
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [52637064,52668002] =>     30939 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    5821] =>      5821 nucs 'mol-32-1e7c-076814_5821'

Score:        5569
Aligned:      5831        nucs
Identic:      5772 ( 99%) nucs =>      2610 (100%)      3162 ( 98%)
Gaps:           47 (  1%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [52644448,52647064] EXCISED REGION [52658003,52661179]
 second seq =>  [       1,    2617] EXCISED REGION [    2618,    5821]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>     10938 nucs [52647065,52658002]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         6 nucs [52647065,52647070] to [52658003,52658008]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [52647065,52647067] to [52658000,52658002]
 second seq =>         0 nucs

 52644448 TATTCAAACACACACCTTAGAGCAAAAGATGGTTAAATATCAATTCAGGCTATTAACAGT 52644507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TATTCAAACACACACCTTAGAGCAAAAGATGGTTAAATATCAATTCAGGCTATTAACAGT 60

 52644508 AAGGGAC---GAAATGTGTTCCAACAAAACTCTGCATGTCAACAAACTACAGAGACTAGG 52644564
          ||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAGG---AATGAAATGTGTTCCAACAAAACTCTGCATGTCAACAAACTACAGAGACTAGG 117

 52644565 TAACATCTTTTAGGAATCATTTTTATTCCACTAATGCCTTTTCCTCCAGAATCCACTGAT 52644624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      118 TAACATCTTTTAGGAATCATTTTTATTCCACTAATGCCTTTTCCTCCAGAATCCACTGAT 177

 52644625 CGTAAACGCAACCTGTCTACTTCCGCCTTTGAAAAATGGATGGACAAATTCATCTGCATG 52644684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      178 CGTAAACGCAACCTGTCTACTTCCGCCTTTGAAAAATGGATGGACAAATTCATCTGCATG 237

 52644685 TAACTCACCTCCTCTTTTCTTTTACATAAAACAGATGCCACAGCTGTTATTGTTCTTCAC 52644744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      238 TAACTCACCTCCTCTTTTCTTTTACATAAAACAGATGCCACAGCTGTTATTGTTCTTCAC 297

 52644745 ACAGAAGTTTCTACCCAGAGAAACATCAGGATGACACTCTGCTGCAATGTGCTATTTGTT 52644804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      298 ACAGAAGTTTCTACCCAGAGAAACATCAGGATGACACTCTGCTGCAATGTGCTATTTGTT 357

 52644805 CTAGAGGGGTCAACAGCTTGCCACCTTGCCTAGGCCCAGGGTGACTGCATATGTGCAGTG 52644864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      358 CTAGAGGGGTCAACAGCTTGCCACCTTGCCTAGGCCCAGGGTGACTGCATATGTGCAGTG 417

 52644865 GTCTTATCCCATTAGCGCCCCCGAGCATGCATTCAGAACCAAGTGGATACACCTTGGCAC 52644924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      418 GTCTTATCCCATTAGCGCCCCCGAGCATGCATTCAGAACCAAGTGGATACACCTTGGCAC 477

 52644925 ACTTACCTTCCCTGCAGGGACATCATCGGACTGCCCTGATAAGCCAGGAACCTCATCCAC 52644984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      478 ACTTACCTTCCCTGCAGGGACATCATCGGACTGCCCTGATAAGCCAGGAACCTCATCCAC 537

 52644985 CTTGTCTTGATGCTCTGCCCTCTTGGCTTCCTGTTGGCTGTCACCTGGCACCTTTTCCTG 52645044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      538 CTTGTCTTGATGCTCTGCCCTCTTGGCTTCCTGTTGGCTGTCACCTGGCACCTTTTCCTG 597

 52645045 TCCCTTGTCCAGCTTGAAGAATTTGTCAAAAAAGCTGGAGTCCTTGGGCTTGGAGGGAGC 52645104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      598 TCCCTTGTCCAGCTTGAAGAATTTGTCAAAAAAGCTGGAGTCCTTGGGCTTGGAGGGAGC 657

 52645105 TTCTCCTCCTGCTCCCCCTGTCTCAGGTGGGAGAAGCGTGGGATCCCTGGCGGCAGAGAG 52645164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      658 TTCTCCTCCTGCTCCCCCTGTCTCAGGTGGGAGAAGCGTGGGATCCCTGGCGGCAGAGAG 717

 52645165 GACCTTGTCTTGGGCCGGGGCGTGCCCTGGGGTTTTATCTGTGTCCTGCCCCGGTCCAGC 52645224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      718 GACCTTGTCTTGGGCCGGGGCGTGCCCTGGGGTTTTATCTGTGTCCTGCCCCGGTCCAGC 777

 52645225 TGCCACCGGAAGTGTCCAGCTCTCACTTGGGTCTTTGTTCGCTGGAGCTTTATTGGAGCT 52645284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      778 TGCCACCGGAAGTGTCCAGCTCTCACTTGGGTCTTTGTTCGCTGGAGCTTTATTGGAGCT 837

 52645285 GACATCAAGCTTCACTGATCCAAGGGATGAATCTGCGGCTTGGTCTCCGGTACGTCCTGG 52645344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      838 GACATCAAGCTTCACTGATCCAAGGGATGAATCTGCGGCTTGGTCTCCGGTACGTCCTGG 897

 52645345 TACAGGCCGAGAGAGCATCAAGAAAAAACGAGATTTAGCAGCTGGTGCCTCGGGTTTGGC 52645404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      898 TACAGGCCGAGAGAGCATCAAGAAAAAACGAGATTTAGCAGCTGGTGCCTCGGGTTTGGC 957

 52645405 CTCTTTCCCAAGATTCTTTCCGTTGGCATCCGCAACAGCACTTATCTCCGTTGTCTCGGG 52645464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      958 CTCTTTCCCAAGATTCTTTCCGTTGGCATCCGCAACAGCACTTATCTCCGTTGTCTCGGG 1017

 52645465 GGAAGAAGTGGCCACATTATCCGTCTTGACACTTATTCCCAAGTCGACTGTAAACACAAA 52645524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1018 GGAAGAAGTGGCCACATTATCCGTCTTGACACTTATTCCCAAGTCGACTGTAAACACAAA 1077

 52645525 CATAAACAGTGGTTATTCAGCCAAGCCGGGAAATTCAGGCACTAATAATGGACTCCAGAC 52645584
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1078 CATAAACAGCGGTTATTCAGCCAAGCCGGGAAATTCAGGCACTAATAATGGACTCCAGAC 1137

 52645585 ATTTTTTATACAAAAGCCATACTGCATACTGGAACTGTGTTGTTCTCTGGTCATTCTGAA 52645644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1138 ATTTTTTATACAAAAGCCATACTGCATACTGGAACTGTGTTGTTCTCTGGTCATTCTGAA 1197

 52645645 AGGCAGAAGTTAGCTCTCTACATCTCCTTGGACCCTGCTTTTCTTGGGAGAGGAGAAGGC 52645704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1198 AGGCAGAAGTTAGCTCTCTACATCTCCTTGGACCCTGCTTTTCTTGGGAGAGGAGAAGGC 1257

 52645705 AAGGTTGGTGAGGAGGGAAAGCTACTTAATGGAAAGTCACTAGCTGCCAGGTGTGGAATG 52645764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1258 AAGGTTGGTGAGGAGGGAAAGCTACTTAATGGAAAGTCACTAGCTGCCAGGTGTGGAATG 1317

 52645765 AGTGATATTCAATGTTAATTAATCTTCTTTTATCTGTGTAAGAACTCCGTGAGCAGCATA 52645824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1318 AGTGATATTCAATGTTAATTAATCTTCTTTTATCTGTGTAAGAACTCCGTGAGCAGCATA 1377

 52645825 TTGTCATGATGTCAACTGGGAGGCAGTACAGCAGTTAGGAGCTTGGGTTCTGGAGCTAGA 52645884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1378 TTGTCATGATGTCAACTGGGAGGCAGTACAGCAGTTAGGAGCTTGGGTTCTGGAGCTAGA 1437

 52645885 ACAAGGTTTCTCAACCTCAGCACTACTCACATTTGAAGCCAGATTATTCTTTGTTAGGGA 52645944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1438 ACAAGGTTTCTCAACCTCAGCACTACTCACATTTGAAGCCAGATTATTCTTTGTTAGGGA 1497

 52645945 GGCTCATCCCGTGCCTCATAGGCTGATTAGCAGCATCCTGGCCTCTGCCCACTAGACGCC 52646004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1498 GGCTCATCCCGTGCCTCATAGGCTGATTAGCAGCATCCTGGCCTCTGCCCACTAGACGCC 1557

 52646005 GGTCACATTTCCCAGTCATGGCAACCAAAAATATCTCTAGGCATTGCTAAATGTCCCCTG 52646064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1558 GGTCACATTTCCCAGTCATGGCAACCAAAAATATCTCTAGGCATTGCTAAATGTCCCCTG 1617

 52646065 GAGGACAAAATCTCTTACGTTTGAGAGGCACTGAGCTGAAATGTCTTTTTGAATCCAGAT 52646124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1618 GAGGACAAAATCTCTTACGTTTGAGAGGCACTGAGCTGAAATGTCTTTTTGAATCCAGAT 1677

 52646125 TATCTAATTTTCTGTGCCTCAACTTTCTGGTAAAAGGAGACAGATAATAAATCTCGTAAT 52646184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1678 TATCTAATTTTCTGTGCCTCAACTTTCTGGTAAAAGGAGACAGATAATAAATCTCGTAAT 1737

 52646185 TTTGTTAGGAAGATTACATGAGTTAATAGTTTTAAAGCAAGTACAATAGCACCTGGAATA 52646244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     1738 TTTGTTAGGAAGATTACATGAGTTAATAGTTTTAAAGCAAGTACAATAGCGCCTGGAATA 1797

 52646245 TATTAAGTGCTTAATAAATATCACAAACATTAGTTATCATTATTCATGAGTGAGAAAACT 52646304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1798 TATTAAGTGCTTAATAAATATCACAAACATTAGTTATCATTATTCATGAGTGAGAAAACT 1857

 52646305 GACAGTCAGAGAGGTCAGTACACCCTCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCTAGTAAGCAGCAGA 52646364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1858 GACAGTCAGAGAGGTCAGTACACCCTCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCTAGTAAGCAGCAGA 1917

 52646365 GTCTGGCTTCAGGCAGAAATCTGACTTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGTCTTACCAGGGAC 52646424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1918 GTCTGGCTTCAGGCAGAAATCTGACTTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGTCTTACCAGGGAC 1977

 52646425 TTGTATTAGCATAGACTGTTAAGAATATGGGAAGATTTTTAAAATACAGTACTCAGAAAA 52646484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1978 TTGTATTAGCATAGACTGTTAAGAATATGGGAAGATTTTTAAAATACAGTACTCAGAAAA 2037

 52646485 TTTCTCTTTGAAAGGCTGGAAGAGCAGATATCCACACAAGAAGGCAAATTAGACCTCAGG 52646544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2038 TTTCTCTTTGAAAGGCTGGAAGAGCAGATATCCACACAAGAAGGCAAATTAGACCTCAGG 2097

 52646545 CCAGTGTGGAATTAAAGGTGTAGGGTTATCTGGTCAAGACTGTGTGTGTGGATACAGGCT 52646604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2098 CCAGTGTGGAATTAAAGGTGTAGGGTTATCTGGTCAAGACTGTGTGTGTGGATACAGGCT 2157

 52646605 CCAACCCCTCCAGGCAAGGGCACTGTTTCCAACATCCACCCTTTCTCCTTTGACCTCTAC 52646664
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2158 CCAACCCCTCCAGGCAAGGGCAATGTTTCCAACATCCACCCTTTCTCCTTTGACCTCTAC 2217

 52646665 CTTGACCTAAATTAACTATAAAAGGTCCTTCTTTTCTAGGACCCTACTATAAATCAGTGA 52646724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2218 CTTGACCTAAATTAACTATAAAAGGTCCTTCTTTTCTAGGACCCTACTATAAATCAGTGA 2277

 52646725 AATATTCAGGAAAAAAAGAACACCAAGAATGTTGGGATCCCAGTTAAAGATCAAGATTCT 52646784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2278 AATATTCAGGAAAAAAAGAACACCAAGAATGTTGGGATCCCAGTTAAAGATCAAGATTCT 2337

 52646785 CTACTGATAAGCTGTGTGATATGGAGTAAATCACTAAAGATCTTTGAATCTCTTCATTTG 52646844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2338 CTACTGATAAGCTGTGTGATATGGAGTAAATCACTAAAGATCTTTGAATCTCTTCATTTG 2397

 52646845 TAAAATGGGAATATTGGTAGTCCTACTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTAAAGAAGAAAAGT 52646904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2398 TAAAATGGGAATATTGGTAGTCCTACTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTAAAGAAGAAAAGT 2457

 52646905 CATGCAAAGGATCTGGCACAACGCCTTTTCCATAATAAGTGCTTAGTAATTGACAGATAC 52646964
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2458 CATGCAAAGGATCTGGCACAATGCCTTTTCCATAATAAGTGCTTAGTAATTGACAGATAC 2517

 52646965 TGTGATAACTTTTCAGGTTTCTCTCATGCCTTTGACAACATTGCATTTTGCTTGCTCTAT 52647024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2518 TGTGATAACTTTTCAGGTTTCTCTCATGCCTTTGACAACATTGCATTTTGCTTGCTCTAT 2577

 52647025 CTGTAGTCAGACACTTCTTAATATCTGTTTGCAGGAAGAC 52647064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2578 CTGTAGTCAGACACTTCTTAATATCTGTTTGCAGGAAGAC 2617

EXCISED REGION

 52658003 AGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTG 52658062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2618 AGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTG 2677

 52658063 GCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTAT 52658122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2678 GCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTAT 2737

 52658123 AAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGG 52658182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2738 AAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGG 2797

 52658183 GAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTG 52658242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2798 GAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTG 2857

 52658243 AAACACTGTCTCTGCTAAAAAACAAAACAAAACAAAACACCAAAAAATAGCTGGGCGTAG 52658302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2858 AAACACTGTCTCTGCTAAAAAACAAAACAAAACAAAACACCAAAAAATAGCTGGGCGTAG 2917

 52658303 TGGCGGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTTGGGAGGCGGTGGCAGGAGAATCATTTGAACCT 52658362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2918 TGGCGGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTTGGGAGGCGGTGGCAGGAGAATCATTTGAACCT 2977

 52658363 GGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGAT--------TGTGCCACTGCACTCTAACCTGG 52658414
          |||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||
     2978 GGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACTGTGCCACTGCACTCTAACCTGG 3037

 52658415 GCAACAGAGTTCAGAGTGAGACTCTGTCTCCCCC-------------------------- 52658448
          ||||||||||||||||||||||||||||||                              
     3038 GCAACAGAGTTCAGAGTGAGACTCTGTCTC----ACCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 3093

 52658449 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAACAGCCATATAGATCGTCGGTGGGAGTGTAATTTGG 52658508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3094 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAACAGCCATATAGATCGTCGGTGGGAGTGTAATTTGG 3153

 52658509 CCACTTCTTTGGAAAATAGCTCAGTAATATCTATTAATACTTAAAATTTCACAAACACTG 52658568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3154 CCACTTCTTTGGAAAATAGCTCAGTAATATCTATTAATACTTAAAATTTCACAAACACTG 3213

 52658569 TAAGTCTAACTTCCACTTCTAAAATGTTATCCTAGAAATAAAATTGCATAGGGGTACAAA 52658628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3214 TAAGTCTAACTTCCACTTCTAAAATGTTATCCTAGAAATAAAATTGCATAGGGGTACAAA 3273

 52658629 GGCTTACGTATGGAACTATTTGCTGGACTACTGTAGTTGTGGCAAAAAACTGGAAATGAC 52658688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3274 GGCTTACGTATGGAACTATTTGCTGGACTACTGTAGTTGTGGCAAAAAACTGGAAATGAC 3333

 52658689 CTAAACGCTTATTAGTAGAAACCTGGTTAAATAAATTATCATATGTCCTTGAGGACACAG 52658748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3334 CTAAACGCTTATTAGTAGAAACCTGGTTAAATAAATTATCATATGTCCTTGAGGACACAG 3393

 52658749 GGACACAAAGAGGGGAATGACAGGCACTGAGCCTACTTGAGGGTGGGAGGAGGAAGTCGA 52658808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3394 GGACACAAAGAGGGGAATGACAGGCACTGAGCCTACTTGAGGGTGGGAGGAGGAAGTCGA 3453

 52658809 TCAGAAAAAATAACTAGTGGGTACTAGGCTTAGTACCCGGGTGAAAAAATAATCTGTACA 52658868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3454 TCAGAAAAAATAACTAGTGGGTACTAGGCTTAGTACCCGGGTGAAAAAATAATCTGTACA 3513

 52658869 ACAAACCCCCATGACATGAGTTTACCTTATAACAAACCTGCACATGTAATCTGAACCTAG 52658928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3514 ACAAACCCCCATGACATGAGTTTACCTTATAACAAACCTGCACATGTAATCTGAACCTAG 3573

 52658929 ATAAAAGTTTAAAAAAATAAATAATCATATGTCCCTACAATGAAATATTCCACAGGCATT 52658988
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     3574 ATAAAAGTTTAAAAAAATAAATAATCATATGTCCCTATAATGAAATATTCCACAGGCATT 3633

 52658989 AAAATTCCCCAAGGAATTTTAGTAAGGAAAGAAAAAGCTGTGCCCAACAGCACGTACAGT 52659048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3634 AAAATTCCCCAAGGAATTTTAGTAAGGAAAGAAAAAGCTGTGCCCAACAGCACGTACAGT 3693

 52659049 ATGTTTCCATTTGTTTTTAAAAAATGGTGTCGGGAGGTTGAGGAGACAACTTATAAATAG 52659108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3694 ATGTTTCCATTTGTTTTTAAAAAATGGTGTCGGGAGGTTGAGGAGACAACTTATAAATAG 3753

 52659109 ACATGCCTGGGATACCTCTGGATATAAGAAACTGTAAAGTATTTACTTCTAAGGAAGGAA 52659168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3754 ACATGCCTGGGATACCTCTGGATATAAGAAACTGTAAAGTATTTACTTCTAAGGAAGGAA 3813

 52659169 ATTTGGGATGGGGCTTGGGGAGCCATCAGAGTTAGGGTGGGGATTTTTTCTCTGCCTTAT 52659228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3814 ATTTGGGATGGGGCTTGGGGAGCCATCAGAGTTAGGGTGGGGATTTTTTCTCTGCCTTAT 3873

 52659229 CTTATTATGTATATCGCTCAGAATGTTTGCTATGTGTATGCACCTACCCCATCCATTAAG 52659288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3874 CTTATTATGTATATCGCTCAGAATGTTTGCTATGTGTATGCACCTACCCCATCCATTAAG 3933

 52659289 AAATGAAGAAATAATGAAAAGAAAAAATGAAAGTAGGGAACTAGAAATGAGAGGTGGGAT 52659348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3934 AAATGAAGAAATAATGAAAAGAAAAAATGAAAGTAGGGAACTAGAAATGAGAGGTGGGAT 3993

 52659349 TCAAAGTGGACTGAACACTTGACCTATTTCCCAATTTGCCTAGGGCTGGCCCAGCAGCGA 52659408
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     3994 TCAAAGTGGACTGAACACTTGACCTATTTCCCAATTTGCCTGGGGCTGGCCCAGCAGCGA 4053

 52659409 GGCAGGTTCTAACCAATGAGCATCAGCTTTGAATGGAGGGGCTGATAGGCCAGGTGGGCC 52659468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4054 GGCAGGTTCTAACCAATGAGCATCAGCTTTGAATGGAGGGGCTGATAGGCCAGGTGGGCC 4113

 52659469 CTGCTTGCTGAGAGTGTCATGGCCTTAGGGACATCTCCATGTTGCAGAGTCTGAGCCTCT 52659528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4114 CTGCTTGCTGAGAGTGTCATGGCCTTAGGGACATCTCCATGTTGCAGAGTCTGAGCCTCT 4173

 52659529 GCTTGGCAAATTCAGAAAATCCAGCTTTTCTTTTTATATCACCTGGAGCTGATGTAACTC 52659588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4174 GCTTGGCAAATTCAGAAAATCCAGCTTTTCTTTTTATATCACCTGGAGCTGATGTAACTC 4233

 52659589 TCAGAAGGCATTTTTAAGAGGACTCATGAATTAACCACATAGCCAACTTACTGGCTTAAG 52659648
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4234 TCAGAACGCATTTTTAAGAGGACTCATGAATTAACCACATAGCCAACTTACTGGCTTAAG 4293

 52659649 ACTACGTGACAGAAAGCTGCAAAGGGGGCCAGCCACTGGTAACATCCCACCACTGTCCCT 52659708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4294 ACTACGTGACAGAAAGCTGCAAAGGGGGCCAGCCACTGGTAACATCCCACCACTGTCCCT 4353

 52659709 CTCTGTGGAAAACACAGATGGGATGCACATTGTGACGGGCAGGATGCCTGGAGAGCCCAC 52659768
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     4354 CTCTGTGGAAAACACAGATGGGATGCACATTGTGATGGGCAGGATGCCTGGAGAGCCCAC 4413

 52659769 AAATCTGCAAGCACAGCTGAAATTGGTTACAGGATTTCAATGTTTCATTGCTTGAAGCTA 52659828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4414 AAATCTGCAAGCACAGCTGAAATTGGTTACAGGATTTCAATGTTTCATTGCTTGAAGCTA 4473

 52659829 TGATAACTTGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGACGATGATTTTTTTTATAGC 52659888
          ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4474 TGATAACT---TGATGATGATGATGATGATGATGATGATGACGATGATTTTTTTTATAGC 4530

 52659889 CATCTTTTTAGAGGGATTTGAGGTAGGGAAAAAAATAAACCTCACACTATCGGAGGTTGC 52659948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4531 CATCTTTTTAGAGGGATTTGAGGTAGGGAAAAAAATAAACCTCACACTATCGGAGGTTGC 4590

 52659949 CAACTATGAGGTCTGCTGATGGTTTGGCCAACACAGTGTTTATATTTTTTTGAATTGGGA 52660008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4591 CAACTATGAGGTCTGCTGATGGTTTGGCCAACACAGTGTTTATATTTTTTTGAATTGGGA 4650

 52660009 AATTTCATTTAAAAGTCCTAAAATCAGGCTGTTATTGAAATATCTTATTATTGGCTCAGG 52660068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4651 AATTTCATTTAAAAGTCCTAAAATCAGGCTGTTATTGAAATATCTTATTATTGGCTCAGG 4710

 52660069 GTTTCCCAGGGCAGCCATCCTTGAAGCTGTGTGGAGCCCTATAAACAAGGACGCTTTCCA 52660128
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     4711 GTTTCCCAGGGCAGCCATCCTTGAAGCTGTGTGGAGCCCTATAAACAAGGAGGCTTTCCA 4770

 52660129 GTTCCCTGCAAACTCCATTTCATTCAGAGCCTTGAGCCAGTTCTTACATGGTCCTCAGAC 52660188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4771 GTTCCCTGCAAACTCCATTTCATTCAGAGCCTTGAGCCAGTTCTTACATGGTCCTCAGAC 4830

 52660189 TTGAGCTAGTGCAAGAATACCCGGGAGGGGTTGTGGGAACAGATAGCTGGGCCCCACCCC 52660248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4831 TTGAGCTAGTGCAAGAATACCCGGGAGGGGTTGTGGGAACAGATAGCTGGGCCCCACCCC 4890

 52660249 CAGGGAAGGGGGTGTTTCTGACTCAGGAGGTCTGGGCTCCGGCTACAGAAACTGCACATC 52660308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4891 CAGGGAAGGGGGTGTTTCTGACTCAGGAGGTCTGGGCTCCGGCTACAGAAACTGCACATC 4950

 52660309 TAACCGGTACCCAGGTGATGTGATGCTGCTGGCCCAGGGACAACTCTGCGAGTCACTGCT 52660368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4951 TAACCGGTACCCAGGTGATGTGATGCTGCTGGCCCAGGGACAACTCTGCGAGTCACTGCT 5010

 52660369 ATTGGGCACTGCTATTGCACCCACACAAGGAGGCAGGCTCTGCTTACATTTTTCAGTTCT 52660428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5011 ATTGGGCACTGCTATTGCACCCACACAAGGAGGCAGGCTCTGCTTACATTTTTCAGTTCT 5070

 52660429 TGTTCCCAGAAACATTTGCTCTTTGGGGTATGCTTTGCATATAATGGATCCTACCCACTA 52660488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5071 TGTTCCCAGAAACATTTGCTCTTTGGGGTATGCTTTGCATATAATGGATCCTACCCACTA 5130

 52660489 ATACAGTATGCTGCTTTTATTGATAAACTTCCAGAAACTTGAAGCGCACCTTACCATTTC 52660548
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     5131 ATACAGTATGCTGCTTTTATTGATAAACTTCCAGATACTTGAAGCGCACCTTACCATTTC 5190

 52660549 TTTGATCTCGCTGATTATTTTTATTTTTGTTAAATGAAAATTGTTGGTAAGTTCTTTTTG 52660608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5191 TTTGATCTCGCTGATTATTTTTATTTTTGTTAAATGAAAATTGTTGGTAAGTTCTTTTTG 5250

 52660609 GTGTGGTAAAAGGATATGAAAAGCTGATTTTAAAAAAATGTCCACTCTAGGATTAGAATT 52660668
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5251 GTGTGGTAAAAGGATATGAAAAACTGATTTTAAAAAAATGTCCACTCTAGGATTAGAATT 5310

 52660669 GTAGGTGTGTTTATTCTATTTCAAGATCTGGTTAAAATGCACCTTGAGGAAAAGAATTGA 52660728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5311 GTAGGTGTGTTTATTCTATTTCAAGATCTGGTTAAAATGCACCTTGAGGAAAAGAATTGA 5370

 52660729 GTGCAGCTGTTGTTATTTCTCAATGCTGTTTCTCTTTTCATGTTTTTTTCATGTTGTCTC 52660788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5371 GTGCAGCTGTTGTTATTTCTCAATGCTGTTTCTCTTTTCATGTTTTTTTCATGTTGTCTC 5430

 52660789 TTGGTCTGTCCTATCTCTCTTGGTCTATCCTCCAAGACAGAGATGAGTGATCTTGAAACC 52660848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5431 TTGGTCTGTCCTATCTCTCTTGGTCTATCCTCCAAGACAGAGATGAGTGATCTTGAAACC 5490

 52660849 CTGCCCATGTTTTTATCTTTGGAGCCCAACTGTGCTGCCTTGTTTTCTTCTCCATCCAAA 52660908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5491 CTGCCCATGTTTTTATCTTTGGAGCCCAACTGTGCTGCCTTGTTTTCTTCTCCATCCAAA 5550

 52660909 GAGGCAAAGAGAAAGTTGCATATTACTCAACAGCAGTTGCATGACAGTTAAAATCAGACT 52660968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5551 GAGGCAAAGAGAAAGTTGCATATTACTCAACAGCAGTTGCATGACAGTTAAAATCAGACT 5610

 52660969 GTATGAGTCATGGAACAGTAAGTTGTGTCCAGAGTATCTGTCATGGTAAGTACAAAAAAG 52661028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5611 GTATGAGTCATGGAACAGTAAGTTGTGTCCAGAGTATCTGTCATGGTAAGTACAAAAAAG 5670

 52661029 TCCTTAAAAATTTAAAACAGAAATGCCAATGTTTTATTTTTGAAAAATGTGAAGAAGAAA 52661088
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     5671 TCCTTAAAAATTTAAAACAGAAATGCCAATGTTTTATTTCTGAAAAATGTGAAGAAGAAA 5730

 52661089 TTTTCCGGCCGGGCGCGGTGGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTG 52661148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5731 TTTTCCGGCCGGGCGCGGTGGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTG 5790

 52661149 GGCAGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGAC 52661179
          |||||||||||||||||||||||||||||||
     5791 GGCAGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGAC 5821

Alignment time is 6.6541 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [52637064,52668002] =>     30939 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    2623] =>      2623 nucs 'mol-32-1e7c-076814_2623'

Score:        2576
Aligned:      2620        nucs
Identic:      2616 (100%) nucs =>        64 (100%)      2552 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [52644448,52644511] EXCISED REGION [52644515,52647070]
 second seq =>  [       1,      64] EXCISED REGION [      68,    2623]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         3 nucs [52644512,52644514]
 second seq =>         3 nucs [65,67]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [52644512,52644513] to [52644515,52644516]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [52644511,52644511] to [52644515,52644515]
 second seq =>         1 nucs [64,64] to [68,68]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 52644448 TATTCAAACACACACCTTAGAGCAAAAGATGGTTAAATATCAATTCAGGCTATTAACAGT 52644507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TATTCAAACACACACCTTAGAGCAAAAGATGGTTAAATATCAATTCAGGCTATTAACAGT 60

 52644508 AAGG 52644511
          ||||
       61 AAGG 64

EXCISED REGION

 52644515 GAAATGTGTTCCAACAAAACTCTGCATGTCAACAAACTACAGAGACTAGGTAACATCTTT 52644574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       68 GAAATGTGTTCCAACAAAACTCTGCATGTCAACAAACTACAGAGACTAGGTAACATCTTT 127

 52644575 TAGGAATCATTTTTATTCCACTAATGCCTTTTCCTCCAGAATCCACTGATCGTAAACGCA 52644634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      128 TAGGAATCATTTTTATTCCACTAATGCCTTTTCCTCCAGAATCCACTGATCGTAAACGCA 187

 52644635 ACCTGTCTACTTCCGCCTTTGAAAAATGGATGGACAAATTCATCTGCATGTAACTCACCT 52644694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      188 ACCTGTCTACTTCCGCCTTTGAAAAATGGATGGACAAATTCATCTGCATGTAACTCACCT 247

 52644695 CCTCTTTTCTTTTACATAAAACAGATGCCACAGCTGTTATTGTTCTTCACACAGAAGTTT 52644754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      248 CCTCTTTTCTTTTACATAAAACAGATGCCACAGCTGTTATTGTTCTTCACACAGAAGTTT 307

 52644755 CTACCCAGAGAAACATCAGGATGACACTCTGCTGCAATGTGCTATTTGTTCTAGAGGGGT 52644814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      308 CTACCCAGAGAAACATCAGGATGACACTCTGCTGCAATGTGCTATTTGTTCTAGAGGGGT 367

 52644815 CAACAGCTTGCCACCTTGCCTAGGCCCAGGGTGACTGCATATGTGCAGTGGTCTTATCCC 52644874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      368 CAACAGCTTGCCACCTTGCCTAGGCCCAGGGTGACTGCATATGTGCAGTGGTCTTATCCC 427

 52644875 ATTAGCGCCCCCGAGCATGCATTCAGAACCAAGTGGATACACCTTGGCACACTTACCTTC 52644934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      428 ATTAGCGCCCCCGAGCATGCATTCAGAACCAAGTGGATACACCTTGGCACACTTACCTTC 487

 52644935 CCTGCAGGGACATCATCGGACTGCCCTGATAAGCCAGGAACCTCATCCACCTTGTCTTGA 52644994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      488 CCTGCAGGGACATCATCGGACTGCCCTGATAAGCCAGGAACCTCATCCACCTTGTCTTGA 547

 52644995 TGCTCTGCCCTCTTGGCTTCCTGTTGGCTGTCACCTGGCACCTTTTCCTGTCCCTTGTCC 52645054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      548 TGCTCTGCCCTCTTGGCTTCCTGTTGGCTGTCACCTGGCACCTTTTCCTGTCCCTTGTCC 607

 52645055 AGCTTGAAGAATTTGTCAAAAAAGCTGGAGTCCTTGGGCTTGGAGGGAGCTTCTCCTCCT 52645114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      608 AGCTTGAAGAATTTGTCAAAAAAGCTGGAGTCCTTGGGCTTGGAGGGAGCTTCTCCTCCT 667

 52645115 GCTCCCCCTGTCTCAGGTGGGAGAAGCGTGGGATCCCTGGCGGCAGAGAGGACCTTGTCT 52645174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      668 GCTCCCCCTGTCTCAGGTGGGAGAAGCGTGGGATCCCTGGCGGCAGAGAGGACCTTGTCT 727

 52645175 TGGGCCGGGGCGTGCCCTGGGGTTTTATCTGTGTCCTGCCCCGGTCCAGCTGCCACCGGA 52645234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      728 TGGGCCGGGGCGTGCCCTGGGGTTTTATCTGTGTCCTGCCCCGGTCCAGCTGCCACCGGA 787

 52645235 AGTGTCCAGCTCTCACTTGGGTCTTTGTTCGCTGGAGCTTTATTGGAGCTGACATCAAGC 52645294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      788 AGTGTCCAGCTCTCACTTGGGTCTTTGTTCGCTGGAGCTTTATTGGAGCTGACATCAAGC 847

 52645295 TTCACTGATCCAAGGGATGAATCTGCGGCTTGGTCTCCGGTACGTCCTGGTACAGGCCGA 52645354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      848 TTCACTGATCCAAGGGATGAATCTGCGGCTTGGTCTCCGGTACGTCCTGGTACAGGCCGA 907

 52645355 GAGAGCATCAAGAAAAAACGAGATTTAGCAGCTGGTGCCTCGGGTTTGGCCTCTTTCCCA 52645414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      908 GAGAGCATCAAGAAAAAACGAGATTTAGCAGCTGGTGCCTCGGGTTTGGCCTCTTTCCCA 967

 52645415 AGATTCTTTCCGTTGGCATCCGCAACAGCACTTATCTCCGTTGTCTCGGGGGAAGAAGTG 52645474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      968 AGATTCTTTCCGTTGGCATCCGCAACAGCACTTATCTCCGTTGTCTCGGGGGAAGAAGTG 1027

 52645475 GCCACATTATCCGTCTTGACACTTATTCCCAAGTCGACTGTAAACACAAACATAAACAGT 52645534
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     1028 GCCACATTATCCGTCTTGACACTTATTCCCAAGTCGACTGTAAACACAAACATAAACAGC 1087

 52645535 GGTTATTCAGCCAAGCCGGGAAATTCAGGCACTAATAATGGACTCCAGACATTTTTTATA 52645594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1088 GGTTATTCAGCCAAGCCGGGAAATTCAGGCACTAATAATGGACTCCAGACATTTTTTATA 1147

 52645595 CAAAAGCCATACTGCATACTGGAACTGTGTTGTTCTCTGGTCATTCTGAAAGGCAGAAGT 52645654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1148 CAAAAGCCATACTGCATACTGGAACTGTGTTGTTCTCTGGTCATTCTGAAAGGCAGAAGT 1207

 52645655 TAGCTCTCTACATCTCCTTGGACCCTGCTTTTCTTGGGAGAGGAGAAGGCAAGGTTGGTG 52645714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1208 TAGCTCTCTACATCTCCTTGGACCCTGCTTTTCTTGGGAGAGGAGAAGGCAAGGTTGGTG 1267

 52645715 AGGAGGGAAAGCTACTTAATGGAAAGTCACTAGCTGCCAGGTGTGGAATGAGTGATATTC 52645774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1268 AGGAGGGAAAGCTACTTAATGGAAAGTCACTAGCTGCCAGGTGTGGAATGAGTGATATTC 1327

 52645775 AATGTTAATTAATCTTCTTTTATCTGTGTAAGAACTCCGTGAGCAGCATATTGTCATGAT 52645834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1328 AATGTTAATTAATCTTCTTTTATCTGTGTAAGAACTCCGTGAGCAGCATATTGTCATGAT 1387

 52645835 GTCAACTGGGAGGCAGTACAGCAGTTAGGAGCTTGGGTTCTGGAGCTAGAACAAGGTTTC 52645894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1388 GTCAACTGGGAGGCAGTACAGCAGTTAGGAGCTTGGGTTCTGGAGCTAGAACAAGGTTTC 1447

 52645895 TCAACCTCAGCACTACTCACATTTGAAGCCAGATTATTCTTTGTTAGGGAGGCTCATCCC 52645954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1448 TCAACCTCAGCACTACTCACATTTGAAGCCAGATTATTCTTTGTTAGGGAGGCTCATCCC 1507

 52645955 GTGCCTCATAGGCTGATTAGCAGCATCCTGGCCTCTGCCCACTAGACGCCGGTCACATTT 52646014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1508 GTGCCTCATAGGCTGATTAGCAGCATCCTGGCCTCTGCCCACTAGACGCCGGTCACATTT 1567

 52646015 CCCAGTCATGGCAACCAAAAATATCTCTAGGCATTGCTAAATGTCCCCTGGAGGACAAAA 52646074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1568 CCCAGTCATGGCAACCAAAAATATCTCTAGGCATTGCTAAATGTCCCCTGGAGGACAAAA 1627

 52646075 TCTCTTACGTTTGAGAGGCACTGAGCTGAAATGTCTTTTTGAATCCAGATTATCTAATTT 52646134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1628 TCTCTTACGTTTGAGAGGCACTGAGCTGAAATGTCTTTTTGAATCCAGATTATCTAATTT 1687

 52646135 TCTGTGCCTCAACTTTCTGGTAAAAGGAGACAGATAATAAATCTCGTAATTTTGTTAGGA 52646194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1688 TCTGTGCCTCAACTTTCTGGTAAAAGGAGACAGATAATAAATCTCGTAATTTTGTTAGGA 1747

 52646195 AGATTACATGAGTTAATAGTTTTAAAGCAAGTACAATAGCACCTGGAATATATTAAGTGC 52646254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     1748 AGATTACATGAGTTAATAGTTTTAAAGCAAGTACAATAGCGCCTGGAATATATTAAGTGC 1807

 52646255 TTAATAAATATCACAAACATTAGTTATCATTATTCATGAGTGAGAAAACTGACAGTCAGA 52646314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1808 TTAATAAATATCACAAACATTAGTTATCATTATTCATGAGTGAGAAAACTGACAGTCAGA 1867

 52646315 GAGGTCAGTACACCCTCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCTAGTAAGCAGCAGAGTCTGGCTTC 52646374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1868 GAGGTCAGTACACCCTCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCTAGTAAGCAGCAGAGTCTGGCTTC 1927

 52646375 AGGCAGAAATCTGACTTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGTCTTACCAGGGACTTGTATTAGC 52646434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1928 AGGCAGAAATCTGACTTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGTCTTACCAGGGACTTGTATTAGC 1987

 52646435 ATAGACTGTTAAGAATATGGGAAGATTTTTAAAATACAGTACTCAGAAAATTTCTCTTTG 52646494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1988 ATAGACTGTTAAGAATATGGGAAGATTTTTAAAATACAGTACTCAGAAAATTTCTCTTTG 2047

 52646495 AAAGGCTGGAAGAGCAGATATCCACACAAGAAGGCAAATTAGACCTCAGGCCAGTGTGGA 52646554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2048 AAAGGCTGGAAGAGCAGATATCCACACAAGAAGGCAAATTAGACCTCAGGCCAGTGTGGA 2107

 52646555 ATTAAAGGTGTAGGGTTATCTGGTCAAGACTGTGTGTGTGGATACAGGCTCCAACCCCTC 52646614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2108 ATTAAAGGTGTAGGGTTATCTGGTCAAGACTGTGTGTGTGGATACAGGCTCCAACCCCTC 2167

 52646615 CAGGCAAGGGCACTGTTTCCAACATCCACCCTTTCTCCTTTGACCTCTACCTTGACCTAA 52646674
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2168 CAGGCAAGGGCAATGTTTCCAACATCCACCCTTTCTCCTTTGACCTCTACCTTGACCTAA 2227

 52646675 ATTAACTATAAAAGGTCCTTCTTTTCTAGGACCCTACTATAAATCAGTGAAATATTCAGG 52646734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2228 ATTAACTATAAAAGGTCCTTCTTTTCTAGGACCCTACTATAAATCAGTGAAATATTCAGG 2287

 52646735 AAAAAAAGAACACCAAGAATGTTGGGATCCCAGTTAAAGATCAAGATTCTCTACTGATAA 52646794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2288 AAAAAAAGAACACCAAGAATGTTGGGATCCCAGTTAAAGATCAAGATTCTCTACTGATAA 2347

 52646795 GCTGTGTGATATGGAGTAAATCACTAAAGATCTTTGAATCTCTTCATTTGTAAAATGGGA 52646854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2348 GCTGTGTGATATGGAGTAAATCACTAAAGATCTTTGAATCTCTTCATTTGTAAAATGGGA 2407

 52646855 ATATTGGTAGTCCTACTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTAAAGAAGAAAAGTCATGCAAAGG 52646914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2408 ATATTGGTAGTCCTACTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTAAAGAAGAAAAGTCATGCAAAGG 2467

 52646915 ATCTGGCACAACGCCTTTTCCATAATAAGTGCTTAGTAATTGACAGATACTGTGATAACT 52646974
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2468 ATCTGGCACAATGCCTTTTCCATAATAAGTGCTTAGTAATTGACAGATACTGTGATAACT 2527

 52646975 TTTCAGGTTTCTCTCATGCCTTTGACAACATTGCATTTTGCTTGCTCTATCTGTAGTCAG 52647034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2528 TTTCAGGTTTCTCTCATGCCTTTGACAACATTGCATTTTGCTTGCTCTATCTGTAGTCAG 2587

 52647035 ACACTTCTTAATATCTGTTTGCAGGAAGACAGAAAA 52647070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2588 ACACTTCTTAATATCTGTTTGCAGGAAGACAGAAAA 2623

Alignment time is 2.95218 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [52637064,52668002] =>     30939 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    6167] =>      6167 nucs 'mol-32-1e87-027970_6167'

Score:        6167
Aligned:      6167        nucs
Identic:      6167 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [52645755,52651921]
 second seq =>  [       1,    6167]

 52645755 GTGTGGAATGAGTGATATTCAATGTTAATTAATCTTCTTTTATCTGTGTAAGAACTCCGT 52645814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTGTGGAATGAGTGATATTCAATGTTAATTAATCTTCTTTTATCTGTGTAAGAACTCCGT 60

 52645815 GAGCAGCATATTGTCATGATGTCAACTGGGAGGCAGTACAGCAGTTAGGAGCTTGGGTTC 52645874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAGCAGCATATTGTCATGATGTCAACTGGGAGGCAGTACAGCAGTTAGGAGCTTGGGTTC 120

 52645875 TGGAGCTAGAACAAGGTTTCTCAACCTCAGCACTACTCACATTTGAAGCCAGATTATTCT 52645934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGGAGCTAGAACAAGGTTTCTCAACCTCAGCACTACTCACATTTGAAGCCAGATTATTCT 180

 52645935 TTGTTAGGGAGGCTCATCCCGTGCCTCATAGGCTGATTAGCAGCATCCTGGCCTCTGCCC 52645994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTGTTAGGGAGGCTCATCCCGTGCCTCATAGGCTGATTAGCAGCATCCTGGCCTCTGCCC 240

 52645995 ACTAGACGCCGGTCACATTTCCCAGTCATGGCAACCAAAAATATCTCTAGGCATTGCTAA 52646054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACTAGACGCCGGTCACATTTCCCAGTCATGGCAACCAAAAATATCTCTAGGCATTGCTAA 300

 52646055 ATGTCCCCTGGAGGACAAAATCTCTTACGTTTGAGAGGCACTGAGCTGAAATGTCTTTTT 52646114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATGTCCCCTGGAGGACAAAATCTCTTACGTTTGAGAGGCACTGAGCTGAAATGTCTTTTT 360

 52646115 GAATCCAGATTATCTAATTTTCTGTGCCTCAACTTTCTGGTAAAAGGAGACAGATAATAA 52646174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GAATCCAGATTATCTAATTTTCTGTGCCTCAACTTTCTGGTAAAAGGAGACAGATAATAA 420

 52646175 ATCTCGTAATTTTGTTAGGAAGATTACATGAGTTAATAGTTTTAAAGCAAGTACAATAGC 52646234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATCTCGTAATTTTGTTAGGAAGATTACATGAGTTAATAGTTTTAAAGCAAGTACAATAGC 480

 52646235 ACCTGGAATATATTAAGTGCTTAATAAATATCACAAACATTAGTTATCATTATTCATGAG 52646294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACCTGGAATATATTAAGTGCTTAATAAATATCACAAACATTAGTTATCATTATTCATGAG 540

 52646295 TGAGAAAACTGACAGTCAGAGAGGTCAGTACACCCTCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCTAGT 52646354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGAGAAAACTGACAGTCAGAGAGGTCAGTACACCCTCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCTAGT 600

 52646355 AAGCAGCAGAGTCTGGCTTCAGGCAGAAATCTGACTTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGTCT 52646414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAGCAGCAGAGTCTGGCTTCAGGCAGAAATCTGACTTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGTCT 660

 52646415 TACCAGGGACTTGTATTAGCATAGACTGTTAAGAATATGGGAAGATTTTTAAAATACAGT 52646474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TACCAGGGACTTGTATTAGCATAGACTGTTAAGAATATGGGAAGATTTTTAAAATACAGT 720

 52646475 ACTCAGAAAATTTCTCTTTGAAAGGCTGGAAGAGCAGATATCCACACAAGAAGGCAAATT 52646534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ACTCAGAAAATTTCTCTTTGAAAGGCTGGAAGAGCAGATATCCACACAAGAAGGCAAATT 780

 52646535 AGACCTCAGGCCAGTGTGGAATTAAAGGTGTAGGGTTATCTGGTCAAGACTGTGTGTGTG 52646594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGACCTCAGGCCAGTGTGGAATTAAAGGTGTAGGGTTATCTGGTCAAGACTGTGTGTGTG 840

 52646595 GATACAGGCTCCAACCCCTCCAGGCAAGGGCACTGTTTCCAACATCCACCCTTTCTCCTT 52646654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GATACAGGCTCCAACCCCTCCAGGCAAGGGCACTGTTTCCAACATCCACCCTTTCTCCTT 900

 52646655 TGACCTCTACCTTGACCTAAATTAACTATAAAAGGTCCTTCTTTTCTAGGACCCTACTAT 52646714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGACCTCTACCTTGACCTAAATTAACTATAAAAGGTCCTTCTTTTCTAGGACCCTACTAT 960

 52646715 AAATCAGTGAAATATTCAGGAAAAAAAGAACACCAAGAATGTTGGGATCCCAGTTAAAGA 52646774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AAATCAGTGAAATATTCAGGAAAAAAAGAACACCAAGAATGTTGGGATCCCAGTTAAAGA 1020

 52646775 TCAAGATTCTCTACTGATAAGCTGTGTGATATGGAGTAAATCACTAAAGATCTTTGAATC 52646834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TCAAGATTCTCTACTGATAAGCTGTGTGATATGGAGTAAATCACTAAAGATCTTTGAATC 1080

 52646835 TCTTCATTTGTAAAATGGGAATATTGGTAGTCCTACTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTAAA 52646894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TCTTCATTTGTAAAATGGGAATATTGGTAGTCCTACTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTAAA 1140

 52646895 GAAGAAAAGTCATGCAAAGGATCTGGCACAACGCCTTTTCCATAATAAGTGCTTAGTAAT 52646954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GAAGAAAAGTCATGCAAAGGATCTGGCACAACGCCTTTTCCATAATAAGTGCTTAGTAAT 1200

 52646955 TGACAGATACTGTGATAACTTTTCAGGTTTCTCTCATGCCTTTGACAACATTGCATTTTG 52647014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TGACAGATACTGTGATAACTTTTCAGGTTTCTCTCATGCCTTTGACAACATTGCATTTTG 1260

 52647015 CTTGCTCTATCTGTAGTCAGACACTTCTTAATATCTGTTTGCAGGAAGACAGAAAAATAA 52647074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTTGCTCTATCTGTAGTCAGACACTTCTTAATATCTGTTTGCAGGAAGACAGAAAAATAA 1320

 52647075 AGGGAAGAATTGAGATTTCTTTGATCTATTCATACTGCTCATTAATATGTAGTGAGAAAT 52647134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AGGGAAGAATTGAGATTTCTTTGATCTATTCATACTGCTCATTAATATGTAGTGAGAAAT 1380

 52647135 ACATACACACACACATACACACACATGCATCCATTAGCAATTGTTTTTGCCCAACTCTAG 52647194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ACATACACACACACATACACACACATGCATCCATTAGCAATTGTTTTTGCCCAACTCTAG 1440

 52647195 TGTCTCGCAGTGTCTAGACTAAACAACAAACAAAAAAGGGGGGAGAGTGAGCTGGATTAA 52647254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TGTCTCGCAGTGTCTAGACTAAACAACAAACAAAAAAGGGGGGAGAGTGAGCTGGATTAA 1500

 52647255 GCATTGAGGCACAGTGAAGAAATGGTCTGGGGCAAGCCCAGGGATGAATGTTAGGGGTTT 52647314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GCATTGAGGCACAGTGAAGAAATGGTCTGGGGCAAGCCCAGGGATGAATGTTAGGGGTTT 1560

 52647315 CTCATAAACCTGAACCTGAAGAAAATCACCCTGCCAGCATATTGATCTTCTAGCTCTTCT 52647374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CTCATAAACCTGAACCTGAAGAAAATCACCCTGCCAGCATATTGATCTTCTAGCTCTTCT 1620

 52647375 TAACCTTTTTTTCTGTGATTCAGGAATTCATAATGATAGAAAATATTATACTAAAGAAGA 52647434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TAACCTTTTTTTCTGTGATTCAGGAATTCATAATGATAGAAAATATTATACTAAAGAAGA 1680

 52647435 AAAAAAGAGGGAGAATAAGTAAGTGATAGATGGATGCATCAGGGTGTAAAGTTAGCAAGT 52647494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AAAAAAGAGGGAGAATAAGTAAGTGATAGATGGATGCATCAGGGTGTAAAGTTAGCAAGT 1740

 52647495 AAGGCTGTTGAAGTGTCAGAGTGAATATAAATGAATTGTGGGAATGGTCCATGCCAGGAG 52647554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AAGGCTGTTGAAGTGTCAGAGTGAATATAAATGAATTGTGGGAATGGTCCATGCCAGGAG 1800

 52647555 AAGAGGGTATGGTTGACAAAAAGGGAAATGCTAAGATTCAAAACAGGGAAGGGCTTTTCA 52647614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AAGAGGGTATGGTTGACAAAAAGGGAAATGCTAAGATTCAAAACAGGGAAGGGCTTTTCA 1860

 52647615 AAATGCCAAGAGCACCAACTTATATCTTTCAGTTTAATTCCTCTCTTCCTTACCCACTGG 52647674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AAATGCCAAGAGCACCAACTTATATCTTTCAGTTTAATTCCTCTCTTCCTTACCCACTGG 1920

 52647675 CTGGAAAGCAAAGGAGCTAGTGGTAAGTAAGAGTGTTATAGCCAGAGAAAAAGTCTTCAA 52647734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CTGGAAAGCAAAGGAGCTAGTGGTAAGTAAGAGTGTTATAGCCAGAGAAAAAGTCTTCAA 1980

 52647735 AAAACACAAAGTACTTTCCATGGACAACCTTTTTTATTTTAAAGTGCCAATATGTTGCTT 52647794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AAAACACAAAGTACTTTCCATGGACAACCTTTTTTATTTTAAAGTGCCAATATGTTGCTT 2040

 52647795 TGAAAAAGAATAAATTCCTTACATCCAGGTATCTGGACTAGACTTCAGTGCATTTAGTGA 52647854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TGAAAAAGAATAAATTCCTTACATCCAGGTATCTGGACTAGACTTCAGTGCATTTAGTGA 2100

 52647855 TTATAGCAAATCCAAACAGTAGCTTTTGATATCAGAGAATGGGTAAAGTGTTTTTGACAA 52647914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TTATAGCAAATCCAAACAGTAGCTTTTGATATCAGAGAATGGGTAAAGTGTTTTTGACAA 2160

 52647915 TTTCTAAGAACTTAGAGTTCTTCGGTGATACGTTCCATGCAACTGAAGCTCTGCTCTCCA 52647974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TTTCTAAGAACTTAGAGTTCTTCGGTGATACGTTCCATGCAACTGAAGCTCTGCTCTCCA 2220

 52647975 AATTTAGGTGGGTACATACCCAAGTCCATCACCTGGGGCTTCTATTTCCTTTGCTCAGAT 52648034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AATTTAGGTGGGTACATACCCAAGTCCATCACCTGGGGCTTCTATTTCCTTTGCTCAGAT 2280

 52648035 GCTCACCTCCTAGGTGGGCACCTGACATAAGATAGACTAATAAAAATAAGTCCTGTAACT 52648094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GCTCACCTCCTAGGTGGGCACCTGACATAAGATAGACTAATAAAAATAAGTCCTGTAACT 2340

 52648095 TTTGATACTCCTATTAAAAAAGAGTTGCAAACCAATAGGAGGTACACTTGAGAATCAGCA 52648154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TTTGATACTCCTATTAAAAAAGAGTTGCAAACCAATAGGAGGTACACTTGAGAATCAGCA 2400

 52648155 CAAATGAAAGTAGAACCTGGAAATCCAGGAAGCAGATACCCAATCATGTCATTTAAACAT 52648214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CAAATGAAAGTAGAACCTGGAAATCCAGGAAGCAGATACCCAATCATGTCATTTAAACAT 2460

 52648215 TTAGATCCAGCTGTGCCTGAAGCTGAACTTTAGCATTACATAAGCCAATAAATCACTCTT 52648274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TTAGATCCAGCTGTGCCTGAAGCTGAACTTTAGCATTACATAAGCCAATAAATCACTCTT 2520

 52648275 CCCCAACTTACGCCAGTTGAAATTGAATACATACTCAGTGACTTTGAGAGAATTCCAGGG 52648334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CCCCAACTTACGCCAGTTGAAATTGAATACATACTCAGTGACTTTGAGAGAATTCCAGGG 2580

 52648335 AATTGGTCAGTCCCTGTTTCACTTGTAAATACACAGCAATCAAGCCTACCAAATCTATGA 52648394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AATTGGTCAGTCCCTGTTTCACTTGTAAATACACAGCAATCAAGCCTACCAAATCTATGA 2640

 52648395 TTGATTGGGGTGTCTGAAAGAGATGGAGGGAATGGAATCAACCTGAAAAACATATTTCAG 52648454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TTGATTGGGGTGTCTGAAAGAGATGGAGGGAATGGAATCAACCTGAAAAACATATTTCAG 2700

 52648455 GAGTTCATCCCTGAAAACTTCCCCAACCTAGCTAGAGGGGCCAACATTCAAATTCAGGAA 52648514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GAGTTCATCCCTGAAAACTTCCCCAACCTAGCTAGAGGGGCCAACATTCAAATTCAGGAA 2760

 52648515 ATGCAGAGAACCCCAGTAAGATACTCCACAAAAAGATCTTCCCCAAGACATCATCATCAG 52648574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 ATGCAGAGAACCCCAGTAAGATACTCCACAAAAAGATCTTCCCCAAGACATCATCATCAG 2820

 52648575 ATTCTCCAAAGTTGAAATGTAAGAAAAAATGCTAAAGGCAACTAGAGTGAAAGGCCCGGT 52648634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 ATTCTCCAAAGTTGAAATGTAAGAAAAAATGCTAAAGGCAACTAGAGTGAAAGGCCCGGT 2880

 52648635 CACCTAAAAAGGGAAGCACAGACTTACAGTGGACCTCTCACTGGTAACCCTACAAGCCAG 52648694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CACCTAAAAAGGGAAGCACAGACTTACAGTGGACCTCTCACTGGTAACCCTACAAGCCAG 2940

 52648695 AAGAGATTGAGGACCAATATTCAACATTCTTAAACAAAAAGAATTCCAACCCAGAATTTT 52648754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 AAGAGATTGAGGACCAATATTCAACATTCTTAAACAAAAAGAATTCCAACCCAGAATTTT 3000

 52648755 ATATCTGACTAAACTAAGCTTCATAAGCAAAAGAGAAATAAGATCATTTTCAGACAAGCA 52648814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 ATATCTGACTAAACTAAGCTTCATAAGCAAAAGAGAAATAAGATCATTTTCAGACAAGCA 3060

 52648815 AATGCTAAGGGAATTTGTGACCATTAGACCTTCCTTGCAACAGTTCCTAAAGGAAGCACT 52648874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 AATGCTAAGGGAATTTGTGACCATTAGACCTTCCTTGCAACAGTTCCTAAAGGAAGCACT 3120

 52648875 AAATATGGAAAGACCATTACCAGACACTACAAAACACACTGAAGTACACAGACCAGTGAC 52648934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 AAATATGGAAAGACCATTACCAGACACTACAAAACACACTGAAGTACACAGACCAGTGAC 3180

 52648935 ATTGTAAAGCAACTACATAACAAGTCTGCAAAATAACCAGCCAACATCATGATGACGGTA 52648994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 ATTGTAAAGCAACTACATAACAAGTCTGCAAAATAACCAGCCAACATCATGATGACGGTA 3240

 52648995 TCAAATCGACACATAGCAACACTAACCTTAAATGTAAATGGACTAAATGATCCCATTAAA 52649054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TCAAATCGACACATAGCAACACTAACCTTAAATGTAAATGGACTAAATGATCCCATTAAA 3300

 52649055 AGACATAAAGTGGCAGGCTGGATAAAGAACCAAGAACCATTGGTATACTGTCTTCAAGAG 52649114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 AGACATAAAGTGGCAGGCTGGATAAAGAACCAAGAACCATTGGTATACTGTCTTCAAGAG 3360

 52649115 ACCCATCTCCTATGCAGTGACACACATAGGTTCAAGATAAAGGGATGGGGAAAAATCTAC 52649174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 ACCCATCTCCTATGCAGTGACACACATAGGTTCAAGATAAAGGGATGGGGAAAAATCTAC 3420

 52649175 CAAGCAAATAGAAAACAGAATAAAACAGGGGTTGCAATCCTAGTTGCCGTCAAAACAGAC 52649234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 CAAGCAAATAGAAAACAGAATAAAACAGGGGTTGCAATCCTAGTTGCCGTCAAAACAGAC 3480

 52649235 TTTAAACCAACAAAGGTTAAAAGAAAAAAATATGGGCATTGCATAAGGATAAAGTGTTAA 52649294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TTTAAACCAACAAAGGTTAAAAGAAAAAAATATGGGCATTGCATAAGGATAAAGTGTTAA 3540

 52649295 ATTAAACAAGAAGATCTAACTATCCTAAGTATATATGCACCAAACACAGGAACACCCAGA 52649354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 ATTAAACAAGAAGATCTAACTATCCTAAGTATATATGCACCAAACACAGGAACACCCAGA 3600

 52649355 TTCATAAAGCAAGTTTATGGAGACCTTCAAACAGACTTAGACTCCCACACAATAGTAGTG 52649414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 TTCATAAAGCAAGTTTATGGAGACCTTCAAACAGACTTAGACTCCCACACAATAGTAGTG 3660

 52649415 GGAGACTTTAATACCCCATGACAATATTAGACAGATCATTGAGACAGGAAATTAACAAAG 52649474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 GGAGACTTTAATACCCCATGACAATATTAGACAGATCATTGAGACAGGAAATTAACAAAG 3720

 52649475 ATATTCAAGATCTAACTCAGCACTAAATCAAATGGCCCTGATAGATATCTACAGGACTGT 52649534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 ATATTCAAGATCTAACTCAGCACTAAATCAAATGGCCCTGATAGATATCTACAGGACTGT 3780

 52649535 CCTACTTGAAACCATACAATTACATGGTAATTGAATGACCTGCTCCTGAATGACTTTTGG 52649594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 CCTACTTGAAACCATACAATTACATGGTAATTGAATGACCTGCTCCTGAATGACTTTTGG 3840

 52649595 GTAAATAATAAAATTAAGGCAGAAATCAAGAAGTTTTTTGAACTAATGAGAACAAAGATA 52649654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 GTAAATAATAAAATTAAGGCAGAAATCAAGAAGTTTTTTGAACTAATGAGAACAAAGATA 3900

 52649655 CAACATACCAGAATCTTTGGGACACAGCTAAGGCAGTGTTAAGAGGGAAATTTATAGCAC 52649714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 CAACATACCAGAATCTTTGGGACACAGCTAAGGCAGTGTTAAGAGGGAAATTTATAGCAC 3960

 52649715 TAAATCCCACATCAAAAAGTTAGAAAGAGCTCACGTTAACAATCTAACCTCACAACTACA 52649774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 TAAATCCCACATCAAAAAGTTAGAAAGAGCTCACGTTAACAATCTAACCTCACAACTACA 4020

 52649775 GGAACTAGAGAACTGAGAGCAGAAAAACCTGAAAGCTAGCAGAAGACAAGAAATAACCAA 52649834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 GGAACTAGAGAACTGAGAGCAGAAAAACCTGAAAGCTAGCAGAAGACAAGAAATAACCAA 4080

 52649835 AATTAGAGCTGAACTGAAGGAGATTGAGACATGAAAAACCATTCAAAAGATCAGTGAATT 52649894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 AATTAGAGCTGAACTGAAGGAGATTGAGACATGAAAAACCATTCAAAAGATCAGTGAATT 4140

 52649895 CAGGAGCTGTTTTTTTTTTGAACAAATTAATAAAATAGACCATTAGCTAGAGTAATAAAC 52649954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 CAGGAGCTGTTTTTTTTTTGAACAAATTAATAAAATAGACCATTAGCTAGAGTAATAAAC 4200

 52649955 AAGAAAATAGAAAAGATTCAAATAAACACAATCAGAAACGACAAGGGGGATATTACCACT 52650014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 AAGAAAATAGAAAAGATTCAAATAAACACAATCAGAAACGACAAGGGGGATATTACCACT 4260

 52650015 GACCCCACAGAAGTACAAACAACCATCAGAGAATATTATGAACATCTCTATGCACATAAA 52650074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 GACCCCACAGAAGTACAAACAACCATCAGAGAATATTATGAACATCTCTATGCACATAAA 4320

 52650075 CTAGAAAATCTAGAAGAAGTGGATAAACTTCTGGACATATACACCCTTCTAAGACTGTAC 52650134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 CTAGAAAATCTAGAAGAAGTGGATAAACTTCTGGACATATACACCCTTCTAAGACTGTAC 4380

 52650135 CAGGAAGAAATTGAATCCCTGAACAGACCAATAATGAGCCCTAAAATTGAGGAAGTAATA 52650194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 CAGGAAGAAATTGAATCCCTGAACAGACCAATAATGAGCCCTAAAATTGAGGAAGTAATA 4440

 52650195 CATAGACTACCAACCATAAAAAAACCCAGTACTAGATGGATTCACAGGTAAGTTCTACCA 52650254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 CATAGACTACCAACCATAAAAAAACCCAGTACTAGATGGATTCACAGGTAAGTTCTACCA 4500

 52650255 GTTGTACAAAGAAGAGCTGGTACAGTTCCTACTGAAATTATTCCAAAAAGTTGAGTAGGA 52650314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 GTTGTACAAAGAAGAGCTGGTACAGTTCCTACTGAAATTATTCCAAAAAGTTGAGTAGGA 4560

 52650315 GGGAGTCCTTCCTAACTCATTTGATGAGGCCAGCATCATCCTGATATCAAAACCTGGCAG 52650374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 GGGAGTCCTTCCTAACTCATTTGATGAGGCCAGCATCATCCTGATATCAAAACCTGGCAG 4620

 52650375 ATATACAACAAGAAAAGCTTCAGGCCAATATCCTTGATGAACTTCAATGCAAAAATCCTC 52650434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 ATATACAACAAGAAAAGCTTCAGGCCAATATCCTTGATGAACTTCAATGCAAAAATCCTC 4680

 52650435 AATAAAATACTGGCAAACTGAATCCAGCAGCACACCAAAAAGCTTATCCACCATGATCAA 52650494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 AATAAAATACTGGCAAACTGAATCCAGCAGCACACCAAAAAGCTTATCCACCATGATCAA 4740

 52650495 GTAGAATGCAAGTTGGTTCAACATATACAAATCAATAAATGTGACTCATCACATAAACAG 52650554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 GTAGAATGCAAGTTGGTTCAACATATACAAATCAATAAATGTGACTCATCACATAAACAG 4800

 52650555 AACTAAAGACAAAAACTACATGATTATCTCAACAGATGCAGAAAAGGCTTTCAATAAAAT 52650614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 AACTAAAGACAAAAACTACATGATTATCTCAACAGATGCAGAAAAGGCTTTCAATAAAAT 4860

 52650615 TAGACATCCATTTATGTTAAAAACTCTCAATAAACTAGGTATTGAAGGAACATACCTCAA 52650674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 TAGACATCCATTTATGTTAAAAACTCTCAATAAACTAGGTATTGAAGGAACATACCTCAA 4920

 52650675 AATAATAAGAGCCATGTATGACAAACCCACAGCTAAGATCATACTGAATGGGCAAAAGCT 52650734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 AATAATAAGAGCCATGTATGACAAACCCACAGCTAAGATCATACTGAATGGGCAAAAGCT 4980

 52650735 GGAAGCATTTTCTTTGAAGACTGGCATAAGACAAGGATGATCTCTCTCACCACTCCTATT 52650794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 GGAAGCATTTTCTTTGAAGACTGGCATAAGACAAGGATGATCTCTCTCACCACTCCTATT 5040

 52650795 CAACATAGTATTGGAAGTCTTGGCCAGGGCAATCGGGCAAGAGAAATAAATAAAGCGCAT 52650854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 CAACATAGTATTGGAAGTCTTGGCCAGGGCAATCGGGCAAGAGAAATAAATAAAGCGCAT 5100

 52650855 CCAAATAGGAAGAGAGGAAGTCAAACTATCCTTGTTTGCAGATTACATGACATTATATCT 52650914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 CCAAATAGGAAGAGAGGAAGTCAAACTATCCTTGTTTGCAGATTACATGACATTATATCT 5160

 52650915 AGAAAACCCCATAGTCTCAGCCCCAAAGCTTCTTAAGCTGATAAACAACTTCAGCAAAGT 52650974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 AGAAAACCCCATAGTCTCAGCCCCAAAGCTTCTTAAGCTGATAAACAACTTCAGCAAAGT 5220

 52650975 CTCAGGATACAAAATAAATGTGCAAAAATTACTGGCATTTCCATGCACCAACAACAGTCA 52651034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 CTCAGGATACAAAATAAATGTGCAAAAATTACTGGCATTTCCATGCACCAACAACAGTCA 5280

 52651035 AGCCAGGAGCCAAACCAGGAATGCACTCCCACTCACAATCGCCACAAAAAGAGTAAAATA 52651094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 AGCCAGGAGCCAAACCAGGAATGCACTCCCACTCACAATCGCCACAAAAAGAGTAAAATA 5340

 52651095 CCTAGGAAAACAGCTAATTAGGGAGGTGAAAGATCTCTACAAGGAGAATAATGAACCAGC 52651154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 CCTAGGAAAACAGCTAATTAGGGAGGTGAAAGATCTCTACAAGGAGAATAATGAACCAGC 5400

 52651155 GCTCAAAGAAATTAGAGATGACACAAACAAATGGAAAAACATTCCATGTTCATTGATAGG 52651214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 GCTCAAAGAAATTAGAGATGACACAAACAAATGGAAAAACATTCCATGTTCATTGATAGG 5460

 52651215 AAGAATCAATATCATTAAAATGGCCATATTGCCCAGAGCAATTTATAGATTCAATGCTAT 52651274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 AAGAATCAATATCATTAAAATGGCCATATTGCCCAGAGCAATTTATAGATTCAATGCTAT 5520

 52651275 ACCTATTAAACTACTGTTGAGATTCTTCACAGAACCAGAGAAAACTATTTTAAAATTCAT 52651334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 ACCTATTAAACTACTGTTGAGATTCTTCACAGAACCAGAGAAAACTATTTTAAAATTCAT 5580

 52651335 ATAGAACCCAGAAAAGAGCCTGAATTGCTAAGGCAATCCTAAGCAAAAAGCATAAAGCTG 52651394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 ATAGAACCCAGAAAAGAGCCTGAATTGCTAAGGCAATCCTAAGCAAAAAGCATAAAGCTG 5640

 52651395 AAGGCATCATGCTACCTGACTTCAAACTATACTACAAGGCTACAGTAACCAAAACAGCAT 52651454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 AAGGCATCATGCTACCTGACTTCAAACTATACTACAAGGCTACAGTAACCAAAACAGCAT 5700

 52651455 ACTACTGGTACAAAAACAGACACATAGACCAATGGAACAGAATAGAGAACCCGGAAATAA 52651514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5701 ACTACTGGTACAAAAACAGACACATAGACCAATGGAACAGAATAGAGAACCCGGAAATAA 5760

 52651515 GACCACACACCTACAACTATCTAATCTTTGACAAACCTGACAAAAACATGCAATGGGGAA 52651574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5761 GACCACACACCTACAACTATCTAATCTTTGACAAACCTGACAAAAACATGCAATGGGGAA 5820

 52651575 AAGATTTCCTATTCAATAAAAAGTGCTGGGATAACCGGCTAGCTGTACACAGAAGATTAA 52651634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5821 AAGATTTCCTATTCAATAAAAAGTGCTGGGATAACCGGCTAGCTGTACACAGAAGATTAA 5880

 52651635 AGCTGGACCCCTTCCTTACAACATATACAAAAATCGGCCGGGCTTGGTGGCTCACGCTTG 52651694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5881 AGCTGGACCCCTTCCTTACAACATATACAAAAATCGGCCGGGCTTGGTGGCTCACGCTTG 5940

 52651695 TAATCCCAGCACTTTGGAAGGCCGAGGAGGGCGGATCATGAGGTCAGGAGATCGAGAACA 52651754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5941 TAATCCCAGCACTTTGGAAGGCCGAGGAGGGCGGATCATGAGGTCAGGAGATCGAGAACA 6000

 52651755 CGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGTGTGGTGGCAGGCGCC 52651814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6001 CGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGTGTGGTGGCAGGCGCC 6060

 52651815 TGTAGTCCCAGCTACTTGGAGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGTGTGAACCCGGGAGACAGA 52651874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6061 TGTAGTCCCAGCTACTTGGAGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGTGTGAACCCGGGAGACAGA 6120

 52651875 GCTTGCACTGAGCCGAGACCACATCACTGCACTCCAGCCTGGGCGAC 52651921
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6121 GCTTGCACTGAGCCGAGACCACATCACTGCACTCCAGCCTGGGCGAC 6167

Alignment time is 6.00399 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [52637064,52668002] =>     30939 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    5647] =>      5647 nucs 'mol-32-1f00-002935_5647'

Score:        5508
Aligned:      5650        nucs
Identic:      5633 (100%) nucs =>      5422 (100%)       211 (100%)
Gaps:            7 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [52641630,52647064] EXCISED REGION [52658003,52658213]
 second seq =>  [       1,    5436] EXCISED REGION [    5437,    5647]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>     10938 nucs [52647065,52658002]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         6 nucs [52647065,52647070] to [52658003,52658008]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [52647065,52647067] to [52658000,52658002]
 second seq =>         0 nucs

 52641630 TACACTTTTAAAAGAAAAAAGACATTCTTCATCTTATGAAACTCTGCATGGCAACACTTT 52641689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TACACTTTTAAAAGAAAAAAGACATTCTTCATCTTATGAAACTCTGCATGGCAACACTTT 60

 52641690 ATGCGCCCCACACCCCCACTCAACACAAACACAACTCTGGAAGTACTGTGTTGATAACAG 52641749
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACGCGCCCCACACCCCCACTCAACACAAACACAACTCTGGAAGTACTGTGTTGATAACAG 120

 52641750 AAATGTGGTGGGTTTTATTTTTAACCAATAAAGGTCAAGTTTGCATTATGTGATTTTGTG 52641809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAATGTGGTGGGTTTTATTTTTAACCAATAAAGGTCAAGTTTGCATTATGTGATTTTGTG 180

 52641810 TGTGTGTGTGTTGAATCTTTTAAATGCATATCTTACAGCTCTGGTTCAGTTGTTGTGGGG 52641869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGTGTGTGTGTTGAATCTTTTAAATGCATATCTTACAGCTCTGGTTCAGTTGTTGTGGGG 240

 52641870 AGAGGAAAAAAACCTCATCCCTGCCAACACATTGGTTTGTATGAATCACAGCTCAGTGAA 52641929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGAGGAAAAAAACCTCATCCCTGCCAACACATTGGTTTGTATGAATCACAGCTCAGTGAA 300

 52641930 ACCTTTCAGGCATATAATTTATCTTTTCTTTGGCCTATGTAGTAAACGCTTCATTTGTTC 52641989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACCTTTCAGGCATATAATTTATCTTTTCTTTGGCCTATGTAGTAAACGCTTCATTTGTTC 360

 52641990 ATGAATTCTTGCCTTGTTTTAATTATGCTTTGCCCTGAATGTAGTTTTATAAGGCACAAA 52642049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATGAATTCTTGCCTTGTTTTAATTATGCTTTGCCCTGAATGTAGTTTTATAAGGCACAAA 420

 52642050 AATAAGATTGTCGTTCTGAAAACACAGAAGATTTGTATGTTTCCCCCAGGATGAAATGGT 52642109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AATAAGATTGTCGTTCTGAAAACACAGAAGATTTGTATGTTTCCCCCAGGATGAAATGGT 480

 52642110 GGCATCTTTCTCCCAATTCACAGCTCTGTGGGCTTGTGGCTGGAATTCCAATCCAGCAGG 52642169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GGCATCTTTCTCCCAATTCACAGCTCTGTGGGCTTGTGGCTGGAATTCCAATCCAGCAGG 540

 52642170 GAGCAAGCCATAAAAATGGGGGGAAGGGCTGCTGGAGGGAGGCAGTAGATGCGGCTGAGC 52642229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GAGCAAGCCATAAAAATGGGGGGAAGGGCTGCTGGAGGGAGGCAGTAGATGCGGCTGAGC 600

 52642230 CCAAGGCATAATTCACCCTAAGAATTCTGAATCAATACACTGACATCCAGCCATGTACAA 52642289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CCAAGGCATAATTCACCCTAAGAATTCTGAATCAATACACTGACATCCAGCCATGTACAA 660

 52642290 TGTGGTACTCCCACCAAGAAAGCCACTGATTGAGAAGTTTTATTCATGTTACTTTCTGAG 52642349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGTGGTACTCCCACCAAGAAAGCCACTGATTGAGAAGTTTTATTCATGTTACTTTCTGAG 720

 52642350 GGTTGGATTGTCCCATTACATTTATAGAACAATTGCTTTTTTCCCCCTAAATACAGAACT 52642409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GGTTGGATTGTCCCATTACATTTATAGAACAATTGCTTTTTTCCCCCTAAATACAGAACT 780

 52642410 ATGCAGCCGGGAGTCAGAAAAGAAACCTTGACAATCAGAAGGCTGTTTTGTTGTTGTTGT 52642469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATGCAGCCGGGAGTCAGAAAAGAAACCTTGACAATCAGAAGGCTGTTTTGTTGTTGTTGT 840

 52642470 TAAAAACCTTTGCAGGCATATGCATCTGAATATCCATAAGTTCACAGGCTGAGGGAGAAA 52642529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TAAAAACCTTTGCAGGCATATGCATCTGAATATCCATAAGTTCACAGGCTGAGGGAGAAA 900

 52642530 TGGCTATTTCATAACTTTTCTGTGTTTCTCATGTACATAGTACAAAGTGGGCACTCAGTA 52642589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGGCTATTTCATAACTTTTCTGTGTTTCTCATGTACATAGTACAAAGTGGGCACTCAGTA 960

 52642590 TTTCAAATTTCAATATCACTGAAAAAAATGGAAATTTGTCATGTAACAAAATCAGATGCA 52642649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTTCAAATTTCAATATCACTGAAAAAAATGGAAATTTGTCATGTAACAAAATCAGATGCA 1020

 52642650 GACTTCACTGGTGAATCTGAGGGAGTGAATTCACTTATTCAGAAAGGAAGACAGTTACAA 52642709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GACTTCACTGGTGAATCTGAGGGAGTGAATTCACTTATTCAGAAAGGAAGACAGTTACAA 1080

 52642710 TTCTTGGGTCTTCTGAGAGATCATTATAACTTGAAAATATTACACAAGGGCTTTGCTATA 52642769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTCTTGGGTCTTCTGAGAGATCATTATAACTTGAAAATATTACACAAGGGCTTTGCTATA 1140

 52642770 TTAGATACCTGCCATGTTCCTAACACAAGCTCCCATTTTCTGACTCAAATCTCATTTTGG 52642829
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTAGATACCTGCCATGTTCCTAATACAAGCTCCCATTTTCTGACTCAAATCTCATTTTGG 1200

 52642830 AACACATTCCACTCAAATTGAGGTTCTACCCCTAAGAGTTCTTTTTCAATAAAGAAAGCT 52642889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AACACATTCCACTCAAATTGAGGTTCTACCCCTAAGAGTTCTTTTTCAATAAAGAAAGCT 1260

 52642890 GAGTTAATAAATCACAACTCCAAAACTTTTCCTCACTTTTCTTAGACTAGAAATAGATTG 52642949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GAGTTAATAAATCACAACTCCAAAACTTTTCCTCACTTTTCTTAGACTAGAAATAGATTG 1320

 52642950 AGTGTGTCGAGGTTTTATGGCTGAGTACATTGGAGGGCTGGCTATTCTATGCTGAACTGG 52643009
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AATGTGTCGAGGTTTTATGGCTGAGTACATTGGAGGGCTGGCTATTCTATGCTGAACTGG 1380

 52643010 TTTACTTGATTAAGATGGGGATTTGGATGAGTCACCGGACACCTGTCCAAAGATGAGTAA 52643069
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     1381 TTTACTTGATTAAGATGGGGATTTGGATGAGTCACTGGACACCTGTCCAAAGATGAGTAA 1440

 52643070 AACACATTCCTTCATTGTCTTCCCATAAATAACTCAATCTTCTCCTAACTGAGCCAATGG 52643129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AACACATTCCTTCATTGTCTTCCCATAAATAACTCAATCTTCTCCTAACTGAGCCAATGG 1500

 52643130 ATAGGCTTTGGATGCCCAAGCAAAACAAACACATGACTGTTAAAAAATCACAACCTCAAA 52643189
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATAGGCTTTGGATGCCCAAGCAAAAGAAACACATGACTGTTAAAAAATCACAACCTCAAA 1560

 52643190 ATGGCCTTAGAAGCCTATGACCAATAATGAGAATGGTTTCTCCACTCAGGCGCAAGTAGT 52643249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ATGGCCTTAGAAGCCTATGACCAATAATGAGAATGGTTTCTCCACTCAGGCGCAAGTAGT 1620

 52643250 AAACAGTTTCTCCCATATGCAGGAATATTGACGACTAGTTTACCGCCTCTGGGCACGTAA 52643309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AAACAGTTTCTCCCATATGCAGGAATATTGACGACTAGTTTACCGCCTCTGGGCACGTAA 1680

 52643310 CTTTCAGGTCCTGGTTCATGCATTTGCTGGAATGTTCCCTGGGCCATGGAGCCCAGTTCT 52643369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CTTTCAGGTCCTGGTTCATGCATTTGCTGGAATGTTCCCTGGGCCATGGAGCCCAGTTCT 1740

 52643370 CCTGGCATCTGGCATCTCCCCCACACTCTGCTCCCCCAGCACAGCACTTGGCATCTTGCA 52643429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CCTGGCATCTGGCATCTCCCCCACACTCTGCTCCCCCAGCACAGCACTTGGCATCTTGCA 1800

 52643430 TTGCAATTGCAGGTTTATTTATTCACTTCTCTCACTGGACAGCAAACTCCACCAGGGCCG 52643489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTGCAATTGCAGGTTTATTTATTCACTTCTCTCACTGGACAGCAAACTCCACCAGGGCCG 1860

 52643490 AGACTCTGTGTCTCGCCCTTCACTGTGGTCCCTGTGCCTCACCTGTTCCTAGTACAGTGT 52643549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AGACTCTGTGTCTCGCCCTTCACTGTGGTCCCTGTGCCTCACCTGTTCCTAGTACAGTGT 1920

 52643550 CACACTCAGTAAAGAGCAGATGCCTGG-TGCATTTGGAGACTTATTTTAAATTATACGGA 52643608
          ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CACACTCAGTAAAGAGCAGATGCCTGGATGCATTTGGAGACTTATTTTAAATTATACGGA 1980

 52643609 AAGTTATTCAACCGGCTTCTTGAACTGGTGAATTTTGGAAAGTGGGTGTTTGAAGGGAAA 52643668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AAGTTATTCAACCGGCTTCTTGAACTGGTGAATTTTGGAAAGTGGGTGTTTGAAGGGAAA 2040

 52643669 ATGTTTAAACTCTGAAAGAAATGTTGGAAATAAGCTCTTTGAATCAAAATGTATAGAAAA 52643728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ATGTTTAAACTCTGAAAGAAATGTTGGAAATAAGCTCTTTGAATCAAAATGTATAGAAAA 2100

 52643729 CACAAGAATGCTGACAGTAAGAGCCTAAAACACATGATGACTATTATCTTTTCCCAATTT 52643788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CACAAGAATGCTGACAGTAAGAGCCTAAAACACATGATGACTATTATCTTTTCCCAATTT 2160

 52643789 TAACTCTCCAGAGTGTTCAGCGGTGCCCAGCCTTCATAATGTAATTCTTCGTAGCACCCT 52643848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TAACTCTCCAGAGTGTTCAGCGGTGCCCAGCCTTCATAATGTAATTCTTCGTAGCACCCT 2220

 52643849 GGATGCATTAAAACCATAGATTAACGTGATACTTATTTTCATTAAGGAAAATAATTTACG 52643908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GGATGCATTAAAACCATAGATTAACGTGATACTTATTTTCATTAAGGAAAATAATTTACG 2280

 52643909 TACAGTGCTCAGAGTAGAGCCTGGCACATTGAACATTTTCAATAAATGACAGCAAGTGTA 52643968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TACAGTGCTCAGAGTAGAGCCTGGCACATTGAACATTTTCAATAAATGACAGCAAGTGTA 2340

 52643969 ATTATTAGCACTTCGGAAGTGCAAAGTTGCATTGTATTAAGACAAATATATTTGGAGCTC 52644028
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 ATTATTAGCACTTTGGAAGTGCAAAGTTGCATTGTATTAAGACAAATATATTTGGAGCTC 2400

 52644029 ATCCAATTTTTTCCTGGCTCTGAAGTCTGCTAGTGGCACTTAACTTTATTCCCAAGTTTT 52644088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ATCCAATTTTTTCCTGGCTCTGAAGTCTGCTAGTGGCACTTAACTTTATTCCCAAGTTTT 2460

 52644089 GAAAAATATTGTTATTTAAAAAGTCTGTTAACCAAGGAAATGCATGCCCTAAACCTATAA 52644148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GAAAAATATTGTTATTTAAAAAGTCTGTTAACCAAGGAAATGCATGCCCTAAACCTATAA 2520

 52644149 TGTATCAAGTTTTACTTCCTTCTTCTTTTAAGGAGTTCTTTTCCTGCCTTGAATACAAAC 52644208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TGTATCAAGTTTTACTTCCTTCTTCTTTTAAGGAGTTCTTTTCCTGCCTTGAATACAAAC 2580

 52644209 AGGCTCTCTCAAGGTTAAAAGCAAATGCTCTTTTTAGTGTCAAAAAGAGCTTGCCTTTCT 52644268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AGGCTCTCTCAAGGTTAAAAGCAAATGCTCTTTTTAGTGTCAAAAAGAGCTTGCCTTTCT 2640

 52644269 TCGCTCAGGAAAAAAAGCAACTGATTCCAGGATACCTTCTTTGAAAACCAACACAAAAAA 52644328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TCGCTCAGGAAAAAAAGCAACTGATTCCAGGATACCTTCTTTGAAAACCAACACAAAAAA 2700

 52644329 ACCCCCCAAAAAACAAAAAAAAAACCCAAAACCCCTAGTTTTTACAAAGGTTTATTACTC 52644388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 ACCCCCCAAAAAACAAAAAAAAAACCCAAAACCCCTAGTTTTTACAAAGGTTTATTACTC 2760

 52644389 CTACTTGTTGGAAAAGAATTACTACATAAAAGAGTCTGCCCAGAGCTGTAAAATCTCCTT 52644448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CTACTTGTTGGAAAAGAATTACTACATAAAAGAGTCTGCCCAGAGCTGTAAAATCTCCTT 2820

 52644449 ATTCAAACACACACCTTAGAGCAAAAGATGGTTAAATATCAATTCAGGCTATTAACAGTA 52644508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 ATTCAAACACACACCTTAGAGCAAAAGATGGTTAAATATCAATTCAGGCTATTAACAGTA 2880

 52644509 AGGGAC---GAAATGTGTTCCAACAAAACTCTGCATGTCAACAAACTACAGAGACTAGGT 52644565
          |||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 AGG---AATGAAATGTGTTCCAACAAAACTCTGCATGTCAACAAACTACAGAGACTAGGT 2937

 52644566 AACATCTTTTAGGAATCATTTTTATTCCACTAATGCCTTTTCCTCCAGAATCCACTGATC 52644625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2938 AACATCTTTTAGGAATCATTTTTATTCCACTAATGCCTTTTCCTCCAGAATCCACTGATC 2997

 52644626 GTAAACGCAACCTGTCTACTTCCGCCTTTGAAAAATGGATGGACAAATTCATCTGCATGT 52644685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2998 GTAAACGCAACCTGTCTACTTCCGCCTTTGAAAAATGGATGGACAAATTCATCTGCATGT 3057

 52644686 AACTCACCTCCTCTTTTCTTTTACATAAAACAGATGCCACAGCTGTTATTGTTCTTCACA 52644745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3058 AACTCACCTCCTCTTTTCTTTTACATAAAACAGATGCCACAGCTGTTATTGTTCTTCACA 3117

 52644746 CAGAAGTTTCTACCCAGAGAAACATCAGGATGACACTCTGCTGCAATGTGCTATTTGTTC 52644805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3118 CAGAAGTTTCTACCCAGAGAAACATCAGGATGACACTCTGCTGCAATGTGCTATTTGTTC 3177

 52644806 TAGAGGGGTCAACAGCTTGCCACCTTGCCTAGGCCCAGGGTGACTGCATATGTGCAGTGG 52644865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3178 TAGAGGGGTCAACAGCTTGCCACCTTGCCTAGGCCCAGGGTGACTGCATATGTGCAGTGG 3237

 52644866 TCTTATCCCATTAGCGCCCCCGAGCATGCATTCAGAACCAAGTGGATACACCTTGGCACA 52644925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3238 TCTTATCCCATTAGCGCCCCCGAGCATGCATTCAGAACCAAGTGGATACACCTTGGCACA 3297

 52644926 CTTACCTTCCCTGCAGGGACATCATCGGACTGCCCTGATAAGCCAGGAACCTCATCCACC 52644985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3298 CTTACCTTCCCTGCAGGGACATCATCGGACTGCCCTGATAAGCCAGGAACCTCATCCACC 3357

 52644986 TTGTCTTGATGCTCTGCCCTCTTGGCTTCCTGTTGGCTGTCACCTGGCACCTTTTCCTGT 52645045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3358 TTGTCTTGATGCTCTGCCCTCTTGGCTTCCTGTTGGCTGTCACCTGGCACCTTTTCCTGT 3417

 52645046 CCCTTGTCCAGCTTGAAGAATTTGTCAAAAAAGCTGGAGTCCTTGGGCTTGGAGGGAGCT 52645105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3418 CCCTTGTCCAGCTTGAAGAATTTGTCAAAAAAGCTGGAGTCCTTGGGCTTGGAGGGAGCT 3477

 52645106 TCTCCTCCTGCTCCCCCTGTCTCAGGTGGGAGAAGCGTGGGATCCCTGGCGGCAGAGAGG 52645165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3478 TCTCCTCCTGCTCCCCCTGTCTCAGGTGGGAGAAGCGTGGGATCCCTGGCGGCAGAGAGG 3537

 52645166 ACCTTGTCTTGGGCCGGGGCGTGCCCTGGGGTTTTATCTGTGTCCTGCCCCGGTCCAGCT 52645225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3538 ACCTTGTCTTGGGCCGGGGCGTGCCCTGGGGTTTTATCTGTGTCCTGCCCCGGTCCAGCT 3597

 52645226 GCCACCGGAAGTGTCCAGCTCTCACTTGGGTCTTTGTTCGCTGGAGCTTTATTGGAGCTG 52645285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3598 GCCACCGGAAGTGTCCAGCTCTCACTTGGGTCTTTGTTCGCTGGAGCTTTATTGGAGCTG 3657

 52645286 ACATCAAGCTTCACTGATCCAAGGGATGAATCTGCGGCTTGGTCTCCGGTACGTCCTGGT 52645345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3658 ACATCAAGCTTCACTGATCCAAGGGATGAATCTGCGGCTTGGTCTCCGGTACGTCCTGGT 3717

 52645346 ACAGGCCGAGAGAGCATCAAGAAAAAACGAGATTTAGCAGCTGGTGCCTCGGGTTTGGCC 52645405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3718 ACAGGCCGAGAGAGCATCAAGAAAAAACGAGATTTAGCAGCTGGTGCCTCGGGTTTGGCC 3777

 52645406 TCTTTCCCAAGATTCTTTCCGTTGGCATCCGCAACAGCACTTATCTCCGTTGTCTCGGGG 52645465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3778 TCTTTCCCAAGATTCTTTCCGTTGGCATCCGCAACAGCACTTATCTCCGTTGTCTCGGGG 3837

 52645466 GAAGAAGTGGCCACATTATCCGTCTTGACACTTATTCCCAAGTCGACTGTAAACACAAAC 52645525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3838 GAAGAAGTGGCCACATTATCCGTCTTGACACTTATTCCCAAGTCGACTGTAAACACAAAC 3897

 52645526 ATAAACAGTGGTTATTCAGCCAAGCCGGGAAATTCAGGCACTAATAATGGACTCCAGACA 52645585
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3898 ATAAACAGCGGTTATTCAGCCAAGCCGGGAAATTCAGGCACTAATAATGGACTCCAGACA 3957

 52645586 TTTTTTATACAAAAGCCATACTGCATACTGGAACTGTGTTGTTCTCTGGTCATTCTGAAA 52645645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3958 TTTTTTATACAAAAGCCATACTGCATACTGGAACTGTGTTGTTCTCTGGTCATTCTGAAA 4017

 52645646 GGCAGAAGTTAGCTCTCTACATCTCCTTGGACCCTGCTTTTCTTGGGAGAGGAGAAGGCA 52645705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4018 GGCAGAAGTTAGCTCTCTACATCTCCTTGGACCCTGCTTTTCTTGGGAGAGGAGAAGGCA 4077

 52645706 AGGTTGGTGAGGAGGGAAAGCTACTTAATGGAAAGTCACTAGCTGCCAGGTGTGGAATGA 52645765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4078 AGGTTGGTGAGGAGGGAAAGCTACTTAATGGAAAGTCACTAGCTGCCAGGTGTGGAATGA 4137

 52645766 GTGATATTCAATGTTAATTAATCTTCTTTTATCTGTGTAAGAACTCCGTGAGCAGCATAT 52645825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4138 GTGATATTCAATGTTAATTAATCTTCTTTTATCTGTGTAAGAACTCCGTGAGCAGCATAT 4197

 52645826 TGTCATGATGTCAACTGGGAGGCAGTACAGCAGTTAGGAGCTTGGGTTCTGGAGCTAGAA 52645885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4198 TGTCATGATGTCAACTGGGAGGCAGTACAGCAGTTAGGAGCTTGGGTTCTGGAGCTAGAA 4257

 52645886 CAAGGTTTCTCAACCTCAGCACTACTCACATTTGAAGCCAGATTATTCTTTGTTAGGGAG 52645945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4258 CAAGGTTTCTCAACCTCAGCACTACTCACATTTGAAGCCAGATTATTCTTTGTTAGGGAG 4317

 52645946 GCTCATCCCGTGCCTCATAGGCTGATTAGCAGCATCCTGGCCTCTGCCCACTAGACGCCG 52646005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4318 GCTCATCCCGTGCCTCATAGGCTGATTAGCAGCATCCTGGCCTCTGCCCACTAGACGCCG 4377

 52646006 GTCACATTTCCCAGTCATGGCAACCAAAAATATCTCTAGGCATTGCTAAATGTCCCCTGG 52646065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4378 GTCACATTTCCCAGTCATGGCAACCAAAAATATCTCTAGGCATTGCTAAATGTCCCCTGG 4437

 52646066 AGGACAAAATCTCTTACGTTTGAGAGGCACTGAGCTGAAATGTCTTTTTGAATCCAGATT 52646125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4438 AGGACAAAATCTCTTACGTTTGAGAGGCACTGAGCTGAAATGTCTTTTTGAATCCAGATT 4497

 52646126 ATCTAATTTTCTGTGCCTCAACTTTCTGGTAAAAGGAGACAGATAATAAATCTCGTAATT 52646185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4498 ATCTAATTTTCTGTGCCTCAACTTTCTGGTAAAAGGAGACAGATAATAAATCTCGTAATT 4557

 52646186 TTGTTAGGAAGATTACATGAGTTAATAGTTTTAAAGCAAGTACAATAGCACCTGGAATAT 52646245
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     4558 TTGTTAGGAAGATTACATGAGTTAATAGTTTTAAAGCAAGTACAATAGCGCCTGGAATAT 4617

 52646246 ATTAAGTGCTTAATAAATATCACAAACATTAGTTATCATTATTCATGAGTGAGAAAACTG 52646305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4618 ATTAAGTGCTTAATAAATATCACAAACATTAGTTATCATTATTCATGAGTGAGAAAACTG 4677

 52646306 ACAGTCAGAGAGGTCAGTACACCCTCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCTAGTAAGCAGCAGAG 52646365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4678 ACAGTCAGAGAGGTCAGTACACCCTCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCTAGTAAGCAGCAGAG 4737

 52646366 TCTGGCTTCAGGCAGAAATCTGACTTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGTCTTACCAGGGACT 52646425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4738 TCTGGCTTCAGGCAGAAATCTGACTTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGTCTTACCAGGGACT 4797

 52646426 TGTATTAGCATAGACTGTTAAGAATATGGGAAGATTTTTAAAATACAGTACTCAGAAAAT 52646485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4798 TGTATTAGCATAGACTGTTAAGAATATGGGAAGATTTTTAAAATACAGTACTCAGAAAAT 4857

 52646486 TTCTCTTTGAAAGGCTGGAAGAGCAGATATCCACACAAGAAGGCAAATTAGACCTCAGGC 52646545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4858 TTCTCTTTGAAAGGCTGGAAGAGCAGATATCCACACAAGAAGGCAAATTAGACCTCAGGC 4917

 52646546 CAGTGTGGAATTAAAGGTGTAGGGTTATCTGGTCAAGACTGTGTGTGTGGATACAGGCTC 52646605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4918 CAGTGTGGAATTAAAGGTGTAGGGTTATCTGGTCAAGACTGTGTGTGTGGATACAGGCTC 4977

 52646606 CAACCCCTCCAGGCAAGGGCACTGTTTCCAACATCCACCCTTTCTCCTTTGACCTCTACC 52646665
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4978 CAACCCCTCCAGGCAAGGGCAATGTTTCCAACATCCACCCTTTCTCCTTTGACCTCTACC 5037

 52646666 TTGACCTAAATTAACTATAAAAGGTCCTTCTTTTCTAGGACCCTACTATAAATCAGTGAA 52646725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5038 TTGACCTAAATTAACTATAAAAGGTCCTTCTTTTCTAGGACCCTACTATAAATCAGTGAA 5097

 52646726 ATATTCAGGAAAAAAAGAACACCAAGAATGTTGGGATCCCAGTTAAAGATCAAGATTCTC 52646785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5098 ATATTCAGGAAAAAAAGAACACCAAGAATGTTGGGATCCCAGTTAAAGATCAAGATTCTC 5157

 52646786 TACTGATAAGCTGTGTGATATGGAGTAAATCACTAAAGATCTTTGAATCTCTTCATTTGT 52646845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5158 TACTGATAAGCTGTGTGATATGGAGTAAATCACTAAAGATCTTTGAATCTCTTCATTTGT 5217

 52646846 AAAATGGGAATATTGGTAGTCCTACTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTAAAGAAGAAAAGTC 52646905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5218 AAAATGGGAATATTGGTAGTCCTACTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTAAAGAAGAAAAGTC 5277

 52646906 ATGCAAAGGATCTGGCACAACGCCTTTTCCATAATAAGTGCTTAGTAATTGACAGATACT 52646965
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5278 ATGCAAAGGATCTGGCACAATGCCTTTTCCATAATAAGTGCTTAGTAATTGACAGATACT 5337

 52646966 GTGATAACTTTTCAGGTTTCTCTCATGCCTTTGACAACATTGCATTTTGCTTGCTCTATC 52647025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5338 GTGATAACTTTTCAGGTTTCTCTCATGCCTTTGACAACATTGCATTTTGCTTGCTCTATC 5397

 52647026 TGTAGTCAGACACTTCTTAATATCTGTTTGCAGGAAGAC 52647064
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5398 TGTAGTCAGACACTTCTTAATATCTGTTTGCAGGAAGAC 5436

EXCISED REGION

 52658003 AGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTG 52658062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5437 AGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTG 5496

 52658063 GCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTAT 52658122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5497 GCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTAT 5556

 52658123 AAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGG 52658182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5557 AAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGG 5616

 52658183 GAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGG 52658213
          |||||||||||||||||||||||||||||||
     5617 GAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGG 5647

Alignment time is 6.27328 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [52637064,52668002] =>     30939 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    9717] =>      9717 nucs 'mol-32-1f00-125835_9717'

Score:        9716
Aligned:      9716        nucs
Identic:      9716 (100%) nucs =>      5727 (100%)      3989 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [52639803,52645529] EXCISED REGION [52645531,52649519]
 second seq =>  [       1,    5727] EXCISED REGION [    5729,    9717]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [52645530,52645530]
 second seq =>         1 nucs [5728,5728]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [52645528,52645529] to [52645529,52645530]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 52639803 AATAGAAACGTTGACTATTTAAGACTATGGGCTTTGGAGATGGACAATTTTGGCTGTGCC 52639862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AATAGAAACGTTGACTATTTAAGACTATGGGCTTTGGAGATGGACAATTTTGGCTGTGCC 60

 52639863 ACCTTTTAGCTGTGTGTCAGGAGTGATATGCTTTCTCTGAACTGTTGACTTCTTCATCTG 52639922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACCTTTTAGCTGTGTGTCAGGAGTGATATGCTTTCTCTGAACTGTTGACTTCTTCATCTG 120

 52639923 TAAAATGGTGAAAATACAGGAATTCCCTGGTAAGATTTGATGGCTCAATGAGCTGATTTC 52639982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TAAAATGGTGAAAATACAGGAATTCCCTGGTAAGATTTGATGGCTCAATGAGCTGATTTC 180

 52639983 TACAAAATGATTTAATCACAGAATTTGACTTAAAATGCGAGAGGGATTCATGCTGTCCGA 52640042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TACAAAATGATTTAATCACAGAATTTGACTTAAAATGCGAGAGGGATTCATGCTGTCCGA 240

 52640043 AATCATCCAAGAGTGGAGATATCTGGTTAGCTTCATGGAGAACCTGGCACTGAATATCAA 52640102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AATCATCCAAGAGTGGAGATATCTGGTTAGCTTCATGGAGAACCTGGCACTGAATATCAA 300

 52640103 GTCAATTTTTGATAAACAGAGAGAGAAAGGGACATAGGCAGAGAAAATACCAGGAGACAG 52640162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTCAATTTTTGATAAACAGAGAGAGAAAGGGACATAGGCAGAGAAAATACCAGGAGACAG 360

 52640163 ATGGCGTTTGCACAGGTCAGGTGTTGGCCATATTGACTGGAGAAATTTAAGGGAAGGGTG 52640222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATGGCGTTTGCACAGGTCAGGTGTTGGCCATATTGACTGGAGAAATTTAAGGGAAGGGTG 420

 52640223 GAAAATGCAGTTGGAAAATAGGCAGAGGAAACATTGTGGAAACCCTTAAATGTCAGACAA 52640282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GAAAATGCAGTTGGAAAATAGGCAGAGGAAACATTGTGGAAACCCTTAAATGTCAGACAA 480

 52640283 AGAAACTGAGGCTTATGGGCATGGACACTAACATTTCTATTGTTTCAAAAATAATTTTAC 52640342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGAAACTGAGGCTTATGGGCATGGACACTAACATTTCTATTGTTTCAAAAATAATTTTAC 540

 52640343 AACTTTTATACCTTTCTCACCCAAGTTAGGACTTGTGCCTTTGGTTATACAACTCTTAAA 52640402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AACTTTTATACCTTTCTCACCCAAGTTAGGACTTGTGCCTTTGGTTATACAACTCTTAAA 600

 52640403 TTAGAGTCAACTGTGCTATCTCTGTGAGTTTGGGTTGAGGACTATGGAAGGGAAAGGCAA 52640462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTAGAGTCAACTGTGCTATCTCTGTGAGTTTGGGTTGAGGACTATGGAAGGGAAAGGCAA 660

 52640463 AAAATAAAAGTAAAATGTGAAGTAGAAGACAGGGAGAAAACCCATAATACTGGTAATAGC 52640522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAAATAAAAGTAAAATGTGAAGTAGAAGACAGGGAGAAAACCCATAATACTGGTAATAGC 720

 52640523 TAATTTCTCTTTTTCTTCTTTCAAAATGCAATTTGTGCTAAGTACTTTATATGGCCTATC 52640582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TAATTTCTCTTTTTCTTCTTTCAAAATGCAATTTGTGCTAAGTACTTTATATGGCCTATC 780

 52640583 TCATTTAACTTCTAAAAGTGTGAACAATGTGAGAATGTGCTAGATACTATTATTATCCCC 52640642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCATTTAACTTCTAAAAGTGTGAACAATGTGAGAATGTGCTAGATACTATTATTATCCCC 840

 52640643 ATTTTACAGATGAGGAAACTGAGGCTCAGGAGGTGAAGTAGCTTGCCCAAGATCACACAG 52640702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATTTTACAGATGAGGAAACTGAGGCTCAGGAGGTGAAGTAGCTTGCCCAAGATCACACAG 900

 52640703 CCAGTAGGTGACAGAGGTAGAGAGGAAACCTAGGCTACTTGACTATGATGCTTATGTTTA 52640762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CCAGTAGGTGACAGAGGTAGAGAGGAAACCTAGGCTACTTGACTATGATGCTTATGTTTA 960

 52640763 ATTCACTACTAAATACCATGTAGGAAAGGACTCTGGAGACCTTAGTTCTTTAATTCCAAT 52640822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATTCACTACTAAATACCATGTAGGAAAGGACTCTGGAGACCTTAGTTCTTTAATTCCAAT 1020

 52640823 TCTACCACTAAACAGTAGAGACAGGATGAACTTGTCATTCACTGAGATGGAAAACCCCGT 52640882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TCTACCACTAAACAGTAGAGACAGGATGAACTTGTCATTCACTGAGATGGAAAACCCCGT 1080

 52640883 GAATTAAACTGGTGGGCATTTTGTTTTTGTCATTGTTAGGCGATGAATGAAGAGTTCCAT 52640942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GAATTAAACTGGTGGGCATTTTGTTTTTGTCATTGTTAGGCGATGAATGAAGAGTTCCAT 1140

 52640943 TCTGGACACATTAGGGTTGAGATACTCAGTGAGCAGCCAAATGGGGATGTAGAAATTCAA 52641002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TCTGGACACATTAGGGTTGAGATACTCAGTGAGCAGCCAAATGGGGATGTAGAAATTCAA 1200

 52641003 GTAGACATGTGGAAGAGGAGGCAGCTGAGACTCACGTCTGGACTTCAGGGATGGATCCCG 52641062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GTAGACATGTGGAAGAGGAGGCAGCTGAGACTCACGTCTGGACTTCAGGGATGGATCCCG 1260

 52641063 GCTAGAGATGTAAATTTGGAACTTGTCAACCCATAGCAGTATTTAAACCTTTGGGACTGA 52641122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GCTAGAGATGTAAATTTGGAACTTGTCAACCCATAGCAGTATTTAAACCTTTGGGACTGA 1320

 52641123 GGGAAACCTTCAAGGAAATAAGCGTAGTTAGAGATAGCCAAGAAGTGAACCCTGGGGAAG 52641182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GGGAAACCTTCAAGGAAATAAGCGTAGTTAGAGATAGCCAAGAAGTGAACCCTGGGGAAG 1380

 52641183 TCCAACATTTAGAGGGTGAGATCCAGCAAAGGAGATGATGGAAGAGTACCAGGGAGGTGG 52641242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TCCAACATTTAGAGGGTGAGATCCAGCAAAGGAGATGATGGAAGAGTACCAGGGAGGTGG 1440

 52641243 AAGGATGTTGTTTCAAACAGCAAGGTGTGGCCCACTCAGTCACTGTGTCGGATTCAACTT 52641302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AAGGATGTTGTTTCAAACAGCAAGGTGTGGCCCACTCAGTCACTGTGTCGGATTCAACTT 1500

 52641303 GCAGGTCAGACCTACTAGGACAAAGATAGAGACCTATAGGATTTGGCAGCCAGGGTGATG 52641362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GCAGGTCAGACCTACTAGGACAAAGATAGAGACCTATAGGATTTGGCAGCCAGGGTGATG 1560

 52641363 GTAGGGAATTTGAAACATCATGGTGGCTGTGACAAGAGCCTGAATGGAGTGTGTTCAAGA 52641422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GTAGGGAATTTGAAACATCATGGTGGCTGTGACAAGAGCCTGAATGGAGTGTGTTCAAGA 1620

 52641423 GAGAAAAGAAGAGAAGTGAAAACACAGAATATTGTTCTTATTATTAGTAGCCTGAGCCAA 52641482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GAGAAAAGAAGAGAAGTGAAAACACAGAATATTGTTCTTATTATTAGTAGCCTGAGCCAA 1680

 52641483 TCTGAGGACCGATGCACTTATCACAATGTCTCTTAAAATACTATGTCTCTTACTAGATTA 52641542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TCTGAGGACCGATGCACTTATCACAATGTCTCTTAAAATACTATGTCTCTTACTAGATTA 1740

 52641543 TACACTCCTTGACAGACGAGAAACATGATTTATTTTTCAAATGCCTTGCACAAGGTTAGT 52641602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TACACTCCTTGACAGACGAGAAACATGATTTATTTTTCAAATGCCTTGCACAAGGTTAGT 1800

 52641603 GCGAAAGTAACGATTGCAGGATTTAATTACACTTTTAAAAGAAAAAAGACATTCTTCATC 52641662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GCGAAAGTAACGATTGCAGGATTTAATTACACTTTTAAAAGAAAAAAGACATTCTTCATC 1860

 52641663 TTATGAAACTCTGCATGGCAACACTTTATGCGCCCCACACCCCCACTCAACACAAACACA 52641722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTATGAAACTCTGCATGGCAACACTTTATGCGCCCCACACCCCCACTCAACACAAACACA 1920

 52641723 ACTCTGGAAGTACTGTGTTGATAACAGAAATGTGGTGGGTTTTATTTTTAACCAATAAAG 52641782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ACTCTGGAAGTACTGTGTTGATAACAGAAATGTGGTGGGTTTTATTTTTAACCAATAAAG 1980

 52641783 GTCAAGTTTGCATTATGTGATTTTGTGTGTGTGTGTGTTGAATCTTTTAAATGCATATCT 52641842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GTCAAGTTTGCATTATGTGATTTTGTGTGTGTGTGTGTTGAATCTTTTAAATGCATATCT 2040

 52641843 TACAGCTCTGGTTCAGTTGTTGTGGGGAGAGGAAAAAAACCTCATCCCTGCCAACACATT 52641902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TACAGCTCTGGTTCAGTTGTTGTGGGGAGAGGAAAAAAACCTCATCCCTGCCAACACATT 2100

 52641903 GGTTTGTATGAATCACAGCTCAGTGAAACCTTTCAGGCATATAATTTATCTTTTCTTTGG 52641962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GGTTTGTATGAATCACAGCTCAGTGAAACCTTTCAGGCATATAATTTATCTTTTCTTTGG 2160

 52641963 CCTATGTAGTAAACGCTTCATTTGTTCATGAATTCTTGCCTTGTTTTAATTATGCTTTGC 52642022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CCTATGTAGTAAACGCTTCATTTGTTCATGAATTCTTGCCTTGTTTTAATTATGCTTTGC 2220

 52642023 CCTGAATGTAGTTTTATAAGGCACAAAAATAAGATTGTCGTTCTGAAAACACAGAAGATT 52642082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CCTGAATGTAGTTTTATAAGGCACAAAAATAAGATTGTCGTTCTGAAAACACAGAAGATT 2280

 52642083 TGTATGTTTCCCCCAGGATGAAATGGTGGCATCTTTCTCCCAATTCACAGCTCTGTGGGC 52642142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TGTATGTTTCCCCCAGGATGAAATGGTGGCATCTTTCTCCCAATTCACAGCTCTGTGGGC 2340

 52642143 TTGTGGCTGGAATTCCAATCCAGCAGGGAGCAAGCCATAAAAATGGGGGGAAGGGCTGCT 52642202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TTGTGGCTGGAATTCCAATCCAGCAGGGAGCAAGCCATAAAAATGGGGGGAAGGGCTGCT 2400

 52642203 GGAGGGAGGCAGTAGATGCGGCTGAGCCCAAGGCATAATTCACCCTAAGAATTCTGAATC 52642262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GGAGGGAGGCAGTAGATGCGGCTGAGCCCAAGGCATAATTCACCCTAAGAATTCTGAATC 2460

 52642263 AATACACTGACATCCAGCCATGTACAATGTGGTACTCCCACCAAGAAAGCCACTGATTGA 52642322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AATACACTGACATCCAGCCATGTACAATGTGGTACTCCCACCAAGAAAGCCACTGATTGA 2520

 52642323 GAAGTTTTATTCATGTTACTTTCTGAGGGTTGGATTGTCCCATTACATTTATAGAACAAT 52642382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GAAGTTTTATTCATGTTACTTTCTGAGGGTTGGATTGTCCCATTACATTTATAGAACAAT 2580

 52642383 TGCTTTTTTCCCCCTAAATACAGAACTATGCAGCCGGGAGTCAGAAAAGAAACCTTGACA 52642442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TGCTTTTTTCCCCCTAAATACAGAACTATGCAGCCGGGAGTCAGAAAAGAAACCTTGACA 2640

 52642443 ATCAGAAGGCTGTTTTGTTGTTGTTGTTAAAAACCTTTGCAGGCATATGCATCTGAATAT 52642502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 ATCAGAAGGCTGTTTTGTTGTTGTTGTTAAAAACCTTTGCAGGCATATGCATCTGAATAT 2700

 52642503 CCATAAGTTCACAGGCTGAGGGAGAAATGGCTATTTCATAACTTTTCTGTGTTTCTCATG 52642562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CCATAAGTTCACAGGCTGAGGGAGAAATGGCTATTTCATAACTTTTCTGTGTTTCTCATG 2760

 52642563 TACATAGTACAAAGTGGGCACTCAGTATTTCAAATTTCAATATCACTGAAAAAAATGGAA 52642622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TACATAGTACAAAGTGGGCACTCAGTATTTCAAATTTCAATATCACTGAAAAAAATGGAA 2820

 52642623 ATTTGTCATGTAACAAAATCAGATGCAGACTTCACTGGTGAATCTGAGGGAGTGAATTCA 52642682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 ATTTGTCATGTAACAAAATCAGATGCAGACTTCACTGGTGAATCTGAGGGAGTGAATTCA 2880

 52642683 CTTATTCAGAAAGGAAGACAGTTACAATTCTTGGGTCTTCTGAGAGATCATTATAACTTG 52642742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CTTATTCAGAAAGGAAGACAGTTACAATTCTTGGGTCTTCTGAGAGATCATTATAACTTG 2940

 52642743 AAAATATTACACAAGGGCTTTGCTATATTAGATACCTGCCATGTTCCTAACACAAGCTCC 52642802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 AAAATATTACACAAGGGCTTTGCTATATTAGATACCTGCCATGTTCCTAACACAAGCTCC 3000

 52642803 CATTTTCTGACTCAAATCTCATTTTGGAACACATTCCACTCAAATTGAGGTTCTACCCCT 52642862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CATTTTCTGACTCAAATCTCATTTTGGAACACATTCCACTCAAATTGAGGTTCTACCCCT 3060

 52642863 AAGAGTTCTTTTTCAATAAAGAAAGCTGAGTTAATAAATCACAACTCCAAAACTTTTCCT 52642922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 AAGAGTTCTTTTTCAATAAAGAAAGCTGAGTTAATAAATCACAACTCCAAAACTTTTCCT 3120

 52642923 CACTTTTCTTAGACTAGAAATAGATTGAGTGTGTCGAGGTTTTATGGCTGAGTACATTGG 52642982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 CACTTTTCTTAGACTAGAAATAGATTGAGTGTGTCGAGGTTTTATGGCTGAGTACATTGG 3180

 52642983 AGGGCTGGCTATTCTATGCTGAACTGGTTTACTTGATTAAGATGGGGATTTGGATGAGTC 52643042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 AGGGCTGGCTATTCTATGCTGAACTGGTTTACTTGATTAAGATGGGGATTTGGATGAGTC 3240

 52643043 ACCGGACACCTGTCCAAAGATGAGTAAAACACATTCCTTCATTGTCTTCCCATAAATAAC 52643102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 ACCGGACACCTGTCCAAAGATGAGTAAAACACATTCCTTCATTGTCTTCCCATAAATAAC 3300

 52643103 TCAATCTTCTCCTAACTGAGCCAATGGATAGGCTTTGGATGCCCAAGCAAAACAAACACA 52643162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TCAATCTTCTCCTAACTGAGCCAATGGATAGGCTTTGGATGCCCAAGCAAAACAAACACA 3360

 52643163 TGACTGTTAAAAAATCACAACCTCAAAATGGCCTTAGAAGCCTATGACCAATAATGAGAA 52643222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TGACTGTTAAAAAATCACAACCTCAAAATGGCCTTAGAAGCCTATGACCAATAATGAGAA 3420

 52643223 TGGTTTCTCCACTCAGGCGCAAGTAGTAAACAGTTTCTCCCATATGCAGGAATATTGACG 52643282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TGGTTTCTCCACTCAGGCGCAAGTAGTAAACAGTTTCTCCCATATGCAGGAATATTGACG 3480

 52643283 ACTAGTTTACCGCCTCTGGGCACGTAACTTTCAGGTCCTGGTTCATGCATTTGCTGGAAT 52643342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 ACTAGTTTACCGCCTCTGGGCACGTAACTTTCAGGTCCTGGTTCATGCATTTGCTGGAAT 3540

 52643343 GTTCCCTGGGCCATGGAGCCCAGTTCTCCTGGCATCTGGCATCTCCCCCACACTCTGCTC 52643402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 GTTCCCTGGGCCATGGAGCCCAGTTCTCCTGGCATCTGGCATCTCCCCCACACTCTGCTC 3600

 52643403 CCCCAGCACAGCACTTGGCATCTTGCATTGCAATTGCAGGTTTATTTATTCACTTCTCTC 52643462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 CCCCAGCACAGCACTTGGCATCTTGCATTGCAATTGCAGGTTTATTTATTCACTTCTCTC 3660

 52643463 ACTGGACAGCAAACTCCACCAGGGCCGAGACTCTGTGTCTCGCCCTTCACTGTGGTCCCT 52643522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 ACTGGACAGCAAACTCCACCAGGGCCGAGACTCTGTGTCTCGCCCTTCACTGTGGTCCCT 3720

 52643523 GTGCCTCACCTGTTCCTAGTACAGTGTCACACTCAGTAAAGAGCAGATGCCTGGTGCATT 52643582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 GTGCCTCACCTGTTCCTAGTACAGTGTCACACTCAGTAAAGAGCAGATGCCTGGTGCATT 3780

 52643583 TGGAGACTTATTTTAAATTATACGGAAAGTTATTCAACCGGCTTCTTGAACTGGTGAATT 52643642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 TGGAGACTTATTTTAAATTATACGGAAAGTTATTCAACCGGCTTCTTGAACTGGTGAATT 3840

 52643643 TTGGAAAGTGGGTGTTTGAAGGGAAAATGTTTAAACTCTGAAAGAAATGTTGGAAATAAG 52643702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 TTGGAAAGTGGGTGTTTGAAGGGAAAATGTTTAAACTCTGAAAGAAATGTTGGAAATAAG 3900

 52643703 CTCTTTGAATCAAAATGTATAGAAAACACAAGAATGCTGACAGTAAGAGCCTAAAACACA 52643762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 CTCTTTGAATCAAAATGTATAGAAAACACAAGAATGCTGACAGTAAGAGCCTAAAACACA 3960

 52643763 TGATGACTATTATCTTTTCCCAATTTTAACTCTCCAGAGTGTTCAGCGGTGCCCAGCCTT 52643822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 TGATGACTATTATCTTTTCCCAATTTTAACTCTCCAGAGTGTTCAGCGGTGCCCAGCCTT 4020

 52643823 CATAATGTAATTCTTCGTAGCACCCTGGATGCATTAAAACCATAGATTAACGTGATACTT 52643882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 CATAATGTAATTCTTCGTAGCACCCTGGATGCATTAAAACCATAGATTAACGTGATACTT 4080

 52643883 ATTTTCATTAAGGAAAATAATTTACGTACAGTGCTCAGAGTAGAGCCTGGCACATTGAAC 52643942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 ATTTTCATTAAGGAAAATAATTTACGTACAGTGCTCAGAGTAGAGCCTGGCACATTGAAC 4140

 52643943 ATTTTCAATAAATGACAGCAAGTGTAATTATTAGCACTTCGGAAGTGCAAAGTTGCATTG 52644002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 ATTTTCAATAAATGACAGCAAGTGTAATTATTAGCACTTCGGAAGTGCAAAGTTGCATTG 4200

 52644003 TATTAAGACAAATATATTTGGAGCTCATCCAATTTTTTCCTGGCTCTGAAGTCTGCTAGT 52644062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 TATTAAGACAAATATATTTGGAGCTCATCCAATTTTTTCCTGGCTCTGAAGTCTGCTAGT 4260

 52644063 GGCACTTAACTTTATTCCCAAGTTTTGAAAAATATTGTTATTTAAAAAGTCTGTTAACCA 52644122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 GGCACTTAACTTTATTCCCAAGTTTTGAAAAATATTGTTATTTAAAAAGTCTGTTAACCA 4320

 52644123 AGGAAATGCATGCCCTAAACCTATAATGTATCAAGTTTTACTTCCTTCTTCTTTTAAGGA 52644182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 AGGAAATGCATGCCCTAAACCTATAATGTATCAAGTTTTACTTCCTTCTTCTTTTAAGGA 4380

 52644183 GTTCTTTTCCTGCCTTGAATACAAACAGGCTCTCTCAAGGTTAAAAGCAAATGCTCTTTT 52644242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 GTTCTTTTCCTGCCTTGAATACAAACAGGCTCTCTCAAGGTTAAAAGCAAATGCTCTTTT 4440

 52644243 TAGTGTCAAAAAGAGCTTGCCTTTCTTCGCTCAGGAAAAAAAGCAACTGATTCCAGGATA 52644302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 TAGTGTCAAAAAGAGCTTGCCTTTCTTCGCTCAGGAAAAAAAGCAACTGATTCCAGGATA 4500

 52644303 CCTTCTTTGAAAACCAACACAAAAAAACCCCCCAAAAAACAAAAAAAAAACCCAAAACCC 52644362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 CCTTCTTTGAAAACCAACACAAAAAAACCCCCCAAAAAACAAAAAAAAAACCCAAAACCC 4560

 52644363 CTAGTTTTTACAAAGGTTTATTACTCCTACTTGTTGGAAAAGAATTACTACATAAAAGAG 52644422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 CTAGTTTTTACAAAGGTTTATTACTCCTACTTGTTGGAAAAGAATTACTACATAAAAGAG 4620

 52644423 TCTGCCCAGAGCTGTAAAATCTCCTTATTCAAACACACACCTTAGAGCAAAAGATGGTTA 52644482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 TCTGCCCAGAGCTGTAAAATCTCCTTATTCAAACACACACCTTAGAGCAAAAGATGGTTA 4680

 52644483 AATATCAATTCAGGCTATTAACAGTAAGGGACGAAATGTGTTCCAACAAAACTCTGCATG 52644542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 AATATCAATTCAGGCTATTAACAGTAAGGGACGAAATGTGTTCCAACAAAACTCTGCATG 4740

 52644543 TCAACAAACTACAGAGACTAGGTAACATCTTTTAGGAATCATTTTTATTCCACTAATGCC 52644602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 TCAACAAACTACAGAGACTAGGTAACATCTTTTAGGAATCATTTTTATTCCACTAATGCC 4800

 52644603 TTTTCCTCCAGAATCCACTGATCGTAAACGCAACCTGTCTACTTCCGCCTTTGAAAAATG 52644662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 TTTTCCTCCAGAATCCACTGATCGTAAACGCAACCTGTCTACTTCCGCCTTTGAAAAATG 4860

 52644663 GATGGACAAATTCATCTGCATGTAACTCACCTCCTCTTTTCTTTTACATAAAACAGATGC 52644722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 GATGGACAAATTCATCTGCATGTAACTCACCTCCTCTTTTCTTTTACATAAAACAGATGC 4920

 52644723 CACAGCTGTTATTGTTCTTCACACAGAAGTTTCTACCCAGAGAAACATCAGGATGACACT 52644782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 CACAGCTGTTATTGTTCTTCACACAGAAGTTTCTACCCAGAGAAACATCAGGATGACACT 4980

 52644783 CTGCTGCAATGTGCTATTTGTTCTAGAGGGGTCAACAGCTTGCCACCTTGCCTAGGCCCA 52644842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 CTGCTGCAATGTGCTATTTGTTCTAGAGGGGTCAACAGCTTGCCACCTTGCCTAGGCCCA 5040

 52644843 GGGTGACTGCATATGTGCAGTGGTCTTATCCCATTAGCGCCCCCGAGCATGCATTCAGAA 52644902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 GGGTGACTGCATATGTGCAGTGGTCTTATCCCATTAGCGCCCCCGAGCATGCATTCAGAA 5100

 52644903 CCAAGTGGATACACCTTGGCACACTTACCTTCCCTGCAGGGACATCATCGGACTGCCCTG 52644962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 CCAAGTGGATACACCTTGGCACACTTACCTTCCCTGCAGGGACATCATCGGACTGCCCTG 5160

 52644963 ATAAGCCAGGAACCTCATCCACCTTGTCTTGATGCTCTGCCCTCTTGGCTTCCTGTTGGC 52645022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 ATAAGCCAGGAACCTCATCCACCTTGTCTTGATGCTCTGCCCTCTTGGCTTCCTGTTGGC 5220

 52645023 TGTCACCTGGCACCTTTTCCTGTCCCTTGTCCAGCTTGAAGAATTTGTCAAAAAAGCTGG 52645082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 TGTCACCTGGCACCTTTTCCTGTCCCTTGTCCAGCTTGAAGAATTTGTCAAAAAAGCTGG 5280

 52645083 AGTCCTTGGGCTTGGAGGGAGCTTCTCCTCCTGCTCCCCCTGTCTCAGGTGGGAGAAGCG 52645142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 AGTCCTTGGGCTTGGAGGGAGCTTCTCCTCCTGCTCCCCCTGTCTCAGGTGGGAGAAGCG 5340

 52645143 TGGGATCCCTGGCGGCAGAGAGGACCTTGTCTTGGGCCGGGGCGTGCCCTGGGGTTTTAT 52645202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 TGGGATCCCTGGCGGCAGAGAGGACCTTGTCTTGGGCCGGGGCGTGCCCTGGGGTTTTAT 5400

 52645203 CTGTGTCCTGCCCCGGTCCAGCTGCCACCGGAAGTGTCCAGCTCTCACTTGGGTCTTTGT 52645262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 CTGTGTCCTGCCCCGGTCCAGCTGCCACCGGAAGTGTCCAGCTCTCACTTGGGTCTTTGT 5460

 52645263 TCGCTGGAGCTTTATTGGAGCTGACATCAAGCTTCACTGATCCAAGGGATGAATCTGCGG 52645322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 TCGCTGGAGCTTTATTGGAGCTGACATCAAGCTTCACTGATCCAAGGGATGAATCTGCGG 5520

 52645323 CTTGGTCTCCGGTACGTCCTGGTACAGGCCGAGAGAGCATCAAGAAAAAACGAGATTTAG 52645382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 CTTGGTCTCCGGTACGTCCTGGTACAGGCCGAGAGAGCATCAAGAAAAAACGAGATTTAG 5580

 52645383 CAGCTGGTGCCTCGGGTTTGGCCTCTTTCCCAAGATTCTTTCCGTTGGCATCCGCAACAG 52645442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 CAGCTGGTGCCTCGGGTTTGGCCTCTTTCCCAAGATTCTTTCCGTTGGCATCCGCAACAG 5640

 52645443 CACTTATCTCCGTTGTCTCGGGGGAAGAAGTGGCCACATTATCCGTCTTGACACTTATTC 52645502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 CACTTATCTCCGTTGTCTCGGGGGAAGAAGTGGCCACATTATCCGTCTTGACACTTATTC 5700

 52645503 CCAAGTCGACTGTAAACACAAACATAA 52645529
          |||||||||||||||||||||||||||
     5701 CCAAGTCGACTGTAAACACAAACATAA 5727

EXCISED REGION

 52645531 CAGTGGTTATTCAGCCAAGCCGGGAAATTCAGGCACTAATAATGGACTCCAGACATTTTT 52645590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5729 CAGTGGTTATTCAGCCAAGCCGGGAAATTCAGGCACTAATAATGGACTCCAGACATTTTT 5788

 52645591 TATACAAAAGCCATACTGCATACTGGAACTGTGTTGTTCTCTGGTCATTCTGAAAGGCAG 52645650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5789 TATACAAAAGCCATACTGCATACTGGAACTGTGTTGTTCTCTGGTCATTCTGAAAGGCAG 5848

 52645651 AAGTTAGCTCTCTACATCTCCTTGGACCCTGCTTTTCTTGGGAGAGGAGAAGGCAAGGTT 52645710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5849 AAGTTAGCTCTCTACATCTCCTTGGACCCTGCTTTTCTTGGGAGAGGAGAAGGCAAGGTT 5908

 52645711 GGTGAGGAGGGAAAGCTACTTAATGGAAAGTCACTAGCTGCCAGGTGTGGAATGAGTGAT 52645770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5909 GGTGAGGAGGGAAAGCTACTTAATGGAAAGTCACTAGCTGCCAGGTGTGGAATGAGTGAT 5968

 52645771 ATTCAATGTTAATTAATCTTCTTTTATCTGTGTAAGAACTCCGTGAGCAGCATATTGTCA 52645830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5969 ATTCAATGTTAATTAATCTTCTTTTATCTGTGTAAGAACTCCGTGAGCAGCATATTGTCA 6028

 52645831 TGATGTCAACTGGGAGGCAGTACAGCAGTTAGGAGCTTGGGTTCTGGAGCTAGAACAAGG 52645890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6029 TGATGTCAACTGGGAGGCAGTACAGCAGTTAGGAGCTTGGGTTCTGGAGCTAGAACAAGG 6088

 52645891 TTTCTCAACCTCAGCACTACTCACATTTGAAGCCAGATTATTCTTTGTTAGGGAGGCTCA 52645950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6089 TTTCTCAACCTCAGCACTACTCACATTTGAAGCCAGATTATTCTTTGTTAGGGAGGCTCA 6148

 52645951 TCCCGTGCCTCATAGGCTGATTAGCAGCATCCTGGCCTCTGCCCACTAGACGCCGGTCAC 52646010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6149 TCCCGTGCCTCATAGGCTGATTAGCAGCATCCTGGCCTCTGCCCACTAGACGCCGGTCAC 6208

 52646011 ATTTCCCAGTCATGGCAACCAAAAATATCTCTAGGCATTGCTAAATGTCCCCTGGAGGAC 52646070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6209 ATTTCCCAGTCATGGCAACCAAAAATATCTCTAGGCATTGCTAAATGTCCCCTGGAGGAC 6268

 52646071 AAAATCTCTTACGTTTGAGAGGCACTGAGCTGAAATGTCTTTTTGAATCCAGATTATCTA 52646130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6269 AAAATCTCTTACGTTTGAGAGGCACTGAGCTGAAATGTCTTTTTGAATCCAGATTATCTA 6328

 52646131 ATTTTCTGTGCCTCAACTTTCTGGTAAAAGGAGACAGATAATAAATCTCGTAATTTTGTT 52646190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6329 ATTTTCTGTGCCTCAACTTTCTGGTAAAAGGAGACAGATAATAAATCTCGTAATTTTGTT 6388

 52646191 AGGAAGATTACATGAGTTAATAGTTTTAAAGCAAGTACAATAGCACCTGGAATATATTAA 52646250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6389 AGGAAGATTACATGAGTTAATAGTTTTAAAGCAAGTACAATAGCACCTGGAATATATTAA 6448

 52646251 GTGCTTAATAAATATCACAAACATTAGTTATCATTATTCATGAGTGAGAAAACTGACAGT 52646310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6449 GTGCTTAATAAATATCACAAACATTAGTTATCATTATTCATGAGTGAGAAAACTGACAGT 6508

 52646311 CAGAGAGGTCAGTACACCCTCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCTAGTAAGCAGCAGAGTCTGG 52646370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6509 CAGAGAGGTCAGTACACCCTCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCTAGTAAGCAGCAGAGTCTGG 6568

 52646371 CTTCAGGCAGAAATCTGACTTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGTCTTACCAGGGACTTGTAT 52646430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6569 CTTCAGGCAGAAATCTGACTTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGTCTTACCAGGGACTTGTAT 6628

 52646431 TAGCATAGACTGTTAAGAATATGGGAAGATTTTTAAAATACAGTACTCAGAAAATTTCTC 52646490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6629 TAGCATAGACTGTTAAGAATATGGGAAGATTTTTAAAATACAGTACTCAGAAAATTTCTC 6688

 52646491 TTTGAAAGGCTGGAAGAGCAGATATCCACACAAGAAGGCAAATTAGACCTCAGGCCAGTG 52646550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6689 TTTGAAAGGCTGGAAGAGCAGATATCCACACAAGAAGGCAAATTAGACCTCAGGCCAGTG 6748

 52646551 TGGAATTAAAGGTGTAGGGTTATCTGGTCAAGACTGTGTGTGTGGATACAGGCTCCAACC 52646610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6749 TGGAATTAAAGGTGTAGGGTTATCTGGTCAAGACTGTGTGTGTGGATACAGGCTCCAACC 6808

 52646611 CCTCCAGGCAAGGGCACTGTTTCCAACATCCACCCTTTCTCCTTTGACCTCTACCTTGAC 52646670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6809 CCTCCAGGCAAGGGCACTGTTTCCAACATCCACCCTTTCTCCTTTGACCTCTACCTTGAC 6868

 52646671 CTAAATTAACTATAAAAGGTCCTTCTTTTCTAGGACCCTACTATAAATCAGTGAAATATT 52646730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6869 CTAAATTAACTATAAAAGGTCCTTCTTTTCTAGGACCCTACTATAAATCAGTGAAATATT 6928

 52646731 CAGGAAAAAAAGAACACCAAGAATGTTGGGATCCCAGTTAAAGATCAAGATTCTCTACTG 52646790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6929 CAGGAAAAAAAGAACACCAAGAATGTTGGGATCCCAGTTAAAGATCAAGATTCTCTACTG 6988

 52646791 ATAAGCTGTGTGATATGGAGTAAATCACTAAAGATCTTTGAATCTCTTCATTTGTAAAAT 52646850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6989 ATAAGCTGTGTGATATGGAGTAAATCACTAAAGATCTTTGAATCTCTTCATTTGTAAAAT 7048

 52646851 GGGAATATTGGTAGTCCTACTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTAAAGAAGAAAAGTCATGCA 52646910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7049 GGGAATATTGGTAGTCCTACTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTAAAGAAGAAAAGTCATGCA 7108

 52646911 AAGGATCTGGCACAACGCCTTTTCCATAATAAGTGCTTAGTAATTGACAGATACTGTGAT 52646970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7109 AAGGATCTGGCACAACGCCTTTTCCATAATAAGTGCTTAGTAATTGACAGATACTGTGAT 7168

 52646971 AACTTTTCAGGTTTCTCTCATGCCTTTGACAACATTGCATTTTGCTTGCTCTATCTGTAG 52647030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7169 AACTTTTCAGGTTTCTCTCATGCCTTTGACAACATTGCATTTTGCTTGCTCTATCTGTAG 7228

 52647031 TCAGACACTTCTTAATATCTGTTTGCAGGAAGACAGAAAAATAAAGGGAAGAATTGAGAT 52647090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7229 TCAGACACTTCTTAATATCTGTTTGCAGGAAGACAGAAAAATAAAGGGAAGAATTGAGAT 7288

 52647091 TTCTTTGATCTATTCATACTGCTCATTAATATGTAGTGAGAAATACATACACACACACAT 52647150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7289 TTCTTTGATCTATTCATACTGCTCATTAATATGTAGTGAGAAATACATACACACACACAT 7348

 52647151 ACACACACATGCATCCATTAGCAATTGTTTTTGCCCAACTCTAGTGTCTCGCAGTGTCTA 52647210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7349 ACACACACATGCATCCATTAGCAATTGTTTTTGCCCAACTCTAGTGTCTCGCAGTGTCTA 7408

 52647211 GACTAAACAACAAACAAAAAAGGGGGGAGAGTGAGCTGGATTAAGCATTGAGGCACAGTG 52647270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7409 GACTAAACAACAAACAAAAAAGGGGGGAGAGTGAGCTGGATTAAGCATTGAGGCACAGTG 7468

 52647271 AAGAAATGGTCTGGGGCAAGCCCAGGGATGAATGTTAGGGGTTTCTCATAAACCTGAACC 52647330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7469 AAGAAATGGTCTGGGGCAAGCCCAGGGATGAATGTTAGGGGTTTCTCATAAACCTGAACC 7528

 52647331 TGAAGAAAATCACCCTGCCAGCATATTGATCTTCTAGCTCTTCTTAACCTTTTTTTCTGT 52647390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7529 TGAAGAAAATCACCCTGCCAGCATATTGATCTTCTAGCTCTTCTTAACCTTTTTTTCTGT 7588

 52647391 GATTCAGGAATTCATAATGATAGAAAATATTATACTAAAGAAGAAAAAAAGAGGGAGAAT 52647450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7589 GATTCAGGAATTCATAATGATAGAAAATATTATACTAAAGAAGAAAAAAAGAGGGAGAAT 7648

 52647451 AAGTAAGTGATAGATGGATGCATCAGGGTGTAAAGTTAGCAAGTAAGGCTGTTGAAGTGT 52647510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7649 AAGTAAGTGATAGATGGATGCATCAGGGTGTAAAGTTAGCAAGTAAGGCTGTTGAAGTGT 7708

 52647511 CAGAGTGAATATAAATGAATTGTGGGAATGGTCCATGCCAGGAGAAGAGGGTATGGTTGA 52647570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7709 CAGAGTGAATATAAATGAATTGTGGGAATGGTCCATGCCAGGAGAAGAGGGTATGGTTGA 7768

 52647571 CAAAAAGGGAAATGCTAAGATTCAAAACAGGGAAGGGCTTTTCAAAATGCCAAGAGCACC 52647630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7769 CAAAAAGGGAAATGCTAAGATTCAAAACAGGGAAGGGCTTTTCAAAATGCCAAGAGCACC 7828

 52647631 AACTTATATCTTTCAGTTTAATTCCTCTCTTCCTTACCCACTGGCTGGAAAGCAAAGGAG 52647690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7829 AACTTATATCTTTCAGTTTAATTCCTCTCTTCCTTACCCACTGGCTGGAAAGCAAAGGAG 7888

 52647691 CTAGTGGTAAGTAAGAGTGTTATAGCCAGAGAAAAAGTCTTCAAAAAACACAAAGTACTT 52647750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7889 CTAGTGGTAAGTAAGAGTGTTATAGCCAGAGAAAAAGTCTTCAAAAAACACAAAGTACTT 7948

 52647751 TCCATGGACAACCTTTTTTATTTTAAAGTGCCAATATGTTGCTTTGAAAAAGAATAAATT 52647810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7949 TCCATGGACAACCTTTTTTATTTTAAAGTGCCAATATGTTGCTTTGAAAAAGAATAAATT 8008

 52647811 CCTTACATCCAGGTATCTGGACTAGACTTCAGTGCATTTAGTGATTATAGCAAATCCAAA 52647870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8009 CCTTACATCCAGGTATCTGGACTAGACTTCAGTGCATTTAGTGATTATAGCAAATCCAAA 8068

 52647871 CAGTAGCTTTTGATATCAGAGAATGGGTAAAGTGTTTTTGACAATTTCTAAGAACTTAGA 52647930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8069 CAGTAGCTTTTGATATCAGAGAATGGGTAAAGTGTTTTTGACAATTTCTAAGAACTTAGA 8128

 52647931 GTTCTTCGGTGATACGTTCCATGCAACTGAAGCTCTGCTCTCCAAATTTAGGTGGGTACA 52647990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8129 GTTCTTCGGTGATACGTTCCATGCAACTGAAGCTCTGCTCTCCAAATTTAGGTGGGTACA 8188

 52647991 TACCCAAGTCCATCACCTGGGGCTTCTATTTCCTTTGCTCAGATGCTCACCTCCTAGGTG 52648050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8189 TACCCAAGTCCATCACCTGGGGCTTCTATTTCCTTTGCTCAGATGCTCACCTCCTAGGTG 8248

 52648051 GGCACCTGACATAAGATAGACTAATAAAAATAAGTCCTGTAACTTTTGATACTCCTATTA 52648110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8249 GGCACCTGACATAAGATAGACTAATAAAAATAAGTCCTGTAACTTTTGATACTCCTATTA 8308

 52648111 AAAAAGAGTTGCAAACCAATAGGAGGTACACTTGAGAATCAGCACAAATGAAAGTAGAAC 52648170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8309 AAAAAGAGTTGCAAACCAATAGGAGGTACACTTGAGAATCAGCACAAATGAAAGTAGAAC 8368

 52648171 CTGGAAATCCAGGAAGCAGATACCCAATCATGTCATTTAAACATTTAGATCCAGCTGTGC 52648230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8369 CTGGAAATCCAGGAAGCAGATACCCAATCATGTCATTTAAACATTTAGATCCAGCTGTGC 8428

 52648231 CTGAAGCTGAACTTTAGCATTACATAAGCCAATAAATCACTCTTCCCCAACTTACGCCAG 52648290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8429 CTGAAGCTGAACTTTAGCATTACATAAGCCAATAAATCACTCTTCCCCAACTTACGCCAG 8488

 52648291 TTGAAATTGAATACATACTCAGTGACTTTGAGAGAATTCCAGGGAATTGGTCAGTCCCTG 52648350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8489 TTGAAATTGAATACATACTCAGTGACTTTGAGAGAATTCCAGGGAATTGGTCAGTCCCTG 8548

 52648351 TTTCACTTGTAAATACACAGCAATCAAGCCTACCAAATCTATGATTGATTGGGGTGTCTG 52648410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8549 TTTCACTTGTAAATACACAGCAATCAAGCCTACCAAATCTATGATTGATTGGGGTGTCTG 8608

 52648411 AAAGAGATGGAGGGAATGGAATCAACCTGAAAAACATATTTCAGGAGTTCATCCCTGAAA 52648470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8609 AAAGAGATGGAGGGAATGGAATCAACCTGAAAAACATATTTCAGGAGTTCATCCCTGAAA 8668

 52648471 ACTTCCCCAACCTAGCTAGAGGGGCCAACATTCAAATTCAGGAAATGCAGAGAACCCCAG 52648530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8669 ACTTCCCCAACCTAGCTAGAGGGGCCAACATTCAAATTCAGGAAATGCAGAGAACCCCAG 8728

 52648531 TAAGATACTCCACAAAAAGATCTTCCCCAAGACATCATCATCAGATTCTCCAAAGTTGAA 52648590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8729 TAAGATACTCCACAAAAAGATCTTCCCCAAGACATCATCATCAGATTCTCCAAAGTTGAA 8788

 52648591 ATGTAAGAAAAAATGCTAAAGGCAACTAGAGTGAAAGGCCCGGTCACCTAAAAAGGGAAG 52648650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8789 ATGTAAGAAAAAATGCTAAAGGCAACTAGAGTGAAAGGCCCGGTCACCTAAAAAGGGAAG 8848

 52648651 CACAGACTTACAGTGGACCTCTCACTGGTAACCCTACAAGCCAGAAGAGATTGAGGACCA 52648710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8849 CACAGACTTACAGTGGACCTCTCACTGGTAACCCTACAAGCCAGAAGAGATTGAGGACCA 8908

 52648711 ATATTCAACATTCTTAAACAAAAAGAATTCCAACCCAGAATTTTATATCTGACTAAACTA 52648770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8909 ATATTCAACATTCTTAAACAAAAAGAATTCCAACCCAGAATTTTATATCTGACTAAACTA 8968

 52648771 AGCTTCATAAGCAAAAGAGAAATAAGATCATTTTCAGACAAGCAAATGCTAAGGGAATTT 52648830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8969 AGCTTCATAAGCAAAAGAGAAATAAGATCATTTTCAGACAAGCAAATGCTAAGGGAATTT 9028

 52648831 GTGACCATTAGACCTTCCTTGCAACAGTTCCTAAAGGAAGCACTAAATATGGAAAGACCA 52648890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9029 GTGACCATTAGACCTTCCTTGCAACAGTTCCTAAAGGAAGCACTAAATATGGAAAGACCA 9088

 52648891 TTACCAGACACTACAAAACACACTGAAGTACACAGACCAGTGACATTGTAAAGCAACTAC 52648950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9089 TTACCAGACACTACAAAACACACTGAAGTACACAGACCAGTGACATTGTAAAGCAACTAC 9148

 52648951 ATAACAAGTCTGCAAAATAACCAGCCAACATCATGATGACGGTATCAAATCGACACATAG 52649010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9149 ATAACAAGTCTGCAAAATAACCAGCCAACATCATGATGACGGTATCAAATCGACACATAG 9208

 52649011 CAACACTAACCTTAAATGTAAATGGACTAAATGATCCCATTAAAAGACATAAAGTGGCAG 52649070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9209 CAACACTAACCTTAAATGTAAATGGACTAAATGATCCCATTAAAAGACATAAAGTGGCAG 9268

 52649071 GCTGGATAAAGAACCAAGAACCATTGGTATACTGTCTTCAAGAGACCCATCTCCTATGCA 52649130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9269 GCTGGATAAAGAACCAAGAACCATTGGTATACTGTCTTCAAGAGACCCATCTCCTATGCA 9328

 52649131 GTGACACACATAGGTTCAAGATAAAGGGATGGGGAAAAATCTACCAAGCAAATAGAAAAC 52649190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9329 GTGACACACATAGGTTCAAGATAAAGGGATGGGGAAAAATCTACCAAGCAAATAGAAAAC 9388

 52649191 AGAATAAAACAGGGGTTGCAATCCTAGTTGCCGTCAAAACAGACTTTAAACCAACAAAGG 52649250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9389 AGAATAAAACAGGGGTTGCAATCCTAGTTGCCGTCAAAACAGACTTTAAACCAACAAAGG 9448

 52649251 TTAAAAGAAAAAAATATGGGCATTGCATAAGGATAAAGTGTTAAATTAAACAAGAAGATC 52649310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9449 TTAAAAGAAAAAAATATGGGCATTGCATAAGGATAAAGTGTTAAATTAAACAAGAAGATC 9508

 52649311 TAACTATCCTAAGTATATATGCACCAAACACAGGAACACCCAGATTCATAAAGCAAGTTT 52649370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9509 TAACTATCCTAAGTATATATGCACCAAACACAGGAACACCCAGATTCATAAAGCAAGTTT 9568

 52649371 ATGGAGACCTTCAAACAGACTTAGACTCCCACACAATAGTAGTGGGAGACTTTAATACCC 52649430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9569 ATGGAGACCTTCAAACAGACTTAGACTCCCACACAATAGTAGTGGGAGACTTTAATACCC 9628

 52649431 CATGACAATATTAGACAGATCATTGAGACAGGAAATTAACAAAGATATTCAAGATCTAAC 52649490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9629 CATGACAATATTAGACAGATCATTGAGACAGGAAATTAACAAAGATATTCAAGATCTAAC 9688

 52649491 TCAGCACTAAATCAAATGGCCCTGATAGA 52649519
          |||||||||||||||||||||||||||||
     9689 TCAGCACTAAATCAAATGGCCCTGATAGA 9717

Alignment time is 10.7746 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [52637064,52668002] =>     30939 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    8676] =>      8676 nucs 'mol-32-1f0b-096123_8676'

Score:        8675
Aligned:      8675        nucs
Identic:      8675 (100%) nucs =>       818 (100%)      7857 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [52639723,52640540] EXCISED REGION [52640542,52648398]
 second seq =>  [       1,     818] EXCISED REGION [     820,    8676]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [52640541,52640541]
 second seq =>         1 nucs [819,819]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [52640541,52640542] to [52640542,52640543]
 second seq =>         1 nucs [818,818] to [819,819]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [52640538,52640540] to [52640542,52640544]
 second seq =>         3 nucs [816,818] to [820,822]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 52639723 AACTTTGCATATGCTAACATCTTTGAATTTCATTGCCTCAAGTTGTAACTTCATTGAACA 52639782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AACTTTGCATATGCTAACATCTTTGAATTTCATTGCCTCAAGTTGTAACTTCATTGAACA 60

 52639783 AGTTTCAAATAATTGGCAAAAATAGAAACGTTGACTATTTAAGACTATGGGCTTTGGAGA 52639842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGTTTCAAATAATTGGCAAAAATAGAAACGTTGACTATTTAAGACTATGGGCTTTGGAGA 120

 52639843 TGGACAATTTTGGCTGTGCCACCTTTTAGCTGTGTGTCAGGAGTGATATGCTTTCTCTGA 52639902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGGACAATTTTGGCTGTGCCACCTTTTAGCTGTGTGTCAGGAGTGATATGCTTTCTCTGA 180

 52639903 ACTGTTGACTTCTTCATCTGTAAAATGGTGAAAATACAGGAATTCCCTGGTAAGATTTGA 52639962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACTGTTGACTTCTTCATCTGTAAAATGGTGAAAATACAGGAATTCCCTGGTAAGATTTGA 240

 52639963 TGGCTCAATGAGCTGATTTCTACAAAATGATTTAATCACAGAATTTGACTTAAAATGCGA 52640022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGGCTCAATGAGCTGATTTCTACAAAATGATTTAATCACAGAATTTGACTTAAAATGCGA 300

 52640023 GAGGGATTCATGCTGTCCGAAATCATCCAAGAGTGGAGATATCTGGTTAGCTTCATGGAG 52640082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GAGGGATTCATGCTGTCCGAAATCATCCAAGAGTGGAGATATCTGGTTAGCTTCATGGAG 360

 52640083 AACCTGGCACTGAATATCAAGTCAATTTTTGATAAACAGAGAGAGAAAGGGACATAGGCA 52640142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AACCTGGCACTGAATATCAAGTCAATTTTTGATAAACAGAGAGAGAAAGGGACATAGGCA 420

 52640143 GAGAAAATACCAGGAGACAGATGGCGTTTGCACAGGTCAGGTGTTGGCCATATTGACTGG 52640202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GAGAAAATACCAGGAGACAGATGGCGTTTGCACAGGTCAGGTGTTGGCCATATTGACTGG 480

 52640203 AGAAATTTAAGGGAAGGGTGGAAAATGCAGTTGGAAAATAGGCAGAGGAAACATTGTGGA 52640262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGAAATTTAAGGGAAGGGTGGAAAATGCAGTTGGAAAATAGGCAGAGGAAACATTGTGGA 540

 52640263 AACCCTTAAATGTCAGACAAAGAAACTGAGGCTTATGGGCATGGACACTAACATTTCTAT 52640322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AACCCTTAAATGTCAGACAAAGAAACTGAGGCTTATGGGCATGGACACTAACATTTCTAT 600

 52640323 TGTTTCAAAAATAATTTTACAACTTTTATACCTTTCTCACCCAAGTTAGGACTTGTGCCT 52640382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGTTTCAAAAATAATTTTACAACTTTTATACCTTTCTCACCCAAGTTAGGACTTGTGCCT 660

 52640383 TTGGTTATACAACTCTTAAATTAGAGTCAACTGTGCTATCTCTGTGAGTTTGGGTTGAGG 52640442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTGGTTATACAACTCTTAAATTAGAGTCAACTGTGCTATCTCTGTGAGTTTGGGTTGAGG 720

 52640443 ACTATGGAAGGGAAAGGCAAAAAATAAAAGTAAAATGTGAAGTAGAAGACAGGGAGAAAA 52640502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ACTATGGAAGGGAAAGGCAAAAAATAAAAGTAAAATGTGAAGTAGAAGACAGGGAGAAAA 780

 52640503 CCCATAATACTGGTAATAGCTAATTTCTCTTTTTCTTC 52640540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CCCATAATACTGGTAATAGCTAATTTCTCTTTTTCTTC 818

EXCISED REGION

 52640542 TTCAAAATGCAATTTGTGCTAAGTACTTTATATGGCCTATCTCATTTAACTTCTAAAAGT 52640601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      820 TTCAAAATGCAATTTGTGCTAAGTACTTTATATGGCCTATCTCATTTAACTTCTAAAAGT 879

 52640602 GTGAACAATGTGAGAATGTGCTAGATACTATTATTATCCCCATTTTACAGATGAGGAAAC 52640661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      880 GTGAACAATGTGAGAATGTGCTAGATACTATTATTATCCCCATTTTACAGATGAGGAAAC 939

 52640662 TGAGGCTCAGGAGGTGAAGTAGCTTGCCCAAGATCACACAGCCAGTAGGTGACAGAGGTA 52640721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      940 TGAGGCTCAGGAGGTGAAGTAGCTTGCCCAAGATCACACAGCCAGTAGGTGACAGAGGTA 999

 52640722 GAGAGGAAACCTAGGCTACTTGACTATGATGCTTATGTTTAATTCACTACTAAATACCAT 52640781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1000 GAGAGGAAACCTAGGCTACTTGACTATGATGCTTATGTTTAATTCACTACTAAATACCAT 1059

 52640782 GTAGGAAAGGACTCTGGAGACCTTAGTTCTTTAATTCCAATTCTACCACTAAACAGTAGA 52640841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1060 GTAGGAAAGGACTCTGGAGACCTTAGTTCTTTAATTCCAATTCTACCACTAAACAGTAGA 1119

 52640842 GACAGGATGAACTTGTCATTCACTGAGATGGAAAACCCCGTGAATTAAACTGGTGGGCAT 52640901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1120 GACAGGATGAACTTGTCATTCACTGAGATGGAAAACCCCGTGAATTAAACTGGTGGGCAT 1179

 52640902 TTTGTTTTTGTCATTGTTAGGCGATGAATGAAGAGTTCCATTCTGGACACATTAGGGTTG 52640961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1180 TTTGTTTTTGTCATTGTTAGGCGATGAATGAAGAGTTCCATTCTGGACACATTAGGGTTG 1239

 52640962 AGATACTCAGTGAGCAGCCAAATGGGGATGTAGAAATTCAAGTAGACATGTGGAAGAGGA 52641021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1240 AGATACTCAGTGAGCAGCCAAATGGGGATGTAGAAATTCAAGTAGACATGTGGAAGAGGA 1299

 52641022 GGCAGCTGAGACTCACGTCTGGACTTCAGGGATGGATCCCGGCTAGAGATGTAAATTTGG 52641081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1300 GGCAGCTGAGACTCACGTCTGGACTTCAGGGATGGATCCCGGCTAGAGATGTAAATTTGG 1359

 52641082 AACTTGTCAACCCATAGCAGTATTTAAACCTTTGGGACTGAGGGAAACCTTCAAGGAAAT 52641141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1360 AACTTGTCAACCCATAGCAGTATTTAAACCTTTGGGACTGAGGGAAACCTTCAAGGAAAT 1419

 52641142 AAGCGTAGTTAGAGATAGCCAAGAAGTGAACCCTGGGGAAGTCCAACATTTAGAGGGTGA 52641201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1420 AAGCGTAGTTAGAGATAGCCAAGAAGTGAACCCTGGGGAAGTCCAACATTTAGAGGGTGA 1479

 52641202 GATCCAGCAAAGGAGATGATGGAAGAGTACCAGGGAGGTGGAAGGATGTTGTTTCAAACA 52641261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1480 GATCCAGCAAAGGAGATGATGGAAGAGTACCAGGGAGGTGGAAGGATGTTGTTTCAAACA 1539

 52641262 GCAAGGTGTGGCCCACTCAGTCACTGTGTCGGATTCAACTTGCAGGTCAGACCTACTAGG 52641321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1540 GCAAGGTGTGGCCCACTCAGTCACTGTGTCGGATTCAACTTGCAGGTCAGACCTACTAGG 1599

 52641322 ACAAAGATAGAGACCTATAGGATTTGGCAGCCAGGGTGATGGTAGGGAATTTGAAACATC 52641381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1600 ACAAAGATAGAGACCTATAGGATTTGGCAGCCAGGGTGATGGTAGGGAATTTGAAACATC 1659

 52641382 ATGGTGGCTGTGACAAGAGCCTGAATGGAGTGTGTTCAAGAGAGAAAAGAAGAGAAGTGA 52641441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1660 ATGGTGGCTGTGACAAGAGCCTGAATGGAGTGTGTTCAAGAGAGAAAAGAAGAGAAGTGA 1719

 52641442 AAACACAGAATATTGTTCTTATTATTAGTAGCCTGAGCCAATCTGAGGACCGATGCACTT 52641501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1720 AAACACAGAATATTGTTCTTATTATTAGTAGCCTGAGCCAATCTGAGGACCGATGCACTT 1779

 52641502 ATCACAATGTCTCTTAAAATACTATGTCTCTTACTAGATTATACACTCCTTGACAGACGA 52641561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1780 ATCACAATGTCTCTTAAAATACTATGTCTCTTACTAGATTATACACTCCTTGACAGACGA 1839

 52641562 GAAACATGATTTATTTTTCAAATGCCTTGCACAAGGTTAGTGCGAAAGTAACGATTGCAG 52641621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1840 GAAACATGATTTATTTTTCAAATGCCTTGCACAAGGTTAGTGCGAAAGTAACGATTGCAG 1899

 52641622 GATTTAATTACACTTTTAAAAGAAAAAAGACATTCTTCATCTTATGAAACTCTGCATGGC 52641681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1900 GATTTAATTACACTTTTAAAAGAAAAAAGACATTCTTCATCTTATGAAACTCTGCATGGC 1959

 52641682 AACACTTTATGCGCCCCACACCCCCACTCAACACAAACACAACTCTGGAAGTACTGTGTT 52641741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1960 AACACTTTATGCGCCCCACACCCCCACTCAACACAAACACAACTCTGGAAGTACTGTGTT 2019

 52641742 GATAACAGAAATGTGGTGGGTTTTATTTTTAACCAATAAAGGTCAAGTTTGCATTATGTG 52641801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2020 GATAACAGAAATGTGGTGGGTTTTATTTTTAACCAATAAAGGTCAAGTTTGCATTATGTG 2079

 52641802 ATTTTGTGTGTGTGTGTGTTGAATCTTTTAAATGCATATCTTACAGCTCTGGTTCAGTTG 52641861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2080 ATTTTGTGTGTGTGTGTGTTGAATCTTTTAAATGCATATCTTACAGCTCTGGTTCAGTTG 2139

 52641862 TTGTGGGGAGAGGAAAAAAACCTCATCCCTGCCAACACATTGGTTTGTATGAATCACAGC 52641921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2140 TTGTGGGGAGAGGAAAAAAACCTCATCCCTGCCAACACATTGGTTTGTATGAATCACAGC 2199

 52641922 TCAGTGAAACCTTTCAGGCATATAATTTATCTTTTCTTTGGCCTATGTAGTAAACGCTTC 52641981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2200 TCAGTGAAACCTTTCAGGCATATAATTTATCTTTTCTTTGGCCTATGTAGTAAACGCTTC 2259

 52641982 ATTTGTTCATGAATTCTTGCCTTGTTTTAATTATGCTTTGCCCTGAATGTAGTTTTATAA 52642041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2260 ATTTGTTCATGAATTCTTGCCTTGTTTTAATTATGCTTTGCCCTGAATGTAGTTTTATAA 2319

 52642042 GGCACAAAAATAAGATTGTCGTTCTGAAAACACAGAAGATTTGTATGTTTCCCCCAGGAT 52642101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2320 GGCACAAAAATAAGATTGTCGTTCTGAAAACACAGAAGATTTGTATGTTTCCCCCAGGAT 2379

 52642102 GAAATGGTGGCATCTTTCTCCCAATTCACAGCTCTGTGGGCTTGTGGCTGGAATTCCAAT 52642161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2380 GAAATGGTGGCATCTTTCTCCCAATTCACAGCTCTGTGGGCTTGTGGCTGGAATTCCAAT 2439

 52642162 CCAGCAGGGAGCAAGCCATAAAAATGGGGGGAAGGGCTGCTGGAGGGAGGCAGTAGATGC 52642221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2440 CCAGCAGGGAGCAAGCCATAAAAATGGGGGGAAGGGCTGCTGGAGGGAGGCAGTAGATGC 2499

 52642222 GGCTGAGCCCAAGGCATAATTCACCCTAAGAATTCTGAATCAATACACTGACATCCAGCC 52642281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2500 GGCTGAGCCCAAGGCATAATTCACCCTAAGAATTCTGAATCAATACACTGACATCCAGCC 2559

 52642282 ATGTACAATGTGGTACTCCCACCAAGAAAGCCACTGATTGAGAAGTTTTATTCATGTTAC 52642341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2560 ATGTACAATGTGGTACTCCCACCAAGAAAGCCACTGATTGAGAAGTTTTATTCATGTTAC 2619

 52642342 TTTCTGAGGGTTGGATTGTCCCATTACATTTATAGAACAATTGCTTTTTTCCCCCTAAAT 52642401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2620 TTTCTGAGGGTTGGATTGTCCCATTACATTTATAGAACAATTGCTTTTTTCCCCCTAAAT 2679

 52642402 ACAGAACTATGCAGCCGGGAGTCAGAAAAGAAACCTTGACAATCAGAAGGCTGTTTTGTT 52642461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2680 ACAGAACTATGCAGCCGGGAGTCAGAAAAGAAACCTTGACAATCAGAAGGCTGTTTTGTT 2739

 52642462 GTTGTTGTTAAAAACCTTTGCAGGCATATGCATCTGAATATCCATAAGTTCACAGGCTGA 52642521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2740 GTTGTTGTTAAAAACCTTTGCAGGCATATGCATCTGAATATCCATAAGTTCACAGGCTGA 2799

 52642522 GGGAGAAATGGCTATTTCATAACTTTTCTGTGTTTCTCATGTACATAGTACAAAGTGGGC 52642581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2800 GGGAGAAATGGCTATTTCATAACTTTTCTGTGTTTCTCATGTACATAGTACAAAGTGGGC 2859

 52642582 ACTCAGTATTTCAAATTTCAATATCACTGAAAAAAATGGAAATTTGTCATGTAACAAAAT 52642641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2860 ACTCAGTATTTCAAATTTCAATATCACTGAAAAAAATGGAAATTTGTCATGTAACAAAAT 2919

 52642642 CAGATGCAGACTTCACTGGTGAATCTGAGGGAGTGAATTCACTTATTCAGAAAGGAAGAC 52642701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2920 CAGATGCAGACTTCACTGGTGAATCTGAGGGAGTGAATTCACTTATTCAGAAAGGAAGAC 2979

 52642702 AGTTACAATTCTTGGGTCTTCTGAGAGATCATTATAACTTGAAAATATTACACAAGGGCT 52642761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2980 AGTTACAATTCTTGGGTCTTCTGAGAGATCATTATAACTTGAAAATATTACACAAGGGCT 3039

 52642762 TTGCTATATTAGATACCTGCCATGTTCCTAACACAAGCTCCCATTTTCTGACTCAAATCT 52642821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3040 TTGCTATATTAGATACCTGCCATGTTCCTAACACAAGCTCCCATTTTCTGACTCAAATCT 3099

 52642822 CATTTTGGAACACATTCCACTCAAATTGAGGTTCTACCCCTAAGAGTTCTTTTTCAATAA 52642881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3100 CATTTTGGAACACATTCCACTCAAATTGAGGTTCTACCCCTAAGAGTTCTTTTTCAATAA 3159

 52642882 AGAAAGCTGAGTTAATAAATCACAACTCCAAAACTTTTCCTCACTTTTCTTAGACTAGAA 52642941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3160 AGAAAGCTGAGTTAATAAATCACAACTCCAAAACTTTTCCTCACTTTTCTTAGACTAGAA 3219

 52642942 ATAGATTGAGTGTGTCGAGGTTTTATGGCTGAGTACATTGGAGGGCTGGCTATTCTATGC 52643001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3220 ATAGATTGAGTGTGTCGAGGTTTTATGGCTGAGTACATTGGAGGGCTGGCTATTCTATGC 3279

 52643002 TGAACTGGTTTACTTGATTAAGATGGGGATTTGGATGAGTCACCGGACACCTGTCCAAAG 52643061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3280 TGAACTGGTTTACTTGATTAAGATGGGGATTTGGATGAGTCACCGGACACCTGTCCAAAG 3339

 52643062 ATGAGTAAAACACATTCCTTCATTGTCTTCCCATAAATAACTCAATCTTCTCCTAACTGA 52643121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3340 ATGAGTAAAACACATTCCTTCATTGTCTTCCCATAAATAACTCAATCTTCTCCTAACTGA 3399

 52643122 GCCAATGGATAGGCTTTGGATGCCCAAGCAAAACAAACACATGACTGTTAAAAAATCACA 52643181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3400 GCCAATGGATAGGCTTTGGATGCCCAAGCAAAACAAACACATGACTGTTAAAAAATCACA 3459

 52643182 ACCTCAAAATGGCCTTAGAAGCCTATGACCAATAATGAGAATGGTTTCTCCACTCAGGCG 52643241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3460 ACCTCAAAATGGCCTTAGAAGCCTATGACCAATAATGAGAATGGTTTCTCCACTCAGGCG 3519

 52643242 CAAGTAGTAAACAGTTTCTCCCATATGCAGGAATATTGACGACTAGTTTACCGCCTCTGG 52643301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3520 CAAGTAGTAAACAGTTTCTCCCATATGCAGGAATATTGACGACTAGTTTACCGCCTCTGG 3579

 52643302 GCACGTAACTTTCAGGTCCTGGTTCATGCATTTGCTGGAATGTTCCCTGGGCCATGGAGC 52643361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3580 GCACGTAACTTTCAGGTCCTGGTTCATGCATTTGCTGGAATGTTCCCTGGGCCATGGAGC 3639

 52643362 CCAGTTCTCCTGGCATCTGGCATCTCCCCCACACTCTGCTCCCCCAGCACAGCACTTGGC 52643421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3640 CCAGTTCTCCTGGCATCTGGCATCTCCCCCACACTCTGCTCCCCCAGCACAGCACTTGGC 3699

 52643422 ATCTTGCATTGCAATTGCAGGTTTATTTATTCACTTCTCTCACTGGACAGCAAACTCCAC 52643481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3700 ATCTTGCATTGCAATTGCAGGTTTATTTATTCACTTCTCTCACTGGACAGCAAACTCCAC 3759

 52643482 CAGGGCCGAGACTCTGTGTCTCGCCCTTCACTGTGGTCCCTGTGCCTCACCTGTTCCTAG 52643541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3760 CAGGGCCGAGACTCTGTGTCTCGCCCTTCACTGTGGTCCCTGTGCCTCACCTGTTCCTAG 3819

 52643542 TACAGTGTCACACTCAGTAAAGAGCAGATGCCTGGTGCATTTGGAGACTTATTTTAAATT 52643601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3820 TACAGTGTCACACTCAGTAAAGAGCAGATGCCTGGTGCATTTGGAGACTTATTTTAAATT 3879

 52643602 ATACGGAAAGTTATTCAACCGGCTTCTTGAACTGGTGAATTTTGGAAAGTGGGTGTTTGA 52643661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3880 ATACGGAAAGTTATTCAACCGGCTTCTTGAACTGGTGAATTTTGGAAAGTGGGTGTTTGA 3939

 52643662 AGGGAAAATGTTTAAACTCTGAAAGAAATGTTGGAAATAAGCTCTTTGAATCAAAATGTA 52643721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3940 AGGGAAAATGTTTAAACTCTGAAAGAAATGTTGGAAATAAGCTCTTTGAATCAAAATGTA 3999

 52643722 TAGAAAACACAAGAATGCTGACAGTAAGAGCCTAAAACACATGATGACTATTATCTTTTC 52643781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4000 TAGAAAACACAAGAATGCTGACAGTAAGAGCCTAAAACACATGATGACTATTATCTTTTC 4059

 52643782 CCAATTTTAACTCTCCAGAGTGTTCAGCGGTGCCCAGCCTTCATAATGTAATTCTTCGTA 52643841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4060 CCAATTTTAACTCTCCAGAGTGTTCAGCGGTGCCCAGCCTTCATAATGTAATTCTTCGTA 4119

 52643842 GCACCCTGGATGCATTAAAACCATAGATTAACGTGATACTTATTTTCATTAAGGAAAATA 52643901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4120 GCACCCTGGATGCATTAAAACCATAGATTAACGTGATACTTATTTTCATTAAGGAAAATA 4179

 52643902 ATTTACGTACAGTGCTCAGAGTAGAGCCTGGCACATTGAACATTTTCAATAAATGACAGC 52643961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4180 ATTTACGTACAGTGCTCAGAGTAGAGCCTGGCACATTGAACATTTTCAATAAATGACAGC 4239

 52643962 AAGTGTAATTATTAGCACTTCGGAAGTGCAAAGTTGCATTGTATTAAGACAAATATATTT 52644021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4240 AAGTGTAATTATTAGCACTTCGGAAGTGCAAAGTTGCATTGTATTAAGACAAATATATTT 4299

 52644022 GGAGCTCATCCAATTTTTTCCTGGCTCTGAAGTCTGCTAGTGGCACTTAACTTTATTCCC 52644081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4300 GGAGCTCATCCAATTTTTTCCTGGCTCTGAAGTCTGCTAGTGGCACTTAACTTTATTCCC 4359

 52644082 AAGTTTTGAAAAATATTGTTATTTAAAAAGTCTGTTAACCAAGGAAATGCATGCCCTAAA 52644141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4360 AAGTTTTGAAAAATATTGTTATTTAAAAAGTCTGTTAACCAAGGAAATGCATGCCCTAAA 4419

 52644142 CCTATAATGTATCAAGTTTTACTTCCTTCTTCTTTTAAGGAGTTCTTTTCCTGCCTTGAA 52644201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4420 CCTATAATGTATCAAGTTTTACTTCCTTCTTCTTTTAAGGAGTTCTTTTCCTGCCTTGAA 4479

 52644202 TACAAACAGGCTCTCTCAAGGTTAAAAGCAAATGCTCTTTTTAGTGTCAAAAAGAGCTTG 52644261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4480 TACAAACAGGCTCTCTCAAGGTTAAAAGCAAATGCTCTTTTTAGTGTCAAAAAGAGCTTG 4539

 52644262 CCTTTCTTCGCTCAGGAAAAAAAGCAACTGATTCCAGGATACCTTCTTTGAAAACCAACA 52644321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4540 CCTTTCTTCGCTCAGGAAAAAAAGCAACTGATTCCAGGATACCTTCTTTGAAAACCAACA 4599

 52644322 CAAAAAAACCCCCCAAAAAACAAAAAAAAAACCCAAAACCCCTAGTTTTTACAAAGGTTT 52644381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4600 CAAAAAAACCCCCCAAAAAACAAAAAAAAAACCCAAAACCCCTAGTTTTTACAAAGGTTT 4659

 52644382 ATTACTCCTACTTGTTGGAAAAGAATTACTACATAAAAGAGTCTGCCCAGAGCTGTAAAA 52644441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4660 ATTACTCCTACTTGTTGGAAAAGAATTACTACATAAAAGAGTCTGCCCAGAGCTGTAAAA 4719

 52644442 TCTCCTTATTCAAACACACACCTTAGAGCAAAAGATGGTTAAATATCAATTCAGGCTATT 52644501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4720 TCTCCTTATTCAAACACACACCTTAGAGCAAAAGATGGTTAAATATCAATTCAGGCTATT 4779

 52644502 AACAGTAAGGGACGAAATGTGTTCCAACAAAACTCTGCATGTCAACAAACTACAGAGACT 52644561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4780 AACAGTAAGGGACGAAATGTGTTCCAACAAAACTCTGCATGTCAACAAACTACAGAGACT 4839

 52644562 AGGTAACATCTTTTAGGAATCATTTTTATTCCACTAATGCCTTTTCCTCCAGAATCCACT 52644621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4840 AGGTAACATCTTTTAGGAATCATTTTTATTCCACTAATGCCTTTTCCTCCAGAATCCACT 4899

 52644622 GATCGTAAACGCAACCTGTCTACTTCCGCCTTTGAAAAATGGATGGACAAATTCATCTGC 52644681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4900 GATCGTAAACGCAACCTGTCTACTTCCGCCTTTGAAAAATGGATGGACAAATTCATCTGC 4959

 52644682 ATGTAACTCACCTCCTCTTTTCTTTTACATAAAACAGATGCCACAGCTGTTATTGTTCTT 52644741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4960 ATGTAACTCACCTCCTCTTTTCTTTTACATAAAACAGATGCCACAGCTGTTATTGTTCTT 5019

 52644742 CACACAGAAGTTTCTACCCAGAGAAACATCAGGATGACACTCTGCTGCAATGTGCTATTT 52644801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5020 CACACAGAAGTTTCTACCCAGAGAAACATCAGGATGACACTCTGCTGCAATGTGCTATTT 5079

 52644802 GTTCTAGAGGGGTCAACAGCTTGCCACCTTGCCTAGGCCCAGGGTGACTGCATATGTGCA 52644861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5080 GTTCTAGAGGGGTCAACAGCTTGCCACCTTGCCTAGGCCCAGGGTGACTGCATATGTGCA 5139

 52644862 GTGGTCTTATCCCATTAGCGCCCCCGAGCATGCATTCAGAACCAAGTGGATACACCTTGG 52644921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5140 GTGGTCTTATCCCATTAGCGCCCCCGAGCATGCATTCAGAACCAAGTGGATACACCTTGG 5199

 52644922 CACACTTACCTTCCCTGCAGGGACATCATCGGACTGCCCTGATAAGCCAGGAACCTCATC 52644981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5200 CACACTTACCTTCCCTGCAGGGACATCATCGGACTGCCCTGATAAGCCAGGAACCTCATC 5259

 52644982 CACCTTGTCTTGATGCTCTGCCCTCTTGGCTTCCTGTTGGCTGTCACCTGGCACCTTTTC 52645041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5260 CACCTTGTCTTGATGCTCTGCCCTCTTGGCTTCCTGTTGGCTGTCACCTGGCACCTTTTC 5319

 52645042 CTGTCCCTTGTCCAGCTTGAAGAATTTGTCAAAAAAGCTGGAGTCCTTGGGCTTGGAGGG 52645101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5320 CTGTCCCTTGTCCAGCTTGAAGAATTTGTCAAAAAAGCTGGAGTCCTTGGGCTTGGAGGG 5379

 52645102 AGCTTCTCCTCCTGCTCCCCCTGTCTCAGGTGGGAGAAGCGTGGGATCCCTGGCGGCAGA 52645161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5380 AGCTTCTCCTCCTGCTCCCCCTGTCTCAGGTGGGAGAAGCGTGGGATCCCTGGCGGCAGA 5439

 52645162 GAGGACCTTGTCTTGGGCCGGGGCGTGCCCTGGGGTTTTATCTGTGTCCTGCCCCGGTCC 52645221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5440 GAGGACCTTGTCTTGGGCCGGGGCGTGCCCTGGGGTTTTATCTGTGTCCTGCCCCGGTCC 5499

 52645222 AGCTGCCACCGGAAGTGTCCAGCTCTCACTTGGGTCTTTGTTCGCTGGAGCTTTATTGGA 52645281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5500 AGCTGCCACCGGAAGTGTCCAGCTCTCACTTGGGTCTTTGTTCGCTGGAGCTTTATTGGA 5559

 52645282 GCTGACATCAAGCTTCACTGATCCAAGGGATGAATCTGCGGCTTGGTCTCCGGTACGTCC 52645341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5560 GCTGACATCAAGCTTCACTGATCCAAGGGATGAATCTGCGGCTTGGTCTCCGGTACGTCC 5619

 52645342 TGGTACAGGCCGAGAGAGCATCAAGAAAAAACGAGATTTAGCAGCTGGTGCCTCGGGTTT 52645401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5620 TGGTACAGGCCGAGAGAGCATCAAGAAAAAACGAGATTTAGCAGCTGGTGCCTCGGGTTT 5679

 52645402 GGCCTCTTTCCCAAGATTCTTTCCGTTGGCATCCGCAACAGCACTTATCTCCGTTGTCTC 52645461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5680 GGCCTCTTTCCCAAGATTCTTTCCGTTGGCATCCGCAACAGCACTTATCTCCGTTGTCTC 5739

 52645462 GGGGGAAGAAGTGGCCACATTATCCGTCTTGACACTTATTCCCAAGTCGACTGTAAACAC 52645521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5740 GGGGGAAGAAGTGGCCACATTATCCGTCTTGACACTTATTCCCAAGTCGACTGTAAACAC 5799

 52645522 AAACATAAACAGTGGTTATTCAGCCAAGCCGGGAAATTCAGGCACTAATAATGGACTCCA 52645581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5800 AAACATAAACAGTGGTTATTCAGCCAAGCCGGGAAATTCAGGCACTAATAATGGACTCCA 5859

 52645582 GACATTTTTTATACAAAAGCCATACTGCATACTGGAACTGTGTTGTTCTCTGGTCATTCT 52645641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5860 GACATTTTTTATACAAAAGCCATACTGCATACTGGAACTGTGTTGTTCTCTGGTCATTCT 5919

 52645642 GAAAGGCAGAAGTTAGCTCTCTACATCTCCTTGGACCCTGCTTTTCTTGGGAGAGGAGAA 52645701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5920 GAAAGGCAGAAGTTAGCTCTCTACATCTCCTTGGACCCTGCTTTTCTTGGGAGAGGAGAA 5979

 52645702 GGCAAGGTTGGTGAGGAGGGAAAGCTACTTAATGGAAAGTCACTAGCTGCCAGGTGTGGA 52645761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5980 GGCAAGGTTGGTGAGGAGGGAAAGCTACTTAATGGAAAGTCACTAGCTGCCAGGTGTGGA 6039

 52645762 ATGAGTGATATTCAATGTTAATTAATCTTCTTTTATCTGTGTAAGAACTCCGTGAGCAGC 52645821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6040 ATGAGTGATATTCAATGTTAATTAATCTTCTTTTATCTGTGTAAGAACTCCGTGAGCAGC 6099

 52645822 ATATTGTCATGATGTCAACTGGGAGGCAGTACAGCAGTTAGGAGCTTGGGTTCTGGAGCT 52645881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6100 ATATTGTCATGATGTCAACTGGGAGGCAGTACAGCAGTTAGGAGCTTGGGTTCTGGAGCT 6159

 52645882 AGAACAAGGTTTCTCAACCTCAGCACTACTCACATTTGAAGCCAGATTATTCTTTGTTAG 52645941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6160 AGAACAAGGTTTCTCAACCTCAGCACTACTCACATTTGAAGCCAGATTATTCTTTGTTAG 6219

 52645942 GGAGGCTCATCCCGTGCCTCATAGGCTGATTAGCAGCATCCTGGCCTCTGCCCACTAGAC 52646001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6220 GGAGGCTCATCCCGTGCCTCATAGGCTGATTAGCAGCATCCTGGCCTCTGCCCACTAGAC 6279

 52646002 GCCGGTCACATTTCCCAGTCATGGCAACCAAAAATATCTCTAGGCATTGCTAAATGTCCC 52646061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6280 GCCGGTCACATTTCCCAGTCATGGCAACCAAAAATATCTCTAGGCATTGCTAAATGTCCC 6339

 52646062 CTGGAGGACAAAATCTCTTACGTTTGAGAGGCACTGAGCTGAAATGTCTTTTTGAATCCA 52646121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6340 CTGGAGGACAAAATCTCTTACGTTTGAGAGGCACTGAGCTGAAATGTCTTTTTGAATCCA 6399

 52646122 GATTATCTAATTTTCTGTGCCTCAACTTTCTGGTAAAAGGAGACAGATAATAAATCTCGT 52646181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6400 GATTATCTAATTTTCTGTGCCTCAACTTTCTGGTAAAAGGAGACAGATAATAAATCTCGT 6459

 52646182 AATTTTGTTAGGAAGATTACATGAGTTAATAGTTTTAAAGCAAGTACAATAGCACCTGGA 52646241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6460 AATTTTGTTAGGAAGATTACATGAGTTAATAGTTTTAAAGCAAGTACAATAGCACCTGGA 6519

 52646242 ATATATTAAGTGCTTAATAAATATCACAAACATTAGTTATCATTATTCATGAGTGAGAAA 52646301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6520 ATATATTAAGTGCTTAATAAATATCACAAACATTAGTTATCATTATTCATGAGTGAGAAA 6579

 52646302 ACTGACAGTCAGAGAGGTCAGTACACCCTCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCTAGTAAGCAGC 52646361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6580 ACTGACAGTCAGAGAGGTCAGTACACCCTCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCTAGTAAGCAGC 6639

 52646362 AGAGTCTGGCTTCAGGCAGAAATCTGACTTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGTCTTACCAGG 52646421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6640 AGAGTCTGGCTTCAGGCAGAAATCTGACTTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGTCTTACCAGG 6699

 52646422 GACTTGTATTAGCATAGACTGTTAAGAATATGGGAAGATTTTTAAAATACAGTACTCAGA 52646481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6700 GACTTGTATTAGCATAGACTGTTAAGAATATGGGAAGATTTTTAAAATACAGTACTCAGA 6759

 52646482 AAATTTCTCTTTGAAAGGCTGGAAGAGCAGATATCCACACAAGAAGGCAAATTAGACCTC 52646541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6760 AAATTTCTCTTTGAAAGGCTGGAAGAGCAGATATCCACACAAGAAGGCAAATTAGACCTC 6819

 52646542 AGGCCAGTGTGGAATTAAAGGTGTAGGGTTATCTGGTCAAGACTGTGTGTGTGGATACAG 52646601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6820 AGGCCAGTGTGGAATTAAAGGTGTAGGGTTATCTGGTCAAGACTGTGTGTGTGGATACAG 6879

 52646602 GCTCCAACCCCTCCAGGCAAGGGCACTGTTTCCAACATCCACCCTTTCTCCTTTGACCTC 52646661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6880 GCTCCAACCCCTCCAGGCAAGGGCACTGTTTCCAACATCCACCCTTTCTCCTTTGACCTC 6939

 52646662 TACCTTGACCTAAATTAACTATAAAAGGTCCTTCTTTTCTAGGACCCTACTATAAATCAG 52646721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6940 TACCTTGACCTAAATTAACTATAAAAGGTCCTTCTTTTCTAGGACCCTACTATAAATCAG 6999

 52646722 TGAAATATTCAGGAAAAAAAGAACACCAAGAATGTTGGGATCCCAGTTAAAGATCAAGAT 52646781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7000 TGAAATATTCAGGAAAAAAAGAACACCAAGAATGTTGGGATCCCAGTTAAAGATCAAGAT 7059

 52646782 TCTCTACTGATAAGCTGTGTGATATGGAGTAAATCACTAAAGATCTTTGAATCTCTTCAT 52646841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7060 TCTCTACTGATAAGCTGTGTGATATGGAGTAAATCACTAAAGATCTTTGAATCTCTTCAT 7119

 52646842 TTGTAAAATGGGAATATTGGTAGTCCTACTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTAAAGAAGAAA 52646901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7120 TTGTAAAATGGGAATATTGGTAGTCCTACTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTAAAGAAGAAA 7179

 52646902 AGTCATGCAAAGGATCTGGCACAACGCCTTTTCCATAATAAGTGCTTAGTAATTGACAGA 52646961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7180 AGTCATGCAAAGGATCTGGCACAACGCCTTTTCCATAATAAGTGCTTAGTAATTGACAGA 7239

 52646962 TACTGTGATAACTTTTCAGGTTTCTCTCATGCCTTTGACAACATTGCATTTTGCTTGCTC 52647021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7240 TACTGTGATAACTTTTCAGGTTTCTCTCATGCCTTTGACAACATTGCATTTTGCTTGCTC 7299

 52647022 TATCTGTAGTCAGACACTTCTTAATATCTGTTTGCAGGAAGACAGAAAAATAAAGGGAAG 52647081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7300 TATCTGTAGTCAGACACTTCTTAATATCTGTTTGCAGGAAGACAGAAAAATAAAGGGAAG 7359

 52647082 AATTGAGATTTCTTTGATCTATTCATACTGCTCATTAATATGTAGTGAGAAATACATACA 52647141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7360 AATTGAGATTTCTTTGATCTATTCATACTGCTCATTAATATGTAGTGAGAAATACATACA 7419

 52647142 CACACACATACACACACATGCATCCATTAGCAATTGTTTTTGCCCAACTCTAGTGTCTCG 52647201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7420 CACACACATACACACACATGCATCCATTAGCAATTGTTTTTGCCCAACTCTAGTGTCTCG 7479

 52647202 CAGTGTCTAGACTAAACAACAAACAAAAAAGGGGGGAGAGTGAGCTGGATTAAGCATTGA 52647261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7480 CAGTGTCTAGACTAAACAACAAACAAAAAAGGGGGGAGAGTGAGCTGGATTAAGCATTGA 7539

 52647262 GGCACAGTGAAGAAATGGTCTGGGGCAAGCCCAGGGATGAATGTTAGGGGTTTCTCATAA 52647321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7540 GGCACAGTGAAGAAATGGTCTGGGGCAAGCCCAGGGATGAATGTTAGGGGTTTCTCATAA 7599

 52647322 ACCTGAACCTGAAGAAAATCACCCTGCCAGCATATTGATCTTCTAGCTCTTCTTAACCTT 52647381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7600 ACCTGAACCTGAAGAAAATCACCCTGCCAGCATATTGATCTTCTAGCTCTTCTTAACCTT 7659

 52647382 TTTTTCTGTGATTCAGGAATTCATAATGATAGAAAATATTATACTAAAGAAGAAAAAAAG 52647441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7660 TTTTTCTGTGATTCAGGAATTCATAATGATAGAAAATATTATACTAAAGAAGAAAAAAAG 7719

 52647442 AGGGAGAATAAGTAAGTGATAGATGGATGCATCAGGGTGTAAAGTTAGCAAGTAAGGCTG 52647501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7720 AGGGAGAATAAGTAAGTGATAGATGGATGCATCAGGGTGTAAAGTTAGCAAGTAAGGCTG 7779

 52647502 TTGAAGTGTCAGAGTGAATATAAATGAATTGTGGGAATGGTCCATGCCAGGAGAAGAGGG 52647561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7780 TTGAAGTGTCAGAGTGAATATAAATGAATTGTGGGAATGGTCCATGCCAGGAGAAGAGGG 7839

 52647562 TATGGTTGACAAAAAGGGAAATGCTAAGATTCAAAACAGGGAAGGGCTTTTCAAAATGCC 52647621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7840 TATGGTTGACAAAAAGGGAAATGCTAAGATTCAAAACAGGGAAGGGCTTTTCAAAATGCC 7899

 52647622 AAGAGCACCAACTTATATCTTTCAGTTTAATTCCTCTCTTCCTTACCCACTGGCTGGAAA 52647681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7900 AAGAGCACCAACTTATATCTTTCAGTTTAATTCCTCTCTTCCTTACCCACTGGCTGGAAA 7959

 52647682 GCAAAGGAGCTAGTGGTAAGTAAGAGTGTTATAGCCAGAGAAAAAGTCTTCAAAAAACAC 52647741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7960 GCAAAGGAGCTAGTGGTAAGTAAGAGTGTTATAGCCAGAGAAAAAGTCTTCAAAAAACAC 8019

 52647742 AAAGTACTTTCCATGGACAACCTTTTTTATTTTAAAGTGCCAATATGTTGCTTTGAAAAA 52647801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8020 AAAGTACTTTCCATGGACAACCTTTTTTATTTTAAAGTGCCAATATGTTGCTTTGAAAAA 8079

 52647802 GAATAAATTCCTTACATCCAGGTATCTGGACTAGACTTCAGTGCATTTAGTGATTATAGC 52647861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8080 GAATAAATTCCTTACATCCAGGTATCTGGACTAGACTTCAGTGCATTTAGTGATTATAGC 8139

 52647862 AAATCCAAACAGTAGCTTTTGATATCAGAGAATGGGTAAAGTGTTTTTGACAATTTCTAA 52647921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8140 AAATCCAAACAGTAGCTTTTGATATCAGAGAATGGGTAAAGTGTTTTTGACAATTTCTAA 8199

 52647922 GAACTTAGAGTTCTTCGGTGATACGTTCCATGCAACTGAAGCTCTGCTCTCCAAATTTAG 52647981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8200 GAACTTAGAGTTCTTCGGTGATACGTTCCATGCAACTGAAGCTCTGCTCTCCAAATTTAG 8259

 52647982 GTGGGTACATACCCAAGTCCATCACCTGGGGCTTCTATTTCCTTTGCTCAGATGCTCACC 52648041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8260 GTGGGTACATACCCAAGTCCATCACCTGGGGCTTCTATTTCCTTTGCTCAGATGCTCACC 8319

 52648042 TCCTAGGTGGGCACCTGACATAAGATAGACTAATAAAAATAAGTCCTGTAACTTTTGATA 52648101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8320 TCCTAGGTGGGCACCTGACATAAGATAGACTAATAAAAATAAGTCCTGTAACTTTTGATA 8379

 52648102 CTCCTATTAAAAAAGAGTTGCAAACCAATAGGAGGTACACTTGAGAATCAGCACAAATGA 52648161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8380 CTCCTATTAAAAAAGAGTTGCAAACCAATAGGAGGTACACTTGAGAATCAGCACAAATGA 8439

 52648162 AAGTAGAACCTGGAAATCCAGGAAGCAGATACCCAATCATGTCATTTAAACATTTAGATC 52648221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8440 AAGTAGAACCTGGAAATCCAGGAAGCAGATACCCAATCATGTCATTTAAACATTTAGATC 8499

 52648222 CAGCTGTGCCTGAAGCTGAACTTTAGCATTACATAAGCCAATAAATCACTCTTCCCCAAC 52648281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8500 CAGCTGTGCCTGAAGCTGAACTTTAGCATTACATAAGCCAATAAATCACTCTTCCCCAAC 8559

 52648282 TTACGCCAGTTGAAATTGAATACATACTCAGTGACTTTGAGAGAATTCCAGGGAATTGGT 52648341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8560 TTACGCCAGTTGAAATTGAATACATACTCAGTGACTTTGAGAGAATTCCAGGGAATTGGT 8619

 52648342 CAGTCCCTGTTTCACTTGTAAATACACAGCAATCAAGCCTACCAAATCTATGATTGA 52648398
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8620 CAGTCCCTGTTTCACTTGTAAATACACAGCAATCAAGCCTACCAAATCTATGATTGA 8676

Alignment time is 9.58564 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [52637064,52668002] =>     30939 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    3899] =>      3899 nucs 'mol-32-1f63-009130_3899'

Score:        3899
Aligned:      3899        nucs
Identic:      3899 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [52654503,52658401]
 second seq =>  [       1,    3899]

 52654503 TATATATTTTTGGTTTTAAATAAAAATTAGGTTATGTCATTCATTTGCATAAAACCATCC 52654562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TATATATTTTTGGTTTTAAATAAAAATTAGGTTATGTCATTCATTTGCATAAAACCATCC 60

 52654563 AAAGAAGGGCCTCACAAAATTAAAACAAAATCCAAACTCTCTACTATGGGCCACACCCTC 52654622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAAGAAGGGCCTCACAAAATTAAAACAAAATCCAAACTCTCTACTATGGGCCACACCCTC 120

 52654623 CAGAACTTCAGCTCGTACTATGTTTTTCCTCACACCTCTCAACATACCAACATGTTTCCA 52654682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAGAACTTCAGCTCGTACTATGTTTTTCCTCACACCTCTCAACATACCAACATGTTTCCA 180

 52654683 CCTGCAGCCCTCACCACTAGTTATTCTTTCAATCTGGAAATATTTTCGCTAAGATCTTCC 52654742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCTGCAGCCCTCACCACTAGTTATTCTTTCAATCTGGAAATATTTTCGCTAAGATCTTCC 240

 52654743 TATGGTTACCTTCTTATCATTCAAGACTTAGGTTATGTCAGGCCTTCCCTGACTCCTCCA 52654802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TATGGTTACCTTCTTATCATTCAAGACTTAGGTTATGTCAGGCCTTCCCTGACTCCTCCA 300

 52654803 TCTGAAGTAACCCCTCCTGCTTACTCCTGTTTATTCTCTAGACTCCACAGAGGATTCATC 52654862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCTGAAGTAACCCCTCCTGCTTACTCCTGTTTATTCTCTAGACTCCACAGAGGATTCATC 360

 52654863 ACTCTCTGAAATGATCCCATTAATTTCTTCTTCACTTGTTTCCTCTCCACGACCTGTAAG 52654922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACTCTCTGAAATGATCCCATTAATTTCTTCTTCACTTGTTTCCTCTCCACGACCTGTAAG 420

 52654923 CCCCAAGTGGACCCGGACTTGGTCTGCTCTGCTTACAGCTGGATTCCAGTTCCCATAGTG 52654982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCCCAAGTGGACCCGGACTTGGTCTGCTCTGCTTACAGCTGGATTCCAGTTCCCATAGTG 480

 52654983 CTAGACACTAGGATTAAGCCAGGAAACATGGGTGAAGCAGCAAGCACAGAGCTTGGGGCA 52655042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTAGACACTAGGATTAAGCCAGGAAACATGGGTGAAGCAGCAAGCACAGAGCTTGGGGCA 540

 52655043 CAGCCTAGCAAACACTCCACAAAGGACCATGATTGTAACTGTAGTAGGGCACACCAATGA 52655102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CAGCCTAGCAAACACTCCACAAAGGACCATGATTGTAACTGTAGTAGGGCACACCAATGA 600

 52655103 ACAGGTTGGGAAACTGAGTCTCTGAGAAGAGACTAATGTTGTGCTGGATGAAATTTCTTT 52655162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ACAGGTTGGGAAACTGAGTCTCTGAGAAGAGACTAATGTTGTGCTGGATGAAATTTCTTT 660

 52655163 TTCTGACAATACATTATCCAAATCCTCCAAGCTTTCAGTTTAAAGGGGAAAGCAGGAACT 52655222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTCTGACAATACATTATCCAAATCCTCCAAGCTTTCAGTTTAAAGGGGAAAGCAGGAACT 720

 52655223 ATCATTATAATTTTATTTACAAAGTGTCCATGTATGAACATTATTCACCGCCGAATCATC 52655282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATCATTATAATTTTATTTACAAAGTGTCCATGTATGAACATTATTCACCGCCGAATCATC 780

 52655283 TCTTCCTATGCAAGCAACACCGTCCTATGCATCAATATCCTGATCTGTCAGGATTCAGGA 52655342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCTTCCTATGCAAGCAACACCGTCCTATGCATCAATATCCTGATCTGTCAGGATTCAGGA 840

 52655343 TAAAGTGGACATATACACACTAATTGCAAAGGGAAATTGTACATCTTGCAAAAGATGCAG 52655402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TAAAGTGGACATATACACACTAATTGCAAAGGGAAATTGTACATCTTGCAAAAGATGCAG 900

 52655403 GGGTTTATAGAGTCTTGTAACATTGGTGAGCTGCTCAGATCACACACATGACCGTGGTTG 52655462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GGGTTTATAGAGTCTTGTAACATTGGTGAGCTGCTCAGATCACACACATGACCGTGGTTG 960

 52655463 GACAAGGATCTGGCAAAGTTAACACAGATCACCGAAGAAGGAAAAGTGGACAACACAACA 52655522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GACAAGGATCTGGCAAAGTTAACACAGATCACCGAAGAAGGAAAAGTGGACAACACAACA 1020

 52655523 CAGTAAGTTCTTCAAAAGAGTTATATTAGAATATCAAAAGATTATGTTAGGCCTTTGGGA 52655582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CAGTAAGTTCTTCAAAAGAGTTATATTAGAATATCAAAAGATTATGTTAGGCCTTTGGGA 1080

 52655583 AAACTCAAAACTTTATGAAGACCTCAAAAAATTATGCAAAAATGACCCTTCAATGGTCAT 52655642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAACTCAAAACTTTATGAAGACCTCAAAAAATTATGCAAAAATGACCCTTCAATGGTCAT 1140

 52655643 GCTGCAAGAGTCAAATGACACTTCAAACAACTGCGGCTTTCTATGTTGTGCAAATGCATT 52655702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GCTGCAAGAGTCAAATGACACTTCAAACAACTGCGGCTTTCTATGTTGTGCAAATGCATT 1200

 52655703 TGTTGTTTTAAAGGTCGTAAAGTCAGGGTACACGTGGCAGATACTTATGACTTGGAGGAA 52655762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TGTTGTTTTAAAGGTCGTAAAGTCAGGGTACACGTGGCAGATACTTATGACTTGGAGGAA 1260

 52655763 GACGTTAGATTAGATTTGAAACTTTCACTGAATGATCGCATTTCATGCTTTTCATCTGTA 52655822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GACGTTAGATTAGATTTGAAACTTTCACTGAATGATCGCATTTCATGCTTTTCATCTGTA 1320

 52655823 CATTAAAAAGCCAGAATGTCTTTGCCAAGAAATTCTAGCATAAATAAAAGAAAAGGATGG 52655882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CATTAAAAAGCCAGAATGTCTTTGCCAAGAAATTCTAGCATAAATAAAAGAAAAGGATGG 1380

 52655883 GATTTTGGAACATCATGGTAGAATTCTTGACTATCAGCTTTATACAACATGTCTGGACAT 52655942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GATTTTGGAACATCATGGTAGAATTCTTGACTATCAGCTTTATACAACATGTCTGGACAT 1440

 52655943 TTAGTGATGGAAATGCTGGATTCCAAAGGAATGTAGGCAAAGGTACTACTACCCCCATGC 52656002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTAGTGATGGAAATGCTGGATTCCAAAGGAATGTAGGCAAAGGTACTACTACCCCCATGC 1500

 52656003 TCTTCAGAAAACATCCTCTAAAAGCAACAGTGATGATCAGATACTGTGGGGCAAGACTGA 52656062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TCTTCAGAAAACATCCTCTAAAAGCAACAGTGATGATCAGATACTGTGGGGCAAGACTGA 1560

 52656063 CAGTGACACTCAAGATTTCCACTCTTCTCTTTAATCATATATTTCCTGTCATTCATGTGC 52656122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CAGTGACACTCAAGATTTCCACTCTTCTCTTTAATCATATATTTCCTGTCATTCATGTGC 1620

 52656123 TACAAAACTCTGGAATATGCAAAGCTCATTCAAATGCAAAACCAGCCTTTGCTCCAACAT 52656182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TACAAAACTCTGGAATATGCAAAGCTCATTCAAATGCAAAACCAGCCTTTGCTCCAACAT 1680

 52656183 GAGCATATATTTTCATTTAAAGACAAATCAGATGTTTCATTTGATTTTTTTTATAAATCT 52656242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GAGCATATATTTTCATTTAAAGACAAATCAGATGTTTCATTTGATTTTTTTTATAAATCT 1740

 52656243 GATAATAATGTACATTTAACCCGTGTTTACAACCAAAATAATTAATCTCTCTGAACCCTT 52656302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GATAATAATGTACATTTAACCCGTGTTTACAACCAAAATAATTAATCTCTCTGAACCCTT 1800

 52656303 TGTTTTTCCTGTCTCTATCCTCCACCCTCATTGCCAGATAAATAACATCTGCAACCTGAT 52656362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TGTTTTTCCTGTCTCTATCCTCCACCCTCATTGCCAGATAAATAACATCTGCAACCTGAT 1860

 52656363 GTGGCATATTGAACTTTGTTTATACTCACACAAACACGTATAAGCATCCCAGATACACAT 52656422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GTGGCATATTGAACTTTGTTTATACTCACACAAACACGTATAAGCATCCCAGATACACAT 1920

 52656423 ATACAGGGACTGTATCTGTCCTTGTTGTTTTTATAGAAATTGGATCACATTAGACATATT 52656482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ATACAGGGACTGTATCTGTCCTTGTTGTTTTTATAGAAATTGGATCACATTAGACATATT 1980

 52656483 TTCTGATGACTTTTGTACATTATAGTTGGTCTTCACAGTCAATAGCTCCAAAGCTATCTT 52656542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TTCTGATGACTTTTGTACATTATAGTTGGTCTTCACAGTCAATAGCTCCAAAGCTATCTT 2040

 52656543 ATCTTCTAAAATAGCTGCATAATATTCCTCAGTATGGATATACCAAAAGATATTTAAACC 52656602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ATCTTCTAAAATAGCTGCATAATATTCCTCAGTATGGATATACCAAAAGATATTTAAACC 2100

 52656603 ATTGCCTAATCAATGAATATCCTGGTAGTTTCCACATTGTTTTTTCCATTTCCACTATAG 52656662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ATTGCCTAATCAATGAATATCCTGGTAGTTTCCACATTGTTTTTTCCATTTCCACTATAG 2160

 52656663 TGGAATAAACTTTCGTGTTCAAAAATCCTAAACTGGTGCTATATTTCTATAGAATAGAGG 52656722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TGGAATAAACTTTCGTGTTCAAAAATCCTAAACTGGTGCTATATTTCTATAGAATAGAGG 2220

 52656723 CACAGATGTAGAAGTGTTACCCTCAAATCAATATGCATTTAGTTTTGAAAAACAGACACT 52656782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CACAGATGTAGAAGTGTTACCCTCAAATCAATATGCATTTAGTTTTGAAAAACAGACACT 2280

 52656783 GCCATATTATTTTCTTAAAAAGGCTCTACAGATTCACATTTCCAGCAGCAATGAGTGTCT 52656842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GCCATATTATTTTCTTAAAAAGGCTCTACAGATTCACATTTCCAGCAGCAATGAGTGTCT 2340

 52656843 CAAGCACCTTTTAAGTGGTAAGCAGCTTACCAGGGGAGGTGGCCTATTATTCTATCAGTG 52656902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CAAGCACCTTTTAAGTGGTAAGCAGCTTACCAGGGGAGGTGGCCTATTATTCTATCAGTG 2400

 52656903 GCTTCAGTTGTTAGGACACCACGGGTCAGCTGTGGAGATACGGTTGTGGGGCAGGTTGAG 52656962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GCTTCAGTTGTTAGGACACCACGGGTCAGCTGTGGAGATACGGTTGTGGGGCAGGTTGAG 2460

 52656963 TTCAGGACACATAGAAGATTGCCAAAGGGTGACTATTATTACTTTGAGACTCTGGAAAAA 52657022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TTCAGGACACATAGAAGATTGCCAAAGGGTGACTATTATTACTTTGAGACTCTGGAAAAA 2520

 52657023 TTAGCCAGGAAACAGAGACAAGAGGCTCAGGGTGCAGCAAAGCAGCCAAATCAGGATGAT 52657082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TTAGCCAGGAAACAGAGACAAGAGGCTCAGGGTGCAGCAAAGCAGCCAAATCAGGATGAT 2580

 52657083 AGTGTTTTCTTTGGAGCAGATATACTAATGGCCAAGGAACTCATAAAAAGATGCCTAATG 52657142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AGTGTTTTCTTTGGAGCAGATATACTAATGGCCAAGGAACTCATAAAAAGATGCCTAATG 2640

 52657143 TCATCTCATTAGGGAAGTGCAGTCAAAGCCACAGCATGATACGTCTTCACACCCACGAGG 52657202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TCATCTCATTAGGGAAGTGCAGTCAAAGCCACAGCATGATACGTCTTCACACCCACGAGG 2700

 52657203 ATGGCCATAATCAGAGAGACAATAACCAGTGGTAGGGAAGATGTGAAAAAATCGGAATGC 52657262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 ATGGCCATAATCAGAGAGACAATAACCAGTGGTAGGGAAGATGTGAAAAAATCGGAATGC 2760

 52657263 TCATGCATTGCTGGTAGGAATGTGACATGGTGCAGCTGCTTTGGAAAGCAGTTTAACAGT 52657322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TCATGCATTGCTGGTAGGAATGTGACATGGTGCAGCTGCTTTGGAAAGCAGTTTAACAGT 2820

 52657323 TCCTGGAAAAGTTAAACATGGAGTTACCCTAAGACCCAGCAATTCCATTCCTAGGTAAGC 52657382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TCCTGGAAAAGTTAAACATGGAGTTACCCTAAGACCCAGCAATTCCATTCCTAGGTAAGC 2880

 52657383 AAGAAAATGAAAACATATGGCCACACAAAAACTTGTACACAAATGTCCATAGCAGCATTT 52657442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 AAGAAAATGAAAACATATGGCCACACAAAAACTTGTACACAAATGTCCATAGCAGCATTT 2940

 52657443 TCATAATAGCTGAAAAGTGGAAACAACCCAAATATCCATCAATTGGAAAAAGGAAATCTA 52657502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TCATAATAGCTGAAAAGTGGAAACAACCCAAATATCCATCAATTGGAAAAAGGAAATCTA 3000

 52657503 GCATTTGCATATAATAGAGTATTAATCAGCCATAAGAAGAAACAAAGCACCGATCCATGT 52657562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GCATTTGCATATAATAGAGTATTAATCAGCCATAAGAAGAAACAAAGCACCGATCCATGT 3060

 52657563 TATATCATGCTTTATACTTGGAAGCATGGTACTAAGTGAAAGACGCCAGACACAAAAAGC 52657622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TATATCATGCTTTATACTTGGAAGCATGGTACTAAGTGAAAGACGCCAGACACAAAAAGC 3120

 52657623 AAAATATTGTATGATTCCATTTATATAAAGTGTCTAGAATAGGCAAATCCATAGAGGCAG 52657682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 AAAATATTGTATGATTCCATTTATATAAAGTGTCTAGAATAGGCAAATCCATAGAGGCAG 3180

 52657683 AAAACAGATTAGTGGTTGCCAGTGGCTGGGAATAGGGAAAAAACTCAGCGCTAAAGGGTA 52657742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 AAAACAGATTAGTGGTTGCCAGTGGCTGGGAATAGGGAAAAAACTCAGCGCTAAAGGGTA 3240

 52657743 GGGAGTTTTGTTTTGGAGTAATGACGATGTTCTGGAATTAGACGTGGAACGATTGCACAC 52657802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 GGGAGTTTTGTTTTGGAGTAATGACGATGTTCTGGAATTAGACGTGGAACGATTGCACAC 3300

 52657803 ATGGTGCAAATATCCTTAAAATCACGGAATTGTCACTCTAAAAGGTGAATTTTATGGTAG 52657862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 ATGGTGCAAATATCCTTAAAATCACGGAATTGTCACTCTAAAAGGTGAATTTTATGGTAG 3360

 52657863 GTGAATTGTACCTCAATTTGTAAAAAGAAGAATTAGATAAATAAACAGCAACACAGCACC 52657922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 GTGAATTGTACCTCAATTTGTAAAAAGAAGAATTAGATAAATAAACAGCAACACAGCACC 3420

 52657923 AAGGGGTGGGGGTAGGAAACAGACAACAAATAGGAGTGAAGAGTTCACAGGAAAAGACAT 52657982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 AAGGGGTGGGGGTAGGAAACAGACAACAAATAGGAGTGAAGAGTTCACAGGAAAAGACAT 3480

 52657983 GCAGCCAGCTTTTAAGCAGAAGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAAGCA 52658042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 GCAGCCAGCTTTTAAGCAGAAGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAAGCA 3540

 52658043 CAATAAAATTATGACACTTGGCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAATTGAT 52658102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 CAATAAAATTATGACACTTGGCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAATTGAT 3600

 52658103 GACCCCAGTGGAAAGCGTATAAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCTTAACGC 52658162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 GACCCCAGTGGAAAGCGTATAAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCTTAACGC 3660

 52658163 CTGTAATCCTAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGGAGTTCAAGA 52658222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 CTGTAATCCTAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGGAGTTCAAGA 3720

 52658223 CCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACACTGTCTCTGCTAAAAAACAAAACAAAACAAAACAC 52658282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 CCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACACTGTCTCTGCTAAAAAACAAAACAAAACAAAACAC 3780

 52658283 CAAAAAATAGCTGGGCGTAGTGGCGGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTTGGGAGGCGGTGG 52658342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 CAAAAAATAGCTGGGCGTAGTGGCGGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTTGGGAGGCGGTGG 3840

 52658343 CAGGAGAATCATTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACTG 52658401
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 CAGGAGAATCATTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACTG 3899

Alignment time is 3.75839 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [52637064,52668002] =>     30939 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    4708] =>      4708 nucs 'mol-32-1f63-047245_4708'

Score:        4708
Aligned:      4708        nucs
Identic:      4708 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [52644422,52649129]
 second seq =>  [       1,    4708]

 52644422 GTCTGCCCAGAGCTGTAAAATCTCCTTATTCAAACACACACCTTAGAGCAAAAGATGGTT 52644481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTCTGCCCAGAGCTGTAAAATCTCCTTATTCAAACACACACCTTAGAGCAAAAGATGGTT 60

 52644482 AAATATCAATTCAGGCTATTAACAGTAAGGGACGAAATGTGTTCCAACAAAACTCTGCAT 52644541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAATATCAATTCAGGCTATTAACAGTAAGGGACGAAATGTGTTCCAACAAAACTCTGCAT 120

 52644542 GTCAACAAACTACAGAGACTAGGTAACATCTTTTAGGAATCATTTTTATTCCACTAATGC 52644601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTCAACAAACTACAGAGACTAGGTAACATCTTTTAGGAATCATTTTTATTCCACTAATGC 180

 52644602 CTTTTCCTCCAGAATCCACTGATCGTAAACGCAACCTGTCTACTTCCGCCTTTGAAAAAT 52644661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTTTTCCTCCAGAATCCACTGATCGTAAACGCAACCTGTCTACTTCCGCCTTTGAAAAAT 240

 52644662 GGATGGACAAATTCATCTGCATGTAACTCACCTCCTCTTTTCTTTTACATAAAACAGATG 52644721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGATGGACAAATTCATCTGCATGTAACTCACCTCCTCTTTTCTTTTACATAAAACAGATG 300

 52644722 CCACAGCTGTTATTGTTCTTCACACAGAAGTTTCTACCCAGAGAAACATCAGGATGACAC 52644781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCACAGCTGTTATTGTTCTTCACACAGAAGTTTCTACCCAGAGAAACATCAGGATGACAC 360

 52644782 TCTGCTGCAATGTGCTATTTGTTCTAGAGGGGTCAACAGCTTGCCACCTTGCCTAGGCCC 52644841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCTGCTGCAATGTGCTATTTGTTCTAGAGGGGTCAACAGCTTGCCACCTTGCCTAGGCCC 420

 52644842 AGGGTGACTGCATATGTGCAGTGGTCTTATCCCATTAGCGCCCCCGAGCATGCATTCAGA 52644901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGGGTGACTGCATATGTGCAGTGGTCTTATCCCATTAGCGCCCCCGAGCATGCATTCAGA 480

 52644902 ACCAAGTGGATACACCTTGGCACACTTACCTTCCCTGCAGGGACATCATCGGACTGCCCT 52644961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACCAAGTGGATACACCTTGGCACACTTACCTTCCCTGCAGGGACATCATCGGACTGCCCT 540

 52644962 GATAAGCCAGGAACCTCATCCACCTTGTCTTGATGCTCTGCCCTCTTGGCTTCCTGTTGG 52645021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GATAAGCCAGGAACCTCATCCACCTTGTCTTGATGCTCTGCCCTCTTGGCTTCCTGTTGG 600

 52645022 CTGTCACCTGGCACCTTTTCCTGTCCCTTGTCCAGCTTGAAGAATTTGTCAAAAAAGCTG 52645081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTGTCACCTGGCACCTTTTCCTGTCCCTTGTCCAGCTTGAAGAATTTGTCAAAAAAGCTG 660

 52645082 GAGTCCTTGGGCTTGGAGGGAGCTTCTCCTCCTGCTCCCCCTGTCTCAGGTGGGAGAAGC 52645141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GAGTCCTTGGGCTTGGAGGGAGCTTCTCCTCCTGCTCCCCCTGTCTCAGGTGGGAGAAGC 720

 52645142 GTGGGATCCCTGGCGGCAGAGAGGACCTTGTCTTGGGCCGGGGCGTGCCCTGGGGTTTTA 52645201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GTGGGATCCCTGGCGGCAGAGAGGACCTTGTCTTGGGCCGGGGCGTGCCCTGGGGTTTTA 780

 52645202 TCTGTGTCCTGCCCCGGTCCAGCTGCCACCGGAAGTGTCCAGCTCTCACTTGGGTCTTTG 52645261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCTGTGTCCTGCCCCGGTCCAGCTGCCACCGGAAGTGTCCAGCTCTCACTTGGGTCTTTG 840

 52645262 TTCGCTGGAGCTTTATTGGAGCTGACATCAAGCTTCACTGATCCAAGGGATGAATCTGCG 52645321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTCGCTGGAGCTTTATTGGAGCTGACATCAAGCTTCACTGATCCAAGGGATGAATCTGCG 900

 52645322 GCTTGGTCTCCGGTACGTCCTGGTACAGGCCGAGAGAGCATCAAGAAAAAACGAGATTTA 52645381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GCTTGGTCTCCGGTACGTCCTGGTACAGGCCGAGAGAGCATCAAGAAAAAACGAGATTTA 960

 52645382 GCAGCTGGTGCCTCGGGTTTGGCCTCTTTCCCAAGATTCTTTCCGTTGGCATCCGCAACA 52645441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GCAGCTGGTGCCTCGGGTTTGGCCTCTTTCCCAAGATTCTTTCCGTTGGCATCCGCAACA 1020

 52645442 GCACTTATCTCCGTTGTCTCGGGGGAAGAAGTGGCCACATTATCCGTCTTGACACTTATT 52645501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GCACTTATCTCCGTTGTCTCGGGGGAAGAAGTGGCCACATTATCCGTCTTGACACTTATT 1080

 52645502 CCCAAGTCGACTGTAAACACAAACATAAACAGTGGTTATTCAGCCAAGCCGGGAAATTCA 52645561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CCCAAGTCGACTGTAAACACAAACATAAACAGTGGTTATTCAGCCAAGCCGGGAAATTCA 1140

 52645562 GGCACTAATAATGGACTCCAGACATTTTTTATACAAAAGCCATACTGCATACTGGAACTG 52645621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GGCACTAATAATGGACTCCAGACATTTTTTATACAAAAGCCATACTGCATACTGGAACTG 1200

 52645622 TGTTGTTCTCTGGTCATTCTGAAAGGCAGAAGTTAGCTCTCTACATCTCCTTGGACCCTG 52645681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TGTTGTTCTCTGGTCATTCTGAAAGGCAGAAGTTAGCTCTCTACATCTCCTTGGACCCTG 1260

 52645682 CTTTTCTTGGGAGAGGAGAAGGCAAGGTTGGTGAGGAGGGAAAGCTACTTAATGGAAAGT 52645741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTTTTCTTGGGAGAGGAGAAGGCAAGGTTGGTGAGGAGGGAAAGCTACTTAATGGAAAGT 1320

 52645742 CACTAGCTGCCAGGTGTGGAATGAGTGATATTCAATGTTAATTAATCTTCTTTTATCTGT 52645801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CACTAGCTGCCAGGTGTGGAATGAGTGATATTCAATGTTAATTAATCTTCTTTTATCTGT 1380

 52645802 GTAAGAACTCCGTGAGCAGCATATTGTCATGATGTCAACTGGGAGGCAGTACAGCAGTTA 52645861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GTAAGAACTCCGTGAGCAGCATATTGTCATGATGTCAACTGGGAGGCAGTACAGCAGTTA 1440

 52645862 GGAGCTTGGGTTCTGGAGCTAGAACAAGGTTTCTCAACCTCAGCACTACTCACATTTGAA 52645921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GGAGCTTGGGTTCTGGAGCTAGAACAAGGTTTCTCAACCTCAGCACTACTCACATTTGAA 1500

 52645922 GCCAGATTATTCTTTGTTAGGGAGGCTCATCCCGTGCCTCATAGGCTGATTAGCAGCATC 52645981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GCCAGATTATTCTTTGTTAGGGAGGCTCATCCCGTGCCTCATAGGCTGATTAGCAGCATC 1560

 52645982 CTGGCCTCTGCCCACTAGACGCCGGTCACATTTCCCAGTCATGGCAACCAAAAATATCTC 52646041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CTGGCCTCTGCCCACTAGACGCCGGTCACATTTCCCAGTCATGGCAACCAAAAATATCTC 1620

 52646042 TAGGCATTGCTAAATGTCCCCTGGAGGACAAAATCTCTTACGTTTGAGAGGCACTGAGCT 52646101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TAGGCATTGCTAAATGTCCCCTGGAGGACAAAATCTCTTACGTTTGAGAGGCACTGAGCT 1680

 52646102 GAAATGTCTTTTTGAATCCAGATTATCTAATTTTCTGTGCCTCAACTTTCTGGTAAAAGG 52646161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GAAATGTCTTTTTGAATCCAGATTATCTAATTTTCTGTGCCTCAACTTTCTGGTAAAAGG 1740

 52646162 AGACAGATAATAAATCTCGTAATTTTGTTAGGAAGATTACATGAGTTAATAGTTTTAAAG 52646221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AGACAGATAATAAATCTCGTAATTTTGTTAGGAAGATTACATGAGTTAATAGTTTTAAAG 1800

 52646222 CAAGTACAATAGCACCTGGAATATATTAAGTGCTTAATAAATATCACAAACATTAGTTAT 52646281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CAAGTACAATAGCACCTGGAATATATTAAGTGCTTAATAAATATCACAAACATTAGTTAT 1860

 52646282 CATTATTCATGAGTGAGAAAACTGACAGTCAGAGAGGTCAGTACACCCTCCCCTGGCTGC 52646341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CATTATTCATGAGTGAGAAAACTGACAGTCAGAGAGGTCAGTACACCCTCCCCTGGCTGC 1920

 52646342 CCAGTAAGCTAGTAAGCAGCAGAGTCTGGCTTCAGGCAGAAATCTGACTTCTAAGTTCAT 52646401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CCAGTAAGCTAGTAAGCAGCAGAGTCTGGCTTCAGGCAGAAATCTGACTTCTAAGTTCAT 1980

 52646402 GCGCTCTCTGTCTTACCAGGGACTTGTATTAGCATAGACTGTTAAGAATATGGGAAGATT 52646461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GCGCTCTCTGTCTTACCAGGGACTTGTATTAGCATAGACTGTTAAGAATATGGGAAGATT 2040

 52646462 TTTAAAATACAGTACTCAGAAAATTTCTCTTTGAAAGGCTGGAAGAGCAGATATCCACAC 52646521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TTTAAAATACAGTACTCAGAAAATTTCTCTTTGAAAGGCTGGAAGAGCAGATATCCACAC 2100

 52646522 AAGAAGGCAAATTAGACCTCAGGCCAGTGTGGAATTAAAGGTGTAGGGTTATCTGGTCAA 52646581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AAGAAGGCAAATTAGACCTCAGGCCAGTGTGGAATTAAAGGTGTAGGGTTATCTGGTCAA 2160

 52646582 GACTGTGTGTGTGGATACAGGCTCCAACCCCTCCAGGCAAGGGCACTGTTTCCAACATCC 52646641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GACTGTGTGTGTGGATACAGGCTCCAACCCCTCCAGGCAAGGGCACTGTTTCCAACATCC 2220

 52646642 ACCCTTTCTCCTTTGACCTCTACCTTGACCTAAATTAACTATAAAAGGTCCTTCTTTTCT 52646701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ACCCTTTCTCCTTTGACCTCTACCTTGACCTAAATTAACTATAAAAGGTCCTTCTTTTCT 2280

 52646702 AGGACCCTACTATAAATCAGTGAAATATTCAGGAAAAAAAGAACACCAAGAATGTTGGGA 52646761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AGGACCCTACTATAAATCAGTGAAATATTCAGGAAAAAAAGAACACCAAGAATGTTGGGA 2340

 52646762 TCCCAGTTAAAGATCAAGATTCTCTACTGATAAGCTGTGTGATATGGAGTAAATCACTAA 52646821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TCCCAGTTAAAGATCAAGATTCTCTACTGATAAGCTGTGTGATATGGAGTAAATCACTAA 2400

 52646822 AGATCTTTGAATCTCTTCATTTGTAAAATGGGAATATTGGTAGTCCTACTGCAGGGTTGT 52646881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AGATCTTTGAATCTCTTCATTTGTAAAATGGGAATATTGGTAGTCCTACTGCAGGGTTGT 2460

 52646882 TGTAATGCTTAAAGAAGAAAAGTCATGCAAAGGATCTGGCACAACGCCTTTTCCATAATA 52646941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TGTAATGCTTAAAGAAGAAAAGTCATGCAAAGGATCTGGCACAACGCCTTTTCCATAATA 2520

 52646942 AGTGCTTAGTAATTGACAGATACTGTGATAACTTTTCAGGTTTCTCTCATGCCTTTGACA 52647001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 AGTGCTTAGTAATTGACAGATACTGTGATAACTTTTCAGGTTTCTCTCATGCCTTTGACA 2580

 52647002 ACATTGCATTTTGCTTGCTCTATCTGTAGTCAGACACTTCTTAATATCTGTTTGCAGGAA 52647061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 ACATTGCATTTTGCTTGCTCTATCTGTAGTCAGACACTTCTTAATATCTGTTTGCAGGAA 2640

 52647062 GACAGAAAAATAAAGGGAAGAATTGAGATTTCTTTGATCTATTCATACTGCTCATTAATA 52647121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GACAGAAAAATAAAGGGAAGAATTGAGATTTCTTTGATCTATTCATACTGCTCATTAATA 2700

 52647122 TGTAGTGAGAAATACATACACACACACATACACACACATGCATCCATTAGCAATTGTTTT 52647181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TGTAGTGAGAAATACATACACACACACATACACACACATGCATCCATTAGCAATTGTTTT 2760

 52647182 TGCCCAACTCTAGTGTCTCGCAGTGTCTAGACTAAACAACAAACAAAAAAGGGGGGAGAG 52647241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TGCCCAACTCTAGTGTCTCGCAGTGTCTAGACTAAACAACAAACAAAAAAGGGGGGAGAG 2820

 52647242 TGAGCTGGATTAAGCATTGAGGCACAGTGAAGAAATGGTCTGGGGCAAGCCCAGGGATGA 52647301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TGAGCTGGATTAAGCATTGAGGCACAGTGAAGAAATGGTCTGGGGCAAGCCCAGGGATGA 2880

 52647302 ATGTTAGGGGTTTCTCATAAACCTGAACCTGAAGAAAATCACCCTGCCAGCATATTGATC 52647361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 ATGTTAGGGGTTTCTCATAAACCTGAACCTGAAGAAAATCACCCTGCCAGCATATTGATC 2940

 52647362 TTCTAGCTCTTCTTAACCTTTTTTTCTGTGATTCAGGAATTCATAATGATAGAAAATATT 52647421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TTCTAGCTCTTCTTAACCTTTTTTTCTGTGATTCAGGAATTCATAATGATAGAAAATATT 3000

 52647422 ATACTAAAGAAGAAAAAAAGAGGGAGAATAAGTAAGTGATAGATGGATGCATCAGGGTGT 52647481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 ATACTAAAGAAGAAAAAAAGAGGGAGAATAAGTAAGTGATAGATGGATGCATCAGGGTGT 3060

 52647482 AAAGTTAGCAAGTAAGGCTGTTGAAGTGTCAGAGTGAATATAAATGAATTGTGGGAATGG 52647541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 AAAGTTAGCAAGTAAGGCTGTTGAAGTGTCAGAGTGAATATAAATGAATTGTGGGAATGG 3120

 52647542 TCCATGCCAGGAGAAGAGGGTATGGTTGACAAAAAGGGAAATGCTAAGATTCAAAACAGG 52647601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TCCATGCCAGGAGAAGAGGGTATGGTTGACAAAAAGGGAAATGCTAAGATTCAAAACAGG 3180

 52647602 GAAGGGCTTTTCAAAATGCCAAGAGCACCAACTTATATCTTTCAGTTTAATTCCTCTCTT 52647661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 GAAGGGCTTTTCAAAATGCCAAGAGCACCAACTTATATCTTTCAGTTTAATTCCTCTCTT 3240

 52647662 CCTTACCCACTGGCTGGAAAGCAAAGGAGCTAGTGGTAAGTAAGAGTGTTATAGCCAGAG 52647721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 CCTTACCCACTGGCTGGAAAGCAAAGGAGCTAGTGGTAAGTAAGAGTGTTATAGCCAGAG 3300

 52647722 AAAAAGTCTTCAAAAAACACAAAGTACTTTCCATGGACAACCTTTTTTATTTTAAAGTGC 52647781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 AAAAAGTCTTCAAAAAACACAAAGTACTTTCCATGGACAACCTTTTTTATTTTAAAGTGC 3360

 52647782 CAATATGTTGCTTTGAAAAAGAATAAATTCCTTACATCCAGGTATCTGGACTAGACTTCA 52647841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 CAATATGTTGCTTTGAAAAAGAATAAATTCCTTACATCCAGGTATCTGGACTAGACTTCA 3420

 52647842 GTGCATTTAGTGATTATAGCAAATCCAAACAGTAGCTTTTGATATCAGAGAATGGGTAAA 52647901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 GTGCATTTAGTGATTATAGCAAATCCAAACAGTAGCTTTTGATATCAGAGAATGGGTAAA 3480

 52647902 GTGTTTTTGACAATTTCTAAGAACTTAGAGTTCTTCGGTGATACGTTCCATGCAACTGAA 52647961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 GTGTTTTTGACAATTTCTAAGAACTTAGAGTTCTTCGGTGATACGTTCCATGCAACTGAA 3540

 52647962 GCTCTGCTCTCCAAATTTAGGTGGGTACATACCCAAGTCCATCACCTGGGGCTTCTATTT 52648021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 GCTCTGCTCTCCAAATTTAGGTGGGTACATACCCAAGTCCATCACCTGGGGCTTCTATTT 3600

 52648022 CCTTTGCTCAGATGCTCACCTCCTAGGTGGGCACCTGACATAAGATAGACTAATAAAAAT 52648081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 CCTTTGCTCAGATGCTCACCTCCTAGGTGGGCACCTGACATAAGATAGACTAATAAAAAT 3660

 52648082 AAGTCCTGTAACTTTTGATACTCCTATTAAAAAAGAGTTGCAAACCAATAGGAGGTACAC 52648141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 AAGTCCTGTAACTTTTGATACTCCTATTAAAAAAGAGTTGCAAACCAATAGGAGGTACAC 3720

 52648142 TTGAGAATCAGCACAAATGAAAGTAGAACCTGGAAATCCAGGAAGCAGATACCCAATCAT 52648201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 TTGAGAATCAGCACAAATGAAAGTAGAACCTGGAAATCCAGGAAGCAGATACCCAATCAT 3780

 52648202 GTCATTTAAACATTTAGATCCAGCTGTGCCTGAAGCTGAACTTTAGCATTACATAAGCCA 52648261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 GTCATTTAAACATTTAGATCCAGCTGTGCCTGAAGCTGAACTTTAGCATTACATAAGCCA 3840

 52648262 ATAAATCACTCTTCCCCAACTTACGCCAGTTGAAATTGAATACATACTCAGTGACTTTGA 52648321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 ATAAATCACTCTTCCCCAACTTACGCCAGTTGAAATTGAATACATACTCAGTGACTTTGA 3900

 52648322 GAGAATTCCAGGGAATTGGTCAGTCCCTGTTTCACTTGTAAATACACAGCAATCAAGCCT 52648381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 GAGAATTCCAGGGAATTGGTCAGTCCCTGTTTCACTTGTAAATACACAGCAATCAAGCCT 3960

 52648382 ACCAAATCTATGATTGATTGGGGTGTCTGAAAGAGATGGAGGGAATGGAATCAACCTGAA 52648441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 ACCAAATCTATGATTGATTGGGGTGTCTGAAAGAGATGGAGGGAATGGAATCAACCTGAA 4020

 52648442 AAACATATTTCAGGAGTTCATCCCTGAAAACTTCCCCAACCTAGCTAGAGGGGCCAACAT 52648501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 AAACATATTTCAGGAGTTCATCCCTGAAAACTTCCCCAACCTAGCTAGAGGGGCCAACAT 4080

 52648502 TCAAATTCAGGAAATGCAGAGAACCCCAGTAAGATACTCCACAAAAAGATCTTCCCCAAG 52648561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 TCAAATTCAGGAAATGCAGAGAACCCCAGTAAGATACTCCACAAAAAGATCTTCCCCAAG 4140

 52648562 ACATCATCATCAGATTCTCCAAAGTTGAAATGTAAGAAAAAATGCTAAAGGCAACTAGAG 52648621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 ACATCATCATCAGATTCTCCAAAGTTGAAATGTAAGAAAAAATGCTAAAGGCAACTAGAG 4200

 52648622 TGAAAGGCCCGGTCACCTAAAAAGGGAAGCACAGACTTACAGTGGACCTCTCACTGGTAA 52648681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 TGAAAGGCCCGGTCACCTAAAAAGGGAAGCACAGACTTACAGTGGACCTCTCACTGGTAA 4260

 52648682 CCCTACAAGCCAGAAGAGATTGAGGACCAATATTCAACATTCTTAAACAAAAAGAATTCC 52648741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 CCCTACAAGCCAGAAGAGATTGAGGACCAATATTCAACATTCTTAAACAAAAAGAATTCC 4320

 52648742 AACCCAGAATTTTATATCTGACTAAACTAAGCTTCATAAGCAAAAGAGAAATAAGATCAT 52648801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 AACCCAGAATTTTATATCTGACTAAACTAAGCTTCATAAGCAAAAGAGAAATAAGATCAT 4380

 52648802 TTTCAGACAAGCAAATGCTAAGGGAATTTGTGACCATTAGACCTTCCTTGCAACAGTTCC 52648861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 TTTCAGACAAGCAAATGCTAAGGGAATTTGTGACCATTAGACCTTCCTTGCAACAGTTCC 4440

 52648862 TAAAGGAAGCACTAAATATGGAAAGACCATTACCAGACACTACAAAACACACTGAAGTAC 52648921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 TAAAGGAAGCACTAAATATGGAAAGACCATTACCAGACACTACAAAACACACTGAAGTAC 4500

 52648922 ACAGACCAGTGACATTGTAAAGCAACTACATAACAAGTCTGCAAAATAACCAGCCAACAT 52648981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 ACAGACCAGTGACATTGTAAAGCAACTACATAACAAGTCTGCAAAATAACCAGCCAACAT 4560

 52648982 CATGATGACGGTATCAAATCGACACATAGCAACACTAACCTTAAATGTAAATGGACTAAA 52649041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 CATGATGACGGTATCAAATCGACACATAGCAACACTAACCTTAAATGTAAATGGACTAAA 4620

 52649042 TGATCCCATTAAAAGACATAAAGTGGCAGGCTGGATAAAGAACCAAGAACCATTGGTATA 52649101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 TGATCCCATTAAAAGACATAAAGTGGCAGGCTGGATAAAGAACCAAGAACCATTGGTATA 4680

 52649102 CTGTCTTCAAGAGACCCATCTCCTATGC 52649129
          ||||||||||||||||||||||||||||
     4681 CTGTCTTCAAGAGACCCATCTCCTATGC 4708

Alignment time is 4.57913 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [52637064,52668002] =>     30939 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    2512] =>      2512 nucs 'mol-32-206b-116858_2512'

Score:        2440
Aligned:      2509        nucs
Identic:      2497 (100%) nucs =>      2055 (100%)       442 ( 98%)
Gaps:            8 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [52645006,52647064] EXCISED REGION [52658003,52658444]
 second seq =>  [       1,    2059] EXCISED REGION [    2060,    2509]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>     10938 nucs [52647065,52658002]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         6 nucs [52647065,52647070] to [52658003,52658008]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [52647065,52647067] to [52658000,52658002]
 second seq =>         0 nucs

 52645006 CTTGGCTTCCTGTTGGCTGTCACCTGGCACCTTTTCCTGTCCCTTGTCCAGCTTGAAGAA 52645065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTTGGCTTCCTGTTGGCTGTCACCTGGCACCTTTTCCTGTCCCTTGTCCAGCTTGAAGAA 60

 52645066 TTTGTCAAAAAAGCTGGAGTCCTTGGGCTTGGAGGGAGCTTCTCCTCCTGCTCCCCCTGT 52645125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTGTCAAAAAAGCTGGAGTCCTTGGGCTTGGAGGGAGCTTCTCCTCCTGCTCCCCCTGT 120

 52645126 CTCAGGTGGGAGAAGCGTGGGATCCCTGGCGGCAGAGAGGACCTTGTCTTGGGCCGGGGC 52645185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTCAGGTGGGAGAAGCGTGGGATCCCTGGCGGCAGAGAGGACCTTGTCTTGGGCCGGGGC 180

 52645186 GTGCCCTGGGGTTTTATCTGTGTCCTGCCCCGGTCCAGCTGCCACCGGAAGTGTCCAGCT 52645245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTGCCCTGGGGTTTTATCTGTGTCCTGCCCCGGTCCAGCTGCCACCGGAAGTGTCCAGCT 240

 52645246 CTCACTTGGGTCTTTGTTCGCTGGAGCTTTATTGGAGCTGACATCAAGCTTCACTGATCC 52645305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTCACTTGGGTCTTTGTTCGCTGGAGCTTTATTGGAGCTGACATCAAGCTTCACTGATCC 300

 52645306 AAGGGATGAATCTGCGGCTTGGTCTCCGGTACGTCCTGGTACAGGCCGAGAGAGCATCAA 52645365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAGGGATGAATCTGCGGCTTGGTCTCCGGTACGTCCTGGTACAGGCCGAGAGAGCATCAA 360

 52645366 GAAAAAACGAGATTTAGCAGCTGGTGCCTCGGGTTTGGCCTCTTTCCCAAGATTCTTTCC 52645425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GAAAAAACGAGATTTAGCAGCTGGTGCCTCGGGTTTGGCCTCTTTCCCAAGATTCTTTCC 420

 52645426 GTTGGCATCCGCAACAGCACTTATCTCCGTTGTCTCGGGGGAAGAAGTGGCCACATTATC 52645485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTTGGCATCCGCAACAGCACTTATCTCCGTTGTCTCGGGGGAAGAAGTGGCCACATTATC 480

 52645486 CGTCTTGACACTTATTCCCAAGTCGACTGTAAACACAAACATAAACAGTGGTTATTCAGC 52645545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
      481 CGTCTTGACACTTATTCCCAAGTCGACTGTAAACACAAACATAAACAGCGGTTATTCAGC 540

 52645546 CAAGCCGGGAAATTCAGGCACTAATAATGGACTCCAGACATTTTTTATACAAAAGCCATA 52645605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CAAGCCGGGAAATTCAGGCACTAATAATGGACTCCAGACATTTTTTATACAAAAGCCATA 600

 52645606 CTGCATACTGGAACTGTGTTGTTCTCTGGTCATTCTGAAAGGCAGAAGTTAGCTCTCTAC 52645665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTGCATACTGGAACTGTGTTGTTCTCTGGTCATTCTGAAAGGCAGAAGTTAGCTCTCTAC 660

 52645666 ATCTCCTTGGACCCTGCTTTTCTTGGGAGAGGAGAAGGCAAGGTTGGTGAGGAGGGAAAG 52645725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATCTCCTTGGACCCTGCTTTTCTTGGGAGAGGAGAAGGCAAGGTTGGTGAGGAGGGAAAG 720

 52645726 CTACTTAATGGAAAGTCACTAGCTGCCAGGTGTGGAATGAGTGATATTCAATGTTAATTA 52645785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTACTTAATGGAAAGTCACTAGCTGCCAGGTGTGGAATGAGTGATATTCAATGTTAATTA 780

 52645786 ATCTTCTTTTATCTGTGTAAGAACTCCGTGAGCAGCATATTGTCATGATGTCAACTGGGA 52645845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATCTTCTTTTATCTGTGTAAGAACTCCGTGAGCAGCATATTGTCATGATGTCAACTGGGA 840

 52645846 GGCAGTACAGCAGTTAGGAGCTTGGGTTCTGGAGCTAGAACAAGGTTTCTCAACCTCAGC 52645905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GGCAGTACAGCAGTTAGGAGCTTGGGTTCTGGAGCTAGAACAAGGTTTCTCAACCTCAGC 900

 52645906 ACTACTCACATTTGAAGCCAGATTATTCTTTGTTAGGGAGGCTCATCCCGTGCCTCATAG 52645965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ACTACTCACATTTGAAGCCAGATTATTCTTTGTTAGGGAGGCTCATCCCGTGCCTCATAG 960

 52645966 GCTGATTAGCAGCATCCTGGCCTCTGCCCACTAGACGCCGGTCACATTTCCCAGTCATGG 52646025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GCTGATTAGCAGCATCCTGGCCTCTGCCCACTAGACGCCGGTCACATTTCCCAGTCATGG 1020

 52646026 CAACCAAAAATATCTCTAGGCATTGCTAAATGTCCCCTGGAGGACAAAATCTCTTACGTT 52646085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CAACCAAAAATATCTCTAGGCATTGCTAAATGTCCCCTGGAGGACAAAATCTCTTACGTT 1080

 52646086 TGAGAGGCACTGAGCTGAAATGTCTTTTTGAATCCAGATTATCTAATTTTCTGTGCCTCA 52646145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGAGAGGCACTGAGCTGAAATGTCTTTTTGAATCCAGATTATCTAATTTTCTGTGCCTCA 1140

 52646146 ACTTTCTGGTAAAAGGAGACAGATAATAAATCTCGTAATTTTGTTAGGAAGATTACATGA 52646205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ACTTTCTGGTAAAAGGAGACAGATAATAAATCTCGTAATTTTGTTAGGAAGATTACATGA 1200

 52646206 GTTAATAGTTTTAAAGCAAGTACAATAGCACCTGGAATATATTAAGTGCTTAATAAATAT 52646265
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GTTAATAGTTTTAAAGCAAGTACAATAGCGCCTGGAATATATTAAGTGCTTAATAAATAT 1260

 52646266 CACAAACATTAGTTATCATTATTCATGAGTGAGAAAACTGACAGTCAGAGAGGTCAGTAC 52646325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CACAAACATTAGTTATCATTATTCATGAGTGAGAAAACTGACAGTCAGAGAGGTCAGTAC 1320

 52646326 ACCCTCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCTAGTAAGCAGCAGAGTCTGGCTTCAGGCAGAAATC 52646385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ACCCTCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCTAGTAAGCAGCAGAGTCTGGCTTCAGGCAGAAATC 1380

 52646386 TGACTTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGTCTTACCAGGGACTTGTATTAGCATAGACTGTTA 52646445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TGACTTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGTCTTACCAGGGACTTGTATTAGCATAGACTGTTA 1440

 52646446 AGAATATGGGAAGATTTTTAAAATACAGTACTCAGAAAATTTCTCTTTGAAAGGCTGGAA 52646505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AGAATATGGGAAGATTTTTAAAATACAGTACTCAGAAAATTTCTCTTTGAAAGGCTGGAA 1500

 52646506 GAGCAGATATCCACACAAGAAGGCAAATTAGACCTCAGGCCAGTGTGGAATTAAAGGTGT 52646565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GAGCAGATATCCACACAAGAAGGCAAATTAGACCTCAGGCCAGTGTGGAATTAAAGGTGT 1560

 52646566 AGGGTTATCTGGTCAAGACTGTGTGTGTGGATACAGGCTCCAACCCCTCCAGGCAAGGGC 52646625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AGGGTTATCTGGTCAAGACTGTGTGTGTGGATACAGGCTCCAACCCCTCCAGGCAAGGGC 1620

 52646626 ACTGTTTCCAACATCCACCCTTTCTCCTTTGACCTCTACCTTGACCTAAATTAACTATAA 52646685
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AATGTTTCCAACATCCACCCTTTCTCCTTTGACCTCTACCTTGACCTAAATTAACTATAA 1680

 52646686 AAGGTCCTTCTTTTCTAGGACCCTACTATAAATCAGTGAAATATTCAGGAAAAAAAGAAC 52646745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AAGGTCCTTCTTTTCTAGGACCCTACTATAAATCAGTGAAATATTCAGGAAAAAAAGAAC 1740

 52646746 ACCAAGAATGTTGGGATCCCAGTTAAAGATCAAGATTCTCTACTGATAAGCTGTGTGATA 52646805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ACCAAGAATGTTGGGATCCCAGTTAAAGATCAAGATTCTCTACTGATAAGCTGTGTGATA 1800

 52646806 TGGAGTAAATCACTAAAGATCTTTGAATCTCTTCATTTGTAAAATGGGAATATTGGTAGT 52646865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TGGAGTAAATCACTAAAGATCTTTGAATCTCTTCATTTGTAAAATGGGAATATTGGTAGT 1860

 52646866 CCTACTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTAAAGAAGAAAAGTCATGCAAAGGATCTGGCACAA 52646925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CCTACTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTAAAGAAGAAAAGTCATGCAAAGGATCTGGCACAA 1920

 52646926 CGCCTTTTCCATAATAAGTGCTTAGTAATTGACAGATACTGTGATAACTTTTCAGGTTTC 52646985
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TGCCTTTTCCATAATAAGTGCTTAGTAATTGACAGATACTGTGATAACTTTTCAGGTTTC 1980

 52646986 TCTCATGCCTTTGACAACATTGCATTTTGCTTGCTCTATCTGTAGTCAGACACTTCTTAA 52647045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TCTCATGCCTTTGACAACATTGCATTTTGCTTGCTCTATCTGTAGTCAGACACTTCTTAA 2040

 52647046 TATCTGTTTGCAGGAAGAC 52647064
          |||||||||||||||||||
     2041 TATCTGTTTGCAGGAAGAC 2059

EXCISED REGION

 52658003 AGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTG 52658062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2060 AGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTG 2119

 52658063 GCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTAT 52658122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2120 GCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTAT 2179

 52658123 AAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGG 52658182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2180 AAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGG 2239

 52658183 GAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTG 52658242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2240 GAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTG 2299

 52658243 AAACACTGTCTCTGCTAAAAAACAAAACAAAACAAAACACCAAAAAATAGCTGGGCGTAG 52658302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2300 AAACACTGTCTCTGCTAAAAAACAAAACAAAACAAAACACCAAAAAATAGCTGGGCGTAG 2359

 52658303 TGGCGGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTTGGGAGGCGGTGGCAGGAGAATCATTTGAACCT 52658362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2360 TGGCGGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTTGGGAGGCGGTGGCAGGAGAATCATTTGAACCT 2419

 52658363 GGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGAT--------TGTGCCACTGCACTCTAACCTGG 52658414
          |||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||
     2420 GGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACTGTGCCACTGCACTCTAACCTGG 2479

 52658415 GCAACAGAGTTCAGAGTGAGACTCTGTCTC 52658444
          ||||||||||||||||||||||||||||||
     2480 GCAACAGAGTTCAGAGTGAGACTCTGTCTC 2509

Alignment time is 2.79901 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [52637064,52668002] =>     30939 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    8481] =>      8481 nucs 'mol-32-2105-065968_8481'

Score:        8481
Aligned:      8481        nucs
Identic:      8481 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [52641533,52650013]
 second seq =>  [       1,    8481]

 52641533 TACTAGATTATACACTCCTTGACAGACGAGAAACATGATTTATTTTTCAAATGCCTTGCA 52641592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TACTAGATTATACACTCCTTGACAGACGAGAAACATGATTTATTTTTCAAATGCCTTGCA 60

 52641593 CAAGGTTAGTGCGAAAGTAACGATTGCAGGATTTAATTACACTTTTAAAAGAAAAAAGAC 52641652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAAGGTTAGTGCGAAAGTAACGATTGCAGGATTTAATTACACTTTTAAAAGAAAAAAGAC 120

 52641653 ATTCTTCATCTTATGAAACTCTGCATGGCAACACTTTATGCGCCCCACACCCCCACTCAA 52641712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATTCTTCATCTTATGAAACTCTGCATGGCAACACTTTATGCGCCCCACACCCCCACTCAA 180

 52641713 CACAAACACAACTCTGGAAGTACTGTGTTGATAACAGAAATGTGGTGGGTTTTATTTTTA 52641772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CACAAACACAACTCTGGAAGTACTGTGTTGATAACAGAAATGTGGTGGGTTTTATTTTTA 240

 52641773 ACCAATAAAGGTCAAGTTTGCATTATGTGATTTTGTGTGTGTGTGTGTTGAATCTTTTAA 52641832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACCAATAAAGGTCAAGTTTGCATTATGTGATTTTGTGTGTGTGTGTGTTGAATCTTTTAA 300

 52641833 ATGCATATCTTACAGCTCTGGTTCAGTTGTTGTGGGGAGAGGAAAAAAACCTCATCCCTG 52641892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATGCATATCTTACAGCTCTGGTTCAGTTGTTGTGGGGAGAGGAAAAAAACCTCATCCCTG 360

 52641893 CCAACACATTGGTTTGTATGAATCACAGCTCAGTGAAACCTTTCAGGCATATAATTTATC 52641952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CCAACACATTGGTTTGTATGAATCACAGCTCAGTGAAACCTTTCAGGCATATAATTTATC 420

 52641953 TTTTCTTTGGCCTATGTAGTAAACGCTTCATTTGTTCATGAATTCTTGCCTTGTTTTAAT 52642012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTTTCTTTGGCCTATGTAGTAAACGCTTCATTTGTTCATGAATTCTTGCCTTGTTTTAAT 480

 52642013 TATGCTTTGCCCTGAATGTAGTTTTATAAGGCACAAAAATAAGATTGTCGTTCTGAAAAC 52642072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TATGCTTTGCCCTGAATGTAGTTTTATAAGGCACAAAAATAAGATTGTCGTTCTGAAAAC 540

 52642073 ACAGAAGATTTGTATGTTTCCCCCAGGATGAAATGGTGGCATCTTTCTCCCAATTCACAG 52642132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACAGAAGATTTGTATGTTTCCCCCAGGATGAAATGGTGGCATCTTTCTCCCAATTCACAG 600

 52642133 CTCTGTGGGCTTGTGGCTGGAATTCCAATCCAGCAGGGAGCAAGCCATAAAAATGGGGGG 52642192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTCTGTGGGCTTGTGGCTGGAATTCCAATCCAGCAGGGAGCAAGCCATAAAAATGGGGGG 660

 52642193 AAGGGCTGCTGGAGGGAGGCAGTAGATGCGGCTGAGCCCAAGGCATAATTCACCCTAAGA 52642252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAGGGCTGCTGGAGGGAGGCAGTAGATGCGGCTGAGCCCAAGGCATAATTCACCCTAAGA 720

 52642253 ATTCTGAATCAATACACTGACATCCAGCCATGTACAATGTGGTACTCCCACCAAGAAAGC 52642312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATTCTGAATCAATACACTGACATCCAGCCATGTACAATGTGGTACTCCCACCAAGAAAGC 780

 52642313 CACTGATTGAGAAGTTTTATTCATGTTACTTTCTGAGGGTTGGATTGTCCCATTACATTT 52642372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CACTGATTGAGAAGTTTTATTCATGTTACTTTCTGAGGGTTGGATTGTCCCATTACATTT 840

 52642373 ATAGAACAATTGCTTTTTTCCCCCTAAATACAGAACTATGCAGCCGGGAGTCAGAAAAGA 52642432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATAGAACAATTGCTTTTTTCCCCCTAAATACAGAACTATGCAGCCGGGAGTCAGAAAAGA 900

 52642433 AACCTTGACAATCAGAAGGCTGTTTTGTTGTTGTTGTTAAAAACCTTTGCAGGCATATGC 52642492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AACCTTGACAATCAGAAGGCTGTTTTGTTGTTGTTGTTAAAAACCTTTGCAGGCATATGC 960

 52642493 ATCTGAATATCCATAAGTTCACAGGCTGAGGGAGAAATGGCTATTTCATAACTTTTCTGT 52642552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATCTGAATATCCATAAGTTCACAGGCTGAGGGAGAAATGGCTATTTCATAACTTTTCTGT 1020

 52642553 GTTTCTCATGTACATAGTACAAAGTGGGCACTCAGTATTTCAAATTTCAATATCACTGAA 52642612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GTTTCTCATGTACATAGTACAAAGTGGGCACTCAGTATTTCAAATTTCAATATCACTGAA 1080

 52642613 AAAAATGGAAATTTGTCATGTAACAAAATCAGATGCAGACTTCACTGGTGAATCTGAGGG 52642672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAAAATGGAAATTTGTCATGTAACAAAATCAGATGCAGACTTCACTGGTGAATCTGAGGG 1140

 52642673 AGTGAATTCACTTATTCAGAAAGGAAGACAGTTACAATTCTTGGGTCTTCTGAGAGATCA 52642732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGTGAATTCACTTATTCAGAAAGGAAGACAGTTACAATTCTTGGGTCTTCTGAGAGATCA 1200

 52642733 TTATAACTTGAAAATATTACACAAGGGCTTTGCTATATTAGATACCTGCCATGTTCCTAA 52642792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTATAACTTGAAAATATTACACAAGGGCTTTGCTATATTAGATACCTGCCATGTTCCTAA 1260

 52642793 CACAAGCTCCCATTTTCTGACTCAAATCTCATTTTGGAACACATTCCACTCAAATTGAGG 52642852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CACAAGCTCCCATTTTCTGACTCAAATCTCATTTTGGAACACATTCCACTCAAATTGAGG 1320

 52642853 TTCTACCCCTAAGAGTTCTTTTTCAATAAAGAAAGCTGAGTTAATAAATCACAACTCCAA 52642912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTCTACCCCTAAGAGTTCTTTTTCAATAAAGAAAGCTGAGTTAATAAATCACAACTCCAA 1380

 52642913 AACTTTTCCTCACTTTTCTTAGACTAGAAATAGATTGAGTGTGTCGAGGTTTTATGGCTG 52642972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AACTTTTCCTCACTTTTCTTAGACTAGAAATAGATTGAGTGTGTCGAGGTTTTATGGCTG 1440

 52642973 AGTACATTGGAGGGCTGGCTATTCTATGCTGAACTGGTTTACTTGATTAAGATGGGGATT 52643032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AGTACATTGGAGGGCTGGCTATTCTATGCTGAACTGGTTTACTTGATTAAGATGGGGATT 1500

 52643033 TGGATGAGTCACCGGACACCTGTCCAAAGATGAGTAAAACACATTCCTTCATTGTCTTCC 52643092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TGGATGAGTCACCGGACACCTGTCCAAAGATGAGTAAAACACATTCCTTCATTGTCTTCC 1560

 52643093 CATAAATAACTCAATCTTCTCCTAACTGAGCCAATGGATAGGCTTTGGATGCCCAAGCAA 52643152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CATAAATAACTCAATCTTCTCCTAACTGAGCCAATGGATAGGCTTTGGATGCCCAAGCAA 1620

 52643153 AACAAACACATGACTGTTAAAAAATCACAACCTCAAAATGGCCTTAGAAGCCTATGACCA 52643212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AACAAACACATGACTGTTAAAAAATCACAACCTCAAAATGGCCTTAGAAGCCTATGACCA 1680

 52643213 ATAATGAGAATGGTTTCTCCACTCAGGCGCAAGTAGTAAACAGTTTCTCCCATATGCAGG 52643272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ATAATGAGAATGGTTTCTCCACTCAGGCGCAAGTAGTAAACAGTTTCTCCCATATGCAGG 1740

 52643273 AATATTGACGACTAGTTTACCGCCTCTGGGCACGTAACTTTCAGGTCCTGGTTCATGCAT 52643332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AATATTGACGACTAGTTTACCGCCTCTGGGCACGTAACTTTCAGGTCCTGGTTCATGCAT 1800

 52643333 TTGCTGGAATGTTCCCTGGGCCATGGAGCCCAGTTCTCCTGGCATCTGGCATCTCCCCCA 52643392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTGCTGGAATGTTCCCTGGGCCATGGAGCCCAGTTCTCCTGGCATCTGGCATCTCCCCCA 1860

 52643393 CACTCTGCTCCCCCAGCACAGCACTTGGCATCTTGCATTGCAATTGCAGGTTTATTTATT 52643452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CACTCTGCTCCCCCAGCACAGCACTTGGCATCTTGCATTGCAATTGCAGGTTTATTTATT 1920

 52643453 CACTTCTCTCACTGGACAGCAAACTCCACCAGGGCCGAGACTCTGTGTCTCGCCCTTCAC 52643512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CACTTCTCTCACTGGACAGCAAACTCCACCAGGGCCGAGACTCTGTGTCTCGCCCTTCAC 1980

 52643513 TGTGGTCCCTGTGCCTCACCTGTTCCTAGTACAGTGTCACACTCAGTAAAGAGCAGATGC 52643572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TGTGGTCCCTGTGCCTCACCTGTTCCTAGTACAGTGTCACACTCAGTAAAGAGCAGATGC 2040

 52643573 CTGGTGCATTTGGAGACTTATTTTAAATTATACGGAAAGTTATTCAACCGGCTTCTTGAA 52643632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CTGGTGCATTTGGAGACTTATTTTAAATTATACGGAAAGTTATTCAACCGGCTTCTTGAA 2100

 52643633 CTGGTGAATTTTGGAAAGTGGGTGTTTGAAGGGAAAATGTTTAAACTCTGAAAGAAATGT 52643692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CTGGTGAATTTTGGAAAGTGGGTGTTTGAAGGGAAAATGTTTAAACTCTGAAAGAAATGT 2160

 52643693 TGGAAATAAGCTCTTTGAATCAAAATGTATAGAAAACACAAGAATGCTGACAGTAAGAGC 52643752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TGGAAATAAGCTCTTTGAATCAAAATGTATAGAAAACACAAGAATGCTGACAGTAAGAGC 2220

 52643753 CTAAAACACATGATGACTATTATCTTTTCCCAATTTTAACTCTCCAGAGTGTTCAGCGGT 52643812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CTAAAACACATGATGACTATTATCTTTTCCCAATTTTAACTCTCCAGAGTGTTCAGCGGT 2280

 52643813 GCCCAGCCTTCATAATGTAATTCTTCGTAGCACCCTGGATGCATTAAAACCATAGATTAA 52643872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GCCCAGCCTTCATAATGTAATTCTTCGTAGCACCCTGGATGCATTAAAACCATAGATTAA 2340

 52643873 CGTGATACTTATTTTCATTAAGGAAAATAATTTACGTACAGTGCTCAGAGTAGAGCCTGG 52643932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CGTGATACTTATTTTCATTAAGGAAAATAATTTACGTACAGTGCTCAGAGTAGAGCCTGG 2400

 52643933 CACATTGAACATTTTCAATAAATGACAGCAAGTGTAATTATTAGCACTTCGGAAGTGCAA 52643992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CACATTGAACATTTTCAATAAATGACAGCAAGTGTAATTATTAGCACTTCGGAAGTGCAA 2460

 52643993 AGTTGCATTGTATTAAGACAAATATATTTGGAGCTCATCCAATTTTTTCCTGGCTCTGAA 52644052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AGTTGCATTGTATTAAGACAAATATATTTGGAGCTCATCCAATTTTTTCCTGGCTCTGAA 2520

 52644053 GTCTGCTAGTGGCACTTAACTTTATTCCCAAGTTTTGAAAAATATTGTTATTTAAAAAGT 52644112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GTCTGCTAGTGGCACTTAACTTTATTCCCAAGTTTTGAAAAATATTGTTATTTAAAAAGT 2580

 52644113 CTGTTAACCAAGGAAATGCATGCCCTAAACCTATAATGTATCAAGTTTTACTTCCTTCTT 52644172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CTGTTAACCAAGGAAATGCATGCCCTAAACCTATAATGTATCAAGTTTTACTTCCTTCTT 2640

 52644173 CTTTTAAGGAGTTCTTTTCCTGCCTTGAATACAAACAGGCTCTCTCAAGGTTAAAAGCAA 52644232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CTTTTAAGGAGTTCTTTTCCTGCCTTGAATACAAACAGGCTCTCTCAAGGTTAAAAGCAA 2700

 52644233 ATGCTCTTTTTAGTGTCAAAAAGAGCTTGCCTTTCTTCGCTCAGGAAAAAAAGCAACTGA 52644292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 ATGCTCTTTTTAGTGTCAAAAAGAGCTTGCCTTTCTTCGCTCAGGAAAAAAAGCAACTGA 2760

 52644293 TTCCAGGATACCTTCTTTGAAAACCAACACAAAAAAACCCCCCAAAAAACAAAAAAAAAA 52644352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TTCCAGGATACCTTCTTTGAAAACCAACACAAAAAAACCCCCCAAAAAACAAAAAAAAAA 2820

 52644353 CCCAAAACCCCTAGTTTTTACAAAGGTTTATTACTCCTACTTGTTGGAAAAGAATTACTA 52644412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CCCAAAACCCCTAGTTTTTACAAAGGTTTATTACTCCTACTTGTTGGAAAAGAATTACTA 2880

 52644413 CATAAAAGAGTCTGCCCAGAGCTGTAAAATCTCCTTATTCAAACACACACCTTAGAGCAA 52644472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CATAAAAGAGTCTGCCCAGAGCTGTAAAATCTCCTTATTCAAACACACACCTTAGAGCAA 2940

 52644473 AAGATGGTTAAATATCAATTCAGGCTATTAACAGTAAGGGACGAAATGTGTTCCAACAAA 52644532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 AAGATGGTTAAATATCAATTCAGGCTATTAACAGTAAGGGACGAAATGTGTTCCAACAAA 3000

 52644533 ACTCTGCATGTCAACAAACTACAGAGACTAGGTAACATCTTTTAGGAATCATTTTTATTC 52644592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 ACTCTGCATGTCAACAAACTACAGAGACTAGGTAACATCTTTTAGGAATCATTTTTATTC 3060

 52644593 CACTAATGCCTTTTCCTCCAGAATCCACTGATCGTAAACGCAACCTGTCTACTTCCGCCT 52644652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 CACTAATGCCTTTTCCTCCAGAATCCACTGATCGTAAACGCAACCTGTCTACTTCCGCCT 3120

 52644653 TTGAAAAATGGATGGACAAATTCATCTGCATGTAACTCACCTCCTCTTTTCTTTTACATA 52644712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TTGAAAAATGGATGGACAAATTCATCTGCATGTAACTCACCTCCTCTTTTCTTTTACATA 3180

 52644713 AAACAGATGCCACAGCTGTTATTGTTCTTCACACAGAAGTTTCTACCCAGAGAAACATCA 52644772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 AAACAGATGCCACAGCTGTTATTGTTCTTCACACAGAAGTTTCTACCCAGAGAAACATCA 3240

 52644773 GGATGACACTCTGCTGCAATGTGCTATTTGTTCTAGAGGGGTCAACAGCTTGCCACCTTG 52644832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 GGATGACACTCTGCTGCAATGTGCTATTTGTTCTAGAGGGGTCAACAGCTTGCCACCTTG 3300

 52644833 CCTAGGCCCAGGGTGACTGCATATGTGCAGTGGTCTTATCCCATTAGCGCCCCCGAGCAT 52644892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 CCTAGGCCCAGGGTGACTGCATATGTGCAGTGGTCTTATCCCATTAGCGCCCCCGAGCAT 3360

 52644893 GCATTCAGAACCAAGTGGATACACCTTGGCACACTTACCTTCCCTGCAGGGACATCATCG 52644952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 GCATTCAGAACCAAGTGGATACACCTTGGCACACTTACCTTCCCTGCAGGGACATCATCG 3420

 52644953 GACTGCCCTGATAAGCCAGGAACCTCATCCACCTTGTCTTGATGCTCTGCCCTCTTGGCT 52645012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 GACTGCCCTGATAAGCCAGGAACCTCATCCACCTTGTCTTGATGCTCTGCCCTCTTGGCT 3480

 52645013 TCCTGTTGGCTGTCACCTGGCACCTTTTCCTGTCCCTTGTCCAGCTTGAAGAATTTGTCA 52645072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TCCTGTTGGCTGTCACCTGGCACCTTTTCCTGTCCCTTGTCCAGCTTGAAGAATTTGTCA 3540

 52645073 AAAAAGCTGGAGTCCTTGGGCTTGGAGGGAGCTTCTCCTCCTGCTCCCCCTGTCTCAGGT 52645132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 AAAAAGCTGGAGTCCTTGGGCTTGGAGGGAGCTTCTCCTCCTGCTCCCCCTGTCTCAGGT 3600

 52645133 GGGAGAAGCGTGGGATCCCTGGCGGCAGAGAGGACCTTGTCTTGGGCCGGGGCGTGCCCT 52645192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 GGGAGAAGCGTGGGATCCCTGGCGGCAGAGAGGACCTTGTCTTGGGCCGGGGCGTGCCCT 3660

 52645193 GGGGTTTTATCTGTGTCCTGCCCCGGTCCAGCTGCCACCGGAAGTGTCCAGCTCTCACTT 52645252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 GGGGTTTTATCTGTGTCCTGCCCCGGTCCAGCTGCCACCGGAAGTGTCCAGCTCTCACTT 3720

 52645253 GGGTCTTTGTTCGCTGGAGCTTTATTGGAGCTGACATCAAGCTTCACTGATCCAAGGGAT 52645312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 GGGTCTTTGTTCGCTGGAGCTTTATTGGAGCTGACATCAAGCTTCACTGATCCAAGGGAT 3780

 52645313 GAATCTGCGGCTTGGTCTCCGGTACGTCCTGGTACAGGCCGAGAGAGCATCAAGAAAAAA 52645372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 GAATCTGCGGCTTGGTCTCCGGTACGTCCTGGTACAGGCCGAGAGAGCATCAAGAAAAAA 3840

 52645373 CGAGATTTAGCAGCTGGTGCCTCGGGTTTGGCCTCTTTCCCAAGATTCTTTCCGTTGGCA 52645432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 CGAGATTTAGCAGCTGGTGCCTCGGGTTTGGCCTCTTTCCCAAGATTCTTTCCGTTGGCA 3900

 52645433 TCCGCAACAGCACTTATCTCCGTTGTCTCGGGGGAAGAAGTGGCCACATTATCCGTCTTG 52645492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 TCCGCAACAGCACTTATCTCCGTTGTCTCGGGGGAAGAAGTGGCCACATTATCCGTCTTG 3960

 52645493 ACACTTATTCCCAAGTCGACTGTAAACACAAACATAAACAGTGGTTATTCAGCCAAGCCG 52645552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 ACACTTATTCCCAAGTCGACTGTAAACACAAACATAAACAGTGGTTATTCAGCCAAGCCG 4020

 52645553 GGAAATTCAGGCACTAATAATGGACTCCAGACATTTTTTATACAAAAGCCATACTGCATA 52645612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 GGAAATTCAGGCACTAATAATGGACTCCAGACATTTTTTATACAAAAGCCATACTGCATA 4080

 52645613 CTGGAACTGTGTTGTTCTCTGGTCATTCTGAAAGGCAGAAGTTAGCTCTCTACATCTCCT 52645672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 CTGGAACTGTGTTGTTCTCTGGTCATTCTGAAAGGCAGAAGTTAGCTCTCTACATCTCCT 4140

 52645673 TGGACCCTGCTTTTCTTGGGAGAGGAGAAGGCAAGGTTGGTGAGGAGGGAAAGCTACTTA 52645732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 TGGACCCTGCTTTTCTTGGGAGAGGAGAAGGCAAGGTTGGTGAGGAGGGAAAGCTACTTA 4200

 52645733 ATGGAAAGTCACTAGCTGCCAGGTGTGGAATGAGTGATATTCAATGTTAATTAATCTTCT 52645792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 ATGGAAAGTCACTAGCTGCCAGGTGTGGAATGAGTGATATTCAATGTTAATTAATCTTCT 4260

 52645793 TTTATCTGTGTAAGAACTCCGTGAGCAGCATATTGTCATGATGTCAACTGGGAGGCAGTA 52645852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 TTTATCTGTGTAAGAACTCCGTGAGCAGCATATTGTCATGATGTCAACTGGGAGGCAGTA 4320

 52645853 CAGCAGTTAGGAGCTTGGGTTCTGGAGCTAGAACAAGGTTTCTCAACCTCAGCACTACTC 52645912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 CAGCAGTTAGGAGCTTGGGTTCTGGAGCTAGAACAAGGTTTCTCAACCTCAGCACTACTC 4380

 52645913 ACATTTGAAGCCAGATTATTCTTTGTTAGGGAGGCTCATCCCGTGCCTCATAGGCTGATT 52645972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 ACATTTGAAGCCAGATTATTCTTTGTTAGGGAGGCTCATCCCGTGCCTCATAGGCTGATT 4440

 52645973 AGCAGCATCCTGGCCTCTGCCCACTAGACGCCGGTCACATTTCCCAGTCATGGCAACCAA 52646032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 AGCAGCATCCTGGCCTCTGCCCACTAGACGCCGGTCACATTTCCCAGTCATGGCAACCAA 4500

 52646033 AAATATCTCTAGGCATTGCTAAATGTCCCCTGGAGGACAAAATCTCTTACGTTTGAGAGG 52646092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 AAATATCTCTAGGCATTGCTAAATGTCCCCTGGAGGACAAAATCTCTTACGTTTGAGAGG 4560

 52646093 CACTGAGCTGAAATGTCTTTTTGAATCCAGATTATCTAATTTTCTGTGCCTCAACTTTCT 52646152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 CACTGAGCTGAAATGTCTTTTTGAATCCAGATTATCTAATTTTCTGTGCCTCAACTTTCT 4620

 52646153 GGTAAAAGGAGACAGATAATAAATCTCGTAATTTTGTTAGGAAGATTACATGAGTTAATA 52646212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 GGTAAAAGGAGACAGATAATAAATCTCGTAATTTTGTTAGGAAGATTACATGAGTTAATA 4680

 52646213 GTTTTAAAGCAAGTACAATAGCACCTGGAATATATTAAGTGCTTAATAAATATCACAAAC 52646272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 GTTTTAAAGCAAGTACAATAGCACCTGGAATATATTAAGTGCTTAATAAATATCACAAAC 4740

 52646273 ATTAGTTATCATTATTCATGAGTGAGAAAACTGACAGTCAGAGAGGTCAGTACACCCTCC 52646332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 ATTAGTTATCATTATTCATGAGTGAGAAAACTGACAGTCAGAGAGGTCAGTACACCCTCC 4800

 52646333 CCTGGCTGCCCAGTAAGCTAGTAAGCAGCAGAGTCTGGCTTCAGGCAGAAATCTGACTTC 52646392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 CCTGGCTGCCCAGTAAGCTAGTAAGCAGCAGAGTCTGGCTTCAGGCAGAAATCTGACTTC 4860

 52646393 TAAGTTCATGCGCTCTCTGTCTTACCAGGGACTTGTATTAGCATAGACTGTTAAGAATAT 52646452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 TAAGTTCATGCGCTCTCTGTCTTACCAGGGACTTGTATTAGCATAGACTGTTAAGAATAT 4920

 52646453 GGGAAGATTTTTAAAATACAGTACTCAGAAAATTTCTCTTTGAAAGGCTGGAAGAGCAGA 52646512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 GGGAAGATTTTTAAAATACAGTACTCAGAAAATTTCTCTTTGAAAGGCTGGAAGAGCAGA 4980

 52646513 TATCCACACAAGAAGGCAAATTAGACCTCAGGCCAGTGTGGAATTAAAGGTGTAGGGTTA 52646572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 TATCCACACAAGAAGGCAAATTAGACCTCAGGCCAGTGTGGAATTAAAGGTGTAGGGTTA 5040

 52646573 TCTGGTCAAGACTGTGTGTGTGGATACAGGCTCCAACCCCTCCAGGCAAGGGCACTGTTT 52646632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 TCTGGTCAAGACTGTGTGTGTGGATACAGGCTCCAACCCCTCCAGGCAAGGGCACTGTTT 5100

 52646633 CCAACATCCACCCTTTCTCCTTTGACCTCTACCTTGACCTAAATTAACTATAAAAGGTCC 52646692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 CCAACATCCACCCTTTCTCCTTTGACCTCTACCTTGACCTAAATTAACTATAAAAGGTCC 5160

 52646693 TTCTTTTCTAGGACCCTACTATAAATCAGTGAAATATTCAGGAAAAAAAGAACACCAAGA 52646752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 TTCTTTTCTAGGACCCTACTATAAATCAGTGAAATATTCAGGAAAAAAAGAACACCAAGA 5220

 52646753 ATGTTGGGATCCCAGTTAAAGATCAAGATTCTCTACTGATAAGCTGTGTGATATGGAGTA 52646812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 ATGTTGGGATCCCAGTTAAAGATCAAGATTCTCTACTGATAAGCTGTGTGATATGGAGTA 5280

 52646813 AATCACTAAAGATCTTTGAATCTCTTCATTTGTAAAATGGGAATATTGGTAGTCCTACTG 52646872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 AATCACTAAAGATCTTTGAATCTCTTCATTTGTAAAATGGGAATATTGGTAGTCCTACTG 5340

 52646873 CAGGGTTGTTGTAATGCTTAAAGAAGAAAAGTCATGCAAAGGATCTGGCACAACGCCTTT 52646932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 CAGGGTTGTTGTAATGCTTAAAGAAGAAAAGTCATGCAAAGGATCTGGCACAACGCCTTT 5400

 52646933 TCCATAATAAGTGCTTAGTAATTGACAGATACTGTGATAACTTTTCAGGTTTCTCTCATG 52646992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 TCCATAATAAGTGCTTAGTAATTGACAGATACTGTGATAACTTTTCAGGTTTCTCTCATG 5460

 52646993 CCTTTGACAACATTGCATTTTGCTTGCTCTATCTGTAGTCAGACACTTCTTAATATCTGT 52647052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 CCTTTGACAACATTGCATTTTGCTTGCTCTATCTGTAGTCAGACACTTCTTAATATCTGT 5520

 52647053 TTGCAGGAAGACAGAAAAATAAAGGGAAGAATTGAGATTTCTTTGATCTATTCATACTGC 52647112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 TTGCAGGAAGACAGAAAAATAAAGGGAAGAATTGAGATTTCTTTGATCTATTCATACTGC 5580

 52647113 TCATTAATATGTAGTGAGAAATACATACACACACACATACACACACATGCATCCATTAGC 52647172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 TCATTAATATGTAGTGAGAAATACATACACACACACATACACACACATGCATCCATTAGC 5640

 52647173 AATTGTTTTTGCCCAACTCTAGTGTCTCGCAGTGTCTAGACTAAACAACAAACAAAAAAG 52647232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 AATTGTTTTTGCCCAACTCTAGTGTCTCGCAGTGTCTAGACTAAACAACAAACAAAAAAG 5700

 52647233 GGGGGAGAGTGAGCTGGATTAAGCATTGAGGCACAGTGAAGAAATGGTCTGGGGCAAGCC 52647292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5701 GGGGGAGAGTGAGCTGGATTAAGCATTGAGGCACAGTGAAGAAATGGTCTGGGGCAAGCC 5760

 52647293 CAGGGATGAATGTTAGGGGTTTCTCATAAACCTGAACCTGAAGAAAATCACCCTGCCAGC 52647352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5761 CAGGGATGAATGTTAGGGGTTTCTCATAAACCTGAACCTGAAGAAAATCACCCTGCCAGC 5820

 52647353 ATATTGATCTTCTAGCTCTTCTTAACCTTTTTTTCTGTGATTCAGGAATTCATAATGATA 52647412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5821 ATATTGATCTTCTAGCTCTTCTTAACCTTTTTTTCTGTGATTCAGGAATTCATAATGATA 5880

 52647413 GAAAATATTATACTAAAGAAGAAAAAAAGAGGGAGAATAAGTAAGTGATAGATGGATGCA 52647472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5881 GAAAATATTATACTAAAGAAGAAAAAAAGAGGGAGAATAAGTAAGTGATAGATGGATGCA 5940

 52647473 TCAGGGTGTAAAGTTAGCAAGTAAGGCTGTTGAAGTGTCAGAGTGAATATAAATGAATTG 52647532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5941 TCAGGGTGTAAAGTTAGCAAGTAAGGCTGTTGAAGTGTCAGAGTGAATATAAATGAATTG 6000

 52647533 TGGGAATGGTCCATGCCAGGAGAAGAGGGTATGGTTGACAAAAAGGGAAATGCTAAGATT 52647592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6001 TGGGAATGGTCCATGCCAGGAGAAGAGGGTATGGTTGACAAAAAGGGAAATGCTAAGATT 6060

 52647593 CAAAACAGGGAAGGGCTTTTCAAAATGCCAAGAGCACCAACTTATATCTTTCAGTTTAAT 52647652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6061 CAAAACAGGGAAGGGCTTTTCAAAATGCCAAGAGCACCAACTTATATCTTTCAGTTTAAT 6120

 52647653 TCCTCTCTTCCTTACCCACTGGCTGGAAAGCAAAGGAGCTAGTGGTAAGTAAGAGTGTTA 52647712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6121 TCCTCTCTTCCTTACCCACTGGCTGGAAAGCAAAGGAGCTAGTGGTAAGTAAGAGTGTTA 6180

 52647713 TAGCCAGAGAAAAAGTCTTCAAAAAACACAAAGTACTTTCCATGGACAACCTTTTTTATT 52647772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6181 TAGCCAGAGAAAAAGTCTTCAAAAAACACAAAGTACTTTCCATGGACAACCTTTTTTATT 6240

 52647773 TTAAAGTGCCAATATGTTGCTTTGAAAAAGAATAAATTCCTTACATCCAGGTATCTGGAC 52647832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6241 TTAAAGTGCCAATATGTTGCTTTGAAAAAGAATAAATTCCTTACATCCAGGTATCTGGAC 6300

 52647833 TAGACTTCAGTGCATTTAGTGATTATAGCAAATCCAAACAGTAGCTTTTGATATCAGAGA 52647892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6301 TAGACTTCAGTGCATTTAGTGATTATAGCAAATCCAAACAGTAGCTTTTGATATCAGAGA 6360

 52647893 ATGGGTAAAGTGTTTTTGACAATTTCTAAGAACTTAGAGTTCTTCGGTGATACGTTCCAT 52647952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6361 ATGGGTAAAGTGTTTTTGACAATTTCTAAGAACTTAGAGTTCTTCGGTGATACGTTCCAT 6420

 52647953 GCAACTGAAGCTCTGCTCTCCAAATTTAGGTGGGTACATACCCAAGTCCATCACCTGGGG 52648012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6421 GCAACTGAAGCTCTGCTCTCCAAATTTAGGTGGGTACATACCCAAGTCCATCACCTGGGG 6480

 52648013 CTTCTATTTCCTTTGCTCAGATGCTCACCTCCTAGGTGGGCACCTGACATAAGATAGACT 52648072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6481 CTTCTATTTCCTTTGCTCAGATGCTCACCTCCTAGGTGGGCACCTGACATAAGATAGACT 6540

 52648073 AATAAAAATAAGTCCTGTAACTTTTGATACTCCTATTAAAAAAGAGTTGCAAACCAATAG 52648132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6541 AATAAAAATAAGTCCTGTAACTTTTGATACTCCTATTAAAAAAGAGTTGCAAACCAATAG 6600

 52648133 GAGGTACACTTGAGAATCAGCACAAATGAAAGTAGAACCTGGAAATCCAGGAAGCAGATA 52648192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6601 GAGGTACACTTGAGAATCAGCACAAATGAAAGTAGAACCTGGAAATCCAGGAAGCAGATA 6660

 52648193 CCCAATCATGTCATTTAAACATTTAGATCCAGCTGTGCCTGAAGCTGAACTTTAGCATTA 52648252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6661 CCCAATCATGTCATTTAAACATTTAGATCCAGCTGTGCCTGAAGCTGAACTTTAGCATTA 6720

 52648253 CATAAGCCAATAAATCACTCTTCCCCAACTTACGCCAGTTGAAATTGAATACATACTCAG 52648312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6721 CATAAGCCAATAAATCACTCTTCCCCAACTTACGCCAGTTGAAATTGAATACATACTCAG 6780

 52648313 TGACTTTGAGAGAATTCCAGGGAATTGGTCAGTCCCTGTTTCACTTGTAAATACACAGCA 52648372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6781 TGACTTTGAGAGAATTCCAGGGAATTGGTCAGTCCCTGTTTCACTTGTAAATACACAGCA 6840

 52648373 ATCAAGCCTACCAAATCTATGATTGATTGGGGTGTCTGAAAGAGATGGAGGGAATGGAAT 52648432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6841 ATCAAGCCTACCAAATCTATGATTGATTGGGGTGTCTGAAAGAGATGGAGGGAATGGAAT 6900

 52648433 CAACCTGAAAAACATATTTCAGGAGTTCATCCCTGAAAACTTCCCCAACCTAGCTAGAGG 52648492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6901 CAACCTGAAAAACATATTTCAGGAGTTCATCCCTGAAAACTTCCCCAACCTAGCTAGAGG 6960

 52648493 GGCCAACATTCAAATTCAGGAAATGCAGAGAACCCCAGTAAGATACTCCACAAAAAGATC 52648552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6961 GGCCAACATTCAAATTCAGGAAATGCAGAGAACCCCAGTAAGATACTCCACAAAAAGATC 7020

 52648553 TTCCCCAAGACATCATCATCAGATTCTCCAAAGTTGAAATGTAAGAAAAAATGCTAAAGG 52648612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7021 TTCCCCAAGACATCATCATCAGATTCTCCAAAGTTGAAATGTAAGAAAAAATGCTAAAGG 7080

 52648613 CAACTAGAGTGAAAGGCCCGGTCACCTAAAAAGGGAAGCACAGACTTACAGTGGACCTCT 52648672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7081 CAACTAGAGTGAAAGGCCCGGTCACCTAAAAAGGGAAGCACAGACTTACAGTGGACCTCT 7140

 52648673 CACTGGTAACCCTACAAGCCAGAAGAGATTGAGGACCAATATTCAACATTCTTAAACAAA 52648732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7141 CACTGGTAACCCTACAAGCCAGAAGAGATTGAGGACCAATATTCAACATTCTTAAACAAA 7200

 52648733 AAGAATTCCAACCCAGAATTTTATATCTGACTAAACTAAGCTTCATAAGCAAAAGAGAAA 52648792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7201 AAGAATTCCAACCCAGAATTTTATATCTGACTAAACTAAGCTTCATAAGCAAAAGAGAAA 7260

 52648793 TAAGATCATTTTCAGACAAGCAAATGCTAAGGGAATTTGTGACCATTAGACCTTCCTTGC 52648852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7261 TAAGATCATTTTCAGACAAGCAAATGCTAAGGGAATTTGTGACCATTAGACCTTCCTTGC 7320

 52648853 AACAGTTCCTAAAGGAAGCACTAAATATGGAAAGACCATTACCAGACACTACAAAACACA 52648912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7321 AACAGTTCCTAAAGGAAGCACTAAATATGGAAAGACCATTACCAGACACTACAAAACACA 7380

 52648913 CTGAAGTACACAGACCAGTGACATTGTAAAGCAACTACATAACAAGTCTGCAAAATAACC 52648972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7381 CTGAAGTACACAGACCAGTGACATTGTAAAGCAACTACATAACAAGTCTGCAAAATAACC 7440

 52648973 AGCCAACATCATGATGACGGTATCAAATCGACACATAGCAACACTAACCTTAAATGTAAA 52649032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7441 AGCCAACATCATGATGACGGTATCAAATCGACACATAGCAACACTAACCTTAAATGTAAA 7500

 52649033 TGGACTAAATGATCCCATTAAAAGACATAAAGTGGCAGGCTGGATAAAGAACCAAGAACC 52649092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7501 TGGACTAAATGATCCCATTAAAAGACATAAAGTGGCAGGCTGGATAAAGAACCAAGAACC 7560

 52649093 ATTGGTATACTGTCTTCAAGAGACCCATCTCCTATGCAGTGACACACATAGGTTCAAGAT 52649152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7561 ATTGGTATACTGTCTTCAAGAGACCCATCTCCTATGCAGTGACACACATAGGTTCAAGAT 7620

 52649153 AAAGGGATGGGGAAAAATCTACCAAGCAAATAGAAAACAGAATAAAACAGGGGTTGCAAT 52649212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7621 AAAGGGATGGGGAAAAATCTACCAAGCAAATAGAAAACAGAATAAAACAGGGGTTGCAAT 7680

 52649213 CCTAGTTGCCGTCAAAACAGACTTTAAACCAACAAAGGTTAAAAGAAAAAAATATGGGCA 52649272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7681 CCTAGTTGCCGTCAAAACAGACTTTAAACCAACAAAGGTTAAAAGAAAAAAATATGGGCA 7740

 52649273 TTGCATAAGGATAAAGTGTTAAATTAAACAAGAAGATCTAACTATCCTAAGTATATATGC 52649332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7741 TTGCATAAGGATAAAGTGTTAAATTAAACAAGAAGATCTAACTATCCTAAGTATATATGC 7800

 52649333 ACCAAACACAGGAACACCCAGATTCATAAAGCAAGTTTATGGAGACCTTCAAACAGACTT 52649392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7801 ACCAAACACAGGAACACCCAGATTCATAAAGCAAGTTTATGGAGACCTTCAAACAGACTT 7860

 52649393 AGACTCCCACACAATAGTAGTGGGAGACTTTAATACCCCATGACAATATTAGACAGATCA 52649452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7861 AGACTCCCACACAATAGTAGTGGGAGACTTTAATACCCCATGACAATATTAGACAGATCA 7920

 52649453 TTGAGACAGGAAATTAACAAAGATATTCAAGATCTAACTCAGCACTAAATCAAATGGCCC 52649512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7921 TTGAGACAGGAAATTAACAAAGATATTCAAGATCTAACTCAGCACTAAATCAAATGGCCC 7980

 52649513 TGATAGATATCTACAGGACTGTCCTACTTGAAACCATACAATTACATGGTAATTGAATGA 52649572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7981 TGATAGATATCTACAGGACTGTCCTACTTGAAACCATACAATTACATGGTAATTGAATGA 8040

 52649573 CCTGCTCCTGAATGACTTTTGGGTAAATAATAAAATTAAGGCAGAAATCAAGAAGTTTTT 52649632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8041 CCTGCTCCTGAATGACTTTTGGGTAAATAATAAAATTAAGGCAGAAATCAAGAAGTTTTT 8100

 52649633 TGAACTAATGAGAACAAAGATACAACATACCAGAATCTTTGGGACACAGCTAAGGCAGTG 52649692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8101 TGAACTAATGAGAACAAAGATACAACATACCAGAATCTTTGGGACACAGCTAAGGCAGTG 8160

 52649693 TTAAGAGGGAAATTTATAGCACTAAATCCCACATCAAAAAGTTAGAAAGAGCTCACGTTA 52649752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8161 TTAAGAGGGAAATTTATAGCACTAAATCCCACATCAAAAAGTTAGAAAGAGCTCACGTTA 8220

 52649753 ACAATCTAACCTCACAACTACAGGAACTAGAGAACTGAGAGCAGAAAAACCTGAAAGCTA 52649812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8221 ACAATCTAACCTCACAACTACAGGAACTAGAGAACTGAGAGCAGAAAAACCTGAAAGCTA 8280

 52649813 GCAGAAGACAAGAAATAACCAAAATTAGAGCTGAACTGAAGGAGATTGAGACATGAAAAA 52649872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8281 GCAGAAGACAAGAAATAACCAAAATTAGAGCTGAACTGAAGGAGATTGAGACATGAAAAA 8340

 52649873 CCATTCAAAAGATCAGTGAATTCAGGAGCTGTTTTTTTTTTGAACAAATTAATAAAATAG 52649932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8341 CCATTCAAAAGATCAGTGAATTCAGGAGCTGTTTTTTTTTTGAACAAATTAATAAAATAG 8400

 52649933 ACCATTAGCTAGAGTAATAAACAAGAAAATAGAAAAGATTCAAATAAACACAATCAGAAA 52649992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8401 ACCATTAGCTAGAGTAATAAACAAGAAAATAGAAAAGATTCAAATAAACACAATCAGAAA 8460

 52649993 CGACAAGGGGGATATTACCAC 52650013
          |||||||||||||||||||||
     8461 CGACAAGGGGGATATTACCAC 8481

Alignment time is 8.13021 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [52637064,52668002] =>     30939 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    4146] =>      4146 nucs 'mol-32-23a4-014682_4146'

Score:        4062
Aligned:      4149        nucs
Identic:      4137 (100%) nucs =>      3764 (100%)       373 (100%)
Gaps:            7 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [52643293,52647064] EXCISED REGION [52658003,52658375]
 second seq =>  [       1,    3773] EXCISED REGION [    3774,    4146]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>     10938 nucs [52647065,52658002]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         6 nucs [52647065,52647070] to [52658003,52658008]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [52647065,52647067] to [52658000,52658002]
 second seq =>         0 nucs

 52643293 CGCCTCTGGGCACGTAACTTTCAGGTCCTGGTTCATGCATTTGCTGGAATGTTCCCTGGG 52643352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CGCCTCTGGGCACGTAACTTTCAGGTCCTGGTTCATGCATTTGCTGGAATGTTCCCTGGG 60

 52643353 CCATGGAGCCCAGTTCTCCTGGCATCTGGCATCTCCCCCACACTCTGCTCCCCCAGCACA 52643412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCATGGAGCCCAGTTCTCCTGGCATCTGGCATCTCCCCCACACTCTGCTCCCCCAGCACA 120

 52643413 GCACTTGGCATCTTGCATTGCAATTGCAGGTTTATTTATTCACTTCTCTCACTGGACAGC 52643472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GCACTTGGCATCTTGCATTGCAATTGCAGGTTTATTTATTCACTTCTCTCACTGGACAGC 180

 52643473 AAACTCCACCAGGGCCGAGACTCTGTGTCTCGCCCTTCACTGTGGTCCCTGTGCCTCACC 52643532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAACTCCACCAGGGCCGAGACTCTGTGTCTCGCCCTTCACTGTGGTCCCTGTGCCTCACC 240

 52643533 TGTTCCTAGTACAGTGTCACACTCAGTAAAGAGCAGATGCCTGG-TGCATTTGGAGACTT 52643591
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
      241 TGTTCCTAGTACAGTGTCACACTCAGTAAAGAGCAGATGCCTGGATGCATTTGGAGACTT 300

 52643592 ATTTTAAATTATACGGAAAGTTATTCAACCGGCTTCTTGAACTGGTGAATTTTGGAAAGT 52643651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATTTTAAATTATACGGAAAGTTATTCAACCGGCTTCTTGAACTGGTGAATTTTGGAAAGT 360

 52643652 GGGTGTTTGAAGGGAAAATGTTTAAACTCTGAAAGAAATGTTGGAAATAAGCTCTTTGAA 52643711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGGTGTTTGAAGGGAAAATGTTTAAACTCTGAAAGAAATGTTGGAAATAAGCTCTTTGAA 420

 52643712 TCAAAATGTATAGAAAACACAAGAATGCTGACAGTAAGAGCCTAAAACACATGATGACTA 52643771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCAAAATGTATAGAAAACACAAGAATGCTGACAGTAAGAGCCTAAAACACATGATGACTA 480

 52643772 TTATCTTTTCCCAATTTTAACTCTCCAGAGTGTTCAGCGGTGCCCAGCCTTCATAATGTA 52643831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTATCTTTTCCCAATTTTAACTCTCCAGAGTGTTCAGCGGTGCCCAGCCTTCATAATGTA 540

 52643832 ATTCTTCGTAGCACCCTGGATGCATTAAAACCATAGATTAACGTGATACTTATTTTCATT 52643891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATTCTTCGTAGCACCCTGGATGCATTAAAACCATAGATTAACGTGATACTTATTTTCATT 600

 52643892 AAGGAAAATAATTTACGTACAGTGCTCAGAGTAGAGCCTGGCACATTGAACATTTTCAAT 52643951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAGGAAAATAATTTACGTACAGTGCTCAGAGTAGAGCCTGGCACATTGAACATTTTCAAT 660

 52643952 AAATGACAGCAAGTGTAATTATTAGCACTTCGGAAGTGCAAAGTTGCATTGTATTAAGAC 52644011
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAATGACAGCAAGTGTAATTATTAGCACTTTGGAAGTGCAAAGTTGCATTGTATTAAGAC 720

 52644012 AAATATATTTGGAGCTCATCCAATTTTTTCCTGGCTCTGAAGTCTGCTAGTGGCACTTAA 52644071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAATATATTTGGAGCTCATCCAATTTTTTCCTGGCTCTGAAGTCTGCTAGTGGCACTTAA 780

 52644072 CTTTATTCCCAAGTTTTGAAAAATATTGTTATTTAAAAAGTCTGTTAACCAAGGAAATGC 52644131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTTTATTCCCAAGTTTTGAAAAATATTGTTATTTAAAAAGTCTGTTAACCAAGGAAATGC 840

 52644132 ATGCCCTAAACCTATAATGTATCAAGTTTTACTTCCTTCTTCTTTTAAGGAGTTCTTTTC 52644191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATGCCCTAAACCTATAATGTATCAAGTTTTACTTCCTTCTTCTTTTAAGGAGTTCTTTTC 900

 52644192 CTGCCTTGAATACAAACAGGCTCTCTCAAGGTTAAAAGCAAATGCTCTTTTTAGTGTCAA 52644251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTGCCTTGAATACAAACAGGCTCTCTCAAGGTTAAAAGCAAATGCTCTTTTTAGTGTCAA 960

 52644252 AAAGAGCTTGCCTTTCTTCGCTCAGGAAAAAAAGCAACTGATTCCAGGATACCTTCTTTG 52644311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AAAGAGCTTGCCTTTCTTCGCTCAGGAAAAAAAGCAACTGATTCCAGGATACCTTCTTTG 1020

 52644312 AAAACCAACACAAAAAAACCCCCCAAAAAACAAAAAAAAAACCCAAAACCCCTAGTTTTT 52644371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AAAACCAACACAAAAAAACCCCCCAAAAAACAAAAAAAAAACCCAAAACCCCTAGTTTTT 1080

 52644372 ACAAAGGTTTATTACTCCTACTTGTTGGAAAAGAATTACTACATAAAAGAGTCTGCCCAG 52644431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ACAAAGGTTTATTACTCCTACTTGTTGGAAAAGAATTACTACATAAAAGAGTCTGCCCAG 1140

 52644432 AGCTGTAAAATCTCCTTATTCAAACACACACCTTAGAGCAAAAGATGGTTAAATATCAAT 52644491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGCTGTAAAATCTCCTTATTCAAACACACACCTTAGAGCAAAAGATGGTTAAATATCAAT 1200

 52644492 TCAGGCTATTAACAGTAAGGGAC---GAAATGTGTTCCAACAAAACTCTGCATGTCAACA 52644548
          ||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TCAGGCTATTAACAGTAAGG---AATGAAATGTGTTCCAACAAAACTCTGCATGTCAACA 1257

 52644549 AACTACAGAGACTAGGTAACATCTTTTAGGAATCATTTTTATTCCACTAATGCCTTTTCC 52644608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1258 AACTACAGAGACTAGGTAACATCTTTTAGGAATCATTTTTATTCCACTAATGCCTTTTCC 1317

 52644609 TCCAGAATCCACTGATCGTAAACGCAACCTGTCTACTTCCGCCTTTGAAAAATGGATGGA 52644668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1318 TCCAGAATCCACTGATCGTAAACGCAACCTGTCTACTTCCGCCTTTGAAAAATGGATGGA 1377

 52644669 CAAATTCATCTGCATGTAACTCACCTCCTCTTTTCTTTTACATAAAACAGATGCCACAGC 52644728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1378 CAAATTCATCTGCATGTAACTCACCTCCTCTTTTCTTTTACATAAAACAGATGCCACAGC 1437

 52644729 TGTTATTGTTCTTCACACAGAAGTTTCTACCCAGAGAAACATCAGGATGACACTCTGCTG 52644788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1438 TGTTATTGTTCTTCACACAGAAGTTTCTACCCAGAGAAACATCAGGATGACACTCTGCTG 1497

 52644789 CAATGTGCTATTTGTTCTAGAGGGGTCAACAGCTTGCCACCTTGCCTAGGCCCAGGGTGA 52644848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1498 CAATGTGCTATTTGTTCTAGAGGGGTCAACAGCTTGCCACCTTGCCTAGGCCCAGGGTGA 1557

 52644849 CTGCATATGTGCAGTGGTCTTATCCCATTAGCGCCCCCGAGCATGCATTCAGAACCAAGT 52644908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1558 CTGCATATGTGCAGTGGTCTTATCCCATTAGCGCCCCCGAGCATGCATTCAGAACCAAGT 1617

 52644909 GGATACACCTTGGCACACTTACCTTCCCTGCAGGGACATCATCGGACTGCCCTGATAAGC 52644968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1618 GGATACACCTTGGCACACTTACCTTCCCTGCAGGGACATCATCGGACTGCCCTGATAAGC 1677

 52644969 CAGGAACCTCATCCACCTTGTCTTGATGCTCTGCCCTCTTGGCTTCCTGTTGGCTGTCAC 52645028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1678 CAGGAACCTCATCCACCTTGTCTTGATGCTCTGCCCTCTTGGCTTCCTGTTGGCTGTCAC 1737

 52645029 CTGGCACCTTTTCCTGTCCCTTGTCCAGCTTGAAGAATTTGTCAAAAAAGCTGGAGTCCT 52645088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1738 CTGGCACCTTTTCCTGTCCCTTGTCCAGCTTGAAGAATTTGTCAAAAAAGCTGGAGTCCT 1797

 52645089 TGGGCTTGGAGGGAGCTTCTCCTCCTGCTCCCCCTGTCTCAGGTGGGAGAAGCGTGGGAT 52645148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1798 TGGGCTTGGAGGGAGCTTCTCCTCCTGCTCCCCCTGTCTCAGGTGGGAGAAGCGTGGGAT 1857

 52645149 CCCTGGCGGCAGAGAGGACCTTGTCTTGGGCCGGGGCGTGCCCTGGGGTTTTATCTGTGT 52645208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1858 CCCTGGCGGCAGAGAGGACCTTGTCTTGGGCCGGGGCGTGCCCTGGGGTTTTATCTGTGT 1917

 52645209 CCTGCCCCGGTCCAGCTGCCACCGGAAGTGTCCAGCTCTCACTTGGGTCTTTGTTCGCTG 52645268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1918 CCTGCCCCGGTCCAGCTGCCACCGGAAGTGTCCAGCTCTCACTTGGGTCTTTGTTCGCTG 1977

 52645269 GAGCTTTATTGGAGCTGACATCAAGCTTCACTGATCCAAGGGATGAATCTGCGGCTTGGT 52645328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1978 GAGCTTTATTGGAGCTGACATCAAGCTTCACTGATCCAAGGGATGAATCTGCGGCTTGGT 2037

 52645329 CTCCGGTACGTCCTGGTACAGGCCGAGAGAGCATCAAGAAAAAACGAGATTTAGCAGCTG 52645388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2038 CTCCGGTACGTCCTGGTACAGGCCGAGAGAGCATCAAGAAAAAACGAGATTTAGCAGCTG 2097

 52645389 GTGCCTCGGGTTTGGCCTCTTTCCCAAGATTCTTTCCGTTGGCATCCGCAACAGCACTTA 52645448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2098 GTGCCTCGGGTTTGGCCTCTTTCCCAAGATTCTTTCCGTTGGCATCCGCAACAGCACTTA 2157

 52645449 TCTCCGTTGTCTCGGGGGAAGAAGTGGCCACATTATCCGTCTTGACACTTATTCCCAAGT 52645508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2158 TCTCCGTTGTCTCGGGGGAAGAAGTGGCCACATTATCCGTCTTGACACTTATTCCCAAGT 2217

 52645509 CGACTGTAAACACAAACATAAACAGTGGTTATTCAGCCAAGCCGGGAAATTCAGGCACTA 52645568
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2218 CGACTGTAAACACAAACATAAACAGCGGTTATTCAGCCAAGCCGGGAAATTCAGGCACTA 2277

 52645569 ATAATGGACTCCAGACATTTTTTATACAAAAGCCATACTGCATACTGGAACTGTGTTGTT 52645628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2278 ATAATGGACTCCAGACATTTTTTATACAAAAGCCATACTGCATACTGGAACTGTGTTGTT 2337

 52645629 CTCTGGTCATTCTGAAAGGCAGAAGTTAGCTCTCTACATCTCCTTGGACCCTGCTTTTCT 52645688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2338 CTCTGGTCATTCTGAAAGGCAGAAGTTAGCTCTCTACATCTCCTTGGACCCTGCTTTTCT 2397

 52645689 TGGGAGAGGAGAAGGCAAGGTTGGTGAGGAGGGAAAGCTACTTAATGGAAAGTCACTAGC 52645748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2398 TGGGAGAGGAGAAGGCAAGGTTGGTGAGGAGGGAAAGCTACTTAATGGAAAGTCACTAGC 2457

 52645749 TGCCAGGTGTGGAATGAGTGATATTCAATGTTAATTAATCTTCTTTTATCTGTGTAAGAA 52645808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2458 TGCCAGGTGTGGAATGAGTGATATTCAATGTTAATTAATCTTCTTTTATCTGTGTAAGAA 2517

 52645809 CTCCGTGAGCAGCATATTGTCATGATGTCAACTGGGAGGCAGTACAGCAGTTAGGAGCTT 52645868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2518 CTCCGTGAGCAGCATATTGTCATGATGTCAACTGGGAGGCAGTACAGCAGTTAGGAGCTT 2577

 52645869 GGGTTCTGGAGCTAGAACAAGGTTTCTCAACCTCAGCACTACTCACATTTGAAGCCAGAT 52645928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2578 GGGTTCTGGAGCTAGAACAAGGTTTCTCAACCTCAGCACTACTCACATTTGAAGCCAGAT 2637

 52645929 TATTCTTTGTTAGGGAGGCTCATCCCGTGCCTCATAGGCTGATTAGCAGCATCCTGGCCT 52645988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2638 TATTCTTTGTTAGGGAGGCTCATCCCGTGCCTCATAGGCTGATTAGCAGCATCCTGGCCT 2697

 52645989 CTGCCCACTAGACGCCGGTCACATTTCCCAGTCATGGCAACCAAAAATATCTCTAGGCAT 52646048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2698 CTGCCCACTAGACGCCGGTCACATTTCCCAGTCATGGCAACCAAAAATATCTCTAGGCAT 2757

 52646049 TGCTAAATGTCCCCTGGAGGACAAAATCTCTTACGTTTGAGAGGCACTGAGCTGAAATGT 52646108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2758 TGCTAAATGTCCCCTGGAGGACAAAATCTCTTACGTTTGAGAGGCACTGAGCTGAAATGT 2817

 52646109 CTTTTTGAATCCAGATTATCTAATTTTCTGTGCCTCAACTTTCTGGTAAAAGGAGACAGA 52646168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2818 CTTTTTGAATCCAGATTATCTAATTTTCTGTGCCTCAACTTTCTGGTAAAAGGAGACAGA 2877

 52646169 TAATAAATCTCGTAATTTTGTTAGGAAGATTACATGAGTTAATAGTTTTAAAGCAAGTAC 52646228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2878 TAATAAATCTCGTAATTTTGTTAGGAAGATTACATGAGTTAATAGTTTTAAAGCAAGTAC 2937

 52646229 AATAGCACCTGGAATATATTAAGTGCTTAATAAATATCACAAACATTAGTTATCATTATT 52646288
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2938 AATAGCGCCTGGAATATATTAAGTGCTTAATAAATATCACAAACATTAGTTATCATTATT 2997

 52646289 CATGAGTGAGAAAACTGACAGTCAGAGAGGTCAGTACACCCTCCCCTGGCTGCCCAGTAA 52646348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2998 CATGAGTGAGAAAACTGACAGTCAGAGAGGTCAGTACACCCTCCCCTGGCTGCCCAGTAA 3057

 52646349 GCTAGTAAGCAGCAGAGTCTGGCTTCAGGCAGAAATCTGACTTCTAAGTTCATGCGCTCT 52646408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3058 GCTAGTAAGCAGCAGAGTCTGGCTTCAGGCAGAAATCTGACTTCTAAGTTCATGCGCTCT 3117

 52646409 CTGTCTTACCAGGGACTTGTATTAGCATAGACTGTTAAGAATATGGGAAGATTTTTAAAA 52646468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3118 CTGTCTTACCAGGGACTTGTATTAGCATAGACTGTTAAGAATATGGGAAGATTTTTAAAA 3177

 52646469 TACAGTACTCAGAAAATTTCTCTTTGAAAGGCTGGAAGAGCAGATATCCACACAAGAAGG 52646528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3178 TACAGTACTCAGAAAATTTCTCTTTGAAAGGCTGGAAGAGCAGATATCCACACAAGAAGG 3237

 52646529 CAAATTAGACCTCAGGCCAGTGTGGAATTAAAGGTGTAGGGTTATCTGGTCAAGACTGTG 52646588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3238 CAAATTAGACCTCAGGCCAGTGTGGAATTAAAGGTGTAGGGTTATCTGGTCAAGACTGTG 3297

 52646589 TGTGTGGATACAGGCTCCAACCCCTCCAGGCAAGGGCACTGTTTCCAACATCCACCCTTT 52646648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     3298 TGTGTGGATACAGGCTCCAACCCCTCCAGGCAAGGGCAATGTTTCCAACATCCACCCTTT 3357

 52646649 CTCCTTTGACCTCTACCTTGACCTAAATTAACTATAAAAGGTCCTTCTTTTCTAGGACCC 52646708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3358 CTCCTTTGACCTCTACCTTGACCTAAATTAACTATAAAAGGTCCTTCTTTTCTAGGACCC 3417

 52646709 TACTATAAATCAGTGAAATATTCAGGAAAAAAAGAACACCAAGAATGTTGGGATCCCAGT 52646768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3418 TACTATAAATCAGTGAAATATTCAGGAAAAAAAGAACACCAAGAATGTTGGGATCCCAGT 3477

 52646769 TAAAGATCAAGATTCTCTACTGATAAGCTGTGTGATATGGAGTAAATCACTAAAGATCTT 52646828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3478 TAAAGATCAAGATTCTCTACTGATAAGCTGTGTGATATGGAGTAAATCACTAAAGATCTT 3537

 52646829 TGAATCTCTTCATTTGTAAAATGGGAATATTGGTAGTCCTACTGCAGGGTTGTTGTAATG 52646888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3538 TGAATCTCTTCATTTGTAAAATGGGAATATTGGTAGTCCTACTGCAGGGTTGTTGTAATG 3597

 52646889 CTTAAAGAAGAAAAGTCATGCAAAGGATCTGGCACAACGCCTTTTCCATAATAAGTGCTT 52646948
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     3598 CTTAAAGAAGAAAAGTCATGCAAAGGATCTGGCACAATGCCTTTTCCATAATAAGTGCTT 3657

 52646949 AGTAATTGACAGATACTGTGATAACTTTTCAGGTTTCTCTCATGCCTTTGACAACATTGC 52647008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3658 AGTAATTGACAGATACTGTGATAACTTTTCAGGTTTCTCTCATGCCTTTGACAACATTGC 3717

 52647009 ATTTTGCTTGCTCTATCTGTAGTCAGACACTTCTTAATATCTGTTTGCAGGAAGAC 52647064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3718 ATTTTGCTTGCTCTATCTGTAGTCAGACACTTCTTAATATCTGTTTGCAGGAAGAC 3773

EXCISED REGION

 52658003 AGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTG 52658062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3774 AGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTG 3833

 52658063 GCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTAT 52658122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3834 GCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTAT 3893

 52658123 AAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGG 52658182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3894 AAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGG 3953

 52658183 GAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTG 52658242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3954 GAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTG 4013

 52658243 AAACACTGTCTCTGCTAAAAAACAAAACAAAACAAAACACCAAAAAATAGCTGGGCGTAG 52658302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4014 AAACACTGTCTCTGCTAAAAAACAAAACAAAACAAAACACCAAAAAATAGCTGGGCGTAG 4073

 52658303 TGGCGGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTTGGGAGGCGGTGGCAGGAGAATCATTTGAACCT 52658362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4074 TGGCGGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTTGGGAGGCGGTGGCAGGAGAATCATTTGAACCT 4133

 52658363 GGGAGGCAGAGGT 52658375
          |||||||||||||
     4134 GGGAGGCAGAGGT 4146

Alignment time is 4.66293 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [52637064,52668002] =>     30939 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    5586] =>      5586 nucs 'mol-32-288a-046467_5586'

Score:        5447
Aligned:      5589        nucs
Identic:      5572 (100%) nucs =>      5255 (100%)       317 (100%)
Gaps:            7 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [52641797,52647064] EXCISED REGION [52658003,52658319]
 second seq =>  [       1,    5269] EXCISED REGION [    5270,    5586]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>     10938 nucs [52647065,52658002]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         6 nucs [52647065,52647070] to [52658003,52658008]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [52647065,52647067] to [52658000,52658002]
 second seq =>         0 nucs

 52641797 ATGTGATTTTGTGTGTGTGTGTGTTGAATCTTTTAAATGCATATCTTACAGCTCTGGTTC 52641856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATGTGATTTTGTGTGTGTGTGTGTTGAATCTTTTAAATGCATATCTTACAGCTCTGGTTC 60

 52641857 AGTTGTTGTGGGGAGAGGAAAAAAACCTCATCCCTGCCAACACATTGGTTTGTATGAATC 52641916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGTTGTTGTGGGGAGAGGAAAAAAACCTCATCCCTGCCAACACATTGGTTTGTATGAATC 120

 52641917 ACAGCTCAGTGAAACCTTTCAGGCATATAATTTATCTTTTCTTTGGCCTATGTAGTAAAC 52641976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACAGCTCAGTGAAACCTTTCAGGCATATAATTTATCTTTTCTTTGGCCTATGTAGTAAAC 180

 52641977 GCTTCATTTGTTCATGAATTCTTGCCTTGTTTTAATTATGCTTTGCCCTGAATGTAGTTT 52642036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCTTCATTTGTTCATGAATTCTTGCCTTGTTTTAATTATGCTTTGCCCTGAATGTAGTTT 240

 52642037 TATAAGGCACAAAAATAAGATTGTCGTTCTGAAAACACAGAAGATTTGTATGTTTCCCCC 52642096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TATAAGGCACAAAAATAAGATTGTCGTTCTGAAAACACAGAAGATTTGTATGTTTCCCCC 300

 52642097 AGGATGAAATGGTGGCATCTTTCTCCCAATTCACAGCTCTGTGGGCTTGTGGCTGGAATT 52642156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGGATGAAATGGTGGCATCTTTCTCCCAATTCACAGCTCTGTGGGCTTGTGGCTGGAATT 360

 52642157 CCAATCCAGCAGGGAGCAAGCCATAAAAATGGGGGGAAGGGCTGCTGGAGGGAGGCAGTA 52642216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CCAATCCAGCAGGGAGCAAGCCATAAAAATGGGGGGAAGGGCTGCTGGAGGGAGGCAGTA 420

 52642217 GATGCGGCTGAGCCCAAGGCATAATTCACCCTAAGAATTCTGAATCAATACACTGACATC 52642276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GATGCGGCTGAGCCCAAGGCATAATTCACCCTAAGAATTCTGAATCAATACACTGACATC 480

 52642277 CAGCCATGTACAATGTGGTACTCCCACCAAGAAAGCCACTGATTGAGAAGTTTTATTCAT 52642336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CAGCCATGTACAATGTGGTACTCCCACCAAGAAAGCCACTGATTGAGAAGTTTTATTCAT 540

 52642337 GTTACTTTCTGAGGGTTGGATTGTCCCATTACATTTATAGAACAATTGCTTTTTTCCCCC 52642396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GTTACTTTCTGAGGGTTGGATTGTCCCATTACATTTATAGAACAATTGCTTTTTTCCCCC 600

 52642397 TAAATACAGAACTATGCAGCCGGGAGTCAGAAAAGAAACCTTGACAATCAGAAGGCTGTT 52642456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TAAATACAGAACTATGCAGCCGGGAGTCAGAAAAGAAACCTTGACAATCAGAAGGCTGTT 660

 52642457 TTGTTGTTGTTGTTAAAAACCTTTGCAGGCATATGCATCTGAATATCCATAAGTTCACAG 52642516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTGTTGTTGTTGTTAAAAACCTTTGCAGGCATATGCATCTGAATATCCATAAGTTCACAG 720

 52642517 GCTGAGGGAGAAATGGCTATTTCATAACTTTTCTGTGTTTCTCATGTACATAGTACAAAG 52642576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GCTGAGGGAGAAATGGCTATTTCATAACTTTTCTGTGTTTCTCATGTACATAGTACAAAG 780

 52642577 TGGGCACTCAGTATTTCAAATTTCAATATCACTGAAAAAAATGGAAATTTGTCATGTAAC 52642636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGGGCACTCAGTATTTCAAATTTCAATATCACTGAAAAAAATGGAAATTTGTCATGTAAC 840

 52642637 AAAATCAGATGCAGACTTCACTGGTGAATCTGAGGGAGTGAATTCACTTATTCAGAAAGG 52642696
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAAATCAGATGCAGACTTCGCTGGTGAATCTGAGGGAGTGAATTCACTTATTCAGAAAGG 900

 52642697 AAGACAGTTACAATTCTTGGGTCTTCTGAGAGATCATTATAACTTGAAAATATTACACAA 52642756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AAGACAGTTACAATTCTTGGGTCTTCTGAGAGATCATTATAACTTGAAAATATTACACAA 960

 52642757 GGGCTTTGCTATATTAGATACCTGCCATGTTCCTAACACAAGCTCCCATTTTCTGACTCA 52642816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
      961 GGGCTTTGCTATATTAGATACCTGCCATGTTCCTAATACAAGCTCCCATTTTCTGACTCA 1020

 52642817 AATCTCATTTTGGAACACATTCCACTCAAATTGAGGTTCTACCCCTAAGAGTTCTTTTTC 52642876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AATCTCATTTTGGAACACATTCCACTCAAATTGAGGTTCTACCCCTAAGAGTTCTTTTTC 1080

 52642877 AATAAAGAAAGCTGAGTTAATAAATCACAACTCCAAAACTTTTCCTCACTTTTCTTAGAC 52642936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AATAAAGAAAGCTGAGTTAATAAATCACAACTCCAAAACTTTTCCTCACTTTTCTTAGAC 1140

 52642937 TAGAAATAGATTGAGTGTGTCGAGGTTTTATGGCTGAGTACATTGGAGGGCTGGCTATTC 52642996
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TAGAAATAGATTGAATGTGTCGAGGTTTTATGGCTGAGTACATTGGAGGGCTGGCTATTC 1200

 52642997 TATGCTGAACTGGTTTACTTGATTAAGATGGGGATTTGGATGAGTCACCGGACACCTGTC 52643056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     1201 TATGCTGAACTGGTTTACTTGATTAAGATGGGGATTTGGATGAGTCACTGGACACCTGTC 1260

 52643057 CAAAGATGAGTAAAACACATTCCTTCATTGTCTTCCCATAAATAACTCAATCTTCTCCTA 52643116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CAAAGATGAGTAAAACACATTCCTTCATTGTCTTCCCATAAATAACTCAATCTTCTCCTA 1320

 52643117 ACTGAGCCAATGGATAGGCTTTGGATGCCCAAGCAAAACAAACACATGACTGTTAAAAAA 52643176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     1321 ACTGAGCCAATGGATAGGCTTTGGATGCCCAAGCAAAAGAAACACATGACTGTTAAAAAA 1380

