
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31515486,31539389] =>     23904 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    6360] =>      6360 nucs 'mol-32-1e71-062836_6360'

Score:        6287
Aligned:      6362        nucs
Identic:      6347 (100%) nucs =>      2039 (100%)      4308 (100%)
Gaps:           11 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31523445,31525486] EXCISED REGION [31529390,31533709]
 second seq =>  [       1,    2042] EXCISED REGION [    2052,    6360]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3903 nucs [31525487,31529389]
 second seq =>         9 nucs [2043,2051]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31523445 TGGGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCCAACTAATTTTGTAGTTTTAGTAGAGATGGGG 31523504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGGGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCCAACTAATTTTGTAGTTTTAGTAGAGATGGGG 60

 31523505 TTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCACCTTG 31523564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCACCTTG 120

 31523565 CCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGAGTGAGTGCACCTGGCCCACTTTGCTCATTTTCTA 31523624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGAGTGAGTGCACCTGGCCCACTTTGCTCATTTTCTA 180

 31523625 ATTGGGTTATTCGTTTTCTGGCTATTGAGTTGTTTGAGTTTCTTATTTATTGTGGATGTT 31523684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATTGGGTTATTCGTTTTCTGGCTATTGAGTTGTTTGAGTTTCTTATTTATTGTGGATGTT 240

 31523685 ACTCCCTTATCAGATGTATGATTTACATATATTTTCTGTCACTCTGTGGGTTATCTCTTT 31523744
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
      241 ACTCCCTTATCAGATGTATGATTTACATATATTTTCTGTCACTTTGTGGGTTATCTCTTT 300

 31523745 ACTTTGTTCATTGTTTCCTTTCTGTCCAAAAGCTTTGTATCTTGTCTAAAATCCCATTTG 31523804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACTTTGTTCATTGTTTCCTTTCTGTCCAAAAGCTTTGTATCTTGTCTAAAATCCCATTTG 360

 31523805 TCTATTTTTGCTTTTATTTATTTTTATTTTTATTTTTATTTTTTATTTTTTTGAAACGGA 31523864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCTATTTTTGCTTTTATTTATTTTTATTTTTATTTTTATTTTTTATTTTTTTGAAACGGA 420

 31523865 GTCTTGCTCTGTCACCCAGGTTGGAGTGCAGTGGTGCAATCTCAGCTCACTGCAACCTCT 31523924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTCTTGCTCTGTCACCCAGGTTGGAGTGCAGTGGTGCAATCTCAGCTCACTGCAACCTCT 480

 31523925 GCCTCCCAGGTTCAAGGAAGTCTCCTACTCCAACTTCCTGAGTAGCTGGGATTATAGGCG 31523984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GCCTCCCAGGTTCAAGGAAGTCTCCTACTCCAACTTCCTGAGTAGCTGGGATTATAGGCG 540

 31523985 TGTGCCACCATGCCTAGCTAATTTTTGTATTTTTTGGTAGAGACAGGATTTCACCATGTT 31524044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGTGCCACCATGCCTAGCTAATTTTTGTATTTTTTGGTAGAGACAGGATTTCACCATGTT 600

 31524045 GGCCAGGCTGGTGTTGAACTCTTGACCTCAGGCAATCCGCCTGACTCAGCCTCCCAAAGT 31524104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GGCCAGGCTGGTGTTGAACTCTTGACCTCAGGCAATCCGCCTGACTCAGCCTCCCAAAGT 660

 31524105 GCTGGGATTACACGTGTGAGCCACCGCGCCTGGCCTATTTTTGCTTTTATTACCTGTGCT 31524164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GCTGGGATTACACGTGTGAGCCACCGCGCCTGGCCTATTTTTGCTTTTATTACCTGTGCT 720

 31524165 TTTGGGGTCATAGCTAAATAACCATTGCTCAGATCAATGTCATGGAGCCTTTCCTCTAGG 31524224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTTGGGGTCATAGCTAAATAACCATTGCTCAGATCAATGTCATGGAGCCTTTCCTCTAGG 780

 31524225 TATTCTTCTAGTTGTTTTACAGTCTCAGATCTTATATTTAAGACTTTAATCCATTTTGAG 31524284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TATTCTTCTAGTTGTTTTACAGTCTCAGATCTTATATTTAAGACTTTAATCCATTTTGAG 840

 31524285 TTGATTTTTTATACTGTGTGAGATAAGGATCCAATTTTATTCTTCTGTATGTGGATCCAA 31524344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTGATTTTTTATACTGTGTGAGATAAGGATCCAATTTTATTCTTCTGTATGTGGATCCAA 900

 31524345 TTTTCCTAGTACAGTTTATTGAAAAGACTGTCTTTTCCCCATTATGTATTAGTAACACCT 31524404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTTTCCTAGTACAGTTTATTGAAAAGACTGTCTTTTCCCCATTATGTATTAGTAACACCT 960

 31524405 TTGTCAAAAATCAATTGACTATTAGTGCATGGGTTTATTTCTGGGTTTTCTATCTTGTTA 31524464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTGTCAAAAATCAATTGACTATTAGTGCATGGGTTTATTTCTGGGTTTTCTATCTTGTTA 1020

 31524465 CATTAGTCGATGTGTCTATTTTTATGCCAGCACCATACTGTTTTGATTATATTAGCTTTA 31524524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CATTAGTCGATGTGTCTATTTTTATGCCAGCACCATACTGTTTTGATTATATTAGCTTTA 1080

 31524525 TAATATATTTTGAAATCAGGGACTGTGATGTCTTTAGCTTTGTTCTTTTTGCTCAAGATT 31524584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TAATATATTTTGAAATCAGGGACTGTGATGTCTTTAGCTTTGTTCTTTTTGCTCAAGATT 1140

 31524585 GTTTTGGCTAGCCAGGGTCTTTTATGATTGCATATGAATTTAAGGATTGTTTTATTTCTA 31524644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GTTTTGGCTAGCCAGGGTCTTTTATGATTGCATATGAATTTAAGGATTGTTTTATTTCTA 1200

 31524645 TAAGAAATGACATTGGAATTTTGATAGGGACTGCATTGAATCTGTAGATTGCTTTGGGTA 31524704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TAAGAAATGACATTGGAATTTTGATAGGGACTGCATTGAATCTGTAGATTGCTTTGGGTA 1260

 31524705 GTATGAATATTTTAATAATATTAATTCTTCTAATTTATCAACACAAGATAGCTTTCCATT 31524764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GTATGAATATTTTAATAATATTAATTCTTCTAATTTATCAACACAAGATAGCTTTCCATT 1320

 31524765 TATTTGTGTTTTCTTAAACAATGTTTTAGTTTCCAGTGTACAGATCTTTTAACTTCTTGG 31524824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TATTTGTGTTTTCTTAAACAATGTTTTAGTTTCCAGTGTACAGATCTTTTAACTTCTTGG 1380

 31524825 TTAAATTTACCCCTAAGTATTTTATTTTATTTTAAAATACCTGGCTAATTTTGTATTTAA 31524884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTAAATTTACCCCTAAGTATTTTATTTTATTTTAAAATACCTGGCTAATTTTGTATTTAA 1440

 31524885 TTTTATATTGTATTTATTTTATTTGTAATAAAATTAAGCATTTTATTTTATTTTAAAATA 31524944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTTTATATTGTATTTATTTTATTTGTAATAAAATTAAGCATTTTATTTTATTTTAAAATA 1500

 31524945 CCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCT 31525004
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGATAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCT 1560

 31525005 CGAACTCCAGACCTCAGGTGATCCGACTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGTATTAGAAG 31525064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CGAACTCCAGACCTCAGGTGATCCGACTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGTATTAGAAG 1620

 31525065 CATGAGCCACTGCCCACTGCACCTAGCTGAAAACCACACTTTCTGTTGATTAAATAATAT 31525124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CATGAGCCACTGCCCACTGCACCTAGCTGAAAACCACACTTTCTGTTGATTAAATAATAT 1680

 31525125 TTCACCTTATGGAGTTACAAATTTTCATTTTATGGGGTTATAATCACTTACTTAGCTTGT 31525184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTCACCTTATGGAGTTACAAATTTTCATTTTATGGGGTTATAATCACTTACTTAGCTTGT 1740

 31525185 TATCTTTTGTTGGACATTAATGTGGTTTCTAACTTTTCATTATCAAAAAATAAAAGAAAA 31525244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TATCTTTTGTTGGACATTAATGTGGTTTCTAACTTTTCATTATCAAAAAATAAAAGAAAA 1800

 31525245 TGGACAAAACCTCAGAAAGACACAAACTACTAAAGCTGACTTAATAAGAAATAGAAAATC 31525304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TGGACAAAACCTCAGAAAGACACAAACTACTAAAGCTGACTTAATAAGAAATAGAAAATC 1860

 31525305 TGAATATATAGAAAATCTGAATGTAACAAGTAAGGAGATTGGATTAGTAATAAAATTTCC 31525364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TGAATATATAGAAAATCTGAATGTAACAAGTAAGGAGATTGGATTAGTAATAAAATTTCC 1920

 31525365 CACAAAGAGAAGTACACATTCAGATGGTTTCACTGGTAAATTCTACCAAATATTTAAAGA 31525424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CACAAAGAGAAGTACACATTCAGATGGTTTCACTGGTAAATTCTACCAAATATTTAAAGA 1980

 31525425 TTTTTCTTTTTTTTTGTTGAGACAGAGTCTCACTCTATTGCCCAGGCTGGAGTACAATGG 31525484
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TTTTTCTTTTTTTTTGTTGAGGCAGAGTCTCACTCTATTGCCCAGGCTGGAGTACAATGG 2040

 31525485 TG 31525486
          ||
     2041 TG 2042

EXCISED REGION

 31529390 AATACTGTGCTAAGTGAAAGAAGCCAACCACAAAATACCATATATTGTGTGATTCTGCTT 31529449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2052 AATACTGTGCTAAGTGAAAGAAGCCAACCACAAAATACCATATATTGTGTGATTCTGCTT 2111

 31529450 AAATGACATGTCCAGAATGTCCATATTAAAGTAGATTAGTGGTTTCCTGAGGCTGGGGGA 31529509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2112 AAATGACATGTCCAGAATGTCCATATTAAAGTAGATTAGTGGTTTCCTGAGGCTGGGGGA 2171

 31529510 GGGAGTTGGGGAAATTGCGTAGTGACTACTGGGTAAAGAGTTTCTTTCTGGGGTGATGAA 31529569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2172 GGGAGTTGGGGAAATTGCGTAGTGACTACTGGGTAAAGAGTTTCTTTCTGGGGTGATGAA 2231

 31529570 ATGGTCTAAAATAGAATGTGGTGGTGGTTGCACAGCTCTGAAAATACTAAAAACCATTGA 31529629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2232 ATGGTCTAAAATAGAATGTGGTGGTGGTTGCACAGCTCTGAAAATACTAAAAACCATTGA 2291

 31529630 ATGAGCACTTTAAATTGGTAAATTTTTATGTGAATTATGATTCAATAAAGTTGTGTTTAG 31529689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2292 ATGAGCACTTTAAATTGGTAAATTTTTATGTGAATTATGATTCAATAAAGTTGTGTTTAG 2351

 31529690 ATATTACTAAAAATGATGGTACAAATATTCTTTTTCACAAATGTTTTTTGTTGTTGTTTA 31529749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2352 ATATTACTAAAAATGATGGTACAAATATTCTTTTTCACAAATGTTTTTTGTTGTTGTTTA 2411

 31529750 TAGTTGTTTATTTGTACATCTAGTAATTTGTCCCAAGGAAAGAGTATGTAAAAGAACATA 31529809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2412 TAGTTGTTTATTTGTACATCTAGTAATTTGTCCCAAGGAAAGAGTATGTAAAAGAACATA 2471

 31529810 AGTCACTTTAAGGCCTTTAATGTATACTACAAAATTGCACTCTAGAAGGTTTATACAGTT 31529869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2472 AGTCACTTTAAGGCCTTTAATGTATACTACAAAATTGCACTCTAGAAGGTTTATACAGTT 2531

 31529870 TTGCATTTCATTAGCCTGTTTTTTTTATCTTTGACAACCTAAAGAATTTATTAGTGGTAT 31529929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2532 TTGCATTTCATTAGCCTGTTTTTTTTATCTTTGACAACCTAAAGAATTTATTAGTGGTAT 2591

 31529930 TCATCTGAGGATCCTCTAGGTCTATCAGAGTGTCTTTCTTATAGAAGGCATTCAATAAAT 31529989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2592 TCATCTGAGGATCCTCTAGGTCTATCAGAGTGTCTTTCTTATAGAAGGCATTCAATAAAT 2651

 31529990 AAATGTCCTAAGTGAGCAAAACATTTTTGGTTGATTTTTAGGTGCAAATGGTTTCTTTTG 31530049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2652 AAATGTCCTAAGTGAGCAAAACATTTTTGGTTGATTTTTAGGTGCAAATGGTTTCTTTTG 2711

 31530050 ATTTTAATTAAGATGCCTTTGTTTATTAGTGATGTTGACATATTTTCTTAATCTATTGGC 31530109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2712 ATTTTAATTAAGATGCCTTTGTTTATTAGTGATGTTGACATATTTTCTTAATCTATTGGC 2771

 31530110 TTTGTATAACTTTATGAATTGTCTCTTCATGTCCTTTGCCTACTTTTCTATTGTGGTAAC 31530169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2772 TTTGTATAACTTTATGAATTGTCTCTTCATGTCCTTTGCCTACTTTTCTATTGTGGTAAC 2831

 31530170 TATCTTTTATAAATGTTGTATAATTATTTAAAAATACATTAGGTTGGGCATGGTAGATCA 31530229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2832 TATCTTTTATAAATGTTGTATAATTATTTAAAAATACATTAGGTTGGGCATGGTAGATCA 2891

 31530230 TGCCTGTAATCCCAGCTCTCTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATTGCTTGAGCCTAACAGTT 31530289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2892 TGCCTGTAATCCCAGCTCTCTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATTGCTTGAGCCTAACAGTT 2951

 31530290 CGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCCATCTCTAAAAAAAAAAACCAATAAAAAT 31530349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2952 CGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCCATCTCTAAAAAAAAAAACCAATAAAAAT 3011

 31530350 ATATTAAAAGATTAACTGATTGTCTATCATATGGATTACAAATATCCCCCCCAATTTGTC 31530409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3012 ATATTAAAAGATTAACTGATTGTCTATCATATGGATTACAAATATCCCCCCCAATTTGTC 3071

 31530410 ATTTGCTTGTTAATTTTATTTATGATGACTTAAAAATTACAATATATTTTTTGGTGTTCA 31530469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3072 ATTTGCTTGTTAATTTTATTTATGATGACTTAAAAATTACAATATATTTTTTGGTGTTCA 3131

 31530470 AGTCAGTTTTTGTCCCCATTGTGATATTTTCCTTTGCCTGTTTATCACTTTCTTAGAGAA 31530529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3132 AGTCAGTTTTTGTCCCCATTGTGATATTTTCCTTTGCCTGTTTATCACTTTCTTAGAGAA 3191

 31530530 AAGATAAATACTGATTCGTTCTTTTGTAGGTGTTTTATGATTTCATTGAAAATAAAATCT 31530589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3192 AAGATAAATACTGATTCGTTCTTTTGTAGGTGTTTTATGATTTCATTGAAAATAAAATCT 3251

 31530590 TCAACGCATCTAGTATTCATTTGGGTGTAAGATAAAAGATAACAACGTAGGTTTCTCTTA 31530649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3252 TCAACGCATCTAGTATTCATTTGGGTGTAAGATAAAAGATAACAACGTAGGTTTCTCTTA 3311

 31530650 TAGTTCATCAGGTATCCTACTACTGTTTATTGAGTCATGTTTTCTGTTACCACTCTTACT 31530709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3312 TAGTTCATCAGGTATCCTACTACTGTTTATTGAGTCATGTTTTCTGTTACCACTCTTACT 3371

 31530710 ATATACCAGTTTTACATACATTTGGGTTGGTTTCTGAGCTTTCTATTGTCTTCCATTGCT 31530769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3372 ATATACCAGTTTTACATACATTTGGGTTGGTTTCTGAGCTTTCTATTGTCTTCCATTGCT 3431

 31530770 TTGTTTAAAATTTAAAGTTTATTATTCTGACTTTCCATACTTGAATATGGTCGAATAAGT 31530829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3432 TTGTTTAAAATTTAAAGTTTATTATTCTGACTTTCCATACTTGAATATGGTCGAATAAGT 3491

 31530830 CCTCCTTTATTAATCTTGTTTTATTTAAAAATGGTCATTTTCACTCATTTTCCAGTTCAG 31530889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3492 CCTCCTTTATTAATCTTGTTTTATTTAAAAATGGTCATTTTCACTCATTTTCCAGTTCAG 3551

 31530890 TAGTTTTATTCTCTCAGTGTAATGTGATTTATCACCCCATTGCTCACCCTATTCATCTCC 31530949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3552 TAGTTTTATTCTCTCAGTGTAATGTGATTTATCACCCCATTGCTCACCCTATTCATCTCC 3611

 31530950 CAATACCCAGCTGAAAAACTTTAGAAGACTGAGGCTCTTGCCCTGGCCCCATCACTTTCT 31531009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3612 CAATACCCAGCTGAAAAACTTTAGAAGACTGAGGCTCTTGCCCTGGCCCCATCACTTTCT 3671

 31531010 AGCTATGTGGGCTTAGGCTAGTTATTGAACATGTCTGACTCTCACTTTTCTCCTCTGTAA 31531069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3672 AGCTATGTGGGCTTAGGCTAGTTATTGAACATGTCTGACTCTCACTTTTCTCCTCTGTAA 3731

 31531070 GTCAGTGAGAATTATATACTTCTTATAAGGTTGTGAGGTTCAAATGGAATAATGTGTACA 31531129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3732 GTCAGTGAGAATTATATACTTCTTATAAGGTTGTGAGGTTCAAATGGAATAATGTGTACA 3791

 31531130 GAGGCACTTGGTAAACAATGTAGTCATATGCAAGTCATATGCAAGTCATATGTAGTCAGC 31531189
          |||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||
     3792 GAGGCACTTGGTAAACAATGT-----------AGTCATATGCAAGTCATATGTAGTCAGC 3840

 31531190 TTGGTGAATTTTGAGAAAGTAAATGCAAGTTCTTTTTATGGTTTTACCTAAGGGGCCAGT 31531249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 TTGGTGAATTTTGAGAAAGTAAATGCAAGTTCTTTTTATGGTTTTACCTAAGGGGCCAGT 3900

 31531250 GAGGGCCAGAGAAGTGCCGGGACCTATGTAAGGTCGCAAGCAAGTTCATGTGGAATGCAT 31531309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 GAGGGCCAGAGAAGTGCCGGGACCTATGTAAGGTCGCAAGCAAGTTCATGTGGAATGCAT 3960

 31531310 CTAGAACTAGAACGCTAGCCTGTGTCCCAGGGCCCTTCCAACTGGGCTCTGCTGCCTGCA 31531369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 CTAGAACTAGAACGCTAGCCTGTGTCCCAGGGCCCTTCCAACTGGGCTCTGCTGCCTGCA 4020

 31531370 GTCCTGGGTGCCTTCTAATTAGCCTGTGTAGTGGTCTTGGTAAAAGTGTTTCTCCTGTAC 31531429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 GTCCTGGGTGCCTTCTAATTAGCCTGTGTAGTGGTCTTGGTAAAAGTGTTTCTCCTGTAC 4080

 31531430 TGTCCCCTATAGGTTGTGGCTGGCCATACCATTTCCCTGGTTCCCCCCACGCTCCTGATG 31531489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 TGTCCCCTATAGGTTGTGGCTGGCCATACCATTTCCCTGGTTCCCCCCACGCTCCTGATG 4140

 31531490 ACCTGGAAAGGCCATTTGAATAGTGTGGCAGACATCCTGTATGTGGACAACTTCCAGCTG 31531549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 ACCTGGAAAGGCCATTTGAATAGTGTGGCAGACATCCTGTATGTGGACAACTTCCAGCTG 4200

 31531550 GTTATCAGCGCTGGCCAGGACCGGGACGTCAAGGCTTGGAAACTCTCCGGTGATGCCATT 31531609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 GTTATCAGCGCTGGCCAGGACCGGGACGTCAAGGCTTGGAAACTCTCCGGTGATGCCATT 4260

 31531610 GGTATGGGTCCTGCTGAAGCTCAGCCATGCCCATGGCCCTTCTTGTCTCTGTCCCTGTCT 31531669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 GGTATGGGTCCTGCTGAAGCTCAGCCATGCCCATGGCCCTTCTTGTCTCTGTCCCTGTCT 4320

 31531670 GAACATAAGCTGGTATGAACTTTGTACTCTGTGGGGAGGGACTCTCAGGCCACAGCAACT 31531729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 GAACATAAGCTGGTATGAACTTTGTACTCTGTGGGGAGGGACTCTCAGGCCACAGCAACT 4380

 31531730 GCCTTCACTTAAATAATATTACAGTCTGTCCAATTATCCATTCAGCAAACGGTCCATCCA 31531789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 GCCTTCACTTAAATAATATTACAGTCTGTCCAATTATCCATTCAGCAAACGGTCCATCCA 4440

 31531790 TTCACCCATCCACCCAATATTATTCACCTATGTATATTTTTGCAAATCATATATCTGATA 31531849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 TTCACCCATCCACCCAATATTATTCACCTATGTATATTTTTGCAAATCATATATCTGATA 4500

 31531850 AAGCATATTCCTTTCTCTTTTAAAAAATAAACTTAATTGTTGCATTGTATATAAAGAAAA 31531909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 AAGCATATTCCTTTCTCTTTTAAAAAATAAACTTAATTGTTGCATTGTATATAAAGAAAA 4560

 31531910 ACATACAAACCAGAAGGGTTCAGCTTGGTGAATTTTGAGAAAGTAAATACATACCCATAT 31531969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 ACATACAAACCAGAAGGGTTCAGCTTGGTGAATTTTGAGAAAGTAAATACATACCCATAT 4620

 31531970 AGCCACCGTTCATGTCAAGAAATAATTAGGGCCAGGCGCGGTGGCTCACTACTGTAATCC 31532029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 AGCCACCGTTCATGTCAAGAAATAATTAGGGCCAGGCGCGGTGGCTCACTACTGTAATCC 4680

 31532030 CAACACTTTTTTGTCCCCTTTTCCTCCTGTGCTGTCTTCCTATGTGTTTGTTTGTTTGTT 31532089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 CAACACTTTTTTGTCCCCTTTTCCTCCTGTGCTGTCTTCCTATGTGTTTGTTTGTTTGTT 4740

 31532090 TTAGTGACCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGTGCATGCCTGT 31532149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 TTAGTGACCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGTGCATGCCTGT 4800

 31532150 AATCCCAGCTACTTGAGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGTTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTT 31532209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 AATCCCAGCTACTTGAGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGTTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTT 4860

 31532210 GCAGTGAGCTGAGATCATGTCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGACTCTGTCT 31532269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 GCAGTGAGCTGAGATCATGTCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGACTCTGTCT 4920

 31532270 AAAAAAAAAATAATAATAAAAATAAAGTGACTTATGTGCCACTATTACAGTATTACAGCA 31532329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 AAAAAAAAAATAATAATAAAAATAAAGTGACTTATGTGCCACTATTACAGTATTACAGCA 4980

 31532330 TTCTGTATTTTTCTATGTGTTTACATTTATCAGAAAGCTTTGTATTTTCATATGCTTTCA 31532389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 TTCTGTATTTTTCTATGTGTTTACATTTATCAGAAAGCTTTGTATTTTCATATGCTTTCA 5040

 31532390 TGTTCCTGCCTAGCATCCTTTTGTTTCAACTTGAAGGGGTCCCTTTAGCATTTCTTTAAA 31532449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 TGTTCCTGCCTAGCATCCTTTTGTTTCAACTTGAAGGGGTCCCTTTAGCATTTCTTTAAA 5100

 31532450 GGCAGGTCTAATGGTGATGAACTCCTCTTGTTTTTATTTATCTGGGAAAATTTTTATTTT 31532509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 GGCAGGTCTAATGGTGATGAACTCCTCTTGTTTTTATTTATCTGGGAAAATTTTTATTTT 5160

 31532510 TCCTTCATTTTTAAAGGACAGCTTTCCTGGATATAGTATTTTTGGATGAGAGTTTTTGTT 31532569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 TCCTTCATTTTTAAAGGACAGCTTTCCTGGATATAGTATTTTTGGATGAGAGTTTTTGTT 5220

 31532570 CTTTTTATAATGTGTCTCCTTGTGGATTTCTTTGACTTTATCCTAGTTGGAATCCCTTGA 31532629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 CTTTTTATAATGTGTCTCCTTGTGGATTTCTTTGACTTTATCCTAGTTGGAATCCCTTGA 5280

 31532630 GCTTCTTGAATATAGGTTTCTTTTCCTTTTTAAGATTTGAAACATTTTCAGCCATTATTT 31532689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 GCTTCTTGAATATAGGTTTCTTTTCCTTTTTAAGATTTGAAACATTTTCAGCCATTATTT 5340

 31532690 ATTCAGATAAGCTTTTTGTCCCTTTCTCTCTCTCTGTCTCTCTCTCCTCCTTCTAGTACT 31532749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 ATTCAGATAAGCTTTTTGTCCCTTTCTCTCTCTCTGTCTCTCTCTCCTCCTTCTAGTACT 5400

 31532750 ACCATAATGCATATATTGTCCATTTGACGATGTCTCATAAATCCCTTAAGTTTTCTTTAC 31532809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 ACCATAATGCATATATTGTCCATTTGACGATGTCTCATAAATCCCTTAAGTTTTCTTTAC 5460

 31532810 TCTTTAAAATTCTTTTTTCTTTTTTGCTTCTCTGACTGGATATCTTCAAGTCTGCTGATT 31532869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 TCTTTAAAATTCTTTTTTCTTTTTTGCTTCTCTGACTGGATATCTTCAAGTCTGCTGATT 5520

 31532870 TTTCCTTCTGCTTGATCAAGCCTGCTGTAGATGACTTTTGAATTCAATTATTTTACTCTT 31532929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 TTTCCTTCTGCTTGATCAAGCCTGCTGTAGATGACTTTTGAATTCAATTATTTTACTCTT 5580

 31532930 CATCTTCAGCTCTAGAATTTCTGTTATTTTTATTATTATTATTATTATTTTTTGAGACAG 31532989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 CATCTTCAGCTCTAGAATTTCTGTTATTTTTATTATTATTATTATTATTTTTTGAGACAG 5640

 31532990 GGTCTTGCTCTGCCACCCAGGGTTGAGTGCAGTGGCACGAATTCAGCTCACTGAAGCCTT 31533049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 GGTCTTGCTCTGCCACCCAGGGTTGAGTGCAGTGGCACGAATTCAGCTCACTGAAGCCTT 5700

 31533050 GACCTCCCAGCCTCAAGTGATCTTCCCACAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCA 31533109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5701 GACCTCCCAGCCTCAAGTGATCTTCCCACAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCA 5760

 31533110 TGCCATCATGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTTGTAGAGACAGAGTTTCACCATGTTGC 31533169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5761 TGCCATCATGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTTGTAGAGACAGAGTTTCACCATGTTGC 5820

 31533170 CCAGGCTGGCCTTGAATTCTTGAGCTCAAGTGATCGCCCACCTAAGCTTCCCAAAGTGTT 31533229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5821 CCAGGCTGGCCTTGAATTCTTGAGCTCAAGTGATCGCCCACCTAAGCTTCCCAAAGTGTT 5880

 31533230 GGGATTATAGGTGTGGGCCACCATGGCTGGCCTCTGTTTGGTTCTTTTCTATATTTTCTG 31533289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5881 GGGATTATAGGTGTGGGCCACCATGGCTGGCCTCTGTTTGGTTCTTTTCTATATTTTCTG 5940

 31533290 TGTCTTCACTAATATTCTCAGTTTGTTCATGTATTGTTTCCCTGAGCTTGTTGAGCATTT 31533349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5941 TGTCTTCACTAATATTCTCAGTTTGTTCATGTATTGTTTCCCTGAGCTTGTTGAGCATTT 6000

 31533350 TTATTACGGTTACTTAGAATTCTTTGTCAAATAATTAATATACCTCAATTTCTTTAGCGG 31533409
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6001 TTATTACAGTTACTTAGAATTCTTTGTCAAATAATTAATATACCTCAATTTCTTTAGCGG 6060

 31533410 CAGTTTCTGGAGATTTATTTTGTTCCTTTGGGCCATGCTTTCCTATTTTTTTTGTGTGCC 31533469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6061 CAGTTTCTGGAGATTTATTTTGTTCCTTTGGGCCATGCTTTCCTATTTTTTTTGTGTGCC 6120

 31533470 TTATAACTTTATATTGGGATCCATGCATTTGTAAAATCAGCCACCTCTCCCAGTCTTTAT 31533529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6121 TTATAACTTTATATTGGGATCCATGCATTTGTAAAATCAGCCACCTCTCCCAGTCTTTAT 6180

 31533530 ATACTGGCTTCATTCAGGGAAAATTCTGCACCAATCAGCTTGGCTAAAGATTCTGGGTGC 31533589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6181 ATACTGGCTTCATTCAGGGAAAATTCTGCACCAATCAGCTTGGCTAAAGATTCTGGGTGC 6240

 31533590 CTCCCCAATCTTTTTTGTGGATACTTTCACCAGACTTACGCATGTAAATTCGCAATTACA 31533649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6241 CTCCCCAATCTTTTTTGTGGATACTTTCACCAGACTTACGCATGTAAATTCGCAATTACA 6300

 31533650 GGAATCTACAGGTTTATTTTTTTCAGGAGTCCATTATCTCTTGCTCTCTCTGGTGTCTAT 31533709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6301 GGAATCTACAGGTTTATTTTTTTCAGGAGTCCATTATCTCTTGCTCTCTCTGGTGTCTAT 6360

Alignment time is 5.52385 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31515486,31539389] =>     23904 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    2042] =>      2042 nucs 'mol-32-1e71-062836_2042'

Score:        2019
Aligned:      2041        nucs
Identic:      2039 (100%) nucs =>       283 (100%)      1756 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31523445,31523727] EXCISED REGION [31523729,31525486]
 second seq =>  [       1,     283] EXCISED REGION [     285,    2042]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [31523728,31523728]
 second seq =>         1 nucs [284,284]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [283,284] to [284,285]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [31523727,31523727] to [31523729,31523729]
 second seq =>         1 nucs [283,283] to [285,285]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31523445 TGGGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCCAACTAATTTTGTAGTTTTAGTAGAGATGGGG 31523504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGGGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCCAACTAATTTTGTAGTTTTAGTAGAGATGGGG 60

 31523505 TTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCACCTTG 31523564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCACCTTG 120

 31523565 CCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGAGTGAGTGCACCTGGCCCACTTTGCTCATTTTCTA 31523624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGAGTGAGTGCACCTGGCCCACTTTGCTCATTTTCTA 180

 31523625 ATTGGGTTATTCGTTTTCTGGCTATTGAGTTGTTTGAGTTTCTTATTTATTGTGGATGTT 31523684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATTGGGTTATTCGTTTTCTGGCTATTGAGTTGTTTGAGTTTCTTATTTATTGTGGATGTT 240

 31523685 ACTCCCTTATCAGATGTATGATTTACATATATTTTCTGTCACT 31523727
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACTCCCTTATCAGATGTATGATTTACATATATTTTCTGTCACT 283

EXCISED REGION

 31523729 TGTGGGTTATCTCTTTACTTTGTTCATTGTTTCCTTTCTGTCCAAAAGCTTTGTATCTTG 31523788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      285 TGTGGGTTATCTCTTTACTTTGTTCATTGTTTCCTTTCTGTCCAAAAGCTTTGTATCTTG 344

 31523789 TCTAAAATCCCATTTGTCTATTTTTGCTTTTATTTATTTTTATTTTTATTTTTATTTTTT 31523848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      345 TCTAAAATCCCATTTGTCTATTTTTGCTTTTATTTATTTTTATTTTTATTTTTATTTTTT 404

 31523849 ATTTTTTTGAAACGGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGTTGGAGTGCAGTGGTGCAATCTCA 31523908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      405 ATTTTTTTGAAACGGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGTTGGAGTGCAGTGGTGCAATCTCA 464

 31523909 GCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGGAAGTCTCCTACTCCAACTTCCTGAGTA 31523968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      465 GCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGGAAGTCTCCTACTCCAACTTCCTGAGTA 524

 31523969 GCTGGGATTATAGGCGTGTGCCACCATGCCTAGCTAATTTTTGTATTTTTTGGTAGAGAC 31524028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      525 GCTGGGATTATAGGCGTGTGCCACCATGCCTAGCTAATTTTTGTATTTTTTGGTAGAGAC 584

 31524029 AGGATTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTGTTGAACTCTTGACCTCAGGCAATCCGCCTGA 31524088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      585 AGGATTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTGTTGAACTCTTGACCTCAGGCAATCCGCCTGA 644

 31524089 CTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACACGTGTGAGCCACCGCGCCTGGCCTATTTTTGC 31524148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      645 CTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACACGTGTGAGCCACCGCGCCTGGCCTATTTTTGC 704

 31524149 TTTTATTACCTGTGCTTTTGGGGTCATAGCTAAATAACCATTGCTCAGATCAATGTCATG 31524208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      705 TTTTATTACCTGTGCTTTTGGGGTCATAGCTAAATAACCATTGCTCAGATCAATGTCATG 764

 31524209 GAGCCTTTCCTCTAGGTATTCTTCTAGTTGTTTTACAGTCTCAGATCTTATATTTAAGAC 31524268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      765 GAGCCTTTCCTCTAGGTATTCTTCTAGTTGTTTTACAGTCTCAGATCTTATATTTAAGAC 824

 31524269 TTTAATCCATTTTGAGTTGATTTTTTATACTGTGTGAGATAAGGATCCAATTTTATTCTT 31524328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      825 TTTAATCCATTTTGAGTTGATTTTTTATACTGTGTGAGATAAGGATCCAATTTTATTCTT 884

 31524329 CTGTATGTGGATCCAATTTTCCTAGTACAGTTTATTGAAAAGACTGTCTTTTCCCCATTA 31524388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      885 CTGTATGTGGATCCAATTTTCCTAGTACAGTTTATTGAAAAGACTGTCTTTTCCCCATTA 944

 31524389 TGTATTAGTAACACCTTTGTCAAAAATCAATTGACTATTAGTGCATGGGTTTATTTCTGG 31524448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      945 TGTATTAGTAACACCTTTGTCAAAAATCAATTGACTATTAGTGCATGGGTTTATTTCTGG 1004

 31524449 GTTTTCTATCTTGTTACATTAGTCGATGTGTCTATTTTTATGCCAGCACCATACTGTTTT 31524508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1005 GTTTTCTATCTTGTTACATTAGTCGATGTGTCTATTTTTATGCCAGCACCATACTGTTTT 1064

 31524509 GATTATATTAGCTTTATAATATATTTTGAAATCAGGGACTGTGATGTCTTTAGCTTTGTT 31524568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1065 GATTATATTAGCTTTATAATATATTTTGAAATCAGGGACTGTGATGTCTTTAGCTTTGTT 1124

 31524569 CTTTTTGCTCAAGATTGTTTTGGCTAGCCAGGGTCTTTTATGATTGCATATGAATTTAAG 31524628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1125 CTTTTTGCTCAAGATTGTTTTGGCTAGCCAGGGTCTTTTATGATTGCATATGAATTTAAG 1184

 31524629 GATTGTTTTATTTCTATAAGAAATGACATTGGAATTTTGATAGGGACTGCATTGAATCTG 31524688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1185 GATTGTTTTATTTCTATAAGAAATGACATTGGAATTTTGATAGGGACTGCATTGAATCTG 1244

 31524689 TAGATTGCTTTGGGTAGTATGAATATTTTAATAATATTAATTCTTCTAATTTATCAACAC 31524748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1245 TAGATTGCTTTGGGTAGTATGAATATTTTAATAATATTAATTCTTCTAATTTATCAACAC 1304

 31524749 AAGATAGCTTTCCATTTATTTGTGTTTTCTTAAACAATGTTTTAGTTTCCAGTGTACAGA 31524808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1305 AAGATAGCTTTCCATTTATTTGTGTTTTCTTAAACAATGTTTTAGTTTCCAGTGTACAGA 1364

 31524809 TCTTTTAACTTCTTGGTTAAATTTACCCCTAAGTATTTTATTTTATTTTAAAATACCTGG 31524868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1365 TCTTTTAACTTCTTGGTTAAATTTACCCCTAAGTATTTTATTTTATTTTAAAATACCTGG 1424

 31524869 CTAATTTTGTATTTAATTTTATATTGTATTTATTTTATTTGTAATAAAATTAAGCATTTT 31524928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1425 CTAATTTTGTATTTAATTTTATATTGTATTTATTTTATTTGTAATAAAATTAAGCATTTT 1484

 31524929 ATTTTATTTTAAAATACCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATG 31524988
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     1485 ATTTTATTTTAAAATACCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGATAGGGTTTCTCCATG 1544

 31524989 TTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCAGACCTCAGGTGATCCGACTGCCTCGGCCTCCCAAA 31525048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1545 TTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCAGACCTCAGGTGATCCGACTGCCTCGGCCTCCCAAA 1604

 31525049 GTGCTGGTATTAGAAGCATGAGCCACTGCCCACTGCACCTAGCTGAAAACCACACTTTCT 31525108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1605 GTGCTGGTATTAGAAGCATGAGCCACTGCCCACTGCACCTAGCTGAAAACCACACTTTCT 1664

 31525109 GTTGATTAAATAATATTTCACCTTATGGAGTTACAAATTTTCATTTTATGGGGTTATAAT 31525168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1665 GTTGATTAAATAATATTTCACCTTATGGAGTTACAAATTTTCATTTTATGGGGTTATAAT 1724

 31525169 CACTTACTTAGCTTGTTATCTTTTGTTGGACATTAATGTGGTTTCTAACTTTTCATTATC 31525228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1725 CACTTACTTAGCTTGTTATCTTTTGTTGGACATTAATGTGGTTTCTAACTTTTCATTATC 1784

 31525229 AAAAAATAAAAGAAAATGGACAAAACCTCAGAAAGACACAAACTACTAAAGCTGACTTAA 31525288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1785 AAAAAATAAAAGAAAATGGACAAAACCTCAGAAAGACACAAACTACTAAAGCTGACTTAA 1844

 31525289 TAAGAAATAGAAAATCTGAATATATAGAAAATCTGAATGTAACAAGTAAGGAGATTGGAT 31525348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1845 TAAGAAATAGAAAATCTGAATATATAGAAAATCTGAATGTAACAAGTAAGGAGATTGGAT 1904

 31525349 TAGTAATAAAATTTCCCACAAAGAGAAGTACACATTCAGATGGTTTCACTGGTAAATTCT 31525408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1905 TAGTAATAAAATTTCCCACAAAGAGAAGTACACATTCAGATGGTTTCACTGGTAAATTCT 1964

 31525409 ACCAAATATTTAAAGATTTTTCTTTTTTTTTGTTGAGACAGAGTCTCACTCTATTGCCCA 31525468
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     1965 ACCAAATATTTAAAGATTTTTCTTTTTTTTTGTTGAGGCAGAGTCTCACTCTATTGCCCA 2024

 31525469 GGCTGGAGTACAATGGTG 31525486
          ||||||||||||||||||
     2025 GGCTGGAGTACAATGGTG 2042

Alignment time is 1.7874 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31515486,31539389] =>     23904 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    7472] =>      7472 nucs 'mol-32-1e7c-136865_7472'

Score:        7399
Aligned:      7474        nucs
Identic:      7459 (100%) nucs =>      2199 (100%)      5260 (100%)
Gaps:           11 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31523285,31525486] EXCISED REGION [31529390,31534661]
 second seq =>  [       1,    2202] EXCISED REGION [    2212,    7472]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3903 nucs [31525487,31529389]
 second seq =>         9 nucs [2203,2211]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31523285 CATGAGCCACTGCACCTGGCCACTTTGCCTATTTTATTTTATTTTGAGATGGAGTTTTGC 31523344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CATGAGCCACTGCACCTGGCCACTTTGCCTATTTTATTTTATTTTGAGATGGAGTTTTGC 60

 31523345 TCTTATTGCCCAGACTGGAGTGCAATGGCGCAATTGCAGCTCACCACAACCTCCGCCTCC 31523404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCTTATTGCCCAGACTGGAGTGCAATGGCGCAATTGCAGCTCACCACAACCTCCGCCTCC 120

 31523405 CAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGGTGGGATTACAGGCATGCGCC 31523464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGGTGGGATTACAGGCATGCGCC 180

 31523465 ACCACGCCCAACTAATTTTGTAGTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGC 31523524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACCACGCCCAACTAATTTTGTAGTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGC 240

 31523525 TGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCACCTTGCCTCCCAAAGTGCTGGGATT 31523584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCACCTTGCCTCCCAAAGTGCTGGGATT 300

 31523585 ACAAGAGTGAGTGCACCTGGCCCACTTTGCTCATTTTCTAATTGGGTTATTCGTTTTCTG 31523644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACAAGAGTGAGTGCACCTGGCCCACTTTGCTCATTTTCTAATTGGGTTATTCGTTTTCTG 360

 31523645 GCTATTGAGTTGTTTGAGTTTCTTATTTATTGTGGATGTTACTCCCTTATCAGATGTATG 31523704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GCTATTGAGTTGTTTGAGTTTCTTATTTATTGTGGATGTTACTCCCTTATCAGATGTATG 420

 31523705 ATTTACATATATTTTCTGTCACTCTGTGGGTTATCTCTTTACTTTGTTCATTGTTTCCTT 31523764
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATTTACATATATTTTCTGTCACTTTGTGGGTTATCTCTTTACTTTGTTCATTGTTTCCTT 480

 31523765 TCTGTCCAAAAGCTTTGTATCTTGTCTAAAATCCCATTTGTCTATTTTTGCTTTTATTTA 31523824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCTGTCCAAAAGCTTTGTATCTTGTCTAAAATCCCATTTGTCTATTTTTGCTTTTATTTA 540

 31523825 TTTTTATTTTTATTTTTATTTTTTATTTTTTTGAAACGGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGG 31523884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTTTTATTTTTATTTTTATTTTTTATTTTTTTGAAACGGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGG 600

 31523885 TTGGAGTGCAGTGGTGCAATCTCAGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGGAAG 31523944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTGGAGTGCAGTGGTGCAATCTCAGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGGAAG 660

 31523945 TCTCCTACTCCAACTTCCTGAGTAGCTGGGATTATAGGCGTGTGCCACCATGCCTAGCTA 31524004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCTCCTACTCCAACTTCCTGAGTAGCTGGGATTATAGGCGTGTGCCACCATGCCTAGCTA 720

 31524005 ATTTTTGTATTTTTTGGTAGAGACAGGATTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTGTTGAACT 31524064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATTTTTGTATTTTTTGGTAGAGACAGGATTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTGTTGAACT 780

 31524065 CTTGACCTCAGGCAATCCGCCTGACTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACACGTGTGAG 31524124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTTGACCTCAGGCAATCCGCCTGACTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACACGTGTGAG 840

 31524125 CCACCGCGCCTGGCCTATTTTTGCTTTTATTACCTGTGCTTTTGGGGTCATAGCTAAATA 31524184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CCACCGCGCCTGGCCTATTTTTGCTTTTATTACCTGTGCTTTTGGGGTCATAGCTAAATA 900

 31524185 ACCATTGCTCAGATCAATGTCATGGAGCCTTTCCTCTAGGTATTCTTCTAGTTGTTTTAC 31524244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ACCATTGCTCAGATCAATGTCATGGAGCCTTTCCTCTAGGTATTCTTCTAGTTGTTTTAC 960

 31524245 AGTCTCAGATCTTATATTTAAGACTTTAATCCATTTTGAGTTGATTTTTTATACTGTGTG 31524304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AGTCTCAGATCTTATATTTAAGACTTTAATCCATTTTGAGTTGATTTTTTATACTGTGTG 1020

 31524305 AGATAAGGATCCAATTTTATTCTTCTGTATGTGGATCCAATTTTCCTAGTACAGTTTATT 31524364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGATAAGGATCCAATTTTATTCTTCTGTATGTGGATCCAATTTTCCTAGTACAGTTTATT 1080

 31524365 GAAAAGACTGTCTTTTCCCCATTATGTATTAGTAACACCTTTGTCAAAAATCAATTGACT 31524424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GAAAAGACTGTCTTTTCCCCATTATGTATTAGTAACACCTTTGTCAAAAATCAATTGACT 1140

 31524425 ATTAGTGCATGGGTTTATTTCTGGGTTTTCTATCTTGTTACATTAGTCGATGTGTCTATT 31524484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATTAGTGCATGGGTTTATTTCTGGGTTTTCTATCTTGTTACATTAGTCGATGTGTCTATT 1200

 31524485 TTTATGCCAGCACCATACTGTTTTGATTATATTAGCTTTATAATATATTTTGAAATCAGG 31524544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTTATGCCAGCACCATACTGTTTTGATTATATTAGCTTTATAATATATTTTGAAATCAGG 1260

 31524545 GACTGTGATGTCTTTAGCTTTGTTCTTTTTGCTCAAGATTGTTTTGGCTAGCCAGGGTCT 31524604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GACTGTGATGTCTTTAGCTTTGTTCTTTTTGCTCAAGATTGTTTTGGCTAGCCAGGGTCT 1320

 31524605 TTTATGATTGCATATGAATTTAAGGATTGTTTTATTTCTATAAGAAATGACATTGGAATT 31524664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTTATGATTGCATATGAATTTAAGGATTGTTTTATTTCTATAAGAAATGACATTGGAATT 1380

 31524665 TTGATAGGGACTGCATTGAATCTGTAGATTGCTTTGGGTAGTATGAATATTTTAATAATA 31524724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTGATAGGGACTGCATTGAATCTGTAGATTGCTTTGGGTAGTATGAATATTTTAATAATA 1440

 31524725 TTAATTCTTCTAATTTATCAACACAAGATAGCTTTCCATTTATTTGTGTTTTCTTAAACA 31524784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTAATTCTTCTAATTTATCAACACAAGATAGCTTTCCATTTATTTGTGTTTTCTTAAACA 1500

 31524785 ATGTTTTAGTTTCCAGTGTACAGATCTTTTAACTTCTTGGTTAAATTTACCCCTAAGTAT 31524844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATGTTTTAGTTTCCAGTGTACAGATCTTTTAACTTCTTGGTTAAATTTACCCCTAAGTAT 1560

 31524845 TTTATTTTATTTTAAAATACCTGGCTAATTTTGTATTTAATTTTATATTGTATTTATTTT 31524904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTTATTTTATTTTAAAATACCTGGCTAATTTTGTATTTAATTTTATATTGTATTTATTTT 1620

 31524905 ATTTGTAATAAAATTAAGCATTTTATTTTATTTTAAAATACCTGGCTAATTTTGTATTTT 31524964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ATTTGTAATAAAATTAAGCATTTTATTTTATTTTAAAATACCTGGCTAATTTTGTATTTT 1680

 31524965 TAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCAGACCTCAGGTG 31525024
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TAGTAGAGATAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCAGACCTCAGGTG 1740

 31525025 ATCCGACTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGTATTAGAAGCATGAGCCACTGCCCACTGC 31525084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ATCCGACTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGTATTAGAAGCATGAGCCACTGCCCACTGC 1800

 31525085 ACCTAGCTGAAAACCACACTTTCTGTTGATTAAATAATATTTCACCTTATGGAGTTACAA 31525144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ACCTAGCTGAAAACCACACTTTCTGTTGATTAAATAATATTTCACCTTATGGAGTTACAA 1860

 31525145 ATTTTCATTTTATGGGGTTATAATCACTTACTTAGCTTGTTATCTTTTGTTGGACATTAA 31525204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ATTTTCATTTTATGGGGTTATAATCACTTACTTAGCTTGTTATCTTTTGTTGGACATTAA 1920

 31525205 TGTGGTTTCTAACTTTTCATTATCAAAAAATAAAAGAAAATGGACAAAACCTCAGAAAGA 31525264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TGTGGTTTCTAACTTTTCATTATCAAAAAATAAAAGAAAATGGACAAAACCTCAGAAAGA 1980

 31525265 CACAAACTACTAAAGCTGACTTAATAAGAAATAGAAAATCTGAATATATAGAAAATCTGA 31525324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CACAAACTACTAAAGCTGACTTAATAAGAAATAGAAAATCTGAATATATAGAAAATCTGA 2040

 31525325 ATGTAACAAGTAAGGAGATTGGATTAGTAATAAAATTTCCCACAAAGAGAAGTACACATT 31525384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ATGTAACAAGTAAGGAGATTGGATTAGTAATAAAATTTCCCACAAAGAGAAGTACACATT 2100

 31525385 CAGATGGTTTCACTGGTAAATTCTACCAAATATTTAAAGATTTTTCTTTTTTTTTGTTGA 31525444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CAGATGGTTTCACTGGTAAATTCTACCAAATATTTAAAGATTTTTCTTTTTTTTTGTTGA 2160

 31525445 GACAGAGTCTCACTCTATTGCCCAGGCTGGAGTACAATGGTG 31525486
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GGCAGAGTCTCACTCTATTGCCCAGGCTGGAGTACAATGGTG 2202

EXCISED REGION

 31529390 AATACTGTGCTAAGTGAAAGAAGCCAACCACAAAATACCATATATTGTGTGATTCTGCTT 31529449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2212 AATACTGTGCTAAGTGAAAGAAGCCAACCACAAAATACCATATATTGTGTGATTCTGCTT 2271

 31529450 AAATGACATGTCCAGAATGTCCATATTAAAGTAGATTAGTGGTTTCCTGAGGCTGGGGGA 31529509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2272 AAATGACATGTCCAGAATGTCCATATTAAAGTAGATTAGTGGTTTCCTGAGGCTGGGGGA 2331

 31529510 GGGAGTTGGGGAAATTGCGTAGTGACTACTGGGTAAAGAGTTTCTTTCTGGGGTGATGAA 31529569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2332 GGGAGTTGGGGAAATTGCGTAGTGACTACTGGGTAAAGAGTTTCTTTCTGGGGTGATGAA 2391

 31529570 ATGGTCTAAAATAGAATGTGGTGGTGGTTGCACAGCTCTGAAAATACTAAAAACCATTGA 31529629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2392 ATGGTCTAAAATAGAATGTGGTGGTGGTTGCACAGCTCTGAAAATACTAAAAACCATTGA 2451

 31529630 ATGAGCACTTTAAATTGGTAAATTTTTATGTGAATTATGATTCAATAAAGTTGTGTTTAG 31529689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2452 ATGAGCACTTTAAATTGGTAAATTTTTATGTGAATTATGATTCAATAAAGTTGTGTTTAG 2511

 31529690 ATATTACTAAAAATGATGGTACAAATATTCTTTTTCACAAATGTTTTTTGTTGTTGTTTA 31529749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2512 ATATTACTAAAAATGATGGTACAAATATTCTTTTTCACAAATGTTTTTTGTTGTTGTTTA 2571

 31529750 TAGTTGTTTATTTGTACATCTAGTAATTTGTCCCAAGGAAAGAGTATGTAAAAGAACATA 31529809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2572 TAGTTGTTTATTTGTACATCTAGTAATTTGTCCCAAGGAAAGAGTATGTAAAAGAACATA 2631

 31529810 AGTCACTTTAAGGCCTTTAATGTATACTACAAAATTGCACTCTAGAAGGTTTATACAGTT 31529869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2632 AGTCACTTTAAGGCCTTTAATGTATACTACAAAATTGCACTCTAGAAGGTTTATACAGTT 2691

 31529870 TTGCATTTCATTAGCCTGTTTTTTTTATCTTTGACAACCTAAAGAATTTATTAGTGGTAT 31529929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2692 TTGCATTTCATTAGCCTGTTTTTTTTATCTTTGACAACCTAAAGAATTTATTAGTGGTAT 2751

 31529930 TCATCTGAGGATCCTCTAGGTCTATCAGAGTGTCTTTCTTATAGAAGGCATTCAATAAAT 31529989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2752 TCATCTGAGGATCCTCTAGGTCTATCAGAGTGTCTTTCTTATAGAAGGCATTCAATAAAT 2811

 31529990 AAATGTCCTAAGTGAGCAAAACATTTTTGGTTGATTTTTAGGTGCAAATGGTTTCTTTTG 31530049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2812 AAATGTCCTAAGTGAGCAAAACATTTTTGGTTGATTTTTAGGTGCAAATGGTTTCTTTTG 2871

 31530050 ATTTTAATTAAGATGCCTTTGTTTATTAGTGATGTTGACATATTTTCTTAATCTATTGGC 31530109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2872 ATTTTAATTAAGATGCCTTTGTTTATTAGTGATGTTGACATATTTTCTTAATCTATTGGC 2931

 31530110 TTTGTATAACTTTATGAATTGTCTCTTCATGTCCTTTGCCTACTTTTCTATTGTGGTAAC 31530169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2932 TTTGTATAACTTTATGAATTGTCTCTTCATGTCCTTTGCCTACTTTTCTATTGTGGTAAC 2991

 31530170 TATCTTTTATAAATGTTGTATAATTATTTAAAAATACATTAGGTTGGGCATGGTAGATCA 31530229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2992 TATCTTTTATAAATGTTGTATAATTATTTAAAAATACATTAGGTTGGGCATGGTAGATCA 3051

 31530230 TGCCTGTAATCCCAGCTCTCTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATTGCTTGAGCCTAACAGTT 31530289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3052 TGCCTGTAATCCCAGCTCTCTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATTGCTTGAGCCTAACAGTT 3111

 31530290 CGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCCATCTCTAAAAAAAAAAACCAATAAAAAT 31530349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3112 CGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCCATCTCTAAAAAAAAAAACCAATAAAAAT 3171

 31530350 ATATTAAAAGATTAACTGATTGTCTATCATATGGATTACAAATATCCCCCCCAATTTGTC 31530409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3172 ATATTAAAAGATTAACTGATTGTCTATCATATGGATTACAAATATCCCCCCCAATTTGTC 3231

 31530410 ATTTGCTTGTTAATTTTATTTATGATGACTTAAAAATTACAATATATTTTTTGGTGTTCA 31530469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3232 ATTTGCTTGTTAATTTTATTTATGATGACTTAAAAATTACAATATATTTTTTGGTGTTCA 3291

 31530470 AGTCAGTTTTTGTCCCCATTGTGATATTTTCCTTTGCCTGTTTATCACTTTCTTAGAGAA 31530529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3292 AGTCAGTTTTTGTCCCCATTGTGATATTTTCCTTTGCCTGTTTATCACTTTCTTAGAGAA 3351

 31530530 AAGATAAATACTGATTCGTTCTTTTGTAGGTGTTTTATGATTTCATTGAAAATAAAATCT 31530589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3352 AAGATAAATACTGATTCGTTCTTTTGTAGGTGTTTTATGATTTCATTGAAAATAAAATCT 3411

 31530590 TCAACGCATCTAGTATTCATTTGGGTGTAAGATAAAAGATAACAACGTAGGTTTCTCTTA 31530649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3412 TCAACGCATCTAGTATTCATTTGGGTGTAAGATAAAAGATAACAACGTAGGTTTCTCTTA 3471

 31530650 TAGTTCATCAGGTATCCTACTACTGTTTATTGAGTCATGTTTTCTGTTACCACTCTTACT 31530709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3472 TAGTTCATCAGGTATCCTACTACTGTTTATTGAGTCATGTTTTCTGTTACCACTCTTACT 3531

 31530710 ATATACCAGTTTTACATACATTTGGGTTGGTTTCTGAGCTTTCTATTGTCTTCCATTGCT 31530769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3532 ATATACCAGTTTTACATACATTTGGGTTGGTTTCTGAGCTTTCTATTGTCTTCCATTGCT 3591

 31530770 TTGTTTAAAATTTAAAGTTTATTATTCTGACTTTCCATACTTGAATATGGTCGAATAAGT 31530829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3592 TTGTTTAAAATTTAAAGTTTATTATTCTGACTTTCCATACTTGAATATGGTCGAATAAGT 3651

 31530830 CCTCCTTTATTAATCTTGTTTTATTTAAAAATGGTCATTTTCACTCATTTTCCAGTTCAG 31530889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3652 CCTCCTTTATTAATCTTGTTTTATTTAAAAATGGTCATTTTCACTCATTTTCCAGTTCAG 3711

 31530890 TAGTTTTATTCTCTCAGTGTAATGTGATTTATCACCCCATTGCTCACCCTATTCATCTCC 31530949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3712 TAGTTTTATTCTCTCAGTGTAATGTGATTTATCACCCCATTGCTCACCCTATTCATCTCC 3771

 31530950 CAATACCCAGCTGAAAAACTTTAGAAGACTGAGGCTCTTGCCCTGGCCCCATCACTTTCT 31531009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3772 CAATACCCAGCTGAAAAACTTTAGAAGACTGAGGCTCTTGCCCTGGCCCCATCACTTTCT 3831

 31531010 AGCTATGTGGGCTTAGGCTAGTTATTGAACATGTCTGACTCTCACTTTTCTCCTCTGTAA 31531069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3832 AGCTATGTGGGCTTAGGCTAGTTATTGAACATGTCTGACTCTCACTTTTCTCCTCTGTAA 3891

 31531070 GTCAGTGAGAATTATATACTTCTTATAAGGTTGTGAGGTTCAAATGGAATAATGTGTACA 31531129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3892 GTCAGTGAGAATTATATACTTCTTATAAGGTTGTGAGGTTCAAATGGAATAATGTGTACA 3951

 31531130 GAGGCACTTGGTAAACAATGTAGTCATATGCAAGTCATATGCAAGTCATATGTAGTCAGC 31531189
          |||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||
     3952 GAGGCACTTGGTAAACAATGT-----------AGTCATATGCAAGTCATATGTAGTCAGC 4000

 31531190 TTGGTGAATTTTGAGAAAGTAAATGCAAGTTCTTTTTATGGTTTTACCTAAGGGGCCAGT 31531249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4001 TTGGTGAATTTTGAGAAAGTAAATGCAAGTTCTTTTTATGGTTTTACCTAAGGGGCCAGT 4060

 31531250 GAGGGCCAGAGAAGTGCCGGGACCTATGTAAGGTCGCAAGCAAGTTCATGTGGAATGCAT 31531309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4061 GAGGGCCAGAGAAGTGCCGGGACCTATGTAAGGTCGCAAGCAAGTTCATGTGGAATGCAT 4120

 31531310 CTAGAACTAGAACGCTAGCCTGTGTCCCAGGGCCCTTCCAACTGGGCTCTGCTGCCTGCA 31531369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4121 CTAGAACTAGAACGCTAGCCTGTGTCCCAGGGCCCTTCCAACTGGGCTCTGCTGCCTGCA 4180

 31531370 GTCCTGGGTGCCTTCTAATTAGCCTGTGTAGTGGTCTTGGTAAAAGTGTTTCTCCTGTAC 31531429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4181 GTCCTGGGTGCCTTCTAATTAGCCTGTGTAGTGGTCTTGGTAAAAGTGTTTCTCCTGTAC 4240

 31531430 TGTCCCCTATAGGTTGTGGCTGGCCATACCATTTCCCTGGTTCCCCCCACGCTCCTGATG 31531489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4241 TGTCCCCTATAGGTTGTGGCTGGCCATACCATTTCCCTGGTTCCCCCCACGCTCCTGATG 4300

 31531490 ACCTGGAAAGGCCATTTGAATAGTGTGGCAGACATCCTGTATGTGGACAACTTCCAGCTG 31531549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4301 ACCTGGAAAGGCCATTTGAATAGTGTGGCAGACATCCTGTATGTGGACAACTTCCAGCTG 4360

 31531550 GTTATCAGCGCTGGCCAGGACCGGGACGTCAAGGCTTGGAAACTCTCCGGTGATGCCATT 31531609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4361 GTTATCAGCGCTGGCCAGGACCGGGACGTCAAGGCTTGGAAACTCTCCGGTGATGCCATT 4420

 31531610 GGTATGGGTCCTGCTGAAGCTCAGCCATGCCCATGGCCCTTCTTGTCTCTGTCCCTGTCT 31531669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4421 GGTATGGGTCCTGCTGAAGCTCAGCCATGCCCATGGCCCTTCTTGTCTCTGTCCCTGTCT 4480

 31531670 GAACATAAGCTGGTATGAACTTTGTACTCTGTGGGGAGGGACTCTCAGGCCACAGCAACT 31531729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4481 GAACATAAGCTGGTATGAACTTTGTACTCTGTGGGGAGGGACTCTCAGGCCACAGCAACT 4540

 31531730 GCCTTCACTTAAATAATATTACAGTCTGTCCAATTATCCATTCAGCAAACGGTCCATCCA 31531789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4541 GCCTTCACTTAAATAATATTACAGTCTGTCCAATTATCCATTCAGCAAACGGTCCATCCA 4600

 31531790 TTCACCCATCCACCCAATATTATTCACCTATGTATATTTTTGCAAATCATATATCTGATA 31531849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4601 TTCACCCATCCACCCAATATTATTCACCTATGTATATTTTTGCAAATCATATATCTGATA 4660

 31531850 AAGCATATTCCTTTCTCTTTTAAAAAATAAACTTAATTGTTGCATTGTATATAAAGAAAA 31531909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4661 AAGCATATTCCTTTCTCTTTTAAAAAATAAACTTAATTGTTGCATTGTATATAAAGAAAA 4720

 31531910 ACATACAAACCAGAAGGGTTCAGCTTGGTGAATTTTGAGAAAGTAAATACATACCCATAT 31531969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4721 ACATACAAACCAGAAGGGTTCAGCTTGGTGAATTTTGAGAAAGTAAATACATACCCATAT 4780

 31531970 AGCCACCGTTCATGTCAAGAAATAATTAGGGCCAGGCGCGGTGGCTCACTACTGTAATCC 31532029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4781 AGCCACCGTTCATGTCAAGAAATAATTAGGGCCAGGCGCGGTGGCTCACTACTGTAATCC 4840

 31532030 CAACACTTTTTTGTCCCCTTTTCCTCCTGTGCTGTCTTCCTATGTGTTTGTTTGTTTGTT 31532089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4841 CAACACTTTTTTGTCCCCTTTTCCTCCTGTGCTGTCTTCCTATGTGTTTGTTTGTTTGTT 4900

 31532090 TTAGTGACCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGTGCATGCCTGT 31532149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4901 TTAGTGACCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGTGCATGCCTGT 4960

 31532150 AATCCCAGCTACTTGAGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGTTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTT 31532209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4961 AATCCCAGCTACTTGAGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGTTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTT 5020

 31532210 GCAGTGAGCTGAGATCATGTCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGACTCTGTCT 31532269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5021 GCAGTGAGCTGAGATCATGTCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGACTCTGTCT 5080

 31532270 AAAAAAAAAATAATAATAAAAATAAAGTGACTTATGTGCCACTATTACAGTATTACAGCA 31532329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5081 AAAAAAAAAATAATAATAAAAATAAAGTGACTTATGTGCCACTATTACAGTATTACAGCA 5140

 31532330 TTCTGTATTTTTCTATGTGTTTACATTTATCAGAAAGCTTTGTATTTTCATATGCTTTCA 31532389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5141 TTCTGTATTTTTCTATGTGTTTACATTTATCAGAAAGCTTTGTATTTTCATATGCTTTCA 5200

 31532390 TGTTCCTGCCTAGCATCCTTTTGTTTCAACTTGAAGGGGTCCCTTTAGCATTTCTTTAAA 31532449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5201 TGTTCCTGCCTAGCATCCTTTTGTTTCAACTTGAAGGGGTCCCTTTAGCATTTCTTTAAA 5260

 31532450 GGCAGGTCTAATGGTGATGAACTCCTCTTGTTTTTATTTATCTGGGAAAATTTTTATTTT 31532509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5261 GGCAGGTCTAATGGTGATGAACTCCTCTTGTTTTTATTTATCTGGGAAAATTTTTATTTT 5320

 31532510 TCCTTCATTTTTAAAGGACAGCTTTCCTGGATATAGTATTTTTGGATGAGAGTTTTTGTT 31532569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5321 TCCTTCATTTTTAAAGGACAGCTTTCCTGGATATAGTATTTTTGGATGAGAGTTTTTGTT 5380

 31532570 CTTTTTATAATGTGTCTCCTTGTGGATTTCTTTGACTTTATCCTAGTTGGAATCCCTTGA 31532629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5381 CTTTTTATAATGTGTCTCCTTGTGGATTTCTTTGACTTTATCCTAGTTGGAATCCCTTGA 5440

 31532630 GCTTCTTGAATATAGGTTTCTTTTCCTTTTTAAGATTTGAAACATTTTCAGCCATTATTT 31532689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5441 GCTTCTTGAATATAGGTTTCTTTTCCTTTTTAAGATTTGAAACATTTTCAGCCATTATTT 5500

 31532690 ATTCAGATAAGCTTTTTGTCCCTTTCTCTCTCTCTGTCTCTCTCTCCTCCTTCTAGTACT 31532749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5501 ATTCAGATAAGCTTTTTGTCCCTTTCTCTCTCTCTGTCTCTCTCTCCTCCTTCTAGTACT 5560

 31532750 ACCATAATGCATATATTGTCCATTTGACGATGTCTCATAAATCCCTTAAGTTTTCTTTAC 31532809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5561 ACCATAATGCATATATTGTCCATTTGACGATGTCTCATAAATCCCTTAAGTTTTCTTTAC 5620

 31532810 TCTTTAAAATTCTTTTTTCTTTTTTGCTTCTCTGACTGGATATCTTCAAGTCTGCTGATT 31532869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5621 TCTTTAAAATTCTTTTTTCTTTTTTGCTTCTCTGACTGGATATCTTCAAGTCTGCTGATT 5680

 31532870 TTTCCTTCTGCTTGATCAAGCCTGCTGTAGATGACTTTTGAATTCAATTATTTTACTCTT 31532929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5681 TTTCCTTCTGCTTGATCAAGCCTGCTGTAGATGACTTTTGAATTCAATTATTTTACTCTT 5740

 31532930 CATCTTCAGCTCTAGAATTTCTGTTATTTTTATTATTATTATTATTATTTTTTGAGACAG 31532989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5741 CATCTTCAGCTCTAGAATTTCTGTTATTTTTATTATTATTATTATTATTTTTTGAGACAG 5800

 31532990 GGTCTTGCTCTGCCACCCAGGGTTGAGTGCAGTGGCACGAATTCAGCTCACTGAAGCCTT 31533049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5801 GGTCTTGCTCTGCCACCCAGGGTTGAGTGCAGTGGCACGAATTCAGCTCACTGAAGCCTT 5860

 31533050 GACCTCCCAGCCTCAAGTGATCTTCCCACAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCA 31533109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5861 GACCTCCCAGCCTCAAGTGATCTTCCCACAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCA 5920

 31533110 TGCCATCATGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTTGTAGAGACAGAGTTTCACCATGTTGC 31533169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5921 TGCCATCATGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTTGTAGAGACAGAGTTTCACCATGTTGC 5980

 31533170 CCAGGCTGGCCTTGAATTCTTGAGCTCAAGTGATCGCCCACCTAAGCTTCCCAAAGTGTT 31533229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5981 CCAGGCTGGCCTTGAATTCTTGAGCTCAAGTGATCGCCCACCTAAGCTTCCCAAAGTGTT 6040

 31533230 GGGATTATAGGTGTGGGCCACCATGGCTGGCCTCTGTTTGGTTCTTTTCTATATTTTCTG 31533289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6041 GGGATTATAGGTGTGGGCCACCATGGCTGGCCTCTGTTTGGTTCTTTTCTATATTTTCTG 6100

 31533290 TGTCTTCACTAATATTCTCAGTTTGTTCATGTATTGTTTCCCTGAGCTTGTTGAGCATTT 31533349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6101 TGTCTTCACTAATATTCTCAGTTTGTTCATGTATTGTTTCCCTGAGCTTGTTGAGCATTT 6160

 31533350 TTATTACGGTTACTTAGAATTCTTTGTCAAATAATTAATATACCTCAATTTCTTTAGCGG 31533409
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6161 TTATTACAGTTACTTAGAATTCTTTGTCAAATAATTAATATACCTCAATTTCTTTAGCGG 6220

 31533410 CAGTTTCTGGAGATTTATTTTGTTCCTTTGGGCCATGCTTTCCTATTTTTTTTGTGTGCC 31533469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6221 CAGTTTCTGGAGATTTATTTTGTTCCTTTGGGCCATGCTTTCCTATTTTTTTTGTGTGCC 6280

 31533470 TTATAACTTTATATTGGGATCCATGCATTTGTAAAATCAGCCACCTCTCCCAGTCTTTAT 31533529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6281 TTATAACTTTATATTGGGATCCATGCATTTGTAAAATCAGCCACCTCTCCCAGTCTTTAT 6340

 31533530 ATACTGGCTTCATTCAGGGAAAATTCTGCACCAATCAGCTTGGCTAAAGATTCTGGGTGC 31533589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6341 ATACTGGCTTCATTCAGGGAAAATTCTGCACCAATCAGCTTGGCTAAAGATTCTGGGTGC 6400

 31533590 CTCCCCAATCTTTTTTGTGGATACTTTCACCAGACTTACGCATGTAAATTCGCAATTACA 31533649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6401 CTCCCCAATCTTTTTTGTGGATACTTTCACCAGACTTACGCATGTAAATTCGCAATTACA 6460

 31533650 GGAATCTACAGGTTTATTTTTTTCAGGAGTCCATTATCTCTTGCTCTCTCTGGTGTCTAT 31533709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6461 GGAATCTACAGGTTTATTTTTTTCAGGAGTCCATTATCTCTTGCTCTCTCTGGTGTCTAT 6520

 31533710 TTGCAGTACTGCAAGTTCTCTAGAGCGGCTACAAGCTTCCCCCAGGCCTCTAGAATATGC 31533769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6521 TTGCAGTACTGCAAGTTCTCTAGAGCGGCTACAAGCTTCCCCCAGGCCTCTAGAATATGC 6580

 31533770 TGGGTCCTTCAATAGTCTGAGAGAGGCAAGACAGAAACCAGTTTCTTGGGTACCCCTCAA 31533829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6581 TGGGTCCTTCAATAGTCTGAGAGAGGCAAGACAGAAACCAGTTTCTTGGGTACCCCTCAA 6640

 31533830 AGGCTAACATTGGATATGTATGCTCCAAATCTGCCTCCTCAAGGAGAAGCTGGAAGTTGG 31533889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6641 AGGCTAACATTGGATATGTATGCTCCAAATCTGCCTCCTCAAGGAGAAGCTGGAAGTTGG 6700

 31533890 GTTGTTTTCTCTACTCATTCCACAGAGCGGCAGGAGGGACTCTGATAGTGTGTGCTAGTC 31533949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6701 GTTGTTTTCTCTACTCATTCCACAGAGCGGCAGGAGGGACTCTGATAGTGTGTGCTAGTC 6760

 31533950 TAAATTGTCACCTTTGTTCTTAGTAGCCCAGTCTGGTGCCTCTTCCTGTCAGTGCTTAGA 31534009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6761 TAAATTGTCACCTTTGTTCTTAGTAGCCCAGTCTGGTGCCTCTTCCTGTCAGTGCTTAGA 6820

 31534010 TTCAGGCAAGACAGAAACTGGTTAATCATGCAGCCCTCTGAAAAGTCTGCATGTTGGATG 31534069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6821 TTCAGGCAAGACAGAAACTGGTTAATCATGCAGCCCTCTGAAAAGTCTGCATGTTGGATG 6880

 31534070 TACATCTCAGTCTTTCCCTCCCAGGGAGAAGCTGGAAGCTGGTGGTTCCTTCCCAATCTG 31534129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6881 TACATCTCAGTCTTTCCCTCCCAGGGAGAAGCTGGAAGCTGGTGGTTCCTTCCCAATCTG 6940

 31534130 CTTCACTGAGCCAGGAGGAGGGATTACAAGTGAGCACTATGAATTTTCCTACTGGCTTCA 31534189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6941 CTTCACTGAGCCAGGAGGAGGGATTACAAGTGAGCACTATGAATTTTCCTACTGGCTTCA 7000

 31534190 GTGCAGCTGGTTTTTTGTTTTTTGTTTTTTTGGTTTTTGTTTGTTTGTTTTTTCATTCAT 31534249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7001 GTGCAGCTGGTTTTTTGTTTTTTGTTTTTTTGGTTTTTGTTTGTTTGTTTTTTCATTCAT 7060

 31534250 CTGGGATGAATGGTCCTGGTTTCTGGTCCATGTACTGTTGTTCAGTCAGTGTCTCCATAG 31534309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7061 CTGGGATGAATGGTCCTGGTTTCTGGTCCATGTACTGTTGTTCAGTCAGTGTCTCCATAG 7120

 31534310 GGAGAAGGAAGTTCTGGATCTTCCTATTCTACCATCTTGCTGATGTCACCCATTTTTTTG 31534369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7121 GGAGAAGGAAGTTCTGGATCTTCCTATTCTACCATCTTGCTGATGTCACCCATTTTTTTG 7180

 31534370 TATCTTTCAAAGACGTCTTTGACTATCCCCTAAATATAATATCTAGTGTTATCTTTTAGA 31534429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7181 TATCTTTCAAAGACGTCTTTGACTATCCCCTAAATATAATATCTAGTGTTATCTTTTAGA 7240

 31534430 AGCTTGTTTTAAAAATCAGATTTCTGAAGTATAATTTACATCCAATAAAAGCACCTTTTA 31534489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7241 AGCTTGTTTTAAAAATCAGATTTCTGAAGTATAATTTACATCCAATAAAAGCACCTTTTA 7300

 31534490 AAAGTATATAGTTCTGTGAGGTTTCATGAATGCATACAATTGTGTAATTGGTATCACAAT 31534549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7301 AAAGTATATAGTTCTGTGAGGTTTCATGAATGCATACAATTGTGTAATTGGTATCACAAT 7360

 31534550 CAAGACATAGACATTACCCCAAAAAGTGACCTCATGTCTCCTCATAGTAAACTCTATTTC 31534609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7361 CAAGACATAGACATTACCCCAAAAAGTGACCTCATGTCTCCTCATAGTAAACTCTATTTC 7420

 31534610 CTTCTCCTAACCCCTGGCAGCCATTGATCTGTTTGTCTCTATAGTTTTGCCT 31534661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7421 CTTCTCCTAACCCCTGGCAGCCATTGATCTGTTTGTCTCTATAGTTTTGCCT 7472

Alignment time is 6.45039 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31515486,31539389] =>     23904 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    2202] =>      2202 nucs 'mol-32-1e7c-136865_2202'

Score:        2179
Aligned:      2201        nucs
Identic:      2199 (100%) nucs =>       443 (100%)      1756 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31523285,31523727] EXCISED REGION [31523729,31525486]
 second seq =>  [       1,     443] EXCISED REGION [     445,    2202]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [31523728,31523728]
 second seq =>         1 nucs [444,444]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [443,444] to [444,445]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [31523727,31523727] to [31523729,31523729]
 second seq =>         1 nucs [443,443] to [445,445]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31523285 CATGAGCCACTGCACCTGGCCACTTTGCCTATTTTATTTTATTTTGAGATGGAGTTTTGC 31523344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CATGAGCCACTGCACCTGGCCACTTTGCCTATTTTATTTTATTTTGAGATGGAGTTTTGC 60

 31523345 TCTTATTGCCCAGACTGGAGTGCAATGGCGCAATTGCAGCTCACCACAACCTCCGCCTCC 31523404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCTTATTGCCCAGACTGGAGTGCAATGGCGCAATTGCAGCTCACCACAACCTCCGCCTCC 120

 31523405 CAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGGTGGGATTACAGGCATGCGCC 31523464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGGTGGGATTACAGGCATGCGCC 180

 31523465 ACCACGCCCAACTAATTTTGTAGTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGC 31523524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACCACGCCCAACTAATTTTGTAGTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGC 240

 31523525 TGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCACCTTGCCTCCCAAAGTGCTGGGATT 31523584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCACCTTGCCTCCCAAAGTGCTGGGATT 300

 31523585 ACAAGAGTGAGTGCACCTGGCCCACTTTGCTCATTTTCTAATTGGGTTATTCGTTTTCTG 31523644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACAAGAGTGAGTGCACCTGGCCCACTTTGCTCATTTTCTAATTGGGTTATTCGTTTTCTG 360

 31523645 GCTATTGAGTTGTTTGAGTTTCTTATTTATTGTGGATGTTACTCCCTTATCAGATGTATG 31523704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GCTATTGAGTTGTTTGAGTTTCTTATTTATTGTGGATGTTACTCCCTTATCAGATGTATG 420

 31523705 ATTTACATATATTTTCTGTCACT 31523727
          |||||||||||||||||||||||
      421 ATTTACATATATTTTCTGTCACT 443

EXCISED REGION

 31523729 TGTGGGTTATCTCTTTACTTTGTTCATTGTTTCCTTTCTGTCCAAAAGCTTTGTATCTTG 31523788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      445 TGTGGGTTATCTCTTTACTTTGTTCATTGTTTCCTTTCTGTCCAAAAGCTTTGTATCTTG 504

 31523789 TCTAAAATCCCATTTGTCTATTTTTGCTTTTATTTATTTTTATTTTTATTTTTATTTTTT 31523848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      505 TCTAAAATCCCATTTGTCTATTTTTGCTTTTATTTATTTTTATTTTTATTTTTATTTTTT 564

 31523849 ATTTTTTTGAAACGGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGTTGGAGTGCAGTGGTGCAATCTCA 31523908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      565 ATTTTTTTGAAACGGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGTTGGAGTGCAGTGGTGCAATCTCA 624

 31523909 GCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGGAAGTCTCCTACTCCAACTTCCTGAGTA 31523968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      625 GCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGGAAGTCTCCTACTCCAACTTCCTGAGTA 684

 31523969 GCTGGGATTATAGGCGTGTGCCACCATGCCTAGCTAATTTTTGTATTTTTTGGTAGAGAC 31524028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      685 GCTGGGATTATAGGCGTGTGCCACCATGCCTAGCTAATTTTTGTATTTTTTGGTAGAGAC 744

 31524029 AGGATTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTGTTGAACTCTTGACCTCAGGCAATCCGCCTGA 31524088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      745 AGGATTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTGTTGAACTCTTGACCTCAGGCAATCCGCCTGA 804

 31524089 CTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACACGTGTGAGCCACCGCGCCTGGCCTATTTTTGC 31524148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      805 CTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACACGTGTGAGCCACCGCGCCTGGCCTATTTTTGC 864

 31524149 TTTTATTACCTGTGCTTTTGGGGTCATAGCTAAATAACCATTGCTCAGATCAATGTCATG 31524208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      865 TTTTATTACCTGTGCTTTTGGGGTCATAGCTAAATAACCATTGCTCAGATCAATGTCATG 924

 31524209 GAGCCTTTCCTCTAGGTATTCTTCTAGTTGTTTTACAGTCTCAGATCTTATATTTAAGAC 31524268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      925 GAGCCTTTCCTCTAGGTATTCTTCTAGTTGTTTTACAGTCTCAGATCTTATATTTAAGAC 984

 31524269 TTTAATCCATTTTGAGTTGATTTTTTATACTGTGTGAGATAAGGATCCAATTTTATTCTT 31524328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      985 TTTAATCCATTTTGAGTTGATTTTTTATACTGTGTGAGATAAGGATCCAATTTTATTCTT 1044

 31524329 CTGTATGTGGATCCAATTTTCCTAGTACAGTTTATTGAAAAGACTGTCTTTTCCCCATTA 31524388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1045 CTGTATGTGGATCCAATTTTCCTAGTACAGTTTATTGAAAAGACTGTCTTTTCCCCATTA 1104

 31524389 TGTATTAGTAACACCTTTGTCAAAAATCAATTGACTATTAGTGCATGGGTTTATTTCTGG 31524448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1105 TGTATTAGTAACACCTTTGTCAAAAATCAATTGACTATTAGTGCATGGGTTTATTTCTGG 1164

 31524449 GTTTTCTATCTTGTTACATTAGTCGATGTGTCTATTTTTATGCCAGCACCATACTGTTTT 31524508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1165 GTTTTCTATCTTGTTACATTAGTCGATGTGTCTATTTTTATGCCAGCACCATACTGTTTT 1224

 31524509 GATTATATTAGCTTTATAATATATTTTGAAATCAGGGACTGTGATGTCTTTAGCTTTGTT 31524568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1225 GATTATATTAGCTTTATAATATATTTTGAAATCAGGGACTGTGATGTCTTTAGCTTTGTT 1284

 31524569 CTTTTTGCTCAAGATTGTTTTGGCTAGCCAGGGTCTTTTATGATTGCATATGAATTTAAG 31524628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1285 CTTTTTGCTCAAGATTGTTTTGGCTAGCCAGGGTCTTTTATGATTGCATATGAATTTAAG 1344

 31524629 GATTGTTTTATTTCTATAAGAAATGACATTGGAATTTTGATAGGGACTGCATTGAATCTG 31524688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1345 GATTGTTTTATTTCTATAAGAAATGACATTGGAATTTTGATAGGGACTGCATTGAATCTG 1404

 31524689 TAGATTGCTTTGGGTAGTATGAATATTTTAATAATATTAATTCTTCTAATTTATCAACAC 31524748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1405 TAGATTGCTTTGGGTAGTATGAATATTTTAATAATATTAATTCTTCTAATTTATCAACAC 1464

 31524749 AAGATAGCTTTCCATTTATTTGTGTTTTCTTAAACAATGTTTTAGTTTCCAGTGTACAGA 31524808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1465 AAGATAGCTTTCCATTTATTTGTGTTTTCTTAAACAATGTTTTAGTTTCCAGTGTACAGA 1524

 31524809 TCTTTTAACTTCTTGGTTAAATTTACCCCTAAGTATTTTATTTTATTTTAAAATACCTGG 31524868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1525 TCTTTTAACTTCTTGGTTAAATTTACCCCTAAGTATTTTATTTTATTTTAAAATACCTGG 1584

 31524869 CTAATTTTGTATTTAATTTTATATTGTATTTATTTTATTTGTAATAAAATTAAGCATTTT 31524928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1585 CTAATTTTGTATTTAATTTTATATTGTATTTATTTTATTTGTAATAAAATTAAGCATTTT 1644

 31524929 ATTTTATTTTAAAATACCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATG 31524988
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     1645 ATTTTATTTTAAAATACCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGATAGGGTTTCTCCATG 1704

 31524989 TTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCAGACCTCAGGTGATCCGACTGCCTCGGCCTCCCAAA 31525048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1705 TTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCAGACCTCAGGTGATCCGACTGCCTCGGCCTCCCAAA 1764

 31525049 GTGCTGGTATTAGAAGCATGAGCCACTGCCCACTGCACCTAGCTGAAAACCACACTTTCT 31525108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1765 GTGCTGGTATTAGAAGCATGAGCCACTGCCCACTGCACCTAGCTGAAAACCACACTTTCT 1824

 31525109 GTTGATTAAATAATATTTCACCTTATGGAGTTACAAATTTTCATTTTATGGGGTTATAAT 31525168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1825 GTTGATTAAATAATATTTCACCTTATGGAGTTACAAATTTTCATTTTATGGGGTTATAAT 1884

 31525169 CACTTACTTAGCTTGTTATCTTTTGTTGGACATTAATGTGGTTTCTAACTTTTCATTATC 31525228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1885 CACTTACTTAGCTTGTTATCTTTTGTTGGACATTAATGTGGTTTCTAACTTTTCATTATC 1944

 31525229 AAAAAATAAAAGAAAATGGACAAAACCTCAGAAAGACACAAACTACTAAAGCTGACTTAA 31525288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1945 AAAAAATAAAAGAAAATGGACAAAACCTCAGAAAGACACAAACTACTAAAGCTGACTTAA 2004

 31525289 TAAGAAATAGAAAATCTGAATATATAGAAAATCTGAATGTAACAAGTAAGGAGATTGGAT 31525348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2005 TAAGAAATAGAAAATCTGAATATATAGAAAATCTGAATGTAACAAGTAAGGAGATTGGAT 2064

 31525349 TAGTAATAAAATTTCCCACAAAGAGAAGTACACATTCAGATGGTTTCACTGGTAAATTCT 31525408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2065 TAGTAATAAAATTTCCCACAAAGAGAAGTACACATTCAGATGGTTTCACTGGTAAATTCT 2124

 31525409 ACCAAATATTTAAAGATTTTTCTTTTTTTTTGTTGAGACAGAGTCTCACTCTATTGCCCA 31525468
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     2125 ACCAAATATTTAAAGATTTTTCTTTTTTTTTGTTGAGGCAGAGTCTCACTCTATTGCCCA 2184

 31525469 GGCTGGAGTACAATGGTG 31525486
          ||||||||||||||||||
     2185 GGCTGGAGTACAATGGTG 2202

Alignment time is 1.92976 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31515486,31539389] =>     23904 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    6709] =>      6709 nucs 'mol-32-1f16-140787_6709'

Score:        6647
Aligned:      6711        nucs
Identic:      6697 (100%) nucs =>       955 (100%)      5742 (100%)
Gaps:           11 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31524530,31525486] EXCISED REGION [31529390,31535143]
 second seq =>  [       1,     957] EXCISED REGION [     967,    6709]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3903 nucs [31525487,31529389]
 second seq =>         9 nucs [958,966]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31524530 TATTTTGAAATCAGGGACTGTGATGTCTTTAGCTTTGTTCTTTTTGCTCAAGATTGTTTT 31524589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TATTTTGAAATCAGGGACTGTGATGTCTTTAGCTTTGTTCTTTTTGCTCAAGATTGTTTT 60

 31524590 GGCTAGCCAGGGTCTTTTATGATTGCATATGAATTTAAGGATTGTTTTATTTCTATAAGA 31524649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGCTAGCCAGGGTCTTTTATGATTGCATATGAATTTAAGGATTGTTTTATTTCTATAAGA 120

 31524650 AATGACATTGGAATTTTGATAGGGACTGCATTGAATCTGTAGATTGCTTTGGGTAGTATG 31524709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AATGACATTGGAATTTTGATAGGGACTGCATTGAATCTGTAGATTGCTTTGGGTAGTATG 180

 31524710 AATATTTTAATAATATTAATTCTTCTAATTTATCAACACAAGATAGCTTTCCATTTATTT 31524769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AATATTTTAATAATATTAATTCTTCTAATTTATCAACACAAGATAGCTTTCCATTTATTT 240

 31524770 GTGTTTTCTTAAACAATGTTTTAGTTTCCAGTGTACAGATCTTTTAACTTCTTGGTTAAA 31524829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTGTTTTCTTAAACAATGTTTTAGTTTCCAGTGTACAGATCTTTTAACTTCTTGGTTAAA 300

 31524830 TTTACCCCTAAGTATTTTATTTTATTTTAAAATACCTGGCTAATTTTGTATTTAATTTTA 31524889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTACCCCTAAGTATTTTATTTTATTTTAAAATACCTGGCTAATTTTGTATTTAATTTTA 360

 31524890 TATTGTATTTATTTTATTTGTAATAAAATTAAGCATTTTATTTTATTTTAAAATACCTGG 31524949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TATTGTATTTATTTTATTTGTAATAAAATTAAGCATTTTATTTTATTTTAAAATACCTGG 420

 31524950 CTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAAC 31525009
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGATAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAAC 480

 31525010 TCCAGACCTCAGGTGATCCGACTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGTATTAGAAGCATGA 31525069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCCAGACCTCAGGTGATCCGACTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGTATTAGAAGCATGA 540

 31525070 GCCACTGCCCACTGCACCTAGCTGAAAACCACACTTTCTGTTGATTAAATAATATTTCAC 31525129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GCCACTGCCCACTGCACCTAGCTGAAAACCACACTTTCTGTTGATTAAATAATATTTCAC 600

 31525130 CTTATGGAGTTACAAATTTTCATTTTATGGGGTTATAATCACTTACTTAGCTTGTTATCT 31525189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTTATGGAGTTACAAATTTTCATTTTATGGGGTTATAATCACTTACTTAGCTTGTTATCT 660

 31525190 TTTGTTGGACATTAATGTGGTTTCTAACTTTTCATTATCAAAAAATAAAAGAAAATGGAC 31525249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTTGTTGGACATTAATGTGGTTTCTAACTTTTCATTATCAAAAAATAAAAGAAAATGGAC 720

 31525250 AAAACCTCAGAAAGACACAAACTACTAAAGCTGACTTAATAAGAAATAGAAAATCTGAAT 31525309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAAACCTCAGAAAGACACAAACTACTAAAGCTGACTTAATAAGAAATAGAAAATCTGAAT 780

 31525310 ATATAGAAAATCTGAATGTAACAAGTAAGGAGATTGGATTAGTAATAAAATTTCCCACAA 31525369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATATAGAAAATCTGAATGTAACAAGTAAGGAGATTGGATTAGTAATAAAATTTCCCACAA 840

 31525370 AGAGAAGTACACATTCAGATGGTTTCACTGGTAAATTCTACCAAATATTTAAAGATTTTT 31525429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGAGAAGTACACATTCAGATGGTTTCACTGGTAAATTCTACCAAATATTTAAAGATTTTT 900

 31525430 CTTTTTTTTTGTTGAGACAGAGTCTCACTCTATTGCCCAGGCTGGAGTACAATGGTG 31525486
          ||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTTTTTTTTTGTTGAGGCAGAGTCTCACTCTATTGCCCAGGCTGGAGTACAATGGTG 957

EXCISED REGION

 31529390 AATACTGTGCTAAGTGAAAGAAGCCAACCACAAAATACCATATATTGTGTGATTCTGCTT 31529449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      967 AATACTGTGCTAAGTGAAAGAAGCCAACCACAAAATACCATATATTGTGTGATTCTGCTT 1026

 31529450 AAATGACATGTCCAGAATGTCCATATTAAAGTAGATTAGTGGTTTCCTGAGGCTGGGGGA 31529509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1027 AAATGACATGTCCAGAATGTCCATATTAAAGTAGATTAGTGGTTTCCTGAGGCTGGGGGA 1086

 31529510 GGGAGTTGGGGAAATTGCGTAGTGACTACTGGGTAAAGAGTTTCTTTCTGGGGTGATGAA 31529569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1087 GGGAGTTGGGGAAATTGCGTAGTGACTACTGGGTAAAGAGTTTCTTTCTGGGGTGATGAA 1146

 31529570 ATGGTCTAAAATAGAATGTGGTGGTGGTTGCACAGCTCTGAAAATACTAAAAACCATTGA 31529629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1147 ATGGTCTAAAATAGAATGTGGTGGTGGTTGCACAGCTCTGAAAATACTAAAAACCATTGA 1206

 31529630 ATGAGCACTTTAAATTGGTAAATTTTTATGTGAATTATGATTCAATAAAGTTGTGTTTAG 31529689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1207 ATGAGCACTTTAAATTGGTAAATTTTTATGTGAATTATGATTCAATAAAGTTGTGTTTAG 1266

 31529690 ATATTACTAAAAATGATGGTACAAATATTCTTTTTCACAAATGTTTTTTGTTGTTGTTTA 31529749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1267 ATATTACTAAAAATGATGGTACAAATATTCTTTTTCACAAATGTTTTTTGTTGTTGTTTA 1326

 31529750 TAGTTGTTTATTTGTACATCTAGTAATTTGTCCCAAGGAAAGAGTATGTAAAAGAACATA 31529809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1327 TAGTTGTTTATTTGTACATCTAGTAATTTGTCCCAAGGAAAGAGTATGTAAAAGAACATA 1386

 31529810 AGTCACTTTAAGGCCTTTAATGTATACTACAAAATTGCACTCTAGAAGGTTTATACAGTT 31529869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1387 AGTCACTTTAAGGCCTTTAATGTATACTACAAAATTGCACTCTAGAAGGTTTATACAGTT 1446

 31529870 TTGCATTTCATTAGCCTGTTTTTTTTATCTTTGACAACCTAAAGAATTTATTAGTGGTAT 31529929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1447 TTGCATTTCATTAGCCTGTTTTTTTTATCTTTGACAACCTAAAGAATTTATTAGTGGTAT 1506

 31529930 TCATCTGAGGATCCTCTAGGTCTATCAGAGTGTCTTTCTTATAGAAGGCATTCAATAAAT 31529989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1507 TCATCTGAGGATCCTCTAGGTCTATCAGAGTGTCTTTCTTATAGAAGGCATTCAATAAAT 1566

 31529990 AAATGTCCTAAGTGAGCAAAACATTTTTGGTTGATTTTTAGGTGCAAATGGTTTCTTTTG 31530049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1567 AAATGTCCTAAGTGAGCAAAACATTTTTGGTTGATTTTTAGGTGCAAATGGTTTCTTTTG 1626

 31530050 ATTTTAATTAAGATGCCTTTGTTTATTAGTGATGTTGACATATTTTCTTAATCTATTGGC 31530109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1627 ATTTTAATTAAGATGCCTTTGTTTATTAGTGATGTTGACATATTTTCTTAATCTATTGGC 1686

 31530110 TTTGTATAACTTTATGAATTGTCTCTTCATGTCCTTTGCCTACTTTTCTATTGTGGTAAC 31530169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1687 TTTGTATAACTTTATGAATTGTCTCTTCATGTCCTTTGCCTACTTTTCTATTGTGGTAAC 1746

 31530170 TATCTTTTATAAATGTTGTATAATTATTTAAAAATACATTAGGTTGGGCATGGTAGATCA 31530229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1747 TATCTTTTATAAATGTTGTATAATTATTTAAAAATACATTAGGTTGGGCATGGTAGATCA 1806

 31530230 TGCCTGTAATCCCAGCTCTCTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATTGCTTGAGCCTAACAGTT 31530289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1807 TGCCTGTAATCCCAGCTCTCTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATTGCTTGAGCCTAACAGTT 1866

 31530290 CGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCCATCTCTAAAAAAAAAAACCAATAAAAAT 31530349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1867 CGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCCATCTCTAAAAAAAAAAACCAATAAAAAT 1926

 31530350 ATATTAAAAGATTAACTGATTGTCTATCATATGGATTACAAATATCCCCCCCAATTTGTC 31530409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1927 ATATTAAAAGATTAACTGATTGTCTATCATATGGATTACAAATATCCCCCCCAATTTGTC 1986

 31530410 ATTTGCTTGTTAATTTTATTTATGATGACTTAAAAATTACAATATATTTTTTGGTGTTCA 31530469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1987 ATTTGCTTGTTAATTTTATTTATGATGACTTAAAAATTACAATATATTTTTTGGTGTTCA 2046

 31530470 AGTCAGTTTTTGTCCCCATTGTGATATTTTCCTTTGCCTGTTTATCACTTTCTTAGAGAA 31530529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2047 AGTCAGTTTTTGTCCCCATTGTGATATTTTCCTTTGCCTGTTTATCACTTTCTTAGAGAA 2106

 31530530 AAGATAAATACTGATTCGTTCTTTTGTAGGTGTTTTATGATTTCATTGAAAATAAAATCT 31530589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2107 AAGATAAATACTGATTCGTTCTTTTGTAGGTGTTTTATGATTTCATTGAAAATAAAATCT 2166

 31530590 TCAACGCATCTAGTATTCATTTGGGTGTAAGATAAAAGATAACAACGTAGGTTTCTCTTA 31530649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2167 TCAACGCATCTAGTATTCATTTGGGTGTAAGATAAAAGATAACAACGTAGGTTTCTCTTA 2226

 31530650 TAGTTCATCAGGTATCCTACTACTGTTTATTGAGTCATGTTTTCTGTTACCACTCTTACT 31530709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2227 TAGTTCATCAGGTATCCTACTACTGTTTATTGAGTCATGTTTTCTGTTACCACTCTTACT 2286

 31530710 ATATACCAGTTTTACATACATTTGGGTTGGTTTCTGAGCTTTCTATTGTCTTCCATTGCT 31530769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2287 ATATACCAGTTTTACATACATTTGGGTTGGTTTCTGAGCTTTCTATTGTCTTCCATTGCT 2346

 31530770 TTGTTTAAAATTTAAAGTTTATTATTCTGACTTTCCATACTTGAATATGGTCGAATAAGT 31530829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2347 TTGTTTAAAATTTAAAGTTTATTATTCTGACTTTCCATACTTGAATATGGTCGAATAAGT 2406

 31530830 CCTCCTTTATTAATCTTGTTTTATTTAAAAATGGTCATTTTCACTCATTTTCCAGTTCAG 31530889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2407 CCTCCTTTATTAATCTTGTTTTATTTAAAAATGGTCATTTTCACTCATTTTCCAGTTCAG 2466

 31530890 TAGTTTTATTCTCTCAGTGTAATGTGATTTATCACCCCATTGCTCACCCTATTCATCTCC 31530949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2467 TAGTTTTATTCTCTCAGTGTAATGTGATTTATCACCCCATTGCTCACCCTATTCATCTCC 2526

 31530950 CAATACCCAGCTGAAAAACTTTAGAAGACTGAGGCTCTTGCCCTGGCCCCATCACTTTCT 31531009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2527 CAATACCCAGCTGAAAAACTTTAGAAGACTGAGGCTCTTGCCCTGGCCCCATCACTTTCT 2586

 31531010 AGCTATGTGGGCTTAGGCTAGTTATTGAACATGTCTGACTCTCACTTTTCTCCTCTGTAA 31531069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2587 AGCTATGTGGGCTTAGGCTAGTTATTGAACATGTCTGACTCTCACTTTTCTCCTCTGTAA 2646

 31531070 GTCAGTGAGAATTATATACTTCTTATAAGGTTGTGAGGTTCAAATGGAATAATGTGTACA 31531129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2647 GTCAGTGAGAATTATATACTTCTTATAAGGTTGTGAGGTTCAAATGGAATAATGTGTACA 2706

 31531130 GAGGCACTTGGTAAACAATGTAGTCATATGCAAGTCATATGCAAGTCATATGTAGTCAGC 31531189
          |||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||
     2707 GAGGCACTTGGTAAACAATGT-----------AGTCATATGCAAGTCATATGTAGTCAGC 2755

 31531190 TTGGTGAATTTTGAGAAAGTAAATGCAAGTTCTTTTTATGGTTTTACCTAAGGGGCCAGT 31531249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2756 TTGGTGAATTTTGAGAAAGTAAATGCAAGTTCTTTTTATGGTTTTACCTAAGGGGCCAGT 2815

 31531250 GAGGGCCAGAGAAGTGCCGGGACCTATGTAAGGTCGCAAGCAAGTTCATGTGGAATGCAT 31531309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2816 GAGGGCCAGAGAAGTGCCGGGACCTATGTAAGGTCGCAAGCAAGTTCATGTGGAATGCAT 2875

 31531310 CTAGAACTAGAACGCTAGCCTGTGTCCCAGGGCCCTTCCAACTGGGCTCTGCTGCCTGCA 31531369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2876 CTAGAACTAGAACGCTAGCCTGTGTCCCAGGGCCCTTCCAACTGGGCTCTGCTGCCTGCA 2935

 31531370 GTCCTGGGTGCCTTCTAATTAGCCTGTGTAGTGGTCTTGGTAAAAGTGTTTCTCCTGTAC 31531429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2936 GTCCTGGGTGCCTTCTAATTAGCCTGTGTAGTGGTCTTGGTAAAAGTGTTTCTCCTGTAC 2995

 31531430 TGTCCCCTATAGGTTGTGGCTGGCCATACCATTTCCCTGGTTCCCCCCACGCTCCTGATG 31531489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2996 TGTCCCCTATAGGTTGTGGCTGGCCATACCATTTCCCTGGTTCCCCCCACGCTCCTGATG 3055

 31531490 ACCTGGAAAGGCCATTTGAATAGTGTGGCAGACATCCTGTATGTGGACAACTTCCAGCTG 31531549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3056 ACCTGGAAAGGCCATTTGAATAGTGTGGCAGACATCCTGTATGTGGACAACTTCCAGCTG 3115

 31531550 GTTATCAGCGCTGGCCAGGACCGGGACGTCAAGGCTTGGAAACTCTCCGGTGATGCCATT 31531609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3116 GTTATCAGCGCTGGCCAGGACCGGGACGTCAAGGCTTGGAAACTCTCCGGTGATGCCATT 3175

 31531610 GGTATGGGTCCTGCTGAAGCTCAGCCATGCCCATGGCCCTTCTTGTCTCTGTCCCTGTCT 31531669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3176 GGTATGGGTCCTGCTGAAGCTCAGCCATGCCCATGGCCCTTCTTGTCTCTGTCCCTGTCT 3235

 31531670 GAACATAAGCTGGTATGAACTTTGTACTCTGTGGGGAGGGACTCTCAGGCCACAGCAACT 31531729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3236 GAACATAAGCTGGTATGAACTTTGTACTCTGTGGGGAGGGACTCTCAGGCCACAGCAACT 3295

 31531730 GCCTTCACTTAAATAATATTACAGTCTGTCCAATTATCCATTCAGCAAACGGTCCATCCA 31531789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3296 GCCTTCACTTAAATAATATTACAGTCTGTCCAATTATCCATTCAGCAAACGGTCCATCCA 3355

 31531790 TTCACCCATCCACCCAATATTATTCACCTATGTATATTTTTGCAAATCATATATCTGATA 31531849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3356 TTCACCCATCCACCCAATATTATTCACCTATGTATATTTTTGCAAATCATATATCTGATA 3415

 31531850 AAGCATATTCCTTTCTCTTTTAAAAAATAAACTTAATTGTTGCATTGTATATAAAGAAAA 31531909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3416 AAGCATATTCCTTTCTCTTTTAAAAAATAAACTTAATTGTTGCATTGTATATAAAGAAAA 3475

 31531910 ACATACAAACCAGAAGGGTTCAGCTTGGTGAATTTTGAGAAAGTAAATACATACCCATAT 31531969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3476 ACATACAAACCAGAAGGGTTCAGCTTGGTGAATTTTGAGAAAGTAAATACATACCCATAT 3535

 31531970 AGCCACCGTTCATGTCAAGAAATAATTAGGGCCAGGCGCGGTGGCTCACTACTGTAATCC 31532029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3536 AGCCACCGTTCATGTCAAGAAATAATTAGGGCCAGGCGCGGTGGCTCACTACTGTAATCC 3595

 31532030 CAACACTTTTTTGTCCCCTTTTCCTCCTGTGCTGTCTTCCTATGTGTTTGTTTGTTTGTT 31532089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3596 CAACACTTTTTTGTCCCCTTTTCCTCCTGTGCTGTCTTCCTATGTGTTTGTTTGTTTGTT 3655

 31532090 TTAGTGACCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGTGCATGCCTGT 31532149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3656 TTAGTGACCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGTGCATGCCTGT 3715

 31532150 AATCCCAGCTACTTGAGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGTTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTT 31532209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3716 AATCCCAGCTACTTGAGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGTTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTT 3775

 31532210 GCAGTGAGCTGAGATCATGTCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGACTCTGTCT 31532269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3776 GCAGTGAGCTGAGATCATGTCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGACTCTGTCT 3835

 31532270 AAAAAAAAAATAATAATAAAAATAAAGTGACTTATGTGCCACTATTACAGTATTACAGCA 31532329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3836 AAAAAAAAAATAATAATAAAAATAAAGTGACTTATGTGCCACTATTACAGTATTACAGCA 3895

 31532330 TTCTGTATTTTTCTATGTGTTTACATTTATCAGAAAGCTTTGTATTTTCATATGCTTTCA 31532389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3896 TTCTGTATTTTTCTATGTGTTTACATTTATCAGAAAGCTTTGTATTTTCATATGCTTTCA 3955

 31532390 TGTTCCTGCCTAGCATCCTTTTGTTTCAACTTGAAGGGGTCCCTTTAGCATTTCTTTAAA 31532449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3956 TGTTCCTGCCTAGCATCCTTTTGTTTCAACTTGAAGGGGTCCCTTTAGCATTTCTTTAAA 4015

 31532450 GGCAGGTCTAATGGTGATGAACTCCTCTTGTTTTTATTTATCTGGGAAAATTTTTATTTT 31532509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4016 GGCAGGTCTAATGGTGATGAACTCCTCTTGTTTTTATTTATCTGGGAAAATTTTTATTTT 4075

 31532510 TCCTTCATTTTTAAAGGACAGCTTTCCTGGATATAGTATTTTTGGATGAGAGTTTTTGTT 31532569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4076 TCCTTCATTTTTAAAGGACAGCTTTCCTGGATATAGTATTTTTGGATGAGAGTTTTTGTT 4135

 31532570 CTTTTTATAATGTGTCTCCTTGTGGATTTCTTTGACTTTATCCTAGTTGGAATCCCTTGA 31532629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4136 CTTTTTATAATGTGTCTCCTTGTGGATTTCTTTGACTTTATCCTAGTTGGAATCCCTTGA 4195

 31532630 GCTTCTTGAATATAGGTTTCTTTTCCTTTTTAAGATTTGAAACATTTTCAGCCATTATTT 31532689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4196 GCTTCTTGAATATAGGTTTCTTTTCCTTTTTAAGATTTGAAACATTTTCAGCCATTATTT 4255

 31532690 ATTCAGATAAGCTTTTTGTCCCTTTCTCTCTCTCTGTCTCTCTCTCCTCCTTCTAGTACT 31532749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4256 ATTCAGATAAGCTTTTTGTCCCTTTCTCTCTCTCTGTCTCTCTCTCCTCCTTCTAGTACT 4315

 31532750 ACCATAATGCATATATTGTCCATTTGACGATGTCTCATAAATCCCTTAAGTTTTCTTTAC 31532809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4316 ACCATAATGCATATATTGTCCATTTGACGATGTCTCATAAATCCCTTAAGTTTTCTTTAC 4375

 31532810 TCTTTAAAATTCTTTTTTCTTTTTTGCTTCTCTGACTGGATATCTTCAAGTCTGCTGATT 31532869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4376 TCTTTAAAATTCTTTTTTCTTTTTTGCTTCTCTGACTGGATATCTTCAAGTCTGCTGATT 4435

 31532870 TTTCCTTCTGCTTGATCAAGCCTGCTGTAGATGACTTTTGAATTCAATTATTTTACTCTT 31532929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4436 TTTCCTTCTGCTTGATCAAGCCTGCTGTAGATGACTTTTGAATTCAATTATTTTACTCTT 4495

 31532930 CATCTTCAGCTCTAGAATTTCTGTTATTTTTATTATTATTATTATTATTTTTTGAGACAG 31532989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4496 CATCTTCAGCTCTAGAATTTCTGTTATTTTTATTATTATTATTATTATTTTTTGAGACAG 4555

 31532990 GGTCTTGCTCTGCCACCCAGGGTTGAGTGCAGTGGCACGAATTCAGCTCACTGAAGCCTT 31533049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4556 GGTCTTGCTCTGCCACCCAGGGTTGAGTGCAGTGGCACGAATTCAGCTCACTGAAGCCTT 4615

 31533050 GACCTCCCAGCCTCAAGTGATCTTCCCACAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCA 31533109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4616 GACCTCCCAGCCTCAAGTGATCTTCCCACAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCA 4675

 31533110 TGCCATCATGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTTGTAGAGACAGAGTTTCACCATGTTGC 31533169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4676 TGCCATCATGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTTGTAGAGACAGAGTTTCACCATGTTGC 4735

 31533170 CCAGGCTGGCCTTGAATTCTTGAGCTCAAGTGATCGCCCACCTAAGCTTCCCAAAGTGTT 31533229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4736 CCAGGCTGGCCTTGAATTCTTGAGCTCAAGTGATCGCCCACCTAAGCTTCCCAAAGTGTT 4795

 31533230 GGGATTATAGGTGTGGGCCACCATGGCTGGCCTCTGTTTGGTTCTTTTCTATATTTTCTG 31533289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4796 GGGATTATAGGTGTGGGCCACCATGGCTGGCCTCTGTTTGGTTCTTTTCTATATTTTCTG 4855

 31533290 TGTCTTCACTAATATTCTCAGTTTGTTCATGTATTGTTTCCCTGAGCTTGTTGAGCATTT 31533349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4856 TGTCTTCACTAATATTCTCAGTTTGTTCATGTATTGTTTCCCTGAGCTTGTTGAGCATTT 4915

 31533350 TTATTACGGTTACTTAGAATTCTTTGTCAAATAATTAATATACCTCAATTTCTTTAGCGG 31533409
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4916 TTATTACAGTTACTTAGAATTCTTTGTCAAATAATTAATATACCTCAATTTCTTTAGCGG 4975

 31533410 CAGTTTCTGGAGATTTATTTTGTTCCTTTGGGCCATGCTTTCCTATTTTTTTTGTGTGCC 31533469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4976 CAGTTTCTGGAGATTTATTTTGTTCCTTTGGGCCATGCTTTCCTATTTTTTTTGTGTGCC 5035

 31533470 TTATAACTTTATATTGGGATCCATGCATTTGTAAAATCAGCCACCTCTCCCAGTCTTTAT 31533529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5036 TTATAACTTTATATTGGGATCCATGCATTTGTAAAATCAGCCACCTCTCCCAGTCTTTAT 5095

 31533530 ATACTGGCTTCATTCAGGGAAAATTCTGCACCAATCAGCTTGGCTAAAGATTCTGGGTGC 31533589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5096 ATACTGGCTTCATTCAGGGAAAATTCTGCACCAATCAGCTTGGCTAAAGATTCTGGGTGC 5155

 31533590 CTCCCCAATCTTTTTTGTGGATACTTTCACCAGACTTACGCATGTAAATTCGCAATTACA 31533649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5156 CTCCCCAATCTTTTTTGTGGATACTTTCACCAGACTTACGCATGTAAATTCGCAATTACA 5215

 31533650 GGAATCTACAGGTTTATTTTTTTCAGGAGTCCATTATCTCTTGCTCTCTCTGGTGTCTAT 31533709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5216 GGAATCTACAGGTTTATTTTTTTCAGGAGTCCATTATCTCTTGCTCTCTCTGGTGTCTAT 5275

 31533710 TTGCAGTACTGCAAGTTCTCTAGAGCGGCTACAAGCTTCCCCCAGGCCTCTAGAATATGC 31533769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5276 TTGCAGTACTGCAAGTTCTCTAGAGCGGCTACAAGCTTCCCCCAGGCCTCTAGAATATGC 5335

 31533770 TGGGTCCTTCAATAGTCTGAGAGAGGCAAGACAGAAACCAGTTTCTTGGGTACCCCTCAA 31533829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5336 TGGGTCCTTCAATAGTCTGAGAGAGGCAAGACAGAAACCAGTTTCTTGGGTACCCCTCAA 5395

 31533830 AGGCTAACATTGGATATGTATGCTCCAAATCTGCCTCCTCAAGGAGAAGCTGGAAGTTGG 31533889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5396 AGGCTAACATTGGATATGTATGCTCCAAATCTGCCTCCTCAAGGAGAAGCTGGAAGTTGG 5455

 31533890 GTTGTTTTCTCTACTCATTCCACAGAGCGGCAGGAGGGACTCTGATAGTGTGTGCTAGTC 31533949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5456 GTTGTTTTCTCTACTCATTCCACAGAGCGGCAGGAGGGACTCTGATAGTGTGTGCTAGTC 5515

 31533950 TAAATTGTCACCTTTGTTCTTAGTAGCCCAGTCTGGTGCCTCTTCCTGTCAGTGCTTAGA 31534009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5516 TAAATTGTCACCTTTGTTCTTAGTAGCCCAGTCTGGTGCCTCTTCCTGTCAGTGCTTAGA 5575

 31534010 TTCAGGCAAGACAGAAACTGGTTAATCATGCAGCCCTCTGAAAAGTCTGCATGTTGGATG 31534069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5576 TTCAGGCAAGACAGAAACTGGTTAATCATGCAGCCCTCTGAAAAGTCTGCATGTTGGATG 5635

 31534070 TACATCTCAGTCTTTCCCTCCCAGGGAGAAGCTGGAAGCTGGTGGTTCCTTCCCAATCTG 31534129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5636 TACATCTCAGTCTTTCCCTCCCAGGGAGAAGCTGGAAGCTGGTGGTTCCTTCCCAATCTG 5695

 31534130 CTTCACTGAGCCAGGAGGAGGGATTACAAGTGAGCACTATGAATTTTCCTACTGGCTTCA 31534189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5696 CTTCACTGAGCCAGGAGGAGGGATTACAAGTGAGCACTATGAATTTTCCTACTGGCTTCA 5755

 31534190 GTGCAGCTGGTTTTTTGTTTTTTGTTTTTTTGGTTTTTGTTTGTTTGTTTTTTCATTCAT 31534249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5756 GTGCAGCTGGTTTTTTGTTTTTTGTTTTTTTGGTTTTTGTTTGTTTGTTTTTTCATTCAT 5815

 31534250 CTGGGATGAATGGTCCTGGTTTCTGGTCCATGTACTGTTGTTCAGTCAGTGTCTCCATAG 31534309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5816 CTGGGATGAATGGTCCTGGTTTCTGGTCCATGTACTGTTGTTCAGTCAGTGTCTCCATAG 5875

 31534310 GGAGAAGGAAGTTCTGGATCTTCCTATTCTACCATCTTGCTGATGTCACCCATTTTTTTG 31534369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5876 GGAGAAGGAAGTTCTGGATCTTCCTATTCTACCATCTTGCTGATGTCACCCATTTTTTTG 5935

 31534370 TATCTTTCAAAGACGTCTTTGACTATCCCCTAAATATAATATCTAGTGTTATCTTTTAGA 31534429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5936 TATCTTTCAAAGACGTCTTTGACTATCCCCTAAATATAATATCTAGTGTTATCTTTTAGA 5995

 31534430 AGCTTGTTTTAAAAATCAGATTTCTGAAGTATAATTTACATCCAATAAAAGCACCTTTTA 31534489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5996 AGCTTGTTTTAAAAATCAGATTTCTGAAGTATAATTTACATCCAATAAAAGCACCTTTTA 6055

 31534490 AAAGTATATAGTTCTGTGAGGTTTCATGAATGCATACAATTGTGTAATTGGTATCACAAT 31534549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6056 AAAGTATATAGTTCTGTGAGGTTTCATGAATGCATACAATTGTGTAATTGGTATCACAAT 6115

 31534550 CAAGACATAGACATTACCCCAAAAAGTGACCTCATGTCTCCTCATAGTAAACTCTATTTC 31534609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6116 CAAGACATAGACATTACCCCAAAAAGTGACCTCATGTCTCCTCATAGTAAACTCTATTTC 6175

 31534610 CTTCTCCTAACCCCTGGCAGCCATTGATCTGTTTGTCTCTATAGTTTTGCCTTTTCCAGA 31534669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6176 CTTCTCCTAACCCCTGGCAGCCATTGATCTGTTTGTCTCTATAGTTTTGCCTTTTCCAGA 6235

 31534670 TTATCATAAATGGAAACATACACATGTAGCTGAGTGAAAGTCTAACTTTCACTTAGCATA 31534729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6236 TTATCATAAATGGAAACATACACATGTAGCTGAGTGAAAGTCTAACTTTCACTTAGCATA 6295

 31534730 ATCAATTTGAGATTCATCTTTGTTGTTGAACGTATCAGTAGTTTGTTCTTTTTATTGCTG 31534789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6296 ATCAATTTGAGATTCATCTTTGTTGTTGAACGTATCAGTAGTTTGTTCTTTTTATTGCTG 6355

 31534790 AGTATTATTCCACTGTATGGCTCTGTCATAGTTTGTTAATCCATTCACCAATTATAGGAC 31534849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6356 AGTATTATTCCACTGTATGGCTCTGTCATAGTTTGTTAATCCATTCACCAATTATAGGAC 6415

 31534850 ATTTGAGTCATTGTCAGTTTTGGATGATTATGAATGAAGCCGCTTTAAACATTGTTTTCA 31534909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6416 ATTTGAGTCATTGTCAGTTTTGGATGATTATGAATGAAGCCGCTTTAAACATTGTTTTCA 6475

 31534910 TTTCTGTTGGGTAAGTATTTAGAAGCAGAATGGCTGGGTTGTATGGTAAGTGTATTGAAA 31534969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6476 TTTCTGTTGGGTAAGTATTTAGAAGCAGAATGGCTGGGTTGTATGGTAAGTGTATTGAAA 6535

 31534970 CTTTATGAAAAATGACCAAACTGTTTTGCATTTCTACCTTTGTGTCTTCATCAACATTTG 31535029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6536 CTTTATGAAAAATGACCAAACTGTTTTGCATTTCTACCTTTGTGTCTTCATCAACATTTG 6595

 31535030 GTGTTTGATCTGTTATTATTTTAAATTTTAATAATCTATGATTGTAGCATGAGATTTCAA 31535089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6596 GTGTTTGATCTGTTATTATTTTAAATTTTAATAATCTATGATTGTAGCATGAGATTTCAA 6655

 31535090 TATTCTCTCAATTTATAAAACAACTATACAGAAAATCATTAATGATATAGAATA 31535143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6656 TATTCTCTCAATTTATAAAACAACTATACAGAAAATCATTAATGATATAGAATA 6709

Alignment time is 5.78118 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31515486,31539389] =>     23904 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    2393] =>      2393 nucs 'mol-32-2076-079264_2393'

Score:        2381
Aligned:      2392        nucs
Identic:      2391 (100%) nucs =>        38 (100%)      2353 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31528299,31528336] EXCISED REGION [31528338,31530691]
 second seq =>  [       1,      38] EXCISED REGION [      40,    2393]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [31528337,31528337]
 second seq =>         1 nucs [39,39]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [38,38] to [39,39]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31528299 AATGGAAAATACTTGTGACCTTAGACAGTGTGTCTTAG 31528336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AATGGAAAATACTTGTGACCTTAGACAGTGTGTCTTAG 38

EXCISED REGION

 31528338 TATGACACCAAAAACAAGCTACAAAAGAAAAAAACAGATAAATTGGACTTTGTCAAAATT 31528397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       40 TATGACACCAAAAACAAGCTACAAAAGAAAAAAACAGATAAATTGGACTTTGTCAAAATT 99

 31528398 AAAAACTTTTGGGCTGCAAAGGATACCGTCAAGAAAGTGAAAGGGTAACCTGAAAGAAAA 31528457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      100 AAAAACTTTTGGGCTGCAAAGGATACCGTCAAGAAAGTGAAAGGGTAACCTGAAAGAAAA 159

 31528458 TACTTGCAAATCATATATCTGATAAGGGACTAGTATCCAGAATATATAAAGCACTCTTGC 31528517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      160 TACTTGCAAATCATATATCTGATAAGGGACTAGTATCCAGAATATATAAAGCACTCTTGC 219

 31528518 AACTTGATAAAAATGATAAATAACCAAATTAAGATACGGGTAAAGGATCTAAATAAACAT 31528577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      220 AACTTGATAAAAATGATAAATAACCAAATTAAGATACGGGTAAAGGATCTAAATAAACAT 279

 31528578 TTCTTCAAAGAAGATGTACAAATGGCTAATAAGTATATTAAATGATGGTGAACATCATTA 31528637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      280 TTCTTCAAAGAAGATGTACAAATGGCTAATAAGTATATTAAATGATGGTGAACATCATTA 339

 31528638 GCTATCAGGGAAATGCATATTAAAACTATAATGAGATCCCACTTTACACTTGCCAGGATA 31528697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      340 GCTATCAGGGAAATGCATATTAAAACTATAATGAGATCCCACTTTACACTTGCCAGGATA 399

 31528698 ACTATAGATAATAGCAATGGTTGGCTGGGATGTGGACAAACTGGGACTCTTACACATTGC 31528757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      400 ACTATAGATAATAGCAATGGTTGGCTGGGATGTGGACAAACTGGGACTCTTACACATTGC 459

 31528758 TGGATAGAATGTAGAAAGCTGGCCAGGTACGGTGGCTCAGGCCTGTAATCCCAGCACTTT 31528817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      460 TGGATAGAATGTAGAAAGCTGGCCAGGTACGGTGGCTCAGGCCTGTAATCCCAGCACTTT 519

 31528818 GGGAGGCTGAGGTGGGCGGATTATGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAGCATGG 31528877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      520 GGGAGGCTGAGGTGGGCGGATTATGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAGCATGG 579

 31528878 TGTAACCCCGTCTCTACTAAACATACAAAAATTAGCAGGGCATGATGGCGGGTGCCTGTA 31528937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      580 TGTAACCCCGTCTCTACTAAACATACAAAAATTAGCAGGGCATGATGGCGGGTGCCTGTA 639

 31528938 ATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTG 31528997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      640 ATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTG 699

 31528998 CAGTGAGCAGAGATCATGCCATTGCGTTCCAGTCTGGGCAACAAGAGCAAAACTCCAAAC 31529057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      700 CAGTGAGCAGAGATCATGCCATTGCGTTCCAGTCTGGGCAACAAGAGCAAAACTCCAAAC 759

 31529058 TCTGTTTAAAAAAAAAAAAAGAAAAAGAACATAGAAAGCTGCAGTCACTTTGGAAAACAG 31529117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      760 TCTGTTTAAAAAAAAAAAAAGAAAAAGAACATAGAAAGCTGCAGTCACTTTGGAAAACAG 819

 31529118 TCTGGCAGTTCCTCAAAAATTAAGTGTAGACTTACCATATTACCCAACAGTTCCACTCCC 31529177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      820 TCTGGCAGTTCCTCAAAAATTAAGTGTAGACTTACCATATTACCCAACAGTTCCACTCCC 879

 31529178 AAGTGTATACCCAAGAGAAATGAAAACATATGTTCACATAAAATCTTGTACATGAATGTT 31529237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      880 AAGTGTATACCCAAGAGAAATGAAAACATATGTTCACATAAAATCTTGTACATGAATGTT 939

 31529238 TATAGTAGCATTATTTATAATACAAAAGTGGAAACAACCCAAATGTCAACTTCCAAATGG 31529297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      940 TATAGTAGCATTATTTATAATACAAAAGTGGAAACAACCCAAATGTCAACTTCCAAATGG 999

 31529298 ATAAAGTGTGGTATGGTGATACAATGGAATGTTATTTAATAATAAAAAGGAATAAAGTAC 31529357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1000 ATAAAGTGTGGTATGGTGATACAATGGAATGTTATTTAATAATAAAAAGGAATAAAGTAC 1059

