
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51916584,51937767] =>     21184 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [       1,    5027] =>      5027 nucs 'mol-32-220d-036326_5027'

Score:        4920
Aligned:      5019        nucs
Identic:      5010 (100%) nucs =>      1880 (100%)      3130 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51924704,51926584] EXCISED REGION [51927768,51930905]
 second seq =>  [       1,    1881] EXCISED REGION [    1882,    5018]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1183 nucs [51926585,51927767]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [51926585,51926587] to [51927768,51927770]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [51926584,51926584] to [51927768,51927768]
 second seq =>         1 nucs [1881,1881] to [1882,1882]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 51924704 ATCTTAGTGTTTCATGAATATTGAAGAATAGTGCAATTATTGAAATTTGGCATTTAAAAA 51924763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATCTTAGTGTTTCATGAATATTGAAGAATAGTGCAATTATTGAAATTTGGCATTTAAAAA 60

 51924764 ATGTTTTTAAATTATTAGGAAGCTACCGTGACCTGTTTACTAAATCCTCAATTCTTTCTC 51924823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATGTTTTTAAATTATTAGGAAGCTACCGTGACCTGTTTACTAAATCCTCAATTCTTTCTC 120

 51924824 TCTCAGTTTTTCTTACTATAAAATTTACTTTTCAAGCCAGAGAATTTTTCTTTCTGACAA 51924883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCTCAGTTTTTCTTACTATAAAATTTACTTTTCAAGCCAGAGAATTTTTCTTTCTGACAA 180

 51924884 GACGTAGATCTATATTGCGCTGTCAAGATGCAGCTTTTGCATCTCTGCTGCCATGTGGAT 51924943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GACGTAGATCTATATTGCGCTGTCAAGATGCAGCTTTTGCATCTCTGCTGCCATGTGGAT 240

 51924944 AGAATAACTTTCTTTCCTCAAGAAGTGGACAAGCCCTCATAGGGACTGATTTTCTGTGAA 51925003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGAATAACTTTCTTTCCTCAAGAAGTGGACAAGCCCTCATAGGGACTGATTTTCTGTGAA 300

 51925004 GTAGTGAGACTTAATCTTTGGGACCTTCACTTACATCACTTACATAGGACCTTTCAATAC 51925063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTAGTGAGACTTAATCTTTGGGACCTTCACTTACATCACTTACATAGGACCTTTCAATAC 360

 51925064 TCAGGGAGGGCCCTTGGCAATAAGTTCTTCTGACAATATATCTTGTGCTGATGGTGGTGT 51925123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCAGGGAGGGCCCTTGGCAATAAGTTCTTCTGACAATATATCTTGTGCTGATGGTGGTGT 420

 51925124 TAGCTTTCAAAATTTGTAATTATTTTGGTAATTTCTGTCATCCTAGAAAAATGTGTATAG 51925183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TAGCTTTCAAAATTTGTAATTATTTTGGTAATTTCTGTCATCCTAGAAAAATGTGTATAG 480

 51925184 TGTATTTGTTCCTAATTTCATTTTCATTATTTATATATTTTTTAATGAACACCCCCAGCA 51925243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGTATTTGTTCCTAATTTCATTTTCATTATTTATATATTTTTTAATGAACACCCCCAGCA 540

 51925244 TAGTATAAGTTTTATACCTCTACAATCTGAATCACCCGCTTGGCCCATGCCTAGGACTAG 51925303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TAGTATAAGTTTTATACCTCTACAATCTGAATCACCCGCTTGGCCCATGCCTAGGACTAG 600

 51925304 GTCTTATCATCCGCAGTGAGAGATTATAGGCTCTTACTAGGAATTTATGGTAACATGGGC 51925363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTCTTATCATCCGCAGTGAGAGATTATAGGCTCTTACTAGGAATTTATGGTAACATGGGC 660

 51925364 TCCTAACAGTCATGATTTTTATAACATGATTGCCTATGTATATAAAGTCCACTGGCTGAA 51925423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCCTAACAGTCATGATTTTTATAACATGATTGCCTATGTATATAAAGTCCACTGGCTGAA 720

 51925424 CAAGTATTTTCCCTCAAATCAGGAAGGAAAAAAAAAAACACGAAGCAAATTGATCCTCTT 51925483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CAAGTATTTTCCCTCAAATCAGGAAGGAAAAAAAAAAACACGAAGCAAATTGATCCTCTT 780

 51925484 CTAAAAGCTGTCACATCAGTAACCCATCATATTCTCATTTACTTATATACTGAGTAGGTA 51925543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTAAAAGCTGTCACATCAGTAACCCATCATATTCTCATTTACTTATATACTGAGTAGGTA 840

 51925544 GTCACCTTTGATTCATATCTCTCAGGAGTTCAGAAGTTTTTGAAAGTAATTTGTGATACA 51925603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GTCACCTTTGATTCATATCTCTCAGGAGTTCAGAAGTTTTTGAAAGTAATTTGTGATACA 900

 51925604 AAATATAGGGAAATTCAGAATGAGATTCTTTTGGCTTGTCTTTCTTTTTCTTTTTTTCTT 51925663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AAATATAGGGAAATTCAGAATGAGATTCTTTTGGCTTGTCTTTCTTTTTCTTTTTTTCTT 960

 51925664 TTTTTTTTTTTTATTTGTTGAACTCAAATCCGGAAATTGTGGAGGTTACTAGAACTCTAA 51925723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTTTTTTTTTTTATTTGTTGAACTCAAATCCGGAAATTGTGGAGGTTACTAGAACTCTAA 1020

 51925724 GTCACAGACTTATAAGTACTGAAAAAGTAGTCAGTAAAGAAAACATACAGTAAGAGACTA 51925783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GTCACAGACTTATAAGTACTGAAAAAGTAGTCAGTAAAGAAAACATACAGTAAGAGACTA 1080

 51925784 GGTTAATTTTCCTATAGTTCATTGATGTTTCCACTATTACTGCCCCTGATTTTTAACTTT 51925843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GGTTAATTTTCCTATAGTTCATTGATGTTTCCACTATTACTGCCCCTGATTTTTAACTTT 1140

 51925844 AGTTTTCCTTAGATTGTTGGAGTAATATATGTACCTTAAAAATTAACTGTGGAACAAGTA 51925903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGTTTTCCTTAGATTGTTGGAGTAATATATGTACCTTAAAAATTAACTGTGGAACAAGTA 1200

 51925904 GATGAACTTTTTACACAATTTCCTGCTTTTATAAAGTTCCTACTAGCTATATTTTCCCAA 51925963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GATGAACTTTTTACACAATTTCCTGCTTTTATAAAGTTCCTACTAGCTATATTTTCCCAA 1260

 51925964 AAGTGCTCAACAATAGAGTCTGGTGCTAAAAAGCAGAGTAGGCTAAATTTAGATCAATGT 51926023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AAGTGCTCAACAATAGAGTCTGGTGCTAAAAAGCAGAGTAGGCTAAATTTAGATCAATGT 1320

 51926024 GAAATGCCCTACTTATTTCCTATGAACTTAATTGATTGAGCTCATTTTGGGGGTGTCTTT 51926083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GAAATGCCCTACTTATTTCCTATGAACTTAATTGATTGAGCTCATTTTGGGGGTGTCTTT 1380