 52643177 TCACAACCTCAAAATGGCCTTAGAAGCCTATGACCAATAATGAGAATGGTTTCTCCACTC 52643236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TCACAACCTCAAAATGGCCTTAGAAGCCTATGACCAATAATGAGAATGGTTTCTCCACTC 1440

 52643237 AGGCGCAAGTAGTAAACAGTTTCTCCCATATGCAGGAATATTGACGACTAGTTTACCGCC 52643296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AGGCGCAAGTAGTAAACAGTTTCTCCCATATGCAGGAATATTGACGACTAGTTTACCGCC 1500

 52643297 TCTGGGCACGTAACTTTCAGGTCCTGGTTCATGCATTTGCTGGAATGTTCCCTGGGCCAT 52643356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TCTGGGCACGTAACTTTCAGGTCCTGGTTCATGCATTTGCTGGAATGTTCCCTGGGCCAT 1560

 52643357 GGAGCCCAGTTCTCCTGGCATCTGGCATCTCCCCCACACTCTGCTCCCCCAGCACAGCAC 52643416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GGAGCCCAGTTCTCCTGGCATCTGGCATCTCCCCCACACTCTGCTCCCCCAGCACAGCAC 1620

 52643417 TTGGCATCTTGCATTGCAATTGCAGGTTTATTTATTCACTTCTCTCACTGGACAGCAAAC 52643476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTGGCATCTTGCATTGCAATTGCAGGTTTATTTATTCACTTCTCTCACTGGACAGCAAAC 1680

 52643477 TCCACCAGGGCCGAGACTCTGTGTCTCGCCCTTCACTGTGGTCCCTGTGCCTCACCTGTT 52643536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TCCACCAGGGCCGAGACTCTGTGTCTCGCCCTTCACTGTGGTCCCTGTGCCTCACCTGTT 1740

 52643537 CCTAGTACAGTGTCACACTCAGTAAAGAGCAGATGCCTGG-TGCATTTGGAGACTTATTT 52643595
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
     1741 CCTAGTACAGTGTCACACTCAGTAAAGAGCAGATGCCTGGATGCATTTGGAGACTTATTT 1800

 52643596 TAAATTATACGGAAAGTTATTCAACCGGCTTCTTGAACTGGTGAATTTTGGAAAGTGGGT 52643655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TAAATTATACGGAAAGTTATTCAACCGGCTTCTTGAACTGGTGAATTTTGGAAAGTGGGT 1860

 52643656 GTTTGAAGGGAAAATGTTTAAACTCTGAAAGAAATGTTGGAAATAAGCTCTTTGAATCAA 52643715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GTTTGAAGGGAAAATGTTTAAACTCTGAAAGAAATGTTGGAAATAAGCTCTTTGAATCAA 1920

 52643716 AATGTATAGAAAACACAAGAATGCTGACAGTAAGAGCCTAAAACACATGATGACTATTAT 52643775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AATGTATAGAAAACACAAGAATGCTGACAGTAAGAGCCTAAAACACATGATGACTATTAT 1980

 52643776 CTTTTCCCAATTTTAACTCTCCAGAGTGTTCAGCGGTGCCCAGCCTTCATAATGTAATTC 52643835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CTTTTCCCAATTTTAACTCTCCAGAGTGTTCAGCGGTGCCCAGCCTTCATAATGTAATTC 2040

 52643836 TTCGTAGCACCCTGGATGCATTAAAACCATAGATTAACGTGATACTTATTTTCATTAAGG 52643895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TTCGTAGCACCCTGGATGCATTAAAACCATAGATTAACGTGATACTTATTTTCATTAAGG 2100

 52643896 AAAATAATTTACGTACAGTGCTCAGAGTAGAGCCTGGCACATTGAACATTTTCAATAAAT 52643955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AAAATAATTTACGTACAGTGCTCAGAGTAGAGCCTGGCACATTGAACATTTTCAATAAAT 2160

 52643956 GACAGCAAGTGTAATTATTAGCACTTCGGAAGTGCAAAGTTGCATTGTATTAAGACAAAT 52644015
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GACAGCAAGTGTAATTATTAGCACTTTGGAAGTGCAAAGTTGCATTGTATTAAGACAAAT 2220

 52644016 ATATTTGGAGCTCATCCAATTTTTTCCTGGCTCTGAAGTCTGCTAGTGGCACTTAACTTT 52644075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ATATTTGGAGCTCATCCAATTTTTTCCTGGCTCTGAAGTCTGCTAGTGGCACTTAACTTT 2280

 52644076 ATTCCCAAGTTTTGAAAAATATTGTTATTTAAAAAGTCTGTTAACCAAGGAAATGCATGC 52644135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 ATTCCCAAGTTTTGAAAAATATTGTTATTTAAAAAGTCTGTTAACCAAGGAAATGCATGC 2340

 52644136 CCTAAACCTATAATGTATCAAGTTTTACTTCCTTCTTCTTTTAAGGAGTTCTTTTCCTGC 52644195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CCTAAACCTATAATGTATCAAGTTTTACTTCCTTCTTCTTTTAAGGAGTTCTTTTCCTGC 2400

 52644196 CTTGAATACAAACAGGCTCTCTCAAGGTTAAAAGCAAATGCTCTTTTTAGTGTCAAAAAG 52644255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CTTGAATACAAACAGGCTCTCTCAAGGTTAAAAGCAAATGCTCTTTTTAGTGTCAAAAAG 2460

 52644256 AGCTTGCCTTTCTTCGCTCAGGAAAAAAAGCAACTGATTCCAGGATACCTTCTTTGAAAA 52644315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AGCTTGCCTTTCTTCGCTCAGGAAAAAAAGCAACTGATTCCAGGATACCTTCTTTGAAAA 2520

 52644316 CCAACACAAAAAAACCCCCCAAAAAACAAAAAAAAAACCCAAAACCCCTAGTTTTTACAA 52644375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CCAACACAAAAAAACCCCCCAAAAAACAAAAAAAAAACCCAAAACCCCTAGTTTTTACAA 2580

 52644376 AGGTTTATTACTCCTACTTGTTGGAAAAGAATTACTACATAAAAGAGTCTGCCCAGAGCT 52644435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AGGTTTATTACTCCTACTTGTTGGAAAAGAATTACTACATAAAAGAGTCTGCCCAGAGCT 2640

 52644436 GTAAAATCTCCTTATTCAAACACACACCTTAGAGCAAAAGATGGTTAAATATCAATTCAG 52644495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GTAAAATCTCCTTATTCAAACACACACCTTAGAGCAAAAGATGGTTAAATATCAATTCAG 2700

 52644496 GCTATTAACAGTAAGGGAC---GAAATGTGTTCCAACAAAACTCTGCATGTCAACAAACT 52644552
          ||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GCTATTAACAGTAAGG---AATGAAATGTGTTCCAACAAAACTCTGCATGTCAACAAACT 2757

 52644553 ACAGAGACTAGGTAACATCTTTTAGGAATCATTTTTATTCCACTAATGCCTTTTCCTCCA 52644612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2758 ACAGAGACTAGGTAACATCTTTTAGGAATCATTTTTATTCCACTAATGCCTTTTCCTCCA 2817

 52644613 GAATCCACTGATCGTAAACGCAACCTGTCTACTTCCGCCTTTGAAAAATGGATGGACAAA 52644672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2818 GAATCCACTGATCGTAAACGCAACCTGTCTACTTCCGCCTTTGAAAAATGGATGGACAAA 2877

 52644673 TTCATCTGCATGTAACTCACCTCCTCTTTTCTTTTACATAAAACAGATGCCACAGCTGTT 52644732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2878 TTCATCTGCATGTAACTCACCTCCTCTTTTCTTTTACATAAAACAGATGCCACAGCTGTT 2937

 52644733 ATTGTTCTTCACACAGAAGTTTCTACCCAGAGAAACATCAGGATGACACTCTGCTGCAAT 52644792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2938 ATTGTTCTTCACACAGAAGTTTCTACCCAGAGAAACATCAGGATGACACTCTGCTGCAAT 2997

 52644793 GTGCTATTTGTTCTAGAGGGGTCAACAGCTTGCCACCTTGCCTAGGCCCAGGGTGACTGC 52644852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2998 GTGCTATTTGTTCTAGAGGGGTCAACAGCTTGCCACCTTGCCTAGGCCCAGGGTGACTGC 3057

 52644853 ATATGTGCAGTGGTCTTATCCCATTAGCGCCCCCGAGCATGCATTCAGAACCAAGTGGAT 52644912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3058 ATATGTGCAGTGGTCTTATCCCATTAGCGCCCCCGAGCATGCATTCAGAACCAAGTGGAT 3117

 52644913 ACACCTTGGCACACTTACCTTCCCTGCAGGGACATCATCGGACTGCCCTGATAAGCCAGG 52644972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3118 ACACCTTGGCACACTTACCTTCCCTGCAGGGACATCATCGGACTGCCCTGATAAGCCAGG 3177

 52644973 AACCTCATCCACCTTGTCTTGATGCTCTGCCCTCTTGGCTTCCTGTTGGCTGTCACCTGG 52645032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3178 AACCTCATCCACCTTGTCTTGATGCTCTGCCCTCTTGGCTTCCTGTTGGCTGTCACCTGG 3237

 52645033 CACCTTTTCCTGTCCCTTGTCCAGCTTGAAGAATTTGTCAAAAAAGCTGGAGTCCTTGGG 52645092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3238 CACCTTTTCCTGTCCCTTGTCCAGCTTGAAGAATTTGTCAAAAAAGCTGGAGTCCTTGGG 3297

 52645093 CTTGGAGGGAGCTTCTCCTCCTGCTCCCCCTGTCTCAGGTGGGAGAAGCGTGGGATCCCT 52645152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3298 CTTGGAGGGAGCTTCTCCTCCTGCTCCCCCTGTCTCAGGTGGGAGAAGCGTGGGATCCCT 3357

 52645153 GGCGGCAGAGAGGACCTTGTCTTGGGCCGGGGCGTGCCCTGGGGTTTTATCTGTGTCCTG 52645212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3358 GGCGGCAGAGAGGACCTTGTCTTGGGCCGGGGCGTGCCCTGGGGTTTTATCTGTGTCCTG 3417

 52645213 CCCCGGTCCAGCTGCCACCGGAAGTGTCCAGCTCTCACTTGGGTCTTTGTTCGCTGGAGC 52645272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3418 CCCCGGTCCAGCTGCCACCGGAAGTGTCCAGCTCTCACTTGGGTCTTTGTTCGCTGGAGC 3477

 52645273 TTTATTGGAGCTGACATCAAGCTTCACTGATCCAAGGGATGAATCTGCGGCTTGGTCTCC 52645332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3478 TTTATTGGAGCTGACATCAAGCTTCACTGATCCAAGGGATGAATCTGCGGCTTGGTCTCC 3537

 52645333 GGTACGTCCTGGTACAGGCCGAGAGAGCATCAAGAAAAAACGAGATTTAGCAGCTGGTGC 52645392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3538 GGTACGTCCTGGTACAGGCCGAGAGAGCATCAAGAAAAAACGAGATTTAGCAGCTGGTGC 3597

 52645393 CTCGGGTTTGGCCTCTTTCCCAAGATTCTTTCCGTTGGCATCCGCAACAGCACTTATCTC 52645452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3598 CTCGGGTTTGGCCTCTTTCCCAAGATTCTTTCCGTTGGCATCCGCAACAGCACTTATCTC 3657

 52645453 CGTTGTCTCGGGGGAAGAAGTGGCCACATTATCCGTCTTGACACTTATTCCCAAGTCGAC 52645512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3658 CGTTGTCTCGGGGGAAGAAGTGGCCACATTATCCGTCTTGACACTTATTCCCAAGTCGAC 3717

 52645513 TGTAAACACAAACATAAACAGTGGTTATTCAGCCAAGCCGGGAAATTCAGGCACTAATAA 52645572
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3718 TGTAAACACAAACATAAACAGCGGTTATTCAGCCAAGCCGGGAAATTCAGGCACTAATAA 3777

 52645573 TGGACTCCAGACATTTTTTATACAAAAGCCATACTGCATACTGGAACTGTGTTGTTCTCT 52645632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3778 TGGACTCCAGACATTTTTTATACAAAAGCCATACTGCATACTGGAACTGTGTTGTTCTCT 3837

 52645633 GGTCATTCTGAAAGGCAGAAGTTAGCTCTCTACATCTCCTTGGACCCTGCTTTTCTTGGG 52645692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3838 GGTCATTCTGAAAGGCAGAAGTTAGCTCTCTACATCTCCTTGGACCCTGCTTTTCTTGGG 3897

 52645693 AGAGGAGAAGGCAAGGTTGGTGAGGAGGGAAAGCTACTTAATGGAAAGTCACTAGCTGCC 52645752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3898 AGAGGAGAAGGCAAGGTTGGTGAGGAGGGAAAGCTACTTAATGGAAAGTCACTAGCTGCC 3957

 52645753 AGGTGTGGAATGAGTGATATTCAATGTTAATTAATCTTCTTTTATCTGTGTAAGAACTCC 52645812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3958 AGGTGTGGAATGAGTGATATTCAATGTTAATTAATCTTCTTTTATCTGTGTAAGAACTCC 4017

 52645813 GTGAGCAGCATATTGTCATGATGTCAACTGGGAGGCAGTACAGCAGTTAGGAGCTTGGGT 52645872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4018 GTGAGCAGCATATTGTCATGATGTCAACTGGGAGGCAGTACAGCAGTTAGGAGCTTGGGT 4077

 52645873 TCTGGAGCTAGAACAAGGTTTCTCAACCTCAGCACTACTCACATTTGAAGCCAGATTATT 52645932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4078 TCTGGAGCTAGAACAAGGTTTCTCAACCTCAGCACTACTCACATTTGAAGCCAGATTATT 4137

 52645933 CTTTGTTAGGGAGGCTCATCCCGTGCCTCATAGGCTGATTAGCAGCATCCTGGCCTCTGC 52645992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4138 CTTTGTTAGGGAGGCTCATCCCGTGCCTCATAGGCTGATTAGCAGCATCCTGGCCTCTGC 4197

 52645993 CCACTAGACGCCGGTCACATTTCCCAGTCATGGCAACCAAAAATATCTCTAGGCATTGCT 52646052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4198 CCACTAGACGCCGGTCACATTTCCCAGTCATGGCAACCAAAAATATCTCTAGGCATTGCT 4257

 52646053 AAATGTCCCCTGGAGGACAAAATCTCTTACGTTTGAGAGGCACTGAGCTGAAATGTCTTT 52646112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4258 AAATGTCCCCTGGAGGACAAAATCTCTTACGTTTGAGAGGCACTGAGCTGAAATGTCTTT 4317

 52646113 TTGAATCCAGATTATCTAATTTTCTGTGCCTCAACTTTCTGGTAAAAGGAGACAGATAAT 52646172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4318 TTGAATCCAGATTATCTAATTTTCTGTGCCTCAACTTTCTGGTAAAAGGAGACAGATAAT 4377

 52646173 AAATCTCGTAATTTTGTTAGGAAGATTACATGAGTTAATAGTTTTAAAGCAAGTACAATA 52646232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4378 AAATCTCGTAATTTTGTTAGGAAGATTACATGAGTTAATAGTTTTAAAGCAAGTACAATA 4437

 52646233 GCACCTGGAATATATTAAGTGCTTAATAAATATCACAAACATTAGTTATCATTATTCATG 52646292
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4438 GCGCCTGGAATATATTAAGTGCTTAATAAATATCACAAACATTAGTTATCATTATTCATG 4497

 52646293 AGTGAGAAAACTGACAGTCAGAGAGGTCAGTACACCCTCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCTA 52646352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4498 AGTGAGAAAACTGACAGTCAGAGAGGTCAGTACACCCTCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCTA 4557

 52646353 GTAAGCAGCAGAGTCTGGCTTCAGGCAGAAATCTGACTTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGT 52646412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4558 GTAAGCAGCAGAGTCTGGCTTCAGGCAGAAATCTGACTTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGT 4617

 52646413 CTTACCAGGGACTTGTATTAGCATAGACTGTTAAGAATATGGGAAGATTTTTAAAATACA 52646472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4618 CTTACCAGGGACTTGTATTAGCATAGACTGTTAAGAATATGGGAAGATTTTTAAAATACA 4677

 52646473 GTACTCAGAAAATTTCTCTTTGAAAGGCTGGAAGAGCAGATATCCACACAAGAAGGCAAA 52646532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4678 GTACTCAGAAAATTTCTCTTTGAAAGGCTGGAAGAGCAGATATCCACACAAGAAGGCAAA 4737

 52646533 TTAGACCTCAGGCCAGTGTGGAATTAAAGGTGTAGGGTTATCTGGTCAAGACTGTGTGTG 52646592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4738 TTAGACCTCAGGCCAGTGTGGAATTAAAGGTGTAGGGTTATCTGGTCAAGACTGTGTGTG 4797

 52646593 TGGATACAGGCTCCAACCCCTCCAGGCAAGGGCACTGTTTCCAACATCCACCCTTTCTCC 52646652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     4798 TGGATACAGGCTCCAACCCCTCCAGGCAAGGGCAATGTTTCCAACATCCACCCTTTCTCC 4857

 52646653 TTTGACCTCTACCTTGACCTAAATTAACTATAAAAGGTCCTTCTTTTCTAGGACCCTACT 52646712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4858 TTTGACCTCTACCTTGACCTAAATTAACTATAAAAGGTCCTTCTTTTCTAGGACCCTACT 4917

 52646713 ATAAATCAGTGAAATATTCAGGAAAAAAAGAACACCAAGAATGTTGGGATCCCAGTTAAA 52646772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4918 ATAAATCAGTGAAATATTCAGGAAAAAAAGAACACCAAGAATGTTGGGATCCCAGTTAAA 4977

 52646773 GATCAAGATTCTCTACTGATAAGCTGTGTGATATGGAGTAAATCACTAAAGATCTTTGAA 52646832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4978 GATCAAGATTCTCTACTGATAAGCTGTGTGATATGGAGTAAATCACTAAAGATCTTTGAA 5037

 52646833 TCTCTTCATTTGTAAAATGGGAATATTGGTAGTCCTACTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTA 52646892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5038 TCTCTTCATTTGTAAAATGGGAATATTGGTAGTCCTACTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTA 5097

 52646893 AAGAAGAAAAGTCATGCAAAGGATCTGGCACAACGCCTTTTCCATAATAAGTGCTTAGTA 52646952
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     5098 AAGAAGAAAAGTCATGCAAAGGATCTGGCACAATGCCTTTTCCATAATAAGTGCTTAGTA 5157

 52646953 ATTGACAGATACTGTGATAACTTTTCAGGTTTCTCTCATGCCTTTGACAACATTGCATTT 52647012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5158 ATTGACAGATACTGTGATAACTTTTCAGGTTTCTCTCATGCCTTTGACAACATTGCATTT 5217

 52647013 TGCTTGCTCTATCTGTAGTCAGACACTTCTTAATATCTGTTTGCAGGAAGAC 52647064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5218 TGCTTGCTCTATCTGTAGTCAGACACTTCTTAATATCTGTTTGCAGGAAGAC 5269

EXCISED REGION

 52658003 AGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTG 52658062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5270 AGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTG 5329

 52658063 GCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTAT 52658122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5330 GCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTAT 5389

 52658123 AAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGG 52658182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5390 AAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGG 5449

 52658183 GAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTG 52658242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5450 GAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTG 5509

 52658243 AAACACTGTCTCTGCTAAAAAACAAAACAAAACAAAACACCAAAAAATAGCTGGGCGTAG 52658302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5510 AAACACTGTCTCTGCTAAAAAACAAAACAAAACAAAACACCAAAAAATAGCTGGGCGTAG 5569

 52658303 TGGCGGGCGCCTGTAAT 52658319
          |||||||||||||||||
     5570 TGGCGGGCGCCTGTAAT 5586

Alignment time is 6.1909 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [52637064,52668002] =>     30939 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    6372] =>      6372 nucs 'mol-32-2895-076348_6372'

Score:        6371
Aligned:      6371        nucs
Identic:      6371 (100%) nucs =>      2180 (100%)      4191 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [52651974,52654153] EXCISED REGION [52654155,52658345]
 second seq =>  [       1,    2180] EXCISED REGION [    2182,    6372]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [52654154,52654154]
 second seq =>         1 nucs [2181,2181]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         4 nucs [2181,2184] to [2182,2185]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 52651974 AGTCAACAAGCATATGAAAAAAAGCTCAATATTACTAATCATCAGAGAAATGCAAATCAA 52652033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGTCAACAAGCATATGAAAAAAAGCTCAATATTACTAATCATCAGAGAAATGCAAATCAA 60

 52652034 AAACCACAATGAGATACCATCTAATACCAGTCAGAATGATATTATTAAAAAGTCAAAAAA 52652093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAACCACAATGAGATACCATCTAATACCAGTCAGAATGATATTATTAAAAAGTCAAAAAA 120

 52652094 TAAGATGCTGGTGAGGTAGTGGAGAGAAAGGAATGCTTATACACTGTTGGTGGGAGTGTA 52652153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TAAGATGCTGGTGAGGTAGTGGAGAGAAAGGAATGCTTATACACTGTTGGTGGGAGTGTA 180

 52652154 AATTAGTTCAACCATTGTGGAAGACAGTGTGGCAATTCCTCAAAGACCTAAAGATAGAAA 52652213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AATTAGTTCAACCATTGTGGAAGACAGTGTGGCAATTCCTCAAAGACCTAAAGATAGAAA 240

 52652214 TACCATTCCACCCAGCAATTCCATTACTGGGTACATACCCGAAAAATAGAAATCATTCTT 52652273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TACCATTCCACCCAGCAATTCCATTACTGGGTACATACCCGAAAAATAGAAATCATTCTT 300

 52652274 TTATAAAGATACATGCATGTGTATGTTCATTGCAGCACTATTCACAATAGCAAAAACATG 52652333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTATAAAGATACATGCATGTGTATGTTCATTGCAGCACTATTCACAATAGCAAAAACATG 360

 52652334 GAATCAACCTAAATACCCACCAATGATAGCCTGGATAAAGAAAATGTGGTACATATACAC 52652393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GAATCAACCTAAATACCCACCAATGATAGCCTGGATAAAGAAAATGTGGTACATATACAC 420

 52652394 CATGGAATACTATGCAGCCATAAAAAGAACGAGATCATGTCCTTTGCAGGAACATGAATG 52652453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CATGGAATACTATGCAGCCATAAAAAGAACGAGATCATGTCCTTTGCAGGAACATGAATG 480

 52652454 GAGCTGAAGGCCATTATCCTTAGCAAAGTATTGCCGAAAAAGAAAATCAAATACTACATG 52652513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GAGCTGAAGGCCATTATCCTTAGCAAAGTATTGCCGAAAAAGAAAATCAAATACTACATG 540

 52652514 TTCTCACTTATAAATGGGAGCTAAATGATGAGAACACATGGCCACACAGGGGGAACAACA 52652573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTCTCACTTATAAATGGGAGCTAAATGATGAGAACACATGGCCACACAGGGGGAACAACA 600

 52652574 CACACTGGGGCCTATTGGAGGGTGGAAGGTGGGAGGAGGGAGAGGATCAGGAAAAATAAT 52652633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CACACTGGGGCCTATTGGAGGGTGGAAGGTGGGAGGAGGGAGAGGATCAGGAAAAATAAT 660

 52652634 TAATAGATATTATTTCATCACCCAGGTATTAATAATACCTATTTCATCACCCAGGCTTGA 52652693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TAATAGATATTATTTCATCACCCAGGTATTAATAATACCTATTTCATCACCCAGGCTTGA 720

 52652694 TACCTGGGTGACAACAAACCCCCATGACACAAATTTACCTATATAACAAACCTGCCCGTG 52652753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TACCTGGGTGACAACAAACCCCCATGACACAAATTTACCTATATAACAAACCTGCCCGTG 780

 52652754 TACCCCTGAACTTAAAATAAAAGTTAAAAAAATGCAAAAAGATGACATACCAAAGAGATG 52652813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TACCCCTGAACTTAAAATAAAAGTTAAAAAAATGCAAAAAGATGACATACCAAAGAGATG 840

 52652814 TTACTTTTCATTTTTAAAAAAGTCAAAGAATTTAAGGAAAATTAAAAAGAAATCAAGAAT 52652873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTACTTTTCATTTTTAAAAAAGTCAAAGAATTTAAGGAAAATTAAAAAGAAATCAAGAAT 900

 52652874 GACAGTAGCAGCTCCAAAATATTTAGAAGGTAGAGTTGAAAATTTTGATTTTCTTAGTGC 52652933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GACAGTAGCAGCTCCAAAATATTTAGAAGGTAGAGTTGAAAATTTTGATTTTCTTAGTGC 960

 52652934 AGAAAAATATTTTGTGCTGCATGTTTTTTTAAAGAAAGTCATTTTATCTGTATATGTGAT 52652993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AGAAAAATATTTTGTGCTGCATGTTTTTTTAAAGAAAGTCATTTTATCTGTATATGTGAT 1020

 52652994 TAAAACCTTATTTCCAGTGCCATCTTCGTGTAATTGTTAAGAACTTGGATTGTGGATCAC 52653053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TAAAACCTTATTTCCAGTGCCATCTTCGTGTAATTGTTAAGAACTTGGATTGTGGATCAC 1080

 52653054 AGGAACCTGGCTTTGACTCTTAACTGCTCACTCTTTAAATGGATAACCCGGGTAAGTTAT 52653113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AGGAACCTGGCTTTGACTCTTAACTGCTCACTCTTTAAATGGATAACCCGGGTAAGTTAT 1140

 52653114 TTCCTGTCTCTGTGCCTCAGTTTTCTTACAAATTGGCATGAAAATAACAGTGCCTCCTTC 52653173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTCCTGTCTCTGTGCCTCAGTTTTCTTACAAATTGGCATGAAAATAACAGTGCCTCCTTC 1200

 52653174 AGAGGGTAATTCTGAGGATTAAATGAAATATTGCCCATACAGTGCTTACCACAGGCTGGT 52653233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AGAGGGTAATTCTGAGGATTAAATGAAATATTGCCCATACAGTGCTTACCACAGGCTGGT 1260

 52653234 AGATGATTGGTATTCGGTAAACAGTAGTTATTTTTGTTATACTAATATGTTATTAATATA 52653293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AGATGATTGGTATTCGGTAAACAGTAGTTATTTTTGTTATACTAATATGTTATTAATATA 1320

 52653294 ATTACCATTTTGTATTTTTAAATGTAAGCCATAAGGAAAGGAATTATTCCAATAGTTTAA 52653353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ATTACCATTTTGTATTTTTAAATGTAAGCCATAAGGAAAGGAATTATTCCAATAGTTTAA 1380

 52653354 TTTACAAACTTGAGTTTTCTAGAAAGACTTTTAAAAACAGTAGTGATATAAATCAATTTA 52653413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTTACAAACTTGAGTTTTCTAGAAAGACTTTTAAAAACAGTAGTGATATAAATCAATTTA 1440

 52653414 TCTTAAGAAACATAAGTATCTGGGCCAGGCAAGTTTCAGAAATGTTTATCATTTTCAAAG 52653473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TCTTAAGAAACATAAGTATCTGGGCCAGGCAAGTTTCAGAAATGTTTATCATTTTCAAAG 1500

 52653474 TACCAAATATTCTCGTCAAAACAAGCTGCTTCATCAGAGTTCTAATTATATATTTAAACA 52653533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TACCAAATATTCTCGTCAAAACAAGCTGCTTCATCAGAGTTCTAATTATATATTTAAACA 1560

 52653534 TACATGCACACACACACGTTTGTATTACAATATTCAAAACTTCTGAGGAAGAATTATCTT 52653593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TACATGCACACACACACGTTTGTATTACAATATTCAAAACTTCTGAGGAAGAATTATCTT 1620

 52653594 TTTTTTTTCATGTGCCAAAGCTAAAACTTTCACTTGCTACAGCTGTGTATTAGTCTATTT 52653653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTTTTTTTCATGTGCCAAAGCTAAAACTTTCACTTGCTACAGCTGTGTATTAGTCTATTT 1680

 52653654 CCATACTGCTATAAAGAGCTGCCCAAGACTGGGTGATTTATAAAGGAAAGAGGTTTAATT 52653713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CCATACTGCTATAAAGAGCTGCCCAAGACTGGGTGATTTATAAAGGAAAGAGGTTTAATT 1740

 52653714 GACTCACAGTTCAGCATGGCAGGGAAGGCCTCAGGAAACTTACAATCATGGTGGAAGTCA 52653773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GACTCACAGTTCAGCATGGCAGGGAAGGCCTCAGGAAACTTACAATCATGGTGGAAGTCA 1800

 52653774 AAGGGGGAGCAAGGACCTTTCTTCACAAGGCAGCAGAAAGAAGTGCCAAATGAACAGGGA 52653833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AAGGGGGAGCAAGGACCTTTCTTCACAAGGCAGCAGAAAGAAGTGCCAAATGAACAGGGA 1860

 52653834 AGAGCTCCTTATGAAACCATCAGGTCTTGTGAGAACTCACTTACTTTTATGAGAACAGCA 52653893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AGAGCTCCTTATGAAACCATCAGGTCTTGTGAGAACTCACTTACTTTTATGAGAACAGCA 1920

 52653894 TGGAGGAAACTGTCCCCATGATCCAATCACCTCCACCTGGTCTCTCCCTTGACACGTGGG 52653953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TGGAGGAAACTGTCCCCATGATCCAATCACCTCCACCTGGTCTCTCCCTTGACACGTGGG 1980

 52653954 GATTATGGGGATTAAATTCCAGATGAGATTTGGGTGGGGACAAAAAGCCTAACGACATCA 52654013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GATTATGGGGATTAAATTCCAGATGAGATTTGGGTGGGGACAAAAAGCCTAACGACATCA 2040

 52654014 AGCTGTAAAAACAATAGCTAACATTCATTGACTGTTTCCCAGCATTAGGATAAATGTGTG 52654073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AGCTGTAAAAACAATAGCTAACATTCATTGACTGTTTCCCAGCATTAGGATAAATGTGTG 2100

 52654074 TAACAAGAGGCATTTTATTTATGTATGACATTTGTTTATTTATTATTTATTTATTTGGAT 52654133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TAACAAGAGGCATTTTATTTATGTATGACATTTGTTTATTTATTATTTATTTATTTGGAT 2160

 52654134 AAATGTCTATAACAAGAAAC 52654153
          ||||||||||||||||||||
     2161 AAATGTCTATAACAAGAAAC 2180

EXCISED REGION

 52654155 TTTTATTTAAGTATAACAGCAAATCTACAAGTTAGGTACTATCATCACTCCCATTTTACA 52654214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2182 TTTTATTTAAGTATAACAGCAAATCTACAAGTTAGGTACTATCATCACTCCCATTTTACA 2241

 52654215 GGTCGTGAAACTGAGGCTCTGAAAAGTCAAGTCAGTTTTCTAATGTTGTCCAGCTAATGA 52654274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2242 GGTCGTGAAACTGAGGCTCTGAAAAGTCAAGTCAGTTTTCTAATGTTGTCCAGCTAATGA 2301

 52654275 CTGGTAGATTTAGTATTTGAACCCACATTTGCCTGATTCCAAAGTTCAAACTCCCAACAA 52654334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2302 CTGGTAGATTTAGTATTTGAACCCACATTTGCCTGATTCCAAAGTTCAAACTCCCAACAA 2361

 52654335 CATGTGGTAACCAAAGCAGGAACAGAAGAGAAAGAAGAAATAGAAGGGAGGGAAGATGAA 52654394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2362 CATGTGGTAACCAAAGCAGGAACAGAAGAGAAAGAAGAAATAGAAGGGAGGGAAGATGAA 2421

 52654395 CAAAGTAGACAAAGTTTAGTTAATAGAATTAGTGGATACCCAAGAAAAAACTATGTACAA 52654454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2422 CAAAGTAGACAAAGTTTAGTTAATAGAATTAGTGGATACCCAAGAAAAAACTATGTACAA 2481

 52654455 GAGGGGGAAAAAAACCCTGTTTTCTCACATCTGGGAAACATTGATATCTATATATTTTTG 52654514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2482 GAGGGGGAAAAAAACCCTGTTTTCTCACATCTGGGAAACATTGATATCTATATATTTTTG 2541

 52654515 GTTTTAAATAAAAATTAGGTTATGTCATTCATTTGCATAAAACCATCCAAAGAAGGGCCT 52654574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2542 GTTTTAAATAAAAATTAGGTTATGTCATTCATTTGCATAAAACCATCCAAAGAAGGGCCT 2601

 52654575 CACAAAATTAAAACAAAATCCAAACTCTCTACTATGGGCCACACCCTCCAGAACTTCAGC 52654634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2602 CACAAAATTAAAACAAAATCCAAACTCTCTACTATGGGCCACACCCTCCAGAACTTCAGC 2661

 52654635 TCGTACTATGTTTTTCCTCACACCTCTCAACATACCAACATGTTTCCACCTGCAGCCCTC 52654694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2662 TCGTACTATGTTTTTCCTCACACCTCTCAACATACCAACATGTTTCCACCTGCAGCCCTC 2721

 52654695 ACCACTAGTTATTCTTTCAATCTGGAAATATTTTCGCTAAGATCTTCCTATGGTTACCTT 52654754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2722 ACCACTAGTTATTCTTTCAATCTGGAAATATTTTCGCTAAGATCTTCCTATGGTTACCTT 2781

 52654755 CTTATCATTCAAGACTTAGGTTATGTCAGGCCTTCCCTGACTCCTCCATCTGAAGTAACC 52654814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2782 CTTATCATTCAAGACTTAGGTTATGTCAGGCCTTCCCTGACTCCTCCATCTGAAGTAACC 2841

 52654815 CCTCCTGCTTACTCCTGTTTATTCTCTAGACTCCACAGAGGATTCATCACTCTCTGAAAT 52654874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2842 CCTCCTGCTTACTCCTGTTTATTCTCTAGACTCCACAGAGGATTCATCACTCTCTGAAAT 2901

 52654875 GATCCCATTAATTTCTTCTTCACTTGTTTCCTCTCCACGACCTGTAAGCCCCAAGTGGAC 52654934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2902 GATCCCATTAATTTCTTCTTCACTTGTTTCCTCTCCACGACCTGTAAGCCCCAAGTGGAC 2961

 52654935 CCGGACTTGGTCTGCTCTGCTTACAGCTGGATTCCAGTTCCCATAGTGCTAGACACTAGG 52654994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2962 CCGGACTTGGTCTGCTCTGCTTACAGCTGGATTCCAGTTCCCATAGTGCTAGACACTAGG 3021

 52654995 ATTAAGCCAGGAAACATGGGTGAAGCAGCAAGCACAGAGCTTGGGGCACAGCCTAGCAAA 52655054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3022 ATTAAGCCAGGAAACATGGGTGAAGCAGCAAGCACAGAGCTTGGGGCACAGCCTAGCAAA 3081

 52655055 CACTCCACAAAGGACCATGATTGTAACTGTAGTAGGGCACACCAATGAACAGGTTGGGAA 52655114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3082 CACTCCACAAAGGACCATGATTGTAACTGTAGTAGGGCACACCAATGAACAGGTTGGGAA 3141

 52655115 ACTGAGTCTCTGAGAAGAGACTAATGTTGTGCTGGATGAAATTTCTTTTTCTGACAATAC 52655174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3142 ACTGAGTCTCTGAGAAGAGACTAATGTTGTGCTGGATGAAATTTCTTTTTCTGACAATAC 3201

 52655175 ATTATCCAAATCCTCCAAGCTTTCAGTTTAAAGGGGAAAGCAGGAACTATCATTATAATT 52655234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3202 ATTATCCAAATCCTCCAAGCTTTCAGTTTAAAGGGGAAAGCAGGAACTATCATTATAATT 3261

 52655235 TTATTTACAAAGTGTCCATGTATGAACATTATTCACCGCCGAATCATCTCTTCCTATGCA 52655294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3262 TTATTTACAAAGTGTCCATGTATGAACATTATTCACCGCCGAATCATCTCTTCCTATGCA 3321

 52655295 AGCAACACCGTCCTATGCATCAATATCCTGATCTGTCAGGATTCAGGATAAAGTGGACAT 52655354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3322 AGCAACACCGTCCTATGCATCAATATCCTGATCTGTCAGGATTCAGGATAAAGTGGACAT 3381

 52655355 ATACACACTAATTGCAAAGGGAAATTGTACATCTTGCAAAAGATGCAGGGGTTTATAGAG 52655414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3382 ATACACACTAATTGCAAAGGGAAATTGTACATCTTGCAAAAGATGCAGGGGTTTATAGAG 3441

 52655415 TCTTGTAACATTGGTGAGCTGCTCAGATCACACACATGACCGTGGTTGGACAAGGATCTG 52655474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3442 TCTTGTAACATTGGTGAGCTGCTCAGATCACACACATGACCGTGGTTGGACAAGGATCTG 3501

 52655475 GCAAAGTTAACACAGATCACCGAAGAAGGAAAAGTGGACAACACAACACAGTAAGTTCTT 52655534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3502 GCAAAGTTAACACAGATCACCGAAGAAGGAAAAGTGGACAACACAACACAGTAAGTTCTT 3561

 52655535 CAAAAGAGTTATATTAGAATATCAAAAGATTATGTTAGGCCTTTGGGAAAACTCAAAACT 52655594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3562 CAAAAGAGTTATATTAGAATATCAAAAGATTATGTTAGGCCTTTGGGAAAACTCAAAACT 3621

 52655595 TTATGAAGACCTCAAAAAATTATGCAAAAATGACCCTTCAATGGTCATGCTGCAAGAGTC 52655654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3622 TTATGAAGACCTCAAAAAATTATGCAAAAATGACCCTTCAATGGTCATGCTGCAAGAGTC 3681

 52655655 AAATGACACTTCAAACAACTGCGGCTTTCTATGTTGTGCAAATGCATTTGTTGTTTTAAA 52655714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3682 AAATGACACTTCAAACAACTGCGGCTTTCTATGTTGTGCAAATGCATTTGTTGTTTTAAA 3741

 52655715 GGTCGTAAAGTCAGGGTACACGTGGCAGATACTTATGACTTGGAGGAAGACGTTAGATTA 52655774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3742 GGTCGTAAAGTCAGGGTACACGTGGCAGATACTTATGACTTGGAGGAAGACGTTAGATTA 3801

 52655775 GATTTGAAACTTTCACTGAATGATCGCATTTCATGCTTTTCATCTGTACATTAAAAAGCC 52655834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3802 GATTTGAAACTTTCACTGAATGATCGCATTTCATGCTTTTCATCTGTACATTAAAAAGCC 3861

 52655835 AGAATGTCTTTGCCAAGAAATTCTAGCATAAATAAAAGAAAAGGATGGGATTTTGGAACA 52655894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3862 AGAATGTCTTTGCCAAGAAATTCTAGCATAAATAAAAGAAAAGGATGGGATTTTGGAACA 3921

 52655895 TCATGGTAGAATTCTTGACTATCAGCTTTATACAACATGTCTGGACATTTAGTGATGGAA 52655954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3922 TCATGGTAGAATTCTTGACTATCAGCTTTATACAACATGTCTGGACATTTAGTGATGGAA 3981

 52655955 ATGCTGGATTCCAAAGGAATGTAGGCAAAGGTACTACTACCCCCATGCTCTTCAGAAAAC 52656014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3982 ATGCTGGATTCCAAAGGAATGTAGGCAAAGGTACTACTACCCCCATGCTCTTCAGAAAAC 4041

 52656015 ATCCTCTAAAAGCAACAGTGATGATCAGATACTGTGGGGCAAGACTGACAGTGACACTCA 52656074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4042 ATCCTCTAAAAGCAACAGTGATGATCAGATACTGTGGGGCAAGACTGACAGTGACACTCA 4101

 52656075 AGATTTCCACTCTTCTCTTTAATCATATATTTCCTGTCATTCATGTGCTACAAAACTCTG 52656134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4102 AGATTTCCACTCTTCTCTTTAATCATATATTTCCTGTCATTCATGTGCTACAAAACTCTG 4161

 52656135 GAATATGCAAAGCTCATTCAAATGCAAAACCAGCCTTTGCTCCAACATGAGCATATATTT 52656194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4162 GAATATGCAAAGCTCATTCAAATGCAAAACCAGCCTTTGCTCCAACATGAGCATATATTT 4221

 52656195 TCATTTAAAGACAAATCAGATGTTTCATTTGATTTTTTTTATAAATCTGATAATAATGTA 52656254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4222 TCATTTAAAGACAAATCAGATGTTTCATTTGATTTTTTTTATAAATCTGATAATAATGTA 4281

 52656255 CATTTAACCCGTGTTTACAACCAAAATAATTAATCTCTCTGAACCCTTTGTTTTTCCTGT 52656314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4282 CATTTAACCCGTGTTTACAACCAAAATAATTAATCTCTCTGAACCCTTTGTTTTTCCTGT 4341

 52656315 CTCTATCCTCCACCCTCATTGCCAGATAAATAACATCTGCAACCTGATGTGGCATATTGA 52656374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4342 CTCTATCCTCCACCCTCATTGCCAGATAAATAACATCTGCAACCTGATGTGGCATATTGA 4401

 52656375 ACTTTGTTTATACTCACACAAACACGTATAAGCATCCCAGATACACATATACAGGGACTG 52656434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4402 ACTTTGTTTATACTCACACAAACACGTATAAGCATCCCAGATACACATATACAGGGACTG 4461

 52656435 TATCTGTCCTTGTTGTTTTTATAGAAATTGGATCACATTAGACATATTTTCTGATGACTT 52656494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4462 TATCTGTCCTTGTTGTTTTTATAGAAATTGGATCACATTAGACATATTTTCTGATGACTT 4521

 52656495 TTGTACATTATAGTTGGTCTTCACAGTCAATAGCTCCAAAGCTATCTTATCTTCTAAAAT 52656554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4522 TTGTACATTATAGTTGGTCTTCACAGTCAATAGCTCCAAAGCTATCTTATCTTCTAAAAT 4581

 52656555 AGCTGCATAATATTCCTCAGTATGGATATACCAAAAGATATTTAAACCATTGCCTAATCA 52656614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4582 AGCTGCATAATATTCCTCAGTATGGATATACCAAAAGATATTTAAACCATTGCCTAATCA 4641

 52656615 ATGAATATCCTGGTAGTTTCCACATTGTTTTTTCCATTTCCACTATAGTGGAATAAACTT 52656674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4642 ATGAATATCCTGGTAGTTTCCACATTGTTTTTTCCATTTCCACTATAGTGGAATAAACTT 4701

 52656675 TCGTGTTCAAAAATCCTAAACTGGTGCTATATTTCTATAGAATAGAGGCACAGATGTAGA 52656734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4702 TCGTGTTCAAAAATCCTAAACTGGTGCTATATTTCTATAGAATAGAGGCACAGATGTAGA 4761

 52656735 AGTGTTACCCTCAAATCAATATGCATTTAGTTTTGAAAAACAGACACTGCCATATTATTT 52656794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4762 AGTGTTACCCTCAAATCAATATGCATTTAGTTTTGAAAAACAGACACTGCCATATTATTT 4821

 52656795 TCTTAAAAAGGCTCTACAGATTCACATTTCCAGCAGCAATGAGTGTCTCAAGCACCTTTT 52656854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4822 TCTTAAAAAGGCTCTACAGATTCACATTTCCAGCAGCAATGAGTGTCTCAAGCACCTTTT 4881

 52656855 AAGTGGTAAGCAGCTTACCAGGGGAGGTGGCCTATTATTCTATCAGTGGCTTCAGTTGTT 52656914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4882 AAGTGGTAAGCAGCTTACCAGGGGAGGTGGCCTATTATTCTATCAGTGGCTTCAGTTGTT 4941

 52656915 AGGACACCACGGGTCAGCTGTGGAGATACGGTTGTGGGGCAGGTTGAGTTCAGGACACAT 52656974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4942 AGGACACCACGGGTCAGCTGTGGAGATACGGTTGTGGGGCAGGTTGAGTTCAGGACACAT 5001

 52656975 AGAAGATTGCCAAAGGGTGACTATTATTACTTTGAGACTCTGGAAAAATTAGCCAGGAAA 52657034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5002 AGAAGATTGCCAAAGGGTGACTATTATTACTTTGAGACTCTGGAAAAATTAGCCAGGAAA 5061

 52657035 CAGAGACAAGAGGCTCAGGGTGCAGCAAAGCAGCCAAATCAGGATGATAGTGTTTTCTTT 52657094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5062 CAGAGACAAGAGGCTCAGGGTGCAGCAAAGCAGCCAAATCAGGATGATAGTGTTTTCTTT 5121

 52657095 GGAGCAGATATACTAATGGCCAAGGAACTCATAAAAAGATGCCTAATGTCATCTCATTAG 52657154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5122 GGAGCAGATATACTAATGGCCAAGGAACTCATAAAAAGATGCCTAATGTCATCTCATTAG 5181

 52657155 GGAAGTGCAGTCAAAGCCACAGCATGATACGTCTTCACACCCACGAGGATGGCCATAATC 52657214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5182 GGAAGTGCAGTCAAAGCCACAGCATGATACGTCTTCACACCCACGAGGATGGCCATAATC 5241

 52657215 AGAGAGACAATAACCAGTGGTAGGGAAGATGTGAAAAAATCGGAATGCTCATGCATTGCT 52657274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5242 AGAGAGACAATAACCAGTGGTAGGGAAGATGTGAAAAAATCGGAATGCTCATGCATTGCT 5301

 52657275 GGTAGGAATGTGACATGGTGCAGCTGCTTTGGAAAGCAGTTTAACAGTTCCTGGAAAAGT 52657334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5302 GGTAGGAATGTGACATGGTGCAGCTGCTTTGGAAAGCAGTTTAACAGTTCCTGGAAAAGT 5361

 52657335 TAAACATGGAGTTACCCTAAGACCCAGCAATTCCATTCCTAGGTAAGCAAGAAAATGAAA 52657394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5362 TAAACATGGAGTTACCCTAAGACCCAGCAATTCCATTCCTAGGTAAGCAAGAAAATGAAA 5421

 52657395 ACATATGGCCACACAAAAACTTGTACACAAATGTCCATAGCAGCATTTTCATAATAGCTG 52657454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5422 ACATATGGCCACACAAAAACTTGTACACAAATGTCCATAGCAGCATTTTCATAATAGCTG 5481

 52657455 AAAAGTGGAAACAACCCAAATATCCATCAATTGGAAAAAGGAAATCTAGCATTTGCATAT 52657514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5482 AAAAGTGGAAACAACCCAAATATCCATCAATTGGAAAAAGGAAATCTAGCATTTGCATAT 5541

 52657515 AATAGAGTATTAATCAGCCATAAGAAGAAACAAAGCACCGATCCATGTTATATCATGCTT 52657574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5542 AATAGAGTATTAATCAGCCATAAGAAGAAACAAAGCACCGATCCATGTTATATCATGCTT 5601

 52657575 TATACTTGGAAGCATGGTACTAAGTGAAAGACGCCAGACACAAAAAGCAAAATATTGTAT 52657634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5602 TATACTTGGAAGCATGGTACTAAGTGAAAGACGCCAGACACAAAAAGCAAAATATTGTAT 5661

 52657635 GATTCCATTTATATAAAGTGTCTAGAATAGGCAAATCCATAGAGGCAGAAAACAGATTAG 52657694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5662 GATTCCATTTATATAAAGTGTCTAGAATAGGCAAATCCATAGAGGCAGAAAACAGATTAG 5721

 52657695 TGGTTGCCAGTGGCTGGGAATAGGGAAAAAACTCAGCGCTAAAGGGTAGGGAGTTTTGTT 52657754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5722 TGGTTGCCAGTGGCTGGGAATAGGGAAAAAACTCAGCGCTAAAGGGTAGGGAGTTTTGTT 5781

 52657755 TTGGAGTAATGACGATGTTCTGGAATTAGACGTGGAACGATTGCACACATGGTGCAAATA 52657814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5782 TTGGAGTAATGACGATGTTCTGGAATTAGACGTGGAACGATTGCACACATGGTGCAAATA 5841

 52657815 TCCTTAAAATCACGGAATTGTCACTCTAAAAGGTGAATTTTATGGTAGGTGAATTGTACC 52657874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5842 TCCTTAAAATCACGGAATTGTCACTCTAAAAGGTGAATTTTATGGTAGGTGAATTGTACC 5901

 52657875 TCAATTTGTAAAAAGAAGAATTAGATAAATAAACAGCAACACAGCACCAAGGGGTGGGGG 52657934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5902 TCAATTTGTAAAAAGAAGAATTAGATAAATAAACAGCAACACAGCACCAAGGGGTGGGGG 5961

 52657935 TAGGAAACAGACAACAAATAGGAGTGAAGAGTTCACAGGAAAAGACATGCAGCCAGCTTT 52657994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5962 TAGGAAACAGACAACAAATAGGAGTGAAGAGTTCACAGGAAAAGACATGCAGCCAGCTTT 6021

 52657995 TAAGCAGAAGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTAT 52658054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6022 TAAGCAGAAGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTAT 6081

 52658055 GACACTTGGCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAATTGATGACCCCAGTGGA 52658114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6082 GACACTTGGCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAATTGATGACCCCAGTGGA 6141

 52658115 AAGCGTATAAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAG 52658174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6142 AAGCGTATAAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAG 6201

 52658175 CACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCA 52658234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6202 CACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCA 6261

 52658235 ACATGGTGAAACACTGTCTCTGCTAAAAAACAAAACAAAACAAAACACCAAAAAATAGCT 52658294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6262 ACATGGTGAAACACTGTCTCTGCTAAAAAACAAAACAAAACAAAACACCAAAAAATAGCT 6321

 52658295 GGGCGTAGTGGCGGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTTGGGAGGCGGTGGCAG 52658345
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6322 GGGCGTAGTGGCGGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTTGGGAGGCGGTGGCAG 6372

Alignment time is 6.93603 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [52637064,52668002] =>     30939 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    6362] =>      6362 nucs 'mol-32-2895-110133_6362'

Score:        6284
Aligned:      6361        nucs
Identic:      6354 (100%) nucs =>      6331 (100%)        23 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [52645610,52651947] EXCISED REGION [52658449,52658471]
 second seq =>  [       1,    6337] EXCISED REGION [    6338,    6360]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6501 nucs [52651948,52658448]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 3
 first  seq =>      9418 nucs [52651960,52661377]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        12 nucs [52651948,52651959] to [52658449,52658460]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         8 nucs [52651940,52651947] to [52658449,52658456]
 second seq =>         8 nucs [6330,6337] to [6338,6345]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 52645610 ATACTGGAACTGTGTTGTTCTCTGGTCATTCTGAAAGGCAGAAGTTAGCTCTCTACATCT 52645669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATACTGGAACTGTGTTGTTCTCTGGTCATTCTGAAAGGCAGAAGTTAGCTCTCTACATCT 60

 52645670 CCTTGGACCCTGCTTTTCTTGGGAGAGGAGAAGGCAAGGTTGGTGAGGAGGGAAAGCTAC 52645729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCTTGGACCCTGCTTTTCTTGGGAGAGGAGAAGGCAAGGTTGGTGAGGAGGGAAAGCTAC 120

 52645730 TTAATGGAAAGTCACTAGCTGCCAGGTGTGGAATGAGTGATATTCAATGTTAATTAATCT 52645789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTAATGGAAAGTCACTAGCTGCCAGGTGTGGAATGAGTGATATTCAATGTTAATTAATCT 180

 52645790 TCTTTTATCTGTGTAAGAACTCCGTGAGCAGCATATTGTCATGATGTCAACTGGGAGGCA 52645849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCTTTTATCTGTGTAAGAACTCCGTGAGCAGCATATTGTCATGATGTCAACTGGGAGGCA 240

 52645850 GTACAGCAGTTAGGAGCTTGGGTTCTGGAGCTAGAACAAGGTTTCTCAACCTCAGCACTA 52645909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTACAGCAGTTAGGAGCTTGGGTTCTGGAGCTAGAACAAGGTTTCTCAACCTCAGCACTA 300

 52645910 CTCACATTTGAAGCCAGATTATTCTTTGTTAGGGAGGCTCATCCCGTGCCTCATAGGCTG 52645969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTCACATTTGAAGCCAGATTATTCTTTGTTAGGGAGGCTCATCCCGTGCCTCATAGGCTG 360

 52645970 ATTAGCAGCATCCTGGCCTCTGCCCACTAGACGCCGGTCACATTTCCCAGTCATGGCAAC 52646029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATTAGCAGCATCCTGGCCTCTGCCCACTAGACGCCGGTCACATTTCCCAGTCATGGCAAC 420

 52646030 CAAAAATATCTCTAGGCATTGCTAAATGTCCCCTGGAGGACAAAATCTCTTACGTTTGAG 52646089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CAAAAATATCTCTAGGCATTGCTAAATGTCCCCTGGAGGACAAAATCTCTTACGTTTGAG 480

 52646090 AGGCACTGAGCTGAAATGTCTTTTTGAATCCAGATTATCTAATTTTCTGTGCCTCAACTT 52646149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGGCACTGAGCTGAAATGTCTTTTTGAATCCAGATTATCTAATTTTCTGTGCCTCAACTT 540

 52646150 TCTGGTAAAAGGAGACAGATAATAAATCTCGTAATTTTGTTAGGAAGATTACATGAGTTA 52646209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCTGGTAAAAGGAGACAGATAATAAATCTCGTAATTTTGTTAGGAAGATTACATGAGTTA 600

 52646210 ATAGTTTTAAAGCAAGTACAATAGCACCTGGAATATATTAAGTGCTTAATAAATATCACA 52646269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATAGTTTTAAAGCAAGTACAATAGCACCTGGAATATATTAAGTGCTTAATAAATATCACA 660

 52646270 AACATTAGTTATCATTATTCATGAGTGAGAAAACTGACAGTCAGAGAGGTCAGTACACCC 52646329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AACATTAGTTATCATTATTCATGAGTGAGAAAACTGACAGTCAGAGAGGTCAGTACACCC 720

 52646330 TCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCTAGTAAGCAGCAGAGTCTGGCTTCAGGCAGAAATCTGAC 52646389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCTAGTAAGCAGCAGAGTCTGGCTTCAGGCAGAAATCTGAC 780

 52646390 TTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGTCTTACCAGGGACTTGTATTAGCATAGACTGTTAAGAA 52646449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
      781 TTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGTCTTACCAGGGACTTGTATTAGCATAGACTGTTAGGAA 840

 52646450 TATGGGAAGATTTTTAAAATACAGTACTCAGAAAATTTCTCTTTGAAAGGCTGGAAGAGC 52646509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TATGGGAAGATTTTTAAAATACAGTACTCAGAAAATTTCTCTTTGAAAGGCTGGAAGAGC 900

 52646510 AGATATCCACACAAGAAGGCAAATTAGACCTCAGGCCAGTGTGGAATTAAAGGTGTAGGG 52646569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGATATCCACACAAGAAGGCAAATTAGACCTCAGGCCAGTGTGGAATTAAAGGTGTAGGG 960

 52646570 TTATCTGGTCAAGACTGTGTGTGTGGATACAGGCTCCAACCCCTCCAGGCAAGGGCACTG 52646629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTATCTGGTCAAGACTGTGTGTGTGGATACAGGCTCCAACCCCTCCAGGCAAGGGCACTG 1020

 52646630 TTTCCAACATCCACCCTTTCTCCTTTGACCTCTACCTTGACCTAAATTAACTATAAAAGG 52646689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTTCCAACATCCACCCTTTCTCCTTTGACCTCTACCTTGACCTAAATTAACTATAAAAGG 1080

 52646690 TCCTTCTTTTCTAGGACCCTACTATAAATCAGTGAAATATTCAGGAAAAAAAGAACACCA 52646749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TCCTTCTTTTCTAGGACCCTACTATAAATCAGTGAAATATTCAGGAAAAAAAGAACACCA 1140

 52646750 AGAATGTTGGGATCCCAGTTAAAGATCAAGATTCTCTACTGATAAGCTGTGTGATATGGA 52646809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGAATGTTGGGATCCCAGTTAAAGATCAAGATTCTCTACTGATAAGCTGTGTGATATGGA 1200

 52646810 GTAAATCACTAAAGATCTTTGAATCTCTTCATTTGTAAAATGGGAATATTGGTAGTCCTA 52646869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GTAAATCACTAAAGATCTTTGAATCTCTTCATTTGTAAAATGGGAATATTGGTAGTCCTA 1260

 52646870 CTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTAAAGAAGAAAAGTCATGCAAAGGATCTGGCACAACGCC 52646929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTAAAGAAGAAAAGTCATGCAAAGGATCTGGCACAACGCC 1320

 52646930 TTTTCCATAATAAGTGCTTAGTAATTGACAGATACTGTGATAACTTTTCAGGTTTCTCTC 52646989
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTTTCCATAGTAAGTGCTTAGTAATTGACAGATACTGTGATAACTTTTCAGGTTTCTCTC 1380

 52646990 ATGCCTTTGACAACATTGCATTTTGCTTGCTCTATCTGTAGTCAGACACTTCTTAATATC 52647049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ATGCCTTTGACAACATTGCATTTTGCTTGCTCTATCTGTAGTCAGACACTTCTTAATATC 1440

 52647050 TGTTTGCAGGAAGACAGAAAAATAAAGGGAAGAATTGAGATTTCTTTGATCTATTCATAC 52647109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TGTTTGCAGGAAGACAGAAAAATAAAGGGAAGAATTGAGATTTCTTTGATCTATTCATAC 1500

 52647110 TGCTCATTAATATGTAGTGAGAAATACATACACACACACATACACACACATGCATCCATT 52647169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TGCTCATTAATATGTAGTGAGAAATACATACACACACACATACACACACATGCATCCATT 1560

 52647170 AGCAATTGTTTTTGCCCAACTCTAGTGTCTCGCAGTGTCTAGACTAAACAACAAACAAAA 52647229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AGCAATTGTTTTTGCCCAACTCTAGTGTCTCGCAGTGTCTAGACTAAACAACAAACAAAA 1620

 52647230 AAGGGGGGAGAGTGAGCTGGATTAAGCATTGAGGCACAGTGAAGAAATGGTCTGGGGCAA 52647289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     1621 AAGGGGGGAGAGTGAGCTGGATTAAGCATTGAGGCACAGTGAAGAAGTGGTCTGGGGCAA 1680

 52647290 GCCCAGGGATGAATGTTAGGGGTTTCTCATAAACCTGAACCTGAAGAAAATCACCCTGCC 52647349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GCCCAGGGATGAATGTTAGGGGTTTCTCATAAACCTGAACCTGAAGAAAATCACCCTGCC 1740

 52647350 AGCATATTGATCTTCTAGCTCTTCTTAACCTTTTTTTCTGTGATTCAGGAATTCATAATG 52647409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AGCATATTGATCTTCTAGCTCTTCTTAACCTTTTTTTCTGTGATTCAGGAATTCATAATG 1800

 52647410 ATAGAAAATATTATACTAAAGAAGAAAAAAAGAGGGAGAATAAGTAAGTGATAGATGGAT 52647469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ATAGAAAATATTATACTAAAGAAGAAAAAAAGAGGGAGAATAAGTAAGTGATAGATGGAT 1860

 52647470 GCATCAGGGTGTAAAGTTAGCAAGTAAGGCTGTTGAAGTGTCAGAGTGAATATAAATGAA 52647529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GCATCAGGGTGTAAAGTTAGCAAGTAAGGCTGTTGAAGTGTCAGAGTGAATATAAATGAA 1920

 52647530 TTGTGGGAATGGTCCATGCCAGGAGAAGAGGGTATGGTTGACAAAAAGGGAAATGCTAAG 52647589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTGTGGGAATGGTCCATGCCAGGAGAAGAGGGTATGGTTGACAAAAAGGGAAATGCTAAG 1980

 52647590 ATTCAAAACAGGGAAGGGCTTTTCAAAATGCCAAGAGCACCAACTTATATCTTTCAGTTT 52647649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ATTCAAAACAGGGAAGGGCTTTTCAAAATGCCAAGAGCACCAACTTATATCTTTCAGTTT 2040

 52647650 AATTCCTCTCTTCCTTACCCACTGGCTGGAAAGCAAAGGAGCTAGTGGTAAGTAAGAGTG 52647709
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     2041 AATTCCTCTCTTCCTTACCCACTGGCTGGAAAGCAAAGGAGCTAGTGGTGAGTAAGAGTG 2100

 52647710 TTATAGCCAGAGAAAAAGTCTTCAAAAAACACAAAGTACTTTCCATGGACAACCTTTTTT 52647769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TTATAGCCAGAGAAAAAGTCTTCAAAAAACACAAAGTACTTTCCATGGACAACCTTTTTT 2160

 52647770 ATTTTAAAGTGCCAATATGTTGCTTTGAAAAAGAATAAATTCCTTACATCCAGGTATCTG 52647829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ATTTTAAAGTGCCAATATGTTGCTTTGAAAAAGAATAAATTCCTTACATCCAGGTATCTG 2220

 52647830 GACTAGACTTCAGTGCATTTAGTGATTATAGCAAATCCAAACAGTAGCTTTTGATATCAG 52647889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GACTAGACTTCAGTGCATTTAGTGATTATAGCAAATCCAAACAGTAGCTTTTGATATCAG 2280

 52647890 AGAATGGGTAAAGTGTTTTTGACAATTTCTAAGAACTTAGAGTTCTTCGGTGATACGTTC 52647949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AGAATGGGTAAAGTGTTTTTGACAATTTCTAAGAACTTAGAGTTCTTCGGTGATACGTTC 2340

 52647950 CATGCAACTGAAGCTCTGCTCTCCAAATTTAGGTGGGTACATACCCAAGTCCATCACCTG 52648009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CATGCAACTGAAGCTCTGCTCTCCAAATTTAGGTGGGTACATACCCAAGTCCATCACCTG 2400

 52648010 GGGCTTCTATTTCCTTTGCTCAGATGCTCACCTCCTAGGTGGGCACCTGACATAAGATAG 52648069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GGGCTTCTATTTCCTTTGCTCAGATGCTCACCTCCTAGGTGGGCACCTGACATAAGATAG 2460

 52648070 ACTAATAAAAATAAGTCCTGTAACTTTTGATACTCCTATTAAAAAAGAGTTGCAAACCAA 52648129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 ACTAATAAAAATAAGTCCTGTAACTTTTGATACTCCTATTAAAAAAGAGTTGCAAACCAA 2520

 52648130 TAGGAGGTACACTTGAGAATCAGCACAAATGAAAGTAGAACCTGGAAATCCAGGAAGCAG 52648189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TAGGAGGTACACTTGAGAATCAGCACAAATGAAAGTAGAACCTGGAAATCCAGGAAGCAG 2580

 52648190 ATACCCAATCATGTCATTTAAACATTTAGATCCAGCTGTGCCTGAAGCTGAACTTTAGCA 52648249
          |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 ATACCCAATCATGTCATTTAAACATT-AGATCCAGCTGTGCCTGAAGCTGAACTTTAGCA 2639

 52648250 TTACATAAGCCAATAAATCACTCTTCCCCAACTTACGCCAGTTGAAATTGAATACATACT 52648309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 TTACATAAGCCAATAAATCACTCTTCCCCAACTTACGCCAGTTGAAATTGAATACATACT 2699

 52648310 CAGTGACTTTGAGAGAATTCCAGGGAATTGGTCAGTCCCTGTTTCACTTGTAAATACACA 52648369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 CAGTGACTTTGAGAGAATTCCAGGGAATTGGTCAGTCCCTGTTTCACTTGTAAATACACA 2759

 52648370 GCAATCAAGCCTACCAAATCTATGATTGATTGGGGTGTCTGAAAGAGATGGAGGGAATGG 52648429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 GCAATCAAGCCTACCAAATCTATGATTGATTGGGGTGTCTGAAAGAGATGGAGGGAATGG 2819

 52648430 AATCAACCTGAAAAACATATTTCAGGAGTTCATCCCTGAAAACTTCCCCAACCTAGCTAG 52648489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2820 AATCAACCTGAAAAACATATTTCAGGAGTTCATCCCTGAAAACTTCCCCAACCTAGCTAG 2879

 52648490 AGGGGCCAACATTCAAATTCAGGAAATGCAGAGAACCCCAGTAAGATACTCCACAAAAAG 52648549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2880 AGGGGCCAACATTCAAATTCAGGAAATGCAGAGAACCCCAGTAAGATACTCCACAAAAAG 2939

 52648550 ATCTTCCCCAAGACATCATCATCAGATTCTCCAAAGTTGAAATGTAAGAAAAAATGCTAA 52648609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2940 ATCTTCCCCAAGACATCATCATCAGATTCTCCAAAGTTGAAATGTAAGAAAAAATGCTAA 2999

 52648610 AGGCAACTAGAGTGAAAGGCCCGGTCACCTAAAAAGGGAAGCACAGACTTACAGTGGACC 52648669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3000 AGGCAACTAGAGTGAAAGGCCCGGTCACCTAAAAAGGGAAGCACAGACTTACAGTGGACC 3059

 52648670 TCTCACTGGTAACCCTACAAGCCAGAAGAGATTGAGGACCAATATTCAACATTCTTAAAC 52648729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3060 TCTCACTGGTAACCCTACAAGCCAGAAGAGATTGAGGACCAATATTCAACATTCTTAAAC 3119

 52648730 AAAAAGAATTCCAACCCAGAATTTTATATCTGACTAAACTAAGCTTCATAAGCAAAAGAG 52648789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3120 AAAAAGAATTCCAACCCAGAATTTTATATCTGACTAAACTAAGCTTCATAAGCAAAAGAG 3179

 52648790 AAATAAGATCATTTTCAGACAAGCAAATGCTAAGGGAATTTGTGACCATTAGACCTTCCT 52648849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3180 AAATAAGATCATTTTCAGACAAGCAAATGCTAAGGGAATTTGTGACCATTAGACCTTCCT 3239

 52648850 TGCAACAGTTCCTAAAGGAAGCACTAAATATGGAAAGACCATTACCAGACACTACAAAAC 52648909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3240 TGCAACAGTTCCTAAAGGAAGCACTAAATATGGAAAGACCATTACCAGACACTACAAAAC 3299

 52648910 ACACTGAAGTACACAGACCAGTGACATTGTAAAGCAACTACATAACAAGTCTGCAAAATA 52648969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3300 ACACTGAAGTACACAGACCAGTGACATTGTAAAGCAACTACATAACAAGTCTGCAAAATA 3359

 52648970 ACCAGCCAACATCATGATGACGGTATCAAATCGACACATAGCAACACTAACCTTAAATGT 52649029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3360 ACCAGCCAACATCATGATGACGGTATCAAATCGACACATAGCAACACTAACCTTAAATGT 3419

 52649030 AAATGGACTAAATGATCCCATTAAAAGACATAAAGTGGCAGGCTGGATAAAGAACCAAGA 52649089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3420 AAATGGACTAAATGATCCCATTAAAAGACATAAAGTGGCAGGCTGGATAAAGAACCAAGA 3479

 52649090 ACCATTGGTATACTGTCTTCAAGAGACCCATCTCCTATGCAGTGACACACATAGGTTCAA 52649149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3480 ACCATTGGTATACTGTCTTCAAGAGACCCATCTCCTATGCAGTGACACACATAGGTTCAA 3539

 52649150 GATAAAGGGATGGGGAAAAATCTACCAAGCAAATAGAAAACAGAATAAAACAGGGGTTGC 52649209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3540 GATAAAGGGATGGGGAAAAATCTACCAAGCAAATAGAAAACAGAATAAAACAGGGGTTGC 3599

 52649210 AATCCTAGTTGCCGTCAAAACAGACTTTAAACCAACAAAGGTTAAAAGAAAAAAATATGG 52649269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3600 AATCCTAGTTGCCGTCAAAACAGACTTTAAACCAACAAAGGTTAAAAGAAAAAAATATGG 3659

 52649270 GCATTGCATAAGGATAAAGTGTTAAATTAAACAAGAAGATCTAACTATCCTAAGTATATA 52649329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3660 GCATTGCATAAGGATAAAGTGTTAAATTAAACAAGAAGATCTAACTATCCTAAGTATATA 3719

 52649330 TGCACCAAACACAGGAACACCCAGATTCATAAAGCAAGTTTATGGAGACCTTCAAACAGA 52649389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3720 TGCACCAAACACAGGAACACCCAGATTCATAAAGCAAGTTTATGGAGACCTTCAAACAGA 3779

 52649390 CTTAGACTCCCACACAATAGTAGTGGGAGACTTTAATACCCCATGACAATATTAGACAGA 52649449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3780 CTTAGACTCCCACACAATAGTAGTGGGAGACTTTAATACCCCATGACAATATTAGACAGA 3839

 52649450 TCATTGAGACAGGAAATTAACAAAGATATTCAAGATCTAACTCAGCACTAAATCAAATGG 52649509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3840 TCATTGAGACAGGAAATTAACAAAGATATTCAAGATCTAACTCAGCACTAAATCAAATGG 3899

 52649510 CCCTGATAGATATCTACAGGACTGTCCTACTTGAAACCATACAATTACATGGTAATTGAA 52649569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3900 CCCTGATAGATATCTACAGGACTGTCCTACTTGAAACCATACAATTACATGGTAATTGAA 3959

 52649570 TGACCTGCTCCTGAATGACTTTTGGGTAAATAATAAAATTAAGGCAGAAATCAAGAAGTT 52649629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3960 TGACCTGCTCCTGAATGACTTTTGGGTAAATAATAAAATTAAGGCAGAAATCAAGAAGTT 4019

 52649630 TTTTGAACTAATGAGAACAAAGATACAACATACCAGAATCTTTGGGACACAGCTAAGGCA 52649689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4020 TTTTGAACTAATGAGAACAAAGATACAACATACCAGAATCTTTGGGACACAGCTAAGGCA 4079

 52649690 GTGTTAAGAGGGAAATTTATAGCACTAAATCCCACATCAAAAAGTTAGAAAGAGCTCACG 52649749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4080 GTGTTAAGAGGGAAATTTATAGCACTAAATCCCACATCAAAAAGTTAGAAAGAGCTCACG 4139

 52649750 TTAACAATCTAACCTCACAACTACAGGAACTAGAGAACTGAGAGCAGAAAAACCTGAAAG 52649809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4140 TTAACAATCTAACCTCACAACTACAGGAACTAGAGAACTGAGAGCAGAAAAACCTGAAAG 4199

 52649810 CTAGCAGAAGACAAGAAATAACCAAAATTAGAGCTGAACTGAAGGAGATTGAGACATGAA 52649869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4200 CTAGCAGAAGACAAGAAATAACCAAAATTAGAGCTGAACTGAAGGAGATTGAGACATGAA 4259

 52649870 AAACCATTCAAAAGATCAGTGAATTCAGGAGCTGTTTTTTTTTTGAACAAATTAATAAAA 52649929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4260 AAACCATTCAAAAGATCAGTGAATTCAGGAGCTGTTTTTTTTTTGAACAAATTAATAAAA 4319

 52649930 TAGACCATTAGCTAGAGTAATAAACAAGAAAATAGAAAAGATTCAAATAAACACAATCAG 52649989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4320 TAGACCATTAGCTAGAGTAATAAACAAGAAAATAGAAAAGATTCAAATAAACACAATCAG 4379

 52649990 AAACGACAAGGGGGATATTACCACTGACCCCACAGAAGTACAAACAACCATCAGAGAATA 52650049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4380 AAACGACAAGGGGGATATTACCACTGACCCCACAGAAGTACAAACAACCATCAGAGAATA 4439

 52650050 TTATGAACATCTCTATGCACATAAACTAGAAAATCTAGAAGAAGTGGATAAACTTCTGGA 52650109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4440 TTATGAACATCTCTATGCACATAAACTAGAAAATCTAGAAGAAGTGGATAAACTTCTGGA 4499

 52650110 CATATACACCCTTCTAAGACTGTACCAGGAAGAAATTGAATCCCTGAACAGACCAATAAT 52650169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4500 CATATACACCCTTCTAAGACTGTACCAGGAAGAAATTGAATCCCTGAACAGACCAATAAT 4559

 52650170 GAGCCCTAAAATTGAGGAAGTAATACATAGACTACCAACCATAAAAAAACCCAGTACTAG 52650229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4560 GAGCCCTAAAATTGAGGAAGTAATACATAGACTACCAACCATAAAAAAACCCAGTACTAG 4619

 52650230 ATGGATTCACAGGTAAGTTCTACCAGTTGTACAAAGAAGAGCTGGTACAGTTCCTACTGA 52650289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4620 ATGGATTCACAGGTAAGTTCTACCAGTTGTACAAAGAAGAGCTGGTACAGTTCCTACTGA 4679

 52650290 AATTATTCCAAAAAGTTGAGTAGGAGGGAGTCCTTCCTAACTCATTTGATGAGGCCAGCA 52650349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4680 AATTATTCCAAAAAGTTGAGTAGGAGGGAGTCCTTCCTAACTCATTTGATGAGGCCAGCA 4739

 52650350 TCATCCTGATATCAAAACCTGGCAGATATACAACAAGAAAAGCTTCAGGCCAATATCCTT 52650409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4740 TCATCCTGATATCAAAACCTGGCAGATATACAACAAGAAAAGCTTCAGGCCAATATCCTT 4799

 52650410 GATGAACTTCAATGCAAAAATCCTCAATAAAATACTGGCAAACTGAATCCAGCAGCACAC 52650469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4800 GATGAACTTCAATGCAAAAATCCTCAATAAAATACTGGCAAACTGAATCCAGCAGCACAC 4859

 52650470 CAAAAAGCTTATCCACCATGATCAAGTAGAATGCAAGTTGGTTCAACATATACAAATCAA 52650529
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     4860 CAAAAAGCTTATCCACCATGATCAAGTAGTATGCAAGTTGGTTCAACATATACAAATCAA 4919

 52650530 TAAATGTGACTCATCACATAAACAGAACTAAAGACAAAAACTACATGATTATCTCAACAG 52650589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4920 TAAATGTGACTCATCACATAAACAGAACTAAAGACAAAAACTACATGATTATCTCAACAG 4979

 52650590 ATGCAGAAAAGGCTTTCAATAAAATTAGACATCCATTTATGTTAAAAACTCTCAATAAAC 52650649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4980 ATGCAGAAAAGGCTTTCAATAAAATTAGACATCCATTTATGTTAAAAACTCTCAATAAAC 5039

 52650650 TAGGTATTGAAGGAACATACCTCAAAATAATAAGAGCCATGTATGACAAACCCACAGCTA 52650709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5040 TAGGTATTGAAGGAACATACCTCAAAATAATAAGAGCCATGTATGACAAACCCACAGCTA 5099

 52650710 AGATCATACTGAATGGGCAAAAGCTGGAAGCATTTTCTTTGAAGACTGGCATAAGACAAG 52650769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5100 AGATCATACTGAATGGGCAAAAGCTGGAAGCATTTTCTTTGAAGACTGGCATAAGACAAG 5159

 52650770 GATGATCTCTCTCACCACTCCTATTCAACATAGTATTGGAAGTCTTGGCCAGGGCAATCG 52650829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5160 GATGATCTCTCTCACCACTCCTATTCAACATAGTATTGGAAGTCTTGGCCAGGGCAATCG 5219

 52650830 GGCAAGAGAAATAAATAAAGCGCATCCAAATAGGAAGAGAGGAAGTCAAACTATCCTTGT 52650889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5220 GGCAAGAGAAATAAATAAAGCGCATCCAAATAGGAAGAGAGGAAGTCAAACTATCCTTGT 5279

 52650890 TTGCAGATTACATGACATTATATCTAGAAAACCCCATAGTCTCAGCCCCAAAGCTTCTTA 52650949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5280 TTGCAGATTACATGACATTATATCTAGAAAACCCCATAGTCTCAGCCCCAAAGCTTCTTA 5339

 52650950 AGCTGATAAACAACTTCAGCAAAGTCTCAGGATACAAAATAAATGTGCAAAAATTACTGG 52651009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5340 AGCTGATAAACAACTTCAGCAAAGTCTCAGGATACAAAATAAATGTGCAAAAATTACTGG 5399

 52651010 CATTTCCATGCACCAACAACAGTCAAGCCAGGAGCCAAACCAGGAATGCACTCCCACTCA 52651069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5400 CATTTCCATGCACCAACAACAGTCAAGCCAGGAGCCAAACCAGGAATGCACTCCCACTCA 5459

 52651070 CAATCGCCACAAAAAGAGTAAAATACCTAGGAAAACAGCTAATTAGGGAGGTGAAAGATC 52651129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5460 CAATCGCCACAAAAAGAGTAAAATACCTAGGAAAACAGCTAATTAGGGAGGTGAAAGATC 5519

 52651130 TCTACAAGGAGAATAATGAACCAGCGCTCAAAGAAATTAGAGATGACACAAACAAATGGA 52651189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     5520 TCTACAAGGAGAATAATGAACCAGCGCTCAAAGAAAATAGAGATGACACAAACAAATGGA 5579

 52651190 AAAACATTCCATGTTCATTGATAGGAAGAATCAATATCATTAAAATGGCCATATTGCCCA 52651249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5580 AAAACATTCCATGTTCATTGATAGGAAGAATCAATATCATTAAAATGGCCATATTGCCCA 5639

 52651250 GAGCAATTTATAGATTCAATGCTATACCTATTAAACTACTGTTGAGATTCTTCACAGAAC 52651309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5640 GAGCAATTTATAGATTCAATGCTATACCTATTAAACTACTGTTGAGATTCTTCACAGAAC 5699

 52651310 CAGAGAAAACTATTTTAAAATTCATATAGAACCCAGAAAAGAGCCTGAATTGCTAAGGCA 52651369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5700 CAGAGAAAACTATTTTAAAATTCATATAGAACCCAGAAAAGAGCCTGAATTGCTAAGGCA 5759

 52651370 ATCCTAAGCAAAAAGCATAAAGCTGAAGGCATCATGCTACCTGACTTCAAACTATACTAC 52651429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5760 ATCCTAAGCAAAAAGCATAAAGCTGAAGGCATCATGCTACCTGACTTCAAACTATACTAC 5819

 52651430 AAGGCTACAGTAACCAAAACAGCATACTACTGGTACAAAAACAGACACATAGACCAATGG 52651489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5820 AAGGCTACAGTAACCAAAACAGCATACTACTGGTACAAAAACAGACACATAGACCAATGG 5879

 52651490 AACAGAATAGAGAACCCGGAAATAAGACCACACACCTACAACTATCTAATCTTTGACAAA 52651549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5880 AACAGAATAGAGAACCCGGAAATAAGACCACACACCTACAACTATCTAATCTTTGACAAA 5939

 52651550 CCTGACAAAAACATGCAATGGGGAAAAGATTTCCTATTCAATAAAAAGTGCTGGGATAAC 52651609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5940 CCTGACAAAAACATGCAATGGGGAAAAGATTTCCTATTCAATAAAAAGTGCTGGGATAAC 5999

 52651610 CGGCTAGCTGTACACAGAAGATTAAAGCTGGACCCCTTCCTTACAACATATACAAAAATC 52651669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6000 CGGCTAGCTGTACACAGAAGATTAAAGCTGGACCCCTTCCTTACAACATATACAAAAATC 6059

 52651670 GGCCGGGCTTGGTGGCTCACGCTTGTAATCCCAGCACTTTGGAAGGCCGAGGAGGGCGGA 52651729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6060 GGCCGGGCTTGGTGGCTCACGCTTGTAATCCCAGCACTTTGGAAGGCCGAGGAGGGCGGA 6119

 52651730 TCATGAGGTCAGGAGATCGAGAACACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAA 52651789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6120 TCATGAGGTCAGGAGATCGAGAACACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAA 6179

 52651790 TTAGCCGGGTGTGGTGGCAGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGAGAGGCTGAGGCAGGA 52651849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6180 TTAGCCGGGTGTGGTGGCAGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGAGAGGCTGAGGCAGGA 6239

 52651850 GAATGGTGTGAACCCGGGAGACAGAGCTTGCACTGAGCCGAGACCACATCACTGCACTCC 52651909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6240 GAATGGTGTGAACCCGGGAGACAGAGCTTGCACTGAGCCGAGACCACATCACTGCACTCC 6299

 52651910 AGCCTGGGCGACAGAGTGAGACTCCGTCTCAAAAAAAA 52651947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6300 AGCCTGGGCGACAGAGTGAGACTCCGTCTCAAAAAAAA 6337

EXCISED REGION

 52658449 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAG 52658471
          |||||||||||||||||||||||
     6338 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAG 6360

Alignment time is 6.93882 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [52637064,52668002] =>     30939 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    8287] =>      8287 nucs 'mol-32-2895-129448_8287'

Score:        7930
Aligned:      8297        nucs
Identic:      8235 ( 99%) nucs =>      5171 (100%)      3064 ( 99%)
Gaps:           40 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [52641879,52647064] EXCISED REGION [52658003,52661083]
 second seq =>  [       1,    5187] EXCISED REGION [    5188,    8287]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>     10938 nucs [52647065,52658002]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         6 nucs [52647065,52647070] to [52658003,52658008]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [52647065,52647067] to [52658000,52658002]
 second seq =>         0 nucs

 52641879 AAACCTCATCCCTGCCAACACATTGGTTTGTATGAATCACAGCTCAGTGAAACCTTTCAG 52641938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAACCTCATCCCTGCCAACACATTGGTTTGTATGAATCACAGCTCAGTGAAACCTTTCAG 60

 52641939 GCATATAATTTATCTTTTCTTTGGCCTATGTAGTAAACGCTTCATTTGTTCATGAATTCT 52641998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCATATAATTTATCTTTTCTTTGGCCTATGTAGTAAACGCTTCATTTGTTCATGAATTCT 120

 52641999 TGCCTTGTTTTAATTATGCTTTGCCCTGAATGTAGTTTTATAAGGCACAAAAATAAGATT 52642058
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGCCTTGTTCTAATTATGCTTTGCCCTGAATGTAGTTTTATAAGGCACAAAAATAAGATT 180

 52642059 GTCGTTCTGAAAACACAGAAGATTTGTATGTTTCCCCCAGGATGAAATGGTGGCATCTTT 52642118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTCGTTCTGAAAACACAGAAGATTTGTATGTTTCCCCCAGGATGAAATGGTGGCATCTTT 240

 52642119 CTCCCAATTCACAGCTCTGTGGGCTTGTGGCTGGAATTCCAATCCAGCAGGGAGCAAGCC 52642178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTCCCAATTCACAGCTCTGTGGGCTTGTGGCTGGAATTCCAATCCAGCAGGGAGCAAGCC 300

 52642179 ATAAAAATGGGGGGAAGGGCTGCTGGAGGGAGGCAGTAGATGCGGCTGAGCCCAAGGCAT 52642238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATAAAAATGGGGGGAAGGGCTGCTGGAGGGAGGCAGTAGATGCGGCTGAGCCCAAGGCAT 360

 52642239 AATTCACCCTAAGAATTCTGAATCAATACACTGACATCCAGCCATGTACAATGTGGTACT 52642298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AATTCACCCTAAGAATTCTGAATCAATACACTGACATCCAGCCATGTACAATGTGGTACT 420

 52642299 CCCACCAAGAAAGCCACTGATTGAGAAGTTTTATTCATGTTACTTTCTGAGGGTTGGATT 52642358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCCACCAAGAAAGCCACTGATTGAGAAGTTTTATTCATGTTACTTTCTGAGGGTTGGATT 480

 52642359 GTCCCATTACATTTATAGAACAATTGCTTTTTTCCCCCTAAATACAGAACTATGCAGCCG 52642418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTCCCATTACATTTATAGAACAATTGCTTTTTTCCCCCTAAATACAGAACTATGCAGCCG 540

 52642419 GGAGTCAGAAAAGAAACCTTGACAATCAGAAGGCTGTTTTGTTGTTGTTGTTAAAAACCT 52642478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGAGTCAGAAAAGAAACCTTGACAATCAGAAGGCTGTTTTGTTGTTGTTGTTAAAAACCT 600

 52642479 TTGCAGGCATATGCATCTGAATATCCATAAGTTCACAGGCTGAGGGAGAAATGGCTATTT 52642538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTGCAGGCATATGCATCTGAATATCCATAAGTTCACAGGCTGAGGGAGAAATGGCTATTT 660

 52642539 CATAACTTTTCTGTGTTTCTCATGTACATAGTACAAAGTGGGCACTCAGTATTTCAAATT 52642598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CATAACTTTTCTGTGTTTCTCATGTACATAGTACAAAGTGGGCACTCAGTATTTCAAATT 720

 52642599 TCAATATCACTGAAAAAAATGGAAATTTGTCATGTAACAAAATCAGATGCAGACTTCACT 52642658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCAATATCACTGAAAAAAATGGAAATTTGTCATGTAACAAAATCAGATGCAGACTTCACT 780

 52642659 GGTGAATCTGAGGGAGTGAATTCACTTATTCAGAAAGGAAGACAGTTACAATTCTTGGGT 52642718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GGTGAATCTGAGGGAGTGAATTCACTTATTCAGAAAGGAAGACAGTTACAATTCTTGGGT 840

 52642719 CTTCTGAGAGATCATTATAACTTGAAAATATTACACAAGGGCTTTGCTATATTAGATACC 52642778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTTCTGAGAGATCATTATAACTTGAAAATATTACACAAGGGCTTTGCTATATTAGATACC 900

 52642779 TGCCATGTTCCTAACACAAGCTCCCATTTTCTGACTCAAATCTCATTTTGGAACACATTC 52642838
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGCCATGTTCCTAATACAAGCTCCCATTTTCTGACTCAAATCTCATTTTGGAACACATTC 960

 52642839 CACTCAAATTGAGGTTCTACCCCTAAGAGTTCTTTTTCAATAAAGAAAGCTGAGTTAATA 52642898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CACTCAAATTGAGGTTCTACCCCTAAGAGTTCTTTTTCAATAAAGAAAGCTGAGTTAATA 1020

 52642899 AATCACAACTCCAAAACTTTTCCTCACTTTTCTTAGACTAGAAATAGATTGAGTGTGTCG 52642958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     1021 AATCACAACTCCAAAACTTTTCCTCACTTTTCTTAGACTAGAAATAGATTGAATGTGTCG 1080

 52642959 AGGTTTTATGGCTGAGTACATTGGAGGGCTGGCTATTCTATGCTGAACTGGTTTACTTGA 52643018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AGGTTTTATGGCTGAGTACATTGGAGGGCTGGCTATTCTATGCTGAACTGGTTTACTTGA 1140

 52643019 TTAAGATGGGGATTTGGATGAGTCACCGGACACCTGTCCAAAGATGAGTAAAACACATTC 52643078
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTAAGATGGGGATTTGGATGAGTCACTGGACACCTGTCCAAAGATGAGTAAAACACATTC 1200

 52643079 CTTCATTGTCTTCCCATAAATAACTCAATCTTCTCCTAACTGAGCCAATGGATAGGCTTT 52643138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CTTCATTGTCTTCCCATAAATAACTCAATCTTCTCCTAACTGAGCCAATGGATAGGCTTT 1260

 52643139 GGATGCCCAAGCAAAACAAACACATGACTGTTAAAAAATCACAACCTCAAAATGGCCTTA 52643198
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GGATGCCCAAGCAAAAGAAACACATGACTGTTAAAAAATCACAACCTCAAAATGGCCTTA 1320

 52643199 GAAGCCTATGACCAATAATGAGAATGGTTTCTCCACTCAGGCGCAAGTAGTAAACAGTTT 52643258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GAAGCCTATGACCAATAATGAGAATGGTTTCTCCACTCAGGCGCAAGTAGTAAACAGTTT 1380

 52643259 CTCCCATATGCAGGAATATTGACGACTAGTTTACCGCCTCTGGGCACGTAACTTTCAGGT 52643318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CTCCCATATGCAGGAATATTGACGACTAGTTTACCGCCTCTGGGCACGTAACTTTCAGGT 1440

 52643319 CCTGGTTCATGCATTTGCTGGAATGTTCCCTGGGCCATGGAGCCCAGTTCTCCTGGCATC 52643378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CCTGGTTCATGCATTTGCTGGAATGTTCCCTGGGCCATGGAGCCCAGTTCTCCTGGCATC 1500

 52643379 TGGCATCTCCCCCACACTCTGCTCCCCCAGCACAGCACTTGGCATCTTGCATTGCAATTG 52643438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TGGCATCTCCCCCACACTCTGCTCCCCCAGCACAGCACTTGGCATCTTGCATTGCAATTG 1560

 52643439 CAGGTTTATTTATTCACTTCTCTCACTGGACAGCAAACTCCACCAGGGCCGAGACTCTGT 52643498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CAGGTTTATTTATTCACTTCTCTCACTGGACAGCAAACTCCACCAGGGCCGAGACTCTGT 1620

 52643499 GTCTCGCCCTTCACTGTGGTCCCTGTGCCTCACCTGTTCCTAGTACAGTGTCACACTCAG 52643558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GTCTCGCCCTTCACTGTGGTCCCTGTGCCTCACCTGTTCCTAGTACAGTGTCACACTCAG 1680

 52643559 TAAAGAGCAGATGCCTGG-TGCATTTGGAGACTTATTTTAAATTATACGGAAAGTTATTC 52643617
          |||||||||||||.|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TAAAGAGCAGATGACTGGATGCATTTGGAGACTTATTTTAAATTATACGGAAAGTTATTC 1740

 52643618 AACCGGCTTCTTGAACTGGTGAATTTTGGAAAGTGGGTGTTTGAAGGGAAAATGTTTAAA 52643677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AACCGGCTTCTTGAACTGGTGAATTTTGGAAAGTGGGTGTTTGAAGGGAAAATGTTTAAA 1800

 52643678 CTCTGAAAGAAATGTTGGAAATAAGCTCTTTGAATCAAAATGTATAGAAAACACAAGAAT 52643737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CTCTGAAAGAAATGTTGGAAATAAGCTCTTTGAATCAAAATGTATAGAAAACACAAGAAT 1860

 52643738 GCTGACAGTAAGAGCCTAAAACACATGATGACTATTATCTTTTCCCAATTTTAACTCTCC 52643797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GCTGACAGTAAGAGCCTAAAACACATGATGACTATTATCTTTTCCCAATTTTAACTCTCC 1920

 52643798 AGAGTGTTCAGCGGTGCCCAGCCTTCATAATGTAATTCTTCGTAGCACCCTGGATGCATT 52643857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AGAGTGTTCAGCGGTGCCCAGCCTTCATAATGTAATTCTTCGTAGCACCCTGGATGCATT 1980

 52643858 AAAACCATAGATTAACGTGATACTTATTTTCATTAAGGAAAATAATTTACGTACAGTGCT 52643917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AAAACCATAGATTAACGTGATACTTATTTTCATTAAGGAAAATAATTTACGTACAGTGCT 2040

 52643918 CAGAGTAGAGCCTGGCACATTGAACATTTTCAATAAATGACAGCAAGTGTAATTATTAGC 52643977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CAGAGTAGAGCCTGGCACATTGAACATTTTCAATAAATGACAGCAAGTGTAATTATTAGC 2100

 52643978 ACTTCGGAAGTGCAAAGTTGCATTGTATTAAGACAAATATATTTGGAGCTCATCCAATTT 52644037
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ACTTTGGAAGTGCAAAGTTGCATTGTATTAAGACAAATATATTTGGAGCTCATCCAATTT 2160

 52644038 TTTCCTGGCTCTGAAGTCTGCTAGTGGCACTTAACTTTATTCCCAAGTTTTGAAAAATAT 52644097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TTTCCTGGCTCTGAAGTCTGCTAGTGGCACTTAACTTTATTCCCAAGTTTTGAAAAATAT 2220

 52644098 TGTTATTTAAAAAGTCTGTTAACCAAGGAAATGCATGCCCTAAACCTATAATGTATCAAG 52644157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TGTTATTTAAAAAGTCTGTTAACCAAGGAAATGCATGCCCTAAACCTATAATGTATCAAG 2280

 52644158 TTTTACTTCCTTCTTCTTTTAAGGAGTTCTTTTCCTGCCTTGAATACAAACAGGCTCTCT 52644217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TTTTACTTCCTTCTTCTTTTAAGGAGTTCTTTTCCTGCCTTGAATACAAACAGGCTCTCT 2340

 52644218 CAAGGTTAAAAGCAAATGCTCTTTTTAGTGTCAAAAAGAGCTTGCCTTTCTTCGCTCAGG 52644277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CAAGGTTAAAAGCAAATGCTCTTTTTAGTGTCAAAAAGAGCTTGCCTTTCTTCGCTCAGG 2400

 52644278 AAAAAAAGCAACTGATTCCAGGATACCTTCTTTGAAAACCAACACAAAAAAACCCCCCAA 52644337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AAAAAAAGCAACTGATTCCAGGATACCTTCTTTGAAAACCAACACAAAAAAACCCCCCAA 2460

 52644338 AAAACAAAAAAAAAACCCAAAACCCCTAGTTTTTACAAAGGTTTATTACTCCTACTTGTT 52644397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AAAACAAAAAAAAAACCCAAAACCCCTAGTTTTTACAAAGGTTTATTACTCCTACTTGTT 2520

 52644398 GGAAAAGAATTACTACATAAAAGAGTCTGCCCAGAGCTGTAAAATCTCCTTATTCAAACA 52644457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GGAAAAGAATTACTACATAAAAGAGTCTGCCCAGAGCTGTAAAATCTCCTTATTCAAACA 2580

 52644458 CACACCTTAGAGCAAAAGATGGTTAAATATCAATTCAGGCTATTAACAGTAAGGGAC--- 52644514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
     2581 CACACCTTAGAGCAAAAGATGGTTAAATATCAATTCAGGCTATTAACAGTAAGG---AAT 2637

 52644515 GAAATGTGTTCCAACAAAACTCTGCATGTCAACAAACTACAGAGACTAGGTAACATCTTT 52644574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2638 GAAATGTGTTCCAACAAAACTCTGCATGTCAACAAACTACAGAGACTAGGTAACATCTTT 2697

 52644575 TAGGAATCATTTTTATTCCACTAATGCCTTTTCCTCCAGAATCCACTGATCGTAAACGCA 52644634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2698 TAGGAATCATTTTTATTCCACTAATGCCTTTTCCTCCAGAATCCACTGATCGTAAACGCA 2757

 52644635 ACCTGTCTACTTCCGCCTTTGAAAAATGGATGGACAAATTCATCTGCATGTAACTCACCT 52644694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2758 ACCTGTCTACTTCCGCCTTTGAAAAATGGATGGACAAATTCATCTGCATGTAACTCACCT 2817

 52644695 CCTCTTTTCTTTTACATAAAACAGATGCCACAGCTGTTATTGTTCTTCACACAGAAGTTT 52644754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2818 CCTCTTTTCTTTTACATAAAACAGATGCCACAGCTGTTATTGTTCTTCACACAGAAGTTT 2877

 52644755 CTACCCAGAGAAACATCAGGATGACACTCTGCTGCAATGTGCTATTTGTTCTAGAGGGGT 52644814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2878 CTACCCAGAGAAACATCAGGATGACACTCTGCTGCAATGTGCTATTTGTTCTAGAGGGGT 2937

 52644815 CAACAGCTTGCCACCTTGCCTAGGCCCAGGGTGACTGCATATGTGCAGTGGTCTTATCCC 52644874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2938 CAACAGCTTGCCACCTTGCCTAGGCCCAGGGTGACTGCATATGTGCAGTGGTCTTATCCC 2997

 52644875 ATTAGCGCCCCCGAGCATGCATTCAGAACCAAGTGGATACACCTTGGCACACTTACCTTC 52644934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2998 ATTAGCGCCCCCGAGCATGCATTCAGAACCAAGTGGATACACCTTGGCACACTTACCTTC 3057

 52644935 CCTGCAGGGACATCATCGGACTGCCCTGATAAGCCAGGAACCTCATCCACCTTGTCTTGA 52644994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3058 CCTGCAGGGACATCATCGGACTGCCCTGATAAGCCAGGAACCTCATCCACCTTGTCTTGA 3117

 52644995 TGCTCTGCCCTCTTGGCTTCCTGTTGGCTGTCACCTGGCACCTTTTCCTGTCCCTTGTCC 52645054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3118 TGCTCTGCCCTCTTGGCTTCCTGTTGGCTGTCACCTGGCACCTTTTCCTGTCCCTTGTCC 3177

 52645055 AGCTTGAAGAATTTGTCAAAAAAGCTGGAGTCCTTGGGCTTGGAGGGAGCTTCTCCTCCT 52645114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3178 AGCTTGAAGAATTTGTCAAAAAAGCTGGAGTCCTTGGGCTTGGAGGGAGCTTCTCCTCCT 3237

 52645115 GCTCCCCCTGTCTCAGGTGGGAGAAGCGTGGGATCCCTGGCGGCAGAGAGGACCTTGTCT 52645174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3238 GCTCCCCCTGTCTCAGGTGGGAGAAGCGTGGGATCCCTGGCGGCAGAGAGGACCTTGTCT 3297

 52645175 TGGGCCGGGGCGTGCCCTGGGGTTTTATCTGTGTCCTGCCCCGGTCCAGCTGCCACCGGA 52645234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3298 TGGGCCGGGGCGTGCCCTGGGGTTTTATCTGTGTCCTGCCCCGGTCCAGCTGCCACCGGA 3357

 52645235 AGTGTCCAGCTCTCACTTGGGTCTTTGTTCGCTGGAGCTTTATTGGAGCTGACATCAAGC 52645294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3358 AGTGTCCAGCTCTCACTTGGGTCTTTGTTCGCTGGAGCTTTATTGGAGCTGACATCAAGC 3417

 52645295 TTCACTGATCCAAGGGATGAATCTGCGGCTTGGTCTCCGGTACGTCCTGGTACAGGCCGA 52645354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3418 TTCACTGATCCAAGGGATGAATCTGCGGCTTGGTCTCCGGTACGTCCTGGTACAGGCCGA 3477

 52645355 GAGAGCATCAAGAAAAAACGAGATTTAGCAGCTGGTGCCTCGGGTTTGGCCTCTTTCCCA 52645414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3478 GAGAGCATCAAGAAAAAACGAGATTTAGCAGCTGGTGCCTCGGGTTTGGCCTCTTTCCCA 3537

 52645415 AGATTCTTTCCGTTGGCATCCGCAACAGCACTTATCTCCGTTGTCTCGGGGGAAGAAGTG 52645474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3538 AGATTCTTTCCGTTGGCATCCGCAACAGCACTTATCTCCGTTGTCTCGGGGGAAGAAGTG 3597

 52645475 GCCACATTATCCGTCTTGACACTTATTCCCAAGTCGACTGTAAACACAAACATAAACAGT 52645534
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     3598 GCCACATTATCCGTCTTGACACTTATTCCCAAGTCGACTGTAAACACAAACATAAACAGC 3657

 52645535 GGTTATTCAGCCAAGCCGGGAAATTCAGGCACTAATAATGGACTCCAGACATTTTTTATA 52645594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3658 GGTTATTCAGCCAAGCCGGGAAATTCAGGCACTAATAATGGACTCCAGACATTTTTTATA 3717

 52645595 CAAAAGCCATACTGCATACTGGAACTGTGTTGTTCTCTGGTCATTCTGAAAGGCAGAAGT 52645654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3718 CAAAAGCCATACTGCATACTGGAACTGTGTTGTTCTCTGGTCATTCTGAAAGGCAGAAGT 3777

 52645655 TAGCTCTCTACATCTCCTTGGACCCTGCTTTTCTTGGGAGAGGAGAAGGCAAGGTTGGTG 52645714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3778 TAGCTCTCTACATCTCCTTGGACCCTGCTTTTCTTGGGAGAGGAGAAGGCAAGGTTGGTG 3837

 52645715 AGGAGGGAAAGCTACTTAATGGAAAGTCACTAGCTGCCAGGTGTGGAATGAGTGATATTC 52645774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3838 AGGAGGGAAAGCTACTTAATGGAAAGTCACTAGCTGCCAGGTGTGGAATGAGTGATATTC 3897

 52645775 AATGTTAATTAATCTTCTTTTATCTGTGTAAGAACTCCGTGAGCAGCATATTGTCATGAT 52645834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3898 AATGTTAATTAATCTTCTTTTATCTGTGTAAGAACTCCGTGAGCAGCATATTGTCATGAT 3957

 52645835 GTCAACTGGGAGGCAGTACAGCAGTTAGGAGCTTGGGTTCTGGAGCTAGAACAAGGTTTC 52645894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3958 GTCAACTGGGAGGCAGTACAGCAGTTAGGAGCTTGGGTTCTGGAGCTAGAACAAGGTTTC 4017

 52645895 TCAACCTCAGCACTACTCACATTTGAAGCCAGATTATTCTTTGTTAGGGAGGCTCATCCC 52645954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4018 TCAACCTCAGCACTACTCACATTTGAAGCCAGATTATTCTTTGTTAGGGAGGCTCATCCC 4077

 52645955 GTGCCTCATAGGCTGATTAGCAGCATCCTGGCCTCTGCCCACTAGACGCCGGTCACATTT 52646014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4078 GTGCCTCATAGGCTGATTAGCAGCATCCTGGCCTCTGCCCACTAGACGCCGGTCACATTT 4137

 52646015 CCCAGTCATGGCAACCAAAAATATCTCTAGGCATTGCTAAATGTCCCCTGGAGGACAAAA 52646074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4138 CCCAGTCATGGCAACCAAAAATATCTCTAGGCATTGCTAAATGTCCCCTGGAGGACAAAA 4197

 52646075 TCTCTTACGTTTGAGAGGCACTGAGCTGAAATGTCTTTTTGAATCCAGATTATCTAATTT 52646134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4198 TCTCTTACGTTTGAGAGGCACTGAGCTGAAATGTCTTTTTGAATCCAGATTATCTAATTT 4257

 52646135 TCTGTGCCTCAACTTTCTGGTAAAAGGAGACAGATAATAAATCTCGTAATTTTGTTAGGA 52646194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4258 TCTGTGCCTCAACTTTCTGGTAAAAGGAGACAGATAATAAATCTCGTAATTTTGTTAGGA 4317

 52646195 AGATTACATGAGTTAATAGTTTTAAAGCAAGTACAATAGCACCTGGAATATATTAAGTGC 52646254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     4318 AGATTACATGAGTTAATAGTTTTAAAGCAAGTACAATAGCGCCTGGAATATATTAAGTGC 4377

 52646255 TTAATAAATATCACAAACATTAGTTATCATTATTCATGAGTGAGAAAACTGACAGTCAGA 52646314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4378 TTAATAAATATCACAAACATTAGTTATCATTATTCATGAGTGAGAAAACTGACAGTCAGA 4437

 52646315 GAGGTCAGTACACCCTCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCTAGTAAGCAGCAGAGTCTGGCTTC 52646374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4438 GAGGTCAGTACACCCTCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCTAGTAAGCAGCAGAGTCTGGCTTC 4497

 52646375 AGGCAGAAATCTGACTTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGTCTTACCAGGGACTTGTATTAGC 52646434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4498 AGGCAGAAATCTGACTTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGTCTTACCAGGGACTTGTATTAGC 4557

 52646435 ATAGACTGTTAAGAATATGGGAAGATTTTTAAAATACAGTACTCAGAAAATTTCTCTTTG 52646494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4558 ATAGACTGTTAAGAATATGGGAAGATTTTTAAAATACAGTACTCAGAAAATTTCTCTTTG 4617

 52646495 AAAGGCTGGAAGAGCAGATATCCACACAAGAAGGCAAATTAGACCTCAGGCCAGTGTGGA 52646554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4618 AAAGGCTGGAAGAGCAGATATCCACACAAGAAGGCAAATTAGACCTCAGGCCAGTGTGGA 4677

 52646555 ATTAAAGGTGTAGGGTTATCTGGTCAAGACTGTGTGTGTGGATACAGGCTCCAACCCCTC 52646614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4678 ATTAAAGGTGTAGGGTTATCTGGTCAAGACTGTGTGTGTGGATACAGGCTCCAACCCCTC 4737

 52646615 CAGGCAAGGGCACTGTTTCCAACATCCACCCTTTCTCCTTTGACCTCTACCTTGACCTAA 52646674
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4738 CAGGCAAGGGCAATGTTTCCAACATCCACCCTTTCTCCTTTGACCTCTACCTTGACCTAA 4797

 52646675 ATTAACTATAAAAGGTCCTTCTTTTCTAGGACCCTACTATAAATCAGTGAAATATTCAGG 52646734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4798 ATTAACTATAAAAGGTCCTTCTTTTCTAGGACCCTACTATAAATCAGTGAAATATTCAGG 4857

 52646735 AAAAAAAGAACACCAAGAATGTTGGGATCCCAGTTAAAGATCAAGATTCTCTACTGATAA 52646794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4858 AAAAAAAGAACACCAAGAATGTTGGGATCCCAGTTAAAGATCAAGATTCTCTACTGATAA 4917

 52646795 GCTGTGTGATATGGAGTAAATCACTAAAGATCTTTGAATCTCTTCATTTGTAAAATGGGA 52646854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4918 GCTGTGTGATATGGAGTAAATCACTAAAGATCTTTGAATCTCTTCATTTGTAAAATGGGA 4977

 52646855 ATATTGGTAGTCCTACTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTAAAGAAGAAAAGTCATGCAAAGG 52646914
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4978 ATATTGGTAGTCTTACTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTAAAGAAGAAAAGTCATGCAAAGG 5037

 52646915 ATCTGGCACAACGCCTTTTCCATAATAAGTGCTTAGTAATTGACAGATACTGTGATAACT 52646974
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5038 ATCTGGCACAATGCCTTTTCCATAATAAGTGCTTAGTAATTGACAGATACTGTGATAACT 5097

 52646975 TTTCAGGTTTCTCTCATGCCTTTGACAACATTGCATTTTGCTTGCTCTATCTGTAGTCAG 52647034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5098 TTTCAGGTTTCTCTCATGCCTTTGACAACATTGCATTTTGCTTGCTCTATCTGTAGTCAG 5157

 52647035 ACACTTCTTAATATCTGTTTGCAGGAAGAC 52647064
          ||||||||||||||||||||||||||||||
     5158 ACACTTCTTAATATCTGTTTGCAGGAAGAC 5187

EXCISED REGION

 52658003 AGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTG 52658062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5188 AGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTG 5247

 52658063 GCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTAT 52658122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5248 GCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTAT 5307

 52658123 AAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGG 52658182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5308 AAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGG 5367

 52658183 GAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTG 52658242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5368 GAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTG 5427

 52658243 AAACACTGTCTCTGCTAAAAAACAAAACAAAACAAAACACCAAAAAATAGCTGGGCGTAG 52658302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5428 AAACACTGTCTCTGCTAAAAAACAAAACAAAACAAAACACCAAAAAATAGCTGGGCGTAG 5487

 52658303 TGGCGGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTTGGGAGGCGGTGGCAGGAGAATCATTTGAACCT 52658362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5488 TGGCGGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTTGGGAGGCGGTGGCAGGAGAATCATTTGAACCT 5547

 52658363 GGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGAT--------TGTGCCACTGCACTCTAACCTGG 52658414
          |||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||
     5548 GGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACTGTGCCACTGCACTCTAACCTGG 5607

 52658415 GCAACAGAGTTCAGAGTGAGACTCTGTCTCCCCC------------------AAAAAAAA 52658456
          ||||||||||||||||||||||||||||||                      ||||||||
     5608 GCAACAGAGTTCAGAGTGAGACTCTGTCTC----ACCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 5663

 52658457 AAAAAAAAAAAAAAGAACAGCCATATAGATCGTCGGTGGGAGTGTAATTTGGCCACTTCT 52658516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5664 AAAAAAAAAAAAAAGAACAGCCATATAGATCGTCGGTGGGAGTGTAATTTGGCCACTTCT 5723

 52658517 TTGGAAAATAGCTCAGTAATATCTATTAATACTTAAAATTTCACAAACACTGTAAGTCTA 52658576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5724 TTGGAAAATAGCTCAGTAATATCTATTAATACTTAAAATTTCACAAACACTGTAAGTCTA 5783

 52658577 ACTTCCACTTCTAAAATGTTATCCTAGAAATAAAATTGCATAGGGGTACAAAGGCTTACG 52658636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5784 ACTTCCACTTCTAAAATGTTATCCTAGAAATAAAATTGCATAGGGGTACAAAGGCTTACG 5843

 52658637 TATGGAACTATTTGCTGGACTACTGTAGTTGTGGCAAAAAACTGGAAATGACCTAAACGC 52658696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5844 TATGGAACTATTTGCTGGACTACTGTAGTTGTGGCAAAAAACTGGAAATGACCTAAACGC 5903

 52658697 TTATTAGTAGAAACCTGGTTAAATAAATTATCATATGTCCTTGAGGACACAGGGACACAA 52658756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5904 TTATTAGTAGAAACCTGGTTAAATAAATTATCATATGTCCTTGAGGACACAGGGACACAA 5963

 52658757 AGAGGGGAATGACAGGCACTGAGCCTACTTGAGGGTGGGAGGAGGAAGTCGATCAGAAAA 52658816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5964 AGAGGGGAATGACAGGCACTGAGCCTACTTGAGGGTGGGAGGAGGAAGTCGATCAGAAAA 6023

 52658817 AATAACTAGTGGGTACTAGGCTTAGTACCCGGGTGAAAAAATAATCTGTACAACAAACCC 52658876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6024 AATAACTAGTGGGTACTAGGCTTAGTACCCGGGTGAAAAAATAATCTGTACAACAAACCC 6083

 52658877 CCATGACATGAGTTTACCTTATAACAAACCTGCACATGTAATCTGAACCTAGATAAAAGT 52658936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6084 CCATGACATGAGTTTACCTTATAACAAACCTGCACATGTAATCTGAACCTAGATAAAAGT 6143

 52658937 TTAAAAAAATAAATAATCATATGTCCCTACAATGAAATATTCCACAGGCATTAAAATTCC 52658996
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     6144 TTAAAAAAATAAATAATCATATGTCCCTATAATGAAATATTCCACAGGCATTAAAATTCC 6203

 52658997 CCAAGGAATTTTAGTAAGGAAAGAAAAAGCTGTGCCCAACAGCACGTACAGTATGTTTCC 52659056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6204 CCAAGGAATTTTAGTAAGGAAAGAAAAAGCTGTGCCCAACAGCACGTACAGTATGTTTCC 6263

 52659057 ATTTGTTTTTAAAAAATGGTGTCGGGAGGTTGAGGAGACAACTTATAAATAGACATGCCT 52659116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6264 ATTTGTTTTTAAAAAATGGTGTCGGGAGGTTGAGGAGACAACTTATAAATAGACATGCCT 6323

 52659117 GGGATACCTCTGGATATAAGAAACTGTAAAGTATTTACTTCTAAGGAAGGAAATTTGGGA 52659176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6324 GGGATACCTCTGGATATAAGAAACTGTAAAGTATTTACTTCTAAGGAAGGAAATTTGGGA 6383

 52659177 TGGGGCTTGGGGAGCCATCAGAGTTAGGGTGGGGATTTTTTCTCTGCCTTATCTTATTAT 52659236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6384 TGGGGCTTGGGGAGCCATCAGAGTTAGGGTGGGGATTTTTTCTCTGCCTTATCTTATTAT 6443

 52659237 GTATATCGCTCAGAATGTTTGCTATGTGTATGCACCTACCCCATCCATTAAGAAATGAAG 52659296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6444 GTATATCGCTCAGAATGTTTGCTATGTGTATGCACCTACCCCATCCATTAAGAAATGAAG 6503

 52659297 AAATAATGAAAAGAAAAAATGAAAGTAGGGAACTAGAAATGAGAGGTGGGATTCAAAGTG 52659356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6504 AAATAATGAAAAGAAAAAATGAAAGTAGGGAACTAGAAATGAGAGGTGGGATTCAAAGTG 6563

 52659357 GACTGAACACTTGACCTATTTCCCAATTTGCCTAGGGCTGGCCCAGCAGCGAGGCAGGTT 52659416
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     6564 GACTGAACACTTGACCTATTTCCCAATTTGCCTGGGGCTGGCCCAGCAGCGAGGCAGGTT 6623

 52659417 CTAACCAATGAGCATCAGCTTTGAATGGAGGGGCTGATAGGCCAGGTGGGCCCTGCTTGC 52659476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6624 CTAACCAATGAGCATCAGCTTTGAATGGAGGGGCTGATAGGCCAGGTGGGCCCTGCTTGC 6683

 52659477 TGAGAGTGTCATGGCCTTAGGGACATCTCCATGTTGCAGAGTCTGAGCCTCTGCTTGGCA 52659536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6684 TGAGAGTGTCATGGCCTTAGGGACATCTCCATGTTGCAGAGTCTGAGCCTCTGCTTGGCA 6743

 52659537 AATTCAGAAAATCCAGCTTTTCTTTTTATATCACCTGGAGCTGATGTAACTCTCAGAAGG 52659596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     6744 AATTCAGAAAATCCAGCTTTTCTTTTTATATCACCTGGAGCTGATGTAACTCTCAGAACG 6803

 52659597 CATTTTTAAGAGGACTCATGAATTAACCACATAGCCAACTTACTGGCTTAAGACTACGTG 52659656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6804 CATTTTTAAGAGGACTCATGAATTAACCACATAGCCAACTTACTGGCTTAAGACTACGTG 6863

 52659657 ACAGAAAGCTGCAAAGGGGGCCAGCCACTGGTAACATCCCACCACTGTCCCTCTCTGTGG 52659716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6864 ACAGAAAGCTGCAAAGGGGGCCAGCCACTGGTAACATCCCACCACTGTCCCTCTCTGTGG 6923

 52659717 AAAACACAGATGGGATGCACATTGTGACGGGCAGGATGCCTGGAGAGCCCACAAATCTGC 52659776
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     6924 AAAACACAGATGGGATGCACATTGTGATGGGCAGGATGCCTGGAGAGCCCACAAATCTGC 6983

 52659777 AAGCACAGCTGAAATTGGTTACAGGATTTCAATGTTTCATTGCTTGAAGCTATGATAACT 52659836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6984 AAGCACAGCTGAAATTGGTTACAGGATTTCAATGTTTCATTGCTTGAAGCTATGATAACT 7043

 52659837 TGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGACGATGATTTTTTTTATAGCCATCTTTT 52659896
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7044 ---TGATGATGATGATGATGATGATGATGATGACGATGATTTTTTTTATAGCCATCTTTT 7100

 52659897 TAGAGGGATTTGAGGTAGGGAAAAAAATAAACCTCACACTATCGGAGGTTGCCAACTATG 52659956
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7101 TAGAGGGATTTGAGGTAAGGAAAAAAATAAACCTCACACTATCGGAGGTTGCCAACTATG 7160

 52659957 AGGTCTGCTGATGGTTTGGCCAACACAGTGTTTATATTTTTTTGAATTGGGAAATTTCAT 52660016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7161 AGGTCTGCTGATGGTTTGGCCAACACAGTGTTTATATTTTTTTGAATTGGGAAATTTCAT 7220

 52660017 TTAAAAGTCCTAAAATCAGGCTGTTATTGAAATATCTTATTATTGGCTCAGGGTTTCCCA 52660076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7221 TTAAAAGTCCTAAAATCAGGCTGTTATTGAAATATCTTATTATTGGCTCAGGGTTTCCCA 7280

 52660077 GGGCAGCCATCCTTGAAGCTGTGTGGAGCCCTATAAACAAGGACGCTTTCCAGTTCCCTG 52660136
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     7281 GGGCAGCCATCCTTGAAGCTGTGTGGAGCCCTATAAACAAGGAGGCTTTCCAGTTCCCTG 7340

 52660137 CAAACTCCATTTCATTCAGAGCCTTGAGCCAGTTCTTACATGGTCCTCAGACTTGAGCTA 52660196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7341 CAAACTCCATTTCATTCAGAGCCTTGAGCCAGTTCTTACATGGTCCTCAGACTTGAGCTA 7400

 52660197 GTGCAAGAATACCCGGGAGGGGTTGTGGGAACAGATAGCTGGGCCCCACCCCCAGGGAAG 52660256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7401 GTGCAAGAATACCCGGGAGGGGTTGTGGGAACAGATAGCTGGGCCCCACCCCCAGGGAAG 7460

 52660257 GGGGTGTTTCTGACTCAGGAGGTCTGGGCTCCGGCTACAGAAACTGCACATCTAACCGGT 52660316
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7461 GGGGTGTTTCTGACTCAGGAGGTATGGGCTCCGGCTACAGAAACTGCACATCTAACCGGT 7520

 52660317 ACCCAGGTGATGTGATGCTGCTGGCCCAGGGACAACTCTGCGAGTCACTGCTATTGGGCA 52660376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7521 ACCCAGGTGATGTGATGCTGCTGGCCCAGGGACAACTCTGCGAGTCACTGCTATTGGGCA 7580

 52660377 CTGCTATTGCACCCACACAAGGAGGCAGGCTCTGCTTACATTTTTCAGTTCTTGTTCCCA 52660436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7581 CTGCTATTGCACCCACACAAGGAGGCAGGCTCTGCTTACATTTTTCAGTTCTTGTTCCCA 7640

 52660437 GAAACATTTGCTCTTTGGGGTATGCTTTGCATATAATGGATCCTACCCACTAATACAGTA 52660496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7641 GAAACATTTGCTCTTTGGGGTATGCTTTGCATATAATGGATCCTACCCACTAATACAGTA 7700

 52660497 TGCTGCTTTTATTGATAAACTTCCAGAAACTTGAAGCGCACCTTACCATTTCTTTGATCT 52660556
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     7701 TGCTGCTTTTATTGATAAACTTCCAGATACTTGAAGCGCACCTTACCATTTCTTTGATCT 7760

 52660557 CGCTGATTATTTTTATTTTTGTTAAATGAAAATTGTTGGTAAGTTCTTTTTGGTGTGGTA 52660616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7761 CGCTGATTATTTTTATTTTTGTTAAATGAAAATTGTTGGTAAGTTCTTTTTGGTGTGGTA 7820

 52660617 AAAGGATATGAAAAGCTGATTTTAAAAAAATGTCCACTCTAGGATTAGAATTGTAGGTGT 52660676
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7821 AAAGGATATGAAAAACTGATTTTAAAAAAATGTCCACTCTAGGATTAGAATTGTAGGTGT 7880

 52660677 GTTTATTCTATTTCAAGATCTGGTTAAAATGCACCTTGAGGAAAAGAATTGAGTGCAGCT 52660736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7881 GTTTATTCTATTTCAAGATCTGGTTAAAATGCACCTTGAGGAAAAGAATTGAGTGCAGCT 7940

 52660737 GTTGTTATTTCTCAATGCTGTTTCTCTTTTCATGTTTTTTTCATGTTGTCTCTTGGTCTG 52660796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7941 GTTGTTATTTCTCAATGCTGTTTCTCTTTTCATGTTTTTTTCATGTTGTCTCTTGGTCTG 8000

 52660797 TCCTATCTCTCTTGGTCTATCCTCCAAGACAGAGATGAGTGATCTTGAAACCCTGCCCAT 52660856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8001 TCCTATCTCTCTTGGTCTATCCTCCAAGACAGAGATGAGTGATCTTGAAACCCTGCCCAT 8060

 52660857 GTTTTTATCTTTGGAGCCCAACTGTGCTGCCTTGTTTTCTTCTCCATCCAAAGAGGCAAA 52660916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8061 GTTTTTATCTTTGGAGCCCAACTGTGCTGCCTTGTTTTCTTCTCCATCCAAAGAGGCAAA 8120

 52660917 GAGAAAGTTGCATATTACTCAACAGCAGTTGCATGACAGTTAAAATCAGACTGTATGAGT 52660976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8121 GAGAAAGTTGCATATTACTCAACAGCAGTTGCATGACAGTTAAAATCAGACTGTATGAGT 8180

 52660977 CATGGAACAGTAAGTTGTGTCCAGAGTATCTGTCATGGTAAGTACAAAAAAGTCCTTAAA 52661036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8181 CATGGAACAGTAAGTTGTGTCCAGAGTATCTGTCATGGTAAGTACAAAAAAGTCCTTAAA 8240

 52661037 AATTTAAAACAGAAATGCCAATGTTTTATTTTTGAAAAATGTGAAGA 52661083
          |||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     8241 AATTTAAAACAGAAATGCCAATGTTTTATTTCTGAAAAATGTGAAGA 8287

Alignment time is 8.91956 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [52637064,52668002] =>     30939 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    3100] =>      3100 nucs 'mol-32-2895-129448_3100'

Score:        2935
Aligned:      3085        nucs
Identic:      3064 ( 99%) nucs =>       442 ( 98%)      2622 (100%)
Gaps:           11 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [52658003,52658444] EXCISED REGION [52658449,52661083]
 second seq =>  [       1,     450] EXCISED REGION [     469,    3100]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         4 nucs [52658445,52658448]
 second seq =>        18 nucs [451,468]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [52658444,52658444] to [52658448,52658448]
 second seq =>         1 nucs [451,451] to [469,469]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [52658445,52658446] to [52658447,52658448]
 second seq =>         1 nucs [451,451] to [468,468]

 52658003 AGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTG 52658062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTG 60

 52658063 GCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTAT 52658122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTAT 120

 52658123 AAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGG 52658182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGG 180

 52658183 GAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTG 52658242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTG 240

 52658243 AAACACTGTCTCTGCTAAAAAACAAAACAAAACAAAACACCAAAAAATAGCTGGGCGTAG 52658302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAACACTGTCTCTGCTAAAAAACAAAACAAAACAAAACACCAAAAAATAGCTGGGCGTAG 300

 52658303 TGGCGGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTTGGGAGGCGGTGGCAGGAGAATCATTTGAACCT 52658362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGGCGGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTTGGGAGGCGGTGGCAGGAGAATCATTTGAACCT 360

 52658363 GGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACTG--------CACTCTAACCTGG 52658414
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||
      361 GGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACTGTGCCACTGCACTCTAACCTGG 420

 52658415 GCAACAGAGTTCAGAGTGAGACTCTGTCTC 52658444
          ||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GCAACAGAGTTCAGAGTGAGACTCTGTCTC 450

EXCISED REGION

 52658449 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAACAGCCATATAGATCGTCGGTGGGAGTGTAATTTGG 52658508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      469 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAACAGCCATATAGATCGTCGGTGGGAGTGTAATTTGG 528

 52658509 CCACTTCTTTGGAAAATAGCTCAGTAATATCTATTAATACTTAAAATTTCACAAACACTG 52658568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      529 CCACTTCTTTGGAAAATAGCTCAGTAATATCTATTAATACTTAAAATTTCACAAACACTG 588

 52658569 TAAGTCTAACTTCCACTTCTAAAATGTTATCCTAGAAATAAAATTGCATAGGGGTACAAA 52658628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      589 TAAGTCTAACTTCCACTTCTAAAATGTTATCCTAGAAATAAAATTGCATAGGGGTACAAA 648

 52658629 GGCTTACGTATGGAACTATTTGCTGGACTACTGTAGTTGTGGCAAAAAACTGGAAATGAC 52658688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      649 GGCTTACGTATGGAACTATTTGCTGGACTACTGTAGTTGTGGCAAAAAACTGGAAATGAC 708

 52658689 CTAAACGCTTATTAGTAGAAACCTGGTTAAATAAATTATCATATGTCCTTGAGGACACAG 52658748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      709 CTAAACGCTTATTAGTAGAAACCTGGTTAAATAAATTATCATATGTCCTTGAGGACACAG 768

 52658749 GGACACAAAGAGGGGAATGACAGGCACTGAGCCTACTTGAGGGTGGGAGGAGGAAGTCGA 52658808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      769 GGACACAAAGAGGGGAATGACAGGCACTGAGCCTACTTGAGGGTGGGAGGAGGAAGTCGA 828

 52658809 TCAGAAAAAATAACTAGTGGGTACTAGGCTTAGTACCCGGGTGAAAAAATAATCTGTACA 52658868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      829 TCAGAAAAAATAACTAGTGGGTACTAGGCTTAGTACCCGGGTGAAAAAATAATCTGTACA 888

 52658869 ACAAACCCCCATGACATGAGTTTACCTTATAACAAACCTGCACATGTAATCTGAACCTAG 52658928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      889 ACAAACCCCCATGACATGAGTTTACCTTATAACAAACCTGCACATGTAATCTGAACCTAG 948

 52658929 ATAAAAGTTTAAAAAAATAAATAATCATATGTCCCTACAATGAAATATTCCACAGGCATT 52658988
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
      949 ATAAAAGTTTAAAAAAATAAATAATCATATGTCCCTATAATGAAATATTCCACAGGCATT 1008

 52658989 AAAATTCCCCAAGGAATTTTAGTAAGGAAAGAAAAAGCTGTGCCCAACAGCACGTACAGT 52659048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1009 AAAATTCCCCAAGGAATTTTAGTAAGGAAAGAAAAAGCTGTGCCCAACAGCACGTACAGT 1068

 52659049 ATGTTTCCATTTGTTTTTAAAAAATGGTGTCGGGAGGTTGAGGAGACAACTTATAAATAG 52659108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1069 ATGTTTCCATTTGTTTTTAAAAAATGGTGTCGGGAGGTTGAGGAGACAACTTATAAATAG 1128

 52659109 ACATGCCTGGGATACCTCTGGATATAAGAAACTGTAAAGTATTTACTTCTAAGGAAGGAA 52659168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1129 ACATGCCTGGGATACCTCTGGATATAAGAAACTGTAAAGTATTTACTTCTAAGGAAGGAA 1188

 52659169 ATTTGGGATGGGGCTTGGGGAGCCATCAGAGTTAGGGTGGGGATTTTTTCTCTGCCTTAT 52659228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1189 ATTTGGGATGGGGCTTGGGGAGCCATCAGAGTTAGGGTGGGGATTTTTTCTCTGCCTTAT 1248

 52659229 CTTATTATGTATATCGCTCAGAATGTTTGCTATGTGTATGCACCTACCCCATCCATTAAG 52659288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1249 CTTATTATGTATATCGCTCAGAATGTTTGCTATGTGTATGCACCTACCCCATCCATTAAG 1308

 52659289 AAATGAAGAAATAATGAAAAGAAAAAATGAAAGTAGGGAACTAGAAATGAGAGGTGGGAT 52659348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1309 AAATGAAGAAATAATGAAAAGAAAAAATGAAAGTAGGGAACTAGAAATGAGAGGTGGGAT 1368

 52659349 TCAAAGTGGACTGAACACTTGACCTATTTCCCAATTTGCCTAGGGCTGGCCCAGCAGCGA 52659408
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     1369 TCAAAGTGGACTGAACACTTGACCTATTTCCCAATTTGCCTGGGGCTGGCCCAGCAGCGA 1428

 52659409 GGCAGGTTCTAACCAATGAGCATCAGCTTTGAATGGAGGGGCTGATAGGCCAGGTGGGCC 52659468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1429 GGCAGGTTCTAACCAATGAGCATCAGCTTTGAATGGAGGGGCTGATAGGCCAGGTGGGCC 1488

 52659469 CTGCTTGCTGAGAGTGTCATGGCCTTAGGGACATCTCCATGTTGCAGAGTCTGAGCCTCT 52659528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1489 CTGCTTGCTGAGAGTGTCATGGCCTTAGGGACATCTCCATGTTGCAGAGTCTGAGCCTCT 1548

 52659529 GCTTGGCAAATTCAGAAAATCCAGCTTTTCTTTTTATATCACCTGGAGCTGATGTAACTC 52659588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1549 GCTTGGCAAATTCAGAAAATCCAGCTTTTCTTTTTATATCACCTGGAGCTGATGTAACTC 1608

 52659589 TCAGAAGGCATTTTTAAGAGGACTCATGAATTAACCACATAGCCAACTTACTGGCTTAAG 52659648
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1609 TCAGAACGCATTTTTAAGAGGACTCATGAATTAACCACATAGCCAACTTACTGGCTTAAG 1668

 52659649 ACTACGTGACAGAAAGCTGCAAAGGGGGCCAGCCACTGGTAACATCCCACCACTGTCCCT 52659708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1669 ACTACGTGACAGAAAGCTGCAAAGGGGGCCAGCCACTGGTAACATCCCACCACTGTCCCT 1728

 52659709 CTCTGTGGAAAACACAGATGGGATGCACATTGTGACGGGCAGGATGCCTGGAGAGCCCAC 52659768
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     1729 CTCTGTGGAAAACACAGATGGGATGCACATTGTGATGGGCAGGATGCCTGGAGAGCCCAC 1788

 52659769 AAATCTGCAAGCACAGCTGAAATTGGTTACAGGATTTCAATGTTTCATTGCTTGAAGCTA 52659828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1789 AAATCTGCAAGCACAGCTGAAATTGGTTACAGGATTTCAATGTTTCATTGCTTGAAGCTA 1848

 52659829 TGATAACTTGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGACGATGATTTTTTTTATAGC 52659888
          ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1849 TGATAACT---TGATGATGATGATGATGATGATGATGATGACGATGATTTTTTTTATAGC 1905

 52659889 CATCTTTTTAGAGGGATTTGAGGTAGGGAAAAAAATAAACCTCACACTATCGGAGGTTGC 52659948
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1906 CATCTTTTTAGAGGGATTTGAGGTAAGGAAAAAAATAAACCTCACACTATCGGAGGTTGC 1965

 52659949 CAACTATGAGGTCTGCTGATGGTTTGGCCAACACAGTGTTTATATTTTTTTGAATTGGGA 52660008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1966 CAACTATGAGGTCTGCTGATGGTTTGGCCAACACAGTGTTTATATTTTTTTGAATTGGGA 2025

 52660009 AATTTCATTTAAAAGTCCTAAAATCAGGCTGTTATTGAAATATCTTATTATTGGCTCAGG 52660068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2026 AATTTCATTTAAAAGTCCTAAAATCAGGCTGTTATTGAAATATCTTATTATTGGCTCAGG 2085

 52660069 GTTTCCCAGGGCAGCCATCCTTGAAGCTGTGTGGAGCCCTATAAACAAGGACGCTTTCCA 52660128
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     2086 GTTTCCCAGGGCAGCCATCCTTGAAGCTGTGTGGAGCCCTATAAACAAGGAGGCTTTCCA 2145

 52660129 GTTCCCTGCAAACTCCATTTCATTCAGAGCCTTGAGCCAGTTCTTACATGGTCCTCAGAC 52660188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2146 GTTCCCTGCAAACTCCATTTCATTCAGAGCCTTGAGCCAGTTCTTACATGGTCCTCAGAC 2205

 52660189 TTGAGCTAGTGCAAGAATACCCGGGAGGGGTTGTGGGAACAGATAGCTGGGCCCCACCCC 52660248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2206 TTGAGCTAGTGCAAGAATACCCGGGAGGGGTTGTGGGAACAGATAGCTGGGCCCCACCCC 2265

 52660249 CAGGGAAGGGGGTGTTTCTGACTCAGGAGGTCTGGGCTCCGGCTACAGAAACTGCACATC 52660308
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     2266 CAGGGAAGGGGGTGTTTCTGACTCAGGAGGTATGGGCTCCGGCTACAGAAACTGCACATC 2325

 52660309 TAACCGGTACCCAGGTGATGTGATGCTGCTGGCCCAGGGACAACTCTGCGAGTCACTGCT 52660368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2326 TAACCGGTACCCAGGTGATGTGATGCTGCTGGCCCAGGGACAACTCTGCGAGTCACTGCT 2385

 52660369 ATTGGGCACTGCTATTGCACCCACACAAGGAGGCAGGCTCTGCTTACATTTTTCAGTTCT 52660428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2386 ATTGGGCACTGCTATTGCACCCACACAAGGAGGCAGGCTCTGCTTACATTTTTCAGTTCT 2445

 52660429 TGTTCCCAGAAACATTTGCTCTTTGGGGTATGCTTTGCATATAATGGATCCTACCCACTA 52660488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2446 TGTTCCCAGAAACATTTGCTCTTTGGGGTATGCTTTGCATATAATGGATCCTACCCACTA 2505

 52660489 ATACAGTATGCTGCTTTTATTGATAAACTTCCAGAAACTTGAAGCGCACCTTACCATTTC 52660548
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     2506 ATACAGTATGCTGCTTTTATTGATAAACTTCCAGATACTTGAAGCGCACCTTACCATTTC 2565

 52660549 TTTGATCTCGCTGATTATTTTTATTTTTGTTAAATGAAAATTGTTGGTAAGTTCTTTTTG 52660608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2566 TTTGATCTCGCTGATTATTTTTATTTTTGTTAAATGAAAATTGTTGGTAAGTTCTTTTTG 2625

 52660609 GTGTGGTAAAAGGATATGAAAAGCTGATTTTAAAAAAATGTCCACTCTAGGATTAGAATT 52660668
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2626 GTGTGGTAAAAGGATATGAAAAACTGATTTTAAAAAAATGTCCACTCTAGGATTAGAATT 2685

 52660669 GTAGGTGTGTTTATTCTATTTCAAGATCTGGTTAAAATGCACCTTGAGGAAAAGAATTGA 52660728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2686 GTAGGTGTGTTTATTCTATTTCAAGATCTGGTTAAAATGCACCTTGAGGAAAAGAATTGA 2745

 52660729 GTGCAGCTGTTGTTATTTCTCAATGCTGTTTCTCTTTTCATGTTTTTTTCATGTTGTCTC 52660788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2746 GTGCAGCTGTTGTTATTTCTCAATGCTGTTTCTCTTTTCATGTTTTTTTCATGTTGTCTC 2805

 52660789 TTGGTCTGTCCTATCTCTCTTGGTCTATCCTCCAAGACAGAGATGAGTGATCTTGAAACC 52660848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2806 TTGGTCTGTCCTATCTCTCTTGGTCTATCCTCCAAGACAGAGATGAGTGATCTTGAAACC 2865

 52660849 CTGCCCATGTTTTTATCTTTGGAGCCCAACTGTGCTGCCTTGTTTTCTTCTCCATCCAAA 52660908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2866 CTGCCCATGTTTTTATCTTTGGAGCCCAACTGTGCTGCCTTGTTTTCTTCTCCATCCAAA 2925

 52660909 GAGGCAAAGAGAAAGTTGCATATTACTCAACAGCAGTTGCATGACAGTTAAAATCAGACT 52660968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2926 GAGGCAAAGAGAAAGTTGCATATTACTCAACAGCAGTTGCATGACAGTTAAAATCAGACT 2985

 52660969 GTATGAGTCATGGAACAGTAAGTTGTGTCCAGAGTATCTGTCATGGTAAGTACAAAAAAG 52661028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2986 GTATGAGTCATGGAACAGTAAGTTGTGTCCAGAGTATCTGTCATGGTAAGTACAAAAAAG 3045

 52661029 TCCTTAAAAATTTAAAACAGAAATGCCAATGTTTTATTTTTGAAAAATGTGAAGA 52661083
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     3046 TCCTTAAAAATTTAAAACAGAAATGCCAATGTTTTATTTCTGAAAAATGTGAAGA 3100

Alignment time is 3.35491 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [52637064,52668002] =>     30939 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    3282] =>      3282 nucs 'mol-32-29be-024074_3282'

Score:        3184
Aligned:      3285        nucs
Identic:      3266 ( 99%) nucs =>      2824 (100%)       442 ( 98%)
Gaps:           14 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [52644233,52647064] EXCISED REGION [52658003,52658444]
 second seq =>  [       1,    2832] EXCISED REGION [    2833,    3282]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>     10938 nucs [52647065,52658002]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         6 nucs [52647065,52647070] to [52658003,52658008]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [52647065,52647067] to [52658000,52658002]
 second seq =>         0 nucs

 52644233 ATGCTCTTTTTAGTGTCAAAAAGAGCTTGCCTTTCTTCGCTCAGGAAAAAAAGCAACTGA 52644292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATGCTCTTTTTAGTGTCAAAAAGAGCTTGCCTTTCTTCGCTCAGGAAAAAAAGCAACTGA 60

 52644293 TTCCAGGATACCTTCTTTGAAAACCAACACAAAAAAACCCCCCAAAAAACAAAAAAAAAA 52644352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTCCAGGATACCTTCTTTGAAAACCAACACAAAAAAACCCCCCAAAAAACAAAAAAAAAA 120

 52644353 CCCAAAACCCCTAGTTTTTACAAAGGTTTATTACTCCTACTTGTTGGAAAAGAATTACTA 52644412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCCAAAACCCCTAGTTTTTACAAAGGTTTATTACTCCTACTTGTTGGAAAAGAATTACTA 180

 52644413 CATAAAAGAGTCTGCCCAGAGCTGTAAAATCTCCTTATTCAAACACACACCTTAGAGCAA 52644472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CATAAAAGAGTCTGCCCAGAGCTGTAAAATCTCCTTATTCAAACACACACCTTAGAGCAA 240

 52644473 AAGATGGTTAAATATCAATTCAGGCTATTAACAGTAAGGGAC---GAAATGTGTTCCAAC 52644529
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||
      241 AAGATGGTTAAATATCAATTCAGGCTATTAACAGTAAGG---AATGAAATGTGTTCCAAC 297

 52644530 AAAACTCTGCATGTCAACAAACTACAGAGACTAGGTAACATCTTTTAGGAATCATTTTTA 52644589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      298 AAAACTCTGCATGTCAACAAACTACAGAGACTAGGTAACATCTTTTAGGAATCATTTTTA 357

 52644590 TTCCACTAATGCCTTTTCCTCCAGAATCCACTGATCGTAAACGCAACCTGTCTACTTCCG 52644649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      358 TTCCACTAATGCCTTTTCCTCCAGAATCCACTGATCGTAAACGCAACCTGTCTACTTCCG 417

 52644650 CCTTTGAAAAATGGATGGACAAATTCATCTGCATGTAACTCACCTCCTCTTTTCTTTTAC 52644709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      418 CCTTTGAAAAATGGATGGACAAATTCATCTGCATGTAACTCACCTCCTCTTTTCTTTTAC 477

 52644710 ATAAAACAGATGCCACAGCTGTTATTGTTCTTCACACAGAAGTTTCTACCCAGAGAAACA 52644769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      478 ATAAAACAGATGCCACAGCTGTTATTGTTCTTCACACAGAAGTTTCTACCCAGAGAAACA 537

 52644770 TCAGGATGACACTCTGCTGCAATGTGCTATTTGTTCTAGAGGGGTCAACAGCTTGCCACC 52644829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      538 TCAGGATGACACTCTGCTGCAATGTGCTATTTGTTCTAGAGGGGTCAACAGCTTGCCACC 597

 52644830 TTGCCTAGGCCCAGGGTGACTGCATATGTGCAGTGGTCTTATCCCATTAGCGCCCCCGAG 52644889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      598 TTGCCTAGGCCCAGGGTGACTGCATATGTGCAGTGGTCTTATCCCATTAGCGCCCCCGAG 657

 52644890 CATGCATTCAGAACCAAGTGGATACACCTTGGCACACTTACCTTCCCTGCAGGGACATCA 52644949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      658 CATGCATTCAGAACCAAGTGGATACACCTTGGCACACTTACCTTCCCTGCAGGGACATCA 717

 52644950 TCGGACTGCCCTGATAAGCCAGGAACCTCATCCACCTTGTCTTGATGCTCTGCCCTCTTG 52645009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      718 TCGGACTGCCCTGATAAGCCAGGAACCTCATCCACCTTGTCTTGATGCTCTGCCCTCTTG 777

 52645010 GCTTCCTGTTGGCTGTCACCTGGCACCTTTTCCTGTCCCTTGTCCAGCTTGAAGAATTTG 52645069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      778 GCTTCCTGTTGGCTGTCACCTGGCACCTTTTCCTGTCCCTTGTCCAGCTTGAAGAATTTG 837

 52645070 TCAAAAAAGCTGGAGTCCTTGGGCTTGGAGGGAGCTTCTCCTCCTGCTCCCCCTGTCTCA 52645129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      838 TCAAAAAAGCTGGAGTCCTTGGGCTTGGAGGGAGCTTCTCCTCCTGCTCCCCCTGTCTCA 897

 52645130 GGTGGGAGAAGCGTGGGATCCCTGGCGGCAGAGAGGACCTTGTCTTGGGCCGGGGCGTGC 52645189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      898 GGTGGGAGAAGCGTGGGATCCCTGGCGGCAGAGAGGACCTTGTCTTGGGCCGGGGCGTGC 957

 52645190 CCTGGGGTTTTATCTGTGTCCTGCCCCGGTCCAGCTGCCACCGGAAGTGTCCAGCTCTCA 52645249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      958 CCTGGGGTTTTATCTGTGTCCTGCCCCGGTCCAGCTGCCACCGGAAGTGTCCAGCTCTCA 1017

 52645250 CTTGGGTCTTTGTTCGCTGGAGCTTTATTGGAGCTGACATCAAGCTTCACTGATCCAAGG 52645309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1018 CTTGGGTCTTTGTTCGCTGGAGCTTTATTGGAGCTGACATCAAGCTTCACTGATCCAAGG 1077

 52645310 GATGAATCTGCGGCTTGGTCTCCGGTACGTCCTGGTACAGGCCGAGAGAGCATCAAGAAA 52645369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1078 GATGAATCTGCGGCTTGGTCTCCGGTACGTCCTGGTACAGGCCGAGAGAGCATCAAGAAA 1137

 52645370 AAACGAGATTTAGCAGCTGGTGCCTCGGGTTTGGCCTCTTTCCCAAGATTCTTTCCGTTG 52645429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1138 AAACGAGATTTAGCAGCTGGTGCCTCGGGTTTGGCCTCTTTCCCAAGATTCTTTCCGTTG 1197

 52645430 GCATCCGCAACAGCACTTATCTCCGTTGTCTCGGGGGAAGAAGTGGCCACATTATCCGTC 52645489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1198 GCATCCGCAACAGCACTTATCTCCGTTGTCTCGGGGGAAGAAGTGGCCACATTATCCGTC 1257

 52645490 TTGACACTTATTCCCAAGTCGACTGTAAACACAAACATAAACAGTGGTTATTCAGCCAAG 52645549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     1258 TTGACACTTATTCCCAAGTCGACTGTAAACACAAACATAAACAGCGGTTATTCAGCCAAG 1317

 52645550 CCGGGAAATTCAGGCACTAATAATGGACTCCAGACATTTTTTATACAAAAGCCATACTGC 52645609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1318 CCGGGAAATTCAGGCACTAATAATGGACTCCAGACATTTTTTATACAAAAGCCATACTGC 1377

 52645610 ATACTGGAACTGTGTTGTTCTCTGGTCATTCTGAAAGGCAGAAGTTAGCTCTCTACATCT 52645669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1378 ATACTGGAACTGTGTTGTTCTCTGGTCATTCTGAAAGGCAGAAGTTAGCTCTCTACATCT 1437

 52645670 CCTTGGACCCTGCTTTTCTTGGGAGAGGAGAAGGCAAGGTTGGTGAGGAGGGAAAGCTAC 52645729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1438 CCTTGGACCCTGCTTTTCTTGGGAGAGGAGAAGGCAAGGTTGGTGAGGAGGGAAAGCTAC 1497

 52645730 TTAATGGAAAGTCACTAGCTGCCAGGTGTGGAATGAGTGATATTCAATGTTAATTAATCT 52645789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1498 TTAATGGAAAGTCACTAGCTGCCAGGTGTGGAATGAGTGATATTCAATGTTAATTAATCT 1557

 52645790 TCTTTTATCTGTGTAAGAACTCCGTGAGCAGCATATTGTCATGATGTCAACTGGGAGGCA 52645849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1558 TCTTTTATCTGTGTAAGAACTCCGTGAGCAGCATATTGTCATGATGTCAACTGGGAGGCA 1617

 52645850 GTACAGCAGTTAGGAGCTTGGGTTCTGGAGCTAGAACAAGGTTTCTCAACCTCAGCACTA 52645909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1618 GTACAGCAGTTAGGAGCTTGGGTTCTGGAGCTAGAACAAGGTTTCTCAACCTCAGCACTA 1677

 52645910 CTCACATTTGAAGCCAGATTATTCTTTGTTAGGGAGGCTCATCCCGTGCCTCATAGGCTG 52645969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1678 CTCACATTTGAAGCCAGATTATTCTTTGTTAGGGAGGCTCATCCCGTGCCTCATAGGCTG 1737

 52645970 ATTAGCAGCATCCTGGCCTCTGCCCACTAGACGCCGGTCACATTTCCCAGTCATGGCAAC 52646029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1738 ATTAGCAGCATCCTGGCCTCTGCCCACTAGACGCCGGTCACATTTCCCAGTCATGGCAAC 1797

 52646030 CAAAAATATCTCTAGGCATTGCTAAATGTCCCCTGGAGGACAAAATCTCTTACGTTTGAG 52646089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1798 CAAAAATATCTCTAGGCATTGCTAAATGTCCCCTGGAGGACAAAATCTCTTACGTTTGAG 1857

 52646090 AGGCACTGAGCTGAAATGTCTTTTTGAATCCAGATTATCTAATTTTCTGTGCCTCAACTT 52646149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1858 AGGCACTGAGCTGAAATGTCTTTTTGAATCCAGATTATCTAATTTTCTGTGCCTCAACTT 1917

 52646150 TCTGGTAAAAGGAGACAGATAATAAATCTCGTAATTTTGTTAGGAAGATTACATGAGTTA 52646209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1918 TCTGGTAAAAGGAGACAGATAATAAATCTCGTAATTTTGTTAGGAAGATTACATGAGTTA 1977

 52646210 ATAGTTTTAAAGCAAGTACAATAGCACCTGGAATATATTAAGTGCTTAATAAATATCACA 52646269
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1978 ATAGTTTTAAAGCAAGTACAATAGCGCCTGGAATATATTAAGTGCTTAATAAATATCACA 2037

 52646270 AACATTAGTTATCATTATTCATGAGTGAGAAAACTGACAGTCAGAGAGGTCAGTACACCC 52646329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2038 AACATTAGTTATCATTATTCATGAGTGAGAAAACTGACAGTCAGAGAGGTCAGTACACCC 2097

 52646330 TCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCTAGTAAGCAGCAGAGTCTGGCTTCAGGCAGAAATCTGAC 52646389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2098 TCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCTAGTAAGCAGCAGAGTCTGGCTTCAGGCAGAAATCTGAC 2157

 52646390 TTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGTCTTACCAGGGACTTGTATTAGCATAGACTGTTAAGAA 52646449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2158 TTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGTCTTACCAGGGACTTGTATTAGCATAGACTGTTAAGAA 2217

 52646450 TATGGGAAGATTTTTAAAATACAGTACTCAGAAAATTTCTCTTTGAAAGGCTGGAAGAGC 52646509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2218 TATGGGAAGATTTTTAAAATACAGTACTCAGAAAATTTCTCTTTGAAAGGCTGGAAGAGC 2277

 52646510 AGATATCCACACAAGAAGGCAAATTAGACCTCAGGCCAGTGTGGAATTAAAGGTGTAGGG 52646569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2278 AGATATCCACACAAGAAGGCAAATTAGACCTCAGGCCAGTGTGGAATTAAAGGTGTAGGG 2337

 52646570 TTATCTGGTCAAGACTGTGTGTGTGGATACAGGCTCCAACCCCTCCAGGCAAGGGCACTG 52646629
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     2338 TTATCTGGTCAAGACTGTGTGTGTGGATACAGGCTCCAACCCCTCCAGGCAAGGGCAATG 2397

 52646630 TTTCCAACATCCACCCTTTCTCCTTTGACCTCTACCTTGACCTAAATTAACTATAAAAGG 52646689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2398 TTTCCAACATCCACCCTTTCTCCTTTGACCTCTACCTTGACCTAAATTAACTATAAAAGG 2457

 52646690 TCCTTCTTTTCTAGGACCCTACTATAAATCAGTGAAATATTCAGGAAAAAAAGAACACCA 52646749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2458 TCCTTCTTTTCTAGGACCCTACTATAAATCAGTGAAATATTCAGGAAAAAAAGAACACCA 2517

 52646750 AGAATGTTGGGATCCCAGTTAAAGATCAAGATTCTCTACTGATAAGCTGTGTGATATGGA 52646809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2518 AGAATGTTGGGATCCCAGTTAAAGATCAAGATTCTCTACTGATAAGCTGTGTGATATGGA 2577

 52646810 GTAAATCACTAAAGATCTTTGAATCTCTTCATTTGTAAAATGGGAATATTGGTAGTCCTA 52646869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2578 GTAAATCACTAAAGATCTTTGAATCTCTTCATTTGTAAAATGGGAATATTGGTAGTCCTA 2637

 52646870 CTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTAAAGAAGAAAAGTCATGCAAAGGATCTGGCACAACGCC 52646929
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||
     2638 CTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTAAAGAAGGAAAGTCATGCAAAGGATCTGGCACAATGCC 2697

 52646930 TTTTCCATAATAAGTGCTTAGTAATTGACAGATACTGTGATAACTTTTCAGGTTTCTCTC 52646989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2698 TTTTCCATAATAAGTGCTTAGTAATTGACAGATACTGTGATAACTTTTCAGGTTTCTCTC 2757

 52646990 ATGCCTTTGACAACATTGCATTTTGCTTGCTCTATCTGTAGTCAGACACTTCTTAATATC 52647049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2758 ATGCCTTTGACAACATTGCATTTTGCTTGCTCTATCTGTAGTCAGACACTTCTTAATATC 2817

 52647050 TGTTTGCAGGAAGAC 52647064
          |||||||||||||||
     2818 TGTTTGCAGGAAGAC 2832

EXCISED REGION

 52658003 AGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTG 52658062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2833 AGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTG 2892

 52658063 GCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTAT 52658122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2893 GCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTAT 2952

 52658123 AAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGG 52658182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2953 AAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGG 3012

 52658183 GAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTG 52658242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3013 GAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTG 3072

 52658243 AAACACTGTCTCTGCTAAAAAACAAAACAAAACAAAACACCAAAAAATAGCTGGGCGTAG 52658302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3073 AAACACTGTCTCTGCTAAAAAACAAAACAAAACAAAACACCAAAAAATAGCTGGGCGTAG 3132

 52658303 TGGCGGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTTGGGAGGCGGTGGCAGGAGAATCATTTGAACCT 52658362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3133 TGGCGGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTTGGGAGGCGGTGGCAGGAGAATCATTTGAACCT 3192

 52658363 GGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGAT--------TGTGCCACTGCACTCTAACCTGG 52658414
          |||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||
     3193 GGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACTGTGCCACTGCACTCTAACCTGG 3252

 52658415 GCAACAGAGTTCAGAGTGAGACTCTGTCTC 52658444
          ||||||||||||||||||||||||||||||
     3253 GCAACAGAGTTCAGAGTGAGACTCTGTCTC 3282

Alignment time is 4.36382 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [52637064,52668002] =>     30939 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    9784] =>      9784 nucs 'mol-32-29be-028935_9784'

Score:        9772
Aligned:      9783        nucs
Identic:      9782 (100%) nucs =>       112 (100%)      9670 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [52642142,52642253] EXCISED REGION [52642255,52651925]
 second seq =>  [       1,     112] EXCISED REGION [     114,    9784]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [52642254,52642254]
 second seq =>         1 nucs [113,113]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [52642254,52642254] to [52642255,52642255]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 52642142 CTTGTGGCTGGAATTCCAATCCAGCAGGGAGCAAGCCATAAAAATGGGGGGAAGGGCTGC 52642201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTTGTGGCTGGAATTCCAATCCAGCAGGGAGCAAGCCATAAAAATGGGGGGAAGGGCTGC 60

 52642202 TGGAGGGAGGCAGTAGATGCGGCTGAGCCCAAGGCATAATTCACCCTAAGAA 52642253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGGAGGGAGGCAGTAGATGCGGCTGAGCCCAAGGCATAATTCACCCTAAGAA 112

EXCISED REGION

 52642255 TCTGAATCAATACACTGACATCCAGCCATGTACAATGTGGTACTCCCACCAAGAAAGCCA 52642314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      114 TCTGAATCAATACACTGACATCCAGCCATGTACAATGTGGTACTCCCACCAAGAAAGCCA 173

 52642315 CTGATTGAGAAGTTTTATTCATGTTACTTTCTGAGGGTTGGATTGTCCCATTACATTTAT 52642374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      174 CTGATTGAGAAGTTTTATTCATGTTACTTTCTGAGGGTTGGATTGTCCCATTACATTTAT 233

 52642375 AGAACAATTGCTTTTTTCCCCCTAAATACAGAACTATGCAGCCGGGAGTCAGAAAAGAAA 52642434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      234 AGAACAATTGCTTTTTTCCCCCTAAATACAGAACTATGCAGCCGGGAGTCAGAAAAGAAA 293

 52642435 CCTTGACAATCAGAAGGCTGTTTTGTTGTTGTTGTTAAAAACCTTTGCAGGCATATGCAT 52642494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      294 CCTTGACAATCAGAAGGCTGTTTTGTTGTTGTTGTTAAAAACCTTTGCAGGCATATGCAT 353

 52642495 CTGAATATCCATAAGTTCACAGGCTGAGGGAGAAATGGCTATTTCATAACTTTTCTGTGT 52642554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      354 CTGAATATCCATAAGTTCACAGGCTGAGGGAGAAATGGCTATTTCATAACTTTTCTGTGT 413

 52642555 TTCTCATGTACATAGTACAAAGTGGGCACTCAGTATTTCAAATTTCAATATCACTGAAAA 52642614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      414 TTCTCATGTACATAGTACAAAGTGGGCACTCAGTATTTCAAATTTCAATATCACTGAAAA 473

 52642615 AAATGGAAATTTGTCATGTAACAAAATCAGATGCAGACTTCACTGGTGAATCTGAGGGAG 52642674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      474 AAATGGAAATTTGTCATGTAACAAAATCAGATGCAGACTTCACTGGTGAATCTGAGGGAG 533

 52642675 TGAATTCACTTATTCAGAAAGGAAGACAGTTACAATTCTTGGGTCTTCTGAGAGATCATT 52642734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      534 TGAATTCACTTATTCAGAAAGGAAGACAGTTACAATTCTTGGGTCTTCTGAGAGATCATT 593

 52642735 ATAACTTGAAAATATTACACAAGGGCTTTGCTATATTAGATACCTGCCATGTTCCTAACA 52642794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      594 ATAACTTGAAAATATTACACAAGGGCTTTGCTATATTAGATACCTGCCATGTTCCTAACA 653

 52642795 CAAGCTCCCATTTTCTGACTCAAATCTCATTTTGGAACACATTCCACTCAAATTGAGGTT 52642854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      654 CAAGCTCCCATTTTCTGACTCAAATCTCATTTTGGAACACATTCCACTCAAATTGAGGTT 713

 52642855 CTACCCCTAAGAGTTCTTTTTCAATAAAGAAAGCTGAGTTAATAAATCACAACTCCAAAA 52642914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      714 CTACCCCTAAGAGTTCTTTTTCAATAAAGAAAGCTGAGTTAATAAATCACAACTCCAAAA 773

 52642915 CTTTTCCTCACTTTTCTTAGACTAGAAATAGATTGAGTGTGTCGAGGTTTTATGGCTGAG 52642974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      774 CTTTTCCTCACTTTTCTTAGACTAGAAATAGATTGAGTGTGTCGAGGTTTTATGGCTGAG 833

 52642975 TACATTGGAGGGCTGGCTATTCTATGCTGAACTGGTTTACTTGATTAAGATGGGGATTTG 52643034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      834 TACATTGGAGGGCTGGCTATTCTATGCTGAACTGGTTTACTTGATTAAGATGGGGATTTG 893

 52643035 GATGAGTCACCGGACACCTGTCCAAAGATGAGTAAAACACATTCCTTCATTGTCTTCCCA 52643094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      894 GATGAGTCACCGGACACCTGTCCAAAGATGAGTAAAACACATTCCTTCATTGTCTTCCCA 953

 52643095 TAAATAACTCAATCTTCTCCTAACTGAGCCAATGGATAGGCTTTGGATGCCCAAGCAAAA 52643154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      954 TAAATAACTCAATCTTCTCCTAACTGAGCCAATGGATAGGCTTTGGATGCCCAAGCAAAA 1013

 52643155 CAAACACATGACTGTTAAAAAATCACAACCTCAAAATGGCCTTAGAAGCCTATGACCAAT 52643214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1014 CAAACACATGACTGTTAAAAAATCACAACCTCAAAATGGCCTTAGAAGCCTATGACCAAT 1073

 52643215 AATGAGAATGGTTTCTCCACTCAGGCGCAAGTAGTAAACAGTTTCTCCCATATGCAGGAA 52643274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1074 AATGAGAATGGTTTCTCCACTCAGGCGCAAGTAGTAAACAGTTTCTCCCATATGCAGGAA 1133

 52643275 TATTGACGACTAGTTTACCGCCTCTGGGCACGTAACTTTCAGGTCCTGGTTCATGCATTT 52643334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1134 TATTGACGACTAGTTTACCGCCTCTGGGCACGTAACTTTCAGGTCCTGGTTCATGCATTT 1193

 52643335 GCTGGAATGTTCCCTGGGCCATGGAGCCCAGTTCTCCTGGCATCTGGCATCTCCCCCACA 52643394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1194 GCTGGAATGTTCCCTGGGCCATGGAGCCCAGTTCTCCTGGCATCTGGCATCTCCCCCACA 1253

 52643395 CTCTGCTCCCCCAGCACAGCACTTGGCATCTTGCATTGCAATTGCAGGTTTATTTATTCA 52643454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1254 CTCTGCTCCCCCAGCACAGCACTTGGCATCTTGCATTGCAATTGCAGGTTTATTTATTCA 1313

 52643455 CTTCTCTCACTGGACAGCAAACTCCACCAGGGCCGAGACTCTGTGTCTCGCCCTTCACTG 52643514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1314 CTTCTCTCACTGGACAGCAAACTCCACCAGGGCCGAGACTCTGTGTCTCGCCCTTCACTG 1373

 52643515 TGGTCCCTGTGCCTCACCTGTTCCTAGTACAGTGTCACACTCAGTAAAGAGCAGATGCCT 52643574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1374 TGGTCCCTGTGCCTCACCTGTTCCTAGTACAGTGTCACACTCAGTAAAGAGCAGATGCCT 1433

 52643575 GGTGCATTTGGAGACTTATTTTAAATTATACGGAAAGTTATTCAACCGGCTTCTTGAACT 52643634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1434 GGTGCATTTGGAGACTTATTTTAAATTATACGGAAAGTTATTCAACCGGCTTCTTGAACT 1493

 52643635 GGTGAATTTTGGAAAGTGGGTGTTTGAAGGGAAAATGTTTAAACTCTGAAAGAAATGTTG 52643694
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     1494 GGTGAATTTTGGAAAGTGGGTGTTTGGAGGGAAAATGTTTAAACTCTGAAAGAAATGTTG 1553

 52643695 GAAATAAGCTCTTTGAATCAAAATGTATAGAAAACACAAGAATGCTGACAGTAAGAGCCT 52643754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1554 GAAATAAGCTCTTTGAATCAAAATGTATAGAAAACACAAGAATGCTGACAGTAAGAGCCT 1613

 52643755 AAAACACATGATGACTATTATCTTTTCCCAATTTTAACTCTCCAGAGTGTTCAGCGGTGC 52643814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1614 AAAACACATGATGACTATTATCTTTTCCCAATTTTAACTCTCCAGAGTGTTCAGCGGTGC 1673

 52643815 CCAGCCTTCATAATGTAATTCTTCGTAGCACCCTGGATGCATTAAAACCATAGATTAACG 52643874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1674 CCAGCCTTCATAATGTAATTCTTCGTAGCACCCTGGATGCATTAAAACCATAGATTAACG 1733

 52643875 TGATACTTATTTTCATTAAGGAAAATAATTTACGTACAGTGCTCAGAGTAGAGCCTGGCA 52643934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1734 TGATACTTATTTTCATTAAGGAAAATAATTTACGTACAGTGCTCAGAGTAGAGCCTGGCA 1793

 52643935 CATTGAACATTTTCAATAAATGACAGCAAGTGTAATTATTAGCACTTCGGAAGTGCAAAG 52643994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1794 CATTGAACATTTTCAATAAATGACAGCAAGTGTAATTATTAGCACTTCGGAAGTGCAAAG 1853

 52643995 TTGCATTGTATTAAGACAAATATATTTGGAGCTCATCCAATTTTTTCCTGGCTCTGAAGT 52644054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1854 TTGCATTGTATTAAGACAAATATATTTGGAGCTCATCCAATTTTTTCCTGGCTCTGAAGT 1913

 52644055 CTGCTAGTGGCACTTAACTTTATTCCCAAGTTTTGAAAAATATTGTTATTTAAAAAGTCT 52644114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1914 CTGCTAGTGGCACTTAACTTTATTCCCAAGTTTTGAAAAATATTGTTATTTAAAAAGTCT 1973

 52644115 GTTAACCAAGGAAATGCATGCCCTAAACCTATAATGTATCAAGTTTTACTTCCTTCTTCT 52644174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1974 GTTAACCAAGGAAATGCATGCCCTAAACCTATAATGTATCAAGTTTTACTTCCTTCTTCT 2033

 52644175 TTTAAGGAGTTCTTTTCCTGCCTTGAATACAAACAGGCTCTCTCAAGGTTAAAAGCAAAT 52644234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2034 TTTAAGGAGTTCTTTTCCTGCCTTGAATACAAACAGGCTCTCTCAAGGTTAAAAGCAAAT 2093

 52644235 GCTCTTTTTAGTGTCAAAAAGAGCTTGCCTTTCTTCGCTCAGGAAAAAAAGCAACTGATT 52644294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2094 GCTCTTTTTAGTGTCAAAAAGAGCTTGCCTTTCTTCGCTCAGGAAAAAAAGCAACTGATT 2153

 52644295 CCAGGATACCTTCTTTGAAAACCAACACAAAAAAACCCCCCAAAAAACAAAAAAAAAACC 52644354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2154 CCAGGATACCTTCTTTGAAAACCAACACAAAAAAACCCCCCAAAAAACAAAAAAAAAACC 2213

 52644355 CAAAACCCCTAGTTTTTACAAAGGTTTATTACTCCTACTTGTTGGAAAAGAATTACTACA 52644414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2214 CAAAACCCCTAGTTTTTACAAAGGTTTATTACTCCTACTTGTTGGAAAAGAATTACTACA 2273

 52644415 TAAAAGAGTCTGCCCAGAGCTGTAAAATCTCCTTATTCAAACACACACCTTAGAGCAAAA 52644474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2274 TAAAAGAGTCTGCCCAGAGCTGTAAAATCTCCTTATTCAAACACACACCTTAGAGCAAAA 2333

 52644475 GATGGTTAAATATCAATTCAGGCTATTAACAGTAAGGGACGAAATGTGTTCCAACAAAAC 52644534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2334 GATGGTTAAATATCAATTCAGGCTATTAACAGTAAGGGACGAAATGTGTTCCAACAAAAC 2393

 52644535 TCTGCATGTCAACAAACTACAGAGACTAGGTAACATCTTTTAGGAATCATTTTTATTCCA 52644594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2394 TCTGCATGTCAACAAACTACAGAGACTAGGTAACATCTTTTAGGAATCATTTTTATTCCA 2453

 52644595 CTAATGCCTTTTCCTCCAGAATCCACTGATCGTAAACGCAACCTGTCTACTTCCGCCTTT 52644654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2454 CTAATGCCTTTTCCTCCAGAATCCACTGATCGTAAACGCAACCTGTCTACTTCCGCCTTT 2513

 52644655 GAAAAATGGATGGACAAATTCATCTGCATGTAACTCACCTCCTCTTTTCTTTTACATAAA 52644714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2514 GAAAAATGGATGGACAAATTCATCTGCATGTAACTCACCTCCTCTTTTCTTTTACATAAA 2573

 52644715 ACAGATGCCACAGCTGTTATTGTTCTTCACACAGAAGTTTCTACCCAGAGAAACATCAGG 52644774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2574 ACAGATGCCACAGCTGTTATTGTTCTTCACACAGAAGTTTCTACCCAGAGAAACATCAGG 2633

 52644775 ATGACACTCTGCTGCAATGTGCTATTTGTTCTAGAGGGGTCAACAGCTTGCCACCTTGCC 52644834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2634 ATGACACTCTGCTGCAATGTGCTATTTGTTCTAGAGGGGTCAACAGCTTGCCACCTTGCC 2693

 52644835 TAGGCCCAGGGTGACTGCATATGTGCAGTGGTCTTATCCCATTAGCGCCCCCGAGCATGC 52644894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2694 TAGGCCCAGGGTGACTGCATATGTGCAGTGGTCTTATCCCATTAGCGCCCCCGAGCATGC 2753

 52644895 ATTCAGAACCAAGTGGATACACCTTGGCACACTTACCTTCCCTGCAGGGACATCATCGGA 52644954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2754 ATTCAGAACCAAGTGGATACACCTTGGCACACTTACCTTCCCTGCAGGGACATCATCGGA 2813

 52644955 CTGCCCTGATAAGCCAGGAACCTCATCCACCTTGTCTTGATGCTCTGCCCTCTTGGCTTC 52645014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2814 CTGCCCTGATAAGCCAGGAACCTCATCCACCTTGTCTTGATGCTCTGCCCTCTTGGCTTC 2873

 52645015 CTGTTGGCTGTCACCTGGCACCTTTTCCTGTCCCTTGTCCAGCTTGAAGAATTTGTCAAA 52645074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2874 CTGTTGGCTGTCACCTGGCACCTTTTCCTGTCCCTTGTCCAGCTTGAAGAATTTGTCAAA 2933

 52645075 AAAGCTGGAGTCCTTGGGCTTGGAGGGAGCTTCTCCTCCTGCTCCCCCTGTCTCAGGTGG 52645134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2934 AAAGCTGGAGTCCTTGGGCTTGGAGGGAGCTTCTCCTCCTGCTCCCCCTGTCTCAGGTGG 2993

 52645135 GAGAAGCGTGGGATCCCTGGCGGCAGAGAGGACCTTGTCTTGGGCCGGGGCGTGCCCTGG 52645194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2994 GAGAAGCGTGGGATCCCTGGCGGCAGAGAGGACCTTGTCTTGGGCCGGGGCGTGCCCTGG 3053

 52645195 GGTTTTATCTGTGTCCTGCCCCGGTCCAGCTGCCACCGGAAGTGTCCAGCTCTCACTTGG 52645254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3054 GGTTTTATCTGTGTCCTGCCCCGGTCCAGCTGCCACCGGAAGTGTCCAGCTCTCACTTGG 3113

 52645255 GTCTTTGTTCGCTGGAGCTTTATTGGAGCTGACATCAAGCTTCACTGATCCAAGGGATGA 52645314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3114 GTCTTTGTTCGCTGGAGCTTTATTGGAGCTGACATCAAGCTTCACTGATCCAAGGGATGA 3173

 52645315 ATCTGCGGCTTGGTCTCCGGTACGTCCTGGTACAGGCCGAGAGAGCATCAAGAAAAAACG 52645374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3174 ATCTGCGGCTTGGTCTCCGGTACGTCCTGGTACAGGCCGAGAGAGCATCAAGAAAAAACG 3233

 52645375 AGATTTAGCAGCTGGTGCCTCGGGTTTGGCCTCTTTCCCAAGATTCTTTCCGTTGGCATC 52645434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3234 AGATTTAGCAGCTGGTGCCTCGGGTTTGGCCTCTTTCCCAAGATTCTTTCCGTTGGCATC 3293

 52645435 CGCAACAGCACTTATCTCCGTTGTCTCGGGGGAAGAAGTGGCCACATTATCCGTCTTGAC 52645494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3294 CGCAACAGCACTTATCTCCGTTGTCTCGGGGGAAGAAGTGGCCACATTATCCGTCTTGAC 3353

 52645495 ACTTATTCCCAAGTCGACTGTAAACACAAACATAAACAGTGGTTATTCAGCCAAGCCGGG 52645554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3354 ACTTATTCCCAAGTCGACTGTAAACACAAACATAAACAGTGGTTATTCAGCCAAGCCGGG 3413

 52645555 AAATTCAGGCACTAATAATGGACTCCAGACATTTTTTATACAAAAGCCATACTGCATACT 52645614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3414 AAATTCAGGCACTAATAATGGACTCCAGACATTTTTTATACAAAAGCCATACTGCATACT 3473

 52645615 GGAACTGTGTTGTTCTCTGGTCATTCTGAAAGGCAGAAGTTAGCTCTCTACATCTCCTTG 52645674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3474 GGAACTGTGTTGTTCTCTGGTCATTCTGAAAGGCAGAAGTTAGCTCTCTACATCTCCTTG 3533

 52645675 GACCCTGCTTTTCTTGGGAGAGGAGAAGGCAAGGTTGGTGAGGAGGGAAAGCTACTTAAT 52645734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3534 GACCCTGCTTTTCTTGGGAGAGGAGAAGGCAAGGTTGGTGAGGAGGGAAAGCTACTTAAT 3593

 52645735 GGAAAGTCACTAGCTGCCAGGTGTGGAATGAGTGATATTCAATGTTAATTAATCTTCTTT 52645794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3594 GGAAAGTCACTAGCTGCCAGGTGTGGAATGAGTGATATTCAATGTTAATTAATCTTCTTT 3653

 52645795 TATCTGTGTAAGAACTCCGTGAGCAGCATATTGTCATGATGTCAACTGGGAGGCAGTACA 52645854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3654 TATCTGTGTAAGAACTCCGTGAGCAGCATATTGTCATGATGTCAACTGGGAGGCAGTACA 3713

 52645855 GCAGTTAGGAGCTTGGGTTCTGGAGCTAGAACAAGGTTTCTCAACCTCAGCACTACTCAC 52645914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3714 GCAGTTAGGAGCTTGGGTTCTGGAGCTAGAACAAGGTTTCTCAACCTCAGCACTACTCAC 3773

 52645915 ATTTGAAGCCAGATTATTCTTTGTTAGGGAGGCTCATCCCGTGCCTCATAGGCTGATTAG 52645974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3774 ATTTGAAGCCAGATTATTCTTTGTTAGGGAGGCTCATCCCGTGCCTCATAGGCTGATTAG 3833

 52645975 CAGCATCCTGGCCTCTGCCCACTAGACGCCGGTCACATTTCCCAGTCATGGCAACCAAAA 52646034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3834 CAGCATCCTGGCCTCTGCCCACTAGACGCCGGTCACATTTCCCAGTCATGGCAACCAAAA 3893

 52646035 ATATCTCTAGGCATTGCTAAATGTCCCCTGGAGGACAAAATCTCTTACGTTTGAGAGGCA 52646094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3894 ATATCTCTAGGCATTGCTAAATGTCCCCTGGAGGACAAAATCTCTTACGTTTGAGAGGCA 3953

 52646095 CTGAGCTGAAATGTCTTTTTGAATCCAGATTATCTAATTTTCTGTGCCTCAACTTTCTGG 52646154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3954 CTGAGCTGAAATGTCTTTTTGAATCCAGATTATCTAATTTTCTGTGCCTCAACTTTCTGG 4013

 52646155 TAAAAGGAGACAGATAATAAATCTCGTAATTTTGTTAGGAAGATTACATGAGTTAATAGT 52646214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4014 TAAAAGGAGACAGATAATAAATCTCGTAATTTTGTTAGGAAGATTACATGAGTTAATAGT 4073

 52646215 TTTAAAGCAAGTACAATAGCACCTGGAATATATTAAGTGCTTAATAAATATCACAAACAT 52646274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4074 TTTAAAGCAAGTACAATAGCACCTGGAATATATTAAGTGCTTAATAAATATCACAAACAT 4133

 52646275 TAGTTATCATTATTCATGAGTGAGAAAACTGACAGTCAGAGAGGTCAGTACACCCTCCCC 52646334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4134 TAGTTATCATTATTCATGAGTGAGAAAACTGACAGTCAGAGAGGTCAGTACACCCTCCCC 4193

 52646335 TGGCTGCCCAGTAAGCTAGTAAGCAGCAGAGTCTGGCTTCAGGCAGAAATCTGACTTCTA 52646394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4194 TGGCTGCCCAGTAAGCTAGTAAGCAGCAGAGTCTGGCTTCAGGCAGAAATCTGACTTCTA 4253

 52646395 AGTTCATGCGCTCTCTGTCTTACCAGGGACTTGTATTAGCATAGACTGTTAAGAATATGG 52646454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4254 AGTTCATGCGCTCTCTGTCTTACCAGGGACTTGTATTAGCATAGACTGTTAAGAATATGG 4313

 52646455 GAAGATTTTTAAAATACAGTACTCAGAAAATTTCTCTTTGAAAGGCTGGAAGAGCAGATA 52646514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4314 GAAGATTTTTAAAATACAGTACTCAGAAAATTTCTCTTTGAAAGGCTGGAAGAGCAGATA 4373

 52646515 TCCACACAAGAAGGCAAATTAGACCTCAGGCCAGTGTGGAATTAAAGGTGTAGGGTTATC 52646574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4374 TCCACACAAGAAGGCAAATTAGACCTCAGGCCAGTGTGGAATTAAAGGTGTAGGGTTATC 4433

 52646575 TGGTCAAGACTGTGTGTGTGGATACAGGCTCCAACCCCTCCAGGCAAGGGCACTGTTTCC 52646634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4434 TGGTCAAGACTGTGTGTGTGGATACAGGCTCCAACCCCTCCAGGCAAGGGCACTGTTTCC 4493

 52646635 AACATCCACCCTTTCTCCTTTGACCTCTACCTTGACCTAAATTAACTATAAAAGGTCCTT 52646694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4494 AACATCCACCCTTTCTCCTTTGACCTCTACCTTGACCTAAATTAACTATAAAAGGTCCTT 4553

 52646695 CTTTTCTAGGACCCTACTATAAATCAGTGAAATATTCAGGAAAAAAAGAACACCAAGAAT 52646754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4554 CTTTTCTAGGACCCTACTATAAATCAGTGAAATATTCAGGAAAAAAAGAACACCAAGAAT 4613

 52646755 GTTGGGATCCCAGTTAAAGATCAAGATTCTCTACTGATAAGCTGTGTGATATGGAGTAAA 52646814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4614 GTTGGGATCCCAGTTAAAGATCAAGATTCTCTACTGATAAGCTGTGTGATATGGAGTAAA 4673

 52646815 TCACTAAAGATCTTTGAATCTCTTCATTTGTAAAATGGGAATATTGGTAGTCCTACTGCA 52646874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4674 TCACTAAAGATCTTTGAATCTCTTCATTTGTAAAATGGGAATATTGGTAGTCCTACTGCA 4733

 52646875 GGGTTGTTGTAATGCTTAAAGAAGAAAAGTCATGCAAAGGATCTGGCACAACGCCTTTTC 52646934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4734 GGGTTGTTGTAATGCTTAAAGAAGAAAAGTCATGCAAAGGATCTGGCACAACGCCTTTTC 4793

 52646935 CATAATAAGTGCTTAGTAATTGACAGATACTGTGATAACTTTTCAGGTTTCTCTCATGCC 52646994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4794 CATAATAAGTGCTTAGTAATTGACAGATACTGTGATAACTTTTCAGGTTTCTCTCATGCC 4853

 52646995 TTTGACAACATTGCATTTTGCTTGCTCTATCTGTAGTCAGACACTTCTTAATATCTGTTT 52647054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4854 TTTGACAACATTGCATTTTGCTTGCTCTATCTGTAGTCAGACACTTCTTAATATCTGTTT 4913

 52647055 GCAGGAAGACAGAAAAATAAAGGGAAGAATTGAGATTTCTTTGATCTATTCATACTGCTC 52647114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4914 GCAGGAAGACAGAAAAATAAAGGGAAGAATTGAGATTTCTTTGATCTATTCATACTGCTC 4973

 52647115 ATTAATATGTAGTGAGAAATACATACACACACACATACACACACATGCATCCATTAGCAA 52647174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4974 ATTAATATGTAGTGAGAAATACATACACACACACATACACACACATGCATCCATTAGCAA 5033

 52647175 TTGTTTTTGCCCAACTCTAGTGTCTCGCAGTGTCTAGACTAAACAACAAACAAAAAAGGG 52647234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5034 TTGTTTTTGCCCAACTCTAGTGTCTCGCAGTGTCTAGACTAAACAACAAACAAAAAAGGG 5093

 52647235 GGGAGAGTGAGCTGGATTAAGCATTGAGGCACAGTGAAGAAATGGTCTGGGGCAAGCCCA 52647294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5094 GGGAGAGTGAGCTGGATTAAGCATTGAGGCACAGTGAAGAAATGGTCTGGGGCAAGCCCA 5153

 52647295 GGGATGAATGTTAGGGGTTTCTCATAAACCTGAACCTGAAGAAAATCACCCTGCCAGCAT 52647354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5154 GGGATGAATGTTAGGGGTTTCTCATAAACCTGAACCTGAAGAAAATCACCCTGCCAGCAT 5213

 52647355 ATTGATCTTCTAGCTCTTCTTAACCTTTTTTTCTGTGATTCAGGAATTCATAATGATAGA 52647414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5214 ATTGATCTTCTAGCTCTTCTTAACCTTTTTTTCTGTGATTCAGGAATTCATAATGATAGA 5273

 52647415 AAATATTATACTAAAGAAGAAAAAAAGAGGGAGAATAAGTAAGTGATAGATGGATGCATC 52647474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5274 AAATATTATACTAAAGAAGAAAAAAAGAGGGAGAATAAGTAAGTGATAGATGGATGCATC 5333

 52647475 AGGGTGTAAAGTTAGCAAGTAAGGCTGTTGAAGTGTCAGAGTGAATATAAATGAATTGTG 52647534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5334 AGGGTGTAAAGTTAGCAAGTAAGGCTGTTGAAGTGTCAGAGTGAATATAAATGAATTGTG 5393

 52647535 GGAATGGTCCATGCCAGGAGAAGAGGGTATGGTTGACAAAAAGGGAAATGCTAAGATTCA 52647594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5394 GGAATGGTCCATGCCAGGAGAAGAGGGTATGGTTGACAAAAAGGGAAATGCTAAGATTCA 5453

 52647595 AAACAGGGAAGGGCTTTTCAAAATGCCAAGAGCACCAACTTATATCTTTCAGTTTAATTC 52647654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5454 AAACAGGGAAGGGCTTTTCAAAATGCCAAGAGCACCAACTTATATCTTTCAGTTTAATTC 5513

 52647655 CTCTCTTCCTTACCCACTGGCTGGAAAGCAAAGGAGCTAGTGGTAAGTAAGAGTGTTATA 52647714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5514 CTCTCTTCCTTACCCACTGGCTGGAAAGCAAAGGAGCTAGTGGTAAGTAAGAGTGTTATA 5573

 52647715 GCCAGAGAAAAAGTCTTCAAAAAACACAAAGTACTTTCCATGGACAACCTTTTTTATTTT 52647774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5574 GCCAGAGAAAAAGTCTTCAAAAAACACAAAGTACTTTCCATGGACAACCTTTTTTATTTT 5633

 52647775 AAAGTGCCAATATGTTGCTTTGAAAAAGAATAAATTCCTTACATCCAGGTATCTGGACTA 52647834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5634 AAAGTGCCAATATGTTGCTTTGAAAAAGAATAAATTCCTTACATCCAGGTATCTGGACTA 5693

 52647835 GACTTCAGTGCATTTAGTGATTATAGCAAATCCAAACAGTAGCTTTTGATATCAGAGAAT 52647894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5694 GACTTCAGTGCATTTAGTGATTATAGCAAATCCAAACAGTAGCTTTTGATATCAGAGAAT 5753

 52647895 GGGTAAAGTGTTTTTGACAATTTCTAAGAACTTAGAGTTCTTCGGTGATACGTTCCATGC 52647954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5754 GGGTAAAGTGTTTTTGACAATTTCTAAGAACTTAGAGTTCTTCGGTGATACGTTCCATGC 5813

 52647955 AACTGAAGCTCTGCTCTCCAAATTTAGGTGGGTACATACCCAAGTCCATCACCTGGGGCT 52648014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5814 AACTGAAGCTCTGCTCTCCAAATTTAGGTGGGTACATACCCAAGTCCATCACCTGGGGCT 5873

 52648015 TCTATTTCCTTTGCTCAGATGCTCACCTCCTAGGTGGGCACCTGACATAAGATAGACTAA 52648074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5874 TCTATTTCCTTTGCTCAGATGCTCACCTCCTAGGTGGGCACCTGACATAAGATAGACTAA 5933

 52648075 TAAAAATAAGTCCTGTAACTTTTGATACTCCTATTAAAAAAGAGTTGCAAACCAATAGGA 52648134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5934 TAAAAATAAGTCCTGTAACTTTTGATACTCCTATTAAAAAAGAGTTGCAAACCAATAGGA 5993

 52648135 GGTACACTTGAGAATCAGCACAAATGAAAGTAGAACCTGGAAATCCAGGAAGCAGATACC 52648194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5994 GGTACACTTGAGAATCAGCACAAATGAAAGTAGAACCTGGAAATCCAGGAAGCAGATACC 6053

 52648195 CAATCATGTCATTTAAACATTTAGATCCAGCTGTGCCTGAAGCTGAACTTTAGCATTACA 52648254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6054 CAATCATGTCATTTAAACATTTAGATCCAGCTGTGCCTGAAGCTGAACTTTAGCATTACA 6113

 52648255 TAAGCCAATAAATCACTCTTCCCCAACTTACGCCAGTTGAAATTGAATACATACTCAGTG 52648314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6114 TAAGCCAATAAATCACTCTTCCCCAACTTACGCCAGTTGAAATTGAATACATACTCAGTG 6173

 52648315 ACTTTGAGAGAATTCCAGGGAATTGGTCAGTCCCTGTTTCACTTGTAAATACACAGCAAT 52648374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6174 ACTTTGAGAGAATTCCAGGGAATTGGTCAGTCCCTGTTTCACTTGTAAATACACAGCAAT 6233

 52648375 CAAGCCTACCAAATCTATGATTGATTGGGGTGTCTGAAAGAGATGGAGGGAATGGAATCA 52648434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6234 CAAGCCTACCAAATCTATGATTGATTGGGGTGTCTGAAAGAGATGGAGGGAATGGAATCA 6293

 52648435 ACCTGAAAAACATATTTCAGGAGTTCATCCCTGAAAACTTCCCCAACCTAGCTAGAGGGG 52648494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6294 ACCTGAAAAACATATTTCAGGAGTTCATCCCTGAAAACTTCCCCAACCTAGCTAGAGGGG 6353

 52648495 CCAACATTCAAATTCAGGAAATGCAGAGAACCCCAGTAAGATACTCCACAAAAAGATCTT 52648554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6354 CCAACATTCAAATTCAGGAAATGCAGAGAACCCCAGTAAGATACTCCACAAAAAGATCTT 6413

 52648555 CCCCAAGACATCATCATCAGATTCTCCAAAGTTGAAATGTAAGAAAAAATGCTAAAGGCA 52648614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6414 CCCCAAGACATCATCATCAGATTCTCCAAAGTTGAAATGTAAGAAAAAATGCTAAAGGCA 6473

 52648615 ACTAGAGTGAAAGGCCCGGTCACCTAAAAAGGGAAGCACAGACTTACAGTGGACCTCTCA 52648674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6474 ACTAGAGTGAAAGGCCCGGTCACCTAAAAAGGGAAGCACAGACTTACAGTGGACCTCTCA 6533

 52648675 CTGGTAACCCTACAAGCCAGAAGAGATTGAGGACCAATATTCAACATTCTTAAACAAAAA 52648734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6534 CTGGTAACCCTACAAGCCAGAAGAGATTGAGGACCAATATTCAACATTCTTAAACAAAAA 6593

 52648735 GAATTCCAACCCAGAATTTTATATCTGACTAAACTAAGCTTCATAAGCAAAAGAGAAATA 52648794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6594 GAATTCCAACCCAGAATTTTATATCTGACTAAACTAAGCTTCATAAGCAAAAGAGAAATA 6653

 52648795 AGATCATTTTCAGACAAGCAAATGCTAAGGGAATTTGTGACCATTAGACCTTCCTTGCAA 52648854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6654 AGATCATTTTCAGACAAGCAAATGCTAAGGGAATTTGTGACCATTAGACCTTCCTTGCAA 6713

 52648855 CAGTTCCTAAAGGAAGCACTAAATATGGAAAGACCATTACCAGACACTACAAAACACACT 52648914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6714 CAGTTCCTAAAGGAAGCACTAAATATGGAAAGACCATTACCAGACACTACAAAACACACT 6773

 52648915 GAAGTACACAGACCAGTGACATTGTAAAGCAACTACATAACAAGTCTGCAAAATAACCAG 52648974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6774 GAAGTACACAGACCAGTGACATTGTAAAGCAACTACATAACAAGTCTGCAAAATAACCAG 6833

 52648975 CCAACATCATGATGACGGTATCAAATCGACACATAGCAACACTAACCTTAAATGTAAATG 52649034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6834 CCAACATCATGATGACGGTATCAAATCGACACATAGCAACACTAACCTTAAATGTAAATG 6893

 52649035 GACTAAATGATCCCATTAAAAGACATAAAGTGGCAGGCTGGATAAAGAACCAAGAACCAT 52649094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6894 GACTAAATGATCCCATTAAAAGACATAAAGTGGCAGGCTGGATAAAGAACCAAGAACCAT 6953

 52649095 TGGTATACTGTCTTCAAGAGACCCATCTCCTATGCAGTGACACACATAGGTTCAAGATAA 52649154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6954 TGGTATACTGTCTTCAAGAGACCCATCTCCTATGCAGTGACACACATAGGTTCAAGATAA 7013

 52649155 AGGGATGGGGAAAAATCTACCAAGCAAATAGAAAACAGAATAAAACAGGGGTTGCAATCC 52649214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7014 AGGGATGGGGAAAAATCTACCAAGCAAATAGAAAACAGAATAAAACAGGGGTTGCAATCC 7073

 52649215 TAGTTGCCGTCAAAACAGACTTTAAACCAACAAAGGTTAAAAGAAAAAAATATGGGCATT 52649274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7074 TAGTTGCCGTCAAAACAGACTTTAAACCAACAAAGGTTAAAAGAAAAAAATATGGGCATT 7133

 52649275 GCATAAGGATAAAGTGTTAAATTAAACAAGAAGATCTAACTATCCTAAGTATATATGCAC 52649334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7134 GCATAAGGATAAAGTGTTAAATTAAACAAGAAGATCTAACTATCCTAAGTATATATGCAC 7193

 52649335 CAAACACAGGAACACCCAGATTCATAAAGCAAGTTTATGGAGACCTTCAAACAGACTTAG 52649394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7194 CAAACACAGGAACACCCAGATTCATAAAGCAAGTTTATGGAGACCTTCAAACAGACTTAG 7253

 52649395 ACTCCCACACAATAGTAGTGGGAGACTTTAATACCCCATGACAATATTAGACAGATCATT 52649454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7254 ACTCCCACACAATAGTAGTGGGAGACTTTAATACCCCATGACAATATTAGACAGATCATT 7313

 52649455 GAGACAGGAAATTAACAAAGATATTCAAGATCTAACTCAGCACTAAATCAAATGGCCCTG 52649514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7314 GAGACAGGAAATTAACAAAGATATTCAAGATCTAACTCAGCACTAAATCAAATGGCCCTG 7373

 52649515 ATAGATATCTACAGGACTGTCCTACTTGAAACCATACAATTACATGGTAATTGAATGACC 52649574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7374 ATAGATATCTACAGGACTGTCCTACTTGAAACCATACAATTACATGGTAATTGAATGACC 7433

 52649575 TGCTCCTGAATGACTTTTGGGTAAATAATAAAATTAAGGCAGAAATCAAGAAGTTTTTTG 52649634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7434 TGCTCCTGAATGACTTTTGGGTAAATAATAAAATTAAGGCAGAAATCAAGAAGTTTTTTG 7493

 52649635 AACTAATGAGAACAAAGATACAACATACCAGAATCTTTGGGACACAGCTAAGGCAGTGTT 52649694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7494 AACTAATGAGAACAAAGATACAACATACCAGAATCTTTGGGACACAGCTAAGGCAGTGTT 7553

 52649695 AAGAGGGAAATTTATAGCACTAAATCCCACATCAAAAAGTTAGAAAGAGCTCACGTTAAC 52649754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7554 AAGAGGGAAATTTATAGCACTAAATCCCACATCAAAAAGTTAGAAAGAGCTCACGTTAAC 7613

 52649755 AATCTAACCTCACAACTACAGGAACTAGAGAACTGAGAGCAGAAAAACCTGAAAGCTAGC 52649814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7614 AATCTAACCTCACAACTACAGGAACTAGAGAACTGAGAGCAGAAAAACCTGAAAGCTAGC 7673

 52649815 AGAAGACAAGAAATAACCAAAATTAGAGCTGAACTGAAGGAGATTGAGACATGAAAAACC 52649874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7674 AGAAGACAAGAAATAACCAAAATTAGAGCTGAACTGAAGGAGATTGAGACATGAAAAACC 7733

 52649875 ATTCAAAAGATCAGTGAATTCAGGAGCTGTTTTTTTTTTGAACAAATTAATAAAATAGAC 52649934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7734 ATTCAAAAGATCAGTGAATTCAGGAGCTGTTTTTTTTTTGAACAAATTAATAAAATAGAC 7793

 52649935 CATTAGCTAGAGTAATAAACAAGAAAATAGAAAAGATTCAAATAAACACAATCAGAAACG 52649994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7794 CATTAGCTAGAGTAATAAACAAGAAAATAGAAAAGATTCAAATAAACACAATCAGAAACG 7853

 52649995 ACAAGGGGGATATTACCACTGACCCCACAGAAGTACAAACAACCATCAGAGAATATTATG 52650054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7854 ACAAGGGGGATATTACCACTGACCCCACAGAAGTACAAACAACCATCAGAGAATATTATG 7913

 52650055 AACATCTCTATGCACATAAACTAGAAAATCTAGAAGAAGTGGATAAACTTCTGGACATAT 52650114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7914 AACATCTCTATGCACATAAACTAGAAAATCTAGAAGAAGTGGATAAACTTCTGGACATAT 7973

 52650115 ACACCCTTCTAAGACTGTACCAGGAAGAAATTGAATCCCTGAACAGACCAATAATGAGCC 52650174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7974 ACACCCTTCTAAGACTGTACCAGGAAGAAATTGAATCCCTGAACAGACCAATAATGAGCC 8033

 52650175 CTAAAATTGAGGAAGTAATACATAGACTACCAACCATAAAAAAACCCAGTACTAGATGGA 52650234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8034 CTAAAATTGAGGAAGTAATACATAGACTACCAACCATAAAAAAACCCAGTACTAGATGGA 8093

 52650235 TTCACAGGTAAGTTCTACCAGTTGTACAAAGAAGAGCTGGTACAGTTCCTACTGAAATTA 52650294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8094 TTCACAGGTAAGTTCTACCAGTTGTACAAAGAAGAGCTGGTACAGTTCCTACTGAAATTA 8153

 52650295 TTCCAAAAAGTTGAGTAGGAGGGAGTCCTTCCTAACTCATTTGATGAGGCCAGCATCATC 52650354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8154 TTCCAAAAAGTTGAGTAGGAGGGAGTCCTTCCTAACTCATTTGATGAGGCCAGCATCATC 8213

 52650355 CTGATATCAAAACCTGGCAGATATACAACAAGAAAAGCTTCAGGCCAATATCCTTGATGA 52650414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8214 CTGATATCAAAACCTGGCAGATATACAACAAGAAAAGCTTCAGGCCAATATCCTTGATGA 8273

 52650415 ACTTCAATGCAAAAATCCTCAATAAAATACTGGCAAACTGAATCCAGCAGCACACCAAAA 52650474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8274 ACTTCAATGCAAAAATCCTCAATAAAATACTGGCAAACTGAATCCAGCAGCACACCAAAA 8333

 52650475 AGCTTATCCACCATGATCAAGTAGAATGCAAGTTGGTTCAACATATACAAATCAATAAAT 52650534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8334 AGCTTATCCACCATGATCAAGTAGAATGCAAGTTGGTTCAACATATACAAATCAATAAAT 8393

 52650535 GTGACTCATCACATAAACAGAACTAAAGACAAAAACTACATGATTATCTCAACAGATGCA 52650594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8394 GTGACTCATCACATAAACAGAACTAAAGACAAAAACTACATGATTATCTCAACAGATGCA 8453

 52650595 GAAAAGGCTTTCAATAAAATTAGACATCCATTTATGTTAAAAACTCTCAATAAACTAGGT 52650654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8454 GAAAAGGCTTTCAATAAAATTAGACATCCATTTATGTTAAAAACTCTCAATAAACTAGGT 8513

 52650655 ATTGAAGGAACATACCTCAAAATAATAAGAGCCATGTATGACAAACCCACAGCTAAGATC 52650714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8514 ATTGAAGGAACATACCTCAAAATAATAAGAGCCATGTATGACAAACCCACAGCTAAGATC 8573

 52650715 ATACTGAATGGGCAAAAGCTGGAAGCATTTTCTTTGAAGACTGGCATAAGACAAGGATGA 52650774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8574 ATACTGAATGGGCAAAAGCTGGAAGCATTTTCTTTGAAGACTGGCATAAGACAAGGATGA 8633

 52650775 TCTCTCTCACCACTCCTATTCAACATAGTATTGGAAGTCTTGGCCAGGGCAATCGGGCAA 52650834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8634 TCTCTCTCACCACTCCTATTCAACATAGTATTGGAAGTCTTGGCCAGGGCAATCGGGCAA 8693

 52650835 GAGAAATAAATAAAGCGCATCCAAATAGGAAGAGAGGAAGTCAAACTATCCTTGTTTGCA 52650894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8694 GAGAAATAAATAAAGCGCATCCAAATAGGAAGAGAGGAAGTCAAACTATCCTTGTTTGCA 8753

 52650895 GATTACATGACATTATATCTAGAAAACCCCATAGTCTCAGCCCCAAAGCTTCTTAAGCTG 52650954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8754 GATTACATGACATTATATCTAGAAAACCCCATAGTCTCAGCCCCAAAGCTTCTTAAGCTG 8813

 52650955 ATAAACAACTTCAGCAAAGTCTCAGGATACAAAATAAATGTGCAAAAATTACTGGCATTT 52651014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8814 ATAAACAACTTCAGCAAAGTCTCAGGATACAAAATAAATGTGCAAAAATTACTGGCATTT 8873

 52651015 CCATGCACCAACAACAGTCAAGCCAGGAGCCAAACCAGGAATGCACTCCCACTCACAATC 52651074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8874 CCATGCACCAACAACAGTCAAGCCAGGAGCCAAACCAGGAATGCACTCCCACTCACAATC 8933

 52651075 GCCACAAAAAGAGTAAAATACCTAGGAAAACAGCTAATTAGGGAGGTGAAAGATCTCTAC 52651134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8934 GCCACAAAAAGAGTAAAATACCTAGGAAAACAGCTAATTAGGGAGGTGAAAGATCTCTAC 8993

 52651135 AAGGAGAATAATGAACCAGCGCTCAAAGAAATTAGAGATGACACAAACAAATGGAAAAAC 52651194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8994 AAGGAGAATAATGAACCAGCGCTCAAAGAAATTAGAGATGACACAAACAAATGGAAAAAC 9053

 52651195 ATTCCATGTTCATTGATAGGAAGAATCAATATCATTAAAATGGCCATATTGCCCAGAGCA 52651254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9054 ATTCCATGTTCATTGATAGGAAGAATCAATATCATTAAAATGGCCATATTGCCCAGAGCA 9113

 52651255 ATTTATAGATTCAATGCTATACCTATTAAACTACTGTTGAGATTCTTCACAGAACCAGAG 52651314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9114 ATTTATAGATTCAATGCTATACCTATTAAACTACTGTTGAGATTCTTCACAGAACCAGAG 9173

 52651315 AAAACTATTTTAAAATTCATATAGAACCCAGAAAAGAGCCTGAATTGCTAAGGCAATCCT 52651374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9174 AAAACTATTTTAAAATTCATATAGAACCCAGAAAAGAGCCTGAATTGCTAAGGCAATCCT 9233

 52651375 AAGCAAAAAGCATAAAGCTGAAGGCATCATGCTACCTGACTTCAAACTATACTACAAGGC 52651434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9234 AAGCAAAAAGCATAAAGCTGAAGGCATCATGCTACCTGACTTCAAACTATACTACAAGGC 9293

 52651435 TACAGTAACCAAAACAGCATACTACTGGTACAAAAACAGACACATAGACCAATGGAACAG 52651494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9294 TACAGTAACCAAAACAGCATACTACTGGTACAAAAACAGACACATAGACCAATGGAACAG 9353

 52651495 AATAGAGAACCCGGAAATAAGACCACACACCTACAACTATCTAATCTTTGACAAACCTGA 52651554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9354 AATAGAGAACCCGGAAATAAGACCACACACCTACAACTATCTAATCTTTGACAAACCTGA 9413

 52651555 CAAAAACATGCAATGGGGAAAAGATTTCCTATTCAATAAAAAGTGCTGGGATAACCGGCT 52651614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9414 CAAAAACATGCAATGGGGAAAAGATTTCCTATTCAATAAAAAGTGCTGGGATAACCGGCT 9473

 52651615 AGCTGTACACAGAAGATTAAAGCTGGACCCCTTCCTTACAACATATACAAAAATCGGCCG 52651674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9474 AGCTGTACACAGAAGATTAAAGCTGGACCCCTTCCTTACAACATATACAAAAATCGGCCG 9533

 52651675 GGCTTGGTGGCTCACGCTTGTAATCCCAGCACTTTGGAAGGCCGAGGAGGGCGGATCATG 52651734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9534 GGCTTGGTGGCTCACGCTTGTAATCCCAGCACTTTGGAAGGCCGAGGAGGGCGGATCATG 9593

 52651735 AGGTCAGGAGATCGAGAACACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGC 52651794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9594 AGGTCAGGAGATCGAGAACACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGC 9653

 52651795 CGGGTGTGGTGGCAGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGAGAGGCTGAGGCAGGAGAATG 52651854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9654 CGGGTGTGGTGGCAGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGAGAGGCTGAGGCAGGAGAATG 9713

 52651855 GTGTGAACCCGGGAGACAGAGCTTGCACTGAGCCGAGACCACATCACTGCACTCCAGCCT 52651914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9714 GTGTGAACCCGGGAGACAGAGCTTGCACTGAGCCGAGACCACATCACTGCACTCCAGCCT 9773

 52651915 GGGCGACAGAG 52651925
          |||||||||||
     9774 GGGCGACAGAG 9784

Alignment time is 10.7101 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [52637064,52668002] =>     30939 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    9537] =>      9537 nucs 'mol-32-2b13-068093_9537'

Score:        9536
Aligned:      9536        nucs
Identic:      9536 (100%) nucs =>      2913 (100%)      6623 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [52648497,52651409] EXCISED REGION [52651411,52658033]
 second seq =>  [       1,    2913] EXCISED REGION [    2915,    9537]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [52651410,52651410]
 second seq =>         1 nucs [2914,2914]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [52651409,52651409] to [52651410,52651410]
 second seq =>         1 nucs [2914,2914] to [2915,2915]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 52648497 AACATTCAAATTCAGGAAATGCAGAGAACCCCAGTAAGATACTCCACAAAAAGATCTTCC 52648556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AACATTCAAATTCAGGAAATGCAGAGAACCCCAGTAAGATACTCCACAAAAAGATCTTCC 60

 52648557 CCAAGACATCATCATCAGATTCTCCAAAGTTGAAATGTAAGAAAAAATGCTAAAGGCAAC 52648616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCAAGACATCATCATCAGATTCTCCAAAGTTGAAATGTAAGAAAAAATGCTAAAGGCAAC 120

 52648617 TAGAGTGAAAGGCCCGGTCACCTAAAAAGGGAAGCACAGACTTACAGTGGACCTCTCACT 52648676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TAGAGTGAAAGGCCCGGTCACCTAAAAAGGGAAGCACAGACTTACAGTGGACCTCTCACT 180

 52648677 GGTAACCCTACAAGCCAGAAGAGATTGAGGACCAATATTCAACATTCTTAAACAAAAAGA 52648736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGTAACCCTACAAGCCAGAAGAGATTGAGGACCAATATTCAACATTCTTAAACAAAAAGA 240

 52648737 ATTCCAACCCAGAATTTTATATCTGACTAAACTAAGCTTCATAAGCAAAAGAGAAATAAG 52648796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATTCCAACCCAGAATTTTATATCTGACTAAACTAAGCTTCATAAGCAAAAGAGAAATAAG 300

 52648797 ATCATTTTCAGACAAGCAAATGCTAAGGGAATTTGTGACCATTAGACCTTCCTTGCAACA 52648856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATCATTTTCAGACAAGCAAATGCTAAGGGAATTTGTGACCATTAGACCTTCCTTGCAACA 360

 52648857 GTTCCTAAAGGAAGCACTAAATATGGAAAGACCATTACCAGACACTACAAAACACACTGA 52648916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTTCCTAAAGGAAGCACTAAATATGGAAAGACCATTACCAGACACTACAAAACACACTGA 420

 52648917 AGTACACAGACCAGTGACATTGTAAAGCAACTACATAACAAGTCTGCAAAATAACCAGCC 52648976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGTACACAGACCAGTGACATTGTAAAGCAACTACATAACAAGTCTGCAAAATAACCAGCC 480

 52648977 AACATCATGATGACGGTATCAAATCGACACATAGCAACACTAACCTTAAATGTAAATGGA 52649036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AACATCATGATGACGGTATCAAATCGACACATAGCAACACTAACCTTAAATGTAAATGGA 540

 52649037 CTAAATGATCCCATTAAAAGACATAAAGTGGCAGGCTGGATAAAGAACCAAGAACCATTG 52649096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTAAATGATCCCATTAAAAGACATAAAGTGGCAGGCTGGATAAAGAACCAAGAACCATTG 600

 52649097 GTATACTGTCTTCAAGAGACCCATCTCCTATGCAGTGACACACATAGGTTCAAGATAAAG 52649156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTATACTGTCTTCAAGAGACCCATCTCCTATGCAGTGACACACATAGGTTCAAGATAAAG 660

 52649157 GGATGGGGAAAAATCTACCAAGCAAATAGAAAACAGAATAAAACAGGGGTTGCAATCCTA 52649216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGATGGGGAAAAATCTACCAAGCAAATAGAAAACAGAATAAAACAGGGGTTGCAATCCTA 720

 52649217 GTTGCCGTCAAAACAGACTTTAAACCAACAAAGGTTAAAAGAAAAAAATATGGGCATTGC 52649276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GTTGCCGTCAAAACAGACTTTAAACCAACAAAGGTTAAAAGAAAAAAATATGGGCATTGC 780

 52649277 ATAAGGATAAAGTGTTAAATTAAACAAGAAGATCTAACTATCCTAAGTATATATGCACCA 52649336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATAAGGATAAAGTGTTAAATTAAACAAGAAGATCTAACTATCCTAAGTATATATGCACCA 840

 52649337 AACACAGGAACACCCAGATTCATAAAGCAAGTTTATGGAGACCTTCAAACAGACTTAGAC 52649396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AACACAGGAACACCCAGATTCATAAAGCAAGTTTATGGAGACCTTCAAACAGACTTAGAC 900

 52649397 TCCCACACAATAGTAGTGGGAGACTTTAATACCCCATGACAATATTAGACAGATCATTGA 52649456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TCCCACACAATAGTAGTGGGAGACTTTAATACCCCATGACAATATTAGACAGATCATTGA 960

 52649457 GACAGGAAATTAACAAAGATATTCAAGATCTAACTCAGCACTAAATCAAATGGCCCTGAT 52649516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GACAGGAAATTAACAAAGATATTCAAGATCTAACTCAGCACTAAATCAAATGGCCCTGAT 1020

 52649517 AGATATCTACAGGACTGTCCTACTTGAAACCATACAATTACATGGTAATTGAATGACCTG 52649576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGATATCTACAGGACTGTCCTACTTGAAACCATACAATTACATGGTAATTGAATGACCTG 1080

 52649577 CTCCTGAATGACTTTTGGGTAAATAATAAAATTAAGGCAGAAATCAAGAAGTTTTTTGAA 52649636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTCCTGAATGACTTTTGGGTAAATAATAAAATTAAGGCAGAAATCAAGAAGTTTTTTGAA 1140

 52649637 CTAATGAGAACAAAGATACAACATACCAGAATCTTTGGGACACAGCTAAGGCAGTGTTAA 52649696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTAATGAGAACAAAGATACAACATACCAGAATCTTTGGGACACAGCTAAGGCAGTGTTAA 1200

 52649697 GAGGGAAATTTATAGCACTAAATCCCACATCAAAAAGTTAGAAAGAGCTCACGTTAACAA 52649756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GAGGGAAATTTATAGCACTAAATCCCACATCAAAAAGTTAGAAAGAGCTCACGTTAACAA 1260

 52649757 TCTAACCTCACAACTACAGGAACTAGAGAACTGAGAGCAGAAAAACCTGAAAGCTAGCAG 52649816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TCTAACCTCACAACTACAGGAACTAGAGAACTGAGAGCAGAAAAACCTGAAAGCTAGCAG 1320

 52649817 AAGACAAGAAATAACCAAAATTAGAGCTGAACTGAAGGAGATTGAGACATGAAAAACCAT 52649876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AAGACAAGAAATAACCAAAATTAGAGCTGAACTGAAGGAGATTGAGACATGAAAAACCAT 1380

 52649877 TCAAAAGATCAGTGAATTCAGGAGCTGTTTTTTTTTTGAACAAATTAATAAAATAGACCA 52649936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TCAAAAGATCAGTGAATTCAGGAGCTGTTTTTTTTTTGAACAAATTAATAAAATAGACCA 1440

 52649937 TTAGCTAGAGTAATAAACAAGAAAATAGAAAAGATTCAAATAAACACAATCAGAAACGAC 52649996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTAGCTAGAGTAATAAACAAGAAAATAGAAAAGATTCAAATAAACACAATCAGAAACGAC 1500

 52649997 AAGGGGGATATTACCACTGACCCCACAGAAGTACAAACAACCATCAGAGAATATTATGAA 52650056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AAGGGGGATATTACCACTGACCCCACAGAAGTACAAACAACCATCAGAGAATATTATGAA 1560

 52650057 CATCTCTATGCACATAAACTAGAAAATCTAGAAGAAGTGGATAAACTTCTGGACATATAC 52650116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CATCTCTATGCACATAAACTAGAAAATCTAGAAGAAGTGGATAAACTTCTGGACATATAC 1620

 52650117 ACCCTTCTAAGACTGTACCAGGAAGAAATTGAATCCCTGAACAGACCAATAATGAGCCCT 52650176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ACCCTTCTAAGACTGTACCAGGAAGAAATTGAATCCCTGAACAGACCAATAATGAGCCCT 1680

 52650177 AAAATTGAGGAAGTAATACATAGACTACCAACCATAAAAAAACCCAGTACTAGATGGATT 52650236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AAAATTGAGGAAGTAATACATAGACTACCAACCATAAAAAAACCCAGTACTAGATGGATT 1740

 52650237 CACAGGTAAGTTCTACCAGTTGTACAAAGAAGAGCTGGTACAGTTCCTACTGAAATTATT 52650296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CACAGGTAAGTTCTACCAGTTGTACAAAGAAGAGCTGGTACAGTTCCTACTGAAATTATT 1800

 52650297 CCAAAAAGTTGAGTAGGAGGGAGTCCTTCCTAACTCATTTGATGAGGCCAGCATCATCCT 52650356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CCAAAAAGTTGAGTAGGAGGGAGTCCTTCCTAACTCATTTGATGAGGCCAGCATCATCCT 1860

 52650357 GATATCAAAACCTGGCAGATATACAACAAGAAAAGCTTCAGGCCAATATCCTTGATGAAC 52650416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GATATCAAAACCTGGCAGATATACAACAAGAAAAGCTTCAGGCCAATATCCTTGATGAAC 1920

 52650417 TTCAATGCAAAAATCCTCAATAAAATACTGGCAAACTGAATCCAGCAGCACACCAAAAAG 52650476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTCAATGCAAAAATCCTCAATAAAATACTGGCAAACTGAATCCAGCAGCACACCAAAAAG 1980

 52650477 CTTATCCACCATGATCAAGTAGAATGCAAGTTGGTTCAACATATACAAATCAATAAATGT 52650536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CTTATCCACCATGATCAAGTAGAATGCAAGTTGGTTCAACATATACAAATCAATAAATGT 2040

 52650537 GACTCATCACATAAACAGAACTAAAGACAAAAACTACATGATTATCTCAACAGATGCAGA 52650596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GACTCATCACATAAACAGAACTAAAGACAAAAACTACATGATTATCTCAACAGATGCAGA 2100

 52650597 AAAGGCTTTCAATAAAATTAGACATCCATTTATGTTAAAAACTCTCAATAAACTAGGTAT 52650656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AAAGGCTTTCAATAAAATTAGACATCCATTTATGTTAAAAACTCTCAATAAACTAGGTAT 2160

 52650657 TGAAGGAACATACCTCAAAATAATAAGAGCCATGTATGACAAACCCACAGCTAAGATCAT 52650716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TGAAGGAACATACCTCAAAATAATAAGAGCCATGTATGACAAACCCACAGCTAAGATCAT 2220

 52650717 ACTGAATGGGCAAAAGCTGGAAGCATTTTCTTTGAAGACTGGCATAAGACAAGGATGATC 52650776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ACTGAATGGGCAAAAGCTGGAAGCATTTTCTTTGAAGACTGGCATAAGACAAGGATGATC 2280

 52650777 TCTCTCACCACTCCTATTCAACATAGTATTGGAAGTCTTGGCCAGGGCAATCGGGCAAGA 52650836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TCTCTCACCACTCCTATTCAACATAGTATTGGAAGTCTTGGCCAGGGCAATCGGGCAAGA 2340

 52650837 GAAATAAATAAAGCGCATCCAAATAGGAAGAGAGGAAGTCAAACTATCCTTGTTTGCAGA 52650896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GAAATAAATAAAGCGCATCCAAATAGGAAGAGAGGAAGTCAAACTATCCTTGTTTGCAGA 2400

 52650897 TTACATGACATTATATCTAGAAAACCCCATAGTCTCAGCCCCAAAGCTTCTTAAGCTGAT 52650956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TTACATGACATTATATCTAGAAAACCCCATAGTCTCAGCCCCAAAGCTTCTTAAGCTGAT 2460

 52650957 AAACAACTTCAGCAAAGTCTCAGGATACAAAATAAATGTGCAAAAATTACTGGCATTTCC 52651016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AAACAACTTCAGCAAAGTCTCAGGATACAAAATAAATGTGCAAAAATTACTGGCATTTCC 2520

 52651017 ATGCACCAACAACAGTCAAGCCAGGAGCCAAACCAGGAATGCACTCCCACTCACAATCGC 52651076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 ATGCACCAACAACAGTCAAGCCAGGAGCCAAACCAGGAATGCACTCCCACTCACAATCGC 2580

 52651077 CACAAAAAGAGTAAAATACCTAGGAAAACAGCTAATTAGGGAGGTGAAAGATCTCTACAA 52651136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CACAAAAAGAGTAAAATACCTAGGAAAACAGCTAATTAGGGAGGTGAAAGATCTCTACAA 2640

 52651137 GGAGAATAATGAACCAGCGCTCAAAGAAATTAGAGATGACACAAACAAATGGAAAAACAT 52651196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GGAGAATAATGAACCAGCGCTCAAAGAAATTAGAGATGACACAAACAAATGGAAAAACAT 2700

 52651197 TCCATGTTCATTGATAGGAAGAATCAATATCATTAAAATGGCCATATTGCCCAGAGCAAT 52651256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TCCATGTTCATTGATAGGAAGAATCAATATCATTAAAATGGCCATATTGCCCAGAGCAAT 2760

 52651257 TTATAGATTCAATGCTATACCTATTAAACTACTGTTGAGATTCTTCACAGAACCAGAGAA 52651316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TTATAGATTCAATGCTATACCTATTAAACTACTGTTGAGATTCTTCACAGAACCAGAGAA 2820

 52651317 AACTATTTTAAAATTCATATAGAACCCAGAAAAGAGCCTGAATTGCTAAGGCAATCCTAA 52651376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 AACTATTTTAAAATTCATATAGAACCCAGAAAAGAGCCTGAATTGCTAAGGCAATCCTAA 2880

 52651377 GCAAAAAGCATAAAGCTGAAGGCATCATGCTAC 52651409
          |||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 GCAAAAAGCATAAAGCTGAAGGCATCATGCTAC 2913

EXCISED REGION

 52651411 TGACTTCAAACTATACTACAAGGCTACAGTAACCAAAACAGCATACTACTGGTACAAAAA 52651470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2915 TGACTTCAAACTATACTACAAGGCTACAGTAACCAAAACAGCATACTACTGGTACAAAAA 2974

 52651471 CAGACACATAGACCAATGGAACAGAATAGAGAACCCGGAAATAAGACCACACACCTACAA 52651530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2975 CAGACACATAGACCAATGGAACAGAATAGAGAACCCGGAAATAAGACCACACACCTACAA 3034

 52651531 CTATCTAATCTTTGACAAACCTGACAAAAACATGCAATGGGGAAAAGATTTCCTATTCAA 52651590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3035 CTATCTAATCTTTGACAAACCTGACAAAAACATGCAATGGGGAAAAGATTTCCTATTCAA 3094

 52651591 TAAAAAGTGCTGGGATAACCGGCTAGCTGTACACAGAAGATTAAAGCTGGACCCCTTCCT 52651650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3095 TAAAAAGTGCTGGGATAACCGGCTAGCTGTACACAGAAGATTAAAGCTGGACCCCTTCCT 3154

 52651651 TACAACATATACAAAAATCGGCCGGGCTTGGTGGCTCACGCTTGTAATCCCAGCACTTTG 52651710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3155 TACAACATATACAAAAATCGGCCGGGCTTGGTGGCTCACGCTTGTAATCCCAGCACTTTG 3214

 52651711 GAAGGCCGAGGAGGGCGGATCATGAGGTCAGGAGATCGAGAACACGGTGAAACCCCGTCT 52651770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3215 GAAGGCCGAGGAGGGCGGATCATGAGGTCAGGAGATCGAGAACACGGTGAAACCCCGTCT 3274

 52651771 CTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGTGTGGTGGCAGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACT 52651830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3275 CTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGTGTGGTGGCAGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACT 3334

 52651831 TGGAGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGTGTGAACCCGGGAGACAGAGCTTGCACTGAGCCGA 52651890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3335 TGGAGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGTGTGAACCCGGGAGACAGAGCTTGCACTGAGCCGA 3394

 52651891 GACCACATCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGTGAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAA 52651950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3395 GACCACATCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGTGAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAA 3454

 52651951 AAAAAAAAAGAAGACATACAGGTAGTCAACAAGCATATGAAAAAAAGCTCAATATTACTA 52652010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3455 AAAAAAAAAGAAGACATACAGGTAGTCAACAAGCATATGAAAAAAAGCTCAATATTACTA 3514

 52652011 ATCATCAGAGAAATGCAAATCAAAAACCACAATGAGATACCATCTAATACCAGTCAGAAT 52652070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3515 ATCATCAGAGAAATGCAAATCAAAAACCACAATGAGATACCATCTAATACCAGTCAGAAT 3574

 52652071 GATATTATTAAAAAGTCAAAAAATAAGATGCTGGTGAGGTAGTGGAGAGAAAGGAATGCT 52652130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3575 GATATTATTAAAAAGTCAAAAAATAAGATGCTGGTGAGGTAGTGGAGAGAAAGGAATGCT 3634

 52652131 TATACACTGTTGGTGGGAGTGTAAATTAGTTCAACCATTGTGGAAGACAGTGTGGCAATT 52652190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3635 TATACACTGTTGGTGGGAGTGTAAATTAGTTCAACCATTGTGGAAGACAGTGTGGCAATT 3694

 52652191 CCTCAAAGACCTAAAGATAGAAATACCATTCCACCCAGCAATTCCATTACTGGGTACATA 52652250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3695 CCTCAAAGACCTAAAGATAGAAATACCATTCCACCCAGCAATTCCATTACTGGGTACATA 3754

 52652251 CCCGAAAAATAGAAATCATTCTTTTATAAAGATACATGCATGTGTATGTTCATTGCAGCA 52652310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3755 CCCGAAAAATAGAAATCATTCTTTTATAAAGATACATGCATGTGTATGTTCATTGCAGCA 3814

 52652311 CTATTCACAATAGCAAAAACATGGAATCAACCTAAATACCCACCAATGATAGCCTGGATA 52652370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3815 CTATTCACAATAGCAAAAACATGGAATCAACCTAAATACCCACCAATGATAGCCTGGATA 3874

 52652371 AAGAAAATGTGGTACATATACACCATGGAATACTATGCAGCCATAAAAAGAACGAGATCA 52652430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3875 AAGAAAATGTGGTACATATACACCATGGAATACTATGCAGCCATAAAAAGAACGAGATCA 3934

 52652431 TGTCCTTTGCAGGAACATGAATGGAGCTGAAGGCCATTATCCTTAGCAAAGTATTGCCGA 52652490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3935 TGTCCTTTGCAGGAACATGAATGGAGCTGAAGGCCATTATCCTTAGCAAAGTATTGCCGA 3994

 52652491 AAAAGAAAATCAAATACTACATGTTCTCACTTATAAATGGGAGCTAAATGATGAGAACAC 52652550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3995 AAAAGAAAATCAAATACTACATGTTCTCACTTATAAATGGGAGCTAAATGATGAGAACAC 4054

 52652551 ATGGCCACACAGGGGGAACAACACACACTGGGGCCTATTGGAGGGTGGAAGGTGGGAGGA 52652610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4055 ATGGCCACACAGGGGGAACAACACACACTGGGGCCTATTGGAGGGTGGAAGGTGGGAGGA 4114

 52652611 GGGAGAGGATCAGGAAAAATAATTAATAGATATTATTTCATCACCCAGGTATTAATAATA 52652670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4115 GGGAGAGGATCAGGAAAAATAATTAATAGATATTATTTCATCACCCAGGTATTAATAATA 4174

 52652671 CCTATTTCATCACCCAGGCTTGATACCTGGGTGACAACAAACCCCCATGACACAAATTTA 52652730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4175 CCTATTTCATCACCCAGGCTTGATACCTGGGTGACAACAAACCCCCATGACACAAATTTA 4234

 52652731 CCTATATAACAAACCTGCCCGTGTACCCCTGAACTTAAAATAAAAGTTAAAAAAATGCAA 52652790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4235 CCTATATAACAAACCTGCCCGTGTACCCCTGAACTTAAAATAAAAGTTAAAAAAATGCAA 4294

 52652791 AAAGATGACATACCAAAGAGATGTTACTTTTCATTTTTAAAAAAGTCAAAGAATTTAAGG 52652850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4295 AAAGATGACATACCAAAGAGATGTTACTTTTCATTTTTAAAAAAGTCAAAGAATTTAAGG 4354

 52652851 AAAATTAAAAAGAAATCAAGAATGACAGTAGCAGCTCCAAAATATTTAGAAGGTAGAGTT 52652910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4355 AAAATTAAAAAGAAATCAAGAATGACAGTAGCAGCTCCAAAATATTTAGAAGGTAGAGTT 4414

 52652911 GAAAATTTTGATTTTCTTAGTGCAGAAAAATATTTTGTGCTGCATGTTTTTTTAAAGAAA 52652970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4415 GAAAATTTTGATTTTCTTAGTGCAGAAAAATATTTTGTGCTGCATGTTTTTTTAAAGAAA 4474

 52652971 GTCATTTTATCTGTATATGTGATTAAAACCTTATTTCCAGTGCCATCTTCGTGTAATTGT 52653030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4475 GTCATTTTATCTGTATATGTGATTAAAACCTTATTTCCAGTGCCATCTTCGTGTAATTGT 4534

 52653031 TAAGAACTTGGATTGTGGATCACAGGAACCTGGCTTTGACTCTTAACTGCTCACTCTTTA 52653090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4535 TAAGAACTTGGATTGTGGATCACAGGAACCTGGCTTTGACTCTTAACTGCTCACTCTTTA 4594

 52653091 AATGGATAACCCGGGTAAGTTATTTCCTGTCTCTGTGCCTCAGTTTTCTTACAAATTGGC 52653150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4595 AATGGATAACCCGGGTAAGTTATTTCCTGTCTCTGTGCCTCAGTTTTCTTACAAATTGGC 4654

 52653151 ATGAAAATAACAGTGCCTCCTTCAGAGGGTAATTCTGAGGATTAAATGAAATATTGCCCA 52653210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4655 ATGAAAATAACAGTGCCTCCTTCAGAGGGTAATTCTGAGGATTAAATGAAATATTGCCCA 4714

 52653211 TACAGTGCTTACCACAGGCTGGTAGATGATTGGTATTCGGTAAACAGTAGTTATTTTTGT 52653270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4715 TACAGTGCTTACCACAGGCTGGTAGATGATTGGTATTCGGTAAACAGTAGTTATTTTTGT 4774

 52653271 TATACTAATATGTTATTAATATAATTACCATTTTGTATTTTTAAATGTAAGCCATAAGGA 52653330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4775 TATACTAATATGTTATTAATATAATTACCATTTTGTATTTTTAAATGTAAGCCATAAGGA 4834

 52653331 AAGGAATTATTCCAATAGTTTAATTTACAAACTTGAGTTTTCTAGAAAGACTTTTAAAAA 52653390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4835 AAGGAATTATTCCAATAGTTTAATTTACAAACTTGAGTTTTCTAGAAAGACTTTTAAAAA 4894

 52653391 CAGTAGTGATATAAATCAATTTATCTTAAGAAACATAAGTATCTGGGCCAGGCAAGTTTC 52653450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4895 CAGTAGTGATATAAATCAATTTATCTTAAGAAACATAAGTATCTGGGCCAGGCAAGTTTC 4954

 52653451 AGAAATGTTTATCATTTTCAAAGTACCAAATATTCTCGTCAAAACAAGCTGCTTCATCAG 52653510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4955 AGAAATGTTTATCATTTTCAAAGTACCAAATATTCTCGTCAAAACAAGCTGCTTCATCAG 5014

 52653511 AGTTCTAATTATATATTTAAACATACATGCACACACACACGTTTGTATTACAATATTCAA 52653570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5015 AGTTCTAATTATATATTTAAACATACATGCACACACACACGTTTGTATTACAATATTCAA 5074

 52653571 AACTTCTGAGGAAGAATTATCTTTTTTTTTTCATGTGCCAAAGCTAAAACTTTCACTTGC 52653630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5075 AACTTCTGAGGAAGAATTATCTTTTTTTTTTCATGTGCCAAAGCTAAAACTTTCACTTGC 5134

 52653631 TACAGCTGTGTATTAGTCTATTTCCATACTGCTATAAAGAGCTGCCCAAGACTGGGTGAT 52653690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5135 TACAGCTGTGTATTAGTCTATTTCCATACTGCTATAAAGAGCTGCCCAAGACTGGGTGAT 5194

 52653691 TTATAAAGGAAAGAGGTTTAATTGACTCACAGTTCAGCATGGCAGGGAAGGCCTCAGGAA 52653750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5195 TTATAAAGGAAAGAGGTTTAATTGACTCACAGTTCAGCATGGCAGGGAAGGCCTCAGGAA 5254

 52653751 ACTTACAATCATGGTGGAAGTCAAAGGGGGAGCAAGGACCTTTCTTCACAAGGCAGCAGA 52653810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5255 ACTTACAATCATGGTGGAAGTCAAAGGGGGAGCAAGGACCTTTCTTCACAAGGCAGCAGA 5314

 52653811 AAGAAGTGCCAAATGAACAGGGAAGAGCTCCTTATGAAACCATCAGGTCTTGTGAGAACT 52653870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5315 AAGAAGTGCCAAATGAACAGGGAAGAGCTCCTTATGAAACCATCAGGTCTTGTGAGAACT 5374

 52653871 CACTTACTTTTATGAGAACAGCATGGAGGAAACTGTCCCCATGATCCAATCACCTCCACC 52653930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5375 CACTTACTTTTATGAGAACAGCATGGAGGAAACTGTCCCCATGATCCAATCACCTCCACC 5434

 52653931 TGGTCTCTCCCTTGACACGTGGGGATTATGGGGATTAAATTCCAGATGAGATTTGGGTGG 52653990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5435 TGGTCTCTCCCTTGACACGTGGGGATTATGGGGATTAAATTCCAGATGAGATTTGGGTGG 5494

 52653991 GGACAAAAAGCCTAACGACATCAAGCTGTAAAAACAATAGCTAACATTCATTGACTGTTT 52654050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5495 GGACAAAAAGCCTAACGACATCAAGCTGTAAAAACAATAGCTAACATTCATTGACTGTTT 5554

 52654051 CCCAGCATTAGGATAAATGTGTGTAACAAGAGGCATTTTATTTATGTATGACATTTGTTT 52654110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5555 CCCAGCATTAGGATAAATGTGTGTAACAAGAGGCATTTTATTTATGTATGACATTTGTTT 5614

 52654111 ATTTATTATTTATTTATTTGGATAAATGTCTATAACAAGAAACATTTTATTTAAGTATAA 52654170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5615 ATTTATTATTTATTTATTTGGATAAATGTCTATAACAAGAAACATTTTATTTAAGTATAA 5674

 52654171 CAGCAAATCTACAAGTTAGGTACTATCATCACTCCCATTTTACAGGTCGTGAAACTGAGG 52654230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5675 CAGCAAATCTACAAGTTAGGTACTATCATCACTCCCATTTTACAGGTCGTGAAACTGAGG 5734

 52654231 CTCTGAAAAGTCAAGTCAGTTTTCTAATGTTGTCCAGCTAATGACTGGTAGATTTAGTAT 52654290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5735 CTCTGAAAAGTCAAGTCAGTTTTCTAATGTTGTCCAGCTAATGACTGGTAGATTTAGTAT 5794

 52654291 TTGAACCCACATTTGCCTGATTCCAAAGTTCAAACTCCCAACAACATGTGGTAACCAAAG 52654350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5795 TTGAACCCACATTTGCCTGATTCCAAAGTTCAAACTCCCAACAACATGTGGTAACCAAAG 5854

 52654351 CAGGAACAGAAGAGAAAGAAGAAATAGAAGGGAGGGAAGATGAACAAAGTAGACAAAGTT 52654410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5855 CAGGAACAGAAGAGAAAGAAGAAATAGAAGGGAGGGAAGATGAACAAAGTAGACAAAGTT 5914

 52654411 TAGTTAATAGAATTAGTGGATACCCAAGAAAAAACTATGTACAAGAGGGGGAAAAAAACC 52654470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5915 TAGTTAATAGAATTAGTGGATACCCAAGAAAAAACTATGTACAAGAGGGGGAAAAAAACC 5974

 52654471 CTGTTTTCTCACATCTGGGAAACATTGATATCTATATATTTTTGGTTTTAAATAAAAATT 52654530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5975 CTGTTTTCTCACATCTGGGAAACATTGATATCTATATATTTTTGGTTTTAAATAAAAATT 6034

 52654531 AGGTTATGTCATTCATTTGCATAAAACCATCCAAAGAAGGGCCTCACAAAATTAAAACAA 52654590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6035 AGGTTATGTCATTCATTTGCATAAAACCATCCAAAGAAGGGCCTCACAAAATTAAAACAA 6094

 52654591 AATCCAAACTCTCTACTATGGGCCACACCCTCCAGAACTTCAGCTCGTACTATGTTTTTC 52654650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6095 AATCCAAACTCTCTACTATGGGCCACACCCTCCAGAACTTCAGCTCGTACTATGTTTTTC 6154

 52654651 CTCACACCTCTCAACATACCAACATGTTTCCACCTGCAGCCCTCACCACTAGTTATTCTT 52654710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6155 CTCACACCTCTCAACATACCAACATGTTTCCACCTGCAGCCCTCACCACTAGTTATTCTT 6214

 52654711 TCAATCTGGAAATATTTTCGCTAAGATCTTCCTATGGTTACCTTCTTATCATTCAAGACT 52654770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6215 TCAATCTGGAAATATTTTCGCTAAGATCTTCCTATGGTTACCTTCTTATCATTCAAGACT 6274

 52654771 TAGGTTATGTCAGGCCTTCCCTGACTCCTCCATCTGAAGTAACCCCTCCTGCTTACTCCT 52654830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6275 TAGGTTATGTCAGGCCTTCCCTGACTCCTCCATCTGAAGTAACCCCTCCTGCTTACTCCT 6334

 52654831 GTTTATTCTCTAGACTCCACAGAGGATTCATCACTCTCTGAAATGATCCCATTAATTTCT 52654890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6335 GTTTATTCTCTAGACTCCACAGAGGATTCATCACTCTCTGAAATGATCCCATTAATTTCT 6394

 52654891 TCTTCACTTGTTTCCTCTCCACGACCTGTAAGCCCCAAGTGGACCCGGACTTGGTCTGCT 52654950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6395 TCTTCACTTGTTTCCTCTCCACGACCTGTAAGCCCCAAGTGGACCCGGACTTGGTCTGCT 6454

 52654951 CTGCTTACAGCTGGATTCCAGTTCCCATAGTGCTAGACACTAGGATTAAGCCAGGAAACA 52655010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6455 CTGCTTACAGCTGGATTCCAGTTCCCATAGTGCTAGACACTAGGATTAAGCCAGGAAACA 6514

 52655011 TGGGTGAAGCAGCAAGCACAGAGCTTGGGGCACAGCCTAGCAAACACTCCACAAAGGACC 52655070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6515 TGGGTGAAGCAGCAAGCACAGAGCTTGGGGCACAGCCTAGCAAACACTCCACAAAGGACC 6574

 52655071 ATGATTGTAACTGTAGTAGGGCACACCAATGAACAGGTTGGGAAACTGAGTCTCTGAGAA 52655130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6575 ATGATTGTAACTGTAGTAGGGCACACCAATGAACAGGTTGGGAAACTGAGTCTCTGAGAA 6634

 52655131 GAGACTAATGTTGTGCTGGATGAAATTTCTTTTTCTGACAATACATTATCCAAATCCTCC 52655190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6635 GAGACTAATGTTGTGCTGGATGAAATTTCTTTTTCTGACAATACATTATCCAAATCCTCC 6694

 52655191 AAGCTTTCAGTTTAAAGGGGAAAGCAGGAACTATCATTATAATTTTATTTACAAAGTGTC 52655250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6695 AAGCTTTCAGTTTAAAGGGGAAAGCAGGAACTATCATTATAATTTTATTTACAAAGTGTC 6754

 52655251 CATGTATGAACATTATTCACCGCCGAATCATCTCTTCCTATGCAAGCAACACCGTCCTAT 52655310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6755 CATGTATGAACATTATTCACCGCCGAATCATCTCTTCCTATGCAAGCAACACCGTCCTAT 6814

 52655311 GCATCAATATCCTGATCTGTCAGGATTCAGGATAAAGTGGACATATACACACTAATTGCA 52655370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6815 GCATCAATATCCTGATCTGTCAGGATTCAGGATAAAGTGGACATATACACACTAATTGCA 6874

 52655371 AAGGGAAATTGTACATCTTGCAAAAGATGCAGGGGTTTATAGAGTCTTGTAACATTGGTG 52655430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6875 AAGGGAAATTGTACATCTTGCAAAAGATGCAGGGGTTTATAGAGTCTTGTAACATTGGTG 6934

 52655431 AGCTGCTCAGATCACACACATGACCGTGGTTGGACAAGGATCTGGCAAAGTTAACACAGA 52655490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6935 AGCTGCTCAGATCACACACATGACCGTGGTTGGACAAGGATCTGGCAAAGTTAACACAGA 6994

 52655491 TCACCGAAGAAGGAAAAGTGGACAACACAACACAGTAAGTTCTTCAAAAGAGTTATATTA 52655550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6995 TCACCGAAGAAGGAAAAGTGGACAACACAACACAGTAAGTTCTTCAAAAGAGTTATATTA 7054

 52655551 GAATATCAAAAGATTATGTTAGGCCTTTGGGAAAACTCAAAACTTTATGAAGACCTCAAA 52655610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7055 GAATATCAAAAGATTATGTTAGGCCTTTGGGAAAACTCAAAACTTTATGAAGACCTCAAA 7114

 52655611 AAATTATGCAAAAATGACCCTTCAATGGTCATGCTGCAAGAGTCAAATGACACTTCAAAC 52655670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7115 AAATTATGCAAAAATGACCCTTCAATGGTCATGCTGCAAGAGTCAAATGACACTTCAAAC 7174

 52655671 AACTGCGGCTTTCTATGTTGTGCAAATGCATTTGTTGTTTTAAAGGTCGTAAAGTCAGGG 52655730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7175 AACTGCGGCTTTCTATGTTGTGCAAATGCATTTGTTGTTTTAAAGGTCGTAAAGTCAGGG 7234

 52655731 TACACGTGGCAGATACTTATGACTTGGAGGAAGACGTTAGATTAGATTTGAAACTTTCAC 52655790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7235 TACACGTGGCAGATACTTATGACTTGGAGGAAGACGTTAGATTAGATTTGAAACTTTCAC 7294

 52655791 TGAATGATCGCATTTCATGCTTTTCATCTGTACATTAAAAAGCCAGAATGTCTTTGCCAA 52655850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7295 TGAATGATCGCATTTCATGCTTTTCATCTGTACATTAAAAAGCCAGAATGTCTTTGCCAA 7354

 52655851 GAAATTCTAGCATAAATAAAAGAAAAGGATGGGATTTTGGAACATCATGGTAGAATTCTT 52655910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7355 GAAATTCTAGCATAAATAAAAGAAAAGGATGGGATTTTGGAACATCATGGTAGAATTCTT 7414

 52655911 GACTATCAGCTTTATACAACATGTCTGGACATTTAGTGATGGAAATGCTGGATTCCAAAG 52655970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7415 GACTATCAGCTTTATACAACATGTCTGGACATTTAGTGATGGAAATGCTGGATTCCAAAG 7474

 52655971 GAATGTAGGCAAAGGTACTACTACCCCCATGCTCTTCAGAAAACATCCTCTAAAAGCAAC 52656030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7475 GAATGTAGGCAAAGGTACTACTACCCCCATGCTCTTCAGAAAACATCCTCTAAAAGCAAC 7534

 52656031 AGTGATGATCAGATACTGTGGGGCAAGACTGACAGTGACACTCAAGATTTCCACTCTTCT 52656090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7535 AGTGATGATCAGATACTGTGGGGCAAGACTGACAGTGACACTCAAGATTTCCACTCTTCT 7594

 52656091 CTTTAATCATATATTTCCTGTCATTCATGTGCTACAAAACTCTGGAATATGCAAAGCTCA 52656150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7595 CTTTAATCATATATTTCCTGTCATTCATGTGCTACAAAACTCTGGAATATGCAAAGCTCA 7654

 52656151 TTCAAATGCAAAACCAGCCTTTGCTCCAACATGAGCATATATTTTCATTTAAAGACAAAT 52656210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7655 TTCAAATGCAAAACCAGCCTTTGCTCCAACATGAGCATATATTTTCATTTAAAGACAAAT 7714

 52656211 CAGATGTTTCATTTGATTTTTTTTATAAATCTGATAATAATGTACATTTAACCCGTGTTT 52656270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7715 CAGATGTTTCATTTGATTTTTTTTATAAATCTGATAATAATGTACATTTAACCCGTGTTT 7774

 52656271 ACAACCAAAATAATTAATCTCTCTGAACCCTTTGTTTTTCCTGTCTCTATCCTCCACCCT 52656330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7775 ACAACCAAAATAATTAATCTCTCTGAACCCTTTGTTTTTCCTGTCTCTATCCTCCACCCT 7834

 52656331 CATTGCCAGATAAATAACATCTGCAACCTGATGTGGCATATTGAACTTTGTTTATACTCA 52656390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7835 CATTGCCAGATAAATAACATCTGCAACCTGATGTGGCATATTGAACTTTGTTTATACTCA 7894

 52656391 CACAAACACGTATAAGCATCCCAGATACACATATACAGGGACTGTATCTGTCCTTGTTGT 52656450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7895 CACAAACACGTATAAGCATCCCAGATACACATATACAGGGACTGTATCTGTCCTTGTTGT 7954

 52656451 TTTTATAGAAATTGGATCACATTAGACATATTTTCTGATGACTTTTGTACATTATAGTTG 52656510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7955 TTTTATAGAAATTGGATCACATTAGACATATTTTCTGATGACTTTTGTACATTATAGTTG 8014

 52656511 GTCTTCACAGTCAATAGCTCCAAAGCTATCTTATCTTCTAAAATAGCTGCATAATATTCC 52656570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8015 GTCTTCACAGTCAATAGCTCCAAAGCTATCTTATCTTCTAAAATAGCTGCATAATATTCC 8074

 52656571 TCAGTATGGATATACCAAAAGATATTTAAACCATTGCCTAATCAATGAATATCCTGGTAG 52656630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8075 TCAGTATGGATATACCAAAAGATATTTAAACCATTGCCTAATCAATGAATATCCTGGTAG 8134

 52656631 TTTCCACATTGTTTTTTCCATTTCCACTATAGTGGAATAAACTTTCGTGTTCAAAAATCC 52656690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8135 TTTCCACATTGTTTTTTCCATTTCCACTATAGTGGAATAAACTTTCGTGTTCAAAAATCC 8194

 52656691 TAAACTGGTGCTATATTTCTATAGAATAGAGGCACAGATGTAGAAGTGTTACCCTCAAAT 52656750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8195 TAAACTGGTGCTATATTTCTATAGAATAGAGGCACAGATGTAGAAGTGTTACCCTCAAAT 8254

 52656751 CAATATGCATTTAGTTTTGAAAAACAGACACTGCCATATTATTTTCTTAAAAAGGCTCTA 52656810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8255 CAATATGCATTTAGTTTTGAAAAACAGACACTGCCATATTATTTTCTTAAAAAGGCTCTA 8314

 52656811 CAGATTCACATTTCCAGCAGCAATGAGTGTCTCAAGCACCTTTTAAGTGGTAAGCAGCTT 52656870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8315 CAGATTCACATTTCCAGCAGCAATGAGTGTCTCAAGCACCTTTTAAGTGGTAAGCAGCTT 8374

 52656871 ACCAGGGGAGGTGGCCTATTATTCTATCAGTGGCTTCAGTTGTTAGGACACCACGGGTCA 52656930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8375 ACCAGGGGAGGTGGCCTATTATTCTATCAGTGGCTTCAGTTGTTAGGACACCACGGGTCA 8434

 52656931 GCTGTGGAGATACGGTTGTGGGGCAGGTTGAGTTCAGGACACATAGAAGATTGCCAAAGG 52656990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8435 GCTGTGGAGATACGGTTGTGGGGCAGGTTGAGTTCAGGACACATAGAAGATTGCCAAAGG 8494

 52656991 GTGACTATTATTACTTTGAGACTCTGGAAAAATTAGCCAGGAAACAGAGACAAGAGGCTC 52657050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8495 GTGACTATTATTACTTTGAGACTCTGGAAAAATTAGCCAGGAAACAGAGACAAGAGGCTC 8554

 52657051 AGGGTGCAGCAAAGCAGCCAAATCAGGATGATAGTGTTTTCTTTGGAGCAGATATACTAA 52657110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8555 AGGGTGCAGCAAAGCAGCCAAATCAGGATGATAGTGTTTTCTTTGGAGCAGATATACTAA 8614

 52657111 TGGCCAAGGAACTCATAAAAAGATGCCTAATGTCATCTCATTAGGGAAGTGCAGTCAAAG 52657170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8615 TGGCCAAGGAACTCATAAAAAGATGCCTAATGTCATCTCATTAGGGAAGTGCAGTCAAAG 8674

 52657171 CCACAGCATGATACGTCTTCACACCCACGAGGATGGCCATAATCAGAGAGACAATAACCA 52657230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8675 CCACAGCATGATACGTCTTCACACCCACGAGGATGGCCATAATCAGAGAGACAATAACCA 8734

 52657231 GTGGTAGGGAAGATGTGAAAAAATCGGAATGCTCATGCATTGCTGGTAGGAATGTGACAT 52657290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8735 GTGGTAGGGAAGATGTGAAAAAATCGGAATGCTCATGCATTGCTGGTAGGAATGTGACAT 8794

 52657291 GGTGCAGCTGCTTTGGAAAGCAGTTTAACAGTTCCTGGAAAAGTTAAACATGGAGTTACC 52657350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8795 GGTGCAGCTGCTTTGGAAAGCAGTTTAACAGTTCCTGGAAAAGTTAAACATGGAGTTACC 8854

 52657351 CTAAGACCCAGCAATTCCATTCCTAGGTAAGCAAGAAAATGAAAACATATGGCCACACAA 52657410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8855 CTAAGACCCAGCAATTCCATTCCTAGGTAAGCAAGAAAATGAAAACATATGGCCACACAA 8914

 52657411 AAACTTGTACACAAATGTCCATAGCAGCATTTTCATAATAGCTGAAAAGTGGAAACAACC 52657470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8915 AAACTTGTACACAAATGTCCATAGCAGCATTTTCATAATAGCTGAAAAGTGGAAACAACC 8974

 52657471 CAAATATCCATCAATTGGAAAAAGGAAATCTAGCATTTGCATATAATAGAGTATTAATCA 52657530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8975 CAAATATCCATCAATTGGAAAAAGGAAATCTAGCATTTGCATATAATAGAGTATTAATCA 9034

 52657531 GCCATAAGAAGAAACAAAGCACCGATCCATGTTATATCATGCTTTATACTTGGAAGCATG 52657590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9035 GCCATAAGAAGAAACAAAGCACCGATCCATGTTATATCATGCTTTATACTTGGAAGCATG 9094

 52657591 GTACTAAGTGAAAGACGCCAGACACAAAAAGCAAAATATTGTATGATTCCATTTATATAA 52657650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9095 GTACTAAGTGAAAGACGCCAGACACAAAAAGCAAAATATTGTATGATTCCATTTATATAA 9154

 52657651 AGTGTCTAGAATAGGCAAATCCATAGAGGCAGAAAACAGATTAGTGGTTGCCAGTGGCTG 52657710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9155 AGTGTCTAGAATAGGCAAATCCATAGAGGCAGAAAACAGATTAGTGGTTGCCAGTGGCTG 9214

 52657711 GGAATAGGGAAAAAACTCAGCGCTAAAGGGTAGGGAGTTTTGTTTTGGAGTAATGACGAT 52657770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9215 GGAATAGGGAAAAAACTCAGCGCTAAAGGGTAGGGAGTTTTGTTTTGGAGTAATGACGAT 9274

 52657771 GTTCTGGAATTAGACGTGGAACGATTGCACACATGGTGCAAATATCCTTAAAATCACGGA 52657830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9275 GTTCTGGAATTAGACGTGGAACGATTGCACACATGGTGCAAATATCCTTAAAATCACGGA 9334

 52657831 ATTGTCACTCTAAAAGGTGAATTTTATGGTAGGTGAATTGTACCTCAATTTGTAAAAAGA 52657890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9335 ATTGTCACTCTAAAAGGTGAATTTTATGGTAGGTGAATTGTACCTCAATTTGTAAAAAGA 9394

 52657891 AGAATTAGATAAATAAACAGCAACACAGCACCAAGGGGTGGGGGTAGGAAACAGACAACA 52657950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9395 AGAATTAGATAAATAAACAGCAACACAGCACCAAGGGGTGGGGGTAGGAAACAGACAACA 9454

 52657951 AATAGGAGTGAAGAGTTCACAGGAAAAGACATGCAGCCAGCTTTTAAGCAGAAGAAAAGA 52658010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9455 AATAGGAGTGAAGAGTTCACAGGAAAAGACATGCAGCCAGCTTTTAAGCAGAAGAAAAGA 9514

 52658011 TGTTTGGCCTCATAAATAGTAAA 52658033
          |||||||||||||||||||||||
     9515 TGTTTGGCCTCATAAATAGTAAA 9537

Alignment time is 10.0715 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [52637064,52668002] =>     30939 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    6106] =>      6106 nucs 'mol-32-2b34-046296_6106'

Score:        6105
Aligned:      6105        nucs
Identic:      6105 (100%) nucs =>      2983 (100%)      3122 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [52645162,52648144] EXCISED REGION [52648146,52651267]
 second seq =>  [       1,    2983] EXCISED REGION [    2985,    6106]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [52648145,52648145]
 second seq =>         1 nucs [2984,2984]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [2983,2984] to [2984,2985]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [52648144,52648144] to [52648146,52648146]
 second seq =>         1 nucs [2983,2983] to [2985,2985]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 52645162 GAGGACCTTGTCTTGGGCCGGGGCGTGCCCTGGGGTTTTATCTGTGTCCTGCCCCGGTCC 52645221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GAGGACCTTGTCTTGGGCCGGGGCGTGCCCTGGGGTTTTATCTGTGTCCTGCCCCGGTCC 60

 52645222 AGCTGCCACCGGAAGTGTCCAGCTCTCACTTGGGTCTTTGTTCGCTGGAGCTTTATTGGA 52645281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGCTGCCACCGGAAGTGTCCAGCTCTCACTTGGGTCTTTGTTCGCTGGAGCTTTATTGGA 120

 52645282 GCTGACATCAAGCTTCACTGATCCAAGGGATGAATCTGCGGCTTGGTCTCCGGTACGTCC 52645341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GCTGACATCAAGCTTCACTGATCCAAGGGATGAATCTGCGGCTTGGTCTCCGGTACGTCC 180

 52645342 TGGTACAGGCCGAGAGAGCATCAAGAAAAAACGAGATTTAGCAGCTGGTGCCTCGGGTTT 52645401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGGTACAGGCCGAGAGAGCATCAAGAAAAAACGAGATTTAGCAGCTGGTGCCTCGGGTTT 240

 52645402 GGCCTCTTTCCCAAGATTCTTTCCGTTGGCATCCGCAACAGCACTTATCTCCGTTGTCTC 52645461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGCCTCTTTCCCAAGATTCTTTCCGTTGGCATCCGCAACAGCACTTATCTCCGTTGTCTC 300

 52645462 GGGGGAAGAAGTGGCCACATTATCCGTCTTGACACTTATTCCCAAGTCGACTGTAAACAC 52645521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GGGGGAAGAAGTGGCCACATTATCCGTCTTGACACTTATTCCCAAGTCGACTGTAAACAC 360

 52645522 AAACATAAACAGTGGTTATTCAGCCAAGCCGGGAAATTCAGGCACTAATAATGGACTCCA 52645581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAACATAAACAGTGGTTATTCAGCCAAGCCGGGAAATTCAGGCACTAATAATGGACTCCA 420

 52645582 GACATTTTTTATACAAAAGCCATACTGCATACTGGAACTGTGTTGTTCTCTGGTCATTCT 52645641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GACATTTTTTATACAAAAGCCATACTGCATACTGGAACTGTGTTGTTCTCTGGTCATTCT 480

 52645642 GAAAGGCAGAAGTTAGCTCTCTACATCTCCTTGGACCCTGCTTTTCTTGGGAGAGGAGAA 52645701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GAAAGGCAGAAGTTAGCTCTCTACATCTCCTTGGACCCTGCTTTTCTTGGGAGAGGAGAA 540

 52645702 GGCAAGGTTGGTGAGGAGGGAAAGCTACTTAATGGAAAGTCACTAGCTGCCAGGTGTGGA 52645761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGCAAGGTTGGTGAGGAGGGAAAGCTACTTAATGGAAAGTCACTAGCTGCCAGGTGTGGA 600

 52645762 ATGAGTGATATTCAATGTTAATTAATCTTCTTTTATCTGTGTAAGAACTCCGTGAGCAGC 52645821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATGAGTGATATTCAATGTTAATTAATCTTCTTTTATCTGTGTAAGAACTCCGTGAGCAGC 660

 52645822 ATATTGTCATGATGTCAACTGGGAGGCAGTACAGCAGTTAGGAGCTTGGGTTCTGGAGCT 52645881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATATTGTCATGATGTCAACTGGGAGGCAGTACAGCAGTTAGGAGCTTGGGTTCTGGAGCT 720

 52645882 AGAACAAGGTTTCTCAACCTCAGCACTACTCACATTTGAAGCCAGATTATTCTTTGTTAG 52645941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGAACAAGGTTTCTCAACCTCAGCACTACTCACATTTGAAGCCAGATTATTCTTTGTTAG 780

 52645942 GGAGGCTCATCCCGTGCCTCATAGGCTGATTAGCAGCATCCTGGCCTCTGCCCACTAGAC 52646001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GGAGGCTCATCCCGTGCCTCATAGGCTGATTAGCAGCATCCTGGCCTCTGCCCACTAGAC 840

 52646002 GCCGGTCACATTTCCCAGTCATGGCAACCAAAAATATCTCTAGGCATTGCTAAATGTCCC 52646061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GCCGGTCACATTTCCCAGTCATGGCAACCAAAAATATCTCTAGGCATTGCTAAATGTCCC 900

 52646062 CTGGAGGACAAAATCTCTTACGTTTGAGAGGCACTGAGCTGAAATGTCTTTTTGAATCCA 52646121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTGGAGGACAAAATCTCTTACGTTTGAGAGGCACTGAGCTGAAATGTCTTTTTGAATCCA 960

 52646122 GATTATCTAATTTTCTGTGCCTCAACTTTCTGGTAAAAGGAGACAGATAATAAATCTCGT 52646181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GATTATCTAATTTTCTGTGCCTCAACTTTCTGGTAAAAGGAGACAGATAATAAATCTCGT 1020

 52646182 AATTTTGTTAGGAAGATTACATGAGTTAATAGTTTTAAAGCAAGTACAATAGCACCTGGA 52646241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AATTTTGTTAGGAAGATTACATGAGTTAATAGTTTTAAAGCAAGTACAATAGCACCTGGA 1080

 52646242 ATATATTAAGTGCTTAATAAATATCACAAACATTAGTTATCATTATTCATGAGTGAGAAA 52646301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATATATTAAGTGCTTAATAAATATCACAAACATTAGTTATCATTATTCATGAGTGAGAAA 1140

 52646302 ACTGACAGTCAGAGAGGTCAGTACACCCTCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCTAGTAAGCAGC 52646361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ACTGACAGTCAGAGAGGTCAGTACACCCTCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCTAGTAAGCAGC 1200

 52646362 AGAGTCTGGCTTCAGGCAGAAATCTGACTTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGTCTTACCAGG 52646421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AGAGTCTGGCTTCAGGCAGAAATCTGACTTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGTCTTACCAGG 1260

 52646422 GACTTGTATTAGCATAGACTGTTAAGAATATGGGAAGATTTTTAAAATACAGTACTCAGA 52646481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GACTTGTATTAGCATAGACTGTTAAGAATATGGGAAGATTTTTAAAATACAGTACTCAGA 1320

 52646482 AAATTTCTCTTTGAAAGGCTGGAAGAGCAGATATCCACACAAGAAGGCAAATTAGACCTC 52646541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AAATTTCTCTTTGAAAGGCTGGAAGAGCAGATATCCACACAAGAAGGCAAATTAGACCTC 1380

 52646542 AGGCCAGTGTGGAATTAAAGGTGTAGGGTTATCTGGTCAAGACTGTGTGTGTGGATACAG 52646601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AGGCCAGTGTGGAATTAAAGGTGTAGGGTTATCTGGTCAAGACTGTGTGTGTGGATACAG 1440

 52646602 GCTCCAACCCCTCCAGGCAAGGGCACTGTTTCCAACATCCACCCTTTCTCCTTTGACCTC 52646661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GCTCCAACCCCTCCAGGCAAGGGCACTGTTTCCAACATCCACCCTTTCTCCTTTGACCTC 1500

 52646662 TACCTTGACCTAAATTAACTATAAAAGGTCCTTCTTTTCTAGGACCCTACTATAAATCAG 52646721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TACCTTGACCTAAATTAACTATAAAAGGTCCTTCTTTTCTAGGACCCTACTATAAATCAG 1560

 52646722 TGAAATATTCAGGAAAAAAAGAACACCAAGAATGTTGGGATCCCAGTTAAAGATCAAGAT 52646781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TGAAATATTCAGGAAAAAAAGAACACCAAGAATGTTGGGATCCCAGTTAAAGATCAAGAT 1620

 52646782 TCTCTACTGATAAGCTGTGTGATATGGAGTAAATCACTAAAGATCTTTGAATCTCTTCAT 52646841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TCTCTACTGATAAGCTGTGTGATATGGAGTAAATCACTAAAGATCTTTGAATCTCTTCAT 1680

 52646842 TTGTAAAATGGGAATATTGGTAGTCCTACTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTAAAGAAGAAA 52646901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTGTAAAATGGGAATATTGGTAGTCCTACTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTAAAGAAGAAA 1740

 52646902 AGTCATGCAAAGGATCTGGCACAACGCCTTTTCCATAATAAGTGCTTAGTAATTGACAGA 52646961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AGTCATGCAAAGGATCTGGCACAACGCCTTTTCCATAATAAGTGCTTAGTAATTGACAGA 1800

 52646962 TACTGTGATAACTTTTCAGGTTTCTCTCATGCCTTTGACAACATTGCATTTTGCTTGCTC 52647021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TACTGTGATAACTTTTCAGGTTTCTCTCATGCCTTTGACAACATTGCATTTTGCTTGCTC 1860

 52647022 TATCTGTAGTCAGACACTTCTTAATATCTGTTTGCAGGAAGACAGAAAAATAAAGGGAAG 52647081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TATCTGTAGTCAGACACTTCTTAATATCTGTTTGCAGGAAGACAGAAAAATAAAGGGAAG 1920

 52647082 AATTGAGATTTCTTTGATCTATTCATACTGCTCATTAATATGTAGTGAGAAATACATACA 52647141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AATTGAGATTTCTTTGATCTATTCATACTGCTCATTAATATGTAGTGAGAAATACATACA 1980

 52647142 CACACACATACACACACATGCATCCATTAGCAATTGTTTTTGCCCAACTCTAGTGTCTCG 52647201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CACACACATACACACACATGCATCCATTAGCAATTGTTTTTGCCCAACTCTAGTGTCTCG 2040

 52647202 CAGTGTCTAGACTAAACAACAAACAAAAAAGGGGGGAGAGTGAGCTGGATTAAGCATTGA 52647261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CAGTGTCTAGACTAAACAACAAACAAAAAAGGGGGGAGAGTGAGCTGGATTAAGCATTGA 2100

 52647262 GGCACAGTGAAGAAATGGTCTGGGGCAAGCCCAGGGATGAATGTTAGGGGTTTCTCATAA 52647321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GGCACAGTGAAGAAATGGTCTGGGGCAAGCCCAGGGATGAATGTTAGGGGTTTCTCATAA 2160

 52647322 ACCTGAACCTGAAGAAAATCACCCTGCCAGCATATTGATCTTCTAGCTCTTCTTAACCTT 52647381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ACCTGAACCTGAAGAAAATCACCCTGCCAGCATATTGATCTTCTAGCTCTTCTTAACCTT 2220

 52647382 TTTTTCTGTGATTCAGGAATTCATAATGATAGAAAATATTATACTAAAGAAGAAAAAAAG 52647441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TTTTTCTGTGATTCAGGAATTCATAATGATAGAAAATATTATACTAAAGAAGAAAAAAAG 2280

 52647442 AGGGAGAATAAGTAAGTGATAGATGGATGCATCAGGGTGTAAAGTTAGCAAGTAAGGCTG 52647501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AGGGAGAATAAGTAAGTGATAGATGGATGCATCAGGGTGTAAAGTTAGCAAGTAAGGCTG 2340

 52647502 TTGAAGTGTCAGAGTGAATATAAATGAATTGTGGGAATGGTCCATGCCAGGAGAAGAGGG 52647561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TTGAAGTGTCAGAGTGAATATAAATGAATTGTGGGAATGGTCCATGCCAGGAGAAGAGGG 2400

 52647562 TATGGTTGACAAAAAGGGAAATGCTAAGATTCAAAACAGGGAAGGGCTTTTCAAAATGCC 52647621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TATGGTTGACAAAAAGGGAAATGCTAAGATTCAAAACAGGGAAGGGCTTTTCAAAATGCC 2460

 52647622 AAGAGCACCAACTTATATCTTTCAGTTTAATTCCTCTCTTCCTTACCCACTGGCTGGAAA 52647681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AAGAGCACCAACTTATATCTTTCAGTTTAATTCCTCTCTTCCTTACCCACTGGCTGGAAA 2520

 52647682 GCAAAGGAGCTAGTGGTAAGTAAGAGTGTTATAGCCAGAGAAAAAGTCTTCAAAAAACAC 52647741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GCAAAGGAGCTAGTGGTAAGTAAGAGTGTTATAGCCAGAGAAAAAGTCTTCAAAAAACAC 2580

 52647742 AAAGTACTTTCCATGGACAACCTTTTTTATTTTAAAGTGCCAATATGTTGCTTTGAAAAA 52647801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AAAGTACTTTCCATGGACAACCTTTTTTATTTTAAAGTGCCAATATGTTGCTTTGAAAAA 2640

 52647802 GAATAAATTCCTTACATCCAGGTATCTGGACTAGACTTCAGTGCATTTAGTGATTATAGC 52647861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GAATAAATTCCTTACATCCAGGTATCTGGACTAGACTTCAGTGCATTTAGTGATTATAGC 2700

 52647862 AAATCCAAACAGTAGCTTTTGATATCAGAGAATGGGTAAAGTGTTTTTGACAATTTCTAA 52647921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AAATCCAAACAGTAGCTTTTGATATCAGAGAATGGGTAAAGTGTTTTTGACAATTTCTAA 2760

 52647922 GAACTTAGAGTTCTTCGGTGATACGTTCCATGCAACTGAAGCTCTGCTCTCCAAATTTAG 52647981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GAACTTAGAGTTCTTCGGTGATACGTTCCATGCAACTGAAGCTCTGCTCTCCAAATTTAG 2820

 52647982 GTGGGTACATACCCAAGTCCATCACCTGGGGCTTCTATTTCCTTTGCTCAGATGCTCACC 52648041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GTGGGTACATACCCAAGTCCATCACCTGGGGCTTCTATTTCCTTTGCTCAGATGCTCACC 2880

 52648042 TCCTAGGTGGGCACCTGACATAAGATAGACTAATAAAAATAAGTCCTGTAACTTTTGATA 52648101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TCCTAGGTGGGCACCTGACATAAGATAGACTAATAAAAATAAGTCCTGTAACTTTTGATA 2940

 52648102 CTCCTATTAAAAAAGAGTTGCAAACCAATAGGAGGTACACTTG 52648144
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CTCCTATTAAAAAAGAGTTGCAAACCAATAGGAGGTACACTTG 2983

EXCISED REGION

 52648146 GAATCAGCACAAATGAAAGTAGAACCTGGAAATCCAGGAAGCAGATACCCAATCATGTCA 52648205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2985 GAATCAGCACAAATGAAAGTAGAACCTGGAAATCCAGGAAGCAGATACCCAATCATGTCA 3044

 52648206 TTTAAACATTTAGATCCAGCTGTGCCTGAAGCTGAACTTTAGCATTACATAAGCCAATAA 52648265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3045 TTTAAACATTTAGATCCAGCTGTGCCTGAAGCTGAACTTTAGCATTACATAAGCCAATAA 3104

 52648266 ATCACTCTTCCCCAACTTACGCCAGTTGAAATTGAATACATACTCAGTGACTTTGAGAGA 52648325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3105 ATCACTCTTCCCCAACTTACGCCAGTTGAAATTGAATACATACTCAGTGACTTTGAGAGA 3164

 52648326 ATTCCAGGGAATTGGTCAGTCCCTGTTTCACTTGTAAATACACAGCAATCAAGCCTACCA 52648385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3165 ATTCCAGGGAATTGGTCAGTCCCTGTTTCACTTGTAAATACACAGCAATCAAGCCTACCA 3224

 52648386 AATCTATGATTGATTGGGGTGTCTGAAAGAGATGGAGGGAATGGAATCAACCTGAAAAAC 52648445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3225 AATCTATGATTGATTGGGGTGTCTGAAAGAGATGGAGGGAATGGAATCAACCTGAAAAAC 3284

 52648446 ATATTTCAGGAGTTCATCCCTGAAAACTTCCCCAACCTAGCTAGAGGGGCCAACATTCAA 52648505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3285 ATATTTCAGGAGTTCATCCCTGAAAACTTCCCCAACCTAGCTAGAGGGGCCAACATTCAA 3344

 52648506 ATTCAGGAAATGCAGAGAACCCCAGTAAGATACTCCACAAAAAGATCTTCCCCAAGACAT 52648565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3345 ATTCAGGAAATGCAGAGAACCCCAGTAAGATACTCCACAAAAAGATCTTCCCCAAGACAT 3404

 52648566 CATCATCAGATTCTCCAAAGTTGAAATGTAAGAAAAAATGCTAAAGGCAACTAGAGTGAA 52648625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3405 CATCATCAGATTCTCCAAAGTTGAAATGTAAGAAAAAATGCTAAAGGCAACTAGAGTGAA 3464

 52648626 AGGCCCGGTCACCTAAAAAGGGAAGCACAGACTTACAGTGGACCTCTCACTGGTAACCCT 52648685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3465 AGGCCCGGTCACCTAAAAAGGGAAGCACAGACTTACAGTGGACCTCTCACTGGTAACCCT 3524

 52648686 ACAAGCCAGAAGAGATTGAGGACCAATATTCAACATTCTTAAACAAAAAGAATTCCAACC 52648745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3525 ACAAGCCAGAAGAGATTGAGGACCAATATTCAACATTCTTAAACAAAAAGAATTCCAACC 3584

 52648746 CAGAATTTTATATCTGACTAAACTAAGCTTCATAAGCAAAAGAGAAATAAGATCATTTTC 52648805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3585 CAGAATTTTATATCTGACTAAACTAAGCTTCATAAGCAAAAGAGAAATAAGATCATTTTC 3644

 52648806 AGACAAGCAAATGCTAAGGGAATTTGTGACCATTAGACCTTCCTTGCAACAGTTCCTAAA 52648865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3645 AGACAAGCAAATGCTAAGGGAATTTGTGACCATTAGACCTTCCTTGCAACAGTTCCTAAA 3704

 52648866 GGAAGCACTAAATATGGAAAGACCATTACCAGACACTACAAAACACACTGAAGTACACAG 52648925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3705 GGAAGCACTAAATATGGAAAGACCATTACCAGACACTACAAAACACACTGAAGTACACAG 3764

 52648926 ACCAGTGACATTGTAAAGCAACTACATAACAAGTCTGCAAAATAACCAGCCAACATCATG 52648985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3765 ACCAGTGACATTGTAAAGCAACTACATAACAAGTCTGCAAAATAACCAGCCAACATCATG 3824

 52648986 ATGACGGTATCAAATCGACACATAGCAACACTAACCTTAAATGTAAATGGACTAAATGAT 52649045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3825 ATGACGGTATCAAATCGACACATAGCAACACTAACCTTAAATGTAAATGGACTAAATGAT 3884

 52649046 CCCATTAAAAGACATAAAGTGGCAGGCTGGATAAAGAACCAAGAACCATTGGTATACTGT 52649105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3885 CCCATTAAAAGACATAAAGTGGCAGGCTGGATAAAGAACCAAGAACCATTGGTATACTGT 3944

 52649106 CTTCAAGAGACCCATCTCCTATGCAGTGACACACATAGGTTCAAGATAAAGGGATGGGGA 52649165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3945 CTTCAAGAGACCCATCTCCTATGCAGTGACACACATAGGTTCAAGATAAAGGGATGGGGA 4004

 52649166 AAAATCTACCAAGCAAATAGAAAACAGAATAAAACAGGGGTTGCAATCCTAGTTGCCGTC 52649225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4005 AAAATCTACCAAGCAAATAGAAAACAGAATAAAACAGGGGTTGCAATCCTAGTTGCCGTC 4064

 52649226 AAAACAGACTTTAAACCAACAAAGGTTAAAAGAAAAAAATATGGGCATTGCATAAGGATA 52649285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4065 AAAACAGACTTTAAACCAACAAAGGTTAAAAGAAAAAAATATGGGCATTGCATAAGGATA 4124

 52649286 AAGTGTTAAATTAAACAAGAAGATCTAACTATCCTAAGTATATATGCACCAAACACAGGA 52649345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4125 AAGTGTTAAATTAAACAAGAAGATCTAACTATCCTAAGTATATATGCACCAAACACAGGA 4184

 52649346 ACACCCAGATTCATAAAGCAAGTTTATGGAGACCTTCAAACAGACTTAGACTCCCACACA 52649405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4185 ACACCCAGATTCATAAAGCAAGTTTATGGAGACCTTCAAACAGACTTAGACTCCCACACA 4244

 52649406 ATAGTAGTGGGAGACTTTAATACCCCATGACAATATTAGACAGATCATTGAGACAGGAAA 52649465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4245 ATAGTAGTGGGAGACTTTAATACCCCATGACAATATTAGACAGATCATTGAGACAGGAAA 4304

 52649466 TTAACAAAGATATTCAAGATCTAACTCAGCACTAAATCAAATGGCCCTGATAGATATCTA 52649525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4305 TTAACAAAGATATTCAAGATCTAACTCAGCACTAAATCAAATGGCCCTGATAGATATCTA 4364

 52649526 CAGGACTGTCCTACTTGAAACCATACAATTACATGGTAATTGAATGACCTGCTCCTGAAT 52649585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4365 CAGGACTGTCCTACTTGAAACCATACAATTACATGGTAATTGAATGACCTGCTCCTGAAT 4424

 52649586 GACTTTTGGGTAAATAATAAAATTAAGGCAGAAATCAAGAAGTTTTTTGAACTAATGAGA 52649645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4425 GACTTTTGGGTAAATAATAAAATTAAGGCAGAAATCAAGAAGTTTTTTGAACTAATGAGA 4484

 52649646 ACAAAGATACAACATACCAGAATCTTTGGGACACAGCTAAGGCAGTGTTAAGAGGGAAAT 52649705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4485 ACAAAGATACAACATACCAGAATCTTTGGGACACAGCTAAGGCAGTGTTAAGAGGGAAAT 4544

 52649706 TTATAGCACTAAATCCCACATCAAAAAGTTAGAAAGAGCTCACGTTAACAATCTAACCTC 52649765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4545 TTATAGCACTAAATCCCACATCAAAAAGTTAGAAAGAGCTCACGTTAACAATCTAACCTC 4604

 52649766 ACAACTACAGGAACTAGAGAACTGAGAGCAGAAAAACCTGAAAGCTAGCAGAAGACAAGA 52649825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4605 ACAACTACAGGAACTAGAGAACTGAGAGCAGAAAAACCTGAAAGCTAGCAGAAGACAAGA 4664

 52649826 AATAACCAAAATTAGAGCTGAACTGAAGGAGATTGAGACATGAAAAACCATTCAAAAGAT 52649885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4665 AATAACCAAAATTAGAGCTGAACTGAAGGAGATTGAGACATGAAAAACCATTCAAAAGAT 4724

 52649886 CAGTGAATTCAGGAGCTGTTTTTTTTTTGAACAAATTAATAAAATAGACCATTAGCTAGA 52649945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4725 CAGTGAATTCAGGAGCTGTTTTTTTTTTGAACAAATTAATAAAATAGACCATTAGCTAGA 4784

 52649946 GTAATAAACAAGAAAATAGAAAAGATTCAAATAAACACAATCAGAAACGACAAGGGGGAT 52650005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4785 GTAATAAACAAGAAAATAGAAAAGATTCAAATAAACACAATCAGAAACGACAAGGGGGAT 4844

 52650006 ATTACCACTGACCCCACAGAAGTACAAACAACCATCAGAGAATATTATGAACATCTCTAT 52650065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4845 ATTACCACTGACCCCACAGAAGTACAAACAACCATCAGAGAATATTATGAACATCTCTAT 4904

 52650066 GCACATAAACTAGAAAATCTAGAAGAAGTGGATAAACTTCTGGACATATACACCCTTCTA 52650125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4905 GCACATAAACTAGAAAATCTAGAAGAAGTGGATAAACTTCTGGACATATACACCCTTCTA 4964

 52650126 AGACTGTACCAGGAAGAAATTGAATCCCTGAACAGACCAATAATGAGCCCTAAAATTGAG 52650185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4965 AGACTGTACCAGGAAGAAATTGAATCCCTGAACAGACCAATAATGAGCCCTAAAATTGAG 5024

 52650186 GAAGTAATACATAGACTACCAACCATAAAAAAACCCAGTACTAGATGGATTCACAGGTAA 52650245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5025 GAAGTAATACATAGACTACCAACCATAAAAAAACCCAGTACTAGATGGATTCACAGGTAA 5084

 52650246 GTTCTACCAGTTGTACAAAGAAGAGCTGGTACAGTTCCTACTGAAATTATTCCAAAAAGT 52650305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5085 GTTCTACCAGTTGTACAAAGAAGAGCTGGTACAGTTCCTACTGAAATTATTCCAAAAAGT 5144

 52650306 TGAGTAGGAGGGAGTCCTTCCTAACTCATTTGATGAGGCCAGCATCATCCTGATATCAAA 52650365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5145 TGAGTAGGAGGGAGTCCTTCCTAACTCATTTGATGAGGCCAGCATCATCCTGATATCAAA 5204

 52650366 ACCTGGCAGATATACAACAAGAAAAGCTTCAGGCCAATATCCTTGATGAACTTCAATGCA 52650425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5205 ACCTGGCAGATATACAACAAGAAAAGCTTCAGGCCAATATCCTTGATGAACTTCAATGCA 5264

 52650426 AAAATCCTCAATAAAATACTGGCAAACTGAATCCAGCAGCACACCAAAAAGCTTATCCAC 52650485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5265 AAAATCCTCAATAAAATACTGGCAAACTGAATCCAGCAGCACACCAAAAAGCTTATCCAC 5324

 52650486 CATGATCAAGTAGAATGCAAGTTGGTTCAACATATACAAATCAATAAATGTGACTCATCA 52650545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5325 CATGATCAAGTAGAATGCAAGTTGGTTCAACATATACAAATCAATAAATGTGACTCATCA 5384

 52650546 CATAAACAGAACTAAAGACAAAAACTACATGATTATCTCAACAGATGCAGAAAAGGCTTT 52650605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5385 CATAAACAGAACTAAAGACAAAAACTACATGATTATCTCAACAGATGCAGAAAAGGCTTT 5444

 52650606 CAATAAAATTAGACATCCATTTATGTTAAAAACTCTCAATAAACTAGGTATTGAAGGAAC 52650665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5445 CAATAAAATTAGACATCCATTTATGTTAAAAACTCTCAATAAACTAGGTATTGAAGGAAC 5504

 52650666 ATACCTCAAAATAATAAGAGCCATGTATGACAAACCCACAGCTAAGATCATACTGAATGG 52650725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5505 ATACCTCAAAATAATAAGAGCCATGTATGACAAACCCACAGCTAAGATCATACTGAATGG 5564

 52650726 GCAAAAGCTGGAAGCATTTTCTTTGAAGACTGGCATAAGACAAGGATGATCTCTCTCACC 52650785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5565 GCAAAAGCTGGAAGCATTTTCTTTGAAGACTGGCATAAGACAAGGATGATCTCTCTCACC 5624

 52650786 ACTCCTATTCAACATAGTATTGGAAGTCTTGGCCAGGGCAATCGGGCAAGAGAAATAAAT 52650845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5625 ACTCCTATTCAACATAGTATTGGAAGTCTTGGCCAGGGCAATCGGGCAAGAGAAATAAAT 5684

 52650846 AAAGCGCATCCAAATAGGAAGAGAGGAAGTCAAACTATCCTTGTTTGCAGATTACATGAC 52650905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5685 AAAGCGCATCCAAATAGGAAGAGAGGAAGTCAAACTATCCTTGTTTGCAGATTACATGAC 5744

 52650906 ATTATATCTAGAAAACCCCATAGTCTCAGCCCCAAAGCTTCTTAAGCTGATAAACAACTT 52650965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5745 ATTATATCTAGAAAACCCCATAGTCTCAGCCCCAAAGCTTCTTAAGCTGATAAACAACTT 5804

 52650966 CAGCAAAGTCTCAGGATACAAAATAAATGTGCAAAAATTACTGGCATTTCCATGCACCAA 52651025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5805 CAGCAAAGTCTCAGGATACAAAATAAATGTGCAAAAATTACTGGCATTTCCATGCACCAA 5864

 52651026 CAACAGTCAAGCCAGGAGCCAAACCAGGAATGCACTCCCACTCACAATCGCCACAAAAAG 52651085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5865 CAACAGTCAAGCCAGGAGCCAAACCAGGAATGCACTCCCACTCACAATCGCCACAAAAAG 5924

 52651086 AGTAAAATACCTAGGAAAACAGCTAATTAGGGAGGTGAAAGATCTCTACAAGGAGAATAA 52651145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5925 AGTAAAATACCTAGGAAAACAGCTAATTAGGGAGGTGAAAGATCTCTACAAGGAGAATAA 5984

 52651146 TGAACCAGCGCTCAAAGAAATTAGAGATGACACAAACAAATGGAAAAACATTCCATGTTC 52651205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5985 TGAACCAGCGCTCAAAGAAATTAGAGATGACACAAACAAATGGAAAAACATTCCATGTTC 6044

 52651206 ATTGATAGGAAGAATCAATATCATTAAAATGGCCATATTGCCCAGAGCAATTTATAGATT 52651265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6045 ATTGATAGGAAGAATCAATATCATTAAAATGGCCATATTGCCCAGAGCAATTTATAGATT 6104

 52651266 CA 52651267
          ||
     6105 CA 6106

Alignment time is 6.7683 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [52637064,52668002] =>     30939 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    3606] =>      3606 nucs 'mol-32-2b3f-006470_3606'

Score:        3440
Aligned:      3610        nucs
Identic:      3570 ( 99%) nucs =>      1860 (100%)      1710 ( 98%)
Gaps:           32 (  1%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [52645201,52647064] EXCISED REGION [52658003,52659720]
 second seq =>  [       1,    1864] EXCISED REGION [    1865,    3606]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>     10938 nucs [52647065,52658002]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         6 nucs [52647065,52647070] to [52658003,52658008]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [52647065,52647067] to [52658000,52658002]
 second seq =>         0 nucs

 52645201 ATCTGTGTCCTGCCCCGGTCCAGCTGCCACCGGAAGTGTCCAGCTCTCACTTGGGTCTTT 52645260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATCTGTGTCCTGCCCCGGTCCAGCTGCCACCGGAAGTGTCCAGCTCTCACTTGGGTCTTT 60

 52645261 GTTCGCTGGAGCTTTATTGGAGCTGACATCAAGCTTCACTGATCCAAGGGATGAATCTGC 52645320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTTCGCTGGAGCTTTATTGGAGCTGACATCAAGCTTCACTGATCCAAGGGATGAATCTGC 120

 52645321 GGCTTGGTCTCCGGTACGTCCTGGTACAGGCCGAGAGAGCATCAAGAAAAAACGAGATTT 52645380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGCTTGGTCTCCGGTACGTCCTGGTACAGGCCGAGAGAGCATCAAGAAAAAACGAGATTT 180

 52645381 AGCAGCTGGTGCCTCGGGTTTGGCCTCTTTCCCAAGATTCTTTCCGTTGGCATCCGCAAC 52645440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGCAGCTGGTGCCTCGGGTTTGGCCTCTTTCCCAAGATTCTTTCCGTTGGCATCCGCAAC 240

 52645441 AGCACTTATCTCCGTTGTCTCGGGGGAAGAAGTGGCCACATTATCCGTCTTGACACTTAT 52645500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGCACTTATCTCCGTTGTCTCGGGGGAAGAAGTGGCCACATTATCCGTCTTGACACTTAT 300

 52645501 TCCCAAGTCGACTGTAAACACAAACATAAACAGTGGTTATTCAGCCAAGCCGGGAAATTC 52645560
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
      301 TCCCAAGTCGACTGTAAACACAAACATAAACAGCGGTTATTCAGCCAAGCCGGGAAATTC 360

 52645561 AGGCACTAATAATGGACTCCAGACATTTTTTATACAAAAGCCATACTGCATACTGGAACT 52645620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGGCACTAATAATGGACTCCAGACATTTTTTATACAAAAGCCATACTGCATACTGGAACT 420

 52645621 GTGTTGTTCTCTGGTCATTCTGAAAGGCAGAAGTTAGCTCTCTACATCTCCTTGGACCCT 52645680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTGTTGTTCTCTGGTCATTCTGAAAGGCAGAAGTTAGCTCTCTACATCTCCTTGGACCCT 480

 52645681 GCTTTTCTTGGGAGAGGAGAAGGCAAGGTTGGTGAGGAGGGAAAGCTACTTAATGGAAAG 52645740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GCTTTTCTTGGGAGAGGAGAAGGCAAGGTTGGTGAGGAGGGAAAGCTACTTAATGGAAAG 540

 52645741 TCACTAGCTGCCAGGTGTGGAATGAGTGATATTCAATGTTAATTAATCTTCTTTTATCTG 52645800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCACTAGCTGCCAGGTGTGGAATGAGTGATATTCAATGTTAATTAATCTTCTTTTATCTG 600

 52645801 TGTAAGAACTCCGTGAGCAGCATATTGTCATGATGTCAACTGGGAGGCAGTACAGCAGTT 52645860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGTAAGAACTCCGTGAGCAGCATATTGTCATGATGTCAACTGGGAGGCAGTACAGCAGTT 660

 52645861 AGGAGCTTGGGTTCTGGAGCTAGAACAAGGTTTCTCAACCTCAGCACTACTCACATTTGA 52645920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGGAGCTTGGGTTCTGGAGCTAGAACAAGGTTTCTCAACCTCAGCACTACTCACATTTGA 720

 52645921 AGCCAGATTATTCTTTGTTAGGGAGGCTCATCCCGTGCCTCATAGGCTGATTAGCAGCAT 52645980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGCCAGATTATTCTTTGTTAGGGAGGCTCATCCCGTGCCTCATAGGCTGATTAGCAGCAT 780

 52645981 CCTGGCCTCTGCCCACTAGACGCCGGTCACATTTCCCAGTCATGGCAACCAAAAATATCT 52646040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CCTGGCCTCTGCCCACTAGACGCCGGTCACATTTCCCAGTCATGGCAACCAAAAATATCT 840

 52646041 CTAGGCATTGCTAAATGTCCCCTGGAGGACAAAATCTCTTACGTTTGAGAGGCACTGAGC 52646100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTAGGCATTGCTAAATGTCCCCTGGAGGACAAAATCTCTTACGTTTGAGAGGCACTGAGC 900

 52646101 TGAAATGTCTTTTTGAATCCAGATTATCTAATTTTCTGTGCCTCAACTTTCTGGTAAAAG 52646160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGAAATGTCTTTTTGAATCCAGATTATCTAATTTTCTGTGCCTCAACTTTCTGGTAAAAG 960

 52646161 GAGACAGATAATAAATCTCGTAATTTTGTTAGGAAGATTACATGAGTTAATAGTTTTAAA 52646220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GAGACAGATAATAAATCTCGTAATTTTGTTAGGAAGATTACATGAGTTAATAGTTTTAAA 1020

 52646221 GCAAGTACAATAGCACCTGGAATATATTAAGTGCTTAATAAATATCACAAACATTAGTTA 52646280
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GCAAGTACAATAGCGCCTGGAATATATTAAGTGCTTAATAAATATCACAAACATTAGTTA 1080

 52646281 TCATTATTCATGAGTGAGAAAACTGACAGTCAGAGAGGTCAGTACACCCTCCCCTGGCTG 52646340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TCATTATTCATGAGTGAGAAAACTGACAGTCAGAGAGGTCAGTACACCCTCCCCTGGCTG 1140

 52646341 CCCAGTAAGCTAGTAAGCAGCAGAGTCTGGCTTCAGGCAGAAATCTGACTTCTAAGTTCA 52646400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CCCAGTAAGCTAGTAAGCAGCAGAGTCTGGCTTCAGGCAGAAATCTGACTTCTAAGTTCA 1200

 52646401 TGCGCTCTCTGTCTTACCAGGGACTTGTATTAGCATAGACTGTTAAGAATATGGGAAGAT 52646460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TGCGCTCTCTGTCTTACCAGGGACTTGTATTAGCATAGACTGTTAAGAATATGGGAAGAT 1260

 52646461 TTTTAAAATACAGTACTCAGAAAATTTCTCTTTGAAAGGCTGGAAGAGCAGATATCCACA 52646520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTTTAAAATACAGTACTCAGAAAATTTCTCTTTGAAAGGCTGGAAGAGCAGATATCCACA 1320

 52646521 CAAGAAGGCAAATTAGACCTCAGGCCAGTGTGGAATTAAAGGTGTAGGGTTATCTGGTCA 52646580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CAAGAAGGCAAATTAGACCTCAGGCCAGTGTGGAATTAAAGGTGTAGGGTTATCTGGTCA 1380

 52646581 AGACTGTGTGTGTGGATACAGGCTCCAACCCCTCCAGGCAAGGGCACTGTTTCCAACATC 52646640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     1381 AGACTGTGTGTGTGGATACAGGCTCCAACCCCTCCAGGCAAGGGCAATGTTTCCAACATC 1440

 52646641 CACCCTTTCTCCTTTGACCTCTACCTTGACCTAAATTAACTATAAAAGGTCCTTCTTTTC 52646700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CACCCTTTCTCCTTTGACCTCTACCTTGACCTAAATTAACTATAAAAGGTCCTTCTTTTC 1500

 52646701 TAGGACCCTACTATAAATCAGTGAAATATTCAGGAAAAAAAGAACACCAAGAATGTTGGG 52646760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TAGGACCCTACTATAAATCAGTGAAATATTCAGGAAAAAAAGAACACCAAGAATGTTGGG 1560

 52646761 ATCCCAGTTAAAGATCAAGATTCTCTACTGATAAGCTGTGTGATATGGAGTAAATCACTA 52646820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ATCCCAGTTAAAGATCAAGATTCTCTACTGATAAGCTGTGTGATATGGAGTAAATCACTA 1620

 52646821 AAGATCTTTGAATCTCTTCATTTGTAAAATGGGAATATTGGTAGTCCTACTGCAGGGTTG 52646880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AAGATCTTTGAATCTCTTCATTTGTAAAATGGGAATATTGGTAGTCCTACTGCAGGGTTG 1680

 52646881 TTGTAATGCTTAAAGAAGAAAAGTCATGCAAAGGATCTGGCACAACGCCTTTTCCATAAT 52646940
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     1681 TTGTAATGCTTAAAGAAGAAAAGTCATGCAAAGGATCTGGCACAATGCCTTTTCCATAAT 1740

 52646941 AAGTGCTTAGTAATTGACAGATACTGTGATAACTTTTCAGGTTTCTCTCATGCCTTTGAC 52647000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AAGTGCTTAGTAATTGACAGATACTGTGATAACTTTTCAGGTTTCTCTCATGCCTTTGAC 1800

 52647001 AACATTGCATTTTGCTTGCTCTATCTGTAGTCAGACACTTCTTAATATCTGTTTGCAGGA 52647060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AACATTGCATTTTGCTTGCTCTATCTGTAGTCAGACACTTCTTAATATCTGTTTGCAGGA 1860

 52647061 AGAC 52647064
          ||||
     1861 AGAC 1864

EXCISED REGION

 52658003 AGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTG 52658062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1865 AGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTG 1924

 52658063 GCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTAT 52658122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1925 GCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTAT 1984

 52658123 AAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGG 52658182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1985 AAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGG 2044

 52658183 GAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTG 52658242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     2045 GAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGCG 2104

 52658243 AAACACTGTCTCTGCTAAAAAACAAAACAAAACAAAACACCAAAAAATAGCTGGGCGTAG 52658302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2105 AAACACTGTCTCTGCTAAAAAACAAAACAAAACAAAACACCAAAAAATAGCTGGGCGTAG 2164

 52658303 TGGCGGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTTGGGAGGCGGTGGCAGGAGAATCATTTGAACCT 52658362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2165 TGGCGGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTTGGGAGGCGGTGGCAGGAGAATCATTTGAACCT 2224

 52658363 GGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGAT--------TGTGCCACTGCACTCTAACCTGG 52658414
          |||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||
     2225 GGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACTGTGCCACTGCACTCTAACCTGG 2284

 52658415 GCAACAGAGTTCAGAGTGAGACTCTGTCTCCCCC--------------------AAAAAA 52658454
          ||||||||||||||||||||||||||||||                        ||||||
     2285 GCAACAGAGTTCAGAGTGAGACTCTGTCTC----ACCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 2340

 52658455 AAAAAAAAAAAAAAAAGAACAGCCATATAGATCGTCGGTGGGAGTGTAATTTGGCCACTT 52658514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AAAAAAAAAAAAAAAAGAACAGCCATATAGATCGTCGGTGGGAGTGTAATTTGGCCACTT 2400

 52658515 CTTTGGAAAATAGCTCAGTAATATCTATTAATACTTAAAATTTCACAAACACTGTAAGTC 52658574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CTTTGGAAAATAGCTCAGTAATATCTATTAATACTTAAAATTTCACAAACACTGTAAGTC 2460

 52658575 TAACTTCCACTTCTAAAATGTTATCCTAGAAATAAAATTGCATAGGGGTACAAAGGCTTA 52658634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TAACTTCCACTTCTAAAATGTTATCCTAGAAATAAAATTGCATAGGGGTACAAAGGCTTA 2520

 52658635 CGTATGGAACTATTTGCTGGACTACTGTAGTTGTGGCAAAAAACTGGAAATGACCTAAAC 52658694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CGTATGGAACTATTTGCTGGACTACTGTAGTTGTGGCAAAAAACTGGAAATGACCTAAAC 2580

 52658695 GCTTATTAGTAGAAACCTGGTTAAATAAATTATCATATGTCCTTGAGGACACAGGGACAC 52658754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GCTTATTAGTAGAAACCTGGTTAAATAAATTATCATATGTCCTTGAGGACACAGGGACAC 2640

 52658755 AAAGAGGGGAATGACAGGCACTGAGCCTACTTGAGGGTGGGAGGAGGAAGTCGATCAGAA 52658814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 AAAGAGGGGAATGACAGGCACTGAGCCTACTTGAGGGTGGGAGGAGGAAGTCGATCAGAA 2700

 52658815 AAAATAACTAGTGGGTACTAGGCTTAGTACCCGGGTGAAAAAATAATCTGTACAACAAAC 52658874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AAAATAACTAGTGGGTACTAGGCTTAGTACCCGGGTGAAAAAATAATCTGTACAACAAAC 2760

 52658875 CCCCATGACATGAGTTTACCTTATAACAAACCTGCACATGTAATCTGAACCTAGATAAAA 52658934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CCCCATGACATGAGTTTACCTTATAACAAACCTGCACATGTAATCTGAACCTAGATAAAA 2820

 52658935 GTTTAAAAAAATAAATAATCATATGTCCCTACAATGAAATATTCCACAGGCATTAAAATT 52658994
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GTTTAAAAAAATAAATAATCATATGTCCCTATAATGAAATATTCCACAGGCATTAAAATT 2880

 52658995 CCCCAAGGAATTTTAGTAAGGAAAGAAAAAGCTGTGCCCAACAGCACGTACAGTATGTTT 52659054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CCCCAAGGAATTTTAGTAAGGAAAGAAAAAGCTGTGCCCAACAGCACGTACAGTATGTTT 2940

 52659055 CCATTTGTTTTTAAAAAATGGTGTCGGGAGGTTGAGGAGACAACTTATAAATAGACATGC 52659114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CCATTTGTTTTTAAAAAATGGTGTCGGGAGGTTGAGGAGACAACTTATAAATAGACATGC 3000

 52659115 CTGGGATACCTCTGGATATAAGAAACTGTAAAGTATTTACTTCTAAGGAAGGAAATTTGG 52659174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CTGGGATACCTCTGGATATAAGAAACTGTAAAGTATTTACTTCTAAGGAAGGAAATTTGG 3060

 52659175 GATGGGGCTTGGGGAGCCATCAGAGTTAGGGTGGGGATTTTTTCTCTGCCTTATCTTATT 52659234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 GATGGGGCTTGGGGAGCCATCAGAGTTAGGGTGGGGATTTTTTCTCTGCCTTATCTTATT 3120

 52659235 ATGTATATCGCTCAGAATGTTTGCTATGTGTATGCACCTACCCCATCCATTAAGAAATGA 52659294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 ATGTATATCGCTCAGAATGTTTGCTATGTGTATGCACCTACCCCATCCATTAAGAAATGA 3180

 52659295 AGAAATAATGAAAAGAAAAAATGAAAGTAGGGAACTAGAAATGAGAGGTGGGATTCAAAG 52659354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 AGAAATAATGAAAAGAAAAAATGAAAGTAGGGAACTAGAAATGAGAGGTGGGATTCAAAG 3240

 52659355 TGGACTGAACACTTGACCTATTTCCCAATTTGCCTAGGGCTGGCCCAGCAGCGAGGCAGG 52659414
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     3241 TGGACTGAACACTTGACCTATTTCCCAATTTGCCTGGGGCTGGCCCAGCAGCGAGGCAGG 3300

 52659415 TTCTAACCAATGAGCATCAGCTTTGAATGGAGGGGCTGATAGGCCAGGTGGGCCCTGCTT 52659474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TTCTAACCAATGAGCATCAGCTTTGAATGGAGGGGCTGATAGGCCAGGTGGGCCCTGCTT 3360

 52659475 GCTGAGAGTGTCATGGCCTTAGGGACATCTCCATGTTGCAGAGTCTGAGCCTCTGCTTGG 52659534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 GCTGAGAGTGTCATGGCCTTAGGGACATCTCCATGTTGCAGAGTCTGAGCCTCTGCTTGG 3420

 52659535 CAAATTCAGAAAATCCAGCTTTTCTTTTTATATCACCTGGAGCTGATGTAACTCTCAGAA 52659594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 CAAATTCAGAAAATCCAGCTTTTCTTTTTATATCACCTGGAGCTGATGTAACTCTCAGAA 3480

 52659595 GGCATTTTTAAGAGGACTCATGAATTAACCACATAGCCAACTTACTGGCTTAAGACTACG 52659654
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 CGCATTTTTAAGAGGACTCATGAATTAACCACATAGCCAACTTACTGGCTTAAGACTACG 3540

 52659655 TGACAGAAAGCTGCAAAGGGGGCCAGCCACTGGTAACATCCCACCACTGTCCCTCTCTGT 52659714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 TGACAGAAAGCTGCAAAGGGGGCCAGCCACTGGTAACATCCCACCACTGTCCCTCTCTGT 3600

 52659715 GGAAAA 52659720
          ||||||
     3601 GGAAAA 3606

Alignment time is 4.14608 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [52637064,52668002] =>     30939 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    2418] =>      2418 nucs 'mol-32-2e15-049842_2418'

Score:        2418
Aligned:      2418        nucs
Identic:      2418 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [52655688,52658105]
 second seq =>  [       1,    2418]

 52655688 TTGTGCAAATGCATTTGTTGTTTTAAAGGTCGTAAAGTCAGGGTACACGTGGCAGATACT 52655747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTGTGCAAATGCATTTGTTGTTTTAAAGGTCGTAAAGTCAGGGTACACGTGGCAGATACT 60

 52655748 TATGACTTGGAGGAAGACGTTAGATTAGATTTGAAACTTTCACTGAATGATCGCATTTCA 52655807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TATGACTTGGAGGAAGACGTTAGATTAGATTTGAAACTTTCACTGAATGATCGCATTTCA 120

 52655808 TGCTTTTCATCTGTACATTAAAAAGCCAGAATGTCTTTGCCAAGAAATTCTAGCATAAAT 52655867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGCTTTTCATCTGTACATTAAAAAGCCAGAATGTCTTTGCCAAGAAATTCTAGCATAAAT 180

 52655868 AAAAGAAAAGGATGGGATTTTGGAACATCATGGTAGAATTCTTGACTATCAGCTTTATAC 52655927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAAAGAAAAGGATGGGATTTTGGAACATCATGGTAGAATTCTTGACTATCAGCTTTATAC 240

 52655928 AACATGTCTGGACATTTAGTGATGGAAATGCTGGATTCCAAAGGAATGTAGGCAAAGGTA 52655987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AACATGTCTGGACATTTAGTGATGGAAATGCTGGATTCCAAAGGAATGTAGGCAAAGGTA 300

 52655988 CTACTACCCCCATGCTCTTCAGAAAACATCCTCTAAAAGCAACAGTGATGATCAGATACT 52656047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTACTACCCCCATGCTCTTCAGAAAACATCCTCTAAAAGCAACAGTGATGATCAGATACT 360

 52656048 GTGGGGCAAGACTGACAGTGACACTCAAGATTTCCACTCTTCTCTTTAATCATATATTTC 52656107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTGGGGCAAGACTGACAGTGACACTCAAGATTTCCACTCTTCTCTTTAATCATATATTTC 420

 52656108 CTGTCATTCATGTGCTACAAAACTCTGGAATATGCAAAGCTCATTCAAATGCAAAACCAG 52656167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTGTCATTCATGTGCTACAAAACTCTGGAATATGCAAAGCTCATTCAAATGCAAAACCAG 480

 52656168 CCTTTGCTCCAACATGAGCATATATTTTCATTTAAAGACAAATCAGATGTTTCATTTGAT 52656227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCTTTGCTCCAACATGAGCATATATTTTCATTTAAAGACAAATCAGATGTTTCATTTGAT 540

 52656228 TTTTTTTATAAATCTGATAATAATGTACATTTAACCCGTGTTTACAACCAAAATAATTAA 52656287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTTTTTTATAAATCTGATAATAATGTACATTTAACCCGTGTTTACAACCAAAATAATTAA 600

 52656288 TCTCTCTGAACCCTTTGTTTTTCCTGTCTCTATCCTCCACCCTCATTGCCAGATAAATAA 52656347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCTCTCTGAACCCTTTGTTTTTCCTGTCTCTATCCTCCACCCTCATTGCCAGATAAATAA 660

 52656348 CATCTGCAACCTGATGTGGCATATTGAACTTTGTTTATACTCACACAAACACGTATAAGC 52656407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CATCTGCAACCTGATGTGGCATATTGAACTTTGTTTATACTCACACAAACACGTATAAGC 720

 52656408 ATCCCAGATACACATATACAGGGACTGTATCTGTCCTTGTTGTTTTTATAGAAATTGGAT 52656467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATCCCAGATACACATATACAGGGACTGTATCTGTCCTTGTTGTTTTTATAGAAATTGGAT 780

 52656468 CACATTAGACATATTTTCTGATGACTTTTGTACATTATAGTTGGTCTTCACAGTCAATAG 52656527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CACATTAGACATATTTTCTGATGACTTTTGTACATTATAGTTGGTCTTCACAGTCAATAG 840

 52656528 CTCCAAAGCTATCTTATCTTCTAAAATAGCTGCATAATATTCCTCAGTATGGATATACCA 52656587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTCCAAAGCTATCTTATCTTCTAAAATAGCTGCATAATATTCCTCAGTATGGATATACCA 900

 52656588 AAAGATATTTAAACCATTGCCTAATCAATGAATATCCTGGTAGTTTCCACATTGTTTTTT 52656647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AAAGATATTTAAACCATTGCCTAATCAATGAATATCCTGGTAGTTTCCACATTGTTTTTT 960

 52656648 CCATTTCCACTATAGTGGAATAAACTTTCGTGTTCAAAAATCCTAAACTGGTGCTATATT 52656707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CCATTTCCACTATAGTGGAATAAACTTTCGTGTTCAAAAATCCTAAACTGGTGCTATATT 1020

 52656708 TCTATAGAATAGAGGCACAGATGTAGAAGTGTTACCCTCAAATCAATATGCATTTAGTTT 52656767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TCTATAGAATAGAGGCACAGATGTAGAAGTGTTACCCTCAAATCAATATGCATTTAGTTT 1080

 52656768 TGAAAAACAGACACTGCCATATTATTTTCTTAAAAAGGCTCTACAGATTCACATTTCCAG 52656827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGAAAAACAGACACTGCCATATTATTTTCTTAAAAAGGCTCTACAGATTCACATTTCCAG 1140

 52656828 CAGCAATGAGTGTCTCAAGCACCTTTTAAGTGGTAAGCAGCTTACCAGGGGAGGTGGCCT 52656887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CAGCAATGAGTGTCTCAAGCACCTTTTAAGTGGTAAGCAGCTTACCAGGGGAGGTGGCCT 1200

 52656888 ATTATTCTATCAGTGGCTTCAGTTGTTAGGACACCACGGGTCAGCTGTGGAGATACGGTT 52656947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATTATTCTATCAGTGGCTTCAGTTGTTAGGACACCACGGGTCAGCTGTGGAGATACGGTT 1260

 52656948 GTGGGGCAGGTTGAGTTCAGGACACATAGAAGATTGCCAAAGGGTGACTATTATTACTTT 52657007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GTGGGGCAGGTTGAGTTCAGGACACATAGAAGATTGCCAAAGGGTGACTATTATTACTTT 1320

 52657008 GAGACTCTGGAAAAATTAGCCAGGAAACAGAGACAAGAGGCTCAGGGTGCAGCAAAGCAG 52657067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GAGACTCTGGAAAAATTAGCCAGGAAACAGAGACAAGAGGCTCAGGGTGCAGCAAAGCAG 1380

 52657068 CCAAATCAGGATGATAGTGTTTTCTTTGGAGCAGATATACTAATGGCCAAGGAACTCATA 52657127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CCAAATCAGGATGATAGTGTTTTCTTTGGAGCAGATATACTAATGGCCAAGGAACTCATA 1440

 52657128 AAAAGATGCCTAATGTCATCTCATTAGGGAAGTGCAGTCAAAGCCACAGCATGATACGTC 52657187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AAAAGATGCCTAATGTCATCTCATTAGGGAAGTGCAGTCAAAGCCACAGCATGATACGTC 1500

 52657188 TTCACACCCACGAGGATGGCCATAATCAGAGAGACAATAACCAGTGGTAGGGAAGATGTG 52657247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTCACACCCACGAGGATGGCCATAATCAGAGAGACAATAACCAGTGGTAGGGAAGATGTG 1560

 52657248 AAAAAATCGGAATGCTCATGCATTGCTGGTAGGAATGTGACATGGTGCAGCTGCTTTGGA 52657307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AAAAAATCGGAATGCTCATGCATTGCTGGTAGGAATGTGACATGGTGCAGCTGCTTTGGA 1620

 52657308 AAGCAGTTTAACAGTTCCTGGAAAAGTTAAACATGGAGTTACCCTAAGACCCAGCAATTC 52657367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AAGCAGTTTAACAGTTCCTGGAAAAGTTAAACATGGAGTTACCCTAAGACCCAGCAATTC 1680

 52657368 CATTCCTAGGTAAGCAAGAAAATGAAAACATATGGCCACACAAAAACTTGTACACAAATG 52657427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CATTCCTAGGTAAGCAAGAAAATGAAAACATATGGCCACACAAAAACTTGTACACAAATG 1740

 52657428 TCCATAGCAGCATTTTCATAATAGCTGAAAAGTGGAAACAACCCAAATATCCATCAATTG 52657487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TCCATAGCAGCATTTTCATAATAGCTGAAAAGTGGAAACAACCCAAATATCCATCAATTG 1800

 52657488 GAAAAAGGAAATCTAGCATTTGCATATAATAGAGTATTAATCAGCCATAAGAAGAAACAA 52657547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GAAAAAGGAAATCTAGCATTTGCATATAATAGAGTATTAATCAGCCATAAGAAGAAACAA 1860

 52657548 AGCACCGATCCATGTTATATCATGCTTTATACTTGGAAGCATGGTACTAAGTGAAAGACG 52657607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AGCACCGATCCATGTTATATCATGCTTTATACTTGGAAGCATGGTACTAAGTGAAAGACG 1920

 52657608 CCAGACACAAAAAGCAAAATATTGTATGATTCCATTTATATAAAGTGTCTAGAATAGGCA 52657667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CCAGACACAAAAAGCAAAATATTGTATGATTCCATTTATATAAAGTGTCTAGAATAGGCA 1980

 52657668 AATCCATAGAGGCAGAAAACAGATTAGTGGTTGCCAGTGGCTGGGAATAGGGAAAAAACT 52657727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AATCCATAGAGGCAGAAAACAGATTAGTGGTTGCCAGTGGCTGGGAATAGGGAAAAAACT 2040

 52657728 CAGCGCTAAAGGGTAGGGAGTTTTGTTTTGGAGTAATGACGATGTTCTGGAATTAGACGT 52657787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CAGCGCTAAAGGGTAGGGAGTTTTGTTTTGGAGTAATGACGATGTTCTGGAATTAGACGT 2100

 52657788 GGAACGATTGCACACATGGTGCAAATATCCTTAAAATCACGGAATTGTCACTCTAAAAGG 52657847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GGAACGATTGCACACATGGTGCAAATATCCTTAAAATCACGGAATTGTCACTCTAAAAGG 2160

 52657848 TGAATTTTATGGTAGGTGAATTGTACCTCAATTTGTAAAAAGAAGAATTAGATAAATAAA 52657907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TGAATTTTATGGTAGGTGAATTGTACCTCAATTTGTAAAAAGAAGAATTAGATAAATAAA 2220

 52657908 CAGCAACACAGCACCAAGGGGTGGGGGTAGGAAACAGACAACAAATAGGAGTGAAGAGTT 52657967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CAGCAACACAGCACCAAGGGGTGGGGGTAGGAAACAGACAACAAATAGGAGTGAAGAGTT 2280

 52657968 CACAGGAAAAGACATGCAGCCAGCTTTTAAGCAGAAGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAAT 52658027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CACAGGAAAAGACATGCAGCCAGCTTTTAAGCAGAAGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAAT 2340

 52658028 AGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTGGCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAA 52658087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTGGCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAA 2400

 52658088 AAGGAGACAATTGATGAC 52658105
          ||||||||||||||||||
     2401 AAGGAGACAATTGATGAC 2418

Alignment time is 3.32808 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [52637064,52668002] =>     30939 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    3060] =>      3060 nucs 'mol-32-2e4c-096353_3060'

Score:        2998
Aligned:      3063        nucs
Identic:      3053 (100%) nucs =>      2705 (100%)       348 (100%)
Gaps:            6 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [52644353,52647064] EXCISED REGION [52658003,52658350]
 second seq =>  [       1,    2712] EXCISED REGION [    2713,    3060]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>     10938 nucs [52647065,52658002]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         6 nucs [52647065,52647070] to [52658003,52658008]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [52647065,52647067] to [52658000,52658002]
 second seq =>         0 nucs

 52644353 CCCAAAACCCCTAGTTTTTACAAAGGTTTATTACTCCTACTTGTTGGAAAAGAATTACTA 52644412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCCAAAACCCCTAGTTTTTACAAAGGTTTATTACTCCTACTTGTTGGAAAAGAATTACTA 60

 52644413 CATAAAAGAGTCTGCCCAGAGCTGTAAAATCTCCTTATTCAAACACACACCTTAGAGCAA 52644472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CATAAAAGAGTCTGCCCAGAGCTGTAAAATCTCCTTATTCAAACACACACCTTAGAGCAA 120

 52644473 AAGATGGTTAAATATCAATTCAGGCTATTAACAGTAAGGGAC---GAAATGTGTTCCAAC 52644529
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||
      121 AAGATGGTTAAATATCAATTCAGGCTATTAACAGTAAGG---AATGAAATGTGTTCCAAC 177

 52644530 AAAACTCTGCATGTCAACAAACTACAGAGACTAGGTAACATCTTTTAGGAATCATTTTTA 52644589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      178 AAAACTCTGCATGTCAACAAACTACAGAGACTAGGTAACATCTTTTAGGAATCATTTTTA 237

 52644590 TTCCACTAATGCCTTTTCCTCCAGAATCCACTGATCGTAAACGCAACCTGTCTACTTCCG 52644649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      238 TTCCACTAATGCCTTTTCCTCCAGAATCCACTGATCGTAAACGCAACCTGTCTACTTCCG 297

 52644650 CCTTTGAAAAATGGATGGACAAATTCATCTGCATGTAACTCACCTCCTCTTTTCTTTTAC 52644709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      298 CCTTTGAAAAATGGATGGACAAATTCATCTGCATGTAACTCACCTCCTCTTTTCTTTTAC 357

 52644710 ATAAAACAGATGCCACAGCTGTTATTGTTCTTCACACAGAAGTTTCTACCCAGAGAAACA 52644769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      358 ATAAAACAGATGCCACAGCTGTTATTGTTCTTCACACAGAAGTTTCTACCCAGAGAAACA 417

 52644770 TCAGGATGACACTCTGCTGCAATGTGCTATTTGTTCTAGAGGGGTCAACAGCTTGCCACC 52644829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      418 TCAGGATGACACTCTGCTGCAATGTGCTATTTGTTCTAGAGGGGTCAACAGCTTGCCACC 477

 52644830 TTGCCTAGGCCCAGGGTGACTGCATATGTGCAGTGGTCTTATCCCATTAGCGCCCCCGAG 52644889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      478 TTGCCTAGGCCCAGGGTGACTGCATATGTGCAGTGGTCTTATCCCATTAGCGCCCCCGAG 537

 52644890 CATGCATTCAGAACCAAGTGGATACACCTTGGCACACTTACCTTCCCTGCAGGGACATCA 52644949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      538 CATGCATTCAGAACCAAGTGGATACACCTTGGCACACTTACCTTCCCTGCAGGGACATCA 597

 52644950 TCGGACTGCCCTGATAAGCCAGGAACCTCATCCACCTTGTCTTGATGCTCTGCCCTCTTG 52645009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      598 TCGGACTGCCCTGATAAGCCAGGAACCTCATCCACCTTGTCTTGATGCTCTGCCCTCTTG 657

 52645010 GCTTCCTGTTGGCTGTCACCTGGCACCTTTTCCTGTCCCTTGTCCAGCTTGAAGAATTTG 52645069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      658 GCTTCCTGTTGGCTGTCACCTGGCACCTTTTCCTGTCCCTTGTCCAGCTTGAAGAATTTG 717

 52645070 TCAAAAAAGCTGGAGTCCTTGGGCTTGGAGGGAGCTTCTCCTCCTGCTCCCCCTGTCTCA 52645129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      718 TCAAAAAAGCTGGAGTCCTTGGGCTTGGAGGGAGCTTCTCCTCCTGCTCCCCCTGTCTCA 777

 52645130 GGTGGGAGAAGCGTGGGATCCCTGGCGGCAGAGAGGACCTTGTCTTGGGCCGGGGCGTGC 52645189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      778 GGTGGGAGAAGCGTGGGATCCCTGGCGGCAGAGAGGACCTTGTCTTGGGCCGGGGCGTGC 837

 52645190 CCTGGGGTTTTATCTGTGTCCTGCCCCGGTCCAGCTGCCACCGGAAGTGTCCAGCTCTCA 52645249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      838 CCTGGGGTTTTATCTGTGTCCTGCCCCGGTCCAGCTGCCACCGGAAGTGTCCAGCTCTCA 897

 52645250 CTTGGGTCTTTGTTCGCTGGAGCTTTATTGGAGCTGACATCAAGCTTCACTGATCCAAGG 52645309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      898 CTTGGGTCTTTGTTCGCTGGAGCTTTATTGGAGCTGACATCAAGCTTCACTGATCCAAGG 957

 52645310 GATGAATCTGCGGCTTGGTCTCCGGTACGTCCTGGTACAGGCCGAGAGAGCATCAAGAAA 52645369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      958 GATGAATCTGCGGCTTGGTCTCCGGTACGTCCTGGTACAGGCCGAGAGAGCATCAAGAAA 1017

 52645370 AAACGAGATTTAGCAGCTGGTGCCTCGGGTTTGGCCTCTTTCCCAAGATTCTTTCCGTTG 52645429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1018 AAACGAGATTTAGCAGCTGGTGCCTCGGGTTTGGCCTCTTTCCCAAGATTCTTTCCGTTG 1077

 52645430 GCATCCGCAACAGCACTTATCTCCGTTGTCTCGGGGGAAGAAGTGGCCACATTATCCGTC 52645489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1078 GCATCCGCAACAGCACTTATCTCCGTTGTCTCGGGGGAAGAAGTGGCCACATTATCCGTC 1137

