
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51963823,51984240] =>     20418 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [       1,    3161] =>      3161 nucs 'mol-32-1e66-013038_3161'

Score:        3083
Aligned:      3157        nucs
Identic:      3147 (100%) nucs =>       225 (100%)      2922 (100%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51973599,51973823] EXCISED REGION [51974241,51977168]
 second seq =>  [       1,     225] EXCISED REGION [     231,    3161]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       417 nucs [51973824,51974240]
 second seq =>         5 nucs [226,230]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [51973823,51973823] to [51974240,51974240]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [51973822,51973823] to [51974241,51974242]
 second seq =>         2 nucs [224,225] to [231,232]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 51973599 TTTAATGGGTTCACAAGCTGCTGCCTTTATAGCTTATGGTACATATGTTTGCCAATATAA 51973658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTAATGGGTTCACAAGCTGCTGCCTTTATAGCTTATGGTACATATGTTTGCCAATATAA 60

 51973659 ATGATCCACTTGAGCTAAATTGCCACAGCTGCTACAACACCTCTTTACCTATTTTTGGAG 51973718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATGATCCACTTGAGCTAAATTGCCACAGCTGCTACAACACCTCTTTACCTATTTTTGGAG 120

 51973719 CAAAACTGAAAATCAGAAAAGTTTAACTTTTTCAAAATAATGAAAAATTTCTCTCCAATC 51973778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAAAACTGAAAATCAGAAAAGTTTAACTTTTTCAAAATAATGAAAAATTTCTCTCCAATC 180

 51973779 CTCTCCATCATTATACATTAATAGGAAAAGAAAGGACAAAGACAA 51973823
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTCTCCATCATTATACATTAATAGGAAAAGAAAGGACAAAGACAA 225

EXCISED REGION

 51974241 AAATTTTCCTTTGAGAAAGTCTCAGTAATATTTGCTTAATATGCTGATAGGCTTATCAAG 51974300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      231 AAATTTTCCTTTGAGAAAGTCTCAGTAATATTTGCTTAATATGCTGATAGGCTTATCAAG 290

 51974301 CTTCTTGAAAAAAAACTGATTTACAATACAGTGGGGATTATTTTTTTTAAGTTGGAAGGG 51974360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      291 CTTCTTGAAAAAAAACTGATTTACAATACAGTGGGGATTATTTTTTTTAAGTTGGAAGGG 350

 51974361 AAAGAAGGTTTGATGTAAGAGTGCTTTGAAATGTGGAGTTTTCCTAAGTATTACTCCCAC 51974420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      351 AAAGAAGGTTTGATGTAAGAGTGCTTTGAAATGTGGAGTTTTCCTAAGTATTACTCCCAC 410

 51974421 AAGACCATAGTCTTGAAATTAAATTAGGCCTTTAGAATATCAGACAAAATAAATGGATTG 51974480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      411 AAGACCATAGTCTTGAAATTAAATTAGGCCTTTAGAATATCAGACAAAATAAATGGATTG 470

 51974481 TAATTTATTTCAATAGCTGAATGCTTACTATTTTTCAAAGGATTAATTGAGATATATAAT 51974540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      471 TAATTTATTTCAATAGCTGAATGCTTACTATTTTTCAAAGGATTAATTGAGATATATAAT 530

 51974541 TCTTTATATAAGTAAAAGAAATTTTCTAACTTTCAGAAACATCTAAACTTAGTTTTCCAC 51974600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      531 TCTTTATATAAGTAAAAGAAATTTTCTAACTTTCAGAAACATCTAAACTTAGTTTTCCAC 590

 51974601 TAAGTTGTCTCTAACTCAACCCTCTTTTCACTTTTTTTATTATTTTAGAGCAGTAACATT 51974660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      591 TAAGTTGTCTCTAACTCAACCCTCTTTTCACTTTTTTTATTATTTTAGAGCAGTAACATT 650

 51974661 TACTTCTGGAAAATCATCCAAATAAAACCAATTTACTTTCATAAAATCTAGACTTTTTGG 51974720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      651 TACTTCTGGAAAATCATCCAAATAAAACCAATTTACTTTCATAAAATCTAGACTTTTTGG 710

 51974721 ATGTTAGAAGCATGATTTACCATCTCCTATTGGGACCTTATTCCAGAAATGATTTGCTCT 51974780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      711 ATGTTAGAAGCATGATTTACCATCTCCTATTGGGACCTTATTCCAGAAATGATTTGCTCT 770

 51974781 TTCATTTGCTAATTGCATGACGATTAGAATCTGGACCCAAGACCTTTTTAATGCATATAA 51974840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      771 TTCATTTGCTAATTGCATGACGATTAGAATCTGGACCCAAGACCTTTTTAATGCATATAA 830

 51974841 TTAAATATTTCAAACTTCTTACACTTTTGATCTTCTGGTATCATATATTCAATTAATAGC 51974900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      831 TTAAATATTTCAAACTTCTTACACTTTTGATCTTCTGGTATCATATATTCAATTAATAGC 890

 51974901 ATAATTCACATTCCCCTACATACCATGAAACTACCTTTTTCCTGATTATATTAATGTATA 51974960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      891 ATAATTCACATTCCCCTACATACCATGAAACTACCTTTTTCCTGATTATATTAATGTATA 950

 51974961 CTAAACATAAAAAAAGAAATTATATAAAATAGTATTAGGACAATCACTTGAAATTTTCCA 51975020
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
      951 CTAAACATAAAAAAAGAAATTATATAAAATAATATTAGGACAATCACTTGAAATTTTCCA 1010

 51975021 CCGAGGGACAACTAGTCAAAATATTTCAGTGACCTCTGATATAACACTATCTGTGCATAG 51975080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1011 CCGAGGGACAACTAGTCAAAATATTTCAGTGACCTCTGATATAACACTATCTGTGCATAG 1070

 51975081 ATATATTCACTTATAAAACATTTCTACATATGTGGTAATAATTACAAAAGTGAGCACAAT 51975140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1071 ATATATTCACTTATAAAACATTTCTACATATGTGGTAATAATTACAAAAGTGAGCACAAT 1130

 51975141 TTTAAAAATAGCTTTCTCTTCACTCTTTAAACTTACCTCTTTATTTCTCTTCTGCTTTTC 51975200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1131 TTTAAAAATAGCTTTCTCTTCACTCTTTAAACTTACCTCTTTATTTCTCTTCTGCTTTTC 1190

 51975201 TATTTCCACATTTCTCATTTTCAATGGCCAGTATTTAGGGGCTTTGTGCTATCTTTCTAC 51975260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1191 TATTTCCACATTTCTCATTTTCAATGGCCAGTATTTAGGGGCTTTGTGCTATCTTTCTAC 1250

 51975261 ACTTTAAATTTTTTATATCAAATTTCATATGTACTTTTACAGTTTCAGAAGTCTTATTGT 51975320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1251 ACTTTAAATTTTTTATATCAAATTTCATATGTACTTTTACAGTTTCAGAAGTCTTATTGT 1310

 51975321 TTTTTACATGAGTGAGATCACAAGGTTTTATACTTAGTTTTAAAAAAATTTTCTCCTTCA 51975380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1311 TTTTTACATGAGTGAGATCACAAGGTTTTATACTTAGTTTTAAAAAAATTTTCTCCTTCA 1370

 51975381 ACAAATATAACTGGAATCCCTGTGAGTCAACCAAAATAGTTTTAACTAACTCTTCATAAT 51975440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1371 ACAAATATAACTGGAATCCCTGTGAGTCAACCAAAATAGTTTTAACTAACTCTTCATAAT 1430

 51975441 GGCTAGCTAAATGGAATTCTGTGGTAATACAAATTATTCTAAAATTCCAATATTTACACC 51975500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1431 GGCTAGCTAAATGGAATTCTGTGGTAATACAAATTATTCTAAAATTCCAATATTTACACC 1490

 51975501 CATTTTTTTTCACTCATGAAAGCACTGCAATAAGCAGCTTTTATAGATATTCTTAGGTAC 51975560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1491 CATTTTTTTTCACTCATGAAAGCACTGCAATAAGCAGCTTTTATAGATATTCTTAGGTAC 1550

 51975561 TATTAGGTGCTTTTCTTTTGGTGGAATGAAACCCCAGGAGTGAGACTGCGGGTTGAAAGA 51975620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1551 TATTAGGTGCTTTTCTTTTGGTGGAATGAAACCCCAGGAGTGAGACTGCGGGTTGAAAGA 1610

 51975621 TATGTGGATTTTTTAAATAGATAACTGTCAGAATATTTTTATTAAAAACTTTAGTATTTC 51975680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1611 TATGTGGATTTTTTAAATAGATAACTGTCAGAATATTTTTATTAAAAACTTTAGTATTTC 1670

 51975681 ACATTCTTGAAGCACTGTATGTGAATATCCTTTCTCCACATTCCCATTGGCAAGGGCTGG 51975740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1671 ACATTCTTGAAGCACTGTATGTGAATATCCTTTCTCCACATTCCCATTGGCAAGGGCTGG 1730

 51975741 TTGGTTTTTGATAGCATGAAATTTGATTTTTGGCATGATATCATTTAGGAATACAATTTT 51975800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1731 TTGGTTTTTGATAGCATGAAATTTGATTTTTGGCATGATATCATTTAGGAATACAATTTT 1790

 51975801 ATTTTCATTCCATAGGAATAAGCAAAATCCCATGACAGTTTATTGAAAAATATGTCAGTT 51975860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1791 ATTTTCATTCCATAGGAATAAGCAAAATCCCATGACAGTTTATTGAAAAATATGTCAGTT 1850

 51975861 CCCACTGACATACTGGGAAACATCAGTCTTATATCAAATGTCCATATGTGCATACATCTA 51975920
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1851 CCCACTGATATACTGGGAAACATCAGTCTTATATCAAATGTCCATATGTGCATACATCTA 1910

 51975921 TTTTTGGACTTTATCTTTTGTTCTATTTGCCTACTCCAGGACCTACCCCATTATCATACA 51975980
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1911 TTTTTGGACTTCATCTTTTGTTCTATTTGCCTACTCCAGGACCTACCCCATTATCATACA 1970

 51975981 ATAACTATTACTTGGCTTCTATCCAACTGTGGTATCTGGTAGAACAAATCCCTACACCTA 51976040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1971 ATAACTATTACTTGGCTTCTATCCAACTGTGGTATCTGGTAGAACAAATCCCTACACCTA 2030

 51976041 TTCTTAATGATGATGTGGACTGATCCGGACTTTTCTTTTCCATATAAGTTTTAGTATTAG 51976100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2031 TTCTTAATGATGATGTGGACTGATCCGGACTTTTCTTTTCCATATAAGTTTTAGTATTAG 2090

 51976101 TTTGTTAATTCCACATAACCCAGTTTGGATATTTGTAGGAATTGTATGAAATATACATCA 51976160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2091 TTTGTTAATTCCACATAACCCAGTTTGGATATTTGTAGGAATTGTATGAAATATACATCA 2150

 51976161 ATTTTAGGAAAATTGGCCTTTTAATATACAGGCTTTTGGTATCCACAGGGGAATGGTTTC 51976220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2151 ATTTTAGGAAAATTGGCCTTTTAATATACAGGCTTTTGGTATCCACAGGGGAATGGTTTC 2210

 51976221 ATCTACCCACCACAACACTCCCCCACCTATGGATACTGAAATCCTAAATCCTCCGATGCT 51976280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2211 ATCTACCCACCACAACACTCCCCCACCTATGGATACTGAAATCCTAAATCCTCCGATGCT 2270

 51976281 CAAGTCTCCTGTATAAAGTGGTGTACTACTTGCATATAACCTACAGCAATTTCCCCATAT 51976340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2271 CAAGTCTCCTGTATAAAGTGGTGTACTACTTGCATATAACCTACAGCAATTTCCCCATAT 2330

 51976341 ACTTTAAGTAATCTCTAGTTTATCTTTATAATACCTACCACAATGTAAGTGCCAGGTAAA 51976400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2331 ACTTTAAGTAATCTCTAGTTTATCTTTATAATACCTACCACAATGTAAGTGCCAGGTAAA 2390

 51976401 TAGTTGTTACACTGTATTGGTTTTTTAAATTGTATTATTTTTCCTTGTTGGTGTTTTTTA 51976460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2391 TAGTTGTTACACTGTATTGGTTTTTTAAATTGTATTATTTTTCCTTGTTGGTGTTTTTTA 2450

 51976461 TTTTTATTTTTTCAAATGTTTTCTATTTGCAGTTGGTTGAATTCATGGACGTAGAACCTA 51976520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2451 TTTTTATTTTTTCAAATGTTTTCTATTTGCAGTTGGTTGAATTCATGGACGTAGAACCTA 2510

 51976521 CAGATACAGAGGAATAATTGTGATAAGACATGTATCTTTTTTATTTTTCTACTTACTTAA 51976580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2511 CAGATACAGAGGAATAATTGTGATAAGACATGTATCTTTTTTATTTTTCTACTTACTTAA 2570

 51976581 AACTTCTTTAATATCTTGTTTCAAATTTCAGTCAGTTTCGGAGGAACAGATGCGTTTGGA 51976640
          |||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2571 AACTTCTTTAATATCTTATTTTAAATTTCAGTCAGTTTCGGAGGAACAGATGCGTTTGGA 2630

 51976641 TACATGGATAAGTTCTTTAGTAGTGATTTCTGAGATTTTGGTGCACCCATTACCCAAGGG 51976700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2631 TACATGGATAAGTTCTTTAGTAGTGATTTCTGAGATTTTGGTGCACCCATTACCCAAGGG 2690

 51976701 GTGCACACTGTACTCAATGTGTCTTTTATCCCTCAACCCCTCCTACCCTTTCCCACGAGT 51976760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2691 GTGCACACTGTACTCAATGTGTCTTTTATCCCTCAACCCCTCCTACCCTTTCCCACGAGT 2750

 51976761 CCCCAAAGTCCATTGTGTCATTCTTATGTCTTTGTGTCTTCATAGCTCAGCTTCTGCTTA 51976820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2751 CCCCAAAGTCCATTGTGTCATTCTTATGTCTTTGTGTCTTCATAGCTCAGCTTCTGCTTA 2810

 51976821 TAAGTGAAAACATATAATTAAAACTTCTTTAATATATTTTAATAATGCTTTAAAATACTT 51976880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2811 TAAGTGAAAACATATAATTAAAACTTCTTTAATATATTTTAATAATGCTTTAAAATACTT 2870

 51976881 CCCCGCAAAGGTCTACCACATATTTTGATAGACTTGTTACTATTATTTTATTGTAAATAT 51976940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2871 CCCCGCAAAGGTCTACCACATATTTTGATAGACTTGTTACTATTATTTTATTGTAAATAT 2930

 51976941 TTTGCTTTATTTTGTCTTGTTGTTATTCTATATTTGTATTATGATGTGTTAAGCATTATT 51977000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2931 TTTGCTTTATTTTGTCTTGTTGTTATTCTATATTTGTATTATGATGTGTTAAGCATTATT 2990

 51977001 ATTATTATTATTATTATTATTT----TTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGC 51977056
          |||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2991 ATTATTATTATTATTATTATT-ATTATTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGC 3049

 51977057 CAGACTGCGGACTGCAGTGGCGCAATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCA 51977116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3050 CAGACTGCGGACTGCAGTGGCGCAATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCA 3109

 51977117 CGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCC 51977168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3110 CGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCC 3161

Alignment time is 2.42024 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51963823,51984240] =>     20418 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [       1,    2177] =>      2177 nucs 'mol-32-1e71-068930_2177'

Score:        2177
Aligned:      2177        nucs
Identic:      2177 (100%) nucs =>       230 (100%)      1947 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51971995,51972224] EXCISED REGION [51972226,51974172]
 second seq =>  [       1,     230] EXCISED REGION [     231,    2177]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [51972225,51972225]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         7 nucs [51972225,51972231] to [51972226,51972232]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 51971995 AAGTGACACATGGGCCTTGCTAAAGAAAGAGTTTAAATCTGGTAGTGCTTCAGAATTTTT 51972054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAGTGACACATGGGCCTTGCTAAAGAAAGAGTTTAAATCTGGTAGTGCTTCAGAATTTTT 60

 51972055 ATTTCAGTGAGGTTCTGTAAAATTAAATTCATCTGGCATTGTGGGAAAAAGTTGTATTAT 51972114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATTTCAGTGAGGTTCTGTAAAATTAAATTCATCTGGCATTGTGGGAAAAAGTTGTATTAT 120

 51972115 ATATGAACCAATTTCTTAAATAAGTGCAACTTAATCTTCTAAGAAACTTTAAAATATTTA 51972174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATATGAACCAATTTCTTAAATAAGTGCAACTTAATCTTCTAAGAAACTTTAAAATATTTA 180

 51972175 ATCTTGTTGGGTATTTTTTTTTCCATTTTTTTCTTGCTATTTCTTTAGGG 51972224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATCTTGTTGGGTATTTTTTTTTCCATTTTTTTCTTGCTATTTCTTTAGGG 230

EXCISED REGION

 51972226 AAAAAAACAGAATATATAACACTCTTCATTAGTATGGAACACACATACTATTTTATTTCC 51972285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      231 AAAAAAACAGAATATATAACACTCTTCATTAGTATGGAACACACATACTATTTTATTTCC 290

 51972286 TATTTTAAAACTTAATTACTCAAATACTCCATGAATTTATTAGCAATTGATCCAATATTT 51972345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      291 TATTTTAAAACTTAATTACTCAAATACTCCATGAATTTATTAGCAATTGATCCAATATTT 350

 51972346 CCCTCTTTAATGTCAATTGCTGCTCCCTTTTCCTTATGCATAGTACATGGATCCTCAGGA 51972405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      351 CCCTCTTTAATGTCAATTGCTGCTCCCTTTTCCTTATGCATAGTACATGGATCCTCAGGA 410

 51972406 TTCACTTACGCAGTCCACTGAGCAGTGGCCATTCACACTTTTAATGTGAGGAAGAGTGAG 51972465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      411 TTCACTTACGCAGTCCACTGAGCAGTGGCCATTCACACTTTTAATGTGAGGAAGAGTGAG 470

 51972466 AGAAAGGAAAACAGAAATTATTTCATACCAAAAGAGCCCCTGATTTTTCACTGCTTCTTT 51972525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      471 AGAAAGGAAAACAGAAATTATTTCATACCAAAAGAGCCCCTGATTTTTCACTGCTTCTTT 530

 51972526 TGTTATTCACATACAGGAGGATATGTTCCTAATCACTTTTATGATGTGAACATGCCTGCA 51972585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      531 TGTTATTCACATACAGGAGGATATGTTCCTAATCACTTTTATGATGTGAACATGCCTGCA 590

 51972586 CAGTTGCCACTGCTGCATCATGTTGGGGTTCCCAAATTTAGACCTTTTTCCACTTACACT 51972645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      591 CAGTTGCCACTGCTGCATCATGTTGGGGTTCCCAAATTTAGACCTTTTTCCACTTACACT 650

 51972646 TTGTTCTCAACCACTGTGCCCTCAAAATGACCACTATTCCAGCATATCTGAGGTAAGAGA 51972705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      651 TTGTTCTCAACCACTGTGCCCTCAAAATGACCACTATTCCAGCATATCTGAGGTAAGAGA 710

 51972706 GAGCTTCTTGCCTGAGACACAAAGTGTGCCCAGAACTAGAATTCTGCTTCTAATACTCAA 51972765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      711 GAGCTTCTTGCCTGAGACACAAAGTGTGCCCAGAACTAGAATTCTGCTTCTAATACTCAA 770

 51972766 ACTCTGGTGTTATGTTGGAGTTACCAGCCCAGACCTCTTCCTTTGTAATAAGTTTCCATT 51972825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      771 ACTCTGGTGTTATGTTGGAGTTACCAGCCCAGACCTCTTCCTTTGTAATAAGTTTCCATT 830

 51972826 TGTGATCAGCAATGGCCCTTTCTGGAACCATCTCAAGCCATCAGTGAAGTTTGACTAACT 51972885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      831 TGTGATCAGCAATGGCCCTTTCTGGAACCATCTCAAGCCATCAGTGAAGTTTGACTAACT 890

 51972886 TTGAAAGGATGGGGGCCTTGATCTTTTATTTTCTGAAGATTCCTGGCACACTATGCTAAT 51972945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      891 TTGAAAGGATGGGGGCCTTGATCTTTTATTTTCTGAAGATTCCTGGCACACTATGCTAAT 950

 51972946 GTACTCATATTCATTCCTCATACCTAGCTTTGTAAATGTAGAACTCAAACTTTTAAGAAG 51973005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      951 GTACTCATATTCATTCCTCATACCTAGCTTTGTAAATGTAGAACTCAAACTTTTAAGAAG 1010

 51973006 ACACTCTCCACAGGAAGTGGATATCTCTTTCCCAACATAAGTGAGGCCACAGATTAGCAC 51973065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1011 ACACTCTCCACAGGAAGTGGATATCTCTTTCCCAACATAAGTGAGGCCACAGATTAGCAC 1070

 51973066 AGACAATTAAAGAGGTAAAATCTGCCAAACGTTTTTTTTTTTATTCTAGCTTAGAAATGA 51973125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1071 AGACAATTAAAGAGGTAAAATCTGCCAAACGTTTTTTTTTTTATTCTAGCTTAGAAATGA 1130

 51973126 TTGGCAAGACTTAAGTTTTTTCCAATACAACTTTTAACTTATCTCTATTACAAATATACA 51973185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1131 TTGGCAAGACTTAAGTTTTTTCCAATACAACTTTTAACTTATCTCTATTACAAATATACA 1190

 51973186 CACAATTATTAATTAATTTATTAGTTTTCATTGATACCTAATAATTTTACTTTTTTATAG 51973245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1191 CACAATTATTAATTAATTTATTAGTTTTCATTGATACCTAATAATTTTACTTTTTTATAG 1250

 51973246 AGCACACAGGATGTTCTGTACACATATAGAATTTGTAACGATCCAATCAAGGTATTTAGG 51973305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1251 AGCACACAGGATGTTCTGTACACATATAGAATTTGTAACGATCCAATCAAGGTATTTAGG 1310

 51973306 TTATTCATCATCTCAAACATTTATAATTTCTTTGTGTTGAGTATGTCTCCAATCTTCTAC 51973365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1311 TTATTCATCATCTCAAACATTTATAATTTCTTTGTGTTGAGTATGTCTCCAATCTTCTAC 1370

 51973366 CTCTTCTGAAATATACAATAAACTCTATTTTTAACTACAGTCACTCTACTTGTCTCATAT 51973425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1371 CTCTTCTGAAATATACAATAAACTCTATTTTTAACTACAGTCACTCTACTTGTCTCATAT 1430

 51973426 GGTACCAAACTAGATCGTTGTTGTCTTGATAACACAGCATTATCATTATAGCTGTAATAC 51973485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1431 GGTACCAAACTAGATCGTTGTTGTCTTGATAACACAGCATTATCATTATAGCTGTAATAC 1490

 51973486 ATAATGCTGTACCTCCTCTCCTAACCCTGGAAGTTGCAATTCATCCTTCAATGCTCAGCT 51973545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1491 ATAATGCTGTACCTCCTCTCCTAACCCTGGAAGTTGCAATTCATCCTTCAATGCTCAGCT 1550

 51973546 CAAAGGATTATTGTCTCTAAAGTTTTAGCAAATGCTGAAGCAGAATTTCACCATTTAATG 51973605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1551 CAAAGGATTATTGTCTCTAAAGTTTTAGCAAATGCTGAAGCAGAATTTCACCATTTAATG 1610

 51973606 GGTTCACAAGCTGCTGCCTTTATAGCTTATGGTACATATGTTTGCCAATATAAATGATCC 51973665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1611 GGTTCACAAGCTGCTGCCTTTATAGCTTATGGTACATATGTTTGCCAATATAAATGATCC 1670

 51973666 ACTTGAGCTAAATTGCCACAGCTGCTACAACACCTCTTTACCTATTTTTGGAGCAAAACT 51973725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1671 ACTTGAGCTAAATTGCCACAGCTGCTACAACACCTCTTTACCTATTTTTGGAGCAAAACT 1730

 51973726 GAAAATCAGAAAAGTTTAACTTTTTCAAAATAATGAAAAATTTCTCTCCAATCCTCTCCA 51973785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1731 GAAAATCAGAAAAGTTTAACTTTTTCAAAATAATGAAAAATTTCTCTCCAATCCTCTCCA 1790

 51973786 TCATTATACATTAATAGGAAAAGAAAGGACAAAGACAAGGTTACAAATGTGAAAGGGTTA 51973845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1791 TCATTATACATTAATAGGAAAAGAAAGGACAAAGACAAGGTTACAAATGTGAAAGGGTTA 1850

 51973846 TTTTTTTCTATTCTGATAGAAATAAGTTTAGAGCACCTGCATGAACAACTTGTATTGAAC 51973905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1851 TTTTTTTCTATTCTGATAGAAATAAGTTTAGAGCACCTGCATGAACAACTTGTATTGAAC 1910

 51973906 AGCAATGCAAGGAACTGCATACCGAAAAGAAGAATCTCTTAGTGACAAGAACCGTGTTGA 51973965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1911 AGCAATGCAAGGAACTGCATACCGAAAAGAAGAATCTCTTAGTGACAAGAACCGTGTTGA 1970

 51973966 CCATGCAACACTATTAGCAAGTTTATTTTCATTCTTTATGTAGATGTCAGGGATATGTAG 51974025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1971 CCATGCAACACTATTAGCAAGTTTATTTTCATTCTTTATGTAGATGTCAGGGATATGTAG 2030

 51974026 CAAAAATACATTTTTAAGTGCAACAGAGTAGATGCTTGCAAAAACAGACTGTGATAACTA 51974085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2031 CAAAAATACATTTTTAAGTGCAACAGAGTAGATGCTTGCAAAAACAGACTGTGATAACTA 2090

 51974086 TCTATTTGCAAAAGTCAGTACAGATATGATTATCTCAGCATTAAATTGGCTGATGTAAAA 51974145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2091 TCTATTTGCAAAAGTCAGTACAGATATGATTATCTCAGCATTAAATTGGCTGATGTAAAA 2150

 51974146 TGGAAATCATGAAAATTAAGTCACCAC 51974172
          |||||||||||||||||||||||||||
     2151 TGGAAATCATGAAAATTAAGTCACCAC 2177

Alignment time is 1.63156 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51963823,51984240] =>     20418 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [       1,    3835] =>      3835 nucs 'mol-32-1e7c-220191_3835'

Score:        3835
Aligned:      3835        nucs
Identic:      3835 (100%) nucs =>      2011 (100%)      1824 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51970214,51972224] EXCISED REGION [51972226,51974049]
 second seq =>  [       1,    2011] EXCISED REGION [    2012,    3835]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [51972225,51972225]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         7 nucs [51972225,51972231] to [51972226,51972232]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 51970214 GTGTTCTGTTTTTATCTTTATAATCTATATTTAACAATTGCATTGTATCTTCCCTGGTCT 51970273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTGTTCTGTTTTTATCTTTATAATCTATATTTAACAATTGCATTGTATCTTCCCTGGTCT 60

 51970274 CCAGCTCTAAGCAAATAAATACTCTTCTTCTTTCTTTTTTCTTGTATATAAATGATTACA 51970333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCAGCTCTAAGCAAATAAATACTCTTCTTCTTTCTTTTTTCTTGTATATAAATGATTACA 120

 51970334 GAGAATGGGACAGAGAGAGAAAATGAAGAGACATAGTTAGAGAGATACACAGGCACAGAG 51970393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GAGAATGGGACAGAGAGAGAAAATGAAGAGACATAGTTAGAGAGATACACAGGCACAGAG 180

 51970394 AGAGAGAGAGAGAAAAAGAGGAGGAGAAGAGAAGAGAGAAGAGACAGAGGAGAGAGAATG 51970453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGAGAGAGAGAGAAAAAGAGGAGGAGAAGAGAAGAGAGAAGAGACAGAGGAGAGAGAATG 240

 51970454 CAGAGAATTTACAATTACTATAGAAAATGTGCACATTTTTCATAATAAAAATGAGTAAAT 51970513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CAGAGAATTTACAATTACTATAGAAAATGTGCACATTTTTCATAATAAAAATGAGTAAAT 300

 51970514 ACTTTCATGATATTATTATCACAGACTGATGATCTGACATAGATTTCGTGCCGTCTACCT 51970573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACTTTCATGATATTATTATCACAGACTGATGATCTGACATAGATTTCGTGCCGTCTACCT 360

 51970574 GGGTCTCTACACGACAAACCTGAGTTAGATGTAATGTAGAGATATGTTTCCACATTGCCC 51970633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGGTCTCTACACGACAAACCTGAGTTAGATGTAATGTAGAGATATGTTTCCACATTGCCC 420

 51970634 TTCTTGGGGAAGGTGAGCCAGTTCTGAGGTGCCTGGTCCTAGTTGTCACAGATGCAGTTA 51970693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTCTTGGGGAAGGTGAGCCAGTTCTGAGGTGCCTGGTCCTAGTTGTCACAGATGCAGTTA 480

 51970694 TTTCACACTAGGCTGCCTGCCAGCCTGGATTTGTCTTCCTTTTTTTTTTTTTTGTTTTCA 51970753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTCACACTAGGCTGCCTGCCAGCCTGGATTTGTCTTCCTTTTTTTTTTTTTTGTTTTCA 540

 51970754 ATCTCCCTGGGCTTGCGTCATTACATCAACACATTCTGAAACATCTGTCAGAATCCTTGC 51970813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATCTCCCTGGGCTTGCGTCATTACATCAACACATTCTGAAACATCTGTCAGAATCCTTGC 600

 51970814 CAGTTCAAATTTACAAAAGTGCAATAATATTCTATCTCCCCATCACCACCAAATCTTGCT 51970873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CAGTTCAAATTTACAAAAGTGCAATAATATTCTATCTCCCCATCACCACCAAATCTTGCT 660

 51970874 AAAATAAAATCATACATTTATTTATAAAAGTTTGTTGTTAAGAAAAAAACTGAAAACATC 51970933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAAATAAAATCATACATTTATTTATAAAAGTTTGTTGTTAAGAAAAAAACTGAAAACATC 720

 51970934 ATGAAGGTCTGAGAGAAATAAAGTGGAATTTAGAAGTATTGTATCCATGTCATATGACAT 51970993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATGAAGGTCTGAGAGAAATAAAGTGGAATTTAGAAGTATTGTATCCATGTCATATGACAT 780

 51970994 ATAAAAGTTTGTAATCATTAAAGATGATGAGTAATATATGGTAAGGAATATTTGGAAAAC 51971053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATAAAAGTTTGTAATCATTAAAGATGATGAGTAATATATGGTAAGGAATATTTGGAAAAC 840

 51971054 TTCTTTCAGTGTTAAAAAAGAAAAATAAAGAAGAGTCAAATTGTATTGCCTCAGTTTTAT 51971113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTCTTTCAGTGTTAAAAAAGAAAAATAAAGAAGAGTCAAATTGTATTGCCTCAGTTTTAT 900

 51971114 TAAACACTTATGTATTTTACATACATTTAAAAAACTTAGCCGGGTGTGGTGGCGCGCGCT 51971173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TAAACACTTATGTATTTTACATACATTTAAAAAACTTAGCCGGGTGTGGTGGCGCGCGCT 960

 51971174 TGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGTGGAG 51971233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGTGGAG 1020

 51971234 GTTGCAGTGAGTGGAAATTGTGCCACTGAACTCCAGCCTGGGGGATAGGGCAAGATTCTG 51971293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GTTGCAGTGAGTGGAAATTGTGCCACTGAACTCCAGCCTGGGGGATAGGGCAAGATTCTG 1080

 51971294 TCTCAAAAAAATAAAGGAAAAAAAAATTTTAATTTGAATAGTTCGCTAGTGCTAAATGTT 51971353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TCTCAAAAAAATAAAGGAAAAAAAAATTTTAATTTGAATAGTTCGCTAGTGCTAAATGTT 1140

 51971354 TATGGTTTTGAATCTGAATGTTTTCATAACATTTTATTTTTAGCGTATTTTTTAGGTTTC 51971413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TATGGTTTTGAATCTGAATGTTTTCATAACATTTTATTTTTAGCGTATTTTTTAGGTTTC 1200

 51971414 CATATTCCAGTGTTGCTGCAACAAATACGTAATGTTTATAATCAGAAAAGCATTGTTAAA 51971473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CATATTCCAGTGTTGCTGCAACAAATACGTAATGTTTATAATCAGAAAAGCATTGTTAAA 1260

 51971474 TAACCTCTGCAAAAACTCTTTAATCTCCCTAATCTAGGGATAGGGAATTATTTTATCTAT 51971533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TAACCTCTGCAAAAACTCTTTAATCTCCCTAATCTAGGGATAGGGAATTATTTTATCTAT 1320

 51971534 AATTTTAATTCTAATTGTTAGAGTGTGGCTGCCTGGAGCACTGACTTGAAAATAAATCTG 51971593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AATTTTAATTCTAATTGTTAGAGTGTGGCTGCCTGGAGCACTGACTTGAAAATAAATCTG 1380

 51971594 AAACCCATCAGGAAAAAATAATGTCAATTAACATTGGTTGTCATTTGTTCAAGAGGAAAA 51971653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AAACCCATCAGGAAAAAATAATGTCAATTAACATTGGTTGTCATTTGTTCAAGAGGAAAA 1440

 51971654 AGTCGGAGCATGATACCCCATATTTGCCATGCATTCTGAAATGTTTTCTTTTGTCTTTTA 51971713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AGTCGGAGCATGATACCCCATATTTGCCATGCATTCTGAAATGTTTTCTTTTGTCTTTTA 1500

 51971714 CTTTAAAAAAAGATGGATGATTTTATTTATATATTAGAACTCATGATCTATATTTTCAAC 51971773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CTTTAAAAAAAGATGGATGATTTTATTTATATATTAGAACTCATGATCTATATTTTCAAC 1560

 51971774 TCTGCTCCAGTAAGTCTCTTATTCATTTGGTTAAAGCACCAATTACACTTACCCCGTAGT 51971833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TCTGCTCCAGTAAGTCTCTTATTCATTTGGTTAAAGCACCAATTACACTTACCCCGTAGT 1620

 51971834 TTCTGATTTTTGATAGGACATTAGGAGAAAGACCATACATTTAAGGGCAATGAAAATAAA 51971893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTCTGATTTTTGATAGGACATTAGGAGAAAGACCATACATTTAAGGGCAATGAAAATAAA 1680

 51971894 TATCTAAGATGAAGTGATTATTATAACTTTGCAATATGGATTGAACCTGGACTAAGTACT 51971953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TATCTAAGATGAAGTGATTATTATAACTTTGCAATATGGATTGAACCTGGACTAAGTACT 1740

 51971954 AGTGCTATATCAGGAAGCTGGATCAATTTGACACCTACTGAAAGTGACACATGGGCCTTG 51972013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AGTGCTATATCAGGAAGCTGGATCAATTTGACACCTACTGAAAGTGACACATGGGCCTTG 1800

 51972014 CTAAAGAAAGAGTTTAAATCTGGTAGTGCTTCAGAATTTTTATTTCAGTGAGGTTCTGTA 51972073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CTAAAGAAAGAGTTTAAATCTGGTAGTGCTTCAGAATTTTTATTTCAGTGAGGTTCTGTA 1860

 51972074 AAATTAAATTCATCTGGCATTGTGGGAAAAAGTTGTATTATATATGAACCAATTTCTTAA 51972133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AAATTAAATTCATCTGGCATTGTGGGAAAAAGTTGTATTATATATGAACCAATTTCTTAA 1920

 51972134 ATAAGTGCAACTTAATCTTCTAAGAAACTTTAAAATATTTAATCTTGTTGGGTATTTTTT 51972193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ATAAGTGCAACTTAATCTTCTAAGAAACTTTAAAATATTTAATCTTGTTGGGTATTTTTT 1980

 51972194 TTTCCATTTTTTTCTTGCTATTTCTTTAGGG 51972224
          |||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TTTCCATTTTTTTCTTGCTATTTCTTTAGGG 2011

EXCISED REGION

 51972226 AAAAAAACAGAATATATAACACTCTTCATTAGTATGGAACACACATACTATTTTATTTCC 51972285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2012 AAAAAAACAGAATATATAACACTCTTCATTAGTATGGAACACACATACTATTTTATTTCC 2071

 51972286 TATTTTAAAACTTAATTACTCAAATACTCCATGAATTTATTAGCAATTGATCCAATATTT 51972345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2072 TATTTTAAAACTTAATTACTCAAATACTCCATGAATTTATTAGCAATTGATCCAATATTT 2131

 51972346 CCCTCTTTAATGTCAATTGCTGCTCCCTTTTCCTTATGCATAGTACATGGATCCTCAGGA 51972405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2132 CCCTCTTTAATGTCAATTGCTGCTCCCTTTTCCTTATGCATAGTACATGGATCCTCAGGA 2191

 51972406 TTCACTTACGCAGTCCACTGAGCAGTGGCCATTCACACTTTTAATGTGAGGAAGAGTGAG 51972465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2192 TTCACTTACGCAGTCCACTGAGCAGTGGCCATTCACACTTTTAATGTGAGGAAGAGTGAG 2251

 51972466 AGAAAGGAAAACAGAAATTATTTCATACCAAAAGAGCCCCTGATTTTTCACTGCTTCTTT 51972525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2252 AGAAAGGAAAACAGAAATTATTTCATACCAAAAGAGCCCCTGATTTTTCACTGCTTCTTT 2311

 51972526 TGTTATTCACATACAGGAGGATATGTTCCTAATCACTTTTATGATGTGAACATGCCTGCA 51972585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2312 TGTTATTCACATACAGGAGGATATGTTCCTAATCACTTTTATGATGTGAACATGCCTGCA 2371

 51972586 CAGTTGCCACTGCTGCATCATGTTGGGGTTCCCAAATTTAGACCTTTTTCCACTTACACT 51972645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2372 CAGTTGCCACTGCTGCATCATGTTGGGGTTCCCAAATTTAGACCTTTTTCCACTTACACT 2431

 51972646 TTGTTCTCAACCACTGTGCCCTCAAAATGACCACTATTCCAGCATATCTGAGGTAAGAGA 51972705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2432 TTGTTCTCAACCACTGTGCCCTCAAAATGACCACTATTCCAGCATATCTGAGGTAAGAGA 2491

 51972706 GAGCTTCTTGCCTGAGACACAAAGTGTGCCCAGAACTAGAATTCTGCTTCTAATACTCAA 51972765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2492 GAGCTTCTTGCCTGAGACACAAAGTGTGCCCAGAACTAGAATTCTGCTTCTAATACTCAA 2551

 51972766 ACTCTGGTGTTATGTTGGAGTTACCAGCCCAGACCTCTTCCTTTGTAATAAGTTTCCATT 51972825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2552 ACTCTGGTGTTATGTTGGAGTTACCAGCCCAGACCTCTTCCTTTGTAATAAGTTTCCATT 2611

 51972826 TGTGATCAGCAATGGCCCTTTCTGGAACCATCTCAAGCCATCAGTGAAGTTTGACTAACT 51972885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2612 TGTGATCAGCAATGGCCCTTTCTGGAACCATCTCAAGCCATCAGTGAAGTTTGACTAACT 2671

 51972886 TTGAAAGGATGGGGGCCTTGATCTTTTATTTTCTGAAGATTCCTGGCACACTATGCTAAT 51972945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2672 TTGAAAGGATGGGGGCCTTGATCTTTTATTTTCTGAAGATTCCTGGCACACTATGCTAAT 2731

 51972946 GTACTCATATTCATTCCTCATACCTAGCTTTGTAAATGTAGAACTCAAACTTTTAAGAAG 51973005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2732 GTACTCATATTCATTCCTCATACCTAGCTTTGTAAATGTAGAACTCAAACTTTTAAGAAG 2791

 51973006 ACACTCTCCACAGGAAGTGGATATCTCTTTCCCAACATAAGTGAGGCCACAGATTAGCAC 51973065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2792 ACACTCTCCACAGGAAGTGGATATCTCTTTCCCAACATAAGTGAGGCCACAGATTAGCAC 2851

 51973066 AGACAATTAAAGAGGTAAAATCTGCCAAACGTTTTTTTTTTTATTCTAGCTTAGAAATGA 51973125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2852 AGACAATTAAAGAGGTAAAATCTGCCAAACGTTTTTTTTTTTATTCTAGCTTAGAAATGA 2911

 51973126 TTGGCAAGACTTAAGTTTTTTCCAATACAACTTTTAACTTATCTCTATTACAAATATACA 51973185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2912 TTGGCAAGACTTAAGTTTTTTCCAATACAACTTTTAACTTATCTCTATTACAAATATACA 2971

 51973186 CACAATTATTAATTAATTTATTAGTTTTCATTGATACCTAATAATTTTACTTTTTTATAG 51973245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2972 CACAATTATTAATTAATTTATTAGTTTTCATTGATACCTAATAATTTTACTTTTTTATAG 3031

 51973246 AGCACACAGGATGTTCTGTACACATATAGAATTTGTAACGATCCAATCAAGGTATTTAGG 51973305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3032 AGCACACAGGATGTTCTGTACACATATAGAATTTGTAACGATCCAATCAAGGTATTTAGG 3091

 51973306 TTATTCATCATCTCAAACATTTATAATTTCTTTGTGTTGAGTATGTCTCCAATCTTCTAC 51973365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3092 TTATTCATCATCTCAAACATTTATAATTTCTTTGTGTTGAGTATGTCTCCAATCTTCTAC 3151

 51973366 CTCTTCTGAAATATACAATAAACTCTATTTTTAACTACAGTCACTCTACTTGTCTCATAT 51973425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3152 CTCTTCTGAAATATACAATAAACTCTATTTTTAACTACAGTCACTCTACTTGTCTCATAT 3211

 51973426 GGTACCAAACTAGATCGTTGTTGTCTTGATAACACAGCATTATCATTATAGCTGTAATAC 51973485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3212 GGTACCAAACTAGATCGTTGTTGTCTTGATAACACAGCATTATCATTATAGCTGTAATAC 3271

 51973486 ATAATGCTGTACCTCCTCTCCTAACCCTGGAAGTTGCAATTCATCCTTCAATGCTCAGCT 51973545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3272 ATAATGCTGTACCTCCTCTCCTAACCCTGGAAGTTGCAATTCATCCTTCAATGCTCAGCT 3331

 51973546 CAAAGGATTATTGTCTCTAAAGTTTTAGCAAATGCTGAAGCAGAATTTCACCATTTAATG 51973605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3332 CAAAGGATTATTGTCTCTAAAGTTTTAGCAAATGCTGAAGCAGAATTTCACCATTTAATG 3391

 51973606 GGTTCACAAGCTGCTGCCTTTATAGCTTATGGTACATATGTTTGCCAATATAAATGATCC 51973665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3392 GGTTCACAAGCTGCTGCCTTTATAGCTTATGGTACATATGTTTGCCAATATAAATGATCC 3451

 51973666 ACTTGAGCTAAATTGCCACAGCTGCTACAACACCTCTTTACCTATTTTTGGAGCAAAACT 51973725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3452 ACTTGAGCTAAATTGCCACAGCTGCTACAACACCTCTTTACCTATTTTTGGAGCAAAACT 3511

 51973726 GAAAATCAGAAAAGTTTAACTTTTTCAAAATAATGAAAAATTTCTCTCCAATCCTCTCCA 51973785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3512 GAAAATCAGAAAAGTTTAACTTTTTCAAAATAATGAAAAATTTCTCTCCAATCCTCTCCA 3571

 51973786 TCATTATACATTAATAGGAAAAGAAAGGACAAAGACAAGGTTACAAATGTGAAAGGGTTA 51973845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3572 TCATTATACATTAATAGGAAAAGAAAGGACAAAGACAAGGTTACAAATGTGAAAGGGTTA 3631

 51973846 TTTTTTTCTATTCTGATAGAAATAAGTTTAGAGCACCTGCATGAACAACTTGTATTGAAC 51973905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3632 TTTTTTTCTATTCTGATAGAAATAAGTTTAGAGCACCTGCATGAACAACTTGTATTGAAC 3691

 51973906 AGCAATGCAAGGAACTGCATACCGAAAAGAAGAATCTCTTAGTGACAAGAACCGTGTTGA 51973965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3692 AGCAATGCAAGGAACTGCATACCGAAAAGAAGAATCTCTTAGTGACAAGAACCGTGTTGA 3751

 51973966 CCATGCAACACTATTAGCAAGTTTATTTTCATTCTTTATGTAGATGTCAGGGATATGTAG 51974025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3752 CCATGCAACACTATTAGCAAGTTTATTTTCATTCTTTATGTAGATGTCAGGGATATGTAG 3811

 51974026 CAAAAATACATTTTTAAGTGCAAC 51974049
          ||||||||||||||||||||||||
     3812 CAAAAATACATTTTTAAGTGCAAC 3835

Alignment time is 2.89622 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51963823,51984240] =>     20418 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [       1,    2009] =>      2009 nucs 'mol-32-1f58-138145_2009'

Score:        2009
Aligned:      2009        nucs
Identic:      2009 (100%) nucs =>        62 (100%)      1947 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51972163,51972224] EXCISED REGION [51972226,51974172]
 second seq =>  [       1,      62] EXCISED REGION [      63,    2009]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [51972225,51972225]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         7 nucs [51972225,51972231] to [51972226,51972232]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 51972163 TTAAAATATTTAATCTTGTTGGGTATTTTTTTTTCCATTTTTTTCTTGCTATTTCTTTAG 51972222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTAAAATATTTAATCTTGTTGGGTATTTTTTTTTCCATTTTTTTCTTGCTATTTCTTTAG 60

 51972223 GG 51972224
          ||
       61 GG 62

EXCISED REGION

 51972226 AAAAAAACAGAATATATAACACTCTTCATTAGTATGGAACACACATACTATTTTATTTCC 51972285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       63 AAAAAAACAGAATATATAACACTCTTCATTAGTATGGAACACACATACTATTTTATTTCC 122

 51972286 TATTTTAAAACTTAATTACTCAAATACTCCATGAATTTATTAGCAATTGATCCAATATTT 51972345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      123 TATTTTAAAACTTAATTACTCAAATACTCCATGAATTTATTAGCAATTGATCCAATATTT 182

 51972346 CCCTCTTTAATGTCAATTGCTGCTCCCTTTTCCTTATGCATAGTACATGGATCCTCAGGA 51972405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      183 CCCTCTTTAATGTCAATTGCTGCTCCCTTTTCCTTATGCATAGTACATGGATCCTCAGGA 242

 51972406 TTCACTTACGCAGTCCACTGAGCAGTGGCCATTCACACTTTTAATGTGAGGAAGAGTGAG 51972465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      243 TTCACTTACGCAGTCCACTGAGCAGTGGCCATTCACACTTTTAATGTGAGGAAGAGTGAG 302

 51972466 AGAAAGGAAAACAGAAATTATTTCATACCAAAAGAGCCCCTGATTTTTCACTGCTTCTTT 51972525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      303 AGAAAGGAAAACAGAAATTATTTCATACCAAAAGAGCCCCTGATTTTTCACTGCTTCTTT 362

 51972526 TGTTATTCACATACAGGAGGATATGTTCCTAATCACTTTTATGATGTGAACATGCCTGCA 51972585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      363 TGTTATTCACATACAGGAGGATATGTTCCTAATCACTTTTATGATGTGAACATGCCTGCA 422

 51972586 CAGTTGCCACTGCTGCATCATGTTGGGGTTCCCAAATTTAGACCTTTTTCCACTTACACT 51972645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      423 CAGTTGCCACTGCTGCATCATGTTGGGGTTCCCAAATTTAGACCTTTTTCCACTTACACT 482

 51972646 TTGTTCTCAACCACTGTGCCCTCAAAATGACCACTATTCCAGCATATCTGAGGTAAGAGA 51972705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      483 TTGTTCTCAACCACTGTGCCCTCAAAATGACCACTATTCCAGCATATCTGAGGTAAGAGA 542

 51972706 GAGCTTCTTGCCTGAGACACAAAGTGTGCCCAGAACTAGAATTCTGCTTCTAATACTCAA 51972765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      543 GAGCTTCTTGCCTGAGACACAAAGTGTGCCCAGAACTAGAATTCTGCTTCTAATACTCAA 602

 51972766 ACTCTGGTGTTATGTTGGAGTTACCAGCCCAGACCTCTTCCTTTGTAATAAGTTTCCATT 51972825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      603 ACTCTGGTGTTATGTTGGAGTTACCAGCCCAGACCTCTTCCTTTGTAATAAGTTTCCATT 662

 51972826 TGTGATCAGCAATGGCCCTTTCTGGAACCATCTCAAGCCATCAGTGAAGTTTGACTAACT 51972885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      663 TGTGATCAGCAATGGCCCTTTCTGGAACCATCTCAAGCCATCAGTGAAGTTTGACTAACT 722

 51972886 TTGAAAGGATGGGGGCCTTGATCTTTTATTTTCTGAAGATTCCTGGCACACTATGCTAAT 51972945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      723 TTGAAAGGATGGGGGCCTTGATCTTTTATTTTCTGAAGATTCCTGGCACACTATGCTAAT 782

 51972946 GTACTCATATTCATTCCTCATACCTAGCTTTGTAAATGTAGAACTCAAACTTTTAAGAAG 51973005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      783 GTACTCATATTCATTCCTCATACCTAGCTTTGTAAATGTAGAACTCAAACTTTTAAGAAG 842

 51973006 ACACTCTCCACAGGAAGTGGATATCTCTTTCCCAACATAAGTGAGGCCACAGATTAGCAC 51973065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      843 ACACTCTCCACAGGAAGTGGATATCTCTTTCCCAACATAAGTGAGGCCACAGATTAGCAC 902

 51973066 AGACAATTAAAGAGGTAAAATCTGCCAAACGTTTTTTTTTTTATTCTAGCTTAGAAATGA 51973125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      903 AGACAATTAAAGAGGTAAAATCTGCCAAACGTTTTTTTTTTTATTCTAGCTTAGAAATGA 962

 51973126 TTGGCAAGACTTAAGTTTTTTCCAATACAACTTTTAACTTATCTCTATTACAAATATACA 51973185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      963 TTGGCAAGACTTAAGTTTTTTCCAATACAACTTTTAACTTATCTCTATTACAAATATACA 1022

 51973186 CACAATTATTAATTAATTTATTAGTTTTCATTGATACCTAATAATTTTACTTTTTTATAG 51973245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1023 CACAATTATTAATTAATTTATTAGTTTTCATTGATACCTAATAATTTTACTTTTTTATAG 1082

 51973246 AGCACACAGGATGTTCTGTACACATATAGAATTTGTAACGATCCAATCAAGGTATTTAGG 51973305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1083 AGCACACAGGATGTTCTGTACACATATAGAATTTGTAACGATCCAATCAAGGTATTTAGG 1142

 51973306 TTATTCATCATCTCAAACATTTATAATTTCTTTGTGTTGAGTATGTCTCCAATCTTCTAC 51973365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1143 TTATTCATCATCTCAAACATTTATAATTTCTTTGTGTTGAGTATGTCTCCAATCTTCTAC 1202

 51973366 CTCTTCTGAAATATACAATAAACTCTATTTTTAACTACAGTCACTCTACTTGTCTCATAT 51973425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1203 CTCTTCTGAAATATACAATAAACTCTATTTTTAACTACAGTCACTCTACTTGTCTCATAT 1262

 51973426 GGTACCAAACTAGATCGTTGTTGTCTTGATAACACAGCATTATCATTATAGCTGTAATAC 51973485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1263 GGTACCAAACTAGATCGTTGTTGTCTTGATAACACAGCATTATCATTATAGCTGTAATAC 1322

 51973486 ATAATGCTGTACCTCCTCTCCTAACCCTGGAAGTTGCAATTCATCCTTCAATGCTCAGCT 51973545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1323 ATAATGCTGTACCTCCTCTCCTAACCCTGGAAGTTGCAATTCATCCTTCAATGCTCAGCT 1382

 51973546 CAAAGGATTATTGTCTCTAAAGTTTTAGCAAATGCTGAAGCAGAATTTCACCATTTAATG 51973605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1383 CAAAGGATTATTGTCTCTAAAGTTTTAGCAAATGCTGAAGCAGAATTTCACCATTTAATG 1442

 51973606 GGTTCACAAGCTGCTGCCTTTATAGCTTATGGTACATATGTTTGCCAATATAAATGATCC 51973665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1443 GGTTCACAAGCTGCTGCCTTTATAGCTTATGGTACATATGTTTGCCAATATAAATGATCC 1502

 51973666 ACTTGAGCTAAATTGCCACAGCTGCTACAACACCTCTTTACCTATTTTTGGAGCAAAACT 51973725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1503 ACTTGAGCTAAATTGCCACAGCTGCTACAACACCTCTTTACCTATTTTTGGAGCAAAACT 1562