 31529358 TGATGCATGCAACAACATGGATGAACCTTGAAAATACTGTGCTAAGTGAAAGAAGCCAAC 31529417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1060 TGATGCATGCAACAACATGGATGAACCTTGAAAATACTGTGCTAAGTGAAAGAAGCCAAC 1119

 31529418 CACAAAATACCATATATTGTGTGATTCTGCTTAAATGACATGTCCAGAATGTCCATATTA 31529477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1120 CACAAAATACCATATATTGTGTGATTCTGCTTAAATGACATGTCCAGAATGTCCATATTA 1179

 31529478 AAGTAGATTAGTGGTTTCCTGAGGCTGGGGGAGGGAGTTGGGGAAATTGCGTAGTGACTA 31529537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1180 AAGTAGATTAGTGGTTTCCTGAGGCTGGGGGAGGGAGTTGGGGAAATTGCGTAGTGACTA 1239

 31529538 CTGGGTAAAGAGTTTCTTTCTGGGGTGATGAAATGGTCTAAAATAGAATGTGGTGGTGGT 31529597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1240 CTGGGTAAAGAGTTTCTTTCTGGGGTGATGAAATGGTCTAAAATAGAATGTGGTGGTGGT 1299

 31529598 TGCACAGCTCTGAAAATACTAAAAACCATTGAATGAGCACTTTAAATTGGTAAATTTTTA 31529657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1300 TGCACAGCTCTGAAAATACTAAAAACCATTGAATGAGCACTTTAAATTGGTAAATTTTTA 1359

 31529658 TGTGAATTATGATTCAATAAAGTTGTGTTTAGATATTACTAAAAATGATGGTACAAATAT 31529717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1360 TGTGAATTATGATTCAATAAAGTTGTGTTTAGATATTACTAAAAATGATGGTACAAATAT 1419

 31529718 TCTTTTTCACAAATGTTTTTTGTTGTTGTTTATAGTTGTTTATTTGTACATCTAGTAATT 31529777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1420 TCTTTTTCACAAATGTTTTTTGTTGTTGTTTATAGTTGTTTATTTGTACATCTAGTAATT 1479

 31529778 TGTCCCAAGGAAAGAGTATGTAAAAGAACATAAGTCACTTTAAGGCCTTTAATGTATACT 31529837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1480 TGTCCCAAGGAAAGAGTATGTAAAAGAACATAAGTCACTTTAAGGCCTTTAATGTATACT 1539

 31529838 ACAAAATTGCACTCTAGAAGGTTTATACAGTTTTGCATTTCATTAGCCTGTTTTTTTTAT 31529897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1540 ACAAAATTGCACTCTAGAAGGTTTATACAGTTTTGCATTTCATTAGCCTGTTTTTTTTAT 1599

 31529898 CTTTGACAACCTAAAGAATTTATTAGTGGTATTCATCTGAGGATCCTCTAGGTCTATCAG 31529957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1600 CTTTGACAACCTAAAGAATTTATTAGTGGTATTCATCTGAGGATCCTCTAGGTCTATCAG 1659

 31529958 AGTGTCTTTCTTATAGAAGGCATTCAATAAATAAATGTCCTAAGTGAGCAAAACATTTTT 31530017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1660 AGTGTCTTTCTTATAGAAGGCATTCAATAAATAAATGTCCTAAGTGAGCAAAACATTTTT 1719

 31530018 GGTTGATTTTTAGGTGCAAATGGTTTCTTTTGATTTTAATTAAGATGCCTTTGTTTATTA 31530077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1720 GGTTGATTTTTAGGTGCAAATGGTTTCTTTTGATTTTAATTAAGATGCCTTTGTTTATTA 1779

 31530078 GTGATGTTGACATATTTTCTTAATCTATTGGCTTTGTATAACTTTATGAATTGTCTCTTC 31530137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1780 GTGATGTTGACATATTTTCTTAATCTATTGGCTTTGTATAACTTTATGAATTGTCTCTTC 1839

 31530138 ATGTCCTTTGCCTACTTTTCTATTGTGGTAACTATCTTTTATAAATGTTGTATAATTATT 31530197
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     1840 ATGTCCTTTGCCTACTTTTCTATTGTGGTAACTATCTTTTATAAATGTTGTATTATTATT 1899

 31530198 TAAAAATACATTAGGTTGGGCATGGTAGATCATGCCTGTAATCCCAGCTCTCTGGGAGGC 31530257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1900 TAAAAATACATTAGGTTGGGCATGGTAGATCATGCCTGTAATCCCAGCTCTCTGGGAGGC 1959

 31530258 CAAGGTGGGCAGATTGCTTGAGCCTAACAGTTCGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGA 31530317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1960 CAAGGTGGGCAGATTGCTTGAGCCTAACAGTTCGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGA 2019

 31530318 CCCCATCTCTAAAAAAAAAAACCAATAAAAATATATTAAAAGATTAACTGATTGTCTATC 31530377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2020 CCCCATCTCTAAAAAAAAAAACCAATAAAAATATATTAAAAGATTAACTGATTGTCTATC 2079

 31530378 ATATGGATTACAAATATCCCCCCCAATTTGTCATTTGCTTGTTAATTTTATTTATGATGA 31530437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2080 ATATGGATTACAAATATCCCCCCCAATTTGTCATTTGCTTGTTAATTTTATTTATGATGA 2139

 31530438 CTTAAAAATTACAATATATTTTTTGGTGTTCAAGTCAGTTTTTGTCCCCATTGTGATATT 31530497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2140 CTTAAAAATTACAATATATTTTTTGGTGTTCAAGTCAGTTTTTGTCCCCATTGTGATATT 2199

 31530498 TTCCTTTGCCTGTTTATCACTTTCTTAGAGAAAAGATAAATACTGATTCGTTCTTTTGTA 31530557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2200 TTCCTTTGCCTGTTTATCACTTTCTTAGAGAAAAGATAAATACTGATTCGTTCTTTTGTA 2259

 31530558 GGTGTTTTATGATTTCATTGAAAATAAAATCTTCAACGCATCTAGTATTCATTTGGGTGT 31530617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2260 GGTGTTTTATGATTTCATTGAAAATAAAATCTTCAACGCATCTAGTATTCATTTGGGTGT 2319

 31530618 AAGATAAAAGATAACAACGTAGGTTTCTCTTATAGTTCATCAGGTATCCTACTACTGTTT 31530677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2320 AAGATAAAAGATAACAACGTAGGTTTCTCTTATAGTTCATCAGGTATCCTACTACTGTTT 2379

 31530678 ATTGAGTCATGTTT 31530691
          ||||||||||||||
     2380 ATTGAGTCATGTTT 2393

Alignment time is 2.09405 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31515486,31539389] =>     23904 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    7016] =>      7016 nucs 'mol-32-2378-003267_7016'

Score:        7016
Aligned:      7016        nucs
Identic:      7016 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31527918,31534933]
 second seq =>  [       1,    7016]

 31527918 AGTAAGAAAAAAATCTTGAGAAAGAACAGAGTTGAAGGACTCACAATTCCCAAGTTCAAA 31527977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGTAAGAAAAAAATCTTGAGAAAGAACAGAGTTGAAGGACTCACAATTCCCAAGTTCAAA 60

 31527978 ACTGAATATGAAGTTAAGTAATCAAGACAATGTGATACTGGCATAAAGAAAGACATGTAA 31528037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACTGAATATGAAGTTAAGTAATCAAGACAATGTGATACTGGCATAAAGAAAGACATGTAA 120

 31528038 ATCAATGGAATAGAATTTAGAGTTAAAAAATAAATTCTCACATTATGATCAATTGATTTT 31528097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATCAATGGAATAGAATTTAGAGTTAAAAAATAAATTCTCACATTATGATCAATTGATTTT 180

 31528098 TGACAAGAATGCTGAGACAATCAAATGGGGAGAAATAATATATTTTTTAAAACATGTCCT 31528157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGACAAGAATGCTGAGACAATCAAATGGGGAGAAATAATATATTTTTTAAAACATGTCCT 240

 31528158 GCTGGGACAATAGGGATAACTTTATCTGTATTAGAAGAATGAAGTTAGACTCCTACCTCA 31528217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GCTGGGACAATAGGGATAACTTTATCTGTATTAGAAGAATGAAGTTAGACTCCTACCTCA 300

 31528218 TAACACATACAAAAATTAACTCCAAATGGATCATAGACCTAAATGTAAGAGCCAAAATTA 31528277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TAACACATACAAAAATTAACTCCAAATGGATCATAGACCTAAATGTAAGAGCCAAAATTA 360

 31528278 TAAGACTTTTAGAAGAAAATAAATGGAAAATACTTGTGACCTTAGACAGTGTGTCTTAGA 31528337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TAAGACTTTTAGAAGAAAATAAATGGAAAATACTTGTGACCTTAGACAGTGTGTCTTAGA 420

 31528338 TATGACACCAAAAACAAGCTACAAAAGAAAAAAACAGATAAATTGGACTTTGTCAAAATT 31528397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TATGACACCAAAAACAAGCTACAAAAGAAAAAAACAGATAAATTGGACTTTGTCAAAATT 480

 31528398 AAAAACTTTTGGGCTGCAAAGGATACCGTCAAGAAAGTGAAAGGGTAACCTGAAAGAAAA 31528457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAAAACTTTTGGGCTGCAAAGGATACCGTCAAGAAAGTGAAAGGGTAACCTGAAAGAAAA 540

 31528458 TACTTGCAAATCATATATCTGATAAGGGACTAGTATCCAGAATATATAAAGCACTCTTGC 31528517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TACTTGCAAATCATATATCTGATAAGGGACTAGTATCCAGAATATATAAAGCACTCTTGC 600

 31528518 AACTTGATAAAAATGATAAATAACCAAATTAAGATACGGGTAAAGGATCTAAATAAACAT 31528577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AACTTGATAAAAATGATAAATAACCAAATTAAGATACGGGTAAAGGATCTAAATAAACAT 660

 31528578 TTCTTCAAAGAAGATGTACAAATGGCTAATAAGTATATTAAATGATGGTGAACATCATTA 31528637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTCTTCAAAGAAGATGTACAAATGGCTAATAAGTATATTAAATGATGGTGAACATCATTA 720

 31528638 GCTATCAGGGAAATGCATATTAAAACTATAATGAGATCCCACTTTACACTTGCCAGGATA 31528697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GCTATCAGGGAAATGCATATTAAAACTATAATGAGATCCCACTTTACACTTGCCAGGATA 780

 31528698 ACTATAGATAATAGCAATGGTTGGCTGGGATGTGGACAAACTGGGACTCTTACACATTGC 31528757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ACTATAGATAATAGCAATGGTTGGCTGGGATGTGGACAAACTGGGACTCTTACACATTGC 840

 31528758 TGGATAGAATGTAGAAAGCTGGCCAGGTACGGTGGCTCAGGCCTGTAATCCCAGCACTTT 31528817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGGATAGAATGTAGAAAGCTGGCCAGGTACGGTGGCTCAGGCCTGTAATCCCAGCACTTT 900

 31528818 GGGAGGCTGAGGTGGGCGGATTATGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAGCATGG 31528877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GGGAGGCTGAGGTGGGCGGATTATGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAGCATGG 960

 31528878 TGTAACCCCGTCTCTACTAAACATACAAAAATTAGCAGGGCATGATGGCGGGTGCCTGTA 31528937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGTAACCCCGTCTCTACTAAACATACAAAAATTAGCAGGGCATGATGGCGGGTGCCTGTA 1020

 31528938 ATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTG 31528997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTG 1080

 31528998 CAGTGAGCAGAGATCATGCCATTGCGTTCCAGTCTGGGCAACAAGAGCAAAACTCCAAAC 31529057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CAGTGAGCAGAGATCATGCCATTGCGTTCCAGTCTGGGCAACAAGAGCAAAACTCCAAAC 1140

 31529058 TCTGTTTAAAAAAAAAAAAAGAAAAAGAACATAGAAAGCTGCAGTCACTTTGGAAAACAG 31529117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TCTGTTTAAAAAAAAAAAAAGAAAAAGAACATAGAAAGCTGCAGTCACTTTGGAAAACAG 1200

 31529118 TCTGGCAGTTCCTCAAAAATTAAGTGTAGACTTACCATATTACCCAACAGTTCCACTCCC 31529177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TCTGGCAGTTCCTCAAAAATTAAGTGTAGACTTACCATATTACCCAACAGTTCCACTCCC 1260

 31529178 AAGTGTATACCCAAGAGAAATGAAAACATATGTTCACATAAAATCTTGTACATGAATGTT 31529237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AAGTGTATACCCAAGAGAAATGAAAACATATGTTCACATAAAATCTTGTACATGAATGTT 1320

 31529238 TATAGTAGCATTATTTATAATACAAAAGTGGAAACAACCCAAATGTCAACTTCCAAATGG 31529297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TATAGTAGCATTATTTATAATACAAAAGTGGAAACAACCCAAATGTCAACTTCCAAATGG 1380

 31529298 ATAAAGTGTGGTATGGTGATACAATGGAATGTTATTTAATAATAAAAAGGAATAAAGTAC 31529357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ATAAAGTGTGGTATGGTGATACAATGGAATGTTATTTAATAATAAAAAGGAATAAAGTAC 1440

 31529358 TGATGCATGCAACAACATGGATGAACCTTGAAAATACTGTGCTAAGTGAAAGAAGCCAAC 31529417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TGATGCATGCAACAACATGGATGAACCTTGAAAATACTGTGCTAAGTGAAAGAAGCCAAC 1500

 31529418 CACAAAATACCATATATTGTGTGATTCTGCTTAAATGACATGTCCAGAATGTCCATATTA 31529477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CACAAAATACCATATATTGTGTGATTCTGCTTAAATGACATGTCCAGAATGTCCATATTA 1560

 31529478 AAGTAGATTAGTGGTTTCCTGAGGCTGGGGGAGGGAGTTGGGGAAATTGCGTAGTGACTA 31529537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AAGTAGATTAGTGGTTTCCTGAGGCTGGGGGAGGGAGTTGGGGAAATTGCGTAGTGACTA 1620

 31529538 CTGGGTAAAGAGTTTCTTTCTGGGGTGATGAAATGGTCTAAAATAGAATGTGGTGGTGGT 31529597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CTGGGTAAAGAGTTTCTTTCTGGGGTGATGAAATGGTCTAAAATAGAATGTGGTGGTGGT 1680

 31529598 TGCACAGCTCTGAAAATACTAAAAACCATTGAATGAGCACTTTAAATTGGTAAATTTTTA 31529657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TGCACAGCTCTGAAAATACTAAAAACCATTGAATGAGCACTTTAAATTGGTAAATTTTTA 1740

 31529658 TGTGAATTATGATTCAATAAAGTTGTGTTTAGATATTACTAAAAATGATGGTACAAATAT 31529717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGTGAATTATGATTCAATAAAGTTGTGTTTAGATATTACTAAAAATGATGGTACAAATAT 1800

 31529718 TCTTTTTCACAAATGTTTTTTGTTGTTGTTTATAGTTGTTTATTTGTACATCTAGTAATT 31529777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TCTTTTTCACAAATGTTTTTTGTTGTTGTTTATAGTTGTTTATTTGTACATCTAGTAATT 1860

 31529778 TGTCCCAAGGAAAGAGTATGTAAAAGAACATAAGTCACTTTAAGGCCTTTAATGTATACT 31529837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TGTCCCAAGGAAAGAGTATGTAAAAGAACATAAGTCACTTTAAGGCCTTTAATGTATACT 1920

 31529838 ACAAAATTGCACTCTAGAAGGTTTATACAGTTTTGCATTTCATTAGCCTGTTTTTTTTAT 31529897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ACAAAATTGCACTCTAGAAGGTTTATACAGTTTTGCATTTCATTAGCCTGTTTTTTTTAT 1980

 31529898 CTTTGACAACCTAAAGAATTTATTAGTGGTATTCATCTGAGGATCCTCTAGGTCTATCAG 31529957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CTTTGACAACCTAAAGAATTTATTAGTGGTATTCATCTGAGGATCCTCTAGGTCTATCAG 2040

 31529958 AGTGTCTTTCTTATAGAAGGCATTCAATAAATAAATGTCCTAAGTGAGCAAAACATTTTT 31530017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AGTGTCTTTCTTATAGAAGGCATTCAATAAATAAATGTCCTAAGTGAGCAAAACATTTTT 2100

 31530018 GGTTGATTTTTAGGTGCAAATGGTTTCTTTTGATTTTAATTAAGATGCCTTTGTTTATTA 31530077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GGTTGATTTTTAGGTGCAAATGGTTTCTTTTGATTTTAATTAAGATGCCTTTGTTTATTA 2160

 31530078 GTGATGTTGACATATTTTCTTAATCTATTGGCTTTGTATAACTTTATGAATTGTCTCTTC 31530137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GTGATGTTGACATATTTTCTTAATCTATTGGCTTTGTATAACTTTATGAATTGTCTCTTC 2220

 31530138 ATGTCCTTTGCCTACTTTTCTATTGTGGTAACTATCTTTTATAAATGTTGTATAATTATT 31530197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ATGTCCTTTGCCTACTTTTCTATTGTGGTAACTATCTTTTATAAATGTTGTATAATTATT 2280

 31530198 TAAAAATACATTAGGTTGGGCATGGTAGATCATGCCTGTAATCCCAGCTCTCTGGGAGGC 31530257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TAAAAATACATTAGGTTGGGCATGGTAGATCATGCCTGTAATCCCAGCTCTCTGGGAGGC 2340

 31530258 CAAGGTGGGCAGATTGCTTGAGCCTAACAGTTCGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGA 31530317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CAAGGTGGGCAGATTGCTTGAGCCTAACAGTTCGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGA 2400

 31530318 CCCCATCTCTAAAAAAAAAAACCAATAAAAATATATTAAAAGATTAACTGATTGTCTATC 31530377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CCCCATCTCTAAAAAAAAAAACCAATAAAAATATATTAAAAGATTAACTGATTGTCTATC 2460

 31530378 ATATGGATTACAAATATCCCCCCCAATTTGTCATTTGCTTGTTAATTTTATTTATGATGA 31530437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 ATATGGATTACAAATATCCCCCCCAATTTGTCATTTGCTTGTTAATTTTATTTATGATGA 2520

 31530438 CTTAAAAATTACAATATATTTTTTGGTGTTCAAGTCAGTTTTTGTCCCCATTGTGATATT 31530497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CTTAAAAATTACAATATATTTTTTGGTGTTCAAGTCAGTTTTTGTCCCCATTGTGATATT 2580

 31530498 TTCCTTTGCCTGTTTATCACTTTCTTAGAGAAAAGATAAATACTGATTCGTTCTTTTGTA 31530557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TTCCTTTGCCTGTTTATCACTTTCTTAGAGAAAAGATAAATACTGATTCGTTCTTTTGTA 2640

 31530558 GGTGTTTTATGATTTCATTGAAAATAAAATCTTCAACGCATCTAGTATTCATTTGGGTGT 31530617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GGTGTTTTATGATTTCATTGAAAATAAAATCTTCAACGCATCTAGTATTCATTTGGGTGT 2700

 31530618 AAGATAAAAGATAACAACGTAGGTTTCTCTTATAGTTCATCAGGTATCCTACTACTGTTT 31530677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AAGATAAAAGATAACAACGTAGGTTTCTCTTATAGTTCATCAGGTATCCTACTACTGTTT 2760

 31530678 ATTGAGTCATGTTTTCTGTTACCACTCTTACTATATACCAGTTTTACATACATTTGGGTT 31530737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 ATTGAGTCATGTTTTCTGTTACCACTCTTACTATATACCAGTTTTACATACATTTGGGTT 2820

 31530738 GGTTTCTGAGCTTTCTATTGTCTTCCATTGCTTTGTTTAAAATTTAAAGTTTATTATTCT 31530797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GGTTTCTGAGCTTTCTATTGTCTTCCATTGCTTTGTTTAAAATTTAAAGTTTATTATTCT 2880

 31530798 GACTTTCCATACTTGAATATGGTCGAATAAGTCCTCCTTTATTAATCTTGTTTTATTTAA 31530857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 GACTTTCCATACTTGAATATGGTCGAATAAGTCCTCCTTTATTAATCTTGTTTTATTTAA 2940

 31530858 AAATGGTCATTTTCACTCATTTTCCAGTTCAGTAGTTTTATTCTCTCAGTGTAATGTGAT 31530917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 AAATGGTCATTTTCACTCATTTTCCAGTTCAGTAGTTTTATTCTCTCAGTGTAATGTGAT 3000

 31530918 TTATCACCCCATTGCTCACCCTATTCATCTCCCAATACCCAGCTGAAAAACTTTAGAAGA 31530977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TTATCACCCCATTGCTCACCCTATTCATCTCCCAATACCCAGCTGAAAAACTTTAGAAGA 3060

 31530978 CTGAGGCTCTTGCCCTGGCCCCATCACTTTCTAGCTATGTGGGCTTAGGCTAGTTATTGA 31531037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 CTGAGGCTCTTGCCCTGGCCCCATCACTTTCTAGCTATGTGGGCTTAGGCTAGTTATTGA 3120

 31531038 ACATGTCTGACTCTCACTTTTCTCCTCTGTAAGTCAGTGAGAATTATATACTTCTTATAA 31531097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 ACATGTCTGACTCTCACTTTTCTCCTCTGTAAGTCAGTGAGAATTATATACTTCTTATAA 3180

 31531098 GGTTGTGAGGTTCAAATGGAATAATGTGTACAGAGGCACTTGGTAAACAATGTAGTCATA 31531157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 GGTTGTGAGGTTCAAATGGAATAATGTGTACAGAGGCACTTGGTAAACAATGTAGTCATA 3240

 31531158 TGCAAGTCATATGCAAGTCATATGTAGTCAGCTTGGTGAATTTTGAGAAAGTAAATGCAA 31531217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TGCAAGTCATATGCAAGTCATATGTAGTCAGCTTGGTGAATTTTGAGAAAGTAAATGCAA 3300

 31531218 GTTCTTTTTATGGTTTTACCTAAGGGGCCAGTGAGGGCCAGAGAAGTGCCGGGACCTATG 31531277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 GTTCTTTTTATGGTTTTACCTAAGGGGCCAGTGAGGGCCAGAGAAGTGCCGGGACCTATG 3360

 31531278 TAAGGTCGCAAGCAAGTTCATGTGGAATGCATCTAGAACTAGAACGCTAGCCTGTGTCCC 31531337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TAAGGTCGCAAGCAAGTTCATGTGGAATGCATCTAGAACTAGAACGCTAGCCTGTGTCCC 3420

 31531338 AGGGCCCTTCCAACTGGGCTCTGCTGCCTGCAGTCCTGGGTGCCTTCTAATTAGCCTGTG 31531397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 AGGGCCCTTCCAACTGGGCTCTGCTGCCTGCAGTCCTGGGTGCCTTCTAATTAGCCTGTG 3480

 31531398 TAGTGGTCTTGGTAAAAGTGTTTCTCCTGTACTGTCCCCTATAGGTTGTGGCTGGCCATA 31531457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TAGTGGTCTTGGTAAAAGTGTTTCTCCTGTACTGTCCCCTATAGGTTGTGGCTGGCCATA 3540

 31531458 CCATTTCCCTGGTTCCCCCCACGCTCCTGATGACCTGGAAAGGCCATTTGAATAGTGTGG 31531517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 CCATTTCCCTGGTTCCCCCCACGCTCCTGATGACCTGGAAAGGCCATTTGAATAGTGTGG 3600

 31531518 CAGACATCCTGTATGTGGACAACTTCCAGCTGGTTATCAGCGCTGGCCAGGACCGGGACG 31531577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 CAGACATCCTGTATGTGGACAACTTCCAGCTGGTTATCAGCGCTGGCCAGGACCGGGACG 3660

 31531578 TCAAGGCTTGGAAACTCTCCGGTGATGCCATTGGTATGGGTCCTGCTGAAGCTCAGCCAT 31531637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 TCAAGGCTTGGAAACTCTCCGGTGATGCCATTGGTATGGGTCCTGCTGAAGCTCAGCCAT 3720

 31531638 GCCCATGGCCCTTCTTGTCTCTGTCCCTGTCTGAACATAAGCTGGTATGAACTTTGTACT 31531697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 GCCCATGGCCCTTCTTGTCTCTGTCCCTGTCTGAACATAAGCTGGTATGAACTTTGTACT 3780

 31531698 CTGTGGGGAGGGACTCTCAGGCCACAGCAACTGCCTTCACTTAAATAATATTACAGTCTG 31531757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 CTGTGGGGAGGGACTCTCAGGCCACAGCAACTGCCTTCACTTAAATAATATTACAGTCTG 3840

 31531758 TCCAATTATCCATTCAGCAAACGGTCCATCCATTCACCCATCCACCCAATATTATTCACC 31531817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 TCCAATTATCCATTCAGCAAACGGTCCATCCATTCACCCATCCACCCAATATTATTCACC 3900

 31531818 TATGTATATTTTTGCAAATCATATATCTGATAAAGCATATTCCTTTCTCTTTTAAAAAAT 31531877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 TATGTATATTTTTGCAAATCATATATCTGATAAAGCATATTCCTTTCTCTTTTAAAAAAT 3960

 31531878 AAACTTAATTGTTGCATTGTATATAAAGAAAAACATACAAACCAGAAGGGTTCAGCTTGG 31531937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 AAACTTAATTGTTGCATTGTATATAAAGAAAAACATACAAACCAGAAGGGTTCAGCTTGG 4020

 31531938 TGAATTTTGAGAAAGTAAATACATACCCATATAGCCACCGTTCATGTCAAGAAATAATTA 31531997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 TGAATTTTGAGAAAGTAAATACATACCCATATAGCCACCGTTCATGTCAAGAAATAATTA 4080

 31531998 GGGCCAGGCGCGGTGGCTCACTACTGTAATCCCAACACTTTTTTGTCCCCTTTTCCTCCT 31532057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 GGGCCAGGCGCGGTGGCTCACTACTGTAATCCCAACACTTTTTTGTCCCCTTTTCCTCCT 4140

 31532058 GTGCTGTCTTCCTATGTGTTTGTTTGTTTGTTTTAGTGACCTGTCTCTACTAAAAATACA 31532117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 GTGCTGTCTTCCTATGTGTTTGTTTGTTTGTTTTAGTGACCTGTCTCTACTAAAAATACA 4200

 31532118 AAAATTAGCCAGGCATGGTGGTGCATGCCTGTAATCCCAGCTACTTGAGAGGCTGAGGCA 31532177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 AAAATTAGCCAGGCATGGTGGTGCATGCCTGTAATCCCAGCTACTTGAGAGGCTGAGGCA 4260

 31532178 GGAGAATCGTTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCATGTCACTGCAC 31532237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 GGAGAATCGTTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCATGTCACTGCAC 4320

 31532238 TCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGACTCTGTCTAAAAAAAAAATAATAATAAAAATAAAGT 31532297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 TCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGACTCTGTCTAAAAAAAAAATAATAATAAAAATAAAGT 4380

 31532298 GACTTATGTGCCACTATTACAGTATTACAGCATTCTGTATTTTTCTATGTGTTTACATTT 31532357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 GACTTATGTGCCACTATTACAGTATTACAGCATTCTGTATTTTTCTATGTGTTTACATTT 4440

 31532358 ATCAGAAAGCTTTGTATTTTCATATGCTTTCATGTTCCTGCCTAGCATCCTTTTGTTTCA 31532417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 ATCAGAAAGCTTTGTATTTTCATATGCTTTCATGTTCCTGCCTAGCATCCTTTTGTTTCA 4500

 31532418 ACTTGAAGGGGTCCCTTTAGCATTTCTTTAAAGGCAGGTCTAATGGTGATGAACTCCTCT 31532477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 ACTTGAAGGGGTCCCTTTAGCATTTCTTTAAAGGCAGGTCTAATGGTGATGAACTCCTCT 4560

 31532478 TGTTTTTATTTATCTGGGAAAATTTTTATTTTTCCTTCATTTTTAAAGGACAGCTTTCCT 31532537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 TGTTTTTATTTATCTGGGAAAATTTTTATTTTTCCTTCATTTTTAAAGGACAGCTTTCCT 4620

 31532538 GGATATAGTATTTTTGGATGAGAGTTTTTGTTCTTTTTATAATGTGTCTCCTTGTGGATT 31532597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 GGATATAGTATTTTTGGATGAGAGTTTTTGTTCTTTTTATAATGTGTCTCCTTGTGGATT 4680

 31532598 TCTTTGACTTTATCCTAGTTGGAATCCCTTGAGCTTCTTGAATATAGGTTTCTTTTCCTT 31532657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 TCTTTGACTTTATCCTAGTTGGAATCCCTTGAGCTTCTTGAATATAGGTTTCTTTTCCTT 4740

 31532658 TTTAAGATTTGAAACATTTTCAGCCATTATTTATTCAGATAAGCTTTTTGTCCCTTTCTC 31532717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 TTTAAGATTTGAAACATTTTCAGCCATTATTTATTCAGATAAGCTTTTTGTCCCTTTCTC 4800

 31532718 TCTCTCTGTCTCTCTCTCCTCCTTCTAGTACTACCATAATGCATATATTGTCCATTTGAC 31532777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 TCTCTCTGTCTCTCTCTCCTCCTTCTAGTACTACCATAATGCATATATTGTCCATTTGAC 4860

 31532778 GATGTCTCATAAATCCCTTAAGTTTTCTTTACTCTTTAAAATTCTTTTTTCTTTTTTGCT 31532837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 GATGTCTCATAAATCCCTTAAGTTTTCTTTACTCTTTAAAATTCTTTTTTCTTTTTTGCT 4920

 31532838 TCTCTGACTGGATATCTTCAAGTCTGCTGATTTTTCCTTCTGCTTGATCAAGCCTGCTGT 31532897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 TCTCTGACTGGATATCTTCAAGTCTGCTGATTTTTCCTTCTGCTTGATCAAGCCTGCTGT 4980

 31532898 AGATGACTTTTGAATTCAATTATTTTACTCTTCATCTTCAGCTCTAGAATTTCTGTTATT 31532957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 AGATGACTTTTGAATTCAATTATTTTACTCTTCATCTTCAGCTCTAGAATTTCTGTTATT 5040

 31532958 TTTATTATTATTATTATTATTTTTTGAGACAGGGTCTTGCTCTGCCACCCAGGGTTGAGT 31533017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 TTTATTATTATTATTATTATTTTTTGAGACAGGGTCTTGCTCTGCCACCCAGGGTTGAGT 5100

 31533018 GCAGTGGCACGAATTCAGCTCACTGAAGCCTTGACCTCCCAGCCTCAAGTGATCTTCCCA 31533077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 GCAGTGGCACGAATTCAGCTCACTGAAGCCTTGACCTCCCAGCCTCAAGTGATCTTCCCA 5160

 31533078 CAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCATGCCATCATGCCTGGCTAATTTTTTGTA 31533137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 CAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCATGCCATCATGCCTGGCTAATTTTTTGTA 5220

 31533138 TTTTTTGTAGAGACAGAGTTTCACCATGTTGCCCAGGCTGGCCTTGAATTCTTGAGCTCA 31533197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 TTTTTTGTAGAGACAGAGTTTCACCATGTTGCCCAGGCTGGCCTTGAATTCTTGAGCTCA 5280

 31533198 AGTGATCGCCCACCTAAGCTTCCCAAAGTGTTGGGATTATAGGTGTGGGCCACCATGGCT 31533257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 AGTGATCGCCCACCTAAGCTTCCCAAAGTGTTGGGATTATAGGTGTGGGCCACCATGGCT 5340

 31533258 GGCCTCTGTTTGGTTCTTTTCTATATTTTCTGTGTCTTCACTAATATTCTCAGTTTGTTC 31533317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 GGCCTCTGTTTGGTTCTTTTCTATATTTTCTGTGTCTTCACTAATATTCTCAGTTTGTTC 5400

 31533318 ATGTATTGTTTCCCTGAGCTTGTTGAGCATTTTTATTACGGTTACTTAGAATTCTTTGTC 31533377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 ATGTATTGTTTCCCTGAGCTTGTTGAGCATTTTTATTACGGTTACTTAGAATTCTTTGTC 5460

 31533378 AAATAATTAATATACCTCAATTTCTTTAGCGGCAGTTTCTGGAGATTTATTTTGTTCCTT 31533437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 AAATAATTAATATACCTCAATTTCTTTAGCGGCAGTTTCTGGAGATTTATTTTGTTCCTT 5520

 31533438 TGGGCCATGCTTTCCTATTTTTTTTGTGTGCCTTATAACTTTATATTGGGATCCATGCAT 31533497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 TGGGCCATGCTTTCCTATTTTTTTTGTGTGCCTTATAACTTTATATTGGGATCCATGCAT 5580

 31533498 TTGTAAAATCAGCCACCTCTCCCAGTCTTTATATACTGGCTTCATTCAGGGAAAATTCTG 31533557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 TTGTAAAATCAGCCACCTCTCCCAGTCTTTATATACTGGCTTCATTCAGGGAAAATTCTG 5640

 31533558 CACCAATCAGCTTGGCTAAAGATTCTGGGTGCCTCCCCAATCTTTTTTGTGGATACTTTC 31533617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 CACCAATCAGCTTGGCTAAAGATTCTGGGTGCCTCCCCAATCTTTTTTGTGGATACTTTC 5700

 31533618 ACCAGACTTACGCATGTAAATTCGCAATTACAGGAATCTACAGGTTTATTTTTTTCAGGA 31533677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5701 ACCAGACTTACGCATGTAAATTCGCAATTACAGGAATCTACAGGTTTATTTTTTTCAGGA 5760

 31533678 GTCCATTATCTCTTGCTCTCTCTGGTGTCTATTTGCAGTACTGCAAGTTCTCTAGAGCGG 31533737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5761 GTCCATTATCTCTTGCTCTCTCTGGTGTCTATTTGCAGTACTGCAAGTTCTCTAGAGCGG 5820

 31533738 CTACAAGCTTCCCCCAGGCCTCTAGAATATGCTGGGTCCTTCAATAGTCTGAGAGAGGCA 31533797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5821 CTACAAGCTTCCCCCAGGCCTCTAGAATATGCTGGGTCCTTCAATAGTCTGAGAGAGGCA 5880

 31533798 AGACAGAAACCAGTTTCTTGGGTACCCCTCAAAGGCTAACATTGGATATGTATGCTCCAA 31533857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5881 AGACAGAAACCAGTTTCTTGGGTACCCCTCAAAGGCTAACATTGGATATGTATGCTCCAA 5940

 31533858 ATCTGCCTCCTCAAGGAGAAGCTGGAAGTTGGGTTGTTTTCTCTACTCATTCCACAGAGC 31533917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5941 ATCTGCCTCCTCAAGGAGAAGCTGGAAGTTGGGTTGTTTTCTCTACTCATTCCACAGAGC 6000

 31533918 GGCAGGAGGGACTCTGATAGTGTGTGCTAGTCTAAATTGTCACCTTTGTTCTTAGTAGCC 31533977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6001 GGCAGGAGGGACTCTGATAGTGTGTGCTAGTCTAAATTGTCACCTTTGTTCTTAGTAGCC 6060

 31533978 CAGTCTGGTGCCTCTTCCTGTCAGTGCTTAGATTCAGGCAAGACAGAAACTGGTTAATCA 31534037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6061 CAGTCTGGTGCCTCTTCCTGTCAGTGCTTAGATTCAGGCAAGACAGAAACTGGTTAATCA 6120

 31534038 TGCAGCCCTCTGAAAAGTCTGCATGTTGGATGTACATCTCAGTCTTTCCCTCCCAGGGAG 31534097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6121 TGCAGCCCTCTGAAAAGTCTGCATGTTGGATGTACATCTCAGTCTTTCCCTCCCAGGGAG 6180

 31534098 AAGCTGGAAGCTGGTGGTTCCTTCCCAATCTGCTTCACTGAGCCAGGAGGAGGGATTACA 31534157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6181 AAGCTGGAAGCTGGTGGTTCCTTCCCAATCTGCTTCACTGAGCCAGGAGGAGGGATTACA 6240

 31534158 AGTGAGCACTATGAATTTTCCTACTGGCTTCAGTGCAGCTGGTTTTTTGTTTTTTGTTTT 31534217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6241 AGTGAGCACTATGAATTTTCCTACTGGCTTCAGTGCAGCTGGTTTTTTGTTTTTTGTTTT 6300

 31534218 TTTGGTTTTTGTTTGTTTGTTTTTTCATTCATCTGGGATGAATGGTCCTGGTTTCTGGTC 31534277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6301 TTTGGTTTTTGTTTGTTTGTTTTTTCATTCATCTGGGATGAATGGTCCTGGTTTCTGGTC 6360

 31534278 CATGTACTGTTGTTCAGTCAGTGTCTCCATAGGGAGAAGGAAGTTCTGGATCTTCCTATT 31534337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6361 CATGTACTGTTGTTCAGTCAGTGTCTCCATAGGGAGAAGGAAGTTCTGGATCTTCCTATT 6420

 31534338 CTACCATCTTGCTGATGTCACCCATTTTTTTGTATCTTTCAAAGACGTCTTTGACTATCC 31534397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6421 CTACCATCTTGCTGATGTCACCCATTTTTTTGTATCTTTCAAAGACGTCTTTGACTATCC 6480

 31534398 CCTAAATATAATATCTAGTGTTATCTTTTAGAAGCTTGTTTTAAAAATCAGATTTCTGAA 31534457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6481 CCTAAATATAATATCTAGTGTTATCTTTTAGAAGCTTGTTTTAAAAATCAGATTTCTGAA 6540

 31534458 GTATAATTTACATCCAATAAAAGCACCTTTTAAAAGTATATAGTTCTGTGAGGTTTCATG 31534517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6541 GTATAATTTACATCCAATAAAAGCACCTTTTAAAAGTATATAGTTCTGTGAGGTTTCATG 6600

 31534518 AATGCATACAATTGTGTAATTGGTATCACAATCAAGACATAGACATTACCCCAAAAAGTG 31534577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6601 AATGCATACAATTGTGTAATTGGTATCACAATCAAGACATAGACATTACCCCAAAAAGTG 6660

 31534578 ACCTCATGTCTCCTCATAGTAAACTCTATTTCCTTCTCCTAACCCCTGGCAGCCATTGAT 31534637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6661 ACCTCATGTCTCCTCATAGTAAACTCTATTTCCTTCTCCTAACCCCTGGCAGCCATTGAT 6720

 31534638 CTGTTTGTCTCTATAGTTTTGCCTTTTCCAGATTATCATAAATGGAAACATACACATGTA 31534697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6721 CTGTTTGTCTCTATAGTTTTGCCTTTTCCAGATTATCATAAATGGAAACATACACATGTA 6780

 31534698 GCTGAGTGAAAGTCTAACTTTCACTTAGCATAATCAATTTGAGATTCATCTTTGTTGTTG 31534757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6781 GCTGAGTGAAAGTCTAACTTTCACTTAGCATAATCAATTTGAGATTCATCTTTGTTGTTG 6840

 31534758 AACGTATCAGTAGTTTGTTCTTTTTATTGCTGAGTATTATTCCACTGTATGGCTCTGTCA 31534817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6841 AACGTATCAGTAGTTTGTTCTTTTTATTGCTGAGTATTATTCCACTGTATGGCTCTGTCA 6900

 31534818 TAGTTTGTTAATCCATTCACCAATTATAGGACATTTGAGTCATTGTCAGTTTTGGATGAT 31534877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6901 TAGTTTGTTAATCCATTCACCAATTATAGGACATTTGAGTCATTGTCAGTTTTGGATGAT 6960

 31534878 TATGAATGAAGCCGCTTTAAACATTGTTTTCATTTCTGTTGGGTAAGTATTTAGAA 31534933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6961 TATGAATGAAGCCGCTTTAAACATTGTTTTCATTTCTGTTGGGTAAGTATTTAGAA 7016

Alignment time is 5.11778 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31515486,31539389] =>     23904 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    2519] =>      2519 nucs 'mol-32-2378-015247_2519'

Score:        2519
Aligned:      2519        nucs
Identic:      2519 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31528673,31531191]
 second seq =>  [       1,    2519]

 31528673 ATCCCACTTTACACTTGCCAGGATAACTATAGATAATAGCAATGGTTGGCTGGGATGTGG 31528732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATCCCACTTTACACTTGCCAGGATAACTATAGATAATAGCAATGGTTGGCTGGGATGTGG 60

 31528733 ACAAACTGGGACTCTTACACATTGCTGGATAGAATGTAGAAAGCTGGCCAGGTACGGTGG 31528792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACAAACTGGGACTCTTACACATTGCTGGATAGAATGTAGAAAGCTGGCCAGGTACGGTGG 120

 31528793 CTCAGGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGCGGATTATGAGGTCAGGAG 31528852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTCAGGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGCGGATTATGAGGTCAGGAG 180

 31528853 TTTGAGACCAGCCTGGCCAGCATGGTGTAACCCCGTCTCTACTAAACATACAAAAATTAG 31528912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTTGAGACCAGCCTGGCCAGCATGGTGTAACCCCGTCTCTACTAAACATACAAAAATTAG 240

 31528913 CAGGGCATGATGGCGGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATC 31528972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CAGGGCATGATGGCGGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATC 300

 31528973 GCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCAGAGATCATGCCATTGCGTTCCAGTCT 31529032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCAGAGATCATGCCATTGCGTTCCAGTCT 360

 31529033 GGGCAACAAGAGCAAAACTCCAAACTCTGTTTAAAAAAAAAAAAAGAAAAAGAACATAGA 31529092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGGCAACAAGAGCAAAACTCCAAACTCTGTTTAAAAAAAAAAAAAGAAAAAGAACATAGA 420

 31529093 AAGCTGCAGTCACTTTGGAAAACAGTCTGGCAGTTCCTCAAAAATTAAGTGTAGACTTAC 31529152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAGCTGCAGTCACTTTGGAAAACAGTCTGGCAGTTCCTCAAAAATTAAGTGTAGACTTAC 480

 31529153 CATATTACCCAACAGTTCCACTCCCAAGTGTATACCCAAGAGAAATGAAAACATATGTTC 31529212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CATATTACCCAACAGTTCCACTCCCAAGTGTATACCCAAGAGAAATGAAAACATATGTTC 540

 31529213 ACATAAAATCTTGTACATGAATGTTTATAGTAGCATTATTTATAATACAAAAGTGGAAAC 31529272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACATAAAATCTTGTACATGAATGTTTATAGTAGCATTATTTATAATACAAAAGTGGAAAC 600

 31529273 AACCCAAATGTCAACTTCCAAATGGATAAAGTGTGGTATGGTGATACAATGGAATGTTAT 31529332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AACCCAAATGTCAACTTCCAAATGGATAAAGTGTGGTATGGTGATACAATGGAATGTTAT 660

 31529333 TTAATAATAAAAAGGAATAAAGTACTGATGCATGCAACAACATGGATGAACCTTGAAAAT 31529392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTAATAATAAAAAGGAATAAAGTACTGATGCATGCAACAACATGGATGAACCTTGAAAAT 720

 31529393 ACTGTGCTAAGTGAAAGAAGCCAACCACAAAATACCATATATTGTGTGATTCTGCTTAAA 31529452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ACTGTGCTAAGTGAAAGAAGCCAACCACAAAATACCATATATTGTGTGATTCTGCTTAAA 780

 31529453 TGACATGTCCAGAATGTCCATATTAAAGTAGATTAGTGGTTTCCTGAGGCTGGGGGAGGG 31529512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGACATGTCCAGAATGTCCATATTAAAGTAGATTAGTGGTTTCCTGAGGCTGGGGGAGGG 840

 31529513 AGTTGGGGAAATTGCGTAGTGACTACTGGGTAAAGAGTTTCTTTCTGGGGTGATGAAATG 31529572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGTTGGGGAAATTGCGTAGTGACTACTGGGTAAAGAGTTTCTTTCTGGGGTGATGAAATG 900

 31529573 GTCTAAAATAGAATGTGGTGGTGGTTGCACAGCTCTGAAAATACTAAAAACCATTGAATG 31529632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GTCTAAAATAGAATGTGGTGGTGGTTGCACAGCTCTGAAAATACTAAAAACCATTGAATG 960

 31529633 AGCACTTTAAATTGGTAAATTTTTATGTGAATTATGATTCAATAAAGTTGTGTTTAGATA 31529692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AGCACTTTAAATTGGTAAATTTTTATGTGAATTATGATTCAATAAAGTTGTGTTTAGATA 1020

 31529693 TTACTAAAAATGATGGTACAAATATTCTTTTTCACAAATGTTTTTTGTTGTTGTTTATAG 31529752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTACTAAAAATGATGGTACAAATATTCTTTTTCACAAATGTTTTTTGTTGTTGTTTATAG 1080

 31529753 TTGTTTATTTGTACATCTAGTAATTTGTCCCAAGGAAAGAGTATGTAAAAGAACATAAGT 31529812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTGTTTATTTGTACATCTAGTAATTTGTCCCAAGGAAAGAGTATGTAAAAGAACATAAGT 1140

 31529813 CACTTTAAGGCCTTTAATGTATACTACAAAATTGCACTCTAGAAGGTTTATACAGTTTTG 31529872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CACTTTAAGGCCTTTAATGTATACTACAAAATTGCACTCTAGAAGGTTTATACAGTTTTG 1200

 31529873 CATTTCATTAGCCTGTTTTTTTTATCTTTGACAACCTAAAGAATTTATTAGTGGTATTCA 31529932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CATTTCATTAGCCTGTTTTTTTTATCTTTGACAACCTAAAGAATTTATTAGTGGTATTCA 1260

 31529933 TCTGAGGATCCTCTAGGTCTATCAGAGTGTCTTTCTTATAGAAGGCATTCAATAAATAAA 31529992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TCTGAGGATCCTCTAGGTCTATCAGAGTGTCTTTCTTATAGAAGGCATTCAATAAATAAA 1320

 31529993 TGTCCTAAGTGAGCAAAACATTTTTGGTTGATTTTTAGGTGCAAATGGTTTCTTTTGATT 31530052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGTCCTAAGTGAGCAAAACATTTTTGGTTGATTTTTAGGTGCAAATGGTTTCTTTTGATT 1380

 31530053 TTAATTAAGATGCCTTTGTTTATTAGTGATGTTGACATATTTTCTTAATCTATTGGCTTT 31530112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTAATTAAGATGCCTTTGTTTATTAGTGATGTTGACATATTTTCTTAATCTATTGGCTTT 1440

 31530113 GTATAACTTTATGAATTGTCTCTTCATGTCCTTTGCCTACTTTTCTATTGTGGTAACTAT 31530172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GTATAACTTTATGAATTGTCTCTTCATGTCCTTTGCCTACTTTTCTATTGTGGTAACTAT 1500

 31530173 CTTTTATAAATGTTGTATAATTATTTAAAAATACATTAGGTTGGGCATGGTAGATCATGC 31530232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CTTTTATAAATGTTGTATAATTATTTAAAAATACATTAGGTTGGGCATGGTAGATCATGC 1560

 31530233 CTGTAATCCCAGCTCTCTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATTGCTTGAGCCTAACAGTTCGA 31530292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CTGTAATCCCAGCTCTCTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATTGCTTGAGCCTAACAGTTCGA 1620

 31530293 GACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCCATCTCTAAAAAAAAAAACCAATAAAAATATA 31530352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCCATCTCTAAAAAAAAAAACCAATAAAAATATA 1680

 31530353 TTAAAAGATTAACTGATTGTCTATCATATGGATTACAAATATCCCCCCCAATTTGTCATT 31530412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTAAAAGATTAACTGATTGTCTATCATATGGATTACAAATATCCCCCCCAATTTGTCATT 1740

 31530413 TGCTTGTTAATTTTATTTATGATGACTTAAAAATTACAATATATTTTTTGGTGTTCAAGT 31530472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGCTTGTTAATTTTATTTATGATGACTTAAAAATTACAATATATTTTTTGGTGTTCAAGT 1800

 31530473 CAGTTTTTGTCCCCATTGTGATATTTTCCTTTGCCTGTTTATCACTTTCTTAGAGAAAAG 31530532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CAGTTTTTGTCCCCATTGTGATATTTTCCTTTGCCTGTTTATCACTTTCTTAGAGAAAAG 1860

 31530533 ATAAATACTGATTCGTTCTTTTGTAGGTGTTTTATGATTTCATTGAAAATAAAATCTTCA 31530592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ATAAATACTGATTCGTTCTTTTGTAGGTGTTTTATGATTTCATTGAAAATAAAATCTTCA 1920

 31530593 ACGCATCTAGTATTCATTTGGGTGTAAGATAAAAGATAACAACGTAGGTTTCTCTTATAG 31530652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ACGCATCTAGTATTCATTTGGGTGTAAGATAAAAGATAACAACGTAGGTTTCTCTTATAG 1980

 31530653 TTCATCAGGTATCCTACTACTGTTTATTGAGTCATGTTTTCTGTTACCACTCTTACTATA 31530712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TTCATCAGGTATCCTACTACTGTTTATTGAGTCATGTTTTCTGTTACCACTCTTACTATA 2040

 31530713 TACCAGTTTTACATACATTTGGGTTGGTTTCTGAGCTTTCTATTGTCTTCCATTGCTTTG 31530772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TACCAGTTTTACATACATTTGGGTTGGTTTCTGAGCTTTCTATTGTCTTCCATTGCTTTG 2100

 31530773 TTTAAAATTTAAAGTTTATTATTCTGACTTTCCATACTTGAATATGGTCGAATAAGTCCT 31530832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TTTAAAATTTAAAGTTTATTATTCTGACTTTCCATACTTGAATATGGTCGAATAAGTCCT 2160

 31530833 CCTTTATTAATCTTGTTTTATTTAAAAATGGTCATTTTCACTCATTTTCCAGTTCAGTAG 31530892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CCTTTATTAATCTTGTTTTATTTAAAAATGGTCATTTTCACTCATTTTCCAGTTCAGTAG 2220

 31530893 TTTTATTCTCTCAGTGTAATGTGATTTATCACCCCATTGCTCACCCTATTCATCTCCCAA 31530952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TTTTATTCTCTCAGTGTAATGTGATTTATCACCCCATTGCTCACCCTATTCATCTCCCAA 2280

 31530953 TACCCAGCTGAAAAACTTTAGAAGACTGAGGCTCTTGCCCTGGCCCCATCACTTTCTAGC 31531012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TACCCAGCTGAAAAACTTTAGAAGACTGAGGCTCTTGCCCTGGCCCCATCACTTTCTAGC 2340

 31531013 TATGTGGGCTTAGGCTAGTTATTGAACATGTCTGACTCTCACTTTTCTCCTCTGTAAGTC 31531072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TATGTGGGCTTAGGCTAGTTATTGAACATGTCTGACTCTCACTTTTCTCCTCTGTAAGTC 2400

 31531073 AGTGAGAATTATATACTTCTTATAAGGTTGTGAGGTTCAAATGGAATAATGTGTACAGAG 31531132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AGTGAGAATTATATACTTCTTATAAGGTTGTGAGGTTCAAATGGAATAATGTGTACAGAG 2460

 31531133 GCACTTGGTAAACAATGTAGTCATATGCAAGTCATATGCAAGTCATATGTAGTCAGCTT 31531191
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GCACTTGGTAAACAATGTAGTCATATGCAAGTCATATGCAAGTCATATGTAGTCAGCTT 2519

Alignment time is 1.92758 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31515486,31539389] =>     23904 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    2672] =>      2672 nucs 'mol-32-2383-139792_2672'

Score:        2672
Aligned:      2672        nucs
Identic:      2672 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31523036,31525707]
 second seq =>  [       1,    2672]

 31523036 TGCTCTTGTTGCCCGGGCTGGAGTGCATTGATCCAATCTTGGCTCACTGCAACCCCCGCC 31523095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGCTCTTGTTGCCCGGGCTGGAGTGCATTGATCCAATCTTGGCTCACTGCAACCCCCGCC 60

 31523096 TCCCGGGTTCAAGCAATTCTCCCGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGTGATTACAGGCACAG 31523155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCCCGGGTTCAAGCAATTCTCCCGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGTGATTACAGGCACAG 120

 31523156 GCTACCACACCCGGCTAATTTTGTATTTTCAGTAGAGACGAGGTGTCACCTTGTTGGTCA 31523215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GCTACCACACCCGGCTAATTTTGTATTTTCAGTAGAGACGAGGTGTCACCTTGTTGGTCA 180

 31523216 GGCTGGTCCCGAACTCCTGACCTCAAGTGATCTGCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGG 31523275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGCTGGTCCCGAACTCCTGACCTCAAGTGATCTGCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGG 240

 31523276 GATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGCCACTTTGCCTATTTTATTTTATTTTGAGATG 31523335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGCCACTTTGCCTATTTTATTTTATTTTGAGATG 300

 31523336 GAGTTTTGCTCTTATTGCCCAGACTGGAGTGCAATGGCGCAATTGCAGCTCACCACAACC 31523395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GAGTTTTGCTCTTATTGCCCAGACTGGAGTGCAATGGCGCAATTGCAGCTCACCACAACC 360

 31523396 TCCGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGGTGGGATTACAG 31523455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCCGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGGTGGGATTACAG 420

 31523456 GCATGCGCCACCACGCCCAACTAATTTTGTAGTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGT 31523515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GCATGCGCCACCACGCCCAACTAATTTTGTAGTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGT 480

 31523516 TGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCACCTTGCCTCCCAAAGT 31523575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCACCTTGCCTCCCAAAGT 540

 31523576 GCTGGGATTACAAGAGTGAGTGCACCTGGCCCACTTTGCTCATTTTCTAATTGGGTTATT 31523635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GCTGGGATTACAAGAGTGAGTGCACCTGGCCCACTTTGCTCATTTTCTAATTGGGTTATT 600

 31523636 CGTTTTCTGGCTATTGAGTTGTTTGAGTTTCTTATTTATTGTGGATGTTACTCCCTTATC 31523695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CGTTTTCTGGCTATTGAGTTGTTTGAGTTTCTTATTTATTGTGGATGTTACTCCCTTATC 660

 31523696 AGATGTATGATTTACATATATTTTCTGTCACTCTGTGGGTTATCTCTTTACTTTGTTCAT 31523755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGATGTATGATTTACATATATTTTCTGTCACTCTGTGGGTTATCTCTTTACTTTGTTCAT 720

 31523756 TGTTTCCTTTCTGTCCAAAAGCTTTGTATCTTGTCTAAAATCCCATTTGTCTATTTTTGC 31523815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGTTTCCTTTCTGTCCAAAAGCTTTGTATCTTGTCTAAAATCCCATTTGTCTATTTTTGC 780

 31523816 TTTTATTTATTTTTATTTTTATTTTTATTTTTTATTTTTTTGAAACGGAGTCTTGCTCTG 31523875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTTTATTTATTTTTATTTTTATTTTTATTTTTTATTTTTTTGAAACGGAGTCTTGCTCTG 840

 31523876 TCACCCAGGTTGGAGTGCAGTGGTGCAATCTCAGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGT 31523935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCACCCAGGTTGGAGTGCAGTGGTGCAATCTCAGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGT 900

 31523936 TCAAGGAAGTCTCCTACTCCAACTTCCTGAGTAGCTGGGATTATAGGCGTGTGCCACCAT 31523995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TCAAGGAAGTCTCCTACTCCAACTTCCTGAGTAGCTGGGATTATAGGCGTGTGCCACCAT 960

 31523996 GCCTAGCTAATTTTTGTATTTTTTGGTAGAGACAGGATTTCACCATGTTGGCCAGGCTGG 31524055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GCCTAGCTAATTTTTGTATTTTTTGGTAGAGACAGGATTTCACCATGTTGGCCAGGCTGG 1020

 31524056 TGTTGAACTCTTGACCTCAGGCAATCCGCCTGACTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAC 31524115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGTTGAACTCTTGACCTCAGGCAATCCGCCTGACTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAC 1080

 31524116 ACGTGTGAGCCACCGCGCCTGGCCTATTTTTGCTTTTATTACCTGTGCTTTTGGGGTCAT 31524175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ACGTGTGAGCCACCGCGCCTGGCCTATTTTTGCTTTTATTACCTGTGCTTTTGGGGTCAT 1140

 31524176 AGCTAAATAACCATTGCTCAGATCAATGTCATGGAGCCTTTCCTCTAGGTATTCTTCTAG 31524235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGCTAAATAACCATTGCTCAGATCAATGTCATGGAGCCTTTCCTCTAGGTATTCTTCTAG 1200

 31524236 TTGTTTTACAGTCTCAGATCTTATATTTAAGACTTTAATCCATTTTGAGTTGATTTTTTA 31524295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTGTTTTACAGTCTCAGATCTTATATTTAAGACTTTAATCCATTTTGAGTTGATTTTTTA 1260

 31524296 TACTGTGTGAGATAAGGATCCAATTTTATTCTTCTGTATGTGGATCCAATTTTCCTAGTA 31524355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TACTGTGTGAGATAAGGATCCAATTTTATTCTTCTGTATGTGGATCCAATTTTCCTAGTA 1320

 31524356 CAGTTTATTGAAAAGACTGTCTTTTCCCCATTATGTATTAGTAACACCTTTGTCAAAAAT 31524415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CAGTTTATTGAAAAGACTGTCTTTTCCCCATTATGTATTAGTAACACCTTTGTCAAAAAT 1380

 31524416 CAATTGACTATTAGTGCATGGGTTTATTTCTGGGTTTTCTATCTTGTTACATTAGTCGAT 31524475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CAATTGACTATTAGTGCATGGGTTTATTTCTGGGTTTTCTATCTTGTTACATTAGTCGAT 1440

 31524476 GTGTCTATTTTTATGCCAGCACCATACTGTTTTGATTATATTAGCTTTATAATATATTTT 31524535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GTGTCTATTTTTATGCCAGCACCATACTGTTTTGATTATATTAGCTTTATAATATATTTT 1500

 31524536 GAAATCAGGGACTGTGATGTCTTTAGCTTTGTTCTTTTTGCTCAAGATTGTTTTGGCTAG 31524595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GAAATCAGGGACTGTGATGTCTTTAGCTTTGTTCTTTTTGCTCAAGATTGTTTTGGCTAG 1560

 31524596 CCAGGGTCTTTTATGATTGCATATGAATTTAAGGATTGTTTTATTTCTATAAGAAATGAC 31524655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CCAGGGTCTTTTATGATTGCATATGAATTTAAGGATTGTTTTATTTCTATAAGAAATGAC 1620

 31524656 ATTGGAATTTTGATAGGGACTGCATTGAATCTGTAGATTGCTTTGGGTAGTATGAATATT 31524715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ATTGGAATTTTGATAGGGACTGCATTGAATCTGTAGATTGCTTTGGGTAGTATGAATATT 1680

 31524716 TTAATAATATTAATTCTTCTAATTTATCAACACAAGATAGCTTTCCATTTATTTGTGTTT 31524775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTAATAATATTAATTCTTCTAATTTATCAACACAAGATAGCTTTCCATTTATTTGTGTTT 1740

 31524776 TCTTAAACAATGTTTTAGTTTCCAGTGTACAGATCTTTTAACTTCTTGGTTAAATTTACC 31524835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TCTTAAACAATGTTTTAGTTTCCAGTGTACAGATCTTTTAACTTCTTGGTTAAATTTACC 1800

 31524836 CCTAAGTATTTTATTTTATTTTAAAATACCTGGCTAATTTTGTATTTAATTTTATATTGT 31524895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CCTAAGTATTTTATTTTATTTTAAAATACCTGGCTAATTTTGTATTTAATTTTATATTGT 1860

 31524896 ATTTATTTTATTTGTAATAAAATTAAGCATTTTATTTTATTTTAAAATACCTGGCTAATT 31524955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ATTTATTTTATTTGTAATAAAATTAAGCATTTTATTTTATTTTAAAATACCTGGCTAATT 1920

 31524956 TTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCAGA 31525015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCAGA 1980

 31525016 CCTCAGGTGATCCGACTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGTATTAGAAGCATGAGCCACT 31525075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CCTCAGGTGATCCGACTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGTATTAGAAGCATGAGCCACT 2040

 31525076 GCCCACTGCACCTAGCTGAAAACCACACTTTCTGTTGATTAAATAATATTTCACCTTATG 31525135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GCCCACTGCACCTAGCTGAAAACCACACTTTCTGTTGATTAAATAATATTTCACCTTATG 2100

 31525136 GAGTTACAAATTTTCATTTTATGGGGTTATAATCACTTACTTAGCTTGTTATCTTTTGTT 31525195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GAGTTACAAATTTTCATTTTATGGGGTTATAATCACTTACTTAGCTTGTTATCTTTTGTT 2160

 31525196 GGACATTAATGTGGTTTCTAACTTTTCATTATCAAAAAATAAAAGAAAATGGACAAAACC 31525255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GGACATTAATGTGGTTTCTAACTTTTCATTATCAAAAAATAAAAGAAAATGGACAAAACC 2220

 31525256 TCAGAAAGACACAAACTACTAAAGCTGACTTAATAAGAAATAGAAAATCTGAATATATAG 31525315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TCAGAAAGACACAAACTACTAAAGCTGACTTAATAAGAAATAGAAAATCTGAATATATAG 2280

 31525316 AAAATCTGAATGTAACAAGTAAGGAGATTGGATTAGTAATAAAATTTCCCACAAAGAGAA 31525375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AAAATCTGAATGTAACAAGTAAGGAGATTGGATTAGTAATAAAATTTCCCACAAAGAGAA 2340

 31525376 GTACACATTCAGATGGTTTCACTGGTAAATTCTACCAAATATTTAAAGATTTTTCTTTTT 31525435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GTACACATTCAGATGGTTTCACTGGTAAATTCTACCAAATATTTAAAGATTTTTCTTTTT 2400

 31525436 TTTTGTTGAGACAGAGTCTCACTCTATTGCCCAGGCTGGAGTACAATGGTGTGATCTTGA 31525495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TTTTGTTGAGACAGAGTCTCACTCTATTGCCCAGGCTGGAGTACAATGGTGTGATCTTGA 2460

 31525496 CTCACTGCAACCTCTGCCTCCGGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAG 31525555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CTCACTGCAACCTCTGCCTCCGGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAG 2520

 31525556 CTGGGATTACAGGCATGCACCACCATGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAG 31525615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CTGGGATTACAGGCATGCACCACCATGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAG 2580

 31525616 GGTTTCACCACATTGGCTAGGCTGGTCTCGAACTCCCAACCTCGTGATCCGCCCACCATG 31525675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GGTTTCACCACATTGGCTAGGCTGGTCTCGAACTCCCAACCTCGTGATCCGCCCACCATG 2640

 31525676 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAG 31525707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAG 2672

Alignment time is 2.03952 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31515486,31539389] =>     23904 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    6235] =>      6235 nucs 'mol-32-299d-078297_6235'

Score:        6162
Aligned:      6237        nucs
Identic:      6222 (100%) nucs =>      1040 (100%)      5182 (100%)
Gaps:           11 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31524445,31525486] EXCISED REGION [31529390,31534584]
 second seq =>  [       1,    1042] EXCISED REGION [    1052,    6235]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3903 nucs [31525487,31529389]
 second seq =>         9 nucs [1043,1051]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31524445 CTGGGTTTTCTATCTTGTTACATTAGTCGATGTGTCTATTTTTATGCCAGCACCATACTG 31524504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTGGGTTTTCTATCTTGTTACATTAGTCGATGTGTCTATTTTTATGCCAGCACCATACTG 60

 31524505 TTTTGATTATATTAGCTTTATAATATATTTTGAAATCAGGGACTGTGATGTCTTTAGCTT 31524564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTTGATTATATTAGCTTTATAATATATTTTGAAATCAGGGACTGTGATGTCTTTAGCTT 120

 31524565 TGTTCTTTTTGCTCAAGATTGTTTTGGCTAGCCAGGGTCTTTTATGATTGCATATGAATT 31524624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGTTCTTTTTGCTCAAGATTGTTTTGGCTAGCCAGGGTCTTTTATGATTGCATATGAATT 180

 31524625 TAAGGATTGTTTTATTTCTATAAGAAATGACATTGGAATTTTGATAGGGACTGCATTGAA 31524684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TAAGGATTGTTTTATTTCTATAAGAAATGACATTGGAATTTTGATAGGGACTGCATTGAA 240

 31524685 TCTGTAGATTGCTTTGGGTAGTATGAATATTTTAATAATATTAATTCTTCTAATTTATCA 31524744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCTGTAGATTGCTTTGGGTAGTATGAATATTTTAATAATATTAATTCTTCTAATTTATCA 300

 31524745 ACACAAGATAGCTTTCCATTTATTTGTGTTTTCTTAAACAATGTTTTAGTTTCCAGTGTA 31524804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACACAAGATAGCTTTCCATTTATTTGTGTTTTCTTAAACAATGTTTTAGTTTCCAGTGTA 360

 31524805 CAGATCTTTTAACTTCTTGGTTAAATTTACCCCTAAGTATTTTATTTTATTTTAAAATAC 31524864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CAGATCTTTTAACTTCTTGGTTAAATTTACCCCTAAGTATTTTATTTTATTTTAAAATAC 420

 31524865 CTGGCTAATTTTGTATTTAATTTTATATTGTATTTATTTTATTTGTAATAAAATTAAGCA 31524924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTGGCTAATTTTGTATTTAATTTTATATTGTATTTATTTTATTTGTAATAAAATTAAGCA 480

 31524925 TTTTATTTTATTTTAAAATACCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTC 31524984
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
      481 TTTTATTTTATTTTAAAATACCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGATAGGGTTTCTC 540

 31524985 CATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCAGACCTCAGGTGATCCGACTGCCTCGGCCTCC 31525044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCAGACCTCAGGTGATCCGACTGCCTCGGCCTCC 600

 31525045 CAAAGTGCTGGTATTAGAAGCATGAGCCACTGCCCACTGCACCTAGCTGAAAACCACACT 31525104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CAAAGTGCTGGTATTAGAAGCATGAGCCACTGCCCACTGCACCTAGCTGAAAACCACACT 660

 31525105 TTCTGTTGATTAAATAATATTTCACCTTATGGAGTTACAAATTTTCATTTTATGGGGTTA 31525164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTCTGTTGATTAAATAATATTTCACCTTATGGAGTTACAAATTTTCATTTTATGGGGTTA 720

 31525165 TAATCACTTACTTAGCTTGTTATCTTTTGTTGGACATTAATGTGGTTTCTAACTTTTCAT 31525224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TAATCACTTACTTAGCTTGTTATCTTTTGTTGGACATTAATGTGGTTTCTAACTTTTCAT 780

 31525225 TATCAAAAAATAAAAGAAAATGGACAAAACCTCAGAAAGACACAAACTACTAAAGCTGAC 31525284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TATCAAAAAATAAAAGAAAATGGACAAAACCTCAGAAAGACACAAACTACTAAAGCTGAC 840

 31525285 TTAATAAGAAATAGAAAATCTGAATATATAGAAAATCTGAATGTAACAAGTAAGGAGATT 31525344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTAATAAGAAATAGAAAATCTGAATATATAGAAAATCTGAATGTAACAAGTAAGGAGATT 900

 31525345 GGATTAGTAATAAAATTTCCCACAAAGAGAAGTACACATTCAGATGGTTTCACTGGTAAA 31525404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GGATTAGTAATAAAATTTCCCACAAAGAGAAGTACACATTCAGATGGTTTCACTGGTAAA 960

 31525405 TTCTACCAAATATTTAAAGATTTTTCTTTTTTTTTGTTGAGACAGAGTCTCACTCTATTG 31525464
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
      961 TTCTACCAAATATTTAAAGATTTTTCTTTTTTTTTGTTGAGGCAGAGTCTCACTCTATTG 1020

 31525465 CCCAGGCTGGAGTACAATGGTG 31525486
          ||||||||||||||||||||||
     1021 CCCAGGCTGGAGTACAATGGTG 1042

EXCISED REGION

 31529390 AATACTGTGCTAAGTGAAAGAAGCCAACCACAAAATACCATATATTGTGTGATTCTGCTT 31529449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1052 AATACTGTGCTAAGTGAAAGAAGCCAACCACAAAATACCATATATTGTGTGATTCTGCTT 1111

 31529450 AAATGACATGTCCAGAATGTCCATATTAAAGTAGATTAGTGGTTTCCTGAGGCTGGGGGA 31529509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1112 AAATGACATGTCCAGAATGTCCATATTAAAGTAGATTAGTGGTTTCCTGAGGCTGGGGGA 1171

 31529510 GGGAGTTGGGGAAATTGCGTAGTGACTACTGGGTAAAGAGTTTCTTTCTGGGGTGATGAA 31529569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1172 GGGAGTTGGGGAAATTGCGTAGTGACTACTGGGTAAAGAGTTTCTTTCTGGGGTGATGAA 1231

 31529570 ATGGTCTAAAATAGAATGTGGTGGTGGTTGCACAGCTCTGAAAATACTAAAAACCATTGA 31529629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1232 ATGGTCTAAAATAGAATGTGGTGGTGGTTGCACAGCTCTGAAAATACTAAAAACCATTGA 1291

 31529630 ATGAGCACTTTAAATTGGTAAATTTTTATGTGAATTATGATTCAATAAAGTTGTGTTTAG 31529689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1292 ATGAGCACTTTAAATTGGTAAATTTTTATGTGAATTATGATTCAATAAAGTTGTGTTTAG 1351

 31529690 ATATTACTAAAAATGATGGTACAAATATTCTTTTTCACAAATGTTTTTTGTTGTTGTTTA 31529749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1352 ATATTACTAAAAATGATGGTACAAATATTCTTTTTCACAAATGTTTTTTGTTGTTGTTTA 1411

 31529750 TAGTTGTTTATTTGTACATCTAGTAATTTGTCCCAAGGAAAGAGTATGTAAAAGAACATA 31529809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1412 TAGTTGTTTATTTGTACATCTAGTAATTTGTCCCAAGGAAAGAGTATGTAAAAGAACATA 1471

 31529810 AGTCACTTTAAGGCCTTTAATGTATACTACAAAATTGCACTCTAGAAGGTTTATACAGTT 31529869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1472 AGTCACTTTAAGGCCTTTAATGTATACTACAAAATTGCACTCTAGAAGGTTTATACAGTT 1531

 31529870 TTGCATTTCATTAGCCTGTTTTTTTTATCTTTGACAACCTAAAGAATTTATTAGTGGTAT 31529929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1532 TTGCATTTCATTAGCCTGTTTTTTTTATCTTTGACAACCTAAAGAATTTATTAGTGGTAT 1591

 31529930 TCATCTGAGGATCCTCTAGGTCTATCAGAGTGTCTTTCTTATAGAAGGCATTCAATAAAT 31529989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1592 TCATCTGAGGATCCTCTAGGTCTATCAGAGTGTCTTTCTTATAGAAGGCATTCAATAAAT 1651

 31529990 AAATGTCCTAAGTGAGCAAAACATTTTTGGTTGATTTTTAGGTGCAAATGGTTTCTTTTG 31530049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1652 AAATGTCCTAAGTGAGCAAAACATTTTTGGTTGATTTTTAGGTGCAAATGGTTTCTTTTG 1711

 31530050 ATTTTAATTAAGATGCCTTTGTTTATTAGTGATGTTGACATATTTTCTTAATCTATTGGC 31530109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1712 ATTTTAATTAAGATGCCTTTGTTTATTAGTGATGTTGACATATTTTCTTAATCTATTGGC 1771

 31530110 TTTGTATAACTTTATGAATTGTCTCTTCATGTCCTTTGCCTACTTTTCTATTGTGGTAAC 31530169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1772 TTTGTATAACTTTATGAATTGTCTCTTCATGTCCTTTGCCTACTTTTCTATTGTGGTAAC 1831

 31530170 TATCTTTTATAAATGTTGTATAATTATTTAAAAATACATTAGGTTGGGCATGGTAGATCA 31530229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1832 TATCTTTTATAAATGTTGTATAATTATTTAAAAATACATTAGGTTGGGCATGGTAGATCA 1891

 31530230 TGCCTGTAATCCCAGCTCTCTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATTGCTTGAGCCTAACAGTT 31530289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1892 TGCCTGTAATCCCAGCTCTCTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATTGCTTGAGCCTAACAGTT 1951

 31530290 CGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCCATCTCTAAAAAAAAAAACCAATAAAAAT 31530349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1952 CGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCCATCTCTAAAAAAAAAAACCAATAAAAAT 2011

 31530350 ATATTAAAAGATTAACTGATTGTCTATCATATGGATTACAAATATCCCCCCCAATTTGTC 31530409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2012 ATATTAAAAGATTAACTGATTGTCTATCATATGGATTACAAATATCCCCCCCAATTTGTC 2071

 31530410 ATTTGCTTGTTAATTTTATTTATGATGACTTAAAAATTACAATATATTTTTTGGTGTTCA 31530469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2072 ATTTGCTTGTTAATTTTATTTATGATGACTTAAAAATTACAATATATTTTTTGGTGTTCA 2131

 31530470 AGTCAGTTTTTGTCCCCATTGTGATATTTTCCTTTGCCTGTTTATCACTTTCTTAGAGAA 31530529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2132 AGTCAGTTTTTGTCCCCATTGTGATATTTTCCTTTGCCTGTTTATCACTTTCTTAGAGAA 2191

 31530530 AAGATAAATACTGATTCGTTCTTTTGTAGGTGTTTTATGATTTCATTGAAAATAAAATCT 31530589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2192 AAGATAAATACTGATTCGTTCTTTTGTAGGTGTTTTATGATTTCATTGAAAATAAAATCT 2251

 31530590 TCAACGCATCTAGTATTCATTTGGGTGTAAGATAAAAGATAACAACGTAGGTTTCTCTTA 31530649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2252 TCAACGCATCTAGTATTCATTTGGGTGTAAGATAAAAGATAACAACGTAGGTTTCTCTTA 2311

 31530650 TAGTTCATCAGGTATCCTACTACTGTTTATTGAGTCATGTTTTCTGTTACCACTCTTACT 31530709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2312 TAGTTCATCAGGTATCCTACTACTGTTTATTGAGTCATGTTTTCTGTTACCACTCTTACT 2371

 31530710 ATATACCAGTTTTACATACATTTGGGTTGGTTTCTGAGCTTTCTATTGTCTTCCATTGCT 31530769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2372 ATATACCAGTTTTACATACATTTGGGTTGGTTTCTGAGCTTTCTATTGTCTTCCATTGCT 2431

 31530770 TTGTTTAAAATTTAAAGTTTATTATTCTGACTTTCCATACTTGAATATGGTCGAATAAGT 31530829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2432 TTGTTTAAAATTTAAAGTTTATTATTCTGACTTTCCATACTTGAATATGGTCGAATAAGT 2491

 31530830 CCTCCTTTATTAATCTTGTTTTATTTAAAAATGGTCATTTTCACTCATTTTCCAGTTCAG 31530889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2492 CCTCCTTTATTAATCTTGTTTTATTTAAAAATGGTCATTTTCACTCATTTTCCAGTTCAG 2551

 31530890 TAGTTTTATTCTCTCAGTGTAATGTGATTTATCACCCCATTGCTCACCCTATTCATCTCC 31530949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2552 TAGTTTTATTCTCTCAGTGTAATGTGATTTATCACCCCATTGCTCACCCTATTCATCTCC 2611

 31530950 CAATACCCAGCTGAAAAACTTTAGAAGACTGAGGCTCTTGCCCTGGCCCCATCACTTTCT 31531009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2612 CAATACCCAGCTGAAAAACTTTAGAAGACTGAGGCTCTTGCCCTGGCCCCATCACTTTCT 2671

 31531010 AGCTATGTGGGCTTAGGCTAGTTATTGAACATGTCTGACTCTCACTTTTCTCCTCTGTAA 31531069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2672 AGCTATGTGGGCTTAGGCTAGTTATTGAACATGTCTGACTCTCACTTTTCTCCTCTGTAA 2731

 31531070 GTCAGTGAGAATTATATACTTCTTATAAGGTTGTGAGGTTCAAATGGAATAATGTGTACA 31531129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2732 GTCAGTGAGAATTATATACTTCTTATAAGGTTGTGAGGTTCAAATGGAATAATGTGTACA 2791

 31531130 GAGGCACTTGGTAAACAATGTAGTCATATGCAAGTCATATGCAAGTCATATGTAGTCAGC 31531189
          |||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||
     2792 GAGGCACTTGGTAAACAATGT-----------AGTCATATGCAAGTCATATGTAGTCAGC 2840

 31531190 TTGGTGAATTTTGAGAAAGTAAATGCAAGTTCTTTTTATGGTTTTACCTAAGGGGCCAGT 31531249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2841 TTGGTGAATTTTGAGAAAGTAAATGCAAGTTCTTTTTATGGTTTTACCTAAGGGGCCAGT 2900

 31531250 GAGGGCCAGAGAAGTGCCGGGACCTATGTAAGGTCGCAAGCAAGTTCATGTGGAATGCAT 31531309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2901 GAGGGCCAGAGAAGTGCCGGGACCTATGTAAGGTCGCAAGCAAGTTCATGTGGAATGCAT 2960

 31531310 CTAGAACTAGAACGCTAGCCTGTGTCCCAGGGCCCTTCCAACTGGGCTCTGCTGCCTGCA 31531369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2961 CTAGAACTAGAACGCTAGCCTGTGTCCCAGGGCCCTTCCAACTGGGCTCTGCTGCCTGCA 3020

 31531370 GTCCTGGGTGCCTTCTAATTAGCCTGTGTAGTGGTCTTGGTAAAAGTGTTTCTCCTGTAC 31531429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3021 GTCCTGGGTGCCTTCTAATTAGCCTGTGTAGTGGTCTTGGTAAAAGTGTTTCTCCTGTAC 3080

 31531430 TGTCCCCTATAGGTTGTGGCTGGCCATACCATTTCCCTGGTTCCCCCCACGCTCCTGATG 31531489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3081 TGTCCCCTATAGGTTGTGGCTGGCCATACCATTTCCCTGGTTCCCCCCACGCTCCTGATG 3140

 31531490 ACCTGGAAAGGCCATTTGAATAGTGTGGCAGACATCCTGTATGTGGACAACTTCCAGCTG 31531549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3141 ACCTGGAAAGGCCATTTGAATAGTGTGGCAGACATCCTGTATGTGGACAACTTCCAGCTG 3200

 31531550 GTTATCAGCGCTGGCCAGGACCGGGACGTCAAGGCTTGGAAACTCTCCGGTGATGCCATT 31531609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3201 GTTATCAGCGCTGGCCAGGACCGGGACGTCAAGGCTTGGAAACTCTCCGGTGATGCCATT 3260

 31531610 GGTATGGGTCCTGCTGAAGCTCAGCCATGCCCATGGCCCTTCTTGTCTCTGTCCCTGTCT 31531669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3261 GGTATGGGTCCTGCTGAAGCTCAGCCATGCCCATGGCCCTTCTTGTCTCTGTCCCTGTCT 3320

 31531670 GAACATAAGCTGGTATGAACTTTGTACTCTGTGGGGAGGGACTCTCAGGCCACAGCAACT 31531729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3321 GAACATAAGCTGGTATGAACTTTGTACTCTGTGGGGAGGGACTCTCAGGCCACAGCAACT 3380

 31531730 GCCTTCACTTAAATAATATTACAGTCTGTCCAATTATCCATTCAGCAAACGGTCCATCCA 31531789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3381 GCCTTCACTTAAATAATATTACAGTCTGTCCAATTATCCATTCAGCAAACGGTCCATCCA 3440

 31531790 TTCACCCATCCACCCAATATTATTCACCTATGTATATTTTTGCAAATCATATATCTGATA 31531849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3441 TTCACCCATCCACCCAATATTATTCACCTATGTATATTTTTGCAAATCATATATCTGATA 3500

 31531850 AAGCATATTCCTTTCTCTTTTAAAAAATAAACTTAATTGTTGCATTGTATATAAAGAAAA 31531909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3501 AAGCATATTCCTTTCTCTTTTAAAAAATAAACTTAATTGTTGCATTGTATATAAAGAAAA 3560

 31531910 ACATACAAACCAGAAGGGTTCAGCTTGGTGAATTTTGAGAAAGTAAATACATACCCATAT 31531969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3561 ACATACAAACCAGAAGGGTTCAGCTTGGTGAATTTTGAGAAAGTAAATACATACCCATAT 3620

 31531970 AGCCACCGTTCATGTCAAGAAATAATTAGGGCCAGGCGCGGTGGCTCACTACTGTAATCC 31532029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3621 AGCCACCGTTCATGTCAAGAAATAATTAGGGCCAGGCGCGGTGGCTCACTACTGTAATCC 3680

 31532030 CAACACTTTTTTGTCCCCTTTTCCTCCTGTGCTGTCTTCCTATGTGTTTGTTTGTTTGTT 31532089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3681 CAACACTTTTTTGTCCCCTTTTCCTCCTGTGCTGTCTTCCTATGTGTTTGTTTGTTTGTT 3740

 31532090 TTAGTGACCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGTGCATGCCTGT 31532149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3741 TTAGTGACCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGTGCATGCCTGT 3800

 31532150 AATCCCAGCTACTTGAGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGTTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTT 31532209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3801 AATCCCAGCTACTTGAGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGTTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTT 3860

 31532210 GCAGTGAGCTGAGATCATGTCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGACTCTGTCT 31532269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3861 GCAGTGAGCTGAGATCATGTCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGACTCTGTCT 3920

 31532270 AAAAAAAAAATAATAATAAAAATAAAGTGACTTATGTGCCACTATTACAGTATTACAGCA 31532329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3921 AAAAAAAAAATAATAATAAAAATAAAGTGACTTATGTGCCACTATTACAGTATTACAGCA 3980

 31532330 TTCTGTATTTTTCTATGTGTTTACATTTATCAGAAAGCTTTGTATTTTCATATGCTTTCA 31532389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3981 TTCTGTATTTTTCTATGTGTTTACATTTATCAGAAAGCTTTGTATTTTCATATGCTTTCA 4040

 31532390 TGTTCCTGCCTAGCATCCTTTTGTTTCAACTTGAAGGGGTCCCTTTAGCATTTCTTTAAA 31532449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4041 TGTTCCTGCCTAGCATCCTTTTGTTTCAACTTGAAGGGGTCCCTTTAGCATTTCTTTAAA 4100

 31532450 GGCAGGTCTAATGGTGATGAACTCCTCTTGTTTTTATTTATCTGGGAAAATTTTTATTTT 31532509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4101 GGCAGGTCTAATGGTGATGAACTCCTCTTGTTTTTATTTATCTGGGAAAATTTTTATTTT 4160

 31532510 TCCTTCATTTTTAAAGGACAGCTTTCCTGGATATAGTATTTTTGGATGAGAGTTTTTGTT 31532569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4161 TCCTTCATTTTTAAAGGACAGCTTTCCTGGATATAGTATTTTTGGATGAGAGTTTTTGTT 4220

 31532570 CTTTTTATAATGTGTCTCCTTGTGGATTTCTTTGACTTTATCCTAGTTGGAATCCCTTGA 31532629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4221 CTTTTTATAATGTGTCTCCTTGTGGATTTCTTTGACTTTATCCTAGTTGGAATCCCTTGA 4280

 31532630 GCTTCTTGAATATAGGTTTCTTTTCCTTTTTAAGATTTGAAACATTTTCAGCCATTATTT 31532689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4281 GCTTCTTGAATATAGGTTTCTTTTCCTTTTTAAGATTTGAAACATTTTCAGCCATTATTT 4340

 31532690 ATTCAGATAAGCTTTTTGTCCCTTTCTCTCTCTCTGTCTCTCTCTCCTCCTTCTAGTACT 31532749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4341 ATTCAGATAAGCTTTTTGTCCCTTTCTCTCTCTCTGTCTCTCTCTCCTCCTTCTAGTACT 4400

 31532750 ACCATAATGCATATATTGTCCATTTGACGATGTCTCATAAATCCCTTAAGTTTTCTTTAC 31532809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4401 ACCATAATGCATATATTGTCCATTTGACGATGTCTCATAAATCCCTTAAGTTTTCTTTAC 4460

 31532810 TCTTTAAAATTCTTTTTTCTTTTTTGCTTCTCTGACTGGATATCTTCAAGTCTGCTGATT 31532869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4461 TCTTTAAAATTCTTTTTTCTTTTTTGCTTCTCTGACTGGATATCTTCAAGTCTGCTGATT 4520

 31532870 TTTCCTTCTGCTTGATCAAGCCTGCTGTAGATGACTTTTGAATTCAATTATTTTACTCTT 31532929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4521 TTTCCTTCTGCTTGATCAAGCCTGCTGTAGATGACTTTTGAATTCAATTATTTTACTCTT 4580

 31532930 CATCTTCAGCTCTAGAATTTCTGTTATTTTTATTATTATTATTATTATTTTTTGAGACAG 31532989
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4581 CATCTTCAGCCCTAGAATTTCTGTTATTTTTATTATTATTATTATTATTTTTTGAGACAG 4640

 31532990 GGTCTTGCTCTGCCACCCAGGGTTGAGTGCAGTGGCACGAATTCAGCTCACTGAAGCCTT 31533049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4641 GGTCTTGCTCTGCCACCCAGGGTTGAGTGCAGTGGCACGAATTCAGCTCACTGAAGCCTT 4700

 31533050 GACCTCCCAGCCTCAAGTGATCTTCCCACAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCA 31533109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4701 GACCTCCCAGCCTCAAGTGATCTTCCCACAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCA 4760

 31533110 TGCCATCATGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTTGTAGAGACAGAGTTTCACCATGTTGC 31533169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4761 TGCCATCATGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTTGTAGAGACAGAGTTTCACCATGTTGC 4820

 31533170 CCAGGCTGGCCTTGAATTCTTGAGCTCAAGTGATCGCCCACCTAAGCTTCCCAAAGTGTT 31533229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4821 CCAGGCTGGCCTTGAATTCTTGAGCTCAAGTGATCGCCCACCTAAGCTTCCCAAAGTGTT 4880

 31533230 GGGATTATAGGTGTGGGCCACCATGGCTGGCCTCTGTTTGGTTCTTTTCTATATTTTCTG 31533289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4881 GGGATTATAGGTGTGGGCCACCATGGCTGGCCTCTGTTTGGTTCTTTTCTATATTTTCTG 4940

 31533290 TGTCTTCACTAATATTCTCAGTTTGTTCATGTATTGTTTCCCTGAGCTTGTTGAGCATTT 31533349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4941 TGTCTTCACTAATATTCTCAGTTTGTTCATGTATTGTTTCCCTGAGCTTGTTGAGCATTT 5000

 31533350 TTATTACGGTTACTTAGAATTCTTTGTCAAATAATTAATATACCTCAATTTCTTTAGCGG 31533409
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5001 TTATTACAGTTACTTAGAATTCTTTGTCAAATAATTAATATACCTCAATTTCTTTAGCGG 5060

 31533410 CAGTTTCTGGAGATTTATTTTGTTCCTTTGGGCCATGCTTTCCTATTTTTTTTGTGTGCC 31533469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5061 CAGTTTCTGGAGATTTATTTTGTTCCTTTGGGCCATGCTTTCCTATTTTTTTTGTGTGCC 5120

 31533470 TTATAACTTTATATTGGGATCCATGCATTTGTAAAATCAGCCACCTCTCCCAGTCTTTAT 31533529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5121 TTATAACTTTATATTGGGATCCATGCATTTGTAAAATCAGCCACCTCTCCCAGTCTTTAT 5180

 31533530 ATACTGGCTTCATTCAGGGAAAATTCTGCACCAATCAGCTTGGCTAAAGATTCTGGGTGC 31533589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5181 ATACTGGCTTCATTCAGGGAAAATTCTGCACCAATCAGCTTGGCTAAAGATTCTGGGTGC 5240

 31533590 CTCCCCAATCTTTTTTGTGGATACTTTCACCAGACTTACGCATGTAAATTCGCAATTACA 31533649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5241 CTCCCCAATCTTTTTTGTGGATACTTTCACCAGACTTACGCATGTAAATTCGCAATTACA 5300

 31533650 GGAATCTACAGGTTTATTTTTTTCAGGAGTCCATTATCTCTTGCTCTCTCTGGTGTCTAT 31533709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5301 GGAATCTACAGGTTTATTTTTTTCAGGAGTCCATTATCTCTTGCTCTCTCTGGTGTCTAT 5360

 31533710 TTGCAGTACTGCAAGTTCTCTAGAGCGGCTACAAGCTTCCCCCAGGCCTCTAGAATATGC 31533769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5361 TTGCAGTACTGCAAGTTCTCTAGAGCGGCTACAAGCTTCCCCCAGGCCTCTAGAATATGC 5420

 31533770 TGGGTCCTTCAATAGTCTGAGAGAGGCAAGACAGAAACCAGTTTCTTGGGTACCCCTCAA 31533829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5421 TGGGTCCTTCAATAGTCTGAGAGAGGCAAGACAGAAACCAGTTTCTTGGGTACCCCTCAA 5480

 31533830 AGGCTAACATTGGATATGTATGCTCCAAATCTGCCTCCTCAAGGAGAAGCTGGAAGTTGG 31533889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5481 AGGCTAACATTGGATATGTATGCTCCAAATCTGCCTCCTCAAGGAGAAGCTGGAAGTTGG 5540

 31533890 GTTGTTTTCTCTACTCATTCCACAGAGCGGCAGGAGGGACTCTGATAGTGTGTGCTAGTC 31533949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5541 GTTGTTTTCTCTACTCATTCCACAGAGCGGCAGGAGGGACTCTGATAGTGTGTGCTAGTC 5600

 31533950 TAAATTGTCACCTTTGTTCTTAGTAGCCCAGTCTGGTGCCTCTTCCTGTCAGTGCTTAGA 31534009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5601 TAAATTGTCACCTTTGTTCTTAGTAGCCCAGTCTGGTGCCTCTTCCTGTCAGTGCTTAGA 5660

 31534010 TTCAGGCAAGACAGAAACTGGTTAATCATGCAGCCCTCTGAAAAGTCTGCATGTTGGATG 31534069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5661 TTCAGGCAAGACAGAAACTGGTTAATCATGCAGCCCTCTGAAAAGTCTGCATGTTGGATG 5720

 31534070 TACATCTCAGTCTTTCCCTCCCAGGGAGAAGCTGGAAGCTGGTGGTTCCTTCCCAATCTG 31534129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5721 TACATCTCAGTCTTTCCCTCCCAGGGAGAAGCTGGAAGCTGGTGGTTCCTTCCCAATCTG 5780

 31534130 CTTCACTGAGCCAGGAGGAGGGATTACAAGTGAGCACTATGAATTTTCCTACTGGCTTCA 31534189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5781 CTTCACTGAGCCAGGAGGAGGGATTACAAGTGAGCACTATGAATTTTCCTACTGGCTTCA 5840

 31534190 GTGCAGCTGGTTTTTTGTTTTTTGTTTTTTTGGTTTTTGTTTGTTTGTTTTTTCATTCAT 31534249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5841 GTGCAGCTGGTTTTTTGTTTTTTGTTTTTTTGGTTTTTGTTTGTTTGTTTTTTCATTCAT 5900

 31534250 CTGGGATGAATGGTCCTGGTTTCTGGTCCATGTACTGTTGTTCAGTCAGTGTCTCCATAG 31534309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5901 CTGGGATGAATGGTCCTGGTTTCTGGTCCATGTACTGTTGTTCAGTCAGTGTCTCCATAG 5960

 31534310 GGAGAAGGAAGTTCTGGATCTTCCTATTCTACCATCTTGCTGATGTCACCCATTTTTTTG 31534369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5961 GGAGAAGGAAGTTCTGGATCTTCCTATTCTACCATCTTGCTGATGTCACCCATTTTTTTG 6020

 31534370 TATCTTTCAAAGACGTCTTTGACTATCCCCTAAATATAATATCTAGTGTTATCTTTTAGA 31534429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6021 TATCTTTCAAAGACGTCTTTGACTATCCCCTAAATATAATATCTAGTGTTATCTTTTAGA 6080

 31534430 AGCTTGTTTTAAAAATCAGATTTCTGAAGTATAATTTACATCCAATAAAAGCACCTTTTA 31534489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6081 AGCTTGTTTTAAAAATCAGATTTCTGAAGTATAATTTACATCCAATAAAAGCACCTTTTA 6140

 31534490 AAAGTATATAGTTCTGTGAGGTTTCATGAATGCATACAATTGTGTAATTGGTATCACAAT 31534549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6141 AAAGTATATAGTTCTGTGAGGTTTCATGAATGCATACAATTGTGTAATTGGTATCACAAT 6200

 31534550 CAAGACATAGACATTACCCCAAAAAGTGACCTCAT 31534584
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6201 CAAGACATAGACATTACCCCAAAAAGTGACCTCAT 6235

Alignment time is 5.36032 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31515486,31539389] =>     23904 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    7351] =>      7351 nucs 'mol-32-2af2-099917_7351'

Score:        7256
Aligned:      7342        nucs
Identic:      7326 (100%) nucs =>      2485 (100%)      4841 (100%)
Gaps:           12 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31522999,31525486] EXCISED REGION [31529390,31534243]
 second seq =>  [      13,    2500] EXCISED REGION [    2510,    7351]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3903 nucs [31525487,31529389]
 second seq =>         9 nucs [2501,2509]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31522999 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGCGTTTTGCTCTTGTTGCCCGGGCTGGAG 31523058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       13 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGCGTTTTGCTCTTGTTGCCCGGGCTGGAG 72

 31523059 TGCATTGATCCAATCTTGGCTCACTGCAACCCCCGCCTCCCGGGTTCAAGCAATTCTCCC 31523118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       73 TGCATTGATCCAATCTTGGCTCACTGCAACCCCCGCCTCCCGGGTTCAAGCAATTCTCCC 132

 31523119 GCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGTGATTACAGGCACAGGCTACCACACCCGGCTAATTTTG 31523178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      133 GCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGTGATTACAGGCACAGGCTACCACACCCGGCTAATTTTG 192

 31523179 TATTTTCAGTAGAGACGAGGTGTCACCTTGTTGGTCAGGCTGGTCCCGAACTCCTGACCT 31523238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      193 TATTTTCAGTAGAGACGAGGTGTCACCTTGTTGGTCAGGCTGGTCCCGAACTCCTGACCT 252

 31523239 CAAGTGATCTGCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCA 31523298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      253 CAAGTGATCTGCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCA 312

 31523299 CCTGGCCACTTTGCCTATTTTATTTTATTTTGAGATGGAGTTTTGCTCTTATTGCCCAGA 31523358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      313 CCTGGCCACTTTGCCTATTTTATTTTATTTTGAGATGGAGTTTTGCTCTTATTGCCCAGA 372

 31523359 CTGGAGTGCAATGGCGCAATTGCAGCTCACCACAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCAAT 31523418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      373 CTGGAGTGCAATGGCGCAATTGCAGCTCACCACAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCAAT 432

 31523419 TCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGGTGGGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCCAACTA 31523478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      433 TCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGGTGGGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCCAACTA 492

 31523479 ATTTTGTAGTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCC 31523538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      493 ATTTTGTAGTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCC 552

 31523539 TGACCTCAGGTGATCTGCCCACCTTGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGAGTGAGTGC 31523598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      553 TGACCTCAGGTGATCTGCCCACCTTGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGAGTGAGTGC 612

 31523599 ACCTGGCCCACTTTGCTCATTTTCTAATTGGGTTATTCGTTTTCTGGCTATTGAGTTGTT 31523658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      613 ACCTGGCCCACTTTGCTCATTTTCTAATTGGGTTATTCGTTTTCTGGCTATTGAGTTGTT 672

 31523659 TGAGTTTCTTATTTATTGTGGATGTTACTCCCTTATCAGATGTATGATTTACATATATTT 31523718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      673 TGAGTTTCTTATTTATTGTGGATGTTACTCCCTTATCAGATGTATGATTTACATATATTT 732

 31523719 TCTGTCACTCTGTGGGTTATCTCTTTACTTTGTTCATTGTTTCCTTTCTGTCCAAAAGCT 31523778
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      733 TCTGTCACTTTGTGGGTTATCTCTTTACTTTGTTCATTGTTTCCTTTCTGTCCAAAAGCT 792

 31523779 TTGTATCTTGTCTAAAATCCCATTTGTCTATTTTTGCTTTTATTTATTTTTATTTTTATT 31523838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      793 TTGTATCTTGTCTAAAATCCCATTTGTCTATTTTTGCTTTTATTTATTTTTATTTTTATT 852

 31523839 TTTATTTTTTATTTTTTTGAAACGGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGTTGGAGTGCAGTGG 31523898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      853 TTTATTTTTTATTTTTTTGAAACGGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGTTGGAGTGCAGTGG 912

 31523899 TGCAATCTCAGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGGAAGTCTCCTACTCCAAC 31523958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      913 TGCAATCTCAGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGGAAGTCTCCTACTCCAAC 972

 31523959 TTCCTGAGTAGCTGGGATTATAGGCGTGTGCCACCATGCCTAGCTAATTTTTGTATTTTT 31524018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      973 TTCCTGAGTAGCTGGGATTATAGGCGTGTGCCACCATGCCTAGCTAATTTTTGTATTTTT 1032

 31524019 TGGTAGAGACAGGATTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTGTTGAACTCTTGACCTCAGGCA 31524078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1033 TGGTAGAGACAGGATTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTGTTGAACTCTTGACCTCAGGCA 1092

 31524079 ATCCGCCTGACTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACACGTGTGAGCCACCGCGCCTGGC 31524138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1093 ATCCGCCTGACTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACACGTGTGAGCCACCGCGCCTGGC 1152

 31524139 CTATTTTTGCTTTTATTACCTGTGCTTTTGGGGTCATAGCTAAATAACCATTGCTCAGAT 31524198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1153 CTATTTTTGCTTTTATTACCTGTGCTTTTGGGGTCATAGCTAAATAACCATTGCTCAGAT 1212

 31524199 CAATGTCATGGAGCCTTTCCTCTAGGTATTCTTCTAGTTGTTTTACAGTCTCAGATCTTA 31524258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1213 CAATGTCATGGAGCCTTTCCTCTAGGTATTCTTCTAGTTGTTTTACAGTCTCAGATCTTA 1272

 31524259 TATTTAAGACTTTAATCCATTTTGAGTTGATTTTTTATACTGTGTGAGATAAGGATCCAA 31524318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1273 TATTTAAGACTTTAATCCATTTTGAGTTGATTTTTTATACTGTGTGAGATAAGGATCCAA 1332

 31524319 TTTTATTCTTCTGTATGTGGATCCAATTTTCCTAGTACAGTTTATTGAAAAGACTGTCTT 31524378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1333 TTTTATTCTTCTGTATGTGGATCCAATTTTCCTAGTACAGTTTATTGAAAAGACTGTCTT 1392

 31524379 TTCCCCATTATGTATTAGTAACACCTTTGTCAAAAATCAATTGACTATTAGTGCATGGGT 31524438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1393 TTCCCCATTATGTATTAGTAACACCTTTGTCAAAAATCAATTGACTATTAGTGCATGGGT 1452

 31524439 TTATTTCTGGGTTTTCTATCTTGTTACATTAGTCGATGTGTCTATTTTTATGCCAGCACC 31524498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1453 TTATTTCTGGGTTTTCTATCTTGTTACATTAGTCGATGTGTCTATTTTTATGCCAGCACC 1512

 31524499 ATACTGTTTTGATTATATTAGCTTTATAATATATTTTGAAATCAGGGACTGTGATGTCTT 31524558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1513 ATACTGTTTTGATTATATTAGCTTTATAATATATTTTGAAATCAGGGACTGTGATGTCTT 1572

 31524559 TAGCTTTGTTCTTTTTGCTCAAGATTGTTTTGGCTAGCCAGGGTCTTTTATGATTGCATA 31524618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1573 TAGCTTTGTTCTTTTTGCTCAAGATTGTTTTGGCTAGCCAGGGTCTTTTATGATTGCATA 1632

 31524619 TGAATTTAAGGATTGTTTTATTTCTATAAGAAATGACATTGGAATTTTGATAGGGACTGC 31524678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1633 TGAATTTAAGGATTGTTTTATTTCTATAAGAAATGACATTGGAATTTTGATAGGGACTGC 1692

 31524679 ATTGAATCTGTAGATTGCTTTGGGTAGTATGAATATTTTAATAATATTAATTCTTCTAAT 31524738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1693 ATTGAATCTGTAGATTGCTTTGGGTAGTATGAATATTTTAATAATATTAATTCTTCTAAT 1752

 31524739 TTATCAACACAAGATAGCTTTCCATTTATTTGTGTTTTCTTAAACAATGTTTTAGTTTCC 31524798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1753 TTATCAACACAAGATAGCTTTCCATTTATTTGTGTTTTCTTAAACAATGTTTTAGTTTCC 1812

 31524799 AGTGTACAGATCTTTTAACTTCTTGGTTAAATTTACCCCTAAGTATTTTATTTTATTTTA 31524858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1813 AGTGTACAGATCTTTTAACTTCTTGGTTAAATTTACCCCTAAGTATTTTATTTTATTTTA 1872

 31524859 AAATACCTGGCTAATTTTGTATTTAATTTTATATTGTATTTATTTTATTTGTAATAAAAT 31524918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1873 AAATACCTGGCTAATTTTGTATTTAATTTTATATTGTATTTATTTTATTTGTAATAAAAT 1932

 31524919 TAAGCATTTTATTTTATTTTAAAATACCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGG 31524978
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     1933 TAAGCATTTTATTTTATTTTAAAATACCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGATAGGG 1992

 31524979 TTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCAGACCTCAGGTGATCCGACTGCCTCG 31525038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1993 TTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCAGACCTCAGGTGATCCGACTGCCTCG 2052

 31525039 GCCTCCCAAAGTGCTGGTATTAGAAGCATGAGCCACTGCCCACTGCACCTAGCTGAAAAC 31525098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2053 GCCTCCCAAAGTGCTGGTATTAGAAGCATGAGCCACTGCCCACTGCACCTAGCTGAAAAC 2112

 31525099 CACACTTTCTGTTGATTAAATAATATTTCACCTTATGGAGTTACAAATTTTCATTTTATG 31525158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2113 CACACTTTCTGTTGATTAAATAATATTTCACCTTATGGAGTTACAAATTTTCATTTTATG 2172

 31525159 GGGTTATAATCACTTACTTAGCTTGTTATCTTTTGTTGGACATTAATGTGGTTTCTAACT 31525218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2173 GGGTTATAATCACTTACTTAGCTTGTTATCTTTTGTTGGACATTAATGTGGTTTCTAACT 2232

 31525219 TTTCATTATCAAAAAATAAAAGAAAATGGACAAAACCTCAGAAAGACACAAACTACTAAA 31525278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2233 TTTCATTATCAAAAAATAAAAGAAAATGGACAAAACCTCAGAAAGACACAAACTACTAAA 2292

 31525279 GCTGACTTAATAAGAAATAGAAAATCTGAATATATAGAAAATCTGAATGTAACAAGTAAG 31525338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2293 GCTGACTTAATAAGAAATAGAAAATCTGAATATATAGAAAATCTGAATGTAACAAGTAAG 2352

 31525339 GAGATTGGATTAGTAATAAAATTTCCCACAAAGAGAAGTACACATTCAGATGGTTTCACT 31525398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2353 GAGATTGGATTAGTAATAAAATTTCCCACAAAGAGAAGTACACATTCAGATGGTTTCACT 2412

 31525399 GGTAAATTCTACCAAATATTTAAAGATTTTTCTTTTTTTTTGTTGAGACAGAGTCTCACT 31525458
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     2413 GGTAAATTCTACCAAATATTTAAAGATTTTTCTTTTTTTTTGTTGAGGCAGAGTCTCACT 2472

 31525459 CTATTGCCCAGGCTGGAGTACAATGGTG 31525486
          ||||||||||||||||||||||||||||
     2473 CTATTGCCCAGGCTGGAGTACAATGGTG 2500

EXCISED REGION

 31529390 AATACTGTGCTAAGTGAAAGAAGCCAACCACAAAATACCATATATTGTGTGATTCTGCTT 31529449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2510 AATACTGTGCTAAGTGAAAGAAGCCAACCACAAAATACCATATATTGTGTGATTCTGCTT 2569

 31529450 AAATGACATGTCCAGAATGTCCATATTAAAGTAGATTAGTGGTTTCCTGAGGCTGGGGGA 31529509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2570 AAATGACATGTCCAGAATGTCCATATTAAAGTAGATTAGTGGTTTCCTGAGGCTGGGGGA 2629

 31529510 GGGAGTTGGGGAAATTGCGTAGTGACTACTGGGTAAAGAGTTTCTTTCTGGGGTGATGAA 31529569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2630 GGGAGTTGGGGAAATTGCGTAGTGACTACTGGGTAAAGAGTTTCTTTCTGGGGTGATGAA 2689

 31529570 ATGGTCTAAAATAGAATGTGGTGGTGGTTGCACAGCTCTGAAAATACTAAAAACCATTGA 31529629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2690 ATGGTCTAAAATAGAATGTGGTGGTGGTTGCACAGCTCTGAAAATACTAAAAACCATTGA 2749

 31529630 ATGAGCACTTTAAATTGGTAAATTTTTATGTGAATTATGATTCAATAAAGTTGTGTTTAG 31529689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2750 ATGAGCACTTTAAATTGGTAAATTTTTATGTGAATTATGATTCAATAAAGTTGTGTTTAG 2809

 31529690 ATATTACTAAAAATGATGGTACAAATATTCTTTTTCACAAATGTTTTTTGTTGTTGTTTA 31529749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2810 ATATTACTAAAAATGATGGTACAAATATTCTTTTTCACAAATGTTTTTTGTTGTTGTTTA 2869

 31529750 TAGTTGTTTATTTGTACATCTAGTAATTTGTCCCAAGGAAAGAGTATGTAAAAGAACATA 31529809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2870 TAGTTGTTTATTTGTACATCTAGTAATTTGTCCCAAGGAAAGAGTATGTAAAAGAACATA 2929

 31529810 AGTCACTTTAAGGCCTTTAATGTATACTACAAAATTGCACTCTAGAAGGTTTATACAGTT 31529869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2930 AGTCACTTTAAGGCCTTTAATGTATACTACAAAATTGCACTCTAGAAGGTTTATACAGTT 2989

 31529870 TTGCATTTCATTAGCCTGTTTTTTTTATCTTTGACAACCTAAAGAATTTATTAGTGGTAT 31529929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2990 TTGCATTTCATTAGCCTGTTTTTTTTATCTTTGACAACCTAAAGAATTTATTAGTGGTAT 3049

 31529930 TCATCTGAGGATCCTCTAGGTCTATCAGAGTGTCTTTCTTATAGAAGGCATTCAATAAAT 31529989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3050 TCATCTGAGGATCCTCTAGGTCTATCAGAGTGTCTTTCTTATAGAAGGCATTCAATAAAT 3109

 31529990 AAATGTCCTAAGTGAGCAAAACATTTTTGGTTGATTTTTAGGTGCAAATGGTTTCTTTTG 31530049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3110 AAATGTCCTAAGTGAGCAAAACATTTTTGGTTGATTTTTAGGTGCAAATGGTTTCTTTTG 3169

 31530050 ATTTTAATTAAGATGCCTTTGTTTATTAGTGATGTTGACATATTTTCTTAATCTATTGGC 31530109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3170 ATTTTAATTAAGATGCCTTTGTTTATTAGTGATGTTGACATATTTTCTTAATCTATTGGC 3229

 31530110 TTTGTATAACTTTATGAATTGTCTCTTCATGTCCTTTGCCTACTTTTCTATTGTGGTAAC 31530169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3230 TTTGTATAACTTTATGAATTGTCTCTTCATGTCCTTTGCCTACTTTTCTATTGTGGTAAC 3289

 31530170 TATCTTTTATAAATGTTGTATAATTATTTAAAAATACATTAGGTTGGGCATGGTAGATCA 31530229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3290 TATCTTTTATAAATGTTGTATAATTATTTAAAAATACATTAGGTTGGGCATGGTAGATCA 3349

 31530230 TGCCTGTAATCCCAGCTCTCTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATTGCTTGAGCCTAACAGTT 31530289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3350 TGCCTGTAATCCCAGCTCTCTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATTGCTTGAGCCTAACAGTT 3409

 31530290 CGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCCATCTCTAAAAAAAAAAACCAATAAAAAT 31530349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3410 CGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCCATCTCTAAAAAAAAAAACCAATAAAAAT 3469

 31530350 ATATTAAAAGATTAACTGATTGTCTATCATATGGATTACAAATATCCCCCCCAATTTGTC 31530409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3470 ATATTAAAAGATTAACTGATTGTCTATCATATGGATTACAAATATCCCCCCCAATTTGTC 3529

 31530410 ATTTGCTTGTTAATTTTATTTATGATGACTTAAAAATTACAATATATTTTTTGGTGTTCA 31530469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3530 ATTTGCTTGTTAATTTTATTTATGATGACTTAAAAATTACAATATATTTTTTGGTGTTCA 3589

 31530470 AGTCAGTTTTTGTCCCCATTGTGATATTTTCCTTTGCCTGTTTATCACTTTCTTAGAGAA 31530529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3590 AGTCAGTTTTTGTCCCCATTGTGATATTTTCCTTTGCCTGTTTATCACTTTCTTAGAGAA 3649

 31530530 AAGATAAATACTGATTCGTTCTTTTGTAGGTGTTTTATGATTTCATTGAAAATAAAATCT 31530589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3650 AAGATAAATACTGATTCGTTCTTTTGTAGGTGTTTTATGATTTCATTGAAAATAAAATCT 3709

 31530590 TCAACGCATCTAGTATTCATTTGGGTGTAAGATAAAAGATAACAACGTAGGTTTCTCTTA 31530649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3710 TCAACGCATCTAGTATTCATTTGGGTGTAAGATAAAAGATAACAACGTAGGTTTCTCTTA 3769

 31530650 TAGTTCATCAGGTATCCTACTACTGTTTATTGAGTCATGTTTTCTGTTACCACTCTTACT 31530709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3770 TAGTTCATCAGGTATCCTACTACTGTTTATTGAGTCATGTTTTCTGTTACCACTCTTACT 3829

 31530710 ATATACCAGTTTTACATACATTTGGGTTGGTTTCTGAGCTTTCTATTGTCTTCCATTGCT 31530769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3830 ATATACCAGTTTTACATACATTTGGGTTGGTTTCTGAGCTTTCTATTGTCTTCCATTGCT 3889

 31530770 TTGTTTAAAATTTAAAGTTTATTATTCTGACTTTCCATACTTGAATATGGTCGAATAAGT 31530829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3890 TTGTTTAAAATTTAAAGTTTATTATTCTGACTTTCCATACTTGAATATGGTCGAATAAGT 3949

 31530830 CCTCCTTTATTAATCTTGTTTTATTTAAAAATGGTCATTTTCACTCATTTTCCAGTTCAG 31530889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3950 CCTCCTTTATTAATCTTGTTTTATTTAAAAATGGTCATTTTCACTCATTTTCCAGTTCAG 4009

 31530890 TAGTTTTATTCTCTCAGTGTAATGTGATTTATCACCCCATTGCTCACCCTATTCATCTCC 31530949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4010 TAGTTTTATTCTCTCAGTGTAATGTGATTTATCACCCCATTGCTCACCCTATTCATCTCC 4069

 31530950 CAATACCCAGCTGAAAAACTTTAGAAGACTGAGGCTCTTGCCCTGGCCCCATCACTTTCT 31531009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4070 CAATACCCAGCTGAAAAACTTTAGAAGACTGAGGCTCTTGCCCTGGCCCCATCACTTTCT 4129

 31531010 AGCTATGTGGGCTTAGGCTAGTTATTGAACATGTCTGACTCTCACTTTTCTCCTCTGTAA 31531069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4130 AGCTATGTGGGCTTAGGCTAGTTATTGAACATGTCTGACTCTCACTTTTCTCCTCTGTAA 4189

 31531070 GTCAGTGAGAATTATATACTTCTTATAAGGTTGTGAGGTTCAAATGGAATAATGTGTACA 31531129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4190 GTCAGTGAGAATTATATACTTCTTATAAGGTTGTGAGGTTCAAATGGAATAATGTGTACA 4249

 31531130 GAGGCACTTGGTAAACAATGTAGTCATATGCAAGTCATATGCAAGTCATATGTAGTCAGC 31531189
          |||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||
     4250 GAGGCACTTGGTAAACAATGT-----------AGTCATATGCAAGTCATATGTAGTCAGC 4298

 31531190 TTGGTGAATTTTGAGAAAGTAAATGCAAGTTCTTTTTATGGTTTTACCTAAGGGGCCAGT 31531249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4299 TTGGTGAATTTTGAGAAAGTAAATGCAAGTTCTTTTTATGGTTTTACCTAAGGGGCCAGT 4358

 31531250 GAGGGCCAGAGAAGTGCCGGGACCTATGTAAGGTCGCAAGCAAGTTCATGTGGAATGCAT 31531309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4359 GAGGGCCAGAGAAGTGCCGGGACCTATGTAAGGTCGCAAGCAAGTTCATGTGGAATGCAT 4418

 31531310 CTAGAACTAGAACGCTAGCCTGTGTCCCAGGGCCCTTCCAACTGGGCTCTGCTGCCTGCA 31531369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4419 CTAGAACTAGAACGCTAGCCTGTGTCCCAGGGCCCTTCCAACTGGGCTCTGCTGCCTGCA 4478

 31531370 GTCCTGGGTGCCTTCTAATTAGCCTGTGTAGTGGTCTTGGTAAAAGTGTTTCTCCTGTAC 31531429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4479 GTCCTGGGTGCCTTCTAATTAGCCTGTGTAGTGGTCTTGGTAAAAGTGTTTCTCCTGTAC 4538

 31531430 TGTCCCCTATAGGTTGTGGCTGGCCATACCATTTCCCTGGTTCCCCCCACGCTCCTGATG 31531489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4539 TGTCCCCTATAGGTTGTGGCTGGCCATACCATTTCCCTGGTTCCCCCCACGCTCCTGATG 4598

 31531490 ACCTGGAAAGGCCATTTGAATAGTGTGGCAGACATCCTGTATGTGGACAACTTCCAGCTG 31531549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4599 ACCTGGAAAGGCCATTTGAATAGTGTGGCAGACATCCTGTATGTGGACAACTTCCAGCTG 4658

 31531550 GTTATCAGCGCTGGCCAGGACCGGGACGTCAAGGCTTGGAAACTCTCCGGTGATGCCATT 31531609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4659 GTTATCAGCGCTGGCCAGGACCGGGACGTCAAGGCTTGGAAACTCTCCGGTGATGCCATT 4718

 31531610 GGTATGGGTCCTGCTGAAGCTCAGCCATGCCCATGGCCCTTCTTGTCTCTGTCCCTGTCT 31531669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4719 GGTATGGGTCCTGCTGAAGCTCAGCCATGCCCATGGCCCTTCTTGTCTCTGTCCCTGTCT 4778

 31531670 GAACATAAGCTGGTATGAACTTTGTACTCTGTGGGGAGGGACTCTCAGGCCACAGCAACT 31531729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4779 GAACATAAGCTGGTATGAACTTTGTACTCTGTGGGGAGGGACTCTCAGGCCACAGCAACT 4838

 31531730 GCCTTCACTTAAATAATATTACAGTCTGTCCAATTATCCATTCAGCAAACGGTCCATCCA 31531789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4839 GCCTTCACTTAAATAATATTACAGTCTGTCCAATTATCCATTCAGCAAACGGTCCATCCA 4898

 31531790 TTCACCCATCCACCCAATATTATTCACCTATGTATATTTTTGCAAATCATATATCTGATA 31531849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4899 TTCACCCATCCACCCAATATTATTCACCTATGTATATTTTTGCAAATCATATATCTGATA 4958

 31531850 AAGCATATTCCTTTCTCTTTTAAAAAATAAACTTAATTGTTGCATTGTATATAAAGAAAA 31531909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4959 AAGCATATTCCTTTCTCTTTTAAAAAATAAACTTAATTGTTGCATTGTATATAAAGAAAA 5018

 31531910 ACATACAAACCAGAAGGGTTCAGCTTGGTGAATTTTGAGAAAGTAAATACATACCCATAT 31531969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5019 ACATACAAACCAGAAGGGTTCAGCTTGGTGAATTTTGAGAAAGTAAATACATACCCATAT 5078

 31531970 AGCCACCGTTCATGTCAAGAAATAATTAGGGCCAGGCGCGGTGGCTCACTACTGTAATCC 31532029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5079 AGCCACCGTTCATGTCAAGAAATAATTAGGGCCAGGCGCGGTGGCTCACTACTGTAATCC 5138

 31532030 CAACACTTTTTTGTCCCCTTTTCCTCCTGTGCTGTCTTCCTATGTGTTTGTTTGTTTGTT 31532089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5139 CAACACTTTTTTGTCCCCTTTTCCTCCTGTGCTGTCTTCCTATGTGTTTGTTTGTTTGTT 5198

 31532090 TTAGTGACCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGTGCATGCCTGT 31532149
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
     5199 TTAGTGACCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAG-CAGGCATGGTGGTGCATGCCTGT 5257

 31532150 AATCCCAGCTACTTGAGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGTTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTT 31532209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5258 AATCCCAGCTACTTGAGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGTTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTT 5317

 31532210 GCAGTGAGCTGAGATCATGTCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGACTCTGTCT 31532269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5318 GCAGTGAGCTGAGATCATGTCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGACTCTGTCT 5377

 31532270 AAAAAAAAAATAATAATAAAAATAAAGTGACTTATGTGCCACTATTACAGTATTACAGCA 31532329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5378 AAAAAAAAAATAATAATAAAAATAAAGTGACTTATGTGCCACTATTACAGTATTACAGCA 5437

 31532330 TTCTGTATTTTTCTATGTGTTTACATTTATCAGAAAGCTTTGTATTTTCATATGCTTTCA 31532389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5438 TTCTGTATTTTTCTATGTGTTTACATTTATCAGAAAGCTTTGTATTTTCATATGCTTTCA 5497

 31532390 TGTTCCTGCCTAGCATCCTTTTGTTTCAACTTGAAGGGGTCCCTTTAGCATTTCTTTAAA 31532449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5498 TGTTCCTGCCTAGCATCCTTTTGTTTCAACTTGAAGGGGTCCCTTTAGCATTTCTTTAAA 5557

 31532450 GGCAGGTCTAATGGTGATGAACTCCTCTTGTTTTTATTTATCTGGGAAAATTTTTATTTT 31532509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5558 GGCAGGTCTAATGGTGATGAACTCCTCTTGTTTTTATTTATCTGGGAAAATTTTTATTTT 5617

 31532510 TCCTTCATTTTTAAAGGACAGCTTTCCTGGATATAGTATTTTTGGATGAGAGTTTTTGTT 31532569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5618 TCCTTCATTTTTAAAGGACAGCTTTCCTGGATATAGTATTTTTGGATGAGAGTTTTTGTT 5677

 31532570 CTTTTTATAATGTGTCTCCTTGTGGATTTCTTTGACTTTATCCTAGTTGGAATCCCTTGA 31532629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5678 CTTTTTATAATGTGTCTCCTTGTGGATTTCTTTGACTTTATCCTAGTTGGAATCCCTTGA 5737

 31532630 GCTTCTTGAATATAGGTTTCTTTTCCTTTTTAAGATTTGAAACATTTTCAGCCATTATTT 31532689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5738 GCTTCTTGAATATAGGTTTCTTTTCCTTTTTAAGATTTGAAACATTTTCAGCCATTATTT 5797

 31532690 ATTCAGATAAGCTTTTTGTCCCTTTCTCTCTCTCTGTCTCTCTCTCCTCCTTCTAGTACT 31532749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5798 ATTCAGATAAGCTTTTTGTCCCTTTCTCTCTCTCTGTCTCTCTCTCCTCCTTCTAGTACT 5857

 31532750 ACCATAATGCATATATTGTCCATTTGACGATGTCTCATAAATCCCTTAAGTTTTCTTTAC 31532809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5858 ACCATAATGCATATATTGTCCATTTGACGATGTCTCATAAATCCCTTAAGTTTTCTTTAC 5917

 31532810 TCTTTAAAATTCTTTTTTCTTTTTTGCTTCTCTGACTGGATATCTTCAAGTCTGCTGATT 31532869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5918 TCTTTAAAATTCTTTTTTCTTTTTTGCTTCTCTGACTGGATATCTTCAAGTCTGCTGATT 5977

 31532870 TTTCCTTCTGCTTGATCAAGCCTGCTGTAGATGACTTTTGAATTCAATTATTTTACTCTT 31532929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5978 TTTCCTTCTGCTTGATCAAGCCTGCTGTAGATGACTTTTGAATTCAATTATTTTACTCTT 6037

 31532930 CATCTTCAGCTCTAGAATTTCTGTTATTTTTATTATTATTATTATTATTTTTTGAGACAG 31532989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6038 CATCTTCAGCTCTAGAATTTCTGTTATTTTTATTATTATTATTATTATTTTTTGAGACAG 6097

 31532990 GGTCTTGCTCTGCCACCCAGGGTTGAGTGCAGTGGCACGAATTCAGCTCACTGAAGCCTT 31533049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6098 GGTCTTGCTCTGCCACCCAGGGTTGAGTGCAGTGGCACGAATTCAGCTCACTGAAGCCTT 6157

 31533050 GACCTCCCAGCCTCAAGTGATCTTCCCACAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCA 31533109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6158 GACCTCCCAGCCTCAAGTGATCTTCCCACAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCA 6217

 31533110 TGCCATCATGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTTGTAGAGACAGAGTTTCACCATGTTGC 31533169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6218 TGCCATCATGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTTGTAGAGACAGAGTTTCACCATGTTGC 6277

 31533170 CCAGGCTGGCCTTGAATTCTTGAGCTCAAGTGATCGCCCACCTAAGCTTCCCAAAGTGTT 31533229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6278 CCAGGCTGGCCTTGAATTCTTGAGCTCAAGTGATCGCCCACCTAAGCTTCCCAAAGTGTT 6337

 31533230 GGGATTATAGGTGTGGGCCACCATGGCTGGCCTCTGTTTGGTTCTTTTCTATATTTTCTG 31533289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6338 GGGATTATAGGTGTGGGCCACCATGGCTGGCCTCTGTTTGGTTCTTTTCTATATTTTCTG 6397

 31533290 TGTCTTCACTAATATTCTCAGTTTGTTCATGTATTGTTTCCCTGAGCTTGTTGAGCATTT 31533349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6398 TGTCTTCACTAATATTCTCAGTTTGTTCATGTATTGTTTCCCTGAGCTTGTTGAGCATTT 6457

