT 20949055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1377 GTCTCTACTCAAAATACAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCGCATGCCTGTAATCCCAACT 1436

 20949056 ACACAGAAGGATGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGATGTAGTGAGCC 20949115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1437 ACACAGAAGGATGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGATGTAGTGAGCC 1496

 20949116 GAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAAGGAGACTCTGTCTCAAAAAAGAA 20949175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1497 GAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAAGGAGACTCTGTCTCAAAAAAGAA 1556

 20949176 AGAAAGAAAGGTCAGGTGCATGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGAGAGGCCAAAG 20949235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1557 AGAAAGAAAGGTCAGGTGCATGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGAGAGGCCAAAG 1616

 20949236 TAGAAGGATCGTTTGAGCCCAGGAGTTGGAGACCAGCCTGGGCAATATAGCCAGACCCTG 20949295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1617 TAGAAGGATCGTTTGAGCCCAGGAGTTGGAGACCAGCCTGGGCAATATAGCCAGACCCTG 1676

 20949296 TCTCTACAAAAAATTAAAAAAATTGCCAGCATGGTGGTGCACATCTGCAGTCCCTGCTAC 20949355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1677 TCTCTACAAAAAATTAAAAAAATTGCCAGCATGGTGGTGCACATCTGCAGTCCCTGCTAC 1736

 20949356 TCAGGAGGCCAAGGCTGCAGTGAGCTGTGATTGTACTACTGCACTCTGGCCTGGGTAACA 20949415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1737 TCAGGAGGCCAAGGCTGCAGTGAGCTGTGATTGTACTACTGCACTCTGGCCTGGGTAACA 1796

 20949416 GAGAGAGACCCTGTCTCAAAAATGGGGTAAAATGGTATAGGAAATTTGGATCTAAAAAAA 20949475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1797 GAGAGAGACCCTGTCTCAAAAATGGGGTAAAATGGTATAGGAAATTTGGATCTAAAAAAA 1856

 20949476 AAAAAAAGGAAGTGCATTAGATAAGAAATAAATGAAGATAAAATAGAATCTTTTTTTTGG 20949535
          |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1857 AAAAAA-GGAAGTGCATTAGATAAGAAATAAATGAAGATAAAATAGAATCTTTTTTTTGG 1915

 20949536 TGGGGGTGGGGAACGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCACGATCT 20949595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1916 TGGGGGTGGGGAACGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCACGATCT 1975

 20949596 TGGCTCACCACAACATCCGCCTACTGGGTTCAGGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAG 20949655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1976 TGGCTCACCACAACATCCGCCTACTGGGTTCAGGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAG 2035

 20949656 TAGCTGGGATTACAGGCATGTGCCACCACGTCCAGCTAATTTTGTATTTTTATTAGAGTC 20949715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2036 TAGCTGGGATTACAGGCATGTGCCACCACGTCCAGCTAATTTTGTATTTTTATTAGAGTC 2095

 20949716 GGGGGTTACTCCACGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTAACCTCAGGCGATCTGCCTG 20949775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2096 GGGGGTTACTCCACGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTAACCTCAGGCGATCTGCCTG 2155

 20949776 CCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGAATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGCCAGAATCTT 20949835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2156 CCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGAATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGCCAGAATCTT 2215

 20949836 GTATTGTTCTTATTTTTAGTTGAACAGATGGCAGGTTATTCAAAATAATTATATCAACAT 20949895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2216 GTATTGTTCTTATTTTTAGTTGAACAGATGGCAGGTTATTCAAAATAATTATATCAACAT 2275

 20949896 GTATTCAGTAATTATAGCTTATGGATAGCTGGAATGAATGGCAGCAATGTTATAAGGGAT 20949955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2276 GTATTCAGTAATTATAGCTTATGGATAGCTGGAATGAATGGCAGCAATGTTATAAGGGAT 2335

 20949956 GGGAAGGAGGATATCCTGAGTGGAAAGAAAGTCACCCAGGCTGGAGTGAAGTGGCACAAT 20950015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2336 GGGAAGGAGGATATCCTGAGTGGAAAGAAAGTCACCCAGGCTGGAGTGAAGTGGCACAAT 2395