 51973726 GAAAATCAGAAAAGTTTAACTTTTTCAAAATAATGAAAAATTTCTCTCCAATCCTCTCCA 51973785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1563 GAAAATCAGAAAAGTTTAACTTTTTCAAAATAATGAAAAATTTCTCTCCAATCCTCTCCA 1622

 51973786 TCATTATACATTAATAGGAAAAGAAAGGACAAAGACAAGGTTACAAATGTGAAAGGGTTA 51973845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1623 TCATTATACATTAATAGGAAAAGAAAGGACAAAGACAAGGTTACAAATGTGAAAGGGTTA 1682

 51973846 TTTTTTTCTATTCTGATAGAAATAAGTTTAGAGCACCTGCATGAACAACTTGTATTGAAC 51973905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1683 TTTTTTTCTATTCTGATAGAAATAAGTTTAGAGCACCTGCATGAACAACTTGTATTGAAC 1742

 51973906 AGCAATGCAAGGAACTGCATACCGAAAAGAAGAATCTCTTAGTGACAAGAACCGTGTTGA 51973965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1743 AGCAATGCAAGGAACTGCATACCGAAAAGAAGAATCTCTTAGTGACAAGAACCGTGTTGA 1802

 51973966 CCATGCAACACTATTAGCAAGTTTATTTTCATTCTTTATGTAGATGTCAGGGATATGTAG 51974025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1803 CCATGCAACACTATTAGCAAGTTTATTTTCATTCTTTATGTAGATGTCAGGGATATGTAG 1862

 51974026 CAAAAATACATTTTTAAGTGCAACAGAGTAGATGCTTGCAAAAACAGACTGTGATAACTA 51974085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1863 CAAAAATACATTTTTAAGTGCAACAGAGTAGATGCTTGCAAAAACAGACTGTGATAACTA 1922

 51974086 TCTATTTGCAAAAGTCAGTACAGATATGATTATCTCAGCATTAAATTGGCTGATGTAAAA 51974145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1923 TCTATTTGCAAAAGTCAGTACAGATATGATTATCTCAGCATTAAATTGGCTGATGTAAAA 1982

 51974146 TGGAAATCATGAAAATTAAGTCACCAC 51974172
          |||||||||||||||||||||||||||
     1983 TGGAAATCATGAAAATTAAGTCACCAC 2009

Alignment time is 1.5355 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51963823,51984240] =>     20418 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [       1,    2573] =>      2573 nucs 'mol-32-2291-116773_2573'

Score:        2572
Aligned:      2572        nucs
Identic:      2572 (100%) nucs =>       690 (100%)      1882 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51972424,51973113] EXCISED REGION [51973115,51974996]
 second seq =>  [       1,     690] EXCISED REGION [     692,    2573]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [51973114,51973114]
 second seq =>         1 nucs [691,691]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [691,691] to [692,692]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 51972424 TGAGCAGTGGCCATTCACACTTTTAATGTGAGGAAGAGTGAGAGAAAGGAAAACAGAAAT 51972483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGAGCAGTGGCCATTCACACTTTTAATGTGAGGAAGAGTGAGAGAAAGGAAAACAGAAAT 60

 51972484 TATTTCATACCAAAAGAGCCCCTGATTTTTCACTGCTTCTTTTGTTATTCACATACAGGA 51972543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TATTTCATACCAAAAGAGCCCCTGATTTTTCACTGCTTCTTTTGTTATTCACATACAGGA 120

 51972544 GGATATGTTCCTAATCACTTTTATGATGTGAACATGCCTGCACAGTTGCCACTGCTGCAT 51972603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGATATGTTCCTAATCACTTTTATGATGTGAACATGCCTGCACAGTTGCCACTGCTGCAT 180

 51972604 CATGTTGGGGTTCCCAAATTTAGACCTTTTTCCACTTACACTTTGTTCTCAACCACTGTG 51972663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CATGTTGGGGTTCCCAAATTTAGACCTTTTTCCACTTACACTTTGTTCTCAACCACTGTG 240

 51972664 CCCTCAAAATGACCACTATTCCAGCATATCTGAGGTAAGAGAGAGCTTCTTGCCTGAGAC 51972723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCCTCAAAATGACCACTATTCCAGCATATCTGAGGTAAGAGAGAGCTTCTTGCCTGAGAC 300

 51972724 ACAAAGTGTGCCCAGAACTAGAATTCTGCTTCTAATACTCAAACTCTGGTGTTATGTTGG 51972783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACAAAGTGTGCCCAGAACTAGAATTCTGCTTCTAATACTCAAACTCTGGTGTTATGTTGG 360

 51972784 AGTTACCAGCCCAGACCTCTTCCTTTGTAATAAGTTTCCATTTGTGATCAGCAATGGCCC 51972843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGTTACCAGCCCAGACCTCTTCCTTTGTAATAAGTTTCCATTTGTGATCAGCAATGGCCC 420

 51972844 TTTCTGGAACCATCTCAAGCCATCAGTGAAGTTTGACTAACTTTGAAAGGATGGGGGCCT 51972903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTTCTGGAACCATCTCAAGCCATCAGTGAAGTTTGACTAACTTTGAAAGGATGGGGGCCT 480

 51972904 TGATCTTTTATTTTCTGAAGATTCCTGGCACACTATGCTAATGTACTCATATTCATTCCT 51972963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGATCTTTTATTTTCTGAAGATTCCTGGCACACTATGCTAATGTACTCATATTCATTCCT 540

 51972964 CATACCTAGCTTTGTAAATGTAGAACTCAAACTTTTAAGAAGACACTCTCCACAGGAAGT 51973023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CATACCTAGCTTTGTAAATGTAGAACTCAAACTTTTAAGAAGACACTCTCCACAGGAAGT 600

 51973024 GGATATCTCTTTCCCAACATAAGTGAGGCCACAGATTAGCACAGACAATTAAAGAGGTAA 51973083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GGATATCTCTTTCCCAACATAAGTGAGGCCACAGATTAGCACAGACAATTAAAGAGGTAA 660

 51973084 AATCTGCCAAACGTTTTTTTTTTTATTCTA 51973113
          ||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AATCTGCCAAACGTTTTTTTTTTTATTCTA 690

EXCISED REGION

 51973115 CTTAGAAATGATTGGCAAGACTTAAGTTTTTTCCAATACAACTTTTAACTTATCTCTATT 51973174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      692 CTTAGAAATGATTGGCAAGACTTAAGTTTTTTCCAATACAACTTTTAACTTATCTCTATT 751

 51973175 ACAAATATACACACAATTATTAATTAATTTATTAGTTTTCATTGATACCTAATAATTTTA 51973234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      752 ACAAATATACACACAATTATTAATTAATTTATTAGTTTTCATTGATACCTAATAATTTTA 811

 51973235 CTTTTTTATAGAGCACACAGGATGTTCTGTACACATATAGAATTTGTAACGATCCAATCA 51973294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      812 CTTTTTTATAGAGCACACAGGATGTTCTGTACACATATAGAATTTGTAACGATCCAATCA 871

 51973295 AGGTATTTAGGTTATTCATCATCTCAAACATTTATAATTTCTTTGTGTTGAGTATGTCTC 51973354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      872 AGGTATTTAGGTTATTCATCATCTCAAACATTTATAATTTCTTTGTGTTGAGTATGTCTC 931

 51973355 CAATCTTCTACCTCTTCTGAAATATACAATAAACTCTATTTTTAACTACAGTCACTCTAC 51973414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      932 CAATCTTCTACCTCTTCTGAAATATACAATAAACTCTATTTTTAACTACAGTCACTCTAC 991

 51973415 TTGTCTCATATGGTACCAAACTAGATCGTTGTTGTCTTGATAACACAGCATTATCATTAT 51973474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      992 TTGTCTCATATGGTACCAAACTAGATCGTTGTTGTCTTGATAACACAGCATTATCATTAT 1051

 51973475 AGCTGTAATACATAATGCTGTACCTCCTCTCCTAACCCTGGAAGTTGCAATTCATCCTTC 51973534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1052 AGCTGTAATACATAATGCTGTACCTCCTCTCCTAACCCTGGAAGTTGCAATTCATCCTTC 1111

 51973535 AATGCTCAGCTCAAAGGATTATTGTCTCTAAAGTTTTAGCAAATGCTGAAGCAGAATTTC 51973594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1112 AATGCTCAGCTCAAAGGATTATTGTCTCTAAAGTTTTAGCAAATGCTGAAGCAGAATTTC 1171

 51973595 ACCATTTAATGGGTTCACAAGCTGCTGCCTTTATAGCTTATGGTACATATGTTTGCCAAT 51973654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1172 ACCATTTAATGGGTTCACAAGCTGCTGCCTTTATAGCTTATGGTACATATGTTTGCCAAT 1231

 51973655 ATAAATGATCCACTTGAGCTAAATTGCCACAGCTGCTACAACACCTCTTTACCTATTTTT 51973714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1232 ATAAATGATCCACTTGAGCTAAATTGCCACAGCTGCTACAACACCTCTTTACCTATTTTT 1291

 51973715 GGAGCAAAACTGAAAATCAGAAAAGTTTAACTTTTTCAAAATAATGAAAAATTTCTCTCC 51973774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1292 GGAGCAAAACTGAAAATCAGAAAAGTTTAACTTTTTCAAAATAATGAAAAATTTCTCTCC 1351

 51973775 AATCCTCTCCATCATTATACATTAATAGGAAAAGAAAGGACAAAGACAAGGTTACAAATG 51973834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1352 AATCCTCTCCATCATTATACATTAATAGGAAAAGAAAGGACAAAGACAAGGTTACAAATG 1411

 51973835 TGAAAGGGTTATTTTTTTCTATTCTGATAGAAATAAGTTTAGAGCACCTGCATGAACAAC 51973894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1412 TGAAAGGGTTATTTTTTTCTATTCTGATAGAAATAAGTTTAGAGCACCTGCATGAACAAC 1471

 51973895 TTGTATTGAACAGCAATGCAAGGAACTGCATACCGAAAAGAAGAATCTCTTAGTGACAAG 51973954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1472 TTGTATTGAACAGCAATGCAAGGAACTGCATACCGAAAAGAAGAATCTCTTAGTGACAAG 1531

 51973955 AACCGTGTTGACCATGCAACACTATTAGCAAGTTTATTTTCATTCTTTATGTAGATGTCA 51974014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1532 AACCGTGTTGACCATGCAACACTATTAGCAAGTTTATTTTCATTCTTTATGTAGATGTCA 1591

 51974015 GGGATATGTAGCAAAAATACATTTTTAAGTGCAACAGAGTAGATGCTTGCAAAAACAGAC 51974074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1592 GGGATATGTAGCAAAAATACATTTTTAAGTGCAACAGAGTAGATGCTTGCAAAAACAGAC 1651

 51974075 TGTGATAACTATCTATTTGCAAAAGTCAGTACAGATATGATTATCTCAGCATTAAATTGG 51974134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1652 TGTGATAACTATCTATTTGCAAAAGTCAGTACAGATATGATTATCTCAGCATTAAATTGG 1711

 51974135 CTGATGTAAAATGGAAATCATGAAAATTAAGTCACCACACAATAAAATGACAATAGGTTC 51974194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1712 CTGATGTAAAATGGAAATCATGAAAATTAAGTCACCACACAATAAAATGACAATAGGTTC 1771

 51974195 CTAAATCAATCATGAAAAATTTTCCCAATGAAGAAGGGACAACATAAAATTTTCCTTTGA 51974254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1772 CTAAATCAATCATGAAAAATTTTCCCAATGAAGAAGGGACAACATAAAATTTTCCTTTGA 1831

 51974255 GAAAGTCTCAGTAATATTTGCTTAATATGCTGATAGGCTTATCAAGCTTCTTGAAAAAAA 51974314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1832 GAAAGTCTCAGTAATATTTGCTTAATATGCTGATAGGCTTATCAAGCTTCTTGAAAAAAA 1891

 51974315 ACTGATTTACAATACAGTGGGGATTATTTTTTTTAAGTTGGAAGGGAAAGAAGGTTTGAT 51974374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1892 ACTGATTTACAATACAGTGGGGATTATTTTTTTTAAGTTGGAAGGGAAAGAAGGTTTGAT 1951

 51974375 GTAAGAGTGCTTTGAAATGTGGAGTTTTCCTAAGTATTACTCCCACAAGACCATAGTCTT 51974434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1952 GTAAGAGTGCTTTGAAATGTGGAGTTTTCCTAAGTATTACTCCCACAAGACCATAGTCTT 2011

 51974435 GAAATTAAATTAGGCCTTTAGAATATCAGACAAAATAAATGGATTGTAATTTATTTCAAT 51974494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2012 GAAATTAAATTAGGCCTTTAGAATATCAGACAAAATAAATGGATTGTAATTTATTTCAAT 2071

 51974495 AGCTGAATGCTTACTATTTTTCAAAGGATTAATTGAGATATATAATTCTTTATATAAGTA 51974554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2072 AGCTGAATGCTTACTATTTTTCAAAGGATTAATTGAGATATATAATTCTTTATATAAGTA 2131

 51974555 AAAGAAATTTTCTAACTTTCAGAAACATCTAAACTTAGTTTTCCACTAAGTTGTCTCTAA 51974614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2132 AAAGAAATTTTCTAACTTTCAGAAACATCTAAACTTAGTTTTCCACTAAGTTGTCTCTAA 2191

 51974615 CTCAACCCTCTTTTCACTTTTTTTATTATTTTAGAGCAGTAACATTTACTTCTGGAAAAT 51974674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2192 CTCAACCCTCTTTTCACTTTTTTTATTATTTTAGAGCAGTAACATTTACTTCTGGAAAAT 2251

 51974675 CATCCAAATAAAACCAATTTACTTTCATAAAATCTAGACTTTTTGGATGTTAGAAGCATG 51974734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2252 CATCCAAATAAAACCAATTTACTTTCATAAAATCTAGACTTTTTGGATGTTAGAAGCATG 2311

 51974735 ATTTACCATCTCCTATTGGGACCTTATTCCAGAAATGATTTGCTCTTTCATTTGCTAATT 51974794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2312 ATTTACCATCTCCTATTGGGACCTTATTCCAGAAATGATTTGCTCTTTCATTTGCTAATT 2371

 51974795 GCATGACGATTAGAATCTGGACCCAAGACCTTTTTAATGCATATAATTAAATATTTCAAA 51974854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2372 GCATGACGATTAGAATCTGGACCCAAGACCTTTTTAATGCATATAATTAAATATTTCAAA 2431

 51974855 CTTCTTACACTTTTGATCTTCTGGTATCATATATTCAATTAATAGCATAATTCACATTCC 51974914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2432 CTTCTTACACTTTTGATCTTCTGGTATCATATATTCAATTAATAGCATAATTCACATTCC 2491

 51974915 CCTACATACCATGAAACTACCTTTTTCCTGATTATATTAATGTATACTAAACATAAAAAA 51974974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2492 CCTACATACCATGAAACTACCTTTTTCCTGATTATATTAATGTATACTAAACATAAAAAA 2551

 51974975 AGAAATTATATAAAATAGTATT 51974996
          ||||||||||||||||||||||
     2552 AGAAATTATATAAAATAGTATT 2573

Alignment time is 1.95659 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51963823,51984240] =>     20418 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [       1,    3922] =>      3922 nucs 'mol-32-22e9-018673_3922'

Score:        3922
Aligned:      3922        nucs
Identic:      3922 (100%) nucs =>      1034 (100%)      2888 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51971191,51972224] EXCISED REGION [51972226,51975113]
 second seq =>  [       1,    1034] EXCISED REGION [    1035,    3922]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [51972225,51972225]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         7 nucs [51972225,51972231] to [51972226,51972232]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 51971191 GGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGTGGAAA 51971250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGTGGAAA 60

 51971251 TTGTGCCACTGAACTCCAGCCTGGGGGATAGGGCAAGATTCTGTCTCAAAAAAATAAAGG 51971310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTGTGCCACTGAACTCCAGCCTGGGGGATAGGGCAAGATTCTGTCTCAAAAAAATAAAGG 120

 51971311 AAAAAAAAATTTTAATTTGAATAGTTCGCTAGTGCTAAATGTTTATGGTTTTGAATCTGA 51971370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAAAAAAAATTTTAATTTGAATAGTTCGCTAGTGCTAAATGTTTATGGTTTTGAATCTGA 180

 51971371 ATGTTTTCATAACATTTTATTTTTAGCGTATTTTTTAGGTTTCCATATTCCAGTGTTGCT 51971430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATGTTTTCATAACATTTTATTTTTAGCGTATTTTTTAGGTTTCCATATTCCAGTGTTGCT 240

 51971431 GCAACAAATACGTAATGTTTATAATCAGAAAAGCATTGTTAAATAACCTCTGCAAAAACT 51971490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GCAACAAATACGTAATGTTTATAATCAGAAAAGCATTGTTAAATAACCTCTGCAAAAACT 300

 51971491 CTTTAATCTCCCTAATCTAGGGATAGGGAATTATTTTATCTATAATTTTAATTCTAATTG 51971550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTTTAATCTCCCTAATCTAGGGATAGGGAATTATTTTATCTATAATTTTAATTCTAATTG 360

 51971551 TTAGAGTGTGGCTGCCTGGAGCACTGACTTGAAAATAAATCTGAAACCCATCAGGAAAAA 51971610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTAGAGTGTGGCTGCCTGGAGCACTGACTTGAAAATAAATCTGAAACCCATCAGGAAAAA 420

 51971611 ATAATGTCAATTAACATTGGTTGTCATTTGTTCAAGAGGAAAAAGTCGGAGCATGATACC 51971670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATAATGTCAATTAACATTGGTTGTCATTTGTTCAAGAGGAAAAAGTCGGAGCATGATACC 480

 51971671 CCATATTTGCCATGCATTCTGAAATGTTTTCTTTTGTCTTTTACTTTAAAAAAAGATGGA 51971730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCATATTTGCCATGCATTCTGAAATGTTTTCTTTTGTCTTTTACTTTAAAAAAAGATGGA 540

 51971731 TGATTTTATTTATATATTAGAACTCATGATCTATATTTTCAACTCTGCTCCAGTAAGTCT 51971790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGATTTTATTTATATATTAGAACTCATGATCTATATTTTCAACTCTGCTCCAGTAAGTCT 600

 51971791 CTTATTCATTTGGTTAAAGCACCAATTACACTTACCCCGTAGTTTCTGATTTTTGATAGG 51971850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTTATTCATTTGGTTAAAGCACCAATTACACTTACCCCGTAGTTTCTGATTTTTGATAGG 660

 51971851 ACATTAGGAGAAAGACCATACATTTAAGGGCAATGAAAATAAATATCTAAGATGAAGTGA 51971910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ACATTAGGAGAAAGACCATACATTTAAGGGCAATGAAAATAAATATCTAAGATGAAGTGA 720

 51971911 TTATTATAACTTTGCAATATGGATTGAACCTGGACTAAGTACTAGTGCTATATCAGGAAG 51971970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTATTATAACTTTGCAATATGGATTGAACCTGGACTAAGTACTAGTGCTATATCAGGAAG 780

 51971971 CTGGATCAATTTGACACCTACTGAAAGTGACACATGGGCCTTGCTAAAGAAAGAGTTTAA 51972030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTGGATCAATTTGACACCTACTGAAAGTGACACATGGGCCTTGCTAAAGAAAGAGTTTAA 840

 51972031 ATCTGGTAGTGCTTCAGAATTTTTATTTCAGTGAGGTTCTGTAAAATTAAATTCATCTGG 51972090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATCTGGTAGTGCTTCAGAATTTTTATTTCAGTGAGGTTCTGTAAAATTAAATTCATCTGG 900

 51972091 CATTGTGGGAAAAAGTTGTATTATATATGAACCAATTTCTTAAATAAGTGCAACTTAATC 51972150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CATTGTGGGAAAAAGTTGTATTATATATGAACCAATTTCTTAAATAAGTGCAACTTAATC 960

 51972151 TTCTAAGAAACTTTAAAATATTTAATCTTGTTGGGTATTTTTTTTTCCATTTTTTTCTTG 51972210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTCTAAGAAACTTTAAAATATTTAATCTTGTTGGGTATTTTTTTTTCCATTTTTTTCTTG 1020

 51972211 CTATTTCTTTAGGG 51972224
          ||||||||||||||
     1021 CTATTTCTTTAGGG 1034

EXCISED REGION

 51972226 AAAAAAACAGAATATATAACACTCTTCATTAGTATGGAACACACATACTATTTTATTTCC 51972285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1035 AAAAAAACAGAATATATAACACTCTTCATTAGTATGGAACACACATACTATTTTATTTCC 1094

 51972286 TATTTTAAAACTTAATTACTCAAATACTCCATGAATTTATTAGCAATTGATCCAATATTT 51972345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1095 TATTTTAAAACTTAATTACTCAAATACTCCATGAATTTATTAGCAATTGATCCAATATTT 1154

 51972346 CCCTCTTTAATGTCAATTGCTGCTCCCTTTTCCTTATGCATAGTACATGGATCCTCAGGA 51972405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1155 CCCTCTTTAATGTCAATTGCTGCTCCCTTTTCCTTATGCATAGTACATGGATCCTCAGGA 1214

 51972406 TTCACTTACGCAGTCCACTGAGCAGTGGCCATTCACACTTTTAATGTGAGGAAGAGTGAG 51972465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1215 TTCACTTACGCAGTCCACTGAGCAGTGGCCATTCACACTTTTAATGTGAGGAAGAGTGAG 1274

 51972466 AGAAAGGAAAACAGAAATTATTTCATACCAAAAGAGCCCCTGATTTTTCACTGCTTCTTT 51972525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1275 AGAAAGGAAAACAGAAATTATTTCATACCAAAAGAGCCCCTGATTTTTCACTGCTTCTTT 1334

 51972526 TGTTATTCACATACAGGAGGATATGTTCCTAATCACTTTTATGATGTGAACATGCCTGCA 51972585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1335 TGTTATTCACATACAGGAGGATATGTTCCTAATCACTTTTATGATGTGAACATGCCTGCA 1394

 51972586 CAGTTGCCACTGCTGCATCATGTTGGGGTTCCCAAATTTAGACCTTTTTCCACTTACACT 51972645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1395 CAGTTGCCACTGCTGCATCATGTTGGGGTTCCCAAATTTAGACCTTTTTCCACTTACACT 1454

 51972646 TTGTTCTCAACCACTGTGCCCTCAAAATGACCACTATTCCAGCATATCTGAGGTAAGAGA 51972705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1455 TTGTTCTCAACCACTGTGCCCTCAAAATGACCACTATTCCAGCATATCTGAGGTAAGAGA 1514

 51972706 GAGCTTCTTGCCTGAGACACAAAGTGTGCCCAGAACTAGAATTCTGCTTCTAATACTCAA 51972765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1515 GAGCTTCTTGCCTGAGACACAAAGTGTGCCCAGAACTAGAATTCTGCTTCTAATACTCAA 1574

 51972766 ACTCTGGTGTTATGTTGGAGTTACCAGCCCAGACCTCTTCCTTTGTAATAAGTTTCCATT 51972825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1575 ACTCTGGTGTTATGTTGGAGTTACCAGCCCAGACCTCTTCCTTTGTAATAAGTTTCCATT 1634

 51972826 TGTGATCAGCAATGGCCCTTTCTGGAACCATCTCAAGCCATCAGTGAAGTTTGACTAACT 51972885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1635 TGTGATCAGCAATGGCCCTTTCTGGAACCATCTCAAGCCATCAGTGAAGTTTGACTAACT 1694

 51972886 TTGAAAGGATGGGGGCCTTGATCTTTTATTTTCTGAAGATTCCTGGCACACTATGCTAAT 51972945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1695 TTGAAAGGATGGGGGCCTTGATCTTTTATTTTCTGAAGATTCCTGGCACACTATGCTAAT 1754

 51972946 GTACTCATATTCATTCCTCATACCTAGCTTTGTAAATGTAGAACTCAAACTTTTAAGAAG 51973005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1755 GTACTCATATTCATTCCTCATACCTAGCTTTGTAAATGTAGAACTCAAACTTTTAAGAAG 1814

 51973006 ACACTCTCCACAGGAAGTGGATATCTCTTTCCCAACATAAGTGAGGCCACAGATTAGCAC 51973065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1815 ACACTCTCCACAGGAAGTGGATATCTCTTTCCCAACATAAGTGAGGCCACAGATTAGCAC 1874

 51973066 AGACAATTAAAGAGGTAAAATCTGCCAAACGTTTTTTTTTTTATTCTAGCTTAGAAATGA 51973125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1875 AGACAATTAAAGAGGTAAAATCTGCCAAACGTTTTTTTTTTTATTCTAGCTTAGAAATGA 1934

 51973126 TTGGCAAGACTTAAGTTTTTTCCAATACAACTTTTAACTTATCTCTATTACAAATATACA 51973185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1935 TTGGCAAGACTTAAGTTTTTTCCAATACAACTTTTAACTTATCTCTATTACAAATATACA 1994

 51973186 CACAATTATTAATTAATTTATTAGTTTTCATTGATACCTAATAATTTTACTTTTTTATAG 51973245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1995 CACAATTATTAATTAATTTATTAGTTTTCATTGATACCTAATAATTTTACTTTTTTATAG 2054

 51973246 AGCACACAGGATGTTCTGTACACATATAGAATTTGTAACGATCCAATCAAGGTATTTAGG 51973305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2055 AGCACACAGGATGTTCTGTACACATATAGAATTTGTAACGATCCAATCAAGGTATTTAGG 2114

 51973306 TTATTCATCATCTCAAACATTTATAATTTCTTTGTGTTGAGTATGTCTCCAATCTTCTAC 51973365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2115 TTATTCATCATCTCAAACATTTATAATTTCTTTGTGTTGAGTATGTCTCCAATCTTCTAC 2174

 51973366 CTCTTCTGAAATATACAATAAACTCTATTTTTAACTACAGTCACTCTACTTGTCTCATAT 51973425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2175 CTCTTCTGAAATATACAATAAACTCTATTTTTAACTACAGTCACTCTACTTGTCTCATAT 2234

 51973426 GGTACCAAACTAGATCGTTGTTGTCTTGATAACACAGCATTATCATTATAGCTGTAATAC 51973485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2235 GGTACCAAACTAGATCGTTGTTGTCTTGATAACACAGCATTATCATTATAGCTGTAATAC 2294

 51973486 ATAATGCTGTACCTCCTCTCCTAACCCTGGAAGTTGCAATTCATCCTTCAATGCTCAGCT 51973545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2295 ATAATGCTGTACCTCCTCTCCTAACCCTGGAAGTTGCAATTCATCCTTCAATGCTCAGCT 2354

 51973546 CAAAGGATTATTGTCTCTAAAGTTTTAGCAAATGCTGAAGCAGAATTTCACCATTTAATG 51973605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2355 CAAAGGATTATTGTCTCTAAAGTTTTAGCAAATGCTGAAGCAGAATTTCACCATTTAATG 2414

 51973606 GGTTCACAAGCTGCTGCCTTTATAGCTTATGGTACATATGTTTGCCAATATAAATGATCC 51973665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2415 GGTTCACAAGCTGCTGCCTTTATAGCTTATGGTACATATGTTTGCCAATATAAATGATCC 2474

 51973666 ACTTGAGCTAAATTGCCACAGCTGCTACAACACCTCTTTACCTATTTTTGGAGCAAAACT 51973725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2475 ACTTGAGCTAAATTGCCACAGCTGCTACAACACCTCTTTACCTATTTTTGGAGCAAAACT 2534

 51973726 GAAAATCAGAAAAGTTTAACTTTTTCAAAATAATGAAAAATTTCTCTCCAATCCTCTCCA 51973785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2535 GAAAATCAGAAAAGTTTAACTTTTTCAAAATAATGAAAAATTTCTCTCCAATCCTCTCCA 2594

 51973786 TCATTATACATTAATAGGAAAAGAAAGGACAAAGACAAGGTTACAAATGTGAAAGGGTTA 51973845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2595 TCATTATACATTAATAGGAAAAGAAAGGACAAAGACAAGGTTACAAATGTGAAAGGGTTA 2654

 51973846 TTTTTTTCTATTCTGATAGAAATAAGTTTAGAGCACCTGCATGAACAACTTGTATTGAAC 51973905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2655 TTTTTTTCTATTCTGATAGAAATAAGTTTAGAGCACCTGCATGAACAACTTGTATTGAAC 2714

 51973906 AGCAATGCAAGGAACTGCATACCGAAAAGAAGAATCTCTTAGTGACAAGAACCGTGTTGA 51973965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2715 AGCAATGCAAGGAACTGCATACCGAAAAGAAGAATCTCTTAGTGACAAGAACCGTGTTGA 2774

 51973966 CCATGCAACACTATTAGCAAGTTTATTTTCATTCTTTATGTAGATGTCAGGGATATGTAG 51974025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2775 CCATGCAACACTATTAGCAAGTTTATTTTCATTCTTTATGTAGATGTCAGGGATATGTAG 2834

 51974026 CAAAAATACATTTTTAAGTGCAACAGAGTAGATGCTTGCAAAAACAGACTGTGATAACTA 51974085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2835 CAAAAATACATTTTTAAGTGCAACAGAGTAGATGCTTGCAAAAACAGACTGTGATAACTA 2894

 51974086 TCTATTTGCAAAAGTCAGTACAGATATGATTATCTCAGCATTAAATTGGCTGATGTAAAA 51974145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2895 TCTATTTGCAAAAGTCAGTACAGATATGATTATCTCAGCATTAAATTGGCTGATGTAAAA 2954

 51974146 TGGAAATCATGAAAATTAAGTCACCACACAATAAAATGACAATAGGTTCCTAAATCAATC 51974205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2955 TGGAAATCATGAAAATTAAGTCACCACACAATAAAATGACAATAGGTTCCTAAATCAATC 3014

 51974206 ATGAAAAATTTTCCCAATGAAGAAGGGACAACATAAAATTTTCCTTTGAGAAAGTCTCAG 51974265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3015 ATGAAAAATTTTCCCAATGAAGAAGGGACAACATAAAATTTTCCTTTGAGAAAGTCTCAG 3074

 51974266 TAATATTTGCTTAATATGCTGATAGGCTTATCAAGCTTCTTGAAAAAAAACTGATTTACA 51974325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3075 TAATATTTGCTTAATATGCTGATAGGCTTATCAAGCTTCTTGAAAAAAAACTGATTTACA 3134

 51974326 ATACAGTGGGGATTATTTTTTTTAAGTTGGAAGGGAAAGAAGGTTTGATGTAAGAGTGCT 51974385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3135 ATACAGTGGGGATTATTTTTTTTAAGTTGGAAGGGAAAGAAGGTTTGATGTAAGAGTGCT 3194

 51974386 TTGAAATGTGGAGTTTTCCTAAGTATTACTCCCACAAGACCATAGTCTTGAAATTAAATT 51974445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3195 TTGAAATGTGGAGTTTTCCTAAGTATTACTCCCACAAGACCATAGTCTTGAAATTAAATT 3254

 51974446 AGGCCTTTAGAATATCAGACAAAATAAATGGATTGTAATTTATTTCAATAGCTGAATGCT 51974505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3255 AGGCCTTTAGAATATCAGACAAAATAAATGGATTGTAATTTATTTCAATAGCTGAATGCT 3314

 51974506 TACTATTTTTCAAAGGATTAATTGAGATATATAATTCTTTATATAAGTAAAAGAAATTTT 51974565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3315 TACTATTTTTCAAAGGATTAATTGAGATATATAATTCTTTATATAAGTAAAAGAAATTTT 3374

 51974566 CTAACTTTCAGAAACATCTAAACTTAGTTTTCCACTAAGTTGTCTCTAACTCAACCCTCT 51974625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3375 CTAACTTTCAGAAACATCTAAACTTAGTTTTCCACTAAGTTGTCTCTAACTCAACCCTCT 3434

 51974626 TTTCACTTTTTTTATTATTTTAGAGCAGTAACATTTACTTCTGGAAAATCATCCAAATAA 51974685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3435 TTTCACTTTTTTTATTATTTTAGAGCAGTAACATTTACTTCTGGAAAATCATCCAAATAA 3494

 51974686 AACCAATTTACTTTCATAAAATCTAGACTTTTTGGATGTTAGAAGCATGATTTACCATCT 51974745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3495 AACCAATTTACTTTCATAAAATCTAGACTTTTTGGATGTTAGAAGCATGATTTACCATCT 3554

 51974746 CCTATTGGGACCTTATTCCAGAAATGATTTGCTCTTTCATTTGCTAATTGCATGACGATT 51974805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3555 CCTATTGGGACCTTATTCCAGAAATGATTTGCTCTTTCATTTGCTAATTGCATGACGATT 3614

 51974806 AGAATCTGGACCCAAGACCTTTTTAATGCATATAATTAAATATTTCAAACTTCTTACACT 51974865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3615 AGAATCTGGACCCAAGACCTTTTTAATGCATATAATTAAATATTTCAAACTTCTTACACT 3674

 51974866 TTTGATCTTCTGGTATCATATATTCAATTAATAGCATAATTCACATTCCCCTACATACCA 51974925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3675 TTTGATCTTCTGGTATCATATATTCAATTAATAGCATAATTCACATTCCCCTACATACCA 3734

 51974926 TGAAACTACCTTTTTCCTGATTATATTAATGTATACTAAACATAAAAAAAGAAATTATAT 51974985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3735 TGAAACTACCTTTTTCCTGATTATATTAATGTATACTAAACATAAAAAAAGAAATTATAT 3794

 51974986 AAAATAGTATTAGGACAATCACTTGAAATTTTCCACCGAGGGACAACTAGTCAAAATATT 51975045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3795 AAAATAGTATTAGGACAATCACTTGAAATTTTCCACCGAGGGACAACTAGTCAAAATATT 3854

 51975046 TCAGTGACCTCTGATATAACACTATCTGTGCATAGATATATTCACTTATAAAACATTTCT 51975105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3855 TCAGTGACCTCTGATATAACACTATCTGTGCATAGATATATTCACTTATAAAACATTTCT 3914

 51975106 ACATATGT 51975113
          ||||||||
     3915 ACATATGT 3922

Alignment time is 2.89355 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51963823,51984240] =>     20418 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [       1,    4638] =>      4638 nucs 'mol-32-2b3f-014378_4638'

Score:        4526
Aligned:      4614        nucs
Identic:      4606 (100%) nucs =>      3255 (100%)      1351 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51970562,51973823] EXCISED REGION [51974241,51975592]
 second seq =>  [      20,    3281] EXCISED REGION [    3287,    4638]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       417 nucs [51973824,51974240]
 second seq =>         5 nucs [3282,3286]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [51973823,51973823] to [51974240,51974240]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [51973822,51973823] to [51974241,51974242]
 second seq =>         2 nucs [3280,3281] to [3287,3288]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 51970562 TGCCGTCTACCTGGGTCTCTACACGACAAACCTGAGTTAGATGTAATGTAGAGATATGTT 51970621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       20 TGCCGTCTACCTGGGTCTCTACACGACAAACCTGAGTTAGATGTAATGTAGAGATATGTT 79

 51970622 TCCACATTGCCCTTCTTGGGGAAGGTGAGCCAGTTCTGAGGTGCCTGGTCCTAGTTGTCA 51970681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       80 TCCACATTGCCCTTCTTGGGGAAGGTGAGCCAGTTCTGAGGTGCCTGGTCCTAGTTGTCA 139

 51970682 CAGATGCAGTTATTTCACACTAGGCTGCCTGCCAGCCTGGATTTGTCTTCCTTTTTTTTT 51970741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      140 CAGATGCAGTTATTTCACACTAGGCTGCCTGCCAGCCTGGATTTGTCTTCCTTTTTTTTT 199

 51970742 TTTTTGTTTTCAATCTCCCTGGGCTTGCGTCATTACATCAACACATTCTGAAACATCTGT 51970801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      200 TTTTTGTTTTCAATCTCCCTGGGCTTGCGTCATTACATCAACACATTCTGAAACATCTGT 259

 51970802 CAGAATCCTTGCCAGTTCAAATTTACAAAAGTGCAATAATATTCTATCTCCCCATCACCA 51970861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      260 CAGAATCCTTGCCAGTTCAAATTTACAAAAGTGCAATAATATTCTATCTCCCCATCACCA 319

 51970862 CCAAATCTTGCTAAAATAAAATCATACATTTATTTATAAAAGTTTGTTGTTAAGAAAAAA 51970921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      320 CCAAATCTTGCTAAAATAAAATCATACATTTATTTATAAAAGTTTGTTGTTAAGAAAAAA 379

 51970922 ACTGAAAACATCATGAAGGTCTGAGAGAAATAAAGTGGAATTTAGAAGTATTGTATCCAT 51970981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
      380 ACTGAAAACATCATGAAGGTCTGAGAGAAATAAAGTGGAATTTAAAAGTATTGTATCCAT 439

 51970982 GTCATATGACATATAAAAGTTTGTAATCATTAAAGATGATGAGTAATATATGGTAAGGAA 51971041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
      440 GTCATATGACATATAAAAGTTTGTAATCATTAAAGATGATGAGTAATATATGGTGAGGAA 499

 51971042 TATTTGGAAAACTTCTTTCAGTGTTAAAAAAGAAAAATAAAGAAGAGTCAAATTGTATTG 51971101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      500 TATTTGGAAAACTTCTTTCAGTGTTAAAAAAGAAAAATAAAGAAGAGTCAAATTGTATTG 559

 51971102 CCTCAGTTTTATTAAACACTTATGTATTTTACATACATTTAAAAAACTTAGCCGGGTGTG 51971161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      560 CCTCAGTTTTATTAAACACTTATGTATTTTACATACATTTAAAAAACTTAGCCGGGTGTG 619

 51971162 GTGGCGCGCGCTTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACC 51971221
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      620 GTGGCGCGCGCTTGTAATCCCGGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACC 679

 51971222 TGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGTGGAAATTGTGCCACTGAACTCCAGCCTGGGGGATAG 51971281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      680 TGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGTGGAAATTGTGCCACTGAACTCCAGCCTGGGGGATAG 739

 51971282 GGCAAGATTCTGTCTCAAAAAAATAAAGGAAAAAAAAATTTTAATTTGAATAGTTCGCTA 51971341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      740 GGCAAGATTCTGTCTCAAAAAAATAAAGGAAAAAAAAATTTTAATTTGAATAGTTCGCTA 799

 51971342 GTGCTAAATGTTTATGGTTTTGAATCTGAATGTTTTCATAACATTTTATTTTTAGCGTAT 51971401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      800 GTGCTAAATGTTTATGGTTTTGAATCTGAATGTTTTCATAACATTTTATTTTTAGCGTAT 859

 51971402 TTTTTAGGTTTCCATATTCCAGTGTTGCTGCAACAAATACGTAATGTTTATAATCAGAAA 51971461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      860 TTTTTAGGTTTCCATATTCCAGTGTTGCTGCAACAAATACGTAATGTTTATAATCAGAAA 919

 51971462 AGCATTGTTAAATAACCTCTGCAAAAACTCTTTAATCTCCCTAATCTAGGGATAGGGAAT 51971521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      920 AGCATTGTTAAATAACCTCTGCAAAAACTCTTTAATCTCCCTAATCTAGGGATAGGGAAT 979

 51971522 TATTTTATCTATAATTTTAATTCTAATTGTTAGAGTGTGGCTGCCTGGAGCACTGACTTG 51971581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      980 TATTTTATCTATAATTTTAATTCTAATTGTTAGAGTGTGGCTGCCTGGAGCACTGACTTG 1039

 51971582 AAAATAAATCTGAAACCCATCAGGAAAAAATAATGTCAATTAACATTGGTTGTCATTTGT 51971641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1040 AAAATAAATCTGAAACCCATCAGGAAAAAATAATGTCAATTAACATTGGTTGTCATTTGT 1099

 51971642 TCAAGAGGAAAAAGTCGGAGCATGATACCCCATATTTGCCATGCATTCTGAAATGTTTTC 51971701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1100 TCAAGAGGAAAAAGTCGGAGCATGATACCCCATATTTGCCATGCATTCTGAAATGTTTTC 1159

 51971702 TTTTGTCTTTTACTTTAAAAAAAGATGGATGATTTTATTTATATATTAGAACTCATGATC 51971761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1160 TTTTGTCTTTTACTTTAAAAAAAGATGGATGATTTTATTTATATATTAGAACTCATGATC 1219

 51971762 TATATTTTCAACTCTGCTCCAGTAAGTCTCTTATTCATTTGGTTAAAGCACCAATTACAC 51971821
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1220 TGTATTTTCAACTCTGCTCCAGTAAGTCTCTTATTCATTTGGTTAAAGCACCAATTACAC 1279

 51971822 TTACCCCGTAGTTTCTGATTTTTGATAGGACATTAGGAGAAAGACCATACATTTAAGGGC 51971881
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     1280 TTACCCCGTAGTTTCTGATTTTTGATAGGACATTAGGAGAAAGACCATACATTTAAGGGA 1339

 51971882 AATGAAAATAAATATCTAAGATGAAGTGATTATTATAACTTTGCAATATGGATTGAACCT 51971941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1340 AATGAAAATAAATATCTAAGATGAAGTGATTATTATAACTTTGCAATATGGATTGAACCT 1399

 51971942 GGACTAAGTACTAGTGCTATATCAGGAAGCTGGATCAATTTGACACCTACTGAAAGTGAC 51972001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1400 GGACTAAGTACTAGTGCTATATCAGGAAGCTGGATCAATTTGACACCTACTGAAAGTGAC 1459

 51972002 ACATGGGCCTTGCTAAAGAAAGAGTTTAAATCTGGTAGTGCTTCAGAATTTTTATTTCAG 51972061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1460 ACATGGGCCTTGCTAAAGAAAGAGTTTAAATCTGGTAGTGCTTCAGAATTTTTATTTCAG 1519

 51972062 TGAGGTTCTGTAAAATTAAATTCATCTGGCATTGTGGGAAAAAGTTGTATTATATATGAA 51972121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1520 TGAGGTTCTGTAAAATTAAATTCATCTGGCATTGTGGGAAAAAGTTGTATTATATATGAA 1579

 51972122 CCAATTTCTTAAATAAGTGCAACTTAATCTTCTAAGAAACTTTAAAATATTTAATCTTGT 51972181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1580 CCAATTTCTTAAATAAGTGCAACTTAATCTTCTAAGAAACTTTAAAATATTTAATCTTGT 1639

 51972182 TGGGTATTTTTTTTTCCATTTTTTTCTTGCTATTTCTTTAGGGAAAAAAAACAGAATATA 51972241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1640 TGGGTATTTTTTTTTCCATTTTTTTCTTGCTATTTCTTTAGGGAAAAAAAACAGAATATA 1699

 51972242 TAACACTCTTCATTAGTATGGAACACACATACTATTTTATTTCCTATTTTAAAACTTAAT 51972301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1700 TAACACTCTTCATTAGTATGGAACACACATACTATTTTATTTCCTATTTTAAAACTTAAT 1759

 51972302 TACTCAAATACTCCATGAATTTATTAGCAATTGATCCAATATTTCCCTCTTTAATGTCAA 51972361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1760 TACTCAAATACTCCATGAATTTATTAGCAATTGATCCAATATTTCCCTCTTTAATGTCAA 1819

 51972362 TTGCTGCTCCCTTTTCCTTATGCATAGTACATGGATCCTCAGGATTCACTTACGCAGTCC 51972421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1820 TTGCTGCTCCCTTTTCCTTATGCATAGTACATGGATCCTCAGGATTCACTTACGCAGTCC 1879

 51972422 ACTGAGCAGTGGCCATTCACACTTTTAATGTGAGGAAGAGTGAGAGAAAGGAAAACAGAA 51972481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1880 ACTGAGCAGTGGCCATTCACACTTTTAATGTGAGGAAGAGTGAGAGAAAGGAAAACAGAA 1939

 51972482 ATTATTTCATACCAAAAGAGCCCCTGATTTTTCACTGCTTCTTTTGTTATTCACATACAG 51972541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1940 ATTATTTCATACCAAAAGAGCCCCTGATTTTTCACTGCTTCTTTTGTTATTCACATACAG 1999

 51972542 GAGGATATGTTCCTAATCACTTTTATGATGTGAACATGCCTGCACAGTTGCCACTGCTGC 51972601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2000 GAGGATATGTTCCTAATCACTTTTATGATGTGAACATGCCTGCACAGTTGCCACTGCTGC 2059

 51972602 ATCATGTTGGGGTTCCCAAATTTAGACCTTTTTCCACTTACACTTTGTTCTCAACCACTG 51972661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2060 ATCATGTTGGGGTTCCCAAATTTAGACCTTTTTCCACTTACACTTTGTTCTCAACCACTG 2119

 51972662 TGCCCTCAAAATGACCACTATTCCAGCATATCTGAGGTAAGAGAGAGCTTCTTGCCTGAG 51972721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2120 TGCCCTCAAAATGACCACTATTCCAGCATATCTGAGGTAAGAGAGAGCTTCTTGCCTGAG 2179

 51972722 ACACAAAGTGTGCCCAGAACTAGAATTCTGCTTCTAATACTCAAACTCTGGTGTTATGTT 51972781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2180 ACACAAAGTGTGCCCAGAACTAGAATTCTGCTTCTAATACTCAAACTCTGGTGTTATGTT 2239

 51972782 GGAGTTACCAGCCCAGACCTCTTCCTTTGTAATAAGTTTCCATTTGTGATCAGCAATGGC 51972841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2240 GGAGTTACCAGCCCAGACCTCTTCCTTTGTAATAAGTTTCCATTTGTGATCAGCAATGGC 2299

 51972842 CCTTTCTGGAACCATCTCAAGCCATCAGTGAAGTTTGACTAACTTTGAAAGGATGGGGGC 51972901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2300 CCTTTCTGGAACCATCTCAAGCCATCAGTGAAGTTTGACTAACTTTGAAAGGATGGGGGC 2359

 51972902 CTTGATCTTTTATTTTCTGAAGATTCCTGGCACACTATGCTAATGTACTCATATTCATTC 51972961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2360 CTTGATCTTTTATTTTCTGAAGATTCCTGGCACACTATGCTAATGTACTCATATTCATTC 2419

 51972962 CTCATACCTAGCTTTGTAAATGTAGAACTCAAACTTTTAAGAAGACACTCTCCACAGGAA 51973021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2420 CTCATACCTAGCTTTGTAAATGTAGAACTCAAACTTTTAAGAAGACACTCTCCACAGGAA 2479

 51973022 GTGGATATCTCTTTCCCAACATAAGTGAGGCCACAGATTAGCACAGACAATTAAAGAGGT 51973081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2480 GTGGATATCTCTTTCCCAACATAAGTGAGGCCACAGATTAGCACAGACAATTAAAGAGGT 2539

 51973082 AAAATCTGCCAAACGTTTTTTTTTTTATTCTAGCTTAGAAATGATTGGCAAGACTTAAGT 51973141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2540 AAAATCTGCCAAACGTTTTTTTTTTTATTCTAGCTTAGAAATGATTGGCAAGACTTAAGT 2599

 51973142 TTTTTCCAATACAACTTTTAACTTATCTCTATTACAAATATACACACAATTATTAATTAA 51973201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2600 TTTTTCCAATACAACTTTTAACTTATCTCTATTACAAATATACACACAATTATTAATTAA 2659

 51973202 TTTATTAGTTTTCATTGATACCTAATAATTTTACTTTTTTATAGAGCACACAGGATGTTC 51973261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2660 TTTATTAGTTTTCATTGATACCTAATAATTTTACTTTTTTATAGAGCACACAGGATGTTC 2719

 51973262 TGTACACATATAGAATTTGTAACGATCCAATCAAGGTATTTAGGTTATTCATCATCTCAA 51973321
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2720 TGTACACATATAGAATTTGTAACGGTCCAATCAAGGTATTTAGGTTATTCATCATCTCAA 2779

 51973322 ACATTTATAATTTCTTTGTGTTGAGTATGTCTCCAATCTTCTACCTCTTCTGAAATATAC 51973381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2780 ACATTTATAATTTCTTTGTGTTGAGTATGTCTCCAATCTTCTACCTCTTCTGAAATATAC 2839

 51973382 AATAAACTCTATTTTTAACTACAGTCACTCTACTTGTCTCATATGGTACCAAACTAGATC 51973441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     2840 AATAAACTCTATTTTTAACTACAGTCACTCTACTTGTCTCATATGGCACCAAACTAGATC 2899

 51973442 GTTGTTGTCTTGATAACACAGCATTATCATTATAGCTGTAATACATAATGCTGTACCTCC 51973501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2900 GTTGTTGTCTTGATAACACAGCATTATCATTATAGCTGTAATACATAATGCTGTACCTCC 2959

 51973502 TCTCCTAACCCTGGAAGTTGCAATTCATCCTTCAATGCTCAGCTCAAAGGATTATTGTCT 51973561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2960 TCTCCTAACCCTGGAAGTTGCAATTCATCCTTCAATGCTCAGCTCAAAGGATTATTGTCT 3019

 51973562 CTAAAGTTTTAGCAAATGCTGAAGCAGAATTTCACCATTTAATGGGTTCACAAGCTGCTG 51973621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3020 CTAAAGTTTTAGCAAATGCTGAAGCAGAATTTCACCATTTAATGGGTTCACAAGCTGCTG 3079

 51973622 CCTTTATAGCTTATGGTACATATGTTTGCCAATATAAATGATCCACTTGAGCTAAATTGC 51973681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3080 CCTTTATAGCTTATGGTACATATGTTTGCCAATATAAATGATCCACTTGAGCTAAATTGC 3139

 51973682 CACAGCTGCTACAACACCTCTTTACCTATTTTTGGAGCAAAACTGAAAATCAGAAAAGTT 51973741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3140 CACAGCTGCTACAACACCTCTTTACCTATTTTTGGAGCAAAACTGAAAATCAGAAAAGTT 3199

 51973742 TAACTTTTTCAAAATAATGAAAAATTTCTCTCCAATCCTCTCCATCATTATACATTAATA 51973801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3200 TAACTTTTTCAAAATAATGAAAAATTTCTCTCCAATCCTCTCCATCATTATACATTAATA 3259

 51973802 GGAAAAGAAAGGACAAAGACAA 51973823
          ||||||||||||||||||||||
     3260 GGAAAAGAAAGGACAAAGACAA 3281

EXCISED REGION

 51974241 AAATTTTCCTTTGAGAAAGTCTCAGTAATATTTGCTTAATATGCTGATAGGCTTATCAAG 51974300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3287 AAATTTTCCTTTGAGAAAGTCTCAGTAATATTTGCTTAATATGCTGATAGGCTTATCAAG 3346

 51974301 CTTCTTGAAAAAAAACTGATTTACAATACAGTGGGGATTATTTTTTTTAAGTTGGAAGGG 51974360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3347 CTTCTTGAAAAAAAACTGATTTACAATACAGTGGGGATTATTTTTTTTAAGTTGGAAGGG 3406

 51974361 AAAGAAGGTTTGATGTAAGAGTGCTTTGAAATGTGGAGTTTTCCTAAGTATTACTCCCAC 51974420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3407 AAAGAAGGTTTGATGTAAGAGTGCTTTGAAATGTGGAGTTTTCCTAAGTATTACTCCCAC 3466

 51974421 AAGACCATAGTCTTGAAATTAAATTAGGCCTTTAGAATATCAGACAAAATAAATGGATTG 51974480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3467 AAGACCATAGTCTTGAAATTAAATTAGGCCTTTAGAATATCAGACAAAATAAATGGATTG 3526

 51974481 TAATTTATTTCAATAGCTGAATGCTTACTATTTTTCAAAGGATTAATTGAGATATATAAT 51974540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3527 TAATTTATTTCAATAGCTGAATGCTTACTATTTTTCAAAGGATTAATTGAGATATATAAT 3586

 51974541 TCTTTATATAAGTAAAAGAAATTTTCTAACTTTCAGAAACATCTAAACTTAGTTTTCCAC 51974600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3587 TCTTTATATAAGTAAAAGAAATTTTCTAACTTTCAGAAACATCTAAACTTAGTTTTCCAC 3646

 51974601 TAAGTTGTCTCTAACTCAACCCTCTTTTCACTTTTTTTATTATTTTAGAGCAGTAACATT 51974660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3647 TAAGTTGTCTCTAACTCAACCCTCTTTTCACTTTTTTTATTATTTTAGAGCAGTAACATT 3706

 51974661 TACTTCTGGAAAATCATCCAAATAAAACCAATTTACTTTCATAAAATCTAGACTTTTTGG 51974720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3707 TACTTCTGGAAAATCATCCAAATAAAACCAATTTACTTTCATAAAATCTAGACTTTTTGG 3766

 51974721 ATGTTAGAAGCATGATTTACCATCTCCTATTGGGACCTTATTCCAGAAATGATTTGCTCT 51974780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3767 ATGTTAGAAGCATGATTTACCATCTCCTATTGGGACCTTATTCCAGAAATGATTTGCTCT 3826