 31533350 TTATTACGGTTACTTAGAATTCTTTGTCAAATAATTAATATACCTCAATTTCTTTAGCGG 31533409
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6458 TTATTACAGTTACTTAGAATTCTTTGTCAAATAATTAATATACCTCAATTTCTTTAGCGG 6517

 31533410 CAGTTTCTGGAGATTTATTTTGTTCCTTTGGGCCATGCTTTCCTATTTTTTTTGTGTGCC 31533469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6518 CAGTTTCTGGAGATTTATTTTGTTCCTTTGGGCCATGCTTTCCTATTTTTTTTGTGTGCC 6577

 31533470 TTATAACTTTATATTGGGATCCATGCATTTGTAAAATCAGCCACCTCTCCCAGTCTTTAT 31533529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6578 TTATAACTTTATATTGGGATCCATGCATTTGTAAAATCAGCCACCTCTCCCAGTCTTTAT 6637

 31533530 ATACTGGCTTCATTCAGGGAAAATTCTGCACCAATCAGCTTGGCTAAAGATTCTGGGTGC 31533589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6638 ATACTGGCTTCATTCAGGGAAAATTCTGCACCAATCAGCTTGGCTAAAGATTCTGGGTGC 6697

 31533590 CTCCCCAATCTTTTTTGTGGATACTTTCACCAGACTTACGCATGTAAATTCGCAATTACA 31533649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6698 CTCCCCAATCTTTTTTGTGGATACTTTCACCAGACTTACGCATGTAAATTCGCAATTACA 6757

 31533650 GGAATCTACAGGTTTATTTTTTTCAGGAGTCCATTATCTCTTGCTCTCTCTGGTGTCTAT 31533709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6758 GGAATCTACAGGTTTATTTTTTTCAGGAGTCCATTATCTCTTGCTCTCTCTGGTGTCTAT 6817

 31533710 TTGCAGTACTGCAAGTTCTCTAGAGCGGCTACAAGCTTCCCCCAGGCCTCTAGAATATGC 31533769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6818 TTGCAGTACTGCAAGTTCTCTAGAGCGGCTACAAGCTTCCCCCAGGCCTCTAGAATATGC 6877

 31533770 TGGGTCCTTCAATAGTCTGAGAGAGGCAAGACAGAAACCAGTTTCTTGGGTACCCCTCAA 31533829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6878 TGGGTCCTTCAATAGTCTGAGAGAGGCAAGACAGAAACCAGTTTCTTGGGTACCCCTCAA 6937

 31533830 AGGCTAACATTGGATATGTATGCTCCAAATCTGCCTCCTCAAGGAGAAGCTGGAAGTTGG 31533889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6938 AGGCTAACATTGGATATGTATGCTCCAAATCTGCCTCCTCAAGGAGAAGCTGGAAGTTGG 6997

 31533890 GTTGTTTTCTCTACTCATTCCACAGAGCGGCAGGAGGGACTCTGATAGTGTGTGCTAGTC 31533949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6998 GTTGTTTTCTCTACTCATTCCACAGAGCGGCAGGAGGGACTCTGATAGTGTGTGCTAGTC 7057

 31533950 TAAATTGTCACCTTTGTTCTTAGTAGCCCAGTCTGGTGCCTCTTCCTGTCAGTGCTTAGA 31534009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7058 TAAATTGTCACCTTTGTTCTTAGTAGCCCAGTCTGGTGCCTCTTCCTGTCAGTGCTTAGA 7117

 31534010 TTCAGGCAAGACAGAAACTGGTTAATCATGCAGCCCTCTGAAAAGTCTGCATGTTGGATG 31534069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7118 TTCAGGCAAGACAGAAACTGGTTAATCATGCAGCCCTCTGAAAAGTCTGCATGTTGGATG 7177

 31534070 TACATCTCAGTCTTTCCCTCCCAGGGAGAAGCTGGAAGCTGGTGGTTCCTTCCCAATCTG 31534129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7178 TACATCTCAGTCTTTCCCTCCCAGGGAGAAGCTGGAAGCTGGTGGTTCCTTCCCAATCTG 7237

 31534130 CTTCACTGAGCCAGGAGGAGGGATTACAAGTGAGCACTATGAATTTTCCTACTGGCTTCA 31534189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7238 CTTCACTGAGCCAGGAGGAGGGATTACAAGTGAGCACTATGAATTTTCCTACTGGCTTCA 7297

 31534190 GTGCAGCTGGTTTTTTGTTTTTTGTTTTTTTGGTTTTTGTTTGTTTGTTTTTTC 31534243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7298 GTGCAGCTGGTTTTTTGTTTTTTGTTTTTTTGGTTTTTGTTTGTTTGTTTTTTC 7351

Alignment time is 6.31305 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31515486,31539389] =>     23904 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    2500] =>      2500 nucs 'mol-32-2af2-099917_2500'

Score:        2467
Aligned:      2500        nucs
Identic:      2497 (100%) nucs =>        12 (100%)      2485 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31516047,31516058] EXCISED REGION [31522999,31525486]
 second seq =>  [       1,      12] EXCISED REGION [      13,    2500]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6940 nucs [31516059,31522998]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 10
 first  seq =>      1164 nucs [31521835,31522998]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [31516059,31516059] to [31522999,31522999]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>        12 nucs [31516047,31516058] to [31522999,31523010]
 second seq =>        12 nucs [1,12] to [13,24]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31516047 TTTTTTTTTTTT 31516058
          ||||||||||||
        1 TTTTTTTTTTTT 12

EXCISED REGION

 31522999 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGCGTTTTGCTCTTGTTGCCCGGGCTGGAG 31523058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       13 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGCGTTTTGCTCTTGTTGCCCGGGCTGGAG 72

 31523059 TGCATTGATCCAATCTTGGCTCACTGCAACCCCCGCCTCCCGGGTTCAAGCAATTCTCCC 31523118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       73 TGCATTGATCCAATCTTGGCTCACTGCAACCCCCGCCTCCCGGGTTCAAGCAATTCTCCC 132

 31523119 GCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGTGATTACAGGCACAGGCTACCACACCCGGCTAATTTTG 31523178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      133 GCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGTGATTACAGGCACAGGCTACCACACCCGGCTAATTTTG 192

 31523179 TATTTTCAGTAGAGACGAGGTGTCACCTTGTTGGTCAGGCTGGTCCCGAACTCCTGACCT 31523238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      193 TATTTTCAGTAGAGACGAGGTGTCACCTTGTTGGTCAGGCTGGTCCCGAACTCCTGACCT 252

 31523239 CAAGTGATCTGCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCA 31523298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      253 CAAGTGATCTGCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCA 312

 31523299 CCTGGCCACTTTGCCTATTTTATTTTATTTTGAGATGGAGTTTTGCTCTTATTGCCCAGA 31523358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      313 CCTGGCCACTTTGCCTATTTTATTTTATTTTGAGATGGAGTTTTGCTCTTATTGCCCAGA 372

 31523359 CTGGAGTGCAATGGCGCAATTGCAGCTCACCACAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCAAT 31523418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      373 CTGGAGTGCAATGGCGCAATTGCAGCTCACCACAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCAAT 432

 31523419 TCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGGTGGGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCCAACTA 31523478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      433 TCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGGTGGGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCCAACTA 492

 31523479 ATTTTGTAGTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCC 31523538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      493 ATTTTGTAGTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCC 552

 31523539 TGACCTCAGGTGATCTGCCCACCTTGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGAGTGAGTGC 31523598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      553 TGACCTCAGGTGATCTGCCCACCTTGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGAGTGAGTGC 612

 31523599 ACCTGGCCCACTTTGCTCATTTTCTAATTGGGTTATTCGTTTTCTGGCTATTGAGTTGTT 31523658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      613 ACCTGGCCCACTTTGCTCATTTTCTAATTGGGTTATTCGTTTTCTGGCTATTGAGTTGTT 672

 31523659 TGAGTTTCTTATTTATTGTGGATGTTACTCCCTTATCAGATGTATGATTTACATATATTT 31523718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      673 TGAGTTTCTTATTTATTGTGGATGTTACTCCCTTATCAGATGTATGATTTACATATATTT 732

 31523719 TCTGTCACTCTGTGGGTTATCTCTTTACTTTGTTCATTGTTTCCTTTCTGTCCAAAAGCT 31523778
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      733 TCTGTCACTTTGTGGGTTATCTCTTTACTTTGTTCATTGTTTCCTTTCTGTCCAAAAGCT 792

 31523779 TTGTATCTTGTCTAAAATCCCATTTGTCTATTTTTGCTTTTATTTATTTTTATTTTTATT 31523838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      793 TTGTATCTTGTCTAAAATCCCATTTGTCTATTTTTGCTTTTATTTATTTTTATTTTTATT 852

 31523839 TTTATTTTTTATTTTTTTGAAACGGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGTTGGAGTGCAGTGG 31523898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      853 TTTATTTTTTATTTTTTTGAAACGGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGTTGGAGTGCAGTGG 912

 31523899 TGCAATCTCAGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGGAAGTCTCCTACTCCAAC 31523958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      913 TGCAATCTCAGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGGAAGTCTCCTACTCCAAC 972

 31523959 TTCCTGAGTAGCTGGGATTATAGGCGTGTGCCACCATGCCTAGCTAATTTTTGTATTTTT 31524018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      973 TTCCTGAGTAGCTGGGATTATAGGCGTGTGCCACCATGCCTAGCTAATTTTTGTATTTTT 1032

 31524019 TGGTAGAGACAGGATTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTGTTGAACTCTTGACCTCAGGCA 31524078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1033 TGGTAGAGACAGGATTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTGTTGAACTCTTGACCTCAGGCA 1092

 31524079 ATCCGCCTGACTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACACGTGTGAGCCACCGCGCCTGGC 31524138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1093 ATCCGCCTGACTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACACGTGTGAGCCACCGCGCCTGGC 1152

 31524139 CTATTTTTGCTTTTATTACCTGTGCTTTTGGGGTCATAGCTAAATAACCATTGCTCAGAT 31524198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1153 CTATTTTTGCTTTTATTACCTGTGCTTTTGGGGTCATAGCTAAATAACCATTGCTCAGAT 1212

 31524199 CAATGTCATGGAGCCTTTCCTCTAGGTATTCTTCTAGTTGTTTTACAGTCTCAGATCTTA 31524258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1213 CAATGTCATGGAGCCTTTCCTCTAGGTATTCTTCTAGTTGTTTTACAGTCTCAGATCTTA 1272

 31524259 TATTTAAGACTTTAATCCATTTTGAGTTGATTTTTTATACTGTGTGAGATAAGGATCCAA 31524318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1273 TATTTAAGACTTTAATCCATTTTGAGTTGATTTTTTATACTGTGTGAGATAAGGATCCAA 1332

 31524319 TTTTATTCTTCTGTATGTGGATCCAATTTTCCTAGTACAGTTTATTGAAAAGACTGTCTT 31524378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1333 TTTTATTCTTCTGTATGTGGATCCAATTTTCCTAGTACAGTTTATTGAAAAGACTGTCTT 1392

 31524379 TTCCCCATTATGTATTAGTAACACCTTTGTCAAAAATCAATTGACTATTAGTGCATGGGT 31524438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1393 TTCCCCATTATGTATTAGTAACACCTTTGTCAAAAATCAATTGACTATTAGTGCATGGGT 1452

 31524439 TTATTTCTGGGTTTTCTATCTTGTTACATTAGTCGATGTGTCTATTTTTATGCCAGCACC 31524498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1453 TTATTTCTGGGTTTTCTATCTTGTTACATTAGTCGATGTGTCTATTTTTATGCCAGCACC 1512

 31524499 ATACTGTTTTGATTATATTAGCTTTATAATATATTTTGAAATCAGGGACTGTGATGTCTT 31524558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1513 ATACTGTTTTGATTATATTAGCTTTATAATATATTTTGAAATCAGGGACTGTGATGTCTT 1572

 31524559 TAGCTTTGTTCTTTTTGCTCAAGATTGTTTTGGCTAGCCAGGGTCTTTTATGATTGCATA 31524618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1573 TAGCTTTGTTCTTTTTGCTCAAGATTGTTTTGGCTAGCCAGGGTCTTTTATGATTGCATA 1632

 31524619 TGAATTTAAGGATTGTTTTATTTCTATAAGAAATGACATTGGAATTTTGATAGGGACTGC 31524678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1633 TGAATTTAAGGATTGTTTTATTTCTATAAGAAATGACATTGGAATTTTGATAGGGACTGC 1692

 31524679 ATTGAATCTGTAGATTGCTTTGGGTAGTATGAATATTTTAATAATATTAATTCTTCTAAT 31524738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1693 ATTGAATCTGTAGATTGCTTTGGGTAGTATGAATATTTTAATAATATTAATTCTTCTAAT 1752

 31524739 TTATCAACACAAGATAGCTTTCCATTTATTTGTGTTTTCTTAAACAATGTTTTAGTTTCC 31524798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1753 TTATCAACACAAGATAGCTTTCCATTTATTTGTGTTTTCTTAAACAATGTTTTAGTTTCC 1812

 31524799 AGTGTACAGATCTTTTAACTTCTTGGTTAAATTTACCCCTAAGTATTTTATTTTATTTTA 31524858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1813 AGTGTACAGATCTTTTAACTTCTTGGTTAAATTTACCCCTAAGTATTTTATTTTATTTTA 1872

 31524859 AAATACCTGGCTAATTTTGTATTTAATTTTATATTGTATTTATTTTATTTGTAATAAAAT 31524918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1873 AAATACCTGGCTAATTTTGTATTTAATTTTATATTGTATTTATTTTATTTGTAATAAAAT 1932

 31524919 TAAGCATTTTATTTTATTTTAAAATACCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGG 31524978
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     1933 TAAGCATTTTATTTTATTTTAAAATACCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGATAGGG 1992

 31524979 TTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCAGACCTCAGGTGATCCGACTGCCTCG 31525038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1993 TTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCAGACCTCAGGTGATCCGACTGCCTCG 2052

 31525039 GCCTCCCAAAGTGCTGGTATTAGAAGCATGAGCCACTGCCCACTGCACCTAGCTGAAAAC 31525098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2053 GCCTCCCAAAGTGCTGGTATTAGAAGCATGAGCCACTGCCCACTGCACCTAGCTGAAAAC 2112

 31525099 CACACTTTCTGTTGATTAAATAATATTTCACCTTATGGAGTTACAAATTTTCATTTTATG 31525158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2113 CACACTTTCTGTTGATTAAATAATATTTCACCTTATGGAGTTACAAATTTTCATTTTATG 2172

 31525159 GGGTTATAATCACTTACTTAGCTTGTTATCTTTTGTTGGACATTAATGTGGTTTCTAACT 31525218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2173 GGGTTATAATCACTTACTTAGCTTGTTATCTTTTGTTGGACATTAATGTGGTTTCTAACT 2232

 31525219 TTTCATTATCAAAAAATAAAAGAAAATGGACAAAACCTCAGAAAGACACAAACTACTAAA 31525278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2233 TTTCATTATCAAAAAATAAAAGAAAATGGACAAAACCTCAGAAAGACACAAACTACTAAA 2292

 31525279 GCTGACTTAATAAGAAATAGAAAATCTGAATATATAGAAAATCTGAATGTAACAAGTAAG 31525338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2293 GCTGACTTAATAAGAAATAGAAAATCTGAATATATAGAAAATCTGAATGTAACAAGTAAG 2352

 31525339 GAGATTGGATTAGTAATAAAATTTCCCACAAAGAGAAGTACACATTCAGATGGTTTCACT 31525398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2353 GAGATTGGATTAGTAATAAAATTTCCCACAAAGAGAAGTACACATTCAGATGGTTTCACT 2412

 31525399 GGTAAATTCTACCAAATATTTAAAGATTTTTCTTTTTTTTTGTTGAGACAGAGTCTCACT 31525458
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     2413 GGTAAATTCTACCAAATATTTAAAGATTTTTCTTTTTTTTTGTTGAGGCAGAGTCTCACT 2472

 31525459 CTATTGCCCAGGCTGGAGTACAATGGTG 31525486
          ||||||||||||||||||||||||||||
     2473 CTATTGCCCAGGCTGGAGTACAATGGTG 2500

Alignment time is 2.16929 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31515486,31539389] =>     23904 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    2703] =>      2703 nucs 'mol-32-2b55-014885_2703'

Score:        2703
Aligned:      2703        nucs
Identic:      2703 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31523417,31526119]
 second seq =>  [       1,    2703]

 31523417 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGGTGGGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCCAAC 31523476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGGTGGGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCCAAC 60

 31523477 TAATTTTGTAGTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACT 31523536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAATTTTGTAGTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACT 120

 31523537 CCTGACCTCAGGTGATCTGCCCACCTTGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGAGTGAGT 31523596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCTGACCTCAGGTGATCTGCCCACCTTGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGAGTGAGT 180

 31523597 GCACCTGGCCCACTTTGCTCATTTTCTAATTGGGTTATTCGTTTTCTGGCTATTGAGTTG 31523656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCACCTGGCCCACTTTGCTCATTTTCTAATTGGGTTATTCGTTTTCTGGCTATTGAGTTG 240

 31523657 TTTGAGTTTCTTATTTATTGTGGATGTTACTCCCTTATCAGATGTATGATTTACATATAT 31523716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTTGAGTTTCTTATTTATTGTGGATGTTACTCCCTTATCAGATGTATGATTTACATATAT 300

 31523717 TTTCTGTCACTCTGTGGGTTATCTCTTTACTTTGTTCATTGTTTCCTTTCTGTCCAAAAG 31523776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTCTGTCACTCTGTGGGTTATCTCTTTACTTTGTTCATTGTTTCCTTTCTGTCCAAAAG 360

 31523777 CTTTGTATCTTGTCTAAAATCCCATTTGTCTATTTTTGCTTTTATTTATTTTTATTTTTA 31523836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTTTGTATCTTGTCTAAAATCCCATTTGTCTATTTTTGCTTTTATTTATTTTTATTTTTA 420

 31523837 TTTTTATTTTTTATTTTTTTGAAACGGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGTTGGAGTGCAGT 31523896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTTTTATTTTTTATTTTTTTGAAACGGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGTTGGAGTGCAGT 480

 31523897 GGTGCAATCTCAGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGGAAGTCTCCTACTCCA 31523956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GGTGCAATCTCAGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGGAAGTCTCCTACTCCA 540

 31523957 ACTTCCTGAGTAGCTGGGATTATAGGCGTGTGCCACCATGCCTAGCTAATTTTTGTATTT 31524016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACTTCCTGAGTAGCTGGGATTATAGGCGTGTGCCACCATGCCTAGCTAATTTTTGTATTT 600

 31524017 TTTGGTAGAGACAGGATTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTGTTGAACTCTTGACCTCAGG 31524076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTTGGTAGAGACAGGATTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTGTTGAACTCTTGACCTCAGG 660

 31524077 CAATCCGCCTGACTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACACGTGTGAGCCACCGCGCCTG 31524136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CAATCCGCCTGACTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACACGTGTGAGCCACCGCGCCTG 720

 31524137 GCCTATTTTTGCTTTTATTACCTGTGCTTTTGGGGTCATAGCTAAATAACCATTGCTCAG 31524196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GCCTATTTTTGCTTTTATTACCTGTGCTTTTGGGGTCATAGCTAAATAACCATTGCTCAG 780

 31524197 ATCAATGTCATGGAGCCTTTCCTCTAGGTATTCTTCTAGTTGTTTTACAGTCTCAGATCT 31524256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATCAATGTCATGGAGCCTTTCCTCTAGGTATTCTTCTAGTTGTTTTACAGTCTCAGATCT 840

 31524257 TATATTTAAGACTTTAATCCATTTTGAGTTGATTTTTTATACTGTGTGAGATAAGGATCC 31524316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TATATTTAAGACTTTAATCCATTTTGAGTTGATTTTTTATACTGTGTGAGATAAGGATCC 900

 31524317 AATTTTATTCTTCTGTATGTGGATCCAATTTTCCTAGTACAGTTTATTGAAAAGACTGTC 31524376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AATTTTATTCTTCTGTATGTGGATCCAATTTTCCTAGTACAGTTTATTGAAAAGACTGTC 960

 31524377 TTTTCCCCATTATGTATTAGTAACACCTTTGTCAAAAATCAATTGACTATTAGTGCATGG 31524436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTTTCCCCATTATGTATTAGTAACACCTTTGTCAAAAATCAATTGACTATTAGTGCATGG 1020

 31524437 GTTTATTTCTGGGTTTTCTATCTTGTTACATTAGTCGATGTGTCTATTTTTATGCCAGCA 31524496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GTTTATTTCTGGGTTTTCTATCTTGTTACATTAGTCGATGTGTCTATTTTTATGCCAGCA 1080

 31524497 CCATACTGTTTTGATTATATTAGCTTTATAATATATTTTGAAATCAGGGACTGTGATGTC 31524556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CCATACTGTTTTGATTATATTAGCTTTATAATATATTTTGAAATCAGGGACTGTGATGTC 1140

 31524557 TTTAGCTTTGTTCTTTTTGCTCAAGATTGTTTTGGCTAGCCAGGGTCTTTTATGATTGCA 31524616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTTAGCTTTGTTCTTTTTGCTCAAGATTGTTTTGGCTAGCCAGGGTCTTTTATGATTGCA 1200

 31524617 TATGAATTTAAGGATTGTTTTATTTCTATAAGAAATGACATTGGAATTTTGATAGGGACT 31524676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TATGAATTTAAGGATTGTTTTATTTCTATAAGAAATGACATTGGAATTTTGATAGGGACT 1260

 31524677 GCATTGAATCTGTAGATTGCTTTGGGTAGTATGAATATTTTAATAATATTAATTCTTCTA 31524736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GCATTGAATCTGTAGATTGCTTTGGGTAGTATGAATATTTTAATAATATTAATTCTTCTA 1320

 31524737 ATTTATCAACACAAGATAGCTTTCCATTTATTTGTGTTTTCTTAAACAATGTTTTAGTTT 31524796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ATTTATCAACACAAGATAGCTTTCCATTTATTTGTGTTTTCTTAAACAATGTTTTAGTTT 1380

 31524797 CCAGTGTACAGATCTTTTAACTTCTTGGTTAAATTTACCCCTAAGTATTTTATTTTATTT 31524856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CCAGTGTACAGATCTTTTAACTTCTTGGTTAAATTTACCCCTAAGTATTTTATTTTATTT 1440

 31524857 TAAAATACCTGGCTAATTTTGTATTTAATTTTATATTGTATTTATTTTATTTGTAATAAA 31524916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TAAAATACCTGGCTAATTTTGTATTTAATTTTATATTGTATTTATTTTATTTGTAATAAA 1500

 31524917 ATTAAGCATTTTATTTTATTTTAAAATACCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACAG 31524976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATTAAGCATTTTATTTTATTTTAAAATACCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACAG 1560

 31524977 GGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCAGACCTCAGGTGATCCGACTGCCT 31525036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCAGACCTCAGGTGATCCGACTGCCT 1620

 31525037 CGGCCTCCCAAAGTGCTGGTATTAGAAGCATGAGCCACTGCCCACTGCACCTAGCTGAAA 31525096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CGGCCTCCCAAAGTGCTGGTATTAGAAGCATGAGCCACTGCCCACTGCACCTAGCTGAAA 1680

 31525097 ACCACACTTTCTGTTGATTAAATAATATTTCACCTTATGGAGTTACAAATTTTCATTTTA 31525156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ACCACACTTTCTGTTGATTAAATAATATTTCACCTTATGGAGTTACAAATTTTCATTTTA 1740

 31525157 TGGGGTTATAATCACTTACTTAGCTTGTTATCTTTTGTTGGACATTAATGTGGTTTCTAA 31525216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGGGGTTATAATCACTTACTTAGCTTGTTATCTTTTGTTGGACATTAATGTGGTTTCTAA 1800

 31525217 CTTTTCATTATCAAAAAATAAAAGAAAATGGACAAAACCTCAGAAAGACACAAACTACTA 31525276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CTTTTCATTATCAAAAAATAAAAGAAAATGGACAAAACCTCAGAAAGACACAAACTACTA 1860

 31525277 AAGCTGACTTAATAAGAAATAGAAAATCTGAATATATAGAAAATCTGAATGTAACAAGTA 31525336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AAGCTGACTTAATAAGAAATAGAAAATCTGAATATATAGAAAATCTGAATGTAACAAGTA 1920

 31525337 AGGAGATTGGATTAGTAATAAAATTTCCCACAAAGAGAAGTACACATTCAGATGGTTTCA 31525396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AGGAGATTGGATTAGTAATAAAATTTCCCACAAAGAGAAGTACACATTCAGATGGTTTCA 1980

 31525397 CTGGTAAATTCTACCAAATATTTAAAGATTTTTCTTTTTTTTTGTTGAGACAGAGTCTCA 31525456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CTGGTAAATTCTACCAAATATTTAAAGATTTTTCTTTTTTTTTGTTGAGACAGAGTCTCA 2040

 31525457 CTCTATTGCCCAGGCTGGAGTACAATGGTGTGATCTTGACTCACTGCAACCTCTGCCTCC 31525516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CTCTATTGCCCAGGCTGGAGTACAATGGTGTGATCTTGACTCACTGCAACCTCTGCCTCC 2100

 31525517 GGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACC 31525576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACC 2160

 31525577 ACCATGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCACATTGGCTAGG 31525636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ACCATGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCACATTGGCTAGG 2220

 31525637 CTGGTCTCGAACTCCCAACCTCGTGATCCGCCCACCATGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATT 31525696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CTGGTCTCGAACTCCCAACCTCGTGATCCGCCCACCATGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATT 2280

 31525697 ACAGGCGTGAGCCACCACACCTGGCTAAAGAATTAATGTCAATTGCTCACAAACTCTTCC 31525756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 ACAGGCGTGAGCCACCACACCTGGCTAAAGAATTAATGTCAATTGCTCACAAACTCTTCC 2340

 31525757 AAAAGAGTTCTCTATGAGGCCAGTATTACCTTGATACCAAAACCAGATAAAGATATCACA 31525816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AAAAGAGTTCTCTATGAGGCCAGTATTACCTTGATACCAAAACCAGATAAAGATATCACA 2400

 31525817 GGAAAATAAAACTGTAGACCAAATATTTTTATGAATATAGATACAAAAATCTTCAAAATA 31525876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GGAAAATAAAACTGTAGACCAAATATTTTTATGAATATAGATACAAAAATCTTCAAAATA 2460

 31525877 CTAGCAAATTGAAACCAACAACATATGAAAATGATTATACACCATGACCAAGTAAGATTT 31525936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CTAGCAAATTGAAACCAACAACATATGAAAATGATTATACACCATGACCAAGTAAGATTT 2520

 31525937 ATCCCAGGAATGCAAAGTTGGCTAAATATCCAAAATCAATTAATGTAATACACCATATTA 31525996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 ATCCCAGGAATGCAAAGTTGGCTAAATATCCAAAATCAATTAATGTAATACACCATATTA 2580

 31525997 ACTGAATAAAAAACAAAAGCCATATGATTATGCCAATAGATGCAAAAAGAGCATTTAACA 31526056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 ACTGAATAAAAAACAAAAGCCATATGATTATGCCAATAGATGCAAAAAGAGCATTTAACA 2640

 31526057 AAATTGAACACCGTTTTCTGATTGAAACACCCAATAAACTAGAAATAGAAACTCCTTCAA 31526116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 AAATTGAACACCGTTTTCTGATTGAAACACCCAATAAACTAGAAATAGAAACTCCTTCAA 2700

 31526117 CCT 31526119
          |||
     2701 CCT 2703

Alignment time is 2.06783 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31515486,31539389] =>     23904 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    3582] =>      3582 nucs 'mol-32-2b55-156647_3582'

Score:        3521
Aligned:      3585        nucs
Identic:      3571 (100%) nucs =>       792 (100%)      2779 (100%)
Gaps:           12 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31524693,31525486] EXCISED REGION [31529390,31532180]
 second seq =>  [       1,     794] EXCISED REGION [     804,    3582]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3903 nucs [31525487,31529389]
 second seq =>         9 nucs [795,803]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31524693 TTGCTTTGGGTAGTATGAATATTTTAATAATATTAATTCTTCTAATTTATCAACACAAGA 31524752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTGCTTTGGGTAGTATGAATATTTTAATAATATTAATTCTTCTAATTTATCAACACAAGA 60

 31524753 TAGCTTTCCATTTATTTGTGTTTTCTTAAACAATGTTTTAGTTTCCAGTGTACAGATCTT 31524812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAGCTTTCCATTTATTTGTGTTTTCTTAAACAATGTTTTAGTTTCCAGTGTACAGATCTT 120

 31524813 TTAACTTCTTGGTTAAATTTACCCCTAAGTATTTTATTTTATTTTAAAATACCTGGCTAA 31524872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTAACTTCTTGGTTAAATTTACCCCTAAGTATTTTATTTTATTTTAAAATACCTGGCTAA 180

 31524873 TTTTGTATTTAATTTTATATTGTATTTATTTTATTTGTAATAAAATTAAGCATTTTATTT 31524932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTTTGTATTTAATTTTATATTGTATTTATTTTATTTGTAATAAAATTAAGCATTTTATTT 240

 31524933 TATTTTAAAATACCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGG 31524992
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
      241 TATTTTAAAATACCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGATAGGGTTTCTCCATGTTGG 300

 31524993 TCAGGCTGGTCTCGAACTCCAGACCTCAGGTGATCCGACTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGC 31525052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCAGGCTGGTCTCGAACTCCAGACCTCAGGTGATCCGACTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGC 360

 31525053 TGGTATTAGAAGCATGAGCCACTGCCCACTGCACCTAGCTGAAAACCACACTTTCTGTTG 31525112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGGTATTAGAAGCATGAGCCACTGCCCACTGCACCTAGCTGAAAACCACACTTTCTGTTG 420

 31525113 ATTAAATAATATTTCACCTTATGGAGTTACAAATTTTCATTTTATGGGGTTATAATCACT 31525172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATTAAATAATATTTCACCTTATGGAGTTACAAATTTTCATTTTATGGGGTTATAATCACT 480

 31525173 TACTTAGCTTGTTATCTTTTGTTGGACATTAATGTGGTTTCTAACTTTTCATTATCAAAA 31525232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TACTTAGCTTGTTATCTTTTGTTGGACATTAATGTGGTTTCTAACTTTTCATTATCAAAA 540

 31525233 AATAAAAGAAAATGGACAAAACCTCAGAAAGACACAAACTACTAAAGCTGACTTAATAAG 31525292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AATAAAAGAAAATGGACAAAACCTCAGAAAGACACAAACTACTAAAGCTGACTTAATAAG 600

 31525293 AAATAGAAAATCTGAATATATAGAAAATCTGAATGTAACAAGTAAGGAGATTGGATTAGT 31525352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAATAGAAAATCTGAATATATAGAAAATCTGAATGTAACAAGTAAGGAGATTGGATTAGT 660

 31525353 AATAAAATTTCCCACAAAGAGAAGTACACATTCAGATGGTTTCACTGGTAAATTCTACCA 31525412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AATAAAATTTCCCACAAAGAGAAGTACACATTCAGATGGTTTCACTGGTAAATTCTACCA 720

 31525413 AATATTTAAAGATTTTTCTTTTTTTTTGTTGAGACAGAGTCTCACTCTATTGCCCAGGCT 31525472
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
      721 AATATTTAAAGATTTTTCTTTTTTTTTGTTGAGGCAGAGTCTCACTCTATTGCCCAGGCT 780

 31525473 GGAGTACAATGGTG 31525486
          ||||||||||||||
      781 GGAGTACAATGGTG 794

EXCISED REGION

 31529390 AATACTGTGCTAAGTGAAAGAAGCCAACCACAAAATACCATATATTGTGTGATTCTGCTT 31529449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      804 AATACTGTGCTAAGTGAAAGAAGCCAACCACAAAATACCATATATTGTGTGATTCTGCTT 863

 31529450 AAATGACATGTCCAGAATGTCCATATTAAAGTAGATTAGTGGTTTCCTGAGGCTGGGGGA 31529509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      864 AAATGACATGTCCAGAATGTCCATATTAAAGTAGATTAGTGGTTTCCTGAGGCTGGGGGA 923

 31529510 GGGAGTTGGGGAAATTGCGTAGTGACTACTGGGTAAAGAGTTTCTTTCTGGGGTGATGAA 31529569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      924 GGGAGTTGGGGAAATTGCGTAGTGACTACTGGGTAAAGAGTTTCTTTCTGGGGTGATGAA 983

 31529570 ATGGTCTAAAATAGAATGTGGTGGTGGTTGCACAGCTCTGAAAATACTAAAAACCATTGA 31529629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      984 ATGGTCTAAAATAGAATGTGGTGGTGGTTGCACAGCTCTGAAAATACTAAAAACCATTGA 1043

 31529630 ATGAGCACTTTAAATTGGTAAATTTTTATGTGAATTATGATTCAATAAAGTTGTGTTTAG 31529689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1044 ATGAGCACTTTAAATTGGTAAATTTTTATGTGAATTATGATTCAATAAAGTTGTGTTTAG 1103

 31529690 ATATTACTAAAAATGATGGTACAAATATTCTTTTTCACAAATGTTTTTTGTTGTTGTTTA 31529749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1104 ATATTACTAAAAATGATGGTACAAATATTCTTTTTCACAAATGTTTTTTGTTGTTGTTTA 1163

 31529750 TAGTTGTTTATTTGTACATCTAGTAATTTGTCCCAAGGAAAGAGTATGTAAAAGAACATA 31529809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1164 TAGTTGTTTATTTGTACATCTAGTAATTTGTCCCAAGGAAAGAGTATGTAAAAGAACATA 1223

 31529810 AGTCACTTTAAGGCCTTTAATGTATACTACAAAATTGCACTCTAGAAGGTTTATACAGTT 31529869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1224 AGTCACTTTAAGGCCTTTAATGTATACTACAAAATTGCACTCTAGAAGGTTTATACAGTT 1283

 31529870 TTGCATTTCATTAGCCTGTTTTTTTTATCTTTGACAACCTAAAGAATTTATTAGTGGTAT 31529929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1284 TTGCATTTCATTAGCCTGTTTTTTTTATCTTTGACAACCTAAAGAATTTATTAGTGGTAT 1343

 31529930 TCATCTGAGGATCCTCTAGGTCTATCAGAGTGTCTTTCTTATAGAAGGCATTCAATAAAT 31529989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1344 TCATCTGAGGATCCTCTAGGTCTATCAGAGTGTCTTTCTTATAGAAGGCATTCAATAAAT 1403

 31529990 AAATGTCCTAAGTGAGCAAAACATTTTTGGTTGATTTTTAGGTGCAAATGGTTTCTTTTG 31530049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1404 AAATGTCCTAAGTGAGCAAAACATTTTTGGTTGATTTTTAGGTGCAAATGGTTTCTTTTG 1463

 31530050 ATTTTAATTAAGATGCCTTTGTTTATTAGTGATGTTGACATATTTTCTTAATCTATTGGC 31530109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1464 ATTTTAATTAAGATGCCTTTGTTTATTAGTGATGTTGACATATTTTCTTAATCTATTGGC 1523

 31530110 TTTGTATAACTTTATGAATTGTCTCTTCATGTCCTTTGCCTACTTTTCTATTGTGGTAAC 31530169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1524 TTTGTATAACTTTATGAATTGTCTCTTCATGTCCTTTGCCTACTTTTCTATTGTGGTAAC 1583

 31530170 TATCTTTTATAAATGTTGTATAATTATTTAAAAATACATTAGGTTGGGCATGGTAGATCA 31530229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1584 TATCTTTTATAAATGTTGTATAATTATTTAAAAATACATTAGGTTGGGCATGGTAGATCA 1643

 31530230 TGCCTGTAATCCCAGCTCTCTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATTGCTTGAGCCTAACAGTT 31530289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1644 TGCCTGTAATCCCAGCTCTCTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATTGCTTGAGCCTAACAGTT 1703

 31530290 CGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCCATCTCTAAAAAAAAAAACCAATAAAAAT 31530349
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
     1704 CGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCCATCTCT-AAAAAAAAAACCAATAAAAAT 1762

 31530350 ATATTAAAAGATTAACTGATTGTCTATCATATGGATTACAAATATCCCCCCCAATTTGTC 31530409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1763 ATATTAAAAGATTAACTGATTGTCTATCATATGGATTACAAATATCCCCCCCAATTTGTC 1822

 31530410 ATTTGCTTGTTAATTTTATTTATGATGACTTAAAAATTACAATATATTTTTTGGTGTTCA 31530469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1823 ATTTGCTTGTTAATTTTATTTATGATGACTTAAAAATTACAATATATTTTTTGGTGTTCA 1882

 31530470 AGTCAGTTTTTGTCCCCATTGTGATATTTTCCTTTGCCTGTTTATCACTTTCTTAGAGAA 31530529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1883 AGTCAGTTTTTGTCCCCATTGTGATATTTTCCTTTGCCTGTTTATCACTTTCTTAGAGAA 1942

 31530530 AAGATAAATACTGATTCGTTCTTTTGTAGGTGTTTTATGATTTCATTGAAAATAAAATCT 31530589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1943 AAGATAAATACTGATTCGTTCTTTTGTAGGTGTTTTATGATTTCATTGAAAATAAAATCT 2002

 31530590 TCAACGCATCTAGTATTCATTTGGGTGTAAGATAAAAGATAACAACGTAGGTTTCTCTTA 31530649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2003 TCAACGCATCTAGTATTCATTTGGGTGTAAGATAAAAGATAACAACGTAGGTTTCTCTTA 2062

 31530650 TAGTTCATCAGGTATCCTACTACTGTTTATTGAGTCATGTTTTCTGTTACCACTCTTACT 31530709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2063 TAGTTCATCAGGTATCCTACTACTGTTTATTGAGTCATGTTTTCTGTTACCACTCTTACT 2122

 31530710 ATATACCAGTTTTACATACATTTGGGTTGGTTTCTGAGCTTTCTATTGTCTTCCATTGCT 31530769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2123 ATATACCAGTTTTACATACATTTGGGTTGGTTTCTGAGCTTTCTATTGTCTTCCATTGCT 2182

 31530770 TTGTTTAAAATTTAAAGTTTATTATTCTGACTTTCCATACTTGAATATGGTCGAATAAGT 31530829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2183 TTGTTTAAAATTTAAAGTTTATTATTCTGACTTTCCATACTTGAATATGGTCGAATAAGT 2242

 31530830 CCTCCTTTATTAATCTTGTTTTATTTAAAAATGGTCATTTTCACTCATTTTCCAGTTCAG 31530889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2243 CCTCCTTTATTAATCTTGTTTTATTTAAAAATGGTCATTTTCACTCATTTTCCAGTTCAG 2302

 31530890 TAGTTTTATTCTCTCAGTGTAATGTGATTTATCACCCCATTGCTCACCCTATTCATCTCC 31530949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2303 TAGTTTTATTCTCTCAGTGTAATGTGATTTATCACCCCATTGCTCACCCTATTCATCTCC 2362

 31530950 CAATACCCAGCTGAAAAACTTTAGAAGACTGAGGCTCTTGCCCTGGCCCCATCACTTTCT 31531009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2363 CAATACCCAGCTGAAAAACTTTAGAAGACTGAGGCTCTTGCCCTGGCCCCATCACTTTCT 2422

 31531010 AGCTATGTGGGCTTAGGCTAGTTATTGAACATGTCTGACTCTCACTTTTCTCCTCTGTAA 31531069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2423 AGCTATGTGGGCTTAGGCTAGTTATTGAACATGTCTGACTCTCACTTTTCTCCTCTGTAA 2482

 31531070 GTCAGTGAGAATTATATACTTCTTATAAGGTTGTGAGGTTCAAATGGAATAATGTGTACA 31531129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2483 GTCAGTGAGAATTATATACTTCTTATAAGGTTGTGAGGTTCAAATGGAATAATGTGTACA 2542

 31531130 GAGGCACTTGGTAAACAATGTAGTCATATGCAAGTCATATGCAAGTCATATGTAGTCAGC 31531189
          |||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||
     2543 GAGGCACTTGGTAAACAATGT-----------AGTCATATGCAAGTCATATGTAGTCAGC 2591

 31531190 TTGGTGAATTTTGAGAAAGTAAATGCAAGTTCTTTTTATGGTTTTACCTAAGGGGCCAGT 31531249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2592 TTGGTGAATTTTGAGAAAGTAAATGCAAGTTCTTTTTATGGTTTTACCTAAGGGGCCAGT 2651

 31531250 GAGGGCCAGAGAAGTGCCGGGACCTATGTAAGGTCGCAAGCAAGTTCATGTGGAATGCAT 31531309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2652 GAGGGCCAGAGAAGTGCCGGGACCTATGTAAGGTCGCAAGCAAGTTCATGTGGAATGCAT 2711

 31531310 CTAGAACTAGAACGCTAGCCTGTGTCCCAGGGCCCTTCCAACTGGGCTCTGCTGCCTGCA 31531369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2712 CTAGAACTAGAACGCTAGCCTGTGTCCCAGGGCCCTTCCAACTGGGCTCTGCTGCCTGCA 2771

 31531370 GTCCTGGGTGCCTTCTAATTAGCCTGTGTAGTGGTCTTGGTAAAAGTGTTTCTCCTGTAC 31531429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2772 GTCCTGGGTGCCTTCTAATTAGCCTGTGTAGTGGTCTTGGTAAAAGTGTTTCTCCTGTAC 2831

 31531430 TGTCCCCTATAGGTTGTGGCTGGCCATACCATTTCCCTGGTTCCCCCCACGCTCCTGATG 31531489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2832 TGTCCCCTATAGGTTGTGGCTGGCCATACCATTTCCCTGGTTCCCCCCACGCTCCTGATG 2891

 31531490 ACCTGGAAAGGCCATTTGAATAGTGTGGCAGACATCCTGTATGTGGACAACTTCCAGCTG 31531549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2892 ACCTGGAAAGGCCATTTGAATAGTGTGGCAGACATCCTGTATGTGGACAACTTCCAGCTG 2951

 31531550 GTTATCAGCGCTGGCCAGGACCGGGACGTCAAGGCTTGGAAACTCTCCGGTGATGCCATT 31531609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2952 GTTATCAGCGCTGGCCAGGACCGGGACGTCAAGGCTTGGAAACTCTCCGGTGATGCCATT 3011

 31531610 GGTATGGGTCCTGCTGAAGCTCAGCCATGCCCATGGCCCTTCTTGTCTCTGTCCCTGTCT 31531669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3012 GGTATGGGTCCTGCTGAAGCTCAGCCATGCCCATGGCCCTTCTTGTCTCTGTCCCTGTCT 3071

 31531670 GAACATAAGCTGGTATGAACTTTGTACTCTGTGGGGAGGGACTCTCAGGCCACAGCAACT 31531729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3072 GAACATAAGCTGGTATGAACTTTGTACTCTGTGGGGAGGGACTCTCAGGCCACAGCAACT 3131

 31531730 GCCTTCACTTAAATAATATTACAGTCTGTCCAATTATCCATTCAGCAAACGGTCCATCCA 31531789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3132 GCCTTCACTTAAATAATATTACAGTCTGTCCAATTATCCATTCAGCAAACGGTCCATCCA 3191

 31531790 TTCACCCATCCACCCAATATTATTCACCTATGTATATTTTTGCAAATCATATATCTGATA 31531849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3192 TTCACCCATCCACCCAATATTATTCACCTATGTATATTTTTGCAAATCATATATCTGATA 3251

 31531850 AAGCATATTCCTTTCTCTTTTAAAAAATAAACTTAATTGTTGCATTGTATATAAAGAAAA 31531909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3252 AAGCATATTCCTTTCTCTTTTAAAAAATAAACTTAATTGTTGCATTGTATATAAAGAAAA 3311

 31531910 ACATACAAACCAGAAGGGTTCAGCTTGGTGAATTTTGAGAAAGTAAATACATACCCATAT 31531969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3312 ACATACAAACCAGAAGGGTTCAGCTTGGTGAATTTTGAGAAAGTAAATACATACCCATAT 3371

 31531970 AGCCACCGTTCATGTCAAGAAATAATTAGGGCCAGGCGCGGTGGCTCACTACTGTAATCC 31532029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3372 AGCCACCGTTCATGTCAAGAAATAATTAGGGCCAGGCGCGGTGGCTCACTACTGTAATCC 3431

 31532030 CAACACTTTTTTGTCCCCTTTTCCTCCTGTGCTGTCTTCCTATGTGTTTGTTTGTTTGTT 31532089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3432 CAACACTTTTTTGTCCCCTTTTCCTCCTGTGCTGTCTTCCTATGTGTTTGTTTGTTTGTT 3491

 31532090 TTAGTGACCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGTGCATGCCTGT 31532149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3492 TTAGTGACCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGTGCATGCCTGT 3551

 31532150 AATCCCAGCTACTTGAGAGGCTGAGGCAGGA 31532180
          |||||||||||||||||||||||||||||||
     3552 AATCCCAGCTACTTGAGAGGCTGAGGCAGGA 3582

Alignment time is 3.09506 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31515486,31539389] =>     23904 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    4502] =>      4502 nucs 'mol-32-2e15-087834_4502'

Score:        4478
Aligned:      4478        nucs
Identic:      4478 (100%) nucs =>      1209 (100%)      3269 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31521790,31522998] EXCISED REGION [31522999,31526267]
 second seq =>  [       1,    1209] EXCISED REGION [    1234,    4502]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        24 nucs [1210,1233]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        25 nucs [1210,1234] to [1234,1258]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        12 nucs [1210,1221] to [1222,1233]

 31521790 CAATCAATCAAATCAAAGCAAATCAAAAACTTTTTTTTTTTTTTTGTAGAGATGAGGTCT 31521849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CAATCAATCAAATCAAAGCAAATCAAAAACTTTTTTTTTTTTTTTGTAGAGATGAGGTCT 60

 31521850 ATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAGGAATCCTCCTGCCTTGACCTCCC 31521909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAGGAATCCTCCTGCCTTGACCTCCC 120

 31521910 AAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGTGCCCAGCCCTTTCTACTTCTATGAGTTT 31521969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGTGCCCAGCCCTTTCTACTTCTATGAGTTT 180

 31521970 GACTTTTTATAATTCCATATATAAATACAATCATGCAGTATTTTTCTTTCATGACTGGCT 31522029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GACTTTTTATAATTCCATATATAAATACAATCATGCAGTATTTTTCTTTCATGACTGGCT 240

 31522030 TATTTCACTTACCATAATGTCTTCCAGATTAATCTATGTTGTCCCAAATGACAGGATTTT 31522089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TATTTCACTTACCATAATGTCTTCCAGATTAATCTATGTTGTCCCAAATGACAGGATTTT 300

 31522090 TTTTCTCTTTTAAGGCTGAATAGTATTCCATTATGTATATACACCACATTTGCATTATCC 31522149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTTCTCTTTTAAGGCTGAATAGTATTCCATTATGTATATACACCACATTTGCATTATCC 360

 31522150 ATTCATCCACTGATGGCCCCTTAGGTTGATTCTATATCTTGGCTATTGTGAAAAGTGCTG 31522209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATTCATCCACTGATGGCCCCTTAGGTTGATTCTATATCTTGGCTATTGTGAAAAGTGCTG 420

 31522210 CAATGAACATGGGAGTGCAGGTATTTCTTTGACATATTGATATGACATATTGATCTCTTT 31522269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CAATGAACATGGGAGTGCAGGTATTTCTTTGACATATTGATATGACATATTGATCTCTTT 480

 31522270 TGGATATATACCCAGAAGTGGAATTGCTAGATCATATAGTAGTTCTAATTTTAGTTTTTT 31522329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGGATATATACCCAGAAGTGGAATTGCTAGATCATATAGTAGTTCTAATTTTAGTTTTTT 540

 31522330 GAGGAAACCCCATACTATTTCTCGTAGTGGTTGATATGGTTTGGTTGTGTCCCCACACAA 31522389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GAGGAAACCCCATACTATTTCTCGTAGTGGTTGATATGGTTTGGTTGTGTCCCCACACAA 600

 31522390 ATCTCATCTTGAATTGTAGCTCTCATAATCCCCAGCTGTCGTGGGAGGGACCTGGTGGGA 31522449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATCTCATCTTGAATTGTAGCTCTCATAATCCCCAGCTGTCGTGGGAGGGACCTGGTGGGA 660

 31522450 GGTAATTGAATCGTGGGGGTGGGTTTTTCCCACCATTCTAATGATAGTGAATAAGTCTCA 31522509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGTAATTGAATCGTGGGGGTGGGTTTTTCCCACCATTCTAATGATAGTGAATAAGTCTCA 720

 31522510 AGAGATATGATGGCTTTATAAAGGGCAGTTCCCCTGCTCATGCTCTCTTGCCTGCTCCCA 31522569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGAGATATGATGGCTTTATAAAGGGCAGTTCCCCTGCTCATGCTCTCTTGCCTGCTCCCA 780

 31522570 TGTAAGACGTGCCTTTGCTCCTCTTTCACCTCTGCCATGATTGTGAGGCCTCCCCAGCCA 31522629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGTAAGACGTGCCTTTGCTCCTCTTTCACCTCTGCCATGATTGTGAGGCCTCCCCAGCCA 840

 31522630 TGTGGAACTGTGAGTCCATTAAACCTTTACTTTATAAATTACCCAGTCTCGGATATGTCT 31522689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGTGGAACTGTGAGTCCATTAAACCTTTACTTTATAAATTACCCAGTCTCGGATATGTCT 900

 31522690 TTATTAGCAGCATGAGAACAGACCAATACAGTGGTTGTACTGATTTACATTCCCTCCAAC 31522749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTATTAGCAGCATGAGAACAGACCAATACAGTGGTTGTACTGATTTACATTCCCTCCAAC 960

 31522750 ATTGTACAAGGGTTTTCTTTTTTCTGCCTCCTCACCAACACTTGTTTCTTGTCTTTTTGA 31522809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATTGTACAAGGGTTTTCTTTTTTCTGCCTCCTCACCAACACTTGTTTCTTGTCTTTTTGA 1020

 31522810 TAACATCTAATCTAACAGATGTAAGATGATATCTCATTGTGGTTTAATTTGTTTTTCCTA 31522869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TAACATCTAATCTAACAGATGTAAGATGATATCTCATTGTGGTTTAATTTGTTTTTCCTA 1080

 31522870 ATGATTAGTGGTGCTCAGCATTTTTTTTCTTGAACCTGTTGGCCATTTGAATGTCTTCTT 31522929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATGATTAGTGGTGCTCAGCATTTTTTTTCTTGAACCTGTTGGCCATTTGAATGTCTTCTT 1140

 31522930 TTGAGAAATGTCTCTTTGGATGCTTTCTCCATTTTCTCTTCTCTTCTCTTTTCTTTCTTT 31522989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTGAGAAATGTCTCTTTGGATGCTTTCTCCATTTTCTCTTCTCTTCTCTTTTCTTTCTTT 1200

 31522990 CTTTCTTTC 31522998
          |||||||||
     1201 CTTTCTTTC 1209

EXCISED REGION

 31522999 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGCGTTTTGCTCTTGTTGCCCGGGCTGGAG 31523058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1234 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGCGTTTTGCTCTTGTTGCCCGGGCTGGAG 1293

 31523059 TGCATTGATCCAATCTTGGCTCACTGCAACCCCCGCCTCCCGGGTTCAAGCAATTCTCCC 31523118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1294 TGCATTGATCCAATCTTGGCTCACTGCAACCCCCGCCTCCCGGGTTCAAGCAATTCTCCC 1353

 31523119 GCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGTGATTACAGGCACAGGCTACCACACCCGGCTAATTTTG 31523178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1354 GCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGTGATTACAGGCACAGGCTACCACACCCGGCTAATTTTG 1413

 31523179 TATTTTCAGTAGAGACGAGGTGTCACCTTGTTGGTCAGGCTGGTCCCGAACTCCTGACCT 31523238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1414 TATTTTCAGTAGAGACGAGGTGTCACCTTGTTGGTCAGGCTGGTCCCGAACTCCTGACCT 1473

 31523239 CAAGTGATCTGCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCA 31523298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1474 CAAGTGATCTGCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCA 1533

 31523299 CCTGGCCACTTTGCCTATTTTATTTTATTTTGAGATGGAGTTTTGCTCTTATTGCCCAGA 31523358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1534 CCTGGCCACTTTGCCTATTTTATTTTATTTTGAGATGGAGTTTTGCTCTTATTGCCCAGA 1593

 31523359 CTGGAGTGCAATGGCGCAATTGCAGCTCACCACAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCAAT 31523418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1594 CTGGAGTGCAATGGCGCAATTGCAGCTCACCACAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCAAT 1653

 31523419 TCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGGTGGGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCCAACTA 31523478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1654 TCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGGTGGGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCCAACTA 1713

 31523479 ATTTTGTAGTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCC 31523538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1714 ATTTTGTAGTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCC 1773

 31523539 TGACCTCAGGTGATCTGCCCACCTTGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGAGTGAGTGC 31523598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1774 TGACCTCAGGTGATCTGCCCACCTTGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGAGTGAGTGC 1833

 31523599 ACCTGGCCCACTTTGCTCATTTTCTAATTGGGTTATTCGTTTTCTGGCTATTGAGTTGTT 31523658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1834 ACCTGGCCCACTTTGCTCATTTTCTAATTGGGTTATTCGTTTTCTGGCTATTGAGTTGTT 1893

 31523659 TGAGTTTCTTATTTATTGTGGATGTTACTCCCTTATCAGATGTATGATTTACATATATTT 31523718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1894 TGAGTTTCTTATTTATTGTGGATGTTACTCCCTTATCAGATGTATGATTTACATATATTT 1953

 31523719 TCTGTCACTCTGTGGGTTATCTCTTTACTTTGTTCATTGTTTCCTTTCTGTCCAAAAGCT 31523778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1954 TCTGTCACTCTGTGGGTTATCTCTTTACTTTGTTCATTGTTTCCTTTCTGTCCAAAAGCT 2013

 31523779 TTGTATCTTGTCTAAAATCCCATTTGTCTATTTTTGCTTTTATTTATTTTTATTTTTATT 31523838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2014 TTGTATCTTGTCTAAAATCCCATTTGTCTATTTTTGCTTTTATTTATTTTTATTTTTATT 2073

 31523839 TTTATTTTTTATTTTTTTGAAACGGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGTTGGAGTGCAGTGG 31523898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2074 TTTATTTTTTATTTTTTTGAAACGGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGTTGGAGTGCAGTGG 2133

 31523899 TGCAATCTCAGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGGAAGTCTCCTACTCCAAC 31523958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2134 TGCAATCTCAGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGGAAGTCTCCTACTCCAAC 2193

 31523959 TTCCTGAGTAGCTGGGATTATAGGCGTGTGCCACCATGCCTAGCTAATTTTTGTATTTTT 31524018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2194 TTCCTGAGTAGCTGGGATTATAGGCGTGTGCCACCATGCCTAGCTAATTTTTGTATTTTT 2253

 31524019 TGGTAGAGACAGGATTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTGTTGAACTCTTGACCTCAGGCA 31524078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2254 TGGTAGAGACAGGATTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTGTTGAACTCTTGACCTCAGGCA 2313

 31524079 ATCCGCCTGACTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACACGTGTGAGCCACCGCGCCTGGC 31524138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2314 ATCCGCCTGACTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACACGTGTGAGCCACCGCGCCTGGC 2373

 31524139 CTATTTTTGCTTTTATTACCTGTGCTTTTGGGGTCATAGCTAAATAACCATTGCTCAGAT 31524198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2374 CTATTTTTGCTTTTATTACCTGTGCTTTTGGGGTCATAGCTAAATAACCATTGCTCAGAT 2433

 31524199 CAATGTCATGGAGCCTTTCCTCTAGGTATTCTTCTAGTTGTTTTACAGTCTCAGATCTTA 31524258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2434 CAATGTCATGGAGCCTTTCCTCTAGGTATTCTTCTAGTTGTTTTACAGTCTCAGATCTTA 2493

 31524259 TATTTAAGACTTTAATCCATTTTGAGTTGATTTTTTATACTGTGTGAGATAAGGATCCAA 31524318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2494 TATTTAAGACTTTAATCCATTTTGAGTTGATTTTTTATACTGTGTGAGATAAGGATCCAA 2553

 31524319 TTTTATTCTTCTGTATGTGGATCCAATTTTCCTAGTACAGTTTATTGAAAAGACTGTCTT 31524378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2554 TTTTATTCTTCTGTATGTGGATCCAATTTTCCTAGTACAGTTTATTGAAAAGACTGTCTT 2613

 31524379 TTCCCCATTATGTATTAGTAACACCTTTGTCAAAAATCAATTGACTATTAGTGCATGGGT 31524438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2614 TTCCCCATTATGTATTAGTAACACCTTTGTCAAAAATCAATTGACTATTAGTGCATGGGT 2673

 31524439 TTATTTCTGGGTTTTCTATCTTGTTACATTAGTCGATGTGTCTATTTTTATGCCAGCACC 31524498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2674 TTATTTCTGGGTTTTCTATCTTGTTACATTAGTCGATGTGTCTATTTTTATGCCAGCACC 2733

 31524499 ATACTGTTTTGATTATATTAGCTTTATAATATATTTTGAAATCAGGGACTGTGATGTCTT 31524558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2734 ATACTGTTTTGATTATATTAGCTTTATAATATATTTTGAAATCAGGGACTGTGATGTCTT 2793

 31524559 TAGCTTTGTTCTTTTTGCTCAAGATTGTTTTGGCTAGCCAGGGTCTTTTATGATTGCATA 31524618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2794 TAGCTTTGTTCTTTTTGCTCAAGATTGTTTTGGCTAGCCAGGGTCTTTTATGATTGCATA 2853

 31524619 TGAATTTAAGGATTGTTTTATTTCTATAAGAAATGACATTGGAATTTTGATAGGGACTGC 31524678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2854 TGAATTTAAGGATTGTTTTATTTCTATAAGAAATGACATTGGAATTTTGATAGGGACTGC 2913

 31524679 ATTGAATCTGTAGATTGCTTTGGGTAGTATGAATATTTTAATAATATTAATTCTTCTAAT 31524738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2914 ATTGAATCTGTAGATTGCTTTGGGTAGTATGAATATTTTAATAATATTAATTCTTCTAAT 2973

 31524739 TTATCAACACAAGATAGCTTTCCATTTATTTGTGTTTTCTTAAACAATGTTTTAGTTTCC 31524798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2974 TTATCAACACAAGATAGCTTTCCATTTATTTGTGTTTTCTTAAACAATGTTTTAGTTTCC 3033

 31524799 AGTGTACAGATCTTTTAACTTCTTGGTTAAATTTACCCCTAAGTATTTTATTTTATTTTA 31524858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3034 AGTGTACAGATCTTTTAACTTCTTGGTTAAATTTACCCCTAAGTATTTTATTTTATTTTA 3093

 31524859 AAATACCTGGCTAATTTTGTATTTAATTTTATATTGTATTTATTTTATTTGTAATAAAAT 31524918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3094 AAATACCTGGCTAATTTTGTATTTAATTTTATATTGTATTTATTTTATTTGTAATAAAAT 3153

 31524919 TAAGCATTTTATTTTATTTTAAAATACCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGG 31524978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3154 TAAGCATTTTATTTTATTTTAAAATACCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGG 3213

 31524979 TTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCAGACCTCAGGTGATCCGACTGCCTCG 31525038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3214 TTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCAGACCTCAGGTGATCCGACTGCCTCG 3273

 31525039 GCCTCCCAAAGTGCTGGTATTAGAAGCATGAGCCACTGCCCACTGCACCTAGCTGAAAAC 31525098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3274 GCCTCCCAAAGTGCTGGTATTAGAAGCATGAGCCACTGCCCACTGCACCTAGCTGAAAAC 3333

 31525099 CACACTTTCTGTTGATTAAATAATATTTCACCTTATGGAGTTACAAATTTTCATTTTATG 31525158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3334 CACACTTTCTGTTGATTAAATAATATTTCACCTTATGGAGTTACAAATTTTCATTTTATG 3393

 31525159 GGGTTATAATCACTTACTTAGCTTGTTATCTTTTGTTGGACATTAATGTGGTTTCTAACT 31525218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3394 GGGTTATAATCACTTACTTAGCTTGTTATCTTTTGTTGGACATTAATGTGGTTTCTAACT 3453

 31525219 TTTCATTATCAAAAAATAAAAGAAAATGGACAAAACCTCAGAAAGACACAAACTACTAAA 31525278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3454 TTTCATTATCAAAAAATAAAAGAAAATGGACAAAACCTCAGAAAGACACAAACTACTAAA 3513

 31525279 GCTGACTTAATAAGAAATAGAAAATCTGAATATATAGAAAATCTGAATGTAACAAGTAAG 31525338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3514 GCTGACTTAATAAGAAATAGAAAATCTGAATATATAGAAAATCTGAATGTAACAAGTAAG 3573

 31525339 GAGATTGGATTAGTAATAAAATTTCCCACAAAGAGAAGTACACATTCAGATGGTTTCACT 31525398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3574 GAGATTGGATTAGTAATAAAATTTCCCACAAAGAGAAGTACACATTCAGATGGTTTCACT 3633

 31525399 GGTAAATTCTACCAAATATTTAAAGATTTTTCTTTTTTTTTGTTGAGACAGAGTCTCACT 31525458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3634 GGTAAATTCTACCAAATATTTAAAGATTTTTCTTTTTTTTTGTTGAGACAGAGTCTCACT 3693

 31525459 CTATTGCCCAGGCTGGAGTACAATGGTGTGATCTTGACTCACTGCAACCTCTGCCTCCGG 31525518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3694 CTATTGCCCAGGCTGGAGTACAATGGTGTGATCTTGACTCACTGCAACCTCTGCCTCCGG 3753

 31525519 GGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCAC 31525578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3754 GGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCAC 3813

 31525579 CATGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCACATTGGCTAGGCT 31525638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3814 CATGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCACATTGGCTAGGCT 3873

 31525639 GGTCTCGAACTCCCAACCTCGTGATCCGCCCACCATGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAC 31525698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3874 GGTCTCGAACTCCCAACCTCGTGATCCGCCCACCATGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAC 3933

 31525699 AGGCGTGAGCCACCACACCTGGCTAAAGAATTAATGTCAATTGCTCACAAACTCTTCCAA 31525758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3934 AGGCGTGAGCCACCACACCTGGCTAAAGAATTAATGTCAATTGCTCACAAACTCTTCCAA 3993

 31525759 AAGAGTTCTCTATGAGGCCAGTATTACCTTGATACCAAAACCAGATAAAGATATCACAGG 31525818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3994 AAGAGTTCTCTATGAGGCCAGTATTACCTTGATACCAAAACCAGATAAAGATATCACAGG 4053

 31525819 AAAATAAAACTGTAGACCAAATATTTTTATGAATATAGATACAAAAATCTTCAAAATACT 31525878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4054 AAAATAAAACTGTAGACCAAATATTTTTATGAATATAGATACAAAAATCTTCAAAATACT 4113

 31525879 AGCAAATTGAAACCAACAACATATGAAAATGATTATACACCATGACCAAGTAAGATTTAT 31525938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4114 AGCAAATTGAAACCAACAACATATGAAAATGATTATACACCATGACCAAGTAAGATTTAT 4173

 31525939 CCCAGGAATGCAAAGTTGGCTAAATATCCAAAATCAATTAATGTAATACACCATATTAAC 31525998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4174 CCCAGGAATGCAAAGTTGGCTAAATATCCAAAATCAATTAATGTAATACACCATATTAAC 4233

 31525999 TGAATAAAAAACAAAAGCCATATGATTATGCCAATAGATGCAAAAAGAGCATTTAACAAA 31526058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4234 TGAATAAAAAACAAAAGCCATATGATTATGCCAATAGATGCAAAAAGAGCATTTAACAAA 4293

 31526059 ATTGAACACCGTTTTCTGATTGAAACACCCAATAAACTAGAAATAGAAACTCCTTCAACC 31526118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4294 ATTGAACACCGTTTTCTGATTGAAACACCCAATAAACTAGAAATAGAAACTCCTTCAACC 4353

 31526119 TGATAAAAGCCATTTATGAAAACTCACAGGTAGCATAAAACTTCATGTTGAAATATTAAA 31526178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4354 TGATAAAAGCCATTTATGAAAACTCACAGGTAGCATAAAACTTCATGTTGAAATATTAAA 4413

 31526179 TACTTTCCTGTAAAATCAGAAATAAAACAAGAATGGTTACTCTTGCCACCCCAATTTAAC 31526238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4414 TACTTTCCTGTAAAATCAGAAATAAAACAAGAATGGTTACTCTTGCCACCCCAATTTAAC 4473

 31526239 ATTTTATTGGGAGGTCAGTTAGGCAAGAA 31526267
          |||||||||||||||||||||||||||||
     4474 ATTTTATTGGGAGGTCAGTTAGGCAAGAA 4502

Alignment time is 3.88339 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31515486,31539389] =>     23904 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,   10477] =>     10477 nucs 'mol-32-2fc2-169820_10477'

Score:       10308
Aligned:     10480        nucs
Identic:     10439 (100%) nucs =>      3700 ( 99%)      6739 (100%)
Gaps:           34 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31521783,31525486] EXCISED REGION [31529390,31536143]
 second seq =>  [       1,    3725] EXCISED REGION [    3735,   10477]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3903 nucs [31525487,31529389]
 second seq =>         9 nucs [3726,3734]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31521783 AAAAAATCAATCAATCAAATCAAAGCAAATCAAAAACTTTTTTTTTTTTTTT-GTAGAGA 31521841
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
        1 AAAAAATCAATCAATCAAATCAAAGCAAATCAAAAACTTTTTTTTTTTTTTTTGTAGAGA 60

 31521842 TGAGGTCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAGGAATCCTCCTGCCTT 31521901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGAGGTCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAGGAATCCTCCTGCCTT 120

 31521902 GACCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGTGCCCAGCCCTTTCTACTTCT 31521961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GACCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGTGCCCAGCCCTTTCTACTTCT 180

 31521962 ATGAGTTTGACTTTTTATAATTCCATATATAAATACAATCATGCAGTATTTTTCTTTCAT 31522021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATGAGTTTGACTTTTTATAATTCCATATATAAATACAATCATGCAGTATTTTTCTTTCAT 240

 31522022 GACTGGCTTATTTCACTTACCATAATGTCTTCCAGATTAATCTATGTTGTCCCAAATGAC 31522081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GACTGGCTTATTTCACTTACCATAATGTCTTCCAGATTAATCTATGTTGTCCCAAATGAC 300

 31522082 AGGATTTTTTTTCTCTTTTAAGGCTGAATAGTATTCCATTATGTATATACACCACATTTG 31522141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGGATTTTTTTTCTCTTTTAAGGCTGAATAGTATTCCATTATGTATATACACCACATTTG 360

 31522142 CATTATCCATTCATCCACTGATGGCCCCTTAGGTTGATTCTATATCTTGGCTATTGTGAA 31522201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CATTATCCATTCATCCACTGATGGCCCCTTAGGTTGATTCTATATCTTGGCTATTGTGAA 420

 31522202 AAGTGCTGCAATGAACATGGGAGTGCAGGTATTTCTTTGACATATTGATATGACATATTG 31522261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAGTGCTGCAATGAACATGGGAGTGCAGGTATTTCTTTGACATATTGATATGACATATTG 480

 31522262 ATCTCTTTTGGATATATACCCAGAAGTGGAATTGCTAGATCATATAGTAGTTCTAATTTT 31522321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATCTCTTTTGGATATATACCCAGAAGTGGAATTGCTAGATCATATAGTAGTTCTAATTTT 540

 31522322 AGTTTTTTGAGGAAACCCCATACTATTTCTCGTAGTGGTTGATATGGTTTGGTTGTGTCC 31522381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGTTTTTTGAGGAAACCCCATACTATTTCTCGTAGTGGTTGATATGGTTTGGTTGTGTCC 600

 31522382 CCACACAAATCTCATCTTGAATTGTAGCTCTCATAATCCCCAGCTGTCGTGGGAGGGACC 31522441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CCACACAAATCTCATCTTGAATTGTAGCTCTCATAATCCCCAGCTGTCGTGGGAGGGACC 660

 31522442 TGGTGGGAGGTAATTGAATCGTGGGGGTGGGTTTTTCCCACCATTCTAATGATAGTGAAT 31522501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGGTGGGAGGTAATTGAATCGTGGGGGTGGGTTTTTCCCACCATTCTAATGATAGTGAAT 720

 31522502 AAGTCTCAAGAGATATGATGGCTTTATAAAGGGCAGTTCCCCTGCTCATGCTCTCTTGCC 31522561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAGTCTCAAGAGATATGATGGCTTTATAAAGGGCAGTTCCCCTGCTCATGCTCTCTTGCC 780

 31522562 TGCTCCCATGTAAGACGTGCCTTTGCTCCTCTTTCACCTCTGCCATGATTGTGAGGCCTC 31522621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGCTCCCATGTAAGACGTGCCTTTGCTCCTCTTTCACCTCTGCCATGATTGTGAGGCCTC 840

 31522622 CCCAGCCATGTGGAACTGTGAGTCCATTAAACCTTTACTTTATAAATTACCCAGTCTCGG 31522681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CCCAGCCATGTGGAACTGTGAGTCCATTAAACCTTTACTTTATAAATTACCCAGTCTCGG 900

 31522682 ATATGTCTTTATTAGCAGCATGAGAACAGACCAATACAGTGGTTGTACTGATTTACATTC 31522741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATATGTCTTTATTAGCAGCATGAGAACAGACCAATACAGTGGTTGTACTGATTTACATTC 960

 31522742 CCTCCAACATTGTACAAGGGTTTTCTTTTTTCTGCCTCCTCACCAACACTTGTTTCTTGT 31522801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CCTCCAACATTGTACAAGGGTTTTCTTTTTTCTGCCTCCTCACCAACACTTGTTTCTTGT 1020

 31522802 CTTTTTGATAACATCTAATCTAACAGATGTAAGATGATATCTCATTGTGGTTTAATTTGT 31522861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTTTTTGATAACATCTAATCTAACAGATGTAAGATGATATCTCATTGTGGTTTAATTTGT 1080

 31522862 TTTTCCTAATGATTAGTGGTGCTCAGCATTTTTTTTCTTGAACCTGTTGGCCATTTGAAT 31522921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTTTCCTAATGATTAGTGGTGCTCAGCATTTTTTTTCTTGAACCTGTTGGCCATTTGAAT 1140

 31522922 GTCTTCTTTTGAGAAATGTCTCTTTGGATGCTTTCTCCATTTTCTCTTCTCTTCTCTTTT 31522981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GTCTTCTTTTGAGAAATGTCTCTTTGGATGCTTTCTCCATTTTCTCTTCTCTTCTCTTTT 1200

 31522982 CTTTCTTTCTTTCTTTC---------------------TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT 31523020
          ||||||||||||||||                      ||||||||||||||||||||||
     1201 CTTTCTTTCTTTCTTT-TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT 1259

 31523021 TTTGAGATGGCGTTTTGCTCTTGTTGCCCGGGCTGGAGTGCATTGATCCAATCTTGGCTC 31523080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 TTTGAGATGGCGTTTTGCTCTTGTTGCCCGGGCTGGAGTGCATTGATCCAATCTTGGCTC 1319

 31523081 ACTGCAACCCCCGCCTCCCGGGTTCAAGCAATTCTCCCGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTG 31523140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 ACTGCAACCCCCGCCTCCCGGGTTCAAGCAATTCTCCCGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTG 1379

 31523141 TGATTACAGGCACAGGCTACCACACCCGGCTAATTTTGTATTTTCAGTAGAGACGAGGTG 31523200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 TGATTACAGGCACAGGCTACCACACCCGGCTAATTTTGTATTTTCAGTAGAGACGAGGTG 1439

 31523201 TCACCTTGTTGGTCAGGCTGGTCCCGAACTCCTGACCTCAAGTGATCTGCCCGCCTTGGC 31523260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 TCACCTTGTTGGTCAGGCTGGTCCCGAACTCCTGACCTCAAGTGATCTGCCCGCCTTGGC 1499

 31523261 CTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGCCACTTTGCCTATTTTA 31523320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 CTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGCCACTTTGCCTATTTTA 1559

 31523321 TTTTATTTTGAGATGGAGTTTTGCTCTTATTGCCCAGACTGGAGTGCAATGGCGCAATTG 31523380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 TTTTATTTTGAGATGGAGTTTTGCTCTTATTGCCCAGACTGGAGTGCAATGGCGCAATTG 1619

 31523381 CAGCTCACCACAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAG 31523440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 CAGCTCACCACAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAG 1679

 31523441 TAGGTGGGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCCAACTAATTTTGTAGTTTTAGTAGAGAT 31523500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 TAGGTGGGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCCAACTAATTTTGTAGTTTTAGTAGAGAT 1739

 31523501 GGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCAC 31523560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 GGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCAC 1799

 31523561 CTTGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGAGTGAGTGCACCTGGCCCACTTTGCTCATTT 31523620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 CTTGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGAGTGAGTGCACCTGGCCCACTTTGCTCATTT 1859

 31523621 TCTAATTGGGTTATTCGTTTTCTGGCTATTGAGTTGTTTGAGTTTCTTATTTATTGTGGA 31523680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 TCTAATTGGGTTATTCGTTTTCTGGCTATTGAGTTGTTTGAGTTTCTTATTTATTGTGGA 1919

 31523681 TGTTACTCCCTTATCAGATGTATGATTTACATATATTTTCTGTCACTCTGTGGGTTATCT 31523740
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     1920 TGTTACTCCCTTATCAGATGTATGATTTACATATATTTTCTGTCACTTTGTGGGTTATCT 1979

 31523741 CTTTACTTTGTTCATTGTTTCCTTTCTGTCCAAAAGCTTTGTATCTTGTCTAAAATCCCA 31523800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 CTTTACTTTGTTCATTGTTTCCTTTCTGTCCAAAAGCTTTGTATCTTGTCTAAAATCCCA 2039

 31523801 TTTGTCTATTTTTGCTTTTATTTATTTTTATTTTTATTTTTATTTTTTATTTTTTTGAAA 31523860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 TTTGTCTATTTTTGCTTTTATTTATTTTTATTTTTATTTTTATTTTTTATTTTTTTGAAA 2099

 31523861 CGGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGTTGGAGTGCAGTGGTGCAATCTCAGCTCACTGCAAC 31523920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 CGGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGTTGGAGTGCAGTGGTGCAATCTCAGCTCACTGCAAC 2159

 31523921 CTCTGCCTCCCAGGTTCAAGGAAGTCTCCTACTCCAACTTCCTGAGTAGCTGGGATTATA 31523980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 CTCTGCCTCCCAGGTTCAAGGAAGTCTCCTACTCCAACTTCCTGAGTAGCTGGGATTATA 2219

 31523981 GGCGTGTGCCACCATGCCTAGCTAATTTTTGTATTTTTTGGTAGAGACAGGATTTCACCA 31524040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 GGCGTGTGCCACCATGCCTAGCTAATTTTTGTATTTTTTGGTAGAGACAGGATTTCACCA 2279

 31524041 TGTTGGCCAGGCTGGTGTTGAACTCTTGACCTCAGGCAATCCGCCTGACTCAGCCTCCCA 31524100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 TGTTGGCCAGGCTGGTGTTGAACTCTTGACCTCAGGCAATCCGCCTGACTCAGCCTCCCA 2339

 31524101 AAGTGCTGGGATTACACGTGTGAGCCACCGCGCCTGGCCTATTTTTGCTTTTATTACCTG 31524160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 AAGTGCTGGGATTACACGTGTGAGCCACCGCGCCTGGCCTATTTTTGCTTTTATTACCTG 2399

 31524161 TGCTTTTGGGGTCATAGCTAAATAACCATTGCTCAGATCAATGTCATGGAGCCTTTCCTC 31524220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 TGCTTTTGGGGTCATAGCTAAATAACCATTGCTCAGATCAATGTCATGGAGCCTTTCCTC 2459

 31524221 TAGGTATTCTTCTAGTTGTTTTACAGTCTCAGATCTTATATTTAAGACTTTAATCCATTT 31524280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 TAGGTATTCTTCTAGTTGTTTTACAGTCTCAGATCTTATATTTAAGACTTTAATCCATTT 2519

 31524281 TGAGTTGATTTTTTATACTGTGTGAGATAAGGATCCAATTTTATTCTTCTGTATGTGGAT 31524340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 TGAGTTGATTTTTTATACTGTGTGAGATAAGGATCCAATTTTATTCTTCTGTATGTGGAT 2579

 31524341 CCAATTTTCCTAGTACAGTTTATTGAAAAGACTGTCTTTTCCCCATTATGTATTAGTAAC 31524400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 CCAATTTTCCTAGTACAGTTTATTGAAAAGACTGTCTTTTCCCCATTATGTATTAGTAAC 2639

 31524401 ACCTTTGTCAAAAATCAATTGACTATTAGTGCATGGGTTTATTTCTGGGTTTTCTATCTT 31524460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 ACCTTTGTCAAAAATCAATTGACTATTAGTGCATGGGTTTATTTCTGGGTTTTCTATCTT 2699

 31524461 GTTACATTAGTCGATGTGTCTATTTTTATGCCAGCACCATACTGTTTTGATTATATTAGC 31524520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 GTTACATTAGTCGATGTGTCTATTTTTATGCCAGCACCATACTGTTTTGATTATATTAGC 2759

 31524521 TTTATAATATATTTTGAAATCAGGGACTGTGATGTCTTTAGCTTTGTTCTTTTTGCTCAA 31524580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 TTTATAATATATTTTGAAATCAGGGACTGTGATGTCTTTAGCTTTGTTCTTTTTGCTCAA 2819

 31524581 GATTGTTTTGGCTAGCCAGGGTCTTTTATGATTGCATATGAATTTAAGGATTGTTTTATT 31524640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2820 GATTGTTTTGGCTAGCCAGGGTCTTTTATGATTGCATATGAATTTAAGGATTGTTTTATT 2879

 31524641 TCTATAAGAAATGACATTGGAATTTTGATAGGGACTGCATTGAATCTGTAGATTGCTTTG 31524700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2880 TCTATAAGAAATGACATTGGAATTTTGATAGGGACTGCATTGAATCTGTAGATTGCTTTG 2939

 31524701 GGTAGTATGAATATTTTAATAATATTAATTCTTCTAATTTATCAACACAAGATAGCTTTC 31524760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2940 GGTAGTATGAATATTTTAATAATATTAATTCTTCTAATTTATCAACACAAGATAGCTTTC 2999

 31524761 CATTTATTTGTGTTTTCTTAAACAATGTTTTAGTTTCCAGTGTACAGATCTTTTAACTTC 31524820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3000 CATTTATTTGTGTTTTCTTAAACAATGTTTTAGTTTCCAGTGTACAGATCTTTTAACTTC 3059

 31524821 TTGGTTAAATTTACCCCTAAGTATTTTATTTTATTTTAAAATACCTGGCTAATTTTGTAT 31524880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3060 TTGGTTAAATTTACCCCTAAGTATTTTATTTTATTTTAAAATACCTGGCTAATTTTGTAT 3119

 31524881 TTAATTTTATATTGTATTTATTTTATTTGTAATAAAATTAAGCATTTTATTTTATTTTAA 31524940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3120 TTAATTTTATATTGTATTTATTTTATTTGTAATAAAATTAAGCATTTTATTTTATTTTAA 3179

 31524941 AATACCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTG 31525000
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     3180 AATACCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGATAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTG 3239

 31525001 GTCTCGAACTCCAGACCTCAGGTGATCCGACTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGTATTA 31525060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3240 GTCTCGAACTCCAGACCTCAGGTGATCCGACTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGTATTA 3299

 31525061 GAAGCATGAGCCACTGCCCACTGCACCTAGCTGAAAACCACACTTTCTGTTGATTAAATA 31525120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3300 GAAGCATGAGCCACTGCCCACTGCACCTAGCTGAAAACCACACTTTCTGTTGATTAAATA 3359

 31525121 ATATTTCACCTTATGGAGTTACAAATTTTCATTTTATGGGGTTATAATCACTTACTTAGC 31525180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3360 ATATTTCACCTTATGGAGTTACAAATTTTCATTTTATGGGGTTATAATCACTTACTTAGC 3419

 31525181 TTGTTATCTTTTGTTGGACATTAATGTGGTTTCTAACTTTTCATTATCAAAAAATAAAAG 31525240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3420 TTGTTATCTTTTGTTGGACATTAATGTGGTTTCTAACTTTTCATTATCAAAAAATAAAAG 3479

 31525241 AAAATGGACAAAACCTCAGAAAGACACAAACTACTAAAGCTGACTTAATAAGAAATAGAA 31525300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3480 AAAATGGACAAAACCTCAGAAAGACACAAACTACTAAAGCTGACTTAATAAGAAATAGAA 3539

 31525301 AATCTGAATATATAGAAAATCTGAATGTAACAAGTAAGGAGATTGGATTAGTAATAAAAT 31525360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3540 AATCTGAATATATAGAAAATCTGAATGTAACAAGTAAGGAGATTGGATTAGTAATAAAAT 3599

 31525361 TTCCCACAAAGAGAAGTACACATTCAGATGGTTTCACTGGTAAATTCTACCAAATATTTA 31525420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3600 TTCCCACAAAGAGAAGTACACATTCAGATGGTTTCACTGGTAAATTCTACCAAATATTTA 3659

 31525421 AAGATTTTTCTTTTTTTTTGTTGAGACAGAGTCTCACTCTATTGCCCAGGCTGGAGTACA 31525480
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3660 AAGATTTTTCTTTTTTTTTGTTGAGGCAGAGTCTCACTCTATTGCCCAGGCTGGAGTACA 3719

 31525481 ATGGTG 31525486
          ||||||
     3720 ATGGTG 3725

EXCISED REGION

 31529390 AATACTGTGCTAAGTGAAAGAAGCCAACCACAAAATACCATATATTGTGTGATTCTGCTT 31529449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3735 AATACTGTGCTAAGTGAAAGAAGCCAACCACAAAATACCATATATTGTGTGATTCTGCTT 3794

 31529450 AAATGACATGTCCAGAATGTCCATATTAAAGTAGATTAGTGGTTTCCTGAGGCTGGGGGA 31529509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3795 AAATGACATGTCCAGAATGTCCATATTAAAGTAGATTAGTGGTTTCCTGAGGCTGGGGGA 3854

 31529510 GGGAGTTGGGGAAATTGCGTAGTGACTACTGGGTAAAGAGTTTCTTTCTGGGGTGATGAA 31529569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3855 GGGAGTTGGGGAAATTGCGTAGTGACTACTGGGTAAAGAGTTTCTTTCTGGGGTGATGAA 3914

 31529570 ATGGTCTAAAATAGAATGTGGTGGTGGTTGCACAGCTCTGAAAATACTAAAAACCATTGA 31529629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3915 ATGGTCTAAAATAGAATGTGGTGGTGGTTGCACAGCTCTGAAAATACTAAAAACCATTGA 3974

 31529630 ATGAGCACTTTAAATTGGTAAATTTTTATGTGAATTATGATTCAATAAAGTTGTGTTTAG 31529689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3975 ATGAGCACTTTAAATTGGTAAATTTTTATGTGAATTATGATTCAATAAAGTTGTGTTTAG 4034

 31529690 ATATTACTAAAAATGATGGTACAAATATTCTTTTTCACAAATGTTTTTTGTTGTTGTTTA 31529749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4035 ATATTACTAAAAATGATGGTACAAATATTCTTTTTCACAAATGTTTTTTGTTGTTGTTTA 4094

 31529750 TAGTTGTTTATTTGTACATCTAGTAATTTGTCCCAAGGAAAGAGTATGTAAAAGAACATA 31529809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4095 TAGTTGTTTATTTGTACATCTAGTAATTTGTCCCAAGGAAAGAGTATGTAAAAGAACATA 4154

 31529810 AGTCACTTTAAGGCCTTTAATGTATACTACAAAATTGCACTCTAGAAGGTTTATACAGTT 31529869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4155 AGTCACTTTAAGGCCTTTAATGTATACTACAAAATTGCACTCTAGAAGGTTTATACAGTT 4214

 31529870 TTGCATTTCATTAGCCTGTTTTTTTTATCTTTGACAACCTAAAGAATTTATTAGTGGTAT 31529929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4215 TTGCATTTCATTAGCCTGTTTTTTTTATCTTTGACAACCTAAAGAATTTATTAGTGGTAT 4274

 31529930 TCATCTGAGGATCCTCTAGGTCTATCAGAGTGTCTTTCTTATAGAAGGCATTCAATAAAT 31529989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4275 TCATCTGAGGATCCTCTAGGTCTATCAGAGTGTCTTTCTTATAGAAGGCATTCAATAAAT 4334

 31529990 AAATGTCCTAAGTGAGCAAAACATTTTTGGTTGATTTTTAGGTGCAAATGGTTTCTTTTG 31530049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4335 AAATGTCCTAAGTGAGCAAAACATTTTTGGTTGATTTTTAGGTGCAAATGGTTTCTTTTG 4394

 31530050 ATTTTAATTAAGATGCCTTTGTTTATTAGTGATGTTGACATATTTTCTTAATCTATTGGC 31530109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4395 ATTTTAATTAAGATGCCTTTGTTTATTAGTGATGTTGACATATTTTCTTAATCTATTGGC 4454

 31530110 TTTGTATAACTTTATGAATTGTCTCTTCATGTCCTTTGCCTACTTTTCTATTGTGGTAAC 31530169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4455 TTTGTATAACTTTATGAATTGTCTCTTCATGTCCTTTGCCTACTTTTCTATTGTGGTAAC 4514

 31530170 TATCTTTTATAAATGTTGTATAATTATTTAAAAATACATTAGGTTGGGCATGGTAGATCA 31530229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4515 TATCTTTTATAAATGTTGTATAATTATTTAAAAATACATTAGGTTGGGCATGGTAGATCA 4574

 31530230 TGCCTGTAATCCCAGCTCTCTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATTGCTTGAGCCTAACAGTT 31530289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4575 TGCCTGTAATCCCAGCTCTCTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATTGCTTGAGCCTAACAGTT 4634

 31530290 CGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCCATCTCTAAAAAAAAAAACCAATAAAAAT 31530349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4635 CGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCCATCTCTAAAAAAAAAAACCAATAAAAAT 4694

 31530350 ATATTAAAAGATTAACTGATTGTCTATCATATGGATTACAAATATCCCCCCCAATTTGTC 31530409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4695 ATATTAAAAGATTAACTGATTGTCTATCATATGGATTACAAATATCCCCCCCAATTTGTC 4754

 31530410 ATTTGCTTGTTAATTTTATTTATGATGACTTAAAAATTACAATATATTTTTTGGTGTTCA 31530469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4755 ATTTGCTTGTTAATTTTATTTATGATGACTTAAAAATTACAATATATTTTTTGGTGTTCA 4814

 31530470 AGTCAGTTTTTGTCCCCATTGTGATATTTTCCTTTGCCTGTTTATCACTTTCTTAGAGAA 31530529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4815 AGTCAGTTTTTGTCCCCATTGTGATATTTTCCTTTGCCTGTTTATCACTTTCTTAGAGAA 4874

 31530530 AAGATAAATACTGATTCGTTCTTTTGTAGGTGTTTTATGATTTCATTGAAAATAAAATCT 31530589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4875 AAGATAAATACTGATTCGTTCTTTTGTAGGTGTTTTATGATTTCATTGAAAATAAAATCT 4934

 31530590 TCAACGCATCTAGTATTCATTTGGGTGTAAGATAAAAGATAACAACGTAGGTTTCTCTTA 31530649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4935 TCAACGCATCTAGTATTCATTTGGGTGTAAGATAAAAGATAACAACGTAGGTTTCTCTTA 4994

 31530650 TAGTTCATCAGGTATCCTACTACTGTTTATTGAGTCATGTTTTCTGTTACCACTCTTACT 31530709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4995 TAGTTCATCAGGTATCCTACTACTGTTTATTGAGTCATGTTTTCTGTTACCACTCTTACT 5054

 31530710 ATATACCAGTTTTACATACATTTGGGTTGGTTTCTGAGCTTTCTATTGTCTTCCATTGCT 31530769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5055 ATATACCAGTTTTACATACATTTGGGTTGGTTTCTGAGCTTTCTATTGTCTTCCATTGCT 5114

 31530770 TTGTTTAAAATTTAAAGTTTATTATTCTGACTTTCCATACTTGAATATGGTCGAATAAGT 31530829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5115 TTGTTTAAAATTTAAAGTTTATTATTCTGACTTTCCATACTTGAATATGGTCGAATAAGT 5174

 31530830 CCTCCTTTATTAATCTTGTTTTATTTAAAAATGGTCATTTTCACTCATTTTCCAGTTCAG 31530889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5175 CCTCCTTTATTAATCTTGTTTTATTTAAAAATGGTCATTTTCACTCATTTTCCAGTTCAG 5234

 31530890 TAGTTTTATTCTCTCAGTGTAATGTGATTTATCACCCCATTGCTCACCCTATTCATCTCC 31530949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5235 TAGTTTTATTCTCTCAGTGTAATGTGATTTATCACCCCATTGCTCACCCTATTCATCTCC 5294

 31530950 CAATACCCAGCTGAAAAACTTTAGAAGACTGAGGCTCTTGCCCTGGCCCCATCACTTTCT 31531009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5295 CAATACCCAGCTGAAAAACTTTAGAAGACTGAGGCTCTTGCCCTGGCCCCATCACTTTCT 5354

 31531010 AGCTATGTGGGCTTAGGCTAGTTATTGAACATGTCTGACTCTCACTTTTCTCCTCTGTAA 31531069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5355 AGCTATGTGGGCTTAGGCTAGTTATTGAACATGTCTGACTCTCACTTTTCTCCTCTGTAA 5414

 31531070 GTCAGTGAGAATTATATACTTCTTATAAGGTTGTGAGGTTCAAATGGAATAATGTGTACA 31531129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5415 GTCAGTGAGAATTATATACTTCTTATAAGGTTGTGAGGTTCAAATGGAATAATGTGTACA 5474

 31531130 GAGGCACTTGGTAAACAATGTAGTCATATGCAAGTCATATGCAAGTCATATGTAGTCAGC 31531189
          |||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||
     5475 GAGGCACTTGGTAAACAATGT-----------AGTCATATGCAAGTCATATGTAGTCAGC 5523

 31531190 TTGGTGAATTTTGAGAAAGTAAATGCAAGTTCTTTTTATGGTTTTACCTAAGGGGCCAGT 31531249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5524 TTGGTGAATTTTGAGAAAGTAAATGCAAGTTCTTTTTATGGTTTTACCTAAGGGGCCAGT 5583

 31531250 GAGGGCCAGAGAAGTGCCGGGACCTATGTAAGGTCGCAAGCAAGTTCATGTGGAATGCAT 31531309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5584 GAGGGCCAGAGAAGTGCCGGGACCTATGTAAGGTCGCAAGCAAGTTCATGTGGAATGCAT 5643

 31531310 CTAGAACTAGAACGCTAGCCTGTGTCCCAGGGCCCTTCCAACTGGGCTCTGCTGCCTGCA 31531369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5644 CTAGAACTAGAACGCTAGCCTGTGTCCCAGGGCCCTTCCAACTGGGCTCTGCTGCCTGCA 5703

 31531370 GTCCTGGGTGCCTTCTAATTAGCCTGTGTAGTGGTCTTGGTAAAAGTGTTTCTCCTGTAC 31531429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5704 GTCCTGGGTGCCTTCTAATTAGCCTGTGTAGTGGTCTTGGTAAAAGTGTTTCTCCTGTAC 5763

 31531430 TGTCCCCTATAGGTTGTGGCTGGCCATACCATTTCCCTGGTTCCCCCCACGCTCCTGATG 31531489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5764 TGTCCCCTATAGGTTGTGGCTGGCCATACCATTTCCCTGGTTCCCCCCACGCTCCTGATG 5823

 31531490 ACCTGGAAAGGCCATTTGAATAGTGTGGCAGACATCCTGTATGTGGACAACTTCCAGCTG 31531549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5824 ACCTGGAAAGGCCATTTGAATAGTGTGGCAGACATCCTGTATGTGGACAACTTCCAGCTG 5883

 31531550 GTTATCAGCGCTGGCCAGGACCGGGACGTCAAGGCTTGGAAACTCTCCGGTGATGCCATT 31531609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5884 GTTATCAGCGCTGGCCAGGACCGGGACGTCAAGGCTTGGAAACTCTCCGGTGATGCCATT 5943

 31531610 GGTATGGGTCCTGCTGAAGCTCAGCCATGCCCATGGCCCTTCTTGTCTCTGTCCCTGTCT 31531669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5944 GGTATGGGTCCTGCTGAAGCTCAGCCATGCCCATGGCCCTTCTTGTCTCTGTCCCTGTCT 6003

 31531670 GAACATAAGCTGGTATGAACTTTGTACTCTGTGGGGAGGGACTCTCAGGCCACAGCAACT 31531729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6004 GAACATAAGCTGGTATGAACTTTGTACTCTGTGGGGAGGGACTCTCAGGCCACAGCAACT 6063

 31531730 GCCTTCACTTAAATAATATTACAGTCTGTCCAATTATCCATTCAGCAAACGGTCCATCCA 31531789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6064 GCCTTCACTTAAATAATATTACAGTCTGTCCAATTATCCATTCAGCAAACGGTCCATCCA 6123

 31531790 TTCACCCATCCACCCAATATTATTCACCTATGTATATTTTTGCAAATCATATATCTGATA 31531849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6124 TTCACCCATCCACCCAATATTATTCACCTATGTATATTTTTGCAAATCATATATCTGATA 6183

 31531850 AAGCATATTCCTTTCTCTTTTAAAAAATAAACTTAATTGTTGCATTGTATATAAAGAAAA 31531909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6184 AAGCATATTCCTTTCTCTTTTAAAAAATAAACTTAATTGTTGCATTGTATATAAAGAAAA 6243

 31531910 ACATACAAACCAGAAGGGTTCAGCTTGGTGAATTTTGAGAAAGTAAATACATACCCATAT 31531969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6244 ACATACAAACCAGAAGGGTTCAGCTTGGTGAATTTTGAGAAAGTAAATACATACCCATAT 6303

 31531970 AGCCACCGTTCATGTCAAGAAATAATTAGGGCCAGGCGCGGTGGCTCACTACTGTAATCC 31532029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6304 AGCCACCGTTCATGTCAAGAAATAATTAGGGCCAGGCGCGGTGGCTCACTACTGTAATCC 6363

 31532030 CAACACTTTTTTGTCCCCTTTTCCTCCTGTGCTGTCTTCCTATGTGTTTGTTTGTTTGTT 31532089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6364 CAACACTTTTTTGTCCCCTTTTCCTCCTGTGCTGTCTTCCTATGTGTTTGTTTGTTTGTT 6423

 31532090 TTAGTGACCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGTGCATGCCTGT 31532149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6424 TTAGTGACCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGTGCATGCCTGT 6483

 31532150 AATCCCAGCTACTTGAGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGTTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTT 31532209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6484 AATCCCAGCTACTTGAGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGTTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTT 6543

 31532210 GCAGTGAGCTGAGATCATGTCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGACTCTGTCT 31532269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6544 GCAGTGAGCTGAGATCATGTCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGACTCTGTCT 6603

 31532270 AAAAAAAAAATAATAATAAAAATAAAGTGACTTATGTGCCACTATTACAGTATTACAGCA 31532329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6604 AAAAAAAAAATAATAATAAAAATAAAGTGACTTATGTGCCACTATTACAGTATTACAGCA 6663

 31532330 TTCTGTATTTTTCTATGTGTTTACATTTATCAGAAAGCTTTGTATTTTCATATGCTTTCA 31532389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6664 TTCTGTATTTTTCTATGTGTTTACATTTATCAGAAAGCTTTGTATTTTCATATGCTTTCA 6723

 31532390 TGTTCCTGCCTAGCATCCTTTTGTTTCAACTTGAAGGGGTCCCTTTAGCATTTCTTTAAA 31532449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6724 TGTTCCTGCCTAGCATCCTTTTGTTTCAACTTGAAGGGGTCCCTTTAGCATTTCTTTAAA 6783

 31532450 GGCAGGTCTAATGGTGATGAACTCCTCTTGTTTTTATTTATCTGGGAAAATTTTTATTTT 31532509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6784 GGCAGGTCTAATGGTGATGAACTCCTCTTGTTTTTATTTATCTGGGAAAATTTTTATTTT 6843

 31532510 TCCTTCATTTTTAAAGGACAGCTTTCCTGGATATAGTATTTTTGGATGAGAGTTTTTGTT 31532569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6844 TCCTTCATTTTTAAAGGACAGCTTTCCTGGATATAGTATTTTTGGATGAGAGTTTTTGTT 6903

 31532570 CTTTTTATAATGTGTCTCCTTGTGGATTTCTTTGACTTTATCCTAGTTGGAATCCCTTGA 31532629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6904 CTTTTTATAATGTGTCTCCTTGTGGATTTCTTTGACTTTATCCTAGTTGGAATCCCTTGA 6963

 31532630 GCTTCTTGAATATAGGTTTCTTTTCCTTTTTAAGATTTGAAACATTTTCAGCCATTATTT 31532689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6964 GCTTCTTGAATATAGGTTTCTTTTCCTTTTTAAGATTTGAAACATTTTCAGCCATTATTT 7023

 31532690 ATTCAGATAAGCTTTTTGTCCCTTTCTCTCTCTCTGTCTCTCTCTCCTCCTTCTAGTACT 31532749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7024 ATTCAGATAAGCTTTTTGTCCCTTTCTCTCTCTCTGTCTCTCTCTCCTCCTTCTAGTACT 7083

 31532750 ACCATAATGCATATATTGTCCATTTGACGATGTCTCATAAATCCCTTAAGTTTTCTTTAC 31532809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7084 ACCATAATGCATATATTGTCCATTTGACGATGTCTCATAAATCCCTTAAGTTTTCTTTAC 7143

 31532810 TCTTTAAAATTCTTTTTTCTTTTTTGCTTCTCTGACTGGATATCTTCAAGTCTGCTGATT 31532869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7144 TCTTTAAAATTCTTTTTTCTTTTTTGCTTCTCTGACTGGATATCTTCAAGTCTGCTGATT 7203

 31532870 TTTCCTTCTGCTTGATCAAGCCTGCTGTAGATGACTTTTGAATTCAATTATTTTACTCTT 31532929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7204 TTTCCTTCTGCTTGATCAAGCCTGCTGTAGATGACTTTTGAATTCAATTATTTTACTCTT 7263

 31532930 CATCTTCAGCTCTAGAATTTCTGTTATTTTTATTATTATTATTATTATTTTTTGAGACAG 31532989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7264 CATCTTCAGCTCTAGAATTTCTGTTATTTTTATTATTATTATTATTATTTTTTGAGACAG 7323

 31532990 GGTCTTGCTCTGCCACCCAGGGTTGAGTGCAGTGGCACGAATTCAGCTCACTGAAGCCTT 31533049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7324 GGTCTTGCTCTGCCACCCAGGGTTGAGTGCAGTGGCACGAATTCAGCTCACTGAAGCCTT 7383

 31533050 GACCTCCCAGCCTCAAGTGATCTTCCCACAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCA 31533109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7384 GACCTCCCAGCCTCAAGTGATCTTCCCACAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCA 7443

 31533110 TGCCATCATGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTTGTAGAGACAGAGTTTCACCATGTTGC 31533169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7444 TGCCATCATGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTTGTAGAGACAGAGTTTCACCATGTTGC 7503

 31533170 CCAGGCTGGCCTTGAATTCTTGAGCTCAAGTGATCGCCCACCTAAGCTTCCCAAAGTGTT 31533229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7504 CCAGGCTGGCCTTGAATTCTTGAGCTCAAGTGATCGCCCACCTAAGCTTCCCAAAGTGTT 7563

 31533230 GGGATTATAGGTGTGGGCCACCATGGCTGGCCTCTGTTTGGTTCTTTTCTATATTTTCTG 31533289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7564 GGGATTATAGGTGTGGGCCACCATGGCTGGCCTCTGTTTGGTTCTTTTCTATATTTTCTG 7623

 31533290 TGTCTTCACTAATATTCTCAGTTTGTTCATGTATTGTTTCCCTGAGCTTGTTGAGCATTT 31533349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7624 TGTCTTCACTAATATTCTCAGTTTGTTCATGTATTGTTTCCCTGAGCTTGTTGAGCATTT 7683

 31533350 TTATTACGGTTACTTAGAATTCTTTGTCAAATAATTAATATACCTCAATTTCTTTAGCGG 31533409
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7684 TTATTACAGTTACTTAGAATTCTTTGTCAAATAATTAATATACCTCAATTTCTTTAGCGG 7743

 31533410 CAGTTTCTGGAGATTTATTTTGTTCCTTTGGGCCATGCTTTCCTATTTTTTTTGTGTGCC 31533469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7744 CAGTTTCTGGAGATTTATTTTGTTCCTTTGGGCCATGCTTTCCTATTTTTTTTGTGTGCC 7803

 31533470 TTATAACTTTATATTGGGATCCATGCATTTGTAAAATCAGCCACCTCTCCCAGTCTTTAT 31533529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7804 TTATAACTTTATATTGGGATCCATGCATTTGTAAAATCAGCCACCTCTCCCAGTCTTTAT 7863

 31533530 ATACTGGCTTCATTCAGGGAAAATTCTGCACCAATCAGCTTGGCTAAAGATTCTGGGTGC 31533589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7864 ATACTGGCTTCATTCAGGGAAAATTCTGCACCAATCAGCTTGGCTAAAGATTCTGGGTGC 7923

 31533590 CTCCCCAATCTTTTTTGTGGATACTTTCACCAGACTTACGCATGTAAATTCGCAATTACA 31533649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7924 CTCCCCAATCTTTTTTGTGGATACTTTCACCAGACTTACGCATGTAAATTCGCAATTACA 7983

 31533650 GGAATCTACAGGTTTATTTTTTTCAGGAGTCCATTATCTCTTGCTCTCTCTGGTGTCTAT 31533709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7984 GGAATCTACAGGTTTATTTTTTTCAGGAGTCCATTATCTCTTGCTCTCTCTGGTGTCTAT 8043

 31533710 TTGCAGTACTGCAAGTTCTCTAGAGCGGCTACAAGCTTCCCCCAGGCCTCTAGAATATGC 31533769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8044 TTGCAGTACTGCAAGTTCTCTAGAGCGGCTACAAGCTTCCCCCAGGCCTCTAGAATATGC 8103

 31533770 TGGGTCCTTCAATAGTCTGAGAGAGGCAAGACAGAAACCAGTTTCTTGGGTACCCCTCAA 31533829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8104 TGGGTCCTTCAATAGTCTGAGAGAGGCAAGACAGAAACCAGTTTCTTGGGTACCCCTCAA 8163

 31533830 AGGCTAACATTGGATATGTATGCTCCAAATCTGCCTCCTCAAGGAGAAGCTGGAAGTTGG 31533889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8164 AGGCTAACATTGGATATGTATGCTCCAAATCTGCCTCCTCAAGGAGAAGCTGGAAGTTGG 8223

 31533890 GTTGTTTTCTCTACTCATTCCACAGAGCGGCAGGAGGGACTCTGATAGTGTGTGCTAGTC 31533949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8224 GTTGTTTTCTCTACTCATTCCACAGAGCGGCAGGAGGGACTCTGATAGTGTGTGCTAGTC 8283

 31533950 TAAATTGTCACCTTTGTTCTTAGTAGCCCAGTCTGGTGCCTCTTCCTGTCAGTGCTTAGA 31534009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8284 TAAATTGTCACCTTTGTTCTTAGTAGCCCAGTCTGGTGCCTCTTCCTGTCAGTGCTTAGA 8343

 31534010 TTCAGGCAAGACAGAAACTGGTTAATCATGCAGCCCTCTGAAAAGTCTGCATGTTGGATG 31534069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8344 TTCAGGCAAGACAGAAACTGGTTAATCATGCAGCCCTCTGAAAAGTCTGCATGTTGGATG 8403

 31534070 TACATCTCAGTCTTTCCCTCCCAGGGAGAAGCTGGAAGCTGGTGGTTCCTTCCCAATCTG 31534129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8404 TACATCTCAGTCTTTCCCTCCCAGGGAGAAGCTGGAAGCTGGTGGTTCCTTCCCAATCTG 8463

 31534130 CTTCACTGAGCCAGGAGGAGGGATTACAAGTGAGCACTATGAATTTTCCTACTGGCTTCA 31534189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8464 CTTCACTGAGCCAGGAGGAGGGATTACAAGTGAGCACTATGAATTTTCCTACTGGCTTCA 8523

 31534190 GTGCAGCTGGTTTTTTGTTTTTTGTTTTTTTGGTTTTTGTTTGTTTGTTTTTTCATTCAT 31534249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8524 GTGCAGCTGGTTTTTTGTTTTTTGTTTTTTTGGTTTTTGTTTGTTTGTTTTTTCATTCAT 8583

 31534250 CTGGGATGAATGGTCCTGGTTTCTGGTCCATGTACTGTTGTTCAGTCAGTGTCTCCATAG 31534309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8584 CTGGGATGAATGGTCCTGGTTTCTGGTCCATGTACTGTTGTTCAGTCAGTGTCTCCATAG 8643

 31534310 GGAGAAGGAAGTTCTGGATCTTCCTATTCTACCATCTTGCTGATGTCACCCATTTTTTTG 31534369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8644 GGAGAAGGAAGTTCTGGATCTTCCTATTCTACCATCTTGCTGATGTCACCCATTTTTTTG 8703

 31534370 TATCTTTCAAAGACGTCTTTGACTATCCCCTAAATATAATATCTAGTGTTATCTTTTAGA 31534429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8704 TATCTTTCAAAGACGTCTTTGACTATCCCCTAAATATAATATCTAGTGTTATCTTTTAGA 8763

 31534430 AGCTTGTTTTAAAAATCAGATTTCTGAAGTATAATTTACATCCAATAAAAGCACCTTTTA 31534489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8764 AGCTTGTTTTAAAAATCAGATTTCTGAAGTATAATTTACATCCAATAAAAGCACCTTTTA 8823

 31534490 AAAGTATATAGTTCTGTGAGGTTTCATGAATGCATACAATTGTGTAATTGGTATCACAAT 31534549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8824 AAAGTATATAGTTCTGTGAGGTTTCATGAATGCATACAATTGTGTAATTGGTATCACAAT 8883

 31534550 CAAGACATAGACATTACCCCAAAAAGTGACCTCATGTCTCCTCATAGTAAACTCTATTTC 31534609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8884 CAAGACATAGACATTACCCCAAAAAGTGACCTCATGTCTCCTCATAGTAAACTCTATTTC 8943

 31534610 CTTCTCCTAACCCCTGGCAGCCATTGATCTGTTTGTCTCTATAGTTTTGCCTTTTCCAGA 31534669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8944 CTTCTCCTAACCCCTGGCAGCCATTGATCTGTTTGTCTCTATAGTTTTGCCTTTTCCAGA 9003

 31534670 TTATCATAAATGGAAACATACACATGTAGCTGAGTGAAAGTCTAACTTTCACTTAGCATA 31534729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9004 TTATCATAAATGGAAACATACACATGTAGCTGAGTGAAAGTCTAACTTTCACTTAGCATA 9063

 31534730 ATCAATTTGAGATTCATCTTTGTTGTTGAACGTATCAGTAGTTTGTTCTTTTTATTGCTG 31534789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9064 ATCAATTTGAGATTCATCTTTGTTGTTGAACGTATCAGTAGTTTGTTCTTTTTATTGCTG 9123

 31534790 AGTATTATTCCACTGTATGGCTCTGTCATAGTTTGTTAATCCATTCACCAATTATAGGAC 31534849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9124 AGTATTATTCCACTGTATGGCTCTGTCATAGTTTGTTAATCCATTCACCAATTATAGGAC 9183

 31534850 ATTTGAGTCATTGTCAGTTTTGGATGATTATGAATGAAGCCGCTTTAAACATTGTTTTCA 31534909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9184 ATTTGAGTCATTGTCAGTTTTGGATGATTATGAATGAAGCCGCTTTAAACATTGTTTTCA 9243

 31534910 TTTCTGTTGGGTAAGTATTTAGAAGCAGAATGGCTGGGTTGTATGGTAAGTGTATTGAAA 31534969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9244 TTTCTGTTGGGTAAGTATTTAGAAGCAGAATGGCTGGGTTGTATGGTAAGTGTATTGAAA 9303

 31534970 CTTTATGAAAAATGACCAAACTGTTTTGCATTTCTACCTTTGTGTCTTCATCAACATTTG 31535029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9304 CTTTATGAAAAATGACCAAACTGTTTTGCATTTCTACCTTTGTGTCTTCATCAACATTTG 9363

 31535030 GTGTTTGATCTGTTATTATTTTAAATTTTAATAATCTATGATTGTAGCATGAGATTTCAA 31535089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9364 GTGTTTGATCTGTTATTATTTTAAATTTTAATAATCTATGATTGTAGCATGAGATTTCAA 9423

 31535090 TATTCTCTCAATTTATAAAACAACTATACAGAAAATCATTAATGATATAGAATACTTGAA 31535149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9424 TATTCTCTCAATTTATAAAACAACTATACAGAAAATCATTAATGATATAGAATACTTGAA 9483

 31535150 TAACACTATCAAACAATTTTACTTAATTAACATTTATAGATCATTCATAAACAAACATTA 31535209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9484 TAACACTATCAAACAATTTTACTTAATTAACATTTATAGATCATTCATAAACAAACATTA 9543

 31535210 TTTTTAAGTGCACACAGAACATTAATTAAACCGACCATATTCTGGTAACAAAACACATCT 31535269
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     9544 TTTTTAAGTGCACACAGAACATTAATTAAACCGACCATATTCTGGTAACAAAACAAATCT 9603

 31535270 CACTAATCTCAAAAGGATTTATGCCATACAAAGTATGTTCTCTGATCCCAATGAAACTGA 31535329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9604 CACTAATCTCAAAAGGATTTATGCCATACAAAGTATGTTCTCTGATCCCAATGAAACTGA 9663

 31535330 ATTATAAATCAAAAACAGAAATATCTTTGAAATATCCCTAAATATTTGGAAGCTAAATGA 31535389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9664 ATTATAAATCAAAAACAGAAATATCTTTGAAATATCCCTAAATATTTGGAAGCTAAATGA 9723

 31535390 CACATTTCTAAATAACCCATGGGCCAAAAAAAGAAATCCAGAGGGAAATTAGAAAATATT 31535449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9724 CACATTTCTAAATAACCCATGGGCCAAAAAAAGAAATCCAGAGGGAAATTAGAAAATATT 9783

 31535450 TTGAACTGAATGAAAATGAAAATGTAACATTTCAAAATTTATGAGATGCCACAAAAAACA 31535509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9784 TTGAACTGAATGAAAATGAAAATGTAACATTTCAAAATTTATGAGATGCCACAAAAAACA 9843

 31535510 GTAGTAACGGGGAAATTTGTAGCACTAAATGCCTATATTAGAAGGAAAAAAGTTCAAATC 31535569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9844 GTAGTAACGGGGAAATTTGTAGCACTAAATGCCTATATTAGAAGGAAAAAAGTTCAAATC 9903

 31535570 TCCAGCCTCAACTTCCACATTAAGAAACTAGAAAGAGGTCTGGTGCGGTGGCTCACGCCT 31535629
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9904 ACCAGCCTCAACTTCCACATTAAGAAACTAGAAAGAGGTCTGGTGCGGTGGCTCACGCCT 9963

 31535630 TTGGGAGGCAGGTGGGAGGATCATTTGAACCCAGGGGTTCAAGACCAGCCTAGGCAACAT 31535689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9964 TTGGGAGGCAGGTGGGAGGATCATTTGAACCCAGGGGTTCAAGACCAGCCTAGGCAACAT 10023

 31535690 AACAAGACCCCATCTCAATTAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAAGAAACTAGAAAGAAAGAG 31535749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10024 AACAAGACCCCATCTCAATTAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAAGAAACTAGAAAGAAAGAG 10083

 31535750 CAAATTGAGCCCAAAGTAAATAGAAGAGAAATAATAAAGATTAGAATGGAAATCGATGAA 31535809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10084 CAAATTGAGCCCAAAGTAAATAGAAGAGAAATAATAAAGATTAGAATGGAAATCGATGAA 10143

 31535810 ACAGGGAAGTAAAAAATAATAAGGAAAATCAATGAACCCAAAAGCTGGTTCTTTGAAAAG 31535869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10144 ACAGGGAAGTAAAAAATAATAAGGAAAATCAATGAACCCAAAAGCTGGTTCTTTGAAAAG 10203

 31535870 ATAGTTAAATCGATAAACCTCCAGCTAGACTGGGCAGGAAAAAGAGAGAGAATACACCAA 31535929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10204 ATAGTTAAATCGATAAACCTCCAGCTAGACTGGGCAGGAAAAAGAGAGAGAATACACCAA 10263

 31535930 TTACCAATATCAGGAATGAGTGAGATGACATCATTTCTGATTCTACAGATATTAAAAGGA 31535989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10264 TTACCAATATCAGGAATGAGTGAGATGACATCATTTCTGATTCTACAGATATTAAAAGGA 10323

 31535990 TAACAATGAAATACTATAAACAACTTTATACAATAAATTTGGCAACTTATATGAAATAAA 31536049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10324 TAACAATGAAATACTATAAACAACTTTATACAATAAATTTGGCAACTTATATGAAATAAA 10383

 31536050 CTCCTTGAAAGAAACAAACTACTAAATCTTACACAAGAAGAAACAGATAACCCGAATATC 31536109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10384 CTCCTTGAAAGAAACAAACTACTAAATCTTACACAAGAAGAAACAGATAACCCGAATATC 10443

 31536110 CTTATATCAAAGAAATTAAATTTGTAGTTTAAAA 31536143
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||
    10444 CTTATATCAAATAAATTAAATTTGTAGTTTAAAA 10477

Alignment time is 8.98158 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31515486,31539389] =>     23904 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    3725] =>      3725 nucs 'mol-32-2fc2-169820_3725'

Score:        3660
Aligned:      3704        nucs
Identic:      3700 (100%) nucs =>      1215 (100%)      2485 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31521783,31522997] EXCISED REGION [31522999,31525486]
 second seq =>  [       1,    1216] EXCISED REGION [    1238,    3725]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [31522998,31522998]
 second seq =>        21 nucs [1217,1237]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        28 nucs [1214,1241] to [1235,1262]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [31522995,31522997] to [31522999,31523001]
 second seq =>         3 nucs [1214,1216] to [1238,1240]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        10 nucs [1217,1226] to [1228,1237]

 31521783 AAAAAATCAATCAATCAAATCAAAGCAAATCAAAAACTTTTTTTTTTTTTTT-GTAGAGA 31521841
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
        1 AAAAAATCAATCAATCAAATCAAAGCAAATCAAAAACTTTTTTTTTTTTTTTTGTAGAGA 60

 31521842 TGAGGTCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAGGAATCCTCCTGCCTT 31521901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGAGGTCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAGGAATCCTCCTGCCTT 120

 31521902 GACCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGTGCCCAGCCCTTTCTACTTCT 31521961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GACCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGTGCCCAGCCCTTTCTACTTCT 180

 31521962 ATGAGTTTGACTTTTTATAATTCCATATATAAATACAATCATGCAGTATTTTTCTTTCAT 31522021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATGAGTTTGACTTTTTATAATTCCATATATAAATACAATCATGCAGTATTTTTCTTTCAT 240

 31522022 GACTGGCTTATTTCACTTACCATAATGTCTTCCAGATTAATCTATGTTGTCCCAAATGAC 31522081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GACTGGCTTATTTCACTTACCATAATGTCTTCCAGATTAATCTATGTTGTCCCAAATGAC 300

 31522082 AGGATTTTTTTTCTCTTTTAAGGCTGAATAGTATTCCATTATGTATATACACCACATTTG 31522141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGGATTTTTTTTCTCTTTTAAGGCTGAATAGTATTCCATTATGTATATACACCACATTTG 360

 31522142 CATTATCCATTCATCCACTGATGGCCCCTTAGGTTGATTCTATATCTTGGCTATTGTGAA 31522201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CATTATCCATTCATCCACTGATGGCCCCTTAGGTTGATTCTATATCTTGGCTATTGTGAA 420

 31522202 AAGTGCTGCAATGAACATGGGAGTGCAGGTATTTCTTTGACATATTGATATGACATATTG 31522261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAGTGCTGCAATGAACATGGGAGTGCAGGTATTTCTTTGACATATTGATATGACATATTG 480

 31522262 ATCTCTTTTGGATATATACCCAGAAGTGGAATTGCTAGATCATATAGTAGTTCTAATTTT 31522321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATCTCTTTTGGATATATACCCAGAAGTGGAATTGCTAGATCATATAGTAGTTCTAATTTT 540

 31522322 AGTTTTTTGAGGAAACCCCATACTATTTCTCGTAGTGGTTGATATGGTTTGGTTGTGTCC 31522381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGTTTTTTGAGGAAACCCCATACTATTTCTCGTAGTGGTTGATATGGTTTGGTTGTGTCC 600

 31522382 CCACACAAATCTCATCTTGAATTGTAGCTCTCATAATCCCCAGCTGTCGTGGGAGGGACC 31522441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CCACACAAATCTCATCTTGAATTGTAGCTCTCATAATCCCCAGCTGTCGTGGGAGGGACC 660

 31522442 TGGTGGGAGGTAATTGAATCGTGGGGGTGGGTTTTTCCCACCATTCTAATGATAGTGAAT 31522501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGGTGGGAGGTAATTGAATCGTGGGGGTGGGTTTTTCCCACCATTCTAATGATAGTGAAT 720

 31522502 AAGTCTCAAGAGATATGATGGCTTTATAAAGGGCAGTTCCCCTGCTCATGCTCTCTTGCC 31522561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAGTCTCAAGAGATATGATGGCTTTATAAAGGGCAGTTCCCCTGCTCATGCTCTCTTGCC 780

 31522562 TGCTCCCATGTAAGACGTGCCTTTGCTCCTCTTTCACCTCTGCCATGATTGTGAGGCCTC 31522621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGCTCCCATGTAAGACGTGCCTTTGCTCCTCTTTCACCTCTGCCATGATTGTGAGGCCTC 840

 31522622 CCCAGCCATGTGGAACTGTGAGTCCATTAAACCTTTACTTTATAAATTACCCAGTCTCGG 31522681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CCCAGCCATGTGGAACTGTGAGTCCATTAAACCTTTACTTTATAAATTACCCAGTCTCGG 900

 31522682 ATATGTCTTTATTAGCAGCATGAGAACAGACCAATACAGTGGTTGTACTGATTTACATTC 31522741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATATGTCTTTATTAGCAGCATGAGAACAGACCAATACAGTGGTTGTACTGATTTACATTC 960

 31522742 CCTCCAACATTGTACAAGGGTTTTCTTTTTTCTGCCTCCTCACCAACACTTGTTTCTTGT 31522801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CCTCCAACATTGTACAAGGGTTTTCTTTTTTCTGCCTCCTCACCAACACTTGTTTCTTGT 1020

 31522802 CTTTTTGATAACATCTAATCTAACAGATGTAAGATGATATCTCATTGTGGTTTAATTTGT 31522861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTTTTTGATAACATCTAATCTAACAGATGTAAGATGATATCTCATTGTGGTTTAATTTGT 1080

 31522862 TTTTCCTAATGATTAGTGGTGCTCAGCATTTTTTTTCTTGAACCTGTTGGCCATTTGAAT 31522921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTTTCCTAATGATTAGTGGTGCTCAGCATTTTTTTTCTTGAACCTGTTGGCCATTTGAAT 1140

 31522922 GTCTTCTTTTGAGAAATGTCTCTTTGGATGCTTTCTCCATTTTCTCTTCTCTTCTCTTTT 31522981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GTCTTCTTTTGAGAAATGTCTCTTTGGATGCTTTCTCCATTTTCTCTTCTCTTCTCTTTT 1200

 31522982 CTTTCTTTCTTTCTTT 31522997
          ||||||||||||||||
     1201 CTTTCTTTCTTTCTTT 1216

EXCISED REGION

 31522999 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGCGTTTTGCTCTTGTTGCCCGGGCTGGAG 31523058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1238 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGCGTTTTGCTCTTGTTGCCCGGGCTGGAG 1297

 31523059 TGCATTGATCCAATCTTGGCTCACTGCAACCCCCGCCTCCCGGGTTCAAGCAATTCTCCC 31523118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1298 TGCATTGATCCAATCTTGGCTCACTGCAACCCCCGCCTCCCGGGTTCAAGCAATTCTCCC 1357

 31523119 GCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGTGATTACAGGCACAGGCTACCACACCCGGCTAATTTTG 31523178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1358 GCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGTGATTACAGGCACAGGCTACCACACCCGGCTAATTTTG 1417

 31523179 TATTTTCAGTAGAGACGAGGTGTCACCTTGTTGGTCAGGCTGGTCCCGAACTCCTGACCT 31523238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1418 TATTTTCAGTAGAGACGAGGTGTCACCTTGTTGGTCAGGCTGGTCCCGAACTCCTGACCT 1477

 31523239 CAAGTGATCTGCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCA 31523298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1478 CAAGTGATCTGCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCA 1537

 31523299 CCTGGCCACTTTGCCTATTTTATTTTATTTTGAGATGGAGTTTTGCTCTTATTGCCCAGA 31523358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1538 CCTGGCCACTTTGCCTATTTTATTTTATTTTGAGATGGAGTTTTGCTCTTATTGCCCAGA 1597

 31523359 CTGGAGTGCAATGGCGCAATTGCAGCTCACCACAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCAAT 31523418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1598 CTGGAGTGCAATGGCGCAATTGCAGCTCACCACAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCAAT 1657

 31523419 TCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGGTGGGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCCAACTA 31523478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1658 TCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGGTGGGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCCAACTA 1717

 31523479 ATTTTGTAGTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCC 31523538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1718 ATTTTGTAGTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCC 1777

 31523539 TGACCTCAGGTGATCTGCCCACCTTGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGAGTGAGTGC 31523598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1778 TGACCTCAGGTGATCTGCCCACCTTGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGAGTGAGTGC 1837

 31523599 ACCTGGCCCACTTTGCTCATTTTCTAATTGGGTTATTCGTTTTCTGGCTATTGAGTTGTT 31523658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1838 ACCTGGCCCACTTTGCTCATTTTCTAATTGGGTTATTCGTTTTCTGGCTATTGAGTTGTT 1897