 51926084 CTGATCGACCAGAAACTTGGCTCATTAGAGCAACTCACAAAGTGACCTTTTAAAAGAAAG 51926143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CTGATCGACCAGAAACTTGGCTCATTAGAGCAACTCACAAAGTGACCTTTTAAAAGAAAG 1440

 51926144 AGTTTTCAATATATTTGTTCATGTTCCATTCCACTGAGAATGGTGCTATTTAAAACTAAA 51926203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AGTTTTCAATATATTTGTTCATGTTCCATTCCACTGAGAATGGTGCTATTTAAAACTAAA 1500

 51926204 TACAATAATTTTAGATATTGTACAGCAGATATAATTTTAAACATAATACATGGGATTTCG 51926263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TACAATAATTTTAGATATTGTACAGCAGATATAATTTTAAACATAATACATGGGATTTCG 1560

 51926264 ATTTTAGGTACTGTTTATAAGGCATTTCTCCTTATATTATTCTAGACTTAAATATAACAA 51926323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ATTTTAGGTACTGTTTATAAGGCATTTCTCCTTATATTATTCTAGACTTAAATATAACAA 1620

 51926324 ATTTCATGCAGAGGTTTCTTTCAAAAGTAAATTCAGCCACATTTAGACTCAAATATTCCC 51926383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ATTTCATGCAGAGGTTTCTTTCAAAAGTAAATTCAGCCACATTTAGACTCAAATATTCCC 1680

 51926384 TAATTTTTTAGTGTAGCTGAAGTCCTAATAATATACTTGTGTTTCTTTTAAATTAAGTCC 51926443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TAATTTTTTAGTGTAGCTGAAGTCCTAATAATATACTTGTGTTTCTTTTAAATTAAGTCC 1740

 51926444 CACATGTTAACTTTACAACAGAAAGTCCATGTATCGTATTATTAGTCTAAATCTTCATTT 51926503
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CACATGTTAACTTTACAGCAGAAAGTCCATGTATCGTATTATTAGTCTAAATCTTCATTT 1800

 51926504 TACTGTTTAGTTAACACAGACATTCATTTAACACACTATGTTTAATTTCCCACTCAGTTT 51926563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TACTGTTTAGTTAACACAGACATTCATTTAACACACTATGTTTAATTTCCCACTCAGTTT 1860

 51926564 TGGCTTATTGTAGTCTAATAA 51926584
          |||||||||||||||||||||
     1861 TGGCTTATTGTAGTCTAATAA 1881

EXCISED REGION

 51927768 ACATATAGTAAGTTGTCCATAAGTATTTGCTGGTAGATTTATTTATTTTTTAAAAAAACA 51927827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1882 ACATATAGTAAGTTGTCCATAAGTATTTGCTGGTAGATTTATTTATTTTTTAAAAAAACA 1941

 51927828 ACTTGGAAAGTTTTCTGTGTGCTTTTATATTAGAACTTGACCTTTGAAGTACCTCCAGGA 51927887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1942 ACTTGGAAAGTTTTCTGTGTGCTTTTATATTAGAACTTGACCTTTGAAGTACCTCCAGGA 2001

 51927888 AATTTTGAAGAGTGCTGGCATATGACAATGCGTAAGTTTATATTTCATGTCCATGCATGC 51927947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2002 AATTTTGAAGAGTGCTGGCATATGACAATGCGTAAGTTTATATTTCATGTCCATGCATGC 2061

 51927948 CATTAAAATTCTAATAATGTAGTTGACAGAGCCTTTCTTGTCCCTTAAGCACTAAATTTG 51928007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2062 CATTAAAATTCTAATAATGTAGTTGACAGAGCCTTTCTTGTCCCTTAAGCACTAAATTTG 2121

 51928008 TGGCTTGCTCTAGATTGTCCCACCTGGCACAAGCGAGGTGAAATTTCAGGTCTAGCCAAC 51928067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     2122 TGGCTTGCTCTAGATTGTCCCACCTGGCACAAGCTAGGTGAAATTTCAGGTCTAGCCAAC 2181

 51928068 TTTTTTCTTTTTTTTTTTTTAACAAGTATTAAAAACATTTTCATATATATTCCCTGTATT 51928127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2182 TTTTTTCTTTTTTTTTTTTTAACAAGTATTAAAAACATTTTCATATATATTCCCTGTATT 2241

 51928128 ATTTCACCTATTTTTGTGTGTGTGTTTCTATCACACTGCCACATCAAAAACCTCTTCTTG 51928187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2242 ATTTCACCTATTTTTGTGTGTGTGTTTCTATCACACTGCCACATCAAAAACCTCTTCTTG 2301

 51928188 AACGACTATAGTATAGTGGTTAATAGTTCAGTGTCTAGATCAAGACCACCTATGGACGTA 51928247
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2302 AACGACTATAGTATAGTGATTAATAGTTCAGTGTCTAGATCAAGACCACCTATGGACGTA 2361

 51928248 TCTTGGCTCTGATTTTACCAGCCGTACAATCCTGGAGAATCTGTTCAAGAGAAATGTGCC 51928307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2362 TCTTGGCTCTGATTTTACCAGCCGTACAATCCTGGAGAATCTGTTCAAGAGAAATGTGCC 2421

 51928308 TCAATTACGTATCTCTAAAGTAGTTGTAGCTATAGAACCTGTTCCATAGATGTGGATCAG 51928367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2422 TCAATTACGTATCTCTAAAGTAGTTGTAGCTATAGAACCTGTTCCATAGATGTGGATCAG 2481

 51928368 AACACTGCATGACATTTAGAAAATGTTTAATAAATGATGTTGCTGTACTTGTTGCTGTTA 51928427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2482 AACACTGCATGACATTTAGAAAATGTTTAATAAATGATGTTGCTGTACTTGTTGCTGTTA 2541

 51928428 TTGTTGCTCTGTCATGTTAGGAGAACTCTCATTTACCCTAGTGTTCTCTCAAAGTGAAAT 51928487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2542 TTGTTGCTCTGTCATGTTAGGAGAACTCTCATTTACCCTAGTGTTCTCTCAAAGTGAAAT 2601

 51928488 ACAGATCATTACCTCTTGAAATCATGTCCAAGTAACTTCAGAATTATTTAGAAATCATTT 51928547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2602 ACAGATCATTACCTCTTGAAATCATGTCCAAGTAACTTCAGAATTATTTAGAAATCATTT 2661

 51928548 ATCTAAATCAGAGTATTTCTTGATATAATTTAAAGTTGATTGTATTTGAAAGTACATATG 51928607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2662 ATCTAAATCAGAGTATTTCTTGATATAATTTAAAGTTGATTGTATTTGAAAGTACATATG 2721

 51928608 TCAATCTAGTATGAGATAATCTCAAGGAAATAAAAATGTATAGGTCTAATTTACATTTTT 51928667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2722 TCAATCTAGTATGAGATAATCTCAAGGAAATAAAAATGTATAGGTCTAATTTACATTTTT 2781