 51974781 TTCATTTGCTAATTGCATGACGATTAGAATCTGGACCCAAGACCTTTTTAATGCATATAA 51974840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3827 TTCATTTGCTAATTGCATGACGATTAGAATCTGGACCCAAGACCTTTTTAATGCATATAA 3886

 51974841 TTAAATATTTCAAACTTCTTACACTTTTGATCTTCTGGTATCATATATTCAATTAATAGC 51974900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3887 TTAAATATTTCAAACTTCTTACACTTTTGATCTTCTGGTATCATATATTCAATTAATAGC 3946

 51974901 ATAATTCACATTCCCCTACATACCATGAAACTACCTTTTTCCTGATTATATTAATGTATA 51974960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3947 ATAATTCACATTCCCCTACATACCATGAAACTACCTTTTTCCTGATTATATTAATGTATA 4006

 51974961 CTAAACATAAAAAAAGAAATTATATAAAATAGTATTAGGACAATCACTTGAAATTTTCCA 51975020
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     4007 CTAAACATAAAAAAAGAAATTATATAAAATAATATTAGGACAATCACTTGAAATTTTCCA 4066

 51975021 CCGAGGGACAACTAGTCAAAATATTTCAGTGACCTCTGATATAACACTATCTGTGCATAG 51975080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4067 CCGAGGGACAACTAGTCAAAATATTTCAGTGACCTCTGATATAACACTATCTGTGCATAG 4126

 51975081 ATATATTCACTTATAAAACATTTCTACATATGTGGTAATAATTACAAAAGTGAGCACAAT 51975140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4127 ATATATTCACTTATAAAACATTTCTACATATGTGGTAATAATTACAAAAGTGAGCACAAT 4186

 51975141 TTTAAAAATAGCTTTCTCTTCACTCTTTAAACTTACCTCTTTATTTCTCTTCTGCTTTTC 51975200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4187 TTTAAAAATAGCTTTCTCTTCACTCTTTAAACTTACCTCTTTATTTCTCTTCTGCTTTTC 4246

 51975201 TATTTCCACATTTCTCATTTTCAATGGCCAGTATTTAGGGGCTTTGTGCTATCTTTCTAC 51975260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4247 TATTTCCACATTTCTCATTTTCAATGGCCAGTATTTAGGGGCTTTGTGCTATCTTTCTAC 4306

 51975261 ACTTTAAATTTTTTATATCAAATTTCATATGTACTTTTACAGTTTCAGAAGTCTTATTGT 51975320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4307 ACTTTAAATTTTTTATATCAAATTTCATATGTACTTTTACAGTTTCAGAAGTCTTATTGT 4366

 51975321 TTTTTACATGAGTGAGATCACAAGGTTTTATACTTAGTTTTAAAAAAATTTTCTCCTTCA 51975380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4367 TTTTTACATGAGTGAGATCACAAGGTTTTATACTTAGTTTTAAAAAAATTTTCTCCTTCA 4426

 51975381 ACAAATATAACTGGAATCCCTGTGAGTCAACCAAAATAGTTTTAACTAACTCTTCATAAT 51975440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4427 ACAAATATAACTGGAATCCCTGTGAGTCAACCAAAATAGTTTTAACTAACTCTTCATAAT 4486

 51975441 GGCTAGCTAAATGGAATTCTGTGGTAATACAAATTATTCTAAAATTCCAATATTTACACC 51975500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4487 GGCTAGCTAAATGGAATTCTGTGGTAATACAAATTATTCTAAAATTCCAATATTTACACC 4546

 51975501 CATTTTTTTTCACTCATGAAAGCACTGCAATAAGCAGCTTTTATAGATATTCTTAGGTAC 51975560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4547 CATTTTTTTTCACTCATGAAAGCACTGCAATAAGCAGCTTTTATAGATATTCTTAGGTAC 4606

 51975561 TATTAGGTGCTTTTCTTTTGGTGGAATGAAAC 51975592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||
     4607 TATTAGGTGCTTTTCTTTTGGTGGAATGAAAC 4638

Alignment time is 3.39195 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51963823,51984240] =>     20418 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [       1,    2063] =>      2063 nucs 'mol-32-2e20-136237_2063'

Score:        2036
Aligned:      2058        nucs
Identic:      2056 (100%) nucs =>      1216 (100%)       840 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51972607,51973823] EXCISED REGION [51974241,51975081]
 second seq =>  [       1,    1217] EXCISED REGION [    1223,    2063]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       417 nucs [51973824,51974240]
 second seq =>         5 nucs [1218,1222]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [51973823,51973823] to [51974240,51974240]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [51973822,51973823] to [51974241,51974242]
 second seq =>         2 nucs [1216,1217] to [1223,1224]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 51972607 GTTGGGGTTCCCAAATTTAGACCTTTTTCCACTTACACTTTGTTCTCAACCACTGTGCCC 51972666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTTGGGGTTCCCAAATTTAGACCTTTTTCCACTTACACTTTGTTCTCAACCACTGTGCCC 60

 51972667 TCAAAATGACCACTATTCCAGCATATCTGAGGTAAGAGAGAGCTTCTTGCCTGAGACACA 51972726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCAAAATGACCACTATTCCAGCATATCTGAGGTAAGAGAGAGCTTCTTGCCTGAGACACA 120

 51972727 AAGTGTGCCCAGAACTAGAATTCTGCTTCTAATACTCAAACTCTGGTGTTATGTTGGAGT 51972786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAGTGTGCCCAGAACTAGAATTCTGCTTCTAATACTCAAACTCTGGTGTTATGTTGGAGT 180

 51972787 TACCAGCCCAGACCTCTTCCTTTGTAATAAGTTTCCATTTGTGATCAGCAATGGCCCTTT 51972846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TACCAGCCCAGACCTCTTCCTTTGTAATAAGTTTCCATTTGTGATCAGCAATGGCCCTTT 240

 51972847 CTGGAACCATCTCAAGCCATCAGTGAAGTTTGACTAACTTTGAAAGGATGGGGGCCTTGA 51972906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTGGAACCATCTCAAGCCATCAGTGAAGTTTGACTAACTTTGAAAGGATGGGGGCCTTGA 300

 51972907 TCTTTTATTTTCTGAAGATTCCTGGCACACTATGCTAATGTACTCATATTCATTCCTCAT 51972966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCTTTTATTTTCTGAAGATTCCTGGCACACTATGCTAATGTACTCATATTCATTCCTCAT 360

 51972967 ACCTAGCTTTGTAAATGTAGAACTCAAACTTTTAAGAAGACACTCTCCACAGGAAGTGGA 51973026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACCTAGCTTTGTAAATGTAGAACTCAAACTTTTAAGAAGACACTCTCCACAGGAAGTGGA 420

 51973027 TATCTCTTTCCCAACATAAGTGAGGCCACAGATTAGCACAGACAATTAAAGAGGTAAAAT 51973086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TATCTCTTTCCCAACATAAGTGAGGCCACAGATTAGCACAGACAATTAAAGAGGTAAAAT 480

 51973087 CTGCCAAACGTTTTTTTTTTTATTCTAGCTTAGAAATGATTGGCAAGACTTAAGTTTTTT 51973146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTGCCAAACGTTTTTTTTTTTATTCTAGCTTAGAAATGATTGGCAAGACTTAAGTTTTTT 540

 51973147 CCAATACAACTTTTAACTTATCTCTATTACAAATATACACACAATTATTAATTAATTTAT 51973206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CCAATACAACTTTTAACTTATCTCTATTACAAATATACACACAATTATTAATTAATTTAT 600

 51973207 TAGTTTTCATTGATACCTAATAATTTTACTTTTTTATAGAGCACACAGGATGTTCTGTAC 51973266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TAGTTTTCATTGATACCTAATAATTTTACTTTTTTATAGAGCACACAGGATGTTCTGTAC 660

 51973267 ACATATAGAATTTGTAACGATCCAATCAAGGTATTTAGGTTATTCATCATCTCAAACATT 51973326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ACATATAGAATTTGTAACGATCCAATCAAGGTATTTAGGTTATTCATCATCTCAAACATT 720

 51973327 TATAATTTCTTTGTGTTGAGTATGTCTCCAATCTTCTACCTCTTCTGAAATATACAATAA 51973386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TATAATTTCTTTGTGTTGAGTATGTCTCCAATCTTCTACCTCTTCTGAAATATACAATAA 780

 51973387 ACTCTATTTTTAACTACAGTCACTCTACTTGTCTCATATGGTACCAAACTAGATCGTTGT 51973446
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
      781 ACTCTATTTTTAACTACAGTCACTCTACTTGTCTCATATGGCACCAAACTAGATCGTTGT 840

 51973447 TGTCTTGATAACACAGCATTATCATTATAGCTGTAATACATAATGCTGTACCTCCTCTCC 51973506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGTCTTGATAACACAGCATTATCATTATAGCTGTAATACATAATGCTGTACCTCCTCTCC 900

 51973507 TAACCCTGGAAGTTGCAATTCATCCTTCAATGCTCAGCTCAAAGGATTATTGTCTCTAAA 51973566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TAACCCTGGAAGTTGCAATTCATCCTTCAATGCTCAGCTCAAAGGATTATTGTCTCTAAA 960

 51973567 GTTTTAGCAAATGCTGAAGCAGAATTTCACCATTTAATGGGTTCACAAGCTGCTGCCTTT 51973626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GTTTTAGCAAATGCTGAAGCAGAATTTCACCATTTAATGGGTTCACAAGCTGCTGCCTTT 1020

 51973627 ATAGCTTATGGTACATATGTTTGCCAATATAAATGATCCACTTGAGCTAAATTGCCACAG 51973686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATAGCTTATGGTACATATGTTTGCCAATATAAATGATCCACTTGAGCTAAATTGCCACAG 1080

 51973687 CTGCTACAACACCTCTTTACCTATTTTTGGAGCAAAACTGAAAATCAGAAAAGTTTAACT 51973746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTGCTACAACACCTCTTTACCTATTTTTGGAGCAAAACTGAAAATCAGAAAAGTTTAACT 1140

 51973747 TTTTCAAAATAATGAAAAATTTCTCTCCAATCCTCTCCATCATTATACATTAATAGGAAA 51973806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTTTCAAAATAATGAAAAATTTCTCTCCAATCCTCTCCATCATTATACATTAATAGGAAA 1200

 51973807 AGAAAGGACAAAGACAA 51973823
          |||||||||||||||||
     1201 AGAAAGGACAAAGACAA 1217

EXCISED REGION

 51974241 AAATTTTCCTTTGAGAAAGTCTCAGTAATATTTGCTTAATATGCTGATAGGCTTATCAAG 51974300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1223 AAATTTTCCTTTGAGAAAGTCTCAGTAATATTTGCTTAATATGCTGATAGGCTTATCAAG 1282

 51974301 CTTCTTGAAAAAAAACTGATTTACAATACAGTGGGGATTATTTTTTTTAAGTTGGAAGGG 51974360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1283 CTTCTTGAAAAAAAACTGATTTACAATACAGTGGGGATTATTTTTTTTAAGTTGGAAGGG 1342

 51974361 AAAGAAGGTTTGATGTAAGAGTGCTTTGAAATGTGGAGTTTTCCTAAGTATTACTCCCAC 51974420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1343 AAAGAAGGTTTGATGTAAGAGTGCTTTGAAATGTGGAGTTTTCCTAAGTATTACTCCCAC 1402

 51974421 AAGACCATAGTCTTGAAATTAAATTAGGCCTTTAGAATATCAGACAAAATAAATGGATTG 51974480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1403 AAGACCATAGTCTTGAAATTAAATTAGGCCTTTAGAATATCAGACAAAATAAATGGATTG 1462

 51974481 TAATTTATTTCAATAGCTGAATGCTTACTATTTTTCAAAGGATTAATTGAGATATATAAT 51974540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1463 TAATTTATTTCAATAGCTGAATGCTTACTATTTTTCAAAGGATTAATTGAGATATATAAT 1522

 51974541 TCTTTATATAAGTAAAAGAAATTTTCTAACTTTCAGAAACATCTAAACTTAGTTTTCCAC 51974600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1523 TCTTTATATAAGTAAAAGAAATTTTCTAACTTTCAGAAACATCTAAACTTAGTTTTCCAC 1582

 51974601 TAAGTTGTCTCTAACTCAACCCTCTTTTCACTTTTTTTATTATTTTAGAGCAGTAACATT 51974660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1583 TAAGTTGTCTCTAACTCAACCCTCTTTTCACTTTTTTTATTATTTTAGAGCAGTAACATT 1642

 51974661 TACTTCTGGAAAATCATCCAAATAAAACCAATTTACTTTCATAAAATCTAGACTTTTTGG 51974720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1643 TACTTCTGGAAAATCATCCAAATAAAACCAATTTACTTTCATAAAATCTAGACTTTTTGG 1702

 51974721 ATGTTAGAAGCATGATTTACCATCTCCTATTGGGACCTTATTCCAGAAATGATTTGCTCT 51974780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1703 ATGTTAGAAGCATGATTTACCATCTCCTATTGGGACCTTATTCCAGAAATGATTTGCTCT 1762

 51974781 TTCATTTGCTAATTGCATGACGATTAGAATCTGGACCCAAGACCTTTTTAATGCATATAA 51974840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1763 TTCATTTGCTAATTGCATGACGATTAGAATCTGGACCCAAGACCTTTTTAATGCATATAA 1822

 51974841 TTAAATATTTCAAACTTCTTACACTTTTGATCTTCTGGTATCATATATTCAATTAATAGC 51974900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1823 TTAAATATTTCAAACTTCTTACACTTTTGATCTTCTGGTATCATATATTCAATTAATAGC 1882

 51974901 ATAATTCACATTCCCCTACATACCATGAAACTACCTTTTTCCTGATTATATTAATGTATA 51974960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1883 ATAATTCACATTCCCCTACATACCATGAAACTACCTTTTTCCTGATTATATTAATGTATA 1942

 51974961 CTAAACATAAAAAAAGAAATTATATAAAATAGTATTAGGACAATCACTTGAAATTTTCCA 51975020
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     1943 CTAAACATAAAAAAAGAAATTATATAAAATAATATTAGGACAATCACTTGAAATTTTCCA 2002

 51975021 CCGAGGGACAACTAGTCAAAATATTTCAGTGACCTCTGATATAACACTATCTGTGCATAG 51975080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2003 CCGAGGGACAACTAGTCAAAATATTTCAGTGACCTCTGATATAACACTATCTGTGCATAG 2062

 51975081 A 51975081
          |
     2063 A 2063

Alignment time is 1.54984 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51963823,51984240] =>     20418 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [       1,    2166] =>      2166 nucs 'mol-32-2ee6-093161_2166'

Score:        2165
Aligned:      2165        nucs
Identic:      2165 (100%) nucs =>      1657 (100%)       508 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51972242,51973898] EXCISED REGION [51973900,51974407]
 second seq =>  [       1,    1657] EXCISED REGION [    1659,    2166]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [51973899,51973899]
 second seq =>         1 nucs [1658,1658]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [51973898,51973898] to [51973900,51973900]
 second seq =>         1 nucs [1657,1657] to [1659,1659]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 51972242 TAACACTCTTCATTAGTATGGAACACACATACTATTTTATTTCCTATTTTAAAACTTAAT 51972301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TAACACTCTTCATTAGTATGGAACACACATACTATTTTATTTCCTATTTTAAAACTTAAT 60

 51972302 TACTCAAATACTCCATGAATTTATTAGCAATTGATCCAATATTTCCCTCTTTAATGTCAA 51972361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TACTCAAATACTCCATGAATTTATTAGCAATTGATCCAATATTTCCCTCTTTAATGTCAA 120

 51972362 TTGCTGCTCCCTTTTCCTTATGCATAGTACATGGATCCTCAGGATTCACTTACGCAGTCC 51972421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTGCTGCTCCCTTTTCCTTATGCATAGTACATGGATCCTCAGGATTCACTTACGCAGTCC 180

 51972422 ACTGAGCAGTGGCCATTCACACTTTTAATGTGAGGAAGAGTGAGAGAAAGGAAAACAGAA 51972481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACTGAGCAGTGGCCATTCACACTTTTAATGTGAGGAAGAGTGAGAGAAAGGAAAACAGAA 240

 51972482 ATTATTTCATACCAAAAGAGCCCCTGATTTTTCACTGCTTCTTTTGTTATTCACATACAG 51972541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATTATTTCATACCAAAAGAGCCCCTGATTTTTCACTGCTTCTTTTGTTATTCACATACAG 300

 51972542 GAGGATATGTTCCTAATCACTTTTATGATGTGAACATGCCTGCACAGTTGCCACTGCTGC 51972601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GAGGATATGTTCCTAATCACTTTTATGATGTGAACATGCCTGCACAGTTGCCACTGCTGC 360

 51972602 ATCATGTTGGGGTTCCCAAATTTAGACCTTTTTCCACTTACACTTTGTTCTCAACCACTG 51972661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATCATGTTGGGGTTCCCAAATTTAGACCTTTTTCCACTTACACTTTGTTCTCAACCACTG 420

 51972662 TGCCCTCAAAATGACCACTATTCCAGCATATCTGAGGTAAGAGAGAGCTTCTTGCCTGAG 51972721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGCCCTCAAAATGACCACTATTCCAGCATATCTGAGGTAAGAGAGAGCTTCTTGCCTGAG 480

 51972722 ACACAAAGTGTGCCCAGAACTAGAATTCTGCTTCTAATACTCAAACTCTGGTGTTATGTT 51972781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACACAAAGTGTGCCCAGAACTAGAATTCTGCTTCTAATACTCAAACTCTGGTGTTATGTT 540

 51972782 GGAGTTACCAGCCCAGACCTCTTCCTTTGTAATAAGTTTCCATTTGTGATCAGCAATGGC 51972841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGAGTTACCAGCCCAGACCTCTTCCTTTGTAATAAGTTTCCATTTGTGATCAGCAATGGC 600

 51972842 CCTTTCTGGAACCATCTCAAGCCATCAGTGAAGTTTGACTAACTTTGAAAGGATGGGGGC 51972901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CCTTTCTGGAACCATCTCAAGCCATCAGTGAAGTTTGACTAACTTTGAAAGGATGGGGGC 660

 51972902 CTTGATCTTTTATTTTCTGAAGATTCCTGGCACACTATGCTAATGTACTCATATTCATTC 51972961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTTGATCTTTTATTTTCTGAAGATTCCTGGCACACTATGCTAATGTACTCATATTCATTC 720

 51972962 CTCATACCTAGCTTTGTAAATGTAGAACTCAAACTTTTAAGAAGACACTCTCCACAGGAA 51973021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTCATACCTAGCTTTGTAAATGTAGAACTCAAACTTTTAAGAAGACACTCTCCACAGGAA 780

 51973022 GTGGATATCTCTTTCCCAACATAAGTGAGGCCACAGATTAGCACAGACAATTAAAGAGGT 51973081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GTGGATATCTCTTTCCCAACATAAGTGAGGCCACAGATTAGCACAGACAATTAAAGAGGT 840

 51973082 AAAATCTGCCAAACGTTTTTTTTTTTATTCTAGCTTAGAAATGATTGGCAAGACTTAAGT 51973141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAAATCTGCCAAACGTTTTTTTTTTTATTCTAGCTTAGAAATGATTGGCAAGACTTAAGT 900

 51973142 TTTTTCCAATACAACTTTTAACTTATCTCTATTACAAATATACACACAATTATTAATTAA 51973201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTTTTCCAATACAACTTTTAACTTATCTCTATTACAAATATACACACAATTATTAATTAA 960

 51973202 TTTATTAGTTTTCATTGATACCTAATAATTTTACTTTTTTATAGAGCACACAGGATGTTC 51973261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTTATTAGTTTTCATTGATACCTAATAATTTTACTTTTTTATAGAGCACACAGGATGTTC 1020

 51973262 TGTACACATATAGAATTTGTAACGATCCAATCAAGGTATTTAGGTTATTCATCATCTCAA 51973321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGTACACATATAGAATTTGTAACGATCCAATCAAGGTATTTAGGTTATTCATCATCTCAA 1080

 51973322 ACATTTATAATTTCTTTGTGTTGAGTATGTCTCCAATCTTCTACCTCTTCTGAAATATAC 51973381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ACATTTATAATTTCTTTGTGTTGAGTATGTCTCCAATCTTCTACCTCTTCTGAAATATAC 1140

 51973382 AATAAACTCTATTTTTAACTACAGTCACTCTACTTGTCTCATATGGTACCAAACTAGATC 51973441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AATAAACTCTATTTTTAACTACAGTCACTCTACTTGTCTCATATGGTACCAAACTAGATC 1200

 51973442 GTTGTTGTCTTGATAACACAGCATTATCATTATAGCTGTAATACATAATGCTGTACCTCC 51973501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GTTGTTGTCTTGATAACACAGCATTATCATTATAGCTGTAATACATAATGCTGTACCTCC 1260

 51973502 TCTCCTAACCCTGGAAGTTGCAATTCATCCTTCAATGCTCAGCTCAAAGGATTATTGTCT 51973561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TCTCCTAACCCTGGAAGTTGCAATTCATCCTTCAATGCTCAGCTCAAAGGATTATTGTCT 1320

 51973562 CTAAAGTTTTAGCAAATGCTGAAGCAGAATTTCACCATTTAATGGGTTCACAAGCTGCTG 51973621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CTAAAGTTTTAGCAAATGCTGAAGCAGAATTTCACCATTTAATGGGTTCACAAGCTGCTG 1380

 51973622 CCTTTATAGCTTATGGTACATATGTTTGCCAATATAAATGATCCACTTGAGCTAAATTGC 51973681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CCTTTATAGCTTATGGTACATATGTTTGCCAATATAAATGATCCACTTGAGCTAAATTGC 1440

 51973682 CACAGCTGCTACAACACCTCTTTACCTATTTTTGGAGCAAAACTGAAAATCAGAAAAGTT 51973741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CACAGCTGCTACAACACCTCTTTACCTATTTTTGGAGCAAAACTGAAAATCAGAAAAGTT 1500

 51973742 TAACTTTTTCAAAATAATGAAAAATTTCTCTCCAATCCTCTCCATCATTATACATTAATA 51973801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TAACTTTTTCAAAATAATGAAAAATTTCTCTCCAATCCTCTCCATCATTATACATTAATA 1560

 51973802 GGAAAAGAAAGGACAAAGACAAGGTTACAAATGTGAAAGGGTTATTTTTTTCTATTCTGA 51973861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GGAAAAGAAAGGACAAAGACAAGGTTACAAATGTGAAAGGGTTATTTTTTTCTATTCTGA 1620

 51973862 TAGAAATAAGTTTAGAGCACCTGCATGAACAACTTGT 51973898
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TAGAAATAAGTTTAGAGCACCTGCATGAACAACTTGT 1657

EXCISED REGION

 51973900 TTGAACAGCAATGCAAGGAACTGCATACCGAAAAGAAGAATCTCTTAGTGACAAGAACCG 51973959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1659 TTGAACAGCAATGCAAGGAACTGCATACCGAAAAGAAGAATCTCTTAGTGACAAGAACCG 1718

 51973960 TGTTGACCATGCAACACTATTAGCAAGTTTATTTTCATTCTTTATGTAGATGTCAGGGAT 51974019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1719 TGTTGACCATGCAACACTATTAGCAAGTTTATTTTCATTCTTTATGTAGATGTCAGGGAT 1778

 51974020 ATGTAGCAAAAATACATTTTTAAGTGCAACAGAGTAGATGCTTGCAAAAACAGACTGTGA 51974079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1779 ATGTAGCAAAAATACATTTTTAAGTGCAACAGAGTAGATGCTTGCAAAAACAGACTGTGA 1838

 51974080 TAACTATCTATTTGCAAAAGTCAGTACAGATATGATTATCTCAGCATTAAATTGGCTGAT 51974139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1839 TAACTATCTATTTGCAAAAGTCAGTACAGATATGATTATCTCAGCATTAAATTGGCTGAT 1898

 51974140 GTAAAATGGAAATCATGAAAATTAAGTCACCACACAATAAAATGACAATAGGTTCCTAAA 51974199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1899 GTAAAATGGAAATCATGAAAATTAAGTCACCACACAATAAAATGACAATAGGTTCCTAAA 1958

 51974200 TCAATCATGAAAAATTTTCCCAATGAAGAAGGGACAACATAAAATTTTCCTTTGAGAAAG 51974259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1959 TCAATCATGAAAAATTTTCCCAATGAAGAAGGGACAACATAAAATTTTCCTTTGAGAAAG 2018

 51974260 TCTCAGTAATATTTGCTTAATATGCTGATAGGCTTATCAAGCTTCTTGAAAAAAAACTGA 51974319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2019 TCTCAGTAATATTTGCTTAATATGCTGATAGGCTTATCAAGCTTCTTGAAAAAAAACTGA 2078

 51974320 TTTACAATACAGTGGGGATTATTTTTTTTAAGTTGGAAGGGAAAGAAGGTTTGATGTAAG 51974379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2079 TTTACAATACAGTGGGGATTATTTTTTTTAAGTTGGAAGGGAAAGAAGGTTTGATGTAAG 2138

 51974380 AGTGCTTTGAAATGTGGAGTTTTCCTAA 51974407
          ||||||||||||||||||||||||||||
     2139 AGTGCTTTGAAATGTGGAGTTTTCCTAA 2166

Alignment time is 1.58682 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51963823,51984240] =>     20418 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [       1,    8923] =>      8923 nucs 'mol-32-2efc-044596_8923'

Score:        8786
Aligned:      8918        nucs
Identic:      8906 (100%) nucs =>      6148 (100%)      2758 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51967669,51973823] EXCISED REGION [51974241,51977003]
 second seq =>  [       1,    6155] EXCISED REGION [    6161,    8923]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       417 nucs [51973824,51974240]
 second seq =>         5 nucs [6156,6160]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [51973823,51973823] to [51974240,51974240]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [51973822,51973823] to [51974241,51974242]
 second seq =>         2 nucs [6154,6155] to [6161,6162]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 51967669 TAAATTTTGTTATTCACTCCCTTTTCCTATTGTCTTATTTTCTTCCTTAACATATTTTTA 51967728
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TAAATTTTGTTATTCACTCCCTTCTCCTATTGTCTTATTTTCTTCCTTAACATATTTTTA 60

 51967729 TATTTCCTATTTTAGCGATTTTAAATTCTTTCTGGAACGACGTTGGCACAAATCAAAAAT 51967788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TATTTCCTATTTTAGCGATTTTAAATTCTTTCTGGAACGACGTTGGCACAAATCAAAAAT 120

 51967789 TAAATCTTATAAAGTGCTCTATGGTCATAGGCAAAATGGAATCTGTAGATAATCAAGTTC 51967848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TAAATCTTATAAAGTGCTCTATGGTCATAGGCAAAATGGAATCTGTAGATAATCAAGTTC 180

 51967849 CTGAAGGGATGTGAAACCAACTGCTACAAGGATAAGCTAGAAGAATCAGAGATTTTTGGC 51967908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTGAAGGGATGTGAAACCAACTGCTACAAGGATAAGCTAGAAGAATCAGAGATTTTTGGC 240

 51967909 CTGAAGCACACACAGAAGACTACTTTTAGAGGGGTCTGATGTCACTAACTTCTTGAGATT 51967968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTGAAGCACACACAGAAGACTACTTTTAGAGGGGTCTGATGTCACTAACTTCTTGAGATT 300

 51967969 GCTGCCATTTTTAACATACAGCTAGCTGGATAGAAGAAGACAGTCTCAGATAAATGACCA 51968028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GCTGCCATTTTTAACATACAGCTAGCTGGATAGAAGAAGACAGTCTCAGATAAATGACCA 360

 51968029 GTTCAGGCCACCAATGTCTCCTTCCAAAAAGGCCTGTACTGCTGTACATGCCAAGGGTTA 51968088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTTCAGGCCACCAATGTCTCCTTCCAAAAAGGCCTGTACTGCTGTACATGCCAAGGGTTA 420

 51968089 GAGATTTTGGGGCCAACTTTTTCCAGCATGTCTTATATCCTTCAATAAGTTGGTTACTTT 51968148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GAGATTTTGGGGCCAACTTTTTCCAGCATGTCTTATATCCTTCAATAAGTTGGTTACTTT 480

 51968149 GCAAAACATTAGACCACTTAATAATCAATTTCCTCCATGGATTCACTCATACTTTGTCCT 51968208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GCAAAACATTAGACCACTTAATAATCAATTTCCTCCATGGATTCACTCATACTTTGTCCT 540

 51968209 CACACTATTCTGGACTCCTTTCTCTTGATTTTATTTCTCCAAGTGATTCAATTGTGTCTT 51968268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CACACTATTCTGGACTCCTTTCTCTTGATTTTATTTCTCCAAGTGATTCAATTGTGTCTT 600

 51968269 TTGGGACACTTATAAGTAAACATTTCCACATCCTCAGCTTTATCACAGAATTTTCACTTC 51968328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTGGGACACTTATAAGTAAACATTTCCACATCCTCAGCTTTATCACAGAATTTTCACTTC 660

 51968329 CTTGCCTTAAGTGTCCCTGGAGGCTGCTGATCTTACAAGTAAATGTCTGGAGATAGGGTT 51968388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTTGCCTTAAGTGTCCCTGGAGGCTGCTGATCTTACAAGTAAATGTCTGGAGATAGGGTT 720

 51968389 GACAGCTCTTGAAGGCAGTGCCATTATGAAATCAATCCTAGTCTAAGTAGACATTTTGGG 51968448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GACAGCTCTTGAAGGCAGTGCCATTATGAAATCAATCCTAGTCTAAGTAGACATTTTGGG 780

 51968449 TACCATGCCTTCTTATCTACTTTTGGGCTGTGAGCATCCAGTCATTTTATTTTACCGTAC 51968508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TACCATGCCTTCTTATCTACTTTTGGGCTGTGAGCATCCAGTCATTTTATTTTACCGTAC 840

 51968509 AACTAGAGGTAACTTCTTAAAGTACCAAGTATATCATTCCCTGGTTTAAAGACCTTTAAC 51968568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AACTAGAGGTAACTTCTTAAAGTACCAAGTATATCATTCCCTGGTTTAAAGACCTTTAAC 900

 51968569 TGTTAACTATTGCTCTGCATATAAAATCTTAACTTTTGCCATAACTAACAGGGATCTTCT 51968628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGTTAACTATTGCTCTGCATATAAAATCTTAACTTTTGCCATAACTAACAGGGATCTTCT 960

 51968629 TGATCTAATTCCATCTCAGATCTTAATGTTGTCTACCTGCTGTGCCTGAGGTTTACTGAG 51968688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGATCTAATTCCATCTCAGATCTTAATGTTGTCTACCTGCTGTGCCTGAGGTTTACTGAG 1020

 51968689 TTGCTGACACTTCCTAAAACATGCCTTGTTCTCTTACTTTTGGGCCTTCCGGACACCAGC 51968748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTGCTGACACTTCCTAAAACATGCCTTGTTCTCTTACTTTTGGGCCTTCCGGACACCAGC 1080

 51968749 TTTGCTTTCTTGGCCCCACTGAGGGGGCTTATTTTGTAGATGTCGTTATTTTCGGAGAGG 51968808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTTGCTTTCTTGGCCCCACTGAGGGGGCTTATTTTGTAGATGTCGTTATTTTCGGAGAGG 1140

 51968809 CTTCTATGAACCACCACCCTCTCTGCAAATTAGGTACTTTTTCTTAGTGCACTCGTCCTC 51968868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTTCTATGAACCACCACCCTCTCTGCAAATTAGGTACTTTTTCTTAGTGCACTCGTCCTC 1200

 51968869 CTTGATCTTATCCTACTGCGACAAAATAATTCTTGTAATTGTATGTGTCCACAAATACAC 51968928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CTTGATCTTATCCTACTGCGACAAAATAATTCTTGTAATTGTATGTGTCCACAAATACAC 1260

 51968929 TATACATTTTCTATGAATGAAGATTATATCTGCAGCATTCAGTAGCATAACAGAGACTCA 51968988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TATACATTTTCTATGAATGAAGATTATATCTGCAGCATTCAGTAGCATAACAGAGACTCA 1320

 51968989 ATAAATATGTATTGAAATGAATTAAATTTAATAGCTGATTACAAATAACTGGCTCTAACA 51969048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ATAAATATGTATTGAAATGAATTAAATTTAATAGCTGATTACAAATAACTGGCTCTAACA 1380

 51969049 TAAAAGTAGAGATAAGTTTGCTTTCATTCATGTAAAGTAGCAGATGTGAAACCAATGAGG 51969108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TAAAAGTAGAGATAAGTTTGCTTTCATTCATGTAAAGTAGCAGATGTGAAACCAATGAGG 1440

 51969109 GAGCATTATTGGGGGCATATTTTAATCAAAACTACTGAAAAATCTGAAAGAATTATGTAA 51969168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GAGCATTATTGGGGGCATATTTTAATCAAAACTACTGAAAAATCTGAAAGAATTATGTAA 1500

 51969169 AGATAAAGTATGCTGTCTTGAGATGTGGTGAGTTTTTCACCAGAATGACTAAAATATGCC 51969228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AGATAAAGTATGCTGTCTTGAGATGTGGTGAGTTTTTCACCAGAATGACTAAAATATGCC 1560

 51969229 TTAGATCATTAGTCCCCAAACCTTCCTTCTTGTGTACAGACTTCTATTAGTTTTATTTTT 51969288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTAGATCATTAGTCCCCAAACCTTCCTTCTTGTGTACAGACTTCTATTAGTTTTATTTTT 1620

 51969289 CTTCTTTTTAAGTAGATATATTTCTATAGCCAAAAAATATAGATTTGTTTCCGTTATAAA 51969348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CTTCTTTTTAAGTAGATATATTTCTATAGCCAAAAAATATAGATTTGTTTCCGTTATAAA 1680

 51969349 AATGTGCTATTGCGCTAGTATGTTATAATAATCATGAAGCCTGCTATAATACATAAAATA 51969408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AATGTGCTATTGCGCTAGTATGTTATAATAATCATGAAGCCTGCTATAATACATAAAATA 1740

 51969409 GACTACTTAGAGAATAAATGTAAAAAATTTTCTAGTACTTTTTCCTGTGTCTTAATGAAT 51969468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GACTACTTAGAGAATAAATGTAAAAAATTTTCTAGTACTTTTTCCTGTGTCTTAATGAAT 1800

 51969469 TGCTTTGTGTACCACCCTGGGTCCTTGCTCTACATTTTGAAATAATTGTAAGGCTATGAT 51969528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TGCTTTGTGTACCACCCTGGGTCCTTGCTCTACATTTTGAAATAATTGTAAGGCTATGAT 1860

 51969529 TAAATTTTAAACATGATAATATTTTTAATGAATATAGTATAGATTTTTGCCTTGAAATTC 51969588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TAAATTTTAAACATGATAATATTTTTAATGAATATAGTATAGATTTTTGCCTTGAAATTC 1920

 51969589 TTATTTTGAAAACAATATTGAATTTAGGCCAAAGAAAAATGTACTTACTTTGTTATCCTT 51969648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTATTTTGAAAACAATATTGAATTTAGGCCAAAGAAAAATGTACTTACTTTGTTATCCTT 1980

 51969649 TTTAGCAAAATCAAATTGCTAATGGCAGTGTTTAGCGTTTTCTGTATGTTGATGACTATG 51969708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TTTAGCAAAATCAAATTGCTAATGGCAGTGTTTAGCGTTTTCTGTATGTTGATGACTATG 2040

 51969709 CTTCAGTGGCGTAAAATCTAATGCAATAAACCAGCATTTACTAGTTGTGGCATAATGCAA 51969768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CTTCAGTGGCGTAAAATCTAATGCAATAAACCAGCATTTACTAGTTGTGGCATAATGCAA 2100

 51969769 GAAAGCATCATTTTGCTAAGGGATATCTAGGGATTACTAGTTCTCTCTCTTTCTGGTCAG 51969828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GAAAGCATCATTTTGCTAAGGGATATCTAGGGATTACTAGTTCTCTCTCTTTCTGGTCAG 2160

 51969829 ATTTAGTCCTAAACTCCATAAGGCATTTACTAACATCTACTTTCAAATGATGAACAACTG 51969888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ATTTAGTCCTAAACTCCATAAGGCATTTACTAACATCTACTTTCAAATGATGAACAACTG 2220

 51969889 TCCTGATCAAAGGAAGATGAAAACACAAAATTCTTTATTCTGGAAAACACATCTCCCTAG 51969948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TCCTGATCAAAGGAAGATGAAAACACAAAATTCTTTATTCTGGAAAACACATCTCCCTAG 2280

 51969949 AGTGTCTCCGCTGCACACTCTTCCACCTTGCATATTTGTATATTCAGACACTAGAAAATT 51970008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AGTGTCTCCGCTGCACACTCTTCCACCTTGCATATTTGTATATTCAGACACTAGAAAATT 2340

 51970009 CACGTGAAAGGAGCCTCCACTTTACCAATTATCAGAAATATGCAAGTGAATTTAATATCA 51970068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CACGTGAAAGGAGCCTCCACTTTACCAATTATCAGAAATATGCAAGTGAATTTAATATCA 2400

 51970069 CTAATAGTTGGCATGTCAATGATTAGATAATCTATTTGAAATGCTTATTCTATAAAGTTG 51970128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CTAATAGTTGGCATGTCAATGATTAGATAATCTATTTGAAATGCTTATTCTATAAAGTTG 2460

 51970129 TATTTTAACCAACAGTTTTATGAAGAGTGTTCAGTCCTCATAAAATCATCTCAGTTCCCA 51970188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TATTTTAACCAACAGTTTTATGAAGAGTGTTCAGTCCTCATAAAATCATCTCAGTTCCCA 2520

 51970189 TTTGTGCACTCAGAAACTTACCACTGTGTTCTGTTTTTATCTTTATAATCTATATTTAAC 51970248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TTTGTGCACTCAGAAACTTACCACTGTGTTCTGTTTTTATCTTTATAATCTATATTTAAC 2580

 51970249 AATTGCATTGTATCTTCCCTGGTCTCCAGCTCTAAGCAAATAAATACTCTTCTTCTTTCT 51970308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AATTGCATTGTATCTTCCCTGGTCTCCAGCTCTAAGCAAATAAATACTCTTCTTCTTTCT 2640

 51970309 TTTTTCTTGTATATAAATGATTACAGAGAATGGGACAGAGAGAGAAAATGAAGAGACATA 51970368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TTTTTCTTGTATATAAATGATTACAGAGAATGGGACAGAGAGAGAAAATGAAGAGACATA 2700

 51970369 GTTAGAGAGATACACAGGCACAGAGAGAGAGAGAGAGAAAAAGAGGAGGAGAAGAGAAGA 51970428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GTTAGAGAGATACACAGGCACAGAGAGAGAGAGAGAGAAAAAGAGGAGGAGAAGAGAAGA 2760

 51970429 GAGAAGAGACAGAGGAGAGAGAATGCAGAGAATTTACAATTACTATAGAAAATGTGCACA 51970488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GAGAAGAGACAGAGGAGAGAGAATGCAGAGAATTTACAATTACTATAGAAAATGTGCACA 2820

 51970489 TTTTTCATAATAAAAATGAGTAAATACTTTCATGATATTATTATCACAGACTGATGATCT 51970548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TTTTTCATAATAAAAATGAGTAAATACTTTCATGATATTATTATCACAGACTGATGATCT 2880

 51970549 GACATAGATTTCGTGCCGTCTACCTGGGTCTCTACACGACAAACCTGAGTTAGATGTAAT 51970608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 GACATAGATTTCGTGCCGTCTACCTGGGTCTCTACACGACAAACCTGAGTTAGATGTAAT 2940

 51970609 GTAGAGATATGTTTCCACATTGCCCTTCTTGGGGAAGGTGAGCCAGTTCTGAGGTGCCTG 51970668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 GTAGAGATATGTTTCCACATTGCCCTTCTTGGGGAAGGTGAGCCAGTTCTGAGGTGCCTG 3000

 51970669 GTCCTAGTTGTCACAGATGCAGTTATTTCACACTAGGCTGCCTGCCAGCCTGGATTTGTC 51970728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GTCCTAGTTGTCACAGATGCAGTTATTTCACACTAGGCTGCCTGCCAGCCTGGATTTGTC 3060

 51970729 TTCCTTTTTTTTTTTTTTGTTTTCAATCTCCCTGGGCTTGCGTCATTACATCAACACATT 51970788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TTCCTTTTTTTTTTTTTTGTTTTCAATCTCCCTGGGCTTGCGTCATTACATCAACACATT 3120

 51970789 CTGAAACATCTGTCAGAATCCTTGCCAGTTCAAATTTACAAAAGTGCAATAATATTCTAT 51970848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 CTGAAACATCTGTCAGAATCCTTGCCAGTTCAAATTTACAAAAGTGCAATAATATTCTAT 3180

 51970849 CTCCCCATCACCACCAAATCTTGCTAAAATAAAATCATACATTTATTTATAAAAGTTTGT 51970908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 CTCCCCATCACCACCAAATCTTGCTAAAATAAAATCATACATTTATTTATAAAAGTTTGT 3240

 51970909 TGTTAAGAAAAAAACTGAAAACATCATGAAGGTCTGAGAGAAATAAAGTGGAATTTAGAA 51970968
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     3241 TGTTAAGAAAAAAACTGAAAACATCATGAAGGTCTGAGAGAAATAAAGTGGAATTTAAAA 3300

 51970969 GTATTGTATCCATGTCATATGACATATAAAAGTTTGTAATCATTAAAGATGATGAGTAAT 51971028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 GTATTGTATCCATGTCATATGACATATAAAAGTTTGTAATCATTAAAGATGATGAGTAAT 3360

 51971029 ATATGGTAAGGAATATTTGGAAAACTTCTTTCAGTGTTAAAAAAGAAAAATAAAGAAGAG 51971088
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 ATATGGTGAGGAATATTTGGAAAACTTCTTTCAGTGTTAAAAAAGAAAAATAAAGAAGAG 3420

 51971089 TCAAATTGTATTGCCTCAGTTTTATTAAACACTTATGTATTTTACATACATTTAAAAAAC 51971148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TCAAATTGTATTGCCTCAGTTTTATTAAACACTTATGTATTTTACATACATTTAAAAAAC 3480

 51971149 TTAGCCGGGTGTGGTGGCGCGCGCTTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAG 51971208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     3481 TTAGCCGGGTGTGGTGGCGCGCGCTTGTAATCCCGGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAG 3540

 51971209 AATCACTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGTGGAAATTGTGCCACTGAACTCCA 51971268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 AATCACTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGTGGAAATTGTGCCACTGAACTCCA 3600

 51971269 GCCTGGGGGATAGGGCAAGATTCTGTCTCAAAAAAATAAAGGAAAAAAAAATTTTAATTT 51971328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 GCCTGGGGGATAGGGCAAGATTCTGTCTCAAAAAAATAAAGGAAAAAAAAATTTTAATTT 3660

 51971329 GAATAGTTCGCTAGTGCTAAATGTTTATGGTTTTGAATCTGAATGTTTTCATAACATTTT 51971388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 GAATAGTTCGCTAGTGCTAAATGTTTATGGTTTTGAATCTGAATGTTTTCATAACATTTT 3720

 51971389 ATTTTTAGCGTATTTTTTAGGTTTCCATATTCCAGTGTTGCTGCAACAAATACGTAATGT 51971448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 ATTTTTAGCGTATTTTTTAGGTTTCCATATTCCAGTGTTGCTGCAACAAATACGTAATGT 3780

 51971449 TTATAATCAGAAAAGCATTGTTAAATAACCTCTGCAAAAACTCTTTAATCTCCCTAATCT 51971508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 TTATAATCAGAAAAGCATTGTTAAATAACCTCTGCAAAAACTCTTTAATCTCCCTAATCT 3840

 51971509 AGGGATAGGGAATTATTTTATCTATAATTTTAATTCTAATTGTTAGAGTGTGGCTGCCTG 51971568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 AGGGATAGGGAATTATTTTATCTATAATTTTAATTCTAATTGTTAGAGTGTGGCTGCCTG 3900

 51971569 GAGCACTGACTTGAAAATAAATCTGAAACCCATCAGGAAAAAATAATGTCAATTAACATT 51971628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 GAGCACTGACTTGAAAATAAATCTGAAACCCATCAGGAAAAAATAATGTCAATTAACATT 3960

 51971629 GGTTGTCATTTGTTCAAGAGGAAAAAGTCGGAGCATGATACCCCATATTTGCCATGCATT 51971688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 GGTTGTCATTTGTTCAAGAGGAAAAAGTCGGAGCATGATACCCCATATTTGCCATGCATT 4020

 51971689 CTGAAATGTTTTCTTTTGTCTTTTACTTTAAAAAAAGATGGATGATTTTATTTATATATT 51971748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 CTGAAATGTTTTCTTTTGTCTTTTACTTTAAAAAAAGATGGATGATTTTATTTATATATT 4080

 51971749 AGAACTCATGATCTATATTTTCAACTCTGCTCCAGTAAGTCTCTTATTCATTTGGTTAAA 51971808
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 AGAACTCATGATCTGTATTTTCAACTCTGCTCCAGTAAGTCTCTTATTCATTTGGTTAAA 4140

 51971809 GCACCAATTACACTTACCCCGTAGTTTCTGATTTTTGATAGGACATTAGGAGAAAGACCA 51971868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 GCACCAATTACACTTACCCCGTAGTTTCTGATTTTTGATAGGACATTAGGAGAAAGACCA 4200

 51971869 TACATTTAAGGGCAATGAAAATAAATATCTAAGATGAAGTGATTATTATAACTTTGCAAT 51971928
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 TACATTTAAGGGAAATGAAAATAAATATCTAAGATGAAGTGATTATTATAACTTTGCAAT 4260

 51971929 ATGGATTGAACCTGGACTAAGTACTAGTGCTATATCAGGAAGCTGGATCAATTTGACACC 51971988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 ATGGATTGAACCTGGACTAAGTACTAGTGCTATATCAGGAAGCTGGATCAATTTGACACC 4320

 51971989 TACTGAAAGTGACACATGGGCCTTGCTAAAGAAAGAGTTTAAATCTGGTAGTGCTTCAGA 51972048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 TACTGAAAGTGACACATGGGCCTTGCTAAAGAAAGAGTTTAAATCTGGTAGTGCTTCAGA 4380

 51972049 ATTTTTATTTCAGTGAGGTTCTGTAAAATTAAATTCATCTGGCATTGTGGGAAAAAGTTG 51972108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 ATTTTTATTTCAGTGAGGTTCTGTAAAATTAAATTCATCTGGCATTGTGGGAAAAAGTTG 4440

 51972109 TATTATATATGAACCAATTTCTTAAATAAGTGCAACTTAATCTTCTAAGAAACTTTAAAA 51972168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 TATTATATATGAACCAATTTCTTAAATAAGTGCAACTTAATCTTCTAAGAAACTTTAAAA 4500

 51972169 TATTTAATCTTGTTGGGTATTTTTTTTTCCATTTTTTTCTTGCTATTTCTTTAGGGAAAA 51972228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 TATTTAATCTTGTTGGGTATTTTTTTTTCCATTTTTTTCTTGCTATTTCTTTAGGGAAAA 4560

 51972229 AAAACAGAATATATAACACTCTTCATTAGTATGGAACACACATACTATTTTATTTCCTAT 51972288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 AAAACAGAATATATAACACTCTTCATTAGTATGGAACACACATACTATTTTATTTCCTAT 4620

 51972289 TTTAAAACTTAATTACTCAAATACTCCATGAATTTATTAGCAATTGATCCAATATTTCCC 51972348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 TTTAAAACTTAATTACTCAAATACTCCATGAATTTATTAGCAATTGATCCAATATTTCCC 4680

 51972349 TCTTTAATGTCAATTGCTGCTCCCTTTTCCTTATGCATAGTACATGGATCCTCAGGATTC 51972408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 TCTTTAATGTCAATTGCTGCTCCCTTTTCCTTATGCATAGTACATGGATCCTCAGGATTC 4740

 51972409 ACTTACGCAGTCCACTGAGCAGTGGCCATTCACACTTTTAATGTGAGGAAGAGTGAGAGA 51972468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 ACTTACGCAGTCCACTGAGCAGTGGCCATTCACACTTTTAATGTGAGGAAGAGTGAGAGA 4800

 51972469 AAGGAAAACAGAAATTATTTCATACCAAAAGAGCCCCTGATTTTTCACTGCTTCTTTTGT 51972528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 AAGGAAAACAGAAATTATTTCATACCAAAAGAGCCCCTGATTTTTCACTGCTTCTTTTGT 4860

 51972529 TATTCACATACAGGAGGATATGTTCCTAATCACTTTTATGATGTGAACATGCCTGCACAG 51972588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 TATTCACATACAGGAGGATATGTTCCTAATCACTTTTATGATGTGAACATGCCTGCACAG 4920

 51972589 TTGCCACTGCTGCATCATGTTGGGGTTCCCAAATTTAGACCTTTTTCCACTTACACTTTG 51972648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 TTGCCACTGCTGCATCATGTTGGGGTTCCCAAATTTAGACCTTTTTCCACTTACACTTTG 4980

 51972649 TTCTCAACCACTGTGCCCTCAAAATGACCACTATTCCAGCATATCTGAGGTAAGAGAGAG 51972708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 TTCTCAACCACTGTGCCCTCAAAATGACCACTATTCCAGCATATCTGAGGTAAGAGAGAG 5040

 51972709 CTTCTTGCCTGAGACACAAAGTGTGCCCAGAACTAGAATTCTGCTTCTAATACTCAAACT 51972768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 CTTCTTGCCTGAGACACAAAGTGTGCCCAGAACTAGAATTCTGCTTCTAATACTCAAACT 5100

 51972769 CTGGTGTTATGTTGGAGTTACCAGCCCAGACCTCTTCCTTTGTAATAAGTTTCCATTTGT 51972828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 CTGGTGTTATGTTGGAGTTACCAGCCCAGACCTCTTCCTTTGTAATAAGTTTCCATTTGT 5160

 51972829 GATCAGCAATGGCCCTTTCTGGAACCATCTCAAGCCATCAGTGAAGTTTGACTAACTTTG 51972888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 GATCAGCAATGGCCCTTTCTGGAACCATCTCAAGCCATCAGTGAAGTTTGACTAACTTTG 5220

 51972889 AAAGGATGGGGGCCTTGATCTTTTATTTTCTGAAGATTCCTGGCACACTATGCTAATGTA 51972948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 AAAGGATGGGGGCCTTGATCTTTTATTTTCTGAAGATTCCTGGCACACTATGCTAATGTA 5280

 51972949 CTCATATTCATTCCTCATACCTAGCTTTGTAAATGTAGAACTCAAACTTTTAAGAAGACA 51973008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 CTCATATTCATTCCTCATACCTAGCTTTGTAAATGTAGAACTCAAACTTTTAAGAAGACA 5340

 51973009 CTCTCCACAGGAAGTGGATATCTCTTTCCCAACATAAGTGAGGCCACAGATTAGCACAGA 51973068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 CTCTCCACAGGAAGTGGATATCTCTTTCCCAACATAAGTGAGGCCACAGATTAGCACAGA 5400

 51973069 CAATTAAAGAGGTAAAATCTGCCAAACGTTTTTTTTTTTATTCTAGCTTAGAAATGATTG 51973128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 CAATTAAAGAGGTAAAATCTGCCAAACGTTTTTTTTTTTATTCTAGCTTAGAAATGATTG 5460

 51973129 GCAAGACTTAAGTTTTTTCCAATACAACTTTTAACTTATCTCTATTACAAATATACACAC 51973188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 GCAAGACTTAAGTTTTTTCCAATACAACTTTTAACTTATCTCTATTACAAATATACACAC 5520

 51973189 AATTATTAATTAATTTATTAGTTTTCATTGATACCTAATAATTTTACTTTTTTATAGAGC 51973248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 AATTATTAATTAATTTATTAGTTTTCATTGATACCTAATAATTTTACTTTTTTATAGAGC 5580

 51973249 ACACAGGATGTTCTGTACACATATAGAATTTGTAACGATCCAATCAAGGTATTTAGGTTA 51973308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 ACACAGGATGTTCTGTACACATATAGAATTTGTAACGATCCAATCAAGGTATTTAGGTTA 5640

 51973309 TTCATCATCTCAAACATTTATAATTTCTTTGTGTTGAGTATGTCTCCAATCTTCTACCTC 51973368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 TTCATCATCTCAAACATTTATAATTTCTTTGTGTTGAGTATGTCTCCAATCTTCTACCTC 5700

 51973369 TTCTGAAATATACAATAAACTCTATTTTTAACTACAGTCACTCTACTTGTCTCATATGGT 51973428
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     5701 TTCTGAAATATACAATAAACTCTATTTTTAACTACAGTCACTCTACTTGTCTCATATGGC 5760