 31523659 TGAGTTTCTTATTTATTGTGGATGTTACTCCCTTATCAGATGTATGATTTACATATATTT 31523718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1898 TGAGTTTCTTATTTATTGTGGATGTTACTCCCTTATCAGATGTATGATTTACATATATTT 1957

 31523719 TCTGTCACTCTGTGGGTTATCTCTTTACTTTGTTCATTGTTTCCTTTCTGTCCAAAAGCT 31523778
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1958 TCTGTCACTTTGTGGGTTATCTCTTTACTTTGTTCATTGTTTCCTTTCTGTCCAAAAGCT 2017

 31523779 TTGTATCTTGTCTAAAATCCCATTTGTCTATTTTTGCTTTTATTTATTTTTATTTTTATT 31523838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2018 TTGTATCTTGTCTAAAATCCCATTTGTCTATTTTTGCTTTTATTTATTTTTATTTTTATT 2077

 31523839 TTTATTTTTTATTTTTTTGAAACGGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGTTGGAGTGCAGTGG 31523898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2078 TTTATTTTTTATTTTTTTGAAACGGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGTTGGAGTGCAGTGG 2137

 31523899 TGCAATCTCAGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGGAAGTCTCCTACTCCAAC 31523958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2138 TGCAATCTCAGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGGAAGTCTCCTACTCCAAC 2197

 31523959 TTCCTGAGTAGCTGGGATTATAGGCGTGTGCCACCATGCCTAGCTAATTTTTGTATTTTT 31524018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2198 TTCCTGAGTAGCTGGGATTATAGGCGTGTGCCACCATGCCTAGCTAATTTTTGTATTTTT 2257

 31524019 TGGTAGAGACAGGATTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTGTTGAACTCTTGACCTCAGGCA 31524078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2258 TGGTAGAGACAGGATTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTGTTGAACTCTTGACCTCAGGCA 2317

 31524079 ATCCGCCTGACTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACACGTGTGAGCCACCGCGCCTGGC 31524138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2318 ATCCGCCTGACTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACACGTGTGAGCCACCGCGCCTGGC 2377

 31524139 CTATTTTTGCTTTTATTACCTGTGCTTTTGGGGTCATAGCTAAATAACCATTGCTCAGAT 31524198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2378 CTATTTTTGCTTTTATTACCTGTGCTTTTGGGGTCATAGCTAAATAACCATTGCTCAGAT 2437

 31524199 CAATGTCATGGAGCCTTTCCTCTAGGTATTCTTCTAGTTGTTTTACAGTCTCAGATCTTA 31524258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2438 CAATGTCATGGAGCCTTTCCTCTAGGTATTCTTCTAGTTGTTTTACAGTCTCAGATCTTA 2497

 31524259 TATTTAAGACTTTAATCCATTTTGAGTTGATTTTTTATACTGTGTGAGATAAGGATCCAA 31524318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2498 TATTTAAGACTTTAATCCATTTTGAGTTGATTTTTTATACTGTGTGAGATAAGGATCCAA 2557

 31524319 TTTTATTCTTCTGTATGTGGATCCAATTTTCCTAGTACAGTTTATTGAAAAGACTGTCTT 31524378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2558 TTTTATTCTTCTGTATGTGGATCCAATTTTCCTAGTACAGTTTATTGAAAAGACTGTCTT 2617

 31524379 TTCCCCATTATGTATTAGTAACACCTTTGTCAAAAATCAATTGACTATTAGTGCATGGGT 31524438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2618 TTCCCCATTATGTATTAGTAACACCTTTGTCAAAAATCAATTGACTATTAGTGCATGGGT 2677

 31524439 TTATTTCTGGGTTTTCTATCTTGTTACATTAGTCGATGTGTCTATTTTTATGCCAGCACC 31524498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2678 TTATTTCTGGGTTTTCTATCTTGTTACATTAGTCGATGTGTCTATTTTTATGCCAGCACC 2737

 31524499 ATACTGTTTTGATTATATTAGCTTTATAATATATTTTGAAATCAGGGACTGTGATGTCTT 31524558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2738 ATACTGTTTTGATTATATTAGCTTTATAATATATTTTGAAATCAGGGACTGTGATGTCTT 2797

 31524559 TAGCTTTGTTCTTTTTGCTCAAGATTGTTTTGGCTAGCCAGGGTCTTTTATGATTGCATA 31524618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2798 TAGCTTTGTTCTTTTTGCTCAAGATTGTTTTGGCTAGCCAGGGTCTTTTATGATTGCATA 2857

 31524619 TGAATTTAAGGATTGTTTTATTTCTATAAGAAATGACATTGGAATTTTGATAGGGACTGC 31524678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2858 TGAATTTAAGGATTGTTTTATTTCTATAAGAAATGACATTGGAATTTTGATAGGGACTGC 2917

 31524679 ATTGAATCTGTAGATTGCTTTGGGTAGTATGAATATTTTAATAATATTAATTCTTCTAAT 31524738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2918 ATTGAATCTGTAGATTGCTTTGGGTAGTATGAATATTTTAATAATATTAATTCTTCTAAT 2977

 31524739 TTATCAACACAAGATAGCTTTCCATTTATTTGTGTTTTCTTAAACAATGTTTTAGTTTCC 31524798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2978 TTATCAACACAAGATAGCTTTCCATTTATTTGTGTTTTCTTAAACAATGTTTTAGTTTCC 3037

 31524799 AGTGTACAGATCTTTTAACTTCTTGGTTAAATTTACCCCTAAGTATTTTATTTTATTTTA 31524858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3038 AGTGTACAGATCTTTTAACTTCTTGGTTAAATTTACCCCTAAGTATTTTATTTTATTTTA 3097

 31524859 AAATACCTGGCTAATTTTGTATTTAATTTTATATTGTATTTATTTTATTTGTAATAAAAT 31524918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3098 AAATACCTGGCTAATTTTGTATTTAATTTTATATTGTATTTATTTTATTTGTAATAAAAT 3157

 31524919 TAAGCATTTTATTTTATTTTAAAATACCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGG 31524978
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     3158 TAAGCATTTTATTTTATTTTAAAATACCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGATAGGG 3217

 31524979 TTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCAGACCTCAGGTGATCCGACTGCCTCG 31525038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3218 TTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCAGACCTCAGGTGATCCGACTGCCTCG 3277

 31525039 GCCTCCCAAAGTGCTGGTATTAGAAGCATGAGCCACTGCCCACTGCACCTAGCTGAAAAC 31525098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3278 GCCTCCCAAAGTGCTGGTATTAGAAGCATGAGCCACTGCCCACTGCACCTAGCTGAAAAC 3337

 31525099 CACACTTTCTGTTGATTAAATAATATTTCACCTTATGGAGTTACAAATTTTCATTTTATG 31525158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3338 CACACTTTCTGTTGATTAAATAATATTTCACCTTATGGAGTTACAAATTTTCATTTTATG 3397

 31525159 GGGTTATAATCACTTACTTAGCTTGTTATCTTTTGTTGGACATTAATGTGGTTTCTAACT 31525218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3398 GGGTTATAATCACTTACTTAGCTTGTTATCTTTTGTTGGACATTAATGTGGTTTCTAACT 3457

 31525219 TTTCATTATCAAAAAATAAAAGAAAATGGACAAAACCTCAGAAAGACACAAACTACTAAA 31525278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3458 TTTCATTATCAAAAAATAAAAGAAAATGGACAAAACCTCAGAAAGACACAAACTACTAAA 3517

 31525279 GCTGACTTAATAAGAAATAGAAAATCTGAATATATAGAAAATCTGAATGTAACAAGTAAG 31525338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3518 GCTGACTTAATAAGAAATAGAAAATCTGAATATATAGAAAATCTGAATGTAACAAGTAAG 3577

 31525339 GAGATTGGATTAGTAATAAAATTTCCCACAAAGAGAAGTACACATTCAGATGGTTTCACT 31525398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3578 GAGATTGGATTAGTAATAAAATTTCCCACAAAGAGAAGTACACATTCAGATGGTTTCACT 3637

 31525399 GGTAAATTCTACCAAATATTTAAAGATTTTTCTTTTTTTTTGTTGAGACAGAGTCTCACT 31525458
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     3638 GGTAAATTCTACCAAATATTTAAAGATTTTTCTTTTTTTTTGTTGAGGCAGAGTCTCACT 3697

 31525459 CTATTGCCCAGGCTGGAGTACAATGGTG 31525486
          ||||||||||||||||||||||||||||
     3698 CTATTGCCCAGGCTGGAGTACAATGGTG 3725

Alignment time is 3.2284 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31515486,31539389] =>     23904 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    3271] =>      3271 nucs 'mol-32-2fcd-030362_3271'

Score:        3271
Aligned:      3271        nucs
Identic:      3271 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31529258,31532528]
 second seq =>  [       1,    3271]

 31529258 TACAAAAGTGGAAACAACCCAAATGTCAACTTCCAAATGGATAAAGTGTGGTATGGTGAT 31529317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TACAAAAGTGGAAACAACCCAAATGTCAACTTCCAAATGGATAAAGTGTGGTATGGTGAT 60

 31529318 ACAATGGAATGTTATTTAATAATAAAAAGGAATAAAGTACTGATGCATGCAACAACATGG 31529377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACAATGGAATGTTATTTAATAATAAAAAGGAATAAAGTACTGATGCATGCAACAACATGG 120

 31529378 ATGAACCTTGAAAATACTGTGCTAAGTGAAAGAAGCCAACCACAAAATACCATATATTGT 31529437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATGAACCTTGAAAATACTGTGCTAAGTGAAAGAAGCCAACCACAAAATACCATATATTGT 180

 31529438 GTGATTCTGCTTAAATGACATGTCCAGAATGTCCATATTAAAGTAGATTAGTGGTTTCCT 31529497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTGATTCTGCTTAAATGACATGTCCAGAATGTCCATATTAAAGTAGATTAGTGGTTTCCT 240

 31529498 GAGGCTGGGGGAGGGAGTTGGGGAAATTGCGTAGTGACTACTGGGTAAAGAGTTTCTTTC 31529557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GAGGCTGGGGGAGGGAGTTGGGGAAATTGCGTAGTGACTACTGGGTAAAGAGTTTCTTTC 300

 31529558 TGGGGTGATGAAATGGTCTAAAATAGAATGTGGTGGTGGTTGCACAGCTCTGAAAATACT 31529617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGGGGTGATGAAATGGTCTAAAATAGAATGTGGTGGTGGTTGCACAGCTCTGAAAATACT 360

 31529618 AAAAACCATTGAATGAGCACTTTAAATTGGTAAATTTTTATGTGAATTATGATTCAATAA 31529677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAAAACCATTGAATGAGCACTTTAAATTGGTAAATTTTTATGTGAATTATGATTCAATAA 420

 31529678 AGTTGTGTTTAGATATTACTAAAAATGATGGTACAAATATTCTTTTTCACAAATGTTTTT 31529737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGTTGTGTTTAGATATTACTAAAAATGATGGTACAAATATTCTTTTTCACAAATGTTTTT 480

 31529738 TGTTGTTGTTTATAGTTGTTTATTTGTACATCTAGTAATTTGTCCCAAGGAAAGAGTATG 31529797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGTTGTTGTTTATAGTTGTTTATTTGTACATCTAGTAATTTGTCCCAAGGAAAGAGTATG 540

 31529798 TAAAAGAACATAAGTCACTTTAAGGCCTTTAATGTATACTACAAAATTGCACTCTAGAAG 31529857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TAAAAGAACATAAGTCACTTTAAGGCCTTTAATGTATACTACAAAATTGCACTCTAGAAG 600

 31529858 GTTTATACAGTTTTGCATTTCATTAGCCTGTTTTTTTTATCTTTGACAACCTAAAGAATT 31529917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTTTATACAGTTTTGCATTTCATTAGCCTGTTTTTTTTATCTTTGACAACCTAAAGAATT 660

 31529918 TATTAGTGGTATTCATCTGAGGATCCTCTAGGTCTATCAGAGTGTCTTTCTTATAGAAGG 31529977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TATTAGTGGTATTCATCTGAGGATCCTCTAGGTCTATCAGAGTGTCTTTCTTATAGAAGG 720

 31529978 CATTCAATAAATAAATGTCCTAAGTGAGCAAAACATTTTTGGTTGATTTTTAGGTGCAAA 31530037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CATTCAATAAATAAATGTCCTAAGTGAGCAAAACATTTTTGGTTGATTTTTAGGTGCAAA 780

 31530038 TGGTTTCTTTTGATTTTAATTAAGATGCCTTTGTTTATTAGTGATGTTGACATATTTTCT 31530097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGGTTTCTTTTGATTTTAATTAAGATGCCTTTGTTTATTAGTGATGTTGACATATTTTCT 840

 31530098 TAATCTATTGGCTTTGTATAACTTTATGAATTGTCTCTTCATGTCCTTTGCCTACTTTTC 31530157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TAATCTATTGGCTTTGTATAACTTTATGAATTGTCTCTTCATGTCCTTTGCCTACTTTTC 900

 31530158 TATTGTGGTAACTATCTTTTATAAATGTTGTATAATTATTTAAAAATACATTAGGTTGGG 31530217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TATTGTGGTAACTATCTTTTATAAATGTTGTATAATTATTTAAAAATACATTAGGTTGGG 960

 31530218 CATGGTAGATCATGCCTGTAATCCCAGCTCTCTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATTGCTTG 31530277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CATGGTAGATCATGCCTGTAATCCCAGCTCTCTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATTGCTTG 1020

 31530278 AGCCTAACAGTTCGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCCATCTCTAAAAAAAAAA 31530337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGCCTAACAGTTCGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCCATCTCTAAAAAAAAAA 1080

 31530338 ACCAATAAAAATATATTAAAAGATTAACTGATTGTCTATCATATGGATTACAAATATCCC 31530397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ACCAATAAAAATATATTAAAAGATTAACTGATTGTCTATCATATGGATTACAAATATCCC 1140

 31530398 CCCCAATTTGTCATTTGCTTGTTAATTTTATTTATGATGACTTAAAAATTACAATATATT 31530457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CCCCAATTTGTCATTTGCTTGTTAATTTTATTTATGATGACTTAAAAATTACAATATATT 1200

 31530458 TTTTGGTGTTCAAGTCAGTTTTTGTCCCCATTGTGATATTTTCCTTTGCCTGTTTATCAC 31530517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTTTGGTGTTCAAGTCAGTTTTTGTCCCCATTGTGATATTTTCCTTTGCCTGTTTATCAC 1260

 31530518 TTTCTTAGAGAAAAGATAAATACTGATTCGTTCTTTTGTAGGTGTTTTATGATTTCATTG 31530577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTTCTTAGAGAAAAGATAAATACTGATTCGTTCTTTTGTAGGTGTTTTATGATTTCATTG 1320

 31530578 AAAATAAAATCTTCAACGCATCTAGTATTCATTTGGGTGTAAGATAAAAGATAACAACGT 31530637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AAAATAAAATCTTCAACGCATCTAGTATTCATTTGGGTGTAAGATAAAAGATAACAACGT 1380

 31530638 AGGTTTCTCTTATAGTTCATCAGGTATCCTACTACTGTTTATTGAGTCATGTTTTCTGTT 31530697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AGGTTTCTCTTATAGTTCATCAGGTATCCTACTACTGTTTATTGAGTCATGTTTTCTGTT 1440

 31530698 ACCACTCTTACTATATACCAGTTTTACATACATTTGGGTTGGTTTCTGAGCTTTCTATTG 31530757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ACCACTCTTACTATATACCAGTTTTACATACATTTGGGTTGGTTTCTGAGCTTTCTATTG 1500

 31530758 TCTTCCATTGCTTTGTTTAAAATTTAAAGTTTATTATTCTGACTTTCCATACTTGAATAT 31530817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TCTTCCATTGCTTTGTTTAAAATTTAAAGTTTATTATTCTGACTTTCCATACTTGAATAT 1560

 31530818 GGTCGAATAAGTCCTCCTTTATTAATCTTGTTTTATTTAAAAATGGTCATTTTCACTCAT 31530877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GGTCGAATAAGTCCTCCTTTATTAATCTTGTTTTATTTAAAAATGGTCATTTTCACTCAT 1620

 31530878 TTTCCAGTTCAGTAGTTTTATTCTCTCAGTGTAATGTGATTTATCACCCCATTGCTCACC 31530937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTTCCAGTTCAGTAGTTTTATTCTCTCAGTGTAATGTGATTTATCACCCCATTGCTCACC 1680

 31530938 CTATTCATCTCCCAATACCCAGCTGAAAAACTTTAGAAGACTGAGGCTCTTGCCCTGGCC 31530997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CTATTCATCTCCCAATACCCAGCTGAAAAACTTTAGAAGACTGAGGCTCTTGCCCTGGCC 1740

 31530998 CCATCACTTTCTAGCTATGTGGGCTTAGGCTAGTTATTGAACATGTCTGACTCTCACTTT 31531057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CCATCACTTTCTAGCTATGTGGGCTTAGGCTAGTTATTGAACATGTCTGACTCTCACTTT 1800

 31531058 TCTCCTCTGTAAGTCAGTGAGAATTATATACTTCTTATAAGGTTGTGAGGTTCAAATGGA 31531117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TCTCCTCTGTAAGTCAGTGAGAATTATATACTTCTTATAAGGTTGTGAGGTTCAAATGGA 1860

 31531118 ATAATGTGTACAGAGGCACTTGGTAAACAATGTAGTCATATGCAAGTCATATGCAAGTCA 31531177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ATAATGTGTACAGAGGCACTTGGTAAACAATGTAGTCATATGCAAGTCATATGCAAGTCA 1920

 31531178 TATGTAGTCAGCTTGGTGAATTTTGAGAAAGTAAATGCAAGTTCTTTTTATGGTTTTACC 31531237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TATGTAGTCAGCTTGGTGAATTTTGAGAAAGTAAATGCAAGTTCTTTTTATGGTTTTACC 1980

 31531238 TAAGGGGCCAGTGAGGGCCAGAGAAGTGCCGGGACCTATGTAAGGTCGCAAGCAAGTTCA 31531297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TAAGGGGCCAGTGAGGGCCAGAGAAGTGCCGGGACCTATGTAAGGTCGCAAGCAAGTTCA 2040

 31531298 TGTGGAATGCATCTAGAACTAGAACGCTAGCCTGTGTCCCAGGGCCCTTCCAACTGGGCT 31531357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TGTGGAATGCATCTAGAACTAGAACGCTAGCCTGTGTCCCAGGGCCCTTCCAACTGGGCT 2100

 31531358 CTGCTGCCTGCAGTCCTGGGTGCCTTCTAATTAGCCTGTGTAGTGGTCTTGGTAAAAGTG 31531417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CTGCTGCCTGCAGTCCTGGGTGCCTTCTAATTAGCCTGTGTAGTGGTCTTGGTAAAAGTG 2160

 31531418 TTTCTCCTGTACTGTCCCCTATAGGTTGTGGCTGGCCATACCATTTCCCTGGTTCCCCCC 31531477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TTTCTCCTGTACTGTCCCCTATAGGTTGTGGCTGGCCATACCATTTCCCTGGTTCCCCCC 2220

 31531478 ACGCTCCTGATGACCTGGAAAGGCCATTTGAATAGTGTGGCAGACATCCTGTATGTGGAC 31531537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ACGCTCCTGATGACCTGGAAAGGCCATTTGAATAGTGTGGCAGACATCCTGTATGTGGAC 2280

 31531538 AACTTCCAGCTGGTTATCAGCGCTGGCCAGGACCGGGACGTCAAGGCTTGGAAACTCTCC 31531597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AACTTCCAGCTGGTTATCAGCGCTGGCCAGGACCGGGACGTCAAGGCTTGGAAACTCTCC 2340

 31531598 GGTGATGCCATTGGTATGGGTCCTGCTGAAGCTCAGCCATGCCCATGGCCCTTCTTGTCT 31531657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GGTGATGCCATTGGTATGGGTCCTGCTGAAGCTCAGCCATGCCCATGGCCCTTCTTGTCT 2400

 31531658 CTGTCCCTGTCTGAACATAAGCTGGTATGAACTTTGTACTCTGTGGGGAGGGACTCTCAG 31531717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CTGTCCCTGTCTGAACATAAGCTGGTATGAACTTTGTACTCTGTGGGGAGGGACTCTCAG 2460

 31531718 GCCACAGCAACTGCCTTCACTTAAATAATATTACAGTCTGTCCAATTATCCATTCAGCAA 31531777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GCCACAGCAACTGCCTTCACTTAAATAATATTACAGTCTGTCCAATTATCCATTCAGCAA 2520

 31531778 ACGGTCCATCCATTCACCCATCCACCCAATATTATTCACCTATGTATATTTTTGCAAATC 31531837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 ACGGTCCATCCATTCACCCATCCACCCAATATTATTCACCTATGTATATTTTTGCAAATC 2580

 31531838 ATATATCTGATAAAGCATATTCCTTTCTCTTTTAAAAAATAAACTTAATTGTTGCATTGT 31531897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 ATATATCTGATAAAGCATATTCCTTTCTCTTTTAAAAAATAAACTTAATTGTTGCATTGT 2640

 31531898 ATATAAAGAAAAACATACAAACCAGAAGGGTTCAGCTTGGTGAATTTTGAGAAAGTAAAT 31531957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 ATATAAAGAAAAACATACAAACCAGAAGGGTTCAGCTTGGTGAATTTTGAGAAAGTAAAT 2700

 31531958 ACATACCCATATAGCCACCGTTCATGTCAAGAAATAATTAGGGCCAGGCGCGGTGGCTCA 31532017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 ACATACCCATATAGCCACCGTTCATGTCAAGAAATAATTAGGGCCAGGCGCGGTGGCTCA 2760

 31532018 CTACTGTAATCCCAACACTTTTTTGTCCCCTTTTCCTCCTGTGCTGTCTTCCTATGTGTT 31532077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CTACTGTAATCCCAACACTTTTTTGTCCCCTTTTCCTCCTGTGCTGTCTTCCTATGTGTT 2820

 31532078 TGTTTGTTTGTTTTAGTGACCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTG 31532137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TGTTTGTTTGTTTTAGTGACCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTG 2880

 31532138 GTGCATGCCTGTAATCCCAGCTACTTGAGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGTTTGAACCTGG 31532197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 GTGCATGCCTGTAATCCCAGCTACTTGAGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGTTTGAACCTGG 2940

 31532198 GAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCATGTCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGT 31532257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 GAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCATGTCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGT 3000

 31532258 GAGACTCTGTCTAAAAAAAAAATAATAATAAAAATAAAGTGACTTATGTGCCACTATTAC 31532317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GAGACTCTGTCTAAAAAAAAAATAATAATAAAAATAAAGTGACTTATGTGCCACTATTAC 3060

 31532318 AGTATTACAGCATTCTGTATTTTTCTATGTGTTTACATTTATCAGAAAGCTTTGTATTTT 31532377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 AGTATTACAGCATTCTGTATTTTTCTATGTGTTTACATTTATCAGAAAGCTTTGTATTTT 3120

 31532378 CATATGCTTTCATGTTCCTGCCTAGCATCCTTTTGTTTCAACTTGAAGGGGTCCCTTTAG 31532437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 CATATGCTTTCATGTTCCTGCCTAGCATCCTTTTGTTTCAACTTGAAGGGGTCCCTTTAG 3180

 31532438 CATTTCTTTAAAGGCAGGTCTAATGGTGATGAACTCCTCTTGTTTTTATTTATCTGGGAA 31532497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 CATTTCTTTAAAGGCAGGTCTAATGGTGATGAACTCCTCTTGTTTTTATTTATCTGGGAA 3240

 31532498 AATTTTTATTTTTCCTTCATTTTTAAAGGAC 31532528
          |||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 AATTTTTATTTTTCCTTCATTTTTAAAGGAC 3271

Alignment time is 2.51575 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31515486,31539389] =>     23904 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    3801] =>      3801 nucs 'mol-32-2fcd-039541_3801'

Score:        3800
Aligned:      3800        nucs
Identic:      3800 (100%) nucs =>      3093 (100%)       707 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31528450,31531542] EXCISED REGION [31531544,31532250]
 second seq =>  [       1,    3093] EXCISED REGION [    3095,    3801]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [31531543,31531543]
 second seq =>         1 nucs [3094,3094]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [31531543,31531543] to [31531544,31531544]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31528450 AAAGAAAATACTTGCAAATCATATATCTGATAAGGGACTAGTATCCAGAATATATAAAGC 31528509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAAGAAAATACTTGCAAATCATATATCTGATAAGGGACTAGTATCCAGAATATATAAAGC 60

 31528510 ACTCTTGCAACTTGATAAAAATGATAAATAACCAAATTAAGATACGGGTAAAGGATCTAA 31528569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACTCTTGCAACTTGATAAAAATGATAAATAACCAAATTAAGATACGGGTAAAGGATCTAA 120

 31528570 ATAAACATTTCTTCAAAGAAGATGTACAAATGGCTAATAAGTATATTAAATGATGGTGAA 31528629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATAAACATTTCTTCAAAGAAGATGTACAAATGGCTAATAAGTATATTAAATGATGGTGAA 180

 31528630 CATCATTAGCTATCAGGGAAATGCATATTAAAACTATAATGAGATCCCACTTTACACTTG 31528689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CATCATTAGCTATCAGGGAAATGCATATTAAAACTATAATGAGATCCCACTTTACACTTG 240

 31528690 CCAGGATAACTATAGATAATAGCAATGGTTGGCTGGGATGTGGACAAACTGGGACTCTTA 31528749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCAGGATAACTATAGATAATAGCAATGGTTGGCTGGGATGTGGACAAACTGGGACTCTTA 300

 31528750 CACATTGCTGGATAGAATGTAGAAAGCTGGCCAGGTACGGTGGCTCAGGCCTGTAATCCC 31528809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CACATTGCTGGATAGAATGTAGAAAGCTGGCCAGGTACGGTGGCTCAGGCCTGTAATCCC 360

 31528810 AGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGCGGATTATGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGC 31528869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGCGGATTATGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGC 420

 31528870 CAGCATGGTGTAACCCCGTCTCTACTAAACATACAAAAATTAGCAGGGCATGATGGCGGG 31528929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CAGCATGGTGTAACCCCGTCTCTACTAAACATACAAAAATTAGCAGGGCATGATGGCGGG 480

 31528930 TGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGC 31528989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGC 540

 31528990 GGAGGTTGCAGTGAGCAGAGATCATGCCATTGCGTTCCAGTCTGGGCAACAAGAGCAAAA 31529049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGAGGTTGCAGTGAGCAGAGATCATGCCATTGCGTTCCAGTCTGGGCAACAAGAGCAAAA 600

 31529050 CTCCAAACTCTGTTTAAAAAAAAAAAAAGAAAAAGAACATAGAAAGCTGCAGTCACTTTG 31529109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTCCAAACTCTGTTTAAAAAAAAAAAAAGAAAAAGAACATAGAAAGCTGCAGTCACTTTG 660

 31529110 GAAAACAGTCTGGCAGTTCCTCAAAAATTAAGTGTAGACTTACCATATTACCCAACAGTT 31529169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GAAAACAGTCTGGCAGTTCCTCAAAAATTAAGTGTAGACTTACCATATTACCCAACAGTT 720

 31529170 CCACTCCCAAGTGTATACCCAAGAGAAATGAAAACATATGTTCACATAAAATCTTGTACA 31529229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CCACTCCCAAGTGTATACCCAAGAGAAATGAAAACATATGTTCACATAAAATCTTGTACA 780

 31529230 TGAATGTTTATAGTAGCATTATTTATAATACAAAAGTGGAAACAACCCAAATGTCAACTT 31529289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGAATGTTTATAGTAGCATTATTTATAATACAAAAGTGGAAACAACCCAAATGTCAACTT 840

 31529290 CCAAATGGATAAAGTGTGGTATGGTGATACAATGGAATGTTATTTAATAATAAAAAGGAA 31529349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CCAAATGGATAAAGTGTGGTATGGTGATACAATGGAATGTTATTTAATAATAAAAAGGAA 900

 31529350 TAAAGTACTGATGCATGCAACAACATGGATGAACCTTGAAAATACTGTGCTAAGTGAAAG 31529409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TAAAGTACTGATGCATGCAACAACATGGATGAACCTTGAAAATACTGTGCTAAGTGAAAG 960

 31529410 AAGCCAACCACAAAATACCATATATTGTGTGATTCTGCTTAAATGACATGTCCAGAATGT 31529469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AAGCCAACCACAAAATACCATATATTGTGTGATTCTGCTTAAATGACATGTCCAGAATGT 1020

 31529470 CCATATTAAAGTAGATTAGTGGTTTCCTGAGGCTGGGGGAGGGAGTTGGGGAAATTGCGT 31529529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CCATATTAAAGTAGATTAGTGGTTTCCTGAGGCTGGGGGAGGGAGTTGGGGAAATTGCGT 1080

 31529530 AGTGACTACTGGGTAAAGAGTTTCTTTCTGGGGTGATGAAATGGTCTAAAATAGAATGTG 31529589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AGTGACTACTGGGTAAAGAGTTTCTTTCTGGGGTGATGAAATGGTCTAAAATAGAATGTG 1140

 31529590 GTGGTGGTTGCACAGCTCTGAAAATACTAAAAACCATTGAATGAGCACTTTAAATTGGTA 31529649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GTGGTGGTTGCACAGCTCTGAAAATACTAAAAACCATTGAATGAGCACTTTAAATTGGTA 1200

 31529650 AATTTTTATGTGAATTATGATTCAATAAAGTTGTGTTTAGATATTACTAAAAATGATGGT 31529709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AATTTTTATGTGAATTATGATTCAATAAAGTTGTGTTTAGATATTACTAAAAATGATGGT 1260

 31529710 ACAAATATTCTTTTTCACAAATGTTTTTTGTTGTTGTTTATAGTTGTTTATTTGTACATC 31529769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ACAAATATTCTTTTTCACAAATGTTTTTTGTTGTTGTTTATAGTTGTTTATTTGTACATC 1320

 31529770 TAGTAATTTGTCCCAAGGAAAGAGTATGTAAAAGAACATAAGTCACTTTAAGGCCTTTAA 31529829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TAGTAATTTGTCCCAAGGAAAGAGTATGTAAAAGAACATAAGTCACTTTAAGGCCTTTAA 1380

 31529830 TGTATACTACAAAATTGCACTCTAGAAGGTTTATACAGTTTTGCATTTCATTAGCCTGTT 31529889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TGTATACTACAAAATTGCACTCTAGAAGGTTTATACAGTTTTGCATTTCATTAGCCTGTT 1440

 31529890 TTTTTTATCTTTGACAACCTAAAGAATTTATTAGTGGTATTCATCTGAGGATCCTCTAGG 31529949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTTTTTATCTTTGACAACCTAAAGAATTTATTAGTGGTATTCATCTGAGGATCCTCTAGG 1500

 31529950 TCTATCAGAGTGTCTTTCTTATAGAAGGCATTCAATAAATAAATGTCCTAAGTGAGCAAA 31530009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TCTATCAGAGTGTCTTTCTTATAGAAGGCATTCAATAAATAAATGTCCTAAGTGAGCAAA 1560

 31530010 ACATTTTTGGTTGATTTTTAGGTGCAAATGGTTTCTTTTGATTTTAATTAAGATGCCTTT 31530069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ACATTTTTGGTTGATTTTTAGGTGCAAATGGTTTCTTTTGATTTTAATTAAGATGCCTTT 1620

 31530070 GTTTATTAGTGATGTTGACATATTTTCTTAATCTATTGGCTTTGTATAACTTTATGAATT 31530129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GTTTATTAGTGATGTTGACATATTTTCTTAATCTATTGGCTTTGTATAACTTTATGAATT 1680

 31530130 GTCTCTTCATGTCCTTTGCCTACTTTTCTATTGTGGTAACTATCTTTTATAAATGTTGTA 31530189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GTCTCTTCATGTCCTTTGCCTACTTTTCTATTGTGGTAACTATCTTTTATAAATGTTGTA 1740

 31530190 TAATTATTTAAAAATACATTAGGTTGGGCATGGTAGATCATGCCTGTAATCCCAGCTCTC 31530249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TAATTATTTAAAAATACATTAGGTTGGGCATGGTAGATCATGCCTGTAATCCCAGCTCTC 1800

 31530250 TGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATTGCTTGAGCCTAACAGTTCGAGACCAGCCTGGGCAACA 31530309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATTGCTTGAGCCTAACAGTTCGAGACCAGCCTGGGCAACA 1860

 31530310 TAGTGAGACCCCATCTCTAAAAAAAAAAACCAATAAAAATATATTAAAAGATTAACTGAT 31530369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TAGTGAGACCCCATCTCTAAAAAAAAAAACCAATAAAAATATATTAAAAGATTAACTGAT 1920

 31530370 TGTCTATCATATGGATTACAAATATCCCCCCCAATTTGTCATTTGCTTGTTAATTTTATT 31530429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TGTCTATCATATGGATTACAAATATCCCCCCCAATTTGTCATTTGCTTGTTAATTTTATT 1980

 31530430 TATGATGACTTAAAAATTACAATATATTTTTTGGTGTTCAAGTCAGTTTTTGTCCCCATT 31530489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TATGATGACTTAAAAATTACAATATATTTTTTGGTGTTCAAGTCAGTTTTTGTCCCCATT 2040

 31530490 GTGATATTTTCCTTTGCCTGTTTATCACTTTCTTAGAGAAAAGATAAATACTGATTCGTT 31530549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GTGATATTTTCCTTTGCCTGTTTATCACTTTCTTAGAGAAAAGATAAATACTGATTCGTT 2100

 31530550 CTTTTGTAGGTGTTTTATGATTTCATTGAAAATAAAATCTTCAACGCATCTAGTATTCAT 31530609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CTTTTGTAGGTGTTTTATGATTTCATTGAAAATAAAATCTTCAACGCATCTAGTATTCAT 2160

 31530610 TTGGGTGTAAGATAAAAGATAACAACGTAGGTTTCTCTTATAGTTCATCAGGTATCCTAC 31530669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TTGGGTGTAAGATAAAAGATAACAACGTAGGTTTCTCTTATAGTTCATCAGGTATCCTAC 2220

 31530670 TACTGTTTATTGAGTCATGTTTTCTGTTACCACTCTTACTATATACCAGTTTTACATACA 31530729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TACTGTTTATTGAGTCATGTTTTCTGTTACCACTCTTACTATATACCAGTTTTACATACA 2280

 31530730 TTTGGGTTGGTTTCTGAGCTTTCTATTGTCTTCCATTGCTTTGTTTAAAATTTAAAGTTT 31530789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TTTGGGTTGGTTTCTGAGCTTTCTATTGTCTTCCATTGCTTTGTTTAAAATTTAAAGTTT 2340

 31530790 ATTATTCTGACTTTCCATACTTGAATATGGTCGAATAAGTCCTCCTTTATTAATCTTGTT 31530849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 ATTATTCTGACTTTCCATACTTGAATATGGTCGAATAAGTCCTCCTTTATTAATCTTGTT 2400

 31530850 TTATTTAAAAATGGTCATTTTCACTCATTTTCCAGTTCAGTAGTTTTATTCTCTCAGTGT 31530909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TTATTTAAAAATGGTCATTTTCACTCATTTTCCAGTTCAGTAGTTTTATTCTCTCAGTGT 2460

 31530910 AATGTGATTTATCACCCCATTGCTCACCCTATTCATCTCCCAATACCCAGCTGAAAAACT 31530969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AATGTGATTTATCACCCCATTGCTCACCCTATTCATCTCCCAATACCCAGCTGAAAAACT 2520

 31530970 TTAGAAGACTGAGGCTCTTGCCCTGGCCCCATCACTTTCTAGCTATGTGGGCTTAGGCTA 31531029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TTAGAAGACTGAGGCTCTTGCCCTGGCCCCATCACTTTCTAGCTATGTGGGCTTAGGCTA 2580

 31531030 GTTATTGAACATGTCTGACTCTCACTTTTCTCCTCTGTAAGTCAGTGAGAATTATATACT 31531089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GTTATTGAACATGTCTGACTCTCACTTTTCTCCTCTGTAAGTCAGTGAGAATTATATACT 2640

 31531090 TCTTATAAGGTTGTGAGGTTCAAATGGAATAATGTGTACAGAGGCACTTGGTAAACAATG 31531149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TCTTATAAGGTTGTGAGGTTCAAATGGAATAATGTGTACAGAGGCACTTGGTAAACAATG 2700

 31531150 TAGTCATATGCAAGTCATATGCAAGTCATATGTAGTCAGCTTGGTGAATTTTGAGAAAGT 31531209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TAGTCATATGCAAGTCATATGCAAGTCATATGTAGTCAGCTTGGTGAATTTTGAGAAAGT 2760

 31531210 AAATGCAAGTTCTTTTTATGGTTTTACCTAAGGGGCCAGTGAGGGCCAGAGAAGTGCCGG 31531269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 AAATGCAAGTTCTTTTTATGGTTTTACCTAAGGGGCCAGTGAGGGCCAGAGAAGTGCCGG 2820

 31531270 GACCTATGTAAGGTCGCAAGCAAGTTCATGTGGAATGCATCTAGAACTAGAACGCTAGCC 31531329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GACCTATGTAAGGTCGCAAGCAAGTTCATGTGGAATGCATCTAGAACTAGAACGCTAGCC 2880

 31531330 TGTGTCCCAGGGCCCTTCCAACTGGGCTCTGCTGCCTGCAGTCCTGGGTGCCTTCTAATT 31531389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TGTGTCCCAGGGCCCTTCCAACTGGGCTCTGCTGCCTGCAGTCCTGGGTGCCTTCTAATT 2940

 31531390 AGCCTGTGTAGTGGTCTTGGTAAAAGTGTTTCTCCTGTACTGTCCCCTATAGGTTGTGGC 31531449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 AGCCTGTGTAGTGGTCTTGGTAAAAGTGTTTCTCCTGTACTGTCCCCTATAGGTTGTGGC 3000

 31531450 TGGCCATACCATTTCCCTGGTTCCCCCCACGCTCCTGATGACCTGGAAAGGCCATTTGAA 31531509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TGGCCATACCATTTCCCTGGTTCCCCCCACGCTCCTGATGACCTGGAAAGGCCATTTGAA 3060

 31531510 TAGTGTGGCAGACATCCTGTATGTGGACAACTT 31531542
          |||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TAGTGTGGCAGACATCCTGTATGTGGACAACTT 3093

EXCISED REGION

 31531544 CAGCTGGTTATCAGCGCTGGCCAGGACCGGGACGTCAAGGCTTGGAAACTCTCCGGTGAT 31531603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3095 CAGCTGGTTATCAGCGCTGGCCAGGACCGGGACGTCAAGGCTTGGAAACTCTCCGGTGAT 3154

 31531604 GCCATTGGTATGGGTCCTGCTGAAGCTCAGCCATGCCCATGGCCCTTCTTGTCTCTGTCC 31531663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3155 GCCATTGGTATGGGTCCTGCTGAAGCTCAGCCATGCCCATGGCCCTTCTTGTCTCTGTCC 3214

 31531664 CTGTCTGAACATAAGCTGGTATGAACTTTGTACTCTGTGGGGAGGGACTCTCAGGCCACA 31531723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3215 CTGTCTGAACATAAGCTGGTATGAACTTTGTACTCTGTGGGGAGGGACTCTCAGGCCACA 3274

 31531724 GCAACTGCCTTCACTTAAATAATATTACAGTCTGTCCAATTATCCATTCAGCAAACGGTC 31531783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3275 GCAACTGCCTTCACTTAAATAATATTACAGTCTGTCCAATTATCCATTCAGCAAACGGTC 3334

 31531784 CATCCATTCACCCATCCACCCAATATTATTCACCTATGTATATTTTTGCAAATCATATAT 31531843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3335 CATCCATTCACCCATCCACCCAATATTATTCACCTATGTATATTTTTGCAAATCATATAT 3394

 31531844 CTGATAAAGCATATTCCTTTCTCTTTTAAAAAATAAACTTAATTGTTGCATTGTATATAA 31531903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3395 CTGATAAAGCATATTCCTTTCTCTTTTAAAAAATAAACTTAATTGTTGCATTGTATATAA 3454

 31531904 AGAAAAACATACAAACCAGAAGGGTTCAGCTTGGTGAATTTTGAGAAAGTAAATACATAC 31531963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3455 AGAAAAACATACAAACCAGAAGGGTTCAGCTTGGTGAATTTTGAGAAAGTAAATACATAC 3514

 31531964 CCATATAGCCACCGTTCATGTCAAGAAATAATTAGGGCCAGGCGCGGTGGCTCACTACTG 31532023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3515 CCATATAGCCACCGTTCATGTCAAGAAATAATTAGGGCCAGGCGCGGTGGCTCACTACTG 3574

 31532024 TAATCCCAACACTTTTTTGTCCCCTTTTCCTCCTGTGCTGTCTTCCTATGTGTTTGTTTG 31532083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3575 TAATCCCAACACTTTTTTGTCCCCTTTTCCTCCTGTGCTGTCTTCCTATGTGTTTGTTTG 3634

 31532084 TTTGTTTTAGTGACCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGTGCAT 31532143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3635 TTTGTTTTAGTGACCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGTGCAT 3694

 31532144 GCCTGTAATCCCAGCTACTTGAGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGTTTGAACCTGGGAGGCA 31532203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3695 GCCTGTAATCCCAGCTACTTGAGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGTTTGAACCTGGGAGGCA 3754

 31532204 GAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCATGTCACTGCACTCCAGCCTGGGCA 31532250
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3755 GAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCATGTCACTGCACTCCAGCCTGGGCA 3801

Alignment time is 3.32713 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31515486,31539389] =>     23904 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    2336] =>      2336 nucs 'mol-32-2fee-209213_2336'

Score:        2283
Aligned:      2327        nucs
Identic:      2323 (100%) nucs =>       966 (100%)      1357 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31524519,31525486] EXCISED REGION [31529390,31530748]
 second seq =>  [       1,     968] EXCISED REGION [     978,    2336]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3903 nucs [31525487,31529389]
 second seq =>         9 nucs [969,977]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31524519 GCTTTATAATATATTTTGAAATCAGGGACTGTGATGTCTTTAGCTTTGTTCTTTTTGCTC 31524578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCTTTATAATATATTTTGAAATCAGGGACTGTGATGTCTTTAGCTTTGTTCTTTTTGCTC 60

 31524579 AAGATTGTTTTGGCTAGCCAGGGTCTTTTATGATTGCATATGAATTTAAGGATTGTTTTA 31524638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAGATTGTTTTGGCTAGCCAGGGTCTTTTATGATTGCATATGAATTTAAGGATTGTTTTA 120

 31524639 TTTCTATAAGAAATGACATTGGAATTTTGATAGGGACTGCATTGAATCTGTAGATTGCTT 31524698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTCTATAAGAAATGACATTGGAATTTTGATAGGGACTGCATTGAATCTGTAGATTGCTT 180

 31524699 TGGGTAGTATGAATATTTTAATAATATTAATTCTTCTAATTTATCAACACAAGATAGCTT 31524758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGGGTAGTATGAATATTTTAATAATATTAATTCTTCTAATTTATCAACACAAGATAGCTT 240

 31524759 TCCATTTATTTGTGTTTTCTTAAACAATGTTTTAGTTTCCAGTGTACAGATCTTTTAACT 31524818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCCATTTATTTGTGTTTTCTTAAACAATGTTTTAGTTTCCAGTGTACAGATCTTTTAACT 300

 31524819 TCTTGGTTAAATTTACCCCTAAGTATTTTATTTTATTTTAAAATACCTGGCTAATTTTGT 31524878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCTTGGTTAAATTTACCCCTAAGTATTTTATTTTATTTTAAAATACCTGGCTAATTTTGT 360

 31524879 ATTTAATTTTATATTGTATTTATTTTATTTGTAATAAAATTAAGCATTTTATTTTATTTT 31524938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATTTAATTTTATATTGTATTTATTTTATTTGTAATAAAATTAAGCATTTTATTTTATTTT 420

 31524939 AAAATACCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGC 31524998
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
      421 AAAATACCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGATAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGC 480

 31524999 TGGTCTCGAACTCCAGACCTCAGGTGATCCGACTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGTAT 31525058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGGTCTCGAACTCCAGACCTCAGGTGATCCGACTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGTAT 540

 31525059 TAGAAGCATGAGCCACTGCCCACTGCACCTAGCTGAAAACCACACTTTCTGTTGATTAAA 31525118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TAGAAGCATGAGCCACTGCCCACTGCACCTAGCTGAAAACCACACTTTCTGTTGATTAAA 600

 31525119 TAATATTTCACCTTATGGAGTTACAAATTTTCATTTTATGGGGTTATAATCACTTACTTA 31525178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TAATATTTCACCTTATGGAGTTACAAATTTTCATTTTATGGGGTTATAATCACTTACTTA 660

 31525179 GCTTGTTATCTTTTGTTGGACATTAATGTGGTTTCTAACTTTTCATTATCAAAAAATAAA 31525238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GCTTGTTATCTTTTGTTGGACATTAATGTGGTTTCTAACTTTTCATTATCAAAAAATAAA 720

 31525239 AGAAAATGGACAAAACCTCAGAAAGACACAAACTACTAAAGCTGACTTAATAAGAAATAG 31525298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGAAAATGGACAAAACCTCAGAAAGACACAAACTACTAAAGCTGACTTAATAAGAAATAG 780

 31525299 AAAATCTGAATATATAGAAAATCTGAATGTAACAAGTAAGGAGATTGGATTAGTAATAAA 31525358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAAATCTGAATATATAGAAAATCTGAATGTAACAAGTAAGGAGATTGGATTAGTAATAAA 840

 31525359 ATTTCCCACAAAGAGAAGTACACATTCAGATGGTTTCACTGGTAAATTCTACCAAATATT 31525418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATTTCCCACAAAGAGAAGTACACATTCAGATGGTTTCACTGGTAAATTCTACCAAATATT 900

 31525419 TAAAGATTTTTCTTTTTTTTTGTTGAGACAGAGTCTCACTCTATTGCCCAGGCTGGAGTA 31525478
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TAAAGATTTTTCTTTTTTTTTGTTGAGGCAGAGTCTCACTCTATTGCCCAGGCTGGAGTA 960

 31525479 CAATGGTG 31525486
          ||||||||
      961 CAATGGTG 968

EXCISED REGION

 31529390 AATACTGTGCTAAGTGAAAGAAGCCAACCACAAAATACCATATATTGTGTGATTCTGCTT 31529449
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      978 AATACTGTGCTAAGTGAAAGAAGTCAACCACAAAATACCATATATTGTGTGATTCTGCTT 1037

 31529450 AAATGACATGTCCAGAATGTCCATATTAAAGTAGATTAGTGGTTTCCTGAGGCTGGGGGA 31529509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1038 AAATGACATGTCCAGAATGTCCATATTAAAGTAGATTAGTGGTTTCCTGAGGCTGGGGGA 1097

 31529510 GGGAGTTGGGGAAATTGCGTAGTGACTACTGGGTAAAGAGTTTCTTTCTGGGGTGATGAA 31529569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1098 GGGAGTTGGGGAAATTGCGTAGTGACTACTGGGTAAAGAGTTTCTTTCTGGGGTGATGAA 1157

 31529570 ATGGTCTAAAATAGAATGTGGTGGTGGTTGCACAGCTCTGAAAATACTAAAAACCATTGA 31529629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1158 ATGGTCTAAAATAGAATGTGGTGGTGGTTGCACAGCTCTGAAAATACTAAAAACCATTGA 1217

 31529630 ATGAGCACTTTAAATTGGTAAATTTTTATGTGAATTATGATTCAATAAAGTTGTGTTTAG 31529689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1218 ATGAGCACTTTAAATTGGTAAATTTTTATGTGAATTATGATTCAATAAAGTTGTGTTTAG 1277

 31529690 ATATTACTAAAAATGATGGTACAAATATTCTTTTTCACAAATGTTTTTTGTTGTTGTTTA 31529749
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1278 ATATTACTAAAAATGATGGTACAAGTATTCTTTTTCACAAATGTTTTTTGTTGTTGTTTA 1337

 31529750 TAGTTGTTTATTTGTACATCTAGTAATTTGTCCCAAGGAAAGAGTATGTAAAAGAACATA 31529809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1338 TAGTTGTTTATTTGTACATCTAGTAATTTGTCCCAAGGAAAGAGTATGTAAAAGAACATA 1397

 31529810 AGTCACTTTAAGGCCTTTAATGTATACTACAAAATTGCACTCTAGAAGGTTTATACAGTT 31529869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1398 AGTCACTTTAAGGCCTTTAATGTATACTACAAAATTGCACTCTAGAAGGTTTATACAGTT 1457

 31529870 TTGCATTTCATTAGCCTGTTTTTTTTATCTTTGACAACCTAAAGAATTTATTAGTGGTAT 31529929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1458 TTGCATTTCATTAGCCTGTTTTTTTTATCTTTGACAACCTAAAGAATTTATTAGTGGTAT 1517

 31529930 TCATCTGAGGATCCTCTAGGTCTATCAGAGTGTCTTTCTTATAGAAGGCATTCAATAAAT 31529989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1518 TCATCTGAGGATCCTCTAGGTCTATCAGAGTGTCTTTCTTATAGAAGGCATTCAATAAAT 1577

 31529990 AAATGTCCTAAGTGAGCAAAACATTTTTGGTTGATTTTTAGGTGCAAATGGTTTCTTTTG 31530049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1578 AAATGTCCTAAGTGAGCAAAACATTTTTGGTTGATTTTTAGGTGCAAATGGTTTCTTTTG 1637

 31530050 ATTTTAATTAAGATGCCTTTGTTTATTAGTGATGTTGACATATTTTCTTAATCTATTGGC 31530109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1638 ATTTTAATTAAGATGCCTTTGTTTATTAGTGATGTTGACATATTTTCTTAATCTATTGGC 1697

 31530110 TTTGTATAACTTTATGAATTGTCTCTTCATGTCCTTTGCCTACTTTTCTATTGTGGTAAC 31530169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1698 TTTGTATAACTTTATGAATTGTCTCTTCATGTCCTTTGCCTACTTTTCTATTGTGGTAAC 1757

 31530170 TATCTTTTATAAATGTTGTATAATTATTTAAAAATACATTAGGTTGGGCATGGTAGATCA 31530229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1758 TATCTTTTATAAATGTTGTATAATTATTTAAAAATACATTAGGTTGGGCATGGTAGATCA 1817

 31530230 TGCCTGTAATCCCAGCTCTCTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATTGCTTGAGCCTAACAGTT 31530289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1818 TGCCTGTAATCCCAGCTCTCTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATTGCTTGAGCCTAACAGTT 1877

 31530290 CGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCCATCTCTAAAAAAAAAAACCAATAAAAAT 31530349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1878 CGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCCATCTCTAAAAAAAAAAACCAATAAAAAT 1937

 31530350 ATATTAAAAGATTAACTGATTGTCTATCATATGGATTACAAATATCCCCCCCAATTTGTC 31530409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1938 ATATTAAAAGATTAACTGATTGTCTATCATATGGATTACAAATATCCCCCCCAATTTGTC 1997

 31530410 ATTTGCTTGTTAATTTTATTTATGATGACTTAAAAATTACAATATATTTTTTGGTGTTCA 31530469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1998 ATTTGCTTGTTAATTTTATTTATGATGACTTAAAAATTACAATATATTTTTTGGTGTTCA 2057

 31530470 AGTCAGTTTTTGTCCCCATTGTGATATTTTCCTTTGCCTGTTTATCACTTTCTTAGAGAA 31530529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2058 AGTCAGTTTTTGTCCCCATTGTGATATTTTCCTTTGCCTGTTTATCACTTTCTTAGAGAA 2117

 31530530 AAGATAAATACTGATTCGTTCTTTTGTAGGTGTTTTATGATTTCATTGAAAATAAAATCT 31530589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2118 AAGATAAATACTGATTCGTTCTTTTGTAGGTGTTTTATGATTTCATTGAAAATAAAATCT 2177

 31530590 TCAACGCATCTAGTATTCATTTGGGTGTAAGATAAAAGATAACAACGTAGGTTTCTCTTA 31530649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2178 TCAACGCATCTAGTATTCATTTGGGTGTAAGATAAAAGATAACAACGTAGGTTTCTCTTA 2237

 31530650 TAGTTCATCAGGTATCCTACTACTGTTTATTGAGTCATGTTTTCTGTTACCACTCTTACT 31530709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2238 TAGTTCATCAGGTATCCTACTACTGTTTATTGAGTCATGTTTTCTGTTACCACTCTTACT 2297

 31530710 ATATACCAGTTTTACATACATTTGGGTTGGTTTCTGAGC 31530748
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2298 ATATACCAGTTTTACATACATTTGGGTTGGTTTCTGAGC 2336

Alignment time is 2.03287 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31515486,31539389] =>     23904 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    3084] =>      3084 nucs 'mol-32-2ff9-312968_3084'

Score:        3031
Aligned:      3075        nucs
Identic:      3071 (100%) nucs =>      2091 (100%)       980 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31523393,31525486] EXCISED REGION [31529390,31530370]
 second seq =>  [       1,    2094] EXCISED REGION [    2104,    3084]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3903 nucs [31525487,31529389]
 second seq =>         9 nucs [2095,2103]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31523393 ACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGGTGGGATTA 31523452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGGTGGGATTA 60

 31523453 CAGGCATGCGCCACCACGCCCAACTAATTTTGTAGTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCA 31523512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAGGCATGCGCCACCACGCCCAACTAATTTTGTAGTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCA 120

 31523513 TGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCACCTTGCCTCCCAA 31523572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCACCTTGCCTCCCAA 180

 31523573 AGTGCTGGGATTACAAGAGTGAGTGCACCTGGCCCACTTTGCTCATTTTCTAATTGGGTT 31523632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGTGCTGGGATTACAAGAGTGAGTGCACCTGGCCCACTTTGCTCATTTTCTAATTGGGTT 240

 31523633 ATTCGTTTTCTGGCTATTGAGTTGTTTGAGTTTCTTATTTATTGTGGATGTTACTCCCTT 31523692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATTCGTTTTCTGGCTATTGAGTTGTTTGAGTTTCTTATTTATTGTGGATGTTACTCCCTT 300

 31523693 ATCAGATGTATGATTTACATATATTTTCTGTCACTCTGTGGGTTATCTCTTTACTTTGTT 31523752
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
      301 ATCAGATGTATGATTTACATATATTTTCTGTCACTTTGTGGGTTATCTCTTTACTTTGTT 360

 31523753 CATTGTTTCCTTTCTGTCCAAAAGCTTTGTATCTTGTCTAAAATCCCATTTGTCTATTTT 31523812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CATTGTTTCCTTTCTGTCCAAAAGCTTTGTATCTTGTCTAAAATCCCATTTGTCTATTTT 420

 31523813 TGCTTTTATTTATTTTTATTTTTATTTTTATTTTTTATTTTTTTGAAACGGAGTCTTGCT 31523872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGCTTTTATTTATTTTTATTTTTATTTTTATTTTTTATTTTTTTGAAACGGAGTCTTGCT 480

 31523873 CTGTCACCCAGGTTGGAGTGCAGTGGTGCAATCTCAGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCA 31523932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTGTCACCCAGGTTGGAGTGCAGTGGTGCAATCTCAGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCA 540

 31523933 GGTTCAAGGAAGTCTCCTACTCCAACTTCCTGAGTAGCTGGGATTATAGGCGTGTGCCAC 31523992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGTTCAAGGAAGTCTCCTACTCCAACTTCCTGAGTAGCTGGGATTATAGGCGTGTGCCAC 600

 31523993 CATGCCTAGCTAATTTTTGTATTTTTTGGTAGAGACAGGATTTCACCATGTTGGCCAGGC 31524052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CATGCCTAGCTAATTTTTGTATTTTTTGGTAGAGACAGGATTTCACCATGTTGGCCAGGC 660

 31524053 TGGTGTTGAACTCTTGACCTCAGGCAATCCGCCTGACTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGAT 31524112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGGTGTTGAACTCTTGACCTCAGGCAATCCGCCTGACTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGAT 720

 31524113 TACACGTGTGAGCCACCGCGCCTGGCCTATTTTTGCTTTTATTACCTGTGCTTTTGGGGT 31524172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TACACGTGTGAGCCACCGCGCCTGGCCTATTTTTGCTTTTATTACCTGTGCTTTTGGGGT 780

 31524173 CATAGCTAAATAACCATTGCTCAGATCAATGTCATGGAGCCTTTCCTCTAGGTATTCTTC 31524232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CATAGCTAAATAACCATTGCTCAGATCAATGTCATGGAGCCTTTCCTCTAGGTATTCTTC 840

 31524233 TAGTTGTTTTACAGTCTCAGATCTTATATTTAAGACTTTAATCCATTTTGAGTTGATTTT 31524292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TAGTTGTTTTACAGTCTCAGATCTTATATTTAAGACTTTAATCCATTTTGAGTTGATTTT 900

 31524293 TTATACTGTGTGAGATAAGGATCCAATTTTATTCTTCTGTATGTGGATCCAATTTTCCTA 31524352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTATACTGTGTGAGATAAGGATCCAATTTTATTCTTCTGTATGTGGATCCAATTTTCCTA 960

 31524353 GTACAGTTTATTGAAAAGACTGTCTTTTCCCCATTATGTATTAGTAACACCTTTGTCAAA 31524412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GTACAGTTTATTGAAAAGACTGTCTTTTCCCCATTATGTATTAGTAACACCTTTGTCAAA 1020

 31524413 AATCAATTGACTATTAGTGCATGGGTTTATTTCTGGGTTTTCTATCTTGTTACATTAGTC 31524472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AATCAATTGACTATTAGTGCATGGGTTTATTTCTGGGTTTTCTATCTTGTTACATTAGTC 1080

 31524473 GATGTGTCTATTTTTATGCCAGCACCATACTGTTTTGATTATATTAGCTTTATAATATAT 31524532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GATGTGTCTATTTTTATGCCAGCACCATACTGTTTTGATTATATTAGCTTTATAATATAT 1140

 31524533 TTTGAAATCAGGGACTGTGATGTCTTTAGCTTTGTTCTTTTTGCTCAAGATTGTTTTGGC 31524592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTTGAAATCAGGGACTGTGATGTCTTTAGCTTTGTTCTTTTTGCTCAAGATTGTTTTGGC 1200

 31524593 TAGCCAGGGTCTTTTATGATTGCATATGAATTTAAGGATTGTTTTATTTCTATAAGAAAT 31524652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TAGCCAGGGTCTTTTATGATTGCATATGAATTTAAGGATTGTTTTATTTCTATAAGAAAT 1260

 31524653 GACATTGGAATTTTGATAGGGACTGCATTGAATCTGTAGATTGCTTTGGGTAGTATGAAT 31524712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GACATTGGAATTTTGATAGGGACTGCATTGAATCTGTAGATTGCTTTGGGTAGTATGAAT 1320

 31524713 ATTTTAATAATATTAATTCTTCTAATTTATCAACACAAGATAGCTTTCCATTTATTTGTG 31524772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ATTTTAATAATATTAATTCTTCTAATTTATCAACACAAGATAGCTTTCCATTTATTTGTG 1380

 31524773 TTTTCTTAAACAATGTTTTAGTTTCCAGTGTACAGATCTTTTAACTTCTTGGTTAAATTT 31524832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTTTCTTAAACAATGTTTTAGTTTCCAGTGTACAGATCTTTTAACTTCTTGGTTAAATTT 1440

 31524833 ACCCCTAAGTATTTTATTTTATTTTAAAATACCTGGCTAATTTTGTATTTAATTTTATAT 31524892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ACCCCTAAGTATTTTATTTTATTTTAAAATACCTGGCTAATTTTGTATTTAATTTTATAT 1500

 31524893 TGTATTTATTTTATTTGTAATAAAATTAAGCATTTTATTTTATTTTAAAATACCTGGCTA 31524952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TGTATTTATTTTATTTGTAATAAAATTAAGCATTTTATTTTATTTTAAAATACCTGGCTA 1560

 31524953 ATTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCC 31525012
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ATTTTGTATTTTTAGTAGAGATAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCC 1620

 31525013 AGACCTCAGGTGATCCGACTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGTATTAGAAGCATGAGCC 31525072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AGACCTCAGGTGATCCGACTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGTATTAGAAGCATGAGCC 1680

 31525073 ACTGCCCACTGCACCTAGCTGAAAACCACACTTTCTGTTGATTAAATAATATTTCACCTT 31525132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ACTGCCCACTGCACCTAGCTGAAAACCACACTTTCTGTTGATTAAATAATATTTCACCTT 1740

 31525133 ATGGAGTTACAAATTTTCATTTTATGGGGTTATAATCACTTACTTAGCTTGTTATCTTTT 31525192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ATGGAGTTACAAATTTTCATTTTATGGGGTTATAATCACTTACTTAGCTTGTTATCTTTT 1800

 31525193 GTTGGACATTAATGTGGTTTCTAACTTTTCATTATCAAAAAATAAAAGAAAATGGACAAA 31525252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GTTGGACATTAATGTGGTTTCTAACTTTTCATTATCAAAAAATAAAAGAAAATGGACAAA 1860

 31525253 ACCTCAGAAAGACACAAACTACTAAAGCTGACTTAATAAGAAATAGAAAATCTGAATATA 31525312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ACCTCAGAAAGACACAAACTACTAAAGCTGACTTAATAAGAAATAGAAAATCTGAATATA 1920

 31525313 TAGAAAATCTGAATGTAACAAGTAAGGAGATTGGATTAGTAATAAAATTTCCCACAAAGA 31525372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TAGAAAATCTGAATGTAACAAGTAAGGAGATTGGATTAGTAATAAAATTTCCCACAAAGA 1980

 31525373 GAAGTACACATTCAGATGGTTTCACTGGTAAATTCTACCAAATATTTAAAGATTTTTCTT 31525432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GAAGTACACATTCAGATGGTTTCACTGGTAAATTCTACCAAATATTTAAAGATTTTTCTT 2040

 31525433 TTTTTTTGTTGAGACAGAGTCTCACTCTATTGCCCAGGCTGGAGTACAATGGTG 31525486
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TTTTTTTGTTGAGGCAGAGTCTCACTCTATTGCCCAGGCTGGAGTACAATGGTG 2094

EXCISED REGION

 31529390 AATACTGTGCTAAGTGAAAGAAGCCAACCACAAAATACCATATATTGTGTGATTCTGCTT 31529449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2104 AATACTGTGCTAAGTGAAAGAAGCCAACCACAAAATACCATATATTGTGTGATTCTGCTT 2163

 31529450 AAATGACATGTCCAGAATGTCCATATTAAAGTAGATTAGTGGTTTCCTGAGGCTGGGGGA 31529509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2164 AAATGACATGTCCAGAATGTCCATATTAAAGTAGATTAGTGGTTTCCTGAGGCTGGGGGA 2223

 31529510 GGGAGTTGGGGAAATTGCGTAGTGACTACTGGGTAAAGAGTTTCTTTCTGGGGTGATGAA 31529569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     2224 GGGAGTTGGGGAAATTGCGTAGTGACTACTGGGTAAAGAGTTTCTTTCTGGGGTGATGGA 2283

 31529570 ATGGTCTAAAATAGAATGTGGTGGTGGTTGCACAGCTCTGAAAATACTAAAAACCATTGA 31529629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2284 ATGGTCTAAAATAGAATGTGGTGGTGGTTGCACAGCTCTGAAAATACTAAAAACCATTGA 2343

 31529630 ATGAGCACTTTAAATTGGTAAATTTTTATGTGAATTATGATTCAATAAAGTTGTGTTTAG 31529689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2344 ATGAGCACTTTAAATTGGTAAATTTTTATGTGAATTATGATTCAATAAAGTTGTGTTTAG 2403

 31529690 ATATTACTAAAAATGATGGTACAAATATTCTTTTTCACAAATGTTTTTTGTTGTTGTTTA 31529749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2404 ATATTACTAAAAATGATGGTACAAATATTCTTTTTCACAAATGTTTTTTGTTGTTGTTTA 2463

 31529750 TAGTTGTTTATTTGTACATCTAGTAATTTGTCCCAAGGAAAGAGTATGTAAAAGAACATA 31529809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2464 TAGTTGTTTATTTGTACATCTAGTAATTTGTCCCAAGGAAAGAGTATGTAAAAGAACATA 2523

 31529810 AGTCACTTTAAGGCCTTTAATGTATACTACAAAATTGCACTCTAGAAGGTTTATACAGTT 31529869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2524 AGTCACTTTAAGGCCTTTAATGTATACTACAAAATTGCACTCTAGAAGGTTTATACAGTT 2583

 31529870 TTGCATTTCATTAGCCTGTTTTTTTTATCTTTGACAACCTAAAGAATTTATTAGTGGTAT 31529929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2584 TTGCATTTCATTAGCCTGTTTTTTTTATCTTTGACAACCTAAAGAATTTATTAGTGGTAT 2643

 31529930 TCATCTGAGGATCCTCTAGGTCTATCAGAGTGTCTTTCTTATAGAAGGCATTCAATAAAT 31529989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2644 TCATCTGAGGATCCTCTAGGTCTATCAGAGTGTCTTTCTTATAGAAGGCATTCAATAAAT 2703

 31529990 AAATGTCCTAAGTGAGCAAAACATTTTTGGTTGATTTTTAGGTGCAAATGGTTTCTTTTG 31530049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2704 AAATGTCCTAAGTGAGCAAAACATTTTTGGTTGATTTTTAGGTGCAAATGGTTTCTTTTG 2763

 31530050 ATTTTAATTAAGATGCCTTTGTTTATTAGTGATGTTGACATATTTTCTTAATCTATTGGC 31530109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2764 ATTTTAATTAAGATGCCTTTGTTTATTAGTGATGTTGACATATTTTCTTAATCTATTGGC 2823

 31530110 TTTGTATAACTTTATGAATTGTCTCTTCATGTCCTTTGCCTACTTTTCTATTGTGGTAAC 31530169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2824 TTTGTATAACTTTATGAATTGTCTCTTCATGTCCTTTGCCTACTTTTCTATTGTGGTAAC 2883

 31530170 TATCTTTTATAAATGTTGTATAATTATTTAAAAATACATTAGGTTGGGCATGGTAGATCA 31530229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2884 TATCTTTTATAAATGTTGTATAATTATTTAAAAATACATTAGGTTGGGCATGGTAGATCA 2943

 31530230 TGCCTGTAATCCCAGCTCTCTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATTGCTTGAGCCTAACAGTT 31530289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2944 TGCCTGTAATCCCAGCTCTCTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATTGCTTGAGCCTAACAGTT 3003

 31530290 CGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCCATCTCTAAAAAAAAAAACCAATAAAAAT 31530349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3004 CGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCCATCTCTAAAAAAAAAAACCAATAAAAAT 3063

 31530350 ATATTAAAAGATTAACTGATT 31530370
          |||||||||||||||||||||
     3064 ATATTAAAAGATTAACTGATT 3084

Alignment time is 2.69891 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31515486,31539389] =>     23904 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    2837] =>      2837 nucs 'mol-32-300f-179726_2837'

Score:        2837
Aligned:      2837        nucs
Identic:      2837 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31523479,31526315]
 second seq =>  [       1,    2837]

 31523479 ATTTTGTAGTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCC 31523538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATTTTGTAGTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCC 60

 31523539 TGACCTCAGGTGATCTGCCCACCTTGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGAGTGAGTGC 31523598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGACCTCAGGTGATCTGCCCACCTTGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGAGTGAGTGC 120

 31523599 ACCTGGCCCACTTTGCTCATTTTCTAATTGGGTTATTCGTTTTCTGGCTATTGAGTTGTT 31523658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACCTGGCCCACTTTGCTCATTTTCTAATTGGGTTATTCGTTTTCTGGCTATTGAGTTGTT 180

 31523659 TGAGTTTCTTATTTATTGTGGATGTTACTCCCTTATCAGATGTATGATTTACATATATTT 31523718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGAGTTTCTTATTTATTGTGGATGTTACTCCCTTATCAGATGTATGATTTACATATATTT 240

 31523719 TCTGTCACTCTGTGGGTTATCTCTTTACTTTGTTCATTGTTTCCTTTCTGTCCAAAAGCT 31523778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCTGTCACTCTGTGGGTTATCTCTTTACTTTGTTCATTGTTTCCTTTCTGTCCAAAAGCT 300

 31523779 TTGTATCTTGTCTAAAATCCCATTTGTCTATTTTTGCTTTTATTTATTTTTATTTTTATT 31523838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTGTATCTTGTCTAAAATCCCATTTGTCTATTTTTGCTTTTATTTATTTTTATTTTTATT 360

 31523839 TTTATTTTTTATTTTTTTGAAACGGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGTTGGAGTGCAGTGG 31523898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTTATTTTTTATTTTTTTGAAACGGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGTTGGAGTGCAGTGG 420

 31523899 TGCAATCTCAGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGGAAGTCTCCTACTCCAAC 31523958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGCAATCTCAGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGGAAGTCTCCTACTCCAAC 480

 31523959 TTCCTGAGTAGCTGGGATTATAGGCGTGTGCCACCATGCCTAGCTAATTTTTGTATTTTT 31524018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTCCTGAGTAGCTGGGATTATAGGCGTGTGCCACCATGCCTAGCTAATTTTTGTATTTTT 540

 31524019 TGGTAGAGACAGGATTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTGTTGAACTCTTGACCTCAGGCA 31524078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGGTAGAGACAGGATTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTGTTGAACTCTTGACCTCAGGCA 600

 31524079 ATCCGCCTGACTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACACGTGTGAGCCACCGCGCCTGGC 31524138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATCCGCCTGACTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACACGTGTGAGCCACCGCGCCTGGC 660

 31524139 CTATTTTTGCTTTTATTACCTGTGCTTTTGGGGTCATAGCTAAATAACCATTGCTCAGAT 31524198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTATTTTTGCTTTTATTACCTGTGCTTTTGGGGTCATAGCTAAATAACCATTGCTCAGAT 720

 31524199 CAATGTCATGGAGCCTTTCCTCTAGGTATTCTTCTAGTTGTTTTACAGTCTCAGATCTTA 31524258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CAATGTCATGGAGCCTTTCCTCTAGGTATTCTTCTAGTTGTTTTACAGTCTCAGATCTTA 780

 31524259 TATTTAAGACTTTAATCCATTTTGAGTTGATTTTTTATACTGTGTGAGATAAGGATCCAA 31524318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TATTTAAGACTTTAATCCATTTTGAGTTGATTTTTTATACTGTGTGAGATAAGGATCCAA 840

 31524319 TTTTATTCTTCTGTATGTGGATCCAATTTTCCTAGTACAGTTTATTGAAAAGACTGTCTT 31524378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTTTATTCTTCTGTATGTGGATCCAATTTTCCTAGTACAGTTTATTGAAAAGACTGTCTT 900

 31524379 TTCCCCATTATGTATTAGTAACACCTTTGTCAAAAATCAATTGACTATTAGTGCATGGGT 31524438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTCCCCATTATGTATTAGTAACACCTTTGTCAAAAATCAATTGACTATTAGTGCATGGGT 960

 31524439 TTATTTCTGGGTTTTCTATCTTGTTACATTAGTCGATGTGTCTATTTTTATGCCAGCACC 31524498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTATTTCTGGGTTTTCTATCTTGTTACATTAGTCGATGTGTCTATTTTTATGCCAGCACC 1020

 31524499 ATACTGTTTTGATTATATTAGCTTTATAATATATTTTGAAATCAGGGACTGTGATGTCTT 31524558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATACTGTTTTGATTATATTAGCTTTATAATATATTTTGAAATCAGGGACTGTGATGTCTT 1080

 31524559 TAGCTTTGTTCTTTTTGCTCAAGATTGTTTTGGCTAGCCAGGGTCTTTTATGATTGCATA 31524618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TAGCTTTGTTCTTTTTGCTCAAGATTGTTTTGGCTAGCCAGGGTCTTTTATGATTGCATA 1140

 31524619 TGAATTTAAGGATTGTTTTATTTCTATAAGAAATGACATTGGAATTTTGATAGGGACTGC 31524678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGAATTTAAGGATTGTTTTATTTCTATAAGAAATGACATTGGAATTTTGATAGGGACTGC 1200

 31524679 ATTGAATCTGTAGATTGCTTTGGGTAGTATGAATATTTTAATAATATTAATTCTTCTAAT 31524738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATTGAATCTGTAGATTGCTTTGGGTAGTATGAATATTTTAATAATATTAATTCTTCTAAT 1260

 31524739 TTATCAACACAAGATAGCTTTCCATTTATTTGTGTTTTCTTAAACAATGTTTTAGTTTCC 31524798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTATCAACACAAGATAGCTTTCCATTTATTTGTGTTTTCTTAAACAATGTTTTAGTTTCC 1320

 31524799 AGTGTACAGATCTTTTAACTTCTTGGTTAAATTTACCCCTAAGTATTTTATTTTATTTTA 31524858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AGTGTACAGATCTTTTAACTTCTTGGTTAAATTTACCCCTAAGTATTTTATTTTATTTTA 1380

 31524859 AAATACCTGGCTAATTTTGTATTTAATTTTATATTGTATTTATTTTATTTGTAATAAAAT 31524918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AAATACCTGGCTAATTTTGTATTTAATTTTATATTGTATTTATTTTATTTGTAATAAAAT 1440

 31524919 TAAGCATTTTATTTTATTTTAAAATACCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGG 31524978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TAAGCATTTTATTTTATTTTAAAATACCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGG 1500

 31524979 TTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCAGACCTCAGGTGATCCGACTGCCTCG 31525038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCAGACCTCAGGTGATCCGACTGCCTCG 1560

 31525039 GCCTCCCAAAGTGCTGGTATTAGAAGCATGAGCCACTGCCCACTGCACCTAGCTGAAAAC 31525098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GCCTCCCAAAGTGCTGGTATTAGAAGCATGAGCCACTGCCCACTGCACCTAGCTGAAAAC 1620

 31525099 CACACTTTCTGTTGATTAAATAATATTTCACCTTATGGAGTTACAAATTTTCATTTTATG 31525158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CACACTTTCTGTTGATTAAATAATATTTCACCTTATGGAGTTACAAATTTTCATTTTATG 1680

 31525159 GGGTTATAATCACTTACTTAGCTTGTTATCTTTTGTTGGACATTAATGTGGTTTCTAACT 31525218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GGGTTATAATCACTTACTTAGCTTGTTATCTTTTGTTGGACATTAATGTGGTTTCTAACT 1740

 31525219 TTTCATTATCAAAAAATAAAAGAAAATGGACAAAACCTCAGAAAGACACAAACTACTAAA 31525278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TTTCATTATCAAAAAATAAAAGAAAATGGACAAAACCTCAGAAAGACACAAACTACTAAA 1800

 31525279 GCTGACTTAATAAGAAATAGAAAATCTGAATATATAGAAAATCTGAATGTAACAAGTAAG 31525338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GCTGACTTAATAAGAAATAGAAAATCTGAATATATAGAAAATCTGAATGTAACAAGTAAG 1860

 31525339 GAGATTGGATTAGTAATAAAATTTCCCACAAAGAGAAGTACACATTCAGATGGTTTCACT 31525398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GAGATTGGATTAGTAATAAAATTTCCCACAAAGAGAAGTACACATTCAGATGGTTTCACT 1920

 31525399 GGTAAATTCTACCAAATATTTAAAGATTTTTCTTTTTTTTTGTTGAGACAGAGTCTCACT 31525458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GGTAAATTCTACCAAATATTTAAAGATTTTTCTTTTTTTTTGTTGAGACAGAGTCTCACT 1980

 31525459 CTATTGCCCAGGCTGGAGTACAATGGTGTGATCTTGACTCACTGCAACCTCTGCCTCCGG 31525518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CTATTGCCCAGGCTGGAGTACAATGGTGTGATCTTGACTCACTGCAACCTCTGCCTCCGG 2040

 31525519 GGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCAC 31525578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCAC 2100

 31525579 CATGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCACATTGGCTAGGCT 31525638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CATGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCACATTGGCTAGGCT 2160

 31525639 GGTCTCGAACTCCCAACCTCGTGATCCGCCCACCATGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAC 31525698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GGTCTCGAACTCCCAACCTCGTGATCCGCCCACCATGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAC 2220

 31525699 AGGCGTGAGCCACCACACCTGGCTAAAGAATTAATGTCAATTGCTCACAAACTCTTCCAA 31525758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AGGCGTGAGCCACCACACCTGGCTAAAGAATTAATGTCAATTGCTCACAAACTCTTCCAA 2280

 31525759 AAGAGTTCTCTATGAGGCCAGTATTACCTTGATACCAAAACCAGATAAAGATATCACAGG 31525818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AAGAGTTCTCTATGAGGCCAGTATTACCTTGATACCAAAACCAGATAAAGATATCACAGG 2340

 31525819 AAAATAAAACTGTAGACCAAATATTTTTATGAATATAGATACAAAAATCTTCAAAATACT 31525878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AAAATAAAACTGTAGACCAAATATTTTTATGAATATAGATACAAAAATCTTCAAAATACT 2400

 31525879 AGCAAATTGAAACCAACAACATATGAAAATGATTATACACCATGACCAAGTAAGATTTAT 31525938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AGCAAATTGAAACCAACAACATATGAAAATGATTATACACCATGACCAAGTAAGATTTAT 2460

 31525939 CCCAGGAATGCAAAGTTGGCTAAATATCCAAAATCAATTAATGTAATACACCATATTAAC 31525998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CCCAGGAATGCAAAGTTGGCTAAATATCCAAAATCAATTAATGTAATACACCATATTAAC 2520

 31525999 TGAATAAAAAACAAAAGCCATATGATTATGCCAATAGATGCAAAAAGAGCATTTAACAAA 31526058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TGAATAAAAAACAAAAGCCATATGATTATGCCAATAGATGCAAAAAGAGCATTTAACAAA 2580

 31526059 ATTGAACACCGTTTTCTGATTGAAACACCCAATAAACTAGAAATAGAAACTCCTTCAACC 31526118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 ATTGAACACCGTTTTCTGATTGAAACACCCAATAAACTAGAAATAGAAACTCCTTCAACC 2640

 31526119 TGATAAAAGCCATTTATGAAAACTCACAGGTAGCATAAAACTTCATGTTGAAATATTAAA 31526178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TGATAAAAGCCATTTATGAAAACTCACAGGTAGCATAAAACTTCATGTTGAAATATTAAA 2700

 31526179 TACTTTCCTGTAAAATCAGAAATAAAACAAGAATGGTTACTCTTGCCACCCCAATTTAAC 31526238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TACTTTCCTGTAAAATCAGAAATAAAACAAGAATGGTTACTCTTGCCACCCCAATTTAAC 2760

 31526239 ATTTTATTGGGAGGTCAGTTAGGCAAGAAAATGAAATAAAAAGTATCTATATTGGGGAGG 31526298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 ATTTTATTGGGAGGTCAGTTAGGCAAGAAAATGAAATAAAAAGTATCTATATTGGGGAGG 2820

 31526299 AAGAAGTTAACTATCTC 31526315
          |||||||||||||||||
     2821 AAGAAGTTAACTATCTC 2837

Alignment time is 2.19028 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31515486,31539389] =>     23904 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    3006] =>      3006 nucs 'mol-32-300f-179790_3006'

Score:        2996
Aligned:      3007        nucs
Identic:      3006 (100%) nucs =>       587 (100%)      2419 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31528478,31529064] EXCISED REGION [31529066,31531485]
 second seq =>  [       1,     587] EXCISED REGION [     588,    3006]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [31529065,31529065]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        12 nucs [31529065,31529076] to [31529066,31529077]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31528478 GATAAGGGACTAGTATCCAGAATATATAAAGCACTCTTGCAACTTGATAAAAATGATAAA 31528537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GATAAGGGACTAGTATCCAGAATATATAAAGCACTCTTGCAACTTGATAAAAATGATAAA 60

 31528538 TAACCAAATTAAGATACGGGTAAAGGATCTAAATAAACATTTCTTCAAAGAAGATGTACA 31528597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAACCAAATTAAGATACGGGTAAAGGATCTAAATAAACATTTCTTCAAAGAAGATGTACA 120

 31528598 AATGGCTAATAAGTATATTAAATGATGGTGAACATCATTAGCTATCAGGGAAATGCATAT 31528657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AATGGCTAATAAGTATATTAAATGATGGTGAACATCATTAGCTATCAGGGAAATGCATAT 180

 31528658 TAAAACTATAATGAGATCCCACTTTACACTTGCCAGGATAACTATAGATAATAGCAATGG 31528717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TAAAACTATAATGAGATCCCACTTTACACTTGCCAGGATAACTATAGATAATAGCAATGG 240

 31528718 TTGGCTGGGATGTGGACAAACTGGGACTCTTACACATTGCTGGATAGAATGTAGAAAGCT 31528777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTGGCTGGGATGTGGACAAACTGGGACTCTTACACATTGCTGGATAGAATGTAGAAAGCT 300

 31528778 GGCCAGGTACGGTGGCTCAGGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGCGGA 31528837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GGCCAGGTACGGTGGCTCAGGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGCGGA 360

 31528838 TTATGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAGCATGGTGTAACCCCGTCTCTACTAA 31528897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTATGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAGCATGGTGTAACCCCGTCTCTACTAA 420

 31528898 ACATACAAAAATTAGCAGGGCATGATGGCGGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGC 31528957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACATACAAAAATTAGCAGGGCATGATGGCGGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGC 480

 31528958 TGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCAGAGATCATGCC 31529017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCAGAGATCATGCC 540

 31529018 ATTGCGTTCCAGTCTGGGCAACAAGAGCAAAACTCCAAACTCTGTTT 31529064
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATTGCGTTCCAGTCTGGGCAACAAGAGCAAAACTCCAAACTCTGTTT 587

EXCISED REGION

 31529066 AAAAAAAAAAAAGAAAAAGAACATAGAAAGCTGCAGTCACTTTGGAAAACAGTCTGGCAG 31529125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      588 AAAAAAAAAAAAGAAAAAGAACATAGAAAGCTGCAGTCACTTTGGAAAACAGTCTGGCAG 647

 31529126 TTCCTCAAAAATTAAGTGTAGACTTACCATATTACCCAACAGTTCCACTCCCAAGTGTAT 31529185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      648 TTCCTCAAAAATTAAGTGTAGACTTACCATATTACCCAACAGTTCCACTCCCAAGTGTAT 707

 31529186 ACCCAAGAGAAATGAAAACATATGTTCACATAAAATCTTGTACATGAATGTTTATAGTAG 31529245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      708 ACCCAAGAGAAATGAAAACATATGTTCACATAAAATCTTGTACATGAATGTTTATAGTAG 767

 31529246 CATTATTTATAATACAAAAGTGGAAACAACCCAAATGTCAACTTCCAAATGGATAAAGTG 31529305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      768 CATTATTTATAATACAAAAGTGGAAACAACCCAAATGTCAACTTCCAAATGGATAAAGTG 827

 31529306 TGGTATGGTGATACAATGGAATGTTATTTAATAATAAAAAGGAATAAAGTACTGATGCAT 31529365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      828 TGGTATGGTGATACAATGGAATGTTATTTAATAATAAAAAGGAATAAAGTACTGATGCAT 887

 31529366 GCAACAACATGGATGAACCTTGAAAATACTGTGCTAAGTGAAAGAAGCCAACCACAAAAT 31529425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      888 GCAACAACATGGATGAACCTTGAAAATACTGTGCTAAGTGAAAGAAGCCAACCACAAAAT 947

 31529426 ACCATATATTGTGTGATTCTGCTTAAATGACATGTCCAGAATGTCCATATTAAAGTAGAT 31529485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      948 ACCATATATTGTGTGATTCTGCTTAAATGACATGTCCAGAATGTCCATATTAAAGTAGAT 1007

 31529486 TAGTGGTTTCCTGAGGCTGGGGGAGGGAGTTGGGGAAATTGCGTAGTGACTACTGGGTAA 31529545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1008 TAGTGGTTTCCTGAGGCTGGGGGAGGGAGTTGGGGAAATTGCGTAGTGACTACTGGGTAA 1067

 31529546 AGAGTTTCTTTCTGGGGTGATGAAATGGTCTAAAATAGAATGTGGTGGTGGTTGCACAGC 31529605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1068 AGAGTTTCTTTCTGGGGTGATGAAATGGTCTAAAATAGAATGTGGTGGTGGTTGCACAGC 1127

 31529606 TCTGAAAATACTAAAAACCATTGAATGAGCACTTTAAATTGGTAAATTTTTATGTGAATT 31529665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1128 TCTGAAAATACTAAAAACCATTGAATGAGCACTTTAAATTGGTAAATTTTTATGTGAATT 1187

 31529666 ATGATTCAATAAAGTTGTGTTTAGATATTACTAAAAATGATGGTACAAATATTCTTTTTC 31529725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1188 ATGATTCAATAAAGTTGTGTTTAGATATTACTAAAAATGATGGTACAAATATTCTTTTTC 1247

 31529726 ACAAATGTTTTTTGTTGTTGTTTATAGTTGTTTATTTGTACATCTAGTAATTTGTCCCAA 31529785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1248 ACAAATGTTTTTTGTTGTTGTTTATAGTTGTTTATTTGTACATCTAGTAATTTGTCCCAA 1307

 31529786 GGAAAGAGTATGTAAAAGAACATAAGTCACTTTAAGGCCTTTAATGTATACTACAAAATT 31529845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1308 GGAAAGAGTATGTAAAAGAACATAAGTCACTTTAAGGCCTTTAATGTATACTACAAAATT 1367

 31529846 GCACTCTAGAAGGTTTATACAGTTTTGCATTTCATTAGCCTGTTTTTTTTATCTTTGACA 31529905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1368 GCACTCTAGAAGGTTTATACAGTTTTGCATTTCATTAGCCTGTTTTTTTTATCTTTGACA 1427

 31529906 ACCTAAAGAATTTATTAGTGGTATTCATCTGAGGATCCTCTAGGTCTATCAGAGTGTCTT 31529965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1428 ACCTAAAGAATTTATTAGTGGTATTCATCTGAGGATCCTCTAGGTCTATCAGAGTGTCTT 1487

 31529966 TCTTATAGAAGGCATTCAATAAATAAATGTCCTAAGTGAGCAAAACATTTTTGGTTGATT 31530025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1488 TCTTATAGAAGGCATTCAATAAATAAATGTCCTAAGTGAGCAAAACATTTTTGGTTGATT 1547

 31530026 TTTAGGTGCAAATGGTTTCTTTTGATTTTAATTAAGATGCCTTTGTTTATTAGTGATGTT 31530085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1548 TTTAGGTGCAAATGGTTTCTTTTGATTTTAATTAAGATGCCTTTGTTTATTAGTGATGTT 1607

 31530086 GACATATTTTCTTAATCTATTGGCTTTGTATAACTTTATGAATTGTCTCTTCATGTCCTT 31530145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1608 GACATATTTTCTTAATCTATTGGCTTTGTATAACTTTATGAATTGTCTCTTCATGTCCTT 1667

 31530146 TGCCTACTTTTCTATTGTGGTAACTATCTTTTATAAATGTTGTATAATTATTTAAAAATA 31530205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1668 TGCCTACTTTTCTATTGTGGTAACTATCTTTTATAAATGTTGTATAATTATTTAAAAATA 1727

 31530206 CATTAGGTTGGGCATGGTAGATCATGCCTGTAATCCCAGCTCTCTGGGAGGCCAAGGTGG 31530265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1728 CATTAGGTTGGGCATGGTAGATCATGCCTGTAATCCCAGCTCTCTGGGAGGCCAAGGTGG 1787

 31530266 GCAGATTGCTTGAGCCTAACAGTTCGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCCATCT 31530325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1788 GCAGATTGCTTGAGCCTAACAGTTCGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCCATCT 1847

 31530326 CTAAAAAAAAAAACCAATAAAAATATATTAAAAGATTAACTGATTGTCTATCATATGGAT 31530385
          || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1848 CT-AAAAAAAAAACCAATAAAAATATATTAAAAGATTAACTGATTGTCTATCATATGGAT 1906

 31530386 TACAAATATCCCCCCCAATTTGTCATTTGCTTGTTAATTTTATTTATGATGACTTAAAAA 31530445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1907 TACAAATATCCCCCCCAATTTGTCATTTGCTTGTTAATTTTATTTATGATGACTTAAAAA 1966

 31530446 TTACAATATATTTTTTGGTGTTCAAGTCAGTTTTTGTCCCCATTGTGATATTTTCCTTTG 31530505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1967 TTACAATATATTTTTTGGTGTTCAAGTCAGTTTTTGTCCCCATTGTGATATTTTCCTTTG 2026

 31530506 CCTGTTTATCACTTTCTTAGAGAAAAGATAAATACTGATTCGTTCTTTTGTAGGTGTTTT 31530565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2027 CCTGTTTATCACTTTCTTAGAGAAAAGATAAATACTGATTCGTTCTTTTGTAGGTGTTTT 2086

 31530566 ATGATTTCATTGAAAATAAAATCTTCAACGCATCTAGTATTCATTTGGGTGTAAGATAAA 31530625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2087 ATGATTTCATTGAAAATAAAATCTTCAACGCATCTAGTATTCATTTGGGTGTAAGATAAA 2146

 31530626 AGATAACAACGTAGGTTTCTCTTATAGTTCATCAGGTATCCTACTACTGTTTATTGAGTC 31530685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2147 AGATAACAACGTAGGTTTCTCTTATAGTTCATCAGGTATCCTACTACTGTTTATTGAGTC 2206

 31530686 ATGTTTTCTGTTACCACTCTTACTATATACCAGTTTTACATACATTTGGGTTGGTTTCTG 31530745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2207 ATGTTTTCTGTTACCACTCTTACTATATACCAGTTTTACATACATTTGGGTTGGTTTCTG 2266

 31530746 AGCTTTCTATTGTCTTCCATTGCTTTGTTTAAAATTTAAAGTTTATTATTCTGACTTTCC 31530805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2267 AGCTTTCTATTGTCTTCCATTGCTTTGTTTAAAATTTAAAGTTTATTATTCTGACTTTCC 2326

 31530806 ATACTTGAATATGGTCGAATAAGTCCTCCTTTATTAATCTTGTTTTATTTAAAAATGGTC 31530865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2327 ATACTTGAATATGGTCGAATAAGTCCTCCTTTATTAATCTTGTTTTATTTAAAAATGGTC 2386

 31530866 ATTTTCACTCATTTTCCAGTTCAGTAGTTTTATTCTCTCAGTGTAATGTGATTTATCACC 31530925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2387 ATTTTCACTCATTTTCCAGTTCAGTAGTTTTATTCTCTCAGTGTAATGTGATTTATCACC 2446

 31530926 CCATTGCTCACCCTATTCATCTCCCAATACCCAGCTGAAAAACTTTAGAAGACTGAGGCT 31530985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2447 CCATTGCTCACCCTATTCATCTCCCAATACCCAGCTGAAAAACTTTAGAAGACTGAGGCT 2506

 31530986 CTTGCCCTGGCCCCATCACTTTCTAGCTATGTGGGCTTAGGCTAGTTATTGAACATGTCT 31531045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2507 CTTGCCCTGGCCCCATCACTTTCTAGCTATGTGGGCTTAGGCTAGTTATTGAACATGTCT 2566

 31531046 GACTCTCACTTTTCTCCTCTGTAAGTCAGTGAGAATTATATACTTCTTATAAGGTTGTGA 31531105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2567 GACTCTCACTTTTCTCCTCTGTAAGTCAGTGAGAATTATATACTTCTTATAAGGTTGTGA 2626

 31531106 GGTTCAAATGGAATAATGTGTACAGAGGCACTTGGTAAACAATGTAGTCATATGCAAGTC 31531165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2627 GGTTCAAATGGAATAATGTGTACAGAGGCACTTGGTAAACAATGTAGTCATATGCAAGTC 2686

 31531166 ATATGCAAGTCATATGTAGTCAGCTTGGTGAATTTTGAGAAAGTAAATGCAAGTTCTTTT 31531225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2687 ATATGCAAGTCATATGTAGTCAGCTTGGTGAATTTTGAGAAAGTAAATGCAAGTTCTTTT 2746

 31531226 TATGGTTTTACCTAAGGGGCCAGTGAGGGCCAGAGAAGTGCCGGGACCTATGTAAGGTCG 31531285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2747 TATGGTTTTACCTAAGGGGCCAGTGAGGGCCAGAGAAGTGCCGGGACCTATGTAAGGTCG 2806

 31531286 CAAGCAAGTTCATGTGGAATGCATCTAGAACTAGAACGCTAGCCTGTGTCCCAGGGCCCT 31531345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2807 CAAGCAAGTTCATGTGGAATGCATCTAGAACTAGAACGCTAGCCTGTGTCCCAGGGCCCT 2866

 31531346 TCCAACTGGGCTCTGCTGCCTGCAGTCCTGGGTGCCTTCTAATTAGCCTGTGTAGTGGTC 31531405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2867 TCCAACTGGGCTCTGCTGCCTGCAGTCCTGGGTGCCTTCTAATTAGCCTGTGTAGTGGTC 2926

 31531406 TTGGTAAAAGTGTTTCTCCTGTACTGTCCCCTATAGGTTGTGGCTGGCCATACCATTTCC 31531465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2927 TTGGTAAAAGTGTTTCTCCTGTACTGTCCCCTATAGGTTGTGGCTGGCCATACCATTTCC 2986

 31531466 CTGGTTCCCCCCACGCTCCT 31531485
          ||||||||||||||||||||
     2987 CTGGTTCCCCCCACGCTCCT 3006

Alignment time is 2.62495 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31515486,31539389] =>     23904 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    7928] =>      7928 nucs 'mol-32-3101-148617_7928'

Score:        7917
Aligned:      7928        nucs
Identic:      7927 (100%) nucs =>      7383 (100%)       544 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31528327,31535709] EXCISED REGION [31535711,31536255]
 second seq =>  [       1,    7383] EXCISED REGION [    7384,    7928]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [31535710,31535710]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [31536227,31536227]
 second seq =>         1 nucs [7900,7900]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        14 nucs [31535710,31535723] to [31535711,31535724]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31528327 TGTGTCTTAGATATGACACCAAAAACAAGCTACAAAAGAAAAAAACAGATAAATTGGACT 31528386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGTGTCTTAGATATGACACCAAAAACAAGCTACAAAAGAAAAAAACAGATAAATTGGACT 60

 31528387 TTGTCAAAATTAAAAACTTTTGGGCTGCAAAGGATACCGTCAAGAAAGTGAAAGGGTAAC 31528446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTGTCAAAATTAAAAACTTTTGGGCTGCAAAGGATACCGTCAAGAAAGTGAAAGGGTAAC 120

 31528447 CTGAAAGAAAATACTTGCAAATCATATATCTGATAAGGGACTAGTATCCAGAATATATAA 31528506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTGAAAGAAAATACTTGCAAATCATATATCTGATAAGGGACTAGTATCCAGAATATATAA 180

 31528507 AGCACTCTTGCAACTTGATAAAAATGATAAATAACCAAATTAAGATACGGGTAAAGGATC 31528566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGCACTCTTGCAACTTGATAAAAATGATAAATAACCAAATTAAGATACGGGTAAAGGATC 240

 31528567 TAAATAAACATTTCTTCAAAGAAGATGTACAAATGGCTAATAAGTATATTAAATGATGGT 31528626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TAAATAAACATTTCTTCAAAGAAGATGTACAAATGGCTAATAAGTATATTAAATGATGGT 300

 31528627 GAACATCATTAGCTATCAGGGAAATGCATATTAAAACTATAATGAGATCCCACTTTACAC 31528686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GAACATCATTAGCTATCAGGGAAATGCATATTAAAACTATAATGAGATCCCACTTTACAC 360

 31528687 TTGCCAGGATAACTATAGATAATAGCAATGGTTGGCTGGGATGTGGACAAACTGGGACTC 31528746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTGCCAGGATAACTATAGATAATAGCAATGGTTGGCTGGGATGTGGACAAACTGGGACTC 420

 31528747 TTACACATTGCTGGATAGAATGTAGAAAGCTGGCCAGGTACGGTGGCTCAGGCCTGTAAT 31528806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTACACATTGCTGGATAGAATGTAGAAAGCTGGCCAGGTACGGTGGCTCAGGCCTGTAAT 480

 31528807 CCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGCGGATTATGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCT 31528866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGCGGATTATGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCT 540

 31528867 GGCCAGCATGGTGTAACCCCGTCTCTACTAAACATACAAAAATTAGCAGGGCATGATGGC 31528926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGCCAGCATGGTGTAACCCCGTCTCTACTAAACATACAAAAATTAGCAGGGCATGATGGC 600

 31528927 GGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGA 31528986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGA 660

 31528987 GGCGGAGGTTGCAGTGAGCAGAGATCATGCCATTGCGTTCCAGTCTGGGCAACAAGAGCA 31529046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGCGGAGGTTGCAGTGAGCAGAGATCATGCCATTGCGTTCCAGTCTGGGCAACAAGAGCA 720

 31529047 AAACTCCAAACTCTGTTTAAAAAAAAAAAAAGAAAAAGAACATAGAAAGCTGCAGTCACT 31529106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAACTCCAAACTCTGTTTAAAAAAAAAAAAAGAAAAAGAACATAGAAAGCTGCAGTCACT 780

 31529107 TTGGAAAACAGTCTGGCAGTTCCTCAAAAATTAAGTGTAGACTTACCATATTACCCAACA 31529166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTGGAAAACAGTCTGGCAGTTCCTCAAAAATTAAGTGTAGACTTACCATATTACCCAACA 840

 31529167 GTTCCACTCCCAAGTGTATACCCAAGAGAAATGAAAACATATGTTCACATAAAATCTTGT 31529226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GTTCCACTCCCAAGTGTATACCCAAGAGAAATGAAAACATATGTTCACATAAAATCTTGT 900

 31529227 ACATGAATGTTTATAGTAGCATTATTTATAATACAAAAGTGGAAACAACCCAAATGTCAA 31529286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ACATGAATGTTTATAGTAGCATTATTTATAATACAAAAGTGGAAACAACCCAAATGTCAA 960

 31529287 CTTCCAAATGGATAAAGTGTGGTATGGTGATACAATGGAATGTTATTTAATAATAAAAAG 31529346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTTCCAAATGGATAAAGTGTGGTATGGTGATACAATGGAATGTTATTTAATAATAAAAAG 1020

 31529347 GAATAAAGTACTGATGCATGCAACAACATGGATGAACCTTGAAAATACTGTGCTAAGTGA 31529406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GAATAAAGTACTGATGCATGCAACAACATGGATGAACCTTGAAAATACTGTGCTAAGTGA 1080

 31529407 AAGAAGCCAACCACAAAATACCATATATTGTGTGATTCTGCTTAAATGACATGTCCAGAA 31529466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAGAAGCCAACCACAAAATACCATATATTGTGTGATTCTGCTTAAATGACATGTCCAGAA 1140

 31529467 TGTCCATATTAAAGTAGATTAGTGGTTTCCTGAGGCTGGGGGAGGGAGTTGGGGAAATTG 31529526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGTCCATATTAAAGTAGATTAGTGGTTTCCTGAGGCTGGGGGAGGGAGTTGGGGAAATTG 1200

 31529527 CGTAGTGACTACTGGGTAAAGAGTTTCTTTCTGGGGTGATGAAATGGTCTAAAATAGAAT 31529586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CGTAGTGACTACTGGGTAAAGAGTTTCTTTCTGGGGTGATGAAATGGTCTAAAATAGAAT 1260

 31529587 GTGGTGGTGGTTGCACAGCTCTGAAAATACTAAAAACCATTGAATGAGCACTTTAAATTG 31529646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GTGGTGGTGGTTGCACAGCTCTGAAAATACTAAAAACCATTGAATGAGCACTTTAAATTG 1320

 31529647 GTAAATTTTTATGTGAATTATGATTCAATAAAGTTGTGTTTAGATATTACTAAAAATGAT 31529706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GTAAATTTTTATGTGAATTATGATTCAATAAAGTTGTGTTTAGATATTACTAAAAATGAT 1380

 31529707 GGTACAAATATTCTTTTTCACAAATGTTTTTTGTTGTTGTTTATAGTTGTTTATTTGTAC 31529766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GGTACAAATATTCTTTTTCACAAATGTTTTTTGTTGTTGTTTATAGTTGTTTATTTGTAC 1440

 31529767 ATCTAGTAATTTGTCCCAAGGAAAGAGTATGTAAAAGAACATAAGTCACTTTAAGGCCTT 31529826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATCTAGTAATTTGTCCCAAGGAAAGAGTATGTAAAAGAACATAAGTCACTTTAAGGCCTT 1500

 31529827 TAATGTATACTACAAAATTGCACTCTAGAAGGTTTATACAGTTTTGCATTTCATTAGCCT 31529886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TAATGTATACTACAAAATTGCACTCTAGAAGGTTTATACAGTTTTGCATTTCATTAGCCT 1560

 31529887 GTTTTTTTTATCTTTGACAACCTAAAGAATTTATTAGTGGTATTCATCTGAGGATCCTCT 31529946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GTTTTTTTTATCTTTGACAACCTAAAGAATTTATTAGTGGTATTCATCTGAGGATCCTCT 1620

 31529947 AGGTCTATCAGAGTGTCTTTCTTATAGAAGGCATTCAATAAATAAATGTCCTAAGTGAGC 31530006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AGGTCTATCAGAGTGTCTTTCTTATAGAAGGCATTCAATAAATAAATGTCCTAAGTGAGC 1680

 31530007 AAAACATTTTTGGTTGATTTTTAGGTGCAAATGGTTTCTTTTGATTTTAATTAAGATGCC 31530066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AAAACATTTTTGGTTGATTTTTAGGTGCAAATGGTTTCTTTTGATTTTAATTAAGATGCC 1740

 31530067 TTTGTTTATTAGTGATGTTGACATATTTTCTTAATCTATTGGCTTTGTATAACTTTATGA 31530126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TTTGTTTATTAGTGATGTTGACATATTTTCTTAATCTATTGGCTTTGTATAACTTTATGA 1800

 31530127 ATTGTCTCTTCATGTCCTTTGCCTACTTTTCTATTGTGGTAACTATCTTTTATAAATGTT 31530186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ATTGTCTCTTCATGTCCTTTGCCTACTTTTCTATTGTGGTAACTATCTTTTATAAATGTT 1860

 31530187 GTATAATTATTTAAAAATACATTAGGTTGGGCATGGTAGATCATGCCTGTAATCCCAGCT 31530246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GTATAATTATTTAAAAATACATTAGGTTGGGCATGGTAGATCATGCCTGTAATCCCAGCT 1920

 31530247 CTCTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATTGCTTGAGCCTAACAGTTCGAGACCAGCCTGGGCA 31530306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CTCTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATTGCTTGAGCCTAACAGTTCGAGACCAGCCTGGGCA 1980

 31530307 ACATAGTGAGACCCCATCTCTAAAAAAAAAAACCAATAAAAATATATTAAAAGATTAACT 31530366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ACATAGTGAGACCCCATCTCTAAAAAAAAAAACCAATAAAAATATATTAAAAGATTAACT 2040

 31530367 GATTGTCTATCATATGGATTACAAATATCCCCCCCAATTTGTCATTTGCTTGTTAATTTT 31530426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GATTGTCTATCATATGGATTACAAATATCCCCCCCAATTTGTCATTTGCTTGTTAATTTT 2100

 31530427 ATTTATGATGACTTAAAAATTACAATATATTTTTTGGTGTTCAAGTCAGTTTTTGTCCCC 31530486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ATTTATGATGACTTAAAAATTACAATATATTTTTTGGTGTTCAAGTCAGTTTTTGTCCCC 2160

 31530487 ATTGTGATATTTTCCTTTGCCTGTTTATCACTTTCTTAGAGAAAAGATAAATACTGATTC 31530546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ATTGTGATATTTTCCTTTGCCTGTTTATCACTTTCTTAGAGAAAAGATAAATACTGATTC 2220

 31530547 GTTCTTTTGTAGGTGTTTTATGATTTCATTGAAAATAAAATCTTCAACGCATCTAGTATT 31530606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GTTCTTTTGTAGGTGTTTTATGATTTCATTGAAAATAAAATCTTCAACGCATCTAGTATT 2280

 31530607 CATTTGGGTGTAAGATAAAAGATAACAACGTAGGTTTCTCTTATAGTTCATCAGGTATCC 31530666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CATTTGGGTGTAAGATAAAAGATAACAACGTAGGTTTCTCTTATAGTTCATCAGGTATCC 2340

 31530667 TACTACTGTTTATTGAGTCATGTTTTCTGTTACCACTCTTACTATATACCAGTTTTACAT 31530726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TACTACTGTTTATTGAGTCATGTTTTCTGTTACCACTCTTACTATATACCAGTTTTACAT 2400

 31530727 ACATTTGGGTTGGTTTCTGAGCTTTCTATTGTCTTCCATTGCTTTGTTTAAAATTTAAAG 31530786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ACATTTGGGTTGGTTTCTGAGCTTTCTATTGTCTTCCATTGCTTTGTTTAAAATTTAAAG 2460

 31530787 TTTATTATTCTGACTTTCCATACTTGAATATGGTCGAATAAGTCCTCCTTTATTAATCTT 31530846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TTTATTATTCTGACTTTCCATACTTGAATATGGTCGAATAAGTCCTCCTTTATTAATCTT 2520

 31530847 GTTTTATTTAAAAATGGTCATTTTCACTCATTTTCCAGTTCAGTAGTTTTATTCTCTCAG 31530906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GTTTTATTTAAAAATGGTCATTTTCACTCATTTTCCAGTTCAGTAGTTTTATTCTCTCAG 2580

 31530907 TGTAATGTGATTTATCACCCCATTGCTCACCCTATTCATCTCCCAATACCCAGCTGAAAA 31530966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TGTAATGTGATTTATCACCCCATTGCTCACCCTATTCATCTCCCAATACCCAGCTGAAAA 2640

 31530967 ACTTTAGAAGACTGAGGCTCTTGCCCTGGCCCCATCACTTTCTAGCTATGTGGGCTTAGG 31531026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 ACTTTAGAAGACTGAGGCTCTTGCCCTGGCCCCATCACTTTCTAGCTATGTGGGCTTAGG 2700

 31531027 CTAGTTATTGAACATGTCTGACTCTCACTTTTCTCCTCTGTAAGTCAGTGAGAATTATAT 31531086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CTAGTTATTGAACATGTCTGACTCTCACTTTTCTCCTCTGTAAGTCAGTGAGAATTATAT 2760

 31531087 ACTTCTTATAAGGTTGTGAGGTTCAAATGGAATAATGTGTACAGAGGCACTTGGTAAACA 31531146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 ACTTCTTATAAGGTTGTGAGGTTCAAATGGAATAATGTGTACAGAGGCACTTGGTAAACA 2820

 31531147 ATGTAGTCATATGCAAGTCATATGCAAGTCATATGTAGTCAGCTTGGTGAATTTTGAGAA 31531206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 ATGTAGTCATATGCAAGTCATATGCAAGTCATATGTAGTCAGCTTGGTGAATTTTGAGAA 2880

 31531207 AGTAAATGCAAGTTCTTTTTATGGTTTTACCTAAGGGGCCAGTGAGGGCCAGAGAAGTGC 31531266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 AGTAAATGCAAGTTCTTTTTATGGTTTTACCTAAGGGGCCAGTGAGGGCCAGAGAAGTGC 2940

 31531267 CGGGACCTATGTAAGGTCGCAAGCAAGTTCATGTGGAATGCATCTAGAACTAGAACGCTA 31531326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CGGGACCTATGTAAGGTCGCAAGCAAGTTCATGTGGAATGCATCTAGAACTAGAACGCTA 3000

 31531327 GCCTGTGTCCCAGGGCCCTTCCAACTGGGCTCTGCTGCCTGCAGTCCTGGGTGCCTTCTA 31531386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GCCTGTGTCCCAGGGCCCTTCCAACTGGGCTCTGCTGCCTGCAGTCCTGGGTGCCTTCTA 3060

 31531387 ATTAGCCTGTGTAGTGGTCTTGGTAAAAGTGTTTCTCCTGTACTGTCCCCTATAGGTTGT 31531446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 ATTAGCCTGTGTAGTGGTCTTGGTAAAAGTGTTTCTCCTGTACTGTCCCCTATAGGTTGT 3120

 31531447 GGCTGGCCATACCATTTCCCTGGTTCCCCCCACGCTCCTGATGACCTGGAAAGGCCATTT 31531506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 GGCTGGCCATACCATTTCCCTGGTTCCCCCCACGCTCCTGATGACCTGGAAAGGCCATTT 3180

 31531507 GAATAGTGTGGCAGACATCCTGTATGTGGACAACTTCCAGCTGGTTATCAGCGCTGGCCA 31531566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 GAATAGTGTGGCAGACATCCTGTATGTGGACAACTTCCAGCTGGTTATCAGCGCTGGCCA 3240

 31531567 GGACCGGGACGTCAAGGCTTGGAAACTCTCCGGTGATGCCATTGGTATGGGTCCTGCTGA 31531626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 GGACCGGGACGTCAAGGCTTGGAAACTCTCCGGTGATGCCATTGGTATGGGTCCTGCTGA 3300

 31531627 AGCTCAGCCATGCCCATGGCCCTTCTTGTCTCTGTCCCTGTCTGAACATAAGCTGGTATG 31531686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 AGCTCAGCCATGCCCATGGCCCTTCTTGTCTCTGTCCCTGTCTGAACATAAGCTGGTATG 3360

 31531687 AACTTTGTACTCTGTGGGGAGGGACTCTCAGGCCACAGCAACTGCCTTCACTTAAATAAT 31531746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 AACTTTGTACTCTGTGGGGAGGGACTCTCAGGCCACAGCAACTGCCTTCACTTAAATAAT 3420

 31531747 ATTACAGTCTGTCCAATTATCCATTCAGCAAACGGTCCATCCATTCACCCATCCACCCAA 31531806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 ATTACAGTCTGTCCAATTATCCATTCAGCAAACGGTCCATCCATTCACCCATCCACCCAA 3480

 31531807 TATTATTCACCTATGTATATTTTTGCAAATCATATATCTGATAAAGCATATTCCTTTCTC 31531866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TATTATTCACCTATGTATATTTTTGCAAATCATATATCTGATAAAGCATATTCCTTTCTC 3540

 31531867 TTTTAAAAAATAAACTTAATTGTTGCATTGTATATAAAGAAAAACATACAAACCAGAAGG 31531926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 TTTTAAAAAATAAACTTAATTGTTGCATTGTATATAAAGAAAAACATACAAACCAGAAGG 3600

 31531927 GTTCAGCTTGGTGAATTTTGAGAAAGTAAATACATACCCATATAGCCACCGTTCATGTCA 31531986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 GTTCAGCTTGGTGAATTTTGAGAAAGTAAATACATACCCATATAGCCACCGTTCATGTCA 3660

 31531987 AGAAATAATTAGGGCCAGGCGCGGTGGCTCACTACTGTAATCCCAACACTTTTTTGTCCC 31532046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 AGAAATAATTAGGGCCAGGCGCGGTGGCTCACTACTGTAATCCCAACACTTTTTTGTCCC 3720

 31532047 CTTTTCCTCCTGTGCTGTCTTCCTATGTGTTTGTTTGTTTGTTTTAGTGACCTGTCTCTA 31532106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 CTTTTCCTCCTGTGCTGTCTTCCTATGTGTTTGTTTGTTTGTTTTAGTGACCTGTCTCTA 3780

 31532107 CTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGTGCATGCCTGTAATCCCAGCTACTTGAG 31532166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 CTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGTGCATGCCTGTAATCCCAGCTACTTGAG 3840

 31532167 AGGCTGAGGCAGGAGAATCGTTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCA 31532226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 AGGCTGAGGCAGGAGAATCGTTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCA 3900

 31532227 TGTCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGACTCTGTCTAAAAAAAAAATAATAAT 31532286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 TGTCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGACTCTGTCTAAAAAAAAAATAATAAT 3960

 31532287 AAAAATAAAGTGACTTATGTGCCACTATTACAGTATTACAGCATTCTGTATTTTTCTATG 31532346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 AAAAATAAAGTGACTTATGTGCCACTATTACAGTATTACAGCATTCTGTATTTTTCTATG 4020

 31532347 TGTTTACATTTATCAGAAAGCTTTGTATTTTCATATGCTTTCATGTTCCTGCCTAGCATC 31532406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 TGTTTACATTTATCAGAAAGCTTTGTATTTTCATATGCTTTCATGTTCCTGCCTAGCATC 4080

 31532407 CTTTTGTTTCAACTTGAAGGGGTCCCTTTAGCATTTCTTTAAAGGCAGGTCTAATGGTGA 31532466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 CTTTTGTTTCAACTTGAAGGGGTCCCTTTAGCATTTCTTTAAAGGCAGGTCTAATGGTGA 4140

 31532467 TGAACTCCTCTTGTTTTTATTTATCTGGGAAAATTTTTATTTTTCCTTCATTTTTAAAGG 31532526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 TGAACTCCTCTTGTTTTTATTTATCTGGGAAAATTTTTATTTTTCCTTCATTTTTAAAGG 4200

 31532527 ACAGCTTTCCTGGATATAGTATTTTTGGATGAGAGTTTTTGTTCTTTTTATAATGTGTCT 31532586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 ACAGCTTTCCTGGATATAGTATTTTTGGATGAGAGTTTTTGTTCTTTTTATAATGTGTCT 4260

 31532587 CCTTGTGGATTTCTTTGACTTTATCCTAGTTGGAATCCCTTGAGCTTCTTGAATATAGGT 31532646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 CCTTGTGGATTTCTTTGACTTTATCCTAGTTGGAATCCCTTGAGCTTCTTGAATATAGGT 4320

 31532647 TTCTTTTCCTTTTTAAGATTTGAAACATTTTCAGCCATTATTTATTCAGATAAGCTTTTT 31532706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 TTCTTTTCCTTTTTAAGATTTGAAACATTTTCAGCCATTATTTATTCAGATAAGCTTTTT 4380

 31532707 GTCCCTTTCTCTCTCTCTGTCTCTCTCTCCTCCTTCTAGTACTACCATAATGCATATATT 31532766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 GTCCCTTTCTCTCTCTCTGTCTCTCTCTCCTCCTTCTAGTACTACCATAATGCATATATT 4440

 31532767 GTCCATTTGACGATGTCTCATAAATCCCTTAAGTTTTCTTTACTCTTTAAAATTCTTTTT 31532826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 GTCCATTTGACGATGTCTCATAAATCCCTTAAGTTTTCTTTACTCTTTAAAATTCTTTTT 4500

 31532827 TCTTTTTTGCTTCTCTGACTGGATATCTTCAAGTCTGCTGATTTTTCCTTCTGCTTGATC 31532886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 TCTTTTTTGCTTCTCTGACTGGATATCTTCAAGTCTGCTGATTTTTCCTTCTGCTTGATC 4560

 31532887 AAGCCTGCTGTAGATGACTTTTGAATTCAATTATTTTACTCTTCATCTTCAGCTCTAGAA 31532946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 AAGCCTGCTGTAGATGACTTTTGAATTCAATTATTTTACTCTTCATCTTCAGCTCTAGAA 4620

 31532947 TTTCTGTTATTTTTATTATTATTATTATTATTTTTTGAGACAGGGTCTTGCTCTGCCACC 31533006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 TTTCTGTTATTTTTATTATTATTATTATTATTTTTTGAGACAGGGTCTTGCTCTGCCACC 4680

 31533007 CAGGGTTGAGTGCAGTGGCACGAATTCAGCTCACTGAAGCCTTGACCTCCCAGCCTCAAG 31533066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 CAGGGTTGAGTGCAGTGGCACGAATTCAGCTCACTGAAGCCTTGACCTCCCAGCCTCAAG 4740

 31533067 TGATCTTCCCACAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCATGCCATCATGCCTGGCT 31533126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 TGATCTTCCCACAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCATGCCATCATGCCTGGCT 4800

 31533127 AATTTTTTGTATTTTTTGTAGAGACAGAGTTTCACCATGTTGCCCAGGCTGGCCTTGAAT 31533186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 AATTTTTTGTATTTTTTGTAGAGACAGAGTTTCACCATGTTGCCCAGGCTGGCCTTGAAT 4860

 31533187 TCTTGAGCTCAAGTGATCGCCCACCTAAGCTTCCCAAAGTGTTGGGATTATAGGTGTGGG 31533246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 TCTTGAGCTCAAGTGATCGCCCACCTAAGCTTCCCAAAGTGTTGGGATTATAGGTGTGGG 4920

 31533247 CCACCATGGCTGGCCTCTGTTTGGTTCTTTTCTATATTTTCTGTGTCTTCACTAATATTC 31533306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 CCACCATGGCTGGCCTCTGTTTGGTTCTTTTCTATATTTTCTGTGTCTTCACTAATATTC 4980

 31533307 TCAGTTTGTTCATGTATTGTTTCCCTGAGCTTGTTGAGCATTTTTATTACGGTTACTTAG 31533366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 TCAGTTTGTTCATGTATTGTTTCCCTGAGCTTGTTGAGCATTTTTATTACGGTTACTTAG 5040

 31533367 AATTCTTTGTCAAATAATTAATATACCTCAATTTCTTTAGCGGCAGTTTCTGGAGATTTA 31533426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 AATTCTTTGTCAAATAATTAATATACCTCAATTTCTTTAGCGGCAGTTTCTGGAGATTTA 5100

 31533427 TTTTGTTCCTTTGGGCCATGCTTTCCTATTTTTTTTGTGTGCCTTATAACTTTATATTGG 31533486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 TTTTGTTCCTTTGGGCCATGCTTTCCTATTTTTTTTGTGTGCCTTATAACTTTATATTGG 5160

 31533487 GATCCATGCATTTGTAAAATCAGCCACCTCTCCCAGTCTTTATATACTGGCTTCATTCAG 31533546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 GATCCATGCATTTGTAAAATCAGCCACCTCTCCCAGTCTTTATATACTGGCTTCATTCAG 5220

 31533547 GGAAAATTCTGCACCAATCAGCTTGGCTAAAGATTCTGGGTGCCTCCCCAATCTTTTTTG 31533606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 GGAAAATTCTGCACCAATCAGCTTGGCTAAAGATTCTGGGTGCCTCCCCAATCTTTTTTG 5280

 31533607 TGGATACTTTCACCAGACTTACGCATGTAAATTCGCAATTACAGGAATCTACAGGTTTAT 31533666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 TGGATACTTTCACCAGACTTACGCATGTAAATTCGCAATTACAGGAATCTACAGGTTTAT 5340

 31533667 TTTTTTCAGGAGTCCATTATCTCTTGCTCTCTCTGGTGTCTATTTGCAGTACTGCAAGTT 31533726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 TTTTTTCAGGAGTCCATTATCTCTTGCTCTCTCTGGTGTCTATTTGCAGTACTGCAAGTT 5400

 31533727 CTCTAGAGCGGCTACAAGCTTCCCCCAGGCCTCTAGAATATGCTGGGTCCTTCAATAGTC 31533786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 CTCTAGAGCGGCTACAAGCTTCCCCCAGGCCTCTAGAATATGCTGGGTCCTTCAATAGTC 5460

 31533787 TGAGAGAGGCAAGACAGAAACCAGTTTCTTGGGTACCCCTCAAAGGCTAACATTGGATAT 31533846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 TGAGAGAGGCAAGACAGAAACCAGTTTCTTGGGTACCCCTCAAAGGCTAACATTGGATAT 5520

 31533847 GTATGCTCCAAATCTGCCTCCTCAAGGAGAAGCTGGAAGTTGGGTTGTTTTCTCTACTCA 31533906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 GTATGCTCCAAATCTGCCTCCTCAAGGAGAAGCTGGAAGTTGGGTTGTTTTCTCTACTCA 5580

 31533907 TTCCACAGAGCGGCAGGAGGGACTCTGATAGTGTGTGCTAGTCTAAATTGTCACCTTTGT 31533966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 TTCCACAGAGCGGCAGGAGGGACTCTGATAGTGTGTGCTAGTCTAAATTGTCACCTTTGT 5640

 31533967 TCTTAGTAGCCCAGTCTGGTGCCTCTTCCTGTCAGTGCTTAGATTCAGGCAAGACAGAAA 31534026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 TCTTAGTAGCCCAGTCTGGTGCCTCTTCCTGTCAGTGCTTAGATTCAGGCAAGACAGAAA 5700

 31534027 CTGGTTAATCATGCAGCCCTCTGAAAAGTCTGCATGTTGGATGTACATCTCAGTCTTTCC 31534086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5701 CTGGTTAATCATGCAGCCCTCTGAAAAGTCTGCATGTTGGATGTACATCTCAGTCTTTCC 5760

 31534087 CTCCCAGGGAGAAGCTGGAAGCTGGTGGTTCCTTCCCAATCTGCTTCACTGAGCCAGGAG 31534146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5761 CTCCCAGGGAGAAGCTGGAAGCTGGTGGTTCCTTCCCAATCTGCTTCACTGAGCCAGGAG 5820

 31534147 GAGGGATTACAAGTGAGCACTATGAATTTTCCTACTGGCTTCAGTGCAGCTGGTTTTTTG 31534206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5821 GAGGGATTACAAGTGAGCACTATGAATTTTCCTACTGGCTTCAGTGCAGCTGGTTTTTTG 5880

 31534207 TTTTTTGTTTTTTTGGTTTTTGTTTGTTTGTTTTTTCATTCATCTGGGATGAATGGTCCT 31534266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5881 TTTTTTGTTTTTTTGGTTTTTGTTTGTTTGTTTTTTCATTCATCTGGGATGAATGGTCCT 5940

 31534267 GGTTTCTGGTCCATGTACTGTTGTTCAGTCAGTGTCTCCATAGGGAGAAGGAAGTTCTGG 31534326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5941 GGTTTCTGGTCCATGTACTGTTGTTCAGTCAGTGTCTCCATAGGGAGAAGGAAGTTCTGG 6000

 31534327 ATCTTCCTATTCTACCATCTTGCTGATGTCACCCATTTTTTTGTATCTTTCAAAGACGTC 31534386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6001 ATCTTCCTATTCTACCATCTTGCTGATGTCACCCATTTTTTTGTATCTTTCAAAGACGTC 6060