 51928668 ATATGGAAGGAGATAATTACTTTCTATCACAAATGATGAAGGCTGACGTTTGTTTCTTTT 51928727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2782 ATATGGAAGGAGATAATTACTTTCTATCACAAATGATGAAGGCTGACGTTTGTTTCTTTT 2841

 51928728 TTACTTTTAATTTTCACTTATATTTTGTTTATTATCAATATTTGCTTTTTAAAAGGTGGG 51928787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2842 TTACTTTTAATTTTCACTTATATTTTGTTTATTATCAATATTTGCTTTTTAAAAGGTGGG 2901

 51928788 AAGAAATCAACCAATCAAACATTAAAAAGCAATATGGAGGAGGGTGATATAATGCCCACT 51928847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2902 AAGAAATCAACCAATCAAACATTAAAAAGCAATATGGAGGAGGGTGATATAATGCCCACT 2961

 51928848 TATATTTCTCTTATAATTTTAAATATTTTCATAATTAACAGAATAATTAGCACTGGTAAT 51928907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2962 TATATTTCTCTTATAATTTTAAATATTTTCATAATTAACAGAATAATTAGCACTGGTAAT 3021

 51928908 ATTAAAATACCATCAAAAGAATCTAAATGTATGTGCTTTCTGTTGCAGCCTTGTTAGATG 51928967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3022 ATTAAAATACCATCAAAAGAATCTAAATGTATGTGCTTTCTGTTGCAGCCTTGTTAGATG 3081

 51928968 TTTCAGTGGATTCAAAGTGTTGTTATAAGAAAACGTGATTTATCAAGACTTTCATGTGTA 51929027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3082 TTTCAGTGGATTCAAAGTGTTGTTATAAGAAAACGTGATTTATCAAGACTTTCATGTGTA 3141

 51929028 AAATAAAAGGCATTTTCAATGACTACTTGGCCAGGCTTTCAGATTCCAATGCCAAGATGT 51929087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3142 AAATAAAAGGCATTTTCAATGACTACTTGGCCAGGCTTTCAGATTCCAATGCCAAGATGT 3201

 51929088 TGTATTTTGATATTGCAGTTTTCTAACAACAACAAAGTTGAGTGGACTTCTGGAACTAAA 51929147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3202 TGTATTTTGATATTGCAGTTTTCTAACAACAACAAAGTTGAGTGGACTTCTGGAACTAAA 3261

 51929148 ACTTAAATATTCAGAACTAATTATCACCACTCTATTTCTTACAGAGCATTTAAGGAACAC 51929207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3262 ACTTAAATATTCAGAACTAATTATCACCACTCTATTTCTTACAGAGCATTTAAGGAACAC 3321

 51929208 ATATATGCATATATCCTTGCACTTTGTGCTACAGGTTGTGAGCCAGGGTTACTTCCTTCT 51929267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3322 ATATATGCATATATCCTTGCACTTTGTGCTACAGGTTGTGAGCCAGGGTTACTTCCTTCT 3381

 51929268 GACCATGTGGGTTCATAATGAAGACCCAACCTTAAGGTACCCAGGGCTTAGAAATCAAAT 51929327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3382 GACCATGTGGGTTCATAATGAAGACCCAACCTTAAGGTACCCAGGGCTTAGAAATCAAAT 3441

 51929328 TTGTCCTTAGGACACTTTGGAAATCTATCTTGTAGTACAGGTGACCCAGCAGCAATCAAT 51929387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3442 TTGTCCTTAGGACACTTTGGAAATCTATCTTGTAGTACAGGTGACCCAGCAGCAATCAAT 3501

 51929388 CTTTCTGCCATCCCTAGTTTTAGTTCAGGACCCAGAAAAGTTGTAACTTGTTTCCTTTCC 51929447
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3502 CTTTCTGCCATCCCTAGTTTTACTTCAGGACCCAGAAAAGTTGTAACTTGTTTCCTTTCC 3561

 51929448 TGTGATCAAGCCTTTGTTTTCTCTTTTTTTCTCCACTTTTTGTAGCTTTTTAATTTGTTT 51929507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3562 TGTGATCAAGCCTTTGTTTTCTCTTTTTTTCTCCACTTTTTGTAGCTTTTTAATTTGTTT 3621

 51929508 CTCTGTTGATTACTAGCCCAATGCCTGAGCATCTTCGTCTTAAGACAAAGCCTCTGTGTT 51929567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3622 CTCTGTTGATTACTAGCCCAATGCCTGAGCATCTTCGTCTTAAGACAAAGCCTCTGTGTT 3681

 51929568 TCTTCAGCTCCTGAAATGACTGGCATGCTGAAAATGAGCTCAGGGCATTAGTCTTTGCTA 51929627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3682 TCTTCAGCTCCTGAAATGACTGGCATGCTGAAAATGAGCTCAGGGCATTAGTCTTTGCTA 3741

 51929628 CTAAGCCACTACAGATTCCATTCCCTTTCTTCTTGAGTATGCACACACCGCTTGTTCACA 51929687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     3742 CTAAGCCACTACAGATTCCATTCCCTTTCTTCCTGAGTATGCACACACCGCTTGTTCACA 3801

 51929688 GACTCCAGATTAGTTATTAAGCTACATCTGTATGCAGTTTGCACTCTCCTGCCTTCGACC 51929747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3802 GACTCCAGATTAGTTATTAAGCTACATCTGTATGCAGTTTGCACTCTCCTGCCTTCGACC 3861

 51929748 TGCTTGTCCCAGAAGTTATTCACCATATTCTACCTTGATCATATTTTCTACTTGTCAATG 51929807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3862 TGCTTGTCCCAGAAGTTATTCACCATATTCTACCTTGATCATATTTTCTACTTGTCAATG 3921

 51929808 CGCATGTCAATTAAGAACTTTTAACATTTATTGACCATTTATTATATACTAGCCAGTCTT 51929867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3922 CGCATGTCAATTAAGAACTTTTAACATTTATTGACCATTTATTATATACTAGCCAGTCTT 3981

 51929868 TTAATTGATTTATGAACAATTAACTTAATCATCATATAAGCATAGTAGGGTACAATTAGT 51929927
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3982 TTAATTGCTTTATGAACAATTAACTTAATCATCATATAAGCATAGTAGGGTACAATTAGT 4041

 51929928 TCCCCAACTTTATATATGAACAAATGGACTTTCAGAAAGGTAAGGTAAAATATCCACGGT 51929987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4042 TCCCCAACTTTATATATGAACAAATGGACTTTCAGAAAGGTAAGGTAAAATATCCACGGT 4101

 51929988 AAGAAAGCCTGCATATGTGGAACTGGGAATTGAACCCCTATGTCTGACCCGAGGGTCCAT 51930047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4102 AAGAAAGCCTGCATATGTGGAACTGGGAATTGAACCCCTATGTCTGACCCGAGGGTCCAT 4161

 51930048 ACACTTAAGCATTATGCTATCAAGTTTTCCACAGCCTGCTTTTCGGCTTCTCTCTCTTTC 51930107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4162 ACACTTAAGCATTATGCTATCAAGTTTTCCACAGCCTGCTTTTCGGCTTCTCTCTCTTTC 4221