 52645490 TTGACACTTATTCCCAAGTCGACTGTAAACACAAACATAAACAGTGGTTATTCAGCCAAG 52645549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     1138 TTGACACTTATTCCCAAGTCGACTGTAAACACAAACATAAACAGCGGTTATTCAGCCAAG 1197

 52645550 CCGGGAAATTCAGGCACTAATAATGGACTCCAGACATTTTTTATACAAAAGCCATACTGC 52645609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1198 CCGGGAAATTCAGGCACTAATAATGGACTCCAGACATTTTTTATACAAAAGCCATACTGC 1257

 52645610 ATACTGGAACTGTGTTGTTCTCTGGTCATTCTGAAAGGCAGAAGTTAGCTCTCTACATCT 52645669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1258 ATACTGGAACTGTGTTGTTCTCTGGTCATTCTGAAAGGCAGAAGTTAGCTCTCTACATCT 1317

 52645670 CCTTGGACCCTGCTTTTCTTGGGAGAGGAGAAGGCAAGGTTGGTGAGGAGGGAAAGCTAC 52645729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1318 CCTTGGACCCTGCTTTTCTTGGGAGAGGAGAAGGCAAGGTTGGTGAGGAGGGAAAGCTAC 1377

 52645730 TTAATGGAAAGTCACTAGCTGCCAGGTGTGGAATGAGTGATATTCAATGTTAATTAATCT 52645789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1378 TTAATGGAAAGTCACTAGCTGCCAGGTGTGGAATGAGTGATATTCAATGTTAATTAATCT 1437

 52645790 TCTTTTATCTGTGTAAGAACTCCGTGAGCAGCATATTGTCATGATGTCAACTGGGAGGCA 52645849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1438 TCTTTTATCTGTGTAAGAACTCCGTGAGCAGCATATTGTCATGATGTCAACTGGGAGGCA 1497

 52645850 GTACAGCAGTTAGGAGCTTGGGTTCTGGAGCTAGAACAAGGTTTCTCAACCTCAGCACTA 52645909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1498 GTACAGCAGTTAGGAGCTTGGGTTCTGGAGCTAGAACAAGGTTTCTCAACCTCAGCACTA 1557

 52645910 CTCACATTTGAAGCCAGATTATTCTTTGTTAGGGAGGCTCATCCCGTGCCTCATAGGCTG 52645969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1558 CTCACATTTGAAGCCAGATTATTCTTTGTTAGGGAGGCTCATCCCGTGCCTCATAGGCTG 1617

 52645970 ATTAGCAGCATCCTGGCCTCTGCCCACTAGACGCCGGTCACATTTCCCAGTCATGGCAAC 52646029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1618 ATTAGCAGCATCCTGGCCTCTGCCCACTAGACGCCGGTCACATTTCCCAGTCATGGCAAC 1677

 52646030 CAAAAATATCTCTAGGCATTGCTAAATGTCCCCTGGAGGACAAAATCTCTTACGTTTGAG 52646089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1678 CAAAAATATCTCTAGGCATTGCTAAATGTCCCCTGGAGGACAAAATCTCTTACGTTTGAG 1737

 52646090 AGGCACTGAGCTGAAATGTCTTTTTGAATCCAGATTATCTAATTTTCTGTGCCTCAACTT 52646149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1738 AGGCACTGAGCTGAAATGTCTTTTTGAATCCAGATTATCTAATTTTCTGTGCCTCAACTT 1797

 52646150 TCTGGTAAAAGGAGACAGATAATAAATCTCGTAATTTTGTTAGGAAGATTACATGAGTTA 52646209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1798 TCTGGTAAAAGGAGACAGATAATAAATCTCGTAATTTTGTTAGGAAGATTACATGAGTTA 1857

 52646210 ATAGTTTTAAAGCAAGTACAATAGCACCTGGAATATATTAAGTGCTTAATAAATATCACA 52646269
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1858 ATAGTTTTAAAGCAAGTACAATAGCGCCTGGAATATATTAAGTGCTTAATAAATATCACA 1917

 52646270 AACATTAGTTATCATTATTCATGAGTGAGAAAACTGACAGTCAGAGAGGTCAGTACACCC 52646329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1918 AACATTAGTTATCATTATTCATGAGTGAGAAAACTGACAGTCAGAGAGGTCAGTACACCC 1977

 52646330 TCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCTAGTAAGCAGCAGAGTCTGGCTTCAGGCAGAAATCTGAC 52646389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1978 TCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCTAGTAAGCAGCAGAGTCTGGCTTCAGGCAGAAATCTGAC 2037

 52646390 TTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGTCTTACCAGGGACTTGTATTAGCATAGACTGTTAAGAA 52646449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2038 TTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGTCTTACCAGGGACTTGTATTAGCATAGACTGTTAAGAA 2097

 52646450 TATGGGAAGATTTTTAAAATACAGTACTCAGAAAATTTCTCTTTGAAAGGCTGGAAGAGC 52646509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2098 TATGGGAAGATTTTTAAAATACAGTACTCAGAAAATTTCTCTTTGAAAGGCTGGAAGAGC 2157

 52646510 AGATATCCACACAAGAAGGCAAATTAGACCTCAGGCCAGTGTGGAATTAAAGGTGTAGGG 52646569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2158 AGATATCCACACAAGAAGGCAAATTAGACCTCAGGCCAGTGTGGAATTAAAGGTGTAGGG 2217

 52646570 TTATCTGGTCAAGACTGTGTGTGTGGATACAGGCTCCAACCCCTCCAGGCAAGGGCACTG 52646629
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     2218 TTATCTGGTCAAGACTGTGTGTGTGGATACAGGCTCCAACCCCTCCAGGCAAGGGCAATG 2277

 52646630 TTTCCAACATCCACCCTTTCTCCTTTGACCTCTACCTTGACCTAAATTAACTATAAAAGG 52646689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2278 TTTCCAACATCCACCCTTTCTCCTTTGACCTCTACCTTGACCTAAATTAACTATAAAAGG 2337

 52646690 TCCTTCTTTTCTAGGACCCTACTATAAATCAGTGAAATATTCAGGAAAAAAAGAACACCA 52646749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2338 TCCTTCTTTTCTAGGACCCTACTATAAATCAGTGAAATATTCAGGAAAAAAAGAACACCA 2397

 52646750 AGAATGTTGGGATCCCAGTTAAAGATCAAGATTCTCTACTGATAAGCTGTGTGATATGGA 52646809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2398 AGAATGTTGGGATCCCAGTTAAAGATCAAGATTCTCTACTGATAAGCTGTGTGATATGGA 2457

 52646810 GTAAATCACTAAAGATCTTTGAATCTCTTCATTTGTAAAATGGGAATATTGGTAGTCCTA 52646869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2458 GTAAATCACTAAAGATCTTTGAATCTCTTCATTTGTAAAATGGGAATATTGGTAGTCCTA 2517

 52646870 CTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTAAAGAAGAAAAGTCATGCAAAGGATCTGGCACAACGCC 52646929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     2518 CTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTAAAGAAGAAAAGTCATGCAAAGGATCTGGCACAATGCC 2577

 52646930 TTTTCCATAATAAGTGCTTAGTAATTGACAGATACTGTGATAACTTTTCAGGTTTCTCTC 52646989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2578 TTTTCCATAATAAGTGCTTAGTAATTGACAGATACTGTGATAACTTTTCAGGTTTCTCTC 2637

 52646990 ATGCCTTTGACAACATTGCATTTTGCTTGCTCTATCTGTAGTCAGACACTTCTTAATATC 52647049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2638 ATGCCTTTGACAACATTGCATTTTGCTTGCTCTATCTGTAGTCAGACACTTCTTAATATC 2697

 52647050 TGTTTGCAGGAAGAC 52647064
          |||||||||||||||
     2698 TGTTTGCAGGAAGAC 2712

EXCISED REGION

 52658003 AGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTG 52658062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2713 AGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTG 2772

 52658063 GCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTAT 52658122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2773 GCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTAT 2832

 52658123 AAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGG 52658182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2833 AAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGG 2892

 52658183 GAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTG 52658242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2893 GAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTG 2952

 52658243 AAACACTGTCTCTGCTAAAAAACAAAACAAAACAAAACACCAAAAAATAGCTGGGCGTAG 52658302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2953 AAACACTGTCTCTGCTAAAAAACAAAACAAAACAAAACACCAAAAAATAGCTGGGCGTAG 3012

 52658303 TGGCGGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTTGGGAGGCGGTGGCAGGAGAA 52658350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3013 TGGCGGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTTGGGAGGCGGTGGCAGGAGAA 3060

Alignment time is 3.31235 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [52637064,52668002] =>     30939 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    5437] =>      5437 nucs 'mol-32-2e57-122879_5437'

Score:        5437
Aligned:      5437        nucs
Identic:      5437 (100%) nucs =>      1069 (100%)      4368 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [52657380,52658448] EXCISED REGION [52658452,52662819]
 second seq =>  [       1,    1069] EXCISED REGION [    1070,    5437]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         3 nucs [52658449,52658451]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        19 nucs [52658449,52658467] to [52658452,52658470]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [52658449,52658449] to [52658451,52658451]
 second seq =>         0 nucs

 52657380 AGCAAGAAAATGAAAACATATGGCCACACAAAAACTTGTACACAAATGTCCATAGCAGCA 52657439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGCAAGAAAATGAAAACATATGGCCACACAAAAACTTGTACACAAATGTCCATAGCAGCA 60

 52657440 TTTTCATAATAGCTGAAAAGTGGAAACAACCCAAATATCCATCAATTGGAAAAAGGAAAT 52657499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTTCATAATAGCTGAAAAGTGGAAACAACCCAAATATCCATCAATTGGAAAAAGGAAAT 120

 52657500 CTAGCATTTGCATATAATAGAGTATTAATCAGCCATAAGAAGAAACAAAGCACCGATCCA 52657559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTAGCATTTGCATATAATAGAGTATTAATCAGCCATAAGAAGAAACAAAGCACCGATCCA 180

 52657560 TGTTATATCATGCTTTATACTTGGAAGCATGGTACTAAGTGAAAGACGCCAGACACAAAA 52657619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGTTATATCATGCTTTATACTTGGAAGCATGGTACTAAGTGAAAGACGCCAGACACAAAA 240

 52657620 AGCAAAATATTGTATGATTCCATTTATATAAAGTGTCTAGAATAGGCAAATCCATAGAGG 52657679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGCAAAATATTGTATGATTCCATTTATATAAAGTGTCTAGAATAGGCAAATCCATAGAGG 300

 52657680 CAGAAAACAGATTAGTGGTTGCCAGTGGCTGGGAATAGGGAAAAAACTCAGCGCTAAAGG 52657739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CAGAAAACAGATTAGTGGTTGCCAGTGGCTGGGAATAGGGAAAAAACTCAGCGCTAAAGG 360

 52657740 GTAGGGAGTTTTGTTTTGGAGTAATGACGATGTTCTGGAATTAGACGTGGAACGATTGCA 52657799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTAGGGAGTTTTGTTTTGGAGTAATGACGATGTTCTGGAATTAGACGTGGAACGATTGCA 420

 52657800 CACATGGTGCAAATATCCTTAAAATCACGGAATTGTCACTCTAAAAGGTGAATTTTATGG 52657859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CACATGGTGCAAATATCCTTAAAATCACGGAATTGTCACTCTAAAAGGTGAATTTTATGG 480

 52657860 TAGGTGAATTGTACCTCAATTTGTAAAAAGAAGAATTAGATAAATAAACAGCAACACAGC 52657919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TAGGTGAATTGTACCTCAATTTGTAAAAAGAAGAATTAGATAAATAAACAGCAACACAGC 540

 52657920 ACCAAGGGGTGGGGGTAGGAAACAGACAACAAATAGGAGTGAAGAGTTCACAGGAAAAGA 52657979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACCAAGGGGTGGGGGTAGGAAACAGACAACAAATAGGAGTGAAGAGTTCACAGGAAAAGA 600

 52657980 CATGCAGCCAGCTTTTAAGCAGAAGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAA 52658039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CATGCAGCCAGCTTTTAAGCAGAAGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAA 660

 52658040 GCACAATAAAATTATGACACTTGGCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAATT 52658099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GCACAATAAAATTATGACACTTGGCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAATT 720

 52658100 GATGACCCCAGTGGAAAGCGTATAAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCTTAA 52658159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GATGACCCCAGTGGAAAGCGTATAAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCTTAA 780

 52658160 CGCCTGTAATCCTAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGGAGTTCA 52658219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CGCCTGTAATCCTAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGGAGTTCA 840

 52658220 AGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACACTGTCTCTGCTAAAAAACAAAACAAAACAAAA 52658279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACACTGTCTCTGCTAAAAAACAAAACAAAACAAAA 900

 52658280 CACCAAAAAATAGCTGGGCGTAGTGGCGGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTTGGGAGGCGG 52658339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CACCAAAAAATAGCTGGGCGTAGTGGCGGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTTGGGAGGCGG 960

 52658340 TGGCAGGAGAATCATTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCAC 52658399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGGCAGGAGAATCATTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCAC 1020

 52658400 TGCACTCTAACCTGGGCAACAGAGTTCAGAGTGAGACTCTGTCTCCCCC 52658448
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGCACTCTAACCTGGGCAACAGAGTTCAGAGTGAGACTCTGTCTCCCCC 1069

EXCISED REGION

 52658452 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAACAGCCATATAGATCGTCGGTGGGAGTGTAATTTGGCCA 52658511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1070 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAACAGCCATATAGATCGTCGGTGGGAGTGTAATTTGGCCA 1129

 52658512 CTTCTTTGGAAAATAGCTCAGTAATATCTATTAATACTTAAAATTTCACAAACACTGTAA 52658571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1130 CTTCTTTGGAAAATAGCTCAGTAATATCTATTAATACTTAAAATTTCACAAACACTGTAA 1189

 52658572 GTCTAACTTCCACTTCTAAAATGTTATCCTAGAAATAAAATTGCATAGGGGTACAAAGGC 52658631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1190 GTCTAACTTCCACTTCTAAAATGTTATCCTAGAAATAAAATTGCATAGGGGTACAAAGGC 1249

 52658632 TTACGTATGGAACTATTTGCTGGACTACTGTAGTTGTGGCAAAAAACTGGAAATGACCTA 52658691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1250 TTACGTATGGAACTATTTGCTGGACTACTGTAGTTGTGGCAAAAAACTGGAAATGACCTA 1309

 52658692 AACGCTTATTAGTAGAAACCTGGTTAAATAAATTATCATATGTCCTTGAGGACACAGGGA 52658751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1310 AACGCTTATTAGTAGAAACCTGGTTAAATAAATTATCATATGTCCTTGAGGACACAGGGA 1369

 52658752 CACAAAGAGGGGAATGACAGGCACTGAGCCTACTTGAGGGTGGGAGGAGGAAGTCGATCA 52658811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1370 CACAAAGAGGGGAATGACAGGCACTGAGCCTACTTGAGGGTGGGAGGAGGAAGTCGATCA 1429

 52658812 GAAAAAATAACTAGTGGGTACTAGGCTTAGTACCCGGGTGAAAAAATAATCTGTACAACA 52658871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1430 GAAAAAATAACTAGTGGGTACTAGGCTTAGTACCCGGGTGAAAAAATAATCTGTACAACA 1489

 52658872 AACCCCCATGACATGAGTTTACCTTATAACAAACCTGCACATGTAATCTGAACCTAGATA 52658931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1490 AACCCCCATGACATGAGTTTACCTTATAACAAACCTGCACATGTAATCTGAACCTAGATA 1549

 52658932 AAAGTTTAAAAAAATAAATAATCATATGTCCCTACAATGAAATATTCCACAGGCATTAAA 52658991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1550 AAAGTTTAAAAAAATAAATAATCATATGTCCCTACAATGAAATATTCCACAGGCATTAAA 1609

 52658992 ATTCCCCAAGGAATTTTAGTAAGGAAAGAAAAAGCTGTGCCCAACAGCACGTACAGTATG 52659051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1610 ATTCCCCAAGGAATTTTAGTAAGGAAAGAAAAAGCTGTGCCCAACAGCACGTACAGTATG 1669

 52659052 TTTCCATTTGTTTTTAAAAAATGGTGTCGGGAGGTTGAGGAGACAACTTATAAATAGACA 52659111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1670 TTTCCATTTGTTTTTAAAAAATGGTGTCGGGAGGTTGAGGAGACAACTTATAAATAGACA 1729

 52659112 TGCCTGGGATACCTCTGGATATAAGAAACTGTAAAGTATTTACTTCTAAGGAAGGAAATT 52659171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1730 TGCCTGGGATACCTCTGGATATAAGAAACTGTAAAGTATTTACTTCTAAGGAAGGAAATT 1789

 52659172 TGGGATGGGGCTTGGGGAGCCATCAGAGTTAGGGTGGGGATTTTTTCTCTGCCTTATCTT 52659231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1790 TGGGATGGGGCTTGGGGAGCCATCAGAGTTAGGGTGGGGATTTTTTCTCTGCCTTATCTT 1849

 52659232 ATTATGTATATCGCTCAGAATGTTTGCTATGTGTATGCACCTACCCCATCCATTAAGAAA 52659291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1850 ATTATGTATATCGCTCAGAATGTTTGCTATGTGTATGCACCTACCCCATCCATTAAGAAA 1909

 52659292 TGAAGAAATAATGAAAAGAAAAAATGAAAGTAGGGAACTAGAAATGAGAGGTGGGATTCA 52659351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1910 TGAAGAAATAATGAAAAGAAAAAATGAAAGTAGGGAACTAGAAATGAGAGGTGGGATTCA 1969

 52659352 AAGTGGACTGAACACTTGACCTATTTCCCAATTTGCCTAGGGCTGGCCCAGCAGCGAGGC 52659411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1970 AAGTGGACTGAACACTTGACCTATTTCCCAATTTGCCTAGGGCTGGCCCAGCAGCGAGGC 2029

 52659412 AGGTTCTAACCAATGAGCATCAGCTTTGAATGGAGGGGCTGATAGGCCAGGTGGGCCCTG 52659471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2030 AGGTTCTAACCAATGAGCATCAGCTTTGAATGGAGGGGCTGATAGGCCAGGTGGGCCCTG 2089

 52659472 CTTGCTGAGAGTGTCATGGCCTTAGGGACATCTCCATGTTGCAGAGTCTGAGCCTCTGCT 52659531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2090 CTTGCTGAGAGTGTCATGGCCTTAGGGACATCTCCATGTTGCAGAGTCTGAGCCTCTGCT 2149

 52659532 TGGCAAATTCAGAAAATCCAGCTTTTCTTTTTATATCACCTGGAGCTGATGTAACTCTCA 52659591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2150 TGGCAAATTCAGAAAATCCAGCTTTTCTTTTTATATCACCTGGAGCTGATGTAACTCTCA 2209

 52659592 GAAGGCATTTTTAAGAGGACTCATGAATTAACCACATAGCCAACTTACTGGCTTAAGACT 52659651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2210 GAAGGCATTTTTAAGAGGACTCATGAATTAACCACATAGCCAACTTACTGGCTTAAGACT 2269

 52659652 ACGTGACAGAAAGCTGCAAAGGGGGCCAGCCACTGGTAACATCCCACCACTGTCCCTCTC 52659711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2270 ACGTGACAGAAAGCTGCAAAGGGGGCCAGCCACTGGTAACATCCCACCACTGTCCCTCTC 2329

 52659712 TGTGGAAAACACAGATGGGATGCACATTGTGACGGGCAGGATGCCTGGAGAGCCCACAAA 52659771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2330 TGTGGAAAACACAGATGGGATGCACATTGTGACGGGCAGGATGCCTGGAGAGCCCACAAA 2389

 52659772 TCTGCAAGCACAGCTGAAATTGGTTACAGGATTTCAATGTTTCATTGCTTGAAGCTATGA 52659831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2390 TCTGCAAGCACAGCTGAAATTGGTTACAGGATTTCAATGTTTCATTGCTTGAAGCTATGA 2449

 52659832 TAACTTGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGACGATGATTTTTTTTATAGCCAT 52659891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2450 TAACTTGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGACGATGATTTTTTTTATAGCCAT 2509

 52659892 CTTTTTAGAGGGATTTGAGGTAGGGAAAAAAATAAACCTCACACTATCGGAGGTTGCCAA 52659951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2510 CTTTTTAGAGGGATTTGAGGTAGGGAAAAAAATAAACCTCACACTATCGGAGGTTGCCAA 2569

 52659952 CTATGAGGTCTGCTGATGGTTTGGCCAACACAGTGTTTATATTTTTTTGAATTGGGAAAT 52660011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2570 CTATGAGGTCTGCTGATGGTTTGGCCAACACAGTGTTTATATTTTTTTGAATTGGGAAAT 2629

 52660012 TTCATTTAAAAGTCCTAAAATCAGGCTGTTATTGAAATATCTTATTATTGGCTCAGGGTT 52660071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2630 TTCATTTAAAAGTCCTAAAATCAGGCTGTTATTGAAATATCTTATTATTGGCTCAGGGTT 2689

 52660072 TCCCAGGGCAGCCATCCTTGAAGCTGTGTGGAGCCCTATAAACAAGGACGCTTTCCAGTT 52660131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2690 TCCCAGGGCAGCCATCCTTGAAGCTGTGTGGAGCCCTATAAACAAGGACGCTTTCCAGTT 2749

 52660132 CCCTGCAAACTCCATTTCATTCAGAGCCTTGAGCCAGTTCTTACATGGTCCTCAGACTTG 52660191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2750 CCCTGCAAACTCCATTTCATTCAGAGCCTTGAGCCAGTTCTTACATGGTCCTCAGACTTG 2809

 52660192 AGCTAGTGCAAGAATACCCGGGAGGGGTTGTGGGAACAGATAGCTGGGCCCCACCCCCAG 52660251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2810 AGCTAGTGCAAGAATACCCGGGAGGGGTTGTGGGAACAGATAGCTGGGCCCCACCCCCAG 2869

 52660252 GGAAGGGGGTGTTTCTGACTCAGGAGGTCTGGGCTCCGGCTACAGAAACTGCACATCTAA 52660311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2870 GGAAGGGGGTGTTTCTGACTCAGGAGGTCTGGGCTCCGGCTACAGAAACTGCACATCTAA 2929

 52660312 CCGGTACCCAGGTGATGTGATGCTGCTGGCCCAGGGACAACTCTGCGAGTCACTGCTATT 52660371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2930 CCGGTACCCAGGTGATGTGATGCTGCTGGCCCAGGGACAACTCTGCGAGTCACTGCTATT 2989

 52660372 GGGCACTGCTATTGCACCCACACAAGGAGGCAGGCTCTGCTTACATTTTTCAGTTCTTGT 52660431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2990 GGGCACTGCTATTGCACCCACACAAGGAGGCAGGCTCTGCTTACATTTTTCAGTTCTTGT 3049

 52660432 TCCCAGAAACATTTGCTCTTTGGGGTATGCTTTGCATATAATGGATCCTACCCACTAATA 52660491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3050 TCCCAGAAACATTTGCTCTTTGGGGTATGCTTTGCATATAATGGATCCTACCCACTAATA 3109

 52660492 CAGTATGCTGCTTTTATTGATAAACTTCCAGAAACTTGAAGCGCACCTTACCATTTCTTT 52660551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3110 CAGTATGCTGCTTTTATTGATAAACTTCCAGAAACTTGAAGCGCACCTTACCATTTCTTT 3169

 52660552 GATCTCGCTGATTATTTTTATTTTTGTTAAATGAAAATTGTTGGTAAGTTCTTTTTGGTG 52660611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3170 GATCTCGCTGATTATTTTTATTTTTGTTAAATGAAAATTGTTGGTAAGTTCTTTTTGGTG 3229

 52660612 TGGTAAAAGGATATGAAAAGCTGATTTTAAAAAAATGTCCACTCTAGGATTAGAATTGTA 52660671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3230 TGGTAAAAGGATATGAAAAGCTGATTTTAAAAAAATGTCCACTCTAGGATTAGAATTGTA 3289

 52660672 GGTGTGTTTATTCTATTTCAAGATCTGGTTAAAATGCACCTTGAGGAAAAGAATTGAGTG 52660731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3290 GGTGTGTTTATTCTATTTCAAGATCTGGTTAAAATGCACCTTGAGGAAAAGAATTGAGTG 3349

 52660732 CAGCTGTTGTTATTTCTCAATGCTGTTTCTCTTTTCATGTTTTTTTCATGTTGTCTCTTG 52660791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3350 CAGCTGTTGTTATTTCTCAATGCTGTTTCTCTTTTCATGTTTTTTTCATGTTGTCTCTTG 3409

 52660792 GTCTGTCCTATCTCTCTTGGTCTATCCTCCAAGACAGAGATGAGTGATCTTGAAACCCTG 52660851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3410 GTCTGTCCTATCTCTCTTGGTCTATCCTCCAAGACAGAGATGAGTGATCTTGAAACCCTG 3469

 52660852 CCCATGTTTTTATCTTTGGAGCCCAACTGTGCTGCCTTGTTTTCTTCTCCATCCAAAGAG 52660911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3470 CCCATGTTTTTATCTTTGGAGCCCAACTGTGCTGCCTTGTTTTCTTCTCCATCCAAAGAG 3529

 52660912 GCAAAGAGAAAGTTGCATATTACTCAACAGCAGTTGCATGACAGTTAAAATCAGACTGTA 52660971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3530 GCAAAGAGAAAGTTGCATATTACTCAACAGCAGTTGCATGACAGTTAAAATCAGACTGTA 3589

 52660972 TGAGTCATGGAACAGTAAGTTGTGTCCAGAGTATCTGTCATGGTAAGTACAAAAAAGTCC 52661031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3590 TGAGTCATGGAACAGTAAGTTGTGTCCAGAGTATCTGTCATGGTAAGTACAAAAAAGTCC 3649

 52661032 TTAAAAATTTAAAACAGAAATGCCAATGTTTTATTTTTGAAAAATGTGAAGAAGAAATTT 52661091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3650 TTAAAAATTTAAAACAGAAATGCCAATGTTTTATTTTTGAAAAATGTGAAGAAGAAATTT 3709

 52661092 TCCGGCCGGGCGCGGTGGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGC 52661151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3710 TCCGGCCGGGCGCGGTGGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGC 3769

 52661152 AGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACACAGTGCAACCCCATCTCT 52661211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3770 AGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACACAGTGCAACCCCATCTCT 3829

 52661212 ACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGATGCGGTGGCACGCGCCTGTAATCTCAGCTACTAGG 52661271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3830 ACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGATGCGGTGGCACGCGCCTGTAATCTCAGCTACTAGG 3889

 52661272 GAGGCTGAGGCATGACAATCGCTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATC 52661331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3890 GAGGCTGAGGCATGACAATCGCTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATC 3949

 52661332 ATACCACTGCACTCCAGCTTGGGCAGCGGAAGGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAGAAA 52661391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3950 ATACCACTGCACTCCAGCTTGGGCAGCGGAAGGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAGAAA 4009

 52661392 AAAAGAAATTTTCTAAGTGTATTCCAAATAACTTTTAATATTGGATAAACATTACGAGTT 52661451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4010 AAAAGAAATTTTCTAAGTGTATTCCAAATAACTTTTAATATTGGATAAACATTACGAGTT 4069

 52661452 TAAAAATACTTATGCCAGAGGAGTGCTGTGACTCGTGCCTCTAATCCCAGCAATGTGGGA 52661511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4070 TAAAAATACTTATGCCAGAGGAGTGCTGTGACTCGTGCCTCTAATCCCAGCAATGTGGGA 4129

 52661512 GGCCAAGGAGGGACAGTCACTTGAGCCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGATAACAAAGGG 52661571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4130 GGCCAAGGAGGGACAGTCACTTGAGCCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGATAACAAAGGG 4189

 52661572 AGACCTCATCTTTACAAAAAAACTAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGTGTGTGCCTGTGA 52661631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4190 AGACCTCATCTTTACAAAAAAACTAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGTGTGTGCCTGTGA 4249

 52661632 TCCCAGCTACACAGGAGGCTGAGGCAAGAGGATTCCTTGAGCCCTGGAGGTCAAGGCTGC 52661691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4250 TCCCAGCTACACAGGAGGCTGAGGCAAGAGGATTCCTTGAGCCCTGGAGGTCAAGGCTGC 4309

 52661692 AGTGAGTGATGATCATGCCATTGCACTCCAGCTGGGTGACAGAGCAAGACCTCATCTCAA 52661751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4310 AGTGAGTGATGATCATGCCATTGCACTCCAGCTGGGTGACAGAGCAAGACCTCATCTCAA 4369

 52661752 AAAAAAAAAAAAAACAAAACAAAACAAAAAACTTACGCCCAGGTAAAAATTGTCAGAGAA 52661811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4370 AAAAAAAAAAAAAACAAAACAAAACAAAAAACTTACGCCCAGGTAAAAATTGTCAGAGAA 4429

 52661812 AAATAAGAAAAAAACTGAATGCCCAAAATTAGCATAATGGCTGAATGAATTATAGTATGT 52661871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4430 AAATAAGAAAAAAACTGAATGCCCAAAATTAGCATAATGGCTGAATGAATTATAGTATGT 4489

 52661872 CTATACCTTGAAGTACATTGTAGCTTTAAAAAAAATGAATTAAAGTTATACCAGTTGAAT 52661931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4490 CTATACCTTGAAGTACATTGTAGCTTTAAAAAAAATGAATTAAAGTTATACCAGTTGAAT 4549

 52661932 TTGGAGTTGAGATGGGGAAGATTATTACAATTAAAAAAAAACAAACACTATTAATGGATG 52661991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4550 TTGGAGTTGAGATGGGGAAGATTATTACAATTAAAAAAAAACAAACACTATTAATGGATG 4609

 52661992 TGCTGGGAAATGTCTGTATGGGGCTAGTTAAAGTAAATTAAAATAAAGACCAGACCTGAA 52662051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4610 TGCTGGGAAATGTCTGTATGGGGCTAGTTAAAGTAAATTAAAATAAAGACCAGACCTGAA 4669

 52662052 GAATCCCTGAGCGGACAAAGCCTGTTAGACCACATAAATGAGCTAAACCTTGCTTGATTT 52662111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4670 GAATCCCTGAGCGGACAAAGCCTGTTAGACCACATAAATGAGCTAAACCTTGCTTGATTT 4729

 52662112 GCAGACATAAGCAAAACAACTCGAACTGTTTCTTGTAAATGCCTATGCTAAAGAAAAACA 52662171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4730 GCAGACATAAGCAAAACAACTCGAACTGTTTCTTGTAAATGCCTATGCTAAAGAAAAACA 4789

 52662172 GAACTTGAGCTCAACCAATCAGAAACAGTCAACAAACTTAAAATTATATAACTGGGTACC 52662231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4790 GAACTTGAGCTCAACCAATCAGAAACAGTCAACAAACTTAAAATTATATAACTGGGTACC 4849

 52662232 TTCCAATGAGATGATCAAATAAGGCAACTGTGTAATTGTAACACATCAAACACATTTTAT 52662291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4850 TTCCAATGAGATGATCAAATAAGGCAACTGTGTAATTGTAACACATCAAACACATTTTAT 4909

 52662292 ATTATGCCTCTGCATTTTCCCTTAATTCTGGCATGTAATGCTTTGTCATCAAAACACTAA 52662351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4910 ATTATGCCTCTGCATTTTCCCTTAATTCTGGCATGTAATGCTTTGTCATCAAAACACTAA 4969

 52662352 TTCCCTTTTGGTTTTCTTTTCTCAAATTAATGAATTGCCTCTATTCAGATACACTCTTTG 52662411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4970 TTCCCTTTTGGTTTTCTTTTCTCAAATTAATGAATTGCCTCTATTCAGATACACTCTTTG 5029

 52662412 AAATTTTATTGTGTCTCAGATTTGTCTTTTACAAAGTATAGAACAAAGAGAAAAATATGA 52662471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5030 AAATTTTATTGTGTCTCAGATTTGTCTTTTACAAAGTATAGAACAAAGAGAAAAATATGA 5089

 52662472 AAGAAGAAATATTAGGTTGTTAGCTTGGGTGTCCTTGGAGGGGGTAGGGAAGATGTGAGA 52662531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5090 AAGAAGAAATATTAGGTTGTTAGCTTGGGTGTCCTTGGAGGGGGTAGGGAAGATGTGAGA 5149

 52662532 TGAGGAAGAAGCCAATAAGAAAAAGAAAAAGACAGGTTTCACCAAAACAACAATAACAGA 52662591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5150 TGAGGAAGAAGCCAATAAGAAAAAGAAAAAGACAGGTTTCACCAAAACAACAATAACAGA 5209

 52662592 AAATATGATTGCATTTATTCATATATGTTAATTGGTATGTATGTAAGTATATATGCATGT 52662651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5210 AAATATGATTGCATTTATTCATATATGTTAATTGGTATGTATGTAAGTATATATGCATGT 5269

 52662652 AAAAATAAAATACAAAGAATTAAAATGCATACTAATAGTTATTTCAGTTATCTATGGCTG 52662711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5270 AAAAATAAAATACAAAGAATTAAAATGCATACTAATAGTTATTTCAGTTATCTATGGCTG 5329

 52662712 TGTAACAAGCATCCCCAAAATGATTGACTTAACCACCATTTTATTAGGTCATGATTCCAT 52662771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5330 TGTAACAAGCATCCCCAAAATGATTGACTTAACCACCATTTTATTAGGTCATGATTCCAT 5389

 52662772 GCATTAAGAATTCAGGGCCGGGTGCGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCA 52662819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5390 GCATTAAGAATTCAGGGCCGGGTGCGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCA 5437

Alignment time is 6.40473 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [52637064,52668002] =>     30939 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    4145] =>      4145 nucs 'mol-32-2edb-061394_4145'

Score:        4144
Aligned:      4144        nucs
Identic:      4144 (100%) nucs =>      3104 (100%)      1040 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [52654059,52657162] EXCISED REGION [52657164,52658203]
 second seq =>  [       1,    3104] EXCISED REGION [    3106,    4145]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [52657163,52657163]
 second seq =>         1 nucs [3105,3105]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 52654059 TAGGATAAATGTGTGTAACAAGAGGCATTTTATTTATGTATGACATTTGTTTATTTATTA 52654118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TAGGATAAATGTGTGTAACAAGAGGCATTTTATTTATGTATGACATTTGTTTATTTATTA 60

 52654119 TTTATTTATTTGGATAAATGTCTATAACAAGAAACATTTTATTTAAGTATAACAGCAAAT 52654178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTATTTATTTGGATAAATGTCTATAACAAGAAACATTTTATTTAAGTATAACAGCAAAT 120

 52654179 CTACAAGTTAGGTACTATCATCACTCCCATTTTACAGGTCGTGAAACTGAGGCTCTGAAA 52654238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTACAAGTTAGGTACTATCATCACTCCCATTTTACAGGTCGTGAAACTGAGGCTCTGAAA 180

 52654239 AGTCAAGTCAGTTTTCTAATGTTGTCCAGCTAATGACTGGTAGATTTAGTATTTGAACCC 52654298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGTCAAGTCAGTTTTCTAATGTTGTCCAGCTAATGACTGGTAGATTTAGTATTTGAACCC 240

 52654299 ACATTTGCCTGATTCCAAAGTTCAAACTCCCAACAACATGTGGTAACCAAAGCAGGAACA 52654358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACATTTGCCTGATTCCAAAGTTCAAACTCCCAACAACATGTGGTAACCAAAGCAGGAACA 300

 52654359 GAAGAGAAAGAAGAAATAGAAGGGAGGGAAGATGAACAAAGTAGACAAAGTTTAGTTAAT 52654418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GAAGAGAAAGAAGAAATAGAAGGGAGGGAAGATGAACAAAGTAGACAAAGTTTAGTTAAT 360

 52654419 AGAATTAGTGGATACCCAAGAAAAAACTATGTACAAGAGGGGGAAAAAAACCCTGTTTTC 52654478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGAATTAGTGGATACCCAAGAAAAAACTATGTACAAGAGGGGGAAAAAAACCCTGTTTTC 420

 52654479 TCACATCTGGGAAACATTGATATCTATATATTTTTGGTTTTAAATAAAAATTAGGTTATG 52654538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCACATCTGGGAAACATTGATATCTATATATTTTTGGTTTTAAATAAAAATTAGGTTATG 480

 52654539 TCATTCATTTGCATAAAACCATCCAAAGAAGGGCCTCACAAAATTAAAACAAAATCCAAA 52654598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCATTCATTTGCATAAAACCATCCAAAGAAGGGCCTCACAAAATTAAAACAAAATCCAAA 540

 52654599 CTCTCTACTATGGGCCACACCCTCCAGAACTTCAGCTCGTACTATGTTTTTCCTCACACC 52654658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTCTCTACTATGGGCCACACCCTCCAGAACTTCAGCTCGTACTATGTTTTTCCTCACACC 600

 52654659 TCTCAACATACCAACATGTTTCCACCTGCAGCCCTCACCACTAGTTATTCTTTCAATCTG 52654718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCTCAACATACCAACATGTTTCCACCTGCAGCCCTCACCACTAGTTATTCTTTCAATCTG 660

 52654719 GAAATATTTTCGCTAAGATCTTCCTATGGTTACCTTCTTATCATTCAAGACTTAGGTTAT 52654778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GAAATATTTTCGCTAAGATCTTCCTATGGTTACCTTCTTATCATTCAAGACTTAGGTTAT 720

 52654779 GTCAGGCCTTCCCTGACTCCTCCATCTGAAGTAACCCCTCCTGCTTACTCCTGTTTATTC 52654838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GTCAGGCCTTCCCTGACTCCTCCATCTGAAGTAACCCCTCCTGCTTACTCCTGTTTATTC 780

 52654839 TCTAGACTCCACAGAGGATTCATCACTCTCTGAAATGATCCCATTAATTTCTTCTTCACT 52654898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCTAGACTCCACAGAGGATTCATCACTCTCTGAAATGATCCCATTAATTTCTTCTTCACT 840

 52654899 TGTTTCCTCTCCACGACCTGTAAGCCCCAAGTGGACCCGGACTTGGTCTGCTCTGCTTAC 52654958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGTTTCCTCTCCACGACCTGTAAGCCCCAAGTGGACCCGGACTTGGTCTGCTCTGCTTAC 900

 52654959 AGCTGGATTCCAGTTCCCATAGTGCTAGACACTAGGATTAAGCCAGGAAACATGGGTGAA 52655018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGCTGGATTCCAGTTCCCATAGTGCTAGACACTAGGATTAAGCCAGGAAACATGGGTGAA 960

 52655019 GCAGCAAGCACAGAGCTTGGGGCACAGCCTAGCAAACACTCCACAAAGGACCATGATTGT 52655078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GCAGCAAGCACAGAGCTTGGGGCACAGCCTAGCAAACACTCCACAAAGGACCATGATTGT 1020

 52655079 AACTGTAGTAGGGCACACCAATGAACAGGTTGGGAAACTGAGTCTCTGAGAAGAGACTAA 52655138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AACTGTAGTAGGGCACACCAATGAACAGGTTGGGAAACTGAGTCTCTGAGAAGAGACTAA 1080

 52655139 TGTTGTGCTGGATGAAATTTCTTTTTCTGACAATACATTATCCAAATCCTCCAAGCTTTC 52655198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGTTGTGCTGGATGAAATTTCTTTTTCTGACAATACATTATCCAAATCCTCCAAGCTTTC 1140

 52655199 AGTTTAAAGGGGAAAGCAGGAACTATCATTATAATTTTATTTACAAAGTGTCCATGTATG 52655258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGTTTAAAGGGGAAAGCAGGAACTATCATTATAATTTTATTTACAAAGTGTCCATGTATG 1200

 52655259 AACATTATTCACCGCCGAATCATCTCTTCCTATGCAAGCAACACCGTCCTATGCATCAAT 52655318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AACATTATTCACCGCCGAATCATCTCTTCCTATGCAAGCAACACCGTCCTATGCATCAAT 1260

 52655319 ATCCTGATCTGTCAGGATTCAGGATAAAGTGGACATATACACACTAATTGCAAAGGGAAA 52655378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATCCTGATCTGTCAGGATTCAGGATAAAGTGGACATATACACACTAATTGCAAAGGGAAA 1320

 52655379 TTGTACATCTTGCAAAAGATGCAGGGGTTTATAGAGTCTTGTAACATTGGTGAGCTGCTC 52655438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTGTACATCTTGCAAAAGATGCAGGGGTTTATAGAGTCTTGTAACATTGGTGAGCTGCTC 1380

 52655439 AGATCACACACATGACCGTGGTTGGACAAGGATCTGGCAAAGTTAACACAGATCACCGAA 52655498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AGATCACACACATGACCGTGGTTGGACAAGGATCTGGCAAAGTTAACACAGATCACCGAA 1440

 52655499 GAAGGAAAAGTGGACAACACAACACAGTAAGTTCTTCAAAAGAGTTATATTAGAATATCA 52655558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GAAGGAAAAGTGGACAACACAACACAGTAAGTTCTTCAAAAGAGTTATATTAGAATATCA 1500

 52655559 AAAGATTATGTTAGGCCTTTGGGAAAACTCAAAACTTTATGAAGACCTCAAAAAATTATG 52655618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AAAGATTATGTTAGGCCTTTGGGAAAACTCAAAACTTTATGAAGACCTCAAAAAATTATG 1560

 52655619 CAAAAATGACCCTTCAATGGTCATGCTGCAAGAGTCAAATGACACTTCAAACAACTGCGG 52655678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CAAAAATGACCCTTCAATGGTCATGCTGCAAGAGTCAAATGACACTTCAAACAACTGCGG 1620

 52655679 CTTTCTATGTTGTGCAAATGCATTTGTTGTTTTAAAGGTCGTAAAGTCAGGGTACACGTG 52655738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CTTTCTATGTTGTGCAAATGCATTTGTTGTTTTAAAGGTCGTAAAGTCAGGGTACACGTG 1680

 52655739 GCAGATACTTATGACTTGGAGGAAGACGTTAGATTAGATTTGAAACTTTCACTGAATGAT 52655798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GCAGATACTTATGACTTGGAGGAAGACGTTAGATTAGATTTGAAACTTTCACTGAATGAT 1740

 52655799 CGCATTTCATGCTTTTCATCTGTACATTAAAAAGCCAGAATGTCTTTGCCAAGAAATTCT 52655858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CGCATTTCATGCTTTTCATCTGTACATTAAAAAGCCAGAATGTCTTTGCCAAGAAATTCT 1800

 52655859 AGCATAAATAAAAGAAAAGGATGGGATTTTGGAACATCATGGTAGAATTCTTGACTATCA 52655918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AGCATAAATAAAAGAAAAGGATGGGATTTTGGAACATCATGGTAGAATTCTTGACTATCA 1860

 52655919 GCTTTATACAACATGTCTGGACATTTAGTGATGGAAATGCTGGATTCCAAAGGAATGTAG 52655978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GCTTTATACAACATGTCTGGACATTTAGTGATGGAAATGCTGGATTCCAAAGGAATGTAG 1920

 52655979 GCAAAGGTACTACTACCCCCATGCTCTTCAGAAAACATCCTCTAAAAGCAACAGTGATGA 52656038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GCAAAGGTACTACTACCCCCATGCTCTTCAGAAAACATCCTCTAAAAGCAACAGTGATGA 1980

 52656039 TCAGATACTGTGGGGCAAGACTGACAGTGACACTCAAGATTTCCACTCTTCTCTTTAATC 52656098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TCAGATACTGTGGGGCAAGACTGACAGTGACACTCAAGATTTCCACTCTTCTCTTTAATC 2040

 52656099 ATATATTTCCTGTCATTCATGTGCTACAAAACTCTGGAATATGCAAAGCTCATTCAAATG 52656158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ATATATTTCCTGTCATTCATGTGCTACAAAACTCTGGAATATGCAAAGCTCATTCAAATG 2100

 52656159 CAAAACCAGCCTTTGCTCCAACATGAGCATATATTTTCATTTAAAGACAAATCAGATGTT 52656218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CAAAACCAGCCTTTGCTCCAACATGAGCATATATTTTCATTTAAAGACAAATCAGATGTT 2160

 52656219 TCATTTGATTTTTTTTATAAATCTGATAATAATGTACATTTAACCCGTGTTTACAACCAA 52656278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TCATTTGATTTTTTTTATAAATCTGATAATAATGTACATTTAACCCGTGTTTACAACCAA 2220

 52656279 AATAATTAATCTCTCTGAACCCTTTGTTTTTCCTGTCTCTATCCTCCACCCTCATTGCCA 52656338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AATAATTAATCTCTCTGAACCCTTTGTTTTTCCTGTCTCTATCCTCCACCCTCATTGCCA 2280

 52656339 GATAAATAACATCTGCAACCTGATGTGGCATATTGAACTTTGTTTATACTCACACAAACA 52656398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GATAAATAACATCTGCAACCTGATGTGGCATATTGAACTTTGTTTATACTCACACAAACA 2340

 52656399 CGTATAAGCATCCCAGATACACATATACAGGGACTGTATCTGTCCTTGTTGTTTTTATAG 52656458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CGTATAAGCATCCCAGATACACATATACAGGGACTGTATCTGTCCTTGTTGTTTTTATAG 2400

 52656459 AAATTGGATCACATTAGACATATTTTCTGATGACTTTTGTACATTATAGTTGGTCTTCAC 52656518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AAATTGGATCACATTAGACATATTTTCTGATGACTTTTGTACATTATAGTTGGTCTTCAC 2460

 52656519 AGTCAATAGCTCCAAAGCTATCTTATCTTCTAAAATAGCTGCATAATATTCCTCAGTATG 52656578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AGTCAATAGCTCCAAAGCTATCTTATCTTCTAAAATAGCTGCATAATATTCCTCAGTATG 2520

 52656579 GATATACCAAAAGATATTTAAACCATTGCCTAATCAATGAATATCCTGGTAGTTTCCACA 52656638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GATATACCAAAAGATATTTAAACCATTGCCTAATCAATGAATATCCTGGTAGTTTCCACA 2580

 52656639 TTGTTTTTTCCATTTCCACTATAGTGGAATAAACTTTCGTGTTCAAAAATCCTAAACTGG 52656698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TTGTTTTTTCCATTTCCACTATAGTGGAATAAACTTTCGTGTTCAAAAATCCTAAACTGG 2640

 52656699 TGCTATATTTCTATAGAATAGAGGCACAGATGTAGAAGTGTTACCCTCAAATCAATATGC 52656758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TGCTATATTTCTATAGAATAGAGGCACAGATGTAGAAGTGTTACCCTCAAATCAATATGC 2700

 52656759 ATTTAGTTTTGAAAAACAGACACTGCCATATTATTTTCTTAAAAAGGCTCTACAGATTCA 52656818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 ATTTAGTTTTGAAAAACAGACACTGCCATATTATTTTCTTAAAAAGGCTCTACAGATTCA 2760

 52656819 CATTTCCAGCAGCAATGAGTGTCTCAAGCACCTTTTAAGTGGTAAGCAGCTTACCAGGGG 52656878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CATTTCCAGCAGCAATGAGTGTCTCAAGCACCTTTTAAGTGGTAAGCAGCTTACCAGGGG 2820

 52656879 AGGTGGCCTATTATTCTATCAGTGGCTTCAGTTGTTAGGACACCACGGGTCAGCTGTGGA 52656938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 AGGTGGCCTATTATTCTATCAGTGGCTTCAGTTGTTAGGACACCACGGGTCAGCTGTGGA 2880

 52656939 GATACGGTTGTGGGGCAGGTTGAGTTCAGGACACATAGAAGATTGCCAAAGGGTGACTAT 52656998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 GATACGGTTGTGGGGCAGGTTGAGTTCAGGACACATAGAAGATTGCCAAAGGGTGACTAT 2940

 52656999 TATTACTTTGAGACTCTGGAAAAATTAGCCAGGAAACAGAGACAAGAGGCTCAGGGTGCA 52657058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TATTACTTTGAGACTCTGGAAAAATTAGCCAGGAAACAGAGACAAGAGGCTCAGGGTGCA 3000

 52657059 GCAAAGCAGCCAAATCAGGATGATAGTGTTTTCTTTGGAGCAGATATACTAATGGCCAAG 52657118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GCAAAGCAGCCAAATCAGGATGATAGTGTTTTCTTTGGAGCAGATATACTAATGGCCAAG 3060

 52657119 GAACTCATAAAAAGATGCCTAATGTCATCTCATTAGGGAAGTGC 52657162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 GAACTCATAAAAAGATGCCTAATGTCATCTCATTAGGGAAGTGC 3104

EXCISED REGION

 52657164 GTCAAAGCCACAGCATGATACGTCTTCACACCCACGAGGATGGCCATAATCAGAGAGACA 52657223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3106 GTCAAAGCCACAGCATGATACGTCTTCACACCCACGAGGATGGCCATAATCAGAGAGACA 3165

 52657224 ATAACCAGTGGTAGGGAAGATGTGAAAAAATCGGAATGCTCATGCATTGCTGGTAGGAAT 52657283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3166 ATAACCAGTGGTAGGGAAGATGTGAAAAAATCGGAATGCTCATGCATTGCTGGTAGGAAT 3225

 52657284 GTGACATGGTGCAGCTGCTTTGGAAAGCAGTTTAACAGTTCCTGGAAAAGTTAAACATGG 52657343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3226 GTGACATGGTGCAGCTGCTTTGGAAAGCAGTTTAACAGTTCCTGGAAAAGTTAAACATGG 3285

 52657344 AGTTACCCTAAGACCCAGCAATTCCATTCCTAGGTAAGCAAGAAAATGAAAACATATGGC 52657403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3286 AGTTACCCTAAGACCCAGCAATTCCATTCCTAGGTAAGCAAGAAAATGAAAACATATGGC 3345

 52657404 CACACAAAAACTTGTACACAAATGTCCATAGCAGCATTTTCATAATAGCTGAAAAGTGGA 52657463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3346 CACACAAAAACTTGTACACAAATGTCCATAGCAGCATTTTCATAATAGCTGAAAAGTGGA 3405

 52657464 AACAACCCAAATATCCATCAATTGGAAAAAGGAAATCTAGCATTTGCATATAATAGAGTA 52657523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3406 AACAACCCAAATATCCATCAATTGGAAAAAGGAAATCTAGCATTTGCATATAATAGAGTA 3465

 52657524 TTAATCAGCCATAAGAAGAAACAAAGCACCGATCCATGTTATATCATGCTTTATACTTGG 52657583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3466 TTAATCAGCCATAAGAAGAAACAAAGCACCGATCCATGTTATATCATGCTTTATACTTGG 3525

 52657584 AAGCATGGTACTAAGTGAAAGACGCCAGACACAAAAAGCAAAATATTGTATGATTCCATT 52657643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3526 AAGCATGGTACTAAGTGAAAGACGCCAGACACAAAAAGCAAAATATTGTATGATTCCATT 3585

 52657644 TATATAAAGTGTCTAGAATAGGCAAATCCATAGAGGCAGAAAACAGATTAGTGGTTGCCA 52657703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3586 TATATAAAGTGTCTAGAATAGGCAAATCCATAGAGGCAGAAAACAGATTAGTGGTTGCCA 3645

 52657704 GTGGCTGGGAATAGGGAAAAAACTCAGCGCTAAAGGGTAGGGAGTTTTGTTTTGGAGTAA 52657763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3646 GTGGCTGGGAATAGGGAAAAAACTCAGCGCTAAAGGGTAGGGAGTTTTGTTTTGGAGTAA 3705

 52657764 TGACGATGTTCTGGAATTAGACGTGGAACGATTGCACACATGGTGCAAATATCCTTAAAA 52657823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3706 TGACGATGTTCTGGAATTAGACGTGGAACGATTGCACACATGGTGCAAATATCCTTAAAA 3765

 52657824 TCACGGAATTGTCACTCTAAAAGGTGAATTTTATGGTAGGTGAATTGTACCTCAATTTGT 52657883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3766 TCACGGAATTGTCACTCTAAAAGGTGAATTTTATGGTAGGTGAATTGTACCTCAATTTGT 3825

 52657884 AAAAAGAAGAATTAGATAAATAAACAGCAACACAGCACCAAGGGGTGGGGGTAGGAAACA 52657943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3826 AAAAAGAAGAATTAGATAAATAAACAGCAACACAGCACCAAGGGGTGGGGGTAGGAAACA 3885

 52657944 GACAACAAATAGGAGTGAAGAGTTCACAGGAAAAGACATGCAGCCAGCTTTTAAGCAGAA 52658003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3886 GACAACAAATAGGAGTGAAGAGTTCACAGGAAAAGACATGCAGCCAGCTTTTAAGCAGAA 3945

 52658004 GAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTGG 52658063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3946 GAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTGG 4005

 52658064 CTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTATA 52658123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4006 CTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTATA 4065

 52658124 AAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGGG 52658183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4066 AAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGGG 4125

 52658184 AGGCCGAGGTGGGCAAATCA 52658203
          ||||||||||||||||||||
     4126 AGGCCGAGGTGGGCAAATCA 4145

Alignment time is 4.42276 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [52637064,52668002] =>     30939 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    2614] =>      2614 nucs 'mol-32-2edb-066374_2614'

Score:        2565
Aligned:      2609        nucs
Identic:      2605 (100%) nucs =>      2206 (100%)       399 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [52644855,52647064] EXCISED REGION [52658003,52658401]
 second seq =>  [       1,    2210] EXCISED REGION [    2211,    2609]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>     10938 nucs [52647065,52658002]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         6 nucs [52647065,52647070] to [52658003,52658008]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [52647065,52647067] to [52658000,52658002]
 second seq =>         0 nucs

 52644855 ATGTGCAGTGGTCTTATCCCATTAGCGCCCCCGAGCATGCATTCAGAACCAAGTGGATAC 52644914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATGTGCAGTGGTCTTATCCCATTAGCGCCCCCGAGCATGCATTCAGAACCAAGTGGATAC 60

 52644915 ACCTTGGCACACTTACCTTCCCTGCAGGGACATCATCGGACTGCCCTGATAAGCCAGGAA 52644974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACCTTGGCACACTTACCTTCCCTGCAGGGACATCATCGGACTGCCCTGATAAGCCAGGAA 120

 52644975 CCTCATCCACCTTGTCTTGATGCTCTGCCCTCTTGGCTTCCTGTTGGCTGTCACCTGGCA 52645034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCTCATCCACCTTGTCTTGATGCTCTGCCCTCTTGGCTTCCTGTTGGCTGTCACCTGGCA 180

 52645035 CCTTTTCCTGTCCCTTGTCCAGCTTGAAGAATTTGTCAAAAAAGCTGGAGTCCTTGGGCT 52645094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCTTTTCCTGTCCCTTGTCCAGCTTGAAGAATTTGTCAAAAAAGCTGGAGTCCTTGGGCT 240

 52645095 TGGAGGGAGCTTCTCCTCCTGCTCCCCCTGTCTCAGGTGGGAGAAGCGTGGGATCCCTGG 52645154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGGAGGGAGCTTCTCCTCCTGCTCCCCCTGTCTCAGGTGGGAGAAGCGTGGGATCCCTGG 300

 52645155 CGGCAGAGAGGACCTTGTCTTGGGCCGGGGCGTGCCCTGGGGTTTTATCTGTGTCCTGCC 52645214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CGGCAGAGAGGACCTTGTCTTGGGCCGGGGCGTGCCCTGGGGTTTTATCTGTGTCCTGCC 360

 52645215 CCGGTCCAGCTGCCACCGGAAGTGTCCAGCTCTCACTTGGGTCTTTGTTCGCTGGAGCTT 52645274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CCGGTCCAGCTGCCACCGGAAGTGTCCAGCTCTCACTTGGGTCTTTGTTCGCTGGAGCTT 420

 52645275 TATTGGAGCTGACATCAAGCTTCACTGATCCAAGGGATGAATCTGCGGCTTGGTCTCCGG 52645334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TATTGGAGCTGACATCAAGCTTCACTGATCCAAGGGATGAATCTGCGGCTTGGTCTCCGG 480

 52645335 TACGTCCTGGTACAGGCCGAGAGAGCATCAAGAAAAAACGAGATTTAGCAGCTGGTGCCT 52645394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TACGTCCTGGTACAGGCCGAGAGAGCATCAAGAAAAAACGAGATTTAGCAGCTGGTGCCT 540

 52645395 CGGGTTTGGCCTCTTTCCCAAGATTCTTTCCGTTGGCATCCGCAACAGCACTTATCTCCG 52645454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CGGGTTTGGCCTCTTTCCCAAGATTCTTTCCGTTGGCATCCGCAACAGCACTTATCTCCG 600

 52645455 TTGTCTCGGGGGAAGAAGTGGCCACATTATCCGTCTTGACACTTATTCCCAAGTCGACTG 52645514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTGTCTCGGGGGAAGAAGTGGCCACATTATCCGTCTTGACACTTATTCCCAAGTCGACTG 660

 52645515 TAAACACAAACATAAACAGTGGTTATTCAGCCAAGCCGGGAAATTCAGGCACTAATAATG 52645574
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TAAACACAAACATAAACAGCGGTTATTCAGCCAAGCCGGGAAATTCAGGCACTAATAATG 720

 52645575 GACTCCAGACATTTTTTATACAAAAGCCATACTGCATACTGGAACTGTGTTGTTCTCTGG 52645634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GACTCCAGACATTTTTTATACAAAAGCCATACTGCATACTGGAACTGTGTTGTTCTCTGG 780

 52645635 TCATTCTGAAAGGCAGAAGTTAGCTCTCTACATCTCCTTGGACCCTGCTTTTCTTGGGAG 52645694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCATTCTGAAAGGCAGAAGTTAGCTCTCTACATCTCCTTGGACCCTGCTTTTCTTGGGAG 840

 52645695 AGGAGAAGGCAAGGTTGGTGAGGAGGGAAAGCTACTTAATGGAAAGTCACTAGCTGCCAG 52645754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGGAGAAGGCAAGGTTGGTGAGGAGGGAAAGCTACTTAATGGAAAGTCACTAGCTGCCAG 900

 52645755 GTGTGGAATGAGTGATATTCAATGTTAATTAATCTTCTTTTATCTGTGTAAGAACTCCGT 52645814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GTGTGGAATGAGTGATATTCAATGTTAATTAATCTTCTTTTATCTGTGTAAGAACTCCGT 960

 52645815 GAGCAGCATATTGTCATGATGTCAACTGGGAGGCAGTACAGCAGTTAGGAGCTTGGGTTC 52645874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GAGCAGCATATTGTCATGATGTCAACTGGGAGGCAGTACAGCAGTTAGGAGCTTGGGTTC 1020

 52645875 TGGAGCTAGAACAAGGTTTCTCAACCTCAGCACTACTCACATTTGAAGCCAGATTATTCT 52645934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGGAGCTAGAACAAGGTTTCTCAACCTCAGCACTACTCACATTTGAAGCCAGATTATTCT 1080

 52645935 TTGTTAGGGAGGCTCATCCCGTGCCTCATAGGCTGATTAGCAGCATCCTGGCCTCTGCCC 52645994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTGTTAGGGAGGCTCATCCCGTGCCTCATAGGCTGATTAGCAGCATCCTGGCCTCTGCCC 1140

 52645995 ACTAGACGCCGGTCACATTTCCCAGTCATGGCAACCAAAAATATCTCTAGGCATTGCTAA 52646054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ACTAGACGCCGGTCACATTTCCCAGTCATGGCAACCAAAAATATCTCTAGGCATTGCTAA 1200

 52646055 ATGTCCCCTGGAGGACAAAATCTCTTACGTTTGAGAGGCACTGAGCTGAAATGTCTTTTT 52646114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATGTCCCCTGGAGGACAAAATCTCTTACGTTTGAGAGGCACTGAGCTGAAATGTCTTTTT 1260

 52646115 GAATCCAGATTATCTAATTTTCTGTGCCTCAACTTTCTGGTAAAAGGAGACAGATAATAA 52646174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GAATCCAGATTATCTAATTTTCTGTGCCTCAACTTTCTGGTAAAAGGAGACAGATAATAA 1320

 52646175 ATCTCGTAATTTTGTTAGGAAGATTACATGAGTTAATAGTTTTAAAGCAAGTACAATAGC 52646234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ATCTCGTAATTTTGTTAGGAAGATTACATGAGTTAATAGTTTTAAAGCAAGTACAATAGC 1380

 52646235 ACCTGGAATATATTAAGTGCTTAATAAATATCACAAACATTAGTTATCATTATTCATGAG 52646294
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GCCTGGAATATATTAAGTGCTTAATAAATATCACAAACATTAGTTATCATTATTCATGAG 1440

 52646295 TGAGAAAACTGACAGTCAGAGAGGTCAGTACACCCTCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCTAGT 52646354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TGAGAAAACTGACAGTCAGAGAGGTCAGTACACCCTCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCTAGT 1500

 52646355 AAGCAGCAGAGTCTGGCTTCAGGCAGAAATCTGACTTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGTCT 52646414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AAGCAGCAGAGTCTGGCTTCAGGCAGAAATCTGACTTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGTCT 1560

 52646415 TACCAGGGACTTGTATTAGCATAGACTGTTAAGAATATGGGAAGATTTTTAAAATACAGT 52646474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TACCAGGGACTTGTATTAGCATAGACTGTTAAGAATATGGGAAGATTTTTAAAATACAGT 1620

 52646475 ACTCAGAAAATTTCTCTTTGAAAGGCTGGAAGAGCAGATATCCACACAAGAAGGCAAATT 52646534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ACTCAGAAAATTTCTCTTTGAAAGGCTGGAAGAGCAGATATCCACACAAGAAGGCAAATT 1680

 52646535 AGACCTCAGGCCAGTGTGGAATTAAAGGTGTAGGGTTATCTGGTCAAGACTGTGTGTGTG 52646594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AGACCTCAGGCCAGTGTGGAATTAAAGGTGTAGGGTTATCTGGTCAAGACTGTGTGTGTG 1740

 52646595 GATACAGGCTCCAACCCCTCCAGGCAAGGGCACTGTTTCCAACATCCACCCTTTCTCCTT 52646654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     1741 GATACAGGCTCCAACCCCTCCAGGCAAGGGCAATGTTTCCAACATCCACCCTTTCTCCTT 1800

 52646655 TGACCTCTACCTTGACCTAAATTAACTATAAAAGGTCCTTCTTTTCTAGGACCCTACTAT 52646714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TGACCTCTACCTTGACCTAAATTAACTATAAAAGGTCCTTCTTTTCTAGGACCCTACTAT 1860

 52646715 AAATCAGTGAAATATTCAGGAAAAAAAGAACACCAAGAATGTTGGGATCCCAGTTAAAGA 52646774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AAATCAGTGAAATATTCAGGAAAAAAAGAACACCAAGAATGTTGGGATCCCAGTTAAAGA 1920

 52646775 TCAAGATTCTCTACTGATAAGCTGTGTGATATGGAGTAAATCACTAAAGATCTTTGAATC 52646834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TCAAGATTCTCTACTGATAAGCTGTGTGATATGGAGTAAATCACTAAAGATCTTTGAATC 1980

 52646835 TCTTCATTTGTAAAATGGGAATATTGGTAGTCCTACTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTAAA 52646894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TCTTCATTTGTAAAATGGGAATATTGGTAGTCCTACTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTAAA 2040

 52646895 GAAGAAAAGTCATGCAAAGGATCTGGCACAACGCCTTTTCCATAATAAGTGCTTAGTAAT 52646954
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GAAGAAAAGTCATGCAAAGGATCTGGCACAATGCCTTTTCCATAATAAGTGCTTAGTAAT 2100

 52646955 TGACAGATACTGTGATAACTTTTCAGGTTTCTCTCATGCCTTTGACAACATTGCATTTTG 52647014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TGACAGATACTGTGATAACTTTTCAGGTTTCTCTCATGCCTTTGACAACATTGCATTTTG 2160

 52647015 CTTGCTCTATCTGTAGTCAGACACTTCTTAATATCTGTTTGCAGGAAGAC 52647064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CTTGCTCTATCTGTAGTCAGACACTTCTTAATATCTGTTTGCAGGAAGAC 2210

EXCISED REGION

 52658003 AGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTG 52658062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2211 AGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTG 2270

 52658063 GCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTAT 52658122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2271 GCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTAT 2330

 52658123 AAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGG 52658182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2331 AAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGG 2390

 52658183 GAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTG 52658242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2391 GAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTG 2450

 52658243 AAACACTGTCTCTGCTAAAAAACAAAACAAAACAAAACACCAAAAAATAGCTGGGCGTAG 52658302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2451 AAACACTGTCTCTGCTAAAAAACAAAACAAAACAAAACACCAAAAAATAGCTGGGCGTAG 2510

 52658303 TGGCGGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTTGGGAGGCGGTGGCAGGAGAATCATTTGAACCT 52658362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2511 TGGCGGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTTGGGAGGCGGTGGCAGGAGAATCATTTGAACCT 2570

 52658363 GGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACTG 52658401
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2571 GGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACTG 2609

Alignment time is 2.79543 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [52637064,52668002] =>     30939 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    6823] =>      6823 nucs 'mol-32-2ee6-027777_6823'

Score:        6637
Aligned:      6815        nucs
Identic:      6789 (100%) nucs =>      6347 (100%)       442 ( 98%)
Gaps:           15 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [52640704,52647064] EXCISED REGION [52658003,52658444]
 second seq =>  [       1,    6362] EXCISED REGION [    6363,    6812]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>     10938 nucs [52647065,52658002]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         6 nucs [52647065,52647070] to [52658003,52658008]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [52647065,52647067] to [52658000,52658002]
 second seq =>         0 nucs

 52640704 CAGTAGGTGACAGAGGTAGAGAGGAAACCTAGGCTACTTGACTATGATGCTTATGTTTAA 52640763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CAGTAGGTGACAGAGGTAGAGAGGAAACCTAGGCTACTTGACTATGATGCTTATGTTTAA 60

 52640764 TTCACTACTAAATACCATGTAGGAAAGGACTCTGGAGACCTTAGTTCTTTAATTCCAATT 52640823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTCACTACTAAATACCATGTAGGAAAGGACTCTGGAGACCTTAGTTCTTTAATTCCAATT 120

 52640824 CTACCACTAAACAGTAGAGACAGGATGAACTTGTCATTCACTGAGATGGAAAACCCCGTG 52640883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTACCACTAAACAGTAGAGACAGGATGAACTTGTCATTCACTGAGATGGAAAACCCCGTG 180

 52640884 AATTAAACTGGTGGGCATTTTGTTTTTGTCATTGTTAGGCGATGAATGAAGAGTTCCATT 52640943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AATTAAACTGGTGGGCATTTTGTTTTTGTCATTGTTAGGCGATGAATGAAGAGTTCCATT 240

 52640944 CTGGACACATTAGGGTTGAGATACTCAGTGAGCAGCCAAATGGGGATGTAGAAATTCAAG 52641003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTGGACACATTAGGGTTGAGATACTCAGTGAGCAGCCAAATGGGGATGTAGAAATTCAAG 300

 52641004 TAGACATGTGGAAGAGGAGGCAGCTGAGACTCACGTCTGGACTTCAGGGATGGATCCCGG 52641063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TAGACATGTGGAAGAGGAGGCAGCTGAGACTCACGTCTGGACTTCAGGGATGGATCCCGG 360

 52641064 CTAGAGATGTAAATTTGGAACTTGTCAACCCATAGCAGTATTTAAACCTTTGGGACTGAG 52641123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTAGAGATGTAAATTTGGAACTTGTCAACCCATAGCAGTATTTAAACCTTTGGGACTGAG 420

 52641124 GGAAACCTTCAAGGAAATAAGCGTAGTTAGAGATAGCCAAGAAGTGAACCCTGGGGAAGT 52641183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGAAACCTTCAAGGAAATAAGCGTAGTTAGAGATAGCCAAGAAGTGAACCCTGGGGAAGT 480

 52641184 CCAACATTTAGAGGGTGAGATCCAGCAAAGGAGATGATGGAAGAGTACCAGGGAGGTGGA 52641243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCAACATTTAGAGGGTGAGATCCAGCAAAGGAGATGATGGAAGAGTACCAGGGAGGTGGA 540

 52641244 AGGATGTTGTTTCAAACAGCAAGGTGTGGCCCACTCAGTCACTGTGTCGGATTCAACTTG 52641303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGGATGTTGTTTCAAACAGCAAGGTGTGGCCCACTCAGTCACTGTGTCGGATTCAACTTG 600

 52641304 CAGGTCAGACCTACTAGGACAAAGATAGAGACCTATAGGATTTGGCAGCCAGGGTGATGG 52641363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CAGGTCAGACCTACTAGGACAAAGATAGAGACCTATAGGATTTGGCAGCCAGGGTGATGG 660

 52641364 TAGGGAATTTGAAACATCATGGTGGCTGTGACAAGAGCCTGAATGGAGTGTGTTCAAGAG 52641423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TAGGGAATTTGAAACATCATGGTGGCTGTGACAAGAGCCTGAATGGAGTGTGTTCAAGAG 720

 52641424 AGAAAAGAAGAGAAGTGAAAACACAGAATATTGTTCTTATTATTAGTAGCCTGAGCCAAT 52641483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
      721 AGAAAAGAAGAGAAGTGAAAACACAGAATATTGTTCTTATTATTAGTAGCCTGAGCAAAT 780

 52641484 CTGAGGACCGATGCACTTATCACAATGTCTCTTAAAATACTATGTCTCTTACTAGATTAT 52641543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTGAGGACCGATGCACTTATCACAATGTCTCTTAAAATACTATGTCTCTTACTAGATTAT 840

 52641544 ACACTCCTTGACAGACGAGAAACATGATTTATTTTTCAAATGCCTTGCACAAGGTTAGTG 52641603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ACACTCCTTGACAGACGAGAAACATGATTTATTTTTCAAATGCCTTGCACAAGGTTAGTG 900

 52641604 CGAAAGTAACGATTGCAGGATTTAATTACACTTTTAAAAGAAAAAAGACATTCTTCATCT 52641663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CGAAAGTAACGATTGCAGGATTTAATTACACTTTTAAAAGAAAAAAGACATTCTTCATCT 960

 52641664 TATGAAACTCTGCATGGCAACACTTTATGCGCCCCACACCCCCACTCAACACAAACACAA 52641723
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TATGAAACTCTGCATGGCAACACTTTACGCGCCCCACACCCCCACTCAACACAAACACAA 1020

 52641724 CTCTGGAAGTACTGTGTTGATAACAGAAATGTGGTGGGTTTTATTTTTAACCAATAAAGG 52641783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTCTGGAAGTACTGTGTTGATAACAGAAATGTGGTGGGTTTTATTTTTAACCAATAAAGG 1080

 52641784 TCAAGTTTGCATTATGTGATTTTGTGTGTGTGTGTGTTGAATCTTTTAAATGCATATCTT 52641843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TCAAGTTTGCATTATGTGATTTTGTGTGTGTGTGTGTTGAATCTTTTAAATGCATATCTT 1140

 52641844 ACAGCTCTGGTTCAGTTGTTGTGGGGAGAGGAAAAAAACCTCATCCCTGCCAACACATTG 52641903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ACAGCTCTGGTTCAGTTGTTGTGGGGAGAGGAAAAAAACCTCATCCCTGCCAACACATTG 1200

 52641904 GTTTGTATGAATCACAGCTCAGTGAAACCTTTCAGGCATATAATTTATCTTTTCTTTGGC 52641963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GTTTGTATGAATCACAGCTCAGTGAAACCTTTCAGGCATATAATTTATCTTTTCTTTGGC 1260

 52641964 CTATGTAGTAAACGCTTCATTTGTTCATGAATTCTTGCCTTGTTTTAATTATGCTTTGCC 52642023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTATGTAGTAAACGCTTCATTTGTTCATGAATTCTTGCCTTGTTTTAATTATGCTTTGCC 1320

 52642024 CTGAATGTAGTTTTATAAGGCACAAAAATAAGATTGTCGTTCTGAAAACACAGAAGATTT 52642083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CTGAATGTAGTTTTATAAGGCACAAAAATAAGATTGTCGTTCTGAAAACACAGAAGATTT 1380

 52642084 GTATGTTTCCCCCAGGATGAAATGGTGGCATCTTTCTCCCAATTCACAGCTCTGTGGGCT 52642143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GTATGTTTCCCCCAGGATGAAATGGTGGCATCTTTCTCCCAATTCACAGCTCTGTGGGCT 1440

 52642144 TGTGGCTGGAATTCCAATCCAGCAGGGAGCAAGCCATAAAAATGGGGGGAAGGGCTGCTG 52642203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TGTGGCTGGAATTCCAATCCAGCAGGGAGCAAGCCATAAAAATGGGGGGAAGGGCTGCTG 1500

 52642204 GAGGGAGGCAGTAGATGCGGCTGAGCCCAAGGCATAATTCACCCTAAGAATTCTGAATCA 52642263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GAGGGAGGCAGTAGATGCGGCTGAGCCCAAGGCATAATTCACCCTAAGAATTCTGAATCA 1560

 52642264 ATACACTGACATCCAGCCATGTACAATGTGGTACTCCCACCAAGAAAGCCACTGATTGAG 52642323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ATACACTGACATCCAGCCATGTACAATGTGGTACTCCCACCAAGAAAGCCACTGATTGAG 1620

 52642324 AAGTTTTATTCATGTTACTTTCTGAGGGTTGGATTGTCCCATTACATTTATAGAACAATT 52642383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AAGTTTTATTCATGTTACTTTCTGAGGGTTGGATTGTCCCATTACATTTATAGAACAATT 1680

 52642384 GCTTTTTTCCCCCTAAATACAGAACTATGCAGCCGGGAGTCAGAAAAGAAACCTTGACAA 52642443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GCTTTTTTCCCCCTAAATACAGAACTATGCAGCCGGGAGTCAGAAAAGAAACCTTGACAA 1740

 52642444 TCAGAAGGCTGTTTTGTTGTTGTTGTTAAAAACCTTTGCAGGCATATGCATCTGAATATC 52642503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TCAGAAGGCTGTTTTGTTGTTGTTGTTAAAAACCTTTGCAGGCATATGCATCTGAATATC 1800

 52642504 CATAAGTTCACAGGCTGAGGGAGAAATGGCTATTTCATAACTTTTCTGTGTTTCTCATGT 52642563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CATAAGTTCACAGGCTGAGGGAGAAATGGCTATTTCATAACTTTTCTGTGTTTCTCATGT 1860

 52642564 ACATAGTACAAAGTGGGCACTCAGTATTTCAAATTTCAATATCACTGAAAAAAATGGAAA 52642623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ACATAGTACAAAGTGGGCACTCAGTATTTCAAATTTCAATATCACTGAAAAAAATGGAAA 1920

 52642624 TTTGTCATGTAACAAAATCAGATGCAGACTTCACTGGTGAATCTGAGGGAGTGAATTCAC 52642683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTTGTCATGTAACAAAATCAGATGCAGACTTCACTGGTGAATCTGAGGGAGTGAATTCAC 1980

 52642684 TTATTCAGAAAGGAAGACAGTTACAATTCTTGGGTCTTCTGAGAGATCATTATAACTTGA 52642743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TTATTCAGAAAGGAAGACAGTTACAATTCTTGGGTCTTCTGAGAGATCATTATAACTTGA 2040

 52642744 AAATATTACACAAGGGCTTTGCTATATTAGATACCTGCCATGTTCCTAACACAAGCTCCC 52642803
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     2041 AAATATTACACAAGGGCTTTGCTATATTAGATACCTGCCATGTTCCTAATACAAGCTCCC 2100

 52642804 ATTTTCTGACTCAAATCTCATTTTGGAACACATTCCACTCAAATTGAGGTTCTACCCCTA 52642863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ATTTTCTGACTCAAATCTCATTTTGGAACACATTCCACTCAAATTGAGGTTCTACCCCTA 2160

 52642864 AGAGTTCTTTTTCAATAAAGAAAGCTGAGTTAATAAATCACAACTCCAAAACTTTTCCTC 52642923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AGAGTTCTTTTTCAATAAAGAAAGCTGAGTTAATAAATCACAACTCCAAAACTTTTCCTC 2220

 52642924 ACTTTTCTTAGACTAGAAATAGATTGAGTGTGTCGAGGTTTTATGGCTGAGTACATTGGA 52642983
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ACTTTTCTTAGACTAGAAATAGATTGAATGTGTCGAGGTTTTATGGCTGAGTACATTGGA 2280

 52642984 GGGCTGGCTATTCTATGCTGAACTGGTTTACTTGATTAAGATGGGGATTTGGATGAGTCA 52643043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GGGCTGGCTATTCTATGCTGAACTGGTTTACTTGATTAAGATGGGGATTTGGATGAGTCA 2340

 52643044 CCGGACACCTGTCCAAAGATGAGTAAAACACATTCCTTCATTGTCTTCCCATAAATAACT 52643103
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CTGGACACCTGTCCAAAGATGAGTAAAACACATTCCTTCATTGTCTTCCCATAAATAACT 2400

 52643104 CAATCTTCTCCTAACTGAGCCAATGGATAGGCTTTGGATGCCCAAGCAAAACAAACACAT 52643163
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     2401 CAATCTTCTCCTAACTGAGCCAATGGATAGGCTTTGGATGCCCAAGCAAAAGAAACACAT 2460

 52643164 GACTGTTAAAAAATCACAACCTCAAAATGGCCTTAGAAGCCTATGACCAATAATGAGAAT 52643223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GACTGTTAAAAAATCACAACCTCAAAATGGCCTTAGAAGCCTATGACCAATAATGAGAAT 2520

 52643224 GGTTTCTCCACTCAGGCGCAAGTAGTAAACAGTTTCTCCCATATGCAGGAATATTGACGA 52643283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GGTTTCTCCACTCAGGCGCAAGTAGTAAACAGTTTCTCCCATATGCAGGAATATTGACGA 2580

 52643284 CTAGTTTACCGCCTCTGGGCACGTAACTTTCAGGTCCTGGTTCATGCATTTGCTGGAATG 52643343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CTAGTTTACCGCCTCTGGGCACGTAACTTTCAGGTCCTGGTTCATGCATTTGCTGGAATG 2640

 52643344 TTCCCTGGGCCATGGAGCCCAGTTCTCCTGGCATCTGGCATCTCCCCCACACTCTGCTCC 52643403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TTCCCTGGGCCATGGAGCCCAGTTCTCCTGGCATCTGGCATCTCCCCCACACTCTGCTCC 2700

 52643404 CCCAGCACAGCACTTGGCATCTTGCATTGCAATTGCAGGTTTATTTATTCACTTCTCTCA 52643463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CCCAGCACAGCACTTGGCATCTTGCATTGCAATTGCAGGTTTATTTATTCACTTCTCTCA 2760

 52643464 CTGGACAGCAAACTCCACCAGGGCCGAGACTCTGTGTCTCGCCCTTCACTGTGGTCCCTG 52643523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CTGGACAGCAAACTCCACCAGGGCCGAGACTCTGTGTCTCGCCCTTCACTGTGGTCCCTG 2820

 52643524 TGCCTCACCTGTTCCTAGTACAGTGTCACACTCAGTAAAGAGCAGATGCCTGG-TGCATT 52643582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
     2821 TGCCTCACCTGTTCCTAGTACAGTGTCACACTCAGTAAAGAGCAGATGCCTGGATGCATT 2880

 52643583 TGGAGACTTATTTTAAATTATACGGAAAGTTATTCAACCGGCTTCTTGAACTGGTGAATT 52643642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TGGAGACTTATTTTAAATTATACGGAAAGTTATTCAACCGGCTTCTTGAACTGGTGAATT 2940

 52643643 TTGGAAAGTGGGTGTTTGAAGGGAAAATGTTTAAACTCTGAAAGAAATGTTGGAAATAAG 52643702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TTGGAAAGTGGGTGTTTGAAGGGAAAATGTTTAAACTCTGAAAGAAATGTTGGAAATAAG 3000

 52643703 CTCTTTGAATCAAAATGTATAGAAAACACAAGAATGCTGACAGTAAGAGCCTAAAACACA 52643762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CTCTTTGAATCAAAATGTATAGAAAACACAAGAATGCTGACAGTAAGAGCCTAAAACACA 3060

 52643763 TGATGACTATTATCTTTTCCCAATTTTAACTCTCCAGAGTGTTCAGCGGTGCCCAGCCTT 52643822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TGATGACTATTATCTTTTCCCAATTTTAACTCTCCAGAGTGTTCAGCGGTGCCCAGCCTT 3120

 52643823 CATAATGTAATTCTTCGTAGCACCCTGGATGCATTAAAACCATAGATTAACGTGATACTT 52643882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 CATAATGTAATTCTTCGTAGCACCCTGGATGCATTAAAACCATAGATTAACGTGATACTT 3180

 52643883 ATTTTCATTAAGGAAAATAATTTACGTACAGTGCTCAGAGTAGAGCCTGGCACATTGAAC 52643942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 ATTTTCATTAAGGAAAATAATTTACGTACAGTGCTCAGAGTAGAGCCTGGCACATTGAAC 3240

 52643943 ATTTTCAATAAATGACAGCAAGTGTAATTATTAGCACTTCGGAAGTGCAAAGTTGCATTG 52644002
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     3241 ATTTTCAATAAATGACAGCAAGTGTAATTATTAGCACTTTGGAAGTGCAAAGTTGCATTG 3300

 52644003 TATTAAGACAAATATATTTGGAGCTCATCCAATTTTTTCCTGGCTCTGAAGTCTGCTAGT 52644062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TATTAAGACAAATATATTTGGAGCTCATCCAATTTTTTCCTGGCTCTGAAGTCTGCTAGT 3360

 52644063 GGCACTTAACTTTATTCCCAAGTTTTGAAAAATATTGTTATTTAAAAAGTCTGTTAACCA 52644122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 GGCACTTAACTTTATTCCCAAGTTTTGAAAAATATTGTTATTTAAAAAGTCTGTTAACCA 3420

 52644123 AGGAAATGCATGCCCTAAACCTATAATGTATCAAGTTTTACTTCCTTCTTCTTTTAAGGA 52644182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 AGGAAATGCATGCCCTAAACCTATAATGTATCAAGTTTTACTTCCTTCTTCTTTTAAGGA 3480

 52644183 GTTCTTTTCCTGCCTTGAATACAAACAGGCTCTCTCAAGGTTAAAAGCAAATGCTCTTTT 52644242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 GTTCTTTTCCTGCCTTGAATACAAACAGGCTCTCTCAAGGTTAAAAGCAAATGCTCTTTT 3540

 52644243 TAGTGTCAAAAAGAGCTTGCCTTTCTTCGCTCAGGAAAAAAAGCAACTGATTCCAGGATA 52644302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 TAGTGTCAAAAAGAGCTTGCCTTTCTTCGCTCAGGAAAAAAAGCAACTGATTCCAGGATA 3600

 52644303 CCTTCTTTGAAAACCAACACAAAAAAACCCCCCAAAAAACAAAAAAAAAACCCAAAACCC 52644362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 CCTTCTTTGAAAACCAACACAAAAAAACCCCCCAAAAAACAAAAAAAAAACCCAAAACCC 3660

 52644363 CTAGTTTTTACAAAGGTTTATTACTCCTACTTGTTGGAAAAGAATTACTACATAAAAGAG 52644422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 CTAGTTTTTACAAAGGTTTATTACTCCTACTTGTTGGAAAAGAATTACTACATAAAAGAG 3720

 52644423 TCTGCCCAGAGCTGTAAAATCTCCTTATTCAAACACACACCTTAGAGCAAAAGATGGTTA 52644482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 TCTGCCCAGAGCTGTAAAATCTCCTTATTCAAACACACACCTTAGAGCAAAAGATGGTTA 3780

 52644483 AATATCAATTCAGGCTATTAACAGTAAGGGAC---GAAATGTGTTCCAACAAAACTCTGC 52644539
          |||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||
     3781 AATATCAATTCAGGCTATTAACAGTAAGG---AATGAAATGTGTTCCAACAAAACTCTGC 3837

 52644540 ATGTCAACAAACTACAGAGACTAGGTAACATCTTTTAGGAATCATTTTTATTCCACTAAT 52644599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3838 ATGTCAACAAACTACAGAGACTAGGTAACATCTTTTAGGAATCATTTTTATTCCACTAAT 3897

 52644600 GCCTTTTCCTCCAGAATCCACTGATCGTAAACGCAACCTGTCTACTTCCGCCTTTGAAAA 52644659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3898 GCCTTTTCCTCCAGAATCCACTGATCGTAAACGCAACCTGTCTACTTCCGCCTTTGAAAA 3957

 52644660 ATGGATGGACAAATTCATCTGCATGTAACTCACCTCCTCTTTTCTTTTACATAAAACAGA 52644719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3958 ATGGATGGACAAATTCATCTGCATGTAACTCACCTCCTCTTTTCTTTTACATAAAACAGA 4017

 52644720 TGCCACAGCTGTTATTGTTCTTCACACAGAAGTTTCTACCCAGAGAAACATCAGGATGAC 52644779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4018 TGCCACAGCTGTTATTGTTCTTCACACAGAAGTTTCTACCCAGAGAAACATCAGGATGAC 4077

 52644780 ACTCTGCTGCAATGTGCTATTTGTTCTAGAGGGGTCAACAGCTTGCCACCTTGCCTAGGC 52644839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4078 ACTCTGCTGCAATGTGCTATTTGTTCTAGAGGGGTCAACAGCTTGCCACCTTGCCTAGGC 4137

 52644840 CCAGGGTGACTGCATATGTGCAGTGGTCTTATCCCATTAGCGCCCCCGAGCATGCATTCA 52644899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4138 CCAGGGTGACTGCATATGTGCAGTGGTCTTATCCCATTAGCGCCCCCGAGCATGCATTCA 4197

 52644900 GAACCAAGTGGATACACCTTGGCACACTTACCTTCCCTGCAGGGACATCATCGGACTGCC 52644959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4198 GAACCAAGTGGATACACCTTGGCACACTTACCTTCCCTGCAGGGACATCATCGGACTGCC 4257

 52644960 CTGATAAGCCAGGAACCTCATCCACCTTGTCTTGATGCTCTGCCCTCTTGGCTTCCTGTT 52645019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4258 CTGATAAGCCAGGAACCTCATCCACCTTGTCTTGATGCTCTGCCCTCTTGGCTTCCTGTT 4317

 52645020 GGCTGTCACCTGGCACCTTTTCCTGTCCCTTGTCCAGCTTGAAGAATTTGTCAAAAAAGC 52645079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4318 GGCTGTCACCTGGCACCTTTTCCTGTCCCTTGTCCAGCTTGAAGAATTTGTCAAAAAAGC 4377

 52645080 TGGAGTCCTTGGGCTTGGAGGGAGCTTCTCCTCCTGCTCCCCCTGTCTCAGGTGGGAGAA 52645139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4378 TGGAGTCCTTGGGCTTGGAGGGAGCTTCTCCTCCTGCTCCCCCTGTCTCAGGTGGGAGAA 4437

 52645140 GCGTGGGATCCCTGGCGGCAGAGAGGACCTTGTCTTGGGCCGGGGCGTGCCCTGGGGTTT 52645199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4438 GCGTGGGATCCCTGGCGGCAGAGAGGACCTTGTCTTGGGCCGGGGCGTGCCCTGGGGTTT 4497

 52645200 TATCTGTGTCCTGCCCCGGTCCAGCTGCCACCGGAAGTGTCCAGCTCTCACTTGGGTCTT 52645259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4498 TATCTGTGTCCTGCCCCGGTCCAGCTGCCACCGGAAGTGTCCAGCTCTCACTTGGGTCTT 4557

 52645260 TGTTCGCTGGAGCTTTATTGGAGCTGACATCAAGCTTCACTGATCCAAGGGATGAATCTG 52645319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4558 TGTTCGCTGGAGCTTTATTGGAGCTGACATCAAGCTTCACTGATCCAAGGGATGAATCTG 4617

 52645320 CGGCTTGGTCTCCGGTACGTCCTGGTACAGGCCGAGAGAGCATCAAGAAAAAACGAGATT 52645379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4618 CGGCTTGGTCTCCGGTACGTCCTGGTACAGGCCGAGAGAGCATCAAGAAAAAACGAGATT 4677

 52645380 TAGCAGCTGGTGCCTCGGGTTTGGCCTCTTTCCCAAGATTCTTTCCGTTGGCATCCGCAA 52645439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4678 TAGCAGCTGGTGCCTCGGGTTTGGCCTCTTTCCCAAGATTCTTTCCGTTGGCATCCGCAA 4737

 52645440 CAGCACTTATCTCCGTTGTCTCGGGGGAAGAAGTGGCCACATTATCCGTCTTGACACTTA 52645499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4738 CAGCACTTATCTCCGTTGTCTCGGGGGAAGAAGTGGCCACATTATCCGTCTTGACACTTA 4797

 52645500 TTCCCAAGTCGACTGTAAACACAAACATAAACAGTGGTTATTCAGCCAAGCCGGGAAATT 52645559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     4798 TTCCCAAGTCGACTGTAAACACAAACATAAACAGCGGTTATTCAGCCAAGCCGGGAAATT 4857

 52645560 CAGGCACTAATAATGGACTCCAGACATTTTTTATACAAAAGCCATACTGCATACTGGAAC 52645619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4858 CAGGCACTAATAATGGACTCCAGACATTTTTTATACAAAAGCCATACTGCATACTGGAAC 4917

 52645620 TGTGTTGTTCTCTGGTCATTCTGAAAGGCAGAAGTTAGCTCTCTACATCTCCTTGGACCC 52645679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4918 TGTGTTGTTCTCTGGTCATTCTGAAAGGCAGAAGTTAGCTCTCTACATCTCCTTGGACCC 4977

 52645680 TGCTTTTCTTGGGAGAGGAGAAGGCAAGGTTGGTGAGGAGGGAAAGCTACTTAATGGAAA 52645739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4978 TGCTTTTCTTGGGAGAGGAGAAGGCAAGGTTGGTGAGGAGGGAAAGCTACTTAATGGAAA 5037

 52645740 GTCACTAGCTGCCAGGTGTGGAATGAGTGATATTCAATGTTAATTAATCTTCTTTTATCT 52645799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5038 GTCACTAGCTGCCAGGTGTGGAATGAGTGATATTCAATGTTAATTAATCTTCTTTTATCT 5097

 52645800 GTGTAAGAACTCCGTGAGCAGCATATTGTCATGATGTCAACTGGGAGGCAGTACAGCAGT 52645859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5098 GTGTAAGAACTCCGTGAGCAGCATATTGTCATGATGTCAACTGGGAGGCAGTACAGCAGT 5157

 52645860 TAGGAGCTTGGGTTCTGGAGCTAGAACAAGGTTTCTCAACCTCAGCACTACTCACATTTG 52645919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5158 TAGGAGCTTGGGTTCTGGAGCTAGAACAAGGTTTCTCAACCTCAGCACTACTCACATTTG 5217

 52645920 AAGCCAGATTATTCTTTGTTAGGGAGGCTCATCCCGTGCCTCATAGGCTGATTAGCAGCA 52645979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5218 AAGCCAGATTATTCTTTGTTAGGGAGGCTCATCCCGTGCCTCATAGGCTGATTAGCAGCA 5277

 52645980 TCCTGGCCTCTGCCCACTAGACGCCGGTCACATTTCCCAGTCATGGCAACCAAAAATATC 52646039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5278 TCCTGGCCTCTGCCCACTAGACGCCGGTCACATTTCCCAGTCATGGCAACCAAAAATATC 5337

 52646040 TCTAGGCATTGCTAAATGTCCCCTGGAGGACAAAATCTCTTACGTTTGAGAGGCACTGAG 52646099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5338 TCTAGGCATTGCTAAATGTCCCCTGGAGGACAAAATCTCTTACGTTTGAGAGGCACTGAG 5397

 52646100 CTGAAATGTCTTTTTGAATCCAGATTATCTAATTTTCTGTGCCTCAACTTTCTGGTAAAA 52646159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5398 CTGAAATGTCTTTTTGAATCCAGATTATCTAATTTTCTGTGCCTCAACTTTCTGGTAAAA 5457

 52646160 GGAGACAGATAATAAATCTCGTAATTTTGTTAGGAAGATTACATGAGTTAATAGTTTTAA 52646219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5458 GGAGACAGATAATAAATCTCGTAATTTTGTTAGGAAGATTACATGAGTTAATAGTTTTAA 5517

 52646220 AGCAAGTACAATAGCACCTGGAATATATTAAGTGCTTAATAAATATCACAAACATTAGTT 52646279
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5518 AGCAAGTACAATAGCGCCTGGAATATATTAAGTGCTTAATAAATATCACAAACATTAGTT 5577

 52646280 ATCATTATTCATGAGTGAGAAAACTGACAGTCAGAGAGGTCAGTACACCCTCCCCTGGCT 52646339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5578 ATCATTATTCATGAGTGAGAAAACTGACAGTCAGAGAGGTCAGTACACCCTCCCCTGGCT 5637

 52646340 GCCCAGTAAGCTAGTAAGCAGCAGAGTCTGGCTTCAGGCAGAAATCTGACTTCTAAGTTC 52646399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5638 GCCCAGTAAGCTAGTAAGCAGCAGAGTCTGGCTTCAGGCAGAAATCTGACTTCTAAGTTC 5697

 52646400 ATGCGCTCTCTGTCTTACCAGGGACTTGTATTAGCATAGACTGTTAAGAATATGGGAAGA 52646459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5698 ATGCGCTCTCTGTCTTACCAGGGACTTGTATTAGCATAGACTGTTAAGAATATGGGAAGA 5757

 52646460 TTTTTAAAATACAGTACTCAGAAAATTTCTCTTTGAAAGGCTGGAAGAGCAGATATCCAC 52646519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5758 TTTTTAAAATACAGTACTCAGAAAATTTCTCTTTGAAAGGCTGGAAGAGCAGATATCCAC 5817

 52646520 ACAAGAAGGCAAATTAGACCTCAGGCCAGTGTGGAATTAAAGGTGTAGGGTTATCTGGTC 52646579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5818 ACAAGAAGGCAAATTAGACCTCAGGCCAGTGTGGAATTAAAGGTGTAGGGTTATCTGGTC 5877

 52646580 AAGACTGTGTGTGTGGATACAGGCTCCAACCCCTCCAGGCAAGGGCACTGTTTCCAACAT 52646639
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     5878 AAGACTGTGTGTGTGGATACAGGCTCCAACCCCTCCAGGCAAGGGCAATGTTTCCAACAT 5937

 52646640 CCACCCTTTCTCCTTTGACCTCTACCTTGACCTAAATTAACTATAAAAGGTCCTTCTTTT 52646699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5938 CCACCCTTTCTCCTTTGACCTCTACCTTGACCTAAATTAACTATAAAAGGTCCTTCTTTT 5997

 52646700 CTAGGACCCTACTATAAATCAGTGAAATATTCAGGAAAAAAAGAACACCAAGAATGTTGG 52646759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5998 CTAGGACCCTACTATAAATCAGTGAAATATTCAGGAAAAAAAGAACACCAAGAATGTTGG 6057

 52646760 GATCCCAGTTAAAGATCAAGATTCTCTACTGATAAGCTGTGTGATATGGAGTAAATCACT 52646819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6058 GATCCCAGTTAAAGATCAAGATTCTCTACTGATAAGCTGTGTGATATGGAGTAAATCACT 6117

 52646820 AAAGATCTTTGAATCTCTTCATTTGTAAAATGGGAATATTGGTAGTCCTACTGCAGGGTT 52646879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6118 AAAGATCTTTGAATCTCTTCATTTGTAAAATGGGAATATTGGTAGTCCTACTGCAGGGTT 6177

 52646880 GTTGTAATGCTTAAAGAAGAAAAGTCATGCAAAGGATCTGGCACAACGCCTTTTCCATAA 52646939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     6178 GTTGTAATGCTTAAAGAAGAAAAGTCATGCAAAGGATCTGGCACAATGCCTTTTCCATAA 6237

 52646940 TAAGTGCTTAGTAATTGACAGATACTGTGATAACTTTTCAGGTTTCTCTCATGCCTTTGA 52646999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6238 TAAGTGCTTAGTAATTGACAGATACTGTGATAACTTTTCAGGTTTCTCTCATGCCTTTGA 6297

 52647000 CAACATTGCATTTTGCTTGCTCTATCTGTAGTCAGACACTTCTTAATATCTGTTTGCAGG 52647059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6298 CAACATTGCATTTTGCTTGCTCTATCTGTAGTCAGACACTTCTTAATATCTGTTTGCAGG 6357

 52647060 AAGAC 52647064
          |||||
     6358 AAGAC 6362

EXCISED REGION

 52658003 AGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTG 52658062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6363 AGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTG 6422

 52658063 GCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTAT 52658122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6423 GCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTAT 6482

 52658123 AAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGG 52658182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6483 AAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGG 6542

 52658183 GAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTG 52658242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6543 GAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTG 6602

 52658243 AAACACTGTCTCTGCTAAAAAACAAAACAAAACAAAACACCAAAAAATAGCTGGGCGTAG 52658302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6603 AAACACTGTCTCTGCTAAAAAACAAAACAAAACAAAACACCAAAAAATAGCTGGGCGTAG 6662

 52658303 TGGCGGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTTGGGAGGCGGTGGCAGGAGAATCATTTGAACCT 52658362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6663 TGGCGGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTTGGGAGGCGGTGGCAGGAGAATCATTTGAACCT 6722

 52658363 GGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGAT--------TGTGCCACTGCACTCTAACCTGG 52658414
          |||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||
     6723 GGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACTGTGCCACTGCACTCTAACCTGG 6782

 52658415 GCAACAGAGTTCAGAGTGAGACTCTGTCTC 52658444
          ||||||||||||||||||||||||||||||
     6783 GCAACAGAGTTCAGAGTGAGACTCTGTCTC 6812

Alignment time is 7.67511 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [52637064,52668002] =>     30939 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    3532] =>      3532 nucs 'mol-32-2ee6-085341_3532'

Score:        3531
Aligned:      3531        nucs
Identic:      3531 (100%) nucs =>      1341 (100%)      2190 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [52645814,52647154] EXCISED REGION [52647156,52649345]
 second seq =>  [       1,    1341] EXCISED REGION [    1343,    3532]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [52647155,52647155]
 second seq =>         1 nucs [1342,1342]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [52647152,52647154] to [52647156,52647158]
 second seq =>         3 nucs [1339,1341] to [1343,1345]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 52645814 TGAGCAGCATATTGTCATGATGTCAACTGGGAGGCAGTACAGCAGTTAGGAGCTTGGGTT 52645873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGAGCAGCATATTGTCATGATGTCAACTGGGAGGCAGTACAGCAGTTAGGAGCTTGGGTT 60

 52645874 CTGGAGCTAGAACAAGGTTTCTCAACCTCAGCACTACTCACATTTGAAGCCAGATTATTC 52645933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTGGAGCTAGAACAAGGTTTCTCAACCTCAGCACTACTCACATTTGAAGCCAGATTATTC 120

 52645934 TTTGTTAGGGAGGCTCATCCCGTGCCTCATAGGCTGATTAGCAGCATCCTGGCCTCTGCC 52645993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTGTTAGGGAGGCTCATCCCGTGCCTCATAGGCTGATTAGCAGCATCCTGGCCTCTGCC 180

 52645994 CACTAGACGCCGGTCACATTTCCCAGTCATGGCAACCAAAAATATCTCTAGGCATTGCTA 52646053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CACTAGACGCCGGTCACATTTCCCAGTCATGGCAACCAAAAATATCTCTAGGCATTGCTA 240

 52646054 AATGTCCCCTGGAGGACAAAATCTCTTACGTTTGAGAGGCACTGAGCTGAAATGTCTTTT 52646113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AATGTCCCCTGGAGGACAAAATCTCTTACGTTTGAGAGGCACTGAGCTGAAATGTCTTTT 300

 52646114 TGAATCCAGATTATCTAATTTTCTGTGCCTCAACTTTCTGGTAAAAGGAGACAGATAATA 52646173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGAATCCAGATTATCTAATTTTCTGTGCCTCAACTTTCTGGTAAAAGGAGACAGATAATA 360

 52646174 AATCTCGTAATTTTGTTAGGAAGATTACATGAGTTAATAGTTTTAAAGCAAGTACAATAG 52646233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AATCTCGTAATTTTGTTAGGAAGATTACATGAGTTAATAGTTTTAAAGCAAGTACAATAG 420

 52646234 CACCTGGAATATATTAAGTGCTTAATAAATATCACAAACATTAGTTATCATTATTCATGA 52646293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CACCTGGAATATATTAAGTGCTTAATAAATATCACAAACATTAGTTATCATTATTCATGA 480

 52646294 GTGAGAAAACTGACAGTCAGAGAGGTCAGTACACCCTCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCTAG 52646353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTGAGAAAACTGACAGTCAGAGAGGTCAGTACACCCTCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCTAG 540

 52646354 TAAGCAGCAGAGTCTGGCTTCAGGCAGAAATCTGACTTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGTC 52646413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TAAGCAGCAGAGTCTGGCTTCAGGCAGAAATCTGACTTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGTC 600

 52646414 TTACCAGGGACTTGTATTAGCATAGACTGTTAAGAATATGGGAAGATTTTTAAAATACAG 52646473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTACCAGGGACTTGTATTAGCATAGACTGTTAAGAATATGGGAAGATTTTTAAAATACAG 660

 52646474 TACTCAGAAAATTTCTCTTTGAAAGGCTGGAAGAGCAGATATCCACACAAGAAGGCAAAT 52646533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TACTCAGAAAATTTCTCTTTGAAAGGCTGGAAGAGCAGATATCCACACAAGAAGGCAAAT 720

 52646534 TAGACCTCAGGCCAGTGTGGAATTAAAGGTGTAGGGTTATCTGGTCAAGACTGTGTGTGT 52646593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TAGACCTCAGGCCAGTGTGGAATTAAAGGTGTAGGGTTATCTGGTCAAGACTGTGTGTGT 780

 52646594 GGATACAGGCTCCAACCCCTCCAGGCAAGGGCACTGTTTCCAACATCCACCCTTTCTCCT 52646653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GGATACAGGCTCCAACCCCTCCAGGCAAGGGCACTGTTTCCAACATCCACCCTTTCTCCT 840

 52646654 TTGACCTCTACCTTGACCTAAATTAACTATAAAAGGTCCTTCTTTTCTAGGACCCTACTA 52646713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTGACCTCTACCTTGACCTAAATTAACTATAAAAGGTCCTTCTTTTCTAGGACCCTACTA 900

 52646714 TAAATCAGTGAAATATTCAGGAAAAAAAGAACACCAAGAATGTTGGGATCCCAGTTAAAG 52646773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TAAATCAGTGAAATATTCAGGAAAAAAAGAACACCAAGAATGTTGGGATCCCAGTTAAAG 960

 52646774 ATCAAGATTCTCTACTGATAAGCTGTGTGATATGGAGTAAATCACTAAAGATCTTTGAAT 52646833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATCAAGATTCTCTACTGATAAGCTGTGTGATATGGAGTAAATCACTAAAGATCTTTGAAT 1020

 52646834 CTCTTCATTTGTAAAATGGGAATATTGGTAGTCCTACTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTAA 52646893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTCTTCATTTGTAAAATGGGAATATTGGTAGTCCTACTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTAA 1080

 52646894 AGAAGAAAAGTCATGCAAAGGATCTGGCACAACGCCTTTTCCATAATAAGTGCTTAGTAA 52646953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AGAAGAAAAGTCATGCAAAGGATCTGGCACAACGCCTTTTCCATAATAAGTGCTTAGTAA 1140

 52646954 TTGACAGATACTGTGATAACTTTTCAGGTTTCTCTCATGCCTTTGACAACATTGCATTTT 52647013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTGACAGATACTGTGATAACTTTTCAGGTTTCTCTCATGCCTTTGACAACATTGCATTTT 1200

 52647014 GCTTGCTCTATCTGTAGTCAGACACTTCTTAATATCTGTTTGCAGGAAGACAGAAAAATA 52647073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GCTTGCTCTATCTGTAGTCAGACACTTCTTAATATCTGTTTGCAGGAAGACAGAAAAATA 1260

 52647074 AAGGGAAGAATTGAGATTTCTTTGATCTATTCATACTGCTCATTAATATGTAGTGAGAAA 52647133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AAGGGAAGAATTGAGATTTCTTTGATCTATTCATACTGCTCATTAATATGTAGTGAGAAA 1320

 52647134 TACATACACACACACATACAC 52647154
          |||||||||||||||||||||
     1321 TACATACACACACACATACAC 1341

EXCISED REGION

 52647156 CACATGCATCCATTAGCAATTGTTTTTGCCCAACTCTAGTGTCTCGCAGTGTCTAGACTA 52647215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1343 CACATGCATCCATTAGCAATTGTTTTTGCCCAACTCTAGTGTCTCGCAGTGTCTAGACTA 1402

 52647216 AACAACAAACAAAAAAGGGGGGAGAGTGAGCTGGATTAAGCATTGAGGCACAGTGAAGAA 52647275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1403 AACAACAAACAAAAAAGGGGGGAGAGTGAGCTGGATTAAGCATTGAGGCACAGTGAAGAA 1462

 52647276 ATGGTCTGGGGCAAGCCCAGGGATGAATGTTAGGGGTTTCTCATAAACCTGAACCTGAAG 52647335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1463 ATGGTCTGGGGCAAGCCCAGGGATGAATGTTAGGGGTTTCTCATAAACCTGAACCTGAAG 1522

 52647336 AAAATCACCCTGCCAGCATATTGATCTTCTAGCTCTTCTTAACCTTTTTTTCTGTGATTC 52647395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1523 AAAATCACCCTGCCAGCATATTGATCTTCTAGCTCTTCTTAACCTTTTTTTCTGTGATTC 1582

 52647396 AGGAATTCATAATGATAGAAAATATTATACTAAAGAAGAAAAAAAGAGGGAGAATAAGTA 52647455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1583 AGGAATTCATAATGATAGAAAATATTATACTAAAGAAGAAAAAAAGAGGGAGAATAAGTA 1642

 52647456 AGTGATAGATGGATGCATCAGGGTGTAAAGTTAGCAAGTAAGGCTGTTGAAGTGTCAGAG 52647515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1643 AGTGATAGATGGATGCATCAGGGTGTAAAGTTAGCAAGTAAGGCTGTTGAAGTGTCAGAG 1702

 52647516 TGAATATAAATGAATTGTGGGAATGGTCCATGCCAGGAGAAGAGGGTATGGTTGACAAAA 52647575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1703 TGAATATAAATGAATTGTGGGAATGGTCCATGCCAGGAGAAGAGGGTATGGTTGACAAAA 1762

 52647576 AGGGAAATGCTAAGATTCAAAACAGGGAAGGGCTTTTCAAAATGCCAAGAGCACCAACTT 52647635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1763 AGGGAAATGCTAAGATTCAAAACAGGGAAGGGCTTTTCAAAATGCCAAGAGCACCAACTT 1822

 52647636 ATATCTTTCAGTTTAATTCCTCTCTTCCTTACCCACTGGCTGGAAAGCAAAGGAGCTAGT 52647695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1823 ATATCTTTCAGTTTAATTCCTCTCTTCCTTACCCACTGGCTGGAAAGCAAAGGAGCTAGT 1882

 52647696 GGTAAGTAAGAGTGTTATAGCCAGAGAAAAAGTCTTCAAAAAACACAAAGTACTTTCCAT 52647755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1883 GGTAAGTAAGAGTGTTATAGCCAGAGAAAAAGTCTTCAAAAAACACAAAGTACTTTCCAT 1942

 52647756 GGACAACCTTTTTTATTTTAAAGTGCCAATATGTTGCTTTGAAAAAGAATAAATTCCTTA 52647815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1943 GGACAACCTTTTTTATTTTAAAGTGCCAATATGTTGCTTTGAAAAAGAATAAATTCCTTA 2002

 52647816 CATCCAGGTATCTGGACTAGACTTCAGTGCATTTAGTGATTATAGCAAATCCAAACAGTA 52647875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2003 CATCCAGGTATCTGGACTAGACTTCAGTGCATTTAGTGATTATAGCAAATCCAAACAGTA 2062

 52647876 GCTTTTGATATCAGAGAATGGGTAAAGTGTTTTTGACAATTTCTAAGAACTTAGAGTTCT 52647935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2063 GCTTTTGATATCAGAGAATGGGTAAAGTGTTTTTGACAATTTCTAAGAACTTAGAGTTCT 2122

 52647936 TCGGTGATACGTTCCATGCAACTGAAGCTCTGCTCTCCAAATTTAGGTGGGTACATACCC 52647995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2123 TCGGTGATACGTTCCATGCAACTGAAGCTCTGCTCTCCAAATTTAGGTGGGTACATACCC 2182

 52647996 AAGTCCATCACCTGGGGCTTCTATTTCCTTTGCTCAGATGCTCACCTCCTAGGTGGGCAC 52648055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2183 AAGTCCATCACCTGGGGCTTCTATTTCCTTTGCTCAGATGCTCACCTCCTAGGTGGGCAC 2242

 52648056 CTGACATAAGATAGACTAATAAAAATAAGTCCTGTAACTTTTGATACTCCTATTAAAAAA 52648115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2243 CTGACATAAGATAGACTAATAAAAATAAGTCCTGTAACTTTTGATACTCCTATTAAAAAA 2302

 52648116 GAGTTGCAAACCAATAGGAGGTACACTTGAGAATCAGCACAAATGAAAGTAGAACCTGGA 52648175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2303 GAGTTGCAAACCAATAGGAGGTACACTTGAGAATCAGCACAAATGAAAGTAGAACCTGGA 2362

 52648176 AATCCAGGAAGCAGATACCCAATCATGTCATTTAAACATTTAGATCCAGCTGTGCCTGAA 52648235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2363 AATCCAGGAAGCAGATACCCAATCATGTCATTTAAACATTTAGATCCAGCTGTGCCTGAA 2422

 52648236 GCTGAACTTTAGCATTACATAAGCCAATAAATCACTCTTCCCCAACTTACGCCAGTTGAA 52648295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2423 GCTGAACTTTAGCATTACATAAGCCAATAAATCACTCTTCCCCAACTTACGCCAGTTGAA 2482

 52648296 ATTGAATACATACTCAGTGACTTTGAGAGAATTCCAGGGAATTGGTCAGTCCCTGTTTCA 52648355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2483 ATTGAATACATACTCAGTGACTTTGAGAGAATTCCAGGGAATTGGTCAGTCCCTGTTTCA 2542

 52648356 CTTGTAAATACACAGCAATCAAGCCTACCAAATCTATGATTGATTGGGGTGTCTGAAAGA 52648415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2543 CTTGTAAATACACAGCAATCAAGCCTACCAAATCTATGATTGATTGGGGTGTCTGAAAGA 2602

 52648416 GATGGAGGGAATGGAATCAACCTGAAAAACATATTTCAGGAGTTCATCCCTGAAAACTTC 52648475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2603 GATGGAGGGAATGGAATCAACCTGAAAAACATATTTCAGGAGTTCATCCCTGAAAACTTC 2662

 52648476 CCCAACCTAGCTAGAGGGGCCAACATTCAAATTCAGGAAATGCAGAGAACCCCAGTAAGA 52648535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2663 CCCAACCTAGCTAGAGGGGCCAACATTCAAATTCAGGAAATGCAGAGAACCCCAGTAAGA 2722

 52648536 TACTCCACAAAAAGATCTTCCCCAAGACATCATCATCAGATTCTCCAAAGTTGAAATGTA 52648595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2723 TACTCCACAAAAAGATCTTCCCCAAGACATCATCATCAGATTCTCCAAAGTTGAAATGTA 2782

 52648596 AGAAAAAATGCTAAAGGCAACTAGAGTGAAAGGCCCGGTCACCTAAAAAGGGAAGCACAG 52648655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2783 AGAAAAAATGCTAAAGGCAACTAGAGTGAAAGGCCCGGTCACCTAAAAAGGGAAGCACAG 2842

 52648656 ACTTACAGTGGACCTCTCACTGGTAACCCTACAAGCCAGAAGAGATTGAGGACCAATATT 52648715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2843 ACTTACAGTGGACCTCTCACTGGTAACCCTACAAGCCAGAAGAGATTGAGGACCAATATT 2902

 52648716 CAACATTCTTAAACAAAAAGAATTCCAACCCAGAATTTTATATCTGACTAAACTAAGCTT 52648775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2903 CAACATTCTTAAACAAAAAGAATTCCAACCCAGAATTTTATATCTGACTAAACTAAGCTT 2962

 52648776 CATAAGCAAAAGAGAAATAAGATCATTTTCAGACAAGCAAATGCTAAGGGAATTTGTGAC 52648835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2963 CATAAGCAAAAGAGAAATAAGATCATTTTCAGACAAGCAAATGCTAAGGGAATTTGTGAC 3022

 52648836 CATTAGACCTTCCTTGCAACAGTTCCTAAAGGAAGCACTAAATATGGAAAGACCATTACC 52648895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3023 CATTAGACCTTCCTTGCAACAGTTCCTAAAGGAAGCACTAAATATGGAAAGACCATTACC 3082

 52648896 AGACACTACAAAACACACTGAAGTACACAGACCAGTGACATTGTAAAGCAACTACATAAC 52648955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3083 AGACACTACAAAACACACTGAAGTACACAGACCAGTGACATTGTAAAGCAACTACATAAC 3142

 52648956 AAGTCTGCAAAATAACCAGCCAACATCATGATGACGGTATCAAATCGACACATAGCAACA 52649015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3143 AAGTCTGCAAAATAACCAGCCAACATCATGATGACGGTATCAAATCGACACATAGCAACA 3202

 52649016 CTAACCTTAAATGTAAATGGACTAAATGATCCCATTAAAAGACATAAAGTGGCAGGCTGG 52649075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3203 CTAACCTTAAATGTAAATGGACTAAATGATCCCATTAAAAGACATAAAGTGGCAGGCTGG 3262

 52649076 ATAAAGAACCAAGAACCATTGGTATACTGTCTTCAAGAGACCCATCTCCTATGCAGTGAC 52649135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3263 ATAAAGAACCAAGAACCATTGGTATACTGTCTTCAAGAGACCCATCTCCTATGCAGTGAC 3322

 52649136 ACACATAGGTTCAAGATAAAGGGATGGGGAAAAATCTACCAAGCAAATAGAAAACAGAAT 52649195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3323 ACACATAGGTTCAAGATAAAGGGATGGGGAAAAATCTACCAAGCAAATAGAAAACAGAAT 3382

 52649196 AAAACAGGGGTTGCAATCCTAGTTGCCGTCAAAACAGACTTTAAACCAACAAAGGTTAAA 52649255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3383 AAAACAGGGGTTGCAATCCTAGTTGCCGTCAAAACAGACTTTAAACCAACAAAGGTTAAA 3442

 52649256 AGAAAAAAATATGGGCATTGCATAAGGATAAAGTGTTAAATTAAACAAGAAGATCTAACT 52649315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3443 AGAAAAAAATATGGGCATTGCATAAGGATAAAGTGTTAAATTAAACAAGAAGATCTAACT 3502

 52649316 ATCCTAAGTATATATGCACCAAACACAGGA 52649345
          ||||||||||||||||||||||||||||||
     3503 ATCCTAAGTATATATGCACCAAACACAGGA 3532

Alignment time is 3.79128 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [52637064,52668002] =>     30939 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    8027] =>      8027 nucs 'mol-32-2f12-102056_8027'

Score:        7690
Aligned:      8039        nucs
Identic:      7959 ( 99%) nucs =>      2998 (100%)      4961 ( 99%)
Gaps:           65 (  1%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [52644060,52647064] EXCISED REGION [52658003,52662983]
 second seq =>  [       1,    3005] EXCISED REGION [    3006,    8027]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>     10938 nucs [52647065,52658002]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         6 nucs [52647065,52647070] to [52658003,52658008]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [52647065,52647067] to [52658000,52658002]
 second seq =>         0 nucs

 52644060 AGTGGCACTTAACTTTATTCCCAAGTTTTGAAAAATATTGTTATTTAAAAAGTCTGTTAA 52644119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGTGGCACTTAACTTTATTCCCAAGTTTTGAAAAATATTGTTATTTAAAAAGTCTGTTAA 60

 52644120 CCAAGGAAATGCATGCCCTAAACCTATAATGTATCAAGTTTTACTTCCTTCTTCTTTTAA 52644179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCAAGGAAATGCATGCCCTAAACCTATAATGTATCAAGTTTTACTTCCTTCTTCTTTTAA 120

 52644180 GGAGTTCTTTTCCTGCCTTGAATACAAACAGGCTCTCTCAAGGTTAAAAGCAAATGCTCT 52644239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGAGTTCTTTTCCTGCCTTGAATACAAACAGGCTCTCTCAAGGTTAAAAGCAAATGCTCT 180

 52644240 TTTTAGTGTCAAAAAGAGCTTGCCTTTCTTCGCTCAGGAAAAAAAGCAACTGATTCCAGG 52644299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTTTAGTGTCAAAAAGAGCTTGCCTTTCTTCGCTCAGGAAAAAAAGCAACTGATTCCAGG 240

 52644300 ATACCTTCTTTGAAAACCAACACAAAAAAACCCCCCAAAAAACAAAAAAAAAACCCAAAA 52644359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATACCTTCTTTGAAAACCAACACAAAAAAACCCCCCAAAAAACAAAAAAAAAACCCAAAA 300

 52644360 CCCCTAGTTTTTACAAAGGTTTATTACTCCTACTTGTTGGAAAAGAATTACTACATAAAA 52644419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCCCTAGTTTTTACAAAGGTTTATTACTCCTACTTGTTGGAAAAGAATTACTACATAAAA 360

 52644420 GAGTCTGCCCAGAGCTGTAAAATCTCCTTATTCAAACACACACCTTAGAGCAAAAGATGG 52644479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GAGTCTGCCCAGAGCTGTAAAATCTCCTTATTCAAACACACACCTTAGAGCAAAAGATGG 420

 52644480 TTAAATATCAATTCAGGCTATTAACAGTAAGGGAC---GAAATGTGTTCCAACAAAACTC 52644536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||
      421 TTAAATATCAATTCAGGCTATTAACAGTAAGG---AATGAAATGTGTTCCAACAAAACTC 477

 52644537 TGCATGTCAACAAACTACAGAGACTAGGTAACATCTTTTAGGAATCATTTTTATTCCACT 52644596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      478 TGCATGTCAACAAACTACAGAGACTAGGTAACATCTTTTAGGAATCATTTTTATTCCACT 537

 52644597 AATGCCTTTTCCTCCAGAATCCACTGATCGTAAACGCAACCTGTCTACTTCCGCCTTTGA 52644656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      538 AATGCCTTTTCCTCCAGAATCCACTGATCGTAAACGCAACCTGTCTACTTCCGCCTTTGA 597

 52644657 AAAATGGATGGACAAATTCATCTGCATGTAACTCACCTCCTCTTTTCTTTTACATAAAAC 52644716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      598 AAAATGGATGGACAAATTCATCTGCATGTAACTCACCTCCTCTTTTCTTTTACATAAAAC 657

 52644717 AGATGCCACAGCTGTTATTGTTCTTCACACAGAAGTTTCTACCCAGAGAAACATCAGGAT 52644776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      658 AGATGCCACAGCTGTTATTGTTCTTCACACAGAAGTTTCTACCCAGAGAAACATCAGGAT 717

 52644777 GACACTCTGCTGCAATGTGCTATTTGTTCTAGAGGGGTCAACAGCTTGCCACCTTGCCTA 52644836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      718 GACACTCTGCTGCAATGTGCTATTTGTTCTAGAGGGGTCAACAGCTTGCCACCTTGCCTA 777

 52644837 GGCCCAGGGTGACTGCATATGTGCAGTGGTCTTATCCCATTAGCGCCCCCGAGCATGCAT 52644896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      778 GGCCCAGGGTGACTGCATATGTGCAGTGGTCTTATCCCATTAGCGCCCCCGAGCATGCAT 837

 52644897 TCAGAACCAAGTGGATACACCTTGGCACACTTACCTTCCCTGCAGGGACATCATCGGACT 52644956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      838 TCAGAACCAAGTGGATACACCTTGGCACACTTACCTTCCCTGCAGGGACATCATCGGACT 897

 52644957 GCCCTGATAAGCCAGGAACCTCATCCACCTTGTCTTGATGCTCTGCCCTCTTGGCTTCCT 52645016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      898 GCCCTGATAAGCCAGGAACCTCATCCACCTTGTCTTGATGCTCTGCCCTCTTGGCTTCCT 957

 52645017 GTTGGCTGTCACCTGGCACCTTTTCCTGTCCCTTGTCCAGCTTGAAGAATTTGTCAAAAA 52645076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      958 GTTGGCTGTCACCTGGCACCTTTTCCTGTCCCTTGTCCAGCTTGAAGAATTTGTCAAAAA 1017

 52645077 AGCTGGAGTCCTTGGGCTTGGAGGGAGCTTCTCCTCCTGCTCCCCCTGTCTCAGGTGGGA 52645136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1018 AGCTGGAGTCCTTGGGCTTGGAGGGAGCTTCTCCTCCTGCTCCCCCTGTCTCAGGTGGGA 1077

 52645137 GAAGCGTGGGATCCCTGGCGGCAGAGAGGACCTTGTCTTGGGCCGGGGCGTGCCCTGGGG 52645196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1078 GAAGCGTGGGATCCCTGGCGGCAGAGAGGACCTTGTCTTGGGCCGGGGCGTGCCCTGGGG 1137

 52645197 TTTTATCTGTGTCCTGCCCCGGTCCAGCTGCCACCGGAAGTGTCCAGCTCTCACTTGGGT 52645256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1138 TTTTATCTGTGTCCTGCCCCGGTCCAGCTGCCACCGGAAGTGTCCAGCTCTCACTTGGGT 1197

 52645257 CTTTGTTCGCTGGAGCTTTATTGGAGCTGACATCAAGCTTCACTGATCCAAGGGATGAAT 52645316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1198 CTTTGTTCGCTGGAGCTTTATTGGAGCTGACATCAAGCTTCACTGATCCAAGGGATGAAT 1257

 52645317 CTGCGGCTTGGTCTCCGGTACGTCCTGGTACAGGCCGAGAGAGCATCAAGAAAAAACGAG 52645376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1258 CTGCGGCTTGGTCTCCGGTACGTCCTGGTACAGGCCGAGAGAGCATCAAGAAAAAACGAG 1317

 52645377 ATTTAGCAGCTGGTGCCTCGGGTTTGGCCTCTTTCCCAAGATTCTTTCCGTTGGCATCCG 52645436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1318 ATTTAGCAGCTGGTGCCTCGGGTTTGGCCTCTTTCCCAAGATTCTTTCCGTTGGCATCCG 1377

 52645437 CAACAGCACTTATCTCCGTTGTCTCGGGGGAAGAAGTGGCCACATTATCCGTCTTGACAC 52645496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1378 CAACAGCACTTATCTCCGTTGTCTCGGGGGAAGAAGTGGCCACATTATCCGTCTTGACAC 1437

 52645497 TTATTCCCAAGTCGACTGTAAACACAAACATAAACAGTGGTTATTCAGCCAAGCCGGGAA 52645556
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     1438 TTATTCCCAAGTCGACTGTAAACACAAACATAAACAGCGGTTATTCAGCCAAGCCGGGAA 1497

 52645557 ATTCAGGCACTAATAATGGACTCCAGACATTTTTTATACAAAAGCCATACTGCATACTGG 52645616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1498 ATTCAGGCACTAATAATGGACTCCAGACATTTTTTATACAAAAGCCATACTGCATACTGG 1557

 52645617 AACTGTGTTGTTCTCTGGTCATTCTGAAAGGCAGAAGTTAGCTCTCTACATCTCCTTGGA 52645676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1558 AACTGTGTTGTTCTCTGGTCATTCTGAAAGGCAGAAGTTAGCTCTCTACATCTCCTTGGA 1617

 52645677 CCCTGCTTTTCTTGGGAGAGGAGAAGGCAAGGTTGGTGAGGAGGGAAAGCTACTTAATGG 52645736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1618 CCCTGCTTTTCTTGGGAGAGGAGAAGGCAAGGTTGGTGAGGAGGGAAAGCTACTTAATGG 1677

 52645737 AAAGTCACTAGCTGCCAGGTGTGGAATGAGTGATATTCAATGTTAATTAATCTTCTTTTA 52645796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1678 AAAGTCACTAGCTGCCAGGTGTGGAATGAGTGATATTCAATGTTAATTAATCTTCTTTTA 1737

 52645797 TCTGTGTAAGAACTCCGTGAGCAGCATATTGTCATGATGTCAACTGGGAGGCAGTACAGC 52645856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1738 TCTGTGTAAGAACTCCGTGAGCAGCATATTGTCATGATGTCAACTGGGAGGCAGTACAGC 1797

 52645857 AGTTAGGAGCTTGGGTTCTGGAGCTAGAACAAGGTTTCTCAACCTCAGCACTACTCACAT 52645916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1798 AGTTAGGAGCTTGGGTTCTGGAGCTAGAACAAGGTTTCTCAACCTCAGCACTACTCACAT 1857

 52645917 TTGAAGCCAGATTATTCTTTGTTAGGGAGGCTCATCCCGTGCCTCATAGGCTGATTAGCA 52645976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1858 TTGAAGCCAGATTATTCTTTGTTAGGGAGGCTCATCCCGTGCCTCATAGGCTGATTAGCA 1917

 52645977 GCATCCTGGCCTCTGCCCACTAGACGCCGGTCACATTTCCCAGTCATGGCAACCAAAAAT 52646036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1918 GCATCCTGGCCTCTGCCCACTAGACGCCGGTCACATTTCCCAGTCATGGCAACCAAAAAT 1977

 52646037 ATCTCTAGGCATTGCTAAATGTCCCCTGGAGGACAAAATCTCTTACGTTTGAGAGGCACT 52646096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1978 ATCTCTAGGCATTGCTAAATGTCCCCTGGAGGACAAAATCTCTTACGTTTGAGAGGCACT 2037

 52646097 GAGCTGAAATGTCTTTTTGAATCCAGATTATCTAATTTTCTGTGCCTCAACTTTCTGGTA 52646156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2038 GAGCTGAAATGTCTTTTTGAATCCAGATTATCTAATTTTCTGTGCCTCAACTTTCTGGTA 2097

 52646157 AAAGGAGACAGATAATAAATCTCGTAATTTTGTTAGGAAGATTACATGAGTTAATAGTTT 52646216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2098 AAAGGAGACAGATAATAAATCTCGTAATTTTGTTAGGAAGATTACATGAGTTAATAGTTT 2157

 52646217 TAAAGCAAGTACAATAGCACCTGGAATATATTAAGTGCTTAATAAATATCACAAACATTA 52646276
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2158 TAAAGCAAGTACAATAGCGCCTGGAATATATTAAGTGCTTAATAAATATCACAAACATTA 2217

 52646277 GTTATCATTATTCATGAGTGAGAAAACTGACAGTCAGAGAGGTCAGTACACCCTCCCCTG 52646336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2218 GTTATCATTATTCATGAGTGAGAAAACTGACAGTCAGAGAGGTCAGTACACCCTCCCCTG 2277

 52646337 GCTGCCCAGTAAGCTAGTAAGCAGCAGAGTCTGGCTTCAGGCAGAAATCTGACTTCTAAG 52646396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2278 GCTGCCCAGTAAGCTAGTAAGCAGCAGAGTCTGGCTTCAGGCAGAAATCTGACTTCTAAG 2337

 52646397 TTCATGCGCTCTCTGTCTTACCAGGGACTTGTATTAGCATAGACTGTTAAGAATATGGGA 52646456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2338 TTCATGCGCTCTCTGTCTTACCAGGGACTTGTATTAGCATAGACTGTTAAGAATATGGGA 2397

 52646457 AGATTTTTAAAATACAGTACTCAGAAAATTTCTCTTTGAAAGGCTGGAAGAGCAGATATC 52646516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2398 AGATTTTTAAAATACAGTACTCAGAAAATTTCTCTTTGAAAGGCTGGAAGAGCAGATATC 2457

 52646517 CACACAAGAAGGCAAATTAGACCTCAGGCCAGTGTGGAATTAAAGGTGTAGGGTTATCTG 52646576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2458 CACACAAGAAGGCAAATTAGACCTCAGGCCAGTGTGGAATTAAAGGTGTAGGGTTATCTG 2517

 52646577 GTCAAGACTGTGTGTGTGGATACAGGCTCCAACCCCTCCAGGCAAGGGCACTGTTTCCAA 52646636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     2518 GTCAAGACTGTGTGTGTGGATACAGGCTCCAACCCCTCCAGGCAAGGGCAATGTTTCCAA 2577

 52646637 CATCCACCCTTTCTCCTTTGACCTCTACCTTGACCTAAATTAACTATAAAAGGTCCTTCT 52646696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2578 CATCCACCCTTTCTCCTTTGACCTCTACCTTGACCTAAATTAACTATAAAAGGTCCTTCT 2637

 52646697 TTTCTAGGACCCTACTATAAATCAGTGAAATATTCAGGAAAAAAAGAACACCAAGAATGT 52646756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2638 TTTCTAGGACCCTACTATAAATCAGTGAAATATTCAGGAAAAAAAGAACACCAAGAATGT 2697

 52646757 TGGGATCCCAGTTAAAGATCAAGATTCTCTACTGATAAGCTGTGTGATATGGAGTAAATC 52646816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2698 TGGGATCCCAGTTAAAGATCAAGATTCTCTACTGATAAGCTGTGTGATATGGAGTAAATC 2757

 52646817 ACTAAAGATCTTTGAATCTCTTCATTTGTAAAATGGGAATATTGGTAGTCCTACTGCAGG 52646876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2758 ACTAAAGATCTTTGAATCTCTTCATTTGTAAAATGGGAATATTGGTAGTCCTACTGCAGG 2817

 52646877 GTTGTTGTAATGCTTAAAGAAGAAAAGTCATGCAAAGGATCTGGCACAACGCCTTTTCCA 52646936
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     2818 GTTGTTGTAATGCTTAAAGAAGAAAAGTCATGCAAAGGATCTGGCACAATGCCTTTTCCA 2877

 52646937 TAATAAGTGCTTAGTAATTGACAGATACTGTGATAACTTTTCAGGTTTCTCTCATGCCTT 52646996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2878 TAATAAGTGCTTAGTAATTGACAGATACTGTGATAACTTTTCAGGTTTCTCTCATGCCTT 2937

 52646997 TGACAACATTGCATTTTGCTTGCTCTATCTGTAGTCAGACACTTCTTAATATCTGTTTGC 52647056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2938 TGACAACATTGCATTTTGCTTGCTCTATCTGTAGTCAGACACTTCTTAATATCTGTTTGC 2997

 52647057 AGGAAGAC 52647064
          ||||||||
     2998 AGGAAGAC 3005

EXCISED REGION

 52658003 AGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTG 52658062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3006 AGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTG 3065

 52658063 GCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTAT 52658122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3066 GCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTAT 3125

 52658123 AAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGG 52658182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3126 AAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGG 3185

 52658183 GAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTG 52658242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3186 GAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTG 3245

 52658243 AAACACTGTCTCTGCTAAAAAACAAAACAAAACAAAACACCAAAAAATAGCTGGGCGTAG 52658302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3246 AAACACTGTCTCTGCTAAAAAACAAAACAAAACAAAACACCAAAAAATAGCTGGGCGTAG 3305

 52658303 TGGCGGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTTGGGAGGCGGTGGCAGGAGAATCATTTGAACCT 52658362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3306 TGGCGGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTTGGGAGGCGGTGGCAGGAGAATCATTTGAACCT 3365

 52658363 GGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGAT--------TGTGCCACTGCACTCTAACCTGG 52658414
          |||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||
     3366 GGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACTGTGCCACTGCACTCTAACCTGG 3425

 52658415 GCAACAGAGTTCAGAGTGAGACTCTGTCTCCCCC-------------------------- 52658448
          ||||||||||||||||||||||||||||||                              
     3426 GCAACAGAGTTCAGAGTGAGACTCTGTCTC----ACCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 3481

 52658449 -------AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAACAGCCATATAGATCGTCGGTGGGAGTGT 52658501
                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3482 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAACAGCCATATAGATCGTCGGTGGGAGTGT 3541

 52658502 AATTTGGCCACTTCTTTGGAAAATAGCTCAGTAATATCTATTAATACTTAAAATTTCACA 52658561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3542 AATTTGGCCACTTCTTTGGAAAATAGCTCAGTAATATCTATTAATACTTAAAATTTCACA 3601

 52658562 AACACTGTAAGTCTAACTTCCACTTCTAAAATGTTATCCTAGAAATAAAATTGCATAGGG 52658621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3602 AACACTGTAAGTCTAACTTCCACTTCTAAAATGTTATCCTAGAAATAAAATTGCATAGGG 3661

 52658622 GTACAAAGGCTTACGTATGGAACTATTTGCTGGACTACTGTAGTTGTGGCAAAAAACTGG 52658681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3662 GTACAAAGGCTTACGTATGGAACTATTTGCTGGACTACTGTAGTTGTGGCAAAAAACTGG 3721

 52658682 AAATGACCTAAACGCTTATTAGTAGAAACCTGGTTAAATAAATTATCATATGTCCTTGAG 52658741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3722 AAATGACCTAAACGCTTATTAGTAGAAACCTGGTTAAATAAATTATCATATGTCCTTGAG 3781

 52658742 GACACAGGGACACAAAGAGGGGAATGACAGGCACTGAGCCTACTTGAGGGTGGGAGGAGG 52658801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3782 GACACAGGGACACAAAGAGGGGAATGACAGGCACTGAGCCTACTTGAGGGTGGGAGGAGG 3841

 52658802 AAGTCGATCAGAAAAAATAACTAGTGGGTACTAGGCTTAGTACCCGGGTGAAAAAATAAT 52658861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3842 AAGTCGATCAGAAAAAATAACTAGTGGGTACTAGGCTTAGTACCCGGGTGAAAAAATAAT 3901

 52658862 CTGTACAACAAACCCCCATGACATGAGTTTACCTTATAACAAACCTGCACATGTAATCTG 52658921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3902 CTGTACAACAAACCCCCATGACATGAGTTTACCTTATAACAAACCTGCACATGTAATCTG 3961

 52658922 AACCTAGATAAAAGTTTAAAAAAATAAATAATCATATGTCCCTACAATGAAATATTCCAC 52658981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     3962 AACCTAGATAAAAGTTTAAAAAAATAAATAATCATATGTCCCTATAATGAAATATTCCAC 4021

 52658982 AGGCATTAAAATTCCCCAAGGAATTTTAGTAAGGAAAGAAAAAGCTGTGCCCAACAGCAC 52659041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4022 AGGCATTAAAATTCCCCAAGGAATTTTAGTAAGGAAAGAAAAAGCTGTGCCCAACAGCAC 4081

 52659042 GTACAGTATGTTTCCATTTGTTTTTAAAAAATGGTGTCGGGAGGTTGAGGAGACAACTTA 52659101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4082 GTACAGTATGTTTCCATTTGTTTTTAAAAAATGGTGTCGGGAGGTTGAGGAGACAACTTA 4141

 52659102 TAAATAGACATGCCTGGGATACCTCTGGATATAAGAAACTGTAAAGTATTTACTTCTAAG 52659161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4142 TAAATAGACATGCCTGGGATACCTCTGGATATAAGAAACTGTAAAGTATTTACTTCTAAG 4201

 52659162 GAAGGAAATTTGGGATGGGGCTTGGGGAGCCATCAGAGTTAGGGTGGGGATTTTTTCTCT 52659221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4202 GAAGGAAATTTGGGATGGGGCTTGGGGAGCCATCAGAGTTAGGGTGGGGATTTTTTCTCT 4261

 52659222 GCCTTATCTTATTATGTATATCGCTCAGAATGTTTGCTATGTGTATGCACCTACCCCATC 52659281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4262 GCCTTATCTTATTATGTATATCGCTCAGAATGTTTGCTATGTGTATGCACCTACCCCATC 4321

 52659282 CATTAAGAAATGAAGAAATAATGAAAAGAAAAAATGAAAGTAGGGAACTAGAAATGAGAG 52659341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4322 CATTAAGAAATGAAGAAATAATGAAAAGAAAAAATGAAAGTAGGGAACTAGAAATGAGAG 4381

 52659342 GTGGGATTCAAAGTGGACTGAACACTTGACCTATTTCCCAATTTGCCTAGGGCTGGCCCA 52659401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     4382 GTGGGATTCAAAGTGGACTGAACACTTGACCTATTTCCCAATTTGCCTGGGGCTGGCCCA 4441

 52659402 GCAGCGAGGCAGGTTCTAACCAATGAGCATCAGCTTTGAATGGAGGGGCTGATAGGCCAG 52659461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4442 GCAGCGAGGCAGGTTCTAACCAATGAGCATCAGCTTTGAATGGAGGGGCTGATAGGCCAG 4501

 52659462 GTGGGCCCTGCTTGCTGAGAGTGTCATGGCCTTAGGGACATCTCCATGTTGCAGAGTCTG 52659521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4502 GTGGGCCCTGCTTGCTGAGAGTGTCATGGCCTTAGGGACATCTCCATGTTGCAGAGTCTG 4561

 52659522 AGCCTCTGCTTGGCAAATTCAGAAAATCCAGCTTTTCTTTTTATATCACCTGGAGCTGAT 52659581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4562 AGCCTCTGCTTGGCAAATTCAGAAAATCCAGCTTTTCTTTTTATATCACCTGGAGCTGAT 4621

 52659582 GTAACTCTCAGAAGGCATTTTTAAGAGGACTCATGAATTAACCACATAGCCAACTTACTG 52659641
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4622 GTAACTCTCAGAACGCATTTTTAAGAGGACTCATGAATTAACCACATAGCCAACTTACTG 4681

 52659642 GCTTAAGACTACGTGACAGAAAGCTGCAAAGGGGGCCAGCCACTGGTAACATCCCACCAC 52659701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4682 GCTTAAGACTACGTGACAGAAAGCTGCAAAGGGGGCCAGCCACTGGTAACATCCCACCAC 4741

 52659702 TGTCCCTCTCTGTGGAAAACACAGATGGGATGCACATTGTGACGGGCAGGATGCCTGGAG 52659761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     4742 TGTCCCTCTCTGTGGAAAACACAGATGGGATGCACATTGTGATGGGCAGGATGCCTGGAG 4801

 52659762 AGCCCACAAATCTGCAAGCACAGCTGAAATTGGTTACAGGATTTCAATGTTTCATTGCTT 52659821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4802 AGCCCACAAATCTGCAAGCACAGCTGAAATTGGTTACAGGATTTCAATGTTTCATTGCTT 4861

 52659822 GAAGCTATGATAACTTGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGACGATGATTTTTT 52659881
          |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4862 GAAGCTATGATAACT---TGATGATGATGATGATGATGATGATGATGACGATGATTTTTT 4918

 52659882 TTATAGCCATCTTTTTAGAGGGATTTGAGGTAGGGAAAAAAATAAACCTCACACTATCGG 52659941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4919 TTATAGCCATCTTTTTAGAGGGATTTGAGGTAGGGAAAAAAATAAACCTCACACTATCGG 4978

 52659942 AGGTTGCCAACTATGAGGTCTGCTGATGGTTTGGCCAACACAGTGTTTATATTTTTTTGA 52660001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4979 AGGTTGCCAACTATGAGGTCTGCTGATGGTTTGGCCAACACAGTGTTTATATTTTTTTGA 5038

 52660002 ATTGGGAAATTTCATTTAAAAGTCCTAAAATCAGGCTGTTATTGAAATATCTTATTATTG 52660061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5039 ATTGGGAAATTTCATTTAAAAGTCCTAAAATCAGGCTGTTATTGAAATATCTTATTATTG 5098

 52660062 GCTCAGGGTTTCCCAGGGCAGCCATCCTTGAAGCTGTGTGGAGCCCTATAAACAAGGACG 52660121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     5099 GCTCAGGGTTTCCCAGGGCAGCCATCCTTGAAGCTGTGTGGAGCCCTATAAACAAGGAGG 5158

 52660122 CTTTCCAGTTCCCTGCAAACTCCATTTCATTCAGAGCCTTGAGCCAGTTCTTACATGGTC 52660181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5159 CTTTCCAGTTCCCTGCAAACTCCATTTCATTCAGAGCCTTGAGCCAGTTCTTACATGGTC 5218

 52660182 CTCAGACTTGAGCTAGTGCAAGAATACCCGGGAGGGGTTGTGGGAACAGATAGCTGGGCC 52660241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5219 CTCAGACTTGAGCTAGTGCAAGAATACCCGGGAGGGGTTGTGGGAACAGATAGCTGGGCC 5278

 52660242 CCACCCCCAGGGAAGGGGGTGTTTCTGACTCAGGAGGTCTGGGCTCCGGCTACAGAAACT 52660301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5279 CCACCCCCAGGGAAGGGGGTGTTTCTGACTCAGGAGGTCTGGGCTCCGGCTACAGAAACT 5338

 52660302 GCACATCTAACCGGTACCCAGGTGATGTGATGCTGCTGGCCCAGGGACAACTCTGCGAGT 52660361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5339 GCACATCTAACCGGTACCCAGGTGATGTGATGCTGCTGGCCCAGGGACAACTCTGCGAGT 5398

 52660362 CACTGCTATTGGGCACTGCTATTGCACCCACACAAGGAGGCAGGCTCTGCTTACATTTTT 52660421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5399 CACTGCTATTGGGCACTGCTATTGCACCCACACAAGGAGGCAGGCTCTGCTTACATTTTT 5458

 52660422 CAGTTCTTGTTCCCAGAAACATTTGCTCTTTGGGGTATGCTTTGCATATAATGGATCCTA 52660481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5459 CAGTTCTTGTTCCCAGAAACATTTGCTCTTTGGGGTATGCTTTGCATATAATGGATCCTA 5518

 52660482 CCCACTAATACAGTATGCTGCTTTTATTGATAAACTTCCAGAAACTTGAAGCGCACCTTA 52660541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     5519 CCCACTAATACAGTATGCTGCTTTTATTGATAAACTTCCAGATACTTGAAGCGCACCTTA 5578

 52660542 CCATTTCTTTGATCTCGCTGATTATTTTTATTTTTGTTAAATGAAAATTGTTGGTAAGTT 52660601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5579 CCATTTCTTTGATCTCGCTGATTATTTTTATTTTTGTTAAATGAAAATTGTTGGTAAGTT 5638

 52660602 CTTTTTGGTGTGGTAAAAGGATATGAAAAGCTGATTTTAAAAAAATGTCCACTCTAGGAT 52660661
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     5639 CTTTTTGGTGTGGTAAAAGGATATGAAAAACTGATTTTAAAAAAATGTCCACTCTAGGAT 5698

 52660662 TAGAATTGTAGGTGTGTTTATTCTATTTCAAGATCTGGTTAAAATGCACCTTGAGGAAAA 52660721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5699 TAGAATTGTAGGTGTGTTTATTCTATTTCAAGATCTGGTTAAAATGCACCTTGAGGAAAA 5758

 52660722 GAATTGAGTGCAGCTGTTGTTATTTCTCAATGCTGTTTCTCTTTTCATGTTTTTTTCATG 52660781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5759 GAATTGAGTGCAGCTGTTGTTATTTCTCAATGCTGTTTCTCTTTTCATGTTTTTTTCATG 5818

 52660782 TTGTCTCTTGGTCTGTCCTATCTCTCTTGGTCTATCCTCCAAGACAGAGATGAGTGATCT 52660841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5819 TTGTCTCTTGGTCTGTCCTATCTCTCTTGGTCTATCCTCCAAGACAGAGATGAGTGATCT 5878

 52660842 TGAAACCCTGCCCATGTTTTTATCTTTGGAGCCCAACTGTGCTGCCTTGTTTTCTTCTCC 52660901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5879 TGAAACCCTGCCCATGTTTTTATCTTTGGAGCCCAACTGTGCTGCCTTGTTTTCTTCTCC 5938

 52660902 ATCCAAAGAGGCAAAGAGAAAGTTGCATATTACTCAACAGCAGTTGCATGACAGTTAAAA 52660961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5939 ATCCAAAGAGGCAAAGAGAAAGTTGCATATTACTCAACAGCAGTTGCATGACAGTTAAAA 5998

 52660962 TCAGACTGTATGAGTCATGGAACAGTAAGTTGTGTCCAGAGTATCTGTCATGGTAAGTAC 52661021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5999 TCAGACTGTATGAGTCATGGAACAGTAAGTTGTGTCCAGAGTATCTGTCATGGTAAGTAC 6058

 52661022 AAAAAAGTCCTTAAAAATTTAAAACAGAAATGCCAATGTTTTATTTTTGAAAAATGTGAA 52661081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     6059 AAAAAAGTCCTTAAAAATTTAAAACAGAAATGCCAATGTTTTATTTCTGAAAAATGTGAA 6118

 52661082 GAAGAAATTTTCCGGCCGGGCGCGGTGGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGC 52661141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6119 GAAGAAATTTTCCGGCCGGGCGCGGTGGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGC 6178

 52661142 CAAGGTGGGCAGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACACAGTGCAA 52661201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6179 CAAGGTGGGCAGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACACAGTGCAA 6238

 52661202 CCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGATGCGGTGGCACGCGCCTGTAATCTC 52661261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6239 CCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGATGCGGTGGCACGCGCCTGTAATCTC 6298

 52661262 AGCTACTAGGGAGGCTGAGGCATGACAATCGCTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTG 52661321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6299 AGCTACTAGGGAGGCTGAGGCATGACAATCGCTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTG 6358

 52661322 AGCTGAGATCATACCACTGCACTCCAGCTTGGGCAGCGGAAGGAGACTCTGTCTC----- 52661376
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
     6359 AGCTGAGATCATACCACTGCACTCCAGCTTGGGCAGCGGAAGGAGACTCTGTCTCAAAAA 6418

 52661377 ---AAAAAAAAAAAGAAAAAAAGAAATTTTCTAAGTGTATTCCAAATAACTTTTAATATT 52661433
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     6419 AAAAAAAAAAAAAAGAAAAAAAGAAATTTTCTAAGTGTATTCCGAATAACTTTTAATATT 6478

 52661434 GGATAAACATTACGAGTTTAAAAATACTTATGCCAGAGGAGTGCTGTGACTCGTGCCTCT 52661493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6479 GGATAAACATTACGAGTTTAAAAATACTTATGCCAGAGGAGTGCTGTGACTCGTGCCTCT 6538

 52661494 AATCCCAGCAATGTGGGAGGCCAAGGAGGGACAGTCACTTGAGCCCAGGAGTTTGAGACC 52661553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6539 AATCCCAGCAATGTGGGAGGCCAAGGAGGGACAGTCACTTGAGCCCAGGAGTTTGAGACC 6598

 52661554 AGCCTGGATAACAAAGGGAGACCTCATCTTTACAAAAAAACTAAAAAATTAGCCAGGTGT 52661613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6599 AGCCTGGATAACAAAGGGAGACCTCATCTTTACAAAAAAACTAAAAAATTAGCCAGGTGT 6658

 52661614 GGTGGTGTGTGCCTGTGATCCCAGCTACACAGGAGGCTGAGGCAAGAGGATTCCTTGAGC 52661673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6659 GGTGGTGTGTGCCTGTGATCCCAGCTACACAGGAGGCTGAGGCAAGAGGATTCCTTGAGC 6718

 52661674 CCTGGAGGTCAAGGCTGCAGTGAGTGATGATCATGCCATTGCACTCCAGCTGGGTGACAG 52661733
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6719 CCTGGAGGTCAAGGCTGCAGTGAGCGATGATCATGCCATTGCACTCCAGCTGGGTGACAG 6778

 52661734 AGCAAGACCTCATCTCAAAAAAAAAAAA-AAAACAAAACAAAACAAAAAACTTACGCCCA 52661792
          |||||||||||||||||||||.||||   |||||||||||||||||||||||||||||||
     6779 AGCAAGACCTCATCTCAAAAACAAAA--CAAAACAAAACAAAACAAAAAACTTACGCCCA 6836

 52661793 GGTAAAAATTGTCAGAGAAAAATAAGAAAAAAACTGAATGCCCAAAATTAGCATAATGGC 52661852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6837 GGTAAAAATTGTCAGAGAAAAATAAGAAAAAAACTGAATGCCCAAAATTAGCATAATGGC 6896

 52661853 TGAATGAATTATAGTATGTCTATACCTTGAAGTACATTGTAGCTTTAAAAAAAATGAATT 52661912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6897 TGAATGAATTATAGTATGTCTATACCTTGAAGTACATTGTAGCTTTAAAAAAAATGAATT 6956

 52661913 AAAGTTATACCAGTTGAATTTGGAGTTGAGATGGGGAAGATTATTACAATTAAAAAAAAA 52661972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6957 AAAGTTATACCAGTTGAATTTGGAGTTGAGATGGGGAAGATTATTACAATTAAAAAAAAA 7016

 52661973 CAAACACTATTAATGGATGTGCTGGGAAATGTCTGTATGGGGCTAGTTAAAGTAAATTAA 52662032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7017 CAAACACTATTAATGGATGTGCTGGGAAATGTCTGTATGGGGCTAGTTAAAGTAAATTAA 7076

 52662033 AATAAAGACCAGACCTGAAGAATCCCTGAGCGGACAAAGCCTGTTAGACCACATAAATGA 52662092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7077 AATAAAGACCAGACCTGAAGAATCCCTGAGCGGACAAAGCCTGTTAGACCACATAAATGA 7136

 52662093 GCTAAACCTTGCTTGATTTGCAGACATAAGCAAAACAACTCGAACTGTTTCTTGTAAATG 52662152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7137 GCTAAACCTTGCTTGATTTGCAGACATAAGCAAAACAACTCGAACTGTTTCTTGTAAATG 7196

 52662153 CCTATGCTAAAGAAAAACAGAACTTGAGCTCAACCAATCAGAAACAGTCAACAAACTTAA 52662212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7197 CCTATGCTAAAGAAAAACAGAACTTGAGCTCAACCAATCAGAAACAGTCAACAAACTTAA 7256

 52662213 AATTATATAACTGGGTACCTTCCAATGAGATGATCAAATAAGGCAACTGTGTAATTGTAA 52662272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7257 AATTATATAACTGGGTACCTTCCAATGAGATGATCAAATAAGGCAACTGTGTAATTGTAA 7316

 52662273 CACATCAAACACATTTTATATTATGCCTCTGCATTTTCCCTTAATTCTGGCATGTAATGC 52662332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7317 CACATCAAACACATTTTATATTATGCCTCTGCATTTTCCCTTAATTCTGGCATGTAATGC 7376

 52662333 TTTGTCATCAAAACACTAATTCCCTTTTGGTTTTCTTTTCTCAAATTAATGAATTGCCTC 52662392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7377 TTTGTCATCAAAACACTAATTCCCTTTTGGTTTTCTTTTCTCAAATTAATGAATTGCCTC 7436

 52662393 TATTCAGATACACTCTTTGAAATTTTATTGTGTCTCAGATTTGTCTTTTACAAAGTATAG 52662452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7437 TATTCAGATACACTCTTTGAAATTTTATTGTGTCTCAGATTTGTCTTTTACAAAGTATAG 7496

 52662453 AACAAAGAGAAAAATATGAAAGAAGAAATATTAGGTTGTTAGCTTGGGTGTCCTTGGAGG 52662512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7497 AACAAAGAGAAAAATATGAAAGAAGAAATATTAGGTTGTTAGCTTGGGTGTCCTTGGAGG 7556

 52662513 GGGTAGGGAAGATGTGAGATGAGGAAGAAGCCAATAAGAAAAAGAAAAAGACAGGTTTCA 52662572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7557 GGGTAGGGAAGATGTGAGATGAGGAAGAAGCCAATAAGAAAAAGAAAAAGACAGGTTTCA 7616

 52662573 CCAAAACAACAATAACAGAAAATATGATTGCATTTATTCATATATGTTAATTGGTATGTA 52662632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7617 CCAAAACAACAATAACAGAAAATATGATTGCATTTATTCATATATGTTAATTGGTATGTA 7676

 52662633 TGTAAGTATATATGCATGTAAAAATAAAATACAAAGAATTAAAATGCATACTAATAGTTA 52662692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7677 TGTAAGTATATATGCATGTAAAAATAAAATACAAAGAATTAAAATGCATACTAATAGTTA 7736

 52662693 TTTCAGTTATCTATGGCTGTGTAACAAGCATCCCCAAAATGATTGACTTAACCACCATTT 52662752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7737 TTTCAGTTATCTATGGCTGTGTAACAAGCATCCCCAAAATGATTGACTTAACCACCATTT 7796

 52662753 TATTAGGTCATGATTCCATGCATTAAGAATTCAGGGCCGGGTGCGGTGGCTCATGCCTGT 52662812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7797 TATTAGGTCATGATTCCATGCATTAAGAATTCAGGGCCGGGTGCGGTGGCTCATGCCTGT 7856

 52662813 AATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGTGGATCACGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAG 52662872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7857 AATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGTGGATCACGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAG 7916

 52662873 CCTGCCCAACATAGTGGAACCCCGTCTGTACTAAAAATACAGAAGATTAGCTGGGTGTGG 52662932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7917 CCTGCCCAACATAGTGGAACCCCGTCTGTACTAAAAATACAGAAGATTAGCTGGGTGTGG 7976

 52662933 TGGCGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCA 52662983
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7977 TGGCGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCA 8027

Alignment time is 8.50243 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [52637064,52668002] =>     30939 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    3011] =>      3011 nucs 'mol-32-2f12-102056_3011'

Score:        2964
Aligned:      3008        nucs
Identic:      3004 (100%) nucs =>       452 (100%)      2552 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [52644060,52644511] EXCISED REGION [52644515,52647070]
 second seq =>  [       1,     452] EXCISED REGION [     456,    3011]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         3 nucs [52644512,52644514]
 second seq =>         3 nucs [453,455]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [52644512,52644513] to [52644515,52644516]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [52644511,52644511] to [52644515,52644515]
 second seq =>         1 nucs [452,452] to [456,456]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 52644060 AGTGGCACTTAACTTTATTCCCAAGTTTTGAAAAATATTGTTATTTAAAAAGTCTGTTAA 52644119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGTGGCACTTAACTTTATTCCCAAGTTTTGAAAAATATTGTTATTTAAAAAGTCTGTTAA 60

 52644120 CCAAGGAAATGCATGCCCTAAACCTATAATGTATCAAGTTTTACTTCCTTCTTCTTTTAA 52644179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCAAGGAAATGCATGCCCTAAACCTATAATGTATCAAGTTTTACTTCCTTCTTCTTTTAA 120

 52644180 GGAGTTCTTTTCCTGCCTTGAATACAAACAGGCTCTCTCAAGGTTAAAAGCAAATGCTCT 52644239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGAGTTCTTTTCCTGCCTTGAATACAAACAGGCTCTCTCAAGGTTAAAAGCAAATGCTCT 180

 52644240 TTTTAGTGTCAAAAAGAGCTTGCCTTTCTTCGCTCAGGAAAAAAAGCAACTGATTCCAGG 52644299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTTTAGTGTCAAAAAGAGCTTGCCTTTCTTCGCTCAGGAAAAAAAGCAACTGATTCCAGG 240

 52644300 ATACCTTCTTTGAAAACCAACACAAAAAAACCCCCCAAAAAACAAAAAAAAAACCCAAAA 52644359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATACCTTCTTTGAAAACCAACACAAAAAAACCCCCCAAAAAACAAAAAAAAAACCCAAAA 300

 52644360 CCCCTAGTTTTTACAAAGGTTTATTACTCCTACTTGTTGGAAAAGAATTACTACATAAAA 52644419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCCCTAGTTTTTACAAAGGTTTATTACTCCTACTTGTTGGAAAAGAATTACTACATAAAA 360

 52644420 GAGTCTGCCCAGAGCTGTAAAATCTCCTTATTCAAACACACACCTTAGAGCAAAAGATGG 52644479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GAGTCTGCCCAGAGCTGTAAAATCTCCTTATTCAAACACACACCTTAGAGCAAAAGATGG 420

 52644480 TTAAATATCAATTCAGGCTATTAACAGTAAGG 52644511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTAAATATCAATTCAGGCTATTAACAGTAAGG 452

EXCISED REGION

 52644515 GAAATGTGTTCCAACAAAACTCTGCATGTCAACAAACTACAGAGACTAGGTAACATCTTT 52644574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      456 GAAATGTGTTCCAACAAAACTCTGCATGTCAACAAACTACAGAGACTAGGTAACATCTTT 515

 52644575 TAGGAATCATTTTTATTCCACTAATGCCTTTTCCTCCAGAATCCACTGATCGTAAACGCA 52644634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      516 TAGGAATCATTTTTATTCCACTAATGCCTTTTCCTCCAGAATCCACTGATCGTAAACGCA 575

 52644635 ACCTGTCTACTTCCGCCTTTGAAAAATGGATGGACAAATTCATCTGCATGTAACTCACCT 52644694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      576 ACCTGTCTACTTCCGCCTTTGAAAAATGGATGGACAAATTCATCTGCATGTAACTCACCT 635

 52644695 CCTCTTTTCTTTTACATAAAACAGATGCCACAGCTGTTATTGTTCTTCACACAGAAGTTT 52644754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      636 CCTCTTTTCTTTTACATAAAACAGATGCCACAGCTGTTATTGTTCTTCACACAGAAGTTT 695

 52644755 CTACCCAGAGAAACATCAGGATGACACTCTGCTGCAATGTGCTATTTGTTCTAGAGGGGT 52644814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      696 CTACCCAGAGAAACATCAGGATGACACTCTGCTGCAATGTGCTATTTGTTCTAGAGGGGT 755

 52644815 CAACAGCTTGCCACCTTGCCTAGGCCCAGGGTGACTGCATATGTGCAGTGGTCTTATCCC 52644874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      756 CAACAGCTTGCCACCTTGCCTAGGCCCAGGGTGACTGCATATGTGCAGTGGTCTTATCCC 815

 52644875 ATTAGCGCCCCCGAGCATGCATTCAGAACCAAGTGGATACACCTTGGCACACTTACCTTC 52644934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      816 ATTAGCGCCCCCGAGCATGCATTCAGAACCAAGTGGATACACCTTGGCACACTTACCTTC 875

 52644935 CCTGCAGGGACATCATCGGACTGCCCTGATAAGCCAGGAACCTCATCCACCTTGTCTTGA 52644994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      876 CCTGCAGGGACATCATCGGACTGCCCTGATAAGCCAGGAACCTCATCCACCTTGTCTTGA 935

 52644995 TGCTCTGCCCTCTTGGCTTCCTGTTGGCTGTCACCTGGCACCTTTTCCTGTCCCTTGTCC 52645054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      936 TGCTCTGCCCTCTTGGCTTCCTGTTGGCTGTCACCTGGCACCTTTTCCTGTCCCTTGTCC 995

 52645055 AGCTTGAAGAATTTGTCAAAAAAGCTGGAGTCCTTGGGCTTGGAGGGAGCTTCTCCTCCT 52645114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      996 AGCTTGAAGAATTTGTCAAAAAAGCTGGAGTCCTTGGGCTTGGAGGGAGCTTCTCCTCCT 1055

 52645115 GCTCCCCCTGTCTCAGGTGGGAGAAGCGTGGGATCCCTGGCGGCAGAGAGGACCTTGTCT 52645174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1056 GCTCCCCCTGTCTCAGGTGGGAGAAGCGTGGGATCCCTGGCGGCAGAGAGGACCTTGTCT 1115

 52645175 TGGGCCGGGGCGTGCCCTGGGGTTTTATCTGTGTCCTGCCCCGGTCCAGCTGCCACCGGA 52645234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1116 TGGGCCGGGGCGTGCCCTGGGGTTTTATCTGTGTCCTGCCCCGGTCCAGCTGCCACCGGA 1175

 52645235 AGTGTCCAGCTCTCACTTGGGTCTTTGTTCGCTGGAGCTTTATTGGAGCTGACATCAAGC 52645294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1176 AGTGTCCAGCTCTCACTTGGGTCTTTGTTCGCTGGAGCTTTATTGGAGCTGACATCAAGC 1235

 52645295 TTCACTGATCCAAGGGATGAATCTGCGGCTTGGTCTCCGGTACGTCCTGGTACAGGCCGA 52645354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1236 TTCACTGATCCAAGGGATGAATCTGCGGCTTGGTCTCCGGTACGTCCTGGTACAGGCCGA 1295

 52645355 GAGAGCATCAAGAAAAAACGAGATTTAGCAGCTGGTGCCTCGGGTTTGGCCTCTTTCCCA 52645414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1296 GAGAGCATCAAGAAAAAACGAGATTTAGCAGCTGGTGCCTCGGGTTTGGCCTCTTTCCCA 1355

 52645415 AGATTCTTTCCGTTGGCATCCGCAACAGCACTTATCTCCGTTGTCTCGGGGGAAGAAGTG 52645474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1356 AGATTCTTTCCGTTGGCATCCGCAACAGCACTTATCTCCGTTGTCTCGGGGGAAGAAGTG 1415

 52645475 GCCACATTATCCGTCTTGACACTTATTCCCAAGTCGACTGTAAACACAAACATAAACAGT 52645534
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     1416 GCCACATTATCCGTCTTGACACTTATTCCCAAGTCGACTGTAAACACAAACATAAACAGC 1475

 52645535 GGTTATTCAGCCAAGCCGGGAAATTCAGGCACTAATAATGGACTCCAGACATTTTTTATA 52645594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1476 GGTTATTCAGCCAAGCCGGGAAATTCAGGCACTAATAATGGACTCCAGACATTTTTTATA 1535

 52645595 CAAAAGCCATACTGCATACTGGAACTGTGTTGTTCTCTGGTCATTCTGAAAGGCAGAAGT 52645654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1536 CAAAAGCCATACTGCATACTGGAACTGTGTTGTTCTCTGGTCATTCTGAAAGGCAGAAGT 1595

 52645655 TAGCTCTCTACATCTCCTTGGACCCTGCTTTTCTTGGGAGAGGAGAAGGCAAGGTTGGTG 52645714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1596 TAGCTCTCTACATCTCCTTGGACCCTGCTTTTCTTGGGAGAGGAGAAGGCAAGGTTGGTG 1655

 52645715 AGGAGGGAAAGCTACTTAATGGAAAGTCACTAGCTGCCAGGTGTGGAATGAGTGATATTC 52645774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1656 AGGAGGGAAAGCTACTTAATGGAAAGTCACTAGCTGCCAGGTGTGGAATGAGTGATATTC 1715

 52645775 AATGTTAATTAATCTTCTTTTATCTGTGTAAGAACTCCGTGAGCAGCATATTGTCATGAT 52645834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1716 AATGTTAATTAATCTTCTTTTATCTGTGTAAGAACTCCGTGAGCAGCATATTGTCATGAT 1775

 52645835 GTCAACTGGGAGGCAGTACAGCAGTTAGGAGCTTGGGTTCTGGAGCTAGAACAAGGTTTC 52645894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1776 GTCAACTGGGAGGCAGTACAGCAGTTAGGAGCTTGGGTTCTGGAGCTAGAACAAGGTTTC 1835

 52645895 TCAACCTCAGCACTACTCACATTTGAAGCCAGATTATTCTTTGTTAGGGAGGCTCATCCC 52645954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1836 TCAACCTCAGCACTACTCACATTTGAAGCCAGATTATTCTTTGTTAGGGAGGCTCATCCC 1895

 52645955 GTGCCTCATAGGCTGATTAGCAGCATCCTGGCCTCTGCCCACTAGACGCCGGTCACATTT 52646014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1896 GTGCCTCATAGGCTGATTAGCAGCATCCTGGCCTCTGCCCACTAGACGCCGGTCACATTT 1955

 52646015 CCCAGTCATGGCAACCAAAAATATCTCTAGGCATTGCTAAATGTCCCCTGGAGGACAAAA 52646074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1956 CCCAGTCATGGCAACCAAAAATATCTCTAGGCATTGCTAAATGTCCCCTGGAGGACAAAA 2015

 52646075 TCTCTTACGTTTGAGAGGCACTGAGCTGAAATGTCTTTTTGAATCCAGATTATCTAATTT 52646134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2016 TCTCTTACGTTTGAGAGGCACTGAGCTGAAATGTCTTTTTGAATCCAGATTATCTAATTT 2075

 52646135 TCTGTGCCTCAACTTTCTGGTAAAAGGAGACAGATAATAAATCTCGTAATTTTGTTAGGA 52646194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2076 TCTGTGCCTCAACTTTCTGGTAAAAGGAGACAGATAATAAATCTCGTAATTTTGTTAGGA 2135

 52646195 AGATTACATGAGTTAATAGTTTTAAAGCAAGTACAATAGCACCTGGAATATATTAAGTGC 52646254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     2136 AGATTACATGAGTTAATAGTTTTAAAGCAAGTACAATAGCGCCTGGAATATATTAAGTGC 2195

 52646255 TTAATAAATATCACAAACATTAGTTATCATTATTCATGAGTGAGAAAACTGACAGTCAGA 52646314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2196 TTAATAAATATCACAAACATTAGTTATCATTATTCATGAGTGAGAAAACTGACAGTCAGA 2255

 52646315 GAGGTCAGTACACCCTCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCTAGTAAGCAGCAGAGTCTGGCTTC 52646374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2256 GAGGTCAGTACACCCTCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCTAGTAAGCAGCAGAGTCTGGCTTC 2315

 52646375 AGGCAGAAATCTGACTTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGTCTTACCAGGGACTTGTATTAGC 52646434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2316 AGGCAGAAATCTGACTTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGTCTTACCAGGGACTTGTATTAGC 2375

 52646435 ATAGACTGTTAAGAATATGGGAAGATTTTTAAAATACAGTACTCAGAAAATTTCTCTTTG 52646494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2376 ATAGACTGTTAAGAATATGGGAAGATTTTTAAAATACAGTACTCAGAAAATTTCTCTTTG 2435

 52646495 AAAGGCTGGAAGAGCAGATATCCACACAAGAAGGCAAATTAGACCTCAGGCCAGTGTGGA 52646554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2436 AAAGGCTGGAAGAGCAGATATCCACACAAGAAGGCAAATTAGACCTCAGGCCAGTGTGGA 2495

 52646555 ATTAAAGGTGTAGGGTTATCTGGTCAAGACTGTGTGTGTGGATACAGGCTCCAACCCCTC 52646614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2496 ATTAAAGGTGTAGGGTTATCTGGTCAAGACTGTGTGTGTGGATACAGGCTCCAACCCCTC 2555

 52646615 CAGGCAAGGGCACTGTTTCCAACATCCACCCTTTCTCCTTTGACCTCTACCTTGACCTAA 52646674
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2556 CAGGCAAGGGCAATGTTTCCAACATCCACCCTTTCTCCTTTGACCTCTACCTTGACCTAA 2615

 52646675 ATTAACTATAAAAGGTCCTTCTTTTCTAGGACCCTACTATAAATCAGTGAAATATTCAGG 52646734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2616 ATTAACTATAAAAGGTCCTTCTTTTCTAGGACCCTACTATAAATCAGTGAAATATTCAGG 2675

 52646735 AAAAAAAGAACACCAAGAATGTTGGGATCCCAGTTAAAGATCAAGATTCTCTACTGATAA 52646794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2676 AAAAAAAGAACACCAAGAATGTTGGGATCCCAGTTAAAGATCAAGATTCTCTACTGATAA 2735

 52646795 GCTGTGTGATATGGAGTAAATCACTAAAGATCTTTGAATCTCTTCATTTGTAAAATGGGA 52646854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2736 GCTGTGTGATATGGAGTAAATCACTAAAGATCTTTGAATCTCTTCATTTGTAAAATGGGA 2795

 52646855 ATATTGGTAGTCCTACTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTAAAGAAGAAAAGTCATGCAAAGG 52646914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2796 ATATTGGTAGTCCTACTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTAAAGAAGAAAAGTCATGCAAAGG 2855

 52646915 ATCTGGCACAACGCCTTTTCCATAATAAGTGCTTAGTAATTGACAGATACTGTGATAACT 52646974
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2856 ATCTGGCACAATGCCTTTTCCATAATAAGTGCTTAGTAATTGACAGATACTGTGATAACT 2915

 52646975 TTTCAGGTTTCTCTCATGCCTTTGACAACATTGCATTTTGCTTGCTCTATCTGTAGTCAG 52647034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2916 TTTCAGGTTTCTCTCATGCCTTTGACAACATTGCATTTTGCTTGCTCTATCTGTAGTCAG 2975

 52647035 ACACTTCTTAATATCTGTTTGCAGGAAGACAGAAAA 52647070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2976 ACACTTCTTAATATCTGTTTGCAGGAAGACAGAAAA 3011

Alignment time is 4.18828 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [52637064,52668002] =>     30939 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    5277] =>      5277 nucs 'mol-32-2f1d-043264_5277'

Score:        5276
Aligned:      5276        nucs
Identic:      5276 (100%) nucs =>      5187 (100%)        89 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [52646145,52651331] EXCISED REGION [52651333,52651421]
 second seq =>  [       1,    5187] EXCISED REGION [    5189,    5277]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [52651332,52651332]
 second seq =>         1 nucs [5188,5188]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [5186,5187] to [5187,5188]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 52646145 AACTTTCTGGTAAAAGGAGACAGATAATAAATCTCGTAATTTTGTTAGGAAGATTACATG 52646204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AACTTTCTGGTAAAAGGAGACAGATAATAAATCTCGTAATTTTGTTAGGAAGATTACATG 60

 52646205 AGTTAATAGTTTTAAAGCAAGTACAATAGCACCTGGAATATATTAAGTGCTTAATAAATA 52646264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGTTAATAGTTTTAAAGCAAGTACAATAGCACCTGGAATATATTAAGTGCTTAATAAATA 120

 52646265 TCACAAACATTAGTTATCATTATTCATGAGTGAGAAAACTGACAGTCAGAGAGGTCAGTA 52646324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCACAAACATTAGTTATCATTATTCATGAGTGAGAAAACTGACAGTCAGAGAGGTCAGTA 180

 52646325 CACCCTCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCTAGTAAGCAGCAGAGTCTGGCTTCAGGCAGAAAT 52646384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CACCCTCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCTAGTAAGCAGCAGAGTCTGGCTTCAGGCAGAAAT 240

 52646385 CTGACTTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGTCTTACCAGGGACTTGTATTAGCATAGACTGTT 52646444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTGACTTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGTCTTACCAGGGACTTGTATTAGCATAGACTGTT 300

 52646445 AAGAATATGGGAAGATTTTTAAAATACAGTACTCAGAAAATTTCTCTTTGAAAGGCTGGA 52646504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAGAATATGGGAAGATTTTTAAAATACAGTACTCAGAAAATTTCTCTTTGAAAGGCTGGA 360

 52646505 AGAGCAGATATCCACACAAGAAGGCAAATTAGACCTCAGGCCAGTGTGGAATTAAAGGTG 52646564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGAGCAGATATCCACACAAGAAGGCAAATTAGACCTCAGGCCAGTGTGGAATTAAAGGTG 420

 52646565 TAGGGTTATCTGGTCAAGACTGTGTGTGTGGATACAGGCTCCAACCCCTCCAGGCAAGGG 52646624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TAGGGTTATCTGGTCAAGACTGTGTGTGTGGATACAGGCTCCAACCCCTCCAGGCAAGGG 480

 52646625 CACTGTTTCCAACATCCACCCTTTCTCCTTTGACCTCTACCTTGACCTAAATTAACTATA 52646684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CACTGTTTCCAACATCCACCCTTTCTCCTTTGACCTCTACCTTGACCTAAATTAACTATA 540

 52646685 AAAGGTCCTTCTTTTCTAGGACCCTACTATAAATCAGTGAAATATTCAGGAAAAAAAGAA 52646744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAAGGTCCTTCTTTTCTAGGACCCTACTATAAATCAGTGAAATATTCAGGAAAAAAAGAA 600

 52646745 CACCAAGAATGTTGGGATCCCAGTTAAAGATCAAGATTCTCTACTGATAAGCTGTGTGAT 52646804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CACCAAGAATGTTGGGATCCCAGTTAAAGATCAAGATTCTCTACTGATAAGCTGTGTGAT 660

 52646805 ATGGAGTAAATCACTAAAGATCTTTGAATCTCTTCATTTGTAAAATGGGAATATTGGTAG 52646864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATGGAGTAAATCACTAAAGATCTTTGAATCTCTTCATTTGTAAAATGGGAATATTGGTAG 720

 52646865 TCCTACTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTAAAGAAGAAAAGTCATGCAAAGGATCTGGCACA 52646924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCCTACTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTAAAGAAGAAAAGTCATGCAAAGGATCTGGCACA 780

 52646925 ACGCCTTTTCCATAATAAGTGCTTAGTAATTGACAGATACTGTGATAACTTTTCAGGTTT 52646984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ACGCCTTTTCCATAATAAGTGCTTAGTAATTGACAGATACTGTGATAACTTTTCAGGTTT 840

 52646985 CTCTCATGCCTTTGACAACATTGCATTTTGCTTGCTCTATCTGTAGTCAGACACTTCTTA 52647044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTCTCATGCCTTTGACAACATTGCATTTTGCTTGCTCTATCTGTAGTCAGACACTTCTTA 900

 52647045 ATATCTGTTTGCAGGAAGACAGAAAAATAAAGGGAAGAATTGAGATTTCTTTGATCTATT 52647104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATATCTGTTTGCAGGAAGACAGAAAAATAAAGGGAAGAATTGAGATTTCTTTGATCTATT 960

 52647105 CATACTGCTCATTAATATGTAGTGAGAAATACATACACACACACATACACACACATGCAT 52647164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CATACTGCTCATTAATATGTAGTGAGAAATACATACACACACACATACACACACATGCAT 1020

 52647165 CCATTAGCAATTGTTTTTGCCCAACTCTAGTGTCTCGCAGTGTCTAGACTAAACAACAAA 52647224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CCATTAGCAATTGTTTTTGCCCAACTCTAGTGTCTCGCAGTGTCTAGACTAAACAACAAA 1080

 52647225 CAAAAAAGGGGGGAGAGTGAGCTGGATTAAGCATTGAGGCACAGTGAAGAAATGGTCTGG 52647284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CAAAAAAGGGGGGAGAGTGAGCTGGATTAAGCATTGAGGCACAGTGAAGAAATGGTCTGG 1140

 52647285 GGCAAGCCCAGGGATGAATGTTAGGGGTTTCTCATAAACCTGAACCTGAAGAAAATCACC 52647344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GGCAAGCCCAGGGATGAATGTTAGGGGTTTCTCATAAACCTGAACCTGAAGAAAATCACC 1200

 52647345 CTGCCAGCATATTGATCTTCTAGCTCTTCTTAACCTTTTTTTCTGTGATTCAGGAATTCA 52647404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CTGCCAGCATATTGATCTTCTAGCTCTTCTTAACCTTTTTTTCTGTGATTCAGGAATTCA 1260

 52647405 TAATGATAGAAAATATTATACTAAAGAAGAAAAAAAGAGGGAGAATAAGTAAGTGATAGA 52647464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TAATGATAGAAAATATTATACTAAAGAAGAAAAAAAGAGGGAGAATAAGTAAGTGATAGA 1320

 52647465 TGGATGCATCAGGGTGTAAAGTTAGCAAGTAAGGCTGTTGAAGTGTCAGAGTGAATATAA 52647524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGGATGCATCAGGGTGTAAAGTTAGCAAGTAAGGCTGTTGAAGTGTCAGAGTGAATATAA 1380

 52647525 ATGAATTGTGGGAATGGTCCATGCCAGGAGAAGAGGGTATGGTTGACAAAAAGGGAAATG 52647584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ATGAATTGTGGGAATGGTCCATGCCAGGAGAAGAGGGTATGGTTGACAAAAAGGGAAATG 1440

 52647585 CTAAGATTCAAAACAGGGAAGGGCTTTTCAAAATGCCAAGAGCACCAACTTATATCTTTC 52647644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTAAGATTCAAAACAGGGAAGGGCTTTTCAAAATGCCAAGAGCACCAACTTATATCTTTC 1500

 52647645 AGTTTAATTCCTCTCTTCCTTACCCACTGGCTGGAAAGCAAAGGAGCTAGTGGTAAGTAA 52647704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AGTTTAATTCCTCTCTTCCTTACCCACTGGCTGGAAAGCAAAGGAGCTAGTGGTAAGTAA 1560

 52647705 GAGTGTTATAGCCAGAGAAAAAGTCTTCAAAAAACACAAAGTACTTTCCATGGACAACCT 52647764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GAGTGTTATAGCCAGAGAAAAAGTCTTCAAAAAACACAAAGTACTTTCCATGGACAACCT 1620

 52647765 TTTTTATTTTAAAGTGCCAATATGTTGCTTTGAAAAAGAATAAATTCCTTACATCCAGGT 52647824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTTTTATTTTAAAGTGCCAATATGTTGCTTTGAAAAAGAATAAATTCCTTACATCCAGGT 1680

 52647825 ATCTGGACTAGACTTCAGTGCATTTAGTGATTATAGCAAATCCAAACAGTAGCTTTTGAT 52647884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ATCTGGACTAGACTTCAGTGCATTTAGTGATTATAGCAAATCCAAACAGTAGCTTTTGAT 1740

 52647885 ATCAGAGAATGGGTAAAGTGTTTTTGACAATTTCTAAGAACTTAGAGTTCTTCGGTGATA 52647944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ATCAGAGAATGGGTAAAGTGTTTTTGACAATTTCTAAGAACTTAGAGTTCTTCGGTGATA 1800

 52647945 CGTTCCATGCAACTGAAGCTCTGCTCTCCAAATTTAGGTGGGTACATACCCAAGTCCATC 52648004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CGTTCCATGCAACTGAAGCTCTGCTCTCCAAATTTAGGTGGGTACATACCCAAGTCCATC 1860

 52648005 ACCTGGGGCTTCTATTTCCTTTGCTCAGATGCTCACCTCCTAGGTGGGCACCTGACATAA 52648064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ACCTGGGGCTTCTATTTCCTTTGCTCAGATGCTCACCTCCTAGGTGGGCACCTGACATAA 1920

 52648065 GATAGACTAATAAAAATAAGTCCTGTAACTTTTGATACTCCTATTAAAAAAGAGTTGCAA 52648124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GATAGACTAATAAAAATAAGTCCTGTAACTTTTGATACTCCTATTAAAAAAGAGTTGCAA 1980

 52648125 ACCAATAGGAGGTACACTTGAGAATCAGCACAAATGAAAGTAGAACCTGGAAATCCAGGA 52648184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ACCAATAGGAGGTACACTTGAGAATCAGCACAAATGAAAGTAGAACCTGGAAATCCAGGA 2040

 52648185 AGCAGATACCCAATCATGTCATTTAAACATTTAGATCCAGCTGTGCCTGAAGCTGAACTT 52648244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AGCAGATACCCAATCATGTCATTTAAACATTTAGATCCAGCTGTGCCTGAAGCTGAACTT 2100

 52648245 TAGCATTACATAAGCCAATAAATCACTCTTCCCCAACTTACGCCAGTTGAAATTGAATAC 52648304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TAGCATTACATAAGCCAATAAATCACTCTTCCCCAACTTACGCCAGTTGAAATTGAATAC 2160

 52648305 ATACTCAGTGACTTTGAGAGAATTCCAGGGAATTGGTCAGTCCCTGTTTCACTTGTAAAT 52648364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ATACTCAGTGACTTTGAGAGAATTCCAGGGAATTGGTCAGTCCCTGTTTCACTTGTAAAT 2220

 52648365 ACACAGCAATCAAGCCTACCAAATCTATGATTGATTGGGGTGTCTGAAAGAGATGGAGGG 52648424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ACACAGCAATCAAGCCTACCAAATCTATGATTGATTGGGGTGTCTGAAAGAGATGGAGGG 2280

 52648425 AATGGAATCAACCTGAAAAACATATTTCAGGAGTTCATCCCTGAAAACTTCCCCAACCTA 52648484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AATGGAATCAACCTGAAAAACATATTTCAGGAGTTCATCCCTGAAAACTTCCCCAACCTA 2340

 52648485 GCTAGAGGGGCCAACATTCAAATTCAGGAAATGCAGAGAACCCCAGTAAGATACTCCACA 52648544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GCTAGAGGGGCCAACATTCAAATTCAGGAAATGCAGAGAACCCCAGTAAGATACTCCACA 2400

 52648545 AAAAGATCTTCCCCAAGACATCATCATCAGATTCTCCAAAGTTGAAATGTAAGAAAAAAT 52648604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AAAAGATCTTCCCCAAGACATCATCATCAGATTCTCCAAAGTTGAAATGTAAGAAAAAAT 2460

 52648605 GCTAAAGGCAACTAGAGTGAAAGGCCCGGTCACCTAAAAAGGGAAGCACAGACTTACAGT 52648664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GCTAAAGGCAACTAGAGTGAAAGGCCCGGTCACCTAAAAAGGGAAGCACAGACTTACAGT 2520

 52648665 GGACCTCTCACTGGTAACCCTACAAGCCAGAAGAGATTGAGGACCAATATTCAACATTCT 52648724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GGACCTCTCACTGGTAACCCTACAAGCCAGAAGAGATTGAGGACCAATATTCAACATTCT 2580

 52648725 TAAACAAAAAGAATTCCAACCCAGAATTTTATATCTGACTAAACTAAGCTTCATAAGCAA 52648784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TAAACAAAAAGAATTCCAACCCAGAATTTTATATCTGACTAAACTAAGCTTCATAAGCAA 2640

 52648785 AAGAGAAATAAGATCATTTTCAGACAAGCAAATGCTAAGGGAATTTGTGACCATTAGACC 52648844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 AAGAGAAATAAGATCATTTTCAGACAAGCAAATGCTAAGGGAATTTGTGACCATTAGACC 2700

 52648845 TTCCTTGCAACAGTTCCTAAAGGAAGCACTAAATATGGAAAGACCATTACCAGACACTAC 52648904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TTCCTTGCAACAGTTCCTAAAGGAAGCACTAAATATGGAAAGACCATTACCAGACACTAC 2760

 52648905 AAAACACACTGAAGTACACAGACCAGTGACATTGTAAAGCAACTACATAACAAGTCTGCA 52648964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 AAAACACACTGAAGTACACAGACCAGTGACATTGTAAAGCAACTACATAACAAGTCTGCA 2820

 52648965 AAATAACCAGCCAACATCATGATGACGGTATCAAATCGACACATAGCAACACTAACCTTA 52649024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 AAATAACCAGCCAACATCATGATGACGGTATCAAATCGACACATAGCAACACTAACCTTA 2880

 52649025 AATGTAAATGGACTAAATGATCCCATTAAAAGACATAAAGTGGCAGGCTGGATAAAGAAC 52649084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 AATGTAAATGGACTAAATGATCCCATTAAAAGACATAAAGTGGCAGGCTGGATAAAGAAC 2940

 52649085 CAAGAACCATTGGTATACTGTCTTCAAGAGACCCATCTCCTATGCAGTGACACACATAGG 52649144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CAAGAACCATTGGTATACTGTCTTCAAGAGACCCATCTCCTATGCAGTGACACACATAGG 3000

 52649145 TTCAAGATAAAGGGATGGGGAAAAATCTACCAAGCAAATAGAAAACAGAATAAAACAGGG 52649204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TTCAAGATAAAGGGATGGGGAAAAATCTACCAAGCAAATAGAAAACAGAATAAAACAGGG 3060

 52649205 GTTGCAATCCTAGTTGCCGTCAAAACAGACTTTAAACCAACAAAGGTTAAAAGAAAAAAA 52649264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 GTTGCAATCCTAGTTGCCGTCAAAACAGACTTTAAACCAACAAAGGTTAAAAGAAAAAAA 3120

 52649265 TATGGGCATTGCATAAGGATAAAGTGTTAAATTAAACAAGAAGATCTAACTATCCTAAGT 52649324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TATGGGCATTGCATAAGGATAAAGTGTTAAATTAAACAAGAAGATCTAACTATCCTAAGT 3180

 52649325 ATATATGCACCAAACACAGGAACACCCAGATTCATAAAGCAAGTTTATGGAGACCTTCAA 52649384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 ATATATGCACCAAACACAGGAACACCCAGATTCATAAAGCAAGTTTATGGAGACCTTCAA 3240

 52649385 ACAGACTTAGACTCCCACACAATAGTAGTGGGAGACTTTAATACCCCATGACAATATTAG 52649444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 ACAGACTTAGACTCCCACACAATAGTAGTGGGAGACTTTAATACCCCATGACAATATTAG 3300

 52649445 ACAGATCATTGAGACAGGAAATTAACAAAGATATTCAAGATCTAACTCAGCACTAAATCA 52649504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 ACAGATCATTGAGACAGGAAATTAACAAAGATATTCAAGATCTAACTCAGCACTAAATCA 3360

 52649505 AATGGCCCTGATAGATATCTACAGGACTGTCCTACTTGAAACCATACAATTACATGGTAA 52649564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 AATGGCCCTGATAGATATCTACAGGACTGTCCTACTTGAAACCATACAATTACATGGTAA 3420

 52649565 TTGAATGACCTGCTCCTGAATGACTTTTGGGTAAATAATAAAATTAAGGCAGAAATCAAG 52649624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TTGAATGACCTGCTCCTGAATGACTTTTGGGTAAATAATAAAATTAAGGCAGAAATCAAG 3480

 52649625 AAGTTTTTTGAACTAATGAGAACAAAGATACAACATACCAGAATCTTTGGGACACAGCTA 52649684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 AAGTTTTTTGAACTAATGAGAACAAAGATACAACATACCAGAATCTTTGGGACACAGCTA 3540

 52649685 AGGCAGTGTTAAGAGGGAAATTTATAGCACTAAATCCCACATCAAAAAGTTAGAAAGAGC 52649744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 AGGCAGTGTTAAGAGGGAAATTTATAGCACTAAATCCCACATCAAAAAGTTAGAAAGAGC 3600

 52649745 TCACGTTAACAATCTAACCTCACAACTACAGGAACTAGAGAACTGAGAGCAGAAAAACCT 52649804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 TCACGTTAACAATCTAACCTCACAACTACAGGAACTAGAGAACTGAGAGCAGAAAAACCT 3660

 52649805 GAAAGCTAGCAGAAGACAAGAAATAACCAAAATTAGAGCTGAACTGAAGGAGATTGAGAC 52649864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 GAAAGCTAGCAGAAGACAAGAAATAACCAAAATTAGAGCTGAACTGAAGGAGATTGAGAC 3720

 52649865 ATGAAAAACCATTCAAAAGATCAGTGAATTCAGGAGCTGTTTTTTTTTTGAACAAATTAA 52649924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 ATGAAAAACCATTCAAAAGATCAGTGAATTCAGGAGCTGTTTTTTTTTTGAACAAATTAA 3780

 52649925 TAAAATAGACCATTAGCTAGAGTAATAAACAAGAAAATAGAAAAGATTCAAATAAACACA 52649984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 TAAAATAGACCATTAGCTAGAGTAATAAACAAGAAAATAGAAAAGATTCAAATAAACACA 3840

 52649985 ATCAGAAACGACAAGGGGGATATTACCACTGACCCCACAGAAGTACAAACAACCATCAGA 52650044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 ATCAGAAACGACAAGGGGGATATTACCACTGACCCCACAGAAGTACAAACAACCATCAGA 3900

 52650045 GAATATTATGAACATCTCTATGCACATAAACTAGAAAATCTAGAAGAAGTGGATAAACTT 52650104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 GAATATTATGAACATCTCTATGCACATAAACTAGAAAATCTAGAAGAAGTGGATAAACTT 3960

 52650105 CTGGACATATACACCCTTCTAAGACTGTACCAGGAAGAAATTGAATCCCTGAACAGACCA 52650164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 CTGGACATATACACCCTTCTAAGACTGTACCAGGAAGAAATTGAATCCCTGAACAGACCA 4020

 52650165 ATAATGAGCCCTAAAATTGAGGAAGTAATACATAGACTACCAACCATAAAAAAACCCAGT 52650224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 ATAATGAGCCCTAAAATTGAGGAAGTAATACATAGACTACCAACCATAAAAAAACCCAGT 4080

 52650225 ACTAGATGGATTCACAGGTAAGTTCTACCAGTTGTACAAAGAAGAGCTGGTACAGTTCCT 52650284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 ACTAGATGGATTCACAGGTAAGTTCTACCAGTTGTACAAAGAAGAGCTGGTACAGTTCCT 4140

 52650285 ACTGAAATTATTCCAAAAAGTTGAGTAGGAGGGAGTCCTTCCTAACTCATTTGATGAGGC 52650344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 ACTGAAATTATTCCAAAAAGTTGAGTAGGAGGGAGTCCTTCCTAACTCATTTGATGAGGC 4200

 52650345 CAGCATCATCCTGATATCAAAACCTGGCAGATATACAACAAGAAAAGCTTCAGGCCAATA 52650404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 CAGCATCATCCTGATATCAAAACCTGGCAGATATACAACAAGAAAAGCTTCAGGCCAATA 4260

 52650405 TCCTTGATGAACTTCAATGCAAAAATCCTCAATAAAATACTGGCAAACTGAATCCAGCAG 52650464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 TCCTTGATGAACTTCAATGCAAAAATCCTCAATAAAATACTGGCAAACTGAATCCAGCAG 4320

 52650465 CACACCAAAAAGCTTATCCACCATGATCAAGTAGAATGCAAGTTGGTTCAACATATACAA 52650524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 CACACCAAAAAGCTTATCCACCATGATCAAGTAGAATGCAAGTTGGTTCAACATATACAA 4380

 52650525 ATCAATAAATGTGACTCATCACATAAACAGAACTAAAGACAAAAACTACATGATTATCTC 52650584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 ATCAATAAATGTGACTCATCACATAAACAGAACTAAAGACAAAAACTACATGATTATCTC 4440

 52650585 AACAGATGCAGAAAAGGCTTTCAATAAAATTAGACATCCATTTATGTTAAAAACTCTCAA 52650644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 AACAGATGCAGAAAAGGCTTTCAATAAAATTAGACATCCATTTATGTTAAAAACTCTCAA 4500

 52650645 TAAACTAGGTATTGAAGGAACATACCTCAAAATAATAAGAGCCATGTATGACAAACCCAC 52650704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 TAAACTAGGTATTGAAGGAACATACCTCAAAATAATAAGAGCCATGTATGACAAACCCAC 4560

 52650705 AGCTAAGATCATACTGAATGGGCAAAAGCTGGAAGCATTTTCTTTGAAGACTGGCATAAG 52650764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 AGCTAAGATCATACTGAATGGGCAAAAGCTGGAAGCATTTTCTTTGAAGACTGGCATAAG 4620

 52650765 ACAAGGATGATCTCTCTCACCACTCCTATTCAACATAGTATTGGAAGTCTTGGCCAGGGC 52650824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 ACAAGGATGATCTCTCTCACCACTCCTATTCAACATAGTATTGGAAGTCTTGGCCAGGGC 4680

 52650825 AATCGGGCAAGAGAAATAAATAAAGCGCATCCAAATAGGAAGAGAGGAAGTCAAACTATC 52650884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 AATCGGGCAAGAGAAATAAATAAAGCGCATCCAAATAGGAAGAGAGGAAGTCAAACTATC 4740

 52650885 CTTGTTTGCAGATTACATGACATTATATCTAGAAAACCCCATAGTCTCAGCCCCAAAGCT 52650944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 CTTGTTTGCAGATTACATGACATTATATCTAGAAAACCCCATAGTCTCAGCCCCAAAGCT 4800

 52650945 TCTTAAGCTGATAAACAACTTCAGCAAAGTCTCAGGATACAAAATAAATGTGCAAAAATT 52651004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 TCTTAAGCTGATAAACAACTTCAGCAAAGTCTCAGGATACAAAATAAATGTGCAAAAATT 4860

 52651005 ACTGGCATTTCCATGCACCAACAACAGTCAAGCCAGGAGCCAAACCAGGAATGCACTCCC 52651064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 ACTGGCATTTCCATGCACCAACAACAGTCAAGCCAGGAGCCAAACCAGGAATGCACTCCC 4920

 52651065 ACTCACAATCGCCACAAAAAGAGTAAAATACCTAGGAAAACAGCTAATTAGGGAGGTGAA 52651124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 ACTCACAATCGCCACAAAAAGAGTAAAATACCTAGGAAAACAGCTAATTAGGGAGGTGAA 4980

 52651125 AGATCTCTACAAGGAGAATAATGAACCAGCGCTCAAAGAAATTAGAGATGACACAAACAA 52651184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 AGATCTCTACAAGGAGAATAATGAACCAGCGCTCAAAGAAATTAGAGATGACACAAACAA 5040

 52651185 ATGGAAAAACATTCCATGTTCATTGATAGGAAGAATCAATATCATTAAAATGGCCATATT 52651244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 ATGGAAAAACATTCCATGTTCATTGATAGGAAGAATCAATATCATTAAAATGGCCATATT 5100

 52651245 GCCCAGAGCAATTTATAGATTCAATGCTATACCTATTAAACTACTGTTGAGATTCTTCAC 52651304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 GCCCAGAGCAATTTATAGATTCAATGCTATACCTATTAAACTACTGTTGAGATTCTTCAC 5160

 52651305 AGAACCAGAGAAAACTATTTTAAAATT 52651331
          |||||||||||||||||||||||||||
     5161 AGAACCAGAGAAAACTATTTTAAAATT 5187

EXCISED REGION

 52651333 ATATAGAACCCAGAAAAGAGCCTGAATTGCTAAGGCAATCCTAAGCAAAAAGCATAAAGC 52651392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5189 ATATAGAACCCAGAAAAGAGCCTGAATTGCTAAGGCAATCCTAAGCAAAAAGCATAAAGC 5248

 52651393 TGAAGGCATCATGCTACCTGACTTCAAAC 52651421
          |||||||||||||||||||||||||||||
     5249 TGAAGGCATCATGCTACCTGACTTCAAAC 5277

Alignment time is 6.04787 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [52637064,52668002] =>     30939 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    8050] =>      8050 nucs 'mol-32-2f33-049109_8050'

Score:        7782
Aligned:      8057        nucs
Identic:      8005 ( 99%) nucs =>      6787 (100%)      1218 ( 98%)
Gaps:           37 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [52640261,52647064] EXCISED REGION [52658003,52659225]
 second seq =>  [       1,    6805] EXCISED REGION [    6806,    8050]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>     10938 nucs [52647065,52658002]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         6 nucs [52647065,52647070] to [52658003,52658008]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [52647065,52647067] to [52658000,52658002]
 second seq =>         0 nucs

 52640261 GAAACCCTTAAATGTCAGACAAAGAAACTGAGGCTTATGGGCATGGACACTAACATTTCT 52640320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GAAACCCTTAAATGTCAGACAAAGAAACTGAGGCTTATGGGCATGGACACTAACATTTCT 60

 52640321 ATTGTTTCAAAAATAATTTTACAACTTTTATACCTTTCTCACCCAAGTTAGGACTTGTGC 52640380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATTGTTTCAAAAATAATTTTACAACTTTTATACCTTTCTCACCCAAGTTAGGACTTGTGC 120

 52640381 CTTTGGTTATACAACTCTTAAATTAGAGTCAACTGTGCTATCTCTGTGAGTTTGGGTTGA 52640440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTTTGGTTATACAACTCTTAAATTAGAGTCAACTGTGCTATCTCTGTGAGTTTGGGTTGA 180

 52640441 GGACTATGGAAGGGAAAGGCAAAAAATAAAAGTAAAATGTGAAGTAGAAGACAGGGAGAA 52640500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGACTATGGAAGGGAAAGGCAAAAAATAAAAGTAAAATGTGAAGTAGAAGACAGGGAGAA 240

 52640501 AACCCATAATACTGGTAATAGCTAATTTCTCTTTTTCTTCTTTCAAAATGCAATTTGTGC 52640560
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AACCCATAATACTAGTAATAGCTAATTTCTCTTTTTCTTCTTTCAAAATGCAATTTGTGC 300

 52640561 TAAGTACTTTATATGGCCTATCTCATTTAACTTCTAAAAGTGTGAACAATGTGAGAATGT 52640620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TAAGTACTTTATATGGCCTATCTCATTTAACTTCTAAAAGTGTGAACAATGTGAGAATGT 360

 52640621 GCTAGATACTATTATTATCCCCATTTTACAGATGAGGAAACTGAGGCTCAGGAGGTGAAG 52640680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GCTAGATACTATTATTATCCCCATTTTACAGATGAGGAAACTGAGGCTCAGGAGGTGAAG 420

 52640681 TAGCTTGCCCAAGATCACACAGCCAGTAGGTGACAGAGGTAGAGAGGAAACCTAGGCTAC 52640740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TAGCTTGCCCAAGATCACACAGCCAGTAGGTGACAGAGGTAGAGAGGAAACCTAGGCTAC 480

 52640741 TTGACTATGATGCTTATGTTTAATTCACTACTAAATACCATGTAGGAAAGGACTCTGGAG 52640800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTGACTATGATGCTTATGTTTAATTCACTACTAAATACCATGTAGGAAAGGACTCTGGAG 540

 52640801 ACCTTAGTTCTTTAATTCCAATTCTACCACTAAACAGTAGAGACAGGATGAACTTGTCAT 52640860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACCTTAGTTCTTTAATTCCAATTCTACCACTAAACAGTAGAGACAGGATGAACTTGTCAT 600

 52640861 TCACTGAGATGGAAAACCCCGTGAATTAAACTGGTGGGCATTTTGTTTTTGTCATTGTTA 52640920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCACTGAGATGGAAAACCCCGTGAATTAAACTGGTGGGCATTTTGTTTTTGTCATTGTTA 660

 52640921 GGCGATGAATGAAGAGTTCCATTCTGGACACATTAGGGTTGAGATACTCAGTGAGCAGCC 52640980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGCGATGAATGAAGAGTTCCATTCTGGACACATTAGGGTTGAGATACTCAGTGAGCAGCC 720

 52640981 AAATGGGGATGTAGAAATTCAAGTAGACATGTGGAAGAGGAGGCAGCTGAGACTCACGTC 52641040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAATGGGGATGTAGAAATTCAAGTAGACATGTGGAAGAGGAGGCAGCTGAGACTCACGTC 780

 52641041 TGGACTTCAGGGATGGATCCCGGCTAGAGATGTAAATTTGGAACTTGTCAACCCATAGCA 52641100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGGACTTCAGGGATGGATCCCGGCTAGAGATGTAAATTTGGAACTTGTCAACCCATAGCA 840

 52641101 GTATTTAAACCTTTGGGACTGAGGGAAACCTTCAAGGAAATAAGCGTAGTTAGAGATAGC 52641160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GTATTTAAACCTTTGGGACTGAGGGAAACCTTCAAGGAAATAAGCGTAGTTAGAGATAGC 900

 52641161 CAAGAAGTGAACCCTGGGGAAGTCCAACATTTAGAGGGTGAGATCCAGCAAAGGAGATGA 52641220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CAAGAAGTGAACCCTGGGGAAGTCCAACATTTAGAGGGTGAGATCCAGCAAAGGAGATGA 960

 52641221 TGGAAGAGTACCAGGGAGGTGGAAGGATGTTGTTTCAAACAGCAAGGTGTGGCCCACTCA 52641280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGGAAGAGTACCAGGGAGGTGGAAGGATGTTGTTTCAAACAGCAAGGTGTGGCCCACTCA 1020

 52641281 GTCACTGTGTCGGATTCAACTTGCAGGTCAGACCTACTAGGACAAAGATAGAGACCTATA 52641340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GTCACTGTGTCGGATTCAACTTGCAGGTCAGACCTACTAGGACAAAGATAGAGACCTATA 1080

 52641341 GGATTTGGCAGCCAGGGTGATGGTAGGGAATTTGAAACATCATGGTGGCTGTGACAAGAG 52641400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GGATTTGGCAGCCAGGGTGATGGTAGGGAATTTGAAACATCATGGTGGCTGTGACAAGAG 1140

 52641401 CCTGAATGGAGTGTGTTCAAGAGAGAAAAGAAGAGAAGTGAAAACACAGAATATTGTTCT 52641460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CCTGAATGGAGTGTGTTCAAGAGAGAAAAGAAGAGAAGTGAAAACACAGAATATTGTTCT 1200

 52641461 TATTATTAGTAGCCTGAGCCAATCTGAGGACCGATGCACTTATCACAATGTCTCTTAAAA 52641520
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TATTATTAGTAGCCTGAGCAAATCTGAGGACCGATGCACTTATCACAATGTCTCTTAAAA 1260

 52641521 TACTATGTCTCTTACTAGATTATACACTCCTTGACAGACGAGAAACATGATTTATTTTTC 52641580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TACTATGTCTCTTACTAGATTATACACTCCTTGACAGACGAGAAACATGATTTATTTTTC 1320

 52641581 AAATGCCTTGCACAAGGTTAGTGCGAAAGTAACGATTGCAGGATTTAATTACACTTTTAA 52641640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AAATGCCTTGCACAAGGTTAGTGCGAAAGTAACGATTGCAGGATTTAATTACACTTTTAA 1380

 52641641 AAGAAAAAAGACATTCTTCATCTTATGAAACTCTGCATGGCAACACTTTATGCGCCCCAC 52641700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     1381 AAGAAAAAAGACATTCTTCATCTTATGAAACTCTGCATGGCAACACTTTACGCGCCCCAC 1440

 52641701 ACCCCCACTCAACACAAACACAACTCTGGAAGTACTGTGTTGATAACAGAAATGTGGTGG 52641760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ACCCCCACTCAACACAAACACAACTCTGGAAGTACTGTGTTGATAACAGAAATGTGGTGG 1500

 52641761 GTTTTATTTTTAACCAATAAAGGTCAAGTTTGCATTATGTGATTTTGTGTGTGTGTGTGT 52641820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GTTTTATTTTTAACCAATAAAGGTCAAGTTTGCATTATGTGATTTTGTGTGTGTGTGTGT 1560

 52641821 TGAATCTTTTAAATGCATATCTTACAGCTCTGGTTCAGTTGTTGTGGGGAGAGGAAAAAA 52641880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TGAATCTTTTAAATGCATATCTTACAGCTCTGGTTCAGTTGTTGTGGGGAGAGGAAAAAA 1620

 52641881 ACCTCATCCCTGCCAACACATTGGTTTGTATGAATCACAGCTCAGTGAAACCTTTCAGGC 52641940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ACCTCATCCCTGCCAACACATTGGTTTGTATGAATCACAGCTCAGTGAAACCTTTCAGGC 1680

 52641941 ATATAATTTATCTTTTCTTTGGCCTATGTAGTAAACGCTTCATTTGTTCATGAATTCTTG 52642000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ATATAATTTATCTTTTCTTTGGCCTATGTAGTAAACGCTTCATTTGTTCATGAATTCTTG 1740

 52642001 CCTTGTTTTAATTATGCTTTGCCCTGAATGTAGTTTTATAAGGCACAAAAATAAGATTGT 52642060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CCTTGTTTTAATTATGCTTTGCCCTGAATGTAGTTTTATAAGGCACAAAAATAAGATTGT 1800

 52642061 CGTTCTGAAAACACAGAAGATTTGTATGTTTCCCCCAGGATGAAATGGTGGCATCTTTCT 52642120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CGTTCTGAAAACACAGAAGATTTGTATGTTTCCCCCAGGATGAAATGGTGGCATCTTTCT 1860

 52642121 CCCAATTCACAGCTCTGTGGGCTTGTGGCTGGAATTCCAATCCAGCAGGGAGCAAGCCAT 52642180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CCCAATTCACAGCTCTGTGGGCTTGTGGCTGGAATTCCAATCCAGCAGGGAGCAAGCCAT 1920

 52642181 AAAAATGGGGGGAAGGGCTGCTGGAGGGAGGCAGTAGATGCGGCTGAGCCCAAGGCATAA 52642240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AAAAATGGGGGGAAGGGCTGCTGGAGGGAGGCAGTAGATGCGGCTGAGCCCAAGGCATAA 1980

 52642241 TTCACCCTAAGAATTCTGAATCAATACACTGACATCCAGCCATGTACAATGTGGTACTCC 52642300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TTCACCCTAAGAATTCTGAATCAATACACTGACATCCAGCCATGTACAATGTGGTACTCC 2040

 52642301 CACCAAGAAAGCCACTGATTGAGAAGTTTTATTCATGTTACTTTCTGAGGGTTGGATTGT 52642360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CACCAAGAAAGCCACTGATTGAGAAGTTTTATTCATGTTACTTTCTGAGGGTTGGATTGT 2100

 52642361 CCCATTACATTTATAGAACAATTGCTTTTTTCCCCCTAAATACAGAACTATGCAGCCGGG 52642420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CCCATTACATTTATAGAACAATTGCTTTTTTCCCCCTAAATACAGAACTATGCAGCCGGG 2160

 52642421 AGTCAGAAAAGAAACCTTGACAATCAGAAGGCTGTTTTGTTGTTGTTGTTAAAAACCTTT 52642480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AGTCAGAAAAGAAACCTTGACAATCAGAAGGCTGTTTTGTTGTTGTTGTTAAAAACCTTT 2220

 52642481 GCAGGCATATGCATCTGAATATCCATAAGTTCACAGGCTGAGGGAGAAATGGCTATTTCA 52642540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GCAGGCATATGCATCTGAATATCCATAAGTTCACAGGCTGAGGGAGAAATGGCTATTTCA 2280

 52642541 TAACTTTTCTGTGTTTCTCATGTACATAGTACAAAGTGGGCACTCAGTATTTCAAATTTC 52642600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TAACTTTTCTGTGTTTCTCATGTACATAGTACAAAGTGGGCACTCAGTATTTCAAATTTC 2340

 52642601 AATATCACTGAAAAAAATGGAAATTTGTCATGTAACAAAATCAGATGCAGACTTCACTGG 52642660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AATATCACTGAAAAAAATGGAAATTTGTCATGTAACAAAATCAGATGCAGACTTCACTGG 2400

 52642661 TGAATCTGAGGGAGTGAATTCACTTATTCAGAAAGGAAGACAGTTACAATTCTTGGGTCT 52642720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TGAATCTGAGGGAGTGAATTCACTTATTCAGAAAGGAAGACAGTTACAATTCTTGGGTCT 2460

 52642721 TCTGAGAGATCATTATAACTTGAAAATATTACACAAGGGCTTTGCTATATTAGATACCTG 52642780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TCTGAGAGATCATTATAACTTGAAAATATTACACAAGGGCTTTGCTATATTAGATACCTG 2520

 52642781 CCATGTTCCTAACACAAGCTCCCATTTTCTGACTCAAATCTCATTTTGGAACACATTCCA 52642840
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CCATGTTCCTAATACAAGCTCCCATTTTCTGACTCAAATCTCATTTTGGAACACATTCCA 2580

 52642841 CTCAAATTGAGGTTCTACCCCTAAGAGTTCTTTTTCAATAAAGAAAGCTGAGTTAATAAA 52642900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CTCAAATTGAGGTTCTACCCCTAAGAGTTCTTTTTCAATAAAGAAAGCTGAGTTAATAAA 2640

 52642901 TCACAACTCCAAAACTTTTCCTCACTTTTCTTAGACTAGAAATAGATTGAGTGTGTCGAG 52642960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     2641 TCACAACTCCAAAACTTTTCCTCACTTTTCTTAGACTAGAAATAGATTGAATGTGTCGAG 2700

 52642961 GTTTTATGGCTGAGTACATTGGAGGGCTGGCTATTCTATGCTGAACTGGTTTACTTGATT 52643020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GTTTTATGGCTGAGTACATTGGAGGGCTGGCTATTCTATGCTGAACTGGTTTACTTGATT 2760

 52643021 AAGATGGGGATTTGGATGAGTCACCGGACACCTGTCCAAAGATGAGTAAAACACATTCCT 52643080
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 AAGATGGGGATTTGGATGAGTCACTGGACACCTGTCCAAAGATGAGTAAAACACATTCCT 2820

 52643081 TCATTGTCTTCCCATAAATAACTCAATCTTCTCCTAACTGAGCCAATGGATAGGCTTTGG 52643140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TCATTGTCTTCCCATAAATAACTCAATCTTCTCCTAACTGAGCCAATGGATAGGCTTTGG 2880

 52643141 ATGCCCAAGCAAAACAAACACATGACTGTTAAAAAATCACAACCTCAAAATGGCCTTAGA 52643200
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 ATGCCCAAGCAAAAGAAACACATGACTGTTAAAAAATCACAACCTCAAAATGGCCTTAGA 2940

 52643201 AGCCTATGACCAATAATGAGAATGGTTTCTCCACTCAGGCGCAAGTAGTAAACAGTTTCT 52643260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 AGCCTATGACCAATAATGAGAATGGTTTCTCCACTCAGGCGCAAGTAGTAAACAGTTTCT 3000

 52643261 CCCATATGCAGGAATATTGACGACTAGTTTACCGCCTCTGGGCACGTAACTTTCAGGTCC 52643320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CCCATATGCAGGAATATTGACGACTAGTTTACCGCCTCTGGGCACGTAACTTTCAGGTCC 3060

 52643321 TGGTTCATGCATTTGCTGGAATGTTCCCTGGGCCATGGAGCCCAGTTCTCCTGGCATCTG 52643380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TGGTTCATGCATTTGCTGGAATGTTCCCTGGGCCATGGAGCCCAGTTCTCCTGGCATCTG 3120

 52643381 GCATCTCCCCCACACTCTGCTCCCCCAGCACAGCACTTGGCATCTTGCATTGCAATTGCA 52643440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 GCATCTCCCCCACACTCTGCTCCCCCAGCACAGCACTTGGCATCTTGCATTGCAATTGCA 3180

 52643441 GGTTTATTTATTCACTTCTCTCACTGGACAGCAAACTCCACCAGGGCCGAGACTCTGTGT 52643500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 GGTTTATTTATTCACTTCTCTCACTGGACAGCAAACTCCACCAGGGCCGAGACTCTGTGT 3240

 52643501 CTCGCCCTTCACTGTGGTCCCTGTGCCTCACCTGTTCCTAGTACAGTGTCACACTCAGTA 52643560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 CTCGCCCTTCACTGTGGTCCCTGTGCCTCACCTGTTCCTAGTACAGTGTCACACTCAGTA 3300

 52643561 AAGAGCAGATGCCTGG-TGCATTTGGAGACTTATTTTAAATTATACGGAAAGTTATTCAA 52643619
          |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 AAGAGCAGATGCCTGGATGCATTTGGAGACTTATTTTAAATTATACGGAAAGTTATTCAA 3360

 52643620 CCGGCTTCTTGAACTGGTGAATTTTGGAAAGTGGGTGTTTGAAGGGAAAATGTTTAAACT 52643679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 CCGGCTTCTTGAACTGGTGAATTTTGGAAAGTGGGTGTTTGAAGGGAAAATGTTTAAACT 3420

 52643680 CTGAAAGAAATGTTGGAAATAAGCTCTTTGAATCAAAATGTATAGAAAACACAAGAATGC 52643739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 CTGAAAGAAATGTTGGAAATAAGCTCTTTGAATCAAAATGTATAGAAAACACAAGAATGC 3480

 52643740 TGACAGTAAGAGCCTAAAACACATGATGACTATTATCTTTTCCCAATTTTAACTCTCCAG 52643799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TGACAGTAAGAGCCTAAAACACATGATGACTATTATCTTTTCCCAATTTTAACTCTCCAG 3540

 52643800 AGTGTTCAGCGGTGCCCAGCCTTCATAATGTAATTCTTCGTAGCACCCTGGATGCATTAA 52643859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 AGTGTTCAGCGGTGCCCAGCCTTCATAATGTAATTCTTCGTAGCACCCTGGATGCATTAA 3600

 52643860 AACCATAGATTAACGTGATACTTATTTTCATTAAGGAAAATAATTTACGTACAGTGCTCA 52643919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 AACCATAGATTAACGTGATACTTATTTTCATTAAGGAAAATAATTTACGTACAGTGCTCA 3660

 52643920 GAGTAGAGCCTGGCACATTGAACATTTTCAATAAATGACAGCAAGTGTAATTATTAGCAC 52643979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 GAGTAGAGCCTGGCACATTGAACATTTTCAATAAATGACAGCAAGTGTAATTATTAGCAC 3720

 52643980 TTCGGAAGTGCAAAGTTGCATTGTATTAAGACAAATATATTTGGAGCTCATCCAATTTTT 52644039
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 TTTGGAAGTGCAAAGTTGCATTGTATTAAGACAAATATATTTGGAGCTCATCCAATTTTT 3780

 52644040 TCCTGGCTCTGAAGTCTGCTAGTGGCACTTAACTTTATTCCCAAGTTTTGAAAAATATTG 52644099
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     3781 TCCTGGCTCTGAAGTCTGCTAGTGGCACTTAACTTTATTCCCAAGCTTTGAAAAATATTG 3840

 52644100 TTATTTAAAAAGTCTGTTAACCAAGGAAATGCATGCCCTAAACCTATAATGTATCAAGTT 52644159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 TTATTTAAAAAGTCTGTTAACCAAGGAAATGCATGCCCTAAACCTATAATGTATCAAGTT 3900

 52644160 TTACTTCCTTCTTCTTTTAAGGAGTTCTTTTCCTGCCTTGAATACAAACAGGCTCTCTCA 52644219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 TTACTTCCTTCTTCTTTTAAGGAGTTCTTTTCCTGCCTTGAATACAAACAGGCTCTCTCA 3960

 52644220 AGGTTAAAAGCAAATGCTCTTTTTAGTGTCAAAAAGAGCTTGCCTTTCTTCGCTCAGGAA 52644279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 AGGTTAAAAGCAAATGCTCTTTTTAGTGTCAAAAAGAGCTTGCCTTTCTTCGCTCAGGAA 4020

 52644280 AAAAAGCAACTGATTCCAGGATACCTTCTTTGAAAACCAACACAAAAAAACCCCCCAAAA 52644339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 AAAAAGCAACTGATTCCAGGATACCTTCTTTGAAAACCAACACAAAAAAACCCCCCAAAA 4080

 52644340 AACAAAAAAAAAACCCAAAACCCCTAGTTTTTACAAAGGTTTATTACTCCTACTTGTTGG 52644399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 AACAAAAAAAAAACCCAAAACCCCTAGTTTTTACAAAGGTTTATTACTCCTACTTGTTGG 4140

 52644400 AAAAGAATTACTACATAAAAGAGTCTGCCCAGAGCTGTAAAATCTCCTTATTCAAACACA 52644459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 AAAAGAATTACTACATAAAAGAGTCTGCCCAGAGCTGTAAAATCTCCTTATTCAAACACA 4200

 52644460 CACCTTAGAGCAAAAGATGGTTAAATATCAATTCAGGCTATTAACAGTAAGGGAC---GA 52644516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||
     4201 CACCTTAGAGCAAAAGATGGTTAAATATCAATTCAGGCTATTAACAGTAAGG---AATGA 4257

 52644517 AATGTGTTCCAACAAAACTCTGCATGTCAACAAACTACAGAGACTAGGTAACATCTTTTA 52644576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4258 AATGTGTTCCAACAAAACTCTGCATGTCAACAAACTACAGAGACTAGGTAACATCTTTTA 4317

 52644577 GGAATCATTTTTATTCCACTAATGCCTTTTCCTCCAGAATCCACTGATCGTAAACGCAAC 52644636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4318 GGAATCATTTTTATTCCACTAATGCCTTTTCCTCCAGAATCCACTGATCGTAAACGCAAC 4377

 52644637 CTGTCTACTTCCGCCTTTGAAAAATGGATGGACAAATTCATCTGCATGTAACTCACCTCC 52644696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4378 CTGTCTACTTCCGCCTTTGAAAAATGGATGGACAAATTCATCTGCATGTAACTCACCTCC 4437

 52644697 TCTTTTCTTTTACATAAAACAGATGCCACAGCTGTTATTGTTCTTCACACAGAAGTTTCT 52644756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4438 TCTTTTCTTTTACATAAAACAGATGCCACAGCTGTTATTGTTCTTCACACAGAAGTTTCT 4497

 52644757 ACCCAGAGAAACATCAGGATGACACTCTGCTGCAATGTGCTATTTGTTCTAGAGGGGTCA 52644816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4498 ACCCAGAGAAACATCAGGATGACACTCTGCTGCAATGTGCTATTTGTTCTAGAGGGGTCA 4557

 52644817 ACAGCTTGCCACCTTGCCTAGGCCCAGGGTGACTGCATATGTGCAGTGGTCTTATCCCAT 52644876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4558 ACAGCTTGCCACCTTGCCTAGGCCCAGGGTGACTGCATATGTGCAGTGGTCTTATCCCAT 4617

 52644877 TAGCGCCCCCGAGCATGCATTCAGAACCAAGTGGATACACCTTGGCACACTTACCTTCCC 52644936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4618 TAGCGCCCCCGAGCATGCATTCAGAACCAAGTGGATACACCTTGGCACACTTACCTTCCC 4677

 52644937 TGCAGGGACATCATCGGACTGCCCTGATAAGCCAGGAACCTCATCCACCTTGTCTTGATG 52644996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4678 TGCAGGGACATCATCGGACTGCCCTGATAAGCCAGGAACCTCATCCACCTTGTCTTGATG 4737

 52644997 CTCTGCCCTCTTGGCTTCCTGTTGGCTGTCACCTGGCACCTTTTCCTGTCCCTTGTCCAG 52645056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4738 CTCTGCCCTCTTGGCTTCCTGTTGGCTGTCACCTGGCACCTTTTCCTGTCCCTTGTCCAG 4797

 52645057 CTTGAAGAATTTGTCAAAAAAGCTGGAGTCCTTGGGCTTGGAGGGAGCTTCTCCTCCTGC 52645116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4798 CTTGAAGAATTTGTCAAAAAAGCTGGAGTCCTTGGGCTTGGAGGGAGCTTCTCCTCCTGC 4857

 52645117 TCCCCCTGTCTCAGGTGGGAGAAGCGTGGGATCCCTGGCGGCAGAGAGGACCTTGTCTTG 52645176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4858 TCCCCCTGTCTCAGGTGGGAGAAGCGTGGGATCCCTGGCGGCAGAGAGGACCTTGTCTTG 4917

 52645177 GGCCGGGGCGTGCCCTGGGGTTTTATCTGTGTCCTGCCCCGGTCCAGCTGCCACCGGAAG 52645236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4918 GGCCGGGGCGTGCCCTGGGGTTTTATCTGTGTCCTGCCCCGGTCCAGCTGCCACCGGAAG 4977

 52645237 TGTCCAGCTCTCACTTGGGTCTTTGTTCGCTGGAGCTTTATTGGAGCTGACATCAAGCTT 52645296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4978 TGTCCAGCTCTCACTTGGGTCTTTGTTCGCTGGAGCTTTATTGGAGCTGACATCAAGCTT 5037

 52645297 CACTGATCCAAGGGATGAATCTGCGGCTTGGTCTCCGGTACGTCCTGGTACAGGCCGAGA 52645356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5038 CACTGATCCAAGGGATGAATCTGCGGCTTGGTCTCCGGTACGTCCTGGTACAGGCCGAGA 5097

 52645357 GAGCATCAAGAAAAAACGAGATTTAGCAGCTGGTGCCTCGGGTTTGGCCTCTTTCCCAAG 52645416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5098 GAGCATCAAGAAAAAACGAGATTTAGCAGCTGGTGCCTCGGGTTTGGCCTCTTTCCCAAG 5157

 52645417 ATTCTTTCCGTTGGCATCCGCAACAGCACTTATCTCCGTTGTCTCGGGGGAAGAAGTGGC 52645476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5158 ATTCTTTCCGTTGGCATCCGCAACAGCACTTATCTCCGTTGTCTCGGGGGAAGAAGTGGC 5217

 52645477 CACATTATCCGTCTTGACACTTATTCCCAAGTCGACTGTAAACACAAACATAAACAGTGG 52645536
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     5218 CACATTATCCGTCTTGACACTTATTCCCAAGTCGACTGTAAACACAAACATAAACAGCGG 5277

 52645537 TTATTCAGCCAAGCCGGGAAATTCAGGCACTAATAATGGACTCCAGACATTTTTTATACA 52645596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5278 TTATTCAGCCAAGCCGGGAAATTCAGGCACTAATAATGGACTCCAGACATTTTTTATACA 5337

 52645597 AAAGCCATACTGCATACTGGAACTGTGTTGTTCTCTGGTCATTCTGAAAGGCAGAAGTTA 52645656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5338 AAAGCCATACTGCATACTGGAACTGTGTTGTTCTCTGGTCATTCTGAAAGGCAGAAGTTA 5397

 52645657 GCTCTCTACATCTCCTTGGACCCTGCTTTTCTTGGGAGAGGAGAAGGCAAGGTTGGTGAG 52645716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5398 GCTCTCTACATCTCCTTGGACCCTGCTTTTCTTGGGAGAGGAGAAGGCAAGGTTGGTGAG 5457

 52645717 GAGGGAAAGCTACTTAATGGAAAGTCACTAGCTGCCAGGTGTGGAATGAGTGATATTCAA 52645776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5458 GAGGGAAAGCTACTTAATGGAAAGTCACTAGCTGCCAGGTGTGGAATGAGTGATATTCAA 5517

 52645777 TGTTAATTAATCTTCTTTTATCTGTGTAAGAACTCCGTGAGCAGCATATTGTCATGATGT 52645836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5518 TGTTAATTAATCTTCTTTTATCTGTGTAAGAACTCCGTGAGCAGCATATTGTCATGATGT 5577

 52645837 CAACTGGGAGGCAGTACAGCAGTTAGGAGCTTGGGTTCTGGAGCTAGAACAAGGTTTCTC 52645896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5578 CAACTGGGAGGCAGTACAGCAGTTAGGAGCTTGGGTTCTGGAGCTAGAACAAGGTTTCTC 5637

 52645897 AACCTCAGCACTACTCACATTTGAAGCCAGATTATTCTTTGTTAGGGAGGCTCATCCCGT 52645956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5638 AACCTCAGCACTACTCACATTTGAAGCCAGATTATTCTTTGTTAGGGAGGCTCATCCCGT 5697

 52645957 GCCTCATAGGCTGATTAGCAGCATCCTGGCCTCTGCCCACTAGACGCCGGTCACATTTCC 52646016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5698 GCCTCATAGGCTGATTAGCAGCATCCTGGCCTCTGCCCACTAGACGCCGGTCACATTTCC 5757

 52646017 CAGTCATGGCAACCAAAAATATCTCTAGGCATTGCTAAATGTCCCCTGGAGGACAAAATC 52646076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5758 CAGTCATGGCAACCAAAAATATCTCTAGGCATTGCTAAATGTCCCCTGGAGGACAAAATC 5817

 52646077 TCTTACGTTTGAGAGGCACTGAGCTGAAATGTCTTTTTGAATCCAGATTATCTAATTTTC 52646136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5818 TCTTACGTTTGAGAGGCACTGAGCTGAAATGTCTTTTTGAATCCAGATTATCTAATTTTC 5877

 52646137 TGTGCCTCAACTTTCTGGTAAAAGGAGACAGATAATAAATCTCGTAATTTTGTTAGGAAG 52646196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5878 TGTGCCTCAACTTTCTGGTAAAAGGAGACAGATAATAAATCTCGTAATTTTGTTAGGAAG 5937

 52646197 ATTACATGAGTTAATAGTTTTAAAGCAAGTACAATAGCACCTGGAATATATTAAGTGCTT 52646256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     5938 ATTACATGAGTTAATAGTTTTAAAGCAAGTACAATAGCGCCTGGAATATATTAAGTGCTT 5997

 52646257 AATAAATATCACAAACATTAGTTATCATTATTCATGAGTGAGAAAACTGACAGTCAGAGA 52646316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5998 AATAAATATCACAAACATTAGTTATCATTATTCATGAGTGAGAAAACTGACAGTCAGAGA 6057

 52646317 GGTCAGTACACCCTCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCTAGTAAGCAGCAGAGTCTGGCTTCAG 52646376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6058 GGTCAGTACACCCTCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCTAGTAAGCAGCAGAGTCTGGCTTCAG 6117

 52646377 GCAGAAATCTGACTTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGTCTTACCAGGGACTTGTATTAGCAT 52646436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6118 GCAGAAATCTGACTTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGTCTTACCAGGGACTTGTATTAGCAT 6177

 52646437 AGACTGTTAAGAATATGGGAAGATTTTTAAAATACAGTACTCAGAAAATTTCTCTTTGAA 52646496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6178 AGACTGTTAAGAATATGGGAAGATTTTTAAAATACAGTACTCAGAAAATTTCTCTTTGAA 6237

 52646497 AGGCTGGAAGAGCAGATATCCACACAAGAAGGCAAATTAGACCTCAGGCCAGTGTGGAAT 52646556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     6238 AGGCTGGAAGAGCAGATATCCACACAAGAAGGCAAATTAGACGTCAGGCCAGTGTGGAAT 6297

 52646557 TAAAGGTGTAGGGTTATCTGGTCAAGACTGTGTGTGTGGATACAGGCTCCAACCCCTCCA 52646616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6298 TAAAGGTGTAGGGTTATCTGGTCAAGACTGTGTGTGTGGATACAGGCTCCAACCCCTCCA 6357

 52646617 GGCAAGGGCACTGTTTCCAACATCCACCCTTTCTCCTTTGACCTCTACCTTGACCTAAAT 52646676
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6358 GGCAAGGGCAATGTTTCCAACATCCACCCTTTCTCCTTTGACCTCTACCTTGACCTAAAT 6417

 52646677 TAACTATAAAAGGTCCTTCTTTTCTAGGACCCTACTATAAATCAGTGAAATATTCAGGAA 52646736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6418 TAACTATAAAAGGTCCTTCTTTTCTAGGACCCTACTATAAATCAGTGAAATATTCAGGAA 6477

 52646737 AAAAAGAACACCAAGAATGTTGGGATCCCAGTTAAAGATCAAGATTCTCTACTGATAAGC 52646796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6478 AAAAAGAACACCAAGAATGTTGGGATCCCAGTTAAAGATCAAGATTCTCTACTGATAAGC 6537

 52646797 TGTGTGATATGGAGTAAATCACTAAAGATCTTTGAATCTCTTCATTTGTAAAATGGGAAT 52646856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6538 TGTGTGATATGGAGTAAATCACTAAAGATCTTTGAATCTCTTCATTTGTAAAATGGGAAT 6597

 52646857 ATTGGTAGTCCTACTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTAAAGAAGAAAAGTCATGCAAAGGAT 52646916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6598 ATTGGTAGTCCTACTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTAAAGAAGAAAAGTCATGCAAAGGAT 6657

 52646917 CTGGCACAACGCCTTTTCCATAATAAGTGCTTAGTAATTGACAGATACTGTGATAACTTT 52646976
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6658 CTGGCACAATGCCTTTTCCATAATAAGTGCTTAGTAATTGACAGATACTGTGATAACTTT 6717

 52646977 TCAGGTTTCTCTCATGCCTTTGACAACATTGCATTTTGCTTGCTCTATCTGTAGTCAGAC 52647036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6718 TCAGGTTTCTCTCATGCCTTTGACAACATTGCATTTTGCTTGCTCTATCTGTAGTCAGAC 6777

 52647037 ACTTCTTAATATCTGTTTGCAGGAAGAC 52647064
          ||||||||||||||||||||||||||||
     6778 ACTTCTTAATATCTGTTTGCAGGAAGAC 6805

EXCISED REGION

 52658003 AGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTG 52658062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6806 AGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTG 6865

 52658063 GCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTAT 52658122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6866 GCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTAT 6925

 52658123 AAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGG 52658182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6926 AAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGG 6985

 52658183 GAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTG 52658242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6986 GAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTG 7045

 52658243 AAACACTGTCTCTGCTAAAAAACAAAACAAAACAAAACACCAAAAAATAGCTGGGCGTAG 52658302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7046 AAACACTGTCTCTGCTAAAAAACAAAACAAAACAAAACACCAAAAAATAGCTGGGCGTAG 7105

 52658303 TGGCGGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTTGGGAGGCGGTGGCAGGAGAATCATTTGAACCT 52658362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7106 TGGCGGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTTGGGAGGCGGTGGCAGGAGAATCATTTGAACCT 7165

 52658363 GGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGAT--------TGTGCCACTGCACTCTAACCTGG 52658414
          |||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||
     7166 GGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACTGTGCCACTGCACTCTAACCTGG 7225

 52658415 GCAACAGAGTTCAGAGTGAGACTCTGTCTCCCCC------------------AAAAAAAA 52658456
          ||||||||||||||||||||||||||||||                      ||||||||
     7226 GCAACAGAGTTCAGAGTGAGACTCTGTCTC----ACCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 7281

 52658457 AAAAAAAAAAAAAAGAACAGCCATATAGATCGTCGGTGGGAGTGTAATTTGGCCACTTCT 52658516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7282 AAAAAAAAAAAAAAGAACAGCCATATAGATCGTCGGTGGGAGTGTAATTTGGCCACTTCT 7341

 52658517 TTGGAAAATAGCTCAGTAATATCTATTAATACTTAAAATTTCACAAACACTGTAAGTCTA 52658576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7342 TTGGAAAATAGCTCAGTAATATCTATTAATACTTAAAATTTCACAAACACTGTAAGTCTA 7401

 52658577 ACTTCCACTTCTAAAATGTTATCCTAGAAATAAAATTGCATAGGGGTACAAAGGCTTACG 52658636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7402 ACTTCCACTTCTAAAATGTTATCCTAGAAATAAAATTGCATAGGGGTACAAAGGCTTACG 7461

 52658637 TATGGAACTATTTGCTGGACTACTGTAGTTGTGGCAAAAAACTGGAAATGACCTAAACGC 52658696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7462 TATGGAACTATTTGCTGGACTACTGTAGTTGTGGCAAAAAACTGGAAATGACCTAAACGC 7521

 52658697 TTATTAGTAGAAACCTGGTTAAATAAATTATCATATGTCCTTGAGGACACAGGGACACAA 52658756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7522 TTATTAGTAGAAACCTGGTTAAATAAATTATCATATGTCCTTGAGGACACAGGGACACAA 7581

 52658757 AGAGGGGAATGACAGGCACTGAGCCTACTTGAGGGTGGGAGGAGGAAGTCGATCAGAAAA 52658816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7582 AGAGGGGAATGACAGGCACTGAGCCTACTTGAGGGTGGGAGGAGGAAGTCGATCAGAAAA 7641

 52658817 AATAACTAGTGGGTACTAGGCTTAGTACCCGGGTGAAAAAATAATCTGTACAACAAACCC 52658876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7642 AATAACTAGTGGGTACTAGGCTTAGTACCCGGGTGAAAAAATAATCTGTACAACAAACCC 7701

 52658877 CCATGACATGAGTTTACCTTATAACAAACCTGCACATGTAATCTGAACCTAGATAAAAGT 52658936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7702 CCATGACATGAGTTTACCTTATAACAAACCTGCACATGTAATCTGAACCTAGATAAAAGT 7761

 52658937 TTAAAAAAATAAATAATCATATGTCCCTACAATGAAATATTCCACAGGCATTAAAATTCC 52658996
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     7762 TTAAAAAAATAAATAATCATATGTCCCTATAATGAAATATTCCACAGGCATTAAAATTCC 7821

 52658997 CCAAGGAATTTTAGTAAGGAAAGAAAAAGCTGTGCCCAACAGCACGTACAGTATGTTTCC 52659056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7822 CCAAGGAATTTTAGTAAGGAAAGAAAAAGCTGTGCCCAACAGCACGTACAGTATGTTTCC 7881

 52659057 ATTTGTTTTTAAAAAATGGTGTCGGGAGGTTGAGGAGACAACTTATAAATAGACATGCCT 52659116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7882 ATTTGTTTTTAAAAAATGGTGTCGGGAGGTTGAGGAGACAACTTATAAATAGACATGCCT 7941

 52659117 GGGATACCTCTGGATATAAGAAACTGTAAAGTATTTACTTCTAAGGAAGGAAATTTGGGA 52659176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7942 GGGATACCTCTGGATATAAGAAACTGTAAAGTATTTACTTCTAAGGAAGGAAATTTGGGA 8001

 52659177 TGGGGCTTGGGGAGCCATCAGAGTTAGGGTGGGGATTTTTTCTCTGCCT 52659225
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8002 TGGGGCTTGGGGAGCCATCAGAGTTAGGGTGGGGATTTTTTCTCTGCCT 8050

Alignment time is 9.30914 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [52637064,52668002] =>     30939 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    8453] =>      8453 nucs 'mol-32-2f3e-004443_8453'

Score:        8075
Aligned:      8465        nucs
Identic:      8396 ( 99%) nucs =>      2381 (100%)      6015 ( 99%)
Gaps:           48 (  1%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [52644679,52647064] EXCISED REGION [52658003,52664045]
 second seq =>  [       1,    2386] EXCISED REGION [    2387,    8453]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>     10938 nucs [52647065,52658002]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         6 nucs [52647065,52647070] to [52658003,52658008]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [52647065,52647067] to [52658000,52658002]
 second seq =>         0 nucs

 52644679 TGCATGTAACTCACCTCCTCTTTTCTTTTACATAAAACAGATGCCACAGCTGTTATTGTT 52644738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGCATGTAACTCACCTCCTCTTTTCTTTTACATAAAACAGATGCCACAGCTGTTATTGTT 60

 52644739 CTTCACACAGAAGTTTCTACCCAGAGAAACATCAGGATGACACTCTGCTGCAATGTGCTA 52644798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTTCACACAGAAGTTTCTACCCAGAGAAACATCAGGATGACACTCTGCTGCAATGTGCTA 120

 52644799 TTTGTTCTAGAGGGGTCAACAGCTTGCCACCTTGCCTAGGCCCAGGGTGACTGCATATGT 52644858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTGTTCTAGAGGGGTCAACAGCTTGCCACCTTGCCTAGGCCCAGGGTGACTGCATATGT 180

 52644859 GCAGTGGTCTTATCCCATTAGCGCCCCCGAGCATGCATTCAGAACCAAGTGGATACACCT 52644918
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACAGTGGTCTTATCCCATTAGCGCCCCCGAGCATGCATTCAGAACCAAGTGGATACACCT 240

 52644919 TGGCACACTTACCTTCCCTGCAGGGACATCATCGGACTGCCCTGATAAGCCAGGAACCTC 52644978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGGCACACTTACCTTCCCTGCAGGGACATCATCGGACTGCCCTGATAAGCCAGGAACCTC 300

 52644979 ATCCACCTTGTCTTGATGCTCTGCCCTCTTGGCTTCCTGTTGGCTGTCACCTGGCACCTT 52645038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATCCACCTTGTCTTGATGCTCTGCCCTCTTGGCTTCCTGTTGGCTGTCACCTGGCACCTT 360

 52645039 TTCCTGTCCCTTGTCCAGCTTGAAGAATTTGTCAAAAAAGCTGGAGTCCTTGGGCTTGGA 52645098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTCCTGTCCCTTGTCCAGCTTGAAGAATTTGTCAAAAAAGCTGGAGTCCTTGGGCTTGGA 420

 52645099 GGGAGCTTCTCCTCCTGCTCCCCCTGTCTCAGGTGGGAGAAGCGTGGGATCCCTGGCGGC 52645158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGGAGCTTCTCCTCCTGCTCCCCCTGTCTCAGGTGGGAGAAGCGTGGGATCCCTGGCGGC 480

 52645159 AGAGAGGACCTTGTCTTGGGCCGGGGCGTGCCCTGGGGTTTTATCTGTGTCCTGCCCCGG 52645218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGAGAGGACCTTGTCTTGGGCCGGGGCGTGCCCTGGGGTTTTATCTGTGTCCTGCCCCGG 540

 52645219 TCCAGCTGCCACCGGAAGTGTCCAGCTCTCACTTGGGTCTTTGTTCGCTGGAGCTTTATT 52645278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCCAGCTGCCACCGGAAGTGTCCAGCTCTCACTTGGGTCTTTGTTCGCTGGAGCTTTATT 600

 52645279 GGAGCTGACATCAAGCTTCACTGATCCAAGGGATGAATCTGCGGCTTGGTCTCCGGTACG 52645338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GGAGCTGACATCAAGCTTCACTGATCCAAGGGATGAATCTGCGGCTTGGTCTCCGGTACG 660

 52645339 TCCTGGTACAGGCCGAGAGAGCATCAAGAAAAAACGAGATTTAGCAGCTGGTGCCTCGGG 52645398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCCTGGTACAGGCCGAGAGAGCATCAAGAAAAAACGAGATTTAGCAGCTGGTGCCTCGGG 720

 52645399 TTTGGCCTCTTTCCCAAGATTCTTTCCGTTGGCATCCGCAACAGCACTTATCTCCGTTGT 52645458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTTGGCCTCTTTCCCAAGATTCTTTCCGTTGGCATCCGCAACAGCACTTATCTCCGTTGT 780

 52645459 CTCGGGGGAAGAAGTGGCCACATTATCCGTCTTGACACTTATTCCCAAGTCGACTGTAAA 52645518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTCGGGGGAAGAAGTGGCCACATTATCCGTCTTGACACTTATTCCCAAGTCGACTGTAAA 840

 52645519 CACAAACATAAACAGTGGTTATTCAGCCAAGCCGGGAAATTCAGGCACTAATAATGGACT 52645578
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CACAAACATAAACAGCGGTTATTCAGCCAAGCCGGGAAATTCAGGCACTAATAATGGACT 900

 52645579 CCAGACATTTTTTATACAAAAGCCATACTGCATACTGGAACTGTGTTGTTCTCTGGTCAT 52645638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CCAGACATTTTTTATACAAAAGCCATACTGCATACTGGAACTGTGTTGTTCTCTGGTCAT 960

 52645639 TCTGAAAGGCAGAAGTTAGCTCTCTACATCTCCTTGGACCCTGCTTTTCTTGGGAGAGGA 52645698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TCTGAAAGGCAGAAGTTAGCTCTCTACATCTCCTTGGACCCTGCTTTTCTTGGGAGAGGA 1020

 52645699 GAAGGCAAGGTTGGTGAGGAGGGAAAGCTACTTAATGGAAAGTCACTAGCTGCCAGGTGT 52645758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GAAGGCAAGGTTGGTGAGGAGGGAAAGCTACTTAATGGAAAGTCACTAGCTGCCAGGTGT 1080

 52645759 GGAATGAGTGATATTCAATGTTAATTAATCTTCTTTTATCTGTGTAAGAACTCCGTGAGC 52645818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GGAATGAGTGATATTCAATGTTAATTAATCTTCTTTTATCTGTGTAAGAACTCCGTGAGC 1140

 52645819 AGCATATTGTCATGATGTCAACTGGGAGGCAGTACAGCAGTTAGGAGCTTGGGTTCTGGA 52645878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGCATATTGTCATGATGTCAACTGGGAGGCAGTACAGCAGTTAGGAGCTTGGGTTCTGGA 1200

 52645879 GCTAGAACAAGGTTTCTCAACCTCAGCACTACTCACATTTGAAGCCAGATTATTCTTTGT 52645938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GCTAGAACAAGGTTTCTCAACCTCAGCACTACTCACATTTGAAGCCAGATTATTCTTTGT 1260

 52645939 TAGGGAGGCTCATCCCGTGCCTCATAGGCTGATTAGCAGCATCCTGGCCTCTGCCCACTA 52645998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TAGGGAGGCTCATCCCGTGCCTCATAGGCTGATTAGCAGCATCCTGGCCTCTGCCCACTA 1320

 52645999 GACGCCGGTCACATTTCCCAGTCATGGCAACCAAAAATATCTCTAGGCATTGCTAAATGT 52646058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GACGCCGGTCACATTTCCCAGTCATGGCAACCAAAAATATCTCTAGGCATTGCTAAATGT 1380

 52646059 CCCCTGGAGGACAAAATCTCTTACGTTTGAGAGGCACTGAGCTGAAATGTCTTTTTGAAT 52646118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CCCCTGGAGGACAAAATCTCTTACGTTTGAGAGGCACTGAGCTGAAATGTCTTTTTGAAT 1440

 52646119 CCAGATTATCTAATTTTCTGTGCCTCAACTTTCTGGTAAAAGGAGACAGATAATAAATCT 52646178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CCAGATTATCTAATTTTCTGTGCCTCAACTTTCTGGTAAAAGGAGACAGATAATAAATCT 1500

 52646179 CGTAATTTTGTTAGGAAGATTACATGAGTTAATAGTTTTAAAGCAAGTACAATAGCACCT 52646238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     1501 CGTAATTTTGTTAGGAAGATTACATGAGTTAATAGTTTTAAAGCAAGTACAATAGCGCCT 1560

 52646239 GGAATATATTAAGTGCTTAATAAATATCACAAACATTAGTTATCATTATTCATGAGTGAG 52646298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GGAATATATTAAGTGCTTAATAAATATCACAAACATTAGTTATCATTATTCATGAGTGAG 1620

 52646299 AAAACTGACAGTCAGAGAGGTCAGTACACCCTCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCTAGTAAGC 52646358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AAAACTGACAGTCAGAGAGGTCAGTACACCCTCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCTAGTAAGC 1680

 52646359 AGCAGAGTCTGGCTTCAGGCAGAAATCTGACTTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGTCTTACC 52646418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AGCAGAGTCTGGCTTCAGGCAGAAATCTGACTTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGTCTTACC 1740

 52646419 AGGGACTTGTATTAGCATAGACTGTTAAGAATATGGGAAGATTTTTAAAATACAGTACTC 52646478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AGGGACTTGTATTAGCATAGACTGTTAAGAATATGGGAAGATTTTTAAAATACAGTACTC 1800

 52646479 AGAAAATTTCTCTTTGAAAGGCTGGAAGAGCAGATATCCACACAAGAAGGCAAATTAGAC 52646538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AGAAAATTTCTCTTTGAAAGGCTGGAAGAGCAGATATCCACACAAGAAGGCAAATTAGAC 1860

 52646539 CTCAGGCCAGTGTGGAATTAAAGGTGTAGGGTTATCTGGTCAAGACTGTGTGTGTGGATA 52646598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CTCAGGCCAGTGTGGAATTAAAGGTGTAGGGTTATCTGGTCAAGACTGTGTGTGTGGATA 1920

 52646599 CAGGCTCCAACCCCTCCAGGCAAGGGCACTGTTTCCAACATCCACCCTTTCTCCTTTGAC 52646658
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CAGGCTCCAACCCCTCCAGGCAAGGGCAATGTTTCCAACATCCACCCTTTCTCCTTTGAC 1980

 52646659 CTCTACCTTGACCTAAATTAACTATAAAAGGTCCTTCTTTTCTAGGACCCTACTATAAAT 52646718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CTCTACCTTGACCTAAATTAACTATAAAAGGTCCTTCTTTTCTAGGACCCTACTATAAAT 2040

 52646719 CAGTGAAATATTCAGGAAAAAAAGAACACCAAGAATGTTGGGATCCCAGTTAAAGATCAA 52646778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CAGTGAAATATTCAGGAAAAAAAGAACACCAAGAATGTTGGGATCCCAGTTAAAGATCAA 2100

 52646779 GATTCTCTACTGATAAGCTGTGTGATATGGAGTAAATCACTAAAGATCTTTGAATCTCTT 52646838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GATTCTCTACTGATAAGCTGTGTGATATGGAGTAAATCACTAAAGATCTTTGAATCTCTT 2160

 52646839 CATTTGTAAAATGGGAATATTGGTAGTCCTACTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTAAAGAAG 52646898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CATTTGTAAAATGGGAATATTGGTAGTCCTACTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTAAAGAAG 2220

 52646899 AAAAGTCATGCAAAGGATCTGGCACAACGCCTTTTCCATAATAAGTGCTTAGTAATTGAC 52646958
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AAAAGTCATGCAAAGGATCTGGCACAATGCCTTTTCCATAATAAGTGCTTAGTAATTGAC 2280

 52646959 AGATACTGTGATAACTTTTCAGGTTTCTCTCATGCCTTTGACAACATTGCATTTTGCTTG 52647018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AGATACTGTGATAACTTTTCAGGTTTCTCTCATGCCTTTGACAACATTGCATTTTGCTTG 2340

 52647019 CTCTATCTGTAGTCAGACACTTCTTAATATCTGTTTGCAGGAAGAC 52647064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CTCTATCTGTAGTCAGACACTTCTTAATATCTGTTTGCAGGAAGAC 2386

EXCISED REGION

 52658003 AGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTG 52658062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2387 AGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTG 2446

 52658063 GCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTAT 52658122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2447 GCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTAT 2506

 52658123 AAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGG 52658182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2507 AAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGG 2566

 52658183 GAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTG 52658242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2567 GAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTG 2626

 52658243 AAACACTGTCTCTGCTAAAAAACAAAACAAAACAAAACACCAAAAAATAGCTGGGCGTAG 52658302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2627 AAACACTGTCTCTGCTAAAAAACAAAACAAAACAAAACACCAAAAAATAGCTGGGCGTAG 2686

 52658303 TGGCGGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTTGGGAGGCGGTGGCAGGAGAATCATTTGAACCT 52658362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2687 TGGCGGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTTGGGAGGCGGTGGCAGGAGAATCATTTGAACCT 2746

 52658363 GGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGAT--------TGTGCCACTGCACTCTAACCTGG 52658414
          |||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||
     2747 GGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACTGTGCCACTGCACTCTAACCTGG 2806

 52658415 GCAACAGAGTTCAGAGTGAGACTCTGTCTCCCCC------------------AAAAAAAA 52658456
          ||||||||||||||||||||||||||||||                      ||||||||
     2807 GCAACAGAGTTCAGAGTGAGACTCTGTCTC----ACCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 2862

 52658457 AAAAAAAAAAAAAAGAACAGCCATATAGATCGTCGGTGGGAGTGTAATTTGGCCACTTCT 52658516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2863 AAAAAAAAAAAAAAGAACAGCCATATAGATCGTCGGTGGGAGTGTAATTTGGCCACTTCT 2922

 52658517 TTGGAAAATAGCTCAGTAATATCTATTAATACTTAAAATTTCACAAACACTGTAAGTCTA 52658576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2923 TTGGAAAATAGCTCAGTAATATCTATTAATACTTAAAATTTCACAAACACTGTAAGTCTA 2982

 52658577 ACTTCCACTTCTAAAATGTTATCCTAGAAATAAAATTGCATAGGGGTACAAAGGCTTACG 52658636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2983 ACTTCCACTTCTAAAATGTTATCCTAGAAATAAAATTGCATAGGGGTACAAAGGCTTACG 3042

 52658637 TATGGAACTATTTGCTGGACTACTGTAGTTGTGGCAAAAAACTGGAAATGACCTAAACGC 52658696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3043 TATGGAACTATTTGCTGGACTACTGTAGTTGTGGCAAAAAACTGGAAATGACCTAAACGC 3102

 52658697 TTATTAGTAGAAACCTGGTTAAATAAATTATCATATGTCCTTGAGGACACAGGGACACAA 52658756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3103 TTATTAGTAGAAACCTGGTTAAATAAATTATCATATGTCCTTGAGGACACAGGGACACAA 3162

 52658757 AGAGGGGAATGACAGGCACTGAGCCTACTTGAGGGTGGGAGGAGGAAGTCGATCAGAAAA 52658816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3163 AGAGGGGAATGACAGGCACTGAGCCTACTTGAGGGTGGGAGGAGGAAGTCGATCAGAAAA 3222

 52658817 AATAACTAGTGGGTACTAGGCTTAGTACCCGGGTGAAAAAATAATCTGTACAACAAACCC 52658876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3223 AATAACTAGTGGGTACTAGGCTTAGTACCCGGGTGAAAAAATAATCTGTACAACAAACCC 3282

 52658877 CCATGACATGAGTTTACCTTATAACAAACCTGCACATGTAATCTGAACCTAGATAAAAGT 52658936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3283 CCATGACATGAGTTTACCTTATAACAAACCTGCACATGTAATCTGAACCTAGATAAAAGT 3342

 52658937 TTAAAAAAATAAATAATCATATGTCCCTACAATGAAATATTCCACAGGCATTAAAATTCC 52658996
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     3343 TTAAAAAAATAAATAATCATATGTCCCTATAATGAAATATTCCACAGGCATTAAAATTCC 3402

 52658997 CCAAGGAATTTTAGTAAGGAAAGAAAAAGCTGTGCCCAACAGCACGTACAGTATGTTTCC 52659056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3403 CCAAGGAATTTTAGTAAGGAAAGAAAAAGCTGTGCCCAACAGCACGTACAGTATGTTTCC 3462

 52659057 ATTTGTTTTTAAAAAATGGTGTCGGGAGGTTGAGGAGACAACTTATAAATAGACATGCCT 52659116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3463 ATTTGTTTTTAAAAAATGGTGTCGGGAGGTTGAGGAGACAACTTATAAATAGACATGCCT 3522

 52659117 GGGATACCTCTGGATATAAGAAACTGTAAAGTATTTACTTCTAAGGAAGGAAATTTGGGA 52659176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3523 GGGATACCTCTGGATATAAGAAACTGTAAAGTATTTACTTCTAAGGAAGGAAATTTGGGA 3582

 52659177 TGGGGCTTGGGGAGCCATCAGAGTTAGGGTGGGGATTTTTTCTCTGCCTTATCTTATTAT 52659236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3583 TGGGGCTTGGGGAGCCATCAGAGTTAGGGTGGGGATTTTTTCTCTGCCTTATCTTATTAT 3642

 52659237 GTATATCGCTCAGAATGTTTGCTATGTGTATGCACCTACCCCATCCATTAAGAAATGAAG 52659296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3643 GTATATCGCTCAGAATGTTTGCTATGTGTATGCACCTACCCCATCCATTAAGAAATGAAG 3702

 52659297 AAATAATGAAAAGAAAAAATGAAAGTAGGGAACTAGAAATGAGAGGTGGGATTCAAAGTG 52659356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3703 AAATAATGAAAAGAAAAAATGAAAGTAGGGAACTAGAAATGAGAGGTGGGATTCAAAGTG 3762

 52659357 GACTGAACACTTGACCTATTTCCCAATTTGCCTAGGGCTGGCCCAGCAGCGAGGCAGGTT 52659416
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     3763 GACTGAACACTTGACCTATTTCCCAATTTGCCTGGGGCTGGCCCAGCAGCGAGGCAGGTT 3822

 52659417 CTAACCAATGAGCATCAGCTTTGAATGGAGGGGCTGATAGGCCAGGTGGGCCCTGCTTGC 52659476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3823 CTAACCAATGAGCATCAGCTTTGAATGGAGGGGCTGATAGGCCAGGTGGGCCCTGCTTGC 3882

 52659477 TGAGAGTGTCATGGCCTTAGGGACATCTCCATGTTGCAGAGTCTGAGCCTCTGCTTGGCA 52659536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3883 TGAGAGTGTCATGGCCTTAGGGACATCTCCATGTTGCAGAGTCTGAGCCTCTGCTTGGCA 3942

 52659537 AATTCAGAAAATCCAGCTTTTCTTTTTATATCACCTGGAGCTGATGTAACTCTCAGAAGG 52659596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     3943 AATTCAGAAAATCCAGCTTTTCTTTTTATATCACCTGGAGCTGATGTAACTCTCAGAACG 4002

 52659597 CATTTTTAAGAGGACTCATGAATTAACCACATAGCCAACTTACTGGCTTAAGACTACGTG 52659656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4003 CATTTTTAAGAGGACTCATGAATTAACCACATAGCCAACTTACTGGCTTAAGACTACGTG 4062

 52659657 ACAGAAAGCTGCAAAGGGGGCCAGCCACTGGTAACATCCCACCACTGTCCCTCTCTGTGG 52659716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4063 ACAGAAAGCTGCAAAGGGGGCCAGCCACTGGTAACATCCCACCACTGTCCCTCTCTGTGG 4122

 52659717 AAAACACAGATGGGATGCACATTGTGACGGGCAGGATGCCTGGAGAGCCCACAAATCTGC 52659776
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     4123 AAAACACAGATGGGATGCACATTGTGATGGGCAGGATGCCTGGAGAGCCCACAAATCTGC 4182

 52659777 AAGCACAGCTGAAATTGGTTACAGGATTTCAATGTTTCATTGCTTGAAGCTATGATAACT 52659836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4183 AAGCACAGCTGAAATTGGTTACAGGATTTCAATGTTTCATTGCTTGAAGCTATGATAACT 4242

 52659837 TGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGACGATGATTTTTTTTATAGCCATCTTTT 52659896
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4243 ---TGATGATGATGATGATGATGATGATGATGACGATGATTTTTTTTATAGCCATCTTTT 4299

 52659897 TAGAGGGATTTGAGGTAGGGAAAAAAATAAACCTCACACTATCGGAGGTTGCCAACTATG 52659956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4300 TAGAGGGATTTGAGGTAGGGAAAAAAATAAACCTCACACTATCGGAGGTTGCCAACTATG 4359

 52659957 AGGTCTGCTGATGGTTTGGCCAACACAGTGTTTATATTTTTTTGAATTGGGAAATTTCAT 52660016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4360 AGGTCTGCTGATGGTTTGGCCAACACAGTGTTTATATTTTTTTGAATTGGGAAATTTCAT 4419

 52660017 TTAAAAGTCCTAAAATCAGGCTGTTATTGAAATATCTTATTATTGGCTCAGGGTTTCCCA 52660076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4420 TTAAAAGTCCTAAAATCAGGCTGTTATTGAAATATCTTATTATTGGCTCAGGGTTTCCCA 4479

 52660077 GGGCAGCCATCCTTGAAGCTGTGTGGAGCCCTATAAACAAGGACGCTTTCCAGTTCCCTG 52660136
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     4480 GGGCAGCCATCCTTGAAGCTGTGTGGAGCCCTATAAACAAGGAGGCTTTCCAGTTCCCTG 4539

 52660137 CAAACTCCATTTCATTCAGAGCCTTGAGCCAGTTCTTACATGGTCCTCAGACTTGAGCTA 52660196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4540 CAAACTCCATTTCATTCAGAGCCTTGAGCCAGTTCTTACATGGTCCTCAGACTTGAGCTA 4599

 52660197 GTGCAAGAATACCCGGGAGGGGTTGTGGGAACAGATAGCTGGGCCCCACCCCCAGGGAAG 52660256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4600 GTGCAAGAATACCCGGGAGGGGTTGTGGGAACAGATAGCTGGGCCCCACCCCCAGGGAAG 4659

 52660257 GGGGTGTTTCTGACTCAGGAGGTCTGGGCTCCGGCTACAGAAACTGCACATCTAACCGGT 52660316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4660 GGGGTGTTTCTGACTCAGGAGGTCTGGGCTCCGGCTACAGAAACTGCACATCTAACCGGT 4719

 52660317 ACCCAGGTGATGTGATGCTGCTGGCCCAGGGACAACTCTGCGAGTCACTGCTATTGGGCA 52660376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4720 ACCCAGGTGATGTGATGCTGCTGGCCCAGGGACAACTCTGCGAGTCACTGCTATTGGGCA 4779

 52660377 CTGCTATTGCACCCACACAAGGAGGCAGGCTCTGCTTACATTTTTCAGTTCTTGTTCCCA 52660436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4780 CTGCTATTGCACCCACACAAGGAGGCAGGCTCTGCTTACATTTTTCAGTTCTTGTTCCCA 4839

 52660437 GAAACATTTGCTCTTTGGGGTATGCTTTGCATATAATGGATCCTACCCACTAATACAGTA 52660496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4840 GAAACATTTGCTCTTTGGGGTATGCTTTGCATATAATGGATCCTACCCACTAATACAGTA 4899

 52660497 TGCTGCTTTTATTGATAAACTTCCAGAAACTTGAAGCGCACCTTACCATTTCTTTGATCT 52660556
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     4900 TGCTGCTTTTATTGATAAACTTCCAGATACTTGAAGCGCACCTTACCATTTCTTTGATCT 4959

 52660557 CGCTGATTATTTTTATTTTTGTTAAATGAAAATTGTTGGTAAGTTCTTTTTGGTGTGGTA 52660616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4960 CGCTGATTATTTTTATTTTTGTTAAATGAAAATTGTTGGTAAGTTCTTTTTGGTGTGGTA 5019

 52660617 AAAGGATATGAAAAGCTGATTTTAAAAAAATGTCCACTCTAGGATTAGAATTGTAGGTGT 52660676
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5020 AAAGGATATGAAAAACTGATTTTAAAAAAATGTCCACTCTAGGATTAGAATTGTAGGTGT 5079

 52660677 GTTTATTCTATTTCAAGATCTGGTTAAAATGCACCTTGAGGAAAAGAATTGAGTGCAGCT 52660736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5080 GTTTATTCTATTTCAAGATCTGGTTAAAATGCACCTTGAGGAAAAGAATTGAGTGCAGCT 5139

 52660737 GTTGTTATTTCTCAATGCTGTTTCTCTTTTCATGTTTTTTTCATGTTGTCTCTTGGTCTG 52660796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5140 GTTGTTATTTCTCAATGCTGTTTCTCTTTTCATGTTTTTTTCATGTTGTCTCTTGGTCTG 5199

 52660797 TCCTATCTCTCTTGGTCTATCCTCCAAGACAGAGATGAGTGATCTTGAAACCCTGCCCAT 52660856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5200 TCCTATCTCTCTTGGTCTATCCTCCAAGACAGAGATGAGTGATCTTGAAACCCTGCCCAT 5259

 52660857 GTTTTTATCTTTGGAGCCCAACTGTGCTGCCTTGTTTTCTTCTCCATCCAAAGAGGCAAA 52660916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5260 GTTTTTATCTTTGGAGCCCAACTGTGCTGCCTTGTTTTCTTCTCCATCCAAAGAGGCAAA 5319

 52660917 GAGAAAGTTGCATATTACTCAACAGCAGTTGCATGACAGTTAAAATCAGACTGTATGAGT 52660976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5320 GAGAAAGTTGCATATTACTCAACAGCAGTTGCATGACAGTTAAAATCAGACTGTATGAGT 5379

 52660977 CATGGAACAGTAAGTTGTGTCCAGAGTATCTGTCATGGTAAGTACAAAAAAGTCCTTAAA 52661036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5380 CATGGAACAGTAAGTTGTGTCCAGAGTATCTGTCATGGTAAGTACAAAAAAGTCCTTAAA 5439

 52661037 AATTTAAAACAGAAATGCCAATGTTTTATTTTTGAAAAATGTGAAGAAGAAATTTTCCGG 52661096
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     5440 AATTTAAAACAGAAATGCCAATGTTTTATTTCTGAAAAATGTGAAGAAGAAATTTTCCGG 5499

 52661097 CCGGGCGCGGTGGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATC 52661156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5500 CCGGGCGCGGTGGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATC 5559

 52661157 ACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACACAGTGCAACCCCATCTCTACTAA 52661216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5560 ACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACACAGTGCAACCCCATCTCTACTAA 5619

 52661217 AAATACAAAAATTAGCCAGATGCGGTGGCACGCGCCTGTAATCTCAGCTACTAGGGAGGC 52661276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5620 AAATACAAAAATTAGCCAGATGCGGTGGCACGCGCCTGTAATCTCAGCTACTAGGGAGGC 5679

 52661277 TGAGGCATGACAATCGCTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCATACC 52661336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5680 TGAGGCATGACAATCGCTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCATACC 5739

 52661337 ACTGCACTCCAGCTTGGGCAGCGGAAGGAGACTCTGTCTC--------AAAAAAAAAAAG 52661388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||
     5740 ACTGCACTCCAGCTTGGGCAGCGGAAGGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAG 5799

 52661389 AAAAAAAGAAATTTTCTAAGTGTATTCCAAATAACTTTTAATATTGGATAAACATTACGA 52661448
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     5800 AAAAAAAGAAATTTTCTAAGTGTATTCCGAATAACTTTTAATATTGGATAAACATTACGA 5859

 52661449 GTTTAAAAATACTTATGCCAGAGGAGTGCTGTGACTCGTGCCTCTAATCCCAGCAATGTG 52661508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5860 GTTTAAAAATACTTATGCCAGAGGAGTGCTGTGACTCGTGCCTCTAATCCCAGCAATGTG 5919

 52661509 GGAGGCCAAGGAGGGACAGTCACTTGAGCCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGATAACAAA 52661568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5920 GGAGGCCAAGGAGGGACAGTCACTTGAGCCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGATAACAAA 5979

 52661569 GGGAGACCTCATCTTTACAAAAAAACTAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGTGTGTGCCTG 52661628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5980 GGGAGACCTCATCTTTACAAAAAAACTAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGTGTGTGCCTG 6039

 52661629 TGATCCCAGCTACACAGGAGGCTGAGGCAAGAGGATTCCTTGAGCCCTGGAGGTCAAGGC 52661688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6040 TGATCCCAGCTACACAGGAGGCTGAGGCAAGAGGATTCCTTGAGCCCTGGAGGTCAAGGC 6099

 52661689 TGCAGTGAGTGATGATCATGCCATTGCACTCCAGCTGGGTGACAGAGCAAGACCTCATCT 52661748
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6100 TGCAGTGAGCGATGATCATGCCATTGCACTCCAGCTGGGTGACAGAGCAAGACCTCATCT 6159

 52661749 CAAAAAAAAAAAA-AAAACAAAACAAAACAAAAAACTTACGCCCAGGTAAAAATTGTCAG 52661807
          ||||||.||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6160 CAAAAACAAAA--CAAAACAAAACAAAACAAAAAACTTACGCCCAGGTAAAAATTGTCAG 6217

 52661808 AGAAAAATAAGAAAAAAACTGAATGCCCAAAATTAGCATAATGGCTGAATGAATTATAGT 52661867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6218 AGAAAAATAAGAAAAAAACTGAATGCCCAAAATTAGCATAATGGCTGAATGAATTATAGT 6277

 52661868 ATGTCTATACCTTGAAGTACATTGTAGCTTTAAAAAAAATGAATTAAAGTTATACCAGTT 52661927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6278 ATGTCTATACCTTGAAGTACATTGTAGCTTTAAAAAAAATGAATTAAAGTTATACCAGTT 6337

 52661928 GAATTTGGAGTTGAGATGGGGAAGATTATTACAATTAAAAAAAAACAAACACTATTAATG 52661987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6338 GAATTTGGAGTTGAGATGGGGAAGATTATTACAATTAAAAAAAAACAAACACTATTAATG 6397

 52661988 GATGTGCTGGGAAATGTCTGTATGGGGCTAGTTAAAGTAAATTAAAATAAAGACCAGACC 52662047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6398 GATGTGCTGGGAAATGTCTGTATGGGGCTAGTTAAAGTAAATTAAAATAAAGACCAGACC 6457

 52662048 TGAAGAATCCCTGAGCGGACAAAGCCTGTTAGACCACATAAATGAGCTAAACCTTGCTTG 52662107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6458 TGAAGAATCCCTGAGCGGACAAAGCCTGTTAGACCACATAAATGAGCTAAACCTTGCTTG 6517

 52662108 ATTTGCAGACATAAGCAAAACAACTCGAACTGTTTCTTGTAAATGCCTATGCTAAAGAAA 52662167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6518 ATTTGCAGACATAAGCAAAACAACTCGAACTGTTTCTTGTAAATGCCTATGCTAAAGAAA 6577

 52662168 AACAGAACTTGAGCTCAACCAATCAGAAACAGTCAACAAACTTAAAATTATATAACTGGG 52662227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6578 AACAGAACTTGAGCTCAACCAATCAGAAACAGTCAACAAACTTAAAATTATATAACTGGG 6637

 52662228 TACCTTCCAATGAGATGATCAAATAAGGCAACTGTGTAATTGTAACACATCAAACACATT 52662287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6638 TACCTTCCAATGAGATGATCAAATAAGGCAACTGTGTAATTGTAACACATCAAACACATT 6697

 52662288 TTATATTATGCCTCTGCATTTTCCCTTAATTCTGGCATGTAATGCTTTGTCATCAAAACA 52662347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6698 TTATATTATGCCTCTGCATTTTCCCTTAATTCTGGCATGTAATGCTTTGTCATCAAAACA 6757

 52662348 CTAATTCCCTTTTGGTTTTCTTTTCTCAAATTAATGAATTGCCTCTATTCAGATACACTC 52662407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6758 CTAATTCCCTTTTGGTTTTCTTTTCTCAAATTAATGAATTGCCTCTATTCAGATACACTC 6817

 52662408 TTTGAAATTTTATTGTGTCTCAGATTTGTCTTTTACAAAGTATAGAACAAAGAGAAAAAT 52662467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6818 TTTGAAATTTTATTGTGTCTCAGATTTGTCTTTTACAAAGTATAGAACAAAGAGAAAAAT 6877

 52662468 ATGAAAGAAGAAATATTAGGTTGTTAGCTTGGGTGTCCTTGGAGGGGGTAGGGAAGATGT 52662527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6878 ATGAAAGAAGAAATATTAGGTTGTTAGCTTGGGTGTCCTTGGAGGGGGTAGGGAAGATGT 6937

 52662528 GAGATGAGGAAGAAGCCAATAAGAAAAAGAAAAAGACAGGTTTCACCAAAACAACAATAA 52662587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6938 GAGATGAGGAAGAAGCCAATAAGAAAAAGAAAAAGACAGGTTTCACCAAAACAACAATAA 6997

 52662588 CAGAAAATATGATTGCATTTATTCATATATGTTAATTGGTATGTATGTAAGTATATATGC 52662647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6998 CAGAAAATATGATTGCATTTATTCATATATGTTAATTGGTATGTATGTAAGTATATATGC 7057

 52662648 ATGTAAAAATAAAATACAAAGAATTAAAATGCATACTAATAGTTATTTCAGTTATCTATG 52662707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7058 ATGTAAAAATAAAATACAAAGAATTAAAATGCATACTAATAGTTATTTCAGTTATCTATG 7117

 52662708 GCTGTGTAACAAGCATCCCCAAAATGATTGACTTAACCACCATTTTATTAGGTCATGATT 52662767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7118 GCTGTGTAACAAGCATCCCCAAAATGATTGACTTAACCACCATTTTATTAGGTCATGATT 7177

 52662768 CCATGCATTAAGAATTCAGGGCCGGGTGCGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTG 52662827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7178 CCATGCATTAAGAATTCAGGGCCGGGTGCGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTG 7237

 52662828 GGAGGCCAAGGTGGGTGGATCACGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGCCCAACATAGT 52662887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7238 GGAGGCCAAGGTGGGTGGATCACGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGCCCAACATAGT 7297

 52662888 GGAACCCCGTCTGTACTAAAAATACAGAAGATTAGCTGGGTGTGGTGGCGGGCACCTGTA 52662947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7298 GGAACCCCGTCTGTACTAAAAATACAGAAGATTAGCTGGGTGTGGTGGCGGGCACCTGTA 7357

 52662948 ATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAAGCTGGAAGGCAGAGGTTG 52663007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     7358 ATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAAGCTGGAAGGCGGAGGTTG 7417

 52663008 CAGTGAGCCAAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGTGGACAGCGCGAGACTCCATCTC 52663067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7418 CAGTGAGCCAAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGTGGACAGCGCGAGACTCCATCTC 7477

 52663068 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAATTCAGGCAGATGCCAGGTGCAGTGGCTCATACCTGTA 52663127
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7478 ---AAAAAAAAAAAAAAAAAGAATTCAGGCAGATGCCAGGTGCAGTGGCTCATACCTGTA 7534

 52663128 ATTCTAGCACTTTGGGAGGCTGAGATGGGCAGATCACCTGAAGTCAAGGAGTTCCAGACC 52663187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7535 ATTCTAGCACTTTGGGAGGCTGAGATGGGCAGATCACCTGAAGTCAAGGAGTTCCAGACC 7594

 52663188 AGCCTGGCCAACATGGTGAAAACCAGTCTGTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGACATG 52663247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7595 AGCCTGGCCAACATGGTGAAAACCAGTCTGTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGACATG 7654

 52663248 GTGGCACGTGCCTGTAATCCCAGCTATACAAGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGATCT 52663307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7655 GTGGCACGTGCCTGTAATCCCAGCTATACAAGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGATCT 7714

 52663308 GGGACGTGGAGGTTGCAGCAAGCCAAGATCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGA 52663367
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7715 GGGAGGTGGAGGTTGCAGCAAGCCAAGATCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGA 7774

 52663368 GTGAGACTCTGTCTC-AAAAAAAAAAAAAAAGAATTCAGGCAGAGAGAGGATAGGATCAG 52663426
          ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7775 GTGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGAATTCAGGCAGAGAGAGGATAGGATCAG 7834

 52663427 CTTATTTCTGCTCTATGATGTCTGGAGCCACAGCTGGGGTGCCTTGAAAGGATGAAGATG 52663486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7835 CTTATTTCTGCTCTATGATGTCTGGAGCCACAGCTGGGGTGCCTTGAAAGGATGAAGATG 7894

 52663487 GCTGGGACGGCTCACACAGGGACATATGTCTGGAGCTTTAGTTCTGGCTATGGGCTGGTT 52663546
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7895 GCTGGGATGGCTCACACAGGGACATATGTCTGGAGCTTTAGTTCTGGCTATGGGCTGGTT 7954

 52663547 CCTATGGTCCTTCCTCATACGGCATCTATTAGCTGAAATGCCCATGATGTCTTCTTTAAT 52663606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7955 CCTATGGTCCTTCCTCATACGGCATCTATTAGCTGAAATGCCCATGATGTCTTCTTTAAT 8014

 52663607 CACAGGTCTGGTTCCTGGACTGGGATGGCTGGAATATTTGGGAACTGGCTGGGTACCTCT 52663666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8015 CACAGGTCTGGTTCCTGGACTGGGATGGCTGGAATATTTGGGAACTGGCTGGGTACCTCT 8074

 52663667 CTCTTGCCTCATGGCTTCTTCATGTGACTAGCTTGGGCTCTCTCACAGCATGGCAATCTC 52663726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8075 CTCTTGCCTCATGGCTTCTTCATGTGACTAGCTTGGGCTCTCTCACAGCATGGCAATCTC 8134

 52663727 AGGGTAGAACTTCTGATATTGTGTCTAGCCTTTCTCAGAGCTAGTGTTGCAAGAGACAAG 52663786
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     8135 AGGGTAGAACTTCTGATATTGTGTCTAGGCTTTCTCAGAGCTAGTGTTGCAAGAGACAAG 8194

 52663787 GCAGAAGCTCCGAGTCTTCTTAAAAGGCTTCTTGAAAGTCCTGTGTCATCCCTTCTACTA 52663846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8195 GCAGAAGCTCCGAGTCTTCTTAAAAGGCTTCTTGAAAGTCCTGTGTCATCCCTTCTACTA 8254

 52663847 CATACTGTTGGTTATATAGGACCAGCCCAGAGGGGACTACACAGGGGTGTGAATACCAGG 52663906
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8255 CATACTGTTGGTTATATAGGACCAGTCCAGAGGGGACTACACAGGGGTGTGAATACCAGG 8314

 52663907 AAGCATGGGTTATTGCGTGGTGGGTTGTATGTGTGCATCTTTGGAGACTATCAACCACAA 52663966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8315 AAGCATGGGTTATTGCGTGGTGGGTTGTATGTGTGCATCTTTGGAGACTATCAACCACAA 8374

 52663967 TAATGCAATAGGGAAGATAATTTTATCTAACAGGAATTCTCCACTAGACTTTTTGGTGAG 52664026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8375 TAATGCAATAGGGAAGATAATTTTATCTAACAGGAATTCTCCACTAGACTTTTTGGTGAG 8434

 52664027 AAAAAGCACTGAGTTTGAG 52664045
          |||||||||||||||||||
     8435 AAAAAGCACTGAGTTTGAG 8453

Alignment time is 11.3798 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [52637064,52668002] =>     30939 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    2392] =>      2392 nucs 'mol-32-2f3e-004443_2392'

Score:        2347
Aligned:      2391        nucs
Identic:      2387 (100%) nucs =>       180 (100%)      2207 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [52644679,52644858] EXCISED REGION [52644860,52647070]
 second seq =>  [       1,     180] EXCISED REGION [     182,    2392]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [52644859,52644859]
 second seq =>         1 nucs [181,181]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 52644679 TGCATGTAACTCACCTCCTCTTTTCTTTTACATAAAACAGATGCCACAGCTGTTATTGTT 52644738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGCATGTAACTCACCTCCTCTTTTCTTTTACATAAAACAGATGCCACAGCTGTTATTGTT 60

 52644739 CTTCACACAGAAGTTTCTACCCAGAGAAACATCAGGATGACACTCTGCTGCAATGTGCTA 52644798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTTCACACAGAAGTTTCTACCCAGAGAAACATCAGGATGACACTCTGCTGCAATGTGCTA 120

 52644799 TTTGTTCTAGAGGGGTCAACAGCTTGCCACCTTGCCTAGGCCCAGGGTGACTGCATATGT 52644858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTGTTCTAGAGGGGTCAACAGCTTGCCACCTTGCCTAGGCCCAGGGTGACTGCATATGT 180

EXCISED REGION

 52644860 CAGTGGTCTTATCCCATTAGCGCCCCCGAGCATGCATTCAGAACCAAGTGGATACACCTT 52644919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      182 CAGTGGTCTTATCCCATTAGCGCCCCCGAGCATGCATTCAGAACCAAGTGGATACACCTT 241

 52644920 GGCACACTTACCTTCCCTGCAGGGACATCATCGGACTGCCCTGATAAGCCAGGAACCTCA 52644979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      242 GGCACACTTACCTTCCCTGCAGGGACATCATCGGACTGCCCTGATAAGCCAGGAACCTCA 301

 52644980 TCCACCTTGTCTTGATGCTCTGCCCTCTTGGCTTCCTGTTGGCTGTCACCTGGCACCTTT 52645039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      302 TCCACCTTGTCTTGATGCTCTGCCCTCTTGGCTTCCTGTTGGCTGTCACCTGGCACCTTT 361

 52645040 TCCTGTCCCTTGTCCAGCTTGAAGAATTTGTCAAAAAAGCTGGAGTCCTTGGGCTTGGAG 52645099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      362 TCCTGTCCCTTGTCCAGCTTGAAGAATTTGTCAAAAAAGCTGGAGTCCTTGGGCTTGGAG 421

 52645100 GGAGCTTCTCCTCCTGCTCCCCCTGTCTCAGGTGGGAGAAGCGTGGGATCCCTGGCGGCA 52645159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      422 GGAGCTTCTCCTCCTGCTCCCCCTGTCTCAGGTGGGAGAAGCGTGGGATCCCTGGCGGCA 481

 52645160 GAGAGGACCTTGTCTTGGGCCGGGGCGTGCCCTGGGGTTTTATCTGTGTCCTGCCCCGGT 52645219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      482 GAGAGGACCTTGTCTTGGGCCGGGGCGTGCCCTGGGGTTTTATCTGTGTCCTGCCCCGGT 541

 52645220 CCAGCTGCCACCGGAAGTGTCCAGCTCTCACTTGGGTCTTTGTTCGCTGGAGCTTTATTG 52645279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      542 CCAGCTGCCACCGGAAGTGTCCAGCTCTCACTTGGGTCTTTGTTCGCTGGAGCTTTATTG 601

 52645280 GAGCTGACATCAAGCTTCACTGATCCAAGGGATGAATCTGCGGCTTGGTCTCCGGTACGT 52645339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      602 GAGCTGACATCAAGCTTCACTGATCCAAGGGATGAATCTGCGGCTTGGTCTCCGGTACGT 661

 52645340 CCTGGTACAGGCCGAGAGAGCATCAAGAAAAAACGAGATTTAGCAGCTGGTGCCTCGGGT 52645399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      662 CCTGGTACAGGCCGAGAGAGCATCAAGAAAAAACGAGATTTAGCAGCTGGTGCCTCGGGT 721

 52645400 TTGGCCTCTTTCCCAAGATTCTTTCCGTTGGCATCCGCAACAGCACTTATCTCCGTTGTC 52645459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      722 TTGGCCTCTTTCCCAAGATTCTTTCCGTTGGCATCCGCAACAGCACTTATCTCCGTTGTC 781

 52645460 TCGGGGGAAGAAGTGGCCACATTATCCGTCTTGACACTTATTCCCAAGTCGACTGTAAAC 52645519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      782 TCGGGGGAAGAAGTGGCCACATTATCCGTCTTGACACTTATTCCCAAGTCGACTGTAAAC 841

 52645520 ACAAACATAAACAGTGGTTATTCAGCCAAGCCGGGAAATTCAGGCACTAATAATGGACTC 52645579
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      842 ACAAACATAAACAGCGGTTATTCAGCCAAGCCGGGAAATTCAGGCACTAATAATGGACTC 901

 52645580 CAGACATTTTTTATACAAAAGCCATACTGCATACTGGAACTGTGTTGTTCTCTGGTCATT 52645639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      902 CAGACATTTTTTATACAAAAGCCATACTGCATACTGGAACTGTGTTGTTCTCTGGTCATT 961

 52645640 CTGAAAGGCAGAAGTTAGCTCTCTACATCTCCTTGGACCCTGCTTTTCTTGGGAGAGGAG 52645699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      962 CTGAAAGGCAGAAGTTAGCTCTCTACATCTCCTTGGACCCTGCTTTTCTTGGGAGAGGAG 1021

 52645700 AAGGCAAGGTTGGTGAGGAGGGAAAGCTACTTAATGGAAAGTCACTAGCTGCCAGGTGTG 52645759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1022 AAGGCAAGGTTGGTGAGGAGGGAAAGCTACTTAATGGAAAGTCACTAGCTGCCAGGTGTG 1081

 52645760 GAATGAGTGATATTCAATGTTAATTAATCTTCTTTTATCTGTGTAAGAACTCCGTGAGCA 52645819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1082 GAATGAGTGATATTCAATGTTAATTAATCTTCTTTTATCTGTGTAAGAACTCCGTGAGCA 1141

 52645820 GCATATTGTCATGATGTCAACTGGGAGGCAGTACAGCAGTTAGGAGCTTGGGTTCTGGAG 52645879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1142 GCATATTGTCATGATGTCAACTGGGAGGCAGTACAGCAGTTAGGAGCTTGGGTTCTGGAG 1201

 52645880 CTAGAACAAGGTTTCTCAACCTCAGCACTACTCACATTTGAAGCCAGATTATTCTTTGTT 52645939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1202 CTAGAACAAGGTTTCTCAACCTCAGCACTACTCACATTTGAAGCCAGATTATTCTTTGTT 1261

 52645940 AGGGAGGCTCATCCCGTGCCTCATAGGCTGATTAGCAGCATCCTGGCCTCTGCCCACTAG 52645999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1262 AGGGAGGCTCATCCCGTGCCTCATAGGCTGATTAGCAGCATCCTGGCCTCTGCCCACTAG 1321

 52646000 ACGCCGGTCACATTTCCCAGTCATGGCAACCAAAAATATCTCTAGGCATTGCTAAATGTC 52646059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1322 ACGCCGGTCACATTTCCCAGTCATGGCAACCAAAAATATCTCTAGGCATTGCTAAATGTC 1381

 52646060 CCCTGGAGGACAAAATCTCTTACGTTTGAGAGGCACTGAGCTGAAATGTCTTTTTGAATC 52646119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1382 CCCTGGAGGACAAAATCTCTTACGTTTGAGAGGCACTGAGCTGAAATGTCTTTTTGAATC 1441

 52646120 CAGATTATCTAATTTTCTGTGCCTCAACTTTCTGGTAAAAGGAGACAGATAATAAATCTC 52646179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1442 CAGATTATCTAATTTTCTGTGCCTCAACTTTCTGGTAAAAGGAGACAGATAATAAATCTC 1501

 52646180 GTAATTTTGTTAGGAAGATTACATGAGTTAATAGTTTTAAAGCAAGTACAATAGCACCTG 52646239
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     1502 GTAATTTTGTTAGGAAGATTACATGAGTTAATAGTTTTAAAGCAAGTACAATAGCGCCTG 1561

 52646240 GAATATATTAAGTGCTTAATAAATATCACAAACATTAGTTATCATTATTCATGAGTGAGA 52646299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1562 GAATATATTAAGTGCTTAATAAATATCACAAACATTAGTTATCATTATTCATGAGTGAGA 1621

 52646300 AAACTGACAGTCAGAGAGGTCAGTACACCCTCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCTAGTAAGCA 52646359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1622 AAACTGACAGTCAGAGAGGTCAGTACACCCTCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCTAGTAAGCA 1681

 52646360 GCAGAGTCTGGCTTCAGGCAGAAATCTGACTTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGTCTTACCA 52646419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1682 GCAGAGTCTGGCTTCAGGCAGAAATCTGACTTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGTCTTACCA 1741

 52646420 GGGACTTGTATTAGCATAGACTGTTAAGAATATGGGAAGATTTTTAAAATACAGTACTCA 52646479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1742 GGGACTTGTATTAGCATAGACTGTTAAGAATATGGGAAGATTTTTAAAATACAGTACTCA 1801

 52646480 GAAAATTTCTCTTTGAAAGGCTGGAAGAGCAGATATCCACACAAGAAGGCAAATTAGACC 52646539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1802 GAAAATTTCTCTTTGAAAGGCTGGAAGAGCAGATATCCACACAAGAAGGCAAATTAGACC 1861

 52646540 TCAGGCCAGTGTGGAATTAAAGGTGTAGGGTTATCTGGTCAAGACTGTGTGTGTGGATAC 52646599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1862 TCAGGCCAGTGTGGAATTAAAGGTGTAGGGTTATCTGGTCAAGACTGTGTGTGTGGATAC 1921

 52646600 AGGCTCCAACCCCTCCAGGCAAGGGCACTGTTTCCAACATCCACCCTTTCTCCTTTGACC 52646659
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     1922 AGGCTCCAACCCCTCCAGGCAAGGGCAATGTTTCCAACATCCACCCTTTCTCCTTTGACC 1981

 52646660 TCTACCTTGACCTAAATTAACTATAAAAGGTCCTTCTTTTCTAGGACCCTACTATAAATC 52646719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1982 TCTACCTTGACCTAAATTAACTATAAAAGGTCCTTCTTTTCTAGGACCCTACTATAAATC 2041

 52646720 AGTGAAATATTCAGGAAAAAAAGAACACCAAGAATGTTGGGATCCCAGTTAAAGATCAAG 52646779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2042 AGTGAAATATTCAGGAAAAAAAGAACACCAAGAATGTTGGGATCCCAGTTAAAGATCAAG 2101

 52646780 ATTCTCTACTGATAAGCTGTGTGATATGGAGTAAATCACTAAAGATCTTTGAATCTCTTC 52646839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2102 ATTCTCTACTGATAAGCTGTGTGATATGGAGTAAATCACTAAAGATCTTTGAATCTCTTC 2161

 52646840 ATTTGTAAAATGGGAATATTGGTAGTCCTACTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTAAAGAAGA 52646899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2162 ATTTGTAAAATGGGAATATTGGTAGTCCTACTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTAAAGAAGA 2221

 52646900 AAAGTCATGCAAAGGATCTGGCACAACGCCTTTTCCATAATAAGTGCTTAGTAATTGACA 52646959
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     2222 AAAGTCATGCAAAGGATCTGGCACAATGCCTTTTCCATAATAAGTGCTTAGTAATTGACA 2281

 52646960 GATACTGTGATAACTTTTCAGGTTTCTCTCATGCCTTTGACAACATTGCATTTTGCTTGC 52647019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2282 GATACTGTGATAACTTTTCAGGTTTCTCTCATGCCTTTGACAACATTGCATTTTGCTTGC 2341

 52647020 TCTATCTGTAGTCAGACACTTCTTAATATCTGTTTGCAGGAAGACAGAAAA 52647070
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2342 TCTATCTGTAGTCAGACACTTCTTAATATCTGTTTGCAGGAAGACAGAAAA 2392

Alignment time is 3.04098 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [52637064,52668002] =>     30939 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    8257] =>      8257 nucs 'mol-32-2f3e-056656_8257'

Score:        7893
Aligned:      8267        nucs
Identic:      8206 ( 99%) nucs =>       770 (100%)      7436 ( 99%)
Gaps:           40 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [52646292,52647064] EXCISED REGION [52658003,52665466]
 second seq =>  [       1,     773] EXCISED REGION [     774,    8257]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>     10938 nucs [52647065,52658002]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         6 nucs [52647065,52647070] to [52658003,52658008]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [52647065,52647067] to [52658000,52658002]
 second seq =>         0 nucs

 52646292 GAGTGAGAAAACTGACAGTCAGAGAGGTCAGTACACCCTCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCT 52646351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GAGTGAGAAAACTGACAGTCAGAGAGGTCAGTACACCCTCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCT 60

 52646352 AGTAAGCAGCAGAGTCTGGCTTCAGGCAGAAATCTGACTTCTAAGTTCATGCGCTCTCTG 52646411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGTAAGCAGCAGAGTCTGGCTTCAGGCAGAAATCTGACTTCTAAGTTCATGCGCTCTCTG 120

 52646412 TCTTACCAGGGACTTGTATTAGCATAGACTGTTAAGAATATGGGAAGATTTTTAAAATAC 52646471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCTTACCAGGGACTTGTATTAGCATAGACTGTTAAGAATATGGGAAGATTTTTAAAATAC 180

 52646472 AGTACTCAGAAAATTTCTCTTTGAAAGGCTGGAAGAGCAGATATCCACACAAGAAGGCAA 52646531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGTACTCAGAAAATTTCTCTTTGAAAGGCTGGAAGAGCAGATATCCACACAAGAAGGCAA 240

 52646532 ATTAGACCTCAGGCCAGTGTGGAATTAAAGGTGTAGGGTTATCTGGTCAAGACTGTGTGT 52646591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATTAGACCTCAGGCCAGTGTGGAATTAAAGGTGTAGGGTTATCTGGTCAAGACTGTGTGT 300

 52646592 GTGGATACAGGCTCCAACCCCTCCAGGCAAGGGCACTGTTTCCAACATCCACCCTTTCTC 52646651
          ||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
      301 GTGGATGCAGGCTCCAACCCCTCCAGGCAAGGGCAATGTTTCCAACATCCACCCTTTCTC 360

 52646652 CTTTGACCTCTACCTTGACCTAAATTAACTATAAAAGGTCCTTCTTTTCTAGGACCCTAC 52646711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTTTGACCTCTACCTTGACCTAAATTAACTATAAAAGGTCCTTCTTTTCTAGGACCCTAC 420

 52646712 TATAAATCAGTGAAATATTCAGGAAAAAAAGAACACCAAGAATGTTGGGATCCCAGTTAA 52646771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TATAAATCAGTGAAATATTCAGGAAAAAAAGAACACCAAGAATGTTGGGATCCCAGTTAA 480

 52646772 AGATCAAGATTCTCTACTGATAAGCTGTGTGATATGGAGTAAATCACTAAAGATCTTTGA 52646831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGATCAAGATTCTCTACTGATAAGCTGTGTGATATGGAGTAAATCACTAAAGATCTTTGA 540

 52646832 ATCTCTTCATTTGTAAAATGGGAATATTGGTAGTCCTACTGCAGGGTTGTTGTAATGCTT 52646891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATCTCTTCATTTGTAAAATGGGAATATTGGTAGTCCTACTGCAGGGTTGTTGTAATGCTT 600

 52646892 AAAGAAGAAAAGTCATGCAAAGGATCTGGCACAACGCCTTTTCCATAATAAGTGCTTAGT 52646951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
      601 AAAGAAGAAAAGTCATGCAAAGGATCTGGCACAATGCCTTTTCCATAATAAGTGCTTAGT 660

 52646952 AATTGACAGATACTGTGATAACTTTTCAGGTTTCTCTCATGCCTTTGACAACATTGCATT 52647011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AATTGACAGATACTGTGATAACTTTTCAGGTTTCTCTCATGCCTTTGACAACATTGCATT 720

 52647012 TTGCTTGCTCTATCTGTAGTCAGACACTTCTTAATATCTGTTTGCAGGAAGAC 52647064
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTGCTTGCTCTATCTGTAGTCAGACACTTCTTAATATCTGTTTGCAGGAAGAC 773

EXCISED REGION

 52658003 AGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTG 52658062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      774 AGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTG 833

 52658063 GCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTAT 52658122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      834 GCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTAT 893

 52658123 AAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGG 52658182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      894 AAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGG 953

 52658183 GAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTG 52658242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      954 GAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTG 1013

 52658243 AAACACTGTCTCTGCTAAAAAACAAAACAAAACAAAACACCAAAAAATAGCTGGGCGTAG 52658302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1014 AAACACTGTCTCTGCTAAAAAACAAAACAAAACAAAACACCAAAAAATAGCTGGGCGTAG 1073

 52658303 TGGCGGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTTGGGAGGCGGTGGCAGGAGAATCATTTGAACCT 52658362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1074 TGGCGGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTTGGGAGGCGGTGGCAGGAGAATCATTTGAACCT 1133

 52658363 GGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGAT--------TGTGCCACTGCACTCTAACCTGG 52658414
          |||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||
     1134 GGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACTGTGCCACTGCACTCTAACCTGG 1193

 52658415 GCAACAGAGTTCAGAGTGAGACTCTGTCTCCCCC-------------AAAAAAAAAAAAA 52658461
          ||||||||||||||||||||||||||||||                 |||||||||||||
     1194 GCAACAGAGTTCAGAGTGAGACTCTGTCTC----ACCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 1249

 52658462 AAAAAAAAAGAACAGCCATATAGATCGTCGGTGGGAGTGTAATTTGGCCACTTCTTTGGA 52658521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1250 AAAAAAAAAGAACAGCCATATAGATCGTCGGTGGGAGTGTAATTTGGCCACTTCTTTGGA 1309

 52658522 AAATAGCTCAGTAATATCTATTAATACTTAAAATTTCACAAACACTGTAAGTCTAACTTC 52658581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1310 AAATAGCTCAGTAATATCTATTAATACTTAAAATTTCACAAACACTGTAAGTCTAACTTC 1369

 52658582 CACTTCTAAAATGTTATCCTAGAAATAAAATTGCATAGGGGTACAAAGGCTTACGTATGG 52658641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1370 CACTTCTAAAATGTTATCCTAGAAATAAAATTGCATAGGGGTACAAAGGCTTACGTATGG 1429

 52658642 AACTATTTGCTGGACTACTGTAGTTGTGGCAAAAAACTGGAAATGACCTAAACGCTTATT 52658701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1430 AACTATTTGCTGGACTACTGTAGTTGTGGCAAAAAACTGGAAATGACCTAAACGCTTATT 1489

 52658702 AGTAGAAACCTGGTTAAATAAATTATCATATGTCCTTGAGGACACAGGGACACAAAGAGG 52658761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1490 AGTAGAAACCTGGTTAAATAAATTATCATATGTCCTTGAGGACACAGGGACACAAAGAGG 1549

 52658762 GGAATGACAGGCACTGAGCCTACTTGAGGGTGGGAGGAGGAAGTCGATCAGAAAAAATAA 52658821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1550 GGAATGACAGGCACTGAGCCTACTTGAGGGTGGGAGGAGGAAGTCGATCAGAAAAAATAA 1609

 52658822 CTAGTGGGTACTAGGCTTAGTACCCGGGTGAAAAAATAATCTGTACAACAAACCCCCATG 52658881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1610 CTAGTGGGTACTAGGCTTAGTACCCGGGTGAAAAAATAATCTGTACAACAAACCCCCATG 1669

 52658882 ACATGAGTTTACCTTATAACAAACCTGCACATGTAATCTGAACCTAGATAAAAGTTTAAA 52658941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1670 ACATGAGTTTACCTTATAACAAACCTGCACATGTAATCTGAACCTAGATAAAAGTTTAAA 1729

 52658942 AAAATAAATAATCATATGTCCCTACAATGAAATATTCCACAGGCATTAAAATTCCCCAAG 52659001
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1730 AAAATAAATAATCATATGTCCCTATAATGAAATATTCCACAGGCATTAAAATTCCCCAAG 1789

 52659002 GAATTTTAGTAAGGAAAGAAAAAGCTGTGCCCAACAGCACGTACAGTATGTTTCCATTTG 52659061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1790 GAATTTTAGTAAGGAAAGAAAAAGCTGTGCCCAACAGCACGTACAGTATGTTTCCATTTG 1849

 52659062 TTTTTAAAAAATGGTGTCGGGAGGTTGAGGAGACAACTTATAAATAGACATGCCTGGGAT 52659121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1850 TTTTTAAAAAATGGTGTCGGGAGGTTGAGGAGACAACTTATAAATAGACATGCCTGGGAT 1909

 52659122 ACCTCTGGATATAAGAAACTGTAAAGTATTTACTTCTAAGGAAGGAAATTTGGGATGGGG 52659181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1910 ACCTCTGGATATAAGAAACTGTAAAGTATTTACTTCTAAGGAAGGAAATTTGGGATGGGG 1969

 52659182 CTTGGGGAGCCATCAGAGTTAGGGTGGGGATTTTTTCTCTGCCTTATCTTATTATGTATA 52659241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1970 CTTGGGGAGCCATCAGAGTTAGGGTGGGGATTTTTTCTCTGCCTTATCTTATTATGTATA 2029

 52659242 TCGCTCAGAATGTTTGCTATGTGTATGCACCTACCCCATCCATTAAGAAATGAAGAAATA 52659301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2030 TCGCTCAGAATGTTTGCTATGTGTATGCACCTACCCCATCCATTAAGAAATGAAGAAATA 2089

 52659302 ATGAAAAGAAAAAATGAAAGTAGGGAACTAGAAATGAGAGGTGGGATTCAAAGTGGACTG 52659361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2090 ATGAAAAGAAAAAATGAAAGTAGGGAACTAGAAATGAGAGGTGGGATTCAAAGTGGACTG 2149

 52659362 AACACTTGACCTATTTCCCAATTTGCCTAGGGCTGGCCCAGCAGCGAGGCAGGTTCTAAC 52659421
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     2150 AACACTTGACCTATTTCCCAATTTGCCTGGGGCTGGCCCAGCAGCGAGGCAGGTTCTAAC 2209

 52659422 CAATGAGCATCAGCTTTGAATGGAGGGGCTGATAGGCCAGGTGGGCCCTGCTTGCTGAGA 52659481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2210 CAATGAGCATCAGCTTTGAATGGAGGGGCTGATAGGCCAGGTGGGCCCTGCTTGCTGAGA 2269

 52659482 GTGTCATGGCCTTAGGGACATCTCCATGTTGCAGAGTCTGAGCCTCTGCTTGGCAAATTC 52659541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2270 GTGTCATGGCCTTAGGGACATCTCCATGTTGCAGAGTCTGAGCCTCTGCTTGGCAAATTC 2329

 52659542 AGAAAATCCAGCTTTTCTTTTTATATCACCTGGAGCTGATGTAACTCTCAGAAGGCATTT 52659601
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     2330 AGAAAATCCAGCTTTTCTTTTTATATCACCTGGAGCTGATGTAACTCTCAGAACGCATTT 2389

 52659602 TTAAGAGGACTCATGAATTAACCACATAGCCAACTTACTGGCTTAAGACTACGTGACAGA 52659661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2390 TTAAGAGGACTCATGAATTAACCACATAGCCAACTTACTGGCTTAAGACTACGTGACAGA 2449

 52659662 AAGCTGCAAAGGGGGCCAGCCACTGGTAACATCCCACCACTGTCCCTCTCTGTGGAAAAC 52659721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2450 AAGCTGCAAAGGGGGCCAGCCACTGGTAACATCCCACCACTGTCCCTCTCTGTGGAAAAC 2509

 52659722 ACAGATGGGATGCACATTGTGACGGGCAGGATGCCTGGAGAGCCCACAAATCTGCAAGCA 52659781
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2510 ACAGATGGGATGCACATTGTGATGGGCAGGATGCCTGGAGAGCCCACAAATCTGCAAGCA 2569

 52659782 CAGCTGAAATTGGTTACAGGATTTCAATGTTTCATTGCTTGAAGCTATGATAACTTGATG 52659841
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||
     2570 CAGCTGAAATTGGTTACAGGATTTCAATGTTTCATTGCTTGAAGCTATGATAACT---TG 2626

 52659842 ATGATGATGATGATGATGATGATGATGACGATGATTTTTTTTATAGCCATCTTTTTAGAG 52659901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2627 ATGATGATGATGATGATGATGATGATGACGATGATTTTTTTTATAGCCATCTTTTTAGAG 2686

 52659902 GGATTTGAGGTAGGGAAAAAAATAAACCTCACACTATCGGAGGTTGCCAACTATGAGGTC 52659961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2687 GGATTTGAGGTAGGGAAAAAAATAAACCTCACACTATCGGAGGTTGCCAACTATGAGGTC 2746

 52659962 TGCTGATGGTTTGGCCAACACAGTGTTTATATTTTTTTGAATTGGGAAATTTCATTTAAA 52660021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2747 TGCTGATGGTTTGGCCAACACAGTGTTTATATTTTTTTGAATTGGGAAATTTCATTTAAA 2806

 52660022 AGTCCTAAAATCAGGCTGTTATTGAAATATCTTATTATTGGCTCAGGGTTTCCCAGGGCA 52660081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2807 AGTCCTAAAATCAGGCTGTTATTGAAATATCTTATTATTGGCTCAGGGTTTCCCAGGGCA 2866

 52660082 GCCATCCTTGAAGCTGTGTGGAGCCCTATAAACAAGGACGCTTTCCAGTTCCCTGCAAAC 52660141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     2867 GCCATCCTTGAAGCTGTGTGGAGCCCTATAAACAAGGAGGCTTTCCAGTTCCCTGCAAAC 2926

 52660142 TCCATTTCATTCAGAGCCTTGAGCCAGTTCTTACATGGTCCTCAGACTTGAGCTAGTGCA 52660201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2927 TCCATTTCATTCAGAGCCTTGAGCCAGTTCTTACATGGTCCTCAGACTTGAGCTAGTGCA 2986

 52660202 AGAATACCCGGGAGGGGTTGTGGGAACAGATAGCTGGGCCCCACCCCCAGGGAAGGGGGT 52660261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2987 AGAATACCCGGGAGGGGTTGTGGGAACAGATAGCTGGGCCCCACCCCCAGGGAAGGGGGT 3046

 52660262 GTTTCTGACTCAGGAGGTCTGGGCTCCGGCTACAGAAACTGCACATCTAACCGGTACCCA 52660321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3047 GTTTCTGACTCAGGAGGTCTGGGCTCCGGCTACAGAAACTGCACATCTAACCGGTACCCA 3106

 52660322 GGTGATGTGATGCTGCTGGCCCAGGGACAACTCTGCGAGTCACTGCTATTGGGCACTGCT 52660381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3107 GGTGATGTGATGCTGCTGGCCCAGGGACAACTCTGCGAGTCACTGCTATTGGGCACTGCT 3166

 52660382 ATTGCACCCACACAAGGAGGCAGGCTCTGCTTACATTTTTCAGTTCTTGTTCCCAGAAAC 52660441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3167 ATTGCACCCACACAAGGAGGCAGGCTCTGCTTACATTTTTCAGTTCTTGTTCCCAGAAAC 3226

 52660442 ATTTGCTCTTTGGGGTATGCTTTGCATATAATGGATCCTACCCACTAATACAGTATGCTG 52660501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3227 ATTTGCTCTTTGGGGTATGCTTTGCATATAATGGATCCTACCCACTAATACAGTATGCTG 3286

 52660502 CTTTTATTGATAAACTTCCAGAAACTTGAAGCGCACCTTACCATTTCTTTGATCTCGCTG 52660561
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3287 CTTTTATTGATAAACTTCCAGATACTTGAAGCGCACCTTACCATTTCTTTGATCTCGCTG 3346

 52660562 ATTATTTTTATTTTTGTTAAATGAAAATTGTTGGTAAGTTCTTTTTGGTGTGGTAAAAGG 52660621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3347 ATTATTTTTATTTTTGTTAAATGAAAATTGTTGGTAAGTTCTTTTTGGTGTGGTAAAAGG 3406

 52660622 ATATGAAAAGCTGATTTTAAAAAAATGTCCACTCTAGGATTAGAATTGTAGGTGTGTTTA 52660681
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3407 ATATGAAAAACTGATTTTAAAAAAATGTCCACTCTAGGATTAGAATTGTAGGTGTGTTTA 3466

 52660682 TTCTATTTCAAGATCTGGTTAAAATGCACCTTGAGGAAAAGAATTGAGTGCAGCTGTTGT 52660741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3467 TTCTATTTCAAGATCTGGTTAAAATGCACCTTGAGGAAAAGAATTGAGTGCAGCTGTTGT 3526

 52660742 TATTTCTCAATGCTGTTTCTCTTTTCATGTTTTTTTCATGTTGTCTCTTGGTCTGTCCTA 52660801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3527 TATTTCTCAATGCTGTTTCTCTTTTCATGTTTTTTTCATGTTGTCTCTTGGTCTGTCCTA 3586

 52660802 TCTCTCTTGGTCTATCCTCCAAGACAGAGATGAGTGATCTTGAAACCCTGCCCATGTTTT 52660861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3587 TCTCTCTTGGTCTATCCTCCAAGACAGAGATGAGTGATCTTGAAACCCTGCCCATGTTTT 3646

 52660862 TATCTTTGGAGCCCAACTGTGCTGCCTTGTTTTCTTCTCCATCCAAAGAGGCAAAGAGAA 52660921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3647 TATCTTTGGAGCCCAACTGTGCTGCCTTGTTTTCTTCTCCATCCAAAGAGGCAAAGAGAA 3706

 52660922 AGTTGCATATTACTCAACAGCAGTTGCATGACAGTTAAAATCAGACTGTATGAGTCATGG 52660981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3707 AGTTGCATATTACTCAACAGCAGTTGCATGACAGTTAAAATCAGACTGTATGAGTCATGG 3766

 52660982 AACAGTAAGTTGTGTCCAGAGTATCTGTCATGGTAAGTACAAAAAAGTCCTTAAAAATTT 52661041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3767 AACAGTAAGTTGTGTCCAGAGTATCTGTCATGGTAAGTACAAAAAAGTCCTTAAAAATTT 3826

 52661042 AAAACAGAAATGCCAATGTTTTATTTTTGAAAAATGTGAAGAAGAAATTTTCCGGCCGGG 52661101
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     3827 AAAACAGAAATGCCAATGTTTTATTTCTGAAAAATGTGAAGAAGAAATTTTCCGGCCGGG 3886

 52661102 CGCGGTGGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATCACCTG 52661161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3887 CGCGGTGGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATCACCTG 3946

 52661162 AGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACACAGTGCAACCCCATCTCTACTAAAAATA 52661221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3947 AGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACACAGTGCAACCCCATCTCTACTAAAAATA 4006

 52661222 CAAAAATTAGCCAGATGCGGTGGCACGCGCCTGTAATCTCAGCTACTAGGGAGGCTGAGG 52661281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4007 CAAAAATTAGCCAGATGCGGTGGCACGCGCCTGTAATCTCAGCTACTAGGGAGGCTGAGG 4066

 52661282 CATGACAATCGCTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCATACCACTGC 52661341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4067 CATGACAATCGCTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCATACCACTGC 4126

 52661342 ACTCCAGCTTGGGCAGCGGAAGGAGACTCTGTCTC-------AAAAAAAAAAAGAAAAAA 52661394
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||
     4127 ACTCCAGCTTGGGCAGCGGAAGGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAA 4186

 52661395 AGAAATTTTCTAAGTGTATTCCAAATAACTTTTAATATTGGATAAACATTACGAGTTTAA 52661454
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4187 AGAAATTTTCTAAGTGTATTCCGAATAACTTTTAATATTGGATAAACATTACGAGTTTAA 4246

 52661455 AAATACTTATGCCAGAGGAGTGCTGTGACTCGTGCCTCTAATCCCAGCAATGTGGGAGGC 52661514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4247 AAATACTTATGCCAGAGGAGTGCTGTGACTCGTGCCTCTAATCCCAGCAATGTGGGAGGC 4306

 52661515 CAAGGAGGGACAGTCACTTGAGCCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGATAACAAAGGGAGA 52661574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4307 CAAGGAGGGACAGTCACTTGAGCCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGATAACAAAGGGAGA 4366

 52661575 CCTCATCTTTACAAAAAAACTAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGTGTGTGCCTGTGATCC 52661634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4367 CCTCATCTTTACAAAAAAACTAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGTGTGTGCCTGTGATCC 4426

 52661635 CAGCTACACAGGAGGCTGAGGCAAGAGGATTCCTTGAGCCCTGGAGGTCAAGGCTGCAGT 52661694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4427 CAGCTACACAGGAGGCTGAGGCAAGAGGATTCCTTGAGCCCTGGAGGTCAAGGCTGCAGT 4486

 52661695 GAGTGATGATCATGCCATTGCACTCCAGCTGGGTGACAGAGCAAGACCTCATCTCAAAAA 52661754
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4487 GAGCGATGATCATGCCATTGCACTCCAGCTGGGTGACAGAGCAAGACCTCATCTCAAAAA 4546

 52661755 AAAAAAA-AAAACAAAACAAAACAAAAAACTTACGCCCAGGTAAAAATTGTCAGAGAAAA 52661813
          .||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4547 CAAAA--CAAAACAAAACAAAACAAAAAACTTACGCCCAGGTAAAAATTGTCAGAGAAAA 4604

 52661814 ATAAGAAAAAAACTGAATGCCCAAAATTAGCATAATGGCTGAATGAATTATAGTATGTCT 52661873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4605 ATAAGAAAAAAACTGAATGCCCAAAATTAGCATAATGGCTGAATGAATTATAGTATGTCT 4664

 52661874 ATACCTTGAAGTACATTGTAGCTTTAAAAAAAATGAATTAAAGTTATACCAGTTGAATTT 52661933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4665 ATACCTTGAAGTACATTGTAGCTTTAAAAAAAATGAATTAAAGTTATACCAGTTGAATTT 4724

 52661934 GGAGTTGAGATGGGGAAGATTATTACAATTAAAAAAAAACAAACACTATTAATGGATGTG 52661993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4725 GGAGTTGAGATGGGGAAGATTATTACAATTAAAAAAAAACAAACACTATTAATGGATGTG 4784

 52661994 CTGGGAAATGTCTGTATGGGGCTAGTTAAAGTAAATTAAAATAAAGACCAGACCTGAAGA 52662053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4785 CTGGGAAATGTCTGTATGGGGCTAGTTAAAGTAAATTAAAATAAAGACCAGACCTGAAGA 4844

 52662054 ATCCCTGAGCGGACAAAGCCTGTTAGACCACATAAATGAGCTAAACCTTGCTTGATTTGC 52662113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4845 ATCCCTGAGCGGACAAAGCCTGTTAGACCACATAAATGAGCTAAACCTTGCTTGATTTGC 4904

 52662114 AGACATAAGCAAAACAACTCGAACTGTTTCTTGTAAATGCCTATGCTAAAGAAAAACAGA 52662173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4905 AGACATAAGCAAAACAACTCGAACTGTTTCTTGTAAATGCCTATGCTAAAGAAAAACAGA 4964

 52662174 ACTTGAGCTCAACCAATCAGAAACAGTCAACAAACTTAAAATTATATAACTGGGTACCTT 52662233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4965 ACTTGAGCTCAACCAATCAGAAACAGTCAACAAACTTAAAATTATATAACTGGGTACCTT 5024

 52662234 CCAATGAGATGATCAAATAAGGCAACTGTGTAATTGTAACACATCAAACACATTTTATAT 52662293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5025 CCAATGAGATGATCAAATAAGGCAACTGTGTAATTGTAACACATCAAACACATTTTATAT 5084

 52662294 TATGCCTCTGCATTTTCCCTTAATTCTGGCATGTAATGCTTTGTCATCAAAACACTAATT 52662353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5085 TATGCCTCTGCATTTTCCCTTAATTCTGGCATGTAATGCTTTGTCATCAAAACACTAATT 5144

 52662354 CCCTTTTGGTTTTCTTTTCTCAAATTAATGAATTGCCTCTATTCAGATACACTCTTTGAA 52662413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5145 CCCTTTTGGTTTTCTTTTCTCAAATTAATGAATTGCCTCTATTCAGATACACTCTTTGAA 5204

 52662414 ATTTTATTGTGTCTCAGATTTGTCTTTTACAAAGTATAGAACAAAGAGAAAAATATGAAA 52662473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5205 ATTTTATTGTGTCTCAGATTTGTCTTTTACAAAGTATAGAACAAAGAGAAAAATATGAAA 5264

 52662474 GAAGAAATATTAGGTTGTTAGCTTGGGTGTCCTTGGAGGGGGTAGGGAAGATGTGAGATG 52662533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5265 GAAGAAATATTAGGTTGTTAGCTTGGGTGTCCTTGGAGGGGGTAGGGAAGATGTGAGATG 5324

