
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [56069234,56090514] =>     21281 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    3568] =>      3568 nucs 'mol-32-1f0b-157047_3568'

Score:        3547
Aligned:      3569        nucs
Identic:      3567 (100%) nucs =>       708 (100%)      2859 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [56078526,56079234] EXCISED REGION [56080515,56083374]
 second seq =>  [       1,     709] EXCISED REGION [     710,    3568]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1280 nucs [56079235,56080514]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        29 nucs [56079235,56079263] to [56080515,56080543]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 56078526 AGCTTCCTTCTGACCCTTTGTGGCTTCCTTCAGGATGGTCTGCTTCCTCTTTCTTGTTCT 56078585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGCTTCCTTCTGACCCTTTGTGGCTTCCTTCAGGATGGTCTGCTTCCTCTTTCTTGTTCT 60

 56078586 TCTTCCCTTTCCTGAAGCAGCCGACTTTGCTTCCCCTGATCCACACTTCTCCGAATGTCT 56078645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCTTCCCTTTCCTGAAGCAGCCGACTTTGCTTCCCCTGATCCACACTTCTCCGAATGTCT 120

 56078646 GTGCAGGTTAATCTGTCGGAGAATTGACACAGAACACACAAGGCGAGTGAGATGGGGCAG 56078705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
      121 GTGCAGGTTAATCTGTCGGAGAATTGACACAGAACACACAAGGCAAGTGAGATGGGGCAG 180

 56078706 GGACCCCTCTCAGGGGCCTGTGGGGACCCCACGCATGGAAAGAAAGAAAAATCCTGAGTT 56078765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGACCCCTCTCAGGGGCCTGTGGGGACCCCACGCATGGAAAGAAAGAAAAATCCTGAGTT 240

 56078766 CTTTCGAGGGCAATTCCACACACCTCGCTAGCCCTAAGAAGTAAATAAGCAACTTGATAA 56078825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTTTCGAGGGCAATTCCACACACCTCGCTAGCCCTAAGAAGTAAATAAGCAACTTGATAA 300

 56078826 GCAAGAAGGTAATAGGAGGCCAGGCACTGTGACTCACGTATGTAATCCCAGTACTTTAGG 56078885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GCAAGAAGGTAATAGGAGGCCAGGCACTGTGACTCACGTATGTAATCCCAGTACTTTAGG 360

 56078886 AGGCCCAGGAGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCGCTTTAGCCCCGGAGGTCGAGGCTGCAG 56078945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGGCCCAGGAGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCGCTTTAGCCCCGGAGGTCGAGGCTGCAG 420

 56078946 TGAGCTGACTGTACCACTGCACTCCAGCCTGAGTGACAGAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAA 56079005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGAGCTGACTGTACCACTGCACTCCAGCCTGAGTGACAGAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAA 480

 56079006 AAGAAAAGGTGATAGAAACCTAAAACAATAGCCAAGGAAGCTACACTCAGGATGTTTGGG 56079065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAGAAAAGGTGATAGAAACCTAAAACAATAGCCAAGGAAGCTACACTCAGGATGTTTGGG 540

 56079066 GCACTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCCATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCT 56079125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GCACTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCCATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCT 600

 56079126 GGGTTCACGTCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCACCCGTCA 56079185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GGGTTCACGTCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCACCCGTCA 660

 56079186 CCACGCCCGGCTGATTTTTTATATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCG 56079234
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCACGCCCGGCTGATTTTTTATATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCG 709

EXCISED REGION

 56080515 TGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAA 56080574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      710 TGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAA 769

 56080575 ATGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCGGCCTTAAAATTTATTTTTCTAGAATG 56080634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      770 ATGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCGGCCTTAAAATTTATTTTTCTAGAATG 829

 56080635 TTTCTACTCTCTAAAGTGAAGACTGATGTTGAACCAAAAATTCAATACATCAGTCAATTT 56080694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      830 TTTCTACTCTCTAAAGTGAAGACTGATGTTGAACCAAAAATTCAATACATCAGTCAATTT 889

 56080695 CATAACCATCAACTACATACCATAAAGATTTTACTTTTCTGTTAGCTACTCTCTTGAAGC 56080754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      890 CATAACCATCAACTACATACCATAAAGATTTTACTTTTCTGTTAGCTACTCTCTTGAAGC 949

 56080755 TACTGAGCAGAGGTCATGGGTGGCAGTTATGAAACTGTATACAACATTCAGGAATAAAAG 56080814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      950 TACTGAGCAGAGGTCATGGGTGGCAGTTATGAAACTGTATACAACATTCAGGAATAAAAG 1009

 56080815 CCAAAGACTTCCCCTAGTCAAGCCTACTCGTGACATAGTCTCATCTAACAAACACTCAGG 56080874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1010 CCAAAGACTTCCCCTAGTCAAGCCTACTCGTGACATAGTCTCATCTAACAAACACTCAGG 1069

 56080875 ATAATCTTAAGTCAGAAAATTTTCACTTTTTGAAAAGGTCCTAGGCAAAAGTAAAAAAAC 56080934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1070 ATAATCTTAAGTCAGAAAATTTTCACTTTTTGAAAAGGTCCTAGGCAAAAGTAAAAAAAC 1129

 56080935 TGGCAACAGGTGTTGAAATTTGCAAATTATGCGAAACATCCCGCCTGATTCCCATTTTGA 56080994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1130 TGGCAACAGGTGTTGAAATTTGCAAATTATGCGAAACATCCCGCCTGATTCCCATTTTGA 1189

 56080995 CTTTCCCACTGTGCTTAACAGGACTGTCTGCGTTTATGATGGAAGAAGGAAGAATTTACA 56081054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1190 CTTTCCCACTGTGCTTAACAGGACTGTCTGCGTTTATGATGGAAGAAGGAAGAATTTACA 1249

 56081055 CATAATGGGGGTGATGGAACAGGTTGTTTAAACTTCTTCCATTTTATGCTTAGACACTGG 56081114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1250 CATAATGGGGGTGATGGAACAGGTTGTTTAAACTTCTTCCATTTTATGCTTAGACACTGG 1309

 56081115 GGTTGGCAAACGACAACCAGTGGGTCAAATCTGGCTGCCAACTGTTTGTGAAAGCAAGTT 56081174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1310 GGTTGGCAAACGACAACCAGTGGGTCAAATCTGGCTGCCAACTGTTTGTGAAAGCAAGTT 1369

 56081175 TTACTGGAACACAGCCATGTCTATTCATTTACACACTGCATCCACAGCTGCTTCCATGAC 56081234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1370 TTACTGGAACACAGCCATGTCTATTCATTTACACACTGCATCCACAGCTGCTTCCATGAC 1429

 56081235 ACAAGGGCAGACTCAAGAAGTCGTGGCAGAAACTGATTTGCGTTGCCCTGGTGATTAATG 56081294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1430 ACAAGGGCAGACTCAAGAAGTCGTGGCAGAAACTGATTTGCGTTGCCCTGGTGATTAATG 1489

 56081295 ACGCTACGCTTACTGGCCACCTGTATGTCTTCTTTGGAGAAAGGTCTATTTAGATACTTT 56081354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1490 ACGCTACGCTTACTGGCCACCTGTATGTCTTCTTTGGAGAAAGGTCTATTTAGATACTTT 1549

 56081355 AACTGTTTTGTTTTGTTTTTTTCCTGAGACAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGACTGT 56081414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1550 AACTGTTTTGTTTTGTTTTTTTCCTGAGACAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGACTGT 1609

 56081415 AGTGGCACAGTCTCAGCTCACTGCAACCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCC 56081474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1610 AGTGGCACAGTCTCAGCTCACTGCAACCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCC 1669

 56081475 TCAGCCTCCTGAGCAGCTAGGATTACAGGCATGTGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTGTA 56081534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1670 TCAGCCTCCTGAGCAGCTAGGATTACAGGCATGTGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTGTA 1729

 56081535 TTTGTAGTAGAGATGGGGTTTCATCATTTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTGCTGACCTTG 56081594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1730 TTTGTAGTAGAGATGGGGTTTCATCATTTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTGCTGACCTTG 1789

 56081595 TGATCCACCTGCCTCTGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAACCACCGCGCCTG 56081654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1790 TGATCCACCTGCCTCTGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAACCACCGCGCCTG 1849

 56081655 GCCTAGATACTTTACCTGTTTTTCATTGGGTATCTGTCTATTTACTGAGTTATAAGAGTT 56081714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1850 GCCTAGATACTTTACCTGTTTTTCATTGGGTATCTGTCTATTTACTGAGTTATAAGAGTT 1909

 56081715 CTTTTTATATTTTAGACACAAGTCCAAATATGCTTTCTTGAATCGGAATTTCAAAAATTT 56081774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1910 CTTTTTATATTTTAGACACAAGTCCAAATATGCTTTCTTGAATCGGAATTTCAAAAATTT 1969

 56081775 TATGTTCTGAGGGACTGCATGAGGCAGACTTGTTCTTTTCTCTACATTTTTATTTCTTGC 56081834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1970 TATGTTCTGAGGGACTGCATGAGGCAGACTTGTTCTTTTCTCTACATTTTTATTTCTTGC 2029

 56081835 ACCAAAGAGCAGTTTTTTTCTCTTTAGAATTCTACTCGTTAATTTTAACTCTTCACAATT 56081894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2030 ACCAAAGAGCAGTTTTTTTCTCTTTAGAATTCTACTCGTTAATTTTAACTCTTCACAATT 2089

 56081895 TTTGCATGAGCAATGGTGTTTTGGGAGCACTGCCACAGCTTTTATTTGAAATTTTAAACT 56081954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2090 TTTGCATGAGCAATGGTGTTTTGGGAGCACTGCCACAGCTTTTATTTGAAATTTTAAACT 2149

 56081955 AATAGGGTTGACATTCCAGAACTATCCCACTGTGCTACTCAGAAAAACACAACTACACTA 56082014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2150 AATAGGGTTGACATTCCAGAACTATCCCACTGTGCTACTCAGAAAAACACAACTACACTA 2209

 56082015 CTGTTTTAAGAAGAAATATTTTTAAAAAAATAGTCAACTTCAGGAAATTCAACTTTTATA 56082074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2210 CTGTTTTAAGAAGAAATATTTTTAAAAAAATAGTCAACTTCAGGAAATTCAACTTTTATA 2269

 56082075 AAACTTTTATAAAGTTAGGCTGAAGCCTACATGGTCCAAGGATCTAGCTAGCCATGTGCA 56082134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2270 AAACTTTTATAAAGTTAGGCTGAAGCCTACATGGTCCAAGGATCTAGCTAGCCATGTGCA 2329

 56082135 GTGGTTTTTAAATGTCCTGAAATTCTTTGATGCTGTTCCTTTCAAAAGAAACTTCATTCC 56082194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2330 GTGGTTTTTAAATGTCCTGAAATTCTTTGATGCTGTTCCTTTCAAAAGAAACTTCATTCC 2389

 56082195 CCACTCGAGTGTGGGTGGGACTTCATGGTTCATTTCTTGTGACTAGAATGTGCCACTTTT 56082254
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
     2390 CCACTCGAGTGTGGGTGGGACTTCATGGTTCATTTCTTGTGACTAGAATGTGCCAC-TTT 2448

 56082255 TTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGGCCAGTGGCACAATC 56082314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2449 TTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGGCCAGTGGCACAATC 2508

 56082315 TCAGCTCACTGCAACCTCTGTCTCCTGGGTTCAAGTGATCCTCCCGTCCCAACCACCCAA 56082374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2509 TCAGCTCACTGCAACCTCTGTCTCCTGGGTTCAAGTGATCCTCCCGTCCCAACCACCCAA 2568

 56082375 GTAGCTGGGATTACAAGCGTGCACTACCACGCCTAGCTATTTTCTTTTTTTTTTTTTAAA 56082434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2569 GTAGCTGGGATTACAAGCGTGCACTACCACGCCTAGCTATTTTCTTTTTTTTTTTTTAAA 2628

 56082435 GTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAGCTCCTGGCCTCAAGTTAT 56082494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2629 GTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAGCTCCTGGCCTCAAGTTAT 2688

 56082495 CCACCTGCCTTGGCCTCCCGAAGTACTGGGATTACAGGTGTGAGCCCCCACAGCTGGCTG 56082554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2689 CCACCTGCCTTGGCCTCCCGAAGTACTGGGATTACAGGTGTGAGCCCCCACAGCTGGCTG 2748

 56082555 TTGTGCCGCTTTTAGGACTAGACTGCAAAAGGCACCATGGCTTCCTACTTGCACTCTCTC 56082614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2749 TTGTGCCGCTTTTAGGACTAGACTGCAAAAGGCACCATGGCTTCCTACTTGCACTCTCTC 2808

 56082615 ACTTGCTCTGAGTCAGGAGGACACTCAAGCAGCCCTGCAGAGAGGTCCCTGTAGCAAGGA 56082674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2809 ACTTGCTCTGAGTCAGGAGGACACTCAAGCAGCCCTGCAGAGAGGTCCCTGTAGCAAGGA 2868

 56082675 ACTGAGGCCGGTGCCAGCAGTTGTGTGGCGGAGCTGTCCTGGAAGTGGATCCTCTGGCCC 56082734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2869 ACTGAGGCCGGTGCCAGCAGTTGTGTGGCGGAGCTGTCCTGGAAGTGGATCCTCTGGCCC 2928

 56082735 CAGTCCAGCCTTCGGATGATGCAGCCCTGGCGGACATCCTGACTGCAGCCTCAGGAGTGG 56082794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2929 CAGTCCAGCCTTCGGATGATGCAGCCCTGGCGGACATCCTGACTGCAGCCTCAGGAGTGG 2988

 56082795 CCCTGAGCCAGGACCACCCAGTTCAGCCACTTCCGAGTTCCCAACCCAGAGAATCTGTCA 56082854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2989 CCCTGAGCCAGGACCACCCAGTTCAGCCACTTCCGAGTTCCCAACCCAGAGAATCTGTCA 3048

 56082855 GGTGATAAATGTTTGTGGTTTTAAGCCACTCCATTTTGAGGTAATCTGTCATACAGAAAT 56082914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3049 GGTGATAAATGTTTGTGGTTTTAAGCCACTCCATTTTGAGGTAATCTGTCATACAGAAAT 3108

 56082915 AGATAACTAATACAACACCTAAAAGAATAAAACCATAAATGTATTGCTTAGTCCAGTACC 56082974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3109 AGATAACTAATACAACACCTAAAAGAATAAAACCATAAATGTATTGCTTAGTCCAGTACC 3168

 56082975 AACAGCACTATTCTTTTTTTTTTAATTAAAAAAGTTATTTTAGAGACAGGGTCTCACTCT 56083034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3169 AACAGCACTATTCTTTTTTTTTTAATTAAAAAAGTTATTTTAGAGACAGGGTCTCACTCT 3228

 56083035 GTCTTTGAGGCCAGAGTGCAGTGGTGCGATCGTGACTCACTGTAGCCTCCAACTCCTGGG 56083094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3229 GTCTTTGAGGCCAGAGTGCAGTGGTGCGATCGTGACTCACTGTAGCCTCCAACTCCTGGG 3288

 56083095 CTCAAGTGGTCCTCCTGTCTCAGCCTCCTGAGCAGCTAGGCCTACAGGGGTGCACCACCA 56083154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3289 CTCAAGTGGTCCTCCTGTCTCAGCCTCCTGAGCAGCTAGGCCTACAGGGGTGCACCACCA 3348