 31534387 TTTGACTATCCCCTAAATATAATATCTAGTGTTATCTTTTAGAAGCTTGTTTTAAAAATC 31534446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6061 TTTGACTATCCCCTAAATATAATATCTAGTGTTATCTTTTAGAAGCTTGTTTTAAAAATC 6120

 31534447 AGATTTCTGAAGTATAATTTACATCCAATAAAAGCACCTTTTAAAAGTATATAGTTCTGT 31534506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6121 AGATTTCTGAAGTATAATTTACATCCAATAAAAGCACCTTTTAAAAGTATATAGTTCTGT 6180

 31534507 GAGGTTTCATGAATGCATACAATTGTGTAATTGGTATCACAATCAAGACATAGACATTAC 31534566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6181 GAGGTTTCATGAATGCATACAATTGTGTAATTGGTATCACAATCAAGACATAGACATTAC 6240

 31534567 CCCAAAAAGTGACCTCATGTCTCCTCATAGTAAACTCTATTTCCTTCTCCTAACCCCTGG 31534626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6241 CCCAAAAAGTGACCTCATGTCTCCTCATAGTAAACTCTATTTCCTTCTCCTAACCCCTGG 6300

 31534627 CAGCCATTGATCTGTTTGTCTCTATAGTTTTGCCTTTTCCAGATTATCATAAATGGAAAC 31534686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6301 CAGCCATTGATCTGTTTGTCTCTATAGTTTTGCCTTTTCCAGATTATCATAAATGGAAAC 6360

 31534687 ATACACATGTAGCTGAGTGAAAGTCTAACTTTCACTTAGCATAATCAATTTGAGATTCAT 31534746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6361 ATACACATGTAGCTGAGTGAAAGTCTAACTTTCACTTAGCATAATCAATTTGAGATTCAT 6420

 31534747 CTTTGTTGTTGAACGTATCAGTAGTTTGTTCTTTTTATTGCTGAGTATTATTCCACTGTA 31534806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6421 CTTTGTTGTTGAACGTATCAGTAGTTTGTTCTTTTTATTGCTGAGTATTATTCCACTGTA 6480

 31534807 TGGCTCTGTCATAGTTTGTTAATCCATTCACCAATTATAGGACATTTGAGTCATTGTCAG 31534866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6481 TGGCTCTGTCATAGTTTGTTAATCCATTCACCAATTATAGGACATTTGAGTCATTGTCAG 6540

 31534867 TTTTGGATGATTATGAATGAAGCCGCTTTAAACATTGTTTTCATTTCTGTTGGGTAAGTA 31534926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6541 TTTTGGATGATTATGAATGAAGCCGCTTTAAACATTGTTTTCATTTCTGTTGGGTAAGTA 6600

 31534927 TTTAGAAGCAGAATGGCTGGGTTGTATGGTAAGTGTATTGAAACTTTATGAAAAATGACC 31534986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6601 TTTAGAAGCAGAATGGCTGGGTTGTATGGTAAGTGTATTGAAACTTTATGAAAAATGACC 6660

 31534987 AAACTGTTTTGCATTTCTACCTTTGTGTCTTCATCAACATTTGGTGTTTGATCTGTTATT 31535046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6661 AAACTGTTTTGCATTTCTACCTTTGTGTCTTCATCAACATTTGGTGTTTGATCTGTTATT 6720

 31535047 ATTTTAAATTTTAATAATCTATGATTGTAGCATGAGATTTCAATATTCTCTCAATTTATA 31535106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6721 ATTTTAAATTTTAATAATCTATGATTGTAGCATGAGATTTCAATATTCTCTCAATTTATA 6780

 31535107 AAACAACTATACAGAAAATCATTAATGATATAGAATACTTGAATAACACTATCAAACAAT 31535166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6781 AAACAACTATACAGAAAATCATTAATGATATAGAATACTTGAATAACACTATCAAACAAT 6840

 31535167 TTTACTTAATTAACATTTATAGATCATTCATAAACAAACATTATTTTTAAGTGCACACAG 31535226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6841 TTTACTTAATTAACATTTATAGATCATTCATAAACAAACATTATTTTTAAGTGCACACAG 6900

 31535227 AACATTAATTAAACCGACCATATTCTGGTAACAAAACACATCTCACTAATCTCAAAAGGA 31535286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6901 AACATTAATTAAACCGACCATATTCTGGTAACAAAACACATCTCACTAATCTCAAAAGGA 6960

 31535287 TTTATGCCATACAAAGTATGTTCTCTGATCCCAATGAAACTGAATTATAAATCAAAAACA 31535346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6961 TTTATGCCATACAAAGTATGTTCTCTGATCCCAATGAAACTGAATTATAAATCAAAAACA 7020

 31535347 GAAATATCTTTGAAATATCCCTAAATATTTGGAAGCTAAATGACACATTTCTAAATAACC 31535406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7021 GAAATATCTTTGAAATATCCCTAAATATTTGGAAGCTAAATGACACATTTCTAAATAACC 7080

 31535407 CATGGGCCAAAAAAAGAAATCCAGAGGGAAATTAGAAAATATTTTGAACTGAATGAAAAT 31535466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7081 CATGGGCCAAAAAAAGAAATCCAGAGGGAAATTAGAAAATATTTTGAACTGAATGAAAAT 7140

 31535467 GAAAATGTAACATTTCAAAATTTATGAGATGCCACAAAAAACAGTAGTAACGGGGAAATT 31535526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7141 GAAAATGTAACATTTCAAAATTTATGAGATGCCACAAAAAACAGTAGTAACGGGGAAATT 7200

 31535527 TGTAGCACTAAATGCCTATATTAGAAGGAAAAAAGTTCAAATCTCCAGCCTCAACTTCCA 31535586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7201 TGTAGCACTAAATGCCTATATTAGAAGGAAAAAAGTTCAAATCTCCAGCCTCAACTTCCA 7260

 31535587 CATTAAGAAACTAGAAAGAGGTCTGGTGCGGTGGCTCACGCCTTTGGGAGGCAGGTGGGA 31535646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7261 CATTAAGAAACTAGAAAGAGGTCTGGTGCGGTGGCTCACGCCTTTGGGAGGCAGGTGGGA 7320

 31535647 GGATCATTTGAACCCAGGGGTTCAAGACCAGCCTAGGCAACATAACAAGACCCCATCTCA 31535706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7321 GGATCATTTGAACCCAGGGGTTCAAGACCAGCCTAGGCAACATAACAAGACCCCATCTCA 7380

 31535707 ATT 31535709
          |||
     7381 ATT 7383

EXCISED REGION

 31535711 AAAAAAAAAAAAAAGAAAAAAGAAACTAGAAAGAAAGAGCAAATTGAGCCCAAAGTAAAT 31535770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7384 AAAAAAAAAAAAAAGAAAAAAGAAACTAGAAAGAAAGAGCAAATTGAGCCCAAAGTAAAT 7443

 31535771 AGAAGAGAAATAATAAAGATTAGAATGGAAATCGATGAAACAGGGAAGTAAAAAATAATA 31535830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7444 AGAAGAGAAATAATAAAGATTAGAATGGAAATCGATGAAACAGGGAAGTAAAAAATAATA 7503

 31535831 AGGAAAATCAATGAACCCAAAAGCTGGTTCTTTGAAAAGATAGTTAAATCGATAAACCTC 31535890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7504 AGGAAAATCAATGAACCCAAAAGCTGGTTCTTTGAAAAGATAGTTAAATCGATAAACCTC 7563

 31535891 CAGCTAGACTGGGCAGGAAAAAGAGAGAGAATACACCAATTACCAATATCAGGAATGAGT 31535950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7564 CAGCTAGACTGGGCAGGAAAAAGAGAGAGAATACACCAATTACCAATATCAGGAATGAGT 7623

 31535951 GAGATGACATCATTTCTGATTCTACAGATATTAAAAGGATAACAATGAAATACTATAAAC 31536010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7624 GAGATGACATCATTTCTGATTCTACAGATATTAAAAGGATAACAATGAAATACTATAAAC 7683

 31536011 AACTTTATACAATAAATTTGGCAACTTATATGAAATAAACTCCTTGAAAGAAACAAACTA 31536070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7684 AACTTTATACAATAAATTTGGCAACTTATATGAAATAAACTCCTTGAAAGAAACAAACTA 7743

 31536071 CTAAATCTTACACAAGAAGAAACAGATAACCCGAATATCCTTATATCAAAGAAATTAAAT 31536130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7744 CTAAATCTTACACAAGAAGAAACAGATAACCCGAATATCCTTATATCAAAGAAATTAAAT 7803

 31536131 TTGTAGTTTAAAACTCTCCTTACAAAGATACCTCCAGGCCTAAATGGCTTCCATGGTGAA 31536190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7804 TTGTAGTTTAAAACTCTCCTTACAAAGATACCTCCAGGCCTAAATGGCTTCCATGGTGAA 7863

 31536191 TTTTACCCAAATATTTGAAGGGGAAATAATATAAATTCTACAGAAACTCTTCCAGAAAGT 31536250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     7864 TTTTACCCAAATATTTGAAGGGGAAATAATATAAATCCTACAGAAACTCTTCCAGAAAGT 7923

 31536251 TGAAA 31536255
          |||||
     7924 TGAAA 7928

Alignment time is 6.87234 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31515486,31539389] =>     23904 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    7020] =>      7020 nucs 'mol-32-317a-140191_7020'

Score:        6925
Aligned:      7022        nucs
Identic:      7005 (100%) nucs =>       303 (100%)      6702 (100%)
Gaps:           11 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31525183,31525486] EXCISED REGION [31529390,31536107]
 second seq =>  [       1,     304] EXCISED REGION [     314,    7020]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3903 nucs [31525487,31529389]
 second seq =>         9 nucs [305,313]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31525183 GTTATCTTTTGTTGGACATTAATGTGGTTTCTAACTTTTCATTATCAAAAAATAAAAGAA 31525242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTTATCTTTTGTTGGACATTAATGTGGTTTCTAACTTTTCATTATCAAAAAATAAAAGAA 60

 31525243 AATGGACAAAACCTCAGAAAGACACAAACTACTAAAGCTGACTTAATAAGAAATAGAAAA 31525302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AATGGACAAAACCTCAGAAAGACACAAACTACTAAAGCTGACTTAATAAGAAATAGAAAA 120

 31525303 TCTGAATATATAGAAAATCTGAATGTAACAAGTAAGGAGATTGGATTAGTAATAAAATTT 31525362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCTGAATATATAGAAAATCTGAATGTAACAAGTAAGGAGATTGGATTAGTAATAAAATTT 180

 31525363 CCCACAAAGAGAAGTACACATTCAGATGGTTTCACTGGTAAATTCTACCAAATATTTAAA 31525422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCCACAAAGAGAAGTACACATTCAGATGGTTTCACTGGTAAATTCTACCAAATATTTAAA 240

 31525423 GATTTTTCTTTTTTTTTGTTGAGACAGAGTCTCACTCTATTGCCCAGGCTGGAGTACAAT 31525482
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GATTTTTCTTTTTTTTTGTTGAGGCAGAGTCTCACTCTATTGCCCAGGCTGGAGTACAAT 300

 31525483 GGTG 31525486
          ||||
      301 GGTG 304

EXCISED REGION

 31529390 AATACTGTGCTAAGTGAAAGAAGCCAACCACAAAATACCATATATTGTGTGATTCTGCTT 31529449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      314 AATACTGTGCTAAGTGAAAGAAGCCAACCACAAAATACCATATATTGTGTGATTCTGCTT 373

 31529450 AAATGACATGTCCAGAATGTCCATATTAAAGTAGATTAGTGGTTTCCTGAGGCTGGGGGA 31529509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      374 AAATGACATGTCCAGAATGTCCATATTAAAGTAGATTAGTGGTTTCCTGAGGCTGGGGGA 433

 31529510 GGGAGTTGGGGAAATTGCGTAGTGACTACTGGGTAAAGAGTTTCTTTCTGGGGTGATGAA 31529569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      434 GGGAGTTGGGGAAATTGCGTAGTGACTACTGGGTAAAGAGTTTCTTTCTGGGGTGATGAA 493

 31529570 ATGGTCTAAAATAGAATGTGGTGGTGGTTGCACAGCTCTGAAAATACTAAAAACCATTGA 31529629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      494 ATGGTCTAAAATAGAATGTGGTGGTGGTTGCACAGCTCTGAAAATACTAAAAACCATTGA 553

 31529630 ATGAGCACTTTAAATTGGTAAATTTTTATGTGAATTATGATTCAATAAAGTTGTGTTTAG 31529689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      554 ATGAGCACTTTAAATTGGTAAATTTTTATGTGAATTATGATTCAATAAAGTTGTGTTTAG 613

 31529690 ATATTACTAAAAATGATGGTACAAATATTCTTTTTCACAAATGTTTTTTGTTGTTGTTTA 31529749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      614 ATATTACTAAAAATGATGGTACAAATATTCTTTTTCACAAATGTTTTTTGTTGTTGTTTA 673

 31529750 TAGTTGTTTATTTGTACATCTAGTAATTTGTCCCAAGGAAAGAGTATGTAAAAGAACATA 31529809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      674 TAGTTGTTTATTTGTACATCTAGTAATTTGTCCCAAGGAAAGAGTATGTAAAAGAACATA 733

 31529810 AGTCACTTTAAGGCCTTTAATGTATACTACAAAATTGCACTCTAGAAGGTTTATACAGTT 31529869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      734 AGTCACTTTAAGGCCTTTAATGTATACTACAAAATTGCACTCTAGAAGGTTTATACAGTT 793

 31529870 TTGCATTTCATTAGCCTGTTTTTTTTATCTTTGACAACCTAAAGAATTTATTAGTGGTAT 31529929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      794 TTGCATTTCATTAGCCTGTTTTTTTTATCTTTGACAACCTAAAGAATTTATTAGTGGTAT 853

 31529930 TCATCTGAGGATCCTCTAGGTCTATCAGAGTGTCTTTCTTATAGAAGGCATTCAATAAAT 31529989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      854 TCATCTGAGGATCCTCTAGGTCTATCAGAGTGTCTTTCTTATAGAAGGCATTCAATAAAT 913

 31529990 AAATGTCCTAAGTGAGCAAAACATTTTTGGTTGATTTTTAGGTGCAAATGGTTTCTTTTG 31530049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      914 AAATGTCCTAAGTGAGCAAAACATTTTTGGTTGATTTTTAGGTGCAAATGGTTTCTTTTG 973

 31530050 ATTTTAATTAAGATGCCTTTGTTTATTAGTGATGTTGACATATTTTCTTAATCTATTGGC 31530109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      974 ATTTTAATTAAGATGCCTTTGTTTATTAGTGATGTTGACATATTTTCTTAATCTATTGGC 1033

 31530110 TTTGTATAACTTTATGAATTGTCTCTTCATGTCCTTTGCCTACTTTTCTATTGTGGTAAC 31530169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1034 TTTGTATAACTTTATGAATTGTCTCTTCATGTCCTTTGCCTACTTTTCTATTGTGGTAAC 1093

 31530170 TATCTTTTATAAATGTTGTATAATTATTTAAAAATACATTAGGTTGGGCATGGTAGATCA 31530229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1094 TATCTTTTATAAATGTTGTATAATTATTTAAAAATACATTAGGTTGGGCATGGTAGATCA 1153

 31530230 TGCCTGTAATCCCAGCTCTCTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATTGCTTGAGCCTAACAGTT 31530289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1154 TGCCTGTAATCCCAGCTCTCTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATTGCTTGAGCCTAACAGTT 1213

 31530290 CGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCCATCTCTAAAAAAAAAAACCAATAAAAAT 31530349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1214 CGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCCATCTCTAAAAAAAAAAACCAATAAAAAT 1273

 31530350 ATATTAAAAGATTAACTGATTGTCTATCATATGGATTACAAATATCCCCCCCAATTTGTC 31530409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1274 ATATTAAAAGATTAACTGATTGTCTATCATATGGATTACAAATATCCCCCCCAATTTGTC 1333

 31530410 ATTTGCTTGTTAATTTTATTTATGATGACTTAAAAATTACAATATATTTTTTGGTGTTCA 31530469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1334 ATTTGCTTGTTAATTTTATTTATGATGACTTAAAAATTACAATATATTTTTTGGTGTTCA 1393

 31530470 AGTCAGTTTTTGTCCCCATTGTGATATTTTCCTTTGCCTGTTTATCACTTTCTTAGAGAA 31530529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1394 AGTCAGTTTTTGTCCCCATTGTGATATTTTCCTTTGCCTGTTTATCACTTTCTTAGAGAA 1453

 31530530 AAGATAAATACTGATTCGTTCTTTTGTAGGTGTTTTATGATTTCATTGAAAATAAAATCT 31530589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1454 AAGATAAATACTGATTCGTTCTTTTGTAGGTGTTTTATGATTTCATTGAAAATAAAATCT 1513

 31530590 TCAACGCATCTAGTATTCATTTGGGTGTAAGATAAAAGATAACAACGTAGGTTTCTCTTA 31530649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1514 TCAACGCATCTAGTATTCATTTGGGTGTAAGATAAAAGATAACAACGTAGGTTTCTCTTA 1573

 31530650 TAGTTCATCAGGTATCCTACTACTGTTTATTGAGTCATGTTTTCTGTTACCACTCTTACT 31530709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1574 TAGTTCATCAGGTATCCTACTACTGTTTATTGAGTCATGTTTTCTGTTACCACTCTTACT 1633

 31530710 ATATACCAGTTTTACATACATTTGGGTTGGTTTCTGAGCTTTCTATTGTCTTCCATTGCT 31530769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1634 ATATACCAGTTTTACATACATTTGGGTTGGTTTCTGAGCTTTCTATTGTCTTCCATTGCT 1693

 31530770 TTGTTTAAAATTTAAAGTTTATTATTCTGACTTTCCATACTTGAATATGGTCGAATAAGT 31530829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1694 TTGTTTAAAATTTAAAGTTTATTATTCTGACTTTCCATACTTGAATATGGTCGAATAAGT 1753

 31530830 CCTCCTTTATTAATCTTGTTTTATTTAAAAATGGTCATTTTCACTCATTTTCCAGTTCAG 31530889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1754 CCTCCTTTATTAATCTTGTTTTATTTAAAAATGGTCATTTTCACTCATTTTCCAGTTCAG 1813

 31530890 TAGTTTTATTCTCTCAGTGTAATGTGATTTATCACCCCATTGCTCACCCTATTCATCTCC 31530949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1814 TAGTTTTATTCTCTCAGTGTAATGTGATTTATCACCCCATTGCTCACCCTATTCATCTCC 1873

 31530950 CAATACCCAGCTGAAAAACTTTAGAAGACTGAGGCTCTTGCCCTGGCCCCATCACTTTCT 31531009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1874 CAATACCCAGCTGAAAAACTTTAGAAGACTGAGGCTCTTGCCCTGGCCCCATCACTTTCT 1933

 31531010 AGCTATGTGGGCTTAGGCTAGTTATTGAACATGTCTGACTCTCACTTTTCTCCTCTGTAA 31531069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1934 AGCTATGTGGGCTTAGGCTAGTTATTGAACATGTCTGACTCTCACTTTTCTCCTCTGTAA 1993

 31531070 GTCAGTGAGAATTATATACTTCTTATAAGGTTGTGAGGTTCAAATGGAATAATGTGTACA 31531129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1994 GTCAGTGAGAATTATATACTTCTTATAAGGTTGTGAGGTTCAAATGGAATAATGTGTACA 2053

 31531130 GAGGCACTTGGTAAACAATGTAGTCATATGCAAGTCATATGCAAGTCATATGTAGTCAGC 31531189
          |||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||
     2054 GAGGCACTTGGTAAACAATGT-----------AGTCATATGCAAGTCATATGTAGTCAGC 2102

 31531190 TTGGTGAATTTTGAGAAAGTAAATGCAAGTTCTTTTTATGGTTTTACCTAAGGGGCCAGT 31531249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2103 TTGGTGAATTTTGAGAAAGTAAATGCAAGTTCTTTTTATGGTTTTACCTAAGGGGCCAGT 2162

 31531250 GAGGGCCAGAGAAGTGCCGGGACCTATGTAAGGTCGCAAGCAAGTTCATGTGGAATGCAT 31531309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2163 GAGGGCCAGAGAAGTGCCGGGACCTATGTAAGGTCGCAAGCAAGTTCATGTGGAATGCAT 2222

 31531310 CTAGAACTAGAACGCTAGCCTGTGTCCCAGGGCCCTTCCAACTGGGCTCTGCTGCCTGCA 31531369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2223 CTAGAACTAGAACGCTAGCCTGTGTCCCAGGGCCCTTCCAACTGGGCTCTGCTGCCTGCA 2282

 31531370 GTCCTGGGTGCCTTCTAATTAGCCTGTGTAGTGGTCTTGGTAAAAGTGTTTCTCCTGTAC 31531429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2283 GTCCTGGGTGCCTTCTAATTAGCCTGTGTAGTGGTCTTGGTAAAAGTGTTTCTCCTGTAC 2342

 31531430 TGTCCCCTATAGGTTGTGGCTGGCCATACCATTTCCCTGGTTCCCCCCACGCTCCTGATG 31531489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2343 TGTCCCCTATAGGTTGTGGCTGGCCATACCATTTCCCTGGTTCCCCCCACGCTCCTGATG 2402

 31531490 ACCTGGAAAGGCCATTTGAATAGTGTGGCAGACATCCTGTATGTGGACAACTTCCAGCTG 31531549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2403 ACCTGGAAAGGCCATTTGAATAGTGTGGCAGACATCCTGTATGTGGACAACTTCCAGCTG 2462

 31531550 GTTATCAGCGCTGGCCAGGACCGGGACGTCAAGGCTTGGAAACTCTCCGGTGATGCCATT 31531609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2463 GTTATCAGCGCTGGCCAGGACCGGGACGTCAAGGCTTGGAAACTCTCCGGTGATGCCATT 2522

 31531610 GGTATGGGTCCTGCTGAAGCTCAGCCATGCCCATGGCCCTTCTTGTCTCTGTCCCTGTCT 31531669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2523 GGTATGGGTCCTGCTGAAGCTCAGCCATGCCCATGGCCCTTCTTGTCTCTGTCCCTGTCT 2582

 31531670 GAACATAAGCTGGTATGAACTTTGTACTCTGTGGGGAGGGACTCTCAGGCCACAGCAACT 31531729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2583 GAACATAAGCTGGTATGAACTTTGTACTCTGTGGGGAGGGACTCTCAGGCCACAGCAACT 2642

 31531730 GCCTTCACTTAAATAATATTACAGTCTGTCCAATTATCCATTCAGCAAACGGTCCATCCA 31531789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2643 GCCTTCACTTAAATAATATTACAGTCTGTCCAATTATCCATTCAGCAAACGGTCCATCCA 2702

 31531790 TTCACCCATCCACCCAATATTATTCACCTATGTATATTTTTGCAAATCATATATCTGATA 31531849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2703 TTCACCCATCCACCCAATATTATTCACCTATGTATATTTTTGCAAATCATATATCTGATA 2762

 31531850 AAGCATATTCCTTTCTCTTTTAAAAAATAAACTTAATTGTTGCATTGTATATAAAGAAAA 31531909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2763 AAGCATATTCCTTTCTCTTTTAAAAAATAAACTTAATTGTTGCATTGTATATAAAGAAAA 2822

 31531910 ACATACAAACCAGAAGGGTTCAGCTTGGTGAATTTTGAGAAAGTAAATACATACCCATAT 31531969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2823 ACATACAAACCAGAAGGGTTCAGCTTGGTGAATTTTGAGAAAGTAAATACATACCCATAT 2882

 31531970 AGCCACCGTTCATGTCAAGAAATAATTAGGGCCAGGCGCGGTGGCTCACTACTGTAATCC 31532029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2883 AGCCACCGTTCATGTCAAGAAATAATTAGGGCCAGGCGCGGTGGCTCACTACTGTAATCC 2942

 31532030 CAACACTTTTTTGTCCCCTTTTCCTCCTGTGCTGTCTTCCTATGTGTTTGTTTGTTTGTT 31532089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2943 CAACACTTTTTTGTCCCCTTTTCCTCCTGTGCTGTCTTCCTATGTGTTTGTTTGTTTGTT 3002

 31532090 TTAGTGACCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGTGCATGCCTGT 31532149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3003 TTAGTGACCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGTGCATGCCTGT 3062

 31532150 AATCCCAGCTACTTGAGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGTTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTT 31532209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3063 AATCCCAGCTACTTGAGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGTTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTT 3122

 31532210 GCAGTGAGCTGAGATCATGTCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGACTCTGTCT 31532269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3123 GCAGTGAGCTGAGATCATGTCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGACTCTGTCT 3182

 31532270 AAAAAAAAAATAATAATAAAAATAAAGTGACTTATGTGCCACTATTACAGTATTACAGCA 31532329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3183 AAAAAAAAAATAATAATAAAAATAAAGTGACTTATGTGCCACTATTACAGTATTACAGCA 3242

 31532330 TTCTGTATTTTTCTATGTGTTTACATTTATCAGAAAGCTTTGTATTTTCATATGCTTTCA 31532389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3243 TTCTGTATTTTTCTATGTGTTTACATTTATCAGAAAGCTTTGTATTTTCATATGCTTTCA 3302

 31532390 TGTTCCTGCCTAGCATCCTTTTGTTTCAACTTGAAGGGGTCCCTTTAGCATTTCTTTAAA 31532449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3303 TGTTCCTGCCTAGCATCCTTTTGTTTCAACTTGAAGGGGTCCCTTTAGCATTTCTTTAAA 3362

 31532450 GGCAGGTCTAATGGTGATGAACTCCTCTTGTTTTTATTTATCTGGGAAAATTTTTATTTT 31532509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3363 GGCAGGTCTAATGGTGATGAACTCCTCTTGTTTTTATTTATCTGGGAAAATTTTTATTTT 3422

 31532510 TCCTTCATTTTTAAAGGACAGCTTTCCTGGATATAGTATTTTTGGATGAGAGTTTTTGTT 31532569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3423 TCCTTCATTTTTAAAGGACAGCTTTCCTGGATATAGTATTTTTGGATGAGAGTTTTTGTT 3482

 31532570 CTTTTTATAATGTGTCTCCTTGTGGATTTCTTTGACTTTATCCTAGTTGGAATCCCTTGA 31532629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3483 CTTTTTATAATGTGTCTCCTTGTGGATTTCTTTGACTTTATCCTAGTTGGAATCCCTTGA 3542

 31532630 GCTTCTTGAATATAGGTTTCTTTTCCTTTTTAAGATTTGAAACATTTTCAGCCATTATTT 31532689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3543 GCTTCTTGAATATAGGTTTCTTTTCCTTTTTAAGATTTGAAACATTTTCAGCCATTATTT 3602

 31532690 ATTCAGATAAGCTTTTTGTCCCTTTCTCTCTCTCTGTCTCTCTCTCCTCCTTCTAGTACT 31532749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3603 ATTCAGATAAGCTTTTTGTCCCTTTCTCTCTCTCTGTCTCTCTCTCCTCCTTCTAGTACT 3662

 31532750 ACCATAATGCATATATTGTCCATTTGACGATGTCTCATAAATCCCTTAAGTTTTCTTTAC 31532809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3663 ACCATAATGCATATATTGTCCATTTGACGATGTCTCATAAATCCCTTAAGTTTTCTTTAC 3722

 31532810 TCTTTAAAATTCTTTTTTCTTTTTTGCTTCTCTGACTGGATATCTTCAAGTCTGCTGATT 31532869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3723 TCTTTAAAATTCTTTTTTCTTTTTTGCTTCTCTGACTGGATATCTTCAAGTCTGCTGATT 3782

 31532870 TTTCCTTCTGCTTGATCAAGCCTGCTGTAGATGACTTTTGAATTCAATTATTTTACTCTT 31532929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3783 TTTCCTTCTGCTTGATCAAGCCTGCTGTAGATGACTTTTGAATTCAATTATTTTACTCTT 3842

 31532930 CATCTTCAGCTCTAGAATTTCTGTTATTTTTATTATTATTATTATTATTTTTTGAGACAG 31532989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3843 CATCTTCAGCTCTAGAATTTCTGTTATTTTTATTATTATTATTATTATTTTTTGAGACAG 3902

 31532990 GGTCTTGCTCTGCCACCCAGGGTTGAGTGCAGTGGCACGAATTCAGCTCACTGAAGCCTT 31533049
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     3903 GGTCTTGCTCTGCCACCCAGGGTTGAATGCAGTGGCACGAATTCAGCTCACTGAAGCCTT 3962

 31533050 GACCTCCCAGCCTCAAGTGATCTTCCCACAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCA 31533109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3963 GACCTCCCAGCCTCAAGTGATCTTCCCACAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCA 4022

 31533110 TGCCATCATGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTTGTAGAGACAGAGTTTCACCATGTTGC 31533169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4023 TGCCATCATGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTTGTAGAGACAGAGTTTCACCATGTTGC 4082

 31533170 CCAGGCTGGCCTTGAATTCTTGAGCTCAAGTGATCGCCCACCTAAGCTTCCCAAAGTGTT 31533229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4083 CCAGGCTGGCCTTGAATTCTTGAGCTCAAGTGATCGCCCACCTAAGCTTCCCAAAGTGTT 4142

 31533230 GGGATTATAGGTGTGGGCCACCATGGCTGGCCTCTGTTTGGTTCTTTTCTATATTTTCTG 31533289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4143 GGGATTATAGGTGTGGGCCACCATGGCTGGCCTCTGTTTGGTTCTTTTCTATATTTTCTG 4202

 31533290 TGTCTTCACTAATATTCTCAGTTTGTTCATGTATTGTTTCCCTGAGCTTGTTGAGCATTT 31533349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4203 TGTCTTCACTAATATTCTCAGTTTGTTCATGTATTGTTTCCCTGAGCTTGTTGAGCATTT 4262

 31533350 TTATTACGGTTACTTAGAATTCTTTGTCAAATAATTAATATACCTCAATTTCTTTAGCGG 31533409
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4263 TTATTACAGTTACTTAGAATTCTTTGTCAAATAATTAATATACCTCAATTTCTTTAGCGG 4322

 31533410 CAGTTTCTGGAGATTTATTTTGTTCCTTTGGGCCATGCTTTCCTATTTTTTTTGTGTGCC 31533469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4323 CAGTTTCTGGAGATTTATTTTGTTCCTTTGGGCCATGCTTTCCTATTTTTTTTGTGTGCC 4382

 31533470 TTATAACTTTATATTGGGATCCATGCATTTGTAAAATCAGCCACCTCTCCCAGTCTTTAT 31533529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4383 TTATAACTTTATATTGGGATCCATGCATTTGTAAAATCAGCCACCTCTCCCAGTCTTTAT 4442

 31533530 ATACTGGCTTCATTCAGGGAAAATTCTGCACCAATCAGCTTGGCTAAAGATTCTGGGTGC 31533589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4443 ATACTGGCTTCATTCAGGGAAAATTCTGCACCAATCAGCTTGGCTAAAGATTCTGGGTGC 4502

 31533590 CTCCCCAATCTTTTTTGTGGATACTTTCACCAGACTTACGCATGTAAATTCGCAATTACA 31533649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4503 CTCCCCAATCTTTTTTGTGGATACTTTCACCAGACTTACGCATGTAAATTCGCAATTACA 4562

 31533650 GGAATCTACAGGTTTATTTTTTTCAGGAGTCCATTATCTCTTGCTCTCTCTGGTGTCTAT 31533709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4563 GGAATCTACAGGTTTATTTTTTTCAGGAGTCCATTATCTCTTGCTCTCTCTGGTGTCTAT 4622

 31533710 TTGCAGTACTGCAAGTTCTCTAGAGCGGCTACAAGCTTCCCCCAGGCCTCTAGAATATGC 31533769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4623 TTGCAGTACTGCAAGTTCTCTAGAGCGGCTACAAGCTTCCCCCAGGCCTCTAGAATATGC 4682

 31533770 TGGGTCCTTCAATAGTCTGAGAGAGGCAAGACAGAAACCAGTTTCTTGGGTACCCCTCAA 31533829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4683 TGGGTCCTTCAATAGTCTGAGAGAGGCAAGACAGAAACCAGTTTCTTGGGTACCCCTCAA 4742

 31533830 AGGCTAACATTGGATATGTATGCTCCAAATCTGCCTCCTCAAGGAGAAGCTGGAAGTTGG 31533889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4743 AGGCTAACATTGGATATGTATGCTCCAAATCTGCCTCCTCAAGGAGAAGCTGGAAGTTGG 4802

 31533890 GTTGTTTTCTCTACTCATTCCACAGAGCGGCAGGAGGGACTCTGATAGTGTGTGCTAGTC 31533949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4803 GTTGTTTTCTCTACTCATTCCACAGAGCGGCAGGAGGGACTCTGATAGTGTGTGCTAGTC 4862

 31533950 TAAATTGTCACCTTTGTTCTTAGTAGCCCAGTCTGGTGCCTCTTCCTGTCAGTGCTTAGA 31534009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4863 TAAATTGTCACCTTTGTTCTTAGTAGCCCAGTCTGGTGCCTCTTCCTGTCAGTGCTTAGA 4922

 31534010 TTCAGGCAAGACAGAAACTGGTTAATCATGCAGCCCTCTGAAAAGTCTGCATGTTGGATG 31534069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4923 TTCAGGCAAGACAGAAACTGGTTAATCATGCAGCCCTCTGAAAAGTCTGCATGTTGGATG 4982

 31534070 TACATCTCAGTCTTTCCCTCCCAGGGAGAAGCTGGAAGCTGGTGGTTCCTTCCCAATCTG 31534129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4983 TACATCTCAGTCTTTCCCTCCCAGGGAGAAGCTGGAAGCTGGTGGTTCCTTCCCAATCTG 5042

 31534130 CTTCACTGAGCCAGGAGGAGGGATTACAAGTGAGCACTATGAATTTTCCTACTGGCTTCA 31534189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5043 CTTCACTGAGCCAGGAGGAGGGATTACAAGTGAGCACTATGAATTTTCCTACTGGCTTCA 5102

 31534190 GTGCAGCTGGTTTTTTGTTTTTTGTTTTTTTGGTTTTTGTTTGTTTGTTTTTTCATTCAT 31534249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5103 GTGCAGCTGGTTTTTTGTTTTTTGTTTTTTTGGTTTTTGTTTGTTTGTTTTTTCATTCAT 5162

 31534250 CTGGGATGAATGGTCCTGGTTTCTGGTCCATGTACTGTTGTTCAGTCAGTGTCTCCATAG 31534309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5163 CTGGGATGAATGGTCCTGGTTTCTGGTCCATGTACTGTTGTTCAGTCAGTGTCTCCATAG 5222

 31534310 GGAGAAGGAAGTTCTGGATCTTCCTATTCTACCATCTTGCTGATGTCACCCATTTTTTTG 31534369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5223 GGAGAAGGAAGTTCTGGATCTTCCTATTCTACCATCTTGCTGATGTCACCCATTTTTTTG 5282

 31534370 TATCTTTCAAAGACGTCTTTGACTATCCCCTAAATATAATATCTAGTGTTATCTTTTAGA 31534429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5283 TATCTTTCAAAGACGTCTTTGACTATCCCCTAAATATAATATCTAGTGTTATCTTTTAGA 5342

 31534430 AGCTTGTTTTAAAAATCAGATTTCTGAAGTATAATTTACATCCAATAAAAGCACCTTTTA 31534489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5343 AGCTTGTTTTAAAAATCAGATTTCTGAAGTATAATTTACATCCAATAAAAGCACCTTTTA 5402

 31534490 AAAGTATATAGTTCTGTGAGGTTTCATGAATGCATACAATTGTGTAATTGGTATCACAAT 31534549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5403 AAAGTATATAGTTCTGTGAGGTTTCATGAATGCATACAATTGTGTAATTGGTATCACAAT 5462

 31534550 CAAGACATAGACATTACCCCAAAAAGTGACCTCATGTCTCCTCATAGTAAACTCTATTTC 31534609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5463 CAAGACATAGACATTACCCCAAAAAGTGACCTCATGTCTCCTCATAGTAAACTCTATTTC 5522

 31534610 CTTCTCCTAACCCCTGGCAGCCATTGATCTGTTTGTCTCTATAGTTTTGCCTTTTCCAGA 31534669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5523 CTTCTCCTAACCCCTGGCAGCCATTGATCTGTTTGTCTCTATAGTTTTGCCTTTTCCAGA 5582

 31534670 TTATCATAAATGGAAACATACACATGTAGCTGAGTGAAAGTCTAACTTTCACTTAGCATA 31534729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5583 TTATCATAAATGGAAACATACACATGTAGCTGAGTGAAAGTCTAACTTTCACTTAGCATA 5642

 31534730 ATCAATTTGAGATTCATCTTTGTTGTTGAACGTATCAGTAGTTTGTTCTTTTTATTGCTG 31534789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5643 ATCAATTTGAGATTCATCTTTGTTGTTGAACGTATCAGTAGTTTGTTCTTTTTATTGCTG 5702

 31534790 AGTATTATTCCACTGTATGGCTCTGTCATAGTTTGTTAATCCATTCACCAATTATAGGAC 31534849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5703 AGTATTATTCCACTGTATGGCTCTGTCATAGTTTGTTAATCCATTCACCAATTATAGGAC 5762

 31534850 ATTTGAGTCATTGTCAGTTTTGGATGATTATGAATGAAGCCGCTTTAAACATTGTTTTCA 31534909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5763 ATTTGAGTCATTGTCAGTTTTGGATGATTATGAATGAAGCCGCTTTAAACATTGTTTTCA 5822

 31534910 TTTCTGTTGGGTAAGTATTTAGAAGCAGAATGGCTGGGTTGTATGGTAAGTGTATTGAAA 31534969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5823 TTTCTGTTGGGTAAGTATTTAGAAGCAGAATGGCTGGGTTGTATGGTAAGTGTATTGAAA 5882

 31534970 CTTTATGAAAAATGACCAAACTGTTTTGCATTTCTACCTTTGTGTCTTCATCAACATTTG 31535029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5883 CTTTATGAAAAATGACCAAACTGTTTTGCATTTCTACCTTTGTGTCTTCATCAACATTTG 5942

 31535030 GTGTTTGATCTGTTATTATTTTAAATTTTAATAATCTATGATTGTAGCATGAGATTTCAA 31535089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5943 GTGTTTGATCTGTTATTATTTTAAATTTTAATAATCTATGATTGTAGCATGAGATTTCAA 6002

 31535090 TATTCTCTCAATTTATAAAACAACTATACAGAAAATCATTAATGATATAGAATACTTGAA 31535149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6003 TATTCTCTCAATTTATAAAACAACTATACAGAAAATCATTAATGATATAGAATACTTGAA 6062

 31535150 TAACACTATCAAACAATTTTACTTAATTAACATTTATAGATCATTCATAAACAAACATTA 31535209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6063 TAACACTATCAAACAATTTTACTTAATTAACATTTATAGATCATTCATAAACAAACATTA 6122

 31535210 TTTTTAAGTGCACACAGAACATTAATTAAACCGACCATATTCTGGTAACAAAACACATCT 31535269
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     6123 TTTTTAAGTGCACACAGAACATTAATTAAACCGACCATATTCTGGTAACAAAACAAATCT 6182

 31535270 CACTAATCTCAAAAGGATTTATGCCATACAAAGTATGTTCTCTGATCCCAATGAAACTGA 31535329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6183 CACTAATCTCAAAAGGATTTATGCCATACAAAGTATGTTCTCTGATCCCAATGAAACTGA 6242

 31535330 ATTATAAATCAAAAACAGAAATATCTTTGAAATATCCCTAAATATTTGGAAGCTAAATGA 31535389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6243 ATTATAAATCAAAAACAGAAATATCTTTGAAATATCCCTAAATATTTGGAAGCTAAATGA 6302

 31535390 CACATTTCTAAATAACCCATGGGCCAAAAAAAGAAATCCAGAGGGAAATTAGAAAATATT 31535449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6303 CACATTTCTAAATAACCCATGGGCCAAAAAAAGAAATCCAGAGGGAAATTAGAAAATATT 6362

 31535450 TTGAACTGAATGAAAATGAAAATGTAACATTTCAAAATTTATGAGATGCCACAAAAAACA 31535509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6363 TTGAACTGAATGAAAATGAAAATGTAACATTTCAAAATTTATGAGATGCCACAAAAAACA 6422

 31535510 GTAGTAACGGGGAAATTTGTAGCACTAAATGCCTATATTAGAAGGAAAAAAGTTCAAATC 31535569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6423 GTAGTAACGGGGAAATTTGTAGCACTAAATGCCTATATTAGAAGGAAAAAAGTTCAAATC 6482

 31535570 TCCAGCCTCAACTTCCACATTAAGAAACTAGAAAGAGGTCTGGTGCGGTGGCTCACGCCT 31535629
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6483 ACCAGCCTCAACTTCCACATTAAGAAACTAGAAAGAGGTCTGGTGCGGTGGCTCACGCCT 6542

 31535630 TTGGGAGGCAGGTGGGAGGATCATTTGAACCCAGGGGTTCAAGACCAGCCTAGGCAACAT 31535689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6543 TTGGGAGGCAGGTGGGAGGATCATTTGAACCCAGGGGTTCAAGACCAGCCTAGGCAACAT 6602

 31535690 AACAAGACCCCATCTCAATTAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAAGAAACTAGAAAGAAAGAG 31535749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6603 AACAAGACCCCATCTCAATTAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAAGAAACTAGAAAGAAAGAG 6662

 31535750 CAAATTGAGCCCAAAGTAAATAGAAGAGAAATAATAAAGATTAGAATGGAAATCGATGAA 31535809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6663 CAAATTGAGCCCAAAGTAAATAGAAGAGAAATAATAAAGATTAGAATGGAAATCGATGAA 6722

 31535810 ACAGGGAAGTAAAAAATAATAAGGAAAATCAATGAACCCAAAAGCTGGTTCTTTGAAAAG 31535869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6723 ACAGGGAAGTAAAAAATAATAAGGAAAATCAATGAACCCAAAAGCTGGTTCTTTGAAAAG 6782

 31535870 ATAGTTAAATCGATAAACCTCCAGCTAGACTGGGCAGGAAAAAGAGAGAGAATACACCAA 31535929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6783 ATAGTTAAATCGATAAACCTCCAGCTAGACTGGGCAGGAAAAAGAGAGAGAATACACCAA 6842

 31535930 TTACCAATATCAGGAATGAGTGAGATGACATCATTTCTGATTCTACAGATATTAAAAGGA 31535989
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     6843 TTACCAATATCAGGAATGAGTGAGATGACATCATTTCTGATCCTACAGATATTAAAAGGA 6902

 31535990 TAACAATGAAATACTATAAACAACTTTATACAATAAATTTGGCAACTTATATGAAATAAA 31536049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6903 TAACAATGAAATACTATAAACAACTTTATACAATAAATTTGGCAACTTATATGAAATAAA 6962

 31536050 CTCCTTGAAAGAAACAAACTACTAAATCTTACACAAGAAGAAACAGATAACCCGAATA 31536107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6963 CTCCTTGAAAGAAACAAACTACTAAATCTTACACAAGAAGAAACAGATAACCCGAATA 7020

Alignment time is 5.9722 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31515486,31539389] =>     23904 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    2410] =>      2410 nucs 'mol-32-317a-163633_2410'

Score:        2410
Aligned:      2410        nucs
Identic:      2410 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31528326,31530735]
 second seq =>  [       1,    2410]

 31528326 GTGTGTCTTAGATATGACACCAAAAACAAGCTACAAAAGAAAAAAACAGATAAATTGGAC 31528385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTGTGTCTTAGATATGACACCAAAAACAAGCTACAAAAGAAAAAAACAGATAAATTGGAC 60

 31528386 TTTGTCAAAATTAAAAACTTTTGGGCTGCAAAGGATACCGTCAAGAAAGTGAAAGGGTAA 31528445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTGTCAAAATTAAAAACTTTTGGGCTGCAAAGGATACCGTCAAGAAAGTGAAAGGGTAA 120

 31528446 CCTGAAAGAAAATACTTGCAAATCATATATCTGATAAGGGACTAGTATCCAGAATATATA 31528505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCTGAAAGAAAATACTTGCAAATCATATATCTGATAAGGGACTAGTATCCAGAATATATA 180

 31528506 AAGCACTCTTGCAACTTGATAAAAATGATAAATAACCAAATTAAGATACGGGTAAAGGAT 31528565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAGCACTCTTGCAACTTGATAAAAATGATAAATAACCAAATTAAGATACGGGTAAAGGAT 240

 31528566 CTAAATAAACATTTCTTCAAAGAAGATGTACAAATGGCTAATAAGTATATTAAATGATGG 31528625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTAAATAAACATTTCTTCAAAGAAGATGTACAAATGGCTAATAAGTATATTAAATGATGG 300

 31528626 TGAACATCATTAGCTATCAGGGAAATGCATATTAAAACTATAATGAGATCCCACTTTACA 31528685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGAACATCATTAGCTATCAGGGAAATGCATATTAAAACTATAATGAGATCCCACTTTACA 360

 31528686 CTTGCCAGGATAACTATAGATAATAGCAATGGTTGGCTGGGATGTGGACAAACTGGGACT 31528745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTTGCCAGGATAACTATAGATAATAGCAATGGTTGGCTGGGATGTGGACAAACTGGGACT 420

 31528746 CTTACACATTGCTGGATAGAATGTAGAAAGCTGGCCAGGTACGGTGGCTCAGGCCTGTAA 31528805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTTACACATTGCTGGATAGAATGTAGAAAGCTGGCCAGGTACGGTGGCTCAGGCCTGTAA 480

 31528806 TCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGCGGATTATGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCC 31528865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGCGGATTATGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCC 540

 31528866 TGGCCAGCATGGTGTAACCCCGTCTCTACTAAACATACAAAAATTAGCAGGGCATGATGG 31528925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGGCCAGCATGGTGTAACCCCGTCTCTACTAAACATACAAAAATTAGCAGGGCATGATGG 600

 31528926 CGGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGG 31528985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CGGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGG 660

 31528986 AGGCGGAGGTTGCAGTGAGCAGAGATCATGCCATTGCGTTCCAGTCTGGGCAACAAGAGC 31529045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGGCGGAGGTTGCAGTGAGCAGAGATCATGCCATTGCGTTCCAGTCTGGGCAACAAGAGC 720

 31529046 AAAACTCCAAACTCTGTTTAAAAAAAAAAAAAGAAAAAGAACATAGAAAGCTGCAGTCAC 31529105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAAACTCCAAACTCTGTTTAAAAAAAAAAAAAGAAAAAGAACATAGAAAGCTGCAGTCAC 780

 31529106 TTTGGAAAACAGTCTGGCAGTTCCTCAAAAATTAAGTGTAGACTTACCATATTACCCAAC 31529165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTTGGAAAACAGTCTGGCAGTTCCTCAAAAATTAAGTGTAGACTTACCATATTACCCAAC 840

 31529166 AGTTCCACTCCCAAGTGTATACCCAAGAGAAATGAAAACATATGTTCACATAAAATCTTG 31529225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGTTCCACTCCCAAGTGTATACCCAAGAGAAATGAAAACATATGTTCACATAAAATCTTG 900

 31529226 TACATGAATGTTTATAGTAGCATTATTTATAATACAAAAGTGGAAACAACCCAAATGTCA 31529285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TACATGAATGTTTATAGTAGCATTATTTATAATACAAAAGTGGAAACAACCCAAATGTCA 960

 31529286 ACTTCCAAATGGATAAAGTGTGGTATGGTGATACAATGGAATGTTATTTAATAATAAAAA 31529345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ACTTCCAAATGGATAAAGTGTGGTATGGTGATACAATGGAATGTTATTTAATAATAAAAA 1020

 31529346 GGAATAAAGTACTGATGCATGCAACAACATGGATGAACCTTGAAAATACTGTGCTAAGTG 31529405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GGAATAAAGTACTGATGCATGCAACAACATGGATGAACCTTGAAAATACTGTGCTAAGTG 1080

 31529406 AAAGAAGCCAACCACAAAATACCATATATTGTGTGATTCTGCTTAAATGACATGTCCAGA 31529465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAAGAAGCCAACCACAAAATACCATATATTGTGTGATTCTGCTTAAATGACATGTCCAGA 1140

 31529466 ATGTCCATATTAAAGTAGATTAGTGGTTTCCTGAGGCTGGGGGAGGGAGTTGGGGAAATT 31529525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATGTCCATATTAAAGTAGATTAGTGGTTTCCTGAGGCTGGGGGAGGGAGTTGGGGAAATT 1200

 31529526 GCGTAGTGACTACTGGGTAAAGAGTTTCTTTCTGGGGTGATGAAATGGTCTAAAATAGAA 31529585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GCGTAGTGACTACTGGGTAAAGAGTTTCTTTCTGGGGTGATGAAATGGTCTAAAATAGAA 1260

 31529586 TGTGGTGGTGGTTGCACAGCTCTGAAAATACTAAAAACCATTGAATGAGCACTTTAAATT 31529645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGTGGTGGTGGTTGCACAGCTCTGAAAATACTAAAAACCATTGAATGAGCACTTTAAATT 1320

 31529646 GGTAAATTTTTATGTGAATTATGATTCAATAAAGTTGTGTTTAGATATTACTAAAAATGA 31529705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GGTAAATTTTTATGTGAATTATGATTCAATAAAGTTGTGTTTAGATATTACTAAAAATGA 1380

 31529706 TGGTACAAATATTCTTTTTCACAAATGTTTTTTGTTGTTGTTTATAGTTGTTTATTTGTA 31529765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TGGTACAAATATTCTTTTTCACAAATGTTTTTTGTTGTTGTTTATAGTTGTTTATTTGTA 1440

 31529766 CATCTAGTAATTTGTCCCAAGGAAAGAGTATGTAAAAGAACATAAGTCACTTTAAGGCCT 31529825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CATCTAGTAATTTGTCCCAAGGAAAGAGTATGTAAAAGAACATAAGTCACTTTAAGGCCT 1500

 31529826 TTAATGTATACTACAAAATTGCACTCTAGAAGGTTTATACAGTTTTGCATTTCATTAGCC 31529885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTAATGTATACTACAAAATTGCACTCTAGAAGGTTTATACAGTTTTGCATTTCATTAGCC 1560

 31529886 TGTTTTTTTTATCTTTGACAACCTAAAGAATTTATTAGTGGTATTCATCTGAGGATCCTC 31529945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TGTTTTTTTTATCTTTGACAACCTAAAGAATTTATTAGTGGTATTCATCTGAGGATCCTC 1620

 31529946 TAGGTCTATCAGAGTGTCTTTCTTATAGAAGGCATTCAATAAATAAATGTCCTAAGTGAG 31530005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TAGGTCTATCAGAGTGTCTTTCTTATAGAAGGCATTCAATAAATAAATGTCCTAAGTGAG 1680

 31530006 CAAAACATTTTTGGTTGATTTTTAGGTGCAAATGGTTTCTTTTGATTTTAATTAAGATGC 31530065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CAAAACATTTTTGGTTGATTTTTAGGTGCAAATGGTTTCTTTTGATTTTAATTAAGATGC 1740

 31530066 CTTTGTTTATTAGTGATGTTGACATATTTTCTTAATCTATTGGCTTTGTATAACTTTATG 31530125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CTTTGTTTATTAGTGATGTTGACATATTTTCTTAATCTATTGGCTTTGTATAACTTTATG 1800

 31530126 AATTGTCTCTTCATGTCCTTTGCCTACTTTTCTATTGTGGTAACTATCTTTTATAAATGT 31530185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AATTGTCTCTTCATGTCCTTTGCCTACTTTTCTATTGTGGTAACTATCTTTTATAAATGT 1860

 31530186 TGTATAATTATTTAAAAATACATTAGGTTGGGCATGGTAGATCATGCCTGTAATCCCAGC 31530245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TGTATAATTATTTAAAAATACATTAGGTTGGGCATGGTAGATCATGCCTGTAATCCCAGC 1920

 31530246 TCTCTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATTGCTTGAGCCTAACAGTTCGAGACCAGCCTGGGC 31530305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TCTCTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATTGCTTGAGCCTAACAGTTCGAGACCAGCCTGGGC 1980

 31530306 AACATAGTGAGACCCCATCTCTAAAAAAAAAAACCAATAAAAATATATTAAAAGATTAAC 31530365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AACATAGTGAGACCCCATCTCTAAAAAAAAAAACCAATAAAAATATATTAAAAGATTAAC 2040

 31530366 TGATTGTCTATCATATGGATTACAAATATCCCCCCCAATTTGTCATTTGCTTGTTAATTT 31530425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TGATTGTCTATCATATGGATTACAAATATCCCCCCCAATTTGTCATTTGCTTGTTAATTT 2100

 31530426 TATTTATGATGACTTAAAAATTACAATATATTTTTTGGTGTTCAAGTCAGTTTTTGTCCC 31530485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TATTTATGATGACTTAAAAATTACAATATATTTTTTGGTGTTCAAGTCAGTTTTTGTCCC 2160

 31530486 CATTGTGATATTTTCCTTTGCCTGTTTATCACTTTCTTAGAGAAAAGATAAATACTGATT 31530545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CATTGTGATATTTTCCTTTGCCTGTTTATCACTTTCTTAGAGAAAAGATAAATACTGATT 2220

 31530546 CGTTCTTTTGTAGGTGTTTTATGATTTCATTGAAAATAAAATCTTCAACGCATCTAGTAT 31530605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CGTTCTTTTGTAGGTGTTTTATGATTTCATTGAAAATAAAATCTTCAACGCATCTAGTAT 2280

 31530606 TCATTTGGGTGTAAGATAAAAGATAACAACGTAGGTTTCTCTTATAGTTCATCAGGTATC 31530665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TCATTTGGGTGTAAGATAAAAGATAACAACGTAGGTTTCTCTTATAGTTCATCAGGTATC 2340

 31530666 CTACTACTGTTTATTGAGTCATGTTTTCTGTTACCACTCTTACTATATACCAGTTTTACA 31530725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CTACTACTGTTTATTGAGTCATGTTTTCTGTTACCACTCTTACTATATACCAGTTTTACA 2400

 31530726 TACATTTGGG 31530735
          ||||||||||
     2401 TACATTTGGG 2410

Alignment time is 1.78574 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31515486,31539389] =>     23904 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    3266] =>      3266 nucs 'mol-32-3185-139134_3266'

Score:        3265
Aligned:      3265        nucs
Identic:      3265 (100%) nucs =>      2733 (100%)       532 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31528478,31531210] EXCISED REGION [31531212,31531743]
 second seq =>  [       1,    2733] EXCISED REGION [    2735,    3266]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [31531211,31531211]
 second seq =>         1 nucs [2734,2734]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [31531210,31531211] to [31531211,31531212]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [31531210,31531210] to [31531212,31531212]
 second seq =>         1 nucs [2733,2733] to [2735,2735]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31528478 GATAAGGGACTAGTATCCAGAATATATAAAGCACTCTTGCAACTTGATAAAAATGATAAA 31528537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GATAAGGGACTAGTATCCAGAATATATAAAGCACTCTTGCAACTTGATAAAAATGATAAA 60

 31528538 TAACCAAATTAAGATACGGGTAAAGGATCTAAATAAACATTTCTTCAAAGAAGATGTACA 31528597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAACCAAATTAAGATACGGGTAAAGGATCTAAATAAACATTTCTTCAAAGAAGATGTACA 120

 31528598 AATGGCTAATAAGTATATTAAATGATGGTGAACATCATTAGCTATCAGGGAAATGCATAT 31528657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AATGGCTAATAAGTATATTAAATGATGGTGAACATCATTAGCTATCAGGGAAATGCATAT 180

 31528658 TAAAACTATAATGAGATCCCACTTTACACTTGCCAGGATAACTATAGATAATAGCAATGG 31528717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TAAAACTATAATGAGATCCCACTTTACACTTGCCAGGATAACTATAGATAATAGCAATGG 240

 31528718 TTGGCTGGGATGTGGACAAACTGGGACTCTTACACATTGCTGGATAGAATGTAGAAAGCT 31528777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTGGCTGGGATGTGGACAAACTGGGACTCTTACACATTGCTGGATAGAATGTAGAAAGCT 300

 31528778 GGCCAGGTACGGTGGCTCAGGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGCGGA 31528837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GGCCAGGTACGGTGGCTCAGGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGCGGA 360

 31528838 TTATGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAGCATGGTGTAACCCCGTCTCTACTAA 31528897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTATGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAGCATGGTGTAACCCCGTCTCTACTAA 420

 31528898 ACATACAAAAATTAGCAGGGCATGATGGCGGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGC 31528957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACATACAAAAATTAGCAGGGCATGATGGCGGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGC 480

 31528958 TGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCAGAGATCATGCC 31529017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCAGAGATCATGCC 540

 31529018 ATTGCGTTCCAGTCTGGGCAACAAGAGCAAAACTCCAAACTCTGTTTAAAAAAAAAAAAA 31529077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATTGCGTTCCAGTCTGGGCAACAAGAGCAAAACTCCAAACTCTGTTTAAAAAAAAAAAAA 600

 31529078 GAAAAAGAACATAGAAAGCTGCAGTCACTTTGGAAAACAGTCTGGCAGTTCCTCAAAAAT 31529137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GAAAAAGAACATAGAAAGCTGCAGTCACTTTGGAAAACAGTCTGGCAGTTCCTCAAAAAT 660

 31529138 TAAGTGTAGACTTACCATATTACCCAACAGTTCCACTCCCAAGTGTATACCCAAGAGAAA 31529197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TAAGTGTAGACTTACCATATTACCCAACAGTTCCACTCCCAAGTGTATACCCAAGAGAAA 720

 31529198 TGAAAACATATGTTCACATAAAATCTTGTACATGAATGTTTATAGTAGCATTATTTATAA 31529257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGAAAACATATGTTCACATAAAATCTTGTACATGAATGTTTATAGTAGCATTATTTATAA 780

 31529258 TACAAAAGTGGAAACAACCCAAATGTCAACTTCCAAATGGATAAAGTGTGGTATGGTGAT 31529317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TACAAAAGTGGAAACAACCCAAATGTCAACTTCCAAATGGATAAAGTGTGGTATGGTGAT 840

 31529318 ACAATGGAATGTTATTTAATAATAAAAAGGAATAAAGTACTGATGCATGCAACAACATGG 31529377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ACAATGGAATGTTATTTAATAATAAAAAGGAATAAAGTACTGATGCATGCAACAACATGG 900

 31529378 ATGAACCTTGAAAATACTGTGCTAAGTGAAAGAAGCCAACCACAAAATACCATATATTGT 31529437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATGAACCTTGAAAATACTGTGCTAAGTGAAAGAAGCCAACCACAAAATACCATATATTGT 960

 31529438 GTGATTCTGCTTAAATGACATGTCCAGAATGTCCATATTAAAGTAGATTAGTGGTTTCCT 31529497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GTGATTCTGCTTAAATGACATGTCCAGAATGTCCATATTAAAGTAGATTAGTGGTTTCCT 1020

 31529498 GAGGCTGGGGGAGGGAGTTGGGGAAATTGCGTAGTGACTACTGGGTAAAGAGTTTCTTTC 31529557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GAGGCTGGGGGAGGGAGTTGGGGAAATTGCGTAGTGACTACTGGGTAAAGAGTTTCTTTC 1080

 31529558 TGGGGTGATGAAATGGTCTAAAATAGAATGTGGTGGTGGTTGCACAGCTCTGAAAATACT 31529617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGGGGTGATGAAATGGTCTAAAATAGAATGTGGTGGTGGTTGCACAGCTCTGAAAATACT 1140

 31529618 AAAAACCATTGAATGAGCACTTTAAATTGGTAAATTTTTATGTGAATTATGATTCAATAA 31529677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AAAAACCATTGAATGAGCACTTTAAATTGGTAAATTTTTATGTGAATTATGATTCAATAA 1200

 31529678 AGTTGTGTTTAGATATTACTAAAAATGATGGTACAAATATTCTTTTTCACAAATGTTTTT 31529737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AGTTGTGTTTAGATATTACTAAAAATGATGGTACAAATATTCTTTTTCACAAATGTTTTT 1260

 31529738 TGTTGTTGTTTATAGTTGTTTATTTGTACATCTAGTAATTTGTCCCAAGGAAAGAGTATG 31529797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGTTGTTGTTTATAGTTGTTTATTTGTACATCTAGTAATTTGTCCCAAGGAAAGAGTATG 1320

 31529798 TAAAAGAACATAAGTCACTTTAAGGCCTTTAATGTATACTACAAAATTGCACTCTAGAAG 31529857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TAAAAGAACATAAGTCACTTTAAGGCCTTTAATGTATACTACAAAATTGCACTCTAGAAG 1380

 31529858 GTTTATACAGTTTTGCATTTCATTAGCCTGTTTTTTTTATCTTTGACAACCTAAAGAATT 31529917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GTTTATACAGTTTTGCATTTCATTAGCCTGTTTTTTTTATCTTTGACAACCTAAAGAATT 1440

 31529918 TATTAGTGGTATTCATCTGAGGATCCTCTAGGTCTATCAGAGTGTCTTTCTTATAGAAGG 31529977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TATTAGTGGTATTCATCTGAGGATCCTCTAGGTCTATCAGAGTGTCTTTCTTATAGAAGG 1500

 31529978 CATTCAATAAATAAATGTCCTAAGTGAGCAAAACATTTTTGGTTGATTTTTAGGTGCAAA 31530037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CATTCAATAAATAAATGTCCTAAGTGAGCAAAACATTTTTGGTTGATTTTTAGGTGCAAA 1560

 31530038 TGGTTTCTTTTGATTTTAATTAAGATGCCTTTGTTTATTAGTGATGTTGACATATTTTCT 31530097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TGGTTTCTTTTGATTTTAATTAAGATGCCTTTGTTTATTAGTGATGTTGACATATTTTCT 1620

 31530098 TAATCTATTGGCTTTGTATAACTTTATGAATTGTCTCTTCATGTCCTTTGCCTACTTTTC 31530157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TAATCTATTGGCTTTGTATAACTTTATGAATTGTCTCTTCATGTCCTTTGCCTACTTTTC 1680

 31530158 TATTGTGGTAACTATCTTTTATAAATGTTGTATAATTATTTAAAAATACATTAGGTTGGG 31530217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TATTGTGGTAACTATCTTTTATAAATGTTGTATAATTATTTAAAAATACATTAGGTTGGG 1740

 31530218 CATGGTAGATCATGCCTGTAATCCCAGCTCTCTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATTGCTTG 31530277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CATGGTAGATCATGCCTGTAATCCCAGCTCTCTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATTGCTTG 1800

 31530278 AGCCTAACAGTTCGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCCATCTCTAAAAAAAAAA 31530337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AGCCTAACAGTTCGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCCATCTCTAAAAAAAAAA 1860

 31530338 ACCAATAAAAATATATTAAAAGATTAACTGATTGTCTATCATATGGATTACAAATATCCC 31530397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ACCAATAAAAATATATTAAAAGATTAACTGATTGTCTATCATATGGATTACAAATATCCC 1920

 31530398 CCCCAATTTGTCATTTGCTTGTTAATTTTATTTATGATGACTTAAAAATTACAATATATT 31530457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CCCCAATTTGTCATTTGCTTGTTAATTTTATTTATGATGACTTAAAAATTACAATATATT 1980

 31530458 TTTTGGTGTTCAAGTCAGTTTTTGTCCCCATTGTGATATTTTCCTTTGCCTGTTTATCAC 31530517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TTTTGGTGTTCAAGTCAGTTTTTGTCCCCATTGTGATATTTTCCTTTGCCTGTTTATCAC 2040

 31530518 TTTCTTAGAGAAAAGATAAATACTGATTCGTTCTTTTGTAGGTGTTTTATGATTTCATTG 31530577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TTTCTTAGAGAAAAGATAAATACTGATTCGTTCTTTTGTAGGTGTTTTATGATTTCATTG 2100

 31530578 AAAATAAAATCTTCAACGCATCTAGTATTCATTTGGGTGTAAGATAAAAGATAACAACGT 31530637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AAAATAAAATCTTCAACGCATCTAGTATTCATTTGGGTGTAAGATAAAAGATAACAACGT 2160

 31530638 AGGTTTCTCTTATAGTTCATCAGGTATCCTACTACTGTTTATTGAGTCATGTTTTCTGTT 31530697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AGGTTTCTCTTATAGTTCATCAGGTATCCTACTACTGTTTATTGAGTCATGTTTTCTGTT 2220

 31530698 ACCACTCTTACTATATACCAGTTTTACATACATTTGGGTTGGTTTCTGAGCTTTCTATTG 31530757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ACCACTCTTACTATATACCAGTTTTACATACATTTGGGTTGGTTTCTGAGCTTTCTATTG 2280

 31530758 TCTTCCATTGCTTTGTTTAAAATTTAAAGTTTATTATTCTGACTTTCCATACTTGAATAT 31530817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TCTTCCATTGCTTTGTTTAAAATTTAAAGTTTATTATTCTGACTTTCCATACTTGAATAT 2340

 31530818 GGTCGAATAAGTCCTCCTTTATTAATCTTGTTTTATTTAAAAATGGTCATTTTCACTCAT 31530877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GGTCGAATAAGTCCTCCTTTATTAATCTTGTTTTATTTAAAAATGGTCATTTTCACTCAT 2400

 31530878 TTTCCAGTTCAGTAGTTTTATTCTCTCAGTGTAATGTGATTTATCACCCCATTGCTCACC 31530937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TTTCCAGTTCAGTAGTTTTATTCTCTCAGTGTAATGTGATTTATCACCCCATTGCTCACC 2460

 31530938 CTATTCATCTCCCAATACCCAGCTGAAAAACTTTAGAAGACTGAGGCTCTTGCCCTGGCC 31530997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CTATTCATCTCCCAATACCCAGCTGAAAAACTTTAGAAGACTGAGGCTCTTGCCCTGGCC 2520

 31530998 CCATCACTTTCTAGCTATGTGGGCTTAGGCTAGTTATTGAACATGTCTGACTCTCACTTT 31531057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CCATCACTTTCTAGCTATGTGGGCTTAGGCTAGTTATTGAACATGTCTGACTCTCACTTT 2580

 31531058 TCTCCTCTGTAAGTCAGTGAGAATTATATACTTCTTATAAGGTTGTGAGGTTCAAATGGA 31531117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TCTCCTCTGTAAGTCAGTGAGAATTATATACTTCTTATAAGGTTGTGAGGTTCAAATGGA 2640

 31531118 ATAATGTGTACAGAGGCACTTGGTAAACAATGTAGTCATATGCAAGTCATATGCAAGTCA 31531177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 ATAATGTGTACAGAGGCACTTGGTAAACAATGTAGTCATATGCAAGTCATATGCAAGTCA 2700

 31531178 TATGTAGTCAGCTTGGTGAATTTTGAGAAAGTA 31531210
          |||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TATGTAGTCAGCTTGGTGAATTTTGAGAAAGTA 2733

EXCISED REGION

 31531212 ATGCAAGTTCTTTTTATGGTTTTACCTAAGGGGCCAGTGAGGGCCAGAGAAGTGCCGGGA 31531271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2735 ATGCAAGTTCTTTTTATGGTTTTACCTAAGGGGCCAGTGAGGGCCAGAGAAGTGCCGGGA 2794

 31531272 CCTATGTAAGGTCGCAAGCAAGTTCATGTGGAATGCATCTAGAACTAGAACGCTAGCCTG 31531331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2795 CCTATGTAAGGTCGCAAGCAAGTTCATGTGGAATGCATCTAGAACTAGAACGCTAGCCTG 2854

 31531332 TGTCCCAGGGCCCTTCCAACTGGGCTCTGCTGCCTGCAGTCCTGGGTGCCTTCTAATTAG 31531391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2855 TGTCCCAGGGCCCTTCCAACTGGGCTCTGCTGCCTGCAGTCCTGGGTGCCTTCTAATTAG 2914

 31531392 CCTGTGTAGTGGTCTTGGTAAAAGTGTTTCTCCTGTACTGTCCCCTATAGGTTGTGGCTG 31531451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2915 CCTGTGTAGTGGTCTTGGTAAAAGTGTTTCTCCTGTACTGTCCCCTATAGGTTGTGGCTG 2974

 31531452 GCCATACCATTTCCCTGGTTCCCCCCACGCTCCTGATGACCTGGAAAGGCCATTTGAATA 31531511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2975 GCCATACCATTTCCCTGGTTCCCCCCACGCTCCTGATGACCTGGAAAGGCCATTTGAATA 3034

 31531512 GTGTGGCAGACATCCTGTATGTGGACAACTTCCAGCTGGTTATCAGCGCTGGCCAGGACC 31531571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3035 GTGTGGCAGACATCCTGTATGTGGACAACTTCCAGCTGGTTATCAGCGCTGGCCAGGACC 3094

 31531572 GGGACGTCAAGGCTTGGAAACTCTCCGGTGATGCCATTGGTATGGGTCCTGCTGAAGCTC 31531631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3095 GGGACGTCAAGGCTTGGAAACTCTCCGGTGATGCCATTGGTATGGGTCCTGCTGAAGCTC 3154

 31531632 AGCCATGCCCATGGCCCTTCTTGTCTCTGTCCCTGTCTGAACATAAGCTGGTATGAACTT 31531691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3155 AGCCATGCCCATGGCCCTTCTTGTCTCTGTCCCTGTCTGAACATAAGCTGGTATGAACTT 3214

 31531692 TGTACTCTGTGGGGAGGGACTCTCAGGCCACAGCAACTGCCTTCACTTAAAT 31531743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3215 TGTACTCTGTGGGGAGGGACTCTCAGGCCACAGCAACTGCCTTCACTTAAAT 3266

Alignment time is 2.75616 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31515486,31539389] =>     23904 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    3148] =>      3148 nucs 'mol-32-3185-184752_3148'

Score:        3147
Aligned:      3147        nucs
Identic:      3147 (100%) nucs =>      1988 (100%)      1159 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31528340,31530327] EXCISED REGION [31530328,31531486]
 second seq =>  [       1,    1988] EXCISED REGION [    1990,    3148]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [1989,1989]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        11 nucs [1989,1999] to [1990,2000]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31528340 TGACACCAAAAACAAGCTACAAAAGAAAAAAACAGATAAATTGGACTTTGTCAAAATTAA 31528399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGACACCAAAAACAAGCTACAAAAGAAAAAAACAGATAAATTGGACTTTGTCAAAATTAA 60

 31528400 AAACTTTTGGGCTGCAAAGGATACCGTCAAGAAAGTGAAAGGGTAACCTGAAAGAAAATA 31528459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAACTTTTGGGCTGCAAAGGATACCGTCAAGAAAGTGAAAGGGTAACCTGAAAGAAAATA 120

 31528460 CTTGCAAATCATATATCTGATAAGGGACTAGTATCCAGAATATATAAAGCACTCTTGCAA 31528519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTTGCAAATCATATATCTGATAAGGGACTAGTATCCAGAATATATAAAGCACTCTTGCAA 180

 31528520 CTTGATAAAAATGATAAATAACCAAATTAAGATACGGGTAAAGGATCTAAATAAACATTT 31528579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTTGATAAAAATGATAAATAACCAAATTAAGATACGGGTAAAGGATCTAAATAAACATTT 240

 31528580 CTTCAAAGAAGATGTACAAATGGCTAATAAGTATATTAAATGATGGTGAACATCATTAGC 31528639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTTCAAAGAAGATGTACAAATGGCTAATAAGTATATTAAATGATGGTGAACATCATTAGC 300

 31528640 TATCAGGGAAATGCATATTAAAACTATAATGAGATCCCACTTTACACTTGCCAGGATAAC 31528699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TATCAGGGAAATGCATATTAAAACTATAATGAGATCCCACTTTACACTTGCCAGGATAAC 360

 31528700 TATAGATAATAGCAATGGTTGGCTGGGATGTGGACAAACTGGGACTCTTACACATTGCTG 31528759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TATAGATAATAGCAATGGTTGGCTGGGATGTGGACAAACTGGGACTCTTACACATTGCTG 420

 31528760 GATAGAATGTAGAAAGCTGGCCAGGTACGGTGGCTCAGGCCTGTAATCCCAGCACTTTGG 31528819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GATAGAATGTAGAAAGCTGGCCAGGTACGGTGGCTCAGGCCTGTAATCCCAGCACTTTGG 480

 31528820 GAGGCTGAGGTGGGCGGATTATGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAGCATGGTG 31528879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GAGGCTGAGGTGGGCGGATTATGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAGCATGGTG 540

 31528880 TAACCCCGTCTCTACTAAACATACAAAAATTAGCAGGGCATGATGGCGGGTGCCTGTAAT 31528939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TAACCCCGTCTCTACTAAACATACAAAAATTAGCAGGGCATGATGGCGGGTGCCTGTAAT 600

 31528940 CCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCA 31528999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCA 660

 31529000 GTGAGCAGAGATCATGCCATTGCGTTCCAGTCTGGGCAACAAGAGCAAAACTCCAAACTC 31529059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GTGAGCAGAGATCATGCCATTGCGTTCCAGTCTGGGCAACAAGAGCAAAACTCCAAACTC 720

 31529060 TGTTTAAAAAAAAAAAAAGAAAAAGAACATAGAAAGCTGCAGTCACTTTGGAAAACAGTC 31529119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGTTTAAAAAAAAAAAAAGAAAAAGAACATAGAAAGCTGCAGTCACTTTGGAAAACAGTC 780

 31529120 TGGCAGTTCCTCAAAAATTAAGTGTAGACTTACCATATTACCCAACAGTTCCACTCCCAA 31529179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGGCAGTTCCTCAAAAATTAAGTGTAGACTTACCATATTACCCAACAGTTCCACTCCCAA 840

 31529180 GTGTATACCCAAGAGAAATGAAAACATATGTTCACATAAAATCTTGTACATGAATGTTTA 31529239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GTGTATACCCAAGAGAAATGAAAACATATGTTCACATAAAATCTTGTACATGAATGTTTA 900

 31529240 TAGTAGCATTATTTATAATACAAAAGTGGAAACAACCCAAATGTCAACTTCCAAATGGAT 31529299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TAGTAGCATTATTTATAATACAAAAGTGGAAACAACCCAAATGTCAACTTCCAAATGGAT 960

 31529300 AAAGTGTGGTATGGTGATACAATGGAATGTTATTTAATAATAAAAAGGAATAAAGTACTG 31529359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AAAGTGTGGTATGGTGATACAATGGAATGTTATTTAATAATAAAAAGGAATAAAGTACTG 1020

 31529360 ATGCATGCAACAACATGGATGAACCTTGAAAATACTGTGCTAAGTGAAAGAAGCCAACCA 31529419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATGCATGCAACAACATGGATGAACCTTGAAAATACTGTGCTAAGTGAAAGAAGCCAACCA 1080

 31529420 CAAAATACCATATATTGTGTGATTCTGCTTAAATGACATGTCCAGAATGTCCATATTAAA 31529479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CAAAATACCATATATTGTGTGATTCTGCTTAAATGACATGTCCAGAATGTCCATATTAAA 1140

 31529480 GTAGATTAGTGGTTTCCTGAGGCTGGGGGAGGGAGTTGGGGAAATTGCGTAGTGACTACT 31529539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GTAGATTAGTGGTTTCCTGAGGCTGGGGGAGGGAGTTGGGGAAATTGCGTAGTGACTACT 1200

 31529540 GGGTAAAGAGTTTCTTTCTGGGGTGATGAAATGGTCTAAAATAGAATGTGGTGGTGGTTG 31529599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GGGTAAAGAGTTTCTTTCTGGGGTGATGAAATGGTCTAAAATAGAATGTGGTGGTGGTTG 1260

 31529600 CACAGCTCTGAAAATACTAAAAACCATTGAATGAGCACTTTAAATTGGTAAATTTTTATG 31529659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CACAGCTCTGAAAATACTAAAAACCATTGAATGAGCACTTTAAATTGGTAAATTTTTATG 1320

 31529660 TGAATTATGATTCAATAAAGTTGTGTTTAGATATTACTAAAAATGATGGTACAAATATTC 31529719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGAATTATGATTCAATAAAGTTGTGTTTAGATATTACTAAAAATGATGGTACAAATATTC 1380

 31529720 TTTTTCACAAATGTTTTTTGTTGTTGTTTATAGTTGTTTATTTGTACATCTAGTAATTTG 31529779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTTTTCACAAATGTTTTTTGTTGTTGTTTATAGTTGTTTATTTGTACATCTAGTAATTTG 1440

 31529780 TCCCAAGGAAAGAGTATGTAAAAGAACATAAGTCACTTTAAGGCCTTTAATGTATACTAC 31529839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TCCCAAGGAAAGAGTATGTAAAAGAACATAAGTCACTTTAAGGCCTTTAATGTATACTAC 1500

 31529840 AAAATTGCACTCTAGAAGGTTTATACAGTTTTGCATTTCATTAGCCTGTTTTTTTTATCT 31529899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AAAATTGCACTCTAGAAGGTTTATACAGTTTTGCATTTCATTAGCCTGTTTTTTTTATCT 1560

 31529900 TTGACAACCTAAAGAATTTATTAGTGGTATTCATCTGAGGATCCTCTAGGTCTATCAGAG 31529959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTGACAACCTAAAGAATTTATTAGTGGTATTCATCTGAGGATCCTCTAGGTCTATCAGAG 1620

 31529960 TGTCTTTCTTATAGAAGGCATTCAATAAATAAATGTCCTAAGTGAGCAAAACATTTTTGG 31530019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TGTCTTTCTTATAGAAGGCATTCAATAAATAAATGTCCTAAGTGAGCAAAACATTTTTGG 1680

 31530020 TTGATTTTTAGGTGCAAATGGTTTCTTTTGATTTTAATTAAGATGCCTTTGTTTATTAGT 31530079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTGATTTTTAGGTGCAAATGGTTTCTTTTGATTTTAATTAAGATGCCTTTGTTTATTAGT 1740

 31530080 GATGTTGACATATTTTCTTAATCTATTGGCTTTGTATAACTTTATGAATTGTCTCTTCAT 31530139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GATGTTGACATATTTTCTTAATCTATTGGCTTTGTATAACTTTATGAATTGTCTCTTCAT 1800

 31530140 GTCCTTTGCCTACTTTTCTATTGTGGTAACTATCTTTTATAAATGTTGTATAATTATTTA 31530199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GTCCTTTGCCTACTTTTCTATTGTGGTAACTATCTTTTATAAATGTTGTATAATTATTTA 1860

 31530200 AAAATACATTAGGTTGGGCATGGTAGATCATGCCTGTAATCCCAGCTCTCTGGGAGGCCA 31530259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AAAATACATTAGGTTGGGCATGGTAGATCATGCCTGTAATCCCAGCTCTCTGGGAGGCCA 1920

 31530260 AGGTGGGCAGATTGCTTGAGCCTAACAGTTCGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACC 31530319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AGGTGGGCAGATTGCTTGAGCCTAACAGTTCGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACC 1980

 31530320 CCATCTCT 31530327
          ||||||||
     1981 CCATCTCT 1988

EXCISED REGION

 31530328 AAAAAAAAAAACCAATAAAAATATATTAAAAGATTAACTGATTGTCTATCATATGGATTA 31530387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1990 AAAAAAAAAAACCAATAAAAATATATTAAAAGATTAACTGATTGTCTATCATATGGATTA 2049

 31530388 CAAATATCCCCCCCAATTTGTCATTTGCTTGTTAATTTTATTTATGATGACTTAAAAATT 31530447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2050 CAAATATCCCCCCCAATTTGTCATTTGCTTGTTAATTTTATTTATGATGACTTAAAAATT 2109

 31530448 ACAATATATTTTTTGGTGTTCAAGTCAGTTTTTGTCCCCATTGTGATATTTTCCTTTGCC 31530507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2110 ACAATATATTTTTTGGTGTTCAAGTCAGTTTTTGTCCCCATTGTGATATTTTCCTTTGCC 2169

 31530508 TGTTTATCACTTTCTTAGAGAAAAGATAAATACTGATTCGTTCTTTTGTAGGTGTTTTAT 31530567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2170 TGTTTATCACTTTCTTAGAGAAAAGATAAATACTGATTCGTTCTTTTGTAGGTGTTTTAT 2229

 31530568 GATTTCATTGAAAATAAAATCTTCAACGCATCTAGTATTCATTTGGGTGTAAGATAAAAG 31530627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2230 GATTTCATTGAAAATAAAATCTTCAACGCATCTAGTATTCATTTGGGTGTAAGATAAAAG 2289

 31530628 ATAACAACGTAGGTTTCTCTTATAGTTCATCAGGTATCCTACTACTGTTTATTGAGTCAT 31530687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2290 ATAACAACGTAGGTTTCTCTTATAGTTCATCAGGTATCCTACTACTGTTTATTGAGTCAT 2349

 31530688 GTTTTCTGTTACCACTCTTACTATATACCAGTTTTACATACATTTGGGTTGGTTTCTGAG 31530747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2350 GTTTTCTGTTACCACTCTTACTATATACCAGTTTTACATACATTTGGGTTGGTTTCTGAG 2409

 31530748 CTTTCTATTGTCTTCCATTGCTTTGTTTAAAATTTAAAGTTTATTATTCTGACTTTCCAT 31530807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2410 CTTTCTATTGTCTTCCATTGCTTTGTTTAAAATTTAAAGTTTATTATTCTGACTTTCCAT 2469

 31530808 ACTTGAATATGGTCGAATAAGTCCTCCTTTATTAATCTTGTTTTATTTAAAAATGGTCAT 31530867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2470 ACTTGAATATGGTCGAATAAGTCCTCCTTTATTAATCTTGTTTTATTTAAAAATGGTCAT 2529

 31530868 TTTCACTCATTTTCCAGTTCAGTAGTTTTATTCTCTCAGTGTAATGTGATTTATCACCCC 31530927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2530 TTTCACTCATTTTCCAGTTCAGTAGTTTTATTCTCTCAGTGTAATGTGATTTATCACCCC 2589

 31530928 ATTGCTCACCCTATTCATCTCCCAATACCCAGCTGAAAAACTTTAGAAGACTGAGGCTCT 31530987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2590 ATTGCTCACCCTATTCATCTCCCAATACCCAGCTGAAAAACTTTAGAAGACTGAGGCTCT 2649

 31530988 TGCCCTGGCCCCATCACTTTCTAGCTATGTGGGCTTAGGCTAGTTATTGAACATGTCTGA 31531047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2650 TGCCCTGGCCCCATCACTTTCTAGCTATGTGGGCTTAGGCTAGTTATTGAACATGTCTGA 2709

 31531048 CTCTCACTTTTCTCCTCTGTAAGTCAGTGAGAATTATATACTTCTTATAAGGTTGTGAGG 31531107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2710 CTCTCACTTTTCTCCTCTGTAAGTCAGTGAGAATTATATACTTCTTATAAGGTTGTGAGG 2769

 31531108 TTCAAATGGAATAATGTGTACAGAGGCACTTGGTAAACAATGTAGTCATATGCAAGTCAT 31531167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2770 TTCAAATGGAATAATGTGTACAGAGGCACTTGGTAAACAATGTAGTCATATGCAAGTCAT 2829

 31531168 ATGCAAGTCATATGTAGTCAGCTTGGTGAATTTTGAGAAAGTAAATGCAAGTTCTTTTTA 31531227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2830 ATGCAAGTCATATGTAGTCAGCTTGGTGAATTTTGAGAAAGTAAATGCAAGTTCTTTTTA 2889

 31531228 TGGTTTTACCTAAGGGGCCAGTGAGGGCCAGAGAAGTGCCGGGACCTATGTAAGGTCGCA 31531287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2890 TGGTTTTACCTAAGGGGCCAGTGAGGGCCAGAGAAGTGCCGGGACCTATGTAAGGTCGCA 2949

 31531288 AGCAAGTTCATGTGGAATGCATCTAGAACTAGAACGCTAGCCTGTGTCCCAGGGCCCTTC 31531347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2950 AGCAAGTTCATGTGGAATGCATCTAGAACTAGAACGCTAGCCTGTGTCCCAGGGCCCTTC 3009

 31531348 CAACTGGGCTCTGCTGCCTGCAGTCCTGGGTGCCTTCTAATTAGCCTGTGTAGTGGTCTT 31531407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3010 CAACTGGGCTCTGCTGCCTGCAGTCCTGGGTGCCTTCTAATTAGCCTGTGTAGTGGTCTT 3069

 31531408 GGTAAAAGTGTTTCTCCTGTACTGTCCCCTATAGGTTGTGGCTGGCCATACCATTTCCCT 31531467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3070 GGTAAAAGTGTTTCTCCTGTACTGTCCCCTATAGGTTGTGGCTGGCCATACCATTTCCCT 3129

 31531468 GGTTCCCCCCACGCTCCTG 31531486
          |||||||||||||||||||
     3130 GGTTCCCCCCACGCTCCTG 3148

Alignment time is 2.65888 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31515486,31539389] =>     23904 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    7836] =>      7836 nucs 'mol-32-3190-111508_7836'

Score:        7763
Aligned:      7838        nucs
Identic:      7823 (100%) nucs =>      2424 (100%)      5399 (100%)
Gaps:           11 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31523060,31525486] EXCISED REGION [31529390,31534800]
 second seq =>  [       1,    2427] EXCISED REGION [    2437,    7836]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3903 nucs [31525487,31529389]
 second seq =>         9 nucs [2428,2436]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31523060 GCATTGATCCAATCTTGGCTCACTGCAACCCCCGCCTCCCGGGTTCAAGCAATTCTCCCG 31523119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCATTGATCCAATCTTGGCTCACTGCAACCCCCGCCTCCCGGGTTCAAGCAATTCTCCCG 60

 31523120 CCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGTGATTACAGGCACAGGCTACCACACCCGGCTAATTTTGT 31523179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGTGATTACAGGCACAGGCTACCACACCCGGCTAATTTTGT 120

 31523180 ATTTTCAGTAGAGACGAGGTGTCACCTTGTTGGTCAGGCTGGTCCCGAACTCCTGACCTC 31523239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATTTTCAGTAGAGACGAGGTGTCACCTTGTTGGTCAGGCTGGTCCCGAACTCCTGACCTC 180

 31523240 AAGTGATCTGCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCAC 31523299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAGTGATCTGCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCAC 240

 31523300 CTGGCCACTTTGCCTATTTTATTTTATTTTGAGATGGAGTTTTGCTCTTATTGCCCAGAC 31523359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTGGCCACTTTGCCTATTTTATTTTATTTTGAGATGGAGTTTTGCTCTTATTGCCCAGAC 300

 31523360 TGGAGTGCAATGGCGCAATTGCAGCTCACCACAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCAATT 31523419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGGAGTGCAATGGCGCAATTGCAGCTCACCACAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCAATT 360

 31523420 CTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGGTGGGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCCAACTAA 31523479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGGTGGGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCCAACTAA 420

 31523480 TTTTGTAGTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCT 31523539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTTTGTAGTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCT 480

 31523540 GACCTCAGGTGATCTGCCCACCTTGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGAGTGAGTGCA 31523599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GACCTCAGGTGATCTGCCCACCTTGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGAGTGAGTGCA 540

 31523600 CCTGGCCCACTTTGCTCATTTTCTAATTGGGTTATTCGTTTTCTGGCTATTGAGTTGTTT 31523659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CCTGGCCCACTTTGCTCATTTTCTAATTGGGTTATTCGTTTTCTGGCTATTGAGTTGTTT 600

 31523660 GAGTTTCTTATTTATTGTGGATGTTACTCCCTTATCAGATGTATGATTTACATATATTTT 31523719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GAGTTTCTTATTTATTGTGGATGTTACTCCCTTATCAGATGTATGATTTACATATATTTT 660

 31523720 CTGTCACTCTGTGGGTTATCTCTTTACTTTGTTCATTGTTTCCTTTCTGTCCAAAAGCTT 31523779
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTGTCACTTTGTGGGTTATCTCTTTACTTTGTTCATTGTTTCCTTTCTGTCCAAAAGCTT 720

 31523780 TGTATCTTGTCTAAAATCCCATTTGTCTATTTTTGCTTTTATTTATTTTTATTTTTATTT 31523839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGTATCTTGTCTAAAATCCCATTTGTCTATTTTTGCTTTTATTTATTTTTATTTTTATTT 780

 31523840 TTATTTTTTATTTTTTTGAAACGGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGTTGGAGTGCAGTGGT 31523899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTATTTTTTATTTTTTTGAAACGGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGTTGGAGTGCAGTGGT 840

 31523900 GCAATCTCAGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGGAAGTCTCCTACTCCAACT 31523959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GCAATCTCAGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGGAAGTCTCCTACTCCAACT 900

 31523960 TCCTGAGTAGCTGGGATTATAGGCGTGTGCCACCATGCCTAGCTAATTTTTGTATTTTTT 31524019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TCCTGAGTAGCTGGGATTATAGGCGTGTGCCACCATGCCTAGCTAATTTTTGTATTTTTT 960

 31524020 GGTAGAGACAGGATTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTGTTGAACTCTTGACCTCAGGCAA 31524079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GGTAGAGACAGGATTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTGTTGAACTCTTGACCTCAGGCAA 1020

 31524080 TCCGCCTGACTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACACGTGTGAGCCACCGCGCCTGGCC 31524139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TCCGCCTGACTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACACGTGTGAGCCACCGCGCCTGGCC 1080

 31524140 TATTTTTGCTTTTATTACCTGTGCTTTTGGGGTCATAGCTAAATAACCATTGCTCAGATC 31524199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TATTTTTGCTTTTATTACCTGTGCTTTTGGGGTCATAGCTAAATAACCATTGCTCAGATC 1140

 31524200 AATGTCATGGAGCCTTTCCTCTAGGTATTCTTCTAGTTGTTTTACAGTCTCAGATCTTAT 31524259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AATGTCATGGAGCCTTTCCTCTAGGTATTCTTCTAGTTGTTTTACAGTCTCAGATCTTAT 1200

 31524260 ATTTAAGACTTTAATCCATTTTGAGTTGATTTTTTATACTGTGTGAGATAAGGATCCAAT 31524319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATTTAAGACTTTAATCCATTTTGAGTTGATTTTTTATACTGTGTGAGATAAGGATCCAAT 1260

 31524320 TTTATTCTTCTGTATGTGGATCCAATTTTCCTAGTACAGTTTATTGAAAAGACTGTCTTT 31524379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTTATTCTTCTGTATGTGGATCCAATTTTCCTAGTACAGTTTATTGAAAAGACTGTCTTT 1320

 31524380 TCCCCATTATGTATTAGTAACACCTTTGTCAAAAATCAATTGACTATTAGTGCATGGGTT 31524439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TCCCCATTATGTATTAGTAACACCTTTGTCAAAAATCAATTGACTATTAGTGCATGGGTT 1380

 31524440 TATTTCTGGGTTTTCTATCTTGTTACATTAGTCGATGTGTCTATTTTTATGCCAGCACCA 31524499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TATTTCTGGGTTTTCTATCTTGTTACATTAGTCGATGTGTCTATTTTTATGCCAGCACCA 1440

 31524500 TACTGTTTTGATTATATTAGCTTTATAATATATTTTGAAATCAGGGACTGTGATGTCTTT 31524559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TACTGTTTTGATTATATTAGCTTTATAATATATTTTGAAATCAGGGACTGTGATGTCTTT 1500

 31524560 AGCTTTGTTCTTTTTGCTCAAGATTGTTTTGGCTAGCCAGGGTCTTTTATGATTGCATAT 31524619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AGCTTTGTTCTTTTTGCTCAAGATTGTTTTGGCTAGCCAGGGTCTTTTATGATTGCATAT 1560

 31524620 GAATTTAAGGATTGTTTTATTTCTATAAGAAATGACATTGGAATTTTGATAGGGACTGCA 31524679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GAATTTAAGGATTGTTTTATTTCTATAAGAAATGACATTGGAATTTTGATAGGGACTGCA 1620

 31524680 TTGAATCTGTAGATTGCTTTGGGTAGTATGAATATTTTAATAATATTAATTCTTCTAATT 31524739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTGAATCTGTAGATTGCTTTGGGTAGTATGAATATTTTAATAATATTAATTCTTCTAATT 1680

 31524740 TATCAACACAAGATAGCTTTCCATTTATTTGTGTTTTCTTAAACAATGTTTTAGTTTCCA 31524799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TATCAACACAAGATAGCTTTCCATTTATTTGTGTTTTCTTAAACAATGTTTTAGTTTCCA 1740

 31524800 GTGTACAGATCTTTTAACTTCTTGGTTAAATTTACCCCTAAGTATTTTATTTTATTTTAA 31524859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GTGTACAGATCTTTTAACTTCTTGGTTAAATTTACCCCTAAGTATTTTATTTTATTTTAA 1800

 31524860 AATACCTGGCTAATTTTGTATTTAATTTTATATTGTATTTATTTTATTTGTAATAAAATT 31524919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AATACCTGGCTAATTTTGTATTTAATTTTATATTGTATTTATTTTATTTGTAATAAAATT 1860

 31524920 AAGCATTTTATTTTATTTTAAAATACCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGT 31524979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     1861 AAGCATTTTATTTTATTTTAAAATACCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGATAGGGT 1920

 31524980 TTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCAGACCTCAGGTGATCCGACTGCCTCGG 31525039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCAGACCTCAGGTGATCCGACTGCCTCGG 1980

 31525040 CCTCCCAAAGTGCTGGTATTAGAAGCATGAGCCACTGCCCACTGCACCTAGCTGAAAACC 31525099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CCTCCCAAAGTGCTGGTATTAGAAGCATGAGCCACTGCCCACTGCACCTAGCTGAAAACC 2040

 31525100 ACACTTTCTGTTGATTAAATAATATTTCACCTTATGGAGTTACAAATTTTCATTTTATGG 31525159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ACACTTTCTGTTGATTAAATAATATTTCACCTTATGGAGTTACAAATTTTCATTTTATGG 2100

 31525160 GGTTATAATCACTTACTTAGCTTGTTATCTTTTGTTGGACATTAATGTGGTTTCTAACTT 31525219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GGTTATAATCACTTACTTAGCTTGTTATCTTTTGTTGGACATTAATGTGGTTTCTAACTT 2160

 31525220 TTCATTATCAAAAAATAAAAGAAAATGGACAAAACCTCAGAAAGACACAAACTACTAAAG 31525279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TTCATTATCAAAAAATAAAAGAAAATGGACAAAACCTCAGAAAGACACAAACTACTAAAG 2220

 31525280 CTGACTTAATAAGAAATAGAAAATCTGAATATATAGAAAATCTGAATGTAACAAGTAAGG 31525339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CTGACTTAATAAGAAATAGAAAATCTGAATATATAGAAAATCTGAATGTAACAAGTAAGG 2280

 31525340 AGATTGGATTAGTAATAAAATTTCCCACAAAGAGAAGTACACATTCAGATGGTTTCACTG 31525399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AGATTGGATTAGTAATAAAATTTCCCACAAAGAGAAGTACACATTCAGATGGTTTCACTG 2340

 31525400 GTAAATTCTACCAAATATTTAAAGATTTTTCTTTTTTTTTGTTGAGACAGAGTCTCACTC 31525459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     2341 GTAAATTCTACCAAATATTTAAAGATTTTTCTTTTTTTTTGTTGAGGCAGAGTCTCACTC 2400

 31525460 TATTGCCCAGGCTGGAGTACAATGGTG 31525486
          |||||||||||||||||||||||||||
     2401 TATTGCCCAGGCTGGAGTACAATGGTG 2427

EXCISED REGION

 31529390 AATACTGTGCTAAGTGAAAGAAGCCAACCACAAAATACCATATATTGTGTGATTCTGCTT 31529449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2437 AATACTGTGCTAAGTGAAAGAAGCCAACCACAAAATACCATATATTGTGTGATTCTGCTT 2496

 31529450 AAATGACATGTCCAGAATGTCCATATTAAAGTAGATTAGTGGTTTCCTGAGGCTGGGGGA 31529509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2497 AAATGACATGTCCAGAATGTCCATATTAAAGTAGATTAGTGGTTTCCTGAGGCTGGGGGA 2556

 31529510 GGGAGTTGGGGAAATTGCGTAGTGACTACTGGGTAAAGAGTTTCTTTCTGGGGTGATGAA 31529569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2557 GGGAGTTGGGGAAATTGCGTAGTGACTACTGGGTAAAGAGTTTCTTTCTGGGGTGATGAA 2616

 31529570 ATGGTCTAAAATAGAATGTGGTGGTGGTTGCACAGCTCTGAAAATACTAAAAACCATTGA 31529629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2617 ATGGTCTAAAATAGAATGTGGTGGTGGTTGCACAGCTCTGAAAATACTAAAAACCATTGA 2676

 31529630 ATGAGCACTTTAAATTGGTAAATTTTTATGTGAATTATGATTCAATAAAGTTGTGTTTAG 31529689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2677 ATGAGCACTTTAAATTGGTAAATTTTTATGTGAATTATGATTCAATAAAGTTGTGTTTAG 2736

 31529690 ATATTACTAAAAATGATGGTACAAATATTCTTTTTCACAAATGTTTTTTGTTGTTGTTTA 31529749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2737 ATATTACTAAAAATGATGGTACAAATATTCTTTTTCACAAATGTTTTTTGTTGTTGTTTA 2796

 31529750 TAGTTGTTTATTTGTACATCTAGTAATTTGTCCCAAGGAAAGAGTATGTAAAAGAACATA 31529809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2797 TAGTTGTTTATTTGTACATCTAGTAATTTGTCCCAAGGAAAGAGTATGTAAAAGAACATA 2856

 31529810 AGTCACTTTAAGGCCTTTAATGTATACTACAAAATTGCACTCTAGAAGGTTTATACAGTT 31529869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2857 AGTCACTTTAAGGCCTTTAATGTATACTACAAAATTGCACTCTAGAAGGTTTATACAGTT 2916

 31529870 TTGCATTTCATTAGCCTGTTTTTTTTATCTTTGACAACCTAAAGAATTTATTAGTGGTAT 31529929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2917 TTGCATTTCATTAGCCTGTTTTTTTTATCTTTGACAACCTAAAGAATTTATTAGTGGTAT 2976

 31529930 TCATCTGAGGATCCTCTAGGTCTATCAGAGTGTCTTTCTTATAGAAGGCATTCAATAAAT 31529989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2977 TCATCTGAGGATCCTCTAGGTCTATCAGAGTGTCTTTCTTATAGAAGGCATTCAATAAAT 3036

 31529990 AAATGTCCTAAGTGAGCAAAACATTTTTGGTTGATTTTTAGGTGCAAATGGTTTCTTTTG 31530049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3037 AAATGTCCTAAGTGAGCAAAACATTTTTGGTTGATTTTTAGGTGCAAATGGTTTCTTTTG 3096

 31530050 ATTTTAATTAAGATGCCTTTGTTTATTAGTGATGTTGACATATTTTCTTAATCTATTGGC 31530109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3097 ATTTTAATTAAGATGCCTTTGTTTATTAGTGATGTTGACATATTTTCTTAATCTATTGGC 3156

 31530110 TTTGTATAACTTTATGAATTGTCTCTTCATGTCCTTTGCCTACTTTTCTATTGTGGTAAC 31530169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3157 TTTGTATAACTTTATGAATTGTCTCTTCATGTCCTTTGCCTACTTTTCTATTGTGGTAAC 3216

 31530170 TATCTTTTATAAATGTTGTATAATTATTTAAAAATACATTAGGTTGGGCATGGTAGATCA 31530229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3217 TATCTTTTATAAATGTTGTATAATTATTTAAAAATACATTAGGTTGGGCATGGTAGATCA 3276

 31530230 TGCCTGTAATCCCAGCTCTCTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATTGCTTGAGCCTAACAGTT 31530289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3277 TGCCTGTAATCCCAGCTCTCTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATTGCTTGAGCCTAACAGTT 3336

 31530290 CGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCCATCTCTAAAAAAAAAAACCAATAAAAAT 31530349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3337 CGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCCATCTCTAAAAAAAAAAACCAATAAAAAT 3396

 31530350 ATATTAAAAGATTAACTGATTGTCTATCATATGGATTACAAATATCCCCCCCAATTTGTC 31530409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3397 ATATTAAAAGATTAACTGATTGTCTATCATATGGATTACAAATATCCCCCCCAATTTGTC 3456

 31530410 ATTTGCTTGTTAATTTTATTTATGATGACTTAAAAATTACAATATATTTTTTGGTGTTCA 31530469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3457 ATTTGCTTGTTAATTTTATTTATGATGACTTAAAAATTACAATATATTTTTTGGTGTTCA 3516

 31530470 AGTCAGTTTTTGTCCCCATTGTGATATTTTCCTTTGCCTGTTTATCACTTTCTTAGAGAA 31530529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3517 AGTCAGTTTTTGTCCCCATTGTGATATTTTCCTTTGCCTGTTTATCACTTTCTTAGAGAA 3576

 31530530 AAGATAAATACTGATTCGTTCTTTTGTAGGTGTTTTATGATTTCATTGAAAATAAAATCT 31530589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3577 AAGATAAATACTGATTCGTTCTTTTGTAGGTGTTTTATGATTTCATTGAAAATAAAATCT 3636

 31530590 TCAACGCATCTAGTATTCATTTGGGTGTAAGATAAAAGATAACAACGTAGGTTTCTCTTA 31530649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3637 TCAACGCATCTAGTATTCATTTGGGTGTAAGATAAAAGATAACAACGTAGGTTTCTCTTA 3696

 31530650 TAGTTCATCAGGTATCCTACTACTGTTTATTGAGTCATGTTTTCTGTTACCACTCTTACT 31530709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3697 TAGTTCATCAGGTATCCTACTACTGTTTATTGAGTCATGTTTTCTGTTACCACTCTTACT 3756

 31530710 ATATACCAGTTTTACATACATTTGGGTTGGTTTCTGAGCTTTCTATTGTCTTCCATTGCT 31530769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3757 ATATACCAGTTTTACATACATTTGGGTTGGTTTCTGAGCTTTCTATTGTCTTCCATTGCT 3816

 31530770 TTGTTTAAAATTTAAAGTTTATTATTCTGACTTTCCATACTTGAATATGGTCGAATAAGT 31530829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3817 TTGTTTAAAATTTAAAGTTTATTATTCTGACTTTCCATACTTGAATATGGTCGAATAAGT 3876

 31530830 CCTCCTTTATTAATCTTGTTTTATTTAAAAATGGTCATTTTCACTCATTTTCCAGTTCAG 31530889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3877 CCTCCTTTATTAATCTTGTTTTATTTAAAAATGGTCATTTTCACTCATTTTCCAGTTCAG 3936

 31530890 TAGTTTTATTCTCTCAGTGTAATGTGATTTATCACCCCATTGCTCACCCTATTCATCTCC 31530949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3937 TAGTTTTATTCTCTCAGTGTAATGTGATTTATCACCCCATTGCTCACCCTATTCATCTCC 3996

 31530950 CAATACCCAGCTGAAAAACTTTAGAAGACTGAGGCTCTTGCCCTGGCCCCATCACTTTCT 31531009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3997 CAATACCCAGCTGAAAAACTTTAGAAGACTGAGGCTCTTGCCCTGGCCCCATCACTTTCT 4056

 31531010 AGCTATGTGGGCTTAGGCTAGTTATTGAACATGTCTGACTCTCACTTTTCTCCTCTGTAA 31531069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4057 AGCTATGTGGGCTTAGGCTAGTTATTGAACATGTCTGACTCTCACTTTTCTCCTCTGTAA 4116

 31531070 GTCAGTGAGAATTATATACTTCTTATAAGGTTGTGAGGTTCAAATGGAATAATGTGTACA 31531129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4117 GTCAGTGAGAATTATATACTTCTTATAAGGTTGTGAGGTTCAAATGGAATAATGTGTACA 4176

 31531130 GAGGCACTTGGTAAACAATGTAGTCATATGCAAGTCATATGCAAGTCATATGTAGTCAGC 31531189
          |||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||
     4177 GAGGCACTTGGTAAACAATGT-----------AGTCATATGCAAGTCATATGTAGTCAGC 4225

 31531190 TTGGTGAATTTTGAGAAAGTAAATGCAAGTTCTTTTTATGGTTTTACCTAAGGGGCCAGT 31531249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4226 TTGGTGAATTTTGAGAAAGTAAATGCAAGTTCTTTTTATGGTTTTACCTAAGGGGCCAGT 4285

 31531250 GAGGGCCAGAGAAGTGCCGGGACCTATGTAAGGTCGCAAGCAAGTTCATGTGGAATGCAT 31531309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4286 GAGGGCCAGAGAAGTGCCGGGACCTATGTAAGGTCGCAAGCAAGTTCATGTGGAATGCAT 4345

 31531310 CTAGAACTAGAACGCTAGCCTGTGTCCCAGGGCCCTTCCAACTGGGCTCTGCTGCCTGCA 31531369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4346 CTAGAACTAGAACGCTAGCCTGTGTCCCAGGGCCCTTCCAACTGGGCTCTGCTGCCTGCA 4405

 31531370 GTCCTGGGTGCCTTCTAATTAGCCTGTGTAGTGGTCTTGGTAAAAGTGTTTCTCCTGTAC 31531429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4406 GTCCTGGGTGCCTTCTAATTAGCCTGTGTAGTGGTCTTGGTAAAAGTGTTTCTCCTGTAC 4465

 31531430 TGTCCCCTATAGGTTGTGGCTGGCCATACCATTTCCCTGGTTCCCCCCACGCTCCTGATG 31531489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4466 TGTCCCCTATAGGTTGTGGCTGGCCATACCATTTCCCTGGTTCCCCCCACGCTCCTGATG 4525

 31531490 ACCTGGAAAGGCCATTTGAATAGTGTGGCAGACATCCTGTATGTGGACAACTTCCAGCTG 31531549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4526 ACCTGGAAAGGCCATTTGAATAGTGTGGCAGACATCCTGTATGTGGACAACTTCCAGCTG 4585

 31531550 GTTATCAGCGCTGGCCAGGACCGGGACGTCAAGGCTTGGAAACTCTCCGGTGATGCCATT 31531609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4586 GTTATCAGCGCTGGCCAGGACCGGGACGTCAAGGCTTGGAAACTCTCCGGTGATGCCATT 4645

 31531610 GGTATGGGTCCTGCTGAAGCTCAGCCATGCCCATGGCCCTTCTTGTCTCTGTCCCTGTCT 31531669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4646 GGTATGGGTCCTGCTGAAGCTCAGCCATGCCCATGGCCCTTCTTGTCTCTGTCCCTGTCT 4705

 31531670 GAACATAAGCTGGTATGAACTTTGTACTCTGTGGGGAGGGACTCTCAGGCCACAGCAACT 31531729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4706 GAACATAAGCTGGTATGAACTTTGTACTCTGTGGGGAGGGACTCTCAGGCCACAGCAACT 4765

 31531730 GCCTTCACTTAAATAATATTACAGTCTGTCCAATTATCCATTCAGCAAACGGTCCATCCA 31531789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4766 GCCTTCACTTAAATAATATTACAGTCTGTCCAATTATCCATTCAGCAAACGGTCCATCCA 4825

 31531790 TTCACCCATCCACCCAATATTATTCACCTATGTATATTTTTGCAAATCATATATCTGATA 31531849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4826 TTCACCCATCCACCCAATATTATTCACCTATGTATATTTTTGCAAATCATATATCTGATA 4885

 31531850 AAGCATATTCCTTTCTCTTTTAAAAAATAAACTTAATTGTTGCATTGTATATAAAGAAAA 31531909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4886 AAGCATATTCCTTTCTCTTTTAAAAAATAAACTTAATTGTTGCATTGTATATAAAGAAAA 4945

 31531910 ACATACAAACCAGAAGGGTTCAGCTTGGTGAATTTTGAGAAAGTAAATACATACCCATAT 31531969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4946 ACATACAAACCAGAAGGGTTCAGCTTGGTGAATTTTGAGAAAGTAAATACATACCCATAT 5005

 31531970 AGCCACCGTTCATGTCAAGAAATAATTAGGGCCAGGCGCGGTGGCTCACTACTGTAATCC 31532029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5006 AGCCACCGTTCATGTCAAGAAATAATTAGGGCCAGGCGCGGTGGCTCACTACTGTAATCC 5065

 31532030 CAACACTTTTTTGTCCCCTTTTCCTCCTGTGCTGTCTTCCTATGTGTTTGTTTGTTTGTT 31532089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5066 CAACACTTTTTTGTCCCCTTTTCCTCCTGTGCTGTCTTCCTATGTGTTTGTTTGTTTGTT 5125

 31532090 TTAGTGACCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGTGCATGCCTGT 31532149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5126 TTAGTGACCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGTGCATGCCTGT 5185

 31532150 AATCCCAGCTACTTGAGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGTTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTT 31532209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5186 AATCCCAGCTACTTGAGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGTTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTT 5245

 31532210 GCAGTGAGCTGAGATCATGTCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGACTCTGTCT 31532269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5246 GCAGTGAGCTGAGATCATGTCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGACTCTGTCT 5305

 31532270 AAAAAAAAAATAATAATAAAAATAAAGTGACTTATGTGCCACTATTACAGTATTACAGCA 31532329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5306 AAAAAAAAAATAATAATAAAAATAAAGTGACTTATGTGCCACTATTACAGTATTACAGCA 5365

 31532330 TTCTGTATTTTTCTATGTGTTTACATTTATCAGAAAGCTTTGTATTTTCATATGCTTTCA 31532389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5366 TTCTGTATTTTTCTATGTGTTTACATTTATCAGAAAGCTTTGTATTTTCATATGCTTTCA 5425

 31532390 TGTTCCTGCCTAGCATCCTTTTGTTTCAACTTGAAGGGGTCCCTTTAGCATTTCTTTAAA 31532449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5426 TGTTCCTGCCTAGCATCCTTTTGTTTCAACTTGAAGGGGTCCCTTTAGCATTTCTTTAAA 5485

 31532450 GGCAGGTCTAATGGTGATGAACTCCTCTTGTTTTTATTTATCTGGGAAAATTTTTATTTT 31532509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5486 GGCAGGTCTAATGGTGATGAACTCCTCTTGTTTTTATTTATCTGGGAAAATTTTTATTTT 5545

 31532510 TCCTTCATTTTTAAAGGACAGCTTTCCTGGATATAGTATTTTTGGATGAGAGTTTTTGTT 31532569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5546 TCCTTCATTTTTAAAGGACAGCTTTCCTGGATATAGTATTTTTGGATGAGAGTTTTTGTT 5605

 31532570 CTTTTTATAATGTGTCTCCTTGTGGATTTCTTTGACTTTATCCTAGTTGGAATCCCTTGA 31532629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5606 CTTTTTATAATGTGTCTCCTTGTGGATTTCTTTGACTTTATCCTAGTTGGAATCCCTTGA 5665

 31532630 GCTTCTTGAATATAGGTTTCTTTTCCTTTTTAAGATTTGAAACATTTTCAGCCATTATTT 31532689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5666 GCTTCTTGAATATAGGTTTCTTTTCCTTTTTAAGATTTGAAACATTTTCAGCCATTATTT 5725

 31532690 ATTCAGATAAGCTTTTTGTCCCTTTCTCTCTCTCTGTCTCTCTCTCCTCCTTCTAGTACT 31532749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5726 ATTCAGATAAGCTTTTTGTCCCTTTCTCTCTCTCTGTCTCTCTCTCCTCCTTCTAGTACT 5785

 31532750 ACCATAATGCATATATTGTCCATTTGACGATGTCTCATAAATCCCTTAAGTTTTCTTTAC 31532809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5786 ACCATAATGCATATATTGTCCATTTGACGATGTCTCATAAATCCCTTAAGTTTTCTTTAC 5845

 31532810 TCTTTAAAATTCTTTTTTCTTTTTTGCTTCTCTGACTGGATATCTTCAAGTCTGCTGATT 31532869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5846 TCTTTAAAATTCTTTTTTCTTTTTTGCTTCTCTGACTGGATATCTTCAAGTCTGCTGATT 5905

 31532870 TTTCCTTCTGCTTGATCAAGCCTGCTGTAGATGACTTTTGAATTCAATTATTTTACTCTT 31532929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5906 TTTCCTTCTGCTTGATCAAGCCTGCTGTAGATGACTTTTGAATTCAATTATTTTACTCTT 5965

 31532930 CATCTTCAGCTCTAGAATTTCTGTTATTTTTATTATTATTATTATTATTTTTTGAGACAG 31532989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5966 CATCTTCAGCTCTAGAATTTCTGTTATTTTTATTATTATTATTATTATTTTTTGAGACAG 6025

 31532990 GGTCTTGCTCTGCCACCCAGGGTTGAGTGCAGTGGCACGAATTCAGCTCACTGAAGCCTT 31533049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6026 GGTCTTGCTCTGCCACCCAGGGTTGAGTGCAGTGGCACGAATTCAGCTCACTGAAGCCTT 6085

 31533050 GACCTCCCAGCCTCAAGTGATCTTCCCACAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCA 31533109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6086 GACCTCCCAGCCTCAAGTGATCTTCCCACAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCA 6145

 31533110 TGCCATCATGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTTGTAGAGACAGAGTTTCACCATGTTGC 31533169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6146 TGCCATCATGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTTGTAGAGACAGAGTTTCACCATGTTGC 6205

 31533170 CCAGGCTGGCCTTGAATTCTTGAGCTCAAGTGATCGCCCACCTAAGCTTCCCAAAGTGTT 31533229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6206 CCAGGCTGGCCTTGAATTCTTGAGCTCAAGTGATCGCCCACCTAAGCTTCCCAAAGTGTT 6265

 31533230 GGGATTATAGGTGTGGGCCACCATGGCTGGCCTCTGTTTGGTTCTTTTCTATATTTTCTG 31533289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6266 GGGATTATAGGTGTGGGCCACCATGGCTGGCCTCTGTTTGGTTCTTTTCTATATTTTCTG 6325

 31533290 TGTCTTCACTAATATTCTCAGTTTGTTCATGTATTGTTTCCCTGAGCTTGTTGAGCATTT 31533349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6326 TGTCTTCACTAATATTCTCAGTTTGTTCATGTATTGTTTCCCTGAGCTTGTTGAGCATTT 6385

 31533350 TTATTACGGTTACTTAGAATTCTTTGTCAAATAATTAATATACCTCAATTTCTTTAGCGG 31533409
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6386 TTATTACAGTTACTTAGAATTCTTTGTCAAATAATTAATATACCTCAATTTCTTTAGCGG 6445

 31533410 CAGTTTCTGGAGATTTATTTTGTTCCTTTGGGCCATGCTTTCCTATTTTTTTTGTGTGCC 31533469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6446 CAGTTTCTGGAGATTTATTTTGTTCCTTTGGGCCATGCTTTCCTATTTTTTTTGTGTGCC 6505

 31533470 TTATAACTTTATATTGGGATCCATGCATTTGTAAAATCAGCCACCTCTCCCAGTCTTTAT 31533529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6506 TTATAACTTTATATTGGGATCCATGCATTTGTAAAATCAGCCACCTCTCCCAGTCTTTAT 6565

 31533530 ATACTGGCTTCATTCAGGGAAAATTCTGCACCAATCAGCTTGGCTAAAGATTCTGGGTGC 31533589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6566 ATACTGGCTTCATTCAGGGAAAATTCTGCACCAATCAGCTTGGCTAAAGATTCTGGGTGC 6625

 31533590 CTCCCCAATCTTTTTTGTGGATACTTTCACCAGACTTACGCATGTAAATTCGCAATTACA 31533649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6626 CTCCCCAATCTTTTTTGTGGATACTTTCACCAGACTTACGCATGTAAATTCGCAATTACA 6685

 31533650 GGAATCTACAGGTTTATTTTTTTCAGGAGTCCATTATCTCTTGCTCTCTCTGGTGTCTAT 31533709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6686 GGAATCTACAGGTTTATTTTTTTCAGGAGTCCATTATCTCTTGCTCTCTCTGGTGTCTAT 6745

 31533710 TTGCAGTACTGCAAGTTCTCTAGAGCGGCTACAAGCTTCCCCCAGGCCTCTAGAATATGC 31533769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6746 TTGCAGTACTGCAAGTTCTCTAGAGCGGCTACAAGCTTCCCCCAGGCCTCTAGAATATGC 6805

 31533770 TGGGTCCTTCAATAGTCTGAGAGAGGCAAGACAGAAACCAGTTTCTTGGGTACCCCTCAA 31533829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6806 TGGGTCCTTCAATAGTCTGAGAGAGGCAAGACAGAAACCAGTTTCTTGGGTACCCCTCAA 6865

 31533830 AGGCTAACATTGGATATGTATGCTCCAAATCTGCCTCCTCAAGGAGAAGCTGGAAGTTGG 31533889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6866 AGGCTAACATTGGATATGTATGCTCCAAATCTGCCTCCTCAAGGAGAAGCTGGAAGTTGG 6925

 31533890 GTTGTTTTCTCTACTCATTCCACAGAGCGGCAGGAGGGACTCTGATAGTGTGTGCTAGTC 31533949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6926 GTTGTTTTCTCTACTCATTCCACAGAGCGGCAGGAGGGACTCTGATAGTGTGTGCTAGTC 6985

 31533950 TAAATTGTCACCTTTGTTCTTAGTAGCCCAGTCTGGTGCCTCTTCCTGTCAGTGCTTAGA 31534009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6986 TAAATTGTCACCTTTGTTCTTAGTAGCCCAGTCTGGTGCCTCTTCCTGTCAGTGCTTAGA 7045

 31534010 TTCAGGCAAGACAGAAACTGGTTAATCATGCAGCCCTCTGAAAAGTCTGCATGTTGGATG 31534069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7046 TTCAGGCAAGACAGAAACTGGTTAATCATGCAGCCCTCTGAAAAGTCTGCATGTTGGATG 7105

 31534070 TACATCTCAGTCTTTCCCTCCCAGGGAGAAGCTGGAAGCTGGTGGTTCCTTCCCAATCTG 31534129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7106 TACATCTCAGTCTTTCCCTCCCAGGGAGAAGCTGGAAGCTGGTGGTTCCTTCCCAATCTG 7165

 31534130 CTTCACTGAGCCAGGAGGAGGGATTACAAGTGAGCACTATGAATTTTCCTACTGGCTTCA 31534189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7166 CTTCACTGAGCCAGGAGGAGGGATTACAAGTGAGCACTATGAATTTTCCTACTGGCTTCA 7225

 31534190 GTGCAGCTGGTTTTTTGTTTTTTGTTTTTTTGGTTTTTGTTTGTTTGTTTTTTCATTCAT 31534249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7226 GTGCAGCTGGTTTTTTGTTTTTTGTTTTTTTGGTTTTTGTTTGTTTGTTTTTTCATTCAT 7285

 31534250 CTGGGATGAATGGTCCTGGTTTCTGGTCCATGTACTGTTGTTCAGTCAGTGTCTCCATAG 31534309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7286 CTGGGATGAATGGTCCTGGTTTCTGGTCCATGTACTGTTGTTCAGTCAGTGTCTCCATAG 7345

 31534310 GGAGAAGGAAGTTCTGGATCTTCCTATTCTACCATCTTGCTGATGTCACCCATTTTTTTG 31534369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7346 GGAGAAGGAAGTTCTGGATCTTCCTATTCTACCATCTTGCTGATGTCACCCATTTTTTTG 7405

 31534370 TATCTTTCAAAGACGTCTTTGACTATCCCCTAAATATAATATCTAGTGTTATCTTTTAGA 31534429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7406 TATCTTTCAAAGACGTCTTTGACTATCCCCTAAATATAATATCTAGTGTTATCTTTTAGA 7465

 31534430 AGCTTGTTTTAAAAATCAGATTTCTGAAGTATAATTTACATCCAATAAAAGCACCTTTTA 31534489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7466 AGCTTGTTTTAAAAATCAGATTTCTGAAGTATAATTTACATCCAATAAAAGCACCTTTTA 7525

 31534490 AAAGTATATAGTTCTGTGAGGTTTCATGAATGCATACAATTGTGTAATTGGTATCACAAT 31534549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7526 AAAGTATATAGTTCTGTGAGGTTTCATGAATGCATACAATTGTGTAATTGGTATCACAAT 7585

 31534550 CAAGACATAGACATTACCCCAAAAAGTGACCTCATGTCTCCTCATAGTAAACTCTATTTC 31534609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7586 CAAGACATAGACATTACCCCAAAAAGTGACCTCATGTCTCCTCATAGTAAACTCTATTTC 7645

 31534610 CTTCTCCTAACCCCTGGCAGCCATTGATCTGTTTGTCTCTATAGTTTTGCCTTTTCCAGA 31534669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7646 CTTCTCCTAACCCCTGGCAGCCATTGATCTGTTTGTCTCTATAGTTTTGCCTTTTCCAGA 7705

 31534670 TTATCATAAATGGAAACATACACATGTAGCTGAGTGAAAGTCTAACTTTCACTTAGCATA 31534729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7706 TTATCATAAATGGAAACATACACATGTAGCTGAGTGAAAGTCTAACTTTCACTTAGCATA 7765

 31534730 ATCAATTTGAGATTCATCTTTGTTGTTGAACGTATCAGTAGTTTGTTCTTTTTATTGCTG 31534789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7766 ATCAATTTGAGATTCATCTTTGTTGTTGAACGTATCAGTAGTTTGTTCTTTTTATTGCTG 7825

 31534790 AGTATTATTCC 31534800
          |||||||||||
     7826 AGTATTATTCC 7836

Alignment time is 6.56004 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31515486,31539389] =>     23904 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    2427] =>      2427 nucs 'mol-32-3190-111508_2427'

Score:        2404
Aligned:      2426        nucs
Identic:      2424 (100%) nucs =>       668 (100%)      1756 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31523060,31523727] EXCISED REGION [31523729,31525486]
 second seq =>  [       1,     668] EXCISED REGION [     670,    2427]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [31523728,31523728]
 second seq =>         1 nucs [669,669]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [668,669] to [669,670]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [31523727,31523727] to [31523729,31523729]
 second seq =>         1 nucs [668,668] to [670,670]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31523060 GCATTGATCCAATCTTGGCTCACTGCAACCCCCGCCTCCCGGGTTCAAGCAATTCTCCCG 31523119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCATTGATCCAATCTTGGCTCACTGCAACCCCCGCCTCCCGGGTTCAAGCAATTCTCCCG 60

 31523120 CCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGTGATTACAGGCACAGGCTACCACACCCGGCTAATTTTGT 31523179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGTGATTACAGGCACAGGCTACCACACCCGGCTAATTTTGT 120