 51973429 ACCAAACTAGATCGTTGTTGTCTTGATAACACAGCATTATCATTATAGCTGTAATACATA 51973488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5761 ACCAAACTAGATCGTTGTTGTCTTGATAACACAGCATTATCATTATAGCTGTAATACATA 5820

 51973489 ATGCTGTACCTCCTCTCCTAACCCTGGAAGTTGCAATTCATCCTTCAATGCTCAGCTCAA 51973548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5821 ATGCTGTACCTCCTCTCCTAACCCTGGAAGTTGCAATTCATCCTTCAATGCTCAGCTCAA 5880

 51973549 AGGATTATTGTCTCTAAAGTTTTAGCAAATGCTGAAGCAGAATTTCACCATTTAATGGGT 51973608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5881 AGGATTATTGTCTCTAAAGTTTTAGCAAATGCTGAAGCAGAATTTCACCATTTAATGGGT 5940

 51973609 TCACAAGCTGCTGCCTTTATAGCTTATGGTACATATGTTTGCCAATATAAATGATCCACT 51973668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5941 TCACAAGCTGCTGCCTTTATAGCTTATGGTACATATGTTTGCCAATATAAATGATCCACT 6000

 51973669 TGAGCTAAATTGCCACAGCTGCTACAACACCTCTTTACCTATTTTTGGAGCAAAACTGAA 51973728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6001 TGAGCTAAATTGCCACAGCTGCTACAACACCTCTTTACCTATTTTTGGAGCAAAACTGAA 6060

 51973729 AATCAGAAAAGTTTAACTTTTTCAAAATAATGAAAAATTTCTCTCCAATCCTCTCCATCA 51973788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6061 AATCAGAAAAGTTTAACTTTTTCAAAATAATGAAAAATTTCTCTCCAATCCTCTCCATCA 6120

 51973789 TTATACATTAATAGGAAAAGAAAGGACAAAGACAA 51973823
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6121 TTATACATTAATAGGAAAAGAAAGGACAAAGACAA 6155

EXCISED REGION

 51974241 AAATTTTCCTTTGAGAAAGTCTCAGTAATATTTGCTTAATATGCTGATAGGCTTATCAAG 51974300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6161 AAATTTTCCTTTGAGAAAGTCTCAGTAATATTTGCTTAATATGCTGATAGGCTTATCAAG 6220

 51974301 CTTCTTGAAAAAAAACTGATTTACAATACAGTGGGGATTATTTTTTTTAAGTTGGAAGGG 51974360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6221 CTTCTTGAAAAAAAACTGATTTACAATACAGTGGGGATTATTTTTTTTAAGTTGGAAGGG 6280

 51974361 AAAGAAGGTTTGATGTAAGAGTGCTTTGAAATGTGGAGTTTTCCTAAGTATTACTCCCAC 51974420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6281 AAAGAAGGTTTGATGTAAGAGTGCTTTGAAATGTGGAGTTTTCCTAAGTATTACTCCCAC 6340

 51974421 AAGACCATAGTCTTGAAATTAAATTAGGCCTTTAGAATATCAGACAAAATAAATGGATTG 51974480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6341 AAGACCATAGTCTTGAAATTAAATTAGGCCTTTAGAATATCAGACAAAATAAATGGATTG 6400

 51974481 TAATTTATTTCAATAGCTGAATGCTTACTATTTTTCAAAGGATTAATTGAGATATATAAT 51974540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6401 TAATTTATTTCAATAGCTGAATGCTTACTATTTTTCAAAGGATTAATTGAGATATATAAT 6460

 51974541 TCTTTATATAAGTAAAAGAAATTTTCTAACTTTCAGAAACATCTAAACTTAGTTTTCCAC 51974600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6461 TCTTTATATAAGTAAAAGAAATTTTCTAACTTTCAGAAACATCTAAACTTAGTTTTCCAC 6520

 51974601 TAAGTTGTCTCTAACTCAACCCTCTTTTCACTTTTTTTATTATTTTAGAGCAGTAACATT 51974660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6521 TAAGTTGTCTCTAACTCAACCCTCTTTTCACTTTTTTTATTATTTTAGAGCAGTAACATT 6580

 51974661 TACTTCTGGAAAATCATCCAAATAAAACCAATTTACTTTCATAAAATCTAGACTTTTTGG 51974720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6581 TACTTCTGGAAAATCATCCAAATAAAACCAATTTACTTTCATAAAATCTAGACTTTTTGG 6640

 51974721 ATGTTAGAAGCATGATTTACCATCTCCTATTGGGACCTTATTCCAGAAATGATTTGCTCT 51974780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6641 ATGTTAGAAGCATGATTTACCATCTCCTATTGGGACCTTATTCCAGAAATGATTTGCTCT 6700

 51974781 TTCATTTGCTAATTGCATGACGATTAGAATCTGGACCCAAGACCTTTTTAATGCATATAA 51974840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6701 TTCATTTGCTAATTGCATGACGATTAGAATCTGGACCCAAGACCTTTTTAATGCATATAA 6760

 51974841 TTAAATATTTCAAACTTCTTACACTTTTGATCTTCTGGTATCATATATTCAATTAATAGC 51974900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6761 TTAAATATTTCAAACTTCTTACACTTTTGATCTTCTGGTATCATATATTCAATTAATAGC 6820

 51974901 ATAATTCACATTCCCCTACATACCATGAAACTACCTTTTTCCTGATTATATTAATGTATA 51974960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6821 ATAATTCACATTCCCCTACATACCATGAAACTACCTTTTTCCTGATTATATTAATGTATA 6880

 51974961 CTAAACATAAAAAAAGAAATTATATAAAATAGTATTAGGACAATCACTTGAAATTTTCCA 51975020
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     6881 CTAAACATAAAAAAAGAAATTATATAAAATAATATTAGGACAATCACTTGAAATTTTCCA 6940

 51975021 CCGAGGGACAACTAGTCAAAATATTTCAGTGACCTCTGATATAACACTATCTGTGCATAG 51975080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6941 CCGAGGGACAACTAGTCAAAATATTTCAGTGACCTCTGATATAACACTATCTGTGCATAG 7000

 51975081 ATATATTCACTTATAAAACATTTCTACATATGTGGTAATAATTACAAAAGTGAGCACAAT 51975140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7001 ATATATTCACTTATAAAACATTTCTACATATGTGGTAATAATTACAAAAGTGAGCACAAT 7060

 51975141 TTTAAAAATAGCTTTCTCTTCACTCTTTAAACTTACCTCTTTATTTCTCTTCTGCTTTTC 51975200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7061 TTTAAAAATAGCTTTCTCTTCACTCTTTAAACTTACCTCTTTATTTCTCTTCTGCTTTTC 7120

 51975201 TATTTCCACATTTCTCATTTTCAATGGCCAGTATTTAGGGGCTTTGTGCTATCTTTCTAC 51975260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7121 TATTTCCACATTTCTCATTTTCAATGGCCAGTATTTAGGGGCTTTGTGCTATCTTTCTAC 7180

 51975261 ACTTTAAATTTTTTATATCAAATTTCATATGTACTTTTACAGTTTCAGAAGTCTTATTGT 51975320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7181 ACTTTAAATTTTTTATATCAAATTTCATATGTACTTTTACAGTTTCAGAAGTCTTATTGT 7240

 51975321 TTTTTACATGAGTGAGATCACAAGGTTTTATACTTAGTTTTAAAAAAATTTTCTCCTTCA 51975380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7241 TTTTTACATGAGTGAGATCACAAGGTTTTATACTTAGTTTTAAAAAAATTTTCTCCTTCA 7300

 51975381 ACAAATATAACTGGAATCCCTGTGAGTCAACCAAAATAGTTTTAACTAACTCTTCATAAT 51975440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7301 ACAAATATAACTGGAATCCCTGTGAGTCAACCAAAATAGTTTTAACTAACTCTTCATAAT 7360

 51975441 GGCTAGCTAAATGGAATTCTGTGGTAATACAAATTATTCTAAAATTCCAATATTTACACC 51975500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7361 GGCTAGCTAAATGGAATTCTGTGGTAATACAAATTATTCTAAAATTCCAATATTTACACC 7420

 51975501 CATTTTTTTTCACTCATGAAAGCACTGCAATAAGCAGCTTTTATAGATATTCTTAGGTAC 51975560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7421 CATTTTTTTTCACTCATGAAAGCACTGCAATAAGCAGCTTTTATAGATATTCTTAGGTAC 7480

 51975561 TATTAGGTGCTTTTCTTTTGGTGGAATGAAACCCCAGGAGTGAGACTGCGGGTTGAAAGA 51975620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7481 TATTAGGTGCTTTTCTTTTGGTGGAATGAAACCCCAGGAGTGAGACTGCGGGTTGAAAGA 7540

 51975621 TATGTGGATTTTTTAAATAGATAACTGTCAGAATATTTTTATTAAAAACTTTAGTATTTC 51975680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7541 TATGTGGATTTTTTAAATAGATAACTGTCAGAATATTTTTATTAAAAACTTTAGTATTTC 7600

 51975681 ACATTCTTGAAGCACTGTATGTGAATATCCTTTCTCCACATTCCCATTGGCAAGGGCTGG 51975740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7601 ACATTCTTGAAGCACTGTATGTGAATATCCTTTCTCCACATTCCCATTGGCAAGGGCTGG 7660

 51975741 TTGGTTTTTGATAGCATGAAATTTGATTTTTGGCATGATATCATTTAGGAATACAATTTT 51975800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7661 TTGGTTTTTGATAGCATGAAATTTGATTTTTGGCATGATATCATTTAGGAATACAATTTT 7720

 51975801 ATTTTCATTCCATAGGAATAAGCAAAATCCCATGACAGTTTATTGAAAAATATGTCAGTT 51975860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7721 ATTTTCATTCCATAGGAATAAGCAAAATCCCATGACAGTTTATTGAAAAATATGTCAGTT 7780

 51975861 CCCACTGACATACTGGGAAACATCAGTCTTATATCAAATGTCCATATGTGCATACATCTA 51975920
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7781 CCCACTGATATACTGGGAAACATCAGTCTTATATCAAATGTCCATATGTGCATACATCTA 7840

 51975921 TTTTTGGACTTTATCTTTTGTTCTATTTGCCTACTCCAGGACCTACCCCATTATCATACA 51975980
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7841 TTTTTGGACTTCATCTTTTGTTCTATTTGCCTACTCCAGGACCTACCCCATTATCATACA 7900

 51975981 ATAACTATTACTTGGCTTCTATCCAACTGTGGTATCTGGTAGAACAAATCCCTACACCTA 51976040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7901 ATAACTATTACTTGGCTTCTATCCAACTGTGGTATCTGGTAGAACAAATCCCTACACCTA 7960

 51976041 TTCTTAATGATGATGTGGACTGATCCGGACTTTTCTTTTCCATATAAGTTTTAGTATTAG 51976100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7961 TTCTTAATGATGATGTGGACTGATCCGGACTTTTCTTTTCCATATAAGTTTTAGTATTAG 8020

 51976101 TTTGTTAATTCCACATAACCCAGTTTGGATATTTGTAGGAATTGTATGAAATATACATCA 51976160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8021 TTTGTTAATTCCACATAACCCAGTTTGGATATTTGTAGGAATTGTATGAAATATACATCA 8080

 51976161 ATTTTAGGAAAATTGGCCTTTTAATATACAGGCTTTTGGTATCCACAGGGGAATGGTTTC 51976220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8081 ATTTTAGGAAAATTGGCCTTTTAATATACAGGCTTTTGGTATCCACAGGGGAATGGTTTC 8140

 51976221 ATCTACCCACCACAACACTCCCCCACCTATGGATACTGAAATCCTAAATCCTCCGATGCT 51976280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8141 ATCTACCCACCACAACACTCCCCCACCTATGGATACTGAAATCCTAAATCCTCCGATGCT 8200

 51976281 CAAGTCTCCTGTATAAAGTGGTGTACTACTTGCATATAACCTACAGCAATTTCCCCATAT 51976340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8201 CAAGTCTCCTGTATAAAGTGGTGTACTACTTGCATATAACCTACAGCAATTTCCCCATAT 8260

 51976341 ACTTTAAGTAATCTCTAGTTTATCTTTATAATACCTACCACAATGTAAGTGCCAGGTAAA 51976400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8261 ACTTTAAGTAATCTCTAGTTTATCTTTATAATACCTACCACAATGTAAGTGCCAGGTAAA 8320

 51976401 TAGTTGTTACACTGTATTGGTTTTTTAAATTGTATTATTTTTCCTTGTTGGTGTTTTTTA 51976460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8321 TAGTTGTTACACTGTATTGGTTTTTTAAATTGTATTATTTTTCCTTGTTGGTGTTTTTTA 8380

 51976461 TTTTTATTTTTTCAAATGTTTTCTATTTGCAGTTGGTTGAATTCATGGACGTAGAACCTA 51976520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8381 TTTTTATTTTTTCAAATGTTTTCTATTTGCAGTTGGTTGAATTCATGGACGTAGAACCTA 8440

 51976521 CAGATACAGAGGAATAATTGTGATAAGACATGTATCTTTTTTATTTTTCTACTTACTTAA 51976580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8441 CAGATACAGAGGAATAATTGTGATAAGACATGTATCTTTTTTATTTTTCTACTTACTTAA 8500

 51976581 AACTTCTTTAATATCTTGTTTCAAATTTCAGTCAGTTTCGGAGGAACAGATGCGTTTGGA 51976640
          |||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8501 AACTTCTTTAATATCTTATTTTAAATTTCAGTCAGTTTCGGAGGAACAGATGCGTTTGGA 8560

 51976641 TACATGGATAAGTTCTTTAGTAGTGATTTCTGAGATTTTGGTGCACCCATTACCCAAGGG 51976700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8561 TACATGGATAAGTTCTTTAGTAGTGATTTCTGAGATTTTGGTGCACCCATTACCCAAGGG 8620

 51976701 GTGCACACTGTACTCAATGTGTCTTTTATCCCTCAACCCCTCCTACCCTTTCCCACGAGT 51976760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8621 GTGCACACTGTACTCAATGTGTCTTTTATCCCTCAACCCCTCCTACCCTTTCCCACGAGT 8680

 51976761 CCCCAAAGTCCATTGTGTCATTCTTATGTCTTTGTGTCTTCATAGCTCAGCTTCTGCTTA 51976820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8681 CCCCAAAGTCCATTGTGTCATTCTTATGTCTTTGTGTCTTCATAGCTCAGCTTCTGCTTA 8740

 51976821 TAAGTGAAAACATATAATTAAAACTTCTTTAATATATTTTAATAATGCTTTAAAATACTT 51976880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8741 TAAGTGAAAACATATAATTAAAACTTCTTTAATATATTTTAATAATGCTTTAAAATACTT 8800

 51976881 CCCCGCAAAGGTCTACCACATATTTTGATAGACTTGTTACTATTATTTTATTGTAAATAT 51976940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8801 CCCCGCAAAGGTCTACCACATATTTTGATAGACTTGTTACTATTATTTTATTGTAAATAT 8860

 51976941 TTTGCTTTATTTTGTCTTGTTGTTATTCTATATTTGTATTATGATGTGTTAAGCATTATT 51977000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8861 TTTGCTTTATTTTGTCTTGTTGTTATTCTATATTTGTATTATGATGTGTTAAGCATTATT 8920

 51977001 ATT 51977003
          |||
     8921 ATT 8923

Alignment time is 6.43424 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51963823,51984240] =>     20418 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [       1,    2763] =>      2763 nucs 'mol-32-2efc-044596_2763'

Score:        2725
Aligned:      2758        nucs
Identic:      2755 (100%) nucs =>      2354 (100%)       401 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51974241,51976597] EXCISED REGION [51976603,51977003]
 second seq =>  [       1,    2357] EXCISED REGION [    2363,    2763]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         5 nucs [51976598,51976602]
 second seq =>         5 nucs [2358,2362]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         3 nucs [2356,2358] to [2361,2363]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 51974241 AAATTTTCCTTTGAGAAAGTCTCAGTAATATTTGCTTAATATGCTGATAGGCTTATCAAG 51974300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAATTTTCCTTTGAGAAAGTCTCAGTAATATTTGCTTAATATGCTGATAGGCTTATCAAG 60

 51974301 CTTCTTGAAAAAAAACTGATTTACAATACAGTGGGGATTATTTTTTTTAAGTTGGAAGGG 51974360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTTCTTGAAAAAAAACTGATTTACAATACAGTGGGGATTATTTTTTTTAAGTTGGAAGGG 120

 51974361 AAAGAAGGTTTGATGTAAGAGTGCTTTGAAATGTGGAGTTTTCCTAAGTATTACTCCCAC 51974420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAAGAAGGTTTGATGTAAGAGTGCTTTGAAATGTGGAGTTTTCCTAAGTATTACTCCCAC 180

 51974421 AAGACCATAGTCTTGAAATTAAATTAGGCCTTTAGAATATCAGACAAAATAAATGGATTG 51974480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAGACCATAGTCTTGAAATTAAATTAGGCCTTTAGAATATCAGACAAAATAAATGGATTG 240

 51974481 TAATTTATTTCAATAGCTGAATGCTTACTATTTTTCAAAGGATTAATTGAGATATATAAT 51974540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TAATTTATTTCAATAGCTGAATGCTTACTATTTTTCAAAGGATTAATTGAGATATATAAT 300

 51974541 TCTTTATATAAGTAAAAGAAATTTTCTAACTTTCAGAAACATCTAAACTTAGTTTTCCAC 51974600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCTTTATATAAGTAAAAGAAATTTTCTAACTTTCAGAAACATCTAAACTTAGTTTTCCAC 360

 51974601 TAAGTTGTCTCTAACTCAACCCTCTTTTCACTTTTTTTATTATTTTAGAGCAGTAACATT 51974660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TAAGTTGTCTCTAACTCAACCCTCTTTTCACTTTTTTTATTATTTTAGAGCAGTAACATT 420

 51974661 TACTTCTGGAAAATCATCCAAATAAAACCAATTTACTTTCATAAAATCTAGACTTTTTGG 51974720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TACTTCTGGAAAATCATCCAAATAAAACCAATTTACTTTCATAAAATCTAGACTTTTTGG 480

 51974721 ATGTTAGAAGCATGATTTACCATCTCCTATTGGGACCTTATTCCAGAAATGATTTGCTCT 51974780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATGTTAGAAGCATGATTTACCATCTCCTATTGGGACCTTATTCCAGAAATGATTTGCTCT 540

 51974781 TTCATTTGCTAATTGCATGACGATTAGAATCTGGACCCAAGACCTTTTTAATGCATATAA 51974840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTCATTTGCTAATTGCATGACGATTAGAATCTGGACCCAAGACCTTTTTAATGCATATAA 600

 51974841 TTAAATATTTCAAACTTCTTACACTTTTGATCTTCTGGTATCATATATTCAATTAATAGC 51974900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTAAATATTTCAAACTTCTTACACTTTTGATCTTCTGGTATCATATATTCAATTAATAGC 660

 51974901 ATAATTCACATTCCCCTACATACCATGAAACTACCTTTTTCCTGATTATATTAATGTATA 51974960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATAATTCACATTCCCCTACATACCATGAAACTACCTTTTTCCTGATTATATTAATGTATA 720

 51974961 CTAAACATAAAAAAAGAAATTATATAAAATAGTATTAGGACAATCACTTGAAATTTTCCA 51975020
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTAAACATAAAAAAAGAAATTATATAAAATAATATTAGGACAATCACTTGAAATTTTCCA 780

 51975021 CCGAGGGACAACTAGTCAAAATATTTCAGTGACCTCTGATATAACACTATCTGTGCATAG 51975080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CCGAGGGACAACTAGTCAAAATATTTCAGTGACCTCTGATATAACACTATCTGTGCATAG 840

 51975081 ATATATTCACTTATAAAACATTTCTACATATGTGGTAATAATTACAAAAGTGAGCACAAT 51975140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATATATTCACTTATAAAACATTTCTACATATGTGGTAATAATTACAAAAGTGAGCACAAT 900

 51975141 TTTAAAAATAGCTTTCTCTTCACTCTTTAAACTTACCTCTTTATTTCTCTTCTGCTTTTC 51975200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTTAAAAATAGCTTTCTCTTCACTCTTTAAACTTACCTCTTTATTTCTCTTCTGCTTTTC 960

 51975201 TATTTCCACATTTCTCATTTTCAATGGCCAGTATTTAGGGGCTTTGTGCTATCTTTCTAC 51975260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TATTTCCACATTTCTCATTTTCAATGGCCAGTATTTAGGGGCTTTGTGCTATCTTTCTAC 1020

 51975261 ACTTTAAATTTTTTATATCAAATTTCATATGTACTTTTACAGTTTCAGAAGTCTTATTGT 51975320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ACTTTAAATTTTTTATATCAAATTTCATATGTACTTTTACAGTTTCAGAAGTCTTATTGT 1080

 51975321 TTTTTACATGAGTGAGATCACAAGGTTTTATACTTAGTTTTAAAAAAATTTTCTCCTTCA 51975380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTTTTACATGAGTGAGATCACAAGGTTTTATACTTAGTTTTAAAAAAATTTTCTCCTTCA 1140

 51975381 ACAAATATAACTGGAATCCCTGTGAGTCAACCAAAATAGTTTTAACTAACTCTTCATAAT 51975440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ACAAATATAACTGGAATCCCTGTGAGTCAACCAAAATAGTTTTAACTAACTCTTCATAAT 1200

 51975441 GGCTAGCTAAATGGAATTCTGTGGTAATACAAATTATTCTAAAATTCCAATATTTACACC 51975500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GGCTAGCTAAATGGAATTCTGTGGTAATACAAATTATTCTAAAATTCCAATATTTACACC 1260

 51975501 CATTTTTTTTCACTCATGAAAGCACTGCAATAAGCAGCTTTTATAGATATTCTTAGGTAC 51975560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CATTTTTTTTCACTCATGAAAGCACTGCAATAAGCAGCTTTTATAGATATTCTTAGGTAC 1320

 51975561 TATTAGGTGCTTTTCTTTTGGTGGAATGAAACCCCAGGAGTGAGACTGCGGGTTGAAAGA 51975620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TATTAGGTGCTTTTCTTTTGGTGGAATGAAACCCCAGGAGTGAGACTGCGGGTTGAAAGA 1380

 51975621 TATGTGGATTTTTTAAATAGATAACTGTCAGAATATTTTTATTAAAAACTTTAGTATTTC 51975680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TATGTGGATTTTTTAAATAGATAACTGTCAGAATATTTTTATTAAAAACTTTAGTATTTC 1440

 51975681 ACATTCTTGAAGCACTGTATGTGAATATCCTTTCTCCACATTCCCATTGGCAAGGGCTGG 51975740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ACATTCTTGAAGCACTGTATGTGAATATCCTTTCTCCACATTCCCATTGGCAAGGGCTGG 1500

 51975741 TTGGTTTTTGATAGCATGAAATTTGATTTTTGGCATGATATCATTTAGGAATACAATTTT 51975800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTGGTTTTTGATAGCATGAAATTTGATTTTTGGCATGATATCATTTAGGAATACAATTTT 1560

 51975801 ATTTTCATTCCATAGGAATAAGCAAAATCCCATGACAGTTTATTGAAAAATATGTCAGTT 51975860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ATTTTCATTCCATAGGAATAAGCAAAATCCCATGACAGTTTATTGAAAAATATGTCAGTT 1620

 51975861 CCCACTGACATACTGGGAAACATCAGTCTTATATCAAATGTCCATATGTGCATACATCTA 51975920
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CCCACTGATATACTGGGAAACATCAGTCTTATATCAAATGTCCATATGTGCATACATCTA 1680

 51975921 TTTTTGGACTTTATCTTTTGTTCTATTTGCCTACTCCAGGACCTACCCCATTATCATACA 51975980
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTTTTGGACTTCATCTTTTGTTCTATTTGCCTACTCCAGGACCTACCCCATTATCATACA 1740

 51975981 ATAACTATTACTTGGCTTCTATCCAACTGTGGTATCTGGTAGAACAAATCCCTACACCTA 51976040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ATAACTATTACTTGGCTTCTATCCAACTGTGGTATCTGGTAGAACAAATCCCTACACCTA 1800

 51976041 TTCTTAATGATGATGTGGACTGATCCGGACTTTTCTTTTCCATATAAGTTTTAGTATTAG 51976100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTCTTAATGATGATGTGGACTGATCCGGACTTTTCTTTTCCATATAAGTTTTAGTATTAG 1860

 51976101 TTTGTTAATTCCACATAACCCAGTTTGGATATTTGTAGGAATTGTATGAAATATACATCA 51976160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTTGTTAATTCCACATAACCCAGTTTGGATATTTGTAGGAATTGTATGAAATATACATCA 1920

 51976161 ATTTTAGGAAAATTGGCCTTTTAATATACAGGCTTTTGGTATCCACAGGGGAATGGTTTC 51976220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ATTTTAGGAAAATTGGCCTTTTAATATACAGGCTTTTGGTATCCACAGGGGAATGGTTTC 1980

 51976221 ATCTACCCACCACAACACTCCCCCACCTATGGATACTGAAATCCTAAATCCTCCGATGCT 51976280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ATCTACCCACCACAACACTCCCCCACCTATGGATACTGAAATCCTAAATCCTCCGATGCT 2040

 51976281 CAAGTCTCCTGTATAAAGTGGTGTACTACTTGCATATAACCTACAGCAATTTCCCCATAT 51976340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CAAGTCTCCTGTATAAAGTGGTGTACTACTTGCATATAACCTACAGCAATTTCCCCATAT 2100

 51976341 ACTTTAAGTAATCTCTAGTTTATCTTTATAATACCTACCACAATGTAAGTGCCAGGTAAA 51976400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ACTTTAAGTAATCTCTAGTTTATCTTTATAATACCTACCACAATGTAAGTGCCAGGTAAA 2160

 51976401 TAGTTGTTACACTGTATTGGTTTTTTAAATTGTATTATTTTTCCTTGTTGGTGTTTTTTA 51976460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TAGTTGTTACACTGTATTGGTTTTTTAAATTGTATTATTTTTCCTTGTTGGTGTTTTTTA 2220

 51976461 TTTTTATTTTTTCAAATGTTTTCTATTTGCAGTTGGTTGAATTCATGGACGTAGAACCTA 51976520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TTTTTATTTTTTCAAATGTTTTCTATTTGCAGTTGGTTGAATTCATGGACGTAGAACCTA 2280

 51976521 CAGATACAGAGGAATAATTGTGATAAGACATGTATCTTTTTTATTTTTCTACTTACTTAA 51976580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CAGATACAGAGGAATAATTGTGATAAGACATGTATCTTTTTTATTTTTCTACTTACTTAA 2340

 51976581 AACTTCTTTAATATCTT 51976597
          |||||||||||||||||
     2341 AACTTCTTTAATATCTT 2357

EXCISED REGION

 51976603 AAATTTCAGTCAGTTTCGGAGGAACAGATGCGTTTGGATACATGGATAAGTTCTTTAGTA 51976662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2363 AAATTTCAGTCAGTTTCGGAGGAACAGATGCGTTTGGATACATGGATAAGTTCTTTAGTA 2422

 51976663 GTGATTTCTGAGATTTTGGTGCACCCATTACCCAAGGGGTGCACACTGTACTCAATGTGT 51976722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2423 GTGATTTCTGAGATTTTGGTGCACCCATTACCCAAGGGGTGCACACTGTACTCAATGTGT 2482

 51976723 CTTTTATCCCTCAACCCCTCCTACCCTTTCCCACGAGTCCCCAAAGTCCATTGTGTCATT 51976782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2483 CTTTTATCCCTCAACCCCTCCTACCCTTTCCCACGAGTCCCCAAAGTCCATTGTGTCATT 2542

 51976783 CTTATGTCTTTGTGTCTTCATAGCTCAGCTTCTGCTTATAAGTGAAAACATATAATTAAA 51976842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2543 CTTATGTCTTTGTGTCTTCATAGCTCAGCTTCTGCTTATAAGTGAAAACATATAATTAAA 2602

 51976843 ACTTCTTTAATATATTTTAATAATGCTTTAAAATACTTCCCCGCAAAGGTCTACCACATA 51976902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2603 ACTTCTTTAATATATTTTAATAATGCTTTAAAATACTTCCCCGCAAAGGTCTACCACATA 2662

 51976903 TTTTGATAGACTTGTTACTATTATTTTATTGTAAATATTTTGCTTTATTTTGTCTTGTTG 51976962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2663 TTTTGATAGACTTGTTACTATTATTTTATTGTAAATATTTTGCTTTATTTTGTCTTGTTG 2722

 51976963 TTATTCTATATTTGTATTATGATGTGTTAAGCATTATTATT 51977003
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2723 TTATTCTATATTTGTATTATGATGTGTTAAGCATTATTATT 2763

Alignment time is 2.0306 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51963823,51984240] =>     20418 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [       1,    9251] =>      9251 nucs 'mol-32-2fc2-048654_9251'

Score:        9230
Aligned:      9252        nucs
Identic:      9250 (100%) nucs =>       597 (100%)      8653 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51964938,51965534] EXCISED REGION [51965536,51974190]
 second seq =>  [       1,     597] EXCISED REGION [     599,    9251]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [51965535,51965535]
 second seq =>         1 nucs [598,598]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [51972225,51972225]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [51965534,51965534] to [51965536,51965536]
 second seq =>         1 nucs [597,597] to [599,599]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 51964938 TCCTCTGGTAGAATTTGGCTGTGAATCCATCTGGTCCTGCGCTCTGTTTCGTTGGTAAGC 51964997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCCTCTGGTAGAATTTGGCTGTGAATCCATCTGGTCCTGCGCTCTGTTTCGTTGGTAAGC 60

 51964998 TATTGATTATTGCCACAATTTCAGAGCCTGTTATCGGTCATTCAACTTCTTCCTGGTTTA 51965057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TATTGATTATTGCCACAATTTCAGAGCCTGTTATCGGTCATTCAACTTCTTCCTGGTTTA 120

 51965058 GTCTTGGGAGAGTGTATCTGTCGAGGAATTTATCCATTTCTTCTAGATTTTCTGGTTTAT 51965117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTCTTGGGAGAGTGTATCTGTCGAGGAATTTATCCATTTCTTCTAGATTTTCTGGTTTAT 180

 51965118 TTGCGTATACGTGTTTGTAGTATTCTCTGATGGTAGTTTTTATTTCTGTGGGATCAGTGG 51965177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTGCGTATACGTGTTTGTAGTATTCTCTGATGGTAGTTTTTATTTCTGTGGGATCAGTGG 240

 51965178 TGATATCCCCTTTATCATTTTTTTATTGTGTCTATTTGATTCTTCTCTTTTTTTCTTTAT 51965237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGATATCCCCTTTATCATTTTTTTATTGTGTCTATTTGATTCTTCTCTTTTTTTCTTTAT 300

 51965238 TAGTCTTGCTAGTGGTCTATCAGTTTTGTTGATCCTTTCAAAAAACCATCTCCTGGATTC 51965297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TAGTCTTGCTAGTGGTCTATCAGTTTTGTTGATCCTTTCAAAAAACCATCTCCTGGATTC 360

 51965298 GTTAATTTTTTGAAGGGTTTTTTGTGTCTCTATTTCCTTCAGTTCTGCTCTGATTTTAGT 51965357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTTAATTTTTTGAAGGGTTTTTTGTGTCTCTATTTCCTTCAGTTCTGCTCTGATTTTAGT 420

 51965358 TATTTCTTGCCTTCTGCTAGCTTTTGAATGTGTTTGCTCTTGCTTTTCTACTTCTTTTAA 51965417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TATTTCTTGCCTTCTGCTAGCTTTTGAATGTGTTTGCTCTTGCTTTTCTACTTCTTTTAA 480

 51965418 TTGTGATGTTAGGGTGTCAATTTTGGATCTTTCCTGCTTTCTGTTGTGGGCATTTAGTGC 51965477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTGTGATGTTAGGGTGTCAATTTTGGATCTTTCCTGCTTTCTGTTGTGGGCATTTAGTGC 540

 51965478 TATAAATTTCCCTCTACACAGTGCTTTGAATGTGTCCCAGAGATTCTGGTATGTTGT 51965534
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TATAAATTTCCCTCTACACAGTGCTTTGAATGTGTCCCAGAGATTCTGGTATGTTGT 597

EXCISED REGION

 51965536 TCTTTGTTCTCGTTGGTTTCAAAGAACATCTTTATTTCTGCCTTCATTTCGTTATGTACC 51965595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      599 TCTTTGTTCTCGTTGGTTTCAAAGAACATCTTTATTTCTGCCTTCATTTCGTTATGTACC 658

 51965596 CAGTAGTCTTTCAGGAGCAGGTTGTTCAGTTTCCATGTAGTTAAGCGGTTTTGAGTGAGA 51965655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      659 CAGTAGTCTTTCAGGAGCAGGTTGTTCAGTTTCCATGTAGTTAAGCGGTTTTGAGTGAGA 718

 51965656 TTCTTAATCCTGAGTTAGTTGAAGTTGGTTGTAATTCTCAATTCTTTGCTTTAAACATCC 51965715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      719 TTCTTAATCCTGAGTTAGTTGAAGTTGGTTGTAATTCTCAATTCTTTGCTTTAAACATCC 778

 51965716 ATGTATTTTCTAAATCATCTACAATGAATTTTTGTATAAATTAACTTTATATACATATAT 51965775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      779 ATGTATTTTCTAAATCATCTACAATGAATTTTTGTATAAATTAACTTTATATACATATAT 838

 51965776 ATGTAGAAAGACTACCCTGCTACAGAAATTATATGAATTGAAATATTATAATAAATTATA 51965835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      839 ATGTAGAAAGACTACCCTGCTACAGAAATTATATGAATTGAAATATTATAATAAATTATA 898

 51965836 ATTATAATTAGAAAAAATAAGTATTTTGTAATCTTAAATATACAAGTCTTCTTTTGTGCT 51965895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      899 ATTATAATTAGAAAAAATAAGTATTTTGTAATCTTAAATATACAAGTCTTCTTTTGTGCT 958

 51965896 CTTTATATAGGCAGTGTGGCACAGGGAAAAGAAAACTGCCATTTTTGAAGCCAGAGTGAG 51965955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      959 CTTTATATAGGCAGTGTGGCACAGGGAAAAGAAAACTGCCATTTTTGAAGCCAGAGTGAG 1018

 51965956 TCAAATCCTAGACAGAAGCACTCAAGTGTAGATAGGAAAAAATTACTTAAAACCTAGCTG 51966015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1019 TCAAATCCTAGACAGAAGCACTCAAGTGTAGATAGGAAAAAATTACTTAAAACCTAGCTG 1078

 51966016 GGAGAAATTATTTAATCTCTGCAAATCATATTTTCTTTATATGTAATATGAAGACAATAA 51966075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1079 GGAGAAATTATTTAATCTCTGCAAATCATATTTTCTTTATATGTAATATGAAGACAATAA 1138

 51966076 TAAGACATACTTCATCAGGCTGCTGTGAAGTTTAAGTGAATTAATATTTGGAAAAAACAA 51966135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1139 TAAGACATACTTCATCAGGCTGCTGTGAAGTTTAAGTGAATTAATATTTGGAAAAAACAA 1198

 51966136 GAAAATATCTAGCAGAGTGACTCTCAATGAGTTTTAATGTCAGTAATAAAATGCAGTATA 51966195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1199 GAAAATATCTAGCAGAGTGACTCTCAATGAGTTTTAATGTCAGTAATAAAATGCAGTATA 1258

 51966196 TGCTCTCCTTCTCTAATGTCTCTTAGTTGTGAAAGATCTCCCTCAACCATATATCTGAAA 51966255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1259 TGCTCTCCTTCTCTAATGTCTCTTAGTTGTGAAAGATCTCCCTCAACCATATATCTGAAA 1318

 51966256 TTATCATCACCTGAAATTGTCATTATCCTCAGAAGGGTTTCATATTAACTAATTTCTACT 51966315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1319 TTATCATCACCTGAAATTGTCATTATCCTCAGAAGGGTTTCATATTAACTAATTTCTACT 1378

 51966316 TAGGTGCCAATGGCTAAACCTACTTCTCTTCTATCAGTGAGGAAAGAGCAAAAAAGGGCT 51966375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1379 TAGGTGCCAATGGCTAAACCTACTTCTCTTCTATCAGTGAGGAAAGAGCAAAAAAGGGCT 1438

 51966376 GAGCTGATAGGAATAAGTAGAAAATAAGAAACAGTATAGAAGTAGGGAAGGGAAGGAGAG 51966435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1439 GAGCTGATAGGAATAAGTAGAAAATAAGAAACAGTATAGAAGTAGGGAAGGGAAGGAGAG 1498

 51966436 TGCAGAGAAAAAGAGATAGATGCAAATAAAAAAAATGTTTTTCCAGTGGCTGACAATGAT 51966495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1499 TGCAGAGAAAAAGAGATAGATGCAAATAAAAAAAATGTTTTTCCAGTGGCTGACAATGAT 1558

 51966496 GCTTGTTTCCAAAATTTAAATGTGAAATGCTTCTTGTTCAATGATTTTTCCCACAAATAA 51966555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1559 GCTTGTTTCCAAAATTTAAATGTGAAATGCTTCTTGTTCAATGATTTTTCCCACAAATAA 1618

 51966556 TATCTACCAGAAATACTACTATTACTTTTGTTTTAAAATGTAGAGTTGTTTTTTAAGGAA 51966615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1619 TATCTACCAGAAATACTACTATTACTTTTGTTTTAAAATGTAGAGTTGTTTTTTAAGGAA 1678

 51966616 ATACATACAAAGTACATTCCTTTAGGAAGTACATTCTTTAGGAAGGTCCACACTAATGTG 51966675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1679 ATACATACAAAGTACATTCCTTTAGGAAGTACATTCTTTAGGAAGGTCCACACTAATGTG 1738

 51966676 AATGAGGAAGCATCTATTAACTGTCTTATATGTATCCTGGTGTGTCAGGTACTTTGGTTT 51966735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1739 AATGAGGAAGCATCTATTAACTGTCTTATATGTATCCTGGTGTGTCAGGTACTTTGGTTT 1798

 51966736 AATATATTCTTATAGTTTATAAGAGAAAACATATGGTCTCTGAGAAATTATATGACATAA 51966795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1799 AATATATTCTTATAGTTTATAAGAGAAAACATATGGTCTCTGAGAAATTATATGACATAA 1858

 51966796 AACTTTTAAATATAGATCCCCCCAAAATTGCTTTCTTTTATGTGGTAATTGAAATTGTCT 51966855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 AACTTTTAAATATAGATCCCCCCAAAATTGCTTTCTTTTATGTGGTAATTGAAATTGTCT 1918

 51966856 ATTTATCTCTCTTTTTATTTACCATCAAGAAATAAGTCATGAGGAGAAATTATAGCAGCA 51966915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 ATTTATCTCTCTTTTTATTTACCATCAAGAAATAAGTCATGAGGAGAAATTATAGCAGCA 1978

 51966916 GAACTTTTCCCCTACTTCATGTATTCATTTTTTAAAAATCATCTTCCTTTATTTATTTAC 51966975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 GAACTTTTCCCCTACTTCATGTATTCATTTTTTAAAAATCATCTTCCTTTATTTATTTAC 2038

 51966976 TTTAGTTCATTATGGCTTAACTCAGTCTCACCCAATTACATGAGCTGTTCATAATGGTGT 51967035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 TTTAGTTCATTATGGCTTAACTCAGTCTCACCCAATTACATGAGCTGTTCATAATGGTGT 2098

 51967036 CTTACTTCAGCAGTCCAGCCAGCTGTGATTGAAGTCAGCCAGGAATGCCGACTACAGATC 51967095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 CTTACTTCAGCAGTCCAGCCAGCTGTGATTGAAGTCAGCCAGGAATGCCGACTACAGATC 2158

 51967096 AGAGCACCTGTGAGATTATCAGTTCCATGTGGAATGTCAGACGTATTCTAAACTAGAGTA 51967155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 AGAGCACCTGTGAGATTATCAGTTCCATGTGGAATGTCAGACGTATTCTAAACTAGAGTA 2218

 51967156 ATTGACTTGGCCAGGATGAGGGGTCAGGAGTGTCATTAAAAATATATAGCTTGGTATGAT 51967215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2219 ATTGACTTGGCCAGGATGAGGGGTCAGGAGTGTCATTAAAAATATATAGCTTGGTATGAT 2278

 51967216 TAGCTGCAGAGAAGAACATTCAAGAGCTAGGGGCCCTGGAATCTCCATCAACTTCACAGG 51967275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 TAGCTGCAGAGAAGAACATTCAAGAGCTAGGGGCCCTGGAATCTCCATCAACTTCACAGG 2338

 51967276 TTTAGGTGCTTGGAAGTGGATTTTGGAGGGATTGCTGTGATCTTTGACAAACTTAATGTA 51967335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 TTTAGGTGCTTGGAAGTGGATTTTGGAGGGATTGCTGTGATCTTTGACAAACTTAATGTA 2398

 51967336 TCATTCACTTAGGCTGTCATTCAGCAAACCTTCTGTGAAAATAGATTCATCACAAAAGGC 51967395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 TCATTCACTTAGGCTGTCATTCAGCAAACCTTCTGTGAAAATAGATTCATCACAAAAGGC 2458

 51967396 CATGACATTAAAGCTGTATACAACTCTTGAACAGAGTCAAAAAAAAAAACTGGATCTTTA 51967455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2459 CATGACATTAAAGCTGTATACAACTCTTGAACAGAGTCAAAAAAAAAAACTGGATCTTTA 2518

 51967456 TGACTTCCTGAGTGTTCTCTTTTACAAAATCAGGACCACAGACATGTGCATGCCTGCATG 51967515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2519 TGACTTCCTGAGTGTTCTCTTTTACAAAATCAGGACCACAGACATGTGCATGCCTGCATG 2578

 51967516 CAAATGTACACAAAGACACACATTCACACACGCACACTCTCACAAACATACCCCTTGTTG 51967575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2579 CAAATGTACACAAAGACACACATTCACACACGCACACTCTCACAAACATACCCCTTGTTG 2638

 51967576 TAGAAAATAGTATAGTCAAAGTCATAGCCTGATTCTGGCAATTATCTGAGACCCAACAGC 51967635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2639 TAGAAAATAGTATAGTCAAAGTCATAGCCTGATTCTGGCAATTATCTGAGACCCAACAGC 2698

 51967636 ATGTGTTTTACATATTTATACTCACTATTGATTTAAATTTTGTTATTCACTCCCTTTTCC 51967695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2699 ATGTGTTTTACATATTTATACTCACTATTGATTTAAATTTTGTTATTCACTCCCTTTTCC 2758

 51967696 TATTGTCTTATTTTCTTCCTTAACATATTTTTATATTTCCTATTTTAGCGATTTTAAATT 51967755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2759 TATTGTCTTATTTTCTTCCTTAACATATTTTTATATTTCCTATTTTAGCGATTTTAAATT 2818

 51967756 CTTTCTGGAACGACGTTGGCACAAATCAAAAATTAAATCTTATAAAGTGCTCTATGGTCA 51967815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2819 CTTTCTGGAACGACGTTGGCACAAATCAAAAATTAAATCTTATAAAGTGCTCTATGGTCA 2878

 51967816 TAGGCAAAATGGAATCTGTAGATAATCAAGTTCCTGAAGGGATGTGAAACCAACTGCTAC 51967875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2879 TAGGCAAAATGGAATCTGTAGATAATCAAGTTCCTGAAGGGATGTGAAACCAACTGCTAC 2938

 51967876 AAGGATAAGCTAGAAGAATCAGAGATTTTTGGCCTGAAGCACACACAGAAGACTACTTTT 51967935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2939 AAGGATAAGCTAGAAGAATCAGAGATTTTTGGCCTGAAGCACACACAGAAGACTACTTTT 2998

 51967936 AGAGGGGTCTGATGTCACTAACTTCTTGAGATTGCTGCCATTTTTAACATACAGCTAGCT 51967995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2999 AGAGGGGTCTGATGTCACTAACTTCTTGAGATTGCTGCCATTTTTAACATACAGCTAGCT 3058

 51967996 GGATAGAAGAAGACAGTCTCAGATAAATGACCAGTTCAGGCCACCAATGTCTCCTTCCAA 51968055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3059 GGATAGAAGAAGACAGTCTCAGATAAATGACCAGTTCAGGCCACCAATGTCTCCTTCCAA 3118

 51968056 AAAGGCCTGTACTGCTGTACATGCCAAGGGTTAGAGATTTTGGGGCCAACTTTTTCCAGC 51968115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3119 AAAGGCCTGTACTGCTGTACATGCCAAGGGTTAGAGATTTTGGGGCCAACTTTTTCCAGC 3178

 51968116 ATGTCTTATATCCTTCAATAAGTTGGTTACTTTGCAAAACATTAGACCACTTAATAATCA 51968175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3179 ATGTCTTATATCCTTCAATAAGTTGGTTACTTTGCAAAACATTAGACCACTTAATAATCA 3238

 51968176 ATTTCCTCCATGGATTCACTCATACTTTGTCCTCACACTATTCTGGACTCCTTTCTCTTG 51968235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3239 ATTTCCTCCATGGATTCACTCATACTTTGTCCTCACACTATTCTGGACTCCTTTCTCTTG 3298

 51968236 ATTTTATTTCTCCAAGTGATTCAATTGTGTCTTTTGGGACACTTATAAGTAAACATTTCC 51968295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3299 ATTTTATTTCTCCAAGTGATTCAATTGTGTCTTTTGGGACACTTATAAGTAAACATTTCC 3358

 51968296 ACATCCTCAGCTTTATCACAGAATTTTCACTTCCTTGCCTTAAGTGTCCCTGGAGGCTGC 51968355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3359 ACATCCTCAGCTTTATCACAGAATTTTCACTTCCTTGCCTTAAGTGTCCCTGGAGGCTGC 3418

 51968356 TGATCTTACAAGTAAATGTCTGGAGATAGGGTTGACAGCTCTTGAAGGCAGTGCCATTAT 51968415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3419 TGATCTTACAAGTAAATGTCTGGAGATAGGGTTGACAGCTCTTGAAGGCAGTGCCATTAT 3478

 51968416 GAAATCAATCCTAGTCTAAGTAGACATTTTGGGTACCATGCCTTCTTATCTACTTTTGGG 51968475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3479 GAAATCAATCCTAGTCTAAGTAGACATTTTGGGTACCATGCCTTCTTATCTACTTTTGGG 3538

 51968476 CTGTGAGCATCCAGTCATTTTATTTTACCGTACAACTAGAGGTAACTTCTTAAAGTACCA 51968535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3539 CTGTGAGCATCCAGTCATTTTATTTTACCGTACAACTAGAGGTAACTTCTTAAAGTACCA 3598

 51968536 AGTATATCATTCCCTGGTTTAAAGACCTTTAACTGTTAACTATTGCTCTGCATATAAAAT 51968595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3599 AGTATATCATTCCCTGGTTTAAAGACCTTTAACTGTTAACTATTGCTCTGCATATAAAAT 3658

 51968596 CTTAACTTTTGCCATAACTAACAGGGATCTTCTTGATCTAATTCCATCTCAGATCTTAAT 51968655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3659 CTTAACTTTTGCCATAACTAACAGGGATCTTCTTGATCTAATTCCATCTCAGATCTTAAT 3718

 51968656 GTTGTCTACCTGCTGTGCCTGAGGTTTACTGAGTTGCTGACACTTCCTAAAACATGCCTT 51968715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3719 GTTGTCTACCTGCTGTGCCTGAGGTTTACTGAGTTGCTGACACTTCCTAAAACATGCCTT 3778

 51968716 GTTCTCTTACTTTTGGGCCTTCCGGACACCAGCTTTGCTTTCTTGGCCCCACTGAGGGGG 51968775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3779 GTTCTCTTACTTTTGGGCCTTCCGGACACCAGCTTTGCTTTCTTGGCCCCACTGAGGGGG 3838

 51968776 CTTATTTTGTAGATGTCGTTATTTTCGGAGAGGCTTCTATGAACCACCACCCTCTCTGCA 51968835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3839 CTTATTTTGTAGATGTCGTTATTTTCGGAGAGGCTTCTATGAACCACCACCCTCTCTGCA 3898

 51968836 AATTAGGTACTTTTTCTTAGTGCACTCGTCCTCCTTGATCTTATCCTACTGCGACAAAAT 51968895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3899 AATTAGGTACTTTTTCTTAGTGCACTCGTCCTCCTTGATCTTATCCTACTGCGACAAAAT 3958

 51968896 AATTCTTGTAATTGTATGTGTCCACAAATACACTATACATTTTCTATGAATGAAGATTAT 51968955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3959 AATTCTTGTAATTGTATGTGTCCACAAATACACTATACATTTTCTATGAATGAAGATTAT 4018

 51968956 ATCTGCAGCATTCAGTAGCATAACAGAGACTCAATAAATATGTATTGAAATGAATTAAAT 51969015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4019 ATCTGCAGCATTCAGTAGCATAACAGAGACTCAATAAATATGTATTGAAATGAATTAAAT 4078

 51969016 TTAATAGCTGATTACAAATAACTGGCTCTAACATAAAAGTAGAGATAAGTTTGCTTTCAT 51969075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4079 TTAATAGCTGATTACAAATAACTGGCTCTAACATAAAAGTAGAGATAAGTTTGCTTTCAT 4138

 51969076 TCATGTAAAGTAGCAGATGTGAAACCAATGAGGGAGCATTATTGGGGGCATATTTTAATC 51969135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4139 TCATGTAAAGTAGCAGATGTGAAACCAATGAGGGAGCATTATTGGGGGCATATTTTAATC 4198

 51969136 AAAACTACTGAAAAATCTGAAAGAATTATGTAAAGATAAAGTATGCTGTCTTGAGATGTG 51969195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4199 AAAACTACTGAAAAATCTGAAAGAATTATGTAAAGATAAAGTATGCTGTCTTGAGATGTG 4258

 51969196 GTGAGTTTTTCACCAGAATGACTAAAATATGCCTTAGATCATTAGTCCCCAAACCTTCCT 51969255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4259 GTGAGTTTTTCACCAGAATGACTAAAATATGCCTTAGATCATTAGTCCCCAAACCTTCCT 4318

 51969256 TCTTGTGTACAGACTTCTATTAGTTTTATTTTTCTTCTTTTTAAGTAGATATATTTCTAT 51969315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4319 TCTTGTGTACAGACTTCTATTAGTTTTATTTTTCTTCTTTTTAAGTAGATATATTTCTAT 4378

 51969316 AGCCAAAAAATATAGATTTGTTTCCGTTATAAAAATGTGCTATTGCGCTAGTATGTTATA 51969375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4379 AGCCAAAAAATATAGATTTGTTTCCGTTATAAAAATGTGCTATTGCGCTAGTATGTTATA 4438

 51969376 ATAATCATGAAGCCTGCTATAATACATAAAATAGACTACTTAGAGAATAAATGTAAAAAA 51969435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4439 ATAATCATGAAGCCTGCTATAATACATAAAATAGACTACTTAGAGAATAAATGTAAAAAA 4498

 51969436 TTTTCTAGTACTTTTTCCTGTGTCTTAATGAATTGCTTTGTGTACCACCCTGGGTCCTTG 51969495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4499 TTTTCTAGTACTTTTTCCTGTGTCTTAATGAATTGCTTTGTGTACCACCCTGGGTCCTTG 4558

 51969496 CTCTACATTTTGAAATAATTGTAAGGCTATGATTAAATTTTAAACATGATAATATTTTTA 51969555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4559 CTCTACATTTTGAAATAATTGTAAGGCTATGATTAAATTTTAAACATGATAATATTTTTA 4618

 51969556 ATGAATATAGTATAGATTTTTGCCTTGAAATTCTTATTTTGAAAACAATATTGAATTTAG 51969615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4619 ATGAATATAGTATAGATTTTTGCCTTGAAATTCTTATTTTGAAAACAATATTGAATTTAG 4678

 51969616 GCCAAAGAAAAATGTACTTACTTTGTTATCCTTTTTAGCAAAATCAAATTGCTAATGGCA 51969675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4679 GCCAAAGAAAAATGTACTTACTTTGTTATCCTTTTTAGCAAAATCAAATTGCTAATGGCA 4738

 51969676 GTGTTTAGCGTTTTCTGTATGTTGATGACTATGCTTCAGTGGCGTAAAATCTAATGCAAT 51969735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4739 GTGTTTAGCGTTTTCTGTATGTTGATGACTATGCTTCAGTGGCGTAAAATCTAATGCAAT 4798

 51969736 AAACCAGCATTTACTAGTTGTGGCATAATGCAAGAAAGCATCATTTTGCTAAGGGATATC 51969795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4799 AAACCAGCATTTACTAGTTGTGGCATAATGCAAGAAAGCATCATTTTGCTAAGGGATATC 4858