 56083155 CAACCAGCTAATTTTTTTGGAGGGATGGGGGTCTCCCTGTGTTGCCCAGGCTGATCTCAA 56083214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3349 CAACCAGCTAATTTTTTTGGAGGGATGGGGGTCTCCCTGTGTTGCCCAGGCTGATCTCAA 3408

 56083215 ACTCCTGGCCTCAAGTAATCCTCCCACCTTGGCCTCTCAAGTAGCTGGGATTATAGACAC 56083274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3409 ACTCCTGGCCTCAAGTAATCCTCCCACCTTGGCCTCTCAAGTAGCTGGGATTATAGACAC 3468

 56083275 CAATAACATTATTCTAGGGACATCTGAAAAAATGTGTGAAAACTGCATTCTCTCTGTCAA 56083334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3469 CAATAACATTATTCTAGGGACATCTGAAAAAATGTGTGAAAACTGCATTCTCTCTGTCAA 3528

 56083335 GTAGCCTAAATCTAGTTCACTGTTTGAAAATATTACACTA 56083374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3529 GTAGCCTAAATCTAGTTCACTGTTTGAAAATATTACACTA 3568

Alignment time is 2.97597 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [56069234,56090514] =>     21281 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    2467] =>      2467 nucs 'mol-32-20fa-042444_2467'

Score:        2455
Aligned:      2466        nucs
Identic:      2465 (100%) nucs =>      1469 (100%)       996 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [56078012,56079480] EXCISED REGION [56079482,56080478]
 second seq =>  [       1,    1469] EXCISED REGION [    1471,    2467]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [56079481,56079481]
 second seq =>         1 nucs [1470,1470]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [1470,1470] to [1471,1471]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 56078012 ACTGGAGGATGTGGCCACAAACTGAGGAATGGTGGAGCCACCAGAGTTGCAAGAGGCTAG 56078071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACTGGAGGATGTGGCCACAAACTGAGGAATGGTGGAGCCACCAGAGTTGCAAGAGGCTAG 60

 56078072 GAGGGACCCTCCCCTAGGTCCCCCGAGGGAGGGCGGCCCTGCCCACACCTGGATTGAGGA 56078131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAGGGACCCTCCCCTAGGTCCCCCGAGGGAGGGCGGCCCTGCCCACACCTGGATTGAGGA 120

 56078132 TTTCTGGCCTCTAGAGCTATTTGAAAATCAATTTCTGTTGTCCCAAGCCACTCAGCTTGT 56078191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTCTGGCCTCTAGAGCTATTTGAAAATCAATTTCTGTTGTCCCAAGCCACTCAGCTTGT 180

 56078192 GGTCATCTATTGCAACAGCCCAGGACAGTCCCTGTAGCTGCAGGCGACAGTCCAATGCGA 56078251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGTCATCTATTGCAACAGCCCAGGACAGTCCCTGTAGCTGCAGGCGACAGTCCAATGCGA 240

 56078252 TGGAAGAGGGCTCCTCGGGGTGGGGGCCACACATGGACCTGCGTGGGGCTCTCACACTGA 56078311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGGAAGAGGGCTCCTCGGGGTGGGGGCCACACATGGACCTGCGTGGGGCTCTCACACTGA 300

 56078312 CTTTCTCACGCTATGCTCACTGCCATTCTGAGAGATCTGGCACAAGCCACCTTGCAGGAC 56078371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTTTCTCACGCTATGCTCACTGCCATTCTGAGAGATCTGGCACAAGCCACCTTGCAGGAC 360

 56078372 CGACTGGTGGACAAATAGGGGCTCTGGACACATCCCCTGGACAGTAACACTCGGCACCCA 56078431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CGACTGGTGGACAAATAGGGGCTCTGGACACATCCCCTGGACAGTAACACTCGGCACCCA 420

 56078432 GGATAGTCACAACCAGAAAATCACTGAGGCGGTAAAAACAAATCTGCGTAAAATCAGTAC 56078491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGATAGTCACAACCAGAAAATCACTGAGGCGGTAAAAACAAATCTGCGTAAAATCAGTAC 480

 56078492 CGTCTCCGTTCGCGGCTTCCTTCCATCCCTTCGCAGCTTCCTTCTGACCCTTTGTGGCTT 56078551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CGTCTCCGTTCGCGGCTTCCTTCCATCCCTTCGCAGCTTCCTTCTGACCCTTTGTGGCTT 540

 56078552 CCTTCAGGATGGTCTGCTTCCTCTTTCTTGTTCTTCTTCCCTTTCCTGAAGCAGCCGACT 56078611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CCTTCAGGATGGTCTGCTTCCTCTTTCTTGTTCTTCTTCCCTTTCCTGAAGCAGCCGACT 600

 56078612 TTGCTTCCCCTGATCCACACTTCTCCGAATGTCTGTGCAGGTTAATCTGTCGGAGAATTG 56078671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTGCTTCCCCTGATCCACACTTCTCCGAATGTCTGTGCAGGTTAATCTGTCGGAGAATTG 660

 56078672 ACACAGAACACACAAGGCGAGTGAGATGGGGCAGGGACCCCTCTCAGGGGCCTGTGGGGA 56078731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ACACAGAACACACAAGGCGAGTGAGATGGGGCAGGGACCCCTCTCAGGGGCCTGTGGGGA 720

 56078732 CCCCACGCATGGAAAGAAAGAAAAATCCTGAGTTCTTTCGAGGGCAATTCCACACACCTC 56078791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CCCCACGCATGGAAAGAAAGAAAAATCCTGAGTTCTTTCGAGGGCAATTCCACACACCTC 780

 56078792 GCTAGCCCTAAGAAGTAAATAAGCAACTTGATAAGCAAGAAGGTAATAGGAGGCCAGGCA 56078851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GCTAGCCCTAAGAAGTAAATAAGCAACTTGATAAGCAAGAAGGTAATAGGAGGCCAGGCA 840

 56078852 CTGTGACTCACGTATGTAATCCCAGTACTTTAGGAGGCCCAGGAGGGAGGCTGAGGTGGG 56078911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTGTGACTCACGTATGTAATCCCAGTACTTTAGGAGGCCCAGGAGGGAGGCTGAGGTGGG 900

 56078912 AGGATCGCTTTAGCCCCGGAGGTCGAGGCTGCAGTGAGCTGACTGTACCACTGCACTCCA 56078971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGGATCGCTTTAGCCCCGGAGGTCGAGGCTGCAGTGAGCTGACTGTACCACTGCACTCCA 960

 56078972 GCCTGAGTGACAGAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAAGAAAAGGTGATAGAAACCTAAAAC 56079031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GCCTGAGTGACAGAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAAGAAAAGGTGATAGAAACCTAAAAC 1020

 56079032 AATAGCCAAGGAAGCTACACTCAGGATGTTTGGGGCACTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTG 56079091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AATAGCCAAGGAAGCTACACTCAGGATGTTTGGGGCACTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTG 1080

 56079092 GCGCCATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCTGGGTTCACGTCATTCTCCTGCCTCAG 56079151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GCGCCATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCTGGGTTCACGTCATTCTCCTGCCTCAG 1140

 56079152 CCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCACCCGTCACCACGCCCGGCTGATTTTTTATATTT 56079211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCACCCGTCACCACGCCCGGCTGATTTTTTATATTT 1200

 56079212 TTAGTAGAGACGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGATATTGTGA 56079271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTAGTAGAGACGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGATATTGTGA 1260

 56079272 TCTGCCCACCTTGGCCTCCCAGAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCACCCGCCC 56079331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TCTGCCCACCTTGGCCTCCCAGAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCACCCGCCC 1320

 56079332 CCCGTCTCCTTTTTTTTTTTTGAGATGGGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCA 56079391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CCCGTCTCCTTTTTTTTTTTTGAGATGGGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCA 1380

 56079392 GTGGCATGGTGTCAGCTCACTGCAACCTCTACTTCCCAGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCT 56079451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GTGGCATGGTGTCAGCTCACTGCAACCTCTACTTCCCAGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCT 1440

 56079452 TAGCCTCCCAAGTAGGTGGGACTACAGGC 56079480
          |||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TAGCCTCCCAAGTAGGTGGGACTACAGGC 1469

EXCISED REGION

 56079482 AGTGCCACCACACCCAGCTAATTTTTGTTATTTTTAGTAGAGACAGTGTTCCACCATGCT 56079541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1471 AGTGCCACCACACCCAGCTAATTTTTGTTATTTTTAGTAGAGACAGTGTTCCACCATGCT 1530

 56079542 GGCCAGGCTGGACTCAAAACTCCTGACCTCAAGTGATCCACCTGCCTTGGCCTCCCAAAG 56079601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1531 GGCCAGGCTGGACTCAAAACTCCTGACCTCAAGTGATCCACCTGCCTTGGCCTCCCAAAG 1590

 56079602 TGCTGAGATTACAGGCGTGAGCCACCGCACTGGCCAAGATAACATCCTAACATCCGTCCC 56079661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1591 TGCTGAGATTACAGGCGTGAGCCACCGCACTGGCCAAGATAACATCCTAACATCCGTCCC 1650

 56079662 TGAGTTGTTTTTTAGAAACCTGGCTCTTTACCAAACAGGTCCACCGGCAGGGAGACCTAA 56079721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1651 TGAGTTGTTTTTTAGAAACCTGGCTCTTTACCAAACAGGTCCACCGGCAGGGAGACCTAA 1710

 56079722 GATAAGGAGGACCTGGGGGCTGAAATCTGACCACTGCTAAATTTGTTCTAATTTTGTTCT 56079781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1711 GATAAGGAGGACCTGGGGGCTGAAATCTGACCACTGCTAAATTTGTTCTAATTTTGTTCT 1770

 56079782 TAATTTCCTCCTGAGAGGCCTAGAGGAGGTCATGCCTCGTGAACCAGAGCTAATACTCTT 56079841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1771 TAATTTCCTCCTGAGAGGCCTAGAGGAGGTCATGCCTCGTGAACCAGAGCTAATACTCTT 1830

 56079842 TTCTCAAAATTTTAAACAAAACTTCTCTTCCTTAACCAATTGCAAACCAGTCTCTGAATC 56079901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1831 TTCTCAAAATTTTAAACAAAACTTCTCTTCCTTAACCAATTGCAAACCAGTCTCTGAATC 1890

 56079902 TACCTACAACCTGTAAGCCCTTGCTGCAAGATATCCTGCCCTTTTAGGGCAAGGTATCCT 56079961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1891 TACCTACAACCTGTAAGCCCTTGCTGCAAGATATCCTGCCCTTTTAGGGCAAGGTATCCT 1950

 56079962 CCATGCGCTGATTTATAATTTTGTCTGTAGCTTCTGCTTCCTTGGCACCCTGCAAATAAA 56080021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1951 CCATGCGCTGATTTATAATTTTGTCTGTAGCTTCTGCTTCCTTGGCACCCTGCAAATAAA 2010

 56080022 CTCCTGCTGCAAACTGTGGTGTGGATATCTGGTCTTACTGCACCAGGCAAGCAGACCCCA 56080081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2011 CTCCTGCTGCAAACTGTGGTGTGGATATCTGGTCTTACTGCACCAGGCAAGCAGACCCCA 2070

 56080082 GTTTGGTTCTATAACAAGAGTCGGCTTCCCCAAAGGCACTGAAAAATGCACAGTTAAAGA 56080141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2071 GTTTGGTTCTATAACAAGAGTCGGCTTCCCCAAAGGCACTGAAAAATGCACAGTTAAAGA 2130

 56080142 GATGGCCTTTGGGAAAACTGTGGGTAGCATGCACCTTTGATAATCTTGTGCAAAAATGAT 56080201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2131 GATGGCCTTTGGGAAAACTGTGGGTAGCATGCACCTTTGATAATCTTGTGCAAAAATGAT 2190

 56080202 GACTTTTTAAAGGTGACCCTTTCTGTTGTGCTTAGCTCTAGCCAAAAGCTAGCTTGCTTT 56080261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2191 GACTTTTTAAAGGTGACCCTTTCTGTTGTGCTTAGCTCTAGCCAAAAGCTAGCTTGCTTT 2250

 56080262 AAGTATTTTTTTTTAATAATAGAAATCAATGAGAAGACAAAATTTATTTATTTATTTATT 56080321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2251 AAGTATTTTTTTTTAATAATAGAAATCAATGAGAAGACAAAATTTATTTATTTATTTATT 2310

 56080322 TATTTTTTGAGACGGAGTCTTGCTCTTTCGTCTAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCT 56080381
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     2311 TATTTTTTGAGACGGAGTCTTGCTCTTTCGTCTAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCT 2370

 56080382 GCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCATGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTA 56080441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2371 GCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCATGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTA 2430

 56080442 GCTGGGACTACAGGCATGTGCCACCACGCCCGGCTAA 56080478
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2431 GCTGGGACTACAGGCATGTGCCACCACGCCCGGCTAA 2467

Alignment time is 1.86082 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [56069234,56090514] =>     21281 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    2458] =>      2458 nucs 'mol-32-22a7-055235_2458'

Score:        2424
Aligned:      2457        nucs
Identic:      2454 (100%) nucs =>      1285 (100%)      1169 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [56078196,56079480] EXCISED REGION [56079482,56080653]
 second seq =>  [       1,    1285] EXCISED REGION [    1287,    2458]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [56079481,56079481]
 second seq =>         1 nucs [1286,1286]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [1286,1286] to [1287,1287]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 56078196 ATCTATTGCAACAGCCCAGGACAGTCCCTGTAGCTGCAGGCGACAGTCCAATGCGATGGA 56078255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATCTATTGCAACAGCCCAGGACAGTCCCTGTAGCTGCAGGCGACAGTCCAATGCGATGGA 60

 56078256 AGAGGGCTCCTCGGGGTGGGGGCCACACATGGACCTGCGTGGGGCTCTCACACTGACTTT 56078315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGAGGGCTCCTCGGGGTGGGGGCCACACATGGACCTGCGTGGGGCTCTCACACTGACTTT 120

 56078316 CTCACGCTATGCTCACTGCCATTCTGAGAGATCTGGCACAAGCCACCTTGCAGGACCGAC 56078375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTCACGCTATGCTCACTGCCATTCTGAGAGATCTGGCACAAGCCACCTTGCAGGACCGAC 180

 56078376 TGGTGGACAAATAGGGGCTCTGGACACATCCCCTGGACAGTAACACTCGGCACCCAGGAT 56078435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGGTGGACAAATAGGGGCTCTGGACACATCCCCTGGACAGTAACACTCGGCACCCAGGAT 240

 56078436 AGTCACAACCAGAAAATCACTGAGGCGGTAAAAACAAATCTGCGTAAAATCAGTACCGTC 56078495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGTCACAACCAGAAAATCACTGAGGCGGTAAAAACAAATCTGCGTAAAATCAGTACCGTC 300

 56078496 TCCGTTCGCGGCTTCCTTCCATCCCTTCGCAGCTTCCTTCTGACCCTTTGTGGCTTCCTT 56078555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCCGTTCGCGGCTTCCTTCCATCCCTTCGCAGCTTCCTTCTGACCCTTTGTGGCTTCCTT 360

 56078556 CAGGATGGTCTGCTTCCTCTTTCTTGTTCTTCTTCCCTTTCCTGAAGCAGCCGACTTTGC 56078615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CAGGATGGTCTGCTTCCTCTTTCTTGTTCTTCTTCCCTTTCCTGAAGCAGCCGACTTTGC 420