 31523180 ATTTTCAGTAGAGACGAGGTGTCACCTTGTTGGTCAGGCTGGTCCCGAACTCCTGACCTC 31523239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATTTTCAGTAGAGACGAGGTGTCACCTTGTTGGTCAGGCTGGTCCCGAACTCCTGACCTC 180

 31523240 AAGTGATCTGCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCAC 31523299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAGTGATCTGCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCAC 240

 31523300 CTGGCCACTTTGCCTATTTTATTTTATTTTGAGATGGAGTTTTGCTCTTATTGCCCAGAC 31523359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTGGCCACTTTGCCTATTTTATTTTATTTTGAGATGGAGTTTTGCTCTTATTGCCCAGAC 300

 31523360 TGGAGTGCAATGGCGCAATTGCAGCTCACCACAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCAATT 31523419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGGAGTGCAATGGCGCAATTGCAGCTCACCACAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCAATT 360

 31523420 CTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGGTGGGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCCAACTAA 31523479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGGTGGGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCCAACTAA 420

 31523480 TTTTGTAGTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCT 31523539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTTTGTAGTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCT 480

 31523540 GACCTCAGGTGATCTGCCCACCTTGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGAGTGAGTGCA 31523599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GACCTCAGGTGATCTGCCCACCTTGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGAGTGAGTGCA 540

 31523600 CCTGGCCCACTTTGCTCATTTTCTAATTGGGTTATTCGTTTTCTGGCTATTGAGTTGTTT 31523659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CCTGGCCCACTTTGCTCATTTTCTAATTGGGTTATTCGTTTTCTGGCTATTGAGTTGTTT 600

 31523660 GAGTTTCTTATTTATTGTGGATGTTACTCCCTTATCAGATGTATGATTTACATATATTTT 31523719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GAGTTTCTTATTTATTGTGGATGTTACTCCCTTATCAGATGTATGATTTACATATATTTT 660

 31523720 CTGTCACT 31523727
          ||||||||
      661 CTGTCACT 668

EXCISED REGION

 31523729 TGTGGGTTATCTCTTTACTTTGTTCATTGTTTCCTTTCTGTCCAAAAGCTTTGTATCTTG 31523788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      670 TGTGGGTTATCTCTTTACTTTGTTCATTGTTTCCTTTCTGTCCAAAAGCTTTGTATCTTG 729

 31523789 TCTAAAATCCCATTTGTCTATTTTTGCTTTTATTTATTTTTATTTTTATTTTTATTTTTT 31523848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      730 TCTAAAATCCCATTTGTCTATTTTTGCTTTTATTTATTTTTATTTTTATTTTTATTTTTT 789

 31523849 ATTTTTTTGAAACGGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGTTGGAGTGCAGTGGTGCAATCTCA 31523908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      790 ATTTTTTTGAAACGGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGTTGGAGTGCAGTGGTGCAATCTCA 849

 31523909 GCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGGAAGTCTCCTACTCCAACTTCCTGAGTA 31523968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      850 GCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGGAAGTCTCCTACTCCAACTTCCTGAGTA 909

 31523969 GCTGGGATTATAGGCGTGTGCCACCATGCCTAGCTAATTTTTGTATTTTTTGGTAGAGAC 31524028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      910 GCTGGGATTATAGGCGTGTGCCACCATGCCTAGCTAATTTTTGTATTTTTTGGTAGAGAC 969

 31524029 AGGATTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTGTTGAACTCTTGACCTCAGGCAATCCGCCTGA 31524088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      970 AGGATTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTGTTGAACTCTTGACCTCAGGCAATCCGCCTGA 1029

 31524089 CTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACACGTGTGAGCCACCGCGCCTGGCCTATTTTTGC 31524148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1030 CTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACACGTGTGAGCCACCGCGCCTGGCCTATTTTTGC 1089

 31524149 TTTTATTACCTGTGCTTTTGGGGTCATAGCTAAATAACCATTGCTCAGATCAATGTCATG 31524208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1090 TTTTATTACCTGTGCTTTTGGGGTCATAGCTAAATAACCATTGCTCAGATCAATGTCATG 1149

 31524209 GAGCCTTTCCTCTAGGTATTCTTCTAGTTGTTTTACAGTCTCAGATCTTATATTTAAGAC 31524268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1150 GAGCCTTTCCTCTAGGTATTCTTCTAGTTGTTTTACAGTCTCAGATCTTATATTTAAGAC 1209

 31524269 TTTAATCCATTTTGAGTTGATTTTTTATACTGTGTGAGATAAGGATCCAATTTTATTCTT 31524328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1210 TTTAATCCATTTTGAGTTGATTTTTTATACTGTGTGAGATAAGGATCCAATTTTATTCTT 1269

 31524329 CTGTATGTGGATCCAATTTTCCTAGTACAGTTTATTGAAAAGACTGTCTTTTCCCCATTA 31524388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1270 CTGTATGTGGATCCAATTTTCCTAGTACAGTTTATTGAAAAGACTGTCTTTTCCCCATTA 1329

 31524389 TGTATTAGTAACACCTTTGTCAAAAATCAATTGACTATTAGTGCATGGGTTTATTTCTGG 31524448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1330 TGTATTAGTAACACCTTTGTCAAAAATCAATTGACTATTAGTGCATGGGTTTATTTCTGG 1389

 31524449 GTTTTCTATCTTGTTACATTAGTCGATGTGTCTATTTTTATGCCAGCACCATACTGTTTT 31524508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1390 GTTTTCTATCTTGTTACATTAGTCGATGTGTCTATTTTTATGCCAGCACCATACTGTTTT 1449

 31524509 GATTATATTAGCTTTATAATATATTTTGAAATCAGGGACTGTGATGTCTTTAGCTTTGTT 31524568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1450 GATTATATTAGCTTTATAATATATTTTGAAATCAGGGACTGTGATGTCTTTAGCTTTGTT 1509

 31524569 CTTTTTGCTCAAGATTGTTTTGGCTAGCCAGGGTCTTTTATGATTGCATATGAATTTAAG 31524628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1510 CTTTTTGCTCAAGATTGTTTTGGCTAGCCAGGGTCTTTTATGATTGCATATGAATTTAAG 1569

 31524629 GATTGTTTTATTTCTATAAGAAATGACATTGGAATTTTGATAGGGACTGCATTGAATCTG 31524688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1570 GATTGTTTTATTTCTATAAGAAATGACATTGGAATTTTGATAGGGACTGCATTGAATCTG 1629

 31524689 TAGATTGCTTTGGGTAGTATGAATATTTTAATAATATTAATTCTTCTAATTTATCAACAC 31524748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1630 TAGATTGCTTTGGGTAGTATGAATATTTTAATAATATTAATTCTTCTAATTTATCAACAC 1689

 31524749 AAGATAGCTTTCCATTTATTTGTGTTTTCTTAAACAATGTTTTAGTTTCCAGTGTACAGA 31524808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1690 AAGATAGCTTTCCATTTATTTGTGTTTTCTTAAACAATGTTTTAGTTTCCAGTGTACAGA 1749

 31524809 TCTTTTAACTTCTTGGTTAAATTTACCCCTAAGTATTTTATTTTATTTTAAAATACCTGG 31524868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1750 TCTTTTAACTTCTTGGTTAAATTTACCCCTAAGTATTTTATTTTATTTTAAAATACCTGG 1809

 31524869 CTAATTTTGTATTTAATTTTATATTGTATTTATTTTATTTGTAATAAAATTAAGCATTTT 31524928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1810 CTAATTTTGTATTTAATTTTATATTGTATTTATTTTATTTGTAATAAAATTAAGCATTTT 1869

 31524929 ATTTTATTTTAAAATACCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATG 31524988
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     1870 ATTTTATTTTAAAATACCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGATAGGGTTTCTCCATG 1929

 31524989 TTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCAGACCTCAGGTGATCCGACTGCCTCGGCCTCCCAAA 31525048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1930 TTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCAGACCTCAGGTGATCCGACTGCCTCGGCCTCCCAAA 1989

 31525049 GTGCTGGTATTAGAAGCATGAGCCACTGCCCACTGCACCTAGCTGAAAACCACACTTTCT 31525108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1990 GTGCTGGTATTAGAAGCATGAGCCACTGCCCACTGCACCTAGCTGAAAACCACACTTTCT 2049

 31525109 GTTGATTAAATAATATTTCACCTTATGGAGTTACAAATTTTCATTTTATGGGGTTATAAT 31525168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2050 GTTGATTAAATAATATTTCACCTTATGGAGTTACAAATTTTCATTTTATGGGGTTATAAT 2109

 31525169 CACTTACTTAGCTTGTTATCTTTTGTTGGACATTAATGTGGTTTCTAACTTTTCATTATC 31525228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2110 CACTTACTTAGCTTGTTATCTTTTGTTGGACATTAATGTGGTTTCTAACTTTTCATTATC 2169

 31525229 AAAAAATAAAAGAAAATGGACAAAACCTCAGAAAGACACAAACTACTAAAGCTGACTTAA 31525288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2170 AAAAAATAAAAGAAAATGGACAAAACCTCAGAAAGACACAAACTACTAAAGCTGACTTAA 2229

 31525289 TAAGAAATAGAAAATCTGAATATATAGAAAATCTGAATGTAACAAGTAAGGAGATTGGAT 31525348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2230 TAAGAAATAGAAAATCTGAATATATAGAAAATCTGAATGTAACAAGTAAGGAGATTGGAT 2289

 31525349 TAGTAATAAAATTTCCCACAAAGAGAAGTACACATTCAGATGGTTTCACTGGTAAATTCT 31525408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2290 TAGTAATAAAATTTCCCACAAAGAGAAGTACACATTCAGATGGTTTCACTGGTAAATTCT 2349

 31525409 ACCAAATATTTAAAGATTTTTCTTTTTTTTTGTTGAGACAGAGTCTCACTCTATTGCCCA 31525468
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     2350 ACCAAATATTTAAAGATTTTTCTTTTTTTTTGTTGAGGCAGAGTCTCACTCTATTGCCCA 2409

 31525469 GGCTGGAGTACAATGGTG 31525486
          ||||||||||||||||||
     2410 GGCTGGAGTACAATGGTG 2427

Alignment time is 2.06859 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31515486,31539389] =>     23904 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    5929] =>      5929 nucs 'mol-32-321f-035804_5929'

Score:        5856
Aligned:      5931        nucs
Identic:      5916 (100%) nucs =>       632 (100%)      5284 (100%)
Gaps:           11 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31524853,31525486] EXCISED REGION [31529390,31534686]
 second seq =>  [       1,     634] EXCISED REGION [     644,    5929]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3903 nucs [31525487,31529389]
 second seq =>         9 nucs [635,643]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31524853 ATTTTAAAATACCTGGCTAATTTTGTATTTAATTTTATATTGTATTTATTTTATTTGTAA 31524912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATTTTAAAATACCTGGCTAATTTTGTATTTAATTTTATATTGTATTTATTTTATTTGTAA 60

 31524913 TAAAATTAAGCATTTTATTTTATTTTAAAATACCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAG 31524972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAAAATTAAGCATTTTATTTTATTTTAAAATACCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAG 120

 31524973 ACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCAGACCTCAGGTGATCCGACT 31525032
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCAGACCTCAGGTGATCCGACT 180

 31525033 GCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGTATTAGAAGCATGAGCCACTGCCCACTGCACCTAGCT 31525092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGTATTAGAAGCATGAGCCACTGCCCACTGCACCTAGCT 240

 31525093 GAAAACCACACTTTCTGTTGATTAAATAATATTTCACCTTATGGAGTTACAAATTTTCAT 31525152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GAAAACCACACTTTCTGTTGATTAAATAATATTTCACCTTATGGAGTTACAAATTTTCAT 300

 31525153 TTTATGGGGTTATAATCACTTACTTAGCTTGTTATCTTTTGTTGGACATTAATGTGGTTT 31525212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTATGGGGTTATAATCACTTACTTAGCTTGTTATCTTTTGTTGGACATTAATGTGGTTT 360

 31525213 CTAACTTTTCATTATCAAAAAATAAAAGAAAATGGACAAAACCTCAGAAAGACACAAACT 31525272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTAACTTTTCATTATCAAAAAATAAAAGAAAATGGACAAAACCTCAGAAAGACACAAACT 420

 31525273 ACTAAAGCTGACTTAATAAGAAATAGAAAATCTGAATATATAGAAAATCTGAATGTAACA 31525332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACTAAAGCTGACTTAATAAGAAATAGAAAATCTGAATATATAGAAAATCTGAATGTAACA 480

 31525333 AGTAAGGAGATTGGATTAGTAATAAAATTTCCCACAAAGAGAAGTACACATTCAGATGGT 31525392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGTAAGGAGATTGGATTAGTAATAAAATTTCCCACAAAGAGAAGTACACATTCAGATGGT 540

 31525393 TTCACTGGTAAATTCTACCAAATATTTAAAGATTTTTCTTTTTTTTTGTTGAGACAGAGT 31525452
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
      541 TTCACTGGTAAATTCTACCAAATATTTAAAGATTTTTCTTTTTTTTTGTTGAGGCAGAGT 600

 31525453 CTCACTCTATTGCCCAGGCTGGAGTACAATGGTG 31525486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTCACTCTATTGCCCAGGCTGGAGTACAATGGTG 634

EXCISED REGION

 31529390 AATACTGTGCTAAGTGAAAGAAGCCAACCACAAAATACCATATATTGTGTGATTCTGCTT 31529449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      644 AATACTGTGCTAAGTGAAAGAAGCCAACCACAAAATACCATATATTGTGTGATTCTGCTT 703

 31529450 AAATGACATGTCCAGAATGTCCATATTAAAGTAGATTAGTGGTTTCCTGAGGCTGGGGGA 31529509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      704 AAATGACATGTCCAGAATGTCCATATTAAAGTAGATTAGTGGTTTCCTGAGGCTGGGGGA 763

 31529510 GGGAGTTGGGGAAATTGCGTAGTGACTACTGGGTAAAGAGTTTCTTTCTGGGGTGATGAA 31529569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      764 GGGAGTTGGGGAAATTGCGTAGTGACTACTGGGTAAAGAGTTTCTTTCTGGGGTGATGAA 823

 31529570 ATGGTCTAAAATAGAATGTGGTGGTGGTTGCACAGCTCTGAAAATACTAAAAACCATTGA 31529629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      824 ATGGTCTAAAATAGAATGTGGTGGTGGTTGCACAGCTCTGAAAATACTAAAAACCATTGA 883

 31529630 ATGAGCACTTTAAATTGGTAAATTTTTATGTGAATTATGATTCAATAAAGTTGTGTTTAG 31529689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      884 ATGAGCACTTTAAATTGGTAAATTTTTATGTGAATTATGATTCAATAAAGTTGTGTTTAG 943

 31529690 ATATTACTAAAAATGATGGTACAAATATTCTTTTTCACAAATGTTTTTTGTTGTTGTTTA 31529749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      944 ATATTACTAAAAATGATGGTACAAATATTCTTTTTCACAAATGTTTTTTGTTGTTGTTTA 1003

 31529750 TAGTTGTTTATTTGTACATCTAGTAATTTGTCCCAAGGAAAGAGTATGTAAAAGAACATA 31529809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1004 TAGTTGTTTATTTGTACATCTAGTAATTTGTCCCAAGGAAAGAGTATGTAAAAGAACATA 1063

 31529810 AGTCACTTTAAGGCCTTTAATGTATACTACAAAATTGCACTCTAGAAGGTTTATACAGTT 31529869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1064 AGTCACTTTAAGGCCTTTAATGTATACTACAAAATTGCACTCTAGAAGGTTTATACAGTT 1123

 31529870 TTGCATTTCATTAGCCTGTTTTTTTTATCTTTGACAACCTAAAGAATTTATTAGTGGTAT 31529929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1124 TTGCATTTCATTAGCCTGTTTTTTTTATCTTTGACAACCTAAAGAATTTATTAGTGGTAT 1183

 31529930 TCATCTGAGGATCCTCTAGGTCTATCAGAGTGTCTTTCTTATAGAAGGCATTCAATAAAT 31529989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1184 TCATCTGAGGATCCTCTAGGTCTATCAGAGTGTCTTTCTTATAGAAGGCATTCAATAAAT 1243

 31529990 AAATGTCCTAAGTGAGCAAAACATTTTTGGTTGATTTTTAGGTGCAAATGGTTTCTTTTG 31530049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1244 AAATGTCCTAAGTGAGCAAAACATTTTTGGTTGATTTTTAGGTGCAAATGGTTTCTTTTG 1303

 31530050 ATTTTAATTAAGATGCCTTTGTTTATTAGTGATGTTGACATATTTTCTTAATCTATTGGC 31530109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1304 ATTTTAATTAAGATGCCTTTGTTTATTAGTGATGTTGACATATTTTCTTAATCTATTGGC 1363

 31530110 TTTGTATAACTTTATGAATTGTCTCTTCATGTCCTTTGCCTACTTTTCTATTGTGGTAAC 31530169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1364 TTTGTATAACTTTATGAATTGTCTCTTCATGTCCTTTGCCTACTTTTCTATTGTGGTAAC 1423

 31530170 TATCTTTTATAAATGTTGTATAATTATTTAAAAATACATTAGGTTGGGCATGGTAGATCA 31530229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1424 TATCTTTTATAAATGTTGTATAATTATTTAAAAATACATTAGGTTGGGCATGGTAGATCA 1483

 31530230 TGCCTGTAATCCCAGCTCTCTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATTGCTTGAGCCTAACAGTT 31530289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1484 TGCCTGTAATCCCAGCTCTCTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATTGCTTGAGCCTAACAGTT 1543

 31530290 CGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCCATCTCTAAAAAAAAAAACCAATAAAAAT 31530349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1544 CGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCCATCTCTAAAAAAAAAAACCAATAAAAAT 1603

 31530350 ATATTAAAAGATTAACTGATTGTCTATCATATGGATTACAAATATCCCCCCCAATTTGTC 31530409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1604 ATATTAAAAGATTAACTGATTGTCTATCATATGGATTACAAATATCCCCCCCAATTTGTC 1663

 31530410 ATTTGCTTGTTAATTTTATTTATGATGACTTAAAAATTACAATATATTTTTTGGTGTTCA 31530469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1664 ATTTGCTTGTTAATTTTATTTATGATGACTTAAAAATTACAATATATTTTTTGGTGTTCA 1723

 31530470 AGTCAGTTTTTGTCCCCATTGTGATATTTTCCTTTGCCTGTTTATCACTTTCTTAGAGAA 31530529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1724 AGTCAGTTTTTGTCCCCATTGTGATATTTTCCTTTGCCTGTTTATCACTTTCTTAGAGAA 1783

 31530530 AAGATAAATACTGATTCGTTCTTTTGTAGGTGTTTTATGATTTCATTGAAAATAAAATCT 31530589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1784 AAGATAAATACTGATTCGTTCTTTTGTAGGTGTTTTATGATTTCATTGAAAATAAAATCT 1843

 31530590 TCAACGCATCTAGTATTCATTTGGGTGTAAGATAAAAGATAACAACGTAGGTTTCTCTTA 31530649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1844 TCAACGCATCTAGTATTCATTTGGGTGTAAGATAAAAGATAACAACGTAGGTTTCTCTTA 1903

 31530650 TAGTTCATCAGGTATCCTACTACTGTTTATTGAGTCATGTTTTCTGTTACCACTCTTACT 31530709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1904 TAGTTCATCAGGTATCCTACTACTGTTTATTGAGTCATGTTTTCTGTTACCACTCTTACT 1963

 31530710 ATATACCAGTTTTACATACATTTGGGTTGGTTTCTGAGCTTTCTATTGTCTTCCATTGCT 31530769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1964 ATATACCAGTTTTACATACATTTGGGTTGGTTTCTGAGCTTTCTATTGTCTTCCATTGCT 2023

 31530770 TTGTTTAAAATTTAAAGTTTATTATTCTGACTTTCCATACTTGAATATGGTCGAATAAGT 31530829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2024 TTGTTTAAAATTTAAAGTTTATTATTCTGACTTTCCATACTTGAATATGGTCGAATAAGT 2083

 31530830 CCTCCTTTATTAATCTTGTTTTATTTAAAAATGGTCATTTTCACTCATTTTCCAGTTCAG 31530889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2084 CCTCCTTTATTAATCTTGTTTTATTTAAAAATGGTCATTTTCACTCATTTTCCAGTTCAG 2143

 31530890 TAGTTTTATTCTCTCAGTGTAATGTGATTTATCACCCCATTGCTCACCCTATTCATCTCC 31530949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2144 TAGTTTTATTCTCTCAGTGTAATGTGATTTATCACCCCATTGCTCACCCTATTCATCTCC 2203

 31530950 CAATACCCAGCTGAAAAACTTTAGAAGACTGAGGCTCTTGCCCTGGCCCCATCACTTTCT 31531009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2204 CAATACCCAGCTGAAAAACTTTAGAAGACTGAGGCTCTTGCCCTGGCCCCATCACTTTCT 2263

 31531010 AGCTATGTGGGCTTAGGCTAGTTATTGAACATGTCTGACTCTCACTTTTCTCCTCTGTAA 31531069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2264 AGCTATGTGGGCTTAGGCTAGTTATTGAACATGTCTGACTCTCACTTTTCTCCTCTGTAA 2323

 31531070 GTCAGTGAGAATTATATACTTCTTATAAGGTTGTGAGGTTCAAATGGAATAATGTGTACA 31531129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2324 GTCAGTGAGAATTATATACTTCTTATAAGGTTGTGAGGTTCAAATGGAATAATGTGTACA 2383

 31531130 GAGGCACTTGGTAAACAATGTAGTCATATGCAAGTCATATGCAAGTCATATGTAGTCAGC 31531189
          |||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||
     2384 GAGGCACTTGGTAAACAATGT-----------AGTCATATGCAAGTCATATGTAGTCAGC 2432

 31531190 TTGGTGAATTTTGAGAAAGTAAATGCAAGTTCTTTTTATGGTTTTACCTAAGGGGCCAGT 31531249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2433 TTGGTGAATTTTGAGAAAGTAAATGCAAGTTCTTTTTATGGTTTTACCTAAGGGGCCAGT 2492

 31531250 GAGGGCCAGAGAAGTGCCGGGACCTATGTAAGGTCGCAAGCAAGTTCATGTGGAATGCAT 31531309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2493 GAGGGCCAGAGAAGTGCCGGGACCTATGTAAGGTCGCAAGCAAGTTCATGTGGAATGCAT 2552

 31531310 CTAGAACTAGAACGCTAGCCTGTGTCCCAGGGCCCTTCCAACTGGGCTCTGCTGCCTGCA 31531369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2553 CTAGAACTAGAACGCTAGCCTGTGTCCCAGGGCCCTTCCAACTGGGCTCTGCTGCCTGCA 2612

 31531370 GTCCTGGGTGCCTTCTAATTAGCCTGTGTAGTGGTCTTGGTAAAAGTGTTTCTCCTGTAC 31531429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2613 GTCCTGGGTGCCTTCTAATTAGCCTGTGTAGTGGTCTTGGTAAAAGTGTTTCTCCTGTAC 2672

 31531430 TGTCCCCTATAGGTTGTGGCTGGCCATACCATTTCCCTGGTTCCCCCCACGCTCCTGATG 31531489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2673 TGTCCCCTATAGGTTGTGGCTGGCCATACCATTTCCCTGGTTCCCCCCACGCTCCTGATG 2732

 31531490 ACCTGGAAAGGCCATTTGAATAGTGTGGCAGACATCCTGTATGTGGACAACTTCCAGCTG 31531549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2733 ACCTGGAAAGGCCATTTGAATAGTGTGGCAGACATCCTGTATGTGGACAACTTCCAGCTG 2792

 31531550 GTTATCAGCGCTGGCCAGGACCGGGACGTCAAGGCTTGGAAACTCTCCGGTGATGCCATT 31531609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2793 GTTATCAGCGCTGGCCAGGACCGGGACGTCAAGGCTTGGAAACTCTCCGGTGATGCCATT 2852

 31531610 GGTATGGGTCCTGCTGAAGCTCAGCCATGCCCATGGCCCTTCTTGTCTCTGTCCCTGTCT 31531669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2853 GGTATGGGTCCTGCTGAAGCTCAGCCATGCCCATGGCCCTTCTTGTCTCTGTCCCTGTCT 2912

 31531670 GAACATAAGCTGGTATGAACTTTGTACTCTGTGGGGAGGGACTCTCAGGCCACAGCAACT 31531729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2913 GAACATAAGCTGGTATGAACTTTGTACTCTGTGGGGAGGGACTCTCAGGCCACAGCAACT 2972

 31531730 GCCTTCACTTAAATAATATTACAGTCTGTCCAATTATCCATTCAGCAAACGGTCCATCCA 31531789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2973 GCCTTCACTTAAATAATATTACAGTCTGTCCAATTATCCATTCAGCAAACGGTCCATCCA 3032

 31531790 TTCACCCATCCACCCAATATTATTCACCTATGTATATTTTTGCAAATCATATATCTGATA 31531849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3033 TTCACCCATCCACCCAATATTATTCACCTATGTATATTTTTGCAAATCATATATCTGATA 3092

 31531850 AAGCATATTCCTTTCTCTTTTAAAAAATAAACTTAATTGTTGCATTGTATATAAAGAAAA 31531909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3093 AAGCATATTCCTTTCTCTTTTAAAAAATAAACTTAATTGTTGCATTGTATATAAAGAAAA 3152

 31531910 ACATACAAACCAGAAGGGTTCAGCTTGGTGAATTTTGAGAAAGTAAATACATACCCATAT 31531969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3153 ACATACAAACCAGAAGGGTTCAGCTTGGTGAATTTTGAGAAAGTAAATACATACCCATAT 3212

 31531970 AGCCACCGTTCATGTCAAGAAATAATTAGGGCCAGGCGCGGTGGCTCACTACTGTAATCC 31532029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3213 AGCCACCGTTCATGTCAAGAAATAATTAGGGCCAGGCGCGGTGGCTCACTACTGTAATCC 3272

 31532030 CAACACTTTTTTGTCCCCTTTTCCTCCTGTGCTGTCTTCCTATGTGTTTGTTTGTTTGTT 31532089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3273 CAACACTTTTTTGTCCCCTTTTCCTCCTGTGCTGTCTTCCTATGTGTTTGTTTGTTTGTT 3332

 31532090 TTAGTGACCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGTGCATGCCTGT 31532149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3333 TTAGTGACCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGTGCATGCCTGT 3392

 31532150 AATCCCAGCTACTTGAGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGTTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTT 31532209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3393 AATCCCAGCTACTTGAGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGTTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTT 3452

 31532210 GCAGTGAGCTGAGATCATGTCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGACTCTGTCT 31532269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3453 GCAGTGAGCTGAGATCATGTCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGACTCTGTCT 3512

 31532270 AAAAAAAAAATAATAATAAAAATAAAGTGACTTATGTGCCACTATTACAGTATTACAGCA 31532329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3513 AAAAAAAAAATAATAATAAAAATAAAGTGACTTATGTGCCACTATTACAGTATTACAGCA 3572

 31532330 TTCTGTATTTTTCTATGTGTTTACATTTATCAGAAAGCTTTGTATTTTCATATGCTTTCA 31532389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3573 TTCTGTATTTTTCTATGTGTTTACATTTATCAGAAAGCTTTGTATTTTCATATGCTTTCA 3632

 31532390 TGTTCCTGCCTAGCATCCTTTTGTTTCAACTTGAAGGGGTCCCTTTAGCATTTCTTTAAA 31532449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3633 TGTTCCTGCCTAGCATCCTTTTGTTTCAACTTGAAGGGGTCCCTTTAGCATTTCTTTAAA 3692

 31532450 GGCAGGTCTAATGGTGATGAACTCCTCTTGTTTTTATTTATCTGGGAAAATTTTTATTTT 31532509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3693 GGCAGGTCTAATGGTGATGAACTCCTCTTGTTTTTATTTATCTGGGAAAATTTTTATTTT 3752

 31532510 TCCTTCATTTTTAAAGGACAGCTTTCCTGGATATAGTATTTTTGGATGAGAGTTTTTGTT 31532569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3753 TCCTTCATTTTTAAAGGACAGCTTTCCTGGATATAGTATTTTTGGATGAGAGTTTTTGTT 3812

 31532570 CTTTTTATAATGTGTCTCCTTGTGGATTTCTTTGACTTTATCCTAGTTGGAATCCCTTGA 31532629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3813 CTTTTTATAATGTGTCTCCTTGTGGATTTCTTTGACTTTATCCTAGTTGGAATCCCTTGA 3872

 31532630 GCTTCTTGAATATAGGTTTCTTTTCCTTTTTAAGATTTGAAACATTTTCAGCCATTATTT 31532689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3873 GCTTCTTGAATATAGGTTTCTTTTCCTTTTTAAGATTTGAAACATTTTCAGCCATTATTT 3932

 31532690 ATTCAGATAAGCTTTTTGTCCCTTTCTCTCTCTCTGTCTCTCTCTCCTCCTTCTAGTACT 31532749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3933 ATTCAGATAAGCTTTTTGTCCCTTTCTCTCTCTCTGTCTCTCTCTCCTCCTTCTAGTACT 3992

 31532750 ACCATAATGCATATATTGTCCATTTGACGATGTCTCATAAATCCCTTAAGTTTTCTTTAC 31532809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3993 ACCATAATGCATATATTGTCCATTTGACGATGTCTCATAAATCCCTTAAGTTTTCTTTAC 4052

 31532810 TCTTTAAAATTCTTTTTTCTTTTTTGCTTCTCTGACTGGATATCTTCAAGTCTGCTGATT 31532869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4053 TCTTTAAAATTCTTTTTTCTTTTTTGCTTCTCTGACTGGATATCTTCAAGTCTGCTGATT 4112

 31532870 TTTCCTTCTGCTTGATCAAGCCTGCTGTAGATGACTTTTGAATTCAATTATTTTACTCTT 31532929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4113 TTTCCTTCTGCTTGATCAAGCCTGCTGTAGATGACTTTTGAATTCAATTATTTTACTCTT 4172

 31532930 CATCTTCAGCTCTAGAATTTCTGTTATTTTTATTATTATTATTATTATTTTTTGAGACAG 31532989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4173 CATCTTCAGCTCTAGAATTTCTGTTATTTTTATTATTATTATTATTATTTTTTGAGACAG 4232

 31532990 GGTCTTGCTCTGCCACCCAGGGTTGAGTGCAGTGGCACGAATTCAGCTCACTGAAGCCTT 31533049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4233 GGTCTTGCTCTGCCACCCAGGGTTGAGTGCAGTGGCACGAATTCAGCTCACTGAAGCCTT 4292

 31533050 GACCTCCCAGCCTCAAGTGATCTTCCCACAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCA 31533109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4293 GACCTCCCAGCCTCAAGTGATCTTCCCACAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCA 4352

 31533110 TGCCATCATGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTTGTAGAGACAGAGTTTCACCATGTTGC 31533169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4353 TGCCATCATGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTTGTAGAGACAGAGTTTCACCATGTTGC 4412

 31533170 CCAGGCTGGCCTTGAATTCTTGAGCTCAAGTGATCGCCCACCTAAGCTTCCCAAAGTGTT 31533229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4413 CCAGGCTGGCCTTGAATTCTTGAGCTCAAGTGATCGCCCACCTAAGCTTCCCAAAGTGTT 4472

 31533230 GGGATTATAGGTGTGGGCCACCATGGCTGGCCTCTGTTTGGTTCTTTTCTATATTTTCTG 31533289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4473 GGGATTATAGGTGTGGGCCACCATGGCTGGCCTCTGTTTGGTTCTTTTCTATATTTTCTG 4532

 31533290 TGTCTTCACTAATATTCTCAGTTTGTTCATGTATTGTTTCCCTGAGCTTGTTGAGCATTT 31533349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4533 TGTCTTCACTAATATTCTCAGTTTGTTCATGTATTGTTTCCCTGAGCTTGTTGAGCATTT 4592

 31533350 TTATTACGGTTACTTAGAATTCTTTGTCAAATAATTAATATACCTCAATTTCTTTAGCGG 31533409
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4593 TTATTACAGTTACTTAGAATTCTTTGTCAAATAATTAATATACCTCAATTTCTTTAGCGG 4652

 31533410 CAGTTTCTGGAGATTTATTTTGTTCCTTTGGGCCATGCTTTCCTATTTTTTTTGTGTGCC 31533469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4653 CAGTTTCTGGAGATTTATTTTGTTCCTTTGGGCCATGCTTTCCTATTTTTTTTGTGTGCC 4712

 31533470 TTATAACTTTATATTGGGATCCATGCATTTGTAAAATCAGCCACCTCTCCCAGTCTTTAT 31533529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4713 TTATAACTTTATATTGGGATCCATGCATTTGTAAAATCAGCCACCTCTCCCAGTCTTTAT 4772

 31533530 ATACTGGCTTCATTCAGGGAAAATTCTGCACCAATCAGCTTGGCTAAAGATTCTGGGTGC 31533589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4773 ATACTGGCTTCATTCAGGGAAAATTCTGCACCAATCAGCTTGGCTAAAGATTCTGGGTGC 4832

 31533590 CTCCCCAATCTTTTTTGTGGATACTTTCACCAGACTTACGCATGTAAATTCGCAATTACA 31533649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4833 CTCCCCAATCTTTTTTGTGGATACTTTCACCAGACTTACGCATGTAAATTCGCAATTACA 4892

 31533650 GGAATCTACAGGTTTATTTTTTTCAGGAGTCCATTATCTCTTGCTCTCTCTGGTGTCTAT 31533709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4893 GGAATCTACAGGTTTATTTTTTTCAGGAGTCCATTATCTCTTGCTCTCTCTGGTGTCTAT 4952

 31533710 TTGCAGTACTGCAAGTTCTCTAGAGCGGCTACAAGCTTCCCCCAGGCCTCTAGAATATGC 31533769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4953 TTGCAGTACTGCAAGTTCTCTAGAGCGGCTACAAGCTTCCCCCAGGCCTCTAGAATATGC 5012

 31533770 TGGGTCCTTCAATAGTCTGAGAGAGGCAAGACAGAAACCAGTTTCTTGGGTACCCCTCAA 31533829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5013 TGGGTCCTTCAATAGTCTGAGAGAGGCAAGACAGAAACCAGTTTCTTGGGTACCCCTCAA 5072

 31533830 AGGCTAACATTGGATATGTATGCTCCAAATCTGCCTCCTCAAGGAGAAGCTGGAAGTTGG 31533889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5073 AGGCTAACATTGGATATGTATGCTCCAAATCTGCCTCCTCAAGGAGAAGCTGGAAGTTGG 5132

 31533890 GTTGTTTTCTCTACTCATTCCACAGAGCGGCAGGAGGGACTCTGATAGTGTGTGCTAGTC 31533949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5133 GTTGTTTTCTCTACTCATTCCACAGAGCGGCAGGAGGGACTCTGATAGTGTGTGCTAGTC 5192

 31533950 TAAATTGTCACCTTTGTTCTTAGTAGCCCAGTCTGGTGCCTCTTCCTGTCAGTGCTTAGA 31534009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5193 TAAATTGTCACCTTTGTTCTTAGTAGCCCAGTCTGGTGCCTCTTCCTGTCAGTGCTTAGA 5252

 31534010 TTCAGGCAAGACAGAAACTGGTTAATCATGCAGCCCTCTGAAAAGTCTGCATGTTGGATG 31534069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5253 TTCAGGCAAGACAGAAACTGGTTAATCATGCAGCCCTCTGAAAAGTCTGCATGTTGGATG 5312

 31534070 TACATCTCAGTCTTTCCCTCCCAGGGAGAAGCTGGAAGCTGGTGGTTCCTTCCCAATCTG 31534129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5313 TACATCTCAGTCTTTCCCTCCCAGGGAGAAGCTGGAAGCTGGTGGTTCCTTCCCAATCTG 5372

 31534130 CTTCACTGAGCCAGGAGGAGGGATTACAAGTGAGCACTATGAATTTTCCTACTGGCTTCA 31534189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5373 CTTCACTGAGCCAGGAGGAGGGATTACAAGTGAGCACTATGAATTTTCCTACTGGCTTCA 5432

 31534190 GTGCAGCTGGTTTTTTGTTTTTTGTTTTTTTGGTTTTTGTTTGTTTGTTTTTTCATTCAT 31534249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5433 GTGCAGCTGGTTTTTTGTTTTTTGTTTTTTTGGTTTTTGTTTGTTTGTTTTTTCATTCAT 5492

 31534250 CTGGGATGAATGGTCCTGGTTTCTGGTCCATGTACTGTTGTTCAGTCAGTGTCTCCATAG 31534309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5493 CTGGGATGAATGGTCCTGGTTTCTGGTCCATGTACTGTTGTTCAGTCAGTGTCTCCATAG 5552

 31534310 GGAGAAGGAAGTTCTGGATCTTCCTATTCTACCATCTTGCTGATGTCACCCATTTTTTTG 31534369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5553 GGAGAAGGAAGTTCTGGATCTTCCTATTCTACCATCTTGCTGATGTCACCCATTTTTTTG 5612

 31534370 TATCTTTCAAAGACGTCTTTGACTATCCCCTAAATATAATATCTAGTGTTATCTTTTAGA 31534429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5613 TATCTTTCAAAGACGTCTTTGACTATCCCCTAAATATAATATCTAGTGTTATCTTTTAGA 5672

 31534430 AGCTTGTTTTAAAAATCAGATTTCTGAAGTATAATTTACATCCAATAAAAGCACCTTTTA 31534489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5673 AGCTTGTTTTAAAAATCAGATTTCTGAAGTATAATTTACATCCAATAAAAGCACCTTTTA 5732

 31534490 AAAGTATATAGTTCTGTGAGGTTTCATGAATGCATACAATTGTGTAATTGGTATCACAAT 31534549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5733 AAAGTATATAGTTCTGTGAGGTTTCATGAATGCATACAATTGTGTAATTGGTATCACAAT 5792

 31534550 CAAGACATAGACATTACCCCAAAAAGTGACCTCATGTCTCCTCATAGTAAACTCTATTTC 31534609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5793 CAAGACATAGACATTACCCCAAAAAGTGACCTCATGTCTCCTCATAGTAAACTCTATTTC 5852

 31534610 CTTCTCCTAACCCCTGGCAGCCATTGATCTGTTTGTCTCTATAGTTTTGCCTTTTCCAGA 31534669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5853 CTTCTCCTAACCCCTGGCAGCCATTGATCTGTTTGTCTCTATAGTTTTGCCTTTTCCAGA 5912

 31534670 TTATCATAAATGGAAAC 31534686
          |||||.|||||||||||
     5913 TTATCGTAAATGGAAAC 5929

Alignment time is 4.93055 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31515486,31539389] =>     23904 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    3913] =>      3913 nucs 'mol-32-321f-152491_3913'

Score:        3901
Aligned:      3912        nucs
Identic:      3911 (100%) nucs =>       808 (100%)      3103 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31528268,31529075] EXCISED REGION [31529077,31532180]
 second seq =>  [       1,     808] EXCISED REGION [     810,    3913]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [31529076,31529076]
 second seq =>         1 nucs [809,809]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        12 nucs [31529065,31529076] to [31529066,31529077]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [31529075,31529075] to [31529077,31529077]
 second seq =>         1 nucs [808,808] to [810,810]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31528268 GCCAAAATTATAAGACTTTTAGAAGAAAATAAATGGAAAATACTTGTGACCTTAGACAGT 31528327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCCAAAATTATAAGACTTTTAGAAGAAAATAAATGGAAAATACTTGTGACCTTAGACAGT 60

 31528328 GTGTCTTAGATATGACACCAAAAACAAGCTACAAAAGAAAAAAACAGATAAATTGGACTT 31528387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTGTCTTAGATATGACACCAAAAACAAGCTACAAAAGAAAAAAACAGATAAATTGGACTT 120

 31528388 TGTCAAAATTAAAAACTTTTGGGCTGCAAAGGATACCGTCAAGAAAGTGAAAGGGTAACC 31528447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGTCAAAATTAAAAACTTTTGGGCTGCAAAGGATACCGTCAAGAAAGTGAAAGGGTAACC 180

 31528448 TGAAAGAAAATACTTGCAAATCATATATCTGATAAGGGACTAGTATCCAGAATATATAAA 31528507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGAAAGAAAATACTTGCAAATCATATATCTGATAAGGGACTAGTATCCAGAATATATAAA 240

 31528508 GCACTCTTGCAACTTGATAAAAATGATAAATAACCAAATTAAGATACGGGTAAAGGATCT 31528567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GCACTCTTGCAACTTGATAAAAATGATAAATAACCAAATTAAGATACGGGTAAAGGATCT 300

 31528568 AAATAAACATTTCTTCAAAGAAGATGTACAAATGGCTAATAAGTATATTAAATGATGGTG 31528627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAATAAACATTTCTTCAAAGAAGATGTACAAATGGCTAATAAGTATATTAAATGATGGTG 360

 31528628 AACATCATTAGCTATCAGGGAAATGCATATTAAAACTATAATGAGATCCCACTTTACACT 31528687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AACATCATTAGCTATCAGGGAAATGCATATTAAAACTATAATGAGATCCCACTTTACACT 420

 31528688 TGCCAGGATAACTATAGATAATAGCAATGGTTGGCTGGGATGTGGACAAACTGGGACTCT 31528747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGCCAGGATAACTATAGATAATAGCAATGGTTGGCTGGGATGTGGACAAACTGGGACTCT 480

 31528748 TACACATTGCTGGATAGAATGTAGAAAGCTGGCCAGGTACGGTGGCTCAGGCCTGTAATC 31528807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TACACATTGCTGGATAGAATGTAGAAAGCTGGCCAGGTACGGTGGCTCAGGCCTGTAATC 540

 31528808 CCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGCGGATTATGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTG 31528867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGCGGATTATGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTG 600

 31528868 GCCAGCATGGTGTAACCCCGTCTCTACTAAACATACAAAAATTAGCAGGGCATGATGGCG 31528927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GCCAGCATGGTGTAACCCCGTCTCTACTAAACATACAAAAATTAGCAGGGCATGATGGCG 660

 31528928 GGTGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAG 31528987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGTGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAG 720

 31528988 GCGGAGGTTGCAGTGAGCAGAGATCATGCCATTGCGTTCCAGTCTGGGCAACAAGAGCAA 31529047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GCGGAGGTTGCAGTGAGCAGAGATCATGCCATTGCGTTCCAGTCTGGGCAACAAGAGCAA 780

 31529048 AACTCCAAACTCTGTTTAAAAAAAAAAA 31529075
          ||||||||||||||||||||||||||||
      781 AACTCCAAACTCTGTTTAAAAAAAAAAA 808

EXCISED REGION

 31529077 AGAAAAAGAACATAGAAAGCTGCAGTCACTTTGGAAAACAGTCTGGCAGTTCCTCAAAAA 31529136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      810 AGAAAAAGAACATAGAAAGCTGCAGTCACTTTGGAAAACAGTCTGGCAGTTCCTCAAAAA 869

 31529137 TTAAGTGTAGACTTACCATATTACCCAACAGTTCCACTCCCAAGTGTATACCCAAGAGAA 31529196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      870 TTAAGTGTAGACTTACCATATTACCCAACAGTTCCACTCCCAAGTGTATACCCAAGAGAA 929

 31529197 ATGAAAACATATGTTCACATAAAATCTTGTACATGAATGTTTATAGTAGCATTATTTATA 31529256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
      930 ATGAAAACATATGTTCACATAAAATCTTGTACATGAATGTTTGTAGTAGCATTATTTATA 989

 31529257 ATACAAAAGTGGAAACAACCCAAATGTCAACTTCCAAATGGATAAAGTGTGGTATGGTGA 31529316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      990 ATACAAAAGTGGAAACAACCCAAATGTCAACTTCCAAATGGATAAAGTGTGGTATGGTGA 1049

 31529317 TACAATGGAATGTTATTTAATAATAAAAAGGAATAAAGTACTGATGCATGCAACAACATG 31529376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1050 TACAATGGAATGTTATTTAATAATAAAAAGGAATAAAGTACTGATGCATGCAACAACATG 1109

 31529377 GATGAACCTTGAAAATACTGTGCTAAGTGAAAGAAGCCAACCACAAAATACCATATATTG 31529436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1110 GATGAACCTTGAAAATACTGTGCTAAGTGAAAGAAGCCAACCACAAAATACCATATATTG 1169

 31529437 TGTGATTCTGCTTAAATGACATGTCCAGAATGTCCATATTAAAGTAGATTAGTGGTTTCC 31529496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1170 TGTGATTCTGCTTAAATGACATGTCCAGAATGTCCATATTAAAGTAGATTAGTGGTTTCC 1229

 31529497 TGAGGCTGGGGGAGGGAGTTGGGGAAATTGCGTAGTGACTACTGGGTAAAGAGTTTCTTT 31529556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1230 TGAGGCTGGGGGAGGGAGTTGGGGAAATTGCGTAGTGACTACTGGGTAAAGAGTTTCTTT 1289

 31529557 CTGGGGTGATGAAATGGTCTAAAATAGAATGTGGTGGTGGTTGCACAGCTCTGAAAATAC 31529616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1290 CTGGGGTGATGAAATGGTCTAAAATAGAATGTGGTGGTGGTTGCACAGCTCTGAAAATAC 1349

 31529617 TAAAAACCATTGAATGAGCACTTTAAATTGGTAAATTTTTATGTGAATTATGATTCAATA 31529676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1350 TAAAAACCATTGAATGAGCACTTTAAATTGGTAAATTTTTATGTGAATTATGATTCAATA 1409

 31529677 AAGTTGTGTTTAGATATTACTAAAAATGATGGTACAAATATTCTTTTTCACAAATGTTTT 31529736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1410 AAGTTGTGTTTAGATATTACTAAAAATGATGGTACAAATATTCTTTTTCACAAATGTTTT 1469

 31529737 TTGTTGTTGTTTATAGTTGTTTATTTGTACATCTAGTAATTTGTCCCAAGGAAAGAGTAT 31529796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1470 TTGTTGTTGTTTATAGTTGTTTATTTGTACATCTAGTAATTTGTCCCAAGGAAAGAGTAT 1529

 31529797 GTAAAAGAACATAAGTCACTTTAAGGCCTTTAATGTATACTACAAAATTGCACTCTAGAA 31529856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1530 GTAAAAGAACATAAGTCACTTTAAGGCCTTTAATGTATACTACAAAATTGCACTCTAGAA 1589

 31529857 GGTTTATACAGTTTTGCATTTCATTAGCCTGTTTTTTTTATCTTTGACAACCTAAAGAAT 31529916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1590 GGTTTATACAGTTTTGCATTTCATTAGCCTGTTTTTTTTATCTTTGACAACCTAAAGAAT 1649

 31529917 TTATTAGTGGTATTCATCTGAGGATCCTCTAGGTCTATCAGAGTGTCTTTCTTATAGAAG 31529976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1650 TTATTAGTGGTATTCATCTGAGGATCCTCTAGGTCTATCAGAGTGTCTTTCTTATAGAAG 1709

 31529977 GCATTCAATAAATAAATGTCCTAAGTGAGCAAAACATTTTTGGTTGATTTTTAGGTGCAA 31530036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1710 GCATTCAATAAATAAATGTCCTAAGTGAGCAAAACATTTTTGGTTGATTTTTAGGTGCAA 1769

 31530037 ATGGTTTCTTTTGATTTTAATTAAGATGCCTTTGTTTATTAGTGATGTTGACATATTTTC 31530096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1770 ATGGTTTCTTTTGATTTTAATTAAGATGCCTTTGTTTATTAGTGATGTTGACATATTTTC 1829

 31530097 TTAATCTATTGGCTTTGTATAACTTTATGAATTGTCTCTTCATGTCCTTTGCCTACTTTT 31530156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1830 TTAATCTATTGGCTTTGTATAACTTTATGAATTGTCTCTTCATGTCCTTTGCCTACTTTT 1889

 31530157 CTATTGTGGTAACTATCTTTTATAAATGTTGTATAATTATTTAAAAATACATTAGGTTGG 31530216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1890 CTATTGTGGTAACTATCTTTTATAAATGTTGTATAATTATTTAAAAATACATTAGGTTGG 1949

 31530217 GCATGGTAGATCATGCCTGTAATCCCAGCTCTCTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATTGCTT 31530276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1950 GCATGGTAGATCATGCCTGTAATCCCAGCTCTCTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATTGCTT 2009

 31530277 GAGCCTAACAGTTCGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCCATCTCTAAAAAAAAA 31530336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2010 GAGCCTAACAGTTCGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCCATCTCTAAAAAAAAA 2069

 31530337 AACCAATAAAAATATATTAAAAGATTAACTGATTGTCTATCATATGGATTACAAATATCC 31530396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2070 AACCAATAAAAATATATTAAAAGATTAACTGATTGTCTATCATATGGATTACAAATATCC 2129

 31530397 CCCCCAATTTGTCATTTGCTTGTTAATTTTATTTATGATGACTTAAAAATTACAATATAT 31530456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2130 CCCCCAATTTGTCATTTGCTTGTTAATTTTATTTATGATGACTTAAAAATTACAATATAT 2189

 31530457 TTTTTGGTGTTCAAGTCAGTTTTTGTCCCCATTGTGATATTTTCCTTTGCCTGTTTATCA 31530516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2190 TTTTTGGTGTTCAAGTCAGTTTTTGTCCCCATTGTGATATTTTCCTTTGCCTGTTTATCA 2249

 31530517 CTTTCTTAGAGAAAAGATAAATACTGATTCGTTCTTTTGTAGGTGTTTTATGATTTCATT 31530576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2250 CTTTCTTAGAGAAAAGATAAATACTGATTCGTTCTTTTGTAGGTGTTTTATGATTTCATT 2309

 31530577 GAAAATAAAATCTTCAACGCATCTAGTATTCATTTGGGTGTAAGATAAAAGATAACAACG 31530636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2310 GAAAATAAAATCTTCAACGCATCTAGTATTCATTTGGGTGTAAGATAAAAGATAACAACG 2369

 31530637 TAGGTTTCTCTTATAGTTCATCAGGTATCCTACTACTGTTTATTGAGTCATGTTTTCTGT 31530696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2370 TAGGTTTCTCTTATAGTTCATCAGGTATCCTACTACTGTTTATTGAGTCATGTTTTCTGT 2429

 31530697 TACCACTCTTACTATATACCAGTTTTACATACATTTGGGTTGGTTTCTGAGCTTTCTATT 31530756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2430 TACCACTCTTACTATATACCAGTTTTACATACATTTGGGTTGGTTTCTGAGCTTTCTATT 2489

 31530757 GTCTTCCATTGCTTTGTTTAAAATTTAAAGTTTATTATTCTGACTTTCCATACTTGAATA 31530816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2490 GTCTTCCATTGCTTTGTTTAAAATTTAAAGTTTATTATTCTGACTTTCCATACTTGAATA 2549

 31530817 TGGTCGAATAAGTCCTCCTTTATTAATCTTGTTTTATTTAAAAATGGTCATTTTCACTCA 31530876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2550 TGGTCGAATAAGTCCTCCTTTATTAATCTTGTTTTATTTAAAAATGGTCATTTTCACTCA 2609

 31530877 TTTTCCAGTTCAGTAGTTTTATTCTCTCAGTGTAATGTGATTTATCACCCCATTGCTCAC 31530936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2610 TTTTCCAGTTCAGTAGTTTTATTCTCTCAGTGTAATGTGATTTATCACCCCATTGCTCAC 2669

 31530937 CCTATTCATCTCCCAATACCCAGCTGAAAAACTTTAGAAGACTGAGGCTCTTGCCCTGGC 31530996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2670 CCTATTCATCTCCCAATACCCAGCTGAAAAACTTTAGAAGACTGAGGCTCTTGCCCTGGC 2729

 31530997 CCCATCACTTTCTAGCTATGTGGGCTTAGGCTAGTTATTGAACATGTCTGACTCTCACTT 31531056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2730 CCCATCACTTTCTAGCTATGTGGGCTTAGGCTAGTTATTGAACATGTCTGACTCTCACTT 2789

 31531057 TTCTCCTCTGTAAGTCAGTGAGAATTATATACTTCTTATAAGGTTGTGAGGTTCAAATGG 31531116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2790 TTCTCCTCTGTAAGTCAGTGAGAATTATATACTTCTTATAAGGTTGTGAGGTTCAAATGG 2849

 31531117 AATAATGTGTACAGAGGCACTTGGTAAACAATGTAGTCATATGCAAGTCATATGCAAGTC 31531176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2850 AATAATGTGTACAGAGGCACTTGGTAAACAATGTAGTCATATGCAAGTCATATGCAAGTC 2909

 31531177 ATATGTAGTCAGCTTGGTGAATTTTGAGAAAGTAAATGCAAGTTCTTTTTATGGTTTTAC 31531236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2910 ATATGTAGTCAGCTTGGTGAATTTTGAGAAAGTAAATGCAAGTTCTTTTTATGGTTTTAC 2969

 31531237 CTAAGGGGCCAGTGAGGGCCAGAGAAGTGCCGGGACCTATGTAAGGTCGCAAGCAAGTTC 31531296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2970 CTAAGGGGCCAGTGAGGGCCAGAGAAGTGCCGGGACCTATGTAAGGTCGCAAGCAAGTTC 3029

 31531297 ATGTGGAATGCATCTAGAACTAGAACGCTAGCCTGTGTCCCAGGGCCCTTCCAACTGGGC 31531356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3030 ATGTGGAATGCATCTAGAACTAGAACGCTAGCCTGTGTCCCAGGGCCCTTCCAACTGGGC 3089

 31531357 TCTGCTGCCTGCAGTCCTGGGTGCCTTCTAATTAGCCTGTGTAGTGGTCTTGGTAAAAGT 31531416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3090 TCTGCTGCCTGCAGTCCTGGGTGCCTTCTAATTAGCCTGTGTAGTGGTCTTGGTAAAAGT 3149

 31531417 GTTTCTCCTGTACTGTCCCCTATAGGTTGTGGCTGGCCATACCATTTCCCTGGTTCCCCC 31531476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3150 GTTTCTCCTGTACTGTCCCCTATAGGTTGTGGCTGGCCATACCATTTCCCTGGTTCCCCC 3209

 31531477 CACGCTCCTGATGACCTGGAAAGGCCATTTGAATAGTGTGGCAGACATCCTGTATGTGGA 31531536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3210 CACGCTCCTGATGACCTGGAAAGGCCATTTGAATAGTGTGGCAGACATCCTGTATGTGGA 3269

 31531537 CAACTTCCAGCTGGTTATCAGCGCTGGCCAGGACCGGGACGTCAAGGCTTGGAAACTCTC 31531596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3270 CAACTTCCAGCTGGTTATCAGCGCTGGCCAGGACCGGGACGTCAAGGCTTGGAAACTCTC 3329

 31531597 CGGTGATGCCATTGGTATGGGTCCTGCTGAAGCTCAGCCATGCCCATGGCCCTTCTTGTC 31531656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3330 CGGTGATGCCATTGGTATGGGTCCTGCTGAAGCTCAGCCATGCCCATGGCCCTTCTTGTC 3389

 31531657 TCTGTCCCTGTCTGAACATAAGCTGGTATGAACTTTGTACTCTGTGGGGAGGGACTCTCA 31531716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3390 TCTGTCCCTGTCTGAACATAAGCTGGTATGAACTTTGTACTCTGTGGGGAGGGACTCTCA 3449

 31531717 GGCCACAGCAACTGCCTTCACTTAAATAATATTACAGTCTGTCCAATTATCCATTCAGCA 31531776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3450 GGCCACAGCAACTGCCTTCACTTAAATAATATTACAGTCTGTCCAATTATCCATTCAGCA 3509

 31531777 AACGGTCCATCCATTCACCCATCCACCCAATATTATTCACCTATGTATATTTTTGCAAAT 31531836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3510 AACGGTCCATCCATTCACCCATCCACCCAATATTATTCACCTATGTATATTTTTGCAAAT 3569

 31531837 CATATATCTGATAAAGCATATTCCTTTCTCTTTTAAAAAATAAACTTAATTGTTGCATTG 31531896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3570 CATATATCTGATAAAGCATATTCCTTTCTCTTTTAAAAAATAAACTTAATTGTTGCATTG 3629

 31531897 TATATAAAGAAAAACATACAAACCAGAAGGGTTCAGCTTGGTGAATTTTGAGAAAGTAAA 31531956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3630 TATATAAAGAAAAACATACAAACCAGAAGGGTTCAGCTTGGTGAATTTTGAGAAAGTAAA 3689

 31531957 TACATACCCATATAGCCACCGTTCATGTCAAGAAATAATTAGGGCCAGGCGCGGTGGCTC 31532016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3690 TACATACCCATATAGCCACCGTTCATGTCAAGAAATAATTAGGGCCAGGCGCGGTGGCTC 3749

 31532017 ACTACTGTAATCCCAACACTTTTTTGTCCCCTTTTCCTCCTGTGCTGTCTTCCTATGTGT 31532076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3750 ACTACTGTAATCCCAACACTTTTTTGTCCCCTTTTCCTCCTGTGCTGTCTTCCTATGTGT 3809

 31532077 TTGTTTGTTTGTTTTAGTGACCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGT 31532136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3810 TTGTTTGTTTGTTTTAGTGACCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGT 3869

 31532137 GGTGCATGCCTGTAATCCCAGCTACTTGAGAGGCTGAGGCAGGA 31532180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3870 GGTGCATGCCTGTAATCCCAGCTACTTGAGAGGCTGAGGCAGGA 3913

Alignment time is 3.27529 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31515486,31539389] =>     23904 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    6561] =>      6561 nucs 'mol-32-321f-179604_6561'

Score:        6549
Aligned:      6560        nucs
Identic:      6559 (100%) nucs =>      3438 (100%)      3121 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31519560,31522998] EXCISED REGION [31522999,31526119]
 second seq =>  [       1,    3438] EXCISED REGION [    3441,    6561]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [3439,3440]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        25 nucs [3439,3463] to [3441,3465]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [3439,3439] to [3440,3440]

 31519560 TTTCAAAAAAGAAAAAGAGTTAGTATTCGTAATAATGCCACATTAGAAACAACTCAAATG 31519619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTCAAAAAAGAAAAAGAGTTAGTATTCGTAATAATGCCACATTAGAAACAACTCAAATG 60

 31519620 CCCATCACCGTAGACTGGAAAATAAATTACAAATAAATTACAGTGTAATATCTGGCACCA 31519679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCCATCACCGTAGACTGGAAAATAAATTACAAATAAATTACAGTGTAATATCTGGCACCA 120

 31519680 GAAGTGAATTTACTCACTACAAAATGGAGAACTCTTCAAACAATTTAGGCAAAAGAAGTC 31519739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GAAGTGAATTTACTCACTACAAAATGGAGAACTCTTCAAACAATTTAGGCAAAAGAAGTC 180

 31519740 AGACCCAGAAGAACATATATTAGAAATGATTGTTTTTGTTGGGGGAGTGGAGAGGCTGGA 31519799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGACCCAGAAGAACATATATTAGAAATGATTGTTTTTGTTGGGGGAGTGGAGAGGCTGGA 240

 31519800 AGGAATCATGAAGGGGACTTCTGGAGAGGTTGGCAGTGCTCTGCTTCATTAACGGGCCTG 31519859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGGAATCATGAAGGGGACTTCTGGAGAGGTTGGCAGTGCTCTGCTTCATTAACGGGCCTG 300

 31519860 ATCATGCAGTTGTATTCAGTTTCTAAAAATTTATTCAGTGGTGGGCCGGGCACGGTGGCT 31519919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATCATGCAGTTGTATTCAGTTTCTAAAAATTTATTCAGTGGTGGGCCGGGCACGGTGGCT 360

 31519920 CATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCTGGTGGATCATCTGAGGTCAGGAG 31519979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCTGGTGGATCATCTGAGGTCAGGAG 420

 31519980 TTTGAGACCAGCCTGGCCAACCTGGTGAAACCCTGTCTACTAAAAATACAAAAATCAGCT 31520039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTTGAGACCAGCCTGGCCAACCTGGTGAAACCCTGTCTACTAAAAATACAAAAATCAGCT 480

 31520040 GGGTGTGGCGGTGCACGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCACAAGAATCAC 31520099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GGGTGTGGCGGTGCACGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCACAAGAATCAC 540

 31520100 TTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCTAGATTGCTCCGTTGCCCTCCAGCCTGG 31520159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCTAGATTGCTCCGTTGCCCTCCAGCCTGG 600

 31520160 GCGACAGCGTGTGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAATTATTCAGTACTACACTTATATACGA 31520219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GCGACAGCGTGTGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAATTATTCAGTACTACACTTATATACGA 660

 31520220 TTTTCTATGTGTATATCATACATCAATGAAAGTTTTAAAAAGTCAGGTAACGTAAAAAGG 31520279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTTTCTATGTGTATATCATACATCAATGAAAGTTTTAAAAAGTCAGGTAACGTAAAAAGG 720

 31520280 CTTACAGCGAAGAGTCTAAGTCCCATTCCTGTTCCCCCAAACAGTTCATGCTCCCTGAAG 31520339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTTACAGCGAAGAGTCTAAGTCCCATTCCTGTTCCCCCAAACAGTTCATGCTCCCTGAAG 780

 31520340 TAACCACGTGTGTTGATTTTTGGTTATTCCTCTGGTGTTTACTTATGCAAACACGATGTG 31520399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TAACCACGTGTGTTGATTTTTGGTTATTCCTCTGGTGTTTACTTATGCAAACACGATGTG 840

 31520400 TAAAGTTATTTTCTACTGAAGGTATCATTTCACTTATACTGGTACTCATCTTGCTTTTCT 31520459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TAAAGTTATTTTCTACTGAAGGTATCATTTCACTTATACTGGTACTCATCTTGCTTTTCT 900

 31520460 TGCTGTATGATATATCTTGGAGACCTTTGCATAGCAGCACTATCCCATTTTAAGGTAAAT 31520519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGCTGTATGATATATCTTGGAGACCTTTGCATAGCAGCACTATCCCATTTTAAGGTAAAT 960

 31520520 TTGTCTTTAAAAAAATCTTACACAAAAGTGAATAGTGAATGTTATTTCACATATGTGAAG 31520579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTGTCTTTAAAAAAATCTTACACAAAAGTGAATAGTGAATGTTATTTCACATATGTGAAG 1020

 31520580 GCATTTCTGTAGGAGATGTTCTTGGAAGTGGGATTGCTAGGTAAAAGGGTTACATGCATT 31520639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GCATTTCTGTAGGAGATGTTCTTGGAAGTGGGATTGCTAGGTAAAAGGGTTACATGCATT 1080

 31520640 TGCAATTTTGATAGCCTTCTTGCAGTCTTATGTGCCTTTTGAATCTCTACATGAGTATGT 31520699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGCAATTTTGATAGCCTTCTTGCAGTCTTATGTGCCTTTTGAATCTCTACATGAGTATGT 1140

 31520700 TATGGCTAGTTCGTTTTAGTATGAAGAGAATGTCATTATATTAAAATGTCTTGGGAACTG 31520759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TATGGCTAGTTCGTTTTAGTATGAAGAGAATGTCATTATATTAAAATGTCTTGGGAACTG 1200

 31520760 ATTACCCACAGTGTCAGTATGTGAAGAATTTATAATGTTGATACAATCATCATCATAATA 31520819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATTACCCACAGTGTCAGTATGTGAAGAATTTATAATGTTGATACAATCATCATCATAATA 1260

 31520820 ATATTTATTTACTGCTTGCAATGTTCCAGGGATGGTGATAGTATATTATATATGCATTCA 31520879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATATTTATTTACTGCTTGCAATGTTCCAGGGATGGTGATAGTATATTATATATGCATTCA 1320

 31520880 TTAATCTCCATAATGACTTGTGAGGGAGATGATGTTTTTCAGATGAGGAAGTAATGAAAC 31520939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTAATCTCCATAATGACTTGTGAGGGAGATGATGTTTTTCAGATGAGGAAGTAATGAAAC 1380

 31520940 TGAAGAGCTGAGAGACTCGTCTAAGCTCCAGTAGCAACCAGTGTAGACCTGAGACTAAAC 31520999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TGAAGAGCTGAGAGACTCGTCTAAGCTCCAGTAGCAACCAGTGTAGACCTGAGACTAAAC 1440

 31521000 CTAAGTCTGTCTGACTCCAGAATCTGTGTTCCTGACCATCTGCTCTTAGTTTTATAATGA 31521059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTAAGTCTGTCTGACTCCAGAATCTGTGTTCCTGACCATCTGCTCTTAGTTTTATAATGA 1500

 31521060 TATATTTTAAACAATTGGGATTATATTGTATGTAACTGGAATTTCCTATACCATCAAGTA 31521119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TATATTTTAAACAATTGGGATTATATTGTATGTAACTGGAATTTCCTATACCATCAAGTA 1560

 31521120 TTCTTTTTTCTTTAAAAATTTTATTGTTTCAAATAGATAAATCATAATTGTAGACATTTC 31521179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTCTTTTTTCTTTAAAAATTTTATTGTTTCAAATAGATAAATCATAATTGTAGACATTTC 1620

 31521180 TGAGGCACAGTGTGCTGTTTTGATCTATGTACACATGTGGAATGATTAAATCAAGCCAAT 31521239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TGAGGCACAGTGTGCTGTTTTGATCTATGTACACATGTGGAATGATTAAATCAAGCCAAT 1680

 31521240 TAACATATCTACCACCTCACTTACAATTTTTATGGTGAGACATTTAAAATTTACTCTTAG 31521299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TAACATATCTACCACCTCACTTACAATTTTTATGGTGAGACATTTAAAATTTACTCTTAG 1740

 31521300 TTATGTTGAAGTATGCAATATATTACTGACTATAGTCACTCTGCTGTGCAGAAGATCTCA 31521359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TTATGTTGAAGTATGCAATATATTACTGACTATAGTCACTCTGCTGTGCAGAAGATCTCA 1800

 31521360 AAACTTTTTCCTCCTGTCTGACCAAAACTTGGTACCCCTTTGACCAATAACTTCCCATTC 31521419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AAACTTTTTCCTCCTGTCTGACCAAAACTTGGTACCCCTTTGACCAATAACTTCCCATTC 1860

 31521420 TCTCTCCCTTATTCCCCACCCCACCCTCTAAGCCTCTGGTAACCATCATTCTCCTTTCTA 31521479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TCTCTCCCTTATTCCCCACCCCACCCTCTAAGCCTCTGGTAACCATCATTCTCCTTTCTA 1920

 31521480 CTTCTTTTTAAAAACCTCTTTTTGGCCGGGCTCAGTGGCTCAAGCCTGTAATCCCAGTAC 31521539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CTTCTTTTTAAAAACCTCTTTTTGGCCGGGCTCAGTGGCTCAAGCCTGTAATCCCAGTAC 1980

 31521540 TTTGGGAGGCCGAGGCGGGCAGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCCA 31521599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TTTGGGAGGCCGAGGCGGGCAGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCCA 2040

 31521600 CATGGTGAAACCTTGTCCCTACTAAAAATACAAAATTAGCCAGGCATGGTGATGCGTGCC 31521659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CATGGTGAAACCTTGTCCCTACTAAAAATACAAAATTAGCCAGGCATGGTGATGCGTGCC 2100

 31521660 TGTAATCCCAGCTACTCTGGAGGCTGAGGCAAGAAATCACTTGAACCTGGGAGGCAGAGG 31521719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TGTAATCCCAGCTACTCTGGAGGCTGAGGCAAGAAATCACTTGAACCTGGGAGGCAGAGG 2160

 31521720 TTGCAGTGAGCCGAGGTTGCGCCACTGCACTTCAGCCTGGGCAACAAAGTGAGACTCCGT 31521779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TTGCAGTGAGCCGAGGTTGCGCCACTGCACTTCAGCCTGGGCAACAAAGTGAGACTCCGT 2220

 31521780 CTCAAAAAATCAATCAATCAAATCAAAGCAAATCAAAAACTTTTTTTTTTTTTTTGTAGA 31521839
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
     2221 CTCAAAAAATCAATCAATCAAATCAAAGCAAATCAAAAACTTTTTTTTTTTTTT-GTAGA 2279

 31521840 GATGAGGTCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAGGAATCCTCCTGCC 31521899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 GATGAGGTCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAGGAATCCTCCTGCC 2339

 31521900 TTGACCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGTGCCCAGCCCTTTCTACTT 31521959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 TTGACCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGTGCCCAGCCCTTTCTACTT 2399

 31521960 CTATGAGTTTGACTTTTTATAATTCCATATATAAATACAATCATGCAGTATTTTTCTTTC 31522019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 CTATGAGTTTGACTTTTTATAATTCCATATATAAATACAATCATGCAGTATTTTTCTTTC 2459

 31522020 ATGACTGGCTTATTTCACTTACCATAATGTCTTCCAGATTAATCTATGTTGTCCCAAATG 31522079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 ATGACTGGCTTATTTCACTTACCATAATGTCTTCCAGATTAATCTATGTTGTCCCAAATG 2519

 31522080 ACAGGATTTTTTTTCTCTTTTAAGGCTGAATAGTATTCCATTATGTATATACACCACATT 31522139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 ACAGGATTTTTTTTCTCTTTTAAGGCTGAATAGTATTCCATTATGTATATACACCACATT 2579

 31522140 TGCATTATCCATTCATCCACTGATGGCCCCTTAGGTTGATTCTATATCTTGGCTATTGTG 31522199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 TGCATTATCCATTCATCCACTGATGGCCCCTTAGGTTGATTCTATATCTTGGCTATTGTG 2639

 31522200 AAAAGTGCTGCAATGAACATGGGAGTGCAGGTATTTCTTTGACATATTGATATGACATAT 31522259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 AAAAGTGCTGCAATGAACATGGGAGTGCAGGTATTTCTTTGACATATTGATATGACATAT 2699

 31522260 TGATCTCTTTTGGATATATACCCAGAAGTGGAATTGCTAGATCATATAGTAGTTCTAATT 31522319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 TGATCTCTTTTGGATATATACCCAGAAGTGGAATTGCTAGATCATATAGTAGTTCTAATT 2759

 31522320 TTAGTTTTTTGAGGAAACCCCATACTATTTCTCGTAGTGGTTGATATGGTTTGGTTGTGT 31522379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 TTAGTTTTTTGAGGAAACCCCATACTATTTCTCGTAGTGGTTGATATGGTTTGGTTGTGT 2819

 31522380 CCCCACACAAATCTCATCTTGAATTGTAGCTCTCATAATCCCCAGCTGTCGTGGGAGGGA 31522439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2820 CCCCACACAAATCTCATCTTGAATTGTAGCTCTCATAATCCCCAGCTGTCGTGGGAGGGA 2879

 31522440 CCTGGTGGGAGGTAATTGAATCGTGGGGGTGGGTTTTTCCCACCATTCTAATGATAGTGA 31522499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2880 CCTGGTGGGAGGTAATTGAATCGTGGGGGTGGGTTTTTCCCACCATTCTAATGATAGTGA 2939

 31522500 ATAAGTCTCAAGAGATATGATGGCTTTATAAAGGGCAGTTCCCCTGCTCATGCTCTCTTG 31522559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2940 ATAAGTCTCAAGAGATATGATGGCTTTATAAAGGGCAGTTCCCCTGCTCATGCTCTCTTG 2999

 31522560 CCTGCTCCCATGTAAGACGTGCCTTTGCTCCTCTTTCACCTCTGCCATGATTGTGAGGCC 31522619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3000 CCTGCTCCCATGTAAGACGTGCCTTTGCTCCTCTTTCACCTCTGCCATGATTGTGAGGCC 3059

 31522620 TCCCCAGCCATGTGGAACTGTGAGTCCATTAAACCTTTACTTTATAAATTACCCAGTCTC 31522679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3060 TCCCCAGCCATGTGGAACTGTGAGTCCATTAAACCTTTACTTTATAAATTACCCAGTCTC 3119

 31522680 GGATATGTCTTTATTAGCAGCATGAGAACAGACCAATACAGTGGTTGTACTGATTTACAT 31522739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3120 GGATATGTCTTTATTAGCAGCATGAGAACAGACCAATACAGTGGTTGTACTGATTTACAT 3179

 31522740 TCCCTCCAACATTGTACAAGGGTTTTCTTTTTTCTGCCTCCTCACCAACACTTGTTTCTT 31522799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3180 TCCCTCCAACATTGTACAAGGGTTTTCTTTTTTCTGCCTCCTCACCAACACTTGTTTCTT 3239

 31522800 GTCTTTTTGATAACATCTAATCTAACAGATGTAAGATGATATCTCATTGTGGTTTAATTT 31522859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3240 GTCTTTTTGATAACATCTAATCTAACAGATGTAAGATGATATCTCATTGTGGTTTAATTT 3299

 31522860 GTTTTTCCTAATGATTAGTGGTGCTCAGCATTTTTTTTCTTGAACCTGTTGGCCATTTGA 31522919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3300 GTTTTTCCTAATGATTAGTGGTGCTCAGCATTTTTTTTCTTGAACCTGTTGGCCATTTGA 3359

 31522920 ATGTCTTCTTTTGAGAAATGTCTCTTTGGATGCTTTCTCCATTTTCTCTTCTCTTCTCTT 31522979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3360 ATGTCTTCTTTTGAGAAATGTCTCTTTGGATGCTTTCTCCATTTTCTCTTCTCTTCTCTT 3419

 31522980 TTCTTTCTTTCTTTCTTTC 31522998
          |||||||||||||||||||
     3420 TTCTTTCTTTCTTTCTTTC 3438

EXCISED REGION

 31522999 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGCGTTTTGCTCTTGTTGCCCGGGCTGGAG 31523058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3441 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGCGTTTTGCTCTTGTTGCCCGGGCTGGAG 3500

 31523059 TGCATTGATCCAATCTTGGCTCACTGCAACCCCCGCCTCCCGGGTTCAAGCAATTCTCCC 31523118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3501 TGCATTGATCCAATCTTGGCTCACTGCAACCCCCGCCTCCCGGGTTCAAGCAATTCTCCC 3560

 31523119 GCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGTGATTACAGGCACAGGCTACCACACCCGGCTAATTTTG 31523178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3561 GCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGTGATTACAGGCACAGGCTACCACACCCGGCTAATTTTG 3620

 31523179 TATTTTCAGTAGAGACGAGGTGTCACCTTGTTGGTCAGGCTGGTCCCGAACTCCTGACCT 31523238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3621 TATTTTCAGTAGAGACGAGGTGTCACCTTGTTGGTCAGGCTGGTCCCGAACTCCTGACCT 3680

 31523239 CAAGTGATCTGCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCA 31523298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3681 CAAGTGATCTGCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCA 3740

 31523299 CCTGGCCACTTTGCCTATTTTATTTTATTTTGAGATGGAGTTTTGCTCTTATTGCCCAGA 31523358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3741 CCTGGCCACTTTGCCTATTTTATTTTATTTTGAGATGGAGTTTTGCTCTTATTGCCCAGA 3800

 31523359 CTGGAGTGCAATGGCGCAATTGCAGCTCACCACAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCAAT 31523418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3801 CTGGAGTGCAATGGCGCAATTGCAGCTCACCACAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCAAT 3860

 31523419 TCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGGTGGGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCCAACTA 31523478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3861 TCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGGTGGGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCCAACTA 3920

 31523479 ATTTTGTAGTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCC 31523538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3921 ATTTTGTAGTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCC 3980

 31523539 TGACCTCAGGTGATCTGCCCACCTTGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGAGTGAGTGC 31523598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3981 TGACCTCAGGTGATCTGCCCACCTTGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGAGTGAGTGC 4040

 31523599 ACCTGGCCCACTTTGCTCATTTTCTAATTGGGTTATTCGTTTTCTGGCTATTGAGTTGTT 31523658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4041 ACCTGGCCCACTTTGCTCATTTTCTAATTGGGTTATTCGTTTTCTGGCTATTGAGTTGTT 4100

 31523659 TGAGTTTCTTATTTATTGTGGATGTTACTCCCTTATCAGATGTATGATTTACATATATTT 31523718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4101 TGAGTTTCTTATTTATTGTGGATGTTACTCCCTTATCAGATGTATGATTTACATATATTT 4160

 31523719 TCTGTCACTCTGTGGGTTATCTCTTTACTTTGTTCATTGTTTCCTTTCTGTCCAAAAGCT 31523778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4161 TCTGTCACTCTGTGGGTTATCTCTTTACTTTGTTCATTGTTTCCTTTCTGTCCAAAAGCT 4220

 31523779 TTGTATCTTGTCTAAAATCCCATTTGTCTATTTTTGCTTTTATTTATTTTTATTTTTATT 31523838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4221 TTGTATCTTGTCTAAAATCCCATTTGTCTATTTTTGCTTTTATTTATTTTTATTTTTATT 4280

 31523839 TTTATTTTTTATTTTTTTGAAACGGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGTTGGAGTGCAGTGG 31523898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4281 TTTATTTTTTATTTTTTTGAAACGGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGTTGGAGTGCAGTGG 4340

 31523899 TGCAATCTCAGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGGAAGTCTCCTACTCCAAC 31523958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4341 TGCAATCTCAGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGGAAGTCTCCTACTCCAAC 4400

 31523959 TTCCTGAGTAGCTGGGATTATAGGCGTGTGCCACCATGCCTAGCTAATTTTTGTATTTTT 31524018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4401 TTCCTGAGTAGCTGGGATTATAGGCGTGTGCCACCATGCCTAGCTAATTTTTGTATTTTT 4460

 31524019 TGGTAGAGACAGGATTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTGTTGAACTCTTGACCTCAGGCA 31524078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4461 TGGTAGAGACAGGATTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTGTTGAACTCTTGACCTCAGGCA 4520

 31524079 ATCCGCCTGACTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACACGTGTGAGCCACCGCGCCTGGC 31524138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4521 ATCCGCCTGACTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACACGTGTGAGCCACCGCGCCTGGC 4580

 31524139 CTATTTTTGCTTTTATTACCTGTGCTTTTGGGGTCATAGCTAAATAACCATTGCTCAGAT 31524198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4581 CTATTTTTGCTTTTATTACCTGTGCTTTTGGGGTCATAGCTAAATAACCATTGCTCAGAT 4640

 31524199 CAATGTCATGGAGCCTTTCCTCTAGGTATTCTTCTAGTTGTTTTACAGTCTCAGATCTTA 31524258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4641 CAATGTCATGGAGCCTTTCCTCTAGGTATTCTTCTAGTTGTTTTACAGTCTCAGATCTTA 4700

 31524259 TATTTAAGACTTTAATCCATTTTGAGTTGATTTTTTATACTGTGTGAGATAAGGATCCAA 31524318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4701 TATTTAAGACTTTAATCCATTTTGAGTTGATTTTTTATACTGTGTGAGATAAGGATCCAA 4760

 31524319 TTTTATTCTTCTGTATGTGGATCCAATTTTCCTAGTACAGTTTATTGAAAAGACTGTCTT 31524378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4761 TTTTATTCTTCTGTATGTGGATCCAATTTTCCTAGTACAGTTTATTGAAAAGACTGTCTT 4820

 31524379 TTCCCCATTATGTATTAGTAACACCTTTGTCAAAAATCAATTGACTATTAGTGCATGGGT 31524438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4821 TTCCCCATTATGTATTAGTAACACCTTTGTCAAAAATCAATTGACTATTAGTGCATGGGT 4880

 31524439 TTATTTCTGGGTTTTCTATCTTGTTACATTAGTCGATGTGTCTATTTTTATGCCAGCACC 31524498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4881 TTATTTCTGGGTTTTCTATCTTGTTACATTAGTCGATGTGTCTATTTTTATGCCAGCACC 4940

 31524499 ATACTGTTTTGATTATATTAGCTTTATAATATATTTTGAAATCAGGGACTGTGATGTCTT 31524558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4941 ATACTGTTTTGATTATATTAGCTTTATAATATATTTTGAAATCAGGGACTGTGATGTCTT 5000

 31524559 TAGCTTTGTTCTTTTTGCTCAAGATTGTTTTGGCTAGCCAGGGTCTTTTATGATTGCATA 31524618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5001 TAGCTTTGTTCTTTTTGCTCAAGATTGTTTTGGCTAGCCAGGGTCTTTTATGATTGCATA 5060

 31524619 TGAATTTAAGGATTGTTTTATTTCTATAAGAAATGACATTGGAATTTTGATAGGGACTGC 31524678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5061 TGAATTTAAGGATTGTTTTATTTCTATAAGAAATGACATTGGAATTTTGATAGGGACTGC 5120

 31524679 ATTGAATCTGTAGATTGCTTTGGGTAGTATGAATATTTTAATAATATTAATTCTTCTAAT 31524738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5121 ATTGAATCTGTAGATTGCTTTGGGTAGTATGAATATTTTAATAATATTAATTCTTCTAAT 5180

 31524739 TTATCAACACAAGATAGCTTTCCATTTATTTGTGTTTTCTTAAACAATGTTTTAGTTTCC 31524798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5181 TTATCAACACAAGATAGCTTTCCATTTATTTGTGTTTTCTTAAACAATGTTTTAGTTTCC 5240

 31524799 AGTGTACAGATCTTTTAACTTCTTGGTTAAATTTACCCCTAAGTATTTTATTTTATTTTA 31524858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5241 AGTGTACAGATCTTTTAACTTCTTGGTTAAATTTACCCCTAAGTATTTTATTTTATTTTA 5300

 31524859 AAATACCTGGCTAATTTTGTATTTAATTTTATATTGTATTTATTTTATTTGTAATAAAAT 31524918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5301 AAATACCTGGCTAATTTTGTATTTAATTTTATATTGTATTTATTTTATTTGTAATAAAAT 5360

 31524919 TAAGCATTTTATTTTATTTTAAAATACCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGG 31524978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5361 TAAGCATTTTATTTTATTTTAAAATACCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGG 5420

 31524979 TTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCAGACCTCAGGTGATCCGACTGCCTCG 31525038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5421 TTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCAGACCTCAGGTGATCCGACTGCCTCG 5480

 31525039 GCCTCCCAAAGTGCTGGTATTAGAAGCATGAGCCACTGCCCACTGCACCTAGCTGAAAAC 31525098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5481 GCCTCCCAAAGTGCTGGTATTAGAAGCATGAGCCACTGCCCACTGCACCTAGCTGAAAAC 5540

 31525099 CACACTTTCTGTTGATTAAATAATATTTCACCTTATGGAGTTACAAATTTTCATTTTATG 31525158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5541 CACACTTTCTGTTGATTAAATAATATTTCACCTTATGGAGTTACAAATTTTCATTTTATG 5600

 31525159 GGGTTATAATCACTTACTTAGCTTGTTATCTTTTGTTGGACATTAATGTGGTTTCTAACT 31525218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5601 GGGTTATAATCACTTACTTAGCTTGTTATCTTTTGTTGGACATTAATGTGGTTTCTAACT 5660

 31525219 TTTCATTATCAAAAAATAAAAGAAAATGGACAAAACCTCAGAAAGACACAAACTACTAAA 31525278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5661 TTTCATTATCAAAAAATAAAAGAAAATGGACAAAACCTCAGAAAGACACAAACTACTAAA 5720

 31525279 GCTGACTTAATAAGAAATAGAAAATCTGAATATATAGAAAATCTGAATGTAACAAGTAAG 31525338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5721 GCTGACTTAATAAGAAATAGAAAATCTGAATATATAGAAAATCTGAATGTAACAAGTAAG 5780

 31525339 GAGATTGGATTAGTAATAAAATTTCCCACAAAGAGAAGTACACATTCAGATGGTTTCACT 31525398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5781 GAGATTGGATTAGTAATAAAATTTCCCACAAAGAGAAGTACACATTCAGATGGTTTCACT 5840

 31525399 GGTAAATTCTACCAAATATTTAAAGATTTTTCTTTTTTTTTGTTGAGACAGAGTCTCACT 31525458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5841 GGTAAATTCTACCAAATATTTAAAGATTTTTCTTTTTTTTTGTTGAGACAGAGTCTCACT 5900

 31525459 CTATTGCCCAGGCTGGAGTACAATGGTGTGATCTTGACTCACTGCAACCTCTGCCTCCGG 31525518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5901 CTATTGCCCAGGCTGGAGTACAATGGTGTGATCTTGACTCACTGCAACCTCTGCCTCCGG 5960

 31525519 GGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCAC 31525578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5961 GGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCAC 6020

 31525579 CATGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCACATTGGCTAGGCT 31525638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6021 CATGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCACATTGGCTAGGCT 6080

 31525639 GGTCTCGAACTCCCAACCTCGTGATCCGCCCACCATGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAC 31525698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6081 GGTCTCGAACTCCCAACCTCGTGATCCGCCCACCATGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAC 6140

 31525699 AGGCGTGAGCCACCACACCTGGCTAAAGAATTAATGTCAATTGCTCACAAACTCTTCCAA 31525758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6141 AGGCGTGAGCCACCACACCTGGCTAAAGAATTAATGTCAATTGCTCACAAACTCTTCCAA 6200

 31525759 AAGAGTTCTCTATGAGGCCAGTATTACCTTGATACCAAAACCAGATAAAGATATCACAGG 31525818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6201 AAGAGTTCTCTATGAGGCCAGTATTACCTTGATACCAAAACCAGATAAAGATATCACAGG 6260

 31525819 AAAATAAAACTGTAGACCAAATATTTTTATGAATATAGATACAAAAATCTTCAAAATACT 31525878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6261 AAAATAAAACTGTAGACCAAATATTTTTATGAATATAGATACAAAAATCTTCAAAATACT 6320

 31525879 AGCAAATTGAAACCAACAACATATGAAAATGATTATACACCATGACCAAGTAAGATTTAT 31525938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6321 AGCAAATTGAAACCAACAACATATGAAAATGATTATACACCATGACCAAGTAAGATTTAT 6380

 31525939 CCCAGGAATGCAAAGTTGGCTAAATATCCAAAATCAATTAATGTAATACACCATATTAAC 31525998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6381 CCCAGGAATGCAAAGTTGGCTAAATATCCAAAATCAATTAATGTAATACACCATATTAAC 6440

 31525999 TGAATAAAAAACAAAAGCCATATGATTATGCCAATAGATGCAAAAAGAGCATTTAACAAA 31526058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6441 TGAATAAAAAACAAAAGCCATATGATTATGCCAATAGATGCAAAAAGAGCATTTAACAAA 6500

 31526059 ATTGAACACCGTTTTCTGATTGAAACACCCAATAAACTAGAAATAGAAACTCCTTCAACC 31526118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6501 ATTGAACACCGTTTTCTGATTGAAACACCCAATAAACTAGAAATAGAAACTCCTTCAACC 6560

 31526119 T 31526119
          |
     6561 T 6561

Alignment time is 5.45933 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31515486,31539389] =>     23904 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    9070] =>      9070 nucs 'mol-32-321f-232235_9070'

Score:        8975
Aligned:      9072        nucs
Identic:      9055 (100%) nucs =>      3851 (100%)      5204 (100%)
Gaps:           12 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31521632,31525486] EXCISED REGION [31529390,31534605]
 second seq =>  [       1,    3856] EXCISED REGION [    3866,    9070]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3903 nucs [31525487,31529389]
 second seq =>         9 nucs [3857,3865]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31521632 AAATTAGCCAGGCATGGTGATGCGTGCCTGTAATCCCAGCTACTCTGGAGGCTGAGGCAA 31521691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAATTAGCCAGGCATGGTGATGCGTGCCTGTAATCCCAGCTACTCTGGAGGCTGAGGCAA 60

 31521692 GAAATCACTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGGTTGCGCCACTGCACTT 31521751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAAATCACTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGGTTGCGCCACTGCACTT 120

 31521752 CAGCCTGGGCAACAAAGTGAGACTCCGTCTCAAAAAATCAATCAATCAAATCAAAGCAAA 31521811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAGCCTGGGCAACAAAGTGAGACTCCGTCTCAAAAAATCAATCAATCAAATCAAAGCAAA 180

 31521812 TCAAAAACTTTTTTTTTTTTTTT-GTAGAGATGAGGTCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTG 31521870
          ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCAAAAACTTTTTTTTTTTTTTTTGTAGAGATGAGGTCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTG 240

 31521871 AACTCCTGGGCTCAAGGAATCCTCCTGCCTTGACCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTG 31521930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AACTCCTGGGCTCAAGGAATCCTCCTGCCTTGACCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTG 300

 31521931 TGAGCCACCGTGCCCAGCCCTTTCTACTTCTATGAGTTTGACTTTTTATAATTCCATATA 31521990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGAGCCACCGTGCCCAGCCCTTTCTACTTCTATGAGTTTGACTTTTTATAATTCCATATA 360

 31521991 TAAATACAATCATGCAGTATTTTTCTTTCATGACTGGCTTATTTCACTTACCATAATGTC 31522050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TAAATACAATCATGCAGTATTTTTCTTTCATGACTGGCTTATTTCACTTACCATAATGTC 420

 31522051 TTCCAGATTAATCTATGTTGTCCCAAATGACAGGATTTTTTTTCTCTTTTAAGGCTGAAT 31522110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTCCAGATTAATCTATGTTGTCCCAAATGACAGGATTTTTTTTCTCTTTTAAGGCTGAAT 480

 31522111 AGTATTCCATTATGTATATACACCACATTTGCATTATCCATTCATCCACTGATGGCCCCT 31522170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGTATTCCATTATGTATATACACCACATTTGCATTATCCATTCATCCACTGATGGCCCCT 540

 31522171 TAGGTTGATTCTATATCTTGGCTATTGTGAAAAGTGCTGCAATGAACATGGGAGTGCAGG 31522230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TAGGTTGATTCTATATCTTGGCTATTGTGAAAAGTGCTGCAATGAACATGGGAGTGCAGG 600

 31522231 TATTTCTTTGACATATTGATATGACATATTGATCTCTTTTGGATATATACCCAGAAGTGG 31522290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TATTTCTTTGACATATTGATATGACATATTGATCTCTTTTGGATATATACCCAGAAGTGG 660

 31522291 AATTGCTAGATCATATAGTAGTTCTAATTTTAGTTTTTTGAGGAAACCCCATACTATTTC 31522350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AATTGCTAGATCATATAGTAGTTCTAATTTTAGTTTTTTGAGGAAACCCCATACTATTTC 720

 31522351 TCGTAGTGGTTGATATGGTTTGGTTGTGTCCCCACACAAATCTCATCTTGAATTGTAGCT 31522410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCGTAGTGGTTGATATGGTTTGGTTGTGTCCCCACACAAATCTCATCTTGAATTGTAGCT 780

 31522411 CTCATAATCCCCAGCTGTCGTGGGAGGGACCTGGTGGGAGGTAATTGAATCGTGGGGGTG 31522470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTCATAATCCCCAGCTGTCGTGGGAGGGACCTGGTGGGAGGTAATTGAATCGTGGGGGTG 840

 31522471 GGTTTTTCCCACCATTCTAATGATAGTGAATAAGTCTCAAGAGATATGATGGCTTTATAA 31522530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GGTTTTTCCCACCATTCTAATGATAGTGAATAAGTCTCAAGAGATATGATGGCTTTATAA 900

 31522531 AGGGCAGTTCCCCTGCTCATGCTCTCTTGCCTGCTCCCATGTAAGACGTGCCTTTGCTCC 31522590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGGGCAGTTCCCCTGCTCATGCTCTCTTGCCTGCTCCCATGTAAGACGTGCCTTTGCTCC 960

 31522591 TCTTTCACCTCTGCCATGATTGTGAGGCCTCCCCAGCCATGTGGAACTGTGAGTCCATTA 31522650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TCTTTCACCTCTGCCATGATTGTGAGGCCTCCCCAGCCATGTGGAACTGTGAGTCCATTA 1020

 31522651 AACCTTTACTTTATAAATTACCCAGTCTCGGATATGTCTTTATTAGCAGCATGAGAACAG 31522710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AACCTTTACTTTATAAATTACCCAGTCTCGGATATGTCTTTATTAGCAGCATGAGAACAG 1080

 31522711 ACCAATACAGTGGTTGTACTGATTTACATTCCCTCCAACATTGTACAAGGGTTTTCTTTT 31522770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ACCAATACAGTGGTTGTACTGATTTACATTCCCTCCAACATTGTACAAGGGTTTTCTTTT 1140

 31522771 TTCTGCCTCCTCACCAACACTTGTTTCTTGTCTTTTTGATAACATCTAATCTAACAGATG 31522830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTCTGCCTCCTCACCAACACTTGTTTCTTGTCTTTTTGATAACATCTAATCTAACAGATG 1200

 31522831 TAAGATGATATCTCATTGTGGTTTAATTTGTTTTTCCTAATGATTAGTGGTGCTCAGCAT 31522890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TAAGATGATATCTCATTGTGGTTTAATTTGTTTTTCCTAATGATTAGTGGTGCTCAGCAT 1260

 31522891 TTTTTTTCTTGAACCTGTTGGCCATTTGAATGTCTTCTTTTGAGAAATGTCTCTTTGGAT 31522950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTTTTTTCTTGAACCTGTTGGCCATTTGAATGTCTTCTTTTGAGAAATGTCTCTTTGGAT 1320

 31522951 GCTTTCTCCATTTTCTCTTCTCTTCTCTTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTT 31523010
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     1321 GCTTTCTCCATTTTCTCTTCTCTTCTCTTTTCTTTCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTT 1380

 31523011 TTTTTTTTTTTTTGAGATGGCGTTTTGCTCTTGTTGCCCGGGCTGGAGTGCATTGATCCA 31523070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTTTTTTTTTTTTGAGATGGCGTTTTGCTCTTGTTGCCCGGGCTGGAGTGCATTGATCCA 1440

 31523071 ATCTTGGCTCACTGCAACCCCCGCCTCCCGGGTTCAAGCAATTCTCCCGCCTCAGCCTCC 31523130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATCTTGGCTCACTGCAACCCCCGCCTCCCGGGTTCAAGCAATTCTCCCGCCTCAGCCTCC 1500

 31523131 TGAGTAGCTGTGATTACAGGCACAGGCTACCACACCCGGCTAATTTTGTATTTTCAGTAG 31523190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TGAGTAGCTGTGATTACAGGCACAGGCTACCACACCCGGCTAATTTTGTATTTTCAGTAG 1560

 31523191 AGACGAGGTGTCACCTTGTTGGTCAGGCTGGTCCCGAACTCCTGACCTCAAGTGATCTGC 31523250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AGACGAGGTGTCACCTTGTTGGTCAGGCTGGTCCCGAACTCCTGACCTCAAGTGATCTGC 1620

 31523251 CCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGCCACTTT 31523310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGCCACTTT 1680

 31523311 GCCTATTTTATTTTATTTTGAGATGGAGTTTTGCTCTTATTGCCCAGACTGGAGTGCAAT 31523370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GCCTATTTTATTTTATTTTGAGATGGAGTTTTGCTCTTATTGCCCAGACTGGAGTGCAAT 1740

 31523371 GGCGCAATTGCAGCTCACCACAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCA 31523430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GGCGCAATTGCAGCTCACCACAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCA 1800

 31523431 GCCTCCCAAGTAGGTGGGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCCAACTAATTTTGTAGTTT 31523490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GCCTCCCAAGTAGGTGGGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCCAACTAATTTTGTAGTTT 1860

 31523491 TAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTG 31523550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTG 1920

 31523551 ATCTGCCCACCTTGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGAGTGAGTGCACCTGGCCCACT 31523610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ATCTGCCCACCTTGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGAGTGAGTGCACCTGGCCCACT 1980

 31523611 TTGCTCATTTTCTAATTGGGTTATTCGTTTTCTGGCTATTGAGTTGTTTGAGTTTCTTAT 31523670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TTGCTCATTTTCTAATTGGGTTATTCGTTTTCTGGCTATTGAGTTGTTTGAGTTTCTTAT 2040

 31523671 TTATTGTGGATGTTACTCCCTTATCAGATGTATGATTTACATATATTTTCTGTCACTCTG 31523730
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     2041 TTATTGTGGATGTTACTCCCTTATCAGATGTATGATTTACATATATTTTCTGTCACTTTG 2100

 31523731 TGGGTTATCTCTTTACTTTGTTCATTGTTTCCTTTCTGTCCAAAAGCTTTGTATCTTGTC 31523790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TGGGTTATCTCTTTACTTTGTTCATTGTTTCCTTTCTGTCCAAAAGCTTTGTATCTTGTC 2160

 31523791 TAAAATCCCATTTGTCTATTTTTGCTTTTATTTATTTTTATTTTTATTTTTATTTTTTAT 31523850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TAAAATCCCATTTGTCTATTTTTGCTTTTATTTATTTTTATTTTTATTTTTATTTTTTAT 2220

 31523851 TTTTTTGAAACGGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGTTGGAGTGCAGTGGTGCAATCTCAGC 31523910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TTTTTTGAAACGGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGTTGGAGTGCAGTGGTGCAATCTCAGC 2280

 31523911 TCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGGAAGTCTCCTACTCCAACTTCCTGAGTAGC 31523970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGGAAGTCTCCTACTCCAACTTCCTGAGTAGC 2340

 31523971 TGGGATTATAGGCGTGTGCCACCATGCCTAGCTAATTTTTGTATTTTTTGGTAGAGACAG 31524030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TGGGATTATAGGCGTGTGCCACCATGCCTAGCTAATTTTTGTATTTTTTGGTAGAGACAG 2400

 31524031 GATTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTGTTGAACTCTTGACCTCAGGCAATCCGCCTGACT 31524090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GATTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTGTTGAACTCTTGACCTCAGGCAATCCGCCTGACT 2460

 31524091 CAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACACGTGTGAGCCACCGCGCCTGGCCTATTTTTGCTT 31524150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACACGTGTGAGCCACCGCGCCTGGCCTATTTTTGCTT 2520

 31524151 TTATTACCTGTGCTTTTGGGGTCATAGCTAAATAACCATTGCTCAGATCAATGTCATGGA 31524210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TTATTACCTGTGCTTTTGGGGTCATAGCTAAATAACCATTGCTCAGATCAATGTCATGGA 2580

 31524211 GCCTTTCCTCTAGGTATTCTTCTAGTTGTTTTACAGTCTCAGATCTTATATTTAAGACTT 31524270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GCCTTTCCTCTAGGTATTCTTCTAGTTGTTTTACAGTCTCAGATCTTATATTTAAGACTT 2640

 31524271 TAATCCATTTTGAGTTGATTTTTTATACTGTGTGAGATAAGGATCCAATTTTATTCTTCT 31524330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TAATCCATTTTGAGTTGATTTTTTATACTGTGTGAGATAAGGATCCAATTTTATTCTTCT 2700

 31524331 GTATGTGGATCCAATTTTCCTAGTACAGTTTATTGAAAAGACTGTCTTTTCCCCATTATG 31524390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GTATGTGGATCCAATTTTCCTAGTACAGTTTATTGAAAAGACTGTCTTTTCCCCATTATG 2760

 31524391 TATTAGTAACACCTTTGTCAAAAATCAATTGACTATTAGTGCATGGGTTTATTTCTGGGT 31524450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TATTAGTAACACCTTTGTCAAAAATCAATTGACTATTAGTGCATGGGTTTATTTCTGGGT 2820

 31524451 TTTCTATCTTGTTACATTAGTCGATGTGTCTATTTTTATGCCAGCACCATACTGTTTTGA 31524510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TTTCTATCTTGTTACATTAGTCGATGTGTCTATTTTTATGCCAGCACCATACTGTTTTGA 2880

 31524511 TTATATTAGCTTTATAATATATTTTGAAATCAGGGACTGTGATGTCTTTAGCTTTGTTCT 31524570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TTATATTAGCTTTATAATATATTTTGAAATCAGGGACTGTGATGTCTTTAGCTTTGTTCT 2940

 31524571 TTTTGCTCAAGATTGTTTTGGCTAGCCAGGGTCTTTTATGATTGCATATGAATTTAAGGA 31524630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TTTTGCTCAAGATTGTTTTGGCTAGCCAGGGTCTTTTATGATTGCATATGAATTTAAGGA 3000

 31524631 TTGTTTTATTTCTATAAGAAATGACATTGGAATTTTGATAGGGACTGCATTGAATCTGTA 31524690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TTGTTTTATTTCTATAAGAAATGACATTGGAATTTTGATAGGGACTGCATTGAATCTGTA 3060

 31524691 GATTGCTTTGGGTAGTATGAATATTTTAATAATATTAATTCTTCTAATTTATCAACACAA 31524750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 GATTGCTTTGGGTAGTATGAATATTTTAATAATATTAATTCTTCTAATTTATCAACACAA 3120

 31524751 GATAGCTTTCCATTTATTTGTGTTTTCTTAAACAATGTTTTAGTTTCCAGTGTACAGATC 31524810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 GATAGCTTTCCATTTATTTGTGTTTTCTTAAACAATGTTTTAGTTTCCAGTGTACAGATC 3180

 31524811 TTTTAACTTCTTGGTTAAATTTACCCCTAAGTATTTTATTTTATTTTAAAATACCTGGCT 31524870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TTTTAACTTCTTGGTTAAATTTACCCCTAAGTATTTTATTTTATTTTAAAATACCTGGCT 3240

 31524871 AATTTTGTATTTAATTTTATATTGTATTTATTTTATTTGTAATAAAATTAAGCATTTTAT 31524930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 AATTTTGTATTTAATTTTATATTGTATTTATTTTATTTGTAATAAAATTAAGCATTTTAT 3300

 31524931 TTTATTTTAAAATACCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTT 31524990
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     3301 TTTATTTTAAAATACCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGATAGGGTTTCTCCATGTT 3360

 31524991 GGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCAGACCTCAGGTGATCCGACTGCCTCGGCCTCCCAAAGT 31525050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 GGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCAGACCTCAGGTGATCCGACTGCCTCGGCCTCCCAAAGT 3420

 31525051 GCTGGTATTAGAAGCATGAGCCACTGCCCACTGCACCTAGCTGAAAACCACACTTTCTGT 31525110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 GCTGGTATTAGAAGCATGAGCCACTGCCCACTGCACCTAGCTGAAAACCACACTTTCTGT 3480

 31525111 TGATTAAATAATATTTCACCTTATGGAGTTACAAATTTTCATTTTATGGGGTTATAATCA 31525170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TGATTAAATAATATTTCACCTTATGGAGTTACAAATTTTCATTTTATGGGGTTATAATCA 3540

 31525171 CTTACTTAGCTTGTTATCTTTTGTTGGACATTAATGTGGTTTCTAACTTTTCATTATCAA 31525230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 CTTACTTAGCTTGTTATCTTTTGTTGGACATTAATGTGGTTTCTAACTTTTCATTATCAA 3600

 31525231 AAAATAAAAGAAAATGGACAAAACCTCAGAAAGACACAAACTACTAAAGCTGACTTAATA 31525290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 AAAATAAAAGAAAATGGACAAAACCTCAGAAAGACACAAACTACTAAAGCTGACTTAATA 3660

 31525291 AGAAATAGAAAATCTGAATATATAGAAAATCTGAATGTAACAAGTAAGGAGATTGGATTA 31525350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 AGAAATAGAAAATCTGAATATATAGAAAATCTGAATGTAACAAGTAAGGAGATTGGATTA 3720

 31525351 GTAATAAAATTTCCCACAAAGAGAAGTACACATTCAGATGGTTTCACTGGTAAATTCTAC 31525410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 GTAATAAAATTTCCCACAAAGAGAAGTACACATTCAGATGGTTTCACTGGTAAATTCTAC 3780

 31525411 CAAATATTTAAAGATTTTTCTTTTTTTTTGTTGAGACAGAGTCTCACTCTATTGCCCAGG 31525470
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     3781 CAAATATTTAAAGATTTTTCTTTTTTTTTGTTGAGGCAGAGTCTCACTCTATTGCCCAGG 3840

 31525471 CTGGAGTACAATGGTG 31525486
          ||||||||||||||||
     3841 CTGGAGTACAATGGTG 3856

EXCISED REGION

 31529390 AATACTGTGCTAAGTGAAAGAAGCCAACCACAAAATACCATATATTGTGTGATTCTGCTT 31529449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3866 AATACTGTGCTAAGTGAAAGAAGCCAACCACAAAATACCATATATTGTGTGATTCTGCTT 3925

 31529450 AAATGACATGTCCAGAATGTCCATATTAAAGTAGATTAGTGGTTTCCTGAGGCTGGGGGA 31529509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3926 AAATGACATGTCCAGAATGTCCATATTAAAGTAGATTAGTGGTTTCCTGAGGCTGGGGGA 3985

 31529510 GGGAGTTGGGGAAATTGCGTAGTGACTACTGGGTAAAGAGTTTCTTTCTGGGGTGATGAA 31529569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3986 GGGAGTTGGGGAAATTGCGTAGTGACTACTGGGTAAAGAGTTTCTTTCTGGGGTGATGAA 4045

 31529570 ATGGTCTAAAATAGAATGTGGTGGTGGTTGCACAGCTCTGAAAATACTAAAAACCATTGA 31529629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4046 ATGGTCTAAAATAGAATGTGGTGGTGGTTGCACAGCTCTGAAAATACTAAAAACCATTGA 4105

 31529630 ATGAGCACTTTAAATTGGTAAATTTTTATGTGAATTATGATTCAATAAAGTTGTGTTTAG 31529689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4106 ATGAGCACTTTAAATTGGTAAATTTTTATGTGAATTATGATTCAATAAAGTTGTGTTTAG 4165

 31529690 ATATTACTAAAAATGATGGTACAAATATTCTTTTTCACAAATGTTTTTTGTTGTTGTTTA 31529749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4166 ATATTACTAAAAATGATGGTACAAATATTCTTTTTCACAAATGTTTTTTGTTGTTGTTTA 4225

 31529750 TAGTTGTTTATTTGTACATCTAGTAATTTGTCCCAAGGAAAGAGTATGTAAAAGAACATA 31529809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4226 TAGTTGTTTATTTGTACATCTAGTAATTTGTCCCAAGGAAAGAGTATGTAAAAGAACATA 4285

 31529810 AGTCACTTTAAGGCCTTTAATGTATACTACAAAATTGCACTCTAGAAGGTTTATACAGTT 31529869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4286 AGTCACTTTAAGGCCTTTAATGTATACTACAAAATTGCACTCTAGAAGGTTTATACAGTT 4345

 31529870 TTGCATTTCATTAGCCTGTTTTTTTTATCTTTGACAACCTAAAGAATTTATTAGTGGTAT 31529929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4346 TTGCATTTCATTAGCCTGTTTTTTTTATCTTTGACAACCTAAAGAATTTATTAGTGGTAT 4405

 31529930 TCATCTGAGGATCCTCTAGGTCTATCAGAGTGTCTTTCTTATAGAAGGCATTCAATAAAT 31529989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4406 TCATCTGAGGATCCTCTAGGTCTATCAGAGTGTCTTTCTTATAGAAGGCATTCAATAAAT 4465

 31529990 AAATGTCCTAAGTGAGCAAAACATTTTTGGTTGATTTTTAGGTGCAAATGGTTTCTTTTG 31530049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4466 AAATGTCCTAAGTGAGCAAAACATTTTTGGTTGATTTTTAGGTGCAAATGGTTTCTTTTG 4525

 31530050 ATTTTAATTAAGATGCCTTTGTTTATTAGTGATGTTGACATATTTTCTTAATCTATTGGC 31530109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4526 ATTTTAATTAAGATGCCTTTGTTTATTAGTGATGTTGACATATTTTCTTAATCTATTGGC 4585

 31530110 TTTGTATAACTTTATGAATTGTCTCTTCATGTCCTTTGCCTACTTTTCTATTGTGGTAAC 31530169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4586 TTTGTATAACTTTATGAATTGTCTCTTCATGTCCTTTGCCTACTTTTCTATTGTGGTAAC 4645

 31530170 TATCTTTTATAAATGTTGTATAATTATTTAAAAATACATTAGGTTGGGCATGGTAGATCA 31530229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4646 TATCTTTTATAAATGTTGTATAATTATTTAAAAATACATTAGGTTGGGCATGGTAGATCA 4705

 31530230 TGCCTGTAATCCCAGCTCTCTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATTGCTTGAGCCTAACAGTT 31530289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4706 TGCCTGTAATCCCAGCTCTCTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATTGCTTGAGCCTAACAGTT 4765

 31530290 CGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCCATCTCTAAAAAAAAAAACCAATAAAAAT 31530349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4766 CGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCCATCTCTAAAAAAAAAAACCAATAAAAAT 4825

 31530350 ATATTAAAAGATTAACTGATTGTCTATCATATGGATTACAAATATCCCCCCCAATTTGTC 31530409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4826 ATATTAAAAGATTAACTGATTGTCTATCATATGGATTACAAATATCCCCCCCAATTTGTC 4885

 31530410 ATTTGCTTGTTAATTTTATTTATGATGACTTAAAAATTACAATATATTTTTTGGTGTTCA 31530469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4886 ATTTGCTTGTTAATTTTATTTATGATGACTTAAAAATTACAATATATTTTTTGGTGTTCA 4945

 31530470 AGTCAGTTTTTGTCCCCATTGTGATATTTTCCTTTGCCTGTTTATCACTTTCTTAGAGAA 31530529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4946 AGTCAGTTTTTGTCCCCATTGTGATATTTTCCTTTGCCTGTTTATCACTTTCTTAGAGAA 5005

 31530530 AAGATAAATACTGATTCGTTCTTTTGTAGGTGTTTTATGATTTCATTGAAAATAAAATCT 31530589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5006 AAGATAAATACTGATTCGTTCTTTTGTAGGTGTTTTATGATTTCATTGAAAATAAAATCT 5065

 31530590 TCAACGCATCTAGTATTCATTTGGGTGTAAGATAAAAGATAACAACGTAGGTTTCTCTTA 31530649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5066 TCAACGCATCTAGTATTCATTTGGGTGTAAGATAAAAGATAACAACGTAGGTTTCTCTTA 5125

 31530650 TAGTTCATCAGGTATCCTACTACTGTTTATTGAGTCATGTTTTCTGTTACCACTCTTACT 31530709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5126 TAGTTCATCAGGTATCCTACTACTGTTTATTGAGTCATGTTTTCTGTTACCACTCTTACT 5185

 31530710 ATATACCAGTTTTACATACATTTGGGTTGGTTTCTGAGCTTTCTATTGTCTTCCATTGCT 31530769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5186 ATATACCAGTTTTACATACATTTGGGTTGGTTTCTGAGCTTTCTATTGTCTTCCATTGCT 5245

 31530770 TTGTTTAAAATTTAAAGTTTATTATTCTGACTTTCCATACTTGAATATGGTCGAATAAGT 31530829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5246 TTGTTTAAAATTTAAAGTTTATTATTCTGACTTTCCATACTTGAATATGGTCGAATAAGT 5305

 31530830 CCTCCTTTATTAATCTTGTTTTATTTAAAAATGGTCATTTTCACTCATTTTCCAGTTCAG 31530889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5306 CCTCCTTTATTAATCTTGTTTTATTTAAAAATGGTCATTTTCACTCATTTTCCAGTTCAG 5365

 31530890 TAGTTTTATTCTCTCAGTGTAATGTGATTTATCACCCCATTGCTCACCCTATTCATCTCC 31530949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5366 TAGTTTTATTCTCTCAGTGTAATGTGATTTATCACCCCATTGCTCACCCTATTCATCTCC 5425

 31530950 CAATACCCAGCTGAAAAACTTTAGAAGACTGAGGCTCTTGCCCTGGCCCCATCACTTTCT 31531009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5426 CAATACCCAGCTGAAAAACTTTAGAAGACTGAGGCTCTTGCCCTGGCCCCATCACTTTCT 5485

 31531010 AGCTATGTGGGCTTAGGCTAGTTATTGAACATGTCTGACTCTCACTTTTCTCCTCTGTAA 31531069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5486 AGCTATGTGGGCTTAGGCTAGTTATTGAACATGTCTGACTCTCACTTTTCTCCTCTGTAA 5545

 31531070 GTCAGTGAGAATTATATACTTCTTATAAGGTTGTGAGGTTCAAATGGAATAATGTGTACA 31531129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5546 GTCAGTGAGAATTATATACTTCTTATAAGGTTGTGAGGTTCAAATGGAATAATGTGTACA 5605

 31531130 GAGGCACTTGGTAAACAATGTAGTCATATGCAAGTCATATGCAAGTCATATGTAGTCAGC 31531189
          |||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||
     5606 GAGGCACTTGGTAAACAATGT-----------AGTCATATGCAAGTCATATGTAGTCAGC 5654

 31531190 TTGGTGAATTTTGAGAAAGTAAATGCAAGTTCTTTTTATGGTTTTACCTAAGGGGCCAGT 31531249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5655 TTGGTGAATTTTGAGAAAGTAAATGCAAGTTCTTTTTATGGTTTTACCTAAGGGGCCAGT 5714

 31531250 GAGGGCCAGAGAAGTGCCGGGACCTATGTAAGGTCGCAAGCAAGTTCATGTGGAATGCAT 31531309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5715 GAGGGCCAGAGAAGTGCCGGGACCTATGTAAGGTCGCAAGCAAGTTCATGTGGAATGCAT 5774

 31531310 CTAGAACTAGAACGCTAGCCTGTGTCCCAGGGCCCTTCCAACTGGGCTCTGCTGCCTGCA 31531369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5775 CTAGAACTAGAACGCTAGCCTGTGTCCCAGGGCCCTTCCAACTGGGCTCTGCTGCCTGCA 5834

 31531370 GTCCTGGGTGCCTTCTAATTAGCCTGTGTAGTGGTCTTGGTAAAAGTGTTTCTCCTGTAC 31531429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5835 GTCCTGGGTGCCTTCTAATTAGCCTGTGTAGTGGTCTTGGTAAAAGTGTTTCTCCTGTAC 5894

 31531430 TGTCCCCTATAGGTTGTGGCTGGCCATACCATTTCCCTGGTTCCCCCCACGCTCCTGATG 31531489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5895 TGTCCCCTATAGGTTGTGGCTGGCCATACCATTTCCCTGGTTCCCCCCACGCTCCTGATG 5954

 31531490 ACCTGGAAAGGCCATTTGAATAGTGTGGCAGACATCCTGTATGTGGACAACTTCCAGCTG 31531549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5955 ACCTGGAAAGGCCATTTGAATAGTGTGGCAGACATCCTGTATGTGGACAACTTCCAGCTG 6014

 31531550 GTTATCAGCGCTGGCCAGGACCGGGACGTCAAGGCTTGGAAACTCTCCGGTGATGCCATT 31531609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6015 GTTATCAGCGCTGGCCAGGACCGGGACGTCAAGGCTTGGAAACTCTCCGGTGATGCCATT 6074

 31531610 GGTATGGGTCCTGCTGAAGCTCAGCCATGCCCATGGCCCTTCTTGTCTCTGTCCCTGTCT 31531669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6075 GGTATGGGTCCTGCTGAAGCTCAGCCATGCCCATGGCCCTTCTTGTCTCTGTCCCTGTCT 6134

 31531670 GAACATAAGCTGGTATGAACTTTGTACTCTGTGGGGAGGGACTCTCAGGCCACAGCAACT 31531729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6135 GAACATAAGCTGGTATGAACTTTGTACTCTGTGGGGAGGGACTCTCAGGCCACAGCAACT 6194

 31531730 GCCTTCACTTAAATAATATTACAGTCTGTCCAATTATCCATTCAGCAAACGGTCCATCCA 31531789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6195 GCCTTCACTTAAATAATATTACAGTCTGTCCAATTATCCATTCAGCAAACGGTCCATCCA 6254

 31531790 TTCACCCATCCACCCAATATTATTCACCTATGTATATTTTTGCAAATCATATATCTGATA 31531849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6255 TTCACCCATCCACCCAATATTATTCACCTATGTATATTTTTGCAAATCATATATCTGATA 6314

 31531850 AAGCATATTCCTTTCTCTTTTAAAAAATAAACTTAATTGTTGCATTGTATATAAAGAAAA 31531909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6315 AAGCATATTCCTTTCTCTTTTAAAAAATAAACTTAATTGTTGCATTGTATATAAAGAAAA 6374

 31531910 ACATACAAACCAGAAGGGTTCAGCTTGGTGAATTTTGAGAAAGTAAATACATACCCATAT 31531969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6375 ACATACAAACCAGAAGGGTTCAGCTTGGTGAATTTTGAGAAAGTAAATACATACCCATAT 6434

 31531970 AGCCACCGTTCATGTCAAGAAATAATTAGGGCCAGGCGCGGTGGCTCACTACTGTAATCC 31532029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6435 AGCCACCGTTCATGTCAAGAAATAATTAGGGCCAGGCGCGGTGGCTCACTACTGTAATCC 6494

 31532030 CAACACTTTTTTGTCCCCTTTTCCTCCTGTGCTGTCTTCCTATGTGTTTGTTTGTTTGTT 31532089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6495 CAACACTTTTTTGTCCCCTTTTCCTCCTGTGCTGTCTTCCTATGTGTTTGTTTGTTTGTT 6554

 31532090 TTAGTGACCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGTGCATGCCTGT 31532149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6555 TTAGTGACCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGTGCATGCCTGT 6614

 31532150 AATCCCAGCTACTTGAGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGTTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTT 31532209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6615 AATCCCAGCTACTTGAGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGTTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTT 6674

 31532210 GCAGTGAGCTGAGATCATGTCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGACTCTGTCT 31532269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6675 GCAGTGAGCTGAGATCATGTCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGACTCTGTCT 6734

 31532270 AAAAAAAAAATAATAATAAAAATAAAGTGACTTATGTGCCACTATTACAGTATTACAGCA 31532329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6735 AAAAAAAAAATAATAATAAAAATAAAGTGACTTATGTGCCACTATTACAGTATTACAGCA 6794

 31532330 TTCTGTATTTTTCTATGTGTTTACATTTATCAGAAAGCTTTGTATTTTCATATGCTTTCA 31532389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6795 TTCTGTATTTTTCTATGTGTTTACATTTATCAGAAAGCTTTGTATTTTCATATGCTTTCA 6854

 31532390 TGTTCCTGCCTAGCATCCTTTTGTTTCAACTTGAAGGGGTCCCTTTAGCATTTCTTTAAA 31532449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6855 TGTTCCTGCCTAGCATCCTTTTGTTTCAACTTGAAGGGGTCCCTTTAGCATTTCTTTAAA 6914

 31532450 GGCAGGTCTAATGGTGATGAACTCCTCTTGTTTTTATTTATCTGGGAAAATTTTTATTTT 31532509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6915 GGCAGGTCTAATGGTGATGAACTCCTCTTGTTTTTATTTATCTGGGAAAATTTTTATTTT 6974

 31532510 TCCTTCATTTTTAAAGGACAGCTTTCCTGGATATAGTATTTTTGGATGAGAGTTTTTGTT 31532569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6975 TCCTTCATTTTTAAAGGACAGCTTTCCTGGATATAGTATTTTTGGATGAGAGTTTTTGTT 7034

 31532570 CTTTTTATAATGTGTCTCCTTGTGGATTTCTTTGACTTTATCCTAGTTGGAATCCCTTGA 31532629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7035 CTTTTTATAATGTGTCTCCTTGTGGATTTCTTTGACTTTATCCTAGTTGGAATCCCTTGA 7094

 31532630 GCTTCTTGAATATAGGTTTCTTTTCCTTTTTAAGATTTGAAACATTTTCAGCCATTATTT 31532689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7095 GCTTCTTGAATATAGGTTTCTTTTCCTTTTTAAGATTTGAAACATTTTCAGCCATTATTT 7154

 31532690 ATTCAGATAAGCTTTTTGTCCCTTTCTCTCTCTCTGTCTCTCTCTCCTCCTTCTAGTACT 31532749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7155 ATTCAGATAAGCTTTTTGTCCCTTTCTCTCTCTCTGTCTCTCTCTCCTCCTTCTAGTACT 7214

 31532750 ACCATAATGCATATATTGTCCATTTGACGATGTCTCATAAATCCCTTAAGTTTTCTTTAC 31532809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7215 ACCATAATGCATATATTGTCCATTTGACGATGTCTCATAAATCCCTTAAGTTTTCTTTAC 7274

 31532810 TCTTTAAAATTCTTTTTTCTTTTTTGCTTCTCTGACTGGATATCTTCAAGTCTGCTGATT 31532869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7275 TCTTTAAAATTCTTTTTTCTTTTTTGCTTCTCTGACTGGATATCTTCAAGTCTGCTGATT 7334

 31532870 TTTCCTTCTGCTTGATCAAGCCTGCTGTAGATGACTTTTGAATTCAATTATTTTACTCTT 31532929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7335 TTTCCTTCTGCTTGATCAAGCCTGCTGTAGATGACTTTTGAATTCAATTATTTTACTCTT 7394

 31532930 CATCTTCAGCTCTAGAATTTCTGTTATTTTTATTATTATTATTATTATTTTTTGAGACAG 31532989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7395 CATCTTCAGCTCTAGAATTTCTGTTATTTTTATTATTATTATTATTATTTTTTGAGACAG 7454

 31532990 GGTCTTGCTCTGCCACCCAGGGTTGAGTGCAGTGGCACGAATTCAGCTCACTGAAGCCTT 31533049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7455 GGTCTTGCTCTGCCACCCAGGGTTGAGTGCAGTGGCACGAATTCAGCTCACTGAAGCCTT 7514

 31533050 GACCTCCCAGCCTCAAGTGATCTTCCCACAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCA 31533109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7515 GACCTCCCAGCCTCAAGTGATCTTCCCACAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCA 7574

 31533110 TGCCATCATGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTTGTAGAGACAGAGTTTCACCATGTTGC 31533169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7575 TGCCATCATGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTTGTAGAGACAGAGTTTCACCATGTTGC 7634

 31533170 CCAGGCTGGCCTTGAATTCTTGAGCTCAAGTGATCGCCCACCTAAGCTTCCCAAAGTGTT 31533229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7635 CCAGGCTGGCCTTGAATTCTTGAGCTCAAGTGATCGCCCACCTAAGCTTCCCAAAGTGTT 7694

 31533230 GGGATTATAGGTGTGGGCCACCATGGCTGGCCTCTGTTTGGTTCTTTTCTATATTTTCTG 31533289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7695 GGGATTATAGGTGTGGGCCACCATGGCTGGCCTCTGTTTGGTTCTTTTCTATATTTTCTG 7754

 31533290 TGTCTTCACTAATATTCTCAGTTTGTTCATGTATTGTTTCCCTGAGCTTGTTGAGCATTT 31533349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7755 TGTCTTCACTAATATTCTCAGTTTGTTCATGTATTGTTTCCCTGAGCTTGTTGAGCATTT 7814