 51969796 TAGGGATTACTAGTTCTCTCTCTTTCTGGTCAGATTTAGTCCTAAACTCCATAAGGCATT 51969855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4859 TAGGGATTACTAGTTCTCTCTCTTTCTGGTCAGATTTAGTCCTAAACTCCATAAGGCATT 4918

 51969856 TACTAACATCTACTTTCAAATGATGAACAACTGTCCTGATCAAAGGAAGATGAAAACACA 51969915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4919 TACTAACATCTACTTTCAAATGATGAACAACTGTCCTGATCAAAGGAAGATGAAAACACA 4978

 51969916 AAATTCTTTATTCTGGAAAACACATCTCCCTAGAGTGTCTCCGCTGCACACTCTTCCACC 51969975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4979 AAATTCTTTATTCTGGAAAACACATCTCCCTAGAGTGTCTCCGCTGCACACTCTTCCACC 5038

 51969976 TTGCATATTTGTATATTCAGACACTAGAAAATTCACGTGAAAGGAGCCTCCACTTTACCA 51970035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5039 TTGCATATTTGTATATTCAGACACTAGAAAATTCACGTGAAAGGAGCCTCCACTTTACCA 5098

 51970036 ATTATCAGAAATATGCAAGTGAATTTAATATCACTAATAGTTGGCATGTCAATGATTAGA 51970095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5099 ATTATCAGAAATATGCAAGTGAATTTAATATCACTAATAGTTGGCATGTCAATGATTAGA 5158

 51970096 TAATCTATTTGAAATGCTTATTCTATAAAGTTGTATTTTAACCAACAGTTTTATGAAGAG 51970155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5159 TAATCTATTTGAAATGCTTATTCTATAAAGTTGTATTTTAACCAACAGTTTTATGAAGAG 5218

 51970156 TGTTCAGTCCTCATAAAATCATCTCAGTTCCCATTTGTGCACTCAGAAACTTACCACTGT 51970215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5219 TGTTCAGTCCTCATAAAATCATCTCAGTTCCCATTTGTGCACTCAGAAACTTACCACTGT 5278

 51970216 GTTCTGTTTTTATCTTTATAATCTATATTTAACAATTGCATTGTATCTTCCCTGGTCTCC 51970275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5279 GTTCTGTTTTTATCTTTATAATCTATATTTAACAATTGCATTGTATCTTCCCTGGTCTCC 5338

 51970276 AGCTCTAAGCAAATAAATACTCTTCTTCTTTCTTTTTTCTTGTATATAAATGATTACAGA 51970335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5339 AGCTCTAAGCAAATAAATACTCTTCTTCTTTCTTTTTTCTTGTATATAAATGATTACAGA 5398

 51970336 GAATGGGACAGAGAGAGAAAATGAAGAGACATAGTTAGAGAGATACACAGGCACAGAGAG 51970395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5399 GAATGGGACAGAGAGAGAAAATGAAGAGACATAGTTAGAGAGATACACAGGCACAGAGAG 5458

 51970396 AGAGAGAGAGAAAAAGAGGAGGAGAAGAGAAGAGAGAAGAGACAGAGGAGAGAGAATGCA 51970455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5459 AGAGAGAGAGAAAAAGAGGAGGAGAAGAGAAGAGAGAAGAGACAGAGGAGAGAGAATGCA 5518

 51970456 GAGAATTTACAATTACTATAGAAAATGTGCACATTTTTCATAATAAAAATGAGTAAATAC 51970515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5519 GAGAATTTACAATTACTATAGAAAATGTGCACATTTTTCATAATAAAAATGAGTAAATAC 5578

 51970516 TTTCATGATATTATTATCACAGACTGATGATCTGACATAGATTTCGTGCCGTCTACCTGG 51970575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5579 TTTCATGATATTATTATCACAGACTGATGATCTGACATAGATTTCGTGCCGTCTACCTGG 5638

 51970576 GTCTCTACACGACAAACCTGAGTTAGATGTAATGTAGAGATATGTTTCCACATTGCCCTT 51970635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5639 GTCTCTACACGACAAACCTGAGTTAGATGTAATGTAGAGATATGTTTCCACATTGCCCTT 5698

 51970636 CTTGGGGAAGGTGAGCCAGTTCTGAGGTGCCTGGTCCTAGTTGTCACAGATGCAGTTATT 51970695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5699 CTTGGGGAAGGTGAGCCAGTTCTGAGGTGCCTGGTCCTAGTTGTCACAGATGCAGTTATT 5758

 51970696 TCACACTAGGCTGCCTGCCAGCCTGGATTTGTCTTCCTTTTTTTTTTTTTTGTTTTCAAT 51970755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5759 TCACACTAGGCTGCCTGCCAGCCTGGATTTGTCTTCCTTTTTTTTTTTTTTGTTTTCAAT 5818

 51970756 CTCCCTGGGCTTGCGTCATTACATCAACACATTCTGAAACATCTGTCAGAATCCTTGCCA 51970815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5819 CTCCCTGGGCTTGCGTCATTACATCAACACATTCTGAAACATCTGTCAGAATCCTTGCCA 5878

 51970816 GTTCAAATTTACAAAAGTGCAATAATATTCTATCTCCCCATCACCACCAAATCTTGCTAA 51970875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5879 GTTCAAATTTACAAAAGTGCAATAATATTCTATCTCCCCATCACCACCAAATCTTGCTAA 5938

 51970876 AATAAAATCATACATTTATTTATAAAAGTTTGTTGTTAAGAAAAAAACTGAAAACATCAT 51970935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5939 AATAAAATCATACATTTATTTATAAAAGTTTGTTGTTAAGAAAAAAACTGAAAACATCAT 5998

 51970936 GAAGGTCTGAGAGAAATAAAGTGGAATTTAGAAGTATTGTATCCATGTCATATGACATAT 51970995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5999 GAAGGTCTGAGAGAAATAAAGTGGAATTTAGAAGTATTGTATCCATGTCATATGACATAT 6058

 51970996 AAAAGTTTGTAATCATTAAAGATGATGAGTAATATATGGTAAGGAATATTTGGAAAACTT 51971055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6059 AAAAGTTTGTAATCATTAAAGATGATGAGTAATATATGGTAAGGAATATTTGGAAAACTT 6118

 51971056 CTTTCAGTGTTAAAAAAGAAAAATAAAGAAGAGTCAAATTGTATTGCCTCAGTTTTATTA 51971115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6119 CTTTCAGTGTTAAAAAAGAAAAATAAAGAAGAGTCAAATTGTATTGCCTCAGTTTTATTA 6178

 51971116 AACACTTATGTATTTTACATACATTTAAAAAACTTAGCCGGGTGTGGTGGCGCGCGCTTG 51971175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6179 AACACTTATGTATTTTACATACATTTAAAAAACTTAGCCGGGTGTGGTGGCGCGCGCTTG 6238

 51971176 TAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGTGGAGGT 51971235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6239 TAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGTGGAGGT 6298

 51971236 TGCAGTGAGTGGAAATTGTGCCACTGAACTCCAGCCTGGGGGATAGGGCAAGATTCTGTC 51971295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6299 TGCAGTGAGTGGAAATTGTGCCACTGAACTCCAGCCTGGGGGATAGGGCAAGATTCTGTC 6358

 51971296 TCAAAAAAATAAAGGAAAAAAAAATTTTAATTTGAATAGTTCGCTAGTGCTAAATGTTTA 51971355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6359 TCAAAAAAATAAAGGAAAAAAAAATTTTAATTTGAATAGTTCGCTAGTGCTAAATGTTTA 6418

 51971356 TGGTTTTGAATCTGAATGTTTTCATAACATTTTATTTTTAGCGTATTTTTTAGGTTTCCA 51971415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6419 TGGTTTTGAATCTGAATGTTTTCATAACATTTTATTTTTAGCGTATTTTTTAGGTTTCCA 6478

 51971416 TATTCCAGTGTTGCTGCAACAAATACGTAATGTTTATAATCAGAAAAGCATTGTTAAATA 51971475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6479 TATTCCAGTGTTGCTGCAACAAATACGTAATGTTTATAATCAGAAAAGCATTGTTAAATA 6538

 51971476 ACCTCTGCAAAAACTCTTTAATCTCCCTAATCTAGGGATAGGGAATTATTTTATCTATAA 51971535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6539 ACCTCTGCAAAAACTCTTTAATCTCCCTAATCTAGGGATAGGGAATTATTTTATCTATAA 6598

 51971536 TTTTAATTCTAATTGTTAGAGTGTGGCTGCCTGGAGCACTGACTTGAAAATAAATCTGAA 51971595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6599 TTTTAATTCTAATTGTTAGAGTGTGGCTGCCTGGAGCACTGACTTGAAAATAAATCTGAA 6658

 51971596 ACCCATCAGGAAAAAATAATGTCAATTAACATTGGTTGTCATTTGTTCAAGAGGAAAAAG 51971655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6659 ACCCATCAGGAAAAAATAATGTCAATTAACATTGGTTGTCATTTGTTCAAGAGGAAAAAG 6718

 51971656 TCGGAGCATGATACCCCATATTTGCCATGCATTCTGAAATGTTTTCTTTTGTCTTTTACT 51971715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6719 TCGGAGCATGATACCCCATATTTGCCATGCATTCTGAAATGTTTTCTTTTGTCTTTTACT 6778

 51971716 TTAAAAAAAGATGGATGATTTTATTTATATATTAGAACTCATGATCTATATTTTCAACTC 51971775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6779 TTAAAAAAAGATGGATGATTTTATTTATATATTAGAACTCATGATCTATATTTTCAACTC 6838

 51971776 TGCTCCAGTAAGTCTCTTATTCATTTGGTTAAAGCACCAATTACACTTACCCCGTAGTTT 51971835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6839 TGCTCCAGTAAGTCTCTTATTCATTTGGTTAAAGCACCAATTACACTTACCCCGTAGTTT 6898

 51971836 CTGATTTTTGATAGGACATTAGGAGAAAGACCATACATTTAAGGGCAATGAAAATAAATA 51971895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6899 CTGATTTTTGATAGGACATTAGGAGAAAGACCATACATTTAAGGGCAATGAAAATAAATA 6958

 51971896 TCTAAGATGAAGTGATTATTATAACTTTGCAATATGGATTGAACCTGGACTAAGTACTAG 51971955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6959 TCTAAGATGAAGTGATTATTATAACTTTGCAATATGGATTGAACCTGGACTAAGTACTAG 7018

 51971956 TGCTATATCAGGAAGCTGGATCAATTTGACACCTACTGAAAGTGACACATGGGCCTTGCT 51972015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7019 TGCTATATCAGGAAGCTGGATCAATTTGACACCTACTGAAAGTGACACATGGGCCTTGCT 7078

 51972016 AAAGAAAGAGTTTAAATCTGGTAGTGCTTCAGAATTTTTATTTCAGTGAGGTTCTGTAAA 51972075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7079 AAAGAAAGAGTTTAAATCTGGTAGTGCTTCAGAATTTTTATTTCAGTGAGGTTCTGTAAA 7138

 51972076 ATTAAATTCATCTGGCATTGTGGGAAAAAGTTGTATTATATATGAACCAATTTCTTAAAT 51972135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7139 ATTAAATTCATCTGGCATTGTGGGAAAAAGTTGTATTATATATGAACCAATTTCTTAAAT 7198

 51972136 AAGTGCAACTTAATCTTCTAAGAAACTTTAAAATATTTAATCTTGTTGGGTATTTTTTTT 51972195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7199 AAGTGCAACTTAATCTTCTAAGAAACTTTAAAATATTTAATCTTGTTGGGTATTTTTTTT 7258

 51972196 TCCATTTTTTTCTTGCTATTTCTTTAGGGAAAAAAAACAGAATATATAACACTCTTCATT 51972255
          ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
     7259 TCCATTTTTTTCTTGCTATTTCTTTAGGG-AAAAAAACAGAATATATAACACTCTTCATT 7317

 51972256 AGTATGGAACACACATACTATTTTATTTCCTATTTTAAAACTTAATTACTCAAATACTCC 51972315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7318 AGTATGGAACACACATACTATTTTATTTCCTATTTTAAAACTTAATTACTCAAATACTCC 7377

 51972316 ATGAATTTATTAGCAATTGATCCAATATTTCCCTCTTTAATGTCAATTGCTGCTCCCTTT 51972375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7378 ATGAATTTATTAGCAATTGATCCAATATTTCCCTCTTTAATGTCAATTGCTGCTCCCTTT 7437

 51972376 TCCTTATGCATAGTACATGGATCCTCAGGATTCACTTACGCAGTCCACTGAGCAGTGGCC 51972435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7438 TCCTTATGCATAGTACATGGATCCTCAGGATTCACTTACGCAGTCCACTGAGCAGTGGCC 7497

 51972436 ATTCACACTTTTAATGTGAGGAAGAGTGAGAGAAAGGAAAACAGAAATTATTTCATACCA 51972495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7498 ATTCACACTTTTAATGTGAGGAAGAGTGAGAGAAAGGAAAACAGAAATTATTTCATACCA 7557

 51972496 AAAGAGCCCCTGATTTTTCACTGCTTCTTTTGTTATTCACATACAGGAGGATATGTTCCT 51972555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7558 AAAGAGCCCCTGATTTTTCACTGCTTCTTTTGTTATTCACATACAGGAGGATATGTTCCT 7617

 51972556 AATCACTTTTATGATGTGAACATGCCTGCACAGTTGCCACTGCTGCATCATGTTGGGGTT 51972615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7618 AATCACTTTTATGATGTGAACATGCCTGCACAGTTGCCACTGCTGCATCATGTTGGGGTT 7677

 51972616 CCCAAATTTAGACCTTTTTCCACTTACACTTTGTTCTCAACCACTGTGCCCTCAAAATGA 51972675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7678 CCCAAATTTAGACCTTTTTCCACTTACACTTTGTTCTCAACCACTGTGCCCTCAAAATGA 7737

 51972676 CCACTATTCCAGCATATCTGAGGTAAGAGAGAGCTTCTTGCCTGAGACACAAAGTGTGCC 51972735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7738 CCACTATTCCAGCATATCTGAGGTAAGAGAGAGCTTCTTGCCTGAGACACAAAGTGTGCC 7797

 51972736 CAGAACTAGAATTCTGCTTCTAATACTCAAACTCTGGTGTTATGTTGGAGTTACCAGCCC 51972795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7798 CAGAACTAGAATTCTGCTTCTAATACTCAAACTCTGGTGTTATGTTGGAGTTACCAGCCC 7857

 51972796 AGACCTCTTCCTTTGTAATAAGTTTCCATTTGTGATCAGCAATGGCCCTTTCTGGAACCA 51972855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7858 AGACCTCTTCCTTTGTAATAAGTTTCCATTTGTGATCAGCAATGGCCCTTTCTGGAACCA 7917

 51972856 TCTCAAGCCATCAGTGAAGTTTGACTAACTTTGAAAGGATGGGGGCCTTGATCTTTTATT 51972915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7918 TCTCAAGCCATCAGTGAAGTTTGACTAACTTTGAAAGGATGGGGGCCTTGATCTTTTATT 7977

 51972916 TTCTGAAGATTCCTGGCACACTATGCTAATGTACTCATATTCATTCCTCATACCTAGCTT 51972975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7978 TTCTGAAGATTCCTGGCACACTATGCTAATGTACTCATATTCATTCCTCATACCTAGCTT 8037

 51972976 TGTAAATGTAGAACTCAAACTTTTAAGAAGACACTCTCCACAGGAAGTGGATATCTCTTT 51973035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8038 TGTAAATGTAGAACTCAAACTTTTAAGAAGACACTCTCCACAGGAAGTGGATATCTCTTT 8097

 51973036 CCCAACATAAGTGAGGCCACAGATTAGCACAGACAATTAAAGAGGTAAAATCTGCCAAAC 51973095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8098 CCCAACATAAGTGAGGCCACAGATTAGCACAGACAATTAAAGAGGTAAAATCTGCCAAAC 8157

 51973096 GTTTTTTTTTTTATTCTAGCTTAGAAATGATTGGCAAGACTTAAGTTTTTTCCAATACAA 51973155
          | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8158 G-TTTTTTTTTTATTCTAGCTTAGAAATGATTGGCAAGACTTAAGTTTTTTCCAATACAA 8216

 51973156 CTTTTAACTTATCTCTATTACAAATATACACACAATTATTAATTAATTTATTAGTTTTCA 51973215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8217 CTTTTAACTTATCTCTATTACAAATATACACACAATTATTAATTAATTTATTAGTTTTCA 8276

 51973216 TTGATACCTAATAATTTTACTTTTTTATAGAGCACACAGGATGTTCTGTACACATATAGA 51973275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8277 TTGATACCTAATAATTTTACTTTTTTATAGAGCACACAGGATGTTCTGTACACATATAGA 8336

 51973276 ATTTGTAACGATCCAATCAAGGTATTTAGGTTATTCATCATCTCAAACATTTATAATTTC 51973335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8337 ATTTGTAACGATCCAATCAAGGTATTTAGGTTATTCATCATCTCAAACATTTATAATTTC 8396

 51973336 TTTGTGTTGAGTATGTCTCCAATCTTCTACCTCTTCTGAAATATACAATAAACTCTATTT 51973395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8397 TTTGTGTTGAGTATGTCTCCAATCTTCTACCTCTTCTGAAATATACAATAAACTCTATTT 8456

 51973396 TTAACTACAGTCACTCTACTTGTCTCATATGGTACCAAACTAGATCGTTGTTGTCTTGAT 51973455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8457 TTAACTACAGTCACTCTACTTGTCTCATATGGTACCAAACTAGATCGTTGTTGTCTTGAT 8516

 51973456 AACACAGCATTATCATTATAGCTGTAATACATAATGCTGTACCTCCTCTCCTAACCCTGG 51973515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8517 AACACAGCATTATCATTATAGCTGTAATACATAATGCTGTACCTCCTCTCCTAACCCTGG 8576

 51973516 AAGTTGCAATTCATCCTTCAATGCTCAGCTCAAAGGATTATTGTCTCTAAAGTTTTAGCA 51973575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8577 AAGTTGCAATTCATCCTTCAATGCTCAGCTCAAAGGATTATTGTCTCTAAAGTTTTAGCA 8636

 51973576 AATGCTGAAGCAGAATTTCACCATTTAATGGGTTCACAAGCTGCTGCCTTTATAGCTTAT 51973635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8637 AATGCTGAAGCAGAATTTCACCATTTAATGGGTTCACAAGCTGCTGCCTTTATAGCTTAT 8696

 51973636 GGTACATATGTTTGCCAATATAAATGATCCACTTGAGCTAAATTGCCACAGCTGCTACAA 51973695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8697 GGTACATATGTTTGCCAATATAAATGATCCACTTGAGCTAAATTGCCACAGCTGCTACAA 8756

 51973696 CACCTCTTTACCTATTTTTGGAGCAAAACTGAAAATCAGAAAAGTTTAACTTTTTCAAAA 51973755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8757 CACCTCTTTACCTATTTTTGGAGCAAAACTGAAAATCAGAAAAGTTTAACTTTTTCAAAA 8816

 51973756 TAATGAAAAATTTCTCTCCAATCCTCTCCATCATTATACATTAATAGGAAAAGAAAGGAC 51973815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8817 TAATGAAAAATTTCTCTCCAATCCTCTCCATCATTATACATTAATAGGAAAAGAAAGGAC 8876

 51973816 AAAGACAAGGTTACAAATGTGAAAGGGTTATTTTTTTCTATTCTGATAGAAATAAGTTTA 51973875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8877 AAAGACAAGGTTACAAATGTGAAAGGGTTATTTTTTTCTATTCTGATAGAAATAAGTTTA 8936

 51973876 GAGCACCTGCATGAACAACTTGTATTGAACAGCAATGCAAGGAACTGCATACCGAAAAGA 51973935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8937 GAGCACCTGCATGAACAACTTGTATTGAACAGCAATGCAAGGAACTGCATACCGAAAAGA 8996

 51973936 AGAATCTCTTAGTGACAAGAACCGTGTTGACCATGCAACACTATTAGCAAGTTTATTTTC 51973995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8997 AGAATCTCTTAGTGACAAGAACCGTGTTGACCATGCAACACTATTAGCAAGTTTATTTTC 9056

 51973996 ATTCTTTATGTAGATGTCAGGGATATGTAGCAAAAATACATTTTTAAGTGCAACAGAGTA 51974055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9057 ATTCTTTATGTAGATGTCAGGGATATGTAGCAAAAATACATTTTTAAGTGCAACAGAGTA 9116

 51974056 GATGCTTGCAAAAACAGACTGTGATAACTATCTATTTGCAAAAGTCAGTACAGATATGAT 51974115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9117 GATGCTTGCAAAAACAGACTGTGATAACTATCTATTTGCAAAAGTCAGTACAGATATGAT 9176

 51974116 TATCTCAGCATTAAATTGGCTGATGTAAAATGGAAATCATGAAAATTAAGTCACCACACA 51974175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9177 TATCTCAGCATTAAATTGGCTGATGTAAAATGGAAATCATGAAAATTAAGTCACCACACA 9236

 51974176 ATAAAATGACAATAG 51974190
          |||||||||||||||
     9237 ATAAAATGACAATAG 9251

Alignment time is 6.73829 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51963823,51984240] =>     20418 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [       1,    4591] =>      4591 nucs 'mol-32-2fee-207022_4591'

Score:        4581
Aligned:      4592        nucs
Identic:      4591 (100%) nucs =>       914 (100%)      3677 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51969819,51970732] EXCISED REGION [51970734,51974411]
 second seq =>  [       1,     914] EXCISED REGION [     915,    4591]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [51970733,51970733]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        13 nucs [51970733,51970745] to [51970734,51970746]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 51969819 TTCTGGTCAGATTTAGTCCTAAACTCCATAAGGCATTTACTAACATCTACTTTCAAATGA 51969878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTCTGGTCAGATTTAGTCCTAAACTCCATAAGGCATTTACTAACATCTACTTTCAAATGA 60

 51969879 TGAACAACTGTCCTGATCAAAGGAAGATGAAAACACAAAATTCTTTATTCTGGAAAACAC 51969938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGAACAACTGTCCTGATCAAAGGAAGATGAAAACACAAAATTCTTTATTCTGGAAAACAC 120

 51969939 ATCTCCCTAGAGTGTCTCCGCTGCACACTCTTCCACCTTGCATATTTGTATATTCAGACA 51969998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATCTCCCTAGAGTGTCTCCGCTGCACACTCTTCCACCTTGCATATTTGTATATTCAGACA 180

 51969999 CTAGAAAATTCACGTGAAAGGAGCCTCCACTTTACCAATTATCAGAAATATGCAAGTGAA 51970058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTAGAAAATTCACGTGAAAGGAGCCTCCACTTTACCAATTATCAGAAATATGCAAGTGAA 240

 51970059 TTTAATATCACTAATAGTTGGCATGTCAATGATTAGATAATCTATTTGAAATGCTTATTC 51970118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTTAATATCACTAATAGTTGGCATGTCAATGATTAGATAATCTATTTGAAATGCTTATTC 300

 51970119 TATAAAGTTGTATTTTAACCAACAGTTTTATGAAGAGTGTTCAGTCCTCATAAAATCATC 51970178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TATAAAGTTGTATTTTAACCAACAGTTTTATGAAGAGTGTTCAGTCCTCATAAAATCATC 360

 51970179 TCAGTTCCCATTTGTGCACTCAGAAACTTACCACTGTGTTCTGTTTTTATCTTTATAATC 51970238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCAGTTCCCATTTGTGCACTCAGAAACTTACCACTGTGTTCTGTTTTTATCTTTATAATC 420

 51970239 TATATTTAACAATTGCATTGTATCTTCCCTGGTCTCCAGCTCTAAGCAAATAAATACTCT 51970298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TATATTTAACAATTGCATTGTATCTTCCCTGGTCTCCAGCTCTAAGCAAATAAATACTCT 480

 51970299 TCTTCTTTCTTTTTTCTTGTATATAAATGATTACAGAGAATGGGACAGAGAGAGAAAATG 51970358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCTTCTTTCTTTTTTCTTGTATATAAATGATTACAGAGAATGGGACAGAGAGAGAAAATG 540

 51970359 AAGAGACATAGTTAGAGAGATACACAGGCACAGAGAGAGAGAGAGAGAAAAAGAGGAGGA 51970418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAGAGACATAGTTAGAGAGATACACAGGCACAGAGAGAGAGAGAGAGAAAAAGAGGAGGA 600

 51970419 GAAGAGAAGAGAGAAGAGACAGAGGAGAGAGAATGCAGAGAATTTACAATTACTATAGAA 51970478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GAAGAGAAGAGAGAAGAGACAGAGGAGAGAGAATGCAGAGAATTTACAATTACTATAGAA 660

 51970479 AATGTGCACATTTTTCATAATAAAAATGAGTAAATACTTTCATGATATTATTATCACAGA 51970538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AATGTGCACATTTTTCATAATAAAAATGAGTAAATACTTTCATGATATTATTATCACAGA 720

 51970539 CTGATGATCTGACATAGATTTCGTGCCGTCTACCTGGGTCTCTACACGACAAACCTGAGT 51970598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTGATGATCTGACATAGATTTCGTGCCGTCTACCTGGGTCTCTACACGACAAACCTGAGT 780

 51970599 TAGATGTAATGTAGAGATATGTTTCCACATTGCCCTTCTTGGGGAAGGTGAGCCAGTTCT 51970658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TAGATGTAATGTAGAGATATGTTTCCACATTGCCCTTCTTGGGGAAGGTGAGCCAGTTCT 840

 51970659 GAGGTGCCTGGTCCTAGTTGTCACAGATGCAGTTATTTCACACTAGGCTGCCTGCCAGCC 51970718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GAGGTGCCTGGTCCTAGTTGTCACAGATGCAGTTATTTCACACTAGGCTGCCTGCCAGCC 900

 51970719 TGGATTTGTCTTCC 51970732
          ||||||||||||||
      901 TGGATTTGTCTTCC 914

EXCISED REGION

 51970734 TTTTTTTTTTTTTGTTTTCAATCTCCCTGGGCTTGCGTCATTACATCAACACATTCTGAA 51970793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      915 TTTTTTTTTTTTTGTTTTCAATCTCCCTGGGCTTGCGTCATTACATCAACACATTCTGAA 974

 51970794 ACATCTGTCAGAATCCTTGCCAGTTCAAATTTACAAAAGTGCAATAATATTCTATCTCCC 51970853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      975 ACATCTGTCAGAATCCTTGCCAGTTCAAATTTACAAAAGTGCAATAATATTCTATCTCCC 1034

 51970854 CATCACCACCAAATCTTGCTAAAATAAAATCATACATTTATTTATAAAAGTTTGTTGTTA 51970913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1035 CATCACCACCAAATCTTGCTAAAATAAAATCATACATTTATTTATAAAAGTTTGTTGTTA 1094

 51970914 AGAAAAAAACTGAAAACATCATGAAGGTCTGAGAGAAATAAAGTGGAATTTAGAAGTATT 51970973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1095 AGAAAAAAACTGAAAACATCATGAAGGTCTGAGAGAAATAAAGTGGAATTTAGAAGTATT 1154

 51970974 GTATCCATGTCATATGACATATAAAAGTTTGTAATCATTAAAGATGATGAGTAATATATG 51971033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1155 GTATCCATGTCATATGACATATAAAAGTTTGTAATCATTAAAGATGATGAGTAATATATG 1214

 51971034 GTAAGGAATATTTGGAAAACTTCTTTCAGTGTTAAAAAAGAAAAATAAAGAAGAGTCAAA 51971093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1215 GTAAGGAATATTTGGAAAACTTCTTTCAGTGTTAAAAAAGAAAAATAAAGAAGAGTCAAA 1274

 51971094 TTGTATTGCCTCAGTTTTATTAAACACTTATGTATTTTACATACATTTAAAAAACTTAGC 51971153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1275 TTGTATTGCCTCAGTTTTATTAAACACTTATGTATTTTACATACATTTAAAAAACTTAGC 1334

 51971154 CGGGTGTGGTGGCGCGCGCTTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCA 51971213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1335 CGGGTGTGGTGGCGCGCGCTTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCA 1394

 51971214 CTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGTGGAAATTGTGCCACTGAACTCCAGCCTG 51971273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1395 CTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGTGGAAATTGTGCCACTGAACTCCAGCCTG 1454

 51971274 GGGGATAGGGCAAGATTCTGTCTCAAAAAAATAAAGGAAAAAAAAATTTTAATTTGAATA 51971333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1455 GGGGATAGGGCAAGATTCTGTCTCAAAAAAATAAAGGAAAAAAAAATTTTAATTTGAATA 1514

 51971334 GTTCGCTAGTGCTAAATGTTTATGGTTTTGAATCTGAATGTTTTCATAACATTTTATTTT 51971393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1515 GTTCGCTAGTGCTAAATGTTTATGGTTTTGAATCTGAATGTTTTCATAACATTTTATTTT 1574

 51971394 TAGCGTATTTTTTAGGTTTCCATATTCCAGTGTTGCTGCAACAAATACGTAATGTTTATA 51971453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1575 TAGCGTATTTTTTAGGTTTCCATATTCCAGTGTTGCTGCAACAAATACGTAATGTTTATA 1634

 51971454 ATCAGAAAAGCATTGTTAAATAACCTCTGCAAAAACTCTTTAATCTCCCTAATCTAGGGA 51971513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1635 ATCAGAAAAGCATTGTTAAATAACCTCTGCAAAAACTCTTTAATCTCCCTAATCTAGGGA 1694

 51971514 TAGGGAATTATTTTATCTATAATTTTAATTCTAATTGTTAGAGTGTGGCTGCCTGGAGCA 51971573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1695 TAGGGAATTATTTTATCTATAATTTTAATTCTAATTGTTAGAGTGTGGCTGCCTGGAGCA 1754

 51971574 CTGACTTGAAAATAAATCTGAAACCCATCAGGAAAAAATAATGTCAATTAACATTGGTTG 51971633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1755 CTGACTTGAAAATAAATCTGAAACCCATCAGGAAAAAATAATGTCAATTAACATTGGTTG 1814

 51971634 TCATTTGTTCAAGAGGAAAAAGTCGGAGCATGATACCCCATATTTGCCATGCATTCTGAA 51971693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1815 TCATTTGTTCAAGAGGAAAAAGTCGGAGCATGATACCCCATATTTGCCATGCATTCTGAA 1874

 51971694 ATGTTTTCTTTTGTCTTTTACTTTAAAAAAAGATGGATGATTTTATTTATATATTAGAAC 51971753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1875 ATGTTTTCTTTTGTCTTTTACTTTAAAAAAAGATGGATGATTTTATTTATATATTAGAAC 1934

 51971754 TCATGATCTATATTTTCAACTCTGCTCCAGTAAGTCTCTTATTCATTTGGTTAAAGCACC 51971813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1935 TCATGATCTATATTTTCAACTCTGCTCCAGTAAGTCTCTTATTCATTTGGTTAAAGCACC 1994

 51971814 AATTACACTTACCCCGTAGTTTCTGATTTTTGATAGGACATTAGGAGAAAGACCATACAT 51971873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1995 AATTACACTTACCCCGTAGTTTCTGATTTTTGATAGGACATTAGGAGAAAGACCATACAT 2054

 51971874 TTAAGGGCAATGAAAATAAATATCTAAGATGAAGTGATTATTATAACTTTGCAATATGGA 51971933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2055 TTAAGGGCAATGAAAATAAATATCTAAGATGAAGTGATTATTATAACTTTGCAATATGGA 2114

 51971934 TTGAACCTGGACTAAGTACTAGTGCTATATCAGGAAGCTGGATCAATTTGACACCTACTG 51971993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2115 TTGAACCTGGACTAAGTACTAGTGCTATATCAGGAAGCTGGATCAATTTGACACCTACTG 2174

 51971994 AAAGTGACACATGGGCCTTGCTAAAGAAAGAGTTTAAATCTGGTAGTGCTTCAGAATTTT 51972053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2175 AAAGTGACACATGGGCCTTGCTAAAGAAAGAGTTTAAATCTGGTAGTGCTTCAGAATTTT 2234

 51972054 TATTTCAGTGAGGTTCTGTAAAATTAAATTCATCTGGCATTGTGGGAAAAAGTTGTATTA 51972113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2235 TATTTCAGTGAGGTTCTGTAAAATTAAATTCATCTGGCATTGTGGGAAAAAGTTGTATTA 2294

 51972114 TATATGAACCAATTTCTTAAATAAGTGCAACTTAATCTTCTAAGAAACTTTAAAATATTT 51972173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2295 TATATGAACCAATTTCTTAAATAAGTGCAACTTAATCTTCTAAGAAACTTTAAAATATTT 2354

 51972174 AATCTTGTTGGGTATTTTTTTTTCCATTTTTTTCTTGCTATTTCTTTAGGGAAAAAAAAC 51972233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
     2355 AATCTTGTTGGGTATTTTTTTTTCCATTTTTTTCTTGCTATTTCTTTAGGG-AAAAAAAC 2413

 51972234 AGAATATATAACACTCTTCATTAGTATGGAACACACATACTATTTTATTTCCTATTTTAA 51972293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2414 AGAATATATAACACTCTTCATTAGTATGGAACACACATACTATTTTATTTCCTATTTTAA 2473

 51972294 AACTTAATTACTCAAATACTCCATGAATTTATTAGCAATTGATCCAATATTTCCCTCTTT 51972353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2474 AACTTAATTACTCAAATACTCCATGAATTTATTAGCAATTGATCCAATATTTCCCTCTTT 2533

 51972354 AATGTCAATTGCTGCTCCCTTTTCCTTATGCATAGTACATGGATCCTCAGGATTCACTTA 51972413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2534 AATGTCAATTGCTGCTCCCTTTTCCTTATGCATAGTACATGGATCCTCAGGATTCACTTA 2593

 51972414 CGCAGTCCACTGAGCAGTGGCCATTCACACTTTTAATGTGAGGAAGAGTGAGAGAAAGGA 51972473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2594 CGCAGTCCACTGAGCAGTGGCCATTCACACTTTTAATGTGAGGAAGAGTGAGAGAAAGGA 2653

 51972474 AAACAGAAATTATTTCATACCAAAAGAGCCCCTGATTTTTCACTGCTTCTTTTGTTATTC 51972533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2654 AAACAGAAATTATTTCATACCAAAAGAGCCCCTGATTTTTCACTGCTTCTTTTGTTATTC 2713

 51972534 ACATACAGGAGGATATGTTCCTAATCACTTTTATGATGTGAACATGCCTGCACAGTTGCC 51972593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2714 ACATACAGGAGGATATGTTCCTAATCACTTTTATGATGTGAACATGCCTGCACAGTTGCC 2773

 51972594 ACTGCTGCATCATGTTGGGGTTCCCAAATTTAGACCTTTTTCCACTTACACTTTGTTCTC 51972653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2774 ACTGCTGCATCATGTTGGGGTTCCCAAATTTAGACCTTTTTCCACTTACACTTTGTTCTC 2833

 51972654 AACCACTGTGCCCTCAAAATGACCACTATTCCAGCATATCTGAGGTAAGAGAGAGCTTCT 51972713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2834 AACCACTGTGCCCTCAAAATGACCACTATTCCAGCATATCTGAGGTAAGAGAGAGCTTCT 2893

 51972714 TGCCTGAGACACAAAGTGTGCCCAGAACTAGAATTCTGCTTCTAATACTCAAACTCTGGT 51972773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2894 TGCCTGAGACACAAAGTGTGCCCAGAACTAGAATTCTGCTTCTAATACTCAAACTCTGGT 2953

 51972774 GTTATGTTGGAGTTACCAGCCCAGACCTCTTCCTTTGTAATAAGTTTCCATTTGTGATCA 51972833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2954 GTTATGTTGGAGTTACCAGCCCAGACCTCTTCCTTTGTAATAAGTTTCCATTTGTGATCA 3013

 51972834 GCAATGGCCCTTTCTGGAACCATCTCAAGCCATCAGTGAAGTTTGACTAACTTTGAAAGG 51972893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3014 GCAATGGCCCTTTCTGGAACCATCTCAAGCCATCAGTGAAGTTTGACTAACTTTGAAAGG 3073

 51972894 ATGGGGGCCTTGATCTTTTATTTTCTGAAGATTCCTGGCACACTATGCTAATGTACTCAT 51972953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3074 ATGGGGGCCTTGATCTTTTATTTTCTGAAGATTCCTGGCACACTATGCTAATGTACTCAT 3133

 51972954 ATTCATTCCTCATACCTAGCTTTGTAAATGTAGAACTCAAACTTTTAAGAAGACACTCTC 51973013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3134 ATTCATTCCTCATACCTAGCTTTGTAAATGTAGAACTCAAACTTTTAAGAAGACACTCTC 3193

 51973014 CACAGGAAGTGGATATCTCTTTCCCAACATAAGTGAGGCCACAGATTAGCACAGACAATT 51973073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3194 CACAGGAAGTGGATATCTCTTTCCCAACATAAGTGAGGCCACAGATTAGCACAGACAATT 3253

 51973074 AAAGAGGTAAAATCTGCCAAACGTTTTTTTTTTTATTCTAGCTTAGAAATGATTGGCAAG 51973133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3254 AAAGAGGTAAAATCTGCCAAACGTTTTTTTTTTTATTCTAGCTTAGAAATGATTGGCAAG 3313

 51973134 ACTTAAGTTTTTTCCAATACAACTTTTAACTTATCTCTATTACAAATATACACACAATTA 51973193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3314 ACTTAAGTTTTTTCCAATACAACTTTTAACTTATCTCTATTACAAATATACACACAATTA 3373

 51973194 TTAATTAATTTATTAGTTTTCATTGATACCTAATAATTTTACTTTTTTATAGAGCACACA 51973253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3374 TTAATTAATTTATTAGTTTTCATTGATACCTAATAATTTTACTTTTTTATAGAGCACACA 3433

 51973254 GGATGTTCTGTACACATATAGAATTTGTAACGATCCAATCAAGGTATTTAGGTTATTCAT 51973313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3434 GGATGTTCTGTACACATATAGAATTTGTAACGATCCAATCAAGGTATTTAGGTTATTCAT 3493

 51973314 CATCTCAAACATTTATAATTTCTTTGTGTTGAGTATGTCTCCAATCTTCTACCTCTTCTG 51973373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3494 CATCTCAAACATTTATAATTTCTTTGTGTTGAGTATGTCTCCAATCTTCTACCTCTTCTG 3553

 51973374 AAATATACAATAAACTCTATTTTTAACTACAGTCACTCTACTTGTCTCATATGGTACCAA 51973433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3554 AAATATACAATAAACTCTATTTTTAACTACAGTCACTCTACTTGTCTCATATGGTACCAA 3613

 51973434 ACTAGATCGTTGTTGTCTTGATAACACAGCATTATCATTATAGCTGTAATACATAATGCT 51973493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3614 ACTAGATCGTTGTTGTCTTGATAACACAGCATTATCATTATAGCTGTAATACATAATGCT 3673

 51973494 GTACCTCCTCTCCTAACCCTGGAAGTTGCAATTCATCCTTCAATGCTCAGCTCAAAGGAT 51973553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3674 GTACCTCCTCTCCTAACCCTGGAAGTTGCAATTCATCCTTCAATGCTCAGCTCAAAGGAT 3733

 51973554 TATTGTCTCTAAAGTTTTAGCAAATGCTGAAGCAGAATTTCACCATTTAATGGGTTCACA 51973613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3734 TATTGTCTCTAAAGTTTTAGCAAATGCTGAAGCAGAATTTCACCATTTAATGGGTTCACA 3793

 51973614 AGCTGCTGCCTTTATAGCTTATGGTACATATGTTTGCCAATATAAATGATCCACTTGAGC 51973673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3794 AGCTGCTGCCTTTATAGCTTATGGTACATATGTTTGCCAATATAAATGATCCACTTGAGC 3853

 51973674 TAAATTGCCACAGCTGCTACAACACCTCTTTACCTATTTTTGGAGCAAAACTGAAAATCA 51973733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3854 TAAATTGCCACAGCTGCTACAACACCTCTTTACCTATTTTTGGAGCAAAACTGAAAATCA 3913

 51973734 GAAAAGTTTAACTTTTTCAAAATAATGAAAAATTTCTCTCCAATCCTCTCCATCATTATA 51973793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3914 GAAAAGTTTAACTTTTTCAAAATAATGAAAAATTTCTCTCCAATCCTCTCCATCATTATA 3973

 51973794 CATTAATAGGAAAAGAAAGGACAAAGACAAGGTTACAAATGTGAAAGGGTTATTTTTTTC 51973853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3974 CATTAATAGGAAAAGAAAGGACAAAGACAAGGTTACAAATGTGAAAGGGTTATTTTTTTC 4033

 51973854 TATTCTGATAGAAATAAGTTTAGAGCACCTGCATGAACAACTTGTATTGAACAGCAATGC 51973913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4034 TATTCTGATAGAAATAAGTTTAGAGCACCTGCATGAACAACTTGTATTGAACAGCAATGC 4093

 51973914 AAGGAACTGCATACCGAAAAGAAGAATCTCTTAGTGACAAGAACCGTGTTGACCATGCAA 51973973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4094 AAGGAACTGCATACCGAAAAGAAGAATCTCTTAGTGACAAGAACCGTGTTGACCATGCAA 4153

 51973974 CACTATTAGCAAGTTTATTTTCATTCTTTATGTAGATGTCAGGGATATGTAGCAAAAATA 51974033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4154 CACTATTAGCAAGTTTATTTTCATTCTTTATGTAGATGTCAGGGATATGTAGCAAAAATA 4213

 51974034 CATTTTTAAGTGCAACAGAGTAGATGCTTGCAAAAACAGACTGTGATAACTATCTATTTG 51974093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4214 CATTTTTAAGTGCAACAGAGTAGATGCTTGCAAAAACAGACTGTGATAACTATCTATTTG 4273

 51974094 CAAAAGTCAGTACAGATATGATTATCTCAGCATTAAATTGGCTGATGTAAAATGGAAATC 51974153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4274 CAAAAGTCAGTACAGATATGATTATCTCAGCATTAAATTGGCTGATGTAAAATGGAAATC 4333

 51974154 ATGAAAATTAAGTCACCACACAATAAAATGACAATAGGTTCCTAAATCAATCATGAAAAA 51974213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4334 ATGAAAATTAAGTCACCACACAATAAAATGACAATAGGTTCCTAAATCAATCATGAAAAA 4393

 51974214 TTTTCCCAATGAAGAAGGGACAACATAAAATTTTCCTTTGAGAAAGTCTCAGTAATATTT 51974273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4394 TTTTCCCAATGAAGAAGGGACAACATAAAATTTTCCTTTGAGAAAGTCTCAGTAATATTT 4453

 51974274 GCTTAATATGCTGATAGGCTTATCAAGCTTCTTGAAAAAAAACTGATTTACAATACAGTG 51974333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4454 GCTTAATATGCTGATAGGCTTATCAAGCTTCTTGAAAAAAAACTGATTTACAATACAGTG 4513

 51974334 GGGATTATTTTTTTTAAGTTGGAAGGGAAAGAAGGTTTGATGTAAGAGTGCTTTGAAATG 51974393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4514 GGGATTATTTTTTTTAAGTTGGAAGGGAAAGAAGGTTTGATGTAAGAGTGCTTTGAAATG 4573

 51974394 TGGAGTTTTCCTAAGTAT 51974411
          ||||||||||||||||||
     4574 TGGAGTTTTCCTAAGTAT 4591

Alignment time is 3.33507 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51963823,51984240] =>     20418 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [       1,    2032] =>      2032 nucs 'mol-32-316f-031340_2032'

Score:        2032
Aligned:      2032        nucs
Identic:      2032 (100%) nucs =>       758 (100%)      1274 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51972339,51973096] EXCISED REGION [51973098,51974371]
 second seq =>  [       1,     758] EXCISED REGION [     759,    2032]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [51973097,51973097]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        10 nucs [51973097,51973106] to [51973098,51973107]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 51972339 AATATTTCCCTCTTTAATGTCAATTGCTGCTCCCTTTTCCTTATGCATAGTACATGGATC 51972398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AATATTTCCCTCTTTAATGTCAATTGCTGCTCCCTTTTCCTTATGCATAGTACATGGATC 60

 51972399 CTCAGGATTCACTTACGCAGTCCACTGAGCAGTGGCCATTCACACTTTTAATGTGAGGAA 51972458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTCAGGATTCACTTACGCAGTCCACTGAGCAGTGGCCATTCACACTTTTAATGTGAGGAA 120

 51972459 GAGTGAGAGAAAGGAAAACAGAAATTATTTCATACCAAAAGAGCCCCTGATTTTTCACTG 51972518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GAGTGAGAGAAAGGAAAACAGAAATTATTTCATACCAAAAGAGCCCCTGATTTTTCACTG 180

 51972519 CTTCTTTTGTTATTCACATACAGGAGGATATGTTCCTAATCACTTTTATGATGTGAACAT 51972578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTTCTTTTGTTATTCACATACAGGAGGATATGTTCCTAATCACTTTTATGATGTGAACAT 240

 51972579 GCCTGCACAGTTGCCACTGCTGCATCATGTTGGGGTTCCCAAATTTAGACCTTTTTCCAC 51972638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GCCTGCACAGTTGCCACTGCTGCATCATGTTGGGGTTCCCAAATTTAGACCTTTTTCCAC 300

 51972639 TTACACTTTGTTCTCAACCACTGTGCCCTCAAAATGACCACTATTCCAGCATATCTGAGG 51972698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTACACTTTGTTCTCAACCACTGTGCCCTCAAAATGACCACTATTCCAGCATATCTGAGG 360

 51972699 TAAGAGAGAGCTTCTTGCCTGAGACACAAAGTGTGCCCAGAACTAGAATTCTGCTTCTAA 51972758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TAAGAGAGAGCTTCTTGCCTGAGACACAAAGTGTGCCCAGAACTAGAATTCTGCTTCTAA 420

 51972759 TACTCAAACTCTGGTGTTATGTTGGAGTTACCAGCCCAGACCTCTTCCTTTGTAATAAGT 51972818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TACTCAAACTCTGGTGTTATGTTGGAGTTACCAGCCCAGACCTCTTCCTTTGTAATAAGT 480

 51972819 TTCCATTTGTGATCAGCAATGGCCCTTTCTGGAACCATCTCAAGCCATCAGTGAAGTTTG 51972878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTCCATTTGTGATCAGCAATGGCCCTTTCTGGAACCATCTCAAGCCATCAGTGAAGTTTG 540

 51972879 ACTAACTTTGAAAGGATGGGGGCCTTGATCTTTTATTTTCTGAAGATTCCTGGCACACTA 51972938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACTAACTTTGAAAGGATGGGGGCCTTGATCTTTTATTTTCTGAAGATTCCTGGCACACTA 600

 51972939 TGCTAATGTACTCATATTCATTCCTCATACCTAGCTTTGTAAATGTAGAACTCAAACTTT 51972998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGCTAATGTACTCATATTCATTCCTCATACCTAGCTTTGTAAATGTAGAACTCAAACTTT 660

 51972999 TAAGAAGACACTCTCCACAGGAAGTGGATATCTCTTTCCCAACATAAGTGAGGCCACAGA 51973058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TAAGAAGACACTCTCCACAGGAAGTGGATATCTCTTTCCCAACATAAGTGAGGCCACAGA 720

 51973059 TTAGCACAGACAATTAAAGAGGTAAAATCTGCCAAACG 51973096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTAGCACAGACAATTAAAGAGGTAAAATCTGCCAAACG 758

EXCISED REGION

 51973098 TTTTTTTTTTATTCTAGCTTAGAAATGATTGGCAAGACTTAAGTTTTTTCCAATACAACT 51973157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      759 TTTTTTTTTTATTCTAGCTTAGAAATGATTGGCAAGACTTAAGTTTTTTCCAATACAACT 818

 51973158 TTTAACTTATCTCTATTACAAATATACACACAATTATTAATTAATTTATTAGTTTTCATT 51973217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      819 TTTAACTTATCTCTATTACAAATATACACACAATTATTAATTAATTTATTAGTTTTCATT 878

 51973218 GATACCTAATAATTTTACTTTTTTATAGAGCACACAGGATGTTCTGTACACATATAGAAT 51973277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      879 GATACCTAATAATTTTACTTTTTTATAGAGCACACAGGATGTTCTGTACACATATAGAAT 938

 51973278 TTGTAACGATCCAATCAAGGTATTTAGGTTATTCATCATCTCAAACATTTATAATTTCTT 51973337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      939 TTGTAACGATCCAATCAAGGTATTTAGGTTATTCATCATCTCAAACATTTATAATTTCTT 998

 51973338 TGTGTTGAGTATGTCTCCAATCTTCTACCTCTTCTGAAATATACAATAAACTCTATTTTT 51973397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      999 TGTGTTGAGTATGTCTCCAATCTTCTACCTCTTCTGAAATATACAATAAACTCTATTTTT 1058

 51973398 AACTACAGTCACTCTACTTGTCTCATATGGTACCAAACTAGATCGTTGTTGTCTTGATAA 51973457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1059 AACTACAGTCACTCTACTTGTCTCATATGGTACCAAACTAGATCGTTGTTGTCTTGATAA 1118

 51973458 CACAGCATTATCATTATAGCTGTAATACATAATGCTGTACCTCCTCTCCTAACCCTGGAA 51973517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1119 CACAGCATTATCATTATAGCTGTAATACATAATGCTGTACCTCCTCTCCTAACCCTGGAA 1178

 51973518 GTTGCAATTCATCCTTCAATGCTCAGCTCAAAGGATTATTGTCTCTAAAGTTTTAGCAAA 51973577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1179 GTTGCAATTCATCCTTCAATGCTCAGCTCAAAGGATTATTGTCTCTAAAGTTTTAGCAAA 1238

 51973578 TGCTGAAGCAGAATTTCACCATTTAATGGGTTCACAAGCTGCTGCCTTTATAGCTTATGG 51973637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1239 TGCTGAAGCAGAATTTCACCATTTAATGGGTTCACAAGCTGCTGCCTTTATAGCTTATGG 1298

 51973638 TACATATGTTTGCCAATATAAATGATCCACTTGAGCTAAATTGCCACAGCTGCTACAACA 51973697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1299 TACATATGTTTGCCAATATAAATGATCCACTTGAGCTAAATTGCCACAGCTGCTACAACA 1358

 51973698 CCTCTTTACCTATTTTTGGAGCAAAACTGAAAATCAGAAAAGTTTAACTTTTTCAAAATA 51973757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1359 CCTCTTTACCTATTTTTGGAGCAAAACTGAAAATCAGAAAAGTTTAACTTTTTCAAAATA 1418

 51973758 ATGAAAAATTTCTCTCCAATCCTCTCCATCATTATACATTAATAGGAAAAGAAAGGACAA 51973817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1419 ATGAAAAATTTCTCTCCAATCCTCTCCATCATTATACATTAATAGGAAAAGAAAGGACAA 1478

 51973818 AGACAAGGTTACAAATGTGAAAGGGTTATTTTTTTCTATTCTGATAGAAATAAGTTTAGA 51973877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1479 AGACAAGGTTACAAATGTGAAAGGGTTATTTTTTTCTATTCTGATAGAAATAAGTTTAGA 1538

 51973878 GCACCTGCATGAACAACTTGTATTGAACAGCAATGCAAGGAACTGCATACCGAAAAGAAG 51973937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1539 GCACCTGCATGAACAACTTGTATTGAACAGCAATGCAAGGAACTGCATACCGAAAAGAAG 1598

 51973938 AATCTCTTAGTGACAAGAACCGTGTTGACCATGCAACACTATTAGCAAGTTTATTTTCAT 51973997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1599 AATCTCTTAGTGACAAGAACCGTGTTGACCATGCAACACTATTAGCAAGTTTATTTTCAT 1658

 51973998 TCTTTATGTAGATGTCAGGGATATGTAGCAAAAATACATTTTTAAGTGCAACAGAGTAGA 51974057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1659 TCTTTATGTAGATGTCAGGGATATGTAGCAAAAATACATTTTTAAGTGCAACAGAGTAGA 1718

 51974058 TGCTTGCAAAAACAGACTGTGATAACTATCTATTTGCAAAAGTCAGTACAGATATGATTA 51974117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1719 TGCTTGCAAAAACAGACTGTGATAACTATCTATTTGCAAAAGTCAGTACAGATATGATTA 1778

 51974118 TCTCAGCATTAAATTGGCTGATGTAAAATGGAAATCATGAAAATTAAGTCACCACACAAT 51974177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1779 TCTCAGCATTAAATTGGCTGATGTAAAATGGAAATCATGAAAATTAAGTCACCACACAAT 1838

 51974178 AAAATGACAATAGGTTCCTAAATCAATCATGAAAAATTTTCCCAATGAAGAAGGGACAAC 51974237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1839 AAAATGACAATAGGTTCCTAAATCAATCATGAAAAATTTTCCCAATGAAGAAGGGACAAC 1898