 56078616 TTCCCCTGATCCACACTTCTCCGAATGTCTGTGCAGGTTAATCTGTCGGAGAATTGACAC 56078675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTCCCCTGATCCACACTTCTCCGAATGTCTGTGCAGGTTAATCTGTCGGAGAATTGACAC 480

 56078676 AGAACACACAAGGCGAGTGAGATGGGGCAGGGACCCCTCTCAGGGGCCTGTGGGGACCCC 56078735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGAACACACAAGGCGAGTGAGATGGGGCAGGGACCCCTCTCAGGGGCCTGTGGGGACCCC 540

 56078736 ACGCATGGAAAGAAAGAAAAATCCTGAGTTCTTTCGAGGGCAATTCCACACACCTCGCTA 56078795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACGCATGGAAAGAAAGAAAAATCCTGAGTTCTTTCGAGGGCAATTCCACACACCTCGCTA 600

 56078796 GCCCTAAGAAGTAAATAAGCAACTTGATAAGCAAGAAGGTAATAGGAGGCCAGGCACTGT 56078855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GCCCTAAGAAGTAAATAAGCAACTTGATAAGCAAGAAGGTAATAGGAGGCCAGGCACTGT 660

 56078856 GACTCACGTATGTAATCCCAGTACTTTAGGAGGCCCAGGAGGGAGGCTGAGGTGGGAGGA 56078915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GACTCACGTATGTAATCCCAGTACTTTAGGAGGCCCAGGAGGGAGGCTGAGGTGGGAGGA 720

 56078916 TCGCTTTAGCCCCGGAGGTCGAGGCTGCAGTGAGCTGACTGTACCACTGCACTCCAGCCT 56078975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCGCTTTAGCCCCGGAGGTCGAGGCTGCAGTGAGCTGACTGTACCACTGCACTCCAGCCT 780

 56078976 GAGTGACAGAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAAGAAAAGGTGATAGAAACCTAAAACAATA 56079035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GAGTGACAGAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAAGAAAAGGTGATAGAAACCTAAAACAATA 840

 56079036 GCCAAGGAAGCTACACTCAGGATGTTTGGGGCACTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGC 56079095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GCCAAGGAAGCTACACTCAGGATGTTTGGGGCACTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGC 900

 56079096 CATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCTGGGTTCACGTCATTCTCCTGCCTCAGCCTC 56079155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCTGGGTTCACGTCATTCTCCTGCCTCAGCCTC 960

 56079156 CCAAGTAGCTGGGACTACAGGCACCCGTCACCACGCCCGGCTGATTTTTTATATTTTTAG 56079215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CCAAGTAGCTGGGACTACAGGCACCCGTCACCACGCCCGGCTGATTTTTTATATTTTTAG 1020

 56079216 TAGAGACGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGATATTGTGATCTG 56079275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TAGAGACGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGATATTGTGATCTG 1080

 56079276 CCCACCTTGGCCTCCCAGAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCACCCGCCCCCCG 56079335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CCCACCTTGGCCTCCCAGAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCACCCGCCCCCCG 1140

 56079336 TCTCCTTTTTTTTTTTTGAGATGGGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGG 56079395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TCTCCTTTTTTTTTTTTGAGATGGGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGG 1200

 56079396 CATGGTGTCAGCTCACTGCAACCTCTACTTCCCAGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTTAGC 56079455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CATGGTGTCAGCTCACTGCAACCTCTACTTCCCAGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTTAGC 1260

 56079456 CTCCCAAGTAGGTGGGACTACAGGC 56079480
          |||||||||||||||||||||||||
     1261 CTCCCAAGTAGGTGGGACTACAGGC 1285

EXCISED REGION

 56079482 AGTGCCACCACACCCAGCTAATTTTTGTTATTTTTAGTAGAGACAGTGTTCCACCATGCT 56079541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1287 AGTGCCACCACACCCAGCTAATTTTTGTTATTTTTAGTAGAGACAGTGTTCCACCATGCT 1346

 56079542 GGCCAGGCTGGACTCAAAACTCCTGACCTCAAGTGATCCACCTGCCTTGGCCTCCCAAAG 56079601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1347 GGCCAGGCTGGACTCAAAACTCCTGACCTCAAGTGATCCACCTGCCTTGGCCTCCCAAAG 1406

 56079602 TGCTGAGATTACAGGCGTGAGCCACCGCACTGGCCAAGATAACATCCTAACATCCGTCCC 56079661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1407 TGCTGAGATTACAGGCGTGAGCCACCGCACTGGCCAAGATAACATCCTAACATCCGTCCC 1466

 56079662 TGAGTTGTTTTTTAGAAACCTGGCTCTTTACCAAACAGGTCCACCGGCAGGGAGACCTAA 56079721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1467 TGAGTTGTTTTTTAGAAACCTGGCTCTTTACCAAACAGGTCCACCGGCAGGGAGACCTAA 1526

 56079722 GATAAGGAGGACCTGGGGGCTGAAATCTGACCACTGCTAAATTTGTTCTAATTTTGTTCT 56079781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1527 GATAAGGAGGACCTGGGGGCTGAAATCTGACCACTGCTAAATTTGTTCTAATTTTGTTCT 1586

 56079782 TAATTTCCTCCTGAGAGGCCTAGAGGAGGTCATGCCTCGTGAACCAGAGCTAATACTCTT 56079841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1587 TAATTTCCTCCTGAGAGGCCTAGAGGAGGTCATGCCTCGTGAACCAGAGCTAATACTCTT 1646

 56079842 TTCTCAAAATTTTAAACAAAACTTCTCTTCCTTAACCAATTGCAAACCAGTCTCTGAATC 56079901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1647 TTCTCAAAATTTTAAACAAAACTTCTCTTCCTTAACCAATTGCAAACCAGTCTCTGAATC 1706

 56079902 TACCTACAACCTGTAAGCCCTTGCTGCAAGATATCCTGCCCTTTTAGGGCAAGGTATCCT 56079961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1707 TACCTACAACCTGTAAGCCCTTGCTGCAAGATATCCTGCCCTTTTAGGGCAAGGTATCCT 1766

 56079962 CCATGCGCTGATTTATAATTTTGTCTGTAGCTTCTGCTTCCTTGGCACCCTGCAAATAAA 56080021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1767 CCATGCGCTGATTTATAATTTTGTCTGTAGCTTCTGCTTCCTTGGCACCCTGCAAATAAA 1826

 56080022 CTCCTGCTGCAAACTGTGGTGTGGATATCTGGTCTTACTGCACCAGGCAAGCAGACCCCA 56080081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1827 CTCCTGCTGCAAACTGTGGTGTGGATATCTGGTCTTACTGCACCAGGCAAGCAGACCCCA 1886

 56080082 GTTTGGTTCTATAACAAGAGTCGGCTTCCCCAAAGGCACTGAAAAATGCACAGTTAAAGA 56080141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1887 GTTTGGTTCTATAACAAGAGTCGGCTTCCCCAAAGGCACTGAAAAATGCACAGTTAAAGA 1946

 56080142 GATGGCCTTTGGGAAAACTGTGGGTAGCATGCACCTTTGATAATCTTGTGCAAAAATGAT 56080201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1947 GATGGCCTTTGGGAAAACTGTGGGTAGCATGCACCTTTGATAATCTTGTGCAAAAATGAT 2006

 56080202 GACTTTTTAAAGGTGACCCTTTCTGTTGTGCTTAGCTCTAGCCAAAAGCTAGCTTGCTTT 56080261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2007 GACTTTTTAAAGGTGACCCTTTCTGTTGTGCTTAGCTCTAGCCAAAAGCTAGCTTGCTTT 2066

 56080262 AAGTATTTTTTTTTAATAATAGAAATCAATGAGAAGACAAAATTTATTTATTTATTTATT 56080321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2067 AAGTATTTTTTTTTAATAATAGAAATCAATGAGAAGACAAAATTTATTTATTTATTTATT 2126

 56080322 TATTTTTTGAGACGGAGTCTTGCTCTTTCGTCTAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCT 56080381
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     2127 TATTTTTTGAGACGGAGTCTTGCTCTTTCGTCTAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCT 2186

 56080382 GCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCATGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTA 56080441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2187 GCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCATGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTA 2246

 56080442 GCTGGGACTACAGGCATGTGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTCAGTAGAGA 56080501
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     2247 GCTGGGACTACAGGCATGTGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTTAGTAGAGA 2306

 56080502 TGGGGTTTCACCATGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCC 56080561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2307 TGGGGTTTCACCATGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCC 2366

 56080562 TCGGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCGGCCTTAAAATTTA 56080621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2367 TCGGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCGGCCTTAAAATTTA 2426

 56080622 TTTTTCTAGAATGTTTCTACTCTCTAAAGTGA 56080653
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||
     2427 TTTTTCTAGAATGTTTCTGCTCTCTAAAGTGA 2458

Alignment time is 1.83213 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [56069234,56090514] =>     21281 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    5177] =>      5177 nucs 'mol-32-23ba-023086_5177'

Score:        5102
Aligned:      5179        nucs
Identic:      5172 (100%) nucs =>      1910 (100%)      3262 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [56080505,56082418] EXCISED REGION [56082421,56085684]
 second seq =>  [       1,    1913] EXCISED REGION [    1914,    5177]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [56082419,56082420]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        11 nucs [56082419,56082429] to [56082421,56082431]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [56082419,56082419] to [56082420,56082420]
 second seq =>         0 nucs

 56080505 GGTTTCACCATGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCG 56080564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGTTTCACCATGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCG 60

 56080565 GCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCGGCCTTAAAATTTATTT 56080624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCGGCCTTAAAATTTATTT 120

 56080625 TTCTAGAATGTTTCTACTCTCTAAAGTGAAGACTGATGTTGAACCAAAAATTCAATACAT 56080684
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTCTAGAATGTTTCTGCTCTCTAAAGTGAAGACTGATGTTGAACCAAAAATTCAATACAT 180

 56080685 CAGTCAATTTCATAACCATCAACTACATACCATAAAGATTTTACTTTTCTGTTAGCTACT 56080744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CAGTCAATTTCATAACCATCAACTACATACCATAAAGATTTTACTTTTCTGTTAGCTACT 240

 56080745 CTCTTGAAGCTACTGAGCAGAGGTCATGGGTGGCAGTTATGAAACTGTATACAACATTCA 56080804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTCTTGAAGCTACTGAGCAGAGGTCATGGGTGGCAGTTATGAAACTGTATACAACATTCA 300

 56080805 GGAATAAAAGCCAAAGACTTCCCCTAGTCAAGCCTACTCGTGACATAGTCTCATCTAACA 56080864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GGAATAAAAGCCAAAGACTTCCCCTAGTCAAGCCTACTCGTGACATAGTCTCATCTAACA 360

 56080865 AACACTCAGGATAATCTTAAGTCAGAAAATTTTCACTTTTTGAAAAGGTCCTAGGCAAAA 56080924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AACACTCAGGATAATCTTAAGTCAGAAAATTTTCACTTTTTGAAAAGGTCCTAGGCAAAA 420

 56080925 GTAAAAAAACTGGCAACAGGTGTTGAAATTTGCAAATTATGCGAAACATCCCGCCTGATT 56080984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
      421 GTAAAAAAACTGGCAACAGGTGTTGAAATTTGCAAATTATGCGAAACATCCCGCTTGATT 480

 56080985 CCCATTTTGACTTTCCCACTGTGCTTAACAGGACTGTCTGCGTTTATGATGGAAGAAGGA 56081044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCCATTTTGACTTTCCCACTGTGCTTAACAGGACTGTCTGCGTTTATGATGGAAGAAGGA 540

 56081045 AGAATTTACACATAATGGGGGTGATGGAACAGGTTGTTTAAACTTCTTCCATTTTATGCT 56081104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGAATTTACACATAATGGGGGTGATGGAACAGGTTGTTTAAACTTCTTCCATTTTATGCT 600

 56081105 TAGACACTGGGGTTGGCAAACGACAACCAGTGGGTCAAATCTGGCTGCCAACTGTTTGTG 56081164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TAGACACTGGGGTTGGCAAACGACAACCAGTGGGTCAAATCTGGCTGCCAACTGTTTGTG 660

 56081165 AAAGCAAGTTTTACTGGAACACAGCCATGTCTATTCATTTACACACTGCATCCACAGCTG 56081224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAAGCAAGTTTTACTGGAACACAGCCATGTCTATTCATTTACACACTGCATCCACAGCTG 720

 56081225 CTTCCATGACACAAGGGCAGACTCAAGAAGTCGTGGCAGAAACTGATTTGCGTTGCCCTG 56081284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTTCCATGACACAAGGGCAGACTCAAGAAGTCGTGGCAGAAACTGATTTGCGTTGCCCTG 780

 56081285 GTGATTAATGACGCTACGCTTACTGGCCACCTGTATGTCTTCTTTGGAGAAAGGTCTATT 56081344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GTGATTAATGACGCTACGCTTACTGGCCACCTGTATGTCTTCTTTGGAGAAAGGTCTATT 840

 56081345 TAGATACTTTAACTGTTTTGTTTTGTTTTTTTCCTGAGACAGTCTCGCTCTGTTGCCCAG 56081404
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TAGATACTTTAACTATTTTGTTTTGTTTTTTTCCTGAGACAGTCTCGCTCTGTTGCCCAG 900

 56081405 GCTGGACTGTAGTGGCACAGTCTCAGCTCACTGCAACCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCAA 56081464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GCTGGACTGTAGTGGCACAGTCTCAGCTCACTGCAACCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCAA 960

 56081465 TTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGCAGCTAGGATTACAGGCATGTGCCACCATGCCCAGCT 56081524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGCAGCTAGGATTACAGGCATGTGCCACCATGCCCAGCT 1020

 56081525 AATTTTTGTATTTGTAGTAGAGATGGGGTTTCATCATTTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACT 56081584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AATTTTTGTATTTGTAGTAGAGATGGGGTTTCATCATTTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACT 1080

 56081585 GCTGACCTTGTGATCCACCTGCCTCTGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAACC 56081644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GCTGACCTTGTGATCCACCTGCCTCTGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAACC 1140

 56081645 ACCGCGCCTGGCCTAGATACTTTACCTGTTTTTCATTGGGTATCTGTCTATTTACTGAGT 56081704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ACCGCGCCTGGCCTAGATACTTTACCTGTTTTTCATTGGGTATCTGTCTATTTACTGAGT 1200

 56081705 TATAAGAGTTCTTTTTATATTTTAGACACAAGTCCAAATATGCTTTCTTGAATCGGAATT 56081764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TATAAGAGTTCTTTTTATATTTTAGACACAAGTCCAAATATGCTTTCTTGAATCGGAATT 1260

 56081765 TCAAAAATTTTATGTTCTGAGGGACTGCATGAGGCAGACTTGTTCTTTTCTCTACATTTT 56081824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TCAAAAATTTTATGTTCTGAGGGACTGCATGAGGCAGACTTGTTCTTTTCTCTACATTTT 1320

 56081825 TATTTCTTGCACCAAAGAGCAGTTTTTTTCTCTTTAGAATTCTACTCGTTAATTTTAACT 56081884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TATTTCTTGCACCAAAGAGCAGTTTTTTTCTCTTTAGAATTCTACTCGTTAATTTTAACT 1380