 20950016 TATAGCCCACTTGCAGCCTGCAACTCCTGGGCTCAAGCCATCCTTCTGCTTCAGCCTCCC 20950075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2396 TATAGCCCACTTGCAGCCTGCAACTCCTGGGCTCAAGCCATCCTTCTGCTTCAGCCTCCC 2455

 20950076 TGGTAACTGGGATTACAGACACACACCACCATGCCTGGCTAATTTTTAAATTTTTTGTCT 20950135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2456 TGGTAACTGGGATTACAGACACACACCACCATGCCTGGCTAATTTTTAAATTTTTTGTCT 2515

 20950136 CGCTGTGTTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGGCTCAAGAAATCCTCCTGCCTTAGCC 20950195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2516 CGCTGTGTTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGGCTCAAGAAATCCTCCTGCCTTAGCC 2575

 20950196 TCCCAAAGTGTTGAGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCTGGTTTATGGTTGCTTTTGAA 20950255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2576 TCCCAAAGTGTTGAGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCTGGTTTATGGTTGCTTTTGAA 2635

 20950256 TGTCCTAGTCCTACATAAGTGGCTTCCAAGAAGGGAAAAAGAAAAATGCAGGCAGGAAAA 20950315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2636 TGTCCTAGTCCTACATAAGTGGCTTCCAAGAAGGGAAAAAGAAAAATGCAGGCAGGAAAA 2695

 20950316 GGTGCTGATCCATAAAAACCTCTGGAAGGTATGTCTCTAGGGAGGGGGTGAGTGTTGAGG 20950375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2696 GGTGCTGATCCATAAAAACCTCTGGAAGGTATGTCTCTAGGGAGGGGGTGAGTGTTGAGG 2755

 20950376 AGGGATGTTGCAAACATGGTAGTGGAGATGGCAAGAGTGGCTGCCTGCCTCTTCGTCTGC 20950435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2756 AGGGATGTTGCAAACATGGTAGTGGAGATGGCAAGAGTGGCTGCCTGCCTCTTCGTCTGC 2815

 20950436 ACTTCCACAATCTGAAGCAGCCATCATCAATCGGAACACAGATCCCCAGTATTTGGAGGA 20950495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2816 ACTTCCACAATCTGAAGCAGCCATCATCAATCGGAACACAGATCCCCAGTATTTGGAGGA 2875

 20950496 TGGGGCTCTTATTGCCTGCTGTGGCTCCTGCAAGCTATAGGGAAGCTACCCCAGAAGTAT 20950555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2876 TGGGGCTCTTATTGCCTGCTGTGGCTCCTGCAAGCTATAGGGAAGCTACCCCAGAAGTAT 2935

 20950556 AGGCATGGCTGCTTGCACCACCAATTTAAATGCTAATTACTTCTGAAAACACCCTCACAC 20950615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2936 AGGCATGGCTGCTTGCACCACCAATTTAAATGCTAATTACTTCTGAAAACACCCTCACAC 2995

 20950616 ACATGCCC 20950623
          ||||||||
     2996 ACATGCCC 3003

EXCISED REGION

 20953851 TATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGCTCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAGCT 20953910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3014 TATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGCTCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAGCT 3073

 20953911 CAGGCGATCCACCTGCCTCGGCTTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTG 20953970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3074 CAGGCGATCCACCTGCCTCGGCTTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTG 3133

 20953971 CCTGGCCAAAAGTAGAAATTCTTGATTGGGAAATAATTTTATATATTTCGGCCCCTTCTC 20954030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3134 CCTGGCCAAAAGTAGAAATTCTTGATTGGGAAATAATTTTATATATTTCGGCCCCTTCTC 3193

 20954031 ACTTGGGAAAATTCTGCTAAGAATTCTGGTTTTGAGAGTCAAGGGAAGCTAGCTTAATTT 20954090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3194 ACTTGGGAAAATTCTGCTAAGAATTCTGGTTTTGAGAGTCAAGGGAAGCTAGCTTAATTT 3253