 31533350 TTATTACGGTTACTTAGAATTCTTTGTCAAATAATTAATATACCTCAATTTCTTTAGCGG 31533409
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7815 TTATTACAGTTACTTAGAATTCTTTGTCAAATAATTAATATACCTCAATTTCTTTAGCGG 7874

 31533410 CAGTTTCTGGAGATTTATTTTGTTCCTTTGGGCCATGCTTTCCTATTTTTTTTGTGTGCC 31533469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7875 CAGTTTCTGGAGATTTATTTTGTTCCTTTGGGCCATGCTTTCCTATTTTTTTTGTGTGCC 7934

 31533470 TTATAACTTTATATTGGGATCCATGCATTTGTAAAATCAGCCACCTCTCCCAGTCTTTAT 31533529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7935 TTATAACTTTATATTGGGATCCATGCATTTGTAAAATCAGCCACCTCTCCCAGTCTTTAT 7994

 31533530 ATACTGGCTTCATTCAGGGAAAATTCTGCACCAATCAGCTTGGCTAAAGATTCTGGGTGC 31533589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7995 ATACTGGCTTCATTCAGGGAAAATTCTGCACCAATCAGCTTGGCTAAAGATTCTGGGTGC 8054

 31533590 CTCCCCAATCTTTTTTGTGGATACTTTCACCAGACTTACGCATGTAAATTCGCAATTACA 31533649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8055 CTCCCCAATCTTTTTTGTGGATACTTTCACCAGACTTACGCATGTAAATTCGCAATTACA 8114

 31533650 GGAATCTACAGGTTTATTTTTTTCAGGAGTCCATTATCTCTTGCTCTCTCTGGTGTCTAT 31533709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8115 GGAATCTACAGGTTTATTTTTTTCAGGAGTCCATTATCTCTTGCTCTCTCTGGTGTCTAT 8174

 31533710 TTGCAGTACTGCAAGTTCTCTAGAGCGGCTACAAGCTTCCCCCAGGCCTCTAGAATATGC 31533769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8175 TTGCAGTACTGCAAGTTCTCTAGAGCGGCTACAAGCTTCCCCCAGGCCTCTAGAATATGC 8234

 31533770 TGGGTCCTTCAATAGTCTGAGAGAGGCAAGACAGAAACCAGTTTCTTGGGTACCCCTCAA 31533829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8235 TGGGTCCTTCAATAGTCTGAGAGAGGCAAGACAGAAACCAGTTTCTTGGGTACCCCTCAA 8294

 31533830 AGGCTAACATTGGATATGTATGCTCCAAATCTGCCTCCTCAAGGAGAAGCTGGAAGTTGG 31533889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8295 AGGCTAACATTGGATATGTATGCTCCAAATCTGCCTCCTCAAGGAGAAGCTGGAAGTTGG 8354

 31533890 GTTGTTTTCTCTACTCATTCCACAGAGCGGCAGGAGGGACTCTGATAGTGTGTGCTAGTC 31533949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8355 GTTGTTTTCTCTACTCATTCCACAGAGCGGCAGGAGGGACTCTGATAGTGTGTGCTAGTC 8414

 31533950 TAAATTGTCACCTTTGTTCTTAGTAGCCCAGTCTGGTGCCTCTTCCTGTCAGTGCTTAGA 31534009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8415 TAAATTGTCACCTTTGTTCTTAGTAGCCCAGTCTGGTGCCTCTTCCTGTCAGTGCTTAGA 8474

 31534010 TTCAGGCAAGACAGAAACTGGTTAATCATGCAGCCCTCTGAAAAGTCTGCATGTTGGATG 31534069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8475 TTCAGGCAAGACAGAAACTGGTTAATCATGCAGCCCTCTGAAAAGTCTGCATGTTGGATG 8534

 31534070 TACATCTCAGTCTTTCCCTCCCAGGGAGAAGCTGGAAGCTGGTGGTTCCTTCCCAATCTG 31534129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8535 TACATCTCAGTCTTTCCCTCCCAGGGAGAAGCTGGAAGCTGGTGGTTCCTTCCCAATCTG 8594

 31534130 CTTCACTGAGCCAGGAGGAGGGATTACAAGTGAGCACTATGAATTTTCCTACTGGCTTCA 31534189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8595 CTTCACTGAGCCAGGAGGAGGGATTACAAGTGAGCACTATGAATTTTCCTACTGGCTTCA 8654

 31534190 GTGCAGCTGGTTTTTTGTTTTTTGTTTTTTTGGTTTTTGTTTGTTTGTTTTTTCATTCAT 31534249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8655 GTGCAGCTGGTTTTTTGTTTTTTGTTTTTTTGGTTTTTGTTTGTTTGTTTTTTCATTCAT 8714

 31534250 CTGGGATGAATGGTCCTGGTTTCTGGTCCATGTACTGTTGTTCAGTCAGTGTCTCCATAG 31534309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8715 CTGGGATGAATGGTCCTGGTTTCTGGTCCATGTACTGTTGTTCAGTCAGTGTCTCCATAG 8774

 31534310 GGAGAAGGAAGTTCTGGATCTTCCTATTCTACCATCTTGCTGATGTCACCCATTTTTTTG 31534369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8775 GGAGAAGGAAGTTCTGGATCTTCCTATTCTACCATCTTGCTGATGTCACCCATTTTTTTG 8834

 31534370 TATCTTTCAAAGACGTCTTTGACTATCCCCTAAATATAATATCTAGTGTTATCTTTTAGA 31534429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8835 TATCTTTCAAAGACGTCTTTGACTATCCCCTAAATATAATATCTAGTGTTATCTTTTAGA 8894

 31534430 AGCTTGTTTTAAAAATCAGATTTCTGAAGTATAATTTACATCCAATAAAAGCACCTTTTA 31534489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8895 AGCTTGTTTTAAAAATCAGATTTCTGAAGTATAATTTACATCCAATAAAAGCACCTTTTA 8954

 31534490 AAAGTATATAGTTCTGTGAGGTTTCATGAATGCATACAATTGTGTAATTGGTATCACAAT 31534549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8955 AAAGTATATAGTTCTGTGAGGTTTCATGAATGCATACAATTGTGTAATTGGTATCACAAT 9014

 31534550 CAAGACATAGACATTACCCCAAAAAGTGACCTCATGTCTCCTCATAGTAAACTCTA 31534605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9015 CAAGACATAGACATTACCCCAAAAAGTGACCTCATGTCTCCTCATAGTAAACTCTA 9070

Alignment time is 7.51132 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31515486,31539389] =>     23904 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    3856] =>      3856 nucs 'mol-32-321f-232235_3856'

Score:        3811
Aligned:      3855        nucs
Identic:      3851 (100%) nucs =>       188 (100%)      3663 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31521632,31521819] EXCISED REGION [31521820,31525486]
 second seq =>  [       1,     188] EXCISED REGION [     190,    3856]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [189,189]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [31522998,31522998]
 second seq =>         1 nucs [1368,1368]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        15 nucs [189,203] to [190,204]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31521632 AAATTAGCCAGGCATGGTGATGCGTGCCTGTAATCCCAGCTACTCTGGAGGCTGAGGCAA 31521691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAATTAGCCAGGCATGGTGATGCGTGCCTGTAATCCCAGCTACTCTGGAGGCTGAGGCAA 60

 31521692 GAAATCACTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGGTTGCGCCACTGCACTT 31521751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAAATCACTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGGTTGCGCCACTGCACTT 120

 31521752 CAGCCTGGGCAACAAAGTGAGACTCCGTCTCAAAAAATCAATCAATCAAATCAAAGCAAA 31521811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAGCCTGGGCAACAAAGTGAGACTCCGTCTCAAAAAATCAATCAATCAAATCAAAGCAAA 180

 31521812 TCAAAAAC 31521819
          ||||||||
      181 TCAAAAAC 188

EXCISED REGION

 31521820 TTTTTTTTTTTTTTTGTAGAGATGAGGTCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGG 31521879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      190 TTTTTTTTTTTTTTTGTAGAGATGAGGTCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGG 249

 31521880 GCTCAAGGAATCCTCCTGCCTTGACCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACC 31521939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      250 GCTCAAGGAATCCTCCTGCCTTGACCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACC 309

 31521940 GTGCCCAGCCCTTTCTACTTCTATGAGTTTGACTTTTTATAATTCCATATATAAATACAA 31521999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      310 GTGCCCAGCCCTTTCTACTTCTATGAGTTTGACTTTTTATAATTCCATATATAAATACAA 369

 31522000 TCATGCAGTATTTTTCTTTCATGACTGGCTTATTTCACTTACCATAATGTCTTCCAGATT 31522059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      370 TCATGCAGTATTTTTCTTTCATGACTGGCTTATTTCACTTACCATAATGTCTTCCAGATT 429

 31522060 AATCTATGTTGTCCCAAATGACAGGATTTTTTTTCTCTTTTAAGGCTGAATAGTATTCCA 31522119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      430 AATCTATGTTGTCCCAAATGACAGGATTTTTTTTCTCTTTTAAGGCTGAATAGTATTCCA 489

 31522120 TTATGTATATACACCACATTTGCATTATCCATTCATCCACTGATGGCCCCTTAGGTTGAT 31522179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      490 TTATGTATATACACCACATTTGCATTATCCATTCATCCACTGATGGCCCCTTAGGTTGAT 549

 31522180 TCTATATCTTGGCTATTGTGAAAAGTGCTGCAATGAACATGGGAGTGCAGGTATTTCTTT 31522239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      550 TCTATATCTTGGCTATTGTGAAAAGTGCTGCAATGAACATGGGAGTGCAGGTATTTCTTT 609

 31522240 GACATATTGATATGACATATTGATCTCTTTTGGATATATACCCAGAAGTGGAATTGCTAG 31522299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      610 GACATATTGATATGACATATTGATCTCTTTTGGATATATACCCAGAAGTGGAATTGCTAG 669

 31522300 ATCATATAGTAGTTCTAATTTTAGTTTTTTGAGGAAACCCCATACTATTTCTCGTAGTGG 31522359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      670 ATCATATAGTAGTTCTAATTTTAGTTTTTTGAGGAAACCCCATACTATTTCTCGTAGTGG 729

 31522360 TTGATATGGTTTGGTTGTGTCCCCACACAAATCTCATCTTGAATTGTAGCTCTCATAATC 31522419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      730 TTGATATGGTTTGGTTGTGTCCCCACACAAATCTCATCTTGAATTGTAGCTCTCATAATC 789

 31522420 CCCAGCTGTCGTGGGAGGGACCTGGTGGGAGGTAATTGAATCGTGGGGGTGGGTTTTTCC 31522479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      790 CCCAGCTGTCGTGGGAGGGACCTGGTGGGAGGTAATTGAATCGTGGGGGTGGGTTTTTCC 849

 31522480 CACCATTCTAATGATAGTGAATAAGTCTCAAGAGATATGATGGCTTTATAAAGGGCAGTT 31522539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      850 CACCATTCTAATGATAGTGAATAAGTCTCAAGAGATATGATGGCTTTATAAAGGGCAGTT 909

 31522540 CCCCTGCTCATGCTCTCTTGCCTGCTCCCATGTAAGACGTGCCTTTGCTCCTCTTTCACC 31522599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      910 CCCCTGCTCATGCTCTCTTGCCTGCTCCCATGTAAGACGTGCCTTTGCTCCTCTTTCACC 969

 31522600 TCTGCCATGATTGTGAGGCCTCCCCAGCCATGTGGAACTGTGAGTCCATTAAACCTTTAC 31522659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      970 TCTGCCATGATTGTGAGGCCTCCCCAGCCATGTGGAACTGTGAGTCCATTAAACCTTTAC 1029

 31522660 TTTATAAATTACCCAGTCTCGGATATGTCTTTATTAGCAGCATGAGAACAGACCAATACA 31522719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1030 TTTATAAATTACCCAGTCTCGGATATGTCTTTATTAGCAGCATGAGAACAGACCAATACA 1089

 31522720 GTGGTTGTACTGATTTACATTCCCTCCAACATTGTACAAGGGTTTTCTTTTTTCTGCCTC 31522779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1090 GTGGTTGTACTGATTTACATTCCCTCCAACATTGTACAAGGGTTTTCTTTTTTCTGCCTC 1149

 31522780 CTCACCAACACTTGTTTCTTGTCTTTTTGATAACATCTAATCTAACAGATGTAAGATGAT 31522839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1150 CTCACCAACACTTGTTTCTTGTCTTTTTGATAACATCTAATCTAACAGATGTAAGATGAT 1209

 31522840 ATCTCATTGTGGTTTAATTTGTTTTTCCTAATGATTAGTGGTGCTCAGCATTTTTTTTCT 31522899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1210 ATCTCATTGTGGTTTAATTTGTTTTTCCTAATGATTAGTGGTGCTCAGCATTTTTTTTCT 1269

 31522900 TGAACCTGTTGGCCATTTGAATGTCTTCTTTTGAGAAATGTCTCTTTGGATGCTTTCTCC 31522959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1270 TGAACCTGTTGGCCATTTGAATGTCTTCTTTTGAGAAATGTCTCTTTGGATGCTTTCTCC 1329

 31522960 ATTTTCTCTTCTCTTCTCTTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT 31523019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     1330 ATTTTCTCTTCTCTTCTCTTTTCTTTCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT 1389

 31523020 TTTTGAGATGGCGTTTTGCTCTTGTTGCCCGGGCTGGAGTGCATTGATCCAATCTTGGCT 31523079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1390 TTTTGAGATGGCGTTTTGCTCTTGTTGCCCGGGCTGGAGTGCATTGATCCAATCTTGGCT 1449

 31523080 CACTGCAACCCCCGCCTCCCGGGTTCAAGCAATTCTCCCGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCT 31523139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1450 CACTGCAACCCCCGCCTCCCGGGTTCAAGCAATTCTCCCGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCT 1509

 31523140 GTGATTACAGGCACAGGCTACCACACCCGGCTAATTTTGTATTTTCAGTAGAGACGAGGT 31523199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1510 GTGATTACAGGCACAGGCTACCACACCCGGCTAATTTTGTATTTTCAGTAGAGACGAGGT 1569

 31523200 GTCACCTTGTTGGTCAGGCTGGTCCCGAACTCCTGACCTCAAGTGATCTGCCCGCCTTGG 31523259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1570 GTCACCTTGTTGGTCAGGCTGGTCCCGAACTCCTGACCTCAAGTGATCTGCCCGCCTTGG 1629

 31523260 CCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGCCACTTTGCCTATTTT 31523319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1630 CCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGCCACTTTGCCTATTTT 1689

 31523320 ATTTTATTTTGAGATGGAGTTTTGCTCTTATTGCCCAGACTGGAGTGCAATGGCGCAATT 31523379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1690 ATTTTATTTTGAGATGGAGTTTTGCTCTTATTGCCCAGACTGGAGTGCAATGGCGCAATT 1749

 31523380 GCAGCTCACCACAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAA 31523439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1750 GCAGCTCACCACAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAA 1809

 31523440 GTAGGTGGGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCCAACTAATTTTGTAGTTTTAGTAGAGA 31523499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1810 GTAGGTGGGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCCAACTAATTTTGTAGTTTTAGTAGAGA 1869

 31523500 TGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCA 31523559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1870 TGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCA 1929

 31523560 CCTTGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGAGTGAGTGCACCTGGCCCACTTTGCTCATT 31523619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1930 CCTTGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGAGTGAGTGCACCTGGCCCACTTTGCTCATT 1989

 31523620 TTCTAATTGGGTTATTCGTTTTCTGGCTATTGAGTTGTTTGAGTTTCTTATTTATTGTGG 31523679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1990 TTCTAATTGGGTTATTCGTTTTCTGGCTATTGAGTTGTTTGAGTTTCTTATTTATTGTGG 2049

 31523680 ATGTTACTCCCTTATCAGATGTATGATTTACATATATTTTCTGTCACTCTGTGGGTTATC 31523739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     2050 ATGTTACTCCCTTATCAGATGTATGATTTACATATATTTTCTGTCACTTTGTGGGTTATC 2109

 31523740 TCTTTACTTTGTTCATTGTTTCCTTTCTGTCCAAAAGCTTTGTATCTTGTCTAAAATCCC 31523799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2110 TCTTTACTTTGTTCATTGTTTCCTTTCTGTCCAAAAGCTTTGTATCTTGTCTAAAATCCC 2169

 31523800 ATTTGTCTATTTTTGCTTTTATTTATTTTTATTTTTATTTTTATTTTTTATTTTTTTGAA 31523859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2170 ATTTGTCTATTTTTGCTTTTATTTATTTTTATTTTTATTTTTATTTTTTATTTTTTTGAA 2229

 31523860 ACGGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGTTGGAGTGCAGTGGTGCAATCTCAGCTCACTGCAA 31523919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2230 ACGGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGTTGGAGTGCAGTGGTGCAATCTCAGCTCACTGCAA 2289

 31523920 CCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGGAAGTCTCCTACTCCAACTTCCTGAGTAGCTGGGATTAT 31523979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2290 CCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGGAAGTCTCCTACTCCAACTTCCTGAGTAGCTGGGATTAT 2349

 31523980 AGGCGTGTGCCACCATGCCTAGCTAATTTTTGTATTTTTTGGTAGAGACAGGATTTCACC 31524039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2350 AGGCGTGTGCCACCATGCCTAGCTAATTTTTGTATTTTTTGGTAGAGACAGGATTTCACC 2409

 31524040 ATGTTGGCCAGGCTGGTGTTGAACTCTTGACCTCAGGCAATCCGCCTGACTCAGCCTCCC 31524099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2410 ATGTTGGCCAGGCTGGTGTTGAACTCTTGACCTCAGGCAATCCGCCTGACTCAGCCTCCC 2469

 31524100 AAAGTGCTGGGATTACACGTGTGAGCCACCGCGCCTGGCCTATTTTTGCTTTTATTACCT 31524159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2470 AAAGTGCTGGGATTACACGTGTGAGCCACCGCGCCTGGCCTATTTTTGCTTTTATTACCT 2529

 31524160 GTGCTTTTGGGGTCATAGCTAAATAACCATTGCTCAGATCAATGTCATGGAGCCTTTCCT 31524219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2530 GTGCTTTTGGGGTCATAGCTAAATAACCATTGCTCAGATCAATGTCATGGAGCCTTTCCT 2589

 31524220 CTAGGTATTCTTCTAGTTGTTTTACAGTCTCAGATCTTATATTTAAGACTTTAATCCATT 31524279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2590 CTAGGTATTCTTCTAGTTGTTTTACAGTCTCAGATCTTATATTTAAGACTTTAATCCATT 2649

 31524280 TTGAGTTGATTTTTTATACTGTGTGAGATAAGGATCCAATTTTATTCTTCTGTATGTGGA 31524339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2650 TTGAGTTGATTTTTTATACTGTGTGAGATAAGGATCCAATTTTATTCTTCTGTATGTGGA 2709

 31524340 TCCAATTTTCCTAGTACAGTTTATTGAAAAGACTGTCTTTTCCCCATTATGTATTAGTAA 31524399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2710 TCCAATTTTCCTAGTACAGTTTATTGAAAAGACTGTCTTTTCCCCATTATGTATTAGTAA 2769

 31524400 CACCTTTGTCAAAAATCAATTGACTATTAGTGCATGGGTTTATTTCTGGGTTTTCTATCT 31524459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2770 CACCTTTGTCAAAAATCAATTGACTATTAGTGCATGGGTTTATTTCTGGGTTTTCTATCT 2829

 31524460 TGTTACATTAGTCGATGTGTCTATTTTTATGCCAGCACCATACTGTTTTGATTATATTAG 31524519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2830 TGTTACATTAGTCGATGTGTCTATTTTTATGCCAGCACCATACTGTTTTGATTATATTAG 2889

 31524520 CTTTATAATATATTTTGAAATCAGGGACTGTGATGTCTTTAGCTTTGTTCTTTTTGCTCA 31524579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2890 CTTTATAATATATTTTGAAATCAGGGACTGTGATGTCTTTAGCTTTGTTCTTTTTGCTCA 2949

 31524580 AGATTGTTTTGGCTAGCCAGGGTCTTTTATGATTGCATATGAATTTAAGGATTGTTTTAT 31524639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2950 AGATTGTTTTGGCTAGCCAGGGTCTTTTATGATTGCATATGAATTTAAGGATTGTTTTAT 3009

 31524640 TTCTATAAGAAATGACATTGGAATTTTGATAGGGACTGCATTGAATCTGTAGATTGCTTT 31524699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3010 TTCTATAAGAAATGACATTGGAATTTTGATAGGGACTGCATTGAATCTGTAGATTGCTTT 3069

 31524700 GGGTAGTATGAATATTTTAATAATATTAATTCTTCTAATTTATCAACACAAGATAGCTTT 31524759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3070 GGGTAGTATGAATATTTTAATAATATTAATTCTTCTAATTTATCAACACAAGATAGCTTT 3129

 31524760 CCATTTATTTGTGTTTTCTTAAACAATGTTTTAGTTTCCAGTGTACAGATCTTTTAACTT 31524819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3130 CCATTTATTTGTGTTTTCTTAAACAATGTTTTAGTTTCCAGTGTACAGATCTTTTAACTT 3189

 31524820 CTTGGTTAAATTTACCCCTAAGTATTTTATTTTATTTTAAAATACCTGGCTAATTTTGTA 31524879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3190 CTTGGTTAAATTTACCCCTAAGTATTTTATTTTATTTTAAAATACCTGGCTAATTTTGTA 3249

 31524880 TTTAATTTTATATTGTATTTATTTTATTTGTAATAAAATTAAGCATTTTATTTTATTTTA 31524939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3250 TTTAATTTTATATTGTATTTATTTTATTTGTAATAAAATTAAGCATTTTATTTTATTTTA 3309

 31524940 AAATACCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCT 31524999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     3310 AAATACCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGATAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCT 3369

 31525000 GGTCTCGAACTCCAGACCTCAGGTGATCCGACTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGTATT 31525059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3370 GGTCTCGAACTCCAGACCTCAGGTGATCCGACTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGTATT 3429

 31525060 AGAAGCATGAGCCACTGCCCACTGCACCTAGCTGAAAACCACACTTTCTGTTGATTAAAT 31525119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3430 AGAAGCATGAGCCACTGCCCACTGCACCTAGCTGAAAACCACACTTTCTGTTGATTAAAT 3489

 31525120 AATATTTCACCTTATGGAGTTACAAATTTTCATTTTATGGGGTTATAATCACTTACTTAG 31525179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3490 AATATTTCACCTTATGGAGTTACAAATTTTCATTTTATGGGGTTATAATCACTTACTTAG 3549

 31525180 CTTGTTATCTTTTGTTGGACATTAATGTGGTTTCTAACTTTTCATTATCAAAAAATAAAA 31525239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3550 CTTGTTATCTTTTGTTGGACATTAATGTGGTTTCTAACTTTTCATTATCAAAAAATAAAA 3609

 31525240 GAAAATGGACAAAACCTCAGAAAGACACAAACTACTAAAGCTGACTTAATAAGAAATAGA 31525299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3610 GAAAATGGACAAAACCTCAGAAAGACACAAACTACTAAAGCTGACTTAATAAGAAATAGA 3669

 31525300 AAATCTGAATATATAGAAAATCTGAATGTAACAAGTAAGGAGATTGGATTAGTAATAAAA 31525359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3670 AAATCTGAATATATAGAAAATCTGAATGTAACAAGTAAGGAGATTGGATTAGTAATAAAA 3729

 31525360 TTTCCCACAAAGAGAAGTACACATTCAGATGGTTTCACTGGTAAATTCTACCAAATATTT 31525419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3730 TTTCCCACAAAGAGAAGTACACATTCAGATGGTTTCACTGGTAAATTCTACCAAATATTT 3789

 31525420 AAAGATTTTTCTTTTTTTTTGTTGAGACAGAGTCTCACTCTATTGCCCAGGCTGGAGTAC 31525479
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     3790 AAAGATTTTTCTTTTTTTTTGTTGAGGCAGAGTCTCACTCTATTGCCCAGGCTGGAGTAC 3849

 31525480 AATGGTG 31525486
          |||||||
     3850 AATGGTG 3856

Alignment time is 3.24583 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31515486,31539389] =>     23904 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    5493] =>      5493 nucs 'mol-32-32f0-185040_5493'

Score:        5339
Aligned:      5576        nucs
Identic:      5480 ( 98%) nucs =>      2149 ( 96%)      3331 (100%)
Gaps:           94 (  2%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31523255,31525486] EXCISED REGION [31529390,31532731]
 second seq =>  [       1,    2153] EXCISED REGION [    2163,    5493]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3903 nucs [31525487,31529389]
 second seq =>         9 nucs [2154,2162]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31523255 CTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGCCACTTTGCCT 31523314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGCCACTTTGCCT 60

 31523315 ATTTTATTTTATTTTGAGATGGAGTTTTGCTCTTATTGCCCAGACTGGAGTGCAATGGCG 31523374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATTTTATTTTATTTTGAGATGGAGTTTTGCTCTTATTGCCCAGACTGGAGTGCAATGGCG 120

 31523375 CAATTGCAGCTCACCACAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCT 31523434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAATTGCAGCTCACCACAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCT 180

 31523435 CCCAAGTAGGTGGGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCCAACTAATTTTGTAGTTTTAGT 31523494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCCAAGTAGGTGGGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCCAACTAATTTTGTAGTTTTAGT 240

 31523495 AGAGATGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCT 31523554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGAGATGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCT 300

 31523555 GCCCACCTTGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGAGTGAGTGCACCTGGCCCACTTTGC 31523614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GCCCACCTTGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGAGTGAGTGCACCTGGCCCACTTTGC 360

 31523615 TCATTTTCTAATTGGGTTATTCGTTTTCTGGCTATTGAGTTGTTTGAGTTTCTTATTTAT 31523674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCATTTTCTAATTGGGTTATTCGTTTTCTGGCTATTGAGTTGTTTGAGTTTCTTATTTAT 420

 31523675 TGTGGATGTTACTCCCTTATCAGATGTATGATTTACATATATTTTCTGTCACTCTGTGGG 31523734
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
      421 TGTGGATGTTACTCCCTTATCAGATGTATGATTTACATATATTTTCTGTCACTTTGTGGG 480

 31523735 TTATCTCTTTACTTTGTTCATTGTTTCCTTTCTGTCCAAAAGCTTTGTATCTTGTCTAAA 31523794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTATCTCTTTACTTTGTTCATTGTTTCCTTTCTGTCCAAAAGCTTTGTATCTTGTCTAAA 540

 31523795 ATCCCATTTGTCTATTTTTGCTTTTATTTATTTTTATTTTTATTTTTATTTTTTATTTTT 31523854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATCCCATTTGTCTATTTTTGCTTTTATTTATTTTTATTTTTATTTTTATTTTTTATTTTT 600

 31523855 TTGAAACGGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGTTGGAGTGCAGTGGTGCAATCTCAGCTCAC 31523914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTGAAACGGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGTTGGAGTGCAGTGGTGCAATCTCAGCTCAC 660

 31523915 TGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGGAAGTCTCCTACTCCAACTTCCTGAGTAGCTGGG 31523974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGGAAGTCTCCTACTCCAACTTCCTGAGTAGCTGGG 720

 31523975 ATTATAGGCGTGTGCCACCATGCCTAGCTAATTTTTGTATTTTTTGGTAGAGACAGGATT 31524034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATTATAGGCGTGTGCCACCATGCCTAGCTAATTTTTGTATTTTTTGGTAGAGACAGGATT 780

 31524035 TCACCATGTTGGCCAGGCTGGTGTTGAACTCTTGACCTCAGGCAATCCGCCTGACTCAGC 31524094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCACCATGTTGGCCAGGCTGGTGTTGAACTCTTGACCTCAGGCAATCCGCCTGACTCAGC 840

 31524095 CTCCCAAAGTGCTGGGATTACACGTGTGAGCCACCGCGCCTGGCCTATTTTTGCTTTTAT 31524154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTCCCAAAGTGCTGGGATTACACGTGTGAGCCACCGCGCCTGGCCTATTTTTGCTTTTAT 900

 31524155 TACCTGTGCTTTTGGGGTCATAGCTAAATAACCATTGCTCAGATCAATGTCATGGAGCCT 31524214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TACCTGTGCTTTTGGGGTCATAGCTAAATAACCATTGCTCAGATCAATGTCATGGAGCCT 960

 31524215 TTCCTCTAGGTATTCTTCTAGTTGTTTTACAGTCTCAGATCTTATATTTAAGACTTTAAT 31524274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTCCTCTAGGTATTCTTCTAGTTGTTTTACAGTCTCAGATCTTATATTTAAGACTTTAAT 1020

 31524275 CCATTTTGAGTTGATTTTTTATACTGTGTGAGATAAGGATCCAATTTTATTCTTCTGTAT 31524334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CCATTTTGAGTTGATTTTTTATACTGTGTGAGATAAGGATCCAATTTTATTCTTCTGTAT 1080

 31524335 GTGGATCCAATTTTCCTAGTACAGTTTATTGAAAAGACTGTCTTTTCCCCATTATGTATT 31524394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GTGGATCCAATTTTCCTAGTACAGTTTATTGAAAAGACTGTCTTTTCCCCATTATGTATT 1140

 31524395 AGTAACACCTTTGTCAAAAATCAATTGACTATTAGTGCATGGGTTTATTTCTGGGTTTTC 31524454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGTAACACCTTTGTCAAAAATCAATTGACTATTAGTGCATGGGTTTATTTCTGGGTTTTC 1200

 31524455 TATCTTGTTACATTAGTCGATGTGTCTATTTTTATGCCAGCACCATACTGTTTTGATTAT 31524514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TATCTTGTTACATTAGTCGATGTGTCTATTTTTATGCCAGCACCATACTGTTTTGATTAT 1260

 31524515 ATTAGCTTTATAATATATTTTGAAATCAGGGACTGTGATGTCTTTAGCTTTGTTCTTTTT 31524574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATTAGCTTTATAATATATTTTGAAATCAGGGACTGTGATGTCTTTAGCTTTGTTCTTTTT 1320

 31524575 GCTCAAGATTGTTTTGGCTAGCCAGGGTCTTTTATGATTGCATATGAATTTAAGGATTGT 31524634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GCTCAAGATTGTTTTGGCTAGCCAGGGTCTTTTATGATTGCATATGAATTTAAGGATTGT 1380

 31524635 TTTATTTCTATAAGAAATGACATTGGAATTTTGATAGGGACTGCATTGAATCTGTAGATT 31524694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTTATTTCTATAAGAAATGACATTGGAATTTTGATAGGGACTGCATTGAATCTGTAGATT 1440

 31524695 GCTTTGGGTAGTATGAATATTTTAATAATATTAATTCTTCTAATTTATCAACACAAGATA 31524754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GCTTTGGGTAGTATGAATATTTTAATAATATTAATTCTTCTAATTTATCAACACAAGATA 1500

 31524755 GCTTTCCATTTATTTGTGTTTTCTTAAACAATGTTTTAGTTTCCAGTGTACAGATCTTTT 31524814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GCTTTCCATTTATTTGTGTTTTCTTAAACAATGTTTTAGTTTCCAGTGTACAGATCTTTT 1560

 31524815 AACTTCTTGGTTAAATTTACCCCTAAGTATTTTATTTTATTTTAAAATACCTGGCTAATT 31524874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AACTTCTTGGTTAAATTTACCCCTAAGTATTTTATTTTATTTTAAAATACCTGGCTAATT 1620

 31524875 TTGTATTTAATTTTATATTGTATTTATTTTATTTGTAATAAAATTAAGCATTTTATTTTA 31524934
          ||||||||||||                                                
     1621 TTGTATTTAATT------------------------------------------------ 1632

 31524935 TTTTAAAATACCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGAC--AGGGTTTCTCCATGTTGG 31524992
                                          |||||||   ||||||||||||||||||
     1633 --------------------------------GTAGAGA-GTAGGGTTTCTCCATGTTGG 1659

 31524993 TCAGGCTGGTCTCGAACTCCAGACCTCAGGTGATCCGACTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGC 31525052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1660 TCAGGCTGGTCTCGAACTCCAGACCTCAGGTGATCCGACTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGC 1719

 31525053 TGGTATTAGAAGCATGAGCCACTGCCCACTGCACCTAGCTGAAAACCACACTTTCTGTTG 31525112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1720 TGGTATTAGAAGCATGAGCCACTGCCCACTGCACCTAGCTGAAAACCACACTTTCTGTTG 1779

 31525113 ATTAAATAATATTTCACCTTATGGAGTTACAAATTTTCATTTTATGGGGTTATAATCACT 31525172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1780 ATTAAATAATATTTCACCTTATGGAGTTACAAATTTTCATTTTATGGGGTTATAATCACT 1839

 31525173 TACTTAGCTTGTTATCTTTTGTTGGACATTAATGTGGTTTCTAACTTTTCATTATCAAAA 31525232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1840 TACTTAGCTTGTTATCTTTTGTTGGACATTAATGTGGTTTCTAACTTTTCATTATCAAAA 1899

 31525233 AATAAAAGAAAATGGACAAAACCTCAGAAAGACACAAACTACTAAAGCTGACTTAATAAG 31525292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1900 AATAAAAGAAAATGGACAAAACCTCAGAAAGACACAAACTACTAAAGCTGACTTAATAAG 1959

 31525293 AAATAGAAAATCTGAATATATAGAAAATCTGAATGTAACAAGTAAGGAGATTGGATTAGT 31525352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1960 AAATAGAAAATCTGAATATATAGAAAATCTGAATGTAACAAGTAAGGAGATTGGATTAGT 2019

 31525353 AATAAAATTTCCCACAAAGAGAAGTACACATTCAGATGGTTTCACTGGTAAATTCTACCA 31525412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2020 AATAAAATTTCCCACAAAGAGAAGTACACATTCAGATGGTTTCACTGGTAAATTCTACCA 2079

 31525413 AATATTTAAAGATTTTTCTTTTTTTTTGTTGAGACAGAGTCTCACTCTATTGCCCAGGCT 31525472
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     2080 AATATTTAAAGATTTTTCTTTTTTTTTGTTGAGGCAGAGTCTCACTCTATTGCCCAGGCT 2139

 31525473 GGAGTACAATGGTG 31525486
          ||||||||||||||
     2140 GGAGTACAATGGTG 2153

EXCISED REGION

 31529390 AATACTGTGCTAAGTGAAAGAAGCCAACCACAAAATACCATATATTGTGTGATTCTGCTT 31529449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2163 AATACTGTGCTAAGTGAAAGAAGCCAACCACAAAATACCATATATTGTGTGATTCTGCTT 2222

 31529450 AAATGACATGTCCAGAATGTCCATATTAAAGTAGATTAGTGGTTTCCTGAGGCTGGGGGA 31529509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2223 AAATGACATGTCCAGAATGTCCATATTAAAGTAGATTAGTGGTTTCCTGAGGCTGGGGGA 2282

 31529510 GGGAGTTGGGGAAATTGCGTAGTGACTACTGGGTAAAGAGTTTCTTTCTGGGGTGATGAA 31529569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2283 GGGAGTTGGGGAAATTGCGTAGTGACTACTGGGTAAAGAGTTTCTTTCTGGGGTGATGAA 2342

 31529570 ATGGTCTAAAATAGAATGTGGTGGTGGTTGCACAGCTCTGAAAATACTAAAAACCATTGA 31529629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2343 ATGGTCTAAAATAGAATGTGGTGGTGGTTGCACAGCTCTGAAAATACTAAAAACCATTGA 2402

 31529630 ATGAGCACTTTAAATTGGTAAATTTTTATGTGAATTATGATTCAATAAAGTTGTGTTTAG 31529689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2403 ATGAGCACTTTAAATTGGTAAATTTTTATGTGAATTATGATTCAATAAAGTTGTGTTTAG 2462

 31529690 ATATTACTAAAAATGATGGTACAAATATTCTTTTTCACAAATGTTTTTTGTTGTTGTTTA 31529749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2463 ATATTACTAAAAATGATGGTACAAATATTCTTTTTCACAAATGTTTTTTGTTGTTGTTTA 2522

 31529750 TAGTTGTTTATTTGTACATCTAGTAATTTGTCCCAAGGAAAGAGTATGTAAAAGAACATA 31529809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2523 TAGTTGTTTATTTGTACATCTAGTAATTTGTCCCAAGGAAAGAGTATGTAAAAGAACATA 2582

 31529810 AGTCACTTTAAGGCCTTTAATGTATACTACAAAATTGCACTCTAGAAGGTTTATACAGTT 31529869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2583 AGTCACTTTAAGGCCTTTAATGTATACTACAAAATTGCACTCTAGAAGGTTTATACAGTT 2642

 31529870 TTGCATTTCATTAGCCTGTTTTTTTTATCTTTGACAACCTAAAGAATTTATTAGTGGTAT 31529929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2643 TTGCATTTCATTAGCCTGTTTTTTTTATCTTTGACAACCTAAAGAATTTATTAGTGGTAT 2702

 31529930 TCATCTGAGGATCCTCTAGGTCTATCAGAGTGTCTTTCTTATAGAAGGCATTCAATAAAT 31529989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2703 TCATCTGAGGATCCTCTAGGTCTATCAGAGTGTCTTTCTTATAGAAGGCATTCAATAAAT 2762

 31529990 AAATGTCCTAAGTGAGCAAAACATTTTTGGTTGATTTTTAGGTGCAAATGGTTTCTTTTG 31530049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2763 AAATGTCCTAAGTGAGCAAAACATTTTTGGTTGATTTTTAGGTGCAAATGGTTTCTTTTG 2822

 31530050 ATTTTAATTAAGATGCCTTTGTTTATTAGTGATGTTGACATATTTTCTTAATCTATTGGC 31530109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2823 ATTTTAATTAAGATGCCTTTGTTTATTAGTGATGTTGACATATTTTCTTAATCTATTGGC 2882

 31530110 TTTGTATAACTTTATGAATTGTCTCTTCATGTCCTTTGCCTACTTTTCTATTGTGGTAAC 31530169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2883 TTTGTATAACTTTATGAATTGTCTCTTCATGTCCTTTGCCTACTTTTCTATTGTGGTAAC 2942

 31530170 TATCTTTTATAAATGTTGTATAATTATTTAAAAATACATTAGGTTGGGCATGGTAGATCA 31530229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2943 TATCTTTTATAAATGTTGTATAATTATTTAAAAATACATTAGGTTGGGCATGGTAGATCA 3002

 31530230 TGCCTGTAATCCCAGCTCTCTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATTGCTTGAGCCTAACAGTT 31530289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3003 TGCCTGTAATCCCAGCTCTCTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATTGCTTGAGCCTAACAGTT 3062

 31530290 CGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCCATCTCTAAAAAAAAAAACCAATAAAAAT 31530349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3063 CGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCCATCTCTAAAAAAAAAAACCAATAAAAAT 3122

 31530350 ATATTAAAAGATTAACTGATTGTCTATCATATGGATTACAAATATCCCCCCCAATTTGTC 31530409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3123 ATATTAAAAGATTAACTGATTGTCTATCATATGGATTACAAATATCCCCCCCAATTTGTC 3182

 31530410 ATTTGCTTGTTAATTTTATTTATGATGACTTAAAAATTACAATATATTTTTTGGTGTTCA 31530469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3183 ATTTGCTTGTTAATTTTATTTATGATGACTTAAAAATTACAATATATTTTTTGGTGTTCA 3242

 31530470 AGTCAGTTTTTGTCCCCATTGTGATATTTTCCTTTGCCTGTTTATCACTTTCTTAGAGAA 31530529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3243 AGTCAGTTTTTGTCCCCATTGTGATATTTTCCTTTGCCTGTTTATCACTTTCTTAGAGAA 3302

 31530530 AAGATAAATACTGATTCGTTCTTTTGTAGGTGTTTTATGATTTCATTGAAAATAAAATCT 31530589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3303 AAGATAAATACTGATTCGTTCTTTTGTAGGTGTTTTATGATTTCATTGAAAATAAAATCT 3362

 31530590 TCAACGCATCTAGTATTCATTTGGGTGTAAGATAAAAGATAACAACGTAGGTTTCTCTTA 31530649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3363 TCAACGCATCTAGTATTCATTTGGGTGTAAGATAAAAGATAACAACGTAGGTTTCTCTTA 3422

 31530650 TAGTTCATCAGGTATCCTACTACTGTTTATTGAGTCATGTTTTCTGTTACCACTCTTACT 31530709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3423 TAGTTCATCAGGTATCCTACTACTGTTTATTGAGTCATGTTTTCTGTTACCACTCTTACT 3482

 31530710 ATATACCAGTTTTACATACATTTGGGTTGGTTTCTGAGCTTTCTATTGTCTTCCATTGCT 31530769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3483 ATATACCAGTTTTACATACATTTGGGTTGGTTTCTGAGCTTTCTATTGTCTTCCATTGCT 3542

 31530770 TTGTTTAAAATTTAAAGTTTATTATTCTGACTTTCCATACTTGAATATGGTCGAATAAGT 31530829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3543 TTGTTTAAAATTTAAAGTTTATTATTCTGACTTTCCATACTTGAATATGGTCGAATAAGT 3602

 31530830 CCTCCTTTATTAATCTTGTTTTATTTAAAAATGGTCATTTTCACTCATTTTCCAGTTCAG 31530889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3603 CCTCCTTTATTAATCTTGTTTTATTTAAAAATGGTCATTTTCACTCATTTTCCAGTTCAG 3662

 31530890 TAGTTTTATTCTCTCAGTGTAATGTGATTTATCACCCCATTGCTCACCCTATTCATCTCC 31530949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3663 TAGTTTTATTCTCTCAGTGTAATGTGATTTATCACCCCATTGCTCACCCTATTCATCTCC 3722

 31530950 CAATACCCAGCTGAAAAACTTTAGAAGACTGAGGCTCTTGCCCTGGCCCCATCACTTTCT 31531009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3723 CAATACCCAGCTGAAAAACTTTAGAAGACTGAGGCTCTTGCCCTGGCCCCATCACTTTCT 3782

 31531010 AGCTATGTGGGCTTAGGCTAGTTATTGAACATGTCTGACTCTCACTTTTCTCCTCTGTAA 31531069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3783 AGCTATGTGGGCTTAGGCTAGTTATTGAACATGTCTGACTCTCACTTTTCTCCTCTGTAA 3842

 31531070 GTCAGTGAGAATTATATACTTCTTATAAGGTTGTGAGGTTCAAATGGAATAATGTGTACA 31531129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3843 GTCAGTGAGAATTATATACTTCTTATAAGGTTGTGAGGTTCAAATGGAATAATGTGTACA 3902

 31531130 GAGGCACTTGGTAAACAATGTAGTCATATGCAAGTCATATGCAAGTCATATGTAGTCAGC 31531189
          |||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||
     3903 GAGGCACTTGGTAAACAATGT-----------AGTCATATGCAAGTCATATGTAGTCAGC 3951

 31531190 TTGGTGAATTTTGAGAAAGTAAATGCAAGTTCTTTTTATGGTTTTACCTAAGGGGCCAGT 31531249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3952 TTGGTGAATTTTGAGAAAGTAAATGCAAGTTCTTTTTATGGTTTTACCTAAGGGGCCAGT 4011

 31531250 GAGGGCCAGAGAAGTGCCGGGACCTATGTAAGGTCGCAAGCAAGTTCATGTGGAATGCAT 31531309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4012 GAGGGCCAGAGAAGTGCCGGGACCTATGTAAGGTCGCAAGCAAGTTCATGTGGAATGCAT 4071

 31531310 CTAGAACTAGAACGCTAGCCTGTGTCCCAGGGCCCTTCCAACTGGGCTCTGCTGCCTGCA 31531369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4072 CTAGAACTAGAACGCTAGCCTGTGTCCCAGGGCCCTTCCAACTGGGCTCTGCTGCCTGCA 4131

 31531370 GTCCTGGGTGCCTTCTAATTAGCCTGTGTAGTGGTCTTGGTAAAAGTGTTTCTCCTGTAC 31531429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4132 GTCCTGGGTGCCTTCTAATTAGCCTGTGTAGTGGTCTTGGTAAAAGTGTTTCTCCTGTAC 4191

 31531430 TGTCCCCTATAGGTTGTGGCTGGCCATACCATTTCCCTGGTTCCCCCCACGCTCCTGATG 31531489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4192 TGTCCCCTATAGGTTGTGGCTGGCCATACCATTTCCCTGGTTCCCCCCACGCTCCTGATG 4251

 31531490 ACCTGGAAAGGCCATTTGAATAGTGTGGCAGACATCCTGTATGTGGACAACTTCCAGCTG 31531549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4252 ACCTGGAAAGGCCATTTGAATAGTGTGGCAGACATCCTGTATGTGGACAACTTCCAGCTG 4311

 31531550 GTTATCAGCGCTGGCCAGGACCGGGACGTCAAGGCTTGGAAACTCTCCGGTGATGCCATT 31531609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4312 GTTATCAGCGCTGGCCAGGACCGGGACGTCAAGGCTTGGAAACTCTCCGGTGATGCCATT 4371

 31531610 GGTATGGGTCCTGCTGAAGCTCAGCCATGCCCATGGCCCTTCTTGTCTCTGTCCCTGTCT 31531669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4372 GGTATGGGTCCTGCTGAAGCTCAGCCATGCCCATGGCCCTTCTTGTCTCTGTCCCTGTCT 4431

 31531670 GAACATAAGCTGGTATGAACTTTGTACTCTGTGGGGAGGGACTCTCAGGCCACAGCAACT 31531729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4432 GAACATAAGCTGGTATGAACTTTGTACTCTGTGGGGAGGGACTCTCAGGCCACAGCAACT 4491

 31531730 GCCTTCACTTAAATAATATTACAGTCTGTCCAATTATCCATTCAGCAAACGGTCCATCCA 31531789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4492 GCCTTCACTTAAATAATATTACAGTCTGTCCAATTATCCATTCAGCAAACGGTCCATCCA 4551

 31531790 TTCACCCATCCACCCAATATTATTCACCTATGTATATTTTTGCAAATCATATATCTGATA 31531849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4552 TTCACCCATCCACCCAATATTATTCACCTATGTATATTTTTGCAAATCATATATCTGATA 4611

 31531850 AAGCATATTCCTTTCTCTTTTAAAAAATAAACTTAATTGTTGCATTGTATATAAAGAAAA 31531909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4612 AAGCATATTCCTTTCTCTTTTAAAAAATAAACTTAATTGTTGCATTGTATATAAAGAAAA 4671

 31531910 ACATACAAACCAGAAGGGTTCAGCTTGGTGAATTTTGAGAAAGTAAATACATACCCATAT 31531969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4672 ACATACAAACCAGAAGGGTTCAGCTTGGTGAATTTTGAGAAAGTAAATACATACCCATAT 4731

 31531970 AGCCACCGTTCATGTCAAGAAATAATTAGGGCCAGGCGCGGTGGCTCACTACTGTAATCC 31532029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4732 AGCCACCGTTCATGTCAAGAAATAATTAGGGCCAGGCGCGGTGGCTCACTACTGTAATCC 4791

 31532030 CAACACTTTTTTGTCCCCTTTTCCTCCTGTGCTGTCTTCCTATGTGTTTGTTTGTTTGTT 31532089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4792 CAACACTTTTTTGTCCCCTTTTCCTCCTGTGCTGTCTTCCTATGTGTTTGTTTGTTTGTT 4851

 31532090 TTAGTGACCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGTGCATGCCTGT 31532149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4852 TTAGTGACCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGTGCATGCCTGT 4911

 31532150 AATCCCAGCTACTTGAGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGTTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTT 31532209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4912 AATCCCAGCTACTTGAGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGTTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTT 4971

 31532210 GCAGTGAGCTGAGATCATGTCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGACTCTGTCT 31532269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4972 GCAGTGAGCTGAGATCATGTCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGACTCTGTCT 5031

 31532270 AAAAAAAAAATAATAATAAAAATAAAGTGACTTATGTGCCACTATTACAGTATTACAGCA 31532329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5032 AAAAAAAAAATAATAATAAAAATAAAGTGACTTATGTGCCACTATTACAGTATTACAGCA 5091

 31532330 TTCTGTATTTTTCTATGTGTTTACATTTATCAGAAAGCTTTGTATTTTCATATGCTTTCA 31532389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5092 TTCTGTATTTTTCTATGTGTTTACATTTATCAGAAAGCTTTGTATTTTCATATGCTTTCA 5151

 31532390 TGTTCCTGCCTAGCATCCTTTTGTTTCAACTTGAAGGGGTCCCTTTAGCATTTCTTTAAA 31532449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5152 TGTTCCTGCCTAGCATCCTTTTGTTTCAACTTGAAGGGGTCCCTTTAGCATTTCTTTAAA 5211

 31532450 GGCAGGTCTAATGGTGATGAACTCCTCTTGTTTTTATTTATCTGGGAAAATTTTTATTTT 31532509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5212 GGCAGGTCTAATGGTGATGAACTCCTCTTGTTTTTATTTATCTGGGAAAATTTTTATTTT 5271

 31532510 TCCTTCATTTTTAAAGGACAGCTTTCCTGGATATAGTATTTTTGGATGAGAGTTTTTGTT 31532569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5272 TCCTTCATTTTTAAAGGACAGCTTTCCTGGATATAGTATTTTTGGATGAGAGTTTTTGTT 5331

 31532570 CTTTTTATAATGTGTCTCCTTGTGGATTTCTTTGACTTTATCCTAGTTGGAATCCCTTGA 31532629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5332 CTTTTTATAATGTGTCTCCTTGTGGATTTCTTTGACTTTATCCTAGTTGGAATCCCTTGA 5391

 31532630 GCTTCTTGAATATAGGTTTCTTTTCCTTTTTAAGATTTGAAACATTTTCAGCCATTATTT 31532689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5392 GCTTCTTGAATATAGGTTTCTTTTCCTTTTTAAGATTTGAAACATTTTCAGCCATTATTT 5451

 31532690 ATTCAGATAAGCTTTTTGTCCCTTTCTCTCTCTCTGTCTCTC 31532731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5452 ATTCAGATAAGCTTTTTGTCCCTTTCTCTCTCTCTGTCTCTC 5493

Alignment time is 4.62799 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31515486,31539389] =>     23904 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    2153] =>      2153 nucs 'mol-32-32f0-185040_2153'

Score:        2122
Aligned:      2144        nucs
Identic:      2142 (100%) nucs =>      1631 (100%)       511 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31523255,31524886] EXCISED REGION [31524975,31525486]
 second seq =>  [       1,    1632] EXCISED REGION [    1642,    2153]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        88 nucs [31524887,31524974]
 second seq =>         9 nucs [1633,1641]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [1632,1632] to [1641,1641]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [1633,1634] to [1640,1641]

 31523255 CTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGCCACTTTGCCT 31523314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGCCACTTTGCCT 60

 31523315 ATTTTATTTTATTTTGAGATGGAGTTTTGCTCTTATTGCCCAGACTGGAGTGCAATGGCG 31523374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATTTTATTTTATTTTGAGATGGAGTTTTGCTCTTATTGCCCAGACTGGAGTGCAATGGCG 120

 31523375 CAATTGCAGCTCACCACAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCT 31523434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAATTGCAGCTCACCACAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCT 180

 31523435 CCCAAGTAGGTGGGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCCAACTAATTTTGTAGTTTTAGT 31523494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCCAAGTAGGTGGGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCCAACTAATTTTGTAGTTTTAGT 240

 31523495 AGAGATGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCT 31523554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGAGATGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCT 300

 31523555 GCCCACCTTGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGAGTGAGTGCACCTGGCCCACTTTGC 31523614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GCCCACCTTGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGAGTGAGTGCACCTGGCCCACTTTGC 360

 31523615 TCATTTTCTAATTGGGTTATTCGTTTTCTGGCTATTGAGTTGTTTGAGTTTCTTATTTAT 31523674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCATTTTCTAATTGGGTTATTCGTTTTCTGGCTATTGAGTTGTTTGAGTTTCTTATTTAT 420

 31523675 TGTGGATGTTACTCCCTTATCAGATGTATGATTTACATATATTTTCTGTCACTCTGTGGG 31523734
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
      421 TGTGGATGTTACTCCCTTATCAGATGTATGATTTACATATATTTTCTGTCACTTTGTGGG 480

 31523735 TTATCTCTTTACTTTGTTCATTGTTTCCTTTCTGTCCAAAAGCTTTGTATCTTGTCTAAA 31523794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTATCTCTTTACTTTGTTCATTGTTTCCTTTCTGTCCAAAAGCTTTGTATCTTGTCTAAA 540

 31523795 ATCCCATTTGTCTATTTTTGCTTTTATTTATTTTTATTTTTATTTTTATTTTTTATTTTT 31523854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATCCCATTTGTCTATTTTTGCTTTTATTTATTTTTATTTTTATTTTTATTTTTTATTTTT 600

 31523855 TTGAAACGGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGTTGGAGTGCAGTGGTGCAATCTCAGCTCAC 31523914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTGAAACGGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGTTGGAGTGCAGTGGTGCAATCTCAGCTCAC 660

 31523915 TGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGGAAGTCTCCTACTCCAACTTCCTGAGTAGCTGGG 31523974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGGAAGTCTCCTACTCCAACTTCCTGAGTAGCTGGG 720

 31523975 ATTATAGGCGTGTGCCACCATGCCTAGCTAATTTTTGTATTTTTTGGTAGAGACAGGATT 31524034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATTATAGGCGTGTGCCACCATGCCTAGCTAATTTTTGTATTTTTTGGTAGAGACAGGATT 780

 31524035 TCACCATGTTGGCCAGGCTGGTGTTGAACTCTTGACCTCAGGCAATCCGCCTGACTCAGC 31524094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCACCATGTTGGCCAGGCTGGTGTTGAACTCTTGACCTCAGGCAATCCGCCTGACTCAGC 840

 31524095 CTCCCAAAGTGCTGGGATTACACGTGTGAGCCACCGCGCCTGGCCTATTTTTGCTTTTAT 31524154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTCCCAAAGTGCTGGGATTACACGTGTGAGCCACCGCGCCTGGCCTATTTTTGCTTTTAT 900

 31524155 TACCTGTGCTTTTGGGGTCATAGCTAAATAACCATTGCTCAGATCAATGTCATGGAGCCT 31524214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TACCTGTGCTTTTGGGGTCATAGCTAAATAACCATTGCTCAGATCAATGTCATGGAGCCT 960

 31524215 TTCCTCTAGGTATTCTTCTAGTTGTTTTACAGTCTCAGATCTTATATTTAAGACTTTAAT 31524274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTCCTCTAGGTATTCTTCTAGTTGTTTTACAGTCTCAGATCTTATATTTAAGACTTTAAT 1020

 31524275 CCATTTTGAGTTGATTTTTTATACTGTGTGAGATAAGGATCCAATTTTATTCTTCTGTAT 31524334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CCATTTTGAGTTGATTTTTTATACTGTGTGAGATAAGGATCCAATTTTATTCTTCTGTAT 1080

 31524335 GTGGATCCAATTTTCCTAGTACAGTTTATTGAAAAGACTGTCTTTTCCCCATTATGTATT 31524394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GTGGATCCAATTTTCCTAGTACAGTTTATTGAAAAGACTGTCTTTTCCCCATTATGTATT 1140

 31524395 AGTAACACCTTTGTCAAAAATCAATTGACTATTAGTGCATGGGTTTATTTCTGGGTTTTC 31524454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGTAACACCTTTGTCAAAAATCAATTGACTATTAGTGCATGGGTTTATTTCTGGGTTTTC 1200

 31524455 TATCTTGTTACATTAGTCGATGTGTCTATTTTTATGCCAGCACCATACTGTTTTGATTAT 31524514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TATCTTGTTACATTAGTCGATGTGTCTATTTTTATGCCAGCACCATACTGTTTTGATTAT 1260

 31524515 ATTAGCTTTATAATATATTTTGAAATCAGGGACTGTGATGTCTTTAGCTTTGTTCTTTTT 31524574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATTAGCTTTATAATATATTTTGAAATCAGGGACTGTGATGTCTTTAGCTTTGTTCTTTTT 1320

 31524575 GCTCAAGATTGTTTTGGCTAGCCAGGGTCTTTTATGATTGCATATGAATTTAAGGATTGT 31524634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GCTCAAGATTGTTTTGGCTAGCCAGGGTCTTTTATGATTGCATATGAATTTAAGGATTGT 1380

 31524635 TTTATTTCTATAAGAAATGACATTGGAATTTTGATAGGGACTGCATTGAATCTGTAGATT 31524694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTTATTTCTATAAGAAATGACATTGGAATTTTGATAGGGACTGCATTGAATCTGTAGATT 1440

 31524695 GCTTTGGGTAGTATGAATATTTTAATAATATTAATTCTTCTAATTTATCAACACAAGATA 31524754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GCTTTGGGTAGTATGAATATTTTAATAATATTAATTCTTCTAATTTATCAACACAAGATA 1500

 31524755 GCTTTCCATTTATTTGTGTTTTCTTAAACAATGTTTTAGTTTCCAGTGTACAGATCTTTT 31524814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GCTTTCCATTTATTTGTGTTTTCTTAAACAATGTTTTAGTTTCCAGTGTACAGATCTTTT 1560

 31524815 AACTTCTTGGTTAAATTTACCCCTAAGTATTTTATTTTATTTTAAAATACCTGGCTAATT 31524874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AACTTCTTGGTTAAATTTACCCCTAAGTATTTTATTTTATTTTAAAATACCTGGCTAATT 1620

 31524875 TTGTATTTAATT 31524886
          ||||||||||||
     1621 TTGTATTTAATT 1632

EXCISED REGION

 31524975 AGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCAGACCTCAGGTGATCCGACTGC 31525034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1642 AGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCAGACCTCAGGTGATCCGACTGC 1701

 31525035 CTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGTATTAGAAGCATGAGCCACTGCCCACTGCACCTAGCTGA 31525094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1702 CTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGTATTAGAAGCATGAGCCACTGCCCACTGCACCTAGCTGA 1761

 31525095 AAACCACACTTTCTGTTGATTAAATAATATTTCACCTTATGGAGTTACAAATTTTCATTT 31525154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1762 AAACCACACTTTCTGTTGATTAAATAATATTTCACCTTATGGAGTTACAAATTTTCATTT 1821

 31525155 TATGGGGTTATAATCACTTACTTAGCTTGTTATCTTTTGTTGGACATTAATGTGGTTTCT 31525214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1822 TATGGGGTTATAATCACTTACTTAGCTTGTTATCTTTTGTTGGACATTAATGTGGTTTCT 1881

 31525215 AACTTTTCATTATCAAAAAATAAAAGAAAATGGACAAAACCTCAGAAAGACACAAACTAC 31525274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1882 AACTTTTCATTATCAAAAAATAAAAGAAAATGGACAAAACCTCAGAAAGACACAAACTAC 1941

 31525275 TAAAGCTGACTTAATAAGAAATAGAAAATCTGAATATATAGAAAATCTGAATGTAACAAG 31525334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1942 TAAAGCTGACTTAATAAGAAATAGAAAATCTGAATATATAGAAAATCTGAATGTAACAAG 2001

 31525335 TAAGGAGATTGGATTAGTAATAAAATTTCCCACAAAGAGAAGTACACATTCAGATGGTTT 31525394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2002 TAAGGAGATTGGATTAGTAATAAAATTTCCCACAAAGAGAAGTACACATTCAGATGGTTT 2061

 31525395 CACTGGTAAATTCTACCAAATATTTAAAGATTTTTCTTTTTTTTTGTTGAGACAGAGTCT 31525454
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     2062 CACTGGTAAATTCTACCAAATATTTAAAGATTTTTCTTTTTTTTTGTTGAGGCAGAGTCT 2121

 31525455 CACTCTATTGCCCAGGCTGGAGTACAATGGTG 31525486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||
     2122 CACTCTATTGCCCAGGCTGGAGTACAATGGTG 2153

Alignment time is 1.92093 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31515486,31539389] =>     23904 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    3994] =>      3994 nucs 'mol-32-32fb-181057_3994'

Score:        3983
Aligned:      3994        nucs
Identic:      3993 (100%) nucs =>       807 (100%)      3186 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31528258,31529064] EXCISED REGION [31529066,31532252]
 second seq =>  [       1,     807] EXCISED REGION [     808,    3994]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [31529065,31529065]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [31532183,31532183]
 second seq =>         1 nucs [3925,3925]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        12 nucs [31529065,31529076] to [31529066,31529077]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31528258 AAATGTAAGAGCCAAAATTATAAGACTTTTAGAAGAAAATAAATGGAAAATACTTGTGAC 31528317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAATGTAAGAGCCAAAATTATAAGACTTTTAGAAGAAAATAAATGGAAAATACTTGTGAC 60

 31528318 CTTAGACAGTGTGTCTTAGATATGACACCAAAAACAAGCTACAAAAGAAAAAAACAGATA 31528377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTTAGACAGTGTGTCTTAGATATGACACCAAAAACAAGCTACAAAAGAAAAAAACAGATA 120

 31528378 AATTGGACTTTGTCAAAATTAAAAACTTTTGGGCTGCAAAGGATACCGTCAAGAAAGTGA 31528437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AATTGGACTTTGTCAAAATTAAAAACTTTTGGGCTGCAAAGGATACCGTCAAGAAAGTGA 180

 31528438 AAGGGTAACCTGAAAGAAAATACTTGCAAATCATATATCTGATAAGGGACTAGTATCCAG 31528497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAGGGTAACCTGAAAGAAAATACTTGCAAATCATATATCTGATAAGGGACTAGTATCCAG 240

 31528498 AATATATAAAGCACTCTTGCAACTTGATAAAAATGATAAATAACCAAATTAAGATACGGG 31528557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AATATATAAAGCACTCTTGCAACTTGATAAAAATGATAAATAACCAAATTAAGATACGGG 300

 31528558 TAAAGGATCTAAATAAACATTTCTTCAAAGAAGATGTACAAATGGCTAATAAGTATATTA 31528617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TAAAGGATCTAAATAAACATTTCTTCAAAGAAGATGTACAAATGGCTAATAAGTATATTA 360

 31528618 AATGATGGTGAACATCATTAGCTATCAGGGAAATGCATATTAAAACTATAATGAGATCCC 31528677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AATGATGGTGAACATCATTAGCTATCAGGGAAATGCATATTAAAACTATAATGAGATCCC 420

 31528678 ACTTTACACTTGCCAGGATAACTATAGATAATAGCAATGGTTGGCTGGGATGTGGACAAA 31528737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACTTTACACTTGCCAGGATAACTATAGATAATAGCAATGGTTGGCTGGGATGTGGACAAA 480

 31528738 CTGGGACTCTTACACATTGCTGGATAGAATGTAGAAAGCTGGCCAGGTACGGTGGCTCAG 31528797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTGGGACTCTTACACATTGCTGGATAGAATGTAGAAAGCTGGCCAGGTACGGTGGCTCAG 540

 31528798 GCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGCGGATTATGAGGTCAGGAGTTTGA 31528857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGCGGATTATGAGGTCAGGAGTTTGA 600

 31528858 GACCAGCCTGGCCAGCATGGTGTAACCCCGTCTCTACTAAACATACAAAAATTAGCAGGG 31528917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GACCAGCCTGGCCAGCATGGTGTAACCCCGTCTCTACTAAACATACAAAAATTAGCAGGG 660

 31528918 CATGATGGCGGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTG 31528977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CATGATGGCGGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTG 720

 31528978 AACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCAGAGATCATGCCATTGCGTTCCAGTCTGGGCA 31529037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCAGAGATCATGCCATTGCGTTCCAGTCTGGGCA 780

 31529038 ACAAGAGCAAAACTCCAAACTCTGTTT 31529064
          |||||||||||||||||||||||||||
      781 ACAAGAGCAAAACTCCAAACTCTGTTT 807

EXCISED REGION

 31529066 AAAAAAAAAAAAGAAAAAGAACATAGAAAGCTGCAGTCACTTTGGAAAACAGTCTGGCAG 31529125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      808 AAAAAAAAAAAAGAAAAAGAACATAGAAAGCTGCAGTCACTTTGGAAAACAGTCTGGCAG 867

 31529126 TTCCTCAAAAATTAAGTGTAGACTTACCATATTACCCAACAGTTCCACTCCCAAGTGTAT 31529185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      868 TTCCTCAAAAATTAAGTGTAGACTTACCATATTACCCAACAGTTCCACTCCCAAGTGTAT 927

 31529186 ACCCAAGAGAAATGAAAACATATGTTCACATAAAATCTTGTACATGAATGTTTATAGTAG 31529245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      928 ACCCAAGAGAAATGAAAACATATGTTCACATAAAATCTTGTACATGAATGTTTATAGTAG 987

 31529246 CATTATTTATAATACAAAAGTGGAAACAACCCAAATGTCAACTTCCAAATGGATAAAGTG 31529305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      988 CATTATTTATAATACAAAAGTGGAAACAACCCAAATGTCAACTTCCAAATGGATAAAGTG 1047

 31529306 TGGTATGGTGATACAATGGAATGTTATTTAATAATAAAAAGGAATAAAGTACTGATGCAT 31529365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1048 TGGTATGGTGATACAATGGAATGTTATTTAATAATAAAAAGGAATAAAGTACTGATGCAT 1107

 31529366 GCAACAACATGGATGAACCTTGAAAATACTGTGCTAAGTGAAAGAAGCCAACCACAAAAT 31529425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1108 GCAACAACATGGATGAACCTTGAAAATACTGTGCTAAGTGAAAGAAGCCAACCACAAAAT 1167

 31529426 ACCATATATTGTGTGATTCTGCTTAAATGACATGTCCAGAATGTCCATATTAAAGTAGAT 31529485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1168 ACCATATATTGTGTGATTCTGCTTAAATGACATGTCCAGAATGTCCATATTAAAGTAGAT 1227

 31529486 TAGTGGTTTCCTGAGGCTGGGGGAGGGAGTTGGGGAAATTGCGTAGTGACTACTGGGTAA 31529545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1228 TAGTGGTTTCCTGAGGCTGGGGGAGGGAGTTGGGGAAATTGCGTAGTGACTACTGGGTAA 1287

 31529546 AGAGTTTCTTTCTGGGGTGATGAAATGGTCTAAAATAGAATGTGGTGGTGGTTGCACAGC 31529605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1288 AGAGTTTCTTTCTGGGGTGATGAAATGGTCTAAAATAGAATGTGGTGGTGGTTGCACAGC 1347

 31529606 TCTGAAAATACTAAAAACCATTGAATGAGCACTTTAAATTGGTAAATTTTTATGTGAATT 31529665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1348 TCTGAAAATACTAAAAACCATTGAATGAGCACTTTAAATTGGTAAATTTTTATGTGAATT 1407

 31529666 ATGATTCAATAAAGTTGTGTTTAGATATTACTAAAAATGATGGTACAAATATTCTTTTTC 31529725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1408 ATGATTCAATAAAGTTGTGTTTAGATATTACTAAAAATGATGGTACAAATATTCTTTTTC 1467

 31529726 ACAAATGTTTTTTGTTGTTGTTTATAGTTGTTTATTTGTACATCTAGTAATTTGTCCCAA 31529785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1468 ACAAATGTTTTTTGTTGTTGTTTATAGTTGTTTATTTGTACATCTAGTAATTTGTCCCAA 1527

 31529786 GGAAAGAGTATGTAAAAGAACATAAGTCACTTTAAGGCCTTTAATGTATACTACAAAATT 31529845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1528 GGAAAGAGTATGTAAAAGAACATAAGTCACTTTAAGGCCTTTAATGTATACTACAAAATT 1587

 31529846 GCACTCTAGAAGGTTTATACAGTTTTGCATTTCATTAGCCTGTTTTTTTTATCTTTGACA 31529905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1588 GCACTCTAGAAGGTTTATACAGTTTTGCATTTCATTAGCCTGTTTTTTTTATCTTTGACA 1647

 31529906 ACCTAAAGAATTTATTAGTGGTATTCATCTGAGGATCCTCTAGGTCTATCAGAGTGTCTT 31529965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1648 ACCTAAAGAATTTATTAGTGGTATTCATCTGAGGATCCTCTAGGTCTATCAGAGTGTCTT 1707

 31529966 TCTTATAGAAGGCATTCAATAAATAAATGTCCTAAGTGAGCAAAACATTTTTGGTTGATT 31530025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1708 TCTTATAGAAGGCATTCAATAAATAAATGTCCTAAGTGAGCAAAACATTTTTGGTTGATT 1767

 31530026 TTTAGGTGCAAATGGTTTCTTTTGATTTTAATTAAGATGCCTTTGTTTATTAGTGATGTT 31530085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1768 TTTAGGTGCAAATGGTTTCTTTTGATTTTAATTAAGATGCCTTTGTTTATTAGTGATGTT 1827

 31530086 GACATATTTTCTTAATCTATTGGCTTTGTATAACTTTATGAATTGTCTCTTCATGTCCTT 31530145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1828 GACATATTTTCTTAATCTATTGGCTTTGTATAACTTTATGAATTGTCTCTTCATGTCCTT 1887

 31530146 TGCCTACTTTTCTATTGTGGTAACTATCTTTTATAAATGTTGTATAATTATTTAAAAATA 31530205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1888 TGCCTACTTTTCTATTGTGGTAACTATCTTTTATAAATGTTGTATAATTATTTAAAAATA 1947

 31530206 CATTAGGTTGGGCATGGTAGATCATGCCTGTAATCCCAGCTCTCTGGGAGGCCAAGGTGG 31530265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1948 CATTAGGTTGGGCATGGTAGATCATGCCTGTAATCCCAGCTCTCTGGGAGGCCAAGGTGG 2007

 31530266 GCAGATTGCTTGAGCCTAACAGTTCGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCCATCT 31530325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2008 GCAGATTGCTTGAGCCTAACAGTTCGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCCATCT 2067

 31530326 CTAAAAAAAAAAACCAATAAAAATATATTAAAAGATTAACTGATTGTCTATCATATGGAT 31530385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2068 CTAAAAAAAAAAACCAATAAAAATATATTAAAAGATTAACTGATTGTCTATCATATGGAT 2127

 31530386 TACAAATATCCCCCCCAATTTGTCATTTGCTTGTTAATTTTATTTATGATGACTTAAAAA 31530445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2128 TACAAATATCCCCCCCAATTTGTCATTTGCTTGTTAATTTTATTTATGATGACTTAAAAA 2187

 31530446 TTACAATATATTTTTTGGTGTTCAAGTCAGTTTTTGTCCCCATTGTGATATTTTCCTTTG 31530505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2188 TTACAATATATTTTTTGGTGTTCAAGTCAGTTTTTGTCCCCATTGTGATATTTTCCTTTG 2247

 31530506 CCTGTTTATCACTTTCTTAGAGAAAAGATAAATACTGATTCGTTCTTTTGTAGGTGTTTT 31530565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2248 CCTGTTTATCACTTTCTTAGAGAAAAGATAAATACTGATTCGTTCTTTTGTAGGTGTTTT 2307

 31530566 ATGATTTCATTGAAAATAAAATCTTCAACGCATCTAGTATTCATTTGGGTGTAAGATAAA 31530625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2308 ATGATTTCATTGAAAATAAAATCTTCAACGCATCTAGTATTCATTTGGGTGTAAGATAAA 2367

 31530626 AGATAACAACGTAGGTTTCTCTTATAGTTCATCAGGTATCCTACTACTGTTTATTGAGTC 31530685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2368 AGATAACAACGTAGGTTTCTCTTATAGTTCATCAGGTATCCTACTACTGTTTATTGAGTC 2427

 31530686 ATGTTTTCTGTTACCACTCTTACTATATACCAGTTTTACATACATTTGGGTTGGTTTCTG 31530745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2428 ATGTTTTCTGTTACCACTCTTACTATATACCAGTTTTACATACATTTGGGTTGGTTTCTG 2487

 31530746 AGCTTTCTATTGTCTTCCATTGCTTTGTTTAAAATTTAAAGTTTATTATTCTGACTTTCC 31530805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2488 AGCTTTCTATTGTCTTCCATTGCTTTGTTTAAAATTTAAAGTTTATTATTCTGACTTTCC 2547

 31530806 ATACTTGAATATGGTCGAATAAGTCCTCCTTTATTAATCTTGTTTTATTTAAAAATGGTC 31530865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2548 ATACTTGAATATGGTCGAATAAGTCCTCCTTTATTAATCTTGTTTTATTTAAAAATGGTC 2607

 31530866 ATTTTCACTCATTTTCCAGTTCAGTAGTTTTATTCTCTCAGTGTAATGTGATTTATCACC 31530925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2608 ATTTTCACTCATTTTCCAGTTCAGTAGTTTTATTCTCTCAGTGTAATGTGATTTATCACC 2667

 31530926 CCATTGCTCACCCTATTCATCTCCCAATACCCAGCTGAAAAACTTTAGAAGACTGAGGCT 31530985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2668 CCATTGCTCACCCTATTCATCTCCCAATACCCAGCTGAAAAACTTTAGAAGACTGAGGCT 2727

 31530986 CTTGCCCTGGCCCCATCACTTTCTAGCTATGTGGGCTTAGGCTAGTTATTGAACATGTCT 31531045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2728 CTTGCCCTGGCCCCATCACTTTCTAGCTATGTGGGCTTAGGCTAGTTATTGAACATGTCT 2787

 31531046 GACTCTCACTTTTCTCCTCTGTAAGTCAGTGAGAATTATATACTTCTTATAAGGTTGTGA 31531105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2788 GACTCTCACTTTTCTCCTCTGTAAGTCAGTGAGAATTATATACTTCTTATAAGGTTGTGA 2847

 31531106 GGTTCAAATGGAATAATGTGTACAGAGGCACTTGGTAAACAATGTAGTCATATGCAAGTC 31531165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2848 GGTTCAAATGGAATAATGTGTACAGAGGCACTTGGTAAACAATGTAGTCATATGCAAGTC 2907

 31531166 ATATGCAAGTCATATGTAGTCAGCTTGGTGAATTTTGAGAAAGTAAATGCAAGTTCTTTT 31531225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2908 ATATGCAAGTCATATGTAGTCAGCTTGGTGAATTTTGAGAAAGTAAATGCAAGTTCTTTT 2967

 31531226 TATGGTTTTACCTAAGGGGCCAGTGAGGGCCAGAGAAGTGCCGGGACCTATGTAAGGTCG 31531285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2968 TATGGTTTTACCTAAGGGGCCAGTGAGGGCCAGAGAAGTGCCGGGACCTATGTAAGGTCG 3027

 31531286 CAAGCAAGTTCATGTGGAATGCATCTAGAACTAGAACGCTAGCCTGTGTCCCAGGGCCCT 31531345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3028 CAAGCAAGTTCATGTGGAATGCATCTAGAACTAGAACGCTAGCCTGTGTCCCAGGGCCCT 3087

 31531346 TCCAACTGGGCTCTGCTGCCTGCAGTCCTGGGTGCCTTCTAATTAGCCTGTGTAGTGGTC 31531405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3088 TCCAACTGGGCTCTGCTGCCTGCAGTCCTGGGTGCCTTCTAATTAGCCTGTGTAGTGGTC 3147

 31531406 TTGGTAAAAGTGTTTCTCCTGTACTGTCCCCTATAGGTTGTGGCTGGCCATACCATTTCC 31531465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3148 TTGGTAAAAGTGTTTCTCCTGTACTGTCCCCTATAGGTTGTGGCTGGCCATACCATTTCC 3207

 31531466 CTGGTTCCCCCCACGCTCCTGATGACCTGGAAAGGCCATTTGAATAGTGTGGCAGACATC 31531525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3208 CTGGTTCCCCCCACGCTCCTGATGACCTGGAAAGGCCATTTGAATAGTGTGGCAGACATC 3267

 31531526 CTGTATGTGGACAACTTCCAGCTGGTTATCAGCGCTGGCCAGGACCGGGACGTCAAGGCT 31531585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3268 CTGTATGTGGACAACTTCCAGCTGGTTATCAGCGCTGGCCAGGACCGGGACGTCAAGGCT 3327

 31531586 TGGAAACTCTCCGGTGATGCCATTGGTATGGGTCCTGCTGAAGCTCAGCCATGCCCATGG 31531645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3328 TGGAAACTCTCCGGTGATGCCATTGGTATGGGTCCTGCTGAAGCTCAGCCATGCCCATGG 3387

 31531646 CCCTTCTTGTCTCTGTCCCTGTCTGAACATAAGCTGGTATGAACTTTGTACTCTGTGGGG 31531705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3388 CCCTTCTTGTCTCTGTCCCTGTCTGAACATAAGCTGGTATGAACTTTGTACTCTGTGGGG 3447

 31531706 AGGGACTCTCAGGCCACAGCAACTGCCTTCACTTAAATAATATTACAGTCTGTCCAATTA 31531765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3448 AGGGACTCTCAGGCCACAGCAACTGCCTTCACTTAAATAATATTACAGTCTGTCCAATTA 3507

 31531766 TCCATTCAGCAAACGGTCCATCCATTCACCCATCCACCCAATATTATTCACCTATGTATA 31531825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3508 TCCATTCAGCAAACGGTCCATCCATTCACCCATCCACCCAATATTATTCACCTATGTATA 3567

 31531826 TTTTTGCAAATCATATATCTGATAAAGCATATTCCTTTCTCTTTTAAAAAATAAACTTAA 31531885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3568 TTTTTGCAAATCATATATCTGATAAAGCATATTCCTTTCTCTTTTAAAAAATAAACTTAA 3627

 31531886 TTGTTGCATTGTATATAAAGAAAAACATACAAACCAGAAGGGTTCAGCTTGGTGAATTTT 31531945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3628 TTGTTGCATTGTATATAAAGAAAAACATACAAACCAGAAGGGTTCAGCTTGGTGAATTTT 3687

 31531946 GAGAAAGTAAATACATACCCATATAGCCACCGTTCATGTCAAGAAATAATTAGGGCCAGG 31532005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3688 GAGAAAGTAAATACATACCCATATAGCCACCGTTCATGTCAAGAAATAATTAGGGCCAGG 3747

 31532006 CGCGGTGGCTCACTACTGTAATCCCAACACTTTTTTGTCCCCTTTTCCTCCTGTGCTGTC 31532065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3748 CGCGGTGGCTCACTACTGTAATCCCAACACTTTTTTGTCCCCTTTTCCTCCTGTGCTGTC 3807

 31532066 TTCCTATGTGTTTGTTTGTTTGTTTTAGTGACCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAG 31532125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3808 TTCCTATGTGTTTGTTTGTTTGTTTTAGTGACCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAG 3867

 31532126 CCAGGCATGGTGGTGCATGCCTGTAATCCCAGCTACTTGAGAGGCTGAGGCAGGAGAATC 31532185
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     3868 CCAGGCATGGTGGTGCATGCCTGTAATCCCAGCTACTTGAGAGGCTGAGGCAGGAGAGTC 3927

 31532186 GTTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCATGTCACTGCACTCCAGCCT 31532245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3928 GTTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCATGTCACTGCACTCCAGCCT 3987

 31532246 GGGCAAC 31532252
          |||||||
     3988 GGGCAAC 3994

Alignment time is 3.34421 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31515486,31539389] =>     23904 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    2287] =>      2287 nucs 'mol-32-32fb-181408_2287'

Score:        2287
Aligned:      2287        nucs
Identic:      2287 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31523883,31526169]
 second seq =>  [       1,    2287]

 31523883 GGTTGGAGTGCAGTGGTGCAATCTCAGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGGA 31523942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGTTGGAGTGCAGTGGTGCAATCTCAGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGGA 60

 31523943 AGTCTCCTACTCCAACTTCCTGAGTAGCTGGGATTATAGGCGTGTGCCACCATGCCTAGC 31524002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGTCTCCTACTCCAACTTCCTGAGTAGCTGGGATTATAGGCGTGTGCCACCATGCCTAGC 120

 31524003 TAATTTTTGTATTTTTTGGTAGAGACAGGATTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTGTTGAA 31524062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TAATTTTTGTATTTTTTGGTAGAGACAGGATTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTGTTGAA 180

 31524063 CTCTTGACCTCAGGCAATCCGCCTGACTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACACGTGTG 31524122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTCTTGACCTCAGGCAATCCGCCTGACTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACACGTGTG 240

 31524123 AGCCACCGCGCCTGGCCTATTTTTGCTTTTATTACCTGTGCTTTTGGGGTCATAGCTAAA 31524182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGCCACCGCGCCTGGCCTATTTTTGCTTTTATTACCTGTGCTTTTGGGGTCATAGCTAAA 300

 31524183 TAACCATTGCTCAGATCAATGTCATGGAGCCTTTCCTCTAGGTATTCTTCTAGTTGTTTT 31524242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TAACCATTGCTCAGATCAATGTCATGGAGCCTTTCCTCTAGGTATTCTTCTAGTTGTTTT 360

 31524243 ACAGTCTCAGATCTTATATTTAAGACTTTAATCCATTTTGAGTTGATTTTTTATACTGTG 31524302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACAGTCTCAGATCTTATATTTAAGACTTTAATCCATTTTGAGTTGATTTTTTATACTGTG 420

 31524303 TGAGATAAGGATCCAATTTTATTCTTCTGTATGTGGATCCAATTTTCCTAGTACAGTTTA 31524362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGAGATAAGGATCCAATTTTATTCTTCTGTATGTGGATCCAATTTTCCTAGTACAGTTTA 480

 31524363 TTGAAAAGACTGTCTTTTCCCCATTATGTATTAGTAACACCTTTGTCAAAAATCAATTGA 31524422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTGAAAAGACTGTCTTTTCCCCATTATGTATTAGTAACACCTTTGTCAAAAATCAATTGA 540

 31524423 CTATTAGTGCATGGGTTTATTTCTGGGTTTTCTATCTTGTTACATTAGTCGATGTGTCTA 31524482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTATTAGTGCATGGGTTTATTTCTGGGTTTTCTATCTTGTTACATTAGTCGATGTGTCTA 600

 31524483 TTTTTATGCCAGCACCATACTGTTTTGATTATATTAGCTTTATAATATATTTTGAAATCA 31524542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTTTTATGCCAGCACCATACTGTTTTGATTATATTAGCTTTATAATATATTTTGAAATCA 660

 31524543 GGGACTGTGATGTCTTTAGCTTTGTTCTTTTTGCTCAAGATTGTTTTGGCTAGCCAGGGT 31524602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGGACTGTGATGTCTTTAGCTTTGTTCTTTTTGCTCAAGATTGTTTTGGCTAGCCAGGGT 720

 31524603 CTTTTATGATTGCATATGAATTTAAGGATTGTTTTATTTCTATAAGAAATGACATTGGAA 31524662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTTTTATGATTGCATATGAATTTAAGGATTGTTTTATTTCTATAAGAAATGACATTGGAA 780

 31524663 TTTTGATAGGGACTGCATTGAATCTGTAGATTGCTTTGGGTAGTATGAATATTTTAATAA 31524722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTTTGATAGGGACTGCATTGAATCTGTAGATTGCTTTGGGTAGTATGAATATTTTAATAA 840

 31524723 TATTAATTCTTCTAATTTATCAACACAAGATAGCTTTCCATTTATTTGTGTTTTCTTAAA 31524782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TATTAATTCTTCTAATTTATCAACACAAGATAGCTTTCCATTTATTTGTGTTTTCTTAAA 900

 31524783 CAATGTTTTAGTTTCCAGTGTACAGATCTTTTAACTTCTTGGTTAAATTTACCCCTAAGT 31524842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CAATGTTTTAGTTTCCAGTGTACAGATCTTTTAACTTCTTGGTTAAATTTACCCCTAAGT 960

 31524843 ATTTTATTTTATTTTAAAATACCTGGCTAATTTTGTATTTAATTTTATATTGTATTTATT 31524902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATTTTATTTTATTTTAAAATACCTGGCTAATTTTGTATTTAATTTTATATTGTATTTATT 1020

 31524903 TTATTTGTAATAAAATTAAGCATTTTATTTTATTTTAAAATACCTGGCTAATTTTGTATT 31524962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTATTTGTAATAAAATTAAGCATTTTATTTTATTTTAAAATACCTGGCTAATTTTGTATT 1080

 31524963 TTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCAGACCTCAGG 31525022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCAGACCTCAGG 1140

 31525023 TGATCCGACTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGTATTAGAAGCATGAGCCACTGCCCACT 31525082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGATCCGACTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGTATTAGAAGCATGAGCCACTGCCCACT 1200

 31525083 GCACCTAGCTGAAAACCACACTTTCTGTTGATTAAATAATATTTCACCTTATGGAGTTAC 31525142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GCACCTAGCTGAAAACCACACTTTCTGTTGATTAAATAATATTTCACCTTATGGAGTTAC 1260

 31525143 AAATTTTCATTTTATGGGGTTATAATCACTTACTTAGCTTGTTATCTTTTGTTGGACATT 31525202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AAATTTTCATTTTATGGGGTTATAATCACTTACTTAGCTTGTTATCTTTTGTTGGACATT 1320

 31525203 AATGTGGTTTCTAACTTTTCATTATCAAAAAATAAAAGAAAATGGACAAAACCTCAGAAA 31525262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AATGTGGTTTCTAACTTTTCATTATCAAAAAATAAAAGAAAATGGACAAAACCTCAGAAA 1380

 31525263 GACACAAACTACTAAAGCTGACTTAATAAGAAATAGAAAATCTGAATATATAGAAAATCT 31525322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GACACAAACTACTAAAGCTGACTTAATAAGAAATAGAAAATCTGAATATATAGAAAATCT 1440

 31525323 GAATGTAACAAGTAAGGAGATTGGATTAGTAATAAAATTTCCCACAAAGAGAAGTACACA 31525382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GAATGTAACAAGTAAGGAGATTGGATTAGTAATAAAATTTCCCACAAAGAGAAGTACACA 1500

 31525383 TTCAGATGGTTTCACTGGTAAATTCTACCAAATATTTAAAGATTTTTCTTTTTTTTTGTT 31525442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTCAGATGGTTTCACTGGTAAATTCTACCAAATATTTAAAGATTTTTCTTTTTTTTTGTT 1560

 31525443 GAGACAGAGTCTCACTCTATTGCCCAGGCTGGAGTACAATGGTGTGATCTTGACTCACTG 31525502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GAGACAGAGTCTCACTCTATTGCCCAGGCTGGAGTACAATGGTGTGATCTTGACTCACTG 1620

 31525503 CAACCTCTGCCTCCGGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGAT 31525562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CAACCTCTGCCTCCGGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGAT 1680

 31525563 TACAGGCATGCACCACCATGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCA 31525622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TACAGGCATGCACCACCATGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCA 1740

 31525623 CCACATTGGCTAGGCTGGTCTCGAACTCCCAACCTCGTGATCCGCCCACCATGGCCTCCC 31525682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CCACATTGGCTAGGCTGGTCTCGAACTCCCAACCTCGTGATCCGCCCACCATGGCCTCCC 1800

 31525683 AAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACACCTGGCTAAAGAATTAATGTCAATTGC 31525742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACACCTGGCTAAAGAATTAATGTCAATTGC 1860

 31525743 TCACAAACTCTTCCAAAAGAGTTCTCTATGAGGCCAGTATTACCTTGATACCAAAACCAG 31525802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TCACAAACTCTTCCAAAAGAGTTCTCTATGAGGCCAGTATTACCTTGATACCAAAACCAG 1920

 31525803 ATAAAGATATCACAGGAAAATAAAACTGTAGACCAAATATTTTTATGAATATAGATACAA 31525862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ATAAAGATATCACAGGAAAATAAAACTGTAGACCAAATATTTTTATGAATATAGATACAA 1980

 31525863 AAATCTTCAAAATACTAGCAAATTGAAACCAACAACATATGAAAATGATTATACACCATG 31525922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AAATCTTCAAAATACTAGCAAATTGAAACCAACAACATATGAAAATGATTATACACCATG 2040

 31525923 ACCAAGTAAGATTTATCCCAGGAATGCAAAGTTGGCTAAATATCCAAAATCAATTAATGT 31525982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ACCAAGTAAGATTTATCCCAGGAATGCAAAGTTGGCTAAATATCCAAAATCAATTAATGT 2100

 31525983 AATACACCATATTAACTGAATAAAAAACAAAAGCCATATGATTATGCCAATAGATGCAAA 31526042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AATACACCATATTAACTGAATAAAAAACAAAAGCCATATGATTATGCCAATAGATGCAAA 2160

 31526043 AAGAGCATTTAACAAAATTGAACACCGTTTTCTGATTGAAACACCCAATAAACTAGAAAT 31526102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AAGAGCATTTAACAAAATTGAACACCGTTTTCTGATTGAAACACCCAATAAACTAGAAAT 2220

 31526103 AGAAACTCCTTCAACCTGATAAAAGCCATTTATGAAAACTCACAGGTAGCATAAAACTTC 31526162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AGAAACTCCTTCAACCTGATAAAAGCCATTTATGAAAACTCACAGGTAGCATAAAACTTC 2280

 31526163 ATGTTGA 31526169
          |||||||
     2281 ATGTTGA 2287

Alignment time is 1.69819 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31515486,31539389] =>     23904 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    4164] =>      4164 nucs 'mol-32-3306-141027_4164'

Score:        4091
Aligned:      4166        nucs
Identic:      4151 (100%) nucs =>       978 (100%)      3173 (100%)
Gaps:           12 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31524507,31525486] EXCISED REGION [31529390,31532574]
 second seq =>  [       1,     980] EXCISED REGION [     990,    4164]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3903 nucs [31525487,31529389]
 second seq =>         9 nucs [981,989]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31524507 TTGATTATATTAGCTTTATAATATATTTTGAAATCAGGGACTGTGATGTCTTTAGCTTTG 31524566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTGATTATATTAGCTTTATAATATATTTTGAAATCAGGGACTGTGATGTCTTTAGCTTTG 60

 31524567 TTCTTTTTGCTCAAGATTGTTTTGGCTAGCCAGGGTCTTTTATGATTGCATATGAATTTA 31524626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTCTTTTTGCTCAAGATTGTTTTGGCTAGCCAGGGTCTTTTATGATTGCATATGAATTTA 120

 31524627 AGGATTGTTTTATTTCTATAAGAAATGACATTGGAATTTTGATAGGGACTGCATTGAATC 31524686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGGATTGTTTTATTTCTATAAGAAATGACATTGGAATTTTGATAGGGACTGCATTGAATC 180

 31524687 TGTAGATTGCTTTGGGTAGTATGAATATTTTAATAATATTAATTCTTCTAATTTATCAAC 31524746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGTAGATTGCTTTGGGTAGTATGAATATTTTAATAATATTAATTCTTCTAATTTATCAAC 240

 31524747 ACAAGATAGCTTTCCATTTATTTGTGTTTTCTTAAACAATGTTTTAGTTTCCAGTGTACA 31524806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACAAGATAGCTTTCCATTTATTTGTGTTTTCTTAAACAATGTTTTAGTTTCCAGTGTACA 300

 31524807 GATCTTTTAACTTCTTGGTTAAATTTACCCCTAAGTATTTTATTTTATTTTAAAATACCT 31524866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GATCTTTTAACTTCTTGGTTAAATTTACCCCTAAGTATTTTATTTTATTTTAAAATACCT 360

 31524867 GGCTAATTTTGTATTTAATTTTATATTGTATTTATTTTATTTGTAATAAAATTAAGCATT 31524926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGCTAATTTTGTATTTAATTTTATATTGTATTTATTTTATTTGTAATAAAATTAAGCATT 420

 31524927 TTATTTTATTTTAAAATACCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCA 31524986
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
      421 TTATTTTATTTTAAAATACCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGATAGGGTTTCTCCA 480

 31524987 TGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCAGACCTCAGGTGATCCGACTGCCTCGGCCTCCCA 31525046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCAGACCTCAGGTGATCCGACTGCCTCGGCCTCCCA 540

 31525047 AAGTGCTGGTATTAGAAGCATGAGCCACTGCCCACTGCACCTAGCTGAAAACCACACTTT 31525106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAGTGCTGGTATTAGAAGCATGAGCCACTGCCCACTGCACCTAGCTGAAAACCACACTTT 600

 31525107 CTGTTGATTAAATAATATTTCACCTTATGGAGTTACAAATTTTCATTTTATGGGGTTATA 31525166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTGTTGATTAAATAATATTTCACCTTATGGAGTTACAAATTTTCATTTTATGGGGTTATA 660

 31525167 ATCACTTACTTAGCTTGTTATCTTTTGTTGGACATTAATGTGGTTTCTAACTTTTCATTA 31525226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATCACTTACTTAGCTTGTTATCTTTTGTTGGACATTAATGTGGTTTCTAACTTTTCATTA 720

 31525227 TCAAAAAATAAAAGAAAATGGACAAAACCTCAGAAAGACACAAACTACTAAAGCTGACTT 31525286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCAAAAAATAAAAGAAAATGGACAAAACCTCAGAAAGACACAAACTACTAAAGCTGACTT 780

 31525287 AATAAGAAATAGAAAATCTGAATATATAGAAAATCTGAATGTAACAAGTAAGGAGATTGG 31525346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AATAAGAAATAGAAAATCTGAATATATAGAAAATCTGAATGTAACAAGTAAGGAGATTGG 840

 31525347 ATTAGTAATAAAATTTCCCACAAAGAGAAGTACACATTCAGATGGTTTCACTGGTAAATT 31525406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATTAGTAATAAAATTTCCCACAAAGAGAAGTACACATTCAGATGGTTTCACTGGTAAATT 900

 31525407 CTACCAAATATTTAAAGATTTTTCTTTTTTTTTGTTGAGACAGAGTCTCACTCTATTGCC 31525466
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
      901 CTACCAAATATTTAAAGATTTTTCTTTTTTTTTGTTGAGGCAGAGTCTCACTCTATTGCC 960

 31525467 CAGGCTGGAGTACAATGGTG 31525486
          ||||||||||||||||||||
      961 CAGGCTGGAGTACAATGGTG 980

EXCISED REGION

 31529390 AATACTGTGCTAAGTGAAAGAAGCCAACCACAAAATACCATATATTGTGTGATTCTGCTT 31529449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      990 AATACTGTGCTAAGTGAAAGAAGCCAACCACAAAATACCATATATTGTGTGATTCTGCTT 1049

 31529450 AAATGACATGTCCAGAATGTCCATATTAAAGTAGATTAGTGGTTTCCTGAGGCTGGGGGA 31529509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1050 AAATGACATGTCCAGAATGTCCATATTAAAGTAGATTAGTGGTTTCCTGAGGCTGGGGGA 1109

 31529510 GGGAGTTGGGGAAATTGCGTAGTGACTACTGGGTAAAGAGTTTCTTTCTGGGGTGATGAA 31529569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1110 GGGAGTTGGGGAAATTGCGTAGTGACTACTGGGTAAAGAGTTTCTTTCTGGGGTGATGAA 1169

 31529570 ATGGTCTAAAATAGAATGTGGTGGTGGTTGCACAGCTCTGAAAATACTAAAAACCATTGA 31529629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1170 ATGGTCTAAAATAGAATGTGGTGGTGGTTGCACAGCTCTGAAAATACTAAAAACCATTGA 1229

 31529630 ATGAGCACTTTAAATTGGTAAATTTTTATGTGAATTATGATTCAATAAAGTTGTGTTTAG 31529689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1230 ATGAGCACTTTAAATTGGTAAATTTTTATGTGAATTATGATTCAATAAAGTTGTGTTTAG 1289

 31529690 ATATTACTAAAAATGATGGTACAAATATTCTTTTTCACAAATGTTTTTTGTTGTTGTTTA 31529749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1290 ATATTACTAAAAATGATGGTACAAATATTCTTTTTCACAAATGTTTTTTGTTGTTGTTTA 1349

 31529750 TAGTTGTTTATTTGTACATCTAGTAATTTGTCCCAAGGAAAGAGTATGTAAAAGAACATA 31529809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1350 TAGTTGTTTATTTGTACATCTAGTAATTTGTCCCAAGGAAAGAGTATGTAAAAGAACATA 1409

 31529810 AGTCACTTTAAGGCCTTTAATGTATACTACAAAATTGCACTCTAGAAGGTTTATACAGTT 31529869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1410 AGTCACTTTAAGGCCTTTAATGTATACTACAAAATTGCACTCTAGAAGGTTTATACAGTT 1469

 31529870 TTGCATTTCATTAGCCTGTTTTTTTTATCTTTGACAACCTAAAGAATTTATTAGTGGTAT 31529929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1470 TTGCATTTCATTAGCCTGTTTTTTTTATCTTTGACAACCTAAAGAATTTATTAGTGGTAT 1529

 31529930 TCATCTGAGGATCCTCTAGGTCTATCAGAGTGTCTTTCTTATAGAAGGCATTCAATAAAT 31529989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1530 TCATCTGAGGATCCTCTAGGTCTATCAGAGTGTCTTTCTTATAGAAGGCATTCAATAAAT 1589

 31529990 AAATGTCCTAAGTGAGCAAAACATTTTTGGTTGATTTTTAGGTGCAAATGGTTTCTTTTG 31530049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1590 AAATGTCCTAAGTGAGCAAAACATTTTTGGTTGATTTTTAGGTGCAAATGGTTTCTTTTG 1649

 31530050 ATTTTAATTAAGATGCCTTTGTTTATTAGTGATGTTGACATATTTTCTTAATCTATTGGC 31530109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1650 ATTTTAATTAAGATGCCTTTGTTTATTAGTGATGTTGACATATTTTCTTAATCTATTGGC 1709

 31530110 TTTGTATAACTTTATGAATTGTCTCTTCATGTCCTTTGCCTACTTTTCTATTGTGGTAAC 31530169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1710 TTTGTATAACTTTATGAATTGTCTCTTCATGTCCTTTGCCTACTTTTCTATTGTGGTAAC 1769

 31530170 TATCTTTTATAAATGTTGTATAATTATTTAAAAATACATTAGGTTGGGCATGGTAGATCA 31530229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1770 TATCTTTTATAAATGTTGTATAATTATTTAAAAATACATTAGGTTGGGCATGGTAGATCA 1829

 31530230 TGCCTGTAATCCCAGCTCTCTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATTGCTTGAGCCTAACAGTT 31530289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1830 TGCCTGTAATCCCAGCTCTCTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATTGCTTGAGCCTAACAGTT 1889

 31530290 CGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCCATCTCTAAAAAAAAAAACCAATAAAAAT 31530349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1890 CGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCCATCTCTAAAAAAAAAAACCAATAAAAAT 1949

 31530350 ATATTAAAAGATTAACTGATTGTCTATCATATGGATTACAAATATCCCCCCCAATTTGTC 31530409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1950 ATATTAAAAGATTAACTGATTGTCTATCATATGGATTACAAATATCCCCCCCAATTTGTC 2009

 31530410 ATTTGCTTGTTAATTTTATTTATGATGACTTAAAAATTACAATATATTTTTTGGTGTTCA 31530469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2010 ATTTGCTTGTTAATTTTATTTATGATGACTTAAAAATTACAATATATTTTTTGGTGTTCA 2069

 31530470 AGTCAGTTTTTGTCCCCATTGTGATATTTTCCTTTGCCTGTTTATCACTTTCTTAGAGAA 31530529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     2070 AGTCAGTTTTTGTCCCCATTGTGATATTTTCCTTTGCCTGTTTATCACTTCCTTAGAGAA 2129

 31530530 AAGATAAATACTGATTCGTTCTTTTGTAGGTGTTTTATGATTTCATTGAAAATAAAATCT 31530589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2130 AAGATAAATACTGATTCGTTCTTTTGTAGGTGTTTTATGATTTCATTGAAAATAAAATCT 2189

 31530590 TCAACGCATCTAGTATTCATTTGGGTGTAAGATAAAAGATAACAACGTAGGTTTCTCTTA 31530649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2190 TCAACGCATCTAGTATTCATTTGGGTGTAAGATAAAAGATAACAACGTAGGTTTCTCTTA 2249

 31530650 TAGTTCATCAGGTATCCTACTACTGTTTATTGAGTCATGTTTTCTGTTACCACTCTTACT 31530709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2250 TAGTTCATCAGGTATCCTACTACTGTTTATTGAGTCATGTTTTCTGTTACCACTCTTACT 2309

 31530710 ATATACCAGTTTTACATACATTTGGGTTGGTTTCTGAGCTTTCTATTGTCTTCCATTGCT 31530769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2310 ATATACCAGTTTTACATACATTTGGGTTGGTTTCTGAGCTTTCTATTGTCTTCCATTGCT 2369

 31530770 TTGTTTAAAATTTAAAGTTTATTATTCTGACTTTCCATACTTGAATATGGTCGAATAAGT 31530829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2370 TTGTTTAAAATTTAAAGTTTATTATTCTGACTTTCCATACTTGAATATGGTCGAATAAGT 2429

 31530830 CCTCCTTTATTAATCTTGTTTTATTTAAAAATGGTCATTTTCACTCATTTTCCAGTTCAG 31530889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2430 CCTCCTTTATTAATCTTGTTTTATTTAAAAATGGTCATTTTCACTCATTTTCCAGTTCAG 2489

 31530890 TAGTTTTATTCTCTCAGTGTAATGTGATTTATCACCCCATTGCTCACCCTATTCATCTCC 31530949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2490 TAGTTTTATTCTCTCAGTGTAATGTGATTTATCACCCCATTGCTCACCCTATTCATCTCC 2549

 31530950 CAATACCCAGCTGAAAAACTTTAGAAGACTGAGGCTCTTGCCCTGGCCCCATCACTTTCT 31531009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2550 CAATACCCAGCTGAAAAACTTTAGAAGACTGAGGCTCTTGCCCTGGCCCCATCACTTTCT 2609

 31531010 AGCTATGTGGGCTTAGGCTAGTTATTGAACATGTCTGACTCTCACTTTTCTCCTCTGTAA 31531069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2610 AGCTATGTGGGCTTAGGCTAGTTATTGAACATGTCTGACTCTCACTTTTCTCCTCTGTAA 2669

 31531070 GTCAGTGAGAATTATATACTTCTTATAAGGTTGTGAGGTTCAAATGGAATAATGTGTACA 31531129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2670 GTCAGTGAGAATTATATACTTCTTATAAGGTTGTGAGGTTCAAATGGAATAATGTGTACA 2729

 31531130 GAGGCACTTGGTAAACAATGTAGTCATATGCAAGTCATATGCAAGTCATATGTAGTCAGC 31531189
          |||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||
     2730 GAGGCACTTGGTAAACAATGT-----------AGTCATATGCAAGTCATATGTAGTCAGC 2778

 31531190 TTGGTGAATTTTGAGAAAGTAAATGCAAGTTCTTTTTATGGTTTTACCTAAGGGGCCAGT 31531249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2779 TTGGTGAATTTTGAGAAAGTAAATGCAAGTTCTTTTTATGGTTTTACCTAAGGGGCCAGT 2838

 31531250 GAGGGCCAGAGAAGTGCCGGGACCTATGTAAGGTCGCAAGCAAGTTCATGTGGAATGCAT 31531309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2839 GAGGGCCAGAGAAGTGCCGGGACCTATGTAAGGTCGCAAGCAAGTTCATGTGGAATGCAT 2898

 31531310 CTAGAACTAGAACGCTAGCCTGTGTCCCAGGGCCCTTCCAACTGGGCTCTGCTGCCTGCA 31531369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2899 CTAGAACTAGAACGCTAGCCTGTGTCCCAGGGCCCTTCCAACTGGGCTCTGCTGCCTGCA 2958

 31531370 GTCCTGGGTGCCTTCTAATTAGCCTGTGTAGTGGTCTTGGTAAAAGTGTTTCTCCTGTAC 31531429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2959 GTCCTGGGTGCCTTCTAATTAGCCTGTGTAGTGGTCTTGGTAAAAGTGTTTCTCCTGTAC 3018

 31531430 TGTCCCCTATAGGTTGTGGCTGGCCATACCATTTCCCTGGTTCCCCCCACGCTCCTGATG 31531489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3019 TGTCCCCTATAGGTTGTGGCTGGCCATACCATTTCCCTGGTTCCCCCCACGCTCCTGATG 3078

 31531490 ACCTGGAAAGGCCATTTGAATAGTGTGGCAGACATCCTGTATGTGGACAACTTCCAGCTG 31531549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3079 ACCTGGAAAGGCCATTTGAATAGTGTGGCAGACATCCTGTATGTGGACAACTTCCAGCTG 3138

 31531550 GTTATCAGCGCTGGCCAGGACCGGGACGTCAAGGCTTGGAAACTCTCCGGTGATGCCATT 31531609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3139 GTTATCAGCGCTGGCCAGGACCGGGACGTCAAGGCTTGGAAACTCTCCGGTGATGCCATT 3198

 31531610 GGTATGGGTCCTGCTGAAGCTCAGCCATGCCCATGGCCCTTCTTGTCTCTGTCCCTGTCT 31531669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3199 GGTATGGGTCCTGCTGAAGCTCAGCCATGCCCATGGCCCTTCTTGTCTCTGTCCCTGTCT 3258

 31531670 GAACATAAGCTGGTATGAACTTTGTACTCTGTGGGGAGGGACTCTCAGGCCACAGCAACT 31531729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3259 GAACATAAGCTGGTATGAACTTTGTACTCTGTGGGGAGGGACTCTCAGGCCACAGCAACT 3318

 31531730 GCCTTCACTTAAATAATATTACAGTCTGTCCAATTATCCATTCAGCAAACGGTCCATCCA 31531789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3319 GCCTTCACTTAAATAATATTACAGTCTGTCCAATTATCCATTCAGCAAACGGTCCATCCA 3378

 31531790 TTCACCCATCCACCCAATATTATTCACCTATGTATATTTTTGCAAATCATATATCTGATA 31531849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3379 TTCACCCATCCACCCAATATTATTCACCTATGTATATTTTTGCAAATCATATATCTGATA 3438

 31531850 AAGCATATTCCTTTCTCTTTTAAAAAATAAACTTAATTGTTGCATTGTATATAAAGAAAA 31531909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3439 AAGCATATTCCTTTCTCTTTTAAAAAATAAACTTAATTGTTGCATTGTATATAAAGAAAA 3498

 31531910 ACATACAAACCAGAAGGGTTCAGCTTGGTGAATTTTGAGAAAGTAAATACATACCCATAT 31531969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3499 ACATACAAACCAGAAGGGTTCAGCTTGGTGAATTTTGAGAAAGTAAATACATACCCATAT 3558

 31531970 AGCCACCGTTCATGTCAAGAAATAATTAGGGCCAGGCGCGGTGGCTCACTACTGTAATCC 31532029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3559 AGCCACCGTTCATGTCAAGAAATAATTAGGGCCAGGCGCGGTGGCTCACTACTGTAATCC 3618

 31532030 CAACACTTTTTTGTCCCCTTTTCCTCCTGTGCTGTCTTCCTATGTGTTTGTTTGTTTGTT 31532089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3619 CAACACTTTTTTGTCCCCTTTTCCTCCTGTGCTGTCTTCCTATGTGTTTGTTTGTTTGTT 3678

 31532090 TTAGTGACCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGTGCATGCCTGT 31532149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3679 TTAGTGACCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGTGCATGCCTGT 3738

 31532150 AATCCCAGCTACTTGAGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGTTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTT 31532209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3739 AATCCCAGCTACTTGAGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGTTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTT 3798

 31532210 GCAGTGAGCTGAGATCATGTCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGACTCTGTCT 31532269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3799 GCAGTGAGCTGAGATCATGTCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGACTCTGTCT 3858

 31532270 -AAAAAAAAAATAATAATAAAAATAAAGTGACTTATGTGCCACTATTACAGTATTACAGC 31532328
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3859 AAAAAAAAAAATAATAATAAAAATAAAGTGACTTATGTGCCACTATTACAGTATTACAGC 3918

 31532329 ATTCTGTATTTTTCTATGTGTTTACATTTATCAGAAAGCTTTGTATTTTCATATGCTTTC 31532388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3919 ATTCTGTATTTTTCTATGTGTTTACATTTATCAGAAAGCTTTGTATTTTCATATGCTTTC 3978

 31532389 ATGTTCCTGCCTAGCATCCTTTTGTTTCAACTTGAAGGGGTCCCTTTAGCATTTCTTTAA 31532448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3979 ATGTTCCTGCCTAGCATCCTTTTGTTTCAACTTGAAGGGGTCCCTTTAGCATTTCTTTAA 4038

 31532449 AGGCAGGTCTAATGGTGATGAACTCCTCTTGTTTTTATTTATCTGGGAAAATTTTTATTT 31532508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4039 AGGCAGGTCTAATGGTGATGAACTCCTCTTGTTTTTATTTATCTGGGAAAATTTTTATTT 4098

 31532509 TTCCTTCATTTTTAAAGGACAGCTTTCCTGGATATAGTATTTTTGGATGAGAGTTTTTGT 31532568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4099 TTCCTTCATTTTTAAAGGACAGCTTTCCTGGATATAGTATTTTTGGATGAGAGTTTTTGT 4158

 31532569 TCTTTT 31532574
          ||||||
     4159 TCTTTT 4164

Alignment time is 3.48417 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31515486,31539389] =>     23904 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    7414] =>      7414 nucs 'mol-32-3311-120971_7414'

Score:        7330
Aligned:      7416        nucs
Identic:      7400 (100%) nucs =>      2240 (100%)      5160 (100%)
Gaps:           11 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31523243,31525486] EXCISED REGION [31529390,31534561]
 second seq =>  [       1,    2244] EXCISED REGION [    2254,    7414]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3903 nucs [31525487,31529389]
 second seq =>         9 nucs [2245,2253]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31523243 TGATCTGCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTG 31523302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGATCTGCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTG 60

 31523303 GCCACTTTGCCTATTTTATTTTATTTTGAGATGGAGTTTTGCTCTTATTGCCCAGACTGG 31523362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCCACTTTGCCTATTTTATTTTATTTTGAGATGGAGTTTTGCTCTTATTGCCCAGACTGG 120

 31523363 AGTGCAATGGCGCAATTGCAGCTCACCACAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTC 31523422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGTGCAATGGCGCAATTGCAGCTCACCACAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTC 180

 31523423 CTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGGTGGGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCCAACTAATTT 31523482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGGTGGGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCCAACTAATTT 240

 31523483 TGTAGTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGAC 31523542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGTAGTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGAC 300

 31523543 CTCAGGTGATCTGCCCACCTTGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGAGTGAGTGCACCT 31523602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTCAGGTGATCTGCCCACCTTGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGAGTGAGTGCACCT 360

 31523603 GGCCCACTTTGCTCATTTTCTAATTGGGTTATTCGTTTTCTGGCTATTGAGTTGTTTGAG 31523662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGCCCACTTTGCTCATTTTCTAATTGGGTTATTCGTTTTCTGGCTATTGAGTTGTTTGAG 420

 31523663 TTTCTTATTTATTGTGGATGTTACTCCCTTATCAGATGTATGATTTACATATATTTTCTG 31523722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTTCTTATTTATTGTGGATGTTACTCCCTTATCAGATGTATGATTTACATATATTTTCTG 480

 31523723 TCACTCTGTGGGTTATCTCTTTACTTTGTTCATTGTTTCCTTTCTGTCCAAAAGCTTTGT 31523782
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCACTTTGTGGGTTATCTCTTTACTTTGTTCATTGTTTCCTTTCTGTCCAAAAGCTTTGT 540

 31523783 ATCTTGTCTAAAATCCCATTTGTCTATTTTTGCTTTTATTTATTTTTATTTTTATTTTTA 31523842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATCTTGTCTAAAATCCCATTTGTCTATTTTTGCTTTTATTTATTTTTATTTTTATTTTTA 600

 31523843 TTTTTTATTTTTTTGAAACGGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGTTGGAGTGCAGTGGTGCA 31523902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTTTTTATTTTTTTGAAACGGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGTTGGAGTGCAGTGGTGCA 660

 31523903 ATCTCAGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGGAAGTCTCCTACTCCAACTTCC 31523962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATCTCAGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGGAAGTCTCCTACTCCAACTTCC 720

 31523963 TGAGTAGCTGGGATTATAGGCGTGTGCCACCATGCCTAGCTAATTTTTGTATTTTTTGGT 31524022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGAGTAGCTGGGATTATAGGCGTGTGCCACCATGCCTAGCTAATTTTTGTATTTTTTGGT 780

 31524023 AGAGACAGGATTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTGTTGAACTCTTGACCTCAGGCAATCC 31524082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGAGACAGGATTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTGTTGAACTCTTGACCTCAGGCAATCC 840

 31524083 GCCTGACTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACACGTGTGAGCCACCGCGCCTGGCCTAT 31524142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GCCTGACTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACACGTGTGAGCCACCGCGCCTGGCCTAT 900

 31524143 TTTTGCTTTTATTACCTGTGCTTTTGGGGTCATAGCTAAATAACCATTGCTCAGATCAAT 31524202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTTTGCTTTTATTACCTGTGCTTTTGGGGTCATAGCTAAATAACCATTGCTCAGATCAAT 960

 31524203 GTCATGGAGCCTTTCCTCTAGGTATTCTTCTAGTTGTTTTACAGTCTCAGATCTTATATT 31524262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GTCATGGAGCCTTTCCTCTAGGTATTCTTCTAGTTGTTTTACAGTCTCAGATCTTATATT 1020

 31524263 TAAGACTTTAATCCATTTTGAGTTGATTTTTTATACTGTGTGAGATAAGGATCCAATTTT 31524322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TAAGACTTTAATCCATTTTGAGTTGATTTTTTATACTGTGTGAGATAAGGATCCAATTTT 1080

 31524323 ATTCTTCTGTATGTGGATCCAATTTTCCTAGTACAGTTTATTGAAAAGACTGTCTTTTCC 31524382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATTCTTCTGTATGTGGATCCAATTTTCCTAGTACAGTTTATTGAAAAGACTGTCTTTTCC 1140

 31524383 CCATTATGTATTAGTAACACCTTTGTCAAAAATCAATTGACTATTAGTGCATGGGTTTAT 31524442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CCATTATGTATTAGTAACACCTTTGTCAAAAATCAATTGACTATTAGTGCATGGGTTTAT 1200

 31524443 TTCTGGGTTTTCTATCTTGTTACATTAGTCGATGTGTCTATTTTTATGCCAGCACCATAC 31524502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTCTGGGTTTTCTATCTTGTTACATTAGTCGATGTGTCTATTTTTATGCCAGCACCATAC 1260

 31524503 TGTTTTGATTATATTAGCTTTATAATATATTTTGAAATCAGGGACTGTGATGTCTTTAGC 31524562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGTTTTGATTATATTAGCTTTATAATATATTTTGAAATCAGGGACTGTGATGTCTTTAGC 1320

 31524563 TTTGTTCTTTTTGCTCAAGATTGTTTTGGCTAGCCAGGGTCTTTTATGATTGCATATGAA 31524622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTTGTTCTTTTTGCTCAAGATTGTTTTGGCTAGCCAGGGTCTTTTATGATTGCATATGAA 1380

 31524623 TTTAAGGATTGTTTTATTTCTATAAGAAATGACATTGGAATTTTGATAGGGACTGCATTG 31524682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTTAAGGATTGTTTTATTTCTATAAGAAATGACATTGGAATTTTGATAGGGACTGCATTG 1440

 31524683 AATCTGTAGATTGCTTTGGGTAGTATGAATATTTTAATAATATTAATTCTTCTAATTTAT 31524742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AATCTGTAGATTGCTTTGGGTAGTATGAATATTTTAATAATATTAATTCTTCTAATTTAT 1500

 31524743 CAACACAAGATAGCTTTCCATTTATTTGTGTTTTCTTAAACAATGTTTTAGTTTCCAGTG 31524802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CAACACAAGATAGCTTTCCATTTATTTGTGTTTTCTTAAACAATGTTTTAGTTTCCAGTG 1560

 31524803 TACAGATCTTTTAACTTCTTGGTTAAATTTACCCCTAAGTATTTTATTTTATTTTAAAAT 31524862
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TACAGATCTTTTAACTTCTTGGTTAAATTTATCCCTAAGTATTTTATTTTATTTTAAAAT 1620

 31524863 ACCTGGCTAATTTTGTATTTAATTTTATATTGTATTTATTTTATTTGTAATAAAATTAAG 31524922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ACCTGGCTAATTTTGTATTTAATTTTATATTGTATTTATTTTATTTGTAATAAAATTAAG 1680

 31524923 CATTTTATTTTATTTTAAAATACCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTC 31524982
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     1681 CATTTTATTTTATTTTAAAATACCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGATAGGGTTTC 1740

 31524983 TCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCAGACCTCAGGTGATCCGACTGCCTCGGCCT 31525042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCAGACCTCAGGTGATCCGACTGCCTCGGCCT 1800

 31525043 CCCAAAGTGCTGGTATTAGAAGCATGAGCCACTGCCCACTGCACCTAGCTGAAAACCACA 31525102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CCCAAAGTGCTGGTATTAGAAGCATGAGCCACTGCCCACTGCACCTAGCTGAAAACCACA 1860

 31525103 CTTTCTGTTGATTAAATAATATTTCACCTTATGGAGTTACAAATTTTCATTTTATGGGGT 31525162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CTTTCTGTTGATTAAATAATATTTCACCTTATGGAGTTACAAATTTTCATTTTATGGGGT 1920

 31525163 TATAATCACTTACTTAGCTTGTTATCTTTTGTTGGACATTAATGTGGTTTCTAACTTTTC 31525222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TATAATCACTTACTTAGCTTGTTATCTTTTGTTGGACATTAATGTGGTTTCTAACTTTTC 1980

 31525223 ATTATCAAAAAATAAAAGAAAATGGACAAAACCTCAGAAAGACACAAACTACTAAAGCTG 31525282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ATTATCAAAAAATAAAAGAAAATGGACAAAACCTCAGAAAGACACAAACTACTAAAGCTG 2040

 31525283 ACTTAATAAGAAATAGAAAATCTGAATATATAGAAAATCTGAATGTAACAAGTAAGGAGA 31525342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ACTTAATAAGAAATAGAAAATCTGAATATATAGAAAATCTGAATGTAACAAGTAAGGAGA 2100

 31525343 TTGGATTAGTAATAAAATTTCCCACAAAGAGAAGTACACATTCAGATGGTTTCACTGGTA 31525402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TTGGATTAGTAATAAAATTTCCCACAAAGAGAAGTACACATTCAGATGGTTTCACTGGTA 2160

 31525403 AATTCTACCAAATATTTAAAGATTTTTCTTTTTTTTTGTTGAGACAGAGTCTCACTCTAT 31525462
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     2161 AATTCTACCAAATATTTAAAGATTTTTCTTTTTTTTTGTTGAGGCAGAGTCTCACTCTAT 2220

 31525463 TGCCCAGGCTGGAGTACAATGGTG 31525486
          ||||||||||||||||||||||||
     2221 TGCCCAGGCTGGAGTACAATGGTG 2244

EXCISED REGION

 31529390 AATACTGTGCTAAGTGAAAGAAGCCAACCACAAAATACCATATATTGTGTGATTCTGCTT 31529449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2254 AATACTGTGCTAAGTGAAAGAAGCCAACCACAAAATACCATATATTGTGTGATTCTGCTT 2313

 31529450 AAATGACATGTCCAGAATGTCCATATTAAAGTAGATTAGTGGTTTCCTGAGGCTGGGGGA 31529509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2314 AAATGACATGTCCAGAATGTCCATATTAAAGTAGATTAGTGGTTTCCTGAGGCTGGGGGA 2373

 31529510 GGGAGTTGGGGAAATTGCGTAGTGACTACTGGGTAAAGAGTTTCTTTCTGGGGTGATGAA 31529569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2374 GGGAGTTGGGGAAATTGCGTAGTGACTACTGGGTAAAGAGTTTCTTTCTGGGGTGATGAA 2433

 31529570 ATGGTCTAAAATAGAATGTGGTGGTGGTTGCACAGCTCTGAAAATACTAAAAACCATTGA 31529629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2434 ATGGTCTAAAATAGAATGTGGTGGTGGTTGCACAGCTCTGAAAATACTAAAAACCATTGA 2493

 31529630 ATGAGCACTTTAAATTGGTAAATTTTTATGTGAATTATGATTCAATAAAGTTGTGTTTAG 31529689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2494 ATGAGCACTTTAAATTGGTAAATTTTTATGTGAATTATGATTCAATAAAGTTGTGTTTAG 2553

 31529690 ATATTACTAAAAATGATGGTACAAATATTCTTTTTCACAAATGTTTTTTGTTGTTGTTTA 31529749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2554 ATATTACTAAAAATGATGGTACAAATATTCTTTTTCACAAATGTTTTTTGTTGTTGTTTA 2613

 31529750 TAGTTGTTTATTTGTACATCTAGTAATTTGTCCCAAGGAAAGAGTATGTAAAAGAACATA 31529809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2614 TAGTTGTTTATTTGTACATCTAGTAATTTGTCCCAAGGAAAGAGTATGTAAAAGAACATA 2673

 31529810 AGTCACTTTAAGGCCTTTAATGTATACTACAAAATTGCACTCTAGAAGGTTTATACAGTT 31529869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2674 AGTCACTTTAAGGCCTTTAATGTATACTACAAAATTGCACTCTAGAAGGTTTATACAGTT 2733

 31529870 TTGCATTTCATTAGCCTGTTTTTTTTATCTTTGACAACCTAAAGAATTTATTAGTGGTAT 31529929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2734 TTGCATTTCATTAGCCTGTTTTTTTTATCTTTGACAACCTAAAGAATTTATTAGTGGTAT 2793

 31529930 TCATCTGAGGATCCTCTAGGTCTATCAGAGTGTCTTTCTTATAGAAGGCATTCAATAAAT 31529989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2794 TCATCTGAGGATCCTCTAGGTCTATCAGAGTGTCTTTCTTATAGAAGGCATTCAATAAAT 2853

 31529990 AAATGTCCTAAGTGAGCAAAACATTTTTGGTTGATTTTTAGGTGCAAATGGTTTCTTTTG 31530049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2854 AAATGTCCTAAGTGAGCAAAACATTTTTGGTTGATTTTTAGGTGCAAATGGTTTCTTTTG 2913

 31530050 ATTTTAATTAAGATGCCTTTGTTTATTAGTGATGTTGACATATTTTCTTAATCTATTGGC 31530109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2914 ATTTTAATTAAGATGCCTTTGTTTATTAGTGATGTTGACATATTTTCTTAATCTATTGGC 2973

 31530110 TTTGTATAACTTTATGAATTGTCTCTTCATGTCCTTTGCCTACTTTTCTATTGTGGTAAC 31530169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2974 TTTGTATAACTTTATGAATTGTCTCTTCATGTCCTTTGCCTACTTTTCTATTGTGGTAAC 3033