 56081885 CTTCACAATTTTTGCATGAGCAATGGTGTTTTGGGAGCACTGCCACAGCTTTTATTTGAA 56081944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CTTCACAATTTTTGCATGAGCAATGGTGTTTTGGGAGCACTGCCACAGCTTTTATTTGAA 1440

 56081945 ATTTTAAACTAATAGGGTTGACATTCCAGAACTATCCCACTGTGCTACTCAGAAAAACAC 56082004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATTTTAAACTAATAGGGTTGACATTCCAGAACTATCCCACTGTGCTACTCAGAAAAACAC 1500

 56082005 AACTACACTACTGTTTTAAGAAGAAATATTTTTAAAAAAATAGTCAACTTCAGGAAATTC 56082064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AACTACACTACTGTTTTAAGAAGAAATATTTTTAAAAAAATAGTCAACTTCAGGAAATTC 1560

 56082065 AACTTTTATAAAACTTTTATAAAGTTAGGCTGAAGCCTACATGGTCCAAGGATCTAGCTA 56082124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AACTTTTATAAAACTTTTATAAAGTTAGGCTGAAGCCTACATGGTCCAAGGATCTAGCTA 1620

 56082125 GCCATGTGCAGTGGTTTTTAAATGTCCTGAAATTCTTTGATGCTGTTCCTTTCAAAAGAA 56082184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GCCATGTGCAGTGGTTTTTAAATGTCCTGAAATTCTTTGATGCTGTTCCTTTCAAAAGAA 1680

 56082185 ACTTCATTCCCCACTCGAGTGTGGGTGGGACTTCATGGTTCATTTCTTGTGACTAGAATG 56082244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ACTTCATTCCCCACTCGAGTGTGGGTGGGACTTCATGGTTCATTTCTTGTGACTAGAATG 1740

 56082245 TGCCACTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGGCCAG 56082304
          |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGCCACTTTTTTTTTTTTTT-GAGACAGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGGCCAG 1799

 56082305 TGGCACAATCTCAGCTCACTGCAACCTCTGTCTCCTGGGTTCAAGTGATCCTCCCGTCCC 56082364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 TGGCACAATCTCAGCTCACTGCAACCTCTGTCTCCTGGGTTCAAGTGATCCTCCCGTCCC 1859

 56082365 AACCACCCAAGTAGCTGGGATTACAAGCGTGCACTACCACGCCTAGCTATTTTC 56082418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 AACCACCCAAGTAGCTGGGATTACAAGCGTGCACTACCACGCCTAGCTATTTTC 1913

EXCISED REGION

 56082421 TTTTTTTTTTTAAAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAGCTCC 56082480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1914 TTTTTTTTTTTAAAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAGCTCC 1973

 56082481 TGGCCTCAAGTTATCCACCTGCCTTGGCCTCCCGAAGTACTGGGATTACAGGTGTGAGCC 56082540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1974 TGGCCTCAAGTTATCCACCTGCCTTGGCCTCCCGAAGTACTGGGATTACAGGTGTGAGCC 2033

 56082541 CCCACAGCTGGCTGTTGTGCCGCTTTTAGGACTAGACTGCAAAAGGCACCATGGCTTCCT 56082600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2034 CCCACAGCTGGCTGTTGTGCCGCTTTTAGGACTAGACTGCAAAAGGCACCATGGCTTCCT 2093

 56082601 ACTTGCACTCTCTCACTTGCTCTGAGTCAGGAGGACACTCAAGCAGCCCTGCAGAGAGGT 56082660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2094 ACTTGCACTCTCTCACTTGCTCTGAGTCAGGAGGACACTCAAGCAGCCCTGCAGAGAGGT 2153

 56082661 CCCTGTAGCAAGGAACTGAGGCCGGTGCCAGCAGTTGTGTGGCGGAGCTGTCCTGGAAGT 56082720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2154 CCCTGTAGCAAGGAACTGAGGCCGGTGCCAGCAGTTGTGTGGCGGAGCTGTCCTGGAAGT 2213

 56082721 GGATCCTCTGGCCCCAGTCCAGCCTTCGGATGATGCAGCCCTGGCGGACATCCTGACTGC 56082780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2214 GGATCCTCTGGCCCCAGTCCAGCCTTCGGATGATGCAGCCCTGGCGGACATCCTGACTGC 2273

 56082781 AGCCTCAGGAGTGGCCCTGAGCCAGGACCACCCAGTTCAGCCACTTCCGAGTTCCCAACC 56082840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2274 AGCCTCAGGAGTGGCCCTGAGCCAGGACCACCCAGTTCAGCCACTTCCGAGTTCCCAACC 2333

 56082841 CAGAGAATCTGTCAGGTGATAAATGTTTGTGGTTTTAAGCCACTCCATTTTGAGGTAATC 56082900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2334 CAGAGAATCTGTCAGGTGATAAATGTTTGTGGTTTTAAGCCACTCCATTTTGAGGTAATC 2393

 56082901 TGTCATACAGAAATAGATAACTAATACAACACCTAAAAGAATAAAACCATAAATGTATTG 56082960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2394 TGTCATACAGAAATAGATAACTAATACAACACCTAAAAGAATAAAACCATAAATGTATTG 2453

 56082961 CTTAGTCCAGTACCAACAGCACTATTCTTTTTTTTTTAATTAAAAAAGTTATTTTAGAGA 56083020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2454 CTTAGTCCAGTACCAACAGCACTATTCTTTTTTTTTTAATTAAAAAAGTTATTTTAGAGA 2513

 56083021 CAGGGTCTCACTCTGTCTTTGAGGCCAGAGTGCAGTGGTGCGATCGTGACTCACTGTAGC 56083080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2514 CAGGGTCTCACTCTGTCTTTGAGGCCAGAGTGCAGTGGTGCGATCGTGACTCACTGTAGC 2573

 56083081 CTCCAACTCCTGGGCTCAAGTGGTCCTCCTGTCTCAGCCTCCTGAGCAGCTAGGCCTACA 56083140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2574 CTCCAACTCCTGGGCTCAAGTGGTCCTCCTGTCTCAGCCTCCTGAGCAGCTAGGCCTACA 2633

 56083141 GGGGTGCACCACCACAACCAGCTAATTTTTTTGGAGGGATGGGGGTCTCCCTGTGTTGCC 56083200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2634 GGGGTGCACCACCACAACCAGCTAATTTTTTTGGAGGGATGGGGGTCTCCCTGTGTTGCC 2693

 56083201 CAGGCTGATCTCAAACTCCTGGCCTCAAGTAATCCTCCCACCTTGGCCTCTCAAGTAGCT 56083260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2694 CAGGCTGATCTCAAACTCCTGGCCTCAAGTAATCCTCCCACCTTGGCCTCTCAAGTAGCT 2753

 56083261 GGGATTATAGACACCAATAACATTATTCTAGGGACATCTGAAAAAATGTGTGAAAACTGC 56083320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2754 GGGATTATAGACACCAATAACATTATTCTAGGGACATCTGAAAAAATGTGTGAAAACTGC 2813

 56083321 ATTCTCTCTGTCAAGTAGCCTAAATCTAGTTCACTGTTTGAAAATATTACACTAAAAGGT 56083380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     2814 ATTCTCTCTGTCAAGTAGCCTAAATCTAGTTCACTGTTTGAAAATATTACACTAAAAGCT 2873

 56083381 GGGGTTCTTTGGGGAGTCTGATAACTCCCTATTGTAAGATTTTGTGTGTTGGATTGTCCT 56083440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
     2874 GGGGTTCTTTGGGGAGTCTGATAACTCCCTATTGTAAGATTTTGTGTGTTGGATTGTCC- 2932

 56083441 TTTTTTTTTTTTTAGGGGATGAGGAGACCACACTTTCATAGGATTCTTCAAGAATTTTGT 56083500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2933 TTTTTTTTTTTTTAGGGGATGAGGAGACCACACTTTCATAGGATTCTTCAAGAATTTTGT 2992

 56083501 GATTTTAAAAAACTAATAACCACTTTCCTAAGGCATGACAGATGCTCCTGAAGTCCTGGC 56083560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2993 GATTTTAAAAAACTAATAACCACTTTCCTAAGGCATGACAGATGCTCCTGAAGTCCTGGC 3052

 56083561 AGGTTTCTATAATCGGGTTTAAACTCTCCTGGTGTGACACTGTCCTCCTGAGATAGAGGG 56083620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3053 AGGTTTCTATAATCGGGTTTAAACTCTCCTGGTGTGACACTGTCCTCCTGAGATAGAGGG 3112

 56083621 ATCTTTCCATGGGGGATTTACTGTGACTTAAGTAAGCTTACCCAGCGGGAAAAGCCTTTG 56083680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3113 ATCTTTCCATGGGGGATTTACTGTGACTTAAGTAAGCTTACCCAGCGGGAAAAGCCTTTG 3172

 56083681 CCACACTTGGAGCATTTGTAAACAGTCGGGATGAAATTTGCATCGTGGTATTTCCTGAAG 56083740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3173 CCACACTTGGAGCATTTGTAAACAGTCGGGATGAAATTTGCATCGTGGTATTTCCTGAAG 3232

 56083741 TGAGCGTTTAGAAGTTGCTTCTGTCGGAAACATTTATTGCAAGAAAGGCAGGTGAATGGT 56083800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3233 TGAGCGTTTAGAAGTTGCTTCTGTCGGAAACATTTATTGCAAGAAAGGCAGGTGAATGGT 3292

 56083801 TTCTCTCCAGTGTGGGTACGAATGTGAGCGGTCATATGACGTTCCTAAGAGGGAAGGGGA 56083860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3293 TTCTCTCCAGTGTGGGTACGAATGTGAGCGGTCATATGACGTTCCTAAGAGGGAAGGGGA 3352

 56083861 AGAAAGCAGCTTGTCTAGTTCAAAGGGTTTTCTCGATATTAGACACTGTTTATCATACAA 56083920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3353 AGAAAGCAGCTTGTCTAGTTCAAAGGGTTTTCTCGATATTAGACACTGTTTATCATACAA 3412

 56083921 TACCTTTTATTTCCCTCCCCAAAGATGAGTCCACTATTAAGCAGAATTACTGCAAACACA 56083980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3413 TACCTTTTATTTCCCTCCCCAAAGATGAGTCCACTATTAAGCAGAATTACTGCAAACACA 3472

 56083981 TTCTGAACAAGGCAGCATTCACTCTCAGTAAGTGGCCGCCTAGGAAACAAAACTCGTATG 56084040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3473 TTCTGAACAAGGCAGCATTCACTCTCAGTAAGTGGCCGCCTAGGAAACAAAACTCGTATG 3532

 56084041 CAGCAGCAAGTGACAAAGGTCTTGCAGTGGATTCCTTGCTGGCTCTCCTGTCCTGTTGGG 56084100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3533 CAGCAGCAAGTGACAAAGGTCTTGCAGTGGATTCCTTGCTGGCTCTCCTGTCCTGTTGGG 3592

 56084101 ATGTGGGAGTACACACCGCAGGGCGTGAAAGGATGGTCCTTTGTCCTCTCATTACTGGGA 56084160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3593 ATGTGGGAGTACACACCGCAGGGCGTGAAAGGATGGTCCTTTGTCCTCTCATTACTGGGA 3652

 56084161 GTCCTCCTTCTATACAACTATTTACAATTACCTGAATTTACAAAGGGCAAATAGAACCTG 56084220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3653 GTCCTCCTTCTATACAACTATTTACAATTACCTGAATTTACAAAGGGCAAATAGAACCTG 3712

 56084221 CAAACTTAAAAATCAAATGTCAGAGTTTAAATTCAGCAGACCTTTGGGGTTGCAAGTACC 56084280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3713 CAAACTTAAAAATCAAATGTCAGAGTTTAAATTCAGCAGACCTTTGGGGTTGCAAGTACC 3772

 56084281 TTAAGTATCAACATTTTTCCATTTACTTCCCAATAGTATCGTAACAGATCTTAATACCGA 56084340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3773 TTAAGTATCAACATTTTTCCATTTACTTCCCAATAGTATCGTAACAGATCTTAATACCGA 3832

 56084341 -TTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGGGTCTCGCTCTGTCACAATCATAGCTCACTGCA 56084399
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3833 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGGGTCTCGCTCTGTCACAATCATAGCTCACTGCA 3892

 56084400 ATCTCAAACTCCTGGGCCCAAGTGATCCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTG 56084459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3893 ATCTCAAACTCCTGGGCCCAAGTGATCCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTG 3952

 56084460 TGGACGCATGCCACTATGCTCGGCTCAGTTTGTATTTTTTGTAGAGACAGGGTCTCACTA 56084519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3953 TGGACGCATGCCACTATGCTCGGCTCAGTTTGTATTTTTTGTAGAGACAGGGTCTCACTA 4012

 56084520 TGTTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTAGCCTCAAGCAATTCTCCTGCCTTAGCCTCCCA 56084579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4013 TGTTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTAGCCTCAAGCAATTCTCCTGCCTTAGCCTCCCA 4072

 56084580 AAGTGCTGGGATTATAGGTGTGAGCCACTGTACCTGGCCTAAATAGAGATTTTATCTTAG 56084639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4073 AAGTGCTGGGATTATAGGTGTGAGCCACTGTACCTGGCCTAAATAGAGATTTTATCTTAG 4132

 56084640 ACAGGAGAAAATAATTTGGGAAATCAGGAAAAAAATATGTATGAAGTCAAGCAAAAGTAC 56084699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4133 ACAGGAGAAAATAATTTGGGAAATCAGGAAAAAAATATGTATGAAGTCAAGCAAAAGTAC 4192

 56084700 ACATTTTGTTTTATTTAAAATGTGATGATTATTTGGATTAAATATATATTCGGCCATTTC 56084759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4193 ACATTTTGTTTTATTTAAAATGTGATGATTATTTGGATTAAATATATATTCGGCCATTTC 4252

 56084760 TGCATTACTGTCAGTGGCCTAACTGATGCTCTTTCTTCTAATCTTTCTCTCACCCAATTC 56084819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4253 TGCATTACTGTCAGTGGCCTAACTGATGCTCTTTCTTCTAATCTTTCTCTCACCCAATTC 4312

 56084820 ACTAAACACCCTCTTCCATGCACAGCTTTCACCTCATCACCCTCCTTTGGGACAGCATCT 56084879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4313 ACTAAACACCCTCTTCCATGCACAGCTTTCACCTCATCACCCTCCTTTGGGACAGCATCT 4372

 56084880 CTGGCGCTCCCTGCTGGGAGCCTGACTCTCCAGGACCGCGGCAGCCAGGAGCACCCAGCA 56084939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4373 CTGGCGCTCCCTGCTGGGAGCCTGACTCTCCAGGACCGCGGCAGCCAGGAGCACCCAGCA 4432

 56084940 GTGCTCCAAGCCTCTGCCCACGGCCATGACCTGCCTGGCTGCTCTCTACTCCCACATACC 56084999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4433 GTGCTCCAAGCCTCTGCCCACGGCCATGACCTGCCTGGCTGCTCTCTACTCCCACATACC 4492

 56085000 TGCTGTATGCCTGCTCCAGGGCCCCTCATCCTTTCCAAGTCCTATCCATCTTTCAGGAAG 56085059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4493 TGCTGTATGCCTGCTCCAGGGCCCCTCATCCTTTCCAAGTCCTATCCATCTTTCAGGAAG 4552

 56085060 CCCTCCTAGTTCATTTGAATAAGTATGAGCCTGAGGCCTCAGAATATTCTTTGTTCAAAA 56085119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4553 CCCTCCTAGTTCATTTGAATAAGTATGAGCCTGAGGCCTCAGAATATTCTTTGTTCAAAA 4612