 20954091 TTAAAGTGAAGGCTACATAAGAGTCCTCTCTCCAGTGTGGTGGCTCACACCTATAAACCC 20954150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3254 TTAAAGTGAAGGCTACATAAGAGTCCTCTCTCCAGTGTGGTGGCTCACACCTATAAACCC 3313

 20954151 AGCGCTTCGGGCAAATCACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCAATGTAGTGAG 20954210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3314 AGCGCTTCGGGCAAATCACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCAATGTAGTGAG 3373

 20954211 ACCCCTATCTCTACAAAAAAATTTAAAAATTAGCAGGGTGTGGTGGTGCGTGCCTGTAGT 20954270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3374 ACCCCTATCTCTACAAAAAAATTTAAAAATTAGCAGGGTGTGGTGGTGCGTGCCTGTAGT 3433

 20954271 CCTGGCTACTTGGGTGGGATGCTGATGTGGGAGGATTGCTTGAGCCCAGGATTTGGAGGT 20954330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3434 CCTGGCTACTTGGGTGGGATGCTGATGTGGGAGGATTGCTTGAGCCCAGGATTTGGAGGT 3493

 20954331 TGCAGCGAGCCATGATGGTGCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACATGGCAAGACCTCGTCT 20954390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3494 TGCAGCGAGCCATGATGGTGCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACATGGCAAGACCTCGTCT 3553

 20954391 CAAAAAAATACAAAGAGTCCTCTCTATGTTGGAAATGTCAGAGTTATTGGCCATTTAGGG 20954450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3554 CAAAAAAATACAAAGAGTCCTCTCTATGTTGGAAATGTCAGAGTTATTGGCCATTTAGGG 3613

 20954451 GATCTAACTTGCTCTTTGATGTCCAAGAGGAAAGGTATAGAGTTCTCCTGATTACACAGG 20954510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3614 GATCTAACTTGCTCTTTGATGTCCAAGAGGAAAGGTATAGAGTTCTCCTGATTACACAGG 3673

 20954511 GCCTCTGCTTGTGGGTCGCCTGCATGAGGCGATCAGAATCTGAGTCACCTGGGATCATGT 20954570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3674 GCCTCTGCTTGTGGGTCGCCTGCATGAGGCGATCAGAATCTGAGTCACCTGGGATCATGT 3733

 20954571 GGGTGCTGGTACATCCTAGAGATAGGATGTGTTGGTCATGGAAGAGAGTGGGCCACAAAT 20954630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3734 GGGTGCTGGTACATCCTAGAGATAGGATGTGTTGGTCATGGAAGAGAGTGGGCCACAAAT 3793

 20954631 GGGTTCCAGGGGAATAGCGTTGCCTGGTGCAAGGAGGGGGATGTGGAGGTGCAGGGAGCA 20954690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3794 GGGTTCCAGGGGAATAGCGTTGCCTGGTGCAAGGAGGGGGATGTGGAGGTGCAGGGAGCA 3853

 20954691 GGGGTGGTGTCTGGAGAGCCTGAAGCTGTGCTGCCAGAGGCTCCAGGCCATGAGGTCTGA 20954750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3854 GGGGTGGTGTCTGGAGAGCCTGAAGCTGTGCTGCCAGAGGCTCCAGGCCATGAGGTCTGA 3913

 20954751 GAAGCATCTAGATTTGGCCTGTTCACAGCAGGGAAGTGTGGTCCAGTGGCAAAAAGTTGA 20954810
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3914 GAAGCATCTGGATTTGGCCTGTTCACAGCAGGGAAGTGTGGTCCAGTGGCAAAAAGTTGA 3973

 20954811 GGGCATCCTAGGAGTTGAGGAGGTGGTGGCGGTTAGAGTAAACCACTCTGGAGGCGTCCG 20954870
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     3974 GGGCATCCTAGGAGTTGAGGAGGTGGTGGCGGTTAGAGTAAACCACTCTGGAGGCATCCG 4033