 51930108 TTTCTTTCCTGATCTCTGTTGCAATTCCTACCTTTCAACTCCCTTCTGACCATGGATAGT 51930167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     4222 TTTCTTTCCTGATCTCTGTTGCAATTCCTACCTTTCAACTCCCTTCTGACCATGGACAGT 4281

 51930168 TTGCAAAATGCCAGAGGTACGTCTCAAAGAAGCTTCAAATAGGAGCGTGTACTACCATTA 51930227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4282 TTGCAAAATGCCAGAGGTACGTCTCAAAGAAGCTTCAAATAGGAGCGTGTACTACCATTA 4341

 51930228 AGTCAGCTCCTCAGTTGTCTTCTTTGGATTGAGAAGCACTTCATCACTTTTTACACAGGT 51930287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4342 AGTCAGCTCCTCAGTTGTCTTCTTTGGATTGAGAAGCACTTCATCACTTTTTACACAGGT 4401

 51930288 TTAATTATCAAATATGACTTTTCTAGTACTACAGCTAATATATGTCAATGTCAAAGGGTT 51930347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4402 TTAATTATCAAATATGACTTTTCTAGTACTACAGCTAATATATGTCAATGTCAAAGGGTT 4461

 51930348 AACAGAATACTAGGCCTATATTAAATTATACATATGAGCTTTCTCTTTACTCCTTTTTAT 51930407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4462 AACAGAATACTAGGCCTATATTAAATTATACATATGAGCTTTCTCTTTACTCCTTTTTAT 4521

 51930408 GTTCATTAGCAAACAGATAAAGCCATAATAGATTTTTTAAGGAATATTTTGTTTTGTTTT 51930467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4522 GTTCATTAGCAAACAGATAAAGCCATAATAGATTTTTTAAGGAATATTTTGTTTTGTTTT 4581

 51930468 GTTTTGGACTTATACATCTATTAACAATAAACCAAACATTGCAGATTAAAGCAAATCTGC 51930527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4582 GTTTTGGACTTATACATCTATTAACAATAAACCAAACATTGCAGATTAAAGCAAATCTGC 4641

 51930528 CAATCTGTTTTACAAACACTATCTTCTGAAGGGTTCCTGGGCACAAGATACTGTTCTAGT 51930587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4642 CAATCTGTTTTACAAACACTATCTTCTGAAGGGTTCCTGGGCACAAGATACTGTTCTAGT 4701

 51930588 AATATTTCACAGCTTTTTTTTTTTTTTCATTTTAGAGAAAATATTCTAAGACTCCAAAGT 51930647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4702 AATATTTCACAGCTTTTTTTTTTTTTTCATTTTAGAGAAAATATTCTAAGACTCCAAAGT 4761

 51930648 TCGATAGTATTTGGTCAGTGTCTTAGTCAGTTTGAGCTAATATAACAAATTATCATAGAA 51930707
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4762 TAGATAGTATTTGGTCAGTGTCTTAGTCAGTTTGAGCTAATATAACAAATTATCATAGAA 4821

 51930708 TAAGTGTCTCAAGCAACAGAAATGTATTTTTTACAATCTGGAGGCTGCAAAGTCCAGAAT 51930767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4822 TAAGTGTCTCAAGCAACAGAAATGTATTTTTTACAATCTGGAGGCTGCAAAGTCCAGAAT 4881

 51930768 CAAGATGCTGGCAGATCTGGTGTCTGATGAGGACCCACCTTCTTATTTGCAAATGATCAT 51930827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4882 CAAGATGCTGGCAGATCTGGTGTCTGATGAGGACCCACCTTCTTATTTGCAAATGATCAT 4941

 51930828 TTTTGTTGTGTCCTCACATGACAAAGAGCAGAGAGAGCAAGCACTCTTGTGTCTCTTCTT 51930887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
     4942 TTTTGTTGTGTCCTCACATGACAAAGAGCAGAGAGAGCAAGCACTCTTGTGTCTCTT-TT 5000

 51930888 TTTTTTTTTTTTTTTTTT 51930905
          ||||||||||||||||||
     5001 TTTTTTTTTTTTTTTTTT 5018

Alignment time is 3.80993 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51916584,51937767] =>     21184 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [       1,    2747] =>      2747 nucs 'mol-32-23a4-040078_2747'

Score:        2665
Aligned:      2742        nucs
Identic:      2735 (100%) nucs =>       546 (100%)      2189 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51927149,51927694] EXCISED REGION [51927696,51929891]
 second seq =>  [       5,     550] EXCISED REGION [     552,    2747]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [51927695,51927695]
 second seq =>         1 nucs [551,551]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [51927694,51927694] to [51927696,51927696]
 second seq =>         1 nucs [550,550] to [552,552]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 51927149 ATCGTAAACAGATCCTCAGTAATTAGTGTAGAAATAAATGTTCTAGACAATCCAAAGTTA 51927208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        5 ATCGTAAACAGATCCTCAGTAATTAGTGTAGAAATAAATGTTCTAGACAATCCAAAGTTA 64

 51927209 TTTAAAGTTTTTCAGAAAGCTACCCTTCTATCATCTGGGGTAATTTTTTTTGTCATTTTG 51927268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       65 TTTAAAGTTTTTCAGAAAGCTACCCTTCTATCATCTGGGGTAATTTTTTTTGTCATTTTG 124

 51927269 GCAAATATGTAGAGAATATATGTGAGTCTTCCTATTAGTCTGAAGTAAGCAAAACTATAA 51927328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      125 GCAAATATGTAGAGAATATATGTGAGTCTTCCTATTAGTCTGAAGTAAGCAAAACTATAA 184

 51927329 AGGCACATTTATCGAGGTGGAATGTGAAAAACAACAATCATTTTAACGTAAATCTATGAT 51927388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      185 AGGCACATTTATCGAGGTGGAATGTGAAAAACAACAATCATTTTAACGTAAATCTATGAT 244

 51927389 ACTTTGGTCTCTTCCAGTGTCCAGGTAACTTATGCCACAACTTTCTTCTATCTTTGTTAA 51927448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      245 ACTTTGGTCTCTTCCAGTGTCCAGGTAACTTATGCCACAACTTTCTTCTATCTTTGTTAA 304

 51927449 TAATACAGTGTGTTTTATACCTGTGGGCACTAACATTTTGTTACTATTTGTAGTAATGCT 51927508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      305 TAATACAGTGTGTTTTATACCTGTGGGCACTAACATTTTGTTACTATTTGTAGTAATGCT 364

 51927509 ACTGCATTACTGATATGAGAATAAAATGATTCTCTGAAATTCCTAATTTCATTTTTGAAG 51927568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      365 ACTGCATTACTGATATGAGAATAAAATGATTCTCTGAAATTCCTAATTTCATTTTTGAAG 424

 51927569 TAATTTGCTAAACAATATGGTCACGTATAATAGCATCAAATATTGATATTCTTCCATTAT 51927628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      425 TAATTTGCTAAACAATATGGTCACGTATAATAGCATCAAATATTGATATTCTTCCATTAT 484

 51927629 TTTTTCCTTTATTGTAATATTTTTCACTTATTGTAATATTTTTCCATGTCATAGTTTCAC 51927688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      485 TTTTTCCTTTATTGTAATATTTTTCACTTATTGTAATATTTTTCCATGTCATAGTTTCAC 544