 51974238 ATAAAATTTTCCTTTGAGAAAGTCTCAGTAATATTTGCTTAATATGCTGATAGGCTTATC 51974297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1899 ATAAAATTTTCCTTTGAGAAAGTCTCAGTAATATTTGCTTAATATGCTGATAGGCTTATC 1958

 51974298 AAGCTTCTTGAAAAAAAACTGATTTACAATACAGTGGGGATTATTTTTTTTAAGTTGGAA 51974357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1959 AAGCTTCTTGAAAAAAAACTGATTTACAATACAGTGGGGATTATTTTTTTTAAGTTGGAA 2018

 51974358 GGGAAAGAAGGTTT 51974371
          ||||||||||||||
     2019 GGGAAAGAAGGTTT 2032

Alignment time is 1.50182 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51963823,51984240] =>     20418 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [       1,    8722] =>      8722 nucs 'mol-32-3190-257397_8722'

Score:        8576
Aligned:      8721        nucs
Identic:      8707 (100%) nucs =>      8429 (100%)       278 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51965381,51973823] EXCISED REGION [51974241,51974518]
 second seq =>  [       1,    8439] EXCISED REGION [    8445,    8722]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       417 nucs [51973824,51974240]
 second seq =>         5 nucs [8440,8444]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [51973823,51973823] to [51974240,51974240]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [51973822,51973823] to [51974241,51974242]
 second seq =>         2 nucs [8438,8439] to [8445,8446]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 51965381 TTGAATGTGTTTGCTCTTGCTTTTCTACTTCTTTTAATTGTGATGTTAGGGTGTCAATTT 51965440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTGAATGTGTTTGCTCTTGCTTTTCTACTTCTTTTAATTGTGATGTTAGGGTGTCAATTT 60

 51965441 TGGATCTTTCCTGCTTTCTGTTGTGGGCATTTAGTGCTATAAATTTCCCTCTACACAGTG 51965500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGGATCTTTCCTGCTTTCTGTTGTGGGCATTTAGTGCTATAAATTTCCCTCTACACAGTG 120

 51965501 CTTTGAATGTGTCCCAGAGATTCTGGTATGTTGTATCTTTGTTCTCGTTGGTTTCAAAGA 51965560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTTTGAATGTGTCCCAGAGATTCTGGTATGTTGTATCTTTGTTCTCGTTGGTTTCAAAGA 180

 51965561 ACATCTTTATTTCTGCCTTCATTTCGTTATGTACCCAGTAGTCTTTCAGGAGCAGGTTGT 51965620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACATCTTTATTTCTGCCTTCATTTCGTTATGTACCCAGTAGTCTTTCAGGAGCAGGTTGT 240

 51965621 TCAGTTTCCATGTAGTTAAGCGGTTTTGAGTGAGATTCTTAATCCTGAGTTAGTTGAAGT 51965680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCAGTTTCCATGTAGTTAAGCGGTTTTGAGTGAGATTCTTAATCCTGAGTTAGTTGAAGT 300

 51965681 TGGTTGTAATTCTCAATTCTTTGCTTTAAACATCCATGTATTTTCTAAATCATCTACAAT 51965740
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
      301 TGGTTGTAATTCTCAATTCTTTGCTTTAAACATCCGTGTATTTTCTAAATCATCTACAAT 360

 51965741 GAATTTTTGTATAAATTAACTTTATATACATATATATGTAGAAAGACTACCCTGCTACAG 51965800
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
      361 GAATTTTTGTATAAATTAACTTTATATACATATATATGTAGAAAGCCTACCCTGCTACAG 420

 51965801 AAATTATATGAATTGAAATATTATAATAAATTATAATTATAATTAGAAAAAATAAGTATT 51965860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAATTATATGAATTGAAATATTATAATAAATTATAATTATAATTAGAAAAAATAAGTATT 480

 51965861 TTGTAATCTTAAATATACAAGTCTTCTTTTGTGCTCTTTATATAGGCAGTGTGGCACAGG 51965920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTGTAATCTTAAATATACAAGTCTTCTTTTGTGCTCTTTATATAGGCAGTGTGGCACAGG 540

 51965921 GAAAAGAAAACTGCCATTTTTGAAGCCAGAGTGAGTCAAATCCTAGACAGAAGCACTCAA 51965980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GAAAAGAAAACTGCCATTTTTGAAGCCAGAGTGAGTCAAATCCTAGACAGAAGCACTCAA 600

 51965981 GTGTAGATAGGAAAAAATTACTTAAAACCTAGCTGGGAGAAATTATTTAATCTCTGCAAA 51966040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTGTAGATAGGAAAAAATTACTTAAAACCTAGCTGGGAGAAATTATTTAATCTCTGCAAA 660

 51966041 TCATATTTTCTTTATATGTAATATGAAGACAATAATAAGACATACTTCATCAGGCTGCTG 51966100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCATATTTTCTTTATATGTAATATGAAGACAATAATAAGACATACTTCATCAGGCTGCTG 720

 51966101 TGAAGTTTAAGTGAATTAATATTTGGAAAAAACAAGAAAATATCTAGCAGAGTGACTCTC 51966160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGAAGTTTAAGTGAATTAATATTTGGAAAAAACAAGAAAATATCTAGCAGAGTGACTCTC 780

 51966161 AATGAGTTTTAATGTCAGTAATAAAATGCAGTATATGCTCTCCTTCTCTAATGTCTCTTA 51966220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AATGAGTTTTAATGTCAGTAATAAAATGCAGTATATGCTCTCCTTCTCTAATGTCTCTTA 840

 51966221 GTTGTGAAAGATCTCCCTCAACCATATATCTGAAATTATCATCACCTGAAATTGTCATTA 51966280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GTTGTGAAAGATCTCCCTCAACCATATATCTGAAATTATCATCACCTGAAATTGTCATTA 900

 51966281 TCCTCAGAAGGGTTTCATATTAACTAATTTCTACTTAGGTGCCAATGGCTAAACCTACTT 51966340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TCCTCAGAAGGGTTTCATATTAACTAATTTCTACTTAGGTGCCAATGGCTAAACCTACTT 960

 51966341 CTCTTCTATCAGTGAGGAAAGAGCAAAAAAGGGCTGAGCTGATAGGAATAAGTAGAAAAT 51966400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTCTTCTATCAGTGAGGAAAGAGCAAAAAAGGGCTGAGCTGATAGGAATAAGTAGAAAAT 1020

 51966401 AAGAAACAGTATAGAAGTAGGGAAGGGAAGGAGAGTGCAGAGAAAAAGAGATAGATGCAA 51966460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AAGAAACAGTATAGAAGTAGGGAAGGGAAGGAGAGTGCAGAGAAAAAGAGATAGATGCAA 1080

 51966461 ATAAAAAAAATGTTTTTCCAGTGGCTGACAATGATGCTTGTTTCCAAAATTTAAATGTGA 51966520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATAAAAAAAATGTTTTTCCAGTGGCTGACAATGATGCTTGTTTCCAAAATTTAAATGTGA 1140

 51966521 AATGCTTCTTGTTCAATGATTTTTCCCACAAATAATATCTACCAGAAATACTACTATTAC 51966580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AATGCTTCTTGTTCAATGATTTTTCCCACAAATAATATCTACCAGAAATACTACTATTAC 1200

 51966581 TTTTGTTTTAAAATGTAGAGTTGTTTTTTAAGGAAATACATACAAAGTACATTCCTTTAG 51966640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTTTGTTTTAAAATGTAGAGTTGTTTTTTAAGGAAATACATACAAAGTACATTCCTTTAG 1260

 51966641 GAAGTACATTCTTTAGGAAGGTCCACACTAATGTGAATGAGGAAGCATCTATTAACTGTC 51966700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GAAGTACATTCTTTAGGAAGGTCCACACTAATGTGAATGAGGAAGCATCTATTAACTGTC 1320

 51966701 TTATATGTATCCTGGTGTGTCAGGTACTTTGGTTTAATATATTCTTATAGTTTATAAGAG 51966760
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTATATGTATCCTGTTGTGTCAGGTACTTTGGTTTAATATATTCTTATAGTTTATAAGAG 1380

 51966761 AAAACATATGGTCTCTGAGAAATTATATGACATAAAACTTTTAAATATAGATCCCCCCAA 51966820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AAAACATATGGTCTCTGAGAAATTATATGACATAAAACTTTTAAATATAGATCCCCCCAA 1440

 51966821 AATTGCTTTCTTTTATGTGGTAATTGAAATTGTCTATTTATCTCTCTTTTTATTTACCAT 51966880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AATTGCTTTCTTTTATGTGGTAATTGAAATTGTCTATTTATCTCTCTTTTTATTTACCAT 1500

 51966881 CAAGAAATAAGTCATGAGGAGAAATTATAGCAGCAGAACTTTTCCCCTACTTCATGTATT 51966940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CAAGAAATAAGTCATGAGGAGAAATTATAGCAGCAGAACTTTTCCCCTACTTCATGTATT 1560

 51966941 CATTTTTTAAAAATCATCTTCCTTTATTTATTTACTTTAGTTCATTATGGCTTAACTCAG 51967000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CATTTTTTAAAAATCATCTTCCTTTATTTATTTACTTTAGTTCATTATGGCTTAACTCAG 1620

 51967001 TCTCACCCAATTACATGAGCTGTTCATAATGGTGTCTTACTTCAGCAGTCCAGCCAGCTG 51967060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TCTCACCCAATTACATGAGCTGTTCATAATGGTGTCTTACTTCAGCAGTCCAGCCAGCTG 1680

 51967061 TGATTGAAGTCAGCCAGGAATGCCGACTACAGATCAGAGCACCTGTGAGATTATCAGTTC 51967120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TGATTGAAGTCAGCCAGGAATGCCGACTACAGATCAGAGCACCTGTGAGATTATCAGTTC 1740

 51967121 CATGTGGAATGTCAGACGTATTCTAAACTAGAGTAATTGACTTGGCCAGGATGAGGGGTC 51967180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CATGTGGAATGTCAGACGTATTCTAAACTAGAGTAATTGACTTGGCCAGGATGAGGGGTC 1800

 51967181 AGGAGTGTCATTAAAAATATATAGCTTGGTATGATTAGCTGCAGAGAAGAACATTCAAGA 51967240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AGGAGTGTCATTAAAAATATATAGCTTGGTATGATTAGCTGCAGAGAAGAACATTCAAGA 1860

 51967241 GCTAGGGGCCCTGGAATCTCCATCAACTTCACAGGTTTAGGTGCTTGGAAGTGGATTTTG 51967300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GCTAGGGGCCCTGGAATCTCCATCAACTTCACAGGTTTAGGTGCTTGGAAGTGGATTTTG 1920

 51967301 GAGGGATTGCTGTGATCTTTGACAAACTTAATGTATCATTCACTTAGGCTGTCATTCAGC 51967360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GAGGGATTGCTGTGATCTTTGACAAACTTAATGTATCATTCACTTAGGCTGTCATTCAGC 1980

 51967361 AAACCTTCTGTGAAAATAGATTCATCACAAAAGGCCATGACATTAAAGCTGTATACAACT 51967420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AAACCTTCTGTGAAAATAGATTCATCACAAAAGGCCATGACATTAAAGCTGTATACAACT 2040

 51967421 CTTGAACAGAGTCAAAAAAAAAAACTGGATCTTTATGACTTCCTGAGTGTTCTCTTTTAC 51967480
          ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CTTGAACAGAGTCAAAAAAAAAA-CTGGATCTTTATGACTTCCTGAGTGTTCTCTTTTAC 2099

 51967481 AAAATCAGGACCACAGACATGTGCATGCCTGCATGCAAATGTACACAAAGACACACATTC 51967540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 AAAATCAGGACCACAGACATGTGCATGCCTGCATGCAAATGTACACAAAGACACACATTC 2159

 51967541 ACACACGCACACTCTCACAAACATACCCCTTGTTGTAGAAAATAGTATAGTCAAAGTCAT 51967600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 ACACACGCACACTCTCACAAACATACCCCTTGTTGTAGAAAATAGTATAGTCAAAGTCAT 2219

 51967601 AGCCTGATTCTGGCAATTATCTGAGACCCAACAGCATGTGTTTTACATATTTATACTCAC 51967660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 AGCCTGATTCTGGCAATTATCTGAGACCCAACAGCATGTGTTTTACATATTTATACTCAC 2279

 51967661 TATTGATTTAAATTTTGTTATTCACTCCCTTTTCCTATTGTCTTATTTTCTTCCTTAACA 51967720
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     2280 TATTGATTTAAATTTTGTTATTCACTCCCTTCTCCTATTGTCTTATTTTCTTCCTTAACA 2339

 51967721 TATTTTTATATTTCCTATTTTAGCGATTTTAAATTCTTTCTGGAACGACGTTGGCACAAA 51967780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 TATTTTTATATTTCCTATTTTAGCGATTTTAAATTCTTTCTGGAACGACGTTGGCACAAA 2399

 51967781 TCAAAAATTAAATCTTATAAAGTGCTCTATGGTCATAGGCAAAATGGAATCTGTAGATAA 51967840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 TCAAAAATTAAATCTTATAAAGTGCTCTATGGTCATAGGCAAAATGGAATCTGTAGATAA 2459

 51967841 TCAAGTTCCTGAAGGGATGTGAAACCAACTGCTACAAGGATAAGCTAGAAGAATCAGAGA 51967900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 TCAAGTTCCTGAAGGGATGTGAAACCAACTGCTACAAGGATAAGCTAGAAGAATCAGAGA 2519

 51967901 TTTTTGGCCTGAAGCACACACAGAAGACTACTTTTAGAGGGGTCTGATGTCACTAACTTC 51967960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 TTTTTGGCCTGAAGCACACACAGAAGACTACTTTTAGAGGGGTCTGATGTCACTAACTTC 2579

 51967961 TTGAGATTGCTGCCATTTTTAACATACAGCTAGCTGGATAGAAGAAGACAGTCTCAGATA 51968020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 TTGAGATTGCTGCCATTTTTAACATACAGCTAGCTGGATAGAAGAAGACAGTCTCAGATA 2639

 51968021 AATGACCAGTTCAGGCCACCAATGTCTCCTTCCAAAAAGGCCTGTACTGCTGTACATGCC 51968080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 AATGACCAGTTCAGGCCACCAATGTCTCCTTCCAAAAAGGCCTGTACTGCTGTACATGCC 2699

 51968081 AAGGGTTAGAGATTTTGGGGCCAACTTTTTCCAGCATGTCTTATATCCTTCAATAAGTTG 51968140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 AAGGGTTAGAGATTTTGGGGCCAACTTTTTCCAGCATGTCTTATATCCTTCAATAAGTTG 2759

 51968141 GTTACTTTGCAAAACATTAGACCACTTAATAATCAATTTCCTCCATGGATTCACTCATAC 51968200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 GTTACTTTGCAAAACATTAGACCACTTAATAATCAATTTCCTCCATGGATTCACTCATAC 2819

 51968201 TTTGTCCTCACACTATTCTGGACTCCTTTCTCTTGATTTTATTTCTCCAAGTGATTCAAT 51968260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2820 TTTGTCCTCACACTATTCTGGACTCCTTTCTCTTGATTTTATTTCTCCAAGTGATTCAAT 2879

 51968261 TGTGTCTTTTGGGACACTTATAAGTAAACATTTCCACATCCTCAGCTTTATCACAGAATT 51968320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2880 TGTGTCTTTTGGGACACTTATAAGTAAACATTTCCACATCCTCAGCTTTATCACAGAATT 2939

 51968321 TTCACTTCCTTGCCTTAAGTGTCCCTGGAGGCTGCTGATCTTACAAGTAAATGTCTGGAG 51968380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2940 TTCACTTCCTTGCCTTAAGTGTCCCTGGAGGCTGCTGATCTTACAAGTAAATGTCTGGAG 2999

 51968381 ATAGGGTTGACAGCTCTTGAAGGCAGTGCCATTATGAAATCAATCCTAGTCTAAGTAGAC 51968440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3000 ATAGGGTTGACAGCTCTTGAAGGCAGTGCCATTATGAAATCAATCCTAGTCTAAGTAGAC 3059

 51968441 ATTTTGGGTACCATGCCTTCTTATCTACTTTTGGGCTGTGAGCATCCAGTCATTTTATTT 51968500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3060 ATTTTGGGTACCATGCCTTCTTATCTACTTTTGGGCTGTGAGCATCCAGTCATTTTATTT 3119

 51968501 TACCGTACAACTAGAGGTAACTTCTTAAAGTACCAAGTATATCATTCCCTGGTTTAAAGA 51968560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3120 TACCGTACAACTAGAGGTAACTTCTTAAAGTACCAAGTATATCATTCCCTGGTTTAAAGA 3179

 51968561 CCTTTAACTGTTAACTATTGCTCTGCATATAAAATCTTAACTTTTGCCATAACTAACAGG 51968620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3180 CCTTTAACTGTTAACTATTGCTCTGCATATAAAATCTTAACTTTTGCCATAACTAACAGG 3239

 51968621 GATCTTCTTGATCTAATTCCATCTCAGATCTTAATGTTGTCTACCTGCTGTGCCTGAGGT 51968680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3240 GATCTTCTTGATCTAATTCCATCTCAGATCTTAATGTTGTCTACCTGCTGTGCCTGAGGT 3299

 51968681 TTACTGAGTTGCTGACACTTCCTAAAACATGCCTTGTTCTCTTACTTTTGGGCCTTCCGG 51968740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3300 TTACTGAGTTGCTGACACTTCCTAAAACATGCCTTGTTCTCTTACTTTTGGGCCTTCCGG 3359

 51968741 ACACCAGCTTTGCTTTCTTGGCCCCACTGAGGGGGCTTATTTTGTAGATGTCGTTATTTT 51968800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3360 ACACCAGCTTTGCTTTCTTGGCCCCACTGAGGGGGCTTATTTTGTAGATGTCGTTATTTT 3419

 51968801 CGGAGAGGCTTCTATGAACCACCACCCTCTCTGCAAATTAGGTACTTTTTCTTAGTGCAC 51968860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3420 CGGAGAGGCTTCTATGAACCACCACCCTCTCTGCAAATTAGGTACTTTTTCTTAGTGCAC 3479

 51968861 TCGTCCTCCTTGATCTTATCCTACTGCGACAAAATAATTCTTGTAATTGTATGTGTCCAC 51968920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3480 TCGTCCTCCTTGATCTTATCCTACTGCGACAAAATAATTCTTGTAATTGTATGTGTCCAC 3539

 51968921 AAATACACTATACATTTTCTATGAATGAAGATTATATCTGCAGCATTCAGTAGCATAACA 51968980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3540 AAATACACTATACATTTTCTATGAATGAAGATTATATCTGCAGCATTCAGTAGCATAACA 3599

 51968981 GAGACTCAATAAATATGTATTGAAATGAATTAAATTTAATAGCTGATTACAAATAACTGG 51969040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3600 GAGACTCAATAAATATGTATTGAAATGAATTAAATTTAATAGCTGATTACAAATAACTGG 3659

 51969041 CTCTAACATAAAAGTAGAGATAAGTTTGCTTTCATTCATGTAAAGTAGCAGATGTGAAAC 51969100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3660 CTCTAACATAAAAGTAGAGATAAGTTTGCTTTCATTCATGTAAAGTAGCAGATGTGAAAC 3719

 51969101 CAATGAGGGAGCATTATTGGGGGCATATTTTAATCAAAACTACTGAAAAATCTGAAAGAA 51969160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3720 CAATGAGGGAGCATTATTGGGGGCATATTTTAATCAAAACTACTGAAAAATCTGAAAGAA 3779

 51969161 TTATGTAAAGATAAAGTATGCTGTCTTGAGATGTGGTGAGTTTTTCACCAGAATGACTAA 51969220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3780 TTATGTAAAGATAAAGTATGCTGTCTTGAGATGTGGTGAGTTTTTCACCAGAATGACTAA 3839

 51969221 AATATGCCTTAGATCATTAGTCCCCAAACCTTCCTTCTTGTGTACAGACTTCTATTAGTT 51969280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3840 AATATGCCTTAGATCATTAGTCCCCAAACCTTCCTTCTTGTGTACAGACTTCTATTAGTT 3899

 51969281 TTATTTTTCTTCTTTTTAAGTAGATATATTTCTATAGCCAAAAAATATAGATTTGTTTCC 51969340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3900 TTATTTTTCTTCTTTTTAAGTAGATATATTTCTATAGCCAAAAAATATAGATTTGTTTCC 3959

 51969341 GTTATAAAAATGTGCTATTGCGCTAGTATGTTATAATAATCATGAAGCCTGCTATAATAC 51969400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3960 GTTATAAAAATGTGCTATTGCGCTAGTATGTTATAATAATCATGAAGCCTGCTATAATAC 4019

 51969401 ATAAAATAGACTACTTAGAGAATAAATGTAAAAAATTTTCTAGTACTTTTTCCTGTGTCT 51969460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4020 ATAAAATAGACTACTTAGAGAATAAATGTAAAAAATTTTCTAGTACTTTTTCCTGTGTCT 4079

 51969461 TAATGAATTGCTTTGTGTACCACCCTGGGTCCTTGCTCTACATTTTGAAATAATTGTAAG 51969520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4080 TAATGAATTGCTTTGTGTACCACCCTGGGTCCTTGCTCTACATTTTGAAATAATTGTAAG 4139

 51969521 GCTATGATTAAATTTTAAACATGATAATATTTTTAATGAATATAGTATAGATTTTTGCCT 51969580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4140 GCTATGATTAAATTTTAAACATGATAATATTTTTAATGAATATAGTATAGATTTTTGCCT 4199

 51969581 TGAAATTCTTATTTTGAAAACAATATTGAATTTAGGCCAAAGAAAAATGTACTTACTTTG 51969640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4200 TGAAATTCTTATTTTGAAAACAATATTGAATTTAGGCCAAAGAAAAATGTACTTACTTTG 4259

 51969641 TTATCCTTTTTAGCAAAATCAAATTGCTAATGGCAGTGTTTAGCGTTTTCTGTATGTTGA 51969700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4260 TTATCCTTTTTAGCAAAATCAAATTGCTAATGGCAGTGTTTAGCGTTTTCTGTATGTTGA 4319

 51969701 TGACTATGCTTCAGTGGCGTAAAATCTAATGCAATAAACCAGCATTTACTAGTTGTGGCA 51969760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4320 TGACTATGCTTCAGTGGCGTAAAATCTAATGCAATAAACCAGCATTTACTAGTTGTGGCA 4379

 51969761 TAATGCAAGAAAGCATCATTTTGCTAAGGGATATCTAGGGATTACTAGTTCTCTCTCTTT 51969820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4380 TAATGCAAGAAAGCATCATTTTGCTAAGGGATATCTAGGGATTACTAGTTCTCTCTCTTT 4439

 51969821 CTGGTCAGATTTAGTCCTAAACTCCATAAGGCATTTACTAACATCTACTTTCAAATGATG 51969880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4440 CTGGTCAGATTTAGTCCTAAACTCCATAAGGCATTTACTAACATCTACTTTCAAATGATG 4499

 51969881 AACAACTGTCCTGATCAAAGGAAGATGAAAACACAAAATTCTTTATTCTGGAAAACACAT 51969940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4500 AACAACTGTCCTGATCAAAGGAAGATGAAAACACAAAATTCTTTATTCTGGAAAACACAT 4559

 51969941 CTCCCTAGAGTGTCTCCGCTGCACACTCTTCCACCTTGCATATTTGTATATTCAGACACT 51970000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4560 CTCCCTAGAGTGTCTCCGCTGCACACTCTTCCACCTTGCATATTTGTATATTCAGACACT 4619

 51970001 AGAAAATTCACGTGAAAGGAGCCTCCACTTTACCAATTATCAGAAATATGCAAGTGAATT 51970060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4620 AGAAAATTCACGTGAAAGGAGCCTCCACTTTACCAATTATCAGAAATATGCAAGTGAATT 4679

 51970061 TAATATCACTAATAGTTGGCATGTCAATGATTAGATAATCTATTTGAAATGCTTATTCTA 51970120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4680 TAATATCACTAATAGTTGGCATGTCAATGATTAGATAATCTATTTGAAATGCTTATTCTA 4739

 51970121 TAAAGTTGTATTTTAACCAACAGTTTTATGAAGAGTGTTCAGTCCTCATAAAATCATCTC 51970180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4740 TAAAGTTGTATTTTAACCAACAGTTTTATGAAGAGTGTTCAGTCCTCATAAAATCATCTC 4799

 51970181 AGTTCCCATTTGTGCACTCAGAAACTTACCACTGTGTTCTGTTTTTATCTTTATAATCTA 51970240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4800 AGTTCCCATTTGTGCACTCAGAAACTTACCACTGTGTTCTGTTTTTATCTTTATAATCTA 4859

 51970241 TATTTAACAATTGCATTGTATCTTCCCTGGTCTCCAGCTCTAAGCAAATAAATACTCTTC 51970300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4860 TATTTAACAATTGCATTGTATCTTCCCTGGTCTCCAGCTCTAAGCAAATAAATACTCTTC 4919

 51970301 TTCTTTCTTTTTTCTTGTATATAAATGATTACAGAGAATGGGACAGAGAGAGAAAATGAA 51970360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4920 TTCTTTCTTTTTTCTTGTATATAAATGATTACAGAGAATGGGACAGAGAGAGAAAATGAA 4979

 51970361 GAGACATAGTTAGAGAGATACACAGGCACAGAGAGAGAGAGAGAGAAAAAGAGGAGGAGA 51970420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4980 GAGACATAGTTAGAGAGATACACAGGCACAGAGAGAGAGAGAGAGAAAAAGAGGAGGAGA 5039

 51970421 AGAGAAGAGAGAAGAGACAGAGGAGAGAGAATGCAGAGAATTTACAATTACTATAGAAAA 51970480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5040 AGAGAAGAGAGAAGAGACAGAGGAGAGAGAATGCAGAGAATTTACAATTACTATAGAAAA 5099

 51970481 TGTGCACATTTTTCATAATAAAAATGAGTAAATACTTTCATGATATTATTATCACAGACT 51970540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5100 TGTGCACATTTTTCATAATAAAAATGAGTAAATACTTTCATGATATTATTATCACAGACT 5159

 51970541 GATGATCTGACATAGATTTCGTGCCGTCTACCTGGGTCTCTACACGACAAACCTGAGTTA 51970600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5160 GATGATCTGACATAGATTTCGTGCCGTCTACCTGGGTCTCTACACGACAAACCTGAGTTA 5219

 51970601 GATGTAATGTAGAGATATGTTTCCACATTGCCCTTCTTGGGGAAGGTGAGCCAGTTCTGA 51970660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5220 GATGTAATGTAGAGATATGTTTCCACATTGCCCTTCTTGGGGAAGGTGAGCCAGTTCTGA 5279

 51970661 GGTGCCTGGTCCTAGTTGTCACAGATGCAGTTATTTCACACTAGGCTGCCTGCCAGCCTG 51970720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5280 GGTGCCTGGTCCTAGTTGTCACAGATGCAGTTATTTCACACTAGGCTGCCTGCCAGCCTG 5339

 51970721 GATTTGTCTTCCTTTTTTTTTTTTTTGTTTTCAATCTCCCTGGGCTTGCGTCATTACATC 51970780
          ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5340 GATTTGTCTTCCTTTTTTTTTTTT--GTTTTCAATCTCCCTGGGCTTGCGTCATTACATC 5397

 51970781 AACACATTCTGAAACATCTGTCAGAATCCTTGCCAGTTCAAATTTACAAAAGTGCAATAA 51970840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5398 AACACATTCTGAAACATCTGTCAGAATCCTTGCCAGTTCAAATTTACAAAAGTGCAATAA 5457

 51970841 TATTCTATCTCCCCATCACCACCAAATCTTGCTAAAATAAAATCATACATTTATTTATAA 51970900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5458 TATTCTATCTCCCCATCACCACCAAATCTTGCTAAAATAAAATCATACATTTATTTATAA 5517

 51970901 AAGTTTGTTGTTAAGAAAAAAACTGAAAACATCATGAAGGTCTGAGAGAAATAAAGTGGA 51970960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5518 AAGTTTGTTGTTAAGAAAAAAACTGAAAACATCATGAAGGTCTGAGAGAAATAAAGTGGA 5577

 51970961 ATTTAGAAGTATTGTATCCATGTCATATGACATATAAAAGTTTGTAATCATTAAAGATGA 51971020
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5578 ATTTAAAAGTATTGTATCCATGTCATATGACATATAAAAGTTTGTAATCATTAAAGATGA 5637

 51971021 TGAGTAATATATGGTAAGGAATATTTGGAAAACTTCTTTCAGTGTTAAAAAAGAAAAATA 51971080
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5638 TGAGTAATATATGGTGAGGAATATTTGGAAAACTTCTTTCAGTGTTAAAAAAGAAAAATA 5697

 51971081 AAGAAGAGTCAAATTGTATTGCCTCAGTTTTATTAAACACTTATGTATTTTACATACATT 51971140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5698 AAGAAGAGTCAAATTGTATTGCCTCAGTTTTATTAAACACTTATGTATTTTACATACATT 5757

 51971141 TAAAAAACTTAGCCGGGTGTGGTGGCGCGCGCTTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGA 51971200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     5758 TAAAAAACTTAGCCGGGTGTGGTGGCGCGCGCTTGTAATCCCGGCTACTCGGGAGGCTGA 5817

 51971201 GGCAGGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGTGGAAATTGTGCCACT 51971260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5818 GGCAGGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGTGGAAATTGTGCCACT 5877

 51971261 GAACTCCAGCCTGGGGGATAGGGCAAGATTCTGTCTCAAAAAAATAAAGGAAAAAAAAAT 51971320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5878 GAACTCCAGCCTGGGGGATAGGGCAAGATTCTGTCTCAAAAAAATAAAGGAAAAAAAAAT 5937

 51971321 TTTAATTTGAATAGTTCGCTAGTGCTAAATGTTTATGGTTTTGAATCTGAATGTTTTCAT 51971380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5938 TTTAATTTGAATAGTTCGCTAGTGCTAAATGTTTATGGTTTTGAATCTGAATGTTTTCAT 5997

 51971381 AACATTTTATTTTTAGCGTATTTTTTAGGTTTCCATATTCCAGTGTTGCTGCAACAAATA 51971440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5998 AACATTTTATTTTTAGCGTATTTTTTAGGTTTCCATATTCCAGTGTTGCTGCAACAAATA 6057

 51971441 CGTAATGTTTATAATCAGAAAAGCATTGTTAAATAACCTCTGCAAAAACTCTTTAATCTC 51971500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6058 CGTAATGTTTATAATCAGAAAAGCATTGTTAAATAACCTCTGCAAAAACTCTTTAATCTC 6117

 51971501 CCTAATCTAGGGATAGGGAATTATTTTATCTATAATTTTAATTCTAATTGTTAGAGTGTG 51971560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6118 CCTAATCTAGGGATAGGGAATTATTTTATCTATAATTTTAATTCTAATTGTTAGAGTGTG 6177

 51971561 GCTGCCTGGAGCACTGACTTGAAAATAAATCTGAAACCCATCAGGAAAAAATAATGTCAA 51971620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6178 GCTGCCTGGAGCACTGACTTGAAAATAAATCTGAAACCCATCAGGAAAAAATAATGTCAA 6237

 51971621 TTAACATTGGTTGTCATTTGTTCAAGAGGAAAAAGTCGGAGCATGATACCCCATATTTGC 51971680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6238 TTAACATTGGTTGTCATTTGTTCAAGAGGAAAAAGTCGGAGCATGATACCCCATATTTGC 6297

 51971681 CATGCATTCTGAAATGTTTTCTTTTGTCTTTTACTTTAAAAAAAGATGGATGATTTTATT 51971740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6298 CATGCATTCTGAAATGTTTTCTTTTGTCTTTTACTTTAAAAAAAGATGGATGATTTTATT 6357

 51971741 TATATATTAGAACTCATGATCTATATTTTCAACTCTGCTCCAGTAAGTCTCTTATTCATT 51971800
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6358 TATATATTAGAACTCATGATCTGTATTTTCAACTCTGCTCCAGTAAGTCTCTTATTCATT 6417

 51971801 TGGTTAAAGCACCAATTACACTTACCCCGTAGTTTCTGATTTTTGATAGGACATTAGGAG 51971860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6418 TGGTTAAAGCACCAATTACACTTACCCCGTAGTTTCTGATTTTTGATAGGACATTAGGAG 6477

 51971861 AAAGACCATACATTTAAGGGCAATGAAAATAAATATCTAAGATGAAGTGATTATTATAAC 51971920
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6478 AAAGACCATACATTTAAGGGAAATGAAAATAAATATCTAAGATGAAGTGATTATTATAAC 6537

 51971921 TTTGCAATATGGATTGAACCTGGACTAAGTACTAGTGCTATATCAGGAAGCTGGATCAAT 51971980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6538 TTTGCAATATGGATTGAACCTGGACTAAGTACTAGTGCTATATCAGGAAGCTGGATCAAT 6597

 51971981 TTGACACCTACTGAAAGTGACACATGGGCCTTGCTAAAGAAAGAGTTTAAATCTGGTAGT 51972040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6598 TTGACACCTACTGAAAGTGACACATGGGCCTTGCTAAAGAAAGAGTTTAAATCTGGTAGT 6657

 51972041 GCTTCAGAATTTTTATTTCAGTGAGGTTCTGTAAAATTAAATTCATCTGGCATTGTGGGA 51972100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6658 GCTTCAGAATTTTTATTTCAGTGAGGTTCTGTAAAATTAAATTCATCTGGCATTGTGGGA 6717

 51972101 AAAAGTTGTATTATATATGAACCAATTTCTTAAATAAGTGCAACTTAATCTTCTAAGAAA 51972160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6718 AAAAGTTGTATTATATATGAACCAATTTCTTAAATAAGTGCAACTTAATCTTCTAAGAAA 6777

 51972161 CTTTAAAATATTTAATCTTGTTGGGTATTTTTTTTTCCATTTTTTTCTTGCTATTTCTTT 51972220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6778 CTTTAAAATATTTAATCTTGTTGGGTATTTTTTTTTCCATTTTTTTCTTGCTATTTCTTT 6837

 51972221 AGGGAAAAAAAACAGAATATATAACACTCTTCATTAGTATGGAACACACATACTATTTTA 51972280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6838 AGGGAAAAAAAACAGAATATATAACACTCTTCATTAGTATGGAACACACATACTATTTTA 6897

 51972281 TTTCCTATTTTAAAACTTAATTACTCAAATACTCCATGAATTTATTAGCAATTGATCCAA 51972340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6898 TTTCCTATTTTAAAACTTAATTACTCAAATACTCCATGAATTTATTAGCAATTGATCCAA 6957

 51972341 TATTTCCCTCTTTAATGTCAATTGCTGCTCCCTTTTCCTTATGCATAGTACATGGATCCT 51972400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6958 TATTTCCCTCTTTAATGTCAATTGCTGCTCCCTTTTCCTTATGCATAGTACATGGATCCT 7017

 51972401 CAGGATTCACTTACGCAGTCCACTGAGCAGTGGCCATTCACACTTTTAATGTGAGGAAGA 51972460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7018 CAGGATTCACTTACGCAGTCCACTGAGCAGTGGCCATTCACACTTTTAATGTGAGGAAGA 7077

 51972461 GTGAGAGAAAGGAAAACAGAAATTATTTCATACCAAAAGAGCCCCTGATTTTTCACTGCT 51972520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7078 GTGAGAGAAAGGAAAACAGAAATTATTTCATACCAAAAGAGCCCCTGATTTTTCACTGCT 7137

 51972521 TCTTTTGTTATTCACATACAGGAGGATATGTTCCTAATCACTTTTATGATGTGAACATGC 51972580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7138 TCTTTTGTTATTCACATACAGGAGGATATGTTCCTAATCACTTTTATGATGTGAACATGC 7197

 51972581 CTGCACAGTTGCCACTGCTGCATCATGTTGGGGTTCCCAAATTTAGACCTTTTTCCACTT 51972640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7198 CTGCACAGTTGCCACTGCTGCATCATGTTGGGGTTCCCAAATTTAGACCTTTTTCCACTT 7257

 51972641 ACACTTTGTTCTCAACCACTGTGCCCTCAAAATGACCACTATTCCAGCATATCTGAGGTA 51972700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7258 ACACTTTGTTCTCAACCACTGTGCCCTCAAAATGACCACTATTCCAGCATATCTGAGGTA 7317

 51972701 AGAGAGAGCTTCTTGCCTGAGACACAAAGTGTGCCCAGAACTAGAATTCTGCTTCTAATA 51972760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7318 AGAGAGAGCTTCTTGCCTGAGACACAAAGTGTGCCCAGAACTAGAATTCTGCTTCTAATA 7377

 51972761 CTCAAACTCTGGTGTTATGTTGGAGTTACCAGCCCAGACCTCTTCCTTTGTAATAAGTTT 51972820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7378 CTCAAACTCTGGTGTTATGTTGGAGTTACCAGCCCAGACCTCTTCCTTTGTAATAAGTTT 7437

 51972821 CCATTTGTGATCAGCAATGGCCCTTTCTGGAACCATCTCAAGCCATCAGTGAAGTTTGAC 51972880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7438 CCATTTGTGATCAGCAATGGCCCTTTCTGGAACCATCTCAAGCCATCAGTGAAGTTTGAC 7497

 51972881 TAACTTTGAAAGGATGGGGGCCTTGATCTTTTATTTTCTGAAGATTCCTGGCACACTATG 51972940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7498 TAACTTTGAAAGGATGGGGGCCTTGATCTTTTATTTTCTGAAGATTCCTGGCACACTATG 7557

 51972941 CTAATGTACTCATATTCATTCCTCATACCTAGCTTTGTAAATGTAGAACTCAAACTTTTA 51973000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7558 CTAATGTACTCATATTCATTCCTCATACCTAGCTTTGTAAATGTAGAACTCAAACTTTTA 7617

 51973001 AGAAGACACTCTCCACAGGAAGTGGATATCTCTTTCCCAACATAAGTGAGGCCACAGATT 51973060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7618 AGAAGACACTCTCCACAGGAAGTGGATATCTCTTTCCCAACATAAGTGAGGCCACAGATT 7677

 51973061 AGCACAGACAATTAAAGAGGTAAAATCTGCCAAACGTTTTTTTTTTTATTCTAGCTTAGA 51973120
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
     7678 AGCACAGACAATTAAAGAGGTAAAATCTGCCAAACGTTTTTTTTTT-ATTCTAGCTTAGA 7736

 51973121 AATGATTGGCAAGACTTAAGTTTTTTCCAATACAACTTTTAACTTATCTCTATTACAAAT 51973180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7737 AATGATTGGCAAGACTTAAGTTTTTTCCAATACAACTTTTAACTTATCTCTATTACAAAT 7796

 51973181 ATACACACAATTATTAATTAATTTATTAGTTTTCATTGATACCTAATAATTTTACTTTTT 51973240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7797 ATACACACAATTATTAATTAATTTATTAGTTTTCATTGATACCTAATAATTTTACTTTTT 7856

 51973241 TATAGAGCACACAGGATGTTCTGTACACATATAGAATTTGTAACGATCCAATCAAGGTAT 51973300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7857 TATAGAGCACACAGGATGTTCTGTACACATATAGAATTTGTAACGATCCAATCAAGGTAT 7916

 51973301 TTAGGTTATTCATCATCTCAAACATTTATAATTTCTTTGTGTTGAGTATGTCTCCAATCT 51973360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7917 TTAGGTTATTCATCATCTCAAACATTTATAATTTCTTTGTGTTGAGTATGTCTCCAATCT 7976

 51973361 TCTACCTCTTCTGAAATATACAATAAACTCTATTTTTAACTACAGTCACTCTACTTGTCT 51973420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7977 TCTACCTCTTCTGAAATATACAATAAACTCTATTTTTAACTACAGTCACTCTACTTGTCT 8036

 51973421 CATATGGTACCAAACTAGATCGTTGTTGTCTTGATAACACAGCATTATCATTATAGCTGT 51973480
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8037 CATATGGCACCAAACTAGATCGTTGTTGTCTTGATAACACAGCATTATCATTATAGCTGT 8096

 51973481 AATACATAATGCTGTACCTCCTCTCCTAACCCTGGAAGTTGCAATTCATCCTTCAATGCT 51973540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8097 AATACATAATGCTGTACCTCCTCTCCTAACCCTGGAAGTTGCAATTCATCCTTCAATGCT 8156

 51973541 CAGCTCAAAGGATTATTGTCTCTAAAGTTTTAGCAAATGCTGAAGCAGAATTTCACCATT 51973600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8157 CAGCTCAAAGGATTATTGTCTCTAAAGTTTTAGCAAATGCTGAAGCAGAATTTCACCATT 8216

 51973601 TAATGGGTTCACAAGCTGCTGCCTTTATAGCTTATGGTACATATGTTTGCCAATATAAAT 51973660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8217 TAATGGGTTCACAAGCTGCTGCCTTTATAGCTTATGGTACATATGTTTGCCAATATAAAT 8276

 51973661 GATCCACTTGAGCTAAATTGCCACAGCTGCTACAACACCTCTTTACCTATTTTTGGAGCA 51973720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8277 GATCCACTTGAGCTAAATTGCCACAGCTGCTACAACACCTCTTTACCTATTTTTGGAGCA 8336

 51973721 AAACTGAAAATCAGAAAAGTTTAACTTTTTCAAAATAATGAAAAATTTCTCTCCAATCCT 51973780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8337 AAACTGAAAATCAGAAAAGTTTAACTTTTTCAAAATAATGAAAAATTTCTCTCCAATCCT 8396

 51973781 CTCCATCATTATACATTAATAGGAAAAGAAAGGACAAAGACAA 51973823
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8397 CTCCATCATTATACATTAATAGGAAAAGAAAGGACAAAGACAA 8439

EXCISED REGION

 51974241 AAATTTTCCTTTGAGAAAGTCTCAGTAATATTTGCTTAATATGCTGATAGGCTTATCAAG 51974300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8445 AAATTTTCCTTTGAGAAAGTCTCAGTAATATTTGCTTAATATGCTGATAGGCTTATCAAG 8504

 51974301 CTTCTTGAAAAAAAACTGATTTACAATACAGTGGGGATTATTTTTTTTAAGTTGGAAGGG 51974360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8505 CTTCTTGAAAAAAAACTGATTTACAATACAGTGGGGATTATTTTTTTTAAGTTGGAAGGG 8564

 51974361 AAAGAAGGTTTGATGTAAGAGTGCTTTGAAATGTGGAGTTTTCCTAAGTATTACTCCCAC 51974420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8565 AAAGAAGGTTTGATGTAAGAGTGCTTTGAAATGTGGAGTTTTCCTAAGTATTACTCCCAC 8624

 51974421 AAGACCATAGTCTTGAAATTAAATTAGGCCTTTAGAATATCAGACAAAATAAATGGATTG 51974480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8625 AAGACCATAGTCTTGAAATTAAATTAGGCCTTTAGAATATCAGACAAAATAAATGGATTG 8684

 51974481 TAATTTATTTCAATAGCTGAATGCTTACTATTTTTCAA 51974518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8685 TAATTTATTTCAATAGCTGAATGCTTACTATTTTTCAA 8722

Alignment time is 6.38319 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51963823,51984240] =>     20418 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [       1,    9049] =>      9049 nucs 'mol-32-331c-091654_9049'

Score:        8893
Aligned:      9047        nucs
Identic:      9033 (100%) nucs =>      8797 (100%)       236 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51965013,51973823] EXCISED REGION [51974241,51974476]
 second seq =>  [       1,    8808] EXCISED REGION [    8814,    9049]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       417 nucs [51973824,51974240]
 second seq =>         5 nucs [8809,8813]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [51973823,51973823] to [51974240,51974240]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [51973822,51973823] to [51974241,51974242]
 second seq =>         2 nucs [8807,8808] to [8814,8815]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 51965013 CAATTTCAGAGCCTGTTATCGGTCATTCAACTTCTTCCTGGTTTAGTCTTGGGAGAGTGT 51965072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CAATTTCAGAGCCTGTTATCGGTCATTCAACTTCTTCCTGGTTTAGTCTTGGGAGAGTGT 60

 51965073 ATCTGTCGAGGAATTTATCCATTTCTTCTAGATTTTCTGGTTTATTTGCGTATACGTGTT 51965132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
       61 ATCTGTCGAGGAATTTATCCATTTCTTCTAGATTTTATGGTTTATTTGCGTATACGTGTT 120

 51965133 TGTAGTATTCTCTGATGGTAGTTTTTATTTCTGTGGGATCAGTGGTGATATCCCCTTTAT 51965192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGTAGTATTCTCTGATGGTAGTTTTTATTTCTGTGGGATCAGTGGTGATATCCCCTTTAT 180

 51965193 CATTTTTTTATTGTGTCTATTTGATTCTTCTCTTTTTTTCTTTATTAGTCTTGCTAGTGG 51965252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CATTTTTTTATTGTGTCTATTTGATTCTTCTCTTTTTTTCTTTATTAGTCTTGCTAGTGG 240

 51965253 TCTATCAGTTTTGTTGATCCTTTCAAAAAACCATCTCCTGGATTCGTTAATTTTTTGAAG 51965312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCTATCAGTTTTGTTGATCCTTTCAAAAAACCATCTCCTGGATTCGTTAATTTTTTGAAG 300

 51965313 GGTTTTTTGTGTCTCTATTTCCTTCAGTTCTGCTCTGATTTTAGTTATTTCTTGCCTTCT 51965372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GGTTTTTTGTGTCTCTATTTCCTTCAGTTCTGCTCTGATTTTAGTTATTTCTTGCCTTCT 360

 51965373 GCTAGCTTTTGAATGTGTTTGCTCTTGCTTTTCTACTTCTTTTAATTGTGATGTTAGGGT 51965432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GCTAGCTTTTGAATGTGTTTGCTCTTGCTTTTCTACTTCTTTTAATTGTGATGTTAGGGT 420

 51965433 GTCAATTTTGGATCTTTCCTGCTTTCTGTTGTGGGCATTTAGTGCTATAAATTTCCCTCT 51965492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTCAATTTTGGATCTTTCCTGCTTTCTGTTGTGGGCATTTAGTGCTATAAATTTCCCTCT 480

 51965493 ACACAGTGCTTTGAATGTGTCCCAGAGATTCTGGTATGTTGTATCTTTGTTCTCGTTGGT 51965552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACACAGTGCTTTGAATGTGTCCCAGAGATTCTGGTATGTTGTATCTTTGTTCTCGTTGGT 540

 51965553 TTCAAAGAACATCTTTATTTCTGCCTTCATTTCGTTATGTACCCAGTAGTCTTTCAGGAG 51965612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTCAAAGAACATCTTTATTTCTGCCTTCATTTCGTTATGTACCCAGTAGTCTTTCAGGAG 600

 51965613 CAGGTTGTTCAGTTTCCATGTAGTTAAGCGGTTTTGAGTGAGATTCTTAATCCTGAGTTA 51965672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CAGGTTGTTCAGTTTCCATGTAGTTAAGCGGTTTTGAGTGAGATTCTTAATCCTGAGTTA 660

 51965673 GTTGAAGTTGGTTGTAATTCTCAATTCTTTGCTTTAAACATCCATGTATTTTCTAAATCA 51965732
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
      661 GTTGAAGTTGGTTGTAATTCTCAATTCTTTGCTTTAAACATCCGTGTATTTTCTAAATCA 720

 51965733 TCTACAATGAATTTTTGTATAAATTAACTTTATATACATATATATGTAGAAAGACTACCC 51965792
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
      721 TCTACAATGAATTTTTGTATAAATTAACTTTATATACATATATATGTAGAAAGCCTACCC 780

 51965793 TGCTACAGAAATTATATGAATTGAAATATTATAATAAATTATAATTATAATTAGAAAAAA 51965852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGCTACAGAAATTATATGAATTGAAATATTATAATAAATTATAATTATAATTAGAAAAAA 840

 51965853 TAAGTATTTTGTAATCTTAAATATACAAGTCTTCTTTTGTGCTCTTTATATAGGCAGTGT 51965912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TAAGTATTTTGTAATCTTAAATATACAAGTCTTCTTTTGTGCTCTTTATATAGGCAGTGT 900

 51965913 GGCACAGGGAAAAGAAAACTGCCATTTTTGAAGCCAGAGTGAGTCAAATCCTAGACAGAA 51965972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GGCACAGGGAAAAGAAAACTGCCATTTTTGAAGCCAGAGTGAGTCAAATCCTAGACAGAA 960

 51965973 GCACTCAAGTGTAGATAGGAAAAAATTACTTAAAACCTAGCTGGGAGAAATTATTTAATC 51966032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GCACTCAAGTGTAGATAGGAAAAAATTACTTAAAACCTAGCTGGGAGAAATTATTTAATC 1020

 51966033 TCTGCAAATCATATTTTCTTTATATGTAATATGAAGACAATAATAAGACATACTTCATCA 51966092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TCTGCAAATCATATTTTCTTTATATGTAATATGAAGACAATAATAAGACATACTTCATCA 1080

 51966093 GGCTGCTGTGAAGTTTAAGTGAATTAATATTTGGAAAAAACAAGAAAATATCTAGCAGAG 51966152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GGCTGCTGTGAAGTTTAAGTGAATTAATATTTGGAAAAAACAAGAAAATATCTAGCAGAG 1140

 51966153 TGACTCTCAATGAGTTTTAATGTCAGTAATAAAATGCAGTATATGCTCTCCTTCTCTAAT 51966212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGACTCTCAATGAGTTTTAATGTCAGTAATAAAATGCAGTATATGCTCTCCTTCTCTAAT 1200

 51966213 GTCTCTTAGTTGTGAAAGATCTCCCTCAACCATATATCTGAAATTATCATCACCTGAAAT 51966272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GTCTCTTAGTTGTGAAAGATCTCCCTCAACCATATATCTGAAATTATCATCACCTGAAAT 1260

 51966273 TGTCATTATCCTCAGAAGGGTTTCATATTAACTAATTTCTACTTAGGTGCCAATGGCTAA 51966332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGTCATTATCCTCAGAAGGGTTTCATATTAACTAATTTCTACTTAGGTGCCAATGGCTAA 1320

 51966333 ACCTACTTCTCTTCTATCAGTGAGGAAAGAGCAAAAAAGGGCTGAGCTGATAGGAATAAG 51966392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ACCTACTTCTCTTCTATCAGTGAGGAAAGAGCAAAAAAGGGCTGAGCTGATAGGAATAAG 1380

 51966393 TAGAAAATAAGAAACAGTATAGAAGTAGGGAAGGGAAGGAGAGTGCAGAGAAAAAGAGAT 51966452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TAGAAAATAAGAAACAGTATAGAAGTAGGGAAGGGAAGGAGAGTGCAGAGAAAAAGAGAT 1440

 51966453 AGATGCAAATAAAAAAAATGTTTTTCCAGTGGCTGACAATGATGCTTGTTTCCAAAATTT 51966512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AGATGCAAATAAAAAAAATGTTTTTCCAGTGGCTGACAATGATGCTTGTTTCCAAAATTT 1500

 51966513 AAATGTGAAATGCTTCTTGTTCAATGATTTTTCCCACAAATAATATCTACCAGAAATACT 51966572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AAATGTGAAATGCTTCTTGTTCAATGATTTTTCCCACAAATAATATCTACCAGAAATACT 1560

 51966573 ACTATTACTTTTGTTTTAAAATGTAGAGTTGTTTTTTAAGGAAATACATACAAAGTACAT 51966632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ACTATTACTTTTGTTTTAAAATGTAGAGTTGTTTTTTAAGGAAATACATACAAAGTACAT 1620

 51966633 TCCTTTAGGAAGTACATTCTTTAGGAAGGTCCACACTAATGTGAATGAGGAAGCATCTAT 51966692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TCCTTTAGGAAGTACATTCTTTAGGAAGGTCCACACTAATGTGAATGAGGAAGCATCTAT 1680

 51966693 TAACTGTCTTATATGTATCCTGGTGTGTCAGGTACTTTGGTTTAATATATTCTTATAGTT 51966752
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TAACTGTCTTATATGTATCCTGTTGTGTCAGGTACTTTGGTTTAATATATTCTTATAGTT 1740

 51966753 TATAAGAGAAAACATATGGTCTCTGAGAAATTATATGACATAAAACTTTTAAATATAGAT 51966812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TATAAGAGAAAACATATGGTCTCTGAGAAATTATATGACATAAAACTTTTAAATATAGAT 1800

 51966813 CCCCCCAAAATTGCTTTCTTTTATGTGGTAATTGAAATTGTCTATTTATCTCTCTTTTTA 51966872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CCCCCCAAAATTGCTTTCTTTTATGTGGTAATTGAAATTGTCTATTTATCTCTCTTTTTA 1860

 51966873 TTTACCATCAAGAAATAAGTCATGAGGAGAAATTATAGCAGCAGAACTTTTCCCCTACTT 51966932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTTACCATCAAGAAATAAGTCATGAGGAGAAATTATAGCAGCAGAACTTTTCCCCTACTT 1920