 52662534 AGGAAGAAGCCAATAAGAAAAAGAAAAAGACAGGTTTCACCAAAACAACAATAACAGAAA 52662593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5325 AGGAAGAAGCCAATAAGAAAAAGAAAAAGACAGGTTTCACCAAAACAACAATAACAGAAA 5384

 52662594 ATATGATTGCATTTATTCATATATGTTAATTGGTATGTATGTAAGTATATATGCATGTAA 52662653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5385 ATATGATTGCATTTATTCATATATGTTAATTGGTATGTATGTAAGTATATATGCATGTAA 5444

 52662654 AAATAAAATACAAAGAATTAAAATGCATACTAATAGTTATTTCAGTTATCTATGGCTGTG 52662713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5445 AAATAAAATACAAAGAATTAAAATGCATACTAATAGTTATTTCAGTTATCTATGGCTGTG 5504

 52662714 TAACAAGCATCCCCAAAATGATTGACTTAACCACCATTTTATTAGGTCATGATTCCATGC 52662773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5505 TAACAAGCATCCCCAAAATGATTGACTTAACCACCATTTTATTAGGTCATGATTCCATGC 5564

 52662774 ATTAAGAATTCAGGGCCGGGTGCGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGC 52662833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5565 ATTAAGAATTCAGGGCCGGGTGCGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGC 5624

 52662834 CAAGGTGGGTGGATCACGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGCCCAACATAGTGGAACC 52662893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5625 CAAGGTGGGTGGATCACGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGCCCAACATAGTGGAACC 5684

 52662894 CCGTCTGTACTAAAAATACAGAAGATTAGCTGGGTGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCA 52662953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5685 CCGTCTGTACTAAAAATACAGAAGATTAGCTGGGTGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCA 5744

 52662954 GCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAAGCTGGAAGGCAGAGGTTGCAGTGA 52663013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     5745 GCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAAGCTGGAAGGCGGAGGTTGCAGTGA 5804

 52663014 GCCAAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGTGGACAGCGCGAGACTCCATCTCAAAAAA 52663073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
     5805 GCCAAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGTGGACAGCGCGAGACTCCATCT-AAAAAA 5863

 52663074 AAAAAAAAAAAAAAGAATTCAGGCAGATGCCAGGTGCAGTGGCTCATACCTGTAATTCTA 52663133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5864 AAAAAAAAAAAAAAGAATTCAGGCAGATGCCAGGTGCAGTGGCTCATACCTGTAATTCTA 5923

 52663134 GCACTTTGGGAGGCTGAGATGGGCAGATCACCTGAAGTCAAGGAGTTCCAGACCAGCCTG 52663193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5924 GCACTTTGGGAGGCTGAGATGGGCAGATCACCTGAAGTCAAGGAGTTCCAGACCAGCCTG 5983

 52663194 GCCAACATGGTGAAAACCAGTCTGTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGACATGGTGGCA 52663253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5984 GCCAACATGGTGAAAACCAGTCTGTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGACATGGTGGCA 6043

 52663254 CGTGCCTGTAATCCCAGCTATACAAGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGATCTGGGACG 52663313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     6044 CGTGCCTGTAATCCCAGCTATACAAGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGATCTGGGAGG 6103

 52663314 TGGAGGTTGCAGCAAGCCAAGATCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGA 52663373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6104 TGGAGGTTGCAGCAAGCCAAGATCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGA 6163

 52663374 CTCTGTCTC-AAAAAAAAAAAAAAAGAATTCAGGCAGAGAGAGGATAGGATCAGCTTATT 52663432
          ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6164 CTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGAATTCAGGCAGAGAGAGGATAGGATCAGCTTATT 6223

 52663433 TCTGCTCTATGATGTCTGGAGCCACAGCTGGGGTGCCTTGAAAGGATGAAGATGGCTGGG 52663492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6224 TCTGCTCTATGATGTCTGGAGCCACAGCTGGGGTGCCTTGAAAGGATGAAGATGGCTGGG 6283

 52663493 ACGGCTCACACAGGGACATATGTCTGGAGCTTTAGTTCTGGCTATGGGCTGGTTCCTATG 52663552
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6284 ATGGCTCACACAGGGACATATGTCTGGAGCTTTAGTTCTGGCTATGGGCTGGTTCCTATG 6343

 52663553 GTCCTTCCTCATACGGCATCTATTAGCTGAAATGCCCATGATGTCTTCTTTAATCACAGG 52663612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6344 GTCCTTCCTCATACGGCATCTATTAGCTGAAATGCCCATGATGTCTTCTTTAATCACAGG 6403

 52663613 TCTGGTTCCTGGACTGGGATGGCTGGAATATTTGGGAACTGGCTGGGTACCTCTCTCTTG 52663672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6404 TCTGGTTCCTGGACTGGGATGGCTGGAATATTTGGGAACTGGCTGGGTACCTCTCTCTTG 6463

 52663673 CCTCATGGCTTCTTCATGTGACTAGCTTGGGCTCTCTCACAGCATGGCAATCTCAGGGTA 52663732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6464 CCTCATGGCTTCTTCATGTGACTAGCTTGGGCTCTCTCACAGCATGGCAATCTCAGGGTA 6523

 52663733 GAACTTCTGATATTGTGTCTAGCCTTTCTCAGAGCTAGTGTTGCAAGAGACAAGGCAGAA 52663792
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6524 GAACTTCTGATATTGTGTCTAGGCTTTCTCAGAGCTAGTGTTGCAAGAGACAAGGCAGAA 6583

 52663793 GCTCCGAGTCTTCTTAAAAGGCTTCTTGAAAGTCCTGTGTCATCCCTTCTACTACATACT 52663852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6584 GCTCCGAGTCTTCTTAAAAGGCTTCTTGAAAGTCCTGTGTCATCCCTTCTACTACATACT 6643

 52663853 GTTGGTTATATAGGACCAGCCCAGAGGGGACTACACAGGGGTGTGAATACCAGGAAGCAT 52663912
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6644 GTTGGTTATATAGGACCAGTCCAGAGGGGACTACACAGGGGTGTGAATACCAGGAAGCAT 6703

 52663913 GGGTTATTGCGTGGTGGGTTGTATGTGTGCATCTTTGGAGACTATCAACCACAATAATGC 52663972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6704 GGGTTATTGCGTGGTGGGTTGTATGTGTGCATCTTTGGAGACTATCAACCACAATAATGC 6763

 52663973 AATAGGGAAGATAATTTTATCTAACAGGAATTCTCCACTAGACTTTTTGGTGAGAAAAAG 52664032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6764 AATAGGGAAGATAATTTTATCTAACAGGAATTCTCCACTAGACTTTTTGGTGAGAAAAAG 6823

 52664033 CACTGAGTTTGAGAAGGATGAGATTTCCCCAGGGCTCTTGCTCACTCCCAAGGAAGACAG 52664092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6824 CACTGAGTTTGAGAAGGATGAGATTTCCCCAGGGCTCTTGCTCACTCCCAAGGAAGACAG 6883

 52664093 AGGCACAAGGAGCTGTTGGGCCATCTGGGAGAGCCAGTGTTCAGAACTCTCTGTTATTAC 52664152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6884 AGGCACAAGGAGCTGTTGGGCCATCTGGGAGAGCCAGTGTTCAGAACTCTCTGTTATTAC 6943

 52664153 TTTAGACTCAGTGGTGATACAGTGCAATGGAGGGAAAGAAGAAAGGAGAGTGCCTGTGAG 52664212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6944 TTTAGACTCAGTGGTGATACAGTGCAATGGAGGGAAAGAAGAAAGGAGAGTGCCTGTGAG 7003

 52664213 TGTTACCAGTGGAGAGTTGTCCAGGTTCTTGGTGTTTTGAACAAAAAAATTGGACAAAAT 52664272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7004 TGTTACCAGTGGAGAGTTGTCCAGGTTCTTGGTGTTTTGAACAAAAAAATTGGACAAAAT 7063

 52664273 GCACAAAGCAATGAAAGCACAGATTTATAGAAATGAAAGTACACTCCACAGAGTGGGAGC 52664332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7064 GCACAAAGCAATGAAAGCACAGATTTATAGAAATGAAAGTACACTCCACAGAGTGGGAGC 7123

 52664333 AGGTTTGAGCAAGTGGCTCAAGAGTGCTGGTTACAGAAATTTCTGGGGTTTAAATACCCT 52664392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7124 AGGTTTGAGCAAGTGGCTCAAGAGTGCTGGTTACAGAAATTTCTGGGGTTTAAATACCCT 7183

 52664393 CTAGTGGTTTCCCATTGGTTACTTGGTGTATGCCCTATGTAAATGAAGAGGATGAAGGGA 52664452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7184 CTAGTGGTTTCCCATTGGTTACTTGGTGTATGCCCTATGTAAATGAAGAGGATGAAGGGA 7243

 52664453 AGTTACAAAGTTATTTACTTGGTGTACACCCTATGCAAATGAAGAGGATATTTCCTGCCA 52664512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7244 AGTTACAAAGTTATTTACTTGGTGTACACCCTATGCAAATGAAGAGGATATTTCCTGCCA 7303

 52664513 TAGCTGAAGTGCAGTTACATCCATAGTTGAGCATAGAAAGTTGTGGGTTTTCTGCTTGAT 52664572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7304 TAGCTGAAGTGCAGTTACATCCATAGTTGAGCATAGAAAGTTGTGGGTTTTCTGCTTGAT 7363

 52664573 TTAGTTCTAGGAAGTCCTTAGCTTCCCCGCCTCCAGACCCTATTCCCCTACCTCATGAGG 52664632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7364 TTAGTTCTAGGAAGTCCTTAGCTTCCCCGCCTCCAGACCCTATTCCCCTACCTCATGAGG 7423

 52664633 ATGGGGTGTCTCACAGAGTTTCAAGGTGGAGAGTTGAGGATAGGGAGCCTCTTGAGTGAG 52664692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7424 ATGGGGTGTCTCACAGAGTTTCAAGGTGGAGAGTTGAGGATAGGGAGCCTCTTGAGTGAG 7483

 52664693 AGACATATAGCAATGTGAGGAGAGAGAAAAGTGGTGTTTAGGATGTGAGTTAGATCTCCT 52664752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7484 AGACATATAGCAATGTGAGGAGAGAGAAAAGTGGTGTTTAGGATGTGAGTTAGATCTCCT 7543

 52664753 TAATGTCTTTTGAAAGGCCAGAGTGAGGATATGAACTACTTTCCTTTGCTCAATTCTAAT 52664812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7544 TAATGTCTTTTGAAAGGCCAGAGTGAGGATATGAACTACTTTCCTTTGCTCAATTCTAAT 7603

 52664813 AATTCTTTGGAATCACCTCTGGCAGACACTGTTTGTGGCCTGCCCAATAGCCAATCGTCT 52664872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7604 AATTCTTTGGAATCACCTCTGGCAGACACTGTTTGTGGCCTGCCCAATAGCCAATCGTCT 7663

 52664873 CCAGCCCCAACCATGTATTATTATTATTCACTTGCATCTCAAAGAGATGCTTGATTCCCA 52664932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7664 CCAGCCCCAACCATGTATTATTATTATTCACTTGCATCTCAAAGAGATGCTTGATTCCCA 7723

 52664933 GTATCCCATGCAGCTGGTATGGGCCATGTGATGTAGCTCTGGCCAATAAGAGGATGCCTA 52664992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7724 GTATCCCATGCAGCTGGTATGGGCCATGTGATGTAGCTCTGGCCAATAAGAGGATGCCTA 7783

 52664993 CATGGTGGCAGAGGCTTCAGGGAAGGATCCTCCTTCCTCGCATAATACAAGGAGAAAAAA 52665052
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     7784 CATGGTGGCAGAGGCTTCAGGGAAGGATCCTCCTTCCTCTCATAATACAAGGAGAAAAAA 7843

 52665053 AAATGGTGGCAAAGTTTGGCCTTTCCTCTCCTGCTTTTGGATCCCATGATGTAGAGATGT 52665112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7844 AAATGGTGGCAAAGTTTGGCCTTTCCTCTCCTGCTTTTGGATCCCATGATGTAGAGATGT 7903

 52665113 GATGTTTGGTTCTGTGACAGCCATCTTGTGAGCAGGAGTGACACAATTGGCTCATGTACT 52665172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7904 GATGTTTGGTTCTGTGACAGCCATCTTGTGAGCAGGAGTGACACAATTGGCTCATGTACT 7963

 52665173 TGGTGTTTTGATGAGGCTGTCAGACTGCTGTACCAAATTTAGAACTGCCACCTCCAGACT 52665232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7964 TGGTGTTTTGATGAGGCTGTCAGACTGCTGTACCAAATTTAGAACTGCCACCTCCAGACT 8023

 52665233 TCTTGCTCAAATTAAAAGTGCTATTTACTTATCCAGGGTTGCATTCCTTGAAGCTGAGTG 52665292
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     8024 TCTTGCTCAAATTAAAAGTGCTATTTACTTGTCCAGGGTTGCATTCCTTGAAGCTGAGTG 8083

 52665293 CAGCAGAGTCTGGGAACTTGCCCTTCGGCCTTATTATTTTATTCCTCTGCTACCACTGGC 52665352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8084 CAGCAGAGTCTGGGAACTTGCCCTTCGGCCTTATTATTTTATTCCTCTGCTACCACTGGC 8143

 52665353 TTAATATGCCACTGTTCATTGATCAACCATTTCTAAGTCTTTAGTGTATCTCAGGCCTTG 52665412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8144 TTAATATGCCACTGTTCATTGATCAACCATTTCTAAGTCTTTAGTGTATCTCAGGCCTTG 8203

 52665413 TGCTGAGCTCTGGGACCCTCATAACAAGAAAGGATGGCAAGCGTCCTGCTCTCA 52665466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8204 TGCTGAGCTCTGGGACCCTCATAACAAGAAAGGATGGCAAGCGTCCTGCTCTCA 8257

Alignment time is 9.54244 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [52637064,52668002] =>     30939 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    9855] =>      9855 nucs 'mol-32-2fcd-143135_9855'

Score:        9578
Aligned:      9868        nucs
Identic:      9831 (100%) nucs =>      9553 (100%)       278 (100%)
Gaps:           19 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [52637481,52647064] EXCISED REGION [52658003,52658280]
 second seq =>  [       1,    9577] EXCISED REGION [    9578,    9855]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>     10938 nucs [52647065,52658002]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         6 nucs [52647065,52647070] to [52658003,52658008]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [52647065,52647067] to [52658000,52658002]
 second seq =>         0 nucs

 52637481 CACAGTTAAATTAGAAAACTAATGTAATGGATACACTCAGATGAATTACCATAGGTGGAT 52637540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CACAGTTAAATTAGAAAACTAATGTAATGGATACACTCAGATGAATTACCATAGGTGGAT 60

 52637541 ACTGTAGCAGCTTCTACTTGCTCCATTCACTTAATGATTTCCAGACAATGTTAGGTAGAG 52637600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACTGTAGCAGCTTCTACTTGCTCCATTCACTTAATGATTTCCAGACAATGTTAGGTAGAG 120

 52637601 AAGATAAATCTGGTTTCTATCTGTGGCATGTCCTCTTTGCTGGAAGAGCCTTCTTTCTAC 52637660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAGATAAATCTGGTTTCTATCTGTGGCATGTCCTCTTTGCTGGAAGAGCCTTCTTTCTAC 180

 52637661 TGAAGAAACTGAAAATGCTGGCTGATAGCTATTTGCACCTTGACACAGACACGTGACTCA 52637720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGAAGAAACTGAAAATGCTGGCTGATAGCTATTTGCACCTTGACACAGACACGTGACTCA 240

 52637721 ATTTCACCAAAGGGCTCTGAGGATAAATTTTAGGAAACTCCTTTCTTATTTATAGGACAT 52637780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATTTCACCAAAGGGCTCTGAGGATAAATTTTAGGAAACTCCTTTCTTATTTATAGGACAT 300

 52637781 TATGACACATACATCGGAAATATTACACGTCCAATTCCAGGTCACTGCAATAGAGTCAAT 52637840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TATGACACATACATCGGAAATATTACACGTCCAATTCCAGGTCACTGCAATAGAGTCAAT 360

 52637841 ATCACAATAGAGTCACACACATTTTTCGGTTTCCCAGTGCACATAAAAGTTCTCCACTGT 52637900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATCACAATAGAGTCACACACATTTTTCGGTTTCCCAGTGCACATAAAAGTTCTCCACTGT 420

 52637901 CCTGGAGTCTATTAAGTGTGCAATAGCATTACGTCTAAAAAAAAAGTACATACTTTAATT 52637960
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
      421 CCTGGAGTCTATTAAGTGTGCAATAGCATTACGTCTAAAAAAAA-GTACATACTTTAATT 479

 52637961 TAAAAATACCTTGTCTCATGGTGTATATGTACCACATTTTCTTTACCCAGTCTATTGTTG 52638020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      480 TAAAAATACCTTGTCTCATGGTGTATATGTACCACATTTTCTTTACCCAGTCTATTGTTG 539

 52638021 ATGGGCATTTGGGTTGATTCCATGTCTTTGCTATTGTGAATAGTGCTGCAATGGAATACT 52638080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      540 ATGGGCATTTGGGTTGATTCCATGTCTTTGCTATTGTGAATAGTGCTGCAATGGAATACT 599

 52638081 ATGTGTCCATAAAAAGGAACAAGATCATGTCCTTTGCAGGGATATGGATGGAGCTGGAAG 52638140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      600 ATGTGTCCATAAAAAGGAACAAGATCATGTCCTTTGCAGGGATATGGATGGAGCTGGAAG 659

 52638141 CCATTATCTTTGGCAAACTAACGCAGGAACAGAGAACCAAACACCGCATGTTCTCACTTA 52638200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      660 CCATTATCTTTGGCAAACTAACGCAGGAACAGAGAACCAAACACCGCATGTTCTCACTTA 719

 52638201 TAAGTGGGAGATGAACAATGAGAACAGATGGACACAGGAAGGGGAACAACACACACTGGG 52638260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      720 TAAGTGGGAGATGAACAATGAGAACAGATGGACACAGGAAGGGGAACAACACACACTGGG 779

 52638261 GCCTGTCGGGGGTTGGGGGAGGGAGAGCATCAGGAAAAATAGCTAATGCATGCTGGGCTT 52638320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      780 GCCTGTCGGGGGTTGGGGGAGGGAGAGCATCAGGAAAAATAGCTAATGCATGCTGGGCTT 839

 52638321 AATACCTAGGTGATGGGATGATAGGTGCAGCAAACCACCATGGCACACATTTATTTTAAG 52638380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 AATACCTAGGTGATGGGATGATAGGTGCAGCAAACCACCATGGCACACATTTATTTTAAG 899

 52638381 TTCTGGGGTACACGTGCACGTCACCCGGGCTCCTGCACATCCTGCATTTGTACCCCAGAA 52638440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 TTCTGGGGTACACGTGCACGTCACCCGGGCTCCTGCACATCCTGCATTTGTACCCCAGAA 959

 52638441 CTTAAAATAAAAATTACAACAAAAACTTTATCTCTAAAAAATGCTGACACAAAGACACAA 52638500
          |||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 CTTAAAA-----ATTACAACAAAAACTTTATCTCTAAAAAATGCTGACACAAAGACACAA 1014

 52638501 AGTGAACACAGGCCATTGGAAAAATGGTGCTGACAGACTTGCTTGATGCAGGATTGTCAC 52638560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1015 AGTGAACACAGGCCATTGGAAAAATGGTGCTGACAGACTTGCTTGATGCAGGATTGTCAC 1074

 52638561 AAACCTTTAATGTGTAAAAATGCAGCATCTGTGAAGCACAATAAAGAGAGGTACTCCTGC 52638620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1075 AAACCTTTAATGTGTAAAAATGCAGCATCTGTGAAGCACAATAAAGAGAGGTACTCCTGC 1134

 52638621 ATACTTGGAATCATGTTAAAACCACAAGGGACTAAGCCTAGGGACTAAGCAACAATGGAG 52638680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1135 ATACTTGGAATCATGTTAAAACCACAAGGGACTAAGCCTAGGGACTAAGCAACAATGGAG 1194

 52638681 GACACCAGTAGAGAAAGACTGAGGCGGGCTTGTGGGGGCTGTGAAGATGTTGAACCAACC 52638740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1195 GACACCAGTAGAGAAAGACTGAGGCGGGCTTGTGGGGGCTGTGAAGATGTTGAACCAACC 1254

 52638741 TGAACTCCCCTACCTCTAGGGTTCTTTTTACATGCAAGAAATAGTACATCCTCCTTGTTA 52638800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1255 TGAACTCCCCTACCTCTAGGGTTCTTTTTACATGCAAGAAATAGTACATCCTCCTTGTTA 1314

 52638801 AGTGAACCACTATTAATTGATTGTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTCCTGCAGCCAAAG 52638860
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||
     1315 AGTGAACCACTATTAATTGATTGTTGTGTGTGTGTGTGTGTGT--TTCCTGCAGCCAAAG 1372

 52638861 TAAAAATGATATATTACCAACCCCTAAATGATACACTATTCAAACTCCATCACTCTGAAA 52638920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1373 TAAAAATGATATATTACCAACCCCTAAATGATACACTATTCAAACTCCATCACTCTGAAA 1432

 52638921 AGCCATTTGATCTATTTCATAATTACTCATTTCTAAGTTTCTAACAATTTAGAAAATATA 52638980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1433 AGCCATTTGATCTATTTCATAATTACTCATTTCTAAGTTTCTAACAATTTAGAAAATATA 1492

 52638981 CAGTTTTATTTAGCATGACTACTACTGATGGCCTATATTATCTTCTAACTTTACAAAAAC 52639040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1493 CAGTTTTATTTAGCATGACTACTACTGATGGCCTATATTATCTTCTAACTTTACAAAAAC 1552

 52639041 CCCTAGGGCAGGTAGTAGCTTCCTTTTGTGGATGAAAACACAGGTTTTTAAATGATTGAG 52639100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1553 CCCTAGGGCAGGTAGTAGCTTCCTTTTGTGGATGAAAACACAGGTTTTTAAATGATTGAG 1612

 52639101 TATAACAGGCTTAGGTGACAGATGGATCTCGATTCCACTTCTGCCACTAATTAGCTTTGC 52639160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1613 TATAACAGGCTTAGGTGACAGATGGATCTCGATTCCACTTCTGCCACTAATTAGCTTTGC 1672

 52639161 GACCTTAACGCAGGTAACTTAAGTTCTCCCCAAGTTCTCTCCTCTGTTCAATGGCAATAG 52639220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1673 GACCTTAACGCAGGTAACTTAAGTTCTCCCCAAGTTCTCTCCTCTGTTCAATGGCAATAG 1732

 52639221 AAATACCTACCTTGTTGGGTTTTTTTAACAATAAAAACAGATAATGTATGCAAAATGCTT 52639280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1733 AAATACCTACCTTGTTGGGTTTTTTTAACAATAAAAACAGATAATGTATGCAAAATGCTT 1792

 52639281 ACTGCACAGCCTAGAAATAATGAATTATTTTAAAATGGGGCTATTATTGTCATTTAACTC 52639340
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1793 ACTACACAGCCTAGAAATAATGAATTATTTTAAAATGGGGCTATTATTGTCATTTAACTC 1852

 52639341 AACCACACAGCTATTTAGTGGTAGAGTCTGGACTCATACCTAGGTCACCCAGGCTCCTAA 52639400
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     1853 AACCACACAGCTATTTAGTGGTAGAGTCTGGACTCATACCTAGGTCACCTAGGCTCCTAA 1912

 52639401 CACTTCCACATCACCTCTGCCACTGCAAACATCTCATATTAAGCGTTTCTTACTGCTAAA 52639460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1913 CACTTCCACATCACCTCTGCCACTGCAAACATCTCATATTAAGCGTTTCTTACTGCTAAA 1972

 52639461 TGCATCAAAATCCCAGTGGTATAGCTGAGGACCTTGTTTACTCCAAAACTTGCATAATGT 52639520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1973 TGCATCAAAATCCCAGTGGTATAGCTGAGGACCTTGTTTACTCCAAAACTTGCATAATGT 2032

 52639521 AAGATGGATTTTCCCTTTGCACTGACAAAGTCTTTTGGGTGGCTAGTTCTCTTTACCAGT 52639580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2033 AAGATGGATTTTCCCTTTGCACTGACAAAGTCTTTTGGGTGGCTAGTTCTCTTTACCAGT 2092

 52639581 TGAAAAGGCATGGCCTTGTGGACATAAGGCAGAAACAACACAAAATAAAAAACAGTTAAT 52639640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2093 TGAAAAGGCATGGCCTTGTGGACATAAGGCAGAAACAACACAAAATAAAAAACAGTTAAT 2152

 52639641 AATTCACTTGGCCTTCTAATGTTGAAATTCGGTAATTCTTTTTATTTGTTTTTATTTTTC 52639700
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     2153 AATTCACTTGGCCTTCTAATGTTGAAATTGGGTAATTCTTTTTATTTGTTTTTATTTTTC 2212

 52639701 ACTTGGGATTTTGGGTATTTACAACTTTGCATATGCTAACATCTTTGAATTTCATTGCCT 52639760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2213 ACTTGGGATTTTGGGTATTTACAACTTTGCATATGCTAACATCTTTGAATTTCATTGCCT 2272

 52639761 CAAGTTGTAACTTCATTGAACAAGTTTCAAATAATTGGCAAAAATAGAAACGTTGACTAT 52639820
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2273 CAAGTTGTAACTTCATTGAACAGGTTTCAAATAATTGGCAAAAATAGAAACGTTGACTAT 2332

 52639821 TTAAGACTATGGGCTTTGGAGATGGACAATTTTGGCTGTGCCACCTTTTAGCTGTGTGTC 52639880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2333 TTAAGACTATGGGCTTTGGAGATGGACAATTTTGGCTGTGCCACCTTTTAGCTGTGTGTC 2392

 52639881 AGGAGTGATATGCTTTCTCTGAACTGTTGACTTCTTCATCTGTAAAATGGTGAAAATACA 52639940
          ||||.||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     2393 AGGAATGATATGCTTTCTCTGAACTGTTGGCTTCTTCATCTGTAAAATGGTGAAAATACA 2452

 52639941 GGAATTCCCTGGTAAGATTTGATGGCTCAATGAGCTGATTTCTACAAAATGATTTAATCA 52640000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2453 GGAATTCCCTGGTAAGATTTGATGGCTCAATGAGCTGATTTCTACAAAATGATTTAATCA 2512

 52640001 CAGAATTTGACTTAAAATGCGAGAGGGATTCATGCTGTCCGAAATCATCCAAGAGTGGAG 52640060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2513 CAGAATTTGACTTAAAATGCGAGAGGGATTCATGCTGTCCGAAATCATCCAAGAGTGGAG 2572

 52640061 ATATCTGGTTAGCTTCATGGAGAACCTGGCACTGAATATCAAGTCAATTTTTGATAAACA 52640120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2573 ATATCTGGTTAGCTTCATGGAGAACCTGGCACTGAATATCAAGTCAATTTTTGATAAACA 2632

 52640121 GAGAGAGAAAGGGACATAGGCAGAGAAAATACCAGGAGACAGATGGCGTTTGCACAGGTC 52640180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2633 GAGAGAGAAAGGGACATAGGCAGAGAAAATACCAGGAGACAGATGGCGTTTGCACAGGTC 2692

 52640181 AGGTGTTGGCCATATTGACTGGAGAAATTTAAGGGAAGGGTGGAAAATGCAGTTGGAAAA 52640240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2693 AGGTGTTGGCCATATTGACTGGAGAAATTTAAGGGAAGGGTGGAAAATGCAGTTGGAAAA 2752

 52640241 TAGGCAGAGGAAACATTGTGGAAACCCTTAAATGTCAGACAAAGAAACTGAGGCTTATGG 52640300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2753 TAGGCAGAGGAAACATTGTGGAAACCCTTAAATGTCAGACAAAGAAACTGAGGCTTATGG 2812

 52640301 GCATGGACACTAACATTTCTATTGTTTCAAAAATAATTTTACAACTTTTATACCTTTCTC 52640360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2813 GCATGGACACTAACATTTCTATTGTTTCAAAAATAATTTTACAACTTTTATACCTTTCTC 2872

 52640361 ACCCAAGTTAGGACTTGTGCCTTTGGTTATACAACTCTTAAATTAGAGTCAACTGTGCTA 52640420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2873 ACCCAAGTTAGGACTTGTGCCTTTGGTTATACAACTCTTAAATTAGAGTCAACTGTGCTA 2932

 52640421 TCTCTGTGAGTTTGGGTTGAGGACTATGGAAGGGAAAGGCAAAAAATAAAAGTAAAATGT 52640480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2933 TCTCTGTGAGTTTGGGTTGAGGACTATGGAAGGGAAAGGCAAAAAATAAAAGTAAAATGT 2992

 52640481 GAAGTAGAAGACAGGGAGAAAACCCATAATACTGGTAATAGCTAATTTCTCTTTTTCTTC 52640540
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     2993 GAAGTAGAAGACAGGGAGAAAACCCATAATACTAGTAATAGCTAATTTCTCTTTTTCTTC 3052

 52640541 TTTCAAAATGCAATTTGTGCTAAGTACTTTATATGGCCTATCTCATTTAACTTCTAAAAG 52640600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3053 TTTCAAAATGCAATTTGTGCTAAGTACTTTATATGGCCTATCTCATTTAACTTCTAAAAG 3112

 52640601 TGTGAACAATGTGAGAATGTGCTAGATACTATTATTATCCCCATTTTACAGATGAGGAAA 52640660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3113 TGTGAACAATGTGAGAATGTGCTAGATACTATTATTATCCCCATTTTACAGATGAGGAAA 3172

 52640661 CTGAGGCTCAGGAGGTGAAGTAGCTTGCCCAAGATCACACAGCCAGTAGGTGACAGAGGT 52640720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3173 CTGAGGCTCAGGAGGTGAAGTAGCTTGCCCAAGATCACACAGCCAGTAGGTGACAGAGGT 3232

 52640721 AGAGAGGAAACCTAGGCTACTTGACTATGATGCTTATGTTTAATTCACTACTAAATACCA 52640780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3233 AGAGAGGAAACCTAGGCTACTTGACTATGATGCTTATGTTTAATTCACTACTAAATACCA 3292

 52640781 TGTAGGAAAGGACTCTGGAGACCTTAGTTCTTTAATTCCAATTCTACCACTAAACAGTAG 52640840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3293 TGTAGGAAAGGACTCTGGAGACCTTAGTTCTTTAATTCCAATTCTACCACTAAACAGTAG 3352

 52640841 AGACAGGATGAACTTGTCATTCACTGAGATGGAAAACCCCGTGAATTAAACTGGTGGGCA 52640900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3353 AGACAGGATGAACTTGTCATTCACTGAGATGGAAAACCCCGTGAATTAAACTGGTGGGCA 3412

 52640901 TTTTGTTTTTGTCATTGTTAGGCGATGAATGAAGAGTTCCATTCTGGACACATTAGGGTT 52640960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3413 TTTTGTTTTTGTCATTGTTAGGCGATGAATGAAGAGTTCCATTCTGGACACATTAGGGTT 3472

 52640961 GAGATACTCAGTGAGCAGCCAAATGGGGATGTAGAAATTCAAGTAGACATGTGGAAGAGG 52641020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3473 GAGATACTCAGTGAGCAGCCAAATGGGGATGTAGAAATTCAAGTAGACATGTGGAAGAGG 3532

 52641021 AGGCAGCTGAGACTCACGTCTGGACTTCAGGGATGGATCCCGGCTAGAGATGTAAATTTG 52641080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3533 AGGCAGCTGAGACTCACGTCTGGACTTCAGGGATGGATCCCGGCTAGAGATGTAAATTTG 3592

 52641081 GAACTTGTCAACCCATAGCAGTATTTAAACCTTTGGGACTGAGGGAAACCTTCAAGGAAA 52641140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3593 GAACTTGTCAACCCATAGCAGTATTTAAACCTTTGGGACTGAGGGAAACCTTCAAGGAAA 3652

 52641141 TAAGCGTAGTTAGAGATAGCCAAGAAGTGAACCCTGGGGAAGTCCAACATTTAGAGGGTG 52641200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3653 TAAGCGTAGTTAGAGATAGCCAAGAAGTGAACCCTGGGGAAGTCCAACATTTAGAGGGTG 3712

 52641201 AGATCCAGCAAAGGAGATGATGGAAGAGTACCAGGGAGGTGGAAGGATGTTGTTTCAAAC 52641260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3713 AGATCCAGCAAAGGAGATGATGGAAGAGTACCAGGGAGGTGGAAGGATGTTGTTTCAAAC 3772

 52641261 AGCAAGGTGTGGCCCACTCAGTCACTGTGTCGGATTCAACTTGCAGGTCAGACCTACTAG 52641320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3773 AGCAAGGTGTGGCCCACTCAGTCACTGTGTCGGATTCAACTTGCAGGTCAGACCTACTAG 3832

 52641321 GACAAAGATAGAGACCTATAGGATTTGGCAGCCAGGGTGATGGTAGGGAATTTGAAACAT 52641380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3833 GACAAAGATAGAGACCTATAGGATTTGGCAGCCAGGGTGATGGTAGGGAATTTGAAACAT 3892

 52641381 CATGGTGGCTGTGACAAGAGCCTGAATGGAGTGTGTTCAAGAGAGAAAAGAAGAGAAGTG 52641440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3893 CATGGTGGCTGTGACAAGAGCCTGAATGGAGTGTGTTCAAGAGAGAAAAGAAGAGAAGTG 3952

 52641441 AAAACACAGAATATTGTTCTTATTATTAGTAGCCTGAGCCAATCTGAGGACCGATGCACT 52641500
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     3953 AAAACACAGAATATTGTTCTTATTATTAGTAGCCTGAGCAAATCTGAGGACCGATGCACT 4012

 52641501 TATCACAATGTCTCTTAAAATACTATGTCTCTTACTAGATTATACACTCCTTGACAGACG 52641560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4013 TATCACAATGTCTCTTAAAATACTATGTCTCTTACTAGATTATACACTCCTTGACAGACG 4072

 52641561 AGAAACATGATTTATTTTTCAAATGCCTTGCACAAGGTTAGTGCGAAAGTAACGATTGCA 52641620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4073 AGAAACATGATTTATTTTTCAAATGCCTTGCACAAGGTTAGTGCGAAAGTAACGATTGCA 4132

 52641621 GGATTTAATTACACTTTTAAAAGAAAAAAGACATTCTTCATCTTATGAAACTCTGCATGG 52641680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4133 GGATTTAATTACACTTTTAAAAGAAAAAAGACATTCTTCATCTTATGAAACTCTGCATGG 4192

 52641681 CAACACTTTATGCGCCCCACACCCCCACTCAACACAAACACAACTCTGGAAGTACTGTGT 52641740
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4193 CAACACTTTACGCGCCCCACACCCCCACTCAACACAAACACAACTCTGGAAGTACTGTGT 4252

 52641741 TGATAACAGAAATGTGGTGGGTTTTATTTTTAACCAATAAAGGTCAAGTTTGCATTATGT 52641800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4253 TGATAACAGAAATGTGGTGGGTTTTATTTTTAACCAATAAAGGTCAAGTTTGCATTATGT 4312

 52641801 GATTTTGTGTGTGTGTGTGTTGAATCTTTTAAATGCATATCTTACAGCTCTGGTTCAGTT 52641860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4313 GATTTTGTGTGTGTGTGTGTTGAATCTTTTAAATGCATATCTTACAGCTCTGGTTCAGTT 4372

 52641861 GTTGTGGGGAGAGGAAAAAAACCTCATCCCTGCCAACACATTGGTTTGTATGAATCACAG 52641920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4373 GTTGTGGGGAGAGGAAAAAAACCTCATCCCTGCCAACACATTGGTTTGTATGAATCACAG 4432

 52641921 CTCAGTGAAACCTTTCAGGCATATAATTTATCTTTTCTTTGGCCTATGTAGTAAACGCTT 52641980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4433 CTCAGTGAAACCTTTCAGGCATATAATTTATCTTTTCTTTGGCCTATGTAGTAAACGCTT 4492

 52641981 CATTTGTTCATGAATTCTTGCCTTGTTTTAATTATGCTTTGCCCTGAATGTAGTTTTATA 52642040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4493 CATTTGTTCATGAATTCTTGCCTTGTTTTAATTATGCTTTGCCCTGAATGTAGTTTTATA 4552

 52642041 AGGCACAAAAATAAGATTGTCGTTCTGAAAACACAGAAGATTTGTATGTTTCCCCCAGGA 52642100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4553 AGGCACAAAAATAAGATTGTCGTTCTGAAAACACAGAAGATTTGTATGTTTCCCCCAGGA 4612

 52642101 TGAAATGGTGGCATCTTTCTCCCAATTCACAGCTCTGTGGGCTTGTGGCTGGAATTCCAA 52642160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4613 TGAAATGGTGGCATCTTTCTCCCAATTCACAGCTCTGTGGGCTTGTGGCTGGAATTCCAA 4672

 52642161 TCCAGCAGGGAGCAAGCCATAAAAATGGGGGGAAGGGCTGCTGGAGGGAGGCAGTAGATG 52642220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4673 TCCAGCAGGGAGCAAGCCATAAAAATGGGGGGAAGGGCTGCTGGAGGGAGGCAGTAGATG 4732

 52642221 CGGCTGAGCCCAAGGCATAATTCACCCTAAGAATTCTGAATCAATACACTGACATCCAGC 52642280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4733 CGGCTGAGCCCAAGGCATAATTCACCCTAAGAATTCTGAATCAATACACTGACATCCAGC 4792

 52642281 CATGTACAATGTGGTACTCCCACCAAGAAAGCCACTGATTGAGAAGTTTTATTCATGTTA 52642340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4793 CATGTACAATGTGGTACTCCCACCAAGAAAGCCACTGATTGAGAAGTTTTATTCATGTTA 4852

 52642341 CTTTCTGAGGGTTGGATTGTCCCATTACATTTATAGAACAATTGCTTTTTTCCCCCTAAA 52642400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4853 CTTTCTGAGGGTTGGATTGTCCCATTACATTTATAGAACAATTGCTTTTTTCCCCCTAAA 4912

 52642401 TACAGAACTATGCAGCCGGGAGTCAGAAAAGAAACCTTGACAATCAGAAGGCTGTTTTGT 52642460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4913 TACAGAACTATGCAGCCGGGAGTCAGAAAAGAAACCTTGACAATCAGAAGGCTGTTTTGT 4972

 52642461 TGTTGTTGTTAAAAACCTTTGCAGGCATATGCATCTGAATATCCATAAGTTCACAGGCTG 52642520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4973 TGTTGTTGTTAAAAACCTTTGCAGGCATATGCATCTGAATATCCATAAGTTCACAGGCTG 5032

 52642521 AGGGAGAAATGGCTATTTCATAACTTTTCTGTGTTTCTCATGTACATAGTACAAAGTGGG 52642580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5033 AGGGAGAAATGGCTATTTCATAACTTTTCTGTGTTTCTCATGTACATAGTACAAAGTGGG 5092

 52642581 CACTCAGTATTTCAAATTTCAATATCACTGAAAAAAATGGAAATTTGTCATGTAACAAAA 52642640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5093 CACTCAGTATTTCAAATTTCAATATCACTGAAAAAAATGGAAATTTGTCATGTAACAAAA 5152

 52642641 TCAGATGCAGACTTCACTGGTGAATCTGAGGGAGTGAATTCACTTATTCAGAAAGGAAGA 52642700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5153 TCAGATGCAGACTTCACTGGTGAATCTGAGGGAGTGAATTCACTTATTCAGAAAGGAAGA 5212

 52642701 CAGTTACAATTCTTGGGTCTTCTGAGAGATCATTATAACTTGAAAATATTACACAAGGGC 52642760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5213 CAGTTACAATTCTTGGGTCTTCTGAGAGATCATTATAACTTGAAAATATTACACAAGGGC 5272

 52642761 TTTGCTATATTAGATACCTGCCATGTTCCTAACACAAGCTCCCATTTTCTGACTCAAATC 52642820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     5273 TTTGCTATATTAGATACCTGCCATGTTCCTAATACAAGCTCCCATTTTCTGACTCAAATC 5332

 52642821 TCATTTTGGAACACATTCCACTCAAATTGAGGTTCTACCCCTAAGAGTTCTTTTTCAATA 52642880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5333 TCATTTTGGAACACATTCCACTCAAATTGAGGTTCTACCCCTAAGAGTTCTTTTTCAATA 5392

 52642881 AAGAAAGCTGAGTTAATAAATCACAACTCCAAAACTTTTCCTCACTTTTCTTAGACTAGA 52642940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5393 AAGAAAGCTGAGTTAATAAATCACAACTCCAAAACTTTTCCTCACTTTTCTTAGACTAGA 5452

 52642941 AATAGATTGAGTGTGTCGAGGTTTTATGGCTGAGTACATTGGAGGGCTGGCTATTCTATG 52643000
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5453 AATAGATTGAATGTGTCGAGGTTTTATGGCTGAGTACATTGGAGGGCTGGCTATTCTATG 5512

 52643001 CTGAACTGGTTTACTTGATTAAGATGGGGATTTGGATGAGTCACCGGACACCTGTCCAAA 52643060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     5513 CTGAACTGGTTTACTTGATTAAGATGGGGATTTGGATGAGTCACTGGACACCTGTCCAAA 5572

 52643061 GATGAGTAAAACACATTCCTTCATTGTCTTCCCATAAATAACTCAATCTTCTCCTAACTG 52643120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5573 GATGAGTAAAACACATTCCTTCATTGTCTTCCCATAAATAACTCAATCTTCTCCTAACTG 5632

 52643121 AGCCAATGGATAGGCTTTGGATGCCCAAGCAAAACA--AACACATGACTGTTAAAAAATC 52643178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||
     5633 AGCCAATGGATAGGCTTTGGATGCCCAAGCAAAA--GGAACACATGACTGTTAAAAAATC 5690

 52643179 ACAACCTCAAAATGGCCTTAGAAGCCTATGACCAATAATGAGAATGGTTTCTCCACTCAG 52643238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5691 ACAACCTCAAAATGGCCTTAGAAGCCTATGACCAATAATGAGAATGGTTTCTCCACTCAG 5750

 52643239 GCGCAAGTAGTAAACAGTTTCTCCCATATGCAGGAATATTGACGACTAGTTTACCGCCTC 52643298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5751 GCGCAAGTAGTAAACAGTTTCTCCCATATGCAGGAATATTGACGACTAGTTTACCGCCTC 5810

 52643299 TGGGCACGTAACTTTCAGGTCCTGGTTCATGCATTTGCTGGAATGTTCCCTGGGCCATGG 52643358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5811 TGGGCACGTAACTTTCAGGTCCTGGTTCATGCATTTGCTGGAATGTTCCCTGGGCCATGG 5870

 52643359 AGCCCAGTTCTCCTGGCATCTGGCATCTCCCCCACACTCTGCTCCCCCAGCACAGCACTT 52643418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5871 AGCCCAGTTCTCCTGGCATCTGGCATCTCCCCCACACTCTGCTCCCCCAGCACAGCACTT 5930

 52643419 GGCATCTTGCATTGCAATTGCAGGTTTATTTATTCACTTCTCTCACTGGACAGCAAACTC 52643478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5931 GGCATCTTGCATTGCAATTGCAGGTTTATTTATTCACTTCTCTCACTGGACAGCAAACTC 5990

 52643479 CACCAGGGCCGAGACTCTGTGTCTCGCCCTTCACTGTGGTCCCTGTGCCTCACCTGTTCC 52643538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5991 CACCAGGGCCGAGACTCTGTGTCTCGCCCTTCACTGTGGTCCCTGTGCCTCACCTGTTCC 6050

 52643539 TAGTACAGTGTCACACTCAGTAAAGAGCAGATGCCTGG-TGCATTTGGAGACTTATTTTA 52643597
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
     6051 TAGTACAGTGTCACACTCAGTAAAGAGCAGATGCCTGGATGCATTTGGAGACTTATTTTA 6110

 52643598 AATTATACGGAAAGTTATTCAACCGGCTTCTTGAACTGGTGAATTTTGGAAAGTGGGTGT 52643657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6111 AATTATACGGAAAGTTATTCAACCGGCTTCTTGAACTGGTGAATTTTGGAAAGTGGGTGT 6170

 52643658 TTGAAGGGAAAATGTTTAAACTCTGAAAGAAATGTTGGAAATAAGCTCTTTGAATCAAAA 52643717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6171 TTGAAGGGAAAATGTTTAAACTCTGAAAGAAATGTTGGAAATAAGCTCTTTGAATCAAAA 6230

 52643718 TGTATAGAAAACACAAGAATGCTGACAGTAAGAGCCTAAAACACATGATGACTATTATCT 52643777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6231 TGTATAGAAAACACAAGAATGCTGACAGTAAGAGCCTAAAACACATGATGACTATTATCT 6290

 52643778 TTTCCCAATTTTAACTCTCCAGAGTGTTCAGCGGTGCCCAGCCTTCATAATGTAATTCTT 52643837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6291 TTTCCCAATTTTAACTCTCCAGAGTGTTCAGCGGTGCCCAGCCTTCATAATGTAATTCTT 6350

 52643838 CGTAGCACCCTGGATGCATTAAAACCATAGATTAACGTGATACTTATTTTCATTAAGGAA 52643897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6351 CGTAGCACCCTGGATGCATTAAAACCATAGATTAACGTGATACTTATTTTCATTAAGGAA 6410

 52643898 AATAATTTACGTACAGTGCTCAGAGTAGAGCCTGGCACATTGAACATTTTCAATAAATGA 52643957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6411 AATAATTTACGTACAGTGCTCAGAGTAGAGCCTGGCACATTGAACATTTTCAATAAATGA 6470

 52643958 CAGCAAGTGTAATTATTAGCACTTCGGAAGTGCAAAGTTGCATTGTATTAAGACAAATAT 52644017
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6471 CAGCAAGTGTAATTATTAGCACTTTGGAAGTGCAAAGTTGCATTGTATTAAGACAAATAT 6530

 52644018 ATTTGGAGCTCATCCAATTTTTTCCTGGCTCTGAAGTCTGCTAGTGGCACTTAACTTTAT 52644077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6531 ATTTGGAGCTCATCCAATTTTTTCCTGGCTCTGAAGTCTGCTAGTGGCACTTAACTTTAT 6590

 52644078 TCCCAAGTTTTGAAAAATATTGTTATTTAAAAAGTCTGTTAACCAAGGAAATGCATGCCC 52644137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6591 TCCCAAGTTTTGAAAAATATTGTTATTTAAAAAGTCTGTTAACCAAGGAAATGCATGCCC 6650

 52644138 TAAACCTATAATGTATCAAGTTTTACTTCCTTCTTCTTTTAAGGAGTTCTTTTCCTGCCT 52644197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6651 TAAACCTATAATGTATCAAGTTTTACTTCCTTCTTCTTTTAAGGAGTTCTTTTCCTGCCT 6710

 52644198 TGAATACAAACAGGCTCTCTCAAGGTTAAAAGCAAATGCTCTTTTTAGTGTCAAAAAGAG 52644257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6711 TGAATACAAACAGGCTCTCTCAAGGTTAAAAGCAAATGCTCTTTTTAGTGTCAAAAAGAG 6770

 52644258 CTTGCCTTTCTTCGCTCAGGAAAAAAAGCAACTGATTCCAGGATACCTTCTTTGAAAACC 52644317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6771 CTTGCCTTTCTTCGCTCAGGAAAAAAAGCAACTGATTCCAGGATACCTTCTTTGAAAACC 6830

 52644318 AACACAAAAAAACCCCCCAAAAAACAAAAAAAAAACCCAAAACCCCTAGTTTTTACAAAG 52644377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6831 AACACAAAAAAACCCCCCAAAAAACAAAAAAAAAACCCAAAACCCCTAGTTTTTACAAAG 6890

 52644378 GTTTATTACTCCTACTTGTTGGAAAAGAATTACTACATAAAAGAGTCTGCCCAGAGCTGT 52644437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6891 GTTTATTACTCCTACTTGTTGGAAAAGAATTACTACATAAAAGAGTCTGCCCAGAGCTGT 6950

 52644438 AAAATCTCCTTATTCAAACACACACCTTAGAGCAAAAGATGGTTAAATATCAATTCAGGC 52644497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6951 AAAATCTCCTTATTCAAACACACACCTTAGAGCAAAAGATGGTTAAATATCAATTCAGGC 7010

 52644498 TATTAACAGTAAGGGAC---GAAATGTGTTCCAACAAAACTCTGCATGTCAACAAACTAC 52644554
          ||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7011 TATTAACAGTAAGG---AATGAAATGTGTTCCAACAAAACTCTGCATGTCAACAAACTAC 7067

 52644555 AGAGACTAGGTAACATCTTTTAGGAATCATTTTTATTCCACTAATGCCTTTTCCTCCAGA 52644614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7068 AGAGACTAGGTAACATCTTTTAGGAATCATTTTTATTCCACTAATGCCTTTTCCTCCAGA 7127

 52644615 ATCCACTGATCGTAAACGCAACCTGTCTACTTCCGCCTTTGAAAAATGGATGGACAAATT 52644674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7128 ATCCACTGATCGTAAACGCAACCTGTCTACTTCCGCCTTTGAAAAATGGATGGACAAATT 7187

 52644675 CATCTGCATGTAACTCACCTCCTCTTTTCTTTTACATAAAACAGATGCCACAGCTGTTAT 52644734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7188 CATCTGCATGTAACTCACCTCCTCTTTTCTTTTACATAAAACAGATGCCACAGCTGTTAT 7247

 52644735 TGTTCTTCACACAGAAGTTTCTACCCAGAGAAACATCAGGATGACACTCTGCTGCAATGT 52644794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7248 TGTTCTTCACACAGAAGTTTCTACCCAGAGAAACATCAGGATGACACTCTGCTGCAATGT 7307

 52644795 GCTATTTGTTCTAGAGGGGTCAACAGCTTGCCACCTTGCCTAGGCCCAGGGTGACTGCAT 52644854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7308 GCTATTTGTTCTAGAGGGGTCAACAGCTTGCCACCTTGCCTAGGCCCAGGGTGACTGCAT 7367

 52644855 ATGTGCAGTGGTCTTATCCCATTAGCGCCCCCGAGCATGCATTCAGAACCAAGTGGATAC 52644914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7368 ATGTGCAGTGGTCTTATCCCATTAGCGCCCCCGAGCATGCATTCAGAACCAAGTGGATAC 7427

 52644915 ACCTTGGCACACTTACCTTCCCTGCAGGGACATCATCGGACTGCCCTGATAAGCCAGGAA 52644974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7428 ACCTTGGCACACTTACCTTCCCTGCAGGGACATCATCGGACTGCCCTGATAAGCCAGGAA 7487

 52644975 CCTCATCCACCTTGTCTTGATGCTCTGCCCTCTTGGCTTCCTGTTGGCTGTCACCTGGCA 52645034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7488 CCTCATCCACCTTGTCTTGATGCTCTGCCCTCTTGGCTTCCTGTTGGCTGTCACCTGGCA 7547

 52645035 CCTTTTCCTGTCCCTTGTCCAGCTTGAAGAATTTGTCAAAAAAGCTGGAGTCCTTGGGCT 52645094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7548 CCTTTTCCTGTCCCTTGTCCAGCTTGAAGAATTTGTCAAAAAAGCTGGAGTCCTTGGGCT 7607

 52645095 TGGAGGGAGCTTCTCCTCCTGCTCCCCCTGTCTCAGGTGGGAGAAGCGTGGGATCCCTGG 52645154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7608 TGGAGGGAGCTTCTCCTCCTGCTCCCCCTGTCTCAGGTGGGAGAAGCGTGGGATCCCTGG 7667

 52645155 CGGCAGAGAGGACCTTGTCTTGGGCCGGGGCGTGCCCTGGGGTTTTATCTGTGTCCTGCC 52645214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7668 CGGCAGAGAGGACCTTGTCTTGGGCCGGGGCGTGCCCTGGGGTTTTATCTGTGTCCTGCC 7727

 52645215 CCGGTCCAGCTGCCACCGGAAGTGTCCAGCTCTCACTTGGGTCTTTGTTCGCTGGAGCTT 52645274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7728 CCGGTCCAGCTGCCACCGGAAGTGTCCAGCTCTCACTTGGGTCTTTGTTCGCTGGAGCTT 7787

 52645275 TATTGGAGCTGACATCAAGCTTCACTGATCCAAGGGATGAATCTGCGGCTTGGTCTCCGG 52645334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7788 TATTGGAGCTGACATCAAGCTTCACTGATCCAAGGGATGAATCTGCGGCTTGGTCTCCGG 7847

 52645335 TACGTCCTGGTACAGGCCGAGAGAGCATCAAGAAAAAACGAGATTTAGCAGCTGGTGCCT 52645394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7848 TACGTCCTGGTACAGGCCGAGAGAGCATCAAGAAAAAACGAGATTTAGCAGCTGGTGCCT 7907

 52645395 CGGGTTTGGCCTCTTTCCCAAGATTCTTTCCGTTGGCATCCGCAACAGCACTTATCTCCG 52645454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7908 CGGGTTTGGCCTCTTTCCCAAGATTCTTTCCGTTGGCATCCGCAACAGCACTTATCTCCG 7967

 52645455 TTGTCTCGGGGGAAGAAGTGGCCACATTATCCGTCTTGACACTTATTCCCAAGTCGACTG 52645514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7968 TTGTCTCGGGGGAAGAAGTGGCCACATTATCCGTCTTGACACTTATTCCCAAGTCGACTG 8027

 52645515 TAAACACAAACATAAACAGTGGTTATTCAGCCAAGCCGGGAAATTCAGGCACTAATAATG 52645574
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8028 TAAACACAAACATAAACAGCGGTTATTCAGCCAAGCCGGGAAATTCAGGCACTAATAATG 8087

 52645575 GACTCCAGACATTTTTTATACAAAAGCCATACTGCATACTGGAACTGTGTTGTTCTCTGG 52645634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8088 GACTCCAGACATTTTTTATACAAAAGCCATACTGCATACTGGAACTGTGTTGTTCTCTGG 8147

 52645635 TCATTCTGAAAGGCAGAAGTTAGCTCTCTACATCTCCTTGGACCCTGCTTTTCTTGGGAG 52645694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8148 TCATTCTGAAAGGCAGAAGTTAGCTCTCTACATCTCCTTGGACCCTGCTTTTCTTGGGAG 8207

 52645695 AGGAGAAGGCAAGGTTGGTGAGGAGGGAAAGCTACTTAATGGAAAGTCACTAGCTGCCAG 52645754
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8208 AGGAGAGGGCAAGGTTGGTGAGGAGGGAAAGCTACTTAATGGAAAGTCACTAGCTGCCAG 8267

 52645755 GTGTGGAATGAGTGATATTCAATGTTAATTAATCTTCTTTTATCTGTGTAAGAACTCCGT 52645814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8268 GTGTGGAATGAGTGATATTCAATGTTAATTAATCTTCTTTTATCTGTGTAAGAACTCCGT 8327

 52645815 GAGCAGCATATTGTCATGATGTCAACTGGGAGGCAGTACAGCAGTTAGGAGCTTGGGTTC 52645874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8328 GAGCAGCATATTGTCATGATGTCAACTGGGAGGCAGTACAGCAGTTAGGAGCTTGGGTTC 8387

 52645875 TGGAGCTAGAACAAGGTTTCTCAACCTCAGCACTACTCACATTTGAAGCCAGATTATTCT 52645934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8388 TGGAGCTAGAACAAGGTTTCTCAACCTCAGCACTACTCACATTTGAAGCCAGATTATTCT 8447

 52645935 TTGTTAGGGAGGCTCATCCCGTGCCTCATAGGCTGATTAGCAGCATCCTGGCCTCTGCCC 52645994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8448 TTGTTAGGGAGGCTCATCCCGTGCCTCATAGGCTGATTAGCAGCATCCTGGCCTCTGCCC 8507

 52645995 ACTAGACGCCGGTCACATTTCCCAGTCATGGCAACCAAAAATATCTCTAGGCATTGCTAA 52646054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8508 ACTAGACGCCGGTCACATTTCCCAGTCATGGCAACCAAAAATATCTCTAGGCATTGCTAA 8567

 52646055 ATGTCCCCTGGAGGACAAAATCTCTTACGTTTGAGAGGCACTGAGCTGAAATGTCTTTTT 52646114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8568 ATGTCCCCTGGAGGACAAAATCTCTTACGTTTGAGAGGCACTGAGCTGAAATGTCTTTTT 8627

 52646115 GAATCCAGATTATCTAATTTTCTGTGCCTCAACTTTCTGGTAAAAGGAGACAGATAATAA 52646174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8628 GAATCCAGATTATCTAATTTTCTGTGCCTCAACTTTCTGGTAAAAGGAGACAGATAATAA 8687

 52646175 ATCTCGTAATTTTGTTAGGAAGATTACATGAGTTAATAGTTTTAAAGCAAGTACAATAGC 52646234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8688 ATCTCGTAATTTTGTTAGGAAGATTACATGAGTTAATAGTTTTAAAGCAAGTACAATAGC 8747

 52646235 ACCTGGAATATATTAAGTGCTTAATAAATATCACAAACATTAGTTATCATTATTCATGAG 52646294
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8748 GCCTGGAATATATTAAGTGCTTAATAAATATCACAAACATTAGTTATCATTATTCATGAG 8807

 52646295 TGAGAAAACTGACAGTCAGAGAGGTCAGTACACCCTCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCTAGT 52646354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8808 TGAGAAAACTGACAGTCAGAGAGGTCAGTACACCCTCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCTAGT 8867

 52646355 AAGCAGCAGAGTCTGGCTTCAGGCAGAAATCTGACTTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGTCT 52646414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8868 AAGCAGCAGAGTCTGGCTTCAGGCAGAAATCTGACTTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGTCT 8927

 52646415 TACCAGGGACTTGTATTAGCATAGACTGTTAAGAATATGGGAAGATTTTTAAAATACAGT 52646474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8928 TACCAGGGACTTGTATTAGCATAGACTGTTAAGAATATGGGAAGATTTTTAAAATACAGT 8987

 52646475 ACTCAGAAAATTTCTCTTTGAAAGGCTGGAAGAGCAGATATCCACACAAGAAGGCAAATT 52646534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8988 ACTCAGAAAATTTCTCTTTGAAAGGCTGGAAGAGCAGATATCCACACAAGAAGGCAAATT 9047

 52646535 AGACCTCAGGCCAGTGTGGAATTAAAGGTGTAGGGTTATCTGGTCAAGACTGTGTGTGTG 52646594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9048 AGACCTCAGGCCAGTGTGGAATTAAAGGTGTAGGGTTATCTGGTCAAGACTGTGTGTGTG 9107

 52646595 GATACAGGCTCCAACCCCTCCAGGCAAGGGCACTGTTTCCAACATCCACCCTTTCTCCTT 52646654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     9108 GATACAGGCTCCAACCCCTCCAGGCAAGGGCAATGTTTCCAACATCCACCCTTTCTCCTT 9167

 52646655 TGACCTCTACCTTGACCTAAATTAACTATAAAAGGTCCTTCTTTTCTAGGACCCTACTAT 52646714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9168 TGACCTCTACCTTGACCTAAATTAACTATAAAAGGTCCTTCTTTTCTAGGACCCTACTAT 9227

 52646715 AAATCAGTGAAATATTCAGGAAAAAAAGAACACCAAGAATGTTGGGATCCCAGTTAAAGA 52646774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9228 AAATCAGTGAAATATTCAGGAAAAAAAGAACACCAAGAATGTTGGGATCCCAGTTAAAGA 9287

 52646775 TCAAGATTCTCTACTGATAAGCTGTGTGATATGGAGTAAATCACTAAAGATCTTTGAATC 52646834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9288 TCAAGATTCTCTACTGATAAGCTGTGTGATATGGAGTAAATCACTAAAGATCTTTGAATC 9347

 52646835 TCTTCATTTGTAAAATGGGAATATTGGTAGTCCTACTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTAAA 52646894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9348 TCTTCATTTGTAAAATGGGAATATTGGTAGTCCTACTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTAAA 9407

 52646895 GAAGAAAAGTCATGCAAAGGATCTGGCACAACGCCTTTTCCATAATAAGTGCTTAGTAAT 52646954
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     9408 GAAGAAAAGTCATGCAAAGGATCTGGCACAATGCCTTTTCCATAATAAGTGCTTAGTAAT 9467

 52646955 TGACAGATACTGTGATAACTTTTCAGGTTTCTCTCATGCCTTTGACAACATTGCATTTTG 52647014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9468 TGACAGATACTGTGATAACTTTTCAGGTTTCTCTCATGCCTTTGACAACATTGCATTTTG 9527

 52647015 CTTGCTCTATCTGTAGTCAGACACTTCTTAATATCTGTTTGCAGGAAGAC 52647064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9528 CTTGCTCTATCTGTAGTCAGACACTTCTTAATATCTGTTTGCAGGAAGAC 9577

EXCISED REGION

 52658003 AGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTG 52658062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9578 AGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTG 9637

 52658063 GCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTAT 52658122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9638 GCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTAT 9697

 52658123 AAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGG 52658182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9698 AAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGG 9757

 52658183 GAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTG 52658242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9758 GAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTG 9817

 52658243 AAACACTGTCTCTGCTAAAAAACAAAACAAAACAAAAC 52658280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9818 AAACACTGTCTCTGCTAAAAAACAAAACAAAACAAAAC 9855

Alignment time is 10.7479 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [52637064,52668002] =>     30939 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    7824] =>      7824 nucs 'mol-32-2fcd-208181_7824'

Score:        7824
Aligned:      7824        nucs
Identic:      7824 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [52652874,52660697]
 second seq =>  [       1,    7824]

 52652874 GACAGTAGCAGCTCCAAAATATTTAGAAGGTAGAGTTGAAAATTTTGATTTTCTTAGTGC 52652933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GACAGTAGCAGCTCCAAAATATTTAGAAGGTAGAGTTGAAAATTTTGATTTTCTTAGTGC 60

 52652934 AGAAAAATATTTTGTGCTGCATGTTTTTTTAAAGAAAGTCATTTTATCTGTATATGTGAT 52652993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGAAAAATATTTTGTGCTGCATGTTTTTTTAAAGAAAGTCATTTTATCTGTATATGTGAT 120

 52652994 TAAAACCTTATTTCCAGTGCCATCTTCGTGTAATTGTTAAGAACTTGGATTGTGGATCAC 52653053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TAAAACCTTATTTCCAGTGCCATCTTCGTGTAATTGTTAAGAACTTGGATTGTGGATCAC 180

 52653054 AGGAACCTGGCTTTGACTCTTAACTGCTCACTCTTTAAATGGATAACCCGGGTAAGTTAT 52653113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGGAACCTGGCTTTGACTCTTAACTGCTCACTCTTTAAATGGATAACCCGGGTAAGTTAT 240

 52653114 TTCCTGTCTCTGTGCCTCAGTTTTCTTACAAATTGGCATGAAAATAACAGTGCCTCCTTC 52653173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTCCTGTCTCTGTGCCTCAGTTTTCTTACAAATTGGCATGAAAATAACAGTGCCTCCTTC 300

 52653174 AGAGGGTAATTCTGAGGATTAAATGAAATATTGCCCATACAGTGCTTACCACAGGCTGGT 52653233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGAGGGTAATTCTGAGGATTAAATGAAATATTGCCCATACAGTGCTTACCACAGGCTGGT 360

 52653234 AGATGATTGGTATTCGGTAAACAGTAGTTATTTTTGTTATACTAATATGTTATTAATATA 52653293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGATGATTGGTATTCGGTAAACAGTAGTTATTTTTGTTATACTAATATGTTATTAATATA 420

 52653294 ATTACCATTTTGTATTTTTAAATGTAAGCCATAAGGAAAGGAATTATTCCAATAGTTTAA 52653353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATTACCATTTTGTATTTTTAAATGTAAGCCATAAGGAAAGGAATTATTCCAATAGTTTAA 480

 52653354 TTTACAAACTTGAGTTTTCTAGAAAGACTTTTAAAAACAGTAGTGATATAAATCAATTTA 52653413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTACAAACTTGAGTTTTCTAGAAAGACTTTTAAAAACAGTAGTGATATAAATCAATTTA 540

 52653414 TCTTAAGAAACATAAGTATCTGGGCCAGGCAAGTTTCAGAAATGTTTATCATTTTCAAAG 52653473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCTTAAGAAACATAAGTATCTGGGCCAGGCAAGTTTCAGAAATGTTTATCATTTTCAAAG 600

 52653474 TACCAAATATTCTCGTCAAAACAAGCTGCTTCATCAGAGTTCTAATTATATATTTAAACA 52653533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TACCAAATATTCTCGTCAAAACAAGCTGCTTCATCAGAGTTCTAATTATATATTTAAACA 660

 52653534 TACATGCACACACACACGTTTGTATTACAATATTCAAAACTTCTGAGGAAGAATTATCTT 52653593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TACATGCACACACACACGTTTGTATTACAATATTCAAAACTTCTGAGGAAGAATTATCTT 720

 52653594 TTTTTTTTCATGTGCCAAAGCTAAAACTTTCACTTGCTACAGCTGTGTATTAGTCTATTT 52653653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTTTTTTTCATGTGCCAAAGCTAAAACTTTCACTTGCTACAGCTGTGTATTAGTCTATTT 780

 52653654 CCATACTGCTATAAAGAGCTGCCCAAGACTGGGTGATTTATAAAGGAAAGAGGTTTAATT 52653713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CCATACTGCTATAAAGAGCTGCCCAAGACTGGGTGATTTATAAAGGAAAGAGGTTTAATT 840

 52653714 GACTCACAGTTCAGCATGGCAGGGAAGGCCTCAGGAAACTTACAATCATGGTGGAAGTCA 52653773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GACTCACAGTTCAGCATGGCAGGGAAGGCCTCAGGAAACTTACAATCATGGTGGAAGTCA 900

 52653774 AAGGGGGAGCAAGGACCTTTCTTCACAAGGCAGCAGAAAGAAGTGCCAAATGAACAGGGA 52653833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AAGGGGGAGCAAGGACCTTTCTTCACAAGGCAGCAGAAAGAAGTGCCAAATGAACAGGGA 960

 52653834 AGAGCTCCTTATGAAACCATCAGGTCTTGTGAGAACTCACTTACTTTTATGAGAACAGCA 52653893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AGAGCTCCTTATGAAACCATCAGGTCTTGTGAGAACTCACTTACTTTTATGAGAACAGCA 1020

 52653894 TGGAGGAAACTGTCCCCATGATCCAATCACCTCCACCTGGTCTCTCCCTTGACACGTGGG 52653953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGGAGGAAACTGTCCCCATGATCCAATCACCTCCACCTGGTCTCTCCCTTGACACGTGGG 1080

 52653954 GATTATGGGGATTAAATTCCAGATGAGATTTGGGTGGGGACAAAAAGCCTAACGACATCA 52654013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GATTATGGGGATTAAATTCCAGATGAGATTTGGGTGGGGACAAAAAGCCTAACGACATCA 1140

 52654014 AGCTGTAAAAACAATAGCTAACATTCATTGACTGTTTCCCAGCATTAGGATAAATGTGTG 52654073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGCTGTAAAAACAATAGCTAACATTCATTGACTGTTTCCCAGCATTAGGATAAATGTGTG 1200

 52654074 TAACAAGAGGCATTTTATTTATGTATGACATTTGTTTATTTATTATTTATTTATTTGGAT 52654133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TAACAAGAGGCATTTTATTTATGTATGACATTTGTTTATTTATTATTTATTTATTTGGAT 1260

 52654134 AAATGTCTATAACAAGAAACATTTTATTTAAGTATAACAGCAAATCTACAAGTTAGGTAC 52654193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AAATGTCTATAACAAGAAACATTTTATTTAAGTATAACAGCAAATCTACAAGTTAGGTAC 1320

 52654194 TATCATCACTCCCATTTTACAGGTCGTGAAACTGAGGCTCTGAAAAGTCAAGTCAGTTTT 52654253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TATCATCACTCCCATTTTACAGGTCGTGAAACTGAGGCTCTGAAAAGTCAAGTCAGTTTT 1380

 52654254 CTAATGTTGTCCAGCTAATGACTGGTAGATTTAGTATTTGAACCCACATTTGCCTGATTC 52654313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CTAATGTTGTCCAGCTAATGACTGGTAGATTTAGTATTTGAACCCACATTTGCCTGATTC 1440

 52654314 CAAAGTTCAAACTCCCAACAACATGTGGTAACCAAAGCAGGAACAGAAGAGAAAGAAGAA 52654373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CAAAGTTCAAACTCCCAACAACATGTGGTAACCAAAGCAGGAACAGAAGAGAAAGAAGAA 1500

 52654374 ATAGAAGGGAGGGAAGATGAACAAAGTAGACAAAGTTTAGTTAATAGAATTAGTGGATAC 52654433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATAGAAGGGAGGGAAGATGAACAAAGTAGACAAAGTTTAGTTAATAGAATTAGTGGATAC 1560

 52654434 CCAAGAAAAAACTATGTACAAGAGGGGGAAAAAAACCCTGTTTTCTCACATCTGGGAAAC 52654493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CCAAGAAAAAACTATGTACAAGAGGGGGAAAAAAACCCTGTTTTCTCACATCTGGGAAAC 1620

 52654494 ATTGATATCTATATATTTTTGGTTTTAAATAAAAATTAGGTTATGTCATTCATTTGCATA 52654553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ATTGATATCTATATATTTTTGGTTTTAAATAAAAATTAGGTTATGTCATTCATTTGCATA 1680

 52654554 AAACCATCCAAAGAAGGGCCTCACAAAATTAAAACAAAATCCAAACTCTCTACTATGGGC 52654613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AAACCATCCAAAGAAGGGCCTCACAAAATTAAAACAAAATCCAAACTCTCTACTATGGGC 1740

 52654614 CACACCCTCCAGAACTTCAGCTCGTACTATGTTTTTCCTCACACCTCTCAACATACCAAC 52654673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CACACCCTCCAGAACTTCAGCTCGTACTATGTTTTTCCTCACACCTCTCAACATACCAAC 1800

 52654674 ATGTTTCCACCTGCAGCCCTCACCACTAGTTATTCTTTCAATCTGGAAATATTTTCGCTA 52654733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ATGTTTCCACCTGCAGCCCTCACCACTAGTTATTCTTTCAATCTGGAAATATTTTCGCTA 1860

 52654734 AGATCTTCCTATGGTTACCTTCTTATCATTCAAGACTTAGGTTATGTCAGGCCTTCCCTG 52654793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AGATCTTCCTATGGTTACCTTCTTATCATTCAAGACTTAGGTTATGTCAGGCCTTCCCTG 1920

 52654794 ACTCCTCCATCTGAAGTAACCCCTCCTGCTTACTCCTGTTTATTCTCTAGACTCCACAGA 52654853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ACTCCTCCATCTGAAGTAACCCCTCCTGCTTACTCCTGTTTATTCTCTAGACTCCACAGA 1980

 52654854 GGATTCATCACTCTCTGAAATGATCCCATTAATTTCTTCTTCACTTGTTTCCTCTCCACG 52654913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GGATTCATCACTCTCTGAAATGATCCCATTAATTTCTTCTTCACTTGTTTCCTCTCCACG 2040

 52654914 ACCTGTAAGCCCCAAGTGGACCCGGACTTGGTCTGCTCTGCTTACAGCTGGATTCCAGTT 52654973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ACCTGTAAGCCCCAAGTGGACCCGGACTTGGTCTGCTCTGCTTACAGCTGGATTCCAGTT 2100

 52654974 CCCATAGTGCTAGACACTAGGATTAAGCCAGGAAACATGGGTGAAGCAGCAAGCACAGAG 52655033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CCCATAGTGCTAGACACTAGGATTAAGCCAGGAAACATGGGTGAAGCAGCAAGCACAGAG 2160

 52655034 CTTGGGGCACAGCCTAGCAAACACTCCACAAAGGACCATGATTGTAACTGTAGTAGGGCA 52655093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CTTGGGGCACAGCCTAGCAAACACTCCACAAAGGACCATGATTGTAACTGTAGTAGGGCA 2220

 52655094 CACCAATGAACAGGTTGGGAAACTGAGTCTCTGAGAAGAGACTAATGTTGTGCTGGATGA 52655153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CACCAATGAACAGGTTGGGAAACTGAGTCTCTGAGAAGAGACTAATGTTGTGCTGGATGA 2280

 52655154 AATTTCTTTTTCTGACAATACATTATCCAAATCCTCCAAGCTTTCAGTTTAAAGGGGAAA 52655213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AATTTCTTTTTCTGACAATACATTATCCAAATCCTCCAAGCTTTCAGTTTAAAGGGGAAA 2340

 52655214 GCAGGAACTATCATTATAATTTTATTTACAAAGTGTCCATGTATGAACATTATTCACCGC 52655273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GCAGGAACTATCATTATAATTTTATTTACAAAGTGTCCATGTATGAACATTATTCACCGC 2400

 52655274 CGAATCATCTCTTCCTATGCAAGCAACACCGTCCTATGCATCAATATCCTGATCTGTCAG 52655333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CGAATCATCTCTTCCTATGCAAGCAACACCGTCCTATGCATCAATATCCTGATCTGTCAG 2460

 52655334 GATTCAGGATAAAGTGGACATATACACACTAATTGCAAAGGGAAATTGTACATCTTGCAA 52655393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GATTCAGGATAAAGTGGACATATACACACTAATTGCAAAGGGAAATTGTACATCTTGCAA 2520

 52655394 AAGATGCAGGGGTTTATAGAGTCTTGTAACATTGGTGAGCTGCTCAGATCACACACATGA 52655453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 AAGATGCAGGGGTTTATAGAGTCTTGTAACATTGGTGAGCTGCTCAGATCACACACATGA 2580

 52655454 CCGTGGTTGGACAAGGATCTGGCAAAGTTAACACAGATCACCGAAGAAGGAAAAGTGGAC 52655513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CCGTGGTTGGACAAGGATCTGGCAAAGTTAACACAGATCACCGAAGAAGGAAAAGTGGAC 2640

 52655514 AACACAACACAGTAAGTTCTTCAAAAGAGTTATATTAGAATATCAAAAGATTATGTTAGG 52655573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 AACACAACACAGTAAGTTCTTCAAAAGAGTTATATTAGAATATCAAAAGATTATGTTAGG 2700

 52655574 CCTTTGGGAAAACTCAAAACTTTATGAAGACCTCAAAAAATTATGCAAAAATGACCCTTC 52655633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CCTTTGGGAAAACTCAAAACTTTATGAAGACCTCAAAAAATTATGCAAAAATGACCCTTC 2760

 52655634 AATGGTCATGCTGCAAGAGTCAAATGACACTTCAAACAACTGCGGCTTTCTATGTTGTGC 52655693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 AATGGTCATGCTGCAAGAGTCAAATGACACTTCAAACAACTGCGGCTTTCTATGTTGTGC 2820

 52655694 AAATGCATTTGTTGTTTTAAAGGTCGTAAAGTCAGGGTACACGTGGCAGATACTTATGAC 52655753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 AAATGCATTTGTTGTTTTAAAGGTCGTAAAGTCAGGGTACACGTGGCAGATACTTATGAC 2880

 52655754 TTGGAGGAAGACGTTAGATTAGATTTGAAACTTTCACTGAATGATCGCATTTCATGCTTT 52655813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TTGGAGGAAGACGTTAGATTAGATTTGAAACTTTCACTGAATGATCGCATTTCATGCTTT 2940

 52655814 TCATCTGTACATTAAAAAGCCAGAATGTCTTTGCCAAGAAATTCTAGCATAAATAAAAGA 52655873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TCATCTGTACATTAAAAAGCCAGAATGTCTTTGCCAAGAAATTCTAGCATAAATAAAAGA 3000

 52655874 AAAGGATGGGATTTTGGAACATCATGGTAGAATTCTTGACTATCAGCTTTATACAACATG 52655933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 AAAGGATGGGATTTTGGAACATCATGGTAGAATTCTTGACTATCAGCTTTATACAACATG 3060

 52655934 TCTGGACATTTAGTGATGGAAATGCTGGATTCCAAAGGAATGTAGGCAAAGGTACTACTA 52655993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TCTGGACATTTAGTGATGGAAATGCTGGATTCCAAAGGAATGTAGGCAAAGGTACTACTA 3120

 52655994 CCCCCATGCTCTTCAGAAAACATCCTCTAAAAGCAACAGTGATGATCAGATACTGTGGGG 52656053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 CCCCCATGCTCTTCAGAAAACATCCTCTAAAAGCAACAGTGATGATCAGATACTGTGGGG 3180

 52656054 CAAGACTGACAGTGACACTCAAGATTTCCACTCTTCTCTTTAATCATATATTTCCTGTCA 52656113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 CAAGACTGACAGTGACACTCAAGATTTCCACTCTTCTCTTTAATCATATATTTCCTGTCA 3240

 52656114 TTCATGTGCTACAAAACTCTGGAATATGCAAAGCTCATTCAAATGCAAAACCAGCCTTTG 52656173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TTCATGTGCTACAAAACTCTGGAATATGCAAAGCTCATTCAAATGCAAAACCAGCCTTTG 3300

 52656174 CTCCAACATGAGCATATATTTTCATTTAAAGACAAATCAGATGTTTCATTTGATTTTTTT 52656233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 CTCCAACATGAGCATATATTTTCATTTAAAGACAAATCAGATGTTTCATTTGATTTTTTT 3360

 52656234 TATAAATCTGATAATAATGTACATTTAACCCGTGTTTACAACCAAAATAATTAATCTCTC 52656293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TATAAATCTGATAATAATGTACATTTAACCCGTGTTTACAACCAAAATAATTAATCTCTC 3420

 52656294 TGAACCCTTTGTTTTTCCTGTCTCTATCCTCCACCCTCATTGCCAGATAAATAACATCTG 52656353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TGAACCCTTTGTTTTTCCTGTCTCTATCCTCCACCCTCATTGCCAGATAAATAACATCTG 3480

 52656354 CAACCTGATGTGGCATATTGAACTTTGTTTATACTCACACAAACACGTATAAGCATCCCA 52656413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 CAACCTGATGTGGCATATTGAACTTTGTTTATACTCACACAAACACGTATAAGCATCCCA 3540

 52656414 GATACACATATACAGGGACTGTATCTGTCCTTGTTGTTTTTATAGAAATTGGATCACATT 52656473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 GATACACATATACAGGGACTGTATCTGTCCTTGTTGTTTTTATAGAAATTGGATCACATT 3600

 52656474 AGACATATTTTCTGATGACTTTTGTACATTATAGTTGGTCTTCACAGTCAATAGCTCCAA 52656533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 AGACATATTTTCTGATGACTTTTGTACATTATAGTTGGTCTTCACAGTCAATAGCTCCAA 3660

 52656534 AGCTATCTTATCTTCTAAAATAGCTGCATAATATTCCTCAGTATGGATATACCAAAAGAT 52656593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 AGCTATCTTATCTTCTAAAATAGCTGCATAATATTCCTCAGTATGGATATACCAAAAGAT 3720

 52656594 ATTTAAACCATTGCCTAATCAATGAATATCCTGGTAGTTTCCACATTGTTTTTTCCATTT 52656653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 ATTTAAACCATTGCCTAATCAATGAATATCCTGGTAGTTTCCACATTGTTTTTTCCATTT 3780

 52656654 CCACTATAGTGGAATAAACTTTCGTGTTCAAAAATCCTAAACTGGTGCTATATTTCTATA 52656713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 CCACTATAGTGGAATAAACTTTCGTGTTCAAAAATCCTAAACTGGTGCTATATTTCTATA 3840

 52656714 GAATAGAGGCACAGATGTAGAAGTGTTACCCTCAAATCAATATGCATTTAGTTTTGAAAA 52656773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 GAATAGAGGCACAGATGTAGAAGTGTTACCCTCAAATCAATATGCATTTAGTTTTGAAAA 3900

 52656774 ACAGACACTGCCATATTATTTTCTTAAAAAGGCTCTACAGATTCACATTTCCAGCAGCAA 52656833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 ACAGACACTGCCATATTATTTTCTTAAAAAGGCTCTACAGATTCACATTTCCAGCAGCAA 3960

 52656834 TGAGTGTCTCAAGCACCTTTTAAGTGGTAAGCAGCTTACCAGGGGAGGTGGCCTATTATT 52656893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 TGAGTGTCTCAAGCACCTTTTAAGTGGTAAGCAGCTTACCAGGGGAGGTGGCCTATTATT 4020

 52656894 CTATCAGTGGCTTCAGTTGTTAGGACACCACGGGTCAGCTGTGGAGATACGGTTGTGGGG 52656953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 CTATCAGTGGCTTCAGTTGTTAGGACACCACGGGTCAGCTGTGGAGATACGGTTGTGGGG 4080

 52656954 CAGGTTGAGTTCAGGACACATAGAAGATTGCCAAAGGGTGACTATTATTACTTTGAGACT 52657013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 CAGGTTGAGTTCAGGACACATAGAAGATTGCCAAAGGGTGACTATTATTACTTTGAGACT 4140

 52657014 CTGGAAAAATTAGCCAGGAAACAGAGACAAGAGGCTCAGGGTGCAGCAAAGCAGCCAAAT 52657073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 CTGGAAAAATTAGCCAGGAAACAGAGACAAGAGGCTCAGGGTGCAGCAAAGCAGCCAAAT 4200

 52657074 CAGGATGATAGTGTTTTCTTTGGAGCAGATATACTAATGGCCAAGGAACTCATAAAAAGA 52657133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 CAGGATGATAGTGTTTTCTTTGGAGCAGATATACTAATGGCCAAGGAACTCATAAAAAGA 4260

 52657134 TGCCTAATGTCATCTCATTAGGGAAGTGCAGTCAAAGCCACAGCATGATACGTCTTCACA 52657193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 TGCCTAATGTCATCTCATTAGGGAAGTGCAGTCAAAGCCACAGCATGATACGTCTTCACA 4320

 52657194 CCCACGAGGATGGCCATAATCAGAGAGACAATAACCAGTGGTAGGGAAGATGTGAAAAAA 52657253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 CCCACGAGGATGGCCATAATCAGAGAGACAATAACCAGTGGTAGGGAAGATGTGAAAAAA 4380

 52657254 TCGGAATGCTCATGCATTGCTGGTAGGAATGTGACATGGTGCAGCTGCTTTGGAAAGCAG 52657313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 TCGGAATGCTCATGCATTGCTGGTAGGAATGTGACATGGTGCAGCTGCTTTGGAAAGCAG 4440

 52657314 TTTAACAGTTCCTGGAAAAGTTAAACATGGAGTTACCCTAAGACCCAGCAATTCCATTCC 52657373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 TTTAACAGTTCCTGGAAAAGTTAAACATGGAGTTACCCTAAGACCCAGCAATTCCATTCC 4500

 52657374 TAGGTAAGCAAGAAAATGAAAACATATGGCCACACAAAAACTTGTACACAAATGTCCATA 52657433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 TAGGTAAGCAAGAAAATGAAAACATATGGCCACACAAAAACTTGTACACAAATGTCCATA 4560

 52657434 GCAGCATTTTCATAATAGCTGAAAAGTGGAAACAACCCAAATATCCATCAATTGGAAAAA 52657493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 GCAGCATTTTCATAATAGCTGAAAAGTGGAAACAACCCAAATATCCATCAATTGGAAAAA 4620

 52657494 GGAAATCTAGCATTTGCATATAATAGAGTATTAATCAGCCATAAGAAGAAACAAAGCACC 52657553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 GGAAATCTAGCATTTGCATATAATAGAGTATTAATCAGCCATAAGAAGAAACAAAGCACC 4680

 52657554 GATCCATGTTATATCATGCTTTATACTTGGAAGCATGGTACTAAGTGAAAGACGCCAGAC 52657613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 GATCCATGTTATATCATGCTTTATACTTGGAAGCATGGTACTAAGTGAAAGACGCCAGAC 4740

 52657614 ACAAAAAGCAAAATATTGTATGATTCCATTTATATAAAGTGTCTAGAATAGGCAAATCCA 52657673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 ACAAAAAGCAAAATATTGTATGATTCCATTTATATAAAGTGTCTAGAATAGGCAAATCCA 4800

 52657674 TAGAGGCAGAAAACAGATTAGTGGTTGCCAGTGGCTGGGAATAGGGAAAAAACTCAGCGC 52657733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 TAGAGGCAGAAAACAGATTAGTGGTTGCCAGTGGCTGGGAATAGGGAAAAAACTCAGCGC 4860

 52657734 TAAAGGGTAGGGAGTTTTGTTTTGGAGTAATGACGATGTTCTGGAATTAGACGTGGAACG 52657793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 TAAAGGGTAGGGAGTTTTGTTTTGGAGTAATGACGATGTTCTGGAATTAGACGTGGAACG 4920

 52657794 ATTGCACACATGGTGCAAATATCCTTAAAATCACGGAATTGTCACTCTAAAAGGTGAATT 52657853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 ATTGCACACATGGTGCAAATATCCTTAAAATCACGGAATTGTCACTCTAAAAGGTGAATT 4980

 52657854 TTATGGTAGGTGAATTGTACCTCAATTTGTAAAAAGAAGAATTAGATAAATAAACAGCAA 52657913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 TTATGGTAGGTGAATTGTACCTCAATTTGTAAAAAGAAGAATTAGATAAATAAACAGCAA 5040

 52657914 CACAGCACCAAGGGGTGGGGGTAGGAAACAGACAACAAATAGGAGTGAAGAGTTCACAGG 52657973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 CACAGCACCAAGGGGTGGGGGTAGGAAACAGACAACAAATAGGAGTGAAGAGTTCACAGG 5100

 52657974 AAAAGACATGCAGCCAGCTTTTAAGCAGAAGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAA 52658033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 AAAAGACATGCAGCCAGCTTTTAAGCAGAAGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAA 5160

 52658034 ATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTGGCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAG 52658093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 ATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTGGCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAG 5220

 52658094 ACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTATAAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTG 52658153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 ACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTATAAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTG 5280

 52658154 GCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGG 52658213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 GCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGG 5340

 52658214 AGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACACTGTCTCTGCTAAAAAACAAAACAAA 52658273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 AGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACACTGTCTCTGCTAAAAAACAAAACAAA 5400

 52658274 ACAAAACACCAAAAAATAGCTGGGCGTAGTGGCGGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTTGGG 52658333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 ACAAAACACCAAAAAATAGCTGGGCGTAGTGGCGGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTTGGG 5460

 52658334 AGGCGGTGGCAGGAGAATCATTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTG 52658393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 AGGCGGTGGCAGGAGAATCATTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTG 5520

 52658394 TGCCACTGCACTCTAACCTGGGCAACAGAGTTCAGAGTGAGACTCTGTCTCCCCCAAAAA 52658453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 TGCCACTGCACTCTAACCTGGGCAACAGAGTTCAGAGTGAGACTCTGTCTCCCCCAAAAA 5580

 52658454 AAAAAAAAAAAAAAAAAGAACAGCCATATAGATCGTCGGTGGGAGTGTAATTTGGCCACT 52658513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 AAAAAAAAAAAAAAAAAGAACAGCCATATAGATCGTCGGTGGGAGTGTAATTTGGCCACT 5640

 52658514 TCTTTGGAAAATAGCTCAGTAATATCTATTAATACTTAAAATTTCACAAACACTGTAAGT 52658573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 TCTTTGGAAAATAGCTCAGTAATATCTATTAATACTTAAAATTTCACAAACACTGTAAGT 5700

 52658574 CTAACTTCCACTTCTAAAATGTTATCCTAGAAATAAAATTGCATAGGGGTACAAAGGCTT 52658633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5701 CTAACTTCCACTTCTAAAATGTTATCCTAGAAATAAAATTGCATAGGGGTACAAAGGCTT 5760

 52658634 ACGTATGGAACTATTTGCTGGACTACTGTAGTTGTGGCAAAAAACTGGAAATGACCTAAA 52658693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5761 ACGTATGGAACTATTTGCTGGACTACTGTAGTTGTGGCAAAAAACTGGAAATGACCTAAA 5820

 52658694 CGCTTATTAGTAGAAACCTGGTTAAATAAATTATCATATGTCCTTGAGGACACAGGGACA 52658753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5821 CGCTTATTAGTAGAAACCTGGTTAAATAAATTATCATATGTCCTTGAGGACACAGGGACA 5880

 52658754 CAAAGAGGGGAATGACAGGCACTGAGCCTACTTGAGGGTGGGAGGAGGAAGTCGATCAGA 52658813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5881 CAAAGAGGGGAATGACAGGCACTGAGCCTACTTGAGGGTGGGAGGAGGAAGTCGATCAGA 5940

 52658814 AAAAATAACTAGTGGGTACTAGGCTTAGTACCCGGGTGAAAAAATAATCTGTACAACAAA 52658873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5941 AAAAATAACTAGTGGGTACTAGGCTTAGTACCCGGGTGAAAAAATAATCTGTACAACAAA 6000

 52658874 CCCCCATGACATGAGTTTACCTTATAACAAACCTGCACATGTAATCTGAACCTAGATAAA 52658933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6001 CCCCCATGACATGAGTTTACCTTATAACAAACCTGCACATGTAATCTGAACCTAGATAAA 6060

 52658934 AGTTTAAAAAAATAAATAATCATATGTCCCTACAATGAAATATTCCACAGGCATTAAAAT 52658993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6061 AGTTTAAAAAAATAAATAATCATATGTCCCTACAATGAAATATTCCACAGGCATTAAAAT 6120

 52658994 TCCCCAAGGAATTTTAGTAAGGAAAGAAAAAGCTGTGCCCAACAGCACGTACAGTATGTT 52659053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6121 TCCCCAAGGAATTTTAGTAAGGAAAGAAAAAGCTGTGCCCAACAGCACGTACAGTATGTT 6180

 52659054 TCCATTTGTTTTTAAAAAATGGTGTCGGGAGGTTGAGGAGACAACTTATAAATAGACATG 52659113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6181 TCCATTTGTTTTTAAAAAATGGTGTCGGGAGGTTGAGGAGACAACTTATAAATAGACATG 6240

 52659114 CCTGGGATACCTCTGGATATAAGAAACTGTAAAGTATTTACTTCTAAGGAAGGAAATTTG 52659173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6241 CCTGGGATACCTCTGGATATAAGAAACTGTAAAGTATTTACTTCTAAGGAAGGAAATTTG 6300

 52659174 GGATGGGGCTTGGGGAGCCATCAGAGTTAGGGTGGGGATTTTTTCTCTGCCTTATCTTAT 52659233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6301 GGATGGGGCTTGGGGAGCCATCAGAGTTAGGGTGGGGATTTTTTCTCTGCCTTATCTTAT 6360

 52659234 TATGTATATCGCTCAGAATGTTTGCTATGTGTATGCACCTACCCCATCCATTAAGAAATG 52659293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6361 TATGTATATCGCTCAGAATGTTTGCTATGTGTATGCACCTACCCCATCCATTAAGAAATG 6420

 52659294 AAGAAATAATGAAAAGAAAAAATGAAAGTAGGGAACTAGAAATGAGAGGTGGGATTCAAA 52659353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6421 AAGAAATAATGAAAAGAAAAAATGAAAGTAGGGAACTAGAAATGAGAGGTGGGATTCAAA 6480

 52659354 GTGGACTGAACACTTGACCTATTTCCCAATTTGCCTAGGGCTGGCCCAGCAGCGAGGCAG 52659413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6481 GTGGACTGAACACTTGACCTATTTCCCAATTTGCCTAGGGCTGGCCCAGCAGCGAGGCAG 6540

 52659414 GTTCTAACCAATGAGCATCAGCTTTGAATGGAGGGGCTGATAGGCCAGGTGGGCCCTGCT 52659473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6541 GTTCTAACCAATGAGCATCAGCTTTGAATGGAGGGGCTGATAGGCCAGGTGGGCCCTGCT 6600

 52659474 TGCTGAGAGTGTCATGGCCTTAGGGACATCTCCATGTTGCAGAGTCTGAGCCTCTGCTTG 52659533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6601 TGCTGAGAGTGTCATGGCCTTAGGGACATCTCCATGTTGCAGAGTCTGAGCCTCTGCTTG 6660

 52659534 GCAAATTCAGAAAATCCAGCTTTTCTTTTTATATCACCTGGAGCTGATGTAACTCTCAGA 52659593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6661 GCAAATTCAGAAAATCCAGCTTTTCTTTTTATATCACCTGGAGCTGATGTAACTCTCAGA 6720

 52659594 AGGCATTTTTAAGAGGACTCATGAATTAACCACATAGCCAACTTACTGGCTTAAGACTAC 52659653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6721 AGGCATTTTTAAGAGGACTCATGAATTAACCACATAGCCAACTTACTGGCTTAAGACTAC 6780

 52659654 GTGACAGAAAGCTGCAAAGGGGGCCAGCCACTGGTAACATCCCACCACTGTCCCTCTCTG 52659713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6781 GTGACAGAAAGCTGCAAAGGGGGCCAGCCACTGGTAACATCCCACCACTGTCCCTCTCTG 6840

 52659714 TGGAAAACACAGATGGGATGCACATTGTGACGGGCAGGATGCCTGGAGAGCCCACAAATC 52659773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6841 TGGAAAACACAGATGGGATGCACATTGTGACGGGCAGGATGCCTGGAGAGCCCACAAATC 6900

 52659774 TGCAAGCACAGCTGAAATTGGTTACAGGATTTCAATGTTTCATTGCTTGAAGCTATGATA 52659833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6901 TGCAAGCACAGCTGAAATTGGTTACAGGATTTCAATGTTTCATTGCTTGAAGCTATGATA 6960

 52659834 ACTTGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGACGATGATTTTTTTTATAGCCATCT 52659893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6961 ACTTGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGACGATGATTTTTTTTATAGCCATCT 7020

 52659894 TTTTAGAGGGATTTGAGGTAGGGAAAAAAATAAACCTCACACTATCGGAGGTTGCCAACT 52659953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7021 TTTTAGAGGGATTTGAGGTAGGGAAAAAAATAAACCTCACACTATCGGAGGTTGCCAACT 7080

 52659954 ATGAGGTCTGCTGATGGTTTGGCCAACACAGTGTTTATATTTTTTTGAATTGGGAAATTT 52660013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7081 ATGAGGTCTGCTGATGGTTTGGCCAACACAGTGTTTATATTTTTTTGAATTGGGAAATTT 7140

 52660014 CATTTAAAAGTCCTAAAATCAGGCTGTTATTGAAATATCTTATTATTGGCTCAGGGTTTC 52660073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7141 CATTTAAAAGTCCTAAAATCAGGCTGTTATTGAAATATCTTATTATTGGCTCAGGGTTTC 7200

 52660074 CCAGGGCAGCCATCCTTGAAGCTGTGTGGAGCCCTATAAACAAGGACGCTTTCCAGTTCC 52660133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7201 CCAGGGCAGCCATCCTTGAAGCTGTGTGGAGCCCTATAAACAAGGACGCTTTCCAGTTCC 7260

 52660134 CTGCAAACTCCATTTCATTCAGAGCCTTGAGCCAGTTCTTACATGGTCCTCAGACTTGAG 52660193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7261 CTGCAAACTCCATTTCATTCAGAGCCTTGAGCCAGTTCTTACATGGTCCTCAGACTTGAG 7320

 52660194 CTAGTGCAAGAATACCCGGGAGGGGTTGTGGGAACAGATAGCTGGGCCCCACCCCCAGGG 52660253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7321 CTAGTGCAAGAATACCCGGGAGGGGTTGTGGGAACAGATAGCTGGGCCCCACCCCCAGGG 7380

 52660254 AAGGGGGTGTTTCTGACTCAGGAGGTCTGGGCTCCGGCTACAGAAACTGCACATCTAACC 52660313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7381 AAGGGGGTGTTTCTGACTCAGGAGGTCTGGGCTCCGGCTACAGAAACTGCACATCTAACC 7440

 52660314 GGTACCCAGGTGATGTGATGCTGCTGGCCCAGGGACAACTCTGCGAGTCACTGCTATTGG 52660373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7441 GGTACCCAGGTGATGTGATGCTGCTGGCCCAGGGACAACTCTGCGAGTCACTGCTATTGG 7500

 52660374 GCACTGCTATTGCACCCACACAAGGAGGCAGGCTCTGCTTACATTTTTCAGTTCTTGTTC 52660433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7501 GCACTGCTATTGCACCCACACAAGGAGGCAGGCTCTGCTTACATTTTTCAGTTCTTGTTC 7560

 52660434 CCAGAAACATTTGCTCTTTGGGGTATGCTTTGCATATAATGGATCCTACCCACTAATACA 52660493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7561 CCAGAAACATTTGCTCTTTGGGGTATGCTTTGCATATAATGGATCCTACCCACTAATACA 7620

 52660494 GTATGCTGCTTTTATTGATAAACTTCCAGAAACTTGAAGCGCACCTTACCATTTCTTTGA 52660553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7621 GTATGCTGCTTTTATTGATAAACTTCCAGAAACTTGAAGCGCACCTTACCATTTCTTTGA 7680

 52660554 TCTCGCTGATTATTTTTATTTTTGTTAAATGAAAATTGTTGGTAAGTTCTTTTTGGTGTG 52660613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7681 TCTCGCTGATTATTTTTATTTTTGTTAAATGAAAATTGTTGGTAAGTTCTTTTTGGTGTG 7740

 52660614 GTAAAAGGATATGAAAAGCTGATTTTAAAAAAATGTCCACTCTAGGATTAGAATTGTAGG 52660673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7741 GTAAAAGGATATGAAAAGCTGATTTTAAAAAAATGTCCACTCTAGGATTAGAATTGTAGG 7800

 52660674 TGTGTTTATTCTATTTCAAGATCT 52660697
          ||||||||||||||||||||||||
     7801 TGTGTTTATTCTATTTCAAGATCT 7824

Alignment time is 8.70732 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [52637064,52668002] =>     30939 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    4020] =>      4020 nucs 'mol-32-2fe3-263838_4020'

Score:        3997
Aligned:      4019        nucs
Identic:      4017 (100%) nucs =>      1384 (100%)      2633 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [52644965,52646348] EXCISED REGION [52646350,52648984]
 second seq =>  [       1,    1384] EXCISED REGION [    1386,    4020]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [52646349,52646349]
 second seq =>         1 nucs [1385,1385]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [1383,1384] to [1384,1385]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 52644965 AAGCCAGGAACCTCATCCACCTTGTCTTGATGCTCTGCCCTCTTGGCTTCCTGTTGGCTG 52645024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAGCCAGGAACCTCATCCACCTTGTCTTGATGCTCTGCCCTCTTGGCTTCCTGTTGGCTG 60

 52645025 TCACCTGGCACCTTTTCCTGTCCCTTGTCCAGCTTGAAGAATTTGTCAAAAAAGCTGGAG 52645084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCACCTGGCACCTTTTCCTGTCCCTTGTCCAGCTTGAAGAATTTGTCAAAAAAGCTGGAG 120

 52645085 TCCTTGGGCTTGGAGGGAGCTTCTCCTCCTGCTCCCCCTGTCTCAGGTGGGAGAAGCGTG 52645144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCCTTGGGCTTGGAGGGAGCTTCTCCTCCTGCTCCCCCTGTCTCAGGTGGGAGAAGCGTG 180

 52645145 GGATCCCTGGCGGCAGAGAGGACCTTGTCTTGGGCCGGGGCGTGCCCTGGGGTTTTATCT 52645204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGATCCCTGGCGGCAGAGAGGACCTTGTCTTGGGCCGGGGCGTGCCCTGGGGTTTTATCT 240

 52645205 GTGTCCTGCCCCGGTCCAGCTGCCACCGGAAGTGTCCAGCTCTCACTTGGGTCTTTGTTC 52645264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTGTCCTGCCCCGGTCCAGCTGCCACCGGAAGTGTCCAGCTCTCACTTGGGTCTTTGTTC 300

 52645265 GCTGGAGCTTTATTGGAGCTGACATCAAGCTTCACTGATCCAAGGGATGAATCTGCGGCT 52645324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GCTGGAGCTTTATTGGAGCTGACATCAAGCTTCACTGATCCAAGGGATGAATCTGCGGCT 360

 52645325 TGGTCTCCGGTACGTCCTGGTACAGGCCGAGAGAGCATCAAGAAAAAACGAGATTTAGCA 52645384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGGTCTCCGGTACGTCCTGGTACAGGCCGAGAGAGCATCAAGAAAAAACGAGATTTAGCA 420

 52645385 GCTGGTGCCTCGGGTTTGGCCTCTTTCCCAAGATTCTTTCCGTTGGCATCCGCAACAGCA 52645444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GCTGGTGCCTCGGGTTTGGCCTCTTTCCCAAGATTCTTTCCGTTGGCATCCGCAACAGCA 480

 52645445 CTTATCTCCGTTGTCTCGGGGGAAGAAGTGGCCACATTATCCGTCTTGACACTTATTCCC 52645504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTTATCTCCGTTGTCTCGGGGGAAGAAGTGGCCACATTATCCGTCTTGACACTTATTCCC 540

 52645505 AAGTCGACTGTAAACACAAACATAAACAGTGGTTATTCAGCCAAGCCGGGAAATTCAGGC 52645564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAGTCGACTGTAAACACAAACATAAACAGTGGTTATTCAGCCAAGCCGGGAAATTCAGGC 600

 52645565 ACTAATAATGGACTCCAGACATTTTTTATACAAAAGCCATACTGCATACTGGAACTGTGT 52645624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ACTAATAATGGACTCCAGACATTTTTTATACAAAAGCCATACTGCATACTGGAACTGTGT 660

 52645625 TGTTCTCTGGTCATTCTGAAAGGCAGAAGTTAGCTCTCTACATCTCCTTGGACCCTGCTT 52645684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGTTCTCTGGTCATTCTGAAAGGCAGAAGTTAGCTCTCTACATCTCCTTGGACCCTGCTT 720

 52645685 TTCTTGGGAGAGGAGAAGGCAAGGTTGGTGAGGAGGGAAAGCTACTTAATGGAAAGTCAC 52645744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTCTTGGGAGAGGAGAAGGCAAGGTTGGTGAGGAGGGAAAGCTACTTAATGGAAAGTCAC 780

 52645745 TAGCTGCCAGGTGTGGAATGAGTGATATTCAATGTTAATTAATCTTCTTTTATCTGTGTA 52645804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TAGCTGCCAGGTGTGGAATGAGTGATATTCAATGTTAATTAATCTTCTTTTATCTGTGTA 840

 52645805 AGAACTCCGTGAGCAGCATATTGTCATGATGTCAACTGGGAGGCAGTACAGCAGTTAGGA 52645864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGAACTCCGTGAGCAGCATATTGTCATGATGTCAACTGGGAGGCAGTACAGCAGTTAGGA 900

 52645865 GCTTGGGTTCTGGAGCTAGAACAAGGTTTCTCAACCTCAGCACTACTCACATTTGAAGCC 52645924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GCTTGGGTTCTGGAGCTAGAACAAGGTTTCTCAACCTCAGCACTACTCACATTTGAAGCC 960

 52645925 AGATTATTCTTTGTTAGGGAGGCTCATCCCGTGCCTCATAGGCTGATTAGCAGCATCCTG 52645984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AGATTATTCTTTGTTAGGGAGGCTCATCCCGTGCCTCATAGGCTGATTAGCAGCATCCTG 1020

 52645985 GCCTCTGCCCACTAGACGCCGGTCACATTTCCCAGTCATGGCAACCAAAAATATCTCTAG 52646044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GCCTCTGCCCACTAGACGCCGGTCACATTTCCCAGTCATGGCAACCAAAAATATCTCTAG 1080

 52646045 GCATTGCTAAATGTCCCCTGGAGGACAAAATCTCTTACGTTTGAGAGGCACTGAGCTGAA 52646104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GCATTGCTAAATGTCCCCTGGAGGACAAAATCTCTTACGTTTGAGAGGCACTGAGCTGAA 1140

 52646105 ATGTCTTTTTGAATCCAGATTATCTAATTTTCTGTGCCTCAACTTTCTGGTAAAAGGAGA 52646164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATGTCTTTTTGAATCCAGATTATCTAATTTTCTGTGCCTCAACTTTCTGGTAAAAGGAGA 1200

 52646165 CAGATAATAAATCTCGTAATTTTGTTAGGAAGATTACATGAGTTAATAGTTTTAAAGCAA 52646224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CAGATAATAAATCTCGTAATTTTGTTAGGAAGATTACATGAGTTAATAGTTTTAAAGCAA 1260

 52646225 GTACAATAGCACCTGGAATATATTAAGTGCTTAATAAATATCACAAACATTAGTTATCAT 52646284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GTACAATAGCACCTGGAATATATTAAGTGCTTAATAAATATCACAAACATTAGTTATCAT 1320

 52646285 TATTCATGAGTGAGAAAACTGACAGTCAGAGAGGTCAGTACACCCTCCCCTGGCTGCCCA 52646344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TATTCATGAGTGAGAAAACTGACAGTCAGAGAGGTCAGTACACCCTCCCCTGGCTGCCCA 1380

 52646345 GTAA 52646348
          ||||
     1381 GTAA 1384

EXCISED REGION

 52646350 CTAGTAAGCAGCAGAGTCTGGCTTCAGGCAGAAATCTGACTTCTAAGTTCATGCGCTCTC 52646409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1386 CTAGTAAGCAGCAGAGTCTGGCTTCAGGCAGAAATCTGACTTCTAAGTTCATGCGCTCTC 1445

 52646410 TGTCTTACCAGGGACTTGTATTAGCATAGACTGTTAAGAATATGGGAAGATTTTTAAAAT 52646469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1446 TGTCTTACCAGGGACTTGTATTAGCATAGACTGTTAAGAATATGGGAAGATTTTTAAAAT 1505

 52646470 ACAGTACTCAGAAAATTTCTCTTTGAAAGGCTGGAAGAGCAGATATCCACACAAGAAGGC 52646529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1506 ACAGTACTCAGAAAATTTCTCTTTGAAAGGCTGGAAGAGCAGATATCCACACAAGAAGGC 1565

 52646530 AAATTAGACCTCAGGCCAGTGTGGAATTAAAGGTGTAGGGTTATCTGGTCAAGACTGTGT 52646589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1566 AAATTAGACCTCAGGCCAGTGTGGAATTAAAGGTGTAGGGTTATCTGGTCAAGACTGTGT 1625

 52646590 GTGTGGATACAGGCTCCAACCCCTCCAGGCAAGGGCACTGTTTCCAACATCCACCCTTTC 52646649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1626 GTGTGGATACAGGCTCCAACCCCTCCAGGCAAGGGCACTGTTTCCAACATCCACCCTTTC 1685

 52646650 TCCTTTGACCTCTACCTTGACCTAAATTAACTATAAAAGGTCCTTCTTTTCTAGGACCCT 52646709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1686 TCCTTTGACCTCTACCTTGACCTAAATTAACTATAAAAGGTCCTTCTTTTCTAGGACCCT 1745

 52646710 ACTATAAATCAGTGAAATATTCAGGAAAAAAAGAACACCAAGAATGTTGGGATCCCAGTT 52646769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1746 ACTATAAATCAGTGAAATATTCAGGAAAAAAAGAACACCAAGAATGTTGGGATCCCAGTT 1805

 52646770 AAAGATCAAGATTCTCTACTGATAAGCTGTGTGATATGGAGTAAATCACTAAAGATCTTT 52646829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1806 AAAGATCAAGATTCTCTACTGATAAGCTGTGTGATATGGAGTAAATCACTAAAGATCTTT 1865

 52646830 GAATCTCTTCATTTGTAAAATGGGAATATTGGTAGTCCTACTGCAGGGTTGTTGTAATGC 52646889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1866 GAATCTCTTCATTTGTAAAATGGGAATATTGGTAGTCCTACTGCAGGGTTGTTGTAATGC 1925

 52646890 TTAAAGAAGAAAAGTCATGCAAAGGATCTGGCACAACGCCTTTTCCATAATAAGTGCTTA 52646949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1926 TTAAAGAAGAAAAGTCATGCAAAGGATCTGGCACAACGCCTTTTCCATAATAAGTGCTTA 1985

 52646950 GTAATTGACAGATACTGTGATAACTTTTCAGGTTTCTCTCATGCCTTTGACAACATTGCA 52647009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1986 GTAATTGACAGATACTGTGATAACTTTTCAGGTTTCTCTCATGCCTTTGACAACATTGCA 2045

 52647010 TTTTGCTTGCTCTATCTGTAGTCAGACACTTCTTAATATCTGTTTGCAGGAAGACAGAAA 52647069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2046 TTTTGCTTGCTCTATCTGTAGTCAGACACTTCTTAATATCTGTTTGCAGGAAGACAGAAA 2105

 52647070 AATAAAGGGAAGAATTGAGATTTCTTTGATCTATTCATACTGCTCATTAATATGTAGTGA 52647129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2106 AATAAAGGGAAGAATTGAGATTTCTTTGATCTATTCATACTGCTCATTAATATGTAGTGA 2165

 52647130 GAAATACATACACACACACATACACACACATGCATCCATTAGCAATTGTTTTTGCCCAAC 52647189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2166 GAAATACATACACACACACATACACACACATGCATCCATTAGCAATTGTTTTTGCCCAAC 2225

 52647190 TCTAGTGTCTCGCAGTGTCTAGACTAAACAACAAACAAAAAAGGGGGGAGAGTGAGCTGG 52647249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2226 TCTAGTGTCTCGCAGTGTCTAGACTAAACAACAAACAAAAAAGGGGGGAGAGTGAGCTGG 2285

 52647250 ATTAAGCATTGAGGCACAGTGAAGAAATGGTCTGGGGCAAGCCCAGGGATGAATGTTAGG 52647309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2286 ATTAAGCATTGAGGCACAGTGAAGAAATGGTCTGGGGCAAGCCCAGGGATGAATGTTAGG 2345

 52647310 GGTTTCTCATAAACCTGAACCTGAAGAAAATCACCCTGCCAGCATATTGATCTTCTAGCT 52647369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2346 GGTTTCTCATAAACCTGAACCTGAAGAAAATCACCCTGCCAGCATATTGATCTTCTAGCT 2405

 52647370 CTTCTTAACCTTTTTTTCTGTGATTCAGGAATTCATAATGATAGAAAATATTATACTAAA 52647429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2406 CTTCTTAACCTTTTTTTCTGTGATTCAGGAATTCATAATGATAGAAAATATTATACTAAA 2465

 52647430 GAAGAAAAAAAGAGGGAGAATAAGTAAGTGATAGATGGATGCATCAGGGTGTAAAGTTAG 52647489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2466 GAAGAAAAAAAGAGGGAGAATAAGTAAGTGATAGATGGATGCATCAGGGTGTAAAGTTAG 2525

 52647490 CAAGTAAGGCTGTTGAAGTGTCAGAGTGAATATAAATGAATTGTGGGAATGGTCCATGCC 52647549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2526 CAAGTAAGGCTGTTGAAGTGTCAGAGTGAATATAAATGAATTGTGGGAATGGTCCATGCC 2585

 52647550 AGGAGAAGAGGGTATGGTTGACAAAAAGGGAAATGCTAAGATTCAAAACAGGGAAGGGCT 52647609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2586 AGGAGAAGAGGGTATGGTTGACAAAAAGGGAAATGCTAAGATTCAAAACAGGGAAGGGCT 2645

 52647610 TTTCAAAATGCCAAGAGCACCAACTTATATCTTTCAGTTTAATTCCTCTCTTCCTTACCC 52647669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2646 TTTCAAAATGCCAAGAGCACCAACTTATATCTTTCAGTTTAATTCCTCTCTTCCTTACCC 2705

 52647670 ACTGGCTGGAAAGCAAAGGAGCTAGTGGTAAGTAAGAGTGTTATAGCCAGAGAAAAAGTC 52647729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2706 ACTGGCTGGAAAGCAAAGGAGCTAGTGGTAAGTAAGAGTGTTATAGCCAGAGAAAAAGTC 2765

 52647730 TTCAAAAAACACAAAGTACTTTCCATGGACAACCTTTTTTATTTTAAAGTGCCAATATGT 52647789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2766 TTCAAAAAACACAAAGTACTTTCCATGGACAACCTTTTTTATTTTAAAGTGCCAATATGT 2825

 52647790 TGCTTTGAAAAAGAATAAATTCCTTACATCCAGGTATCTGGACTAGACTTCAGTGCATTT 52647849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2826 TGCTTTGAAAAAGAATAAATTCCTTACATCCAGGTATCTGGACTAGACTTCAGTGCATTT 2885

 52647850 AGTGATTATAGCAAATCCAAACAGTAGCTTTTGATATCAGAGAATGGGTAAAGTGTTTTT 52647909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2886 AGTGATTATAGCAAATCCAAACAGTAGCTTTTGATATCAGAGAATGGGTAAAGTGTTTTT 2945

 52647910 GACAATTTCTAAGAACTTAGAGTTCTTCGGTGATACGTTCCATGCAACTGAAGCTCTGCT 52647969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2946 GACAATTTCTAAGAACTTAGAGTTCTTCGGTGATACGTTCCATGCAACTGAAGCTCTGCT 3005

 52647970 CTCCAAATTTAGGTGGGTACATACCCAAGTCCATCACCTGGGGCTTCTATTTCCTTTGCT 52648029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3006 CTCCAAATTTAGGTGGGTACATACCCAAGTCCATCACCTGGGGCTTCTATTTCCTTTGCT 3065

 52648030 CAGATGCTCACCTCCTAGGTGGGCACCTGACATAAGATAGACTAATAAAAATAAGTCCTG 52648089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3066 CAGATGCTCACCTCCTAGGTGGGCACCTGACATAAGATAGACTAATAAAAATAAGTCCTG 3125

 52648090 TAACTTTTGATACTCCTATTAAAAAAGAGTTGCAAACCAATAGGAGGTACACTTGAGAAT 52648149
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     3126 TAACTTTTGATACTCCTATTAAAAAAGAGTCGCAAACCAATAGGAGGTACACTTGAGAAT 3185

 52648150 CAGCACAAATGAAAGTAGAACCTGGAAATCCAGGAAGCAGATACCCAATCATGTCATTTA 52648209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3186 CAGCACAAATGAAAGTAGAACCTGGAAATCCAGGAAGCAGATACCCAATCATGTCATTTA 3245

 52648210 AACATTTAGATCCAGCTGTGCCTGAAGCTGAACTTTAGCATTACATAAGCCAATAAATCA 52648269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3246 AACATTTAGATCCAGCTGTGCCTGAAGCTGAACTTTAGCATTACATAAGCCAATAAATCA 3305

 52648270 CTCTTCCCCAACTTACGCCAGTTGAAATTGAATACATACTCAGTGACTTTGAGAGAATTC 52648329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3306 CTCTTCCCCAACTTACGCCAGTTGAAATTGAATACATACTCAGTGACTTTGAGAGAATTC 3365

 52648330 CAGGGAATTGGTCAGTCCCTGTTTCACTTGTAAATACACAGCAATCAAGCCTACCAAATC 52648389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3366 CAGGGAATTGGTCAGTCCCTGTTTCACTTGTAAATACACAGCAATCAAGCCTACCAAATC 3425

 52648390 TATGATTGATTGGGGTGTCTGAAAGAGATGGAGGGAATGGAATCAACCTGAAAAACATAT 52648449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3426 TATGATTGATTGGGGTGTCTGAAAGAGATGGAGGGAATGGAATCAACCTGAAAAACATAT 3485

 52648450 TTCAGGAGTTCATCCCTGAAAACTTCCCCAACCTAGCTAGAGGGGCCAACATTCAAATTC 52648509
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3486 TTCAGGGGTTCATCCCTGAAAACTTCCCCAACCTAGCTAGAGGGGCCAACATTCAAATTC 3545

 52648510 AGGAAATGCAGAGAACCCCAGTAAGATACTCCACAAAAAGATCTTCCCCAAGACATCATC 52648569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3546 AGGAAATGCAGAGAACCCCAGTAAGATACTCCACAAAAAGATCTTCCCCAAGACATCATC 3605

 52648570 ATCAGATTCTCCAAAGTTGAAATGTAAGAAAAAATGCTAAAGGCAACTAGAGTGAAAGGC 52648629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3606 ATCAGATTCTCCAAAGTTGAAATGTAAGAAAAAATGCTAAAGGCAACTAGAGTGAAAGGC 3665

 52648630 CCGGTCACCTAAAAAGGGAAGCACAGACTTACAGTGGACCTCTCACTGGTAACCCTACAA 52648689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3666 CCGGTCACCTAAAAAGGGAAGCACAGACTTACAGTGGACCTCTCACTGGTAACCCTACAA 3725

 52648690 GCCAGAAGAGATTGAGGACCAATATTCAACATTCTTAAACAAAAAGAATTCCAACCCAGA 52648749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3726 GCCAGAAGAGATTGAGGACCAATATTCAACATTCTTAAACAAAAAGAATTCCAACCCAGA 3785

 52648750 ATTTTATATCTGACTAAACTAAGCTTCATAAGCAAAAGAGAAATAAGATCATTTTCAGAC 52648809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3786 ATTTTATATCTGACTAAACTAAGCTTCATAAGCAAAAGAGAAATAAGATCATTTTCAGAC 3845

 52648810 AAGCAAATGCTAAGGGAATTTGTGACCATTAGACCTTCCTTGCAACAGTTCCTAAAGGAA 52648869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3846 AAGCAAATGCTAAGGGAATTTGTGACCATTAGACCTTCCTTGCAACAGTTCCTAAAGGAA 3905

 52648870 GCACTAAATATGGAAAGACCATTACCAGACACTACAAAACACACTGAAGTACACAGACCA 52648929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3906 GCACTAAATATGGAAAGACCATTACCAGACACTACAAAACACACTGAAGTACACAGACCA 3965

 52648930 GTGACATTGTAAAGCAACTACATAACAAGTCTGCAAAATAACCAGCCAACATCAT 52648984
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3966 GTGACATTGTAAAGCAACTACATAACAAGTCTGCAAAATAACCAGCCAACATCAT 4020

Alignment time is 5.22975 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [52637064,52668002] =>     30939 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    6067] =>      6067 nucs 'mol-32-2fe3-280040_6067'

Score:        6044
Aligned:      6066        nucs
Identic:      6064 (100%) nucs =>       483 (100%)      5581 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [52652147,52652629] EXCISED REGION [52652631,52658213]
 second seq =>  [       1,     483] EXCISED REGION [     485,    6067]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [52652630,52652630]
 second seq =>         1 nucs [484,484]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [52652628,52652629] to [52652631,52652632]
 second seq =>         2 nucs [482,483] to [485,486]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 52652147 GAGTGTAAATTAGTTCAACCATTGTGGAAGACAGTGTGGCAATTCCTCAAAGACCTAAAG 52652206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GAGTGTAAATTAGTTCAACCATTGTGGAAGACAGTGTGGCAATTCCTCAAAGACCTAAAG 60

 52652207 ATAGAAATACCATTCCACCCAGCAATTCCATTACTGGGTACATACCCGAAAAATAGAAAT 52652266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATAGAAATACCATTCCACCCAGCAATTCCATTACTGGGTACATACCCGAAAAATAGAAAT 120

 52652267 CATTCTTTTATAAAGATACATGCATGTGTATGTTCATTGCAGCACTATTCACAATAGCAA 52652326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CATTCTTTTATAAAGATACATGCATGTGTATGTTCATTGCAGCACTATTCACAATAGCAA 180

 52652327 AAACATGGAATCAACCTAAATACCCACCAATGATAGCCTGGATAAAGAAAATGTGGTACA 52652386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAACATGGAATCAACCTAAATACCCACCAATGATAGCCTGGATAAAGAAAATGTGGTACA 240

 52652387 TATACACCATGGAATACTATGCAGCCATAAAAAGAACGAGATCATGTCCTTTGCAGGAAC 52652446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TATACACCATGGAATACTATGCAGCCATAAAAAGAACGAGATCATGTCCTTTGCAGGAAC 300

 52652447 ATGAATGGAGCTGAAGGCCATTATCCTTAGCAAAGTATTGCCGAAAAAGAAAATCAAATA 52652506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATGAATGGAGCTGAAGGCCATTATCCTTAGCAAAGTATTGCCGAAAAAGAAAATCAAATA 360

 52652507 CTACATGTTCTCACTTATAAATGGGAGCTAAATGATGAGAACACATGGCCACACAGGGGG 52652566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTACATGTTCTCACTTATAAATGGGAGCTAAATGATGAGAACACATGGCCACACAGGGGG 420

 52652567 AACAACACACACTGGGGCCTATTGGAGGGTGGAAGGTGGGAGGAGGGAGAGGATCAGGAA 52652626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AACAACACACACTGGGGCCTATTGGAGGGTGGAAGGTGGGAGGAGGGAGAGGATCAGGAA 480

 52652627 AAA 52652629
          |||
      481 AAA 483

EXCISED REGION

 52652631 AATTAATAGATATTATTTCATCACCCAGGTATTAATAATACCTATTTCATCACCCAGGCT 52652690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      485 AATTAATAGATATTATTTCATCACCCAGGTATTAATAATACCTATTTCATCACCCAGGCT 544

 52652691 TGATACCTGGGTGACAACAAACCCCCATGACACAAATTTACCTATATAACAAACCTGCCC 52652750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      545 TGATACCTGGGTGACAACAAACCCCCATGACACAAATTTACCTATATAACAAACCTGCCC 604

 52652751 GTGTACCCCTGAACTTAAAATAAAAGTTAAAAAAATGCAAAAAGATGACATACCAAAGAG 52652810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      605 GTGTACCCCTGAACTTAAAATAAAAGTTAAAAAAATGCAAAAAGATGACATACCAAAGAG 664

 52652811 ATGTTACTTTTCATTTTTAAAAAAGTCAAAGAATTTAAGGAAAATTAAAAAGAAATCAAG 52652870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      665 ATGTTACTTTTCATTTTTAAAAAAGTCAAAGAATTTAAGGAAAATTAAAAAGAAATCAAG 724

 52652871 AATGACAGTAGCAGCTCCAAAATATTTAGAAGGTAGAGTTGAAAATTTTGATTTTCTTAG 52652930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      725 AATGACAGTAGCAGCTCCAAAATATTTAGAAGGTAGAGTTGAAAATTTTGATTTTCTTAG 784

 52652931 TGCAGAAAAATATTTTGTGCTGCATGTTTTTTTAAAGAAAGTCATTTTATCTGTATATGT 52652990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      785 TGCAGAAAAATATTTTGTGCTGCATGTTTTTTTAAAGAAAGTCATTTTATCTGTATATGT 844

 52652991 GATTAAAACCTTATTTCCAGTGCCATCTTCGTGTAATTGTTAAGAACTTGGATTGTGGAT 52653050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      845 GATTAAAACCTTATTTCCAGTGCCATCTTCGTGTAATTGTTAAGAACTTGGATTGTGGAT 904

 52653051 CACAGGAACCTGGCTTTGACTCTTAACTGCTCACTCTTTAAATGGATAACCCGGGTAAGT 52653110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      905 CACAGGAACCTGGCTTTGACTCTTAACTGCTCACTCTTTAAATGGATAACCCGGGTAAGT 964

 52653111 TATTTCCTGTCTCTGTGCCTCAGTTTTCTTACAAATTGGCATGAAAATAACAGTGCCTCC 52653170
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
      965 TATTTCCTGTCTCTGTGCCTCAGTTTTCTTACAAATTGGCATGAAAATAACGGTGCCTCC 1024

 52653171 TTCAGAGGGTAATTCTGAGGATTAAATGAAATATTGCCCATACAGTGCTTACCACAGGCT 52653230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1025 TTCAGAGGGTAATTCTGAGGATTAAATGAAATATTGCCCATACAGTGCTTACCACAGGCT 1084

 52653231 GGTAGATGATTGGTATTCGGTAAACAGTAGTTATTTTTGTTATACTAATATGTTATTAAT 52653290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1085 GGTAGATGATTGGTATTCGGTAAACAGTAGTTATTTTTGTTATACTAATATGTTATTAAT 1144

 52653291 ATAATTACCATTTTGTATTTTTAAATGTAAGCCATAAGGAAAGGAATTATTCCAATAGTT 52653350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1145 ATAATTACCATTTTGTATTTTTAAATGTAAGCCATAAGGAAAGGAATTATTCCAATAGTT 1204

 52653351 TAATTTACAAACTTGAGTTTTCTAGAAAGACTTTTAAAAACAGTAGTGATATAAATCAAT 52653410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1205 TAATTTACAAACTTGAGTTTTCTAGAAAGACTTTTAAAAACAGTAGTGATATAAATCAAT 1264

 52653411 TTATCTTAAGAAACATAAGTATCTGGGCCAGGCAAGTTTCAGAAATGTTTATCATTTTCA 52653470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1265 TTATCTTAAGAAACATAAGTATCTGGGCCAGGCAAGTTTCAGAAATGTTTATCATTTTCA 1324

 52653471 AAGTACCAAATATTCTCGTCAAAACAAGCTGCTTCATCAGAGTTCTAATTATATATTTAA 52653530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1325 AAGTACCAAATATTCTCGTCAAAACAAGCTGCTTCATCAGAGTTCTAATTATATATTTAA 1384

 52653531 ACATACATGCACACACACACGTTTGTATTACAATATTCAAAACTTCTGAGGAAGAATTAT 52653590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1385 ACATACATGCACACACACACGTTTGTATTACAATATTCAAAACTTCTGAGGAAGAATTAT 1444

 52653591 CTTTTTTTTTTCATGTGCCAAAGCTAAAACTTTCACTTGCTACAGCTGTGTATTAGTCTA 52653650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1445 CTTTTTTTTTTCATGTGCCAAAGCTAAAACTTTCACTTGCTACAGCTGTGTATTAGTCTA 1504

 52653651 TTTCCATACTGCTATAAAGAGCTGCCCAAGACTGGGTGATTTATAAAGGAAAGAGGTTTA 52653710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1505 TTTCCATACTGCTATAAAGAGCTGCCCAAGACTGGGTGATTTATAAAGGAAAGAGGTTTA 1564

 52653711 ATTGACTCACAGTTCAGCATGGCAGGGAAGGCCTCAGGAAACTTACAATCATGGTGGAAG 52653770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1565 ATTGACTCACAGTTCAGCATGGCAGGGAAGGCCTCAGGAAACTTACAATCATGGTGGAAG 1624

 52653771 TCAAAGGGGGAGCAAGGACCTTTCTTCACAAGGCAGCAGAAAGAAGTGCCAAATGAACAG 52653830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1625 TCAAAGGGGGAGCAAGGACCTTTCTTCACAAGGCAGCAGAAAGAAGTGCCAAATGAACAG 1684

 52653831 GGAAGAGCTCCTTATGAAACCATCAGGTCTTGTGAGAACTCACTTACTTTTATGAGAACA 52653890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1685 GGAAGAGCTCCTTATGAAACCATCAGGTCTTGTGAGAACTCACTTACTTTTATGAGAACA 1744

 52653891 GCATGGAGGAAACTGTCCCCATGATCCAATCACCTCCACCTGGTCTCTCCCTTGACACGT 52653950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1745 GCATGGAGGAAACTGTCCCCATGATCCAATCACCTCCACCTGGTCTCTCCCTTGACACGT 1804

 52653951 GGGGATTATGGGGATTAAATTCCAGATGAGATTTGGGTGGGGACAAAAAGCCTAACGACA 52654010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1805 GGGGATTATGGGGATTAAATTCCAGATGAGATTTGGGTGGGGACAAAAAGCCTAACGACA 1864

 52654011 TCAAGCTGTAAAAACAATAGCTAACATTCATTGACTGTTTCCCAGCATTAGGATAAATGT 52654070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1865 TCAAGCTGTAAAAACAATAGCTAACATTCATTGACTGTTTCCCAGCATTAGGATAAATGT 1924

 52654071 GTGTAACAAGAGGCATTTTATTTATGTATGACATTTGTTTATTTATTATTTATTTATTTG 52654130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1925 GTGTAACAAGAGGCATTTTATTTATGTATGACATTTGTTTATTTATTATTTATTTATTTG 1984

 52654131 GATAAATGTCTATAACAAGAAACATTTTATTTAAGTATAACAGCAAATCTACAAGTTAGG 52654190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1985 GATAAATGTCTATAACAAGAAACATTTTATTTAAGTATAACAGCAAATCTACAAGTTAGG 2044

 52654191 TACTATCATCACTCCCATTTTACAGGTCGTGAAACTGAGGCTCTGAAAAGTCAAGTCAGT 52654250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2045 TACTATCATCACTCCCATTTTACAGGTCGTGAAACTGAGGCTCTGAAAAGTCAAGTCAGT 2104

 52654251 TTTCTAATGTTGTCCAGCTAATGACTGGTAGATTTAGTATTTGAACCCACATTTGCCTGA 52654310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2105 TTTCTAATGTTGTCCAGCTAATGACTGGTAGATTTAGTATTTGAACCCACATTTGCCTGA 2164

 52654311 TTCCAAAGTTCAAACTCCCAACAACATGTGGTAACCAAAGCAGGAACAGAAGAGAAAGAA 52654370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2165 TTCCAAAGTTCAAACTCCCAACAACATGTGGTAACCAAAGCAGGAACAGAAGAGAAAGAA 2224

 52654371 GAAATAGAAGGGAGGGAAGATGAACAAAGTAGACAAAGTTTAGTTAATAGAATTAGTGGA 52654430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2225 GAAATAGAAGGGAGGGAAGATGAACAAAGTAGACAAAGTTTAGTTAATAGAATTAGTGGA 2284

 52654431 TACCCAAGAAAAAACTATGTACAAGAGGGGGAAAAAAACCCTGTTTTCTCACATCTGGGA 52654490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2285 TACCCAAGAAAAAACTATGTACAAGAGGGGGAAAAAAACCCTGTTTTCTCACATCTGGGA 2344

 52654491 AACATTGATATCTATATATTTTTGGTTTTAAATAAAAATTAGGTTATGTCATTCATTTGC 52654550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2345 AACATTGATATCTATATATTTTTGGTTTTAAATAAAAATTAGGTTATGTCATTCATTTGC 2404

 52654551 ATAAAACCATCCAAAGAAGGGCCTCACAAAATTAAAACAAAATCCAAACTCTCTACTATG 52654610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2405 ATAAAACCATCCAAAGAAGGGCCTCACAAAATTAAAACAAAATCCAAACTCTCTACTATG 2464

 52654611 GGCCACACCCTCCAGAACTTCAGCTCGTACTATGTTTTTCCTCACACCTCTCAACATACC 52654670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2465 GGCCACACCCTCCAGAACTTCAGCTCGTACTATGTTTTTCCTCACACCTCTCAACATACC 2524

 52654671 AACATGTTTCCACCTGCAGCCCTCACCACTAGTTATTCTTTCAATCTGGAAATATTTTCG 52654730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2525 AACATGTTTCCACCTGCAGCCCTCACCACTAGTTATTCTTTCAATCTGGAAATATTTTCG 2584

 52654731 CTAAGATCTTCCTATGGTTACCTTCTTATCATTCAAGACTTAGGTTATGTCAGGCCTTCC 52654790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2585 CTAAGATCTTCCTATGGTTACCTTCTTATCATTCAAGACTTAGGTTATGTCAGGCCTTCC 2644

 52654791 CTGACTCCTCCATCTGAAGTAACCCCTCCTGCTTACTCCTGTTTATTCTCTAGACTCCAC 52654850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2645 CTGACTCCTCCATCTGAAGTAACCCCTCCTGCTTACTCCTGTTTATTCTCTAGACTCCAC 2704

 52654851 AGAGGATTCATCACTCTCTGAAATGATCCCATTAATTTCTTCTTCACTTGTTTCCTCTCC 52654910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2705 AGAGGATTCATCACTCTCTGAAATGATCCCATTAATTTCTTCTTCACTTGTTTCCTCTCC 2764

 52654911 ACGACCTGTAAGCCCCAAGTGGACCCGGACTTGGTCTGCTCTGCTTACAGCTGGATTCCA 52654970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2765 ACGACCTGTAAGCCCCAAGTGGACCCGGACTTGGTCTGCTCTGCTTACAGCTGGATTCCA 2824

 52654971 GTTCCCATAGTGCTAGACACTAGGATTAAGCCAGGAAACATGGGTGAAGCAGCAAGCACA 52655030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2825 GTTCCCATAGTGCTAGACACTAGGATTAAGCCAGGAAACATGGGTGAAGCAGCAAGCACA 2884

 52655031 GAGCTTGGGGCACAGCCTAGCAAACACTCCACAAAGGACCATGATTGTAACTGTAGTAGG 52655090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2885 GAGCTTGGGGCACAGCCTAGCAAACACTCCACAAAGGACCATGATTGTAACTGTAGTAGG 2944

 52655091 GCACACCAATGAACAGGTTGGGAAACTGAGTCTCTGAGAAGAGACTAATGTTGTGCTGGA 52655150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2945 GCACACCAATGAACAGGTTGGGAAACTGAGTCTCTGAGAAGAGACTAATGTTGTGCTGGA 3004

 52655151 TGAAATTTCTTTTTCTGACAATACATTATCCAAATCCTCCAAGCTTTCAGTTTAAAGGGG 52655210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3005 TGAAATTTCTTTTTCTGACAATACATTATCCAAATCCTCCAAGCTTTCAGTTTAAAGGGG 3064

 52655211 AAAGCAGGAACTATCATTATAATTTTATTTACAAAGTGTCCATGTATGAACATTATTCAC 52655270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3065 AAAGCAGGAACTATCATTATAATTTTATTTACAAAGTGTCCATGTATGAACATTATTCAC 3124

 52655271 CGCCGAATCATCTCTTCCTATGCAAGCAACACCGTCCTATGCATCAATATCCTGATCTGT 52655330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3125 CGCCGAATCATCTCTTCCTATGCAAGCAACACCGTCCTATGCATCAATATCCTGATCTGT 3184

 52655331 CAGGATTCAGGATAAAGTGGACATATACACACTAATTGCAAAGGGAAATTGTACATCTTG 52655390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3185 CAGGATTCAGGATAAAGTGGACATATACACACTAATTGCAAAGGGAAATTGTACATCTTG 3244

 52655391 CAAAAGATGCAGGGGTTTATAGAGTCTTGTAACATTGGTGAGCTGCTCAGATCACACACA 52655450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3245 CAAAAGATGCAGGGGTTTATAGAGTCTTGTAACATTGGTGAGCTGCTCAGATCACACACA 3304

 52655451 TGACCGTGGTTGGACAAGGATCTGGCAAAGTTAACACAGATCACCGAAGAAGGAAAAGTG 52655510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3305 TGACCGTGGTTGGACAAGGATCTGGCAAAGTTAACACAGATCACCGAAGAAGGAAAAGTG 3364

 52655511 GACAACACAACACAGTAAGTTCTTCAAAAGAGTTATATTAGAATATCAAAAGATTATGTT 52655570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3365 GACAACACAACACAGTAAGTTCTTCAAAAGAGTTATATTAGAATATCAAAAGATTATGTT 3424

 52655571 AGGCCTTTGGGAAAACTCAAAACTTTATGAAGACCTCAAAAAATTATGCAAAAATGACCC 52655630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3425 AGGCCTTTGGGAAAACTCAAAACTTTATGAAGACCTCAAAAAATTATGCAAAAATGACCC 3484

 52655631 TTCAATGGTCATGCTGCAAGAGTCAAATGACACTTCAAACAACTGCGGCTTTCTATGTTG 52655690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3485 TTCAATGGTCATGCTGCAAGAGTCAAATGACACTTCAAACAACTGCGGCTTTCTATGTTG 3544

 52655691 TGCAAATGCATTTGTTGTTTTAAAGGTCGTAAAGTCAGGGTACACGTGGCAGATACTTAT 52655750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3545 TGCAAATGCATTTGTTGTTTTAAAGGTCGTAAAGTCAGGGTACACGTGGCAGATACTTAT 3604

 52655751 GACTTGGAGGAAGACGTTAGATTAGATTTGAAACTTTCACTGAATGATCGCATTTCATGC 52655810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3605 GACTTGGAGGAAGACGTTAGATTAGATTTGAAACTTTCACTGAATGATCGCATTTCATGC 3664

 52655811 TTTTCATCTGTACATTAAAAAGCCAGAATGTCTTTGCCAAGAAATTCTAGCATAAATAAA 52655870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3665 TTTTCATCTGTACATTAAAAAGCCAGAATGTCTTTGCCAAGAAATTCTAGCATAAATAAA 3724

 52655871 AGAAAAGGATGGGATTTTGGAACATCATGGTAGAATTCTTGACTATCAGCTTTATACAAC 52655930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3725 AGAAAAGGATGGGATTTTGGAACATCATGGTAGAATTCTTGACTATCAGCTTTATACAAC 3784

 52655931 ATGTCTGGACATTTAGTGATGGAAATGCTGGATTCCAAAGGAATGTAGGCAAAGGTACTA 52655990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3785 ATGTCTGGACATTTAGTGATGGAAATGCTGGATTCCAAAGGAATGTAGGCAAAGGTACTA 3844

 52655991 CTACCCCCATGCTCTTCAGAAAACATCCTCTAAAAGCAACAGTGATGATCAGATACTGTG 52656050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3845 CTACCCCCATGCTCTTCAGAAAACATCCTCTAAAAGCAACAGTGATGATCAGATACTGTG 3904

 52656051 GGGCAAGACTGACAGTGACACTCAAGATTTCCACTCTTCTCTTTAATCATATATTTCCTG 52656110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3905 GGGCAAGACTGACAGTGACACTCAAGATTTCCACTCTTCTCTTTAATCATATATTTCCTG 3964

 52656111 TCATTCATGTGCTACAAAACTCTGGAATATGCAAAGCTCATTCAAATGCAAAACCAGCCT 52656170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3965 TCATTCATGTGCTACAAAACTCTGGAATATGCAAAGCTCATTCAAATGCAAAACCAGCCT 4024

 52656171 TTGCTCCAACATGAGCATATATTTTCATTTAAAGACAAATCAGATGTTTCATTTGATTTT 52656230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4025 TTGCTCCAACATGAGCATATATTTTCATTTAAAGACAAATCAGATGTTTCATTTGATTTT 4084

 52656231 TTTTATAAATCTGATAATAATGTACATTTAACCCGTGTTTACAACCAAAATAATTAATCT 52656290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4085 TTTTATAAATCTGATAATAATGTACATTTAACCCGTGTTTACAACCAAAATAATTAATCT 4144

 52656291 CTCTGAACCCTTTGTTTTTCCTGTCTCTATCCTCCACCCTCATTGCCAGATAAATAACAT 52656350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4145 CTCTGAACCCTTTGTTTTTCCTGTCTCTATCCTCCACCCTCATTGCCAGATAAATAACAT 4204

 52656351 CTGCAACCTGATGTGGCATATTGAACTTTGTTTATACTCACACAAACACGTATAAGCATC 52656410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4205 CTGCAACCTGATGTGGCATATTGAACTTTGTTTATACTCACACAAACACGTATAAGCATC 4264

 52656411 CCAGATACACATATACAGGGACTGTATCTGTCCTTGTTGTTTTTATAGAAATTGGATCAC 52656470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4265 CCAGATACACATATACAGGGACTGTATCTGTCCTTGTTGTTTTTATAGAAATTGGATCAC 4324

 52656471 ATTAGACATATTTTCTGATGACTTTTGTACATTATAGTTGGTCTTCACAGTCAATAGCTC 52656530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4325 ATTAGACATATTTTCTGATGACTTTTGTACATTATAGTTGGTCTTCACAGTCAATAGCTC 4384

 52656531 CAAAGCTATCTTATCTTCTAAAATAGCTGCATAATATTCCTCAGTATGGATATACCAAAA 52656590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4385 CAAAGCTATCTTATCTTCTAAAATAGCTGCATAATATTCCTCAGTATGGATATACCAAAA 4444

 52656591 GATATTTAAACCATTGCCTAATCAATGAATATCCTGGTAGTTTCCACATTGTTTTTTCCA 52656650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4445 GATATTTAAACCATTGCCTAATCAATGAATATCCTGGTAGTTTCCACATTGTTTTTTCCA 4504

 52656651 TTTCCACTATAGTGGAATAAACTTTCGTGTTCAAAAATCCTAAACTGGTGCTATATTTCT 52656710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4505 TTTCCACTATAGTGGAATAAACTTTCGTGTTCAAAAATCCTAAACTGGTGCTATATTTCT 4564

 52656711 ATAGAATAGAGGCACAGATGTAGAAGTGTTACCCTCAAATCAATATGCATTTAGTTTTGA 52656770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4565 ATAGAATAGAGGCACAGATGTAGAAGTGTTACCCTCAAATCAATATGCATTTAGTTTTGA 4624

 52656771 AAAACAGACACTGCCATATTATTTTCTTAAAAAGGCTCTACAGATTCACATTTCCAGCAG 52656830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4625 AAAACAGACACTGCCATATTATTTTCTTAAAAAGGCTCTACAGATTCACATTTCCAGCAG 4684

 52656831 CAATGAGTGTCTCAAGCACCTTTTAAGTGGTAAGCAGCTTACCAGGGGAGGTGGCCTATT 52656890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4685 CAATGAGTGTCTCAAGCACCTTTTAAGTGGTAAGCAGCTTACCAGGGGAGGTGGCCTATT 4744

 52656891 ATTCTATCAGTGGCTTCAGTTGTTAGGACACCACGGGTCAGCTGTGGAGATACGGTTGTG 52656950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4745 ATTCTATCAGTGGCTTCAGTTGTTAGGACACCACGGGTCAGCTGTGGAGATACGGTTGTG 4804

 52656951 GGGCAGGTTGAGTTCAGGACACATAGAAGATTGCCAAAGGGTGACTATTATTACTTTGAG 52657010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4805 GGGCAGGTTGAGTTCAGGACACATAGAAGATTGCCAAAGGGTGACTATTATTACTTTGAG 4864

 52657011 ACTCTGGAAAAATTAGCCAGGAAACAGAGACAAGAGGCTCAGGGTGCAGCAAAGCAGCCA 52657070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4865 ACTCTGGAAAAATTAGCCAGGAAACAGAGACAAGAGGCTCAGGGTGCAGCAAAGCAGCCA 4924

 52657071 AATCAGGATGATAGTGTTTTCTTTGGAGCAGATATACTAATGGCCAAGGAACTCATAAAA 52657130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4925 AATCAGGATGATAGTGTTTTCTTTGGAGCAGATATACTAATGGCCAAGGAACTCATAAAA 4984

 52657131 AGATGCCTAATGTCATCTCATTAGGGAAGTGCAGTCAAAGCCACAGCATGATACGTCTTC 52657190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4985 AGATGCCTAATGTCATCTCATTAGGGAAGTGCAGTCAAAGCCACAGCATGATACGTCTTC 5044

 52657191 ACACCCACGAGGATGGCCATAATCAGAGAGACAATAACCAGTGGTAGGGAAGATGTGAAA 52657250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5045 ACACCCACGAGGATGGCCATAATCAGAGAGACAATAACCAGTGGTAGGGAAGATGTGAAA 5104

 52657251 AAATCGGAATGCTCATGCATTGCTGGTAGGAATGTGACATGGTGCAGCTGCTTTGGAAAG 52657310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5105 AAATCGGAATGCTCATGCATTGCTGGTAGGAATGTGACATGGTGCAGCTGCTTTGGAAAG 5164

 52657311 CAGTTTAACAGTTCCTGGAAAAGTTAAACATGGAGTTACCCTAAGACCCAGCAATTCCAT 52657370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5165 CAGTTTAACAGTTCCTGGAAAAGTTAAACATGGAGTTACCCTAAGACCCAGCAATTCCAT 5224

 52657371 TCCTAGGTAAGCAAGAAAATGAAAACATATGGCCACACAAAAACTTGTACACAAATGTCC 52657430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5225 TCCTAGGTAAGCAAGAAAATGAAAACATATGGCCACACAAAAACTTGTACACAAATGTCC 5284

 52657431 ATAGCAGCATTTTCATAATAGCTGAAAAGTGGAAACAACCCAAATATCCATCAATTGGAA 52657490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5285 ATAGCAGCATTTTCATAATAGCTGAAAAGTGGAAACAACCCAAATATCCATCAATTGGAA 5344

 52657491 AAAGGAAATCTAGCATTTGCATATAATAGAGTATTAATCAGCCATAAGAAGAAACAAAGC 52657550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5345 AAAGGAAATCTAGCATTTGCATATAATAGAGTATTAATCAGCCATAAGAAGAAACAAAGC 5404

 52657551 ACCGATCCATGTTATATCATGCTTTATACTTGGAAGCATGGTACTAAGTGAAAGACGCCA 52657610
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5405 ACCGATCCATGTTATAGCATGCTTTATACTTGGAAGCATGGTACTAAGTGAAAGACGCCA 5464

 52657611 GACACAAAAAGCAAAATATTGTATGATTCCATTTATATAAAGTGTCTAGAATAGGCAAAT 52657670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5465 GACACAAAAAGCAAAATATTGTATGATTCCATTTATATAAAGTGTCTAGAATAGGCAAAT 5524

 52657671 CCATAGAGGCAGAAAACAGATTAGTGGTTGCCAGTGGCTGGGAATAGGGAAAAAACTCAG 52657730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5525 CCATAGAGGCAGAAAACAGATTAGTGGTTGCCAGTGGCTGGGAATAGGGAAAAAACTCAG 5584

 52657731 CGCTAAAGGGTAGGGAGTTTTGTTTTGGAGTAATGACGATGTTCTGGAATTAGACGTGGA 52657790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5585 CGCTAAAGGGTAGGGAGTTTTGTTTTGGAGTAATGACGATGTTCTGGAATTAGACGTGGA 5644

 52657791 ACGATTGCACACATGGTGCAAATATCCTTAAAATCACGGAATTGTCACTCTAAAAGGTGA 52657850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5645 ACGATTGCACACATGGTGCAAATATCCTTAAAATCACGGAATTGTCACTCTAAAAGGTGA 5704

 52657851 ATTTTATGGTAGGTGAATTGTACCTCAATTTGTAAAAAGAAGAATTAGATAAATAAACAG 52657910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5705 ATTTTATGGTAGGTGAATTGTACCTCAATTTGTAAAAAGAAGAATTAGATAAATAAACAG 5764

 52657911 CAACACAGCACCAAGGGGTGGGGGTAGGAAACAGACAACAAATAGGAGTGAAGAGTTCAC 52657970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5765 CAACACAGCACCAAGGGGTGGGGGTAGGAAACAGACAACAAATAGGAGTGAAGAGTTCAC 5824

 52657971 AGGAAAAGACATGCAGCCAGCTTTTAAGCAGAAGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGT 52658030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5825 AGGAAAAGACATGCAGCCAGCTTTTAAGCAGAAGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGT 5884

 52658031 AAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTGGCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAG 52658090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5885 AAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTGGCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAG 5944

 52658091 GAGACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTATAAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACG 52658150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5945 GAGACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTATAAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACG 6004

 52658151 GTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTA 52658210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6005 GTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTA 6064

 52658211 AGG 52658213
          |||
     6065 AGG 6067

Alignment time is 7.29826 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [52637064,52668002] =>     30939 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    6273] =>      6273 nucs 'mol-32-2fee-217835_6273'

Score:        6273
Aligned:      6273        nucs
Identic:      6273 (100%) nucs =>      3687 (100%)      2586 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [52654762,52658448] EXCISED REGION [52658451,52661036]
 second seq =>  [       1,    3687] EXCISED REGION [    3688,    6273]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [52658449,52658450]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        20 nucs [52658449,52658468] to [52658451,52658470]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [52658449,52658449] to [52658450,52658450]
 second seq =>         0 nucs

 52654762 TTCAAGACTTAGGTTATGTCAGGCCTTCCCTGACTCCTCCATCTGAAGTAACCCCTCCTG 52654821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTCAAGACTTAGGTTATGTCAGGCCTTCCCTGACTCCTCCATCTGAAGTAACCCCTCCTG 60

 52654822 CTTACTCCTGTTTATTCTCTAGACTCCACAGAGGATTCATCACTCTCTGAAATGATCCCA 52654881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTTACTCCTGTTTATTCTCTAGACTCCACAGAGGATTCATCACTCTCTGAAATGATCCCA 120

 52654882 TTAATTTCTTCTTCACTTGTTTCCTCTCCACGACCTGTAAGCCCCAAGTGGACCCGGACT 52654941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTAATTTCTTCTTCACTTGTTTCCTCTCCACGACCTGTAAGCCCCAAGTGGACCCGGACT 180

 52654942 TGGTCTGCTCTGCTTACAGCTGGATTCCAGTTCCCATAGTGCTAGACACTAGGATTAAGC 52655001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGGTCTGCTCTGCTTACAGCTGGATTCCAGTTCCCATAGTGCTAGACACTAGGATTAAGC 240

 52655002 CAGGAAACATGGGTGAAGCAGCAAGCACAGAGCTTGGGGCACAGCCTAGCAAACACTCCA 52655061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CAGGAAACATGGGTGAAGCAGCAAGCACAGAGCTTGGGGCACAGCCTAGCAAACACTCCA 300

 52655062 CAAAGGACCATGATTGTAACTGTAGTAGGGCACACCAATGAACAGGTTGGGAAACTGAGT 52655121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CAAAGGACCATGATTGTAACTGTAGTAGGGCACACCAATGAACAGGTTGGGAAACTGAGT 360

 52655122 CTCTGAGAAGAGACTAATGTTGTGCTGGATGAAATTTCTTTTTCTGACAATACATTATCC 52655181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTCTGAGAAGAGACTAATGTTGTGCTGGATGAAATTTCTTTTTCTGACAATACATTATCC 420

 52655182 AAATCCTCCAAGCTTTCAGTTTAAAGGGGAAAGCAGGAACTATCATTATAATTTTATTTA 52655241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAATCCTCCAAGCTTTCAGTTTAAAGGGGAAAGCAGGAACTATCATTATAATTTTATTTA 480

 52655242 CAAAGTGTCCATGTATGAACATTATTCACCGCCGAATCATCTCTTCCTATGCAAGCAACA 52655301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CAAAGTGTCCATGTATGAACATTATTCACCGCCGAATCATCTCTTCCTATGCAAGCAACA 540

 52655302 CCGTCCTATGCATCAATATCCTGATCTGTCAGGATTCAGGATAAAGTGGACATATACACA 52655361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CCGTCCTATGCATCAATATCCTGATCTGTCAGGATTCAGGATAAAGTGGACATATACACA 600

 52655362 CTAATTGCAAAGGGAAATTGTACATCTTGCAAAAGATGCAGGGGTTTATAGAGTCTTGTA 52655421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTAATTGCAAAGGGAAATTGTACATCTTGCAAAAGATGCAGGGGTTTATAGAGTCTTGTA 660

 52655422 ACATTGGTGAGCTGCTCAGATCACACACATGACCGTGGTTGGACAAGGATCTGGCAAAGT 52655481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ACATTGGTGAGCTGCTCAGATCACACACATGACCGTGGTTGGACAAGGATCTGGCAAAGT 720

 52655482 TAACACAGATCACCGAAGAAGGAAAAGTGGACAACACAACACAGTAAGTTCTTCAAAAGA 52655541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TAACACAGATCACCGAAGAAGGAAAAGTGGACAACACAACACAGTAAGTTCTTCAAAAGA 780

 52655542 GTTATATTAGAATATCAAAAGATTATGTTAGGCCTTTGGGAAAACTCAAAACTTTATGAA 52655601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GTTATATTAGAATATCAAAAGATTATGTTAGGCCTTTGGGAAAACTCAAAACTTTATGAA 840

 52655602 GACCTCAAAAAATTATGCAAAAATGACCCTTCAATGGTCATGCTGCAAGAGTCAAATGAC 52655661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GACCTCAAAAAATTATGCAAAAATGACCCTTCAATGGTCATGCTGCAAGAGTCAAATGAC 900

 52655662 ACTTCAAACAACTGCGGCTTTCTATGTTGTGCAAATGCATTTGTTGTTTTAAAGGTCGTA 52655721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ACTTCAAACAACTGCGGCTTTCTATGTTGTGCAAATGCATTTGTTGTTTTAAAGGTCGTA 960

 52655722 AAGTCAGGGTACACGTGGCAGATACTTATGACTTGGAGGAAGACGTTAGATTAGATTTGA 52655781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AAGTCAGGGTACACGTGGCAGATACTTATGACTTGGAGGAAGACGTTAGATTAGATTTGA 1020

 52655782 AACTTTCACTGAATGATCGCATTTCATGCTTTTCATCTGTACATTAAAAAGCCAGAATGT 52655841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AACTTTCACTGAATGATCGCATTTCATGCTTTTCATCTGTACATTAAAAAGCCAGAATGT 1080

 52655842 CTTTGCCAAGAAATTCTAGCATAAATAAAAGAAAAGGATGGGATTTTGGAACATCATGGT 52655901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTTTGCCAAGAAATTCTAGCATAAATAAAAGAAAAGGATGGGATTTTGGAACATCATGGT 1140

 52655902 AGAATTCTTGACTATCAGCTTTATACAACATGTCTGGACATTTAGTGATGGAAATGCTGG 52655961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGAATTCTTGACTATCAGCTTTATACAACATGTCTGGACATTTAGTGATGGAAATGCTGG 1200

 52655962 ATTCCAAAGGAATGTAGGCAAAGGTACTACTACCCCCATGCTCTTCAGAAAACATCCTCT 52656021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATTCCAAAGGAATGTAGGCAAAGGTACTACTACCCCCATGCTCTTCAGAAAACATCCTCT 1260

 52656022 AAAAGCAACAGTGATGATCAGATACTGTGGGGCAAGACTGACAGTGACACTCAAGATTTC 52656081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AAAAGCAACAGTGATGATCAGATACTGTGGGGCAAGACTGACAGTGACACTCAAGATTTC 1320

 52656082 CACTCTTCTCTTTAATCATATATTTCCTGTCATTCATGTGCTACAAAACTCTGGAATATG 52656141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CACTCTTCTCTTTAATCATATATTTCCTGTCATTCATGTGCTACAAAACTCTGGAATATG 1380

 52656142 CAAAGCTCATTCAAATGCAAAACCAGCCTTTGCTCCAACATGAGCATATATTTTCATTTA 52656201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CAAAGCTCATTCAAATGCAAAACCAGCCTTTGCTCCAACATGAGCATATATTTTCATTTA 1440

 52656202 AAGACAAATCAGATGTTTCATTTGATTTTTTTTATAAATCTGATAATAATGTACATTTAA 52656261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AAGACAAATCAGATGTTTCATTTGATTTTTTTTATAAATCTGATAATAATGTACATTTAA 1500

 52656262 CCCGTGTTTACAACCAAAATAATTAATCTCTCTGAACCCTTTGTTTTTCCTGTCTCTATC 52656321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CCCGTGTTTACAACCAAAATAATTAATCTCTCTGAACCCTTTGTTTTTCCTGTCTCTATC 1560

 52656322 CTCCACCCTCATTGCCAGATAAATAACATCTGCAACCTGATGTGGCATATTGAACTTTGT 52656381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CTCCACCCTCATTGCCAGATAAATAACATCTGCAACCTGATGTGGCATATTGAACTTTGT 1620

 52656382 TTATACTCACACAAACACGTATAAGCATCCCAGATACACATATACAGGGACTGTATCTGT 52656441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTATACTCACACAAACACGTATAAGCATCCCAGATACACATATACAGGGACTGTATCTGT 1680

 52656442 CCTTGTTGTTTTTATAGAAATTGGATCACATTAGACATATTTTCTGATGACTTTTGTACA 52656501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CCTTGTTGTTTTTATAGAAATTGGATCACATTAGACATATTTTCTGATGACTTTTGTACA 1740

 52656502 TTATAGTTGGTCTTCACAGTCAATAGCTCCAAAGCTATCTTATCTTCTAAAATAGCTGCA 52656561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TTATAGTTGGTCTTCACAGTCAATAGCTCCAAAGCTATCTTATCTTCTAAAATAGCTGCA 1800

 52656562 TAATATTCCTCAGTATGGATATACCAAAAGATATTTAAACCATTGCCTAATCAATGAATA 52656621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TAATATTCCTCAGTATGGATATACCAAAAGATATTTAAACCATTGCCTAATCAATGAATA 1860

 52656622 TCCTGGTAGTTTCCACATTGTTTTTTCCATTTCCACTATAGTGGAATAAACTTTCGTGTT 52656681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TCCTGGTAGTTTCCACATTGTTTTTTCCATTTCCACTATAGTGGAATAAACTTTCGTGTT 1920

 52656682 CAAAAATCCTAAACTGGTGCTATATTTCTATAGAATAGAGGCACAGATGTAGAAGTGTTA 52656741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CAAAAATCCTAAACTGGTGCTATATTTCTATAGAATAGAGGCACAGATGTAGAAGTGTTA 1980

 52656742 CCCTCAAATCAATATGCATTTAGTTTTGAAAAACAGACACTGCCATATTATTTTCTTAAA 52656801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CCCTCAAATCAATATGCATTTAGTTTTGAAAAACAGACACTGCCATATTATTTTCTTAAA 2040

 52656802 AAGGCTCTACAGATTCACATTTCCAGCAGCAATGAGTGTCTCAAGCACCTTTTAAGTGGT 52656861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AAGGCTCTACAGATTCACATTTCCAGCAGCAATGAGTGTCTCAAGCACCTTTTAAGTGGT 2100

 52656862 AAGCAGCTTACCAGGGGAGGTGGCCTATTATTCTATCAGTGGCTTCAGTTGTTAGGACAC 52656921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AAGCAGCTTACCAGGGGAGGTGGCCTATTATTCTATCAGTGGCTTCAGTTGTTAGGACAC 2160

 52656922 CACGGGTCAGCTGTGGAGATACGGTTGTGGGGCAGGTTGAGTTCAGGACACATAGAAGAT 52656981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CACGGGTCAGCTGTGGAGATACGGTTGTGGGGCAGGTTGAGTTCAGGACACATAGAAGAT 2220

 52656982 TGCCAAAGGGTGACTATTATTACTTTGAGACTCTGGAAAAATTAGCCAGGAAACAGAGAC 52657041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TGCCAAAGGGTGACTATTATTACTTTGAGACTCTGGAAAAATTAGCCAGGAAACAGAGAC 2280

 52657042 AAGAGGCTCAGGGTGCAGCAAAGCAGCCAAATCAGGATGATAGTGTTTTCTTTGGAGCAG 52657101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AAGAGGCTCAGGGTGCAGCAAAGCAGCCAAATCAGGATGATAGTGTTTTCTTTGGAGCAG 2340

 52657102 ATATACTAATGGCCAAGGAACTCATAAAAAGATGCCTAATGTCATCTCATTAGGGAAGTG 52657161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 ATATACTAATGGCCAAGGAACTCATAAAAAGATGCCTAATGTCATCTCATTAGGGAAGTG 2400

 52657162 CAGTCAAAGCCACAGCATGATACGTCTTCACACCCACGAGGATGGCCATAATCAGAGAGA 52657221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CAGTCAAAGCCACAGCATGATACGTCTTCACACCCACGAGGATGGCCATAATCAGAGAGA 2460

 52657222 CAATAACCAGTGGTAGGGAAGATGTGAAAAAATCGGAATGCTCATGCATTGCTGGTAGGA 52657281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CAATAACCAGTGGTAGGGAAGATGTGAAAAAATCGGAATGCTCATGCATTGCTGGTAGGA 2520

 52657282 ATGTGACATGGTGCAGCTGCTTTGGAAAGCAGTTTAACAGTTCCTGGAAAAGTTAAACAT 52657341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 ATGTGACATGGTGCAGCTGCTTTGGAAAGCAGTTTAACAGTTCCTGGAAAAGTTAAACAT 2580

 52657342 GGAGTTACCCTAAGACCCAGCAATTCCATTCCTAGGTAAGCAAGAAAATGAAAACATATG 52657401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GGAGTTACCCTAAGACCCAGCAATTCCATTCCTAGGTAAGCAAGAAAATGAAAACATATG 2640

 52657402 GCCACACAAAAACTTGTACACAAATGTCCATAGCAGCATTTTCATAATAGCTGAAAAGTG 52657461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GCCACACAAAAACTTGTACACAAATGTCCATAGCAGCATTTTCATAATAGCTGAAAAGTG 2700

 52657462 GAAACAACCCAAATATCCATCAATTGGAAAAAGGAAATCTAGCATTTGCATATAATAGAG 52657521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GAAACAACCCAAATATCCATCAATTGGAAAAAGGAAATCTAGCATTTGCATATAATAGAG 2760

 52657522 TATTAATCAGCCATAAGAAGAAACAAAGCACCGATCCATGTTATATCATGCTTTATACTT 52657581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TATTAATCAGCCATAAGAAGAAACAAAGCACCGATCCATGTTATATCATGCTTTATACTT 2820

 52657582 GGAAGCATGGTACTAAGTGAAAGACGCCAGACACAAAAAGCAAAATATTGTATGATTCCA 52657641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GGAAGCATGGTACTAAGTGAAAGACGCCAGACACAAAAAGCAAAATATTGTATGATTCCA 2880

 52657642 TTTATATAAAGTGTCTAGAATAGGCAAATCCATAGAGGCAGAAAACAGATTAGTGGTTGC 52657701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TTTATATAAAGTGTCTAGAATAGGCAAATCCATAGAGGCAGAAAACAGATTAGTGGTTGC 2940

 52657702 CAGTGGCTGGGAATAGGGAAAAAACTCAGCGCTAAAGGGTAGGGAGTTTTGTTTTGGAGT 52657761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CAGTGGCTGGGAATAGGGAAAAAACTCAGCGCTAAAGGGTAGGGAGTTTTGTTTTGGAGT 3000

 52657762 AATGACGATGTTCTGGAATTAGACGTGGAACGATTGCACACATGGTGCAAATATCCTTAA 52657821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 AATGACGATGTTCTGGAATTAGACGTGGAACGATTGCACACATGGTGCAAATATCCTTAA 3060

 52657822 AATCACGGAATTGTCACTCTAAAAGGTGAATTTTATGGTAGGTGAATTGTACCTCAATTT 52657881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 AATCACGGAATTGTCACTCTAAAAGGTGAATTTTATGGTAGGTGAATTGTACCTCAATTT 3120

 52657882 GTAAAAAGAAGAATTAGATAAATAAACAGCAACACAGCACCAAGGGGTGGGGGTAGGAAA 52657941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 GTAAAAAGAAGAATTAGATAAATAAACAGCAACACAGCACCAAGGGGTGGGGGTAGGAAA 3180

 52657942 CAGACAACAAATAGGAGTGAAGAGTTCACAGGAAAAGACATGCAGCCAGCTTTTAAGCAG 52658001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 CAGACAACAAATAGGAGTGAAGAGTTCACAGGAAAAGACATGCAGCCAGCTTTTAAGCAG 3240

 52658002 AAGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTT 52658061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 AAGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTT 3300

 52658062 GGCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTA 52658121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 GGCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTA 3360

 52658122 TAAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTG 52658181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TAAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTG 3420

 52658182 GGAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGT 52658241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 GGAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGT 3480

 52658242 GAAACACTGTCTCTGCTAAAAAACAAAACAAAACAAAACACCAAAAAATAGCTGGGCGTA 52658301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 GAAACACTGTCTCTGCTAAAAAACAAAACAAAACAAAACACCAAAAAATAGCTGGGCGTA 3540

 52658302 GTGGCGGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTTGGGAGGCGGTGGCAGGAGAATCATTTGAACC 52658361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 GTGGCGGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTTGGGAGGCGGTGGCAGGAGAATCATTTGAACC 3600

 52658362 TGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACTGCACTCTAACCTGGGCAACAG 52658421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 TGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACTGCACTCTAACCTGGGCAACAG 3660

 52658422 AGTTCAGAGTGAGACTCTGTCTCCCCC 52658448
          |||||||||||||||||||||||||||
     3661 AGTTCAGAGTGAGACTCTGTCTCCCCC 3687

EXCISED REGION

 52658451 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAACAGCCATATAGATCGTCGGTGGGAGTGTAATTTGGCC 52658510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3688 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAACAGCCATATAGATCGTCGGTGGGAGTGTAATTTGGCC 3747

 52658511 ACTTCTTTGGAAAATAGCTCAGTAATATCTATTAATACTTAAAATTTCACAAACACTGTA 52658570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3748 ACTTCTTTGGAAAATAGCTCAGTAATATCTATTAATACTTAAAATTTCACAAACACTGTA 3807

 52658571 AGTCTAACTTCCACTTCTAAAATGTTATCCTAGAAATAAAATTGCATAGGGGTACAAAGG 52658630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3808 AGTCTAACTTCCACTTCTAAAATGTTATCCTAGAAATAAAATTGCATAGGGGTACAAAGG 3867

 52658631 CTTACGTATGGAACTATTTGCTGGACTACTGTAGTTGTGGCAAAAAACTGGAAATGACCT 52658690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3868 CTTACGTATGGAACTATTTGCTGGACTACTGTAGTTGTGGCAAAAAACTGGAAATGACCT 3927

 52658691 AAACGCTTATTAGTAGAAACCTGGTTAAATAAATTATCATATGTCCTTGAGGACACAGGG 52658750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3928 AAACGCTTATTAGTAGAAACCTGGTTAAATAAATTATCATATGTCCTTGAGGACACAGGG 3987

 52658751 ACACAAAGAGGGGAATGACAGGCACTGAGCCTACTTGAGGGTGGGAGGAGGAAGTCGATC 52658810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3988 ACACAAAGAGGGGAATGACAGGCACTGAGCCTACTTGAGGGTGGGAGGAGGAAGTCGATC 4047

 52658811 AGAAAAAATAACTAGTGGGTACTAGGCTTAGTACCCGGGTGAAAAAATAATCTGTACAAC 52658870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4048 AGAAAAAATAACTAGTGGGTACTAGGCTTAGTACCCGGGTGAAAAAATAATCTGTACAAC 4107

 52658871 AAACCCCCATGACATGAGTTTACCTTATAACAAACCTGCACATGTAATCTGAACCTAGAT 52658930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4108 AAACCCCCATGACATGAGTTTACCTTATAACAAACCTGCACATGTAATCTGAACCTAGAT 4167

 52658931 AAAAGTTTAAAAAAATAAATAATCATATGTCCCTACAATGAAATATTCCACAGGCATTAA 52658990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4168 AAAAGTTTAAAAAAATAAATAATCATATGTCCCTACAATGAAATATTCCACAGGCATTAA 4227

 52658991 AATTCCCCAAGGAATTTTAGTAAGGAAAGAAAAAGCTGTGCCCAACAGCACGTACAGTAT 52659050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4228 AATTCCCCAAGGAATTTTAGTAAGGAAAGAAAAAGCTGTGCCCAACAGCACGTACAGTAT 4287

 52659051 GTTTCCATTTGTTTTTAAAAAATGGTGTCGGGAGGTTGAGGAGACAACTTATAAATAGAC 52659110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4288 GTTTCCATTTGTTTTTAAAAAATGGTGTCGGGAGGTTGAGGAGACAACTTATAAATAGAC 4347

 52659111 ATGCCTGGGATACCTCTGGATATAAGAAACTGTAAAGTATTTACTTCTAAGGAAGGAAAT 52659170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4348 ATGCCTGGGATACCTCTGGATATAAGAAACTGTAAAGTATTTACTTCTAAGGAAGGAAAT 4407

 52659171 TTGGGATGGGGCTTGGGGAGCCATCAGAGTTAGGGTGGGGATTTTTTCTCTGCCTTATCT 52659230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4408 TTGGGATGGGGCTTGGGGAGCCATCAGAGTTAGGGTGGGGATTTTTTCTCTGCCTTATCT 4467

 52659231 TATTATGTATATCGCTCAGAATGTTTGCTATGTGTATGCACCTACCCCATCCATTAAGAA 52659290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4468 TATTATGTATATCGCTCAGAATGTTTGCTATGTGTATGCACCTACCCCATCCATTAAGAA 4527

 52659291 ATGAAGAAATAATGAAAAGAAAAAATGAAAGTAGGGAACTAGAAATGAGAGGTGGGATTC 52659350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4528 ATGAAGAAATAATGAAAAGAAAAAATGAAAGTAGGGAACTAGAAATGAGAGGTGGGATTC 4587

 52659351 AAAGTGGACTGAACACTTGACCTATTTCCCAATTTGCCTAGGGCTGGCCCAGCAGCGAGG 52659410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4588 AAAGTGGACTGAACACTTGACCTATTTCCCAATTTGCCTAGGGCTGGCCCAGCAGCGAGG 4647

 52659411 CAGGTTCTAACCAATGAGCATCAGCTTTGAATGGAGGGGCTGATAGGCCAGGTGGGCCCT 52659470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4648 CAGGTTCTAACCAATGAGCATCAGCTTTGAATGGAGGGGCTGATAGGCCAGGTGGGCCCT 4707

 52659471 GCTTGCTGAGAGTGTCATGGCCTTAGGGACATCTCCATGTTGCAGAGTCTGAGCCTCTGC 52659530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4708 GCTTGCTGAGAGTGTCATGGCCTTAGGGACATCTCCATGTTGCAGAGTCTGAGCCTCTGC 4767

 52659531 TTGGCAAATTCAGAAAATCCAGCTTTTCTTTTTATATCACCTGGAGCTGATGTAACTCTC 52659590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4768 TTGGCAAATTCAGAAAATCCAGCTTTTCTTTTTATATCACCTGGAGCTGATGTAACTCTC 4827

 52659591 AGAAGGCATTTTTAAGAGGACTCATGAATTAACCACATAGCCAACTTACTGGCTTAAGAC 52659650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4828 AGAAGGCATTTTTAAGAGGACTCATGAATTAACCACATAGCCAACTTACTGGCTTAAGAC 4887

 52659651 TACGTGACAGAAAGCTGCAAAGGGGGCCAGCCACTGGTAACATCCCACCACTGTCCCTCT 52659710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4888 TACGTGACAGAAAGCTGCAAAGGGGGCCAGCCACTGGTAACATCCCACCACTGTCCCTCT 4947

 52659711 CTGTGGAAAACACAGATGGGATGCACATTGTGACGGGCAGGATGCCTGGAGAGCCCACAA 52659770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4948 CTGTGGAAAACACAGATGGGATGCACATTGTGACGGGCAGGATGCCTGGAGAGCCCACAA 5007

 52659771 ATCTGCAAGCACAGCTGAAATTGGTTACAGGATTTCAATGTTTCATTGCTTGAAGCTATG 52659830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5008 ATCTGCAAGCACAGCTGAAATTGGTTACAGGATTTCAATGTTTCATTGCTTGAAGCTATG 5067

 52659831 ATAACTTGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGACGATGATTTTTTTTATAGCCA 52659890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5068 ATAACTTGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGACGATGATTTTTTTTATAGCCA 5127

 52659891 TCTTTTTAGAGGGATTTGAGGTAGGGAAAAAAATAAACCTCACACTATCGGAGGTTGCCA 52659950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5128 TCTTTTTAGAGGGATTTGAGGTAGGGAAAAAAATAAACCTCACACTATCGGAGGTTGCCA 5187

 52659951 ACTATGAGGTCTGCTGATGGTTTGGCCAACACAGTGTTTATATTTTTTTGAATTGGGAAA 52660010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5188 ACTATGAGGTCTGCTGATGGTTTGGCCAACACAGTGTTTATATTTTTTTGAATTGGGAAA 5247

 52660011 TTTCATTTAAAAGTCCTAAAATCAGGCTGTTATTGAAATATCTTATTATTGGCTCAGGGT 52660070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5248 TTTCATTTAAAAGTCCTAAAATCAGGCTGTTATTGAAATATCTTATTATTGGCTCAGGGT 5307

 52660071 TTCCCAGGGCAGCCATCCTTGAAGCTGTGTGGAGCCCTATAAACAAGGACGCTTTCCAGT 52660130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5308 TTCCCAGGGCAGCCATCCTTGAAGCTGTGTGGAGCCCTATAAACAAGGACGCTTTCCAGT 5367

 52660131 TCCCTGCAAACTCCATTTCATTCAGAGCCTTGAGCCAGTTCTTACATGGTCCTCAGACTT 52660190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5368 TCCCTGCAAACTCCATTTCATTCAGAGCCTTGAGCCAGTTCTTACATGGTCCTCAGACTT 5427

 52660191 GAGCTAGTGCAAGAATACCCGGGAGGGGTTGTGGGAACAGATAGCTGGGCCCCACCCCCA 52660250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5428 GAGCTAGTGCAAGAATACCCGGGAGGGGTTGTGGGAACAGATAGCTGGGCCCCACCCCCA 5487

 52660251 GGGAAGGGGGTGTTTCTGACTCAGGAGGTCTGGGCTCCGGCTACAGAAACTGCACATCTA 52660310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5488 GGGAAGGGGGTGTTTCTGACTCAGGAGGTCTGGGCTCCGGCTACAGAAACTGCACATCTA 5547

 52660311 ACCGGTACCCAGGTGATGTGATGCTGCTGGCCCAGGGACAACTCTGCGAGTCACTGCTAT 52660370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5548 ACCGGTACCCAGGTGATGTGATGCTGCTGGCCCAGGGACAACTCTGCGAGTCACTGCTAT 5607

 52660371 TGGGCACTGCTATTGCACCCACACAAGGAGGCAGGCTCTGCTTACATTTTTCAGTTCTTG 52660430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5608 TGGGCACTGCTATTGCACCCACACAAGGAGGCAGGCTCTGCTTACATTTTTCAGTTCTTG 5667

 52660431 TTCCCAGAAACATTTGCTCTTTGGGGTATGCTTTGCATATAATGGATCCTACCCACTAAT 52660490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5668 TTCCCAGAAACATTTGCTCTTTGGGGTATGCTTTGCATATAATGGATCCTACCCACTAAT 5727

 52660491 ACAGTATGCTGCTTTTATTGATAAACTTCCAGAAACTTGAAGCGCACCTTACCATTTCTT 52660550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5728 ACAGTATGCTGCTTTTATTGATAAACTTCCAGAAACTTGAAGCGCACCTTACCATTTCTT 5787

 52660551 TGATCTCGCTGATTATTTTTATTTTTGTTAAATGAAAATTGTTGGTAAGTTCTTTTTGGT 52660610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5788 TGATCTCGCTGATTATTTTTATTTTTGTTAAATGAAAATTGTTGGTAAGTTCTTTTTGGT 5847

 52660611 GTGGTAAAAGGATATGAAAAGCTGATTTTAAAAAAATGTCCACTCTAGGATTAGAATTGT 52660670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5848 GTGGTAAAAGGATATGAAAAGCTGATTTTAAAAAAATGTCCACTCTAGGATTAGAATTGT 5907

 52660671 AGGTGTGTTTATTCTATTTCAAGATCTGGTTAAAATGCACCTTGAGGAAAAGAATTGAGT 52660730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5908 AGGTGTGTTTATTCTATTTCAAGATCTGGTTAAAATGCACCTTGAGGAAAAGAATTGAGT 5967

 52660731 GCAGCTGTTGTTATTTCTCAATGCTGTTTCTCTTTTCATGTTTTTTTCATGTTGTCTCTT 52660790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5968 GCAGCTGTTGTTATTTCTCAATGCTGTTTCTCTTTTCATGTTTTTTTCATGTTGTCTCTT 6027

 52660791 GGTCTGTCCTATCTCTCTTGGTCTATCCTCCAAGACAGAGATGAGTGATCTTGAAACCCT 52660850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6028 GGTCTGTCCTATCTCTCTTGGTCTATCCTCCAAGACAGAGATGAGTGATCTTGAAACCCT 6087

 52660851 GCCCATGTTTTTATCTTTGGAGCCCAACTGTGCTGCCTTGTTTTCTTCTCCATCCAAAGA 52660910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6088 GCCCATGTTTTTATCTTTGGAGCCCAACTGTGCTGCCTTGTTTTCTTCTCCATCCAAAGA 6147

 52660911 GGCAAAGAGAAAGTTGCATATTACTCAACAGCAGTTGCATGACAGTTAAAATCAGACTGT 52660970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6148 GGCAAAGAGAAAGTTGCATATTACTCAACAGCAGTTGCATGACAGTTAAAATCAGACTGT 6207

 52660971 ATGAGTCATGGAACAGTAAGTTGTGTCCAGAGTATCTGTCATGGTAAGTACAAAAAAGTC 52661030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6208 ATGAGTCATGGAACAGTAAGTTGTGTCCAGAGTATCTGTCATGGTAAGTACAAAAAAGTC 6267

 52661031 CTTAAA 52661036
          ||||||
     6268 CTTAAA 6273

Alignment time is 7.64969 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [52637064,52668002] =>     30939 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    9132] =>      9132 nucs 'mol-32-3004-040042_9132'

Score:        8866
Aligned:      9142        nucs
Identic:      9103 (100%) nucs =>      8679 (100%)       424 ( 98%)
Gaps:           22 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [52638359,52647064] EXCISED REGION [52658003,52658426]
 second seq =>  [       1,    8700] EXCISED REGION [    8701,    9132]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>     10938 nucs [52647065,52658002]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         6 nucs [52647065,52647070] to [52658003,52658008]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [52647065,52647067] to [52658000,52658002]
 second seq =>         0 nucs

 52638359 CATGGCACACATTTATTTTAAGTTCTGGGGTACACGTGCACGTCACCCGGGCTCCTGCAC 52638418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CATGGCACACATTTATTTTAAGTTCTGGGGTACACGTGCACGTCACCCGGGCTCCTGCAC 60

 52638419 ATCCTGCATTTGTACCCCAGAACTTAAAATAAAAATTACAACAAAAACTTTATCTCTAAA 52638478
          |||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||
       61 ATCCTGCATTTGTACCCCAGAACTTAAAA-----ATTACAACAAAAACTTTATCTCTAAA 115

 52638479 AAATGCTGACACAAAGACACAAAGTGAACACAGGCCATTGGAAAAATGGTGCTGACAGAC 52638538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      116 AAATGCTGACACAAAGACACAAAGTGAACACAGGCCATTGGAAAAATGGTGCTGACAGAC 175

 52638539 TTGCTTGATGCAGGATTGTCACAAACCTTTAATGTGTAAAAATGCAGCATCTGTGAAGCA 52638598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      176 TTGCTTGATGCAGGATTGTCACAAACCTTTAATGTGTAAAAATGCAGCATCTGTGAAGCA 235

 52638599 CAATAAAGAGAGGTACTCCTGCATACTTGGAATCATGTTAAAACCACAAGGGACTAAGCC 52638658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      236 CAATAAAGAGAGGTACTCCTGCATACTTGGAATCATGTTAAAACCACAAGGGACTAAGCC 295

 52638659 TAGGGACTAAGCAACAATGGAGGACACCAGTAGAGAAAGACTGAGGCGGGCTTGTGGGGG 52638718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      296 TAGGGACTAAGCAACAATGGAGGACACCAGTAGAGAAAGACTGAGGCGGGCTTGTGGGGG 355

 52638719 CTGTGAAGATGTTGAACCAACCTGAACTCCCCTACCTCTAGGGTTCTTTTTACATGCAAG 52638778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      356 CTGTGAAGATGTTGAACCAACCTGAACTCCCCTACCTCTAGGGTTCTTTTTACATGCAAG 415

 52638779 AAATAGTACATCCTCCTTGTTAAGTGAACCACTATTAATTGATTGTTGTGTGTGTGTGTG 52638838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      416 AAATAGTACATCCTCCTTGTTAAGTGAACCACTATTAATTGATTGTTGTGTGTGTGTGTG 475

 52638839 TGTGTGTTTCCTGCAGCCAAAGTAAAAATGATATATTACCAACCCCTAAATGATACACTA 52638898
          |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      476 TGTGT--TTCCTGCAGCCAAAGTAAAAATGATATATTACCAACCCCTAAATGATACACTA 533

 52638899 TTCAAACTCCATCACTCTGAAAAGCCATTTGATCTATTTCATAATTACTCATTTCTAAGT 52638958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      534 TTCAAACTCCATCACTCTGAAAAGCCATTTGATCTATTTCATAATTACTCATTTCTAAGT 593

 52638959 TTCTAACAATTTAGAAAATATACAGTTTTATTTAGCATGACTACTACTGATGGCCTATAT 52639018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      594 TTCTAACAATTTAGAAAATATACAGTTTTATTTAGCATGACTACTACTGATGGCCTATAT 653

 52639019 TATCTTCTAACTTTACAAAAACCCCTAGGGCAGGTAGTAGCTTCCTTTTGTGGATGAAAA 52639078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      654 TATCTTCTAACTTTACAAAAACCCCTAGGGCAGGTAGTAGCTTCCTTTTGTGGATGAAAA 713

 52639079 CACAGGTTTTTAAATGATTGAGTATAACAGGCTTAGGTGACAGATGGATCTCGATTCCAC 52639138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      714 CACAGGTTTTTAAATGATTGAGTATAACAGGCTTAGGTGACAGATGGATCTCGATTCCAC 773

 52639139 TTCTGCCACTAATTAGCTTTGCGACCTTAACGCAGGTAACTTAAGTTCTCCCCAAGTTCT 52639198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      774 TTCTGCCACTAATTAGCTTTGCGACCTTAACGCAGGTAACTTAAGTTCTCCCCAAGTTCT 833

 52639199 CTCCTCTGTTCAATGGCAATAGAAATACCTACCTTGTTGGGTTTTTTTAACAATAAAAAC 52639258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      834 CTCCTCTGTTCAATGGCAATAGAAATACCTACCTTGTTGGGTTTTTTTAACAATAAAAAC 893

 52639259 AGATAATGTATGCAAAATGCTTACTGCACAGCCTAGAAATAATGAATTATTTTAAAATGG 52639318
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
      894 AGATAATGTATGCAAAATGCTTACTACACAGCCTAGAAATAATGAATTATTTTAAAATGG 953

 52639319 GGCTATTATTGTCATTTAACTCAACCACACAGCTATTTAGTGGTAGAGTCTGGACTCATA 52639378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      954 GGCTATTATTGTCATTTAACTCAACCACACAGCTATTTAGTGGTAGAGTCTGGACTCATA 1013

 52639379 CCTAGGTCACCCAGGCTCCTAACACTTCCACATCACCTCTGCCACTGCAAACATCTCATA 52639438
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1014 CCTAGGTCACCTAGGCTCCTAACACTTCCACATCACCTCTGCCACTGCAAACATCTCATA 1073

 52639439 TTAAGCGTTTCTTACTGCTAAATGCATCAAAATCCCAGTGGTATAGCTGAGGACCTTGTT 52639498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1074 TTAAGCGTTTCTTACTGCTAAATGCATCAAAATCCCAGTGGTATAGCTGAGGACCTTGTT 1133

 52639499 TACTCCAAAACTTGCATAATGTAAGATGGATTTTCCCTTTGCACTGACAAAGTCTTTTGG 52639558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1134 TACTCCAAAACTTGCATAATGTAAGATGGATTTTCCCTTTGCACTGACAAAGTCTTTTGG 1193

 52639559 GTGGCTAGTTCTCTTTACCAGTTGAAAAGGCATGGCCTTGTGGACATAAGGCAGAAACAA 52639618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1194 GTGGCTAGTTCTCTTTACCAGTTGAAAAGGCATGGCCTTGTGGACATAAGGCAGAAACAA 1253

 52639619 CACAAAATAAAAAACAGTTAATAATTCACTTGGCCTTCTAATGTTGAAATTCGGTAATTC 52639678
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     1254 CACAAAATAAAAAACAGTTAATAATTCACTTGGCCTTCTAATGTTGAAATTGGGTAATTC 1313

 52639679 TTTTTATTTGTTTTTATTTTTCACTTGGGATTTTGGGTATTTACAACTTTGCATATGCTA 52639738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1314 TTTTTATTTGTTTTTATTTTTCACTTGGGATTTTGGGTATTTACAACTTTGCATATGCTA 1373

 52639739 ACATCTTTGAATTTCATTGCCTCAAGTTGTAACTTCATTGAACAAGTTTCAAATAATTGG 52639798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1374 ACATCTTTGAATTTCATTGCCTCAAGTTGTAACTTCATTGAACAAGTTTCAAATAATTGG 1433

 52639799 CAAAAATAGAAACGTTGACTATTTAAGACTATGGGCTTTGGAGATGGACAATTTTGGCTG 52639858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1434 CAAAAATAGAAACGTTGACTATTTAAGACTATGGGCTTTGGAGATGGACAATTTTGGCTG 1493

 52639859 TGCCACCTTTTAGCTGTGTGTCAGGAGTGATATGCTTTCTCTGAACTGTTGACTTCTTCA 52639918
          ||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.||||||||
     1494 TGCCACCTTTTAGCTGTGTGTCAGGAATGATATGCTTTCTCTGAACTGTTGGCTTCTTCA 1553

 52639919 TCTGTAAAATGGTGAAAATACAGGAATTCCCTGGTAAGATTTGATGGCTCAATGAGCTGA 52639978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1554 TCTGTAAAATGGTGAAAATACAGGAATTCCCTGGTAAGATTTGATGGCTCAATGAGCTGA 1613

 52639979 TTTCTACAAAATGATTTAATCACAGAATTTGACTTAAAATGCGAGAGGGATTCATGCTGT 52640038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1614 TTTCTACAAAATGATTTAATCACAGAATTTGACTTAAAATGCGAGAGGGATTCATGCTGT 1673

 52640039 CCGAAATCATCCAAGAGTGGAGATATCTGGTTAGCTTCATGGAGAACCTGGCACTGAATA 52640098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1674 CCGAAATCATCCAAGAGTGGAGATATCTGGTTAGCTTCATGGAGAACCTGGCACTGAATA 1733

 52640099 TCAAGTCAATTTTTGATAAACAGAGAGAGAAAGGGACATAGGCAGAGAAAATACCAGGAG 52640158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1734 TCAAGTCAATTTTTGATAAACAGAGAGAGAAAGGGACATAGGCAGAGAAAATACCAGGAG 1793

 52640159 ACAGATGGCGTTTGCACAGGTCAGGTGTTGGCCATATTGACTGGAGAAATTTAAGGGAAG 52640218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1794 ACAGATGGCGTTTGCACAGGTCAGGTGTTGGCCATATTGACTGGAGAAATTTAAGGGAAG 1853

 52640219 GGTGGAAAATGCAGTTGGAAAATAGGCAGAGGAAACATTGTGGAAACCCTTAAATGTCAG 52640278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1854 GGTGGAAAATGCAGTTGGAAAATAGGCAGAGGAAACATTGTGGAAACCCTTAAATGTCAG 1913

 52640279 ACAAAGAAACTGAGGCTTATGGGCATGGACACTAACATTTCTATTGTTTCAAAAATAATT 52640338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1914 ACAAAGAAACTGAGGCTTATGGGCATGGACACTAACATTTCTATTGTTTCAAAAATAATT 1973

 52640339 TTACAACTTTTATACCTTTCTCACCCAAGTTAGGACTTGTGCCTTTGGTTATACAACTCT 52640398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1974 TTACAACTTTTATACCTTTCTCACCCAAGTTAGGACTTGTGCCTTTGGTTATACAACTCT 2033

 52640399 TAAATTAGAGTCAACTGTGCTATCTCTGTGAGTTTGGGTTGAGGACTATGGAAGGGAAAG 52640458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2034 TAAATTAGAGTCAACTGTGCTATCTCTGTGAGTTTGGGTTGAGGACTATGGAAGGGAAAG 2093

 52640459 GCAAAAAATAAAAGTAAAATGTGAAGTAGAAGACAGGGAGAAAACCCATAATACTGGTAA 52640518
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     2094 GCAAAAAATAAAAGTAAAATGTGAAGTAGAAGACAGGGAGAAAACCCATAATACTAGTAA 2153

 52640519 TAGCTAATTTCTCTTTTTCTTCTTTCAAAATGCAATTTGTGCTAAGTACTTTATATGGCC 52640578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2154 TAGCTAATTTCTCTTTTTCTTCTTTCAAAATGCAATTTGTGCTAAGTACTTTATATGGCC 2213

 52640579 TATCTCATTTAACTTCTAAAAGTGTGAACAATGTGAGAATGTGCTAGATACTATTATTAT 52640638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2214 TATCTCATTTAACTTCTAAAAGTGTGAACAATGTGAGAATGTGCTAGATACTATTATTAT 2273

 52640639 CCCCATTTTACAGATGAGGAAACTGAGGCTCAGGAGGTGAAGTAGCTTGCCCAAGATCAC 52640698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2274 CCCCATTTTACAGATGAGGAAACTGAGGCTCAGGAGGTGAAGTAGCTTGCCCAAGATCAC 2333

 52640699 ACAGCCAGTAGGTGACAGAGGTAGAGAGGAAACCTAGGCTACTTGACTATGATGCTTATG 52640758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2334 ACAGCCAGTAGGTGACAGAGGTAGAGAGGAAACCTAGGCTACTTGACTATGATGCTTATG 2393

 52640759 TTTAATTCACTACTAAATACCATGTAGGAAAGGACTCTGGAGACCTTAGTTCTTTAATTC 52640818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2394 TTTAATTCACTACTAAATACCATGTAGGAAAGGACTCTGGAGACCTTAGTTCTTTAATTC 2453

 52640819 CAATTCTACCACTAAACAGTAGAGACAGGATGAACTTGTCATTCACTGAGATGGAAAACC 52640878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2454 CAATTCTACCACTAAACAGTAGAGACAGGATGAACTTGTCATTCACTGAGATGGAAAACC 2513

 52640879 CCGTGAATTAAACTGGTGGGCATTTTGTTTTTGTCATTGTTAGGCGATGAATGAAGAGTT 52640938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2514 CCGTGAATTAAACTGGTGGGCATTTTGTTTTTGTCATTGTTAGGCGATGAATGAAGAGTT 2573

 52640939 CCATTCTGGACACATTAGGGTTGAGATACTCAGTGAGCAGCCAAATGGGGATGTAGAAAT 52640998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2574 CCATTCTGGACACATTAGGGTTGAGATACTCAGTGAGCAGCCAAATGGGGATGTAGAAAT 2633

 52640999 TCAAGTAGACATGTGGAAGAGGAGGCAGCTGAGACTCACGTCTGGACTTCAGGGATGGAT 52641058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2634 TCAAGTAGACATGTGGAAGAGGAGGCAGCTGAGACTCACGTCTGGACTTCAGGGATGGAT 2693

 52641059 CCCGGCTAGAGATGTAAATTTGGAACTTGTCAACCCATAGCAGTATTTAAACCTTTGGGA 52641118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2694 CCCGGCTAGAGATGTAAATTTGGAACTTGTCAACCCATAGCAGTATTTAAACCTTTGGGA 2753

 52641119 CTGAGGGAAACCTTCAAGGAAATAAGCGTAGTTAGAGATAGCCAAGAAGTGAACCCTGGG 52641178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2754 CTGAGGGAAACCTTCAAGGAAATAAGCGTAGTTAGAGATAGCCAAGAAGTGAACCCTGGG 2813

 52641179 GAAGTCCAACATTTAGAGGGTGAGATCCAGCAAAGGAGATGATGGAAGAGTACCAGGGAG 52641238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2814 GAAGTCCAACATTTAGAGGGTGAGATCCAGCAAAGGAGATGATGGAAGAGTACCAGGGAG 2873

 52641239 GTGGAAGGATGTTGTTTCAAACAGCAAGGTGTGGCCCACTCAGTCACTGTGTCGGATTCA 52641298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2874 GTGGAAGGATGTTGTTTCAAACAGCAAGGTGTGGCCCACTCAGTCACTGTGTCGGATTCA 2933

 52641299 ACTTGCAGGTCAGACCTACTAGGACAAAGATAGAGACCTATAGGATTTGGCAGCCAGGGT 52641358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2934 ACTTGCAGGTCAGACCTACTAGGACAAAGATAGAGACCTATAGGATTTGGCAGCCAGGGT 2993

 52641359 GATGGTAGGGAATTTGAAACATCATGGTGGCTGTGACAAGAGCCTGAATGGAGTGTGTTC 52641418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2994 GATGGTAGGGAATTTGAAACATCATGGTGGCTGTGACAAGAGCCTGAATGGAGTGTGTTC 3053

 52641419 AAGAGAGAAAAGAAGAGAAGTGAAAACACAGAATATTGTTCTTATTATTAGTAGCCTGAG 52641478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3054 AAGAGAGAAAAGAAGAGAAGTGAAAACACAGAATATTGTTCTTATTATTAGTAGCCTGAG 3113

 52641479 CCAATCTGAGGACCGATGCACTTATCACAATGTCTCTTAAAATACTATGTCTCTTACTAG 52641538
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3114 CAAATCTGAGGACCGATGCACTTATCACAATGTCTCTTAAAATACTATGTCTCTTACTAG 3173

 52641539 ATTATACACTCCTTGACAGACGAGAAACATGATTTATTTTTCAAATGCCTTGCACAAGGT 52641598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3174 ATTATACACTCCTTGACAGACGAGAAACATGATTTATTTTTCAAATGCCTTGCACAAGGT 3233

 52641599 TAGTGCGAAAGTAACGATTGCAGGATTTAATTACACTTTTAAAAGAAAAAAGACATTCTT 52641658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3234 TAGTGCGAAAGTAACGATTGCAGGATTTAATTACACTTTTAAAAGAAAAAAGACATTCTT 3293

 52641659 CATCTTATGAAACTCTGCATGGCAACACTTTATGCGCCCCACACCCCCACTCAACACAAA 52641718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     3294 CATCTTATGAAACTCTGCATGGCAACACTTTACGCGCCCCACACCCCCACTCAACACAAA 3353

 52641719 CACAACTCTGGAAGTACTGTGTTGATAACAGAAATGTGGTGGGTTTTATTTTTAACCAAT 52641778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3354 CACAACTCTGGAAGTACTGTGTTGATAACAGAAATGTGGTGGGTTTTATTTTTAACCAAT 3413

 52641779 AAAGGTCAAGTTTGCATTATGTGATTTTGTGTGTGTGTGTGTTGAATCTTTTAAATGCAT 52641838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3414 AAAGGTCAAGTTTGCATTATGTGATTTTGTGTGTGTGTGTGTTGAATCTTTTAAATGCAT 3473

 52641839 ATCTTACAGCTCTGGTTCAGTTGTTGTGGGGAGAGGAAAAAAACCTCATCCCTGCCAACA 52641898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3474 ATCTTACAGCTCTGGTTCAGTTGTTGTGGGGAGAGGAAAAAAACCTCATCCCTGCCAACA 3533

 52641899 CATTGGTTTGTATGAATCACAGCTCAGTGAAACCTTTCAGGCATATAATTTATCTTTTCT 52641958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3534 CATTGGTTTGTATGAATCACAGCTCAGTGAAACCTTTCAGGCATATAATTTATCTTTTCT 3593

 52641959 TTGGCCTATGTAGTAAACGCTTCATTTGTTCATGAATTCTTGCCTTGTTTTAATTATGCT 52642018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3594 TTGGCCTATGTAGTAAACGCTTCATTTGTTCATGAATTCTTGCCTTGTTTTAATTATGCT 3653

 52642019 TTGCCCTGAATGTAGTTTTATAAGGCACAAAAATAAGATTGTCGTTCTGAAAACACAGAA 52642078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3654 TTGCCCTGAATGTAGTTTTATAAGGCACAAAAATAAGATTGTCGTTCTGAAAACACAGAA 3713

 52642079 GATTTGTATGTTTCCCCCAGGATGAAATGGTGGCATCTTTCTCCCAATTCACAGCTCTGT 52642138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3714 GATTTGTATGTTTCCCCCAGGATGAAATGGTGGCATCTTTCTCCCAATTCACAGCTCTGT 3773

 52642139 GGGCTTGTGGCTGGAATTCCAATCCAGCAGGGAGCAAGCCATAAAAATGGGGGGAAGGGC 52642198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3774 GGGCTTGTGGCTGGAATTCCAATCCAGCAGGGAGCAAGCCATAAAAATGGGGGGAAGGGC 3833

 52642199 TGCTGGAGGGAGGCAGTAGATGCGGCTGAGCCCAAGGCATAATTCACCCTAAGAATTCTG 52642258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3834 TGCTGGAGGGAGGCAGTAGATGCGGCTGAGCCCAAGGCATAATTCACCCTAAGAATTCTG 3893

 52642259 AATCAATACACTGACATCCAGCCATGTACAATGTGGTACTCCCACCAAGAAAGCCACTGA 52642318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3894 AATCAATACACTGACATCCAGCCATGTACAATGTGGTACTCCCACCAAGAAAGCCACTGA 3953

 52642319 TTGAGAAGTTTTATTCATGTTACTTTCTGAGGGTTGGATTGTCCCATTACATTTATAGAA 52642378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3954 TTGAGAAGTTTTATTCATGTTACTTTCTGAGGGTTGGATTGTCCCATTACATTTATAGAA 4013

 52642379 CAATTGCTTTTTTCCCCCTAAATACAGAACTATGCAGCCGGGAGTCAGAAAAGAAACCTT 52642438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4014 CAATTGCTTTTTTCCCCCTAAATACAGAACTATGCAGCCGGGAGTCAGAAAAGAAACCTT 4073

 52642439 GACAATCAGAAGGCTGTTTTGTTGTTGTTGTTAAAAACCTTTGCAGGCATATGCATCTGA 52642498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4074 GACAATCAGAAGGCTGTTTTGTTGTTGTTGTTAAAAACCTTTGCAGGCATATGCATCTGA 4133

 52642499 ATATCCATAAGTTCACAGGCTGAGGGAGAAATGGCTATTTCATAACTTTTCTGTGTTTCT 52642558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4134 ATATCCATAAGTTCACAGGCTGAGGGAGAAATGGCTATTTCATAACTTTTCTGTGTTTCT 4193

 52642559 CATGTACATAGTACAAAGTGGGCACTCAGTATTTCAAATTTCAATATCACTGAAAAAAAT 52642618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4194 CATGTACATAGTACAAAGTGGGCACTCAGTATTTCAAATTTCAATATCACTGAAAAAAAT 4253

 52642619 GGAAATTTGTCATGTAACAAAATCAGATGCAGACTTCACTGGTGAATCTGAGGGAGTGAA 52642678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4254 GGAAATTTGTCATGTAACAAAATCAGATGCAGACTTCACTGGTGAATCTGAGGGAGTGAA 4313

 52642679 TTCACTTATTCAGAAAGGAAGACAGTTACAATTCTTGGGTCTTCTGAGAGATCATTATAA 52642738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4314 TTCACTTATTCAGAAAGGAAGACAGTTACAATTCTTGGGTCTTCTGAGAGATCATTATAA 4373

 52642739 CTTGAAAATATTACACAAGGGCTTTGCTATATTAGATACCTGCCATGTTCCTAACACAAG 52642798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     4374 CTTGAAAATATTACACAAGGGCTTTGCTATATTAGATACCTGCCATGTTCCTAATACAAG 4433

 52642799 CTCCCATTTTCTGACTCAAATCTCATTTTGGAACACATTCCACTCAAATTGAGGTTCTAC 52642858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4434 CTCCCATTTTCTGACTCAAATCTCATTTTGGAACACATTCCACTCAAATTGAGGTTCTAC 4493

 52642859 CCCTAAGAGTTCTTTTTCAATAAAGAAAGCTGAGTTAATAAATCACAACTCCAAAACTTT 52642918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4494 CCCTAAGAGTTCTTTTTCAATAAAGAAAGCTGAGTTAATAAATCACAACTCCAAAACTTT 4553

 52642919 TCCTCACTTTTCTTAGACTAGAAATAGATTGAGTGTGTCGAGGTTTTATGGCTGAGTACA 52642978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     4554 TCCTCACTTTTCTTAGACTAGAAATAGATTGAATGTGTCGAGGTTTTATGGCTGAGTACA 4613

 52642979 TTGGAGGGCTGGCTATTCTATGCTGAACTGGTTTACTTGATTAAGATGGGGATTTGGATG 52643038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4614 TTGGAGGGCTGGCTATTCTATGCTGAACTGGTTTACTTGATTAAGATGGGGATTTGGATG 4673

 52643039 AGTCACCGGACACCTGTCCAAAGATGAGTAAAACACATTCCTTCATTGTCTTCCCATAAA 52643098
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4674 AGTCACTGGACACCTGTCCAAAGATGAGTAAAACACATTCCTTCATTGTCTTCCCATAAA 4733

 52643099 TAACTCAATCTTCTCCTAACTGAGCCAATGGATAGGCTTTGGATGCCCAAGCAAAACAAA 52643158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     4734 TAACTCAATCTTCTCCTAACTGAGCCAATGGATAGGCTTTGGATGCCCAAGCAAAAGAAA 4793

 52643159 CACATGACTGTTAAAAAATCACAACCTCAAAATGGCCTTAGAAGCCTATGACCAATAATG 52643218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4794 CACATGACTGTTAAAAAATCACAACCTCAAAATGGCCTTAGAAGCCTATGACCAATAATG 4853

 52643219 AGAATGGTTTCTCCACTCAGGCGCAAGTAGTAAACAGTTTCTCCCATATGCAGGAATATT 52643278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4854 AGAATGGTTTCTCCACTCAGGCGCAAGTAGTAAACAGTTTCTCCCATATGCAGGAATATT 4913

 52643279 GACGACTAGTTTACCGCCTCTGGGCACGTAACTTTCAGGTCCTGGTTCATGCATTTGCTG 52643338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4914 GACGACTAGTTTACCGCCTCTGGGCACGTAACTTTCAGGTCCTGGTTCATGCATTTGCTG 4973

 52643339 GAATGTTCCCTGGGCCATGGAGCCCAGTTCTCCTGGCATCTGGCATCTCCCCCACACTCT 52643398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4974 GAATGTTCCCTGGGCCATGGAGCCCAGTTCTCCTGGCATCTGGCATCTCCCCCACACTCT 5033

 52643399 GCTCCCCCAGCACAGCACTTGGCATCTTGCATTGCAATTGCAGGTTTATTTATTCACTTC 52643458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5034 GCTCCCCCAGCACAGCACTTGGCATCTTGCATTGCAATTGCAGGTTTATTTATTCACTTC 5093

 52643459 TCTCACTGGACAGCAAACTCCACCAGGGCCGAGACTCTGTGTCTCGCCCTTCACTGTGGT 52643518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5094 TCTCACTGGACAGCAAACTCCACCAGGGCCGAGACTCTGTGTCTCGCCCTTCACTGTGGT 5153

 52643519 CCCTGTGCCTCACCTGTTCCTAGTACAGTGTCACACTCAGTAAAGAGCAGATGCCTGG-T 52643577
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
     5154 CCCTGTGCCTCACCTGTTCCTAGTACAGTGTCACACTCAGTAAAGAGCAGATGCCTGGAT 5213

 52643578 GCATTTGGAGACTTATTTTAAATTATACGGAAAGTTATTCAACCGGCTTCTTGAACTGGT 52643637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5214 GCATTTGGAGACTTATTTTAAATTATACGGAAAGTTATTCAACCGGCTTCTTGAACTGGT 5273

 52643638 GAATTTTGGAAAGTGGGTGTTTGAAGGGAAAATGTTTAAACTCTGAAAGAAATGTTGGAA 52643697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5274 GAATTTTGGAAAGTGGGTGTTTGAAGGGAAAATGTTTAAACTCTGAAAGAAATGTTGGAA 5333

 52643698 ATAAGCTCTTTGAATCAAAATGTATAGAAAACACAAGAATGCTGACAGTAAGAGCCTAAA 52643757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5334 ATAAGCTCTTTGAATCAAAATGTATAGAAAACACAAGAATGCTGACAGTAAGAGCCTAAA 5393

 52643758 ACACATGATGACTATTATCTTTTCCCAATTTTAACTCTCCAGAGTGTTCAGCGGTGCCCA 52643817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5394 ACACATGATGACTATTATCTTTTCCCAATTTTAACTCTCCAGAGTGTTCAGCGGTGCCCA 5453

 52643818 GCCTTCATAATGTAATTCTTCGTAGCACCCTGGATGCATTAAAACCATAGATTAACGTGA 52643877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5454 GCCTTCATAATGTAATTCTTCGTAGCACCCTGGATGCATTAAAACCATAGATTAACGTGA 5513

 52643878 TACTTATTTTCATTAAGGAAAATAATTTACGTACAGTGCTCAGAGTAGAGCCTGGCACAT 52643937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5514 TACTTATTTTCATTAAGGAAAATAATTTACGTACAGTGCTCAGAGTAGAGCCTGGCACAT 5573

 52643938 TGAACATTTTCAATAAATGACAGCAAGTGTAATTATTAGCACTTCGGAAGTGCAAAGTTG 52643997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     5574 TGAACATTTTCAATAAATGACAGCAAGTGTAATTATTAGCACTTTGGAAGTGCAAAGTTG 5633

 52643998 CATTGTATTAAGACAAATATATTTGGAGCTCATCCAATTTTTTCCTGGCTCTGAAGTCTG 52644057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5634 CATTGTATTAAGACAAATATATTTGGAGCTCATCCAATTTTTTCCTGGCTCTGAAGTCTG 5693

 52644058 CTAGTGGCACTTAACTTTATTCCCAAGTTTTGAAAAATATTGTTATTTAAAAAGTCTGTT 52644117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5694 CTAGTGGCACTTAACTTTATTCCCAAGTTTTGAAAAATATTGTTATTTAAAAAGTCTGTT 5753

 52644118 AACCAAGGAAATGCATGCCCTAAACCTATAATGTATCAAGTTTTACTTCCTTCTTCTTTT 52644177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5754 AACCAAGGAAATGCATGCCCTAAACCTATAATGTATCAAGTTTTACTTCCTTCTTCTTTT 5813

 52644178 AAGGAGTTCTTTTCCTGCCTTGAATACAAACAGGCTCTCTCAAGGTTAAAAGCAAATGCT 52644237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5814 AAGGAGTTCTTTTCCTGCCTTGAATACAAACAGGCTCTCTCAAGGTTAAAAGCAAATGCT 5873

 52644238 CTTTTTAGTGTCAAAAAGAGCTTGCCTTTCTTCGCTCAGGAAAAAAAGCAACTGATTCCA 52644297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5874 CTTTTTAGTGTCAAAAAGAGCTTGCCTTTCTTCGCTCAGGAAAAAAAGCAACTGATTCCA 5933

 52644298 GGATACCTTCTTTGAAAACCAACACAAAAAAACCCCCCAAAAAACAAAAAAAAAACCCAA 52644357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5934 GGATACCTTCTTTGAAAACCAACACAAAAAAACCCCCCAAAAAACAAAAAAAAAACCCAA 5993

 52644358 AACCCCTAGTTTTTACAAAGGTTTATTACTCCTACTTGTTGGAAAAGAATTACTACATAA 52644417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5994 AACCCCTAGTTTTTACAAAGGTTTATTACTCCTACTTGTTGGAAAAGAATTACTACATAA 6053

 52644418 AAGAGTCTGCCCAGAGCTGTAAAATCTCCTTATTCAAACACACACCTTAGAGCAAAAGAT 52644477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6054 AAGAGTCTGCCCAGAGCTGTAAAATCTCCTTATTCAAACACACACCTTAGAGCAAAAGAT 6113

 52644478 GGTTAAATATCAATTCAGGCTATTAACAGTAAGGGAC---GAAATGTGTTCCAACAAAAC 52644534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||
     6114 GGTTAAATATCAATTCAGGCTATTAACAGTAAGG---AATGAAATGTGTTCCAACAAAAC 6170

 52644535 TCTGCATGTCAACAAACTACAGAGACTAGGTAACATCTTTTAGGAATCATTTTTATTCCA 52644594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6171 TCTGCATGTCAACAAACTACAGAGACTAGGTAACATCTTTTAGGAATCATTTTTATTCCA 6230

 52644595 CTAATGCCTTTTCCTCCAGAATCCACTGATCGTAAACGCAACCTGTCTACTTCCGCCTTT 52644654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6231 CTAATGCCTTTTCCTCCAGAATCCACTGATCGTAAACGCAACCTGTCTACTTCCGCCTTT 6290

 52644655 GAAAAATGGATGGACAAATTCATCTGCATGTAACTCACCTCCTCTTTTCTTTTACATAAA 52644714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6291 GAAAAATGGATGGACAAATTCATCTGCATGTAACTCACCTCCTCTTTTCTTTTACATAAA 6350

 52644715 ACAGATGCCACAGCTGTTATTGTTCTTCACACAGAAGTTTCTACCCAGAGAAACATCAGG 52644774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6351 ACAGATGCCACAGCTGTTATTGTTCTTCACACAGAAGTTTCTACCCAGAGAAACATCAGG 6410

 52644775 ATGACACTCTGCTGCAATGTGCTATTTGTTCTAGAGGGGTCAACAGCTTGCCACCTTGCC 52644834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6411 ATGACACTCTGCTGCAATGTGCTATTTGTTCTAGAGGGGTCAACAGCTTGCCACCTTGCC 6470

 52644835 TAGGCCCAGGGTGACTGCATATGTGCAGTGGTCTTATCCCATTAGCGCCCCCGAGCATGC 52644894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6471 TAGGCCCAGGGTGACTGCATATGTGCAGTGGTCTTATCCCATTAGCGCCCCCGAGCATGC 6530

 52644895 ATTCAGAACCAAGTGGATACACCTTGGCACACTTACCTTCCCTGCAGGGACATCATCGGA 52644954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6531 ATTCAGAACCAAGTGGATACACCTTGGCACACTTACCTTCCCTGCAGGGACATCATCGGA 6590

 52644955 CTGCCCTGATAAGCCAGGAACCTCATCCACCTTGTCTTGATGCTCTGCCCTCTTGGCTTC 52645014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6591 CTGCCCTGATAAGCCAGGAACCTCATCCACCTTGTCTTGATGCTCTGCCCTCTTGGCTTC 6650

 52645015 CTGTTGGCTGTCACCTGGCACCTTTTCCTGTCCCTTGTCCAGCTTGAAGAATTTGTCAAA 52645074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6651 CTGTTGGCTGTCACCTGGCACCTTTTCCTGTCCCTTGTCCAGCTTGAAGAATTTGTCAAA 6710

 52645075 AAAGCTGGAGTCCTTGGGCTTGGAGGGAGCTTCTCCTCCTGCTCCCCCTGTCTCAGGTGG 52645134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6711 AAAGCTGGAGTCCTTGGGCTTGGAGGGAGCTTCTCCTCCTGCTCCCCCTGTCTCAGGTGG 6770

 52645135 GAGAAGCGTGGGATCCCTGGCGGCAGAGAGGACCTTGTCTTGGGCCGGGGCGTGCCCTGG 52645194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6771 GAGAAGCGTGGGATCCCTGGCGGCAGAGAGGACCTTGTCTTGGGCCGGGGCGTGCCCTGG 6830

 52645195 GGTTTTATCTGTGTCCTGCCCCGGTCCAGCTGCCACCGGAAGTGTCCAGCTCTCACTTGG 52645254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6831 GGTTTTATCTGTGTCCTGCCCCGGTCCAGCTGCCACCGGAAGTGTCCAGCTCTCACTTGG 6890

 52645255 GTCTTTGTTCGCTGGAGCTTTATTGGAGCTGACATCAAGCTTCACTGATCCAAGGGATGA 52645314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6891 GTCTTTGTTCGCTGGAGCTTTATTGGAGCTGACATCAAGCTTCACTGATCCAAGGGATGA 6950

 52645315 ATCTGCGGCTTGGTCTCCGGTACGTCCTGGTACAGGCCGAGAGAGCATCAAGAAAAAACG 52645374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6951 ATCTGCGGCTTGGTCTCCGGTACGTCCTGGTACAGGCCGAGAGAGCATCAAGAAAAAACG 7010

 52645375 AGATTTAGCAGCTGGTGCCTCGGGTTTGGCCTCTTTCCCAAGATTCTTTCCGTTGGCATC 52645434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7011 AGATTTAGCAGCTGGTGCCTCGGGTTTGGCCTCTTTCCCAAGATTCTTTCCGTTGGCATC 7070

 52645435 CGCAACAGCACTTATCTCCGTTGTCTCGGGGGAAGAAGTGGCCACATTATCCGTCTTGAC 52645494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7071 CGCAACAGCACTTATCTCCGTTGTCTCGGGGGAAGAAGTGGCCACATTATCCGTCTTGAC 7130

 52645495 ACTTATTCCCAAGTCGACTGTAAACACAAACATAAACAGTGGTTATTCAGCCAAGCCGGG 52645554
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     7131 ACTTATTCCCAAGTCGACTGTAAACACAAACATAAACAGCGGTTATTCAGCCAAGCCGGG 7190

 52645555 AAATTCAGGCACTAATAATGGACTCCAGACATTTTTTATACAAAAGCCATACTGCATACT 52645614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7191 AAATTCAGGCACTAATAATGGACTCCAGACATTTTTTATACAAAAGCCATACTGCATACT 7250

 52645615 GGAACTGTGTTGTTCTCTGGTCATTCTGAAAGGCAGAAGTTAGCTCTCTACATCTCCTTG 52645674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7251 GGAACTGTGTTGTTCTCTGGTCATTCTGAAAGGCAGAAGTTAGCTCTCTACATCTCCTTG 7310

 52645675 GACCCTGCTTTTCTTGGGAGAGGAGAAGGCAAGGTTGGTGAGGAGGGAAAGCTACTTAAT 52645734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7311 GACCCTGCTTTTCTTGGGAGAGGAGAAGGCAAGGTTGGTGAGGAGGGAAAGCTACTTAAT 7370

 52645735 GGAAAGTCACTAGCTGCCAGGTGTGGAATGAGTGATATTCAATGTTAATTAATCTTCTTT 52645794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7371 GGAAAGTCACTAGCTGCCAGGTGTGGAATGAGTGATATTCAATGTTAATTAATCTTCTTT 7430

 52645795 TATCTGTGTAAGAACTCCGTGAGCAGCATATTGTCATGATGTCAACTGGGAGGCAGTACA 52645854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7431 TATCTGTGTAAGAACTCCGTGAGCAGCATATTGTCATGATGTCAACTGGGAGGCAGTACA 7490

 52645855 GCAGTTAGGAGCTTGGGTTCTGGAGCTAGAACAAGGTTTCTCAACCTCAGCACTACTCAC 52645914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7491 GCAGTTAGGAGCTTGGGTTCTGGAGCTAGAACAAGGTTTCTCAACCTCAGCACTACTCAC 7550

 52645915 ATTTGAAGCCAGATTATTCTTTGTTAGGGAGGCTCATCCCGTGCCTCATAGGCTGATTAG 52645974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7551 ATTTGAAGCCAGATTATTCTTTGTTAGGGAGGCTCATCCCGTGCCTCATAGGCTGATTAG 7610

 52645975 CAGCATCCTGGCCTCTGCCCACTAGACGCCGGTCACATTTCCCAGTCATGGCAACCAAAA 52646034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7611 CAGCATCCTGGCCTCTGCCCACTAGACGCCGGTCACATTTCCCAGTCATGGCAACCAAAA 7670

 52646035 ATATCTCTAGGCATTGCTAAATGTCCCCTGGAGGACAAAATCTCTTACGTTTGAGAGGCA 52646094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7671 ATATCTCTAGGCATTGCTAAATGTCCCCTGGAGGACAAAATCTCTTACGTTTGAGAGGCA 7730

 52646095 CTGAGCTGAAATGTCTTTTTGAATCCAGATTATCTAATTTTCTGTGCCTCAACTTTCTGG 52646154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7731 CTGAGCTGAAATGTCTTTTTGAATCCAGATTATCTAATTTTCTGTGCCTCAACTTTCTGG 7790

 52646155 TAAAAGGAGACAGATAATAAATCTCGTAATTTTGTTAGGAAGATTACATGAGTTAATAGT 52646214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7791 TAAAAGGAGACAGATAATAAATCTCGTAATTTTGTTAGGAAGATTACATGAGTTAATAGT 7850

 52646215 TTTAAAGCAAGTACAATAGCACCTGGAATATATTAAGTGCTTAATAAATATCACAAACAT 52646274
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7851 TTTAAAGCAAGTACAATAGCGCCTGGAATATATTAAGTGCTTAATAAATATCACAAACAT 7910

 52646275 TAGTTATCATTATTCATGAGTGAGAAAACTGACAGTCAGAGAGGTCAGTACACCCTCCCC 52646334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7911 TAGTTATCATTATTCATGAGTGAGAAAACTGACAGTCAGAGAGGTCAGTACACCCTCCCC 7970

 52646335 TGGCTGCCCAGTAAGCTAGTAAGCAGCAGAGTCTGGCTTCAGGCAGAAATCTGACTTCTA 52646394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7971 TGGCTGCCCAGTAAGCTAGTAAGCAGCAGAGTCTGGCTTCAGGCAGAAATCTGACTTCTA 8030

 52646395 AGTTCATGCGCTCTCTGTCTTACCAGGGACTTGTATTAGCATAGACTGTTAAGAATATGG 52646454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8031 AGTTCATGCGCTCTCTGTCTTACCAGGGACTTGTATTAGCATAGACTGTTAAGAATATGG 8090

 52646455 GAAGATTTTTAAAATACAGTACTCAGAAAATTTCTCTTTGAAAGGCTGGAAGAGCAGATA 52646514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8091 GAAGATTTTTAAAATACAGTACTCAGAAAATTTCTCTTTGAAAGGCTGGAAGAGCAGATA 8150

 52646515 TCCACACAAGAAGGCAAATTAGACCTCAGGCCAGTGTGGAATTAAAGGTGTAGGGTTATC 52646574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8151 TCCACACAAGAAGGCAAATTAGACCTCAGGCCAGTGTGGAATTAAAGGTGTAGGGTTATC 8210

 52646575 TGGTCAAGACTGTGTGTGTGGATACAGGCTCCAACCCCTCCAGGCAAGGGCACTGTTTCC 52646634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     8211 TGGTCAAGACTGTGTGTGTGGATACAGGCTCCAACCCCTCCAGGCAAGGGCAATGTTTCC 8270

 52646635 AACATCCACCCTTTCTCCTTTGACCTCTACCTTGACCTAAATTAACTATAAAAGGTCCTT 52646694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8271 AACATCCACCCTTTCTCCTTTGACCTCTACCTTGACCTAAATTAACTATAAAAGGTCCTT 8330

 52646695 CTTTTCTAGGACCCTACTATAAATCAGTGAAATATTCAGGAAAAAAAGAACACCAAGAAT 52646754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8331 CTTTTCTAGGACCCTACTATAAATCAGTGAAATATTCAGGAAAAAAAGAACACCAAGAAT 8390

 52646755 GTTGGGATCCCAGTTAAAGATCAAGATTCTCTACTGATAAGCTGTGTGATATGGAGTAAA 52646814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8391 GTTGGGATCCCAGTTAAAGATCAAGATTCTCTACTGATAAGCTGTGTGATATGGAGTAAA 8450

 52646815 TCACTAAAGATCTTTGAATCTCTTCATTTGTAAAATGGGAATATTGGTAGTCCTACTGCA 52646874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8451 TCACTAAAGATCTTTGAATCTCTTCATTTGTAAAATGGGAATATTGGTAGTCCTACTGCA 8510

 52646875 GGGTTGTTGTAATGCTTAAAGAAGAAAAGTCATGCAAAGGATCTGGCACAACGCCTTTTC 52646934
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     8511 GGGTTGTTGTAATGCTTAAAGAAGAAAAGTCATGCAAAGGATCTGGCACAATGCCTTTTC 8570

 52646935 CATAATAAGTGCTTAGTAATTGACAGATACTGTGATAACTTTTCAGGTTTCTCTCATGCC 52646994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8571 CATAATAAGTGCTTAGTAATTGACAGATACTGTGATAACTTTTCAGGTTTCTCTCATGCC 8630

 52646995 TTTGACAACATTGCATTTTGCTTGCTCTATCTGTAGTCAGACACTTCTTAATATCTGTTT 52647054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8631 TTTGACAACATTGCATTTTGCTTGCTCTATCTGTAGTCAGACACTTCTTAATATCTGTTT 8690

 52647055 GCAGGAAGAC 52647064
          ||||||||||
     8691 GCAGGAAGAC 8700

EXCISED REGION

 52658003 AGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTG 52658062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8701 AGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTG 8760

 52658063 GCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTAT 52658122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8761 GCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTAT 8820

 52658123 AAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGG 52658182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8821 AAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGG 8880

 52658183 GAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTG 52658242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8881 GAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTG 8940

 52658243 AAACACTGTCTCTGCTAAAAAACAAAACAAAACAAAACACCAAAAAATAGCTGGGCGTAG 52658302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8941 AAACACTGTCTCTGCTAAAAAACAAAACAAAACAAAACACCAAAAAATAGCTGGGCGTAG 9000

 52658303 TGGCGGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTTGGGAGGCGGTGGCAGGAGAATCATTTGAACCT 52658362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9001 TGGCGGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTTGGGAGGCGGTGGCAGGAGAATCATTTGAACCT 9060

 52658363 GGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGAT--------TGTGCCACTGCACTCTAACCTGG 52658414
          |||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||
     9061 GGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACTGTGCCACTGCACTCTAACCTGG 9120

 52658415 GCAACAGAGTTC 52658426
          ||||||||||||
     9121 GCAACAGAGTTC 9132

Alignment time is 10.1935 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [52637064,52668002] =>     30939 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    3953] =>      3953 nucs 'mol-32-3004-119064_3953'

Score:        3952
Aligned:      3952        nucs
Identic:      3952 (100%) nucs =>      1980 (100%)      1972 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [52645715,52647694] EXCISED REGION [52647696,52649667]
 second seq =>  [       1,    1980] EXCISED REGION [    1982,    3953]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [52647695,52647695]
 second seq =>         1 nucs [1981,1981]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [52647694,52647694] to [52647696,52647696]
 second seq =>         1 nucs [1980,1980] to [1982,1982]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 52645715 AGGAGGGAAAGCTACTTAATGGAAAGTCACTAGCTGCCAGGTGTGGAATGAGTGATATTC 52645774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGGAGGGAAAGCTACTTAATGGAAAGTCACTAGCTGCCAGGTGTGGAATGAGTGATATTC 60

 52645775 AATGTTAATTAATCTTCTTTTATCTGTGTAAGAACTCCGTGAGCAGCATATTGTCATGAT 52645834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AATGTTAATTAATCTTCTTTTATCTGTGTAAGAACTCCGTGAGCAGCATATTGTCATGAT 120

 52645835 GTCAACTGGGAGGCAGTACAGCAGTTAGGAGCTTGGGTTCTGGAGCTAGAACAAGGTTTC 52645894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTCAACTGGGAGGCAGTACAGCAGTTAGGAGCTTGGGTTCTGGAGCTAGAACAAGGTTTC 180

 52645895 TCAACCTCAGCACTACTCACATTTGAAGCCAGATTATTCTTTGTTAGGGAGGCTCATCCC 52645954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCAACCTCAGCACTACTCACATTTGAAGCCAGATTATTCTTTGTTAGGGAGGCTCATCCC 240

 52645955 GTGCCTCATAGGCTGATTAGCAGCATCCTGGCCTCTGCCCACTAGACGCCGGTCACATTT 52646014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTGCCTCATAGGCTGATTAGCAGCATCCTGGCCTCTGCCCACTAGACGCCGGTCACATTT 300

 52646015 CCCAGTCATGGCAACCAAAAATATCTCTAGGCATTGCTAAATGTCCCCTGGAGGACAAAA 52646074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCCAGTCATGGCAACCAAAAATATCTCTAGGCATTGCTAAATGTCCCCTGGAGGACAAAA 360

 52646075 TCTCTTACGTTTGAGAGGCACTGAGCTGAAATGTCTTTTTGAATCCAGATTATCTAATTT 52646134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCTCTTACGTTTGAGAGGCACTGAGCTGAAATGTCTTTTTGAATCCAGATTATCTAATTT 420

 52646135 TCTGTGCCTCAACTTTCTGGTAAAAGGAGACAGATAATAAATCTCGTAATTTTGTTAGGA 52646194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCTGTGCCTCAACTTTCTGGTAAAAGGAGACAGATAATAAATCTCGTAATTTTGTTAGGA 480

 52646195 AGATTACATGAGTTAATAGTTTTAAAGCAAGTACAATAGCACCTGGAATATATTAAGTGC 52646254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGATTACATGAGTTAATAGTTTTAAAGCAAGTACAATAGCACCTGGAATATATTAAGTGC 540

 52646255 TTAATAAATATCACAAACATTAGTTATCATTATTCATGAGTGAGAAAACTGACAGTCAGA 52646314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTAATAAATATCACAAACATTAGTTATCATTATTCATGAGTGAGAAAACTGACAGTCAGA 600

 52646315 GAGGTCAGTACACCCTCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCTAGTAAGCAGCAGAGTCTGGCTTC 52646374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GAGGTCAGTACACCCTCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCTAGTAAGCAGCAGAGTCTGGCTTC 660

 52646375 AGGCAGAAATCTGACTTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGTCTTACCAGGGACTTGTATTAGC 52646434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGGCAGAAATCTGACTTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGTCTTACCAGGGACTTGTATTAGC 720

 52646435 ATAGACTGTTAAGAATATGGGAAGATTTTTAAAATACAGTACTCAGAAAATTTCTCTTTG 52646494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATAGACTGTTAAGAATATGGGAAGATTTTTAAAATACAGTACTCAGAAAATTTCTCTTTG 780

 52646495 AAAGGCTGGAAGAGCAGATATCCACACAAGAAGGCAAATTAGACCTCAGGCCAGTGTGGA 52646554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAAGGCTGGAAGAGCAGATATCCACACAAGAAGGCAAATTAGACCTCAGGCCAGTGTGGA 840

 52646555 ATTAAAGGTGTAGGGTTATCTGGTCAAGACTGTGTGTGTGGATACAGGCTCCAACCCCTC 52646614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATTAAAGGTGTAGGGTTATCTGGTCAAGACTGTGTGTGTGGATACAGGCTCCAACCCCTC 900

 52646615 CAGGCAAGGGCACTGTTTCCAACATCCACCCTTTCTCCTTTGACCTCTACCTTGACCTAA 52646674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CAGGCAAGGGCACTGTTTCCAACATCCACCCTTTCTCCTTTGACCTCTACCTTGACCTAA 960

 52646675 ATTAACTATAAAAGGTCCTTCTTTTCTAGGACCCTACTATAAATCAGTGAAATATTCAGG 52646734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATTAACTATAAAAGGTCCTTCTTTTCTAGGACCCTACTATAAATCAGTGAAATATTCAGG 1020

 52646735 AAAAAAAGAACACCAAGAATGTTGGGATCCCAGTTAAAGATCAAGATTCTCTACTGATAA 52646794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AAAAAAAGAACACCAAGAATGTTGGGATCCCAGTTAAAGATCAAGATTCTCTACTGATAA 1080

 52646795 GCTGTGTGATATGGAGTAAATCACTAAAGATCTTTGAATCTCTTCATTTGTAAAATGGGA 52646854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GCTGTGTGATATGGAGTAAATCACTAAAGATCTTTGAATCTCTTCATTTGTAAAATGGGA 1140

 52646855 ATATTGGTAGTCCTACTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTAAAGAAGAAAAGTCATGCAAAGG 52646914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATATTGGTAGTCCTACTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTAAAGAAGAAAAGTCATGCAAAGG 1200

 52646915 ATCTGGCACAACGCCTTTTCCATAATAAGTGCTTAGTAATTGACAGATACTGTGATAACT 52646974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATCTGGCACAACGCCTTTTCCATAATAAGTGCTTAGTAATTGACAGATACTGTGATAACT 1260

 52646975 TTTCAGGTTTCTCTCATGCCTTTGACAACATTGCATTTTGCTTGCTCTATCTGTAGTCAG 52647034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTTCAGGTTTCTCTCATGCCTTTGACAACATTGCATTTTGCTTGCTCTATCTGTAGTCAG 1320

 52647035 ACACTTCTTAATATCTGTTTGCAGGAAGACAGAAAAATAAAGGGAAGAATTGAGATTTCT 52647094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ACACTTCTTAATATCTGTTTGCAGGAAGACAGAAAAATAAAGGGAAGAATTGAGATTTCT 1380

 52647095 TTGATCTATTCATACTGCTCATTAATATGTAGTGAGAAATACATACACACACACATACAC 52647154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTGATCTATTCATACTGCTCATTAATATGTAGTGAGAAATACATACACACACACATACAC 1440

 52647155 ACACATGCATCCATTAGCAATTGTTTTTGCCCAACTCTAGTGTCTCGCAGTGTCTAGACT 52647214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ACACATGCATCCATTAGCAATTGTTTTTGCCCAACTCTAGTGTCTCGCAGTGTCTAGACT 1500

 52647215 AAACAACAAACAAAAAAGGGGGGAGAGTGAGCTGGATTAAGCATTGAGGCACAGTGAAGA 52647274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AAACAACAAACAAAAAAGGGGGGAGAGTGAGCTGGATTAAGCATTGAGGCACAGTGAAGA 1560

 52647275 AATGGTCTGGGGCAAGCCCAGGGATGAATGTTAGGGGTTTCTCATAAACCTGAACCTGAA 52647334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AATGGTCTGGGGCAAGCCCAGGGATGAATGTTAGGGGTTTCTCATAAACCTGAACCTGAA 1620

 52647335 GAAAATCACCCTGCCAGCATATTGATCTTCTAGCTCTTCTTAACCTTTTTTTCTGTGATT 52647394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GAAAATCACCCTGCCAGCATATTGATCTTCTAGCTCTTCTTAACCTTTTTTTCTGTGATT 1680

 52647395 CAGGAATTCATAATGATAGAAAATATTATACTAAAGAAGAAAAAAAGAGGGAGAATAAGT 52647454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CAGGAATTCATAATGATAGAAAATATTATACTAAAGAAGAAAAAAAGAGGGAGAATAAGT 1740

 52647455 AAGTGATAGATGGATGCATCAGGGTGTAAAGTTAGCAAGTAAGGCTGTTGAAGTGTCAGA 52647514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AAGTGATAGATGGATGCATCAGGGTGTAAAGTTAGCAAGTAAGGCTGTTGAAGTGTCAGA 1800

 52647515 GTGAATATAAATGAATTGTGGGAATGGTCCATGCCAGGAGAAGAGGGTATGGTTGACAAA 52647574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GTGAATATAAATGAATTGTGGGAATGGTCCATGCCAGGAGAAGAGGGTATGGTTGACAAA 1860

 52647575 AAGGGAAATGCTAAGATTCAAAACAGGGAAGGGCTTTTCAAAATGCCAAGAGCACCAACT 52647634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AAGGGAAATGCTAAGATTCAAAACAGGGAAGGGCTTTTCAAAATGCCAAGAGCACCAACT 1920

 52647635 TATATCTTTCAGTTTAATTCCTCTCTTCCTTACCCACTGGCTGGAAAGCAAAGGAGCTAG 52647694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TATATCTTTCAGTTTAATTCCTCTCTTCCTTACCCACTGGCTGGAAAGCAAAGGAGCTAG 1980

EXCISED REGION

 52647696 GGTAAGTAAGAGTGTTATAGCCAGAGAAAAAGTCTTCAAAAAACACAAAGTACTTTCCAT 52647755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1982 GGTAAGTAAGAGTGTTATAGCCAGAGAAAAAGTCTTCAAAAAACACAAAGTACTTTCCAT 2041

 52647756 GGACAACCTTTTTTATTTTAAAGTGCCAATATGTTGCTTTGAAAAAGAATAAATTCCTTA 52647815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2042 GGACAACCTTTTTTATTTTAAAGTGCCAATATGTTGCTTTGAAAAAGAATAAATTCCTTA 2101

 52647816 CATCCAGGTATCTGGACTAGACTTCAGTGCATTTAGTGATTATAGCAAATCCAAACAGTA 52647875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2102 CATCCAGGTATCTGGACTAGACTTCAGTGCATTTAGTGATTATAGCAAATCCAAACAGTA 2161

 52647876 GCTTTTGATATCAGAGAATGGGTAAAGTGTTTTTGACAATTTCTAAGAACTTAGAGTTCT 52647935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2162 GCTTTTGATATCAGAGAATGGGTAAAGTGTTTTTGACAATTTCTAAGAACTTAGAGTTCT 2221

 52647936 TCGGTGATACGTTCCATGCAACTGAAGCTCTGCTCTCCAAATTTAGGTGGGTACATACCC 52647995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2222 TCGGTGATACGTTCCATGCAACTGAAGCTCTGCTCTCCAAATTTAGGTGGGTACATACCC 2281

 52647996 AAGTCCATCACCTGGGGCTTCTATTTCCTTTGCTCAGATGCTCACCTCCTAGGTGGGCAC 52648055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2282 AAGTCCATCACCTGGGGCTTCTATTTCCTTTGCTCAGATGCTCACCTCCTAGGTGGGCAC 2341

 52648056 CTGACATAAGATAGACTAATAAAAATAAGTCCTGTAACTTTTGATACTCCTATTAAAAAA 52648115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2342 CTGACATAAGATAGACTAATAAAAATAAGTCCTGTAACTTTTGATACTCCTATTAAAAAA 2401

 52648116 GAGTTGCAAACCAATAGGAGGTACACTTGAGAATCAGCACAAATGAAAGTAGAACCTGGA 52648175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2402 GAGTTGCAAACCAATAGGAGGTACACTTGAGAATCAGCACAAATGAAAGTAGAACCTGGA 2461

 52648176 AATCCAGGAAGCAGATACCCAATCATGTCATTTAAACATTTAGATCCAGCTGTGCCTGAA 52648235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2462 AATCCAGGAAGCAGATACCCAATCATGTCATTTAAACATTTAGATCCAGCTGTGCCTGAA 2521

 52648236 GCTGAACTTTAGCATTACATAAGCCAATAAATCACTCTTCCCCAACTTACGCCAGTTGAA 52648295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2522 GCTGAACTTTAGCATTACATAAGCCAATAAATCACTCTTCCCCAACTTACGCCAGTTGAA 2581

 52648296 ATTGAATACATACTCAGTGACTTTGAGAGAATTCCAGGGAATTGGTCAGTCCCTGTTTCA 52648355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2582 ATTGAATACATACTCAGTGACTTTGAGAGAATTCCAGGGAATTGGTCAGTCCCTGTTTCA 2641

 52648356 CTTGTAAATACACAGCAATCAAGCCTACCAAATCTATGATTGATTGGGGTGTCTGAAAGA 52648415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2642 CTTGTAAATACACAGCAATCAAGCCTACCAAATCTATGATTGATTGGGGTGTCTGAAAGA 2701

 52648416 GATGGAGGGAATGGAATCAACCTGAAAAACATATTTCAGGAGTTCATCCCTGAAAACTTC 52648475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2702 GATGGAGGGAATGGAATCAACCTGAAAAACATATTTCAGGAGTTCATCCCTGAAAACTTC 2761

 52648476 CCCAACCTAGCTAGAGGGGCCAACATTCAAATTCAGGAAATGCAGAGAACCCCAGTAAGA 52648535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2762 CCCAACCTAGCTAGAGGGGCCAACATTCAAATTCAGGAAATGCAGAGAACCCCAGTAAGA 2821

 52648536 TACTCCACAAAAAGATCTTCCCCAAGACATCATCATCAGATTCTCCAAAGTTGAAATGTA 52648595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2822 TACTCCACAAAAAGATCTTCCCCAAGACATCATCATCAGATTCTCCAAAGTTGAAATGTA 2881

 52648596 AGAAAAAATGCTAAAGGCAACTAGAGTGAAAGGCCCGGTCACCTAAAAAGGGAAGCACAG 52648655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2882 AGAAAAAATGCTAAAGGCAACTAGAGTGAAAGGCCCGGTCACCTAAAAAGGGAAGCACAG 2941

 52648656 ACTTACAGTGGACCTCTCACTGGTAACCCTACAAGCCAGAAGAGATTGAGGACCAATATT 52648715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2942 ACTTACAGTGGACCTCTCACTGGTAACCCTACAAGCCAGAAGAGATTGAGGACCAATATT 3001

 52648716 CAACATTCTTAAACAAAAAGAATTCCAACCCAGAATTTTATATCTGACTAAACTAAGCTT 52648775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3002 CAACATTCTTAAACAAAAAGAATTCCAACCCAGAATTTTATATCTGACTAAACTAAGCTT 3061

 52648776 CATAAGCAAAAGAGAAATAAGATCATTTTCAGACAAGCAAATGCTAAGGGAATTTGTGAC 52648835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3062 CATAAGCAAAAGAGAAATAAGATCATTTTCAGACAAGCAAATGCTAAGGGAATTTGTGAC 3121

 52648836 CATTAGACCTTCCTTGCAACAGTTCCTAAAGGAAGCACTAAATATGGAAAGACCATTACC 52648895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3122 CATTAGACCTTCCTTGCAACAGTTCCTAAAGGAAGCACTAAATATGGAAAGACCATTACC 3181

 52648896 AGACACTACAAAACACACTGAAGTACACAGACCAGTGACATTGTAAAGCAACTACATAAC 52648955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3182 AGACACTACAAAACACACTGAAGTACACAGACCAGTGACATTGTAAAGCAACTACATAAC 3241

 52648956 AAGTCTGCAAAATAACCAGCCAACATCATGATGACGGTATCAAATCGACACATAGCAACA 52649015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3242 AAGTCTGCAAAATAACCAGCCAACATCATGATGACGGTATCAAATCGACACATAGCAACA 3301

 52649016 CTAACCTTAAATGTAAATGGACTAAATGATCCCATTAAAAGACATAAAGTGGCAGGCTGG 52649075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3302 CTAACCTTAAATGTAAATGGACTAAATGATCCCATTAAAAGACATAAAGTGGCAGGCTGG 3361

 52649076 ATAAAGAACCAAGAACCATTGGTATACTGTCTTCAAGAGACCCATCTCCTATGCAGTGAC 52649135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3362 ATAAAGAACCAAGAACCATTGGTATACTGTCTTCAAGAGACCCATCTCCTATGCAGTGAC 3421

 52649136 ACACATAGGTTCAAGATAAAGGGATGGGGAAAAATCTACCAAGCAAATAGAAAACAGAAT 52649195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3422 ACACATAGGTTCAAGATAAAGGGATGGGGAAAAATCTACCAAGCAAATAGAAAACAGAAT 3481

 52649196 AAAACAGGGGTTGCAATCCTAGTTGCCGTCAAAACAGACTTTAAACCAACAAAGGTTAAA 52649255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3482 AAAACAGGGGTTGCAATCCTAGTTGCCGTCAAAACAGACTTTAAACCAACAAAGGTTAAA 3541

 52649256 AGAAAAAAATATGGGCATTGCATAAGGATAAAGTGTTAAATTAAACAAGAAGATCTAACT 52649315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3542 AGAAAAAAATATGGGCATTGCATAAGGATAAAGTGTTAAATTAAACAAGAAGATCTAACT 3601

 52649316 ATCCTAAGTATATATGCACCAAACACAGGAACACCCAGATTCATAAAGCAAGTTTATGGA 52649375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3602 ATCCTAAGTATATATGCACCAAACACAGGAACACCCAGATTCATAAAGCAAGTTTATGGA 3661

 52649376 GACCTTCAAACAGACTTAGACTCCCACACAATAGTAGTGGGAGACTTTAATACCCCATGA 52649435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3662 GACCTTCAAACAGACTTAGACTCCCACACAATAGTAGTGGGAGACTTTAATACCCCATGA 3721

 52649436 CAATATTAGACAGATCATTGAGACAGGAAATTAACAAAGATATTCAAGATCTAACTCAGC 52649495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3722 CAATATTAGACAGATCATTGAGACAGGAAATTAACAAAGATATTCAAGATCTAACTCAGC 3781

 52649496 ACTAAATCAAATGGCCCTGATAGATATCTACAGGACTGTCCTACTTGAAACCATACAATT 52649555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3782 ACTAAATCAAATGGCCCTGATAGATATCTACAGGACTGTCCTACTTGAAACCATACAATT 3841

 52649556 ACATGGTAATTGAATGACCTGCTCCTGAATGACTTTTGGGTAAATAATAAAATTAAGGCA 52649615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3842 ACATGGTAATTGAATGACCTGCTCCTGAATGACTTTTGGGTAAATAATAAAATTAAGGCA 3901

 52649616 GAAATCAAGAAGTTTTTTGAACTAATGAGAACAAAGATACAACATACCAGAA 52649667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3902 GAAATCAAGAAGTTTTTTGAACTAATGAGAACAAAGATACAACATACCAGAA 3953

Alignment time is 4.81927 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [52637064,52668002] =>     30939 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    2341] =>      2341 nucs 'mol-32-3004-370910_2341'

Score:        2297
Aligned:      2341        nucs
Identic:      2337 (100%) nucs =>      2010 (100%)       327 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [52645051,52647064] EXCISED REGION [52658003,52658329]
 second seq =>  [       1,    2014] EXCISED REGION [    2015,    2341]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>     10938 nucs [52647065,52658002]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         6 nucs [52647065,52647070] to [52658003,52658008]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [52647065,52647067] to [52658000,52658002]
 second seq =>         0 nucs

 52645051 GTCCAGCTTGAAGAATTTGTCAAAAAAGCTGGAGTCCTTGGGCTTGGAGGGAGCTTCTCC 52645110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTCCAGCTTGAAGAATTTGTCAAAAAAGCTGGAGTCCTTGGGCTTGGAGGGAGCTTCTCC 60

 52645111 TCCTGCTCCCCCTGTCTCAGGTGGGAGAAGCGTGGGATCCCTGGCGGCAGAGAGGACCTT 52645170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCCTGCTCCCCCTGTCTCAGGTGGGAGAAGCGTGGGATCCCTGGCGGCAGAGAGGACCTT 120

 52645171 GTCTTGGGCCGGGGCGTGCCCTGGGGTTTTATCTGTGTCCTGCCCCGGTCCAGCTGCCAC 52645230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTCTTGGGCCGGGGCGTGCCCTGGGGTTTTATCTGTGTCCTGCCCCGGTCCAGCTGCCAC 180

 52645231 CGGAAGTGTCCAGCTCTCACTTGGGTCTTTGTTCGCTGGAGCTTTATTGGAGCTGACATC 52645290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CGGAAGTGTCCAGCTCTCACTTGGGTCTTTGTTCGCTGGAGCTTTATTGGAGCTGACATC 240

 52645291 AAGCTTCACTGATCCAAGGGATGAATCTGCGGCTTGGTCTCCGGTACGTCCTGGTACAGG 52645350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAGCTTCACTGATCCAAGGGATGAATCTGCGGCTTGGTCTCCGGTACGTCCTGGTACAGG 300

 52645351 CCGAGAGAGCATCAAGAAAAAACGAGATTTAGCAGCTGGTGCCTCGGGTTTGGCCTCTTT 52645410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCGAGAGAGCATCAAGAAAAAACGAGATTTAGCAGCTGGTGCCTCGGGTTTGGCCTCTTT 360

 52645411 CCCAAGATTCTTTCCGTTGGCATCCGCAACAGCACTTATCTCCGTTGTCTCGGGGGAAGA 52645470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CCCAAGATTCTTTCCGTTGGCATCCGCAACAGCACTTATCTCCGTTGTCTCGGGGGAAGA 420

 52645471 AGTGGCCACATTATCCGTCTTGACACTTATTCCCAAGTCGACTGTAAACACAAACATAAA 52645530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGTGGCCACATTATCCGTCTTGACACTTATTCCCAAGTCGACTGTAAACACAAACATAAA 480

 52645531 CAGTGGTTATTCAGCCAAGCCGGGAAATTCAGGCACTAATAATGGACTCCAGACATTTTT 52645590
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CAGCGGTTATTCAGCCAAGCCGGGAAATTCAGGCACTAATAATGGACTCCAGACATTTTT 540

 52645591 TATACAAAAGCCATACTGCATACTGGAACTGTGTTGTTCTCTGGTCATTCTGAAAGGCAG 52645650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TATACAAAAGCCATACTGCATACTGGAACTGTGTTGTTCTCTGGTCATTCTGAAAGGCAG 600

 52645651 AAGTTAGCTCTCTACATCTCCTTGGACCCTGCTTTTCTTGGGAGAGGAGAAGGCAAGGTT 52645710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAGTTAGCTCTCTACATCTCCTTGGACCCTGCTTTTCTTGGGAGAGGAGAAGGCAAGGTT 660

 52645711 GGTGAGGAGGGAAAGCTACTTAATGGAAAGTCACTAGCTGCCAGGTGTGGAATGAGTGAT 52645770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGTGAGGAGGGAAAGCTACTTAATGGAAAGTCACTAGCTGCCAGGTGTGGAATGAGTGAT 720

 52645771 ATTCAATGTTAATTAATCTTCTTTTATCTGTGTAAGAACTCCGTGAGCAGCATATTGTCA 52645830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATTCAATGTTAATTAATCTTCTTTTATCTGTGTAAGAACTCCGTGAGCAGCATATTGTCA 780

 52645831 TGATGTCAACTGGGAGGCAGTACAGCAGTTAGGAGCTTGGGTTCTGGAGCTAGAACAAGG 52645890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGATGTCAACTGGGAGGCAGTACAGCAGTTAGGAGCTTGGGTTCTGGAGCTAGAACAAGG 840

 52645891 TTTCTCAACCTCAGCACTACTCACATTTGAAGCCAGATTATTCTTTGTTAGGGAGGCTCA 52645950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTTCTCAACCTCAGCACTACTCACATTTGAAGCCAGATTATTCTTTGTTAGGGAGGCTCA 900

 52645951 TCCCGTGCCTCATAGGCTGATTAGCAGCATCCTGGCCTCTGCCCACTAGACGCCGGTCAC 52646010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TCCCGTGCCTCATAGGCTGATTAGCAGCATCCTGGCCTCTGCCCACTAGACGCCGGTCAC 960

 52646011 ATTTCCCAGTCATGGCAACCAAAAATATCTCTAGGCATTGCTAAATGTCCCCTGGAGGAC 52646070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATTTCCCAGTCATGGCAACCAAAAATATCTCTAGGCATTGCTAAATGTCCCCTGGAGGAC 1020

 52646071 AAAATCTCTTACGTTTGAGAGGCACTGAGCTGAAATGTCTTTTTGAATCCAGATTATCTA 52646130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AAAATCTCTTACGTTTGAGAGGCACTGAGCTGAAATGTCTTTTTGAATCCAGATTATCTA 1080

 52646131 ATTTTCTGTGCCTCAACTTTCTGGTAAAAGGAGACAGATAATAAATCTCGTAATTTTGTT 52646190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATTTTCTGTGCCTCAACTTTCTGGTAAAAGGAGACAGATAATAAATCTCGTAATTTTGTT 1140

 52646191 AGGAAGATTACATGAGTTAATAGTTTTAAAGCAAGTACAATAGCACCTGGAATATATTAA 52646250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     1141 AGGAAGATTACATGAGTTAATAGTTTTAAAGCAAGTACAATAGCGCCTGGAATATATTAA 1200

 52646251 GTGCTTAATAAATATCACAAACATTAGTTATCATTATTCATGAGTGAGAAAACTGACAGT 52646310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GTGCTTAATAAATATCACAAACATTAGTTATCATTATTCATGAGTGAGAAAACTGACAGT 1260

 52646311 CAGAGAGGTCAGTACACCCTCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCTAGTAAGCAGCAGAGTCTGG 52646370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CAGAGAGGTCAGTACACCCTCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCTAGTAAGCAGCAGAGTCTGG 1320

 52646371 CTTCAGGCAGAAATCTGACTTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGTCTTACCAGGGACTTGTAT 52646430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CTTCAGGCAGAAATCTGACTTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGTCTTACCAGGGACTTGTAT 1380

 52646431 TAGCATAGACTGTTAAGAATATGGGAAGATTTTTAAAATACAGTACTCAGAAAATTTCTC 52646490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TAGCATAGACTGTTAAGAATATGGGAAGATTTTTAAAATACAGTACTCAGAAAATTTCTC 1440

 52646491 TTTGAAAGGCTGGAAGAGCAGATATCCACACAAGAAGGCAAATTAGACCTCAGGCCAGTG 52646550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTTGAAAGGCTGGAAGAGCAGATATCCACACAAGAAGGCAAATTAGACCTCAGGCCAGTG 1500

 52646551 TGGAATTAAAGGTGTAGGGTTATCTGGTCAAGACTGTGTGTGTGGATACAGGCTCCAACC 52646610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TGGAATTAAAGGTGTAGGGTTATCTGGTCAAGACTGTGTGTGTGGATACAGGCTCCAACC 1560

 52646611 CCTCCAGGCAAGGGCACTGTTTCCAACATCCACCCTTTCTCCTTTGACCTCTACCTTGAC 52646670
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CCTCCAGGCAAGGGCAATGTTTCCAACATCCACCCTTTCTCCTTTGACCTCTACCTTGAC 1620

 52646671 CTAAATTAACTATAAAAGGTCCTTCTTTTCTAGGACCCTACTATAAATCAGTGAAATATT 52646730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CTAAATTAACTATAAAAGGTCCTTCTTTTCTAGGACCCTACTATAAATCAGTGAAATATT 1680

 52646731 CAGGAAAAAAAGAACACCAAGAATGTTGGGATCCCAGTTAAAGATCAAGATTCTCTACTG 52646790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CAGGAAAAAAAGAACACCAAGAATGTTGGGATCCCAGTTAAAGATCAAGATTCTCTACTG 1740

 52646791 ATAAGCTGTGTGATATGGAGTAAATCACTAAAGATCTTTGAATCTCTTCATTTGTAAAAT 52646850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ATAAGCTGTGTGATATGGAGTAAATCACTAAAGATCTTTGAATCTCTTCATTTGTAAAAT 1800

 52646851 GGGAATATTGGTAGTCCTACTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTAAAGAAGAAAAGTCATGCA 52646910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GGGAATATTGGTAGTCCTACTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTAAAGAAGAAAAGTCATGCA 1860

 52646911 AAGGATCTGGCACAACGCCTTTTCCATAATAAGTGCTTAGTAATTGACAGATACTGTGAT 52646970
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AAGGATCTGGCACAATGCCTTTTCCATAATAAGTGCTTAGTAATTGACAGATACTGTGAT 1920

 52646971 AACTTTTCAGGTTTCTCTCATGCCTTTGACAACATTGCATTTTGCTTGCTCTATCTGTAG 52647030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AACTTTTCAGGTTTCTCTCATGCCTTTGACAACATTGCATTTTGCTTGCTCTATCTGTAG 1980

 52647031 TCAGACACTTCTTAATATCTGTTTGCAGGAAGAC 52647064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TCAGACACTTCTTAATATCTGTTTGCAGGAAGAC 2014

EXCISED REGION

 52658003 AGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTG 52658062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2015 AGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTG 2074

 52658063 GCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTAT 52658122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2075 GCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTAT 2134

 52658123 AAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGG 52658182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2135 AAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGG 2194

 52658183 GAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTG 52658242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2195 GAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTG 2254

 52658243 AAACACTGTCTCTGCTAAAAAACAAAACAAAACAAAACACCAAAAAATAGCTGGGCGTAG 52658302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2255 AAACACTGTCTCTGCTAAAAAACAAAACAAAACAAAACACCAAAAAATAGCTGGGCGTAG 2314

 52658303 TGGCGGGCGCCTGTAATCTCAGCTACT 52658329
          |||||||||||||||||||||||||||
     2315 TGGCGGGCGCCTGTAATCTCAGCTACT 2341

Alignment time is 3.62288 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [52637064,52668002] =>     30939 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,   10092] =>     10092 nucs 'mol-32-300f-083487_10092'

Score:       10081
Aligned:     10092        nucs
Identic:     10091 (100%) nucs =>      6364 (100%)      3727 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [52645576,52651939] EXCISED REGION [52651944,52655670]
 second seq =>  [       1,    6365] EXCISED REGION [    6366,   10092]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         4 nucs [52651940,52651943]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        16 nucs [52651940,52651955] to [52651944,52651959]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [52651940,52651941] to [52651942,52651943]
 second seq =>         0 nucs

 52645576 ACTCCAGACATTTTTTATACAAAAGCCATACTGCATACTGGAACTGTGTTGTTCTCTGGT 52645635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACTCCAGACATTTTTTATACAAAAGCCATACTGCATACTGGAACTGTGTTGTTCTCTGGT 60

 52645636 CATTCTGAAAGGCAGAAGTTAGCTCTCTACATCTCCTTGGACCCTGCTTTTCTTGGGAGA 52645695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CATTCTGAAAGGCAGAAGTTAGCTCTCTACATCTCCTTGGACCCTGCTTTTCTTGGGAGA 120

 52645696 GGAGAAGGCAAGGTTGGTGAGGAGGGAAAGCTACTTAATGGAAAGTCACTAGCTGCCAGG 52645755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGAGAAGGCAAGGTTGGTGAGGAGGGAAAGCTACTTAATGGAAAGTCACTAGCTGCCAGG 180

 52645756 TGTGGAATGAGTGATATTCAATGTTAATTAATCTTCTTTTATCTGTGTAAGAACTCCGTG 52645815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGTGGAATGAGTGATATTCAATGTTAATTAATCTTCTTTTATCTGTGTAAGAACTCCGTG 240

 52645816 AGCAGCATATTGTCATGATGTCAACTGGGAGGCAGTACAGCAGTTAGGAGCTTGGGTTCT 52645875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGCAGCATATTGTCATGATGTCAACTGGGAGGCAGTACAGCAGTTAGGAGCTTGGGTTCT 300

 52645876 GGAGCTAGAACAAGGTTTCTCAACCTCAGCACTACTCACATTTGAAGCCAGATTATTCTT 52645935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GGAGCTAGAACAAGGTTTCTCAACCTCAGCACTACTCACATTTGAAGCCAGATTATTCTT 360

 52645936 TGTTAGGGAGGCTCATCCCGTGCCTCATAGGCTGATTAGCAGCATCCTGGCCTCTGCCCA 52645995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGTTAGGGAGGCTCATCCCGTGCCTCATAGGCTGATTAGCAGCATCCTGGCCTCTGCCCA 420

 52645996 CTAGACGCCGGTCACATTTCCCAGTCATGGCAACCAAAAATATCTCTAGGCATTGCTAAA 52646055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTAGACGCCGGTCACATTTCCCAGTCATGGCAACCAAAAATATCTCTAGGCATTGCTAAA 480

 52646056 TGTCCCCTGGAGGACAAAATCTCTTACGTTTGAGAGGCACTGAGCTGAAATGTCTTTTTG 52646115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGTCCCCTGGAGGACAAAATCTCTTACGTTTGAGAGGCACTGAGCTGAAATGTCTTTTTG 540

 52646116 AATCCAGATTATCTAATTTTCTGTGCCTCAACTTTCTGGTAAAAGGAGACAGATAATAAA 52646175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AATCCAGATTATCTAATTTTCTGTGCCTCAACTTTCTGGTAAAAGGAGACAGATAATAAA 600

 52646176 TCTCGTAATTTTGTTAGGAAGATTACATGAGTTAATAGTTTTAAAGCAAGTACAATAGCA 52646235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCTCGTAATTTTGTTAGGAAGATTACATGAGTTAATAGTTTTAAAGCAAGTACAATAGCA 660

 52646236 CCTGGAATATATTAAGTGCTTAATAAATATCACAAACATTAGTTATCATTATTCATGAGT 52646295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCTGGAATATATTAAGTGCTTAATAAATATCACAAACATTAGTTATCATTATTCATGAGT 720

 52646296 GAGAAAACTGACAGTCAGAGAGGTCAGTACACCCTCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCTAGTA 52646355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GAGAAAACTGACAGTCAGAGAGGTCAGTACACCCTCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCTAGTA 780

 52646356 AGCAGCAGAGTCTGGCTTCAGGCAGAAATCTGACTTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGTCTT 52646415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGCAGCAGAGTCTGGCTTCAGGCAGAAATCTGACTTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGTCTT 840

 52646416 ACCAGGGACTTGTATTAGCATAGACTGTTAAGAATATGGGAAGATTTTTAAAATACAGTA 52646475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ACCAGGGACTTGTATTAGCATAGACTGTTAAGAATATGGGAAGATTTTTAAAATACAGTA 900

 52646476 CTCAGAAAATTTCTCTTTGAAAGGCTGGAAGAGCAGATATCCACACAAGAAGGCAAATTA 52646535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTCAGAAAATTTCTCTTTGAAAGGCTGGAAGAGCAGATATCCACACAAGAAGGCAAATTA 960

 52646536 GACCTCAGGCCAGTGTGGAATTAAAGGTGTAGGGTTATCTGGTCAAGACTGTGTGTGTGG 52646595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GACCTCAGGCCAGTGTGGAATTAAAGGTGTAGGGTTATCTGGTCAAGACTGTGTGTGTGG 1020

 52646596 ATACAGGCTCCAACCCCTCCAGGCAAGGGCACTGTTTCCAACATCCACCCTTTCTCCTTT 52646655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATACAGGCTCCAACCCCTCCAGGCAAGGGCACTGTTTCCAACATCCACCCTTTCTCCTTT 1080

 52646656 GACCTCTACCTTGACCTAAATTAACTATAAAAGGTCCTTCTTTTCTAGGACCCTACTATA 52646715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GACCTCTACCTTGACCTAAATTAACTATAAAAGGTCCTTCTTTTCTAGGACCCTACTATA 1140

 52646716 AATCAGTGAAATATTCAGGAAAAAAAGAACACCAAGAATGTTGGGATCCCAGTTAAAGAT 52646775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AATCAGTGAAATATTCAGGAAAAAAAGAACACCAAGAATGTTGGGATCCCAGTTAAAGAT 1200

 52646776 CAAGATTCTCTACTGATAAGCTGTGTGATATGGAGTAAATCACTAAAGATCTTTGAATCT 52646835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CAAGATTCTCTACTGATAAGCTGTGTGATATGGAGTAAATCACTAAAGATCTTTGAATCT 1260

 52646836 CTTCATTTGTAAAATGGGAATATTGGTAGTCCTACTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTAAAG 52646895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTTCATTTGTAAAATGGGAATATTGGTAGTCCTACTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTAAAG 1320

 52646896 AAGAAAAGTCATGCAAAGGATCTGGCACAACGCCTTTTCCATAATAAGTGCTTAGTAATT 52646955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AAGAAAAGTCATGCAAAGGATCTGGCACAACGCCTTTTCCATAATAAGTGCTTAGTAATT 1380

 52646956 GACAGATACTGTGATAACTTTTCAGGTTTCTCTCATGCCTTTGACAACATTGCATTTTGC 52647015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GACAGATACTGTGATAACTTTTCAGGTTTCTCTCATGCCTTTGACAACATTGCATTTTGC 1440

 52647016 TTGCTCTATCTGTAGTCAGACACTTCTTAATATCTGTTTGCAGGAAGACAGAAAAATAAA 52647075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTGCTCTATCTGTAGTCAGACACTTCTTAATATCTGTTTGCAGGAAGACAGAAAAATAAA 1500

 52647076 GGGAAGAATTGAGATTTCTTTGATCTATTCATACTGCTCATTAATATGTAGTGAGAAATA 52647135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GGGAAGAATTGAGATTTCTTTGATCTATTCATACTGCTCATTAATATGTAGTGAGAAATA 1560

 52647136 CATACACACACACATACACACACATGCATCCATTAGCAATTGTTTTTGCCCAACTCTAGT 52647195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CATACACACACACATACACACACATGCATCCATTAGCAATTGTTTTTGCCCAACTCTAGT 1620

 52647196 GTCTCGCAGTGTCTAGACTAAACAACAAACAAAAAAGGGGGGAGAGTGAGCTGGATTAAG 52647255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GTCTCGCAGTGTCTAGACTAAACAACAAACAAAAAAGGGGGGAGAGTGAGCTGGATTAAG 1680

 52647256 CATTGAGGCACAGTGAAGAAATGGTCTGGGGCAAGCCCAGGGATGAATGTTAGGGGTTTC 52647315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CATTGAGGCACAGTGAAGAAATGGTCTGGGGCAAGCCCAGGGATGAATGTTAGGGGTTTC 1740

 52647316 TCATAAACCTGAACCTGAAGAAAATCACCCTGCCAGCATATTGATCTTCTAGCTCTTCTT 52647375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TCATAAACCTGAACCTGAAGAAAATCACCCTGCCAGCATATTGATCTTCTAGCTCTTCTT 1800

 52647376 AACCTTTTTTTCTGTGATTCAGGAATTCATAATGATAGAAAATATTATACTAAAGAAGAA 52647435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AACCTTTTTTTCTGTGATTCAGGAATTCATAATGATAGAAAATATTATACTAAAGAAGAA 1860

 52647436 AAAAAGAGGGAGAATAAGTAAGTGATAGATGGATGCATCAGGGTGTAAAGTTAGCAAGTA 52647495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AAAAAGAGGGAGAATAAGTAAGTGATAGATGGATGCATCAGGGTGTAAAGTTAGCAAGTA 1920

 52647496 AGGCTGTTGAAGTGTCAGAGTGAATATAAATGAATTGTGGGAATGGTCCATGCCAGGAGA 52647555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AGGCTGTTGAAGTGTCAGAGTGAATATAAATGAATTGTGGGAATGGTCCATGCCAGGAGA 1980

 52647556 AGAGGGTATGGTTGACAAAAAGGGAAATGCTAAGATTCAAAACAGGGAAGGGCTTTTCAA 52647615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AGAGGGTATGGTTGACAAAAAGGGAAATGCTAAGATTCAAAACAGGGAAGGGCTTTTCAA 2040

 52647616 AATGCCAAGAGCACCAACTTATATCTTTCAGTTTAATTCCTCTCTTCCTTACCCACTGGC 52647675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AATGCCAAGAGCACCAACTTATATCTTTCAGTTTAATTCCTCTCTTCCTTACCCACTGGC 2100

 52647676 TGGAAAGCAAAGGAGCTAGTGGTAAGTAAGAGTGTTATAGCCAGAGAAAAAGTCTTCAAA 52647735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TGGAAAGCAAAGGAGCTAGTGGTAAGTAAGAGTGTTATAGCCAGAGAAAAAGTCTTCAAA 2160

 52647736 AAACACAAAGTACTTTCCATGGACAACCTTTTTTATTTTAAAGTGCCAATATGTTGCTTT 52647795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AAACACAAAGTACTTTCCATGGACAACCTTTTTTATTTTAAAGTGCCAATATGTTGCTTT 2220

 52647796 GAAAAAGAATAAATTCCTTACATCCAGGTATCTGGACTAGACTTCAGTGCATTTAGTGAT 52647855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GAAAAAGAATAAATTCCTTACATCCAGGTATCTGGACTAGACTTCAGTGCATTTAGTGAT 2280

 52647856 TATAGCAAATCCAAACAGTAGCTTTTGATATCAGAGAATGGGTAAAGTGTTTTTGACAAT 52647915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TATAGCAAATCCAAACAGTAGCTTTTGATATCAGAGAATGGGTAAAGTGTTTTTGACAAT 2340

 52647916 TTCTAAGAACTTAGAGTTCTTCGGTGATACGTTCCATGCAACTGAAGCTCTGCTCTCCAA 52647975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TTCTAAGAACTTAGAGTTCTTCGGTGATACGTTCCATGCAACTGAAGCTCTGCTCTCCAA 2400

 52647976 ATTTAGGTGGGTACATACCCAAGTCCATCACCTGGGGCTTCTATTTCCTTTGCTCAGATG 52648035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ATTTAGGTGGGTACATACCCAAGTCCATCACCTGGGGCTTCTATTTCCTTTGCTCAGATG 2460

 52648036 CTCACCTCCTAGGTGGGCACCTGACATAAGATAGACTAATAAAAATAAGTCCTGTAACTT 52648095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CTCACCTCCTAGGTGGGCACCTGACATAAGATAGACTAATAAAAATAAGTCCTGTAACTT 2520

 52648096 TTGATACTCCTATTAAAAAAGAGTTGCAAACCAATAGGAGGTACACTTGAGAATCAGCAC 52648155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TTGATACTCCTATTAAAAAAGAGTTGCAAACCAATAGGAGGTACACTTGAGAATCAGCAC 2580

 52648156 AAATGAAAGTAGAACCTGGAAATCCAGGAAGCAGATACCCAATCATGTCATTTAAACATT 52648215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AAATGAAAGTAGAACCTGGAAATCCAGGAAGCAGATACCCAATCATGTCATTTAAACATT 2640

 52648216 TAGATCCAGCTGTGCCTGAAGCTGAACTTTAGCATTACATAAGCCAATAAATCACTCTTC 52648275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TAGATCCAGCTGTGCCTGAAGCTGAACTTTAGCATTACATAAGCCAATAAATCACTCTTC 2700

 52648276 CCCAACTTACGCCAGTTGAAATTGAATACATACTCAGTGACTTTGAGAGAATTCCAGGGA 52648335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CCCAACTTACGCCAGTTGAAATTGAATACATACTCAGTGACTTTGAGAGAATTCCAGGGA 2760

 52648336 ATTGGTCAGTCCCTGTTTCACTTGTAAATACACAGCAATCAAGCCTACCAAATCTATGAT 52648395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 ATTGGTCAGTCCCTGTTTCACTTGTAAATACACAGCAATCAAGCCTACCAAATCTATGAT 2820

 52648396 TGATTGGGGTGTCTGAAAGAGATGGAGGGAATGGAATCAACCTGAAAAACATATTTCAGG 52648455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TGATTGGGGTGTCTGAAAGAGATGGAGGGAATGGAATCAACCTGAAAAACATATTTCAGG 2880

 52648456 AGTTCATCCCTGAAAACTTCCCCAACCTAGCTAGAGGGGCCAACATTCAAATTCAGGAAA 52648515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 AGTTCATCCCTGAAAACTTCCCCAACCTAGCTAGAGGGGCCAACATTCAAATTCAGGAAA 2940

 52648516 TGCAGAGAACCCCAGTAAGATACTCCACAAAAAGATCTTCCCCAAGACATCATCATCAGA 52648575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TGCAGAGAACCCCAGTAAGATACTCCACAAAAAGATCTTCCCCAAGACATCATCATCAGA 3000

 52648576 TTCTCCAAAGTTGAAATGTAAGAAAAAATGCTAAAGGCAACTAGAGTGAAAGGCCCGGTC 52648635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TTCTCCAAAGTTGAAATGTAAGAAAAAATGCTAAAGGCAACTAGAGTGAAAGGCCCGGTC 3060

 52648636 ACCTAAAAAGGGAAGCACAGACTTACAGTGGACCTCTCACTGGTAACCCTACAAGCCAGA 52648695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 ACCTAAAAAGGGAAGCACAGACTTACAGTGGACCTCTCACTGGTAACCCTACAAGCCAGA 3120

 52648696 AGAGATTGAGGACCAATATTCAACATTCTTAAACAAAAAGAATTCCAACCCAGAATTTTA 52648755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 AGAGATTGAGGACCAATATTCAACATTCTTAAACAAAAAGAATTCCAACCCAGAATTTTA 3180

 52648756 TATCTGACTAAACTAAGCTTCATAAGCAAAAGAGAAATAAGATCATTTTCAGACAAGCAA 52648815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TATCTGACTAAACTAAGCTTCATAAGCAAAAGAGAAATAAGATCATTTTCAGACAAGCAA 3240

 52648816 ATGCTAAGGGAATTTGTGACCATTAGACCTTCCTTGCAACAGTTCCTAAAGGAAGCACTA 52648875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 ATGCTAAGGGAATTTGTGACCATTAGACCTTCCTTGCAACAGTTCCTAAAGGAAGCACTA 3300

 52648876 AATATGGAAAGACCATTACCAGACACTACAAAACACACTGAAGTACACAGACCAGTGACA 52648935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 AATATGGAAAGACCATTACCAGACACTACAAAACACACTGAAGTACACAGACCAGTGACA 3360

 52648936 TTGTAAAGCAACTACATAACAAGTCTGCAAAATAACCAGCCAACATCATGATGACGGTAT 52648995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TTGTAAAGCAACTACATAACAAGTCTGCAAAATAACCAGCCAACATCATGATGACGGTAT 3420

 52648996 CAAATCGACACATAGCAACACTAACCTTAAATGTAAATGGACTAAATGATCCCATTAAAA 52649055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 CAAATCGACACATAGCAACACTAACCTTAAATGTAAATGGACTAAATGATCCCATTAAAA 3480

 52649056 GACATAAAGTGGCAGGCTGGATAAAGAACCAAGAACCATTGGTATACTGTCTTCAAGAGA 52649115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 GACATAAAGTGGCAGGCTGGATAAAGAACCAAGAACCATTGGTATACTGTCTTCAAGAGA 3540

 52649116 CCCATCTCCTATGCAGTGACACACATAGGTTCAAGATAAAGGGATGGGGAAAAATCTACC 52649175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 CCCATCTCCTATGCAGTGACACACATAGGTTCAAGATAAAGGGATGGGGAAAAATCTACC 3600

 52649176 AAGCAAATAGAAAACAGAATAAAACAGGGGTTGCAATCCTAGTTGCCGTCAAAACAGACT 52649235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 AAGCAAATAGAAAACAGAATAAAACAGGGGTTGCAATCCTAGTTGCCGTCAAAACAGACT 3660

 52649236 TTAAACCAACAAAGGTTAAAAGAAAAAAATATGGGCATTGCATAAGGATAAAGTGTTAAA 52649295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 TTAAACCAACAAAGGTTAAAAGAAAAAAATATGGGCATTGCATAAGGATAAAGTGTTAAA 3720

 52649296 TTAAACAAGAAGATCTAACTATCCTAAGTATATATGCACCAAACACAGGAACACCCAGAT 52649355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 TTAAACAAGAAGATCTAACTATCCTAAGTATATATGCACCAAACACAGGAACACCCAGAT 3780

 52649356 TCATAAAGCAAGTTTATGGAGACCTTCAAACAGACTTAGACTCCCACACAATAGTAGTGG 52649415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 TCATAAAGCAAGTTTATGGAGACCTTCAAACAGACTTAGACTCCCACACAATAGTAGTGG 3840

 52649416 GAGACTTTAATACCCCATGACAATATTAGACAGATCATTGAGACAGGAAATTAACAAAGA 52649475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 GAGACTTTAATACCCCATGACAATATTAGACAGATCATTGAGACAGGAAATTAACAAAGA 3900

 52649476 TATTCAAGATCTAACTCAGCACTAAATCAAATGGCCCTGATAGATATCTACAGGACTGTC 52649535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 TATTCAAGATCTAACTCAGCACTAAATCAAATGGCCCTGATAGATATCTACAGGACTGTC 3960

 52649536 CTACTTGAAACCATACAATTACATGGTAATTGAATGACCTGCTCCTGAATGACTTTTGGG 52649595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 CTACTTGAAACCATACAATTACATGGTAATTGAATGACCTGCTCCTGAATGACTTTTGGG 4020

 52649596 TAAATAATAAAATTAAGGCAGAAATCAAGAAGTTTTTTGAACTAATGAGAACAAAGATAC 52649655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 TAAATAATAAAATTAAGGCAGAAATCAAGAAGTTTTTTGAACTAATGAGAACAAAGATAC 4080

 52649656 AACATACCAGAATCTTTGGGACACAGCTAAGGCAGTGTTAAGAGGGAAATTTATAGCACT 52649715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 AACATACCAGAATCTTTGGGACACAGCTAAGGCAGTGTTAAGAGGGAAATTTATAGCACT 4140

 52649716 AAATCCCACATCAAAAAGTTAGAAAGAGCTCACGTTAACAATCTAACCTCACAACTACAG 52649775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 AAATCCCACATCAAAAAGTTAGAAAGAGCTCACGTTAACAATCTAACCTCACAACTACAG 4200

 52649776 GAACTAGAGAACTGAGAGCAGAAAAACCTGAAAGCTAGCAGAAGACAAGAAATAACCAAA 52649835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 GAACTAGAGAACTGAGAGCAGAAAAACCTGAAAGCTAGCAGAAGACAAGAAATAACCAAA 4260

 52649836 ATTAGAGCTGAACTGAAGGAGATTGAGACATGAAAAACCATTCAAAAGATCAGTGAATTC 52649895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 ATTAGAGCTGAACTGAAGGAGATTGAGACATGAAAAACCATTCAAAAGATCAGTGAATTC 4320

 52649896 AGGAGCTGTTTTTTTTTT-GAACAAATTAATAAAATAGACCATTAGCTAGAGTAATAAAC 52649954
          |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 AGGAGCTGTTTTTTTTTTTGAACAAATTAATAAAATAGACCATTAGCTAGAGTAATAAAC 4380

 52649955 AAGAAAATAGAAAAGATTCAAATAAACACAATCAGAAACGACAAGGGGGATATTACCACT 52650014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 AAGAAAATAGAAAAGATTCAAATAAACACAATCAGAAACGACAAGGGGGATATTACCACT 4440

 52650015 GACCCCACAGAAGTACAAACAACCATCAGAGAATATTATGAACATCTCTATGCACATAAA 52650074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 GACCCCACAGAAGTACAAACAACCATCAGAGAATATTATGAACATCTCTATGCACATAAA 4500

 52650075 CTAGAAAATCTAGAAGAAGTGGATAAACTTCTGGACATATACACCCTTCTAAGACTGTAC 52650134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 CTAGAAAATCTAGAAGAAGTGGATAAACTTCTGGACATATACACCCTTCTAAGACTGTAC 4560

 52650135 CAGGAAGAAATTGAATCCCTGAACAGACCAATAATGAGCCCTAAAATTGAGGAAGTAATA 52650194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 CAGGAAGAAATTGAATCCCTGAACAGACCAATAATGAGCCCTAAAATTGAGGAAGTAATA 4620

 52650195 CATAGACTACCAACCATAAAAAAACCCAGTACTAGATGGATTCACAGGTAAGTTCTACCA 52650254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 CATAGACTACCAACCATAAAAAAACCCAGTACTAGATGGATTCACAGGTAAGTTCTACCA 4680

 52650255 GTTGTACAAAGAAGAGCTGGTACAGTTCCTACTGAAATTATTCCAAAAAGTTGAGTAGGA 52650314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 GTTGTACAAAGAAGAGCTGGTACAGTTCCTACTGAAATTATTCCAAAAAGTTGAGTAGGA 4740

 52650315 GGGAGTCCTTCCTAACTCATTTGATGAGGCCAGCATCATCCTGATATCAAAACCTGGCAG 52650374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 GGGAGTCCTTCCTAACTCATTTGATGAGGCCAGCATCATCCTGATATCAAAACCTGGCAG 4800

 52650375 ATATACAACAAGAAAAGCTTCAGGCCAATATCCTTGATGAACTTCAATGCAAAAATCCTC 52650434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 ATATACAACAAGAAAAGCTTCAGGCCAATATCCTTGATGAACTTCAATGCAAAAATCCTC 4860

 52650435 AATAAAATACTGGCAAACTGAATCCAGCAGCACACCAAAAAGCTTATCCACCATGATCAA 52650494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 AATAAAATACTGGCAAACTGAATCCAGCAGCACACCAAAAAGCTTATCCACCATGATCAA 4920

 52650495 GTAGAATGCAAGTTGGTTCAACATATACAAATCAATAAATGTGACTCATCACATAAACAG 52650554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 GTAGAATGCAAGTTGGTTCAACATATACAAATCAATAAATGTGACTCATCACATAAACAG 4980

 52650555 AACTAAAGACAAAAACTACATGATTATCTCAACAGATGCAGAAAAGGCTTTCAATAAAAT 52650614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 AACTAAAGACAAAAACTACATGATTATCTCAACAGATGCAGAAAAGGCTTTCAATAAAAT 5040

 52650615 TAGACATCCATTTATGTTAAAAACTCTCAATAAACTAGGTATTGAAGGAACATACCTCAA 52650674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 TAGACATCCATTTATGTTAAAAACTCTCAATAAACTAGGTATTGAAGGAACATACCTCAA 5100

 52650675 AATAATAAGAGCCATGTATGACAAACCCACAGCTAAGATCATACTGAATGGGCAAAAGCT 52650734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 AATAATAAGAGCCATGTATGACAAACCCACAGCTAAGATCATACTGAATGGGCAAAAGCT 5160

 52650735 GGAAGCATTTTCTTTGAAGACTGGCATAAGACAAGGATGATCTCTCTCACCACTCCTATT 52650794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 GGAAGCATTTTCTTTGAAGACTGGCATAAGACAAGGATGATCTCTCTCACCACTCCTATT 5220

 52650795 CAACATAGTATTGGAAGTCTTGGCCAGGGCAATCGGGCAAGAGAAATAAATAAAGCGCAT 52650854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 CAACATAGTATTGGAAGTCTTGGCCAGGGCAATCGGGCAAGAGAAATAAATAAAGCGCAT 5280

 52650855 CCAAATAGGAAGAGAGGAAGTCAAACTATCCTTGTTTGCAGATTACATGACATTATATCT 52650914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 CCAAATAGGAAGAGAGGAAGTCAAACTATCCTTGTTTGCAGATTACATGACATTATATCT 5340

 52650915 AGAAAACCCCATAGTCTCAGCCCCAAAGCTTCTTAAGCTGATAAACAACTTCAGCAAAGT 52650974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 AGAAAACCCCATAGTCTCAGCCCCAAAGCTTCTTAAGCTGATAAACAACTTCAGCAAAGT 5400

 52650975 CTCAGGATACAAAATAAATGTGCAAAAATTACTGGCATTTCCATGCACCAACAACAGTCA 52651034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 CTCAGGATACAAAATAAATGTGCAAAAATTACTGGCATTTCCATGCACCAACAACAGTCA 5460

 52651035 AGCCAGGAGCCAAACCAGGAATGCACTCCCACTCACAATCGCCACAAAAAGAGTAAAATA 52651094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 AGCCAGGAGCCAAACCAGGAATGCACTCCCACTCACAATCGCCACAAAAAGAGTAAAATA 5520

 52651095 CCTAGGAAAACAGCTAATTAGGGAGGTGAAAGATCTCTACAAGGAGAATAATGAACCAGC 52651154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 CCTAGGAAAACAGCTAATTAGGGAGGTGAAAGATCTCTACAAGGAGAATAATGAACCAGC 5580

 52651155 GCTCAAAGAAATTAGAGATGACACAAACAAATGGAAAAACATTCCATGTTCATTGATAGG 52651214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 GCTCAAAGAAATTAGAGATGACACAAACAAATGGAAAAACATTCCATGTTCATTGATAGG 5640

 52651215 AAGAATCAATATCATTAAAATGGCCATATTGCCCAGAGCAATTTATAGATTCAATGCTAT 52651274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 AAGAATCAATATCATTAAAATGGCCATATTGCCCAGAGCAATTTATAGATTCAATGCTAT 5700

 52651275 ACCTATTAAACTACTGTTGAGATTCTTCACAGAACCAGAGAAAACTATTTTAAAATTCAT 52651334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5701 ACCTATTAAACTACTGTTGAGATTCTTCACAGAACCAGAGAAAACTATTTTAAAATTCAT 5760

 52651335 ATAGAACCCAGAAAAGAGCCTGAATTGCTAAGGCAATCCTAAGCAAAAAGCATAAAGCTG 52651394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5761 ATAGAACCCAGAAAAGAGCCTGAATTGCTAAGGCAATCCTAAGCAAAAAGCATAAAGCTG 5820

 52651395 AAGGCATCATGCTACCTGACTTCAAACTATACTACAAGGCTACAGTAACCAAAACAGCAT 52651454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5821 AAGGCATCATGCTACCTGACTTCAAACTATACTACAAGGCTACAGTAACCAAAACAGCAT 5880

 52651455 ACTACTGGTACAAAAACAGACACATAGACCAATGGAACAGAATAGAGAACCCGGAAATAA 52651514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5881 ACTACTGGTACAAAAACAGACACATAGACCAATGGAACAGAATAGAGAACCCGGAAATAA 5940

 52651515 GACCACACACCTACAACTATCTAATCTTTGACAAACCTGACAAAAACATGCAATGGGGAA 52651574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5941 GACCACACACCTACAACTATCTAATCTTTGACAAACCTGACAAAAACATGCAATGGGGAA 6000

 52651575 AAGATTTCCTATTCAATAAAAAGTGCTGGGATAACCGGCTAGCTGTACACAGAAGATTAA 52651634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6001 AAGATTTCCTATTCAATAAAAAGTGCTGGGATAACCGGCTAGCTGTACACAGAAGATTAA 6060

 52651635 AGCTGGACCCCTTCCTTACAACATATACAAAAATCGGCCGGGCTTGGTGGCTCACGCTTG 52651694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6061 AGCTGGACCCCTTCCTTACAACATATACAAAAATCGGCCGGGCTTGGTGGCTCACGCTTG 6120

 52651695 TAATCCCAGCACTTTGGAAGGCCGAGGAGGGCGGATCATGAGGTCAGGAGATCGAGAACA 52651754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6121 TAATCCCAGCACTTTGGAAGGCCGAGGAGGGCGGATCATGAGGTCAGGAGATCGAGAACA 6180

 52651755 CGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGTGTGGTGGCAGGCGCC 52651814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6181 CGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGTGTGGTGGCAGGCGCC 6240

 52651815 TGTAGTCCCAGCTACTTGGAGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGTGTGAACCCGGGAGACAGA 52651874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6241 TGTAGTCCCAGCTACTTGGAGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGTGTGAACCCGGGAGACAGA 6300

 52651875 GCTTGCACTGAGCCGAGACCACATCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGTGAGACTCC 52651934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6301 GCTTGCACTGAGCCGAGACCACATCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGTGAGACTCC 6360

 52651935 GTCTC 52651939
          |||||
     6361 GTCTC 6365

EXCISED REGION

 52651944 AAAAAAAAAAAAAAAAGAAGACATACAGGTAGTCAACAAGCATATGAAAAAAAGCTCAAT 52652003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6366 AAAAAAAAAAAAAAAAGAAGACATACAGGTAGTCAACAAGCATATGAAAAAAAGCTCAAT 6425

 52652004 ATTACTAATCATCAGAGAAATGCAAATCAAAAACCACAATGAGATACCATCTAATACCAG 52652063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6426 ATTACTAATCATCAGAGAAATGCAAATCAAAAACCACAATGAGATACCATCTAATACCAG 6485

 52652064 TCAGAATGATATTATTAAAAAGTCAAAAAATAAGATGCTGGTGAGGTAGTGGAGAGAAAG 52652123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6486 TCAGAATGATATTATTAAAAAGTCAAAAAATAAGATGCTGGTGAGGTAGTGGAGAGAAAG 6545

 52652124 GAATGCTTATACACTGTTGGTGGGAGTGTAAATTAGTTCAACCATTGTGGAAGACAGTGT 52652183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6546 GAATGCTTATACACTGTTGGTGGGAGTGTAAATTAGTTCAACCATTGTGGAAGACAGTGT 6605

 52652184 GGCAATTCCTCAAAGACCTAAAGATAGAAATACCATTCCACCCAGCAATTCCATTACTGG 52652243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6606 GGCAATTCCTCAAAGACCTAAAGATAGAAATACCATTCCACCCAGCAATTCCATTACTGG 6665

 52652244 GTACATACCCGAAAAATAGAAATCATTCTTTTATAAAGATACATGCATGTGTATGTTCAT 52652303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6666 GTACATACCCGAAAAATAGAAATCATTCTTTTATAAAGATACATGCATGTGTATGTTCAT 6725

 52652304 TGCAGCACTATTCACAATAGCAAAAACATGGAATCAACCTAAATACCCACCAATGATAGC 52652363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6726 TGCAGCACTATTCACAATAGCAAAAACATGGAATCAACCTAAATACCCACCAATGATAGC 6785

 52652364 CTGGATAAAGAAAATGTGGTACATATACACCATGGAATACTATGCAGCCATAAAAAGAAC 52652423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6786 CTGGATAAAGAAAATGTGGTACATATACACCATGGAATACTATGCAGCCATAAAAAGAAC 6845

 52652424 GAGATCATGTCCTTTGCAGGAACATGAATGGAGCTGAAGGCCATTATCCTTAGCAAAGTA 52652483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6846 GAGATCATGTCCTTTGCAGGAACATGAATGGAGCTGAAGGCCATTATCCTTAGCAAAGTA 6905

 52652484 TTGCCGAAAAAGAAAATCAAATACTACATGTTCTCACTTATAAATGGGAGCTAAATGATG 52652543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6906 TTGCCGAAAAAGAAAATCAAATACTACATGTTCTCACTTATAAATGGGAGCTAAATGATG 6965

 52652544 AGAACACATGGCCACACAGGGGGAACAACACACACTGGGGCCTATTGGAGGGTGGAAGGT 52652603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6966 AGAACACATGGCCACACAGGGGGAACAACACACACTGGGGCCTATTGGAGGGTGGAAGGT 7025

 52652604 GGGAGGAGGGAGAGGATCAGGAAAAATAATTAATAGATATTATTTCATCACCCAGGTATT 52652663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7026 GGGAGGAGGGAGAGGATCAGGAAAAATAATTAATAGATATTATTTCATCACCCAGGTATT 7085

 52652664 AATAATACCTATTTCATCACCCAGGCTTGATACCTGGGTGACAACAAACCCCCATGACAC 52652723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7086 AATAATACCTATTTCATCACCCAGGCTTGATACCTGGGTGACAACAAACCCCCATGACAC 7145

 52652724 AAATTTACCTATATAACAAACCTGCCCGTGTACCCCTGAACTTAAAATAAAAGTTAAAAA 52652783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7146 AAATTTACCTATATAACAAACCTGCCCGTGTACCCCTGAACTTAAAATAAAAGTTAAAAA 7205

 52652784 AATGCAAAAAGATGACATACCAAAGAGATGTTACTTTTCATTTTTAAAAAAGTCAAAGAA 52652843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7206 AATGCAAAAAGATGACATACCAAAGAGATGTTACTTTTCATTTTTAAAAAAGTCAAAGAA 7265

 52652844 TTTAAGGAAAATTAAAAAGAAATCAAGAATGACAGTAGCAGCTCCAAAATATTTAGAAGG 52652903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7266 TTTAAGGAAAATTAAAAAGAAATCAAGAATGACAGTAGCAGCTCCAAAATATTTAGAAGG 7325

 52652904 TAGAGTTGAAAATTTTGATTTTCTTAGTGCAGAAAAATATTTTGTGCTGCATGTTTTTTT 52652963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7326 TAGAGTTGAAAATTTTGATTTTCTTAGTGCAGAAAAATATTTTGTGCTGCATGTTTTTTT 7385

 52652964 AAAGAAAGTCATTTTATCTGTATATGTGATTAAAACCTTATTTCCAGTGCCATCTTCGTG 52653023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7386 AAAGAAAGTCATTTTATCTGTATATGTGATTAAAACCTTATTTCCAGTGCCATCTTCGTG 7445

 52653024 TAATTGTTAAGAACTTGGATTGTGGATCACAGGAACCTGGCTTTGACTCTTAACTGCTCA 52653083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7446 TAATTGTTAAGAACTTGGATTGTGGATCACAGGAACCTGGCTTTGACTCTTAACTGCTCA 7505

 52653084 CTCTTTAAATGGATAACCCGGGTAAGTTATTTCCTGTCTCTGTGCCTCAGTTTTCTTACA 52653143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7506 CTCTTTAAATGGATAACCCGGGTAAGTTATTTCCTGTCTCTGTGCCTCAGTTTTCTTACA 7565

 52653144 AATTGGCATGAAAATAACAGTGCCTCCTTCAGAGGGTAATTCTGAGGATTAAATGAAATA 52653203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7566 AATTGGCATGAAAATAACAGTGCCTCCTTCAGAGGGTAATTCTGAGGATTAAATGAAATA 7625

 52653204 TTGCCCATACAGTGCTTACCACAGGCTGGTAGATGATTGGTATTCGGTAAACAGTAGTTA 52653263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7626 TTGCCCATACAGTGCTTACCACAGGCTGGTAGATGATTGGTATTCGGTAAACAGTAGTTA 7685

 52653264 TTTTTGTTATACTAATATGTTATTAATATAATTACCATTTTGTATTTTTAAATGTAAGCC 52653323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7686 TTTTTGTTATACTAATATGTTATTAATATAATTACCATTTTGTATTTTTAAATGTAAGCC 7745

 52653324 ATAAGGAAAGGAATTATTCCAATAGTTTAATTTACAAACTTGAGTTTTCTAGAAAGACTT 52653383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7746 ATAAGGAAAGGAATTATTCCAATAGTTTAATTTACAAACTTGAGTTTTCTAGAAAGACTT 7805

 52653384 TTAAAAACAGTAGTGATATAAATCAATTTATCTTAAGAAACATAAGTATCTGGGCCAGGC 52653443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7806 TTAAAAACAGTAGTGATATAAATCAATTTATCTTAAGAAACATAAGTATCTGGGCCAGGC 7865

 52653444 AAGTTTCAGAAATGTTTATCATTTTCAAAGTACCAAATATTCTCGTCAAAACAAGCTGCT 52653503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7866 AAGTTTCAGAAATGTTTATCATTTTCAAAGTACCAAATATTCTCGTCAAAACAAGCTGCT 7925

 52653504 TCATCAGAGTTCTAATTATATATTTAAACATACATGCACACACACACGTTTGTATTACAA 52653563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7926 TCATCAGAGTTCTAATTATATATTTAAACATACATGCACACACACACGTTTGTATTACAA 7985

 52653564 TATTCAAAACTTCTGAGGAAGAATTATCTTTTTTTTTTCATGTGCCAAAGCTAAAACTTT 52653623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7986 TATTCAAAACTTCTGAGGAAGAATTATCTTTTTTTTTTCATGTGCCAAAGCTAAAACTTT 8045

 52653624 CACTTGCTACAGCTGTGTATTAGTCTATTTCCATACTGCTATAAAGAGCTGCCCAAGACT 52653683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8046 CACTTGCTACAGCTGTGTATTAGTCTATTTCCATACTGCTATAAAGAGCTGCCCAAGACT 8105

 52653684 GGGTGATTTATAAAGGAAAGAGGTTTAATTGACTCACAGTTCAGCATGGCAGGGAAGGCC 52653743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8106 GGGTGATTTATAAAGGAAAGAGGTTTAATTGACTCACAGTTCAGCATGGCAGGGAAGGCC 8165

 52653744 TCAGGAAACTTACAATCATGGTGGAAGTCAAAGGGGGAGCAAGGACCTTTCTTCACAAGG 52653803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8166 TCAGGAAACTTACAATCATGGTGGAAGTCAAAGGGGGAGCAAGGACCTTTCTTCACAAGG 8225

 52653804 CAGCAGAAAGAAGTGCCAAATGAACAGGGAAGAGCTCCTTATGAAACCATCAGGTCTTGT 52653863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8226 CAGCAGAAAGAAGTGCCAAATGAACAGGGAAGAGCTCCTTATGAAACCATCAGGTCTTGT 8285

 52653864 GAGAACTCACTTACTTTTATGAGAACAGCATGGAGGAAACTGTCCCCATGATCCAATCAC 52653923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8286 GAGAACTCACTTACTTTTATGAGAACAGCATGGAGGAAACTGTCCCCATGATCCAATCAC 8345

 52653924 CTCCACCTGGTCTCTCCCTTGACACGTGGGGATTATGGGGATTAAATTCCAGATGAGATT 52653983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8346 CTCCACCTGGTCTCTCCCTTGACACGTGGGGATTATGGGGATTAAATTCCAGATGAGATT 8405

 52653984 TGGGTGGGGACAAAAAGCCTAACGACATCAAGCTGTAAAAACAATAGCTAACATTCATTG 52654043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8406 TGGGTGGGGACAAAAAGCCTAACGACATCAAGCTGTAAAAACAATAGCTAACATTCATTG 8465

 52654044 ACTGTTTCCCAGCATTAGGATAAATGTGTGTAACAAGAGGCATTTTATTTATGTATGACA 52654103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8466 ACTGTTTCCCAGCATTAGGATAAATGTGTGTAACAAGAGGCATTTTATTTATGTATGACA 8525

 52654104 TTTGTTTATTTATTATTTATTTATTTGGATAAATGTCTATAACAAGAAACATTTTATTTA 52654163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8526 TTTGTTTATTTATTATTTATTTATTTGGATAAATGTCTATAACAAGAAACATTTTATTTA 8585

 52654164 AGTATAACAGCAAATCTACAAGTTAGGTACTATCATCACTCCCATTTTACAGGTCGTGAA 52654223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8586 AGTATAACAGCAAATCTACAAGTTAGGTACTATCATCACTCCCATTTTACAGGTCGTGAA 8645

 52654224 ACTGAGGCTCTGAAAAGTCAAGTCAGTTTTCTAATGTTGTCCAGCTAATGACTGGTAGAT 52654283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8646 ACTGAGGCTCTGAAAAGTCAAGTCAGTTTTCTAATGTTGTCCAGCTAATGACTGGTAGAT 8705

 52654284 TTAGTATTTGAACCCACATTTGCCTGATTCCAAAGTTCAAACTCCCAACAACATGTGGTA 52654343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8706 TTAGTATTTGAACCCACATTTGCCTGATTCCAAAGTTCAAACTCCCAACAACATGTGGTA 8765

 52654344 ACCAAAGCAGGAACAGAAGAGAAAGAAGAAATAGAAGGGAGGGAAGATGAACAAAGTAGA 52654403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8766 ACCAAAGCAGGAACAGAAGAGAAAGAAGAAATAGAAGGGAGGGAAGATGAACAAAGTAGA 8825

 52654404 CAAAGTTTAGTTAATAGAATTAGTGGATACCCAAGAAAAAACTATGTACAAGAGGGGGAA 52654463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8826 CAAAGTTTAGTTAATAGAATTAGTGGATACCCAAGAAAAAACTATGTACAAGAGGGGGAA 8885

 52654464 AAAAACCCTGTTTTCTCACATCTGGGAAACATTGATATCTATATATTTTTGGTTTTAAAT 52654523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8886 AAAAACCCTGTTTTCTCACATCTGGGAAACATTGATATCTATATATTTTTGGTTTTAAAT 8945

 52654524 AAAAATTAGGTTATGTCATTCATTTGCATAAAACCATCCAAAGAAGGGCCTCACAAAATT 52654583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8946 AAAAATTAGGTTATGTCATTCATTTGCATAAAACCATCCAAAGAAGGGCCTCACAAAATT 9005

 52654584 AAAACAAAATCCAAACTCTCTACTATGGGCCACACCCTCCAGAACTTCAGCTCGTACTAT 52654643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9006 AAAACAAAATCCAAACTCTCTACTATGGGCCACACCCTCCAGAACTTCAGCTCGTACTAT 9065

 52654644 GTTTTTCCTCACACCTCTCAACATACCAACATGTTTCCACCTGCAGCCCTCACCACTAGT 52654703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9066 GTTTTTCCTCACACCTCTCAACATACCAACATGTTTCCACCTGCAGCCCTCACCACTAGT 9125

 52654704 TATTCTTTCAATCTGGAAATATTTTCGCTAAGATCTTCCTATGGTTACCTTCTTATCATT 52654763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9126 TATTCTTTCAATCTGGAAATATTTTCGCTAAGATCTTCCTATGGTTACCTTCTTATCATT 9185

 52654764 CAAGACTTAGGTTATGTCAGGCCTTCCCTGACTCCTCCATCTGAAGTAACCCCTCCTGCT 52654823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9186 CAAGACTTAGGTTATGTCAGGCCTTCCCTGACTCCTCCATCTGAAGTAACCCCTCCTGCT 9245

 52654824 TACTCCTGTTTATTCTCTAGACTCCACAGAGGATTCATCACTCTCTGAAATGATCCCATT 52654883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9246 TACTCCTGTTTATTCTCTAGACTCCACAGAGGATTCATCACTCTCTGAAATGATCCCATT 9305

 52654884 AATTTCTTCTTCACTTGTTTCCTCTCCACGACCTGTAAGCCCCAAGTGGACCCGGACTTG 52654943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9306 AATTTCTTCTTCACTTGTTTCCTCTCCACGACCTGTAAGCCCCAAGTGGACCCGGACTTG 9365

 52654944 GTCTGCTCTGCTTACAGCTGGATTCCAGTTCCCATAGTGCTAGACACTAGGATTAAGCCA 52655003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9366 GTCTGCTCTGCTTACAGCTGGATTCCAGTTCCCATAGTGCTAGACACTAGGATTAAGCCA 9425

 52655004 GGAAACATGGGTGAAGCAGCAAGCACAGAGCTTGGGGCACAGCCTAGCAAACACTCCACA 52655063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9426 GGAAACATGGGTGAAGCAGCAAGCACAGAGCTTGGGGCACAGCCTAGCAAACACTCCACA 9485

 52655064 AAGGACCATGATTGTAACTGTAGTAGGGCACACCAATGAACAGGTTGGGAAACTGAGTCT 52655123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9486 AAGGACCATGATTGTAACTGTAGTAGGGCACACCAATGAACAGGTTGGGAAACTGAGTCT 9545

 52655124 CTGAGAAGAGACTAATGTTGTGCTGGATGAAATTTCTTTTTCTGACAATACATTATCCAA 52655183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9546 CTGAGAAGAGACTAATGTTGTGCTGGATGAAATTTCTTTTTCTGACAATACATTATCCAA 9605

 52655184 ATCCTCCAAGCTTTCAGTTTAAAGGGGAAAGCAGGAACTATCATTATAATTTTATTTACA 52655243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9606 ATCCTCCAAGCTTTCAGTTTAAAGGGGAAAGCAGGAACTATCATTATAATTTTATTTACA 9665

 52655244 AAGTGTCCATGTATGAACATTATTCACCGCCGAATCATCTCTTCCTATGCAAGCAACACC 52655303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9666 AAGTGTCCATGTATGAACATTATTCACCGCCGAATCATCTCTTCCTATGCAAGCAACACC 9725

 52655304 GTCCTATGCATCAATATCCTGATCTGTCAGGATTCAGGATAAAGTGGACATATACACACT 52655363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9726 GTCCTATGCATCAATATCCTGATCTGTCAGGATTCAGGATAAAGTGGACATATACACACT 9785

 52655364 AATTGCAAAGGGAAATTGTACATCTTGCAAAAGATGCAGGGGTTTATAGAGTCTTGTAAC 52655423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9786 AATTGCAAAGGGAAATTGTACATCTTGCAAAAGATGCAGGGGTTTATAGAGTCTTGTAAC 9845

 52655424 ATTGGTGAGCTGCTCAGATCACACACATGACCGTGGTTGGACAAGGATCTGGCAAAGTTA 52655483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9846 ATTGGTGAGCTGCTCAGATCACACACATGACCGTGGTTGGACAAGGATCTGGCAAAGTTA 9905

 52655484 ACACAGATCACCGAAGAAGGAAAAGTGGACAACACAACACAGTAAGTTCTTCAAAAGAGT 52655543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9906 ACACAGATCACCGAAGAAGGAAAAGTGGACAACACAACACAGTAAGTTCTTCAAAAGAGT 9965

 52655544 TATATTAGAATATCAAAAGATTATGTTAGGCCTTTGGGAAAACTCAAAACTTTATGAAGA 52655603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9966 TATATTAGAATATCAAAAGATTATGTTAGGCCTTTGGGAAAACTCAAAACTTTATGAAGA 10025

 52655604 CCTCAAAAAATTATGCAAAAATGACCCTTCAATGGTCATGCTGCAAGAGTCAAATGACAC 52655663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10026 CCTCAAAAAATTATGCAAAAATGACCCTTCAATGGTCATGCTGCAAGAGTCAAATGACAC 10085

 52655664 TTCAAAC 52655670
          |||||||
    10086 TTCAAAC 10092

Alignment time is 11.4852 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [52637064,52668002] =>     30939 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    4165] =>      4165 nucs 'mol-32-300f-107679_4165'

Score:        4164
Aligned:      4164        nucs
Identic:      4164 (100%) nucs =>      1173 (100%)      2991 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [52645407,52646579] EXCISED REGION [52646581,52649571]
 second seq =>  [       1,    1173] EXCISED REGION [    1175,    4165]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [52646580,52646580]
 second seq =>         1 nucs [1174,1174]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [52646580,52646580] to [52646581,52646581]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 52645407 CTTTCCCAAGATTCTTTCCGTTGGCATCCGCAACAGCACTTATCTCCGTTGTCTCGGGGG 52645466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTTTCCCAAGATTCTTTCCGTTGGCATCCGCAACAGCACTTATCTCCGTTGTCTCGGGGG 60

 52645467 AAGAAGTGGCCACATTATCCGTCTTGACACTTATTCCCAAGTCGACTGTAAACACAAACA 52645526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAGAAGTGGCCACATTATCCGTCTTGACACTTATTCCCAAGTCGACTGTAAACACAAACA 120

 52645527 TAAACAGTGGTTATTCAGCCAAGCCGGGAAATTCAGGCACTAATAATGGACTCCAGACAT 52645586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TAAACAGTGGTTATTCAGCCAAGCCGGGAAATTCAGGCACTAATAATGGACTCCAGACAT 180

 52645587 TTTTTATACAAAAGCCATACTGCATACTGGAACTGTGTTGTTCTCTGGTCATTCTGAAAG 52645646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTTTTATACAAAAGCCATACTGCATACTGGAACTGTGTTGTTCTCTGGTCATTCTGAAAG 240

 52645647 GCAGAAGTTAGCTCTCTACATCTCCTTGGACCCTGCTTTTCTTGGGAGAGGAGAAGGCAA 52645706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GCAGAAGTTAGCTCTCTACATCTCCTTGGACCCTGCTTTTCTTGGGAGAGGAGAAGGCAA 300

 52645707 GGTTGGTGAGGAGGGAAAGCTACTTAATGGAAAGTCACTAGCTGCCAGGTGTGGAATGAG 52645766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GGTTGGTGAGGAGGGAAAGCTACTTAATGGAAAGTCACTAGCTGCCAGGTGTGGAATGAG 360

 52645767 TGATATTCAATGTTAATTAATCTTCTTTTATCTGTGTAAGAACTCCGTGAGCAGCATATT 52645826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGATATTCAATGTTAATTAATCTTCTTTTATCTGTGTAAGAACTCCGTGAGCAGCATATT 420

 52645827 GTCATGATGTCAACTGGGAGGCAGTACAGCAGTTAGGAGCTTGGGTTCTGGAGCTAGAAC 52645886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTCATGATGTCAACTGGGAGGCAGTACAGCAGTTAGGAGCTTGGGTTCTGGAGCTAGAAC 480

 52645887 AAGGTTTCTCAACCTCAGCACTACTCACATTTGAAGCCAGATTATTCTTTGTTAGGGAGG 52645946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAGGTTTCTCAACCTCAGCACTACTCACATTTGAAGCCAGATTATTCTTTGTTAGGGAGG 540

 52645947 CTCATCCCGTGCCTCATAGGCTGATTAGCAGCATCCTGGCCTCTGCCCACTAGACGCCGG 52646006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTCATCCCGTGCCTCATAGGCTGATTAGCAGCATCCTGGCCTCTGCCCACTAGACGCCGG 600

 52646007 TCACATTTCCCAGTCATGGCAACCAAAAATATCTCTAGGCATTGCTAAATGTCCCCTGGA 52646066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCACATTTCCCAGTCATGGCAACCAAAAATATCTCTAGGCATTGCTAAATGTCCCCTGGA 660

 52646067 GGACAAAATCTCTTACGTTTGAGAGGCACTGAGCTGAAATGTCTTTTTGAATCCAGATTA 52646126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGACAAAATCTCTTACGTTTGAGAGGCACTGAGCTGAAATGTCTTTTTGAATCCAGATTA 720

 52646127 TCTAATTTTCTGTGCCTCAACTTTCTGGTAAAAGGAGACAGATAATAAATCTCGTAATTT 52646186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCTAATTTTCTGTGCCTCAACTTTCTGGTAAAAGGAGACAGATAATAAATCTCGTAATTT 780

 52646187 TGTTAGGAAGATTACATGAGTTAATAGTTTTAAAGCAAGTACAATAGCACCTGGAATATA 52646246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGTTAGGAAGATTACATGAGTTAATAGTTTTAAAGCAAGTACAATAGCACCTGGAATATA 840

 52646247 TTAAGTGCTTAATAAATATCACAAACATTAGTTATCATTATTCATGAGTGAGAAAACTGA 52646306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTAAGTGCTTAATAAATATCACAAACATTAGTTATCATTATTCATGAGTGAGAAAACTGA 900

 52646307 CAGTCAGAGAGGTCAGTACACCCTCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCTAGTAAGCAGCAGAGT 52646366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CAGTCAGAGAGGTCAGTACACCCTCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCTAGTAAGCAGCAGAGT 960

 52646367 CTGGCTTCAGGCAGAAATCTGACTTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGTCTTACCAGGGACTT 52646426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTGGCTTCAGGCAGAAATCTGACTTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGTCTTACCAGGGACTT 1020

 52646427 GTATTAGCATAGACTGTTAAGAATATGGGAAGATTTTTAAAATACAGTACTCAGAAAATT 52646486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GTATTAGCATAGACTGTTAAGAATATGGGAAGATTTTTAAAATACAGTACTCAGAAAATT 1080

 52646487 TCTCTTTGAAAGGCTGGAAGAGCAGATATCCACACAAGAAGGCAAATTAGACCTCAGGCC 52646546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TCTCTTTGAAAGGCTGGAAGAGCAGATATCCACACAAGAAGGCAAATTAGACCTCAGGCC 1140

 52646547 AGTGTGGAATTAAAGGTGTAGGGTTATCTGGTC 52646579
          |||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGTGTGGAATTAAAGGTGTAGGGTTATCTGGTC 1173

EXCISED REGION

 52646581 AGACTGTGTGTGTGGATACAGGCTCCAACCCCTCCAGGCAAGGGCACTGTTTCCAACATC 52646640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1175 AGACTGTGTGTGTGGATACAGGCTCCAACCCCTCCAGGCAAGGGCACTGTTTCCAACATC 1234

 52646641 CACCCTTTCTCCTTTGACCTCTACCTTGACCTAAATTAACTATAAAAGGTCCTTCTTTTC 52646700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1235 CACCCTTTCTCCTTTGACCTCTACCTTGACCTAAATTAACTATAAAAGGTCCTTCTTTTC 1294

 52646701 TAGGACCCTACTATAAATCAGTGAAATATTCAGGAAAAAAAGAACACCAAGAATGTTGGG 52646760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1295 TAGGACCCTACTATAAATCAGTGAAATATTCAGGAAAAAAAGAACACCAAGAATGTTGGG 1354

 52646761 ATCCCAGTTAAAGATCAAGATTCTCTACTGATAAGCTGTGTGATATGGAGTAAATCACTA 52646820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1355 ATCCCAGTTAAAGATCAAGATTCTCTACTGATAAGCTGTGTGATATGGAGTAAATCACTA 1414

 52646821 AAGATCTTTGAATCTCTTCATTTGTAAAATGGGAATATTGGTAGTCCTACTGCAGGGTTG 52646880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1415 AAGATCTTTGAATCTCTTCATTTGTAAAATGGGAATATTGGTAGTCCTACTGCAGGGTTG 1474

 52646881 TTGTAATGCTTAAAGAAGAAAAGTCATGCAAAGGATCTGGCACAACGCCTTTTCCATAAT 52646940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1475 TTGTAATGCTTAAAGAAGAAAAGTCATGCAAAGGATCTGGCACAACGCCTTTTCCATAAT 1534

 52646941 AAGTGCTTAGTAATTGACAGATACTGTGATAACTTTTCAGGTTTCTCTCATGCCTTTGAC 52647000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1535 AAGTGCTTAGTAATTGACAGATACTGTGATAACTTTTCAGGTTTCTCTCATGCCTTTGAC 1594

 52647001 AACATTGCATTTTGCTTGCTCTATCTGTAGTCAGACACTTCTTAATATCTGTTTGCAGGA 52647060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1595 AACATTGCATTTTGCTTGCTCTATCTGTAGTCAGACACTTCTTAATATCTGTTTGCAGGA 1654

 52647061 AGACAGAAAAATAAAGGGAAGAATTGAGATTTCTTTGATCTATTCATACTGCTCATTAAT 52647120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1655 AGACAGAAAAATAAAGGGAAGAATTGAGATTTCTTTGATCTATTCATACTGCTCATTAAT 1714