 51927689 TTATTT 51927694
          ||||||
      545 TTATTT 550

EXCISED REGION

 51927696 TCAACATACTATGTATCCATGAATGTCCTGAAGGGAAAAAAAAATCTCATATATACCTAA 51927755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      552 TCAACATACTATGTATCCATGAATGTCCTGAAGGGAAAAAAAAATCTCATATATACCTAA 611

 51927756 CTGATGTGCTTGACATATAGTAAGTTGTCCATAAGTATTTGCTGGTAGATTTATTTATTT 51927815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      612 CTGATGTGCTTGACATATAGTAAGTTGTCCATAAGTATTTGCTGGTAGATTTATTTATTT 671

 51927816 TTTAAAAAAACAACTTGGAAAGTTTTCTGTGTGCTTTTATATTAGAACTTGACCTTTGAA 51927875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      672 TTTAAAAAAACAACTTGGAAAGTTTTCTGTGTGCTTTTATATTAGAACTTGACCTTTGAA 731

 51927876 GTACCTCCAGGAAATTTTGAAGAGTGCTGGCATATGACAATGCGTAAGTTTATATTTCAT 51927935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      732 GTACCTCCAGGAAATTTTGAAGAGTGCTGGCATATGACAATGCGTAAGTTTATATTTCAT 791

 51927936 GTCCATGCATGCCATTAAAATTCTAATAATGTAGTTGACAGAGCCTTTCTTGTCCCTTAA 51927995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      792 GTCCATGCATGCCATTAAAATTCTAATAATGTAGTTGACAGAGCCTTTCTTGTCCCTTAA 851

 51927996 GCACTAAATTTGTGGCTTGCTCTAGATTGTCCCACCTGGCACAAGCGAGGTGAAATTTCA 51928055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
      852 GCACTAAATTTGTGGCTTGCTCTAGATTGTCCCACCTGGCACAAGCTAGGTGAAATTTCA 911

 51928056 GGTCTAGCCAACTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTAACAAGTATTAAAAACATTTTCATATAT 51928115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      912 GGTCTAGCCAACTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTAACAAGTATTAAAAACATTTTCATATAT 971

 51928116 ATTCCCTGTATTATTTCACCTATTTTTGTGTGTGTGTTTCTATCACACTGCCACATCAAA 51928175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      972 ATTCCCTGTATTATTTCACCTATTTTTGTGTGTGTGTTTCTATCACACTGCCACATCAAA 1031

 51928176 AACCTCTTCTTGAACGACTATAGTATAGTGGTTAATAGTTCAGTGTCTAGATCAAGACCA 51928235
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     1032 AACCTCTTCTTGAACGACTATAGTATAGTGATTAATAGTTCAGTGTCTAGATCAAGACCA 1091

 51928236 CCTATGGACGTATCTTGGCTCTGATTTTACCAGCCGTACAATCCTGGAGAATCTGTTCAA 51928295
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     1092 CCTATGGACGTATCTTGGCTCTGATTCTACCAGCCGTACAATCCTGGAGAATCTGTTCAA 1151

 51928296 GAGAAATGTGCCTCAATTACGTATCTCTAAAGTAGTTGTAGCTATAGAACCTGTTCCATA 51928355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1152 GAGAAATGTGCCTCAATTACGTATCTCTAAAGTAGTTGTAGCTATAGAACCTGTTCCATA 1211

 51928356 GATGTGGATCAGAACACTGCATGACATTTAGAAAATGTTTAATAAATGATGTTGCTGTAC 51928415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1212 GATGTGGATCAGAACACTGCATGACATTTAGAAAATGTTTAATAAATGATGTTGCTGTAC 1271

 51928416 TTGTTGCTGTTATTGTTGCTCTGTCATGTTAGGAGAACTCTCATTTACCCTAGTGTTCTC 51928475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1272 TTGTTGCTGTTATTGTTGCTCTGTCATGTTAGGAGAACTCTCATTTACCCTAGTGTTCTC 1331

 51928476 TCAAAGTGAAATACAGATCATTACCTCTTGAAATCATGTCCAAGTAACTTCAGAATTATT 51928535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1332 TCAAAGTGAAATACAGATCATTACCTCTTGAAATCATGTCCAAGTAACTTCAGAATTATT 1391

 51928536 TAGAAATCATTTATCTAAATCAGAGTATTTCTTGATATAATTTAAAGTTGATTGTATTTG 51928595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1392 TAGAAATCATTTATCTAAATCAGAGTATTTCTTGATATAATTTAAAGTTGATTGTATTTG 1451

 51928596 AAAGTACATATGTCAATCTAGTATGAGATAATCTCAAGGAAATAAAAATGTATAGGTCTA 51928655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1452 AAAGTACATATGTCAATCTAGTATGAGATAATCTCAAGGAAATAAAAATGTATAGGTCTA 1511

 51928656 ATTTACATTTTTATATGGAAGGAGATAATTACTTTCTATCACAAATGATGAAGGCTGACG 51928715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1512 ATTTACATTTTTATATGGAAGGAGATAATTACTTTCTATCACAAATGATGAAGGCTGACG 1571

 51928716 TTTGTTTCTTTTTTACTTTTAATTTTCACTTATATTTTGTTTATTATCAATATTTGCTTT 51928775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1572 TTTGTTTCTTTTTTACTTTTAATTTTCACTTATATTTTGTTTATTATCAATATTTGCTTT 1631

 51928776 TTAAAAGGTGGGAAGAAATCAACCAATCAAACATTAAAAAGCAATATGGAGGAGGGTGAT 51928835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1632 TTAAAAGGTGGGAAGAAATCAACCAATCAAACATTAAAAAGCAATATGGAGGAGGGTGAT 1691

 51928836 ATAATGCCCACTTATATTTCTCTTATAATTTTAAATATTTTCATAATTAACAGAATAATT 51928895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1692 ATAATGCCCACTTATATTTCTCTTATAATTTTAAATATTTTCATAATTAACAGAATAATT 1751

 51928896 AGCACTGGTAATATTAAAATACCATCAAAAGAATCTAAATGTATGTGCTTTCTGTTGCAG 51928955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1752 AGCACTGGTAATATTAAAATACCATCAAAAGAATCTAAATGTATGTGCTTTCTGTTGCAG 1811

 51928956 CCTTGTTAGATGTTTCAGTGGATTCAAAGTGTTGTTATAAGAAAACGTGATTTATCAAGA 51929015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1812 CCTTGTTAGATGTTTCAGTGGATTCAAAGTGTTGTTATAAGAAAACGTGATTTATCAAGA 1871

 51929016 CTTTCATGTGTAAAATAAAAGGCATTTTCAATGACTACTTGGCCAGGCTTTCAGATTCCA 51929075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1872 CTTTCATGTGTAAAATAAAAGGCATTTTCAATGACTACTTGGCCAGGCTTTCAGATTCCA 1931

 51929076 ATGCCAAGATGTTGTATTTTGATATTGCAGTTTTCTAACAACAACAAAGTTGAGTGGACT 51929135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1932 ATGCCAAGATGTTGTATTTTGATATTGCAGTTTTCTAACAACAACAAAGTTGAGTGGACT 1991