 20954871 GGGTGGAGAGACGAGAATGTGCAAGAACTCCTGCCTCTAGCCTGGCCTCCTCAGGACCCC 20954930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4034 GGGTGGAGAGACGAGAATGTGCAAGAACTCCTGCCTCTAGCCTGGCCTCCTCAGGACCCC 4093

 20954931 GGCCACCAGCCTCCCTCCTAGAAGTCCCCAGAGCTTCCTCCTCCTTGTGCCCCAGAACTG 20954990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4094 GGCCACCAGCCTCCCTCCTAGAAGTCCCCAGAGCTTCCTCCTCCTTGTGCCCCAGAACTG 4153

 20954991 GTTCCTGGGTTGCTCCAACCCCAGACCTTCCCTGGAAGTCCCCCCCAGTGCCTCCTGGCT 20955050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4154 GTTCCTGGGTTGCTCCAACCCCAGACCTTCCCTGGAAGTCCCCCCCAGTGCCTCCTGGCT 4213

 20955051 GGGAACCCCCAACTGCATTTTGCTTCTGCTCTCGTGCCAGTAGTCCCCTTTTCTCTCCAG 20955110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4214 GGGAACCCCCAACTGCATTTTGCTTCTGCTCTCGTGCCAGTAGTCCCCTTTTCTCTCCAG 4273

 20955111 TGTCCAGGCCCCAACCACCAAGACCCTGCCTCCTCACTTGGCTTTGCTGTTCTTAGTTCT 20955170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4274 TGTCCAGGCCCCAACCACCAAGACCCTGCCTCCTCACTTGGCTTTGCTGTTCTTAGTTCT 4333

 20955171 CTACTCAGTAGGTTGTGTCTGCCTCCATTCCTGGCCAGACGCTGCCCTGGGGCTGAGTGC 20955230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4334 CTACTCAGTAGGTTGTGTCTGCCTCCATTCCTGGCCAGACGCTGCCCTGGGGCTGAGTGC 4393

 20955231 ACAGTCCCCAGCCACTCCCGAGATCCTCAGAGCTTCTGGAAGCCACAGACATGGTGGCAT 20955290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4394 ACAGTCCCCAGCCACTCCCGAGATCCTCAGAGCTTCTGGAAGCCACAGACATGGTGGCAT 4453

 20955291 ATGTTTCAGGTCGTCAGCTTGTTTTTTTTTGGAGACAGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGC 20955350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4454 ATGTTTCAGGTCGTCAGCTTGTTTTTTTTTGGAGACAGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGC 4513

 20955351 TGGAGTGCGGTGACGTGATCATTCACTGCAGCCTTGACCTTCTGAGCCCGGGTGATCCTC 20955410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4514 TGGAGTGCGGTGACGTGATCATTCACTGCAGCCTTGACCTTCTGAGCCCGGGTGATCCTC 4573

 20955411 CCACCTCAGCCTGTCAAGTAGCTGAGACCACATGTGTGAGCCACCACACCTAGCTTTTTG 20955470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4574 CCACCTCAGCCTGTCAAGTAGCTGAGACCACATGTGTGAGCCACCACACCTAGCTTTTTG 4633

 20955471 AATCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCA 20955530
          ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4634 AATC--TTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCA 4691

 20955531 GTGGCACAATCTTGGCTTACTGCAACCTCCAGCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCT 20955590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4692 GTGGCACAATCTTGGCTTACTGCAACCTCCAGCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCT 4751

 20955591 CTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGTAGGTGGCACCACACCTAGCTAATTTTTATGTCTTT 20955650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4752 CTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGTAGGTGGCACCACACCTAGCTAATTTTTATGTCTTT 4811

 20955651 AGTAGAGACAAAGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGATCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGA 20955710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4812 AGTAGAGACAAAGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGATCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGA 4871

 20955711 TCTGCCTGTCTTGACCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGGGCCACGCGCCCAGCCA 20955770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4872 TCTGCCTGTCTTGACCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGGGCCACGCGCCCAGCCA 4931

 20955771 ACTTTTTGAATCT 20955783
          |||||||||||||
     4932 ACTTTTTGAATCT 4944

Alignment time is 3.88029 s