 52647121 ATGTAGTGAGAAATACATACACACACACATACACACACATGCATCCATTAGCAATTGTTT 52647180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1715 ATGTAGTGAGAAATACATACACACACACATACACACACATGCATCCATTAGCAATTGTTT 1774

 52647181 TTGCCCAACTCTAGTGTCTCGCAGTGTCTAGACTAAACAACAAACAAAAAAGGGGGGAGA 52647240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1775 TTGCCCAACTCTAGTGTCTCGCAGTGTCTAGACTAAACAACAAACAAAAAAGGGGGGAGA 1834

 52647241 GTGAGCTGGATTAAGCATTGAGGCACAGTGAAGAAATGGTCTGGGGCAAGCCCAGGGATG 52647300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1835 GTGAGCTGGATTAAGCATTGAGGCACAGTGAAGAAATGGTCTGGGGCAAGCCCAGGGATG 1894

 52647301 AATGTTAGGGGTTTCTCATAAACCTGAACCTGAAGAAAATCACCCTGCCAGCATATTGAT 52647360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1895 AATGTTAGGGGTTTCTCATAAACCTGAACCTGAAGAAAATCACCCTGCCAGCATATTGAT 1954

 52647361 CTTCTAGCTCTTCTTAACCTTTTTTTCTGTGATTCAGGAATTCATAATGATAGAAAATAT 52647420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1955 CTTCTAGCTCTTCTTAACCTTTTTTTCTGTGATTCAGGAATTCATAATGATAGAAAATAT 2014

 52647421 TATACTAAAGAAGAAAAAAAGAGGGAGAATAAGTAAGTGATAGATGGATGCATCAGGGTG 52647480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2015 TATACTAAAGAAGAAAAAAAGAGGGAGAATAAGTAAGTGATAGATGGATGCATCAGGGTG 2074

 52647481 TAAAGTTAGCAAGTAAGGCTGTTGAAGTGTCAGAGTGAATATAAATGAATTGTGGGAATG 52647540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2075 TAAAGTTAGCAAGTAAGGCTGTTGAAGTGTCAGAGTGAATATAAATGAATTGTGGGAATG 2134

 52647541 GTCCATGCCAGGAGAAGAGGGTATGGTTGACAAAAAGGGAAATGCTAAGATTCAAAACAG 52647600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2135 GTCCATGCCAGGAGAAGAGGGTATGGTTGACAAAAAGGGAAATGCTAAGATTCAAAACAG 2194

 52647601 GGAAGGGCTTTTCAAAATGCCAAGAGCACCAACTTATATCTTTCAGTTTAATTCCTCTCT 52647660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2195 GGAAGGGCTTTTCAAAATGCCAAGAGCACCAACTTATATCTTTCAGTTTAATTCCTCTCT 2254

 52647661 TCCTTACCCACTGGCTGGAAAGCAAAGGAGCTAGTGGTAAGTAAGAGTGTTATAGCCAGA 52647720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2255 TCCTTACCCACTGGCTGGAAAGCAAAGGAGCTAGTGGTAAGTAAGAGTGTTATAGCCAGA 2314

 52647721 GAAAAAGTCTTCAAAAAACACAAAGTACTTTCCATGGACAACCTTTTTTATTTTAAAGTG 52647780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2315 GAAAAAGTCTTCAAAAAACACAAAGTACTTTCCATGGACAACCTTTTTTATTTTAAAGTG 2374

 52647781 CCAATATGTTGCTTTGAAAAAGAATAAATTCCTTACATCCAGGTATCTGGACTAGACTTC 52647840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2375 CCAATATGTTGCTTTGAAAAAGAATAAATTCCTTACATCCAGGTATCTGGACTAGACTTC 2434

 52647841 AGTGCATTTAGTGATTATAGCAAATCCAAACAGTAGCTTTTGATATCAGAGAATGGGTAA 52647900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2435 AGTGCATTTAGTGATTATAGCAAATCCAAACAGTAGCTTTTGATATCAGAGAATGGGTAA 2494

 52647901 AGTGTTTTTGACAATTTCTAAGAACTTAGAGTTCTTCGGTGATACGTTCCATGCAACTGA 52647960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2495 AGTGTTTTTGACAATTTCTAAGAACTTAGAGTTCTTCGGTGATACGTTCCATGCAACTGA 2554

 52647961 AGCTCTGCTCTCCAAATTTAGGTGGGTACATACCCAAGTCCATCACCTGGGGCTTCTATT 52648020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2555 AGCTCTGCTCTCCAAATTTAGGTGGGTACATACCCAAGTCCATCACCTGGGGCTTCTATT 2614

 52648021 TCCTTTGCTCAGATGCTCACCTCCTAGGTGGGCACCTGACATAAGATAGACTAATAAAAA 52648080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2615 TCCTTTGCTCAGATGCTCACCTCCTAGGTGGGCACCTGACATAAGATAGACTAATAAAAA 2674

 52648081 TAAGTCCTGTAACTTTTGATACTCCTATTAAAAAAGAGTTGCAAACCAATAGGAGGTACA 52648140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2675 TAAGTCCTGTAACTTTTGATACTCCTATTAAAAAAGAGTTGCAAACCAATAGGAGGTACA 2734

 52648141 CTTGAGAATCAGCACAAATGAAAGTAGAACCTGGAAATCCAGGAAGCAGATACCCAATCA 52648200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2735 CTTGAGAATCAGCACAAATGAAAGTAGAACCTGGAAATCCAGGAAGCAGATACCCAATCA 2794

 52648201 TGTCATTTAAACATTTAGATCCAGCTGTGCCTGAAGCTGAACTTTAGCATTACATAAGCC 52648260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2795 TGTCATTTAAACATTTAGATCCAGCTGTGCCTGAAGCTGAACTTTAGCATTACATAAGCC 2854

 52648261 AATAAATCACTCTTCCCCAACTTACGCCAGTTGAAATTGAATACATACTCAGTGACTTTG 52648320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2855 AATAAATCACTCTTCCCCAACTTACGCCAGTTGAAATTGAATACATACTCAGTGACTTTG 2914

 52648321 AGAGAATTCCAGGGAATTGGTCAGTCCCTGTTTCACTTGTAAATACACAGCAATCAAGCC 52648380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2915 AGAGAATTCCAGGGAATTGGTCAGTCCCTGTTTCACTTGTAAATACACAGCAATCAAGCC 2974

 52648381 TACCAAATCTATGATTGATTGGGGTGTCTGAAAGAGATGGAGGGAATGGAATCAACCTGA 52648440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2975 TACCAAATCTATGATTGATTGGGGTGTCTGAAAGAGATGGAGGGAATGGAATCAACCTGA 3034

 52648441 AAAACATATTTCAGGAGTTCATCCCTGAAAACTTCCCCAACCTAGCTAGAGGGGCCAACA 52648500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3035 AAAACATATTTCAGGAGTTCATCCCTGAAAACTTCCCCAACCTAGCTAGAGGGGCCAACA 3094

 52648501 TTCAAATTCAGGAAATGCAGAGAACCCCAGTAAGATACTCCACAAAAAGATCTTCCCCAA 52648560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3095 TTCAAATTCAGGAAATGCAGAGAACCCCAGTAAGATACTCCACAAAAAGATCTTCCCCAA 3154

 52648561 GACATCATCATCAGATTCTCCAAAGTTGAAATGTAAGAAAAAATGCTAAAGGCAACTAGA 52648620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3155 GACATCATCATCAGATTCTCCAAAGTTGAAATGTAAGAAAAAATGCTAAAGGCAACTAGA 3214

 52648621 GTGAAAGGCCCGGTCACCTAAAAAGGGAAGCACAGACTTACAGTGGACCTCTCACTGGTA 52648680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3215 GTGAAAGGCCCGGTCACCTAAAAAGGGAAGCACAGACTTACAGTGGACCTCTCACTGGTA 3274

 52648681 ACCCTACAAGCCAGAAGAGATTGAGGACCAATATTCAACATTCTTAAACAAAAAGAATTC 52648740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3275 ACCCTACAAGCCAGAAGAGATTGAGGACCAATATTCAACATTCTTAAACAAAAAGAATTC 3334

 52648741 CAACCCAGAATTTTATATCTGACTAAACTAAGCTTCATAAGCAAAAGAGAAATAAGATCA 52648800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3335 CAACCCAGAATTTTATATCTGACTAAACTAAGCTTCATAAGCAAAAGAGAAATAAGATCA 3394

 52648801 TTTTCAGACAAGCAAATGCTAAGGGAATTTGTGACCATTAGACCTTCCTTGCAACAGTTC 52648860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3395 TTTTCAGACAAGCAAATGCTAAGGGAATTTGTGACCATTAGACCTTCCTTGCAACAGTTC 3454

 52648861 CTAAAGGAAGCACTAAATATGGAAAGACCATTACCAGACACTACAAAACACACTGAAGTA 52648920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3455 CTAAAGGAAGCACTAAATATGGAAAGACCATTACCAGACACTACAAAACACACTGAAGTA 3514

 52648921 CACAGACCAGTGACATTGTAAAGCAACTACATAACAAGTCTGCAAAATAACCAGCCAACA 52648980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3515 CACAGACCAGTGACATTGTAAAGCAACTACATAACAAGTCTGCAAAATAACCAGCCAACA 3574

 52648981 TCATGATGACGGTATCAAATCGACACATAGCAACACTAACCTTAAATGTAAATGGACTAA 52649040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3575 TCATGATGACGGTATCAAATCGACACATAGCAACACTAACCTTAAATGTAAATGGACTAA 3634

 52649041 ATGATCCCATTAAAAGACATAAAGTGGCAGGCTGGATAAAGAACCAAGAACCATTGGTAT 52649100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3635 ATGATCCCATTAAAAGACATAAAGTGGCAGGCTGGATAAAGAACCAAGAACCATTGGTAT 3694

 52649101 ACTGTCTTCAAGAGACCCATCTCCTATGCAGTGACACACATAGGTTCAAGATAAAGGGAT 52649160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3695 ACTGTCTTCAAGAGACCCATCTCCTATGCAGTGACACACATAGGTTCAAGATAAAGGGAT 3754

 52649161 GGGGAAAAATCTACCAAGCAAATAGAAAACAGAATAAAACAGGGGTTGCAATCCTAGTTG 52649220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3755 GGGGAAAAATCTACCAAGCAAATAGAAAACAGAATAAAACAGGGGTTGCAATCCTAGTTG 3814

 52649221 CCGTCAAAACAGACTTTAAACCAACAAAGGTTAAAAGAAAAAAATATGGGCATTGCATAA 52649280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3815 CCGTCAAAACAGACTTTAAACCAACAAAGGTTAAAAGAAAAAAATATGGGCATTGCATAA 3874

 52649281 GGATAAAGTGTTAAATTAAACAAGAAGATCTAACTATCCTAAGTATATATGCACCAAACA 52649340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3875 GGATAAAGTGTTAAATTAAACAAGAAGATCTAACTATCCTAAGTATATATGCACCAAACA 3934

 52649341 CAGGAACACCCAGATTCATAAAGCAAGTTTATGGAGACCTTCAAACAGACTTAGACTCCC 52649400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3935 CAGGAACACCCAGATTCATAAAGCAAGTTTATGGAGACCTTCAAACAGACTTAGACTCCC 3994

 52649401 ACACAATAGTAGTGGGAGACTTTAATACCCCATGACAATATTAGACAGATCATTGAGACA 52649460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3995 ACACAATAGTAGTGGGAGACTTTAATACCCCATGACAATATTAGACAGATCATTGAGACA 4054

 52649461 GGAAATTAACAAAGATATTCAAGATCTAACTCAGCACTAAATCAAATGGCCCTGATAGAT 52649520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4055 GGAAATTAACAAAGATATTCAAGATCTAACTCAGCACTAAATCAAATGGCCCTGATAGAT 4114

 52649521 ATCTACAGGACTGTCCTACTTGAAACCATACAATTACATGGTAATTGAATG 52649571
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4115 ATCTACAGGACTGTCCTACTTGAAACCATACAATTACATGGTAATTGAATG 4165

Alignment time is 5.34247 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [52637064,52668002] =>     30939 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    9685] =>      9685 nucs 'mol-32-300f-248424_9685'

Score:        9685
Aligned:      9685        nucs
Identic:      9685 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [52639463,52649147]
 second seq =>  [       1,    9685]

 52639463 CATCAAAATCCCAGTGGTATAGCTGAGGACCTTGTTTACTCCAAAACTTGCATAATGTAA 52639522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CATCAAAATCCCAGTGGTATAGCTGAGGACCTTGTTTACTCCAAAACTTGCATAATGTAA 60

 52639523 GATGGATTTTCCCTTTGCACTGACAAAGTCTTTTGGGTGGCTAGTTCTCTTTACCAGTTG 52639582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GATGGATTTTCCCTTTGCACTGACAAAGTCTTTTGGGTGGCTAGTTCTCTTTACCAGTTG 120

 52639583 AAAAGGCATGGCCTTGTGGACATAAGGCAGAAACAACACAAAATAAAAAACAGTTAATAA 52639642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAAAGGCATGGCCTTGTGGACATAAGGCAGAAACAACACAAAATAAAAAACAGTTAATAA 180

 52639643 TTCACTTGGCCTTCTAATGTTGAAATTCGGTAATTCTTTTTATTTGTTTTTATTTTTCAC 52639702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTCACTTGGCCTTCTAATGTTGAAATTCGGTAATTCTTTTTATTTGTTTTTATTTTTCAC 240

 52639703 TTGGGATTTTGGGTATTTACAACTTTGCATATGCTAACATCTTTGAATTTCATTGCCTCA 52639762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTGGGATTTTGGGTATTTACAACTTTGCATATGCTAACATCTTTGAATTTCATTGCCTCA 300

 52639763 AGTTGTAACTTCATTGAACAAGTTTCAAATAATTGGCAAAAATAGAAACGTTGACTATTT 52639822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGTTGTAACTTCATTGAACAAGTTTCAAATAATTGGCAAAAATAGAAACGTTGACTATTT 360

 52639823 AAGACTATGGGCTTTGGAGATGGACAATTTTGGCTGTGCCACCTTTTAGCTGTGTGTCAG 52639882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAGACTATGGGCTTTGGAGATGGACAATTTTGGCTGTGCCACCTTTTAGCTGTGTGTCAG 420

 52639883 GAGTGATATGCTTTCTCTGAACTGTTGACTTCTTCATCTGTAAAATGGTGAAAATACAGG 52639942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GAGTGATATGCTTTCTCTGAACTGTTGACTTCTTCATCTGTAAAATGGTGAAAATACAGG 480

 52639943 AATTCCCTGGTAAGATTTGATGGCTCAATGAGCTGATTTCTACAAAATGATTTAATCACA 52640002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AATTCCCTGGTAAGATTTGATGGCTCAATGAGCTGATTTCTACAAAATGATTTAATCACA 540

 52640003 GAATTTGACTTAAAATGCGAGAGGGATTCATGCTGTCCGAAATCATCCAAGAGTGGAGAT 52640062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GAATTTGACTTAAAATGCGAGAGGGATTCATGCTGTCCGAAATCATCCAAGAGTGGAGAT 600

 52640063 ATCTGGTTAGCTTCATGGAGAACCTGGCACTGAATATCAAGTCAATTTTTGATAAACAGA 52640122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATCTGGTTAGCTTCATGGAGAACCTGGCACTGAATATCAAGTCAATTTTTGATAAACAGA 660

 52640123 GAGAGAAAGGGACATAGGCAGAGAAAATACCAGGAGACAGATGGCGTTTGCACAGGTCAG 52640182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GAGAGAAAGGGACATAGGCAGAGAAAATACCAGGAGACAGATGGCGTTTGCACAGGTCAG 720

 52640183 GTGTTGGCCATATTGACTGGAGAAATTTAAGGGAAGGGTGGAAAATGCAGTTGGAAAATA 52640242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GTGTTGGCCATATTGACTGGAGAAATTTAAGGGAAGGGTGGAAAATGCAGTTGGAAAATA 780

 52640243 GGCAGAGGAAACATTGTGGAAACCCTTAAATGTCAGACAAAGAAACTGAGGCTTATGGGC 52640302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GGCAGAGGAAACATTGTGGAAACCCTTAAATGTCAGACAAAGAAACTGAGGCTTATGGGC 840

 52640303 ATGGACACTAACATTTCTATTGTTTCAAAAATAATTTTACAACTTTTATACCTTTCTCAC 52640362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATGGACACTAACATTTCTATTGTTTCAAAAATAATTTTACAACTTTTATACCTTTCTCAC 900

 52640363 CCAAGTTAGGACTTGTGCCTTTGGTTATACAACTCTTAAATTAGAGTCAACTGTGCTATC 52640422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CCAAGTTAGGACTTGTGCCTTTGGTTATACAACTCTTAAATTAGAGTCAACTGTGCTATC 960

 52640423 TCTGTGAGTTTGGGTTGAGGACTATGGAAGGGAAAGGCAAAAAATAAAAGTAAAATGTGA 52640482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TCTGTGAGTTTGGGTTGAGGACTATGGAAGGGAAAGGCAAAAAATAAAAGTAAAATGTGA 1020

 52640483 AGTAGAAGACAGGGAGAAAACCCATAATACTGGTAATAGCTAATTTCTCTTTTTCTTCTT 52640542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGTAGAAGACAGGGAGAAAACCCATAATACTGGTAATAGCTAATTTCTCTTTTTCTTCTT 1080

 52640543 TCAAAATGCAATTTGTGCTAAGTACTTTATATGGCCTATCTCATTTAACTTCTAAAAGTG 52640602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TCAAAATGCAATTTGTGCTAAGTACTTTATATGGCCTATCTCATTTAACTTCTAAAAGTG 1140

 52640603 TGAACAATGTGAGAATGTGCTAGATACTATTATTATCCCCATTTTACAGATGAGGAAACT 52640662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGAACAATGTGAGAATGTGCTAGATACTATTATTATCCCCATTTTACAGATGAGGAAACT 1200

 52640663 GAGGCTCAGGAGGTGAAGTAGCTTGCCCAAGATCACACAGCCAGTAGGTGACAGAGGTAG 52640722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GAGGCTCAGGAGGTGAAGTAGCTTGCCCAAGATCACACAGCCAGTAGGTGACAGAGGTAG 1260

 52640723 AGAGGAAACCTAGGCTACTTGACTATGATGCTTATGTTTAATTCACTACTAAATACCATG 52640782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AGAGGAAACCTAGGCTACTTGACTATGATGCTTATGTTTAATTCACTACTAAATACCATG 1320

 52640783 TAGGAAAGGACTCTGGAGACCTTAGTTCTTTAATTCCAATTCTACCACTAAACAGTAGAG 52640842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TAGGAAAGGACTCTGGAGACCTTAGTTCTTTAATTCCAATTCTACCACTAAACAGTAGAG 1380

 52640843 ACAGGATGAACTTGTCATTCACTGAGATGGAAAACCCCGTGAATTAAACTGGTGGGCATT 52640902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ACAGGATGAACTTGTCATTCACTGAGATGGAAAACCCCGTGAATTAAACTGGTGGGCATT 1440

 52640903 TTGTTTTTGTCATTGTTAGGCGATGAATGAAGAGTTCCATTCTGGACACATTAGGGTTGA 52640962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTGTTTTTGTCATTGTTAGGCGATGAATGAAGAGTTCCATTCTGGACACATTAGGGTTGA 1500

 52640963 GATACTCAGTGAGCAGCCAAATGGGGATGTAGAAATTCAAGTAGACATGTGGAAGAGGAG 52641022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GATACTCAGTGAGCAGCCAAATGGGGATGTAGAAATTCAAGTAGACATGTGGAAGAGGAG 1560

 52641023 GCAGCTGAGACTCACGTCTGGACTTCAGGGATGGATCCCGGCTAGAGATGTAAATTTGGA 52641082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GCAGCTGAGACTCACGTCTGGACTTCAGGGATGGATCCCGGCTAGAGATGTAAATTTGGA 1620

 52641083 ACTTGTCAACCCATAGCAGTATTTAAACCTTTGGGACTGAGGGAAACCTTCAAGGAAATA 52641142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ACTTGTCAACCCATAGCAGTATTTAAACCTTTGGGACTGAGGGAAACCTTCAAGGAAATA 1680

 52641143 AGCGTAGTTAGAGATAGCCAAGAAGTGAACCCTGGGGAAGTCCAACATTTAGAGGGTGAG 52641202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AGCGTAGTTAGAGATAGCCAAGAAGTGAACCCTGGGGAAGTCCAACATTTAGAGGGTGAG 1740

 52641203 ATCCAGCAAAGGAGATGATGGAAGAGTACCAGGGAGGTGGAAGGATGTTGTTTCAAACAG 52641262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ATCCAGCAAAGGAGATGATGGAAGAGTACCAGGGAGGTGGAAGGATGTTGTTTCAAACAG 1800

 52641263 CAAGGTGTGGCCCACTCAGTCACTGTGTCGGATTCAACTTGCAGGTCAGACCTACTAGGA 52641322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CAAGGTGTGGCCCACTCAGTCACTGTGTCGGATTCAACTTGCAGGTCAGACCTACTAGGA 1860

 52641323 CAAAGATAGAGACCTATAGGATTTGGCAGCCAGGGTGATGGTAGGGAATTTGAAACATCA 52641382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CAAAGATAGAGACCTATAGGATTTGGCAGCCAGGGTGATGGTAGGGAATTTGAAACATCA 1920

 52641383 TGGTGGCTGTGACAAGAGCCTGAATGGAGTGTGTTCAAGAGAGAAAAGAAGAGAAGTGAA 52641442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TGGTGGCTGTGACAAGAGCCTGAATGGAGTGTGTTCAAGAGAGAAAAGAAGAGAAGTGAA 1980

 52641443 AACACAGAATATTGTTCTTATTATTAGTAGCCTGAGCCAATCTGAGGACCGATGCACTTA 52641502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AACACAGAATATTGTTCTTATTATTAGTAGCCTGAGCCAATCTGAGGACCGATGCACTTA 2040

 52641503 TCACAATGTCTCTTAAAATACTATGTCTCTTACTAGATTATACACTCCTTGACAGACGAG 52641562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TCACAATGTCTCTTAAAATACTATGTCTCTTACTAGATTATACACTCCTTGACAGACGAG 2100

 52641563 AAACATGATTTATTTTTCAAATGCCTTGCACAAGGTTAGTGCGAAAGTAACGATTGCAGG 52641622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AAACATGATTTATTTTTCAAATGCCTTGCACAAGGTTAGTGCGAAAGTAACGATTGCAGG 2160

 52641623 ATTTAATTACACTTTTAAAAGAAAAAAGACATTCTTCATCTTATGAAACTCTGCATGGCA 52641682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ATTTAATTACACTTTTAAAAGAAAAAAGACATTCTTCATCTTATGAAACTCTGCATGGCA 2220

 52641683 ACACTTTATGCGCCCCACACCCCCACTCAACACAAACACAACTCTGGAAGTACTGTGTTG 52641742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ACACTTTATGCGCCCCACACCCCCACTCAACACAAACACAACTCTGGAAGTACTGTGTTG 2280

 52641743 ATAACAGAAATGTGGTGGGTTTTATTTTTAACCAATAAAGGTCAAGTTTGCATTATGTGA 52641802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 ATAACAGAAATGTGGTGGGTTTTATTTTTAACCAATAAAGGTCAAGTTTGCATTATGTGA 2340

 52641803 TTTTGTGTGTGTGTGTGTTGAATCTTTTAAATGCATATCTTACAGCTCTGGTTCAGTTGT 52641862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TTTTGTGTGTGTGTGTGTTGAATCTTTTAAATGCATATCTTACAGCTCTGGTTCAGTTGT 2400

 52641863 TGTGGGGAGAGGAAAAAAACCTCATCCCTGCCAACACATTGGTTTGTATGAATCACAGCT 52641922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TGTGGGGAGAGGAAAAAAACCTCATCCCTGCCAACACATTGGTTTGTATGAATCACAGCT 2460

 52641923 CAGTGAAACCTTTCAGGCATATAATTTATCTTTTCTTTGGCCTATGTAGTAAACGCTTCA 52641982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CAGTGAAACCTTTCAGGCATATAATTTATCTTTTCTTTGGCCTATGTAGTAAACGCTTCA 2520

 52641983 TTTGTTCATGAATTCTTGCCTTGTTTTAATTATGCTTTGCCCTGAATGTAGTTTTATAAG 52642042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TTTGTTCATGAATTCTTGCCTTGTTTTAATTATGCTTTGCCCTGAATGTAGTTTTATAAG 2580

 52642043 GCACAAAAATAAGATTGTCGTTCTGAAAACACAGAAGATTTGTATGTTTCCCCCAGGATG 52642102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GCACAAAAATAAGATTGTCGTTCTGAAAACACAGAAGATTTGTATGTTTCCCCCAGGATG 2640

 52642103 AAATGGTGGCATCTTTCTCCCAATTCACAGCTCTGTGGGCTTGTGGCTGGAATTCCAATC 52642162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 AAATGGTGGCATCTTTCTCCCAATTCACAGCTCTGTGGGCTTGTGGCTGGAATTCCAATC 2700

 52642163 CAGCAGGGAGCAAGCCATAAAAATGGGGGGAAGGGCTGCTGGAGGGAGGCAGTAGATGCG 52642222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CAGCAGGGAGCAAGCCATAAAAATGGGGGGAAGGGCTGCTGGAGGGAGGCAGTAGATGCG 2760

 52642223 GCTGAGCCCAAGGCATAATTCACCCTAAGAATTCTGAATCAATACACTGACATCCAGCCA 52642282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GCTGAGCCCAAGGCATAATTCACCCTAAGAATTCTGAATCAATACACTGACATCCAGCCA 2820

 52642283 TGTACAATGTGGTACTCCCACCAAGAAAGCCACTGATTGAGAAGTTTTATTCATGTTACT 52642342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TGTACAATGTGGTACTCCCACCAAGAAAGCCACTGATTGAGAAGTTTTATTCATGTTACT 2880

 52642343 TTCTGAGGGTTGGATTGTCCCATTACATTTATAGAACAATTGCTTTTTTCCCCCTAAATA 52642402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TTCTGAGGGTTGGATTGTCCCATTACATTTATAGAACAATTGCTTTTTTCCCCCTAAATA 2940

 52642403 CAGAACTATGCAGCCGGGAGTCAGAAAAGAAACCTTGACAATCAGAAGGCTGTTTTGTTG 52642462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CAGAACTATGCAGCCGGGAGTCAGAAAAGAAACCTTGACAATCAGAAGGCTGTTTTGTTG 3000

 52642463 TTGTTGTTAAAAACCTTTGCAGGCATATGCATCTGAATATCCATAAGTTCACAGGCTGAG 52642522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TTGTTGTTAAAAACCTTTGCAGGCATATGCATCTGAATATCCATAAGTTCACAGGCTGAG 3060

 52642523 GGAGAAATGGCTATTTCATAACTTTTCTGTGTTTCTCATGTACATAGTACAAAGTGGGCA 52642582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 GGAGAAATGGCTATTTCATAACTTTTCTGTGTTTCTCATGTACATAGTACAAAGTGGGCA 3120

 52642583 CTCAGTATTTCAAATTTCAATATCACTGAAAAAAATGGAAATTTGTCATGTAACAAAATC 52642642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 CTCAGTATTTCAAATTTCAATATCACTGAAAAAAATGGAAATTTGTCATGTAACAAAATC 3180

 52642643 AGATGCAGACTTCACTGGTGAATCTGAGGGAGTGAATTCACTTATTCAGAAAGGAAGACA 52642702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 AGATGCAGACTTCACTGGTGAATCTGAGGGAGTGAATTCACTTATTCAGAAAGGAAGACA 3240

 52642703 GTTACAATTCTTGGGTCTTCTGAGAGATCATTATAACTTGAAAATATTACACAAGGGCTT 52642762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 GTTACAATTCTTGGGTCTTCTGAGAGATCATTATAACTTGAAAATATTACACAAGGGCTT 3300

 52642763 TGCTATATTAGATACCTGCCATGTTCCTAACACAAGCTCCCATTTTCTGACTCAAATCTC 52642822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TGCTATATTAGATACCTGCCATGTTCCTAACACAAGCTCCCATTTTCTGACTCAAATCTC 3360

 52642823 ATTTTGGAACACATTCCACTCAAATTGAGGTTCTACCCCTAAGAGTTCTTTTTCAATAAA 52642882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 ATTTTGGAACACATTCCACTCAAATTGAGGTTCTACCCCTAAGAGTTCTTTTTCAATAAA 3420

 52642883 GAAAGCTGAGTTAATAAATCACAACTCCAAAACTTTTCCTCACTTTTCTTAGACTAGAAA 52642942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 GAAAGCTGAGTTAATAAATCACAACTCCAAAACTTTTCCTCACTTTTCTTAGACTAGAAA 3480

 52642943 TAGATTGAGTGTGTCGAGGTTTTATGGCTGAGTACATTGGAGGGCTGGCTATTCTATGCT 52643002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TAGATTGAGTGTGTCGAGGTTTTATGGCTGAGTACATTGGAGGGCTGGCTATTCTATGCT 3540

 52643003 GAACTGGTTTACTTGATTAAGATGGGGATTTGGATGAGTCACCGGACACCTGTCCAAAGA 52643062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 GAACTGGTTTACTTGATTAAGATGGGGATTTGGATGAGTCACCGGACACCTGTCCAAAGA 3600

 52643063 TGAGTAAAACACATTCCTTCATTGTCTTCCCATAAATAACTCAATCTTCTCCTAACTGAG 52643122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 TGAGTAAAACACATTCCTTCATTGTCTTCCCATAAATAACTCAATCTTCTCCTAACTGAG 3660

 52643123 CCAATGGATAGGCTTTGGATGCCCAAGCAAAACAAACACATGACTGTTAAAAAATCACAA 52643182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 CCAATGGATAGGCTTTGGATGCCCAAGCAAAACAAACACATGACTGTTAAAAAATCACAA 3720

 52643183 CCTCAAAATGGCCTTAGAAGCCTATGACCAATAATGAGAATGGTTTCTCCACTCAGGCGC 52643242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 CCTCAAAATGGCCTTAGAAGCCTATGACCAATAATGAGAATGGTTTCTCCACTCAGGCGC 3780

 52643243 AAGTAGTAAACAGTTTCTCCCATATGCAGGAATATTGACGACTAGTTTACCGCCTCTGGG 52643302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 AAGTAGTAAACAGTTTCTCCCATATGCAGGAATATTGACGACTAGTTTACCGCCTCTGGG 3840

 52643303 CACGTAACTTTCAGGTCCTGGTTCATGCATTTGCTGGAATGTTCCCTGGGCCATGGAGCC 52643362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 CACGTAACTTTCAGGTCCTGGTTCATGCATTTGCTGGAATGTTCCCTGGGCCATGGAGCC 3900

 52643363 CAGTTCTCCTGGCATCTGGCATCTCCCCCACACTCTGCTCCCCCAGCACAGCACTTGGCA 52643422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 CAGTTCTCCTGGCATCTGGCATCTCCCCCACACTCTGCTCCCCCAGCACAGCACTTGGCA 3960

 52643423 TCTTGCATTGCAATTGCAGGTTTATTTATTCACTTCTCTCACTGGACAGCAAACTCCACC 52643482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 TCTTGCATTGCAATTGCAGGTTTATTTATTCACTTCTCTCACTGGACAGCAAACTCCACC 4020

 52643483 AGGGCCGAGACTCTGTGTCTCGCCCTTCACTGTGGTCCCTGTGCCTCACCTGTTCCTAGT 52643542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 AGGGCCGAGACTCTGTGTCTCGCCCTTCACTGTGGTCCCTGTGCCTCACCTGTTCCTAGT 4080

 52643543 ACAGTGTCACACTCAGTAAAGAGCAGATGCCTGGTGCATTTGGAGACTTATTTTAAATTA 52643602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 ACAGTGTCACACTCAGTAAAGAGCAGATGCCTGGTGCATTTGGAGACTTATTTTAAATTA 4140

 52643603 TACGGAAAGTTATTCAACCGGCTTCTTGAACTGGTGAATTTTGGAAAGTGGGTGTTTGAA 52643662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 TACGGAAAGTTATTCAACCGGCTTCTTGAACTGGTGAATTTTGGAAAGTGGGTGTTTGAA 4200

 52643663 GGGAAAATGTTTAAACTCTGAAAGAAATGTTGGAAATAAGCTCTTTGAATCAAAATGTAT 52643722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 GGGAAAATGTTTAAACTCTGAAAGAAATGTTGGAAATAAGCTCTTTGAATCAAAATGTAT 4260

 52643723 AGAAAACACAAGAATGCTGACAGTAAGAGCCTAAAACACATGATGACTATTATCTTTTCC 52643782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 AGAAAACACAAGAATGCTGACAGTAAGAGCCTAAAACACATGATGACTATTATCTTTTCC 4320

 52643783 CAATTTTAACTCTCCAGAGTGTTCAGCGGTGCCCAGCCTTCATAATGTAATTCTTCGTAG 52643842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 CAATTTTAACTCTCCAGAGTGTTCAGCGGTGCCCAGCCTTCATAATGTAATTCTTCGTAG 4380

 52643843 CACCCTGGATGCATTAAAACCATAGATTAACGTGATACTTATTTTCATTAAGGAAAATAA 52643902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 CACCCTGGATGCATTAAAACCATAGATTAACGTGATACTTATTTTCATTAAGGAAAATAA 4440

 52643903 TTTACGTACAGTGCTCAGAGTAGAGCCTGGCACATTGAACATTTTCAATAAATGACAGCA 52643962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 TTTACGTACAGTGCTCAGAGTAGAGCCTGGCACATTGAACATTTTCAATAAATGACAGCA 4500

 52643963 AGTGTAATTATTAGCACTTCGGAAGTGCAAAGTTGCATTGTATTAAGACAAATATATTTG 52644022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 AGTGTAATTATTAGCACTTCGGAAGTGCAAAGTTGCATTGTATTAAGACAAATATATTTG 4560

 52644023 GAGCTCATCCAATTTTTTCCTGGCTCTGAAGTCTGCTAGTGGCACTTAACTTTATTCCCA 52644082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 GAGCTCATCCAATTTTTTCCTGGCTCTGAAGTCTGCTAGTGGCACTTAACTTTATTCCCA 4620

 52644083 AGTTTTGAAAAATATTGTTATTTAAAAAGTCTGTTAACCAAGGAAATGCATGCCCTAAAC 52644142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 AGTTTTGAAAAATATTGTTATTTAAAAAGTCTGTTAACCAAGGAAATGCATGCCCTAAAC 4680

 52644143 CTATAATGTATCAAGTTTTACTTCCTTCTTCTTTTAAGGAGTTCTTTTCCTGCCTTGAAT 52644202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 CTATAATGTATCAAGTTTTACTTCCTTCTTCTTTTAAGGAGTTCTTTTCCTGCCTTGAAT 4740

 52644203 ACAAACAGGCTCTCTCAAGGTTAAAAGCAAATGCTCTTTTTAGTGTCAAAAAGAGCTTGC 52644262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 ACAAACAGGCTCTCTCAAGGTTAAAAGCAAATGCTCTTTTTAGTGTCAAAAAGAGCTTGC 4800

 52644263 CTTTCTTCGCTCAGGAAAAAAAGCAACTGATTCCAGGATACCTTCTTTGAAAACCAACAC 52644322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 CTTTCTTCGCTCAGGAAAAAAAGCAACTGATTCCAGGATACCTTCTTTGAAAACCAACAC 4860

 52644323 AAAAAAACCCCCCAAAAAACAAAAAAAAAACCCAAAACCCCTAGTTTTTACAAAGGTTTA 52644382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 AAAAAAACCCCCCAAAAAACAAAAAAAAAACCCAAAACCCCTAGTTTTTACAAAGGTTTA 4920

 52644383 TTACTCCTACTTGTTGGAAAAGAATTACTACATAAAAGAGTCTGCCCAGAGCTGTAAAAT 52644442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 TTACTCCTACTTGTTGGAAAAGAATTACTACATAAAAGAGTCTGCCCAGAGCTGTAAAAT 4980

 52644443 CTCCTTATTCAAACACACACCTTAGAGCAAAAGATGGTTAAATATCAATTCAGGCTATTA 52644502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 CTCCTTATTCAAACACACACCTTAGAGCAAAAGATGGTTAAATATCAATTCAGGCTATTA 5040

 52644503 ACAGTAAGGGACGAAATGTGTTCCAACAAAACTCTGCATGTCAACAAACTACAGAGACTA 52644562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 ACAGTAAGGGACGAAATGTGTTCCAACAAAACTCTGCATGTCAACAAACTACAGAGACTA 5100

 52644563 GGTAACATCTTTTAGGAATCATTTTTATTCCACTAATGCCTTTTCCTCCAGAATCCACTG 52644622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 GGTAACATCTTTTAGGAATCATTTTTATTCCACTAATGCCTTTTCCTCCAGAATCCACTG 5160

 52644623 ATCGTAAACGCAACCTGTCTACTTCCGCCTTTGAAAAATGGATGGACAAATTCATCTGCA 52644682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 ATCGTAAACGCAACCTGTCTACTTCCGCCTTTGAAAAATGGATGGACAAATTCATCTGCA 5220

 52644683 TGTAACTCACCTCCTCTTTTCTTTTACATAAAACAGATGCCACAGCTGTTATTGTTCTTC 52644742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 TGTAACTCACCTCCTCTTTTCTTTTACATAAAACAGATGCCACAGCTGTTATTGTTCTTC 5280

 52644743 ACACAGAAGTTTCTACCCAGAGAAACATCAGGATGACACTCTGCTGCAATGTGCTATTTG 52644802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 ACACAGAAGTTTCTACCCAGAGAAACATCAGGATGACACTCTGCTGCAATGTGCTATTTG 5340

 52644803 TTCTAGAGGGGTCAACAGCTTGCCACCTTGCCTAGGCCCAGGGTGACTGCATATGTGCAG 52644862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 TTCTAGAGGGGTCAACAGCTTGCCACCTTGCCTAGGCCCAGGGTGACTGCATATGTGCAG 5400

 52644863 TGGTCTTATCCCATTAGCGCCCCCGAGCATGCATTCAGAACCAAGTGGATACACCTTGGC 52644922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 TGGTCTTATCCCATTAGCGCCCCCGAGCATGCATTCAGAACCAAGTGGATACACCTTGGC 5460

 52644923 ACACTTACCTTCCCTGCAGGGACATCATCGGACTGCCCTGATAAGCCAGGAACCTCATCC 52644982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 ACACTTACCTTCCCTGCAGGGACATCATCGGACTGCCCTGATAAGCCAGGAACCTCATCC 5520

 52644983 ACCTTGTCTTGATGCTCTGCCCTCTTGGCTTCCTGTTGGCTGTCACCTGGCACCTTTTCC 52645042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 ACCTTGTCTTGATGCTCTGCCCTCTTGGCTTCCTGTTGGCTGTCACCTGGCACCTTTTCC 5580

 52645043 TGTCCCTTGTCCAGCTTGAAGAATTTGTCAAAAAAGCTGGAGTCCTTGGGCTTGGAGGGA 52645102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 TGTCCCTTGTCCAGCTTGAAGAATTTGTCAAAAAAGCTGGAGTCCTTGGGCTTGGAGGGA 5640

 52645103 GCTTCTCCTCCTGCTCCCCCTGTCTCAGGTGGGAGAAGCGTGGGATCCCTGGCGGCAGAG 52645162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 GCTTCTCCTCCTGCTCCCCCTGTCTCAGGTGGGAGAAGCGTGGGATCCCTGGCGGCAGAG 5700

 52645163 AGGACCTTGTCTTGGGCCGGGGCGTGCCCTGGGGTTTTATCTGTGTCCTGCCCCGGTCCA 52645222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5701 AGGACCTTGTCTTGGGCCGGGGCGTGCCCTGGGGTTTTATCTGTGTCCTGCCCCGGTCCA 5760

 52645223 GCTGCCACCGGAAGTGTCCAGCTCTCACTTGGGTCTTTGTTCGCTGGAGCTTTATTGGAG 52645282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5761 GCTGCCACCGGAAGTGTCCAGCTCTCACTTGGGTCTTTGTTCGCTGGAGCTTTATTGGAG 5820

 52645283 CTGACATCAAGCTTCACTGATCCAAGGGATGAATCTGCGGCTTGGTCTCCGGTACGTCCT 52645342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5821 CTGACATCAAGCTTCACTGATCCAAGGGATGAATCTGCGGCTTGGTCTCCGGTACGTCCT 5880

 52645343 GGTACAGGCCGAGAGAGCATCAAGAAAAAACGAGATTTAGCAGCTGGTGCCTCGGGTTTG 52645402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5881 GGTACAGGCCGAGAGAGCATCAAGAAAAAACGAGATTTAGCAGCTGGTGCCTCGGGTTTG 5940

 52645403 GCCTCTTTCCCAAGATTCTTTCCGTTGGCATCCGCAACAGCACTTATCTCCGTTGTCTCG 52645462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5941 GCCTCTTTCCCAAGATTCTTTCCGTTGGCATCCGCAACAGCACTTATCTCCGTTGTCTCG 6000

 52645463 GGGGAAGAAGTGGCCACATTATCCGTCTTGACACTTATTCCCAAGTCGACTGTAAACACA 52645522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6001 GGGGAAGAAGTGGCCACATTATCCGTCTTGACACTTATTCCCAAGTCGACTGTAAACACA 6060

 52645523 AACATAAACAGTGGTTATTCAGCCAAGCCGGGAAATTCAGGCACTAATAATGGACTCCAG 52645582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6061 AACATAAACAGTGGTTATTCAGCCAAGCCGGGAAATTCAGGCACTAATAATGGACTCCAG 6120

 52645583 ACATTTTTTATACAAAAGCCATACTGCATACTGGAACTGTGTTGTTCTCTGGTCATTCTG 52645642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6121 ACATTTTTTATACAAAAGCCATACTGCATACTGGAACTGTGTTGTTCTCTGGTCATTCTG 6180

 52645643 AAAGGCAGAAGTTAGCTCTCTACATCTCCTTGGACCCTGCTTTTCTTGGGAGAGGAGAAG 52645702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6181 AAAGGCAGAAGTTAGCTCTCTACATCTCCTTGGACCCTGCTTTTCTTGGGAGAGGAGAAG 6240

 52645703 GCAAGGTTGGTGAGGAGGGAAAGCTACTTAATGGAAAGTCACTAGCTGCCAGGTGTGGAA 52645762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6241 GCAAGGTTGGTGAGGAGGGAAAGCTACTTAATGGAAAGTCACTAGCTGCCAGGTGTGGAA 6300

 52645763 TGAGTGATATTCAATGTTAATTAATCTTCTTTTATCTGTGTAAGAACTCCGTGAGCAGCA 52645822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6301 TGAGTGATATTCAATGTTAATTAATCTTCTTTTATCTGTGTAAGAACTCCGTGAGCAGCA 6360

 52645823 TATTGTCATGATGTCAACTGGGAGGCAGTACAGCAGTTAGGAGCTTGGGTTCTGGAGCTA 52645882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6361 TATTGTCATGATGTCAACTGGGAGGCAGTACAGCAGTTAGGAGCTTGGGTTCTGGAGCTA 6420

 52645883 GAACAAGGTTTCTCAACCTCAGCACTACTCACATTTGAAGCCAGATTATTCTTTGTTAGG 52645942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6421 GAACAAGGTTTCTCAACCTCAGCACTACTCACATTTGAAGCCAGATTATTCTTTGTTAGG 6480

 52645943 GAGGCTCATCCCGTGCCTCATAGGCTGATTAGCAGCATCCTGGCCTCTGCCCACTAGACG 52646002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6481 GAGGCTCATCCCGTGCCTCATAGGCTGATTAGCAGCATCCTGGCCTCTGCCCACTAGACG 6540

 52646003 CCGGTCACATTTCCCAGTCATGGCAACCAAAAATATCTCTAGGCATTGCTAAATGTCCCC 52646062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6541 CCGGTCACATTTCCCAGTCATGGCAACCAAAAATATCTCTAGGCATTGCTAAATGTCCCC 6600

 52646063 TGGAGGACAAAATCTCTTACGTTTGAGAGGCACTGAGCTGAAATGTCTTTTTGAATCCAG 52646122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6601 TGGAGGACAAAATCTCTTACGTTTGAGAGGCACTGAGCTGAAATGTCTTTTTGAATCCAG 6660

 52646123 ATTATCTAATTTTCTGTGCCTCAACTTTCTGGTAAAAGGAGACAGATAATAAATCTCGTA 52646182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6661 ATTATCTAATTTTCTGTGCCTCAACTTTCTGGTAAAAGGAGACAGATAATAAATCTCGTA 6720

 52646183 ATTTTGTTAGGAAGATTACATGAGTTAATAGTTTTAAAGCAAGTACAATAGCACCTGGAA 52646242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6721 ATTTTGTTAGGAAGATTACATGAGTTAATAGTTTTAAAGCAAGTACAATAGCACCTGGAA 6780

 52646243 TATATTAAGTGCTTAATAAATATCACAAACATTAGTTATCATTATTCATGAGTGAGAAAA 52646302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6781 TATATTAAGTGCTTAATAAATATCACAAACATTAGTTATCATTATTCATGAGTGAGAAAA 6840

 52646303 CTGACAGTCAGAGAGGTCAGTACACCCTCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCTAGTAAGCAGCA 52646362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6841 CTGACAGTCAGAGAGGTCAGTACACCCTCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCTAGTAAGCAGCA 6900

 52646363 GAGTCTGGCTTCAGGCAGAAATCTGACTTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGTCTTACCAGGG 52646422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6901 GAGTCTGGCTTCAGGCAGAAATCTGACTTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGTCTTACCAGGG 6960

 52646423 ACTTGTATTAGCATAGACTGTTAAGAATATGGGAAGATTTTTAAAATACAGTACTCAGAA 52646482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6961 ACTTGTATTAGCATAGACTGTTAAGAATATGGGAAGATTTTTAAAATACAGTACTCAGAA 7020

 52646483 AATTTCTCTTTGAAAGGCTGGAAGAGCAGATATCCACACAAGAAGGCAAATTAGACCTCA 52646542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7021 AATTTCTCTTTGAAAGGCTGGAAGAGCAGATATCCACACAAGAAGGCAAATTAGACCTCA 7080

 52646543 GGCCAGTGTGGAATTAAAGGTGTAGGGTTATCTGGTCAAGACTGTGTGTGTGGATACAGG 52646602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7081 GGCCAGTGTGGAATTAAAGGTGTAGGGTTATCTGGTCAAGACTGTGTGTGTGGATACAGG 7140

 52646603 CTCCAACCCCTCCAGGCAAGGGCACTGTTTCCAACATCCACCCTTTCTCCTTTGACCTCT 52646662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7141 CTCCAACCCCTCCAGGCAAGGGCACTGTTTCCAACATCCACCCTTTCTCCTTTGACCTCT 7200

 52646663 ACCTTGACCTAAATTAACTATAAAAGGTCCTTCTTTTCTAGGACCCTACTATAAATCAGT 52646722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7201 ACCTTGACCTAAATTAACTATAAAAGGTCCTTCTTTTCTAGGACCCTACTATAAATCAGT 7260

 52646723 GAAATATTCAGGAAAAAAAGAACACCAAGAATGTTGGGATCCCAGTTAAAGATCAAGATT 52646782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7261 GAAATATTCAGGAAAAAAAGAACACCAAGAATGTTGGGATCCCAGTTAAAGATCAAGATT 7320

 52646783 CTCTACTGATAAGCTGTGTGATATGGAGTAAATCACTAAAGATCTTTGAATCTCTTCATT 52646842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7321 CTCTACTGATAAGCTGTGTGATATGGAGTAAATCACTAAAGATCTTTGAATCTCTTCATT 7380

 52646843 TGTAAAATGGGAATATTGGTAGTCCTACTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTAAAGAAGAAAA 52646902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7381 TGTAAAATGGGAATATTGGTAGTCCTACTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTAAAGAAGAAAA 7440

 52646903 GTCATGCAAAGGATCTGGCACAACGCCTTTTCCATAATAAGTGCTTAGTAATTGACAGAT 52646962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7441 GTCATGCAAAGGATCTGGCACAACGCCTTTTCCATAATAAGTGCTTAGTAATTGACAGAT 7500

 52646963 ACTGTGATAACTTTTCAGGTTTCTCTCATGCCTTTGACAACATTGCATTTTGCTTGCTCT 52647022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7501 ACTGTGATAACTTTTCAGGTTTCTCTCATGCCTTTGACAACATTGCATTTTGCTTGCTCT 7560

 52647023 ATCTGTAGTCAGACACTTCTTAATATCTGTTTGCAGGAAGACAGAAAAATAAAGGGAAGA 52647082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7561 ATCTGTAGTCAGACACTTCTTAATATCTGTTTGCAGGAAGACAGAAAAATAAAGGGAAGA 7620

 52647083 ATTGAGATTTCTTTGATCTATTCATACTGCTCATTAATATGTAGTGAGAAATACATACAC 52647142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7621 ATTGAGATTTCTTTGATCTATTCATACTGCTCATTAATATGTAGTGAGAAATACATACAC 7680

 52647143 ACACACATACACACACATGCATCCATTAGCAATTGTTTTTGCCCAACTCTAGTGTCTCGC 52647202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7681 ACACACATACACACACATGCATCCATTAGCAATTGTTTTTGCCCAACTCTAGTGTCTCGC 7740

 52647203 AGTGTCTAGACTAAACAACAAACAAAAAAGGGGGGAGAGTGAGCTGGATTAAGCATTGAG 52647262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7741 AGTGTCTAGACTAAACAACAAACAAAAAAGGGGGGAGAGTGAGCTGGATTAAGCATTGAG 7800

 52647263 GCACAGTGAAGAAATGGTCTGGGGCAAGCCCAGGGATGAATGTTAGGGGTTTCTCATAAA 52647322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7801 GCACAGTGAAGAAATGGTCTGGGGCAAGCCCAGGGATGAATGTTAGGGGTTTCTCATAAA 7860

 52647323 CCTGAACCTGAAGAAAATCACCCTGCCAGCATATTGATCTTCTAGCTCTTCTTAACCTTT 52647382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7861 CCTGAACCTGAAGAAAATCACCCTGCCAGCATATTGATCTTCTAGCTCTTCTTAACCTTT 7920

 52647383 TTTTCTGTGATTCAGGAATTCATAATGATAGAAAATATTATACTAAAGAAGAAAAAAAGA 52647442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7921 TTTTCTGTGATTCAGGAATTCATAATGATAGAAAATATTATACTAAAGAAGAAAAAAAGA 7980

 52647443 GGGAGAATAAGTAAGTGATAGATGGATGCATCAGGGTGTAAAGTTAGCAAGTAAGGCTGT 52647502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7981 GGGAGAATAAGTAAGTGATAGATGGATGCATCAGGGTGTAAAGTTAGCAAGTAAGGCTGT 8040

 52647503 TGAAGTGTCAGAGTGAATATAAATGAATTGTGGGAATGGTCCATGCCAGGAGAAGAGGGT 52647562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8041 TGAAGTGTCAGAGTGAATATAAATGAATTGTGGGAATGGTCCATGCCAGGAGAAGAGGGT 8100

 52647563 ATGGTTGACAAAAAGGGAAATGCTAAGATTCAAAACAGGGAAGGGCTTTTCAAAATGCCA 52647622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8101 ATGGTTGACAAAAAGGGAAATGCTAAGATTCAAAACAGGGAAGGGCTTTTCAAAATGCCA 8160

 52647623 AGAGCACCAACTTATATCTTTCAGTTTAATTCCTCTCTTCCTTACCCACTGGCTGGAAAG 52647682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8161 AGAGCACCAACTTATATCTTTCAGTTTAATTCCTCTCTTCCTTACCCACTGGCTGGAAAG 8220

 52647683 CAAAGGAGCTAGTGGTAAGTAAGAGTGTTATAGCCAGAGAAAAAGTCTTCAAAAAACACA 52647742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8221 CAAAGGAGCTAGTGGTAAGTAAGAGTGTTATAGCCAGAGAAAAAGTCTTCAAAAAACACA 8280

 52647743 AAGTACTTTCCATGGACAACCTTTTTTATTTTAAAGTGCCAATATGTTGCTTTGAAAAAG 52647802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8281 AAGTACTTTCCATGGACAACCTTTTTTATTTTAAAGTGCCAATATGTTGCTTTGAAAAAG 8340

 52647803 AATAAATTCCTTACATCCAGGTATCTGGACTAGACTTCAGTGCATTTAGTGATTATAGCA 52647862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8341 AATAAATTCCTTACATCCAGGTATCTGGACTAGACTTCAGTGCATTTAGTGATTATAGCA 8400

 52647863 AATCCAAACAGTAGCTTTTGATATCAGAGAATGGGTAAAGTGTTTTTGACAATTTCTAAG 52647922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8401 AATCCAAACAGTAGCTTTTGATATCAGAGAATGGGTAAAGTGTTTTTGACAATTTCTAAG 8460

 52647923 AACTTAGAGTTCTTCGGTGATACGTTCCATGCAACTGAAGCTCTGCTCTCCAAATTTAGG 52647982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8461 AACTTAGAGTTCTTCGGTGATACGTTCCATGCAACTGAAGCTCTGCTCTCCAAATTTAGG 8520

 52647983 TGGGTACATACCCAAGTCCATCACCTGGGGCTTCTATTTCCTTTGCTCAGATGCTCACCT 52648042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8521 TGGGTACATACCCAAGTCCATCACCTGGGGCTTCTATTTCCTTTGCTCAGATGCTCACCT 8580

 52648043 CCTAGGTGGGCACCTGACATAAGATAGACTAATAAAAATAAGTCCTGTAACTTTTGATAC 52648102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8581 CCTAGGTGGGCACCTGACATAAGATAGACTAATAAAAATAAGTCCTGTAACTTTTGATAC 8640

 52648103 TCCTATTAAAAAAGAGTTGCAAACCAATAGGAGGTACACTTGAGAATCAGCACAAATGAA 52648162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8641 TCCTATTAAAAAAGAGTTGCAAACCAATAGGAGGTACACTTGAGAATCAGCACAAATGAA 8700

 52648163 AGTAGAACCTGGAAATCCAGGAAGCAGATACCCAATCATGTCATTTAAACATTTAGATCC 52648222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8701 AGTAGAACCTGGAAATCCAGGAAGCAGATACCCAATCATGTCATTTAAACATTTAGATCC 8760

 52648223 AGCTGTGCCTGAAGCTGAACTTTAGCATTACATAAGCCAATAAATCACTCTTCCCCAACT 52648282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8761 AGCTGTGCCTGAAGCTGAACTTTAGCATTACATAAGCCAATAAATCACTCTTCCCCAACT 8820

 52648283 TACGCCAGTTGAAATTGAATACATACTCAGTGACTTTGAGAGAATTCCAGGGAATTGGTC 52648342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8821 TACGCCAGTTGAAATTGAATACATACTCAGTGACTTTGAGAGAATTCCAGGGAATTGGTC 8880

 52648343 AGTCCCTGTTTCACTTGTAAATACACAGCAATCAAGCCTACCAAATCTATGATTGATTGG 52648402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8881 AGTCCCTGTTTCACTTGTAAATACACAGCAATCAAGCCTACCAAATCTATGATTGATTGG 8940

 52648403 GGTGTCTGAAAGAGATGGAGGGAATGGAATCAACCTGAAAAACATATTTCAGGAGTTCAT 52648462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8941 GGTGTCTGAAAGAGATGGAGGGAATGGAATCAACCTGAAAAACATATTTCAGGAGTTCAT 9000

 52648463 CCCTGAAAACTTCCCCAACCTAGCTAGAGGGGCCAACATTCAAATTCAGGAAATGCAGAG 52648522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9001 CCCTGAAAACTTCCCCAACCTAGCTAGAGGGGCCAACATTCAAATTCAGGAAATGCAGAG 9060

 52648523 AACCCCAGTAAGATACTCCACAAAAAGATCTTCCCCAAGACATCATCATCAGATTCTCCA 52648582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9061 AACCCCAGTAAGATACTCCACAAAAAGATCTTCCCCAAGACATCATCATCAGATTCTCCA 9120

 52648583 AAGTTGAAATGTAAGAAAAAATGCTAAAGGCAACTAGAGTGAAAGGCCCGGTCACCTAAA 52648642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9121 AAGTTGAAATGTAAGAAAAAATGCTAAAGGCAACTAGAGTGAAAGGCCCGGTCACCTAAA 9180

 52648643 AAGGGAAGCACAGACTTACAGTGGACCTCTCACTGGTAACCCTACAAGCCAGAAGAGATT 52648702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9181 AAGGGAAGCACAGACTTACAGTGGACCTCTCACTGGTAACCCTACAAGCCAGAAGAGATT 9240

 52648703 GAGGACCAATATTCAACATTCTTAAACAAAAAGAATTCCAACCCAGAATTTTATATCTGA 52648762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9241 GAGGACCAATATTCAACATTCTTAAACAAAAAGAATTCCAACCCAGAATTTTATATCTGA 9300

 52648763 CTAAACTAAGCTTCATAAGCAAAAGAGAAATAAGATCATTTTCAGACAAGCAAATGCTAA 52648822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9301 CTAAACTAAGCTTCATAAGCAAAAGAGAAATAAGATCATTTTCAGACAAGCAAATGCTAA 9360

 52648823 GGGAATTTGTGACCATTAGACCTTCCTTGCAACAGTTCCTAAAGGAAGCACTAAATATGG 52648882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9361 GGGAATTTGTGACCATTAGACCTTCCTTGCAACAGTTCCTAAAGGAAGCACTAAATATGG 9420

 52648883 AAAGACCATTACCAGACACTACAAAACACACTGAAGTACACAGACCAGTGACATTGTAAA 52648942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9421 AAAGACCATTACCAGACACTACAAAACACACTGAAGTACACAGACCAGTGACATTGTAAA 9480

 52648943 GCAACTACATAACAAGTCTGCAAAATAACCAGCCAACATCATGATGACGGTATCAAATCG 52649002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9481 GCAACTACATAACAAGTCTGCAAAATAACCAGCCAACATCATGATGACGGTATCAAATCG 9540

 52649003 ACACATAGCAACACTAACCTTAAATGTAAATGGACTAAATGATCCCATTAAAAGACATAA 52649062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9541 ACACATAGCAACACTAACCTTAAATGTAAATGGACTAAATGATCCCATTAAAAGACATAA 9600

 52649063 AGTGGCAGGCTGGATAAAGAACCAAGAACCATTGGTATACTGTCTTCAAGAGACCCATCT 52649122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9601 AGTGGCAGGCTGGATAAAGAACCAAGAACCATTGGTATACTGTCTTCAAGAGACCCATCT 9660

 52649123 CCTATGCAGTGACACACATAGGTTC 52649147
          |||||||||||||||||||||||||
     9661 CCTATGCAGTGACACACATAGGTTC 9685

Alignment time is 9.74593 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [52637064,52668002] =>     30939 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    2012] =>      2012 nucs 'mol-32-3046-166334_2012'

Score:        2012
Aligned:      2012        nucs
Identic:      2012 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [52646416,52648427]
 second seq =>  [       1,    2012]

 52646416 ACCAGGGACTTGTATTAGCATAGACTGTTAAGAATATGGGAAGATTTTTAAAATACAGTA 52646475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACCAGGGACTTGTATTAGCATAGACTGTTAAGAATATGGGAAGATTTTTAAAATACAGTA 60

 52646476 CTCAGAAAATTTCTCTTTGAAAGGCTGGAAGAGCAGATATCCACACAAGAAGGCAAATTA 52646535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTCAGAAAATTTCTCTTTGAAAGGCTGGAAGAGCAGATATCCACACAAGAAGGCAAATTA 120

 52646536 GACCTCAGGCCAGTGTGGAATTAAAGGTGTAGGGTTATCTGGTCAAGACTGTGTGTGTGG 52646595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GACCTCAGGCCAGTGTGGAATTAAAGGTGTAGGGTTATCTGGTCAAGACTGTGTGTGTGG 180

 52646596 ATACAGGCTCCAACCCCTCCAGGCAAGGGCACTGTTTCCAACATCCACCCTTTCTCCTTT 52646655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATACAGGCTCCAACCCCTCCAGGCAAGGGCACTGTTTCCAACATCCACCCTTTCTCCTTT 240

 52646656 GACCTCTACCTTGACCTAAATTAACTATAAAAGGTCCTTCTTTTCTAGGACCCTACTATA 52646715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GACCTCTACCTTGACCTAAATTAACTATAAAAGGTCCTTCTTTTCTAGGACCCTACTATA 300

 52646716 AATCAGTGAAATATTCAGGAAAAAAAGAACACCAAGAATGTTGGGATCCCAGTTAAAGAT 52646775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AATCAGTGAAATATTCAGGAAAAAAAGAACACCAAGAATGTTGGGATCCCAGTTAAAGAT 360

 52646776 CAAGATTCTCTACTGATAAGCTGTGTGATATGGAGTAAATCACTAAAGATCTTTGAATCT 52646835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CAAGATTCTCTACTGATAAGCTGTGTGATATGGAGTAAATCACTAAAGATCTTTGAATCT 420

 52646836 CTTCATTTGTAAAATGGGAATATTGGTAGTCCTACTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTAAAG 52646895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTTCATTTGTAAAATGGGAATATTGGTAGTCCTACTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTAAAG 480

 52646896 AAGAAAAGTCATGCAAAGGATCTGGCACAACGCCTTTTCCATAATAAGTGCTTAGTAATT 52646955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAGAAAAGTCATGCAAAGGATCTGGCACAACGCCTTTTCCATAATAAGTGCTTAGTAATT 540

 52646956 GACAGATACTGTGATAACTTTTCAGGTTTCTCTCATGCCTTTGACAACATTGCATTTTGC 52647015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GACAGATACTGTGATAACTTTTCAGGTTTCTCTCATGCCTTTGACAACATTGCATTTTGC 600

 52647016 TTGCTCTATCTGTAGTCAGACACTTCTTAATATCTGTTTGCAGGAAGACAGAAAAATAAA 52647075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTGCTCTATCTGTAGTCAGACACTTCTTAATATCTGTTTGCAGGAAGACAGAAAAATAAA 660

 52647076 GGGAAGAATTGAGATTTCTTTGATCTATTCATACTGCTCATTAATATGTAGTGAGAAATA 52647135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGGAAGAATTGAGATTTCTTTGATCTATTCATACTGCTCATTAATATGTAGTGAGAAATA 720

 52647136 CATACACACACACATACACACACATGCATCCATTAGCAATTGTTTTTGCCCAACTCTAGT 52647195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CATACACACACACATACACACACATGCATCCATTAGCAATTGTTTTTGCCCAACTCTAGT 780

 52647196 GTCTCGCAGTGTCTAGACTAAACAACAAACAAAAAAGGGGGGAGAGTGAGCTGGATTAAG 52647255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GTCTCGCAGTGTCTAGACTAAACAACAAACAAAAAAGGGGGGAGAGTGAGCTGGATTAAG 840

 52647256 CATTGAGGCACAGTGAAGAAATGGTCTGGGGCAAGCCCAGGGATGAATGTTAGGGGTTTC 52647315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CATTGAGGCACAGTGAAGAAATGGTCTGGGGCAAGCCCAGGGATGAATGTTAGGGGTTTC 900

 52647316 TCATAAACCTGAACCTGAAGAAAATCACCCTGCCAGCATATTGATCTTCTAGCTCTTCTT 52647375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TCATAAACCTGAACCTGAAGAAAATCACCCTGCCAGCATATTGATCTTCTAGCTCTTCTT 960

 52647376 AACCTTTTTTTCTGTGATTCAGGAATTCATAATGATAGAAAATATTATACTAAAGAAGAA 52647435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AACCTTTTTTTCTGTGATTCAGGAATTCATAATGATAGAAAATATTATACTAAAGAAGAA 1020

 52647436 AAAAAGAGGGAGAATAAGTAAGTGATAGATGGATGCATCAGGGTGTAAAGTTAGCAAGTA 52647495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AAAAAGAGGGAGAATAAGTAAGTGATAGATGGATGCATCAGGGTGTAAAGTTAGCAAGTA 1080

 52647496 AGGCTGTTGAAGTGTCAGAGTGAATATAAATGAATTGTGGGAATGGTCCATGCCAGGAGA 52647555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AGGCTGTTGAAGTGTCAGAGTGAATATAAATGAATTGTGGGAATGGTCCATGCCAGGAGA 1140

 52647556 AGAGGGTATGGTTGACAAAAAGGGAAATGCTAAGATTCAAAACAGGGAAGGGCTTTTCAA 52647615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGAGGGTATGGTTGACAAAAAGGGAAATGCTAAGATTCAAAACAGGGAAGGGCTTTTCAA 1200

 52647616 AATGCCAAGAGCACCAACTTATATCTTTCAGTTTAATTCCTCTCTTCCTTACCCACTGGC 52647675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AATGCCAAGAGCACCAACTTATATCTTTCAGTTTAATTCCTCTCTTCCTTACCCACTGGC 1260

 52647676 TGGAAAGCAAAGGAGCTAGTGGTAAGTAAGAGTGTTATAGCCAGAGAAAAAGTCTTCAAA 52647735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGGAAAGCAAAGGAGCTAGTGGTAAGTAAGAGTGTTATAGCCAGAGAAAAAGTCTTCAAA 1320

 52647736 AAACACAAAGTACTTTCCATGGACAACCTTTTTTATTTTAAAGTGCCAATATGTTGCTTT 52647795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AAACACAAAGTACTTTCCATGGACAACCTTTTTTATTTTAAAGTGCCAATATGTTGCTTT 1380

 52647796 GAAAAAGAATAAATTCCTTACATCCAGGTATCTGGACTAGACTTCAGTGCATTTAGTGAT 52647855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GAAAAAGAATAAATTCCTTACATCCAGGTATCTGGACTAGACTTCAGTGCATTTAGTGAT 1440

 52647856 TATAGCAAATCCAAACAGTAGCTTTTGATATCAGAGAATGGGTAAAGTGTTTTTGACAAT 52647915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TATAGCAAATCCAAACAGTAGCTTTTGATATCAGAGAATGGGTAAAGTGTTTTTGACAAT 1500

 52647916 TTCTAAGAACTTAGAGTTCTTCGGTGATACGTTCCATGCAACTGAAGCTCTGCTCTCCAA 52647975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTCTAAGAACTTAGAGTTCTTCGGTGATACGTTCCATGCAACTGAAGCTCTGCTCTCCAA 1560

 52647976 ATTTAGGTGGGTACATACCCAAGTCCATCACCTGGGGCTTCTATTTCCTTTGCTCAGATG 52648035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ATTTAGGTGGGTACATACCCAAGTCCATCACCTGGGGCTTCTATTTCCTTTGCTCAGATG 1620

 52648036 CTCACCTCCTAGGTGGGCACCTGACATAAGATAGACTAATAAAAATAAGTCCTGTAACTT 52648095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CTCACCTCCTAGGTGGGCACCTGACATAAGATAGACTAATAAAAATAAGTCCTGTAACTT 1680

 52648096 TTGATACTCCTATTAAAAAAGAGTTGCAAACCAATAGGAGGTACACTTGAGAATCAGCAC 52648155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTGATACTCCTATTAAAAAAGAGTTGCAAACCAATAGGAGGTACACTTGAGAATCAGCAC 1740

 52648156 AAATGAAAGTAGAACCTGGAAATCCAGGAAGCAGATACCCAATCATGTCATTTAAACATT 52648215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AAATGAAAGTAGAACCTGGAAATCCAGGAAGCAGATACCCAATCATGTCATTTAAACATT 1800

 52648216 TAGATCCAGCTGTGCCTGAAGCTGAACTTTAGCATTACATAAGCCAATAAATCACTCTTC 52648275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TAGATCCAGCTGTGCCTGAAGCTGAACTTTAGCATTACATAAGCCAATAAATCACTCTTC 1860

 52648276 CCCAACTTACGCCAGTTGAAATTGAATACATACTCAGTGACTTTGAGAGAATTCCAGGGA 52648335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CCCAACTTACGCCAGTTGAAATTGAATACATACTCAGTGACTTTGAGAGAATTCCAGGGA 1920

 52648336 ATTGGTCAGTCCCTGTTTCACTTGTAAATACACAGCAATCAAGCCTACCAAATCTATGAT 52648395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ATTGGTCAGTCCCTGTTTCACTTGTAAATACACAGCAATCAAGCCTACCAAATCTATGAT 1980

 52648396 TGATTGGGGTGTCTGAAAGAGATGGAGGGAAT 52648427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TGATTGGGGTGTCTGAAAGAGATGGAGGGAAT 2012

Alignment time is 1.95857 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [52637064,52668002] =>     30939 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    3063] =>      3063 nucs 'mol-32-3046-172040_3063'

Score:        3001
Aligned:      3066        nucs
Identic:      3056 (100%) nucs =>      2671 (100%)       385 (100%)
Gaps:            6 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [52644387,52647064] EXCISED REGION [52658003,52658387]
 second seq =>  [       1,    2678] EXCISED REGION [    2679,    3063]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>     10938 nucs [52647065,52658002]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         6 nucs [52647065,52647070] to [52658003,52658008]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [52647065,52647067] to [52658000,52658002]
 second seq =>         0 nucs

 52644387 TCCTACTTGTTGGAAAAGAATTACTACATAAAAGAGTCTGCCCAGAGCTGTAAAATCTCC 52644446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCCTACTTGTTGGAAAAGAATTACTACATAAAAGAGTCTGCCCAGAGCTGTAAAATCTCC 60

 52644447 TTATTCAAACACACACCTTAGAGCAAAAGATGGTTAAATATCAATTCAGGCTATTAACAG 52644506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTATTCAAACACACACCTTAGAGCAAAAGATGGTTAAATATCAATTCAGGCTATTAACAG 120

 52644507 TAAGGGAC---GAAATGTGTTCCAACAAAACTCTGCATGTCAACAAACTACAGAGACTAG 52644563
          |||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TAAGG---AATGAAATGTGTTCCAACAAAACTCTGCATGTCAACAAACTACAGAGACTAG 177

 52644564 GTAACATCTTTTAGGAATCATTTTTATTCCACTAATGCCTTTTCCTCCAGAATCCACTGA 52644623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      178 GTAACATCTTTTAGGAATCATTTTTATTCCACTAATGCCTTTTCCTCCAGAATCCACTGA 237

 52644624 TCGTAAACGCAACCTGTCTACTTCCGCCTTTGAAAAATGGATGGACAAATTCATCTGCAT 52644683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      238 TCGTAAACGCAACCTGTCTACTTCCGCCTTTGAAAAATGGATGGACAAATTCATCTGCAT 297

 52644684 GTAACTCACCTCCTCTTTTCTTTTACATAAAACAGATGCCACAGCTGTTATTGTTCTTCA 52644743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      298 GTAACTCACCTCCTCTTTTCTTTTACATAAAACAGATGCCACAGCTGTTATTGTTCTTCA 357

 52644744 CACAGAAGTTTCTACCCAGAGAAACATCAGGATGACACTCTGCTGCAATGTGCTATTTGT 52644803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      358 CACAGAAGTTTCTACCCAGAGAAACATCAGGATGACACTCTGCTGCAATGTGCTATTTGT 417

 52644804 TCTAGAGGGGTCAACAGCTTGCCACCTTGCCTAGGCCCAGGGTGACTGCATATGTGCAGT 52644863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      418 TCTAGAGGGGTCAACAGCTTGCCACCTTGCCTAGGCCCAGGGTGACTGCATATGTGCAGT 477

 52644864 GGTCTTATCCCATTAGCGCCCCCGAGCATGCATTCAGAACCAAGTGGATACACCTTGGCA 52644923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      478 GGTCTTATCCCATTAGCGCCCCCGAGCATGCATTCAGAACCAAGTGGATACACCTTGGCA 537

 52644924 CACTTACCTTCCCTGCAGGGACATCATCGGACTGCCCTGATAAGCCAGGAACCTCATCCA 52644983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      538 CACTTACCTTCCCTGCAGGGACATCATCGGACTGCCCTGATAAGCCAGGAACCTCATCCA 597

 52644984 CCTTGTCTTGATGCTCTGCCCTCTTGGCTTCCTGTTGGCTGTCACCTGGCACCTTTTCCT 52645043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      598 CCTTGTCTTGATGCTCTGCCCTCTTGGCTTCCTGTTGGCTGTCACCTGGCACCTTTTCCT 657

 52645044 GTCCCTTGTCCAGCTTGAAGAATTTGTCAAAAAAGCTGGAGTCCTTGGGCTTGGAGGGAG 52645103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      658 GTCCCTTGTCCAGCTTGAAGAATTTGTCAAAAAAGCTGGAGTCCTTGGGCTTGGAGGGAG 717

 52645104 CTTCTCCTCCTGCTCCCCCTGTCTCAGGTGGGAGAAGCGTGGGATCCCTGGCGGCAGAGA 52645163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      718 CTTCTCCTCCTGCTCCCCCTGTCTCAGGTGGGAGAAGCGTGGGATCCCTGGCGGCAGAGA 777

 52645164 GGACCTTGTCTTGGGCCGGGGCGTGCCCTGGGGTTTTATCTGTGTCCTGCCCCGGTCCAG 52645223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      778 GGACCTTGTCTTGGGCCGGGGCGTGCCCTGGGGTTTTATCTGTGTCCTGCCCCGGTCCAG 837

 52645224 CTGCCACCGGAAGTGTCCAGCTCTCACTTGGGTCTTTGTTCGCTGGAGCTTTATTGGAGC 52645283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      838 CTGCCACCGGAAGTGTCCAGCTCTCACTTGGGTCTTTGTTCGCTGGAGCTTTATTGGAGC 897

 52645284 TGACATCAAGCTTCACTGATCCAAGGGATGAATCTGCGGCTTGGTCTCCGGTACGTCCTG 52645343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      898 TGACATCAAGCTTCACTGATCCAAGGGATGAATCTGCGGCTTGGTCTCCGGTACGTCCTG 957

 52645344 GTACAGGCCGAGAGAGCATCAAGAAAAAACGAGATTTAGCAGCTGGTGCCTCGGGTTTGG 52645403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      958 GTACAGGCCGAGAGAGCATCAAGAAAAAACGAGATTTAGCAGCTGGTGCCTCGGGTTTGG 1017

 52645404 CCTCTTTCCCAAGATTCTTTCCGTTGGCATCCGCAACAGCACTTATCTCCGTTGTCTCGG 52645463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1018 CCTCTTTCCCAAGATTCTTTCCGTTGGCATCCGCAACAGCACTTATCTCCGTTGTCTCGG 1077

 52645464 GGGAAGAAGTGGCCACATTATCCGTCTTGACACTTATTCCCAAGTCGACTGTAAACACAA 52645523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1078 GGGAAGAAGTGGCCACATTATCCGTCTTGACACTTATTCCCAAGTCGACTGTAAACACAA 1137

 52645524 ACATAAACAGTGGTTATTCAGCCAAGCCGGGAAATTCAGGCACTAATAATGGACTCCAGA 52645583
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1138 ACATAAACAGCGGTTATTCAGCCAAGCCGGGAAATTCAGGCACTAATAATGGACTCCAGA 1197

 52645584 CATTTTTTATACAAAAGCCATACTGCATACTGGAACTGTGTTGTTCTCTGGTCATTCTGA 52645643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1198 CATTTTTTATACAAAAGCCATACTGCATACTGGAACTGTGTTGTTCTCTGGTCATTCTGA 1257

 52645644 AAGGCAGAAGTTAGCTCTCTACATCTCCTTGGACCCTGCTTTTCTTGGGAGAGGAGAAGG 52645703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1258 AAGGCAGAAGTTAGCTCTCTACATCTCCTTGGACCCTGCTTTTCTTGGGAGAGGAGAAGG 1317

 52645704 CAAGGTTGGTGAGGAGGGAAAGCTACTTAATGGAAAGTCACTAGCTGCCAGGTGTGGAAT 52645763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1318 CAAGGTTGGTGAGGAGGGAAAGCTACTTAATGGAAAGTCACTAGCTGCCAGGTGTGGAAT 1377

 52645764 GAGTGATATTCAATGTTAATTAATCTTCTTTTATCTGTGTAAGAACTCCGTGAGCAGCAT 52645823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1378 GAGTGATATTCAATGTTAATTAATCTTCTTTTATCTGTGTAAGAACTCCGTGAGCAGCAT 1437

 52645824 ATTGTCATGATGTCAACTGGGAGGCAGTACAGCAGTTAGGAGCTTGGGTTCTGGAGCTAG 52645883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1438 ATTGTCATGATGTCAACTGGGAGGCAGTACAGCAGTTAGGAGCTTGGGTTCTGGAGCTAG 1497

 52645884 AACAAGGTTTCTCAACCTCAGCACTACTCACATTTGAAGCCAGATTATTCTTTGTTAGGG 52645943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1498 AACAAGGTTTCTCAACCTCAGCACTACTCACATTTGAAGCCAGATTATTCTTTGTTAGGG 1557

 52645944 AGGCTCATCCCGTGCCTCATAGGCTGATTAGCAGCATCCTGGCCTCTGCCCACTAGACGC 52646003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1558 AGGCTCATCCCGTGCCTCATAGGCTGATTAGCAGCATCCTGGCCTCTGCCCACTAGACGC 1617

 52646004 CGGTCACATTTCCCAGTCATGGCAACCAAAAATATCTCTAGGCATTGCTAAATGTCCCCT 52646063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1618 CGGTCACATTTCCCAGTCATGGCAACCAAAAATATCTCTAGGCATTGCTAAATGTCCCCT 1677

 52646064 GGAGGACAAAATCTCTTACGTTTGAGAGGCACTGAGCTGAAATGTCTTTTTGAATCCAGA 52646123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1678 GGAGGACAAAATCTCTTACGTTTGAGAGGCACTGAGCTGAAATGTCTTTTTGAATCCAGA 1737

 52646124 TTATCTAATTTTCTGTGCCTCAACTTTCTGGTAAAAGGAGACAGATAATAAATCTCGTAA 52646183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1738 TTATCTAATTTTCTGTGCCTCAACTTTCTGGTAAAAGGAGACAGATAATAAATCTCGTAA 1797

 52646184 TTTTGTTAGGAAGATTACATGAGTTAATAGTTTTAAAGCAAGTACAATAGCACCTGGAAT 52646243
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     1798 TTTTGTTAGGAAGATTACATGAGTTAATAGTTTTAAAGCAAGTACAATAGCGCCTGGAAT 1857

 52646244 ATATTAAGTGCTTAATAAATATCACAAACATTAGTTATCATTATTCATGAGTGAGAAAAC 52646303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1858 ATATTAAGTGCTTAATAAATATCACAAACATTAGTTATCATTATTCATGAGTGAGAAAAC 1917

 52646304 TGACAGTCAGAGAGGTCAGTACACCCTCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCTAGTAAGCAGCAG 52646363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1918 TGACAGTCAGAGAGGTCAGTACACCCTCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCTAGTAAGCAGCAG 1977

 52646364 AGTCTGGCTTCAGGCAGAAATCTGACTTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGTCTTACCAGGGA 52646423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1978 AGTCTGGCTTCAGGCAGAAATCTGACTTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGTCTTACCAGGGA 2037

 52646424 CTTGTATTAGCATAGACTGTTAAGAATATGGGAAGATTTTTAAAATACAGTACTCAGAAA 52646483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2038 CTTGTATTAGCATAGACTGTTAAGAATATGGGAAGATTTTTAAAATACAGTACTCAGAAA 2097

 52646484 ATTTCTCTTTGAAAGGCTGGAAGAGCAGATATCCACACAAGAAGGCAAATTAGACCTCAG 52646543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2098 ATTTCTCTTTGAAAGGCTGGAAGAGCAGATATCCACACAAGAAGGCAAATTAGACCTCAG 2157

 52646544 GCCAGTGTGGAATTAAAGGTGTAGGGTTATCTGGTCAAGACTGTGTGTGTGGATACAGGC 52646603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2158 GCCAGTGTGGAATTAAAGGTGTAGGGTTATCTGGTCAAGACTGTGTGTGTGGATACAGGC 2217

 52646604 TCCAACCCCTCCAGGCAAGGGCACTGTTTCCAACATCCACCCTTTCTCCTTTGACCTCTA 52646663
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2218 TCCAACCCCTCCAGGCAAGGGCAATGTTTCCAACATCCACCCTTTCTCCTTTGACCTCTA 2277

 52646664 CCTTGACCTAAATTAACTATAAAAGGTCCTTCTTTTCTAGGACCCTACTATAAATCAGTG 52646723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2278 CCTTGACCTAAATTAACTATAAAAGGTCCTTCTTTTCTAGGACCCTACTATAAATCAGTG 2337

 52646724 AAATATTCAGGAAAAAAAGAACACCAAGAATGTTGGGATCCCAGTTAAAGATCAAGATTC 52646783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2338 AAATATTCAGGAAAAAAAGAACACCAAGAATGTTGGGATCCCAGTTAAAGATCAAGATTC 2397

 52646784 TCTACTGATAAGCTGTGTGATATGGAGTAAATCACTAAAGATCTTTGAATCTCTTCATTT 52646843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2398 TCTACTGATAAGCTGTGTGATATGGAGTAAATCACTAAAGATCTTTGAATCTCTTCATTT 2457

 52646844 GTAAAATGGGAATATTGGTAGTCCTACTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTAAAGAAGAAAAG 52646903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2458 GTAAAATGGGAATATTGGTAGTCCTACTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTAAAGAAGAAAAG 2517

 52646904 TCATGCAAAGGATCTGGCACAACGCCTTTTCCATAATAAGTGCTTAGTAATTGACAGATA 52646963
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2518 TCATGCAAAGGATCTGGCACAATGCCTTTTCCATAATAAGTGCTTAGTAATTGACAGATA 2577

 52646964 CTGTGATAACTTTTCAGGTTTCTCTCATGCCTTTGACAACATTGCATTTTGCTTGCTCTA 52647023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2578 CTGTGATAACTTTTCAGGTTTCTCTCATGCCTTTGACAACATTGCATTTTGCTTGCTCTA 2637

 52647024 TCTGTAGTCAGACACTTCTTAATATCTGTTTGCAGGAAGAC 52647064
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2638 TCTGTAGTCAGACACTTCTTAATATCTGTTTGCAGGAAGAC 2678

EXCISED REGION

 52658003 AGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTG 52658062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2679 AGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTG 2738

 52658063 GCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTAT 52658122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2739 GCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTAT 2798

 52658123 AAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGG 52658182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2799 AAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGG 2858

 52658183 GAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTG 52658242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2859 GAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTG 2918

 52658243 AAACACTGTCTCTGCTAAAAAACAAAACAAAACAAAACACCAAAAAATAGCTGGGCGTAG 52658302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2919 AAACACTGTCTCTGCTAAAAAACAAAACAAAACAAAACACCAAAAAATAGCTGGGCGTAG 2978

 52658303 TGGCGGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTTGGGAGGCGGTGGCAGGAGAATCATTTGAACCT 52658362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2979 TGGCGGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTTGGGAGGCGGTGGCAGGAGAATCATTTGAACCT 3038

 52658363 GGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCG 52658387
          |||||||||||||||||||||||||
     3039 GGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCG 3063

Alignment time is 3.68627 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [52637064,52668002] =>     30939 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    3428] =>      3428 nucs 'mol-32-30eb-248160_3428'

Score:        3324
Aligned:      3433        nucs
Identic:      3419 (100%) nucs =>      3188 (100%)       231 (100%)
Gaps:            8 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [52643866,52647064] EXCISED REGION [52658003,52658233]
 second seq =>  [       1,    3197] EXCISED REGION [    3198,    3428]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>     10938 nucs [52647065,52658002]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         6 nucs [52647065,52647070] to [52658003,52658008]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [52647065,52647067] to [52658000,52658002]
 second seq =>         0 nucs

 52643866 AGATTAACGTGATACTTATTTTCATTAAGGAAAATAATTTACGTACAGTGCTCAGAGTAG 52643925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGATTAACGTGATACTTATTTTCATTAAGGAAAATAATTTACGTACAGTGCTCAGAGTAG 60

 52643926 AGCCTGGCACATTGAACATTTTCAATAAATGACAGCAAGTGTAATTATTAGCACTTCGGA 52643985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
       61 AGCCTGGCACATTGAACATTTTCAATAAATGACAGCAAGTGTAATTATTAGCACTTTGGA 120

 52643986 AGTGCAAAGTTGCATTGTATTAAGACAAATATATTTGGAGCTCATCCAATTTTTTCCTGG 52644045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGTGCAAAGTTGCATTGTATTAAGACAAATATATTTGGAGCTCATCCAATTTTTTCCTGG 180

 52644046 CTCTGAAGTCTGCTAGTGGCACTTAACTTTATTCCCAAGTTTTGAAAAATATTGTTATTT 52644105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTCTGAAGTCTGCTAGTGGCACTTAACTTTATTCCCAAGTTTTGAAAAATATTGTTATTT 240

 52644106 AAAAAGTCTGTTAACCAAGGAAATGCATGCCCTAAACCTATAATGTATCAAGTTTTACTT 52644165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAAAAGTCTGTTAACCAAGGAAATGCATGCCCTAAACCTATAATGTATCAAGTTTTACTT 300

 52644166 CCTTCTTCTTTTAAGGAGTTCTTTTCCTGCCTTGAATACAAACAGGCTCTCTCAAGGTTA 52644225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCTTCTTCTTTTAAGGAGTTCTTTTCCTGCCTTGAATACAAACAGGCTCTCTCAAGGTTA 360

 52644226 AAAGCAAATGCTCTTTTTAGTGTCAAAAAGAGCTTGCCTTTCTTCGCTCAGGAAAAAAAG 52644285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAAGCAAATGCTCTTTTTAGTGTCAAAAAGAGCTTGCCTTTCTTCGCTCAGGAAAAAAAG 420

 52644286 CAACTGATTCCAGGATACCTTCTTTGAAAACCAACACAAAAAAACCCCCCAAAAAACAAA 52644345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
      421 CAACTGATTCCAGGATACCTTCTTTGAAAACCAACACAAAAAA-CCCCCCAAAAAACAAA 479

 52644346 AAAAAAACCCAAAACCCCTAGTTTTTACAAAGGTTTATTACTCCTACTTGTTGGAAAAGA 52644405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      480 AAAAAAACCCAAAACCCCTAGTTTTTACAAAGGTTTATTACTCCTACTTGTTGGAAAAGA 539

 52644406 ATTACTACATAAAAGAGTCTGCCCAGAGCTGTAAAATCTCCTTATTCAAACACACACCTT 52644465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      540 ATTACTACATAAAAGAGTCTGCCCAGAGCTGTAAAATCTCCTTATTCAAACACACACCTT 599

 52644466 AGAGCAAAAGATGGTTAAATATCAATTCAGGCTATTAACAGTAAGGGAC---GAAATGTG 52644522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||
      600 AGAGCAAAAGATGGTTAAATATCAATTCAGGCTATTAACAGTAAGG---AATGAAATGTG 656

 52644523 TTCCAACAAAACTCTGCATGTCAACAAACTACAGAGACTAGGTAACATCTTTTAGGAATC 52644582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      657 TTCCAACAAAACTCTGCATGTCAACAAACTACAGAGACTAGGTAACATCTTTTAGGAATC 716

 52644583 ATTTTTATTCCACTAATGCCTTTTCCTCCAGAATCCACTGATCGTAAACGCAACCTGTCT 52644642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      717 ATTTTTATTCCACTAATGCCTTTTCCTCCAGAATCCACTGATCGTAAACGCAACCTGTCT 776

 52644643 ACTTCCGCCTTTGAAAAATGGATGGACAAATTCATCTGCATGTAACTCACCTCCTCTTTT 52644702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      777 ACTTCCGCCTTTGAAAAATGGATGGACAAATTCATCTGCATGTAACTCACCTCCTCTTTT 836

 52644703 CTTTTACATAAAACAGATGCCACAGCTGTTATTGTTCTTCACACAGAAGTTTCTACCCAG 52644762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      837 CTTTTACATAAAACAGATGCCACAGCTGTTATTGTTCTTCACACAGAAGTTTCTACCCAG 896

 52644763 AGAAACATCAGGATGACACTCTGCTGCAATGTGCTATTTGTTCTAGAGGGGTCAACAGCT 52644822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      897 AGAAACATCAGGATGACACTCTGCTGCAATGTGCTATTTGTTCTAGAGGGGTCAACAGCT 956

 52644823 TGCCACCTTGCCTAGGCCCAGGGTGACTGCATATGTGCAGTGGTCTTATCCCATTAGCGC 52644882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      957 TGCCACCTTGCCTAGGCCCAGGGTGACTGCATATGTGCAGTGGTCTTATCCCATTAGCGC 1016

 52644883 CCCCGAGCATGCATTCAGAACCAAGTGGATACACCTTGGCACACTTACCTTCCCTGCAGG 52644942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1017 CCCCGAGCATGCATTCAGAACCAAGTGGATACACCTTGGCACACTTACCTTCCCTGCAGG 1076

 52644943 GACATCATCGGACTGCCCTGATAAGCCAGGAACCTCATCCACCTTGTCTTGATGCTCTGC 52645002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1077 GACATCATCGGACTGCCCTGATAAGCCAGGAACCTCATCCACCTTGTCTTGATGCTCTGC 1136

 52645003 CCTCTTGGCTTCCTGTTGGCTGTCACCTGGCACCTTTTCCTGTCCCTTGTCCAGCTTGAA 52645062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1137 CCTCTTGGCTTCCTGTTGGCTGTCACCTGGCACCTTTTCCTGTCCCTTGTCCAGCTTGAA 1196

 52645063 GAATTTGTCAAAAAAGCTGGAGTCCTTGGGCTTGGAGGGAGCTTCTCCTCCTGCTCCCCC 52645122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1197 GAATTTGTCAAAAAAGCTGGAGTCCTTGGGCTTGGAGGGAGCTTCTCCTCCTGCTCCCCC 1256

 52645123 TGTCTCAGGTGGGAGAAGCGTGGGATCCCTGGCGGCAGAGAGGACCTTGTCTTGGGCCGG 52645182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1257 TGTCTCAGGTGGGAGAAGCGTGGGATCCCTGGCGGCAGAGAGGACCTTGTCTTGGGCCGG 1316

 52645183 GGCGTGCCCTGGGGTTTTATCTGTGTCCTGCCCCGGTCCAGCTGCCACCGGAAGTGTCCA 52645242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1317 GGCGTGCCCTGGGGTTTTATCTGTGTCCTGCCCCGGTCCAGCTGCCACCGGAAGTGTCCA 1376

 52645243 GCTCTCACTTGGGTCTTTGTTCGCTGGAGCTTTATTGGAGCTGACATCAAGCTTCACTGA 52645302
          |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1377 GCTCTCACTTGG-TCTTTGTTCGCTGGAGCTTTATTGGAGCTGACATCAAGCTTCACTGA 1435

 52645303 TCCAAGGGATGAATCTGCGGCTTGGTCTCCGGTACGTCCTGGTACAGGCCGAGAGAGCAT 52645362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1436 TCCAAGGGATGAATCTGCGGCTTGGTCTCCGGTACGTCCTGGTACAGGCCGAGAGAGCAT 1495

 52645363 CAAGAAAAAACGAGATTTAGCAGCTGGTGCCTCGGGTTTGGCCTCTTTCCCAAGATTCTT 52645422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1496 CAAGAAAAAACGAGATTTAGCAGCTGGTGCCTCGGGTTTGGCCTCTTTCCCAAGATTCTT 1555

 52645423 TCCGTTGGCATCCGCAACAGCACTTATCTCCGTTGTCTCGGGGGAAGAAGTGGCCACATT 52645482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1556 TCCGTTGGCATCCGCAACAGCACTTATCTCCGTTGTCTCGGGGGAAGAAGTGGCCACATT 1615

 52645483 ATCCGTCTTGACACTTATTCCCAAGTCGACTGTAAACACAAACATAAACAGTGGTTATTC 52645542
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     1616 ATCCGTCTTGACACTTATTCCCAAGTCGACTGTAAACACAAACATAAACAGCGGTTATTC 1675

 52645543 AGCCAAGCCGGGAAATTCAGGCACTAATAATGGACTCCAGACATTTTTTATACAAAAGCC 52645602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1676 AGCCAAGCCGGGAAATTCAGGCACTAATAATGGACTCCAGACATTTTTTATACAAAAGCC 1735

 52645603 ATACTGCATACTGGAACTGTGTTGTTCTCTGGTCATTCTGAAAGGCAGAAGTTAGCTCTC 52645662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1736 ATACTGCATACTGGAACTGTGTTGTTCTCTGGTCATTCTGAAAGGCAGAAGTTAGCTCTC 1795

 52645663 TACATCTCCTTGGACCCTGCTTTTCTTGGGAGAGGAGAAGGCAAGGTTGGTGAGGAGGGA 52645722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1796 TACATCTCCTTGGACCCTGCTTTTCTTGGGAGAGGAGAAGGCAAGGTTGGTGAGGAGGGA 1855

 52645723 AAGCTACTTAATGGAAAGTCACTAGCTGCCAGGTGTGGAATGAGTGATATTCAATGTTAA 52645782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1856 AAGCTACTTAATGGAAAGTCACTAGCTGCCAGGTGTGGAATGAGTGATATTCAATGTTAA 1915

 52645783 TTAATCTTCTTTTATCTGTGTAAGAACTCCGTGAGCAGCATATTGTCATGATGTCAACTG 52645842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1916 TTAATCTTCTTTTATCTGTGTAAGAACTCCGTGAGCAGCATATTGTCATGATGTCAACTG 1975

 52645843 GGAGGCAGTACAGCAGTTAGGAGCTTGGGTTCTGGAGCTAGAACAAGGTTTCTCAACCTC 52645902
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     1976 GGAGGCAGTACAGCAGTTAGGAGCTTGGGTTCTGGAGCTGGAACAAGGTTTCTCAACCTC 2035

 52645903 AGCACTACTCACATTTGAAGCCAGATTATTCTTTGTTAGGGAGGCTCATCCCGTGCCTCA 52645962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2036 AGCACTACTCACATTTGAAGCCAGATTATTCTTTGTTAGGGAGGCTCATCCCGTGCCTCA 2095

 52645963 TAGGCTGATTAGCAGCATCCTGGCCTCTGCCCACTAGACGCCGGTCACATTTCCCAGTCA 52646022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2096 TAGGCTGATTAGCAGCATCCTGGCCTCTGCCCACTAGACGCCGGTCACATTTCCCAGTCA 2155

 52646023 TGGCAACCAAAAATATCTCTAGGCATTGCTAAATGTCCCCTGGAGGACAAAATCTCTTAC 52646082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2156 TGGCAACCAAAAATATCTCTAGGCATTGCTAAATGTCCCCTGGAGGACAAAATCTCTTAC 2215

 52646083 GTTTGAGAGGCACTGAGCTGAAATGTCTTTTTGAATCCAGATTATCTAATTTTCTGTGCC 52646142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2216 GTTTGAGAGGCACTGAGCTGAAATGTCTTTTTGAATCCAGATTATCTAATTTTCTGTGCC 2275

 52646143 TCAACTTTCTGGTAAAAGGAGACAGATAATAAATCTCGTAATTTTGTTAGGAAGATTACA 52646202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2276 TCAACTTTCTGGTAAAAGGAGACAGATAATAAATCTCGTAATTTTGTTAGGAAGATTACA 2335

 52646203 TGAGTTAATAGTTTTAAAGCAAGTACAATAGCACCTGGAATATATTAAGTGCTTAATAAA 52646262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     2336 TGAGTTAATAGTTTTAAAGCAAGTACAATAGCGCCTGGAATATATTAAGTGCTTAATAAA 2395

 52646263 TATCACAAACATTAGTTATCATTATTCATGAGTGAGAAAACTGACAGTCAGAGAGGTCAG 52646322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2396 TATCACAAACATTAGTTATCATTATTCATGAGTGAGAAAACTGACAGTCAGAGAGGTCAG 2455

 52646323 TACACCCTCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCTAGTAAGCAGCAGAGTCTGGCTTCAGGCAGAA 52646382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2456 TACACCCTCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCTAGTAAGCAGCAGAGTCTGGCTTCAGGCAGAA 2515

 52646383 ATCTGACTTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGTCTTACCAGGGACTTGTATTAGCATAGACTG 52646442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2516 ATCTGACTTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGTCTTACCAGGGACTTGTATTAGCATAGACTG 2575

 52646443 TTAAGAATATGGGAAGATTTTTAAAATACAGTACTCAGAAAATTTCTCTTTGAAAGGCTG 52646502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2576 TTAAGAATATGGGAAGATTTTTAAAATACAGTACTCAGAAAATTTCTCTTTGAAAGGCTG 2635

 52646503 GAAGAGCAGATATCCACACAAGAAGGCAAATTAGACCTCAGGCCAGTGTGGAATTAAAGG 52646562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2636 GAAGAGCAGATATCCACACAAGAAGGCAAATTAGACCTCAGGCCAGTGTGGAATTAAAGG 2695

 52646563 TGTAGGGTTATCTGGTCAAGACTGTGTGTGTGGATACAGGCTCCAACCCCTCCAGGCAAG 52646622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2696 TGTAGGGTTATCTGGTCAAGACTGTGTGTGTGGATACAGGCTCCAACCCCTCCAGGCAAG 2755

 52646623 GGCACTGTTTCCAACATCCACCCTTTCTCCTTTGACCTCTACCTTGACCTAAATTAACTA 52646682
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2756 GGCAATGTTTCCAACATCCACCCTTTCTCCTTTGACCTCTACCTTGACCTAAATTAACTA 2815

 52646683 TAAAAGGTCCTTCTTTTCTAGGACCCTACTATAAATCAGTGAAATATTCAGGAAAAAAAG 52646742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2816 TAAAAGGTCCTTCTTTTCTAGGACCCTACTATAAATCAGTGAAATATTCAGGAAAAAAAG 2875

 52646743 AACACCAAGAATGTTGGGATCCCAGTTAAAGATCAAGATTCTCTACTGATAAGCTGTGTG 52646802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2876 AACACCAAGAATGTTGGGATCCCAGTTAAAGATCAAGATTCTCTACTGATAAGCTGTGTG 2935

 52646803 ATATGGAGTAAATCACTAAAGATCTTTGAATCTCTTCATTTGTAAAATGGGAATATTGGT 52646862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2936 ATATGGAGTAAATCACTAAAGATCTTTGAATCTCTTCATTTGTAAAATGGGAATATTGGT 2995

 52646863 AGTCCTACTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTAAAGAAGAAAAGTCATGCAAAGGATCTGGCA 52646922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2996 AGTCCTACTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTAAAGAAGAAAAGTCATGCAAAGGATCTGGCA 3055

 52646923 CAACGCCTTTTCCATAATAAGTGCTTAGTAATTGACAGATACTGTGATAACTTTTCAGGT 52646982
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3056 CAATGCCTTTTCCATAATAAGTGCTTAGTAATTGACAGATACTGTGATAACTTTTCAGGT 3115

 52646983 TTCTCTCATGCCTTTGACAACATTGCATTTTGCTTGCTCTATCTGTAGTCAGACACTTCT 52647042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3116 TTCTCTCATGCCTTTGACAACATTGCATTTTGCTTGCTCTATCTGTAGTCAGACACTTCT 3175

 52647043 TAATATCTGTTTGCAGGAAGAC 52647064
          ||||||||||||||||||||||
     3176 TAATATCTGTTTGCAGGAAGAC 3197

EXCISED REGION

 52658003 AGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTG 52658062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3198 AGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTG 3257

 52658063 GCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTAT 52658122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3258 GCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTAT 3317

 52658123 AAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGG 52658182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3318 AAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGG 3377

 52658183 GAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCC 52658233
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3378 GAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCC 3428

Alignment time is 4.28013 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [52637064,52668002] =>     30939 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    8799] =>      8799 nucs 'mol-32-30f6-071709_8799'

Score:        8572
Aligned:      8804        nucs
Identic:      8778 (100%) nucs =>      8535 (100%)       243 (100%)
Gaps:            9 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [52638508,52647064] EXCISED REGION [52658003,52658245]
 second seq =>  [       1,    8556] EXCISED REGION [    8557,    8799]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>     10938 nucs [52647065,52658002]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         6 nucs [52647065,52647070] to [52658003,52658008]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [52647065,52647067] to [52658000,52658002]
 second seq =>         0 nucs

 52638508 ACAGGCCATTGGAAAAATGGTGCTGACAGACTTGCTTGATGCAGGATTGTCACAAACCTT 52638567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACAGGCCATTGGAAAAATGGTGCTGACAGACTTGCTTGATGCAGGATTGTCACAAACCTT 60

 52638568 TAATGTGTAAAAATGCAGCATCTGTGAAGCACAATAAAGAGAGGTACTCCTGCATACTTG 52638627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAATGTGTAAAAATGCAGCATCTGTGAAGCACAATAAAGAGAGGTACTCCTGCATACTTG 120

 52638628 GAATCATGTTAAAACCACAAGGGACTAAGCCTAGGGACTAAGCAACAATGGAGGACACCA 52638687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GAATCATGTTAAAACCACAAGGGACTAAGCCTAGGGACTAAGCAACAATGGAGGACACCA 180

 52638688 GTAGAGAAAGACTGAGGCGGGCTTGTGGGGGCTGTGAAGATGTTGAACCAACCTGAACTC 52638747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTAGAGAAAGACTGAGGCGGGCTTGTGGGGGCTGTGAAGATGTTGAACCAACCTGAACTC 240

 52638748 CCCTACCTCTAGGGTTCTTTTTACATGCAAGAAATAGTACATCCTCCTTGTTAAGTGAAC 52638807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCCTACCTCTAGGGTTCTTTTTACATGCAAGAAATAGTACATCCTCCTTGTTAAGTGAAC 300

 52638808 CACTATTAATTGATTGTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTCCTGCAGCCAAAGTAAAAAT 52638867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||
      301 CACTATTAATTGATTGTTGTGTGTGTGTGTGTGTGT--TTCCTGCAGCCAAAGTAAAAAT 358

 52638868 GATATATTACCAACCCCTAAATGATACACTATTCAAACTCCATCACTCTGAAAAGCCATT 52638927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      359 GATATATTACCAACCCCTAAATGATACACTATTCAAACTCCATCACTCTGAAAAGCCATT 418

 52638928 TGATCTATTTCATAATTACTCATTTCTAAGTTTCTAACAATTTAGAAAATATACAGTTTT 52638987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      419 TGATCTATTTCATAATTACTCATTTCTAAGTTTCTAACAATTTAGAAAATATACAGTTTT 478

 52638988 ATTTAGCATGACTACTACTGATGGCCTATATTATCTTCTAACTTTACAAAAACCCCTAGG 52639047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      479 ATTTAGCATGACTACTACTGATGGCCTATATTATCTTCTAACTTTACAAAAACCCCTAGG 538

 52639048 GCAGGTAGTAGCTTCCTTTTGTGGATGAAAACACAGGTTTTTAAATGATTGAGTATAACA 52639107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      539 GCAGGTAGTAGCTTCCTTTTGTGGATGAAAACACAGGTTTTTAAATGATTGAGTATAACA 598

 52639108 GGCTTAGGTGACAGATGGATCTCGATTCCACTTCTGCCACTAATTAGCTTTGCGACCTTA 52639167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      599 GGCTTAGGTGACAGATGGATCTCGATTCCACTTCTGCCACTAATTAGCTTTGCGACCTTA 658

 52639168 ACGCAGGTAACTTAAGTTCTCCCCAAGTTCTCTCCTCTGTTCAATGGCAATAGAAATACC 52639227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      659 ACGCAGGTAACTTAAGTTCTCCCCAAGTTCTCTCCTCTGTTCAATGGCAATAGAAATACC 718

 52639228 TACCTTGTTGGGTTTTTTTAACAATAAAAACAGATAATGTATGCAAAATGCTTACTGCAC 52639287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
      719 TACCTTGTTGGGTTTTTTTAACAATAAAAACAGATAATGTATGCAAAATGCTTACTACAC 778

 52639288 AGCCTAGAAATAATGAATTATTTTAAAATGGGGCTATTATTGTCATTTAACTCAACCACA 52639347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      779 AGCCTAGAAATAATGAATTATTTTAAAATGGGGCTATTATTGTCATTTAACTCAACCACA 838

 52639348 CAGCTATTTAGTGGTAGAGTCTGGACTCATACCTAGGTCACCCAGGCTCCTAACACTTCC 52639407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
      839 CAGCTATTTAGTGGTAGAGTCTGGACTCATACCTAGGTCACCTAGGCTCCTAACACTTCC 898

 52639408 ACATCACCTCTGCCACTGCAAACATCTCATATTAAGCGTTTCTTACTGCTAAATGCATCA 52639467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      899 ACATCACCTCTGCCACTGCAAACATCTCATATTAAGCGTTTCTTACTGCTAAATGCATCA 958

 52639468 AAATCCCAGTGGTATAGCTGAGGACCTTGTTTACTCCAAAACTTGCATAATGTAAGATGG 52639527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      959 AAATCCCAGTGGTATAGCTGAGGACCTTGTTTACTCCAAAACTTGCATAATGTAAGATGG 1018

 52639528 ATTTTCCCTTTGCACTGACAAAGTCTTTTGGGTGGCTAGTTCTCTTTACCAGTTGAAAAG 52639587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1019 ATTTTCCCTTTGCACTGACAAAGTCTTTTGGGTGGCTAGTTCTCTTTACCAGTTGAAAAG 1078

 52639588 GCATGGCCTTGTGGACATAAGGCAGAAACAACACAAAATAAAAAACAGTTAATAATTCAC 52639647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1079 GCATGGCCTTGTGGACATAAGGCAGAAACAACACAAAATAAAAAACAGTTAATAATTCAC 1138

 52639648 TTGGCCTTCTAATGTTGAAATTCGGTAATTCTTTTTATTTGTTTTTATTTTTCACTTGGG 52639707
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1139 TTGGCCTTCTAATGTTGAAATTGGGTAATTCTTTTTATTTGTTTTTATTTTTCACTTGGG 1198

 52639708 ATTTTGGGTATTTACAACTTTGCATATGCTAACATCTTTGAATTTCATTGCCTCAAGTTG 52639767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1199 ATTTTGGGTATTTACAACTTTGCATATGCTAACATCTTTGAATTTCATTGCCTCAAGTTG 1258

 52639768 TAACTTCATTGAACAAGTTTCAAATAATTGGCAAAAATAGAAACGTTGACTATTTAAGAC 52639827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1259 TAACTTCATTGAACAAGTTTCAAATAATTGGCAAAAATAGAAACGTTGACTATTTAAGAC 1318

 52639828 TATGGGCTTTGGAGATGGACAATTTTGGCTGTGCCACCTTTTAGCTGTGTGTCAGGAGTG 52639887
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     1319 TATGGGCTTTGGAGATGGACAATTTTGGCTGTGCCACCTTTTAGCTGTGTGTCAGGAATG 1378

 52639888 ATATGCTTTCTCTGAACTGTTGACTTCTTCATCTGTAAAATGGTGAAAATACAGGAATTC 52639947
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1379 ATATGCTTTCTCTGAACTGTTGGCTTCTTCATCTGTAAAATGGTGAAAATACAGGAATTC 1438

 52639948 CCTGGTAAGATTTGATGGCTCAATGAGCTGATTTCTACAAAATGATTTAATCACAGAATT 52640007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1439 CCTGGTAAGATTTGATGGCTCAATGAGCTGATTTCTACAAAATGATTTAATCACAGAATT 1498

 52640008 TGACTTAAAATGCGAGAGGGATTCATGCTGTCCGAAATCATCCAAGAGTGGAGATATCTG 52640067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1499 TGACTTAAAATGCGAGAGGGATTCATGCTGTCCGAAATCATCCAAGAGTGGAGATATCTG 1558

 52640068 GTTAGCTTCATGGAGAACCTGGCACTGAATATCAAGTCAATTTTTGATAAACAGAGAGAG 52640127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1559 GTTAGCTTCATGGAGAACCTGGCACTGAATATCAAGTCAATTTTTGATAAACAGAGAGAG 1618

 52640128 AAAGGGACATAGGCAGAGAAAATACCAGGAGACAGATGGCGTTTGCACAGGTCAGGTGTT 52640187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1619 AAAGGGACATAGGCAGAGAAAATACCAGGAGACAGATGGCGTTTGCACAGGTCAGGTGTT 1678

 52640188 GGCCATATTGACTGGAGAAATTTAAGGGAAGGGTGGAAAATGCAGTTGGAAAATAGGCAG 52640247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1679 GGCCATATTGACTGGAGAAATTTAAGGGAAGGGTGGAAAATGCAGTTGGAAAATAGGCAG 1738

 52640248 AGGAAACATTGTGGAAACCCTTAAATGTCAGACAAAGAAACTGAGGCTTATGGGCATGGA 52640307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1739 AGGAAACATTGTGGAAACCCTTAAATGTCAGACAAAGAAACTGAGGCTTATGGGCATGGA 1798

 52640308 CACTAACATTTCTATTGTTTCAAAAATAATTTTACAACTTTTATACCTTTCTCACCCAAG 52640367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1799 CACTAACATTTCTATTGTTTCAAAAATAATTTTACAACTTTTATACCTTTCTCACCCAAG 1858

 52640368 TTAGGACTTGTGCCTTTGGTTATACAACTCTTAAATTAGAGTCAACTGTGCTATCTCTGT 52640427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 TTAGGACTTGTGCCTTTGGTTATACAACTCTTAAATTAGAGTCAACTGTGCTATCTCTGT 1918

 52640428 GAGTTTGGGTTGAGGACTATGGAAGGGAAAGGCAAAAAATAAAAGTAAAATGTGAAGTAG 52640487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 GAGTTTGGGTTGAGGACTATGGAAGGGAAAGGCAAAAAATAAAAGTAAAATGTGAAGTAG 1978

 52640488 AAGACAGGGAGAAAACCCATAATACTGGTAATAGCTAATTTCTCTTTTTCTTCTTTCAAA 52640547
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 AAGACAGGGAGAAAACCCATAATACTAGTAATAGCTAATTTCTCTTTTTCTTCTTTCAAA 2038

 52640548 ATGCAATTTGTGCTAAGTACTTTATATGGCCTATCTCATTTAACTTCTAAAAGTGTGAAC 52640607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 ATGCAATTTGTGCTAAGTACTTTATATGGCCTATCTCATTTAACTTCTAAAAGTGTGAAC 2098

 52640608 AATGTGAGAATGTGCTAGATACTATTATTATCCCCATTTTACAGATGAGGAAACTGAGGC 52640667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 AATGTGAGAATGTGCTAGATACTATTATTATCCCCATTTTACAGATGAGGAAACTGAGGC 2158

 52640668 TCAGGAGGTGAAGTAGCTTGCCCAAGATCACACAGCCAGTAGGTGACAGAGGTAGAGAGG 52640727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 TCAGGAGGTGAAGTAGCTTGCCCAAGATCACACAGCCAGTAGGTGACAGAGGTAGAGAGG 2218

 52640728 AAACCTAGGCTACTTGACTATGATGCTTATGTTTAATTCACTACTAAATACCATGTAGGA 52640787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2219 AAACCTAGGCTACTTGACTATGATGCTTATGTTTAATTCACTACTAAATACCATGTAGGA 2278

 52640788 AAGGACTCTGGAGACCTTAGTTCTTTAATTCCAATTCTACCACTAAACAGTAGAGACAGG 52640847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 AAGGACTCTGGAGACCTTAGTTCTTTAATTCCAATTCTACCACTAAACAGTAGAGACAGG 2338

 52640848 ATGAACTTGTCATTCACTGAGATGGAAAACCCCGTGAATTAAACTGGTGGGCATTTTGTT 52640907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 ATGAACTTGTCATTCACTGAGATGGAAAACCCCGTGAATTAAACTGGTGGGCATTTTGTT 2398

 52640908 TTTGTCATTGTTAGGCGATGAATGAAGAGTTCCATTCTGGACACATTAGGGTTGAGATAC 52640967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 TTTGTCATTGTTAGGCGATGAATGAAGAGTTCCATTCTGGACACATTAGGGTTGAGATAC 2458

 52640968 TCAGTGAGCAGCCAAATGGGGATGTAGAAATTCAAGTAGACATGTGGAAGAGGAGGCAGC 52641027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2459 TCAGTGAGCAGCCAAATGGGGATGTAGAAATTCAAGTAGACATGTGGAAGAGGAGGCAGC 2518

 52641028 TGAGACTCACGTCTGGACTTCAGGGATGGATCCCGGCTAGAGATGTAAATTTGGAACTTG 52641087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2519 TGAGACTCACGTCTGGACTTCAGGGATGGATCCCGGCTAGAGATGTAAATTTGGAACTTG 2578

 52641088 TCAACCCATAGCAGTATTTAAACCTTTGGGACTGAGGGAAACCTTCAAGGAAATAAGCGT 52641147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2579 TCAACCCATAGCAGTATTTAAACCTTTGGGACTGAGGGAAACCTTCAAGGAAATAAGCGT 2638

 52641148 AGTTAGAGATAGCCAAGAAGTGAACCCTGGGGAAGTCCAACATTTAGAGGGTGAGATCCA 52641207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2639 AGTTAGAGATAGCCAAGAAGTGAACCCTGGGGAAGTCCAACATTTAGAGGGTGAGATCCA 2698

 52641208 GCAAAGGAGATGATGGAAGAGTACCAGGGAGGTGGAAGGATGTTGTTTCAAACAGCAAGG 52641267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2699 GCAAAGGAGATGATGGAAGAGTACCAGGGAGGTGGAAGGATGTTGTTTCAAACAGCAAGG 2758

 52641268 TGTGGCCCACTCAGTCACTGTGTCGGATTCAACTTGCAGGTCAGACCTACTAGGACAAAG 52641327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2759 TGTGGCCCACTCAGTCACTGTGTCGGATTCAACTTGCAGGTCAGACCTACTAGGACAAAG 2818

 52641328 ATAGAGACCTATAGGATTTGGCAGCCAGGGTGATGGTAGGGAATTTGAAACATCATGGTG 52641387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2819 ATAGAGACCTATAGGATTTGGCAGCCAGGGTGATGGTAGGGAATTTGAAACATCATGGTG 2878

 52641388 GCTGTGACAAGAGCCTGAATGGAGTGTGTTCAAGAGAGAAAAGAAGAGAAGTGAAAACAC 52641447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2879 GCTGTGACAAGAGCCTGAATGGAGTGTGTTCAAGAGAGAAAAGAAGAGAAGTGAAAACAC 2938

 52641448 AGAATATTGTTCTTATTATTAGTAGCCTGAGCCAATCTGAGGACCGATGCACTTATCACA 52641507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     2939 AGAATATTGTTCTTATTATTAGTAGCCTGAGCAAATCTGAGGACCGATGCACTTATCACA 2998

 52641508 ATGTCTCTTAAAATACTATGTCTCTTACTAGATTATACACTCCTTGACAGACGAGAAACA 52641567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2999 ATGTCTCTTAAAATACTATGTCTCTTACTAGATTATACACTCCTTGACAGACGAGAAACA 3058

 52641568 TGATTTATTTTTCAAATGCCTTGCACAAGGTTAGTGCGAAAGTAACGATTGCAGGATTTA 52641627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3059 TGATTTATTTTTCAAATGCCTTGCACAAGGTTAGTGCGAAAGTAACGATTGCAGGATTTA 3118

 52641628 ATTACACTTTTAAAAGAAAAAAGACATTCTTCATCTTATGAAACTCTGCATGGCAACACT 52641687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3119 ATTACACTTTTAAAAGAAAAAAGACATTCTTCATCTTATGAAACTCTGCATGGCAACACT 3178

 52641688 TTATGCGCCCCACACCCCCACTCAACACAAACACAACTCTGGAAGTACTGTGTTGATAAC 52641747
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3179 TTACGCGCCCCACACCCCCACTCAACACAAACACAACTCTGGAAGTACTGTGTTGATAAC 3238

 52641748 AGAAATGTGGTGGGTTTTATTTTTAACCAATAAAGGTCAAGTTTGCATTATGTGATTTTG 52641807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3239 AGAAATGTGGTGGGTTTTATTTTTAACCAATAAAGGTCAAGTTTGCATTATGTGATTTTG 3298

 52641808 TGTGTGTGTGTGTTGAATCTTTTAAATGCATATCTTACAGCTCTGGTTCAGTTGTTGTGG 52641867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3299 TGTGTGTGTGTGTTGAATCTTTTAAATGCATATCTTACAGCTCTGGTTCAGTTGTTGTGG 3358

 52641868 GGAGAGGAAAAAAACCTCATCCCTGCCAACACATTGGTTTGTATGAATCACAGCTCAGTG 52641927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3359 GGAGAGGAAAAAAACCTCATCCCTGCCAACACATTGGTTTGTATGAATCACAGCTCAGTG 3418

 52641928 AAACCTTTCAGGCATATAATTTATCTTTTCTTTGGCCTATGTAGTAAACGCTTCATTTGT 52641987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3419 AAACCTTTCAGGCATATAATTTATCTTTTCTTTGGCCTATGTAGTAAACGCTTCATTTGT 3478

 52641988 TCATGAATTCTTGCCTTGTTTTAATTATGCTTTGCCCTGAATGTAGTTTTATAAGGCACA 52642047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3479 TCATGAATTCTTGCCTTGTTTTAATTATGCTTTGCCCTGAATGTAGTTTTATAAGGCACA 3538

 52642048 AAAATAAGATTGTCGTTCTGAAAACACAGAAGATTTGTATGTTTCCCCCAGGATGAAATG 52642107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3539 AAAATAAGATTGTCGTTCTGAAAACACAGAAGATTTGTATGTTTCCCCCAGGATGAAATG 3598

 52642108 GTGGCATCTTTCTCCCAATTCACAGCTCTGTGGGCTTGTGGCTGGAATTCCAATCCAGCA 52642167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3599 GTGGCATCTTTCTCCCAATTCACAGCTCTGTGGGCTTGTGGCTGGAATTCCAATCCAGCA 3658

 52642168 GGGAGCAAGCCATAAAAATGGGGGGAAGGGCTGCTGGAGGGAGGCAGTAGATGCGGCTGA 52642227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3659 GGGAGCAAGCCATAAAAATGGGGGGAAGGGCTGCTGGAGGGAGGCAGTAGATGCGGCTGA 3718

 52642228 GCCCAAGGCATAATTCACCCTAAGAATTCTGAATCAATACACTGACATCCAGCCATGTAC 52642287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3719 GCCCAAGGCATAATTCACCCTAAGAATTCTGAATCAATACACTGACATCCAGCCATGTAC 3778

 52642288 AATGTGGTACTCCCACCAAGAAAGCCACTGATTGAGAAGTTTTATTCATGTTACTTTCTG 52642347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3779 AATGTGGTACTCCCACCAAGAAAGCCACTGATTGAGAAGTTTTATTCATGTTACTTTCTG 3838

 52642348 AGGGTTGGATTGTCCCATTACATTTATAGAACAATTGCTTTTTTCCCCCTAAATACAGAA 52642407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3839 AGGGTTGGATTGTCCCATTACATTTATAGAACAATTGCTTTTTTCCCCCTAAATACAGAA 3898

 52642408 CTATGCAGCCGGGAGTCAGAAAAGAAACCTTGACAATCAGAAGGCTGTTTTGTTGTTGTT 52642467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3899 CTATGCAGCCGGGAGTCAGAAAAGAAACCTTGACAATCAGAAGGCTGTTTTGTTGTTGTT 3958

 52642468 GTTAAAAACCTTTGCAGGCATATGCATCTGAATATCCATAAGTTCACAGGCTGAGGGAGA 52642527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3959 GTTAAAAACCTTTGCAGGCATATGCATCTGAATATCCATAAGTTCACAGGCTGAGGGAGA 4018

 52642528 AATGGCTATTTCATAACTTTTCTGTGTTTCTCATGTACATAGTACAAAGTGGGCACTCAG 52642587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4019 AATGGCTATTTCATAACTTTTCTGTGTTTCTCATGTACATAGTACAAAGTGGGCACTCAG 4078

 52642588 TATTTCAAATTTCAATATCACTGAAAAAAATGGAAATTTGTCATGTAACAAAATCAGATG 52642647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4079 TATTTCAAATTTCAATATCACTGAAAAAAATGGAAATTTGTCATGTAACAAAATCAGATG 4138

 52642648 CAGACTTCACTGGTGAATCTGAGGGAGTGAATTCACTTATTCAGAAAGGAAGACAGTTAC 52642707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4139 CAGACTTCACTGGTGAATCTGAGGGAGTGAATTCACTTATTCAGAAAGGAAGACAGTTAC 4198

 52642708 AATTCTTGGGTCTTCTGAGAGATCATTATAACTTGAAAATATTACACAAGGGCTTTGCTA 52642767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4199 AATTCTTGGGTCTTCTGAGAGATCATTATAACTTGAAAATATTACACAAGGGCTTTGCTA 4258

 52642768 TATTAGATACCTGCCATGTTCCTAACACAAGCTCCCATTTTCTGACTCAAATCTCATTTT 52642827
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4259 TATTAGATACCTGCCATGTTCCTAATACAAGCTCCCATTTTCTGACTCAAATCTCATTTT 4318

 52642828 GGAACACATTCCACTCAAATTGAGGTTCTACCCCTAAGAGTTCTTTTTCAATAAAGAAAG 52642887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4319 GGAACACATTCCACTCAAATTGAGGTTCTACCCCTAAGAGTTCTTTTTCAATAAAGAAAG 4378

 52642888 CTGAGTTAATAAATCACAACTCCAAAACTTTTCCTCACTTTTCTTAGACTAGAAATAGAT 52642947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4379 CTGAGTTAATAAATCACAACTCCAAAACTTTTCCTCACTTTTCTTAGACTAGAAATAGAT 4438

 52642948 TGAGTGTGTCGAGGTTTTATGGCTGAGTACATTGGAGGGCTGGCTATTCTATGCTGAACT 52643007
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4439 TGAATGTGTCGAGGTTTTATGGCTGAGTACATTGGAGGGCTGGCTATTCTATGCTGAACT 4498

 52643008 GGTTTACTTGATTAAGATGGGGATTTGGATGAGTCACCGGACACCTGTCCAAAGATGAGT 52643067
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     4499 GGTTTACTTGATTAAGATGGGGATTTGGATGAGTCACTGGACACCTGTCCAAAGATGAGT 4558

 52643068 AAAACACATTCCTTCATTGTCTTCCCATAAATAACTCAATCTTCTCCTAACTGAGCCAAT 52643127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4559 AAAACACATTCCTTCATTGTCTTCCCATAAATAACTCAATCTTCTCCTAACTGAGCCAAT 4618

 52643128 GGATAGGCTTTGGATGCCCAAGCAAAACAAACACATGACTGTTAAAAAATCACAACCTCA 52643187
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     4619 GGATAGGCTTTGGATGCCCAAGCAAAAGAAACACATGACTGTTAAAAAATCACAACCTCA 4678

 52643188 AAATGGCCTTAGAAGCCTATGACCAATAATGAGAATGGTTTCTCCACTCAGGCGCAAGTA 52643247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4679 AAATGGCCTTAGAAGCCTATGACCAATAATGAGAATGGTTTCTCCACTCAGGCGCAAGTA 4738

 52643248 GTAAACAGTTTCTCCCATATGCAGGAATATTGACGACTAGTTTACCGCCTCTGGGCACGT 52643307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4739 GTAAACAGTTTCTCCCATATGCAGGAATATTGACGACTAGTTTACCGCCTCTGGGCACGT 4798

 52643308 AACTTTCAGGTCCTGGTTCATGCATTTGCTGGAATGTTCCCTGGGCCATGGAGCCCAGTT 52643367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4799 AACTTTCAGGTCCTGGTTCATGCATTTGCTGGAATGTTCCCTGGGCCATGGAGCCCAGTT 4858

 52643368 CTCCTGGCATCTGGCATCTCCCCCACACTCTGCTCCCCCAGCACAGCACTTGGCATCTTG 52643427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4859 CTCCTGGCATCTGGCATCTCCCCCACACTCTGCTCCCCCAGCACAGCACTTGGCATCTTG 4918

 52643428 CATTGCAATTGCAGGTTTATTTATTCACTTCTCTCACTGGACAGCAAACTCCACCAGGGC 52643487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4919 CATTGCAATTGCAGGTTTATTTATTCACTTCTCTCACTGGACAGCAAACTCCACCAGGGC 4978

 52643488 CGAGACTCTGTGTCTCGCCCTTCACTGTGGTCCCTGTGCCTCACCTGTTCCTAGTACAGT 52643547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4979 CGAGACTCTGTGTCTCGCCCTTCACTGTGGTCCCTGTGCCTCACCTGTTCCTAGTACAGT 5038

 52643548 GTCACACTCAGTAAAGAGCAGATGCCTGG-TGCATTTGGAGACTTATTTTAAATTATACG 52643606
          ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
     5039 GTCACACTCAGTAAAGAGCAGATGCCTGGATGCATTTGGAGACTTATTTTAAATTATACG 5098

 52643607 GAAAGTTATTCAACCGGCTTCTTGAACTGGTGAATTTTGGAAAGTGGGTGTTTGAAGGGA 52643666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5099 GAAAGTTATTCAACCGGCTTCTTGAACTGGTGAATTTTGGAAAGTGGGTGTTTGAAGGGA 5158

 52643667 AAATGTTTAAACTCTGAAAGAAATGTTGGAAATAAGCTCTTTGAATCAAAATGTATAGAA 52643726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5159 AAATGTTTAAACTCTGAAAGAAATGTTGGAAATAAGCTCTTTGAATCAAAATGTATAGAA 5218

 52643727 AACACAAGAATGCTGACAGTAAGAGCCTAAAACACATGATGACTATTATCTTTTCCCAAT 52643786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5219 AACACAAGAATGCTGACAGTAAGAGCCTAAAACACATGATGACTATTATCTTTTCCCAAT 5278

 52643787 TTTAACTCTCCAGAGTGTTCAGCGGTGCCCAGCCTTCATAATGTAATTCTTCGTAGCACC 52643846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5279 TTTAACTCTCCAGAGTGTTCAGCGGTGCCCAGCCTTCATAATGTAATTCTTCGTAGCACC 5338

 52643847 CTGGATGCATTAAAACCATAGATTAACGTGATACTTATTTTCATTAAGGAAAATAATTTA 52643906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5339 CTGGATGCATTAAAACCATAGATTAACGTGATACTTATTTTCATTAAGGAAAATAATTTA 5398

 52643907 CGTACAGTGCTCAGAGTAGAGCCTGGCACATTGAACATTTTCAATAAATGACAGCAAGTG 52643966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5399 CGTACAGTGCTCAGAGTAGAGCCTGGCACATTGAACATTTTCAATAAATGACAGCAAGTG 5458

 52643967 TAATTATTAGCACTTCGGAAGTGCAAAGTTGCATTGTATTAAGACAAATATATTTGGAGC 52644026
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5459 TAATTATTAGCACTTTGGAAGTGCAAAGTTGCATTGTATTAAGACAAATATATTTGGAGC 5518

 52644027 TCATCCAATTTTTTCCTGGCTCTGAAGTCTGCTAGTGGCACTTAACTTTATTCCCAAGTT 52644086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5519 TCATCCAATTTTTTCCTGGCTCTGAAGTCTGCTAGTGGCACTTAACTTTATTCCCAAGTT 5578

 52644087 TTGAAAAATATTGTTATTTAAAAAGTCTGTTAACCAAGGAAATGCATGCCCTAAACCTAT 52644146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5579 TTGAAAAATATTGTTATTTAAAAAGTCTGTTAACCAAGGAAATGCATGCCCTAAACCTAT 5638

 52644147 AATGTATCAAGTTTTACTTCCTTCTTCTTTTAAGGAGTTCTTTTCCTGCCTTGAATACAA 52644206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5639 AATGTATCAAGTTTTACTTCCTTCTTCTTTTAAGGAGTTCTTTTCCTGCCTTGAATACAA 5698

 52644207 ACAGGCTCTCTCAAGGTTAAAAGCAAATGCTCTTTTTAGTGTCAAAAAGAGCTTGCCTTT 52644266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5699 ACAGGCTCTCTCAAGGTTAAAAGCAAATGCTCTTTTTAGTGTCAAAAAGAGCTTGCCTTT 5758

 52644267 CTTCGCTCAGGAAAAAAAGCAACTGATTCCAGGATACCTTCTTTGAAAACCAACACAAAA 52644326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5759 CTTCGCTCAGGAAAAAAAGCAACTGATTCCAGGATACCTTCTTTGAAAACCAACACAAAA 5818

 52644327 AAACCCCCCAAAAAACAAAAAAAAAACCCAAAACCCCTAGTTTTTACAAAGGTTTATTAC 52644386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5819 AAACCCCCCAAAAAACAAAAAAAAAACCCAAAACCCCTAGTTTTTACAAAGGTTTATTAC 5878

 52644387 TCCTACTTGTTGGAAAAGAATTACTACATAAAAGAGTCTGCCCAGAGCTGTAAAATCTCC 52644446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5879 TCCTACTTGTTGGAAAAGAATTACTACATAAAAGAGTCTGCCCAGAGCTGTAAAATCTCC 5938

 52644447 TTATTCAAACACACACCTTAGAGCAAAAGATGGTTAAATATCAATTCAGGCTATTAACAG 52644506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5939 TTATTCAAACACACACCTTAGAGCAAAAGATGGTTAAATATCAATTCAGGCTATTAACAG 5998

 52644507 TAAGGGAC---GAAATGTGTTCCAACAAAACTCTGCATGTCAACAAACTACAGAGACTAG 52644563
          |||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5999 TAAGG---AATGAAATGTGTTCCAACAAAACTCTGCATGTCAACAAACTACAGAGACTAG 6055

 52644564 GTAACATCTTTTAGGAATCATTTTTATTCCACTAATGCCTTTTCCTCCAGAATCCACTGA 52644623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6056 GTAACATCTTTTAGGAATCATTTTTATTCCACTAATGCCTTTTCCTCCAGAATCCACTGA 6115

 52644624 TCGTAAACGCAACCTGTCTACTTCCGCCTTTGAAAAATGGATGGACAAATTCATCTGCAT 52644683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6116 TCGTAAACGCAACCTGTCTACTTCCGCCTTTGAAAAATGGATGGACAAATTCATCTGCAT 6175

 52644684 GTAACTCACCTCCTCTTTTCTTTTACATAAAACAGATGCCACAGCTGTTATTGTTCTTCA 52644743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6176 GTAACTCACCTCCTCTTTTCTTTTACATAAAACAGATGCCACAGCTGTTATTGTTCTTCA 6235

 52644744 CACAGAAGTTTCTACCCAGAGAAACATCAGGATGACACTCTGCTGCAATGTGCTATTTGT 52644803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6236 CACAGAAGTTTCTACCCAGAGAAACATCAGGATGACACTCTGCTGCAATGTGCTATTTGT 6295

 52644804 TCTAGAGGGGTCAACAGCTTGCCACCTTGCCTAGGCCCAGGGTGACTGCATATGTGCAGT 52644863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6296 TCTAGAGGGGTCAACAGCTTGCCACCTTGCCTAGGCCCAGGGTGACTGCATATGTGCAGT 6355

 52644864 GGTCTTATCCCATTAGCGCCCCCGAGCATGCATTCAGAACCAAGTGGATACACCTTGGCA 52644923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6356 GGTCTTATCCCATTAGCGCCCCCGAGCATGCATTCAGAACCAAGTGGATACACCTTGGCA 6415

 52644924 CACTTACCTTCCCTGCAGGGACATCATCGGACTGCCCTGATAAGCCAGGAACCTCATCCA 52644983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6416 CACTTACCTTCCCTGCAGGGACATCATCGGACTGCCCTGATAAGCCAGGAACCTCATCCA 6475

 52644984 CCTTGTCTTGATGCTCTGCCCTCTTGGCTTCCTGTTGGCTGTCACCTGGCACCTTTTCCT 52645043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6476 CCTTGTCTTGATGCTCTGCCCTCTTGGCTTCCTGTTGGCTGTCACCTGGCACCTTTTCCT 6535

 52645044 GTCCCTTGTCCAGCTTGAAGAATTTGTCAAAAAAGCTGGAGTCCTTGGGCTTGGAGGGAG 52645103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6536 GTCCCTTGTCCAGCTTGAAGAATTTGTCAAAAAAGCTGGAGTCCTTGGGCTTGGAGGGAG 6595

 52645104 CTTCTCCTCCTGCTCCCCCTGTCTCAGGTGGGAGAAGCGTGGGATCCCTGGCGGCAGAGA 52645163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6596 CTTCTCCTCCTGCTCCCCCTGTCTCAGGTGGGAGAAGCGTGGGATCCCTGGCGGCAGAGA 6655

 52645164 GGACCTTGTCTTGGGCCGGGGCGTGCCCTGGGGTTTTATCTGTGTCCTGCCCCGGTCCAG 52645223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6656 GGACCTTGTCTTGGGCCGGGGCGTGCCCTGGGGTTTTATCTGTGTCCTGCCCCGGTCCAG 6715

 52645224 CTGCCACCGGAAGTGTCCAGCTCTCACTTGGGTCTTTGTTCGCTGGAGCTTTATTGGAGC 52645283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6716 CTGCCACCGGAAGTGTCCAGCTCTCACTTGGGTCTTTGTTCGCTGGAGCTTTATTGGAGC 6775

 52645284 TGACATCAAGCTTCACTGATCCAAGGGATGAATCTGCGGCTTGGTCTCCGGTACGTCCTG 52645343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6776 TGACATCAAGCTTCACTGATCCAAGGGATGAATCTGCGGCTTGGTCTCCGGTACGTCCTG 6835

 52645344 GTACAGGCCGAGAGAGCATCAAGAAAAAACGAGATTTAGCAGCTGGTGCCTCGGGTTTGG 52645403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6836 GTACAGGCCGAGAGAGCATCAAGAAAAAACGAGATTTAGCAGCTGGTGCCTCGGGTTTGG 6895

 52645404 CCTCTTTCCCAAGATTCTTTCCGTTGGCATCCGCAACAGCACTTATCTCCGTTGTCTCGG 52645463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6896 CCTCTTTCCCAAGATTCTTTCCGTTGGCATCCGCAACAGCACTTATCTCCGTTGTCTCGG 6955

 52645464 GGGAAGAAGTGGCCACATTATCCGTCTTGACACTTATTCCCAAGTCGACTGTAAACACAA 52645523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6956 GGGAAGAAGTGGCCACATTATCCGTCTTGACACTTATTCCCAAGTCGACTGTAAACACAA 7015

 52645524 ACATAAACAGTGGTTATTCAGCCAAGCCGGGAAATTCAGGCACTAATAATGGACTCCAGA 52645583
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7016 ACATAAACAGCGGTTATTCAGCCAAGCCGGGAAATTCAGGCACTAATAATGGACTCCAGA 7075

 52645584 CATTTTTTATACAAAAGCCATACTGCATACTGGAACTGTGTTGTTCTCTGGTCATTCTGA 52645643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7076 CATTTTTTATACAAAAGCCATACTGCATACTGGAACTGTGTTGTTCTCTGGTCATTCTGA 7135

 52645644 AAGGCAGAAGTTAGCTCTCTACATCTCCTTGGACCCTGCTTTTCTTGGGAGAGGAGAAGG 52645703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7136 AAGGCAGAAGTTAGCTCTCTACATCTCCTTGGACCCTGCTTTTCTTGGGAGAGGAGAAGG 7195

 52645704 CAAGGTTGGTGAGGAGGGAAAGCTACTTAATGGAAAGTCACTAGCTGCCAGGTGTGGAAT 52645763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7196 CAAGGTTGGTGAGGAGGGAAAGCTACTTAATGGAAAGTCACTAGCTGCCAGGTGTGGAAT 7255

 52645764 GAGTGATATTCAATGTTAATTAATCTTCTTTTATCTGTGTAAGAACTCCGTGAGCAGCAT 52645823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7256 GAGTGATATTCAATGTTAATTAATCTTCTTTTATCTGTGTAAGAACTCCGTGAGCAGCAT 7315

 52645824 ATTGTCATGATGTCAACTGGGAGGCAGTACAGCAGTTAGGAGCTTGGGTTCTGGAGCTAG 52645883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7316 ATTGTCATGATGTCAACTGGGAGGCAGTACAGCAGTTAGGAGCTTGGGTTCTGGAGCTAG 7375

 52645884 AACAAGGTTTCTCAACCTCAGCACTACTCACATTTGAAGCCAGATTATTCTTTGTTAGGG 52645943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7376 AACAAGGTTTCTCAACCTCAGCACTACTCACATTTGAAGCCAGATTATTCTTTGTTAGGG 7435

 52645944 AGGCTCATCCCGTGCCTCATAGGCTGATTAGCAGCATCCTGGCCTCTGCCCACTAGACGC 52646003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7436 AGGCTCATCCCGTGCCTCATAGGCTGATTAGCAGCATCCTGGCCTCTGCCCACTAGACGC 7495

 52646004 CGGTCACATTTCCCAGTCATGGCAACCAAAAATATCTCTAGGCATTGCTAAATGTCCCCT 52646063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7496 CGGTCACATTTCCCAGTCATGGCAACCAAAAATATCTCTAGGCATTGCTAAATGTCCCCT 7555

 52646064 GGAGGACAAAATCTCTTACGTTTGAGAGGCACTGAGCTGAAATGTCTTTTTGAATCCAGA 52646123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7556 GGAGGACAAAATCTCTTACGTTTGAGAGGCACTGAGCTGAAATGTCTTTTTGAATCCAGA 7615

 52646124 TTATCTAATTTTCTGTGCCTCAACTTTCTGGTAAAAGGAGACAGATAATAAATCTCGTAA 52646183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7616 TTATCTAATTTTCTGTGCCTCAACTTTCTGGTAAAAGGAGACAGATAATAAATCTCGTAA 7675

 52646184 TTTTGTTAGGAAGATTACATGAGTTAATAGTTTTAAAGCAAGTACAATAGCACCTGGAAT 52646243
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     7676 TTTTGTTAGGAAGATTACATGAGTTAATAGTTTTAAAGCAAGTACAATAGCGCCTGGAAT 7735

 52646244 ATATTAAGTGCTTAATAAATATCACAAACATTAGTTATCATTATTCATGAGTGAGAAAAC 52646303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7736 ATATTAAGTGCTTAATAAATATCACAAACATTAGTTATCATTATTCATGAGTGAGAAAAC 7795

 52646304 TGACAGTCAGAGAGGTCAGTACACCCTCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCTAGTAAGCAGCAG 52646363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7796 TGACAGTCAGAGAGGTCAGTACACCCTCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCTAGTAAGCAGCAG 7855

 52646364 AGTCTGGCTTCAGGCAGAAATCTGACTTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGTCTTACCAGGGA 52646423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7856 AGTCTGGCTTCAGGCAGAAATCTGACTTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGTCTTACCAGGGA 7915

 52646424 CTTGTATTAGCATAGACTGTTAAGAATATGGGAAGATTTTTAAAATACAGTACTCAGAAA 52646483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7916 CTTGTATTAGCATAGACTGTTAAGAATATGGGAAGATTTTTAAAATACAGTACTCAGAAA 7975

 52646484 ATTTCTCTTTGAAAGGCTGGAAGAGCAGATATCCACACAAGAAGGCAAATTAGACCTCAG 52646543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7976 ATTTCTCTTTGAAAGGCTGGAAGAGCAGATATCCACACAAGAAGGCAAATTAGACCTCAG 8035

 52646544 GCCAGTGTGGAATTAAAGGTGTAGGGTTATCTGGTCAAGACTGTGTGTGTGGATACAGGC 52646603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8036 GCCAGTGTGGAATTAAAGGTGTAGGGTTATCTGGTCAAGACTGTGTGTGTGGATACAGGC 8095

 52646604 TCCAACCCCTCCAGGCAAGGGCACTGTTTCCAACATCCACCCTTTCTCCTTTGACCTCTA 52646663
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8096 TCCAACCCCTCCAGGCAAGGGCAATGTTTCCAACATCCACCCTTTCTCCTTTGACCTCTA 8155

 52646664 CCTTGACCTAAATTAACTATAAAAGGTCCTTCTTTTCTAGGACCCTACTATAAATCAGTG 52646723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8156 CCTTGACCTAAATTAACTATAAAAGGTCCTTCTTTTCTAGGACCCTACTATAAATCAGTG 8215

 52646724 AAATATTCAGGAAAAAAAGAACACCAAGAATGTTGGGATCCCAGTTAAAGATCAAGATTC 52646783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8216 AAATATTCAGGAAAAAAAGAACACCAAGAATGTTGGGATCCCAGTTAAAGATCAAGATTC 8275

 52646784 TCTACTGATAAGCTGTGTGATATGGAGTAAATCACTAAAGATCTTTGAATCTCTTCATTT 52646843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8276 TCTACTGATAAGCTGTGTGATATGGAGTAAATCACTAAAGATCTTTGAATCTCTTCATTT 8335

 52646844 GTAAAATGGGAATATTGGTAGTCCTACTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTAAAGAAGAAAAG 52646903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8336 GTAAAATGGGAATATTGGTAGTCCTACTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTAAAGAAGAAAAG 8395

 52646904 TCATGCAAAGGATCTGGCACAACGCCTTTTCCATAATAAGTGCTTAGTAATTGACAGATA 52646963
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8396 TCATGCAAAGGATCTGGCACAATGCCTTTTCCATAATAAGTGCTTAGTAATTGACAGATA 8455

 52646964 CTGTGATAACTTTTCAGGTTTCTCTCATGCCTTTGACAACATTGCATTTTGCTTGCTCTA 52647023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8456 CTGTGATAACTTTTCAGGTTTCTCTCATGCCTTTGACAACATTGCATTTTGCTTGCTCTA 8515

 52647024 TCTGTAGTCAGACACTTCTTAATATCTGTTTGCAGGAAGAC 52647064
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8516 TCTGTAGTCAGACACTTCTTAATATCTGTTTGCAGGAAGAC 8556

EXCISED REGION

 52658003 AGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTG 52658062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8557 AGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTG 8616

 52658063 GCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTAT 52658122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8617 GCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTAT 8676

 52658123 AAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGG 52658182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8677 AAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGG 8736

 52658183 GAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTG 52658242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8737 GAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTG 8796

 52658243 AAA 52658245
          |||
     8797 AAA 8799

Alignment time is 9.96199 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [52637064,52668002] =>     30939 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    8159] =>      8159 nucs 'mol-32-30f6-106351_8159'

Score:        8136
Aligned:      8158        nucs
Identic:      8156 (100%) nucs =>      2269 (100%)      5887 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [52656171,52658439] EXCISED REGION [52658444,52664332]
 second seq =>  [       1,    2269] EXCISED REGION [    2272,    8159]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         4 nucs [52658440,52658443]
 second seq =>         2 nucs [2270,2271]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [52658437,52658439] to [52658441,52658443]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 52656171 TTGCTCCAACATGAGCATATATTTTCATTTAAAGACAAATCAGATGTTTCATTTGATTTT 52656230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTGCTCCAACATGAGCATATATTTTCATTTAAAGACAAATCAGATGTTTCATTTGATTTT 60

 52656231 TTTTATAAATCTGATAATAATGTACATTTAACCCGTGTTTACAACCAAAATAATTAATCT 52656290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTTATAAATCTGATAATAATGTACATTTAACCCGTGTTTACAACCAAAATAATTAATCT 120

 52656291 CTCTGAACCCTTTGTTTTTCCTGTCTCTATCCTCCACCCTCATTGCCAGATAAATAACAT 52656350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTCTGAACCCTTTGTTTTTCCTGTCTCTATCCTCCACCCTCATTGCCAGATAAATAACAT 180

 52656351 CTGCAACCTGATGTGGCATATTGAACTTTGTTTATACTCACACAAACACGTATAAGCATC 52656410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTGCAACCTGATGTGGCATATTGAACTTTGTTTATACTCACACAAACACGTATAAGCATC 240

 52656411 CCAGATACACATATACAGGGACTGTATCTGTCCTTGTTGTTTTTATAGAAATTGGATCAC 52656470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCAGATACACATATACAGGGACTGTATCTGTCCTTGTTGTTTTTATAGAAATTGGATCAC 300

 52656471 ATTAGACATATTTTCTGATGACTTTTGTACATTATAGTTGGTCTTCACAGTCAATAGCTC 52656530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATTAGACATATTTTCTGATGACTTTTGTACATTATAGTTGGTCTTCACAGTCAATAGCTC 360

 52656531 CAAAGCTATCTTATCTTCTAAAATAGCTGCATAATATTCCTCAGTATGGATATACCAAAA 52656590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CAAAGCTATCTTATCTTCTAAAATAGCTGCATAATATTCCTCAGTATGGATATACCAAAA 420

 52656591 GATATTTAAACCATTGCCTAATCAATGAATATCCTGGTAGTTTCCACATTGTTTTTTCCA 52656650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GATATTTAAACCATTGCCTAATCAATGAATATCCTGGTAGTTTCCACATTGTTTTTTCCA 480

 52656651 TTTCCACTATAGTGGAATAAACTTTCGTGTTCAAAAATCCTAAACTGGTGCTATATTTCT 52656710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTCCACTATAGTGGAATAAACTTTCGTGTTCAAAAATCCTAAACTGGTGCTATATTTCT 540

 52656711 ATAGAATAGAGGCACAGATGTAGAAGTGTTACCCTCAAATCAATATGCATTTAGTTTTGA 52656770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATAGAATAGAGGCACAGATGTAGAAGTGTTACCCTCAAATCAATATGCATTTAGTTTTGA 600

 52656771 AAAACAGACACTGCCATATTATTTTCTTAAAAAGGCTCTACAGATTCACATTTCCAGCAG 52656830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAAACAGACACTGCCATATTATTTTCTTAAAAAGGCTCTACAGATTCACATTTCCAGCAG 660

 52656831 CAATGAGTGTCTCAAGCACCTTTTAAGTGGTAAGCAGCTTACCAGGGGAGGTGGCCTATT 52656890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CAATGAGTGTCTCAAGCACCTTTTAAGTGGTAAGCAGCTTACCAGGGGAGGTGGCCTATT 720

 52656891 ATTCTATCAGTGGCTTCAGTTGTTAGGACACCACGGGTCAGCTGTGGAGATACGGTTGTG 52656950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATTCTATCAGTGGCTTCAGTTGTTAGGACACCACGGGTCAGCTGTGGAGATACGGTTGTG 780

 52656951 GGGCAGGTTGAGTTCAGGACACATAGAAGATTGCCAAAGGGTGACTATTATTACTTTGAG 52657010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GGGCAGGTTGAGTTCAGGACACATAGAAGATTGCCAAAGGGTGACTATTATTACTTTGAG 840

 52657011 ACTCTGGAAAAATTAGCCAGGAAACAGAGACAAGAGGCTCAGGGTGCAGCAAAGCAGCCA 52657070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ACTCTGGAAAAATTAGCCAGGAAACAGAGACAAGAGGCTCAGGGTGCAGCAAAGCAGCCA 900

 52657071 AATCAGGATGATAGTGTTTTCTTTGGAGCAGATATACTAATGGCCAAGGAACTCATAAAA 52657130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AATCAGGATGATAGTGTTTTCTTTGGAGCAGATATACTAATGGCCAAGGAACTCATAAAA 960

 52657131 AGATGCCTAATGTCATCTCATTAGGGAAGTGCAGTCAAAGCCACAGCATGATACGTCTTC 52657190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AGATGCCTAATGTCATCTCATTAGGGAAGTGCAGTCAAAGCCACAGCATGATACGTCTTC 1020

 52657191 ACACCCACGAGGATGGCCATAATCAGAGAGACAATAACCAGTGGTAGGGAAGATGTGAAA 52657250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ACACCCACGAGGATGGCCATAATCAGAGAGACAATAACCAGTGGTAGGGAAGATGTGAAA 1080

 52657251 AAATCGGAATGCTCATGCATTGCTGGTAGGAATGTGACATGGTGCAGCTGCTTTGGAAAG 52657310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAATCGGAATGCTCATGCATTGCTGGTAGGAATGTGACATGGTGCAGCTGCTTTGGAAAG 1140

 52657311 CAGTTTAACAGTTCCTGGAAAAGTTAAACATGGAGTTACCCTAAGACCCAGCAATTCCAT 52657370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CAGTTTAACAGTTCCTGGAAAAGTTAAACATGGAGTTACCCTAAGACCCAGCAATTCCAT 1200

 52657371 TCCTAGGTAAGCAAGAAAATGAAAACATATGGCCACACAAAAACTTGTACACAAATGTCC 52657430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TCCTAGGTAAGCAAGAAAATGAAAACATATGGCCACACAAAAACTTGTACACAAATGTCC 1260

 52657431 ATAGCAGCATTTTCATAATAGCTGAAAAGTGGAAACAACCCAAATATCCATCAATTGGAA 52657490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATAGCAGCATTTTCATAATAGCTGAAAAGTGGAAACAACCCAAATATCCATCAATTGGAA 1320

 52657491 AAAGGAAATCTAGCATTTGCATATAATAGAGTATTAATCAGCCATAAGAAGAAACAAAGC 52657550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AAAGGAAATCTAGCATTTGCATATAATAGAGTATTAATCAGCCATAAGAAGAAACAAAGC 1380

 52657551 ACCGATCCATGTTATATCATGCTTTATACTTGGAAGCATGGTACTAAGTGAAAGACGCCA 52657610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ACCGATCCATGTTATATCATGCTTTATACTTGGAAGCATGGTACTAAGTGAAAGACGCCA 1440

 52657611 GACACAAAAAGCAAAATATTGTATGATTCCATTTATATAAAGTGTCTAGAATAGGCAAAT 52657670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GACACAAAAAGCAAAATATTGTATGATTCCATTTATATAAAGTGTCTAGAATAGGCAAAT 1500

 52657671 CCATAGAGGCAGAAAACAGATTAGTGGTTGCCAGTGGCTGGGAATAGGGAAAAAACTCAG 52657730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CCATAGAGGCAGAAAACAGATTAGTGGTTGCCAGTGGCTGGGAATAGGGAAAAAACTCAG 1560

 52657731 CGCTAAAGGGTAGGGAGTTTTGTTTTGGAGTAATGACGATGTTCTGGAATTAGACGTGGA 52657790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CGCTAAAGGGTAGGGAGTTTTGTTTTGGAGTAATGACGATGTTCTGGAATTAGACGTGGA 1620

 52657791 ACGATTGCACACATGGTGCAAATATCCTTAAAATCACGGAATTGTCACTCTAAAAGGTGA 52657850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ACGATTGCACACATGGTGCAAATATCCTTAAAATCACGGAATTGTCACTCTAAAAGGTGA 1680

 52657851 ATTTTATGGTAGGTGAATTGTACCTCAATTTGTAAAAAGAAGAATTAGATAAATAAACAG 52657910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ATTTTATGGTAGGTGAATTGTACCTCAATTTGTAAAAAGAAGAATTAGATAAATAAACAG 1740

 52657911 CAACACAGCACCAAGGGGTGGGGGTAGGAAACAGACAACAAATAGGAGTGAAGAGTTCAC 52657970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CAACACAGCACCAAGGGGTGGGGGTAGGAAACAGACAACAAATAGGAGTGAAGAGTTCAC 1800

 52657971 AGGAAAAGACATGCAGCCAGCTTTTAAGCAGAAGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGT 52658030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AGGAAAAGACATGCAGCCAGCTTTTAAGCAGAAGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGT 1860

 52658031 AAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTGGCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAG 52658090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTGGCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAG 1920

 52658091 GAGACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTATAAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACG 52658150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GAGACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTATAAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACG 1980

 52658151 GTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTA 52658210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTA 2040

 52658211 AGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACACTGTCTCTGCTAAAAAACAAAAC 52658270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACACTGTCTCTGCTAAAAAACAAAAC 2100

 52658271 AAAACAAAACACCAAAAAATAGCTGGGCGTAGTGGCGGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTT 52658330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AAAACAAAACACCAAAAAATAGCTGGGCGTAGTGGCGGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTT 2160

 52658331 GGGAGGCGGTGGCAGGAGAATCATTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGA 52658390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GGGAGGCGGTGGCAGGAGAATCATTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGA 2220

 52658391 TTGTGCCACTGCACTCTAACCTGGGCAACAGAGTTCAGAGTGAGACTCT 52658439
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TTGTGCCACTGCACTCTAACCTGGGCAACAGAGTTCAGAGTGAGACTCT 2269

EXCISED REGION

 52658444 CCCCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAACAGCCATATAGATCGTCGGTGGGAGTGTAA 52658503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2272 CCCCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAACAGCCATATAGATCGTCGGTGGGAGTGTAA 2331

 52658504 TTTGGCCACTTCTTTGGAAAATAGCTCAGTAATATCTATTAATACTTAAAATTTCACAAA 52658563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2332 TTTGGCCACTTCTTTGGAAAATAGCTCAGTAATATCTATTAATACTTAAAATTTCACAAA 2391

 52658564 CACTGTAAGTCTAACTTCCACTTCTAAAATGTTATCCTAGAAATAAAATTGCATAGGGGT 52658623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2392 CACTGTAAGTCTAACTTCCACTTCTAAAATGTTATCCTAGAAATAAAATTGCATAGGGGT 2451

 52658624 ACAAAGGCTTACGTATGGAACTATTTGCTGGACTACTGTAGTTGTGGCAAAAAACTGGAA 52658683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2452 ACAAAGGCTTACGTATGGAACTATTTGCTGGACTACTGTAGTTGTGGCAAAAAACTGGAA 2511

 52658684 ATGACCTAAACGCTTATTAGTAGAAACCTGGTTAAATAAATTATCATATGTCCTTGAGGA 52658743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2512 ATGACCTAAACGCTTATTAGTAGAAACCTGGTTAAATAAATTATCATATGTCCTTGAGGA 2571

 52658744 CACAGGGACACAAAGAGGGGAATGACAGGCACTGAGCCTACTTGAGGGTGGGAGGAGGAA 52658803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2572 CACAGGGACACAAAGAGGGGAATGACAGGCACTGAGCCTACTTGAGGGTGGGAGGAGGAA 2631

 52658804 GTCGATCAGAAAAAATAACTAGTGGGTACTAGGCTTAGTACCCGGGTGAAAAAATAATCT 52658863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2632 GTCGATCAGAAAAAATAACTAGTGGGTACTAGGCTTAGTACCCGGGTGAAAAAATAATCT 2691

 52658864 GTACAACAAACCCCCATGACATGAGTTTACCTTATAACAAACCTGCACATGTAATCTGAA 52658923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2692 GTACAACAAACCCCCATGACATGAGTTTACCTTATAACAAACCTGCACATGTAATCTGAA 2751

 52658924 CCTAGATAAAAGTTTAAAAAAATAAATAATCATATGTCCCTACAATGAAATATTCCACAG 52658983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2752 CCTAGATAAAAGTTTAAAAAAATAAATAATCATATGTCCCTACAATGAAATATTCCACAG 2811

 52658984 GCATTAAAATTCCCCAAGGAATTTTAGTAAGGAAAGAAAAAGCTGTGCCCAACAGCACGT 52659043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2812 GCATTAAAATTCCCCAAGGAATTTTAGTAAGGAAAGAAAAAGCTGTGCCCAACAGCACGT 2871

 52659044 ACAGTATGTTTCCATTTGTTTTTAAAAAATGGTGTCGGGAGGTTGAGGAGACAACTTATA 52659103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2872 ACAGTATGTTTCCATTTGTTTTTAAAAAATGGTGTCGGGAGGTTGAGGAGACAACTTATA 2931

 52659104 AATAGACATGCCTGGGATACCTCTGGATATAAGAAACTGTAAAGTATTTACTTCTAAGGA 52659163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2932 AATAGACATGCCTGGGATACCTCTGGATATAAGAAACTGTAAAGTATTTACTTCTAAGGA 2991

 52659164 AGGAAATTTGGGATGGGGCTTGGGGAGCCATCAGAGTTAGGGTGGGGATTTTTTCTCTGC 52659223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2992 AGGAAATTTGGGATGGGGCTTGGGGAGCCATCAGAGTTAGGGTGGGGATTTTTTCTCTGC 3051

 52659224 CTTATCTTATTATGTATATCGCTCAGAATGTTTGCTATGTGTATGCACCTACCCCATCCA 52659283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3052 CTTATCTTATTATGTATATCGCTCAGAATGTTTGCTATGTGTATGCACCTACCCCATCCA 3111

 52659284 TTAAGAAATGAAGAAATAATGAAAAGAAAAAATGAAAGTAGGGAACTAGAAATGAGAGGT 52659343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3112 TTAAGAAATGAAGAAATAATGAAAAGAAAAAATGAAAGTAGGGAACTAGAAATGAGAGGT 3171

 52659344 GGGATTCAAAGTGGACTGAACACTTGACCTATTTCCCAATTTGCCTAGGGCTGGCCCAGC 52659403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3172 GGGATTCAAAGTGGACTGAACACTTGACCTATTTCCCAATTTGCCTAGGGCTGGCCCAGC 3231

 52659404 AGCGAGGCAGGTTCTAACCAATGAGCATCAGCTTTGAATGGAGGGGCTGATAGGCCAGGT 52659463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3232 AGCGAGGCAGGTTCTAACCAATGAGCATCAGCTTTGAATGGAGGGGCTGATAGGCCAGGT 3291

 52659464 GGGCCCTGCTTGCTGAGAGTGTCATGGCCTTAGGGACATCTCCATGTTGCAGAGTCTGAG 52659523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3292 GGGCCCTGCTTGCTGAGAGTGTCATGGCCTTAGGGACATCTCCATGTTGCAGAGTCTGAG 3351

 52659524 CCTCTGCTTGGCAAATTCAGAAAATCCAGCTTTTCTTTTTATATCACCTGGAGCTGATGT 52659583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3352 CCTCTGCTTGGCAAATTCAGAAAATCCAGCTTTTCTTTTTATATCACCTGGAGCTGATGT 3411

 52659584 AACTCTCAGAAGGCATTTTTAAGAGGACTCATGAATTAACCACATAGCCAACTTACTGGC 52659643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3412 AACTCTCAGAAGGCATTTTTAAGAGGACTCATGAATTAACCACATAGCCAACTTACTGGC 3471

 52659644 TTAAGACTACGTGACAGAAAGCTGCAAAGGGGGCCAGCCACTGGTAACATCCCACCACTG 52659703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3472 TTAAGACTACGTGACAGAAAGCTGCAAAGGGGGCCAGCCACTGGTAACATCCCACCACTG 3531

 52659704 TCCCTCTCTGTGGAAAACACAGATGGGATGCACATTGTGACGGGCAGGATGCCTGGAGAG 52659763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3532 TCCCTCTCTGTGGAAAACACAGATGGGATGCACATTGTGACGGGCAGGATGCCTGGAGAG 3591

 52659764 CCCACAAATCTGCAAGCACAGCTGAAATTGGTTACAGGATTTCAATGTTTCATTGCTTGA 52659823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3592 CCCACAAATCTGCAAGCACAGCTGAAATTGGTTACAGGATTTCAATGTTTCATTGCTTGA 3651

 52659824 AGCTATGATAACTTGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGACGATGATTTTTTTT 52659883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3652 AGCTATGATAACTTGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGACGATGATTTTTTTT 3711

 52659884 ATAGCCATCTTTTTAGAGGGATTTGAGGTAGGGAAAAAAATAAACCTCACACTATCGGAG 52659943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3712 ATAGCCATCTTTTTAGAGGGATTTGAGGTAGGGAAAAAAATAAACCTCACACTATCGGAG 3771

 52659944 GTTGCCAACTATGAGGTCTGCTGATGGTTTGGCCAACACAGTGTTTATATTTTTTTGAAT 52660003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3772 GTTGCCAACTATGAGGTCTGCTGATGGTTTGGCCAACACAGTGTTTATATTTTTTTGAAT 3831

 52660004 TGGGAAATTTCATTTAAAAGTCCTAAAATCAGGCTGTTATTGAAATATCTTATTATTGGC 52660063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3832 TGGGAAATTTCATTTAAAAGTCCTAAAATCAGGCTGTTATTGAAATATCTTATTATTGGC 3891

 52660064 TCAGGGTTTCCCAGGGCAGCCATCCTTGAAGCTGTGTGGAGCCCTATAAACAAGGACGCT 52660123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3892 TCAGGGTTTCCCAGGGCAGCCATCCTTGAAGCTGTGTGGAGCCCTATAAACAAGGACGCT 3951

 52660124 TTCCAGTTCCCTGCAAACTCCATTTCATTCAGAGCCTTGAGCCAGTTCTTACATGGTCCT 52660183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3952 TTCCAGTTCCCTGCAAACTCCATTTCATTCAGAGCCTTGAGCCAGTTCTTACATGGTCCT 4011

 52660184 CAGACTTGAGCTAGTGCAAGAATACCCGGGAGGGGTTGTGGGAACAGATAGCTGGGCCCC 52660243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4012 CAGACTTGAGCTAGTGCAAGAATACCCGGGAGGGGTTGTGGGAACAGATAGCTGGGCCCC 4071

 52660244 ACCCCCAGGGAAGGGGGTGTTTCTGACTCAGGAGGTCTGGGCTCCGGCTACAGAAACTGC 52660303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4072 ACCCCCAGGGAAGGGGGTGTTTCTGACTCAGGAGGTCTGGGCTCCGGCTACAGAAACTGC 4131

 52660304 ACATCTAACCGGTACCCAGGTGATGTGATGCTGCTGGCCCAGGGACAACTCTGCGAGTCA 52660363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4132 ACATCTAACCGGTACCCAGGTGATGTGATGCTGCTGGCCCAGGGACAACTCTGCGAGTCA 4191

 52660364 CTGCTATTGGGCACTGCTATTGCACCCACACAAGGAGGCAGGCTCTGCTTACATTTTTCA 52660423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     4192 CTGCTATTGGGCACTGCTATTGCACCCACACAGGGAGGCAGGCTCTGCTTACATTTTTCA 4251

 52660424 GTTCTTGTTCCCAGAAACATTTGCTCTTTGGGGTATGCTTTGCATATAATGGATCCTACC 52660483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4252 GTTCTTGTTCCCAGAAACATTTGCTCTTTGGGGTATGCTTTGCATATAATGGATCCTACC 4311

 52660484 CACTAATACAGTATGCTGCTTTTATTGATAAACTTCCAGAAACTTGAAGCGCACCTTACC 52660543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4312 CACTAATACAGTATGCTGCTTTTATTGATAAACTTCCAGAAACTTGAAGCGCACCTTACC 4371

 52660544 ATTTCTTTGATCTCGCTGATTATTTTTATTTTTGTTAAATGAAAATTGTTGGTAAGTTCT 52660603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4372 ATTTCTTTGATCTCGCTGATTATTTTTATTTTTGTTAAATGAAAATTGTTGGTAAGTTCT 4431

 52660604 TTTTGGTGTGGTAAAAGGATATGAAAAGCTGATTTTAAAAAAATGTCCACTCTAGGATTA 52660663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4432 TTTTGGTGTGGTAAAAGGATATGAAAAGCTGATTTTAAAAAAATGTCCACTCTAGGATTA 4491

 52660664 GAATTGTAGGTGTGTTTATTCTATTTCAAGATCTGGTTAAAATGCACCTTGAGGAAAAGA 52660723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4492 GAATTGTAGGTGTGTTTATTCTATTTCAAGATCTGGTTAAAATGCACCTTGAGGAAAAGA 4551

 52660724 ATTGAGTGCAGCTGTTGTTATTTCTCAATGCTGTTTCTCTTTTCATGTTTTTTTCATGTT 52660783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4552 ATTGAGTGCAGCTGTTGTTATTTCTCAATGCTGTTTCTCTTTTCATGTTTTTTTCATGTT 4611

 52660784 GTCTCTTGGTCTGTCCTATCTCTCTTGGTCTATCCTCCAAGACAGAGATGAGTGATCTTG 52660843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4612 GTCTCTTGGTCTGTCCTATCTCTCTTGGTCTATCCTCCAAGACAGAGATGAGTGATCTTG 4671

 52660844 AAACCCTGCCCATGTTTTTATCTTTGGAGCCCAACTGTGCTGCCTTGTTTTCTTCTCCAT 52660903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4672 AAACCCTGCCCATGTTTTTATCTTTGGAGCCCAACTGTGCTGCCTTGTTTTCTTCTCCAT 4731

 52660904 CCAAAGAGGCAAAGAGAAAGTTGCATATTACTCAACAGCAGTTGCATGACAGTTAAAATC 52660963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4732 CCAAAGAGGCAAAGAGAAAGTTGCATATTACTCAACAGCAGTTGCATGACAGTTAAAATC 4791

 52660964 AGACTGTATGAGTCATGGAACAGTAAGTTGTGTCCAGAGTATCTGTCATGGTAAGTACAA 52661023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4792 AGACTGTATGAGTCATGGAACAGTAAGTTGTGTCCAGAGTATCTGTCATGGTAAGTACAA 4851

 52661024 AAAAGTCCTTAAAAATTTAAAACAGAAATGCCAATGTTTTATTTTTGAAAAATGTGAAGA 52661083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4852 AAAAGTCCTTAAAAATTTAAAACAGAAATGCCAATGTTTTATTTTTGAAAAATGTGAAGA 4911

 52661084 AGAAATTTTCCGGCCGGGCGCGGTGGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCA 52661143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4912 AGAAATTTTCCGGCCGGGCGCGGTGGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCA 4971

 52661144 AGGTGGGCAGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACACAGTGCAACC 52661203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4972 AGGTGGGCAGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACACAGTGCAACC 5031

 52661204 CCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGATGCGGTGGCACGCGCCTGTAATCTCAG 52661263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5032 CCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGATGCGGTGGCACGCGCCTGTAATCTCAG 5091

 52661264 CTACTAGGGAGGCTGAGGCATGACAATCGCTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAG 52661323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5092 CTACTAGGGAGGCTGAGGCATGACAATCGCTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAG 5151

 52661324 CTGAGATCATACCACTGCACTCCAGCTTGGGCAGCGGAAGGAGACTCTGTCTCAAAAAAA 52661383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5152 CTGAGATCATACCACTGCACTCCAGCTTGGGCAGCGGAAGGAGACTCTGTCTCAAAAAAA 5211

 52661384 AAAAGAAAAAAAGAAATTTTCTAAGTGTATTCCAAATAACTTTTAATATTGGATAAACAT 52661443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5212 AAAAGAAAAAAAGAAATTTTCTAAGTGTATTCCAAATAACTTTTAATATTGGATAAACAT 5271

 52661444 TACGAGTTTAAAAATACTTATGCCAGAGGAGTGCTGTGACTCGTGCCTCTAATCCCAGCA 52661503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5272 TACGAGTTTAAAAATACTTATGCCAGAGGAGTGCTGTGACTCGTGCCTCTAATCCCAGCA 5331

 52661504 ATGTGGGAGGCCAAGGAGGGACAGTCACTTGAGCCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGATA 52661563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5332 ATGTGGGAGGCCAAGGAGGGACAGTCACTTGAGCCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGATA 5391

 52661564 ACAAAGGGAGACCTCATCTTTACAAAAAAACTAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGTGTGT 52661623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5392 ACAAAGGGAGACCTCATCTTTACAAAAAAACTAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGTGTGT 5451

 52661624 GCCTGTGATCCCAGCTACACAGGAGGCTGAGGCAAGAGGATTCCTTGAGCCCTGGAGGTC 52661683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5452 GCCTGTGATCCCAGCTACACAGGAGGCTGAGGCAAGAGGATTCCTTGAGCCCTGGAGGTC 5511

 52661684 AAGGCTGCAGTGAGTGATGATCATGCCATTGCACTCCAGCTGGGTGACAGAGCAAGACCT 52661743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5512 AAGGCTGCAGTGAGTGATGATCATGCCATTGCACTCCAGCTGGGTGACAGAGCAAGACCT 5571

 52661744 CATCTCAAAAAAAAAAAAAAAACAAAACAAAACAAAAAACTTACGCCCAGGTAAAAATTG 52661803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5572 CATCTCAAAAAAAAAAAAAAAACAAAACAAAACAAAAAACTTACGCCCAGGTAAAAATTG 5631

 52661804 TCAGAGAAAAATAAGAAAAAAACTGAATGCCCAAAATTAGCATAATGGCTGAATGAATTA 52661863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5632 TCAGAGAAAAATAAGAAAAAAACTGAATGCCCAAAATTAGCATAATGGCTGAATGAATTA 5691

 52661864 TAGTATGTCTATACCTTGAAGTACATTGTAGCTTTAAAAAAAATGAATTAAAGTTATACC 52661923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5692 TAGTATGTCTATACCTTGAAGTACATTGTAGCTTTAAAAAAAATGAATTAAAGTTATACC 5751

 52661924 AGTTGAATTTGGAGTTGAGATGGGGAAGATTATTACAATTAAAAAAAAACAAACACTATT 52661983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5752 AGTTGAATTTGGAGTTGAGATGGGGAAGATTATTACAATTAAAAAAAAACAAACACTATT 5811

 52661984 AATGGATGTGCTGGGAAATGTCTGTATGGGGCTAGTTAAAGTAAATTAAAATAAAGACCA 52662043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5812 AATGGATGTGCTGGGAAATGTCTGTATGGGGCTAGTTAAAGTAAATTAAAATAAAGACCA 5871

 52662044 GACCTGAAGAATCCCTGAGCGGACAAAGCCTGTTAGACCACATAAATGAGCTAAACCTTG 52662103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5872 GACCTGAAGAATCCCTGAGCGGACAAAGCCTGTTAGACCACATAAATGAGCTAAACCTTG 5931

 52662104 CTTGATTTGCAGACATAAGCAAAACAACTCGAACTGTTTCTTGTAAATGCCTATGCTAAA 52662163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5932 CTTGATTTGCAGACATAAGCAAAACAACTCGAACTGTTTCTTGTAAATGCCTATGCTAAA 5991

 52662164 GAAAAACAGAACTTGAGCTCAACCAATCAGAAACAGTCAACAAACTTAAAATTATATAAC 52662223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5992 GAAAAACAGAACTTGAGCTCAACCAATCAGAAACAGTCAACAAACTTAAAATTATATAAC 6051

 52662224 TGGGTACCTTCCAATGAGATGATCAAATAAGGCAACTGTGTAATTGTAACACATCAAACA 52662283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6052 TGGGTACCTTCCAATGAGATGATCAAATAAGGCAACTGTGTAATTGTAACACATCAAACA 6111

 52662284 CATTTTATATTATGCCTCTGCATTTTCCCTTAATTCTGGCATGTAATGCTTTGTCATCAA 52662343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6112 CATTTTATATTATGCCTCTGCATTTTCCCTTAATTCTGGCATGTAATGCTTTGTCATCAA 6171

 52662344 AACACTAATTCCCTTTTGGTTTTCTTTTCTCAAATTAATGAATTGCCTCTATTCAGATAC 52662403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6172 AACACTAATTCCCTTTTGGTTTTCTTTTCTCAAATTAATGAATTGCCTCTATTCAGATAC 6231

 52662404 ACTCTTTGAAATTTTATTGTGTCTCAGATTTGTCTTTTACAAAGTATAGAACAAAGAGAA 52662463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6232 ACTCTTTGAAATTTTATTGTGTCTCAGATTTGTCTTTTACAAAGTATAGAACAAAGAGAA 6291

 52662464 AAATATGAAAGAAGAAATATTAGGTTGTTAGCTTGGGTGTCCTTGGAGGGGGTAGGGAAG 52662523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6292 AAATATGAAAGAAGAAATATTAGGTTGTTAGCTTGGGTGTCCTTGGAGGGGGTAGGGAAG 6351

 52662524 ATGTGAGATGAGGAAGAAGCCAATAAGAAAAAGAAAAAGACAGGTTTCACCAAAACAACA 52662583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6352 ATGTGAGATGAGGAAGAAGCCAATAAGAAAAAGAAAAAGACAGGTTTCACCAAAACAACA 6411

 52662584 ATAACAGAAAATATGATTGCATTTATTCATATATGTTAATTGGTATGTATGTAAGTATAT 52662643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6412 ATAACAGAAAATATGATTGCATTTATTCATATATGTTAATTGGTATGTATGTAAGTATAT 6471

 52662644 ATGCATGTAAAAATAAAATACAAAGAATTAAAATGCATACTAATAGTTATTTCAGTTATC 52662703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6472 ATGCATGTAAAAATAAAATACAAAGAATTAAAATGCATACTAATAGTTATTTCAGTTATC 6531

 52662704 TATGGCTGTGTAACAAGCATCCCCAAAATGATTGACTTAACCACCATTTTATTAGGTCAT 52662763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6532 TATGGCTGTGTAACAAGCATCCCCAAAATGATTGACTTAACCACCATTTTATTAGGTCAT 6591

 52662764 GATTCCATGCATTAAGAATTCAGGGCCGGGTGCGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCAC 52662823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6592 GATTCCATGCATTAAGAATTCAGGGCCGGGTGCGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCAC 6651

 52662824 TTTGGGAGGCCAAGGTGGGTGGATCACGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGCCCAACA 52662883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6652 TTTGGGAGGCCAAGGTGGGTGGATCACGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGCCCAACA 6711

 52662884 TAGTGGAACCCCGTCTGTACTAAAAATACAGAAGATTAGCTGGGTGTGGTGGCGGGCACC 52662943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6712 TAGTGGAACCCCGTCTGTACTAAAAATACAGAAGATTAGCTGGGTGTGGTGGCGGGCACC 6771

 52662944 TGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAAGCTGGAAGGCAGAG 52663003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6772 TGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAAGCTGGAAGGCAGAG 6831

 52663004 GTTGCAGTGAGCCAAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGTGGACAGCGCGAGACTCCA 52663063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6832 GTTGCAGTGAGCCAAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGTGGACAGCGCGAGACTCCA 6891

 52663064 TCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAATTCAGGCAGATGCCAGGTGCAGTGGCTCATACC 52663123
          |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6892 TCTC-AAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAATTCAGGCAGATGCCAGGTGCAGTGGCTCATACC 6950

 52663124 TGTAATTCTAGCACTTTGGGAGGCTGAGATGGGCAGATCACCTGAAGTCAAGGAGTTCCA 52663183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6951 TGTAATTCTAGCACTTTGGGAGGCTGAGATGGGCAGATCACCTGAAGTCAAGGAGTTCCA 7010

 52663184 GACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAAACCAGTCTGTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGA 52663243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7011 GACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAAACCAGTCTGTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGA 7070

 52663244 CATGGTGGCACGTGCCTGTAATCCCAGCTATACAAGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTG 52663303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7071 CATGGTGGCACGTGCCTGTAATCCCAGCTATACAAGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTG 7130

 52663304 ATCTGGGACGTGGAGGTTGCAGCAAGCCAAGATCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGA 52663363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7131 ATCTGGGACGTGGAGGTTGCAGCAAGCCAAGATCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGA 7190

 52663364 CAGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAGAATTCAGGCAGAGAGAGGATAGGAT 52663423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7191 CAGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAGAATTCAGGCAGAGAGAGGATAGGAT 7250

 52663424 CAGCTTATTTCTGCTCTATGATGTCTGGAGCCACAGCTGGGGTGCCTTGAAAGGATGAAG 52663483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7251 CAGCTTATTTCTGCTCTATGATGTCTGGAGCCACAGCTGGGGTGCCTTGAAAGGATGAAG 7310

 52663484 ATGGCTGGGACGGCTCACACAGGGACATATGTCTGGAGCTTTAGTTCTGGCTATGGGCTG 52663543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7311 ATGGCTGGGACGGCTCACACAGGGACATATGTCTGGAGCTTTAGTTCTGGCTATGGGCTG 7370

 52663544 GTTCCTATGGTCCTTCCTCATACGGCATCTATTAGCTGAAATGCCCATGATGTCTTCTTT 52663603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7371 GTTCCTATGGTCCTTCCTCATACGGCATCTATTAGCTGAAATGCCCATGATGTCTTCTTT 7430

 52663604 AATCACAGGTCTGGTTCCTGGACTGGGATGGCTGGAATATTTGGGAACTGGCTGGGTACC 52663663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7431 AATCACAGGTCTGGTTCCTGGACTGGGATGGCTGGAATATTTGGGAACTGGCTGGGTACC 7490

 52663664 TCTCTCTTGCCTCATGGCTTCTTCATGTGACTAGCTTGGGCTCTCTCACAGCATGGCAAT 52663723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7491 TCTCTCTTGCCTCATGGCTTCTTCATGTGACTAGCTTGGGCTCTCTCACAGCATGGCAAT 7550

 52663724 CTCAGGGTAGAACTTCTGATATTGTGTCTAGCCTTTCTCAGAGCTAGTGTTGCAAGAGAC 52663783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7551 CTCAGGGTAGAACTTCTGATATTGTGTCTAGCCTTTCTCAGAGCTAGTGTTGCAAGAGAC 7610

 52663784 AAGGCAGAAGCTCCGAGTCTTCTTAAAAGGCTTCTTGAAAGTCCTGTGTCATCCCTTCTA 52663843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7611 AAGGCAGAAGCTCCGAGTCTTCTTAAAAGGCTTCTTGAAAGTCCTGTGTCATCCCTTCTA 7670

 52663844 CTACATACTGTTGGTTATATAGGACCAGCCCAGAGGGGACTACACAGGGGTGTGAATACC 52663903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7671 CTACATACTGTTGGTTATATAGGACCAGCCCAGAGGGGACTACACAGGGGTGTGAATACC 7730

 52663904 AGGAAGCATGGGTTATTGCGTGGTGGGTTGTATGTGTGCATCTTTGGAGACTATCAACCA 52663963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7731 AGGAAGCATGGGTTATTGCGTGGTGGGTTGTATGTGTGCATCTTTGGAGACTATCAACCA 7790

 52663964 CAATAATGCAATAGGGAAGATAATTTTATCTAACAGGAATTCTCCACTAGACTTTTTGGT 52664023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7791 CAATAATGCAATAGGGAAGATAATTTTATCTAACAGGAATTCTCCACTAGACTTTTTGGT 7850

 52664024 GAGAAAAAGCACTGAGTTTGAGAAGGATGAGATTTCCCCAGGGCTCTTGCTCACTCCCAA 52664083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7851 GAGAAAAAGCACTGAGTTTGAGAAGGATGAGATTTCCCCAGGGCTCTTGCTCACTCCCAA 7910

 52664084 GGAAGACAGAGGCACAAGGAGCTGTTGGGCCATCTGGGAGAGCCAGTGTTCAGAACTCTC 52664143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7911 GGAAGACAGAGGCACAAGGAGCTGTTGGGCCATCTGGGAGAGCCAGTGTTCAGAACTCTC 7970

 52664144 TGTTATTACTTTAGACTCAGTGGTGATACAGTGCAATGGAGGGAAAGAAGAAAGGAGAGT 52664203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7971 TGTTATTACTTTAGACTCAGTGGTGATACAGTGCAATGGAGGGAAAGAAGAAAGGAGAGT 8030

 52664204 GCCTGTGAGTGTTACCAGTGGAGAGTTGTCCAGGTTCTTGGTGTTTTGAACAAAAAAATT 52664263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8031 GCCTGTGAGTGTTACCAGTGGAGAGTTGTCCAGGTTCTTGGTGTTTTGAACAAAAAAATT 8090

 52664264 GGACAAAATGCACAAAGCAATGAAAGCACAGATTTATAGAAATGAAAGTACACTCCACAG 52664323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8091 GGACAAAATGCACAAAGCAATGAAAGCACAGATTTATAGAAATGAAAGTACACTCCACAG 8150

 52664324 AGTGGGAGC 52664332
          |||||||||
     8151 AGTGGGAGC 8159

Alignment time is 9.27017 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [52637064,52668002] =>     30939 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    9441] =>      9441 nucs 'mol-32-30f6-139434_9441'

Score:        9430
Aligned:      9441        nucs
Identic:      9440 (100%) nucs =>      5180 (100%)      4260 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [52653269,52658448] EXCISED REGION [52658451,52662711]
 second seq =>  [       1,    5180] EXCISED REGION [    5181,    9441]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [52658449,52658450]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        20 nucs [52658449,52658468] to [52658451,52658470]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [52658449,52658449] to [52658450,52658450]
 second seq =>         0 nucs

 52653269 GTTATACTAATATGTTATTAATATAATTACCATTTTGTATTTTTAAATGTAAGCCATAAG 52653328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTTATACTAATATGTTATTAATATAATTACCATTTTGTATTTTTAAATGTAAGCCATAAG 60

 52653329 GAAAGGAATTATTCCAATAGTTTAATTTACAAACTTGAGTTTTCTAGAAAGACTTTTAAA 52653388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAAAGGAATTATTCCAATAGTTTAATTTACAAACTTGAGTTTTCTAGAAAGACTTTTAAA 120

 52653389 AACAGTAGTGATATAAATCAATTTATCTTAAGAAACATAAGTATCTGGGCCAGGCAAGTT 52653448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AACAGTAGTGATATAAATCAATTTATCTTAAGAAACATAAGTATCTGGGCCAGGCAAGTT 180

 52653449 TCAGAAATGTTTATCATTTTCAAAGTACCAAATATTCTCGTCAAAACAAGCTGCTTCATC 52653508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCAGAAATGTTTATCATTTTCAAAGTACCAAATATTCTCGTCAAAACAAGCTGCTTCATC 240

 52653509 AGAGTTCTAATTATATATTTAAACATACATGCACACACACACGTTTGTATTACAATATTC 52653568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGAGTTCTAATTATATATTTAAACATACATGCACACACACACGTTTGTATTACAATATTC 300

 52653569 AAAACTTCTGAGGAAGAATTATCTTTTTTTTTTCATGTGCCAAAGCTAAAACTTTCACTT 52653628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAAACTTCTGAGGAAGAATTATCTTTTTTTTTTCATGTGCCAAAGCTAAAACTTTCACTT 360

 52653629 GCTACAGCTGTGTATTAGTCTATTTCCATACTGCTATAAAGAGCTGCCCAAGACTGGGTG 52653688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GCTACAGCTGTGTATTAGTCTATTTCCATACTGCTATAAAGAGCTGCCCAAGACTGGGTG 420

 52653689 ATTTATAAAGGAAAGAGGTTTAATTGACTCACAGTTCAGCATGGCAGGGAAGGCCTCAGG 52653748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATTTATAAAGGAAAGAGGTTTAATTGACTCACAGTTCAGCATGGCAGGGAAGGCCTCAGG 480

 52653749 AAACTTACAATCATGGTGGAAGTCAAAGGGGGAGCAAGGACCTTTCTTCACAAGGCAGCA 52653808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAACTTACAATCATGGTGGAAGTCAAAGGGGGAGCAAGGACCTTTCTTCACAAGGCAGCA 540

 52653809 GAAAGAAGTGCCAAATGAACAGGGAAGAGCTCCTTATGAAACCATCAGGTCTTGTGAGAA 52653868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GAAAGAAGTGCCAAATGAACAGGGAAGAGCTCCTTATGAAACCATCAGGTCTTGTGAGAA 600

 52653869 CTCACTTACTTTTATGAGAACAGCATGGAGGAAACTGTCCCCATGATCCAATCACCTCCA 52653928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTCACTTACTTTTATGAGAACAGCATGGAGGAAACTGTCCCCATGATCCAATCACCTCCA 660

 52653929 CCTGGTCTCTCCCTTGACACGTGGGGATTATGGGGATTAAATTCCAGATGAGATTTGGGT 52653988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCTGGTCTCTCCCTTGACACGTGGGGATTATGGGGATTAAATTCCAGATGAGATTTGGGT 720

 52653989 GGGGACAAAAAGCCTAACGACATCAAGCTGTAAAAACAATAGCTAACATTCATTGACTGT 52654048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GGGGACAAAAAGCCTAACGACATCAAGCTGTAAAAACAATAGCTAACATTCATTGACTGT 780

 52654049 TTCCCAGCATTAGGATAAATGTGTGTAACAAGAGGCATTTTATTTATGTATGACATTTGT 52654108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTCCCAGCATTAGGATAAATGTGTGTAACAAGAGGCATTTTATTTATGTATGACATTTGT 840

 52654109 TTATTTATTATTTATTTATTTGGATAAATGTCTATAACAAGAAACATTTTATTTAAGTAT 52654168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTATTTATTATTTATTTATTTGGATAAATGTCTATAACAAGAAACATTTTATTTAAGTAT 900

 52654169 AACAGCAAATCTACAAGTTAGGTACTATCATCACTCCCATTTTACAGGTCGTGAAACTGA 52654228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AACAGCAAATCTACAAGTTAGGTACTATCATCACTCCCATTTTACAGGTCGTGAAACTGA 960

 52654229 GGCTCTGAAAAGTCAAGTCAGTTTTCTAATGTTGTCCAGCTAATGACTGGTAGATTTAGT 52654288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GGCTCTGAAAAGTCAAGTCAGTTTTCTAATGTTGTCCAGCTAATGACTGGTAGATTTAGT 1020

 52654289 ATTTGAACCCACATTTGCCTGATTCCAAAGTTCAAACTCCCAACAACATGTGGTAACCAA 52654348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATTTGAACCCACATTTGCCTGATTCCAAAGTTCAAACTCCCAACAACATGTGGTAACCAA 1080

 52654349 AGCAGGAACAGAAGAGAAAGAAGAAATAGAAGGGAGGGAAGATGAACAAAGTAGACAAAG 52654408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AGCAGGAACAGAAGAGAAAGAAGAAATAGAAGGGAGGGAAGATGAACAAAGTAGACAAAG 1140

 52654409 TTTAGTTAATAGAATTAGTGGATACCCAAGAAAAAACTATGTACAAGAGGGGGAAAAAAA 52654468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTTAGTTAATAGAATTAGTGGATACCCAAGAAAAAACTATGTACAAGAGGGGGAAAAAAA 1200

 52654469 CCCTGTTTTCTCACATCTGGGAAACATTGATATCTATATATTTTTGGTTTTAAATAAAAA 52654528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CCCTGTTTTCTCACATCTGGGAAACATTGATATCTATATATTTTTGGTTTTAAATAAAAA 1260

 52654529 TTAGGTTATGTCATTCATTTGCATAAAACCATCCAAAGAAGGGCCTCACAAAATTAAAAC 52654588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTAGGTTATGTCATTCATTTGCATAAAACCATCCAAAGAAGGGCCTCACAAAATTAAAAC 1320

 52654589 AAAATCCAAACTCTCTACTATGGGCCACACCCTCCAGAACTTCAGCTCGTACTATGTTTT 52654648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AAAATCCAAACTCTCTACTATGGGCCACACCCTCCAGAACTTCAGCTCGTACTATGTTTT 1380

 52654649 TCCTCACACCTCTCAACATACCAACATGTTTCCACCTGCAGCCCTCACCACTAGTTATTC 52654708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TCCTCACACCTCTCAACATACCAACATGTTTCCACCTGCAGCCCTCACCACTAGTTATTC 1440

 52654709 TTTCAATCTGGAAATATTTTCGCTAAGATCTTCCTATGGTTACCTTCTTATCATTCAAGA 52654768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTTCAATCTGGAAATATTTTCGCTAAGATCTTCCTATGGTTACCTTCTTATCATTCAAGA 1500

 52654769 CTTAGGTTATGTCAGGCCTTCCCTGACTCCTCCATCTGAAGTAACCCCTCCTGCTTACTC 52654828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CTTAGGTTATGTCAGGCCTTCCCTGACTCCTCCATCTGAAGTAACCCCTCCTGCTTACTC 1560

 52654829 CTGTTTATTCTCTAGACTCCACAGAGGATTCATCACTCTCTGAAATGATCCCATTAATTT 52654888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CTGTTTATTCTCTAGACTCCACAGAGGATTCATCACTCTCTGAAATGATCCCATTAATTT 1620

 52654889 CTTCTTCACTTGTTTCCTCTCCACGACCTGTAAGCCCCAAGTGGACCCGGACTTGGTCTG 52654948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CTTCTTCACTTGTTTCCTCTCCACGACCTGTAAGCCCCAAGTGGACCCGGACTTGGTCTG 1680

 52654949 CTCTGCTTACAGCTGGATTCCAGTTCCCATAGTGCTAGACACTAGGATTAAGCCAGGAAA 52655008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CTCTGCTTACAGCTGGATTCCAGTTCCCATAGTGCTAGACACTAGGATTAAGCCAGGAAA 1740

 52655009 CATGGGTGAAGCAGCAAGCACAGAGCTTGGGGCACAGCCTAGCAAACACTCCACAAAGGA 52655068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CATGGGTGAAGCAGCAAGCACAGAGCTTGGGGCACAGCCTAGCAAACACTCCACAAAGGA 1800

 52655069 CCATGATTGTAACTGTAGTAGGGCACACCAATGAACAGGTTGGGAAACTGAGTCTCTGAG 52655128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CCATGATTGTAACTGTAGTAGGGCACACCAATGAACAGGTTGGGAAACTGAGTCTCTGAG 1860

 52655129 AAGAGACTAATGTTGTGCTGGATGAAATTTCTTTTTCTGACAATACATTATCCAAATCCT 52655188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AAGAGACTAATGTTGTGCTGGATGAAATTTCTTTTTCTGACAATACATTATCCAAATCCT 1920

 52655189 CCAAGCTTTCAGTTTAAAGGGGAAAGCAGGAACTATCATTATAATTTTATTTACAAAGTG 52655248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CCAAGCTTTCAGTTTAAAGGGGAAAGCAGGAACTATCATTATAATTTTATTTACAAAGTG 1980

 52655249 TCCATGTATGAACATTATTCACCGCCGAATCATCTCTTCCTATGCAAGCAACACCGTCCT 52655308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TCCATGTATGAACATTATTCACCGCCGAATCATCTCTTCCTATGCAAGCAACACCGTCCT 2040

 52655309 ATGCATCAATATCCTGATCTGTCAGGATTCAGGATAAAGTGGACATATACACACTAATTG 52655368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ATGCATCAATATCCTGATCTGTCAGGATTCAGGATAAAGTGGACATATACACACTAATTG 2100

 52655369 CAAAGGGAAATTGTACATCTTGCAAAAGATGCAGGGGTTTATAGAGTCTTGTAACATTGG 52655428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CAAAGGGAAATTGTACATCTTGCAAAAGATGCAGGGGTTTATAGAGTCTTGTAACATTGG 2160

 52655429 TGAGCTGCTCAGATCACACACATGACCGTGGTTGGACAAGGATCTGGCAAAGTTAACACA 52655488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TGAGCTGCTCAGATCACACACATGACCGTGGTTGGACAAGGATCTGGCAAAGTTAACACA 2220

 52655489 GATCACCGAAGAAGGAAAAGTGGACAACACAACACAGTAAGTTCTTCAAAAGAGTTATAT 52655548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GATCACCGAAGAAGGAAAAGTGGACAACACAACACAGTAAGTTCTTCAAAAGAGTTATAT 2280

 52655549 TAGAATATCAAAAGATTATGTTAGGCCTTTGGGAAAACTCAAAACTTTATGAAGACCTCA 52655608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TAGAATATCAAAAGATTATGTTAGGCCTTTGGGAAAACTCAAAACTTTATGAAGACCTCA 2340

 52655609 AAAAATTATGCAAAAATGACCCTTCAATGGTCATGCTGCAAGAGTCAAATGACACTTCAA 52655668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AAAAATTATGCAAAAATGACCCTTCAATGGTCATGCTGCAAGAGTCAAATGACACTTCAA 2400

 52655669 ACAACTGCGGCTTTCTATGTTGTGCAAATGCATTTGTTGTTTTAAAGGTCGTAAAGTCAG 52655728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ACAACTGCGGCTTTCTATGTTGTGCAAATGCATTTGTTGTTTTAAAGGTCGTAAAGTCAG 2460

 52655729 GGTACACGTGGCAGATACTTATGACTTGGAGGAAGACGTTAGATTAGATTTGAAACTTTC 52655788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GGTACACGTGGCAGATACTTATGACTTGGAGGAAGACGTTAGATTAGATTTGAAACTTTC 2520

 52655789 ACTGAATGATCGCATTTCATGCTTTTCATCTGTACATTAAAAAGCCAGAATGTCTTTGCC 52655848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 ACTGAATGATCGCATTTCATGCTTTTCATCTGTACATTAAAAAGCCAGAATGTCTTTGCC 2580

 52655849 AAGAAATTCTAGCATAAATAAAAGAAAAGGATGGGATTTTGGAACATCATGGTAGAATTC 52655908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AAGAAATTCTAGCATAAATAAAAGAAAAGGATGGGATTTTGGAACATCATGGTAGAATTC 2640

 52655909 TTGACTATCAGCTTTATACAACATGTCTGGACATTTAGTGATGGAAATGCTGGATTCCAA 52655968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TTGACTATCAGCTTTATACAACATGTCTGGACATTTAGTGATGGAAATGCTGGATTCCAA 2700

 52655969 AGGAATGTAGGCAAAGGTACTACTACCCCCATGCTCTTCAGAAAACATCCTCTAAAAGCA 52656028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AGGAATGTAGGCAAAGGTACTACTACCCCCATGCTCTTCAGAAAACATCCTCTAAAAGCA 2760

 52656029 ACAGTGATGATCAGATACTGTGGGGCAAGACTGACAGTGACACTCAAGATTTCCACTCTT 52656088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 ACAGTGATGATCAGATACTGTGGGGCAAGACTGACAGTGACACTCAAGATTTCCACTCTT 2820

 52656089 CTCTTTAATCATATATTTCCTGTCATTCATGTGCTACAAAACTCTGGAATATGCAAAGCT 52656148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CTCTTTAATCATATATTTCCTGTCATTCATGTGCTACAAAACTCTGGAATATGCAAAGCT 2880

 52656149 CATTCAAATGCAAAACCAGCCTTTGCTCCAACATGAGCATATATTTTCATTTAAAGACAA 52656208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CATTCAAATGCAAAACCAGCCTTTGCTCCAACATGAGCATATATTTTCATTTAAAGACAA 2940

 52656209 ATCAGATGTTTCATTTGATTTTTTTTATAAATCTGATAATAATGTACATTTAACCCGTGT 52656268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 ATCAGATGTTTCATTTGATTTTTTTTATAAATCTGATAATAATGTACATTTAACCCGTGT 3000

 52656269 TTACAACCAAAATAATTAATCTCTCTGAACCCTTTGTTTTTCCTGTCTCTATCCTCCACC 52656328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TTACAACCAAAATAATTAATCTCTCTGAACCCTTTGTTTTTCCTGTCTCTATCCTCCACC 3060

 52656329 CTCATTGCCAGATAAATAACATCTGCAACCTGATGTGGCATATTGAACTTTGTTTATACT 52656388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 CTCATTGCCAGATAAATAACATCTGCAACCTGATGTGGCATATTGAACTTTGTTTATACT 3120

 52656389 CACACAAACACGTATAAGCATCCCAGATACACATATACAGGGACTGTATCTGTCCTTGTT 52656448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 CACACAAACACGTATAAGCATCCCAGATACACATATACAGGGACTGTATCTGTCCTTGTT 3180

 52656449 GTTTTTATAGAAATTGGATCACATTAGACATATTTTCTGATGACTTTTGTACATTATAGT 52656508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 GTTTTTATAGAAATTGGATCACATTAGACATATTTTCTGATGACTTTTGTACATTATAGT 3240

 52656509 TGGTCTTCACAGTCAATAGCTCCAAAGCTATCTTATCTTCTAAAATAGCTGCATAATATT 52656568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TGGTCTTCACAGTCAATAGCTCCAAAGCTATCTTATCTTCTAAAATAGCTGCATAATATT 3300

 52656569 CCTCAGTATGGATATACCAAAAGATATTTAAACCATTGCCTAATCAATGAATATCCTGGT 52656628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 CCTCAGTATGGATATACCAAAAGATATTTAAACCATTGCCTAATCAATGAATATCCTGGT 3360

 52656629 AGTTTCCACATTGTTTTTTCCATTTCCACTATAGTGGAATAAACTTTCGTGTTCAAAAAT 52656688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 AGTTTCCACATTGTTTTTTCCATTTCCACTATAGTGGAATAAACTTTCGTGTTCAAAAAT 3420

 52656689 CCTAAACTGGTGCTATATTTCTATAGAATAGAGGCACAGATGTAGAAGTGTTACCCTCAA 52656748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 CCTAAACTGGTGCTATATTTCTATAGAATAGAGGCACAGATGTAGAAGTGTTACCCTCAA 3480

 52656749 ATCAATATGCATTTAGTTTTGAAAAACAGACACTGCCATATTATTTTCTTAAAAAGGCTC 52656808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 ATCAATATGCATTTAGTTTTGAAAAACAGACACTGCCATATTATTTTCTTAAAAAGGCTC 3540

 52656809 TACAGATTCACATTTCCAGCAGCAATGAGTGTCTCAAGCACCTTTTAAGTGGTAAGCAGC 52656868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 TACAGATTCACATTTCCAGCAGCAATGAGTGTCTCAAGCACCTTTTAAGTGGTAAGCAGC 3600

 52656869 TTACCAGGGGAGGTGGCCTATTATTCTATCAGTGGCTTCAGTTGTTAGGACACCACGGGT 52656928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 TTACCAGGGGAGGTGGCCTATTATTCTATCAGTGGCTTCAGTTGTTAGGACACCACGGGT 3660

 52656929 CAGCTGTGGAGATACGGTTGTGGGGCAGGTTGAGTTCAGGACACATAGAAGATTGCCAAA 52656988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 CAGCTGTGGAGATACGGTTGTGGGGCAGGTTGAGTTCAGGACACATAGAAGATTGCCAAA 3720

 52656989 GGGTGACTATTATTACTTTGAGACTCTGGAAAAATTAGCCAGGAAACAGAGACAAGAGGC 52657048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 GGGTGACTATTATTACTTTGAGACTCTGGAAAAATTAGCCAGGAAACAGAGACAAGAGGC 3780

 52657049 TCAGGGTGCAGCAAAGCAGCCAAATCAGGATGATAGTGTTTTCTTTGGAGCAGATATACT 52657108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 TCAGGGTGCAGCAAAGCAGCCAAATCAGGATGATAGTGTTTTCTTTGGAGCAGATATACT 3840

 52657109 AATGGCCAAGGAACTCATAAAAAGATGCCTAATGTCATCTCATTAGGGAAGTGCAGTCAA 52657168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 AATGGCCAAGGAACTCATAAAAAGATGCCTAATGTCATCTCATTAGGGAAGTGCAGTCAA 3900

 52657169 AGCCACAGCATGATACGTCTTCACACCCACGAGGATGGCCATAATCAGAGAGACAATAAC 52657228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 AGCCACAGCATGATACGTCTTCACACCCACGAGGATGGCCATAATCAGAGAGACAATAAC 3960

 52657229 CAGTGGTAGGGAAGATGTGAAAAAATCGGAATGCTCATGCATTGCTGGTAGGAATGTGAC 52657288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 CAGTGGTAGGGAAGATGTGAAAAAATCGGAATGCTCATGCATTGCTGGTAGGAATGTGAC 4020

 52657289 ATGGTGCAGCTGCTTTGGAAAGCAGTTTAACAGTTCCTGGAAAAGTTAAACATGGAGTTA 52657348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 ATGGTGCAGCTGCTTTGGAAAGCAGTTTAACAGTTCCTGGAAAAGTTAAACATGGAGTTA 4080

 52657349 CCCTAAGACCCAGCAATTCCATTCCTAGGTAAGCAAGAAAATGAAAACATATGGCCACAC 52657408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 CCCTAAGACCCAGCAATTCCATTCCTAGGTAAGCAAGAAAATGAAAACATATGGCCACAC 4140

 52657409 AAAAACTTGTACACAAATGTCCATAGCAGCATTTTCATAATAGCTGAAAAGTGGAAACAA 52657468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 AAAAACTTGTACACAAATGTCCATAGCAGCATTTTCATAATAGCTGAAAAGTGGAAACAA 4200

 52657469 CCCAAATATCCATCAATTGGAAAAAGGAAATCTAGCATTTGCATATAATAGAGTATTAAT 52657528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 CCCAAATATCCATCAATTGGAAAAAGGAAATCTAGCATTTGCATATAATAGAGTATTAAT 4260

 52657529 CAGCCATAAGAAGAAACAAAGCACCGATCCATGTTATATCATGCTTTATACTTGGAAGCA 52657588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 CAGCCATAAGAAGAAACAAAGCACCGATCCATGTTATATCATGCTTTATACTTGGAAGCA 4320

 52657589 TGGTACTAAGTGAAAGACGCCAGACACAAAAAGCAAAATATTGTATGATTCCATTTATAT 52657648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 TGGTACTAAGTGAAAGACGCCAGACACAAAAAGCAAAATATTGTATGATTCCATTTATAT 4380

 52657649 AAAGTGTCTAGAATAGGCAAATCCATAGAGGCAGAAAACAGATTAGTGGTTGCCAGTGGC 52657708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 AAAGTGTCTAGAATAGGCAAATCCATAGAGGCAGAAAACAGATTAGTGGTTGCCAGTGGC 4440

 52657709 TGGGAATAGGGAAAAAACTCAGCGCTAAAGGGTAGGGAGTTTTGTTTTGGAGTAATGACG 52657768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 TGGGAATAGGGAAAAAACTCAGCGCTAAAGGGTAGGGAGTTTTGTTTTGGAGTAATGACG 4500

 52657769 ATGTTCTGGAATTAGACGTGGAACGATTGCACACATGGTGCAAATATCCTTAAAATCACG 52657828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 ATGTTCTGGAATTAGACGTGGAACGATTGCACACATGGTGCAAATATCCTTAAAATCACG 4560

 52657829 GAATTGTCACTCTAAAAGGTGAATTTTATGGTAGGTGAATTGTACCTCAATTTGTAAAAA 52657888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 GAATTGTCACTCTAAAAGGTGAATTTTATGGTAGGTGAATTGTACCTCAATTTGTAAAAA 4620

 52657889 GAAGAATTAGATAAATAAACAGCAACACAGCACCAAGGGGTGGGGGTAGGAAACAGACAA 52657948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 GAAGAATTAGATAAATAAACAGCAACACAGCACCAAGGGGTGGGGGTAGGAAACAGACAA 4680

 52657949 CAAATAGGAGTGAAGAGTTCACAGGAAAAGACATGCAGCCAGCTTTTAAGCAGAAGAAAA 52658008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 CAAATAGGAGTGAAGAGTTCACAGGAAAAGACATGCAGCCAGCTTTTAAGCAGAAGAAAA 4740

 52658009 GATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTGGCTTTC 52658068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 GATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTGGCTTTC 4800

 52658069 CCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTATAAAAAA 52658128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 CCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTATAAAAAA 4860

 52658129 AGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGGGAGGCC 52658188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 AGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGGGAGGCC 4920

 52658189 GAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACAC 52658248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 GAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACAC 4980

 52658249 TGTCTCTGCTAAAAAACAAAACAAAACAAAACACCAAAAAATAGCTGGGCGTAGTGGCGG 52658308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 TGTCTCTGCTAAAAAACAAAACAAAACAAAACACCAAAAAATAGCTGGGCGTAGTGGCGG 5040

 52658309 GCGCCTGTAATCTCAGCTACTTGGGAGGCGGTGGCAGGAGAATCATTTGAACCTGGGAGG 52658368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 GCGCCTGTAATCTCAGCTACTTGGGAGGCGGTGGCAGGAGAATCATTTGAACCTGGGAGG 5100

 52658369 CAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACTGCACTCTAACCTGGGCAACAGAGTTCAG 52658428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 CAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACTGCACTCTAACCTGGGCAACAGAGTTCAG 5160

 52658429 AGTGAGACTCTGTCTCCCCC 52658448
          ||||||||||||||||||||
     5161 AGTGAGACTCTGTCTCCCCC 5180

EXCISED REGION

 52658451 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAACAGCCATATAGATCGTCGGTGGGAGTGTAATTTGGCC 52658510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5181 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAACAGCCATATAGATCGTCGGTGGGAGTGTAATTTGGCC 5240

 52658511 ACTTCTTTGGAAAATAGCTCAGTAATATCTATTAATACTTAAAATTTCACAAACACTGTA 52658570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5241 ACTTCTTTGGAAAATAGCTCAGTAATATCTATTAATACTTAAAATTTCACAAACACTGTA 5300

 52658571 AGTCTAACTTCCACTTCTAAAATGTTATCCTAGAAATAAAATTGCATAGGGGTACAAAGG 52658630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5301 AGTCTAACTTCCACTTCTAAAATGTTATCCTAGAAATAAAATTGCATAGGGGTACAAAGG 5360

 52658631 CTTACGTATGGAACTATTTGCTGGACTACTGTAGTTGTGGCAAAAAACTGGAAATGACCT 52658690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5361 CTTACGTATGGAACTATTTGCTGGACTACTGTAGTTGTGGCAAAAAACTGGAAATGACCT 5420

 52658691 AAACGCTTATTAGTAGAAACCTGGTTAAATAAATTATCATATGTCCTTGAGGACACAGGG 52658750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5421 AAACGCTTATTAGTAGAAACCTGGTTAAATAAATTATCATATGTCCTTGAGGACACAGGG 5480

 52658751 ACACAAAGAGGGGAATGACAGGCACTGAGCCTACTTGAGGGTGGGAGGAGGAAGTCGATC 52658810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5481 ACACAAAGAGGGGAATGACAGGCACTGAGCCTACTTGAGGGTGGGAGGAGGAAGTCGATC 5540

 52658811 AGAAAAAATAACTAGTGGGTACTAGGCTTAGTACCCGGGTGAAAAAATAATCTGTACAAC 52658870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5541 AGAAAAAATAACTAGTGGGTACTAGGCTTAGTACCCGGGTGAAAAAATAATCTGTACAAC 5600

 52658871 AAACCCCCATGACATGAGTTTACCTTATAACAAACCTGCACATGTAATCTGAACCTAGAT 52658930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5601 AAACCCCCATGACATGAGTTTACCTTATAACAAACCTGCACATGTAATCTGAACCTAGAT 5660

 52658931 AAAAGTTTAAAAAAATAAATAATCATATGTCCCTACAATGAAATATTCCACAGGCATTAA 52658990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5661 AAAAGTTTAAAAAAATAAATAATCATATGTCCCTACAATGAAATATTCCACAGGCATTAA 5720

 52658991 AATTCCCCAAGGAATTTTAGTAAGGAAAGAAAAAGCTGTGCCCAACAGCACGTACAGTAT 52659050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5721 AATTCCCCAAGGAATTTTAGTAAGGAAAGAAAAAGCTGTGCCCAACAGCACGTACAGTAT 5780

 52659051 GTTTCCATTTGTTTTTAAAAAATGGTGTCGGGAGGTTGAGGAGACAACTTATAAATAGAC 52659110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5781 GTTTCCATTTGTTTTTAAAAAATGGTGTCGGGAGGTTGAGGAGACAACTTATAAATAGAC 5840

 52659111 ATGCCTGGGATACCTCTGGATATAAGAAACTGTAAAGTATTTACTTCTAAGGAAGGAAAT 52659170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5841 ATGCCTGGGATACCTCTGGATATAAGAAACTGTAAAGTATTTACTTCTAAGGAAGGAAAT 5900

 52659171 TTGGGATGGGGCTTGGGGAGCCATCAGAGTTAGGGTGGGGATTTTTTCTCTGCCTTATCT 52659230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5901 TTGGGATGGGGCTTGGGGAGCCATCAGAGTTAGGGTGGGGATTTTTTCTCTGCCTTATCT 5960

 52659231 TATTATGTATATCGCTCAGAATGTTTGCTATGTGTATGCACCTACCCCATCCATTAAGAA 52659290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5961 TATTATGTATATCGCTCAGAATGTTTGCTATGTGTATGCACCTACCCCATCCATTAAGAA 6020

 52659291 ATGAAGAAATAATGAAAAGAAAAAATGAAAGTAGGGAACTAGAAATGAGAGGTGGGATTC 52659350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6021 ATGAAGAAATAATGAAAAGAAAAAATGAAAGTAGGGAACTAGAAATGAGAGGTGGGATTC 6080

 52659351 AAAGTGGACTGAACACTTGACCTATTTCCCAATTTGCCTAGGGCTGGCCCAGCAGCGAGG 52659410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6081 AAAGTGGACTGAACACTTGACCTATTTCCCAATTTGCCTAGGGCTGGCCCAGCAGCGAGG 6140

 52659411 CAGGTTCTAACCAATGAGCATCAGCTTTGAATGGAGGGGCTGATAGGCCAGGTGGGCCCT 52659470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6141 CAGGTTCTAACCAATGAGCATCAGCTTTGAATGGAGGGGCTGATAGGCCAGGTGGGCCCT 6200

 52659471 GCTTGCTGAGAGTGTCATGGCCTTAGGGACATCTCCATGTTGCAGAGTCTGAGCCTCTGC 52659530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6201 GCTTGCTGAGAGTGTCATGGCCTTAGGGACATCTCCATGTTGCAGAGTCTGAGCCTCTGC 6260

 52659531 TTGGCAAATTCAGAAAATCCAGCTTTTCTTTTTATATCACCTGGAGCTGATGTAACTCTC 52659590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6261 TTGGCAAATTCAGAAAATCCAGCTTTTCTTTTTATATCACCTGGAGCTGATGTAACTCTC 6320

 52659591 AGAAGGCATTTTTAAGAGGACTCATGAATTAACCACATAGCCAACTTACTGGCTTAAGAC 52659650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6321 AGAAGGCATTTTTAAGAGGACTCATGAATTAACCACATAGCCAACTTACTGGCTTAAGAC 6380

 52659651 TACGTGACAGAAAGCTGCAAAGGGGGCCAGCCACTGGTAACATCCCACCACTGTCCCTCT 52659710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6381 TACGTGACAGAAAGCTGCAAAGGGGGCCAGCCACTGGTAACATCCCACCACTGTCCCTCT 6440

 52659711 CTGTGGAAAACACAGATGGGATGCACATTGTGACGGGCAGGATGCCTGGAGAGCCCACAA 52659770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6441 CTGTGGAAAACACAGATGGGATGCACATTGTGACGGGCAGGATGCCTGGAGAGCCCACAA 6500

 52659771 ATCTGCAAGCACAGCTGAAATTGGTTACAGGATTTCAATGTTTCATTGCTTGAAGCTATG 52659830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6501 ATCTGCAAGCACAGCTGAAATTGGTTACAGGATTTCAATGTTTCATTGCTTGAAGCTATG 6560

 52659831 ATAACTTGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGACGATGATTTTTTTTATAGCCA 52659890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6561 ATAACTTGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGACGATGATTTTTTTTATAGCCA 6620

 52659891 TCTTTTTAGAGGGATTTGAGGTAGGGAAAAAAATAAACCTCACACTATCGGAGGTTGCCA 52659950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6621 TCTTTTTAGAGGGATTTGAGGTAGGGAAAAAAATAAACCTCACACTATCGGAGGTTGCCA 6680

 52659951 ACTATGAGGTCTGCTGATGGTTTGGCCAACACAGTGTTTATATTTTTTTGAATTGGGAAA 52660010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6681 ACTATGAGGTCTGCTGATGGTTTGGCCAACACAGTGTTTATATTTTTTTGAATTGGGAAA 6740

 52660011 TTTCATTTAAAAGTCCTAAAATCAGGCTGTTATTGAAATATCTTATTATTGGCTCAGGGT 52660070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6741 TTTCATTTAAAAGTCCTAAAATCAGGCTGTTATTGAAATATCTTATTATTGGCTCAGGGT 6800

 52660071 TTCCCAGGGCAGCCATCCTTGAAGCTGTGTGGAGCCCTATAAACAAGGACGCTTTCCAGT 52660130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6801 TTCCCAGGGCAGCCATCCTTGAAGCTGTGTGGAGCCCTATAAACAAGGACGCTTTCCAGT 6860

 52660131 TCCCTGCAAACTCCATTTCATTCAGAGCCTTGAGCCAGTTCTTACATGGTCCTCAGACTT 52660190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6861 TCCCTGCAAACTCCATTTCATTCAGAGCCTTGAGCCAGTTCTTACATGGTCCTCAGACTT 6920

 52660191 GAGCTAGTGCAAGAATACCCGGGAGGGGTTGTGGGAACAGATAGCTGGGCCCCACCCCCA 52660250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6921 GAGCTAGTGCAAGAATACCCGGGAGGGGTTGTGGGAACAGATAGCTGGGCCCCACCCCCA 6980

 52660251 GGGAAGGGGGTGTTTCTGACTCAGGAGGTCTGGGCTCCGGCTACAGAAACTGCACATCTA 52660310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6981 GGGAAGGGGGTGTTTCTGACTCAGGAGGTCTGGGCTCCGGCTACAGAAACTGCACATCTA 7040

 52660311 ACCGGTACCCAGGTGATGTGATGCTGCTGGCCCAGGGACAACTCTGCGAGTCACTGCTAT 52660370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7041 ACCGGTACCCAGGTGATGTGATGCTGCTGGCCCAGGGACAACTCTGCGAGTCACTGCTAT 7100

 52660371 TGGGCACTGCTATTGCACCCACACAAGGAGGCAGGCTCTGCTTACATTTTTCAGTTCTTG 52660430
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7101 TGGGCACTGCTATTACACCCACACAAGGAGGCAGGCTCTGCTTACATTTTTCAGTTCTTG 7160

 52660431 TTCCCAGAAACATTTGCTCTTTGGGGTATGCTTTGCATATAATGGATCCTACCCACTAAT 52660490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7161 TTCCCAGAAACATTTGCTCTTTGGGGTATGCTTTGCATATAATGGATCCTACCCACTAAT 7220

 52660491 ACAGTATGCTGCTTTTATTGATAAACTTCCAGAAACTTGAAGCGCACCTTACCATTTCTT 52660550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7221 ACAGTATGCTGCTTTTATTGATAAACTTCCAGAAACTTGAAGCGCACCTTACCATTTCTT 7280

 52660551 TGATCTCGCTGATTATTTTTATTTTTGTTAAATGAAAATTGTTGGTAAGTTCTTTTTGGT 52660610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7281 TGATCTCGCTGATTATTTTTATTTTTGTTAAATGAAAATTGTTGGTAAGTTCTTTTTGGT 7340

 52660611 GTGGTAAAAGGATATGAAAAGCTGATTTTAAAAAAATGTCCACTCTAGGATTAGAATTGT 52660670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7341 GTGGTAAAAGGATATGAAAAGCTGATTTTAAAAAAATGTCCACTCTAGGATTAGAATTGT 7400

 52660671 AGGTGTGTTTATTCTATTTCAAGATCTGGTTAAAATGCACCTTGAGGAAAAGAATTGAGT 52660730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7401 AGGTGTGTTTATTCTATTTCAAGATCTGGTTAAAATGCACCTTGAGGAAAAGAATTGAGT 7460

 52660731 GCAGCTGTTGTTATTTCTCAATGCTGTTTCTCTTTTCATGTTTTTTTCATGTTGTCTCTT 52660790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7461 GCAGCTGTTGTTATTTCTCAATGCTGTTTCTCTTTTCATGTTTTTTTCATGTTGTCTCTT 7520

 52660791 GGTCTGTCCTATCTCTCTTGGTCTATCCTCCAAGACAGAGATGAGTGATCTTGAAACCCT 52660850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7521 GGTCTGTCCTATCTCTCTTGGTCTATCCTCCAAGACAGAGATGAGTGATCTTGAAACCCT 7580

 52660851 GCCCATGTTTTTATCTTTGGAGCCCAACTGTGCTGCCTTGTTTTCTTCTCCATCCAAAGA 52660910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7581 GCCCATGTTTTTATCTTTGGAGCCCAACTGTGCTGCCTTGTTTTCTTCTCCATCCAAAGA 7640

 52660911 GGCAAAGAGAAAGTTGCATATTACTCAACAGCAGTTGCATGACAGTTAAAATCAGACTGT 52660970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7641 GGCAAAGAGAAAGTTGCATATTACTCAACAGCAGTTGCATGACAGTTAAAATCAGACTGT 7700

 52660971 ATGAGTCATGGAACAGTAAGTTGTGTCCAGAGTATCTGTCATGGTAAGTACAAAAAAGTC 52661030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7701 ATGAGTCATGGAACAGTAAGTTGTGTCCAGAGTATCTGTCATGGTAAGTACAAAAAAGTC 7760

 52661031 CTTAAAAATTTAAAACAGAAATGCCAATGTTTTATTTTTGAAAAATGTGAAGAAGAAATT 52661090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7761 CTTAAAAATTTAAAACAGAAATGCCAATGTTTTATTTTTGAAAAATGTGAAGAAGAAATT 7820

 52661091 TTCCGGCCGGGCGCGGTGGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGG 52661150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7821 TTCCGGCCGGGCGCGGTGGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGG 7880

 52661151 CAGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACACAGTGCAACCCCATCTC 52661210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7881 CAGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACACAGTGCAACCCCATCTC 7940

 52661211 TACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGATGCGGTGGCACGCGCCTGTAATCTCAGCTACTAG 52661270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7941 TACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGATGCGGTGGCACGCGCCTGTAATCTCAGCTACTAG 8000

 52661271 GGAGGCTGAGGCATGACAATCGCTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGAT 52661330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8001 GGAGGCTGAGGCATGACAATCGCTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGAT 8060

 52661331 CATACCACTGCACTCCAGCTTGGGCAGCGGAAGGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAGAA 52661390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8061 CATACCACTGCACTCCAGCTTGGGCAGCGGAAGGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAGAA 8120

 52661391 AAAAAGAAATTTTCTAAGTGTATTCCAAATAACTTTTAATATTGGATAAACATTACGAGT 52661450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8121 AAAAAGAAATTTTCTAAGTGTATTCCAAATAACTTTTAATATTGGATAAACATTACGAGT 8180

 52661451 TTAAAAATACTTATGCCAGAGGAGTGCTGTGACTCGTGCCTCTAATCCCAGCAATGTGGG 52661510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8181 TTAAAAATACTTATGCCAGAGGAGTGCTGTGACTCGTGCCTCTAATCCCAGCAATGTGGG 8240

 52661511 AGGCCAAGGAGGGACAGTCACTTGAGCCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGATAACAAAGG 52661570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8241 AGGCCAAGGAGGGACAGTCACTTGAGCCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGATAACAAAGG 8300

 52661571 GAGACCTCATCTTTACAAAAAAACTAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGTGTGTGCCTGTG 52661630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8301 GAGACCTCATCTTTACAAAAAAACTAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGTGTGTGCCTGTG 8360

 52661631 ATCCCAGCTACACAGGAGGCTGAGGCAAGAGGATTCCTTGAGCCCTGGAGGTCAAGGCTG 52661690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8361 ATCCCAGCTACACAGGAGGCTGAGGCAAGAGGATTCCTTGAGCCCTGGAGGTCAAGGCTG 8420

 52661691 CAGTGAGTGATGATCATGCCATTGCACTCCAGCTGGGTGACAGAGCAAGACCTCATCTCA 52661750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8421 CAGTGAGTGATGATCATGCCATTGCACTCCAGCTGGGTGACAGAGCAAGACCTCATCTCA 8480

 52661751 AAAAAAAAAAAAAAACAAAACAAAACAAAAAACTTACGCCCAGGTAAAAATTGTCAGAGA 52661810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8481 AAAAAAAAAAAAAAACAAAACAAAACAAAAAACTTACGCCCAGGTAAAAATTGTCAGAGA 8540

 52661811 AAAATAAGAAAAAAACTGAATGCCCAAAATTAGCATAATGGCTGAATGAATTATAGTATG 52661870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8541 AAAATAAGAAAAAAACTGAATGCCCAAAATTAGCATAATGGCTGAATGAATTATAGTATG 8600

 52661871 TCTATACCTTGAAGTACATTGTAGCTTTAAAAAAAATGAATTAAAGTTATACCAGTTGAA 52661930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8601 TCTATACCTTGAAGTACATTGTAGCTTTAAAAAAAATGAATTAAAGTTATACCAGTTGAA 8660

 52661931 TTTGGAGTTGAGATGGGGAAGATTATTACAATTAAAAAAAAACAAACACTATTAATGGAT 52661990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8661 TTTGGAGTTGAGATGGGGAAGATTATTACAATTAAAAAAAAACAAACACTATTAATGGAT 8720

 52661991 GTGCTGGGAAATGTCTGTATGGGGCTAGTTAAAGTAAATTAAAATAAAGACCAGACCTGA 52662050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8721 GTGCTGGGAAATGTCTGTATGGGGCTAGTTAAAGTAAATTAAAATAAAGACCAGACCTGA 8780

 52662051 AGAATCCCTGAGCGGACAAAGCCTGTTAGACCACATAAATGAGCTAAACCTTGCTTGATT 52662110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8781 AGAATCCCTGAGCGGACAAAGCCTGTTAGACCACATAAATGAGCTAAACCTTGCTTGATT 8840

 52662111 TGCAGACATAAGCAAAACAACTCGAACTGTTTCTTGTAAATGCCTATGCTAAAGAAAAAC 52662170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8841 TGCAGACATAAGCAAAACAACTCGAACTGTTTCTTGTAAATGCCTATGCTAAAGAAAAAC 8900

 52662171 AGAACTTGAGCTCAACCAATCAGAAACAGTCAACAAACTTAAAATTATATAACTGGGTAC 52662230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8901 AGAACTTGAGCTCAACCAATCAGAAACAGTCAACAAACTTAAAATTATATAACTGGGTAC 8960

 52662231 CTTCCAATGAGATGATCAAATAAGGCAACTGTGTAATTGTAACACATCAAACACATTTTA 52662290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8961 CTTCCAATGAGATGATCAAATAAGGCAACTGTGTAATTGTAACACATCAAACACATTTTA 9020

 52662291 TATTATGCCTCTGCATTTTCCCTTAATTCTGGCATGTAATGCTTTGTCATCAAAACACTA 52662350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9021 TATTATGCCTCTGCATTTTCCCTTAATTCTGGCATGTAATGCTTTGTCATCAAAACACTA 9080

 52662351 ATTCCCTTTTGGTTTTCTTTTCTCAAATTAATGAATTGCCTCTATTCAGATACACTCTTT 52662410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9081 ATTCCCTTTTGGTTTTCTTTTCTCAAATTAATGAATTGCCTCTATTCAGATACACTCTTT 9140

 52662411 GAAATTTTATTGTGTCTCAGATTTGTCTTTTACAAAGTATAGAACAAAGAGAAAAATATG 52662470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9141 GAAATTTTATTGTGTCTCAGATTTGTCTTTTACAAAGTATAGAACAAAGAGAAAAATATG 9200

 52662471 AAAGAAGAAATATTAGGTTGTTAGCTTGGGTGTCCTTGGAGGGGGTAGGGAAGATGTGAG 52662530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9201 AAAGAAGAAATATTAGGTTGTTAGCTTGGGTGTCCTTGGAGGGGGTAGGGAAGATGTGAG 9260

 52662531 ATGAGGAAGAAGCCAATAAGAAAAAGAAAAAGACAGGTTTCACCAAAACAACAATAACAG 52662590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9261 ATGAGGAAGAAGCCAATAAGAAAAAGAAAAAGACAGGTTTCACCAAAACAACAATAACAG 9320

 52662591 AAAATATGATTGCATTTATTCATATATGTTAATTGGTATGTATGTAAGTATATATGCATG 52662650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9321 AAAATATGATTGCATTTATTCATATATGTTAATTGGTATGTATGTAAGTATATATGCATG 9380

 52662651 TAAAAATAAAATACAAAGAATTAAAATGCATACTAATAGTTATTTCAGTTATCTATGGCT 52662710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9381 TAAAAATAAAATACAAAGAATTAAAATGCATACTAATAGTTATTTCAGTTATCTATGGCT 9440

 52662711 G 52662711
          |
     9441 G 9441

Alignment time is 10.5992 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [52637064,52668002] =>     30939 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    3939] =>      3939 nucs 'mol-32-3143-269970_3939'

Score:        3939
Aligned:      3939        nucs
Identic:      3939 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [52654379,52658317]
 second seq =>  [       1,    3939]

 52654379 AGGGAGGGAAGATGAACAAAGTAGACAAAGTTTAGTTAATAGAATTAGTGGATACCCAAG 52654438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGGGAGGGAAGATGAACAAAGTAGACAAAGTTTAGTTAATAGAATTAGTGGATACCCAAG 60

 52654439 AAAAAACTATGTACAAGAGGGGGAAAAAAACCCTGTTTTCTCACATCTGGGAAACATTGA 52654498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAAAAACTATGTACAAGAGGGGGAAAAAAACCCTGTTTTCTCACATCTGGGAAACATTGA 120

 52654499 TATCTATATATTTTTGGTTTTAAATAAAAATTAGGTTATGTCATTCATTTGCATAAAACC 52654558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TATCTATATATTTTTGGTTTTAAATAAAAATTAGGTTATGTCATTCATTTGCATAAAACC 180

 52654559 ATCCAAAGAAGGGCCTCACAAAATTAAAACAAAATCCAAACTCTCTACTATGGGCCACAC 52654618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATCCAAAGAAGGGCCTCACAAAATTAAAACAAAATCCAAACTCTCTACTATGGGCCACAC 240

 52654619 CCTCCAGAACTTCAGCTCGTACTATGTTTTTCCTCACACCTCTCAACATACCAACATGTT 52654678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCTCCAGAACTTCAGCTCGTACTATGTTTTTCCTCACACCTCTCAACATACCAACATGTT 300

 52654679 TCCACCTGCAGCCCTCACCACTAGTTATTCTTTCAATCTGGAAATATTTTCGCTAAGATC 52654738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCCACCTGCAGCCCTCACCACTAGTTATTCTTTCAATCTGGAAATATTTTCGCTAAGATC 360

 52654739 TTCCTATGGTTACCTTCTTATCATTCAAGACTTAGGTTATGTCAGGCCTTCCCTGACTCC 52654798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTCCTATGGTTACCTTCTTATCATTCAAGACTTAGGTTATGTCAGGCCTTCCCTGACTCC 420

 52654799 TCCATCTGAAGTAACCCCTCCTGCTTACTCCTGTTTATTCTCTAGACTCCACAGAGGATT 52654858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCCATCTGAAGTAACCCCTCCTGCTTACTCCTGTTTATTCTCTAGACTCCACAGAGGATT 480

 52654859 CATCACTCTCTGAAATGATCCCATTAATTTCTTCTTCACTTGTTTCCTCTCCACGACCTG 52654918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CATCACTCTCTGAAATGATCCCATTAATTTCTTCTTCACTTGTTTCCTCTCCACGACCTG 540

 52654919 TAAGCCCCAAGTGGACCCGGACTTGGTCTGCTCTGCTTACAGCTGGATTCCAGTTCCCAT 52654978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TAAGCCCCAAGTGGACCCGGACTTGGTCTGCTCTGCTTACAGCTGGATTCCAGTTCCCAT 600

 52654979 AGTGCTAGACACTAGGATTAAGCCAGGAAACATGGGTGAAGCAGCAAGCACAGAGCTTGG 52655038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGTGCTAGACACTAGGATTAAGCCAGGAAACATGGGTGAAGCAGCAAGCACAGAGCTTGG 660

 52655039 GGCACAGCCTAGCAAACACTCCACAAAGGACCATGATTGTAACTGTAGTAGGGCACACCA 52655098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGCACAGCCTAGCAAACACTCCACAAAGGACCATGATTGTAACTGTAGTAGGGCACACCA 720

 52655099 ATGAACAGGTTGGGAAACTGAGTCTCTGAGAAGAGACTAATGTTGTGCTGGATGAAATTT 52655158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATGAACAGGTTGGGAAACTGAGTCTCTGAGAAGAGACTAATGTTGTGCTGGATGAAATTT 780

 52655159 CTTTTTCTGACAATACATTATCCAAATCCTCCAAGCTTTCAGTTTAAAGGGGAAAGCAGG 52655218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTTTTTCTGACAATACATTATCCAAATCCTCCAAGCTTTCAGTTTAAAGGGGAAAGCAGG 840

 52655219 AACTATCATTATAATTTTATTTACAAAGTGTCCATGTATGAACATTATTCACCGCCGAAT 52655278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AACTATCATTATAATTTTATTTACAAAGTGTCCATGTATGAACATTATTCACCGCCGAAT 900

 52655279 CATCTCTTCCTATGCAAGCAACACCGTCCTATGCATCAATATCCTGATCTGTCAGGATTC 52655338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CATCTCTTCCTATGCAAGCAACACCGTCCTATGCATCAATATCCTGATCTGTCAGGATTC 960

 52655339 AGGATAAAGTGGACATATACACACTAATTGCAAAGGGAAATTGTACATCTTGCAAAAGAT 52655398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AGGATAAAGTGGACATATACACACTAATTGCAAAGGGAAATTGTACATCTTGCAAAAGAT 1020

 52655399 GCAGGGGTTTATAGAGTCTTGTAACATTGGTGAGCTGCTCAGATCACACACATGACCGTG 52655458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GCAGGGGTTTATAGAGTCTTGTAACATTGGTGAGCTGCTCAGATCACACACATGACCGTG 1080

 52655459 GTTGGACAAGGATCTGGCAAAGTTAACACAGATCACCGAAGAAGGAAAAGTGGACAACAC 52655518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GTTGGACAAGGATCTGGCAAAGTTAACACAGATCACCGAAGAAGGAAAAGTGGACAACAC 1140

 52655519 AACACAGTAAGTTCTTCAAAAGAGTTATATTAGAATATCAAAAGATTATGTTAGGCCTTT 52655578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AACACAGTAAGTTCTTCAAAAGAGTTATATTAGAATATCAAAAGATTATGTTAGGCCTTT 1200

 52655579 GGGAAAACTCAAAACTTTATGAAGACCTCAAAAAATTATGCAAAAATGACCCTTCAATGG 52655638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GGGAAAACTCAAAACTTTATGAAGACCTCAAAAAATTATGCAAAAATGACCCTTCAATGG 1260

 52655639 TCATGCTGCAAGAGTCAAATGACACTTCAAACAACTGCGGCTTTCTATGTTGTGCAAATG 52655698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TCATGCTGCAAGAGTCAAATGACACTTCAAACAACTGCGGCTTTCTATGTTGTGCAAATG 1320

 52655699 CATTTGTTGTTTTAAAGGTCGTAAAGTCAGGGTACACGTGGCAGATACTTATGACTTGGA 52655758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CATTTGTTGTTTTAAAGGTCGTAAAGTCAGGGTACACGTGGCAGATACTTATGACTTGGA 1380

 52655759 GGAAGACGTTAGATTAGATTTGAAACTTTCACTGAATGATCGCATTTCATGCTTTTCATC 52655818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GGAAGACGTTAGATTAGATTTGAAACTTTCACTGAATGATCGCATTTCATGCTTTTCATC 1440

 52655819 TGTACATTAAAAAGCCAGAATGTCTTTGCCAAGAAATTCTAGCATAAATAAAAGAAAAGG 52655878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TGTACATTAAAAAGCCAGAATGTCTTTGCCAAGAAATTCTAGCATAAATAAAAGAAAAGG 1500

 52655879 ATGGGATTTTGGAACATCATGGTAGAATTCTTGACTATCAGCTTTATACAACATGTCTGG 52655938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATGGGATTTTGGAACATCATGGTAGAATTCTTGACTATCAGCTTTATACAACATGTCTGG 1560

 52655939 ACATTTAGTGATGGAAATGCTGGATTCCAAAGGAATGTAGGCAAAGGTACTACTACCCCC 52655998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ACATTTAGTGATGGAAATGCTGGATTCCAAAGGAATGTAGGCAAAGGTACTACTACCCCC 1620

 52655999 ATGCTCTTCAGAAAACATCCTCTAAAAGCAACAGTGATGATCAGATACTGTGGGGCAAGA 52656058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ATGCTCTTCAGAAAACATCCTCTAAAAGCAACAGTGATGATCAGATACTGTGGGGCAAGA 1680

 52656059 CTGACAGTGACACTCAAGATTTCCACTCTTCTCTTTAATCATATATTTCCTGTCATTCAT 52656118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CTGACAGTGACACTCAAGATTTCCACTCTTCTCTTTAATCATATATTTCCTGTCATTCAT 1740

 52656119 GTGCTACAAAACTCTGGAATATGCAAAGCTCATTCAAATGCAAAACCAGCCTTTGCTCCA 52656178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GTGCTACAAAACTCTGGAATATGCAAAGCTCATTCAAATGCAAAACCAGCCTTTGCTCCA 1800

 52656179 ACATGAGCATATATTTTCATTTAAAGACAAATCAGATGTTTCATTTGATTTTTTTTATAA 52656238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ACATGAGCATATATTTTCATTTAAAGACAAATCAGATGTTTCATTTGATTTTTTTTATAA 1860

 52656239 ATCTGATAATAATGTACATTTAACCCGTGTTTACAACCAAAATAATTAATCTCTCTGAAC 52656298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ATCTGATAATAATGTACATTTAACCCGTGTTTACAACCAAAATAATTAATCTCTCTGAAC 1920

 52656299 CCTTTGTTTTTCCTGTCTCTATCCTCCACCCTCATTGCCAGATAAATAACATCTGCAACC 52656358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CCTTTGTTTTTCCTGTCTCTATCCTCCACCCTCATTGCCAGATAAATAACATCTGCAACC 1980

 52656359 TGATGTGGCATATTGAACTTTGTTTATACTCACACAAACACGTATAAGCATCCCAGATAC 52656418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TGATGTGGCATATTGAACTTTGTTTATACTCACACAAACACGTATAAGCATCCCAGATAC 2040

 52656419 ACATATACAGGGACTGTATCTGTCCTTGTTGTTTTTATAGAAATTGGATCACATTAGACA 52656478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ACATATACAGGGACTGTATCTGTCCTTGTTGTTTTTATAGAAATTGGATCACATTAGACA 2100

 52656479 TATTTTCTGATGACTTTTGTACATTATAGTTGGTCTTCACAGTCAATAGCTCCAAAGCTA 52656538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TATTTTCTGATGACTTTTGTACATTATAGTTGGTCTTCACAGTCAATAGCTCCAAAGCTA 2160

 52656539 TCTTATCTTCTAAAATAGCTGCATAATATTCCTCAGTATGGATATACCAAAAGATATTTA 52656598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TCTTATCTTCTAAAATAGCTGCATAATATTCCTCAGTATGGATATACCAAAAGATATTTA 2220

 52656599 AACCATTGCCTAATCAATGAATATCCTGGTAGTTTCCACATTGTTTTTTCCATTTCCACT 52656658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AACCATTGCCTAATCAATGAATATCCTGGTAGTTTCCACATTGTTTTTTCCATTTCCACT 2280

 52656659 ATAGTGGAATAAACTTTCGTGTTCAAAAATCCTAAACTGGTGCTATATTTCTATAGAATA 52656718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 ATAGTGGAATAAACTTTCGTGTTCAAAAATCCTAAACTGGTGCTATATTTCTATAGAATA 2340

 52656719 GAGGCACAGATGTAGAAGTGTTACCCTCAAATCAATATGCATTTAGTTTTGAAAAACAGA 52656778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GAGGCACAGATGTAGAAGTGTTACCCTCAAATCAATATGCATTTAGTTTTGAAAAACAGA 2400

 52656779 CACTGCCATATTATTTTCTTAAAAAGGCTCTACAGATTCACATTTCCAGCAGCAATGAGT 52656838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CACTGCCATATTATTTTCTTAAAAAGGCTCTACAGATTCACATTTCCAGCAGCAATGAGT 2460

 52656839 GTCTCAAGCACCTTTTAAGTGGTAAGCAGCTTACCAGGGGAGGTGGCCTATTATTCTATC 52656898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GTCTCAAGCACCTTTTAAGTGGTAAGCAGCTTACCAGGGGAGGTGGCCTATTATTCTATC 2520

 52656899 AGTGGCTTCAGTTGTTAGGACACCACGGGTCAGCTGTGGAGATACGGTTGTGGGGCAGGT 52656958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 AGTGGCTTCAGTTGTTAGGACACCACGGGTCAGCTGTGGAGATACGGTTGTGGGGCAGGT 2580

 52656959 TGAGTTCAGGACACATAGAAGATTGCCAAAGGGTGACTATTATTACTTTGAGACTCTGGA 52657018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TGAGTTCAGGACACATAGAAGATTGCCAAAGGGTGACTATTATTACTTTGAGACTCTGGA 2640

 52657019 AAAATTAGCCAGGAAACAGAGACAAGAGGCTCAGGGTGCAGCAAAGCAGCCAAATCAGGA 52657078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 AAAATTAGCCAGGAAACAGAGACAAGAGGCTCAGGGTGCAGCAAAGCAGCCAAATCAGGA 2700

 52657079 TGATAGTGTTTTCTTTGGAGCAGATATACTAATGGCCAAGGAACTCATAAAAAGATGCCT 52657138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TGATAGTGTTTTCTTTGGAGCAGATATACTAATGGCCAAGGAACTCATAAAAAGATGCCT 2760

 52657139 AATGTCATCTCATTAGGGAAGTGCAGTCAAAGCCACAGCATGATACGTCTTCACACCCAC 52657198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 AATGTCATCTCATTAGGGAAGTGCAGTCAAAGCCACAGCATGATACGTCTTCACACCCAC 2820

 52657199 GAGGATGGCCATAATCAGAGAGACAATAACCAGTGGTAGGGAAGATGTGAAAAAATCGGA 52657258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GAGGATGGCCATAATCAGAGAGACAATAACCAGTGGTAGGGAAGATGTGAAAAAATCGGA 2880

 52657259 ATGCTCATGCATTGCTGGTAGGAATGTGACATGGTGCAGCTGCTTTGGAAAGCAGTTTAA 52657318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 ATGCTCATGCATTGCTGGTAGGAATGTGACATGGTGCAGCTGCTTTGGAAAGCAGTTTAA 2940

 52657319 CAGTTCCTGGAAAAGTTAAACATGGAGTTACCCTAAGACCCAGCAATTCCATTCCTAGGT 52657378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CAGTTCCTGGAAAAGTTAAACATGGAGTTACCCTAAGACCCAGCAATTCCATTCCTAGGT 3000

 52657379 AAGCAAGAAAATGAAAACATATGGCCACACAAAAACTTGTACACAAATGTCCATAGCAGC 52657438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 AAGCAAGAAAATGAAAACATATGGCCACACAAAAACTTGTACACAAATGTCCATAGCAGC 3060

 52657439 ATTTTCATAATAGCTGAAAAGTGGAAACAACCCAAATATCCATCAATTGGAAAAAGGAAA 52657498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 ATTTTCATAATAGCTGAAAAGTGGAAACAACCCAAATATCCATCAATTGGAAAAAGGAAA 3120

 52657499 TCTAGCATTTGCATATAATAGAGTATTAATCAGCCATAAGAAGAAACAAAGCACCGATCC 52657558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TCTAGCATTTGCATATAATAGAGTATTAATCAGCCATAAGAAGAAACAAAGCACCGATCC 3180

 52657559 ATGTTATATCATGCTTTATACTTGGAAGCATGGTACTAAGTGAAAGACGCCAGACACAAA 52657618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 ATGTTATATCATGCTTTATACTTGGAAGCATGGTACTAAGTGAAAGACGCCAGACACAAA 3240

 52657619 AAGCAAAATATTGTATGATTCCATTTATATAAAGTGTCTAGAATAGGCAAATCCATAGAG 52657678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 AAGCAAAATATTGTATGATTCCATTTATATAAAGTGTCTAGAATAGGCAAATCCATAGAG 3300

 52657679 GCAGAAAACAGATTAGTGGTTGCCAGTGGCTGGGAATAGGGAAAAAACTCAGCGCTAAAG 52657738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 GCAGAAAACAGATTAGTGGTTGCCAGTGGCTGGGAATAGGGAAAAAACTCAGCGCTAAAG 3360

 52657739 GGTAGGGAGTTTTGTTTTGGAGTAATGACGATGTTCTGGAATTAGACGTGGAACGATTGC 52657798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 GGTAGGGAGTTTTGTTTTGGAGTAATGACGATGTTCTGGAATTAGACGTGGAACGATTGC 3420

 52657799 ACACATGGTGCAAATATCCTTAAAATCACGGAATTGTCACTCTAAAAGGTGAATTTTATG 52657858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 ACACATGGTGCAAATATCCTTAAAATCACGGAATTGTCACTCTAAAAGGTGAATTTTATG 3480

 52657859 GTAGGTGAATTGTACCTCAATTTGTAAAAAGAAGAATTAGATAAATAAACAGCAACACAG 52657918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 GTAGGTGAATTGTACCTCAATTTGTAAAAAGAAGAATTAGATAAATAAACAGCAACACAG 3540

 52657919 CACCAAGGGGTGGGGGTAGGAAACAGACAACAAATAGGAGTGAAGAGTTCACAGGAAAAG 52657978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 CACCAAGGGGTGGGGGTAGGAAACAGACAACAAATAGGAGTGAAGAGTTCACAGGAAAAG 3600

 52657979 ACATGCAGCCAGCTTTTAAGCAGAAGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAA 52658038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 ACATGCAGCCAGCTTTTAAGCAGAAGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAA 3660

 52658039 AGCACAATAAAATTATGACACTTGGCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAAT 52658098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 AGCACAATAAAATTATGACACTTGGCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAAT 3720

 52658099 TGATGACCCCAGTGGAAAGCGTATAAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCTTA 52658158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 TGATGACCCCAGTGGAAAGCGTATAAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCTTA 3780

 52658159 ACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGGAGTTC 52658218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 ACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGGAGTTC 3840

 52658219 AAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACACTGTCTCTGCTAAAAAACAAAACAAAACAAA 52658278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 AAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACACTGTCTCTGCTAAAAAACAAAACAAAACAAA 3900

 52658279 ACACCAAAAAATAGCTGGGCGTAGTGGCGGGCGCCTGTA 52658317
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 ACACCAAAAAATAGCTGGGCGTAGTGGCGGGCGCCTGTA 3939

Alignment time is 4.54785 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [52637064,52668002] =>     30939 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    5976] =>      5976 nucs 'mol-32-314e-013161_5976'

Score:        5976
Aligned:      5976        nucs
Identic:      5976 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [52652394,52658369]
 second seq =>  [       1,    5976]

 52652394 CATGGAATACTATGCAGCCATAAAAAGAACGAGATCATGTCCTTTGCAGGAACATGAATG 52652453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CATGGAATACTATGCAGCCATAAAAAGAACGAGATCATGTCCTTTGCAGGAACATGAATG 60

 52652454 GAGCTGAAGGCCATTATCCTTAGCAAAGTATTGCCGAAAAAGAAAATCAAATACTACATG 52652513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAGCTGAAGGCCATTATCCTTAGCAAAGTATTGCCGAAAAAGAAAATCAAATACTACATG 120

 52652514 TTCTCACTTATAAATGGGAGCTAAATGATGAGAACACATGGCCACACAGGGGGAACAACA 52652573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTCTCACTTATAAATGGGAGCTAAATGATGAGAACACATGGCCACACAGGGGGAACAACA 180

 52652574 CACACTGGGGCCTATTGGAGGGTGGAAGGTGGGAGGAGGGAGAGGATCAGGAAAAATAAT 52652633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CACACTGGGGCCTATTGGAGGGTGGAAGGTGGGAGGAGGGAGAGGATCAGGAAAAATAAT 240

 52652634 TAATAGATATTATTTCATCACCCAGGTATTAATAATACCTATTTCATCACCCAGGCTTGA 52652693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TAATAGATATTATTTCATCACCCAGGTATTAATAATACCTATTTCATCACCCAGGCTTGA 300

 52652694 TACCTGGGTGACAACAAACCCCCATGACACAAATTTACCTATATAACAAACCTGCCCGTG 52652753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TACCTGGGTGACAACAAACCCCCATGACACAAATTTACCTATATAACAAACCTGCCCGTG 360

 52652754 TACCCCTGAACTTAAAATAAAAGTTAAAAAAATGCAAAAAGATGACATACCAAAGAGATG 52652813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TACCCCTGAACTTAAAATAAAAGTTAAAAAAATGCAAAAAGATGACATACCAAAGAGATG 420

 52652814 TTACTTTTCATTTTTAAAAAAGTCAAAGAATTTAAGGAAAATTAAAAAGAAATCAAGAAT 52652873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTACTTTTCATTTTTAAAAAAGTCAAAGAATTTAAGGAAAATTAAAAAGAAATCAAGAAT 480

 52652874 GACAGTAGCAGCTCCAAAATATTTAGAAGGTAGAGTTGAAAATTTTGATTTTCTTAGTGC 52652933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GACAGTAGCAGCTCCAAAATATTTAGAAGGTAGAGTTGAAAATTTTGATTTTCTTAGTGC 540

 52652934 AGAAAAATATTTTGTGCTGCATGTTTTTTTAAAGAAAGTCATTTTATCTGTATATGTGAT 52652993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGAAAAATATTTTGTGCTGCATGTTTTTTTAAAGAAAGTCATTTTATCTGTATATGTGAT 600

 52652994 TAAAACCTTATTTCCAGTGCCATCTTCGTGTAATTGTTAAGAACTTGGATTGTGGATCAC 52653053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TAAAACCTTATTTCCAGTGCCATCTTCGTGTAATTGTTAAGAACTTGGATTGTGGATCAC 660

 52653054 AGGAACCTGGCTTTGACTCTTAACTGCTCACTCTTTAAATGGATAACCCGGGTAAGTTAT 52653113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGGAACCTGGCTTTGACTCTTAACTGCTCACTCTTTAAATGGATAACCCGGGTAAGTTAT 720

 52653114 TTCCTGTCTCTGTGCCTCAGTTTTCTTACAAATTGGCATGAAAATAACAGTGCCTCCTTC 52653173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTCCTGTCTCTGTGCCTCAGTTTTCTTACAAATTGGCATGAAAATAACAGTGCCTCCTTC 780

 52653174 AGAGGGTAATTCTGAGGATTAAATGAAATATTGCCCATACAGTGCTTACCACAGGCTGGT 52653233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGAGGGTAATTCTGAGGATTAAATGAAATATTGCCCATACAGTGCTTACCACAGGCTGGT 840

 52653234 AGATGATTGGTATTCGGTAAACAGTAGTTATTTTTGTTATACTAATATGTTATTAATATA 52653293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGATGATTGGTATTCGGTAAACAGTAGTTATTTTTGTTATACTAATATGTTATTAATATA 900

 52653294 ATTACCATTTTGTATTTTTAAATGTAAGCCATAAGGAAAGGAATTATTCCAATAGTTTAA 52653353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATTACCATTTTGTATTTTTAAATGTAAGCCATAAGGAAAGGAATTATTCCAATAGTTTAA 960

 52653354 TTTACAAACTTGAGTTTTCTAGAAAGACTTTTAAAAACAGTAGTGATATAAATCAATTTA 52653413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTTACAAACTTGAGTTTTCTAGAAAGACTTTTAAAAACAGTAGTGATATAAATCAATTTA 1020

 52653414 TCTTAAGAAACATAAGTATCTGGGCCAGGCAAGTTTCAGAAATGTTTATCATTTTCAAAG 52653473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TCTTAAGAAACATAAGTATCTGGGCCAGGCAAGTTTCAGAAATGTTTATCATTTTCAAAG 1080

 52653474 TACCAAATATTCTCGTCAAAACAAGCTGCTTCATCAGAGTTCTAATTATATATTTAAACA 52653533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TACCAAATATTCTCGTCAAAACAAGCTGCTTCATCAGAGTTCTAATTATATATTTAAACA 1140

 52653534 TACATGCACACACACACGTTTGTATTACAATATTCAAAACTTCTGAGGAAGAATTATCTT 52653593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TACATGCACACACACACGTTTGTATTACAATATTCAAAACTTCTGAGGAAGAATTATCTT 1200

 52653594 TTTTTTTTCATGTGCCAAAGCTAAAACTTTCACTTGCTACAGCTGTGTATTAGTCTATTT 52653653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTTTTTTTCATGTGCCAAAGCTAAAACTTTCACTTGCTACAGCTGTGTATTAGTCTATTT 1260

 52653654 CCATACTGCTATAAAGAGCTGCCCAAGACTGGGTGATTTATAAAGGAAAGAGGTTTAATT 52653713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CCATACTGCTATAAAGAGCTGCCCAAGACTGGGTGATTTATAAAGGAAAGAGGTTTAATT 1320

 52653714 GACTCACAGTTCAGCATGGCAGGGAAGGCCTCAGGAAACTTACAATCATGGTGGAAGTCA 52653773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GACTCACAGTTCAGCATGGCAGGGAAGGCCTCAGGAAACTTACAATCATGGTGGAAGTCA 1380

 52653774 AAGGGGGAGCAAGGACCTTTCTTCACAAGGCAGCAGAAAGAAGTGCCAAATGAACAGGGA 52653833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AAGGGGGAGCAAGGACCTTTCTTCACAAGGCAGCAGAAAGAAGTGCCAAATGAACAGGGA 1440

 52653834 AGAGCTCCTTATGAAACCATCAGGTCTTGTGAGAACTCACTTACTTTTATGAGAACAGCA 52653893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AGAGCTCCTTATGAAACCATCAGGTCTTGTGAGAACTCACTTACTTTTATGAGAACAGCA 1500

 52653894 TGGAGGAAACTGTCCCCATGATCCAATCACCTCCACCTGGTCTCTCCCTTGACACGTGGG 52653953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TGGAGGAAACTGTCCCCATGATCCAATCACCTCCACCTGGTCTCTCCCTTGACACGTGGG 1560

 52653954 GATTATGGGGATTAAATTCCAGATGAGATTTGGGTGGGGACAAAAAGCCTAACGACATCA 52654013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GATTATGGGGATTAAATTCCAGATGAGATTTGGGTGGGGACAAAAAGCCTAACGACATCA 1620

 52654014 AGCTGTAAAAACAATAGCTAACATTCATTGACTGTTTCCCAGCATTAGGATAAATGTGTG 52654073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AGCTGTAAAAACAATAGCTAACATTCATTGACTGTTTCCCAGCATTAGGATAAATGTGTG 1680

 52654074 TAACAAGAGGCATTTTATTTATGTATGACATTTGTTTATTTATTATTTATTTATTTGGAT 52654133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TAACAAGAGGCATTTTATTTATGTATGACATTTGTTTATTTATTATTTATTTATTTGGAT 1740

 52654134 AAATGTCTATAACAAGAAACATTTTATTTAAGTATAACAGCAAATCTACAAGTTAGGTAC 52654193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AAATGTCTATAACAAGAAACATTTTATTTAAGTATAACAGCAAATCTACAAGTTAGGTAC 1800

 52654194 TATCATCACTCCCATTTTACAGGTCGTGAAACTGAGGCTCTGAAAAGTCAAGTCAGTTTT 52654253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TATCATCACTCCCATTTTACAGGTCGTGAAACTGAGGCTCTGAAAAGTCAAGTCAGTTTT 1860

 52654254 CTAATGTTGTCCAGCTAATGACTGGTAGATTTAGTATTTGAACCCACATTTGCCTGATTC 52654313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CTAATGTTGTCCAGCTAATGACTGGTAGATTTAGTATTTGAACCCACATTTGCCTGATTC 1920

 52654314 CAAAGTTCAAACTCCCAACAACATGTGGTAACCAAAGCAGGAACAGAAGAGAAAGAAGAA 52654373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CAAAGTTCAAACTCCCAACAACATGTGGTAACCAAAGCAGGAACAGAAGAGAAAGAAGAA 1980

 52654374 ATAGAAGGGAGGGAAGATGAACAAAGTAGACAAAGTTTAGTTAATAGAATTAGTGGATAC 52654433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ATAGAAGGGAGGGAAGATGAACAAAGTAGACAAAGTTTAGTTAATAGAATTAGTGGATAC 2040

 52654434 CCAAGAAAAAACTATGTACAAGAGGGGGAAAAAAACCCTGTTTTCTCACATCTGGGAAAC 52654493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CCAAGAAAAAACTATGTACAAGAGGGGGAAAAAAACCCTGTTTTCTCACATCTGGGAAAC 2100

 52654494 ATTGATATCTATATATTTTTGGTTTTAAATAAAAATTAGGTTATGTCATTCATTTGCATA 52654553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ATTGATATCTATATATTTTTGGTTTTAAATAAAAATTAGGTTATGTCATTCATTTGCATA 2160

 52654554 AAACCATCCAAAGAAGGGCCTCACAAAATTAAAACAAAATCCAAACTCTCTACTATGGGC 52654613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AAACCATCCAAAGAAGGGCCTCACAAAATTAAAACAAAATCCAAACTCTCTACTATGGGC 2220

 52654614 CACACCCTCCAGAACTTCAGCTCGTACTATGTTTTTCCTCACACCTCTCAACATACCAAC 52654673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CACACCCTCCAGAACTTCAGCTCGTACTATGTTTTTCCTCACACCTCTCAACATACCAAC 2280

 52654674 ATGTTTCCACCTGCAGCCCTCACCACTAGTTATTCTTTCAATCTGGAAATATTTTCGCTA 52654733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 ATGTTTCCACCTGCAGCCCTCACCACTAGTTATTCTTTCAATCTGGAAATATTTTCGCTA 2340

 52654734 AGATCTTCCTATGGTTACCTTCTTATCATTCAAGACTTAGGTTATGTCAGGCCTTCCCTG 52654793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AGATCTTCCTATGGTTACCTTCTTATCATTCAAGACTTAGGTTATGTCAGGCCTTCCCTG 2400

 52654794 ACTCCTCCATCTGAAGTAACCCCTCCTGCTTACTCCTGTTTATTCTCTAGACTCCACAGA 52654853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ACTCCTCCATCTGAAGTAACCCCTCCTGCTTACTCCTGTTTATTCTCTAGACTCCACAGA 2460

 52654854 GGATTCATCACTCTCTGAAATGATCCCATTAATTTCTTCTTCACTTGTTTCCTCTCCACG 52654913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GGATTCATCACTCTCTGAAATGATCCCATTAATTTCTTCTTCACTTGTTTCCTCTCCACG 2520

 52654914 ACCTGTAAGCCCCAAGTGGACCCGGACTTGGTCTGCTCTGCTTACAGCTGGATTCCAGTT 52654973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 ACCTGTAAGCCCCAAGTGGACCCGGACTTGGTCTGCTCTGCTTACAGCTGGATTCCAGTT 2580

 52654974 CCCATAGTGCTAGACACTAGGATTAAGCCAGGAAACATGGGTGAAGCAGCAAGCACAGAG 52655033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CCCATAGTGCTAGACACTAGGATTAAGCCAGGAAACATGGGTGAAGCAGCAAGCACAGAG 2640

 52655034 CTTGGGGCACAGCCTAGCAAACACTCCACAAAGGACCATGATTGTAACTGTAGTAGGGCA 52655093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CTTGGGGCACAGCCTAGCAAACACTCCACAAAGGACCATGATTGTAACTGTAGTAGGGCA 2700

 52655094 CACCAATGAACAGGTTGGGAAACTGAGTCTCTGAGAAGAGACTAATGTTGTGCTGGATGA 52655153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CACCAATGAACAGGTTGGGAAACTGAGTCTCTGAGAAGAGACTAATGTTGTGCTGGATGA 2760

 52655154 AATTTCTTTTTCTGACAATACATTATCCAAATCCTCCAAGCTTTCAGTTTAAAGGGGAAA 52655213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 AATTTCTTTTTCTGACAATACATTATCCAAATCCTCCAAGCTTTCAGTTTAAAGGGGAAA 2820

 52655214 GCAGGAACTATCATTATAATTTTATTTACAAAGTGTCCATGTATGAACATTATTCACCGC 52655273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GCAGGAACTATCATTATAATTTTATTTACAAAGTGTCCATGTATGAACATTATTCACCGC 2880

 52655274 CGAATCATCTCTTCCTATGCAAGCAACACCGTCCTATGCATCAATATCCTGATCTGTCAG 52655333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CGAATCATCTCTTCCTATGCAAGCAACACCGTCCTATGCATCAATATCCTGATCTGTCAG 2940

 52655334 GATTCAGGATAAAGTGGACATATACACACTAATTGCAAAGGGAAATTGTACATCTTGCAA 52655393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 GATTCAGGATAAAGTGGACATATACACACTAATTGCAAAGGGAAATTGTACATCTTGCAA 3000

 52655394 AAGATGCAGGGGTTTATAGAGTCTTGTAACATTGGTGAGCTGCTCAGATCACACACATGA 52655453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 AAGATGCAGGGGTTTATAGAGTCTTGTAACATTGGTGAGCTGCTCAGATCACACACATGA 3060

 52655454 CCGTGGTTGGACAAGGATCTGGCAAAGTTAACACAGATCACCGAAGAAGGAAAAGTGGAC 52655513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 CCGTGGTTGGACAAGGATCTGGCAAAGTTAACACAGATCACCGAAGAAGGAAAAGTGGAC 3120

 52655514 AACACAACACAGTAAGTTCTTCAAAAGAGTTATATTAGAATATCAAAAGATTATGTTAGG 52655573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 AACACAACACAGTAAGTTCTTCAAAAGAGTTATATTAGAATATCAAAAGATTATGTTAGG 3180

 52655574 CCTTTGGGAAAACTCAAAACTTTATGAAGACCTCAAAAAATTATGCAAAAATGACCCTTC 52655633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 CCTTTGGGAAAACTCAAAACTTTATGAAGACCTCAAAAAATTATGCAAAAATGACCCTTC 3240

 52655634 AATGGTCATGCTGCAAGAGTCAAATGACACTTCAAACAACTGCGGCTTTCTATGTTGTGC 52655693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 AATGGTCATGCTGCAAGAGTCAAATGACACTTCAAACAACTGCGGCTTTCTATGTTGTGC 3300

 52655694 AAATGCATTTGTTGTTTTAAAGGTCGTAAAGTCAGGGTACACGTGGCAGATACTTATGAC 52655753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 AAATGCATTTGTTGTTTTAAAGGTCGTAAAGTCAGGGTACACGTGGCAGATACTTATGAC 3360

 52655754 TTGGAGGAAGACGTTAGATTAGATTTGAAACTTTCACTGAATGATCGCATTTCATGCTTT 52655813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TTGGAGGAAGACGTTAGATTAGATTTGAAACTTTCACTGAATGATCGCATTTCATGCTTT 3420

 52655814 TCATCTGTACATTAAAAAGCCAGAATGTCTTTGCCAAGAAATTCTAGCATAAATAAAAGA 52655873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TCATCTGTACATTAAAAAGCCAGAATGTCTTTGCCAAGAAATTCTAGCATAAATAAAAGA 3480

 52655874 AAAGGATGGGATTTTGGAACATCATGGTAGAATTCTTGACTATCAGCTTTATACAACATG 52655933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 AAAGGATGGGATTTTGGAACATCATGGTAGAATTCTTGACTATCAGCTTTATACAACATG 3540

 52655934 TCTGGACATTTAGTGATGGAAATGCTGGATTCCAAAGGAATGTAGGCAAAGGTACTACTA 52655993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 TCTGGACATTTAGTGATGGAAATGCTGGATTCCAAAGGAATGTAGGCAAAGGTACTACTA 3600

 52655994 CCCCCATGCTCTTCAGAAAACATCCTCTAAAAGCAACAGTGATGATCAGATACTGTGGGG 52656053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 CCCCCATGCTCTTCAGAAAACATCCTCTAAAAGCAACAGTGATGATCAGATACTGTGGGG 3660

 52656054 CAAGACTGACAGTGACACTCAAGATTTCCACTCTTCTCTTTAATCATATATTTCCTGTCA 52656113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 CAAGACTGACAGTGACACTCAAGATTTCCACTCTTCTCTTTAATCATATATTTCCTGTCA 3720

 52656114 TTCATGTGCTACAAAACTCTGGAATATGCAAAGCTCATTCAAATGCAAAACCAGCCTTTG 52656173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 TTCATGTGCTACAAAACTCTGGAATATGCAAAGCTCATTCAAATGCAAAACCAGCCTTTG 3780

 52656174 CTCCAACATGAGCATATATTTTCATTTAAAGACAAATCAGATGTTTCATTTGATTTTTTT 52656233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 CTCCAACATGAGCATATATTTTCATTTAAAGACAAATCAGATGTTTCATTTGATTTTTTT 3840

 52656234 TATAAATCTGATAATAATGTACATTTAACCCGTGTTTACAACCAAAATAATTAATCTCTC 52656293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 TATAAATCTGATAATAATGTACATTTAACCCGTGTTTACAACCAAAATAATTAATCTCTC 3900

 52656294 TGAACCCTTTGTTTTTCCTGTCTCTATCCTCCACCCTCATTGCCAGATAAATAACATCTG 52656353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 TGAACCCTTTGTTTTTCCTGTCTCTATCCTCCACCCTCATTGCCAGATAAATAACATCTG 3960

 52656354 CAACCTGATGTGGCATATTGAACTTTGTTTATACTCACACAAACACGTATAAGCATCCCA 52656413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 CAACCTGATGTGGCATATTGAACTTTGTTTATACTCACACAAACACGTATAAGCATCCCA 4020

 52656414 GATACACATATACAGGGACTGTATCTGTCCTTGTTGTTTTTATAGAAATTGGATCACATT 52656473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 GATACACATATACAGGGACTGTATCTGTCCTTGTTGTTTTTATAGAAATTGGATCACATT 4080

 52656474 AGACATATTTTCTGATGACTTTTGTACATTATAGTTGGTCTTCACAGTCAATAGCTCCAA 52656533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 AGACATATTTTCTGATGACTTTTGTACATTATAGTTGGTCTTCACAGTCAATAGCTCCAA 4140

 52656534 AGCTATCTTATCTTCTAAAATAGCTGCATAATATTCCTCAGTATGGATATACCAAAAGAT 52656593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 AGCTATCTTATCTTCTAAAATAGCTGCATAATATTCCTCAGTATGGATATACCAAAAGAT 4200

 52656594 ATTTAAACCATTGCCTAATCAATGAATATCCTGGTAGTTTCCACATTGTTTTTTCCATTT 52656653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 ATTTAAACCATTGCCTAATCAATGAATATCCTGGTAGTTTCCACATTGTTTTTTCCATTT 4260

 52656654 CCACTATAGTGGAATAAACTTTCGTGTTCAAAAATCCTAAACTGGTGCTATATTTCTATA 52656713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 CCACTATAGTGGAATAAACTTTCGTGTTCAAAAATCCTAAACTGGTGCTATATTTCTATA 4320

 52656714 GAATAGAGGCACAGATGTAGAAGTGTTACCCTCAAATCAATATGCATTTAGTTTTGAAAA 52656773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 GAATAGAGGCACAGATGTAGAAGTGTTACCCTCAAATCAATATGCATTTAGTTTTGAAAA 4380

 52656774 ACAGACACTGCCATATTATTTTCTTAAAAAGGCTCTACAGATTCACATTTCCAGCAGCAA 52656833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 ACAGACACTGCCATATTATTTTCTTAAAAAGGCTCTACAGATTCACATTTCCAGCAGCAA 4440

 52656834 TGAGTGTCTCAAGCACCTTTTAAGTGGTAAGCAGCTTACCAGGGGAGGTGGCCTATTATT 52656893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 TGAGTGTCTCAAGCACCTTTTAAGTGGTAAGCAGCTTACCAGGGGAGGTGGCCTATTATT 4500

 52656894 CTATCAGTGGCTTCAGTTGTTAGGACACCACGGGTCAGCTGTGGAGATACGGTTGTGGGG 52656953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 CTATCAGTGGCTTCAGTTGTTAGGACACCACGGGTCAGCTGTGGAGATACGGTTGTGGGG 4560

 52656954 CAGGTTGAGTTCAGGACACATAGAAGATTGCCAAAGGGTGACTATTATTACTTTGAGACT 52657013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 CAGGTTGAGTTCAGGACACATAGAAGATTGCCAAAGGGTGACTATTATTACTTTGAGACT 4620

 52657014 CTGGAAAAATTAGCCAGGAAACAGAGACAAGAGGCTCAGGGTGCAGCAAAGCAGCCAAAT 52657073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 CTGGAAAAATTAGCCAGGAAACAGAGACAAGAGGCTCAGGGTGCAGCAAAGCAGCCAAAT 4680

 52657074 CAGGATGATAGTGTTTTCTTTGGAGCAGATATACTAATGGCCAAGGAACTCATAAAAAGA 52657133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 CAGGATGATAGTGTTTTCTTTGGAGCAGATATACTAATGGCCAAGGAACTCATAAAAAGA 4740

 52657134 TGCCTAATGTCATCTCATTAGGGAAGTGCAGTCAAAGCCACAGCATGATACGTCTTCACA 52657193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 TGCCTAATGTCATCTCATTAGGGAAGTGCAGTCAAAGCCACAGCATGATACGTCTTCACA 4800

 52657194 CCCACGAGGATGGCCATAATCAGAGAGACAATAACCAGTGGTAGGGAAGATGTGAAAAAA 52657253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 CCCACGAGGATGGCCATAATCAGAGAGACAATAACCAGTGGTAGGGAAGATGTGAAAAAA 4860

 52657254 TCGGAATGCTCATGCATTGCTGGTAGGAATGTGACATGGTGCAGCTGCTTTGGAAAGCAG 52657313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 TCGGAATGCTCATGCATTGCTGGTAGGAATGTGACATGGTGCAGCTGCTTTGGAAAGCAG 4920

 52657314 TTTAACAGTTCCTGGAAAAGTTAAACATGGAGTTACCCTAAGACCCAGCAATTCCATTCC 52657373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 TTTAACAGTTCCTGGAAAAGTTAAACATGGAGTTACCCTAAGACCCAGCAATTCCATTCC 4980

 52657374 TAGGTAAGCAAGAAAATGAAAACATATGGCCACACAAAAACTTGTACACAAATGTCCATA 52657433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 TAGGTAAGCAAGAAAATGAAAACATATGGCCACACAAAAACTTGTACACAAATGTCCATA 5040

 52657434 GCAGCATTTTCATAATAGCTGAAAAGTGGAAACAACCCAAATATCCATCAATTGGAAAAA 52657493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 GCAGCATTTTCATAATAGCTGAAAAGTGGAAACAACCCAAATATCCATCAATTGGAAAAA 5100

 52657494 GGAAATCTAGCATTTGCATATAATAGAGTATTAATCAGCCATAAGAAGAAACAAAGCACC 52657553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 GGAAATCTAGCATTTGCATATAATAGAGTATTAATCAGCCATAAGAAGAAACAAAGCACC 5160

 52657554 GATCCATGTTATATCATGCTTTATACTTGGAAGCATGGTACTAAGTGAAAGACGCCAGAC 52657613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 GATCCATGTTATATCATGCTTTATACTTGGAAGCATGGTACTAAGTGAAAGACGCCAGAC 5220

 52657614 ACAAAAAGCAAAATATTGTATGATTCCATTTATATAAAGTGTCTAGAATAGGCAAATCCA 52657673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 ACAAAAAGCAAAATATTGTATGATTCCATTTATATAAAGTGTCTAGAATAGGCAAATCCA 5280

 52657674 TAGAGGCAGAAAACAGATTAGTGGTTGCCAGTGGCTGGGAATAGGGAAAAAACTCAGCGC 52657733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 TAGAGGCAGAAAACAGATTAGTGGTTGCCAGTGGCTGGGAATAGGGAAAAAACTCAGCGC 5340

 52657734 TAAAGGGTAGGGAGTTTTGTTTTGGAGTAATGACGATGTTCTGGAATTAGACGTGGAACG 52657793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 TAAAGGGTAGGGAGTTTTGTTTTGGAGTAATGACGATGTTCTGGAATTAGACGTGGAACG 5400

 52657794 ATTGCACACATGGTGCAAATATCCTTAAAATCACGGAATTGTCACTCTAAAAGGTGAATT 52657853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 ATTGCACACATGGTGCAAATATCCTTAAAATCACGGAATTGTCACTCTAAAAGGTGAATT 5460

 52657854 TTATGGTAGGTGAATTGTACCTCAATTTGTAAAAAGAAGAATTAGATAAATAAACAGCAA 52657913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 TTATGGTAGGTGAATTGTACCTCAATTTGTAAAAAGAAGAATTAGATAAATAAACAGCAA 5520

 52657914 CACAGCACCAAGGGGTGGGGGTAGGAAACAGACAACAAATAGGAGTGAAGAGTTCACAGG 52657973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 CACAGCACCAAGGGGTGGGGGTAGGAAACAGACAACAAATAGGAGTGAAGAGTTCACAGG 5580

 52657974 AAAAGACATGCAGCCAGCTTTTAAGCAGAAGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAA 52658033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 AAAAGACATGCAGCCAGCTTTTAAGCAGAAGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAA 5640

 52658034 ATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTGGCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAG 52658093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 ATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTGGCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAG 5700

 52658094 ACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTATAAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTG 52658153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5701 ACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTATAAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTG 5760

 52658154 GCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGG 52658213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5761 GCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGG 5820

 52658214 AGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACACTGTCTCTGCTAAAAAACAAAACAAA 52658273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5821 AGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACACTGTCTCTGCTAAAAAACAAAACAAA 5880

 52658274 ACAAAACACCAAAAAATAGCTGGGCGTAGTGGCGGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTTGGG 52658333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5881 ACAAAACACCAAAAAATAGCTGGGCGTAGTGGCGGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTTGGG 5940

 52658334 AGGCGGTGGCAGGAGAATCATTTGAACCTGGGAGGC 52658369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5941 AGGCGGTGGCAGGAGAATCATTTGAACCTGGGAGGC 5976

Alignment time is 6.46497 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [52637064,52668002] =>     30939 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    3058] =>      3058 nucs 'mol-32-3159-025609_3058'

Score:        2996
Aligned:      3061        nucs
Identic:      3051 (100%) nucs =>      2993 (100%)        58 (100%)
Gaps:            6 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [52644065,52647064] EXCISED REGION [52658003,52658060]
 second seq =>  [       1,    3000] EXCISED REGION [    3001,    3058]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>     10938 nucs [52647065,52658002]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         6 nucs [52647065,52647070] to [52658003,52658008]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [52647065,52647067] to [52658000,52658002]
 second seq =>         0 nucs

 52644065 CACTTAACTTTATTCCCAAGTTTTGAAAAATATTGTTATTTAAAAAGTCTGTTAACCAAG 52644124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CACTTAACTTTATTCCCAAGTTTTGAAAAATATTGTTATTTAAAAAGTCTGTTAACCAAG 60

 52644125 GAAATGCATGCCCTAAACCTATAATGTATCAAGTTTTACTTCCTTCTTCTTTTAAGGAGT 52644184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAAATGCATGCCCTAAACCTATAATGTATCAAGTTTTACTTCCTTCTTCTTTTAAGGAGT 120

 52644185 TCTTTTCCTGCCTTGAATACAAACAGGCTCTCTCAAGGTTAAAAGCAAATGCTCTTTTTA 52644244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCTTTTCCTGCCTTGAATACAAACAGGCTCTCTCAAGGTTAAAAGCAAATGCTCTTTTTA 180

 52644245 GTGTCAAAAAGAGCTTGCCTTTCTTCGCTCAGGAAAAAAAGCAACTGATTCCAGGATACC 52644304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTGTCAAAAAGAGCTTGCCTTTCTTCGCTCAGGAAAAAAAGCAACTGATTCCAGGATACC 240

 52644305 TTCTTTGAAAACCAACACAAAAAAACCCCCCAAAAAACAAAAAAAAAACCCAAAACCCCT 52644364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTCTTTGAAAACCAACACAAAAAAACCCCCCAAAAAACAAAAAAAAAACCCAAAACCCCT 300

 52644365 AGTTTTTACAAAGGTTTATTACTCCTACTTGTTGGAAAAGAATTACTACATAAAAGAGTC 52644424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGTTTTTACAAAGGTTTATTACTCCTACTTGTTGGAAAAGAATTACTACATAAAAGAGTC 360

 52644425 TGCCCAGAGCTGTAAAATCTCCTTATTCAAACACACACCTTAGAGCAAAAGATGGTTAAA 52644484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGCCCAGAGCTGTAAAATCTCCTTATTCAAACACACACCTTAGAGCAAAAGATGGTTAAA 420

 52644485 TATCAATTCAGGCTATTAACAGTAAGGGAC---GAAATGTGTTCCAACAAAACTCTGCAT 52644541
          |||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||
      421 TATCAATTCAGGCTATTAACAGTAAGG---AATGAAATGTGTTCCAACAAAACTCTGCAT 477

 52644542 GTCAACAAACTACAGAGACTAGGTAACATCTTTTAGGAATCATTTTTATTCCACTAATGC 52644601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      478 GTCAACAAACTACAGAGACTAGGTAACATCTTTTAGGAATCATTTTTATTCCACTAATGC 537

 52644602 CTTTTCCTCCAGAATCCACTGATCGTAAACGCAACCTGTCTACTTCCGCCTTTGAAAAAT 52644661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      538 CTTTTCCTCCAGAATCCACTGATCGTAAACGCAACCTGTCTACTTCCGCCTTTGAAAAAT 597

 52644662 GGATGGACAAATTCATCTGCATGTAACTCACCTCCTCTTTTCTTTTACATAAAACAGATG 52644721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      598 GGATGGACAAATTCATCTGCATGTAACTCACCTCCTCTTTTCTTTTACATAAAACAGATG 657

 52644722 CCACAGCTGTTATTGTTCTTCACACAGAAGTTTCTACCCAGAGAAACATCAGGATGACAC 52644781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      658 CCACAGCTGTTATTGTTCTTCACACAGAAGTTTCTACCCAGAGAAACATCAGGATGACAC 717

 52644782 TCTGCTGCAATGTGCTATTTGTTCTAGAGGGGTCAACAGCTTGCCACCTTGCCTAGGCCC 52644841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      718 TCTGCTGCAATGTGCTATTTGTTCTAGAGGGGTCAACAGCTTGCCACCTTGCCTAGGCCC 777

 52644842 AGGGTGACTGCATATGTGCAGTGGTCTTATCCCATTAGCGCCCCCGAGCATGCATTCAGA 52644901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      778 AGGGTGACTGCATATGTGCAGTGGTCTTATCCCATTAGCGCCCCCGAGCATGCATTCAGA 837

 52644902 ACCAAGTGGATACACCTTGGCACACTTACCTTCCCTGCAGGGACATCATCGGACTGCCCT 52644961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      838 ACCAAGTGGATACACCTTGGCACACTTACCTTCCCTGCAGGGACATCATCGGACTGCCCT 897

 52644962 GATAAGCCAGGAACCTCATCCACCTTGTCTTGATGCTCTGCCCTCTTGGCTTCCTGTTGG 52645021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      898 GATAAGCCAGGAACCTCATCCACCTTGTCTTGATGCTCTGCCCTCTTGGCTTCCTGTTGG 957

 52645022 CTGTCACCTGGCACCTTTTCCTGTCCCTTGTCCAGCTTGAAGAATTTGTCAAAAAAGCTG 52645081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      958 CTGTCACCTGGCACCTTTTCCTGTCCCTTGTCCAGCTTGAAGAATTTGTCAAAAAAGCTG 1017

 52645082 GAGTCCTTGGGCTTGGAGGGAGCTTCTCCTCCTGCTCCCCCTGTCTCAGGTGGGAGAAGC 52645141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1018 GAGTCCTTGGGCTTGGAGGGAGCTTCTCCTCCTGCTCCCCCTGTCTCAGGTGGGAGAAGC 1077

 52645142 GTGGGATCCCTGGCGGCAGAGAGGACCTTGTCTTGGGCCGGGGCGTGCCCTGGGGTTTTA 52645201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1078 GTGGGATCCCTGGCGGCAGAGAGGACCTTGTCTTGGGCCGGGGCGTGCCCTGGGGTTTTA 1137

 52645202 TCTGTGTCCTGCCCCGGTCCAGCTGCCACCGGAAGTGTCCAGCTCTCACTTGGGTCTTTG 52645261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1138 TCTGTGTCCTGCCCCGGTCCAGCTGCCACCGGAAGTGTCCAGCTCTCACTTGGGTCTTTG 1197

 52645262 TTCGCTGGAGCTTTATTGGAGCTGACATCAAGCTTCACTGATCCAAGGGATGAATCTGCG 52645321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1198 TTCGCTGGAGCTTTATTGGAGCTGACATCAAGCTTCACTGATCCAAGGGATGAATCTGCG 1257

 52645322 GCTTGGTCTCCGGTACGTCCTGGTACAGGCCGAGAGAGCATCAAGAAAAAACGAGATTTA 52645381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1258 GCTTGGTCTCCGGTACGTCCTGGTACAGGCCGAGAGAGCATCAAGAAAAAACGAGATTTA 1317

 52645382 GCAGCTGGTGCCTCGGGTTTGGCCTCTTTCCCAAGATTCTTTCCGTTGGCATCCGCAACA 52645441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1318 GCAGCTGGTGCCTCGGGTTTGGCCTCTTTCCCAAGATTCTTTCCGTTGGCATCCGCAACA 1377

 52645442 GCACTTATCTCCGTTGTCTCGGGGGAAGAAGTGGCCACATTATCCGTCTTGACACTTATT 52645501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1378 GCACTTATCTCCGTTGTCTCGGGGGAAGAAGTGGCCACATTATCCGTCTTGACACTTATT 1437

 52645502 CCCAAGTCGACTGTAAACACAAACATAAACAGTGGTTATTCAGCCAAGCCGGGAAATTCA 52645561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     1438 CCCAAGTCGACTGTAAACACAAACATAAACAGCGGTTATTCAGCCAAGCCGGGAAATTCA 1497

 52645562 GGCACTAATAATGGACTCCAGACATTTTTTATACAAAAGCCATACTGCATACTGGAACTG 52645621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1498 GGCACTAATAATGGACTCCAGACATTTTTTATACAAAAGCCATACTGCATACTGGAACTG 1557

 52645622 TGTTGTTCTCTGGTCATTCTGAAAGGCAGAAGTTAGCTCTCTACATCTCCTTGGACCCTG 52645681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1558 TGTTGTTCTCTGGTCATTCTGAAAGGCAGAAGTTAGCTCTCTACATCTCCTTGGACCCTG 1617

 52645682 CTTTTCTTGGGAGAGGAGAAGGCAAGGTTGGTGAGGAGGGAAAGCTACTTAATGGAAAGT 52645741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1618 CTTTTCTTGGGAGAGGAGAAGGCAAGGTTGGTGAGGAGGGAAAGCTACTTAATGGAAAGT 1677

 52645742 CACTAGCTGCCAGGTGTGGAATGAGTGATATTCAATGTTAATTAATCTTCTTTTATCTGT 52645801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1678 CACTAGCTGCCAGGTGTGGAATGAGTGATATTCAATGTTAATTAATCTTCTTTTATCTGT 1737

 52645802 GTAAGAACTCCGTGAGCAGCATATTGTCATGATGTCAACTGGGAGGCAGTACAGCAGTTA 52645861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1738 GTAAGAACTCCGTGAGCAGCATATTGTCATGATGTCAACTGGGAGGCAGTACAGCAGTTA 1797

 52645862 GGAGCTTGGGTTCTGGAGCTAGAACAAGGTTTCTCAACCTCAGCACTACTCACATTTGAA 52645921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1798 GGAGCTTGGGTTCTGGAGCTAGAACAAGGTTTCTCAACCTCAGCACTACTCACATTTGAA 1857

 52645922 GCCAGATTATTCTTTGTTAGGGAGGCTCATCCCGTGCCTCATAGGCTGATTAGCAGCATC 52645981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1858 GCCAGATTATTCTTTGTTAGGGAGGCTCATCCCGTGCCTCATAGGCTGATTAGCAGCATC 1917

 52645982 CTGGCCTCTGCCCACTAGACGCCGGTCACATTTCCCAGTCATGGCAACCAAAAATATCTC 52646041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1918 CTGGCCTCTGCCCACTAGACGCCGGTCACATTTCCCAGTCATGGCAACCAAAAATATCTC 1977

 52646042 TAGGCATTGCTAAATGTCCCCTGGAGGACAAAATCTCTTACGTTTGAGAGGCACTGAGCT 52646101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1978 TAGGCATTGCTAAATGTCCCCTGGAGGACAAAATCTCTTACGTTTGAGAGGCACTGAGCT 2037

 52646102 GAAATGTCTTTTTGAATCCAGATTATCTAATTTTCTGTGCCTCAACTTTCTGGTAAAAGG 52646161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2038 GAAATGTCTTTTTGAATCCAGATTATCTAATTTTCTGTGCCTCAACTTTCTGGTAAAAGG 2097

 52646162 AGACAGATAATAAATCTCGTAATTTTGTTAGGAAGATTACATGAGTTAATAGTTTTAAAG 52646221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2098 AGACAGATAATAAATCTCGTAATTTTGTTAGGAAGATTACATGAGTTAATAGTTTTAAAG 2157

 52646222 CAAGTACAATAGCACCTGGAATATATTAAGTGCTTAATAAATATCACAAACATTAGTTAT 52646281
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2158 CAAGTACAATAGCGCCTGGAATATATTAAGTGCTTAATAAATATCACAAACATTAGTTAT 2217

 52646282 CATTATTCATGAGTGAGAAAACTGACAGTCAGAGAGGTCAGTACACCCTCCCCTGGCTGC 52646341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2218 CATTATTCATGAGTGAGAAAACTGACAGTCAGAGAGGTCAGTACACCCTCCCCTGGCTGC 2277

 52646342 CCAGTAAGCTAGTAAGCAGCAGAGTCTGGCTTCAGGCAGAAATCTGACTTCTAAGTTCAT 52646401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2278 CCAGTAAGCTAGTAAGCAGCAGAGTCTGGCTTCAGGCAGAAATCTGACTTCTAAGTTCAT 2337

 52646402 GCGCTCTCTGTCTTACCAGGGACTTGTATTAGCATAGACTGTTAAGAATATGGGAAGATT 52646461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2338 GCGCTCTCTGTCTTACCAGGGACTTGTATTAGCATAGACTGTTAAGAATATGGGAAGATT 2397

 52646462 TTTAAAATACAGTACTCAGAAAATTTCTCTTTGAAAGGCTGGAAGAGCAGATATCCACAC 52646521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2398 TTTAAAATACAGTACTCAGAAAATTTCTCTTTGAAAGGCTGGAAGAGCAGATATCCACAC 2457

 52646522 AAGAAGGCAAATTAGACCTCAGGCCAGTGTGGAATTAAAGGTGTAGGGTTATCTGGTCAA 52646581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2458 AAGAAGGCAAATTAGACCTCAGGCCAGTGTGGAATTAAAGGTGTAGGGTTATCTGGTCAA 2517

 52646582 GACTGTGTGTGTGGATACAGGCTCCAACCCCTCCAGGCAAGGGCACTGTTTCCAACATCC 52646641
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     2518 GACTGTGTGTGTGGATACAGGCTCCAACCCCTCCAGGCAAGGGCAATGTTTCCAACATCC 2577

 52646642 ACCCTTTCTCCTTTGACCTCTACCTTGACCTAAATTAACTATAAAAGGTCCTTCTTTTCT 52646701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2578 ACCCTTTCTCCTTTGACCTCTACCTTGACCTAAATTAACTATAAAAGGTCCTTCTTTTCT 2637

 52646702 AGGACCCTACTATAAATCAGTGAAATATTCAGGAAAAAAAGAACACCAAGAATGTTGGGA 52646761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2638 AGGACCCTACTATAAATCAGTGAAATATTCAGGAAAAAAAGAACACCAAGAATGTTGGGA 2697

 52646762 TCCCAGTTAAAGATCAAGATTCTCTACTGATAAGCTGTGTGATATGGAGTAAATCACTAA 52646821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2698 TCCCAGTTAAAGATCAAGATTCTCTACTGATAAGCTGTGTGATATGGAGTAAATCACTAA 2757

 52646822 AGATCTTTGAATCTCTTCATTTGTAAAATGGGAATATTGGTAGTCCTACTGCAGGGTTGT 52646881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2758 AGATCTTTGAATCTCTTCATTTGTAAAATGGGAATATTGGTAGTCCTACTGCAGGGTTGT 2817

 52646882 TGTAATGCTTAAAGAAGAAAAGTCATGCAAAGGATCTGGCACAACGCCTTTTCCATAATA 52646941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     2818 TGTAATGCTTAAAGAAGAAAAGTCATGCAAAGGATCTGGCACAATGCCTTTTCCATAATA 2877

 52646942 AGTGCTTAGTAATTGACAGATACTGTGATAACTTTTCAGGTTTCTCTCATGCCTTTGACA 52647001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2878 AGTGCTTAGTAATTGACAGATACTGTGATAACTTTTCAGGTTTCTCTCATGCCTTTGACA 2937

 52647002 ACATTGCATTTTGCTTGCTCTATCTGTAGTCAGACACTTCTTAATATCTGTTTGCAGGAA 52647061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2938 ACATTGCATTTTGCTTGCTCTATCTGTAGTCAGACACTTCTTAATATCTGTTTGCAGGAA 2997

 52647062 GAC 52647064
          |||
     2998 GAC 3000

EXCISED REGION

 52658003 AGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACT 52658060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 AGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACT 3058

Alignment time is 4.13412 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [52637064,52668002] =>     30939 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    5942] =>      5942 nucs 'mol-32-3159-208549_5942'

Score:        5942
Aligned:      5942        nucs
Identic:      5942 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [52652164,52658105]
 second seq =>  [       1,    5942]

 52652164 ACCATTGTGGAAGACAGTGTGGCAATTCCTCAAAGACCTAAAGATAGAAATACCATTCCA 52652223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACCATTGTGGAAGACAGTGTGGCAATTCCTCAAAGACCTAAAGATAGAAATACCATTCCA 60

 52652224 CCCAGCAATTCCATTACTGGGTACATACCCGAAAAATAGAAATCATTCTTTTATAAAGAT 52652283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCCAGCAATTCCATTACTGGGTACATACCCGAAAAATAGAAATCATTCTTTTATAAAGAT 120

 52652284 ACATGCATGTGTATGTTCATTGCAGCACTATTCACAATAGCAAAAACATGGAATCAACCT 52652343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACATGCATGTGTATGTTCATTGCAGCACTATTCACAATAGCAAAAACATGGAATCAACCT 180

 52652344 AAATACCCACCAATGATAGCCTGGATAAAGAAAATGTGGTACATATACACCATGGAATAC 52652403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAATACCCACCAATGATAGCCTGGATAAAGAAAATGTGGTACATATACACCATGGAATAC 240

 52652404 TATGCAGCCATAAAAAGAACGAGATCATGTCCTTTGCAGGAACATGAATGGAGCTGAAGG 52652463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TATGCAGCCATAAAAAGAACGAGATCATGTCCTTTGCAGGAACATGAATGGAGCTGAAGG 300

 52652464 CCATTATCCTTAGCAAAGTATTGCCGAAAAAGAAAATCAAATACTACATGTTCTCACTTA 52652523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCATTATCCTTAGCAAAGTATTGCCGAAAAAGAAAATCAAATACTACATGTTCTCACTTA 360

 52652524 TAAATGGGAGCTAAATGATGAGAACACATGGCCACACAGGGGGAACAACACACACTGGGG 52652583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TAAATGGGAGCTAAATGATGAGAACACATGGCCACACAGGGGGAACAACACACACTGGGG 420

 52652584 CCTATTGGAGGGTGGAAGGTGGGAGGAGGGAGAGGATCAGGAAAAATAATTAATAGATAT 52652643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCTATTGGAGGGTGGAAGGTGGGAGGAGGGAGAGGATCAGGAAAAATAATTAATAGATAT 480

 52652644 TATTTCATCACCCAGGTATTAATAATACCTATTTCATCACCCAGGCTTGATACCTGGGTG 52652703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TATTTCATCACCCAGGTATTAATAATACCTATTTCATCACCCAGGCTTGATACCTGGGTG 540

 52652704 ACAACAAACCCCCATGACACAAATTTACCTATATAACAAACCTGCCCGTGTACCCCTGAA 52652763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACAACAAACCCCCATGACACAAATTTACCTATATAACAAACCTGCCCGTGTACCCCTGAA 600

 52652764 CTTAAAATAAAAGTTAAAAAAATGCAAAAAGATGACATACCAAAGAGATGTTACTTTTCA 52652823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTTAAAATAAAAGTTAAAAAAATGCAAAAAGATGACATACCAAAGAGATGTTACTTTTCA 660

 52652824 TTTTTAAAAAAGTCAAAGAATTTAAGGAAAATTAAAAAGAAATCAAGAATGACAGTAGCA 52652883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTTTTAAAAAAGTCAAAGAATTTAAGGAAAATTAAAAAGAAATCAAGAATGACAGTAGCA 720

 52652884 GCTCCAAAATATTTAGAAGGTAGAGTTGAAAATTTTGATTTTCTTAGTGCAGAAAAATAT 52652943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GCTCCAAAATATTTAGAAGGTAGAGTTGAAAATTTTGATTTTCTTAGTGCAGAAAAATAT 780

 52652944 TTTGTGCTGCATGTTTTTTTAAAGAAAGTCATTTTATCTGTATATGTGATTAAAACCTTA 52653003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTTGTGCTGCATGTTTTTTTAAAGAAAGTCATTTTATCTGTATATGTGATTAAAACCTTA 840

 52653004 TTTCCAGTGCCATCTTCGTGTAATTGTTAAGAACTTGGATTGTGGATCACAGGAACCTGG 52653063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTTCCAGTGCCATCTTCGTGTAATTGTTAAGAACTTGGATTGTGGATCACAGGAACCTGG 900

 52653064 CTTTGACTCTTAACTGCTCACTCTTTAAATGGATAACCCGGGTAAGTTATTTCCTGTCTC 52653123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTTTGACTCTTAACTGCTCACTCTTTAAATGGATAACCCGGGTAAGTTATTTCCTGTCTC 960

 52653124 TGTGCCTCAGTTTTCTTACAAATTGGCATGAAAATAACAGTGCCTCCTTCAGAGGGTAAT 52653183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGTGCCTCAGTTTTCTTACAAATTGGCATGAAAATAACAGTGCCTCCTTCAGAGGGTAAT 1020

 52653184 TCTGAGGATTAAATGAAATATTGCCCATACAGTGCTTACCACAGGCTGGTAGATGATTGG 52653243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TCTGAGGATTAAATGAAATATTGCCCATACAGTGCTTACCACAGGCTGGTAGATGATTGG 1080

 52653244 TATTCGGTAAACAGTAGTTATTTTTGTTATACTAATATGTTATTAATATAATTACCATTT 52653303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TATTCGGTAAACAGTAGTTATTTTTGTTATACTAATATGTTATTAATATAATTACCATTT 1140

 52653304 TGTATTTTTAAATGTAAGCCATAAGGAAAGGAATTATTCCAATAGTTTAATTTACAAACT 52653363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGTATTTTTAAATGTAAGCCATAAGGAAAGGAATTATTCCAATAGTTTAATTTACAAACT 1200

 52653364 TGAGTTTTCTAGAAAGACTTTTAAAAACAGTAGTGATATAAATCAATTTATCTTAAGAAA 52653423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TGAGTTTTCTAGAAAGACTTTTAAAAACAGTAGTGATATAAATCAATTTATCTTAAGAAA 1260

 52653424 CATAAGTATCTGGGCCAGGCAAGTTTCAGAAATGTTTATCATTTTCAAAGTACCAAATAT 52653483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CATAAGTATCTGGGCCAGGCAAGTTTCAGAAATGTTTATCATTTTCAAAGTACCAAATAT 1320

 52653484 TCTCGTCAAAACAAGCTGCTTCATCAGAGTTCTAATTATATATTTAAACATACATGCACA 52653543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TCTCGTCAAAACAAGCTGCTTCATCAGAGTTCTAATTATATATTTAAACATACATGCACA 1380

 52653544 CACACACGTTTGTATTACAATATTCAAAACTTCTGAGGAAGAATTATCTTTTTTTTTTCA 52653603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CACACACGTTTGTATTACAATATTCAAAACTTCTGAGGAAGAATTATCTTTTTTTTTTCA 1440

 52653604 TGTGCCAAAGCTAAAACTTTCACTTGCTACAGCTGTGTATTAGTCTATTTCCATACTGCT 52653663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TGTGCCAAAGCTAAAACTTTCACTTGCTACAGCTGTGTATTAGTCTATTTCCATACTGCT 1500

 52653664 ATAAAGAGCTGCCCAAGACTGGGTGATTTATAAAGGAAAGAGGTTTAATTGACTCACAGT 52653723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATAAAGAGCTGCCCAAGACTGGGTGATTTATAAAGGAAAGAGGTTTAATTGACTCACAGT 1560

 52653724 TCAGCATGGCAGGGAAGGCCTCAGGAAACTTACAATCATGGTGGAAGTCAAAGGGGGAGC 52653783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TCAGCATGGCAGGGAAGGCCTCAGGAAACTTACAATCATGGTGGAAGTCAAAGGGGGAGC 1620

 52653784 AAGGACCTTTCTTCACAAGGCAGCAGAAAGAAGTGCCAAATGAACAGGGAAGAGCTCCTT 52653843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AAGGACCTTTCTTCACAAGGCAGCAGAAAGAAGTGCCAAATGAACAGGGAAGAGCTCCTT 1680

 52653844 ATGAAACCATCAGGTCTTGTGAGAACTCACTTACTTTTATGAGAACAGCATGGAGGAAAC 52653903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ATGAAACCATCAGGTCTTGTGAGAACTCACTTACTTTTATGAGAACAGCATGGAGGAAAC 1740

 52653904 TGTCCCCATGATCCAATCACCTCCACCTGGTCTCTCCCTTGACACGTGGGGATTATGGGG 52653963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGTCCCCATGATCCAATCACCTCCACCTGGTCTCTCCCTTGACACGTGGGGATTATGGGG 1800

 52653964 ATTAAATTCCAGATGAGATTTGGGTGGGGACAAAAAGCCTAACGACATCAAGCTGTAAAA 52654023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ATTAAATTCCAGATGAGATTTGGGTGGGGACAAAAAGCCTAACGACATCAAGCTGTAAAA 1860

 52654024 ACAATAGCTAACATTCATTGACTGTTTCCCAGCATTAGGATAAATGTGTGTAACAAGAGG 52654083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ACAATAGCTAACATTCATTGACTGTTTCCCAGCATTAGGATAAATGTGTGTAACAAGAGG 1920

 52654084 CATTTTATTTATGTATGACATTTGTTTATTTATTATTTATTTATTTGGATAAATGTCTAT 52654143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CATTTTATTTATGTATGACATTTGTTTATTTATTATTTATTTATTTGGATAAATGTCTAT 1980

 52654144 AACAAGAAACATTTTATTTAAGTATAACAGCAAATCTACAAGTTAGGTACTATCATCACT 52654203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AACAAGAAACATTTTATTTAAGTATAACAGCAAATCTACAAGTTAGGTACTATCATCACT 2040

 52654204 CCCATTTTACAGGTCGTGAAACTGAGGCTCTGAAAAGTCAAGTCAGTTTTCTAATGTTGT 52654263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CCCATTTTACAGGTCGTGAAACTGAGGCTCTGAAAAGTCAAGTCAGTTTTCTAATGTTGT 2100

 52654264 CCAGCTAATGACTGGTAGATTTAGTATTTGAACCCACATTTGCCTGATTCCAAAGTTCAA 52654323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CCAGCTAATGACTGGTAGATTTAGTATTTGAACCCACATTTGCCTGATTCCAAAGTTCAA 2160

 52654324 ACTCCCAACAACATGTGGTAACCAAAGCAGGAACAGAAGAGAAAGAAGAAATAGAAGGGA 52654383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ACTCCCAACAACATGTGGTAACCAAAGCAGGAACAGAAGAGAAAGAAGAAATAGAAGGGA 2220

 52654384 GGGAAGATGAACAAAGTAGACAAAGTTTAGTTAATAGAATTAGTGGATACCCAAGAAAAA 52654443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GGGAAGATGAACAAAGTAGACAAAGTTTAGTTAATAGAATTAGTGGATACCCAAGAAAAA 2280

 52654444 ACTATGTACAAGAGGGGGAAAAAAACCCTGTTTTCTCACATCTGGGAAACATTGATATCT 52654503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 ACTATGTACAAGAGGGGGAAAAAAACCCTGTTTTCTCACATCTGGGAAACATTGATATCT 2340

 52654504 ATATATTTTTGGTTTTAAATAAAAATTAGGTTATGTCATTCATTTGCATAAAACCATCCA 52654563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 ATATATTTTTGGTTTTAAATAAAAATTAGGTTATGTCATTCATTTGCATAAAACCATCCA 2400

 52654564 AAGAAGGGCCTCACAAAATTAAAACAAAATCCAAACTCTCTACTATGGGCCACACCCTCC 52654623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AAGAAGGGCCTCACAAAATTAAAACAAAATCCAAACTCTCTACTATGGGCCACACCCTCC 2460

 52654624 AGAACTTCAGCTCGTACTATGTTTTTCCTCACACCTCTCAACATACCAACATGTTTCCAC 52654683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AGAACTTCAGCTCGTACTATGTTTTTCCTCACACCTCTCAACATACCAACATGTTTCCAC 2520

 52654684 CTGCAGCCCTCACCACTAGTTATTCTTTCAATCTGGAAATATTTTCGCTAAGATCTTCCT 52654743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CTGCAGCCCTCACCACTAGTTATTCTTTCAATCTGGAAATATTTTCGCTAAGATCTTCCT 2580

 52654744 ATGGTTACCTTCTTATCATTCAAGACTTAGGTTATGTCAGGCCTTCCCTGACTCCTCCAT 52654803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 ATGGTTACCTTCTTATCATTCAAGACTTAGGTTATGTCAGGCCTTCCCTGACTCCTCCAT 2640

 52654804 CTGAAGTAACCCCTCCTGCTTACTCCTGTTTATTCTCTAGACTCCACAGAGGATTCATCA 52654863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CTGAAGTAACCCCTCCTGCTTACTCCTGTTTATTCTCTAGACTCCACAGAGGATTCATCA 2700

 52654864 CTCTCTGAAATGATCCCATTAATTTCTTCTTCACTTGTTTCCTCTCCACGACCTGTAAGC 52654923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CTCTCTGAAATGATCCCATTAATTTCTTCTTCACTTGTTTCCTCTCCACGACCTGTAAGC 2760

 52654924 CCCAAGTGGACCCGGACTTGGTCTGCTCTGCTTACAGCTGGATTCCAGTTCCCATAGTGC 52654983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CCCAAGTGGACCCGGACTTGGTCTGCTCTGCTTACAGCTGGATTCCAGTTCCCATAGTGC 2820

 52654984 TAGACACTAGGATTAAGCCAGGAAACATGGGTGAAGCAGCAAGCACAGAGCTTGGGGCAC 52655043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TAGACACTAGGATTAAGCCAGGAAACATGGGTGAAGCAGCAAGCACAGAGCTTGGGGCAC 2880

 52655044 AGCCTAGCAAACACTCCACAAAGGACCATGATTGTAACTGTAGTAGGGCACACCAATGAA 52655103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 AGCCTAGCAAACACTCCACAAAGGACCATGATTGTAACTGTAGTAGGGCACACCAATGAA 2940

 52655104 CAGGTTGGGAAACTGAGTCTCTGAGAAGAGACTAATGTTGTGCTGGATGAAATTTCTTTT 52655163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CAGGTTGGGAAACTGAGTCTCTGAGAAGAGACTAATGTTGTGCTGGATGAAATTTCTTTT 3000

 52655164 TCTGACAATACATTATCCAAATCCTCCAAGCTTTCAGTTTAAAGGGGAAAGCAGGAACTA 52655223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TCTGACAATACATTATCCAAATCCTCCAAGCTTTCAGTTTAAAGGGGAAAGCAGGAACTA 3060

 52655224 TCATTATAATTTTATTTACAAAGTGTCCATGTATGAACATTATTCACCGCCGAATCATCT 52655283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TCATTATAATTTTATTTACAAAGTGTCCATGTATGAACATTATTCACCGCCGAATCATCT 3120

 52655284 CTTCCTATGCAAGCAACACCGTCCTATGCATCAATATCCTGATCTGTCAGGATTCAGGAT 52655343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 CTTCCTATGCAAGCAACACCGTCCTATGCATCAATATCCTGATCTGTCAGGATTCAGGAT 3180

 52655344 AAAGTGGACATATACACACTAATTGCAAAGGGAAATTGTACATCTTGCAAAAGATGCAGG 52655403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 AAAGTGGACATATACACACTAATTGCAAAGGGAAATTGTACATCTTGCAAAAGATGCAGG 3240

 52655404 GGTTTATAGAGTCTTGTAACATTGGTGAGCTGCTCAGATCACACACATGACCGTGGTTGG 52655463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 GGTTTATAGAGTCTTGTAACATTGGTGAGCTGCTCAGATCACACACATGACCGTGGTTGG 3300

 52655464 ACAAGGATCTGGCAAAGTTAACACAGATCACCGAAGAAGGAAAAGTGGACAACACAACAC 52655523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 ACAAGGATCTGGCAAAGTTAACACAGATCACCGAAGAAGGAAAAGTGGACAACACAACAC 3360

 52655524 AGTAAGTTCTTCAAAAGAGTTATATTAGAATATCAAAAGATTATGTTAGGCCTTTGGGAA 52655583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 AGTAAGTTCTTCAAAAGAGTTATATTAGAATATCAAAAGATTATGTTAGGCCTTTGGGAA 3420

 52655584 AACTCAAAACTTTATGAAGACCTCAAAAAATTATGCAAAAATGACCCTTCAATGGTCATG 52655643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 AACTCAAAACTTTATGAAGACCTCAAAAAATTATGCAAAAATGACCCTTCAATGGTCATG 3480

 52655644 CTGCAAGAGTCAAATGACACTTCAAACAACTGCGGCTTTCTATGTTGTGCAAATGCATTT 52655703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 CTGCAAGAGTCAAATGACACTTCAAACAACTGCGGCTTTCTATGTTGTGCAAATGCATTT 3540

 52655704 GTTGTTTTAAAGGTCGTAAAGTCAGGGTACACGTGGCAGATACTTATGACTTGGAGGAAG 52655763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 GTTGTTTTAAAGGTCGTAAAGTCAGGGTACACGTGGCAGATACTTATGACTTGGAGGAAG 3600

 52655764 ACGTTAGATTAGATTTGAAACTTTCACTGAATGATCGCATTTCATGCTTTTCATCTGTAC 52655823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 ACGTTAGATTAGATTTGAAACTTTCACTGAATGATCGCATTTCATGCTTTTCATCTGTAC 3660

 52655824 ATTAAAAAGCCAGAATGTCTTTGCCAAGAAATTCTAGCATAAATAAAAGAAAAGGATGGG 52655883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 ATTAAAAAGCCAGAATGTCTTTGCCAAGAAATTCTAGCATAAATAAAAGAAAAGGATGGG 3720

 52655884 ATTTTGGAACATCATGGTAGAATTCTTGACTATCAGCTTTATACAACATGTCTGGACATT 52655943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 ATTTTGGAACATCATGGTAGAATTCTTGACTATCAGCTTTATACAACATGTCTGGACATT 3780

 52655944 TAGTGATGGAAATGCTGGATTCCAAAGGAATGTAGGCAAAGGTACTACTACCCCCATGCT 52656003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 TAGTGATGGAAATGCTGGATTCCAAAGGAATGTAGGCAAAGGTACTACTACCCCCATGCT 3840

 52656004 CTTCAGAAAACATCCTCTAAAAGCAACAGTGATGATCAGATACTGTGGGGCAAGACTGAC 52656063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 CTTCAGAAAACATCCTCTAAAAGCAACAGTGATGATCAGATACTGTGGGGCAAGACTGAC 3900

 52656064 AGTGACACTCAAGATTTCCACTCTTCTCTTTAATCATATATTTCCTGTCATTCATGTGCT 52656123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 AGTGACACTCAAGATTTCCACTCTTCTCTTTAATCATATATTTCCTGTCATTCATGTGCT 3960

 52656124 ACAAAACTCTGGAATATGCAAAGCTCATTCAAATGCAAAACCAGCCTTTGCTCCAACATG 52656183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 ACAAAACTCTGGAATATGCAAAGCTCATTCAAATGCAAAACCAGCCTTTGCTCCAACATG 4020

 52656184 AGCATATATTTTCATTTAAAGACAAATCAGATGTTTCATTTGATTTTTTTTATAAATCTG 52656243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 AGCATATATTTTCATTTAAAGACAAATCAGATGTTTCATTTGATTTTTTTTATAAATCTG 4080

 52656244 ATAATAATGTACATTTAACCCGTGTTTACAACCAAAATAATTAATCTCTCTGAACCCTTT 52656303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 ATAATAATGTACATTTAACCCGTGTTTACAACCAAAATAATTAATCTCTCTGAACCCTTT 4140

 52656304 GTTTTTCCTGTCTCTATCCTCCACCCTCATTGCCAGATAAATAACATCTGCAACCTGATG 52656363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 GTTTTTCCTGTCTCTATCCTCCACCCTCATTGCCAGATAAATAACATCTGCAACCTGATG 4200

 52656364 TGGCATATTGAACTTTGTTTATACTCACACAAACACGTATAAGCATCCCAGATACACATA 52656423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 TGGCATATTGAACTTTGTTTATACTCACACAAACACGTATAAGCATCCCAGATACACATA 4260

 52656424 TACAGGGACTGTATCTGTCCTTGTTGTTTTTATAGAAATTGGATCACATTAGACATATTT 52656483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 TACAGGGACTGTATCTGTCCTTGTTGTTTTTATAGAAATTGGATCACATTAGACATATTT 4320

 52656484 TCTGATGACTTTTGTACATTATAGTTGGTCTTCACAGTCAATAGCTCCAAAGCTATCTTA 52656543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 TCTGATGACTTTTGTACATTATAGTTGGTCTTCACAGTCAATAGCTCCAAAGCTATCTTA 4380

 52656544 TCTTCTAAAATAGCTGCATAATATTCCTCAGTATGGATATACCAAAAGATATTTAAACCA 52656603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 TCTTCTAAAATAGCTGCATAATATTCCTCAGTATGGATATACCAAAAGATATTTAAACCA 4440

 52656604 TTGCCTAATCAATGAATATCCTGGTAGTTTCCACATTGTTTTTTCCATTTCCACTATAGT 52656663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 TTGCCTAATCAATGAATATCCTGGTAGTTTCCACATTGTTTTTTCCATTTCCACTATAGT 4500

 52656664 GGAATAAACTTTCGTGTTCAAAAATCCTAAACTGGTGCTATATTTCTATAGAATAGAGGC 52656723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 GGAATAAACTTTCGTGTTCAAAAATCCTAAACTGGTGCTATATTTCTATAGAATAGAGGC 4560

 52656724 ACAGATGTAGAAGTGTTACCCTCAAATCAATATGCATTTAGTTTTGAAAAACAGACACTG 52656783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 ACAGATGTAGAAGTGTTACCCTCAAATCAATATGCATTTAGTTTTGAAAAACAGACACTG 4620

 52656784 CCATATTATTTTCTTAAAAAGGCTCTACAGATTCACATTTCCAGCAGCAATGAGTGTCTC 52656843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 CCATATTATTTTCTTAAAAAGGCTCTACAGATTCACATTTCCAGCAGCAATGAGTGTCTC 4680

 52656844 AAGCACCTTTTAAGTGGTAAGCAGCTTACCAGGGGAGGTGGCCTATTATTCTATCAGTGG 52656903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 AAGCACCTTTTAAGTGGTAAGCAGCTTACCAGGGGAGGTGGCCTATTATTCTATCAGTGG 4740

 52656904 CTTCAGTTGTTAGGACACCACGGGTCAGCTGTGGAGATACGGTTGTGGGGCAGGTTGAGT 52656963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 CTTCAGTTGTTAGGACACCACGGGTCAGCTGTGGAGATACGGTTGTGGGGCAGGTTGAGT 4800

 52656964 TCAGGACACATAGAAGATTGCCAAAGGGTGACTATTATTACTTTGAGACTCTGGAAAAAT 52657023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 TCAGGACACATAGAAGATTGCCAAAGGGTGACTATTATTACTTTGAGACTCTGGAAAAAT 4860

 52657024 TAGCCAGGAAACAGAGACAAGAGGCTCAGGGTGCAGCAAAGCAGCCAAATCAGGATGATA 52657083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 TAGCCAGGAAACAGAGACAAGAGGCTCAGGGTGCAGCAAAGCAGCCAAATCAGGATGATA 4920

 52657084 GTGTTTTCTTTGGAGCAGATATACTAATGGCCAAGGAACTCATAAAAAGATGCCTAATGT 52657143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 GTGTTTTCTTTGGAGCAGATATACTAATGGCCAAGGAACTCATAAAAAGATGCCTAATGT 4980