 51929136 TCTGGAACTAAAACTTAAATATTCAGAACTAATTATCACCACTCTATTTCTTACAGAGCA 51929195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1992 TCTGGAACTAAAACTTAAATATTCAGAACTAATTATCACCACTCTATTTCTTACAGAGCA 2051

 51929196 TTTAAGGAACACATATATGCATATATCCTTGCACTTTGTGCTACAGGTTGTGAGCCAGGG 51929255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2052 TTTAAGGAACACATATATGCATATATCCTTGCACTTTGTGCTACAGGTTGTGAGCCAGGG 2111

 51929256 TTACTTCCTTCTGACCATGTGGGTTCATAATGAAGACCCAACCTTAAGGTACCCAGGGCT 51929315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2112 TTACTTCCTTCTGACCATGTGGGTTCATAATGAAGACCCAACCTTAAGGTACCCAGGGCT 2171

 51929316 TAGAAATCAAATTTGTCCTTAGGACACTTTGGAAATCTATCTTGTAGTACAGGTGACCCA 51929375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2172 TAGAAATCAAATTTGTCCTTAGGACACTTTGGAAATCTATCTTGTAGTACAGGTGACCCA 2231

 51929376 GCAGCAATCAATCTTTCTGCCATCCCTAGTTTTAGTTCAGGACCCAGAAAAGTTGTAACT 51929435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     2232 GCAGCAATCAATCTTTCTGCCATCCCTAGTTTTACTTCAGGACCCAGAAAAGTTGTAACT 2291

 51929436 TGTTTCCTTTCCTGTGATCAAGCCTTTGTTTTCTCTTTTTTTCTCCACTTTTTGTAGCTT 51929495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2292 TGTTTCCTTTCCTGTGATCAAGCCTTTGTTTTCTCTTTTTTTCTCCACTTTTTGTAGCTT 2351

 51929496 TTTAATTTGTTTCTCTGTTGATTACTAGCCCAATGCCTGAGCATCTTCGTCTTAAGACAA 51929555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2352 TTTAATTTGTTTCTCTGTTGATTACTAGCCCAATGCCTGAGCATCTTCGTCTTAAGACAA 2411

 51929556 AGCCTCTGTGTTTCTTCAGCTCCTGAAATGACTGGCATGCTGAAAATGAGCTCAGGGCAT 51929615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     2412 AGCCTCTGTGTTTCTTCAGCTCCTGAAATGACTGGCATACTGAAAATGAGCTCAGGGCAT 2471

 51929616 TAGTCTTTGCTACTAAGCCACTACAGATTCCATTCCCTTTCTTCTTGAGTATGCACACAC 51929675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     2472 TAGTCTTTGCTACTAAGCCACTACAGATTCCATTCCCTTTCTTCCTGAGTATGCACACAC 2531

 51929676 CGCTTGTTCACAGACTCCAGATTAGTTATTAAGCTACATCTGTATGCAGTTTGCACTCTC 51929735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2532 CGCTTGTTCACAGACTCCAGATTAGTTATTAAGCTACATCTGTATGCAGTTTGCACTCTC 2591

 51929736 CTGCCTTCGACCTGCTTGTCCCAGAAGTTATTCACCATATTCTACCTTGATCATATTTTC 51929795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2592 CTGCCTTCGACCTGCTTGTCCCAGAAGTTATTCACCATATTCTACCTTGATCATATTTTC 2651

 51929796 TACTTGTCAATGCGCATGTCAATTAAGAACTTTTAACATTTATTGACCATTTATTATATA 51929855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2652 TACTTGTCAATGCGCATGTCAATTAAGAACTTTTAACATTTATTGACCATTTATTATATA 2711

 51929856 CTAGCCAGTCTTTTAATTGATTTATGAACAATTAAC 51929891
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     2712 CTAGCCAGTCTTTTAATTGCTTTATGAACAATTAAC 2747

Alignment time is 2.70248 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51916584,51937767] =>     21184 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [       1,    9707] =>      9707 nucs 'mol-32-2b13-104688_9707'

Score:        9453
Aligned:      9712        nucs
Identic:      9686 (100%) nucs =>      7165 (100%)      2521 (100%)
Gaps:            6 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51919401,51926584] EXCISED REGION [51927768,51930294]
 second seq =>  [       1,    7180] EXCISED REGION [    7181,    9707]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1183 nucs [51926585,51927767]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [51926585,51926587] to [51927768,51927770]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [51926584,51926584] to [51927768,51927768]
 second seq =>         1 nucs [7180,7180] to [7181,7181]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 51919401 TTTTTCATTTGTTGGTGTCATCTCTAATTTATTTGAGCAGTGTTTTGTAATTCTCATCGG 51919460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTTTCATTTGTTGGTGTCATCTCTAATTTATTTGAGCAGTGTTTTGTAATTCTCATCGG 60

 51919461 AGAGATTTTTCACCCCCTGGTTAGTGGAATTCCTGGGTATTTTATTCTTTTTGTGACTAT 51919520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGAGATTTTTCACCCCCTGGTTAGTGGAATTCCTGGGTATTTTATTCTTTTTGTGACTAT 120

 51919521 TTTGAATGGCACTGTGTTCTTGATTTGGGTCTCGGCTTGGATGTTGTTGGTGTATATGAA 51919580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTGAATGGCACTGTGTTCTTGATTTGGGTCTCGGCTTGGATGTTGTTGGTGTATATGAA 180

 51919581 CATTAAAGATTTCTGTACATTGATTTTGTGTTCTGAAACTTTGCTGAAGTTGTTTATCAG 51919640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CATTAAAGATTTCTGTACATTGATTTTGTGTTCTGAAACTTTGCTGAAGTTGTTTATCAG 240

 51919641 ATAAAGGAGGTTTTGGGCAGAGATTATGAGGTTTTCTAGGTATAGAATCATATTATATAA 51919700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATAAAGGAGGTTTTGGGCAGAGATTATGAGGTTTTCTAGGTATAGAATCATATTATATAA 300

 51919701 AAATGGGGATAACTTCCCTTCTTCCTATTTGGATGACTTTTATTTCTTTCTCTTGCCTGA 51919760
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAATGGGGACAACTTCCCTTCTTCCTATTTGGATGACTTTTATTTCTTTCTCTTGCCTGA 360

 51919761 TTGTTCTGGCCAGGACTTCCAGTACTATGCTGAATAGATGTGGGGAGAGAGGACATCCTT 51919820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTGTTCTGGCCAGGACTTCCAGTACTATGCTGAATAGATGTGGGGAGAGAGGACATCCTT 420

 51919821 GTCTTGTGCCAGTTTTCAAGGGAAATGCTTCCAGCTTTTACCCATTCAGTATGATGGTGG 51919880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTCTTGTGCCAGTTTTCAAGGGAAATGCTTCCAGCTTTTACCCATTCAGTATGATGGTGG 480

 51919881 CTGTGGTTGTGTCATAGATAGCTCTTATTATTTTGAACTATGTGATTGGACAATTCCTGG 51919940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTGTGGTTGTGTCATAGATAGCTCTTATTATTTTGAACTATGTGATTGGACAATTCCTGG 540