 56085120 TCTACCAGAAAAACTCCTTTTCCCTTATTCAAAGCATTTACAGTTTACAGCCCACACTTC 56085179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4613 TCTACCAGAAAAACTCCTTTTCCCTTATTCAAAGCATTTACAGTTTACAGCCCACACTTC 4672

 56085180 AAAACACACAGTAAGCACTGATTTTCACCTTTGGTAACCAATAGCATGCAATACTTTGAA 56085239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4673 AAAACACACAGTAAGCACTGATTTTCACCTTTGGTAACCAATAGCATGCAATACTTTGAA 4732

 56085240 GCAGTGTTTTGGTTTTCAAACTTCTACTCTGAGGGCCTTTTATACTTTAAAAAATTACTG 56085299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4733 GCAGTGTTTTGGTTTTCAAACTTCTACTCTGAGGGCCTTTTATACTTTAAAAAATTACTG 4792

 56085300 TGGCCTCTGAAGAGCTTTTATGTATACAGGTGGCATGTATTAGTATTTACTTTCTTAGAA 56085359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4793 TGGCCTCTGAAGAGCTTTTATGTATACAGGTGGCATGTATTAGTATTTACTTTCTTAGAA 4852

 56085360 AGCAAACCTGGGGAATTCTTAAGTGTTTTTTAAAATAAAACAATTTATTAACTCATTTAA 56085419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4853 AGCAAACCTGGGGAATTCTTAAGTGTTTTTTAAAATAAAACAATTTATTAACTCATTTAA 4912

 56085420 AAATAAAAACAAACCAACTACATATTATTTCTGTAAAATTATCTATTTTTCAAAACAAAA 56085479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4913 AAATAAAAACAAACCAACTACATATTATTTCTGTAAAATTATCTATTTTTCAAAACAAAA 4972

 56085480 ATAACCTAATGTCTGTCTTAATAGATAAGGTTTCCAGTTAAAATACAGGCTGCAACTACT 56085539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4973 ATAACCTAATGTCTGTCTTAATAGATAAGGTTTCCAGTTAAAATACAGGCTGCAACTACT 5032

 56085540 TGTATATAAAACTATTTGTTGTTGTCTGAAGTTCAAATGTCACTAAGTGTGCTGTATTTT 56085599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5033 TGTATATAAAACTATTTGTTGTTGTCTGAAGTTCAAATGTCACTAAGTGTGCTGTATTTT 5092

 56085600 TATTTGCTAAGTCTGACAGCTCTATTAAAAGCATTCGGGGCCAGGCGCGGTGGCTCACGC 56085659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5093 TATTTGCTAAGTCTGACAGCTCTATTAAAAGCATTCGGGGCCAGGCGCGGTGGCTCACGC 5152

 56085660 CTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGC 56085684
          |||||||||||||||||||||||||
     5153 CTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGC 5177

Alignment time is 3.85579 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [56069234,56090514] =>     21281 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    2700] =>      2700 nucs 'mol-32-3046-278662_2700'

Score:        2700
Aligned:      2700        nucs
Identic:      2700 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [56076557,56079256]
 second seq =>  [       1,    2700]

 56076557 AAATGTGAAAAATGATATTTTACAACATCATTGGTATAAAGGAATCCAAATGGAATGCAG 56076616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAATGTGAAAAATGATATTTTACAACATCATTGGTATAAAGGAATCCAAATGGAATGCAG 60

 56076617 GCTGCATTCATTGCTTGATACCCATCAGTGAGACACTGGTTTTTCTTCTGATCTGCCCCT 56076676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCTGCATTCATTGCTTGATACCCATCAGTGAGACACTGGTTTTTCTTCTGATCTGCCCCT 120

 56076677 ATGAGCACTGTGGACAGCCCTGTGCCCTGCGGGGCCGGATGGAGAAGCCCCAGGAGCTGG 56076736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATGAGCACTGTGGACAGCCCTGTGCCCTGCGGGGCCGGATGGAGAAGCCCCAGGAGCTGG 180

 56076737 CGGAGGATGGCGGGAACTCCAGCTGGGAGTGGGATGACACAGGAATGCCGGGGCAGCGGG 56076796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CGGAGGATGGCGGGAACTCCAGCTGGGAGTGGGATGACACAGGAATGCCGGGGCAGCGGG 240

 56076797 CAGCAGAGCCCATCTGCTGGTGCAGAGTCAGTGAGGCCTCCACCCAGAGGGAGGGAGGCA 56076856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CAGCAGAGCCCATCTGCTGGTGCAGAGTCAGTGAGGCCTCCACCCAGAGGGAGGGAGGCA 300

 56076857 GGGGCTGGGAGTTTGGGATGAAGGTGCTCACTGGAAATCAGTGGAAAAGTTATTGGTGCT 56076916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GGGGCTGGGAGTTTGGGATGAAGGTGCTCACTGGAAATCAGTGGAAAAGTTATTGGTGCT 360

 56076917 GAGGTTCAGAATGAGGGCTCTGGGCACCTGGGCAGGCTCGTCCCCACCCTGTGATGGAGC 56076976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GAGGTTCAGAATGAGGGCTCTGGGCACCTGGGCAGGCTCGTCCCCACCCTGTGATGGAGC 420

 56076977 TCTCTCCCTGTCAGATGGATGACAGTGCCCCCTGCAGAGGCCTGTGGTCATGATAAGAAG 56077036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCTCTCCCTGTCAGATGGATGACAGTGCCCCCTGCAGAGGCCTGTGGTCATGATAAGAAG 480

 56077037 GGACTTGCATGAGCTCAGTGGTAATTGCCGATGCCTGGAGGAGAAAGGAGGGTGCTCCGC 56077096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GGACTTGCATGAGCTCAGTGGTAATTGCCGATGCCTGGAGGAGAAAGGAGGGTGCTCCGC 540

 56077097 GCATGGGCAGTGTGCACAATTCTGGAGAGTTCCAACTGAGCTGAGTGATGGGGCACTGCC 56077156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GCATGGGCAGTGTGCACAATTCTGGAGAGTTCCAACTGAGCTGAGTGATGGGGCACTGCC 600

 56077157 TGGGACCCCTCAGTCTCACCAGTTCCCTGCCAGGCAGGGCCTGGCTGTGTGACGCAGGCA 56077216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGGGACCCCTCAGTCTCACCAGTTCCCTGCCAGGCAGGGCCTGGCTGTGTGACGCAGGCA 660

 56077217 TGGGAAAGGCAGGCCGGGGGCACACCCAGGCTTAGGGCTTTGCCAGATGGTGAGACGCAG 56077276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGGGAAAGGCAGGCCGGGGGCACACCCAGGCTTAGGGCTTTGCCAGATGGTGAGACGCAG 720

 56077277 AGAAAGAGTGGGGGAGTGCTGCCTGTGGACAGAGCGACTGGAACCAGGGACCCAGAACCG 56077336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGAAAGAGTGGGGGAGTGCTGCCTGTGGACAGAGCGACTGGAACCAGGGACCCAGAACCG 780

 56077337 ACTCCACACAGAGGGAGTGGGAAGGACTGCAGGATGCCCGCTTCTACCCGAGTTTCAGAT 56077396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ACTCCACACAGAGGGAGTGGGAAGGACTGCAGGATGCCCGCTTCTACCCGAGTTTCAGAT 840

 56077397 ACATGATGAACATTTTTTTTAGTATAAGTATATCCCAAATAGTGCATGGGACACATTTAA 56077456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ACATGATGAACATTTTTTTTAGTATAAGTATATCCCAAATAGTGCATGGGACACATTTAA 900

 56077457 ACAATGATTCACTGTGTATCTGAAATTCAGATTGAGCTGGGCATCCTCTATCTGATCTGG 56077516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ACAATGATTCACTGTGTATCTGAAATTCAGATTGAGCTGGGCATCCTCTATCTGATCTGG 960

 56077517 TAACTCTTGAGGAAAGGCAGGTGGAGGGCGACCGTCATCTGTGGGAACATTCGCAATGCA 56077576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TAACTCTTGAGGAAAGGCAGGTGGAGGGCGACCGTCATCTGTGGGAACATTCGCAATGCA 1020

 56077577 GGGACTGAGTCTGGAATGAGAACGTGGGGTATTTGCTTGTGCCGTAAAAGTCTGGACAGT 56077636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GGGACTGAGTCTGGAATGAGAACGTGGGGTATTTGCTTGTGCCGTAAAAGTCTGGACAGT 1080

 56077637 TTCCAGTCATCTACGGTTCTAAGGTTCTCAGAGGAAAGGAATGGAGAAGGTGAACAGTGC 56077696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTCCAGTCATCTACGGTTCTAAGGTTCTCAGAGGAAAGGAATGGAGAAGGTGAACAGTGC 1140

 56077697 AGGTGTTCACCTGTGCAGGTGTCAGGTTGGCCCCTCTTACAGCAGAGCCATTCACAGGAC 56077756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGGTGTTCACCTGTGCAGGTGTCAGGTTGGCCCCTCTTACAGCAGAGCCATTCACAGGAC 1200

 56077757 ACACAGGACAGGGCCCAGCTTCAGCCAACCTGGGAACTCACTTCAGCTCCCAGAGGCCAG 56077816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ACACAGGACAGGGCCCAGCTTCAGCCAACCTGGGAACTCACTTCAGCTCCCAGAGGCCAG 1260

 56077817 AGGACGAAGACTGTGATGGCTGTGGGGGCTGAATGGTGACCCCTAAAGGGATATGTCCAT 56077876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AGGACGAAGACTGTGATGGCTGTGGGGGCTGAATGGTGACCCCTAAAGGGATATGTCCAT 1320

 56077877 ATCCTAAGCCCCATAGCTGACCTCCTTTTTTCAAAAGAAGTTCTAAATCCTAAATGATAA 56077936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ATCCTAAGCCCCATAGCTGACCTCCTTTTTTCAAAAGAAGTTCTAAATCCTAAATGATAA 1380

 56077937 ATGTCTTTGTAAGAGGCAGAAGAGAAGGCCCACACACAGAAGAGAGGAGAGAGCTAGGAA 56077996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ATGTCTTTGTAAGAGGCAGAAGAGAAGGCCCACACACAGAAGAGAGGAGAGAGCTAGGAA 1440

 56077997 AAGACAGAGGCAGAGACTGGAGGATGTGGCCACAAACTGAGGAATGGTGGAGCCACCAGA 56078056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AAGACAGAGGCAGAGACTGGAGGATGTGGCCACAAACTGAGGAATGGTGGAGCCACCAGA 1500

 56078057 GTTGCAAGAGGCTAGGAGGGACCCTCCCCTAGGTCCCCCGAGGGAGGGCGGCCCTGCCCA 56078116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GTTGCAAGAGGCTAGGAGGGACCCTCCCCTAGGTCCCCCGAGGGAGGGCGGCCCTGCCCA 1560

 56078117 CACCTGGATTGAGGATTTCTGGCCTCTAGAGCTATTTGAAAATCAATTTCTGTTGTCCCA 56078176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CACCTGGATTGAGGATTTCTGGCCTCTAGAGCTATTTGAAAATCAATTTCTGTTGTCCCA 1620

 56078177 AGCCACTCAGCTTGTGGTCATCTATTGCAACAGCCCAGGACAGTCCCTGTAGCTGCAGGC 56078236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AGCCACTCAGCTTGTGGTCATCTATTGCAACAGCCCAGGACAGTCCCTGTAGCTGCAGGC 1680

 56078237 GACAGTCCAATGCGATGGAAGAGGGCTCCTCGGGGTGGGGGCCACACATGGACCTGCGTG 56078296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GACAGTCCAATGCGATGGAAGAGGGCTCCTCGGGGTGGGGGCCACACATGGACCTGCGTG 1740

 56078297 GGGCTCTCACACTGACTTTCTCACGCTATGCTCACTGCCATTCTGAGAGATCTGGCACAA 56078356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GGGCTCTCACACTGACTTTCTCACGCTATGCTCACTGCCATTCTGAGAGATCTGGCACAA 1800

 56078357 GCCACCTTGCAGGACCGACTGGTGGACAAATAGGGGCTCTGGACACATCCCCTGGACAGT 56078416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GCCACCTTGCAGGACCGACTGGTGGACAAATAGGGGCTCTGGACACATCCCCTGGACAGT 1860

 56078417 AACACTCGGCACCCAGGATAGTCACAACCAGAAAATCACTGAGGCGGTAAAAACAAATCT 56078476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AACACTCGGCACCCAGGATAGTCACAACCAGAAAATCACTGAGGCGGTAAAAACAAATCT 1920

 56078477 GCGTAAAATCAGTACCGTCTCCGTTCGCGGCTTCCTTCCATCCCTTCGCAGCTTCCTTCT 56078536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GCGTAAAATCAGTACCGTCTCCGTTCGCGGCTTCCTTCCATCCCTTCGCAGCTTCCTTCT 1980

 56078537 GACCCTTTGTGGCTTCCTTCAGGATGGTCTGCTTCCTCTTTCTTGTTCTTCTTCCCTTTC 56078596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GACCCTTTGTGGCTTCCTTCAGGATGGTCTGCTTCCTCTTTCTTGTTCTTCTTCCCTTTC 2040

 56078597 CTGAAGCAGCCGACTTTGCTTCCCCTGATCCACACTTCTCCGAATGTCTGTGCAGGTTAA 56078656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CTGAAGCAGCCGACTTTGCTTCCCCTGATCCACACTTCTCCGAATGTCTGTGCAGGTTAA 2100

 56078657 TCTGTCGGAGAATTGACACAGAACACACAAGGCGAGTGAGATGGGGCAGGGACCCCTCTC 56078716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TCTGTCGGAGAATTGACACAGAACACACAAGGCGAGTGAGATGGGGCAGGGACCCCTCTC 2160

 56078717 AGGGGCCTGTGGGGACCCCACGCATGGAAAGAAAGAAAAATCCTGAGTTCTTTCGAGGGC 56078776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AGGGGCCTGTGGGGACCCCACGCATGGAAAGAAAGAAAAATCCTGAGTTCTTTCGAGGGC 2220

 56078777 AATTCCACACACCTCGCTAGCCCTAAGAAGTAAATAAGCAACTTGATAAGCAAGAAGGTA 56078836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AATTCCACACACCTCGCTAGCCCTAAGAAGTAAATAAGCAACTTGATAAGCAAGAAGGTA 2280

 56078837 ATAGGAGGCCAGGCACTGTGACTCACGTATGTAATCCCAGTACTTTAGGAGGCCCAGGAG 56078896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 ATAGGAGGCCAGGCACTGTGACTCACGTATGTAATCCCAGTACTTTAGGAGGCCCAGGAG 2340

 56078897 GGAGGCTGAGGTGGGAGGATCGCTTTAGCCCCGGAGGTCGAGGCTGCAGTGAGCTGACTG 56078956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GGAGGCTGAGGTGGGAGGATCGCTTTAGCCCCGGAGGTCGAGGCTGCAGTGAGCTGACTG 2400

 56078957 TACCACTGCACTCCAGCCTGAGTGACAGAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAAGAAAAGGTG 56079016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TACCACTGCACTCCAGCCTGAGTGACAGAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAAGAAAAGGTG 2460