 31530170 TATCTTTTATAAATGTTGTATAATTATTTAAAAATACATTAGGTTGGGCATGGTAGATCA 31530229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3034 TATCTTTTATAAATGTTGTATAATTATTTAAAAATACATTAGGTTGGGCATGGTAGATCA 3093

 31530230 TGCCTGTAATCCCAGCTCTCTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATTGCTTGAGCCTAACAGTT 31530289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3094 TGCCTGTAATCCCAGCTCTCTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATTGCTTGAGCCTAACAGTT 3153

 31530290 CGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCCATCTCTAAAAAAAAAAACCAATAAAAAT 31530349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3154 CGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCCATCTCTAAAAAAAAAAACCAATAAAAAT 3213

 31530350 ATATTAAAAGATTAACTGATTGTCTATCATATGGATTACAAATATCCCCCCCAATTTGTC 31530409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3214 ATATTAAAAGATTAACTGATTGTCTATCATATGGATTACAAATATCCCCCCCAATTTGTC 3273

 31530410 ATTTGCTTGTTAATTTTATTTATGATGACTTAAAAATTACAATATATTTTTTGGTGTTCA 31530469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3274 ATTTGCTTGTTAATTTTATTTATGATGACTTAAAAATTACAATATATTTTTTGGTGTTCA 3333

 31530470 AGTCAGTTTTTGTCCCCATTGTGATATTTTCCTTTGCCTGTTTATCACTTTCTTAGAGAA 31530529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3334 AGTCAGTTTTTGTCCCCATTGTGATATTTTCCTTTGCCTGTTTATCACTTTCTTAGAGAA 3393

 31530530 AAGATAAATACTGATTCGTTCTTTTGTAGGTGTTTTATGATTTCATTGAAAATAAAATCT 31530589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3394 AAGATAAATACTGATTCGTTCTTTTGTAGGTGTTTTATGATTTCATTGAAAATAAAATCT 3453

 31530590 TCAACGCATCTAGTATTCATTTGGGTGTAAGATAAAAGATAACAACGTAGGTTTCTCTTA 31530649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3454 TCAACGCATCTAGTATTCATTTGGGTGTAAGATAAAAGATAACAACGTAGGTTTCTCTTA 3513

 31530650 TAGTTCATCAGGTATCCTACTACTGTTTATTGAGTCATGTTTTCTGTTACCACTCTTACT 31530709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3514 TAGTTCATCAGGTATCCTACTACTGTTTATTGAGTCATGTTTTCTGTTACCACTCTTACT 3573

 31530710 ATATACCAGTTTTACATACATTTGGGTTGGTTTCTGAGCTTTCTATTGTCTTCCATTGCT 31530769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3574 ATATACCAGTTTTACATACATTTGGGTTGGTTTCTGAGCTTTCTATTGTCTTCCATTGCT 3633

 31530770 TTGTTTAAAATTTAAAGTTTATTATTCTGACTTTCCATACTTGAATATGGTCGAATAAGT 31530829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3634 TTGTTTAAAATTTAAAGTTTATTATTCTGACTTTCCATACTTGAATATGGTCGAATAAGT 3693

 31530830 CCTCCTTTATTAATCTTGTTTTATTTAAAAATGGTCATTTTCACTCATTTTCCAGTTCAG 31530889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3694 CCTCCTTTATTAATCTTGTTTTATTTAAAAATGGTCATTTTCACTCATTTTCCAGTTCAG 3753

 31530890 TAGTTTTATTCTCTCAGTGTAATGTGATTTATCACCCCATTGCTCACCCTATTCATCTCC 31530949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3754 TAGTTTTATTCTCTCAGTGTAATGTGATTTATCACCCCATTGCTCACCCTATTCATCTCC 3813

 31530950 CAATACCCAGCTGAAAAACTTTAGAAGACTGAGGCTCTTGCCCTGGCCCCATCACTTTCT 31531009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3814 CAATACCCAGCTGAAAAACTTTAGAAGACTGAGGCTCTTGCCCTGGCCCCATCACTTTCT 3873

 31531010 AGCTATGTGGGCTTAGGCTAGTTATTGAACATGTCTGACTCTCACTTTTCTCCTCTGTAA 31531069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3874 AGCTATGTGGGCTTAGGCTAGTTATTGAACATGTCTGACTCTCACTTTTCTCCTCTGTAA 3933

 31531070 GTCAGTGAGAATTATATACTTCTTATAAGGTTGTGAGGTTCAAATGGAATAATGTGTACA 31531129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3934 GTCAGTGAGAATTATATACTTCTTATAAGGTTGTGAGGTTCAAATGGAATAATGTGTACA 3993

 31531130 GAGGCACTTGGTAAACAATGTAGTCATATGCAAGTCATATGCAAGTCATATGTAGTCAGC 31531189
          |||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||
     3994 GAGGCACTTGGTAAACAATGT-----------AGTCATATGCAAGTCATATGTAGTCAGC 4042

 31531190 TTGGTGAATTTTGAGAAAGTAAATGCAAGTTCTTTTTATGGTTTTACCTAAGGGGCCAGT 31531249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4043 TTGGTGAATTTTGAGAAAGTAAATGCAAGTTCTTTTTATGGTTTTACCTAAGGGGCCAGT 4102

 31531250 GAGGGCCAGAGAAGTGCCGGGACCTATGTAAGGTCGCAAGCAAGTTCATGTGGAATGCAT 31531309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4103 GAGGGCCAGAGAAGTGCCGGGACCTATGTAAGGTCGCAAGCAAGTTCATGTGGAATGCAT 4162

 31531310 CTAGAACTAGAACGCTAGCCTGTGTCCCAGGGCCCTTCCAACTGGGCTCTGCTGCCTGCA 31531369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4163 CTAGAACTAGAACGCTAGCCTGTGTCCCAGGGCCCTTCCAACTGGGCTCTGCTGCCTGCA 4222

 31531370 GTCCTGGGTGCCTTCTAATTAGCCTGTGTAGTGGTCTTGGTAAAAGTGTTTCTCCTGTAC 31531429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4223 GTCCTGGGTGCCTTCTAATTAGCCTGTGTAGTGGTCTTGGTAAAAGTGTTTCTCCTGTAC 4282

 31531430 TGTCCCCTATAGGTTGTGGCTGGCCATACCATTTCCCTGGTTCCCCCCACGCTCCTGATG 31531489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4283 TGTCCCCTATAGGTTGTGGCTGGCCATACCATTTCCCTGGTTCCCCCCACGCTCCTGATG 4342

 31531490 ACCTGGAAAGGCCATTTGAATAGTGTGGCAGACATCCTGTATGTGGACAACTTCCAGCTG 31531549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4343 ACCTGGAAAGGCCATTTGAATAGTGTGGCAGACATCCTGTATGTGGACAACTTCCAGCTG 4402

 31531550 GTTATCAGCGCTGGCCAGGACCGGGACGTCAAGGCTTGGAAACTCTCCGGTGATGCCATT 31531609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4403 GTTATCAGCGCTGGCCAGGACCGGGACGTCAAGGCTTGGAAACTCTCCGGTGATGCCATT 4462

 31531610 GGTATGGGTCCTGCTGAAGCTCAGCCATGCCCATGGCCCTTCTTGTCTCTGTCCCTGTCT 31531669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4463 GGTATGGGTCCTGCTGAAGCTCAGCCATGCCCATGGCCCTTCTTGTCTCTGTCCCTGTCT 4522

 31531670 GAACATAAGCTGGTATGAACTTTGTACTCTGTGGGGAGGGACTCTCAGGCCACAGCAACT 31531729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4523 GAACATAAGCTGGTATGAACTTTGTACTCTGTGGGGAGGGACTCTCAGGCCACAGCAACT 4582

 31531730 GCCTTCACTTAAATAATATTACAGTCTGTCCAATTATCCATTCAGCAAACGGTCCATCCA 31531789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4583 GCCTTCACTTAAATAATATTACAGTCTGTCCAATTATCCATTCAGCAAACGGTCCATCCA 4642

 31531790 TTCACCCATCCACCCAATATTATTCACCTATGTATATTTTTGCAAATCATATATCTGATA 31531849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4643 TTCACCCATCCACCCAATATTATTCACCTATGTATATTTTTGCAAATCATATATCTGATA 4702

 31531850 AAGCATATTCCTTTCTCTTTTAAAAAATAAACTTAATTGTTGCATTGTATATAAAGAAAA 31531909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4703 AAGCATATTCCTTTCTCTTTTAAAAAATAAACTTAATTGTTGCATTGTATATAAAGAAAA 4762

 31531910 ACATACAAACCAGAAGGGTTCAGCTTGGTGAATTTTGAGAAAGTAAATACATACCCATAT 31531969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4763 ACATACAAACCAGAAGGGTTCAGCTTGGTGAATTTTGAGAAAGTAAATACATACCCATAT 4822

 31531970 AGCCACCGTTCATGTCAAGAAATAATTAGGGCCAGGCGCGGTGGCTCACTACTGTAATCC 31532029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4823 AGCCACCGTTCATGTCAAGAAATAATTAGGGCCAGGCGCGGTGGCTCACTACTGTAATCC 4882

 31532030 CAACACTTTTTTGTCCCCTTTTCCTCCTGTGCTGTCTTCCTATGTGTTTGTTTGTTTGTT 31532089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4883 CAACACTTTTTTGTCCCCTTTTCCTCCTGTGCTGTCTTCCTATGTGTTTGTTTGTTTGTT 4942

 31532090 TTAGTGACCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGTGCATGCCTGT 31532149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4943 TTAGTGACCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGTGCATGCCTGT 5002

 31532150 AATCCCAGCTACTTGAGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGTTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTT 31532209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5003 AATCCCAGCTACTTGAGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGTTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTT 5062

 31532210 GCAGTGAGCTGAGATCATGTCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGACTCTGTCT 31532269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5063 GCAGTGAGCTGAGATCATGTCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGACTCTGTCT 5122

 31532270 AAAAAAAAAATAATAATAAAAATAAAGTGACTTATGTGCCACTATTACAGTATTACAGCA 31532329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5123 AAAAAAAAAATAATAATAAAAATAAAGTGACTTATGTGCCACTATTACAGTATTACAGCA 5182

 31532330 TTCTGTATTTTTCTATGTGTTTACATTTATCAGAAAGCTTTGTATTTTCATATGCTTTCA 31532389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5183 TTCTGTATTTTTCTATGTGTTTACATTTATCAGAAAGCTTTGTATTTTCATATGCTTTCA 5242

 31532390 TGTTCCTGCCTAGCATCCTTTTGTTTCAACTTGAAGGGGTCCCTTTAGCATTTCTTTAAA 31532449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5243 TGTTCCTGCCTAGCATCCTTTTGTTTCAACTTGAAGGGGTCCCTTTAGCATTTCTTTAAA 5302

 31532450 GGCAGGTCTAATGGTGATGAACTCCTCTTGTTTTTATTTATCTGGGAAAATTTTTATTTT 31532509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5303 GGCAGGTCTAATGGTGATGAACTCCTCTTGTTTTTATTTATCTGGGAAAATTTTTATTTT 5362

 31532510 TCCTTCATTTTTAAAGGACAGCTTTCCTGGATATAGTATTTTTGGATGAGAGTTTTTGTT 31532569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5363 TCCTTCATTTTTAAAGGACAGCTTTCCTGGATATAGTATTTTTGGATGAGAGTTTTTGTT 5422

 31532570 CTTTTTATAATGTGTCTCCTTGTGGATTTCTTTGACTTTATCCTAGTTGGAATCCCTTGA 31532629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5423 CTTTTTATAATGTGTCTCCTTGTGGATTTCTTTGACTTTATCCTAGTTGGAATCCCTTGA 5482

 31532630 GCTTCTTGAATATAGGTTTCTTTTCCTTTTTAAGATTTGAAACATTTTCAGCCATTATTT 31532689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5483 GCTTCTTGAATATAGGTTTCTTTTCCTTTTTAAGATTTGAAACATTTTCAGCCATTATTT 5542

 31532690 ATTCAGATAAGCTTTTTGTCCCTTTCTCTCTCTCTGTCTCTCTCTCCTCCTTCTAGTACT 31532749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5543 ATTCAGATAAGCTTTTTGTCCCTTTCTCTCTCTCTGTCTCTCTCTCCTCCTTCTAGTACT 5602

 31532750 ACCATAATGCATATATTGTCCATTTGACGATGTCTCATAAATCCCTTAAGTTTTCTTTAC 31532809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5603 ACCATAATGCATATATTGTCCATTTGACGATGTCTCATAAATCCCTTAAGTTTTCTTTAC 5662

 31532810 TCTTTAAAATTCTTTTTTCTTTTTTGCTTCTCTGACTGGATATCTTCAAGTCTGCTGATT 31532869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5663 TCTTTAAAATTCTTTTTTCTTTTTTGCTTCTCTGACTGGATATCTTCAAGTCTGCTGATT 5722

 31532870 TTTCCTTCTGCTTGATCAAGCCTGCTGTAGATGACTTTTGAATTCAATTATTTTACTCTT 31532929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5723 TTTCCTTCTGCTTGATCAAGCCTGCTGTAGATGACTTTTGAATTCAATTATTTTACTCTT 5782

 31532930 CATCTTCAGCTCTAGAATTTCTGTTATTTTTATTATTATTATTATTATTTTTTGAGACAG 31532989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5783 CATCTTCAGCTCTAGAATTTCTGTTATTTTTATTATTATTATTATTATTTTTTGAGACAG 5842

 31532990 GGTCTTGCTCTGCCACCCAGGGTTGAGTGCAGTGGCACGAATTCAGCTCACTGAAGCCTT 31533049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5843 GGTCTTGCTCTGCCACCCAGGGTTGAGTGCAGTGGCACGAATTCAGCTCACTGAAGCCTT 5902

 31533050 GACCTCCCAGCCTCAAGTGATCTTCCCACAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCA 31533109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5903 GACCTCCCAGCCTCAAGTGATCTTCCCACAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCA 5962

 31533110 TGCCATCATGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTTGTAGAGACAGAGTTTCACCATGTTGC 31533169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5963 TGCCATCATGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTTGTAGAGACAGAGTTTCACCATGTTGC 6022

 31533170 CCAGGCTGGCCTTGAATTCTTGAGCTCAAGTGATCGCCCACCTAAGCTTCCCAAAGTGTT 31533229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6023 CCAGGCTGGCCTTGAATTCTTGAGCTCAAGTGATCGCCCACCTAAGCTTCCCAAAGTGTT 6082

 31533230 GGGATTATAGGTGTGGGCCACCATGGCTGGCCTCTGTTTGGTTCTTTTCTATATTTTCTG 31533289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6083 GGGATTATAGGTGTGGGCCACCATGGCTGGCCTCTGTTTGGTTCTTTTCTATATTTTCTG 6142

 31533290 TGTCTTCACTAATATTCTCAGTTTGTTCATGTATTGTTTCCCTGAGCTTGTTGAGCATTT 31533349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6143 TGTCTTCACTAATATTCTCAGTTTGTTCATGTATTGTTTCCCTGAGCTTGTTGAGCATTT 6202

 31533350 TTATTACGGTTACTTAGAATTCTTTGTCAAATAATTAATATACCTCAATTTCTTTAGCGG 31533409
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6203 TTATTACAGTTACTTAGAATTCTTTGTCAAATAATTAATATACCTCAATTTCTTTAGCGG 6262

 31533410 CAGTTTCTGGAGATTTATTTTGTTCCTTTGGGCCATGCTTTCCTATTTTTTTTGTGTGCC 31533469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6263 CAGTTTCTGGAGATTTATTTTGTTCCTTTGGGCCATGCTTTCCTATTTTTTTTGTGTGCC 6322

 31533470 TTATAACTTTATATTGGGATCCATGCATTTGTAAAATCAGCCACCTCTCCCAGTCTTTAT 31533529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6323 TTATAACTTTATATTGGGATCCATGCATTTGTAAAATCAGCCACCTCTCCCAGTCTTTAT 6382

 31533530 ATACTGGCTTCATTCAGGGAAAATTCTGCACCAATCAGCTTGGCTAAAGATTCTGGGTGC 31533589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6383 ATACTGGCTTCATTCAGGGAAAATTCTGCACCAATCAGCTTGGCTAAAGATTCTGGGTGC 6442

 31533590 CTCCCCAATCTTTTTTGTGGATACTTTCACCAGACTTACGCATGTAAATTCGCAATTACA 31533649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6443 CTCCCCAATCTTTTTTGTGGATACTTTCACCAGACTTACGCATGTAAATTCGCAATTACA 6502

 31533650 GGAATCTACAGGTTTATTTTTTTCAGGAGTCCATTATCTCTTGCTCTCTCTGGTGTCTAT 31533709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6503 GGAATCTACAGGTTTATTTTTTTCAGGAGTCCATTATCTCTTGCTCTCTCTGGTGTCTAT 6562

 31533710 TTGCAGTACTGCAAGTTCTCTAGAGCGGCTACAAGCTTCCCCCAGGCCTCTAGAATATGC 31533769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6563 TTGCAGTACTGCAAGTTCTCTAGAGCGGCTACAAGCTTCCCCCAGGCCTCTAGAATATGC 6622

 31533770 TGGGTCCTTCAATAGTCTGAGAGAGGCAAGACAGAAACCAGTTTCTTGGGTACCCCTCAA 31533829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6623 TGGGTCCTTCAATAGTCTGAGAGAGGCAAGACAGAAACCAGTTTCTTGGGTACCCCTCAA 6682

 31533830 AGGCTAACATTGGATATGTATGCTCCAAATCTGCCTCCTCAAGGAGAAGCTGGAAGTTGG 31533889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6683 AGGCTAACATTGGATATGTATGCTCCAAATCTGCCTCCTCAAGGAGAAGCTGGAAGTTGG 6742

 31533890 GTTGTTTTCTCTACTCATTCCACAGAGCGGCAGGAGGGACTCTGATAGTGTGTGCTAGTC 31533949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6743 GTTGTTTTCTCTACTCATTCCACAGAGCGGCAGGAGGGACTCTGATAGTGTGTGCTAGTC 6802

 31533950 TAAATTGTCACCTTTGTTCTTAGTAGCCCAGTCTGGTGCCTCTTCCTGTCAGTGCTTAGA 31534009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6803 TAAATTGTCACCTTTGTTCTTAGTAGCCCAGTCTGGTGCCTCTTCCTGTCAGTGCTTAGA 6862

 31534010 TTCAGGCAAGACAGAAACTGGTTAATCATGCAGCCCTCTGAAAAGTCTGCATGTTGGATG 31534069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6863 TTCAGGCAAGACAGAAACTGGTTAATCATGCAGCCCTCTGAAAAGTCTGCATGTTGGATG 6922

 31534070 TACATCTCAGTCTTTCCCTCCCAGGGAGAAGCTGGAAGCTGGTGGTTCCTTCCCAATCTG 31534129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6923 TACATCTCAGTCTTTCCCTCCCAGGGAGAAGCTGGAAGCTGGTGGTTCCTTCCCAATCTG 6982

 31534130 CTTCACTGAGCCAGGAGGAGGGATTACAAGTGAGCACTATGAATTTTCCTACTGGCTTCA 31534189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6983 CTTCACTGAGCCAGGAGGAGGGATTACAAGTGAGCACTATGAATTTTCCTACTGGCTTCA 7042

 31534190 GTGCAGCTGGTTTTTTGTTTTTTGTTTTTTTGGTTTTTGTTTGTTTGTTTTTTCATTCAT 31534249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7043 GTGCAGCTGGTTTTTTGTTTTTTGTTTTTTTGGTTTTTGTTTGTTTGTTTTTTCATTCAT 7102

 31534250 CTGGGATGAATGGTCCTGGTTTCTGGTCCATGTACTGTTGTTCAGTCAGTGTCTCCATAG 31534309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7103 CTGGGATGAATGGTCCTGGTTTCTGGTCCATGTACTGTTGTTCAGTCAGTGTCTCCATAG 7162

 31534310 GGAGAAGGAAGTTCTGGATCTTCCTATTCTACCATCTTGCTGATGTCACCCATTTTTTTG 31534369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7163 GGAGAAGGAAGTTCTGGATCTTCCTATTCTACCATCTTGCTGATGTCACCCATTTTTTTG 7222

 31534370 TATCTTTCAAAGACGTCTTTGACTATCCCCTAAATATAATATCTAGTGTTATCTTTTAGA 31534429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7223 TATCTTTCAAAGACGTCTTTGACTATCCCCTAAATATAATATCTAGTGTTATCTTTTAGA 7282

 31534430 AGCTTGTTTTAAAAATCAGATTTCTGAAGTATAATTTACATCCAATAAAAGCACCTTTTA 31534489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7283 AGCTTGTTTTAAAAATCAGATTTCTGAAGTATAATTTACATCCAATAAAAGCACCTTTTA 7342

 31534490 AAAGTATATAGTTCTGTGAGGTTTCATGAATGCATACAATTGTGTAATTGGTATCACAAT 31534549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7343 AAAGTATATAGTTCTGTGAGGTTTCATGAATGCATACAATTGTGTAATTGGTATCACAAT 7402

 31534550 CAAGACATAGAC 31534561
          ||||||||||||
     7403 CAAGACATAGAC 7414

Alignment time is 6.14254 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31515486,31539389] =>     23904 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    2244] =>      2244 nucs 'mol-32-3311-120971_2244'

Score:        2210
Aligned:      2243        nucs
Identic:      2240 (100%) nucs =>       485 (100%)      1755 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31523243,31523727] EXCISED REGION [31523729,31525486]
 second seq =>  [       1,     485] EXCISED REGION [     487,    2244]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [31523728,31523728]
 second seq =>         1 nucs [486,486]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [485,486] to [486,487]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [31523727,31523727] to [31523729,31523729]
 second seq =>         1 nucs [485,485] to [487,487]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31523243 TGATCTGCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTG 31523302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGATCTGCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTG 60

 31523303 GCCACTTTGCCTATTTTATTTTATTTTGAGATGGAGTTTTGCTCTTATTGCCCAGACTGG 31523362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCCACTTTGCCTATTTTATTTTATTTTGAGATGGAGTTTTGCTCTTATTGCCCAGACTGG 120

 31523363 AGTGCAATGGCGCAATTGCAGCTCACCACAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTC 31523422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGTGCAATGGCGCAATTGCAGCTCACCACAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTC 180

 31523423 CTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGGTGGGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCCAACTAATTT 31523482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGGTGGGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCCAACTAATTT 240

 31523483 TGTAGTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGAC 31523542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGTAGTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGAC 300

 31523543 CTCAGGTGATCTGCCCACCTTGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGAGTGAGTGCACCT 31523602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTCAGGTGATCTGCCCACCTTGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGAGTGAGTGCACCT 360

 31523603 GGCCCACTTTGCTCATTTTCTAATTGGGTTATTCGTTTTCTGGCTATTGAGTTGTTTGAG 31523662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGCCCACTTTGCTCATTTTCTAATTGGGTTATTCGTTTTCTGGCTATTGAGTTGTTTGAG 420

 31523663 TTTCTTATTTATTGTGGATGTTACTCCCTTATCAGATGTATGATTTACATATATTTTCTG 31523722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTTCTTATTTATTGTGGATGTTACTCCCTTATCAGATGTATGATTTACATATATTTTCTG 480

 31523723 TCACT 31523727
          |||||
      481 TCACT 485

EXCISED REGION

 31523729 TGTGGGTTATCTCTTTACTTTGTTCATTGTTTCCTTTCTGTCCAAAAGCTTTGTATCTTG 31523788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      487 TGTGGGTTATCTCTTTACTTTGTTCATTGTTTCCTTTCTGTCCAAAAGCTTTGTATCTTG 546

 31523789 TCTAAAATCCCATTTGTCTATTTTTGCTTTTATTTATTTTTATTTTTATTTTTATTTTTT 31523848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      547 TCTAAAATCCCATTTGTCTATTTTTGCTTTTATTTATTTTTATTTTTATTTTTATTTTTT 606

 31523849 ATTTTTTTGAAACGGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGTTGGAGTGCAGTGGTGCAATCTCA 31523908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      607 ATTTTTTTGAAACGGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGTTGGAGTGCAGTGGTGCAATCTCA 666

 31523909 GCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGGAAGTCTCCTACTCCAACTTCCTGAGTA 31523968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      667 GCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGGAAGTCTCCTACTCCAACTTCCTGAGTA 726

 31523969 GCTGGGATTATAGGCGTGTGCCACCATGCCTAGCTAATTTTTGTATTTTTTGGTAGAGAC 31524028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      727 GCTGGGATTATAGGCGTGTGCCACCATGCCTAGCTAATTTTTGTATTTTTTGGTAGAGAC 786

 31524029 AGGATTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTGTTGAACTCTTGACCTCAGGCAATCCGCCTGA 31524088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      787 AGGATTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTGTTGAACTCTTGACCTCAGGCAATCCGCCTGA 846

 31524089 CTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACACGTGTGAGCCACCGCGCCTGGCCTATTTTTGC 31524148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      847 CTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACACGTGTGAGCCACCGCGCCTGGCCTATTTTTGC 906

 31524149 TTTTATTACCTGTGCTTTTGGGGTCATAGCTAAATAACCATTGCTCAGATCAATGTCATG 31524208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      907 TTTTATTACCTGTGCTTTTGGGGTCATAGCTAAATAACCATTGCTCAGATCAATGTCATG 966

 31524209 GAGCCTTTCCTCTAGGTATTCTTCTAGTTGTTTTACAGTCTCAGATCTTATATTTAAGAC 31524268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      967 GAGCCTTTCCTCTAGGTATTCTTCTAGTTGTTTTACAGTCTCAGATCTTATATTTAAGAC 1026

 31524269 TTTAATCCATTTTGAGTTGATTTTTTATACTGTGTGAGATAAGGATCCAATTTTATTCTT 31524328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1027 TTTAATCCATTTTGAGTTGATTTTTTATACTGTGTGAGATAAGGATCCAATTTTATTCTT 1086

 31524329 CTGTATGTGGATCCAATTTTCCTAGTACAGTTTATTGAAAAGACTGTCTTTTCCCCATTA 31524388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1087 CTGTATGTGGATCCAATTTTCCTAGTACAGTTTATTGAAAAGACTGTCTTTTCCCCATTA 1146

 31524389 TGTATTAGTAACACCTTTGTCAAAAATCAATTGACTATTAGTGCATGGGTTTATTTCTGG 31524448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1147 TGTATTAGTAACACCTTTGTCAAAAATCAATTGACTATTAGTGCATGGGTTTATTTCTGG 1206

 31524449 GTTTTCTATCTTGTTACATTAGTCGATGTGTCTATTTTTATGCCAGCACCATACTGTTTT 31524508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1207 GTTTTCTATCTTGTTACATTAGTCGATGTGTCTATTTTTATGCCAGCACCATACTGTTTT 1266

 31524509 GATTATATTAGCTTTATAATATATTTTGAAATCAGGGACTGTGATGTCTTTAGCTTTGTT 31524568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1267 GATTATATTAGCTTTATAATATATTTTGAAATCAGGGACTGTGATGTCTTTAGCTTTGTT 1326

 31524569 CTTTTTGCTCAAGATTGTTTTGGCTAGCCAGGGTCTTTTATGATTGCATATGAATTTAAG 31524628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1327 CTTTTTGCTCAAGATTGTTTTGGCTAGCCAGGGTCTTTTATGATTGCATATGAATTTAAG 1386

 31524629 GATTGTTTTATTTCTATAAGAAATGACATTGGAATTTTGATAGGGACTGCATTGAATCTG 31524688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1387 GATTGTTTTATTTCTATAAGAAATGACATTGGAATTTTGATAGGGACTGCATTGAATCTG 1446

 31524689 TAGATTGCTTTGGGTAGTATGAATATTTTAATAATATTAATTCTTCTAATTTATCAACAC 31524748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1447 TAGATTGCTTTGGGTAGTATGAATATTTTAATAATATTAATTCTTCTAATTTATCAACAC 1506

 31524749 AAGATAGCTTTCCATTTATTTGTGTTTTCTTAAACAATGTTTTAGTTTCCAGTGTACAGA 31524808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1507 AAGATAGCTTTCCATTTATTTGTGTTTTCTTAAACAATGTTTTAGTTTCCAGTGTACAGA 1566

 31524809 TCTTTTAACTTCTTGGTTAAATTTACCCCTAAGTATTTTATTTTATTTTAAAATACCTGG 31524868
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1567 TCTTTTAACTTCTTGGTTAAATTTATCCCTAAGTATTTTATTTTATTTTAAAATACCTGG 1626

 31524869 CTAATTTTGTATTTAATTTTATATTGTATTTATTTTATTTGTAATAAAATTAAGCATTTT 31524928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1627 CTAATTTTGTATTTAATTTTATATTGTATTTATTTTATTTGTAATAAAATTAAGCATTTT 1686

 31524929 ATTTTATTTTAAAATACCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATG 31524988
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     1687 ATTTTATTTTAAAATACCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGATAGGGTTTCTCCATG 1746

 31524989 TTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCAGACCTCAGGTGATCCGACTGCCTCGGCCTCCCAAA 31525048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1747 TTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCAGACCTCAGGTGATCCGACTGCCTCGGCCTCCCAAA 1806

 31525049 GTGCTGGTATTAGAAGCATGAGCCACTGCCCACTGCACCTAGCTGAAAACCACACTTTCT 31525108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1807 GTGCTGGTATTAGAAGCATGAGCCACTGCCCACTGCACCTAGCTGAAAACCACACTTTCT 1866

 31525109 GTTGATTAAATAATATTTCACCTTATGGAGTTACAAATTTTCATTTTATGGGGTTATAAT 31525168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1867 GTTGATTAAATAATATTTCACCTTATGGAGTTACAAATTTTCATTTTATGGGGTTATAAT 1926

 31525169 CACTTACTTAGCTTGTTATCTTTTGTTGGACATTAATGTGGTTTCTAACTTTTCATTATC 31525228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1927 CACTTACTTAGCTTGTTATCTTTTGTTGGACATTAATGTGGTTTCTAACTTTTCATTATC 1986

 31525229 AAAAAATAAAAGAAAATGGACAAAACCTCAGAAAGACACAAACTACTAAAGCTGACTTAA 31525288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1987 AAAAAATAAAAGAAAATGGACAAAACCTCAGAAAGACACAAACTACTAAAGCTGACTTAA 2046

 31525289 TAAGAAATAGAAAATCTGAATATATAGAAAATCTGAATGTAACAAGTAAGGAGATTGGAT 31525348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2047 TAAGAAATAGAAAATCTGAATATATAGAAAATCTGAATGTAACAAGTAAGGAGATTGGAT 2106

 31525349 TAGTAATAAAATTTCCCACAAAGAGAAGTACACATTCAGATGGTTTCACTGGTAAATTCT 31525408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2107 TAGTAATAAAATTTCCCACAAAGAGAAGTACACATTCAGATGGTTTCACTGGTAAATTCT 2166

 31525409 ACCAAATATTTAAAGATTTTTCTTTTTTTTTGTTGAGACAGAGTCTCACTCTATTGCCCA 31525468
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     2167 ACCAAATATTTAAAGATTTTTCTTTTTTTTTGTTGAGGCAGAGTCTCACTCTATTGCCCA 2226

 31525469 GGCTGGAGTACAATGGTG 31525486
          ||||||||||||||||||
     2227 GGCTGGAGTACAATGGTG 2244

Alignment time is 1.89715 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31515486,31539389] =>     23904 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    6185] =>      6185 nucs 'mol-32-33ab-255783_6185'

Score:        6185
Aligned:      6185        nucs
Identic:      6185 (100%) nucs =>       644 (100%)      5541 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31528421,31529064] EXCISED REGION [31529066,31534606]
 second seq =>  [       1,     644] EXCISED REGION [     645,    6185]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [31529065,31529065]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        12 nucs [31529065,31529076] to [31529066,31529077]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31528421 TACCGTCAAGAAAGTGAAAGGGTAACCTGAAAGAAAATACTTGCAAATCATATATCTGAT 31528480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TACCGTCAAGAAAGTGAAAGGGTAACCTGAAAGAAAATACTTGCAAATCATATATCTGAT 60

 31528481 AAGGGACTAGTATCCAGAATATATAAAGCACTCTTGCAACTTGATAAAAATGATAAATAA 31528540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAGGGACTAGTATCCAGAATATATAAAGCACTCTTGCAACTTGATAAAAATGATAAATAA 120

 31528541 CCAAATTAAGATACGGGTAAAGGATCTAAATAAACATTTCTTCAAAGAAGATGTACAAAT 31528600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCAAATTAAGATACGGGTAAAGGATCTAAATAAACATTTCTTCAAAGAAGATGTACAAAT 180

 31528601 GGCTAATAAGTATATTAAATGATGGTGAACATCATTAGCTATCAGGGAAATGCATATTAA 31528660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGCTAATAAGTATATTAAATGATGGTGAACATCATTAGCTATCAGGGAAATGCATATTAA 240

 31528661 AACTATAATGAGATCCCACTTTACACTTGCCAGGATAACTATAGATAATAGCAATGGTTG 31528720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AACTATAATGAGATCCCACTTTACACTTGCCAGGATAACTATAGATAATAGCAATGGTTG 300

 31528721 GCTGGGATGTGGACAAACTGGGACTCTTACACATTGCTGGATAGAATGTAGAAAGCTGGC 31528780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GCTGGGATGTGGACAAACTGGGACTCTTACACATTGCTGGATAGAATGTAGAAAGCTGGC 360

 31528781 CAGGTACGGTGGCTCAGGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGCGGATTA 31528840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CAGGTACGGTGGCTCAGGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGCGGATTA 420

 31528841 TGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAGCATGGTGTAACCCCGTCTCTACTAAACA 31528900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAGCATGGTGTAACCCCGTCTCTACTAAACA 480

 31528901 TACAAAAATTAGCAGGGCATGATGGCGGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGA 31528960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TACAAAAATTAGCAGGGCATGATGGCGGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGA 540

 31528961 GGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCAGAGATCATGCCATT 31529020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCAGAGATCATGCCATT 600

 31529021 GCGTTCCAGTCTGGGCAACAAGAGCAAAACTCCAAACTCTGTTT 31529064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GCGTTCCAGTCTGGGCAACAAGAGCAAAACTCCAAACTCTGTTT 644

EXCISED REGION

 31529066 AAAAAAAAAAAAGAAAAAGAACATAGAAAGCTGCAGTCACTTTGGAAAACAGTCTGGCAG 31529125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      645 AAAAAAAAAAAAGAAAAAGAACATAGAAAGCTGCAGTCACTTTGGAAAACAGTCTGGCAG 704

 31529126 TTCCTCAAAAATTAAGTGTAGACTTACCATATTACCCAACAGTTCCACTCCCAAGTGTAT 31529185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      705 TTCCTCAAAAATTAAGTGTAGACTTACCATATTACCCAACAGTTCCACTCCCAAGTGTAT 764

 31529186 ACCCAAGAGAAATGAAAACATATGTTCACATAAAATCTTGTACATGAATGTTTATAGTAG 31529245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      765 ACCCAAGAGAAATGAAAACATATGTTCACATAAAATCTTGTACATGAATGTTTATAGTAG 824

 31529246 CATTATTTATAATACAAAAGTGGAAACAACCCAAATGTCAACTTCCAAATGGATAAAGTG 31529305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      825 CATTATTTATAATACAAAAGTGGAAACAACCCAAATGTCAACTTCCAAATGGATAAAGTG 884

 31529306 TGGTATGGTGATACAATGGAATGTTATTTAATAATAAAAAGGAATAAAGTACTGATGCAT 31529365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      885 TGGTATGGTGATACAATGGAATGTTATTTAATAATAAAAAGGAATAAAGTACTGATGCAT 944

 31529366 GCAACAACATGGATGAACCTTGAAAATACTGTGCTAAGTGAAAGAAGCCAACCACAAAAT 31529425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      945 GCAACAACATGGATGAACCTTGAAAATACTGTGCTAAGTGAAAGAAGCCAACCACAAAAT 1004

 31529426 ACCATATATTGTGTGATTCTGCTTAAATGACATGTCCAGAATGTCCATATTAAAGTAGAT 31529485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1005 ACCATATATTGTGTGATTCTGCTTAAATGACATGTCCAGAATGTCCATATTAAAGTAGAT 1064

 31529486 TAGTGGTTTCCTGAGGCTGGGGGAGGGAGTTGGGGAAATTGCGTAGTGACTACTGGGTAA 31529545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1065 TAGTGGTTTCCTGAGGCTGGGGGAGGGAGTTGGGGAAATTGCGTAGTGACTACTGGGTAA 1124

 31529546 AGAGTTTCTTTCTGGGGTGATGAAATGGTCTAAAATAGAATGTGGTGGTGGTTGCACAGC 31529605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1125 AGAGTTTCTTTCTGGGGTGATGAAATGGTCTAAAATAGAATGTGGTGGTGGTTGCACAGC 1184

 31529606 TCTGAAAATACTAAAAACCATTGAATGAGCACTTTAAATTGGTAAATTTTTATGTGAATT 31529665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1185 TCTGAAAATACTAAAAACCATTGAATGAGCACTTTAAATTGGTAAATTTTTATGTGAATT 1244

 31529666 ATGATTCAATAAAGTTGTGTTTAGATATTACTAAAAATGATGGTACAAATATTCTTTTTC 31529725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1245 ATGATTCAATAAAGTTGTGTTTAGATATTACTAAAAATGATGGTACAAATATTCTTTTTC 1304

 31529726 ACAAATGTTTTTTGTTGTTGTTTATAGTTGTTTATTTGTACATCTAGTAATTTGTCCCAA 31529785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1305 ACAAATGTTTTTTGTTGTTGTTTATAGTTGTTTATTTGTACATCTAGTAATTTGTCCCAA 1364

 31529786 GGAAAGAGTATGTAAAAGAACATAAGTCACTTTAAGGCCTTTAATGTATACTACAAAATT 31529845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1365 GGAAAGAGTATGTAAAAGAACATAAGTCACTTTAAGGCCTTTAATGTATACTACAAAATT 1424

 31529846 GCACTCTAGAAGGTTTATACAGTTTTGCATTTCATTAGCCTGTTTTTTTTATCTTTGACA 31529905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1425 GCACTCTAGAAGGTTTATACAGTTTTGCATTTCATTAGCCTGTTTTTTTTATCTTTGACA 1484

 31529906 ACCTAAAGAATTTATTAGTGGTATTCATCTGAGGATCCTCTAGGTCTATCAGAGTGTCTT 31529965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1485 ACCTAAAGAATTTATTAGTGGTATTCATCTGAGGATCCTCTAGGTCTATCAGAGTGTCTT 1544

 31529966 TCTTATAGAAGGCATTCAATAAATAAATGTCCTAAGTGAGCAAAACATTTTTGGTTGATT 31530025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1545 TCTTATAGAAGGCATTCAATAAATAAATGTCCTAAGTGAGCAAAACATTTTTGGTTGATT 1604

 31530026 TTTAGGTGCAAATGGTTTCTTTTGATTTTAATTAAGATGCCTTTGTTTATTAGTGATGTT 31530085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1605 TTTAGGTGCAAATGGTTTCTTTTGATTTTAATTAAGATGCCTTTGTTTATTAGTGATGTT 1664

 31530086 GACATATTTTCTTAATCTATTGGCTTTGTATAACTTTATGAATTGTCTCTTCATGTCCTT 31530145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1665 GACATATTTTCTTAATCTATTGGCTTTGTATAACTTTATGAATTGTCTCTTCATGTCCTT 1724

 31530146 TGCCTACTTTTCTATTGTGGTAACTATCTTTTATAAATGTTGTATAATTATTTAAAAATA 31530205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1725 TGCCTACTTTTCTATTGTGGTAACTATCTTTTATAAATGTTGTATAATTATTTAAAAATA 1784

 31530206 CATTAGGTTGGGCATGGTAGATCATGCCTGTAATCCCAGCTCTCTGGGAGGCCAAGGTGG 31530265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1785 CATTAGGTTGGGCATGGTAGATCATGCCTGTAATCCCAGCTCTCTGGGAGGCCAAGGTGG 1844

 31530266 GCAGATTGCTTGAGCCTAACAGTTCGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCCATCT 31530325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1845 GCAGATTGCTTGAGCCTAACAGTTCGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCCATCT 1904

 31530326 CTAAAAAAAAAAACCAATAAAAATATATTAAAAGATTAACTGATTGTCTATCATATGGAT 31530385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1905 CTAAAAAAAAAAACCAATAAAAATATATTAAAAGATTAACTGATTGTCTATCATATGGAT 1964

 31530386 TACAAATATCCCCCCCAATTTGTCATTTGCTTGTTAATTTTATTTATGATGACTTAAAAA 31530445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1965 TACAAATATCCCCCCCAATTTGTCATTTGCTTGTTAATTTTATTTATGATGACTTAAAAA 2024

 31530446 TTACAATATATTTTTTGGTGTTCAAGTCAGTTTTTGTCCCCATTGTGATATTTTCCTTTG 31530505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2025 TTACAATATATTTTTTGGTGTTCAAGTCAGTTTTTGTCCCCATTGTGATATTTTCCTTTG 2084

 31530506 CCTGTTTATCACTTTCTTAGAGAAAAGATAAATACTGATTCGTTCTTTTGTAGGTGTTTT 31530565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2085 CCTGTTTATCACTTTCTTAGAGAAAAGATAAATACTGATTCGTTCTTTTGTAGGTGTTTT 2144

 31530566 ATGATTTCATTGAAAATAAAATCTTCAACGCATCTAGTATTCATTTGGGTGTAAGATAAA 31530625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2145 ATGATTTCATTGAAAATAAAATCTTCAACGCATCTAGTATTCATTTGGGTGTAAGATAAA 2204

 31530626 AGATAACAACGTAGGTTTCTCTTATAGTTCATCAGGTATCCTACTACTGTTTATTGAGTC 31530685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2205 AGATAACAACGTAGGTTTCTCTTATAGTTCATCAGGTATCCTACTACTGTTTATTGAGTC 2264

 31530686 ATGTTTTCTGTTACCACTCTTACTATATACCAGTTTTACATACATTTGGGTTGGTTTCTG 31530745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2265 ATGTTTTCTGTTACCACTCTTACTATATACCAGTTTTACATACATTTGGGTTGGTTTCTG 2324

 31530746 AGCTTTCTATTGTCTTCCATTGCTTTGTTTAAAATTTAAAGTTTATTATTCTGACTTTCC 31530805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2325 AGCTTTCTATTGTCTTCCATTGCTTTGTTTAAAATTTAAAGTTTATTATTCTGACTTTCC 2384

 31530806 ATACTTGAATATGGTCGAATAAGTCCTCCTTTATTAATCTTGTTTTATTTAAAAATGGTC 31530865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2385 ATACTTGAATATGGTCGAATAAGTCCTCCTTTATTAATCTTGTTTTATTTAAAAATGGTC 2444

 31530866 ATTTTCACTCATTTTCCAGTTCAGTAGTTTTATTCTCTCAGTGTAATGTGATTTATCACC 31530925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2445 ATTTTCACTCATTTTCCAGTTCAGTAGTTTTATTCTCTCAGTGTAATGTGATTTATCACC 2504

 31530926 CCATTGCTCACCCTATTCATCTCCCAATACCCAGCTGAAAAACTTTAGAAGACTGAGGCT 31530985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2505 CCATTGCTCACCCTATTCATCTCCCAATACCCAGCTGAAAAACTTTAGAAGACTGAGGCT 2564

 31530986 CTTGCCCTGGCCCCATCACTTTCTAGCTATGTGGGCTTAGGCTAGTTATTGAACATGTCT 31531045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2565 CTTGCCCTGGCCCCATCACTTTCTAGCTATGTGGGCTTAGGCTAGTTATTGAACATGTCT 2624

 31531046 GACTCTCACTTTTCTCCTCTGTAAGTCAGTGAGAATTATATACTTCTTATAAGGTTGTGA 31531105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2625 GACTCTCACTTTTCTCCTCTGTAAGTCAGTGAGAATTATATACTTCTTATAAGGTTGTGA 2684

 31531106 GGTTCAAATGGAATAATGTGTACAGAGGCACTTGGTAAACAATGTAGTCATATGCAAGTC 31531165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2685 GGTTCAAATGGAATAATGTGTACAGAGGCACTTGGTAAACAATGTAGTCATATGCAAGTC 2744

 31531166 ATATGCAAGTCATATGTAGTCAGCTTGGTGAATTTTGAGAAAGTAAATGCAAGTTCTTTT 31531225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2745 ATATGCAAGTCATATGTAGTCAGCTTGGTGAATTTTGAGAAAGTAAATGCAAGTTCTTTT 2804

 31531226 TATGGTTTTACCTAAGGGGCCAGTGAGGGCCAGAGAAGTGCCGGGACCTATGTAAGGTCG 31531285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2805 TATGGTTTTACCTAAGGGGCCAGTGAGGGCCAGAGAAGTGCCGGGACCTATGTAAGGTCG 2864

 31531286 CAAGCAAGTTCATGTGGAATGCATCTAGAACTAGAACGCTAGCCTGTGTCCCAGGGCCCT 31531345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2865 CAAGCAAGTTCATGTGGAATGCATCTAGAACTAGAACGCTAGCCTGTGTCCCAGGGCCCT 2924

 31531346 TCCAACTGGGCTCTGCTGCCTGCAGTCCTGGGTGCCTTCTAATTAGCCTGTGTAGTGGTC 31531405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2925 TCCAACTGGGCTCTGCTGCCTGCAGTCCTGGGTGCCTTCTAATTAGCCTGTGTAGTGGTC 2984

 31531406 TTGGTAAAAGTGTTTCTCCTGTACTGTCCCCTATAGGTTGTGGCTGGCCATACCATTTCC 31531465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2985 TTGGTAAAAGTGTTTCTCCTGTACTGTCCCCTATAGGTTGTGGCTGGCCATACCATTTCC 3044

 31531466 CTGGTTCCCCCCACGCTCCTGATGACCTGGAAAGGCCATTTGAATAGTGTGGCAGACATC 31531525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3045 CTGGTTCCCCCCACGCTCCTGATGACCTGGAAAGGCCATTTGAATAGTGTGGCAGACATC 3104

 31531526 CTGTATGTGGACAACTTCCAGCTGGTTATCAGCGCTGGCCAGGACCGGGACGTCAAGGCT 31531585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3105 CTGTATGTGGACAACTTCCAGCTGGTTATCAGCGCTGGCCAGGACCGGGACGTCAAGGCT 3164

 31531586 TGGAAACTCTCCGGTGATGCCATTGGTATGGGTCCTGCTGAAGCTCAGCCATGCCCATGG 31531645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3165 TGGAAACTCTCCGGTGATGCCATTGGTATGGGTCCTGCTGAAGCTCAGCCATGCCCATGG 3224

 31531646 CCCTTCTTGTCTCTGTCCCTGTCTGAACATAAGCTGGTATGAACTTTGTACTCTGTGGGG 31531705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3225 CCCTTCTTGTCTCTGTCCCTGTCTGAACATAAGCTGGTATGAACTTTGTACTCTGTGGGG 3284

 31531706 AGGGACTCTCAGGCCACAGCAACTGCCTTCACTTAAATAATATTACAGTCTGTCCAATTA 31531765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3285 AGGGACTCTCAGGCCACAGCAACTGCCTTCACTTAAATAATATTACAGTCTGTCCAATTA 3344

 31531766 TCCATTCAGCAAACGGTCCATCCATTCACCCATCCACCCAATATTATTCACCTATGTATA 31531825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3345 TCCATTCAGCAAACGGTCCATCCATTCACCCATCCACCCAATATTATTCACCTATGTATA 3404

 31531826 TTTTTGCAAATCATATATCTGATAAAGCATATTCCTTTCTCTTTTAAAAAATAAACTTAA 31531885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3405 TTTTTGCAAATCATATATCTGATAAAGCATATTCCTTTCTCTTTTAAAAAATAAACTTAA 3464

 31531886 TTGTTGCATTGTATATAAAGAAAAACATACAAACCAGAAGGGTTCAGCTTGGTGAATTTT 31531945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3465 TTGTTGCATTGTATATAAAGAAAAACATACAAACCAGAAGGGTTCAGCTTGGTGAATTTT 3524

 31531946 GAGAAAGTAAATACATACCCATATAGCCACCGTTCATGTCAAGAAATAATTAGGGCCAGG 31532005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3525 GAGAAAGTAAATACATACCCATATAGCCACCGTTCATGTCAAGAAATAATTAGGGCCAGG 3584

 31532006 CGCGGTGGCTCACTACTGTAATCCCAACACTTTTTTGTCCCCTTTTCCTCCTGTGCTGTC 31532065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3585 CGCGGTGGCTCACTACTGTAATCCCAACACTTTTTTGTCCCCTTTTCCTCCTGTGCTGTC 3644

 31532066 TTCCTATGTGTTTGTTTGTTTGTTTTAGTGACCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAG 31532125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3645 TTCCTATGTGTTTGTTTGTTTGTTTTAGTGACCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAG 3704

 31532126 CCAGGCATGGTGGTGCATGCCTGTAATCCCAGCTACTTGAGAGGCTGAGGCAGGAGAATC 31532185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3705 CCAGGCATGGTGGTGCATGCCTGTAATCCCAGCTACTTGAGAGGCTGAGGCAGGAGAATC 3764

 31532186 GTTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCATGTCACTGCACTCCAGCCT 31532245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3765 GTTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCATGTCACTGCACTCCAGCCT 3824

 31532246 GGGCAACAGAGTGAGACTCTGTCTAAAAAAAAAATAATAATAAAAATAAAGTGACTTATG 31532305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3825 GGGCAACAGAGTGAGACTCTGTCTAAAAAAAAAATAATAATAAAAATAAAGTGACTTATG 3884

 31532306 TGCCACTATTACAGTATTACAGCATTCTGTATTTTTCTATGTGTTTACATTTATCAGAAA 31532365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3885 TGCCACTATTACAGTATTACAGCATTCTGTATTTTTCTATGTGTTTACATTTATCAGAAA 3944

 31532366 GCTTTGTATTTTCATATGCTTTCATGTTCCTGCCTAGCATCCTTTTGTTTCAACTTGAAG 31532425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3945 GCTTTGTATTTTCATATGCTTTCATGTTCCTGCCTAGCATCCTTTTGTTTCAACTTGAAG 4004

 31532426 GGGTCCCTTTAGCATTTCTTTAAAGGCAGGTCTAATGGTGATGAACTCCTCTTGTTTTTA 31532485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4005 GGGTCCCTTTAGCATTTCTTTAAAGGCAGGTCTAATGGTGATGAACTCCTCTTGTTTTTA 4064

 31532486 TTTATCTGGGAAAATTTTTATTTTTCCTTCATTTTTAAAGGACAGCTTTCCTGGATATAG 31532545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4065 TTTATCTGGGAAAATTTTTATTTTTCCTTCATTTTTAAAGGACAGCTTTCCTGGATATAG 4124

 31532546 TATTTTTGGATGAGAGTTTTTGTTCTTTTTATAATGTGTCTCCTTGTGGATTTCTTTGAC 31532605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4125 TATTTTTGGATGAGAGTTTTTGTTCTTTTTATAATGTGTCTCCTTGTGGATTTCTTTGAC 4184

 31532606 TTTATCCTAGTTGGAATCCCTTGAGCTTCTTGAATATAGGTTTCTTTTCCTTTTTAAGAT 31532665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4185 TTTATCCTAGTTGGAATCCCTTGAGCTTCTTGAATATAGGTTTCTTTTCCTTTTTAAGAT 4244

 31532666 TTGAAACATTTTCAGCCATTATTTATTCAGATAAGCTTTTTGTCCCTTTCTCTCTCTCTG 31532725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4245 TTGAAACATTTTCAGCCATTATTTATTCAGATAAGCTTTTTGTCCCTTTCTCTCTCTCTG 4304

 31532726 TCTCTCTCTCCTCCTTCTAGTACTACCATAATGCATATATTGTCCATTTGACGATGTCTC 31532785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4305 TCTCTCTCTCCTCCTTCTAGTACTACCATAATGCATATATTGTCCATTTGACGATGTCTC 4364

 31532786 ATAAATCCCTTAAGTTTTCTTTACTCTTTAAAATTCTTTTTTCTTTTTTGCTTCTCTGAC 31532845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4365 ATAAATCCCTTAAGTTTTCTTTACTCTTTAAAATTCTTTTTTCTTTTTTGCTTCTCTGAC 4424

 31532846 TGGATATCTTCAAGTCTGCTGATTTTTCCTTCTGCTTGATCAAGCCTGCTGTAGATGACT 31532905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4425 TGGATATCTTCAAGTCTGCTGATTTTTCCTTCTGCTTGATCAAGCCTGCTGTAGATGACT 4484

 31532906 TTTGAATTCAATTATTTTACTCTTCATCTTCAGCTCTAGAATTTCTGTTATTTTTATTAT 31532965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4485 TTTGAATTCAATTATTTTACTCTTCATCTTCAGCTCTAGAATTTCTGTTATTTTTATTAT 4544

 31532966 TATTATTATTATTTTTTGAGACAGGGTCTTGCTCTGCCACCCAGGGTTGAGTGCAGTGGC 31533025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4545 TATTATTATTATTTTTTGAGACAGGGTCTTGCTCTGCCACCCAGGGTTGAGTGCAGTGGC 4604

 31533026 ACGAATTCAGCTCACTGAAGCCTTGACCTCCCAGCCTCAAGTGATCTTCCCACAGCCTCC 31533085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4605 ACGAATTCAGCTCACTGAAGCCTTGACCTCCCAGCCTCAAGTGATCTTCCCACAGCCTCC 4664

 31533086 TGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCATGCCATCATGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTTGT 31533145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4665 TGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCATGCCATCATGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTTGT 4724

 31533146 AGAGACAGAGTTTCACCATGTTGCCCAGGCTGGCCTTGAATTCTTGAGCTCAAGTGATCG 31533205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4725 AGAGACAGAGTTTCACCATGTTGCCCAGGCTGGCCTTGAATTCTTGAGCTCAAGTGATCG 4784

 31533206 CCCACCTAAGCTTCCCAAAGTGTTGGGATTATAGGTGTGGGCCACCATGGCTGGCCTCTG 31533265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4785 CCCACCTAAGCTTCCCAAAGTGTTGGGATTATAGGTGTGGGCCACCATGGCTGGCCTCTG 4844

 31533266 TTTGGTTCTTTTCTATATTTTCTGTGTCTTCACTAATATTCTCAGTTTGTTCATGTATTG 31533325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4845 TTTGGTTCTTTTCTATATTTTCTGTGTCTTCACTAATATTCTCAGTTTGTTCATGTATTG 4904

 31533326 TTTCCCTGAGCTTGTTGAGCATTTTTATTACGGTTACTTAGAATTCTTTGTCAAATAATT 31533385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4905 TTTCCCTGAGCTTGTTGAGCATTTTTATTACGGTTACTTAGAATTCTTTGTCAAATAATT 4964

 31533386 AATATACCTCAATTTCTTTAGCGGCAGTTTCTGGAGATTTATTTTGTTCCTTTGGGCCAT 31533445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4965 AATATACCTCAATTTCTTTAGCGGCAGTTTCTGGAGATTTATTTTGTTCCTTTGGGCCAT 5024

 31533446 GCTTTCCTATTTTTTTTGTGTGCCTTATAACTTTATATTGGGATCCATGCATTTGTAAAA 31533505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5025 GCTTTCCTATTTTTTTTGTGTGCCTTATAACTTTATATTGGGATCCATGCATTTGTAAAA 5084

 31533506 TCAGCCACCTCTCCCAGTCTTTATATACTGGCTTCATTCAGGGAAAATTCTGCACCAATC 31533565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5085 TCAGCCACCTCTCCCAGTCTTTATATACTGGCTTCATTCAGGGAAAATTCTGCACCAATC 5144

 31533566 AGCTTGGCTAAAGATTCTGGGTGCCTCCCCAATCTTTTTTGTGGATACTTTCACCAGACT 31533625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5145 AGCTTGGCTAAAGATTCTGGGTGCCTCCCCAATCTTTTTTGTGGATACTTTCACCAGACT 5204

 31533626 TACGCATGTAAATTCGCAATTACAGGAATCTACAGGTTTATTTTTTTCAGGAGTCCATTA 31533685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5205 TACGCATGTAAATTCGCAATTACAGGAATCTACAGGTTTATTTTTTTCAGGAGTCCATTA 5264

 31533686 TCTCTTGCTCTCTCTGGTGTCTATTTGCAGTACTGCAAGTTCTCTAGAGCGGCTACAAGC 31533745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5265 TCTCTTGCTCTCTCTGGTGTCTATTTGCAGTACTGCAAGTTCTCTAGAGCGGCTACAAGC 5324

 31533746 TTCCCCCAGGCCTCTAGAATATGCTGGGTCCTTCAATAGTCTGAGAGAGGCAAGACAGAA 31533805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5325 TTCCCCCAGGCCTCTAGAATATGCTGGGTCCTTCAATAGTCTGAGAGAGGCAAGACAGAA 5384

 31533806 ACCAGTTTCTTGGGTACCCCTCAAAGGCTAACATTGGATATGTATGCTCCAAATCTGCCT 31533865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5385 ACCAGTTTCTTGGGTACCCCTCAAAGGCTAACATTGGATATGTATGCTCCAAATCTGCCT 5444

 31533866 CCTCAAGGAGAAGCTGGAAGTTGGGTTGTTTTCTCTACTCATTCCACAGAGCGGCAGGAG 31533925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5445 CCTCAAGGAGAAGCTGGAAGTTGGGTTGTTTTCTCTACTCATTCCACAGAGCGGCAGGAG 5504

 31533926 GGACTCTGATAGTGTGTGCTAGTCTAAATTGTCACCTTTGTTCTTAGTAGCCCAGTCTGG 31533985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5505 GGACTCTGATAGTGTGTGCTAGTCTAAATTGTCACCTTTGTTCTTAGTAGCCCAGTCTGG 5564

 31533986 TGCCTCTTCCTGTCAGTGCTTAGATTCAGGCAAGACAGAAACTGGTTAATCATGCAGCCC 31534045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5565 TGCCTCTTCCTGTCAGTGCTTAGATTCAGGCAAGACAGAAACTGGTTAATCATGCAGCCC 5624

 31534046 TCTGAAAAGTCTGCATGTTGGATGTACATCTCAGTCTTTCCCTCCCAGGGAGAAGCTGGA 31534105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5625 TCTGAAAAGTCTGCATGTTGGATGTACATCTCAGTCTTTCCCTCCCAGGGAGAAGCTGGA 5684

 31534106 AGCTGGTGGTTCCTTCCCAATCTGCTTCACTGAGCCAGGAGGAGGGATTACAAGTGAGCA 31534165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5685 AGCTGGTGGTTCCTTCCCAATCTGCTTCACTGAGCCAGGAGGAGGGATTACAAGTGAGCA 5744

 31534166 CTATGAATTTTCCTACTGGCTTCAGTGCAGCTGGTTTTTTGTTTTTTGTTTTTTTGGTTT 31534225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5745 CTATGAATTTTCCTACTGGCTTCAGTGCAGCTGGTTTTTTGTTTTTTGTTTTTTTGGTTT 5804

 31534226 TTGTTTGTTTGTTTTTTCATTCATCTGGGATGAATGGTCCTGGTTTCTGGTCCATGTACT 31534285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5805 TTGTTTGTTTGTTTTTTCATTCATCTGGGATGAATGGTCCTGGTTTCTGGTCCATGTACT 5864

 31534286 GTTGTTCAGTCAGTGTCTCCATAGGGAGAAGGAAGTTCTGGATCTTCCTATTCTACCATC 31534345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5865 GTTGTTCAGTCAGTGTCTCCATAGGGAGAAGGAAGTTCTGGATCTTCCTATTCTACCATC 5924

 31534346 TTGCTGATGTCACCCATTTTTTTGTATCTTTCAAAGACGTCTTTGACTATCCCCTAAATA 31534405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5925 TTGCTGATGTCACCCATTTTTTTGTATCTTTCAAAGACGTCTTTGACTATCCCCTAAATA 5984

 31534406 TAATATCTAGTGTTATCTTTTAGAAGCTTGTTTTAAAAATCAGATTTCTGAAGTATAATT 31534465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5985 TAATATCTAGTGTTATCTTTTAGAAGCTTGTTTTAAAAATCAGATTTCTGAAGTATAATT 6044

 31534466 TACATCCAATAAAAGCACCTTTTAAAAGTATATAGTTCTGTGAGGTTTCATGAATGCATA 31534525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6045 TACATCCAATAAAAGCACCTTTTAAAAGTATATAGTTCTGTGAGGTTTCATGAATGCATA 6104

 31534526 CAATTGTGTAATTGGTATCACAATCAAGACATAGACATTACCCCAAAAAGTGACCTCATG 31534585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6105 CAATTGTGTAATTGGTATCACAATCAAGACATAGACATTACCCCAAAAAGTGACCTCATG 6164

 31534586 TCTCCTCATAGTAAACTCTAT 31534606
          |||||||||||||||||||||
     6165 TCTCCTCATAGTAAACTCTAT 6185

Alignment time is 5.74782 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31515486,31539389] =>     23904 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    9414] =>      9414 nucs 'mol-32-349d-017287_9414'

Score:        9298
Aligned:      9426        nucs
Identic:      9398 (100%) nucs =>      3706 (100%)      5692 (100%)
Gaps:           23 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31521768,31525486] EXCISED REGION [31529390,31535094]
 second seq =>  [       1,    3711] EXCISED REGION [    3721,    9414]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3903 nucs [31525487,31529389]
 second seq =>         9 nucs [3712,3720]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31521768 GTGAGACTCCGTCTCAAAAAATCAATCAATCAAATCAAAGCAAATCAAAAACTTTTTTTT 31521827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTGAGACTCCGTCTCAAAAAATCAATCAATCAAATCAAAGCAAATCAAAAACTTTTTTTT 60

 31521828 TTTTTTT--GTAGAGATGAGGTCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGGGCTCAA 31521885
          |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTTTTTTTGTAGAGATGAGGTCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGGGCTCAA 120

 31521886 GGAATCCTCCTGCCTTGACCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGTGCCC 31521945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGAATCCTCCTGCCTTGACCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGTGCCC 180

 31521946 AGCCCTTTCTACTTCTATGAGTTTGACTTTTTATAATTCCATATATAAATACAATCATGC 31522005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGCCCTTTCTACTTCTATGAGTTTGACTTTTTATAATTCCATATATAAATACAATCATGC 240

 31522006 AGTATTTTTCTTTCATGACTGGCTTATTTCACTTACCATAATGTCTTCCAGATTAATCTA 31522065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGTATTTTTCTTTCATGACTGGCTTATTTCACTTACCATAATGTCTTCCAGATTAATCTA 300

 31522066 TGTTGTCCCAAATGACAGGATTTTTTTTCTCTTTTAAGGCTGAATAGTATTCCATTATGT 31522125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGTTGTCCCAAATGACAGGATTTTTTTTCTCTTTTAAGGCTGAATAGTATTCCATTATGT 360

 31522126 ATATACACCACATTTGCATTATCCATTCATCCACTGATGGCCCCTTAGGTTGATTCTATA 31522185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATATACACCACATTTGCATTATCCATTCATCCACTGATGGCCCCTTAGGTTGATTCTATA 420

 31522186 TCTTGGCTATTGTGAAAAGTGCTGCAATGAACATGGGAGTGCAGGTATTTCTTTGACATA 31522245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCTTGGCTATTGTGAAAAGTGCTGCAATGAACATGGGAGTGCAGGTATTTCTTTGACATA 480

 31522246 TTGATATGACATATTGATCTCTTTTGGATATATACCCAGAAGTGGAATTGCTAGATCATA 31522305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTGATATGACATATTGATCTCTTTTGGATATATACCCAGAAGTGGAATTGCTAGATCATA 540

 31522306 TAGTAGTTCTAATTTTAGTTTTTTGAGGAAACCCCATACTATTTCTCGTAGTGGTTGATA 31522365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TAGTAGTTCTAATTTTAGTTTTTTGAGGAAACCCCATACTATTTCTCGTAGTGGTTGATA 600

 31522366 TGGTTTGGTTGTGTCCCCACACAAATCTCATCTTGAATTGTAGCTCTCATAATCCCCAGC 31522425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGGTTTGGTTGTGTCCCCACACAAATCTCATCTTGAATTGTAGCTCTCATAATCCCCAGC 660

 31522426 TGTCGTGGGAGGGACCTGGTGGGAGGTAATTGAATCGTGGGGGTGGGTTTTTCCCACCAT 31522485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGTCGTGGGAGGGACCTGGTGGGAGGTAATTGAATCGTGGGGGTGGGTTTTTCCCACCAT 720

 31522486 TCTAATGATAGTGAATAAGTCTCAAGAGATATGATGGCTTTATAAAGGGCAGTTCCCCTG 31522545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCTAATGATAGTGAATAAGTCTCAAGAGATATGATGGCTTTATAAAGGGCAGTTCCCCTG 780

 31522546 CTCATGCTCTCTTGCCTGCTCCCATGTAAGACGTGCCTTTGCTCCTCTTTCACCTCTGCC 31522605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTCATGCTCTCTTGCCTGCTCCCATGTAAGACGTGCCTTTGCTCCTCTTTCACCTCTGCC 840

 31522606 ATGATTGTGAGGCCTCCCCAGCCATGTGGAACTGTGAGTCCATTAAACCTTTACTTTATA 31522665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATGATTGTGAGGCCTCCCCAGCCATGTGGAACTGTGAGTCCATTAAACCTTTACTTTATA 900

 31522666 AATTACCCAGTCTCGGATATGTCTTTATTAGCAGCATGAGAACAGACCAATACAGTGGTT 31522725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AATTACCCAGTCTCGGATATGTCTTTATTAGCAGCATGAGAACAGACCAATACAGTGGTT 960

 31522726 GTACTGATTTACATTCCCTCCAACATTGTACAAGGGTTTTCTTTTTTCTGCCTCCTCACC 31522785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GTACTGATTTACATTCCCTCCAACATTGTACAAGGGTTTTCTTTTTTCTGCCTCCTCACC 1020

 31522786 AACACTTGTTTCTTGTCTTTTTGATAACATCTAATCTAACAGATGTAAGATGATATCTCA 31522845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AACACTTGTTTCTTGTCTTTTTGATAACATCTAATCTAACAGATGTAAGATGATATCTCA 1080

 31522846 TTGTGGTTTAATTTGTTTTTCCTAATGATTAGTGGTGCTCAGCATTTTTTTTCTTGAACC 31522905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTGTGGTTTAATTTGTTTTTCCTAATGATTAGTGGTGCTCAGCATTTTTTTTCTTGAACC 1140

 31522906 TGTTGGCCATTTGAATGTCTTCTTTTGAGAAATGTCTCTTTGGATGCTTTCTCCATTTTC 31522965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGTTGGCCATTTGAATGTCTTCTTTTGAGAAATGTCTCTTTGGATGCTTTCTCCATTTTC 1200

 31522966 TCTTCTCTTCTCTTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGA 31523025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||
     1201 TCTTCTCTTCTCTTTTCTTTCTTTCTTTCTTT----------TTTTTTTTTTTTTTTTGA 1250

 31523026 GATGGCGTTTTGCTCTTGTTGCCCGGGCTGGAGTGCATTGATCCAATCTTGGCTCACTGC 31523085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1251 GATGGCGTTTTGCTCTTGTTGCCCGGGCTGGAGTGCATTGATCCAATCTTGGCTCACTGC 1310

 31523086 AACCCCCGCCTCCCGGGTTCAAGCAATTCTCCCGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGTGATT 31523145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1311 AACCCCCGCCTCCCGGGTTCAAGCAATTCTCCCGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGTGATT 1370

 31523146 ACAGGCACAGGCTACCACACCCGGCTAATTTTGTATTTTCAGTAGAGACGAGGTGTCACC 31523205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1371 ACAGGCACAGGCTACCACACCCGGCTAATTTTGTATTTTCAGTAGAGACGAGGTGTCACC 1430

 31523206 TTGTTGGTCAGGCTGGTCCCGAACTCCTGACCTCAAGTGATCTGCCCGCCTTGGCCTCCC 31523265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1431 TTGTTGGTCAGGCTGGTCCCGAACTCCTGACCTCAAGTGATCTGCCCGCCTTGGCCTCCC 1490

 31523266 AAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGCCACTTTGCCTATTTTATTTTA 31523325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1491 AAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGCCACTTTGCCTATTTTATTTTA 1550

 31523326 TTTTGAGATGGAGTTTTGCTCTTATTGCCCAGACTGGAGTGCAATGGCGCAATTGCAGCT 31523385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1551 TTTTGAGATGGAGTTTTGCTCTTATTGCCCAGACTGGAGTGCAATGGCGCAATTGCAGCT 1610

 31523386 CACCACAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGGT 31523445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1611 CACCACAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGGT 1670

 31523446 GGGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCCAACTAATTTTGTAGTTTTAGTAGAGATGGGGT 31523505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1671 GGGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCCAACTAATTTTGTAGTTTTAGTAGAGATGGGGT 1730

 31523506 TTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCACCTTGC 31523565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1731 TTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCACCTTGC 1790

 31523566 CTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGAGTGAGTGCACCTGGCCCACTTTGCTCATTTTCTAA 31523625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1791 CTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGAGTGAGTGCACCTGGCCCACTTTGCTCATTTTCTAA 1850

 31523626 TTGGGTTATTCGTTTTCTGGCTATTGAGTTGTTTGAGTTTCTTATTTATTGTGGATGTTA 31523685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1851 TTGGGTTATTCGTTTTCTGGCTATTGAGTTGTTTGAGTTTCTTATTTATTGTGGATGTTA 1910

 31523686 CTCCCTTATCAGATGTATGATTTACATATATTTTCTGTCACTCTGTGGGTTATCTCTTTA 31523745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     1911 CTCCCTTATCAGATGTATGATTTACATATATTTTCTGTCACTTTGTGGGTTATCTCTTTA 1970

 31523746 CTTTGTTCATTGTTTCCTTTCTGTCCAAAAGCTTTGTATCTTGTCTAAAATCCCATTTGT 31523805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1971 CTTTGTTCATTGTTTCCTTTCTGTCCAAAAGCTTTGTATCTTGTCTAAAATCCCATTTGT 2030

 31523806 CTATTTTTGCTTTTATTTATTTTTATTTTTATTTTTATTTTTTATTTTTTTGAAACGGAG 31523865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2031 CTATTTTTGCTTTTATTTATTTTTATTTTTATTTTTATTTTTTATTTTTTTGAAACGGAG 2090

 31523866 TCTTGCTCTGTCACCCAGGTTGGAGTGCAGTGGTGCAATCTCAGCTCACTGCAACCTCTG 31523925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2091 TCTTGCTCTGTCACCCAGGTTGGAGTGCAGTGGTGCAATCTCAGCTCACTGCAACCTCTG 2150

 31523926 CCTCCCAGGTTCAAGGAAGTCTCCTACTCCAACTTCCTGAGTAGCTGGGATTATAGGCGT 31523985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2151 CCTCCCAGGTTCAAGGAAGTCTCCTACTCCAACTTCCTGAGTAGCTGGGATTATAGGCGT 2210

 31523986 GTGCCACCATGCCTAGCTAATTTTTGTATTTTTTGGTAGAGACAGGATTTCACCATGTTG 31524045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2211 GTGCCACCATGCCTAGCTAATTTTTGTATTTTTTGGTAGAGACAGGATTTCACCATGTTG 2270

 31524046 GCCAGGCTGGTGTTGAACTCTTGACCTCAGGCAATCCGCCTGACTCAGCCTCCCAAAGTG 31524105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2271 GCCAGGCTGGTGTTGAACTCTTGACCTCAGGCAATCCGCCTGACTCAGCCTCCCAAAGTG 2330

 31524106 CTGGGATTACACGTGTGAGCCACCGCGCCTGGCCTATTTTTGCTTTTATTACCTGTGCTT 31524165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2331 CTGGGATTACACGTGTGAGCCACCGCGCCTGGCCTATTTTTGCTTTTATTACCTGTGCTT 2390

 31524166 TTGGGGTCATAGCTAAATAACCATTGCTCAGATCAATGTCATGGAGCCTTTCCTCTAGGT 31524225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2391 TTGGGGTCATAGCTAAATAACCATTGCTCAGATCAATGTCATGGAGCCTTTCCTCTAGGT 2450

 31524226 ATTCTTCTAGTTGTTTTACAGTCTCAGATCTTATATTTAAGACTTTAATCCATTTTGAGT 31524285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2451 ATTCTTCTAGTTGTTTTACAGTCTCAGATCTTATATTTAAGACTTTAATCCATTTTGAGT 2510

 31524286 TGATTTTTTATACTGTGTGAGATAAGGATCCAATTTTATTCTTCTGTATGTGGATCCAAT 31524345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2511 TGATTTTTTATACTGTGTGAGATAAGGATCCAATTTTATTCTTCTGTATGTGGATCCAAT 2570

 31524346 TTTCCTAGTACAGTTTATTGAAAAGACTGTCTTTTCCCCATTATGTATTAGTAACACCTT 31524405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2571 TTTCCTAGTACAGTTTATTGAAAAGACTGTCTTTTCCCCATTATGTATTAGTAACACCTT 2630

 31524406 TGTCAAAAATCAATTGACTATTAGTGCATGGGTTTATTTCTGGGTTTTCTATCTTGTTAC 31524465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2631 TGTCAAAAATCAATTGACTATTAGTGCATGGGTTTATTTCTGGGTTTTCTATCTTGTTAC 2690

 31524466 ATTAGTCGATGTGTCTATTTTTATGCCAGCACCATACTGTTTTGATTATATTAGCTTTAT 31524525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2691 ATTAGTCGATGTGTCTATTTTTATGCCAGCACCATACTGTTTTGATTATATTAGCTTTAT 2750

 31524526 AATATATTTTGAAATCAGGGACTGTGATGTCTTTAGCTTTGTTCTTTTTGCTCAAGATTG 31524585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2751 AATATATTTTGAAATCAGGGACTGTGATGTCTTTAGCTTTGTTCTTTTTGCTCAAGATTG 2810

 31524586 TTTTGGCTAGCCAGGGTCTTTTATGATTGCATATGAATTTAAGGATTGTTTTATTTCTAT 31524645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2811 TTTTGGCTAGCCAGGGTCTTTTATGATTGCATATGAATTTAAGGATTGTTTTATTTCTAT 2870

 31524646 AAGAAATGACATTGGAATTTTGATAGGGACTGCATTGAATCTGTAGATTGCTTTGGGTAG 31524705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2871 AAGAAATGACATTGGAATTTTGATAGGGACTGCATTGAATCTGTAGATTGCTTTGGGTAG 2930

 31524706 TATGAATATTTTAATAATATTAATTCTTCTAATTTATCAACACAAGATAGCTTTCCATTT 31524765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2931 TATGAATATTTTAATAATATTAATTCTTCTAATTTATCAACACAAGATAGCTTTCCATTT 2990

 31524766 ATTTGTGTTTTCTTAAACAATGTTTTAGTTTCCAGTGTACAGATCTTTTAACTTCTTGGT 31524825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2991 ATTTGTGTTTTCTTAAACAATGTTTTAGTTTCCAGTGTACAGATCTTTTAACTTCTTGGT 3050

 31524826 TAAATTTACCCCTAAGTATTTTATTTTATTTTAAAATACCTGGCTAATTTTGTATTTAAT 31524885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3051 TAAATTTACCCCTAAGTATTTTATTTTATTTTAAAATACCTGGCTAATTTTGTATTTAAT 3110

 31524886 TTTATATTGTATTTATTTTATTTGTAATAAAATTAAGCATTTTATTTTATTTTAAAATAC 31524945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3111 TTTATATTGTATTTATTTTATTTGTAATAAAATTAAGCATTTTATTTTATTTTAAAATAC 3170

 31524946 CTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTC 31525005
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     3171 CTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGATAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTC 3230

 31525006 GAACTCCAGACCTCAGGTGATCCGACTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGTATTAGAAGC 31525065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3231 GAACTCCAGACCTCAGGTGATCCGACTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGTATTAGAAGC 3290

 31525066 ATGAGCCACTGCCCACTGCACCTAGCTGAAAACCACACTTTCTGTTGATTAAATAATATT 31525125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3291 ATGAGCCACTGCCCACTGCACCTAGCTGAAAACCACACTTTCTGTTGATTAAATAATATT 3350

 31525126 TCACCTTATGGAGTTACAAATTTTCATTTTATGGGGTTATAATCACTTACTTAGCTTGTT 31525185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3351 TCACCTTATGGAGTTACAAATTTTCATTTTATGGGGTTATAATCACTTACTTAGCTTGTT 3410

 31525186 ATCTTTTGTTGGACATTAATGTGGTTTCTAACTTTTCATTATCAAAAAATAAAAGAAAAT 31525245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3411 ATCTTTTGTTGGACATTAATGTGGTTTCTAACTTTTCATTATCAAAAAATAAAAGAAAAT 3470

 31525246 GGACAAAACCTCAGAAAGACACAAACTACTAAAGCTGACTTAATAAGAAATAGAAAATCT 31525305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3471 GGACAAAACCTCAGAAAGACACAAACTACTAAAGCTGACTTAATAAGAAATAGAAAATCT 3530

 31525306 GAATATATAGAAAATCTGAATGTAACAAGTAAGGAGATTGGATTAGTAATAAAATTTCCC 31525365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3531 GAATATATAGAAAATCTGAATGTAACAAGTAAGGAGATTGGATTAGTAATAAAATTTCCC 3590

 31525366 ACAAAGAGAAGTACACATTCAGATGGTTTCACTGGTAAATTCTACCAAATATTTAAAGAT 31525425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3591 ACAAAGAGAAGTACACATTCAGATGGTTTCACTGGTAAATTCTACCAAATATTTAAAGAT 3650

 31525426 TTTTCTTTTTTTTTGTTGAGACAGAGTCTCACTCTATTGCCCAGGCTGGAGTACAATGGT 31525485
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3651 TTTTCTTTTTTTTTGTTGAGGCAGAGTCTCACTCTATTGCCCAGGCTGGAGTACAATGGT 3710

 31525486 G 31525486
          |
     3711 G 3711

EXCISED REGION

 31529390 AATACTGTGCTAAGTGAAAGAAGCCAACCACAAAATACCATATATTGTGTGATTCTGCTT 31529449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 AATACTGTGCTAAGTGAAAGAAGCCAACCACAAAATACCATATATTGTGTGATTCTGCTT 3780

 31529450 AAATGACATGTCCAGAATGTCCATATTAAAGTAGATTAGTGGTTTCCTGAGGCTGGGGGA 31529509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 AAATGACATGTCCAGAATGTCCATATTAAAGTAGATTAGTGGTTTCCTGAGGCTGGGGGA 3840

 31529510 GGGAGTTGGGGAAATTGCGTAGTGACTACTGGGTAAAGAGTTTCTTTCTGGGGTGATGAA 31529569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 GGGAGTTGGGGAAATTGCGTAGTGACTACTGGGTAAAGAGTTTCTTTCTGGGGTGATGAA 3900

 31529570 ATGGTCTAAAATAGAATGTGGTGGTGGTTGCACAGCTCTGAAAATACTAAAAACCATTGA 31529629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 ATGGTCTAAAATAGAATGTGGTGGTGGTTGCACAGCTCTGAAAATACTAAAAACCATTGA 3960

 31529630 ATGAGCACTTTAAATTGGTAAATTTTTATGTGAATTATGATTCAATAAAGTTGTGTTTAG 31529689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 ATGAGCACTTTAAATTGGTAAATTTTTATGTGAATTATGATTCAATAAAGTTGTGTTTAG 4020

 31529690 ATATTACTAAAAATGATGGTACAAATATTCTTTTTCACAAATGTTTTTTGTTGTTGTTTA 31529749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 ATATTACTAAAAATGATGGTACAAATATTCTTTTTCACAAATGTTTTTTGTTGTTGTTTA 4080

 31529750 TAGTTGTTTATTTGTACATCTAGTAATTTGTCCCAAGGAAAGAGTATGTAAAAGAACATA 31529809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 TAGTTGTTTATTTGTACATCTAGTAATTTGTCCCAAGGAAAGAGTATGTAAAAGAACATA 4140

 31529810 AGTCACTTTAAGGCCTTTAATGTATACTACAAAATTGCACTCTAGAAGGTTTATACAGTT 31529869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 AGTCACTTTAAGGCCTTTAATGTATACTACAAAATTGCACTCTAGAAGGTTTATACAGTT 4200

 31529870 TTGCATTTCATTAGCCTGTTTTTTTTATCTTTGACAACCTAAAGAATTTATTAGTGGTAT 31529929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 TTGCATTTCATTAGCCTGTTTTTTTTATCTTTGACAACCTAAAGAATTTATTAGTGGTAT 4260

 31529930 TCATCTGAGGATCCTCTAGGTCTATCAGAGTGTCTTTCTTATAGAAGGCATTCAATAAAT 31529989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 TCATCTGAGGATCCTCTAGGTCTATCAGAGTGTCTTTCTTATAGAAGGCATTCAATAAAT 4320

 31529990 AAATGTCCTAAGTGAGCAAAACATTTTTGGTTGATTTTTAGGTGCAAATGGTTTCTTTTG 31530049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 AAATGTCCTAAGTGAGCAAAACATTTTTGGTTGATTTTTAGGTGCAAATGGTTTCTTTTG 4380

 31530050 ATTTTAATTAAGATGCCTTTGTTTATTAGTGATGTTGACATATTTTCTTAATCTATTGGC 31530109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 ATTTTAATTAAGATGCCTTTGTTTATTAGTGATGTTGACATATTTTCTTAATCTATTGGC 4440

 31530110 TTTGTATAACTTTATGAATTGTCTCTTCATGTCCTTTGCCTACTTTTCTATTGTGGTAAC 31530169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 TTTGTATAACTTTATGAATTGTCTCTTCATGTCCTTTGCCTACTTTTCTATTGTGGTAAC 4500

 31530170 TATCTTTTATAAATGTTGTATAATTATTTAAAAATACATTAGGTTGGGCATGGTAGATCA 31530229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 TATCTTTTATAAATGTTGTATAATTATTTAAAAATACATTAGGTTGGGCATGGTAGATCA 4560

 31530230 TGCCTGTAATCCCAGCTCTCTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATTGCTTGAGCCTAACAGTT 31530289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 TGCCTGTAATCCCAGCTCTCTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATTGCTTGAGCCTAACAGTT 4620

 31530290 CGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCCATCTCTAAAAAAAAAAACCAATAAAAAT 31530349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 CGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCCATCTCTAAAAAAAAAAACCAATAAAAAT 4680

 31530350 ATATTAAAAGATTAACTGATTGTCTATCATATGGATTACAAATATCCCCCCCAATTTGTC 31530409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 ATATTAAAAGATTAACTGATTGTCTATCATATGGATTACAAATATCCCCCCCAATTTGTC 4740

 31530410 ATTTGCTTGTTAATTTTATTTATGATGACTTAAAAATTACAATATATTTTTTGGTGTTCA 31530469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 ATTTGCTTGTTAATTTTATTTATGATGACTTAAAAATTACAATATATTTTTTGGTGTTCA 4800

 31530470 AGTCAGTTTTTGTCCCCATTGTGATATTTTCCTTTGCCTGTTTATCACTTTCTTAGAGAA 31530529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 AGTCAGTTTTTGTCCCCATTGTGATATTTTCCTTTGCCTGTTTATCACTTTCTTAGAGAA 4860

 31530530 AAGATAAATACTGATTCGTTCTTTTGTAGGTGTTTTATGATTTCATTGAAAATAAAATCT 31530589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 AAGATAAATACTGATTCGTTCTTTTGTAGGTGTTTTATGATTTCATTGAAAATAAAATCT 4920

 31530590 TCAACGCATCTAGTATTCATTTGGGTGTAAGATAAAAGATAACAACGTAGGTTTCTCTTA 31530649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 TCAACGCATCTAGTATTCATTTGGGTGTAAGATAAAAGATAACAACGTAGGTTTCTCTTA 4980

 31530650 TAGTTCATCAGGTATCCTACTACTGTTTATTGAGTCATGTTTTCTGTTACCACTCTTACT 31530709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 TAGTTCATCAGGTATCCTACTACTGTTTATTGAGTCATGTTTTCTGTTACCACTCTTACT 5040

 31530710 ATATACCAGTTTTACATACATTTGGGTTGGTTTCTGAGCTTTCTATTGTCTTCCATTGCT 31530769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 ATATACCAGTTTTACATACATTTGGGTTGGTTTCTGAGCTTTCTATTGTCTTCCATTGCT 5100

 31530770 TTGTTTAAAATTTAAAGTTTATTATTCTGACTTTCCATACTTGAATATGGTCGAATAAGT 31530829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 TTGTTTAAAATTTAAAGTTTATTATTCTGACTTTCCATACTTGAATATGGTCGAATAAGT 5160

 31530830 CCTCCTTTATTAATCTTGTTTTATTTAAAAATGGTCATTTTCACTCATTTTCCAGTTCAG 31530889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 CCTCCTTTATTAATCTTGTTTTATTTAAAAATGGTCATTTTCACTCATTTTCCAGTTCAG 5220

 31530890 TAGTTTTATTCTCTCAGTGTAATGTGATTTATCACCCCATTGCTCACCCTATTCATCTCC 31530949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 TAGTTTTATTCTCTCAGTGTAATGTGATTTATCACCCCATTGCTCACCCTATTCATCTCC 5280

 31530950 CAATACCCAGCTGAAAAACTTTAGAAGACTGAGGCTCTTGCCCTGGCCCCATCACTTTCT 31531009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 CAATACCCAGCTGAAAAACTTTAGAAGACTGAGGCTCTTGCCCTGGCCCCATCACTTTCT 5340

 31531010 AGCTATGTGGGCTTAGGCTAGTTATTGAACATGTCTGACTCTCACTTTTCTCCTCTGTAA 31531069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 AGCTATGTGGGCTTAGGCTAGTTATTGAACATGTCTGACTCTCACTTTTCTCCTCTGTAA 5400

 31531070 GTCAGTGAGAATTATATACTTCTTATAAGGTTGTGAGGTTCAAATGGAATAATGTGTACA 31531129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 GTCAGTGAGAATTATATACTTCTTATAAGGTTGTGAGGTTCAAATGGAATAATGTGTACA 5460

 31531130 GAGGCACTTGGTAAACAATGTAGTCATATGCAAGTCATATGCAAGTCATATGTAGTCAGC 31531189
          |||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||
     5461 GAGGCACTTGGTAAACAATGT-----------AGTCATATGCAAGTCATATGTAGTCAGC 5509

 31531190 TTGGTGAATTTTGAGAAAGTAAATGCAAGTTCTTTTTATGGTTTTACCTAAGGGGCCAGT 31531249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5510 TTGGTGAATTTTGAGAAAGTAAATGCAAGTTCTTTTTATGGTTTTACCTAAGGGGCCAGT 5569

 31531250 GAGGGCCAGAGAAGTGCCGGGACCTATGTAAGGTCGCAAGCAAGTTCATGTGGAATGCAT 31531309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5570 GAGGGCCAGAGAAGTGCCGGGACCTATGTAAGGTCGCAAGCAAGTTCATGTGGAATGCAT 5629

 31531310 CTAGAACTAGAACGCTAGCCTGTGTCCCAGGGCCCTTCCAACTGGGCTCTGCTGCCTGCA 31531369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5630 CTAGAACTAGAACGCTAGCCTGTGTCCCAGGGCCCTTCCAACTGGGCTCTGCTGCCTGCA 5689

 31531370 GTCCTGGGTGCCTTCTAATTAGCCTGTGTAGTGGTCTTGGTAAAAGTGTTTCTCCTGTAC 31531429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5690 GTCCTGGGTGCCTTCTAATTAGCCTGTGTAGTGGTCTTGGTAAAAGTGTTTCTCCTGTAC 5749

 31531430 TGTCCCCTATAGGTTGTGGCTGGCCATACCATTTCCCTGGTTCCCCCCACGCTCCTGATG 31531489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5750 TGTCCCCTATAGGTTGTGGCTGGCCATACCATTTCCCTGGTTCCCCCCACGCTCCTGATG 5809

 31531490 ACCTGGAAAGGCCATTTGAATAGTGTGGCAGACATCCTGTATGTGGACAACTTCCAGCTG 31531549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5810 ACCTGGAAAGGCCATTTGAATAGTGTGGCAGACATCCTGTATGTGGACAACTTCCAGCTG 5869

 31531550 GTTATCAGCGCTGGCCAGGACCGGGACGTCAAGGCTTGGAAACTCTCCGGTGATGCCATT 31531609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5870 GTTATCAGCGCTGGCCAGGACCGGGACGTCAAGGCTTGGAAACTCTCCGGTGATGCCATT 5929

 31531610 GGTATGGGTCCTGCTGAAGCTCAGCCATGCCCATGGCCCTTCTTGTCTCTGTCCCTGTCT 31531669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5930 GGTATGGGTCCTGCTGAAGCTCAGCCATGCCCATGGCCCTTCTTGTCTCTGTCCCTGTCT 5989

 31531670 GAACATAAGCTGGTATGAACTTTGTACTCTGTGGGGAGGGACTCTCAGGCCACAGCAACT 31531729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5990 GAACATAAGCTGGTATGAACTTTGTACTCTGTGGGGAGGGACTCTCAGGCCACAGCAACT 6049

 31531730 GCCTTCACTTAAATAATATTACAGTCTGTCCAATTATCCATTCAGCAAACGGTCCATCCA 31531789
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6050 GCCCTCACTTAAATAATATTACAGTCTGTCCAATTATCCATTCAGCAAACGGTCCATCCA 6109

 31531790 TTCACCCATCCACCCAATATTATTCACCTATGTATATTTTTGCAAATCATATATCTGATA 31531849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6110 TTCACCCATCCACCCAATATTATTCACCTATGTATATTTTTGCAAATCATATATCTGATA 6169

 31531850 AAGCATATTCCTTTCTCTTTTAAAAAATAAACTTAATTGTTGCATTGTATATAAAGAAAA 31531909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6170 AAGCATATTCCTTTCTCTTTTAAAAAATAAACTTAATTGTTGCATTGTATATAAAGAAAA 6229

 31531910 ACATACAAACCAGAAGGGTTCAGCTTGGTGAATTTTGAGAAAGTAAATACATACCCATAT 31531969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6230 ACATACAAACCAGAAGGGTTCAGCTTGGTGAATTTTGAGAAAGTAAATACATACCCATAT 6289

 31531970 AGCCACCGTTCATGTCAAGAAATAATTAGGGCCAGGCGCGGTGGCTCACTACTGTAATCC 31532029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6290 AGCCACCGTTCATGTCAAGAAATAATTAGGGCCAGGCGCGGTGGCTCACTACTGTAATCC 6349

 31532030 CAACACTTTTTTGTCCCCTTTTCCTCCTGTGCTGTCTTCCTATGTGTTTGTTTGTTTGTT 31532089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6350 CAACACTTTTTTGTCCCCTTTTCCTCCTGTGCTGTCTTCCTATGTGTTTGTTTGTTTGTT 6409

 31532090 TTAGTGACCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGTGCATGCCTGT 31532149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6410 TTAGTGACCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGTGCATGCCTGT 6469

 31532150 AATCCCAGCTACTTGAGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGTTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTT 31532209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6470 AATCCCAGCTACTTGAGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGTTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTT 6529

 31532210 GCAGTGAGCTGAGATCATGTCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGACTCTGTCT 31532269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6530 GCAGTGAGCTGAGATCATGTCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGACTCTGTCT 6589

 31532270 AAAAAAAAAATAATAATAAAAATAAAGTGACTTATGTGCCACTATTACAGTATTACAGCA 31532329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6590 AAAAAAAAAATAATAATAAAAATAAAGTGACTTATGTGCCACTATTACAGTATTACAGCA 6649

 31532330 TTCTGTATTTTTCTATGTGTTTACATTTATCAGAAAGCTTTGTATTTTCATATGCTTTCA 31532389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6650 TTCTGTATTTTTCTATGTGTTTACATTTATCAGAAAGCTTTGTATTTTCATATGCTTTCA 6709

 31532390 TGTTCCTGCCTAGCATCCTTTTGTTTCAACTTGAAGGGGTCCCTTTAGCATTTCTTTAAA 31532449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6710 TGTTCCTGCCTAGCATCCTTTTGTTTCAACTTGAAGGGGTCCCTTTAGCATTTCTTTAAA 6769

 31532450 GGCAGGTCTAATGGTGATGAACTCCTCTTGTTTTTATTTATCTGGGAAAATTTTTATTTT 31532509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6770 GGCAGGTCTAATGGTGATGAACTCCTCTTGTTTTTATTTATCTGGGAAAATTTTTATTTT 6829

 31532510 TCCTTCATTTTTAAAGGACAGCTTTCCTGGATATAGTATTTTTGGATGAGAGTTTTTGTT 31532569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6830 TCCTTCATTTTTAAAGGACAGCTTTCCTGGATATAGTATTTTTGGATGAGAGTTTTTGTT 6889

 31532570 CTTTTTATAATGTGTCTCCTTGTGGATTTCTTTGACTTTATCCTAGTTGGAATCCCTTGA 31532629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6890 CTTTTTATAATGTGTCTCCTTGTGGATTTCTTTGACTTTATCCTAGTTGGAATCCCTTGA 6949

 31532630 GCTTCTTGAATATAGGTTTCTTTTCCTTTTTAAGATTTGAAACATTTTCAGCCATTATTT 31532689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6950 GCTTCTTGAATATAGGTTTCTTTTCCTTTTTAAGATTTGAAACATTTTCAGCCATTATTT 7009

 31532690 ATTCAGATAAGCTTTTTGTCCCTTTCTCTCTCTCTGTCTCTCTCTCCTCCTTCTAGTACT 31532749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7010 ATTCAGATAAGCTTTTTGTCCCTTTCTCTCTCTCTGTCTCTCTCTCCTCCTTCTAGTACT 7069

 31532750 ACCATAATGCATATATTGTCCATTTGACGATGTCTCATAAATCCCTTAAGTTTTCTTTAC 31532809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7070 ACCATAATGCATATATTGTCCATTTGACGATGTCTCATAAATCCCTTAAGTTTTCTTTAC 7129

 31532810 TCTTTAAAATTCTTTTTTCTTTTTTGCTTCTCTGACTGGATATCTTCAAGTCTGCTGATT 31532869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7130 TCTTTAAAATTCTTTTTTCTTTTTTGCTTCTCTGACTGGATATCTTCAAGTCTGCTGATT 7189

 31532870 TTTCCTTCTGCTTGATCAAGCCTGCTGTAGATGACTTTTGAATTCAATTATTTTACTCTT 31532929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7190 TTTCCTTCTGCTTGATCAAGCCTGCTGTAGATGACTTTTGAATTCAATTATTTTACTCTT 7249

 31532930 CATCTTCAGCTCTAGAATTTCTGTTATTTTTATTATTATTATTATTATTTTTTGAGACAG 31532989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7250 CATCTTCAGCTCTAGAATTTCTGTTATTTTTATTATTATTATTATTATTTTTTGAGACAG 7309

 31532990 GGTCTTGCTCTGCCACCCAGGGTTGAGTGCAGTGGCACGAATTCAGCTCACTGAAGCCTT 31533049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7310 GGTCTTGCTCTGCCACCCAGGGTTGAGTGCAGTGGCACGAATTCAGCTCACTGAAGCCTT 7369

 31533050 GACCTCCCAGCCTCAAGTGATCTTCCCACAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCA 31533109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7370 GACCTCCCAGCCTCAAGTGATCTTCCCACAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCA 7429

 31533110 TGCCATCATGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTTGTAGAGACAGAGTTTCACCATGTTGC 31533169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7430 TGCCATCATGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTTGTAGAGACAGAGTTTCACCATGTTGC 7489

 31533170 CCAGGCTGGCCTTGAATTCTTGAGCTCAAGTGATCGCCCACCTAAGCTTCCCAAAGTGTT 31533229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7490 CCAGGCTGGCCTTGAATTCTTGAGCTCAAGTGATCGCCCACCTAAGCTTCCCAAAGTGTT 7549

 31533230 GGGATTATAGGTGTGGGCCACCATGGCTGGCCTCTGTTTGGTTCTTTTCTATATTTTCTG 31533289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7550 GGGATTATAGGTGTGGGCCACCATGGCTGGCCTCTGTTTGGTTCTTTTCTATATTTTCTG 7609

 31533290 TGTCTTCACTAATATTCTCAGTTTGTTCATGTATTGTTTCCCTGAGCTTGTTGAGCATTT 31533349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7610 TGTCTTCACTAATATTCTCAGTTTGTTCATGTATTGTTTCCCTGAGCTTGTTGAGCATTT 7669

 31533350 TTATTACGGTTACTTAGAATTCTTTGTCAAATAATTAATATACCTCAATTTCTTTAGCGG 31533409
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7670 TTATTACAGTTACTTAGAATTCTTTGTCAAATAATTAATATACCTCAATTTCTTTAGCGG 7729

 31533410 CAGTTTCTGGAGATTTATTTTGTTCCTTTGGGCCATGCTTTCCTATTTTTTTTGTGTGCC 31533469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7730 CAGTTTCTGGAGATTTATTTTGTTCCTTTGGGCCATGCTTTCCTATTTTTTTTGTGTGCC 7789

 31533470 TTATAACTTTATATTGGGATCCATGCATTTGTAAAATCAGCCACCTCTCCCAGTCTTTAT 31533529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7790 TTATAACTTTATATTGGGATCCATGCATTTGTAAAATCAGCCACCTCTCCCAGTCTTTAT 7849

 31533530 ATACTGGCTTCATTCAGGGAAAATTCTGCACCAATCAGCTTGGCTAAAGATTCTGGGTGC 31533589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7850 ATACTGGCTTCATTCAGGGAAAATTCTGCACCAATCAGCTTGGCTAAAGATTCTGGGTGC 7909

 31533590 CTCCCCAATCTTTTTTGTGGATACTTTCACCAGACTTACGCATGTAAATTCGCAATTACA 31533649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7910 CTCCCCAATCTTTTTTGTGGATACTTTCACCAGACTTACGCATGTAAATTCGCAATTACA 7969

 31533650 GGAATCTACAGGTTTATTTTTTTCAGGAGTCCATTATCTCTTGCTCTCTCTGGTGTCTAT 31533709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7970 GGAATCTACAGGTTTATTTTTTTCAGGAGTCCATTATCTCTTGCTCTCTCTGGTGTCTAT 8029

 31533710 TTGCAGTACTGCAAGTTCTCTAGAGCGGCTACAAGCTTCCCCCAGGCCTCTAGAATATGC 31533769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8030 TTGCAGTACTGCAAGTTCTCTAGAGCGGCTACAAGCTTCCCCCAGGCCTCTAGAATATGC 8089

 31533770 TGGGTCCTTCAATAGTCTGAGAGAGGCAAGACAGAAACCAGTTTCTTGGGTACCCCTCAA 31533829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8090 TGGGTCCTTCAATAGTCTGAGAGAGGCAAGACAGAAACCAGTTTCTTGGGTACCCCTCAA 8149

 31533830 AGGCTAACATTGGATATGTATGCTCCAAATCTGCCTCCTCAAGGAGAAGCTGGAAGTTGG 31533889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8150 AGGCTAACATTGGATATGTATGCTCCAAATCTGCCTCCTCAAGGAGAAGCTGGAAGTTGG 8209

 31533890 GTTGTTTTCTCTACTCATTCCACAGAGCGGCAGGAGGGACTCTGATAGTGTGTGCTAGTC 31533949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8210 GTTGTTTTCTCTACTCATTCCACAGAGCGGCAGGAGGGACTCTGATAGTGTGTGCTAGTC 8269

 31533950 TAAATTGTCACCTTTGTTCTTAGTAGCCCAGTCTGGTGCCTCTTCCTGTCAGTGCTTAGA 31534009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8270 TAAATTGTCACCTTTGTTCTTAGTAGCCCAGTCTGGTGCCTCTTCCTGTCAGTGCTTAGA 8329

 31534010 TTCAGGCAAGACAGAAACTGGTTAATCATGCAGCCCTCTGAAAAGTCTGCATGTTGGATG 31534069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8330 TTCAGGCAAGACAGAAACTGGTTAATCATGCAGCCCTCTGAAAAGTCTGCATGTTGGATG 8389

 31534070 TACATCTCAGTCTTTCCCTCCCAGGGAGAAGCTGGAAGCTGGTGGTTCCTTCCCAATCTG 31534129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8390 TACATCTCAGTCTTTCCCTCCCAGGGAGAAGCTGGAAGCTGGTGGTTCCTTCCCAATCTG 8449

 31534130 CTTCACTGAGCCAGGAGGAGGGATTACAAGTGAGCACTATGAATTTTCCTACTGGCTTCA 31534189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8450 CTTCACTGAGCCAGGAGGAGGGATTACAAGTGAGCACTATGAATTTTCCTACTGGCTTCA 8509

 31534190 GTGCAGCTGGTTTTTTGTTTTTTGTTTTTTTGGTTTTTGTTTGTTTGTTTTTTCATTCAT 31534249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8510 GTGCAGCTGGTTTTTTGTTTTTTGTTTTTTTGGTTTTTGTTTGTTTGTTTTTTCATTCAT 8569

 31534250 CTGGGATGAATGGTCCTGGTTTCTGGTCCATGTACTGTTGTTCAGTCAGTGTCTCCATAG 31534309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8570 CTGGGATGAATGGTCCTGGTTTCTGGTCCATGTACTGTTGTTCAGTCAGTGTCTCCATAG 8629

 31534310 GGAGAAGGAAGTTCTGGATCTTCCTATTCTACCATCTTGCTGATGTCACCCATTTTTTTG 31534369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8630 GGAGAAGGAAGTTCTGGATCTTCCTATTCTACCATCTTGCTGATGTCACCCATTTTTTTG 8689

 31534370 TATCTTTCAAAGACGTCTTTGACTATCCCCTAAATATAATATCTAGTGTTATCTTTTAGA 31534429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8690 TATCTTTCAAAGACGTCTTTGACTATCCCCTAAATATAATATCTAGTGTTATCTTTTAGA 8749

 31534430 AGCTTGTTTTAAAAATCAGATTTCTGAAGTATAATTTACATCCAATAAAAGCACCTTTTA 31534489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8750 AGCTTGTTTTAAAAATCAGATTTCTGAAGTATAATTTACATCCAATAAAAGCACCTTTTA 8809

 31534490 AAAGTATATAGTTCTGTGAGGTTTCATGAATGCATACAATTGTGTAATTGGTATCACAAT 31534549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8810 AAAGTATATAGTTCTGTGAGGTTTCATGAATGCATACAATTGTGTAATTGGTATCACAAT 8869

 31534550 CAAGACATAGACATTACCCCAAAAAGTGACCTCATGTCTCCTCATAGTAAACTCTATTTC 31534609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8870 CAAGACATAGACATTACCCCAAAAAGTGACCTCATGTCTCCTCATAGTAAACTCTATTTC 8929

 31534610 CTTCTCCTAACCCCTGGCAGCCATTGATCTGTTTGTCTCTATAGTTTTGCCTTTTCCAGA 31534669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8930 CTTCTCCTAACCCCTGGCAGCCATTGATCTGTTTGTCTCTATAGTTTTGCCTTTTCCAGA 8989

 31534670 TTATCATAAATGGAAACATACACATGTAGCTGAGTGAAAGTCTAACTTTCACTTAGCATA 31534729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8990 TTATCATAAATGGAAACATACACATGTAGCTGAGTGAAAGTCTAACTTTCACTTAGCATA 9049

 31534730 ATCAATTTGAGATTCATCTTTGTTGTTGAACGTATCAGTAGTTTGTTCTTTTTATTGCTG 31534789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9050 ATCAATTTGAGATTCATCTTTGTTGTTGAACGTATCAGTAGTTTGTTCTTTTTATTGCTG 9109

 31534790 AGTATTATTCCACTGTATGGCTCTGTCATAGTTTGTTAATCCATTCACCAATTATAGGAC 31534849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9110 AGTATTATTCCACTGTATGGCTCTGTCATAGTTTGTTAATCCATTCACCAATTATAGGAC 9169

 31534850 ATTTGAGTCATTGTCAGTTTTGGATGATTATGAATGAAGCCGCTTTAAACATTGTTTTCA 31534909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9170 ATTTGAGTCATTGTCAGTTTTGGATGATTATGAATGAAGCCGCTTTAAACATTGTTTTCA 9229

 31534910 TTTCTGTTGGGTAAGTATTTAGAAGCAGAATGGCTGGGTTGTATGGTAAGTGTATTGAAA 31534969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9230 TTTCTGTTGGGTAAGTATTTAGAAGCAGAATGGCTGGGTTGTATGGTAAGTGTATTGAAA 9289

 31534970 CTTTATGAAAAATGACCAAACTGTTTTGCATTTCTACCTTTGTGTCTTCATCAACATTTG 31535029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9290 CTTTATGAAAAATGACCAAACTGTTTTGCATTTCTACCTTTGTGTCTTCATCAACATTTG 9349

 31535030 GTGTTTGATCTGTTATTATTTTAAATTTTAATAATCTATGATTGTAGCATGAGATTTCAA 31535089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9350 GTGTTTGATCTGTTATTATTTTAAATTTTAATAATCTATGATTGTAGCATGAGATTTCAA 9409

 31535090 TATTC 31535094
          |||||
     9410 TATTC 9414

Alignment time is 7.8182 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31515486,31539389] =>     23904 nucs '20 dna:chromosome chromosome:GRCh37:20:1:63025520:1'
Second seq [       1,    3711] =>      3711 nucs 'mol-32-349d-017287_3711'

Score:        3665
Aligned:      3711        nucs
Identic:      3706 (100%) nucs =>      1227 (100%)      2479 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31521768,31522994] EXCISED REGION [31523005,31525486]
 second seq =>  [       1,    1229] EXCISED REGION [    1230,    3711]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        10 nucs [31522995,31523004]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [31522995,31522997] to [31523005,31523007]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [31522995,31522997] to [31523002,31523004]
 second seq =>         0 nucs

 31521768 GTGAGACTCCGTCTCAAAAAATCAATCAATCAAATCAAAGCAAATCAAAAACTTTTTTTT 31521827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTGAGACTCCGTCTCAAAAAATCAATCAATCAAATCAAAGCAAATCAAAAACTTTTTTTT 60

 31521828 TTTTTTT--GTAGAGATGAGGTCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGGGCTCAA 31521885
          |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTTTTTTTGTAGAGATGAGGTCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGGGCTCAA 120

 31521886 GGAATCCTCCTGCCTTGACCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGTGCCC 31521945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGAATCCTCCTGCCTTGACCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGTGCCC 180

 31521946 AGCCCTTTCTACTTCTATGAGTTTGACTTTTTATAATTCCATATATAAATACAATCATGC 31522005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGCCCTTTCTACTTCTATGAGTTTGACTTTTTATAATTCCATATATAAATACAATCATGC 240

 31522006 AGTATTTTTCTTTCATGACTGGCTTATTTCACTTACCATAATGTCTTCCAGATTAATCTA 31522065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGTATTTTTCTTTCATGACTGGCTTATTTCACTTACCATAATGTCTTCCAGATTAATCTA 300

 31522066 TGTTGTCCCAAATGACAGGATTTTTTTTCTCTTTTAAGGCTGAATAGTATTCCATTATGT 31522125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGTTGTCCCAAATGACAGGATTTTTTTTCTCTTTTAAGGCTGAATAGTATTCCATTATGT 360

 31522126 ATATACACCACATTTGCATTATCCATTCATCCACTGATGGCCCCTTAGGTTGATTCTATA 31522185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATATACACCACATTTGCATTATCCATTCATCCACTGATGGCCCCTTAGGTTGATTCTATA 420

 31522186 TCTTGGCTATTGTGAAAAGTGCTGCAATGAACATGGGAGTGCAGGTATTTCTTTGACATA 31522245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCTTGGCTATTGTGAAAAGTGCTGCAATGAACATGGGAGTGCAGGTATTTCTTTGACATA 480

 31522246 TTGATATGACATATTGATCTCTTTTGGATATATACCCAGAAGTGGAATTGCTAGATCATA 31522305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTGATATGACATATTGATCTCTTTTGGATATATACCCAGAAGTGGAATTGCTAGATCATA 540

 31522306 TAGTAGTTCTAATTTTAGTTTTTTGAGGAAACCCCATACTATTTCTCGTAGTGGTTGATA 31522365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TAGTAGTTCTAATTTTAGTTTTTTGAGGAAACCCCATACTATTTCTCGTAGTGGTTGATA 600

 31522366 TGGTTTGGTTGTGTCCCCACACAAATCTCATCTTGAATTGTAGCTCTCATAATCCCCAGC 31522425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGGTTTGGTTGTGTCCCCACACAAATCTCATCTTGAATTGTAGCTCTCATAATCCCCAGC 660

 31522426 TGTCGTGGGAGGGACCTGGTGGGAGGTAATTGAATCGTGGGGGTGGGTTTTTCCCACCAT 31522485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGTCGTGGGAGGGACCTGGTGGGAGGTAATTGAATCGTGGGGGTGGGTTTTTCCCACCAT 720

 31522486 TCTAATGATAGTGAATAAGTCTCAAGAGATATGATGGCTTTATAAAGGGCAGTTCCCCTG 31522545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCTAATGATAGTGAATAAGTCTCAAGAGATATGATGGCTTTATAAAGGGCAGTTCCCCTG 780

 31522546 CTCATGCTCTCTTGCCTGCTCCCATGTAAGACGTGCCTTTGCTCCTCTTTCACCTCTGCC 31522605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTCATGCTCTCTTGCCTGCTCCCATGTAAGACGTGCCTTTGCTCCTCTTTCACCTCTGCC 840

 31522606 ATGATTGTGAGGCCTCCCCAGCCATGTGGAACTGTGAGTCCATTAAACCTTTACTTTATA 31522665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATGATTGTGAGGCCTCCCCAGCCATGTGGAACTGTGAGTCCATTAAACCTTTACTTTATA 900

 31522666 AATTACCCAGTCTCGGATATGTCTTTATTAGCAGCATGAGAACAGACCAATACAGTGGTT 31522725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AATTACCCAGTCTCGGATATGTCTTTATTAGCAGCATGAGAACAGACCAATACAGTGGTT 960

 31522726 GTACTGATTTACATTCCCTCCAACATTGTACAAGGGTTTTCTTTTTTCTGCCTCCTCACC 31522785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GTACTGATTTACATTCCCTCCAACATTGTACAAGGGTTTTCTTTTTTCTGCCTCCTCACC 1020

 31522786 AACACTTGTTTCTTGTCTTTTTGATAACATCTAATCTAACAGATGTAAGATGATATCTCA 31522845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AACACTTGTTTCTTGTCTTTTTGATAACATCTAATCTAACAGATGTAAGATGATATCTCA 1080

 31522846 TTGTGGTTTAATTTGTTTTTCCTAATGATTAGTGGTGCTCAGCATTTTTTTTCTTGAACC 31522905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTGTGGTTTAATTTGTTTTTCCTAATGATTAGTGGTGCTCAGCATTTTTTTTCTTGAACC 1140

 31522906 TGTTGGCCATTTGAATGTCTTCTTTTGAGAAATGTCTCTTTGGATGCTTTCTCCATTTTC 31522965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGTTGGCCATTTGAATGTCTTCTTTTGAGAAATGTCTCTTTGGATGCTTTCTCCATTTTC 1200

 31522966 TCTTCTCTTCTCTTTTCTTTCTTTCTTTC 31522994
          |||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TCTTCTCTTCTCTTTTCTTTCTTTCTTTC 1229

EXCISED REGION

 31523005 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGCGTTTTGCTCTTGTTGCCCGGGCTGGAGTGCATT 31523064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1230 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGCGTTTTGCTCTTGTTGCCCGGGCTGGAGTGCATT 1289

 31523065 GATCCAATCTTGGCTCACTGCAACCCCCGCCTCCCGGGTTCAAGCAATTCTCCCGCCTCA 31523124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1290 GATCCAATCTTGGCTCACTGCAACCCCCGCCTCCCGGGTTCAAGCAATTCTCCCGCCTCA 1349

 31523125 GCCTCCTGAGTAGCTGTGATTACAGGCACAGGCTACCACACCCGGCTAATTTTGTATTTT 31523184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1350 GCCTCCTGAGTAGCTGTGATTACAGGCACAGGCTACCACACCCGGCTAATTTTGTATTTT 1409

 31523185 CAGTAGAGACGAGGTGTCACCTTGTTGGTCAGGCTGGTCCCGAACTCCTGACCTCAAGTG 31523244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1410 CAGTAGAGACGAGGTGTCACCTTGTTGGTCAGGCTGGTCCCGAACTCCTGACCTCAAGTG 1469

 31523245 ATCTGCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGC 31523304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1470 ATCTGCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGC 1529

 31523305 CACTTTGCCTATTTTATTTTATTTTGAGATGGAGTTTTGCTCTTATTGCCCAGACTGGAG 31523364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1530 CACTTTGCCTATTTTATTTTATTTTGAGATGGAGTTTTGCTCTTATTGCCCAGACTGGAG 1589

 31523365 TGCAATGGCGCAATTGCAGCTCACCACAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCT 31523424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1590 TGCAATGGCGCAATTGCAGCTCACCACAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCT 1649

 31523425 GCCTCAGCCTCCCAAGTAGGTGGGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCCAACTAATTTTG 31523484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1650 GCCTCAGCCTCCCAAGTAGGTGGGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCCAACTAATTTTG 1709

 31523485 TAGTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCT 31523544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1710 TAGTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCT 1769

 31523545 CAGGTGATCTGCCCACCTTGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGAGTGAGTGCACCTGG 31523604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1770 CAGGTGATCTGCCCACCTTGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGAGTGAGTGCACCTGG 1829

 31523605 CCCACTTTGCTCATTTTCTAATTGGGTTATTCGTTTTCTGGCTATTGAGTTGTTTGAGTT 31523664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1830 CCCACTTTGCTCATTTTCTAATTGGGTTATTCGTTTTCTGGCTATTGAGTTGTTTGAGTT 1889

 31523665 TCTTATTTATTGTGGATGTTACTCCCTTATCAGATGTATGATTTACATATATTTTCTGTC 31523724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1890 TCTTATTTATTGTGGATGTTACTCCCTTATCAGATGTATGATTTACATATATTTTCTGTC 1949

 31523725 ACTCTGTGGGTTATCTCTTTACTTTGTTCATTGTTTCCTTTCTGTCCAAAAGCTTTGTAT 31523784
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1950 ACTTTGTGGGTTATCTCTTTACTTTGTTCATTGTTTCCTTTCTGTCCAAAAGCTTTGTAT 2009

 31523785 CTTGTCTAAAATCCCATTTGTCTATTTTTGCTTTTATTTATTTTTATTTTTATTTTTATT 31523844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2010 CTTGTCTAAAATCCCATTTGTCTATTTTTGCTTTTATTTATTTTTATTTTTATTTTTATT 2069

 31523845 TTTTATTTTTTTGAAACGGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGTTGGAGTGCAGTGGTGCAAT 31523904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2070 TTTTATTTTTTTGAAACGGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGTTGGAGTGCAGTGGTGCAAT 2129

 31523905 CTCAGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGGAAGTCTCCTACTCCAACTTCCTG 31523964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2130 CTCAGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGGAAGTCTCCTACTCCAACTTCCTG 2189

 31523965 AGTAGCTGGGATTATAGGCGTGTGCCACCATGCCTAGCTAATTTTTGTATTTTTTGGTAG 31524024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2190 AGTAGCTGGGATTATAGGCGTGTGCCACCATGCCTAGCTAATTTTTGTATTTTTTGGTAG 2249

 31524025 AGACAGGATTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTGTTGAACTCTTGACCTCAGGCAATCCGC 31524084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2250 AGACAGGATTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTGTTGAACTCTTGACCTCAGGCAATCCGC 2309

 31524085 CTGACTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACACGTGTGAGCCACCGCGCCTGGCCTATTT 31524144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2310 CTGACTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACACGTGTGAGCCACCGCGCCTGGCCTATTT 2369

 31524145 TTGCTTTTATTACCTGTGCTTTTGGGGTCATAGCTAAATAACCATTGCTCAGATCAATGT 31524204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2370 TTGCTTTTATTACCTGTGCTTTTGGGGTCATAGCTAAATAACCATTGCTCAGATCAATGT 2429

 31524205 CATGGAGCCTTTCCTCTAGGTATTCTTCTAGTTGTTTTACAGTCTCAGATCTTATATTTA 31524264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2430 CATGGAGCCTTTCCTCTAGGTATTCTTCTAGTTGTTTTACAGTCTCAGATCTTATATTTA 2489

 31524265 AGACTTTAATCCATTTTGAGTTGATTTTTTATACTGTGTGAGATAAGGATCCAATTTTAT 31524324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2490 AGACTTTAATCCATTTTGAGTTGATTTTTTATACTGTGTGAGATAAGGATCCAATTTTAT 2549

 31524325 TCTTCTGTATGTGGATCCAATTTTCCTAGTACAGTTTATTGAAAAGACTGTCTTTTCCCC 31524384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2550 TCTTCTGTATGTGGATCCAATTTTCCTAGTACAGTTTATTGAAAAGACTGTCTTTTCCCC 2609

 31524385 ATTATGTATTAGTAACACCTTTGTCAAAAATCAATTGACTATTAGTGCATGGGTTTATTT 31524444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2610 ATTATGTATTAGTAACACCTTTGTCAAAAATCAATTGACTATTAGTGCATGGGTTTATTT 2669

 31524445 CTGGGTTTTCTATCTTGTTACATTAGTCGATGTGTCTATTTTTATGCCAGCACCATACTG 31524504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2670 CTGGGTTTTCTATCTTGTTACATTAGTCGATGTGTCTATTTTTATGCCAGCACCATACTG 2729

 31524505 TTTTGATTATATTAGCTTTATAATATATTTTGAAATCAGGGACTGTGATGTCTTTAGCTT 31524564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2730 TTTTGATTATATTAGCTTTATAATATATTTTGAAATCAGGGACTGTGATGTCTTTAGCTT 2789

 31524565 TGTTCTTTTTGCTCAAGATTGTTTTGGCTAGCCAGGGTCTTTTATGATTGCATATGAATT 31524624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2790 TGTTCTTTTTGCTCAAGATTGTTTTGGCTAGCCAGGGTCTTTTATGATTGCATATGAATT 2849

 31524625 TAAGGATTGTTTTATTTCTATAAGAAATGACATTGGAATTTTGATAGGGACTGCATTGAA 31524684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2850 TAAGGATTGTTTTATTTCTATAAGAAATGACATTGGAATTTTGATAGGGACTGCATTGAA 2909

 31524685 TCTGTAGATTGCTTTGGGTAGTATGAATATTTTAATAATATTAATTCTTCTAATTTATCA 31524744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2910 TCTGTAGATTGCTTTGGGTAGTATGAATATTTTAATAATATTAATTCTTCTAATTTATCA 2969

 31524745 ACACAAGATAGCTTTCCATTTATTTGTGTTTTCTTAAACAATGTTTTAGTTTCCAGTGTA 31524804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2970 ACACAAGATAGCTTTCCATTTATTTGTGTTTTCTTAAACAATGTTTTAGTTTCCAGTGTA 3029

 31524805 CAGATCTTTTAACTTCTTGGTTAAATTTACCCCTAAGTATTTTATTTTATTTTAAAATAC 31524864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3030 CAGATCTTTTAACTTCTTGGTTAAATTTACCCCTAAGTATTTTATTTTATTTTAAAATAC 3089

 31524865 CTGGCTAATTTTGTATTTAATTTTATATTGTATTTATTTTATTTGTAATAAAATTAAGCA 31524924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3090 CTGGCTAATTTTGTATTTAATTTTATATTGTATTTATTTTATTTGTAATAAAATTAAGCA 3149

 31524925 TTTTATTTTATTTTAAAATACCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTC 31524984
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     3150 TTTTATTTTATTTTAAAATACCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGATAGGGTTTCTC 3209

 31524985 CATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCAGACCTCAGGTGATCCGACTGCCTCGGCCTCC 31525044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3210 CATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCAGACCTCAGGTGATCCGACTGCCTCGGCCTCC 3269

 31525045 CAAAGTGCTGGTATTAGAAGCATGAGCCACTGCCCACTGCACCTAGCTGAAAACCACACT 31525104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3270 CAAAGTGCTGGTATTAGAAGCATGAGCCACTGCCCACTGCACCTAGCTGAAAACCACACT 3329

 31525105 TTCTGTTGATTAAATAATATTTCACCTTATGGAGTTACAAATTTTCATTTTATGGGGTTA 31525164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3330 TTCTGTTGATTAAATAATATTTCACCTTATGGAGTTACAAATTTTCATTTTATGGGGTTA 3389

 31525165 TAATCACTTACTTAGCTTGTTATCTTTTGTTGGACATTAATGTGGTTTCTAACTTTTCAT 31525224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3390 TAATCACTTACTTAGCTTGTTATCTTTTGTTGGACATTAATGTGGTTTCTAACTTTTCAT 3449

 31525225 TATCAAAAAATAAAAGAAAATGGACAAAACCTCAGAAAGACACAAACTACTAAAGCTGAC 31525284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3450 TATCAAAAAATAAAAGAAAATGGACAAAACCTCAGAAAGACACAAACTACTAAAGCTGAC 3509

 31525285 TTAATAAGAAATAGAAAATCTGAATATATAGAAAATCTGAATGTAACAAGTAAGGAGATT 31525344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3510 TTAATAAGAAATAGAAAATCTGAATATATAGAAAATCTGAATGTAACAAGTAAGGAGATT 3569

 31525345 GGATTAGTAATAAAATTTCCCACAAAGAGAAGTACACATTCAGATGGTTTCACTGGTAAA 31525404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3570 GGATTAGTAATAAAATTTCCCACAAAGAGAAGTACACATTCAGATGGTTTCACTGGTAAA 3629

 31525405 TTCTACCAAATATTTAAAGATTTTTCTTTTTTTTTGTTGAGACAGAGTCTCACTCTATTG 31525464
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     3630 TTCTACCAAATATTTAAAGATTTTTCTTTTTTTTTGTTGAGGCAGAGTCTCACTCTATTG 3689

 31525465 CCCAGGCTGGAGTACAATGGTG 31525486
          ||||||||||||||||||||||
     3690 CCCAGGCTGGAGTACAATGGTG 3711

Alignment time is 3.12253 s