 51919941 AAGAGCTTGAAACAGAATTACTATTCCACTCAGCAATCCATTATAGATTATATGCCCAAA 51920000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAGAGCTTGAAACAGAATTACTATTCCACTCAGCAATCCATTATAGATTATATGCCCAAA 600

 51920001 GGAATATAAGTCGTTCTACCATGGAAACACTATTCACAATAGCAGAGACATGGAATCAAG 51920060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GGAATATAAGTCGTTCTACCATGGAAACACTATTCACAATAGCAGAGACATGGAATCAAG 660

 51920061 CTGAATGCCCAGCGATGGTAGATTAGAAAAAGAAAATGTGGTACATATATACTATGGAAT 51920120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTGAATGCCCAGCGATGGTAGATTAGAAAAAGAAAATGTGGTACATATATACTATGGAAT 720

 51920121 ACTGTGCATCCATAAAATGAATGATATCATGTCCTTTACAGCAACATGGATGGAGCTGGA 51920180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ACTGTGCATCCATAAAATGAATGATATCATGTCCTTTACAGCAACATGGATGGAGCTGGA 780

 51920181 GCCCATTATCCTAAGCAAACTAACACAGGAAGAGAAAACCAAATACCACATGTTCTCACT 51920240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GCCCATTATCCTAAGCAAACTAACACAGGAAGAGAAAACCAAATACCACATGTTCTCACT 840

 51920241 CATAAGGGGAAGCTAAATGTCGAGTATACATAAACACAAAGAAGAGAACAACAGCACCAG 51920300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CATAAGGGGAAGCTAAATGTCGAGTATACATAAACACAAAGAAGAGAACAACAGCACCAG 900

 51920301 AGCTTCTTGAGGGTGGAGGGTGGGAGGAGGGTGAGGATCAAAAAAACTGCCTATCAGGTG 51920360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGCTTCTTGAGGGTGGAGGGTGGGAGGAGGGTGAGGATCAAAAAAACTGCCTATCAGGTG 960

 51920361 CTATGCTTATTACCTTGATGATGAAATAATATGTACACCAAACCCCCCATGACACTTAAT 51920420
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||
      961 CTATGCTTATTACCTTGATGATGAAATAATATGTACACCAAACCCCCCATGGCACTCAAT 1020

 51920421 TTACTTAAATAACAAACTTGCACATGTATTCCTAAACCTAAAATAACAGCTTTTTAAAAA 51920480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTACTTAAATAACAAACTTGCACATGTATTCCTAAACCTAAAATAACAGCTTTTTAAAAA 1080

 51920481 AGAAAAGAGTAAAACTTCAACAGAGTTTTCTAAATTGTTATTACCAAGTTTGGACTGAGT 51920540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AGAAAAGAGTAAAACTTCAACAGAGTTTTCTAAATTGTTATTACCAAGTTTGGACTGAGT 1140

 51920541 GTTACATTATCTTAAATATAAATGAAAAGCACGTAGTGTTTATGGCTGGATGTTCAGCTT 51920600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GTTACATTATCTTAAATATAAATGAAAAGCACGTAGTGTTTATGGCTGGATGTTCAGCTT 1200

 51920601 TCATATGTAGACTGCTAAACATGATTGATTGTTCCACAAAATTCTTAGTTAATAATGTCT 51920660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     1201 TCATATGTAGACTGCTAAACATGATTGATTGTTCCACAAAATTCTTAGTTAATAATATCT 1260

 51920661 CAGGACATAGTTTATTCTTATCTGAAATTCTCTGTTAACTTTGCAGAGTAGAGATTACAT 51920720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CAGGACATAGTTTATTCTTATCTGAAATTCTCTGTTAACTTTGCAGAGTAGAGATTACAT 1320

 51920721 CATCTTGTTTTACCTCATAATATGGCTGCCAGGGCTTATAATTATGGTAGTAGTGCAGGC 51920780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CATCTTGTTTTACCTCATAATATGGCTGCCAGGGCTTATAATTATGGTAGTAGTGCAGGC 1380

 51920781 TTTACCAACCCCTTAGTTTTTGCTTTTGTTTTTGTTATTATTATTGTAATCACTCTGGTA 51920840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTTACCAACCCCTTAGTTTTTGCTTTTGTTTTTGTTATTATTATTGTAATCACTCTGGTA 1440

 51920841 TTTATTTTTAGGTATTTTTTAAAGCCACTGTTTCTTATAGTGGAAGTTAGATAAGTTAAA 51920900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTTATTTTTAGGTATTTTTTAAAGCCACTGTTTCTTATAGTGGAAGTTAGATAAGTTAAA 1500

 51920901 ACTGGATATATTATATCCTAAAGTATTTTAATTGGATCAAACTGTTGTTAGTCAAAATAT 51920960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1501 ACTGGATATATTATATCCTAAAGTATTTTAATTGGAACAAACTGTTGTTAGTCAAAATAT 1560

 51920961 GTTGAAAGCCAGCAAAGCAGTGGATGACCTCATTTTGCAAATTTCTGCGTTGTGTAAATT 51921020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GTTGAAAGCCAGCAAAGCAGTGGATGACCTCATTTTGCAAATTTCTGCGTTGTGTAAATT 1620

 51921021 TCATGATGCACTGCCAATACTTCATTTAAAATTTATAATATATGATATGTAGACTGAGTT 51921080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TCATGATGCACTGCCAATACTTCATTTAAAATTTATAATATATGATATGTAGACTGAGTT 1680

 51921081 GGGCACTCCTGGGAAATCCATGTATTAAATATTAGTTATGCTATTATTGATTCTTTAAAA 51921140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GGGCACTCCTGGGAAATCCATGTATTAAATATTAGTTATGCTATTATTGATTCTTTAAAA 1740

 51921141 TAATAATAAGGCCAGACTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAAGCAGGTGG 51921200
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TAATAATAAGGCCAGACTCACACCTGTTATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAAGCAGGTGG 1800

 51921201 ATCATCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAAAATGGTGAAACCCTGTCGCTAC 51921260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ATCATCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAAAATGGTGAAACCCTGTCGCTAC 1860

 51921261 TAAAAATACATAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCACACTCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGG 51921320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TAAAAATACATAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCACACTCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGG 1920

 51921321 AGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGGTTA 51921380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGGTTA 1980

 51921381 TGCCACTGCATCCCAGCCTGGGCGATAGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAAAATAAAATTAA 51921440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TGCCACTGCATCCCAGCCTGGGCGATAGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAAAATAAAATTAA 2040

 51921441 ATTAAAAATAAATAAATAAATAAATAGAATTAGAAATTCTAACATGTTCTCTCAGTACCA 51921500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ATTAAAAATAAATAAATAAATAAATAGAATTAGAAATTCTAACATGTTCTCTCAGTACCA 2100

 51921501 CAAGAAATTATTTGGAGAACCCACTAGAATACACACTTCTTGCTTGAGGAACCACTGGCC 51921560
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||
     2101 CAAGAAATTATTTGGAGAACCCACTAGAATGCACACATCTTGCTTGAGGAACCACTGGCC 2160