 56079017 ATAGAAACCTAAAACAATAGCCAAGGAAGCTACACTCAGGATGTTTGGGGCACTCGCCCA 56079076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 ATAGAAACCTAAAACAATAGCCAAGGAAGCTACACTCAGGATGTTTGGGGCACTCGCCCA 2520

 56079077 GGCTGGAGTGCAGTGGCGCCATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCTGGGTTCACGTC 56079136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GGCTGGAGTGCAGTGGCGCCATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCTGGGTTCACGTC 2580

 56079137 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCACCCGTCACCACGCCCGGC 56079196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCACCCGTCACCACGCCCGGC 2640

 56079197 TGATTTTTTATATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGAT 56079256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TGATTTTTTATATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGAT 2700

Alignment time is 1.80862 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [56069234,56090514] =>     21281 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    2595] =>      2595 nucs 'mol-32-3395-153758_2595'

Score:        2534
Aligned:      2589        nucs
Identic:      2584 (100%) nucs =>       907 (100%)      1677 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [56079440,56080347] EXCISED REGION [56080355,56082035]
 second seq =>  [       1,     908] EXCISED REGION [     916,    2595]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         7 nucs [56080348,56080354]
 second seq =>         7 nucs [909,915]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [56080345,56080347] to [56080352,56080354]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [56080348,56080348] to [56080354,56080354]
 second seq =>         0 nucs

 56079440 ATTCTCCTGCCTTAGCCTCCCAAGTAGGTGGGACTACAGGCGAGTGCCACCACACCCAGC 56079499
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
        1 ATTCTCCTGCCTTAGCCTCCCAAGTAGGTGGGACTACAGGCAAGTGCCACCACACCCAGC 60

 56079500 TAATTTTTGTTATTTTTAGTAGAGACAGTGTTCCACCATGCTGGCCAGGCTGGACTCAAA 56079559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAATTTTTGTTATTTTTAGTAGAGACAGTGTTCCACCATGCTGGCCAGGCTGGACTCAAA 120

 56079560 ACTCCTGACCTCAAGTGATCCACCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGCGT 56079619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACTCCTGACCTCAAGTGATCCACCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGCGT 180

 56079620 GAGCCACCGCACTGGCCAAGATAACATCCTAACATCCGTCCCTGAGTTGTTTTTTAGAAA 56079679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GAGCCACCGCACTGGCCAAGATAACATCCTAACATCCGTCCCTGAGTTGTTTTTTAGAAA 240

 56079680 CCTGGCTCTTTACCAAACAGGTCCACCGGCAGGGAGACCTAAGATAAGGAGGACCTGGGG 56079739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCTGGCTCTTTACCAAACAGGTCCACCGGCAGGGAGACCTAAGATAAGGAGGACCTGGGG 300

 56079740 GCTGAAATCTGACCACTGCTAAATTTGTTCTAATTTTGTTCTTAATTTCCTCCTGAGAGG 56079799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GCTGAAATCTGACCACTGCTAAATTTGTTCTAATTTTGTTCTTAATTTCCTCCTGAGAGG 360

 56079800 CCTAGAGGAGGTCATGCCTCGTGAACCAGAGCTAATACTCTTTTCTCAAAATTTTAAACA 56079859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CCTAGAGGAGGTCATGCCTCGTGAACCAGAGCTAATACTCTTTTCTCAAAATTTTAAACA 420

 56079860 AAACTTCTCTTCCTTAACCAATTGCAAACCAGTCTCTGAATCTACCTACAACCTGTAAGC 56079919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAACTTCTCTTCCTTAACCAATTGCAAACCAGTCTCTGAATCTACCTACAACCTGTAAGC 480

 56079920 CCTTGCTGCAAGATATCCTGCCCTTTTAGGGCAAGGTATCCTCCATGCGCTGATTTATAA 56079979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCTTGCTGCAAGATATCCTGCCCTTTTAGGGCAAGGTATCCTCCATGCGCTGATTTATAA 540

 56079980 TTTTGTCTGTAGCTTCTGCTTCCTTGGCACCCTGCAAATAAACTCCTGCTGCAAACTGTG 56080039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTTTGTCTGTAGCTTCTGCTTCCTTGGCACCCTGCAAATAAACTCCTGCTGCAAACTGTG 600

 56080040 GTGTGGATATCTGGTCTTACTGCACCAGGCAAGCAGACCCCAGTTTGGTTCTATAACAAG 56080099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTGTGGATATCTGGTCTTACTGCACCAGGCAAGCAGACCCCAGTTTGGTTCTATAACAAG 660

 56080100 AGTCGGCTTCCCCAAAGGCACTGAAAAATGCACAGTTAAAGAGATGGCCTTTGGGAAAAC 56080159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGTCGGCTTCCCCAAAGGCACTGAAAAATGCACAGTTAAAGAGATGGCCTTTGGGAAAAC 720

 56080160 TGTGGGTAGCATGCACCTTTGATAATCTTGTGCAAAAATGATGACTTTTTAAAGGTGACC 56080219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGTGGGTAGCATGCACCTTTGATAATCTTGTGCAAAAATGATGACTTTTTAAAGGTGACC 780

 56080220 CTTTCTGTTGTGCTTAGCTCTAGCCAAAAGCTAGCTTGCTTTAAGTATTTTTTTTTAATA 56080279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTTTCTGTTGTGCTTAGCTCTAGCCAAAAGCTAGCTTGCTTTAAGTATTTTTTTTTAATA 840

 56080280 ATAGAAATCAATGAGAAGACAAAATTTATTTATTTATTTATTTATTTTTTGAGACGGAGT 56080339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATAGAAATCAATGAGAAGACAAAATTTATTTATTTATTTATTTATTTTTTGAGACGGAGT 900

 56080340 CTTGCTCT 56080347
          ||||||||
      901 CTTGCTCT 908

EXCISED REGION

 56080355 AGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCTGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCATGC 56080414
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      916 AGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCTGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCATGC 975

 56080415 CATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCCACCACGCCCGG 56080474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      976 CATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCCACCACGCCCGG 1035

 56080475 CTAATTTTTTGTATTTTTCAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTAGCCAGGATGGTCTCG 56080534
          |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1036 CTAATTTTTTGTATTTTT-AGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTAGCCAGGATGGTCTCG 1094

 56080535 ATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGCGTG 56080594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1095 ATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGCGTG 1154

 56080595 AGCCACCGCGCCCGGCCTTAAAATTTATTTTTCTAGAATGTTTCTACTCTCTAAAGTGAA 56080654
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     1155 AGCCACCGCGCCCGGCCTTAAAATTTATTTTTCTAGAATGTTTCTGCTCTCTAAAGTGAA 1214

 56080655 GACTGATGTTGAACCAAAAATTCAATACATCAGTCAATTTCATAACCATCAACTACATAC 56080714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1215 GACTGATGTTGAACCAAAAATTCAATACATCAGTCAATTTCATAACCATCAACTACATAC 1274

 56080715 CATAAAGATTTTACTTTTCTGTTAGCTACTCTCTTGAAGCTACTGAGCAGAGGTCATGGG 56080774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1275 CATAAAGATTTTACTTTTCTGTTAGCTACTCTCTTGAAGCTACTGAGCAGAGGTCATGGG 1334

 56080775 TGGCAGTTATGAAACTGTATACAACATTCAGGAATAAAAGCCAAAGACTTCCCCTAGTCA 56080834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1335 TGGCAGTTATGAAACTGTATACAACATTCAGGAATAAAAGCCAAAGACTTCCCCTAGTCA 1394

 56080835 AGCCTACTCGTGACATAGTCTCATCTAACAAACACTCAGGATAATCTTAAGTCAGAAAAT 56080894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1395 AGCCTACTCGTGACATAGTCTCATCTAACAAACACTCAGGATAATCTTAAGTCAGAAAAT 1454

 56080895 TTTCACTTTTTGAAAAGGTCCTAGGCAAAAGTAAAAAAACTGGCAACAGGTGTTGAAATT 56080954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1455 TTTCACTTTTTGAAAAGGTCCTAGGCAAAAGTAAAAAAACTGGCAACAGGTGTTGAAATT 1514

 56080955 TGCAAATTATGCGAAACATCCCGCCTGATTCCCATTTTGACTTTCCCACTGTGCTTAACA 56081014
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1515 TGCAAATTATGCGAAACATCCCGCTTGATTCCCATTTTGACTTTCCCACTGTGCTTAACA 1574

 56081015 GGACTGTCTGCGTTTATGATGGAAGAAGGAAGAATTTACACATAATGGGGGTGATGGAAC 56081074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1575 GGACTGTCTGCGTTTATGATGGAAGAAGGAAGAATTTACACATAATGGGGGTGATGGAAC 1634

 56081075 AGGTTGTTTAAACTTCTTCCATTTTATGCTTAGACACTGGGGTTGGCAAACGACAACCAG 56081134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1635 AGGTTGTTTAAACTTCTTCCATTTTATGCTTAGACACTGGGGTTGGCAAACGACAACCAG 1694

 56081135 TGGGTCAAATCTGGCTGCCAACTGTTTGTGAAAGCAAGTTTTACTGGAACACAGCCATGT 56081194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1695 TGGGTCAAATCTGGCTGCCAACTGTTTGTGAAAGCAAGTTTTACTGGAACACAGCCATGT 1754

 56081195 CTATTCATTTACACACTGCATCCACAGCTGCTTCCATGACACAAGGGCAGACTCAAGAAG 56081254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1755 CTATTCATTTACACACTGCATCCACAGCTGCTTCCATGACACAAGGGCAGACTCAAGAAG 1814

 56081255 TCGTGGCAGAAACTGATTTGCGTTGCCCTGGTGATTAATGACGCTACGCTTACTGGCCAC 56081314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1815 TCGTGGCAGAAACTGATTTGCGTTGCCCTGGTGATTAATGACGCTACGCTTACTGGCCAC 1874

 56081315 CTGTATGTCTTCTTTGGAGAAAGGTCTATTTAGATACTTTAACTGTTTTGTTTTGTTTTT 56081374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1875 CTGTATGTCTTCTTTGGAGAAAGGTCTATTTAGATACTTTAACTGTTTTGTTTTGTTTTT 1934

 56081375 TTCCTGAGACAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGACTGTAGTGGCACAGTCTCAGCTCA 56081434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1935 TTCCTGAGACAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGACTGTAGTGGCACAGTCTCAGCTCA 1994

 56081435 CTGCAACCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGCAGCTAG 56081494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1995 CTGCAACCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGCAGCTAG 2054

 56081495 GATTACAGGCATGTGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTGTATTTGTAGTAGAGATGGGGTT 56081554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2055 GATTACAGGCATGTGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTGTATTTGTAGTAGAGATGGGGTT 2114

 56081555 TCATCATTTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTGCTGACCTTGTGATCCACCTGCCTCTGCCT 56081614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2115 TCATCATTTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTGCTGACCTTGTGATCCACCTGCCTCTGCCT 2174

 56081615 CCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAACCACCGCGCCTGGCCTAGATACTTTACCTGTT 56081674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2175 CCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAACCACCGCGCCTGGCCTAGATACTTTACCTGTT 2234

 56081675 TTTCATTGGGTATCTGTCTATTTACTGAGTTATAAGAGTTCTTTTTATATTTTAGACACA 56081734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2235 TTTCATTGGGTATCTGTCTATTTACTGAGTTATAAGAGTTCTTTTTATATTTTAGACACA 2294

 56081735 AGTCCAAATATGCTTTCTTGAATCGGAATTTCAAAAATTTTATGTTCTGAGGGACTGCAT 56081794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2295 AGTCCAAATATGCTTTCTTGAATCGGAATTTCAAAAATTTTATGTTCTGAGGGACTGCAT 2354

 56081795 GAGGCAGACTTGTTCTTTTCTCTACATTTTTATTTCTTGCACCAAAGAGCAGTTTTTTTC 56081854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2355 GAGGCAGACTTGTTCTTTTCTCTACATTTTTATTTCTTGCACCAAAGAGCAGTTTTTTTC 2414

 56081855 TCTTTAGAATTCTACTCGTTAATTTTAACTCTTCACAATTTTTGCATGAGCAATGGTGTT 56081914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2415 TCTTTAGAATTCTACTCGTTAATTTTAACTCTTCACAATTTTTGCATGAGCAATGGTGTT 2474

 56081915 TTGGGAGCACTGCCACAGCTTTTATTTGAAATTTTAAACTAATAGGGTTGACATTCCAGA 56081974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2475 TTGGGAGCACTGCCACAGCTTTTATTTGAAATTTTAAACTAATAGGGTTGACATTCCAGA 2534

 56081975 ACTATCCCACTGTGCTACTCAGAAAAACACAACTACACTACTGTTTTAAGAAGAAATATT 56082034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2535 ACTATCCCACTGTGCTACTCAGAAAAACACAACTACACTACTGTTTTAAGAAGAAATATT 2594

 56082035 T 56082035
          |
     2595 T 2595

Alignment time is 1.97966 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [56069234,56090514] =>     21281 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    6970] =>      6970 nucs 'mol-32-34a8-080168_6970'

Score:        6850
Aligned:      6971        nucs
Identic:      6960 (100%) nucs =>        42 (100%)      6918 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [56079439,56079480] EXCISED REGION [56079482,56086409]
 second seq =>  [       1,      42] EXCISED REGION [      44,    6970]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [56079481,56079481]
 second seq =>         1 nucs [43,43]
ALTERNATIVE REGION(S): 2
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [4901,4901]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [43,43] to [44,44]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 56079439 GATTCTCCTGCCTTAGCCTCCCAAGTAGGTGGGACTACAGGC 56079480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GATTCTCCTGCCTTAGCCTCCCAAGTAGGTGGGACTACAGGC 42

EXCISED REGION

 56079482 AGTGCCACCACACCCAGCTAATTTTTGTTATTTTTAGTAGAGACAGTGTTCCACCATGCT 56079541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       44 AGTGCCACCACACCCAGCTAATTTTTGTTATTTTTAGTAGAGACAGTGTTCCACCATGCT 103

 56079542 GGCCAGGCTGGACTCAAAACTCCTGACCTCAAGTGATCCACCTGCCTTGGCCTCCCAAAG 56079601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      104 GGCCAGGCTGGACTCAAAACTCCTGACCTCAAGTGATCCACCTGCCTTGGCCTCCCAAAG 163

 56079602 TGCTGAGATTACAGGCGTGAGCCACCGCACTGGCCAAGATAACATCCTAACATCCGTCCC 56079661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      164 TGCTGAGATTACAGGCGTGAGCCACCGCACTGGCCAAGATAACATCCTAACATCCGTCCC 223

 56079662 TGAGTTGTTTTTTAGAAACCTGGCTCTTTACCAAACAGGTCCACCGGCAGGGAGACCTAA 56079721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      224 TGAGTTGTTTTTTAGAAACCTGGCTCTTTACCAAACAGGTCCACCGGCAGGGAGACCTAA 283

 56079722 GATAAGGAGGACCTGGGGGCTGAAATCTGACCACTGCTAAATTTGTTCTAATTTTGTTCT 56079781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      284 GATAAGGAGGACCTGGGGGCTGAAATCTGACCACTGCTAAATTTGTTCTAATTTTGTTCT 343

 56079782 TAATTTCCTCCTGAGAGGCCTAGAGGAGGTCATGCCTCGTGAACCAGAGCTAATACTCTT 56079841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      344 TAATTTCCTCCTGAGAGGCCTAGAGGAGGTCATGCCTCGTGAACCAGAGCTAATACTCTT 403