 51966933 CATGTATTCATTTTTTAAAAATCATCTTCCTTTATTTATTTACTTTAGTTCATTATGGCT 51966992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CATGTATTCATTTTTTAAAAATCATCTTCCTTTATTTATTTACTTTAGTTCATTATGGCT 1980

 51966993 TAACTCAGTCTCACCCAATTACATGAGCTGTTCATAATGGTGTCTTACTTCAGCAGTCCA 51967052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TAACTCAGTCTCACCCAATTACATGAGCTGTTCATAATGGTGTCTTACTTCAGCAGTCCA 2040

 51967053 GCCAGCTGTGATTGAAGTCAGCCAGGAATGCCGACTACAGATCAGAGCACCTGTGAGATT 51967112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GCCAGCTGTGATTGAAGTCAGCCAGGAATGCCGACTACAGATCAGAGCACCTGTGAGATT 2100

 51967113 ATCAGTTCCATGTGGAATGTCAGACGTATTCTAAACTAGAGTAATTGACTTGGCCAGGAT 51967172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ATCAGTTCCATGTGGAATGTCAGACGTATTCTAAACTAGAGTAATTGACTTGGCCAGGAT 2160

 51967173 GAGGGGTCAGGAGTGTCATTAAAAATATATAGCTTGGTATGATTAGCTGCAGAGAAGAAC 51967232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GAGGGGTCAGGAGTGTCATTAAAAATATATAGCTTGGTATGATTAGCTGCAGAGAAGAAC 2220

 51967233 ATTCAAGAGCTAGGGGCCCTGGAATCTCCATCAACTTCACAGGTTTAGGTGCTTGGAAGT 51967292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ATTCAAGAGCTAGGGGCCCTGGAATCTCCATCAACTTCACAGGTTTAGGTGCTTGGAAGT 2280

 51967293 GGATTTTGGAGGGATTGCTGTGATCTTTGACAAACTTAATGTATCATTCACTTAGGCTGT 51967352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GGATTTTGGAGGGATTGCTGTGATCTTTGACAAACTTAATGTATCATTCACTTAGGCTGT 2340

 51967353 CATTCAGCAAACCTTCTGTGAAAATAGATTCATCACAAAAGGCCATGACATTAAAGCTGT 51967412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CATTCAGCAAACCTTCTGTGAAAATAGATTCATCACAAAAGGCCATGACATTAAAGCTGT 2400

 51967413 ATACAACTCTTGAACAGAGTCAAAAAAAAAAACTGGATCTTTATGACTTCCTGAGTGTTC 51967472
          ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ATACAACTCTTGAACAGAGTCAAAAAAAAAA-CTGGATCTTTATGACTTCCTGAGTGTTC 2459

 51967473 TCTTTTACAAAATCAGGACCACAGACATGTGCATGCCTGCATGCAAATGTACACAAAGAC 51967532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 TCTTTTACAAAATCAGGACCACAGACATGTGCATGCCTGCATGCAAATGTACACAAAGAC 2519

 51967533 ACACATTCACACACGCACACTCTCACAAACATACCCCTTGTTGTAGAAAATAGTATAGTC 51967592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 ACACATTCACACACGCACACTCTCACAAACATACCCCTTGTTGTAGAAAATAGTATAGTC 2579

 51967593 AAAGTCATAGCCTGATTCTGGCAATTATCTGAGACCCAACAGCATGTGTTTTACATATTT 51967652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 AAAGTCATAGCCTGATTCTGGCAATTATCTGAGACCCAACAGCATGTGTTTTACATATTT 2639

 51967653 ATACTCACTATTGATTTAAATTTTGTTATTCACTCCCTTTTCCTATTGTCTTATTTTCTT 51967712
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     2640 ATACTCACTATTGATTTAAATTTTGTTATTCACTCCCTTCTCCTATTGTCTTATTTTCTT 2699

 51967713 CCTTAACATATTTTTATATTTCCTATTTTAGCGATTTTAAATTCTTTCTGGAACGACGTT 51967772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 CCTTAACATATTTTTATATTTCCTATTTTAGCGATTTTAAATTCTTTCTGGAACGACGTT 2759

 51967773 GGCACAAATCAAAAATTAAATCTTATAAAGTGCTCTATGGTCATAGGCAAAATGGAATCT 51967832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 GGCACAAATCAAAAATTAAATCTTATAAAGTGCTCTATGGTCATAGGCAAAATGGAATCT 2819

 51967833 GTAGATAATCAAGTTCCTGAAGGGATGTGAAACCAACTGCTACAAGGATAAGCTAGAAGA 51967892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2820 GTAGATAATCAAGTTCCTGAAGGGATGTGAAACCAACTGCTACAAGGATAAGCTAGAAGA 2879

 51967893 ATCAGAGATTTTTGGCCTGAAGCACACACAGAAGACTACTTTTAGAGGGGTCTGATGTCA 51967952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2880 ATCAGAGATTTTTGGCCTGAAGCACACACAGAAGACTACTTTTAGAGGGGTCTGATGTCA 2939

 51967953 CTAACTTCTTGAGATTGCTGCCATTTTTAACATACAGCTAGCTGGATAGAAGAAGACAGT 51968012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2940 CTAACTTCTTGAGATTGCTGCCATTTTTAACATACAGCTAGCTGGATAGAAGAAGACAGT 2999

 51968013 CTCAGATAAATGACCAGTTCAGGCCACCAATGTCTCCTTCCAAAAAGGCCTGTACTGCTG 51968072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3000 CTCAGATAAATGACCAGTTCAGGCCACCAATGTCTCCTTCCAAAAAGGCCTGTACTGCTG 3059

 51968073 TACATGCCAAGGGTTAGAGATTTTGGGGCCAACTTTTTCCAGCATGTCTTATATCCTTCA 51968132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3060 TACATGCCAAGGGTTAGAGATTTTGGGGCCAACTTTTTCCAGCATGTCTTATATCCTTCA 3119

 51968133 ATAAGTTGGTTACTTTGCAAAACATTAGACCACTTAATAATCAATTTCCTCCATGGATTC 51968192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3120 ATAAGTTGGTTACTTTGCAAAACATTAGACCACTTAATAATCAATTTCCTCCATGGATTC 3179

 51968193 ACTCATACTTTGTCCTCACACTATTCTGGACTCCTTTCTCTTGATTTTATTTCTCCAAGT 51968252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3180 ACTCATACTTTGTCCTCACACTATTCTGGACTCCTTTCTCTTGATTTTATTTCTCCAAGT 3239

 51968253 GATTCAATTGTGTCTTTTGGGACACTTATAAGTAAACATTTCCACATCCTCAGCTTTATC 51968312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3240 GATTCAATTGTGTCTTTTGGGACACTTATAAGTAAACATTTCCACATCCTCAGCTTTATC 3299

 51968313 ACAGAATTTTCACTTCCTTGCCTTAAGTGTCCCTGGAGGCTGCTGATCTTACAAGTAAAT 51968372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3300 ACAGAATTTTCACTTCCTTGCCTTAAGTGTCCCTGGAGGCTGCTGATCTTACAAGTAAAT 3359

 51968373 GTCTGGAGATAGGGTTGACAGCTCTTGAAGGCAGTGCCATTATGAAATCAATCCTAGTCT 51968432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3360 GTCTGGAGATAGGGTTGACAGCTCTTGAAGGCAGTGCCATTATGAAATCAATCCTAGTCT 3419

 51968433 AAGTAGACATTTTGGGTACCATGCCTTCTTATCTACTTTTGGGCTGTGAGCATCCAGTCA 51968492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3420 AAGTAGACATTTTGGGTACCATGCCTTCTTATCTACTTTTGGGCTGTGAGCATCCAGTCA 3479

 51968493 TTTTATTTTACCGTACAACTAGAGGTAACTTCTTAAAGTACCAAGTATATCATTCCCTGG 51968552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3480 TTTTATTTTACCGTACAACTAGAGGTAACTTCTTAAAGTACCAAGTATATCATTCCCTGG 3539

 51968553 TTTAAAGACCTTTAACTGTTAACTATTGCTCTGCATATAAAATCTTAACTTTTGCCATAA 51968612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3540 TTTAAAGACCTTTAACTGTTAACTATTGCTCTGCATATAAAATCTTAACTTTTGCCATAA 3599

 51968613 CTAACAGGGATCTTCTTGATCTAATTCCATCTCAGATCTTAATGTTGTCTACCTGCTGTG 51968672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3600 CTAACAGGGATCTTCTTGATCTAATTCCATCTCAGATCTTAATGTTGTCTACCTGCTGTG 3659

 51968673 CCTGAGGTTTACTGAGTTGCTGACACTTCCTAAAACATGCCTTGTTCTCTTACTTTTGGG 51968732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3660 CCTGAGGTTTACTGAGTTGCTGACACTTCCTAAAACATGCCTTGTTCTCTTACTTTTGGG 3719

 51968733 CCTTCCGGACACCAGCTTTGCTTTCTTGGCCCCACTGAGGGGGCTTATTTTGTAGATGTC 51968792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3720 CCTTCCGGACACCAGCTTTGCTTTCTTGGCCCCACTGAGGGGGCTTATTTTGTAGATGTC 3779

 51968793 GTTATTTTCGGAGAGGCTTCTATGAACCACCACCCTCTCTGCAAATTAGGTACTTTTTCT 51968852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3780 GTTATTTTCGGAGAGGCTTCTATGAACCACCACCCTCTCTGCAAATTAGGTACTTTTTCT 3839

 51968853 TAGTGCACTCGTCCTCCTTGATCTTATCCTACTGCGACAAAATAATTCTTGTAATTGTAT 51968912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3840 TAGTGCACTCGTCCTCCTTGATCTTATCCTACTGCGACAAAATAATTCTTGTAATTGTAT 3899

 51968913 GTGTCCACAAATACACTATACATTTTCTATGAATGAAGATTATATCTGCAGCATTCAGTA 51968972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3900 GTGTCCACAAATACACTATACATTTTCTATGAATGAAGATTATATCTGCAGCATTCAGTA 3959

 51968973 GCATAACAGAGACTCAATAAATATGTATTGAAATGAATTAAATTTAATAGCTGATTACAA 51969032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3960 GCATAACAGAGACTCAATAAATATGTATTGAAATGAATTAAATTTAATAGCTGATTACAA 4019

 51969033 ATAACTGGCTCTAACATAAAAGTAGAGATAAGTTTGCTTTCATTCATGTAAAGTAGCAGA 51969092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4020 ATAACTGGCTCTAACATAAAAGTAGAGATAAGTTTGCTTTCATTCATGTAAAGTAGCAGA 4079

 51969093 TGTGAAACCAATGAGGGAGCATTATTGGGGGCATATTTTAATCAAAACTACTGAAAAATC 51969152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4080 TGTGAAACCAATGAGGGAGCATTATTGGGGGCATATTTTAATCAAAACTACTGAAAAATC 4139

 51969153 TGAAAGAATTATGTAAAGATAAAGTATGCTGTCTTGAGATGTGGTGAGTTTTTCACCAGA 51969212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4140 TGAAAGAATTATGTAAAGATAAAGTATGCTGTCTTGAGATGTGGTGAGTTTTTCACCAGA 4199

 51969213 ATGACTAAAATATGCCTTAGATCATTAGTCCCCAAACCTTCCTTCTTGTGTACAGACTTC 51969272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4200 ATGACTAAAATATGCCTTAGATCATTAGTCCCCAAACCTTCCTTCTTGTGTACAGACTTC 4259

 51969273 TATTAGTTTTATTTTTCTTCTTTTTAAGTAGATATATTTCTATAGCCAAAAAATATAGAT 51969332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4260 TATTAGTTTTATTTTTCTTCTTTTTAAGTAGATATATTTCTATAGCCAAAAAATATAGAT 4319

 51969333 TTGTTTCCGTTATAAAAATGTGCTATTGCGCTAGTATGTTATAATAATCATGAAGCCTGC 51969392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4320 TTGTTTCCGTTATAAAAATGTGCTATTGCGCTAGTATGTTATAATAATCATGAAGCCTGC 4379

 51969393 TATAATACATAAAATAGACTACTTAGAGAATAAATGTAAAAAATTTTCTAGTACTTTTTC 51969452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4380 TATAATACATAAAATAGACTACTTAGAGAATAAATGTAAAAAATTTTCTAGTACTTTTTC 4439

 51969453 CTGTGTCTTAATGAATTGCTTTGTGTACCACCCTGGGTCCTTGCTCTACATTTTGAAATA 51969512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4440 CTGTGTCTTAATGAATTGCTTTGTGTACCACCCTGGGTCCTTGCTCTACATTTTGAAATA 4499

 51969513 ATTGTAAGGCTATGATTAAATTTTAAACATGATAATATTTTTAATGAATATAGTATAGAT 51969572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4500 ATTGTAAGGCTATGATTAAATTTTAAACATGATAATATTTTTAATGAATATAGTATAGAT 4559

 51969573 TTTTGCCTTGAAATTCTTATTTTGAAAACAATATTGAATTTAGGCCAAAGAAAAATGTAC 51969632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4560 TTTTGCCTTGAAATTCTTATTTTGAAAACAATATTGAATTTAGGCCAAAGAAAAATGTAC 4619

 51969633 TTACTTTGTTATCCTTTTTAGCAAAATCAAATTGCTAATGGCAGTGTTTAGCGTTTTCTG 51969692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4620 TTACTTTGTTATCCTTTTTAGCAAAATCAAATTGCTAATGGCAGTGTTTAGCGTTTTCTG 4679

 51969693 TATGTTGATGACTATGCTTCAGTGGCGTAAAATCTAATGCAATAAACCAGCATTTACTAG 51969752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4680 TATGTTGATGACTATGCTTCAGTGGCGTAAAATCTAATGCAATAAACCAGCATTTACTAG 4739

 51969753 TTGTGGCATAATGCAAGAAAGCATCATTTTGCTAAGGGATATCTAGGGATTACTAGTTCT 51969812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4740 TTGTGGCATAATGCAAGAAAGCATCATTTTGCTAAGGGATATCTAGGGATTACTAGTTCT 4799

 51969813 CTCTCTTTCTGGTCAGATTTAGTCCTAAACTCCATAAGGCATTTACTAACATCTACTTTC 51969872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4800 CTCTCTTTCTGGTCAGATTTAGTCCTAAACTCCATAAGGCATTTACTAACATCTACTTTC 4859

 51969873 AAATGATGAACAACTGTCCTGATCAAAGGAAGATGAAAACACAAAATTCTTTATTCTGGA 51969932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4860 AAATGATGAACAACTGTCCTGATCAAAGGAAGATGAAAACACAAAATTCTTTATTCTGGA 4919

 51969933 AAACACATCTCCCTAGAGTGTCTCCGCTGCACACTCTTCCACCTTGCATATTTGTATATT 51969992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4920 AAACACATCTCCCTAGAGTGTCTCCGCTGCACACTCTTCCACCTTGCATATTTGTATATT 4979

 51969993 CAGACACTAGAAAATTCACGTGAAAGGAGCCTCCACTTTACCAATTATCAGAAATATGCA 51970052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4980 CAGACACTAGAAAATTCACGTGAAAGGAGCCTCCACTTTACCAATTATCAGAAATATGCA 5039

 51970053 AGTGAATTTAATATCACTAATAGTTGGCATGTCAATGATTAGATAATCTATTTGAAATGC 51970112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5040 AGTGAATTTAATATCACTAATAGTTGGCATGTCAATGATTAGATAATCTATTTGAAATGC 5099

 51970113 TTATTCTATAAAGTTGTATTTTAACCAACAGTTTTATGAAGAGTGTTCAGTCCTCATAAA 51970172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5100 TTATTCTATAAAGTTGTATTTTAACCAACAGTTTTATGAAGAGTGTTCAGTCCTCATAAA 5159

 51970173 ATCATCTCAGTTCCCATTTGTGCACTCAGAAACTTACCACTGTGTTCTGTTTTTATCTTT 51970232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5160 ATCATCTCAGTTCCCATTTGTGCACTCAGAAACTTACCACTGTGTTCTGTTTTTATCTTT 5219

 51970233 ATAATCTATATTTAACAATTGCATTGTATCTTCCCTGGTCTCCAGCTCTAAGCAAATAAA 51970292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5220 ATAATCTATATTTAACAATTGCATTGTATCTTCCCTGGTCTCCAGCTCTAAGCAAATAAA 5279

 51970293 TACTCTTCTTCTTTCTTTTTTCTTGTATATAAATGATTACAGAGAATGGGACAGAGAGAG 51970352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5280 TACTCTTCTTCTTTCTTTTTTCTTGTATATAAATGATTACAGAGAATGGGACAGAGAGAG 5339

 51970353 AAAATGAAGAGACATAGTTAGAGAGATACACAGGCACAGAGAGAGAGAGAGAGAAAAAGA 51970412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5340 AAAATGAAGAGACATAGTTAGAGAGATACACAGGCACAGAGAGAGAGAGAGAGAAAAAGA 5399

 51970413 GGAGGAGAAGAGAAGAGAGAAGAGACAGAGGAGAGAGAATGCAGAGAATTTACAATTACT 51970472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5400 GGAGGAGAAGAGAAGAGAGAAGAGACAGAGGAGAGAGAATGCAGAGAATTTACAATTACT 5459

 51970473 ATAGAAAATGTGCACATTTTTCATAATAAAAATGAGTAAATACTTTCATGATATTATTAT 51970532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5460 ATAGAAAATGTGCACATTTTTCATAATAAAAATGAGTAAATACTTTCATGATATTATTAT 5519

 51970533 CACAGACTGATGATCTGACATAGATTTCGTGCCGTCTACCTGGGTCTCTACACGACAAAC 51970592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5520 CACAGACTGATGATCTGACATAGATTTCGTGCCGTCTACCTGGGTCTCTACACGACAAAC 5579

 51970593 CTGAGTTAGATGTAATGTAGAGATATGTTTCCACATTGCCCTTCTTGGGGAAGGTGAGCC 51970652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5580 CTGAGTTAGATGTAATGTAGAGATATGTTTCCACATTGCCCTTCTTGGGGAAGGTGAGCC 5639

 51970653 AGTTCTGAGGTGCCTGGTCCTAGTTGTCACAGATGCAGTTATTTCACACTAGGCTGCCTG 51970712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5640 AGTTCTGAGGTGCCTGGTCCTAGTTGTCACAGATGCAGTTATTTCACACTAGGCTGCCTG 5699

 51970713 CCAGCCTGGATTTGTCTTCCTTTTTTTTTTTTTTGTTTTCAATCTCCCTGGGCTTGCGTC 51970772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
     5700 CCAGCCTGGATTTGTCTTCCTTTTTTTTTTTTT-GTTTTCAATCTCCCTGGGCTTGCGTC 5758

 51970773 ATTACATCAACACATTCTGAAACATCTGTCAGAATCCTTGCCAGTTCAAATTTACAAAAG 51970832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5759 ATTACATCAACACATTCTGAAACATCTGTCAGAATCCTTGCCAGTTCAAATTTACAAAAG 5818

 51970833 TGCAATAATATTCTATCTCCCCATCACCACCAAATCTTGCTAAAATAAAATCATACATTT 51970892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5819 TGCAATAATATTCTATCTCCCCATCACCACCAAATCTTGCTAAAATAAAATCATACATTT 5878

 51970893 ATTTATAAAAGTTTGTTGTTAAGAAAAAAACTGAAAACATCATGAAGGTCTGAGAGAAAT 51970952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5879 ATTTATAAAAGTTTGTTGTTAAGAAAAAAACTGAAAACATCATGAAGGTCTGAGAGAAAT 5938

 51970953 AAAGTGGAATTTAGAAGTATTGTATCCATGTCATATGACATATAAAAGTTTGTAATCATT 51971012
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5939 AAAGTGGAATTTAAAAGTATTGTATCCATGTCATATGACATATAAAAGTTTGTAATCATT 5998

 51971013 AAAGATGATGAGTAATATATGGTAAGGAATATTTGGAAAACTTCTTTCAGTGTTAAAAAA 51971072
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5999 AAAGATGATGAGTAATATATGGTGAGGAATATTTGGAAAACTTCTTTCAGTGTTAAAAAA 6058

 51971073 GAAAAATAAAGAAGAGTCAAATTGTATTGCCTCAGTTTTATTAAACACTTATGTATTTTA 51971132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6059 GAAAAATAAAGAAGAGTCAAATTGTATTGCCTCAGTTTTATTAAACACTTATGTATTTTA 6118

 51971133 CATACATTTAAAAAACTTAGCCGGGTGTGGTGGCGCGCGCTTGTAATCCCAGCTACTCGG 51971192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     6119 CATACATTTAAAAAACTTAGCCGGGTGTGGTGGCGCGCGCTTGTAATCCCGGCTACTCGG 6178

 51971193 GAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGTGGAAATT 51971252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6179 GAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGTGGAAATT 6238

 51971253 GTGCCACTGAACTCCAGCCTGGGGGATAGGGCAAGATTCTGTCTCAAAAAAATAAAGGAA 51971312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6239 GTGCCACTGAACTCCAGCCTGGGGGATAGGGCAAGATTCTGTCTCAAAAAAATAAAGGAA 6298

 51971313 AAAAAAATTTTAATTTGAATAGTTCGCTAGTGCTAAATGTTTATGGTTTTGAATCTGAAT 51971372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6299 AAAAAAATTTTAATTTGAATAGTTCGCTAGTGCTAAATGTTTATGGTTTTGAATCTGAAT 6358

 51971373 GTTTTCATAACATTTTATTTTTAGCGTATTTTTTAGGTTTCCATATTCCAGTGTTGCTGC 51971432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6359 GTTTTCATAACATTTTATTTTTAGCGTATTTTTTAGGTTTCCATATTCCAGTGTTGCTGC 6418

 51971433 AACAAATACGTAATGTTTATAATCAGAAAAGCATTGTTAAATAACCTCTGCAAAAACTCT 51971492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6419 AACAAATACGTAATGTTTATAATCAGAAAAGCATTGTTAAATAACCTCTGCAAAAACTCT 6478

 51971493 TTAATCTCCCTAATCTAGGGATAGGGAATTATTTTATCTATAATTTTAATTCTAATTGTT 51971552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6479 TTAATCTCCCTAATCTAGGGATAGGGAATTATTTTATCTATAATTTTAATTCTAATTGTT 6538

 51971553 AGAGTGTGGCTGCCTGGAGCACTGACTTGAAAATAAATCTGAAACCCATCAGGAAAAAAT 51971612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6539 AGAGTGTGGCTGCCTGGAGCACTGACTTGAAAATAAATCTGAAACCCATCAGGAAAAAAT 6598

 51971613 AATGTCAATTAACATTGGTTGTCATTTGTTCAAGAGGAAAAAGTCGGAGCATGATACCCC 51971672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6599 AATGTCAATTAACATTGGTTGTCATTTGTTCAAGAGGAAAAAGTCGGAGCATGATACCCC 6658

 51971673 ATATTTGCCATGCATTCTGAAATGTTTTCTTTTGTCTTTTACTTTAAAAAAAGATGGATG 51971732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6659 ATATTTGCCATGCATTCTGAAATGTTTTCTTTTGTCTTTTACTTTAAAAAAAGATGGATG 6718

 51971733 ATTTTATTTATATATTAGAACTCATGATCTATATTTTCAACTCTGCTCCAGTAAGTCTCT 51971792
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     6719 ATTTTATTTATATATTAGAACTCATGATCTGTATTTTCAACTCTGCTCCAGTAAGTCTCT 6778

 51971793 TATTCATTTGGTTAAAGCACCAATTACACTTACCCCGTAGTTTCTGATTTTTGATAGGAC 51971852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6779 TATTCATTTGGTTAAAGCACCAATTACACTTACCCCGTAGTTTCTGATTTTTGATAGGAC 6838

 51971853 ATTAGGAGAAAGACCATACATTTAAGGGCAATGAAAATAAATATCTAAGATGAAGTGATT 51971912
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     6839 ATTAGGAGAAAGACCATACATTTAAGGGAAATGAAAATAAATATCTAAGATGAAGTGATT 6898

 51971913 ATTATAACTTTGCAATATGGATTGAACCTGGACTAAGTACTAGTGCTATATCAGGAAGCT 51971972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6899 ATTATAACTTTGCAATATGGATTGAACCTGGACTAAGTACTAGTGCTATATCAGGAAGCT 6958

 51971973 GGATCAATTTGACACCTACTGAAAGTGACACATGGGCCTTGCTAAAGAAAGAGTTTAAAT 51972032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6959 GGATCAATTTGACACCTACTGAAAGTGACACATGGGCCTTGCTAAAGAAAGAGTTTAAAT 7018

 51972033 CTGGTAGTGCTTCAGAATTTTTATTTCAGTGAGGTTCTGTAAAATTAAATTCATCTGGCA 51972092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7019 CTGGTAGTGCTTCAGAATTTTTATTTCAGTGAGGTTCTGTAAAATTAAATTCATCTGGCA 7078

 51972093 TTGTGGGAAAAAGTTGTATTATATATGAACCAATTTCTTAAATAAGTGCAACTTAATCTT 51972152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7079 TTGTGGGAAAAAGTTGTATTATATATGAACCAATTTCTTAAATAAGTGCAACTTAATCTT 7138

 51972153 CTAAGAAACTTTAAAATATTTAATCTTGTTGGGTATTTTTTTTTCCATTTTTTTCTTGCT 51972212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7139 CTAAGAAACTTTAAAATATTTAATCTTGTTGGGTATTTTTTTTTCCATTTTTTTCTTGCT 7198

 51972213 ATTTCTTTAGGGAAAAAAAACAGAATATATAACACTCTTCATTAGTATGGAACACACATA 51972272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7199 ATTTCTTTAGGGAAAAAAAACAGAATATATAACACTCTTCATTAGTATGGAACACACATA 7258

 51972273 CTATTTTATTTCCTATTTTAAAACTTAATTACTCAAATACTCCATGAATTTATTAGCAAT 51972332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7259 CTATTTTATTTCCTATTTTAAAACTTAATTACTCAAATACTCCATGAATTTATTAGCAAT 7318

 51972333 TGATCCAATATTTCCCTCTTTAATGTCAATTGCTGCTCCCTTTTCCTTATGCATAGTACA 51972392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7319 TGATCCAATATTTCCCTCTTTAATGTCAATTGCTGCTCCCTTTTCCTTATGCATAGTACA 7378

 51972393 TGGATCCTCAGGATTCACTTACGCAGTCCACTGAGCAGTGGCCATTCACACTTTTAATGT 51972452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7379 TGGATCCTCAGGATTCACTTACGCAGTCCACTGAGCAGTGGCCATTCACACTTTTAATGT 7438

 51972453 GAGGAAGAGTGAGAGAAAGGAAAACAGAAATTATTTCATACCAAAAGAGCCCCTGATTTT 51972512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7439 GAGGAAGAGTGAGAGAAAGGAAAACAGAAATTATTTCATACCAAAAGAGCCCCTGATTTT 7498

 51972513 TCACTGCTTCTTTTGTTATTCACATACAGGAGGATATGTTCCTAATCACTTTTATGATGT 51972572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7499 TCACTGCTTCTTTTGTTATTCACATACAGGAGGATATGTTCCTAATCACTTTTATGATGT 7558

 51972573 GAACATGCCTGCACAGTTGCCACTGCTGCATCATGTTGGGGTTCCCAAATTTAGACCTTT 51972632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7559 GAACATGCCTGCACAGTTGCCACTGCTGCATCATGTTGGGGTTCCCAAATTTAGACCTTT 7618

 51972633 TTCCACTTACACTTTGTTCTCAACCACTGTGCCCTCAAAATGACCACTATTCCAGCATAT 51972692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7619 TTCCACTTACACTTTGTTCTCAACCACTGTGCCCTCAAAATGACCACTATTCCAGCATAT 7678

 51972693 CTGAGGTAAGAGAGAGCTTCTTGCCTGAGACACAAAGTGTGCCCAGAACTAGAATTCTGC 51972752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7679 CTGAGGTAAGAGAGAGCTTCTTGCCTGAGACACAAAGTGTGCCCAGAACTAGAATTCTGC 7738

 51972753 TTCTAATACTCAAACTCTGGTGTTATGTTGGAGTTACCAGCCCAGACCTCTTCCTTTGTA 51972812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7739 TTCTAATACTCAAACTCTGGTGTTATGTTGGAGTTACCAGCCCAGACCTCTTCCTTTGTA 7798

 51972813 ATAAGTTTCCATTTGTGATCAGCAATGGCCCTTTCTGGAACCATCTCAAGCCATCAGTGA 51972872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7799 ATAAGTTTCCATTTGTGATCAGCAATGGCCCTTTCTGGAACCATCTCAAGCCATCAGTGA 7858

 51972873 AGTTTGACTAACTTTGAAAGGATGGGGGCCTTGATCTTTTATTTTCTGAAGATTCCTGGC 51972932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7859 AGTTTGACTAACTTTGAAAGGATGGGGGCCTTGATCTTTTATTTTCTGAAGATTCCTGGC 7918

 51972933 ACACTATGCTAATGTACTCATATTCATTCCTCATACCTAGCTTTGTAAATGTAGAACTCA 51972992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7919 ACACTATGCTAATGTACTCATATTCATTCCTCATACCTAGCTTTGTAAATGTAGAACTCA 7978

 51972993 AACTTTTAAGAAGACACTCTCCACAGGAAGTGGATATCTCTTTCCCAACATAAGTGAGGC 51973052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7979 AACTTTTAAGAAGACACTCTCCACAGGAAGTGGATATCTCTTTCCCAACATAAGTGAGGC 8038

 51973053 CACAGATTAGCACAGACAATTAAAGAGGTAAAATCTGCCAAACGTTTTTTTTTTTATTCT 51973112
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
     8039 CACAGATTAGCACAGACAATTAAAGAGGTAAAATCTGCCAAACGTTTTTTTTTT-ATTCT 8097

 51973113 AGCTTAGAAATGATTGGCAAGACTTAAGTTTTTTCCAATACAACTTTTAACTTATCTCTA 51973172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8098 AGCTTAGAAATGATTGGCAAGACTTAAGTTTTTTCCAATACAACTTTTAACTTATCTCTA 8157

 51973173 TTACAAATATACACACAATTATTAATTAATTTATTAGTTTTCATTGATACCTAATAATTT 51973232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8158 TTACAAATATACACACAATTATTAATTAATTTATTAGTTTTCATTGATACCTAATAATTT 8217

 51973233 TACTTTTTTATAGAGCACACAGGATGTTCTGTACACATATAGAATTTGTAACGATCCAAT 51973292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8218 TACTTTTTTATAGAGCACACAGGATGTTCTGTACACATATAGAATTTGTAACGATCCAAT 8277

 51973293 CAAGGTATTTAGGTTATTCATCATCTCAAACATTTATAATTTCTTTGTGTTGAGTATGTC 51973352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8278 CAAGGTATTTAGGTTATTCATCATCTCAAACATTTATAATTTCTTTGTGTTGAGTATGTC 8337

 51973353 TCCAATCTTCTACCTCTTCTGAAATATACAATAAACTCTATTTTTAACTACAGTCACTCT 51973412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8338 TCCAATCTTCTACCTCTTCTGAAATATACAATAAACTCTATTTTTAACTACAGTCACTCT 8397

 51973413 ACTTGTCTCATATGGTACCAAACTAGATCGTTGTTGTCTTGATAACACAGCATTATCATT 51973472
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8398 ACTTGTCTCATATGGCACCAAACTAGATCGTTGTTGTCTTGATAACACAGCATTATCATT 8457

 51973473 ATAGCTGTAATACATAATGCTGTACCTCCTCTCCTAACCCTGGAAGTTGCAATTCATCCT 51973532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8458 ATAGCTGTAATACATAATGCTGTACCTCCTCTCCTAACCCTGGAAGTTGCAATTCATCCT 8517

 51973533 TCAATGCTCAGCTCAAAGGATTATTGTCTCTAAAGTTTTAGCAAATGCTGAAGCAGAATT 51973592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8518 TCAATGCTCAGCTCAAAGGATTATTGTCTCTAAAGTTTTAGCAAATGCTGAAGCAGAATT 8577

 51973593 TCACCATTTAATGGGTTCACAAGCTGCTGCCTTTATAGCTTATGGTACATATGTTTGCCA 51973652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8578 TCACCATTTAATGGGTTCACAAGCTGCTGCCTTTATAGCTTATGGTACATATGTTTGCCA 8637

 51973653 ATATAAATGATCCACTTGAGCTAAATTGCCACAGCTGCTACAACACCTCTTTACCTATTT 51973712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8638 ATATAAATGATCCACTTGAGCTAAATTGCCACAGCTGCTACAACACCTCTTTACCTATTT 8697

 51973713 TTGGAGCAAAACTGAAAATCAGAAAAGTTTAACTTTTTCAAAATAATGAAAAATTTCTCT 51973772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8698 TTGGAGCAAAACTGAAAATCAGAAAAGTTTAACTTTTTCAAAATAATGAAAAATTTCTCT 8757

 51973773 CCAATCCTCTCCATCATTATACATTAATAGGAAAAGAAAGGACAAAGACAA 51973823
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8758 CCAATCCTCTCCATCATTATACATTAATAGGAAAAGAAAGGACAAAGACAA 8808

EXCISED REGION

 51974241 AAATTTTCCTTTGAGAAAGTCTCAGTAATATTTGCTTAATATGCTGATAGGCTTATCAAG 51974300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8814 AAATTTTCCTTTGAGAAAGTCTCAGTAATATTTGCTTAATATGCTGATAGGCTTATCAAG 8873

 51974301 CTTCTTGAAAAAAAACTGATTTACAATACAGTGGGGATTATTTTTTTTAAGTTGGAAGGG 51974360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8874 CTTCTTGAAAAAAAACTGATTTACAATACAGTGGGGATTATTTTTTTTAAGTTGGAAGGG 8933

 51974361 AAAGAAGGTTTGATGTAAGAGTGCTTTGAAATGTGGAGTTTTCCTAAGTATTACTCCCAC 51974420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8934 AAAGAAGGTTTGATGTAAGAGTGCTTTGAAATGTGGAGTTTTCCTAAGTATTACTCCCAC 8993

 51974421 AAGACCATAGTCTTGAAATTAAATTAGGCCTTTAGAATATCAGACAAAATAAATGG 51974476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8994 AAGACCATAGTCTTGAAATTAAATTAGGCCTTTAGAATATCAGACAAAATAAATGG 9049

Alignment time is 6.61394 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51963823,51984240] =>     20418 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [       1,    2116] =>      2116 nucs 'mol-32-338a-043767_2116'

Score:        2089
Aligned:      2111        nucs
Identic:      2109 (100%) nucs =>      2023 (100%)        86 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51971799,51973823] EXCISED REGION [51974241,51974326]
 second seq =>  [       1,    2025] EXCISED REGION [    2031,    2116]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       417 nucs [51973824,51974240]
 second seq =>         5 nucs [2026,2030]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [51973823,51973823] to [51974240,51974240]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [51973822,51973823] to [51974241,51974242]
 second seq =>         2 nucs [2024,2025] to [2031,2032]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 51971799 TTTGGTTAAAGCACCAATTACACTTACCCCGTAGTTTCTGATTTTTGATAGGACATTAGG 51971858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTGGTTAAAGCACCAATTACACTTACCCCGTAGTTTCTGATTTTTGATAGGACATTAGG 60

 51971859 AGAAAGACCATACATTTAAGGGCAATGAAAATAAATATCTAAGATGAAGTGATTATTATA 51971918
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGAAAGACCATACATTTAAGGGAAATGAAAATAAATATCTAAGATGAAGTGATTATTATA 120

 51971919 ACTTTGCAATATGGATTGAACCTGGACTAAGTACTAGTGCTATATCAGGAAGCTGGATCA 51971978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACTTTGCAATATGGATTGAACCTGGACTAAGTACTAGTGCTATATCAGGAAGCTGGATCA 180

 51971979 ATTTGACACCTACTGAAAGTGACACATGGGCCTTGCTAAAGAAAGAGTTTAAATCTGGTA 51972038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATTTGACACCTACTGAAAGTGACACATGGGCCTTGCTAAAGAAAGAGTTTAAATCTGGTA 240

 51972039 GTGCTTCAGAATTTTTATTTCAGTGAGGTTCTGTAAAATTAAATTCATCTGGCATTGTGG 51972098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTGCTTCAGAATTTTTATTTCAGTGAGGTTCTGTAAAATTAAATTCATCTGGCATTGTGG 300

 51972099 GAAAAAGTTGTATTATATATGAACCAATTTCTTAAATAAGTGCAACTTAATCTTCTAAGA 51972158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GAAAAAGTTGTATTATATATGAACCAATTTCTTAAATAAGTGCAACTTAATCTTCTAAGA 360

 51972159 AACTTTAAAATATTTAATCTTGTTGGGTATTTTTTTTTCCATTTTTTTCTTGCTATTTCT 51972218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AACTTTAAAATATTTAATCTTGTTGGGTATTTTTTTTTCCATTTTTTTCTTGCTATTTCT 420

 51972219 TTAGGGAAAAAAAACAGAATATATAACACTCTTCATTAGTATGGAACACACATACTATTT 51972278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTAGGGAAAAAAAACAGAATATATAACACTCTTCATTAGTATGGAACACACATACTATTT 480

 51972279 TATTTCCTATTTTAAAACTTAATTACTCAAATACTCCATGAATTTATTAGCAATTGATCC 51972338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TATTTCCTATTTTAAAACTTAATTACTCAAATACTCCATGAATTTATTAGCAATTGATCC 540

 51972339 AATATTTCCCTCTTTAATGTCAATTGCTGCTCCCTTTTCCTTATGCATAGTACATGGATC 51972398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AATATTTCCCTCTTTAATGTCAATTGCTGCTCCCTTTTCCTTATGCATAGTACATGGATC 600

 51972399 CTCAGGATTCACTTACGCAGTCCACTGAGCAGTGGCCATTCACACTTTTAATGTGAGGAA 51972458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTCAGGATTCACTTACGCAGTCCACTGAGCAGTGGCCATTCACACTTTTAATGTGAGGAA 660

 51972459 GAGTGAGAGAAAGGAAAACAGAAATTATTTCATACCAAAAGAGCCCCTGATTTTTCACTG 51972518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GAGTGAGAGAAAGGAAAACAGAAATTATTTCATACCAAAAGAGCCCCTGATTTTTCACTG 720

 51972519 CTTCTTTTGTTATTCACATACAGGAGGATATGTTCCTAATCACTTTTATGATGTGAACAT 51972578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTTCTTTTGTTATTCACATACAGGAGGATATGTTCCTAATCACTTTTATGATGTGAACAT 780

 51972579 GCCTGCACAGTTGCCACTGCTGCATCATGTTGGGGTTCCCAAATTTAGACCTTTTTCCAC 51972638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GCCTGCACAGTTGCCACTGCTGCATCATGTTGGGGTTCCCAAATTTAGACCTTTTTCCAC 840

 51972639 TTACACTTTGTTCTCAACCACTGTGCCCTCAAAATGACCACTATTCCAGCATATCTGAGG 51972698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTACACTTTGTTCTCAACCACTGTGCCCTCAAAATGACCACTATTCCAGCATATCTGAGG 900

 51972699 TAAGAGAGAGCTTCTTGCCTGAGACACAAAGTGTGCCCAGAACTAGAATTCTGCTTCTAA 51972758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TAAGAGAGAGCTTCTTGCCTGAGACACAAAGTGTGCCCAGAACTAGAATTCTGCTTCTAA 960

 51972759 TACTCAAACTCTGGTGTTATGTTGGAGTTACCAGCCCAGACCTCTTCCTTTGTAATAAGT 51972818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TACTCAAACTCTGGTGTTATGTTGGAGTTACCAGCCCAGACCTCTTCCTTTGTAATAAGT 1020

 51972819 TTCCATTTGTGATCAGCAATGGCCCTTTCTGGAACCATCTCAAGCCATCAGTGAAGTTTG 51972878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTCCATTTGTGATCAGCAATGGCCCTTTCTGGAACCATCTCAAGCCATCAGTGAAGTTTG 1080

 51972879 ACTAACTTTGAAAGGATGGGGGCCTTGATCTTTTATTTTCTGAAGATTCCTGGCACACTA 51972938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ACTAACTTTGAAAGGATGGGGGCCTTGATCTTTTATTTTCTGAAGATTCCTGGCACACTA 1140

 51972939 TGCTAATGTACTCATATTCATTCCTCATACCTAGCTTTGTAAATGTAGAACTCAAACTTT 51972998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGCTAATGTACTCATATTCATTCCTCATACCTAGCTTTGTAAATGTAGAACTCAAACTTT 1200

 51972999 TAAGAAGACACTCTCCACAGGAAGTGGATATCTCTTTCCCAACATAAGTGAGGCCACAGA 51973058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TAAGAAGACACTCTCCACAGGAAGTGGATATCTCTTTCCCAACATAAGTGAGGCCACAGA 1260

 51973059 TTAGCACAGACAATTAAAGAGGTAAAATCTGCCAAACGTTTTTTTTTTTATTCTAGCTTA 51973118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTAGCACAGACAATTAAAGAGGTAAAATCTGCCAAACGTTTTTTTTTTTATTCTAGCTTA 1320

 51973119 GAAATGATTGGCAAGACTTAAGTTTTTTCCAATACAACTTTTAACTTATCTCTATTACAA 51973178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GAAATGATTGGCAAGACTTAAGTTTTTTCCAATACAACTTTTAACTTATCTCTATTACAA 1380

 51973179 ATATACACACAATTATTAATTAATTTATTAGTTTTCATTGATACCTAATAATTTTACTTT 51973238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ATATACACACAATTATTAATTAATTTATTAGTTTTCATTGATACCTAATAATTTTACTTT 1440

 51973239 TTTATAGAGCACACAGGATGTTCTGTACACATATAGAATTTGTAACGATCCAATCAAGGT 51973298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTTATAGAGCACACAGGATGTTCTGTACACATATAGAATTTGTAACGATCCAATCAAGGT 1500

 51973299 ATTTAGGTTATTCATCATCTCAAACATTTATAATTTCTTTGTGTTGAGTATGTCTCCAAT 51973358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATTTAGGTTATTCATCATCTCAAACATTTATAATTTCTTTGTGTTGAGTATGTCTCCAAT 1560

 51973359 CTTCTACCTCTTCTGAAATATACAATAAACTCTATTTTTAACTACAGTCACTCTACTTGT 51973418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CTTCTACCTCTTCTGAAATATACAATAAACTCTATTTTTAACTACAGTCACTCTACTTGT 1620

 51973419 CTCATATGGTACCAAACTAGATCGTTGTTGTCTTGATAACACAGCATTATCATTATAGCT 51973478
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CTCATATGGCACCAAACTAGATCGTTGTTGTCTTGATAACACAGCATTATCATTATAGCT 1680

 51973479 GTAATACATAATGCTGTACCTCCTCTCCTAACCCTGGAAGTTGCAATTCATCCTTCAATG 51973538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GTAATACATAATGCTGTACCTCCTCTCCTAACCCTGGAAGTTGCAATTCATCCTTCAATG 1740

 51973539 CTCAGCTCAAAGGATTATTGTCTCTAAAGTTTTAGCAAATGCTGAAGCAGAATTTCACCA 51973598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CTCAGCTCAAAGGATTATTGTCTCTAAAGTTTTAGCAAATGCTGAAGCAGAATTTCACCA 1800

 51973599 TTTAATGGGTTCACAAGCTGCTGCCTTTATAGCTTATGGTACATATGTTTGCCAATATAA 51973658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTTAATGGGTTCACAAGCTGCTGCCTTTATAGCTTATGGTACATATGTTTGCCAATATAA 1860

 51973659 ATGATCCACTTGAGCTAAATTGCCACAGCTGCTACAACACCTCTTTACCTATTTTTGGAG 51973718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ATGATCCACTTGAGCTAAATTGCCACAGCTGCTACAACACCTCTTTACCTATTTTTGGAG 1920

 51973719 CAAAACTGAAAATCAGAAAAGTTTAACTTTTTCAAAATAATGAAAAATTTCTCTCCAATC 51973778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CAAAACTGAAAATCAGAAAAGTTTAACTTTTTCAAAATAATGAAAAATTTCTCTCCAATC 1980

 51973779 CTCTCCATCATTATACATTAATAGGAAAAGAAAGGACAAAGACAA 51973823
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CTCTCCATCATTATACATTAATAGGAAAAGAAAGGACAAAGACAA 2025

EXCISED REGION

 51974241 AAATTTTCCTTTGAGAAAGTCTCAGTAATATTTGCTTAATATGCTGATAGGCTTATCAAG 51974300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2031 AAATTTTCCTTTGAGAAAGTCTCAGTAATATTTGCTTAATATGCTGATAGGCTTATCAAG 2090

 51974301 CTTCTTGAAAAAAAACTGATTTACAA 51974326
          ||||||||||||||||||||||||||
     2091 CTTCTTGAAAAAAAACTGATTTACAA 2116

Alignment time is 1.5808 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51963823,51984240] =>     20418 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [       1,    7818] =>      7818 nucs 'mol-32-3419-052921_7818'

Score:        7796
Aligned:      7818        nucs
Identic:      7816 (100%) nucs =>      3800 (100%)      4016 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51966605,51970404] EXCISED REGION [51970406,51974423]
 second seq =>  [       1,    3800] EXCISED REGION [    3802,    7818]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [51970405,51970405]
 second seq =>         1 nucs [3801,3801]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [51972225,51972225]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [51970404,51970404] to [51970406,51970406]
 second seq =>         1 nucs [3800,3800] to [3802,3802]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 51966605 TTTTTAAGGAAATACATACAAAGTACATTCCTTTAGGAAGTACATTCTTTAGGAAGGTCC 51966664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTTTAAGGAAATACATACAAAGTACATTCCTTTAGGAAGTACATTCTTTAGGAAGGTCC 60

 51966665 ACACTAATGTGAATGAGGAAGCATCTATTAACTGTCTTATATGTATCCTGGTGTGTCAGG 51966724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACACTAATGTGAATGAGGAAGCATCTATTAACTGTCTTATATGTATCCTGGTGTGTCAGG 120

 51966725 TACTTTGGTTTAATATATTCTTATAGTTTATAAGAGAAAACATATGGTCTCTGAGAAATT 51966784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TACTTTGGTTTAATATATTCTTATAGTTTATAAGAGAAAACATATGGTCTCTGAGAAATT 180

 51966785 ATATGACATAAAACTTTTAAATATAGATCCCCCCAAAATTGCTTTCTTTTATGTGGTAAT 51966844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATATGACATAAAACTTTTAAATATAGATCCCCCCAAAATTGCTTTCTTTTATGTGGTAAT 240

 51966845 TGAAATTGTCTATTTATCTCTCTTTTTATTTACCATCAAGAAATAAGTCATGAGGAGAAA 51966904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGAAATTGTCTATTTATCTCTCTTTTTATTTACCATCAAGAAATAAGTCATGAGGAGAAA 300

 51966905 TTATAGCAGCAGAACTTTTCCCCTACTTCATGTATTCATTTTTTAAAAATCATCTTCCTT 51966964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTATAGCAGCAGAACTTTTCCCCTACTTCATGTATTCATTTTTTAAAAATCATCTTCCTT 360

 51966965 TATTTATTTACTTTAGTTCATTATGGCTTAACTCAGTCTCACCCAATTACATGAGCTGTT 51967024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TATTTATTTACTTTAGTTCATTATGGCTTAACTCAGTCTCACCCAATTACATGAGCTGTT 420

 51967025 CATAATGGTGTCTTACTTCAGCAGTCCAGCCAGCTGTGATTGAAGTCAGCCAGGAATGCC 51967084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CATAATGGTGTCTTACTTCAGCAGTCCAGCCAGCTGTGATTGAAGTCAGCCAGGAATGCC 480

 51967085 GACTACAGATCAGAGCACCTGTGAGATTATCAGTTCCATGTGGAATGTCAGACGTATTCT 51967144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GACTACAGATCAGAGCACCTGTGAGATTATCAGTTCCATGTGGAATGTCAGACGTATTCT 540

 51967145 AAACTAGAGTAATTGACTTGGCCAGGATGAGGGGTCAGGAGTGTCATTAAAAATATATAG 51967204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAACTAGAGTAATTGACTTGGCCAGGATGAGGGGTCAGGAGTGTCATTAAAAATATATAG 600

 51967205 CTTGGTATGATTAGCTGCAGAGAAGAACATTCAAGAGCTAGGGGCCCTGGAATCTCCATC 51967264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTTGGTATGATTAGCTGCAGAGAAGAACATTCAAGAGCTAGGGGCCCTGGAATCTCCATC 660

 51967265 AACTTCACAGGTTTAGGTGCTTGGAAGTGGATTTTGGAGGGATTGCTGTGATCTTTGACA 51967324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AACTTCACAGGTTTAGGTGCTTGGAAGTGGATTTTGGAGGGATTGCTGTGATCTTTGACA 720

 51967325 AACTTAATGTATCATTCACTTAGGCTGTCATTCAGCAAACCTTCTGTGAAAATAGATTCA 51967384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AACTTAATGTATCATTCACTTAGGCTGTCATTCAGCAAACCTTCTGTGAAAATAGATTCA 780

 51967385 TCACAAAAGGCCATGACATTAAAGCTGTATACAACTCTTGAACAGAGTCAAAAAAAAAAA 51967444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCACAAAAGGCCATGACATTAAAGCTGTATACAACTCTTGAACAGAGTCAAAAAAAAAAA 840

 51967445 CTGGATCTTTATGACTTCCTGAGTGTTCTCTTTTACAAAATCAGGACCACAGACATGTGC 51967504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTGGATCTTTATGACTTCCTGAGTGTTCTCTTTTACAAAATCAGGACCACAGACATGTGC 900

 51967505 ATGCCTGCATGCAAATGTACACAAAGACACACATTCACACACGCACACTCTCACAAACAT 51967564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATGCCTGCATGCAAATGTACACAAAGACACACATTCACACACGCACACTCTCACAAACAT 960

 51967565 ACCCCTTGTTGTAGAAAATAGTATAGTCAAAGTCATAGCCTGATTCTGGCAATTATCTGA 51967624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ACCCCTTGTTGTAGAAAATAGTATAGTCAAAGTCATAGCCTGATTCTGGCAATTATCTGA 1020

 51967625 GACCCAACAGCATGTGTTTTACATATTTATACTCACTATTGATTTAAATTTTGTTATTCA 51967684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GACCCAACAGCATGTGTTTTACATATTTATACTCACTATTGATTTAAATTTTGTTATTCA 1080

 51967685 CTCCCTTTTCCTATTGTCTTATTTTCTTCCTTAACATATTTTTATATTTCCTATTTTAGC 51967744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTCCCTTTTCCTATTGTCTTATTTTCTTCCTTAACATATTTTTATATTTCCTATTTTAGC 1140

 51967745 GATTTTAAATTCTTTCTGGAACGACGTTGGCACAAATCAAAAATTAAATCTTATAAAGTG 51967804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GATTTTAAATTCTTTCTGGAACGACGTTGGCACAAATCAAAAATTAAATCTTATAAAGTG 1200

 51967805 CTCTATGGTCATAGGCAAAATGGAATCTGTAGATAATCAAGTTCCTGAAGGGATGTGAAA 51967864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CTCTATGGTCATAGGCAAAATGGAATCTGTAGATAATCAAGTTCCTGAAGGGATGTGAAA 1260

 51967865 CCAACTGCTACAAGGATAAGCTAGAAGAATCAGAGATTTTTGGCCTGAAGCACACACAGA 51967924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CCAACTGCTACAAGGATAAGCTAGAAGAATCAGAGATTTTTGGCCTGAAGCACACACAGA 1320

 51967925 AGACTACTTTTAGAGGGGTCTGATGTCACTAACTTCTTGAGATTGCTGCCATTTTTAACA 51967984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AGACTACTTTTAGAGGGGTCTGATGTCACTAACTTCTTGAGATTGCTGCCATTTTTAACA 1380

 51967985 TACAGCTAGCTGGATAGAAGAAGACAGTCTCAGATAAATGACCAGTTCAGGCCACCAATG 51968044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TACAGCTAGCTGGATAGAAGAAGACAGTCTCAGATAAATGACCAGTTCAGGCCACCAATG 1440

 51968045 TCTCCTTCCAAAAAGGCCTGTACTGCTGTACATGCCAAGGGTTAGAGATTTTGGGGCCAA 51968104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TCTCCTTCCAAAAAGGCCTGTACTGCTGTACATGCCAAGGGTTAGAGATTTTGGGGCCAA 1500

 51968105 CTTTTTCCAGCATGTCTTATATCCTTCAATAAGTTGGTTACTTTGCAAAACATTAGACCA 51968164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CTTTTTCCAGCATGTCTTATATCCTTCAATAAGTTGGTTACTTTGCAAAACATTAGACCA 1560