 52657144 CATCTCATTAGGGAAGTGCAGTCAAAGCCACAGCATGATACGTCTTCACACCCACGAGGA 52657203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 CATCTCATTAGGGAAGTGCAGTCAAAGCCACAGCATGATACGTCTTCACACCCACGAGGA 5040

 52657204 TGGCCATAATCAGAGAGACAATAACCAGTGGTAGGGAAGATGTGAAAAAATCGGAATGCT 52657263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 TGGCCATAATCAGAGAGACAATAACCAGTGGTAGGGAAGATGTGAAAAAATCGGAATGCT 5100

 52657264 CATGCATTGCTGGTAGGAATGTGACATGGTGCAGCTGCTTTGGAAAGCAGTTTAACAGTT 52657323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 CATGCATTGCTGGTAGGAATGTGACATGGTGCAGCTGCTTTGGAAAGCAGTTTAACAGTT 5160

 52657324 CCTGGAAAAGTTAAACATGGAGTTACCCTAAGACCCAGCAATTCCATTCCTAGGTAAGCA 52657383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 CCTGGAAAAGTTAAACATGGAGTTACCCTAAGACCCAGCAATTCCATTCCTAGGTAAGCA 5220

 52657384 AGAAAATGAAAACATATGGCCACACAAAAACTTGTACACAAATGTCCATAGCAGCATTTT 52657443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 AGAAAATGAAAACATATGGCCACACAAAAACTTGTACACAAATGTCCATAGCAGCATTTT 5280

 52657444 CATAATAGCTGAAAAGTGGAAACAACCCAAATATCCATCAATTGGAAAAAGGAAATCTAG 52657503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 CATAATAGCTGAAAAGTGGAAACAACCCAAATATCCATCAATTGGAAAAAGGAAATCTAG 5340

 52657504 CATTTGCATATAATAGAGTATTAATCAGCCATAAGAAGAAACAAAGCACCGATCCATGTT 52657563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 CATTTGCATATAATAGAGTATTAATCAGCCATAAGAAGAAACAAAGCACCGATCCATGTT 5400

 52657564 ATATCATGCTTTATACTTGGAAGCATGGTACTAAGTGAAAGACGCCAGACACAAAAAGCA 52657623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 ATATCATGCTTTATACTTGGAAGCATGGTACTAAGTGAAAGACGCCAGACACAAAAAGCA 5460

 52657624 AAATATTGTATGATTCCATTTATATAAAGTGTCTAGAATAGGCAAATCCATAGAGGCAGA 52657683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 AAATATTGTATGATTCCATTTATATAAAGTGTCTAGAATAGGCAAATCCATAGAGGCAGA 5520

 52657684 AAACAGATTAGTGGTTGCCAGTGGCTGGGAATAGGGAAAAAACTCAGCGCTAAAGGGTAG 52657743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 AAACAGATTAGTGGTTGCCAGTGGCTGGGAATAGGGAAAAAACTCAGCGCTAAAGGGTAG 5580

 52657744 GGAGTTTTGTTTTGGAGTAATGACGATGTTCTGGAATTAGACGTGGAACGATTGCACACA 52657803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 GGAGTTTTGTTTTGGAGTAATGACGATGTTCTGGAATTAGACGTGGAACGATTGCACACA 5640

 52657804 TGGTGCAAATATCCTTAAAATCACGGAATTGTCACTCTAAAAGGTGAATTTTATGGTAGG 52657863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 TGGTGCAAATATCCTTAAAATCACGGAATTGTCACTCTAAAAGGTGAATTTTATGGTAGG 5700

 52657864 TGAATTGTACCTCAATTTGTAAAAAGAAGAATTAGATAAATAAACAGCAACACAGCACCA 52657923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5701 TGAATTGTACCTCAATTTGTAAAAAGAAGAATTAGATAAATAAACAGCAACACAGCACCA 5760

 52657924 AGGGGTGGGGGTAGGAAACAGACAACAAATAGGAGTGAAGAGTTCACAGGAAAAGACATG 52657983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5761 AGGGGTGGGGGTAGGAAACAGACAACAAATAGGAGTGAAGAGTTCACAGGAAAAGACATG 5820

 52657984 CAGCCAGCTTTTAAGCAGAAGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAAGCAC 52658043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5821 CAGCCAGCTTTTAAGCAGAAGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAAGCAC 5880

 52658044 AATAAAATTATGACACTTGGCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAATTGATG 52658103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5881 AATAAAATTATGACACTTGGCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAATTGATG 5940

 52658104 AC 52658105
          ||
     5941 AC 5942

Alignment time is 6.35642 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [52637064,52668002] =>     30939 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    4465] =>      4465 nucs 'mol-32-3164-257806_4465'

Score:        4337
Aligned:      4468        nucs
Identic:      4452 (100%) nucs =>      4256 (100%)       196 (100%)
Gaps:            7 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [52642797,52647064] EXCISED REGION [52658003,52658198]
 second seq =>  [       1,    4269] EXCISED REGION [    4270,    4465]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>     10938 nucs [52647065,52658002]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         6 nucs [52647065,52647070] to [52658003,52658008]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [52647065,52647067] to [52658000,52658002]
 second seq =>         0 nucs

 52642797 AGCTCCCATTTTCTGACTCAAATCTCATTTTGGAACACATTCCACTCAAATTGAGGTTCT 52642856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGCTCCCATTTTCTGACTCAAATCTCATTTTGGAACACATTCCACTCAAATTGAGGTTCT 60

 52642857 ACCCCTAAGAGTTCTTTTTCAATAAAGAAAGCTGAGTTAATAAATCACAACTCCAAAACT 52642916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACCCCTAAGAGTTCTTTTTCAATAAAGAAAGCTGAGTTAATAAATCACAACTCCAAAACT 120

 52642917 TTTCCTCACTTTTCTTAGACTAGAAATAGATTGAGTGTGTCGAGGTTTTATGGCTGAGTA 52642976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
      121 TTTCCTCACTTTTCTTAGACTAGAAATAGATTGAATGTGTCGAGGTTTTATGGCTGAGTA 180

 52642977 CATTGGAGGGCTGGCTATTCTATGCTGAACTGGTTTACTTGATTAAGATGGGGATTTGGA 52643036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CATTGGAGGGCTGGCTATTCTATGCTGAACTGGTTTACTTGATTAAGATGGGGATTTGGA 240

 52643037 TGAGTCACCGGACACCTGTCCAAAGATGAGTAAAACACATTCCTTCATTGTCTTCCCATA 52643096
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGAGTCACTGGACACCTGTCCAAAGATGAGTAAAACACATTCCTTCATTGTCTTCCCATA 300

 52643097 AATAACTCAATCTTCTCCTAACTGAGCCAATGGATAGGCTTTGGATGCCCAAGCAAAACA 52643156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
      301 AATAACTCAATCTTCTCCTAACTGAGCCAATGGATAGGCTTTGGATGCCCAAGCAAAAGA 360

 52643157 AACACATGACTGTTAAAAAATCACAACCTCAAAATGGCCTTAGAAGCCTATGACCAATAA 52643216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AACACATGACTGTTAAAAAATCACAACCTCAAAATGGCCTTAGAAGCCTATGACCAATAA 420

 52643217 TGAGAATGGTTTCTCCACTCAGGCGCAAGTAGTAAACAGTTTCTCCCATATGCAGGAATA 52643276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGAGAATGGTTTCTCCACTCAGGCGCAAGTAGTAAACAGTTTCTCCCATATGCAGGAATA 480

 52643277 TTGACGACTAGTTTACCGCCTCTGGGCACGTAACTTTCAGGTCCTGGTTCATGCATTTGC 52643336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTGACGACTAGTTTACCGCCTCTGGGCACGTAACTTTCAGGTCCTGGTTCATGCATTTGC 540

 52643337 TGGAATGTTCCCTGGGCCATGGAGCCCAGTTCTCCTGGCATCTGGCATCTCCCCCACACT 52643396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGGAATGTTCCCTGGGCCATGGAGCCCAGTTCTCCTGGCATCTGGCATCTCCCCCACACT 600

 52643397 CTGCTCCCCCAGCACAGCACTTGGCATCTTGCATTGCAATTGCAGGTTTATTTATTCACT 52643456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTGCTCCCCCAGCACAGCACTTGGCATCTTGCATTGCAATTGCAGGTTTATTTATTCACT 660

 52643457 TCTCTCACTGGACAGCAAACTCCACCAGGGCCGAGACTCTGTGTCTCGCCCTTCACTGTG 52643516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCTCTCACTGGACAGCAAACTCCACCAGGGCCGAGACTCTGTGTCTCGCCCTTCACTGTG 720

 52643517 GTCCCTGTGCCTCACCTGTTCCTAGTACAGTGTCACACTCAGTAAAGAGCAGATGCCTGG 52643576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GTCCCTGTGCCTCACCTGTTCCTAGTACAGTGTCACACTCAGTAAAGAGCAGATGCCTGG 780

 52643577 -TGCATTTGGAGACTTATTTTAAATTATACGGAAAGTTATTCAACCGGCTTCTTGAACTG 52643635
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATGCATTTGGAGACTTATTTTAAATTATACGGAAAGTTATTCAACCGGCTTCTTGAACTG 840

 52643636 GTGAATTTTGGAAAGTGGGTGTTTGAAGGGAAAATGTTTAAACTCTGAAAGAAATGTTGG 52643695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GTGAATTTTGGAAAGTGGGTGTTTGAAGGGAAAATGTTTAAACTCTGAAAGAAATGTTGG 900

 52643696 AAATAAGCTCTTTGAATCAAAATGTATAGAAAACACAAGAATGCTGACAGTAAGAGCCTA 52643755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AAATAAGCTCTTTGAATCAAAATGTATAGAAAACACAAGAATGCTGACAGTAAGAGCCTA 960

 52643756 AAACACATGATGACTATTATCTTTTCCCAATTTTAACTCTCCAGAGTGTTCAGCGGTGCC 52643815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AAACACATGATGACTATTATCTTTTCCCAATTTTAACTCTCCAGAGTGTTCAGCGGTGCC 1020

 52643816 CAGCCTTCATAATGTAATTCTTCGTAGCACCCTGGATGCATTAAAACCATAGATTAACGT 52643875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CAGCCTTCATAATGTAATTCTTCGTAGCACCCTGGATGCATTAAAACCATAGATTAACGT 1080

 52643876 GATACTTATTTTCATTAAGGAAAATAATTTACGTACAGTGCTCAGAGTAGAGCCTGGCAC 52643935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GATACTTATTTTCATTAAGGAAAATAATTTACGTACAGTGCTCAGAGTAGAGCCTGGCAC 1140

 52643936 ATTGAACATTTTCAATAAATGACAGCAAGTGTAATTATTAGCACTTCGGAAGTGCAAAGT 52643995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     1141 ATTGAACATTTTCAATAAATGACAGCAAGTGTAATTATTAGCACTTTGGAAGTGCAAAGT 1200

 52643996 TGCATTGTATTAAGACAAATATATTTGGAGCTCATCCAATTTTTTCCTGGCTCTGAAGTC 52644055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TGCATTGTATTAAGACAAATATATTTGGAGCTCATCCAATTTTTTCCTGGCTCTGAAGTC 1260

 52644056 TGCTAGTGGCACTTAACTTTATTCCCAAGTTTTGAAAAATATTGTTATTTAAAAAGTCTG 52644115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGCTAGTGGCACTTAACTTTATTCCCAAGTTTTGAAAAATATTGTTATTTAAAAAGTCTG 1320

 52644116 TTAACCAAGGAAATGCATGCCCTAAACCTATAATGTATCAAGTTTTACTTCCTTCTTCTT 52644175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTAACCAAGGAAATGCATGCCCTAAACCTATAATGTATCAAGTTTTACTTCCTTCTTCTT 1380

 52644176 TTAAGGAGTTCTTTTCCTGCCTTGAATACAAACAGGCTCTCTCAAGGTTAAAAGCAAATG 52644235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTAAGGAGTTCTTTTCCTGCCTTGAATACAAACAGGCTCTCTCAAGGTTAAAAGCAAATG 1440

 52644236 CTCTTTTTAGTGTCAAAAAGAGCTTGCCTTTCTTCGCTCAGGAAAAAAAGCAACTGATTC 52644295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTCTTTTTAGTGTCAAAAAGAGCTTGCCTTTCTTCGCTCAGGAAAAAAAGCAACTGATTC 1500

 52644296 CAGGATACCTTCTTTGAAAACCAACACAAAAAAACCCCCCAAAAAACAAAAAAAAAACCC 52644355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CAGGATACCTTCTTTGAAAACCAACACAAAAAAACCCCCCAAAAAACAAAAAAAAAACCC 1560

 52644356 AAAACCCCTAGTTTTTACAAAGGTTTATTACTCCTACTTGTTGGAAAAGAATTACTACAT 52644415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AAAACCCCTAGTTTTTACAAAGGTTTATTACTCCTACTTGTTGGAAAAGAATTACTACAT 1620

 52644416 AAAAGAGTCTGCCCAGAGCTGTAAAATCTCCTTATTCAAACACACACCTTAGAGCAAAAG 52644475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AAAAGAGTCTGCCCAGAGCTGTAAAATCTCCTTATTCAAACACACACCTTAGAGCAAAAG 1680

 52644476 ATGGTTAAATATCAATTCAGGCTATTAACAGTAAGGGAC---GAAATGTGTTCCAACAAA 52644532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||
     1681 ATGGTTAAATATCAATTCAGGCTATTAACAGTAAGG---AATGAAATGTGTTCCAACAAA 1737

 52644533 ACTCTGCATGTCAACAAACTACAGAGACTAGGTAACATCTTTTAGGAATCATTTTTATTC 52644592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1738 ACTCTGCATGTCAACAAACTACAGAGACTAGGTAACATCTTTTAGGAATCATTTTTATTC 1797

 52644593 CACTAATGCCTTTTCCTCCAGAATCCACTGATCGTAAACGCAACCTGTCTACTTCCGCCT 52644652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1798 CACTAATGCCTTTTCCTCCAGAATCCACTGATCGTAAACGCAACCTGTCTACTTCCGCCT 1857

 52644653 TTGAAAAATGGATGGACAAATTCATCTGCATGTAACTCACCTCCTCTTTTCTTTTACATA 52644712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1858 TTGAAAAATGGATGGACAAATTCATCTGCATGTAACTCACCTCCTCTTTTCTTTTACATA 1917

 52644713 AAACAGATGCCACAGCTGTTATTGTTCTTCACACAGAAGTTTCTACCCAGAGAAACATCA 52644772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1918 AAACAGATGCCACAGCTGTTATTGTTCTTCACACAGAAGTTTCTACCCAGAGAAACATCA 1977

 52644773 GGATGACACTCTGCTGCAATGTGCTATTTGTTCTAGAGGGGTCAACAGCTTGCCACCTTG 52644832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1978 GGATGACACTCTGCTGCAATGTGCTATTTGTTCTAGAGGGGTCAACAGCTTGCCACCTTG 2037

 52644833 CCTAGGCCCAGGGTGACTGCATATGTGCAGTGGTCTTATCCCATTAGCGCCCCCGAGCAT 52644892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2038 CCTAGGCCCAGGGTGACTGCATATGTGCAGTGGTCTTATCCCATTAGCGCCCCCGAGCAT 2097

 52644893 GCATTCAGAACCAAGTGGATACACCTTGGCACACTTACCTTCCCTGCAGGGACATCATCG 52644952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2098 GCATTCAGAACCAAGTGGATACACCTTGGCACACTTACCTTCCCTGCAGGGACATCATCG 2157

 52644953 GACTGCCCTGATAAGCCAGGAACCTCATCCACCTTGTCTTGATGCTCTGCCCTCTTGGCT 52645012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2158 GACTGCCCTGATAAGCCAGGAACCTCATCCACCTTGTCTTGATGCTCTGCCCTCTTGGCT 2217

 52645013 TCCTGTTGGCTGTCACCTGGCACCTTTTCCTGTCCCTTGTCCAGCTTGAAGAATTTGTCA 52645072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2218 TCCTGTTGGCTGTCACCTGGCACCTTTTCCTGTCCCTTGTCCAGCTTGAAGAATTTGTCA 2277

 52645073 AAAAAGCTGGAGTCCTTGGGCTTGGAGGGAGCTTCTCCTCCTGCTCCCCCTGTCTCAGGT 52645132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2278 AAAAAGCTGGAGTCCTTGGGCTTGGAGGGAGCTTCTCCTCCTGCTCCCCCTGTCTCAGGT 2337

 52645133 GGGAGAAGCGTGGGATCCCTGGCGGCAGAGAGGACCTTGTCTTGGGCCGGGGCGTGCCCT 52645192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2338 GGGAGAAGCGTGGGATCCCTGGCGGCAGAGAGGACCTTGTCTTGGGCCGGGGCGTGCCCT 2397

 52645193 GGGGTTTTATCTGTGTCCTGCCCCGGTCCAGCTGCCACCGGAAGTGTCCAGCTCTCACTT 52645252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2398 GGGGTTTTATCTGTGTCCTGCCCCGGTCCAGCTGCCACCGGAAGTGTCCAGCTCTCACTT 2457

 52645253 GGGTCTTTGTTCGCTGGAGCTTTATTGGAGCTGACATCAAGCTTCACTGATCCAAGGGAT 52645312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2458 GGGTCTTTGTTCGCTGGAGCTTTATTGGAGCTGACATCAAGCTTCACTGATCCAAGGGAT 2517

 52645313 GAATCTGCGGCTTGGTCTCCGGTACGTCCTGGTACAGGCCGAGAGAGCATCAAGAAAAAA 52645372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2518 GAATCTGCGGCTTGGTCTCCGGTACGTCCTGGTACAGGCCGAGAGAGCATCAAGAAAAAA 2577

 52645373 CGAGATTTAGCAGCTGGTGCCTCGGGTTTGGCCTCTTTCCCAAGATTCTTTCCGTTGGCA 52645432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2578 CGAGATTTAGCAGCTGGTGCCTCGGGTTTGGCCTCTTTCCCAAGATTCTTTCCGTTGGCA 2637

 52645433 TCCGCAACAGCACTTATCTCCGTTGTCTCGGGGGAAGAAGTGGCCACATTATCCGTCTTG 52645492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2638 TCCGCAACAGCACTTATCTCCGTTGTCTCGGGGGAAGAAGTGGCCACATTATCCGTCTTG 2697

 52645493 ACACTTATTCCCAAGTCGACTGTAAACACAAACATAAACAGTGGTTATTCAGCCAAGCCG 52645552
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     2698 ACACTTATTCCCAAGTCGACTGTAAACACAAACATAAACAGCGGTTATTCAGCCAAGCCG 2757

 52645553 GGAAATTCAGGCACTAATAATGGACTCCAGACATTTTTTATACAAAAGCCATACTGCATA 52645612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2758 GGAAATTCAGGCACTAATAATGGACTCCAGACATTTTTTATACAAAAGCCATACTGCATA 2817

 52645613 CTGGAACTGTGTTGTTCTCTGGTCATTCTGAAAGGCAGAAGTTAGCTCTCTACATCTCCT 52645672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2818 CTGGAACTGTGTTGTTCTCTGGTCATTCTGAAAGGCAGAAGTTAGCTCTCTACATCTCCT 2877

 52645673 TGGACCCTGCTTTTCTTGGGAGAGGAGAAGGCAAGGTTGGTGAGGAGGGAAAGCTACTTA 52645732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2878 TGGACCCTGCTTTTCTTGGGAGAGGAGAAGGCAAGGTTGGTGAGGAGGGAAAGCTACTTA 2937

 52645733 ATGGAAAGTCACTAGCTGCCAGGTGTGGAATGAGTGATATTCAATGTTAATTAATCTTCT 52645792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2938 ATGGAAAGTCACTAGCTGCCAGGTGTGGAATGAGTGATATTCAATGTTAATTAATCTTCT 2997

 52645793 TTTATCTGTGTAAGAACTCCGTGAGCAGCATATTGTCATGATGTCAACTGGGAGGCAGTA 52645852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2998 TTTATCTGTGTAAGAACTCCGTGAGCAGCATATTGTCATGATGTCAACTGGGAGGCAGTA 3057

 52645853 CAGCAGTTAGGAGCTTGGGTTCTGGAGCTAGAACAAGGTTTCTCAACCTCAGCACTACTC 52645912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3058 CAGCAGTTAGGAGCTTGGGTTCTGGAGCTAGAACAAGGTTTCTCAACCTCAGCACTACTC 3117

 52645913 ACATTTGAAGCCAGATTATTCTTTGTTAGGGAGGCTCATCCCGTGCCTCATAGGCTGATT 52645972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3118 ACATTTGAAGCCAGATTATTCTTTGTTAGGGAGGCTCATCCCGTGCCTCATAGGCTGATT 3177

 52645973 AGCAGCATCCTGGCCTCTGCCCACTAGACGCCGGTCACATTTCCCAGTCATGGCAACCAA 52646032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3178 AGCAGCATCCTGGCCTCTGCCCACTAGACGCCGGTCACATTTCCCAGTCATGGCAACCAA 3237

 52646033 AAATATCTCTAGGCATTGCTAAATGTCCCCTGGAGGACAAAATCTCTTACGTTTGAGAGG 52646092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3238 AAATATCTCTAGGCATTGCTAAATGTCCCCTGGAGGACAAAATCTCTTACGTTTGAGAGG 3297

 52646093 CACTGAGCTGAAATGTCTTTTTGAATCCAGATTATCTAATTTTCTGTGCCTCAACTTTCT 52646152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3298 CACTGAGCTGAAATGTCTTTTTGAATCCAGATTATCTAATTTTCTGTGCCTCAACTTTCT 3357

 52646153 GGTAAAAGGAGACAGATAATAAATCTCGTAATTTTGTTAGGAAGATTACATGAGTTAATA 52646212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3358 GGTAAAAGGAGACAGATAATAAATCTCGTAATTTTGTTAGGAAGATTACATGAGTTAATA 3417

 52646213 GTTTTAAAGCAAGTACAATAGCACCTGGAATATATTAAGTGCTTAATAAATATCACAAAC 52646272
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3418 GTTTTAAAGCAAGTACAATAGCGCCTGGAATATATTAAGTGCTTAATAAATATCACAAAC 3477

 52646273 ATTAGTTATCATTATTCATGAGTGAGAAAACTGACAGTCAGAGAGGTCAGTACACCCTCC 52646332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3478 ATTAGTTATCATTATTCATGAGTGAGAAAACTGACAGTCAGAGAGGTCAGTACACCCTCC 3537

 52646333 CCTGGCTGCCCAGTAAGCTAGTAAGCAGCAGAGTCTGGCTTCAGGCAGAAATCTGACTTC 52646392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3538 CCTGGCTGCCCAGTAAGCTAGTAAGCAGCAGAGTCTGGCTTCAGGCAGAAATCTGACTTC 3597

 52646393 TAAGTTCATGCGCTCTCTGTCTTACCAGGGACTTGTATTAGCATAGACTGTTAAGAATAT 52646452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3598 TAAGTTCATGCGCTCTCTGTCTTACCAGGGACTTGTATTAGCATAGACTGTTAAGAATAT 3657

 52646453 GGGAAGATTTTTAAAATACAGTACTCAGAAAATTTCTCTTTGAAAGGCTGGAAGAGCAGA 52646512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3658 GGGAAGATTTTTAAAATACAGTACTCAGAAAATTTCTCTTTGAAAGGCTGGAAGAGCAGA 3717

 52646513 TATCCACACAAGAAGGCAAATTAGACCTCAGGCCAGTGTGGAATTAAAGGTGTAGGGTTA 52646572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3718 TATCCACACAAGAAGGCAAATTAGACCTCAGGCCAGTGTGGAATTAAAGGTGTAGGGTTA 3777

 52646573 TCTGGTCAAGACTGTGTGTGTGGATACAGGCTCCAACCCCTCCAGGCAAGGGCACTGTTT 52646632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     3778 TCTGGTCAAGACTGTGTGTGTGGATACAGGCTCCAACCCCTCCAGGCAAGGGCAATGTTT 3837

 52646633 CCAACATCCACCCTTTCTCCTTTGACCTCTACCTTGACCTAAATTAACTATAAAAGGTCC 52646692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3838 CCAACATCCACCCTTTCTCCTTTGACCTCTACCTTGACCTAAATTAACTATAAAAGGTCC 3897

 52646693 TTCTTTTCTAGGACCCTACTATAAATCAGTGAAATATTCAGGAAAAAAAGAACACCAAGA 52646752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3898 TTCTTTTCTAGGACCCTACTATAAATCAGTGAAATATTCAGGAAAAAAAGAACACCAAGA 3957

 52646753 ATGTTGGGATCCCAGTTAAAGATCAAGATTCTCTACTGATAAGCTGTGTGATATGGAGTA 52646812
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     3958 ATGTTGGGATCCCAGTTAAAGATCAAGATCCTCTACTGATAAGCTGTGTGATATGGAGTA 4017

 52646813 AATCACTAAAGATCTTTGAATCTCTTCATTTGTAAAATGGGAATATTGGTAGTCCTACTG 52646872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4018 AATCACTAAAGATCTTTGAATCTCTTCATTTGTAAAATGGGAATATTGGTAGTCCTACTG 4077

 52646873 CAGGGTTGTTGTAATGCTTAAAGAAGAAAAGTCATGCAAAGGATCTGGCACAACGCCTTT 52646932
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     4078 CAGGGTTGTTGTAATGCTTAAAGAAGAAAAGTCATGCAAAGGATCTGGCACAATGCCTTT 4137

 52646933 TCCATAATAAGTGCTTAGTAATTGACAGATACTGTGATAACTTTTCAGGTTTCTCTCATG 52646992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4138 TCCATAATAAGTGCTTAGTAATTGACAGATACTGTGATAACTTTTCAGGTTTCTCTCATG 4197

 52646993 CCTTTGACAACATTGCATTTTGCTTGCTCTATCTGTAGTCAGACACTTCTTAATATCTGT 52647052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4198 CCTTTGACAACATTGCATTTTGCTTGCTCTATCTGTAGTCAGACACTTCTTAATATCTGT 4257

 52647053 TTGCAGGAAGAC 52647064
          ||||||||||||
     4258 TTGCAGGAAGAC 4269

EXCISED REGION

 52658003 AGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTG 52658062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4270 AGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTG 4329

 52658063 GCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTAT 52658122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4330 GCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTAT 4389

 52658123 AAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGG 52658182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4390 AAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGG 4449

 52658183 GAGGCCGAGGTGGGCA 52658198
          ||||||||||||||||
     4450 GAGGCCGAGGTGGGCA 4465

Alignment time is 5.6687 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [52637064,52668002] =>     30939 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    6082] =>      6082 nucs 'mol-32-316f-004632_6082'

Score:        6070
Aligned:      6081        nucs
Identic:      6080 (100%) nucs =>      3588 (100%)      2492 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [52652159,52655746] EXCISED REGION [52655748,52658240]
 second seq =>  [       1,    3588] EXCISED REGION [    3590,    6082]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [52655747,52655747]
 second seq =>         1 nucs [3589,3589]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [52655747,52655747] to [52655748,52655748]
 second seq =>         1 nucs [3588,3588] to [3589,3589]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 52652159 GTTCAACCATTGTGGAAGACAGTGTGGCAATTCCTCAAAGACCTAAAGATAGAAATACCA 52652218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTTCAACCATTGTGGAAGACAGTGTGGCAATTCCTCAAAGACCTAAAGATAGAAATACCA 60

 52652219 TTCCACCCAGCAATTCCATTACTGGGTACATACCCGAAAAATAGAAATCATTCTTTTATA 52652278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTCCACCCAGCAATTCCATTACTGGGTACATACCCGAAAAATAGAAATCATTCTTTTATA 120

 52652279 AAGATACATGCATGTGTATGTTCATTGCAGCACTATTCACAATAGCAAAAACATGGAATC 52652338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAGATACATGCATGTGTATGTTCATTGCAGCACTATTCACAATAGCAAAAACATGGAATC 180

 52652339 AACCTAAATACCCACCAATGATAGCCTGGATAAAGAAAATGTGGTACATATACACCATGG 52652398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AACCTAAATACCCACCAATGATAGCCTGGATAAAGAAAATGTGGTACATATACACCATGG 240

 52652399 AATACTATGCAGCCATAAAAAGAACGAGATCATGTCCTTTGCAGGAACATGAATGGAGCT 52652458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AATACTATGCAGCCATAAAAAGAACGAGATCATGTCCTTTGCAGGAACATGAATGGAGCT 300

 52652459 GAAGGCCATTATCCTTAGCAAAGTATTGCCGAAAAAGAAAATCAAATACTACATGTTCTC 52652518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GAAGGCCATTATCCTTAGCAAAGTATTGCCGAAAAAGAAAATCAAATACTACATGTTCTC 360

 52652519 ACTTATAAATGGGAGCTAAATGATGAGAACACATGGCCACACAGGGGGAACAACACACAC 52652578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACTTATAAATGGGAGCTAAATGATGAGAACACATGGCCACACAGGGGGAACAACACACAC 420

 52652579 TGGGGCCTATTGGAGGGTGGAAGGTGGGAGGAGGGAGAGGATCAGGAAAAATAATTAATA 52652638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGGGGCCTATTGGAGGGTGGAAGGTGGGAGGAGGGAGAGGATCAGGAAAAATAATTAATA 480

 52652639 GATATTATTTCATCACCCAGGTATTAATAATACCTATTTCATCACCCAGGCTTGATACCT 52652698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GATATTATTTCATCACCCAGGTATTAATAATACCTATTTCATCACCCAGGCTTGATACCT 540

 52652699 GGGTGACAACAAACCCCCATGACACAAATTTACCTATATAACAAACCTGCCCGTGTACCC 52652758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGGTGACAACAAACCCCCATGACACAAATTTACCTATATAACAAACCTGCCCGTGTACCC 600

 52652759 CTGAACTTAAAATAAAAGTTAAAAAAATGCAAAAAGATGACATACCAAAGAGATGTTACT 52652818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTGAACTTAAAATAAAAGTTAAAAAAATGCAAAAAGATGACATACCAAAGAGATGTTACT 660

 52652819 TTTCATTTTTAAAAAAGTCAAAGAATTTAAGGAAAATTAAAAAGAAATCAAGAATGACAG 52652878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTTCATTTTTAAAAAAGTCAAAGAATTTAAGGAAAATTAAAAAGAAATCAAGAATGACAG 720

 52652879 TAGCAGCTCCAAAATATTTAGAAGGTAGAGTTGAAAATTTTGATTTTCTTAGTGCAGAAA 52652938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TAGCAGCTCCAAAATATTTAGAAGGTAGAGTTGAAAATTTTGATTTTCTTAGTGCAGAAA 780

 52652939 AATATTTTGTGCTGCATGTTTTTTTAAAGAAAGTCATTTTATCTGTATATGTGATTAAAA 52652998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AATATTTTGTGCTGCATGTTTTTTTAAAGAAAGTCATTTTATCTGTATATGTGATTAAAA 840

 52652999 CCTTATTTCCAGTGCCATCTTCGTGTAATTGTTAAGAACTTGGATTGTGGATCACAGGAA 52653058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CCTTATTTCCAGTGCCATCTTCGTGTAATTGTTAAGAACTTGGATTGTGGATCACAGGAA 900

 52653059 CCTGGCTTTGACTCTTAACTGCTCACTCTTTAAATGGATAACCCGGGTAAGTTATTTCCT 52653118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CCTGGCTTTGACTCTTAACTGCTCACTCTTTAAATGGATAACCCGGGTAAGTTATTTCCT 960

 52653119 GTCTCTGTGCCTCAGTTTTCTTACAAATTGGCATGAAAATAACAGTGCCTCCTTCAGAGG 52653178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GTCTCTGTGCCTCAGTTTTCTTACAAATTGGCATGAAAATAACAGTGCCTCCTTCAGAGG 1020

 52653179 GTAATTCTGAGGATTAAATGAAATATTGCCCATACAGTGCTTACCACAGGCTGGTAGATG 52653238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GTAATTCTGAGGATTAAATGAAATATTGCCCATACAGTGCTTACCACAGGCTGGTAGATG 1080

 52653239 ATTGGTATTCGGTAAACAGTAGTTATTTTTGTTATACTAATATGTTATTAATATAATTAC 52653298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATTGGTATTCGGTAAACAGTAGTTATTTTTGTTATACTAATATGTTATTAATATAATTAC 1140

 52653299 CATTTTGTATTTTTAAATGTAAGCCATAAGGAAAGGAATTATTCCAATAGTTTAATTTAC 52653358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CATTTTGTATTTTTAAATGTAAGCCATAAGGAAAGGAATTATTCCAATAGTTTAATTTAC 1200

 52653359 AAACTTGAGTTTTCTAGAAAGACTTTTAAAAACAGTAGTGATATAAATCAATTTATCTTA 52653418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AAACTTGAGTTTTCTAGAAAGACTTTTAAAAACAGTAGTGATATAAATCAATTTATCTTA 1260

 52653419 AGAAACATAAGTATCTGGGCCAGGCAAGTTTCAGAAATGTTTATCATTTTCAAAGTACCA 52653478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AGAAACATAAGTATCTGGGCCAGGCAAGTTTCAGAAATGTTTATCATTTTCAAAGTACCA 1320

 52653479 AATATTCTCGTCAAAACAAGCTGCTTCATCAGAGTTCTAATTATATATTTAAACATACAT 52653538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AATATTCTCGTCAAAACAAGCTGCTTCATCAGAGTTCTAATTATATATTTAAACATACAT 1380

 52653539 GCACACACACACGTTTGTATTACAATATTCAAAACTTCTGAGGAAGAATTATCTTTTTTT 52653598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GCACACACACACGTTTGTATTACAATATTCAAAACTTCTGAGGAAGAATTATCTTTTTTT 1440

 52653599 TTTCATGTGCCAAAGCTAAAACTTTCACTTGCTACAGCTGTGTATTAGTCTATTTCCATA 52653658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTTCATGTGCCAAAGCTAAAACTTTCACTTGCTACAGCTGTGTATTAGTCTATTTCCATA 1500

 52653659 CTGCTATAAAGAGCTGCCCAAGACTGGGTGATTTATAAAGGAAAGAGGTTTAATTGACTC 52653718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CTGCTATAAAGAGCTGCCCAAGACTGGGTGATTTATAAAGGAAAGAGGTTTAATTGACTC 1560

 52653719 ACAGTTCAGCATGGCAGGGAAGGCCTCAGGAAACTTACAATCATGGTGGAAGTCAAAGGG 52653778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ACAGTTCAGCATGGCAGGGAAGGCCTCAGGAAACTTACAATCATGGTGGAAGTCAAAGGG 1620

 52653779 GGAGCAAGGACCTTTCTTCACAAGGCAGCAGAAAGAAGTGCCAAATGAACAGGGAAGAGC 52653838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GGAGCAAGGACCTTTCTTCACAAGGCAGCAGAAAGAAGTGCCAAATGAACAGGGAAGAGC 1680

 52653839 TCCTTATGAAACCATCAGGTCTTGTGAGAACTCACTTACTTTTATGAGAACAGCATGGAG 52653898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TCCTTATGAAACCATCAGGTCTTGTGAGAACTCACTTACTTTTATGAGAACAGCATGGAG 1740

 52653899 GAAACTGTCCCCATGATCCAATCACCTCCACCTGGTCTCTCCCTTGACACGTGGGGATTA 52653958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GAAACTGTCCCCATGATCCAATCACCTCCACCTGGTCTCTCCCTTGACACGTGGGGATTA 1800

 52653959 TGGGGATTAAATTCCAGATGAGATTTGGGTGGGGACAAAAAGCCTAACGACATCAAGCTG 52654018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TGGGGATTAAATTCCAGATGAGATTTGGGTGGGGACAAAAAGCCTAACGACATCAAGCTG 1860

 52654019 TAAAAACAATAGCTAACATTCATTGACTGTTTCCCAGCATTAGGATAAATGTGTGTAACA 52654078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TAAAAACAATAGCTAACATTCATTGACTGTTTCCCAGCATTAGGATAAATGTGTGTAACA 1920

 52654079 AGAGGCATTTTATTTATGTATGACATTTGTTTATTTATTATTTATTTATTTGGATAAATG 52654138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AGAGGCATTTTATTTATGTATGACATTTGTTTATTTATTATTTATTTATTTGGATAAATG 1980

 52654139 TCTATAACAAGAAACATTTTATTTAAGTATAACAGCAAATCTACAAGTTAGGTACTATCA 52654198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TCTATAACAAGAAACATTTTATTTAAGTATAACAGCAAATCTACAAGTTAGGTACTATCA 2040

 52654199 TCACTCCCATTTTACAGGTCGTGAAACTGAGGCTCTGAAAAGTCAAGTCAGTTTTCTAAT 52654258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TCACTCCCATTTTACAGGTCGTGAAACTGAGGCTCTGAAAAGTCAAGTCAGTTTTCTAAT 2100

 52654259 GTTGTCCAGCTAATGACTGGTAGATTTAGTATTTGAACCCACATTTGCCTGATTCCAAAG 52654318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GTTGTCCAGCTAATGACTGGTAGATTTAGTATTTGAACCCACATTTGCCTGATTCCAAAG 2160

 52654319 TTCAAACTCCCAACAACATGTGGTAACCAAAGCAGGAACAGAAGAGAAAGAAGAAATAGA 52654378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TTCAAACTCCCAACAACATGTGGTAACCAAAGCAGGAACAGAAGAGAAAGAAGAAATAGA 2220

 52654379 AGGGAGGGAAGATGAACAAAGTAGACAAAGTTTAGTTAATAGAATTAGTGGATACCCAAG 52654438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AGGGAGGGAAGATGAACAAAGTAGACAAAGTTTAGTTAATAGAATTAGTGGATACCCAAG 2280

 52654439 AAAAAACTATGTACAAGAGGGGGAAAAAAACCCTGTTTTCTCACATCTGGGAAACATTGA 52654498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AAAAAACTATGTACAAGAGGGGGAAAAAAACCCTGTTTTCTCACATCTGGGAAACATTGA 2340

 52654499 TATCTATATATTTTTGGTTTTAAATAAAAATTAGGTTATGTCATTCATTTGCATAAAACC 52654558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TATCTATATATTTTTGGTTTTAAATAAAAATTAGGTTATGTCATTCATTTGCATAAAACC 2400

 52654559 ATCCAAAGAAGGGCCTCACAAAATTAAAACAAAATCCAAACTCTCTACTATGGGCCACAC 52654618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ATCCAAAGAAGGGCCTCACAAAATTAAAACAAAATCCAAACTCTCTACTATGGGCCACAC 2460

 52654619 CCTCCAGAACTTCAGCTCGTACTATGTTTTTCCTCACACCTCTCAACATACCAACATGTT 52654678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CCTCCAGAACTTCAGCTCGTACTATGTTTTTCCTCACACCTCTCAACATACCAACATGTT 2520

 52654679 TCCACCTGCAGCCCTCACCACTAGTTATTCTTTCAATCTGGAAATATTTTCGCTAAGATC 52654738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TCCACCTGCAGCCCTCACCACTAGTTATTCTTTCAATCTGGAAATATTTTCGCTAAGATC 2580

 52654739 TTCCTATGGTTACCTTCTTATCATTCAAGACTTAGGTTATGTCAGGCCTTCCCTGACTCC 52654798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TTCCTATGGTTACCTTCTTATCATTCAAGACTTAGGTTATGTCAGGCCTTCCCTGACTCC 2640

 52654799 TCCATCTGAAGTAACCCCTCCTGCTTACTCCTGTTTATTCTCTAGACTCCACAGAGGATT 52654858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TCCATCTGAAGTAACCCCTCCTGCTTACTCCTGTTTATTCTCTAGACTCCACAGAGGATT 2700

 52654859 CATCACTCTCTGAAATGATCCCATTAATTTCTTCTTCACTTGTTTCCTCTCCACGACCTG 52654918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CATCACTCTCTGAAATGATCCCATTAATTTCTTCTTCACTTGTTTCCTCTCCACGACCTG 2760

 52654919 TAAGCCCCAAGTGGACCCGGACTTGGTCTGCTCTGCTTACAGCTGGATTCCAGTTCCCAT 52654978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TAAGCCCCAAGTGGACCCGGACTTGGTCTGCTCTGCTTACAGCTGGATTCCAGTTCCCAT 2820

 52654979 AGTGCTAGACACTAGGATTAAGCCAGGAAACATGGGTGAAGCAGCAAGCACAGAGCTTGG 52655038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 AGTGCTAGACACTAGGATTAAGCCAGGAAACATGGGTGAAGCAGCAAGCACAGAGCTTGG 2880

 52655039 GGCACAGCCTAGCAAACACTCCACAAAGGACCATGATTGTAACTGTAGTAGGGCACACCA 52655098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 GGCACAGCCTAGCAAACACTCCACAAAGGACCATGATTGTAACTGTAGTAGGGCACACCA 2940

 52655099 ATGAACAGGTTGGGAAACTGAGTCTCTGAGAAGAGACTAATGTTGTGCTGGATGAAATTT 52655158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 ATGAACAGGTTGGGAAACTGAGTCTCTGAGAAGAGACTAATGTTGTGCTGGATGAAATTT 3000

 52655159 CTTTTTCTGACAATACATTATCCAAATCCTCCAAGCTTTCAGTTTAAAGGGGAAAGCAGG 52655218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CTTTTTCTGACAATACATTATCCAAATCCTCCAAGCTTTCAGTTTAAAGGGGAAAGCAGG 3060

 52655219 AACTATCATTATAATTTTATTTACAAAGTGTCCATGTATGAACATTATTCACCGCCGAAT 52655278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 AACTATCATTATAATTTTATTTACAAAGTGTCCATGTATGAACATTATTCACCGCCGAAT 3120

 52655279 CATCTCTTCCTATGCAAGCAACACCGTCCTATGCATCAATATCCTGATCTGTCAGGATTC 52655338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 CATCTCTTCCTATGCAAGCAACACCGTCCTATGCATCAATATCCTGATCTGTCAGGATTC 3180

 52655339 AGGATAAAGTGGACATATACACACTAATTGCAAAGGGAAATTGTACATCTTGCAAAAGAT 52655398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 AGGATAAAGTGGACATATACACACTAATTGCAAAGGGAAATTGTACATCTTGCAAAAGAT 3240

 52655399 GCAGGGGTTTATAGAGTCTTGTAACATTGGTGAGCTGCTCAGATCACACACATGACCGTG 52655458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 GCAGGGGTTTATAGAGTCTTGTAACATTGGTGAGCTGCTCAGATCACACACATGACCGTG 3300

 52655459 GTTGGACAAGGATCTGGCAAAGTTAACACAGATCACCGAAGAAGGAAAAGTGGACAACAC 52655518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 GTTGGACAAGGATCTGGCAAAGTTAACACAGATCACCGAAGAAGGAAAAGTGGACAACAC 3360

 52655519 AACACAGTAAGTTCTTCAAAAGAGTTATATTAGAATATCAAAAGATTATGTTAGGCCTTT 52655578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 AACACAGTAAGTTCTTCAAAAGAGTTATATTAGAATATCAAAAGATTATGTTAGGCCTTT 3420

 52655579 GGGAAAACTCAAAACTTTATGAAGACCTCAAAAAATTATGCAAAAATGACCCTTCAATGG 52655638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 GGGAAAACTCAAAACTTTATGAAGACCTCAAAAAATTATGCAAAAATGACCCTTCAATGG 3480

 52655639 TCATGCTGCAAGAGTCAAATGACACTTCAAACAACTGCGGCTTTCTATGTTGTGCAAATG 52655698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TCATGCTGCAAGAGTCAAATGACACTTCAAACAACTGCGGCTTTCTATGTTGTGCAAATG 3540

 52655699 CATTTGTTGTTTTAAAGGTCGTAAAGTCAGGGTACACGTGGCAGATAC 52655746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 CATTTGTTGTTTTAAAGGTCGTAAAGTCAGGGTACACGTGGCAGATAC 3588

EXCISED REGION

 52655748 TATGACTTGGAGGAAGACGTTAGATTAGATTTGAAACTTTCACTGAATGATCGCATTTCA 52655807
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3590 TATGACTTGGAGGAAGGCGTTAGATTAGATTTGAAACTTTCACTGAATGATCGCATTTCA 3649

 52655808 TGCTTTTCATCTGTACATTAAAAAGCCAGAATGTCTTTGCCAAGAAATTCTAGCATAAAT 52655867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3650 TGCTTTTCATCTGTACATTAAAAAGCCAGAATGTCTTTGCCAAGAAATTCTAGCATAAAT 3709

 52655868 AAAAGAAAAGGATGGGATTTTGGAACATCATGGTAGAATTCTTGACTATCAGCTTTATAC 52655927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3710 AAAAGAAAAGGATGGGATTTTGGAACATCATGGTAGAATTCTTGACTATCAGCTTTATAC 3769

 52655928 AACATGTCTGGACATTTAGTGATGGAAATGCTGGATTCCAAAGGAATGTAGGCAAAGGTA 52655987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3770 AACATGTCTGGACATTTAGTGATGGAAATGCTGGATTCCAAAGGAATGTAGGCAAAGGTA 3829

 52655988 CTACTACCCCCATGCTCTTCAGAAAACATCCTCTAAAAGCAACAGTGATGATCAGATACT 52656047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3830 CTACTACCCCCATGCTCTTCAGAAAACATCCTCTAAAAGCAACAGTGATGATCAGATACT 3889

 52656048 GTGGGGCAAGACTGACAGTGACACTCAAGATTTCCACTCTTCTCTTTAATCATATATTTC 52656107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3890 GTGGGGCAAGACTGACAGTGACACTCAAGATTTCCACTCTTCTCTTTAATCATATATTTC 3949

 52656108 CTGTCATTCATGTGCTACAAAACTCTGGAATATGCAAAGCTCATTCAAATGCAAAACCAG 52656167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3950 CTGTCATTCATGTGCTACAAAACTCTGGAATATGCAAAGCTCATTCAAATGCAAAACCAG 4009

 52656168 CCTTTGCTCCAACATGAGCATATATTTTCATTTAAAGACAAATCAGATGTTTCATTTGAT 52656227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4010 CCTTTGCTCCAACATGAGCATATATTTTCATTTAAAGACAAATCAGATGTTTCATTTGAT 4069

 52656228 TTTTTTTATAAATCTGATAATAATGTACATTTAACCCGTGTTTACAACCAAAATAATTAA 52656287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4070 TTTTTTTATAAATCTGATAATAATGTACATTTAACCCGTGTTTACAACCAAAATAATTAA 4129

 52656288 TCTCTCTGAACCCTTTGTTTTTCCTGTCTCTATCCTCCACCCTCATTGCCAGATAAATAA 52656347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4130 TCTCTCTGAACCCTTTGTTTTTCCTGTCTCTATCCTCCACCCTCATTGCCAGATAAATAA 4189

 52656348 CATCTGCAACCTGATGTGGCATATTGAACTTTGTTTATACTCACACAAACACGTATAAGC 52656407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4190 CATCTGCAACCTGATGTGGCATATTGAACTTTGTTTATACTCACACAAACACGTATAAGC 4249

 52656408 ATCCCAGATACACATATACAGGGACTGTATCTGTCCTTGTTGTTTTTATAGAAATTGGAT 52656467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4250 ATCCCAGATACACATATACAGGGACTGTATCTGTCCTTGTTGTTTTTATAGAAATTGGAT 4309

 52656468 CACATTAGACATATTTTCTGATGACTTTTGTACATTATAGTTGGTCTTCACAGTCAATAG 52656527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4310 CACATTAGACATATTTTCTGATGACTTTTGTACATTATAGTTGGTCTTCACAGTCAATAG 4369

 52656528 CTCCAAAGCTATCTTATCTTCTAAAATAGCTGCATAATATTCCTCAGTATGGATATACCA 52656587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4370 CTCCAAAGCTATCTTATCTTCTAAAATAGCTGCATAATATTCCTCAGTATGGATATACCA 4429

 52656588 AAAGATATTTAAACCATTGCCTAATCAATGAATATCCTGGTAGTTTCCACATTGTTTTTT 52656647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4430 AAAGATATTTAAACCATTGCCTAATCAATGAATATCCTGGTAGTTTCCACATTGTTTTTT 4489

 52656648 CCATTTCCACTATAGTGGAATAAACTTTCGTGTTCAAAAATCCTAAACTGGTGCTATATT 52656707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4490 CCATTTCCACTATAGTGGAATAAACTTTCGTGTTCAAAAATCCTAAACTGGTGCTATATT 4549

 52656708 TCTATAGAATAGAGGCACAGATGTAGAAGTGTTACCCTCAAATCAATATGCATTTAGTTT 52656767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4550 TCTATAGAATAGAGGCACAGATGTAGAAGTGTTACCCTCAAATCAATATGCATTTAGTTT 4609

 52656768 TGAAAAACAGACACTGCCATATTATTTTCTTAAAAAGGCTCTACAGATTCACATTTCCAG 52656827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4610 TGAAAAACAGACACTGCCATATTATTTTCTTAAAAAGGCTCTACAGATTCACATTTCCAG 4669

 52656828 CAGCAATGAGTGTCTCAAGCACCTTTTAAGTGGTAAGCAGCTTACCAGGGGAGGTGGCCT 52656887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4670 CAGCAATGAGTGTCTCAAGCACCTTTTAAGTGGTAAGCAGCTTACCAGGGGAGGTGGCCT 4729

 52656888 ATTATTCTATCAGTGGCTTCAGTTGTTAGGACACCACGGGTCAGCTGTGGAGATACGGTT 52656947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4730 ATTATTCTATCAGTGGCTTCAGTTGTTAGGACACCACGGGTCAGCTGTGGAGATACGGTT 4789

 52656948 GTGGGGCAGGTTGAGTTCAGGACACATAGAAGATTGCCAAAGGGTGACTATTATTACTTT 52657007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4790 GTGGGGCAGGTTGAGTTCAGGACACATAGAAGATTGCCAAAGGGTGACTATTATTACTTT 4849

 52657008 GAGACTCTGGAAAAATTAGCCAGGAAACAGAGACAAGAGGCTCAGGGTGCAGCAAAGCAG 52657067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4850 GAGACTCTGGAAAAATTAGCCAGGAAACAGAGACAAGAGGCTCAGGGTGCAGCAAAGCAG 4909

 52657068 CCAAATCAGGATGATAGTGTTTTCTTTGGAGCAGATATACTAATGGCCAAGGAACTCATA 52657127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4910 CCAAATCAGGATGATAGTGTTTTCTTTGGAGCAGATATACTAATGGCCAAGGAACTCATA 4969

 52657128 AAAAGATGCCTAATGTCATCTCATTAGGGAAGTGCAGTCAAAGCCACAGCATGATACGTC 52657187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4970 AAAAGATGCCTAATGTCATCTCATTAGGGAAGTGCAGTCAAAGCCACAGCATGATACGTC 5029

 52657188 TTCACACCCACGAGGATGGCCATAATCAGAGAGACAATAACCAGTGGTAGGGAAGATGTG 52657247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5030 TTCACACCCACGAGGATGGCCATAATCAGAGAGACAATAACCAGTGGTAGGGAAGATGTG 5089

 52657248 AAAAAATCGGAATGCTCATGCATTGCTGGTAGGAATGTGACATGGTGCAGCTGCTTTGGA 52657307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5090 AAAAAATCGGAATGCTCATGCATTGCTGGTAGGAATGTGACATGGTGCAGCTGCTTTGGA 5149

 52657308 AAGCAGTTTAACAGTTCCTGGAAAAGTTAAACATGGAGTTACCCTAAGACCCAGCAATTC 52657367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5150 AAGCAGTTTAACAGTTCCTGGAAAAGTTAAACATGGAGTTACCCTAAGACCCAGCAATTC 5209

 52657368 CATTCCTAGGTAAGCAAGAAAATGAAAACATATGGCCACACAAAAACTTGTACACAAATG 52657427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5210 CATTCCTAGGTAAGCAAGAAAATGAAAACATATGGCCACACAAAAACTTGTACACAAATG 5269

 52657428 TCCATAGCAGCATTTTCATAATAGCTGAAAAGTGGAAACAACCCAAATATCCATCAATTG 52657487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5270 TCCATAGCAGCATTTTCATAATAGCTGAAAAGTGGAAACAACCCAAATATCCATCAATTG 5329

 52657488 GAAAAAGGAAATCTAGCATTTGCATATAATAGAGTATTAATCAGCCATAAGAAGAAACAA 52657547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5330 GAAAAAGGAAATCTAGCATTTGCATATAATAGAGTATTAATCAGCCATAAGAAGAAACAA 5389

 52657548 AGCACCGATCCATGTTATATCATGCTTTATACTTGGAAGCATGGTACTAAGTGAAAGACG 52657607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5390 AGCACCGATCCATGTTATATCATGCTTTATACTTGGAAGCATGGTACTAAGTGAAAGACG 5449

 52657608 CCAGACACAAAAAGCAAAATATTGTATGATTCCATTTATATAAAGTGTCTAGAATAGGCA 52657667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5450 CCAGACACAAAAAGCAAAATATTGTATGATTCCATTTATATAAAGTGTCTAGAATAGGCA 5509

 52657668 AATCCATAGAGGCAGAAAACAGATTAGTGGTTGCCAGTGGCTGGGAATAGGGAAAAAACT 52657727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5510 AATCCATAGAGGCAGAAAACAGATTAGTGGTTGCCAGTGGCTGGGAATAGGGAAAAAACT 5569

 52657728 CAGCGCTAAAGGGTAGGGAGTTTTGTTTTGGAGTAATGACGATGTTCTGGAATTAGACGT 52657787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5570 CAGCGCTAAAGGGTAGGGAGTTTTGTTTTGGAGTAATGACGATGTTCTGGAATTAGACGT 5629

 52657788 GGAACGATTGCACACATGGTGCAAATATCCTTAAAATCACGGAATTGTCACTCTAAAAGG 52657847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5630 GGAACGATTGCACACATGGTGCAAATATCCTTAAAATCACGGAATTGTCACTCTAAAAGG 5689

 52657848 TGAATTTTATGGTAGGTGAATTGTACCTCAATTTGTAAAAAGAAGAATTAGATAAATAAA 52657907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5690 TGAATTTTATGGTAGGTGAATTGTACCTCAATTTGTAAAAAGAAGAATTAGATAAATAAA 5749

 52657908 CAGCAACACAGCACCAAGGGGTGGGGGTAGGAAACAGACAACAAATAGGAGTGAAGAGTT 52657967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5750 CAGCAACACAGCACCAAGGGGTGGGGGTAGGAAACAGACAACAAATAGGAGTGAAGAGTT 5809

 52657968 CACAGGAAAAGACATGCAGCCAGCTTTTAAGCAGAAGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAAT 52658027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5810 CACAGGAAAAGACATGCAGCCAGCTTTTAAGCAGAAGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAAT 5869

 52658028 AGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTGGCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAA 52658087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5870 AGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTGGCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAA 5929

 52658088 AAGGAGACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTATAAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGT 52658147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5930 AAGGAGACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTATAAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGT 5989

 52658148 ACGGTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAG 52658207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5990 ACGGTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAG 6049

 52658208 GTAAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGG 52658240
          |||||||||||||||||||||||||||||||||
     6050 GTAAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGG 6082

Alignment time is 7.25626 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [52637064,52668002] =>     30939 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    4471] =>      4471 nucs 'mol-32-316f-033648_4471'

Score:        4301
Aligned:      4478        nucs
Identic:      4439 ( 99%) nucs =>      2353 (100%)      2086 ( 98%)
Gaps:           31 (  1%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [52644708,52647064] EXCISED REGION [52658003,52660099]
 second seq =>  [       1,    2357] EXCISED REGION [    2358,    4471]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>     10938 nucs [52647065,52658002]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         6 nucs [52647065,52647070] to [52658003,52658008]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [52647065,52647067] to [52658000,52658002]
 second seq =>         0 nucs

 52644708 ACATAAAACAGATGCCACAGCTGTTATTGTTCTTCACACAGAAGTTTCTACCCAGAGAAA 52644767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACATAAAACAGATGCCACAGCTGTTATTGTTCTTCACACAGAAGTTTCTACCCAGAGAAA 60

 52644768 CATCAGGATGACACTCTGCTGCAATGTGCTATTTGTTCTAGAGGGGTCAACAGCTTGCCA 52644827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CATCAGGATGACACTCTGCTGCAATGTGCTATTTGTTCTAGAGGGGTCAACAGCTTGCCA 120

 52644828 CCTTGCCTAGGCCCAGGGTGACTGCATATGTGCAGTGGTCTTATCCCATTAGCGCCCCCG 52644887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCTTGCCTAGGCCCAGGGTGACTGCATATGTGCAGTGGTCTTATCCCATTAGCGCCCCCG 180

 52644888 AGCATGCATTCAGAACCAAGTGGATACACCTTGGCACACTTACCTTCCCTGCAGGGACAT 52644947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGCATGCATTCAGAACCAAGTGGATACACCTTGGCACACTTACCTTCCCTGCAGGGACAT 240

 52644948 CATCGGACTGCCCTGATAAGCCAGGAACCTCATCCACCTTGTCTTGATGCTCTGCCCTCT 52645007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CATCGGACTGCCCTGATAAGCCAGGAACCTCATCCACCTTGTCTTGATGCTCTGCCCTCT 300

 52645008 TGGCTTCCTGTTGGCTGTCACCTGGCACCTTTTCCTGTCCCTTGTCCAGCTTGAAGAATT 52645067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGGCTTCCTGTTGGCTGTCACCTGGCACCTTTTCCTGTCCCTTGTCCAGCTTGAAGAATT 360

 52645068 TGTCAAAAAAGCTGGAGTCCTTGGGCTTGGAGGGAGCTTCTCCTCCTGCTCCCCCTGTCT 52645127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGTCAAAAAAGCTGGAGTCCTTGGGCTTGGAGGGAGCTTCTCCTCCTGCTCCCCCTGTCT 420

 52645128 CAGGTGGGAGAAGCGTGGGATCCCTGGCGGCAGAGAGGACCTTGTCTTGGGCCGGGGCGT 52645187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CAGGTGGGAGAAGCGTGGGATCCCTGGCGGCAGAGAGGACCTTGTCTTGGGCCGGGGCGT 480

 52645188 GCCCTGGGGTTTTATCTGTGTCCTGCCCCGGTCCAGCTGCCACCGGAAGTGTCCAGCTCT 52645247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GCCCTGGGGTTTTATCTGTGTCCTGCCCCGGTCCAGCTGCCACCGGAAGTGTCCAGCTCT 540

 52645248 CACTTGGGTCTTTGTTCGCTGGAGCTTTATTGGAGCTGACATCAAGCTTCACTGATCCAA 52645307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CACTTGGGTCTTTGTTCGCTGGAGCTTTATTGGAGCTGACATCAAGCTTCACTGATCCAA 600

 52645308 GGGATGAATCTGCGGCTTGGTCTCCGGTACGTCCTGGTACAGGCCGAGAGAGCATCAAGA 52645367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GGGATGAATCTGCGGCTTGGTCTCCGGTACGTCCTGGTACAGGCCGAGAGAGCATCAAGA 660

 52645368 AAAAACGAGATTTAGCAGCTGGTGCCTCGGGTTTGGCCTCTTTCCCAAGATTCTTTCCGT 52645427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAAAACGAGATTTAGCAGCTGGTGCCTCGGGTTTGGCCTCTTTCCCAAGATTCTTTCCGT 720

 52645428 TGGCATCCGCAACAGCACTTATCTCCGTTGTCTCGGGGGAAGAAGTGGCCACATTATCCG 52645487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGGCATCCGCAACAGCACTTATCTCCGTTGTCTCGGGGGAAGAAGTGGCCACATTATCCG 780

 52645488 TCTTGACACTTATTCCCAAGTCGACTGTAAACACAAACATAAACAGTGGTTATTCAGCCA 52645547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
      781 TCTTGACACTTATTCCCAAGTCGACTGTAAACACAAACATAAACAGCGGTTATTCAGCCA 840

 52645548 AGCCGGGAAATTCAGGCACTAATAATGGACTCCAGACATTTTTTATACAAAAGCCATACT 52645607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGCCGGGAAATTCAGGCACTAATAATGGACTCCAGACATTTTTTATACAAAAGCCATACT 900

 52645608 GCATACTGGAACTGTGTTGTTCTCTGGTCATTCTGAAAGGCAGAAGTTAGCTCTCTACAT 52645667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GCATACTGGAACTGTGTTGTTCTCTGGTCATTCTGAAAGGCAGAAGTTAGCTCTCTACAT 960

 52645668 CTCCTTGGACCCTGCTTTTCTTGGGAGAGGAGAAGGCAAGGTTGGTGAGGAGGGAAAGCT 52645727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTCCTTGGACCCTGCTTTTCTTGGGAGAGGAGAAGGCAAGGTTGGTGAGGAGGGAAAGCT 1020

 52645728 ACTTAATGGAAAGTCACTAGCTGCCAGGTGTGGAATGAGTGATATTCAATGTTAATTAAT 52645787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ACTTAATGGAAAGTCACTAGCTGCCAGGTGTGGAATGAGTGATATTCAATGTTAATTAAT 1080

 52645788 CTTCTTTTATCTGTGTAAGAACTCCGTGAGCAGCATATTGTCATGATGTCAACTGGGAGG 52645847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTTCTTTTATCTGTGTAAGAACTCCGTGAGCAGCATATTGTCATGATGTCAACTGGGAGG 1140

 52645848 CAGTACAGCAGTTAGGAGCTTGGGTTCTGGAGCTAGAACAAGGTTTCTCAACCTCAGCAC 52645907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CAGTACAGCAGTTAGGAGCTTGGGTTCTGGAGCTAGAACAAGGTTTCTCAACCTCAGCAC 1200

 52645908 TACTCACATTTGAAGCCAGATTATTCTTTGTTAGGGAGGCTCATCCCGTGCCTCATAGGC 52645967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TACTCACATTTGAAGCCAGATTATTCTTTGTTAGGGAGGCTCATCCCGTGCCTCATAGGC 1260

 52645968 TGATTAGCAGCATCCTGGCCTCTGCCCACTAGACGCCGGTCACATTTCCCAGTCATGGCA 52646027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGATTAGCAGCATCCTGGCCTCTGCCCACTAGACGCCGGTCACATTTCCCAGTCATGGCA 1320

 52646028 ACCAAAAATATCTCTAGGCATTGCTAAATGTCCCCTGGAGGACAAAATCTCTTACGTTTG 52646087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ACCAAAAATATCTCTAGGCATTGCTAAATGTCCCCTGGAGGACAAAATCTCTTACGTTTG 1380

 52646088 AGAGGCACTGAGCTGAAATGTCTTTTTGAATCCAGATTATCTAATTTTCTGTGCCTCAAC 52646147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AGAGGCACTGAGCTGAAATGTCTTTTTGAATCCAGATTATCTAATTTTCTGTGCCTCAAC 1440

 52646148 TTTCTGGTAAAAGGAGACAGATAATAAATCTCGTAATTTTGTTAGGAAGATTACATGAGT 52646207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTTCTGGTAAAAGGAGACAGATAATAAATCTCGTAATTTTGTTAGGAAGATTACATGAGT 1500

 52646208 TAATAGTTTTAAAGCAAGTACAATAGCACCTGGAATATATTAAGTGCTTAATAAATATCA 52646267
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TAATAGTTTTAAAGCAAGTACAATAGCGCCTGGAATATATTAAGTGCTTAATAAATATCA 1560

 52646268 CAAACATTAGTTATCATTATTCATGAGTGAGAAAACTGACAGTCAGAGAGGTCAGTACAC 52646327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CAAACATTAGTTATCATTATTCATGAGTGAGAAAACTGACAGTCAGAGAGGTCAGTACAC 1620

 52646328 CCTCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCTAGTAAGCAGCAGAGTCTGGCTTCAGGCAGAAATCTG 52646387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CCTCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCTAGTAAGCAGCAGAGTCTGGCTTCAGGCAGAAATCTG 1680

 52646388 ACTTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGTCTTACCAGGGACTTGTATTAGCATAGACTGTTAAG 52646447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ACTTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGTCTTACCAGGGACTTGTATTAGCATAGACTGTTAAG 1740

 52646448 AATATGGGAAGATTTTTAAAATACAGTACTCAGAAAATTTCTCTTTGAAAGGCTGGAAGA 52646507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AATATGGGAAGATTTTTAAAATACAGTACTCAGAAAATTTCTCTTTGAAAGGCTGGAAGA 1800

 52646508 GCAGATATCCACACAAGAAGGCAAATTAGACCTCAGGCCAGTGTGGAATTAAAGGTGTAG 52646567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GCAGATATCCACACAAGAAGGCAAATTAGACCTCAGGCCAGTGTGGAATTAAAGGTGTAG 1860

 52646568 GGTTATCTGGTCAAGACTGTGTGTGTGGATACAGGCTCCAACCCCTCCAGGCAAGGGCAC 52646627
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     1861 GGTTATCTGGTCAAGACTGTGTGTGTGGATACAGGCTCCAACCCCTCCAGGCAAGGGCAA 1920

 52646628 TGTTTCCAACATCCACCCTTTCTCCTTTGACCTCTACCTTGACCTAAATTAACTATAAAA 52646687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TGTTTCCAACATCCACCCTTTCTCCTTTGACCTCTACCTTGACCTAAATTAACTATAAAA 1980

 52646688 GGTCCTTCTTTTCTAGGACCCTACTATAAATCAGTGAAATATTCAGGAAAAAAAGAACAC 52646747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GGTCCTTCTTTTCTAGGACCCTACTATAAATCAGTGAAATATTCAGGAAAAAAAGAACAC 2040

 52646748 CAAGAATGTTGGGATCCCAGTTAAAGATCAAGATTCTCTACTGATAAGCTGTGTGATATG 52646807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CAAGAATGTTGGGATCCCAGTTAAAGATCAAGATTCTCTACTGATAAGCTGTGTGATATG 2100

 52646808 GAGTAAATCACTAAAGATCTTTGAATCTCTTCATTTGTAAAATGGGAATATTGGTAGTCC 52646867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GAGTAAATCACTAAAGATCTTTGAATCTCTTCATTTGTAAAATGGGAATATTGGTAGTCC 2160

 52646868 TACTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTAAAGAAGAAAAGTCATGCAAAGGATCTGGCACAACG 52646927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     2161 TACTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTAAAGAAGAAAAGTCATGCAAAGGATCTGGCACAATG 2220

 52646928 CCTTTTCCATAATAAGTGCTTAGTAATTGACAGATACTGTGATAACTTTTCAGGTTTCTC 52646987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CCTTTTCCATAATAAGTGCTTAGTAATTGACAGATACTGTGATAACTTTTCAGGTTTCTC 2280

 52646988 TCATGCCTTTGACAACATTGCATTTTGCTTGCTCTATCTGTAGTCAGACACTTCTTAATA 52647047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TCATGCCTTTGACAACATTGCATTTTGCTTGCTCTATCTGTAGTCAGACACTTCTTAATA 2340

 52647048 TCTGTTTGCAGGAAGAC 52647064
          |||||||||||||||||
     2341 TCTGTTTGCAGGAAGAC 2357

EXCISED REGION

 52658003 AGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTG 52658062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2358 AGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTG 2417

 52658063 GCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTAT 52658122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2418 GCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTAT 2477

 52658123 AAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGG 52658182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2478 AAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGG 2537

 52658183 GAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTG 52658242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2538 GAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTG 2597

 52658243 AAACACTGTCTCTGCTAAAAAACAAAACAAAACAAAACACCAAAAAATAGCTGGGCGTAG 52658302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2598 AAACACTGTCTCTGCTAAAAAACAAAACAAAACAAAACACCAAAAAATAGCTGGGCGTAG 2657

 52658303 TGGCGGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTTGGGAGGCGGTGGCAGGAGAATCATTTGAACCT 52658362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2658 TGGCGGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTTGGGAGGCGGTGGCAGGAGAATCATTTGAACCT 2717

 52658363 GGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGAT--------TGTGCCACTGCACTCTAACCTGG 52658414
          |||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||
     2718 GGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACTGTGCCACTGCACTCTAACCTGG 2777

 52658415 GCAACAGAGTTCAGAGTGAGACTCTGTCTCCCCC----------------AAAAAAAAAA 52658458
          ||||||||||||||||||||||||||||||                    ||||||||||
     2778 GCAACAGAGTTCAGAGTGAGACTCTGTCTC----ACCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 2833

 52658459 AAAAAAAAAAAAGAACAGCCATATAGATCGTCGGTGGGAGTGTAATTTGGCCACTTCTTT 52658518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2834 AAAAAAAAAAAAGAACAGCCATATAGATCGTCGGTGGGAGTGTAATTTGGCCACTTCTTT 2893

 52658519 GGAAAATAGCTCAGTAATATCTATTAATACTTAAAATTTCACAAACACTGTAAGTCTAAC 52658578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2894 GGAAAATAGCTCAGTAATATCTATTAATACTTAAAATTTCACAAACACTGTAAGTCTAAC 2953

 52658579 TTCCACTTCTAAAATGTTATCCTAGAAATAAAATTGCATAGGGGTACAAAGGCTTACGTA 52658638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2954 TTCCACTTCTAAAATGTTATCCTAGAAATAAAATTGCATAGGGGTACAAAGGCTTACGTA 3013

 52658639 TGGAACTATTTGCTGGACTACTGTAGTTGTGGCAAAAAACTGGAAATGACCTAAACGCTT 52658698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3014 TGGAACTATTTGCTGGACTACTGTAGTTGTGGCAAAAAACTGGAAATGACCTAAACGCTT 3073

 52658699 ATTAGTAGAAACCTGGTTAAATAAATTATCATATGTCCTTGAGGACACAGGGACACAAAG 52658758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3074 ATTAGTAGAAACCTGGTTAAATAAATTATCATATGTCCTTGAGGACACAGGGACACAAAG 3133

 52658759 AGGGGAATGACAGGCACTGAGCCTACTTGAGGGTGGGAGGAGGAAGTCGATCAGAAAAAA 52658818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3134 AGGGGAATGACAGGCACTGAGCCTACTTGAGGGTGGGAGGAGGAAGTCGATCAGAAAAAA 3193

 52658819 TAACTAGTGGGTACTAGGCTTAGTACCCGGGTGAAAAAATAATCTGTACAACAAACCCCC 52658878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3194 TAACTAGTGGGTACTAGGCTTAGTACCCGGGTGAAAAAATAATCTGTACAACAAACCCCC 3253

 52658879 ATGACATGAGTTTACCTTATAACAAACCTGCACATGTAATCTGAACCTAGATAAAAGTTT 52658938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3254 ATGACATGAGTTTACCTTATAACAAACCTGCACATGTAATCTGAACCTAGATAAAAGTTT 3313

 52658939 AAAAAAATAAATAATCATATGTCCCTACAATGAAATATTCCACAGGCATTAAAATTCCCC 52658998
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     3314 AAAAAAATAAATAATCATATGTCCCTATAATGAAATATTCCACAGGCATTAAAATTCCCC 3373

 52658999 AAGGAATTTTAGTAAGGAAAGAAAAAGCTGTGCCCAACAGCACGTACAGTATGTTTCCAT 52659058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3374 AAGGAATTTTAGTAAGGAAAGAAAAAGCTGTGCCCAACAGCACGTACAGTATGTTTCCAT 3433

 52659059 TTGTTTTTAAAAAATGGTGTCGGGAGGTTGAGGAGACAACTTATAAATAGACATGCCTGG 52659118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3434 TTGTTTTTAAAAAATGGTGTCGGGAGGTTGAGGAGACAACTTATAAATAGACATGCCTGG 3493

 52659119 GATACCTCTGGATATAAGAAACTGTAAAGTATTTACTTCTAAGGAAGGAAATTTGGGATG 52659178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3494 GATACCTCTGGATATAAGAAACTGTAAAGTATTTACTTCTAAGGAAGGAAATTTGGGATG 3553

 52659179 GGGCTTGGGGAGCCATCAGAGTTAGGGTGGGGATTTTTTCTCTGCCTTATCTTATTATGT 52659238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3554 GGGCTTGGGGAGCCATCAGAGTTAGGGTGGGGATTTTTTCTCTGCCTTATCTTATTATGT 3613

 52659239 ATATCGCTCAGAATGTTTGCTATGTGTATGCACCTACCCCATCCATTAAGAAATGAAGAA 52659298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3614 ATATCGCTCAGAATGTTTGCTATGTGTATGCACCTACCCCATCCATTAAGAAATGAAGAA 3673

 52659299 ATAATGAAAAGAAAAAATGAAAGTAGGGAACTAGAAATGAGAGGTGGGATTCAAAGTGGA 52659358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3674 ATAATGAAAAGAAAAAATGAAAGTAGGGAACTAGAAATGAGAGGTGGGATTCAAAGTGGA 3733

 52659359 CTGAACACTTGACCTATTTCCCAATTTGCCTAGGGCTGGCCCAGCAGCGAGGCAGGTTCT 52659418
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     3734 CTGAACACTTGACCTATTTCCCAATTTGCCTGGGGCTGGCCCAGCAGCGAGGCAGGTTCT 3793

 52659419 AACCAATGAGCATCAGCTTTGAATGGAGGGGCTGATAGGCCAGGTGGGCCCTGCTTGCTG 52659478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3794 AACCAATGAGCATCAGCTTTGAATGGAGGGGCTGATAGGCCAGGTGGGCCCTGCTTGCTG 3853

 52659479 AGAGTGTCATGGCCTTAGGGACATCTCCATGTTGCAGAGTCTGAGCCTCTGCTTGGCAAA 52659538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3854 AGAGTGTCATGGCCTTAGGGACATCTCCATGTTGCAGAGTCTGAGCCTCTGCTTGGCAAA 3913

 52659539 TTCAGAAAATCCAGCTTTTCTTTTTATATCACCTGGAGCTGATGTAACTCTCAGAAGGCA 52659598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     3914 TTCAGAAAATCCAGCTTTTCTTTTTATATCACCTGGAGCTGATGTAACTCTCAGAACGCA 3973

 52659599 TTTTTAAGAGGACTCATGAATTAACCACATAGCCAACTTACTGGCTTAAGACTACGTGAC 52659658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3974 TTTTTAAGAGGACTCATGAATTAACCACATAGCCAACTTACTGGCTTAAGACTACGTGAC 4033

 52659659 AGAAAGCTGCAAAGGGGGCCAGCCACTGGTAACATCCCACCACTGTCCCTCTCTGTGGAA 52659718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4034 AGAAAGCTGCAAAGGGGGCCAGCCACTGGTAACATCCCACCACTGTCCCTCTCTGTGGAA 4093

 52659719 AACACAGATGGGATGCACATTGTGACGGGCAGGATGCCTGGAGAGCCCACAAATCTGCAA 52659778
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4094 AACACAGATGGGATGCACATTGTGATGGGCAGGATGCCTGGAGAGCCCACAAATCTGCAA 4153

 52659779 GCACAGCTGAAATTGGTTACAGGATTTCAATGTTTCATTGCTTGAAGCTATGATAACTTG 52659838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  
     4154 GCACAGCTGAAATTGGTTACAGGATTTCAATGTTTCATTGCTTGAAGCTATGATAACT-- 4211

 52659839 ATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGACGATGATTTTTTTTATAGCCATCTTTTTA 52659898
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4212 -TGATGATGATGATGATGATGATGATGATGACGATGATTTTTTTTATAGCCATCTTTTTA 4270

 52659899 GAGGGATTTGAGGTAGGGAAAAAAATAAACCTCACACTATCGGAGGTTGCCAACTATGAG 52659958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4271 GAGGGATTTGAGGTAGGGAAAAAAATAAACCTCACACTATCGGAGGTTGCCAACTATGAG 4330

 52659959 GTCTGCTGATGGTTTGGCCAACACAGTGTTTATATTTTTTTGAATTGGGAAATTTCATTT 52660018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4331 GTCTGCTGATGGTTTGGCCAACACAGTGTTTATATTTTTTTGAATTGGGAAATTTCATTT 4390

 52660019 AAAAGTCCTAAAATCAGGCTGTTATTGAAATATCTTATTATTGGCTCAGGGTTTCCCAGG 52660078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4391 AAAAGTCCTAAAATCAGGCTGTTATTGAAATATCTTATTATTGGCTCAGGGTTTCCCAGG 4450

 52660079 GCAGCCATCCTTGAAGCTGTG 52660099
          |||||||||||||||||||||
     4451 GCAGCCATCCTTGAAGCTGTG 4471

Alignment time is 5.75529 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [52637064,52668002] =>     30939 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    2114] =>      2114 nucs 'mol-32-316f-033648_2114'

Score:        2017
Aligned:      2101        nucs
Identic:      2086 ( 99%) nucs =>       442 ( 98%)      1644 (100%)
Gaps:           11 (  1%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [52658003,52658444] EXCISED REGION [52658449,52660099]
 second seq =>  [       1,     450] EXCISED REGION [     467,    2114]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         4 nucs [52658445,52658448]
 second seq =>        16 nucs [451,466]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [52658444,52658444] to [52658448,52658448]
 second seq =>         1 nucs [451,451] to [467,467]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [52658445,52658446] to [52658447,52658448]
 second seq =>         1 nucs [451,451] to [466,466]

 52658003 AGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTG 52658062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTG 60

 52658063 GCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTAT 52658122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTAT 120

 52658123 AAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGG 52658182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGG 180

 52658183 GAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTG 52658242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTG 240

 52658243 AAACACTGTCTCTGCTAAAAAACAAAACAAAACAAAACACCAAAAAATAGCTGGGCGTAG 52658302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAACACTGTCTCTGCTAAAAAACAAAACAAAACAAAACACCAAAAAATAGCTGGGCGTAG 300

 52658303 TGGCGGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTTGGGAGGCGGTGGCAGGAGAATCATTTGAACCT 52658362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGGCGGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTTGGGAGGCGGTGGCAGGAGAATCATTTGAACCT 360

 52658363 GGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACTG--------CACTCTAACCTGG 52658414
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||
      361 GGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACTGTGCCACTGCACTCTAACCTGG 420

 52658415 GCAACAGAGTTCAGAGTGAGACTCTGTCTC 52658444
          ||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GCAACAGAGTTCAGAGTGAGACTCTGTCTC 450

EXCISED REGION

 52658449 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAACAGCCATATAGATCGTCGGTGGGAGTGTAATTTGG 52658508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      467 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAACAGCCATATAGATCGTCGGTGGGAGTGTAATTTGG 526

 52658509 CCACTTCTTTGGAAAATAGCTCAGTAATATCTATTAATACTTAAAATTTCACAAACACTG 52658568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      527 CCACTTCTTTGGAAAATAGCTCAGTAATATCTATTAATACTTAAAATTTCACAAACACTG 586

 52658569 TAAGTCTAACTTCCACTTCTAAAATGTTATCCTAGAAATAAAATTGCATAGGGGTACAAA 52658628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      587 TAAGTCTAACTTCCACTTCTAAAATGTTATCCTAGAAATAAAATTGCATAGGGGTACAAA 646

 52658629 GGCTTACGTATGGAACTATTTGCTGGACTACTGTAGTTGTGGCAAAAAACTGGAAATGAC 52658688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      647 GGCTTACGTATGGAACTATTTGCTGGACTACTGTAGTTGTGGCAAAAAACTGGAAATGAC 706

 52658689 CTAAACGCTTATTAGTAGAAACCTGGTTAAATAAATTATCATATGTCCTTGAGGACACAG 52658748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      707 CTAAACGCTTATTAGTAGAAACCTGGTTAAATAAATTATCATATGTCCTTGAGGACACAG 766

 52658749 GGACACAAAGAGGGGAATGACAGGCACTGAGCCTACTTGAGGGTGGGAGGAGGAAGTCGA 52658808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      767 GGACACAAAGAGGGGAATGACAGGCACTGAGCCTACTTGAGGGTGGGAGGAGGAAGTCGA 826

 52658809 TCAGAAAAAATAACTAGTGGGTACTAGGCTTAGTACCCGGGTGAAAAAATAATCTGTACA 52658868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      827 TCAGAAAAAATAACTAGTGGGTACTAGGCTTAGTACCCGGGTGAAAAAATAATCTGTACA 886

 52658869 ACAAACCCCCATGACATGAGTTTACCTTATAACAAACCTGCACATGTAATCTGAACCTAG 52658928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      887 ACAAACCCCCATGACATGAGTTTACCTTATAACAAACCTGCACATGTAATCTGAACCTAG 946

 52658929 ATAAAAGTTTAAAAAAATAAATAATCATATGTCCCTACAATGAAATATTCCACAGGCATT 52658988
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
      947 ATAAAAGTTTAAAAAAATAAATAATCATATGTCCCTATAATGAAATATTCCACAGGCATT 1006

 52658989 AAAATTCCCCAAGGAATTTTAGTAAGGAAAGAAAAAGCTGTGCCCAACAGCACGTACAGT 52659048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1007 AAAATTCCCCAAGGAATTTTAGTAAGGAAAGAAAAAGCTGTGCCCAACAGCACGTACAGT 1066

 52659049 ATGTTTCCATTTGTTTTTAAAAAATGGTGTCGGGAGGTTGAGGAGACAACTTATAAATAG 52659108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1067 ATGTTTCCATTTGTTTTTAAAAAATGGTGTCGGGAGGTTGAGGAGACAACTTATAAATAG 1126

 52659109 ACATGCCTGGGATACCTCTGGATATAAGAAACTGTAAAGTATTTACTTCTAAGGAAGGAA 52659168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1127 ACATGCCTGGGATACCTCTGGATATAAGAAACTGTAAAGTATTTACTTCTAAGGAAGGAA 1186

 52659169 ATTTGGGATGGGGCTTGGGGAGCCATCAGAGTTAGGGTGGGGATTTTTTCTCTGCCTTAT 52659228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1187 ATTTGGGATGGGGCTTGGGGAGCCATCAGAGTTAGGGTGGGGATTTTTTCTCTGCCTTAT 1246

 52659229 CTTATTATGTATATCGCTCAGAATGTTTGCTATGTGTATGCACCTACCCCATCCATTAAG 52659288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1247 CTTATTATGTATATCGCTCAGAATGTTTGCTATGTGTATGCACCTACCCCATCCATTAAG 1306

 52659289 AAATGAAGAAATAATGAAAAGAAAAAATGAAAGTAGGGAACTAGAAATGAGAGGTGGGAT 52659348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1307 AAATGAAGAAATAATGAAAAGAAAAAATGAAAGTAGGGAACTAGAAATGAGAGGTGGGAT 1366

 52659349 TCAAAGTGGACTGAACACTTGACCTATTTCCCAATTTGCCTAGGGCTGGCCCAGCAGCGA 52659408
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     1367 TCAAAGTGGACTGAACACTTGACCTATTTCCCAATTTGCCTGGGGCTGGCCCAGCAGCGA 1426

 52659409 GGCAGGTTCTAACCAATGAGCATCAGCTTTGAATGGAGGGGCTGATAGGCCAGGTGGGCC 52659468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1427 GGCAGGTTCTAACCAATGAGCATCAGCTTTGAATGGAGGGGCTGATAGGCCAGGTGGGCC 1486

 52659469 CTGCTTGCTGAGAGTGTCATGGCCTTAGGGACATCTCCATGTTGCAGAGTCTGAGCCTCT 52659528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1487 CTGCTTGCTGAGAGTGTCATGGCCTTAGGGACATCTCCATGTTGCAGAGTCTGAGCCTCT 1546

 52659529 GCTTGGCAAATTCAGAAAATCCAGCTTTTCTTTTTATATCACCTGGAGCTGATGTAACTC 52659588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1547 GCTTGGCAAATTCAGAAAATCCAGCTTTTCTTTTTATATCACCTGGAGCTGATGTAACTC 1606

 52659589 TCAGAAGGCATTTTTAAGAGGACTCATGAATTAACCACATAGCCAACTTACTGGCTTAAG 52659648
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1607 TCAGAACGCATTTTTAAGAGGACTCATGAATTAACCACATAGCCAACTTACTGGCTTAAG 1666

 52659649 ACTACGTGACAGAAAGCTGCAAAGGGGGCCAGCCACTGGTAACATCCCACCACTGTCCCT 52659708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1667 ACTACGTGACAGAAAGCTGCAAAGGGGGCCAGCCACTGGTAACATCCCACCACTGTCCCT 1726

 52659709 CTCTGTGGAAAACACAGATGGGATGCACATTGTGACGGGCAGGATGCCTGGAGAGCCCAC 52659768
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     1727 CTCTGTGGAAAACACAGATGGGATGCACATTGTGATGGGCAGGATGCCTGGAGAGCCCAC 1786

 52659769 AAATCTGCAAGCACAGCTGAAATTGGTTACAGGATTTCAATGTTTCATTGCTTGAAGCTA 52659828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1787 AAATCTGCAAGCACAGCTGAAATTGGTTACAGGATTTCAATGTTTCATTGCTTGAAGCTA 1846

 52659829 TGATAACTTGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGACGATGATTTTTTTTATAGC 52659888
          ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1847 TGATAACT---TGATGATGATGATGATGATGATGATGATGACGATGATTTTTTTTATAGC 1903

 52659889 CATCTTTTTAGAGGGATTTGAGGTAGGGAAAAAAATAAACCTCACACTATCGGAGGTTGC 52659948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1904 CATCTTTTTAGAGGGATTTGAGGTAGGGAAAAAAATAAACCTCACACTATCGGAGGTTGC 1963

 52659949 CAACTATGAGGTCTGCTGATGGTTTGGCCAACACAGTGTTTATATTTTTTTGAATTGGGA 52660008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1964 CAACTATGAGGTCTGCTGATGGTTTGGCCAACACAGTGTTTATATTTTTTTGAATTGGGA 2023

 52660009 AATTTCATTTAAAAGTCCTAAAATCAGGCTGTTATTGAAATATCTTATTATTGGCTCAGG 52660068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2024 AATTTCATTTAAAAGTCCTAAAATCAGGCTGTTATTGAAATATCTTATTATTGGCTCAGG 2083

 52660069 GTTTCCCAGGGCAGCCATCCTTGAAGCTGTG 52660099
          |||||||||||||||||||||||||||||||
     2084 GTTTCCCAGGGCAGCCATCCTTGAAGCTGTG 2114

Alignment time is 3.08956 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [52637064,52668002] =>     30939 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    2600] =>      2600 nucs 'mol-32-317a-079384_2600'

Score:        2599
Aligned:      2599        nucs
Identic:      2599 (100%) nucs =>      2056 (100%)       543 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [52646238,52648293] EXCISED REGION [52648295,52648837]
 second seq =>  [       1,    2056] EXCISED REGION [    2058,    2600]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [52648294,52648294]
 second seq =>         1 nucs [2057,2057]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [52648294,52648295] to [52648295,52648296]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 52646238 TGGAATATATTAAGTGCTTAATAAATATCACAAACATTAGTTATCATTATTCATGAGTGA 52646297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGGAATATATTAAGTGCTTAATAAATATCACAAACATTAGTTATCATTATTCATGAGTGA 60

 52646298 GAAAACTGACAGTCAGAGAGGTCAGTACACCCTCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCTAGTAAG 52646357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAAAACTGACAGTCAGAGAGGTCAGTACACCCTCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCTAGTAAG 120

 52646358 CAGCAGAGTCTGGCTTCAGGCAGAAATCTGACTTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGTCTTAC 52646417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAGCAGAGTCTGGCTTCAGGCAGAAATCTGACTTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGTCTTAC 180

 52646418 CAGGGACTTGTATTAGCATAGACTGTTAAGAATATGGGAAGATTTTTAAAATACAGTACT 52646477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CAGGGACTTGTATTAGCATAGACTGTTAAGAATATGGGAAGATTTTTAAAATACAGTACT 240

 52646478 CAGAAAATTTCTCTTTGAAAGGCTGGAAGAGCAGATATCCACACAAGAAGGCAAATTAGA 52646537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CAGAAAATTTCTCTTTGAAAGGCTGGAAGAGCAGATATCCACACAAGAAGGCAAATTAGA 300

 52646538 CCTCAGGCCAGTGTGGAATTAAAGGTGTAGGGTTATCTGGTCAAGACTGTGTGTGTGGAT 52646597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCTCAGGCCAGTGTGGAATTAAAGGTGTAGGGTTATCTGGTCAAGACTGTGTGTGTGGAT 360

 52646598 ACAGGCTCCAACCCCTCCAGGCAAGGGCACTGTTTCCAACATCCACCCTTTCTCCTTTGA 52646657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACAGGCTCCAACCCCTCCAGGCAAGGGCACTGTTTCCAACATCCACCCTTTCTCCTTTGA 420

 52646658 CCTCTACCTTGACCTAAATTAACTATAAAAGGTCCTTCTTTTCTAGGACCCTACTATAAA 52646717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCTCTACCTTGACCTAAATTAACTATAAAAGGTCCTTCTTTTCTAGGACCCTACTATAAA 480

 52646718 TCAGTGAAATATTCAGGAAAAAAAGAACACCAAGAATGTTGGGATCCCAGTTAAAGATCA 52646777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCAGTGAAATATTCAGGAAAAAAAGAACACCAAGAATGTTGGGATCCCAGTTAAAGATCA 540

 52646778 AGATTCTCTACTGATAAGCTGTGTGATATGGAGTAAATCACTAAAGATCTTTGAATCTCT 52646837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGATTCTCTACTGATAAGCTGTGTGATATGGAGTAAATCACTAAAGATCTTTGAATCTCT 600

 52646838 TCATTTGTAAAATGGGAATATTGGTAGTCCTACTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTAAAGAA 52646897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCATTTGTAAAATGGGAATATTGGTAGTCCTACTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTAAAGAA 660

 52646898 GAAAAGTCATGCAAAGGATCTGGCACAACGCCTTTTCCATAATAAGTGCTTAGTAATTGA 52646957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GAAAAGTCATGCAAAGGATCTGGCACAACGCCTTTTCCATAATAAGTGCTTAGTAATTGA 720

 52646958 CAGATACTGTGATAACTTTTCAGGTTTCTCTCATGCCTTTGACAACATTGCATTTTGCTT 52647017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CAGATACTGTGATAACTTTTCAGGTTTCTCTCATGCCTTTGACAACATTGCATTTTGCTT 780

 52647018 GCTCTATCTGTAGTCAGACACTTCTTAATATCTGTTTGCAGGAAGACAGAAAAATAAAGG 52647077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GCTCTATCTGTAGTCAGACACTTCTTAATATCTGTTTGCAGGAAGACAGAAAAATAAAGG 840

 52647078 GAAGAATTGAGATTTCTTTGATCTATTCATACTGCTCATTAATATGTAGTGAGAAATACA 52647137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GAAGAATTGAGATTTCTTTGATCTATTCATACTGCTCATTAATATGTAGTGAGAAATACA 900

 52647138 TACACACACACATACACACACATGCATCCATTAGCAATTGTTTTTGCCCAACTCTAGTGT 52647197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TACACACACACATACACACACATGCATCCATTAGCAATTGTTTTTGCCCAACTCTAGTGT 960

 52647198 CTCGCAGTGTCTAGACTAAACAACAAACAAAAAAGGGGGGAGAGTGAGCTGGATTAAGCA 52647257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTCGCAGTGTCTAGACTAAACAACAAACAAAAAAGGGGGGAGAGTGAGCTGGATTAAGCA 1020

 52647258 TTGAGGCACAGTGAAGAAATGGTCTGGGGCAAGCCCAGGGATGAATGTTAGGGGTTTCTC 52647317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTGAGGCACAGTGAAGAAATGGTCTGGGGCAAGCCCAGGGATGAATGTTAGGGGTTTCTC 1080

 52647318 ATAAACCTGAACCTGAAGAAAATCACCCTGCCAGCATATTGATCTTCTAGCTCTTCTTAA 52647377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATAAACCTGAACCTGAAGAAAATCACCCTGCCAGCATATTGATCTTCTAGCTCTTCTTAA 1140

 52647378 CCTTTTTTTCTGTGATTCAGGAATTCATAATGATAGAAAATATTATACTAAAGAAGAAAA 52647437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CCTTTTTTTCTGTGATTCAGGAATTCATAATGATAGAAAATATTATACTAAAGAAGAAAA 1200

 52647438 AAAGAGGGAGAATAAGTAAGTGATAGATGGATGCATCAGGGTGTAAAGTTAGCAAGTAAG 52647497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AAAGAGGGAGAATAAGTAAGTGATAGATGGATGCATCAGGGTGTAAAGTTAGCAAGTAAG 1260

 52647498 GCTGTTGAAGTGTCAGAGTGAATATAAATGAATTGTGGGAATGGTCCATGCCAGGAGAAG 52647557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GCTGTTGAAGTGTCAGAGTGAATATAAATGAATTGTGGGAATGGTCCATGCCAGGAGAAG 1320

 52647558 AGGGTATGGTTGACAAAAAGGGAAATGCTAAGATTCAAAACAGGGAAGGGCTTTTCAAAA 52647617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AGGGTATGGTTGACAAAAAGGGAAATGCTAAGATTCAAAACAGGGAAGGGCTTTTCAAAA 1380

 52647618 TGCCAAGAGCACCAACTTATATCTTTCAGTTTAATTCCTCTCTTCCTTACCCACTGGCTG 52647677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TGCCAAGAGCACCAACTTATATCTTTCAGTTTAATTCCTCTCTTCCTTACCCACTGGCTG 1440

 52647678 GAAAGCAAAGGAGCTAGTGGTAAGTAAGAGTGTTATAGCCAGAGAAAAAGTCTTCAAAAA 52647737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GAAAGCAAAGGAGCTAGTGGTAAGTAAGAGTGTTATAGCCAGAGAAAAAGTCTTCAAAAA 1500

 52647738 ACACAAAGTACTTTCCATGGACAACCTTTTTTATTTTAAAGTGCCAATATGTTGCTTTGA 52647797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ACACAAAGTACTTTCCATGGACAACCTTTTTTATTTTAAAGTGCCAATATGTTGCTTTGA 1560

 52647798 AAAAGAATAAATTCCTTACATCCAGGTATCTGGACTAGACTTCAGTGCATTTAGTGATTA 52647857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AAAAGAATAAATTCCTTACATCCAGGTATCTGGACTAGACTTCAGTGCATTTAGTGATTA 1620

 52647858 TAGCAAATCCAAACAGTAGCTTTTGATATCAGAGAATGGGTAAAGTGTTTTTGACAATTT 52647917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TAGCAAATCCAAACAGTAGCTTTTGATATCAGAGAATGGGTAAAGTGTTTTTGACAATTT 1680

 52647918 CTAAGAACTTAGAGTTCTTCGGTGATACGTTCCATGCAACTGAAGCTCTGCTCTCCAAAT 52647977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CTAAGAACTTAGAGTTCTTCGGTGATACGTTCCATGCAACTGAAGCTCTGCTCTCCAAAT 1740

 52647978 TTAGGTGGGTACATACCCAAGTCCATCACCTGGGGCTTCTATTTCCTTTGCTCAGATGCT 52648037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TTAGGTGGGTACATACCCAAGTCCATCACCTGGGGCTTCTATTTCCTTTGCTCAGATGCT 1800

 52648038 CACCTCCTAGGTGGGCACCTGACATAAGATAGACTAATAAAAATAAGTCCTGTAACTTTT 52648097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CACCTCCTAGGTGGGCACCTGACATAAGATAGACTAATAAAAATAAGTCCTGTAACTTTT 1860

 52648098 GATACTCCTATTAAAAAAGAGTTGCAAACCAATAGGAGGTACACTTGAGAATCAGCACAA 52648157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GATACTCCTATTAAAAAAGAGTTGCAAACCAATAGGAGGTACACTTGAGAATCAGCACAA 1920

 52648158 ATGAAAGTAGAACCTGGAAATCCAGGAAGCAGATACCCAATCATGTCATTTAAACATTTA 52648217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ATGAAAGTAGAACCTGGAAATCCAGGAAGCAGATACCCAATCATGTCATTTAAACATTTA 1980

 52648218 GATCCAGCTGTGCCTGAAGCTGAACTTTAGCATTACATAAGCCAATAAATCACTCTTCCC 52648277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GATCCAGCTGTGCCTGAAGCTGAACTTTAGCATTACATAAGCCAATAAATCACTCTTCCC 2040

 52648278 CAACTTACGCCAGTTG 52648293
          ||||||||||||||||
     2041 CAACTTACGCCAGTTG 2056

EXCISED REGION

 52648295 AATTGAATACATACTCAGTGACTTTGAGAGAATTCCAGGGAATTGGTCAGTCCCTGTTTC 52648354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2058 AATTGAATACATACTCAGTGACTTTGAGAGAATTCCAGGGAATTGGTCAGTCCCTGTTTC 2117

 52648355 ACTTGTAAATACACAGCAATCAAGCCTACCAAATCTATGATTGATTGGGGTGTCTGAAAG 52648414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2118 ACTTGTAAATACACAGCAATCAAGCCTACCAAATCTATGATTGATTGGGGTGTCTGAAAG 2177

 52648415 AGATGGAGGGAATGGAATCAACCTGAAAAACATATTTCAGGAGTTCATCCCTGAAAACTT 52648474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2178 AGATGGAGGGAATGGAATCAACCTGAAAAACATATTTCAGGAGTTCATCCCTGAAAACTT 2237

 52648475 CCCCAACCTAGCTAGAGGGGCCAACATTCAAATTCAGGAAATGCAGAGAACCCCAGTAAG 52648534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2238 CCCCAACCTAGCTAGAGGGGCCAACATTCAAATTCAGGAAATGCAGAGAACCCCAGTAAG 2297

 52648535 ATACTCCACAAAAAGATCTTCCCCAAGACATCATCATCAGATTCTCCAAAGTTGAAATGT 52648594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2298 ATACTCCACAAAAAGATCTTCCCCAAGACATCATCATCAGATTCTCCAAAGTTGAAATGT 2357

 52648595 AAGAAAAAATGCTAAAGGCAACTAGAGTGAAAGGCCCGGTCACCTAAAAAGGGAAGCACA 52648654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2358 AAGAAAAAATGCTAAAGGCAACTAGAGTGAAAGGCCCGGTCACCTAAAAAGGGAAGCACA 2417

 52648655 GACTTACAGTGGACCTCTCACTGGTAACCCTACAAGCCAGAAGAGATTGAGGACCAATAT 52648714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2418 GACTTACAGTGGACCTCTCACTGGTAACCCTACAAGCCAGAAGAGATTGAGGACCAATAT 2477

 52648715 TCAACATTCTTAAACAAAAAGAATTCCAACCCAGAATTTTATATCTGACTAAACTAAGCT 52648774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2478 TCAACATTCTTAAACAAAAAGAATTCCAACCCAGAATTTTATATCTGACTAAACTAAGCT 2537

 52648775 TCATAAGCAAAAGAGAAATAAGATCATTTTCAGACAAGCAAATGCTAAGGGAATTTGTGA 52648834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2538 TCATAAGCAAAAGAGAAATAAGATCATTTTCAGACAAGCAAATGCTAAGGGAATTTGTGA 2597

 52648835 CCA 52648837
          |||
     2598 CCA 2600

Alignment time is 3.62225 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [52637064,52668002] =>     30939 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    3960] =>      3960 nucs 'mol-32-317a-102445_3960'

Score:        3960
Aligned:      3960        nucs
Identic:      3960 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [52646380,52650339]
 second seq =>  [       1,    3960]

 52646380 GAAATCTGACTTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGTCTTACCAGGGACTTGTATTAGCATAGA 52646439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GAAATCTGACTTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGTCTTACCAGGGACTTGTATTAGCATAGA 60

 52646440 CTGTTAAGAATATGGGAAGATTTTTAAAATACAGTACTCAGAAAATTTCTCTTTGAAAGG 52646499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTGTTAAGAATATGGGAAGATTTTTAAAATACAGTACTCAGAAAATTTCTCTTTGAAAGG 120

 52646500 CTGGAAGAGCAGATATCCACACAAGAAGGCAAATTAGACCTCAGGCCAGTGTGGAATTAA 52646559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTGGAAGAGCAGATATCCACACAAGAAGGCAAATTAGACCTCAGGCCAGTGTGGAATTAA 180

 52646560 AGGTGTAGGGTTATCTGGTCAAGACTGTGTGTGTGGATACAGGCTCCAACCCCTCCAGGC 52646619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGGTGTAGGGTTATCTGGTCAAGACTGTGTGTGTGGATACAGGCTCCAACCCCTCCAGGC 240

 52646620 AAGGGCACTGTTTCCAACATCCACCCTTTCTCCTTTGACCTCTACCTTGACCTAAATTAA 52646679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAGGGCACTGTTTCCAACATCCACCCTTTCTCCTTTGACCTCTACCTTGACCTAAATTAA 300

 52646680 CTATAAAAGGTCCTTCTTTTCTAGGACCCTACTATAAATCAGTGAAATATTCAGGAAAAA 52646739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTATAAAAGGTCCTTCTTTTCTAGGACCCTACTATAAATCAGTGAAATATTCAGGAAAAA 360

 52646740 AAGAACACCAAGAATGTTGGGATCCCAGTTAAAGATCAAGATTCTCTACTGATAAGCTGT 52646799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAGAACACCAAGAATGTTGGGATCCCAGTTAAAGATCAAGATTCTCTACTGATAAGCTGT 420

 52646800 GTGATATGGAGTAAATCACTAAAGATCTTTGAATCTCTTCATTTGTAAAATGGGAATATT 52646859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTGATATGGAGTAAATCACTAAAGATCTTTGAATCTCTTCATTTGTAAAATGGGAATATT 480

 52646860 GGTAGTCCTACTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTAAAGAAGAAAAGTCATGCAAAGGATCTG 52646919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GGTAGTCCTACTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTAAAGAAGAAAAGTCATGCAAAGGATCTG 540

 52646920 GCACAACGCCTTTTCCATAATAAGTGCTTAGTAATTGACAGATACTGTGATAACTTTTCA 52646979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GCACAACGCCTTTTCCATAATAAGTGCTTAGTAATTGACAGATACTGTGATAACTTTTCA 600

 52646980 GGTTTCTCTCATGCCTTTGACAACATTGCATTTTGCTTGCTCTATCTGTAGTCAGACACT 52647039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GGTTTCTCTCATGCCTTTGACAACATTGCATTTTGCTTGCTCTATCTGTAGTCAGACACT 660

 52647040 TCTTAATATCTGTTTGCAGGAAGACAGAAAAATAAAGGGAAGAATTGAGATTTCTTTGAT 52647099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCTTAATATCTGTTTGCAGGAAGACAGAAAAATAAAGGGAAGAATTGAGATTTCTTTGAT 720

 52647100 CTATTCATACTGCTCATTAATATGTAGTGAGAAATACATACACACACACATACACACACA 52647159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTATTCATACTGCTCATTAATATGTAGTGAGAAATACATACACACACACATACACACACA 780

 52647160 TGCATCCATTAGCAATTGTTTTTGCCCAACTCTAGTGTCTCGCAGTGTCTAGACTAAACA 52647219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGCATCCATTAGCAATTGTTTTTGCCCAACTCTAGTGTCTCGCAGTGTCTAGACTAAACA 840

 52647220 ACAAACAAAAAAGGGGGGAGAGTGAGCTGGATTAAGCATTGAGGCACAGTGAAGAAATGG 52647279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ACAAACAAAAAAGGGGGGAGAGTGAGCTGGATTAAGCATTGAGGCACAGTGAAGAAATGG 900

 52647280 TCTGGGGCAAGCCCAGGGATGAATGTTAGGGGTTTCTCATAAACCTGAACCTGAAGAAAA 52647339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TCTGGGGCAAGCCCAGGGATGAATGTTAGGGGTTTCTCATAAACCTGAACCTGAAGAAAA 960

 52647340 TCACCCTGCCAGCATATTGATCTTCTAGCTCTTCTTAACCTTTTTTTCTGTGATTCAGGA 52647399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TCACCCTGCCAGCATATTGATCTTCTAGCTCTTCTTAACCTTTTTTTCTGTGATTCAGGA 1020

 52647400 ATTCATAATGATAGAAAATATTATACTAAAGAAGAAAAAAAGAGGGAGAATAAGTAAGTG 52647459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATTCATAATGATAGAAAATATTATACTAAAGAAGAAAAAAAGAGGGAGAATAAGTAAGTG 1080

 52647460 ATAGATGGATGCATCAGGGTGTAAAGTTAGCAAGTAAGGCTGTTGAAGTGTCAGAGTGAA 52647519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATAGATGGATGCATCAGGGTGTAAAGTTAGCAAGTAAGGCTGTTGAAGTGTCAGAGTGAA 1140

 52647520 TATAAATGAATTGTGGGAATGGTCCATGCCAGGAGAAGAGGGTATGGTTGACAAAAAGGG 52647579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TATAAATGAATTGTGGGAATGGTCCATGCCAGGAGAAGAGGGTATGGTTGACAAAAAGGG 1200

 52647580 AAATGCTAAGATTCAAAACAGGGAAGGGCTTTTCAAAATGCCAAGAGCACCAACTTATAT 52647639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AAATGCTAAGATTCAAAACAGGGAAGGGCTTTTCAAAATGCCAAGAGCACCAACTTATAT 1260

 52647640 CTTTCAGTTTAATTCCTCTCTTCCTTACCCACTGGCTGGAAAGCAAAGGAGCTAGTGGTA 52647699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTTTCAGTTTAATTCCTCTCTTCCTTACCCACTGGCTGGAAAGCAAAGGAGCTAGTGGTA 1320

 52647700 AGTAAGAGTGTTATAGCCAGAGAAAAAGTCTTCAAAAAACACAAAGTACTTTCCATGGAC 52647759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AGTAAGAGTGTTATAGCCAGAGAAAAAGTCTTCAAAAAACACAAAGTACTTTCCATGGAC 1380

 52647760 AACCTTTTTTATTTTAAAGTGCCAATATGTTGCTTTGAAAAAGAATAAATTCCTTACATC 52647819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AACCTTTTTTATTTTAAAGTGCCAATATGTTGCTTTGAAAAAGAATAAATTCCTTACATC 1440

 52647820 CAGGTATCTGGACTAGACTTCAGTGCATTTAGTGATTATAGCAAATCCAAACAGTAGCTT 52647879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CAGGTATCTGGACTAGACTTCAGTGCATTTAGTGATTATAGCAAATCCAAACAGTAGCTT 1500

 52647880 TTGATATCAGAGAATGGGTAAAGTGTTTTTGACAATTTCTAAGAACTTAGAGTTCTTCGG 52647939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTGATATCAGAGAATGGGTAAAGTGTTTTTGACAATTTCTAAGAACTTAGAGTTCTTCGG 1560

 52647940 TGATACGTTCCATGCAACTGAAGCTCTGCTCTCCAAATTTAGGTGGGTACATACCCAAGT 52647999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TGATACGTTCCATGCAACTGAAGCTCTGCTCTCCAAATTTAGGTGGGTACATACCCAAGT 1620

 52648000 CCATCACCTGGGGCTTCTATTTCCTTTGCTCAGATGCTCACCTCCTAGGTGGGCACCTGA 52648059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CCATCACCTGGGGCTTCTATTTCCTTTGCTCAGATGCTCACCTCCTAGGTGGGCACCTGA 1680

 52648060 CATAAGATAGACTAATAAAAATAAGTCCTGTAACTTTTGATACTCCTATTAAAAAAGAGT 52648119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CATAAGATAGACTAATAAAAATAAGTCCTGTAACTTTTGATACTCCTATTAAAAAAGAGT 1740

 52648120 TGCAAACCAATAGGAGGTACACTTGAGAATCAGCACAAATGAAAGTAGAACCTGGAAATC 52648179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGCAAACCAATAGGAGGTACACTTGAGAATCAGCACAAATGAAAGTAGAACCTGGAAATC 1800

 52648180 CAGGAAGCAGATACCCAATCATGTCATTTAAACATTTAGATCCAGCTGTGCCTGAAGCTG 52648239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CAGGAAGCAGATACCCAATCATGTCATTTAAACATTTAGATCCAGCTGTGCCTGAAGCTG 1860

 52648240 AACTTTAGCATTACATAAGCCAATAAATCACTCTTCCCCAACTTACGCCAGTTGAAATTG 52648299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AACTTTAGCATTACATAAGCCAATAAATCACTCTTCCCCAACTTACGCCAGTTGAAATTG 1920

 52648300 AATACATACTCAGTGACTTTGAGAGAATTCCAGGGAATTGGTCAGTCCCTGTTTCACTTG 52648359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AATACATACTCAGTGACTTTGAGAGAATTCCAGGGAATTGGTCAGTCCCTGTTTCACTTG 1980

 52648360 TAAATACACAGCAATCAAGCCTACCAAATCTATGATTGATTGGGGTGTCTGAAAGAGATG 52648419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TAAATACACAGCAATCAAGCCTACCAAATCTATGATTGATTGGGGTGTCTGAAAGAGATG 2040

 52648420 GAGGGAATGGAATCAACCTGAAAAACATATTTCAGGAGTTCATCCCTGAAAACTTCCCCA 52648479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GAGGGAATGGAATCAACCTGAAAAACATATTTCAGGAGTTCATCCCTGAAAACTTCCCCA 2100

 52648480 ACCTAGCTAGAGGGGCCAACATTCAAATTCAGGAAATGCAGAGAACCCCAGTAAGATACT 52648539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ACCTAGCTAGAGGGGCCAACATTCAAATTCAGGAAATGCAGAGAACCCCAGTAAGATACT 2160

 52648540 CCACAAAAAGATCTTCCCCAAGACATCATCATCAGATTCTCCAAAGTTGAAATGTAAGAA 52648599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CCACAAAAAGATCTTCCCCAAGACATCATCATCAGATTCTCCAAAGTTGAAATGTAAGAA 2220

 52648600 AAAATGCTAAAGGCAACTAGAGTGAAAGGCCCGGTCACCTAAAAAGGGAAGCACAGACTT 52648659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AAAATGCTAAAGGCAACTAGAGTGAAAGGCCCGGTCACCTAAAAAGGGAAGCACAGACTT 2280

 52648660 ACAGTGGACCTCTCACTGGTAACCCTACAAGCCAGAAGAGATTGAGGACCAATATTCAAC 52648719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 ACAGTGGACCTCTCACTGGTAACCCTACAAGCCAGAAGAGATTGAGGACCAATATTCAAC 2340

 52648720 ATTCTTAAACAAAAAGAATTCCAACCCAGAATTTTATATCTGACTAAACTAAGCTTCATA 52648779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 ATTCTTAAACAAAAAGAATTCCAACCCAGAATTTTATATCTGACTAAACTAAGCTTCATA 2400

 52648780 AGCAAAAGAGAAATAAGATCATTTTCAGACAAGCAAATGCTAAGGGAATTTGTGACCATT 52648839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AGCAAAAGAGAAATAAGATCATTTTCAGACAAGCAAATGCTAAGGGAATTTGTGACCATT 2460

 52648840 AGACCTTCCTTGCAACAGTTCCTAAAGGAAGCACTAAATATGGAAAGACCATTACCAGAC 52648899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AGACCTTCCTTGCAACAGTTCCTAAAGGAAGCACTAAATATGGAAAGACCATTACCAGAC 2520

 52648900 ACTACAAAACACACTGAAGTACACAGACCAGTGACATTGTAAAGCAACTACATAACAAGT 52648959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 ACTACAAAACACACTGAAGTACACAGACCAGTGACATTGTAAAGCAACTACATAACAAGT 2580

 52648960 CTGCAAAATAACCAGCCAACATCATGATGACGGTATCAAATCGACACATAGCAACACTAA 52649019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CTGCAAAATAACCAGCCAACATCATGATGACGGTATCAAATCGACACATAGCAACACTAA 2640

 52649020 CCTTAAATGTAAATGGACTAAATGATCCCATTAAAAGACATAAAGTGGCAGGCTGGATAA 52649079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CCTTAAATGTAAATGGACTAAATGATCCCATTAAAAGACATAAAGTGGCAGGCTGGATAA 2700

 52649080 AGAACCAAGAACCATTGGTATACTGTCTTCAAGAGACCCATCTCCTATGCAGTGACACAC 52649139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AGAACCAAGAACCATTGGTATACTGTCTTCAAGAGACCCATCTCCTATGCAGTGACACAC 2760

 52649140 ATAGGTTCAAGATAAAGGGATGGGGAAAAATCTACCAAGCAAATAGAAAACAGAATAAAA 52649199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 ATAGGTTCAAGATAAAGGGATGGGGAAAAATCTACCAAGCAAATAGAAAACAGAATAAAA 2820

 52649200 CAGGGGTTGCAATCCTAGTTGCCGTCAAAACAGACTTTAAACCAACAAAGGTTAAAAGAA 52649259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CAGGGGTTGCAATCCTAGTTGCCGTCAAAACAGACTTTAAACCAACAAAGGTTAAAAGAA 2880

 52649260 AAAAATATGGGCATTGCATAAGGATAAAGTGTTAAATTAAACAAGAAGATCTAACTATCC 52649319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 AAAAATATGGGCATTGCATAAGGATAAAGTGTTAAATTAAACAAGAAGATCTAACTATCC 2940

 52649320 TAAGTATATATGCACCAAACACAGGAACACCCAGATTCATAAAGCAAGTTTATGGAGACC 52649379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TAAGTATATATGCACCAAACACAGGAACACCCAGATTCATAAAGCAAGTTTATGGAGACC 3000

 52649380 TTCAAACAGACTTAGACTCCCACACAATAGTAGTGGGAGACTTTAATACCCCATGACAAT 52649439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TTCAAACAGACTTAGACTCCCACACAATAGTAGTGGGAGACTTTAATACCCCATGACAAT 3060

 52649440 ATTAGACAGATCATTGAGACAGGAAATTAACAAAGATATTCAAGATCTAACTCAGCACTA 52649499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 ATTAGACAGATCATTGAGACAGGAAATTAACAAAGATATTCAAGATCTAACTCAGCACTA 3120

 52649500 AATCAAATGGCCCTGATAGATATCTACAGGACTGTCCTACTTGAAACCATACAATTACAT 52649559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 AATCAAATGGCCCTGATAGATATCTACAGGACTGTCCTACTTGAAACCATACAATTACAT 3180

 52649560 GGTAATTGAATGACCTGCTCCTGAATGACTTTTGGGTAAATAATAAAATTAAGGCAGAAA 52649619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 GGTAATTGAATGACCTGCTCCTGAATGACTTTTGGGTAAATAATAAAATTAAGGCAGAAA 3240

 52649620 TCAAGAAGTTTTTTGAACTAATGAGAACAAAGATACAACATACCAGAATCTTTGGGACAC 52649679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TCAAGAAGTTTTTTGAACTAATGAGAACAAAGATACAACATACCAGAATCTTTGGGACAC 3300

 52649680 AGCTAAGGCAGTGTTAAGAGGGAAATTTATAGCACTAAATCCCACATCAAAAAGTTAGAA 52649739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 AGCTAAGGCAGTGTTAAGAGGGAAATTTATAGCACTAAATCCCACATCAAAAAGTTAGAA 3360

 52649740 AGAGCTCACGTTAACAATCTAACCTCACAACTACAGGAACTAGAGAACTGAGAGCAGAAA 52649799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 AGAGCTCACGTTAACAATCTAACCTCACAACTACAGGAACTAGAGAACTGAGAGCAGAAA 3420

 52649800 AACCTGAAAGCTAGCAGAAGACAAGAAATAACCAAAATTAGAGCTGAACTGAAGGAGATT 52649859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 AACCTGAAAGCTAGCAGAAGACAAGAAATAACCAAAATTAGAGCTGAACTGAAGGAGATT 3480

 52649860 GAGACATGAAAAACCATTCAAAAGATCAGTGAATTCAGGAGCTGTTTTTTTTTTGAACAA 52649919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 GAGACATGAAAAACCATTCAAAAGATCAGTGAATTCAGGAGCTGTTTTTTTTTTGAACAA 3540

 52649920 ATTAATAAAATAGACCATTAGCTAGAGTAATAAACAAGAAAATAGAAAAGATTCAAATAA 52649979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 ATTAATAAAATAGACCATTAGCTAGAGTAATAAACAAGAAAATAGAAAAGATTCAAATAA 3600

 52649980 ACACAATCAGAAACGACAAGGGGGATATTACCACTGACCCCACAGAAGTACAAACAACCA 52650039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 ACACAATCAGAAACGACAAGGGGGATATTACCACTGACCCCACAGAAGTACAAACAACCA 3660

 52650040 TCAGAGAATATTATGAACATCTCTATGCACATAAACTAGAAAATCTAGAAGAAGTGGATA 52650099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 TCAGAGAATATTATGAACATCTCTATGCACATAAACTAGAAAATCTAGAAGAAGTGGATA 3720

 52650100 AACTTCTGGACATATACACCCTTCTAAGACTGTACCAGGAAGAAATTGAATCCCTGAACA 52650159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 AACTTCTGGACATATACACCCTTCTAAGACTGTACCAGGAAGAAATTGAATCCCTGAACA 3780

 52650160 GACCAATAATGAGCCCTAAAATTGAGGAAGTAATACATAGACTACCAACCATAAAAAAAC 52650219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 GACCAATAATGAGCCCTAAAATTGAGGAAGTAATACATAGACTACCAACCATAAAAAAAC 3840

 52650220 CCAGTACTAGATGGATTCACAGGTAAGTTCTACCAGTTGTACAAAGAAGAGCTGGTACAG 52650279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 CCAGTACTAGATGGATTCACAGGTAAGTTCTACCAGTTGTACAAAGAAGAGCTGGTACAG 3900

 52650280 TTCCTACTGAAATTATTCCAAAAAGTTGAGTAGGAGGGAGTCCTTCCTAACTCATTTGAT 52650339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 TTCCTACTGAAATTATTCCAAAAAGTTGAGTAGGAGGGAGTCCTTCCTAACTCATTTGAT 3960

Alignment time is 4.60346 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [52637064,52668002] =>     30939 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    3352] =>      3352 nucs 'mol-32-317a-183455_3352'

Score:        3351
Aligned:      3351        nucs
Identic:      3351 (100%) nucs =>      1173 (100%)      2178 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [52643715,52644887] EXCISED REGION [52644889,52647066]
 second seq =>  [       1,    1173] EXCISED REGION [    1175,    3352]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [52644888,52644888]
 second seq =>         1 nucs [1174,1174]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [1173,1174] to [1174,1175]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [52644887,52644887] to [52644889,52644889]
 second seq =>         1 nucs [1173,1173] to [1175,1175]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 52643715 AAATGTATAGAAAACACAAGAATGCTGACAGTAAGAGCCTAAAACACATGATGACTATTA 52643774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAATGTATAGAAAACACAAGAATGCTGACAGTAAGAGCCTAAAACACATGATGACTATTA 60

 52643775 TCTTTTCCCAATTTTAACTCTCCAGAGTGTTCAGCGGTGCCCAGCCTTCATAATGTAATT 52643834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCTTTTCCCAATTTTAACTCTCCAGAGTGTTCAGCGGTGCCCAGCCTTCATAATGTAATT 120

 52643835 CTTCGTAGCACCCTGGATGCATTAAAACCATAGATTAACGTGATACTTATTTTCATTAAG 52643894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTTCGTAGCACCCTGGATGCATTAAAACCATAGATTAACGTGATACTTATTTTCATTAAG 180

 52643895 GAAAATAATTTACGTACAGTGCTCAGAGTAGAGCCTGGCACATTGAACATTTTCAATAAA 52643954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GAAAATAATTTACGTACAGTGCTCAGAGTAGAGCCTGGCACATTGAACATTTTCAATAAA 240

 52643955 TGACAGCAAGTGTAATTATTAGCACTTCGGAAGTGCAAAGTTGCATTGTATTAAGACAAA 52644014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGACAGCAAGTGTAATTATTAGCACTTCGGAAGTGCAAAGTTGCATTGTATTAAGACAAA 300

 52644015 TATATTTGGAGCTCATCCAATTTTTTCCTGGCTCTGAAGTCTGCTAGTGGCACTTAACTT 52644074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TATATTTGGAGCTCATCCAATTTTTTCCTGGCTCTGAAGTCTGCTAGTGGCACTTAACTT 360

 52644075 TATTCCCAAGTTTTGAAAAATATTGTTATTTAAAAAGTCTGTTAACCAAGGAAATGCATG 52644134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TATTCCCAAGTTTTGAAAAATATTGTTATTTAAAAAGTCTGTTAACCAAGGAAATGCATG 420

 52644135 CCCTAAACCTATAATGTATCAAGTTTTACTTCCTTCTTCTTTTAAGGAGTTCTTTTCCTG 52644194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCCTAAACCTATAATGTATCAAGTTTTACTTCCTTCTTCTTTTAAGGAGTTCTTTTCCTG 480

 52644195 CCTTGAATACAAACAGGCTCTCTCAAGGTTAAAAGCAAATGCTCTTTTTAGTGTCAAAAA 52644254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCTTGAATACAAACAGGCTCTCTCAAGGTTAAAAGCAAATGCTCTTTTTAGTGTCAAAAA 540

 52644255 GAGCTTGCCTTTCTTCGCTCAGGAAAAAAAGCAACTGATTCCAGGATACCTTCTTTGAAA 52644314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GAGCTTGCCTTTCTTCGCTCAGGAAAAAAAGCAACTGATTCCAGGATACCTTCTTTGAAA 600

 52644315 ACCAACACAAAAAAACCCCCCAAAAAACAAAAAAAAAACCCAAAACCCCTAGTTTTTACA 52644374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ACCAACACAAAAAAACCCCCCAAAAAACAAAAAAAAAACCCAAAACCCCTAGTTTTTACA 660

 52644375 AAGGTTTATTACTCCTACTTGTTGGAAAAGAATTACTACATAAAAGAGTCTGCCCAGAGC 52644434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAGGTTTATTACTCCTACTTGTTGGAAAAGAATTACTACATAAAAGAGTCTGCCCAGAGC 720

 52644435 TGTAAAATCTCCTTATTCAAACACACACCTTAGAGCAAAAGATGGTTAAATATCAATTCA 52644494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGTAAAATCTCCTTATTCAAACACACACCTTAGAGCAAAAGATGGTTAAATATCAATTCA 780

 52644495 GGCTATTAACAGTAAGGGACGAAATGTGTTCCAACAAAACTCTGCATGTCAACAAACTAC 52644554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GGCTATTAACAGTAAGGGACGAAATGTGTTCCAACAAAACTCTGCATGTCAACAAACTAC 840

 52644555 AGAGACTAGGTAACATCTTTTAGGAATCATTTTTATTCCACTAATGCCTTTTCCTCCAGA 52644614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGAGACTAGGTAACATCTTTTAGGAATCATTTTTATTCCACTAATGCCTTTTCCTCCAGA 900

 52644615 ATCCACTGATCGTAAACGCAACCTGTCTACTTCCGCCTTTGAAAAATGGATGGACAAATT 52644674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATCCACTGATCGTAAACGCAACCTGTCTACTTCCGCCTTTGAAAAATGGATGGACAAATT 960

 52644675 CATCTGCATGTAACTCACCTCCTCTTTTCTTTTACATAAAACAGATGCCACAGCTGTTAT 52644734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CATCTGCATGTAACTCACCTCCTCTTTTCTTTTACATAAAACAGATGCCACAGCTGTTAT 1020

 52644735 TGTTCTTCACACAGAAGTTTCTACCCAGAGAAACATCAGGATGACACTCTGCTGCAATGT 52644794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGTTCTTCACACAGAAGTTTCTACCCAGAGAAACATCAGGATGACACTCTGCTGCAATGT 1080

 52644795 GCTATTTGTTCTAGAGGGGTCAACAGCTTGCCACCTTGCCTAGGCCCAGGGTGACTGCAT 52644854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GCTATTTGTTCTAGAGGGGTCAACAGCTTGCCACCTTGCCTAGGCCCAGGGTGACTGCAT 1140

 52644855 ATGTGCAGTGGTCTTATCCCATTAGCGCCCCCG 52644887
          |||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATGTGCAGTGGTCTTATCCCATTAGCGCCCCCG 1173

EXCISED REGION

 52644889 GCATGCATTCAGAACCAAGTGGATACACCTTGGCACACTTACCTTCCCTGCAGGGACATC 52644948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1175 GCATGCATTCAGAACCAAGTGGATACACCTTGGCACACTTACCTTCCCTGCAGGGACATC 1234

 52644949 ATCGGACTGCCCTGATAAGCCAGGAACCTCATCCACCTTGTCTTGATGCTCTGCCCTCTT 52645008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1235 ATCGGACTGCCCTGATAAGCCAGGAACCTCATCCACCTTGTCTTGATGCTCTGCCCTCTT 1294

 52645009 GGCTTCCTGTTGGCTGTCACCTGGCACCTTTTCCTGTCCCTTGTCCAGCTTGAAGAATTT 52645068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1295 GGCTTCCTGTTGGCTGTCACCTGGCACCTTTTCCTGTCCCTTGTCCAGCTTGAAGAATTT 1354

 52645069 GTCAAAAAAGCTGGAGTCCTTGGGCTTGGAGGGAGCTTCTCCTCCTGCTCCCCCTGTCTC 52645128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1355 GTCAAAAAAGCTGGAGTCCTTGGGCTTGGAGGGAGCTTCTCCTCCTGCTCCCCCTGTCTC 1414

 52645129 AGGTGGGAGAAGCGTGGGATCCCTGGCGGCAGAGAGGACCTTGTCTTGGGCCGGGGCGTG 52645188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1415 AGGTGGGAGAAGCGTGGGATCCCTGGCGGCAGAGAGGACCTTGTCTTGGGCCGGGGCGTG 1474

 52645189 CCCTGGGGTTTTATCTGTGTCCTGCCCCGGTCCAGCTGCCACCGGAAGTGTCCAGCTCTC 52645248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1475 CCCTGGGGTTTTATCTGTGTCCTGCCCCGGTCCAGCTGCCACCGGAAGTGTCCAGCTCTC 1534

 52645249 ACTTGGGTCTTTGTTCGCTGGAGCTTTATTGGAGCTGACATCAAGCTTCACTGATCCAAG 52645308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1535 ACTTGGGTCTTTGTTCGCTGGAGCTTTATTGGAGCTGACATCAAGCTTCACTGATCCAAG 1594

 52645309 GGATGAATCTGCGGCTTGGTCTCCGGTACGTCCTGGTACAGGCCGAGAGAGCATCAAGAA 52645368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1595 GGATGAATCTGCGGCTTGGTCTCCGGTACGTCCTGGTACAGGCCGAGAGAGCATCAAGAA 1654

 52645369 AAAACGAGATTTAGCAGCTGGTGCCTCGGGTTTGGCCTCTTTCCCAAGATTCTTTCCGTT 52645428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1655 AAAACGAGATTTAGCAGCTGGTGCCTCGGGTTTGGCCTCTTTCCCAAGATTCTTTCCGTT 1714

 52645429 GGCATCCGCAACAGCACTTATCTCCGTTGTCTCGGGGGAAGAAGTGGCCACATTATCCGT 52645488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1715 GGCATCCGCAACAGCACTTATCTCCGTTGTCTCGGGGGAAGAAGTGGCCACATTATCCGT 1774

 52645489 CTTGACACTTATTCCCAAGTCGACTGTAAACACAAACATAAACAGTGGTTATTCAGCCAA 52645548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1775 CTTGACACTTATTCCCAAGTCGACTGTAAACACAAACATAAACAGTGGTTATTCAGCCAA 1834

 52645549 GCCGGGAAATTCAGGCACTAATAATGGACTCCAGACATTTTTTATACAAAAGCCATACTG 52645608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1835 GCCGGGAAATTCAGGCACTAATAATGGACTCCAGACATTTTTTATACAAAAGCCATACTG 1894

 52645609 CATACTGGAACTGTGTTGTTCTCTGGTCATTCTGAAAGGCAGAAGTTAGCTCTCTACATC 52645668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1895 CATACTGGAACTGTGTTGTTCTCTGGTCATTCTGAAAGGCAGAAGTTAGCTCTCTACATC 1954

 52645669 TCCTTGGACCCTGCTTTTCTTGGGAGAGGAGAAGGCAAGGTTGGTGAGGAGGGAAAGCTA 52645728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1955 TCCTTGGACCCTGCTTTTCTTGGGAGAGGAGAAGGCAAGGTTGGTGAGGAGGGAAAGCTA 2014

 52645729 CTTAATGGAAAGTCACTAGCTGCCAGGTGTGGAATGAGTGATATTCAATGTTAATTAATC 52645788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2015 CTTAATGGAAAGTCACTAGCTGCCAGGTGTGGAATGAGTGATATTCAATGTTAATTAATC 2074

 52645789 TTCTTTTATCTGTGTAAGAACTCCGTGAGCAGCATATTGTCATGATGTCAACTGGGAGGC 52645848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2075 TTCTTTTATCTGTGTAAGAACTCCGTGAGCAGCATATTGTCATGATGTCAACTGGGAGGC 2134

 52645849 AGTACAGCAGTTAGGAGCTTGGGTTCTGGAGCTAGAACAAGGTTTCTCAACCTCAGCACT 52645908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2135 AGTACAGCAGTTAGGAGCTTGGGTTCTGGAGCTAGAACAAGGTTTCTCAACCTCAGCACT 2194

 52645909 ACTCACATTTGAAGCCAGATTATTCTTTGTTAGGGAGGCTCATCCCGTGCCTCATAGGCT 52645968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2195 ACTCACATTTGAAGCCAGATTATTCTTTGTTAGGGAGGCTCATCCCGTGCCTCATAGGCT 2254

 52645969 GATTAGCAGCATCCTGGCCTCTGCCCACTAGACGCCGGTCACATTTCCCAGTCATGGCAA 52646028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2255 GATTAGCAGCATCCTGGCCTCTGCCCACTAGACGCCGGTCACATTTCCCAGTCATGGCAA 2314

 52646029 CCAAAAATATCTCTAGGCATTGCTAAATGTCCCCTGGAGGACAAAATCTCTTACGTTTGA 52646088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2315 CCAAAAATATCTCTAGGCATTGCTAAATGTCCCCTGGAGGACAAAATCTCTTACGTTTGA 2374

 52646089 GAGGCACTGAGCTGAAATGTCTTTTTGAATCCAGATTATCTAATTTTCTGTGCCTCAACT 52646148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2375 GAGGCACTGAGCTGAAATGTCTTTTTGAATCCAGATTATCTAATTTTCTGTGCCTCAACT 2434

 52646149 TTCTGGTAAAAGGAGACAGATAATAAATCTCGTAATTTTGTTAGGAAGATTACATGAGTT 52646208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2435 TTCTGGTAAAAGGAGACAGATAATAAATCTCGTAATTTTGTTAGGAAGATTACATGAGTT 2494

 52646209 AATAGTTTTAAAGCAAGTACAATAGCACCTGGAATATATTAAGTGCTTAATAAATATCAC 52646268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2495 AATAGTTTTAAAGCAAGTACAATAGCACCTGGAATATATTAAGTGCTTAATAAATATCAC 2554

 52646269 AAACATTAGTTATCATTATTCATGAGTGAGAAAACTGACAGTCAGAGAGGTCAGTACACC 52646328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2555 AAACATTAGTTATCATTATTCATGAGTGAGAAAACTGACAGTCAGAGAGGTCAGTACACC 2614

 52646329 CTCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCTAGTAAGCAGCAGAGTCTGGCTTCAGGCAGAAATCTGA 52646388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2615 CTCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCTAGTAAGCAGCAGAGTCTGGCTTCAGGCAGAAATCTGA 2674

 52646389 CTTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGTCTTACCAGGGACTTGTATTAGCATAGACTGTTAAGA 52646448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2675 CTTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGTCTTACCAGGGACTTGTATTAGCATAGACTGTTAAGA 2734

 52646449 ATATGGGAAGATTTTTAAAATACAGTACTCAGAAAATTTCTCTTTGAAAGGCTGGAAGAG 52646508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2735 ATATGGGAAGATTTTTAAAATACAGTACTCAGAAAATTTCTCTTTGAAAGGCTGGAAGAG 2794

 52646509 CAGATATCCACACAAGAAGGCAAATTAGACCTCAGGCCAGTGTGGAATTAAAGGTGTAGG 52646568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2795 CAGATATCCACACAAGAAGGCAAATTAGACCTCAGGCCAGTGTGGAATTAAAGGTGTAGG 2854

 52646569 GTTATCTGGTCAAGACTGTGTGTGTGGATACAGGCTCCAACCCCTCCAGGCAAGGGCACT 52646628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2855 GTTATCTGGTCAAGACTGTGTGTGTGGATACAGGCTCCAACCCCTCCAGGCAAGGGCACT 2914

 52646629 GTTTCCAACATCCACCCTTTCTCCTTTGACCTCTACCTTGACCTAAATTAACTATAAAAG 52646688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2915 GTTTCCAACATCCACCCTTTCTCCTTTGACCTCTACCTTGACCTAAATTAACTATAAAAG 2974

 52646689 GTCCTTCTTTTCTAGGACCCTACTATAAATCAGTGAAATATTCAGGAAAAAAAGAACACC 52646748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2975 GTCCTTCTTTTCTAGGACCCTACTATAAATCAGTGAAATATTCAGGAAAAAAAGAACACC 3034

 52646749 AAGAATGTTGGGATCCCAGTTAAAGATCAAGATTCTCTACTGATAAGCTGTGTGATATGG 52646808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3035 AAGAATGTTGGGATCCCAGTTAAAGATCAAGATTCTCTACTGATAAGCTGTGTGATATGG 3094

 52646809 AGTAAATCACTAAAGATCTTTGAATCTCTTCATTTGTAAAATGGGAATATTGGTAGTCCT 52646868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3095 AGTAAATCACTAAAGATCTTTGAATCTCTTCATTTGTAAAATGGGAATATTGGTAGTCCT 3154

 52646869 ACTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTAAAGAAGAAAAGTCATGCAAAGGATCTGGCACAACGC 52646928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3155 ACTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTAAAGAAGAAAAGTCATGCAAAGGATCTGGCACAACGC 3214

 52646929 CTTTTCCATAATAAGTGCTTAGTAATTGACAGATACTGTGATAACTTTTCAGGTTTCTCT 52646988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3215 CTTTTCCATAATAAGTGCTTAGTAATTGACAGATACTGTGATAACTTTTCAGGTTTCTCT 3274

 52646989 CATGCCTTTGACAACATTGCATTTTGCTTGCTCTATCTGTAGTCAGACACTTCTTAATAT 52647048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3275 CATGCCTTTGACAACATTGCATTTTGCTTGCTCTATCTGTAGTCAGACACTTCTTAATAT 3334

 52647049 CTGTTTGCAGGAAGACAG 52647066
          ||||||||||||||||||
     3335 CTGTTTGCAGGAAGACAG 3352

Alignment time is 4.64748 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [52637064,52668002] =>     30939 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    5361] =>      5361 nucs 'mol-32-3185-272340_5361'

Score:        5222
Aligned:      5364        nucs
Identic:      5347 (100%) nucs =>      4979 (100%)       368 (100%)
Gaps:            7 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [52642073,52647064] EXCISED REGION [52658003,52658370]
 second seq =>  [       1,    4993] EXCISED REGION [    4994,    5361]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>     10938 nucs [52647065,52658002]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         6 nucs [52647065,52647070] to [52658003,52658008]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [52647065,52647067] to [52658000,52658002]
 second seq =>         0 nucs

 52642073 ACAGAAGATTTGTATGTTTCCCCCAGGATGAAATGGTGGCATCTTTCTCCCAATTCACAG 52642132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACAGAAGATTTGTATGTTTCCCCCAGGATGAAATGGTGGCATCTTTCTCCCAATTCACAG 60

 52642133 CTCTGTGGGCTTGTGGCTGGAATTCCAATCCAGCAGGGAGCAAGCCATAAAAATGGGGGG 52642192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTCTGTGGGCTTGTGGCTGGAATTCCAATCCAGCAGGGAGCAAGCCATAAAAATGGGGGG 120

 52642193 AAGGGCTGCTGGAGGGAGGCAGTAGATGCGGCTGAGCCCAAGGCATAATTCACCCTAAGA 52642252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAGGGCTGCTGGAGGGAGGCAGTAGATGCGGCTGAGCCCAAGGCATAATTCACCCTAAGA 180

 52642253 ATTCTGAATCAATACACTGACATCCAGCCATGTACAATGTGGTACTCCCACCAAGAAAGC 52642312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATTCTGAATCAATACACTGACATCCAGCCATGTACAATGTGGTACTCCCACCAAGAAAGC 240

 52642313 CACTGATTGAGAAGTTTTATTCATGTTACTTTCTGAGGGTTGGATTGTCCCATTACATTT 52642372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CACTGATTGAGAAGTTTTATTCATGTTACTTTCTGAGGGTTGGATTGTCCCATTACATTT 300

 52642373 ATAGAACAATTGCTTTTTTCCCCCTAAATACAGAACTATGCAGCCGGGAGTCAGAAAAGA 52642432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATAGAACAATTGCTTTTTTCCCCCTAAATACAGAACTATGCAGCCGGGAGTCAGAAAAGA 360

 52642433 AACCTTGACAATCAGAAGGCTGTTTTGTTGTTGTTGTTAAAAACCTTTGCAGGCATATGC 52642492
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GACCTTGACAATCAGAAGGCTGTTTTGTTGTTGTTGTTAAAAACCTTTGCAGGCATATGC 420

 52642493 ATCTGAATATCCATAAGTTCACAGGCTGAGGGAGAAATGGCTATTTCATAACTTTTCTGT 52642552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATCTGAATATCCATAAGTTCACAGGCTGAGGGAGAAATGGCTATTTCATAACTTTTCTGT 480

 52642553 GTTTCTCATGTACATAGTACAAAGTGGGCACTCAGTATTTCAAATTTCAATATCACTGAA 52642612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTTTCTCATGTACATAGTACAAAGTGGGCACTCAGTATTTCAAATTTCAATATCACTGAA 540

 52642613 AAAAATGGAAATTTGTCATGTAACAAAATCAGATGCAGACTTCACTGGTGAATCTGAGGG 52642672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAAAATGGAAATTTGTCATGTAACAAAATCAGATGCAGACTTCACTGGTGAATCTGAGGG 600

 52642673 AGTGAATTCACTTATTCAGAAAGGAAGACAGTTACAATTCTTGGGTCTTCTGAGAGATCA 52642732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGTGAATTCACTTATTCAGAAAGGAAGACAGTTACAATTCTTGGGTCTTCTGAGAGATCA 660

 52642733 TTATAACTTGAAAATATTACACAAGGGCTTTGCTATATTAGATACCTGCCATGTTCCTAA 52642792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTATAACTTGAAAATATTACACAAGGGCTTTGCTATATTAGATACCTGCCATGTTCCTAA 720

 52642793 CACAAGCTCCCATTTTCTGACTCAAATCTCATTTTGGAACACATTCCACTCAAATTGAGG 52642852
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TACAAGCTCCCATTTTCTGACTCAAATCTCATTTTGGAACACATTCCACTCAAATTGAGG 780

 52642853 TTCTACCCCTAAGAGTTCTTTTTCAATAAAGAAAGCTGAGTTAATAAATCACAACTCCAA 52642912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTCTACCCCTAAGAGTTCTTTTTCAATAAAGAAAGCTGAGTTAATAAATCACAACTCCAA 840

 52642913 AACTTTTCCTCACTTTTCTTAGACTAGAAATAGATTGAGTGTGTCGAGGTTTTATGGCTG 52642972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
      841 AACTTTTCCTCACTTTTCTTAGACTAGAAATAGATTGAATGTGTCGAGGTTTTATGGCTG 900

 52642973 AGTACATTGGAGGGCTGGCTATTCTATGCTGAACTGGTTTACTTGATTAAGATGGGGATT 52643032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGTACATTGGAGGGCTGGCTATTCTATGCTGAACTGGTTTACTTGATTAAGATGGGGATT 960

 52643033 TGGATGAGTCACCGGACACCTGTCCAAAGATGAGTAAAACACATTCCTTCATTGTCTTCC 52643092
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGGATGAGTCACTGGACACCTGTCCAAAGATGAGTAAAACACATTCCTTCATTGTCTTCC 1020

 52643093 CATAAATAACTCAATCTTCTCCTAACTGAGCCAATGGATAGGCTTTGGATGCCCAAGCAA 52643152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CATAAATAACTCAATCTTCTCCTAACTGAGCCAATGGATAGGCTTTGGATGCCCAAGCAA 1080

 52643153 AACAAACACATGACTGTTAAAAAATCACAACCTCAAAATGGCCTTAGAAGCCTATGACCA 52643212
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAGAAACACATGACTGTTAAAAAATCACAACCTCAAAATGGCCTTAGAAGCCTATGACCA 1140

 52643213 ATAATGAGAATGGTTTCTCCACTCAGGCGCAAGTAGTAAACAGTTTCTCCCATATGCAGG 52643272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATAATGAGAATGGTTTCTCCACTCAGGCGCAAGTAGTAAACAGTTTCTCCCATATGCAGG 1200

 52643273 AATATTGACGACTAGTTTACCGCCTCTGGGCACGTAACTTTCAGGTCCTGGTTCATGCAT 52643332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AATATTGACGACTAGTTTACCGCCTCTGGGCACGTAACTTTCAGGTCCTGGTTCATGCAT 1260

 52643333 TTGCTGGAATGTTCCCTGGGCCATGGAGCCCAGTTCTCCTGGCATCTGGCATCTCCCCCA 52643392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTGCTGGAATGTTCCCTGGGCCATGGAGCCCAGTTCTCCTGGCATCTGGCATCTCCCCCA 1320

 52643393 CACTCTGCTCCCCCAGCACAGCACTTGGCATCTTGCATTGCAATTGCAGGTTTATTTATT 52643452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CACTCTGCTCCCCCAGCACAGCACTTGGCATCTTGCATTGCAATTGCAGGTTTATTTATT 1380

 52643453 CACTTCTCTCACTGGACAGCAAACTCCACCAGGGCCGAGACTCTGTGTCTCGCCCTTCAC 52643512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CACTTCTCTCACTGGACAGCAAACTCCACCAGGGCCGAGACTCTGTGTCTCGCCCTTCAC 1440

 52643513 TGTGGTCCCTGTGCCTCACCTGTTCCTAGTACAGTGTCACACTCAGTAAAGAGCAGATGC 52643572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TGTGGTCCCTGTGCCTCACCTGTTCCTAGTACAGTGTCACACTCAGTAAAGAGCAGATGC 1500

 52643573 CTGG-TGCATTTGGAGACTTATTTTAAATTATACGGAAAGTTATTCAACCGGCTTCTTGA 52643631
          |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CTGGATGCATTTGGAGACTTATTTTAAATTATACGGAAAGTTATTCAACCGGCTTCTTGA 1560

 52643632 ACTGGTGAATTTTGGAAAGTGGGTGTTTGAAGGGAAAATGTTTAAACTCTGAAAGAAATG 52643691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ACTGGTGAATTTTGGAAAGTGGGTGTTTGAAGGGAAAATGTTTAAACTCTGAAAGAAATG 1620

 52643692 TTGGAAATAAGCTCTTTGAATCAAAATGTATAGAAAACACAAGAATGCTGACAGTAAGAG 52643751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTGGAAATAAGCTCTTTGAATCAAAATGTATAGAAAACACAAGAATGCTGACAGTAAGAG 1680

 52643752 CCTAAAACACATGATGACTATTATCTTTTCCCAATTTTAACTCTCCAGAGTGTTCAGCGG 52643811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CCTAAAACACATGATGACTATTATCTTTTCCCAATTTTAACTCTCCAGAGTGTTCAGCGG 1740

 52643812 TGCCCAGCCTTCATAATGTAATTCTTCGTAGCACCCTGGATGCATTAAAACCATAGATTA 52643871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGCCCAGCCTTCATAATGTAATTCTTCGTAGCACCCTGGATGCATTAAAACCATAGATTA 1800

 52643872 ACGTGATACTTATTTTCATTAAGGAAAATAATTTACGTACAGTGCTCAGAGTAGAGCCTG 52643931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ACGTGATACTTATTTTCATTAAGGAAAATAATTTACGTACAGTGCTCAGAGTAGAGCCTG 1860

 52643932 GCACATTGAACATTTTCAATAAATGACAGCAAGTGTAATTATTAGCACTTCGGAAGTGCA 52643991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     1861 GCACATTGAACATTTTCAATAAATGACAGCAAGTGTAATTATTAGCACTTTGGAAGTGCA 1920

 52643992 AAGTTGCATTGTATTAAGACAAATATATTTGGAGCTCATCCAATTTTTTCCTGGCTCTGA 52644051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AAGTTGCATTGTATTAAGACAAATATATTTGGAGCTCATCCAATTTTTTCCTGGCTCTGA 1980

 52644052 AGTCTGCTAGTGGCACTTAACTTTATTCCCAAGTTTTGAAAAATATTGTTATTTAAAAAG 52644111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AGTCTGCTAGTGGCACTTAACTTTATTCCCAAGTTTTGAAAAATATTGTTATTTAAAAAG 2040

 52644112 TCTGTTAACCAAGGAAATGCATGCCCTAAACCTATAATGTATCAAGTTTTACTTCCTTCT 52644171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TCTGTTAACCAAGGAAATGCATGCCCTAAACCTATAATGTATCAAGTTTTACTTCCTTCT 2100

 52644172 TCTTTTAAGGAGTTCTTTTCCTGCCTTGAATACAAACAGGCTCTCTCAAGGTTAAAAGCA 52644231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TCTTTTAAGGAGTTCTTTTCCTGCCTTGAATACAAACAGGCTCTCTCAAGGTTAAAAGCA 2160

 52644232 AATGCTCTTTTTAGTGTCAAAAAGAGCTTGCCTTTCTTCGCTCAGGAAAAAAAGCAACTG 52644291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AATGCTCTTTTTAGTGTCAAAAAGAGCTTGCCTTTCTTCGCTCAGGAAAAAAAGCAACTG 2220

 52644292 ATTCCAGGATACCTTCTTTGAAAACCAACACAAAAAAACCCCCCAAAAAACAAAAAAAAA 52644351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ATTCCAGGATACCTTCTTTGAAAACCAACACAAAAAAACCCCCCAAAAAACAAAAAAAAA 2280

 52644352 ACCCAAAACCCCTAGTTTTTACAAAGGTTTATTACTCCTACTTGTTGGAAAAGAATTACT 52644411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 ACCCAAAACCCCTAGTTTTTACAAAGGTTTATTACTCCTACTTGTTGGAAAAGAATTACT 2340

 52644412 ACATAAAAGAGTCTGCCCAGAGCTGTAAAATCTCCTTATTCAAACACACACCTTAGAGCA 52644471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 ACATAAAAGAGTCTGCCCAGAGCTGTAAAATCTCCTTATTCAAACACACACCTTAGAGCA 2400

 52644472 AAAGATGGTTAAATATCAATTCAGGCTATTAACAGTAAGGGAC---GAAATGTGTTCCAA 52644528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||
     2401 AAAGATGGTTAAATATCAATTCAGGCTATTAACAGTAAGG---AATGAAATGTGTTCCAA 2457

 52644529 CAAAACTCTGCATGTCAACAAACTACAGAGACTAGGTAACATCTTTTAGGAATCATTTTT 52644588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2458 CAAAACTCTGCATGTCAACAAACTACAGAGACTAGGTAACATCTTTTAGGAATCATTTTT 2517

 52644589 ATTCCACTAATGCCTTTTCCTCCAGAATCCACTGATCGTAAACGCAACCTGTCTACTTCC 52644648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2518 ATTCCACTAATGCCTTTTCCTCCAGAATCCACTGATCGTAAACGCAACCTGTCTACTTCC 2577

 52644649 GCCTTTGAAAAATGGATGGACAAATTCATCTGCATGTAACTCACCTCCTCTTTTCTTTTA 52644708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2578 GCCTTTGAAAAATGGATGGACAAATTCATCTGCATGTAACTCACCTCCTCTTTTCTTTTA 2637

 52644709 CATAAAACAGATGCCACAGCTGTTATTGTTCTTCACACAGAAGTTTCTACCCAGAGAAAC 52644768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2638 CATAAAACAGATGCCACAGCTGTTATTGTTCTTCACACAGAAGTTTCTACCCAGAGAAAC 2697

 52644769 ATCAGGATGACACTCTGCTGCAATGTGCTATTTGTTCTAGAGGGGTCAACAGCTTGCCAC 52644828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2698 ATCAGGATGACACTCTGCTGCAATGTGCTATTTGTTCTAGAGGGGTCAACAGCTTGCCAC 2757

 52644829 CTTGCCTAGGCCCAGGGTGACTGCATATGTGCAGTGGTCTTATCCCATTAGCGCCCCCGA 52644888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2758 CTTGCCTAGGCCCAGGGTGACTGCATATGTGCAGTGGTCTTATCCCATTAGCGCCCCCGA 2817

 52644889 GCATGCATTCAGAACCAAGTGGATACACCTTGGCACACTTACCTTCCCTGCAGGGACATC 52644948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2818 GCATGCATTCAGAACCAAGTGGATACACCTTGGCACACTTACCTTCCCTGCAGGGACATC 2877

 52644949 ATCGGACTGCCCTGATAAGCCAGGAACCTCATCCACCTTGTCTTGATGCTCTGCCCTCTT 52645008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2878 ATCGGACTGCCCTGATAAGCCAGGAACCTCATCCACCTTGTCTTGATGCTCTGCCCTCTT 2937

 52645009 GGCTTCCTGTTGGCTGTCACCTGGCACCTTTTCCTGTCCCTTGTCCAGCTTGAAGAATTT 52645068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2938 GGCTTCCTGTTGGCTGTCACCTGGCACCTTTTCCTGTCCCTTGTCCAGCTTGAAGAATTT 2997

 52645069 GTCAAAAAAGCTGGAGTCCTTGGGCTTGGAGGGAGCTTCTCCTCCTGCTCCCCCTGTCTC 52645128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2998 GTCAAAAAAGCTGGAGTCCTTGGGCTTGGAGGGAGCTTCTCCTCCTGCTCCCCCTGTCTC 3057

 52645129 AGGTGGGAGAAGCGTGGGATCCCTGGCGGCAGAGAGGACCTTGTCTTGGGCCGGGGCGTG 52645188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3058 AGGTGGGAGAAGCGTGGGATCCCTGGCGGCAGAGAGGACCTTGTCTTGGGCCGGGGCGTG 3117

 52645189 CCCTGGGGTTTTATCTGTGTCCTGCCCCGGTCCAGCTGCCACCGGAAGTGTCCAGCTCTC 52645248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3118 CCCTGGGGTTTTATCTGTGTCCTGCCCCGGTCCAGCTGCCACCGGAAGTGTCCAGCTCTC 3177

 52645249 ACTTGGGTCTTTGTTCGCTGGAGCTTTATTGGAGCTGACATCAAGCTTCACTGATCCAAG 52645308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3178 ACTTGGGTCTTTGTTCGCTGGAGCTTTATTGGAGCTGACATCAAGCTTCACTGATCCAAG 3237

 52645309 GGATGAATCTGCGGCTTGGTCTCCGGTACGTCCTGGTACAGGCCGAGAGAGCATCAAGAA 52645368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3238 GGATGAATCTGCGGCTTGGTCTCCGGTACGTCCTGGTACAGGCCGAGAGAGCATCAAGAA 3297

 52645369 AAAACGAGATTTAGCAGCTGGTGCCTCGGGTTTGGCCTCTTTCCCAAGATTCTTTCCGTT 52645428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3298 AAAACGAGATTTAGCAGCTGGTGCCTCGGGTTTGGCCTCTTTCCCAAGATTCTTTCCGTT 3357

 52645429 GGCATCCGCAACAGCACTTATCTCCGTTGTCTCGGGGGAAGAAGTGGCCACATTATCCGT 52645488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3358 GGCATCCGCAACAGCACTTATCTCCGTTGTCTCGGGGGAAGAAGTGGCCACATTATCCGT 3417

 52645489 CTTGACACTTATTCCCAAGTCGACTGTAAACACAAACATAAACAGTGGTTATTCAGCCAA 52645548
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     3418 CTTGACACTTATTCCCAAGTCGACTGTAAACACAAACATAAACAGCGGTTATTCAGCCAA 3477

 52645549 GCCGGGAAATTCAGGCACTAATAATGGACTCCAGACATTTTTTATACAAAAGCCATACTG 52645608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3478 GCCGGGAAATTCAGGCACTAATAATGGACTCCAGACATTTTTTATACAAAAGCCATACTG 3537

 52645609 CATACTGGAACTGTGTTGTTCTCTGGTCATTCTGAAAGGCAGAAGTTAGCTCTCTACATC 52645668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3538 CATACTGGAACTGTGTTGTTCTCTGGTCATTCTGAAAGGCAGAAGTTAGCTCTCTACATC 3597

 52645669 TCCTTGGACCCTGCTTTTCTTGGGAGAGGAGAAGGCAAGGTTGGTGAGGAGGGAAAGCTA 52645728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3598 TCCTTGGACCCTGCTTTTCTTGGGAGAGGAGAAGGCAAGGTTGGTGAGGAGGGAAAGCTA 3657

 52645729 CTTAATGGAAAGTCACTAGCTGCCAGGTGTGGAATGAGTGATATTCAATGTTAATTAATC 52645788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3658 CTTAATGGAAAGTCACTAGCTGCCAGGTGTGGAATGAGTGATATTCAATGTTAATTAATC 3717

 52645789 TTCTTTTATCTGTGTAAGAACTCCGTGAGCAGCATATTGTCATGATGTCAACTGGGAGGC 52645848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3718 TTCTTTTATCTGTGTAAGAACTCCGTGAGCAGCATATTGTCATGATGTCAACTGGGAGGC 3777

 52645849 AGTACAGCAGTTAGGAGCTTGGGTTCTGGAGCTAGAACAAGGTTTCTCAACCTCAGCACT 52645908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3778 AGTACAGCAGTTAGGAGCTTGGGTTCTGGAGCTAGAACAAGGTTTCTCAACCTCAGCACT 3837

 52645909 ACTCACATTTGAAGCCAGATTATTCTTTGTTAGGGAGGCTCATCCCGTGCCTCATAGGCT 52645968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3838 ACTCACATTTGAAGCCAGATTATTCTTTGTTAGGGAGGCTCATCCCGTGCCTCATAGGCT 3897

 52645969 GATTAGCAGCATCCTGGCCTCTGCCCACTAGACGCCGGTCACATTTCCCAGTCATGGCAA 52646028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3898 GATTAGCAGCATCCTGGCCTCTGCCCACTAGACGCCGGTCACATTTCCCAGTCATGGCAA 3957

 52646029 CCAAAAATATCTCTAGGCATTGCTAAATGTCCCCTGGAGGACAAAATCTCTTACGTTTGA 52646088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3958 CCAAAAATATCTCTAGGCATTGCTAAATGTCCCCTGGAGGACAAAATCTCTTACGTTTGA 4017

 52646089 GAGGCACTGAGCTGAAATGTCTTTTTGAATCCAGATTATCTAATTTTCTGTGCCTCAACT 52646148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4018 GAGGCACTGAGCTGAAATGTCTTTTTGAATCCAGATTATCTAATTTTCTGTGCCTCAACT 4077

 52646149 TTCTGGTAAAAGGAGACAGATAATAAATCTCGTAATTTTGTTAGGAAGATTACATGAGTT 52646208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4078 TTCTGGTAAAAGGAGACAGATAATAAATCTCGTAATTTTGTTAGGAAGATTACATGAGTT 4137

 52646209 AATAGTTTTAAAGCAAGTACAATAGCACCTGGAATATATTAAGTGCTTAATAAATATCAC 52646268
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     4138 AATAGTTTTAAAGCAAGTACAATAGCGCCTGGAATATATTAAGTGCTTAATAAATATCAC 4197

 52646269 AAACATTAGTTATCATTATTCATGAGTGAGAAAACTGACAGTCAGAGAGGTCAGTACACC 52646328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4198 AAACATTAGTTATCATTATTCATGAGTGAGAAAACTGACAGTCAGAGAGGTCAGTACACC 4257

 52646329 CTCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCTAGTAAGCAGCAGAGTCTGGCTTCAGGCAGAAATCTGA 52646388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4258 CTCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCTAGTAAGCAGCAGAGTCTGGCTTCAGGCAGAAATCTGA 4317

 52646389 CTTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGTCTTACCAGGGACTTGTATTAGCATAGACTGTTAAGA 52646448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4318 CTTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGTCTTACCAGGGACTTGTATTAGCATAGACTGTTAAGA 4377

 52646449 ATATGGGAAGATTTTTAAAATACAGTACTCAGAAAATTTCTCTTTGAAAGGCTGGAAGAG 52646508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4378 ATATGGGAAGATTTTTAAAATACAGTACTCAGAAAATTTCTCTTTGAAAGGCTGGAAGAG 4437

 52646509 CAGATATCCACACAAGAAGGCAAATTAGACCTCAGGCCAGTGTGGAATTAAAGGTGTAGG 52646568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4438 CAGATATCCACACAAGAAGGCAAATTAGACCTCAGGCCAGTGTGGAATTAAAGGTGTAGG 4497

 52646569 GTTATCTGGTCAAGACTGTGTGTGTGGATACAGGCTCCAACCCCTCCAGGCAAGGGCACT 52646628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     4498 GTTATCTGGTCAAGACTGTGTGTGTGGATACAGGCTCCAACCCCTCCAGGCAAGGGCAAT 4557

 52646629 GTTTCCAACATCCACCCTTTCTCCTTTGACCTCTACCTTGACCTAAATTAACTATAAAAG 52646688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4558 GTTTCCAACATCCACCCTTTCTCCTTTGACCTCTACCTTGACCTAAATTAACTATAAAAG 4617

 52646689 GTCCTTCTTTTCTAGGACCCTACTATAAATCAGTGAAATATTCAGGAAAAAAAGAACACC 52646748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4618 GTCCTTCTTTTCTAGGACCCTACTATAAATCAGTGAAATATTCAGGAAAAAAAGAACACC 4677

 52646749 AAGAATGTTGGGATCCCAGTTAAAGATCAAGATTCTCTACTGATAAGCTGTGTGATATGG 52646808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4678 AAGAATGTTGGGATCCCAGTTAAAGATCAAGATTCTCTACTGATAAGCTGTGTGATATGG 4737

 52646809 AGTAAATCACTAAAGATCTTTGAATCTCTTCATTTGTAAAATGGGAATATTGGTAGTCCT 52646868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4738 AGTAAATCACTAAAGATCTTTGAATCTCTTCATTTGTAAAATGGGAATATTGGTAGTCCT 4797

 52646869 ACTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTAAAGAAGAAAAGTCATGCAAAGGATCTGGCACAACGC 52646928
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     4798 ACTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTAAAGAAGAAAAGTCATGCAAAGGATCTGGCACAATGC 4857

 52646929 CTTTTCCATAATAAGTGCTTAGTAATTGACAGATACTGTGATAACTTTTCAGGTTTCTCT 52646988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4858 CTTTTCCATAATAAGTGCTTAGTAATTGACAGATACTGTGATAACTTTTCAGGTTTCTCT 4917

 52646989 CATGCCTTTGACAACATTGCATTTTGCTTGCTCTATCTGTAGTCAGACACTTCTTAATAT 52647048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4918 CATGCCTTTGACAACATTGCATTTTGCTTGCTCTATCTGTAGTCAGACACTTCTTAATAT 4977

 52647049 CTGTTTGCAGGAAGAC 52647064
          ||||||||||||||||
     4978 CTGTTTGCAGGAAGAC 4993

EXCISED REGION

 52658003 AGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTG 52658062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4994 AGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTG 5053

 52658063 GCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTAT 52658122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5054 GCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTAT 5113

 52658123 AAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGG 52658182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5114 AAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGG 5173

 52658183 GAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTG 52658242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5174 GAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTG 5233

 52658243 AAACACTGTCTCTGCTAAAAAACAAAACAAAACAAAACACCAAAAAATAGCTGGGCGTAG 52658302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5234 AAACACTGTCTCTGCTAAAAAACAAAACAAAACAAAACACCAAAAAATAGCTGGGCGTAG 5293

 52658303 TGGCGGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTTGGGAGGCGGTGGCAGGAGAATCATTTGAACCT 52658362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5294 TGGCGGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTTGGGAGGCGGTGGCAGGAGAATCATTTGAACCT 5353

 52658363 GGGAGGCA 52658370
          ||||||||
     5354 GGGAGGCA 5361

Alignment time is 6.45425 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [52637064,52668002] =>     30939 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    4082] =>      4082 nucs 'mol-32-3190-157568_4082'

Score:        3859
Aligned:      4089        nucs
Identic:      4037 ( 99%) nucs =>       885 (100%)      3152 ( 98%)
Gaps:           41 (  1%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [52646177,52647064] EXCISED REGION [52658003,52661169]
 second seq =>  [       1,     888] EXCISED REGION [     889,    4082]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>     10938 nucs [52647065,52658002]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         6 nucs [52647065,52647070] to [52658003,52658008]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [52647065,52647067] to [52658000,52658002]
 second seq =>         0 nucs

 52646177 CTCGTAATTTTGTTAGGAAGATTACATGAGTTAATAGTTTTAAAGCAAGTACAATAGCAC 52646236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
        1 CTCGTAATTTTGTTAGGAAGATTACATGAGTTAATAGTTTTAAAGCAAGTACAATAGCGC 60

 52646237 CTGGAATATATTAAGTGCTTAATAAATATCACAAACATTAGTTATCATTATTCATGAGTG 52646296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTGGAATATATTAAGTGCTTAATAAATATCACAAACATTAGTTATCATTATTCATGAGTG 120

 52646297 AGAAAACTGACAGTCAGAGAGGTCAGTACACCCTCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCTAGTAA 52646356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGAAAACTGACAGTCAGAGAGGTCAGTACACCCTCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCTAGTAA 180

 52646357 GCAGCAGAGTCTGGCTTCAGGCAGAAATCTGACTTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGTCTTA 52646416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCAGCAGAGTCTGGCTTCAGGCAGAAATCTGACTTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGTCTTA 240

 52646417 CCAGGGACTTGTATTAGCATAGACTGTTAAGAATATGGGAAGATTTTTAAAATACAGTAC 52646476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCAGGGACTTGTATTAGCATAGACTGTTAAGAATATGGGAAGATTTTTAAAATACAGTAC 300

 52646477 TCAGAAAATTTCTCTTTGAAAGGCTGGAAGAGCAGATATCCACACAAGAAGGCAAATTAG 52646536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCAGAAAATTTCTCTTTGAAAGGCTGGAAGAGCAGATATCCACACAAGAAGGCAAATTAG 360

 52646537 ACCTCAGGCCAGTGTGGAATTAAAGGTGTAGGGTTATCTGGTCAAGACTGTGTGTGTGGA 52646596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACCTCAGGCCAGTGTGGAATTAAAGGTGTAGGGTTATCTGGTCAAGACTGTGTGTGTGGA 420

 52646597 TACAGGCTCCAACCCCTCCAGGCAAGGGCACTGTTTCCAACATCCACCCTTTCTCCTTTG 52646656
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
      421 TACAGGCTCCAACCCCTCCAGGCAAGGGCAATGTTTCCAACATCCACCCTTTCTCCTTTG 480

 52646657 ACCTCTACCTTGACCTAAATTAACTATAAAAGGTCCTTCTTTTCTAGGACCCTACTATAA 52646716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACCTCTACCTTGACCTAAATTAACTATAAAAGGTCCTTCTTTTCTAGGACCCTACTATAA 540

 52646717 ATCAGTGAAATATTCAGGAAAAAAAGAACACCAAGAATGTTGGGATCCCAGTTAAAGATC 52646776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATCAGTGAAATATTCAGGAAAAAAAGAACACCAAGAATGTTGGGATCCCAGTTAAAGATC 600

 52646777 AAGATTCTCTACTGATAAGCTGTGTGATATGGAGTAAATCACTAAAGATCTTTGAATCTC 52646836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAGATTCTCTACTGATAAGCTGTGTGATATGGAGTAAATCACTAAAGATCTTTGAATCTC 660

 52646837 TTCATTTGTAAAATGGGAATATTGGTAGTCCTACTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTAAAGA 52646896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTCATTTGTAAAATGGGAATATTGGTAGTCCTACTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTAAAGA 720

 52646897 AGAAAAGTCATGCAAAGGATCTGGCACAACGCCTTTTCCATAATAAGTGCTTAGTAATTG 52646956
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGAAAAGTCATGCAAAGGATCTGGCACAATGCCTTTTCCATAATAAGTGCTTAGTAATTG 780

 52646957 ACAGATACTGTGATAACTTTTCAGGTTTCTCTCATGCCTTTGACAACATTGCATTTTGCT 52647016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ACAGATACTGTGATAACTTTTCAGGTTTCTCTCATGCCTTTGACAACATTGCATTTTGCT 840

 52647017 TGCTCTATCTGTAGTCAGACACTTCTTAATATCTGTTTGCAGGAAGAC 52647064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGCTCTATCTGTAGTCAGACACTTCTTAATATCTGTTTGCAGGAAGAC 888

EXCISED REGION

 52658003 AGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTG 52658062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      889 AGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTG 948

 52658063 GCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTAT 52658122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      949 GCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTAT 1008

 52658123 AAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGG 52658182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1009 AAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGG 1068

 52658183 GAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTG 52658242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1069 GAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTG 1128

 52658243 AAACACTGTCTCTGCTAAAAAACAAAACAAAACAAAACACCAAAAAATAGCTGGGCGTAG 52658302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1129 AAACACTGTCTCTGCTAAAAAACAAAACAAAACAAAACACCAAAAAATAGCTGGGCGTAG 1188

 52658303 TGGCGGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTTGGGAGGCGGTGGCAGGAGAATCATTTGAACCT 52658362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1189 TGGCGGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTTGGGAGGCGGTGGCAGGAGAATCATTTGAACCT 1248

 52658363 GGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGAT--------TGTGCCACTGCACTCTAACCTGG 52658414
          |||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||
     1249 GGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACTGTGCCACTGCACTCTAACCTGG 1308

 52658415 GCAACAGAGTTCAGAGTGAGACTCTGTCTCCCCC-------------------------- 52658448
          ||||||||||||||||||||||||||||||                              
     1309 GCAACAGAGTTCAGAGTGAGACTCTGTCTC----ACCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 1364

 52658449 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAACAGCCATATAGATCGTCGGTGGGAGTGTAATTTGG 52658508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1365 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAACAGCCATATAGATCGTCGGTGGGAGTGTAATTTGG 1424

 52658509 CCACTTCTTTGGAAAATAGCTCAGTAATATCTATTAATACTTAAAATTTCACAAACACTG 52658568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1425 CCACTTCTTTGGAAAATAGCTCAGTAATATCTATTAATACTTAAAATTTCACAAACACTG 1484

 52658569 TAAGTCTAACTTCCACTTCTAAAATGTTATCCTAGAAATAAAATTGCATAGGGGTACAAA 52658628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1485 TAAGTCTAACTTCCACTTCTAAAATGTTATCCTAGAAATAAAATTGCATAGGGGTACAAA 1544

 52658629 GGCTTACGTATGGAACTATTTGCTGGACTACTGTAGTTGTGGCAAAAAACTGGAAATGAC 52658688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1545 GGCTTACGTATGGAACTATTTGCTGGACTACTGTAGTTGTGGCAAAAAACTGGAAATGAC 1604

 52658689 CTAAACGCTTATTAGTAGAAACCTGGTTAAATAAATTATCATATGTCCTTGAGGACACAG 52658748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1605 CTAAACGCTTATTAGTAGAAACCTGGTTAAATAAATTATCATATGTCCTTGAGGACACAG 1664

 52658749 GGACACAAAGAGGGGAATGACAGGCACTGAGCCTACTTGAGGGTGGGAGGAGGAAGTCGA 52658808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1665 GGACACAAAGAGGGGAATGACAGGCACTGAGCCTACTTGAGGGTGGGAGGAGGAAGTCGA 1724

 52658809 TCAGAAAAAATAACTAGTGGGTACTAGGCTTAGTACCCGGGTGAAAAAATAATCTGTACA 52658868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1725 TCAGAAAAAATAACTAGTGGGTACTAGGCTTAGTACCCGGGTGAAAAAATAATCTGTACA 1784

 52658869 ACAAACCCCCATGACATGAGTTTACCTTATAACAAACCTGCACATGTAATCTGAACCTAG 52658928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1785 ACAAACCCCCATGACATGAGTTTACCTTATAACAAACCTGCACATGTAATCTGAACCTAG 1844

 52658929 ATAAAAGTTTAAAAAAATAAATAATCATATGTCCCTACAATGAAATATTCCACAGGCATT 52658988
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     1845 ATAAAAGTTTAAAAAAATAAATAATCATATGTCCCTATAATGAAATATTCCACAGGCATT 1904

 52658989 AAAATTCCCCAAGGAATTTTAGTAAGGAAAGAAAAAGCTGTGCCCAACAGCACGTACAGT 52659048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1905 AAAATTCCCCAAGGAATTTTAGTAAGGAAAGAAAAAGCTGTGCCCAACAGCACGTACAGT 1964

 52659049 ATGTTTCCATTTGTTTTTAAAAAATGGTGTCGGGAGGTTGAGGAGACAACTTATAAATAG 52659108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1965 ATGTTTCCATTTGTTTTTAAAAAATGGTGTCGGGAGGTTGAGGAGACAACTTATAAATAG 2024

 52659109 ACATGCCTGGGATACCTCTGGATATAAGAAACTGTAAAGTATTTACTTCTAAGGAAGGAA 52659168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2025 ACATGCCTGGGATACCTCTGGATATAAGAAACTGTAAAGTATTTACTTCTAAGGAAGGAA 2084

 52659169 ATTTGGGATGGGGCTTGGGGAGCCATCAGAGTTAGGGTGGGGATTTTTTCTCTGCCTTAT 52659228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2085 ATTTGGGATGGGGCTTGGGGAGCCATCAGAGTTAGGGTGGGGATTTTTTCTCTGCCTTAT 2144

 52659229 CTTATTATGTATATCGCTCAGAATGTTTGCTATGTGTATGCACCTACCCCATCCATTAAG 52659288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2145 CTTATTATGTATATCGCTCAGAATGTTTGCTATGTGTATGCACCTACCCCATCCATTAAG 2204

 52659289 AAATGAAGAAATAATGAAAAGAAAAAATGAAAGTAGGGAACTAGAAATGAGAGGTGGGAT 52659348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2205 AAATGAAGAAATAATGAAAAGAAAAAATGAAAGTAGGGAACTAGAAATGAGAGGTGGGAT 2264

 52659349 TCAAAGTGGACTGAACACTTGACCTATTTCCCAATTTGCCTAGGGCTGGCCCAGCAGCGA 52659408
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     2265 TCAAAGTGGACTGAACACTTGACCTATTTCCCAATTTGCCTGGGGCTGGCCCAGCAGCGA 2324

 52659409 GGCAGGTTCTAACCAATGAGCATCAGCTTTGAATGGAGGGGCTGATAGGCCAGGTGGGCC 52659468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2325 GGCAGGTTCTAACCAATGAGCATCAGCTTTGAATGGAGGGGCTGATAGGCCAGGTGGGCC 2384

 52659469 CTGCTTGCTGAGAGTGTCATGGCCTTAGGGACATCTCCATGTTGCAGAGTCTGAGCCTCT 52659528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2385 CTGCTTGCTGAGAGTGTCATGGCCTTAGGGACATCTCCATGTTGCAGAGTCTGAGCCTCT 2444

 52659529 GCTTGGCAAATTCAGAAAATCCAGCTTTTCTTTTTATATCACCTGGAGCTGATGTAACTC 52659588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2445 GCTTGGCAAATTCAGAAAATCCAGCTTTTCTTTTTATATCACCTGGAGCTGATGTAACTC 2504

 52659589 TCAGAAGGCATTTTTAAGAGGACTCATGAATTAACCACATAGCCAACTTACTGGCTTAAG 52659648
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2505 TCAGAACGCATTTTTAAGAGGACTCATGAATTAACCACATAGCCAACTTACTGGCTTAAG 2564

 52659649 ACTACGTGACAGAAAGCTGCAAAGGGGGCCAGCCACTGGTAACATCCCACCACTGTCCCT 52659708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2565 ACTACGTGACAGAAAGCTGCAAAGGGGGCCAGCCACTGGTAACATCCCACCACTGTCCCT 2624

 52659709 CTCTGTGGAAAACACAGATGGGATGCACATTGTGACGGGCAGGATGCCTGGAGAGCCCAC 52659768
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     2625 CTCTGTGGAAAACACAGATGGGATGCACATTGTGATGGGCAGGATGCCTGGAGAGCCCAC 2684

 52659769 AAATCTGCAAGCACAGCTGAAATTGGTTACAGGATTTCAATGTTTCATTGCTTGAAGCTA 52659828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2685 AAATCTGCAAGCACAGCTGAAATTGGTTACAGGATTTCAATGTTTCATTGCTTGAAGCTA 2744

 52659829 TGATAACTTGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGACGATGATTTTTTTTATAGC 52659888
          ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2745 TGATAACT---TGATGATGATGATGATGATGATGATGATGACGATGATTTTTTTTATAGC 2801

 52659889 CATCTTTTTAGAGGGATTTGAGGTAGGGAAAAAAATAAACCTCACACTATCGGAGGTTGC 52659948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2802 CATCTTTTTAGAGGGATTTGAGGTAGGGAAAAAAATAAACCTCACACTATCGGAGGTTGC 2861

 52659949 CAACTATGAGGTCTGCTGATGGTTTGGCCAACACAGTGTTTATATTTTTTTGAATTGGGA 52660008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2862 CAACTATGAGGTCTGCTGATGGTTTGGCCAACACAGTGTTTATATTTTTTTGAATTGGGA 2921

 52660009 AATTTCATTTAAAAGTCCTAAAATCAGGCTGTTATTGAAATATCTTATTATTGGCTCAGG 52660068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2922 AATTTCATTTAAAAGTCCTAAAATCAGGCTGTTATTGAAATATCTTATTATTGGCTCAGG 2981

 52660069 GTTTCCCAGGGCAGCCATCCTTGAAGCTGTGTGGAGCCCTATAAACAAGGACGCTTTCCA 52660128
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     2982 GTTTCCCAGGGCAGCCATCCTTGAAGCTGTGTGGAGCCCTATAAACAAGGAGGCTTTCCA 3041

 52660129 GTTCCCTGCAAACTCCATTTCATTCAGAGCCTTGAGCCAGTTCTTACATGGTCCTCAGAC 52660188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3042 GTTCCCTGCAAACTCCATTTCATTCAGAGCCTTGAGCCAGTTCTTACATGGTCCTCAGAC 3101

 52660189 TTGAGCTAGTGCAAGAATACCCGGGAGGGGTTGTGGGAACAGATAGCTGGGCCCCACCCC 52660248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3102 TTGAGCTAGTGCAAGAATACCCGGGAGGGGTTGTGGGAACAGATAGCTGGGCCCCACCCC 3161

 52660249 CAGGGAAGGGGGTGTTTCTGACTCAGGAGGTCTGGGCTCCGGCTACAGAAACTGCACATC 52660308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3162 CAGGGAAGGGGGTGTTTCTGACTCAGGAGGTCTGGGCTCCGGCTACAGAAACTGCACATC 3221

 52660309 TAACCGGTACCCAGGTGATGTGATGCTGCTGGCCCAGGGACAACTCTGCGAGTCACTGCT 52660368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3222 TAACCGGTACCCAGGTGATGTGATGCTGCTGGCCCAGGGACAACTCTGCGAGTCACTGCT 3281

 52660369 ATTGGGCACTGCTATTGCACCCACACAAGGAGGCAGGCTCTGCTTACATTTTTCAGTTCT 52660428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3282 ATTGGGCACTGCTATTGCACCCACACAAGGAGGCAGGCTCTGCTTACATTTTTCAGTTCT 3341

 52660429 TGTTCCCAGAAACATTTGCTCTTTGGGGTATGCTTTGCATATAATGGATCCTACCCACTA 52660488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3342 TGTTCCCAGAAACATTTGCTCTTTGGGGTATGCTTTGCATATAATGGATCCTACCCACTA 3401

 52660489 ATACAGTATGCTGCTTTTATTGATAAACTTCCAGAAACTTGAAGCGCACCTTACCATTTC 52660548
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     3402 ATACAGTATGCTGCTTTTATTGATAAACTTCCAGATACTTGAAGCGCACCTTACCATTTC 3461

 52660549 TTTGATCTCGCTGATTATTTTTATTTTTGTTAAATGAAAATTGTTGGTAAGTTCTTTTTG 52660608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3462 TTTGATCTCGCTGATTATTTTTATTTTTGTTAAATGAAAATTGTTGGTAAGTTCTTTTTG 3521

 52660609 GTGTGGTAAAAGGATATGAAAAGCTGATTTTAAAAAAATGTCCACTCTAGGATTAGAATT 52660668
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3522 GTGTGGTAAAAGGATATGAAAAACTGATTTTAAAAAAATGTCCACTCTAGGATTAGAATT 3581

 52660669 GTAGGTGTGTTTATTCTATTTCAAGATCTGGTTAAAATGCACCTTGAGGAAAAGAATTGA 52660728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3582 GTAGGTGTGTTTATTCTATTTCAAGATCTGGTTAAAATGCACCTTGAGGAAAAGAATTGA 3641

 52660729 GTGCAGCTGTTGTTATTTCTCAATGCTGTTTCTCTTTTCATGTTTTTTTCATGTTGTCTC 52660788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3642 GTGCAGCTGTTGTTATTTCTCAATGCTGTTTCTCTTTTCATGTTTTTTTCATGTTGTCTC 3701

 52660789 TTGGTCTGTCCTATCTCTCTTGGTCTATCCTCCAAGACAGAGATGAGTGATCTTGAAACC 52660848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3702 TTGGTCTGTCCTATCTCTCTTGGTCTATCCTCCAAGACAGAGATGAGTGATCTTGAAACC 3761

 52660849 CTGCCCATGTTTTTATCTTTGGAGCCCAACTGTGCTGCCTTGTTTTCTTCTCCATCCAAA 52660908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3762 CTGCCCATGTTTTTATCTTTGGAGCCCAACTGTGCTGCCTTGTTTTCTTCTCCATCCAAA 3821

 52660909 GAGGCAAAGAGAAAGTTGCATATTACTCAACAGCAGTTGCATGACAGTTAAAATCAGACT 52660968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3822 GAGGCAAAGAGAAAGTTGCATATTACTCAACAGCAGTTGCATGACAGTTAAAATCAGACT 3881

 52660969 GTATGAGTCATGGAACAGTAAGTTGTGTCCAGAGTATCTGTCATGGTAAGTACAAAAAAG 52661028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3882 GTATGAGTCATGGAACAGTAAGTTGTGTCCAGAGTATCTGTCATGGTAAGTACAAAAAAG 3941

 52661029 TCCTTAAAAATTTAAAACAGAAATGCCAATGTTTTATTTTTGAAAAATGTGAAGAAGAAA 52661088
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     3942 TCCTTAAAAATTTAAAACAGAAATGCCAATGTTTTATTTCTGAAAAATGTGAAGAAGAAA 4001

 52661089 TTTTCCGGCCGGGCGCGGTGGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTG 52661148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4002 TTTTCCGGCCGGGCGCGGTGGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTG 4061

 52661149 GGCAGATCACCTGAGGTCAGG 52661169
          |||||||||||||||||||||
     4062 GGCAGATCACCTGAGGTCAGG 4082

Alignment time is 4.96045 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [52637064,52668002] =>     30939 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    9591] =>      9591 nucs 'mol-32-3190-267563_9591'

Score:        9202
Aligned:      9605        nucs
Identic:      9534 ( 99%) nucs =>      2911 (100%)      6623 ( 99%)
Gaps:           50 (  1%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [52644146,52647064] EXCISED REGION [52658003,52664652]
 second seq =>  [       1,    2919] EXCISED REGION [    2920,    9591]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>     10938 nucs [52647065,52658002]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         6 nucs [52647065,52647070] to [52658003,52658008]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [52647065,52647067] to [52658000,52658002]
 second seq =>         0 nucs

 52644146 TAATGTATCAAGTTTTACTTCCTTCTTCTTTTAAGGAGTTCTTTTCCTGCCTTGAATACA 52644205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TAATGTATCAAGTTTTACTTCCTTCTTCTTTTAAGGAGTTCTTTTCCTGCCTTGAATACA 60

 52644206 AACAGGCTCTCTCAAGGTTAAAAGCAAATGCTCTTTTTAGTGTCAAAAAGAGCTTGCCTT 52644265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AACAGGCTCTCTCAAGGTTAAAAGCAAATGCTCTTTTTAGTGTCAAAAAGAGCTTGCCTT 120

 52644266 TCTTCGCTCAGGAAAAAAAGCAACTGATTCCAGGATACCTTCTTTGAAAACCAACACAAA 52644325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCTTCGCTCAGGAAAAAAAGCAACTGATTCCAGGATACCTTCTTTGAAAACCAACACAAA 180

 52644326 AAAACCCCCCAAAAAACAAAAAAAAAACCCAAAACCCCTAGTTTTTACAAAGGTTTATTA 52644385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAAACCCCCCAAAAAACAAAAAAAAAACCCAAAACCCCTAGTTTTTACAAAGGTTTATTA 240

 52644386 CTCCTACTTGTTGGAAAAGAATTACTACATAAAAGAGTCTGCCCAGAGCTGTAAAATCTC 52644445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTCCTACTTGTTGGAAAAGAATTACTACATAAAAGAGTCTGCCCAGAGCTGTAAAATCTC 300

 52644446 CTTATTCAAACACACACCTTAGAGCAAAAGATGGTTAAATATCAATTCAGGCTATTAACA 52644505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTTATTCAAACACACACCTTAGAGCAAAAGATGGTTAAATATCAATTCAGGCTATTAACA 360

 52644506 GTAAGGGAC---GAAATGTGTTCCAACAAAACTCTGCATGTCAACAAACTACAGAGACTA 52644562
          ||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTAAGG---AATGAAATGTGTTCCAACAAAACTCTGCATGTCAACAAACTACAGAGACTA 417

 52644563 GGTAACATCTTTTAGGAATCATTTTTATTCCACTAATGCCTTTTCCTCCAGAATCCACTG 52644622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      418 GGTAACATCTTTTAGGAATCATTTTTATTCCACTAATGCCTTTTCCTCCAGAATCCACTG 477

 52644623 ATCGTAAACGCAACCTGTCTACTTCCGCCTTTGAAAAATGGATGGACAAATTCATCTGCA 52644682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      478 ATCGTAAACGCAACCTGTCTACTTCCGCCTTTGAAAAATGGATGGACAAATTCATCTGCA 537

 52644683 TGTAACTCACCTCCTCTTTTCTTTTACATAAAACAGATGCCACAGCTGTTATTGTTCTTC 52644742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      538 TGTAACTCACCTCCTCTTTTCTTTTACATAAAACAGATGCCACAGCTGTTATTGTTCTTC 597

 52644743 ACACAGAAGTTTCTACCCAGAGAAACATCAGGATGACACTCTGCTGCAATGTGCTATTTG 52644802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      598 ACACAGAAGTTTCTACCCAGAGAAACATCAGGATGACACTCTGCTGCAATGTGCTATTTG 657

 52644803 TTCTAGAGGGGTCAACAGCTTGCCACCTTGCCTAGGCCCAGGGTGACTGCATATGTGCAG 52644862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      658 TTCTAGAGGGGTCAACAGCTTGCCACCTTGCCTAGGCCCAGGGTGACTGCATATGTGCAG 717

 52644863 TGGTCTTATCCCATTAGCGCCCCCGAGCATGCATTCAGAACCAAGTGGATACACCTTGGC 52644922
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
      718 TGGTCTTATCCCATTAGCGCCCCCGAGCATGCATTCAGAACCAAGTGAATACACCTTGGC 777

 52644923 ACACTTACCTTCCCTGCAGGGACATCATCGGACTGCCCTGATAAGCCAGGAACCTCATCC 52644982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      778 ACACTTACCTTCCCTGCAGGGACATCATCGGACTGCCCTGATAAGCCAGGAACCTCATCC 837

 52644983 ACCTTGTCTTGATGCTCTGCCCTCTTGGCTTCCTGTTGGCTGTCACCTGGCACCTTTTCC 52645042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      838 ACCTTGTCTTGATGCTCTGCCCTCTTGGCTTCCTGTTGGCTGTCACCTGGCACCTTTTCC 897

 52645043 TGTCCCTTGTCCAGCTTGAAGAATTTGTCAAAAAAGCTGGAGTCCTTGGGCTTGGAGGGA 52645102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      898 TGTCCCTTGTCCAGCTTGAAGAATTTGTCAAAAAAGCTGGAGTCCTTGGGCTTGGAGGGA 957

 52645103 GCTTCTCCTCCTGCTCCCCCTGTCTCAGGTGGGAGAAGCGTGGGATCCCTGGCGGCAGAG 52645162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      958 GCTTCTCCTCCTGCTCCCCCTGTCTCAGGTGGGAGAAGCGTGGGATCCCTGGCGGCAGAG 1017

 52645163 AGGACCTTGTCTTGGGCCGGGGCGTGCCCTGGGGTTTTATCTGTGTCCTGCCCCGGTCCA 52645222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1018 AGGACCTTGTCTTGGGCCGGGGCGTGCCCTGGGGTTTTATCTGTGTCCTGCCCCGGTCCA 1077

 52645223 GCTGCCACCGGAAGTGTCCAGCTCTCACTTGGGTCTTTGTTCGCTGGAGCTTTATTGGAG 52645282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1078 GCTGCCACCGGAAGTGTCCAGCTCTCACTTGGGTCTTTGTTCGCTGGAGCTTTATTGGAG 1137

 52645283 CTGACATCAAGCTTCACTGATCCAAGGGATGAATCTGCGGCTTGGTCTCCGGTACGTCCT 52645342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1138 CTGACATCAAGCTTCACTGATCCAAGGGATGAATCTGCGGCTTGGTCTCCGGTACGTCCT 1197

 52645343 GGTACAGGCCGAGAGAGCATCAAGAAAAAACGAGATTTAGCAGCTGGTGCCTCGGGTTTG 52645402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1198 GGTACAGGCCGAGAGAGCATCAAGAAAAAACGAGATTTAGCAGCTGGTGCCTCGGGTTTG 1257

 52645403 GCCTCTTTCCCAAGATTCTTTCCGTTGGCATCCGCAACAGCACTTATCTCCGTTGTCTCG 52645462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1258 GCCTCTTTCCCAAGATTCTTTCCGTTGGCATCCGCAACAGCACTTATCTCCGTTGTCTCG 1317

 52645463 GGGGAAGAAGTGGCCACATTATCCGTCTTGACACTTATTCCCAAGTCGACTGTAAACACA 52645522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1318 GGGGAAGAAGTGGCCACATTATCCGTCTTGACACTTATTCCCAAGTCGACTGTAAACACA 1377

 52645523 AACATAAACAGTGGTTATTCAGCCAAGCCGGGAAATTCAGGCACTAATAATGGACTCCAG 52645582
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1378 AACATAAACAGCGGTTATTCAGCCAAGCCGGGAAATTCAGGCACTAATAATGGACTCCAG 1437

 52645583 ACATTTTTTATACAAAAGCCATACTGCATACTGGAACTGTGTTGTTCTCTGGTCATTCTG 52645642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1438 ACATTTTTTATACAAAAGCCATACTGCATACTGGAACTGTGTTGTTCTCTGGTCATTCTG 1497

 52645643 AAAGGCAGAAGTTAGCTCTCTACATCTCCTTGGACCCTGCTTTTCTTGGGAGAGGAGAAG 52645702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1498 AAAGGCAGAAGTTAGCTCTCTACATCTCCTTGGACCCTGCTTTTCTTGGGAGAGGAGAAG 1557

 52645703 GCAAGGTTGGTGAGGAGGGAAAGCTACTTAATGGAAAGTCACTAGCTGCCAGGTGTGGAA 52645762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1558 GCAAGGTTGGTGAGGAGGGAAAGCTACTTAATGGAAAGTCACTAGCTGCCAGGTGTGGAA 1617

 52645763 TGAGTGATATTCAATGTTAATTAATCTTCTTTTATCTGTGTAAGAACTCCGTGAGCAGCA 52645822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1618 TGAGTGATATTCAATGTTAATTAATCTTCTTTTATCTGTGTAAGAACTCCGTGAGCAGCA 1677

 52645823 TATTGTCATGATGTCAACTGGGAGGCAGTACAGCAGTTAGGAGCTTGGGTTCTGGAGCTA 52645882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1678 TATTGTCATGATGTCAACTGGGAGGCAGTACAGCAGTTAGGAGCTTGGGTTCTGGAGCTA 1737

 52645883 GAACAAGGTTTCTCAACCTCAGCACTACTCACATTTGAAGCCAGATTATTCTTTGTTAGG 52645942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1738 GAACAAGGTTTCTCAACCTCAGCACTACTCACATTTGAAGCCAGATTATTCTTTGTTAGG 1797

 52645943 GAGGCTCATCCCGTGCCTCATAGGCTGATTAGCAGCATCCTGGCCTCTGCCCACTAGACG 52646002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1798 GAGGCTCATCCCGTGCCTCATAGGCTGATTAGCAGCATCCTGGCCTCTGCCCACTAGACG 1857

 52646003 CCGGTCACATTTCCCAGTCATGGCAACCAAAAATATCTCTAGGCATTGCTAAATGTCCCC 52646062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1858 CCGGTCACATTTCCCAGTCATGGCAACCAAAAATATCTCTAGGCATTGCTAAATGTCCCC 1917

 52646063 TGGAGGACAAAATCTCTTACGTTTGAGAGGCACTGAGCTGAAATGTCTTTTTGAATCCAG 52646122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1918 TGGAGGACAAAATCTCTTACGTTTGAGAGGCACTGAGCTGAAATGTCTTTTTGAATCCAG 1977

 52646123 ATTATCTAATTTTCTGTGCCTCAACTTTCTGGTAAAAGGAGACAGATAATAAATCTCGTA 52646182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1978 ATTATCTAATTTTCTGTGCCTCAACTTTCTGGTAAAAGGAGACAGATAATAAATCTCGTA 2037

 52646183 ATTTTGTTAGGAAGATTACATGAGTTAATAGTTTTAAAGCAAGTACAATAGCACCTGGAA 52646242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     2038 ATTTTGTTAGGAAGATTACATGAGTTAATAGTTTTAAAGCAAGTACAATAGCGCCTGGAA 2097

 52646243 TATATTAAGTGCTTAATAAATATCACAAACATTAGTTATCATTATTCATGAGTGAGAAAA 52646302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2098 TATATTAAGTGCTTAATAAATATCACAAACATTAGTTATCATTATTCATGAGTGAGAAAA 2157

 52646303 CTGACAGTCAGAGAGGTCAGTACACCCTCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCTAGTAAGCAGCA 52646362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2158 CTGACAGTCAGAGAGGTCAGTACACCCTCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCTAGTAAGCAGCA 2217

 52646363 GAGTCTGGCTTCAGGCAGAAATCTGACTTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGTCTTACCAGGG 52646422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2218 GAGTCTGGCTTCAGGCAGAAATCTGACTTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGTCTTACCAGGG 2277

 52646423 ACTTGTATTAGCATAGACTGTTAAGAATATGGGAAGATTTTTAAAATACAGTACTCAGAA 52646482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2278 ACTTGTATTAGCATAGACTGTTAAGAATATGGGAAGATTTTTAAAATACAGTACTCAGAA 2337

 52646483 AATTTCTCTTTGAAAGGCTGGAAGAGCAGATATCCACACAAGAAGGCAAATTAGACCTCA 52646542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2338 AATTTCTCTTTGAAAGGCTGGAAGAGCAGATATCCACACAAGAAGGCAAATTAGACCTCA 2397

 52646543 GGCCAGTGTGGAATTAAAGGTGTAGGGTTATCTGGTCAAGACTGTGTGTGTGGATACAGG 52646602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2398 GGCCAGTGTGGAATTAAAGGTGTAGGGTTATCTGGTCAAGACTGTGTGTGTGGATACAGG 2457

 52646603 CTCCAACCCCTCCAGGCAAGGGCACTGTTTCCAACATCCACCCTTTCTCCTTTGACCTCT 52646662
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2458 CTCCAACCCCTCCAGGCAAGGGCAATGTTTCCAACATCCACCCTTTCTCCTTTGACCTCT 2517

 52646663 ACCTTGACCTAAATTAACTATAAAAGGTCCTTCTTTTCTAGGACCCTACTATAAATCAGT 52646722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2518 ACCTTGACCTAAATTAACTATAAAAGGTCCTTCTTTTCTAGGACCCTACTATAAATCAGT 2577

 52646723 GAAATATTCAGGAAAAAAAGAACACCAAGAATGTTGGGATCCCAGTTAAAGATCAAGATT 52646782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2578 GAAATATTCAGGAAAAAAAGAACACCAAGAATGTTGGGATCCCAGTTAAAGATCAAGATT 2637

 52646783 CTCTACTGATAAGCTGTGTGATATGGAGTAAATCACTAAAGATCTTTGAATCTCTTCATT 52646842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2638 CTCTACTGATAAGCTGTGTGATATGGAGTAAATCACTAAAGATCTTTGAATCTCTTCATT 2697

 52646843 TGTAAAATGGGAATATTGGTAGTCCTACTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTAAAGAAGAAAA 52646902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2698 TGTAAAATGGGAATATTGGTAGTCCTACTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTAAAGAAGAAAA 2757

 52646903 GTCATGCAAAGGATCTGGCACAACGCCTTTTCCATAATAAGTGCTTAGTAATTGACAGAT 52646962
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2758 GTCATGCAAAGGATCTGGCACAATGCCTTTTCCATAATAAGTGCTTAGTAATTGACAGAT 2817

 52646963 ACTGTGATAACTTTTCAGGTTTCTCTCATGCCTTTGACAACATTGCATTTTGCTTGCTCT 52647022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2818 ACTGTGATAACTTTTCAGGTTTCTCTCATGCCTTTGACAACATTGCATTTTGCTTGCTCT 2877

 52647023 ATCTGTAGTCAGACACTTCTTAATATCTGTTTGCAGGAAGAC 52647064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2878 ATCTGTAGTCAGACACTTCTTAATATCTGTTTGCAGGAAGAC 2919

EXCISED REGION

 52658003 AGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTG 52658062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2920 AGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTG 2979

 52658063 GCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTAT 52658122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2980 GCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTAT 3039

 52658123 AAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGG 52658182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3040 AAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGG 3099

 52658183 GAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTG 52658242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3100 GAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTG 3159

 52658243 AAACACTGTCTCTGCTAAAAAACAAAACAAAACAAAACACCAAAAAATAGCTGGGCGTAG 52658302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3160 AAACACTGTCTCTGCTAAAAAACAAAACAAAACAAAACACCAAAAAATAGCTGGGCGTAG 3219

 52658303 TGGCGGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTTGGGAGGCGGTGGCAGGAGAATCATTTGAACCT 52658362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3220 TGGCGGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTTGGGAGGCGGTGGCAGGAGAATCATTTGAACCT 3279

 52658363 GGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGAT--------TGTGCCACTGCACTCTAACCTGG 52658414
          |||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||
     3280 GGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACTGTGCCACTGCACTCTAACCTGG 3339

 52658415 GCAACAGAGTTCAGAGTGAGACTCTGTCTCCCCC----------------AAAAAAAAAA 52658458
          ||||||||||||||||||||||||||||||                    ||||||||||
     3340 GCAACAGAGTTCAGAGTGAGACTCTGTCTC----ACCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 3395

 52658459 AAAAAAAAAAAAGAACAGCCATATAGATCGTCGGTGGGAGTGTAATTTGGCCACTTCTTT 52658518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3396 AAAAAAAAAAAAGAACAGCCATATAGATCGTCGGTGGGAGTGTAATTTGGCCACTTCTTT 3455

 52658519 GGAAAATAGCTCAGTAATATCTATTAATACTTAAAATTTCACAAACACTGTAAGTCTAAC 52658578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3456 GGAAAATAGCTCAGTAATATCTATTAATACTTAAAATTTCACAAACACTGTAAGTCTAAC 3515

 52658579 TTCCACTTCTAAAATGTTATCCTAGAAATAAAATTGCATAGGGGTACAAAGGCTTACGTA 52658638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3516 TTCCACTTCTAAAATGTTATCCTAGAAATAAAATTGCATAGGGGTACAAAGGCTTACGTA 3575

 52658639 TGGAACTATTTGCTGGACTACTGTAGTTGTGGCAAAAAACTGGAAATGACCTAAACGCTT 52658698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3576 TGGAACTATTTGCTGGACTACTGTAGTTGTGGCAAAAAACTGGAAATGACCTAAACGCTT 3635

 52658699 ATTAGTAGAAACCTGGTTAAATAAATTATCATATGTCCTTGAGGACACAGGGACACAAAG 52658758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3636 ATTAGTAGAAACCTGGTTAAATAAATTATCATATGTCCTTGAGGACACAGGGACACAAAG 3695

 52658759 AGGGGAATGACAGGCACTGAGCCTACTTGAGGGTGGGAGGAGGAAGTCGATCAGAAAAAA 52658818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3696 AGGGGAATGACAGGCACTGAGCCTACTTGAGGGTGGGAGGAGGAAGTCGATCAGAAAAAA 3755

 52658819 TAACTAGTGGGTACTAGGCTTAGTACCCGGGTGAAAAAATAATCTGTACAACAAACCCCC 52658878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3756 TAACTAGTGGGTACTAGGCTTAGTACCCGGGTGAAAAAATAATCTGTACAACAAACCCCC 3815

 52658879 ATGACATGAGTTTACCTTATAACAAACCTGCACATGTAATCTGAACCTAGATAAAAGTTT 52658938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3816 ATGACATGAGTTTACCTTATAACAAACCTGCACATGTAATCTGAACCTAGATAAAAGTTT 3875

 52658939 AAAAAAATAAATAATCATATGTCCCTACAATGAAATATTCCACAGGCATTAAAATTCCCC 52658998
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     3876 AAAAAAATAAATAATCATATGTCCCTATAATGAAATATTCCACAGGCATTAAAATTCCCC 3935

 52658999 AAGGAATTTTAGTAAGGAAAGAAAAAGCTGTGCCCAACAGCACGTACAGTATGTTTCCAT 52659058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3936 AAGGAATTTTAGTAAGGAAAGAAAAAGCTGTGCCCAACAGCACGTACAGTATGTTTCCAT 3995

 52659059 TTGTTTTTAAAAAATGGTGTCGGGAGGTTGAGGAGACAACTTATAAATAGACATGCCTGG 52659118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3996 TTGTTTTTAAAAAATGGTGTCGGGAGGTTGAGGAGACAACTTATAAATAGACATGCCTGG 4055

 52659119 GATACCTCTGGATATAAGAAACTGTAAAGTATTTACTTCTAAGGAAGGAAATTTGGGATG 52659178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4056 GATACCTCTGGATATAAGAAACTGTAAAGTATTTACTTCTAAGGAAGGAAATTTGGGATG 4115

 52659179 GGGCTTGGGGAGCCATCAGAGTTAGGGTGGGGATTTTTTCTCTGCCTTATCTTATTATGT 52659238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4116 GGGCTTGGGGAGCCATCAGAGTTAGGGTGGGGATTTTTTCTCTGCCTTATCTTATTATGT 4175

 52659239 ATATCGCTCAGAATGTTTGCTATGTGTATGCACCTACCCCATCCATTAAGAAATGAAGAA 52659298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4176 ATATCGCTCAGAATGTTTGCTATGTGTATGCACCTACCCCATCCATTAAGAAATGAAGAA 4235

 52659299 ATAATGAAAAGAAAAAATGAAAGTAGGGAACTAGAAATGAGAGGTGGGATTCAAAGTGGA 52659358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4236 ATAATGAAAAGAAAAAATGAAAGTAGGGAACTAGAAATGAGAGGTGGGATTCAAAGTGGA 4295

 52659359 CTGAACACTTGACCTATTTCCCAATTTGCCTAGGGCTGGCCCAGCAGCGAGGCAGGTTCT 52659418
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     4296 CTGAACACTTGACCTATTTCCCAATTTGCCTGGGGCTGGCCCAGCAGCGAGGCAGGTTCT 4355

 52659419 AACCAATGAGCATCAGCTTTGAATGGAGGGGCTGATAGGCCAGGTGGGCCCTGCTTGCTG 52659478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4356 AACCAATGAGCATCAGCTTTGAATGGAGGGGCTGATAGGCCAGGTGGGCCCTGCTTGCTG 4415

 52659479 AGAGTGTCATGGCCTTAGGGACATCTCCATGTTGCAGAGTCTGAGCCTCTGCTTGGCAAA 52659538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4416 AGAGTGTCATGGCCTTAGGGACATCTCCATGTTGCAGAGTCTGAGCCTCTGCTTGGCAAA 4475

 52659539 TTCAGAAAATCCAGCTTTTCTTTTTATATCACCTGGAGCTGATGTAACTCTCAGAAGGCA 52659598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     4476 TTCAGAAAATCCAGCTTTTCTTTTTATATCACCTGGAGCTGATGTAACTCTCAGAACGCA 4535

 52659599 TTTTTAAGAGGACTCATGAATTAACCACATAGCCAACTTACTGGCTTAAGACTACGTGAC 52659658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4536 TTTTTAAGAGGACTCATGAATTAACCACATAGCCAACTTACTGGCTTAAGACTACGTGAC 4595

 52659659 AGAAAGCTGCAAAGGGGGCCAGCCACTGGTAACATCCCACCACTGTCCCTCTCTGTGGAA 52659718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4596 AGAAAGCTGCAAAGGGGGCCAGCCACTGGTAACATCCCACCACTGTCCCTCTCTGTGGAA 4655

 52659719 AACACAGATGGGATGCACATTGTGACGGGCAGGATGCCTGGAGAGCCCACAAATCTGCAA 52659778
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4656 AACACAGATGGGATGCACATTGTGATGGGCAGGATGCCTGGAGAGCCCACAAATCTGCAA 4715

 52659779 GCACAGCTGAAATTGGTTACAGGATTTCAATGTTTCATTGCTTGAAGCTATGATAACTTG 52659838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  
     4716 GCACAGCTGAAATTGGTTACAGGATTTCAATGTTTCATTGCTTGAAGCTATGATAACT-- 4773

 52659839 ATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGACGATGATTTTTTTTATAGCCATCTTTTTA 52659898
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4774 -TGATGATGATGATGATGATGATGATGATGACGATGATTTTTTTTATAGCCATCTTTTTA 4832

 52659899 GAGGGATTTGAGGTAGGGAAAAAAATAAACCTCACACTATCGGAGGTTGCCAACTATGAG 52659958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4833 GAGGGATTTGAGGTAGGGAAAAAAATAAACCTCACACTATCGGAGGTTGCCAACTATGAG 4892

 52659959 GTCTGCTGATGGTTTGGCCAACACAGTGTTTATATTTTTTTGAATTGGGAAATTTCATTT 52660018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4893 GTCTGCTGATGGTTTGGCCAACACAGTGTTTATATTTTTTTGAATTGGGAAATTTCATTT 4952

 52660019 AAAAGTCCTAAAATCAGGCTGTTATTGAAATATCTTATTATTGGCTCAGGGTTTCCCAGG 52660078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4953 AAAAGTCCTAAAATCAGGCTGTTATTGAAATATCTTATTATTGGCTCAGGGTTTCCCAGG 5012

 52660079 GCAGCCATCCTTGAAGCTGTGTGGAGCCCTATAAACAAGGACGCTTTCCAGTTCCCTGCA 52660138
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     5013 GCAGCCATCCTTGAAGCTGTGTGGAGCCCTATAAACAAGGAGGCTTTCCAGTTCCCTGCA 5072

 52660139 AACTCCATTTCATTCAGAGCCTTGAGCCAGTTCTTACATGGTCCTCAGACTTGAGCTAGT 52660198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5073 AACTCCATTTCATTCAGAGCCTTGAGCCAGTTCTTACATGGTCCTCAGACTTGAGCTAGT 5132

 52660199 GCAAGAATACCCGGGAGGGGTTGTGGGAACAGATAGCTGGGCCCCACCCCCAGGGAAGGG 52660258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5133 GCAAGAATACCCGGGAGGGGTTGTGGGAACAGATAGCTGGGCCCCACCCCCAGGGAAGGG 5192

 52660259 GGTGTTTCTGACTCAGGAGGTCTGGGCTCCGGCTACAGAAACTGCACATCTAACCGGTAC 52660318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5193 GGTGTTTCTGACTCAGGAGGTCTGGGCTCCGGCTACAGAAACTGCACATCTAACCGGTAC 5252

 52660319 CCAGGTGATGTGATGCTGCTGGCCCAGGGACAACTCTGCGAGTCACTGCTATTGGGCACT 52660378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5253 CCAGGTGATGTGATGCTGCTGGCCCAGGGACAACTCTGCGAGTCACTGCTATTGGGCACT 5312

 52660379 GCTATTGCACCCACACAAGGAGGCAGGCTCTGCTTACATTTTTCAGTTCTTGTTCCCAGA 52660438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5313 GCTATTGCACCCACACAAGGAGGCAGGCTCTGCTTACATTTTTCAGTTCTTGTTCCCAGA 5372

 52660439 AACATTTGCTCTTTGGGGTATGCTTTGCATATAATGGATCCTACCCACTAATACAGTATG 52660498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5373 AACATTTGCTCTTTGGGGTATGCTTTGCATATAATGGATCCTACCCACTAATACAGTATG 5432

 52660499 CTGCTTTTATTGATAAACTTCCAGAAACTTGAAGCGCACCTTACCATTTCTTTGATCTCG 52660558
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5433 CTGCTTTTATTGATAAACTTCCAGATACTTGAAGCGCACCTTACCATTTCTTTGATCTCG 5492

 52660559 CTGATTATTTTTATTTTTGTTAAATGAAAATTGTTGGTAAGTTCTTTTTGGTGTGGTAAA 52660618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5493 CTGATTATTTTTATTTTTGTTAAATGAAAATTGTTGGTAAGTTCTTTTTGGTGTGGTAAA 5552

 52660619 AGGATATGAAAAGCTGATTTTAAAAAAATGTCCACTCTAGGATTAGAATTGTAGGTGTGT 52660678
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5553 AGGATATGAAAAACTGATTTTAAAAAAATGTCCACTCTAGGATTAGAATTGTAGGTGTGT 5612

 52660679 TTATTCTATTTCAAGATCTGGTTAAAATGCACCTTGAGGAAAAGAATTGAGTGCAGCTGT 52660738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5613 TTATTCTATTTCAAGATCTGGTTAAAATGCACCTTGAGGAAAAGAATTGAGTGCAGCTGT 5672

 52660739 TGTTATTTCTCAATGCTGTTTCTCTTTTCATGTTTTTTTCATGTTGTCTCTTGGTCTGTC 52660798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5673 TGTTATTTCTCAATGCTGTTTCTCTTTTCATGTTTTTTTCATGTTGTCTCTTGGTCTGTC 5732

 52660799 CTATCTCTCTTGGTCTATCCTCCAAGACAGAGATGAGTGATCTTGAAACCCTGCCCATGT 52660858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5733 CTATCTCTCTTGGTCTATCCTCCAAGACAGAGATGAGTGATCTTGAAACCCTGCCCATGT 5792

 52660859 TTTTATCTTTGGAGCCCAACTGTGCTGCCTTGTTTTCTTCTCCATCCAAAGAGGCAAAGA 52660918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5793 TTTTATCTTTGGAGCCCAACTGTGCTGCCTTGTTTTCTTCTCCATCCAAAGAGGCAAAGA 5852

 52660919 GAAAGTTGCATATTACTCAACAGCAGTTGCATGACAGTTAAAATCAGACTGTATGAGTCA 52660978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5853 GAAAGTTGCATATTACTCAACAGCAGTTGCATGACAGTTAAAATCAGACTGTATGAGTCA 5912

 52660979 TGGAACAGTAAGTTGTGTCCAGAGTATCTGTCATGGTAAGTACAAAAAAGTCCTTAAAAA 52661038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5913 TGGAACAGTAAGTTGTGTCCAGAGTATCTGTCATGGTAAGTACAAAAAAGTCCTTAAAAA 5972

 52661039 TTTAAAACAGAAATGCCAATGTTTTATTTTTGAAAAATGTGAAGAAGAAATTTTCCGGCC 52661098
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     5973 TTTAAAACAGAAATGCCAATGTTTTATTTCTGAAAAATGTGAAGAAGAAATTTTCCGGCC 6032

 52661099 GGGCGCGGTGGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATCAC 52661158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6033 GGGCGCGGTGGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATCAC 6092

 52661159 CTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACACAGTGCAACCCCATCTCTACTAAAA 52661218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6093 CTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACACAGTGCAACCCCATCTCTACTAAAA 6152

 52661219 ATACAAAAATTAGCCAGATGCGGTGGCACGCGCCTGTAATCTCAGCTACTAGGGAGGCTG 52661278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6153 ATACAAAAATTAGCCAGATGCGGTGGCACGCGCCTGTAATCTCAGCTACTAGGGAGGCTG 6212

 52661279 AGGCATGACAATCGCTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCATACCAC 52661338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6213 AGGCATGACAATCGCTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCATACCAC 6272

 52661339 TGCACTCCAGCTTGGGCAGCGGAAGGAGACTCTGTCTC------AAAAAAAAAAAGAAAA 52661392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||
     6273 TGCACTCCAGCTTGGGCAGCGGAAGGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAA 6332

 52661393 AAAGAAATTTTCTAAGTGTATTCCAAATAACTTTTAATATTGGATAAACATTACGAGTTT 52661452
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6333 AAAGAAATTTTCTAAGTGTATTCCGAATAACTTTTAATATTGGATAAACATTACGAGTTT 6392

 52661453 AAAAATACTTATGCCAGAGGAGTGCTGTGACTCGTGCCTCTAATCCCAGCAATGTGGGAG 52661512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6393 AAAAATACTTATGCCAGAGGAGTGCTGTGACTCGTGCCTCTAATCCCAGCAATGTGGGAG 6452

 52661513 GCCAAGGAGGGACAGTCACTTGAGCCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGATAACAAAGGGA 52661572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6453 GCCAAGGAGGGACAGTCACTTGAGCCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGATAACAAAGGGA 6512

 52661573 GACCTCATCTTTACAAAAAAACTAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGTGTGTGCCTGTGAT 52661632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6513 GACCTCATCTTTACAAAAAAACTAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGTGTGTGCCTGTGAT 6572

 52661633 CCCAGCTACACAGGAGGCTGAGGCAAGAGGATTCCTTGAGCCCTGGAGGTCAAGGCTGCA 52661692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6573 CCCAGCTACACAGGAGGCTGAGGCAAGAGGATTCCTTGAGCCCTGGAGGTCAAGGCTGCA 6632

 52661693 GTGAGTGATGATCATGCCATTGCACTCCAGCTGGGTGACAGAGCAAGACCTCATCTCAAA 52661752
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6633 GTGAGCGATGATCATGCCATTGCACTCCAGCTGGGTGACAGAGCAAGACCTCATCTCAAA 6692

 52661753 AAAAAAAAA-AAAACAAAACAAAACAAAAAACTTACGCCCAGGTAAAAATTGTCAGAGAA 52661811
          ||.||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6693 AACAAAA--CAAAACAAAACAAAACAAAAAACTTACGCCCAGGTAAAAATTGTCAGAGAA 6750

 52661812 AAATAAGAAAAAAACTGAATGCCCAAAATTAGCATAATGGCTGAATGAATTATAGTATGT 52661871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6751 AAATAAGAAAAAAACTGAATGCCCAAAATTAGCATAATGGCTGAATGAATTATAGTATGT 6810

 52661872 CTATACCTTGAAGTACATTGTAGCTTTAAAAAAAATGAATTAAAGTTATACCAGTTGAAT 52661931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6811 CTATACCTTGAAGTACATTGTAGCTTTAAAAAAAATGAATTAAAGTTATACCAGTTGAAT 6870

 52661932 TTGGAGTTGAGATGGGGAAGATTATTACAATTAAAAAAAAACAAACACTATTAATGGATG 52661991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6871 TTGGAGTTGAGATGGGGAAGATTATTACAATTAAAAAAAAACAAACACTATTAATGGATG 6930

 52661992 TGCTGGGAAATGTCTGTATGGGGCTAGTTAAAGTAAATTAAAATAAAGACCAGACCTGAA 52662051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6931 TGCTGGGAAATGTCTGTATGGGGCTAGTTAAAGTAAATTAAAATAAAGACCAGACCTGAA 6990

 52662052 GAATCCCTGAGCGGACAAAGCCTGTTAGACCACATAAATGAGCTAAACCTTGCTTGATTT 52662111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6991 GAATCCCTGAGCGGACAAAGCCTGTTAGACCACATAAATGAGCTAAACCTTGCTTGATTT 7050

 52662112 GCAGACATAAGCAAAACAACTCGAACTGTTTCTTGTAAATGCCTATGCTAAAGAAAAACA 52662171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7051 GCAGACATAAGCAAAACAACTCGAACTGTTTCTTGTAAATGCCTATGCTAAAGAAAAACA 7110

 52662172 GAACTTGAGCTCAACCAATCAGAAACAGTCAACAAACTTAAAATTATATAACTGGGTACC 52662231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7111 GAACTTGAGCTCAACCAATCAGAAACAGTCAACAAACTTAAAATTATATAACTGGGTACC 7170

 52662232 TTCCAATGAGATGATCAAATAAGGCAACTGTGTAATTGTAACACATCAAACACATTTTAT 52662291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7171 TTCCAATGAGATGATCAAATAAGGCAACTGTGTAATTGTAACACATCAAACACATTTTAT 7230

 52662292 ATTATGCCTCTGCATTTTCCCTTAATTCTGGCATGTAATGCTTTGTCATCAAAACACTAA 52662351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7231 ATTATGCCTCTGCATTTTCCCTTAATTCTGGCATGTAATGCTTTGTCATCAAAACACTAA 7290

 52662352 TTCCCTTTTGGTTTTCTTTTCTCAAATTAATGAATTGCCTCTATTCAGATACACTCTTTG 52662411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7291 TTCCCTTTTGGTTTTCTTTTCTCAAATTAATGAATTGCCTCTATTCAGATACACTCTTTG 7350

 52662412 AAATTTTATTGTGTCTCAGATTTGTCTTTTACAAAGTATAGAACAAAGAGAAAAATATGA 52662471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7351 AAATTTTATTGTGTCTCAGATTTGTCTTTTACAAAGTATAGAACAAAGAGAAAAATATGA 7410

 52662472 AAGAAGAAATATTAGGTTGTTAGCTTGGGTGTCCTTGGAGGGGGTAGGGAAGATGTGAGA 52662531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7411 AAGAAGAAATATTAGGTTGTTAGCTTGGGTGTCCTTGGAGGGGGTAGGGAAGATGTGAGA 7470

 52662532 TGAGGAAGAAGCCAATAAGAAAAAGAAAAAGACAGGTTTCACCAAAACAACAATAACAGA 52662591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7471 TGAGGAAGAAGCCAATAAGAAAAAGAAAAAGACAGGTTTCACCAAAACAACAATAACAGA 7530

 52662592 AAATATGATTGCATTTATTCATATATGTTAATTGGTATGTATGTAAGTATATATGCATGT 52662651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7531 AAATATGATTGCATTTATTCATATATGTTAATTGGTATGTATGTAAGTATATATGCATGT 7590

 52662652 AAAAATAAAATACAAAGAATTAAAATGCATACTAATAGTTATTTCAGTTATCTATGGCTG 52662711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7591 AAAAATAAAATACAAAGAATTAAAATGCATACTAATAGTTATTTCAGTTATCTATGGCTG 7650

 52662712 TGTAACAAGCATCCCCAAAATGATTGACTTAACCACCATTTTATTAGGTCATGATTCCAT 52662771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7651 TGTAACAAGCATCCCCAAAATGATTGACTTAACCACCATTTTATTAGGTCATGATTCCAT 7710

 52662772 GCATTAAGAATTCAGGGCCGGGTGCGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAG 52662831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7711 GCATTAAGAATTCAGGGCCGGGTGCGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAG 7770

 52662832 GCCAAGGTGGGTGGATCACGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGCCCAACATAGTGGAA 52662891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7771 GCCAAGGTGGGTGGATCACGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGCCCAACATAGTGGAA 7830

 52662892 CCCCGTCTGTACTAAAAATACAGAAGATTAGCTGGGTGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCC 52662951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7831 CCCCGTCTGTACTAAAAATACAGAAGATTAGCTGGGTGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCC 7890

 52662952 CAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAAGCTGGAAGGCAGAGGTTGCAGT 52663011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     7891 CAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAAGCTGGAAGGCGGAGGTTGCAGT 7950

 52663012 GAGCCAAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGTGGACAGCGCGAGACTCCATCTCAAAA 52663071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||
     7951 GAGCCAAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGTGGACAGCGCGAGACTCCATCTC--AA 8008

 52663072 AAAAAAAAAAAAAAAAGAATTCAGGCAGATGCCAGGTGCAGTGGCTCATACCTGTAATTC 52663131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8009 AAAAAAAAAAAAAAAAGAATTCAGGCAGATGCCAGGTGCAGTGGCTCATACCTGTAATTC 8068

 52663132 TAGCACTTTGGGAGGCTGAGATGGGCAGATCACCTGAAGTCAAGGAGTTCCAGACCAGCC 52663191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8069 TAGCACTTTGGGAGGCTGAGATGGGCAGATCACCTGAAGTCAAGGAGTTCCAGACCAGCC 8128

 52663192 TGGCCAACATGGTGAAAACCAGTCTGTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGACATGGTGG 52663251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8129 TGGCCAACATGGTGAAAACCAGTCTGTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGACATGGTGG 8188

 52663252 CACGTGCCTGTAATCCCAGCTATACAAGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGATCTGGGA 52663311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8189 CACGTGCCTGTAATCCCAGCTATACAAGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGATCTGGGA 8248

 52663312 CGTGGAGGTTGCAGCAAGCCAAGATCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGA 52663371
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8249 GGTGGAGGTTGCAGCAAGCCAAGATCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGA 8308

 52663372 GACTCTGTCTC--AAAAAAAAAAAAAAAGAATTCAGGCAGAGAGAGGATAGGATCAGCTT 52663429
          |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8309 GACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAGAATTCAGGCAGAGAGAGGATAGGATCAGCTT 8368

 52663430 ATTTCTGCTCTATGATGTCTGGAGCCACAGCTGGGGTGCCTTGAAAGGATGAAGATGGCT 52663489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8369 ATTTCTGCTCTATGATGTCTGGAGCCACAGCTGGGGTGCCTTGAAAGGATGAAGATGGCT 8428

 52663490 GGGACGGCTCACACAGGGACATATGTCTGGAGCTTTAGTTCTGGCTATGGGCTGGTTCCT 52663549
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8429 GGGATGGCTCACACAGGGACATATGTCTGGAGCTTTAGTTCTGGCTATGGGCTGGTTCCT 8488

 52663550 ATGGTCCTTCCTCATACGGCATCTATTAGCTGAAATGCCCATGATGTCTTCTTTAATCAC 52663609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8489 ATGGTCCTTCCTCATACGGCATCTATTAGCTGAAATGCCCATGATGTCTTCTTTAATCAC 8548

 52663610 AGGTCTGGTTCCTGGACTGGGATGGCTGGAATATTTGGGAACTGGCTGGGTACCTCTCTC 52663669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8549 AGGTCTGGTTCCTGGACTGGGATGGCTGGAATATTTGGGAACTGGCTGGGTACCTCTCTC 8608

 52663670 TTGCCTCATGGCTTCTTCATGTGACTAGCTTGGGCTCTCTCACAGCATGGCAATCTCAGG 52663729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8609 TTGCCTCATGGCTTCTTCATGTGACTAGCTTGGGCTCTCTCACAGCATGGCAATCTCAGG 8668

 52663730 GTAGAACTTCTGATATTGTGTCTAGCCTTTCTCAGAGCTAGTGTTGCAAGAGACAAGGCA 52663789
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8669 GTAGAACTTCTGATATTGTGTCTAGGCTTTCTCAGAGCTAGTGTTGCAAGAGACAAGGCA 8728

 52663790 GAAGCTCCGAGTCTTCTTAAAAGGCTTCTTGAAAGTCCTGTGTCATCCCTTCTACTACAT 52663849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8729 GAAGCTCCGAGTCTTCTTAAAAGGCTTCTTGAAAGTCCTGTGTCATCCCTTCTACTACAT 8788

 52663850 ACTGTTGGTTATATAGGACCAGCCCAGAGGGGACTACACAGGGGTGTGAATACCAGGAAG 52663909
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8789 ACTGTTGGTTATATAGGACCAGTCCAGAGGGGACTACACAGGGGTGTGAATACCAGGAAG 8848

 52663910 CATGGGTTATTGCGTGGTGGGTTGTATGTGTGCATCTTTGGAGACTATCAACCACAATAA 52663969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8849 CATGGGTTATTGCGTGGTGGGTTGTATGTGTGCATCTTTGGAGACTATCAACCACAATAA 8908

 52663970 TGCAATAGGGAAGATAATTTTATCTAACAGGAATTCTCCACTAGACTTTTTGGTGAGAAA 52664029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8909 TGCAATAGGGAAGATAATTTTATCTAACAGGAATTCTCCACTAGACTTTTTGGTGAGAAA 8968

 52664030 AAGCACTGAGTTTGAGAAGGATGAGATTTCCCCAGGGCTCTTGCTCACTCCCAAGGAAGA 52664089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8969 AAGCACTGAGTTTGAGAAGGATGAGATTTCCCCAGGGCTCTTGCTCACTCCCAAGGAAGA 9028

 52664090 CAGAGGCACAAGGAGCTGTTGGGCCATCTGGGAGAGCCAGTGTTCAGAACTCTCTGTTAT 52664149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9029 CAGAGGCACAAGGAGCTGTTGGGCCATCTGGGAGAGCCAGTGTTCAGAACTCTCTGTTAT 9088

 52664150 TACTTTAGACTCAGTGGTGATACAGTGCAATGGAGGGAAAGAAGAAAGGAGAGTGCCTGT 52664209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9089 TACTTTAGACTCAGTGGTGATACAGTGCAATGGAGGGAAAGAAGAAAGGAGAGTGCCTGT 9148

 52664210 GAGTGTTACCAGTGGAGAGTTGTCCAGGTTCTTGGTGTTTTGAACAAAAAAATTGGACAA 52664269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9149 GAGTGTTACCAGTGGAGAGTTGTCCAGGTTCTTGGTGTTTTGAACAAAAAAATTGGACAA 9208

 52664270 AATGCACAAAGCAATGAAAGCACAGATTTATAGAAATGAAAGTACACTCCACAGAGTGGG 52664329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9209 AATGCACAAAGCAATGAAAGCACAGATTTATAGAAATGAAAGTACACTCCACAGAGTGGG 9268

 52664330 AGCAGGTTTGAGCAAGTGGCTCAAGAGTGCTGGTTACAGAAATTTCTGGGGTTTAAATAC 52664389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9269 AGCAGGTTTGAGCAAGTGGCTCAAGAGTGCTGGTTACAGAAATTTCTGGGGTTTAAATAC 9328

 52664390 CCTCTAGTGGTTTCCCATTGGTTACTTGGTGTATGCCCTATGTAAATGAAGAGGATGAAG 52664449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9329 CCTCTAGTGGTTTCCCATTGGTTACTTGGTGTATGCCCTATGTAAATGAAGAGGATGAAG 9388

 52664450 GGAAGTTACAAAGTTATTTACTTGGTGTACACCCTATGCAAATGAAGAGGATATTTCCTG 52664509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9389 GGAAGTTACAAAGTTATTTACTTGGTGTACACCCTATGCAAATGAAGAGGATATTTCCTG 9448

 52664510 CCATAGCTGAAGTGCAGTTACATCCATAGTTGAGCATAGAAAGTTGTGGGTTTTCTGCTT 52664569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9449 CCATAGCTGAAGTGCAGTTACATCCATAGTTGAGCATAGAAAGTTGTGGGTTTTCTGCTT 9508

 52664570 GATTTAGTTCTAGGAAGTCCTTAGCTTCCCCGCCTCCAGACCCTATTCCCCTACCTCATG 52664629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9509 GATTTAGTTCTAGGAAGTCCTTAGCTTCCCCGCCTCCAGACCCTATTCCCCTACCTCATG 9568

 52664630 AGGATGGGGTGTCTCACAGAGTT 52664652
          |||||||||||||||||||||||
     9569 AGGATGGGGTGTCTCACAGAGTT 9591

Alignment time is 10.5037 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [52637064,52668002] =>     30939 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    2925] =>      2925 nucs 'mol-32-3190-267563_2925'

Score:        2867
Aligned:      2922        nucs
Identic:      2917 (100%) nucs =>       366 (100%)      2551 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [52644146,52644511] EXCISED REGION [52644515,52647070]
 second seq =>  [       1,     366] EXCISED REGION [     370,    2925]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         3 nucs [52644512,52644514]
 second seq =>         3 nucs [367,369]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [52644512,52644513] to [52644515,52644516]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [52644511,52644511] to [52644515,52644515]
 second seq =>         1 nucs [366,366] to [370,370]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 52644146 TAATGTATCAAGTTTTACTTCCTTCTTCTTTTAAGGAGTTCTTTTCCTGCCTTGAATACA 52644205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TAATGTATCAAGTTTTACTTCCTTCTTCTTTTAAGGAGTTCTTTTCCTGCCTTGAATACA 60

 52644206 AACAGGCTCTCTCAAGGTTAAAAGCAAATGCTCTTTTTAGTGTCAAAAAGAGCTTGCCTT 52644265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AACAGGCTCTCTCAAGGTTAAAAGCAAATGCTCTTTTTAGTGTCAAAAAGAGCTTGCCTT 120

 52644266 TCTTCGCTCAGGAAAAAAAGCAACTGATTCCAGGATACCTTCTTTGAAAACCAACACAAA 52644325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCTTCGCTCAGGAAAAAAAGCAACTGATTCCAGGATACCTTCTTTGAAAACCAACACAAA 180

 52644326 AAAACCCCCCAAAAAACAAAAAAAAAACCCAAAACCCCTAGTTTTTACAAAGGTTTATTA 52644385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAAACCCCCCAAAAAACAAAAAAAAAACCCAAAACCCCTAGTTTTTACAAAGGTTTATTA 240

 52644386 CTCCTACTTGTTGGAAAAGAATTACTACATAAAAGAGTCTGCCCAGAGCTGTAAAATCTC 52644445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTCCTACTTGTTGGAAAAGAATTACTACATAAAAGAGTCTGCCCAGAGCTGTAAAATCTC 300

 52644446 CTTATTCAAACACACACCTTAGAGCAAAAGATGGTTAAATATCAATTCAGGCTATTAACA 52644505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTTATTCAAACACACACCTTAGAGCAAAAGATGGTTAAATATCAATTCAGGCTATTAACA 360

 52644506 GTAAGG 52644511
          ||||||
      361 GTAAGG 366

EXCISED REGION

 52644515 GAAATGTGTTCCAACAAAACTCTGCATGTCAACAAACTACAGAGACTAGGTAACATCTTT 52644574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      370 GAAATGTGTTCCAACAAAACTCTGCATGTCAACAAACTACAGAGACTAGGTAACATCTTT 429

 52644575 TAGGAATCATTTTTATTCCACTAATGCCTTTTCCTCCAGAATCCACTGATCGTAAACGCA 52644634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      430 TAGGAATCATTTTTATTCCACTAATGCCTTTTCCTCCAGAATCCACTGATCGTAAACGCA 489

 52644635 ACCTGTCTACTTCCGCCTTTGAAAAATGGATGGACAAATTCATCTGCATGTAACTCACCT 52644694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      490 ACCTGTCTACTTCCGCCTTTGAAAAATGGATGGACAAATTCATCTGCATGTAACTCACCT 549

 52644695 CCTCTTTTCTTTTACATAAAACAGATGCCACAGCTGTTATTGTTCTTCACACAGAAGTTT 52644754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      550 CCTCTTTTCTTTTACATAAAACAGATGCCACAGCTGTTATTGTTCTTCACACAGAAGTTT 609

 52644755 CTACCCAGAGAAACATCAGGATGACACTCTGCTGCAATGTGCTATTTGTTCTAGAGGGGT 52644814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      610 CTACCCAGAGAAACATCAGGATGACACTCTGCTGCAATGTGCTATTTGTTCTAGAGGGGT 669

 52644815 CAACAGCTTGCCACCTTGCCTAGGCCCAGGGTGACTGCATATGTGCAGTGGTCTTATCCC 52644874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      670 CAACAGCTTGCCACCTTGCCTAGGCCCAGGGTGACTGCATATGTGCAGTGGTCTTATCCC 729

 52644875 ATTAGCGCCCCCGAGCATGCATTCAGAACCAAGTGGATACACCTTGGCACACTTACCTTC 52644934
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
      730 ATTAGCGCCCCCGAGCATGCATTCAGAACCAAGTGAATACACCTTGGCACACTTACCTTC 789

 52644935 CCTGCAGGGACATCATCGGACTGCCCTGATAAGCCAGGAACCTCATCCACCTTGTCTTGA 52644994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      790 CCTGCAGGGACATCATCGGACTGCCCTGATAAGCCAGGAACCTCATCCACCTTGTCTTGA 849

 52644995 TGCTCTGCCCTCTTGGCTTCCTGTTGGCTGTCACCTGGCACCTTTTCCTGTCCCTTGTCC 52645054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      850 TGCTCTGCCCTCTTGGCTTCCTGTTGGCTGTCACCTGGCACCTTTTCCTGTCCCTTGTCC 909

 52645055 AGCTTGAAGAATTTGTCAAAAAAGCTGGAGTCCTTGGGCTTGGAGGGAGCTTCTCCTCCT 52645114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      910 AGCTTGAAGAATTTGTCAAAAAAGCTGGAGTCCTTGGGCTTGGAGGGAGCTTCTCCTCCT 969

 52645115 GCTCCCCCTGTCTCAGGTGGGAGAAGCGTGGGATCCCTGGCGGCAGAGAGGACCTTGTCT 52645174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      970 GCTCCCCCTGTCTCAGGTGGGAGAAGCGTGGGATCCCTGGCGGCAGAGAGGACCTTGTCT 1029

 52645175 TGGGCCGGGGCGTGCCCTGGGGTTTTATCTGTGTCCTGCCCCGGTCCAGCTGCCACCGGA 52645234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1030 TGGGCCGGGGCGTGCCCTGGGGTTTTATCTGTGTCCTGCCCCGGTCCAGCTGCCACCGGA 1089

 52645235 AGTGTCCAGCTCTCACTTGGGTCTTTGTTCGCTGGAGCTTTATTGGAGCTGACATCAAGC 52645294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1090 AGTGTCCAGCTCTCACTTGGGTCTTTGTTCGCTGGAGCTTTATTGGAGCTGACATCAAGC 1149

 52645295 TTCACTGATCCAAGGGATGAATCTGCGGCTTGGTCTCCGGTACGTCCTGGTACAGGCCGA 52645354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1150 TTCACTGATCCAAGGGATGAATCTGCGGCTTGGTCTCCGGTACGTCCTGGTACAGGCCGA 1209

 52645355 GAGAGCATCAAGAAAAAACGAGATTTAGCAGCTGGTGCCTCGGGTTTGGCCTCTTTCCCA 52645414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1210 GAGAGCATCAAGAAAAAACGAGATTTAGCAGCTGGTGCCTCGGGTTTGGCCTCTTTCCCA 1269

 52645415 AGATTCTTTCCGTTGGCATCCGCAACAGCACTTATCTCCGTTGTCTCGGGGGAAGAAGTG 52645474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1270 AGATTCTTTCCGTTGGCATCCGCAACAGCACTTATCTCCGTTGTCTCGGGGGAAGAAGTG 1329

 52645475 GCCACATTATCCGTCTTGACACTTATTCCCAAGTCGACTGTAAACACAAACATAAACAGT 52645534
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     1330 GCCACATTATCCGTCTTGACACTTATTCCCAAGTCGACTGTAAACACAAACATAAACAGC 1389

 52645535 GGTTATTCAGCCAAGCCGGGAAATTCAGGCACTAATAATGGACTCCAGACATTTTTTATA 52645594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1390 GGTTATTCAGCCAAGCCGGGAAATTCAGGCACTAATAATGGACTCCAGACATTTTTTATA 1449

 52645595 CAAAAGCCATACTGCATACTGGAACTGTGTTGTTCTCTGGTCATTCTGAAAGGCAGAAGT 52645654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1450 CAAAAGCCATACTGCATACTGGAACTGTGTTGTTCTCTGGTCATTCTGAAAGGCAGAAGT 1509

 52645655 TAGCTCTCTACATCTCCTTGGACCCTGCTTTTCTTGGGAGAGGAGAAGGCAAGGTTGGTG 52645714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1510 TAGCTCTCTACATCTCCTTGGACCCTGCTTTTCTTGGGAGAGGAGAAGGCAAGGTTGGTG 1569

 52645715 AGGAGGGAAAGCTACTTAATGGAAAGTCACTAGCTGCCAGGTGTGGAATGAGTGATATTC 52645774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1570 AGGAGGGAAAGCTACTTAATGGAAAGTCACTAGCTGCCAGGTGTGGAATGAGTGATATTC 1629

 52645775 AATGTTAATTAATCTTCTTTTATCTGTGTAAGAACTCCGTGAGCAGCATATTGTCATGAT 52645834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1630 AATGTTAATTAATCTTCTTTTATCTGTGTAAGAACTCCGTGAGCAGCATATTGTCATGAT 1689

 52645835 GTCAACTGGGAGGCAGTACAGCAGTTAGGAGCTTGGGTTCTGGAGCTAGAACAAGGTTTC 52645894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1690 GTCAACTGGGAGGCAGTACAGCAGTTAGGAGCTTGGGTTCTGGAGCTAGAACAAGGTTTC 1749

 52645895 TCAACCTCAGCACTACTCACATTTGAAGCCAGATTATTCTTTGTTAGGGAGGCTCATCCC 52645954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1750 TCAACCTCAGCACTACTCACATTTGAAGCCAGATTATTCTTTGTTAGGGAGGCTCATCCC 1809

 52645955 GTGCCTCATAGGCTGATTAGCAGCATCCTGGCCTCTGCCCACTAGACGCCGGTCACATTT 52646014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1810 GTGCCTCATAGGCTGATTAGCAGCATCCTGGCCTCTGCCCACTAGACGCCGGTCACATTT 1869

 52646015 CCCAGTCATGGCAACCAAAAATATCTCTAGGCATTGCTAAATGTCCCCTGGAGGACAAAA 52646074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1870 CCCAGTCATGGCAACCAAAAATATCTCTAGGCATTGCTAAATGTCCCCTGGAGGACAAAA 1929

 52646075 TCTCTTACGTTTGAGAGGCACTGAGCTGAAATGTCTTTTTGAATCCAGATTATCTAATTT 52646134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1930 TCTCTTACGTTTGAGAGGCACTGAGCTGAAATGTCTTTTTGAATCCAGATTATCTAATTT 1989

 52646135 TCTGTGCCTCAACTTTCTGGTAAAAGGAGACAGATAATAAATCTCGTAATTTTGTTAGGA 52646194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1990 TCTGTGCCTCAACTTTCTGGTAAAAGGAGACAGATAATAAATCTCGTAATTTTGTTAGGA 2049

 52646195 AGATTACATGAGTTAATAGTTTTAAAGCAAGTACAATAGCACCTGGAATATATTAAGTGC 52646254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     2050 AGATTACATGAGTTAATAGTTTTAAAGCAAGTACAATAGCGCCTGGAATATATTAAGTGC 2109

 52646255 TTAATAAATATCACAAACATTAGTTATCATTATTCATGAGTGAGAAAACTGACAGTCAGA 52646314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2110 TTAATAAATATCACAAACATTAGTTATCATTATTCATGAGTGAGAAAACTGACAGTCAGA 2169

 52646315 GAGGTCAGTACACCCTCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCTAGTAAGCAGCAGAGTCTGGCTTC 52646374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2170 GAGGTCAGTACACCCTCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCTAGTAAGCAGCAGAGTCTGGCTTC 2229

 52646375 AGGCAGAAATCTGACTTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGTCTTACCAGGGACTTGTATTAGC 52646434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2230 AGGCAGAAATCTGACTTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGTCTTACCAGGGACTTGTATTAGC 2289

 52646435 ATAGACTGTTAAGAATATGGGAAGATTTTTAAAATACAGTACTCAGAAAATTTCTCTTTG 52646494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2290 ATAGACTGTTAAGAATATGGGAAGATTTTTAAAATACAGTACTCAGAAAATTTCTCTTTG 2349

 52646495 AAAGGCTGGAAGAGCAGATATCCACACAAGAAGGCAAATTAGACCTCAGGCCAGTGTGGA 52646554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2350 AAAGGCTGGAAGAGCAGATATCCACACAAGAAGGCAAATTAGACCTCAGGCCAGTGTGGA 2409

 52646555 ATTAAAGGTGTAGGGTTATCTGGTCAAGACTGTGTGTGTGGATACAGGCTCCAACCCCTC 52646614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2410 ATTAAAGGTGTAGGGTTATCTGGTCAAGACTGTGTGTGTGGATACAGGCTCCAACCCCTC 2469

 52646615 CAGGCAAGGGCACTGTTTCCAACATCCACCCTTTCTCCTTTGACCTCTACCTTGACCTAA 52646674
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2470 CAGGCAAGGGCAATGTTTCCAACATCCACCCTTTCTCCTTTGACCTCTACCTTGACCTAA 2529

 52646675 ATTAACTATAAAAGGTCCTTCTTTTCTAGGACCCTACTATAAATCAGTGAAATATTCAGG 52646734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2530 ATTAACTATAAAAGGTCCTTCTTTTCTAGGACCCTACTATAAATCAGTGAAATATTCAGG 2589

 52646735 AAAAAAAGAACACCAAGAATGTTGGGATCCCAGTTAAAGATCAAGATTCTCTACTGATAA 52646794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2590 AAAAAAAGAACACCAAGAATGTTGGGATCCCAGTTAAAGATCAAGATTCTCTACTGATAA 2649

 52646795 GCTGTGTGATATGGAGTAAATCACTAAAGATCTTTGAATCTCTTCATTTGTAAAATGGGA 52646854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2650 GCTGTGTGATATGGAGTAAATCACTAAAGATCTTTGAATCTCTTCATTTGTAAAATGGGA 2709

 52646855 ATATTGGTAGTCCTACTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTAAAGAAGAAAAGTCATGCAAAGG 52646914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2710 ATATTGGTAGTCCTACTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTAAAGAAGAAAAGTCATGCAAAGG 2769

 52646915 ATCTGGCACAACGCCTTTTCCATAATAAGTGCTTAGTAATTGACAGATACTGTGATAACT 52646974
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2770 ATCTGGCACAATGCCTTTTCCATAATAAGTGCTTAGTAATTGACAGATACTGTGATAACT 2829

 52646975 TTTCAGGTTTCTCTCATGCCTTTGACAACATTGCATTTTGCTTGCTCTATCTGTAGTCAG 52647034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2830 TTTCAGGTTTCTCTCATGCCTTTGACAACATTGCATTTTGCTTGCTCTATCTGTAGTCAG 2889

 52647035 ACACTTCTTAATATCTGTTTGCAGGAAGACAGAAAA 52647070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2890 ACACTTCTTAATATCTGTTTGCAGGAAGACAGAAAA 2925

Alignment time is 3.15293 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [52637064,52668002] =>     30939 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    4119] =>      4119 nucs 'mol-32-321f-132474_4119'

Score:        4035
Aligned:      4122        nucs
Identic:      4110 (100%) nucs =>      3799 (100%)       311 (100%)
Gaps:            7 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [52643258,52647064] EXCISED REGION [52658003,52658313]
 second seq =>  [       1,    3808] EXCISED REGION [    3809,    4119]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>     10938 nucs [52647065,52658002]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         6 nucs [52647065,52647070] to [52658003,52658008]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [52647065,52647067] to [52658000,52658002]
 second seq =>         0 nucs

 52643258 TCTCCCATATGCAGGAATATTGACGACTAGTTTACCGCCTCTGGGCACGTAACTTTCAGG 52643317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCTCCCATATGCAGGAATATTGACGACTAGTTTACCGCCTCTGGGCACGTAACTTTCAGG 60

 52643318 TCCTGGTTCATGCATTTGCTGGAATGTTCCCTGGGCCATGGAGCCCAGTTCTCCTGGCAT 52643377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCCTGGTTCATGCATTTGCTGGAATGTTCCCTGGGCCATGGAGCCCAGTTCTCCTGGCAT 120

 52643378 CTGGCATCTCCCCCACACTCTGCTCCCCCAGCACAGCACTTGGCATCTTGCATTGCAATT 52643437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTGGCATCTCCCCCACACTCTGCTCCCCCAGCACAGCACTTGGCATCTTGCATTGCAATT 180

 52643438 GCAGGTTTATTTATTCACTTCTCTCACTGGACAGCAAACTCCACCAGGGCCGAGACTCTG 52643497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCAGGTTTATTTATTCACTTCTCTCACTGGACAGCAAACTCCACCAGGGCCGAGACTCTG 240

 52643498 TGTCTCGCCCTTCACTGTGGTCCCTGTGCCTCACCTGTTCCTAGTACAGTGTCACACTCA 52643557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGTCTCGCCCTTCACTGTGGTCCCTGTGCCTCACCTGTTCCTAGTACAGTGTCACACTCA 300

 52643558 GTAAAGAGCAGATGCCTGG-TGCATTTGGAGACTTATTTTAAATTATACGGAAAGTTATT 52643616
          ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTAAAGAGCAGATGCCTGGATGCATTTGGAGACTTATTTTAAATTATACGGAAAGTTATT 360

 52643617 CAACCGGCTTCTTGAACTGGTGAATTTTGGAAAGTGGGTGTTTGAAGGGAAAATGTTTAA 52643676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CAACCGGCTTCTTGAACTGGTGAATTTTGGAAAGTGGGTGTTTGAAGGGAAAATGTTTAA 420

 52643677 ACTCTGAAAGAAATGTTGGAAATAAGCTCTTTGAATCAAAATGTATAGAAAACACAAGAA 52643736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACTCTGAAAGAAATGTTGGAAATAAGCTCTTTGAATCAAAATGTATAGAAAACACAAGAA 480

 52643737 TGCTGACAGTAAGAGCCTAAAACACATGATGACTATTATCTTTTCCCAATTTTAACTCTC 52643796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGCTGACAGTAAGAGCCTAAAACACATGATGACTATTATCTTTTCCCAATTTTAACTCTC 540

 52643797 CAGAGTGTTCAGCGGTGCCCAGCCTTCATAATGTAATTCTTCGTAGCACCCTGGATGCAT 52643856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CAGAGTGTTCAGCGGTGCCCAGCCTTCATAATGTAATTCTTCGTAGCACCCTGGATGCAT 600

 52643857 TAAAACCATAGATTAACGTGATACTTATTTTCATTAAGGAAAATAATTTACGTACAGTGC 52643916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TAAAACCATAGATTAACGTGATACTTATTTTCATTAAGGAAAATAATTTACGTACAGTGC 660

 52643917 TCAGAGTAGAGCCTGGCACATTGAACATTTTCAATAAATGACAGCAAGTGTAATTATTAG 52643976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCAGAGTAGAGCCTGGCACATTGAACATTTTCAATAAATGACAGCAAGTGTAATTATTAG 720

 52643977 CACTTCGGAAGTGCAAAGTTGCATTGTATTAAGACAAATATATTTGGAGCTCATCCAATT 52644036
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CACTTTGGAAGTGCAAAGTTGCATTGTATTAAGACAAATATATTTGGAGCTCATCCAATT 780

 52644037 TTTTCCTGGCTCTGAAGTCTGCTAGTGGCACTTAACTTTATTCCCAAGTTTTGAAAAATA 52644096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTTTCCTGGCTCTGAAGTCTGCTAGTGGCACTTAACTTTATTCCCAAGTTTTGAAAAATA 840

 52644097 TTGTTATTTAAAAAGTCTGTTAACCAAGGAAATGCATGCCCTAAACCTATAATGTATCAA 52644156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTGTTATTTAAAAAGTCTGTTAACCAAGGAAATGCATGCCCTAAACCTATAATGTATCAA 900

 52644157 GTTTTACTTCCTTCTTCTTTTAAGGAGTTCTTTTCCTGCCTTGAATACAAACAGGCTCTC 52644216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GTTTTACTTCCTTCTTCTTTTAAGGAGTTCTTTTCCTGCCTTGAATACAAACAGGCTCTC 960

 52644217 TCAAGGTTAAAAGCAAATGCTCTTTTTAGTGTCAAAAAGAGCTTGCCTTTCTTCGCTCAG 52644276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TCAAGGTTAAAAGCAAATGCTCTTTTTAGTGTCAAAAAGAGCTTGCCTTTCTTCGCTCAG 1020

 52644277 GAAAAAAAGCAACTGATTCCAGGATACCTTCTTTGAAAACCAACACAAAAAAACCCCCCA 52644336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GAAAAAAAGCAACTGATTCCAGGATACCTTCTTTGAAAACCAACACAAAAAAACCCCCCA 1080

 52644337 AAAAACAAAAAAAAAACCCAAAACCCCTAGTTTTTACAAAGGTTTATTACTCCTACTTGT 52644396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAAAACAAAAAAAAAACCCAAAACCCCTAGTTTTTACAAAGGTTTATTACTCCTACTTGT 1140

 52644397 TGGAAAAGAATTACTACATAAAAGAGTCTGCCCAGAGCTGTAAAATCTCCTTATTCAAAC 52644456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGGAAAAGAATTACTACATAAAAGAGTCTGCCCAGAGCTGTAAAATCTCCTTATTCAAAC 1200

 52644457 ACACACCTTAGAGCAAAAGATGGTTAAATATCAATTCAGGCTATTAACAGTAAGGGAC-- 52644514
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
     1201 ACACACCTTAGAGCAAAAGATGGTTAAATATCAATTCAGGCTATTAACAGTAAGG---AA 1257

 52644515 -GAAATGTGTTCCAACAAAACTCTGCATGTCAACAAACTACAGAGACTAGGTAACATCTT 52644573
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1258 TGAAATGTGTTCCAACAAAACTCTGCATGTCAACAAACTACAGAGACTAGGTAACATCTT 1317

 52644574 TTAGGAATCATTTTTATTCCACTAATGCCTTTTCCTCCAGAATCCACTGATCGTAAACGC 52644633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1318 TTAGGAATCATTTTTATTCCACTAATGCCTTTTCCTCCAGAATCCACTGATCGTAAACGC 1377

 52644634 AACCTGTCTACTTCCGCCTTTGAAAAATGGATGGACAAATTCATCTGCATGTAACTCACC 52644693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1378 AACCTGTCTACTTCCGCCTTTGAAAAATGGATGGACAAATTCATCTGCATGTAACTCACC 1437

 52644694 TCCTCTTTTCTTTTACATAAAACAGATGCCACAGCTGTTATTGTTCTTCACACAGAAGTT 52644753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1438 TCCTCTTTTCTTTTACATAAAACAGATGCCACAGCTGTTATTGTTCTTCACACAGAAGTT 1497

 52644754 TCTACCCAGAGAAACATCAGGATGACACTCTGCTGCAATGTGCTATTTGTTCTAGAGGGG 52644813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1498 TCTACCCAGAGAAACATCAGGATGACACTCTGCTGCAATGTGCTATTTGTTCTAGAGGGG 1557

 52644814 TCAACAGCTTGCCACCTTGCCTAGGCCCAGGGTGACTGCATATGTGCAGTGGTCTTATCC 52644873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1558 TCAACAGCTTGCCACCTTGCCTAGGCCCAGGGTGACTGCATATGTGCAGTGGTCTTATCC 1617

 52644874 CATTAGCGCCCCCGAGCATGCATTCAGAACCAAGTGGATACACCTTGGCACACTTACCTT 52644933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1618 CATTAGCGCCCCCGAGCATGCATTCAGAACCAAGTGGATACACCTTGGCACACTTACCTT 1677

 52644934 CCCTGCAGGGACATCATCGGACTGCCCTGATAAGCCAGGAACCTCATCCACCTTGTCTTG 52644993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1678 CCCTGCAGGGACATCATCGGACTGCCCTGATAAGCCAGGAACCTCATCCACCTTGTCTTG 1737

 52644994 ATGCTCTGCCCTCTTGGCTTCCTGTTGGCTGTCACCTGGCACCTTTTCCTGTCCCTTGTC 52645053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1738 ATGCTCTGCCCTCTTGGCTTCCTGTTGGCTGTCACCTGGCACCTTTTCCTGTCCCTTGTC 1797

 52645054 CAGCTTGAAGAATTTGTCAAAAAAGCTGGAGTCCTTGGGCTTGGAGGGAGCTTCTCCTCC 52645113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1798 CAGCTTGAAGAATTTGTCAAAAAAGCTGGAGTCCTTGGGCTTGGAGGGAGCTTCTCCTCC 1857

 52645114 TGCTCCCCCTGTCTCAGGTGGGAGAAGCGTGGGATCCCTGGCGGCAGAGAGGACCTTGTC 52645173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1858 TGCTCCCCCTGTCTCAGGTGGGAGAAGCGTGGGATCCCTGGCGGCAGAGAGGACCTTGTC 1917

 52645174 TTGGGCCGGGGCGTGCCCTGGGGTTTTATCTGTGTCCTGCCCCGGTCCAGCTGCCACCGG 52645233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1918 TTGGGCCGGGGCGTGCCCTGGGGTTTTATCTGTGTCCTGCCCCGGTCCAGCTGCCACCGG 1977

 52645234 AAGTGTCCAGCTCTCACTTGGGTCTTTGTTCGCTGGAGCTTTATTGGAGCTGACATCAAG 52645293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1978 AAGTGTCCAGCTCTCACTTGGGTCTTTGTTCGCTGGAGCTTTATTGGAGCTGACATCAAG 2037

 52645294 CTTCACTGATCCAAGGGATGAATCTGCGGCTTGGTCTCCGGTACGTCCTGGTACAGGCCG 52645353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2038 CTTCACTGATCCAAGGGATGAATCTGCGGCTTGGTCTCCGGTACGTCCTGGTACAGGCCG 2097

 52645354 AGAGAGCATCAAGAAAAAACGAGATTTAGCAGCTGGTGCCTCGGGTTTGGCCTCTTTCCC 52645413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2098 AGAGAGCATCAAGAAAAAACGAGATTTAGCAGCTGGTGCCTCGGGTTTGGCCTCTTTCCC 2157

 52645414 AAGATTCTTTCCGTTGGCATCCGCAACAGCACTTATCTCCGTTGTCTCGGGGGAAGAAGT 52645473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2158 AAGATTCTTTCCGTTGGCATCCGCAACAGCACTTATCTCCGTTGTCTCGGGGGAAGAAGT 2217

 52645474 GGCCACATTATCCGTCTTGACACTTATTCCCAAGTCGACTGTAAACACAAACATAAACAG 52645533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2218 GGCCACATTATCCGTCTTGACACTTATTCCCAAGTCGACTGTAAACACAAACATAAACAG 2277

 52645534 TGGTTATTCAGCCAAGCCGGGAAATTCAGGCACTAATAATGGACTCCAGACATTTTTTAT 52645593
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2278 CGGTTATTCAGCCAAGCCGGGAAATTCAGGCACTAATAATGGACTCCAGACATTTTTTAT 2337

 52645594 ACAAAAGCCATACTGCATACTGGAACTGTGTTGTTCTCTGGTCATTCTGAAAGGCAGAAG 52645653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2338 ACAAAAGCCATACTGCATACTGGAACTGTGTTGTTCTCTGGTCATTCTGAAAGGCAGAAG 2397

 52645654 TTAGCTCTCTACATCTCCTTGGACCCTGCTTTTCTTGGGAGAGGAGAAGGCAAGGTTGGT 52645713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2398 TTAGCTCTCTACATCTCCTTGGACCCTGCTTTTCTTGGGAGAGGAGAAGGCAAGGTTGGT 2457

 52645714 GAGGAGGGAAAGCTACTTAATGGAAAGTCACTAGCTGCCAGGTGTGGAATGAGTGATATT 52645773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2458 GAGGAGGGAAAGCTACTTAATGGAAAGTCACTAGCTGCCAGGTGTGGAATGAGTGATATT 2517

 52645774 CAATGTTAATTAATCTTCTTTTATCTGTGTAAGAACTCCGTGAGCAGCATATTGTCATGA 52645833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2518 CAATGTTAATTAATCTTCTTTTATCTGTGTAAGAACTCCGTGAGCAGCATATTGTCATGA 2577

 52645834 TGTCAACTGGGAGGCAGTACAGCAGTTAGGAGCTTGGGTTCTGGAGCTAGAACAAGGTTT 52645893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2578 TGTCAACTGGGAGGCAGTACAGCAGTTAGGAGCTTGGGTTCTGGAGCTAGAACAAGGTTT 2637

 52645894 CTCAACCTCAGCACTACTCACATTTGAAGCCAGATTATTCTTTGTTAGGGAGGCTCATCC 52645953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2638 CTCAACCTCAGCACTACTCACATTTGAAGCCAGATTATTCTTTGTTAGGGAGGCTCATCC 2697

 52645954 CGTGCCTCATAGGCTGATTAGCAGCATCCTGGCCTCTGCCCACTAGACGCCGGTCACATT 52646013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2698 CGTGCCTCATAGGCTGATTAGCAGCATCCTGGCCTCTGCCCACTAGACGCCGGTCACATT 2757

 52646014 TCCCAGTCATGGCAACCAAAAATATCTCTAGGCATTGCTAAATGTCCCCTGGAGGACAAA 52646073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2758 TCCCAGTCATGGCAACCAAAAATATCTCTAGGCATTGCTAAATGTCCCCTGGAGGACAAA 2817

 52646074 ATCTCTTACGTTTGAGAGGCACTGAGCTGAAATGTCTTTTTGAATCCAGATTATCTAATT 52646133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2818 ATCTCTTACGTTTGAGAGGCACTGAGCTGAAATGTCTTTTTGAATCCAGATTATCTAATT 2877

 52646134 TTCTGTGCCTCAACTTTCTGGTAAAAGGAGACAGATAATAAATCTCGTAATTTTGTTAGG 52646193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2878 TTCTGTGCCTCAACTTTCTGGTAAAAGGAGACAGATAATAAATCTCGTAATTTTGTTAGG 2937

 52646194 AAGATTACATGAGTTAATAGTTTTAAAGCAAGTACAATAGCACCTGGAATATATTAAGTG 52646253
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     2938 AAGATTACATGAGTTAATAGTTTTAAAGCAAGTACAATAGCGCCTGGAATATATTAAGTG 2997

 52646254 CTTAATAAATATCACAAACATTAGTTATCATTATTCATGAGTGAGAAAACTGACAGTCAG 52646313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2998 CTTAATAAATATCACAAACATTAGTTATCATTATTCATGAGTGAGAAAACTGACAGTCAG 3057

 52646314 AGAGGTCAGTACACCCTCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCTAGTAAGCAGCAGAGTCTGGCTT 52646373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3058 AGAGGTCAGTACACCCTCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCTAGTAAGCAGCAGAGTCTGGCTT 3117

 52646374 CAGGCAGAAATCTGACTTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGTCTTACCAGGGACTTGTATTAG 52646433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3118 CAGGCAGAAATCTGACTTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGTCTTACCAGGGACTTGTATTAG 3177

 52646434 CATAGACTGTTAAGAATATGGGAAGATTTTTAAAATACAGTACTCAGAAAATTTCTCTTT 52646493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3178 CATAGACTGTTAAGAATATGGGAAGATTTTTAAAATACAGTACTCAGAAAATTTCTCTTT 3237

 52646494 GAAAGGCTGGAAGAGCAGATATCCACACAAGAAGGCAAATTAGACCTCAGGCCAGTGTGG 52646553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3238 GAAAGGCTGGAAGAGCAGATATCCACACAAGAAGGCAAATTAGACCTCAGGCCAGTGTGG 3297

 52646554 AATTAAAGGTGTAGGGTTATCTGGTCAAGACTGTGTGTGTGGATACAGGCTCCAACCCCT 52646613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3298 AATTAAAGGTGTAGGGTTATCTGGTCAAGACTGTGTGTGTGGATACAGGCTCCAACCCCT 3357

 52646614 CCAGGCAAGGGCACTGTTTCCAACATCCACCCTTTCTCCTTTGACCTCTACCTTGACCTA 52646673
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3358 CCAGGCAAGGGCAATGTTTCCAACATCCACCCTTTCTCCTTTGACCTCTACCTTGACCTA 3417

 52646674 AATTAACTATAAAAGGTCCTTCTTTTCTAGGACCCTACTATAAATCAGTGAAATATTCAG 52646733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3418 AATTAACTATAAAAGGTCCTTCTTTTCTAGGACCCTACTATAAATCAGTGAAATATTCAG 3477

 52646734 GAAAAAAAGAACACCAAGAATGTTGGGATCCCAGTTAAAGATCAAGATTCTCTACTGATA 52646793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3478 GAAAAAAAGAACACCAAGAATGTTGGGATCCCAGTTAAAGATCAAGATTCTCTACTGATA 3537

 52646794 AGCTGTGTGATATGGAGTAAATCACTAAAGATCTTTGAATCTCTTCATTTGTAAAATGGG 52646853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3538 AGCTGTGTGATATGGAGTAAATCACTAAAGATCTTTGAATCTCTTCATTTGTAAAATGGG 3597

 52646854 AATATTGGTAGTCCTACTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTAAAGAAGAAAAGTCATGCAAAG 52646913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3598 AATATTGGTAGTCCTACTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTAAAGAAGAAAAGTCATGCAAAG 3657

 52646914 GATCTGGCACAACGCCTTTTCCATAATAAGTGCTTAGTAATTGACAGATACTGTGATAAC 52646973
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3658 GATCTGGCACAATGCCTTTTCCATAATAAGTGCTTAGTAATTGACAGATACTGTGATAAC 3717

 52646974 TTTTCAGGTTTCTCTCATGCCTTTGACAACATTGCATTTTGCTTGCTCTATCTGTAGTCA 52647033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3718 TTTTCAGGTTTCTCTCATGCCTTTGACAACATTGCATTTTGCTTGCTCTATCTGTAGTCA 3777

 52647034 GACACTTCTTAATATCTGTTTGCAGGAAGAC 52647064
          |||||||||||||||||||||||||||||||
     3778 GACACTTCTTAATATCTGTTTGCAGGAAGAC 3808

EXCISED REGION

 52658003 AGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTG 52658062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3809 AGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTG 3868

 52658063 GCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTAT 52658122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3869 GCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTAT 3928

 52658123 AAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGG 52658182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3929 AAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGG 3988

 52658183 GAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTG 52658242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3989 GAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTG 4048

 52658243 AAACACTGTCTCTGCTAAAAAACAAAACAAAACAAAACACCAAAAAATAGCTGGGCGTAG 52658302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4049 AAACACTGTCTCTGCTAAAAAACAAAACAAAACAAAACACCAAAAAATAGCTGGGCGTAG 4108

 52658303 TGGCGGGCGCC 52658313
          |||||||||||
     4109 TGGCGGGCGCC 4119

Alignment time is 4.4461 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [52637064,52668002] =>     30939 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    6308] =>      6308 nucs 'mol-32-321f-293003_6308'

Score:        6308
Aligned:      6308        nucs
Identic:      6308 (100%) nucs =>      2169 (100%)      4139 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [52656280,52658448] EXCISED REGION [52658454,52662592]
 second seq =>  [       1,    2169] EXCISED REGION [    2170,    6308]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         5 nucs [52658449,52658453]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        17 nucs [52658449,52658465] to [52658454,52658470]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [52658449,52658450] to [52658452,52658453]
 second seq =>         0 nucs

 52656280 ATAATTAATCTCTCTGAACCCTTTGTTTTTCCTGTCTCTATCCTCCACCCTCATTGCCAG 52656339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATAATTAATCTCTCTGAACCCTTTGTTTTTCCTGTCTCTATCCTCCACCCTCATTGCCAG 60

 52656340 ATAAATAACATCTGCAACCTGATGTGGCATATTGAACTTTGTTTATACTCACACAAACAC 52656399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATAAATAACATCTGCAACCTGATGTGGCATATTGAACTTTGTTTATACTCACACAAACAC 120

 52656400 GTATAAGCATCCCAGATACACATATACAGGGACTGTATCTGTCCTTGTTGTTTTTATAGA 52656459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTATAAGCATCCCAGATACACATATACAGGGACTGTATCTGTCCTTGTTGTTTTTATAGA 180

 52656460 AATTGGATCACATTAGACATATTTTCTGATGACTTTTGTACATTATAGTTGGTCTTCACA 52656519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AATTGGATCACATTAGACATATTTTCTGATGACTTTTGTACATTATAGTTGGTCTTCACA 240

 52656520 GTCAATAGCTCCAAAGCTATCTTATCTTCTAAAATAGCTGCATAATATTCCTCAGTATGG 52656579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTCAATAGCTCCAAAGCTATCTTATCTTCTAAAATAGCTGCATAATATTCCTCAGTATGG 300

 52656580 ATATACCAAAAGATATTTAAACCATTGCCTAATCAATGAATATCCTGGTAGTTTCCACAT 52656639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATATACCAAAAGATATTTAAACCATTGCCTAATCAATGAATATCCTGGTAGTTTCCACAT 360

 52656640 TGTTTTTTCCATTTCCACTATAGTGGAATAAACTTTCGTGTTCAAAAATCCTAAACTGGT 52656699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGTTTTTTCCATTTCCACTATAGTGGAATAAACTTTCGTGTTCAAAAATCCTAAACTGGT 420

 52656700 GCTATATTTCTATAGAATAGAGGCACAGATGTAGAAGTGTTACCCTCAAATCAATATGCA 52656759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GCTATATTTCTATAGAATAGAGGCACAGATGTAGAAGTGTTACCCTCAAATCAATATGCA 480

 52656760 TTTAGTTTTGAAAAACAGACACTGCCATATTATTTTCTTAAAAAGGCTCTACAGATTCAC 52656819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTAGTTTTGAAAAACAGACACTGCCATATTATTTTCTTAAAAAGGCTCTACAGATTCAC 540

 52656820 ATTTCCAGCAGCAATGAGTGTCTCAAGCACCTTTTAAGTGGTAAGCAGCTTACCAGGGGA 52656879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATTTCCAGCAGCAATGAGTGTCTCAAGCACCTTTTAAGTGGTAAGCAGCTTACCAGGGGA 600

 52656880 GGTGGCCTATTATTCTATCAGTGGCTTCAGTTGTTAGGACACCACGGGTCAGCTGTGGAG 52656939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GGTGGCCTATTATTCTATCAGTGGCTTCAGTTGTTAGGACACCACGGGTCAGCTGTGGAG 660

 52656940 ATACGGTTGTGGGGCAGGTTGAGTTCAGGACACATAGAAGATTGCCAAAGGGTGACTATT 52656999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATACGGTTGTGGGGCAGGTTGAGTTCAGGACACATAGAAGATTGCCAAAGGGTGACTATT 720

 52657000 ATTACTTTGAGACTCTGGAAAAATTAGCCAGGAAACAGAGACAAGAGGCTCAGGGTGCAG 52657059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATTACTTTGAGACTCTGGAAAAATTAGCCAGGAAACAGAGACAAGAGGCTCAGGGTGCAG 780

 52657060 CAAAGCAGCCAAATCAGGATGATAGTGTTTTCTTTGGAGCAGATATACTAATGGCCAAGG 52657119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CAAAGCAGCCAAATCAGGATGATAGTGTTTTCTTTGGAGCAGATATACTAATGGCCAAGG 840

 52657120 AACTCATAAAAAGATGCCTAATGTCATCTCATTAGGGAAGTGCAGTCAAAGCCACAGCAT 52657179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AACTCATAAAAAGATGCCTAATGTCATCTCATTAGGGAAGTGCAGTCAAAGCCACAGCAT 900

 52657180 GATACGTCTTCACACCCACGAGGATGGCCATAATCAGAGAGACAATAACCAGTGGTAGGG 52657239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GATACGTCTTCACACCCACGAGGATGGCCATAATCAGAGAGACAATAACCAGTGGTAGGG 960

 52657240 AAGATGTGAAAAAATCGGAATGCTCATGCATTGCTGGTAGGAATGTGACATGGTGCAGCT 52657299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AAGATGTGAAAAAATCGGAATGCTCATGCATTGCTGGTAGGAATGTGACATGGTGCAGCT 1020

 52657300 GCTTTGGAAAGCAGTTTAACAGTTCCTGGAAAAGTTAAACATGGAGTTACCCTAAGACCC 52657359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GCTTTGGAAAGCAGTTTAACAGTTCCTGGAAAAGTTAAACATGGAGTTACCCTAAGACCC 1080

 52657360 AGCAATTCCATTCCTAGGTAAGCAAGAAAATGAAAACATATGGCCACACAAAAACTTGTA 52657419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AGCAATTCCATTCCTAGGTAAGCAAGAAAATGAAAACATATGGCCACACAAAAACTTGTA 1140

 52657420 CACAAATGTCCATAGCAGCATTTTCATAATAGCTGAAAAGTGGAAACAACCCAAATATCC 52657479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CACAAATGTCCATAGCAGCATTTTCATAATAGCTGAAAAGTGGAAACAACCCAAATATCC 1200

 52657480 ATCAATTGGAAAAAGGAAATCTAGCATTTGCATATAATAGAGTATTAATCAGCCATAAGA 52657539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATCAATTGGAAAAAGGAAATCTAGCATTTGCATATAATAGAGTATTAATCAGCCATAAGA 1260

 52657540 AGAAACAAAGCACCGATCCATGTTATATCATGCTTTATACTTGGAAGCATGGTACTAAGT 52657599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AGAAACAAAGCACCGATCCATGTTATATCATGCTTTATACTTGGAAGCATGGTACTAAGT 1320

 52657600 GAAAGACGCCAGACACAAAAAGCAAAATATTGTATGATTCCATTTATATAAAGTGTCTAG 52657659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GAAAGACGCCAGACACAAAAAGCAAAATATTGTATGATTCCATTTATATAAAGTGTCTAG 1380

 52657660 AATAGGCAAATCCATAGAGGCAGAAAACAGATTAGTGGTTGCCAGTGGCTGGGAATAGGG 52657719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AATAGGCAAATCCATAGAGGCAGAAAACAGATTAGTGGTTGCCAGTGGCTGGGAATAGGG 1440

 52657720 AAAAAACTCAGCGCTAAAGGGTAGGGAGTTTTGTTTTGGAGTAATGACGATGTTCTGGAA 52657779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AAAAAACTCAGCGCTAAAGGGTAGGGAGTTTTGTTTTGGAGTAATGACGATGTTCTGGAA 1500

 52657780 TTAGACGTGGAACGATTGCACACATGGTGCAAATATCCTTAAAATCACGGAATTGTCACT 52657839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTAGACGTGGAACGATTGCACACATGGTGCAAATATCCTTAAAATCACGGAATTGTCACT 1560

 52657840 CTAAAAGGTGAATTTTATGGTAGGTGAATTGTACCTCAATTTGTAAAAAGAAGAATTAGA 52657899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CTAAAAGGTGAATTTTATGGTAGGTGAATTGTACCTCAATTTGTAAAAAGAAGAATTAGA 1620

 52657900 TAAATAAACAGCAACACAGCACCAAGGGGTGGGGGTAGGAAACAGACAACAAATAGGAGT 52657959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TAAATAAACAGCAACACAGCACCAAGGGGTGGGGGTAGGAAACAGACAACAAATAGGAGT 1680

 52657960 GAAGAGTTCACAGGAAAAGACATGCAGCCAGCTTTTAAGCAGAAGAAAAGATGTTTGGCC 52658019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GAAGAGTTCACAGGAAAAGACATGCAGCCAGCTTTTAAGCAGAAGAAAAGATGTTTGGCC 1740

 52658020 TCATAAATAGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTGGCTTTCCCTTGCCAAAT 52658079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TCATAAATAGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTGGCTTTCCCTTGCCAAAT 1800

 52658080 TGGTTAAAAAGGAGACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTATAAAAAAAGAGCAGCTGT 52658139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TGGTTAAAAAGGAGACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTATAAAAAAAGAGCAGCTGT 1860

 52658140 GGCTGGGTACGGTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCAA 52658199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GGCTGGGTACGGTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCAA 1920

 52658200 ATCATGAGGTAAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACACTGTCTCTGCTA 52658259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ATCATGAGGTAAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACACTGTCTCTGCTA 1980

 52658260 AAAAACAAAACAAAACAAAACACCAAAAAATAGCTGGGCGTAGTGGCGGGCGCCTGTAAT 52658319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AAAAACAAAACAAAACAAAACACCAAAAAATAGCTGGGCGTAGTGGCGGGCGCCTGTAAT 2040

 52658320 CTCAGCTACTTGGGAGGCGGTGGCAGGAGAATCATTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCA 52658379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CTCAGCTACTTGGGAGGCGGTGGCAGGAGAATCATTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCA 2100

 52658380 GTGAGCCGAGATTGTGCCACTGCACTCTAACCTGGGCAACAGAGTTCAGAGTGAGACTCT 52658439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GTGAGCCGAGATTGTGCCACTGCACTCTAACCTGGGCAACAGAGTTCAGAGTGAGACTCT 2160

 52658440 GTCTCCCCC 52658448
          |||||||||
     2161 GTCTCCCCC 2169

EXCISED REGION

 52658454 AAAAAAAAAAAAAAAAAGAACAGCCATATAGATCGTCGGTGGGAGTGTAATTTGGCCACT 52658513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2170 AAAAAAAAAAAAAAAAAGAACAGCCATATAGATCGTCGGTGGGAGTGTAATTTGGCCACT 2229

 52658514 TCTTTGGAAAATAGCTCAGTAATATCTATTAATACTTAAAATTTCACAAACACTGTAAGT 52658573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2230 TCTTTGGAAAATAGCTCAGTAATATCTATTAATACTTAAAATTTCACAAACACTGTAAGT 2289

 52658574 CTAACTTCCACTTCTAAAATGTTATCCTAGAAATAAAATTGCATAGGGGTACAAAGGCTT 52658633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2290 CTAACTTCCACTTCTAAAATGTTATCCTAGAAATAAAATTGCATAGGGGTACAAAGGCTT 2349

 52658634 ACGTATGGAACTATTTGCTGGACTACTGTAGTTGTGGCAAAAAACTGGAAATGACCTAAA 52658693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2350 ACGTATGGAACTATTTGCTGGACTACTGTAGTTGTGGCAAAAAACTGGAAATGACCTAAA 2409

 52658694 CGCTTATTAGTAGAAACCTGGTTAAATAAATTATCATATGTCCTTGAGGACACAGGGACA 52658753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2410 CGCTTATTAGTAGAAACCTGGTTAAATAAATTATCATATGTCCTTGAGGACACAGGGACA 2469

 52658754 CAAAGAGGGGAATGACAGGCACTGAGCCTACTTGAGGGTGGGAGGAGGAAGTCGATCAGA 52658813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2470 CAAAGAGGGGAATGACAGGCACTGAGCCTACTTGAGGGTGGGAGGAGGAAGTCGATCAGA 2529

 52658814 AAAAATAACTAGTGGGTACTAGGCTTAGTACCCGGGTGAAAAAATAATCTGTACAACAAA 52658873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2530 AAAAATAACTAGTGGGTACTAGGCTTAGTACCCGGGTGAAAAAATAATCTGTACAACAAA 2589

 52658874 CCCCCATGACATGAGTTTACCTTATAACAAACCTGCACATGTAATCTGAACCTAGATAAA 52658933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2590 CCCCCATGACATGAGTTTACCTTATAACAAACCTGCACATGTAATCTGAACCTAGATAAA 2649

 52658934 AGTTTAAAAAAATAAATAATCATATGTCCCTACAATGAAATATTCCACAGGCATTAAAAT 52658993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2650 AGTTTAAAAAAATAAATAATCATATGTCCCTACAATGAAATATTCCACAGGCATTAAAAT 2709

 52658994 TCCCCAAGGAATTTTAGTAAGGAAAGAAAAAGCTGTGCCCAACAGCACGTACAGTATGTT 52659053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2710 TCCCCAAGGAATTTTAGTAAGGAAAGAAAAAGCTGTGCCCAACAGCACGTACAGTATGTT 2769

 52659054 TCCATTTGTTTTTAAAAAATGGTGTCGGGAGGTTGAGGAGACAACTTATAAATAGACATG 52659113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2770 TCCATTTGTTTTTAAAAAATGGTGTCGGGAGGTTGAGGAGACAACTTATAAATAGACATG 2829

 52659114 CCTGGGATACCTCTGGATATAAGAAACTGTAAAGTATTTACTTCTAAGGAAGGAAATTTG 52659173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2830 CCTGGGATACCTCTGGATATAAGAAACTGTAAAGTATTTACTTCTAAGGAAGGAAATTTG 2889

 52659174 GGATGGGGCTTGGGGAGCCATCAGAGTTAGGGTGGGGATTTTTTCTCTGCCTTATCTTAT 52659233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2890 GGATGGGGCTTGGGGAGCCATCAGAGTTAGGGTGGGGATTTTTTCTCTGCCTTATCTTAT 2949

 52659234 TATGTATATCGCTCAGAATGTTTGCTATGTGTATGCACCTACCCCATCCATTAAGAAATG 52659293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2950 TATGTATATCGCTCAGAATGTTTGCTATGTGTATGCACCTACCCCATCCATTAAGAAATG 3009

 52659294 AAGAAATAATGAAAAGAAAAAATGAAAGTAGGGAACTAGAAATGAGAGGTGGGATTCAAA 52659353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3010 AAGAAATAATGAAAAGAAAAAATGAAAGTAGGGAACTAGAAATGAGAGGTGGGATTCAAA 3069

 52659354 GTGGACTGAACACTTGACCTATTTCCCAATTTGCCTAGGGCTGGCCCAGCAGCGAGGCAG 52659413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3070 GTGGACTGAACACTTGACCTATTTCCCAATTTGCCTAGGGCTGGCCCAGCAGCGAGGCAG 3129

 52659414 GTTCTAACCAATGAGCATCAGCTTTGAATGGAGGGGCTGATAGGCCAGGTGGGCCCTGCT 52659473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3130 GTTCTAACCAATGAGCATCAGCTTTGAATGGAGGGGCTGATAGGCCAGGTGGGCCCTGCT 3189

 52659474 TGCTGAGAGTGTCATGGCCTTAGGGACATCTCCATGTTGCAGAGTCTGAGCCTCTGCTTG 52659533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3190 TGCTGAGAGTGTCATGGCCTTAGGGACATCTCCATGTTGCAGAGTCTGAGCCTCTGCTTG 3249

 52659534 GCAAATTCAGAAAATCCAGCTTTTCTTTTTATATCACCTGGAGCTGATGTAACTCTCAGA 52659593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3250 GCAAATTCAGAAAATCCAGCTTTTCTTTTTATATCACCTGGAGCTGATGTAACTCTCAGA 3309

 52659594 AGGCATTTTTAAGAGGACTCATGAATTAACCACATAGCCAACTTACTGGCTTAAGACTAC 52659653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3310 AGGCATTTTTAAGAGGACTCATGAATTAACCACATAGCCAACTTACTGGCTTAAGACTAC 3369

 52659654 GTGACAGAAAGCTGCAAAGGGGGCCAGCCACTGGTAACATCCCACCACTGTCCCTCTCTG 52659713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3370 GTGACAGAAAGCTGCAAAGGGGGCCAGCCACTGGTAACATCCCACCACTGTCCCTCTCTG 3429

 52659714 TGGAAAACACAGATGGGATGCACATTGTGACGGGCAGGATGCCTGGAGAGCCCACAAATC 52659773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3430 TGGAAAACACAGATGGGATGCACATTGTGACGGGCAGGATGCCTGGAGAGCCCACAAATC 3489

 52659774 TGCAAGCACAGCTGAAATTGGTTACAGGATTTCAATGTTTCATTGCTTGAAGCTATGATA 52659833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3490 TGCAAGCACAGCTGAAATTGGTTACAGGATTTCAATGTTTCATTGCTTGAAGCTATGATA 3549

 52659834 ACTTGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGACGATGATTTTTTTTATAGCCATCT 52659893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3550 ACTTGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGACGATGATTTTTTTTATAGCCATCT 3609

 52659894 TTTTAGAGGGATTTGAGGTAGGGAAAAAAATAAACCTCACACTATCGGAGGTTGCCAACT 52659953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3610 TTTTAGAGGGATTTGAGGTAGGGAAAAAAATAAACCTCACACTATCGGAGGTTGCCAACT 3669

 52659954 ATGAGGTCTGCTGATGGTTTGGCCAACACAGTGTTTATATTTTTTTGAATTGGGAAATTT 52660013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3670 ATGAGGTCTGCTGATGGTTTGGCCAACACAGTGTTTATATTTTTTTGAATTGGGAAATTT 3729

 52660014 CATTTAAAAGTCCTAAAATCAGGCTGTTATTGAAATATCTTATTATTGGCTCAGGGTTTC 52660073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3730 CATTTAAAAGTCCTAAAATCAGGCTGTTATTGAAATATCTTATTATTGGCTCAGGGTTTC 3789

 52660074 CCAGGGCAGCCATCCTTGAAGCTGTGTGGAGCCCTATAAACAAGGACGCTTTCCAGTTCC 52660133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3790 CCAGGGCAGCCATCCTTGAAGCTGTGTGGAGCCCTATAAACAAGGACGCTTTCCAGTTCC 3849

 52660134 CTGCAAACTCCATTTCATTCAGAGCCTTGAGCCAGTTCTTACATGGTCCTCAGACTTGAG 52660193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3850 CTGCAAACTCCATTTCATTCAGAGCCTTGAGCCAGTTCTTACATGGTCCTCAGACTTGAG 3909

 52660194 CTAGTGCAAGAATACCCGGGAGGGGTTGTGGGAACAGATAGCTGGGCCCCACCCCCAGGG 52660253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3910 CTAGTGCAAGAATACCCGGGAGGGGTTGTGGGAACAGATAGCTGGGCCCCACCCCCAGGG 3969

 52660254 AAGGGGGTGTTTCTGACTCAGGAGGTCTGGGCTCCGGCTACAGAAACTGCACATCTAACC 52660313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3970 AAGGGGGTGTTTCTGACTCAGGAGGTCTGGGCTCCGGCTACAGAAACTGCACATCTAACC 4029

 52660314 GGTACCCAGGTGATGTGATGCTGCTGGCCCAGGGACAACTCTGCGAGTCACTGCTATTGG 52660373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4030 GGTACCCAGGTGATGTGATGCTGCTGGCCCAGGGACAACTCTGCGAGTCACTGCTATTGG 4089

 52660374 GCACTGCTATTGCACCCACACAAGGAGGCAGGCTCTGCTTACATTTTTCAGTTCTTGTTC 52660433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4090 GCACTGCTATTGCACCCACACAAGGAGGCAGGCTCTGCTTACATTTTTCAGTTCTTGTTC 4149

 52660434 CCAGAAACATTTGCTCTTTGGGGTATGCTTTGCATATAATGGATCCTACCCACTAATACA 52660493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4150 CCAGAAACATTTGCTCTTTGGGGTATGCTTTGCATATAATGGATCCTACCCACTAATACA 4209

 52660494 GTATGCTGCTTTTATTGATAAACTTCCAGAAACTTGAAGCGCACCTTACCATTTCTTTGA 52660553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4210 GTATGCTGCTTTTATTGATAAACTTCCAGAAACTTGAAGCGCACCTTACCATTTCTTTGA 4269

 52660554 TCTCGCTGATTATTTTTATTTTTGTTAAATGAAAATTGTTGGTAAGTTCTTTTTGGTGTG 52660613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4270 TCTCGCTGATTATTTTTATTTTTGTTAAATGAAAATTGTTGGTAAGTTCTTTTTGGTGTG 4329

 52660614 GTAAAAGGATATGAAAAGCTGATTTTAAAAAAATGTCCACTCTAGGATTAGAATTGTAGG 52660673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4330 GTAAAAGGATATGAAAAGCTGATTTTAAAAAAATGTCCACTCTAGGATTAGAATTGTAGG 4389

 52660674 TGTGTTTATTCTATTTCAAGATCTGGTTAAAATGCACCTTGAGGAAAAGAATTGAGTGCA 52660733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4390 TGTGTTTATTCTATTTCAAGATCTGGTTAAAATGCACCTTGAGGAAAAGAATTGAGTGCA 4449

 52660734 GCTGTTGTTATTTCTCAATGCTGTTTCTCTTTTCATGTTTTTTTCATGTTGTCTCTTGGT 52660793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4450 GCTGTTGTTATTTCTCAATGCTGTTTCTCTTTTCATGTTTTTTTCATGTTGTCTCTTGGT 4509

 52660794 CTGTCCTATCTCTCTTGGTCTATCCTCCAAGACAGAGATGAGTGATCTTGAAACCCTGCC 52660853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4510 CTGTCCTATCTCTCTTGGTCTATCCTCCAAGACAGAGATGAGTGATCTTGAAACCCTGCC 4569

 52660854 CATGTTTTTATCTTTGGAGCCCAACTGTGCTGCCTTGTTTTCTTCTCCATCCAAAGAGGC 52660913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4570 CATGTTTTTATCTTTGGAGCCCAACTGTGCTGCCTTGTTTTCTTCTCCATCCAAAGAGGC 4629

 52660914 AAAGAGAAAGTTGCATATTACTCAACAGCAGTTGCATGACAGTTAAAATCAGACTGTATG 52660973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4630 AAAGAGAAAGTTGCATATTACTCAACAGCAGTTGCATGACAGTTAAAATCAGACTGTATG 4689

 52660974 AGTCATGGAACAGTAAGTTGTGTCCAGAGTATCTGTCATGGTAAGTACAAAAAAGTCCTT 52661033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4690 AGTCATGGAACAGTAAGTTGTGTCCAGAGTATCTGTCATGGTAAGTACAAAAAAGTCCTT 4749

 52661034 AAAAATTTAAAACAGAAATGCCAATGTTTTATTTTTGAAAAATGTGAAGAAGAAATTTTC 52661093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4750 AAAAATTTAAAACAGAAATGCCAATGTTTTATTTTTGAAAAATGTGAAGAAGAAATTTTC 4809

 52661094 CGGCCGGGCGCGGTGGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAG 52661153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4810 CGGCCGGGCGCGGTGGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAG 4869

 52661154 ATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACACAGTGCAACCCCATCTCTAC 52661213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4870 ATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACACAGTGCAACCCCATCTCTAC 4929

 52661214 TAAAAATACAAAAATTAGCCAGATGCGGTGGCACGCGCCTGTAATCTCAGCTACTAGGGA 52661273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4930 TAAAAATACAAAAATTAGCCAGATGCGGTGGCACGCGCCTGTAATCTCAGCTACTAGGGA 4989

 52661274 GGCTGAGGCATGACAATCGCTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCAT 52661333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4990 GGCTGAGGCATGACAATCGCTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCAT 5049

 52661334 ACCACTGCACTCCAGCTTGGGCAGCGGAAGGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAGAAAAA 52661393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5050 ACCACTGCACTCCAGCTTGGGCAGCGGAAGGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAGAAAAA 5109

 52661394 AAGAAATTTTCTAAGTGTATTCCAAATAACTTTTAATATTGGATAAACATTACGAGTTTA 52661453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5110 AAGAAATTTTCTAAGTGTATTCCAAATAACTTTTAATATTGGATAAACATTACGAGTTTA 5169

 52661454 AAAATACTTATGCCAGAGGAGTGCTGTGACTCGTGCCTCTAATCCCAGCAATGTGGGAGG 52661513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5170 AAAATACTTATGCCAGAGGAGTGCTGTGACTCGTGCCTCTAATCCCAGCAATGTGGGAGG 5229

 52661514 CCAAGGAGGGACAGTCACTTGAGCCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGATAACAAAGGGAG 52661573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5230 CCAAGGAGGGACAGTCACTTGAGCCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGATAACAAAGGGAG 5289

 52661574 ACCTCATCTTTACAAAAAAACTAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGTGTGTGCCTGTGATC 52661633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5290 ACCTCATCTTTACAAAAAAACTAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGTGTGTGCCTGTGATC 5349

 52661634 CCAGCTACACAGGAGGCTGAGGCAAGAGGATTCCTTGAGCCCTGGAGGTCAAGGCTGCAG 52661693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5350 CCAGCTACACAGGAGGCTGAGGCAAGAGGATTCCTTGAGCCCTGGAGGTCAAGGCTGCAG 5409

 52661694 TGAGTGATGATCATGCCATTGCACTCCAGCTGGGTGACAGAGCAAGACCTCATCTCAAAA 52661753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5410 TGAGTGATGATCATGCCATTGCACTCCAGCTGGGTGACAGAGCAAGACCTCATCTCAAAA 5469

 52661754 AAAAAAAAAAAACAAAACAAAACAAAAAACTTACGCCCAGGTAAAAATTGTCAGAGAAAA 52661813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5470 AAAAAAAAAAAACAAAACAAAACAAAAAACTTACGCCCAGGTAAAAATTGTCAGAGAAAA 5529

 52661814 ATAAGAAAAAAACTGAATGCCCAAAATTAGCATAATGGCTGAATGAATTATAGTATGTCT 52661873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5530 ATAAGAAAAAAACTGAATGCCCAAAATTAGCATAATGGCTGAATGAATTATAGTATGTCT 5589

 52661874 ATACCTTGAAGTACATTGTAGCTTTAAAAAAAATGAATTAAAGTTATACCAGTTGAATTT 52661933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5590 ATACCTTGAAGTACATTGTAGCTTTAAAAAAAATGAATTAAAGTTATACCAGTTGAATTT 5649

 52661934 GGAGTTGAGATGGGGAAGATTATTACAATTAAAAAAAAACAAACACTATTAATGGATGTG 52661993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5650 GGAGTTGAGATGGGGAAGATTATTACAATTAAAAAAAAACAAACACTATTAATGGATGTG 5709

 52661994 CTGGGAAATGTCTGTATGGGGCTAGTTAAAGTAAATTAAAATAAAGACCAGACCTGAAGA 52662053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5710 CTGGGAAATGTCTGTATGGGGCTAGTTAAAGTAAATTAAAATAAAGACCAGACCTGAAGA 5769

 52662054 ATCCCTGAGCGGACAAAGCCTGTTAGACCACATAAATGAGCTAAACCTTGCTTGATTTGC 52662113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5770 ATCCCTGAGCGGACAAAGCCTGTTAGACCACATAAATGAGCTAAACCTTGCTTGATTTGC 5829

 52662114 AGACATAAGCAAAACAACTCGAACTGTTTCTTGTAAATGCCTATGCTAAAGAAAAACAGA 52662173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5830 AGACATAAGCAAAACAACTCGAACTGTTTCTTGTAAATGCCTATGCTAAAGAAAAACAGA 5889

 52662174 ACTTGAGCTCAACCAATCAGAAACAGTCAACAAACTTAAAATTATATAACTGGGTACCTT 52662233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5890 ACTTGAGCTCAACCAATCAGAAACAGTCAACAAACTTAAAATTATATAACTGGGTACCTT 5949

 52662234 CCAATGAGATGATCAAATAAGGCAACTGTGTAATTGTAACACATCAAACACATTTTATAT 52662293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5950 CCAATGAGATGATCAAATAAGGCAACTGTGTAATTGTAACACATCAAACACATTTTATAT 6009

 52662294 TATGCCTCTGCATTTTCCCTTAATTCTGGCATGTAATGCTTTGTCATCAAAACACTAATT 52662353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6010 TATGCCTCTGCATTTTCCCTTAATTCTGGCATGTAATGCTTTGTCATCAAAACACTAATT 6069

 52662354 CCCTTTTGGTTTTCTTTTCTCAAATTAATGAATTGCCTCTATTCAGATACACTCTTTGAA 52662413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6070 CCCTTTTGGTTTTCTTTTCTCAAATTAATGAATTGCCTCTATTCAGATACACTCTTTGAA 6129

 52662414 ATTTTATTGTGTCTCAGATTTGTCTTTTACAAAGTATAGAACAAAGAGAAAAATATGAAA 52662473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6130 ATTTTATTGTGTCTCAGATTTGTCTTTTACAAAGTATAGAACAAAGAGAAAAATATGAAA 6189

 52662474 GAAGAAATATTAGGTTGTTAGCTTGGGTGTCCTTGGAGGGGGTAGGGAAGATGTGAGATG 52662533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6190 GAAGAAATATTAGGTTGTTAGCTTGGGTGTCCTTGGAGGGGGTAGGGAAGATGTGAGATG 6249

 52662534 AGGAAGAAGCCAATAAGAAAAAGAAAAAGACAGGTTTCACCAAAACAACAATAACAGAA 52662592
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6250 AGGAAGAAGCCAATAAGAAAAAGAAAAAGACAGGTTTCACCAAAACAACAATAACAGAA 6308

Alignment time is 6.86655 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [52637064,52668002] =>     30939 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,   12518] =>     12518 nucs 'mol-32-322a-214611_12518'

Score:       12518
Aligned:     12518        nucs
Identic:     12518 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [52638934,52651451]
 second seq =>  [       1,   12518]

 52638934 ATTTCATAATTACTCATTTCTAAGTTTCTAACAATTTAGAAAATATACAGTTTTATTTAG 52638993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATTTCATAATTACTCATTTCTAAGTTTCTAACAATTTAGAAAATATACAGTTTTATTTAG 60

 52638994 CATGACTACTACTGATGGCCTATATTATCTTCTAACTTTACAAAAACCCCTAGGGCAGGT 52639053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CATGACTACTACTGATGGCCTATATTATCTTCTAACTTTACAAAAACCCCTAGGGCAGGT 120

 52639054 AGTAGCTTCCTTTTGTGGATGAAAACACAGGTTTTTAAATGATTGAGTATAACAGGCTTA 52639113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGTAGCTTCCTTTTGTGGATGAAAACACAGGTTTTTAAATGATTGAGTATAACAGGCTTA 180

 52639114 GGTGACAGATGGATCTCGATTCCACTTCTGCCACTAATTAGCTTTGCGACCTTAACGCAG 52639173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGTGACAGATGGATCTCGATTCCACTTCTGCCACTAATTAGCTTTGCGACCTTAACGCAG 240

 52639174 GTAACTTAAGTTCTCCCCAAGTTCTCTCCTCTGTTCAATGGCAATAGAAATACCTACCTT 52639233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTAACTTAAGTTCTCCCCAAGTTCTCTCCTCTGTTCAATGGCAATAGAAATACCTACCTT 300

 52639234 GTTGGGTTTTTTTAACAATAAAAACAGATAATGTATGCAAAATGCTTACTGCACAGCCTA 52639293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTTGGGTTTTTTTAACAATAAAAACAGATAATGTATGCAAAATGCTTACTGCACAGCCTA 360

 52639294 GAAATAATGAATTATTTTAAAATGGGGCTATTATTGTCATTTAACTCAACCACACAGCTA 52639353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GAAATAATGAATTATTTTAAAATGGGGCTATTATTGTCATTTAACTCAACCACACAGCTA 420

 52639354 TTTAGTGGTAGAGTCTGGACTCATACCTAGGTCACCCAGGCTCCTAACACTTCCACATCA 52639413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTTAGTGGTAGAGTCTGGACTCATACCTAGGTCACCCAGGCTCCTAACACTTCCACATCA 480

 52639414 CCTCTGCCACTGCAAACATCTCATATTAAGCGTTTCTTACTGCTAAATGCATCAAAATCC 52639473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCTCTGCCACTGCAAACATCTCATATTAAGCGTTTCTTACTGCTAAATGCATCAAAATCC 540

 52639474 CAGTGGTATAGCTGAGGACCTTGTTTACTCCAAAACTTGCATAATGTAAGATGGATTTTC 52639533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CAGTGGTATAGCTGAGGACCTTGTTTACTCCAAAACTTGCATAATGTAAGATGGATTTTC 600

 52639534 CCTTTGCACTGACAAAGTCTTTTGGGTGGCTAGTTCTCTTTACCAGTTGAAAAGGCATGG 52639593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CCTTTGCACTGACAAAGTCTTTTGGGTGGCTAGTTCTCTTTACCAGTTGAAAAGGCATGG 660

 52639594 CCTTGTGGACATAAGGCAGAAACAACACAAAATAAAAAACAGTTAATAATTCACTTGGCC 52639653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCTTGTGGACATAAGGCAGAAACAACACAAAATAAAAAACAGTTAATAATTCACTTGGCC 720

 52639654 TTCTAATGTTGAAATTCGGTAATTCTTTTTATTTGTTTTTATTTTTCACTTGGGATTTTG 52639713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTCTAATGTTGAAATTCGGTAATTCTTTTTATTTGTTTTTATTTTTCACTTGGGATTTTG 780

 52639714 GGTATTTACAACTTTGCATATGCTAACATCTTTGAATTTCATTGCCTCAAGTTGTAACTT 52639773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GGTATTTACAACTTTGCATATGCTAACATCTTTGAATTTCATTGCCTCAAGTTGTAACTT 840

 52639774 CATTGAACAAGTTTCAAATAATTGGCAAAAATAGAAACGTTGACTATTTAAGACTATGGG 52639833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CATTGAACAAGTTTCAAATAATTGGCAAAAATAGAAACGTTGACTATTTAAGACTATGGG 900

 52639834 CTTTGGAGATGGACAATTTTGGCTGTGCCACCTTTTAGCTGTGTGTCAGGAGTGATATGC 52639893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTTTGGAGATGGACAATTTTGGCTGTGCCACCTTTTAGCTGTGTGTCAGGAGTGATATGC 960

 52639894 TTTCTCTGAACTGTTGACTTCTTCATCTGTAAAATGGTGAAAATACAGGAATTCCCTGGT 52639953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTTCTCTGAACTGTTGACTTCTTCATCTGTAAAATGGTGAAAATACAGGAATTCCCTGGT 1020

 52639954 AAGATTTGATGGCTCAATGAGCTGATTTCTACAAAATGATTTAATCACAGAATTTGACTT 52640013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AAGATTTGATGGCTCAATGAGCTGATTTCTACAAAATGATTTAATCACAGAATTTGACTT 1080

 52640014 AAAATGCGAGAGGGATTCATGCTGTCCGAAATCATCCAAGAGTGGAGATATCTGGTTAGC 52640073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAAATGCGAGAGGGATTCATGCTGTCCGAAATCATCCAAGAGTGGAGATATCTGGTTAGC 1140

 52640074 TTCATGGAGAACCTGGCACTGAATATCAAGTCAATTTTTGATAAACAGAGAGAGAAAGGG 52640133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTCATGGAGAACCTGGCACTGAATATCAAGTCAATTTTTGATAAACAGAGAGAGAAAGGG 1200

 52640134 ACATAGGCAGAGAAAATACCAGGAGACAGATGGCGTTTGCACAGGTCAGGTGTTGGCCAT 52640193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ACATAGGCAGAGAAAATACCAGGAGACAGATGGCGTTTGCACAGGTCAGGTGTTGGCCAT 1260

 52640194 ATTGACTGGAGAAATTTAAGGGAAGGGTGGAAAATGCAGTTGGAAAATAGGCAGAGGAAA 52640253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATTGACTGGAGAAATTTAAGGGAAGGGTGGAAAATGCAGTTGGAAAATAGGCAGAGGAAA 1320

 52640254 CATTGTGGAAACCCTTAAATGTCAGACAAAGAAACTGAGGCTTATGGGCATGGACACTAA 52640313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CATTGTGGAAACCCTTAAATGTCAGACAAAGAAACTGAGGCTTATGGGCATGGACACTAA 1380

 52640314 CATTTCTATTGTTTCAAAAATAATTTTACAACTTTTATACCTTTCTCACCCAAGTTAGGA 52640373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CATTTCTATTGTTTCAAAAATAATTTTACAACTTTTATACCTTTCTCACCCAAGTTAGGA 1440

 52640374 CTTGTGCCTTTGGTTATACAACTCTTAAATTAGAGTCAACTGTGCTATCTCTGTGAGTTT 52640433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTTGTGCCTTTGGTTATACAACTCTTAAATTAGAGTCAACTGTGCTATCTCTGTGAGTTT 1500

 52640434 GGGTTGAGGACTATGGAAGGGAAAGGCAAAAAATAAAAGTAAAATGTGAAGTAGAAGACA 52640493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GGGTTGAGGACTATGGAAGGGAAAGGCAAAAAATAAAAGTAAAATGTGAAGTAGAAGACA 1560

 52640494 GGGAGAAAACCCATAATACTGGTAATAGCTAATTTCTCTTTTTCTTCTTTCAAAATGCAA 52640553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GGGAGAAAACCCATAATACTGGTAATAGCTAATTTCTCTTTTTCTTCTTTCAAAATGCAA 1620

 52640554 TTTGTGCTAAGTACTTTATATGGCCTATCTCATTTAACTTCTAAAAGTGTGAACAATGTG 52640613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTTGTGCTAAGTACTTTATATGGCCTATCTCATTTAACTTCTAAAAGTGTGAACAATGTG 1680

 52640614 AGAATGTGCTAGATACTATTATTATCCCCATTTTACAGATGAGGAAACTGAGGCTCAGGA 52640673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AGAATGTGCTAGATACTATTATTATCCCCATTTTACAGATGAGGAAACTGAGGCTCAGGA 1740

 52640674 GGTGAAGTAGCTTGCCCAAGATCACACAGCCAGTAGGTGACAGAGGTAGAGAGGAAACCT 52640733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GGTGAAGTAGCTTGCCCAAGATCACACAGCCAGTAGGTGACAGAGGTAGAGAGGAAACCT 1800

 52640734 AGGCTACTTGACTATGATGCTTATGTTTAATTCACTACTAAATACCATGTAGGAAAGGAC 52640793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AGGCTACTTGACTATGATGCTTATGTTTAATTCACTACTAAATACCATGTAGGAAAGGAC 1860

 52640794 TCTGGAGACCTTAGTTCTTTAATTCCAATTCTACCACTAAACAGTAGAGACAGGATGAAC 52640853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TCTGGAGACCTTAGTTCTTTAATTCCAATTCTACCACTAAACAGTAGAGACAGGATGAAC 1920

 52640854 TTGTCATTCACTGAGATGGAAAACCCCGTGAATTAAACTGGTGGGCATTTTGTTTTTGTC 52640913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTGTCATTCACTGAGATGGAAAACCCCGTGAATTAAACTGGTGGGCATTTTGTTTTTGTC 1980

 52640914 ATTGTTAGGCGATGAATGAAGAGTTCCATTCTGGACACATTAGGGTTGAGATACTCAGTG 52640973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ATTGTTAGGCGATGAATGAAGAGTTCCATTCTGGACACATTAGGGTTGAGATACTCAGTG 2040

 52640974 AGCAGCCAAATGGGGATGTAGAAATTCAAGTAGACATGTGGAAGAGGAGGCAGCTGAGAC 52641033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AGCAGCCAAATGGGGATGTAGAAATTCAAGTAGACATGTGGAAGAGGAGGCAGCTGAGAC 2100

 52641034 TCACGTCTGGACTTCAGGGATGGATCCCGGCTAGAGATGTAAATTTGGAACTTGTCAACC 52641093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TCACGTCTGGACTTCAGGGATGGATCCCGGCTAGAGATGTAAATTTGGAACTTGTCAACC 2160

 52641094 CATAGCAGTATTTAAACCTTTGGGACTGAGGGAAACCTTCAAGGAAATAAGCGTAGTTAG 52641153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CATAGCAGTATTTAAACCTTTGGGACTGAGGGAAACCTTCAAGGAAATAAGCGTAGTTAG 2220

 52641154 AGATAGCCAAGAAGTGAACCCTGGGGAAGTCCAACATTTAGAGGGTGAGATCCAGCAAAG 52641213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AGATAGCCAAGAAGTGAACCCTGGGGAAGTCCAACATTTAGAGGGTGAGATCCAGCAAAG 2280

 52641214 GAGATGATGGAAGAGTACCAGGGAGGTGGAAGGATGTTGTTTCAAACAGCAAGGTGTGGC 52641273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GAGATGATGGAAGAGTACCAGGGAGGTGGAAGGATGTTGTTTCAAACAGCAAGGTGTGGC 2340

 52641274 CCACTCAGTCACTGTGTCGGATTCAACTTGCAGGTCAGACCTACTAGGACAAAGATAGAG 52641333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CCACTCAGTCACTGTGTCGGATTCAACTTGCAGGTCAGACCTACTAGGACAAAGATAGAG 2400

 52641334 ACCTATAGGATTTGGCAGCCAGGGTGATGGTAGGGAATTTGAAACATCATGGTGGCTGTG 52641393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ACCTATAGGATTTGGCAGCCAGGGTGATGGTAGGGAATTTGAAACATCATGGTGGCTGTG 2460

 52641394 ACAAGAGCCTGAATGGAGTGTGTTCAAGAGAGAAAAGAAGAGAAGTGAAAACACAGAATA 52641453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 ACAAGAGCCTGAATGGAGTGTGTTCAAGAGAGAAAAGAAGAGAAGTGAAAACACAGAATA 2520

 52641454 TTGTTCTTATTATTAGTAGCCTGAGCCAATCTGAGGACCGATGCACTTATCACAATGTCT 52641513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TTGTTCTTATTATTAGTAGCCTGAGCCAATCTGAGGACCGATGCACTTATCACAATGTCT 2580

 52641514 CTTAAAATACTATGTCTCTTACTAGATTATACACTCCTTGACAGACGAGAAACATGATTT 52641573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CTTAAAATACTATGTCTCTTACTAGATTATACACTCCTTGACAGACGAGAAACATGATTT 2640

 52641574 ATTTTTCAAATGCCTTGCACAAGGTTAGTGCGAAAGTAACGATTGCAGGATTTAATTACA 52641633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 ATTTTTCAAATGCCTTGCACAAGGTTAGTGCGAAAGTAACGATTGCAGGATTTAATTACA 2700

 52641634 CTTTTAAAAGAAAAAAGACATTCTTCATCTTATGAAACTCTGCATGGCAACACTTTATGC 52641693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CTTTTAAAAGAAAAAAGACATTCTTCATCTTATGAAACTCTGCATGGCAACACTTTATGC 2760

 52641694 GCCCCACACCCCCACTCAACACAAACACAACTCTGGAAGTACTGTGTTGATAACAGAAAT 52641753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GCCCCACACCCCCACTCAACACAAACACAACTCTGGAAGTACTGTGTTGATAACAGAAAT 2820

 52641754 GTGGTGGGTTTTATTTTTAACCAATAAAGGTCAAGTTTGCATTATGTGATTTTGTGTGTG 52641813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GTGGTGGGTTTTATTTTTAACCAATAAAGGTCAAGTTTGCATTATGTGATTTTGTGTGTG 2880

 52641814 TGTGTGTTGAATCTTTTAAATGCATATCTTACAGCTCTGGTTCAGTTGTTGTGGGGAGAG 52641873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TGTGTGTTGAATCTTTTAAATGCATATCTTACAGCTCTGGTTCAGTTGTTGTGGGGAGAG 2940

 52641874 GAAAAAAACCTCATCCCTGCCAACACATTGGTTTGTATGAATCACAGCTCAGTGAAACCT 52641933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 GAAAAAAACCTCATCCCTGCCAACACATTGGTTTGTATGAATCACAGCTCAGTGAAACCT 3000

 52641934 TTCAGGCATATAATTTATCTTTTCTTTGGCCTATGTAGTAAACGCTTCATTTGTTCATGA 52641993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TTCAGGCATATAATTTATCTTTTCTTTGGCCTATGTAGTAAACGCTTCATTTGTTCATGA 3060

 52641994 ATTCTTGCCTTGTTTTAATTATGCTTTGCCCTGAATGTAGTTTTATAAGGCACAAAAATA 52642053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 ATTCTTGCCTTGTTTTAATTATGCTTTGCCCTGAATGTAGTTTTATAAGGCACAAAAATA 3120

 52642054 AGATTGTCGTTCTGAAAACACAGAAGATTTGTATGTTTCCCCCAGGATGAAATGGTGGCA 52642113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 AGATTGTCGTTCTGAAAACACAGAAGATTTGTATGTTTCCCCCAGGATGAAATGGTGGCA 3180

 52642114 TCTTTCTCCCAATTCACAGCTCTGTGGGCTTGTGGCTGGAATTCCAATCCAGCAGGGAGC 52642173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TCTTTCTCCCAATTCACAGCTCTGTGGGCTTGTGGCTGGAATTCCAATCCAGCAGGGAGC 3240

 52642174 AAGCCATAAAAATGGGGGGAAGGGCTGCTGGAGGGAGGCAGTAGATGCGGCTGAGCCCAA 52642233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 AAGCCATAAAAATGGGGGGAAGGGCTGCTGGAGGGAGGCAGTAGATGCGGCTGAGCCCAA 3300

 52642234 GGCATAATTCACCCTAAGAATTCTGAATCAATACACTGACATCCAGCCATGTACAATGTG 52642293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 GGCATAATTCACCCTAAGAATTCTGAATCAATACACTGACATCCAGCCATGTACAATGTG 3360

 52642294 GTACTCCCACCAAGAAAGCCACTGATTGAGAAGTTTTATTCATGTTACTTTCTGAGGGTT 52642353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 GTACTCCCACCAAGAAAGCCACTGATTGAGAAGTTTTATTCATGTTACTTTCTGAGGGTT 3420

 52642354 GGATTGTCCCATTACATTTATAGAACAATTGCTTTTTTCCCCCTAAATACAGAACTATGC 52642413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 GGATTGTCCCATTACATTTATAGAACAATTGCTTTTTTCCCCCTAAATACAGAACTATGC 3480

 52642414 AGCCGGGAGTCAGAAAAGAAACCTTGACAATCAGAAGGCTGTTTTGTTGTTGTTGTTAAA 52642473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 AGCCGGGAGTCAGAAAAGAAACCTTGACAATCAGAAGGCTGTTTTGTTGTTGTTGTTAAA 3540

 52642474 AACCTTTGCAGGCATATGCATCTGAATATCCATAAGTTCACAGGCTGAGGGAGAAATGGC 52642533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 AACCTTTGCAGGCATATGCATCTGAATATCCATAAGTTCACAGGCTGAGGGAGAAATGGC 3600

 52642534 TATTTCATAACTTTTCTGTGTTTCTCATGTACATAGTACAAAGTGGGCACTCAGTATTTC 52642593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 TATTTCATAACTTTTCTGTGTTTCTCATGTACATAGTACAAAGTGGGCACTCAGTATTTC 3660

 52642594 AAATTTCAATATCACTGAAAAAAATGGAAATTTGTCATGTAACAAAATCAGATGCAGACT 52642653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 AAATTTCAATATCACTGAAAAAAATGGAAATTTGTCATGTAACAAAATCAGATGCAGACT 3720

 52642654 TCACTGGTGAATCTGAGGGAGTGAATTCACTTATTCAGAAAGGAAGACAGTTACAATTCT 52642713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 TCACTGGTGAATCTGAGGGAGTGAATTCACTTATTCAGAAAGGAAGACAGTTACAATTCT 3780

 52642714 TGGGTCTTCTGAGAGATCATTATAACTTGAAAATATTACACAAGGGCTTTGCTATATTAG 52642773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 TGGGTCTTCTGAGAGATCATTATAACTTGAAAATATTACACAAGGGCTTTGCTATATTAG 3840

 52642774 ATACCTGCCATGTTCCTAACACAAGCTCCCATTTTCTGACTCAAATCTCATTTTGGAACA 52642833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 ATACCTGCCATGTTCCTAACACAAGCTCCCATTTTCTGACTCAAATCTCATTTTGGAACA 3900

 52642834 CATTCCACTCAAATTGAGGTTCTACCCCTAAGAGTTCTTTTTCAATAAAGAAAGCTGAGT 52642893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 CATTCCACTCAAATTGAGGTTCTACCCCTAAGAGTTCTTTTTCAATAAAGAAAGCTGAGT 3960

 52642894 TAATAAATCACAACTCCAAAACTTTTCCTCACTTTTCTTAGACTAGAAATAGATTGAGTG 52642953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 TAATAAATCACAACTCCAAAACTTTTCCTCACTTTTCTTAGACTAGAAATAGATTGAGTG 4020