 56079842 TTCTCAAAATTTTAAACAAAACTTCTCTTCCTTAACCAATTGCAAACCAGTCTCTGAATC 56079901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      404 TTCTCAAAATTTTAAACAAAACTTCTCTTCCTTAACCAATTGCAAACCAGTCTCTGAATC 463

 56079902 TACCTACAACCTGTAAGCCCTTGCTGCAAGATATCCTGCCCTTTTAGGGCAAGGTATCCT 56079961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      464 TACCTACAACCTGTAAGCCCTTGCTGCAAGATATCCTGCCCTTTTAGGGCAAGGTATCCT 523

 56079962 CCATGCGCTGATTTATAATTTTGTCTGTAGCTTCTGCTTCCTTGGCACCCTGCAAATAAA 56080021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      524 CCATGCGCTGATTTATAATTTTGTCTGTAGCTTCTGCTTCCTTGGCACCCTGCAAATAAA 583

 56080022 CTCCTGCTGCAAACTGTGGTGTGGATATCTGGTCTTACTGCACCAGGCAAGCAGACCCCA 56080081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      584 CTCCTGCTGCAAACTGTGGTGTGGATATCTGGTCTTACTGCACCAGGCAAGCAGACCCCA 643

 56080082 GTTTGGTTCTATAACAAGAGTCGGCTTCCCCAAAGGCACTGAAAAATGCACAGTTAAAGA 56080141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      644 GTTTGGTTCTATAACAAGAGTCGGCTTCCCCAAAGGCACTGAAAAATGCACAGTTAAAGA 703

 56080142 GATGGCCTTTGGGAAAACTGTGGGTAGCATGCACCTTTGATAATCTTGTGCAAAAATGAT 56080201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      704 GATGGCCTTTGGGAAAACTGTGGGTAGCATGCACCTTTGATAATCTTGTGCAAAAATGAT 763

 56080202 GACTTTTTAAAGGTGACCCTTTCTGTTGTGCTTAGCTCTAGCCAAAAGCTAGCTTGCTTT 56080261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      764 GACTTTTTAAAGGTGACCCTTTCTGTTGTGCTTAGCTCTAGCCAAAAGCTAGCTTGCTTT 823

 56080262 AAGTATTTTTTTTTAATAATAGAAATCAATGAGAAGACAAAATTTATTTATTTATTTATT 56080321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      824 AAGTATTTTTTTTTAATAATAGAAATCAATGAGAAGACAAAATTTATTTATTTATTTATT 883

 56080322 TATTTTTTGAGACGGAGTCTTGCTCTTTCGTCTAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCT 56080381
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
      884 TATTTTTTGAGACGGAGTCTTGCTCTTTCGTCTAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCT 943

 56080382 GCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCATGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTA 56080441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      944 GCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCATGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTA 1003

 56080442 GCTGGGACTACAGGCATGTGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTCAGTAGAGA 56080501
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     1004 GCTGGGACTACAGGCATGTGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTTAGTAGAGA 1063

 56080502 TGGGGTTTCACCATGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCC 56080561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1064 TGGGGTTTCACCATGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCC 1123

 56080562 TCGGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCGGCCTTAAAATTTA 56080621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1124 TCGGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCGGCCTTAAAATTTA 1183

 56080622 TTTTTCTAGAATGTTTCTACTCTCTAAAGTGAAGACTGATGTTGAACCAAAAATTCAATA 56080681
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1184 TTTTTCTAGAATGTTTCTGCTCTCTAAAGTGAAGACTGATGTTGAACCAAAAATTCAATA 1243

 56080682 CATCAGTCAATTTCATAACCATCAACTACATACCATAAAGATTTTACTTTTCTGTTAGCT 56080741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1244 CATCAGTCAATTTCATAACCATCAACTACATACCATAAAGATTTTACTTTTCTGTTAGCT 1303

 56080742 ACTCTCTTGAAGCTACTGAGCAGAGGTCATGGGTGGCAGTTATGAAACTGTATACAACAT 56080801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1304 ACTCTCTTGAAGCTACTGAGCAGAGGTCATGGGTGGCAGTTATGAAACTGTATACAACAT 1363

 56080802 TCAGGAATAAAAGCCAAAGACTTCCCCTAGTCAAGCCTACTCGTGACATAGTCTCATCTA 56080861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1364 TCAGGAATAAAAGCCAAAGACTTCCCCTAGTCAAGCCTACTCGTGACATAGTCTCATCTA 1423

 56080862 ACAAACACTCAGGATAATCTTAAGTCAGAAAATTTTCACTTTTTGAAAAGGTCCTAGGCA 56080921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1424 ACAAACACTCAGGATAATCTTAAGTCAGAAAATTTTCACTTTTTGAAAAGGTCCTAGGCA 1483

 56080922 AAAGTAAAAAAACTGGCAACAGGTGTTGAAATTTGCAAATTATGCGAAACATCCCGCCTG 56080981
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     1484 AAAGTAAAAAAACTGGCAACAGGTGTTGAAATTTGCAAATTATGCGAAACATCCCGCTTG 1543

 56080982 ATTCCCATTTTGACTTTCCCACTGTGCTTAACAGGACTGTCTGCGTTTATGATGGAAGAA 56081041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1544 ATTCCCATTTTGACTTTCCCACTGTGCTTAACAGGACTGTCTGCGTTTATGATGGAAGAA 1603

 56081042 GGAAGAATTTACACATAATGGGGGTGATGGAACAGGTTGTTTAAACTTCTTCCATTTTAT 56081101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1604 GGAAGAATTTACACATAATGGGGGTGATGGAACAGGTTGTTTAAACTTCTTCCATTTTAT 1663

 56081102 GCTTAGACACTGGGGTTGGCAAACGACAACCAGTGGGTCAAATCTGGCTGCCAACTGTTT 56081161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1664 GCTTAGACACTGGGGTTGGCAAACGACAACCAGTGGGTCAAATCTGGCTGCCAACTGTTT 1723

 56081162 GTGAAAGCAAGTTTTACTGGAACACAGCCATGTCTATTCATTTACACACTGCATCCACAG 56081221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1724 GTGAAAGCAAGTTTTACTGGAACACAGCCATGTCTATTCATTTACACACTGCATCCACAG 1783

 56081222 CTGCTTCCATGACACAAGGGCAGACTCAAGAAGTCGTGGCAGAAACTGATTTGCGTTGCC 56081281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1784 CTGCTTCCATGACACAAGGGCAGACTCAAGAAGTCGTGGCAGAAACTGATTTGCGTTGCC 1843

 56081282 CTGGTGATTAATGACGCTACGCTTACTGGCCACCTGTATGTCTTCTTTGGAGAAAGGTCT 56081341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1844 CTGGTGATTAATGACGCTACGCTTACTGGCCACCTGTATGTCTTCTTTGGAGAAAGGTCT 1903

 56081342 ATTTAGATACTTTAACTGTTTTGTTTTGTTTTTTTCCTGAGACAGTCTCGCTCTGTTGCC 56081401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1904 ATTTAGATACTTTAACTGTTTTGTTTTGTTTTTTTCCTGAGACAGTCTCGCTCTGTTGCC 1963

 56081402 CAGGCTGGACTGTAGTGGCACAGTCTCAGCTCACTGCAACCTCCACCTCCTGGGTTCAAG 56081461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1964 CAGGCTGGACTGTAGTGGCACAGTCTCAGCTCACTGCAACCTCCACCTCCTGGGTTCAAG 2023

 56081462 CAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGCAGCTAGGATTACAGGCATGTGCCACCATGCCCA 56081521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2024 CAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGCAGCTAGGATTACAGGCATGTGCCACCATGCCCA 2083

 56081522 GCTAATTTTTGTATTTGTAGTAGAGATGGGGTTTCATCATTTTGGCCAGGCTGGTCTTGA 56081581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2084 GCTAATTTTTGTATTTGTAGTAGAGATGGGGTTTCATCATTTTGGCCAGGCTGGTCTTGA 2143

 56081582 ACTGCTGACCTTGTGATCCACCTGCCTCTGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGA 56081641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2144 ACTGCTGACCTTGTGATCCACCTGCCTCTGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGA 2203

 56081642 ACCACCGCGCCTGGCCTAGATACTTTACCTGTTTTTCATTGGGTATCTGTCTATTTACTG 56081701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2204 ACCACCGCGCCTGGCCTAGATACTTTACCTGTTTTTCATTGGGTATCTGTCTATTTACTG 2263

 56081702 AGTTATAAGAGTTCTTTTTATATTTTAGACACAAGTCCAAATATGCTTTCTTGAATCGGA 56081761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2264 AGTTATAAGAGTTCTTTTTATATTTTAGACACAAGTCCAAATATGCTTTCTTGAATCGGA 2323

 56081762 ATTTCAAAAATTTTATGTTCTGAGGGACTGCATGAGGCAGACTTGTTCTTTTCTCTACAT 56081821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2324 ATTTCAAAAATTTTATGTTCTGAGGGACTGCATGAGGCAGACTTGTTCTTTTCTCTACAT 2383

 56081822 TTTTATTTCTTGCACCAAAGAGCAGTTTTTTTCTCTTTAGAATTCTACTCGTTAATTTTA 56081881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2384 TTTTATTTCTTGCACCAAAGAGCAGTTTTTTTCTCTTTAGAATTCTACTCGTTAATTTTA 2443

 56081882 ACTCTTCACAATTTTTGCATGAGCAATGGTGTTTTGGGAGCACTGCCACAGCTTTTATTT 56081941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2444 ACTCTTCACAATTTTTGCATGAGCAATGGTGTTTTGGGAGCACTGCCACAGCTTTTATTT 2503

 56081942 GAAATTTTAAACTAATAGGGTTGACATTCCAGAACTATCCCACTGTGCTACTCAGAAAAA 56082001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2504 GAAATTTTAAACTAATAGGGTTGACATTCCAGAACTATCCCACTGTGCTACTCAGAAAAA 2563

 56082002 CACAACTACACTACTGTTTTAAGAAGAAATATTTTTAAAAAAATAGTCAACTTCAGGAAA 56082061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2564 CACAACTACACTACTGTTTTAAGAAGAAATATTTTTAAAAAAATAGTCAACTTCAGGAAA 2623

 56082062 TTCAACTTTTATAAAACTTTTATAAAGTTAGGCTGAAGCCTACATGGTCCAAGGATCTAG 56082121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2624 TTCAACTTTTATAAAACTTTTATAAAGTTAGGCTGAAGCCTACATGGTCCAAGGATCTAG 2683

 56082122 CTAGCCATGTGCAGTGGTTTTTAAATGTCCTGAAATTCTTTGATGCTGTTCCTTTCAAAA 56082181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2684 CTAGCCATGTGCAGTGGTTTTTAAATGTCCTGAAATTCTTTGATGCTGTTCCTTTCAAAA 2743

 56082182 GAAACTTCATTCCCCACTCGAGTGTGGGTGGGACTTCATGGTTCATTTCTTGTGACTAGA 56082241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2744 GAAACTTCATTCCCCACTCGAGTGTGGGTGGGACTTCATGGTTCATTTCTTGTGACTAGA 2803

 56082242 ATGTGCCACTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGGC 56082301
          ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2804 ATGTGCCAC-TTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGGC 2862

 56082302 CAGTGGCACAATCTCAGCTCACTGCAACCTCTGTCTCCTGGGTTCAAGTGATCCTCCCGT 56082361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2863 CAGTGGCACAATCTCAGCTCACTGCAACCTCTGTCTCCTGGGTTCAAGTGATCCTCCCGT 2922

 56082362 CCCAACCACCCAAGTAGCTGGGATTACAAGCGTGCACTACCACGCCTAGCTATTTTCTTT 56082421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2923 CCCAACCACCCAAGTAGCTGGGATTACAAGCGTGCACTACCACGCCTAGCTATTTTCTTT 2982

 56082422 TTTTTTTTTTAAAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAGCTCCT 56082481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2983 TTTTTTTTTTAAAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAGCTCCT 3042

 56082482 GGCCTCAAGTTATCCACCTGCCTTGGCCTCCCGAAGTACTGGGATTACAGGTGTGAGCCC 56082541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3043 GGCCTCAAGTTATCCACCTGCCTTGGCCTCCCGAAGTACTGGGATTACAGGTGTGAGCCC 3102

 56082542 CCACAGCTGGCTGTTGTGCCGCTTTTAGGACTAGACTGCAAAAGGCACCATGGCTTCCTA 56082601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3103 CCACAGCTGGCTGTTGTGCCGCTTTTAGGACTAGACTGCAAAAGGCACCATGGCTTCCTA 3162

 56082602 CTTGCACTCTCTCACTTGCTCTGAGTCAGGAGGACACTCAAGCAGCCCTGCAGAGAGGTC 56082661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3163 CTTGCACTCTCTCACTTGCTCTGAGTCAGGAGGACACTCAAGCAGCCCTGCAGAGAGGTC 3222

 56082662 CCTGTAGCAAGGAACTGAGGCCGGTGCCAGCAGTTGTGTGGCGGAGCTGTCCTGGAAGTG 56082721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3223 CCTGTAGCAAGGAACTGAGGCCGGTGCCAGCAGTTGTGTGGCGGAGCTGTCCTGGAAGTG 3282

 56082722 GATCCTCTGGCCCCAGTCCAGCCTTCGGATGATGCAGCCCTGGCGGACATCCTGACTGCA 56082781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3283 GATCCTCTGGCCCCAGTCCAGCCTTCGGATGATGCAGCCCTGGCGGACATCCTGACTGCA 3342

 56082782 GCCTCAGGAGTGGCCCTGAGCCAGGACCACCCAGTTCAGCCACTTCCGAGTTCCCAACCC 56082841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3343 GCCTCAGGAGTGGCCCTGAGCCAGGACCACCCAGTTCAGCCACTTCCGAGTTCCCAACCC 3402

 56082842 AGAGAATCTGTCAGGTGATAAATGTTTGTGGTTTTAAGCCACTCCATTTTGAGGTAATCT 56082901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3403 AGAGAATCTGTCAGGTGATAAATGTTTGTGGTTTTAAGCCACTCCATTTTGAGGTAATCT 3462

 56082902 GTCATACAGAAATAGATAACTAATACAACACCTAAAAGAATAAAACCATAAATGTATTGC 56082961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3463 GTCATACAGAAATAGATAACTAATACAACACCTAAAAGAATAAAACCATAAATGTATTGC 3522

 56082962 TTAGTCCAGTACCAACAGCACTATTCTTTTTTTTTTAATTAAAAAAGTTATTTTAGAGAC 56083021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3523 TTAGTCCAGTACCAACAGCACTATTCTTTTTTTTTTAATTAAAAAAGTTATTTTAGAGAC 3582

 56083022 AGGGTCTCACTCTGTCTTTGAGGCCAGAGTGCAGTGGTGCGATCGTGACTCACTGTAGCC 56083081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3583 AGGGTCTCACTCTGTCTTTGAGGCCAGAGTGCAGTGGTGCGATCGTGACTCACTGTAGCC 3642

 56083082 TCCAACTCCTGGGCTCAAGTGGTCCTCCTGTCTCAGCCTCCTGAGCAGCTAGGCCTACAG 56083141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3643 TCCAACTCCTGGGCTCAAGTGGTCCTCCTGTCTCAGCCTCCTGAGCAGCTAGGCCTACAG 3702

 56083142 GGGTGCACCACCACAACCAGCTAATTTTTTTGGAGGGATGGGGGTCTCCCTGTGTTGCCC 56083201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3703 GGGTGCACCACCACAACCAGCTAATTTTTTTGGAGGGATGGGGGTCTCCCTGTGTTGCCC 3762