 51968165 CTTAATAATCAATTTCCTCCATGGATTCACTCATACTTTGTCCTCACACTATTCTGGACT 51968224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CTTAATAATCAATTTCCTCCATGGATTCACTCATACTTTGTCCTCACACTATTCTGGACT 1620

 51968225 CCTTTCTCTTGATTTTATTTCTCCAAGTGATTCAATTGTGTCTTTTGGGACACTTATAAG 51968284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CCTTTCTCTTGATTTTATTTCTCCAAGTGATTCAATTGTGTCTTTTGGGACACTTATAAG 1680

 51968285 TAAACATTTCCACATCCTCAGCTTTATCACAGAATTTTCACTTCCTTGCCTTAAGTGTCC 51968344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TAAACATTTCCACATCCTCAGCTTTATCACAGAATTTTCACTTCCTTGCCTTAAGTGTCC 1740

 51968345 CTGGAGGCTGCTGATCTTACAAGTAAATGTCTGGAGATAGGGTTGACAGCTCTTGAAGGC 51968404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CTGGAGGCTGCTGATCTTACAAGTAAATGTCTGGAGATAGGGTTGACAGCTCTTGAAGGC 1800

 51968405 AGTGCCATTATGAAATCAATCCTAGTCTAAGTAGACATTTTGGGTACCATGCCTTCTTAT 51968464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AGTGCCATTATGAAATCAATCCTAGTCTAAGTAGACATTTTGGGTACCATGCCTTCTTAT 1860

 51968465 CTACTTTTGGGCTGTGAGCATCCAGTCATTTTATTTTACCGTACAACTAGAGGTAACTTC 51968524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CTACTTTTGGGCTGTGAGCATCCAGTCATTTTATTTTACCGTACAACTAGAGGTAACTTC 1920

 51968525 TTAAAGTACCAAGTATATCATTCCCTGGTTTAAAGACCTTTAACTGTTAACTATTGCTCT 51968584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTAAAGTACCAAGTATATCATTCCCTGGTTTAAAGACCTTTAACTGTTAACTATTGCTCT 1980

 51968585 GCATATAAAATCTTAACTTTTGCCATAACTAACAGGGATCTTCTTGATCTAATTCCATCT 51968644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GCATATAAAATCTTAACTTTTGCCATAACTAACAGGGATCTTCTTGATCTAATTCCATCT 2040

 51968645 CAGATCTTAATGTTGTCTACCTGCTGTGCCTGAGGTTTACTGAGTTGCTGACACTTCCTA 51968704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CAGATCTTAATGTTGTCTACCTGCTGTGCCTGAGGTTTACTGAGTTGCTGACACTTCCTA 2100

 51968705 AAACATGCCTTGTTCTCTTACTTTTGGGCCTTCCGGACACCAGCTTTGCTTTCTTGGCCC 51968764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AAACATGCCTTGTTCTCTTACTTTTGGGCCTTCCGGACACCAGCTTTGCTTTCTTGGCCC 2160

 51968765 CACTGAGGGGGCTTATTTTGTAGATGTCGTTATTTTCGGAGAGGCTTCTATGAACCACCA 51968824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CACTGAGGGGGCTTATTTTGTAGATGTCGTTATTTTCGGAGAGGCTTCTATGAACCACCA 2220

 51968825 CCCTCTCTGCAAATTAGGTACTTTTTCTTAGTGCACTCGTCCTCCTTGATCTTATCCTAC 51968884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CCCTCTCTGCAAATTAGGTACTTTTTCTTAGTGCACTCGTCCTCCTTGATCTTATCCTAC 2280

 51968885 TGCGACAAAATAATTCTTGTAATTGTATGTGTCCACAAATACACTATACATTTTCTATGA 51968944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TGCGACAAAATAATTCTTGTAATTGTATGTGTCCACAAATACACTATACATTTTCTATGA 2340

 51968945 ATGAAGATTATATCTGCAGCATTCAGTAGCATAACAGAGACTCAATAAATATGTATTGAA 51969004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 ATGAAGATTATATCTGCAGCATTCAGTAGCATAACAGAGACTCAATAAATATGTATTGAA 2400

 51969005 ATGAATTAAATTTAATAGCTGATTACAAATAACTGGCTCTAACATAAAAGTAGAGATAAG 51969064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ATGAATTAAATTTAATAGCTGATTACAAATAACTGGCTCTAACATAAAAGTAGAGATAAG 2460

 51969065 TTTGCTTTCATTCATGTAAAGTAGCAGATGTGAAACCAATGAGGGAGCATTATTGGGGGC 51969124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TTTGCTTTCATTCATGTAAAGTAGCAGATGTGAAACCAATGAGGGAGCATTATTGGGGGC 2520

 51969125 ATATTTTAATCAAAACTACTGAAAAATCTGAAAGAATTATGTAAAGATAAAGTATGCTGT 51969184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 ATATTTTAATCAAAACTACTGAAAAATCTGAAAGAATTATGTAAAGATAAAGTATGCTGT 2580

 51969185 CTTGAGATGTGGTGAGTTTTTCACCAGAATGACTAAAATATGCCTTAGATCATTAGTCCC 51969244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CTTGAGATGTGGTGAGTTTTTCACCAGAATGACTAAAATATGCCTTAGATCATTAGTCCC 2640

 51969245 CAAACCTTCCTTCTTGTGTACAGACTTCTATTAGTTTTATTTTTCTTCTTTTTAAGTAGA 51969304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CAAACCTTCCTTCTTGTGTACAGACTTCTATTAGTTTTATTTTTCTTCTTTTTAAGTAGA 2700

 51969305 TATATTTCTATAGCCAAAAAATATAGATTTGTTTCCGTTATAAAAATGTGCTATTGCGCT 51969364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TATATTTCTATAGCCAAAAAATATAGATTTGTTTCCGTTATAAAAATGTGCTATTGCGCT 2760

 51969365 AGTATGTTATAATAATCATGAAGCCTGCTATAATACATAAAATAGACTACTTAGAGAATA 51969424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 AGTATGTTATAATAATCATGAAGCCTGCTATAATACATAAAATAGACTACTTAGAGAATA 2820

 51969425 AATGTAAAAAATTTTCTAGTACTTTTTCCTGTGTCTTAATGAATTGCTTTGTGTACCACC 51969484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 AATGTAAAAAATTTTCTAGTACTTTTTCCTGTGTCTTAATGAATTGCTTTGTGTACCACC 2880

 51969485 CTGGGTCCTTGCTCTACATTTTGAAATAATTGTAAGGCTATGATTAAATTTTAAACATGA 51969544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CTGGGTCCTTGCTCTACATTTTGAAATAATTGTAAGGCTATGATTAAATTTTAAACATGA 2940

 51969545 TAATATTTTTAATGAATATAGTATAGATTTTTGCCTTGAAATTCTTATTTTGAAAACAAT 51969604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TAATATTTTTAATGAATATAGTATAGATTTTTGCCTTGAAATTCTTATTTTGAAAACAAT 3000

 51969605 ATTGAATTTAGGCCAAAGAAAAATGTACTTACTTTGTTATCCTTTTTAGCAAAATCAAAT 51969664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 ATTGAATTTAGGCCAAAGAAAAATGTACTTACTTTGTTATCCTTTTTAGCAAAATCAAAT 3060

 51969665 TGCTAATGGCAGTGTTTAGCGTTTTCTGTATGTTGATGACTATGCTTCAGTGGCGTAAAA 51969724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TGCTAATGGCAGTGTTTAGCGTTTTCTGTATGTTGATGACTATGCTTCAGTGGCGTAAAA 3120

 51969725 TCTAATGCAATAAACCAGCATTTACTAGTTGTGGCATAATGCAAGAAAGCATCATTTTGC 51969784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TCTAATGCAATAAACCAGCATTTACTAGTTGTGGCATAATGCAAGAAAGCATCATTTTGC 3180

 51969785 TAAGGGATATCTAGGGATTACTAGTTCTCTCTCTTTCTGGTCAGATTTAGTCCTAAACTC 51969844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TAAGGGATATCTAGGGATTACTAGTTCTCTCTCTTTCTGGTCAGATTTAGTCCTAAACTC 3240

 51969845 CATAAGGCATTTACTAACATCTACTTTCAAATGATGAACAACTGTCCTGATCAAAGGAAG 51969904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 CATAAGGCATTTACTAACATCTACTTTCAAATGATGAACAACTGTCCTGATCAAAGGAAG 3300

 51969905 ATGAAAACACAAAATTCTTTATTCTGGAAAACACATCTCCCTAGAGTGTCTCCGCTGCAC 51969964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 ATGAAAACACAAAATTCTTTATTCTGGAAAACACATCTCCCTAGAGTGTCTCCGCTGCAC 3360

 51969965 ACTCTTCCACCTTGCATATTTGTATATTCAGACACTAGAAAATTCACGTGAAAGGAGCCT 51970024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 ACTCTTCCACCTTGCATATTTGTATATTCAGACACTAGAAAATTCACGTGAAAGGAGCCT 3420

 51970025 CCACTTTACCAATTATCAGAAATATGCAAGTGAATTTAATATCACTAATAGTTGGCATGT 51970084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 CCACTTTACCAATTATCAGAAATATGCAAGTGAATTTAATATCACTAATAGTTGGCATGT 3480

 51970085 CAATGATTAGATAATCTATTTGAAATGCTTATTCTATAAAGTTGTATTTTAACCAACAGT 51970144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 CAATGATTAGATAATCTATTTGAAATGCTTATTCTATAAAGTTGTATTTTAACCAACAGT 3540

 51970145 TTTATGAAGAGTGTTCAGTCCTCATAAAATCATCTCAGTTCCCATTTGTGCACTCAGAAA 51970204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 TTTATGAAGAGTGTTCAGTCCTCATAAAATCATCTCAGTTCCCATTTGTGCACTCAGAAA 3600

 51970205 CTTACCACTGTGTTCTGTTTTTATCTTTATAATCTATATTTAACAATTGCATTGTATCTT 51970264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 CTTACCACTGTGTTCTGTTTTTATCTTTATAATCTATATTTAACAATTGCATTGTATCTT 3660

 51970265 CCCTGGTCTCCAGCTCTAAGCAAATAAATACTCTTCTTCTTTCTTTTTTCTTGTATATAA 51970324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 CCCTGGTCTCCAGCTCTAAGCAAATAAATACTCTTCTTCTTTCTTTTTTCTTGTATATAA 3720

 51970325 ATGATTACAGAGAATGGGACAGAGAGAGAAAATGAAGAGACATAGTTAGAGAGATACACA 51970384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 ATGATTACAGAGAATGGGACAGAGAGAGAAAATGAAGAGACATAGTTAGAGAGATACACA 3780

 51970385 GGCACAGAGAGAGAGAGAGA 51970404
          ||||||||||||||||||||
     3781 GGCACAGAGAGAGAGAGAGA 3800

EXCISED REGION

 51970406 AAAAAGAGGAGGAGAAGAGAAGAGAGAAGAGACAGAGGAGAGAGAATGCAGAGAATTTAC 51970465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3802 AAAAAGAGGAGGAGAAGAGAAGAGAGAAGAGACAGAGGAGAGAGAATGCAGAGAATTTAC 3861

 51970466 AATTACTATAGAAAATGTGCACATTTTTCATAATAAAAATGAGTAAATACTTTCATGATA 51970525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3862 AATTACTATAGAAAATGTGCACATTTTTCATAATAAAAATGAGTAAATACTTTCATGATA 3921

 51970526 TTATTATCACAGACTGATGATCTGACATAGATTTCGTGCCGTCTACCTGGGTCTCTACAC 51970585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3922 TTATTATCACAGACTGATGATCTGACATAGATTTCGTGCCGTCTACCTGGGTCTCTACAC 3981

 51970586 GACAAACCTGAGTTAGATGTAATGTAGAGATATGTTTCCACATTGCCCTTCTTGGGGAAG 51970645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3982 GACAAACCTGAGTTAGATGTAATGTAGAGATATGTTTCCACATTGCCCTTCTTGGGGAAG 4041

 51970646 GTGAGCCAGTTCTGAGGTGCCTGGTCCTAGTTGTCACAGATGCAGTTATTTCACACTAGG 51970705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4042 GTGAGCCAGTTCTGAGGTGCCTGGTCCTAGTTGTCACAGATGCAGTTATTTCACACTAGG 4101

 51970706 CTGCCTGCCAGCCTGGATTTGTCTTCCTTTTTTTTTTTTTTGTTTTCAATCTCCCTGGGC 51970765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4102 CTGCCTGCCAGCCTGGATTTGTCTTCCTTTTTTTTTTTTTTGTTTTCAATCTCCCTGGGC 4161

 51970766 TTGCGTCATTACATCAACACATTCTGAAACATCTGTCAGAATCCTTGCCAGTTCAAATTT 51970825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4162 TTGCGTCATTACATCAACACATTCTGAAACATCTGTCAGAATCCTTGCCAGTTCAAATTT 4221

 51970826 ACAAAAGTGCAATAATATTCTATCTCCCCATCACCACCAAATCTTGCTAAAATAAAATCA 51970885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4222 ACAAAAGTGCAATAATATTCTATCTCCCCATCACCACCAAATCTTGCTAAAATAAAATCA 4281

 51970886 TACATTTATTTATAAAAGTTTGTTGTTAAGAAAAAAACTGAAAACATCATGAAGGTCTGA 51970945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4282 TACATTTATTTATAAAAGTTTGTTGTTAAGAAAAAAACTGAAAACATCATGAAGGTCTGA 4341

 51970946 GAGAAATAAAGTGGAATTTAGAAGTATTGTATCCATGTCATATGACATATAAAAGTTTGT 51971005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4342 GAGAAATAAAGTGGAATTTAGAAGTATTGTATCCATGTCATATGACATATAAAAGTTTGT 4401

 51971006 AATCATTAAAGATGATGAGTAATATATGGTAAGGAATATTTGGAAAACTTCTTTCAGTGT 51971065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4402 AATCATTAAAGATGATGAGTAATATATGGTAAGGAATATTTGGAAAACTTCTTTCAGTGT 4461

 51971066 TAAAAAAGAAAAATAAAGAAGAGTCAAATTGTATTGCCTCAGTTTTATTAAACACTTATG 51971125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4462 TAAAAAAGAAAAATAAAGAAGAGTCAAATTGTATTGCCTCAGTTTTATTAAACACTTATG 4521

 51971126 TATTTTACATACATTTAAAAAACTTAGCCGGGTGTGGTGGCGCGCGCTTGTAATCCCAGC 51971185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4522 TATTTTACATACATTTAAAAAACTTAGCCGGGTGTGGTGGCGCGCGCTTGTAATCCCAGC 4581

 51971186 TACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGT 51971245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4582 TACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGT 4641

 51971246 GGAAATTGTGCCACTGAACTCCAGCCTGGGGGATAGGGCAAGATTCTGTCTCAAAAAAAT 51971305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4642 GGAAATTGTGCCACTGAACTCCAGCCTGGGGGATAGGGCAAGATTCTGTCTCAAAAAAAT 4701

 51971306 AAAGGAAAAAAAAATTTTAATTTGAATAGTTCGCTAGTGCTAAATGTTTATGGTTTTGAA 51971365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4702 AAAGGAAAAAAAAATTTTAATTTGAATAGTTCGCTAGTGCTAAATGTTTATGGTTTTGAA 4761

 51971366 TCTGAATGTTTTCATAACATTTTATTTTTAGCGTATTTTTTAGGTTTCCATATTCCAGTG 51971425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4762 TCTGAATGTTTTCATAACATTTTATTTTTAGCGTATTTTTTAGGTTTCCATATTCCAGTG 4821

 51971426 TTGCTGCAACAAATACGTAATGTTTATAATCAGAAAAGCATTGTTAAATAACCTCTGCAA 51971485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4822 TTGCTGCAACAAATACGTAATGTTTATAATCAGAAAAGCATTGTTAAATAACCTCTGCAA 4881

 51971486 AAACTCTTTAATCTCCCTAATCTAGGGATAGGGAATTATTTTATCTATAATTTTAATTCT 51971545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4882 AAACTCTTTAATCTCCCTAATCTAGGGATAGGGAATTATTTTATCTATAATTTTAATTCT 4941

 51971546 AATTGTTAGAGTGTGGCTGCCTGGAGCACTGACTTGAAAATAAATCTGAAACCCATCAGG 51971605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4942 AATTGTTAGAGTGTGGCTGCCTGGAGCACTGACTTGAAAATAAATCTGAAACCCATCAGG 5001

 51971606 AAAAAATAATGTCAATTAACATTGGTTGTCATTTGTTCAAGAGGAAAAAGTCGGAGCATG 51971665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5002 AAAAAATAATGTCAATTAACATTGGTTGTCATTTGTTCAAGAGGAAAAAGTCGGAGCATG 5061

 51971666 ATACCCCATATTTGCCATGCATTCTGAAATGTTTTCTTTTGTCTTTTACTTTAAAAAAAG 51971725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5062 ATACCCCATATTTGCCATGCATTCTGAAATGTTTTCTTTTGTCTTTTACTTTAAAAAAAG 5121

 51971726 ATGGATGATTTTATTTATATATTAGAACTCATGATCTATATTTTCAACTCTGCTCCAGTA 51971785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5122 ATGGATGATTTTATTTATATATTAGAACTCATGATCTATATTTTCAACTCTGCTCCAGTA 5181

 51971786 AGTCTCTTATTCATTTGGTTAAAGCACCAATTACACTTACCCCGTAGTTTCTGATTTTTG 51971845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5182 AGTCTCTTATTCATTTGGTTAAAGCACCAATTACACTTACCCCGTAGTTTCTGATTTTTG 5241

 51971846 ATAGGACATTAGGAGAAAGACCATACATTTAAGGGCAATGAAAATAAATATCTAAGATGA 51971905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5242 ATAGGACATTAGGAGAAAGACCATACATTTAAGGGCAATGAAAATAAATATCTAAGATGA 5301

 51971906 AGTGATTATTATAACTTTGCAATATGGATTGAACCTGGACTAAGTACTAGTGCTATATCA 51971965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5302 AGTGATTATTATAACTTTGCAATATGGATTGAACCTGGACTAAGTACTAGTGCTATATCA 5361

 51971966 GGAAGCTGGATCAATTTGACACCTACTGAAAGTGACACATGGGCCTTGCTAAAGAAAGAG 51972025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5362 GGAAGCTGGATCAATTTGACACCTACTGAAAGTGACACATGGGCCTTGCTAAAGAAAGAG 5421

 51972026 TTTAAATCTGGTAGTGCTTCAGAATTTTTATTTCAGTGAGGTTCTGTAAAATTAAATTCA 51972085
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     5422 TTTAAATCTGGTAGTGCTTCAGAATTTTTATTTCAGTGAGGTTCTGTAAAATTAAATCCA 5481

 51972086 TCTGGCATTGTGGGAAAAAGTTGTATTATATATGAACCAATTTCTTAAATAAGTGCAACT 51972145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5482 TCTGGCATTGTGGGAAAAAGTTGTATTATATATGAACCAATTTCTTAAATAAGTGCAACT 5541

 51972146 TAATCTTCTAAGAAACTTTAAAATATTTAATCTTGTTGGGTATTTTTTTTTCCATTTTTT 51972205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5542 TAATCTTCTAAGAAACTTTAAAATATTTAATCTTGTTGGGTATTTTTTTTTCCATTTTTT 5601

 51972206 TCTTGCTATTTCTTTAGGGAAAAAAAACAGAATATATAACACTCTTCATTAGTATGGAAC 51972265
          ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5602 TCTTGCTATTTCTTTAGGG-AAAAAAACAGAATATATAACACTCTTCATTAGTATGGAAC 5660

 51972266 ACACATACTATTTTATTTCCTATTTTAAAACTTAATTACTCAAATACTCCATGAATTTAT 51972325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5661 ACACATACTATTTTATTTCCTATTTTAAAACTTAATTACTCAAATACTCCATGAATTTAT 5720

 51972326 TAGCAATTGATCCAATATTTCCCTCTTTAATGTCAATTGCTGCTCCCTTTTCCTTATGCA 51972385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5721 TAGCAATTGATCCAATATTTCCCTCTTTAATGTCAATTGCTGCTCCCTTTTCCTTATGCA 5780

 51972386 TAGTACATGGATCCTCAGGATTCACTTACGCAGTCCACTGAGCAGTGGCCATTCACACTT 51972445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5781 TAGTACATGGATCCTCAGGATTCACTTACGCAGTCCACTGAGCAGTGGCCATTCACACTT 5840

 51972446 TTAATGTGAGGAAGAGTGAGAGAAAGGAAAACAGAAATTATTTCATACCAAAAGAGCCCC 51972505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5841 TTAATGTGAGGAAGAGTGAGAGAAAGGAAAACAGAAATTATTTCATACCAAAAGAGCCCC 5900

 51972506 TGATTTTTCACTGCTTCTTTTGTTATTCACATACAGGAGGATATGTTCCTAATCACTTTT 51972565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5901 TGATTTTTCACTGCTTCTTTTGTTATTCACATACAGGAGGATATGTTCCTAATCACTTTT 5960

 51972566 ATGATGTGAACATGCCTGCACAGTTGCCACTGCTGCATCATGTTGGGGTTCCCAAATTTA 51972625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5961 ATGATGTGAACATGCCTGCACAGTTGCCACTGCTGCATCATGTTGGGGTTCCCAAATTTA 6020

 51972626 GACCTTTTTCCACTTACACTTTGTTCTCAACCACTGTGCCCTCAAAATGACCACTATTCC 51972685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6021 GACCTTTTTCCACTTACACTTTGTTCTCAACCACTGTGCCCTCAAAATGACCACTATTCC 6080

 51972686 AGCATATCTGAGGTAAGAGAGAGCTTCTTGCCTGAGACACAAAGTGTGCCCAGAACTAGA 51972745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6081 AGCATATCTGAGGTAAGAGAGAGCTTCTTGCCTGAGACACAAAGTGTGCCCAGAACTAGA 6140

 51972746 ATTCTGCTTCTAATACTCAAACTCTGGTGTTATGTTGGAGTTACCAGCCCAGACCTCTTC 51972805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6141 ATTCTGCTTCTAATACTCAAACTCTGGTGTTATGTTGGAGTTACCAGCCCAGACCTCTTC 6200

 51972806 CTTTGTAATAAGTTTCCATTTGTGATCAGCAATGGCCCTTTCTGGAACCATCTCAAGCCA 51972865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6201 CTTTGTAATAAGTTTCCATTTGTGATCAGCAATGGCCCTTTCTGGAACCATCTCAAGCCA 6260

 51972866 TCAGTGAAGTTTGACTAACTTTGAAAGGATGGGGGCCTTGATCTTTTATTTTCTGAAGAT 51972925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6261 TCAGTGAAGTTTGACTAACTTTGAAAGGATGGGGGCCTTGATCTTTTATTTTCTGAAGAT 6320

 51972926 TCCTGGCACACTATGCTAATGTACTCATATTCATTCCTCATACCTAGCTTTGTAAATGTA 51972985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6321 TCCTGGCACACTATGCTAATGTACTCATATTCATTCCTCATACCTAGCTTTGTAAATGTA 6380

 51972986 GAACTCAAACTTTTAAGAAGACACTCTCCACAGGAAGTGGATATCTCTTTCCCAACATAA 51973045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6381 GAACTCAAACTTTTAAGAAGACACTCTCCACAGGAAGTGGATATCTCTTTCCCAACATAA 6440

 51973046 GTGAGGCCACAGATTAGCACAGACAATTAAAGAGGTAAAATCTGCCAAACGTTTTTTTTT 51973105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6441 GTGAGGCCACAGATTAGCACAGACAATTAAAGAGGTAAAATCTGCCAAACGTTTTTTTTT 6500

 51973106 TTATTCTAGCTTAGAAATGATTGGCAAGACTTAAGTTTTTTCCAATACAACTTTTAACTT 51973165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6501 TTATTCTAGCTTAGAAATGATTGGCAAGACTTAAGTTTTTTCCAATACAACTTTTAACTT 6560

 51973166 ATCTCTATTACAAATATACACACAATTATTAATTAATTTATTAGTTTTCATTGATACCTA 51973225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6561 ATCTCTATTACAAATATACACACAATTATTAATTAATTTATTAGTTTTCATTGATACCTA 6620

 51973226 ATAATTTTACTTTTTTATAGAGCACACAGGATGTTCTGTACACATATAGAATTTGTAACG 51973285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6621 ATAATTTTACTTTTTTATAGAGCACACAGGATGTTCTGTACACATATAGAATTTGTAACG 6680

 51973286 ATCCAATCAAGGTATTTAGGTTATTCATCATCTCAAACATTTATAATTTCTTTGTGTTGA 51973345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6681 ATCCAATCAAGGTATTTAGGTTATTCATCATCTCAAACATTTATAATTTCTTTGTGTTGA 6740

 51973346 GTATGTCTCCAATCTTCTACCTCTTCTGAAATATACAATAAACTCTATTTTTAACTACAG 51973405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6741 GTATGTCTCCAATCTTCTACCTCTTCTGAAATATACAATAAACTCTATTTTTAACTACAG 6800

 51973406 TCACTCTACTTGTCTCATATGGTACCAAACTAGATCGTTGTTGTCTTGATAACACAGCAT 51973465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6801 TCACTCTACTTGTCTCATATGGTACCAAACTAGATCGTTGTTGTCTTGATAACACAGCAT 6860

 51973466 TATCATTATAGCTGTAATACATAATGCTGTACCTCCTCTCCTAACCCTGGAAGTTGCAAT 51973525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6861 TATCATTATAGCTGTAATACATAATGCTGTACCTCCTCTCCTAACCCTGGAAGTTGCAAT 6920

 51973526 TCATCCTTCAATGCTCAGCTCAAAGGATTATTGTCTCTAAAGTTTTAGCAAATGCTGAAG 51973585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6921 TCATCCTTCAATGCTCAGCTCAAAGGATTATTGTCTCTAAAGTTTTAGCAAATGCTGAAG 6980

 51973586 CAGAATTTCACCATTTAATGGGTTCACAAGCTGCTGCCTTTATAGCTTATGGTACATATG 51973645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6981 CAGAATTTCACCATTTAATGGGTTCACAAGCTGCTGCCTTTATAGCTTATGGTACATATG 7040

 51973646 TTTGCCAATATAAATGATCCACTTGAGCTAAATTGCCACAGCTGCTACAACACCTCTTTA 51973705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7041 TTTGCCAATATAAATGATCCACTTGAGCTAAATTGCCACAGCTGCTACAACACCTCTTTA 7100

 51973706 CCTATTTTTGGAGCAAAACTGAAAATCAGAAAAGTTTAACTTTTTCAAAATAATGAAAAA 51973765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7101 CCTATTTTTGGAGCAAAACTGAAAATCAGAAAAGTTTAACTTTTTCAAAATAATGAAAAA 7160

 51973766 TTTCTCTCCAATCCTCTCCATCATTATACATTAATAGGAAAAGAAAGGACAAAGACAAGG 51973825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7161 TTTCTCTCCAATCCTCTCCATCATTATACATTAATAGGAAAAGAAAGGACAAAGACAAGG 7220

 51973826 TTACAAATGTGAAAGGGTTATTTTTTTCTATTCTGATAGAAATAAGTTTAGAGCACCTGC 51973885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7221 TTACAAATGTGAAAGGGTTATTTTTTTCTATTCTGATAGAAATAAGTTTAGAGCACCTGC 7280

 51973886 ATGAACAACTTGTATTGAACAGCAATGCAAGGAACTGCATACCGAAAAGAAGAATCTCTT 51973945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7281 ATGAACAACTTGTATTGAACAGCAATGCAAGGAACTGCATACCGAAAAGAAGAATCTCTT 7340

 51973946 AGTGACAAGAACCGTGTTGACCATGCAACACTATTAGCAAGTTTATTTTCATTCTTTATG 51974005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7341 AGTGACAAGAACCGTGTTGACCATGCAACACTATTAGCAAGTTTATTTTCATTCTTTATG 7400

 51974006 TAGATGTCAGGGATATGTAGCAAAAATACATTTTTAAGTGCAACAGAGTAGATGCTTGCA 51974065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7401 TAGATGTCAGGGATATGTAGCAAAAATACATTTTTAAGTGCAACAGAGTAGATGCTTGCA 7460

 51974066 AAAACAGACTGTGATAACTATCTATTTGCAAAAGTCAGTACAGATATGATTATCTCAGCA 51974125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7461 AAAACAGACTGTGATAACTATCTATTTGCAAAAGTCAGTACAGATATGATTATCTCAGCA 7520

 51974126 TTAAATTGGCTGATGTAAAATGGAAATCATGAAAATTAAGTCACCACACAATAAAATGAC 51974185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7521 TTAAATTGGCTGATGTAAAATGGAAATCATGAAAATTAAGTCACCACACAATAAAATGAC 7580

 51974186 AATAGGTTCCTAAATCAATCATGAAAAATTTTCCCAATGAAGAAGGGACAACATAAAATT 51974245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7581 AATAGGTTCCTAAATCAATCATGAAAAATTTTCCCAATGAAGAAGGGACAACATAAAATT 7640

 51974246 TTCCTTTGAGAAAGTCTCAGTAATATTTGCTTAATATGCTGATAGGCTTATCAAGCTTCT 51974305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7641 TTCCTTTGAGAAAGTCTCAGTAATATTTGCTTAATATGCTGATAGGCTTATCAAGCTTCT 7700

 51974306 TGAAAAAAAACTGATTTACAATACAGTGGGGATTATTTTTTTTAAGTTGGAAGGGAAAGA 51974365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7701 TGAAAAAAAACTGATTTACAATACAGTGGGGATTATTTTTTTTAAGTTGGAAGGGAAAGA 7760

 51974366 AGGTTTGATGTAAGAGTGCTTTGAAATGTGGAGTTTTCCTAAGTATTACTCCCACAAG 51974423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7761 AGGTTTGATGTAAGAGTGCTTTGAAATGTGGAGTTTTCCTAAGTATTACTCCCACAAG 7818

Alignment time is 5.69094 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51963823,51984240] =>     20418 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [       1,    4784] =>      4784 nucs 'mol-32-3419-107552_4784'

Score:        4713
Aligned:      4779        nucs
Identic:      4773 (100%) nucs =>      4406 (100%)       367 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51969412,51973823] EXCISED REGION [51974241,51974607]
 second seq =>  [       1,    4412] EXCISED REGION [    4418,    4784]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       417 nucs [51973824,51974240]
 second seq =>         5 nucs [4413,4417]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [51973823,51973823] to [51974240,51974240]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [51973822,51973823] to [51974241,51974242]
 second seq =>         2 nucs [4411,4412] to [4418,4419]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 51969412 TACTTAGAGAATAAATGTAAAAAATTTTCTAGTACTTTTTCCTGTGTCTTAATGAATTGC 51969471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TACTTAGAGAATAAATGTAAAAAATTTTCTAGTACTTTTTCCTGTGTCTTAATGAATTGC 60

 51969472 TTTGTGTACCACCCTGGGTCCTTGCTCTACATTTTGAAATAATTGTAAGGCTATGATTAA 51969531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTGTGTACCACCCTGGGTCCTTGCTCTACATTTTGAAATAATTGTAAGGCTATGATTAA 120

 51969532 ATTTTAAACATGATAATATTTTTAATGAATATAGTATAGATTTTTGCCTTGAAATTCTTA 51969591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATTTTAAACATGATAATATTTTTAATGAATATAGTATAGATTTTTGCCTTGAAATTCTTA 180

 51969592 TTTTGAAAACAATATTGAATTTAGGCCAAAGAAAAATGTACTTACTTTGTTATCCTTTTT 51969651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTTTGAAAACAATATTGAATTTAGGCCAAAGAAAAATGTACTTACTTTGTTATCCTTTTT 240

 51969652 AGCAAAATCAAATTGCTAATGGCAGTGTTTAGCGTTTTCTGTATGTTGATGACTATGCTT 51969711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGCAAAATCAAATTGCTAATGGCAGTGTTTAGCGTTTTCTGTATGTTGATGACTATGCTT 300

 51969712 CAGTGGCGTAAAATCTAATGCAATAAACCAGCATTTACTAGTTGTGGCATAATGCAAGAA 51969771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CAGTGGCGTAAAATCTAATGCAATAAACCAGCATTTACTAGTTGTGGCATAATGCAAGAA 360

 51969772 AGCATCATTTTGCTAAGGGATATCTAGGGATTACTAGTTCTCTCTCTTTCTGGTCAGATT 51969831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGCATCATTTTGCTAAGGGATATCTAGGGATTACTAGTTCTCTCTCTTTCTGGTCAGATT 420

 51969832 TAGTCCTAAACTCCATAAGGCATTTACTAACATCTACTTTCAAATGATGAACAACTGTCC 51969891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TAGTCCTAAACTCCATAAGGCATTTACTAACATCTACTTTCAAATGATGAACAACTGTCC 480

 51969892 TGATCAAAGGAAGATGAAAACACAAAATTCTTTATTCTGGAAAACACATCTCCCTAGAGT 51969951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGATCAAAGGAAGATGAAAACACAAAATTCTTTATTCTGGAAAACACATCTCCCTAGAGT 540

 51969952 GTCTCCGCTGCACACTCTTCCACCTTGCATATTTGTATATTCAGACACTAGAAAATTCAC 51970011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GTCTCCGCTGCACACTCTTCCACCTTGCATATTTGTATATTCAGACACTAGAAAATTCAC 600

 51970012 GTGAAAGGAGCCTCCACTTTACCAATTATCAGAAATATGCAAGTGAATTTAATATCACTA 51970071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTGAAAGGAGCCTCCACTTTACCAATTATCAGAAATATGCAAGTGAATTTAATATCACTA 660

 51970072 ATAGTTGGCATGTCAATGATTAGATAATCTATTTGAAATGCTTATTCTATAAAGTTGTAT 51970131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATAGTTGGCATGTCAATGATTAGATAATCTATTTGAAATGCTTATTCTATAAAGTTGTAT 720

 51970132 TTTAACCAACAGTTTTATGAAGAGTGTTCAGTCCTCATAAAATCATCTCAGTTCCCATTT 51970191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTTAACCAACAGTTTTATGAAGAGTGTTCAGTCCTCATAAAATCATCTCAGTTCCCATTT 780

 51970192 GTGCACTCAGAAACTTACCACTGTGTTCTGTTTTTATCTTTATAATCTATATTTAACAAT 51970251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GTGCACTCAGAAACTTACCACTGTGTTCTGTTTTTATCTTTATAATCTATATTTAACAAT 840

 51970252 TGCATTGTATCTTCCCTGGTCTCCAGCTCTAAGCAAATAAATACTCTTCTTCTTTCTTTT 51970311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGCATTGTATCTTCCCTGGTCTCCAGCTCTAAGCAAATAAATACTCTTCTTCTTTCTTTT 900

 51970312 TTCTTGTATATAAATGATTACAGAGAATGGGACAGAGAGAGAAAATGAAGAGACATAGTT 51970371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTCTTGTATATAAATGATTACAGAGAATGGGACAGAGAGAGAAAATGAAGAGACATAGTT 960

 51970372 AGAGAGATACACAGGCACAGAGAGAGAGAGAGAGAAAAAGAGGAGGAGAAGAGAAGAGAG 51970431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AGAGAGATACACAGGCACAGAGAGAGAGAGAGAGAAAAAGAGGAGGAGAAGAGAAGAGAG 1020

 51970432 AAGAGACAGAGGAGAGAGAATGCAGAGAATTTACAATTACTATAGAAAATGTGCACATTT 51970491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AAGAGACAGAGGAGAGAGAATGCAGAGAATTTACAATTACTATAGAAAATGTGCACATTT 1080

 51970492 TTCATAATAAAAATGAGTAAATACTTTCATGATATTATTATCACAGACTGATGATCTGAC 51970551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTCATAATAAAAATGAGTAAATACTTTCATGATATTATTATCACAGACTGATGATCTGAC 1140

 51970552 ATAGATTTCGTGCCGTCTACCTGGGTCTCTACACGACAAACCTGAGTTAGATGTAATGTA 51970611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATAGATTTCGTGCCGTCTACCTGGGTCTCTACACGACAAACCTGAGTTAGATGTAATGTA 1200

 51970612 GAGATATGTTTCCACATTGCCCTTCTTGGGGAAGGTGAGCCAGTTCTGAGGTGCCTGGTC 51970671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GAGATATGTTTCCACATTGCCCTTCTTGGGGAAGGTGAGCCAGTTCTGAGGTGCCTGGTC 1260

 51970672 CTAGTTGTCACAGATGCAGTTATTTCACACTAGGCTGCCTGCCAGCCTGGATTTGTCTTC 51970731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTAGTTGTCACAGATGCAGTTATTTCACACTAGGCTGCCTGCCAGCCTGGATTTGTCTTC 1320

 51970732 CTTTTTTTTTTTTTTGTTTTCAATCTCCCTGGGCTTGCGTCATTACATCAACACATTCTG 51970791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CTTTTTTTTTTTTTTGTTTTCAATCTCCCTGGGCTTGCGTCATTACATCAACACATTCTG 1380

 51970792 AAACATCTGTCAGAATCCTTGCCAGTTCAAATTTACAAAAGTGCAATAATATTCTATCTC 51970851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AAACATCTGTCAGAATCCTTGCCAGTTCAAATTTACAAAAGTGCAATAATATTCTATCTC 1440

 51970852 CCCATCACCACCAAATCTTGCTAAAATAAAATCATACATTTATTTATAAAAGTTTGTTGT 51970911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CCCATCACCACCAAATCTTGCTAAAATAAAATCATACATTTATTTATAAAAGTTTGTTGT 1500

 51970912 TAAGAAAAAAACTGAAAACATCATGAAGGTCTGAGAGAAATAAAGTGGAATTTAGAAGTA 51970971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     1501 TAAGAAAAAAACTGAAAACATCATGAAGGTCTGAGAGAAATAAAGTGGAATTTAAAAGTA 1560

 51970972 TTGTATCCATGTCATATGACATATAAAAGTTTGTAATCATTAAAGATGATGAGTAATATA 51971031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTGTATCCATGTCATATGACATATAAAAGTTTGTAATCATTAAAGATGATGAGTAATATA 1620

 51971032 TGGTAAGGAATATTTGGAAAACTTCTTTCAGTGTTAAAAAAGAAAAATAAAGAAGAGTCA 51971091
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TGGTGAGGAATATTTGGAAAACTTCTTTCAGTGTTAAAAAAGAAAAATAAAGAAGAGTCA 1680

 51971092 AATTGTATTGCCTCAGTTTTATTAAACACTTATGTATTTTACATACATTTAAAAAACTTA 51971151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AATTGTATTGCCTCAGTTTTATTAAACACTTATGTATTTTACATACATTTAAAAAACTTA 1740

 51971152 GCCGGGTGTGGTGGCGCGCGCTTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAAT 51971211
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GCCGGGTGTGGTGGCGCGCGCTTGTAATCCCGGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAAT 1800

 51971212 CACTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGTGGAAATTGTGCCACTGAACTCCAGCC 51971271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CACTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGTGGAAATTGTGCCACTGAACTCCAGCC 1860

 51971272 TGGGGGATAGGGCAAGATTCTGTCTCAAAAAAATAAAGGAAAAAAAAATTTTAATTTGAA 51971331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TGGGGGATAGGGCAAGATTCTGTCTCAAAAAAATAAAGGAAAAAAAAATTTTAATTTGAA 1920

 51971332 TAGTTCGCTAGTGCTAAATGTTTATGGTTTTGAATCTGAATGTTTTCATAACATTTTATT 51971391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TAGTTCGCTAGTGCTAAATGTTTATGGTTTTGAATCTGAATGTTTTCATAACATTTTATT 1980

 51971392 TTTAGCGTATTTTTTAGGTTTCCATATTCCAGTGTTGCTGCAACAAATACGTAATGTTTA 51971451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TTTAGCGTATTTTTTAGGTTTCCATATTCCAGTGTTGCTGCAACAAATACGTAATGTTTA 2040

 51971452 TAATCAGAAAAGCATTGTTAAATAACCTCTGCAAAAACTCTTTAATCTCCCTAATCTAGG 51971511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TAATCAGAAAAGCATTGTTAAATAACCTCTGCAAAAACTCTTTAATCTCCCTAATCTAGG 2100

 51971512 GATAGGGAATTATTTTATCTATAATTTTAATTCTAATTGTTAGAGTGTGGCTGCCTGGAG 51971571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GATAGGGAATTATTTTATCTATAATTTTAATTCTAATTGTTAGAGTGTGGCTGCCTGGAG 2160

 51971572 CACTGACTTGAAAATAAATCTGAAACCCATCAGGAAAAAATAATGTCAATTAACATTGGT 51971631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CACTGACTTGAAAATAAATCTGAAACCCATCAGGAAAAAATAATGTCAATTAACATTGGT 2220

 51971632 TGTCATTTGTTCAAGAGGAAAAAGTCGGAGCATGATACCCCATATTTGCCATGCATTCTG 51971691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TGTCATTTGTTCAAGAGGAAAAAGTCGGAGCATGATACCCCATATTTGCCATGCATTCTG 2280

 51971692 AAATGTTTTCTTTTGTCTTTTACTTTAAAAAAAGATGGATGATTTTATTTATATATTAGA 51971751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AAATGTTTTCTTTTGTCTTTTACTTTAAAAAAAGATGGATGATTTTATTTATATATTAGA 2340

 51971752 ACTCATGATCTATATTTTCAACTCTGCTCCAGTAAGTCTCTTATTCATTTGGTTAAAGCA 51971811
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 ACTCATGATCTGTATTTTCAACTCTGCTCCAGTAAGTCTCTTATTCATTTGGTTAAAGCA 2400

 51971812 CCAATTACACTTACCCCGTAGTTTCTGATTTTTGATAGGACATTAGGAGAAAGACCATAC 51971871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CCAATTACACTTACCCCGTAGTTTCTGATTTTTGATAGGACATTAGGAGAAAGACCATAC 2460

 51971872 ATTTAAGGGCAATGAAAATAAATATCTAAGATGAAGTGATTATTATAACTTTGCAATATG 51971931
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 ATTTAAGGGAAATGAAAATAAATATCTAAGATGAAGTGATTATTATAACTTTGCAATATG 2520

 51971932 GATTGAACCTGGACTAAGTACTAGTGCTATATCAGGAAGCTGGATCAATTTGACACCTAC 51971991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GATTGAACCTGGACTAAGTACTAGTGCTATATCAGGAAGCTGGATCAATTTGACACCTAC 2580

 51971992 TGAAAGTGACACATGGGCCTTGCTAAAGAAAGAGTTTAAATCTGGTAGTGCTTCAGAATT 51972051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TGAAAGTGACACATGGGCCTTGCTAAAGAAAGAGTTTAAATCTGGTAGTGCTTCAGAATT 2640

 51972052 TTTATTTCAGTGAGGTTCTGTAAAATTAAATTCATCTGGCATTGTGGGAAAAAGTTGTAT 51972111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TTTATTTCAGTGAGGTTCTGTAAAATTAAATTCATCTGGCATTGTGGGAAAAAGTTGTAT 2700

 51972112 TATATATGAACCAATTTCTTAAATAAGTGCAACTTAATCTTCTAAGAAACTTTAAAATAT 51972171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TATATATGAACCAATTTCTTAAATAAGTGCAACTTAATCTTCTAAGAAACTTTAAAATAT 2760

 51972172 TTAATCTTGTTGGGTATTTTTTTTTCCATTTTTTTCTTGCTATTTCTTTAGGGAAAAAAA 51972231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TTAATCTTGTTGGGTATTTTTTTTTCCATTTTTTTCTTGCTATTTCTTTAGGGAAAAAAA 2820

 51972232 ACAGAATATATAACACTCTTCATTAGTATGGAACACACATACTATTTTATTTCCTATTTT 51972291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 ACAGAATATATAACACTCTTCATTAGTATGGAACACACATACTATTTTATTTCCTATTTT 2880

 51972292 AAAACTTAATTACTCAAATACTCCATGAATTTATTAGCAATTGATCCAATATTTCCCTCT 51972351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 AAAACTTAATTACTCAAATACTCCATGAATTTATTAGCAATTGATCCAATATTTCCCTCT 2940

 51972352 TTAATGTCAATTGCTGCTCCCTTTTCCTTATGCATAGTACATGGATCCTCAGGATTCACT 51972411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TTAATGTCAATTGCTGCTCCCTTTTCCTTATGCATAGTACATGGATCCTCAGGATTCACT 3000

 51972412 TACGCAGTCCACTGAGCAGTGGCCATTCACACTTTTAATGTGAGGAAGAGTGAGAGAAAG 51972471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TACGCAGTCCACTGAGCAGTGGCCATTCACACTTTTAATGTGAGGAAGAGTGAGAGAAAG 3060

 51972472 GAAAACAGAAATTATTTCATACCAAAAGAGCCCCTGATTTTTCACTGCTTCTTTTGTTAT 51972531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 GAAAACAGAAATTATTTCATACCAAAAGAGCCCCTGATTTTTCACTGCTTCTTTTGTTAT 3120

 51972532 TCACATACAGGAGGATATGTTCCTAATCACTTTTATGATGTGAACATGCCTGCACAGTTG 51972591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TCACATACAGGAGGATATGTTCCTAATCACTTTTATGATGTGAACATGCCTGCACAGTTG 3180

 51972592 CCACTGCTGCATCATGTTGGGGTTCCCAAATTTAGACCTTTTTCCACTTACACTTTGTTC 51972651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 CCACTGCTGCATCATGTTGGGGTTCCCAAATTTAGACCTTTTTCCACTTACACTTTGTTC 3240

 51972652 TCAACCACTGTGCCCTCAAAATGACCACTATTCCAGCATATCTGAGGTAAGAGAGAGCTT 51972711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TCAACCACTGTGCCCTCAAAATGACCACTATTCCAGCATATCTGAGGTAAGAGAGAGCTT 3300

 51972712 CTTGCCTGAGACACAAAGTGTGCCCAGAACTAGAATTCTGCTTCTAATACTCAAACTCTG 51972771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 CTTGCCTGAGACACAAAGTGTGCCCAGAACTAGAATTCTGCTTCTAATACTCAAACTCTG 3360

 51972772 GTGTTATGTTGGAGTTACCAGCCCAGACCTCTTCCTTTGTAATAAGTTTCCATTTGTGAT 51972831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 GTGTTATGTTGGAGTTACCAGCCCAGACCTCTTCCTTTGTAATAAGTTTCCATTTGTGAT 3420

 51972832 CAGCAATGGCCCTTTCTGGAACCATCTCAAGCCATCAGTGAAGTTTGACTAACTTTGAAA 51972891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 CAGCAATGGCCCTTTCTGGAACCATCTCAAGCCATCAGTGAAGTTTGACTAACTTTGAAA 3480

 51972892 GGATGGGGGCCTTGATCTTTTATTTTCTGAAGATTCCTGGCACACTATGCTAATGTACTC 51972951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 GGATGGGGGCCTTGATCTTTTATTTTCTGAAGATTCCTGGCACACTATGCTAATGTACTC 3540

 51972952 ATATTCATTCCTCATACCTAGCTTTGTAAATGTAGAACTCAAACTTTTAAGAAGACACTC 51973011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 ATATTCATTCCTCATACCTAGCTTTGTAAATGTAGAACTCAAACTTTTAAGAAGACACTC 3600

 51973012 TCCACAGGAAGTGGATATCTCTTTCCCAACATAAGTGAGGCCACAGATTAGCACAGACAA 51973071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 TCCACAGGAAGTGGATATCTCTTTCCCAACATAAGTGAGGCCACAGATTAGCACAGACAA 3660

 51973072 TTAAAGAGGTAAAATCTGCCAAACGTTTTTTTTTTTATTCTAGCTTAGAAATGATTGGCA 51973131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 TTAAAGAGGTAAAATCTGCCAAACGTTTTTTTTTTTATTCTAGCTTAGAAATGATTGGCA 3720

 51973132 AGACTTAAGTTTTTTCCAATACAACTTTTAACTTATCTCTATTACAAATATACACACAAT 51973191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 AGACTTAAGTTTTTTCCAATACAACTTTTAACTTATCTCTATTACAAATATACACACAAT 3780

 51973192 TATTAATTAATTTATTAGTTTTCATTGATACCTAATAATTTTACTTTTTTATAGAGCACA 51973251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 TATTAATTAATTTATTAGTTTTCATTGATACCTAATAATTTTACTTTTTTATAGAGCACA 3840

 51973252 CAGGATGTTCTGTACACATATAGAATTTGTAACGATCCAATCAAGGTATTTAGGTTATTC 51973311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 CAGGATGTTCTGTACACATATAGAATTTGTAACGATCCAATCAAGGTATTTAGGTTATTC 3900

 51973312 ATCATCTCAAACATTTATAATTTCTTTGTGTTGAGTATGTCTCCAATCTTCTACCTCTTC 51973371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 ATCATCTCAAACATTTATAATTTCTTTGTGTTGAGTATGTCTCCAATCTTCTACCTCTTC 3960

 51973372 TGAAATATACAATAAACTCTATTTTTAACTACAGTCACTCTACTTGTCTCATATGGTACC 51973431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     3961 TGAAATATACAATAAACTCTATTTTTAACTACAGTCACTCTACTTGTCTCATATGGCACC 4020

 51973432 AAACTAGATCGTTGTTGTCTTGATAACACAGCATTATCATTATAGCTGTAATACATAATG 51973491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 AAACTAGATCGTTGTTGTCTTGATAACACAGCATTATCATTATAGCTGTAATACATAATG 4080

 51973492 CTGTACCTCCTCTCCTAACCCTGGAAGTTGCAATTCATCCTTCAATGCTCAGCTCAAAGG 51973551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 CTGTACCTCCTCTCCTAACCCTGGAAGTTGCAATTCATCCTTCAATGCTCAGCTCAAAGG 4140

 51973552 ATTATTGTCTCTAAAGTTTTAGCAAATGCTGAAGCAGAATTTCACCATTTAATGGGTTCA 51973611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 ATTATTGTCTCTAAAGTTTTAGCAAATGCTGAAGCAGAATTTCACCATTTAATGGGTTCA 4200

 51973612 CAAGCTGCTGCCTTTATAGCTTATGGTACATATGTTTGCCAATATAAATGATCCACTTGA 51973671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 CAAGCTGCTGCCTTTATAGCTTATGGTACATATGTTTGCCAATATAAATGATCCACTTGA 4260

 51973672 GCTAAATTGCCACAGCTGCTACAACACCTCTTTACCTATTTTTGGAGCAAAACTGAAAAT 51973731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 GCTAAATTGCCACAGCTGCTACAACACCTCTTTACCTATTTTTGGAGCAAAACTGAAAAT 4320

 51973732 CAGAAAAGTTTAACTTTTTCAAAATAATGAAAAATTTCTCTCCAATCCTCTCCATCATTA 51973791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 CAGAAAAGTTTAACTTTTTCAAAATAATGAAAAATTTCTCTCCAATCCTCTCCATCATTA 4380

 51973792 TACATTAATAGGAAAAGAAAGGACAAAGACAA 51973823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 TACATTAATAGGAAAAGAAAGGACAAAGACAA 4412

EXCISED REGION

 51974241 AAATTTTCCTTTGAGAAAGTCTCAGTAATATTTGCTTAATATGCTGATAGGCTTATCAAG 51974300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4418 AAATTTTCCTTTGAGAAAGTCTCAGTAATATTTGCTTAATATGCTGATAGGCTTATCAAG 4477

 51974301 CTTCTTGAAAAAAAACTGATTTACAATACAGTGGGGATTATTTTTTTTAAGTTGGAAGGG 51974360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4478 CTTCTTGAAAAAAAACTGATTTACAATACAGTGGGGATTATTTTTTTTAAGTTGGAAGGG 4537

 51974361 AAAGAAGGTTTGATGTAAGAGTGCTTTGAAATGTGGAGTTTTCCTAAGTATTACTCCCAC 51974420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4538 AAAGAAGGTTTGATGTAAGAGTGCTTTGAAATGTGGAGTTTTCCTAAGTATTACTCCCAC 4597

 51974421 AAGACCATAGTCTTGAAATTAAATTAGGCCTTTAGAATATCAGACAAAATAAATGGATTG 51974480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4598 AAGACCATAGTCTTGAAATTAAATTAGGCCTTTAGAATATCAGACAAAATAAATGGATTG 4657

 51974481 TAATTTATTTCAATAGCTGAATGCTTACTATTTTTCAAAGGATTAATTGAGATATATAAT 51974540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4658 TAATTTATTTCAATAGCTGAATGCTTACTATTTTTCAAAGGATTAATTGAGATATATAAT 4717

 51974541 TCTTTATATAAGTAAAAGAAATTTTCTAACTTTCAGAAACATCTAAACTTAGTTTTCCAC 51974600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4718 TCTTTATATAAGTAAAAGAAATTTTCTAACTTTCAGAAACATCTAAACTTAGTTTTCCAC 4777

 51974601 TAAGTTG 51974607
          |||||||
     4778 TAAGTTG 4784

Alignment time is 3.59939 s