 52642954 TGTCGAGGTTTTATGGCTGAGTACATTGGAGGGCTGGCTATTCTATGCTGAACTGGTTTA 52643013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 TGTCGAGGTTTTATGGCTGAGTACATTGGAGGGCTGGCTATTCTATGCTGAACTGGTTTA 4080

 52643014 CTTGATTAAGATGGGGATTTGGATGAGTCACCGGACACCTGTCCAAAGATGAGTAAAACA 52643073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 CTTGATTAAGATGGGGATTTGGATGAGTCACCGGACACCTGTCCAAAGATGAGTAAAACA 4140

 52643074 CATTCCTTCATTGTCTTCCCATAAATAACTCAATCTTCTCCTAACTGAGCCAATGGATAG 52643133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 CATTCCTTCATTGTCTTCCCATAAATAACTCAATCTTCTCCTAACTGAGCCAATGGATAG 4200

 52643134 GCTTTGGATGCCCAAGCAAAACAAACACATGACTGTTAAAAAATCACAACCTCAAAATGG 52643193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 GCTTTGGATGCCCAAGCAAAACAAACACATGACTGTTAAAAAATCACAACCTCAAAATGG 4260

 52643194 CCTTAGAAGCCTATGACCAATAATGAGAATGGTTTCTCCACTCAGGCGCAAGTAGTAAAC 52643253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 CCTTAGAAGCCTATGACCAATAATGAGAATGGTTTCTCCACTCAGGCGCAAGTAGTAAAC 4320

 52643254 AGTTTCTCCCATATGCAGGAATATTGACGACTAGTTTACCGCCTCTGGGCACGTAACTTT 52643313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 AGTTTCTCCCATATGCAGGAATATTGACGACTAGTTTACCGCCTCTGGGCACGTAACTTT 4380

 52643314 CAGGTCCTGGTTCATGCATTTGCTGGAATGTTCCCTGGGCCATGGAGCCCAGTTCTCCTG 52643373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 CAGGTCCTGGTTCATGCATTTGCTGGAATGTTCCCTGGGCCATGGAGCCCAGTTCTCCTG 4440

 52643374 GCATCTGGCATCTCCCCCACACTCTGCTCCCCCAGCACAGCACTTGGCATCTTGCATTGC 52643433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 GCATCTGGCATCTCCCCCACACTCTGCTCCCCCAGCACAGCACTTGGCATCTTGCATTGC 4500

 52643434 AATTGCAGGTTTATTTATTCACTTCTCTCACTGGACAGCAAACTCCACCAGGGCCGAGAC 52643493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 AATTGCAGGTTTATTTATTCACTTCTCTCACTGGACAGCAAACTCCACCAGGGCCGAGAC 4560

 52643494 TCTGTGTCTCGCCCTTCACTGTGGTCCCTGTGCCTCACCTGTTCCTAGTACAGTGTCACA 52643553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 TCTGTGTCTCGCCCTTCACTGTGGTCCCTGTGCCTCACCTGTTCCTAGTACAGTGTCACA 4620

 52643554 CTCAGTAAAGAGCAGATGCCTGGTGCATTTGGAGACTTATTTTAAATTATACGGAAAGTT 52643613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 CTCAGTAAAGAGCAGATGCCTGGTGCATTTGGAGACTTATTTTAAATTATACGGAAAGTT 4680

 52643614 ATTCAACCGGCTTCTTGAACTGGTGAATTTTGGAAAGTGGGTGTTTGAAGGGAAAATGTT 52643673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 ATTCAACCGGCTTCTTGAACTGGTGAATTTTGGAAAGTGGGTGTTTGAAGGGAAAATGTT 4740

 52643674 TAAACTCTGAAAGAAATGTTGGAAATAAGCTCTTTGAATCAAAATGTATAGAAAACACAA 52643733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 TAAACTCTGAAAGAAATGTTGGAAATAAGCTCTTTGAATCAAAATGTATAGAAAACACAA 4800

 52643734 GAATGCTGACAGTAAGAGCCTAAAACACATGATGACTATTATCTTTTCCCAATTTTAACT 52643793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 GAATGCTGACAGTAAGAGCCTAAAACACATGATGACTATTATCTTTTCCCAATTTTAACT 4860

 52643794 CTCCAGAGTGTTCAGCGGTGCCCAGCCTTCATAATGTAATTCTTCGTAGCACCCTGGATG 52643853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 CTCCAGAGTGTTCAGCGGTGCCCAGCCTTCATAATGTAATTCTTCGTAGCACCCTGGATG 4920

 52643854 CATTAAAACCATAGATTAACGTGATACTTATTTTCATTAAGGAAAATAATTTACGTACAG 52643913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 CATTAAAACCATAGATTAACGTGATACTTATTTTCATTAAGGAAAATAATTTACGTACAG 4980

 52643914 TGCTCAGAGTAGAGCCTGGCACATTGAACATTTTCAATAAATGACAGCAAGTGTAATTAT 52643973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 TGCTCAGAGTAGAGCCTGGCACATTGAACATTTTCAATAAATGACAGCAAGTGTAATTAT 5040

 52643974 TAGCACTTCGGAAGTGCAAAGTTGCATTGTATTAAGACAAATATATTTGGAGCTCATCCA 52644033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 TAGCACTTCGGAAGTGCAAAGTTGCATTGTATTAAGACAAATATATTTGGAGCTCATCCA 5100

 52644034 ATTTTTTCCTGGCTCTGAAGTCTGCTAGTGGCACTTAACTTTATTCCCAAGTTTTGAAAA 52644093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 ATTTTTTCCTGGCTCTGAAGTCTGCTAGTGGCACTTAACTTTATTCCCAAGTTTTGAAAA 5160

 52644094 ATATTGTTATTTAAAAAGTCTGTTAACCAAGGAAATGCATGCCCTAAACCTATAATGTAT 52644153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 ATATTGTTATTTAAAAAGTCTGTTAACCAAGGAAATGCATGCCCTAAACCTATAATGTAT 5220

 52644154 CAAGTTTTACTTCCTTCTTCTTTTAAGGAGTTCTTTTCCTGCCTTGAATACAAACAGGCT 52644213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 CAAGTTTTACTTCCTTCTTCTTTTAAGGAGTTCTTTTCCTGCCTTGAATACAAACAGGCT 5280

 52644214 CTCTCAAGGTTAAAAGCAAATGCTCTTTTTAGTGTCAAAAAGAGCTTGCCTTTCTTCGCT 52644273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 CTCTCAAGGTTAAAAGCAAATGCTCTTTTTAGTGTCAAAAAGAGCTTGCCTTTCTTCGCT 5340

 52644274 CAGGAAAAAAAGCAACTGATTCCAGGATACCTTCTTTGAAAACCAACACAAAAAAACCCC 52644333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 CAGGAAAAAAAGCAACTGATTCCAGGATACCTTCTTTGAAAACCAACACAAAAAAACCCC 5400

 52644334 CCAAAAAACAAAAAAAAAACCCAAAACCCCTAGTTTTTACAAAGGTTTATTACTCCTACT 52644393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 CCAAAAAACAAAAAAAAAACCCAAAACCCCTAGTTTTTACAAAGGTTTATTACTCCTACT 5460

 52644394 TGTTGGAAAAGAATTACTACATAAAAGAGTCTGCCCAGAGCTGTAAAATCTCCTTATTCA 52644453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 TGTTGGAAAAGAATTACTACATAAAAGAGTCTGCCCAGAGCTGTAAAATCTCCTTATTCA 5520

 52644454 AACACACACCTTAGAGCAAAAGATGGTTAAATATCAATTCAGGCTATTAACAGTAAGGGA 52644513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 AACACACACCTTAGAGCAAAAGATGGTTAAATATCAATTCAGGCTATTAACAGTAAGGGA 5580

 52644514 CGAAATGTGTTCCAACAAAACTCTGCATGTCAACAAACTACAGAGACTAGGTAACATCTT 52644573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 CGAAATGTGTTCCAACAAAACTCTGCATGTCAACAAACTACAGAGACTAGGTAACATCTT 5640

 52644574 TTAGGAATCATTTTTATTCCACTAATGCCTTTTCCTCCAGAATCCACTGATCGTAAACGC 52644633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 TTAGGAATCATTTTTATTCCACTAATGCCTTTTCCTCCAGAATCCACTGATCGTAAACGC 5700

 52644634 AACCTGTCTACTTCCGCCTTTGAAAAATGGATGGACAAATTCATCTGCATGTAACTCACC 52644693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5701 AACCTGTCTACTTCCGCCTTTGAAAAATGGATGGACAAATTCATCTGCATGTAACTCACC 5760

 52644694 TCCTCTTTTCTTTTACATAAAACAGATGCCACAGCTGTTATTGTTCTTCACACAGAAGTT 52644753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5761 TCCTCTTTTCTTTTACATAAAACAGATGCCACAGCTGTTATTGTTCTTCACACAGAAGTT 5820

 52644754 TCTACCCAGAGAAACATCAGGATGACACTCTGCTGCAATGTGCTATTTGTTCTAGAGGGG 52644813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5821 TCTACCCAGAGAAACATCAGGATGACACTCTGCTGCAATGTGCTATTTGTTCTAGAGGGG 5880

 52644814 TCAACAGCTTGCCACCTTGCCTAGGCCCAGGGTGACTGCATATGTGCAGTGGTCTTATCC 52644873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5881 TCAACAGCTTGCCACCTTGCCTAGGCCCAGGGTGACTGCATATGTGCAGTGGTCTTATCC 5940

 52644874 CATTAGCGCCCCCGAGCATGCATTCAGAACCAAGTGGATACACCTTGGCACACTTACCTT 52644933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5941 CATTAGCGCCCCCGAGCATGCATTCAGAACCAAGTGGATACACCTTGGCACACTTACCTT 6000

 52644934 CCCTGCAGGGACATCATCGGACTGCCCTGATAAGCCAGGAACCTCATCCACCTTGTCTTG 52644993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6001 CCCTGCAGGGACATCATCGGACTGCCCTGATAAGCCAGGAACCTCATCCACCTTGTCTTG 6060

 52644994 ATGCTCTGCCCTCTTGGCTTCCTGTTGGCTGTCACCTGGCACCTTTTCCTGTCCCTTGTC 52645053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6061 ATGCTCTGCCCTCTTGGCTTCCTGTTGGCTGTCACCTGGCACCTTTTCCTGTCCCTTGTC 6120

 52645054 CAGCTTGAAGAATTTGTCAAAAAAGCTGGAGTCCTTGGGCTTGGAGGGAGCTTCTCCTCC 52645113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6121 CAGCTTGAAGAATTTGTCAAAAAAGCTGGAGTCCTTGGGCTTGGAGGGAGCTTCTCCTCC 6180

 52645114 TGCTCCCCCTGTCTCAGGTGGGAGAAGCGTGGGATCCCTGGCGGCAGAGAGGACCTTGTC 52645173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6181 TGCTCCCCCTGTCTCAGGTGGGAGAAGCGTGGGATCCCTGGCGGCAGAGAGGACCTTGTC 6240

 52645174 TTGGGCCGGGGCGTGCCCTGGGGTTTTATCTGTGTCCTGCCCCGGTCCAGCTGCCACCGG 52645233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6241 TTGGGCCGGGGCGTGCCCTGGGGTTTTATCTGTGTCCTGCCCCGGTCCAGCTGCCACCGG 6300

 52645234 AAGTGTCCAGCTCTCACTTGGGTCTTTGTTCGCTGGAGCTTTATTGGAGCTGACATCAAG 52645293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6301 AAGTGTCCAGCTCTCACTTGGGTCTTTGTTCGCTGGAGCTTTATTGGAGCTGACATCAAG 6360

 52645294 CTTCACTGATCCAAGGGATGAATCTGCGGCTTGGTCTCCGGTACGTCCTGGTACAGGCCG 52645353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6361 CTTCACTGATCCAAGGGATGAATCTGCGGCTTGGTCTCCGGTACGTCCTGGTACAGGCCG 6420

 52645354 AGAGAGCATCAAGAAAAAACGAGATTTAGCAGCTGGTGCCTCGGGTTTGGCCTCTTTCCC 52645413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6421 AGAGAGCATCAAGAAAAAACGAGATTTAGCAGCTGGTGCCTCGGGTTTGGCCTCTTTCCC 6480

 52645414 AAGATTCTTTCCGTTGGCATCCGCAACAGCACTTATCTCCGTTGTCTCGGGGGAAGAAGT 52645473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6481 AAGATTCTTTCCGTTGGCATCCGCAACAGCACTTATCTCCGTTGTCTCGGGGGAAGAAGT 6540

 52645474 GGCCACATTATCCGTCTTGACACTTATTCCCAAGTCGACTGTAAACACAAACATAAACAG 52645533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6541 GGCCACATTATCCGTCTTGACACTTATTCCCAAGTCGACTGTAAACACAAACATAAACAG 6600

 52645534 TGGTTATTCAGCCAAGCCGGGAAATTCAGGCACTAATAATGGACTCCAGACATTTTTTAT 52645593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6601 TGGTTATTCAGCCAAGCCGGGAAATTCAGGCACTAATAATGGACTCCAGACATTTTTTAT 6660

 52645594 ACAAAAGCCATACTGCATACTGGAACTGTGTTGTTCTCTGGTCATTCTGAAAGGCAGAAG 52645653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6661 ACAAAAGCCATACTGCATACTGGAACTGTGTTGTTCTCTGGTCATTCTGAAAGGCAGAAG 6720

 52645654 TTAGCTCTCTACATCTCCTTGGACCCTGCTTTTCTTGGGAGAGGAGAAGGCAAGGTTGGT 52645713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6721 TTAGCTCTCTACATCTCCTTGGACCCTGCTTTTCTTGGGAGAGGAGAAGGCAAGGTTGGT 6780

 52645714 GAGGAGGGAAAGCTACTTAATGGAAAGTCACTAGCTGCCAGGTGTGGAATGAGTGATATT 52645773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6781 GAGGAGGGAAAGCTACTTAATGGAAAGTCACTAGCTGCCAGGTGTGGAATGAGTGATATT 6840

 52645774 CAATGTTAATTAATCTTCTTTTATCTGTGTAAGAACTCCGTGAGCAGCATATTGTCATGA 52645833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6841 CAATGTTAATTAATCTTCTTTTATCTGTGTAAGAACTCCGTGAGCAGCATATTGTCATGA 6900

 52645834 TGTCAACTGGGAGGCAGTACAGCAGTTAGGAGCTTGGGTTCTGGAGCTAGAACAAGGTTT 52645893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6901 TGTCAACTGGGAGGCAGTACAGCAGTTAGGAGCTTGGGTTCTGGAGCTAGAACAAGGTTT 6960

 52645894 CTCAACCTCAGCACTACTCACATTTGAAGCCAGATTATTCTTTGTTAGGGAGGCTCATCC 52645953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6961 CTCAACCTCAGCACTACTCACATTTGAAGCCAGATTATTCTTTGTTAGGGAGGCTCATCC 7020

 52645954 CGTGCCTCATAGGCTGATTAGCAGCATCCTGGCCTCTGCCCACTAGACGCCGGTCACATT 52646013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7021 CGTGCCTCATAGGCTGATTAGCAGCATCCTGGCCTCTGCCCACTAGACGCCGGTCACATT 7080

 52646014 TCCCAGTCATGGCAACCAAAAATATCTCTAGGCATTGCTAAATGTCCCCTGGAGGACAAA 52646073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7081 TCCCAGTCATGGCAACCAAAAATATCTCTAGGCATTGCTAAATGTCCCCTGGAGGACAAA 7140

 52646074 ATCTCTTACGTTTGAGAGGCACTGAGCTGAAATGTCTTTTTGAATCCAGATTATCTAATT 52646133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7141 ATCTCTTACGTTTGAGAGGCACTGAGCTGAAATGTCTTTTTGAATCCAGATTATCTAATT 7200

 52646134 TTCTGTGCCTCAACTTTCTGGTAAAAGGAGACAGATAATAAATCTCGTAATTTTGTTAGG 52646193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7201 TTCTGTGCCTCAACTTTCTGGTAAAAGGAGACAGATAATAAATCTCGTAATTTTGTTAGG 7260

 52646194 AAGATTACATGAGTTAATAGTTTTAAAGCAAGTACAATAGCACCTGGAATATATTAAGTG 52646253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7261 AAGATTACATGAGTTAATAGTTTTAAAGCAAGTACAATAGCACCTGGAATATATTAAGTG 7320

 52646254 CTTAATAAATATCACAAACATTAGTTATCATTATTCATGAGTGAGAAAACTGACAGTCAG 52646313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7321 CTTAATAAATATCACAAACATTAGTTATCATTATTCATGAGTGAGAAAACTGACAGTCAG 7380

 52646314 AGAGGTCAGTACACCCTCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCTAGTAAGCAGCAGAGTCTGGCTT 52646373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7381 AGAGGTCAGTACACCCTCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCTAGTAAGCAGCAGAGTCTGGCTT 7440

 52646374 CAGGCAGAAATCTGACTTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGTCTTACCAGGGACTTGTATTAG 52646433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7441 CAGGCAGAAATCTGACTTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGTCTTACCAGGGACTTGTATTAG 7500

 52646434 CATAGACTGTTAAGAATATGGGAAGATTTTTAAAATACAGTACTCAGAAAATTTCTCTTT 52646493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7501 CATAGACTGTTAAGAATATGGGAAGATTTTTAAAATACAGTACTCAGAAAATTTCTCTTT 7560

 52646494 GAAAGGCTGGAAGAGCAGATATCCACACAAGAAGGCAAATTAGACCTCAGGCCAGTGTGG 52646553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7561 GAAAGGCTGGAAGAGCAGATATCCACACAAGAAGGCAAATTAGACCTCAGGCCAGTGTGG 7620

 52646554 AATTAAAGGTGTAGGGTTATCTGGTCAAGACTGTGTGTGTGGATACAGGCTCCAACCCCT 52646613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7621 AATTAAAGGTGTAGGGTTATCTGGTCAAGACTGTGTGTGTGGATACAGGCTCCAACCCCT 7680

 52646614 CCAGGCAAGGGCACTGTTTCCAACATCCACCCTTTCTCCTTTGACCTCTACCTTGACCTA 52646673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7681 CCAGGCAAGGGCACTGTTTCCAACATCCACCCTTTCTCCTTTGACCTCTACCTTGACCTA 7740

 52646674 AATTAACTATAAAAGGTCCTTCTTTTCTAGGACCCTACTATAAATCAGTGAAATATTCAG 52646733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7741 AATTAACTATAAAAGGTCCTTCTTTTCTAGGACCCTACTATAAATCAGTGAAATATTCAG 7800

 52646734 GAAAAAAAGAACACCAAGAATGTTGGGATCCCAGTTAAAGATCAAGATTCTCTACTGATA 52646793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7801 GAAAAAAAGAACACCAAGAATGTTGGGATCCCAGTTAAAGATCAAGATTCTCTACTGATA 7860

 52646794 AGCTGTGTGATATGGAGTAAATCACTAAAGATCTTTGAATCTCTTCATTTGTAAAATGGG 52646853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7861 AGCTGTGTGATATGGAGTAAATCACTAAAGATCTTTGAATCTCTTCATTTGTAAAATGGG 7920

 52646854 AATATTGGTAGTCCTACTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTAAAGAAGAAAAGTCATGCAAAG 52646913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7921 AATATTGGTAGTCCTACTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTAAAGAAGAAAAGTCATGCAAAG 7980

 52646914 GATCTGGCACAACGCCTTTTCCATAATAAGTGCTTAGTAATTGACAGATACTGTGATAAC 52646973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7981 GATCTGGCACAACGCCTTTTCCATAATAAGTGCTTAGTAATTGACAGATACTGTGATAAC 8040

 52646974 TTTTCAGGTTTCTCTCATGCCTTTGACAACATTGCATTTTGCTTGCTCTATCTGTAGTCA 52647033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8041 TTTTCAGGTTTCTCTCATGCCTTTGACAACATTGCATTTTGCTTGCTCTATCTGTAGTCA 8100

 52647034 GACACTTCTTAATATCTGTTTGCAGGAAGACAGAAAAATAAAGGGAAGAATTGAGATTTC 52647093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8101 GACACTTCTTAATATCTGTTTGCAGGAAGACAGAAAAATAAAGGGAAGAATTGAGATTTC 8160

 52647094 TTTGATCTATTCATACTGCTCATTAATATGTAGTGAGAAATACATACACACACACATACA 52647153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8161 TTTGATCTATTCATACTGCTCATTAATATGTAGTGAGAAATACATACACACACACATACA 8220

 52647154 CACACATGCATCCATTAGCAATTGTTTTTGCCCAACTCTAGTGTCTCGCAGTGTCTAGAC 52647213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8221 CACACATGCATCCATTAGCAATTGTTTTTGCCCAACTCTAGTGTCTCGCAGTGTCTAGAC 8280

 52647214 TAAACAACAAACAAAAAAGGGGGGAGAGTGAGCTGGATTAAGCATTGAGGCACAGTGAAG 52647273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8281 TAAACAACAAACAAAAAAGGGGGGAGAGTGAGCTGGATTAAGCATTGAGGCACAGTGAAG 8340

 52647274 AAATGGTCTGGGGCAAGCCCAGGGATGAATGTTAGGGGTTTCTCATAAACCTGAACCTGA 52647333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8341 AAATGGTCTGGGGCAAGCCCAGGGATGAATGTTAGGGGTTTCTCATAAACCTGAACCTGA 8400

 52647334 AGAAAATCACCCTGCCAGCATATTGATCTTCTAGCTCTTCTTAACCTTTTTTTCTGTGAT 52647393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8401 AGAAAATCACCCTGCCAGCATATTGATCTTCTAGCTCTTCTTAACCTTTTTTTCTGTGAT 8460

 52647394 TCAGGAATTCATAATGATAGAAAATATTATACTAAAGAAGAAAAAAAGAGGGAGAATAAG 52647453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8461 TCAGGAATTCATAATGATAGAAAATATTATACTAAAGAAGAAAAAAAGAGGGAGAATAAG 8520

 52647454 TAAGTGATAGATGGATGCATCAGGGTGTAAAGTTAGCAAGTAAGGCTGTTGAAGTGTCAG 52647513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8521 TAAGTGATAGATGGATGCATCAGGGTGTAAAGTTAGCAAGTAAGGCTGTTGAAGTGTCAG 8580

 52647514 AGTGAATATAAATGAATTGTGGGAATGGTCCATGCCAGGAGAAGAGGGTATGGTTGACAA 52647573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8581 AGTGAATATAAATGAATTGTGGGAATGGTCCATGCCAGGAGAAGAGGGTATGGTTGACAA 8640

 52647574 AAAGGGAAATGCTAAGATTCAAAACAGGGAAGGGCTTTTCAAAATGCCAAGAGCACCAAC 52647633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8641 AAAGGGAAATGCTAAGATTCAAAACAGGGAAGGGCTTTTCAAAATGCCAAGAGCACCAAC 8700

 52647634 TTATATCTTTCAGTTTAATTCCTCTCTTCCTTACCCACTGGCTGGAAAGCAAAGGAGCTA 52647693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8701 TTATATCTTTCAGTTTAATTCCTCTCTTCCTTACCCACTGGCTGGAAAGCAAAGGAGCTA 8760

 52647694 GTGGTAAGTAAGAGTGTTATAGCCAGAGAAAAAGTCTTCAAAAAACACAAAGTACTTTCC 52647753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8761 GTGGTAAGTAAGAGTGTTATAGCCAGAGAAAAAGTCTTCAAAAAACACAAAGTACTTTCC 8820

 52647754 ATGGACAACCTTTTTTATTTTAAAGTGCCAATATGTTGCTTTGAAAAAGAATAAATTCCT 52647813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8821 ATGGACAACCTTTTTTATTTTAAAGTGCCAATATGTTGCTTTGAAAAAGAATAAATTCCT 8880

 52647814 TACATCCAGGTATCTGGACTAGACTTCAGTGCATTTAGTGATTATAGCAAATCCAAACAG 52647873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8881 TACATCCAGGTATCTGGACTAGACTTCAGTGCATTTAGTGATTATAGCAAATCCAAACAG 8940

 52647874 TAGCTTTTGATATCAGAGAATGGGTAAAGTGTTTTTGACAATTTCTAAGAACTTAGAGTT 52647933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8941 TAGCTTTTGATATCAGAGAATGGGTAAAGTGTTTTTGACAATTTCTAAGAACTTAGAGTT 9000

 52647934 CTTCGGTGATACGTTCCATGCAACTGAAGCTCTGCTCTCCAAATTTAGGTGGGTACATAC 52647993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9001 CTTCGGTGATACGTTCCATGCAACTGAAGCTCTGCTCTCCAAATTTAGGTGGGTACATAC 9060

 52647994 CCAAGTCCATCACCTGGGGCTTCTATTTCCTTTGCTCAGATGCTCACCTCCTAGGTGGGC 52648053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9061 CCAAGTCCATCACCTGGGGCTTCTATTTCCTTTGCTCAGATGCTCACCTCCTAGGTGGGC 9120

 52648054 ACCTGACATAAGATAGACTAATAAAAATAAGTCCTGTAACTTTTGATACTCCTATTAAAA 52648113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9121 ACCTGACATAAGATAGACTAATAAAAATAAGTCCTGTAACTTTTGATACTCCTATTAAAA 9180

 52648114 AAGAGTTGCAAACCAATAGGAGGTACACTTGAGAATCAGCACAAATGAAAGTAGAACCTG 52648173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9181 AAGAGTTGCAAACCAATAGGAGGTACACTTGAGAATCAGCACAAATGAAAGTAGAACCTG 9240

 52648174 GAAATCCAGGAAGCAGATACCCAATCATGTCATTTAAACATTTAGATCCAGCTGTGCCTG 52648233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9241 GAAATCCAGGAAGCAGATACCCAATCATGTCATTTAAACATTTAGATCCAGCTGTGCCTG 9300

 52648234 AAGCTGAACTTTAGCATTACATAAGCCAATAAATCACTCTTCCCCAACTTACGCCAGTTG 52648293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9301 AAGCTGAACTTTAGCATTACATAAGCCAATAAATCACTCTTCCCCAACTTACGCCAGTTG 9360

 52648294 AAATTGAATACATACTCAGTGACTTTGAGAGAATTCCAGGGAATTGGTCAGTCCCTGTTT 52648353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9361 AAATTGAATACATACTCAGTGACTTTGAGAGAATTCCAGGGAATTGGTCAGTCCCTGTTT 9420

 52648354 CACTTGTAAATACACAGCAATCAAGCCTACCAAATCTATGATTGATTGGGGTGTCTGAAA 52648413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9421 CACTTGTAAATACACAGCAATCAAGCCTACCAAATCTATGATTGATTGGGGTGTCTGAAA 9480

 52648414 GAGATGGAGGGAATGGAATCAACCTGAAAAACATATTTCAGGAGTTCATCCCTGAAAACT 52648473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9481 GAGATGGAGGGAATGGAATCAACCTGAAAAACATATTTCAGGAGTTCATCCCTGAAAACT 9540

 52648474 TCCCCAACCTAGCTAGAGGGGCCAACATTCAAATTCAGGAAATGCAGAGAACCCCAGTAA 52648533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9541 TCCCCAACCTAGCTAGAGGGGCCAACATTCAAATTCAGGAAATGCAGAGAACCCCAGTAA 9600

 52648534 GATACTCCACAAAAAGATCTTCCCCAAGACATCATCATCAGATTCTCCAAAGTTGAAATG 52648593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9601 GATACTCCACAAAAAGATCTTCCCCAAGACATCATCATCAGATTCTCCAAAGTTGAAATG 9660

 52648594 TAAGAAAAAATGCTAAAGGCAACTAGAGTGAAAGGCCCGGTCACCTAAAAAGGGAAGCAC 52648653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9661 TAAGAAAAAATGCTAAAGGCAACTAGAGTGAAAGGCCCGGTCACCTAAAAAGGGAAGCAC 9720

 52648654 AGACTTACAGTGGACCTCTCACTGGTAACCCTACAAGCCAGAAGAGATTGAGGACCAATA 52648713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9721 AGACTTACAGTGGACCTCTCACTGGTAACCCTACAAGCCAGAAGAGATTGAGGACCAATA 9780

 52648714 TTCAACATTCTTAAACAAAAAGAATTCCAACCCAGAATTTTATATCTGACTAAACTAAGC 52648773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9781 TTCAACATTCTTAAACAAAAAGAATTCCAACCCAGAATTTTATATCTGACTAAACTAAGC 9840

 52648774 TTCATAAGCAAAAGAGAAATAAGATCATTTTCAGACAAGCAAATGCTAAGGGAATTTGTG 52648833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9841 TTCATAAGCAAAAGAGAAATAAGATCATTTTCAGACAAGCAAATGCTAAGGGAATTTGTG 9900

 52648834 ACCATTAGACCTTCCTTGCAACAGTTCCTAAAGGAAGCACTAAATATGGAAAGACCATTA 52648893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9901 ACCATTAGACCTTCCTTGCAACAGTTCCTAAAGGAAGCACTAAATATGGAAAGACCATTA 9960

 52648894 CCAGACACTACAAAACACACTGAAGTACACAGACCAGTGACATTGTAAAGCAACTACATA 52648953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9961 CCAGACACTACAAAACACACTGAAGTACACAGACCAGTGACATTGTAAAGCAACTACATA 10020

 52648954 ACAAGTCTGCAAAATAACCAGCCAACATCATGATGACGGTATCAAATCGACACATAGCAA 52649013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10021 ACAAGTCTGCAAAATAACCAGCCAACATCATGATGACGGTATCAAATCGACACATAGCAA 10080

 52649014 CACTAACCTTAAATGTAAATGGACTAAATGATCCCATTAAAAGACATAAAGTGGCAGGCT 52649073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10081 CACTAACCTTAAATGTAAATGGACTAAATGATCCCATTAAAAGACATAAAGTGGCAGGCT 10140

 52649074 GGATAAAGAACCAAGAACCATTGGTATACTGTCTTCAAGAGACCCATCTCCTATGCAGTG 52649133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10141 GGATAAAGAACCAAGAACCATTGGTATACTGTCTTCAAGAGACCCATCTCCTATGCAGTG 10200

 52649134 ACACACATAGGTTCAAGATAAAGGGATGGGGAAAAATCTACCAAGCAAATAGAAAACAGA 52649193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10201 ACACACATAGGTTCAAGATAAAGGGATGGGGAAAAATCTACCAAGCAAATAGAAAACAGA 10260

 52649194 ATAAAACAGGGGTTGCAATCCTAGTTGCCGTCAAAACAGACTTTAAACCAACAAAGGTTA 52649253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10261 ATAAAACAGGGGTTGCAATCCTAGTTGCCGTCAAAACAGACTTTAAACCAACAAAGGTTA 10320

 52649254 AAAGAAAAAAATATGGGCATTGCATAAGGATAAAGTGTTAAATTAAACAAGAAGATCTAA 52649313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10321 AAAGAAAAAAATATGGGCATTGCATAAGGATAAAGTGTTAAATTAAACAAGAAGATCTAA 10380

 52649314 CTATCCTAAGTATATATGCACCAAACACAGGAACACCCAGATTCATAAAGCAAGTTTATG 52649373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10381 CTATCCTAAGTATATATGCACCAAACACAGGAACACCCAGATTCATAAAGCAAGTTTATG 10440

 52649374 GAGACCTTCAAACAGACTTAGACTCCCACACAATAGTAGTGGGAGACTTTAATACCCCAT 52649433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10441 GAGACCTTCAAACAGACTTAGACTCCCACACAATAGTAGTGGGAGACTTTAATACCCCAT 10500

 52649434 GACAATATTAGACAGATCATTGAGACAGGAAATTAACAAAGATATTCAAGATCTAACTCA 52649493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10501 GACAATATTAGACAGATCATTGAGACAGGAAATTAACAAAGATATTCAAGATCTAACTCA 10560

 52649494 GCACTAAATCAAATGGCCCTGATAGATATCTACAGGACTGTCCTACTTGAAACCATACAA 52649553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10561 GCACTAAATCAAATGGCCCTGATAGATATCTACAGGACTGTCCTACTTGAAACCATACAA 10620

 52649554 TTACATGGTAATTGAATGACCTGCTCCTGAATGACTTTTGGGTAAATAATAAAATTAAGG 52649613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10621 TTACATGGTAATTGAATGACCTGCTCCTGAATGACTTTTGGGTAAATAATAAAATTAAGG 10680

 52649614 CAGAAATCAAGAAGTTTTTTGAACTAATGAGAACAAAGATACAACATACCAGAATCTTTG 52649673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10681 CAGAAATCAAGAAGTTTTTTGAACTAATGAGAACAAAGATACAACATACCAGAATCTTTG 10740

 52649674 GGACACAGCTAAGGCAGTGTTAAGAGGGAAATTTATAGCACTAAATCCCACATCAAAAAG 52649733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10741 GGACACAGCTAAGGCAGTGTTAAGAGGGAAATTTATAGCACTAAATCCCACATCAAAAAG 10800

 52649734 TTAGAAAGAGCTCACGTTAACAATCTAACCTCACAACTACAGGAACTAGAGAACTGAGAG 52649793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10801 TTAGAAAGAGCTCACGTTAACAATCTAACCTCACAACTACAGGAACTAGAGAACTGAGAG 10860

 52649794 CAGAAAAACCTGAAAGCTAGCAGAAGACAAGAAATAACCAAAATTAGAGCTGAACTGAAG 52649853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10861 CAGAAAAACCTGAAAGCTAGCAGAAGACAAGAAATAACCAAAATTAGAGCTGAACTGAAG 10920

 52649854 GAGATTGAGACATGAAAAACCATTCAAAAGATCAGTGAATTCAGGAGCTGTTTTTTTTTT 52649913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10921 GAGATTGAGACATGAAAAACCATTCAAAAGATCAGTGAATTCAGGAGCTGTTTTTTTTTT 10980

 52649914 GAACAAATTAATAAAATAGACCATTAGCTAGAGTAATAAACAAGAAAATAGAAAAGATTC 52649973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10981 GAACAAATTAATAAAATAGACCATTAGCTAGAGTAATAAACAAGAAAATAGAAAAGATTC 11040

 52649974 AAATAAACACAATCAGAAACGACAAGGGGGATATTACCACTGACCCCACAGAAGTACAAA 52650033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11041 AAATAAACACAATCAGAAACGACAAGGGGGATATTACCACTGACCCCACAGAAGTACAAA 11100

 52650034 CAACCATCAGAGAATATTATGAACATCTCTATGCACATAAACTAGAAAATCTAGAAGAAG 52650093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11101 CAACCATCAGAGAATATTATGAACATCTCTATGCACATAAACTAGAAAATCTAGAAGAAG 11160

 52650094 TGGATAAACTTCTGGACATATACACCCTTCTAAGACTGTACCAGGAAGAAATTGAATCCC 52650153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11161 TGGATAAACTTCTGGACATATACACCCTTCTAAGACTGTACCAGGAAGAAATTGAATCCC 11220

 52650154 TGAACAGACCAATAATGAGCCCTAAAATTGAGGAAGTAATACATAGACTACCAACCATAA 52650213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11221 TGAACAGACCAATAATGAGCCCTAAAATTGAGGAAGTAATACATAGACTACCAACCATAA 11280

 52650214 AAAAACCCAGTACTAGATGGATTCACAGGTAAGTTCTACCAGTTGTACAAAGAAGAGCTG 52650273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11281 AAAAACCCAGTACTAGATGGATTCACAGGTAAGTTCTACCAGTTGTACAAAGAAGAGCTG 11340

 52650274 GTACAGTTCCTACTGAAATTATTCCAAAAAGTTGAGTAGGAGGGAGTCCTTCCTAACTCA 52650333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11341 GTACAGTTCCTACTGAAATTATTCCAAAAAGTTGAGTAGGAGGGAGTCCTTCCTAACTCA 11400

 52650334 TTTGATGAGGCCAGCATCATCCTGATATCAAAACCTGGCAGATATACAACAAGAAAAGCT 52650393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11401 TTTGATGAGGCCAGCATCATCCTGATATCAAAACCTGGCAGATATACAACAAGAAAAGCT 11460

 52650394 TCAGGCCAATATCCTTGATGAACTTCAATGCAAAAATCCTCAATAAAATACTGGCAAACT 52650453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11461 TCAGGCCAATATCCTTGATGAACTTCAATGCAAAAATCCTCAATAAAATACTGGCAAACT 11520

 52650454 GAATCCAGCAGCACACCAAAAAGCTTATCCACCATGATCAAGTAGAATGCAAGTTGGTTC 52650513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11521 GAATCCAGCAGCACACCAAAAAGCTTATCCACCATGATCAAGTAGAATGCAAGTTGGTTC 11580

 52650514 AACATATACAAATCAATAAATGTGACTCATCACATAAACAGAACTAAAGACAAAAACTAC 52650573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11581 AACATATACAAATCAATAAATGTGACTCATCACATAAACAGAACTAAAGACAAAAACTAC 11640

 52650574 ATGATTATCTCAACAGATGCAGAAAAGGCTTTCAATAAAATTAGACATCCATTTATGTTA 52650633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11641 ATGATTATCTCAACAGATGCAGAAAAGGCTTTCAATAAAATTAGACATCCATTTATGTTA 11700

 52650634 AAAACTCTCAATAAACTAGGTATTGAAGGAACATACCTCAAAATAATAAGAGCCATGTAT 52650693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11701 AAAACTCTCAATAAACTAGGTATTGAAGGAACATACCTCAAAATAATAAGAGCCATGTAT 11760

 52650694 GACAAACCCACAGCTAAGATCATACTGAATGGGCAAAAGCTGGAAGCATTTTCTTTGAAG 52650753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11761 GACAAACCCACAGCTAAGATCATACTGAATGGGCAAAAGCTGGAAGCATTTTCTTTGAAG 11820

 52650754 ACTGGCATAAGACAAGGATGATCTCTCTCACCACTCCTATTCAACATAGTATTGGAAGTC 52650813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11821 ACTGGCATAAGACAAGGATGATCTCTCTCACCACTCCTATTCAACATAGTATTGGAAGTC 11880

 52650814 TTGGCCAGGGCAATCGGGCAAGAGAAATAAATAAAGCGCATCCAAATAGGAAGAGAGGAA 52650873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11881 TTGGCCAGGGCAATCGGGCAAGAGAAATAAATAAAGCGCATCCAAATAGGAAGAGAGGAA 11940

 52650874 GTCAAACTATCCTTGTTTGCAGATTACATGACATTATATCTAGAAAACCCCATAGTCTCA 52650933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11941 GTCAAACTATCCTTGTTTGCAGATTACATGACATTATATCTAGAAAACCCCATAGTCTCA 12000

 52650934 GCCCCAAAGCTTCTTAAGCTGATAAACAACTTCAGCAAAGTCTCAGGATACAAAATAAAT 52650993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12001 GCCCCAAAGCTTCTTAAGCTGATAAACAACTTCAGCAAAGTCTCAGGATACAAAATAAAT 12060

 52650994 GTGCAAAAATTACTGGCATTTCCATGCACCAACAACAGTCAAGCCAGGAGCCAAACCAGG 52651053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12061 GTGCAAAAATTACTGGCATTTCCATGCACCAACAACAGTCAAGCCAGGAGCCAAACCAGG 12120

 52651054 AATGCACTCCCACTCACAATCGCCACAAAAAGAGTAAAATACCTAGGAAAACAGCTAATT 52651113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12121 AATGCACTCCCACTCACAATCGCCACAAAAAGAGTAAAATACCTAGGAAAACAGCTAATT 12180

 52651114 AGGGAGGTGAAAGATCTCTACAAGGAGAATAATGAACCAGCGCTCAAAGAAATTAGAGAT 52651173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12181 AGGGAGGTGAAAGATCTCTACAAGGAGAATAATGAACCAGCGCTCAAAGAAATTAGAGAT 12240

 52651174 GACACAAACAAATGGAAAAACATTCCATGTTCATTGATAGGAAGAATCAATATCATTAAA 52651233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12241 GACACAAACAAATGGAAAAACATTCCATGTTCATTGATAGGAAGAATCAATATCATTAAA 12300

 52651234 ATGGCCATATTGCCCAGAGCAATTTATAGATTCAATGCTATACCTATTAAACTACTGTTG 52651293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12301 ATGGCCATATTGCCCAGAGCAATTTATAGATTCAATGCTATACCTATTAAACTACTGTTG 12360

 52651294 AGATTCTTCACAGAACCAGAGAAAACTATTTTAAAATTCATATAGAACCCAGAAAAGAGC 52651353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12361 AGATTCTTCACAGAACCAGAGAAAACTATTTTAAAATTCATATAGAACCCAGAAAAGAGC 12420

 52651354 CTGAATTGCTAAGGCAATCCTAAGCAAAAAGCATAAAGCTGAAGGCATCATGCTACCTGA 52651413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12421 CTGAATTGCTAAGGCAATCCTAAGCAAAAAGCATAAAGCTGAAGGCATCATGCTACCTGA 12480

 52651414 CTTCAAACTATACTACAAGGCTACAGTAACCAAAACAG 52651451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12481 CTTCAAACTATACTACAAGGCTACAGTAACCAAAACAG 12518

Alignment time is 11.4935 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [52637064,52668002] =>     30939 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,   10105] =>     10105 nucs 'mol-32-322a-277877_10105'

Score:       10080
Aligned:     10102        nucs
Identic:     10100 (100%) nucs =>      7790 (100%)      2310 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [52642113,52649903] EXCISED REGION [52649904,52652214]
 second seq =>  [       1,    7791] EXCISED REGION [    7795,   10105]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         3 nucs [7792,7794]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        10 nucs [7792,7801] to [7795,7804]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [7792,7792] to [7794,7794]

 52642113 ATCTTTCTCCCAATTCACAGCTCTGTGGGCTTGTGGCTGGAATTCCAATCCAGCAGGGAG 52642172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATCTTTCTCCCAATTCACAGCTCTGTGGGCTTGTGGCTGGAATTCCAATCCAGCAGGGAG 60

 52642173 CAAGCCATAAAAATGGGGGGAAGGGCTGCTGGAGGGAGGCAGTAGATGCGGCTGAGCCCA 52642232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAAGCCATAAAAATGGGGGGAAGGGCTGCTGGAGGGAGGCAGTAGATGCGGCTGAGCCCA 120

 52642233 AGGCATAATTCACCCTAAGAATTCTGAATCAATACACTGACATCCAGCCATGTACAATGT 52642292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGGCATAATTCACCCTAAGAATTCTGAATCAATACACTGACATCCAGCCATGTACAATGT 180

 52642293 GGTACTCCCACCAAGAAAGCCACTGATTGAGAAGTTTTATTCATGTTACTTTCTGAGGGT 52642352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGTACTCCCACCAAGAAAGCCACTGATTGAGAAGTTTTATTCATGTTACTTTCTGAGGGT 240

 52642353 TGGATTGTCCCATTACATTTATAGAACAATTGCTTTTTTCCCCCTAAATACAGAACTATG 52642412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGGATTGTCCCATTACATTTATAGAACAATTGCTTTTTTCCCCCTAAATACAGAACTATG 300

 52642413 CAGCCGGGAGTCAGAAAAGAAACCTTGACAATCAGAAGGCTGTTTTGTTGTTGTTGTTAA 52642472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CAGCCGGGAGTCAGAAAAGAAACCTTGACAATCAGAAGGCTGTTTTGTTGTTGTTGTTAA 360

 52642473 AAACCTTTGCAGGCATATGCATCTGAATATCCATAAGTTCACAGGCTGAGGGAGAAATGG 52642532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAACCTTTGCAGGCATATGCATCTGAATATCCATAAGTTCACAGGCTGAGGGAGAAATGG 420

 52642533 CTATTTCATAACTTTTCTGTGTTTCTCATGTACATAGTACAAAGTGGGCACTCAGTATTT 52642592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTATTTCATAACTTTTCTGTGTTTCTCATGTACATAGTACAAAGTGGGCACTCAGTATTT 480

 52642593 CAAATTTCAATATCACTGAAAAAAATGGAAATTTGTCATGTAACAAAATCAGATGCAGAC 52642652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CAAATTTCAATATCACTGAAAAAAATGGAAATTTGTCATGTAACAAAATCAGATGCAGAC 540

 52642653 TTCACTGGTGAATCTGAGGGAGTGAATTCACTTATTCAGAAAGGAAGACAGTTACAATTC 52642712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTCACTGGTGAATCTGAGGGAGTGAATTCACTTATTCAGAAAGGAAGACAGTTACAATTC 600

 52642713 TTGGGTCTTCTGAGAGATCATTATAACTTGAAAATATTACACAAGGGCTTTGCTATATTA 52642772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTGGGTCTTCTGAGAGATCATTATAACTTGAAAATATTACACAAGGGCTTTGCTATATTA 660

 52642773 GATACCTGCCATGTTCCTAACACAAGCTCCCATTTTCTGACTCAAATCTCATTTTGGAAC 52642832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GATACCTGCCATGTTCCTAACACAAGCTCCCATTTTCTGACTCAAATCTCATTTTGGAAC 720

 52642833 ACATTCCACTCAAATTGAGGTTCTACCCCTAAGAGTTCTTTTTCAATAAAGAAAGCTGAG 52642892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ACATTCCACTCAAATTGAGGTTCTACCCCTAAGAGTTCTTTTTCAATAAAGAAAGCTGAG 780

 52642893 TTAATAAATCACAACTCCAAAACTTTTCCTCACTTTTCTTAGACTAGAAATAGATTGAGT 52642952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTAATAAATCACAACTCCAAAACTTTTCCTCACTTTTCTTAGACTAGAAATAGATTGAGT 840

 52642953 GTGTCGAGGTTTTATGGCTGAGTACATTGGAGGGCTGGCTATTCTATGCTGAACTGGTTT 52643012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GTGTCGAGGTTTTATGGCTGAGTACATTGGAGGGCTGGCTATTCTATGCTGAACTGGTTT 900

 52643013 ACTTGATTAAGATGGGGATTTGGATGAGTCACCGGACACCTGTCCAAAGATGAGTAAAAC 52643072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ACTTGATTAAGATGGGGATTTGGATGAGTCACCGGACACCTGTCCAAAGATGAGTAAAAC 960

 52643073 ACATTCCTTCATTGTCTTCCCATAAATAACTCAATCTTCTCCTAACTGAGCCAATGGATA 52643132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ACATTCCTTCATTGTCTTCCCATAAATAACTCAATCTTCTCCTAACTGAGCCAATGGATA 1020

 52643133 GGCTTTGGATGCCCAAGCAAAACAAACACATGACTGTTAAAAAATCACAACCTCAAAATG 52643192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GGCTTTGGATGCCCAAGCAAAACAAACACATGACTGTTAAAAAATCACAACCTCAAAATG 1080

 52643193 GCCTTAGAAGCCTATGACCAATAATGAGAATGGTTTCTCCACTCAGGCGCAAGTAGTAAA 52643252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     1081 GCCTTAGAAGCCTATGACCAATAATGAGAATGGTTTCTCCACTCAGGCGCGAGTAGTAAA 1140

 52643253 CAGTTTCTCCCATATGCAGGAATATTGACGACTAGTTTACCGCCTCTGGGCACGTAACTT 52643312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CAGTTTCTCCCATATGCAGGAATATTGACGACTAGTTTACCGCCTCTGGGCACGTAACTT 1200

 52643313 TCAGGTCCTGGTTCATGCATTTGCTGGAATGTTCCCTGGGCCATGGAGCCCAGTTCTCCT 52643372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TCAGGTCCTGGTTCATGCATTTGCTGGAATGTTCCCTGGGCCATGGAGCCCAGTTCTCCT 1260

 52643373 GGCATCTGGCATCTCCCCCACACTCTGCTCCCCCAGCACAGCACTTGGCATCTTGCATTG 52643432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GGCATCTGGCATCTCCCCCACACTCTGCTCCCCCAGCACAGCACTTGGCATCTTGCATTG 1320

 52643433 CAATTGCAGGTTTATTTATTCACTTCTCTCACTGGACAGCAAACTCCACCAGGGCCGAGA 52643492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CAATTGCAGGTTTATTTATTCACTTCTCTCACTGGACAGCAAACTCCACCAGGGCCGAGA 1380

 52643493 CTCTGTGTCTCGCCCTTCACTGTGGTCCCTGTGCCTCACCTGTTCCTAGTACAGTGTCAC 52643552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CTCTGTGTCTCGCCCTTCACTGTGGTCCCTGTGCCTCACCTGTTCCTAGTACAGTGTCAC 1440

 52643553 ACTCAGTAAAGAGCAGATGCCTGGTGCATTTGGAGACTTATTTTAAATTATACGGAAAGT 52643612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ACTCAGTAAAGAGCAGATGCCTGGTGCATTTGGAGACTTATTTTAAATTATACGGAAAGT 1500

 52643613 TATTCAACCGGCTTCTTGAACTGGTGAATTTTGGAAAGTGGGTGTTTGAAGGGAAAATGT 52643672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TATTCAACCGGCTTCTTGAACTGGTGAATTTTGGAAAGTGGGTGTTTGAAGGGAAAATGT 1560

 52643673 TTAAACTCTGAAAGAAATGTTGGAAATAAGCTCTTTGAATCAAAATGTATAGAAAACACA 52643732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTAAACTCTGAAAGAAATGTTGGAAATAAGCTCTTTGAATCAAAATGTATAGAAAACACA 1620

 52643733 AGAATGCTGACAGTAAGAGCCTAAAACACATGATGACTATTATCTTTTCCCAATTTTAAC 52643792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AGAATGCTGACAGTAAGAGCCTAAAACACATGATGACTATTATCTTTTCCCAATTTTAAC 1680

 52643793 TCTCCAGAGTGTTCAGCGGTGCCCAGCCTTCATAATGTAATTCTTCGTAGCACCCTGGAT 52643852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TCTCCAGAGTGTTCAGCGGTGCCCAGCCTTCATAATGTAATTCTTCGTAGCACCCTGGAT 1740

 52643853 GCATTAAAACCATAGATTAACGTGATACTTATTTTCATTAAGGAAAATAATTTACGTACA 52643912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GCATTAAAACCATAGATTAACGTGATACTTATTTTCATTAAGGAAAATAATTTACGTACA 1800

 52643913 GTGCTCAGAGTAGAGCCTGGCACATTGAACATTTTCAATAAATGACAGCAAGTGTAATTA 52643972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GTGCTCAGAGTAGAGCCTGGCACATTGAACATTTTCAATAAATGACAGCAAGTGTAATTA 1860

 52643973 TTAGCACTTCGGAAGTGCAAAGTTGCATTGTATTAAGACAAATATATTTGGAGCTCATCC 52644032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTAGCACTTCGGAAGTGCAAAGTTGCATTGTATTAAGACAAATATATTTGGAGCTCATCC 1920

 52644033 AATTTTTTCCTGGCTCTGAAGTCTGCTAGTGGCACTTAACTTTATTCCCAAGTTTTGAAA 52644092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AATTTTTTCCTGGCTCTGAAGTCTGCTAGTGGCACTTAACTTTATTCCCAAGTTTTGAAA 1980

 52644093 AATATTGTTATTTAAAAAGTCTGTTAACCAAGGAAATGCATGCCCTAAACCTATAATGTA 52644152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AATATTGTTATTTAAAAAGTCTGTTAACCAAGGAAATGCATGCCCTAAACCTATAATGTA 2040

 52644153 TCAAGTTTTACTTCCTTCTTCTTTTAAGGAGTTCTTTTCCTGCCTTGAATACAAACAGGC 52644212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TCAAGTTTTACTTCCTTCTTCTTTTAAGGAGTTCTTTTCCTGCCTTGAATACAAACAGGC 2100

 52644213 TCTCTCAAGGTTAAAAGCAAATGCTCTTTTTAGTGTCAAAAAGAGCTTGCCTTTCTTCGC 52644272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TCTCTCAAGGTTAAAAGCAAATGCTCTTTTTAGTGTCAAAAAGAGCTTGCCTTTCTTCGC 2160

 52644273 TCAGGAAAAAAAGCAACTGATTCCAGGATACCTTCTTTGAAAACCAACACAAAAAAACCC 52644332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TCAGGAAAAAAAGCAACTGATTCCAGGATACCTTCTTTGAAAACCAACACAAAAAAACCC 2220

 52644333 CCCAAAAAACAAAAAAAAAACCCAAAACCCCTAGTTTTTACAAAGGTTTATTACTCCTAC 52644392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CCCAAAAAACAAAAAAAAAACCCAAAACCCCTAGTTTTTACAAAGGTTTATTACTCCTAC 2280

 52644393 TTGTTGGAAAAGAATTACTACATAAAAGAGTCTGCCCAGAGCTGTAAAATCTCCTTATTC 52644452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TTGTTGGAAAAGAATTACTACATAAAAGAGTCTGCCCAGAGCTGTAAAATCTCCTTATTC 2340

 52644453 AAACACACACCTTAGAGCAAAAGATGGTTAAATATCAATTCAGGCTATTAACAGTAAGGG 52644512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AAACACACACCTTAGAGCAAAAGATGGTTAAATATCAATTCAGGCTATTAACAGTAAGGG 2400

 52644513 ACGAAATGTGTTCCAACAAAACTCTGCATGTCAACAAACTACAGAGACTAGGTAACATCT 52644572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ACGAAATGTGTTCCAACAAAACTCTGCATGTCAACAAACTACAGAGACTAGGTAACATCT 2460

 52644573 TTTAGGAATCATTTTTATTCCACTAATGCCTTTTCCTCCAGAATCCACTGATCGTAAACG 52644632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TTTAGGAATCATTTTTATTCCACTAATGCCTTTTCCTCCAGAATCCACTGATCGTAAACG 2520

 52644633 CAACCTGTCTACTTCCGCCTTTGAAAAATGGATGGACAAATTCATCTGCATGTAACTCAC 52644692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CAACCTGTCTACTTCCGCCTTTGAAAAATGGATGGACAAATTCATCTGCATGTAACTCAC 2580

 52644693 CTCCTCTTTTCTTTTACATAAAACAGATGCCACAGCTGTTATTGTTCTTCACACAGAAGT 52644752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CTCCTCTTTTCTTTTACATAAAACAGATGCCACAGCTGTTATTGTTCTTCACACAGAAGT 2640

 52644753 TTCTACCCAGAGAAACATCAGGATGACACTCTGCTGCAATGTGCTATTTGTTCTAGAGGG 52644812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TTCTACCCAGAGAAACATCAGGATGACACTCTGCTGCAATGTGCTATTTGTTCTAGAGGG 2700

 52644813 GTCAACAGCTTGCCACCTTGCCTAGGCCCAGGGTGACTGCATATGTGCAGTGGTCTTATC 52644872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GTCAACAGCTTGCCACCTTGCCTAGGCCCAGGGTGACTGCATATGTGCAGTGGTCTTATC 2760

 52644873 CCATTAGCGCCCCCGAGCATGCATTCAGAACCAAGTGGATACACCTTGGCACACTTACCT 52644932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CCATTAGCGCCCCCGAGCATGCATTCAGAACCAAGTGGATACACCTTGGCACACTTACCT 2820

 52644933 TCCCTGCAGGGACATCATCGGACTGCCCTGATAAGCCAGGAACCTCATCCACCTTGTCTT 52644992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TCCCTGCAGGGACATCATCGGACTGCCCTGATAAGCCAGGAACCTCATCCACCTTGTCTT 2880

 52644993 GATGCTCTGCCCTCTTGGCTTCCTGTTGGCTGTCACCTGGCACCTTTTCCTGTCCCTTGT 52645052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 GATGCTCTGCCCTCTTGGCTTCCTGTTGGCTGTCACCTGGCACCTTTTCCTGTCCCTTGT 2940

 52645053 CCAGCTTGAAGAATTTGTCAAAAAAGCTGGAGTCCTTGGGCTTGGAGGGAGCTTCTCCTC 52645112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CCAGCTTGAAGAATTTGTCAAAAAAGCTGGAGTCCTTGGGCTTGGAGGGAGCTTCTCCTC 3000

 52645113 CTGCTCCCCCTGTCTCAGGTGGGAGAAGCGTGGGATCCCTGGCGGCAGAGAGGACCTTGT 52645172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CTGCTCCCCCTGTCTCAGGTGGGAGAAGCGTGGGATCCCTGGCGGCAGAGAGGACCTTGT 3060

 52645173 CTTGGGCCGGGGCGTGCCCTGGGGTTTTATCTGTGTCCTGCCCCGGTCCAGCTGCCACCG 52645232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 CTTGGGCCGGGGCGTGCCCTGGGGTTTTATCTGTGTCCTGCCCCGGTCCAGCTGCCACCG 3120

 52645233 GAAGTGTCCAGCTCTCACTTGGGTCTTTGTTCGCTGGAGCTTTATTGGAGCTGACATCAA 52645292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 GAAGTGTCCAGCTCTCACTTGGGTCTTTGTTCGCTGGAGCTTTATTGGAGCTGACATCAA 3180

 52645293 GCTTCACTGATCCAAGGGATGAATCTGCGGCTTGGTCTCCGGTACGTCCTGGTACAGGCC 52645352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 GCTTCACTGATCCAAGGGATGAATCTGCGGCTTGGTCTCCGGTACGTCCTGGTACAGGCC 3240

 52645353 GAGAGAGCATCAAGAAAAAACGAGATTTAGCAGCTGGTGCCTCGGGTTTGGCCTCTTTCC 52645412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 GAGAGAGCATCAAGAAAAAACGAGATTTAGCAGCTGGTGCCTCGGGTTTGGCCTCTTTCC 3300

 52645413 CAAGATTCTTTCCGTTGGCATCCGCAACAGCACTTATCTCCGTTGTCTCGGGGGAAGAAG 52645472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 CAAGATTCTTTCCGTTGGCATCCGCAACAGCACTTATCTCCGTTGTCTCGGGGGAAGAAG 3360

 52645473 TGGCCACATTATCCGTCTTGACACTTATTCCCAAGTCGACTGTAAACACAAACATAAACA 52645532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TGGCCACATTATCCGTCTTGACACTTATTCCCAAGTCGACTGTAAACACAAACATAAACA 3420

 52645533 GTGGTTATTCAGCCAAGCCGGGAAATTCAGGCACTAATAATGGACTCCAGACATTTTTTA 52645592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 GTGGTTATTCAGCCAAGCCGGGAAATTCAGGCACTAATAATGGACTCCAGACATTTTTTA 3480

 52645593 TACAAAAGCCATACTGCATACTGGAACTGTGTTGTTCTCTGGTCATTCTGAAAGGCAGAA 52645652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TACAAAAGCCATACTGCATACTGGAACTGTGTTGTTCTCTGGTCATTCTGAAAGGCAGAA 3540

 52645653 GTTAGCTCTCTACATCTCCTTGGACCCTGCTTTTCTTGGGAGAGGAGAAGGCAAGGTTGG 52645712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 GTTAGCTCTCTACATCTCCTTGGACCCTGCTTTTCTTGGGAGAGGAGAAGGCAAGGTTGG 3600

 52645713 TGAGGAGGGAAAGCTACTTAATGGAAAGTCACTAGCTGCCAGGTGTGGAATGAGTGATAT 52645772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 TGAGGAGGGAAAGCTACTTAATGGAAAGTCACTAGCTGCCAGGTGTGGAATGAGTGATAT 3660

 52645773 TCAATGTTAATTAATCTTCTTTTATCTGTGTAAGAACTCCGTGAGCAGCATATTGTCATG 52645832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 TCAATGTTAATTAATCTTCTTTTATCTGTGTAAGAACTCCGTGAGCAGCATATTGTCATG 3720

 52645833 ATGTCAACTGGGAGGCAGTACAGCAGTTAGGAGCTTGGGTTCTGGAGCTAGAACAAGGTT 52645892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 ATGTCAACTGGGAGGCAGTACAGCAGTTAGGAGCTTGGGTTCTGGAGCTAGAACAAGGTT 3780

 52645893 TCTCAACCTCAGCACTACTCACATTTGAAGCCAGATTATTCTTTGTTAGGGAGGCTCATC 52645952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 TCTCAACCTCAGCACTACTCACATTTGAAGCCAGATTATTCTTTGTTAGGGAGGCTCATC 3840

 52645953 CCGTGCCTCATAGGCTGATTAGCAGCATCCTGGCCTCTGCCCACTAGACGCCGGTCACAT 52646012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 CCGTGCCTCATAGGCTGATTAGCAGCATCCTGGCCTCTGCCCACTAGACGCCGGTCACAT 3900

 52646013 TTCCCAGTCATGGCAACCAAAAATATCTCTAGGCATTGCTAAATGTCCCCTGGAGGACAA 52646072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 TTCCCAGTCATGGCAACCAAAAATATCTCTAGGCATTGCTAAATGTCCCCTGGAGGACAA 3960

 52646073 AATCTCTTACGTTTGAGAGGCACTGAGCTGAAATGTCTTTTTGAATCCAGATTATCTAAT 52646132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 AATCTCTTACGTTTGAGAGGCACTGAGCTGAAATGTCTTTTTGAATCCAGATTATCTAAT 4020

 52646133 TTTCTGTGCCTCAACTTTCTGGTAAAAGGAGACAGATAATAAATCTCGTAATTTTGTTAG 52646192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 TTTCTGTGCCTCAACTTTCTGGTAAAAGGAGACAGATAATAAATCTCGTAATTTTGTTAG 4080

 52646193 GAAGATTACATGAGTTAATAGTTTTAAAGCAAGTACAATAGCACCTGGAATATATTAAGT 52646252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 GAAGATTACATGAGTTAATAGTTTTAAAGCAAGTACAATAGCACCTGGAATATATTAAGT 4140

 52646253 GCTTAATAAATATCACAAACATTAGTTATCATTATTCATGAGTGAGAAAACTGACAGTCA 52646312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 GCTTAATAAATATCACAAACATTAGTTATCATTATTCATGAGTGAGAAAACTGACAGTCA 4200

 52646313 GAGAGGTCAGTACACCCTCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCTAGTAAGCAGCAGAGTCTGGCT 52646372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 GAGAGGTCAGTACACCCTCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCTAGTAAGCAGCAGAGTCTGGCT 4260

 52646373 TCAGGCAGAAATCTGACTTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGTCTTACCAGGGACTTGTATTA 52646432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 TCAGGCAGAAATCTGACTTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGTCTTACCAGGGACTTGTATTA 4320

 52646433 GCATAGACTGTTAAGAATATGGGAAGATTTTTAAAATACAGTACTCAGAAAATTTCTCTT 52646492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 GCATAGACTGTTAAGAATATGGGAAGATTTTTAAAATACAGTACTCAGAAAATTTCTCTT 4380

 52646493 TGAAAGGCTGGAAGAGCAGATATCCACACAAGAAGGCAAATTAGACCTCAGGCCAGTGTG 52646552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 TGAAAGGCTGGAAGAGCAGATATCCACACAAGAAGGCAAATTAGACCTCAGGCCAGTGTG 4440

 52646553 GAATTAAAGGTGTAGGGTTATCTGGTCAAGACTGTGTGTGTGGATACAGGCTCCAACCCC 52646612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 GAATTAAAGGTGTAGGGTTATCTGGTCAAGACTGTGTGTGTGGATACAGGCTCCAACCCC 4500

 52646613 TCCAGGCAAGGGCACTGTTTCCAACATCCACCCTTTCTCCTTTGACCTCTACCTTGACCT 52646672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 TCCAGGCAAGGGCACTGTTTCCAACATCCACCCTTTCTCCTTTGACCTCTACCTTGACCT 4560

 52646673 AAATTAACTATAAAAGGTCCTTCTTTTCTAGGACCCTACTATAAATCAGTGAAATATTCA 52646732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 AAATTAACTATAAAAGGTCCTTCTTTTCTAGGACCCTACTATAAATCAGTGAAATATTCA 4620

 52646733 GGAAAAAAAGAACACCAAGAATGTTGGGATCCCAGTTAAAGATCAAGATTCTCTACTGAT 52646792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 GGAAAAAAAGAACACCAAGAATGTTGGGATCCCAGTTAAAGATCAAGATTCTCTACTGAT 4680

 52646793 AAGCTGTGTGATATGGAGTAAATCACTAAAGATCTTTGAATCTCTTCATTTGTAAAATGG 52646852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 AAGCTGTGTGATATGGAGTAAATCACTAAAGATCTTTGAATCTCTTCATTTGTAAAATGG 4740

 52646853 GAATATTGGTAGTCCTACTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTAAAGAAGAAAAGTCATGCAAA 52646912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 GAATATTGGTAGTCCTACTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTAAAGAAGAAAAGTCATGCAAA 4800

 52646913 GGATCTGGCACAACGCCTTTTCCATAATAAGTGCTTAGTAATTGACAGATACTGTGATAA 52646972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 GGATCTGGCACAACGCCTTTTCCATAATAAGTGCTTAGTAATTGACAGATACTGTGATAA 4860

 52646973 CTTTTCAGGTTTCTCTCATGCCTTTGACAACATTGCATTTTGCTTGCTCTATCTGTAGTC 52647032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 CTTTTCAGGTTTCTCTCATGCCTTTGACAACATTGCATTTTGCTTGCTCTATCTGTAGTC 4920

 52647033 AGACACTTCTTAATATCTGTTTGCAGGAAGACAGAAAAATAAAGGGAAGAATTGAGATTT 52647092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 AGACACTTCTTAATATCTGTTTGCAGGAAGACAGAAAAATAAAGGGAAGAATTGAGATTT 4980

 52647093 CTTTGATCTATTCATACTGCTCATTAATATGTAGTGAGAAATACATACACACACACATAC 52647152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 CTTTGATCTATTCATACTGCTCATTAATATGTAGTGAGAAATACATACACACACACATAC 5040

 52647153 ACACACATGCATCCATTAGCAATTGTTTTTGCCCAACTCTAGTGTCTCGCAGTGTCTAGA 52647212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 ACACACATGCATCCATTAGCAATTGTTTTTGCCCAACTCTAGTGTCTCGCAGTGTCTAGA 5100

 52647213 CTAAACAACAAACAAAAAAGGGGGGAGAGTGAGCTGGATTAAGCATTGAGGCACAGTGAA 52647272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 CTAAACAACAAACAAAAAAGGGGGGAGAGTGAGCTGGATTAAGCATTGAGGCACAGTGAA 5160

 52647273 GAAATGGTCTGGGGCAAGCCCAGGGATGAATGTTAGGGGTTTCTCATAAACCTGAACCTG 52647332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 GAAATGGTCTGGGGCAAGCCCAGGGATGAATGTTAGGGGTTTCTCATAAACCTGAACCTG 5220

 52647333 AAGAAAATCACCCTGCCAGCATATTGATCTTCTAGCTCTTCTTAACCTTTTTTTCTGTGA 52647392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 AAGAAAATCACCCTGCCAGCATATTGATCTTCTAGCTCTTCTTAACCTTTTTTTCTGTGA 5280

 52647393 TTCAGGAATTCATAATGATAGAAAATATTATACTAAAGAAGAAAAAAAGAGGGAGAATAA 52647452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 TTCAGGAATTCATAATGATAGAAAATATTATACTAAAGAAGAAAAAAAGAGGGAGAATAA 5340

 52647453 GTAAGTGATAGATGGATGCATCAGGGTGTAAAGTTAGCAAGTAAGGCTGTTGAAGTGTCA 52647512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 GTAAGTGATAGATGGATGCATCAGGGTGTAAAGTTAGCAAGTAAGGCTGTTGAAGTGTCA 5400

 52647513 GAGTGAATATAAATGAATTGTGGGAATGGTCCATGCCAGGAGAAGAGGGTATGGTTGACA 52647572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 GAGTGAATATAAATGAATTGTGGGAATGGTCCATGCCAGGAGAAGAGGGTATGGTTGACA 5460

 52647573 AAAAGGGAAATGCTAAGATTCAAAACAGGGAAGGGCTTTTCAAAATGCCAAGAGCACCAA 52647632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 AAAAGGGAAATGCTAAGATTCAAAACAGGGAAGGGCTTTTCAAAATGCCAAGAGCACCAA 5520

 52647633 CTTATATCTTTCAGTTTAATTCCTCTCTTCCTTACCCACTGGCTGGAAAGCAAAGGAGCT 52647692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 CTTATATCTTTCAGTTTAATTCCTCTCTTCCTTACCCACTGGCTGGAAAGCAAAGGAGCT 5580

 52647693 AGTGGTAAGTAAGAGTGTTATAGCCAGAGAAAAAGTCTTCAAAAAACACAAAGTACTTTC 52647752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 AGTGGTAAGTAAGAGTGTTATAGCCAGAGAAAAAGTCTTCAAAAAACACAAAGTACTTTC 5640

 52647753 CATGGACAACCTTTTTTATTTTAAAGTGCCAATATGTTGCTTTGAAAAAGAATAAATTCC 52647812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 CATGGACAACCTTTTTTATTTTAAAGTGCCAATATGTTGCTTTGAAAAAGAATAAATTCC 5700

 52647813 TTACATCCAGGTATCTGGACTAGACTTCAGTGCATTTAGTGATTATAGCAAATCCAAACA 52647872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5701 TTACATCCAGGTATCTGGACTAGACTTCAGTGCATTTAGTGATTATAGCAAATCCAAACA 5760

 52647873 GTAGCTTTTGATATCAGAGAATGGGTAAAGTGTTTTTGACAATTTCTAAGAACTTAGAGT 52647932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5761 GTAGCTTTTGATATCAGAGAATGGGTAAAGTGTTTTTGACAATTTCTAAGAACTTAGAGT 5820

 52647933 TCTTCGGTGATACGTTCCATGCAACTGAAGCTCTGCTCTCCAAATTTAGGTGGGTACATA 52647992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5821 TCTTCGGTGATACGTTCCATGCAACTGAAGCTCTGCTCTCCAAATTTAGGTGGGTACATA 5880

 52647993 CCCAAGTCCATCACCTGGGGCTTCTATTTCCTTTGCTCAGATGCTCACCTCCTAGGTGGG 52648052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5881 CCCAAGTCCATCACCTGGGGCTTCTATTTCCTTTGCTCAGATGCTCACCTCCTAGGTGGG 5940

 52648053 CACCTGACATAAGATAGACTAATAAAAATAAGTCCTGTAACTTTTGATACTCCTATTAAA 52648112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5941 CACCTGACATAAGATAGACTAATAAAAATAAGTCCTGTAACTTTTGATACTCCTATTAAA 6000

 52648113 AAAGAGTTGCAAACCAATAGGAGGTACACTTGAGAATCAGCACAAATGAAAGTAGAACCT 52648172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6001 AAAGAGTTGCAAACCAATAGGAGGTACACTTGAGAATCAGCACAAATGAAAGTAGAACCT 6060

 52648173 GGAAATCCAGGAAGCAGATACCCAATCATGTCATTTAAACATTTAGATCCAGCTGTGCCT 52648232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6061 GGAAATCCAGGAAGCAGATACCCAATCATGTCATTTAAACATTTAGATCCAGCTGTGCCT 6120

 52648233 GAAGCTGAACTTTAGCATTACATAAGCCAATAAATCACTCTTCCCCAACTTACGCCAGTT 52648292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6121 GAAGCTGAACTTTAGCATTACATAAGCCAATAAATCACTCTTCCCCAACTTACGCCAGTT 6180

 52648293 GAAATTGAATACATACTCAGTGACTTTGAGAGAATTCCAGGGAATTGGTCAGTCCCTGTT 52648352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6181 GAAATTGAATACATACTCAGTGACTTTGAGAGAATTCCAGGGAATTGGTCAGTCCCTGTT 6240

 52648353 TCACTTGTAAATACACAGCAATCAAGCCTACCAAATCTATGATTGATTGGGGTGTCTGAA 52648412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6241 TCACTTGTAAATACACAGCAATCAAGCCTACCAAATCTATGATTGATTGGGGTGTCTGAA 6300

 52648413 AGAGATGGAGGGAATGGAATCAACCTGAAAAACATATTTCAGGAGTTCATCCCTGAAAAC 52648472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6301 AGAGATGGAGGGAATGGAATCAACCTGAAAAACATATTTCAGGAGTTCATCCCTGAAAAC 6360

 52648473 TTCCCCAACCTAGCTAGAGGGGCCAACATTCAAATTCAGGAAATGCAGAGAACCCCAGTA 52648532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6361 TTCCCCAACCTAGCTAGAGGGGCCAACATTCAAATTCAGGAAATGCAGAGAACCCCAGTA 6420

 52648533 AGATACTCCACAAAAAGATCTTCCCCAAGACATCATCATCAGATTCTCCAAAGTTGAAAT 52648592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6421 AGATACTCCACAAAAAGATCTTCCCCAAGACATCATCATCAGATTCTCCAAAGTTGAAAT 6480

 52648593 GTAAGAAAAAATGCTAAAGGCAACTAGAGTGAAAGGCCCGGTCACCTAAAAAGGGAAGCA 52648652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6481 GTAAGAAAAAATGCTAAAGGCAACTAGAGTGAAAGGCCCGGTCACCTAAAAAGGGAAGCA 6540

 52648653 CAGACTTACAGTGGACCTCTCACTGGTAACCCTACAAGCCAGAAGAGATTGAGGACCAAT 52648712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6541 CAGACTTACAGTGGACCTCTCACTGGTAACCCTACAAGCCAGAAGAGATTGAGGACCAAT 6600

 52648713 ATTCAACATTCTTAAACAAAAAGAATTCCAACCCAGAATTTTATATCTGACTAAACTAAG 52648772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6601 ATTCAACATTCTTAAACAAAAAGAATTCCAACCCAGAATTTTATATCTGACTAAACTAAG 6660

 52648773 CTTCATAAGCAAAAGAGAAATAAGATCATTTTCAGACAAGCAAATGCTAAGGGAATTTGT 52648832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6661 CTTCATAAGCAAAAGAGAAATAAGATCATTTTCAGACAAGCAAATGCTAAGGGAATTTGT 6720

 52648833 GACCATTAGACCTTCCTTGCAACAGTTCCTAAAGGAAGCACTAAATATGGAAAGACCATT 52648892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6721 GACCATTAGACCTTCCTTGCAACAGTTCCTAAAGGAAGCACTAAATATGGAAAGACCATT 6780

 52648893 ACCAGACACTACAAAACACACTGAAGTACACAGACCAGTGACATTGTAAAGCAACTACAT 52648952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6781 ACCAGACACTACAAAACACACTGAAGTACACAGACCAGTGACATTGTAAAGCAACTACAT 6840

 52648953 AACAAGTCTGCAAAATAACCAGCCAACATCATGATGACGGTATCAAATCGACACATAGCA 52649012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6841 AACAAGTCTGCAAAATAACCAGCCAACATCATGATGACGGTATCAAATCGACACATAGCA 6900

 52649013 ACACTAACCTTAAATGTAAATGGACTAAATGATCCCATTAAAAGACATAAAGTGGCAGGC 52649072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6901 ACACTAACCTTAAATGTAAATGGACTAAATGATCCCATTAAAAGACATAAAGTGGCAGGC 6960

 52649073 TGGATAAAGAACCAAGAACCATTGGTATACTGTCTTCAAGAGACCCATCTCCTATGCAGT 52649132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6961 TGGATAAAGAACCAAGAACCATTGGTATACTGTCTTCAAGAGACCCATCTCCTATGCAGT 7020

 52649133 GACACACATAGGTTCAAGATAAAGGGATGGGGAAAAATCTACCAAGCAAATAGAAAACAG 52649192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7021 GACACACATAGGTTCAAGATAAAGGGATGGGGAAAAATCTACCAAGCAAATAGAAAACAG 7080

 52649193 AATAAAACAGGGGTTGCAATCCTAGTTGCCGTCAAAACAGACTTTAAACCAACAAAGGTT 52649252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7081 AATAAAACAGGGGTTGCAATCCTAGTTGCCGTCAAAACAGACTTTAAACCAACAAAGGTT 7140

 52649253 AAAAGAAAAAAATATGGGCATTGCATAAGGATAAAGTGTTAAATTAAACAAGAAGATCTA 52649312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7141 AAAAGAAAAAAATATGGGCATTGCATAAGGATAAAGTGTTAAATTAAACAAGAAGATCTA 7200

 52649313 ACTATCCTAAGTATATATGCACCAAACACAGGAACACCCAGATTCATAAAGCAAGTTTAT 52649372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7201 ACTATCCTAAGTATATATGCACCAAACACAGGAACACCCAGATTCATAAAGCAAGTTTAT 7260

 52649373 GGAGACCTTCAAACAGACTTAGACTCCCACACAATAGTAGTGGGAGACTTTAATACCCCA 52649432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7261 GGAGACCTTCAAACAGACTTAGACTCCCACACAATAGTAGTGGGAGACTTTAATACCCCA 7320

 52649433 TGACAATATTAGACAGATCATTGAGACAGGAAATTAACAAAGATATTCAAGATCTAACTC 52649492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7321 TGACAATATTAGACAGATCATTGAGACAGGAAATTAACAAAGATATTCAAGATCTAACTC 7380

 52649493 AGCACTAAATCAAATGGCCCTGATAGATATCTACAGGACTGTCCTACTTGAAACCATACA 52649552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7381 AGCACTAAATCAAATGGCCCTGATAGATATCTACAGGACTGTCCTACTTGAAACCATACA 7440

 52649553 ATTACATGGTAATTGAATGACCTGCTCCTGAATGACTTTTGGGTAAATAATAAAATTAAG 52649612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7441 ATTACATGGTAATTGAATGACCTGCTCCTGAATGACTTTTGGGTAAATAATAAAATTAAG 7500

 52649613 GCAGAAATCAAGAAGTTTTTTGAACTAATGAGAACAAAGATACAACATACCAGAATCTTT 52649672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7501 GCAGAAATCAAGAAGTTTTTTGAACTAATGAGAACAAAGATACAACATACCAGAATCTTT 7560

 52649673 GGGACACAGCTAAGGCAGTGTTAAGAGGGAAATTTATAGCACTAAATCCCACATCAAAAA 52649732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7561 GGGACACAGCTAAGGCAGTGTTAAGAGGGAAATTTATAGCACTAAATCCCACATCAAAAA 7620

 52649733 GTTAGAAAGAGCTCACGTTAACAATCTAACCTCACAACTACAGGAACTAGAGAACTGAGA 52649792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7621 GTTAGAAAGAGCTCACGTTAACAATCTAACCTCACAACTACAGGAACTAGAGAACTGAGA 7680

 52649793 GCAGAAAAACCTGAAAGCTAGCAGAAGACAAGAAATAACCAAAATTAGAGCTGAACTGAA 52649852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7681 GCAGAAAAACCTGAAAGCTAGCAGAAGACAAGAAATAACCAAAATTAGAGCTGAACTGAA 7740

 52649853 GGAGATTGAGACATGAAAAACCATTCAAAAGATCAGTGAATTCAGGAGCTG 52649903
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7741 GGAGATTGAGACATGAAAAACCATTCAAAAGATCAGTGAATTCAGGAGCTG 7791

EXCISED REGION

 52649904 TTTTTTTTTTGAACAAATTAATAAAATAGACCATTAGCTAGAGTAATAAACAAGAAAATA 52649963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7795 TTTTTTTTTTGAACAAATTAATAAAATAGACCATTAGCTAGAGTAATAAACAAGAAAATA 7854

 52649964 GAAAAGATTCAAATAAACACAATCAGAAACGACAAGGGGGATATTACCACTGACCCCACA 52650023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7855 GAAAAGATTCAAATAAACACAATCAGAAACGACAAGGGGGATATTACCACTGACCCCACA 7914

 52650024 GAAGTACAAACAACCATCAGAGAATATTATGAACATCTCTATGCACATAAACTAGAAAAT 52650083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7915 GAAGTACAAACAACCATCAGAGAATATTATGAACATCTCTATGCACATAAACTAGAAAAT 7974

 52650084 CTAGAAGAAGTGGATAAACTTCTGGACATATACACCCTTCTAAGACTGTACCAGGAAGAA 52650143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7975 CTAGAAGAAGTGGATAAACTTCTGGACATATACACCCTTCTAAGACTGTACCAGGAAGAA 8034

 52650144 ATTGAATCCCTGAACAGACCAATAATGAGCCCTAAAATTGAGGAAGTAATACATAGACTA 52650203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8035 ATTGAATCCCTGAACAGACCAATAATGAGCCCTAAAATTGAGGAAGTAATACATAGACTA 8094

 52650204 CCAACCATAAAAAAACCCAGTACTAGATGGATTCACAGGTAAGTTCTACCAGTTGTACAA 52650263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8095 CCAACCATAAAAAAACCCAGTACTAGATGGATTCACAGGTAAGTTCTACCAGTTGTACAA 8154

 52650264 AGAAGAGCTGGTACAGTTCCTACTGAAATTATTCCAAAAAGTTGAGTAGGAGGGAGTCCT 52650323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8155 AGAAGAGCTGGTACAGTTCCTACTGAAATTATTCCAAAAAGTTGAGTAGGAGGGAGTCCT 8214

 52650324 TCCTAACTCATTTGATGAGGCCAGCATCATCCTGATATCAAAACCTGGCAGATATACAAC 52650383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8215 TCCTAACTCATTTGATGAGGCCAGCATCATCCTGATATCAAAACCTGGCAGATATACAAC 8274

 52650384 AAGAAAAGCTTCAGGCCAATATCCTTGATGAACTTCAATGCAAAAATCCTCAATAAAATA 52650443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8275 AAGAAAAGCTTCAGGCCAATATCCTTGATGAACTTCAATGCAAAAATCCTCAATAAAATA 8334

 52650444 CTGGCAAACTGAATCCAGCAGCACACCAAAAAGCTTATCCACCATGATCAAGTAGAATGC 52650503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8335 CTGGCAAACTGAATCCAGCAGCACACCAAAAAGCTTATCCACCATGATCAAGTAGAATGC 8394

 52650504 AAGTTGGTTCAACATATACAAATCAATAAATGTGACTCATCACATAAACAGAACTAAAGA 52650563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8395 AAGTTGGTTCAACATATACAAATCAATAAATGTGACTCATCACATAAACAGAACTAAAGA 8454

 52650564 CAAAAACTACATGATTATCTCAACAGATGCAGAAAAGGCTTTCAATAAAATTAGACATCC 52650623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8455 CAAAAACTACATGATTATCTCAACAGATGCAGAAAAGGCTTTCAATAAAATTAGACATCC 8514

 52650624 ATTTATGTTAAAAACTCTCAATAAACTAGGTATTGAAGGAACATACCTCAAAATAATAAG 52650683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8515 ATTTATGTTAAAAACTCTCAATAAACTAGGTATTGAAGGAACATACCTCAAAATAATAAG 8574

 52650684 AGCCATGTATGACAAACCCACAGCTAAGATCATACTGAATGGGCAAAAGCTGGAAGCATT 52650743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8575 AGCCATGTATGACAAACCCACAGCTAAGATCATACTGAATGGGCAAAAGCTGGAAGCATT 8634

 52650744 TTCTTTGAAGACTGGCATAAGACAAGGATGATCTCTCTCACCACTCCTATTCAACATAGT 52650803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8635 TTCTTTGAAGACTGGCATAAGACAAGGATGATCTCTCTCACCACTCCTATTCAACATAGT 8694

 52650804 ATTGGAAGTCTTGGCCAGGGCAATCGGGCAAGAGAAATAAATAAAGCGCATCCAAATAGG 52650863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8695 ATTGGAAGTCTTGGCCAGGGCAATCGGGCAAGAGAAATAAATAAAGCGCATCCAAATAGG 8754

 52650864 AAGAGAGGAAGTCAAACTATCCTTGTTTGCAGATTACATGACATTATATCTAGAAAACCC 52650923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8755 AAGAGAGGAAGTCAAACTATCCTTGTTTGCAGATTACATGACATTATATCTAGAAAACCC 8814

 52650924 CATAGTCTCAGCCCCAAAGCTTCTTAAGCTGATAAACAACTTCAGCAAAGTCTCAGGATA 52650983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8815 CATAGTCTCAGCCCCAAAGCTTCTTAAGCTGATAAACAACTTCAGCAAAGTCTCAGGATA 8874

 52650984 CAAAATAAATGTGCAAAAATTACTGGCATTTCCATGCACCAACAACAGTCAAGCCAGGAG 52651043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8875 CAAAATAAATGTGCAAAAATTACTGGCATTTCCATGCACCAACAACAGTCAAGCCAGGAG 8934

 52651044 CCAAACCAGGAATGCACTCCCACTCACAATCGCCACAAAAAGAGTAAAATACCTAGGAAA 52651103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8935 CCAAACCAGGAATGCACTCCCACTCACAATCGCCACAAAAAGAGTAAAATACCTAGGAAA 8994

 52651104 ACAGCTAATTAGGGAGGTGAAAGATCTCTACAAGGAGAATAATGAACCAGCGCTCAAAGA 52651163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8995 ACAGCTAATTAGGGAGGTGAAAGATCTCTACAAGGAGAATAATGAACCAGCGCTCAAAGA 9054

 52651164 AATTAGAGATGACACAAACAAATGGAAAAACATTCCATGTTCATTGATAGGAAGAATCAA 52651223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9055 AATTAGAGATGACACAAACAAATGGAAAAACATTCCATGTTCATTGATAGGAAGAATCAA 9114

 52651224 TATCATTAAAATGGCCATATTGCCCAGAGCAATTTATAGATTCAATGCTATACCTATTAA 52651283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9115 TATCATTAAAATGGCCATATTGCCCAGAGCAATTTATAGATTCAATGCTATACCTATTAA 9174

 52651284 ACTACTGTTGAGATTCTTCACAGAACCAGAGAAAACTATTTTAAAATTCATATAGAACCC 52651343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9175 ACTACTGTTGAGATTCTTCACAGAACCAGAGAAAACTATTTTAAAATTCATATAGAACCC 9234

 52651344 AGAAAAGAGCCTGAATTGCTAAGGCAATCCTAAGCAAAAAGCATAAAGCTGAAGGCATCA 52651403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9235 AGAAAAGAGCCTGAATTGCTAAGGCAATCCTAAGCAAAAAGCATAAAGCTGAAGGCATCA 9294

 52651404 TGCTACCTGACTTCAAACTATACTACAAGGCTACAGTAACCAAAACAGCATACTACTGGT 52651463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9295 TGCTACCTGACTTCAAACTATACTACAAGGCTACAGTAACCAAAACAGCATACTACTGGT 9354

 52651464 ACAAAAACAGACACATAGACCAATGGAACAGAATAGAGAACCCGGAAATAAGACCACACA 52651523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9355 ACAAAAACAGACACATAGACCAATGGAACAGAATAGAGAACCCGGAAATAAGACCACACA 9414

 52651524 CCTACAACTATCTAATCTTTGACAAACCTGACAAAAACATGCAATGGGGAAAAGATTTCC 52651583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9415 CCTACAACTATCTAATCTTTGACAAACCTGACAAAAACATGCAATGGGGAAAAGATTTCC 9474

 52651584 TATTCAATAAAAAGTGCTGGGATAACCGGCTAGCTGTACACAGAAGATTAAAGCTGGACC 52651643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9475 TATTCAATAAAAAGTGCTGGGATAACCGGCTAGCTGTACACAGAAGATTAAAGCTGGACC 9534

 52651644 CCTTCCTTACAACATATACAAAAATCGGCCGGGCTTGGTGGCTCACGCTTGTAATCCCAG 52651703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9535 CCTTCCTTACAACATATACAAAAATCGGCCGGGCTTGGTGGCTCACGCTTGTAATCCCAG 9594

 52651704 CACTTTGGAAGGCCGAGGAGGGCGGATCATGAGGTCAGGAGATCGAGAACACGGTGAAAC 52651763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9595 CACTTTGGAAGGCCGAGGAGGGCGGATCATGAGGTCAGGAGATCGAGAACACGGTGAAAC 9654

 52651764 CCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGTGTGGTGGCAGGCGCCTGTAGTCCC 52651823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9655 CCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGTGTGGTGGCAGGCGCCTGTAGTCCC 9714

 52651824 AGCTACTTGGAGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGTGTGAACCCGGGAGACAGAGCTTGCACT 52651883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9715 AGCTACTTGGAGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGTGTGAACCCGGGAGACAGAGCTTGCACT 9774

 52651884 GAGCCGAGACCACATCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGTGAGACTCCGTCTCAAAA 52651943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9775 GAGCCGAGACCACATCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGTGAGACTCCGTCTCAAAA 9834

 52651944 AAAAAAAAAAAAAAAAGAAGACATACAGGTAGTCAACAAGCATATGAAAAAAAGCTCAAT 52652003
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9835 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAGACATACAGGTAGTCAACAAGCATATGAAAAAAAGCTCAAT 9894

 52652004 ATTACTAATCATCAGAGAAATGCAAATCAAAAACCACAATGAGATACCATCTAATACCAG 52652063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9895 ATTACTAATCATCAGAGAAATGCAAATCAAAAACCACAATGAGATACCATCTAATACCAG 9954

 52652064 TCAGAATGATATTATTAAAAAGTCAAAAAATAAGATGCTGGTGAGGTAGTGGAGAGAAAG 52652123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9955 TCAGAATGATATTATTAAAAAGTCAAAAAATAAGATGCTGGTGAGGTAGTGGAGAGAAAG 10014

 52652124 GAATGCTTATACACTGTTGGTGGGAGTGTAAATTAGTTCAACCATTGTGGAAGACAGTGT 52652183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10015 GAATGCTTATACACTGTTGGTGGGAGTGTAAATTAGTTCAACCATTGTGGAAGACAGTGT 10074

 52652184 GGCAATTCCTCAAAGACCTAAAGATAGAAAT 52652214
          |||||||||||||||||||||||||||||||
    10075 GGCAATTCCTCAAAGACCTAAAGATAGAAAT 10105

Alignment time is 10.575 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [52637064,52668002] =>     30939 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    9075] =>      9075 nucs 'mol-32-3332-016793_9075'

Score:        8753
Aligned:      9083        nucs
Identic:      9026 ( 99%) nucs =>      8006 (100%)      1020 ( 97%)
Gaps:           38 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [52639037,52647064] EXCISED REGION [52658003,52659027]
 second seq =>  [       1,    8028] EXCISED REGION [    8029,    9075]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>     10938 nucs [52647065,52658002]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         6 nucs [52647065,52647070] to [52658003,52658008]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [52647065,52647067] to [52658000,52658002]
 second seq =>         0 nucs

 52639037 AAACCCCTAGGGCAGGTAGTAGCTTCCTTTTGTGGATGAAAACACAGGTTTTTAAATGAT 52639096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAACCCCTAGGGCAGGTAGTAGCTTCCTTTTGTGGATGAAAACACAGGTTTTTAAATGAT 60

 52639097 TGAGTATAACAGGCTTAGGTGACAGATGGATCTCGATTCCACTTCTGCCACTAATTAGCT 52639156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGAGTATAACAGGCTTAGGTGACAGATGGATCTCGATTCCACTTCTGCCACTAATTAGCT 120

 52639157 TTGCGACCTTAACGCAGGTAACTTAAGTTCTCCCCAAGTTCTCTCCTCTGTTCAATGGCA 52639216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTGCGACCTTAACGCAGGTAACTTAAGTTCTCCCCAAGTTCTCTCCTCTGTTCAATGGCA 180

 52639217 ATAGAAATACCTACCTTGTTGGGTTTTTTTAACAATAAAAACAGATAATGTATGCAAAAT 52639276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATAGAAATACCTACCTTGTTGGGTTTTTTTAACAATAAAAACAGATAATGTATGCAAAAT 240

 52639277 GCTTACTGCACAGCCTAGAAATAATGAATTATTTTAAAATGGGGCTATTATTGTCATTTA 52639336
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GCTTACTACACAGCCTAGAAATAATGAATTATTTTAAAATGGGGCTATTATTGTCATTTA 300

 52639337 ACTCAACCACACAGCTATTTAGTGGTAGAGTCTGGACTCATACCTAGGTCACCCAGGCTC 52639396
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
      301 ACTCAACCACACAGCTATTTAGTGGTAGAGTCTGGACTCATACCTAGGTCACCTAGGCTC 360

 52639397 CTAACACTTCCACATCACCTCTGCCACTGCAAACATCTCATATTAAGCGTTTCTTACTGC 52639456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTAACACTTCCACATCACCTCTGCCACTGCAAACATCTCATATTAAGCGTTTCTTACTGC 420

 52639457 TAAATGCATCAAAATCCCAGTGGTATAGCTGAGGACCTTGTTTACTCCAAAACTTGCATA 52639516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TAAATGCATCAAAATCCCAGTGGTATAGCTGAGGACCTTGTTTACTCCAAAACTTGCATA 480

 52639517 ATGTAAGATGGATTTTCCCTTTGCACTGACAAAGTCTTTTGGGTGGCTAGTTCTCTTTAC 52639576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATGTAAGATGGATTTTCCCTTTGCACTGACAAAGTCTTTTGGGTGGCTAGTTCTCTTTAC 540

 52639577 CAGTTGAAAAGGCATGGCCTTGTGGACATAAGGCAGAAACAACACAAAATAAAAAACAGT 52639636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CAGTTGAAAAGGCATGGCCTTGTGGACATAAGGCAGAAACAACACAAAATAAAAAACAGT 600

 52639637 TAATAATTCACTTGGCCTTCTAATGTTGAAATTCGGTAATTCTTTTTATTTGTTTTTATT 52639696
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
      601 TAATAATTCACTTGGCCTTCTAATGTTGAAATTGGGTAATTCTTTTTATTTGTTTTTATT 660

 52639697 TTTCACTTGGGATTTTGGGTATTTACAACTTTGCATATGCTAACATCTTTGAATTTCATT 52639756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTTCACTTGGGATTTTGGGTATTTACAACTTTGCATATGCTAACATCTTTGAATTTCATT 720

 52639757 GCCTCAAGTTGTAACTTCATTGAACAAGTTTCAAATAATTGGCAAAAATAGAAACGTTGA 52639816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GCCTCAAGTTGTAACTTCATTGAACAAGTTTCAAATAATTGGCAAAAATAGAAACGTTGA 780

 52639817 CTATTTAAGACTATGGGCTTTGGAGATGGACAATTTTGGCTGTGCCACCTTTTAGCTGTG 52639876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTATTTAAGACTATGGGCTTTGGAGATGGACAATTTTGGCTGTGCCACCTTTTAGCTGTG 840

 52639877 TGTCAGGAGTGATATGCTTTCTCTGAACTGTTGACTTCTTCATCTGTAAAATGGTGAAAA 52639936
          ||||||||.||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
      841 TGTCAGGAATGATATGCTTTCTCTGAACTGTTGGCTTCTTCATCTGTAAAATGGTGAAAA 900

 52639937 TACAGGAATTCCCTGGTAAGATTTGATGGCTCAATGAGCTGATTTCTACAAAATGATTTA 52639996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TACAGGAATTCCCTGGTAAGATTTGATGGCTCAATGAGCTGATTTCTACAAAATGATTTA 960

 52639997 ATCACAGAATTTGACTTAAAATGCGAGAGGGATTCATGCTGTCCGAAATCATCCAAGAGT 52640056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATCACAGAATTTGACTTAAAATGCGAGAGGGATTCATGCTGTCCGAAATCATCCAAGAGT 1020

 52640057 GGAGATATCTGGTTAGCTTCATGGAGAACCTGGCACTGAATATCAAGTCAATTTTTGATA 52640116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GGAGATATCTGGTTAGCTTCATGGAGAACCTGGCACTGAATATCAAGTCAATTTTTGATA 1080

 52640117 AACAGAGAGAGAAAGGGACATAGGCAGAGAAAATACCAGGAGACAGATGGCGTTTGCACA 52640176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AACAGAGAGAGAAAGGGACATAGGCAGAGAAAATACCAGGAGACAGATGGCGTTTGCACA 1140

 52640177 GGTCAGGTGTTGGCCATATTGACTGGAGAAATTTAAGGGAAGGGTGGAAAATGCAGTTGG 52640236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GGTCAGGTGTTGGCCATATTGACTGGAGAAATTTAAGGGAAGGGTGGAAAATGCAGTTGG 1200

 52640237 AAAATAGGCAGAGGAAACATTGTGGAAACCCTTAAATGTCAGACAAAGAAACTGAGGCTT 52640296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AAAATAGGCAGAGGAAACATTGTGGAAACCCTTAAATGTCAGACAAAGAAACTGAGGCTT 1260

 52640297 ATGGGCATGGACACTAACATTTCTATTGTTTCAAAAATAATTTTACAACTTTTATACCTT 52640356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATGGGCATGGACACTAACATTTCTATTGTTTCAAAAATAATTTTACAACTTTTATACCTT 1320

 52640357 TCTCACCCAAGTTAGGACTTGTGCCTTTGGTTATACAACTCTTAAATTAGAGTCAACTGT 52640416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TCTCACCCAAGTTAGGACTTGTGCCTTTGGTTATACAACTCTTAAATTAGAGTCAACTGT 1380

 52640417 GCTATCTCTGTGAGTTTGGGTTGAGGACTATGGAAGGGAAAGGCAAAAAATAAAAGTAAA 52640476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GCTATCTCTGTGAGTTTGGGTTGAGGACTATGGAAGGGAAAGGCAAAAAATAAAAGTAAA 1440

 52640477 ATGTGAAGTAGAAGACAGGGAGAAAACCCATAATACTGGTAATAGCTAATTTCTCTTTTT 52640536
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     1441 ATGTGAAGTAGAAGACAGGGAGAAAACCCATAATACTAGTAATAGCTAATTTCTCTTTTT 1500

 52640537 CTTCTTTCAAAATGCAATTTGTGCTAAGTACTTTATATGGCCTATCTCATTTAACTTCTA 52640596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CTTCTTTCAAAATGCAATTTGTGCTAAGTACTTTATATGGCCTATCTCATTTAACTTCTA 1560

 52640597 AAAGTGTGAACAATGTGAGAATGTGCTAGATACTATTATTATCCCCATTTTACAGATGAG 52640656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AAAGTGTGAACAATGTGAGAATGTGCTAGATACTATTATTATCCCCATTTTACAGATGAG 1620

 52640657 GAAACTGAGGCTCAGGAGGTGAAGTAGCTTGCCCAAGATCACACAGCCAGTAGGTGACAG 52640716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GAAACTGAGGCTCAGGAGGTGAAGTAGCTTGCCCAAGATCACACAGCCAGTAGGTGACAG 1680

 52640717 AGGTAGAGAGGAAACCTAGGCTACTTGACTATGATGCTTATGTTTAATTCACTACTAAAT 52640776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AGGTAGAGAGGAAACCTAGGCTACTTGACTATGATGCTTATGTTTAATTCACTACTAAAT 1740

 52640777 ACCATGTAGGAAAGGACTCTGGAGACCTTAGTTCTTTAATTCCAATTCTACCACTAAACA 52640836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ACCATGTAGGAAAGGACTCTGGAGACCTTAGTTCTTTAATTCCAATTCTACCACTAAACA 1800

 52640837 GTAGAGACAGGATGAACTTGTCATTCACTGAGATGGAAAACCCCGTGAATTAAACTGGTG 52640896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GTAGAGACAGGATGAACTTGTCATTCACTGAGATGGAAAACCCCGTGAATTAAACTGGTG 1860

 52640897 GGCATTTTGTTTTTGTCATTGTTAGGCGATGAATGAAGAGTTCCATTCTGGACACATTAG 52640956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GGCATTTTGTTTTTGTCATTGTTAGGCGATGAATGAAGAGTTCCATTCTGGACACATTAG 1920

 52640957 GGTTGAGATACTCAGTGAGCAGCCAAATGGGGATGTAGAAATTCAAGTAGACATGTGGAA 52641016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GGTTGAGATACTCAGTGAGCAGCCAAATGGGGATGTAGAAATTCAAGTAGACATGTGGAA 1980

 52641017 GAGGAGGCAGCTGAGACTCACGTCTGGACTTCAGGGATGGATCCCGGCTAGAGATGTAAA 52641076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GAGGAGGCAGCTGAGACTCACGTCTGGACTTCAGGGATGGATCCCGGCTAGAGATGTAAA 2040

 52641077 TTTGGAACTTGTCAACCCATAGCAGTATTTAAACCTTTGGGACTGAGGGAAACCTTCAAG 52641136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TTTGGAACTTGTCAACCCATAGCAGTATTTAAACCTTTGGGACTGAGGGAAACCTTCAAG 2100

 52641137 GAAATAAGCGTAGTTAGAGATAGCCAAGAAGTGAACCCTGGGGAAGTCCAACATTTAGAG 52641196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GAAATAAGCGTAGTTAGAGATAGCCAAGAAGTGAACCCTGGGGAAGTCCAACATTTAGAG 2160

 52641197 GGTGAGATCCAGCAAAGGAGATGATGGAAGAGTACCAGGGAGGTGGAAGGATGTTGTTTC 52641256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GGTGAGATCCAGCAAAGGAGATGATGGAAGAGTACCAGGGAGGTGGAAGGATGTTGTTTC 2220

 52641257 AAACAGCAAGGTGTGGCCCACTCAGTCACTGTGTCGGATTCAACTTGCAGGTCAGACCTA 52641316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AAACAGCAAGGTGTGGCCCACTCAGTCACTGTGTCGGATTCAACTTGCAGGTCAGACCTA 2280

 52641317 CTAGGACAAAGATAGAGACCTATAGGATTTGGCAGCCAGGGTGATGGTAGGGAATTTGAA 52641376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CTAGGACAAAGATAGAGACCTATAGGATTTGGCAGCCAGGGTGATGGTAGGGAATTTGAA 2340

 52641377 ACATCATGGTGGCTGTGACAAGAGCCTGAATGGAGTGTGTTCAAGAGAGAAAAGAAGAGA 52641436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 ACATCATGGTGGCTGTGACAAGAGCCTGAATGGAGTGTGTTCAAGAGAGAAAAGAAGAGA 2400

 52641437 AGTGAAAACACAGAATATTGTTCTTATTATTAGTAGCCTGAGCCAATCTGAGGACCGATG 52641496
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     2401 AGTGAAAACACAGAATATTGTTCTTATTATTAGTAGCCTGAGCAAATCTGAGGACCGATG 2460

 52641497 CACTTATCACAATGTCTCTTAAAATACTATGTCTCTTACTAGATTATACACTCCTTGACA 52641556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CACTTATCACAATGTCTCTTAAAATACTATGTCTCTTACTAGATTATACACTCCTTGACA 2520

 52641557 GACGAGAAACATGATTTATTTTTCAAATGCCTTGCACAAGGTTAGTGCGAAAGTAACGAT 52641616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GACGAGAAACATGATTTATTTTTCAAATGCCTTGCACAAGGTTAGTGCGAAAGTAACGAT 2580

 52641617 TGCAGGATTTAATTACACTTTTAAAAGAAAAAAGACATTCTTCATCTTATGAAACTCTGC 52641676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TGCAGGATTTAATTACACTTTTAAAAGAAAAAAGACATTCTTCATCTTATGAAACTCTGC 2640

 52641677 ATGGCAACACTTTATGCGCCCCACACCCCCACTCAACACAAACACAACTCTGGAAGTACT 52641736
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 ATGGCAACACTTTACGCGCCCCACACCCCCACTCAACACAAACACAACTCTGGAAGTACT 2700

 52641737 GTGTTGATAACAGAAATGTGGTGGGTTTTATTTTTAACCAATAAAGGTCAAGTTTGCATT 52641796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GTGTTGATAACAGAAATGTGGTGGGTTTTATTTTTAACCAATAAAGGTCAAGTTTGCATT 2760

 52641797 ATGTGATTTTGTGTGTGTGTGTGTTGAATCTTTTAAATGCATATCTTACAGCTCTGGTTC 52641856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 ATGTGATTTTGTGTGTGTGTGTGTTGAATCTTTTAAATGCATATCTTACAGCTCTGGTTC 2820

 52641857 AGTTGTTGTGGGGAGAGGAAAAAAACCTCATCCCTGCCAACACATTGGTTTGTATGAATC 52641916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 AGTTGTTGTGGGGAGAGGAAAAAAACCTCATCCCTGCCAACACATTGGTTTGTATGAATC 2880

 52641917 ACAGCTCAGTGAAACCTTTCAGGCATATAATTTATCTTTTCTTTGGCCTATGTAGTAAAC 52641976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 ACAGCTCAGTGAAACCTTTCAGGCATATAATTTATCTTTTCTTTGGCCTATGTAGTAAAC 2940

 52641977 GCTTCATTTGTTCATGAATTCTTGCCTTGTTTTAATTATGCTTTGCCCTGAATGTAGTTT 52642036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 GCTTCATTTGTTCATGAATTCTTGCCTTGTTTTAATTATGCTTTGCCCTGAATGTAGTTT 3000

 52642037 TATAAGGCACAAAAATAAGATTGTCGTTCTGAAAACACAGAAGATTTGTATGTTTCCCCC 52642096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TATAAGGCACAAAAATAAGATTGTCGTTCTGAAAACACAGAAGATTTGTATGTTTCCCCC 3060

 52642097 AGGATGAAATGGTGGCATCTTTCTCCCAATTCACAGCTCTGTGGGCTTGTGGCTGGAATT 52642156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 AGGATGAAATGGTGGCATCTTTCTCCCAATTCACAGCTCTGTGGGCTTGTGGCTGGAATT 3120

 52642157 CCAATCCAGCAGGGAGCAAGCCATAAAAATGGGGGGAAGGGCTGCTGGAGGGAGGCAGTA 52642216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 CCAATCCAGCAGGGAGCAAGCCATAAAAATGGGGGGAAGGGCTGCTGGAGGGAGGCAGTA 3180

 52642217 GATGCGGCTGAGCCCAAGGCATAATTCACCCTAAGAATTCTGAATCAATACACTGACATC 52642276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 GATGCGGCTGAGCCCAAGGCATAATTCACCCTAAGAATTCTGAATCAATACACTGACATC 3240

 52642277 CAGCCATGTACAATGTGGTACTCCCACCAAGAAAGCCACTGATTGAGAAGTTTTATTCAT 52642336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 CAGCCATGTACAATGTGGTACTCCCACCAAGAAAGCCACTGATTGAGAAGTTTTATTCAT 3300

 52642337 GTTACTTTCTGAGGGTTGGATTGTCCCATTACATTTATAGAACAATTGCTTTTTTCCCCC 52642396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 GTTACTTTCTGAGGGTTGGATTGTCCCATTACATTTATAGAACAATTGCTTTTTTCCCCC 3360

 52642397 TAAATACAGAACTATGCAGCCGGGAGTCAGAAAAGAAACCTTGACAATCAGAAGGCTGTT 52642456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TAAATACAGAACTATGCAGCCGGGAGTCAGAAAAGAAACCTTGACAATCAGAAGGCTGTT 3420

 52642457 TTGTTGTTGTTGTTAAAAACCTTTGCAGGCATATGCATCTGAATATCCATAAGTTCACAG 52642516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TTGTTGTTGTTGTTAAAAACCTTTGCAGGCATATGCATCTGAATATCCATAAGTTCACAG 3480

 52642517 GCTGAGGGAGAAATGGCTATTTCATAACTTTTCTGTGTTTCTCATGTACATAGTACAAAG 52642576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 GCTGAGGGAGAAATGGCTATTTCATAACTTTTCTGTGTTTCTCATGTACATAGTACAAAG 3540

 52642577 TGGGCACTCAGTATTTCAAATTTCAATATCACTGAAAAAAATGGAAATTTGTCATGTAAC 52642636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 TGGGCACTCAGTATTTCAAATTTCAATATCACTGAAAAAAATGGAAATTTGTCATGTAAC 3600

 52642637 AAAATCAGATGCAGACTTCACTGGTGAATCTGAGGGAGTGAATTCACTTATTCAGAAAGG 52642696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 AAAATCAGATGCAGACTTCACTGGTGAATCTGAGGGAGTGAATTCACTTATTCAGAAAGG 3660

 52642697 AAGACAGTTACAATTCTTGGGTCTTCTGAGAGATCATTATAACTTGAAAATATTACACAA 52642756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 AAGACAGTTACAATTCTTGGGTCTTCTGAGAGATCATTATAACTTGAAAATATTACACAA 3720

 52642757 GGGCTTTGCTATATTAGATACCTGCCATGTTCCTAACACAAGCTCCCATTTTCTGACTCA 52642816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     3721 GGGCTTTGCTATATTAGATACCTGCCATGTTCCTAATACAAGCTCCCATTTTCTGACTCA 3780

 52642817 AATCTCATTTTGGAACACATTCCACTCAAATTGAGGTTCTACCCCTAAGAGTTCTTTTTC 52642876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 AATCTCATTTTGGAACACATTCCACTCAAATTGAGGTTCTACCCCTAAGAGTTCTTTTTC 3840

 52642877 AATAAAGAAAGCTGAGTTAATAAATCACAACTCCAAAACTTTTCCTCACTTTTCTTAGAC 52642936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 AATAAAGAAAGCTGAGTTAATAAATCACAACTCCAAAACTTTTCCTCACTTTTCTTAGAC 3900

 52642937 TAGAAATAGATTGAGTGTGTCGAGGTTTTATGGCTGAGTACATTGGAGGGCTGGCTATTC 52642996
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 TAGAAATAGATTGAATGTGTCGAGGTTTTATGGCTGAGTACATTGGAGGGCTGGCTATTC 3960

 52642997 TATGCTGAACTGGTTTACTTGATTAAGATGGGGATTTGGATGAGTCACCGGACACCTGTC 52643056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     3961 TATGCTGAACTGGTTTACTTGATTAAGATGGGGATTTGGATGAGTCACTGGACACCTGTC 4020

 52643057 CAAAGATGAGTAAAACACATTCCTTCATTGTCTTCCCATAAATAACTCAATCTTCTCCTA 52643116
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 CAAAGATGAGTAGAACACATTCCTTCATTGTCTTCCCATAAATAACTCAATCTTCTCCTA 4080

 52643117 ACTGAGCCAATGGATAGGCTTTGGATGCCCAAGCAAAACAAACACATGACTGTTAAAAAA 52643176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     4081 ACTGAGCCAATGGATAGGCTTTGGATGCCCAAGCAAAAGAAACACATGACTGTTAAAAAA 4140

 52643177 TCACAACCTCAAAATGGCCTTAGAAGCCTATGACCAATAATGAGAATGGTTTCTCCACTC 52643236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 TCACAACCTCAAAATGGCCTTAGAAGCCTATGACCAATAATGAGAATGGTTTCTCCACTC 4200

 52643237 AGGCGCAAGTAGTAAACAGTTTCTCCCATATGCAGGAATATTGACGACTAGTTTACCGCC 52643296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 AGGCGCAAGTAGTAAACAGTTTCTCCCATATGCAGGAATATTGACGACTAGTTTACCGCC 4260

 52643297 TCTGGGCACGTAACTTTCAGGTCCTGGTTCATGCATTTGCTGGAATGTTCCCTGGGCCAT 52643356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 TCTGGGCACGTAACTTTCAGGTCCTGGTTCATGCATTTGCTGGAATGTTCCCTGGGCCAT 4320

 52643357 GGAGCCCAGTTCTCCTGGCATCTGGCATCTCCCCCACACTCTGCTCCCCCAGCACAGCAC 52643416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 GGAGCCCAGTTCTCCTGGCATCTGGCATCTCCCCCACACTCTGCTCCCCCAGCACAGCAC 4380

 52643417 TTGGCATCTTGCATTGCAATTGCAGGTTTATTTATTCACTTCTCTCACTGGACAGCAAAC 52643476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 TTGGCATCTTGCATTGCAATTGCAGGTTTATTTATTCACTTCTCTCACTGGACAGCAAAC 4440

 52643477 TCCACCAGGGCCGAGACTCTGTGTCTCGCCCTTCACTGTGGTCCCTGTGCCTCACCTGTT 52643536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 TCCACCAGGGCCGAGACTCTGTGTCTCGCCCTTCACTGTGGTCCCTGTGCCTCACCTGTT 4500

 52643537 CCTAGTACAGTGTCACACTCAGTAAAGAGCAGATGCCTGG-TGCATTTGGAGACTTATTT 52643595
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
     4501 CCTAGTACAGTGTCACACTCAGTAAAGAGCAGATGCCTGGATGCATTTGGAGACTTATTT 4560

 52643596 TAAATTATACGGAAAGTTATTCAACCGGCTTCTTGAACTGGTGAATTTTGGAAAGTGGGT 52643655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 TAAATTATACGGAAAGTTATTCAACCGGCTTCTTGAACTGGTGAATTTTGGAAAGTGGGT 4620

 52643656 GTTTGAAGGGAAAATGTTTAAACTCTGAAAGAAATGTTGGAAATAAGCTCTTTGAATCAA 52643715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 GTTTGAAGGGAAAATGTTTAAACTCTGAAAGAAATGTTGGAAATAAGCTCTTTGAATCAA 4680

 52643716 AATGTATAGAAAACACAAGAATGCTGACAGTAAGAGCCTAAAACACATGATGACTATTAT 52643775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 AATGTATAGAAAACACAAGAATGCTGACAGTAAGAGCCTAAAACACATGATGACTATTAT 4740

 52643776 CTTTTCCCAATTTTAACTCTCCAGAGTGTTCAGCGGTGCCCAGCCTTCATAATGTAATTC 52643835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 CTTTTCCCAATTTTAACTCTCCAGAGTGTTCAGCGGTGCCCAGCCTTCATAATGTAATTC 4800

 52643836 TTCGTAGCACCCTGGATGCATTAAAACCATAGATTAACGTGATACTTATTTTCATTAAGG 52643895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 TTCGTAGCACCCTGGATGCATTAAAACCATAGATTAACGTGATACTTATTTTCATTAAGG 4860

 52643896 AAAATAATTTACGTACAGTGCTCAGAGTAGAGCCTGGCACATTGAACATTTTCAATAAAT 52643955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 AAAATAATTTACGTACAGTGCTCAGAGTAGAGCCTGGCACATTGAACATTTTCAATAAAT 4920

 52643956 GACAGCAAGTGTAATTATTAGCACTTCGGAAGTGCAAAGTTGCATTGTATTAAGACAAAT 52644015
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 GACAGCAAGTGTAATTATTAGCACTTTGGAAGTGCAAAGTTGCATTGTATTAAGACAAAT 4980

 52644016 ATATTTGGAGCTCATCCAATTTTTTCCTGGCTCTGAAGTCTGCTAGTGGCACTTAACTTT 52644075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 ATATTTGGAGCTCATCCAATTTTTTCCTGGCTCTGAAGTCTGCTAGTGGCACTTAACTTT 5040

 52644076 ATTCCCAAGTTTTGAAAAATATTGTTATTTAAAAAGTCTGTTAACCAAGGAAATGCATGC 52644135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 ATTCCCAAGTTTTGAAAAATATTGTTATTTAAAAAGTCTGTTAACCAAGGAAATGCATGC 5100

 52644136 CCTAAACCTATAATGTATCAAGTTTTACTTCCTTCTTCTTTTAAGGAGTTCTTTTCCTGC 52644195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 CCTAAACCTATAATGTATCAAGTTTTACTTCCTTCTTCTTTTAAGGAGTTCTTTTCCTGC 5160

 52644196 CTTGAATACAAACAGGCTCTCTCAAGGTTAAAAGCAAATGCTCTTTTTAGTGTCAAAAAG 52644255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 CTTGAATACAAACAGGCTCTCTCAAGGTTAAAAGCAAATGCTCTTTTTAGTGTCAAAAAG 5220

 52644256 AGCTTGCCTTTCTTCGCTCAGGAAAAAAAGCAACTGATTCCAGGATACCTTCTTTGAAAA 52644315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 AGCTTGCCTTTCTTCGCTCAGGAAAAAAAGCAACTGATTCCAGGATACCTTCTTTGAAAA 5280

 52644316 CCAACACAAAAAAACCCCCCAAAAAACAAAAAAAAAACCCAAAACCCCTAGTTTTTACAA 52644375
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
     5281 CCAACACAAAAAAACCCCCCAAAAAACAAAAAAAAA-CCCAAAACCCCTAGTTTTTACAA 5339

 52644376 AGGTTTATTACTCCTACTTGTTGGAAAAGAATTACTACATAAAAGAGTCTGCCCAGAGCT 52644435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5340 AGGTTTATTACTCCTACTTGTTGGAAAAGAATTACTACATAAAAGAGTCTGCCCAGAGCT 5399

 52644436 GTAAAATCTCCTTATTCAAACACACACCTTAGAGCAAAAGATGGTTAAATATCAATTCAG 52644495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5400 GTAAAATCTCCTTATTCAAACACACACCTTAGAGCAAAAGATGGTTAAATATCAATTCAG 5459

 52644496 GCTATTAACAGTAAGGGAC---GAAATGTGTTCCAACAAAACTCTGCATGTCAACAAACT 52644552
          ||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5460 GCTATTAACAGTAAGG---AATGAAATGTGTTCCAACAAAACTCTGCATGTCAACAAACT 5516

 52644553 ACAGAGACTAGGTAACATCTTTTAGGAATCATTTTTATTCCACTAATGCCTTTTCCTCCA 52644612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5517 ACAGAGACTAGGTAACATCTTTTAGGAATCATTTTTATTCCACTAATGCCTTTTCCTCCA 5576

 52644613 GAATCCACTGATCGTAAACGCAACCTGTCTACTTCCGCCTTTGAAAAATGGATGGACAAA 52644672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5577 GAATCCACTGATCGTAAACGCAACCTGTCTACTTCCGCCTTTGAAAAATGGATGGACAAA 5636

 52644673 TTCATCTGCATGTAACTCACCTCCTCTTTTCTTTTACATAAAACAGATGCCACAGCTGTT 52644732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5637 TTCATCTGCATGTAACTCACCTCCTCTTTTCTTTTACATAAAACAGATGCCACAGCTGTT 5696

 52644733 ATTGTTCTTCACACAGAAGTTTCTACCCAGAGAAACATCAGGATGACACTCTGCTGCAAT 52644792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5697 ATTGTTCTTCACACAGAAGTTTCTACCCAGAGAAACATCAGGATGACACTCTGCTGCAAT 5756

 52644793 GTGCTATTTGTTCTAGAGGGGTCAACAGCTTGCCACCTTGCCTAGGCCCAGGGTGACTGC 52644852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5757 GTGCTATTTGTTCTAGAGGGGTCAACAGCTTGCCACCTTGCCTAGGCCCAGGGTGACTGC 5816

 52644853 ATATGTGCAGTGGTCTTATCCCATTAGCGCCCCCGAGCATGCATTCAGAACCAAGTGGAT 52644912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5817 ATATGTGCAGTGGTCTTATCCCATTAGCGCCCCCGAGCATGCATTCAGAACCAAGTGGAT 5876

 52644913 ACACCTTGGCACACTTACCTTCCCTGCAGGGACATCATCGGACTGCCCTGATAAGCCAGG 52644972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5877 ACACCTTGGCACACTTACCTTCCCTGCAGGGACATCATCGGACTGCCCTGATAAGCCAGG 5936

 52644973 AACCTCATCCACCTTGTCTTGATGCTCTGCCCTCTTGGCTTCCTGTTGGCTGTCACCTGG 52645032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5937 AACCTCATCCACCTTGTCTTGATGCTCTGCCCTCTTGGCTTCCTGTTGGCTGTCACCTGG 5996

 52645033 CACCTTTTCCTGTCCCTTGTCCAGCTTGAAGAATTTGTCAAAAAAGCTGGAGTCCTTGGG 52645092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5997 CACCTTTTCCTGTCCCTTGTCCAGCTTGAAGAATTTGTCAAAAAAGCTGGAGTCCTTGGG 6056

 52645093 CTTGGAGGGAGCTTCTCCTCCTGCTCCCCCTGTCTCAGGTGGGAGAAGCGTGGGATCCCT 52645152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6057 CTTGGAGGGAGCTTCTCCTCCTGCTCCCCCTGTCTCAGGTGGGAGAAGCGTGGGATCCCT 6116

 52645153 GGCGGCAGAGAGGACCTTGTCTTGGGCCGGGGCGTGCCCTGGGGTTTTATCTGTGTCCTG 52645212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6117 GGCGGCAGAGAGGACCTTGTCTTGGGCCGGGGCGTGCCCTGGGGTTTTATCTGTGTCCTG 6176

 52645213 CCCCGGTCCAGCTGCCACCGGAAGTGTCCAGCTCTCACTTGGGTCTTTGTTCGCTGGAGC 52645272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6177 CCCCGGTCCAGCTGCCACCGGAAGTGTCCAGCTCTCACTTGGGTCTTTGTTCGCTGGAGC 6236

 52645273 TTTATTGGAGCTGACATCAAGCTTCACTGATCCAAGGGATGAATCTGCGGCTTGGTCTCC 52645332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6237 TTTATTGGAGCTGACATCAAGCTTCACTGATCCAAGGGATGAATCTGCGGCTTGGTCTCC 6296

 52645333 GGTACGTCCTGGTACAGGCCGAGAGAGCATCAAGAAAAAACGAGATTTAGCAGCTGGTGC 52645392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6297 GGTACGTCCTGGTACAGGCCGAGAGAGCATCAAGAAAAAACGAGATTTAGCAGCTGGTGC 6356

 52645393 CTCGGGTTTGGCCTCTTTCCCAAGATTCTTTCCGTTGGCATCCGCAACAGCACTTATCTC 52645452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6357 CTCGGGTTTGGCCTCTTTCCCAAGATTCTTTCCGTTGGCATCCGCAACAGCACTTATCTC 6416

 52645453 CGTTGTCTCGGGGGAAGAAGTGGCCACATTATCCGTCTTGACACTTATTCCCAAGTCGAC 52645512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6417 CGTTGTCTCGGGGGAAGAAGTGGCCACATTATCCGTCTTGACACTTATTCCCAAGTCGAC 6476

 52645513 TGTAAACACAAACATAAACAGTGGTTATTCAGCCAAGCCGGGAAATTCAGGCACTAATAA 52645572
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6477 TGTAAACACAAACATAAACAGCGGTTATTCAGCCAAGCCGGGAAATTCAGGCACTAATAA 6536

 52645573 TGGACTCCAGACATTTTTTATACAAAAGCCATACTGCATACTGGAACTGTGTTGTTCTCT 52645632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6537 TGGACTCCAGACATTTTTTATACAAAAGCCATACTGCATACTGGAACTGTGTTGTTCTCT 6596

 52645633 GGTCATTCTGAAAGGCAGAAGTTAGCTCTCTACATCTCCTTGGACCCTGCTTTTCTTGGG 52645692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6597 GGTCATTCTGAAAGGCAGAAGTTAGCTCTCTACATCTCCTTGGACCCTGCTTTTCTTGGG 6656

 52645693 AGAGGAGAAGGCAAGGTTGGTGAGGAGGGAAAGCTACTTAATGGAAAGTCACTAGCTGCC 52645752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6657 AGAGGAGAAGGCAAGGTTGGTGAGGAGGGAAAGCTACTTAATGGAAAGTCACTAGCTGCC 6716

 52645753 AGGTGTGGAATGAGTGATATTCAATGTTAATTAATCTTCTTTTATCTGTGTAAGAACTCC 52645812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6717 AGGTGTGGAATGAGTGATATTCAATGTTAATTAATCTTCTTTTATCTGTGTAAGAACTCC 6776

 52645813 GTGAGCAGCATATTGTCATGATGTCAACTGGGAGGCAGTACAGCAGTTAGGAGCTTGGGT 52645872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6777 GTGAGCAGCATATTGTCATGATGTCAACTGGGAGGCAGTACAGCAGTTAGGAGCTTGGGT 6836

 52645873 TCTGGAGCTAGAACAAGGTTTCTCAACCTCAGCACTACTCACATTTGAAGCCAGATTATT 52645932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6837 TCTGGAGCTAGAACAAGGTTTCTCAACCTCAGCACTACTCACATTTGAAGCCAGATTATT 6896

 52645933 CTTTGTTAGGGAGGCTCATCCCGTGCCTCATAGGCTGATTAGCAGCATCCTGGCCTCTGC 52645992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6897 CTTTGTTAGGGAGGCTCATCCCGTGCCTCATAGGCTGATTAGCAGCATCCTGGCCTCTGC 6956

 52645993 CCACTAGACGCCGGTCACATTTCCCAGTCATGGCAACCAAAAATATCTCTAGGCATTGCT 52646052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6957 CCACTAGACGCCGGTCACATTTCCCAGTCATGGCAACCAAAAATATCTCTAGGCATTGCT 7016

 52646053 AAATGTCCCCTGGAGGACAAAATCTCTTACGTTTGAGAGGCACTGAGCTGAAATGTCTTT 52646112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7017 AAATGTCCCCTGGAGGACAAAATCTCTTACGTTTGAGAGGCACTGAGCTGAAATGTCTTT 7076

 52646113 TTGAATCCAGATTATCTAATTTTCTGTGCCTCAACTTTCTGGTAAAAGGAGACAGATAAT 52646172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7077 TTGAATCCAGATTATCTAATTTTCTGTGCCTCAACTTTCTGGTAAAAGGAGACAGATAAT 7136

 52646173 AAATCTCGTAATTTTGTTAGGAAGATTACATGAGTTAATAGTTTTAAAGCAAGTACAATA 52646232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7137 AAATCTCGTAATTTTGTTAGGAAGATTACATGAGTTAATAGTTTTAAAGCAAGTACAATA 7196

 52646233 GCACCTGGAATATATTAAGTGCTTAATAAATATCACAAACATTAGTTATCATTATTCATG 52646292
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7197 GCGCCTGGAATATATTAAGTGCTTAATAAATATCACAAACATTAGTTATCATTATTCATG 7256

 52646293 AGTGAGAAAACTGACAGTCAGAGAGGTCAGTACACCCTCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCTA 52646352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7257 AGTGAGAAAACTGACAGTCAGAGAGGTCAGTACACCCTCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCTA 7316

 52646353 GTAAGCAGCAGAGTCTGGCTTCAGGCAGAAATCTGACTTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGT 52646412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7317 GTAAGCAGCAGAGTCTGGCTTCAGGCAGAAATCTGACTTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGT 7376

 52646413 CTTACCAGGGACTTGTATTAGCATAGACTGTTAAGAATATGGGAAGATTTTTAAAATACA 52646472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7377 CTTACCAGGGACTTGTATTAGCATAGACTGTTAAGAATATGGGAAGATTTTTAAAATACA 7436

 52646473 GTACTCAGAAAATTTCTCTTTGAAAGGCTGGAAGAGCAGATATCCACACAAGAAGGCAAA 52646532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7437 GTACTCAGAAAATTTCTCTTTGAAAGGCTGGAAGAGCAGATATCCACACAAGAAGGCAAA 7496

 52646533 TTAGACCTCAGGCCAGTGTGGAATTAAAGGTGTAGGGTTATCTGGTCAAGACTGTGTGTG 52646592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7497 TTAGACCTCAGGCCAGTGTGGAATTAAAGGTGTAGGGTTATCTGGTCAAGACTGTGTGTG 7556

 52646593 TGGATACAGGCTCCAACCCCTCCAGGCAAGGGCACTGTTTCCAACATCCACCCTTTCTCC 52646652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     7557 TGGATACAGGCTCCAACCCCTCCAGGCAAGGGCAATGTTTCCAACATCCACCCTTTCTCC 7616

 52646653 TTTGACCTCTACCTTGACCTAAATTAACTATAAAAGGTCCTTCTTTTCTAGGACCCTACT 52646712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7617 TTTGACCTCTACCTTGACCTAAATTAACTATAAAAGGTCCTTCTTTTCTAGGACCCTACT 7676

 52646713 ATAAATCAGTGAAATATTCAGGAAAAAAAGAACACCAAGAATGTTGGGATCCCAGTTAAA 52646772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7677 ATAAATCAGTGAAATATTCAGGAAAAAAAGAACACCAAGAATGTTGGGATCCCAGTTAAA 7736

 52646773 GATCAAGATTCTCTACTGATAAGCTGTGTGATATGGAGTAAATCACTAAAGATCTTTGAA 52646832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7737 GATCAAGATTCTCTACTGATAAGCTGTGTGATATGGAGTAAATCACTAAAGATCTTTGAA 7796

 52646833 TCTCTTCATTTGTAAAATGGGAATATTGGTAGTCCTACTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTA 52646892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7797 TCTCTTCATTTGTAAAATGGGAATATTGGTAGTCCTACTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTA 7856

 52646893 AAGAAGAAAAGTCATGCAAAGGATCTGGCACAACGCCTTTTCCATAATAAGTGCTTAGTA 52646952
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     7857 AAGAAGAAAAGTCATGCAAAGGATCTGGCACAATGCCTTTTCCATAATAAGTGCTTAGTA 7916

 52646953 ATTGACAGATACTGTGATAACTTTTCAGGTTTCTCTCATGCCTTTGACAACATTGCATTT 52647012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7917 ATTGACAGATACTGTGATAACTTTTCAGGTTTCTCTCATGCCTTTGACAACATTGCATTT 7976

 52647013 TGCTTGCTCTATCTGTAGTCAGACACTTCTTAATATCTGTTTGCAGGAAGAC 52647064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7977 TGCTTGCTCTATCTGTAGTCAGACACTTCTTAATATCTGTTTGCAGGAAGAC 8028

EXCISED REGION

 52658003 AGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTG 52658062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8029 AGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTG 8088

 52658063 GCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTAT 52658122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8089 GCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTAT 8148

 52658123 AAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGG 52658182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8149 AAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGG 8208

 52658183 GAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTG 52658242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8209 GAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTG 8268

 52658243 AAACACTGTCTCTGCTAAAAAACAAAACAAAACAAAACACCAAAAAATAGCTGGGCGTAG 52658302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8269 AAACACTGTCTCTGCTAAAAAACAAAACAAAACAAAACACCAAAAAATAGCTGGGCGTAG 8328

 52658303 TGGCGGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTTGGGAGGCGGTGGCAGGAGAATCATTTGAACCT 52658362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8329 TGGCGGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTTGGGAGGCGGTGGCAGGAGAATCATTTGAACCT 8388

 52658363 GGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGAT--------TGTGCCACTGCACTCTAACCTGG 52658414
          |||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||
     8389 GGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACTGTGCCACTGCACTCTAACCTGG 8448

 52658415 GCAACAGAGTTCAGAGTGAGACTCTGTCTCCCCC------------------AAAAAAAA 52658456
          ||||||||||||||||||||||||||||||                      ||||||||
     8449 GCAACAGAGTTCAGAGTGAGACTCTGTCTC----ACCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 8504

 52658457 AAAAAAAAAAAAAAGAACAGCCATATAGATCGTCGGTGGGAGTGTAATTTGGCCACTTCT 52658516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8505 AAAAAAAAAAAAAAGAACAGCCATATAGATCGTCGGTGGGAGTGTAATTTGGCCACTTCT 8564

 52658517 TTGGAAAATAGCTCAGTAATATCTATTAATACTTAAAATTTCACAAACACTGTAAGTCTA 52658576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8565 TTGGAAAATAGCTCAGTAATATCTATTAATACTTAAAATTTCACAAACACTGTAAGTCTA 8624

 52658577 ACTTCCACTTCTAAAATGTTATCCTAGAAATAAAATTGCATAGGGGTACAAAGGCTTACG 52658636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8625 ACTTCCACTTCTAAAATGTTATCCTAGAAATAAAATTGCATAGGGGTACAAAGGCTTACG 8684

 52658637 TATGGAACTATTTGCTGGACTACTGTAGTTGTGGCAAAAAACTGGAAATGACCTAAACGC 52658696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8685 TATGGAACTATTTGCTGGACTACTGTAGTTGTGGCAAAAAACTGGAAATGACCTAAACGC 8744

 52658697 TTATTAGTAGAAACCTGGTTAAATAAATTATCATATGTCCTTGAGGACACAGGGACACAA 52658756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8745 TTATTAGTAGAAACCTGGTTAAATAAATTATCATATGTCCTTGAGGACACAGGGACACAA 8804

 52658757 AGAGGGGAATGACAGGCACTGAGCCTACTTGAGGGTGGGAGGAGGAAGTCGATCAGAAAA 52658816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8805 AGAGGGGAATGACAGGCACTGAGCCTACTTGAGGGTGGGAGGAGGAAGTCGATCAGAAAA 8864

 52658817 AATAACTAGTGGGTACTAGGCTTAGTACCCGGGTGAAAAAATAATCTGTACAACAAACCC 52658876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8865 AATAACTAGTGGGTACTAGGCTTAGTACCCGGGTGAAAAAATAATCTGTACAACAAACCC 8924

 52658877 CCATGACATGAGTTTACCTTATAACAAACCTGCACATGTAATCTGAACCTAGATAAAAGT 52658936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8925 CCATGACATGAGTTTACCTTATAACAAACCTGCACATGTAATCTGAACCTAGATAAAAGT 8984

 52658937 TTAAAAAAATAAATAATCATATGTCCCTACAATGAAATATTCCACAGGCATTAAAATTCC 52658996
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     8985 TTAAAAAAATAAATAATCATATGTCCCTATAATGAAATATTCCACAGGCATTAAAATTCC 9044

 52658997 CCAAGGAATTTTAGTAAGGAAAGAAAAAGCT 52659027
          |||||||||||||||||||||||||||||||
     9045 CCAAGGAATTTTAGTAAGGAAAGAAAAAGCT 9075

Alignment time is 10.0381 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [52637064,52668002] =>     30939 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    9692] =>      9692 nucs 'mol-32-33a0-047324_9692'

Score:        9680
Aligned:      9691        nucs
Identic:      9690 (100%) nucs =>      2563 (100%)      7127 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [52642113,52644675] EXCISED REGION [52644677,52651804]
 second seq =>  [       1,    2563] EXCISED REGION [    2565,    9692]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [52644676,52644676]
 second seq =>         1 nucs [2564,2564]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [52644674,52644675] to [52644677,52644678]
 second seq =>         2 nucs [2562,2563] to [2565,2566]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 52642113 ATCTTTCTCCCAATTCACAGCTCTGTGGGCTTGTGGCTGGAATTCCAATCCAGCAGGGAG 52642172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATCTTTCTCCCAATTCACAGCTCTGTGGGCTTGTGGCTGGAATTCCAATCCAGCAGGGAG 60

 52642173 CAAGCCATAAAAATGGGGGGAAGGGCTGCTGGAGGGAGGCAGTAGATGCGGCTGAGCCCA 52642232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAAGCCATAAAAATGGGGGGAAGGGCTGCTGGAGGGAGGCAGTAGATGCGGCTGAGCCCA 120

 52642233 AGGCATAATTCACCCTAAGAATTCTGAATCAATACACTGACATCCAGCCATGTACAATGT 52642292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGGCATAATTCACCCTAAGAATTCTGAATCAATACACTGACATCCAGCCATGTACAATGT 180

 52642293 GGTACTCCCACCAAGAAAGCCACTGATTGAGAAGTTTTATTCATGTTACTTTCTGAGGGT 52642352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGTACTCCCACCAAGAAAGCCACTGATTGAGAAGTTTTATTCATGTTACTTTCTGAGGGT 240

 52642353 TGGATTGTCCCATTACATTTATAGAACAATTGCTTTTTTCCCCCTAAATACAGAACTATG 52642412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGGATTGTCCCATTACATTTATAGAACAATTGCTTTTTTCCCCCTAAATACAGAACTATG 300

 52642413 CAGCCGGGAGTCAGAAAAGAAACCTTGACAATCAGAAGGCTGTTTTGTTGTTGTTGTTAA 52642472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CAGCCGGGAGTCAGAAAAGAAACCTTGACAATCAGAAGGCTGTTTTGTTGTTGTTGTTAA 360

 52642473 AAACCTTTGCAGGCATATGCATCTGAATATCCATAAGTTCACAGGCTGAGGGAGAAATGG 52642532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAACCTTTGCAGGCATATGCATCTGAATATCCATAAGTTCACAGGCTGAGGGAGAAATGG 420

 52642533 CTATTTCATAACTTTTCTGTGTTTCTCATGTACATAGTACAAAGTGGGCACTCAGTATTT 52642592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTATTTCATAACTTTTCTGTGTTTCTCATGTACATAGTACAAAGTGGGCACTCAGTATTT 480

 52642593 CAAATTTCAATATCACTGAAAAAAATGGAAATTTGTCATGTAACAAAATCAGATGCAGAC 52642652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CAAATTTCAATATCACTGAAAAAAATGGAAATTTGTCATGTAACAAAATCAGATGCAGAC 540

 52642653 TTCACTGGTGAATCTGAGGGAGTGAATTCACTTATTCAGAAAGGAAGACAGTTACAATTC 52642712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTCACTGGTGAATCTGAGGGAGTGAATTCACTTATTCAGAAAGGAAGACAGTTACAATTC 600

 52642713 TTGGGTCTTCTGAGAGATCATTATAACTTGAAAATATTACACAAGGGCTTTGCTATATTA 52642772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTGGGTCTTCTGAGAGATCATTATAACTTGAAAATATTACACAAGGGCTTTGCTATATTA 660

 52642773 GATACCTGCCATGTTCCTAACACAAGCTCCCATTTTCTGACTCAAATCTCATTTTGGAAC 52642832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GATACCTGCCATGTTCCTAACACAAGCTCCCATTTTCTGACTCAAATCTCATTTTGGAAC 720

 52642833 ACATTCCACTCAAATTGAGGTTCTACCCCTAAGAGTTCTTTTTCAATAAAGAAAGCTGAG 52642892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ACATTCCACTCAAATTGAGGTTCTACCCCTAAGAGTTCTTTTTCAATAAAGAAAGCTGAG 780

 52642893 TTAATAAATCACAACTCCAAAACTTTTCCTCACTTTTCTTAGACTAGAAATAGATTGAGT 52642952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTAATAAATCACAACTCCAAAACTTTTCCTCACTTTTCTTAGACTAGAAATAGATTGAGT 840

 52642953 GTGTCGAGGTTTTATGGCTGAGTACATTGGAGGGCTGGCTATTCTATGCTGAACTGGTTT 52643012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GTGTCGAGGTTTTATGGCTGAGTACATTGGAGGGCTGGCTATTCTATGCTGAACTGGTTT 900

 52643013 ACTTGATTAAGATGGGGATTTGGATGAGTCACCGGACACCTGTCCAAAGATGAGTAAAAC 52643072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ACTTGATTAAGATGGGGATTTGGATGAGTCACCGGACACCTGTCCAAAGATGAGTAAAAC 960

 52643073 ACATTCCTTCATTGTCTTCCCATAAATAACTCAATCTTCTCCTAACTGAGCCAATGGATA 52643132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ACATTCCTTCATTGTCTTCCCATAAATAACTCAATCTTCTCCTAACTGAGCCAATGGATA 1020

 52643133 GGCTTTGGATGCCCAAGCAAAACAAACACATGACTGTTAAAAAATCACAACCTCAAAATG 52643192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GGCTTTGGATGCCCAAGCAAAACAAACACATGACTGTTAAAAAATCACAACCTCAAAATG 1080

 52643193 GCCTTAGAAGCCTATGACCAATAATGAGAATGGTTTCTCCACTCAGGCGCAAGTAGTAAA 52643252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GCCTTAGAAGCCTATGACCAATAATGAGAATGGTTTCTCCACTCAGGCGCAAGTAGTAAA 1140

 52643253 CAGTTTCTCCCATATGCAGGAATATTGACGACTAGTTTACCGCCTCTGGGCACGTAACTT 52643312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CAGTTTCTCCCATATGCAGGAATATTGACGACTAGTTTACCGCCTCTGGGCACGTAACTT 1200

 52643313 TCAGGTCCTGGTTCATGCATTTGCTGGAATGTTCCCTGGGCCATGGAGCCCAGTTCTCCT 52643372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TCAGGTCCTGGTTCATGCATTTGCTGGAATGTTCCCTGGGCCATGGAGCCCAGTTCTCCT 1260

 52643373 GGCATCTGGCATCTCCCCCACACTCTGCTCCCCCAGCACAGCACTTGGCATCTTGCATTG 52643432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GGCATCTGGCATCTCCCCCACACTCTGCTCCCCCAGCACAGCACTTGGCATCTTGCATTG 1320

 52643433 CAATTGCAGGTTTATTTATTCACTTCTCTCACTGGACAGCAAACTCCACCAGGGCCGAGA 52643492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CAATTGCAGGTTTATTTATTCACTTCTCTCACTGGACAGCAAACTCCACCAGGGCCGAGA 1380

 52643493 CTCTGTGTCTCGCCCTTCACTGTGGTCCCTGTGCCTCACCTGTTCCTAGTACAGTGTCAC 52643552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CTCTGTGTCTCGCCCTTCACTGTGGTCCCTGTGCCTCACCTGTTCCTAGTACAGTGTCAC 1440

 52643553 ACTCAGTAAAGAGCAGATGCCTGGTGCATTTGGAGACTTATTTTAAATTATACGGAAAGT 52643612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ACTCAGTAAAGAGCAGATGCCTGGTGCATTTGGAGACTTATTTTAAATTATACGGAAAGT 1500

 52643613 TATTCAACCGGCTTCTTGAACTGGTGAATTTTGGAAAGTGGGTGTTTGAAGGGAAAATGT 52643672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TATTCAACCGGCTTCTTGAACTGGTGAATTTTGGAAAGTGGGTGTTTGAAGGGAAAATGT 1560

 52643673 TTAAACTCTGAAAGAAATGTTGGAAATAAGCTCTTTGAATCAAAATGTATAGAAAACACA 52643732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTAAACTCTGAAAGAAATGTTGGAAATAAGCTCTTTGAATCAAAATGTATAGAAAACACA 1620

 52643733 AGAATGCTGACAGTAAGAGCCTAAAACACATGATGACTATTATCTTTTCCCAATTTTAAC 52643792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AGAATGCTGACAGTAAGAGCCTAAAACACATGATGACTATTATCTTTTCCCAATTTTAAC 1680

 52643793 TCTCCAGAGTGTTCAGCGGTGCCCAGCCTTCATAATGTAATTCTTCGTAGCACCCTGGAT 52643852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TCTCCAGAGTGTTCAGCGGTGCCCAGCCTTCATAATGTAATTCTTCGTAGCACCCTGGAT 1740

 52643853 GCATTAAAACCATAGATTAACGTGATACTTATTTTCATTAAGGAAAATAATTTACGTACA 52643912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GCATTAAAACCATAGATTAACGTGATACTTATTTTCATTAAGGAAAATAATTTACGTACA 1800

 52643913 GTGCTCAGAGTAGAGCCTGGCACATTGAACATTTTCAATAAATGACAGCAAGTGTAATTA 52643972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GTGCTCAGAGTAGAGCCTGGCACATTGAACATTTTCAATAAATGACAGCAAGTGTAATTA 1860

 52643973 TTAGCACTTCGGAAGTGCAAAGTTGCATTGTATTAAGACAAATATATTTGGAGCTCATCC 52644032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTAGCACTTCGGAAGTGCAAAGTTGCATTGTATTAAGACAAATATATTTGGAGCTCATCC 1920

 52644033 AATTTTTTCCTGGCTCTGAAGTCTGCTAGTGGCACTTAACTTTATTCCCAAGTTTTGAAA 52644092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AATTTTTTCCTGGCTCTGAAGTCTGCTAGTGGCACTTAACTTTATTCCCAAGTTTTGAAA 1980

 52644093 AATATTGTTATTTAAAAAGTCTGTTAACCAAGGAAATGCATGCCCTAAACCTATAATGTA 52644152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AATATTGTTATTTAAAAAGTCTGTTAACCAAGGAAATGCATGCCCTAAACCTATAATGTA 2040

 52644153 TCAAGTTTTACTTCCTTCTTCTTTTAAGGAGTTCTTTTCCTGCCTTGAATACAAACAGGC 52644212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TCAAGTTTTACTTCCTTCTTCTTTTAAGGAGTTCTTTTCCTGCCTTGAATACAAACAGGC 2100

 52644213 TCTCTCAAGGTTAAAAGCAAATGCTCTTTTTAGTGTCAAAAAGAGCTTGCCTTTCTTCGC 52644272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TCTCTCAAGGTTAAAAGCAAATGCTCTTTTTAGTGTCAAAAAGAGCTTGCCTTTCTTCGC 2160

 52644273 TCAGGAAAAAAAGCAACTGATTCCAGGATACCTTCTTTGAAAACCAACACAAAAAAACCC 52644332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TCAGGAAAAAAAGCAACTGATTCCAGGATACCTTCTTTGAAAACCAACACAAAAAAACCC 2220

 52644333 CCCAAAAAACAAAAAAAAAACCCAAAACCCCTAGTTTTTACAAAGGTTTATTACTCCTAC 52644392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CCCAAAAAACAAAAAAAAAACCCAAAACCCCTAGTTTTTACAAAGGTTTATTACTCCTAC 2280

 52644393 TTGTTGGAAAAGAATTACTACATAAAAGAGTCTGCCCAGAGCTGTAAAATCTCCTTATTC 52644452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TTGTTGGAAAAGAATTACTACATAAAAGAGTCTGCCCAGAGCTGTAAAATCTCCTTATTC 2340

 52644453 AAACACACACCTTAGAGCAAAAGATGGTTAAATATCAATTCAGGCTATTAACAGTAAGGG 52644512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AAACACACACCTTAGAGCAAAAGATGGTTAAATATCAATTCAGGCTATTAACAGTAAGGG 2400

 52644513 ACGAAATGTGTTCCAACAAAACTCTGCATGTCAACAAACTACAGAGACTAGGTAACATCT 52644572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ACGAAATGTGTTCCAACAAAACTCTGCATGTCAACAAACTACAGAGACTAGGTAACATCT 2460

 52644573 TTTAGGAATCATTTTTATTCCACTAATGCCTTTTCCTCCAGAATCCACTGATCGTAAACG 52644632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TTTAGGAATCATTTTTATTCCACTAATGCCTTTTCCTCCAGAATCCACTGATCGTAAACG 2520

 52644633 CAACCTGTCTACTTCCGCCTTTGAAAAATGGATGGACAAATTC 52644675
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CAACCTGTCTACTTCCGCCTTTGAAAAATGGATGGACAAATTC 2563

EXCISED REGION

 52644677 TCTGCATGTAACTCACCTCCTCTTTTCTTTTACATAAAACAGATGCCACAGCTGTTATTG 52644736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2565 TCTGCATGTAACTCACCTCCTCTTTTCTTTTACATAAAACAGATGCCACAGCTGTTATTG 2624

 52644737 TTCTTCACACAGAAGTTTCTACCCAGAGAAACATCAGGATGACACTCTGCTGCAATGTGC 52644796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2625 TTCTTCACACAGAAGTTTCTACCCAGAGAAACATCAGGATGACACTCTGCTGCAATGTGC 2684

 52644797 TATTTGTTCTAGAGGGGTCAACAGCTTGCCACCTTGCCTAGGCCCAGGGTGACTGCATAT 52644856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2685 TATTTGTTCTAGAGGGGTCAACAGCTTGCCACCTTGCCTAGGCCCAGGGTGACTGCATAT 2744

 52644857 GTGCAGTGGTCTTATCCCATTAGCGCCCCCGAGCATGCATTCAGAACCAAGTGGATACAC 52644916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2745 GTGCAGTGGTCTTATCCCATTAGCGCCCCCGAGCATGCATTCAGAACCAAGTGGATACAC 2804

 52644917 CTTGGCACACTTACCTTCCCTGCAGGGACATCATCGGACTGCCCTGATAAGCCAGGAACC 52644976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2805 CTTGGCACACTTACCTTCCCTGCAGGGACATCATCGGACTGCCCTGATAAGCCAGGAACC 2864

 52644977 TCATCCACCTTGTCTTGATGCTCTGCCCTCTTGGCTTCCTGTTGGCTGTCACCTGGCACC 52645036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2865 TCATCCACCTTGTCTTGATGCTCTGCCCTCTTGGCTTCCTGTTGGCTGTCACCTGGCACC 2924

 52645037 TTTTCCTGTCCCTTGTCCAGCTTGAAGAATTTGTCAAAAAAGCTGGAGTCCTTGGGCTTG 52645096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2925 TTTTCCTGTCCCTTGTCCAGCTTGAAGAATTTGTCAAAAAAGCTGGAGTCCTTGGGCTTG 2984

 52645097 GAGGGAGCTTCTCCTCCTGCTCCCCCTGTCTCAGGTGGGAGAAGCGTGGGATCCCTGGCG 52645156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2985 GAGGGAGCTTCTCCTCCTGCTCCCCCTGTCTCAGGTGGGAGAAGCGTGGGATCCCTGGCG 3044

 52645157 GCAGAGAGGACCTTGTCTTGGGCCGGGGCGTGCCCTGGGGTTTTATCTGTGTCCTGCCCC 52645216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3045 GCAGAGAGGACCTTGTCTTGGGCCGGGGCGTGCCCTGGGGTTTTATCTGTGTCCTGCCCC 3104

 52645217 GGTCCAGCTGCCACCGGAAGTGTCCAGCTCTCACTTGGGTCTTTGTTCGCTGGAGCTTTA 52645276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3105 GGTCCAGCTGCCACCGGAAGTGTCCAGCTCTCACTTGGGTCTTTGTTCGCTGGAGCTTTA 3164

 52645277 TTGGAGCTGACATCAAGCTTCACTGATCCAAGGGATGAATCTGCGGCTTGGTCTCCGGTA 52645336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3165 TTGGAGCTGACATCAAGCTTCACTGATCCAAGGGATGAATCTGCGGCTTGGTCTCCGGTA 3224

 52645337 CGTCCTGGTACAGGCCGAGAGAGCATCAAGAAAAAACGAGATTTAGCAGCTGGTGCCTCG 52645396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3225 CGTCCTGGTACAGGCCGAGAGAGCATCAAGAAAAAACGAGATTTAGCAGCTGGTGCCTCG 3284

 52645397 GGTTTGGCCTCTTTCCCAAGATTCTTTCCGTTGGCATCCGCAACAGCACTTATCTCCGTT 52645456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3285 GGTTTGGCCTCTTTCCCAAGATTCTTTCCGTTGGCATCCGCAACAGCACTTATCTCCGTT 3344

 52645457 GTCTCGGGGGAAGAAGTGGCCACATTATCCGTCTTGACACTTATTCCCAAGTCGACTGTA 52645516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3345 GTCTCGGGGGAAGAAGTGGCCACATTATCCGTCTTGACACTTATTCCCAAGTCGACTGTA 3404

 52645517 AACACAAACATAAACAGTGGTTATTCAGCCAAGCCGGGAAATTCAGGCACTAATAATGGA 52645576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3405 AACACAAACATAAACAGTGGTTATTCAGCCAAGCCGGGAAATTCAGGCACTAATAATGGA 3464

 52645577 CTCCAGACATTTTTTATACAAAAGCCATACTGCATACTGGAACTGTGTTGTTCTCTGGTC 52645636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3465 CTCCAGACATTTTTTATACAAAAGCCATACTGCATACTGGAACTGTGTTGTTCTCTGGTC 3524

 52645637 ATTCTGAAAGGCAGAAGTTAGCTCTCTACATCTCCTTGGACCCTGCTTTTCTTGGGAGAG 52645696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3525 ATTCTGAAAGGCAGAAGTTAGCTCTCTACATCTCCTTGGACCCTGCTTTTCTTGGGAGAG 3584

 52645697 GAGAAGGCAAGGTTGGTGAGGAGGGAAAGCTACTTAATGGAAAGTCACTAGCTGCCAGGT 52645756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3585 GAGAAGGCAAGGTTGGTGAGGAGGGAAAGCTACTTAATGGAAAGTCACTAGCTGCCAGGT 3644

 52645757 GTGGAATGAGTGATATTCAATGTTAATTAATCTTCTTTTATCTGTGTAAGAACTCCGTGA 52645816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3645 GTGGAATGAGTGATATTCAATGTTAATTAATCTTCTTTTATCTGTGTAAGAACTCCGTGA 3704

 52645817 GCAGCATATTGTCATGATGTCAACTGGGAGGCAGTACAGCAGTTAGGAGCTTGGGTTCTG 52645876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3705 GCAGCATATTGTCATGATGTCAACTGGGAGGCAGTACAGCAGTTAGGAGCTTGGGTTCTG 3764

 52645877 GAGCTAGAACAAGGTTTCTCAACCTCAGCACTACTCACATTTGAAGCCAGATTATTCTTT 52645936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3765 GAGCTAGAACAAGGTTTCTCAACCTCAGCACTACTCACATTTGAAGCCAGATTATTCTTT 3824

 52645937 GTTAGGGAGGCTCATCCCGTGCCTCATAGGCTGATTAGCAGCATCCTGGCCTCTGCCCAC 52645996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3825 GTTAGGGAGGCTCATCCCGTGCCTCATAGGCTGATTAGCAGCATCCTGGCCTCTGCCCAC 3884

 52645997 TAGACGCCGGTCACATTTCCCAGTCATGGCAACCAAAAATATCTCTAGGCATTGCTAAAT 52646056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3885 TAGACGCCGGTCACATTTCCCAGTCATGGCAACCAAAAATATCTCTAGGCATTGCTAAAT 3944

 52646057 GTCCCCTGGAGGACAAAATCTCTTACGTTTGAGAGGCACTGAGCTGAAATGTCTTTTTGA 52646116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3945 GTCCCCTGGAGGACAAAATCTCTTACGTTTGAGAGGCACTGAGCTGAAATGTCTTTTTGA 4004

 52646117 ATCCAGATTATCTAATTTTCTGTGCCTCAACTTTCTGGTAAAAGGAGACAGATAATAAAT 52646176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4005 ATCCAGATTATCTAATTTTCTGTGCCTCAACTTTCTGGTAAAAGGAGACAGATAATAAAT 4064

 52646177 CTCGTAATTTTGTTAGGAAGATTACATGAGTTAATAGTTTTAAAGCAAGTACAATAGCAC 52646236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4065 CTCGTAATTTTGTTAGGAAGATTACATGAGTTAATAGTTTTAAAGCAAGTACAATAGCAC 4124

 52646237 CTGGAATATATTAAGTGCTTAATAAATATCACAAACATTAGTTATCATTATTCATGAGTG 52646296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4125 CTGGAATATATTAAGTGCTTAATAAATATCACAAACATTAGTTATCATTATTCATGAGTG 4184

 52646297 AGAAAACTGACAGTCAGAGAGGTCAGTACACCCTCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCTAGTAA 52646356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4185 AGAAAACTGACAGTCAGAGAGGTCAGTACACCCTCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCTAGTAA 4244

 52646357 GCAGCAGAGTCTGGCTTCAGGCAGAAATCTGACTTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGTCTTA 52646416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4245 GCAGCAGAGTCTGGCTTCAGGCAGAAATCTGACTTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGTCTTA 4304

 52646417 CCAGGGACTTGTATTAGCATAGACTGTTAAGAATATGGGAAGATTTTTAAAATACAGTAC 52646476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4305 CCAGGGACTTGTATTAGCATAGACTGTTAAGAATATGGGAAGATTTTTAAAATACAGTAC 4364

 52646477 TCAGAAAATTTCTCTTTGAAAGGCTGGAAGAGCAGATATCCACACAAGAAGGCAAATTAG 52646536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4365 TCAGAAAATTTCTCTTTGAAAGGCTGGAAGAGCAGATATCCACACAAGAAGGCAAATTAG 4424

 52646537 ACCTCAGGCCAGTGTGGAATTAAAGGTGTAGGGTTATCTGGTCAAGACTGTGTGTGTGGA 52646596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4425 ACCTCAGGCCAGTGTGGAATTAAAGGTGTAGGGTTATCTGGTCAAGACTGTGTGTGTGGA 4484

 52646597 TACAGGCTCCAACCCCTCCAGGCAAGGGCACTGTTTCCAACATCCACCCTTTCTCCTTTG 52646656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4485 TACAGGCTCCAACCCCTCCAGGCAAGGGCACTGTTTCCAACATCCACCCTTTCTCCTTTG 4544

 52646657 ACCTCTACCTTGACCTAAATTAACTATAAAAGGTCCTTCTTTTCTAGGACCCTACTATAA 52646716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4545 ACCTCTACCTTGACCTAAATTAACTATAAAAGGTCCTTCTTTTCTAGGACCCTACTATAA 4604

 52646717 ATCAGTGAAATATTCAGGAAAAAAAGAACACCAAGAATGTTGGGATCCCAGTTAAAGATC 52646776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4605 ATCAGTGAAATATTCAGGAAAAAAAGAACACCAAGAATGTTGGGATCCCAGTTAAAGATC 4664

 52646777 AAGATTCTCTACTGATAAGCTGTGTGATATGGAGTAAATCACTAAAGATCTTTGAATCTC 52646836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4665 AAGATTCTCTACTGATAAGCTGTGTGATATGGAGTAAATCACTAAAGATCTTTGAATCTC 4724

 52646837 TTCATTTGTAAAATGGGAATATTGGTAGTCCTACTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTAAAGA 52646896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4725 TTCATTTGTAAAATGGGAATATTGGTAGTCCTACTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTAAAGA 4784

 52646897 AGAAAAGTCATGCAAAGGATCTGGCACAACGCCTTTTCCATAATAAGTGCTTAGTAATTG 52646956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4785 AGAAAAGTCATGCAAAGGATCTGGCACAACGCCTTTTCCATAATAAGTGCTTAGTAATTG 4844

 52646957 ACAGATACTGTGATAACTTTTCAGGTTTCTCTCATGCCTTTGACAACATTGCATTTTGCT 52647016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4845 ACAGATACTGTGATAACTTTTCAGGTTTCTCTCATGCCTTTGACAACATTGCATTTTGCT 4904

 52647017 TGCTCTATCTGTAGTCAGACACTTCTTAATATCTGTTTGCAGGAAGACAGAAAAATAAAG 52647076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4905 TGCTCTATCTGTAGTCAGACACTTCTTAATATCTGTTTGCAGGAAGACAGAAAAATAAAG 4964

 52647077 GGAAGAATTGAGATTTCTTTGATCTATTCATACTGCTCATTAATATGTAGTGAGAAATAC 52647136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4965 GGAAGAATTGAGATTTCTTTGATCTATTCATACTGCTCATTAATATGTAGTGAGAAATAC 5024

 52647137 ATACACACACACATACACACACATGCATCCATTAGCAATTGTTTTTGCCCAACTCTAGTG 52647196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5025 ATACACACACACATACACACACATGCATCCATTAGCAATTGTTTTTGCCCAACTCTAGTG 5084

 52647197 TCTCGCAGTGTCTAGACTAAACAACAAACAAAAAAGGGGGGAGAGTGAGCTGGATTAAGC 52647256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5085 TCTCGCAGTGTCTAGACTAAACAACAAACAAAAAAGGGGGGAGAGTGAGCTGGATTAAGC 5144

 52647257 ATTGAGGCACAGTGAAGAAATGGTCTGGGGCAAGCCCAGGGATGAATGTTAGGGGTTTCT 52647316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5145 ATTGAGGCACAGTGAAGAAATGGTCTGGGGCAAGCCCAGGGATGAATGTTAGGGGTTTCT 5204

 52647317 CATAAACCTGAACCTGAAGAAAATCACCCTGCCAGCATATTGATCTTCTAGCTCTTCTTA 52647376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5205 CATAAACCTGAACCTGAAGAAAATCACCCTGCCAGCATATTGATCTTCTAGCTCTTCTTA 5264

 52647377 ACCTTTTTTTCTGTGATTCAGGAATTCATAATGATAGAAAATATTATACTAAAGAAGAAA 52647436
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5265 ACCTTTTTTTCTGTGATTCAGGAACTCATAATGATAGAAAATATTATACTAAAGAAGAAA 5324

 52647437 AAAAGAGGGAGAATAAGTAAGTGATAGATGGATGCATCAGGGTGTAAAGTTAGCAAGTAA 52647496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5325 AAAAGAGGGAGAATAAGTAAGTGATAGATGGATGCATCAGGGTGTAAAGTTAGCAAGTAA 5384

 52647497 GGCTGTTGAAGTGTCAGAGTGAATATAAATGAATTGTGGGAATGGTCCATGCCAGGAGAA 52647556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5385 GGCTGTTGAAGTGTCAGAGTGAATATAAATGAATTGTGGGAATGGTCCATGCCAGGAGAA 5444

 52647557 GAGGGTATGGTTGACAAAAAGGGAAATGCTAAGATTCAAAACAGGGAAGGGCTTTTCAAA 52647616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5445 GAGGGTATGGTTGACAAAAAGGGAAATGCTAAGATTCAAAACAGGGAAGGGCTTTTCAAA 5504

 52647617 ATGCCAAGAGCACCAACTTATATCTTTCAGTTTAATTCCTCTCTTCCTTACCCACTGGCT 52647676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5505 ATGCCAAGAGCACCAACTTATATCTTTCAGTTTAATTCCTCTCTTCCTTACCCACTGGCT 5564

 52647677 GGAAAGCAAAGGAGCTAGTGGTAAGTAAGAGTGTTATAGCCAGAGAAAAAGTCTTCAAAA 52647736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5565 GGAAAGCAAAGGAGCTAGTGGTAAGTAAGAGTGTTATAGCCAGAGAAAAAGTCTTCAAAA 5624

 52647737 AACACAAAGTACTTTCCATGGACAACCTTTTTTATTTTAAAGTGCCAATATGTTGCTTTG 52647796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5625 AACACAAAGTACTTTCCATGGACAACCTTTTTTATTTTAAAGTGCCAATATGTTGCTTTG 5684

 52647797 AAAAAGAATAAATTCCTTACATCCAGGTATCTGGACTAGACTTCAGTGCATTTAGTGATT 52647856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5685 AAAAAGAATAAATTCCTTACATCCAGGTATCTGGACTAGACTTCAGTGCATTTAGTGATT 5744

 52647857 ATAGCAAATCCAAACAGTAGCTTTTGATATCAGAGAATGGGTAAAGTGTTTTTGACAATT 52647916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5745 ATAGCAAATCCAAACAGTAGCTTTTGATATCAGAGAATGGGTAAAGTGTTTTTGACAATT 5804

 52647917 TCTAAGAACTTAGAGTTCTTCGGTGATACGTTCCATGCAACTGAAGCTCTGCTCTCCAAA 52647976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5805 TCTAAGAACTTAGAGTTCTTCGGTGATACGTTCCATGCAACTGAAGCTCTGCTCTCCAAA 5864

 52647977 TTTAGGTGGGTACATACCCAAGTCCATCACCTGGGGCTTCTATTTCCTTTGCTCAGATGC 52648036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5865 TTTAGGTGGGTACATACCCAAGTCCATCACCTGGGGCTTCTATTTCCTTTGCTCAGATGC 5924

 52648037 TCACCTCCTAGGTGGGCACCTGACATAAGATAGACTAATAAAAATAAGTCCTGTAACTTT 52648096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5925 TCACCTCCTAGGTGGGCACCTGACATAAGATAGACTAATAAAAATAAGTCCTGTAACTTT 5984

 52648097 TGATACTCCTATTAAAAAAGAGTTGCAAACCAATAGGAGGTACACTTGAGAATCAGCACA 52648156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5985 TGATACTCCTATTAAAAAAGAGTTGCAAACCAATAGGAGGTACACTTGAGAATCAGCACA 6044

 52648157 AATGAAAGTAGAACCTGGAAATCCAGGAAGCAGATACCCAATCATGTCATTTAAACATTT 52648216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6045 AATGAAAGTAGAACCTGGAAATCCAGGAAGCAGATACCCAATCATGTCATTTAAACATTT 6104

 52648217 AGATCCAGCTGTGCCTGAAGCTGAACTTTAGCATTACATAAGCCAATAAATCACTCTTCC 52648276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6105 AGATCCAGCTGTGCCTGAAGCTGAACTTTAGCATTACATAAGCCAATAAATCACTCTTCC 6164

 52648277 CCAACTTACGCCAGTTGAAATTGAATACATACTCAGTGACTTTGAGAGAATTCCAGGGAA 52648336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6165 CCAACTTACGCCAGTTGAAATTGAATACATACTCAGTGACTTTGAGAGAATTCCAGGGAA 6224

 52648337 TTGGTCAGTCCCTGTTTCACTTGTAAATACACAGCAATCAAGCCTACCAAATCTATGATT 52648396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6225 TTGGTCAGTCCCTGTTTCACTTGTAAATACACAGCAATCAAGCCTACCAAATCTATGATT 6284

 52648397 GATTGGGGTGTCTGAAAGAGATGGAGGGAATGGAATCAACCTGAAAAACATATTTCAGGA 52648456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6285 GATTGGGGTGTCTGAAAGAGATGGAGGGAATGGAATCAACCTGAAAAACATATTTCAGGA 6344

 52648457 GTTCATCCCTGAAAACTTCCCCAACCTAGCTAGAGGGGCCAACATTCAAATTCAGGAAAT 52648516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6345 GTTCATCCCTGAAAACTTCCCCAACCTAGCTAGAGGGGCCAACATTCAAATTCAGGAAAT 6404

 52648517 GCAGAGAACCCCAGTAAGATACTCCACAAAAAGATCTTCCCCAAGACATCATCATCAGAT 52648576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6405 GCAGAGAACCCCAGTAAGATACTCCACAAAAAGATCTTCCCCAAGACATCATCATCAGAT 6464

 52648577 TCTCCAAAGTTGAAATGTAAGAAAAAATGCTAAAGGCAACTAGAGTGAAAGGCCCGGTCA 52648636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6465 TCTCCAAAGTTGAAATGTAAGAAAAAATGCTAAAGGCAACTAGAGTGAAAGGCCCGGTCA 6524

 52648637 CCTAAAAAGGGAAGCACAGACTTACAGTGGACCTCTCACTGGTAACCCTACAAGCCAGAA 52648696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6525 CCTAAAAAGGGAAGCACAGACTTACAGTGGACCTCTCACTGGTAACCCTACAAGCCAGAA 6584

 52648697 GAGATTGAGGACCAATATTCAACATTCTTAAACAAAAAGAATTCCAACCCAGAATTTTAT 52648756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6585 GAGATTGAGGACCAATATTCAACATTCTTAAACAAAAAGAATTCCAACCCAGAATTTTAT 6644

 52648757 ATCTGACTAAACTAAGCTTCATAAGCAAAAGAGAAATAAGATCATTTTCAGACAAGCAAA 52648816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6645 ATCTGACTAAACTAAGCTTCATAAGCAAAAGAGAAATAAGATCATTTTCAGACAAGCAAA 6704

 52648817 TGCTAAGGGAATTTGTGACCATTAGACCTTCCTTGCAACAGTTCCTAAAGGAAGCACTAA 52648876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6705 TGCTAAGGGAATTTGTGACCATTAGACCTTCCTTGCAACAGTTCCTAAAGGAAGCACTAA 6764

 52648877 ATATGGAAAGACCATTACCAGACACTACAAAACACACTGAAGTACACAGACCAGTGACAT 52648936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6765 ATATGGAAAGACCATTACCAGACACTACAAAACACACTGAAGTACACAGACCAGTGACAT 6824

 52648937 TGTAAAGCAACTACATAACAAGTCTGCAAAATAACCAGCCAACATCATGATGACGGTATC 52648996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6825 TGTAAAGCAACTACATAACAAGTCTGCAAAATAACCAGCCAACATCATGATGACGGTATC 6884

 52648997 AAATCGACACATAGCAACACTAACCTTAAATGTAAATGGACTAAATGATCCCATTAAAAG 52649056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6885 AAATCGACACATAGCAACACTAACCTTAAATGTAAATGGACTAAATGATCCCATTAAAAG 6944

 52649057 ACATAAAGTGGCAGGCTGGATAAAGAACCAAGAACCATTGGTATACTGTCTTCAAGAGAC 52649116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6945 ACATAAAGTGGCAGGCTGGATAAAGAACCAAGAACCATTGGTATACTGTCTTCAAGAGAC 7004

 52649117 CCATCTCCTATGCAGTGACACACATAGGTTCAAGATAAAGGGATGGGGAAAAATCTACCA 52649176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7005 CCATCTCCTATGCAGTGACACACATAGGTTCAAGATAAAGGGATGGGGAAAAATCTACCA 7064

 52649177 AGCAAATAGAAAACAGAATAAAACAGGGGTTGCAATCCTAGTTGCCGTCAAAACAGACTT 52649236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7065 AGCAAATAGAAAACAGAATAAAACAGGGGTTGCAATCCTAGTTGCCGTCAAAACAGACTT 7124

 52649237 TAAACCAACAAAGGTTAAAAGAAAAAAATATGGGCATTGCATAAGGATAAAGTGTTAAAT 52649296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7125 TAAACCAACAAAGGTTAAAAGAAAAAAATATGGGCATTGCATAAGGATAAAGTGTTAAAT 7184

 52649297 TAAACAAGAAGATCTAACTATCCTAAGTATATATGCACCAAACACAGGAACACCCAGATT 52649356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7185 TAAACAAGAAGATCTAACTATCCTAAGTATATATGCACCAAACACAGGAACACCCAGATT 7244

 52649357 CATAAAGCAAGTTTATGGAGACCTTCAAACAGACTTAGACTCCCACACAATAGTAGTGGG 52649416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7245 CATAAAGCAAGTTTATGGAGACCTTCAAACAGACTTAGACTCCCACACAATAGTAGTGGG 7304

 52649417 AGACTTTAATACCCCATGACAATATTAGACAGATCATTGAGACAGGAAATTAACAAAGAT 52649476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7305 AGACTTTAATACCCCATGACAATATTAGACAGATCATTGAGACAGGAAATTAACAAAGAT 7364

 52649477 ATTCAAGATCTAACTCAGCACTAAATCAAATGGCCCTGATAGATATCTACAGGACTGTCC 52649536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7365 ATTCAAGATCTAACTCAGCACTAAATCAAATGGCCCTGATAGATATCTACAGGACTGTCC 7424

 52649537 TACTTGAAACCATACAATTACATGGTAATTGAATGACCTGCTCCTGAATGACTTTTGGGT 52649596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7425 TACTTGAAACCATACAATTACATGGTAATTGAATGACCTGCTCCTGAATGACTTTTGGGT 7484

 52649597 AAATAATAAAATTAAGGCAGAAATCAAGAAGTTTTTTGAACTAATGAGAACAAAGATACA 52649656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7485 AAATAATAAAATTAAGGCAGAAATCAAGAAGTTTTTTGAACTAATGAGAACAAAGATACA 7544

 52649657 ACATACCAGAATCTTTGGGACACAGCTAAGGCAGTGTTAAGAGGGAAATTTATAGCACTA 52649716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7545 ACATACCAGAATCTTTGGGACACAGCTAAGGCAGTGTTAAGAGGGAAATTTATAGCACTA 7604

 52649717 AATCCCACATCAAAAAGTTAGAAAGAGCTCACGTTAACAATCTAACCTCACAACTACAGG 52649776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7605 AATCCCACATCAAAAAGTTAGAAAGAGCTCACGTTAACAATCTAACCTCACAACTACAGG 7664

 52649777 AACTAGAGAACTGAGAGCAGAAAAACCTGAAAGCTAGCAGAAGACAAGAAATAACCAAAA 52649836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7665 AACTAGAGAACTGAGAGCAGAAAAACCTGAAAGCTAGCAGAAGACAAGAAATAACCAAAA 7724

 52649837 TTAGAGCTGAACTGAAGGAGATTGAGACATGAAAAACCATTCAAAAGATCAGTGAATTCA 52649896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7725 TTAGAGCTGAACTGAAGGAGATTGAGACATGAAAAACCATTCAAAAGATCAGTGAATTCA 7784

 52649897 GGAGCTGTTTTTTTTTTGAACAAATTAATAAAATAGACCATTAGCTAGAGTAATAAACAA 52649956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7785 GGAGCTGTTTTTTTTTTGAACAAATTAATAAAATAGACCATTAGCTAGAGTAATAAACAA 7844

 52649957 GAAAATAGAAAAGATTCAAATAAACACAATCAGAAACGACAAGGGGGATATTACCACTGA 52650016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7845 GAAAATAGAAAAGATTCAAATAAACACAATCAGAAACGACAAGGGGGATATTACCACTGA 7904

 52650017 CCCCACAGAAGTACAAACAACCATCAGAGAATATTATGAACATCTCTATGCACATAAACT 52650076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7905 CCCCACAGAAGTACAAACAACCATCAGAGAATATTATGAACATCTCTATGCACATAAACT 7964

 52650077 AGAAAATCTAGAAGAAGTGGATAAACTTCTGGACATATACACCCTTCTAAGACTGTACCA 52650136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7965 AGAAAATCTAGAAGAAGTGGATAAACTTCTGGACATATACACCCTTCTAAGACTGTACCA 8024

 52650137 GGAAGAAATTGAATCCCTGAACAGACCAATAATGAGCCCTAAAATTGAGGAAGTAATACA 52650196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8025 GGAAGAAATTGAATCCCTGAACAGACCAATAATGAGCCCTAAAATTGAGGAAGTAATACA 8084

 52650197 TAGACTACCAACCATAAAAAAACCCAGTACTAGATGGATTCACAGGTAAGTTCTACCAGT 52650256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8085 TAGACTACCAACCATAAAAAAACCCAGTACTAGATGGATTCACAGGTAAGTTCTACCAGT 8144

 52650257 TGTACAAAGAAGAGCTGGTACAGTTCCTACTGAAATTATTCCAAAAAGTTGAGTAGGAGG 52650316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8145 TGTACAAAGAAGAGCTGGTACAGTTCCTACTGAAATTATTCCAAAAAGTTGAGTAGGAGG 8204

 52650317 GAGTCCTTCCTAACTCATTTGATGAGGCCAGCATCATCCTGATATCAAAACCTGGCAGAT 52650376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8205 GAGTCCTTCCTAACTCATTTGATGAGGCCAGCATCATCCTGATATCAAAACCTGGCAGAT 8264

 52650377 ATACAACAAGAAAAGCTTCAGGCCAATATCCTTGATGAACTTCAATGCAAAAATCCTCAA 52650436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8265 ATACAACAAGAAAAGCTTCAGGCCAATATCCTTGATGAACTTCAATGCAAAAATCCTCAA 8324

 52650437 TAAAATACTGGCAAACTGAATCCAGCAGCACACCAAAAAGCTTATCCACCATGATCAAGT 52650496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8325 TAAAATACTGGCAAACTGAATCCAGCAGCACACCAAAAAGCTTATCCACCATGATCAAGT 8384

 52650497 AGAATGCAAGTTGGTTCAACATATACAAATCAATAAATGTGACTCATCACATAAACAGAA 52650556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8385 AGAATGCAAGTTGGTTCAACATATACAAATCAATAAATGTGACTCATCACATAAACAGAA 8444

 52650557 CTAAAGACAAAAACTACATGATTATCTCAACAGATGCAGAAAAGGCTTTCAATAAAATTA 52650616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8445 CTAAAGACAAAAACTACATGATTATCTCAACAGATGCAGAAAAGGCTTTCAATAAAATTA 8504

 52650617 GACATCCATTTATGTTAAAAACTCTCAATAAACTAGGTATTGAAGGAACATACCTCAAAA 52650676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8505 GACATCCATTTATGTTAAAAACTCTCAATAAACTAGGTATTGAAGGAACATACCTCAAAA 8564

 52650677 TAATAAGAGCCATGTATGACAAACCCACAGCTAAGATCATACTGAATGGGCAAAAGCTGG 52650736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8565 TAATAAGAGCCATGTATGACAAACCCACAGCTAAGATCATACTGAATGGGCAAAAGCTGG 8624

 52650737 AAGCATTTTCTTTGAAGACTGGCATAAGACAAGGATGATCTCTCTCACCACTCCTATTCA 52650796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8625 AAGCATTTTCTTTGAAGACTGGCATAAGACAAGGATGATCTCTCTCACCACTCCTATTCA 8684

 52650797 ACATAGTATTGGAAGTCTTGGCCAGGGCAATCGGGCAAGAGAAATAAATAAAGCGCATCC 52650856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8685 ACATAGTATTGGAAGTCTTGGCCAGGGCAATCGGGCAAGAGAAATAAATAAAGCGCATCC 8744

 52650857 AAATAGGAAGAGAGGAAGTCAAACTATCCTTGTTTGCAGATTACATGACATTATATCTAG 52650916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8745 AAATAGGAAGAGAGGAAGTCAAACTATCCTTGTTTGCAGATTACATGACATTATATCTAG 8804

 52650917 AAAACCCCATAGTCTCAGCCCCAAAGCTTCTTAAGCTGATAAACAACTTCAGCAAAGTCT 52650976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8805 AAAACCCCATAGTCTCAGCCCCAAAGCTTCTTAAGCTGATAAACAACTTCAGCAAAGTCT 8864

 52650977 CAGGATACAAAATAAATGTGCAAAAATTACTGGCATTTCCATGCACCAACAACAGTCAAG 52651036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8865 CAGGATACAAAATAAATGTGCAAAAATTACTGGCATTTCCATGCACCAACAACAGTCAAG 8924

 52651037 CCAGGAGCCAAACCAGGAATGCACTCCCACTCACAATCGCCACAAAAAGAGTAAAATACC 52651096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8925 CCAGGAGCCAAACCAGGAATGCACTCCCACTCACAATCGCCACAAAAAGAGTAAAATACC 8984

 52651097 TAGGAAAACAGCTAATTAGGGAGGTGAAAGATCTCTACAAGGAGAATAATGAACCAGCGC 52651156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8985 TAGGAAAACAGCTAATTAGGGAGGTGAAAGATCTCTACAAGGAGAATAATGAACCAGCGC 9044

 52651157 TCAAAGAAATTAGAGATGACACAAACAAATGGAAAAACATTCCATGTTCATTGATAGGAA 52651216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9045 TCAAAGAAATTAGAGATGACACAAACAAATGGAAAAACATTCCATGTTCATTGATAGGAA 9104

 52651217 GAATCAATATCATTAAAATGGCCATATTGCCCAGAGCAATTTATAGATTCAATGCTATAC 52651276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9105 GAATCAATATCATTAAAATGGCCATATTGCCCAGAGCAATTTATAGATTCAATGCTATAC 9164

 52651277 CTATTAAACTACTGTTGAGATTCTTCACAGAACCAGAGAAAACTATTTTAAAATTCATAT 52651336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9165 CTATTAAACTACTGTTGAGATTCTTCACAGAACCAGAGAAAACTATTTTAAAATTCATAT 9224

 52651337 AGAACCCAGAAAAGAGCCTGAATTGCTAAGGCAATCCTAAGCAAAAAGCATAAAGCTGAA 52651396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9225 AGAACCCAGAAAAGAGCCTGAATTGCTAAGGCAATCCTAAGCAAAAAGCATAAAGCTGAA 9284

 52651397 GGCATCATGCTACCTGACTTCAAACTATACTACAAGGCTACAGTAACCAAAACAGCATAC 52651456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9285 GGCATCATGCTACCTGACTTCAAACTATACTACAAGGCTACAGTAACCAAAACAGCATAC 9344

 52651457 TACTGGTACAAAAACAGACACATAGACCAATGGAACAGAATAGAGAACCCGGAAATAAGA 52651516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9345 TACTGGTACAAAAACAGACACATAGACCAATGGAACAGAATAGAGAACCCGGAAATAAGA 9404

 52651517 CCACACACCTACAACTATCTAATCTTTGACAAACCTGACAAAAACATGCAATGGGGAAAA 52651576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9405 CCACACACCTACAACTATCTAATCTTTGACAAACCTGACAAAAACATGCAATGGGGAAAA 9464

 52651577 GATTTCCTATTCAATAAAAAGTGCTGGGATAACCGGCTAGCTGTACACAGAAGATTAAAG 52651636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9465 GATTTCCTATTCAATAAAAAGTGCTGGGATAACCGGCTAGCTGTACACAGAAGATTAAAG 9524

 52651637 CTGGACCCCTTCCTTACAACATATACAAAAATCGGCCGGGCTTGGTGGCTCACGCTTGTA 52651696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9525 CTGGACCCCTTCCTTACAACATATACAAAAATCGGCCGGGCTTGGTGGCTCACGCTTGTA 9584

 52651697 ATCCCAGCACTTTGGAAGGCCGAGGAGGGCGGATCATGAGGTCAGGAGATCGAGAACACG 52651756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9585 ATCCCAGCACTTTGGAAGGCCGAGGAGGGCGGATCATGAGGTCAGGAGATCGAGAACACG 9644

 52651757 GTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGTGTGGT 52651804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9645 GTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGTGTGGT 9692

Alignment time is 10.5812 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [52637064,52668002] =>     30939 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    8217] =>      8217 nucs 'mol-32-33a0-119778_8217'

Score:        7979
Aligned:      8220        nucs
Identic:      8194 (100%) nucs =>      7960 (100%)       234 (100%)
Gaps:            7 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [52639083,52647064] EXCISED REGION [52658003,52658236]
 second seq =>  [       1,    7983] EXCISED REGION [    7984,    8217]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>     10938 nucs [52647065,52658002]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         6 nucs [52647065,52647070] to [52658003,52658008]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [52647065,52647067] to [52658000,52658002]
 second seq =>         0 nucs

 52639083 GGTTTTTAAATGATTGAGTATAACAGGCTTAGGTGACAGATGGATCTCGATTCCACTTCT 52639142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGTTTTTAAATGATTGAGTATAACAGGCTTAGGTGACAGATGGATCTCGATTCCACTTCT 60

 52639143 GCCACTAATTAGCTTTGCGACCTTAACGCAGGTAACTTAAGTTCTCCCCAAGTTCTCTCC 52639202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCCACTAATTAGCTTTGCGACCTTAACGCAGGTAACTTAAGTTCTCCCCAAGTTCTCTCC 120

 52639203 TCTGTTCAATGGCAATAGAAATACCTACCTTGTTGGGTTTTTTTAACAATAAAAACAGAT 52639262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCTGTTCAATGGCAATAGAAATACCTACCTTGTTGGGTTTTTTTAACAATAAAAACAGAT 180

 52639263 AATGTATGCAAAATGCTTACTGCACAGCCTAGAAATAATGAATTATTTTAAAATGGGGCT 52639322
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AATGTATGCAAAATGCTTACTACACAGCCTAGAAATAATGAATTATTTTAAAATGGGGCT 240

 52639323 ATTATTGTCATTTAACTCAACCACACAGCTATTTAGTGGTAGAGTCTGGACTCATACCTA 52639382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATTATTGTCATTTAACTCAACCACACAGCTATTTAGTGGTAGAGTCTGGACTCATACCTA 300

 52639383 GGTCACCCAGGCTCCTAACACTTCCACATCACCTCTGCCACTGCAAACATCTCATATTAA 52639442
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GGTCACCTAGGCTCCTAACACTTCCACATCACCTCTGCCACTGCAAACATCTCATATTAA 360

 52639443 GCGTTTCTTACTGCTAAATGCATCAAAATCCCAGTGGTATAGCTGAGGACCTTGTTTACT 52639502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GCGTTTCTTACTGCTAAATGCATCAAAATCCCAGTGGTATAGCTGAGGACCTTGTTTACT 420

 52639503 CCAAAACTTGCATAATGTAAGATGGATTTTCCCTTTGCACTGACAAAGTCTTTTGGGTGG 52639562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCAAAACTTGCATAATGTAAGATGGATTTTCCCTTTGCACTGACAAAGTCTTTTGGGTGG 480

 52639563 CTAGTTCTCTTTACCAGTTGAAAAGGCATGGCCTTGTGGACATAAGGCAGAAACAACACA 52639622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTAGTTCTCTTTACCAGTTGAAAAGGCATGGCCTTGTGGACATAAGGCAGAAACAACACA 540

 52639623 AAATAAAAAACAGTTAATAATTCACTTGGCCTTCTAATGTTGAAATTCGGTAATTCTTTT 52639682
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
      541 AAATAAAAAACAGTTAATAATTCACTTGGCCTTCTAATGTTGAAATTGGGTAATTCTTTT 600

 52639683 TATTTGTTTTTATTTTTCACTTGGGATTTTGGGTATTTACAACTTTGCATATGCTAACAT 52639742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TATTTGTTTTTATTTTTCACTTGGGATTTTGGGTATTTACAACTTTGCATATGCTAACAT 660

 52639743 CTTTGAATTTCATTGCCTCAAGTTGTAACTTCATTGAACAAGTTTCAAATAATTGGCAAA 52639802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTTTGAATTTCATTGCCTCAAGTTGTAACTTCATTGAACAAGTTTCAAATAATTGGCAAA 720

 52639803 AATAGAAACGTTGACTATTTAAGACTATGGGCTTTGGAGATGGACAATTTTGGCTGTGCC 52639862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AATAGAAACGTTGACTATTTAAGACTATGGGCTTTGGAGATGGACAATTTTGGCTGTGCC 780

 52639863 ACCTTTTAGCTGTGTGTCAGGAGTGATATGCTTTCTCTGAACTGTTGACTTCTTCATCTG 52639922
          ||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
      781 ACCTTTTAGCTGTGTGTCAGGAATGATATGCTTTCTCTGAACTGTTGGCTTCTTCATCTG 840

 52639923 TAAAATGGTGAAAATACAGGAATTCCCTGGTAAGATTTGATGGCTCAATGAGCTGATTTC 52639982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TAAAATGGTGAAAATACAGGAATTCCCTGGTAAGATTTGATGGCTCAATGAGCTGATTTC 900

 52639983 TACAAAATGATTTAATCACAGAATTTGACTTAAAATGCGAGAGGGATTCATGCTGTCCGA 52640042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TACAAAATGATTTAATCACAGAATTTGACTTAAAATGCGAGAGGGATTCATGCTGTCCGA 960

 52640043 AATCATCCAAGAGTGGAGATATCTGGTTAGCTTCATGGAGAACCTGGCACTGAATATCAA 52640102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AATCATCCAAGAGTGGAGATATCTGGTTAGCTTCATGGAGAACCTGGCACTGAATATCAA 1020

 52640103 GTCAATTTTTGATAAACAGAGAGAGAAAGGGACATAGGCAGAGAAAATACCAGGAGACAG 52640162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GTCAATTTTTGATAAACAGAGAGAGAAAGGGACATAGGCAGAGAAAATACCAGGAGACAG 1080

 52640163 ATGGCGTTTGCACAGGTCAGGTGTTGGCCATATTGACTGGAGAAATTTAAGGGAAGGGTG 52640222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATGGCGTTTGCACAGGTCAGGTGTTGGCCATATTGACTGGAGAAATTTAAGGGAAGGGTG 1140

 52640223 GAAAATGCAGTTGGAAAATAGGCAGAGGAAACATTGTGGAAACCCTTAAATGTCAGACAA 52640282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GAAAATGCAGTTGGAAAATAGGCAGAGGAAACATTGTGGAAACCCTTAAATGTCAGACAA 1200

 52640283 AGAAACTGAGGCTTATGGGCATGGACACTAACATTTCTATTGTTTCAAAAATAATTTTAC 52640342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AGAAACTGAGGCTTATGGGCATGGACACTAACATTTCTATTGTTTCAAAAATAATTTTAC 1260

 52640343 AACTTTTATACCTTTCTCACCCAAGTTAGGACTTGTGCCTTTGGTTATACAACTCTTAAA 52640402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AACTTTTATACCTTTCTCACCCAAGTTAGGACTTGTGCCTTTGGTTATACAACTCTTAAA 1320

 52640403 TTAGAGTCAACTGTGCTATCTCTGTGAGTTTGGGTTGAGGACTATGGAAGGGAAAGGCAA 52640462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTAGAGTCAACTGTGCTATCTCTGTGAGTTTGGGTTGAGGACTATGGAAGGGAAAGGCAA 1380

 52640463 AAAATAAAAGTAAAATGTGAAGTAGAAGACAGGGAGAAAACCCATAATACTGGTAATAGC 52640522
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     1381 AAAATAAAAGTAAAATGTGAAGTAGAAGACAGGGAGAAAACCCATAATACTAGTAATAGC 1440

 52640523 TAATTTCTCTTTTTCTTCTTTCAAAATGCAATTTGTGCTAAGTACTTTATATGGCCTATC 52640582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TAATTTCTCTTTTTCTTCTTTCAAAATGCAATTTGTGCTAAGTACTTTATATGGCCTATC 1500

 52640583 TCATTTAACTTCTAAAAGTGTGAACAATGTGAGAATGTGCTAGATACTATTATTATCCCC 52640642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TCATTTAACTTCTAAAAGTGTGAACAATGTGAGAATGTGCTAGATACTATTATTATCCCC 1560

 52640643 ATTTTACAGATGAGGAAACTGAGGCTCAGGAGGTGAAGTAGCTTGCCCAAGATCACACAG 52640702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ATTTTACAGATGAGGAAACTGAGGCTCAGGAGGTGAAGTAGCTTGCCCAAGATCACACAG 1620

 52640703 CCAGTAGGTGACAGAGGTAGAGAGGAAACCTAGGCTACTTGACTATGATGCTTATGTTTA 52640762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CCAGTAGGTGACAGAGGTAGAGAGGAAACCTAGGCTACTTGACTATGATGCTTATGTTTA 1680

 52640763 ATTCACTACTAAATACCATGTAGGAAAGGACTCTGGAGACCTTAGTTCTTTAATTCCAAT 52640822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ATTCACTACTAAATACCATGTAGGAAAGGACTCTGGAGACCTTAGTTCTTTAATTCCAAT 1740

 52640823 TCTACCACTAAACAGTAGAGACAGGATGAACTTGTCATTCACTGAGATGGAAAACCCCGT 52640882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TCTACCACTAAACAGTAGAGACAGGATGAACTTGTCATTCACTGAGATGGAAAACCCCGT 1800

 52640883 GAATTAAACTGGTGGGCATTTTGTTTTTGTCATTGTTAGGCGATGAATGAAGAGTTCCAT 52640942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GAATTAAACTGGTGGGCATTTTGTTTTTGTCATTGTTAGGCGATGAATGAAGAGTTCCAT 1860

 52640943 TCTGGACACATTAGGGTTGAGATACTCAGTGAGCAGCCAAATGGGGATGTAGAAATTCAA 52641002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TCTGGACACATTAGGGTTGAGATACTCAGTGAGCAGCCAAATGGGGATGTAGAAATTCAA 1920

 52641003 GTAGACATGTGGAAGAGGAGGCAGCTGAGACTCACGTCTGGACTTCAGGGATGGATCCCG 52641062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GTAGACATGTGGAAGAGGAGGCAGCTGAGACTCACGTCTGGACTTCAGGGATGGATCCCG 1980

 52641063 GCTAGAGATGTAAATTTGGAACTTGTCAACCCATAGCAGTATTTAAACCTTTGGGACTGA 52641122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GCTAGAGATGTAAATTTGGAACTTGTCAACCCATAGCAGTATTTAAACCTTTGGGACTGA 2040

 52641123 GGGAAACCTTCAAGGAAATAAGCGTAGTTAGAGATAGCCAAGAAGTGAACCCTGGGGAAG 52641182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GGGAAACCTTCAAGGAAATAAGCGTAGTTAGAGATAGCCAAGAAGTGAACCCTGGGGAAG 2100

 52641183 TCCAACATTTAGAGGGTGAGATCCAGCAAAGGAGATGATGGAAGAGTACCAGGGAGGTGG 52641242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TCCAACATTTAGAGGGTGAGATCCAGCAAAGGAGATGATGGAAGAGTACCAGGGAGGTGG 2160

 52641243 AAGGATGTTGTTTCAAACAGCAAGGTGTGGCCCACTCAGTCACTGTGTCGGATTCAACTT 52641302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AAGGATGTTGTTTCAAACAGCAAGGTGTGGCCCACTCAGTCACTGTGTCGGATTCAACTT 2220

 52641303 GCAGGTCAGACCTACTAGGACAAAGATAGAGACCTATAGGATTTGGCAGCCAGGGTGATG 52641362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GCAGGTCAGACCTACTAGGACAAAGATAGAGACCTATAGGATTTGGCAGCCAGGGTGATG 2280

 52641363 GTAGGGAATTTGAAACATCATGGTGGCTGTGACAAGAGCCTGAATGGAGTGTGTTCAAGA 52641422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GTAGGGAATTTGAAACATCATGGTGGCTGTGACAAGAGCCTGAATGGAGTGTGTTCAAGA 2340

 52641423 GAGAAAAGAAGAGAAGTGAAAACACAGAATATTGTTCTTATTATTAGTAGCCTGAGCCAA 52641482
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     2341 GAGAAAAGAAGAGAAGTGAAAACACAGAATATTGTTCTTATTATTAGTAGCCTGAGCAAA 2400

 52641483 TCTGAGGACCGATGCACTTATCACAATGTCTCTTAAAATACTATGTCTCTTACTAGATTA 52641542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TCTGAGGACCGATGCACTTATCACAATGTCTCTTAAAATACTATGTCTCTTACTAGATTA 2460

 52641543 TACACTCCTTGACAGACGAGAAACATGATTTATTTTTCAAATGCCTTGCACAAGGTTAGT 52641602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TACACTCCTTGACAGACGAGAAACATGATTTATTTTTCAAATGCCTTGCACAAGGTTAGT 2520

 52641603 GCGAAAGTAACGATTGCAGGATTTAATTACACTTTTAAAAGAAAAAAGACATTCTTCATC 52641662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GCGAAAGTAACGATTGCAGGATTTAATTACACTTTTAAAAGAAAAAAGACATTCTTCATC 2580

 52641663 TTATGAAACTCTGCATGGCAACACTTTATGCGCCCCACACCCCCACTCAACACAAACACA 52641722
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TTATGAAACTCTGCATGGCAACACTTTACGCGCCCCACACCCCCACTCAACACAAACACA 2640

 52641723 ACTCTGGAAGTACTGTGTTGATAACAGAAATGTGGTGGGTTTTATTTTTAACCAATAAAG 52641782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 ACTCTGGAAGTACTGTGTTGATAACAGAAATGTGGTGGGTTTTATTTTTAACCAATAAAG 2700

 52641783 GTCAAGTTTGCATTATGTGATTTTGTGTGTGTGTGTGTTGAATCTTTTAAATGCATATCT 52641842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GTCAAGTTTGCATTATGTGATTTTGTGTGTGTGTGTGTTGAATCTTTTAAATGCATATCT 2760

 52641843 TACAGCTCTGGTTCAGTTGTTGTGGGGAGAGGAAAAAAACCTCATCCCTGCCAACACATT 52641902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TACAGCTCTGGTTCAGTTGTTGTGGGGAGAGGAAAAAAACCTCATCCCTGCCAACACATT 2820

 52641903 GGTTTGTATGAATCACAGCTCAGTGAAACCTTTCAGGCATATAATTTATCTTTTCTTTGG 52641962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GGTTTGTATGAATCACAGCTCAGTGAAACCTTTCAGGCATATAATTTATCTTTTCTTTGG 2880

 52641963 CCTATGTAGTAAACGCTTCATTTGTTCATGAATTCTTGCCTTGTTTTAATTATGCTTTGC 52642022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CCTATGTAGTAAACGCTTCATTTGTTCATGAATTCTTGCCTTGTTTTAATTATGCTTTGC 2940

 52642023 CCTGAATGTAGTTTTATAAGGCACAAAAATAAGATTGTCGTTCTGAAAACACAGAAGATT 52642082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CCTGAATGTAGTTTTATAAGGCACAAAAATAAGATTGTCGTTCTGAAAACACAGAAGATT 3000

 52642083 TGTATGTTTCCCCCAGGATGAAATGGTGGCATCTTTCTCCCAATTCACAGCTCTGTGGGC 52642142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TGTATGTTTCCCCCAGGATGAAATGGTGGCATCTTTCTCCCAATTCACAGCTCTGTGGGC 3060

 52642143 TTGTGGCTGGAATTCCAATCCAGCAGGGAGCAAGCCATAAAAATGGGGGGAAGGGCTGCT 52642202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TTGTGGCTGGAATTCCAATCCAGCAGGGAGCAAGCCATAAAAATGGGGGGAAGGGCTGCT 3120

 52642203 GGAGGGAGGCAGTAGATGCGGCTGAGCCCAAGGCATAATTCACCCTAAGAATTCTGAATC 52642262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 GGAGGGAGGCAGTAGATGCGGCTGAGCCCAAGGCATAATTCACCCTAAGAATTCTGAATC 3180

 52642263 AATACACTGACATCCAGCCATGTACAATGTGGTACTCCCACCAAGAAAGCCACTGATTGA 52642322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 AATACACTGACATCCAGCCATGTACAATGTGGTACTCCCACCAAGAAAGCCACTGATTGA 3240

 52642323 GAAGTTTTATTCATGTTACTTTCTGAGGGTTGGATTGTCCCATTACATTTATAGAACAAT 52642382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 GAAGTTTTATTCATGTTACTTTCTGAGGGTTGGATTGTCCCATTACATTTATAGAACAAT 3300

 52642383 TGCTTTTTTCCCCCTAAATACAGAACTATGCAGCCGGGAGTCAGAAAAGAAACCTTGACA 52642442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TGCTTTTTTCCCCCTAAATACAGAACTATGCAGCCGGGAGTCAGAAAAGAAACCTTGACA 3360

 52642443 ATCAGAAGGCTGTTTTGTTGTTGTTGTTAAAAACCTTTGCAGGCATATGCATCTGAATAT 52642502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 ATCAGAAGGCTGTTTTGTTGTTGTTGTTAAAAACCTTTGCAGGCATATGCATCTGAATAT 3420

 52642503 CCATAAGTTCACAGGCTGAGGGAGAAATGGCTATTTCATAACTTTTCTGTGTTTCTCATG 52642562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 CCATAAGTTCACAGGCTGAGGGAGAAATGGCTATTTCATAACTTTTCTGTGTTTCTCATG 3480

 52642563 TACATAGTACAAAGTGGGCACTCAGTATTTCAAATTTCAATATCACTGAAAAAAATGGAA 52642622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TACATAGTACAAAGTGGGCACTCAGTATTTCAAATTTCAATATCACTGAAAAAAATGGAA 3540

 52642623 ATTTGTCATGTAACAAAATCAGATGCAGACTTCACTGGTGAATCTGAGGGAGTGAATTCA 52642682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 ATTTGTCATGTAACAAAATCAGATGCAGACTTCACTGGTGAATCTGAGGGAGTGAATTCA 3600

 52642683 CTTATTCAGAAAGGAAGACAGTTACAATTCTTGGGTCTTCTGAGAGATCATTATAACTTG 52642742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 CTTATTCAGAAAGGAAGACAGTTACAATTCTTGGGTCTTCTGAGAGATCATTATAACTTG 3660

 52642743 AAAATATTACACAAGGGCTTTGCTATATTAGATACCTGCCATGTTCCTAACACAAGCTCC 52642802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     3661 AAAATATTACACAAGGGCTTTGCTATATTAGATACCTGCCATGTTCCTAATACAAGCTCC 3720

 52642803 CATTTTCTGACTCAAATCTCATTTTGGAACACATTCCACTCAAATTGAGGTTCTACCCCT 52642862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 CATTTTCTGACTCAAATCTCATTTTGGAACACATTCCACTCAAATTGAGGTTCTACCCCT 3780

 52642863 AAGAGTTCTTTTTCAATAAAGAAAGCTGAGTTAATAAATCACAACTCCAAAACTTTTCCT 52642922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 AAGAGTTCTTTTTCAATAAAGAAAGCTGAGTTAATAAATCACAACTCCAAAACTTTTCCT 3840

 52642923 CACTTTTCTTAGACTAGAAATAGATTGAGTGTGTCGAGGTTTTATGGCTGAGTACATTGG 52642982
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 CACTTTTCTTAGACTAGAAATAGATTGAATGTGTCGAGGTTTTATGGCTGAGTACATTGG 3900

 52642983 AGGGCTGGCTATTCTATGCTGAACTGGTTTACTTGATTAAGATGGGGATTTGGATGAGTC 52643042
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     3901 AGGGCTGGCTATTCTATGCTGAACTGGTTTACTCGATTAAGATGGGGATTTGGATGAGTC 3960

 52643043 ACCGGACACCTGTCCAAAGATGAGTAAAACACATTCCTTCATTGTCTTCCCATAAATAAC 52643102
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 ACTGGACACCTGTCCAAAGATGAGTAAAACACATTCCTTCATTGTCTTCCCATAAATAAC 4020

 52643103 TCAATCTTCTCCTAACTGAGCCAATGGATAGGCTTTGGATGCCCAAGCAAAACAAACACA 52643162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     4021 TCAATCTTCTCCTAACTGAGCCAATGGATAGGCTTTGGATGCCCAAGCAAAAGAAACACA 4080

 52643163 TGACTGTTAAAAAATCACAACCTCAAAATGGCCTTAGAAGCCTATGACCAATAATGAGAA 52643222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 TGACTGTTAAAAAATCACAACCTCAAAATGGCCTTAGAAGCCTATGACCAATAATGAGAA 4140

 52643223 TGGTTTCTCCACTCAGGCGCAAGTAGTAAACAGTTTCTCCCATATGCAGGAATATTGACG 52643282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 TGGTTTCTCCACTCAGGCGCAAGTAGTAAACAGTTTCTCCCATATGCAGGAATATTGACG 4200

 52643283 ACTAGTTTACCGCCTCTGGGCACGTAACTTTCAGGTCCTGGTTCATGCATTTGCTGGAAT 52643342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 ACTAGTTTACCGCCTCTGGGCACGTAACTTTCAGGTCCTGGTTCATGCATTTGCTGGAAT 4260

 52643343 GTTCCCTGGGCCATGGAGCCCAGTTCTCCTGGCATCTGGCATCTCCCCCACACTCTGCTC 52643402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 GTTCCCTGGGCCATGGAGCCCAGTTCTCCTGGCATCTGGCATCTCCCCCACACTCTGCTC 4320

 52643403 CCCCAGCACAGCACTTGGCATCTTGCATTGCAATTGCAGGTTTATTTATTCACTTCTCTC 52643462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 CCCCAGCACAGCACTTGGCATCTTGCATTGCAATTGCAGGTTTATTTATTCACTTCTCTC 4380

 52643463 ACTGGACAGCAAACTCCACCAGGGCCGAGACTCTGTGTCTCGCCCTTCACTGTGGTCCCT 52643522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 ACTGGACAGCAAACTCCACCAGGGCCGAGACTCTGTGTCTCGCCCTTCACTGTGGTCCCT 4440

 52643523 GTGCCTCACCTGTTCCTAGTACAGTGTCACACTCAGTAAAGAGCAGATGCCTGG-TGCAT 52643581
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
     4441 GTGCCTCACCTGTTCCTAGTACAGTGTCACACTCAGTAAAGAGCAGATGCCTGGATGCAT 4500

 52643582 TTGGAGACTTATTTTAAATTATACGGAAAGTTATTCAACCGGCTTCTTGAACTGGTGAAT 52643641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 TTGGAGACTTATTTTAAATTATACGGAAAGTTATTCAACCGGCTTCTTGAACTGGTGAAT 4560

 52643642 TTTGGAAAGTGGGTGTTTGAAGGGAAAATGTTTAAACTCTGAAAGAAATGTTGGAAATAA 52643701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 TTTGGAAAGTGGGTGTTTGAAGGGAAAATGTTTAAACTCTGAAAGAAATGTTGGAAATAA 4620

 52643702 GCTCTTTGAATCAAAATGTATAGAAAACACAAGAATGCTGACAGTAAGAGCCTAAAACAC 52643761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 GCTCTTTGAATCAAAATGTATAGAAAACACAAGAATGCTGACAGTAAGAGCCTAAAACAC 4680

 52643762 ATGATGACTATTATCTTTTCCCAATTTTAACTCTCCAGAGTGTTCAGCGGTGCCCAGCCT 52643821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 ATGATGACTATTATCTTTTCCCAATTTTAACTCTCCAGAGTGTTCAGCGGTGCCCAGCCT 4740

 52643822 TCATAATGTAATTCTTCGTAGCACCCTGGATGCATTAAAACCATAGATTAACGTGATACT 52643881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 TCATAATGTAATTCTTCGTAGCACCCTGGATGCATTAAAACCATAGATTAACGTGATACT 4800

 52643882 TATTTTCATTAAGGAAAATAATTTACGTACAGTGCTCAGAGTAGAGCCTGGCACATTGAA 52643941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 TATTTTCATTAAGGAAAATAATTTACGTACAGTGCTCAGAGTAGAGCCTGGCACATTGAA 4860

 52643942 CATTTTCAATAAATGACAGCAAGTGTAATTATTAGCACTTCGGAAGTGCAAAGTTGCATT 52644001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     4861 CATTTTCAATAAATGACAGCAAGTGTAATTATTAGCACTTTGGAAGTGCAAAGTTGCATT 4920

 52644002 GTATTAAGACAAATATATTTGGAGCTCATCCAATTTTTTCCTGGCTCTGAAGTCTGCTAG 52644061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 GTATTAAGACAAATATATTTGGAGCTCATCCAATTTTTTCCTGGCTCTGAAGTCTGCTAG 4980

 52644062 TGGCACTTAACTTTATTCCCAAGTTTTGAAAAATATTGTTATTTAAAAAGTCTGTTAACC 52644121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 TGGCACTTAACTTTATTCCCAAGTTTTGAAAAATATTGTTATTTAAAAAGTCTGTTAACC 5040

 52644122 AAGGAAATGCATGCCCTAAACCTATAATGTATCAAGTTTTACTTCCTTCTTCTTTTAAGG 52644181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 AAGGAAATGCATGCCCTAAACCTATAATGTATCAAGTTTTACTTCCTTCTTCTTTTAAGG 5100

 52644182 AGTTCTTTTCCTGCCTTGAATACAAACAGGCTCTCTCAAGGTTAAAAGCAAATGCTCTTT 52644241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 AGTTCTTTTCCTGCCTTGAATACAAACAGGCTCTCTCAAGGTTAAAAGCAAATGCTCTTT 5160

 52644242 TTAGTGTCAAAAAGAGCTTGCCTTTCTTCGCTCAGGAAAAAAAGCAACTGATTCCAGGAT 52644301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 TTAGTGTCAAAAAGAGCTTGCCTTTCTTCGCTCAGGAAAAAAAGCAACTGATTCCAGGAT 5220

 52644302 ACCTTCTTTGAAAACCAACACAAAAAAACCCCCCAAAAAACAAAAAAAAAACCCAAAACC 52644361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 ACCTTCTTTGAAAACCAACACAAAAAAACCCCCCAAAAAACAAAAAAAAAACCCAAAACC 5280

 52644362 CCTAGTTTTTACAAAGGTTTATTACTCCTACTTGTTGGAAAAGAATTACTACATAAAAGA 52644421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 CCTAGTTTTTACAAAGGTTTATTACTCCTACTTGTTGGAAAAGAATTACTACATAAAAGA 5340

 52644422 GTCTGCCCAGAGCTGTAAAATCTCCTTATTCAAACACACACCTTAGAGCAAAAGATGGTT 52644481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 GTCTGCCCAGAGCTGTAAAATCTCCTTATTCAAACACACACCTTAGAGCAAAAGATGGTT 5400

 52644482 AAATATCAATTCAGGCTATTAACAGTAAGGGAC---GAAATGTGTTCCAACAAAACTCTG 52644538
          ||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||
     5401 AAATATCAATTCAGGCTATTAACAGTAAGG---AATGAAATGTGTTCCAACAAAACTCTG 5457

 52644539 CATGTCAACAAACTACAGAGACTAGGTAACATCTTTTAGGAATCATTTTTATTCCACTAA 52644598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5458 CATGTCAACAAACTACAGAGACTAGGTAACATCTTTTAGGAATCATTTTTATTCCACTAA 5517

 52644599 TGCCTTTTCCTCCAGAATCCACTGATCGTAAACGCAACCTGTCTACTTCCGCCTTTGAAA 52644658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5518 TGCCTTTTCCTCCAGAATCCACTGATCGTAAACGCAACCTGTCTACTTCCGCCTTTGAAA 5577

 52644659 AATGGATGGACAAATTCATCTGCATGTAACTCACCTCCTCTTTTCTTTTACATAAAACAG 52644718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5578 AATGGATGGACAAATTCATCTGCATGTAACTCACCTCCTCTTTTCTTTTACATAAAACAG 5637

 52644719 ATGCCACAGCTGTTATTGTTCTTCACACAGAAGTTTCTACCCAGAGAAACATCAGGATGA 52644778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5638 ATGCCACAGCTGTTATTGTTCTTCACACAGAAGTTTCTACCCAGAGAAACATCAGGATGA 5697

 52644779 CACTCTGCTGCAATGTGCTATTTGTTCTAGAGGGGTCAACAGCTTGCCACCTTGCCTAGG 52644838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5698 CACTCTGCTGCAATGTGCTATTTGTTCTAGAGGGGTCAACAGCTTGCCACCTTGCCTAGG 5757

 52644839 CCCAGGGTGACTGCATATGTGCAGTGGTCTTATCCCATTAGCGCCCCCGAGCATGCATTC 52644898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5758 CCCAGGGTGACTGCATATGTGCAGTGGTCTTATCCCATTAGCGCCCCCGAGCATGCATTC 5817

 52644899 AGAACCAAGTGGATACACCTTGGCACACTTACCTTCCCTGCAGGGACATCATCGGACTGC 52644958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5818 AGAACCAAGTGGATACACCTTGGCACACTTACCTTCCCTGCAGGGACATCATCGGACTGC 5877

 52644959 CCTGATAAGCCAGGAACCTCATCCACCTTGTCTTGATGCTCTGCCCTCTTGGCTTCCTGT 52645018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5878 CCTGATAAGCCAGGAACCTCATCCACCTTGTCTTGATGCTCTGCCCTCTTGGCTTCCTGT 5937

 52645019 TGGCTGTCACCTGGCACCTTTTCCTGTCCCTTGTCCAGCTTGAAGAATTTGTCAAAAAAG 52645078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5938 TGGCTGTCACCTGGCACCTTTTCCTGTCCCTTGTCCAGCTTGAAGAATTTGTCAAAAAAG 5997

 52645079 CTGGAGTCCTTGGGCTTGGAGGGAGCTTCTCCTCCTGCTCCCCCTGTCTCAGGTGGGAGA 52645138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5998 CTGGAGTCCTTGGGCTTGGAGGGAGCTTCTCCTCCTGCTCCCCCTGTCTCAGGTGGGAGA 6057

 52645139 AGCGTGGGATCCCTGGCGGCAGAGAGGACCTTGTCTTGGGCCGGGGCGTGCCCTGGGGTT 52645198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6058 AGCGTGGGATCCCTGGCGGCAGAGAGGACCTTGTCTTGGGCCGGGGCGTGCCCTGGGGTT 6117

 52645199 TTATCTGTGTCCTGCCCCGGTCCAGCTGCCACCGGAAGTGTCCAGCTCTCACTTGGGTCT 52645258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6118 TTATCTGTGTCCTGCCCCGGTCCAGCTGCCACCGGAAGTGTCCAGCTCTCACTTGGGTCT 6177

 52645259 TTGTTCGCTGGAGCTTTATTGGAGCTGACATCAAGCTTCACTGATCCAAGGGATGAATCT 52645318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6178 TTGTTCGCTGGAGCTTTATTGGAGCTGACATCAAGCTTCACTGATCCAAGGGATGAATCT 6237

 52645319 GCGGCTTGGTCTCCGGTACGTCCTGGTACAGGCCGAGAGAGCATCAAGAAAAAACGAGAT 52645378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6238 GCGGCTTGGTCTCCGGTACGTCCTGGTACAGGCCGAGAGAGCATCAAGAAAAAACGAGAT 6297

 52645379 TTAGCAGCTGGTGCCTCGGGTTTGGCCTCTTTCCCAAGATTCTTTCCGTTGGCATCCGCA 52645438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6298 TTAGCAGCTGGTGCCTCGGGTTTGGCCTCTTTCCCAAGATTCTTTCCGTTGGCATCCGCA 6357

 52645439 ACAGCACTTATCTCCGTTGTCTCGGGGGAAGAAGTGGCCACATTATCCGTCTTGACACTT 52645498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6358 ACAGCACTTATCTCCGTTGTCTCGGGGGAAGAAGTGGCCACATTATCCGTCTTGACACTT 6417

 52645499 ATTCCCAAGTCGACTGTAAACACAAACATAAACAGTGGTTATTCAGCCAAGCCGGGAAAT 52645558
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     6418 ATTCCCAAGTCGACTGTAAACACAAACATAAACAGCGGTTATTCAGCCAAGCCGGGAAAT 6477

 52645559 TCAGGCACTAATAATGGACTCCAGACATTTTTTATACAAAAGCCATACTGCATACTGGAA 52645618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6478 TCAGGCACTAATAATGGACTCCAGACATTTTTTATACAAAAGCCATACTGCATACTGGAA 6537

 52645619 CTGTGTTGTTCTCTGGTCATTCTGAAAGGCAGAAGTTAGCTCTCTACATCTCCTTGGACC 52645678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6538 CTGTGTTGTTCTCTGGTCATTCTGAAAGGCAGAAGTTAGCTCTCTACATCTCCTTGGACC 6597

 52645679 CTGCTTTTCTTGGGAGAGGAGAAGGCAAGGTTGGTGAGGAGGGAAAGCTACTTAATGGAA 52645738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6598 CTGCTTTTCTTGGGAGAGGAGAAGGCAAGGTTGGTGAGGAGGGAAAGCTACTTAATGGAA 6657

 52645739 AGTCACTAGCTGCCAGGTGTGGAATGAGTGATATTCAATGTTAATTAATCTTCTTTTATC 52645798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6658 AGTCACTAGCTGCCAGGTGTGGAATGAGTGATATTCAATGTTAATTAATCTTCTTTTATC 6717

 52645799 TGTGTAAGAACTCCGTGAGCAGCATATTGTCATGATGTCAACTGGGAGGCAGTACAGCAG 52645858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6718 TGTGTAAGAACTCCGTGAGCAGCATATTGTCATGATGTCAACTGGGAGGCAGTACAGCAG 6777

 52645859 TTAGGAGCTTGGGTTCTGGAGCTAGAACAAGGTTTCTCAACCTCAGCACTACTCACATTT 52645918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6778 TTAGGAGCTTGGGTTCTGGAGCTAGAACAAGGTTTCTCAACCTCAGCACTACTCACATTT 6837

 52645919 GAAGCCAGATTATTCTTTGTTAGGGAGGCTCATCCCGTGCCTCATAGGCTGATTAGCAGC 52645978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6838 GAAGCCAGATTATTCTTTGTTAGGGAGGCTCATCCCGTGCCTCATAGGCTGATTAGCAGC 6897

 52645979 ATCCTGGCCTCTGCCCACTAGACGCCGGTCACATTTCCCAGTCATGGCAACCAAAAATAT 52646038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6898 ATCCTGGCCTCTGCCCACTAGACGCCGGTCACATTTCCCAGTCATGGCAACCAAAAATAT 6957

 52646039 CTCTAGGCATTGCTAAATGTCCCCTGGAGGACAAAATCTCTTACGTTTGAGAGGCACTGA 52646098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6958 CTCTAGGCATTGCTAAATGTCCCCTGGAGGACAAAATCTCTTACGTTTGAGAGGCACTGA 7017

 52646099 GCTGAAATGTCTTTTTGAATCCAGATTATCTAATTTTCTGTGCCTCAACTTTCTGGTAAA 52646158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     7018 GCTGAAATGTCTTTTTGAATCCAGATTATCTAATTTTCTGCGCCTCAACTTTCTGGTAAA 7077

 52646159 AGGAGACAGATAATAAATCTCGTAATTTTGTTAGGAAGATTACATGAGTTAATAGTTTTA 52646218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7078 AGGAGACAGATAATAAATCTCGTAATTTTGTTAGGAAGATTACATGAGTTAATAGTTTTA 7137

 52646219 AAGCAAGTACAATAGCACCTGGAATATATTAAGTGCTTAATAAATATCACAAACATTAGT 52646278
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7138 AAGCAAGTACAATAGCGCCTGGAATATATTAAGTGCTTAATAAATATCACAAACATTAGT 7197

 52646279 TATCATTATTCATGAGTGAGAAAACTGACAGTCAGAGAGGTCAGTACACCCTCCCCTGGC 52646338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7198 TATCATTATTCATGAGTGAGAAAACTGACAGTCAGAGAGGTCAGTACACCCTCCCCTGGC 7257

 52646339 TGCCCAGTAAGCTAGTAAGCAGCAGAGTCTGGCTTCAGGCAGAAATCTGACTTCTAAGTT 52646398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7258 TGCCCAGTAAGCTAGTAAGCAGCAGAGTCTGGCTTCAGGCAGAAATCTGACTTCTAAGTT 7317

 52646399 CATGCGCTCTCTGTCTTACCAGGGACTTGTATTAGCATAGACTGTTAAGAATATGGGAAG 52646458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7318 CATGCGCTCTCTGTCTTACCAGGGACTTGTATTAGCATAGACTGTTAAGAATATGGGAAG 7377

 52646459 ATTTTTAAAATACAGTACTCAGAAAATTTCTCTTTGAAAGGCTGGAAGAGCAGATATCCA 52646518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7378 ATTTTTAAAATACAGTACTCAGAAAATTTCTCTTTGAAAGGCTGGAAGAGCAGATATCCA 7437

 52646519 CACAAGAAGGCAAATTAGACCTCAGGCCAGTGTGGAATTAAAGGTGTAGGGTTATCTGGT 52646578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7438 CACAAGAAGGCAAATTAGACCTCAGGCCAGTGTGGAATTAAAGGTGTAGGGTTATCTGGT 7497

 52646579 CAAGACTGTGTGTGTGGATACAGGCTCCAACCCCTCCAGGCAAGGGCACTGTTTCCAACA 52646638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     7498 CAAGACTGTGTGTGTGGATACAGGCTCCAACCCCTCCAGGCAAGGGCAATGTTTCCAACA 7557

 52646639 TCCACCCTTTCTCCTTTGACCTCTACCTTGACCTAAATTAACTATAAAAGGTCCTTCTTT 52646698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7558 TCCACCCTTTCTCCTTTGACCTCTACCTTGACCTAAATTAACTATAAAAGGTCCTTCTTT 7617

 52646699 TCTAGGACCCTACTATAAATCAGTGAAATATTCAGGAAAAAAAGAACACCAAGAATGTTG 52646758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7618 TCTAGGACCCTACTATAAATCAGTGAAATATTCAGGAAAAAAAGAACACCAAGAATGTTG 7677

 52646759 GGATCCCAGTTAAAGATCAAGATTCTCTACTGATAAGCTGTGTGATATGGAGTAAATCAC 52646818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7678 GGATCCCAGTTAAAGATCAAGATTCTCTACTGATAAGCTGTGTGATATGGAGTAAATCAC 7737

 52646819 TAAAGATCTTTGAATCTCTTCATTTGTAAAATGGGAATATTGGTAGTCCTACTGCAGGGT 52646878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7738 TAAAGATCTTTGAATCTCTTCATTTGTAAAATGGGAATATTGGTAGTCCTACTGCAGGGT 7797

 52646879 TGTTGTAATGCTTAAAGAAGAAAAGTCATGCAAAGGATCTGGCACAACGCCTTTTCCATA 52646938
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     7798 TGTTGTAATGCTTAAAGAAGAAAAGTCATGCAAAGGATCTGGCACAATGCCTTTTCCATA 7857

 52646939 ATAAGTGCTTAGTAATTGACAGATACTGTGATAACTTTTCAGGTTTCTCTCATGCCTTTG 52646998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7858 ATAAGTGCTTAGTAATTGACAGATACTGTGATAACTTTTCAGGTTTCTCTCATGCCTTTG 7917

 52646999 ACAACATTGCATTTTGCTTGCTCTATCTGTAGTCAGACACTTCTTAATATCTGTTTGCAG 52647058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7918 ACAACATTGCATTTTGCTTGCTCTATCTGTAGTCAGACACTTCTTAATATCTGTTTGCAG 7977

 52647059 GAAGAC 52647064
          ||||||
     7978 GAAGAC 7983

EXCISED REGION

 52658003 AGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTG 52658062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7984 AGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTG 8043

 52658063 GCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTAT 52658122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8044 GCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTAT 8103

 52658123 AAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGG 52658182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8104 AAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGG 8163

 52658183 GAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAAC 52658236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8164 GAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAAC 8217

Alignment time is 9.17316 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [52637064,52668002] =>     30939 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    4668] =>      4668 nucs 'mol-32-33ab-071183_4668'

Score:        4667
Aligned:      4667        nucs
Identic:      4667 (100%) nucs =>      3961 (100%)       706 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [52653775,52657735] EXCISED REGION [52657737,52658442]
 second seq =>  [       1,    3961] EXCISED REGION [    3963,    4668]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [52657736,52657736]
 second seq =>         1 nucs [3962,3962]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [52657735,52657736] to [52657736,52657737]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [52657735,52657735] to [52657737,52657737]
 second seq =>         1 nucs [3961,3961] to [3963,3963]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 52653775 AGGGGGAGCAAGGACCTTTCTTCACAAGGCAGCAGAAAGAAGTGCCAAATGAACAGGGAA 52653834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGGGGGAGCAAGGACCTTTCTTCACAAGGCAGCAGAAAGAAGTGCCAAATGAACAGGGAA 60

 52653835 GAGCTCCTTATGAAACCATCAGGTCTTGTGAGAACTCACTTACTTTTATGAGAACAGCAT 52653894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAGCTCCTTATGAAACCATCAGGTCTTGTGAGAACTCACTTACTTTTATGAGAACAGCAT 120

 52653895 GGAGGAAACTGTCCCCATGATCCAATCACCTCCACCTGGTCTCTCCCTTGACACGTGGGG 52653954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGAGGAAACTGTCCCCATGATCCAATCACCTCCACCTGGTCTCTCCCTTGACACGTGGGG 180

 52653955 ATTATGGGGATTAAATTCCAGATGAGATTTGGGTGGGGACAAAAAGCCTAACGACATCAA 52654014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATTATGGGGATTAAATTCCAGATGAGATTTGGGTGGGGACAAAAAGCCTAACGACATCAA 240

 52654015 GCTGTAAAAACAATAGCTAACATTCATTGACTGTTTCCCAGCATTAGGATAAATGTGTGT 52654074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GCTGTAAAAACAATAGCTAACATTCATTGACTGTTTCCCAGCATTAGGATAAATGTGTGT 300

 52654075 AACAAGAGGCATTTTATTTATGTATGACATTTGTTTATTTATTATTTATTTATTTGGATA 52654134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AACAAGAGGCATTTTATTTATGTATGACATTTGTTTATTTATTATTTATTTATTTGGATA 360

 52654135 AATGTCTATAACAAGAAACATTTTATTTAAGTATAACAGCAAATCTACAAGTTAGGTACT 52654194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AATGTCTATAACAAGAAACATTTTATTTAAGTATAACAGCAAATCTACAAGTTAGGTACT 420

 52654195 ATCATCACTCCCATTTTACAGGTCGTGAAACTGAGGCTCTGAAAAGTCAAGTCAGTTTTC 52654254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATCATCACTCCCATTTTACAGGTCGTGAAACTGAGGCTCTGAAAAGTCAAGTCAGTTTTC 480

 52654255 TAATGTTGTCCAGCTAATGACTGGTAGATTTAGTATTTGAACCCACATTTGCCTGATTCC 52654314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TAATGTTGTCCAGCTAATGACTGGTAGATTTAGTATTTGAACCCACATTTGCCTGATTCC 540

 52654315 AAAGTTCAAACTCCCAACAACATGTGGTAACCAAAGCAGGAACAGAAGAGAAAGAAGAAA 52654374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAAGTTCAAACTCCCAACAACATGTGGTAACCAAAGCAGGAACAGAAGAGAAAGAAGAAA 600

 52654375 TAGAAGGGAGGGAAGATGAACAAAGTAGACAAAGTTTAGTTAATAGAATTAGTGGATACC 52654434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TAGAAGGGAGGGAAGATGAACAAAGTAGACAAAGTTTAGTTAATAGAATTAGTGGATACC 660

 52654435 CAAGAAAAAACTATGTACAAGAGGGGGAAAAAAACCCTGTTTTCTCACATCTGGGAAACA 52654494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CAAGAAAAAACTATGTACAAGAGGGGGAAAAAAACCCTGTTTTCTCACATCTGGGAAACA 720

 52654495 TTGATATCTATATATTTTTGGTTTTAAATAAAAATTAGGTTATGTCATTCATTTGCATAA 52654554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTGATATCTATATATTTTTGGTTTTAAATAAAAATTAGGTTATGTCATTCATTTGCATAA 780

 52654555 AACCATCCAAAGAAGGGCCTCACAAAATTAAAACAAAATCCAAACTCTCTACTATGGGCC 52654614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AACCATCCAAAGAAGGGCCTCACAAAATTAAAACAAAATCCAAACTCTCTACTATGGGCC 840

 52654615 ACACCCTCCAGAACTTCAGCTCGTACTATGTTTTTCCTCACACCTCTCAACATACCAACA 52654674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ACACCCTCCAGAACTTCAGCTCGTACTATGTTTTTCCTCACACCTCTCAACATACCAACA 900

 52654675 TGTTTCCACCTGCAGCCCTCACCACTAGTTATTCTTTCAATCTGGAAATATTTTCGCTAA 52654734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGTTTCCACCTGCAGCCCTCACCACTAGTTATTCTTTCAATCTGGAAATATTTTCGCTAA 960

 52654735 GATCTTCCTATGGTTACCTTCTTATCATTCAAGACTTAGGTTATGTCAGGCCTTCCCTGA 52654794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GATCTTCCTATGGTTACCTTCTTATCATTCAAGACTTAGGTTATGTCAGGCCTTCCCTGA 1020

 52654795 CTCCTCCATCTGAAGTAACCCCTCCTGCTTACTCCTGTTTATTCTCTAGACTCCACAGAG 52654854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTCCTCCATCTGAAGTAACCCCTCCTGCTTACTCCTGTTTATTCTCTAGACTCCACAGAG 1080

 52654855 GATTCATCACTCTCTGAAATGATCCCATTAATTTCTTCTTCACTTGTTTCCTCTCCACGA 52654914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GATTCATCACTCTCTGAAATGATCCCATTAATTTCTTCTTCACTTGTTTCCTCTCCACGA 1140

 52654915 CCTGTAAGCCCCAAGTGGACCCGGACTTGGTCTGCTCTGCTTACAGCTGGATTCCAGTTC 52654974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CCTGTAAGCCCCAAGTGGACCCGGACTTGGTCTGCTCTGCTTACAGCTGGATTCCAGTTC 1200

 52654975 CCATAGTGCTAGACACTAGGATTAAGCCAGGAAACATGGGTGAAGCAGCAAGCACAGAGC 52655034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CCATAGTGCTAGACACTAGGATTAAGCCAGGAAACATGGGTGAAGCAGCAAGCACAGAGC 1260

 52655035 TTGGGGCACAGCCTAGCAAACACTCCACAAAGGACCATGATTGTAACTGTAGTAGGGCAC 52655094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTGGGGCACAGCCTAGCAAACACTCCACAAAGGACCATGATTGTAACTGTAGTAGGGCAC 1320

 52655095 ACCAATGAACAGGTTGGGAAACTGAGTCTCTGAGAAGAGACTAATGTTGTGCTGGATGAA 52655154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ACCAATGAACAGGTTGGGAAACTGAGTCTCTGAGAAGAGACTAATGTTGTGCTGGATGAA 1380

 52655155 ATTTCTTTTTCTGACAATACATTATCCAAATCCTCCAAGCTTTCAGTTTAAAGGGGAAAG 52655214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ATTTCTTTTTCTGACAATACATTATCCAAATCCTCCAAGCTTTCAGTTTAAAGGGGAAAG 1440

 52655215 CAGGAACTATCATTATAATTTTATTTACAAAGTGTCCATGTATGAACATTATTCACCGCC 52655274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CAGGAACTATCATTATAATTTTATTTACAAAGTGTCCATGTATGAACATTATTCACCGCC 1500

 52655275 GAATCATCTCTTCCTATGCAAGCAACACCGTCCTATGCATCAATATCCTGATCTGTCAGG 52655334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GAATCATCTCTTCCTATGCAAGCAACACCGTCCTATGCATCAATATCCTGATCTGTCAGG 1560

 52655335 ATTCAGGATAAAGTGGACATATACACACTAATTGCAAAGGGAAATTGTACATCTTGCAAA 52655394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ATTCAGGATAAAGTGGACATATACACACTAATTGCAAAGGGAAATTGTACATCTTGCAAA 1620

 52655395 AGATGCAGGGGTTTATAGAGTCTTGTAACATTGGTGAGCTGCTCAGATCACACACATGAC 52655454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AGATGCAGGGGTTTATAGAGTCTTGTAACATTGGTGAGCTGCTCAGATCACACACATGAC 1680

 52655455 CGTGGTTGGACAAGGATCTGGCAAAGTTAACACAGATCACCGAAGAAGGAAAAGTGGACA 52655514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CGTGGTTGGACAAGGATCTGGCAAAGTTAACACAGATCACCGAAGAAGGAAAAGTGGACA 1740

 52655515 ACACAACACAGTAAGTTCTTCAAAAGAGTTATATTAGAATATCAAAAGATTATGTTAGGC 52655574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ACACAACACAGTAAGTTCTTCAAAAGAGTTATATTAGAATATCAAAAGATTATGTTAGGC 1800

 52655575 CTTTGGGAAAACTCAAAACTTTATGAAGACCTCAAAAAATTATGCAAAAATGACCCTTCA 52655634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CTTTGGGAAAACTCAAAACTTTATGAAGACCTCAAAAAATTATGCAAAAATGACCCTTCA 1860

 52655635 ATGGTCATGCTGCAAGAGTCAAATGACACTTCAAACAACTGCGGCTTTCTATGTTGTGCA 52655694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ATGGTCATGCTGCAAGAGTCAAATGACACTTCAAACAACTGCGGCTTTCTATGTTGTGCA 1920

 52655695 AATGCATTTGTTGTTTTAAAGGTCGTAAAGTCAGGGTACACGTGGCAGATACTTATGACT 52655754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AATGCATTTGTTGTTTTAAAGGTCGTAAAGTCAGGGTACACGTGGCAGATACTTATGACT 1980

 52655755 TGGAGGAAGACGTTAGATTAGATTTGAAACTTTCACTGAATGATCGCATTTCATGCTTTT 52655814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TGGAGGAAGACGTTAGATTAGATTTGAAACTTTCACTGAATGATCGCATTTCATGCTTTT 2040

 52655815 CATCTGTACATTAAAAAGCCAGAATGTCTTTGCCAAGAAATTCTAGCATAAATAAAAGAA 52655874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CATCTGTACATTAAAAAGCCAGAATGTCTTTGCCAAGAAATTCTAGCATAAATAAAAGAA 2100

 52655875 AAGGATGGGATTTTGGAACATCATGGTAGAATTCTTGACTATCAGCTTTATACAACATGT 52655934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AAGGATGGGATTTTGGAACATCATGGTAGAATTCTTGACTATCAGCTTTATACAACATGT 2160

 52655935 CTGGACATTTAGTGATGGAAATGCTGGATTCCAAAGGAATGTAGGCAAAGGTACTACTAC 52655994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CTGGACATTTAGTGATGGAAATGCTGGATTCCAAAGGAATGTAGGCAAAGGTACTACTAC 2220

 52655995 CCCCATGCTCTTCAGAAAACATCCTCTAAAAGCAACAGTGATGATCAGATACTGTGGGGC 52656054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CCCCATGCTCTTCAGAAAACATCCTCTAAAAGCAACAGTGATGATCAGATACTGTGGGGC 2280

 52656055 AAGACTGACAGTGACACTCAAGATTTCCACTCTTCTCTTTAATCATATATTTCCTGTCAT 52656114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AAGACTGACAGTGACACTCAAGATTTCCACTCTTCTCTTTAATCATATATTTCCTGTCAT 2340

 52656115 TCATGTGCTACAAAACTCTGGAATATGCAAAGCTCATTCAAATGCAAAACCAGCCTTTGC 52656174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TCATGTGCTACAAAACTCTGGAATATGCAAAGCTCATTCAAATGCAAAACCAGCCTTTGC 2400

 52656175 TCCAACATGAGCATATATTTTCATTTAAAGACAAATCAGATGTTTCATTTGATTTTTTTT 52656234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TCCAACATGAGCATATATTTTCATTTAAAGACAAATCAGATGTTTCATTTGATTTTTTTT 2460

 52656235 ATAAATCTGATAATAATGTACATTTAACCCGTGTTTACAACCAAAATAATTAATCTCTCT 52656294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 ATAAATCTGATAATAATGTACATTTAACCCGTGTTTACAACCAAAATAATTAATCTCTCT 2520

 52656295 GAACCCTTTGTTTTTCCTGTCTCTATCCTCCACCCTCATTGCCAGATAAATAACATCTGC 52656354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GAACCCTTTGTTTTTCCTGTCTCTATCCTCCACCCTCATTGCCAGATAAATAACATCTGC 2580

 52656355 AACCTGATGTGGCATATTGAACTTTGTTTATACTCACACAAACACGTATAAGCATCCCAG 52656414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AACCTGATGTGGCATATTGAACTTTGTTTATACTCACACAAACACGTATAAGCATCCCAG 2640

 52656415 ATACACATATACAGGGACTGTATCTGTCCTTGTTGTTTTTATAGAAATTGGATCACATTA 52656474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 ATACACATATACAGGGACTGTATCTGTCCTTGTTGTTTTTATAGAAATTGGATCACATTA 2700

 52656475 GACATATTTTCTGATGACTTTTGTACATTATAGTTGGTCTTCACAGTCAATAGCTCCAAA 52656534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GACATATTTTCTGATGACTTTTGTACATTATAGTTGGTCTTCACAGTCAATAGCTCCAAA 2760

 52656535 GCTATCTTATCTTCTAAAATAGCTGCATAATATTCCTCAGTATGGATATACCAAAAGATA 52656594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GCTATCTTATCTTCTAAAATAGCTGCATAATATTCCTCAGTATGGATATACCAAAAGATA 2820

 52656595 TTTAAACCATTGCCTAATCAATGAATATCCTGGTAGTTTCCACATTGTTTTTTCCATTTC 52656654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TTTAAACCATTGCCTAATCAATGAATATCCTGGTAGTTTCCACATTGTTTTTTCCATTTC 2880

 52656655 CACTATAGTGGAATAAACTTTCGTGTTCAAAAATCCTAAACTGGTGCTATATTTCTATAG 52656714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CACTATAGTGGAATAAACTTTCGTGTTCAAAAATCCTAAACTGGTGCTATATTTCTATAG 2940

 52656715 AATAGAGGCACAGATGTAGAAGTGTTACCCTCAAATCAATATGCATTTAGTTTTGAAAAA 52656774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 AATAGAGGCACAGATGTAGAAGTGTTACCCTCAAATCAATATGCATTTAGTTTTGAAAAA 3000

 52656775 CAGACACTGCCATATTATTTTCTTAAAAAGGCTCTACAGATTCACATTTCCAGCAGCAAT 52656834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CAGACACTGCCATATTATTTTCTTAAAAAGGCTCTACAGATTCACATTTCCAGCAGCAAT 3060

 52656835 GAGTGTCTCAAGCACCTTTTAAGTGGTAAGCAGCTTACCAGGGGAGGTGGCCTATTATTC 52656894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 GAGTGTCTCAAGCACCTTTTAAGTGGTAAGCAGCTTACCAGGGGAGGTGGCCTATTATTC 3120

 52656895 TATCAGTGGCTTCAGTTGTTAGGACACCACGGGTCAGCTGTGGAGATACGGTTGTGGGGC 52656954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TATCAGTGGCTTCAGTTGTTAGGACACCACGGGTCAGCTGTGGAGATACGGTTGTGGGGC 3180

 52656955 AGGTTGAGTTCAGGACACATAGAAGATTGCCAAAGGGTGACTATTATTACTTTGAGACTC 52657014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 AGGTTGAGTTCAGGACACATAGAAGATTGCCAAAGGGTGACTATTATTACTTTGAGACTC 3240

 52657015 TGGAAAAATTAGCCAGGAAACAGAGACAAGAGGCTCAGGGTGCAGCAAAGCAGCCAAATC 52657074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TGGAAAAATTAGCCAGGAAACAGAGACAAGAGGCTCAGGGTGCAGCAAAGCAGCCAAATC 3300

 52657075 AGGATGATAGTGTTTTCTTTGGAGCAGATATACTAATGGCCAAGGAACTCATAAAAAGAT 52657134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 AGGATGATAGTGTTTTCTTTGGAGCAGATATACTAATGGCCAAGGAACTCATAAAAAGAT 3360

 52657135 GCCTAATGTCATCTCATTAGGGAAGTGCAGTCAAAGCCACAGCATGATACGTCTTCACAC 52657194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 GCCTAATGTCATCTCATTAGGGAAGTGCAGTCAAAGCCACAGCATGATACGTCTTCACAC 3420

 52657195 CCACGAGGATGGCCATAATCAGAGAGACAATAACCAGTGGTAGGGAAGATGTGAAAAAAT 52657254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 CCACGAGGATGGCCATAATCAGAGAGACAATAACCAGTGGTAGGGAAGATGTGAAAAAAT 3480

 52657255 CGGAATGCTCATGCATTGCTGGTAGGAATGTGACATGGTGCAGCTGCTTTGGAAAGCAGT 52657314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 CGGAATGCTCATGCATTGCTGGTAGGAATGTGACATGGTGCAGCTGCTTTGGAAAGCAGT 3540

 52657315 TTAACAGTTCCTGGAAAAGTTAAACATGGAGTTACCCTAAGACCCAGCAATTCCATTCCT 52657374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 TTAACAGTTCCTGGAAAAGTTAAACATGGAGTTACCCTAAGACCCAGCAATTCCATTCCT 3600

 52657375 AGGTAAGCAAGAAAATGAAAACATATGGCCACACAAAAACTTGTACACAAATGTCCATAG 52657434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 AGGTAAGCAAGAAAATGAAAACATATGGCCACACAAAAACTTGTACACAAATGTCCATAG 3660

 52657435 CAGCATTTTCATAATAGCTGAAAAGTGGAAACAACCCAAATATCCATCAATTGGAAAAAG 52657494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 CAGCATTTTCATAATAGCTGAAAAGTGGAAACAACCCAAATATCCATCAATTGGAAAAAG 3720

 52657495 GAAATCTAGCATTTGCATATAATAGAGTATTAATCAGCCATAAGAAGAAACAAAGCACCG 52657554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 GAAATCTAGCATTTGCATATAATAGAGTATTAATCAGCCATAAGAAGAAACAAAGCACCG 3780

 52657555 ATCCATGTTATATCATGCTTTATACTTGGAAGCATGGTACTAAGTGAAAGACGCCAGACA 52657614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 ATCCATGTTATATCATGCTTTATACTTGGAAGCATGGTACTAAGTGAAAGACGCCAGACA 3840

 52657615 CAAAAAGCAAAATATTGTATGATTCCATTTATATAAAGTGTCTAGAATAGGCAAATCCAT 52657674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 CAAAAAGCAAAATATTGTATGATTCCATTTATATAAAGTGTCTAGAATAGGCAAATCCAT 3900

 52657675 AGAGGCAGAAAACAGATTAGTGGTTGCCAGTGGCTGGGAATAGGGAAAAAACTCAGCGCT 52657734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 AGAGGCAGAAAACAGATTAGTGGTTGCCAGTGGCTGGGAATAGGGAAAAAACTCAGCGCT 3960

 52657735 A 52657735
          |
     3961 A 3961

EXCISED REGION

 52657737 AGGGTAGGGAGTTTTGTTTTGGAGTAATGACGATGTTCTGGAATTAGACGTGGAACGATT 52657796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3963 AGGGTAGGGAGTTTTGTTTTGGAGTAATGACGATGTTCTGGAATTAGACGTGGAACGATT 4022

 52657797 GCACACATGGTGCAAATATCCTTAAAATCACGGAATTGTCACTCTAAAAGGTGAATTTTA 52657856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4023 GCACACATGGTGCAAATATCCTTAAAATCACGGAATTGTCACTCTAAAAGGTGAATTTTA 4082

 52657857 TGGTAGGTGAATTGTACCTCAATTTGTAAAAAGAAGAATTAGATAAATAAACAGCAACAC 52657916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4083 TGGTAGGTGAATTGTACCTCAATTTGTAAAAAGAAGAATTAGATAAATAAACAGCAACAC 4142

 52657917 AGCACCAAGGGGTGGGGGTAGGAAACAGACAACAAATAGGAGTGAAGAGTTCACAGGAAA 52657976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4143 AGCACCAAGGGGTGGGGGTAGGAAACAGACAACAAATAGGAGTGAAGAGTTCACAGGAAA 4202

 52657977 AGACATGCAGCCAGCTTTTAAGCAGAAGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATA 52658036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4203 AGACATGCAGCCAGCTTTTAAGCAGAAGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATA 4262

 52658037 AAAGCACAATAAAATTATGACACTTGGCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACA 52658096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4263 AAAGCACAATAAAATTATGACACTTGGCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACA 4322

 52658097 ATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTATAAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCT 52658156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4323 ATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTATAAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCT 4382

 52658157 TAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGGAGT 52658216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4383 TAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGGAGT 4442

 52658217 TCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACACTGTCTCTGCTAAAAAACAAAACAAAACA 52658276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4443 TCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACACTGTCTCTGCTAAAAAACAAAACAAAACA 4502

 52658277 AAACACCAAAAAATAGCTGGGCGTAGTGGCGGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTTGGGAGG 52658336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4503 AAACACCAAAAAATAGCTGGGCGTAGTGGCGGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTTGGGAGG 4562

 52658337 CGGTGGCAGGAGAATCATTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGTGC 52658396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4563 CGGTGGCAGGAGAATCATTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGTGC 4622

 52658397 CACTGCACTCTAACCTGGGCAACAGAGTTCAGAGTGAGACTCTGTC 52658442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4623 CACTGCACTCTAACCTGGGCAACAGAGTTCAGAGTGAGACTCTGTC 4668

Alignment time is 5.07392 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [52637064,52668002] =>     30939 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    3935] =>      3935 nucs 'mol-32-33ab-186269_3935'

Score:        3935
Aligned:      3935        nucs
Identic:      3935 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [52654314,52658248]
 second seq =>  [       1,    3935]

 52654314 CAAAGTTCAAACTCCCAACAACATGTGGTAACCAAAGCAGGAACAGAAGAGAAAGAAGAA 52654373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CAAAGTTCAAACTCCCAACAACATGTGGTAACCAAAGCAGGAACAGAAGAGAAAGAAGAA 60

 52654374 ATAGAAGGGAGGGAAGATGAACAAAGTAGACAAAGTTTAGTTAATAGAATTAGTGGATAC 52654433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATAGAAGGGAGGGAAGATGAACAAAGTAGACAAAGTTTAGTTAATAGAATTAGTGGATAC 120

 52654434 CCAAGAAAAAACTATGTACAAGAGGGGGAAAAAAACCCTGTTTTCTCACATCTGGGAAAC 52654493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCAAGAAAAAACTATGTACAAGAGGGGGAAAAAAACCCTGTTTTCTCACATCTGGGAAAC 180

 52654494 ATTGATATCTATATATTTTTGGTTTTAAATAAAAATTAGGTTATGTCATTCATTTGCATA 52654553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATTGATATCTATATATTTTTGGTTTTAAATAAAAATTAGGTTATGTCATTCATTTGCATA 240

 52654554 AAACCATCCAAAGAAGGGCCTCACAAAATTAAAACAAAATCCAAACTCTCTACTATGGGC 52654613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAACCATCCAAAGAAGGGCCTCACAAAATTAAAACAAAATCCAAACTCTCTACTATGGGC 300

 52654614 CACACCCTCCAGAACTTCAGCTCGTACTATGTTTTTCCTCACACCTCTCAACATACCAAC 52654673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CACACCCTCCAGAACTTCAGCTCGTACTATGTTTTTCCTCACACCTCTCAACATACCAAC 360

 52654674 ATGTTTCCACCTGCAGCCCTCACCACTAGTTATTCTTTCAATCTGGAAATATTTTCGCTA 52654733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATGTTTCCACCTGCAGCCCTCACCACTAGTTATTCTTTCAATCTGGAAATATTTTCGCTA 420

 52654734 AGATCTTCCTATGGTTACCTTCTTATCATTCAAGACTTAGGTTATGTCAGGCCTTCCCTG 52654793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGATCTTCCTATGGTTACCTTCTTATCATTCAAGACTTAGGTTATGTCAGGCCTTCCCTG 480

 52654794 ACTCCTCCATCTGAAGTAACCCCTCCTGCTTACTCCTGTTTATTCTCTAGACTCCACAGA 52654853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACTCCTCCATCTGAAGTAACCCCTCCTGCTTACTCCTGTTTATTCTCTAGACTCCACAGA 540

 52654854 GGATTCATCACTCTCTGAAATGATCCCATTAATTTCTTCTTCACTTGTTTCCTCTCCACG 52654913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGATTCATCACTCTCTGAAATGATCCCATTAATTTCTTCTTCACTTGTTTCCTCTCCACG 600

 52654914 ACCTGTAAGCCCCAAGTGGACCCGGACTTGGTCTGCTCTGCTTACAGCTGGATTCCAGTT 52654973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ACCTGTAAGCCCCAAGTGGACCCGGACTTGGTCTGCTCTGCTTACAGCTGGATTCCAGTT 660

 52654974 CCCATAGTGCTAGACACTAGGATTAAGCCAGGAAACATGGGTGAAGCAGCAAGCACAGAG 52655033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCCATAGTGCTAGACACTAGGATTAAGCCAGGAAACATGGGTGAAGCAGCAAGCACAGAG 720

 52655034 CTTGGGGCACAGCCTAGCAAACACTCCACAAAGGACCATGATTGTAACTGTAGTAGGGCA 52655093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTTGGGGCACAGCCTAGCAAACACTCCACAAAGGACCATGATTGTAACTGTAGTAGGGCA 780

 52655094 CACCAATGAACAGGTTGGGAAACTGAGTCTCTGAGAAGAGACTAATGTTGTGCTGGATGA 52655153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CACCAATGAACAGGTTGGGAAACTGAGTCTCTGAGAAGAGACTAATGTTGTGCTGGATGA 840

 52655154 AATTTCTTTTTCTGACAATACATTATCCAAATCCTCCAAGCTTTCAGTTTAAAGGGGAAA 52655213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AATTTCTTTTTCTGACAATACATTATCCAAATCCTCCAAGCTTTCAGTTTAAAGGGGAAA 900

 52655214 GCAGGAACTATCATTATAATTTTATTTACAAAGTGTCCATGTATGAACATTATTCACCGC 52655273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GCAGGAACTATCATTATAATTTTATTTACAAAGTGTCCATGTATGAACATTATTCACCGC 960

 52655274 CGAATCATCTCTTCCTATGCAAGCAACACCGTCCTATGCATCAATATCCTGATCTGTCAG 52655333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CGAATCATCTCTTCCTATGCAAGCAACACCGTCCTATGCATCAATATCCTGATCTGTCAG 1020

 52655334 GATTCAGGATAAAGTGGACATATACACACTAATTGCAAAGGGAAATTGTACATCTTGCAA 52655393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GATTCAGGATAAAGTGGACATATACACACTAATTGCAAAGGGAAATTGTACATCTTGCAA 1080

 52655394 AAGATGCAGGGGTTTATAGAGTCTTGTAACATTGGTGAGCTGCTCAGATCACACACATGA 52655453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAGATGCAGGGGTTTATAGAGTCTTGTAACATTGGTGAGCTGCTCAGATCACACACATGA 1140

 52655454 CCGTGGTTGGACAAGGATCTGGCAAAGTTAACACAGATCACCGAAGAAGGAAAAGTGGAC 52655513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CCGTGGTTGGACAAGGATCTGGCAAAGTTAACACAGATCACCGAAGAAGGAAAAGTGGAC 1200

 52655514 AACACAACACAGTAAGTTCTTCAAAAGAGTTATATTAGAATATCAAAAGATTATGTTAGG 52655573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AACACAACACAGTAAGTTCTTCAAAAGAGTTATATTAGAATATCAAAAGATTATGTTAGG 1260

 52655574 CCTTTGGGAAAACTCAAAACTTTATGAAGACCTCAAAAAATTATGCAAAAATGACCCTTC 52655633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CCTTTGGGAAAACTCAAAACTTTATGAAGACCTCAAAAAATTATGCAAAAATGACCCTTC 1320

 52655634 AATGGTCATGCTGCAAGAGTCAAATGACACTTCAAACAACTGCGGCTTTCTATGTTGTGC 52655693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AATGGTCATGCTGCAAGAGTCAAATGACACTTCAAACAACTGCGGCTTTCTATGTTGTGC 1380

 52655694 AAATGCATTTGTTGTTTTAAAGGTCGTAAAGTCAGGGTACACGTGGCAGATACTTATGAC 52655753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AAATGCATTTGTTGTTTTAAAGGTCGTAAAGTCAGGGTACACGTGGCAGATACTTATGAC 1440

 52655754 TTGGAGGAAGACGTTAGATTAGATTTGAAACTTTCACTGAATGATCGCATTTCATGCTTT 52655813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTGGAGGAAGACGTTAGATTAGATTTGAAACTTTCACTGAATGATCGCATTTCATGCTTT 1500

 52655814 TCATCTGTACATTAAAAAGCCAGAATGTCTTTGCCAAGAAATTCTAGCATAAATAAAAGA 52655873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TCATCTGTACATTAAAAAGCCAGAATGTCTTTGCCAAGAAATTCTAGCATAAATAAAAGA 1560

 52655874 AAAGGATGGGATTTTGGAACATCATGGTAGAATTCTTGACTATCAGCTTTATACAACATG 52655933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AAAGGATGGGATTTTGGAACATCATGGTAGAATTCTTGACTATCAGCTTTATACAACATG 1620

 52655934 TCTGGACATTTAGTGATGGAAATGCTGGATTCCAAAGGAATGTAGGCAAAGGTACTACTA 52655993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TCTGGACATTTAGTGATGGAAATGCTGGATTCCAAAGGAATGTAGGCAAAGGTACTACTA 1680

 52655994 CCCCCATGCTCTTCAGAAAACATCCTCTAAAAGCAACAGTGATGATCAGATACTGTGGGG 52656053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CCCCCATGCTCTTCAGAAAACATCCTCTAAAAGCAACAGTGATGATCAGATACTGTGGGG 1740

 52656054 CAAGACTGACAGTGACACTCAAGATTTCCACTCTTCTCTTTAATCATATATTTCCTGTCA 52656113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CAAGACTGACAGTGACACTCAAGATTTCCACTCTTCTCTTTAATCATATATTTCCTGTCA 1800

 52656114 TTCATGTGCTACAAAACTCTGGAATATGCAAAGCTCATTCAAATGCAAAACCAGCCTTTG 52656173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTCATGTGCTACAAAACTCTGGAATATGCAAAGCTCATTCAAATGCAAAACCAGCCTTTG 1860

 52656174 CTCCAACATGAGCATATATTTTCATTTAAAGACAAATCAGATGTTTCATTTGATTTTTTT 52656233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CTCCAACATGAGCATATATTTTCATTTAAAGACAAATCAGATGTTTCATTTGATTTTTTT 1920

 52656234 TATAAATCTGATAATAATGTACATTTAACCCGTGTTTACAACCAAAATAATTAATCTCTC 52656293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TATAAATCTGATAATAATGTACATTTAACCCGTGTTTACAACCAAAATAATTAATCTCTC 1980

 52656294 TGAACCCTTTGTTTTTCCTGTCTCTATCCTCCACCCTCATTGCCAGATAAATAACATCTG 52656353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TGAACCCTTTGTTTTTCCTGTCTCTATCCTCCACCCTCATTGCCAGATAAATAACATCTG 2040

 52656354 CAACCTGATGTGGCATATTGAACTTTGTTTATACTCACACAAACACGTATAAGCATCCCA 52656413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CAACCTGATGTGGCATATTGAACTTTGTTTATACTCACACAAACACGTATAAGCATCCCA 2100

 52656414 GATACACATATACAGGGACTGTATCTGTCCTTGTTGTTTTTATAGAAATTGGATCACATT 52656473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GATACACATATACAGGGACTGTATCTGTCCTTGTTGTTTTTATAGAAATTGGATCACATT 2160

 52656474 AGACATATTTTCTGATGACTTTTGTACATTATAGTTGGTCTTCACAGTCAATAGCTCCAA 52656533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AGACATATTTTCTGATGACTTTTGTACATTATAGTTGGTCTTCACAGTCAATAGCTCCAA 2220

 52656534 AGCTATCTTATCTTCTAAAATAGCTGCATAATATTCCTCAGTATGGATATACCAAAAGAT 52656593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AGCTATCTTATCTTCTAAAATAGCTGCATAATATTCCTCAGTATGGATATACCAAAAGAT 2280

 52656594 ATTTAAACCATTGCCTAATCAATGAATATCCTGGTAGTTTCCACATTGTTTTTTCCATTT 52656653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 ATTTAAACCATTGCCTAATCAATGAATATCCTGGTAGTTTCCACATTGTTTTTTCCATTT 2340

 52656654 CCACTATAGTGGAATAAACTTTCGTGTTCAAAAATCCTAAACTGGTGCTATATTTCTATA 52656713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CCACTATAGTGGAATAAACTTTCGTGTTCAAAAATCCTAAACTGGTGCTATATTTCTATA 2400

 52656714 GAATAGAGGCACAGATGTAGAAGTGTTACCCTCAAATCAATATGCATTTAGTTTTGAAAA 52656773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GAATAGAGGCACAGATGTAGAAGTGTTACCCTCAAATCAATATGCATTTAGTTTTGAAAA 2460

 52656774 ACAGACACTGCCATATTATTTTCTTAAAAAGGCTCTACAGATTCACATTTCCAGCAGCAA 52656833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 ACAGACACTGCCATATTATTTTCTTAAAAAGGCTCTACAGATTCACATTTCCAGCAGCAA 2520

 52656834 TGAGTGTCTCAAGCACCTTTTAAGTGGTAAGCAGCTTACCAGGGGAGGTGGCCTATTATT 52656893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TGAGTGTCTCAAGCACCTTTTAAGTGGTAAGCAGCTTACCAGGGGAGGTGGCCTATTATT 2580

 52656894 CTATCAGTGGCTTCAGTTGTTAGGACACCACGGGTCAGCTGTGGAGATACGGTTGTGGGG 52656953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CTATCAGTGGCTTCAGTTGTTAGGACACCACGGGTCAGCTGTGGAGATACGGTTGTGGGG 2640

 52656954 CAGGTTGAGTTCAGGACACATAGAAGATTGCCAAAGGGTGACTATTATTACTTTGAGACT 52657013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CAGGTTGAGTTCAGGACACATAGAAGATTGCCAAAGGGTGACTATTATTACTTTGAGACT 2700

 52657014 CTGGAAAAATTAGCCAGGAAACAGAGACAAGAGGCTCAGGGTGCAGCAAAGCAGCCAAAT 52657073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CTGGAAAAATTAGCCAGGAAACAGAGACAAGAGGCTCAGGGTGCAGCAAAGCAGCCAAAT 2760

 52657074 CAGGATGATAGTGTTTTCTTTGGAGCAGATATACTAATGGCCAAGGAACTCATAAAAAGA 52657133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CAGGATGATAGTGTTTTCTTTGGAGCAGATATACTAATGGCCAAGGAACTCATAAAAAGA 2820

 52657134 TGCCTAATGTCATCTCATTAGGGAAGTGCAGTCAAAGCCACAGCATGATACGTCTTCACA 52657193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TGCCTAATGTCATCTCATTAGGGAAGTGCAGTCAAAGCCACAGCATGATACGTCTTCACA 2880

 52657194 CCCACGAGGATGGCCATAATCAGAGAGACAATAACCAGTGGTAGGGAAGATGTGAAAAAA 52657253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CCCACGAGGATGGCCATAATCAGAGAGACAATAACCAGTGGTAGGGAAGATGTGAAAAAA 2940

 52657254 TCGGAATGCTCATGCATTGCTGGTAGGAATGTGACATGGTGCAGCTGCTTTGGAAAGCAG 52657313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TCGGAATGCTCATGCATTGCTGGTAGGAATGTGACATGGTGCAGCTGCTTTGGAAAGCAG 3000

 52657314 TTTAACAGTTCCTGGAAAAGTTAAACATGGAGTTACCCTAAGACCCAGCAATTCCATTCC 52657373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TTTAACAGTTCCTGGAAAAGTTAAACATGGAGTTACCCTAAGACCCAGCAATTCCATTCC 3060

 52657374 TAGGTAAGCAAGAAAATGAAAACATATGGCCACACAAAAACTTGTACACAAATGTCCATA 52657433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TAGGTAAGCAAGAAAATGAAAACATATGGCCACACAAAAACTTGTACACAAATGTCCATA 3120

 52657434 GCAGCATTTTCATAATAGCTGAAAAGTGGAAACAACCCAAATATCCATCAATTGGAAAAA 52657493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 GCAGCATTTTCATAATAGCTGAAAAGTGGAAACAACCCAAATATCCATCAATTGGAAAAA 3180

 52657494 GGAAATCTAGCATTTGCATATAATAGAGTATTAATCAGCCATAAGAAGAAACAAAGCACC 52657553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 GGAAATCTAGCATTTGCATATAATAGAGTATTAATCAGCCATAAGAAGAAACAAAGCACC 3240

 52657554 GATCCATGTTATATCATGCTTTATACTTGGAAGCATGGTACTAAGTGAAAGACGCCAGAC 52657613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 GATCCATGTTATATCATGCTTTATACTTGGAAGCATGGTACTAAGTGAAAGACGCCAGAC 3300

 52657614 ACAAAAAGCAAAATATTGTATGATTCCATTTATATAAAGTGTCTAGAATAGGCAAATCCA 52657673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 ACAAAAAGCAAAATATTGTATGATTCCATTTATATAAAGTGTCTAGAATAGGCAAATCCA 3360

 52657674 TAGAGGCAGAAAACAGATTAGTGGTTGCCAGTGGCTGGGAATAGGGAAAAAACTCAGCGC 52657733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TAGAGGCAGAAAACAGATTAGTGGTTGCCAGTGGCTGGGAATAGGGAAAAAACTCAGCGC 3420

 52657734 TAAAGGGTAGGGAGTTTTGTTTTGGAGTAATGACGATGTTCTGGAATTAGACGTGGAACG 52657793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TAAAGGGTAGGGAGTTTTGTTTTGGAGTAATGACGATGTTCTGGAATTAGACGTGGAACG 3480

 52657794 ATTGCACACATGGTGCAAATATCCTTAAAATCACGGAATTGTCACTCTAAAAGGTGAATT 52657853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 ATTGCACACATGGTGCAAATATCCTTAAAATCACGGAATTGTCACTCTAAAAGGTGAATT 3540

 52657854 TTATGGTAGGTGAATTGTACCTCAATTTGTAAAAAGAAGAATTAGATAAATAAACAGCAA 52657913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 TTATGGTAGGTGAATTGTACCTCAATTTGTAAAAAGAAGAATTAGATAAATAAACAGCAA 3600

 52657914 CACAGCACCAAGGGGTGGGGGTAGGAAACAGACAACAAATAGGAGTGAAGAGTTCACAGG 52657973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 CACAGCACCAAGGGGTGGGGGTAGGAAACAGACAACAAATAGGAGTGAAGAGTTCACAGG 3660

 52657974 AAAAGACATGCAGCCAGCTTTTAAGCAGAAGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAA 52658033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 AAAAGACATGCAGCCAGCTTTTAAGCAGAAGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAA 3720

 52658034 ATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTGGCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAG 52658093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 ATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTGGCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAG 3780

 52658094 ACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTATAAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTG 52658153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 ACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTATAAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTG 3840

 52658154 GCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGG 52658213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 GCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGG 3900

 52658214 AGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACAC 52658248
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 AGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACAC 3935

Alignment time is 3.74599 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [52637064,52668002] =>     30939 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    3597] =>      3597 nucs 'mol-32-33f8-172112_3597'

Score:        3584
Aligned:      3595        nucs
Identic:      3594 (100%) nucs =>      2878 (100%)       716 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [52655562,52658440] EXCISED REGION [52658444,52659159]
 second seq =>  [       1,    2879] EXCISED REGION [    2882,    3597]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         3 nucs [52658441,52658443]
 second seq =>         2 nucs [2880,2881]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         5 nucs [2880,2884] to [2882,2886]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [52658441,52658441] to [52658443,52658443]
 second seq =>         1 nucs [2880,2880] to [2881,2881]

 52655562 GATTATGTTAGGCCTTTGGGAAAACTCAAAACTTTATGAAGACCTCAAAAAATTATGCAA 52655621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GATTATGTTAGGCCTTTGGGAAAACTCAAAACTTTATGAAGACCTCAAAAAATTATGCAA 60

 52655622 AAATGACCCTTCAATGGTCATGCTGCAAGAGTCAAATGACACTTCAAACAACTGCGGCTT 52655681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAATGACCCTTCAATGGTCATGCTGCAAGAGTCAAATGACACTTCAAACAACTGCGGCTT 120

 52655682 TCTATGTTGTGCAAATGCATTTGTTGTTTTAAAGGTCGTAAAGTCAGGGTACACGTGGCA 52655741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCTATGTTGTGCAAATGCATTTGTTGTTTTAAAGGTCGTAAAGTCAGGGTACACGTGGCA 180

 52655742 GATACTTATGACTTGGAGGAAGACGTTAGATTAGATTTGAAACTTTCACTGAATGATCGC 52655801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GATACTTATGACTTGGAGGAAGACGTTAGATTAGATTTGAAACTTTCACTGAATGATCGC 240

 52655802 ATTTCATGCTTTTCATCTGTACATTAAAAAGCCAGAATGTCTTTGCCAAGAAATTCTAGC 52655861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATTTCATGCTTTTCATCTGTACATTAAAAAGCCAGAATGTCTTTGCCAAGAAATTCTAGC 300

 52655862 ATAAATAAAAGAAAAGGATGGGATTTTGGAACATCATGGTAGAATTCTTGACTATCAGCT 52655921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATAAATAAAAGAAAAGGATGGGATTTTGGAACATCATGGTAGAATTCTTGACTATCAGCT 360

 52655922 TTATACAACATGTCTGGACATTTAGTGATGGAAATGCTGGATTCCAAAGGAATGTAGGCA 52655981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTATACAACATGTCTGGACATTTAGTGATGGAAATGCTGGATTCCAAAGGAATGTAGGCA 420

 52655982 AAGGTACTACTACCCCCATGCTCTTCAGAAAACATCCTCTAAAAGCAACAGTGATGATCA 52656041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAGGTACTACTACCCCCATGCTCTTCAGAAAACATCCTCTAAAAGCAACAGTGATGATCA 480

 52656042 GATACTGTGGGGCAAGACTGACAGTGACACTCAAGATTTCCACTCTTCTCTTTAATCATA 52656101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GATACTGTGGGGCAAGACTGACAGTGACACTCAAGATTTCCACTCTTCTCTTTAATCATA 540

 52656102 TATTTCCTGTCATTCATGTGCTACAAAACTCTGGAATATGCAAAGCTCATTCAAATGCAA 52656161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TATTTCCTGTCATTCATGTGCTACAAAACTCTGGAATATGCAAAGCTCATTCAAATGCAA 600

 52656162 AACCAGCCTTTGCTCCAACATGAGCATATATTTTCATTTAAAGACAAATCAGATGTTTCA 52656221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AACCAGCCTTTGCTCCAACATGAGCATATATTTTCATTTAAAGACAAATCAGATGTTTCA 660

 52656222 TTTGATTTTTTTTATAAATCTGATAATAATGTACATTTAACCCGTGTTTACAACCAAAAT 52656281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTTGATTTTTTTTATAAATCTGATAATAATGTACATTTAACCCGTGTTTACAACCAAAAT 720

 52656282 AATTAATCTCTCTGAACCCTTTGTTTTTCCTGTCTCTATCCTCCACCCTCATTGCCAGAT 52656341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AATTAATCTCTCTGAACCCTTTGTTTTTCCTGTCTCTATCCTCCACCCTCATTGCCAGAT 780

 52656342 AAATAACATCTGCAACCTGATGTGGCATATTGAACTTTGTTTATACTCACACAAACACGT 52656401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAATAACATCTGCAACCTGATGTGGCATATTGAACTTTGTTTATACTCACACAAACACGT 840

 52656402 ATAAGCATCCCAGATACACATATACAGGGACTGTATCTGTCCTTGTTGTTTTTATAGAAA 52656461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATAAGCATCCCAGATACACATATACAGGGACTGTATCTGTCCTTGTTGTTTTTATAGAAA 900

 52656462 TTGGATCACATTAGACATATTTTCTGATGACTTTTGTACATTATAGTTGGTCTTCACAGT 52656521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTGGATCACATTAGACATATTTTCTGATGACTTTTGTACATTATAGTTGGTCTTCACAGT 960

 52656522 CAATAGCTCCAAAGCTATCTTATCTTCTAAAATAGCTGCATAATATTCCTCAGTATGGAT 52656581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CAATAGCTCCAAAGCTATCTTATCTTCTAAAATAGCTGCATAATATTCCTCAGTATGGAT 1020

 52656582 ATACCAAAAGATATTTAAACCATTGCCTAATCAATGAATATCCTGGTAGTTTCCACATTG 52656641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATACCAAAAGATATTTAAACCATTGCCTAATCAATGAATATCCTGGTAGTTTCCACATTG 1080

 52656642 TTTTTTCCATTTCCACTATAGTGGAATAAACTTTCGTGTTCAAAAATCCTAAACTGGTGC 52656701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTTTTTCCATTTCCACTATAGTGGAATAAACTTTCGTGTTCAAAAATCCTAAACTGGTGC 1140

 52656702 TATATTTCTATAGAATAGAGGCACAGATGTAGAAGTGTTACCCTCAAATCAATATGCATT 52656761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TATATTTCTATAGAATAGAGGCACAGATGTAGAAGTGTTACCCTCAAATCAATATGCATT 1200

 52656762 TAGTTTTGAAAAACAGACACTGCCATATTATTTTCTTAAAAAGGCTCTACAGATTCACAT 52656821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TAGTTTTGAAAAACAGACACTGCCATATTATTTTCTTAAAAAGGCTCTACAGATTCACAT 1260

 52656822 TTCCAGCAGCAATGAGTGTCTCAAGCACCTTTTAAGTGGTAAGCAGCTTACCAGGGGAGG 52656881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTCCAGCAGCAATGAGTGTCTCAAGCACCTTTTAAGTGGTAAGCAGCTTACCAGGGGAGG 1320

 52656882 TGGCCTATTATTCTATCAGTGGCTTCAGTTGTTAGGACACCACGGGTCAGCTGTGGAGAT 52656941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGGCCTATTATTCTATCAGTGGCTTCAGTTGTTAGGACACCACGGGTCAGCTGTGGAGAT 1380

 52656942 ACGGTTGTGGGGCAGGTTGAGTTCAGGACACATAGAAGATTGCCAAAGGGTGACTATTAT 52657001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ACGGTTGTGGGGCAGGTTGAGTTCAGGACACATAGAAGATTGCCAAAGGGTGACTATTAT 1440

 52657002 TACTTTGAGACTCTGGAAAAATTAGCCAGGAAACAGAGACAAGAGGCTCAGGGTGCAGCA 52657061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TACTTTGAGACTCTGGAAAAATTAGCCAGGAAACAGAGACAAGAGGCTCAGGGTGCAGCA 1500

 52657062 AAGCAGCCAAATCAGGATGATAGTGTTTTCTTTGGAGCAGATATACTAATGGCCAAGGAA 52657121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AAGCAGCCAAATCAGGATGATAGTGTTTTCTTTGGAGCAGATATACTAATGGCCAAGGAA 1560

 52657122 CTCATAAAAAGATGCCTAATGTCATCTCATTAGGGAAGTGCAGTCAAAGCCACAGCATGA 52657181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CTCATAAAAAGATGCCTAATGTCATCTCATTAGGGAAGTGCAGTCAAAGCCACAGCATGA 1620

 52657182 TACGTCTTCACACCCACGAGGATGGCCATAATCAGAGAGACAATAACCAGTGGTAGGGAA 52657241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TACGTCTTCACACCCACGAGGATGGCCATAATCAGAGAGACAATAACCAGTGGTAGGGAA 1680

 52657242 GATGTGAAAAAATCGGAATGCTCATGCATTGCTGGTAGGAATGTGACATGGTGCAGCTGC 52657301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GATGTGAAAAAATCGGAATGCTCATGCATTGCTGGTAGGAATGTGACATGGTGCAGCTGC 1740

 52657302 TTTGGAAAGCAGTTTAACAGTTCCTGGAAAAGTTAAACATGGAGTTACCCTAAGACCCAG 52657361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TTTGGAAAGCAGTTTAACAGTTCCTGGAAAAGTTAAACATGGAGTTACCCTAAGACCCAG 1800

 52657362 CAATTCCATTCCTAGGTAAGCAAGAAAATGAAAACATATGGCCACACAAAAACTTGTACA 52657421
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     1801 CAATTCCATTCCTAGGTAAGCAAGAAAATGAAAGCATATGGCCACACAAAAACTTGTACA 1860

 52657422 CAAATGTCCATAGCAGCATTTTCATAATAGCTGAAAAGTGGAAACAACCCAAATATCCAT 52657481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CAAATGTCCATAGCAGCATTTTCATAATAGCTGAAAAGTGGAAACAACCCAAATATCCAT 1920

 52657482 CAATTGGAAAAAGGAAATCTAGCATTTGCATATAATAGAGTATTAATCAGCCATAAGAAG 52657541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CAATTGGAAAAAGGAAATCTAGCATTTGCATATAATAGAGTATTAATCAGCCATAAGAAG 1980

 52657542 AAACAAAGCACCGATCCATGTTATATCATGCTTTATACTTGGAAGCATGGTACTAAGTGA 52657601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AAACAAAGCACCGATCCATGTTATATCATGCTTTATACTTGGAAGCATGGTACTAAGTGA 2040

 52657602 AAGACGCCAGACACAAAAAGCAAAATATTGTATGATTCCATTTATATAAAGTGTCTAGAA 52657661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AAGACGCCAGACACAAAAAGCAAAATATTGTATGATTCCATTTATATAAAGTGTCTAGAA 2100

 52657662 TAGGCAAATCCATAGAGGCAGAAAACAGATTAGTGGTTGCCAGTGGCTGGGAATAGGGAA 52657721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TAGGCAAATCCATAGAGGCAGAAAACAGATTAGTGGTTGCCAGTGGCTGGGAATAGGGAA 2160

 52657722 AAAACTCAGCGCTAAAGGGTAGGGAGTTTTGTTTTGGAGTAATGACGATGTTCTGGAATT 52657781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AAAACTCAGCGCTAAAGGGTAGGGAGTTTTGTTTTGGAGTAATGACGATGTTCTGGAATT 2220

 52657782 AGACGTGGAACGATTGCACACATGGTGCAAATATCCTTAAAATCACGGAATTGTCACTCT 52657841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AGACGTGGAACGATTGCACACATGGTGCAAATATCCTTAAAATCACGGAATTGTCACTCT 2280

 52657842 AAAAGGTGAATTTTATGGTAGGTGAATTGTACCTCAATTTGTAAAAAGAAGAATTAGATA 52657901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AAAAGGTGAATTTTATGGTAGGTGAATTGTACCTCAATTTGTAAAAAGAAGAATTAGATA 2340

 52657902 AATAAACAGCAACACAGCACCAAGGGGTGGGGGTAGGAAACAGACAACAAATAGGAGTGA 52657961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AATAAACAGCAACACAGCACCAAGGGGTGGGGGTAGGAAACAGACAACAAATAGGAGTGA 2400

 52657962 AGAGTTCACAGGAAAAGACATGCAGCCAGCTTTTAAGCAGAAGAAAAGATGTTTGGCCTC 52658021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AGAGTTCACAGGAAAAGACATGCAGCCAGCTTTTAAGCAGAAGAAAAGATGTTTGGCCTC 2460

 52658022 ATAAATAGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTGGCTTTCCCTTGCCAAATTG 52658081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 ATAAATAGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTGGCTTTCCCTTGCCAAATTG 2520

 52658082 GTTAAAAAGGAGACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTATAAAAAAAGAGCAGCTGTGG 52658141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GTTAAAAAGGAGACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTATAAAAAAAGAGCAGCTGTGG 2580

 52658142 CTGGGTACGGTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCAAAT 52658201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CTGGGTACGGTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCAAAT 2640

 52658202 CATGAGGTAAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACACTGTCTCTGCTAAA 52658261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CATGAGGTAAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACACTGTCTCTGCTAAA 2700

 52658262 AAACAAAACAAAACAAAACACCAAAAAATAGCTGGGCGTAGTGGCGGGCGCCTGTAATCT 52658321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AAACAAAACAAAACAAAACACCAAAAAATAGCTGGGCGTAGTGGCGGGCGCCTGTAATCT 2760

 52658322 CAGCTACTTGGGAGGCGGTGGCAGGAGAATCATTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGT 52658381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CAGCTACTTGGGAGGCGGTGGCAGGAGAATCATTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGT 2820

 52658382 GAGCCGAGATTGTGCCACTGCACTCTAACCTGGGCAACAGAGTTCAGAGTGAGACTCTG 52658440
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GAGCCGAGATTGTGCCACTGCACTCTAACCTGGGCAACAGAGTTCAGAGTGAGACTCTG 2879

EXCISED REGION

 52658444 CCCCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAACAGCCATATAGATCGTCGGTGGGAGTGTAA 52658503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2882 CCCCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAACAGCCATATAGATCGTCGGTGGGAGTGTAA 2941

 52658504 TTTGGCCACTTCTTTGGAAAATAGCTCAGTAATATCTATTAATACTTAAAATTTCACAAA 52658563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2942 TTTGGCCACTTCTTTGGAAAATAGCTCAGTAATATCTATTAATACTTAAAATTTCACAAA 3001

 52658564 CACTGTAAGTCTAACTTCCACTTCTAAAATGTTATCCTAGAAATAAAATTGCATAGGGGT 52658623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3002 CACTGTAAGTCTAACTTCCACTTCTAAAATGTTATCCTAGAAATAAAATTGCATAGGGGT 3061

 52658624 ACAAAGGCTTACGTATGGAACTATTTGCTGGACTACTGTAGTTGTGGCAAAAAACTGGAA 52658683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3062 ACAAAGGCTTACGTATGGAACTATTTGCTGGACTACTGTAGTTGTGGCAAAAAACTGGAA 3121

 52658684 ATGACCTAAACGCTTATTAGTAGAAACCTGGTTAAATAAATTATCATATGTCCTTGAGGA 52658743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3122 ATGACCTAAACGCTTATTAGTAGAAACCTGGTTAAATAAATTATCATATGTCCTTGAGGA 3181

 52658744 CACAGGGACACAAAGAGGGGAATGACAGGCACTGAGCCTACTTGAGGGTGGGAGGAGGAA 52658803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3182 CACAGGGACACAAAGAGGGGAATGACAGGCACTGAGCCTACTTGAGGGTGGGAGGAGGAA 3241

 52658804 GTCGATCAGAAAAAATAACTAGTGGGTACTAGGCTTAGTACCCGGGTGAAAAAATAATCT 52658863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3242 GTCGATCAGAAAAAATAACTAGTGGGTACTAGGCTTAGTACCCGGGTGAAAAAATAATCT 3301

 52658864 GTACAACAAACCCCCATGACATGAGTTTACCTTATAACAAACCTGCACATGTAATCTGAA 52658923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3302 GTACAACAAACCCCCATGACATGAGTTTACCTTATAACAAACCTGCACATGTAATCTGAA 3361

 52658924 CCTAGATAAAAGTTTAAAAAAATAAATAATCATATGTCCCTACAATGAAATATTCCACAG 52658983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3362 CCTAGATAAAAGTTTAAAAAAATAAATAATCATATGTCCCTACAATGAAATATTCCACAG 3421

 52658984 GCATTAAAATTCCCCAAGGAATTTTAGTAAGGAAAGAAAAAGCTGTGCCCAACAGCACGT 52659043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3422 GCATTAAAATTCCCCAAGGAATTTTAGTAAGGAAAGAAAAAGCTGTGCCCAACAGCACGT 3481

 52659044 ACAGTATGTTTCCATTTGTTTTTAAAAAATGGTGTCGGGAGGTTGAGGAGACAACTTATA 52659103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3482 ACAGTATGTTTCCATTTGTTTTTAAAAAATGGTGTCGGGAGGTTGAGGAGACAACTTATA 3541

 52659104 AATAGACATGCCTGGGATACCTCTGGATATAAGAAACTGTAAAGTATTTACTTCTA 52659159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3542 AATAGACATGCCTGGGATACCTCTGGATATAAGAAACTGTAAAGTATTTACTTCTA 3597

Alignment time is 4.00694 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [52637064,52668002] =>     30939 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    7177] =>      7177 nucs 'mol-32-3403-117026_7177'

Score:        7177
Aligned:      7177        nucs
Identic:      7177 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [52644747,52651923]
 second seq =>  [       1,    7177]

 52644747 AGAAGTTTCTACCCAGAGAAACATCAGGATGACACTCTGCTGCAATGTGCTATTTGTTCT 52644806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGAAGTTTCTACCCAGAGAAACATCAGGATGACACTCTGCTGCAATGTGCTATTTGTTCT 60

 52644807 AGAGGGGTCAACAGCTTGCCACCTTGCCTAGGCCCAGGGTGACTGCATATGTGCAGTGGT 52644866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGAGGGGTCAACAGCTTGCCACCTTGCCTAGGCCCAGGGTGACTGCATATGTGCAGTGGT 120

 52644867 CTTATCCCATTAGCGCCCCCGAGCATGCATTCAGAACCAAGTGGATACACCTTGGCACAC 52644926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTTATCCCATTAGCGCCCCCGAGCATGCATTCAGAACCAAGTGGATACACCTTGGCACAC 180

 52644927 TTACCTTCCCTGCAGGGACATCATCGGACTGCCCTGATAAGCCAGGAACCTCATCCACCT 52644986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTACCTTCCCTGCAGGGACATCATCGGACTGCCCTGATAAGCCAGGAACCTCATCCACCT 240

 52644987 TGTCTTGATGCTCTGCCCTCTTGGCTTCCTGTTGGCTGTCACCTGGCACCTTTTCCTGTC 52645046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGTCTTGATGCTCTGCCCTCTTGGCTTCCTGTTGGCTGTCACCTGGCACCTTTTCCTGTC 300

 52645047 CCTTGTCCAGCTTGAAGAATTTGTCAAAAAAGCTGGAGTCCTTGGGCTTGGAGGGAGCTT 52645106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCTTGTCCAGCTTGAAGAATTTGTCAAAAAAGCTGGAGTCCTTGGGCTTGGAGGGAGCTT 360

 52645107 CTCCTCCTGCTCCCCCTGTCTCAGGTGGGAGAAGCGTGGGATCCCTGGCGGCAGAGAGGA 52645166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTCCTCCTGCTCCCCCTGTCTCAGGTGGGAGAAGCGTGGGATCCCTGGCGGCAGAGAGGA 420

 52645167 CCTTGTCTTGGGCCGGGGCGTGCCCTGGGGTTTTATCTGTGTCCTGCCCCGGTCCAGCTG 52645226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCTTGTCTTGGGCCGGGGCGTGCCCTGGGGTTTTATCTGTGTCCTGCCCCGGTCCAGCTG 480

 52645227 CCACCGGAAGTGTCCAGCTCTCACTTGGGTCTTTGTTCGCTGGAGCTTTATTGGAGCTGA 52645286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCACCGGAAGTGTCCAGCTCTCACTTGGGTCTTTGTTCGCTGGAGCTTTATTGGAGCTGA 540

 52645287 CATCAAGCTTCACTGATCCAAGGGATGAATCTGCGGCTTGGTCTCCGGTACGTCCTGGTA 52645346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CATCAAGCTTCACTGATCCAAGGGATGAATCTGCGGCTTGGTCTCCGGTACGTCCTGGTA 600

 52645347 CAGGCCGAGAGAGCATCAAGAAAAAACGAGATTTAGCAGCTGGTGCCTCGGGTTTGGCCT 52645406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CAGGCCGAGAGAGCATCAAGAAAAAACGAGATTTAGCAGCTGGTGCCTCGGGTTTGGCCT 660

 52645407 CTTTCCCAAGATTCTTTCCGTTGGCATCCGCAACAGCACTTATCTCCGTTGTCTCGGGGG 52645466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTTTCCCAAGATTCTTTCCGTTGGCATCCGCAACAGCACTTATCTCCGTTGTCTCGGGGG 720

 52645467 AAGAAGTGGCCACATTATCCGTCTTGACACTTATTCCCAAGTCGACTGTAAACACAAACA 52645526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAGAAGTGGCCACATTATCCGTCTTGACACTTATTCCCAAGTCGACTGTAAACACAAACA 780

 52645527 TAAACAGTGGTTATTCAGCCAAGCCGGGAAATTCAGGCACTAATAATGGACTCCAGACAT 52645586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TAAACAGTGGTTATTCAGCCAAGCCGGGAAATTCAGGCACTAATAATGGACTCCAGACAT 840

 52645587 TTTTTATACAAAAGCCATACTGCATACTGGAACTGTGTTGTTCTCTGGTCATTCTGAAAG 52645646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTTTTATACAAAAGCCATACTGCATACTGGAACTGTGTTGTTCTCTGGTCATTCTGAAAG 900

 52645647 GCAGAAGTTAGCTCTCTACATCTCCTTGGACCCTGCTTTTCTTGGGAGAGGAGAAGGCAA 52645706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GCAGAAGTTAGCTCTCTACATCTCCTTGGACCCTGCTTTTCTTGGGAGAGGAGAAGGCAA 960

 52645707 GGTTGGTGAGGAGGGAAAGCTACTTAATGGAAAGTCACTAGCTGCCAGGTGTGGAATGAG 52645766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GGTTGGTGAGGAGGGAAAGCTACTTAATGGAAAGTCACTAGCTGCCAGGTGTGGAATGAG 1020

 52645767 TGATATTCAATGTTAATTAATCTTCTTTTATCTGTGTAAGAACTCCGTGAGCAGCATATT 52645826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGATATTCAATGTTAATTAATCTTCTTTTATCTGTGTAAGAACTCCGTGAGCAGCATATT 1080

 52645827 GTCATGATGTCAACTGGGAGGCAGTACAGCAGTTAGGAGCTTGGGTTCTGGAGCTAGAAC 52645886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GTCATGATGTCAACTGGGAGGCAGTACAGCAGTTAGGAGCTTGGGTTCTGGAGCTAGAAC 1140

 52645887 AAGGTTTCTCAACCTCAGCACTACTCACATTTGAAGCCAGATTATTCTTTGTTAGGGAGG 52645946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AAGGTTTCTCAACCTCAGCACTACTCACATTTGAAGCCAGATTATTCTTTGTTAGGGAGG 1200

 52645947 CTCATCCCGTGCCTCATAGGCTGATTAGCAGCATCCTGGCCTCTGCCCACTAGACGCCGG 52646006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CTCATCCCGTGCCTCATAGGCTGATTAGCAGCATCCTGGCCTCTGCCCACTAGACGCCGG 1260

 52646007 TCACATTTCCCAGTCATGGCAACCAAAAATATCTCTAGGCATTGCTAAATGTCCCCTGGA 52646066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TCACATTTCCCAGTCATGGCAACCAAAAATATCTCTAGGCATTGCTAAATGTCCCCTGGA 1320

 52646067 GGACAAAATCTCTTACGTTTGAGAGGCACTGAGCTGAAATGTCTTTTTGAATCCAGATTA 52646126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GGACAAAATCTCTTACGTTTGAGAGGCACTGAGCTGAAATGTCTTTTTGAATCCAGATTA 1380

 52646127 TCTAATTTTCTGTGCCTCAACTTTCTGGTAAAAGGAGACAGATAATAAATCTCGTAATTT 52646186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TCTAATTTTCTGTGCCTCAACTTTCTGGTAAAAGGAGACAGATAATAAATCTCGTAATTT 1440

 52646187 TGTTAGGAAGATTACATGAGTTAATAGTTTTAAAGCAAGTACAATAGCACCTGGAATATA 52646246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TGTTAGGAAGATTACATGAGTTAATAGTTTTAAAGCAAGTACAATAGCACCTGGAATATA 1500

 52646247 TTAAGTGCTTAATAAATATCACAAACATTAGTTATCATTATTCATGAGTGAGAAAACTGA 52646306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTAAGTGCTTAATAAATATCACAAACATTAGTTATCATTATTCATGAGTGAGAAAACTGA 1560

 52646307 CAGTCAGAGAGGTCAGTACACCCTCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCTAGTAAGCAGCAGAGT 52646366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CAGTCAGAGAGGTCAGTACACCCTCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCTAGTAAGCAGCAGAGT 1620

 52646367 CTGGCTTCAGGCAGAAATCTGACTTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGTCTTACCAGGGACTT 52646426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CTGGCTTCAGGCAGAAATCTGACTTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGTCTTACCAGGGACTT 1680

 52646427 GTATTAGCATAGACTGTTAAGAATATGGGAAGATTTTTAAAATACAGTACTCAGAAAATT 52646486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GTATTAGCATAGACTGTTAAGAATATGGGAAGATTTTTAAAATACAGTACTCAGAAAATT 1740

 52646487 TCTCTTTGAAAGGCTGGAAGAGCAGATATCCACACAAGAAGGCAAATTAGACCTCAGGCC 52646546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TCTCTTTGAAAGGCTGGAAGAGCAGATATCCACACAAGAAGGCAAATTAGACCTCAGGCC 1800

 52646547 AGTGTGGAATTAAAGGTGTAGGGTTATCTGGTCAAGACTGTGTGTGTGGATACAGGCTCC 52646606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AGTGTGGAATTAAAGGTGTAGGGTTATCTGGTCAAGACTGTGTGTGTGGATACAGGCTCC 1860

 52646607 AACCCCTCCAGGCAAGGGCACTGTTTCCAACATCCACCCTTTCTCCTTTGACCTCTACCT 52646666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AACCCCTCCAGGCAAGGGCACTGTTTCCAACATCCACCCTTTCTCCTTTGACCTCTACCT 1920

 52646667 TGACCTAAATTAACTATAAAAGGTCCTTCTTTTCTAGGACCCTACTATAAATCAGTGAAA 52646726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TGACCTAAATTAACTATAAAAGGTCCTTCTTTTCTAGGACCCTACTATAAATCAGTGAAA 1980

 52646727 TATTCAGGAAAAAAAGAACACCAAGAATGTTGGGATCCCAGTTAAAGATCAAGATTCTCT 52646786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TATTCAGGAAAAAAAGAACACCAAGAATGTTGGGATCCCAGTTAAAGATCAAGATTCTCT 2040

 52646787 ACTGATAAGCTGTGTGATATGGAGTAAATCACTAAAGATCTTTGAATCTCTTCATTTGTA 52646846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ACTGATAAGCTGTGTGATATGGAGTAAATCACTAAAGATCTTTGAATCTCTTCATTTGTA 2100

 52646847 AAATGGGAATATTGGTAGTCCTACTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTAAAGAAGAAAAGTCA 52646906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AAATGGGAATATTGGTAGTCCTACTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTAAAGAAGAAAAGTCA 2160

 52646907 TGCAAAGGATCTGGCACAACGCCTTTTCCATAATAAGTGCTTAGTAATTGACAGATACTG 52646966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TGCAAAGGATCTGGCACAACGCCTTTTCCATAATAAGTGCTTAGTAATTGACAGATACTG 2220

 52646967 TGATAACTTTTCAGGTTTCTCTCATGCCTTTGACAACATTGCATTTTGCTTGCTCTATCT 52647026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TGATAACTTTTCAGGTTTCTCTCATGCCTTTGACAACATTGCATTTTGCTTGCTCTATCT 2280

 52647027 GTAGTCAGACACTTCTTAATATCTGTTTGCAGGAAGACAGAAAAATAAAGGGAAGAATTG 52647086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GTAGTCAGACACTTCTTAATATCTGTTTGCAGGAAGACAGAAAAATAAAGGGAAGAATTG 2340

 52647087 AGATTTCTTTGATCTATTCATACTGCTCATTAATATGTAGTGAGAAATACATACACACAC 52647146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AGATTTCTTTGATCTATTCATACTGCTCATTAATATGTAGTGAGAAATACATACACACAC 2400

 52647147 ACATACACACACATGCATCCATTAGCAATTGTTTTTGCCCAACTCTAGTGTCTCGCAGTG 52647206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ACATACACACACATGCATCCATTAGCAATTGTTTTTGCCCAACTCTAGTGTCTCGCAGTG 2460

 52647207 TCTAGACTAAACAACAAACAAAAAAGGGGGGAGAGTGAGCTGGATTAAGCATTGAGGCAC 52647266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TCTAGACTAAACAACAAACAAAAAAGGGGGGAGAGTGAGCTGGATTAAGCATTGAGGCAC 2520

 52647267 AGTGAAGAAATGGTCTGGGGCAAGCCCAGGGATGAATGTTAGGGGTTTCTCATAAACCTG 52647326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 AGTGAAGAAATGGTCTGGGGCAAGCCCAGGGATGAATGTTAGGGGTTTCTCATAAACCTG 2580

 52647327 AACCTGAAGAAAATCACCCTGCCAGCATATTGATCTTCTAGCTCTTCTTAACCTTTTTTT 52647386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AACCTGAAGAAAATCACCCTGCCAGCATATTGATCTTCTAGCTCTTCTTAACCTTTTTTT 2640

 52647387 CTGTGATTCAGGAATTCATAATGATAGAAAATATTATACTAAAGAAGAAAAAAAGAGGGA 52647446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CTGTGATTCAGGAATTCATAATGATAGAAAATATTATACTAAAGAAGAAAAAAAGAGGGA 2700

 52647447 GAATAAGTAAGTGATAGATGGATGCATCAGGGTGTAAAGTTAGCAAGTAAGGCTGTTGAA 52647506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GAATAAGTAAGTGATAGATGGATGCATCAGGGTGTAAAGTTAGCAAGTAAGGCTGTTGAA 2760

 52647507 GTGTCAGAGTGAATATAAATGAATTGTGGGAATGGTCCATGCCAGGAGAAGAGGGTATGG 52647566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GTGTCAGAGTGAATATAAATGAATTGTGGGAATGGTCCATGCCAGGAGAAGAGGGTATGG 2820

 52647567 TTGACAAAAAGGGAAATGCTAAGATTCAAAACAGGGAAGGGCTTTTCAAAATGCCAAGAG 52647626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TTGACAAAAAGGGAAATGCTAAGATTCAAAACAGGGAAGGGCTTTTCAAAATGCCAAGAG 2880

 52647627 CACCAACTTATATCTTTCAGTTTAATTCCTCTCTTCCTTACCCACTGGCTGGAAAGCAAA 52647686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CACCAACTTATATCTTTCAGTTTAATTCCTCTCTTCCTTACCCACTGGCTGGAAAGCAAA 2940

 52647687 GGAGCTAGTGGTAAGTAAGAGTGTTATAGCCAGAGAAAAAGTCTTCAAAAAACACAAAGT 52647746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 GGAGCTAGTGGTAAGTAAGAGTGTTATAGCCAGAGAAAAAGTCTTCAAAAAACACAAAGT 3000

 52647747 ACTTTCCATGGACAACCTTTTTTATTTTAAAGTGCCAATATGTTGCTTTGAAAAAGAATA 52647806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 ACTTTCCATGGACAACCTTTTTTATTTTAAAGTGCCAATATGTTGCTTTGAAAAAGAATA 3060

 52647807 AATTCCTTACATCCAGGTATCTGGACTAGACTTCAGTGCATTTAGTGATTATAGCAAATC 52647866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 AATTCCTTACATCCAGGTATCTGGACTAGACTTCAGTGCATTTAGTGATTATAGCAAATC 3120

 52647867 CAAACAGTAGCTTTTGATATCAGAGAATGGGTAAAGTGTTTTTGACAATTTCTAAGAACT 52647926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 CAAACAGTAGCTTTTGATATCAGAGAATGGGTAAAGTGTTTTTGACAATTTCTAAGAACT 3180

 52647927 TAGAGTTCTTCGGTGATACGTTCCATGCAACTGAAGCTCTGCTCTCCAAATTTAGGTGGG 52647986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TAGAGTTCTTCGGTGATACGTTCCATGCAACTGAAGCTCTGCTCTCCAAATTTAGGTGGG 3240

 52647987 TACATACCCAAGTCCATCACCTGGGGCTTCTATTTCCTTTGCTCAGATGCTCACCTCCTA 52648046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TACATACCCAAGTCCATCACCTGGGGCTTCTATTTCCTTTGCTCAGATGCTCACCTCCTA 3300

 52648047 GGTGGGCACCTGACATAAGATAGACTAATAAAAATAAGTCCTGTAACTTTTGATACTCCT 52648106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 GGTGGGCACCTGACATAAGATAGACTAATAAAAATAAGTCCTGTAACTTTTGATACTCCT 3360

 52648107 ATTAAAAAAGAGTTGCAAACCAATAGGAGGTACACTTGAGAATCAGCACAAATGAAAGTA 52648166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 ATTAAAAAAGAGTTGCAAACCAATAGGAGGTACACTTGAGAATCAGCACAAATGAAAGTA 3420

 52648167 GAACCTGGAAATCCAGGAAGCAGATACCCAATCATGTCATTTAAACATTTAGATCCAGCT 52648226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 GAACCTGGAAATCCAGGAAGCAGATACCCAATCATGTCATTTAAACATTTAGATCCAGCT 3480

 52648227 GTGCCTGAAGCTGAACTTTAGCATTACATAAGCCAATAAATCACTCTTCCCCAACTTACG 52648286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 GTGCCTGAAGCTGAACTTTAGCATTACATAAGCCAATAAATCACTCTTCCCCAACTTACG 3540

 52648287 CCAGTTGAAATTGAATACATACTCAGTGACTTTGAGAGAATTCCAGGGAATTGGTCAGTC 52648346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 CCAGTTGAAATTGAATACATACTCAGTGACTTTGAGAGAATTCCAGGGAATTGGTCAGTC 3600

 52648347 CCTGTTTCACTTGTAAATACACAGCAATCAAGCCTACCAAATCTATGATTGATTGGGGTG 52648406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 CCTGTTTCACTTGTAAATACACAGCAATCAAGCCTACCAAATCTATGATTGATTGGGGTG 3660

 52648407 TCTGAAAGAGATGGAGGGAATGGAATCAACCTGAAAAACATATTTCAGGAGTTCATCCCT 52648466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 TCTGAAAGAGATGGAGGGAATGGAATCAACCTGAAAAACATATTTCAGGAGTTCATCCCT 3720

 52648467 GAAAACTTCCCCAACCTAGCTAGAGGGGCCAACATTCAAATTCAGGAAATGCAGAGAACC 52648526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 GAAAACTTCCCCAACCTAGCTAGAGGGGCCAACATTCAAATTCAGGAAATGCAGAGAACC 3780

 52648527 CCAGTAAGATACTCCACAAAAAGATCTTCCCCAAGACATCATCATCAGATTCTCCAAAGT 52648586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 CCAGTAAGATACTCCACAAAAAGATCTTCCCCAAGACATCATCATCAGATTCTCCAAAGT 3840

 52648587 TGAAATGTAAGAAAAAATGCTAAAGGCAACTAGAGTGAAAGGCCCGGTCACCTAAAAAGG 52648646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 TGAAATGTAAGAAAAAATGCTAAAGGCAACTAGAGTGAAAGGCCCGGTCACCTAAAAAGG 3900

 52648647 GAAGCACAGACTTACAGTGGACCTCTCACTGGTAACCCTACAAGCCAGAAGAGATTGAGG 52648706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 GAAGCACAGACTTACAGTGGACCTCTCACTGGTAACCCTACAAGCCAGAAGAGATTGAGG 3960

 52648707 ACCAATATTCAACATTCTTAAACAAAAAGAATTCCAACCCAGAATTTTATATCTGACTAA 52648766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 ACCAATATTCAACATTCTTAAACAAAAAGAATTCCAACCCAGAATTTTATATCTGACTAA 4020

 52648767 ACTAAGCTTCATAAGCAAAAGAGAAATAAGATCATTTTCAGACAAGCAAATGCTAAGGGA 52648826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 ACTAAGCTTCATAAGCAAAAGAGAAATAAGATCATTTTCAGACAAGCAAATGCTAAGGGA 4080

 52648827 ATTTGTGACCATTAGACCTTCCTTGCAACAGTTCCTAAAGGAAGCACTAAATATGGAAAG 52648886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 ATTTGTGACCATTAGACCTTCCTTGCAACAGTTCCTAAAGGAAGCACTAAATATGGAAAG 4140

 52648887 ACCATTACCAGACACTACAAAACACACTGAAGTACACAGACCAGTGACATTGTAAAGCAA 52648946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 ACCATTACCAGACACTACAAAACACACTGAAGTACACAGACCAGTGACATTGTAAAGCAA 4200

 52648947 CTACATAACAAGTCTGCAAAATAACCAGCCAACATCATGATGACGGTATCAAATCGACAC 52649006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 CTACATAACAAGTCTGCAAAATAACCAGCCAACATCATGATGACGGTATCAAATCGACAC 4260

 52649007 ATAGCAACACTAACCTTAAATGTAAATGGACTAAATGATCCCATTAAAAGACATAAAGTG 52649066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 ATAGCAACACTAACCTTAAATGTAAATGGACTAAATGATCCCATTAAAAGACATAAAGTG 4320

 52649067 GCAGGCTGGATAAAGAACCAAGAACCATTGGTATACTGTCTTCAAGAGACCCATCTCCTA 52649126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 GCAGGCTGGATAAAGAACCAAGAACCATTGGTATACTGTCTTCAAGAGACCCATCTCCTA 4380

 52649127 TGCAGTGACACACATAGGTTCAAGATAAAGGGATGGGGAAAAATCTACCAAGCAAATAGA 52649186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 TGCAGTGACACACATAGGTTCAAGATAAAGGGATGGGGAAAAATCTACCAAGCAAATAGA 4440

 52649187 AAACAGAATAAAACAGGGGTTGCAATCCTAGTTGCCGTCAAAACAGACTTTAAACCAACA 52649246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 AAACAGAATAAAACAGGGGTTGCAATCCTAGTTGCCGTCAAAACAGACTTTAAACCAACA 4500

 52649247 AAGGTTAAAAGAAAAAAATATGGGCATTGCATAAGGATAAAGTGTTAAATTAAACAAGAA 52649306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 AAGGTTAAAAGAAAAAAATATGGGCATTGCATAAGGATAAAGTGTTAAATTAAACAAGAA 4560

 52649307 GATCTAACTATCCTAAGTATATATGCACCAAACACAGGAACACCCAGATTCATAAAGCAA 52649366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 GATCTAACTATCCTAAGTATATATGCACCAAACACAGGAACACCCAGATTCATAAAGCAA 4620

 52649367 GTTTATGGAGACCTTCAAACAGACTTAGACTCCCACACAATAGTAGTGGGAGACTTTAAT 52649426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 GTTTATGGAGACCTTCAAACAGACTTAGACTCCCACACAATAGTAGTGGGAGACTTTAAT 4680

 52649427 ACCCCATGACAATATTAGACAGATCATTGAGACAGGAAATTAACAAAGATATTCAAGATC 52649486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 ACCCCATGACAATATTAGACAGATCATTGAGACAGGAAATTAACAAAGATATTCAAGATC 4740

 52649487 TAACTCAGCACTAAATCAAATGGCCCTGATAGATATCTACAGGACTGTCCTACTTGAAAC 52649546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 TAACTCAGCACTAAATCAAATGGCCCTGATAGATATCTACAGGACTGTCCTACTTGAAAC 4800

 52649547 CATACAATTACATGGTAATTGAATGACCTGCTCCTGAATGACTTTTGGGTAAATAATAAA 52649606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 CATACAATTACATGGTAATTGAATGACCTGCTCCTGAATGACTTTTGGGTAAATAATAAA 4860

 52649607 ATTAAGGCAGAAATCAAGAAGTTTTTTGAACTAATGAGAACAAAGATACAACATACCAGA 52649666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 ATTAAGGCAGAAATCAAGAAGTTTTTTGAACTAATGAGAACAAAGATACAACATACCAGA 4920

 52649667 ATCTTTGGGACACAGCTAAGGCAGTGTTAAGAGGGAAATTTATAGCACTAAATCCCACAT 52649726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 ATCTTTGGGACACAGCTAAGGCAGTGTTAAGAGGGAAATTTATAGCACTAAATCCCACAT 4980

 52649727 CAAAAAGTTAGAAAGAGCTCACGTTAACAATCTAACCTCACAACTACAGGAACTAGAGAA 52649786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 CAAAAAGTTAGAAAGAGCTCACGTTAACAATCTAACCTCACAACTACAGGAACTAGAGAA 5040

 52649787 CTGAGAGCAGAAAAACCTGAAAGCTAGCAGAAGACAAGAAATAACCAAAATTAGAGCTGA 52649846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 CTGAGAGCAGAAAAACCTGAAAGCTAGCAGAAGACAAGAAATAACCAAAATTAGAGCTGA 5100

 52649847 ACTGAAGGAGATTGAGACATGAAAAACCATTCAAAAGATCAGTGAATTCAGGAGCTGTTT 52649906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 ACTGAAGGAGATTGAGACATGAAAAACCATTCAAAAGATCAGTGAATTCAGGAGCTGTTT 5160

 52649907 TTTTTTTGAACAAATTAATAAAATAGACCATTAGCTAGAGTAATAAACAAGAAAATAGAA 52649966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 TTTTTTTGAACAAATTAATAAAATAGACCATTAGCTAGAGTAATAAACAAGAAAATAGAA 5220

 52649967 AAGATTCAAATAAACACAATCAGAAACGACAAGGGGGATATTACCACTGACCCCACAGAA 52650026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 AAGATTCAAATAAACACAATCAGAAACGACAAGGGGGATATTACCACTGACCCCACAGAA 5280

 52650027 GTACAAACAACCATCAGAGAATATTATGAACATCTCTATGCACATAAACTAGAAAATCTA 52650086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 GTACAAACAACCATCAGAGAATATTATGAACATCTCTATGCACATAAACTAGAAAATCTA 5340

 52650087 GAAGAAGTGGATAAACTTCTGGACATATACACCCTTCTAAGACTGTACCAGGAAGAAATT 52650146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 GAAGAAGTGGATAAACTTCTGGACATATACACCCTTCTAAGACTGTACCAGGAAGAAATT 5400

 52650147 GAATCCCTGAACAGACCAATAATGAGCCCTAAAATTGAGGAAGTAATACATAGACTACCA 52650206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 GAATCCCTGAACAGACCAATAATGAGCCCTAAAATTGAGGAAGTAATACATAGACTACCA 5460

 52650207 ACCATAAAAAAACCCAGTACTAGATGGATTCACAGGTAAGTTCTACCAGTTGTACAAAGA 52650266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 ACCATAAAAAAACCCAGTACTAGATGGATTCACAGGTAAGTTCTACCAGTTGTACAAAGA 5520

 52650267 AGAGCTGGTACAGTTCCTACTGAAATTATTCCAAAAAGTTGAGTAGGAGGGAGTCCTTCC 52650326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 AGAGCTGGTACAGTTCCTACTGAAATTATTCCAAAAAGTTGAGTAGGAGGGAGTCCTTCC 5580

 52650327 TAACTCATTTGATGAGGCCAGCATCATCCTGATATCAAAACCTGGCAGATATACAACAAG 52650386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 TAACTCATTTGATGAGGCCAGCATCATCCTGATATCAAAACCTGGCAGATATACAACAAG 5640

 52650387 AAAAGCTTCAGGCCAATATCCTTGATGAACTTCAATGCAAAAATCCTCAATAAAATACTG 52650446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 AAAAGCTTCAGGCCAATATCCTTGATGAACTTCAATGCAAAAATCCTCAATAAAATACTG 5700

 52650447 GCAAACTGAATCCAGCAGCACACCAAAAAGCTTATCCACCATGATCAAGTAGAATGCAAG 52650506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5701 GCAAACTGAATCCAGCAGCACACCAAAAAGCTTATCCACCATGATCAAGTAGAATGCAAG 5760

 52650507 TTGGTTCAACATATACAAATCAATAAATGTGACTCATCACATAAACAGAACTAAAGACAA 52650566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5761 TTGGTTCAACATATACAAATCAATAAATGTGACTCATCACATAAACAGAACTAAAGACAA 5820

 52650567 AAACTACATGATTATCTCAACAGATGCAGAAAAGGCTTTCAATAAAATTAGACATCCATT 52650626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5821 AAACTACATGATTATCTCAACAGATGCAGAAAAGGCTTTCAATAAAATTAGACATCCATT 5880

 52650627 TATGTTAAAAACTCTCAATAAACTAGGTATTGAAGGAACATACCTCAAAATAATAAGAGC 52650686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5881 TATGTTAAAAACTCTCAATAAACTAGGTATTGAAGGAACATACCTCAAAATAATAAGAGC 5940

 52650687 CATGTATGACAAACCCACAGCTAAGATCATACTGAATGGGCAAAAGCTGGAAGCATTTTC 52650746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5941 CATGTATGACAAACCCACAGCTAAGATCATACTGAATGGGCAAAAGCTGGAAGCATTTTC 6000

 52650747 TTTGAAGACTGGCATAAGACAAGGATGATCTCTCTCACCACTCCTATTCAACATAGTATT 52650806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6001 TTTGAAGACTGGCATAAGACAAGGATGATCTCTCTCACCACTCCTATTCAACATAGTATT 6060

 52650807 GGAAGTCTTGGCCAGGGCAATCGGGCAAGAGAAATAAATAAAGCGCATCCAAATAGGAAG 52650866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6061 GGAAGTCTTGGCCAGGGCAATCGGGCAAGAGAAATAAATAAAGCGCATCCAAATAGGAAG 6120

 52650867 AGAGGAAGTCAAACTATCCTTGTTTGCAGATTACATGACATTATATCTAGAAAACCCCAT 52650926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6121 AGAGGAAGTCAAACTATCCTTGTTTGCAGATTACATGACATTATATCTAGAAAACCCCAT 6180

 52650927 AGTCTCAGCCCCAAAGCTTCTTAAGCTGATAAACAACTTCAGCAAAGTCTCAGGATACAA 52650986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6181 AGTCTCAGCCCCAAAGCTTCTTAAGCTGATAAACAACTTCAGCAAAGTCTCAGGATACAA 6240

 52650987 AATAAATGTGCAAAAATTACTGGCATTTCCATGCACCAACAACAGTCAAGCCAGGAGCCA 52651046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6241 AATAAATGTGCAAAAATTACTGGCATTTCCATGCACCAACAACAGTCAAGCCAGGAGCCA 6300

 52651047 AACCAGGAATGCACTCCCACTCACAATCGCCACAAAAAGAGTAAAATACCTAGGAAAACA 52651106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6301 AACCAGGAATGCACTCCCACTCACAATCGCCACAAAAAGAGTAAAATACCTAGGAAAACA 6360

 52651107 GCTAATTAGGGAGGTGAAAGATCTCTACAAGGAGAATAATGAACCAGCGCTCAAAGAAAT 52651166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6361 GCTAATTAGGGAGGTGAAAGATCTCTACAAGGAGAATAATGAACCAGCGCTCAAAGAAAT 6420

 52651167 TAGAGATGACACAAACAAATGGAAAAACATTCCATGTTCATTGATAGGAAGAATCAATAT 52651226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6421 TAGAGATGACACAAACAAATGGAAAAACATTCCATGTTCATTGATAGGAAGAATCAATAT 6480

 52651227 CATTAAAATGGCCATATTGCCCAGAGCAATTTATAGATTCAATGCTATACCTATTAAACT 52651286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6481 CATTAAAATGGCCATATTGCCCAGAGCAATTTATAGATTCAATGCTATACCTATTAAACT 6540

 52651287 ACTGTTGAGATTCTTCACAGAACCAGAGAAAACTATTTTAAAATTCATATAGAACCCAGA 52651346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6541 ACTGTTGAGATTCTTCACAGAACCAGAGAAAACTATTTTAAAATTCATATAGAACCCAGA 6600

 52651347 AAAGAGCCTGAATTGCTAAGGCAATCCTAAGCAAAAAGCATAAAGCTGAAGGCATCATGC 52651406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6601 AAAGAGCCTGAATTGCTAAGGCAATCCTAAGCAAAAAGCATAAAGCTGAAGGCATCATGC 6660

 52651407 TACCTGACTTCAAACTATACTACAAGGCTACAGTAACCAAAACAGCATACTACTGGTACA 52651466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6661 TACCTGACTTCAAACTATACTACAAGGCTACAGTAACCAAAACAGCATACTACTGGTACA 6720

 52651467 AAAACAGACACATAGACCAATGGAACAGAATAGAGAACCCGGAAATAAGACCACACACCT 52651526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6721 AAAACAGACACATAGACCAATGGAACAGAATAGAGAACCCGGAAATAAGACCACACACCT 6780