 56083202 AGGCTGATCTCAAACTCCTGGCCTCAAGTAATCCTCCCACCTTGGCCTCTCAAGTAGCTG 56083261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3763 AGGCTGATCTCAAACTCCTGGCCTCAAGTAATCCTCCCACCTTGGCCTCTCAAGTAGCTG 3822

 56083262 GGATTATAGACACCAATAACATTATTCTAGGGACATCTGAAAAAATGTGTGAAAACTGCA 56083321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3823 GGATTATAGACACCAATAACATTATTCTAGGGACATCTGAAAAAATGTGTGAAAACTGCA 3882

 56083322 TTCTCTCTGTCAAGTAGCCTAAATCTAGTTCACTGTTTGAAAATATTACACTAAAAGGTG 56083381
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     3883 TTCTCTCTGTCAAGTAGCCTAAATCTAGTTCACTGTTTGAAAATATTACACTAAAAGCTG 3942

 56083382 GGGTTCTTTGGGGAGTCTGATAACTCCCTATTGTAAGATTTTGTGTGTTGGATTGTCCTT 56083441
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
     3943 GGGTTCTTTGGGGAGTCTGATAACTCCCTATTGTAAGATTTTGTGTGTTGGATTGTCC-T 4001

 56083442 TTTTTTTTTTTTAGGGGATGAGGAGACCACACTTTCATAGGATTCTTCAAGAATTTTGTG 56083501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4002 TTTTTTTTTTTTAGGGGATGAGGAGACCACACTTTCATAGGATTCTTCAAGAATTTTGTG 4061

 56083502 ATTTTAAAAAACTAATAACCACTTTCCTAAGGCATGACAGATGCTCCTGAAGTCCTGGCA 56083561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4062 ATTTTAAAAAACTAATAACCACTTTCCTAAGGCATGACAGATGCTCCTGAAGTCCTGGCA 4121

 56083562 GGTTTCTATAATCGGGTTTAAACTCTCCTGGTGTGACACTGTCCTCCTGAGATAGAGGGA 56083621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4122 GGTTTCTATAATCGGGTTTAAACTCTCCTGGTGTGACACTGTCCTCCTGAGATAGAGGGA 4181

 56083622 TCTTTCCATGGGGGATTTACTGTGACTTAAGTAAGCTTACCCAGCGGGAAAAGCCTTTGC 56083681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4182 TCTTTCCATGGGGGATTTACTGTGACTTAAGTAAGCTTACCCAGCGGGAAAAGCCTTTGC 4241

 56083682 CACACTTGGAGCATTTGTAAACAGTCGGGATGAAATTTGCATCGTGGTATTTCCTGAAGT 56083741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4242 CACACTTGGAGCATTTGTAAACAGTCGGGATGAAATTTGCATCGTGGTATTTCCTGAAGT 4301

 56083742 GAGCGTTTAGAAGTTGCTTCTGTCGGAAACATTTATTGCAAGAAAGGCAGGTGAATGGTT 56083801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4302 GAGCGTTTAGAAGTTGCTTCTGTCGGAAACATTTATTGCAAGAAAGGCAGGTGAATGGTT 4361

 56083802 TCTCTCCAGTGTGGGTACGAATGTGAGCGGTCATATGACGTTCCTAAGAGGGAAGGGGAA 56083861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4362 TCTCTCCAGTGTGGGTACGAATGTGAGCGGTCATATGACGTTCCTAAGAGGGAAGGGGAA 4421

 56083862 GAAAGCAGCTTGTCTAGTTCAAAGGGTTTTCTCGATATTAGACACTGTTTATCATACAAT 56083921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4422 GAAAGCAGCTTGTCTAGTTCAAAGGGTTTTCTCGATATTAGACACTGTTTATCATACAAT 4481

 56083922 ACCTTTTATTTCCCTCCCCAAAGATGAGTCCACTATTAAGCAGAATTACTGCAAACACAT 56083981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4482 ACCTTTTATTTCCCTCCCCAAAGATGAGTCCACTATTAAGCAGAATTACTGCAAACACAT 4541

 56083982 TCTGAACAAGGCAGCATTCACTCTCAGTAAGTGGCCGCCTAGGAAACAAAACTCGTATGC 56084041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4542 TCTGAACAAGGCAGCATTCACTCTCAGTAAGTGGCCGCCTAGGAAACAAAACTCGTATGC 4601

 56084042 AGCAGCAAGTGACAAAGGTCTTGCAGTGGATTCCTTGCTGGCTCTCCTGTCCTGTTGGGA 56084101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4602 AGCAGCAAGTGACAAAGGTCTTGCAGTGGATTCCTTGCTGGCTCTCCTGTCCTGTTGGGA 4661

 56084102 TGTGGGAGTACACACCGCAGGGCGTGAAAGGATGGTCCTTTGTCCTCTCATTACTGGGAG 56084161
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4662 TGTGGGGGTACACACCGCAGGGCGTGAAAGGATGGTCCTTTGTCCTCTCATTACTGGGAG 4721

 56084162 TCCTCCTTCTATACAACTATTTACAATTACCTGAATTTACAAAGGGCAAATAGAACCTGC 56084221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4722 TCCTCCTTCTATACAACTATTTACAATTACCTGAATTTACAAAGGGCAAATAGAACCTGC 4781

 56084222 AAACTTAAAAATCAAATGTCAGAGTTTAAATTCAGCAGACCTTTGGGGTTGCAAGTACCT 56084281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4782 AAACTTAAAAATCAAATGTCAGAGTTTAAATTCAGCAGACCTTTGGGGTTGCAAGTACCT 4841

 56084282 TAAGTATCAACATTTTTCCATTTACTTCCCAATAGTATCGTAACAGATCTTAATACCGA- 56084340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
     4842 TAAGTATCAACATTTTTCCATTTACTTCCCAATAGTATCGTAACAGATCTTAATACCGAT 4901

 56084341 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGGGTCTCGCTCTGTCACAATCATAGCTCACTGCAA 56084400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4902 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGGGTCTCGCTCTGTCACAATCATAGCTCACTGCAA 4961

 56084401 TCTCAAACTCCTGGGCCCAAGTGATCCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTGT 56084460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4962 TCTCAAACTCCTGGGCCCAAGTGATCCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTGT 5021

 56084461 GGACGCATGCCACTATGCTCGGCTCAGTTTGTATTTTTTGTAGAGACAGGGTCTCACTAT 56084520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5022 GGACGCATGCCACTATGCTCGGCTCAGTTTGTATTTTTTGTAGAGACAGGGTCTCACTAT 5081

 56084521 GTTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTAGCCTCAAGCAATTCTCCTGCCTTAGCCTCCCAA 56084580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5082 GTTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTAGCCTCAAGCAATTCTCCTGCCTTAGCCTCCCAA 5141

 56084581 AGTGCTGGGATTATAGGTGTGAGCCACTGTACCTGGCCTAAATAGAGATTTTATCTTAGA 56084640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5142 AGTGCTGGGATTATAGGTGTGAGCCACTGTACCTGGCCTAAATAGAGATTTTATCTTAGA 5201

 56084641 CAGGAGAAAATAATTTGGGAAATCAGGAAAAAAATATGTATGAAGTCAAGCAAAAGTACA 56084700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5202 CAGGAGAAAATAATTTGGGAAATCAGGAAAAAAATATGTATGAAGTCAAGCAAAAGTACA 5261

 56084701 CATTTTGTTTTATTTAAAATGTGATGATTATTTGGATTAAATATATATTCGGCCATTTCT 56084760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5262 CATTTTGTTTTATTTAAAATGTGATGATTATTTGGATTAAATATATATTCGGCCATTTCT 5321

 56084761 GCATTACTGTCAGTGGCCTAACTGATGCTCTTTCTTCTAATCTTTCTCTCACCCAATTCA 56084820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5322 GCATTACTGTCAGTGGCCTAACTGATGCTCTTTCTTCTAATCTTTCTCTCACCCAATTCA 5381

 56084821 CTAAACACCCTCTTCCATGCACAGCTTTCACCTCATCACCCTCCTTTGGGACAGCATCTC 56084880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5382 CTAAACACCCTCTTCCATGCACAGCTTTCACCTCATCACCCTCCTTTGGGACAGCATCTC 5441

 56084881 TGGCGCTCCCTGCTGGGAGCCTGACTCTCCAGGACCGCGGCAGCCAGGAGCACCCAGCAG 56084940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5442 TGGCGCTCCCTGCTGGGAGCCTGACTCTCCAGGACCGCGGCAGCCAGGAGCACCCAGCAG 5501

 56084941 TGCTCCAAGCCTCTGCCCACGGCCATGACCTGCCTGGCTGCTCTCTACTCCCACATACCT 56085000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5502 TGCTCCAAGCCTCTGCCCACGGCCATGACCTGCCTGGCTGCTCTCTACTCCCACATACCT 5561

 56085001 GCTGTATGCCTGCTCCAGGGCCCCTCATCCTTTCCAAGTCCTATCCATCTTTCAGGAAGC 56085060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5562 GCTGTATGCCTGCTCCAGGGCCCCTCATCCTTTCCAAGTCCTATCCATCTTTCAGGAAGC 5621

 56085061 CCTCCTAGTTCATTTGAATAAGTATGAGCCTGAGGCCTCAGAATATTCTTTGTTCAAAAT 56085120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5622 CCTCCTAGTTCATTTGAATAAGTATGAGCCTGAGGCCTCAGAATATTCTTTGTTCAAAAT 5681

 56085121 CTACCAGAAAAACTCCTTTTCCCTTATTCAAAGCATTTACAGTTTACAGCCCACACTTCA 56085180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5682 CTACCAGAAAAACTCCTTTTCCCTTATTCAAAGCATTTACAGTTTACAGCCCACACTTCA 5741

 56085181 AAACACACAGTAAGCACTGATTTTCACCTTTGGTAACCAATAGCATGCAATACTTTGAAG 56085240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5742 AAACACACAGTAAGCACTGATTTTCACCTTTGGTAACCAATAGCATGCAATACTTTGAAG 5801

 56085241 CAGTGTTTTGGTTTTCAAACTTCTACTCTGAGGGCCTTTTATACTTTAAAAAATTACTGT 56085300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5802 CAGTGTTTTGGTTTTCAAACTTCTACTCTGAGGGCCTTTTATACTTTAAAAAATTACTGT 5861

 56085301 GGCCTCTGAAGAGCTTTTATGTATACAGGTGGCATGTATTAGTATTTACTTTCTTAGAAA 56085360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5862 GGCCTCTGAAGAGCTTTTATGTATACAGGTGGCATGTATTAGTATTTACTTTCTTAGAAA 5921

 56085361 GCAAACCTGGGGAATTCTTAAGTGTTTTTTAAAATAAAACAATTTATTAACTCATTTAAA 56085420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5922 GCAAACCTGGGGAATTCTTAAGTGTTTTTTAAAATAAAACAATTTATTAACTCATTTAAA 5981

 56085421 AATAAAAACAAACCAACTACATATTATTTCTGTAAAATTATCTATTTTTCAAAACAAAAA 56085480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5982 AATAAAAACAAACCAACTACATATTATTTCTGTAAAATTATCTATTTTTCAAAACAAAAA 6041

 56085481 TAACCTAATGTCTGTCTTAATAGATAAGGTTTCCAGTTAAAATACAGGCTGCAACTACTT 56085540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6042 TAACCTAATGTCTGTCTTAATAGATAAGGTTTCCAGTTAAAATACAGGCTGCAACTACTT 6101

 56085541 GTATATAAAACTATTTGTTGTTGTCTGAAGTTCAAATGTCACTAAGTGTGCTGTATTTTT 56085600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6102 GTATATAAAACTATTTGTTGTTGTCTGAAGTTCAAATGTCACTAAGTGTGCTGTATTTTT 6161

 56085601 ATTTGCTAAGTCTGACAGCTCTATTAAAAGCATTCGGGGCCAGGCGCGGTGGCTCACGCC 56085660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6162 ATTTGCTAAGTCTGACAGCTCTATTAAAAGCATTCGGGGCCAGGCGCGGTGGCTCACGCC 6221

 56085661 TATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCAGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGAC 56085720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6222 TATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCAGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGAC 6281

 56085721 CATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAATAAGCCAGGCG 56085780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6282 CATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAATAAGCCAGGCG 6341

 56085781 TGGTGGGGGCCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAA 56085840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6342 TGGTGGGGGCCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAA 6401

 56085841 CCCAGGAGGTGGAGTTTGCAGTGATAGCGCCACTGCACTCTAGCCTGGGCAACAGAGTGA 56085900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6402 CCCAGGAGGTGGAGTTTGCAGTGATAGCGCCACTGCACTCTAGCCTGGGCAACAGAGTGA 6461

 56085901 GACTCCGTCTAAAAAATAAAAAAATAAAAAAAGAATTCAGATGGATTCCTATCTCTGCTC 56085960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6462 GACTCCGTCTAAAAAATAAAAAAATAAAAAAAGAATTCAGATGGATTCCTATCTCTGCTC 6521

 56085961 TTCCCTCAGTCCACTGGAGTATGTTAAGTGATAAAGAAAATTTGGTCTCACAGACATGTA 56086020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6522 TTCCCTCAGTCCACTGGAGTATGTTAAGTGATAAAGAAAATTTGGTCTCACAGACATGTA 6581

 56086021 GTTTGAAAAGAGAGCAACATTTTACTAGCTCTTCCAAATAACTGTGGGCATTCTTCTCTG 56086080
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6582 GCTTGAAAAGAGAGCAACATTTTACTAGCTCTTCCAAATAACTGTGGGCATTCTTCTCTG 6641

 56086081 CTATTACACTAAAATTCAGTTAGTAGTAATTTCTTTTTTTAGGGTCTCACTCAGTTGTCC 56086140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6642 CTATTACACTAAAATTCAGTTAGTAGTAATTTCTTTTTTTAGGGTCTCACTCAGTTGTCC 6701

 56086141 GTGCTGGAGTGCAGTGGTATGAACACAGCCTACTGCAGCCTCAACCTCCTGGGCTTAAGT 56086200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6702 GTGCTGGAGTGCAGTGGTATGAACACAGCCTACTGCAGCCTCAACCTCCTGGGCTTAAGT 6761

 56086201 GATCCTCCAACCTTAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACAGATATGCACCACCACCCACAGCTA 56086260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6762 GATCCTCCAACCTTAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACAGATATGCACCACCACCCACAGCTA 6821

 56086261 ATTTTTGTATTTTTTTGTAGAGACAGGGTCTCATTATGTTGCCCAGGTTGGTCTTGAATT 56086320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6822 ATTTTTGTATTTTTTTGTAGAGACAGGGTCTCATTATGTTGCCCAGGTTGGTCTTGAATT 6881

 56086321 CCTGAGCTCAACAGTTCTGTCCATCTCGGCCTCCCAAAGTGTTGGGACTATAGGTGTGAG 56086380
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6882 CCTGAGCTCAAGAGTTCTGTCCATCTCGGCCTCCCAAAGTGTTGGGACTATAGGTGTGAG 6941

 56086381 CCAGTGTGTCTGGCCATGGTAATTTCTTA 56086409
          |||||||||||||||||||||||||||||
     6942 CCAGTGTGTCTGGCCATGGTAATTTCTTA 6970

Alignment time is 5.19191 s