 52651527 ACAACTATCTAATCTTTGACAAACCTGACAAAAACATGCAATGGGGAAAAGATTTCCTAT 52651586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6781 ACAACTATCTAATCTTTGACAAACCTGACAAAAACATGCAATGGGGAAAAGATTTCCTAT 6840

 52651587 TCAATAAAAAGTGCTGGGATAACCGGCTAGCTGTACACAGAAGATTAAAGCTGGACCCCT 52651646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6841 TCAATAAAAAGTGCTGGGATAACCGGCTAGCTGTACACAGAAGATTAAAGCTGGACCCCT 6900

 52651647 TCCTTACAACATATACAAAAATCGGCCGGGCTTGGTGGCTCACGCTTGTAATCCCAGCAC 52651706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6901 TCCTTACAACATATACAAAAATCGGCCGGGCTTGGTGGCTCACGCTTGTAATCCCAGCAC 6960

 52651707 TTTGGAAGGCCGAGGAGGGCGGATCATGAGGTCAGGAGATCGAGAACACGGTGAAACCCC 52651766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6961 TTTGGAAGGCCGAGGAGGGCGGATCATGAGGTCAGGAGATCGAGAACACGGTGAAACCCC 7020

 52651767 GTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGTGTGGTGGCAGGCGCCTGTAGTCCCAGC 52651826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7021 GTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGTGTGGTGGCAGGCGCCTGTAGTCCCAGC 7080

 52651827 TACTTGGAGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGTGTGAACCCGGGAGACAGAGCTTGCACTGAG 52651886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7081 TACTTGGAGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGTGTGAACCCGGGAGACAGAGCTTGCACTGAG 7140

 52651887 CCGAGACCACATCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAG 52651923
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7141 CCGAGACCACATCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAG 7177

Alignment time is 6.97157 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [52637064,52668002] =>     30939 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    2876] =>      2876 nucs 'mol-32-340e-137685_2876'

Score:        2807
Aligned:      2876        nucs
Identic:      2864 (100%) nucs =>      2430 (100%)       434 ( 98%)
Gaps:            8 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [52644631,52647064] EXCISED REGION [52658003,52658436]
 second seq =>  [       1,    2434] EXCISED REGION [    2435,    2876]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>     10938 nucs [52647065,52658002]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         6 nucs [52647065,52647070] to [52658003,52658008]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [52647065,52647067] to [52658000,52658002]
 second seq =>         0 nucs

 52644631 CGCAACCTGTCTACTTCCGCCTTTGAAAAATGGATGGACAAATTCATCTGCATGTAACTC 52644690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CGCAACCTGTCTACTTCCGCCTTTGAAAAATGGATGGACAAATTCATCTGCATGTAACTC 60

 52644691 ACCTCCTCTTTTCTTTTACATAAAACAGATGCCACAGCTGTTATTGTTCTTCACACAGAA 52644750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACCTCCTCTTTTCTTTTACATAAAACAGATGCCACAGCTGTTATTGTTCTTCACACAGAA 120

 52644751 GTTTCTACCCAGAGAAACATCAGGATGACACTCTGCTGCAATGTGCTATTTGTTCTAGAG 52644810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTTTCTACCCAGAGAAACATCAGGATGACACTCTGCTGCAATGTGCTATTTGTTCTAGAG 180

 52644811 GGGTCAACAGCTTGCCACCTTGCCTAGGCCCAGGGTGACTGCATATGTGCAGTGGTCTTA 52644870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGGTCAACAGCTTGCCACCTTGCCTAGGCCCAGGGTGACTGCATATGTGCAGTGGTCTTA 240

 52644871 TCCCATTAGCGCCCCCGAGCATGCATTCAGAACCAAGTGGATACACCTTGGCACACTTAC 52644930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCCCATTAGCGCCCCCGAGCATGCATTCAGAACCAAGTGGATACACCTTGGCACACTTAC 300

 52644931 CTTCCCTGCAGGGACATCATCGGACTGCCCTGATAAGCCAGGAACCTCATCCACCTTGTC 52644990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTTCCCTGCAGGGACATCATCGGACTGCCCTGATAAGCCAGGAACCTCATCCACCTTGTC 360

 52644991 TTGATGCTCTGCCCTCTTGGCTTCCTGTTGGCTGTCACCTGGCACCTTTTCCTGTCCCTT 52645050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTGATGCTCTGCCCTCTTGGCTTCCTGTTGGCTGTCACCTGGCACCTTTTCCTGTCCCTT 420

 52645051 GTCCAGCTTGAAGAATTTGTCAAAAAAGCTGGAGTCCTTGGGCTTGGAGGGAGCTTCTCC 52645110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTCCAGCTTGAAGAATTTGTCAAAAAAGCTGGAGTCCTTGGGCTTGGAGGGAGCTTCTCC 480

 52645111 TCCTGCTCCCCCTGTCTCAGGTGGGAGAAGCGTGGGATCCCTGGCGGCAGAGAGGACCTT 52645170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCCTGCTCCCCCTGTCTCAGGTGGGAGAAGCGTGGGATCCCTGGCGGCAGAGAGGACCTT 540

 52645171 GTCTTGGGCCGGGGCGTGCCCTGGGGTTTTATCTGTGTCCTGCCCCGGTCCAGCTGCCAC 52645230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GTCTTGGGCCGGGGCGTGCCCTGGGGTTTTATCTGTGTCCTGCCCCGGTCCAGCTGCCAC 600

 52645231 CGGAAGTGTCCAGCTCTCACTTGGGTCTTTGTTCGCTGGAGCTTTATTGGAGCTGACATC 52645290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CGGAAGTGTCCAGCTCTCACTTGGGTCTTTGTTCGCTGGAGCTTTATTGGAGCTGACATC 660

 52645291 AAGCTTCACTGATCCAAGGGATGAATCTGCGGCTTGGTCTCCGGTACGTCCTGGTACAGG 52645350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAGCTTCACTGATCCAAGGGATGAATCTGCGGCTTGGTCTCCGGTACGTCCTGGTACAGG 720

 52645351 CCGAGAGAGCATCAAGAAAAAACGAGATTTAGCAGCTGGTGCCTCGGGTTTGGCCTCTTT 52645410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CCGAGAGAGCATCAAGAAAAAACGAGATTTAGCAGCTGGTGCCTCGGGTTTGGCCTCTTT 780

 52645411 CCCAAGATTCTTTCCGTTGGCATCCGCAACAGCACTTATCTCCGTTGTCTCGGGGGAAGA 52645470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CCCAAGATTCTTTCCGTTGGCATCCGCAACAGCACTTATCTCCGTTGTCTCGGGGGAAGA 840

 52645471 AGTGGCCACATTATCCGTCTTGACACTTATTCCCAAGTCGACTGTAAACACAAACATAAA 52645530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGTGGCCACATTATCCGTCTTGACACTTATTCCCAAGTCGACTGTAAACACAAACATAAA 900

 52645531 CAGTGGTTATTCAGCCAAGCCGGGAAATTCAGGCACTAATAATGGACTCCAGACATTTTT 52645590
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CAGCGGTTATTCAGCCAAGCCGGGAAATTCAGGCACTAATAATGGACTCCAGACATTTTT 960

 52645591 TATACAAAAGCCATACTGCATACTGGAACTGTGTTGTTCTCTGGTCATTCTGAAAGGCAG 52645650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TATACAAAAGCCATACTGCATACTGGAACTGTGTTGTTCTCTGGTCATTCTGAAAGGCAG 1020

 52645651 AAGTTAGCTCTCTACATCTCCTTGGACCCTGCTTTTCTTGGGAGAGGAGAAGGCAAGGTT 52645710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AAGTTAGCTCTCTACATCTCCTTGGACCCTGCTTTTCTTGGGAGAGGAGAAGGCAAGGTT 1080

 52645711 GGTGAGGAGGGAAAGCTACTTAATGGAAAGTCACTAGCTGCCAGGTGTGGAATGAGTGAT 52645770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GGTGAGGAGGGAAAGCTACTTAATGGAAAGTCACTAGCTGCCAGGTGTGGAATGAGTGAT 1140

 52645771 ATTCAATGTTAATTAATCTTCTTTTATCTGTGTAAGAACTCCGTGAGCAGCATATTGTCA 52645830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATTCAATGTTAATTAATCTTCTTTTATCTGTGTAAGAACTCCGTGAGCAGCATATTGTCA 1200

 52645831 TGATGTCAACTGGGAGGCAGTACAGCAGTTAGGAGCTTGGGTTCTGGAGCTAGAACAAGG 52645890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TGATGTCAACTGGGAGGCAGTACAGCAGTTAGGAGCTTGGGTTCTGGAGCTAGAACAAGG 1260

 52645891 TTTCTCAACCTCAGCACTACTCACATTTGAAGCCAGATTATTCTTTGTTAGGGAGGCTCA 52645950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTTCTCAACCTCAGCACTACTCACATTTGAAGCCAGATTATTCTTTGTTAGGGAGGCTCA 1320

 52645951 TCCCGTGCCTCATAGGCTGATTAGCAGCATCCTGGCCTCTGCCCACTAGACGCCGGTCAC 52646010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TCCCGTGCCTCATAGGCTGATTAGCAGCATCCTGGCCTCTGCCCACTAGACGCCGGTCAC 1380

 52646011 ATTTCCCAGTCATGGCAACCAAAAATATCTCTAGGCATTGCTAAATGTCCCCTGGAGGAC 52646070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ATTTCCCAGTCATGGCAACCAAAAATATCTCTAGGCATTGCTAAATGTCCCCTGGAGGAC 1440

 52646071 AAAATCTCTTACGTTTGAGAGGCACTGAGCTGAAATGTCTTTTTGAATCCAGATTATCTA 52646130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AAAATCTCTTACGTTTGAGAGGCACTGAGCTGAAATGTCTTTTTGAATCCAGATTATCTA 1500

 52646131 ATTTTCTGTGCCTCAACTTTCTGGTAAAAGGAGACAGATAATAAATCTCGTAATTTTGTT 52646190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATTTTCTGTGCCTCAACTTTCTGGTAAAAGGAGACAGATAATAAATCTCGTAATTTTGTT 1560

 52646191 AGGAAGATTACATGAGTTAATAGTTTTAAAGCAAGTACAATAGCACCTGGAATATATTAA 52646250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     1561 AGGAAGATTACATGAGTTAATAGTTTTAAAGCAAGTACAATAGCGCCTGGAATATATTAA 1620

 52646251 GTGCTTAATAAATATCACAAACATTAGTTATCATTATTCATGAGTGAGAAAACTGACAGT 52646310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GTGCTTAATAAATATCACAAACATTAGTTATCATTATTCATGAGTGAGAAAACTGACAGT 1680

 52646311 CAGAGAGGTCAGTACACCCTCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCTAGTAAGCAGCAGAGTCTGG 52646370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CAGAGAGGTCAGTACACCCTCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCTAGTAAGCAGCAGAGTCTGG 1740

 52646371 CTTCAGGCAGAAATCTGACTTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGTCTTACCAGGGACTTGTAT 52646430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CTTCAGGCAGAAATCTGACTTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGTCTTACCAGGGACTTGTAT 1800

 52646431 TAGCATAGACTGTTAAGAATATGGGAAGATTTTTAAAATACAGTACTCAGAAAATTTCTC 52646490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TAGCATAGACTGTTAAGAATATGGGAAGATTTTTAAAATACAGTACTCAGAAAATTTCTC 1860

 52646491 TTTGAAAGGCTGGAAGAGCAGATATCCACACAAGAAGGCAAATTAGACCTCAGGCCAGTG 52646550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTTGAAAGGCTGGAAGAGCAGATATCCACACAAGAAGGCAAATTAGACCTCAGGCCAGTG 1920

 52646551 TGGAATTAAAGGTGTAGGGTTATCTGGTCAAGACTGTGTGTGTGGATACAGGCTCCAACC 52646610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TGGAATTAAAGGTGTAGGGTTATCTGGTCAAGACTGTGTGTGTGGATACAGGCTCCAACC 1980

 52646611 CCTCCAGGCAAGGGCACTGTTTCCAACATCCACCCTTTCTCCTTTGACCTCTACCTTGAC 52646670
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CCTCCAGGCAAGGGCAATGTTTCCAACATCCACCCTTTCTCCTTTGACCTCTACCTTGAC 2040

 52646671 CTAAATTAACTATAAAAGGTCCTTCTTTTCTAGGACCCTACTATAAATCAGTGAAATATT 52646730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CTAAATTAACTATAAAAGGTCCTTCTTTTCTAGGACCCTACTATAAATCAGTGAAATATT 2100

 52646731 CAGGAAAAAAAGAACACCAAGAATGTTGGGATCCCAGTTAAAGATCAAGATTCTCTACTG 52646790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CAGGAAAAAAAGAACACCAAGAATGTTGGGATCCCAGTTAAAGATCAAGATTCTCTACTG 2160

 52646791 ATAAGCTGTGTGATATGGAGTAAATCACTAAAGATCTTTGAATCTCTTCATTTGTAAAAT 52646850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ATAAGCTGTGTGATATGGAGTAAATCACTAAAGATCTTTGAATCTCTTCATTTGTAAAAT 2220

 52646851 GGGAATATTGGTAGTCCTACTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTAAAGAAGAAAAGTCATGCA 52646910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GGGAATATTGGTAGTCCTACTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTAAAGAAGAAAAGTCATGCA 2280

 52646911 AAGGATCTGGCACAACGCCTTTTCCATAATAAGTGCTTAGTAATTGACAGATACTGTGAT 52646970
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AAGGATCTGGCACAATGCCTTTTCCATAATAAGTGCTTAGTAATTGACAGATACTGTGAT 2340

 52646971 AACTTTTCAGGTTTCTCTCATGCCTTTGACAACATTGCATTTTGCTTGCTCTATCTGTAG 52647030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AACTTTTCAGGTTTCTCTCATGCCTTTGACAACATTGCATTTTGCTTGCTCTATCTGTAG 2400

 52647031 TCAGACACTTCTTAATATCTGTTTGCAGGAAGAC 52647064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TCAGACACTTCTTAATATCTGTTTGCAGGAAGAC 2434

EXCISED REGION

 52658003 AGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTG 52658062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2435 AGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTG 2494

 52658063 GCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTAT 52658122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2495 GCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTAT 2554

 52658123 AAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGG 52658182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2555 AAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGG 2614

 52658183 GAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTG 52658242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2615 GAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTG 2674

 52658243 AAACACTGTCTCTGCTAAAAAACAAAACAAAACAAAACACCAAAAAATAGCTGGGCGTAG 52658302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2675 AAACACTGTCTCTGCTAAAAAACAAAACAAAACAAAACACCAAAAAATAGCTGGGCGTAG 2734

 52658303 TGGCGGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTTGGGAGGCGGTGGCAGGAGAATCATTTGAACCT 52658362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2735 TGGCGGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTTGGGAGGCGGTGGCAGGAGAATCATTTGAACCT 2794

 52658363 GGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGAT--------TGTGCCACTGCACTCTAACCTGG 52658414
          |||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||
     2795 GGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACTGTGCCACTGCACTCTAACCTGG 2854

 52658415 GCAACAGAGTTCAGAGTGAGAC 52658436
          ||||||||||||||||||||||
     2855 GCAACAGAGTTCAGAGTGAGAC 2876

Alignment time is 3.23325 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [52637064,52668002] =>     30939 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,   13107] =>     13107 nucs 'mol-32-3419-088753_13107'

Score:       13075
Aligned:     13108        nucs
Identic:     13105 (100%) nucs =>      1690 (100%)     11415 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [52650250,52651939] EXCISED REGION [52651942,52663358]
 second seq =>  [       1,    1690] EXCISED REGION [    1691,   13107]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [52651940,52651941]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        18 nucs [52651940,52651957] to [52651942,52651959]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [52651940,52651940] to [52651941,52651941]
 second seq =>         0 nucs

 52650250 TACCAGTTGTACAAAGAAGAGCTGGTACAGTTCCTACTGAAATTATTCCAAAAAGTTGAG 52650309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TACCAGTTGTACAAAGAAGAGCTGGTACAGTTCCTACTGAAATTATTCCAAAAAGTTGAG 60

 52650310 TAGGAGGGAGTCCTTCCTAACTCATTTGATGAGGCCAGCATCATCCTGATATCAAAACCT 52650369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAGGAGGGAGTCCTTCCTAACTCATTTGATGAGGCCAGCATCATCCTGATATCAAAACCT 120

 52650370 GGCAGATATACAACAAGAAAAGCTTCAGGCCAATATCCTTGATGAACTTCAATGCAAAAA 52650429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGCAGATATACAACAAGAAAAGCTTCAGGCCAATATCCTTGATGAACTTCAATGCAAAAA 180

 52650430 TCCTCAATAAAATACTGGCAAACTGAATCCAGCAGCACACCAAAAAGCTTATCCACCATG 52650489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCCTCAATAAAATACTGGCAAACTGAATCCAGCAGCACACCAAAAAGCTTATCCACCATG 240

 52650490 ATCAAGTAGAATGCAAGTTGGTTCAACATATACAAATCAATAAATGTGACTCATCACATA 52650549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATCAAGTAGAATGCAAGTTGGTTCAACATATACAAATCAATAAATGTGACTCATCACATA 300

 52650550 AACAGAACTAAAGACAAAAACTACATGATTATCTCAACAGATGCAGAAAAGGCTTTCAAT 52650609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AACAGAACTAAAGACAAAAACTACATGATTATCTCAACAGATGCAGAAAAGGCTTTCAAT 360

 52650610 AAAATTAGACATCCATTTATGTTAAAAACTCTCAATAAACTAGGTATTGAAGGAACATAC 52650669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAAATTAGACATCCATTTATGTTAAAAACTCTCAATAAACTAGGTATTGAAGGAACATAC 420

 52650670 CTCAAAATAATAAGAGCCATGTATGACAAACCCACAGCTAAGATCATACTGAATGGGCAA 52650729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTCAAAATAATAAGAGCCATGTATGACAAACCCACAGCTAAGATCATACTGAATGGGCAA 480

 52650730 AAGCTGGAAGCATTTTCTTTGAAGACTGGCATAAGACAAGGATGATCTCTCTCACCACTC 52650789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAGCTGGAAGCATTTTCTTTGAAGACTGGCATAAGACAAGGATGATCTCTCTCACCACTC 540

 52650790 CTATTCAACATAGTATTGGAAGTCTTGGCCAGGGCAATCGGGCAAGAGAAATAAATAAAG 52650849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTATTCAACATAGTATTGGAAGTCTTGGCCAGGGCAATCGGGCAAGAGAAATAAATAAAG 600

 52650850 CGCATCCAAATAGGAAGAGAGGAAGTCAAACTATCCTTGTTTGCAGATTACATGACATTA 52650909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CGCATCCAAATAGGAAGAGAGGAAGTCAAACTATCCTTGTTTGCAGATTACATGACATTA 660

 52650910 TATCTAGAAAACCCCATAGTCTCAGCCCCAAAGCTTCTTAAGCTGATAAACAACTTCAGC 52650969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TATCTAGAAAACCCCATAGTCTCAGCCCCAAAGCTTCTTAAGCTGATAAACAACTTCAGC 720

 52650970 AAAGTCTCAGGATACAAAATAAATGTGCAAAAATTACTGGCATTTCCATGCACCAACAAC 52651029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAAGTCTCAGGATACAAAATAAATGTGCAAAAATTACTGGCATTTCCATGCACCAACAAC 780

 52651030 AGTCAAGCCAGGAGCCAAACCAGGAATGCACTCCCACTCACAATCGCCACAAAAAGAGTA 52651089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGTCAAGCCAGGAGCCAAACCAGGAATGCACTCCCACTCACAATCGCCACAAAAAGAGTA 840

 52651090 AAATACCTAGGAAAACAGCTAATTAGGGAGGTGAAAGATCTCTACAAGGAGAATAATGAA 52651149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAATACCTAGGAAAACAGCTAATTAGGGAGGTGAAAGATCTCTACAAGGAGAATAATGAA 900

 52651150 CCAGCGCTCAAAGAAATTAGAGATGACACAAACAAATGGAAAAACATTCCATGTTCATTG 52651209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CCAGCGCTCAAAGAAATTAGAGATGACACAAACAAATGGAAAAACATTCCATGTTCATTG 960

 52651210 ATAGGAAGAATCAATATCATTAAAATGGCCATATTGCCCAGAGCAATTTATAGATTCAAT 52651269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATAGGAAGAATCAATATCATTAAAATGGCCATATTGCCCAGAGCAATTTATAGATTCAAT 1020

 52651270 GCTATACCTATTAAACTACTGTTGAGATTCTTCACAGAACCAGAGAAAACTATTTTAAAA 52651329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GCTATACCTATTAAACTACTGTTGAGATTCTTCACAGAACCAGAGAAAACTATTTTAAAA 1080

 52651330 TTCATATAGAACCCAGAAAAGAGCCTGAATTGCTAAGGCAATCCTAAGCAAAAAGCATAA 52651389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTCATATAGAACCCAGAAAAGAGCCTGAATTGCTAAGGCAATCCTAAGCAAAAAGCATAA 1140

 52651390 AGCTGAAGGCATCATGCTACCTGACTTCAAACTATACTACAAGGCTACAGTAACCAAAAC 52651449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGCTGAAGGCATCATGCTACCTGACTTCAAACTATACTACAAGGCTACAGTAACCAAAAC 1200

 52651450 AGCATACTACTGGTACAAAAACAGACACATAGACCAATGGAACAGAATAGAGAACCCGGA 52651509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AGCATACTACTGGTACAAAAACAGACACATAGACCAATGGAACAGAATAGAGAACCCGGA 1260

 52651510 AATAAGACCACACACCTACAACTATCTAATCTTTGACAAACCTGACAAAAACATGCAATG 52651569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AATAAGACCACACACCTACAACTATCTAATCTTTGACAAACCTGACAAAAACATGCAATG 1320

 52651570 GGGAAAAGATTTCCTATTCAATAAAAAGTGCTGGGATAACCGGCTAGCTGTACACAGAAG 52651629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GGGAAAAGATTTCCTATTCAATAAAAAGTGCTGGGATAACCGGCTAGCTGTACACAGAAG 1380

 52651630 ATTAAAGCTGGACCCCTTCCTTACAACATATACAAAAATCGGCCGGGCTTGGTGGCTCAC 52651689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ATTAAAGCTGGACCCCTTCCTTACAACATATACAAAAATCGGCCGGGCTTGGTGGCTCAC 1440

 52651690 GCTTGTAATCCCAGCACTTTGGAAGGCCGAGGAGGGCGGATCATGAGGTCAGGAGATCGA 52651749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GCTTGTAATCCCAGCACTTTGGAAGGCCGAGGAGGGCGGATCATGAGGTCAGGAGATCGA 1500

 52651750 GAACACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGTGTGGTGGCAG 52651809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GAACACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGTGTGGTGGCAG 1560

 52651810 GCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGAGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGTGTGAACCCGGGAG 52651869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGAGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGTGTGAACCCGGGAG 1620

 52651870 ACAGAGCTTGCACTGAGCCGAGACCACATCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGTGAG 52651929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ACAGAGCTTGCACTGAGCCGAGACCACATCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGTGAG 1680

 52651930 ACTCCGTCTC 52651939
          ||||||||||
     1681 ACTCCGTCTC 1690

EXCISED REGION

 52651942 AAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAGACATACAGGTAGTCAACAAGCATATGAAAAAAAGCTCA 52652001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1691 AAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAGACATACAGGTAGTCAACAAGCATATGAAAAAAAGCTCA 1750

 52652002 ATATTACTAATCATCAGAGAAATGCAAATCAAAAACCACAATGAGATACCATCTAATACC 52652061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1751 ATATTACTAATCATCAGAGAAATGCAAATCAAAAACCACAATGAGATACCATCTAATACC 1810

 52652062 AGTCAGAATGATATTATTAAAAAGTCAAAAAATAAGATGCTGGTGAGGTAGTGGAGAGAA 52652121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1811 AGTCAGAATGATATTATTAAAAAGTCAAAAAATAAGATGCTGGTGAGGTAGTGGAGAGAA 1870

 52652122 AGGAATGCTTATACACTGTTGGTGGGAGTGTAAATTAGTTCAACCATTGTGGAAGACAGT 52652181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1871 AGGAATGCTTATACACTGTTGGTGGGAGTGTAAATTAGTTCAACCATTGTGGAAGACAGT 1930

 52652182 GTGGCAATTCCTCAAAGACCTAAAGATAGAAATACCATTCCACCCAGCAATTCCATTACT 52652241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1931 GTGGCAATTCCTCAAAGACCTAAAGATAGAAATACCATTCCACCCAGCAATTCCATTACT 1990

 52652242 GGGTACATACCCGAAAAATAGAAATCATTCTTTTATAAAGATACATGCATGTGTATGTTC 52652301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1991 GGGTACATACCCGAAAAATAGAAATCATTCTTTTATAAAGATACATGCATGTGTATGTTC 2050

 52652302 ATTGCAGCACTATTCACAATAGCAAAAACATGGAATCAACCTAAATACCCACCAATGATA 52652361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2051 ATTGCAGCACTATTCACAATAGCAAAAACATGGAATCAACCTAAATACCCACCAATGATA 2110

 52652362 GCCTGGATAAAGAAAATGTGGTACATATACACCATGGAATACTATGCAGCCATAAAAAGA 52652421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2111 GCCTGGATAAAGAAAATGTGGTACATATACACCATGGAATACTATGCAGCCATAAAAAGA 2170

 52652422 ACGAGATCATGTCCTTTGCAGGAACATGAATGGAGCTGAAGGCCATTATCCTTAGCAAAG 52652481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2171 ACGAGATCATGTCCTTTGCAGGAACATGAATGGAGCTGAAGGCCATTATCCTTAGCAAAG 2230

 52652482 TATTGCCGAAAAAGAAAATCAAATACTACATGTTCTCACTTATAAATGGGAGCTAAATGA 52652541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2231 TATTGCCGAAAAAGAAAATCAAATACTACATGTTCTCACTTATAAATGGGAGCTAAATGA 2290

 52652542 TGAGAACACATGGCCACACAGGGGGAACAACACACACTGGGGCCTATTGGAGGGTGGAAG 52652601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2291 TGAGAACACATGGCCACACAGGGGGAACAACACACACTGGGGCCTATTGGAGGGTGGAAG 2350

 52652602 GTGGGAGGAGGGAGAGGATCAGGAAAAATAATTAATAGATATTATTTCATCACCCAGGTA 52652661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2351 GTGGGAGGAGGGAGAGGATCAGGAAAAATAATTAATAGATATTATTTCATCACCCAGGTA 2410

 52652662 TTAATAATACCTATTTCATCACCCAGGCTTGATACCTGGGTGACAACAAACCCCCATGAC 52652721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2411 TTAATAATACCTATTTCATCACCCAGGCTTGATACCTGGGTGACAACAAACCCCCATGAC 2470

 52652722 ACAAATTTACCTATATAACAAACCTGCCCGTGTACCCCTGAACTTAAAATAAAAGTTAAA 52652781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2471 ACAAATTTACCTATATAACAAACCTGCCCGTGTACCCCTGAACTTAAAATAAAAGTTAAA 2530

 52652782 AAAATGCAAAAAGATGACATACCAAAGAGATGTTACTTTTCATTTTTAAAAAAGTCAAAG 52652841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2531 AAAATGCAAAAAGATGACATACCAAAGAGATGTTACTTTTCATTTTTAAAAAAGTCAAAG 2590

 52652842 AATTTAAGGAAAATTAAAAAGAAATCAAGAATGACAGTAGCAGCTCCAAAATATTTAGAA 52652901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2591 AATTTAAGGAAAATTAAAAAGAAATCAAGAATGACAGTAGCAGCTCCAAAATATTTAGAA 2650

 52652902 GGTAGAGTTGAAAATTTTGATTTTCTTAGTGCAGAAAAATATTTTGTGCTGCATGTTTTT 52652961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2651 GGTAGAGTTGAAAATTTTGATTTTCTTAGTGCAGAAAAATATTTTGTGCTGCATGTTTTT 2710

 52652962 TTAAAGAAAGTCATTTTATCTGTATATGTGATTAAAACCTTATTTCCAGTGCCATCTTCG 52653021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2711 TTAAAGAAAGTCATTTTATCTGTATATGTGATTAAAACCTTATTTCCAGTGCCATCTTCG 2770

 52653022 TGTAATTGTTAAGAACTTGGATTGTGGATCACAGGAACCTGGCTTTGACTCTTAACTGCT 52653081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2771 TGTAATTGTTAAGAACTTGGATTGTGGATCACAGGAACCTGGCTTTGACTCTTAACTGCT 2830

 52653082 CACTCTTTAAATGGATAACCCGGGTAAGTTATTTCCTGTCTCTGTGCCTCAGTTTTCTTA 52653141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2831 CACTCTTTAAATGGATAACCCGGGTAAGTTATTTCCTGTCTCTGTGCCTCAGTTTTCTTA 2890

 52653142 CAAATTGGCATGAAAATAACAGTGCCTCCTTCAGAGGGTAATTCTGAGGATTAAATGAAA 52653201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2891 CAAATTGGCATGAAAATAACAGTGCCTCCTTCAGAGGGTAATTCTGAGGATTAAATGAAA 2950

 52653202 TATTGCCCATACAGTGCTTACCACAGGCTGGTAGATGATTGGTATTCGGTAAACAGTAGT 52653261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2951 TATTGCCCATACAGTGCTTACCACAGGCTGGTAGATGATTGGTATTCGGTAAACAGTAGT 3010

 52653262 TATTTTTGTTATACTAATATGTTATTAATATAATTACCATTTTGTATTTTTAAATGTAAG 52653321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3011 TATTTTTGTTATACTAATATGTTATTAATATAATTACCATTTTGTATTTTTAAATGTAAG 3070

 52653322 CCATAAGGAAAGGAATTATTCCAATAGTTTAATTTACAAACTTGAGTTTTCTAGAAAGAC 52653381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3071 CCATAAGGAAAGGAATTATTCCAATAGTTTAATTTACAAACTTGAGTTTTCTAGAAAGAC 3130

 52653382 TTTTAAAAACAGTAGTGATATAAATCAATTTATCTTAAGAAACATAAGTATCTGGGCCAG 52653441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3131 TTTTAAAAACAGTAGTGATATAAATCAATTTATCTTAAGAAACATAAGTATCTGGGCCAG 3190

 52653442 GCAAGTTTCAGAAATGTTTATCATTTTCAAAGTACCAAATATTCTCGTCAAAACAAGCTG 52653501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3191 GCAAGTTTCAGAAATGTTTATCATTTTCAAAGTACCAAATATTCTCGTCAAAACAAGCTG 3250

 52653502 CTTCATCAGAGTTCTAATTATATATTTAAACATACATGCACACACACACGTTTGTATTAC 52653561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3251 CTTCATCAGAGTTCTAATTATATATTTAAACATACATGCACACACACACGTTTGTATTAC 3310

 52653562 AATATTCAAAACTTCTGAGGAAGAATTATCTTTTTTTTTTCATGTGCCAAAGCTAAAACT 52653621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3311 AATATTCAAAACTTCTGAGGAAGAATTATCTTTTTTTTTTCATGTGCCAAAGCTAAAACT 3370

 52653622 TTCACTTGCTACAGCTGTGTATTAGTCTATTTCCATACTGCTATAAAGAGCTGCCCAAGA 52653681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3371 TTCACTTGCTACAGCTGTGTATTAGTCTATTTCCATACTGCTATAAAGAGCTGCCCAAGA 3430

 52653682 CTGGGTGATTTATAAAGGAAAGAGGTTTAATTGACTCACAGTTCAGCATGGCAGGGAAGG 52653741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3431 CTGGGTGATTTATAAAGGAAAGAGGTTTAATTGACTCACAGTTCAGCATGGCAGGGAAGG 3490

 52653742 CCTCAGGAAACTTACAATCATGGTGGAAGTCAAAGGGGGAGCAAGGACCTTTCTTCACAA 52653801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3491 CCTCAGGAAACTTACAATCATGGTGGAAGTCAAAGGGGGAGCAAGGACCTTTCTTCACAA 3550

 52653802 GGCAGCAGAAAGAAGTGCCAAATGAACAGGGAAGAGCTCCTTATGAAACCATCAGGTCTT 52653861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3551 GGCAGCAGAAAGAAGTGCCAAATGAACAGGGAAGAGCTCCTTATGAAACCATCAGGTCTT 3610

 52653862 GTGAGAACTCACTTACTTTTATGAGAACAGCATGGAGGAAACTGTCCCCATGATCCAATC 52653921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3611 GTGAGAACTCACTTACTTTTATGAGAACAGCATGGAGGAAACTGTCCCCATGATCCAATC 3670

 52653922 ACCTCCACCTGGTCTCTCCCTTGACACGTGGGGATTATGGGGATTAAATTCCAGATGAGA 52653981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3671 ACCTCCACCTGGTCTCTCCCTTGACACGTGGGGATTATGGGGATTAAATTCCAGATGAGA 3730

 52653982 TTTGGGTGGGGACAAAAAGCCTAACGACATCAAGCTGTAAAAACAATAGCTAACATTCAT 52654041
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     3731 TTTGGGTGGGGACAAAAAGCCTAACGACATCAAGCTGTAGAAACAATAGCTAACATTCAT 3790

 52654042 TGACTGTTTCCCAGCATTAGGATAAATGTGTGTAACAAGAGGCATTTTATTTATGTATGA 52654101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3791 TGACTGTTTCCCAGCATTAGGATAAATGTGTGTAACAAGAGGCATTTTATTTATGTATGA 3850

 52654102 CATTTGTTTATTTATTATTTATTTATTTGGATAAATGTCTATAACAAGAAACATTTTATT 52654161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3851 CATTTGTTTATTTATTATTTATTTATTTGGATAAATGTCTATAACAAGAAACATTTTATT 3910

 52654162 TAAGTATAACAGCAAATCTACAAGTTAGGTACTATCATCACTCCCATTTTACAGGTCGTG 52654221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3911 TAAGTATAACAGCAAATCTACAAGTTAGGTACTATCATCACTCCCATTTTACAGGTCGTG 3970

 52654222 AAACTGAGGCTCTGAAAAGTCAAGTCAGTTTTCTAATGTTGTCCAGCTAATGACTGGTAG 52654281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3971 AAACTGAGGCTCTGAAAAGTCAAGTCAGTTTTCTAATGTTGTCCAGCTAATGACTGGTAG 4030

 52654282 ATTTAGTATTTGAACCCACATTTGCCTGATTCCAAAGTTCAAACTCCCAACAACATGTGG 52654341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4031 ATTTAGTATTTGAACCCACATTTGCCTGATTCCAAAGTTCAAACTCCCAACAACATGTGG 4090

 52654342 TAACCAAAGCAGGAACAGAAGAGAAAGAAGAAATAGAAGGGAGGGAAGATGAACAAAGTA 52654401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4091 TAACCAAAGCAGGAACAGAAGAGAAAGAAGAAATAGAAGGGAGGGAAGATGAACAAAGTA 4150

 52654402 GACAAAGTTTAGTTAATAGAATTAGTGGATACCCAAGAAAAAACTATGTACAAGAGGGGG 52654461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4151 GACAAAGTTTAGTTAATAGAATTAGTGGATACCCAAGAAAAAACTATGTACAAGAGGGGG 4210

 52654462 AAAAAAACCCTGTTTTCTCACATCTGGGAAACATTGATATCTATATATTTTTGGTTTTAA 52654521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4211 AAAAAAACCCTGTTTTCTCACATCTGGGAAACATTGATATCTATATATTTTTGGTTTTAA 4270

 52654522 ATAAAAATTAGGTTATGTCATTCATTTGCATAAAACCATCCAAAGAAGGGCCTCACAAAA 52654581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4271 ATAAAAATTAGGTTATGTCATTCATTTGCATAAAACCATCCAAAGAAGGGCCTCACAAAA 4330

 52654582 TTAAAACAAAATCCAAACTCTCTACTATGGGCCACACCCTCCAGAACTTCAGCTCGTACT 52654641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4331 TTAAAACAAAATCCAAACTCTCTACTATGGGCCACACCCTCCAGAACTTCAGCTCGTACT 4390

 52654642 ATGTTTTTCCTCACACCTCTCAACATACCAACATGTTTCCACCTGCAGCCCTCACCACTA 52654701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4391 ATGTTTTTCCTCACACCTCTCAACATACCAACATGTTTCCACCTGCAGCCCTCACCACTA 4450

 52654702 GTTATTCTTTCAATCTGGAAATATTTTCGCTAAGATCTTCCTATGGTTACCTTCTTATCA 52654761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4451 GTTATTCTTTCAATCTGGAAATATTTTCGCTAAGATCTTCCTATGGTTACCTTCTTATCA 4510

 52654762 TTCAAGACTTAGGTTATGTCAGGCCTTCCCTGACTCCTCCATCTGAAGTAACCCCTCCTG 52654821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4511 TTCAAGACTTAGGTTATGTCAGGCCTTCCCTGACTCCTCCATCTGAAGTAACCCCTCCTG 4570

 52654822 CTTACTCCTGTTTATTCTCTAGACTCCACAGAGGATTCATCACTCTCTGAAATGATCCCA 52654881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4571 CTTACTCCTGTTTATTCTCTAGACTCCACAGAGGATTCATCACTCTCTGAAATGATCCCA 4630

 52654882 TTAATTTCTTCTTCACTTGTTTCCTCTCCACGACCTGTAAGCCCCAAGTGGACCCGGACT 52654941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4631 TTAATTTCTTCTTCACTTGTTTCCTCTCCACGACCTGTAAGCCCCAAGTGGACCCGGACT 4690

 52654942 TGGTCTGCTCTGCTTACAGCTGGATTCCAGTTCCCATAGTGCTAGACACTAGGATTAAGC 52655001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4691 TGGTCTGCTCTGCTTACAGCTGGATTCCAGTTCCCATAGTGCTAGACACTAGGATTAAGC 4750

 52655002 CAGGAAACATGGGTGAAGCAGCAAGCACAGAGCTTGGGGCACAGCCTAGCAAACACTCCA 52655061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4751 CAGGAAACATGGGTGAAGCAGCAAGCACAGAGCTTGGGGCACAGCCTAGCAAACACTCCA 4810

 52655062 CAAAGGACCATGATTGTAACTGTAGTAGGGCACACCAATGAACAGGTTGGGAAACTGAGT 52655121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4811 CAAAGGACCATGATTGTAACTGTAGTAGGGCACACCAATGAACAGGTTGGGAAACTGAGT 4870

 52655122 CTCTGAGAAGAGACTAATGTTGTGCTGGATGAAATTTCTTTTTCTGACAATACATTATCC 52655181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4871 CTCTGAGAAGAGACTAATGTTGTGCTGGATGAAATTTCTTTTTCTGACAATACATTATCC 4930

 52655182 AAATCCTCCAAGCTTTCAGTTTAAAGGGGAAAGCAGGAACTATCATTATAATTTTATTTA 52655241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4931 AAATCCTCCAAGCTTTCAGTTTAAAGGGGAAAGCAGGAACTATCATTATAATTTTATTTA 4990

 52655242 CAAAGTGTCCATGTATGAACATTATTCACCGCCGAATCATCTCTTCCTATGCAAGCAACA 52655301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4991 CAAAGTGTCCATGTATGAACATTATTCACCGCCGAATCATCTCTTCCTATGCAAGCAACA 5050

 52655302 CCGTCCTATGCATCAATATCCTGATCTGTCAGGATTCAGGATAAAGTGGACATATACACA 52655361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5051 CCGTCCTATGCATCAATATCCTGATCTGTCAGGATTCAGGATAAAGTGGACATATACACA 5110

 52655362 CTAATTGCAAAGGGAAATTGTACATCTTGCAAAAGATGCAGGGGTTTATAGAGTCTTGTA 52655421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5111 CTAATTGCAAAGGGAAATTGTACATCTTGCAAAAGATGCAGGGGTTTATAGAGTCTTGTA 5170

 52655422 ACATTGGTGAGCTGCTCAGATCACACACATGACCGTGGTTGGACAAGGATCTGGCAAAGT 52655481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5171 ACATTGGTGAGCTGCTCAGATCACACACATGACCGTGGTTGGACAAGGATCTGGCAAAGT 5230

 52655482 TAACACAGATCACCGAAGAAGGAAAAGTGGACAACACAACACAGTAAGTTCTTCAAAAGA 52655541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5231 TAACACAGATCACCGAAGAAGGAAAAGTGGACAACACAACACAGTAAGTTCTTCAAAAGA 5290

 52655542 GTTATATTAGAATATCAAAAGATTATGTTAGGCCTTTGGGAAAACTCAAAACTTTATGAA 52655601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5291 GTTATATTAGAATATCAAAAGATTATGTTAGGCCTTTGGGAAAACTCAAAACTTTATGAA 5350

 52655602 GACCTCAAAAAATTATGCAAAAATGACCCTTCAATGGTCATGCTGCAAGAGTCAAATGAC 52655661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5351 GACCTCAAAAAATTATGCAAAAATGACCCTTCAATGGTCATGCTGCAAGAGTCAAATGAC 5410

 52655662 ACTTCAAACAACTGCGGCTTTCTATGTTGTGCAAATGCATTTGTTGTTTTAAAGGTCGTA 52655721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5411 ACTTCAAACAACTGCGGCTTTCTATGTTGTGCAAATGCATTTGTTGTTTTAAAGGTCGTA 5470

 52655722 AAGTCAGGGTACACGTGGCAGATACTTATGACTTGGAGGAAGACGTTAGATTAGATTTGA 52655781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5471 AAGTCAGGGTACACGTGGCAGATACTTATGACTTGGAGGAAGACGTTAGATTAGATTTGA 5530

 52655782 AACTTTCACTGAATGATCGCATTTCATGCTTTTCATCTGTACATTAAAAAGCCAGAATGT 52655841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5531 AACTTTCACTGAATGATCGCATTTCATGCTTTTCATCTGTACATTAAAAAGCCAGAATGT 5590

 52655842 CTTTGCCAAGAAATTCTAGCATAAATAAAAGAAAAGGATGGGATTTTGGAACATCATGGT 52655901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5591 CTTTGCCAAGAAATTCTAGCATAAATAAAAGAAAAGGATGGGATTTTGGAACATCATGGT 5650

 52655902 AGAATTCTTGACTATCAGCTTTATACAACATGTCTGGACATTTAGTGATGGAAATGCTGG 52655961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5651 AGAATTCTTGACTATCAGCTTTATACAACATGTCTGGACATTTAGTGATGGAAATGCTGG 5710

 52655962 ATTCCAAAGGAATGTAGGCAAAGGTACTACTACCCCCATGCTCTTCAGAAAACATCCTCT 52656021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5711 ATTCCAAAGGAATGTAGGCAAAGGTACTACTACCCCCATGCTCTTCAGAAAACATCCTCT 5770

 52656022 AAAAGCAACAGTGATGATCAGATACTGTGGGGCAAGACTGACAGTGACACTCAAGATTTC 52656081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5771 AAAAGCAACAGTGATGATCAGATACTGTGGGGCAAGACTGACAGTGACACTCAAGATTTC 5830

 52656082 CACTCTTCTCTTTAATCATATATTTCCTGTCATTCATGTGCTACAAAACTCTGGAATATG 52656141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5831 CACTCTTCTCTTTAATCATATATTTCCTGTCATTCATGTGCTACAAAACTCTGGAATATG 5890

 52656142 CAAAGCTCATTCAAATGCAAAACCAGCCTTTGCTCCAACATGAGCATATATTTTCATTTA 52656201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5891 CAAAGCTCATTCAAATGCAAAACCAGCCTTTGCTCCAACATGAGCATATATTTTCATTTA 5950

 52656202 AAGACAAATCAGATGTTTCATTTGATTTTTTTTATAAATCTGATAATAATGTACATTTAA 52656261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5951 AAGACAAATCAGATGTTTCATTTGATTTTTTTTATAAATCTGATAATAATGTACATTTAA 6010

 52656262 CCCGTGTTTACAACCAAAATAATTAATCTCTCTGAACCCTTTGTTTTTCCTGTCTCTATC 52656321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6011 CCCGTGTTTACAACCAAAATAATTAATCTCTCTGAACCCTTTGTTTTTCCTGTCTCTATC 6070

 52656322 CTCCACCCTCATTGCCAGATAAATAACATCTGCAACCTGATGTGGCATATTGAACTTTGT 52656381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6071 CTCCACCCTCATTGCCAGATAAATAACATCTGCAACCTGATGTGGCATATTGAACTTTGT 6130

 52656382 TTATACTCACACAAACACGTATAAGCATCCCAGATACACATATACAGGGACTGTATCTGT 52656441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6131 TTATACTCACACAAACACGTATAAGCATCCCAGATACACATATACAGGGACTGTATCTGT 6190

 52656442 CCTTGTTGTTTTTATAGAAATTGGATCACATTAGACATATTTTCTGATGACTTTTGTACA 52656501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6191 CCTTGTTGTTTTTATAGAAATTGGATCACATTAGACATATTTTCTGATGACTTTTGTACA 6250

 52656502 TTATAGTTGGTCTTCACAGTCAATAGCTCCAAAGCTATCTTATCTTCTAAAATAGCTGCA 52656561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6251 TTATAGTTGGTCTTCACAGTCAATAGCTCCAAAGCTATCTTATCTTCTAAAATAGCTGCA 6310

 52656562 TAATATTCCTCAGTATGGATATACCAAAAGATATTTAAACCATTGCCTAATCAATGAATA 52656621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6311 TAATATTCCTCAGTATGGATATACCAAAAGATATTTAAACCATTGCCTAATCAATGAATA 6370

 52656622 TCCTGGTAGTTTCCACATTGTTTTTTCCATTTCCACTATAGTGGAATAAACTTTCGTGTT 52656681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6371 TCCTGGTAGTTTCCACATTGTTTTTTCCATTTCCACTATAGTGGAATAAACTTTCGTGTT 6430

 52656682 CAAAAATCCTAAACTGGTGCTATATTTCTATAGAATAGAGGCACAGATGTAGAAGTGTTA 52656741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6431 CAAAAATCCTAAACTGGTGCTATATTTCTATAGAATAGAGGCACAGATGTAGAAGTGTTA 6490

 52656742 CCCTCAAATCAATATGCATTTAGTTTTGAAAAACAGACACTGCCATATTATTTTCTTAAA 52656801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6491 CCCTCAAATCAATATGCATTTAGTTTTGAAAAACAGACACTGCCATATTATTTTCTTAAA 6550

 52656802 AAGGCTCTACAGATTCACATTTCCAGCAGCAATGAGTGTCTCAAGCACCTTTTAAGTGGT 52656861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6551 AAGGCTCTACAGATTCACATTTCCAGCAGCAATGAGTGTCTCAAGCACCTTTTAAGTGGT 6610

 52656862 AAGCAGCTTACCAGGGGAGGTGGCCTATTATTCTATCAGTGGCTTCAGTTGTTAGGACAC 52656921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6611 AAGCAGCTTACCAGGGGAGGTGGCCTATTATTCTATCAGTGGCTTCAGTTGTTAGGACAC 6670

 52656922 CACGGGTCAGCTGTGGAGATACGGTTGTGGGGCAGGTTGAGTTCAGGACACATAGAAGAT 52656981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6671 CACGGGTCAGCTGTGGAGATACGGTTGTGGGGCAGGTTGAGTTCAGGACACATAGAAGAT 6730

 52656982 TGCCAAAGGGTGACTATTATTACTTTGAGACTCTGGAAAAATTAGCCAGGAAACAGAGAC 52657041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6731 TGCCAAAGGGTGACTATTATTACTTTGAGACTCTGGAAAAATTAGCCAGGAAACAGAGAC 6790

 52657042 AAGAGGCTCAGGGTGCAGCAAAGCAGCCAAATCAGGATGATAGTGTTTTCTTTGGAGCAG 52657101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6791 AAGAGGCTCAGGGTGCAGCAAAGCAGCCAAATCAGGATGATAGTGTTTTCTTTGGAGCAG 6850

 52657102 ATATACTAATGGCCAAGGAACTCATAAAAAGATGCCTAATGTCATCTCATTAGGGAAGTG 52657161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6851 ATATACTAATGGCCAAGGAACTCATAAAAAGATGCCTAATGTCATCTCATTAGGGAAGTG 6910

 52657162 CAGTCAAAGCCACAGCATGATACGTCTTCACACCCACGAGGATGGCCATAATCAGAGAGA 52657221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6911 CAGTCAAAGCCACAGCATGATACGTCTTCACACCCACGAGGATGGCCATAATCAGAGAGA 6970

 52657222 CAATAACCAGTGGTAGGGAAGATGTGAAAAAATCGGAATGCTCATGCATTGCTGGTAGGA 52657281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6971 CAATAACCAGTGGTAGGGAAGATGTGAAAAAATCGGAATGCTCATGCATTGCTGGTAGGA 7030

 52657282 ATGTGACATGGTGCAGCTGCTTTGGAAAGCAGTTTAACAGTTCCTGGAAAAGTTAAACAT 52657341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7031 ATGTGACATGGTGCAGCTGCTTTGGAAAGCAGTTTAACAGTTCCTGGAAAAGTTAAACAT 7090

 52657342 GGAGTTACCCTAAGACCCAGCAATTCCATTCCTAGGTAAGCAAGAAAATGAAAACATATG 52657401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7091 GGAGTTACCCTAAGACCCAGCAATTCCATTCCTAGGTAAGCAAGAAAATGAAAACATATG 7150

 52657402 GCCACACAAAAACTTGTACACAAATGTCCATAGCAGCATTTTCATAATAGCTGAAAAGTG 52657461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7151 GCCACACAAAAACTTGTACACAAATGTCCATAGCAGCATTTTCATAATAGCTGAAAAGTG 7210

 52657462 GAAACAACCCAAATATCCATCAATTGGAAAAAGGAAATCTAGCATTTGCATATAATAGAG 52657521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7211 GAAACAACCCAAATATCCATCAATTGGAAAAAGGAAATCTAGCATTTGCATATAATAGAG 7270

 52657522 TATTAATCAGCCATAAGAAGAAACAAAGCACCGATCCATGTTATATCATGCTTTATACTT 52657581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7271 TATTAATCAGCCATAAGAAGAAACAAAGCACCGATCCATGTTATATCATGCTTTATACTT 7330

 52657582 GGAAGCATGGTACTAAGTGAAAGACGCCAGACACAAAAAGCAAAATATTGTATGATTCCA 52657641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7331 GGAAGCATGGTACTAAGTGAAAGACGCCAGACACAAAAAGCAAAATATTGTATGATTCCA 7390

 52657642 TTTATATAAAGTGTCTAGAATAGGCAAATCCATAGAGGCAGAAAACAGATTAGTGGTTGC 52657701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7391 TTTATATAAAGTGTCTAGAATAGGCAAATCCATAGAGGCAGAAAACAGATTAGTGGTTGC 7450

 52657702 CAGTGGCTGGGAATAGGGAAAAAACTCAGCGCTAAAGGGTAGGGAGTTTTGTTTTGGAGT 52657761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7451 CAGTGGCTGGGAATAGGGAAAAAACTCAGCGCTAAAGGGTAGGGAGTTTTGTTTTGGAGT 7510

 52657762 AATGACGATGTTCTGGAATTAGACGTGGAACGATTGCACACATGGTGCAAATATCCTTAA 52657821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7511 AATGACGATGTTCTGGAATTAGACGTGGAACGATTGCACACATGGTGCAAATATCCTTAA 7570

 52657822 AATCACGGAATTGTCACTCTAAAAGGTGAATTTTATGGTAGGTGAATTGTACCTCAATTT 52657881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7571 AATCACGGAATTGTCACTCTAAAAGGTGAATTTTATGGTAGGTGAATTGTACCTCAATTT 7630

 52657882 GTAAAAAGAAGAATTAGATAAATAAACAGCAACACAGCACCAAGGGGTGGGGGTAGGAAA 52657941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7631 GTAAAAAGAAGAATTAGATAAATAAACAGCAACACAGCACCAAGGGGTGGGGGTAGGAAA 7690

 52657942 CAGACAACAAATAGGAGTGAAGAGTTCACAGGAAAAGACATGCAGCCAGCTTTTAAGCAG 52658001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7691 CAGACAACAAATAGGAGTGAAGAGTTCACAGGAAAAGACATGCAGCCAGCTTTTAAGCAG 7750

 52658002 AAGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTT 52658061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7751 AAGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTT 7810

 52658062 GGCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTA 52658121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7811 GGCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTA 7870

 52658122 TAAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTG 52658181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7871 TAAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTG 7930

 52658182 GGAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGT 52658241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7931 GGAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGT 7990

 52658242 GAAACACTGTCTCTGCTAAAAAACAAAACAAAACAAAACACCAAAAAATAGCTGGGCGTA 52658301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7991 GAAACACTGTCTCTGCTAAAAAACAAAACAAAACAAAACACCAAAAAATAGCTGGGCGTA 8050

 52658302 GTGGCGGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTTGGGAGGCGGTGGCAGGAGAATCATTTGAACC 52658361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8051 GTGGCGGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTTGGGAGGCGGTGGCAGGAGAATCATTTGAACC 8110

 52658362 TGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACTGCACTCTAACCTGGGCAACAG 52658421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8111 TGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACTGCACTCTAACCTGGGCAACAG 8170

 52658422 AGTTCAGAGTGAGACTCTGTCTCCCCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAACAGCCATA 52658481
          ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
     8171 AGTTCAGAGTGAGACTCTGTCTCCCCC-AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAACAGCCATA 8229

 52658482 TAGATCGTCGGTGGGAGTGTAATTTGGCCACTTCTTTGGAAAATAGCTCAGTAATATCTA 52658541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8230 TAGATCGTCGGTGGGAGTGTAATTTGGCCACTTCTTTGGAAAATAGCTCAGTAATATCTA 8289

 52658542 TTAATACTTAAAATTTCACAAACACTGTAAGTCTAACTTCCACTTCTAAAATGTTATCCT 52658601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8290 TTAATACTTAAAATTTCACAAACACTGTAAGTCTAACTTCCACTTCTAAAATGTTATCCT 8349

 52658602 AGAAATAAAATTGCATAGGGGTACAAAGGCTTACGTATGGAACTATTTGCTGGACTACTG 52658661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8350 AGAAATAAAATTGCATAGGGGTACAAAGGCTTACGTATGGAACTATTTGCTGGACTACTG 8409

 52658662 TAGTTGTGGCAAAAAACTGGAAATGACCTAAACGCTTATTAGTAGAAACCTGGTTAAATA 52658721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8410 TAGTTGTGGCAAAAAACTGGAAATGACCTAAACGCTTATTAGTAGAAACCTGGTTAAATA 8469

 52658722 AATTATCATATGTCCTTGAGGACACAGGGACACAAAGAGGGGAATGACAGGCACTGAGCC 52658781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8470 AATTATCATATGTCCTTGAGGACACAGGGACACAAAGAGGGGAATGACAGGCACTGAGCC 8529

 52658782 TACTTGAGGGTGGGAGGAGGAAGTCGATCAGAAAAAATAACTAGTGGGTACTAGGCTTAG 52658841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8530 TACTTGAGGGTGGGAGGAGGAAGTCGATCAGAAAAAATAACTAGTGGGTACTAGGCTTAG 8589

 52658842 TACCCGGGTGAAAAAATAATCTGTACAACAAACCCCCATGACATGAGTTTACCTTATAAC 52658901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8590 TACCCGGGTGAAAAAATAATCTGTACAACAAACCCCCATGACATGAGTTTACCTTATAAC 8649

 52658902 AAACCTGCACATGTAATCTGAACCTAGATAAAAGTTTAAAAAAATAAATAATCATATGTC 52658961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8650 AAACCTGCACATGTAATCTGAACCTAGATAAAAGTTTAAAAAAATAAATAATCATATGTC 8709

 52658962 CCTACAATGAAATATTCCACAGGCATTAAAATTCCCCAAGGAATTTTAGTAAGGAAAGAA 52659021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8710 CCTACAATGAAATATTCCACAGGCATTAAAATTCCCCAAGGAATTTTAGTAAGGAAAGAA 8769

 52659022 AAAGCTGTGCCCAACAGCACGTACAGTATGTTTCCATTTGTTTTTAAAAAATGGTGTCGG 52659081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8770 AAAGCTGTGCCCAACAGCACGTACAGTATGTTTCCATTTGTTTTTAAAAAATGGTGTCGG 8829

 52659082 GAGGTTGAGGAGACAACTTATAAATAGACATGCCTGGGATACCTCTGGATATAAGAAACT 52659141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8830 GAGGTTGAGGAGACAACTTATAAATAGACATGCCTGGGATACCTCTGGATATAAGAAACT 8889

 52659142 GTAAAGTATTTACTTCTAAGGAAGGAAATTTGGGATGGGGCTTGGGGAGCCATCAGAGTT 52659201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8890 GTAAAGTATTTACTTCTAAGGAAGGAAATTTGGGATGGGGCTTGGGGAGCCATCAGAGTT 8949

 52659202 AGGGTGGGGATTTTTTCTCTGCCTTATCTTATTATGTATATCGCTCAGAATGTTTGCTAT 52659261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8950 AGGGTGGGGATTTTTTCTCTGCCTTATCTTATTATGTATATCGCTCAGAATGTTTGCTAT 9009

 52659262 GTGTATGCACCTACCCCATCCATTAAGAAATGAAGAAATAATGAAAAGAAAAAATGAAAG 52659321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9010 GTGTATGCACCTACCCCATCCATTAAGAAATGAAGAAATAATGAAAAGAAAAAATGAAAG 9069

 52659322 TAGGGAACTAGAAATGAGAGGTGGGATTCAAAGTGGACTGAACACTTGACCTATTTCCCA 52659381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9070 TAGGGAACTAGAAATGAGAGGTGGGATTCAAAGTGGACTGAACACTTGACCTATTTCCCA 9129

 52659382 ATTTGCCTAGGGCTGGCCCAGCAGCGAGGCAGGTTCTAACCAATGAGCATCAGCTTTGAA 52659441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9130 ATTTGCCTAGGGCTGGCCCAGCAGCGAGGCAGGTTCTAACCAATGAGCATCAGCTTTGAA 9189

 52659442 TGGAGGGGCTGATAGGCCAGGTGGGCCCTGCTTGCTGAGAGTGTCATGGCCTTAGGGACA 52659501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9190 TGGAGGGGCTGATAGGCCAGGTGGGCCCTGCTTGCTGAGAGTGTCATGGCCTTAGGGACA 9249

 52659502 TCTCCATGTTGCAGAGTCTGAGCCTCTGCTTGGCAAATTCAGAAAATCCAGCTTTTCTTT 52659561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9250 TCTCCATGTTGCAGAGTCTGAGCCTCTGCTTGGCAAATTCAGAAAATCCAGCTTTTCTTT 9309

 52659562 TTATATCACCTGGAGCTGATGTAACTCTCAGAAGGCATTTTTAAGAGGACTCATGAATTA 52659621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9310 TTATATCACCTGGAGCTGATGTAACTCTCAGAAGGCATTTTTAAGAGGACTCATGAATTA 9369

 52659622 ACCACATAGCCAACTTACTGGCTTAAGACTACGTGACAGAAAGCTGCAAAGGGGGCCAGC 52659681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9370 ACCACATAGCCAACTTACTGGCTTAAGACTACGTGACAGAAAGCTGCAAAGGGGGCCAGC 9429

 52659682 CACTGGTAACATCCCACCACTGTCCCTCTCTGTGGAAAACACAGATGGGATGCACATTGT 52659741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9430 CACTGGTAACATCCCACCACTGTCCCTCTCTGTGGAAAACACAGATGGGATGCACATTGT 9489

 52659742 GACGGGCAGGATGCCTGGAGAGCCCACAAATCTGCAAGCACAGCTGAAATTGGTTACAGG 52659801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9490 GACGGGCAGGATGCCTGGAGAGCCCACAAATCTGCAAGCACAGCTGAAATTGGTTACAGG 9549

 52659802 ATTTCAATGTTTCATTGCTTGAAGCTATGATAACTTGATGATGATGATGATGATGATGAT 52659861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9550 ATTTCAATGTTTCATTGCTTGAAGCTATGATAACTTGATGATGATGATGATGATGATGAT 9609

 52659862 GATGATGACGATGATTTTTTTTATAGCCATCTTTTTAGAGGGATTTGAGGTAGGGAAAAA 52659921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9610 GATGATGACGATGATTTTTTTTATAGCCATCTTTTTAGAGGGATTTGAGGTAGGGAAAAA 9669

 52659922 AATAAACCTCACACTATCGGAGGTTGCCAACTATGAGGTCTGCTGATGGTTTGGCCAACA 52659981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9670 AATAAACCTCACACTATCGGAGGTTGCCAACTATGAGGTCTGCTGATGGTTTGGCCAACA 9729

 52659982 CAGTGTTTATATTTTTTTGAATTGGGAAATTTCATTTAAAAGTCCTAAAATCAGGCTGTT 52660041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9730 CAGTGTTTATATTTTTTTGAATTGGGAAATTTCATTTAAAAGTCCTAAAATCAGGCTGTT 9789

 52660042 ATTGAAATATCTTATTATTGGCTCAGGGTTTCCCAGGGCAGCCATCCTTGAAGCTGTGTG 52660101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9790 ATTGAAATATCTTATTATTGGCTCAGGGTTTCCCAGGGCAGCCATCCTTGAAGCTGTGTG 9849

 52660102 GAGCCCTATAAACAAGGACGCTTTCCAGTTCCCTGCAAACTCCATTTCATTCAGAGCCTT 52660161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9850 GAGCCCTATAAACAAGGACGCTTTCCAGTTCCCTGCAAACTCCATTTCATTCAGAGCCTT 9909

 52660162 GAGCCAGTTCTTACATGGTCCTCAGACTTGAGCTAGTGCAAGAATACCCGGGAGGGGTTG 52660221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9910 GAGCCAGTTCTTACATGGTCCTCAGACTTGAGCTAGTGCAAGAATACCCGGGAGGGGTTG 9969

 52660222 TGGGAACAGATAGCTGGGCCCCACCCCCAGGGAAGGGGGTGTTTCTGACTCAGGAGGTCT 52660281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9970 TGGGAACAGATAGCTGGGCCCCACCCCCAGGGAAGGGGGTGTTTCTGACTCAGGAGGTCT 10029

 52660282 GGGCTCCGGCTACAGAAACTGCACATCTAACCGGTACCCAGGTGATGTGATGCTGCTGGC 52660341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10030 GGGCTCCGGCTACAGAAACTGCACATCTAACCGGTACCCAGGTGATGTGATGCTGCTGGC 10089

 52660342 CCAGGGACAACTCTGCGAGTCACTGCTATTGGGCACTGCTATTGCACCCACACAAGGAGG 52660401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10090 CCAGGGACAACTCTGCGAGTCACTGCTATTGGGCACTGCTATTGCACCCACACAAGGAGG 10149

 52660402 CAGGCTCTGCTTACATTTTTCAGTTCTTGTTCCCAGAAACATTTGCTCTTTGGGGTATGC 52660461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10150 CAGGCTCTGCTTACATTTTTCAGTTCTTGTTCCCAGAAACATTTGCTCTTTGGGGTATGC 10209

 52660462 TTTGCATATAATGGATCCTACCCACTAATACAGTATGCTGCTTTTATTGATAAACTTCCA 52660521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10210 TTTGCATATAATGGATCCTACCCACTAATACAGTATGCTGCTTTTATTGATAAACTTCCA 10269

 52660522 GAAACTTGAAGCGCACCTTACCATTTCTTTGATCTCGCTGATTATTTTTATTTTTGTTAA 52660581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10270 GAAACTTGAAGCGCACCTTACCATTTCTTTGATCTCGCTGATTATTTTTATTTTTGTTAA 10329

 52660582 ATGAAAATTGTTGGTAAGTTCTTTTTGGTGTGGTAAAAGGATATGAAAAGCTGATTTTAA 52660641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10330 ATGAAAATTGTTGGTAAGTTCTTTTTGGTGTGGTAAAAGGATATGAAAAGCTGATTTTAA 10389

 52660642 AAAAATGTCCACTCTAGGATTAGAATTGTAGGTGTGTTTATTCTATTTCAAGATCTGGTT 52660701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10390 AAAAATGTCCACTCTAGGATTAGAATTGTAGGTGTGTTTATTCTATTTCAAGATCTGGTT 10449

 52660702 AAAATGCACCTTGAGGAAAAGAATTGAGTGCAGCTGTTGTTATTTCTCAATGCTGTTTCT 52660761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10450 AAAATGCACCTTGAGGAAAAGAATTGAGTGCAGCTGTTGTTATTTCTCAATGCTGTTTCT 10509

 52660762 CTTTTCATGTTTTTTTCATGTTGTCTCTTGGTCTGTCCTATCTCTCTTGGTCTATCCTCC 52660821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10510 CTTTTCATGTTTTTTTCATGTTGTCTCTTGGTCTGTCCTATCTCTCTTGGTCTATCCTCC 10569

 52660822 AAGACAGAGATGAGTGATCTTGAAACCCTGCCCATGTTTTTATCTTTGGAGCCCAACTGT 52660881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10570 AAGACAGAGATGAGTGATCTTGAAACCCTGCCCATGTTTTTATCTTTGGAGCCCAACTGT 10629

 52660882 GCTGCCTTGTTTTCTTCTCCATCCAAAGAGGCAAAGAGAAAGTTGCATATTACTCAACAG 52660941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10630 GCTGCCTTGTTTTCTTCTCCATCCAAAGAGGCAAAGAGAAAGTTGCATATTACTCAACAG 10689

 52660942 CAGTTGCATGACAGTTAAAATCAGACTGTATGAGTCATGGAACAGTAAGTTGTGTCCAGA 52661001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10690 CAGTTGCATGACAGTTAAAATCAGACTGTATGAGTCATGGAACAGTAAGTTGTGTCCAGA 10749

 52661002 GTATCTGTCATGGTAAGTACAAAAAAGTCCTTAAAAATTTAAAACAGAAATGCCAATGTT 52661061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10750 GTATCTGTCATGGTAAGTACAAAAAAGTCCTTAAAAATTTAAAACAGAAATGCCAATGTT 10809

 52661062 TTATTTTTGAAAAATGTGAAGAAGAAATTTTCCGGCCGGGCGCGGTGGCTCATGCCTATA 52661121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10810 TTATTTTTGAAAAATGTGAAGAAGAAATTTTCCGGCCGGGCGCGGTGGCTCATGCCTATA 10869

 52661122 ATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCA 52661181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10870 ATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCA 10929

 52661182 GCCTGGCCAACACAGTGCAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGATGCGG 52661241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10930 GCCTGGCCAACACAGTGCAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGATGCGG 10989

 52661242 TGGCACGCGCCTGTAATCTCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCATGACAATCGCTTGAACCC 52661301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10990 TGGCACGCGCCTGTAATCTCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCATGACAATCGCTTGAACCC 11049

 52661302 AGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCATACCACTGCACTCCAGCTTGGGCAGCGGA 52661361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11050 AGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCATACCACTGCACTCCAGCTTGGGCAGCGGA 11109

 52661362 AGGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAGAAAAAAAGAAATTTTCTAAGTGTATTCCAAATA 52661421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11110 AGGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAGAAAAAAAGAAATTTTCTAAGTGTATTCCAAATA 11169

 52661422 ACTTTTAATATTGGATAAACATTACGAGTTTAAAAATACTTATGCCAGAGGAGTGCTGTG 52661481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11170 ACTTTTAATATTGGATAAACATTACGAGTTTAAAAATACTTATGCCAGAGGAGTGCTGTG 11229

 52661482 ACTCGTGCCTCTAATCCCAGCAATGTGGGAGGCCAAGGAGGGACAGTCACTTGAGCCCAG 52661541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11230 ACTCGTGCCTCTAATCCCAGCAATGTGGGAGGCCAAGGAGGGACAGTCACTTGAGCCCAG 11289

 52661542 GAGTTTGAGACCAGCCTGGATAACAAAGGGAGACCTCATCTTTACAAAAAAACTAAAAAA 52661601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11290 GAGTTTGAGACCAGCCTGGATAACAAAGGGAGACCTCATCTTTACAAAAAAACTAAAAAA 11349

 52661602 TTAGCCAGGTGTGGTGGTGTGTGCCTGTGATCCCAGCTACACAGGAGGCTGAGGCAAGAG 52661661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11350 TTAGCCAGGTGTGGTGGTGTGTGCCTGTGATCCCAGCTACACAGGAGGCTGAGGCAAGAG 11409

 52661662 GATTCCTTGAGCCCTGGAGGTCAAGGCTGCAGTGAGTGATGATCATGCCATTGCACTCCA 52661721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11410 GATTCCTTGAGCCCTGGAGGTCAAGGCTGCAGTGAGTGATGATCATGCCATTGCACTCCA 11469

 52661722 GCTGGGTGACAGAGCAAGACCTCATCTC-AAAAAAAAAAAAAAAACAAAACAAAACAAAA 52661780
          |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
    11470 GCTGGGTGACAGAGCAAGACCTCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAACAAAACAAAACAAAA 11529

 52661781 AACTTACGCCCAGGTAAAAATTGTCAGAGAAAAATAAGAAAAAAACTGAATGCCCAAAAT 52661840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11530 AACTTACGCCCAGGTAAAAATTGTCAGAGAAAAATAAGAAAAAAACTGAATGCCCAAAAT 11589

 52661841 TAGCATAATGGCTGAATGAATTATAGTATGTCTATACCTTGAAGTACATTGTAGCTTTAA 52661900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11590 TAGCATAATGGCTGAATGAATTATAGTATGTCTATACCTTGAAGTACATTGTAGCTTTAA 11649

 52661901 AAAAAATGAATTAAAGTTATACCAGTTGAATTTGGAGTTGAGATGGGGAAGATTATTACA 52661960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11650 AAAAAATGAATTAAAGTTATACCAGTTGAATTTGGAGTTGAGATGGGGAAGATTATTACA 11709

 52661961 ATTAAAAAAAAACAAACACTATTAATGGATGTGCTGGGAAATGTCTGTATGGGGCTAGTT 52662020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11710 ATTAAAAAAAAACAAACACTATTAATGGATGTGCTGGGAAATGTCTGTATGGGGCTAGTT 11769

 52662021 AAAGTAAATTAAAATAAAGACCAGACCTGAAGAATCCCTGAGCGGACAAAGCCTGTTAGA 52662080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11770 AAAGTAAATTAAAATAAAGACCAGACCTGAAGAATCCCTGAGCGGACAAAGCCTGTTAGA 11829

 52662081 CCACATAAATGAGCTAAACCTTGCTTGATTTGCAGACATAAGCAAAACAACTCGAACTGT 52662140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11830 CCACATAAATGAGCTAAACCTTGCTTGATTTGCAGACATAAGCAAAACAACTCGAACTGT 11889

 52662141 TTCTTGTAAATGCCTATGCTAAAGAAAAACAGAACTTGAGCTCAACCAATCAGAAACAGT 52662200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11890 TTCTTGTAAATGCCTATGCTAAAGAAAAACAGAACTTGAGCTCAACCAATCAGAAACAGT 11949

 52662201 CAACAAACTTAAAATTATATAACTGGGTACCTTCCAATGAGATGATCAAATAAGGCAACT 52662260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11950 CAACAAACTTAAAATTATATAACTGGGTACCTTCCAATGAGATGATCAAATAAGGCAACT 12009

 52662261 GTGTAATTGTAACACATCAAACACATTTTATATTATGCCTCTGCATTTTCCCTTAATTCT 52662320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12010 GTGTAATTGTAACACATCAAACACATTTTATATTATGCCTCTGCATTTTCCCTTAATTCT 12069

 52662321 GGCATGTAATGCTTTGTCATCAAAACACTAATTCCCTTTTGGTTTTCTTTTCTCAAATTA 52662380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12070 GGCATGTAATGCTTTGTCATCAAAACACTAATTCCCTTTTGGTTTTCTTTTCTCAAATTA 12129

 52662381 ATGAATTGCCTCTATTCAGATACACTCTTTGAAATTTTATTGTGTCTCAGATTTGTCTTT 52662440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12130 ATGAATTGCCTCTATTCAGATACACTCTTTGAAATTTTATTGTGTCTCAGATTTGTCTTT 12189

 52662441 TACAAAGTATAGAACAAAGAGAAAAATATGAAAGAAGAAATATTAGGTTGTTAGCTTGGG 52662500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12190 TACAAAGTATAGAACAAAGAGAAAAATATGAAAGAAGAAATATTAGGTTGTTAGCTTGGG 12249

 52662501 TGTCCTTGGAGGGGGTAGGGAAGATGTGAGATGAGGAAGAAGCCAATAAGAAAAAGAAAA 52662560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12250 TGTCCTTGGAGGGGGTAGGGAAGATGTGAGATGAGGAAGAAGCCAATAAGAAAAAGAAAA 12309

 52662561 AGACAGGTTTCACCAAAACAACAATAACAGAAAATATGATTGCATTTATTCATATATGTT 52662620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12310 AGACAGGTTTCACCAAAACAACAATAACAGAAAATATGATTGCATTTATTCATATATGTT 12369

 52662621 AATTGGTATGTATGTAAGTATATATGCATGTAAAAATAAAATACAAAGAATTAAAATGCA 52662680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12370 AATTGGTATGTATGTAAGTATATATGCATGTAAAAATAAAATACAAAGAATTAAAATGCA 12429

 52662681 TACTAATAGTTATTTCAGTTATCTATGGCTGTGTAACAAGCATCCCCAAAATGATTGACT 52662740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12430 TACTAATAGTTATTTCAGTTATCTATGGCTGTGTAACAAGCATCCCCAAAATGATTGACT 12489

 52662741 TAACCACCATTTTATTAGGTCATGATTCCATGCATTAAGAATTCAGGGCCGGGTGCGGTG 52662800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12490 TAACCACCATTTTATTAGGTCATGATTCCATGCATTAAGAATTCAGGGCCGGGTGCGGTG 12549

 52662801 GCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGTGGATCACGAGGTCAGGA 52662860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12550 GCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGTGGATCACGAGGTCAGGA 12609

 52662861 GTTTGAGACCAGCCTGCCCAACATAGTGGAACCCCGTCTGTACTAAAAATACAGAAGATT 52662920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12610 GTTTGAGACCAGCCTGCCCAACATAGTGGAACCCCGTCTGTACTAAAAATACAGAAGATT 12669

 52662921 AGCTGGGTGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAA 52662980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12670 AGCTGGGTGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAA 12729

 52662981 TCACTTGAAGCTGGAAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATCATGCCACTGCACTCCAGC 52663040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12730 TCACTTGAAGCTGGAAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATCATGCCACTGCACTCCAGC 12789

 52663041 CTGGTGGACAGCGCGAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAATTCAGGCAGA 52663100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12790 CTGGTGGACAGCGCGAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAATTCAGGCAGA 12849

 52663101 TGCCAGGTGCAGTGGCTCATACCTGTAATTCTAGCACTTTGGGAGGCTGAGATGGGCAGA 52663160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12850 TGCCAGGTGCAGTGGCTCATACCTGTAATTCTAGCACTTTGGGAGGCTGAGATGGGCAGA 12909

 52663161 TCACCTGAAGTCAAGGAGTTCCAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAAACCAGTCTGTAC 52663220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12910 TCACCTGAAGTCAAGGAGTTCCAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAAACCAGTCTGTAC 12969

 52663221 TAAAAATACAAAAATTAGCCAGACATGGTGGCACGTGCCTGTAATCCCAGCTATACAAGA 52663280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12970 TAAAAATACAAAAATTAGCCAGACATGGTGGCACGTGCCTGTAATCCCAGCTATACAAGA 13029

 52663281 GGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGATCTGGGACGTGGAGGTTGCAGCAAGCCAAGATCGTG 52663340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    13030 GGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGATCTGGGACGTGGAGGTTGCAGCAAGCCAAGATCGTG 13089

 52663341 CCACTGCACTCCAGCCTG 52663358
          ||||||||||||||||||
    13090 CCACTGCACTCCAGCCTG 13107

Alignment time is 13.7767 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [52637064,52668002] =>     30939 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    9223] =>      9223 nucs 'mol-32-3487-070673_9223'

Score:        8842
Aligned:      9236        nucs
Identic:      9165 ( 99%) nucs =>      4655 (100%)      4510 ( 99%)
Gaps:           50 (  1%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [52642398,52647064] EXCISED REGION [52658003,52662534]
 second seq =>  [       1,    4668] EXCISED REGION [    4669,    9223]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>     10938 nucs [52647065,52658002]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         6 nucs [52647065,52647070] to [52658003,52658008]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [52647065,52647067] to [52658000,52658002]
 second seq =>         0 nucs

 52642398 AAATACAGAACTATGCAGCCGGGAGTCAGAAAAGAAACCTTGACAATCAGAAGGCTGTTT 52642457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAATACAGAACTATGCAGCCGGGAGTCAGAAAAGAAACCTTGACAATCAGAAGGCTGTTT 60

 52642458 TGTTGTTGTTGTTAAAAACCTTTGCAGGCATATGCATCTGAATATCCATAAGTTCACAGG 52642517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGTTGTTGTTGTTAAAAACCTTTGCAGGCATATGCATCTGAATATCCATAAGTTCACAGG 120

 52642518 CTGAGGGAGAAATGGCTATTTCATAACTTTTCTGTGTTTCTCATGTACATAGTACAAAGT 52642577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTGAGGGAGAAATGGCTATTTCATAACTTTTCTGTGTTTCTCATGTACATAGTACAAAGT 180

 52642578 GGGCACTCAGTATTTCAAATTTCAATATCACTGAAAAAAATGGAAATTTGTCATGTAACA 52642637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGGCACTCAGTATTTCAAATTTCAATATCACTGAAAAAAATGGAAATTTGTCATGTAACA 240

 52642638 AAATCAGATGCAGACTTCACTGGTGAATCTGAGGGAGTGAATTCACTTATTCAGAAAGGA 52642697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAATCAGATGCAGACTTCACTGGTGAATCTGAGGGAGTGAATTCACTTATTCAGAAAGGA 300

 52642698 AGACAGTTACAATTCTTGGGTCTTCTGAGAGATCATTATAACTTGAAAATATTACACAAG 52642757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGACAGTTACAATTCTTGGGTCTTCTGAGAGATCATTATAACTTGAAAATATTACACAAG 360

 52642758 GGCTTTGCTATATTAGATACCTGCCATGTTCCTAACACAAGCTCCCATTTTCTGACTCAA 52642817
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
      361 GGCTTTGCTATATTAGATACCTGCCATGTTCCTAATACAAGCTCCCATTTTCTGACTCAA 420

 52642818 ATCTCATTTTGGAACACATTCCACTCAAATTGAGGTTCTACCCCTAAGAGTTCTTTTTCA 52642877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATCTCATTTTGGAACACATTCCACTCAAATTGAGGTTCTACCCCTAAGAGTTCTTTTTCA 480

 52642878 ATAAAGAAAGCTGAGTTAATAAATCACAACTCCAAAACTTTTCCTCACTTTTCTTAGACT 52642937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATAAAGAAAGCTGAGTTAATAAATCACAACTCCAAAACTTTTCCTCACTTTTCTTAGACT 540

 52642938 AGAAATAGATTGAGTGTGTCGAGGTTTTATGGCTGAGTACATTGGAGGGCTGGCTATTCT 52642997
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGAAATAGATTGAATGTGTCGAGGTTTTATGGCTGAGTACATTGGAGGGCTGGCTATTCT 600

 52642998 ATGCTGAACTGGTTTACTTGATTAAGATGGGGATTTGGATGAGTCACCGGACACCTGTCC 52643057
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
      601 ATGCTGAACTGGTTTACTTGATTAAGATGGGGATTTGGATGAGTCACTGGACACCTGTCC 660

 52643058 AAAGATGAGTAAAACACATTCCTTCATTGTCTTCCCATAAATAACTCAATCTTCTCCTAA 52643117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAAGATGAGTAAAACACATTCCTTCATTGTCTTCCCATAAATAACTCAATCTTCTCCTAA 720

 52643118 CTGAGCCAATGGATAGGCTTTGGATGCCCAAGCAAAACAAACACATGACTGTTAAAAAAT 52643177
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
      721 CTGAGCCAATGGATAGGCTTTGGATGCCCAAGCAAAAGAAACACATGACTGTTAAAAAAT 780

 52643178 CACAACCTCAAAATGGCCTTAGAAGCCTATGACCAATAATGAGAATGGTTTCTCCACTCA 52643237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CACAACCTCAAAATGGCCTTAGAAGCCTATGACCAATAATGAGAATGGTTTCTCCACTCA 840

 52643238 GGCGCAAGTAGTAAACAGTTTCTCCCATATGCAGGAATATTGACGACTAGTTTACCGCCT 52643297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GGCGCAAGTAGTAAACAGTTTCTCCCATATGCAGGAATATTGACGACTAGTTTACCGCCT 900

 52643298 CTGGGCACGTAACTTTCAGGTCCTGGTTCATGCATTTGCTGGAATGTTCCCTGGGCCATG 52643357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTGGGCACGTAACTTTCAGGTCCTGGTTCATGCATTTGCTGGAATGTTCCCTGGGCCATG 960

 52643358 GAGCCCAGTTCTCCTGGCATCTGGCATCTCCCCCACACTCTGCTCCCCCAGCACAGCACT 52643417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GAGCCCAGTTCTCCTGGCATCTGGCATCTCCCCCACACTCTGCTCCCCCAGCACAGCACT 1020

 52643418 TGGCATCTTGCATTGCAATTGCAGGTTTATTTATTCACTTCTCTCACTGGACAGCAAACT 52643477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGGCATCTTGCATTGCAATTGCAGGTTTATTTATTCACTTCTCTCACTGGACAGCAAACT 1080

 52643478 CCACCAGGGCCGAGACTCTGTGTCTCGCCCTTCACTGTGGTCCCTGTGCCTCACCTGTTC 52643537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CCACCAGGGCCGAGACTCTGTGTCTCGCCCTTCACTGTGGTCCCTGTGCCTCACCTGTTC 1140

 52643538 CTAGTACAGTGTCACACTCAGTAAAGAGCAGATGCCTGG-TGCATTTGGAGACTTATTTT 52643596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
     1141 CTAGTACAGTGTCACACTCAGTAAAGAGCAGATGCCTGGATGCATTTGGAGACTTATTTT 1200

 52643597 AAATTATACGGAAAGTTATTCAACCGGCTTCTTGAACTGGTGAATTTTGGAAAGTGGGTG 52643656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AAATTATACGGAAAGTTATTCAACCGGCTTCTTGAACTGGTGAATTTTGGAAAGTGGGTG 1260

 52643657 TTTGAAGGGAAAATGTTTAAACTCTGAAAGAAATGTTGGAAATAAGCTCTTTGAATCAAA 52643716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTTGAAGGGAAAATGTTTAAACTCTGAAAGAAATGTTGGAAATAAGCTCTTTGAATCAAA 1320

 52643717 ATGTATAGAAAACACAAGAATGCTGACAGTAAGAGCCTAAAACACATGATGACTATTATC 52643776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ATGTATAGAAAACACAAGAATGCTGACAGTAAGAGCCTAAAACACATGATGACTATTATC 1380

 52643777 TTTTCCCAATTTTAACTCTCCAGAGTGTTCAGCGGTGCCCAGCCTTCATAATGTAATTCT 52643836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTTTCCCAATTTTAACTCTCCAGAGTGTTCAGCGGTGCCCAGCCTTCATAATGTAATTCT 1440

 52643837 TCGTAGCACCCTGGATGCATTAAAACCATAGATTAACGTGATACTTATTTTCATTAAGGA 52643896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TCGTAGCACCCTGGATGCATTAAAACCATAGATTAACGTGATACTTATTTTCATTAAGGA 1500

 52643897 AAATAATTTACGTACAGTGCTCAGAGTAGAGCCTGGCACATTGAACATTTTCAATAAATG 52643956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AAATAATTTACGTACAGTGCTCAGAGTAGAGCCTGGCACATTGAACATTTTCAATAAATG 1560

 52643957 ACAGCAAGTGTAATTATTAGCACTTCGGAAGTGCAAAGTTGCATTGTATTAAGACAAATA 52644016
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ACAGCAAGTGTAATTATTAGCACTTTGGAAGTGCAAAGTTGCATTGTATTAAGACAAATA 1620

 52644017 TATTTGGAGCTCATCCAATTTTTTCCTGGCTCTGAAGTCTGCTAGTGGCACTTAACTTTA 52644076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TATTTGGAGCTCATCCAATTTTTTCCTGGCTCTGAAGTCTGCTAGTGGCACTTAACTTTA 1680

 52644077 TTCCCAAGTTTTGAAAAATATTGTTATTTAAAAAGTCTGTTAACCAAGGAAATGCATGCC 52644136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTCCCAAGTTTTGAAAAATATTGTTATTTAAAAAGTCTGTTAACCAAGGAAATGCATGCC 1740

 52644137 CTAAACCTATAATGTATCAAGTTTTACTTCCTTCTTCTTTTAAGGAGTTCTTTTCCTGCC 52644196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CTAAACCTATAATGTATCAAGTTTTACTTCCTTCTTCTTTTAAGGAGTTCTTTTCCTGCC 1800

 52644197 TTGAATACAAACAGGCTCTCTCAAGGTTAAAAGCAAATGCTCTTTTTAGTGTCAAAAAGA 52644256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTGAATACAAACAGGCTCTCTCAAGGTTAAAAGCAAATGCTCTTTTTAGTGTCAAAAAGA 1860

 52644257 GCTTGCCTTTCTTCGCTCAGGAAAAAAAGCAACTGATTCCAGGATACCTTCTTTGAAAAC 52644316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GCTTGCCTTTCTTCGCTCAGGAAAAAAAGCAACTGATTCCAGGATACCTTCTTTGAAAAC 1920

 52644317 CAACACAAAAAAACCCCCCAAAAAACAAAAAAAAAACCCAAAACCCCTAGTTTTTACAAA 52644376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CAACACAAAAAAACCCCCCAAAAAACAAAAAAAAAACCCAAAACCCCTAGTTTTTACAAA 1980

 52644377 GGTTTATTACTCCTACTTGTTGGAAAAGAATTACTACATAAAAGAGTCTGCCCAGAGCTG 52644436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GGTTTATTACTCCTACTTGTTGGAAAAGAATTACTACATAAAAGAGTCTGCCCAGAGCTG 2040

 52644437 TAAAATCTCCTTATTCAAACACACACCTTAGAGCAAAAGATGGTTAAATATCAATTCAGG 52644496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TAAAATCTCCTTATTCAAACACACACCTTAGAGCAAAAGATGGTTAAATATCAATTCAGG 2100

 52644497 CTATTAACAGTAAGGGAC---GAAATGTGTTCCAACAAAACTCTGCATGTCAACAAACTA 52644553
          |||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CTATTAACAGTAAGG---AATGAAATGTGTTCCAACAAAACTCTGCATGTCAACAAACTA 2157

 52644554 CAGAGACTAGGTAACATCTTTTAGGAATCATTTTTATTCCACTAATGCCTTTTCCTCCAG 52644613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2158 CAGAGACTAGGTAACATCTTTTAGGAATCATTTTTATTCCACTAATGCCTTTTCCTCCAG 2217

 52644614 AATCCACTGATCGTAAACGCAACCTGTCTACTTCCGCCTTTGAAAAATGGATGGACAAAT 52644673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2218 AATCCACTGATCGTAAACGCAACCTGTCTACTTCCGCCTTTGAAAAATGGATGGACAAAT 2277

 52644674 TCATCTGCATGTAACTCACCTCCTCTTTTCTTTTACATAAAACAGATGCCACAGCTGTTA 52644733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2278 TCATCTGCATGTAACTCACCTCCTCTTTTCTTTTACATAAAACAGATGCCACAGCTGTTA 2337

 52644734 TTGTTCTTCACACAGAAGTTTCTACCCAGAGAAACATCAGGATGACACTCTGCTGCAATG 52644793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2338 TTGTTCTTCACACAGAAGTTTCTACCCAGAGAAACATCAGGATGACACTCTGCTGCAATG 2397

 52644794 TGCTATTTGTTCTAGAGGGGTCAACAGCTTGCCACCTTGCCTAGGCCCAGGGTGACTGCA 52644853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2398 TGCTATTTGTTCTAGAGGGGTCAACAGCTTGCCACCTTGCCTAGGCCCAGGGTGACTGCA 2457

 52644854 TATGTGCAGTGGTCTTATCCCATTAGCGCCCCCGAGCATGCATTCAGAACCAAGTGGATA 52644913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2458 TATGTGCAGTGGTCTTATCCCATTAGCGCCCCCGAGCATGCATTCAGAACCAAGTGGATA 2517

 52644914 CACCTTGGCACACTTACCTTCCCTGCAGGGACATCATCGGACTGCCCTGATAAGCCAGGA 52644973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2518 CACCTTGGCACACTTACCTTCCCTGCAGGGACATCATCGGACTGCCCTGATAAGCCAGGA 2577

 52644974 ACCTCATCCACCTTGTCTTGATGCTCTGCCCTCTTGGCTTCCTGTTGGCTGTCACCTGGC 52645033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2578 ACCTCATCCACCTTGTCTTGATGCTCTGCCCTCTTGGCTTCCTGTTGGCTGTCACCTGGC 2637

 52645034 ACCTTTTCCTGTCCCTTGTCCAGCTTGAAGAATTTGTCAAAAAAGCTGGAGTCCTTGGGC 52645093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2638 ACCTTTTCCTGTCCCTTGTCCAGCTTGAAGAATTTGTCAAAAAAGCTGGAGTCCTTGGGC 2697

 52645094 TTGGAGGGAGCTTCTCCTCCTGCTCCCCCTGTCTCAGGTGGGAGAAGCGTGGGATCCCTG 52645153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2698 TTGGAGGGAGCTTCTCCTCCTGCTCCCCCTGTCTCAGGTGGGAGAAGCGTGGGATCCCTG 2757

 52645154 GCGGCAGAGAGGACCTTGTCTTGGGCCGGGGCGTGCCCTGGGGTTTTATCTGTGTCCTGC 52645213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2758 GCGGCAGAGAGGACCTTGTCTTGGGCCGGGGCGTGCCCTGGGGTTTTATCTGTGTCCTGC 2817

 52645214 CCCGGTCCAGCTGCCACCGGAAGTGTCCAGCTCTCACTTGGGTCTTTGTTCGCTGGAGCT 52645273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2818 CCCGGTCCAGCTGCCACCGGAAGTGTCCAGCTCTCACTTGGGTCTTTGTTCGCTGGAGCT 2877

 52645274 TTATTGGAGCTGACATCAAGCTTCACTGATCCAAGGGATGAATCTGCGGCTTGGTCTCCG 52645333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2878 TTATTGGAGCTGACATCAAGCTTCACTGATCCAAGGGATGAATCTGCGGCTTGGTCTCCG 2937

 52645334 GTACGTCCTGGTACAGGCCGAGAGAGCATCAAGAAAAAACGAGATTTAGCAGCTGGTGCC 52645393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2938 GTACGTCCTGGTACAGGCCGAGAGAGCATCAAGAAAAAACGAGATTTAGCAGCTGGTGCC 2997

 52645394 TCGGGTTTGGCCTCTTTCCCAAGATTCTTTCCGTTGGCATCCGCAACAGCACTTATCTCC 52645453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2998 TCGGGTTTGGCCTCTTTCCCAAGATTCTTTCCGTTGGCATCCGCAACAGCACTTATCTCC 3057

 52645454 GTTGTCTCGGGGGAAGAAGTGGCCACATTATCCGTCTTGACACTTATTCCCAAGTCGACT 52645513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3058 GTTGTCTCGGGGGAAGAAGTGGCCACATTATCCGTCTTGACACTTATTCCCAAGTCGACT 3117

 52645514 GTAAACACAAACATAAACAGTGGTTATTCAGCCAAGCCGGGAAATTCAGGCACTAATAAT 52645573
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3118 GTAAACACAAACATAAACAGCGGTTATTCAGCCAAGCCGGGAAATTCAGGCACTAATAAT 3177

 52645574 GGACTCCAGACATTTTTTATACAAAAGCCATACTGCATACTGGAACTGTGTTGTTCTCTG 52645633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3178 GGACTCCAGACATTTTTTATACAAAAGCCATACTGCATACTGGAACTGTGTTGTTCTCTG 3237

 52645634 GTCATTCTGAAAGGCAGAAGTTAGCTCTCTACATCTCCTTGGACCCTGCTTTTCTTGGGA 52645693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3238 GTCATTCTGAAAGGCAGAAGTTAGCTCTCTACATCTCCTTGGACCCTGCTTTTCTTGGGA 3297

 52645694 GAGGAGAAGGCAAGGTTGGTGAGGAGGGAAAGCTACTTAATGGAAAGTCACTAGCTGCCA 52645753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3298 GAGGAGAAGGCAAGGTTGGTGAGGAGGGAAAGCTACTTAATGGAAAGTCACTAGCTGCCA 3357

 52645754 GGTGTGGAATGAGTGATATTCAATGTTAATTAATCTTCTTTTATCTGTGTAAGAACTCCG 52645813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3358 GGTGTGGAATGAGTGATATTCAATGTTAATTAATCTTCTTTTATCTGTGTAAGAACTCCG 3417

 52645814 TGAGCAGCATATTGTCATGATGTCAACTGGGAGGCAGTACAGCAGTTAGGAGCTTGGGTT 52645873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3418 TGAGCAGCATATTGTCATGATGTCAACTGGGAGGCAGTACAGCAGTTAGGAGCTTGGGTT 3477

 52645874 CTGGAGCTAGAACAAGGTTTCTCAACCTCAGCACTACTCACATTTGAAGCCAGATTATTC 52645933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3478 CTGGAGCTAGAACAAGGTTTCTCAACCTCAGCACTACTCACATTTGAAGCCAGATTATTC 3537

 52645934 TTTGTTAGGGAGGCTCATCCCGTGCCTCATAGGCTGATTAGCAGCATCCTGGCCTCTGCC 52645993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3538 TTTGTTAGGGAGGCTCATCCCGTGCCTCATAGGCTGATTAGCAGCATCCTGGCCTCTGCC 3597

 52645994 CACTAGACGCCGGTCACATTTCCCAGTCATGGCAACCAAAAATATCTCTAGGCATTGCTA 52646053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3598 CACTAGACGCCGGTCACATTTCCCAGTCATGGCAACCAAAAATATCTCTAGGCATTGCTA 3657

 52646054 AATGTCCCCTGGAGGACAAAATCTCTTACGTTTGAGAGGCACTGAGCTGAAATGTCTTTT 52646113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3658 AATGTCCCCTGGAGGACAAAATCTCTTACGTTTGAGAGGCACTGAGCTGAAATGTCTTTT 3717

 52646114 TGAATCCAGATTATCTAATTTTCTGTGCCTCAACTTTCTGGTAAAAGGAGACAGATAATA 52646173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3718 TGAATCCAGATTATCTAATTTTCTGTGCCTCAACTTTCTGGTAAAAGGAGACAGATAATA 3777

 52646174 AATCTCGTAATTTTGTTAGGAAGATTACATGAGTTAATAGTTTTAAAGCAAGTACAATAG 52646233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3778 AATCTCGTAATTTTGTTAGGAAGATTACATGAGTTAATAGTTTTAAAGCAAGTACAATAG 3837

 52646234 CACCTGGAATATATTAAGTGCTTAATAAATATCACAAACATTAGTTATCATTATTCATGA 52646293
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3838 CGCCTGGAATATATTAAGTGCTTAATAAATATCACAAACATTAGTTATCATTATTCATGA 3897

 52646294 GTGAGAAAACTGACAGTCAGAGAGGTCAGTACACCCTCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCTAG 52646353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3898 GTGAGAAAACTGACAGTCAGAGAGGTCAGTACACCCTCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCTAG 3957

 52646354 TAAGCAGCAGAGTCTGGCTTCAGGCAGAAATCTGACTTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGTC 52646413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3958 TAAGCAGCAGAGTCTGGCTTCAGGCAGAAATCTGACTTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGTC 4017

 52646414 TTACCAGGGACTTGTATTAGCATAGACTGTTAAGAATATGGGAAGATTTTTAAAATACAG 52646473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4018 TTACCAGGGACTTGTATTAGCATAGACTGTTAAGAATATGGGAAGATTTTTAAAATACAG 4077

 52646474 TACTCAGAAAATTTCTCTTTGAAAGGCTGGAAGAGCAGATATCCACACAAGAAGGCAAAT 52646533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4078 TACTCAGAAAATTTCTCTTTGAAAGGCTGGAAGAGCAGATATCCACACAAGAAGGCAAAT 4137

 52646534 TAGACCTCAGGCCAGTGTGGAATTAAAGGTGTAGGGTTATCTGGTCAAGACTGTGTGTGT 52646593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4138 TAGACCTCAGGCCAGTGTGGAATTAAAGGTGTAGGGTTATCTGGTCAAGACTGTGTGTGT 4197

 52646594 GGATACAGGCTCCAACCCCTCCAGGCAAGGGCACTGTTTCCAACATCCACCCTTTCTCCT 52646653
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     4198 GGATACAGGCTCCAACCCCTCCAGGCAAGGGCAATGTTTCCAACATCCACCCTTTCTCCT 4257

 52646654 TTGACCTCTACCTTGACCTAAATTAACTATAAAAGGTCCTTCTTTTCTAGGACCCTACTA 52646713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4258 TTGACCTCTACCTTGACCTAAATTAACTATAAAAGGTCCTTCTTTTCTAGGACCCTACTA 4317

 52646714 TAAATCAGTGAAATATTCAGGAAAAAAAGAACACCAAGAATGTTGGGATCCCAGTTAAAG 52646773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4318 TAAATCAGTGAAATATTCAGGAAAAAAAGAACACCAAGAATGTTGGGATCCCAGTTAAAG 4377

 52646774 ATCAAGATTCTCTACTGATAAGCTGTGTGATATGGAGTAAATCACTAAAGATCTTTGAAT 52646833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4378 ATCAAGATTCTCTACTGATAAGCTGTGTGATATGGAGTAAATCACTAAAGATCTTTGAAT 4437

 52646834 CTCTTCATTTGTAAAATGGGAATATTGGTAGTCCTACTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTAA 52646893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4438 CTCTTCATTTGTAAAATGGGAATATTGGTAGTCCTACTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTAA 4497

 52646894 AGAAGAAAAGTCATGCAAAGGATCTGGCACAACGCCTTTTCCATAATAAGTGCTTAGTAA 52646953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     4498 AGAAGAAAAGTCATGCAAAGGATCTGGCACAATGCCTTTTCCATAATAAGTGCTTAGTAA 4557

 52646954 TTGACAGATACTGTGATAACTTTTCAGGTTTCTCTCATGCCTTTGACAACATTGCATTTT 52647013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4558 TTGACAGATACTGTGATAACTTTTCAGGTTTCTCTCATGCCTTTGACAACATTGCATTTT 4617

 52647014 GCTTGCTCTATCTGTAGTCAGACACTTCTTAATATCTGTTTGCAGGAAGAC 52647064
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4618 GCTTGCTCTATCTGTAGTCAGACACTTCTTAATATCTGTTTGCAGGAAGAC 4668

EXCISED REGION

 52658003 AGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTG 52658062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4669 AGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTG 4728

 52658063 GCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTAT 52658122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4729 GCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTAT 4788

 52658123 AAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGG 52658182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4789 AAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGG 4848

 52658183 GAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTG 52658242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4849 GAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTG 4908

 52658243 AAACACTGTCTCTGCTAAAAAACAAAACAAAACAAAACACCAAAAAATAGCTGGGCGTAG 52658302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4909 AAACACTGTCTCTGCTAAAAAACAAAACAAAACAAAACACCAAAAAATAGCTGGGCGTAG 4968

 52658303 TGGCGGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTTGGGAGGCGGTGGCAGGAGAATCATTTGAACCT 52658362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4969 TGGCGGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTTGGGAGGCGGTGGCAGGAGAATCATTTGAACCT 5028

 52658363 GGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGAT--------TGTGCCACTGCACTCTAACCTGG 52658414
          |||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||
     5029 GGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACTGTGCCACTGCACTCTAACCTGG 5088

 52658415 GCAACAGAGTTCAGAGTGAGACTCTGTCTCCCCC----------------AAAAAAAAAA 52658458
          ||||||||||||||||||||||||||||||                    ||||||||||
     5089 GCAACAGAGTTCAGAGTGAGACTCTGTCTC----ACCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 5144

 52658459 AAAAAAAAAAAAGAACAGCCATATAGATCGTCGGTGGGAGTGTAATTTGGCCACTTCTTT 52658518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5145 AAAAAAAAAAAAGAACAGCCATATAGATCGTCGGTGGGAGTGTAATTTGGCCACTTCTTT 5204

 52658519 GGAAAATAGCTCAGTAATATCTATTAATACTTAAAATTTCACAAACACTGTAAGTCTAAC 52658578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5205 GGAAAATAGCTCAGTAATATCTATTAATACTTAAAATTTCACAAACACTGTAAGTCTAAC 5264

 52658579 TTCCACTTCTAAAATGTTATCCTAGAAATAAAATTGCATAGGGGTACAAAGGCTTACGTA 52658638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5265 TTCCACTTCTAAAATGTTATCCTAGAAATAAAATTGCATAGGGGTACAAAGGCTTACGTA 5324

 52658639 TGGAACTATTTGCTGGACTACTGTAGTTGTGGCAAAAAACTGGAAATGACCTAAACGCTT 52658698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5325 TGGAACTATTTGCTGGACTACTGTAGTTGTGGCAAAAAACTGGAAATGACCTAAACGCTT 5384

 52658699 ATTAGTAGAAACCTGGTTAAATAAATTATCATATGTCCTTGAGGACACAGGGACACAAAG 52658758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5385 ATTAGTAGAAACCTGGTTAAATAAATTATCATATGTCCTTGAGGACACAGGGACACAAAG 5444

 52658759 AGGGGAATGACAGGCACTGAGCCTACTTGAGGGTGGGAGGAGGAAGTCGATCAGAAAAAA 52658818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5445 AGGGGAATGACAGGCACTGAGCCTACTTGAGGGTGGGAGGAGGAAGTCGATCAGAAAAAA 5504

 52658819 TAACTAGTGGGTACTAGGCTTAGTACCCGGGTGAAAAAATAATCTGTACAACAAACCCCC 52658878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5505 TAACTAGTGGGTACTAGGCTTAGTACCCGGGTGAAAAAATAATCTGTACAACAAACCCCC 5564

 52658879 ATGACATGAGTTTACCTTATAACAAACCTGCACATGTAATCTGAACCTAGATAAAAGTTT 52658938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5565 ATGACATGAGTTTACCTTATAACAAACCTGCACATGTAATCTGAACCTAGATAAAAGTTT 5624

 52658939 AAAAAAATAAATAATCATATGTCCCTACAATGAAATATTCCACAGGCATTAAAATTCCCC 52658998
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     5625 AAAAAAATAAATAATCATATGTCCCTATAATGAAATATTCCACAGGCATTAAAATTCCCC 5684

 52658999 AAGGAATTTTAGTAAGGAAAGAAAAAGCTGTGCCCAACAGCACGTACAGTATGTTTCCAT 52659058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5685 AAGGAATTTTAGTAAGGAAAGAAAAAGCTGTGCCCAACAGCACGTACAGTATGTTTCCAT 5744

 52659059 TTGTTTTTAAAAAATGGTGTCGGGAGGTTGAGGAGACAACTTATAAATAGACATGCCTGG 52659118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5745 TTGTTTTTAAAAAATGGTGTCGGGAGGTTGAGGAGACAACTTATAAATAGACATGCCTGG 5804

 52659119 GATACCTCTGGATATAAGAAACTGTAAAGTATTTACTTCTAAGGAAGGAAATTTGGGATG 52659178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5805 GATACCTCTGGATATAAGAAACTGTAAAGTATTTACTTCTAAGGAAGGAAATTTGGGATG 5864

 52659179 GGGCTTGGGGAGCCATCAGAGTTAGGGTGGGGATTTTTTCTCTGCCTTATCTTATTATGT 52659238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5865 GGGCTTGGGGAGCCATCAGAGTTAGGGTGGGGATTTTTTCTCTGCCTTATCTTATTATGT 5924

 52659239 ATATCGCTCAGAATGTTTGCTATGTGTATGCACCTACCCCATCCATTAAGAAATGAAGAA 52659298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5925 ATATCGCTCAGAATGTTTGCTATGTGTATGCACCTACCCCATCCATTAAGAAATGAAGAA 5984

 52659299 ATAATGAAAAGAAAAAATGAAAGTAGGGAACTAGAAATGAGAGGTGGGATTCAAAGTGGA 52659358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5985 ATAATGAAAAGAAAAAATGAAAGTAGGGAACTAGAAATGAGAGGTGGGATTCAAAGTGGA 6044

 52659359 CTGAACACTTGACCTATTTCCCAATTTGCCTAGGGCTGGCCCAGCAGCGAGGCAGGTTCT 52659418
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     6045 CTGAACACTTGACCTATTTCCCAATTTGCCTGGGGCTGGCCCAGCAGCGAGGCAGGTTCT 6104

 52659419 AACCAATGAGCATCAGCTTTGAATGGAGGGGCTGATAGGCCAGGTGGGCCCTGCTTGCTG 52659478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6105 AACCAATGAGCATCAGCTTTGAATGGAGGGGCTGATAGGCCAGGTGGGCCCTGCTTGCTG 6164

 52659479 AGAGTGTCATGGCCTTAGGGACATCTCCATGTTGCAGAGTCTGAGCCTCTGCTTGGCAAA 52659538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6165 AGAGTGTCATGGCCTTAGGGACATCTCCATGTTGCAGAGTCTGAGCCTCTGCTTGGCAAA 6224

 52659539 TTCAGAAAATCCAGCTTTTCTTTTTATATCACCTGGAGCTGATGTAACTCTCAGAAGGCA 52659598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     6225 TTCAGAAAATCCAGCTTTTCTTTTTATATCACCTGGAGCTGATGTAACTCTCAGAACGCA 6284

 52659599 TTTTTAAGAGGACTCATGAATTAACCACATAGCCAACTTACTGGCTTAAGACTACGTGAC 52659658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6285 TTTTTAAGAGGACTCATGAATTAACCACATAGCCAACTTACTGGCTTAAGACTACGTGAC 6344

 52659659 AGAAAGCTGCAAAGGGGGCCAGCCACTGGTAACATCCCACCACTGTCCCTCTCTGTGGAA 52659718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6345 AGAAAGCTGCAAAGGGGGCCAGCCACTGGTAACATCCCACCACTGTCCCTCTCTGTGGAA 6404

 52659719 AACACAGATGGGATGCACATTGTGACGGGCAGGATGCCTGGAGAGCCCACAAATCTGCAA 52659778
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6405 AACACAGATGGGATGCACATTGTGATGGGCAGGATGCCTGGAGAGCCCACAAATCTGCAA 6464

 52659779 GCACAGCTGAAATTGGTTACAGGATTTCAATGTTTCATTGCTTGAAGCTATGATAACTTG 52659838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  
     6465 GCACAGCTGAAATTGGTTACAGGATTTCAATGTTTCATTGCTTGAAGCTATGATAACT-- 6522

 52659839 ATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGACGATGATTTTTTTTATAGCCATCTTTTTA 52659898
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6523 -TGATGATGATGATGATGATGATGATGATGACGATGATTTTTTTTATAGCCATCTTTTTA 6581

 52659899 GAGGGATTTGAGGTAGGGAAAAAAATAAACCTCACACTATCGGAGGTTGCCAACTATGAG 52659958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6582 GAGGGATTTGAGGTAGGGAAAAAAATAAACCTCACACTATCGGAGGTTGCCAACTATGAG 6641

 52659959 GTCTGCTGATGGTTTGGCCAACACAGTGTTTATATTTTTTTGAATTGGGAAATTTCATTT 52660018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6642 GTCTGCTGATGGTTTGGCCAACACAGTGTTTATATTTTTTTGAATTGGGAAATTTCATTT 6701

 52660019 AAAAGTCCTAAAATCAGGCTGTTATTGAAATATCTTATTATTGGCTCAGGGTTTCCCAGG 52660078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6702 AAAAGTCCTAAAATCAGGCTGTTATTGAAATATCTTATTATTGGCTCAGGGTTTCCCAGG 6761

 52660079 GCAGCCATCCTTGAAGCTGTGTGGAGCCCTATAAACAAGGACGCTTTCCAGTTCCCTGCA 52660138
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     6762 GCAGCCATCCTTGAAGCTGTGTGGAGCCCTATAAACAAGGAGGCTTTCCAGTTCCCTGCA 6821

 52660139 AACTCCATTTCATTCAGAGCCTTGAGCCAGTTCTTACATGGTCCTCAGACTTGAGCTAGT 52660198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6822 AACTCCATTTCATTCAGAGCCTTGAGCCAGTTCTTACATGGTCCTCAGACTTGAGCTAGT 6881

 52660199 GCAAGAATACCCGGGAGGGGTTGTGGGAACAGATAGCTGGGCCCCACCCCCAGGGAAGGG 52660258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6882 GCAAGAATACCCGGGAGGGGTTGTGGGAACAGATAGCTGGGCCCCACCCCCAGGGAAGGG 6941

 52660259 GGTGTTTCTGACTCAGGAGGTCTGGGCTCCGGCTACAGAAACTGCACATCTAACCGGTAC 52660318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6942 GGTGTTTCTGACTCAGGAGGTCTGGGCTCCGGCTACAGAAACTGCACATCTAACCGGTAC 7001

 52660319 CCAGGTGATGTGATGCTGCTGGCCCAGGGACAACTCTGCGAGTCACTGCTATTGGGCACT 52660378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7002 CCAGGTGATGTGATGCTGCTGGCCCAGGGACAACTCTGCGAGTCACTGCTATTGGGCACT 7061

 52660379 GCTATTGCACCCACACAAGGAGGCAGGCTCTGCTTACATTTTTCAGTTCTTGTTCCCAGA 52660438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7062 GCTATTGCACCCACACAAGGAGGCAGGCTCTGCTTACATTTTTCAGTTCTTGTTCCCAGA 7121

 52660439 AACATTTGCTCTTTGGGGTATGCTTTGCATATAATGGATCCTACCCACTAATACAGTATG 52660498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7122 AACATTTGCTCTTTGGGGTATGCTTTGCATATAATGGATCCTACCCACTAATACAGTATG 7181

 52660499 CTGCTTTTATTGATAAACTTCCAGAAACTTGAAGCGCACCTTACCATTTCTTTGATCTCG 52660558
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7182 CTGCTTTTATTGATAAACTTCCAGATACTTGAAGCGCACCTTACCATTTCTTTGATCTCG 7241

 52660559 CTGATTATTTTTATTTTTGTTAAATGAAAATTGTTGGTAAGTTCTTTTTGGTGTGGTAAA 52660618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7242 CTGATTATTTTTATTTTTGTTAAATGAAAATTGTTGGTAAGTTCTTTTTGGTGTGGTAAA 7301

 52660619 AGGATATGAAAAGCTGATTTTAAAAAAATGTCCACTCTAGGATTAGAATTGTAGGTGTGT 52660678
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7302 AGGATATGAAAAACTGATTTTAAAAAAATGTCCACTCTAGGATTAGAATTGTAGGTGTGT 7361

 52660679 TTATTCTATTTCAAGATCTGGTTAAAATGCACCTTGAGGAAAAGAATTGAGTGCAGCTGT 52660738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7362 TTATTCTATTTCAAGATCTGGTTAAAATGCACCTTGAGGAAAAGAATTGAGTGCAGCTGT 7421

 52660739 TGTTATTTCTCAATGCTGTTTCTCTTTTCATGTTTTTTTCATGTTGTCTCTTGGTCTGTC 52660798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7422 TGTTATTTCTCAATGCTGTTTCTCTTTTCATGTTTTTTTCATGTTGTCTCTTGGTCTGTC 7481

 52660799 CTATCTCTCTTGGTCTATCCTCCAAGACAGAGATGAGTGATCTTGAAACCCTGCCCATGT 52660858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7482 CTATCTCTCTTGGTCTATCCTCCAAGACAGAGATGAGTGATCTTGAAACCCTGCCCATGT 7541

 52660859 TTTTATCTTTGGAGCCCAACTGTGCTGCCTTGTTTTCTTCTCCATCCAAAGAGGCAAAGA 52660918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7542 TTTTATCTTTGGAGCCCAACTGTGCTGCCTTGTTTTCTTCTCCATCCAAAGAGGCAAAGA 7601

 52660919 GAAAGTTGCATATTACTCAACAGCAGTTGCATGACAGTTAAAATCAGACTGTATGAGTCA 52660978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7602 GAAAGTTGCATATTACTCAACAGCAGTTGCATGACAGTTAAAATCAGACTGTATGAGTCA 7661

 52660979 TGGAACAGTAAGTTGTGTCCAGAGTATCTGTCATGGTAAGTACAAAAAAGTCCTTAAAAA 52661038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7662 TGGAACAGTAAGTTGTGTCCAGAGTATCTGTCATGGTAAGTACAAAAAAGTCCTTAAAAA 7721

 52661039 TTTAAAACAGAAATGCCAATGTTTTATTTTTGAAAAATGTGAAGAAGAAATTTTCCGGCC 52661098
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     7722 TTTAAAACAGAAATGCCAATGTTTTATTTCTGAAAAATGTGAAGAAGAAATTTTCCGGCC 7781

 52661099 GGGCGCGGTGGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATCAC 52661158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7782 GGGCGCGGTGGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATCAC 7841

 52661159 CTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACACAGTGCAACCCCATCTCTACTAAAA 52661218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7842 CTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACACAGTGCAACCCCATCTCTACTAAAA 7901

 52661219 ATACAAAAATTAGCCAGATGCGGTGGCACGCGCCTGTAATCTCAGCTACTAGGGAGGCTG 52661278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7902 ATACAAAAATTAGCCAGATGCGGTGGCACGCGCCTGTAATCTCAGCTACTAGGGAGGCTG 7961

 52661279 AGGCATGACAATCGCTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCATACCAC 52661338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7962 AGGCATGACAATCGCTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCATACCAC 8021

 52661339 TGCACTCCAGCTTGGGCAGCGGAAGGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAGAAAAAAAG-- 52661396
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||   
     8022 TGCACTCCAGCTTGGGCAGCGGAAGGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAA-AA 8080

 52661397 ------AAATTTTCTAAGTGTATTCCAAATAACTTTTAATATTGGATAAACATTACGAGT 52661450
                ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     8081 AAAAAAAAATTTTCTAAGTGTATTCCGAATAACTTTTAATATTGGATAAACATTACGAGT 8140

 52661451 TTAAAAATACTTATGCCAGAGGAGTGCTGTGACTCGTGCCTCTAATCCCAGCAATGTGGG 52661510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8141 TTAAAAATACTTATGCCAGAGGAGTGCTGTGACTCGTGCCTCTAATCCCAGCAATGTGGG 8200

 52661511 AGGCCAAGGAGGGACAGTCACTTGAGCCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGATAACAAAGG 52661570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8201 AGGCCAAGGAGGGACAGTCACTTGAGCCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGATAACAAAGG 8260

 52661571 GAGACCTCATCTTTACAAAAAAACTAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGTGTGTGCCTGTG 52661630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8261 GAGACCTCATCTTTACAAAAAAACTAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGTGTGTGCCTGTG 8320

 52661631 ATCCCAGCTACACAGGAGGCTGAGGCAAGAGGATTCCTTGAGCCCTGGAGGTCAAGGCTG 52661690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8321 ATCCCAGCTACACAGGAGGCTGAGGCAAGAGGATTCCTTGAGCCCTGGAGGTCAAGGCTG 8380

 52661691 CAGTGAGTGATGATCATGCCATTGCACTCCAGCTGGGTGACAGAGCAAGACCTCATCTCA 52661750
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8381 CAGTGAGCGATGATCATGCCATTGCACTCCAGCTGGGTGACAGAGCAAGACCTCATCTCA 8440

 52661751 AAAAAAAAAAA-AAAACAAAACAAAACAAAAAACTTACGCCCAGGTAAAAATTGTCAGAG 52661809
          ||||.||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8441 AAAACAAAA--CAAAACAAAACAAAACAAAAAACTTACGCCCAGGTAAAAATTGTCAGAG 8498

 52661810 AAAAATAAGAAAAAAACTGAATGCCCAAAATTAGCATAATGGCTGAATGAATTATAGTAT 52661869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8499 AAAAATAAGAAAAAAACTGAATGCCCAAAATTAGCATAATGGCTGAATGAATTATAGTAT 8558

 52661870 GTCTATACCTTGAAGTACATTGTAGCTTTAAAAAAAATGAATTAAAGTTATACCAGTTGA 52661929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8559 GTCTATACCTTGAAGTACATTGTAGCTTTAAAAAAAATGAATTAAAGTTATACCAGTTGA 8618

 52661930 ATTTGGAGTTGAGATGGGGAAGATTATTACAATTAAAAAAAAACAAACACTATTAATGGA 52661989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8619 ATTTGGAGTTGAGATGGGGAAGATTATTACAATTAAAAAAAAACAAACACTATTAATGGA 8678

 52661990 TGTGCTGGGAAATGTCTGTATGGGGCTAGTTAAAGTAAATTAAAATAAAGACCAGACCTG 52662049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8679 TGTGCTGGGAAATGTCTGTATGGGGCTAGTTAAAGTAAATTAAAATAAAGACCAGACCTG 8738

 52662050 AAGAATCCCTGAGCGGACAAAGCCTGTTAGACCACATAAATGAGCTAAACCTTGCTTGAT 52662109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8739 AAGAATCCCTGAGCGGACAAAGCCTGTTAGACCACATAAATGAGCTAAACCTTGCTTGAT 8798

 52662110 TTGCAGACATAAGCAAAACAACTCGAACTGTTTCTTGTAAATGCCTATGCTAAAGAAAAA 52662169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8799 TTGCAGACATAAGCAAAACAACTCGAACTGTTTCTTGTAAATGCCTATGCTAAAGAAAAA 8858

 52662170 CAGAACTTGAGCTCAACCAATCAGAAACAGTCAACAAACTTAAAATTATATAACTGGGTA 52662229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8859 CAGAACTTGAGCTCAACCAATCAGAAACAGTCAACAAACTTAAAATTATATAACTGGGTA 8918

 52662230 CCTTCCAATGAGATGATCAAATAAGGCAACTGTGTAATTGTAACACATCAAACACATTTT 52662289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8919 CCTTCCAATGAGATGATCAAATAAGGCAACTGTGTAATTGTAACACATCAAACACATTTT 8978

 52662290 ATATTATGCCTCTGCATTTTCCCTTAATTCTGGCATGTAATGCTTTGTCATCAAAACACT 52662349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8979 ATATTATGCCTCTGCATTTTCCCTTAATTCTGGCATGTAATGCTTTGTCATCAAAACACT 9038

 52662350 AATTCCCTTTTGGTTTTCTTTTCTCAAATTAATGAATTGCCTCTATTCAGATACACTCTT 52662409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9039 AATTCCCTTTTGGTTTTCTTTTCTCAAATTAATGAATTGCCTCTATTCAGATACACTCTT 9098

 52662410 TGAAATTTTATTGTGTCTCAGATTTGTCTTTTACAAAGTATAGAACAAAGAGAAAAATAT 52662469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9099 TGAAATTTTATTGTGTCTCAGATTTGTCTTTTACAAAGTATAGAACAAAGAGAAAAATAT 9158

 52662470 GAAAGAAGAAATATTAGGTTGTTAGCTTGGGTGTCCTTGGAGGGGGTAGGGAAGATGTGA 52662529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9159 GAAAGAAGAAATATTAGGTTGTTAGCTTGGGTGTCCTTGGAGGGGGTAGGGAAGATGTGA 9218

 52662530 GATGA 52662534
          |||||
     9219 GATGA 9223

Alignment time is 9.77789 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [52637064,52668002] =>     30939 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    4555] =>      4555 nucs 'mol-32-3487-070673_4555'

Score:        4331
Aligned:      4545        nucs
Identic:      4510 ( 99%) nucs =>       442 ( 98%)      4068 ( 99%)
Gaps:           23 (  1%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [52658003,52658444] EXCISED REGION [52658449,52662534]
 second seq =>  [       1,     450] EXCISED REGION [     467,    4555]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         4 nucs [52658445,52658448]
 second seq =>        16 nucs [451,466]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [52658444,52658444] to [52658448,52658448]
 second seq =>         1 nucs [451,451] to [467,467]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [52658445,52658446] to [52658447,52658448]
 second seq =>         1 nucs [451,451] to [466,466]

 52658003 AGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTG 52658062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTG 60

 52658063 GCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTAT 52658122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTAT 120

 52658123 AAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGG 52658182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGG 180

 52658183 GAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTG 52658242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTG 240

 52658243 AAACACTGTCTCTGCTAAAAAACAAAACAAAACAAAACACCAAAAAATAGCTGGGCGTAG 52658302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAACACTGTCTCTGCTAAAAAACAAAACAAAACAAAACACCAAAAAATAGCTGGGCGTAG 300

 52658303 TGGCGGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTTGGGAGGCGGTGGCAGGAGAATCATTTGAACCT 52658362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGGCGGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTTGGGAGGCGGTGGCAGGAGAATCATTTGAACCT 360

 52658363 GGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACTG--------CACTCTAACCTGG 52658414
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||
      361 GGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACTGTGCCACTGCACTCTAACCTGG 420

 52658415 GCAACAGAGTTCAGAGTGAGACTCTGTCTC 52658444
          ||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GCAACAGAGTTCAGAGTGAGACTCTGTCTC 450

EXCISED REGION

 52658449 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAACAGCCATATAGATCGTCGGTGGGAGTGTAATTTGG 52658508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      467 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAACAGCCATATAGATCGTCGGTGGGAGTGTAATTTGG 526

 52658509 CCACTTCTTTGGAAAATAGCTCAGTAATATCTATTAATACTTAAAATTTCACAAACACTG 52658568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      527 CCACTTCTTTGGAAAATAGCTCAGTAATATCTATTAATACTTAAAATTTCACAAACACTG 586

 52658569 TAAGTCTAACTTCCACTTCTAAAATGTTATCCTAGAAATAAAATTGCATAGGGGTACAAA 52658628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      587 TAAGTCTAACTTCCACTTCTAAAATGTTATCCTAGAAATAAAATTGCATAGGGGTACAAA 646

 52658629 GGCTTACGTATGGAACTATTTGCTGGACTACTGTAGTTGTGGCAAAAAACTGGAAATGAC 52658688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      647 GGCTTACGTATGGAACTATTTGCTGGACTACTGTAGTTGTGGCAAAAAACTGGAAATGAC 706

 52658689 CTAAACGCTTATTAGTAGAAACCTGGTTAAATAAATTATCATATGTCCTTGAGGACACAG 52658748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      707 CTAAACGCTTATTAGTAGAAACCTGGTTAAATAAATTATCATATGTCCTTGAGGACACAG 766

 52658749 GGACACAAAGAGGGGAATGACAGGCACTGAGCCTACTTGAGGGTGGGAGGAGGAAGTCGA 52658808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      767 GGACACAAAGAGGGGAATGACAGGCACTGAGCCTACTTGAGGGTGGGAGGAGGAAGTCGA 826

 52658809 TCAGAAAAAATAACTAGTGGGTACTAGGCTTAGTACCCGGGTGAAAAAATAATCTGTACA 52658868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      827 TCAGAAAAAATAACTAGTGGGTACTAGGCTTAGTACCCGGGTGAAAAAATAATCTGTACA 886

 52658869 ACAAACCCCCATGACATGAGTTTACCTTATAACAAACCTGCACATGTAATCTGAACCTAG 52658928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      887 ACAAACCCCCATGACATGAGTTTACCTTATAACAAACCTGCACATGTAATCTGAACCTAG 946

 52658929 ATAAAAGTTTAAAAAAATAAATAATCATATGTCCCTACAATGAAATATTCCACAGGCATT 52658988
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
      947 ATAAAAGTTTAAAAAAATAAATAATCATATGTCCCTATAATGAAATATTCCACAGGCATT 1006

 52658989 AAAATTCCCCAAGGAATTTTAGTAAGGAAAGAAAAAGCTGTGCCCAACAGCACGTACAGT 52659048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1007 AAAATTCCCCAAGGAATTTTAGTAAGGAAAGAAAAAGCTGTGCCCAACAGCACGTACAGT 1066

 52659049 ATGTTTCCATTTGTTTTTAAAAAATGGTGTCGGGAGGTTGAGGAGACAACTTATAAATAG 52659108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1067 ATGTTTCCATTTGTTTTTAAAAAATGGTGTCGGGAGGTTGAGGAGACAACTTATAAATAG 1126

 52659109 ACATGCCTGGGATACCTCTGGATATAAGAAACTGTAAAGTATTTACTTCTAAGGAAGGAA 52659168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1127 ACATGCCTGGGATACCTCTGGATATAAGAAACTGTAAAGTATTTACTTCTAAGGAAGGAA 1186

 52659169 ATTTGGGATGGGGCTTGGGGAGCCATCAGAGTTAGGGTGGGGATTTTTTCTCTGCCTTAT 52659228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1187 ATTTGGGATGGGGCTTGGGGAGCCATCAGAGTTAGGGTGGGGATTTTTTCTCTGCCTTAT 1246

 52659229 CTTATTATGTATATCGCTCAGAATGTTTGCTATGTGTATGCACCTACCCCATCCATTAAG 52659288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1247 CTTATTATGTATATCGCTCAGAATGTTTGCTATGTGTATGCACCTACCCCATCCATTAAG 1306

 52659289 AAATGAAGAAATAATGAAAAGAAAAAATGAAAGTAGGGAACTAGAAATGAGAGGTGGGAT 52659348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1307 AAATGAAGAAATAATGAAAAGAAAAAATGAAAGTAGGGAACTAGAAATGAGAGGTGGGAT 1366

 52659349 TCAAAGTGGACTGAACACTTGACCTATTTCCCAATTTGCCTAGGGCTGGCCCAGCAGCGA 52659408
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     1367 TCAAAGTGGACTGAACACTTGACCTATTTCCCAATTTGCCTGGGGCTGGCCCAGCAGCGA 1426

 52659409 GGCAGGTTCTAACCAATGAGCATCAGCTTTGAATGGAGGGGCTGATAGGCCAGGTGGGCC 52659468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1427 GGCAGGTTCTAACCAATGAGCATCAGCTTTGAATGGAGGGGCTGATAGGCCAGGTGGGCC 1486

 52659469 CTGCTTGCTGAGAGTGTCATGGCCTTAGGGACATCTCCATGTTGCAGAGTCTGAGCCTCT 52659528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1487 CTGCTTGCTGAGAGTGTCATGGCCTTAGGGACATCTCCATGTTGCAGAGTCTGAGCCTCT 1546

 52659529 GCTTGGCAAATTCAGAAAATCCAGCTTTTCTTTTTATATCACCTGGAGCTGATGTAACTC 52659588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1547 GCTTGGCAAATTCAGAAAATCCAGCTTTTCTTTTTATATCACCTGGAGCTGATGTAACTC 1606

 52659589 TCAGAAGGCATTTTTAAGAGGACTCATGAATTAACCACATAGCCAACTTACTGGCTTAAG 52659648
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1607 TCAGAACGCATTTTTAAGAGGACTCATGAATTAACCACATAGCCAACTTACTGGCTTAAG 1666

 52659649 ACTACGTGACAGAAAGCTGCAAAGGGGGCCAGCCACTGGTAACATCCCACCACTGTCCCT 52659708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1667 ACTACGTGACAGAAAGCTGCAAAGGGGGCCAGCCACTGGTAACATCCCACCACTGTCCCT 1726

 52659709 CTCTGTGGAAAACACAGATGGGATGCACATTGTGACGGGCAGGATGCCTGGAGAGCCCAC 52659768
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     1727 CTCTGTGGAAAACACAGATGGGATGCACATTGTGATGGGCAGGATGCCTGGAGAGCCCAC 1786

 52659769 AAATCTGCAAGCACAGCTGAAATTGGTTACAGGATTTCAATGTTTCATTGCTTGAAGCTA 52659828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1787 AAATCTGCAAGCACAGCTGAAATTGGTTACAGGATTTCAATGTTTCATTGCTTGAAGCTA 1846

 52659829 TGATAACTTGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGACGATGATTTTTTTTATAGC 52659888
          ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1847 TGATAACT---TGATGATGATGATGATGATGATGATGATGACGATGATTTTTTTTATAGC 1903

 52659889 CATCTTTTTAGAGGGATTTGAGGTAGGGAAAAAAATAAACCTCACACTATCGGAGGTTGC 52659948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1904 CATCTTTTTAGAGGGATTTGAGGTAGGGAAAAAAATAAACCTCACACTATCGGAGGTTGC 1963

 52659949 CAACTATGAGGTCTGCTGATGGTTTGGCCAACACAGTGTTTATATTTTTTTGAATTGGGA 52660008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1964 CAACTATGAGGTCTGCTGATGGTTTGGCCAACACAGTGTTTATATTTTTTTGAATTGGGA 2023

 52660009 AATTTCATTTAAAAGTCCTAAAATCAGGCTGTTATTGAAATATCTTATTATTGGCTCAGG 52660068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2024 AATTTCATTTAAAAGTCCTAAAATCAGGCTGTTATTGAAATATCTTATTATTGGCTCAGG 2083

 52660069 GTTTCCCAGGGCAGCCATCCTTGAAGCTGTGTGGAGCCCTATAAACAAGGACGCTTTCCA 52660128
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     2084 GTTTCCCAGGGCAGCCATCCTTGAAGCTGTGTGGAGCCCTATAAACAAGGAGGCTTTCCA 2143

 52660129 GTTCCCTGCAAACTCCATTTCATTCAGAGCCTTGAGCCAGTTCTTACATGGTCCTCAGAC 52660188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2144 GTTCCCTGCAAACTCCATTTCATTCAGAGCCTTGAGCCAGTTCTTACATGGTCCTCAGAC 2203

 52660189 TTGAGCTAGTGCAAGAATACCCGGGAGGGGTTGTGGGAACAGATAGCTGGGCCCCACCCC 52660248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2204 TTGAGCTAGTGCAAGAATACCCGGGAGGGGTTGTGGGAACAGATAGCTGGGCCCCACCCC 2263

 52660249 CAGGGAAGGGGGTGTTTCTGACTCAGGAGGTCTGGGCTCCGGCTACAGAAACTGCACATC 52660308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2264 CAGGGAAGGGGGTGTTTCTGACTCAGGAGGTCTGGGCTCCGGCTACAGAAACTGCACATC 2323

 52660309 TAACCGGTACCCAGGTGATGTGATGCTGCTGGCCCAGGGACAACTCTGCGAGTCACTGCT 52660368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2324 TAACCGGTACCCAGGTGATGTGATGCTGCTGGCCCAGGGACAACTCTGCGAGTCACTGCT 2383

 52660369 ATTGGGCACTGCTATTGCACCCACACAAGGAGGCAGGCTCTGCTTACATTTTTCAGTTCT 52660428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2384 ATTGGGCACTGCTATTGCACCCACACAAGGAGGCAGGCTCTGCTTACATTTTTCAGTTCT 2443

 52660429 TGTTCCCAGAAACATTTGCTCTTTGGGGTATGCTTTGCATATAATGGATCCTACCCACTA 52660488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2444 TGTTCCCAGAAACATTTGCTCTTTGGGGTATGCTTTGCATATAATGGATCCTACCCACTA 2503

 52660489 ATACAGTATGCTGCTTTTATTGATAAACTTCCAGAAACTTGAAGCGCACCTTACCATTTC 52660548
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     2504 ATACAGTATGCTGCTTTTATTGATAAACTTCCAGATACTTGAAGCGCACCTTACCATTTC 2563

 52660549 TTTGATCTCGCTGATTATTTTTATTTTTGTTAAATGAAAATTGTTGGTAAGTTCTTTTTG 52660608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2564 TTTGATCTCGCTGATTATTTTTATTTTTGTTAAATGAAAATTGTTGGTAAGTTCTTTTTG 2623

 52660609 GTGTGGTAAAAGGATATGAAAAGCTGATTTTAAAAAAATGTCCACTCTAGGATTAGAATT 52660668
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2624 GTGTGGTAAAAGGATATGAAAAACTGATTTTAAAAAAATGTCCACTCTAGGATTAGAATT 2683

 52660669 GTAGGTGTGTTTATTCTATTTCAAGATCTGGTTAAAATGCACCTTGAGGAAAAGAATTGA 52660728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2684 GTAGGTGTGTTTATTCTATTTCAAGATCTGGTTAAAATGCACCTTGAGGAAAAGAATTGA 2743

 52660729 GTGCAGCTGTTGTTATTTCTCAATGCTGTTTCTCTTTTCATGTTTTTTTCATGTTGTCTC 52660788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2744 GTGCAGCTGTTGTTATTTCTCAATGCTGTTTCTCTTTTCATGTTTTTTTCATGTTGTCTC 2803

 52660789 TTGGTCTGTCCTATCTCTCTTGGTCTATCCTCCAAGACAGAGATGAGTGATCTTGAAACC 52660848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2804 TTGGTCTGTCCTATCTCTCTTGGTCTATCCTCCAAGACAGAGATGAGTGATCTTGAAACC 2863

 52660849 CTGCCCATGTTTTTATCTTTGGAGCCCAACTGTGCTGCCTTGTTTTCTTCTCCATCCAAA 52660908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2864 CTGCCCATGTTTTTATCTTTGGAGCCCAACTGTGCTGCCTTGTTTTCTTCTCCATCCAAA 2923

 52660909 GAGGCAAAGAGAAAGTTGCATATTACTCAACAGCAGTTGCATGACAGTTAAAATCAGACT 52660968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2924 GAGGCAAAGAGAAAGTTGCATATTACTCAACAGCAGTTGCATGACAGTTAAAATCAGACT 2983

 52660969 GTATGAGTCATGGAACAGTAAGTTGTGTCCAGAGTATCTGTCATGGTAAGTACAAAAAAG 52661028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2984 GTATGAGTCATGGAACAGTAAGTTGTGTCCAGAGTATCTGTCATGGTAAGTACAAAAAAG 3043

 52661029 TCCTTAAAAATTTAAAACAGAAATGCCAATGTTTTATTTTTGAAAAATGTGAAGAAGAAA 52661088
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     3044 TCCTTAAAAATTTAAAACAGAAATGCCAATGTTTTATTTCTGAAAAATGTGAAGAAGAAA 3103

 52661089 TTTTCCGGCCGGGCGCGGTGGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTG 52661148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3104 TTTTCCGGCCGGGCGCGGTGGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTG 3163

 52661149 GGCAGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACACAGTGCAACCCCATC 52661208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3164 GGCAGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACACAGTGCAACCCCATC 3223

 52661209 TCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGATGCGGTGGCACGCGCCTGTAATCTCAGCTACT 52661268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3224 TCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGATGCGGTGGCACGCGCCTGTAATCTCAGCTACT 3283

 52661269 AGGGAGGCTGAGGCATGACAATCGCTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAG 52661328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3284 AGGGAGGCTGAGGCATGACAATCGCTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAG 3343

 52661329 ATCATACCACTGCACTCCAGCTTGGGCAGCGGAAGGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAG 52661388
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     3344 ATCATACCACTGCACTCCAGCTTGGGCAGCGGAAGGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAA 3403

 52661389 AAAAAAAG--------AAATTTTCTAAGTGTATTCCAAATAACTTTTAATATTGGATAAA 52661440
          |||||||         ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     3404 AAAAAAA-AAAAAAAAAAATTTTCTAAGTGTATTCCGAATAACTTTTAATATTGGATAAA 3462

 52661441 CATTACGAGTTTAAAAATACTTATGCCAGAGGAGTGCTGTGACTCGTGCCTCTAATCCCA 52661500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3463 CATTACGAGTTTAAAAATACTTATGCCAGAGGAGTGCTGTGACTCGTGCCTCTAATCCCA 3522

 52661501 GCAATGTGGGAGGCCAAGGAGGGACAGTCACTTGAGCCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGG 52661560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3523 GCAATGTGGGAGGCCAAGGAGGGACAGTCACTTGAGCCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGG 3582

 52661561 ATAACAAAGGGAGACCTCATCTTTACAAAAAAACTAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGTG 52661620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3583 ATAACAAAGGGAGACCTCATCTTTACAAAAAAACTAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGTG 3642

 52661621 TGTGCCTGTGATCCCAGCTACACAGGAGGCTGAGGCAAGAGGATTCCTTGAGCCCTGGAG 52661680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3643 TGTGCCTGTGATCCCAGCTACACAGGAGGCTGAGGCAAGAGGATTCCTTGAGCCCTGGAG 3702

 52661681 GTCAAGGCTGCAGTGAGTGATGATCATGCCATTGCACTCCAGCTGGGTGACAGAGCAAGA 52661740
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3703 GTCAAGGCTGCAGTGAGCGATGATCATGCCATTGCACTCCAGCTGGGTGACAGAGCAAGA 3762

 52661741 CCTCATCTCAAAAAAAAAAAA-AAAACAAAACAAAACAAAAAACTTACGCCCAGGTAAAA 52661799
          ||||||||||||||.||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3763 CCTCATCTCAAAAACAAAA--CAAAACAAAACAAAACAAAAAACTTACGCCCAGGTAAAA 3820

 52661800 ATTGTCAGAGAAAAATAAGAAAAAAACTGAATGCCCAAAATTAGCATAATGGCTGAATGA 52661859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3821 ATTGTCAGAGAAAAATAAGAAAAAAACTGAATGCCCAAAATTAGCATAATGGCTGAATGA 3880

 52661860 ATTATAGTATGTCTATACCTTGAAGTACATTGTAGCTTTAAAAAAAATGAATTAAAGTTA 52661919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3881 ATTATAGTATGTCTATACCTTGAAGTACATTGTAGCTTTAAAAAAAATGAATTAAAGTTA 3940

 52661920 TACCAGTTGAATTTGGAGTTGAGATGGGGAAGATTATTACAATTAAAAAAAAACAAACAC 52661979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3941 TACCAGTTGAATTTGGAGTTGAGATGGGGAAGATTATTACAATTAAAAAAAAACAAACAC 4000

 52661980 TATTAATGGATGTGCTGGGAAATGTCTGTATGGGGCTAGTTAAAGTAAATTAAAATAAAG 52662039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4001 TATTAATGGATGTGCTGGGAAATGTCTGTATGGGGCTAGTTAAAGTAAATTAAAATAAAG 4060

 52662040 ACCAGACCTGAAGAATCCCTGAGCGGACAAAGCCTGTTAGACCACATAAATGAGCTAAAC 52662099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4061 ACCAGACCTGAAGAATCCCTGAGCGGACAAAGCCTGTTAGACCACATAAATGAGCTAAAC 4120

 52662100 CTTGCTTGATTTGCAGACATAAGCAAAACAACTCGAACTGTTTCTTGTAAATGCCTATGC 52662159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4121 CTTGCTTGATTTGCAGACATAAGCAAAACAACTCGAACTGTTTCTTGTAAATGCCTATGC 4180

 52662160 TAAAGAAAAACAGAACTTGAGCTCAACCAATCAGAAACAGTCAACAAACTTAAAATTATA 52662219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4181 TAAAGAAAAACAGAACTTGAGCTCAACCAATCAGAAACAGTCAACAAACTTAAAATTATA 4240

 52662220 TAACTGGGTACCTTCCAATGAGATGATCAAATAAGGCAACTGTGTAATTGTAACACATCA 52662279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4241 TAACTGGGTACCTTCCAATGAGATGATCAAATAAGGCAACTGTGTAATTGTAACACATCA 4300

 52662280 AACACATTTTATATTATGCCTCTGCATTTTCCCTTAATTCTGGCATGTAATGCTTTGTCA 52662339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4301 AACACATTTTATATTATGCCTCTGCATTTTCCCTTAATTCTGGCATGTAATGCTTTGTCA 4360

 52662340 TCAAAACACTAATTCCCTTTTGGTTTTCTTTTCTCAAATTAATGAATTGCCTCTATTCAG 52662399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4361 TCAAAACACTAATTCCCTTTTGGTTTTCTTTTCTCAAATTAATGAATTGCCTCTATTCAG 4420

 52662400 ATACACTCTTTGAAATTTTATTGTGTCTCAGATTTGTCTTTTACAAAGTATAGAACAAAG 52662459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4421 ATACACTCTTTGAAATTTTATTGTGTCTCAGATTTGTCTTTTACAAAGTATAGAACAAAG 4480

 52662460 AGAAAAATATGAAAGAAGAAATATTAGGTTGTTAGCTTGGGTGTCCTTGGAGGGGGTAGG 52662519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4481 AGAAAAATATGAAAGAAGAAATATTAGGTTGTTAGCTTGGGTGTCCTTGGAGGGGGTAGG 4540

 52662520 GAAGATGTGAGATGA 52662534
          |||||||||||||||
     4541 GAAGATGTGAGATGA 4555

Alignment time is 5.00459 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [52637064,52668002] =>     30939 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    2708] =>      2708 nucs 'mol-32-34a8-055775_2708'

Score:        2639
Aligned:      2708        nucs
Identic:      2696 (100%) nucs =>      2254 (100%)       442 ( 98%)
Gaps:            8 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [52644807,52647064] EXCISED REGION [52658003,52658444]
 second seq =>  [       1,    2258] EXCISED REGION [    2259,    2708]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>     10938 nucs [52647065,52658002]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         6 nucs [52647065,52647070] to [52658003,52658008]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [52647065,52647067] to [52658000,52658002]
 second seq =>         0 nucs

 52644807 AGAGGGGTCAACAGCTTGCCACCTTGCCTAGGCCCAGGGTGACTGCATATGTGCAGTGGT 52644866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGAGGGGTCAACAGCTTGCCACCTTGCCTAGGCCCAGGGTGACTGCATATGTGCAGTGGT 60

 52644867 CTTATCCCATTAGCGCCCCCGAGCATGCATTCAGAACCAAGTGGATACACCTTGGCACAC 52644926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTTATCCCATTAGCGCCCCCGAGCATGCATTCAGAACCAAGTGGATACACCTTGGCACAC 120

 52644927 TTACCTTCCCTGCAGGGACATCATCGGACTGCCCTGATAAGCCAGGAACCTCATCCACCT 52644986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTACCTTCCCTGCAGGGACATCATCGGACTGCCCTGATAAGCCAGGAACCTCATCCACCT 180

 52644987 TGTCTTGATGCTCTGCCCTCTTGGCTTCCTGTTGGCTGTCACCTGGCACCTTTTCCTGTC 52645046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGTCTTGATGCTCTGCCCTCTTGGCTTCCTGTTGGCTGTCACCTGGCACCTTTTCCTGTC 240

 52645047 CCTTGTCCAGCTTGAAGAATTTGTCAAAAAAGCTGGAGTCCTTGGGCTTGGAGGGAGCTT 52645106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCTTGTCCAGCTTGAAGAATTTGTCAAAAAAGCTGGAGTCCTTGGGCTTGGAGGGAGCTT 300

 52645107 CTCCTCCTGCTCCCCCTGTCTCAGGTGGGAGAAGCGTGGGATCCCTGGCGGCAGAGAGGA 52645166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTCCTCCTGCTCCCCCTGTCTCAGGTGGGAGAAGCGTGGGATCCCTGGCGGCAGAGAGGA 360

 52645167 CCTTGTCTTGGGCCGGGGCGTGCCCTGGGGTTTTATCTGTGTCCTGCCCCGGTCCAGCTG 52645226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CCTTGTCTTGGGCCGGGGCGTGCCCTGGGGTTTTATCTGTGTCCTGCCCCGGTCCAGCTG 420

 52645227 CCACCGGAAGTGTCCAGCTCTCACTTGGGTCTTTGTTCGCTGGAGCTTTATTGGAGCTGA 52645286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCACCGGAAGTGTCCAGCTCTCACTTGGGTCTTTGTTCGCTGGAGCTTTATTGGAGCTGA 480

 52645287 CATCAAGCTTCACTGATCCAAGGGATGAATCTGCGGCTTGGTCTCCGGTACGTCCTGGTA 52645346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CATCAAGCTTCACTGATCCAAGGGATGAATCTGCGGCTTGGTCTCCGGTACGTCCTGGTA 540

 52645347 CAGGCCGAGAGAGCATCAAGAAAAAACGAGATTTAGCAGCTGGTGCCTCGGGTTTGGCCT 52645406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CAGGCCGAGAGAGCATCAAGAAAAAACGAGATTTAGCAGCTGGTGCCTCGGGTTTGGCCT 600

 52645407 CTTTCCCAAGATTCTTTCCGTTGGCATCCGCAACAGCACTTATCTCCGTTGTCTCGGGGG 52645466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTTTCCCAAGATTCTTTCCGTTGGCATCCGCAACAGCACTTATCTCCGTTGTCTCGGGGG 660

 52645467 AAGAAGTGGCCACATTATCCGTCTTGACACTTATTCCCAAGTCGACTGTAAACACAAACA 52645526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAGAAGTGGCCACATTATCCGTCTTGACACTTATTCCCAAGTCGACTGTAAACACAAACA 720

 52645527 TAAACAGTGGTTATTCAGCCAAGCCGGGAAATTCAGGCACTAATAATGGACTCCAGACAT 52645586
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TAAACAGCGGTTATTCAGCCAAGCCGGGAAATTCAGGCACTAATAATGGACTCCAGACAT 780

 52645587 TTTTTATACAAAAGCCATACTGCATACTGGAACTGTGTTGTTCTCTGGTCATTCTGAAAG 52645646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTTTTATACAAAAGCCATACTGCATACTGGAACTGTGTTGTTCTCTGGTCATTCTGAAAG 840

 52645647 GCAGAAGTTAGCTCTCTACATCTCCTTGGACCCTGCTTTTCTTGGGAGAGGAGAAGGCAA 52645706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GCAGAAGTTAGCTCTCTACATCTCCTTGGACCCTGCTTTTCTTGGGAGAGGAGAAGGCAA 900

 52645707 GGTTGGTGAGGAGGGAAAGCTACTTAATGGAAAGTCACTAGCTGCCAGGTGTGGAATGAG 52645766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GGTTGGTGAGGAGGGAAAGCTACTTAATGGAAAGTCACTAGCTGCCAGGTGTGGAATGAG 960

 52645767 TGATATTCAATGTTAATTAATCTTCTTTTATCTGTGTAAGAACTCCGTGAGCAGCATATT 52645826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGATATTCAATGTTAATTAATCTTCTTTTATCTGTGTAAGAACTCCGTGAGCAGCATATT 1020

 52645827 GTCATGATGTCAACTGGGAGGCAGTACAGCAGTTAGGAGCTTGGGTTCTGGAGCTAGAAC 52645886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GTCATGATGTCAACTGGGAGGCAGTACAGCAGTTAGGAGCTTGGGTTCTGGAGCTAGAAC 1080

 52645887 AAGGTTTCTCAACCTCAGCACTACTCACATTTGAAGCCAGATTATTCTTTGTTAGGGAGG 52645946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAGGTTTCTCAACCTCAGCACTACTCACATTTGAAGCCAGATTATTCTTTGTTAGGGAGG 1140

 52645947 CTCATCCCGTGCCTCATAGGCTGATTAGCAGCATCCTGGCCTCTGCCCACTAGACGCCGG 52646006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTCATCCCGTGCCTCATAGGCTGATTAGCAGCATCCTGGCCTCTGCCCACTAGACGCCGG 1200

 52646007 TCACATTTCCCAGTCATGGCAACCAAAAATATCTCTAGGCATTGCTAAATGTCCCCTGGA 52646066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TCACATTTCCCAGTCATGGCAACCAAAAATATCTCTAGGCATTGCTAAATGTCCCCTGGA 1260

 52646067 GGACAAAATCTCTTACGTTTGAGAGGCACTGAGCTGAAATGTCTTTTTGAATCCAGATTA 52646126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GGACAAAATCTCTTACGTTTGAGAGGCACTGAGCTGAAATGTCTTTTTGAATCCAGATTA 1320

 52646127 TCTAATTTTCTGTGCCTCAACTTTCTGGTAAAAGGAGACAGATAATAAATCTCGTAATTT 52646186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TCTAATTTTCTGTGCCTCAACTTTCTGGTAAAAGGAGACAGATAATAAATCTCGTAATTT 1380

 52646187 TGTTAGGAAGATTACATGAGTTAATAGTTTTAAAGCAAGTACAATAGCACCTGGAATATA 52646246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     1381 TGTTAGGAAGATTACATGAGTTAATAGTTTTAAAGCAAGTACAATAGCGCCTGGAATATA 1440

 52646247 TTAAGTGCTTAATAAATATCACAAACATTAGTTATCATTATTCATGAGTGAGAAAACTGA 52646306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTAAGTGCTTAATAAATATCACAAACATTAGTTATCATTATTCATGAGTGAGAAAACTGA 1500

 52646307 CAGTCAGAGAGGTCAGTACACCCTCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCTAGTAAGCAGCAGAGT 52646366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CAGTCAGAGAGGTCAGTACACCCTCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCTAGTAAGCAGCAGAGT 1560

 52646367 CTGGCTTCAGGCAGAAATCTGACTTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGTCTTACCAGGGACTT 52646426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CTGGCTTCAGGCAGAAATCTGACTTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGTCTTACCAGGGACTT 1620

 52646427 GTATTAGCATAGACTGTTAAGAATATGGGAAGATTTTTAAAATACAGTACTCAGAAAATT 52646486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GTATTAGCATAGACTGTTAAGAATATGGGAAGATTTTTAAAATACAGTACTCAGAAAATT 1680

 52646487 TCTCTTTGAAAGGCTGGAAGAGCAGATATCCACACAAGAAGGCAAATTAGACCTCAGGCC 52646546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TCTCTTTGAAAGGCTGGAAGAGCAGATATCCACACAAGAAGGCAAATTAGACCTCAGGCC 1740

 52646547 AGTGTGGAATTAAAGGTGTAGGGTTATCTGGTCAAGACTGTGTGTGTGGATACAGGCTCC 52646606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AGTGTGGAATTAAAGGTGTAGGGTTATCTGGTCAAGACTGTGTGTGTGGATACAGGCTCC 1800

 52646607 AACCCCTCCAGGCAAGGGCACTGTTTCCAACATCCACCCTTTCTCCTTTGACCTCTACCT 52646666
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AACCCCTCCAGGCAAGGGCAATGTTTCCAACATCCACCCTTTCTCCTTTGACCTCTACCT 1860

 52646667 TGACCTAAATTAACTATAAAAGGTCCTTCTTTTCTAGGACCCTACTATAAATCAGTGAAA 52646726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TGACCTAAATTAACTATAAAAGGTCCTTCTTTTCTAGGACCCTACTATAAATCAGTGAAA 1920

 52646727 TATTCAGGAAAAAAAGAACACCAAGAATGTTGGGATCCCAGTTAAAGATCAAGATTCTCT 52646786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TATTCAGGAAAAAAAGAACACCAAGAATGTTGGGATCCCAGTTAAAGATCAAGATTCTCT 1980

 52646787 ACTGATAAGCTGTGTGATATGGAGTAAATCACTAAAGATCTTTGAATCTCTTCATTTGTA 52646846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ACTGATAAGCTGTGTGATATGGAGTAAATCACTAAAGATCTTTGAATCTCTTCATTTGTA 2040

 52646847 AAATGGGAATATTGGTAGTCCTACTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTAAAGAAGAAAAGTCA 52646906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AAATGGGAATATTGGTAGTCCTACTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTAAAGAAGAAAAGTCA 2100

 52646907 TGCAAAGGATCTGGCACAACGCCTTTTCCATAATAAGTGCTTAGTAATTGACAGATACTG 52646966
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TGCAAAGGATCTGGCACAATGCCTTTTCCATAATAAGTGCTTAGTAATTGACAGATACTG 2160

 52646967 TGATAACTTTTCAGGTTTCTCTCATGCCTTTGACAACATTGCATTTTGCTTGCTCTATCT 52647026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TGATAACTTTTCAGGTTTCTCTCATGCCTTTGACAACATTGCATTTTGCTTGCTCTATCT 2220

 52647027 GTAGTCAGACACTTCTTAATATCTGTTTGCAGGAAGAC 52647064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GTAGTCAGACACTTCTTAATATCTGTTTGCAGGAAGAC 2258

EXCISED REGION

 52658003 AGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTG 52658062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2259 AGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTG 2318

 52658063 GCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTAT 52658122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2319 GCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTAT 2378

 52658123 AAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGG 52658182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2379 AAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGG 2438

 52658183 GAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTG 52658242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2439 GAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTG 2498

 52658243 AAACACTGTCTCTGCTAAAAAACAAAACAAAACAAAACACCAAAAAATAGCTGGGCGTAG 52658302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2499 AAACACTGTCTCTGCTAAAAAACAAAACAAAACAAAACACCAAAAAATAGCTGGGCGTAG 2558

 52658303 TGGCGGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTTGGGAGGCGGTGGCAGGAGAATCATTTGAACCT 52658362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2559 TGGCGGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTTGGGAGGCGGTGGCAGGAGAATCATTTGAACCT 2618

 52658363 GGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGAT--------TGTGCCACTGCACTCTAACCTGG 52658414
          |||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||
     2619 GGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACTGTGCCACTGCACTCTAACCTGG 2678

 52658415 GCAACAGAGTTCAGAGTGAGACTCTGTCTC 52658444
          ||||||||||||||||||||||||||||||
     2679 GCAACAGAGTTCAGAGTGAGACTCTGTCTC 2708

Alignment time is 3.01676 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [52637064,52668002] =>     30939 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    8372] =>      8372 nucs 'mol-32-34b3-170089_8372'

Score:        8371
Aligned:      8371        nucs
Identic:      8371 (100%) nucs =>      2694 (100%)      5677 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [52641309,52644002] EXCISED REGION [52644004,52649680]
 second seq =>  [       1,    2694] EXCISED REGION [    2696,    8372]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [52644003,52644003]
 second seq =>         1 nucs [2695,2695]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 52641309 CAGACCTACTAGGACAAAGATAGAGACCTATAGGATTTGGCAGCCAGGGTGATGGTAGGG 52641368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CAGACCTACTAGGACAAAGATAGAGACCTATAGGATTTGGCAGCCAGGGTGATGGTAGGG 60

 52641369 AATTTGAAACATCATGGTGGCTGTGACAAGAGCCTGAATGGAGTGTGTTCAAGAGAGAAA 52641428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AATTTGAAACATCATGGTGGCTGTGACAAGAGCCTGAATGGAGTGTGTTCAAGAGAGAAA 120

 52641429 AGAAGAGAAGTGAAAACACAGAATATTGTTCTTATTATTAGTAGCCTGAGCCAATCTGAG 52641488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGAAGAGAAGTGAAAACACAGAATATTGTTCTTATTATTAGTAGCCTGAGCCAATCTGAG 180

 52641489 GACCGATGCACTTATCACAATGTCTCTTAAAATACTATGTCTCTTACTAGATTATACACT 52641548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GACCGATGCACTTATCACAATGTCTCTTAAAATACTATGTCTCTTACTAGATTATACACT 240

 52641549 CCTTGACAGACGAGAAACATGATTTATTTTTCAAATGCCTTGCACAAGGTTAGTGCGAAA 52641608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCTTGACAGACGAGAAACATGATTTATTTTTCAAATGCCTTGCACAAGGTTAGTGCGAAA 300

 52641609 GTAACGATTGCAGGATTTAATTACACTTTTAAAAGAAAAAAGACATTCTTCATCTTATGA 52641668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTAACGATTGCAGGATTTAATTACACTTTTAAAAGAAAAAAGACATTCTTCATCTTATGA 360

 52641669 AACTCTGCATGGCAACACTTTATGCGCCCCACACCCCCACTCAACACAAACACAACTCTG 52641728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AACTCTGCATGGCAACACTTTATGCGCCCCACACCCCCACTCAACACAAACACAACTCTG 420

 52641729 GAAGTACTGTGTTGATAACAGAAATGTGGTGGGTTTTATTTTTAACCAATAAAGGTCAAG 52641788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GAAGTACTGTGTTGATAACAGAAATGTGGTGGGTTTTATTTTTAACCAATAAAGGTCAAG 480

 52641789 TTTGCATTATGTGATTTTGTGTGTGTGTGTGTTGAATCTTTTAAATGCATATCTTACAGC 52641848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTGCATTATGTGATTTTGTGTGTGTGTGTGTTGAATCTTTTAAATGCATATCTTACAGC 540

 52641849 TCTGGTTCAGTTGTTGTGGGGAGAGGAAAAAAACCTCATCCCTGCCAACACATTGGTTTG 52641908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCTGGTTCAGTTGTTGTGGGGAGAGGAAAAAAACCTCATCCCTGCCAACACATTGGTTTG 600

 52641909 TATGAATCACAGCTCAGTGAAACCTTTCAGGCATATAATTTATCTTTTCTTTGGCCTATG 52641968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TATGAATCACAGCTCAGTGAAACCTTTCAGGCATATAATTTATCTTTTCTTTGGCCTATG 660

 52641969 TAGTAAACGCTTCATTTGTTCATGAATTCTTGCCTTGTTTTAATTATGCTTTGCCCTGAA 52642028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TAGTAAACGCTTCATTTGTTCATGAATTCTTGCCTTGTTTTAATTATGCTTTGCCCTGAA 720

 52642029 TGTAGTTTTATAAGGCACAAAAATAAGATTGTCGTTCTGAAAACACAGAAGATTTGTATG 52642088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGTAGTTTTATAAGGCACAAAAATAAGATTGTCGTTCTGAAAACACAGAAGATTTGTATG 780

 52642089 TTTCCCCCAGGATGAAATGGTGGCATCTTTCTCCCAATTCACAGCTCTGTGGGCTTGTGG 52642148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTTCCCCCAGGATGAAATGGTGGCATCTTTCTCCCAATTCACAGCTCTGTGGGCTTGTGG 840

 52642149 CTGGAATTCCAATCCAGCAGGGAGCAAGCCATAAAAATGGGGGGAAGGGCTGCTGGAGGG 52642208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTGGAATTCCAATCCAGCAGGGAGCAAGCCATAAAAATGGGGGGAAGGGCTGCTGGAGGG 900

 52642209 AGGCAGTAGATGCGGCTGAGCCCAAGGCATAATTCACCCTAAGAATTCTGAATCAATACA 52642268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGGCAGTAGATGCGGCTGAGCCCAAGGCATAATTCACCCTAAGAATTCTGAATCAATACA 960

 52642269 CTGACATCCAGCCATGTACAATGTGGTACTCCCACCAAGAAAGCCACTGATTGAGAAGTT 52642328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTGACATCCAGCCATGTACAATGTGGTACTCCCACCAAGAAAGCCACTGATTGAGAAGTT 1020

 52642329 TTATTCATGTTACTTTCTGAGGGTTGGATTGTCCCATTACATTTATAGAACAATTGCTTT 52642388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTATTCATGTTACTTTCTGAGGGTTGGATTGTCCCATTACATTTATAGAACAATTGCTTT 1080

 52642389 TTTCCCCCTAAATACAGAACTATGCAGCCGGGAGTCAGAAAAGAAACCTTGACAATCAGA 52642448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTTCCCCCTAAATACAGAACTATGCAGCCGGGAGTCAGAAAAGAAACCTTGACAATCAGA 1140

 52642449 AGGCTGTTTTGTTGTTGTTGTTAAAAACCTTTGCAGGCATATGCATCTGAATATCCATAA 52642508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGGCTGTTTTGTTGTTGTTGTTAAAAACCTTTGCAGGCATATGCATCTGAATATCCATAA 1200

 52642509 GTTCACAGGCTGAGGGAGAAATGGCTATTTCATAACTTTTCTGTGTTTCTCATGTACATA 52642568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GTTCACAGGCTGAGGGAGAAATGGCTATTTCATAACTTTTCTGTGTTTCTCATGTACATA 1260

 52642569 GTACAAAGTGGGCACTCAGTATTTCAAATTTCAATATCACTGAAAAAAATGGAAATTTGT 52642628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GTACAAAGTGGGCACTCAGTATTTCAAATTTCAATATCACTGAAAAAAATGGAAATTTGT 1320

 52642629 CATGTAACAAAATCAGATGCAGACTTCACTGGTGAATCTGAGGGAGTGAATTCACTTATT 52642688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CATGTAACAAAATCAGATGCAGACTTCACTGGTGAATCTGAGGGAGTGAATTCACTTATT 1380

 52642689 CAGAAAGGAAGACAGTTACAATTCTTGGGTCTTCTGAGAGATCATTATAACTTGAAAATA 52642748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CAGAAAGGAAGACAGTTACAATTCTTGGGTCTTCTGAGAGATCATTATAACTTGAAAATA 1440

 52642749 TTACACAAGGGCTTTGCTATATTAGATACCTGCCATGTTCCTAACACAAGCTCCCATTTT 52642808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTACACAAGGGCTTTGCTATATTAGATACCTGCCATGTTCCTAACACAAGCTCCCATTTT 1500

 52642809 CTGACTCAAATCTCATTTTGGAACACATTCCACTCAAATTGAGGTTCTACCCCTAAGAGT 52642868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CTGACTCAAATCTCATTTTGGAACACATTCCACTCAAATTGAGGTTCTACCCCTAAGAGT 1560

 52642869 TCTTTTTCAATAAAGAAAGCTGAGTTAATAAATCACAACTCCAAAACTTTTCCTCACTTT 52642928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TCTTTTTCAATAAAGAAAGCTGAGTTAATAAATCACAACTCCAAAACTTTTCCTCACTTT 1620

 52642929 TCTTAGACTAGAAATAGATTGAGTGTGTCGAGGTTTTATGGCTGAGTACATTGGAGGGCT 52642988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TCTTAGACTAGAAATAGATTGAGTGTGTCGAGGTTTTATGGCTGAGTACATTGGAGGGCT 1680

 52642989 GGCTATTCTATGCTGAACTGGTTTACTTGATTAAGATGGGGATTTGGATGAGTCACCGGA 52643048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GGCTATTCTATGCTGAACTGGTTTACTTGATTAAGATGGGGATTTGGATGAGTCACCGGA 1740

 52643049 CACCTGTCCAAAGATGAGTAAAACACATTCCTTCATTGTCTTCCCATAAATAACTCAATC 52643108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CACCTGTCCAAAGATGAGTAAAACACATTCCTTCATTGTCTTCCCATAAATAACTCAATC 1800

 52643109 TTCTCCTAACTGAGCCAATGGATAGGCTTTGGATGCCCAAGCAAAACAAACACATGACTG 52643168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTCTCCTAACTGAGCCAATGGATAGGCTTTGGATGCCCAAGCAAAACAAACACATGACTG 1860

 52643169 TTAAAAAATCACAACCTCAAAATGGCCTTAGAAGCCTATGACCAATAATGAGAATGGTTT 52643228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTAAAAAATCACAACCTCAAAATGGCCTTAGAAGCCTATGACCAATAATGAGAATGGTTT 1920

 52643229 CTCCACTCAGGCGCAAGTAGTAAACAGTTTCTCCCATATGCAGGAATATTGACGACTAGT 52643288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CTCCACTCAGGCGCAAGTAGTAAACAGTTTCTCCCATATGCAGGAATATTGACGACTAGT 1980

 52643289 TTACCGCCTCTGGGCACGTAACTTTCAGGTCCTGGTTCATGCATTTGCTGGAATGTTCCC 52643348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TTACCGCCTCTGGGCACGTAACTTTCAGGTCCTGGTTCATGCATTTGCTGGAATGTTCCC 2040

 52643349 TGGGCCATGGAGCCCAGTTCTCCTGGCATCTGGCATCTCCCCCACACTCTGCTCCCCCAG 52643408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TGGGCCATGGAGCCCAGTTCTCCTGGCATCTGGCATCTCCCCCACACTCTGCTCCCCCAG 2100

 52643409 CACAGCACTTGGCATCTTGCATTGCAATTGCAGGTTTATTTATTCACTTCTCTCACTGGA 52643468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CACAGCACTTGGCATCTTGCATTGCAATTGCAGGTTTATTTATTCACTTCTCTCACTGGA 2160

 52643469 CAGCAAACTCCACCAGGGCCGAGACTCTGTGTCTCGCCCTTCACTGTGGTCCCTGTGCCT 52643528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CAGCAAACTCCACCAGGGCCGAGACTCTGTGTCTCGCCCTTCACTGTGGTCCCTGTGCCT 2220

 52643529 CACCTGTTCCTAGTACAGTGTCACACTCAGTAAAGAGCAGATGCCTGGTGCATTTGGAGA 52643588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CACCTGTTCCTAGTACAGTGTCACACTCAGTAAAGAGCAGATGCCTGGTGCATTTGGAGA 2280

 52643589 CTTATTTTAAATTATACGGAAAGTTATTCAACCGGCTTCTTGAACTGGTGAATTTTGGAA 52643648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CTTATTTTAAATTATACGGAAAGTTATTCAACCGGCTTCTTGAACTGGTGAATTTTGGAA 2340

 52643649 AGTGGGTGTTTGAAGGGAAAATGTTTAAACTCTGAAAGAAATGTTGGAAATAAGCTCTTT 52643708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AGTGGGTGTTTGAAGGGAAAATGTTTAAACTCTGAAAGAAATGTTGGAAATAAGCTCTTT 2400

 52643709 GAATCAAAATGTATAGAAAACACAAGAATGCTGACAGTAAGAGCCTAAAACACATGATGA 52643768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GAATCAAAATGTATAGAAAACACAAGAATGCTGACAGTAAGAGCCTAAAACACATGATGA 2460

 52643769 CTATTATCTTTTCCCAATTTTAACTCTCCAGAGTGTTCAGCGGTGCCCAGCCTTCATAAT 52643828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CTATTATCTTTTCCCAATTTTAACTCTCCAGAGTGTTCAGCGGTGCCCAGCCTTCATAAT 2520

 52643829 GTAATTCTTCGTAGCACCCTGGATGCATTAAAACCATAGATTAACGTGATACTTATTTTC 52643888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GTAATTCTTCGTAGCACCCTGGATGCATTAAAACCATAGATTAACGTGATACTTATTTTC 2580

 52643889 ATTAAGGAAAATAATTTACGTACAGTGCTCAGAGTAGAGCCTGGCACATTGAACATTTTC 52643948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 ATTAAGGAAAATAATTTACGTACAGTGCTCAGAGTAGAGCCTGGCACATTGAACATTTTC 2640

 52643949 AATAAATGACAGCAAGTGTAATTATTAGCACTTCGGAAGTGCAAAGTTGCATTG 52644002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 AATAAATGACAGCAAGTGTAATTATTAGCACTTCGGAAGTGCAAAGTTGCATTG 2694

EXCISED REGION

 52644004 ATTAAGACAAATATATTTGGAGCTCATCCAATTTTTTCCTGGCTCTGAAGTCTGCTAGTG 52644063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2696 ATTAAGACAAATATATTTGGAGCTCATCCAATTTTTTCCTGGCTCTGAAGTCTGCTAGTG 2755

 52644064 GCACTTAACTTTATTCCCAAGTTTTGAAAAATATTGTTATTTAAAAAGTCTGTTAACCAA 52644123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2756 GCACTTAACTTTATTCCCAAGTTTTGAAAAATATTGTTATTTAAAAAGTCTGTTAACCAA 2815

 52644124 GGAAATGCATGCCCTAAACCTATAATGTATCAAGTTTTACTTCCTTCTTCTTTTAAGGAG 52644183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2816 GGAAATGCATGCCCTAAACCTATAATGTATCAAGTTTTACTTCCTTCTTCTTTTAAGGAG 2875

 52644184 TTCTTTTCCTGCCTTGAATACAAACAGGCTCTCTCAAGGTTAAAAGCAAATGCTCTTTTT 52644243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2876 TTCTTTTCCTGCCTTGAATACAAACAGGCTCTCTCAAGGTTAAAAGCAAATGCTCTTTTT 2935

 52644244 AGTGTCAAAAAGAGCTTGCCTTTCTTCGCTCAGGAAAAAAAGCAACTGATTCCAGGATAC 52644303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2936 AGTGTCAAAAAGAGCTTGCCTTTCTTCGCTCAGGAAAAAAAGCAACTGATTCCAGGATAC 2995

 52644304 CTTCTTTGAAAACCAACACAAAAAAACCCCCCAAAAAACAAAAAAAAAACCCAAAACCCC 52644363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2996 CTTCTTTGAAAACCAACACAAAAAAACCCCCCAAAAAACAAAAAAAAAACCCAAAACCCC 3055

 52644364 TAGTTTTTACAAAGGTTTATTACTCCTACTTGTTGGAAAAGAATTACTACATAAAAGAGT 52644423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3056 TAGTTTTTACAAAGGTTTATTACTCCTACTTGTTGGAAAAGAATTACTACATAAAAGAGT 3115

 52644424 CTGCCCAGAGCTGTAAAATCTCCTTATTCAAACACACACCTTAGAGCAAAAGATGGTTAA 52644483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3116 CTGCCCAGAGCTGTAAAATCTCCTTATTCAAACACACACCTTAGAGCAAAAGATGGTTAA 3175

 52644484 ATATCAATTCAGGCTATTAACAGTAAGGGACGAAATGTGTTCCAACAAAACTCTGCATGT 52644543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3176 ATATCAATTCAGGCTATTAACAGTAAGGGACGAAATGTGTTCCAACAAAACTCTGCATGT 3235

 52644544 CAACAAACTACAGAGACTAGGTAACATCTTTTAGGAATCATTTTTATTCCACTAATGCCT 52644603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3236 CAACAAACTACAGAGACTAGGTAACATCTTTTAGGAATCATTTTTATTCCACTAATGCCT 3295

 52644604 TTTCCTCCAGAATCCACTGATCGTAAACGCAACCTGTCTACTTCCGCCTTTGAAAAATGG 52644663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3296 TTTCCTCCAGAATCCACTGATCGTAAACGCAACCTGTCTACTTCCGCCTTTGAAAAATGG 3355

 52644664 ATGGACAAATTCATCTGCATGTAACTCACCTCCTCTTTTCTTTTACATAAAACAGATGCC 52644723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3356 ATGGACAAATTCATCTGCATGTAACTCACCTCCTCTTTTCTTTTACATAAAACAGATGCC 3415

 52644724 ACAGCTGTTATTGTTCTTCACACAGAAGTTTCTACCCAGAGAAACATCAGGATGACACTC 52644783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3416 ACAGCTGTTATTGTTCTTCACACAGAAGTTTCTACCCAGAGAAACATCAGGATGACACTC 3475

 52644784 TGCTGCAATGTGCTATTTGTTCTAGAGGGGTCAACAGCTTGCCACCTTGCCTAGGCCCAG 52644843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3476 TGCTGCAATGTGCTATTTGTTCTAGAGGGGTCAACAGCTTGCCACCTTGCCTAGGCCCAG 3535

 52644844 GGTGACTGCATATGTGCAGTGGTCTTATCCCATTAGCGCCCCCGAGCATGCATTCAGAAC 52644903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3536 GGTGACTGCATATGTGCAGTGGTCTTATCCCATTAGCGCCCCCGAGCATGCATTCAGAAC 3595

 52644904 CAAGTGGATACACCTTGGCACACTTACCTTCCCTGCAGGGACATCATCGGACTGCCCTGA 52644963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3596 CAAGTGGATACACCTTGGCACACTTACCTTCCCTGCAGGGACATCATCGGACTGCCCTGA 3655

 52644964 TAAGCCAGGAACCTCATCCACCTTGTCTTGATGCTCTGCCCTCTTGGCTTCCTGTTGGCT 52645023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3656 TAAGCCAGGAACCTCATCCACCTTGTCTTGATGCTCTGCCCTCTTGGCTTCCTGTTGGCT 3715

 52645024 GTCACCTGGCACCTTTTCCTGTCCCTTGTCCAGCTTGAAGAATTTGTCAAAAAAGCTGGA 52645083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3716 GTCACCTGGCACCTTTTCCTGTCCCTTGTCCAGCTTGAAGAATTTGTCAAAAAAGCTGGA 3775

 52645084 GTCCTTGGGCTTGGAGGGAGCTTCTCCTCCTGCTCCCCCTGTCTCAGGTGGGAGAAGCGT 52645143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3776 GTCCTTGGGCTTGGAGGGAGCTTCTCCTCCTGCTCCCCCTGTCTCAGGTGGGAGAAGCGT 3835

 52645144 GGGATCCCTGGCGGCAGAGAGGACCTTGTCTTGGGCCGGGGCGTGCCCTGGGGTTTTATC 52645203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3836 GGGATCCCTGGCGGCAGAGAGGACCTTGTCTTGGGCCGGGGCGTGCCCTGGGGTTTTATC 3895

 52645204 TGTGTCCTGCCCCGGTCCAGCTGCCACCGGAAGTGTCCAGCTCTCACTTGGGTCTTTGTT 52645263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3896 TGTGTCCTGCCCCGGTCCAGCTGCCACCGGAAGTGTCCAGCTCTCACTTGGGTCTTTGTT 3955

 52645264 CGCTGGAGCTTTATTGGAGCTGACATCAAGCTTCACTGATCCAAGGGATGAATCTGCGGC 52645323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3956 CGCTGGAGCTTTATTGGAGCTGACATCAAGCTTCACTGATCCAAGGGATGAATCTGCGGC 4015

 52645324 TTGGTCTCCGGTACGTCCTGGTACAGGCCGAGAGAGCATCAAGAAAAAACGAGATTTAGC 52645383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4016 TTGGTCTCCGGTACGTCCTGGTACAGGCCGAGAGAGCATCAAGAAAAAACGAGATTTAGC 4075

 52645384 AGCTGGTGCCTCGGGTTTGGCCTCTTTCCCAAGATTCTTTCCGTTGGCATCCGCAACAGC 52645443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4076 AGCTGGTGCCTCGGGTTTGGCCTCTTTCCCAAGATTCTTTCCGTTGGCATCCGCAACAGC 4135

 52645444 ACTTATCTCCGTTGTCTCGGGGGAAGAAGTGGCCACATTATCCGTCTTGACACTTATTCC 52645503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4136 ACTTATCTCCGTTGTCTCGGGGGAAGAAGTGGCCACATTATCCGTCTTGACACTTATTCC 4195

 52645504 CAAGTCGACTGTAAACACAAACATAAACAGTGGTTATTCAGCCAAGCCGGGAAATTCAGG 52645563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4196 CAAGTCGACTGTAAACACAAACATAAACAGTGGTTATTCAGCCAAGCCGGGAAATTCAGG 4255

 52645564 CACTAATAATGGACTCCAGACATTTTTTATACAAAAGCCATACTGCATACTGGAACTGTG 52645623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4256 CACTAATAATGGACTCCAGACATTTTTTATACAAAAGCCATACTGCATACTGGAACTGTG 4315

 52645624 TTGTTCTCTGGTCATTCTGAAAGGCAGAAGTTAGCTCTCTACATCTCCTTGGACCCTGCT 52645683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4316 TTGTTCTCTGGTCATTCTGAAAGGCAGAAGTTAGCTCTCTACATCTCCTTGGACCCTGCT 4375

 52645684 TTTCTTGGGAGAGGAGAAGGCAAGGTTGGTGAGGAGGGAAAGCTACTTAATGGAAAGTCA 52645743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4376 TTTCTTGGGAGAGGAGAAGGCAAGGTTGGTGAGGAGGGAAAGCTACTTAATGGAAAGTCA 4435

 52645744 CTAGCTGCCAGGTGTGGAATGAGTGATATTCAATGTTAATTAATCTTCTTTTATCTGTGT 52645803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4436 CTAGCTGCCAGGTGTGGAATGAGTGATATTCAATGTTAATTAATCTTCTTTTATCTGTGT 4495

 52645804 AAGAACTCCGTGAGCAGCATATTGTCATGATGTCAACTGGGAGGCAGTACAGCAGTTAGG 52645863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4496 AAGAACTCCGTGAGCAGCATATTGTCATGATGTCAACTGGGAGGCAGTACAGCAGTTAGG 4555

 52645864 AGCTTGGGTTCTGGAGCTAGAACAAGGTTTCTCAACCTCAGCACTACTCACATTTGAAGC 52645923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4556 AGCTTGGGTTCTGGAGCTAGAACAAGGTTTCTCAACCTCAGCACTACTCACATTTGAAGC 4615

 52645924 CAGATTATTCTTTGTTAGGGAGGCTCATCCCGTGCCTCATAGGCTGATTAGCAGCATCCT 52645983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4616 CAGATTATTCTTTGTTAGGGAGGCTCATCCCGTGCCTCATAGGCTGATTAGCAGCATCCT 4675

 52645984 GGCCTCTGCCCACTAGACGCCGGTCACATTTCCCAGTCATGGCAACCAAAAATATCTCTA 52646043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4676 GGCCTCTGCCCACTAGACGCCGGTCACATTTCCCAGTCATGGCAACCAAAAATATCTCTA 4735

 52646044 GGCATTGCTAAATGTCCCCTGGAGGACAAAATCTCTTACGTTTGAGAGGCACTGAGCTGA 52646103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4736 GGCATTGCTAAATGTCCCCTGGAGGACAAAATCTCTTACGTTTGAGAGGCACTGAGCTGA 4795

 52646104 AATGTCTTTTTGAATCCAGATTATCTAATTTTCTGTGCCTCAACTTTCTGGTAAAAGGAG 52646163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4796 AATGTCTTTTTGAATCCAGATTATCTAATTTTCTGTGCCTCAACTTTCTGGTAAAAGGAG 4855

 52646164 ACAGATAATAAATCTCGTAATTTTGTTAGGAAGATTACATGAGTTAATAGTTTTAAAGCA 52646223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4856 ACAGATAATAAATCTCGTAATTTTGTTAGGAAGATTACATGAGTTAATAGTTTTAAAGCA 4915

 52646224 AGTACAATAGCACCTGGAATATATTAAGTGCTTAATAAATATCACAAACATTAGTTATCA 52646283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4916 AGTACAATAGCACCTGGAATATATTAAGTGCTTAATAAATATCACAAACATTAGTTATCA 4975

 52646284 TTATTCATGAGTGAGAAAACTGACAGTCAGAGAGGTCAGTACACCCTCCCCTGGCTGCCC 52646343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4976 TTATTCATGAGTGAGAAAACTGACAGTCAGAGAGGTCAGTACACCCTCCCCTGGCTGCCC 5035

 52646344 AGTAAGCTAGTAAGCAGCAGAGTCTGGCTTCAGGCAGAAATCTGACTTCTAAGTTCATGC 52646403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5036 AGTAAGCTAGTAAGCAGCAGAGTCTGGCTTCAGGCAGAAATCTGACTTCTAAGTTCATGC 5095

 52646404 GCTCTCTGTCTTACCAGGGACTTGTATTAGCATAGACTGTTAAGAATATGGGAAGATTTT 52646463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5096 GCTCTCTGTCTTACCAGGGACTTGTATTAGCATAGACTGTTAAGAATATGGGAAGATTTT 5155

 52646464 TAAAATACAGTACTCAGAAAATTTCTCTTTGAAAGGCTGGAAGAGCAGATATCCACACAA 52646523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5156 TAAAATACAGTACTCAGAAAATTTCTCTTTGAAAGGCTGGAAGAGCAGATATCCACACAA 5215

 52646524 GAAGGCAAATTAGACCTCAGGCCAGTGTGGAATTAAAGGTGTAGGGTTATCTGGTCAAGA 52646583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5216 GAAGGCAAATTAGACCTCAGGCCAGTGTGGAATTAAAGGTGTAGGGTTATCTGGTCAAGA 5275

 52646584 CTGTGTGTGTGGATACAGGCTCCAACCCCTCCAGGCAAGGGCACTGTTTCCAACATCCAC 52646643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5276 CTGTGTGTGTGGATACAGGCTCCAACCCCTCCAGGCAAGGGCACTGTTTCCAACATCCAC 5335

 52646644 CCTTTCTCCTTTGACCTCTACCTTGACCTAAATTAACTATAAAAGGTCCTTCTTTTCTAG 52646703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5336 CCTTTCTCCTTTGACCTCTACCTTGACCTAAATTAACTATAAAAGGTCCTTCTTTTCTAG 5395

 52646704 GACCCTACTATAAATCAGTGAAATATTCAGGAAAAAAAGAACACCAAGAATGTTGGGATC 52646763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5396 GACCCTACTATAAATCAGTGAAATATTCAGGAAAAAAAGAACACCAAGAATGTTGGGATC 5455

 52646764 CCAGTTAAAGATCAAGATTCTCTACTGATAAGCTGTGTGATATGGAGTAAATCACTAAAG 52646823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5456 CCAGTTAAAGATCAAGATTCTCTACTGATAAGCTGTGTGATATGGAGTAAATCACTAAAG 5515

 52646824 ATCTTTGAATCTCTTCATTTGTAAAATGGGAATATTGGTAGTCCTACTGCAGGGTTGTTG 52646883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5516 ATCTTTGAATCTCTTCATTTGTAAAATGGGAATATTGGTAGTCCTACTGCAGGGTTGTTG 5575

 52646884 TAATGCTTAAAGAAGAAAAGTCATGCAAAGGATCTGGCACAACGCCTTTTCCATAATAAG 52646943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5576 TAATGCTTAAAGAAGAAAAGTCATGCAAAGGATCTGGCACAACGCCTTTTCCATAATAAG 5635

 52646944 TGCTTAGTAATTGACAGATACTGTGATAACTTTTCAGGTTTCTCTCATGCCTTTGACAAC 52647003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5636 TGCTTAGTAATTGACAGATACTGTGATAACTTTTCAGGTTTCTCTCATGCCTTTGACAAC 5695

 52647004 ATTGCATTTTGCTTGCTCTATCTGTAGTCAGACACTTCTTAATATCTGTTTGCAGGAAGA 52647063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5696 ATTGCATTTTGCTTGCTCTATCTGTAGTCAGACACTTCTTAATATCTGTTTGCAGGAAGA 5755

 52647064 CAGAAAAATAAAGGGAAGAATTGAGATTTCTTTGATCTATTCATACTGCTCATTAATATG 52647123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5756 CAGAAAAATAAAGGGAAGAATTGAGATTTCTTTGATCTATTCATACTGCTCATTAATATG 5815

 52647124 TAGTGAGAAATACATACACACACACATACACACACATGCATCCATTAGCAATTGTTTTTG 52647183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5816 TAGTGAGAAATACATACACACACACATACACACACATGCATCCATTAGCAATTGTTTTTG 5875

 52647184 CCCAACTCTAGTGTCTCGCAGTGTCTAGACTAAACAACAAACAAAAAAGGGGGGAGAGTG 52647243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5876 CCCAACTCTAGTGTCTCGCAGTGTCTAGACTAAACAACAAACAAAAAAGGGGGGAGAGTG 5935

 52647244 AGCTGGATTAAGCATTGAGGCACAGTGAAGAAATGGTCTGGGGCAAGCCCAGGGATGAAT 52647303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5936 AGCTGGATTAAGCATTGAGGCACAGTGAAGAAATGGTCTGGGGCAAGCCCAGGGATGAAT 5995

 52647304 GTTAGGGGTTTCTCATAAACCTGAACCTGAAGAAAATCACCCTGCCAGCATATTGATCTT 52647363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5996 GTTAGGGGTTTCTCATAAACCTGAACCTGAAGAAAATCACCCTGCCAGCATATTGATCTT 6055

 52647364 CTAGCTCTTCTTAACCTTTTTTTCTGTGATTCAGGAATTCATAATGATAGAAAATATTAT 52647423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6056 CTAGCTCTTCTTAACCTTTTTTTCTGTGATTCAGGAATTCATAATGATAGAAAATATTAT 6115

 52647424 ACTAAAGAAGAAAAAAAGAGGGAGAATAAGTAAGTGATAGATGGATGCATCAGGGTGTAA 52647483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6116 ACTAAAGAAGAAAAAAAGAGGGAGAATAAGTAAGTGATAGATGGATGCATCAGGGTGTAA 6175

 52647484 AGTTAGCAAGTAAGGCTGTTGAAGTGTCAGAGTGAATATAAATGAATTGTGGGAATGGTC 52647543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6176 AGTTAGCAAGTAAGGCTGTTGAAGTGTCAGAGTGAATATAAATGAATTGTGGGAATGGTC 6235

 52647544 CATGCCAGGAGAAGAGGGTATGGTTGACAAAAAGGGAAATGCTAAGATTCAAAACAGGGA 52647603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6236 CATGCCAGGAGAAGAGGGTATGGTTGACAAAAAGGGAAATGCTAAGATTCAAAACAGGGA 6295

 52647604 AGGGCTTTTCAAAATGCCAAGAGCACCAACTTATATCTTTCAGTTTAATTCCTCTCTTCC 52647663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6296 AGGGCTTTTCAAAATGCCAAGAGCACCAACTTATATCTTTCAGTTTAATTCCTCTCTTCC 6355

 52647664 TTACCCACTGGCTGGAAAGCAAAGGAGCTAGTGGTAAGTAAGAGTGTTATAGCCAGAGAA 52647723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6356 TTACCCACTGGCTGGAAAGCAAAGGAGCTAGTGGTAAGTAAGAGTGTTATAGCCAGAGAA 6415

 52647724 AAAGTCTTCAAAAAACACAAAGTACTTTCCATGGACAACCTTTTTTATTTTAAAGTGCCA 52647783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6416 AAAGTCTTCAAAAAACACAAAGTACTTTCCATGGACAACCTTTTTTATTTTAAAGTGCCA 6475

 52647784 ATATGTTGCTTTGAAAAAGAATAAATTCCTTACATCCAGGTATCTGGACTAGACTTCAGT 52647843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6476 ATATGTTGCTTTGAAAAAGAATAAATTCCTTACATCCAGGTATCTGGACTAGACTTCAGT 6535

 52647844 GCATTTAGTGATTATAGCAAATCCAAACAGTAGCTTTTGATATCAGAGAATGGGTAAAGT 52647903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6536 GCATTTAGTGATTATAGCAAATCCAAACAGTAGCTTTTGATATCAGAGAATGGGTAAAGT 6595

 52647904 GTTTTTGACAATTTCTAAGAACTTAGAGTTCTTCGGTGATACGTTCCATGCAACTGAAGC 52647963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6596 GTTTTTGACAATTTCTAAGAACTTAGAGTTCTTCGGTGATACGTTCCATGCAACTGAAGC 6655

 52647964 TCTGCTCTCCAAATTTAGGTGGGTACATACCCAAGTCCATCACCTGGGGCTTCTATTTCC 52648023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6656 TCTGCTCTCCAAATTTAGGTGGGTACATACCCAAGTCCATCACCTGGGGCTTCTATTTCC 6715

 52648024 TTTGCTCAGATGCTCACCTCCTAGGTGGGCACCTGACATAAGATAGACTAATAAAAATAA 52648083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6716 TTTGCTCAGATGCTCACCTCCTAGGTGGGCACCTGACATAAGATAGACTAATAAAAATAA 6775

 52648084 GTCCTGTAACTTTTGATACTCCTATTAAAAAAGAGTTGCAAACCAATAGGAGGTACACTT 52648143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6776 GTCCTGTAACTTTTGATACTCCTATTAAAAAAGAGTTGCAAACCAATAGGAGGTACACTT 6835

 52648144 GAGAATCAGCACAAATGAAAGTAGAACCTGGAAATCCAGGAAGCAGATACCCAATCATGT 52648203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6836 GAGAATCAGCACAAATGAAAGTAGAACCTGGAAATCCAGGAAGCAGATACCCAATCATGT 6895

 52648204 CATTTAAACATTTAGATCCAGCTGTGCCTGAAGCTGAACTTTAGCATTACATAAGCCAAT 52648263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6896 CATTTAAACATTTAGATCCAGCTGTGCCTGAAGCTGAACTTTAGCATTACATAAGCCAAT 6955

 52648264 AAATCACTCTTCCCCAACTTACGCCAGTTGAAATTGAATACATACTCAGTGACTTTGAGA 52648323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6956 AAATCACTCTTCCCCAACTTACGCCAGTTGAAATTGAATACATACTCAGTGACTTTGAGA 7015

 52648324 GAATTCCAGGGAATTGGTCAGTCCCTGTTTCACTTGTAAATACACAGCAATCAAGCCTAC 52648383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7016 GAATTCCAGGGAATTGGTCAGTCCCTGTTTCACTTGTAAATACACAGCAATCAAGCCTAC 7075

 52648384 CAAATCTATGATTGATTGGGGTGTCTGAAAGAGATGGAGGGAATGGAATCAACCTGAAAA 52648443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7076 CAAATCTATGATTGATTGGGGTGTCTGAAAGAGATGGAGGGAATGGAATCAACCTGAAAA 7135

 52648444 ACATATTTCAGGAGTTCATCCCTGAAAACTTCCCCAACCTAGCTAGAGGGGCCAACATTC 52648503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7136 ACATATTTCAGGAGTTCATCCCTGAAAACTTCCCCAACCTAGCTAGAGGGGCCAACATTC 7195

 52648504 AAATTCAGGAAATGCAGAGAACCCCAGTAAGATACTCCACAAAAAGATCTTCCCCAAGAC 52648563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7196 AAATTCAGGAAATGCAGAGAACCCCAGTAAGATACTCCACAAAAAGATCTTCCCCAAGAC 7255

 52648564 ATCATCATCAGATTCTCCAAAGTTGAAATGTAAGAAAAAATGCTAAAGGCAACTAGAGTG 52648623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7256 ATCATCATCAGATTCTCCAAAGTTGAAATGTAAGAAAAAATGCTAAAGGCAACTAGAGTG 7315

 52648624 AAAGGCCCGGTCACCTAAAAAGGGAAGCACAGACTTACAGTGGACCTCTCACTGGTAACC 52648683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7316 AAAGGCCCGGTCACCTAAAAAGGGAAGCACAGACTTACAGTGGACCTCTCACTGGTAACC 7375

 52648684 CTACAAGCCAGAAGAGATTGAGGACCAATATTCAACATTCTTAAACAAAAAGAATTCCAA 52648743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7376 CTACAAGCCAGAAGAGATTGAGGACCAATATTCAACATTCTTAAACAAAAAGAATTCCAA 7435

 52648744 CCCAGAATTTTATATCTGACTAAACTAAGCTTCATAAGCAAAAGAGAAATAAGATCATTT 52648803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7436 CCCAGAATTTTATATCTGACTAAACTAAGCTTCATAAGCAAAAGAGAAATAAGATCATTT 7495

 52648804 TCAGACAAGCAAATGCTAAGGGAATTTGTGACCATTAGACCTTCCTTGCAACAGTTCCTA 52648863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7496 TCAGACAAGCAAATGCTAAGGGAATTTGTGACCATTAGACCTTCCTTGCAACAGTTCCTA 7555

 52648864 AAGGAAGCACTAAATATGGAAAGACCATTACCAGACACTACAAAACACACTGAAGTACAC 52648923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7556 AAGGAAGCACTAAATATGGAAAGACCATTACCAGACACTACAAAACACACTGAAGTACAC 7615

 52648924 AGACCAGTGACATTGTAAAGCAACTACATAACAAGTCTGCAAAATAACCAGCCAACATCA 52648983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7616 AGACCAGTGACATTGTAAAGCAACTACATAACAAGTCTGCAAAATAACCAGCCAACATCA 7675

 52648984 TGATGACGGTATCAAATCGACACATAGCAACACTAACCTTAAATGTAAATGGACTAAATG 52649043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7676 TGATGACGGTATCAAATCGACACATAGCAACACTAACCTTAAATGTAAATGGACTAAATG 7735

 52649044 ATCCCATTAAAAGACATAAAGTGGCAGGCTGGATAAAGAACCAAGAACCATTGGTATACT 52649103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7736 ATCCCATTAAAAGACATAAAGTGGCAGGCTGGATAAAGAACCAAGAACCATTGGTATACT 7795

 52649104 GTCTTCAAGAGACCCATCTCCTATGCAGTGACACACATAGGTTCAAGATAAAGGGATGGG 52649163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7796 GTCTTCAAGAGACCCATCTCCTATGCAGTGACACACATAGGTTCAAGATAAAGGGATGGG 7855

 52649164 GAAAAATCTACCAAGCAAATAGAAAACAGAATAAAACAGGGGTTGCAATCCTAGTTGCCG 52649223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7856 GAAAAATCTACCAAGCAAATAGAAAACAGAATAAAACAGGGGTTGCAATCCTAGTTGCCG 7915

 52649224 TCAAAACAGACTTTAAACCAACAAAGGTTAAAAGAAAAAAATATGGGCATTGCATAAGGA 52649283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7916 TCAAAACAGACTTTAAACCAACAAAGGTTAAAAGAAAAAAATATGGGCATTGCATAAGGA 7975

 52649284 TAAAGTGTTAAATTAAACAAGAAGATCTAACTATCCTAAGTATATATGCACCAAACACAG 52649343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7976 TAAAGTGTTAAATTAAACAAGAAGATCTAACTATCCTAAGTATATATGCACCAAACACAG 8035

 52649344 GAACACCCAGATTCATAAAGCAAGTTTATGGAGACCTTCAAACAGACTTAGACTCCCACA 52649403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8036 GAACACCCAGATTCATAAAGCAAGTTTATGGAGACCTTCAAACAGACTTAGACTCCCACA 8095

 52649404 CAATAGTAGTGGGAGACTTTAATACCCCATGACAATATTAGACAGATCATTGAGACAGGA 52649463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8096 CAATAGTAGTGGGAGACTTTAATACCCCATGACAATATTAGACAGATCATTGAGACAGGA 8155

 52649464 AATTAACAAAGATATTCAAGATCTAACTCAGCACTAAATCAAATGGCCCTGATAGATATC 52649523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8156 AATTAACAAAGATATTCAAGATCTAACTCAGCACTAAATCAAATGGCCCTGATAGATATC 8215

 52649524 TACAGGACTGTCCTACTTGAAACCATACAATTACATGGTAATTGAATGACCTGCTCCTGA 52649583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8216 TACAGGACTGTCCTACTTGAAACCATACAATTACATGGTAATTGAATGACCTGCTCCTGA 8275

 52649584 ATGACTTTTGGGTAAATAATAAAATTAAGGCAGAAATCAAGAAGTTTTTTGAACTAATGA 52649643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8276 ATGACTTTTGGGTAAATAATAAAATTAAGGCAGAAATCAAGAAGTTTTTTGAACTAATGA 8335

 52649644 GAACAAAGATACAACATACCAGAATCTTTGGGACACA 52649680
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8336 GAACAAAGATACAACATACCAGAATCTTTGGGACACA 8372

Alignment time is 9.84529 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [52637064,52668002] =>     30939 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    6943] =>      6943 nucs 'mol-32-34b3-171886_6943'

Score:        6768
Aligned:      6946        nucs
Identic:      6920 (100%) nucs =>      6485 (100%)       435 ( 98%)
Gaps:           15 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [52640566,52647064] EXCISED REGION [52658003,52658437]
 second seq =>  [       1,    6500] EXCISED REGION [    6501,    6943]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>     10938 nucs [52647065,52658002]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         6 nucs [52647065,52647070] to [52658003,52658008]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [52647065,52647067] to [52658000,52658002]
 second seq =>         0 nucs

 52640566 ACTTTATATGGCCTATCTCATTTAACTTCTAAAAGTGTGAACAATGTGAGAATGTGCTAG 52640625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACTTTATATGGCCTATCTCATTTAACTTCTAAAAGTGTGAACAATGTGAGAATGTGCTAG 60

 52640626 ATACTATTATTATCCCCATTTTACAGATGAGGAAACTGAGGCTCAGGAGGTGAAGTAGCT 52640685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATACTATTATTATCCCCATTTTACAGATGAGGAAACTGAGGCTCAGGAGGTGAAGTAGCT 120

 52640686 TGCCCAAGATCACACAGCCAGTAGGTGACAGAGGTAGAGAGGAAACCTAGGCTACTTGAC 52640745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGCCCAAGATCACACAGCCAGTAGGTGACAGAGGTAGAGAGGAAACCTAGGCTACTTGAC 180

 52640746 TATGATGCTTATGTTTAATTCACTACTAAATACCATGTAGGAAAGGACTCTGGAGACCTT 52640805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TATGATGCTTATGTTTAATTCACTACTAAATACCATGTAGGAAAGGACTCTGGAGACCTT 240

 52640806 AGTTCTTTAATTCCAATTCTACCACTAAACAGTAGAGACAGGATGAACTTGTCATTCACT 52640865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGTTCTTTAATTCCAATTCTACCACTAAACAGTAGAGACAGGATGAACTTGTCATTCACT 300

 52640866 GAGATGGAAAACCCCGTGAATTAAACTGGTGGGCATTTTGTTTTTGTCATTGTTAGGCGA 52640925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GAGATGGAAAACCCCGTGAATTAAACTGGTGGGCATTTTGTTTTTGTCATTGTTAGGCGA 360

 52640926 TGAATGAAGAGTTCCATTCTGGACACATTAGGGTTGAGATACTCAGTGAGCAGCCAAATG 52640985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGAATGAAGAGTTCCATTCTGGACACATTAGGGTTGAGATACTCAGTGAGCAGCCAAATG 420

 52640986 GGGATGTAGAAATTCAAGTAGACATGTGGAAGAGGAGGCAGCTGAGACTCACGTCTGGAC 52641045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGGATGTAGAAATTCAAGTAGACATGTGGAAGAGGAGGCAGCTGAGACTCACGTCTGGAC 480

 52641046 TTCAGGGATGGATCCCGGCTAGAGATGTAAATTTGGAACTTGTCAACCCATAGCAGTATT 52641105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTCAGGGATGGATCCCGGCTAGAGATGTAAATTTGGAACTTGTCAACCCATAGCAGTATT 540

 52641106 TAAACCTTTGGGACTGAGGGAAACCTTCAAGGAAATAAGCGTAGTTAGAGATAGCCAAGA 52641165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TAAACCTTTGGGACTGAGGGAAACCTTCAAGGAAATAAGCGTAGTTAGAGATAGCCAAGA 600

 52641166 AGTGAACCCTGGGGAAGTCCAACATTTAGAGGGTGAGATCCAGCAAAGGAGATGATGGAA 52641225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGTGAACCCTGGGGAAGTCCAACATTTAGAGGGTGAGATCCAGCAAAGGAGATGATGGAA 660

 52641226 GAGTACCAGGGAGGTGGAAGGATGTTGTTTCAAACAGCAAGGTGTGGCCCACTCAGTCAC 52641285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GAGTACCAGGGAGGTGGAAGGATGTTGTTTCAAACAGCAAGGTGTGGCCCACTCAGTCAC 720

 52641286 TGTGTCGGATTCAACTTGCAGGTCAGACCTACTAGGACAAAGATAGAGACCTATAGGATT 52641345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGTGTCGGATTCAACTTGCAGGTCAGACCTACTAGGACAAAGATAGAGACCTATAGGATT 780

 52641346 TGGCAGCCAGGGTGATGGTAGGGAATTTGAAACATCATGGTGGCTGTGACAAGAGCCTGA 52641405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGGCAGCCAGGGTGATGGTAGGGAATTTGAAACATCATGGTGGCTGTGACAAGAGCCTGA 840

 52641406 ATGGAGTGTGTTCAAGAGAGAAAAGAAGAGAAGTGAAAACACAGAATATTGTTCTTATTA 52641465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATGGAGTGTGTTCAAGAGAGAAAAGAAGAGAAGTGAAAACACAGAATATTGTTCTTATTA 900

 52641466 TTAGTAGCCTGAGCCAATCTGAGGACCGATGCACTTATCACAATGTCTCTTAAAATACTA 52641525
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTAGTAGCCTGAGCAAATCTGAGGACCGATGCACTTATCACAATGTCTCTTAAAATACTA 960

 52641526 TGTCTCTTACTAGATTATACACTCCTTGACAGACGAGAAACATGATTTATTTTTCAAATG 52641585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGTCTCTTACTAGATTATACACTCCTTGACAGACGAGAAACATGATTTATTTTTCAAATG 1020

 52641586 CCTTGCACAAGGTTAGTGCGAAAGTAACGATTGCAGGATTTAATTACACTTTTAAAAGAA 52641645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CCTTGCACAAGGTTAGTGCGAAAGTAACGATTGCAGGATTTAATTACACTTTTAAAAGAA 1080

 52641646 AAAAGACATTCTTCATCTTATGAAACTCTGCATGGCAACACTTTATGCGCCCCACACCCC 52641705
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     1081 AAAAGACATTCTTCATCTTATGAAACTCTGCATGGCAACACTTTACGCGCCCCACACCCC 1140

 52641706 CACTCAACACAAACACAACTCTGGAAGTACTGTGTTGATAACAGAAATGTGGTGGGTTTT 52641765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CACTCAACACAAACACAACTCTGGAAGTACTGTGTTGATAACAGAAATGTGGTGGGTTTT 1200

 52641766 ATTTTTAACCAATAAAGGTCAAGTTTGCATTATGTGATTTTGTGTGTGTGTGTGTTGAAT 52641825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATTTTTAACCAATAAAGGTCAAGTTTGCATTATGTGATTTTGTGTGTGTGTGTGTTGAAT 1260

 52641826 CTTTTAAATGCATATCTTACAGCTCTGGTTCAGTTGTTGTGGGGAGAGGAAAAAAACCTC 52641885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTTTTAAATGCATATCTTACAGCTCTGGTTCAGTTGTTGTGGGGAGAGGAAAAAAACCTC 1320

 52641886 ATCCCTGCCAACACATTGGTTTGTATGAATCACAGCTCAGTGAAACCTTTCAGGCATATA 52641945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ATCCCTGCCAACACATTGGTTTGTATGAATCACAGCTCAGTGAAACCTTTCAGGCATATA 1380

 52641946 ATTTATCTTTTCTTTGGCCTATGTAGTAAACGCTTCATTTGTTCATGAATTCTTGCCTTG 52642005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ATTTATCTTTTCTTTGGCCTATGTAGTAAACGCTTCATTTGTTCATGAATTCTTGCCTTG 1440

 52642006 TTTTAATTATGCTTTGCCCTGAATGTAGTTTTATAAGGCACAAAAATAAGATTGTCGTTC 52642065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTTTAATTATGCTTTGCCCTGAATGTAGTTTTATAAGGCACAAAAATAAGATTGTCGTTC 1500

 52642066 TGAAAACACAGAAGATTTGTATGTTTCCCCCAGGATGAAATGGTGGCATCTTTCTCCCAA 52642125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TGAAAACACAGAAGATTTGTATGTTTCCCCCAGGATGAAATGGTGGCATCTTTCTCCCAA 1560

 52642126 TTCACAGCTCTGTGGGCTTGTGGCTGGAATTCCAATCCAGCAGGGAGCAAGCCATAAAAA 52642185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTCACAGCTCTGTGGGCTTGTGGCTGGAATTCCAATCCAGCAGGGAGCAAGCCATAAAAA 1620

 52642186 TGGGGGGAAGGGCTGCTGGAGGGAGGCAGTAGATGCGGCTGAGCCCAAGGCATAATTCAC 52642245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TGGGGGGAAGGGCTGCTGGAGGGAGGCAGTAGATGCGGCTGAGCCCAAGGCATAATTCAC 1680

 52642246 CCTAAGAATTCTGAATCAATACACTGACATCCAGCCATGTACAATGTGGTACTCCCACCA 52642305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CCTAAGAATTCTGAATCAATACACTGACATCCAGCCATGTACAATGTGGTACTCCCACCA 1740

 52642306 AGAAAGCCACTGATTGAGAAGTTTTATTCATGTTACTTTCTGAGGGTTGGATTGTCCCAT 52642365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AGAAAGCCACTGATTGAGAAGTTTTATTCATGTTACTTTCTGAGGGTTGGATTGTCCCAT 1800

 52642366 TACATTTATAGAACAATTGCTTTTTTCCCCCTAAATACAGAACTATGCAGCCGGGAGTCA 52642425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TACATTTATAGAACAATTGCTTTTTTCCCCCTAAATACAGAACTATGCAGCCGGGAGTCA 1860

 52642426 GAAAAGAAACCTTGACAATCAGAAGGCTGTTTTGTTGTTGTTGTTAAAAACCTTTGCAGG 52642485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GAAAAGAAACCTTGACAATCAGAAGGCTGTTTTGTTGTTGTTGTTAAAAACCTTTGCAGG 1920

 52642486 CATATGCATCTGAATATCCATAAGTTCACAGGCTGAGGGAGAAATGGCTATTTCATAACT 52642545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CATATGCATCTGAATATCCATAAGTTCACAGGCTGAGGGAGAAATGGCTATTTCATAACT 1980

 52642546 TTTCTGTGTTTCTCATGTACATAGTACAAAGTGGGCACTCAGTATTTCAAATTTCAATAT 52642605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TTTCTGTGTTTCTCATGTACATAGTACAAAGTGGGCACTCAGTATTTCAAATTTCAATAT 2040

 52642606 CACTGAAAAAAATGGAAATTTGTCATGTAACAAAATCAGATGCAGACTTCACTGGTGAAT 52642665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CACTGAAAAAAATGGAAATTTGTCATGTAACAAAATCAGATGCAGACTTCACTGGTGAAT 2100

 52642666 CTGAGGGAGTGAATTCACTTATTCAGAAAGGAAGACAGTTACAATTCTTGGGTCTTCTGA 52642725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CTGAGGGAGTGAATTCACTTATTCAGAAAGGAAGACAGTTACAATTCTTGGGTCTTCTGA 2160

 52642726 GAGATCATTATAACTTGAAAATATTACACAAGGGCTTTGCTATATTAGATACCTGCCATG 52642785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GAGATCATTATAACTTGAAAATATTACACAAGGGCTTTGCTATATTAGATACCTGCCATG 2220

 52642786 TTCCTAACACAAGCTCCCATTTTCTGACTCAAATCTCATTTTGGAACACATTCCACTCAA 52642845
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TTCCTAATACAAGCTCCCATTTTCTGACTCAAATCTCATTTTGGAACACATTCCACTCAA 2280

 52642846 ATTGAGGTTCTACCCCTAAGAGTTCTTTTTCAATAAAGAAAGCTGAGTTAATAAATCACA 52642905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 ATTGAGGTTCTACCCCTAAGAGTTCTTTTTCAATAAAGAAAGCTGAGTTAATAAATCACA 2340

 52642906 ACTCCAAAACTTTTCCTCACTTTTCTTAGACTAGAAATAGATTGAGTGTGTCGAGGTTTT 52642965
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     2341 ACTCCAAAACTTTTCCTCACTTTTCTTAGACTAGAAATAGATTGAATGTGTCGAGGTTTT 2400

 52642966 ATGGCTGAGTACATTGGAGGGCTGGCTATTCTATGCTGAACTGGTTTACTTGATTAAGAT 52643025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ATGGCTGAGTACATTGGAGGGCTGGCTATTCTATGCTGAACTGGTTTACTTGATTAAGAT 2460

 52643026 GGGGATTTGGATGAGTCACCGGACACCTGTCCAAAGATGAGTAAAACACATTCCTTCATT 52643085
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GGGGATTTGGATGAGTCACTGGACACCTGTCCAAAGATGAGTAAAACACATTCCTTCATT 2520

 52643086 GTCTTCCCATAAATAACTCAATCTTCTCCTAACTGAGCCAATGGATAGGCTTTGGATGCC 52643145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GTCTTCCCATAAATAACTCAATCTTCTCCTAACTGAGCCAATGGATAGGCTTTGGATGCC 2580

 52643146 CAAGCAAAACAAACACATGACTGTTAAAAAATCACAACCTCAAAATGGCCTTAGAAGCCT 52643205
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CAAGCAAAAGAAACACATGACTGTTAAAAAATCACAACCTCAAAATGGCCTTAGAAGCCT 2640

 52643206 ATGACCAATAATGAGAATGGTTTCTCCACTCAGGCGCAAGTAGTAAACAGTTTCTCCCAT 52643265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 ATGACCAATAATGAGAATGGTTTCTCCACTCAGGCGCAAGTAGTAAACAGTTTCTCCCAT 2700

 52643266 ATGCAGGAATATTGACGACTAGTTTACCGCCTCTGGGCACGTAACTTTCAGGTCCTGGTT 52643325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 ATGCAGGAATATTGACGACTAGTTTACCGCCTCTGGGCACGTAACTTTCAGGTCCTGGTT 2760

 52643326 CATGCATTTGCTGGAATGTTCCCTGGGCCATGGAGCCCAGTTCTCCTGGCATCTGGCATC 52643385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CATGCATTTGCTGGAATGTTCCCTGGGCCATGGAGCCCAGTTCTCCTGGCATCTGGCATC 2820

 52643386 TCCCCCACACTCTGCTCCCCCAGCACAGCACTTGGCATCTTGCATTGCAATTGCAGGTTT 52643445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TCCCCCACACTCTGCTCCCCCAGCACAGCACTTGGCATCTTGCATTGCAATTGCAGGTTT 2880

 52643446 ATTTATTCACTTCTCTCACTGGACAGCAAACTCCACCAGGGCCGAGACTCTGTGTCTCGC 52643505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 ATTTATTCACTTCTCTCACTGGACAGCAAACTCCACCAGGGCCGAGACTCTGTGTCTCGC 2940

 52643506 CCTTCACTGTGGTCCCTGTGCCTCACCTGTTCCTAGTACAGTGTCACACTCAGTAAAGAG 52643565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CCTTCACTGTGGTCCCTGTGCCTCACCTGTTCCTAGTACAGTGTCACACTCAGTAAAGAG 3000

 52643566 CAGATGCCTGG-TGCATTTGGAGACTTATTTTAAATTATACGGAAAGTTATTCAACCGGC 52643624
          ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CAGATGCCTGGATGCATTTGGAGACTTATTTTAAATTATACGGAAAGTTATTCAACCGGC 3060

 52643625 TTCTTGAACTGGTGAATTTTGGAAAGTGGGTGTTTGAAGGGAAAATGTTTAAACTCTGAA 52643684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TTCTTGAACTGGTGAATTTTGGAAAGTGGGTGTTTGAAGGGAAAATGTTTAAACTCTGAA 3120

 52643685 AGAAATGTTGGAAATAAGCTCTTTGAATCAAAATGTATAGAAAACACAAGAATGCTGACA 52643744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 AGAAATGTTGGAAATAAGCTCTTTGAATCAAAATGTATAGAAAACACAAGAATGCTGACA 3180

 52643745 GTAAGAGCCTAAAACACATGATGACTATTATCTTTTCCCAATTTTAACTCTCCAGAGTGT 52643804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 GTAAGAGCCTAAAACACATGATGACTATTATCTTTTCCCAATTTTAACTCTCCAGAGTGT 3240

 52643805 TCAGCGGTGCCCAGCCTTCATAATGTAATTCTTCGTAGCACCCTGGATGCATTAAAACCA 52643864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TCAGCGGTGCCCAGCCTTCATAATGTAATTCTTCGTAGCACCCTGGATGCATTAAAACCA 3300

 52643865 TAGATTAACGTGATACTTATTTTCATTAAGGAAAATAATTTACGTACAGTGCTCAGAGTA 52643924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TAGATTAACGTGATACTTATTTTCATTAAGGAAAATAATTTACGTACAGTGCTCAGAGTA 3360

 52643925 GAGCCTGGCACATTGAACATTTTCAATAAATGACAGCAAGTGTAATTATTAGCACTTCGG 52643984
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     3361 GAGCCTGGCACATTGAACATTTTCAATAAATGACAGCAAGTGTAATTATTAGCACTTTGG 3420

 52643985 AAGTGCAAAGTTGCATTGTATTAAGACAAATATATTTGGAGCTCATCCAATTTTTTCCTG 52644044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 AAGTGCAAAGTTGCATTGTATTAAGACAAATATATTTGGAGCTCATCCAATTTTTTCCTG 3480

 52644045 GCTCTGAAGTCTGCTAGTGGCACTTAACTTTATTCCCAAGTTTTGAAAAATATTGTTATT 52644104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 GCTCTGAAGTCTGCTAGTGGCACTTAACTTTATTCCCAAGTTTTGAAAAATATTGTTATT 3540

 52644105 TAAAAAGTCTGTTAACCAAGGAAATGCATGCCCTAAACCTATAATGTATCAAGTTTTACT 52644164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 TAAAAAGTCTGTTAACCAAGGAAATGCATGCCCTAAACCTATAATGTATCAAGTTTTACT 3600

 52644165 TCCTTCTTCTTTTAAGGAGTTCTTTTCCTGCCTTGAATACAAACAGGCTCTCTCAAGGTT 52644224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 TCCTTCTTCTTTTAAGGAGTTCTTTTCCTGCCTTGAATACAAACAGGCTCTCTCAAGGTT 3660

 52644225 AAAAGCAAATGCTCTTTTTAGTGTCAAAAAGAGCTTGCCTTTCTTCGCTCAGGAAAAAAA 52644284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 AAAAGCAAATGCTCTTTTTAGTGTCAAAAAGAGCTTGCCTTTCTTCGCTCAGGAAAAAAA 3720

 52644285 GCAACTGATTCCAGGATACCTTCTTTGAAAACCAACACAAAAAAACCCCCCAAAAAACAA 52644344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 GCAACTGATTCCAGGATACCTTCTTTGAAAACCAACACAAAAAAACCCCCCAAAAAACAA 3780

 52644345 AAAAAAAACCCAAAACCCCTAGTTTTTACAAAGGTTTATTACTCCTACTTGTTGGAAAAG 52644404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 AAAAAAAACCCAAAACCCCTAGTTTTTACAAAGGTTTATTACTCCTACTTGTTGGAAAAG 3840

 52644405 AATTACTACATAAAAGAGTCTGCCCAGAGCTGTAAAATCTCCTTATTCAAACACACACCT 52644464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 AATTACTACATAAAAGAGTCTGCCCAGAGCTGTAAAATCTCCTTATTCAAACACACACCT 3900

 52644465 TAGAGCAAAAGATGGTTAAATATCAATTCAGGCTATTAACAGTAAGGGAC---GAAATGT 52644521
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||
     3901 TAGAGCAAAAGATGGTTAAATATCAATTCAGGCTATTAACAGTAAGG---AATGAAATGT 3957

 52644522 GTTCCAACAAAACTCTGCATGTCAACAAACTACAGAGACTAGGTAACATCTTTTAGGAAT 52644581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3958 GTTCCAACAAAACTCTGCATGTCAACAAACTACAGAGACTAGGTAACATCTTTTAGGAAT 4017

 52644582 CATTTTTATTCCACTAATGCCTTTTCCTCCAGAATCCACTGATCGTAAACGCAACCTGTC 52644641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4018 CATTTTTATTCCACTAATGCCTTTTCCTCCAGAATCCACTGATCGTAAACGCAACCTGTC 4077

 52644642 TACTTCCGCCTTTGAAAAATGGATGGACAAATTCATCTGCATGTAACTCACCTCCTCTTT 52644701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4078 TACTTCCGCCTTTGAAAAATGGATGGACAAATTCATCTGCATGTAACTCACCTCCTCTTT 4137

 52644702 TCTTTTACATAAAACAGATGCCACAGCTGTTATTGTTCTTCACACAGAAGTTTCTACCCA 52644761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4138 TCTTTTACATAAAACAGATGCCACAGCTGTTATTGTTCTTCACACAGAAGTTTCTACCCA 4197

 52644762 GAGAAACATCAGGATGACACTCTGCTGCAATGTGCTATTTGTTCTAGAGGGGTCAACAGC 52644821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4198 GAGAAACATCAGGATGACACTCTGCTGCAATGTGCTATTTGTTCTAGAGGGGTCAACAGC 4257

 52644822 TTGCCACCTTGCCTAGGCCCAGGGTGACTGCATATGTGCAGTGGTCTTATCCCATTAGCG 52644881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4258 TTGCCACCTTGCCTAGGCCCAGGGTGACTGCATATGTGCAGTGGTCTTATCCCATTAGCG 4317

 52644882 CCCCCGAGCATGCATTCAGAACCAAGTGGATACACCTTGGCACACTTACCTTCCCTGCAG 52644941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4318 CCCCCGAGCATGCATTCAGAACCAAGTGGATACACCTTGGCACACTTACCTTCCCTGCAG 4377

 52644942 GGACATCATCGGACTGCCCTGATAAGCCAGGAACCTCATCCACCTTGTCTTGATGCTCTG 52645001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4378 GGACATCATCGGACTGCCCTGATAAGCCAGGAACCTCATCCACCTTGTCTTGATGCTCTG 4437

 52645002 CCCTCTTGGCTTCCTGTTGGCTGTCACCTGGCACCTTTTCCTGTCCCTTGTCCAGCTTGA 52645061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4438 CCCTCTTGGCTTCCTGTTGGCTGTCACCTGGCACCTTTTCCTGTCCCTTGTCCAGCTTGA 4497

 52645062 AGAATTTGTCAAAAAAGCTGGAGTCCTTGGGCTTGGAGGGAGCTTCTCCTCCTGCTCCCC 52645121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4498 AGAATTTGTCAAAAAAGCTGGAGTCCTTGGGCTTGGAGGGAGCTTCTCCTCCTGCTCCCC 4557

 52645122 CTGTCTCAGGTGGGAGAAGCGTGGGATCCCTGGCGGCAGAGAGGACCTTGTCTTGGGCCG 52645181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4558 CTGTCTCAGGTGGGAGAAGCGTGGGATCCCTGGCGGCAGAGAGGACCTTGTCTTGGGCCG 4617

 52645182 GGGCGTGCCCTGGGGTTTTATCTGTGTCCTGCCCCGGTCCAGCTGCCACCGGAAGTGTCC 52645241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4618 GGGCGTGCCCTGGGGTTTTATCTGTGTCCTGCCCCGGTCCAGCTGCCACCGGAAGTGTCC 4677

 52645242 AGCTCTCACTTGGGTCTTTGTTCGCTGGAGCTTTATTGGAGCTGACATCAAGCTTCACTG 52645301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4678 AGCTCTCACTTGGGTCTTTGTTCGCTGGAGCTTTATTGGAGCTGACATCAAGCTTCACTG 4737

 52645302 ATCCAAGGGATGAATCTGCGGCTTGGTCTCCGGTACGTCCTGGTACAGGCCGAGAGAGCA 52645361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4738 ATCCAAGGGATGAATCTGCGGCTTGGTCTCCGGTACGTCCTGGTACAGGCCGAGAGAGCA 4797

 52645362 TCAAGAAAAAACGAGATTTAGCAGCTGGTGCCTCGGGTTTGGCCTCTTTCCCAAGATTCT 52645421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4798 TCAAGAAAAAACGAGATTTAGCAGCTGGTGCCTCGGGTTTGGCCTCTTTCCCAAGATTCT 4857

 52645422 TTCCGTTGGCATCCGCAACAGCACTTATCTCCGTTGTCTCGGGGGAAGAAGTGGCCACAT 52645481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4858 TTCCGTTGGCATCCGCAACAGCACTTATCTCCGTTGTCTCGGGGGAAGAAGTGGCCACAT 4917

 52645482 TATCCGTCTTGACACTTATTCCCAAGTCGACTGTAAACACAAACATAAACAGTGGTTATT 52645541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     4918 TATCCGTCTTGACACTTATTCCCAAGTCGACTGTAAACACAAACATAAACAGCGGTTATT 4977

 52645542 CAGCCAAGCCGGGAAATTCAGGCACTAATAATGGACTCCAGACATTTTTTATACAAAAGC 52645601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4978 CAGCCAAGCCGGGAAATTCAGGCACTAATAATGGACTCCAGACATTTTTTATACAAAAGC 5037

 52645602 CATACTGCATACTGGAACTGTGTTGTTCTCTGGTCATTCTGAAAGGCAGAAGTTAGCTCT 52645661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5038 CATACTGCATACTGGAACTGTGTTGTTCTCTGGTCATTCTGAAAGGCAGAAGTTAGCTCT 5097

 52645662 CTACATCTCCTTGGACCCTGCTTTTCTTGGGAGAGGAGAAGGCAAGGTTGGTGAGGAGGG 52645721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5098 CTACATCTCCTTGGACCCTGCTTTTCTTGGGAGAGGAGAAGGCAAGGTTGGTGAGGAGGG 5157

 52645722 AAAGCTACTTAATGGAAAGTCACTAGCTGCCAGGTGTGGAATGAGTGATATTCAATGTTA 52645781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5158 AAAGCTACTTAATGGAAAGTCACTAGCTGCCAGGTGTGGAATGAGTGATATTCAATGTTA 5217

 52645782 ATTAATCTTCTTTTATCTGTGTAAGAACTCCGTGAGCAGCATATTGTCATGATGTCAACT 52645841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5218 ATTAATCTTCTTTTATCTGTGTAAGAACTCCGTGAGCAGCATATTGTCATGATGTCAACT 5277

 52645842 GGGAGGCAGTACAGCAGTTAGGAGCTTGGGTTCTGGAGCTAGAACAAGGTTTCTCAACCT 52645901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5278 GGGAGGCAGTACAGCAGTTAGGAGCTTGGGTTCTGGAGCTAGAACAAGGTTTCTCAACCT 5337

 52645902 CAGCACTACTCACATTTGAAGCCAGATTATTCTTTGTTAGGGAGGCTCATCCCGTGCCTC 52645961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5338 CAGCACTACTCACATTTGAAGCCAGATTATTCTTTGTTAGGGAGGCTCATCCCGTGCCTC 5397

 52645962 ATAGGCTGATTAGCAGCATCCTGGCCTCTGCCCACTAGACGCCGGTCACATTTCCCAGTC 52646021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5398 ATAGGCTGATTAGCAGCATCCTGGCCTCTGCCCACTAGACGCCGGTCACATTTCCCAGTC 5457

 52646022 ATGGCAACCAAAAATATCTCTAGGCATTGCTAAATGTCCCCTGGAGGACAAAATCTCTTA 52646081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5458 ATGGCAACCAAAAATATCTCTAGGCATTGCTAAATGTCCCCTGGAGGACAAAATCTCTTA 5517

 52646082 CGTTTGAGAGGCACTGAGCTGAAATGTCTTTTTGAATCCAGATTATCTAATTTTCTGTGC 52646141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5518 CGTTTGAGAGGCACTGAGCTGAAATGTCTTTTTGAATCCAGATTATCTAATTTTCTGTGC 5577

 52646142 CTCAACTTTCTGGTAAAAGGAGACAGATAATAAATCTCGTAATTTTGTTAGGAAGATTAC 52646201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5578 CTCAACTTTCTGGTAAAAGGAGACAGATAATAAATCTCGTAATTTTGTTAGGAAGATTAC 5637

 52646202 ATGAGTTAATAGTTTTAAAGCAAGTACAATAGCACCTGGAATATATTAAGTGCTTAATAA 52646261
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     5638 ATGAGTTAATAGTTTTAAAGCAAGTACAATAGCGCCTGGAATATATTAAGTGCTTAATAA 5697

 52646262 ATATCACAAACATTAGTTATCATTATTCATGAGTGAGAAAACTGACAGTCAGAGAGGTCA 52646321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5698 ATATCACAAACATTAGTTATCATTATTCATGAGTGAGAAAACTGACAGTCAGAGAGGTCA 5757

 52646322 GTACACCCTCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCTAGTAAGCAGCAGAGTCTGGCTTCAGGCAGA 52646381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5758 GTACACCCTCCCCTGGCTGCCCAGTAAGCTAGTAAGCAGCAGAGTCTGGCTTCAGGCAGA 5817

 52646382 AATCTGACTTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGTCTTACCAGGGACTTGTATTAGCATAGACT 52646441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5818 AATCTGACTTCTAAGTTCATGCGCTCTCTGTCTTACCAGGGACTTGTATTAGCATAGACT 5877

 52646442 GTTAAGAATATGGGAAGATTTTTAAAATACAGTACTCAGAAAATTTCTCTTTGAAAGGCT 52646501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5878 GTTAAGAATATGGGAAGATTTTTAAAATACAGTACTCAGAAAATTTCTCTTTGAAAGGCT 5937

 52646502 GGAAGAGCAGATATCCACACAAGAAGGCAAATTAGACCTCAGGCCAGTGTGGAATTAAAG 52646561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5938 GGAAGAGCAGATATCCACACAAGAAGGCAAATTAGACCTCAGGCCAGTGTGGAATTAAAG 5997

 52646562 GTGTAGGGTTATCTGGTCAAGACTGTGTGTGTGGATACAGGCTCCAACCCCTCCAGGCAA 52646621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5998 GTGTAGGGTTATCTGGTCAAGACTGTGTGTGTGGATACAGGCTCCAACCCCTCCAGGCAA 6057

 52646622 GGGCACTGTTTCCAACATCCACCCTTTCTCCTTTGACCTCTACCTTGACCTAAATTAACT 52646681
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6058 GGGCAATGTTTCCAACATCCACCCTTTCTCCTTTGACCTCTACCTTGACCTAAATTAACT 6117

 52646682 ATAAAAGGTCCTTCTTTTCTAGGACCCTACTATAAATCAGTGAAATATTCAGGAAAAAAA 52646741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6118 ATAAAAGGTCCTTCTTTTCTAGGACCCTACTATAAATCAGTGAAATATTCAGGAAAAAAA 6177

 52646742 GAACACCAAGAATGTTGGGATCCCAGTTAAAGATCAAGATTCTCTACTGATAAGCTGTGT 52646801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6178 GAACACCAAGAATGTTGGGATCCCAGTTAAAGATCAAGATTCTCTACTGATAAGCTGTGT 6237

 52646802 GATATGGAGTAAATCACTAAAGATCTTTGAATCTCTTCATTTGTAAAATGGGAATATTGG 52646861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6238 GATATGGAGTAAATCACTAAAGATCTTTGAATCTCTTCATTTGTAAAATGGGAATATTGG 6297

 52646862 TAGTCCTACTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTAAAGAAGAAAAGTCATGCAAAGGATCTGGC 52646921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6298 TAGTCCTACTGCAGGGTTGTTGTAATGCTTAAAGAAGAAAAGTCATGCAAAGGATCTGGC 6357

 52646922 ACAACGCCTTTTCCATAATAAGTGCTTAGTAATTGACAGATACTGTGATAACTTTTCAGG 52646981
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6358 ACAATGCCTTTTCCATAATAAGTGCTTAGTAATTGACAGATACTGTGATAACTTTTCAGG 6417

 52646982 TTTCTCTCATGCCTTTGACAACATTGCATTTTGCTTGCTCTATCTGTAGTCAGACACTTC 52647041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6418 TTTCTCTCATGCCTTTGACAACATTGCATTTTGCTTGCTCTATCTGTAGTCAGACACTTC 6477

 52647042 TTAATATCTGTTTGCAGGAAGAC 52647064
          |||||||||||||||||||||||
     6478 TTAATATCTGTTTGCAGGAAGAC 6500

EXCISED REGION

 52658003 AGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTG 52658062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6501 AGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTATGACACTTG 6560

 52658063 GCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTAT 52658122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6561 GCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAATTGATGACCCCAGTGGAAAGCGTAT 6620

 52658123 AAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGG 52658182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6621 AAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGG 6680

 52658183 GAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTG 52658242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6681 GAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTG 6740

 52658243 AAACACTGTCTCTGCTAAAAAACAAAACAAAACAAAACACCAAAAAATAGCTGGGCGTAG 52658302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6741 AAACACTGTCTCTGCTAAAAAACAAAACAAAACAAAACACCAAAAAATAGCTGGGCGTAG 6800

 52658303 TGGCGGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTTGGGAGGCGGTGGCAGGAGAATCATTTGAACCT 52658362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6801 TGGCGGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTTGGGAGGCGGTGGCAGGAGAATCATTTGAACCT 6860

 52658363 GGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGAT--------TGTGCCACTGCACTCTAACCTGG 52658414
          |||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||
     6861 GGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACTGTGCCACTGCACTCTAACCTGG 6920

 52658415 GCAACAGAGTTCAGAGTGAGACT 52658437
          |||||||||||||||||||||||
     6921 GCAACAGAGTTCAGAGTGAGACT 6943

Alignment time is 7.95219 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [52637064,52668002] =>     30939 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    6598] =>      6598 nucs 'mol-32-34c9-186968_6598'

Score:        6574
Aligned:      6596        nucs
Identic:      6594 (100%) nucs =>      2097 (100%)      4497 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [52656374,52658470] EXCISED REGION [52658477,52662975]
 second seq =>  [       1,    2097] EXCISED REGION [    2101,    6598]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         6 nucs [52658471,52658476]
 second seq =>         3 nucs [2098,2100]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [52658471,52658471] to [52658476,52658476]
 second seq =>         0 nucs

 52656374 AACTTTGTTTATACTCACACAAACACGTATAAGCATCCCAGATACACATATACAGGGACT 52656433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AACTTTGTTTATACTCACACAAACACGTATAAGCATCCCAGATACACATATACAGGGACT 60

 52656434 GTATCTGTCCTTGTTGTTTTTATAGAAATTGGATCACATTAGACATATTTTCTGATGACT 52656493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTATCTGTCCTTGTTGTTTTTATAGAAATTGGATCACATTAGACATATTTTCTGATGACT 120

 52656494 TTTGTACATTATAGTTGGTCTTCACAGTCAATAGCTCCAAAGCTATCTTATCTTCTAAAA 52656553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTGTACATTATAGTTGGTCTTCACAGTCAATAGCTCCAAAGCTATCTTATCTTCTAAAA 180

 52656554 TAGCTGCATAATATTCCTCAGTATGGATATACCAAAAGATATTTAAACCATTGCCTAATC 52656613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TAGCTGCATAATATTCCTCAGTATGGATATACCAAAAGATATTTAAACCATTGCCTAATC 240

 52656614 AATGAATATCCTGGTAGTTTCCACATTGTTTTTTCCATTTCCACTATAGTGGAATAAACT 52656673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AATGAATATCCTGGTAGTTTCCACATTGTTTTTTCCATTTCCACTATAGTGGAATAAACT 300

 52656674 TTCGTGTTCAAAAATCCTAAACTGGTGCTATATTTCTATAGAATAGAGGCACAGATGTAG 52656733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTCGTGTTCAAAAATCCTAAACTGGTGCTATATTTCTATAGAATAGAGGCACAGATGTAG 360

 52656734 AAGTGTTACCCTCAAATCAATATGCATTTAGTTTTGAAAAACAGACACTGCCATATTATT 52656793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAGTGTTACCCTCAAATCAATATGCATTTAGTTTTGAAAAACAGACACTGCCATATTATT 420

 52656794 TTCTTAAAAAGGCTCTACAGATTCACATTTCCAGCAGCAATGAGTGTCTCAAGCACCTTT 52656853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTCTTAAAAAGGCTCTACAGATTCACATTTCCAGCAGCAATGAGTGTCTCAAGCACCTTT 480

 52656854 TAAGTGGTAAGCAGCTTACCAGGGGAGGTGGCCTATTATTCTATCAGTGGCTTCAGTTGT 52656913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TAAGTGGTAAGCAGCTTACCAGGGGAGGTGGCCTATTATTCTATCAGTGGCTTCAGTTGT 540

 52656914 TAGGACACCACGGGTCAGCTGTGGAGATACGGTTGTGGGGCAGGTTGAGTTCAGGACACA 52656973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TAGGACACCACGGGTCAGCTGTGGAGATACGGTTGTGGGGCAGGTTGAGTTCAGGACACA 600

 52656974 TAGAAGATTGCCAAAGGGTGACTATTATTACTTTGAGACTCTGGAAAAATTAGCCAGGAA 52657033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TAGAAGATTGCCAAAGGGTGACTATTATTACTTTGAGACTCTGGAAAAATTAGCCAGGAA 660

 52657034 ACAGAGACAAGAGGCTCAGGGTGCAGCAAAGCAGCCAAATCAGGATGATAGTGTTTTCTT 52657093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ACAGAGACAAGAGGCTCAGGGTGCAGCAAAGCAGCCAAATCAGGATGATAGTGTTTTCTT 720

 52657094 TGGAGCAGATATACTAATGGCCAAGGAACTCATAAAAAGATGCCTAATGTCATCTCATTA 52657153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGGAGCAGATATACTAATGGCCAAGGAACTCATAAAAAGATGCCTAATGTCATCTCATTA 780

 52657154 GGGAAGTGCAGTCAAAGCCACAGCATGATACGTCTTCACACCCACGAGGATGGCCATAAT 52657213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GGGAAGTGCAGTCAAAGCCACAGCATGATACGTCTTCACACCCACGAGGATGGCCATAAT 840

 52657214 CAGAGAGACAATAACCAGTGGTAGGGAAGATGTGAAAAAATCGGAATGCTCATGCATTGC 52657273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CAGAGAGACAATAACCAGTGGTAGGGAAGATGTGAAAAAATCGGAATGCTCATGCATTGC 900

 52657274 TGGTAGGAATGTGACATGGTGCAGCTGCTTTGGAAAGCAGTTTAACAGTTCCTGGAAAAG 52657333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGGTAGGAATGTGACATGGTGCAGCTGCTTTGGAAAGCAGTTTAACAGTTCCTGGAAAAG 960

 52657334 TTAAACATGGAGTTACCCTAAGACCCAGCAATTCCATTCCTAGGTAAGCAAGAAAATGAA 52657393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTAAACATGGAGTTACCCTAAGACCCAGCAATTCCATTCCTAGGTAAGCAAGAAAATGAA 1020

 52657394 AACATATGGCCACACAAAAACTTGTACACAAATGTCCATAGCAGCATTTTCATAATAGCT 52657453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AACATATGGCCACACAAAAACTTGTACACAAATGTCCATAGCAGCATTTTCATAATAGCT 1080

 52657454 GAAAAGTGGAAACAACCCAAATATCCATCAATTGGAAAAAGGAAATCTAGCATTTGCATA 52657513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GAAAAGTGGAAACAACCCAAATATCCATCAATTGGAAAAAGGAAATCTAGCATTTGCATA 1140

 52657514 TAATAGAGTATTAATCAGCCATAAGAAGAAACAAAGCACCGATCCATGTTATATCATGCT 52657573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TAATAGAGTATTAATCAGCCATAAGAAGAAACAAAGCACCGATCCATGTTATATCATGCT 1200

 52657574 TTATACTTGGAAGCATGGTACTAAGTGAAAGACGCCAGACACAAAAAGCAAAATATTGTA 52657633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTATACTTGGAAGCATGGTACTAAGTGAAAGACGCCAGACACAAAAAGCAAAATATTGTA 1260

 52657634 TGATTCCATTTATATAAAGTGTCTAGAATAGGCAAATCCATAGAGGCAGAAAACAGATTA 52657693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGATTCCATTTATATAAAGTGTCTAGAATAGGCAAATCCATAGAGGCAGAAAACAGATTA 1320

 52657694 GTGGTTGCCAGTGGCTGGGAATAGGGAAAAAACTCAGCGCTAAAGGGTAGGGAGTTTTGT 52657753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GTGGTTGCCAGTGGCTGGGAATAGGGAAAAAACTCAGCGCTAAAGGGTAGGGAGTTTTGT 1380

 52657754 TTTGGAGTAATGACGATGTTCTGGAATTAGACGTGGAACGATTGCACACATGGTGCAAAT 52657813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTTGGAGTAATGACGATGTTCTGGAATTAGACGTGGAACGATTGCACACATGGTGCAAAT 1440

 52657814 ATCCTTAAAATCACGGAATTGTCACTCTAAAAGGTGAATTTTATGGTAGGTGAATTGTAC 52657873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATCCTTAAAATCACGGAATTGTCACTCTAAAAGGTGAATTTTATGGTAGGTGAATTGTAC 1500

 52657874 CTCAATTTGTAAAAAGAAGAATTAGATAAATAAACAGCAACACAGCACCAAGGGGTGGGG 52657933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CTCAATTTGTAAAAAGAAGAATTAGATAAATAAACAGCAACACAGCACCAAGGGGTGGGG 1560

 52657934 GTAGGAAACAGACAACAAATAGGAGTGAAGAGTTCACAGGAAAAGACATGCAGCCAGCTT 52657993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GTAGGAAACAGACAACAAATAGGAGTGAAGAGTTCACAGGAAAAGACATGCAGCCAGCTT 1620

 52657994 TTAAGCAGAAGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTA 52658053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTAAGCAGAAGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTA 1680

 52658054 TGACACTTGGCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAATTGATGACCCCAGTGG 52658113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TGACACTTGGCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAATTGATGACCCCAGTGG 1740

 52658114 AAAGCGTATAAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCTTAACGCCTGTAATCCTA 52658173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AAAGCGTATAAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCTTAACGCCTGTAATCCTA 1800

 52658174 GCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCC 52658233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCC 1860

 52658234 AACATGGTGAAACACTGTCTCTGCTAAAAAACAAAACAAAACAAAACACCAAAAAATAGC 52658293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AACATGGTGAAACACTGTCTCTGCTAAAAAACAAAACAAAACAAAACACCAAAAAATAGC 1920

 52658294 TGGGCGTAGTGGCGGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTTGGGAGGCGGTGGCAGGAGAATCA 52658353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TGGGCGTAGTGGCGGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTTGGGAGGCGGTGGCAGGAGAATCA 1980

 52658354 TTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACTGCACTCTAACCTG 52658413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACTGCACTCTAACCTG 2040

 52658414 GGCAACAGAGTTCAGAGTGAGACTCTGTCTCCCCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 52658470
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GGCAACAGAGTTCAGAGTGAGACTCTGTCTCCCCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 2097

EXCISED REGION

 52658477 CCATATAGATCGTCGGTGGGAGTGTAATTTGGCCACTTCTTTGGAAAATAGCTCAGTAAT 52658536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CCATATAGATCGTCGGTGGGAGTGTAATTTGGCCACTTCTTTGGAAAATAGCTCAGTAAT 2160

 52658537 ATCTATTAATACTTAAAATTTCACAAACACTGTAAGTCTAACTTCCACTTCTAAAATGTT 52658596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ATCTATTAATACTTAAAATTTCACAAACACTGTAAGTCTAACTTCCACTTCTAAAATGTT 2220

 52658597 ATCCTAGAAATAAAATTGCATAGGGGTACAAAGGCTTACGTATGGAACTATTTGCTGGAC 52658656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ATCCTAGAAATAAAATTGCATAGGGGTACAAAGGCTTACGTATGGAACTATTTGCTGGAC 2280

 52658657 TACTGTAGTTGTGGCAAAAAACTGGAAATGACCTAAACGCTTATTAGTAGAAACCTGGTT 52658716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TACTGTAGTTGTGGCAAAAAACTGGAAATGACCTAAACGCTTATTAGTAGAAACCTGGTT 2340

 52658717 AAATAAATTATCATATGTCCTTGAGGACACAGGGACACAAAGAGGGGAATGACAGGCACT 52658776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AAATAAATTATCATATGTCCTTGAGGACACAGGGACACAAAGAGGGGAATGACAGGCACT 2400

 52658777 GAGCCTACTTGAGGGTGGGAGGAGGAAGTCGATCAGAAAAAATAACTAGTGGGTACTAGG 52658836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GAGCCTACTTGAGGGTGGGAGGAGGAAGTCGATCAGAAAAAATAACTAGTGGGTACTAGG 2460

 52658837 CTTAGTACCCGGGTGAAAAAATAATCTGTACAACAAACCCCCATGACATGAGTTTACCTT 52658896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CTTAGTACCCGGGTGAAAAAATAATCTGTACAACAAACCCCCATGACATGAGTTTACCTT 2520

 52658897 ATAACAAACCTGCACATGTAATCTGAACCTAGATAAAAGTTTAAAAAAATAAATAATCAT 52658956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 ATAACAAACCTGCACATGTAATCTGAACCTAGATAAAAGTTTAAAAAAATAAATAATCAT 2580

 52658957 ATGTCCCTACAATGAAATATTCCACAGGCATTAAAATTCCCCAAGGAATTTTAGTAAGGA 52659016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 ATGTCCCTACAATGAAATATTCCACAGGCATTAAAATTCCCCAAGGAATTTTAGTAAGGA 2640

 52659017 AAGAAAAAGCTGTGCCCAACAGCACGTACAGTATGTTTCCATTTGTTTTTAAAAAATGGT 52659076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 AAGAAAAAGCTGTGCCCAACAGCACGTACAGTATGTTTCCATTTGTTTTTAAAAAATGGT 2700

 52659077 GTCGGGAGGTTGAGGAGACAACTTATAAATAGACATGCCTGGGATACCTCTGGATATAAG 52659136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GTCGGGAGGTTGAGGAGACAACTTATAAATAGACATGCCTGGGATACCTCTGGATATAAG 2760

 52659137 AAACTGTAAAGTATTTACTTCTAAGGAAGGAAATTTGGGATGGGGCTTGGGGAGCCATCA 52659196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 AAACTGTAAAGTATTTACTTCTAAGGAAGGAAATTTGGGATGGGGCTTGGGGAGCCATCA 2820

 52659197 GAGTTAGGGTGGGGATTTTTTCTCTGCCTTATCTTATTATGTATATCGCTCAGAATGTTT 52659256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GAGTTAGGGTGGGGATTTTTTCTCTGCCTTATCTTATTATGTATATCGCTCAGAATGTTT 2880

 52659257 GCTATGTGTATGCACCTACCCCATCCATTAAGAAATGAAGAAATAATGAAAAGAAAAAAT 52659316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 GCTATGTGTATGCACCTACCCCATCCATTAAGAAATGAAGAAATAATGAAAAGAAAAAAT 2940

 52659317 GAAAGTAGGGAACTAGAAATGAGAGGTGGGATTCAAAGTGGACTGAACACTTGACCTATT 52659376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 GAAAGTAGGGAACTAGAAATGAGAGGTGGGATTCAAAGTGGACTGAACACTTGACCTATT 3000

 52659377 TCCCAATTTGCCTAGGGCTGGCCCAGCAGCGAGGCAGGTTCTAACCAATGAGCATCAGCT 52659436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TCCCAATTTGCCTAGGGCTGGCCCAGCAGCGAGGCAGGTTCTAACCAATGAGCATCAGCT 3060

 52659437 TTGAATGGAGGGGCTGATAGGCCAGGTGGGCCCTGCTTGCTGAGAGTGTCATGGCCTTAG 52659496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TTGAATGGAGGGGCTGATAGGCCAGGTGGGCCCTGCTTGCTGAGAGTGTCATGGCCTTAG 3120

 52659497 GGACATCTCCATGTTGCAGAGTCTGAGCCTCTGCTTGGCAAATTCAGAAAATCCAGCTTT 52659556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 GGACATCTCCATGTTGCAGAGTCTGAGCCTCTGCTTGGCAAATTCAGAAAATCCAGCTTT 3180

 52659557 TCTTTTTATATCACCTGGAGCTGATGTAACTCTCAGAAGGCATTTTTAAGAGGACTCATG 52659616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TCTTTTTATATCACCTGGAGCTGATGTAACTCTCAGAAGGCATTTTTAAGAGGACTCATG 3240

 52659617 AATTAACCACATAGCCAACTTACTGGCTTAAGACTACGTGACAGAAAGCTGCAAAGGGGG 52659676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 AATTAACCACATAGCCAACTTACTGGCTTAAGACTACGTGACAGAAAGCTGCAAAGGGGG 3300

 52659677 CCAGCCACTGGTAACATCCCACCACTGTCCCTCTCTGTGGAAAACACAGATGGGATGCAC 52659736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 CCAGCCACTGGTAACATCCCACCACTGTCCCTCTCTGTGGAAAACACAGATGGGATGCAC 3360

 52659737 ATTGTGACGGGCAGGATGCCTGGAGAGCCCACAAATCTGCAAGCACAGCTGAAATTGGTT 52659796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 ATTGTGACGGGCAGGATGCCTGGAGAGCCCACAAATCTGCAAGCACAGCTGAAATTGGTT 3420

 52659797 ACAGGATTTCAATGTTTCATTGCTTGAAGCTATGATAACTTGATGATGATGATGATGATG 52659856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 ACAGGATTTCAATGTTTCATTGCTTGAAGCTATGATAACTTGATGATGATGATGATGATG 3480

 52659857 ATGATGATGATGACGATGATTTTTTTTATAGCCATCTTTTTAGAGGGATTTGAGGTAGGG 52659916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 ATGATGATGATGACGATGATTTTTTTTATAGCCATCTTTTTAGAGGGATTTGAGGTAGGG 3540

 52659917 AAAAAAATAAACCTCACACTATCGGAGGTTGCCAACTATGAGGTCTGCTGATGGTTTGGC 52659976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 AAAAAAATAAACCTCACACTATCGGAGGTTGCCAACTATGAGGTCTGCTGATGGTTTGGC 3600

 52659977 CAACACAGTGTTTATATTTTTTTGAATTGGGAAATTTCATTTAAAAGTCCTAAAATCAGG 52660036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 CAACACAGTGTTTATATTTTTTTGAATTGGGAAATTTCATTTAAAAGTCCTAAAATCAGG 3660

 52660037 CTGTTATTGAAATATCTTATTATTGGCTCAGGGTTTCCCAGGGCAGCCATCCTTGAAGCT 52660096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 CTGTTATTGAAATATCTTATTATTGGCTCAGGGTTTCCCAGGGCAGCCATCCTTGAAGCT 3720

 52660097 GTGTGGAGCCCTATAAACAAGGACGCTTTCCAGTTCCCTGCAAACTCCATTTCATTCAGA 52660156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 GTGTGGAGCCCTATAAACAAGGACGCTTTCCAGTTCCCTGCAAACTCCATTTCATTCAGA 3780

 52660157 GCCTTGAGCCAGTTCTTACATGGTCCTCAGACTTGAGCTAGTGCAAGAATACCCGGGAGG 52660216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 GCCTTGAGCCAGTTCTTACATGGTCCTCAGACTTGAGCTAGTGCAAGAATACCCGGGAGG 3840

 52660217 GGTTGTGGGAACAGATAGCTGGGCCCCACCCCCAGGGAAGGGGGTGTTTCTGACTCAGGA 52660276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 GGTTGTGGGAACAGATAGCTGGGCCCCACCCCCAGGGAAGGGGGTGTTTCTGACTCAGGA 3900

 52660277 GGTCTGGGCTCCGGCTACAGAAACTGCACATCTAACCGGTACCCAGGTGATGTGATGCTG 52660336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 GGTCTGGGCTCCGGCTACAGAAACTGCACATCTAACCGGTACCCAGGTGATGTGATGCTG 3960

 52660337 CTGGCCCAGGGACAACTCTGCGAGTCACTGCTATTGGGCACTGCTATTGCACCCACACAA 52660396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 CTGGCCCAGGGACAACTCTGCGAGTCACTGCTATTGGGCACTGCTATTGCACCCACACAA 4020

 52660397 GGAGGCAGGCTCTGCTTACATTTTTCAGTTCTTGTTCCCAGAAACATTTGCTCTTTGGGG 52660456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 GGAGGCAGGCTCTGCTTACATTTTTCAGTTCTTGTTCCCAGAAACATTTGCTCTTTGGGG 4080

 52660457 TATGCTTTGCATATAATGGATCCTACCCACTAATACAGTATGCTGCTTTTATTGATAAAC 52660516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 TATGCTTTGCATATAATGGATCCTACCCACTAATACAGTATGCTGCTTTTATTGATAAAC 4140

 52660517 TTCCAGAAACTTGAAGCGCACCTTACCATTTCTTTGATCTCGCTGATTATTTTTATTTTT 52660576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 TTCCAGAAACTTGAAGCGCACCTTACCATTTCTTTGATCTCGCTGATTATTTTTATTTTT 4200

 52660577 GTTAAATGAAAATTGTTGGTAAGTTCTTTTTGGTGTGGTAAAAGGATATGAAAAGCTGAT 52660636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 GTTAAATGAAAATTGTTGGTAAGTTCTTTTTGGTGTGGTAAAAGGATATGAAAAGCTGAT 4260

 52660637 TTTAAAAAAATGTCCACTCTAGGATTAGAATTGTAGGTGTGTTTATTCTATTTCAAGATC 52660696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     4261 TTTAAAAAAATGTCCACTCTAGGATTAGAATTGTAGGTGTGTTTATCCTATTTCAAGATC 4320

 52660697 TGGTTAAAATGCACCTTGAGGAAAAGAATTGAGTGCAGCTGTTGTTATTTCTCAATGCTG 52660756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 TGGTTAAAATGCACCTTGAGGAAAAGAATTGAGTGCAGCTGTTGTTATTTCTCAATGCTG 4380

 52660757 TTTCTCTTTTCATGTTTTTTTCATGTTGTCTCTTGGTCTGTCCTATCTCTCTTGGTCTAT 52660816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 TTTCTCTTTTCATGTTTTTTTCATGTTGTCTCTTGGTCTGTCCTATCTCTCTTGGTCTAT 4440

 52660817 CCTCCAAGACAGAGATGAGTGATCTTGAAACCCTGCCCATGTTTTTATCTTTGGAGCCCA 52660876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 CCTCCAAGACAGAGATGAGTGATCTTGAAACCCTGCCCATGTTTTTATCTTTGGAGCCCA 4500

 52660877 ACTGTGCTGCCTTGTTTTCTTCTCCATCCAAAGAGGCAAAGAGAAAGTTGCATATTACTC 52660936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 ACTGTGCTGCCTTGTTTTCTTCTCCATCCAAAGAGGCAAAGAGAAAGTTGCATATTACTC 4560

 52660937 AACAGCAGTTGCATGACAGTTAAAATCAGACTGTATGAGTCATGGAACAGTAAGTTGTGT 52660996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 AACAGCAGTTGCATGACAGTTAAAATCAGACTGTATGAGTCATGGAACAGTAAGTTGTGT 4620

 52660997 CCAGAGTATCTGTCATGGTAAGTACAAAAAAGTCCTTAAAAATTTAAAACAGAAATGCCA 52661056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 CCAGAGTATCTGTCATGGTAAGTACAAAAAAGTCCTTAAAAATTTAAAACAGAAATGCCA 4680

 52661057 ATGTTTTATTTTTGAAAAATGTGAAGAAGAAATTTTCCGGCCGGGCGCGGTGGCTCATGC 52661116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 ATGTTTTATTTTTGAAAAATGTGAAGAAGAAATTTTCCGGCCGGGCGCGGTGGCTCATGC 4740

 52661117 CTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGA 52661176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 CTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGA 4800

 52661177 GACCAGCCTGGCCAACACAGTGCAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGA 52661236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 GACCAGCCTGGCCAACACAGTGCAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGA 4860

 52661237 TGCGGTGGCACGCGCCTGTAATCTCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCATGACAATCGCTTG 52661296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 TGCGGTGGCACGCGCCTGTAATCTCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCATGACAATCGCTTG 4920

 52661297 AACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCATACCACTGCACTCCAGCTTGGGCA 52661356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 AACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCATACCACTGCACTCCAGCTTGGGCA 4980

 52661357 GCGGAAGGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAGAAAAAAAGAAATTTTCTAAGTGTATTCC 52661416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 GCGGAAGGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAGAAAAAAAGAAATTTTCTAAGTGTATTCC 5040

 52661417 AAATAACTTTTAATATTGGATAAACATTACGAGTTTAAAAATACTTATGCCAGAGGAGTG 52661476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 AAATAACTTTTAATATTGGATAAACATTACGAGTTTAAAAATACTTATGCCAGAGGAGTG 5100

 52661477 CTGTGACTCGTGCCTCTAATCCCAGCAATGTGGGAGGCCAAGGAGGGACAGTCACTTGAG 52661536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 CTGTGACTCGTGCCTCTAATCCCAGCAATGTGGGAGGCCAAGGAGGGACAGTCACTTGAG 5160

 52661537 CCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGATAACAAAGGGAGACCTCATCTTTACAAAAAAACTA 52661596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 CCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGATAACAAAGGGAGACCTCATCTTTACAAAAAAACTA 5220

 52661597 AAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGTGTGTGCCTGTGATCCCAGCTACACAGGAGGCTGAGGC 52661656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 AAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGTGTGTGCCTGTGATCCCAGCTACACAGGAGGCTGAGGC 5280

 52661657 AAGAGGATTCCTTGAGCCCTGGAGGTCAAGGCTGCAGTGAGTGATGATCATGCCATTGCA 52661716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 AAGAGGATTCCTTGAGCCCTGGAGGTCAAGGCTGCAGTGAGTGATGATCATGCCATTGCA 5340

 52661717 CTCCAGCTGGGTGACAGAGCAAGACCTCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAACAAAACAAAAC 52661776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
     5341 CTCCAGCTGGGTGACAGAGCAAGACCTCATCTC-AAAAAAAAAAAAAAACAAAACAAAAC 5399

 52661777 AAAAAACTTACGCCCAGGTAAAAATTGTCAGAGAAAAATAAGAAAAAAACTGAATGCCCA 52661836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5400 AAAAAACTTACGCCCAGGTAAAAATTGTCAGAGAAAAATAAGAAAAAAACTGAATGCCCA 5459

 52661837 AAATTAGCATAATGGCTGAATGAATTATAGTATGTCTATACCTTGAAGTACATTGTAGCT 52661896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5460 AAATTAGCATAATGGCTGAATGAATTATAGTATGTCTATACCTTGAAGTACATTGTAGCT 5519

 52661897 TTAAAAAAAATGAATTAAAGTTATACCAGTTGAATTTGGAGTTGAGATGGGGAAGATTAT 52661956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5520 TTAAAAAAAATGAATTAAAGTTATACCAGTTGAATTTGGAGTTGAGATGGGGAAGATTAT 5579

 52661957 TACAATTAAAAAAAAACAAACACTATTAATGGATGTGCTGGGAAATGTCTGTATGGGGCT 52662016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5580 TACAATTAAAAAAAAACAAACACTATTAATGGATGTGCTGGGAAATGTCTGTATGGGGCT 5639

 52662017 AGTTAAAGTAAATTAAAATAAAGACCAGACCTGAAGAATCCCTGAGCGGACAAAGCCTGT 52662076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5640 AGTTAAAGTAAATTAAAATAAAGACCAGACCTGAAGAATCCCTGAGCGGACAAAGCCTGT 5699

 52662077 TAGACCACATAAATGAGCTAAACCTTGCTTGATTTGCAGACATAAGCAAAACAACTCGAA 52662136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5700 TAGACCACATAAATGAGCTAAACCTTGCTTGATTTGCAGACATAAGCAAAACAACTCGAA 5759

 52662137 CTGTTTCTTGTAAATGCCTATGCTAAAGAAAAACAGAACTTGAGCTCAACCAATCAGAAA 52662196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5760 CTGTTTCTTGTAAATGCCTATGCTAAAGAAAAACAGAACTTGAGCTCAACCAATCAGAAA 5819

 52662197 CAGTCAACAAACTTAAAATTATATAACTGGGTACCTTCCAATGAGATGATCAAATAAGGC 52662256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5820 CAGTCAACAAACTTAAAATTATATAACTGGGTACCTTCCAATGAGATGATCAAATAAGGC 5879

 52662257 AACTGTGTAATTGTAACACATCAAACACATTTTATATTATGCCTCTGCATTTTCCCTTAA 52662316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5880 AACTGTGTAATTGTAACACATCAAACACATTTTATATTATGCCTCTGCATTTTCCCTTAA 5939

 52662317 TTCTGGCATGTAATGCTTTGTCATCAAAACACTAATTCCCTTTTGGTTTTCTTTTCTCAA 52662376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5940 TTCTGGCATGTAATGCTTTGTCATCAAAACACTAATTCCCTTTTGGTTTTCTTTTCTCAA 5999

 52662377 ATTAATGAATTGCCTCTATTCAGATACACTCTTTGAAATTTTATTGTGTCTCAGATTTGT 52662436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6000 ATTAATGAATTGCCTCTATTCAGATACACTCTTTGAAATTTTATTGTGTCTCAGATTTGT 6059

 52662437 CTTTTACAAAGTATAGAACAAAGAGAAAAATATGAAAGAAGAAATATTAGGTTGTTAGCT 52662496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6060 CTTTTACAAAGTATAGAACAAAGAGAAAAATATGAAAGAAGAAATATTAGGTTGTTAGCT 6119

 52662497 TGGGTGTCCTTGGAGGGGGTAGGGAAGATGTGAGATGAGGAAGAAGCCAATAAGAAAAAG 52662556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6120 TGGGTGTCCTTGGAGGGGGTAGGGAAGATGTGAGATGAGGAAGAAGCCAATAAGAAAAAG 6179

 52662557 AAAAAGACAGGTTTCACCAAAACAACAATAACAGAAAATATGATTGCATTTATTCATATA 52662616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6180 AAAAAGACAGGTTTCACCAAAACAACAATAACAGAAAATATGATTGCATTTATTCATATA 6239

 52662617 TGTTAATTGGTATGTATGTAAGTATATATGCATGTAAAAATAAAATACAAAGAATTAAAA 52662676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6240 TGTTAATTGGTATGTATGTAAGTATATATGCATGTAAAAATAAAATACAAAGAATTAAAA 6299

 52662677 TGCATACTAATAGTTATTTCAGTTATCTATGGCTGTGTAACAAGCATCCCCAAAATGATT 52662736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6300 TGCATACTAATAGTTATTTCAGTTATCTATGGCTGTGTAACAAGCATCCCCAAAATGATT 6359

 52662737 GACTTAACCACCATTTTATTAGGTCATGATTCCATGCATTAAGAATTCAGGGCCGGGTGC 52662796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6360 GACTTAACCACCATTTTATTAGGTCATGATTCCATGCATTAAGAATTCAGGGCCGGGTGC 6419

 52662797 GGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGTGGATCACGAGGTC 52662856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6420 GGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGTGGATCACGAGGTC 6479

 52662857 AGGAGTTTGAGACCAGCCTGCCCAACATAGTGGAACCCCGTCTGTACTAAAAATACAGAA 52662916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6480 AGGAGTTTGAGACCAGCCTGCCCAACATAGTGGAACCCCGTCTGTACTAAAAATACAGAA 6539

 52662917 GATTAGCTGGGTGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAG 52662975
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6540 GATTAGCTGGGTGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAG 6598

Alignment time is 7.54052 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [52637064,52668002] =>     30939 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,   10752] =>     10752 nucs 'mol-32-34d4-137791_10752'

Score:       10731
Aligned:     10753        nucs
Identic:     10751 (100%) nucs =>      1146 (100%)      9605 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [52650789,52651935] EXCISED REGION [52651938,52661542]
 second seq =>  [       1,    1146] EXCISED REGION [    1147,   10752]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [52651936,52651937]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [52651936,52651937] to [52651938,52651939]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 52650789 CCTATTCAACATAGTATTGGAAGTCTTGGCCAGGGCAATCGGGCAAGAGAAATAAATAAA 52650848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCTATTCAACATAGTATTGGAAGTCTTGGCCAGGGCAATCGGGCAAGAGAAATAAATAAA 60

 52650849 GCGCATCCAAATAGGAAGAGAGGAAGTCAAACTATCCTTGTTTGCAGATTACATGACATT 52650908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCGCATCCAAATAGGAAGAGAGGAAGTCAAACTATCCTTGTTTGCAGATTACATGACATT 120

 52650909 ATATCTAGAAAACCCCATAGTCTCAGCCCCAAAGCTTCTTAAGCTGATAAACAACTTCAG 52650968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATATCTAGAAAACCCCATAGTCTCAGCCCCAAAGCTTCTTAAGCTGATAAACAACTTCAG 180

 52650969 CAAAGTCTCAGGATACAAAATAAATGTGCAAAAATTACTGGCATTTCCATGCACCAACAA 52651028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CAAAGTCTCAGGATACAAAATAAATGTGCAAAAATTACTGGCATTTCCATGCACCAACAA 240

 52651029 CAGTCAAGCCAGGAGCCAAACCAGGAATGCACTCCCACTCACAATCGCCACAAAAAGAGT 52651088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CAGTCAAGCCAGGAGCCAAACCAGGAATGCACTCCCACTCACAATCGCCACAAAAAGAGT 300

 52651089 AAAATACCTAGGAAAACAGCTAATTAGGGAGGTGAAAGATCTCTACAAGGAGAATAATGA 52651148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAAATACCTAGGAAAACAGCTAATTAGGGAGGTGAAAGATCTCTACAAGGAGAATAATGA 360

 52651149 ACCAGCGCTCAAAGAAATTAGAGATGACACAAACAAATGGAAAAACATTCCATGTTCATT 52651208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACCAGCGCTCAAAGAAATTAGAGATGACACAAACAAATGGAAAAACATTCCATGTTCATT 420

 52651209 GATAGGAAGAATCAATATCATTAAAATGGCCATATTGCCCAGAGCAATTTATAGATTCAA 52651268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GATAGGAAGAATCAATATCATTAAAATGGCCATATTGCCCAGAGCAATTTATAGATTCAA 480

 52651269 TGCTATACCTATTAAACTACTGTTGAGATTCTTCACAGAACCAGAGAAAACTATTTTAAA 52651328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGCTATACCTATTAAACTACTGTTGAGATTCTTCACAGAACCAGAGAAAACTATTTTAAA 540

 52651329 ATTCATATAGAACCCAGAAAAGAGCCTGAATTGCTAAGGCAATCCTAAGCAAAAAGCATA 52651388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATTCATATAGAACCCAGAAAAGAGCCTGAATTGCTAAGGCAATCCTAAGCAAAAAGCATA 600

 52651389 AAGCTGAAGGCATCATGCTACCTGACTTCAAACTATACTACAAGGCTACAGTAACCAAAA 52651448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAGCTGAAGGCATCATGCTACCTGACTTCAAACTATACTACAAGGCTACAGTAACCAAAA 660

 52651449 CAGCATACTACTGGTACAAAAACAGACACATAGACCAATGGAACAGAATAGAGAACCCGG 52651508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CAGCATACTACTGGTACAAAAACAGACACATAGACCAATGGAACAGAATAGAGAACCCGG 720

 52651509 AAATAAGACCACACACCTACAACTATCTAATCTTTGACAAACCTGACAAAAACATGCAAT 52651568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAATAAGACCACACACCTACAACTATCTAATCTTTGACAAACCTGACAAAAACATGCAAT 780

 52651569 GGGGAAAAGATTTCCTATTCAATAAAAAGTGCTGGGATAACCGGCTAGCTGTACACAGAA 52651628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GGGGAAAAGATTTCCTATTCAATAAAAAGTGCTGGGATAACCGGCTAGCTGTACACAGAA 840

 52651629 GATTAAAGCTGGACCCCTTCCTTACAACATATACAAAAATCGGCCGGGCTTGGTGGCTCA 52651688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GATTAAAGCTGGACCCCTTCCTTACAACATATACAAAAATCGGCCGGGCTTGGTGGCTCA 900

 52651689 CGCTTGTAATCCCAGCACTTTGGAAGGCCGAGGAGGGCGGATCATGAGGTCAGGAGATCG 52651748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CGCTTGTAATCCCAGCACTTTGGAAGGCCGAGGAGGGCGGATCATGAGGTCAGGAGATCG 960

 52651749 AGAACACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGTGTGGTGGCA 52651808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AGAACACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGTGTGGTGGCA 1020

 52651809 GGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGAGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGTGTGAACCCGGGA 52651868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGAGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGTGTGAACCCGGGA 1080

 52651869 GACAGAGCTTGCACTGAGCCGAGACCACATCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGTGA 52651928
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
     1081 GACAGAGCTTGCACTGAGCCGAGACCACATCACTGCACTCCAGCCTGGGC-ACAGAGTGA 1139

 52651929 GACTCCG 52651935
          |||||||
     1140 GACTCCG 1146

EXCISED REGION

 52651938 TCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAGACATACAGGTAGTCAACAAGCATATGAAAAAAAG 52651997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1147 TCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAGACATACAGGTAGTCAACAAGCATATGAAAAAAAG 1206

 52651998 CTCAATATTACTAATCATCAGAGAAATGCAAATCAAAAACCACAATGAGATACCATCTAA 52652057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1207 CTCAATATTACTAATCATCAGAGAAATGCAAATCAAAAACCACAATGAGATACCATCTAA 1266

 52652058 TACCAGTCAGAATGATATTATTAAAAAGTCAAAAAATAAGATGCTGGTGAGGTAGTGGAG 52652117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1267 TACCAGTCAGAATGATATTATTAAAAAGTCAAAAAATAAGATGCTGGTGAGGTAGTGGAG 1326

 52652118 AGAAAGGAATGCTTATACACTGTTGGTGGGAGTGTAAATTAGTTCAACCATTGTGGAAGA 52652177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1327 AGAAAGGAATGCTTATACACTGTTGGTGGGAGTGTAAATTAGTTCAACCATTGTGGAAGA 1386

 52652178 CAGTGTGGCAATTCCTCAAAGACCTAAAGATAGAAATACCATTCCACCCAGCAATTCCAT 52652237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1387 CAGTGTGGCAATTCCTCAAAGACCTAAAGATAGAAATACCATTCCACCCAGCAATTCCAT 1446

 52652238 TACTGGGTACATACCCGAAAAATAGAAATCATTCTTTTATAAAGATACATGCATGTGTAT 52652297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1447 TACTGGGTACATACCCGAAAAATAGAAATCATTCTTTTATAAAGATACATGCATGTGTAT 1506

 52652298 GTTCATTGCAGCACTATTCACAATAGCAAAAACATGGAATCAACCTAAATACCCACCAAT 52652357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1507 GTTCATTGCAGCACTATTCACAATAGCAAAAACATGGAATCAACCTAAATACCCACCAAT 1566

 52652358 GATAGCCTGGATAAAGAAAATGTGGTACATATACACCATGGAATACTATGCAGCCATAAA 52652417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1567 GATAGCCTGGATAAAGAAAATGTGGTACATATACACCATGGAATACTATGCAGCCATAAA 1626

 52652418 AAGAACGAGATCATGTCCTTTGCAGGAACATGAATGGAGCTGAAGGCCATTATCCTTAGC 52652477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1627 AAGAACGAGATCATGTCCTTTGCAGGAACATGAATGGAGCTGAAGGCCATTATCCTTAGC 1686

 52652478 AAAGTATTGCCGAAAAAGAAAATCAAATACTACATGTTCTCACTTATAAATGGGAGCTAA 52652537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1687 AAAGTATTGCCGAAAAAGAAAATCAAATACTACATGTTCTCACTTATAAATGGGAGCTAA 1746

 52652538 ATGATGAGAACACATGGCCACACAGGGGGAACAACACACACTGGGGCCTATTGGAGGGTG 52652597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1747 ATGATGAGAACACATGGCCACACAGGGGGAACAACACACACTGGGGCCTATTGGAGGGTG 1806

 52652598 GAAGGTGGGAGGAGGGAGAGGATCAGGAAAAATAATTAATAGATATTATTTCATCACCCA 52652657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1807 GAAGGTGGGAGGAGGGAGAGGATCAGGAAAAATAATTAATAGATATTATTTCATCACCCA 1866

 52652658 GGTATTAATAATACCTATTTCATCACCCAGGCTTGATACCTGGGTGACAACAAACCCCCA 52652717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1867 GGTATTAATAATACCTATTTCATCACCCAGGCTTGATACCTGGGTGACAACAAACCCCCA 1926

 52652718 TGACACAAATTTACCTATATAACAAACCTGCCCGTGTACCCCTGAACTTAAAATAAAAGT 52652777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1927 TGACACAAATTTACCTATATAACAAACCTGCCCGTGTACCCCTGAACTTAAAATAAAAGT 1986

 52652778 TAAAAAAATGCAAAAAGATGACATACCAAAGAGATGTTACTTTTCATTTTTAAAAAAGTC 52652837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1987 TAAAAAAATGCAAAAAGATGACATACCAAAGAGATGTTACTTTTCATTTTTAAAAAAGTC 2046

 52652838 AAAGAATTTAAGGAAAATTAAAAAGAAATCAAGAATGACAGTAGCAGCTCCAAAATATTT 52652897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2047 AAAGAATTTAAGGAAAATTAAAAAGAAATCAAGAATGACAGTAGCAGCTCCAAAATATTT 2106

 52652898 AGAAGGTAGAGTTGAAAATTTTGATTTTCTTAGTGCAGAAAAATATTTTGTGCTGCATGT 52652957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2107 AGAAGGTAGAGTTGAAAATTTTGATTTTCTTAGTGCAGAAAAATATTTTGTGCTGCATGT 2166

 52652958 TTTTTTAAAGAAAGTCATTTTATCTGTATATGTGATTAAAACCTTATTTCCAGTGCCATC 52653017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2167 TTTTTTAAAGAAAGTCATTTTATCTGTATATGTGATTAAAACCTTATTTCCAGTGCCATC 2226

 52653018 TTCGTGTAATTGTTAAGAACTTGGATTGTGGATCACAGGAACCTGGCTTTGACTCTTAAC 52653077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2227 TTCGTGTAATTGTTAAGAACTTGGATTGTGGATCACAGGAACCTGGCTTTGACTCTTAAC 2286

 52653078 TGCTCACTCTTTAAATGGATAACCCGGGTAAGTTATTTCCTGTCTCTGTGCCTCAGTTTT 52653137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2287 TGCTCACTCTTTAAATGGATAACCCGGGTAAGTTATTTCCTGTCTCTGTGCCTCAGTTTT 2346

 52653138 CTTACAAATTGGCATGAAAATAACAGTGCCTCCTTCAGAGGGTAATTCTGAGGATTAAAT 52653197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2347 CTTACAAATTGGCATGAAAATAACAGTGCCTCCTTCAGAGGGTAATTCTGAGGATTAAAT 2406

 52653198 GAAATATTGCCCATACAGTGCTTACCACAGGCTGGTAGATGATTGGTATTCGGTAAACAG 52653257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2407 GAAATATTGCCCATACAGTGCTTACCACAGGCTGGTAGATGATTGGTATTCGGTAAACAG 2466

 52653258 TAGTTATTTTTGTTATACTAATATGTTATTAATATAATTACCATTTTGTATTTTTAAATG 52653317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2467 TAGTTATTTTTGTTATACTAATATGTTATTAATATAATTACCATTTTGTATTTTTAAATG 2526

 52653318 TAAGCCATAAGGAAAGGAATTATTCCAATAGTTTAATTTACAAACTTGAGTTTTCTAGAA 52653377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2527 TAAGCCATAAGGAAAGGAATTATTCCAATAGTTTAATTTACAAACTTGAGTTTTCTAGAA 2586

 52653378 AGACTTTTAAAAACAGTAGTGATATAAATCAATTTATCTTAAGAAACATAAGTATCTGGG 52653437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2587 AGACTTTTAAAAACAGTAGTGATATAAATCAATTTATCTTAAGAAACATAAGTATCTGGG 2646

 52653438 CCAGGCAAGTTTCAGAAATGTTTATCATTTTCAAAGTACCAAATATTCTCGTCAAAACAA 52653497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2647 CCAGGCAAGTTTCAGAAATGTTTATCATTTTCAAAGTACCAAATATTCTCGTCAAAACAA 2706

 52653498 GCTGCTTCATCAGAGTTCTAATTATATATTTAAACATACATGCACACACACACGTTTGTA 52653557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2707 GCTGCTTCATCAGAGTTCTAATTATATATTTAAACATACATGCACACACACACGTTTGTA 2766

 52653558 TTACAATATTCAAAACTTCTGAGGAAGAATTATCTTTTTTTTTTCATGTGCCAAAGCTAA 52653617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2767 TTACAATATTCAAAACTTCTGAGGAAGAATTATCTTTTTTTTTTCATGTGCCAAAGCTAA 2826

 52653618 AACTTTCACTTGCTACAGCTGTGTATTAGTCTATTTCCATACTGCTATAAAGAGCTGCCC 52653677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2827 AACTTTCACTTGCTACAGCTGTGTATTAGTCTATTTCCATACTGCTATAAAGAGCTGCCC 2886

 52653678 AAGACTGGGTGATTTATAAAGGAAAGAGGTTTAATTGACTCACAGTTCAGCATGGCAGGG 52653737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2887 AAGACTGGGTGATTTATAAAGGAAAGAGGTTTAATTGACTCACAGTTCAGCATGGCAGGG 2946

 52653738 AAGGCCTCAGGAAACTTACAATCATGGTGGAAGTCAAAGGGGGAGCAAGGACCTTTCTTC 52653797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2947 AAGGCCTCAGGAAACTTACAATCATGGTGGAAGTCAAAGGGGGAGCAAGGACCTTTCTTC 3006

 52653798 ACAAGGCAGCAGAAAGAAGTGCCAAATGAACAGGGAAGAGCTCCTTATGAAACCATCAGG 52653857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3007 ACAAGGCAGCAGAAAGAAGTGCCAAATGAACAGGGAAGAGCTCCTTATGAAACCATCAGG 3066

 52653858 TCTTGTGAGAACTCACTTACTTTTATGAGAACAGCATGGAGGAAACTGTCCCCATGATCC 52653917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3067 TCTTGTGAGAACTCACTTACTTTTATGAGAACAGCATGGAGGAAACTGTCCCCATGATCC 3126

 52653918 AATCACCTCCACCTGGTCTCTCCCTTGACACGTGGGGATTATGGGGATTAAATTCCAGAT 52653977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3127 AATCACCTCCACCTGGTCTCTCCCTTGACACGTGGGGATTATGGGGATTAAATTCCAGAT 3186

 52653978 GAGATTTGGGTGGGGACAAAAAGCCTAACGACATCAAGCTGTAAAAACAATAGCTAACAT 52654037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3187 GAGATTTGGGTGGGGACAAAAAGCCTAACGACATCAAGCTGTAAAAACAATAGCTAACAT 3246

 52654038 TCATTGACTGTTTCCCAGCATTAGGATAAATGTGTGTAACAAGAGGCATTTTATTTATGT 52654097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3247 TCATTGACTGTTTCCCAGCATTAGGATAAATGTGTGTAACAAGAGGCATTTTATTTATGT 3306

 52654098 ATGACATTTGTTTATTTATTATTTATTTATTTGGATAAATGTCTATAACAAGAAACATTT 52654157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3307 ATGACATTTGTTTATTTATTATTTATTTATTTGGATAAATGTCTATAACAAGAAACATTT 3366

 52654158 TATTTAAGTATAACAGCAAATCTACAAGTTAGGTACTATCATCACTCCCATTTTACAGGT 52654217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3367 TATTTAAGTATAACAGCAAATCTACAAGTTAGGTACTATCATCACTCCCATTTTACAGGT 3426

 52654218 CGTGAAACTGAGGCTCTGAAAAGTCAAGTCAGTTTTCTAATGTTGTCCAGCTAATGACTG 52654277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3427 CGTGAAACTGAGGCTCTGAAAAGTCAAGTCAGTTTTCTAATGTTGTCCAGCTAATGACTG 3486

 52654278 GTAGATTTAGTATTTGAACCCACATTTGCCTGATTCCAAAGTTCAAACTCCCAACAACAT 52654337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3487 GTAGATTTAGTATTTGAACCCACATTTGCCTGATTCCAAAGTTCAAACTCCCAACAACAT 3546

 52654338 GTGGTAACCAAAGCAGGAACAGAAGAGAAAGAAGAAATAGAAGGGAGGGAAGATGAACAA 52654397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3547 GTGGTAACCAAAGCAGGAACAGAAGAGAAAGAAGAAATAGAAGGGAGGGAAGATGAACAA 3606

 52654398 AGTAGACAAAGTTTAGTTAATAGAATTAGTGGATACCCAAGAAAAAACTATGTACAAGAG 52654457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3607 AGTAGACAAAGTTTAGTTAATAGAATTAGTGGATACCCAAGAAAAAACTATGTACAAGAG 3666

 52654458 GGGGAAAAAAACCCTGTTTTCTCACATCTGGGAAACATTGATATCTATATATTTTTGGTT 52654517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3667 GGGGAAAAAAACCCTGTTTTCTCACATCTGGGAAACATTGATATCTATATATTTTTGGTT 3726

 52654518 TTAAATAAAAATTAGGTTATGTCATTCATTTGCATAAAACCATCCAAAGAAGGGCCTCAC 52654577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3727 TTAAATAAAAATTAGGTTATGTCATTCATTTGCATAAAACCATCCAAAGAAGGGCCTCAC 3786

 52654578 AAAATTAAAACAAAATCCAAACTCTCTACTATGGGCCACACCCTCCAGAACTTCAGCTCG 52654637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3787 AAAATTAAAACAAAATCCAAACTCTCTACTATGGGCCACACCCTCCAGAACTTCAGCTCG 3846

 52654638 TACTATGTTTTTCCTCACACCTCTCAACATACCAACATGTTTCCACCTGCAGCCCTCACC 52654697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3847 TACTATGTTTTTCCTCACACCTCTCAACATACCAACATGTTTCCACCTGCAGCCCTCACC 3906

 52654698 ACTAGTTATTCTTTCAATCTGGAAATATTTTCGCTAAGATCTTCCTATGGTTACCTTCTT 52654757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3907 ACTAGTTATTCTTTCAATCTGGAAATATTTTCGCTAAGATCTTCCTATGGTTACCTTCTT 3966

 52654758 ATCATTCAAGACTTAGGTTATGTCAGGCCTTCCCTGACTCCTCCATCTGAAGTAACCCCT 52654817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3967 ATCATTCAAGACTTAGGTTATGTCAGGCCTTCCCTGACTCCTCCATCTGAAGTAACCCCT 4026

 52654818 CCTGCTTACTCCTGTTTATTCTCTAGACTCCACAGAGGATTCATCACTCTCTGAAATGAT 52654877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4027 CCTGCTTACTCCTGTTTATTCTCTAGACTCCACAGAGGATTCATCACTCTCTGAAATGAT 4086

 52654878 CCCATTAATTTCTTCTTCACTTGTTTCCTCTCCACGACCTGTAAGCCCCAAGTGGACCCG 52654937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4087 CCCATTAATTTCTTCTTCACTTGTTTCCTCTCCACGACCTGTAAGCCCCAAGTGGACCCG 4146

 52654938 GACTTGGTCTGCTCTGCTTACAGCTGGATTCCAGTTCCCATAGTGCTAGACACTAGGATT 52654997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4147 GACTTGGTCTGCTCTGCTTACAGCTGGATTCCAGTTCCCATAGTGCTAGACACTAGGATT 4206

 52654998 AAGCCAGGAAACATGGGTGAAGCAGCAAGCACAGAGCTTGGGGCACAGCCTAGCAAACAC 52655057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4207 AAGCCAGGAAACATGGGTGAAGCAGCAAGCACAGAGCTTGGGGCACAGCCTAGCAAACAC 4266

 52655058 TCCACAAAGGACCATGATTGTAACTGTAGTAGGGCACACCAATGAACAGGTTGGGAAACT 52655117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4267 TCCACAAAGGACCATGATTGTAACTGTAGTAGGGCACACCAATGAACAGGTTGGGAAACT 4326

 52655118 GAGTCTCTGAGAAGAGACTAATGTTGTGCTGGATGAAATTTCTTTTTCTGACAATACATT 52655177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4327 GAGTCTCTGAGAAGAGACTAATGTTGTGCTGGATGAAATTTCTTTTTCTGACAATACATT 4386

 52655178 ATCCAAATCCTCCAAGCTTTCAGTTTAAAGGGGAAAGCAGGAACTATCATTATAATTTTA 52655237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4387 ATCCAAATCCTCCAAGCTTTCAGTTTAAAGGGGAAAGCAGGAACTATCATTATAATTTTA 4446

 52655238 TTTACAAAGTGTCCATGTATGAACATTATTCACCGCCGAATCATCTCTTCCTATGCAAGC 52655297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4447 TTTACAAAGTGTCCATGTATGAACATTATTCACCGCCGAATCATCTCTTCCTATGCAAGC 4506

 52655298 AACACCGTCCTATGCATCAATATCCTGATCTGTCAGGATTCAGGATAAAGTGGACATATA 52655357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4507 AACACCGTCCTATGCATCAATATCCTGATCTGTCAGGATTCAGGATAAAGTGGACATATA 4566

 52655358 CACACTAATTGCAAAGGGAAATTGTACATCTTGCAAAAGATGCAGGGGTTTATAGAGTCT 52655417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4567 CACACTAATTGCAAAGGGAAATTGTACATCTTGCAAAAGATGCAGGGGTTTATAGAGTCT 4626

 52655418 TGTAACATTGGTGAGCTGCTCAGATCACACACATGACCGTGGTTGGACAAGGATCTGGCA 52655477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4627 TGTAACATTGGTGAGCTGCTCAGATCACACACATGACCGTGGTTGGACAAGGATCTGGCA 4686

 52655478 AAGTTAACACAGATCACCGAAGAAGGAAAAGTGGACAACACAACACAGTAAGTTCTTCAA 52655537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4687 AAGTTAACACAGATCACCGAAGAAGGAAAAGTGGACAACACAACACAGTAAGTTCTTCAA 4746

 52655538 AAGAGTTATATTAGAATATCAAAAGATTATGTTAGGCCTTTGGGAAAACTCAAAACTTTA 52655597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4747 AAGAGTTATATTAGAATATCAAAAGATTATGTTAGGCCTTTGGGAAAACTCAAAACTTTA 4806

 52655598 TGAAGACCTCAAAAAATTATGCAAAAATGACCCTTCAATGGTCATGCTGCAAGAGTCAAA 52655657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4807 TGAAGACCTCAAAAAATTATGCAAAAATGACCCTTCAATGGTCATGCTGCAAGAGTCAAA 4866

 52655658 TGACACTTCAAACAACTGCGGCTTTCTATGTTGTGCAAATGCATTTGTTGTTTTAAAGGT 52655717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4867 TGACACTTCAAACAACTGCGGCTTTCTATGTTGTGCAAATGCATTTGTTGTTTTAAAGGT 4926

 52655718 CGTAAAGTCAGGGTACACGTGGCAGATACTTATGACTTGGAGGAAGACGTTAGATTAGAT 52655777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4927 CGTAAAGTCAGGGTACACGTGGCAGATACTTATGACTTGGAGGAAGACGTTAGATTAGAT 4986

 52655778 TTGAAACTTTCACTGAATGATCGCATTTCATGCTTTTCATCTGTACATTAAAAAGCCAGA 52655837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4987 TTGAAACTTTCACTGAATGATCGCATTTCATGCTTTTCATCTGTACATTAAAAAGCCAGA 5046

 52655838 ATGTCTTTGCCAAGAAATTCTAGCATAAATAAAAGAAAAGGATGGGATTTTGGAACATCA 52655897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5047 ATGTCTTTGCCAAGAAATTCTAGCATAAATAAAAGAAAAGGATGGGATTTTGGAACATCA 5106

 52655898 TGGTAGAATTCTTGACTATCAGCTTTATACAACATGTCTGGACATTTAGTGATGGAAATG 52655957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5107 TGGTAGAATTCTTGACTATCAGCTTTATACAACATGTCTGGACATTTAGTGATGGAAATG 5166

 52655958 CTGGATTCCAAAGGAATGTAGGCAAAGGTACTACTACCCCCATGCTCTTCAGAAAACATC 52656017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5167 CTGGATTCCAAAGGAATGTAGGCAAAGGTACTACTACCCCCATGCTCTTCAGAAAACATC 5226

 52656018 CTCTAAAAGCAACAGTGATGATCAGATACTGTGGGGCAAGACTGACAGTGACACTCAAGA 52656077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5227 CTCTAAAAGCAACAGTGATGATCAGATACTGTGGGGCAAGACTGACAGTGACACTCAAGA 5286

 52656078 TTTCCACTCTTCTCTTTAATCATATATTTCCTGTCATTCATGTGCTACAAAACTCTGGAA 52656137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5287 TTTCCACTCTTCTCTTTAATCATATATTTCCTGTCATTCATGTGCTACAAAACTCTGGAA 5346

 52656138 TATGCAAAGCTCATTCAAATGCAAAACCAGCCTTTGCTCCAACATGAGCATATATTTTCA 52656197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5347 TATGCAAAGCTCATTCAAATGCAAAACCAGCCTTTGCTCCAACATGAGCATATATTTTCA 5406

 52656198 TTTAAAGACAAATCAGATGTTTCATTTGATTTTTTTTATAAATCTGATAATAATGTACAT 52656257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5407 TTTAAAGACAAATCAGATGTTTCATTTGATTTTTTTTATAAATCTGATAATAATGTACAT 5466

 52656258 TTAACCCGTGTTTACAACCAAAATAATTAATCTCTCTGAACCCTTTGTTTTTCCTGTCTC 52656317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5467 TTAACCCGTGTTTACAACCAAAATAATTAATCTCTCTGAACCCTTTGTTTTTCCTGTCTC 5526

 52656318 TATCCTCCACCCTCATTGCCAGATAAATAACATCTGCAACCTGATGTGGCATATTGAACT 52656377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5527 TATCCTCCACCCTCATTGCCAGATAAATAACATCTGCAACCTGATGTGGCATATTGAACT 5586

 52656378 TTGTTTATACTCACACAAACACGTATAAGCATCCCAGATACACATATACAGGGACTGTAT 52656437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5587 TTGTTTATACTCACACAAACACGTATAAGCATCCCAGATACACATATACAGGGACTGTAT 5646

 52656438 CTGTCCTTGTTGTTTTTATAGAAATTGGATCACATTAGACATATTTTCTGATGACTTTTG 52656497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5647 CTGTCCTTGTTGTTTTTATAGAAATTGGATCACATTAGACATATTTTCTGATGACTTTTG 5706

 52656498 TACATTATAGTTGGTCTTCACAGTCAATAGCTCCAAAGCTATCTTATCTTCTAAAATAGC 52656557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5707 TACATTATAGTTGGTCTTCACAGTCAATAGCTCCAAAGCTATCTTATCTTCTAAAATAGC 5766

 52656558 TGCATAATATTCCTCAGTATGGATATACCAAAAGATATTTAAACCATTGCCTAATCAATG 52656617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5767 TGCATAATATTCCTCAGTATGGATATACCAAAAGATATTTAAACCATTGCCTAATCAATG 5826

 52656618 AATATCCTGGTAGTTTCCACATTGTTTTTTCCATTTCCACTATAGTGGAATAAACTTTCG 52656677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5827 AATATCCTGGTAGTTTCCACATTGTTTTTTCCATTTCCACTATAGTGGAATAAACTTTCG 5886

 52656678 TGTTCAAAAATCCTAAACTGGTGCTATATTTCTATAGAATAGAGGCACAGATGTAGAAGT 52656737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5887 TGTTCAAAAATCCTAAACTGGTGCTATATTTCTATAGAATAGAGGCACAGATGTAGAAGT 5946

 52656738 GTTACCCTCAAATCAATATGCATTTAGTTTTGAAAAACAGACACTGCCATATTATTTTCT 52656797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5947 GTTACCCTCAAATCAATATGCATTTAGTTTTGAAAAACAGACACTGCCATATTATTTTCT 6006

 52656798 TAAAAAGGCTCTACAGATTCACATTTCCAGCAGCAATGAGTGTCTCAAGCACCTTTTAAG 52656857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6007 TAAAAAGGCTCTACAGATTCACATTTCCAGCAGCAATGAGTGTCTCAAGCACCTTTTAAG 6066

 52656858 TGGTAAGCAGCTTACCAGGGGAGGTGGCCTATTATTCTATCAGTGGCTTCAGTTGTTAGG 52656917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6067 TGGTAAGCAGCTTACCAGGGGAGGTGGCCTATTATTCTATCAGTGGCTTCAGTTGTTAGG 6126

 52656918 ACACCACGGGTCAGCTGTGGAGATACGGTTGTGGGGCAGGTTGAGTTCAGGACACATAGA 52656977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6127 ACACCACGGGTCAGCTGTGGAGATACGGTTGTGGGGCAGGTTGAGTTCAGGACACATAGA 6186

 52656978 AGATTGCCAAAGGGTGACTATTATTACTTTGAGACTCTGGAAAAATTAGCCAGGAAACAG 52657037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6187 AGATTGCCAAAGGGTGACTATTATTACTTTGAGACTCTGGAAAAATTAGCCAGGAAACAG 6246

 52657038 AGACAAGAGGCTCAGGGTGCAGCAAAGCAGCCAAATCAGGATGATAGTGTTTTCTTTGGA 52657097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6247 AGACAAGAGGCTCAGGGTGCAGCAAAGCAGCCAAATCAGGATGATAGTGTTTTCTTTGGA 6306

 52657098 GCAGATATACTAATGGCCAAGGAACTCATAAAAAGATGCCTAATGTCATCTCATTAGGGA 52657157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6307 GCAGATATACTAATGGCCAAGGAACTCATAAAAAGATGCCTAATGTCATCTCATTAGGGA 6366

 52657158 AGTGCAGTCAAAGCCACAGCATGATACGTCTTCACACCCACGAGGATGGCCATAATCAGA 52657217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6367 AGTGCAGTCAAAGCCACAGCATGATACGTCTTCACACCCACGAGGATGGCCATAATCAGA 6426

 52657218 GAGACAATAACCAGTGGTAGGGAAGATGTGAAAAAATCGGAATGCTCATGCATTGCTGGT 52657277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6427 GAGACAATAACCAGTGGTAGGGAAGATGTGAAAAAATCGGAATGCTCATGCATTGCTGGT 6486

 52657278 AGGAATGTGACATGGTGCAGCTGCTTTGGAAAGCAGTTTAACAGTTCCTGGAAAAGTTAA 52657337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6487 AGGAATGTGACATGGTGCAGCTGCTTTGGAAAGCAGTTTAACAGTTCCTGGAAAAGTTAA 6546

 52657338 ACATGGAGTTACCCTAAGACCCAGCAATTCCATTCCTAGGTAAGCAAGAAAATGAAAACA 52657397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6547 ACATGGAGTTACCCTAAGACCCAGCAATTCCATTCCTAGGTAAGCAAGAAAATGAAAACA 6606

 52657398 TATGGCCACACAAAAACTTGTACACAAATGTCCATAGCAGCATTTTCATAATAGCTGAAA 52657457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6607 TATGGCCACACAAAAACTTGTACACAAATGTCCATAGCAGCATTTTCATAATAGCTGAAA 6666

 52657458 AGTGGAAACAACCCAAATATCCATCAATTGGAAAAAGGAAATCTAGCATTTGCATATAAT 52657517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6667 AGTGGAAACAACCCAAATATCCATCAATTGGAAAAAGGAAATCTAGCATTTGCATATAAT 6726

 52657518 AGAGTATTAATCAGCCATAAGAAGAAACAAAGCACCGATCCATGTTATATCATGCTTTAT 52657577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6727 AGAGTATTAATCAGCCATAAGAAGAAACAAAGCACCGATCCATGTTATATCATGCTTTAT 6786

 52657578 ACTTGGAAGCATGGTACTAAGTGAAAGACGCCAGACACAAAAAGCAAAATATTGTATGAT 52657637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6787 ACTTGGAAGCATGGTACTAAGTGAAAGACGCCAGACACAAAAAGCAAAATATTGTATGAT 6846

 52657638 TCCATTTATATAAAGTGTCTAGAATAGGCAAATCCATAGAGGCAGAAAACAGATTAGTGG 52657697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6847 TCCATTTATATAAAGTGTCTAGAATAGGCAAATCCATAGAGGCAGAAAACAGATTAGTGG 6906

 52657698 TTGCCAGTGGCTGGGAATAGGGAAAAAACTCAGCGCTAAAGGGTAGGGAGTTTTGTTTTG 52657757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6907 TTGCCAGTGGCTGGGAATAGGGAAAAAACTCAGCGCTAAAGGGTAGGGAGTTTTGTTTTG 6966

 52657758 GAGTAATGACGATGTTCTGGAATTAGACGTGGAACGATTGCACACATGGTGCAAATATCC 52657817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6967 GAGTAATGACGATGTTCTGGAATTAGACGTGGAACGATTGCACACATGGTGCAAATATCC 7026

 52657818 TTAAAATCACGGAATTGTCACTCTAAAAGGTGAATTTTATGGTAGGTGAATTGTACCTCA 52657877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7027 TTAAAATCACGGAATTGTCACTCTAAAAGGTGAATTTTATGGTAGGTGAATTGTACCTCA 7086

 52657878 ATTTGTAAAAAGAAGAATTAGATAAATAAACAGCAACACAGCACCAAGGGGTGGGGGTAG 52657937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7087 ATTTGTAAAAAGAAGAATTAGATAAATAAACAGCAACACAGCACCAAGGGGTGGGGGTAG 7146

 52657938 GAAACAGACAACAAATAGGAGTGAAGAGTTCACAGGAAAAGACATGCAGCCAGCTTTTAA 52657997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7147 GAAACAGACAACAAATAGGAGTGAAGAGTTCACAGGAAAAGACATGCAGCCAGCTTTTAA 7206

 52657998 GCAGAAGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTATGAC 52658057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7207 GCAGAAGAAAAGATGTTTGGCCTCATAAATAGTAAAATAAAAGCACAATAAAATTATGAC 7266

 52658058 ACTTGGCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAATTGATGACCCCAGTGGAAAG 52658117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7267 ACTTGGCTTTCCCTTGCCAAATTGGTTAAAAAGGAGACAATTGATGACCCCAGTGGAAAG 7326

 52658118 CGTATAAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAGCAC 52658177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7327 CGTATAAAAAAAGAGCAGCTGTGGCTGGGTACGGTGGCTTAACGCCTGTAATCCTAGCAC 7386

 52658178 TTTGGGAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACA 52658237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7387 TTTGGGAGGCCGAGGTGGGCAAATCATGAGGTAAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACA 7446

 52658238 TGGTGAAACACTGTCTCTGCTAAAAAACAAAACAAAACAAAACACCAAAAAATAGCTGGG 52658297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7447 TGGTGAAACACTGTCTCTGCTAAAAAACAAAACAAAACAAAACACCAAAAAATAGCTGGG 7506

 52658298 CGTAGTGGCGGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTTGGGAGGCGGTGGCAGGAGAATCATTTG 52658357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7507 CGTAGTGGCGGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTTGGGAGGCGGTGGCAGGAGAATCATTTG 7566

 52658358 AACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACTGCACTCTAACCTGGGCA 52658417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7567 AACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACTGCACTCTAACCTGGGCA 7626

 52658418 ACAGAGTTCAGAGTGAGACTCTGTCTCCCCC-AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAACAG 52658476
          ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
     7627 ACAGAGTTCAGAGTGAGACTCTGTCTCCCCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAACAG 7686

 52658477 CCATATAGATCGTCGGTGGGAGTGTAATTTGGCCACTTCTTTGGAAAATAGCTCAGTAAT 52658536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7687 CCATATAGATCGTCGGTGGGAGTGTAATTTGGCCACTTCTTTGGAAAATAGCTCAGTAAT 7746

 52658537 ATCTATTAATACTTAAAATTTCACAAACACTGTAAGTCTAACTTCCACTTCTAAAATGTT 52658596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7747 ATCTATTAATACTTAAAATTTCACAAACACTGTAAGTCTAACTTCCACTTCTAAAATGTT 7806

 52658597 ATCCTAGAAATAAAATTGCATAGGGGTACAAAGGCTTACGTATGGAACTATTTGCTGGAC 52658656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7807 ATCCTAGAAATAAAATTGCATAGGGGTACAAAGGCTTACGTATGGAACTATTTGCTGGAC 7866

 52658657 TACTGTAGTTGTGGCAAAAAACTGGAAATGACCTAAACGCTTATTAGTAGAAACCTGGTT 52658716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7867 TACTGTAGTTGTGGCAAAAAACTGGAAATGACCTAAACGCTTATTAGTAGAAACCTGGTT 7926

 52658717 AAATAAATTATCATATGTCCTTGAGGACACAGGGACACAAAGAGGGGAATGACAGGCACT 52658776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7927 AAATAAATTATCATATGTCCTTGAGGACACAGGGACACAAAGAGGGGAATGACAGGCACT 7986

 52658777 GAGCCTACTTGAGGGTGGGAGGAGGAAGTCGATCAGAAAAAATAACTAGTGGGTACTAGG 52658836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7987 GAGCCTACTTGAGGGTGGGAGGAGGAAGTCGATCAGAAAAAATAACTAGTGGGTACTAGG 8046

 52658837 CTTAGTACCCGGGTGAAAAAATAATCTGTACAACAAACCCCCATGACATGAGTTTACCTT 52658896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8047 CTTAGTACCCGGGTGAAAAAATAATCTGTACAACAAACCCCCATGACATGAGTTTACCTT 8106

 52658897 ATAACAAACCTGCACATGTAATCTGAACCTAGATAAAAGTTTAAAAAAATAAATAATCAT 52658956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8107 ATAACAAACCTGCACATGTAATCTGAACCTAGATAAAAGTTTAAAAAAATAAATAATCAT 8166

 52658957 ATGTCCCTACAATGAAATATTCCACAGGCATTAAAATTCCCCAAGGAATTTTAGTAAGGA 52659016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8167 ATGTCCCTACAATGAAATATTCCACAGGCATTAAAATTCCCCAAGGAATTTTAGTAAGGA 8226

 52659017 AAGAAAAAGCTGTGCCCAACAGCACGTACAGTATGTTTCCATTTGTTTTTAAAAAATGGT 52659076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8227 AAGAAAAAGCTGTGCCCAACAGCACGTACAGTATGTTTCCATTTGTTTTTAAAAAATGGT 8286

 52659077 GTCGGGAGGTTGAGGAGACAACTTATAAATAGACATGCCTGGGATACCTCTGGATATAAG 52659136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8287 GTCGGGAGGTTGAGGAGACAACTTATAAATAGACATGCCTGGGATACCTCTGGATATAAG 8346

 52659137 AAACTGTAAAGTATTTACTTCTAAGGAAGGAAATTTGGGATGGGGCTTGGGGAGCCATCA 52659196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8347 AAACTGTAAAGTATTTACTTCTAAGGAAGGAAATTTGGGATGGGGCTTGGGGAGCCATCA 8406

 52659197 GAGTTAGGGTGGGGATTTTTTCTCTGCCTTATCTTATTATGTATATCGCTCAGAATGTTT 52659256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8407 GAGTTAGGGTGGGGATTTTTTCTCTGCCTTATCTTATTATGTATATCGCTCAGAATGTTT 8466

 52659257 GCTATGTGTATGCACCTACCCCATCCATTAAGAAATGAAGAAATAATGAAAAGAAAAAAT 52659316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8467 GCTATGTGTATGCACCTACCCCATCCATTAAGAAATGAAGAAATAATGAAAAGAAAAAAT 8526

 52659317 GAAAGTAGGGAACTAGAAATGAGAGGTGGGATTCAAAGTGGACTGAACACTTGACCTATT 52659376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8527 GAAAGTAGGGAACTAGAAATGAGAGGTGGGATTCAAAGTGGACTGAACACTTGACCTATT 8586

 52659377 TCCCAATTTGCCTAGGGCTGGCCCAGCAGCGAGGCAGGTTCTAACCAATGAGCATCAGCT 52659436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8587 TCCCAATTTGCCTAGGGCTGGCCCAGCAGCGAGGCAGGTTCTAACCAATGAGCATCAGCT 8646

 52659437 TTGAATGGAGGGGCTGATAGGCCAGGTGGGCCCTGCTTGCTGAGAGTGTCATGGCCTTAG 52659496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8647 TTGAATGGAGGGGCTGATAGGCCAGGTGGGCCCTGCTTGCTGAGAGTGTCATGGCCTTAG 8706

 52659497 GGACATCTCCATGTTGCAGAGTCTGAGCCTCTGCTTGGCAAATTCAGAAAATCCAGCTTT 52659556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8707 GGACATCTCCATGTTGCAGAGTCTGAGCCTCTGCTTGGCAAATTCAGAAAATCCAGCTTT 8766

 52659557 TCTTTTTATATCACCTGGAGCTGATGTAACTCTCAGAAGGCATTTTTAAGAGGACTCATG 52659616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8767 TCTTTTTATATCACCTGGAGCTGATGTAACTCTCAGAAGGCATTTTTAAGAGGACTCATG 8826

 52659617 AATTAACCACATAGCCAACTTACTGGCTTAAGACTACGTGACAGAAAGCTGCAAAGGGGG 52659676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8827 AATTAACCACATAGCCAACTTACTGGCTTAAGACTACGTGACAGAAAGCTGCAAAGGGGG 8886

 52659677 CCAGCCACTGGTAACATCCCACCACTGTCCCTCTCTGTGGAAAACACAGATGGGATGCAC 52659736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8887 CCAGCCACTGGTAACATCCCACCACTGTCCCTCTCTGTGGAAAACACAGATGGGATGCAC 8946

 52659737 ATTGTGACGGGCAGGATGCCTGGAGAGCCCACAAATCTGCAAGCACAGCTGAAATTGGTT 52659796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8947 ATTGTGACGGGCAGGATGCCTGGAGAGCCCACAAATCTGCAAGCACAGCTGAAATTGGTT 9006

 52659797 ACAGGATTTCAATGTTTCATTGCTTGAAGCTATGATAACTTGATGATGATGATGATGATG 52659856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9007 ACAGGATTTCAATGTTTCATTGCTTGAAGCTATGATAACTTGATGATGATGATGATGATG 9066

 52659857 ATGATGATGATGACGATGATTTTTTTTATAGCCATCTTTTTAGAGGGATTTGAGGTAGGG 52659916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9067 ATGATGATGATGACGATGATTTTTTTTATAGCCATCTTTTTAGAGGGATTTGAGGTAGGG 9126

 52659917 AAAAAAATAAACCTCACACTATCGGAGGTTGCCAACTATGAGGTCTGCTGATGGTTTGGC 52659976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9127 AAAAAAATAAACCTCACACTATCGGAGGTTGCCAACTATGAGGTCTGCTGATGGTTTGGC 9186

 52659977 CAACACAGTGTTTATATTTTTTTGAATTGGGAAATTTCATTTAAAAGTCCTAAAATCAGG 52660036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9187 CAACACAGTGTTTATATTTTTTTGAATTGGGAAATTTCATTTAAAAGTCCTAAAATCAGG 9246

 52660037 CTGTTATTGAAATATCTTATTATTGGCTCAGGGTTTCCCAGGGCAGCCATCCTTGAAGCT 52660096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9247 CTGTTATTGAAATATCTTATTATTGGCTCAGGGTTTCCCAGGGCAGCCATCCTTGAAGCT 9306

 52660097 GTGTGGAGCCCTATAAACAAGGACGCTTTCCAGTTCCCTGCAAACTCCATTTCATTCAGA 52660156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9307 GTGTGGAGCCCTATAAACAAGGACGCTTTCCAGTTCCCTGCAAACTCCATTTCATTCAGA 9366

 52660157 GCCTTGAGCCAGTTCTTACATGGTCCTCAGACTTGAGCTAGTGCAAGAATACCCGGGAGG 52660216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9367 GCCTTGAGCCAGTTCTTACATGGTCCTCAGACTTGAGCTAGTGCAAGAATACCCGGGAGG 9426

 52660217 GGTTGTGGGAACAGATAGCTGGGCCCCACCCCCAGGGAAGGGGGTGTTTCTGACTCAGGA 52660276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9427 GGTTGTGGGAACAGATAGCTGGGCCCCACCCCCAGGGAAGGGGGTGTTTCTGACTCAGGA 9486

 52660277 GGTCTGGGCTCCGGCTACAGAAACTGCACATCTAACCGGTACCCAGGTGATGTGATGCTG 52660336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9487 GGTCTGGGCTCCGGCTACAGAAACTGCACATCTAACCGGTACCCAGGTGATGTGATGCTG 9546

 52660337 CTGGCCCAGGGACAACTCTGCGAGTCACTGCTATTGGGCACTGCTATTGCACCCACACAA 52660396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9547 CTGGCCCAGGGACAACTCTGCGAGTCACTGCTATTGGGCACTGCTATTGCACCCACACAA 9606

 52660397 GGAGGCAGGCTCTGCTTACATTTTTCAGTTCTTGTTCCCAGAAACATTTGCTCTTTGGGG 52660456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9607 GGAGGCAGGCTCTGCTTACATTTTTCAGTTCTTGTTCCCAGAAACATTTGCTCTTTGGGG 9666

 52660457 TATGCTTTGCATATAATGGATCCTACCCACTAATACAGTATGCTGCTTTTATTGATAAAC 52660516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9667 TATGCTTTGCATATAATGGATCCTACCCACTAATACAGTATGCTGCTTTTATTGATAAAC 9726

 52660517 TTCCAGAAACTTGAAGCGCACCTTACCATTTCTTTGATCTCGCTGATTATTTTTATTTTT 52660576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9727 TTCCAGAAACTTGAAGCGCACCTTACCATTTCTTTGATCTCGCTGATTATTTTTATTTTT 9786

 52660577 GTTAAATGAAAATTGTTGGTAAGTTCTTTTTGGTGTGGTAAAAGGATATGAAAAGCTGAT 52660636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9787 GTTAAATGAAAATTGTTGGTAAGTTCTTTTTGGTGTGGTAAAAGGATATGAAAAGCTGAT 9846

 52660637 TTTAAAAAAATGTCCACTCTAGGATTAGAATTGTAGGTGTGTTTATTCTATTTCAAGATC 52660696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9847 TTTAAAAAAATGTCCACTCTAGGATTAGAATTGTAGGTGTGTTTATTCTATTTCAAGATC 9906

 52660697 TGGTTAAAATGCACCTTGAGGAAAAGAATTGAGTGCAGCTGTTGTTATTTCTCAATGCTG 52660756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9907 TGGTTAAAATGCACCTTGAGGAAAAGAATTGAGTGCAGCTGTTGTTATTTCTCAATGCTG 9966

 52660757 TTTCTCTTTTCATGTTTTTTTCATGTTGTCTCTTGGTCTGTCCTATCTCTCTTGGTCTAT 52660816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9967 TTTCTCTTTTCATGTTTTTTTCATGTTGTCTCTTGGTCTGTCCTATCTCTCTTGGTCTAT 10026

 52660817 CCTCCAAGACAGAGATGAGTGATCTTGAAACCCTGCCCATGTTTTTATCTTTGGAGCCCA 52660876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10027 CCTCCAAGACAGAGATGAGTGATCTTGAAACCCTGCCCATGTTTTTATCTTTGGAGCCCA 10086

 52660877 ACTGTGCTGCCTTGTTTTCTTCTCCATCCAAAGAGGCAAAGAGAAAGTTGCATATTACTC 52660936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10087 ACTGTGCTGCCTTGTTTTCTTCTCCATCCAAAGAGGCAAAGAGAAAGTTGCATATTACTC 10146

 52660937 AACAGCAGTTGCATGACAGTTAAAATCAGACTGTATGAGTCATGGAACAGTAAGTTGTGT 52660996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10147 AACAGCAGTTGCATGACAGTTAAAATCAGACTGTATGAGTCATGGAACAGTAAGTTGTGT 10206

 52660997 CCAGAGTATCTGTCATGGTAAGTACAAAAAAGTCCTTAAAAATTTAAAACAGAAATGCCA 52661056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10207 CCAGAGTATCTGTCATGGTAAGTACAAAAAAGTCCTTAAAAATTTAAAACAGAAATGCCA 10266

 52661057 ATGTTTTATTTTTGAAAAATGTGAAGAAGAAATTTTCCGGCCGGGCGCGGTGGCTCATGC 52661116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10267 ATGTTTTATTTTTGAAAAATGTGAAGAAGAAATTTTCCGGCCGGGCGCGGTGGCTCATGC 10326

 52661117 CTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGA 52661176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10327 CTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGA 10386

 52661177 GACCAGCCTGGCCAACACAGTGCAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGA 52661236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10387 GACCAGCCTGGCCAACACAGTGCAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGA 10446

 52661237 TGCGGTGGCACGCGCCTGTAATCTCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCATGACAATCGCTTG 52661296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10447 TGCGGTGGCACGCGCCTGTAATCTCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCATGACAATCGCTTG 10506

 52661297 AACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCATACCACTGCACTCCAGCTTGGGCA 52661356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10507 AACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCATACCACTGCACTCCAGCTTGGGCA 10566

 52661357 GCGGAAGGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAGAAAAAAAGAAATTTTCTAAGTGTATTCC 52661416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10567 GCGGAAGGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAGAAAAAAAGAAATTTTCTAAGTGTATTCC 10626

 52661417 AAATAACTTTTAATATTGGATAAACATTACGAGTTTAAAAATACTTATGCCAGAGGAGTG 52661476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10627 AAATAACTTTTAATATTGGATAAACATTACGAGTTTAAAAATACTTATGCCAGAGGAGTG 10686

 52661477 CTGTGACTCGTGCCTCTAATCCCAGCAATGTGGGAGGCCAAGGAGGGACAGTCACTTGAG 52661536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10687 CTGTGACTCGTGCCTCTAATCCCAGCAATGTGGGAGGCCAAGGAGGGACAGTCACTTGAG 10746

 52661537 CCCAGG 52661542
          ||||||
    10747 CCCAGG 10752

Alignment time is 11.6005 s