 51921561 TCAGGACATAGGCTTAAAGTAAATCAACAAAAATTAACTACATACATATAAGCATATCTT 51921620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TCAGGACATAGGCTTAAAGTAAATCAACAAAAATTAACTACATACATATAAGCATATCTT 2220

 51921621 CCTAATTTTTGCATTGCGTGACCTAACTATAATCTATAGCATATCTTTCCATGCCCAGAT 51921680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CCTAATTTTTGCATTGCGTGACCTAACTATAATCTATAGCATATCTTTCCATGCCCAGAT 2280

 51921681 CTATTTCTGAACTGTTATATGACATCTCCACACAGTTCATACTTGCTTTGACTATGACCT 51921740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CTATTTCTGAACTGTTATATGACATCTCCACACAGTTCATACTTGCTTTGACTATGACCT 2340

 51921741 AAATTCCTAGCCTGTTCCCTGGATAGTTTCTCAGTAGTGCAGGACTATAAATGCACAGTC 51921800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AAATTCCTAGCCTGTTCCCTGGATAGTTTCTCAGTAGTGCAGGACTATAAATGCACAGTC 2400

 51921801 ACTGTGTGTACAAGTTATATGGGAATATAACAAGTTATGTGTTAATAAAAGTTATTTAGA 51921860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     2401 ACTGTGTGTACAAGTTATATGGGAATATAACAAGTTATGTGTTAATAAAAATTATTTAGA 2460

 51921861 AATAAAACGAAAATTATAAACAATTTGTACTAATACTATATTTTTTCTGTTATACAACAT 51921920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AATAAAACGAAAATTATAAACAATTTGTACTAATACTATATTTTTTCTGTTATACAACAT 2520

 51921921 AGTGACATGAAAAACAAATATAATAATGGCTTAATTGTAAAGTATATAATAATAGTTTAT 51921980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 AGTGACATGAAAAACAAATATAATAATGGCTTAATTGTAAAGTATATAATAATAGTTTAT 2580

 51921981 CTGATTTGACCCTCCATATACTGTATGAGGGCCTTAAACCTCTTTCATGATACTTTCCAT 51922040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CTGATTTGACCCTCCATATACTGTATGAGGGCCTTAAACCTCTTTCATGATACTTTCCAT 2640

 51922041 CTAATTATGGCTATTGTCAGGGTGTGTCTGATGTATGCCTCAGGAAACATCCTCAGTCAC 51922100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CTAATTATGGCTATTGTCAGGGTGTGTCTGATGTATGCCTCAGGAAACATCCTCAGTCAC 2700

 51922101 CAGCTGGTATTAATAGTTTTGTCTCTCTGTTCTGATTCTTTTCATAATATTTGGAATTTT 51922160
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CAGCTGGTATTAATAGTTTTGTCTATCTGTTCTGATTCTTTTCATAATATTTGGAATTTT 2760

 51922161 GTCTTCCACTACCTGTACAAGGGCAAGGCAACTCATCTGTTACTAAGAGATAACTTGGCC 51922220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     2761 GTCTTCCACTACCTGTACAAGGGCAAGGCAACTCATCTGTTAGTAAGAGATAACTTGGCC 2820

 51922221 GGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTGTGGGAGGCTGAGGTGGGGGGATCAC 51922280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTGTGGGAGGCTGAGGTGGGGGGATCAC 2880

 51922281 TAGGTCAGGAGATCAAGACCATCGTGGCCAACATGGTGAAACCCGTCTCTACTAAAAATA 51922340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TAGGTCAGGAGATCAAGACCATCGTGGCCAACATGGTGAAACCCGTCTCTACTAAAAATA 2940

 51922341 CAAAAATTAGCCAGGCATGGTTGTGGGCACCTGTAATCCCACCTACTCGGGAGGCTGAGG 51922400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CAAAAATTAGCCAGGCATGGTTGTGGGCACCTGTAATCCCACCTACTCGGGAGGCTGAGG 3000

 51922401 CAGGAGAATAGCTTGAACCAGGGAGTTGGAGGTTACAGTGAGCCAAGATCACACCACTGC 51922460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CAGGAGAATAGCTTGAACCAGGGAGTTGGAGGTTACAGTGAGCCAAGATCACACCACTGC 3060

 51922461 ACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCCATCTCAAAAAAAAGATAGAGTTAACTTGAA 51922520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 ACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCCATCTCAAAAAAAAGATAGAGTTAACTTGAA 3120

 51922521 TTTACTTAAATCATAACTTGGGGGAATTTTACCATTAAATCATTATACAATATTTTTATT 51922580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TTTACTTAAATCATAACTTGGGGGAATTTTACCATTAAATCATTATACAATATTTTTATT 3180

 51922581 ACTCTGTTCAGAGTAATATACCAGAGTAAGTACCATTTTATAAGCTTCTATAGTTCAATG 51922640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 ACTCTGTTCAGAGTAATATACCAGAGTAAGTACCATTTTATAAGCTTCTATAGTTCAATG 3240

 51922641 GCATCTCCATGAAACTTATATAAGTAGCTTTTAATTAAAAATTAAAGTTTTTTTCAGAAA 51922700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 GCATCTCCATGAAACTTATATAAGTAGCTTTTAATTAAAAATTAAAGTTTTTTTCAGAAA 3300

 51922701 GAATTTTTTTGTTAATTGGTCATTATCCATTTATTGATTTCTTATGGCATGTTCAGCTTT 51922760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 GAATTTTTTTGTTAATTGGTCATTATCCATTTATTGATTTCTTATGGCATGTTCAGCTTT 3360

 51922761 ATTCATAAAATAGGCATCATCTAAAAGAATTGTAAGCATGAATTCCTTTTCAGTGTGTGG 51922820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 ATTCATAAAATAGGCATCATCTAAAAGAATTGTAAGCATGAATTCCTTTTCAGTGTGTGG 3420

 51922821 GCAGTGTAATTGGAGAGCCAAGAGAAATACAGAGGAAATTACTGATGCCAAAAATACATA 51922880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 GCAGTGTAATTGGAGAGCCAAGAGAAATACAGAGGAAATTACTGATGCCAAAAATACATA 3480

 51922881 AAATGTAATAGAGAAAATAGAATTGGAAACTCTTCTTGGTATACTCTCTTTCTTCATACT 51922940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 AAATGTAATAGAGAAAATAGAATTGGAAACTCTTCTTGGTATACTCTCTTTCTTCATACT 3540

 51922941 GAATCACATGGCTCGCTATCAGTTCAAATAGGAATTTTTAAGGAAGTCCTTTATGGATTT 51923000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 GAATCACATGGCTCGCTATCAGTTCAAATAGGAATTTTTAAGGAAGTCCTTTATGGATTT 3600

 51923001 CACCTCACTCCAATGTGTCCACACTCAGTGCTTTCTCAGGATAAAGAAACTCAATTCTAT 51923060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 CACCTCACTCCAATGTGTCCACACTCAGTGCTTTCTCAGGATAAAGAAACTCAATTCTAT 3660

 51923061 TACATAATTTTGTAAATTGTTTTCTTTTTCTTTGCCCACCATATTCTCATAAGGACACCT 51923120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 TACATAATTTTGTAAATTGTTTTCTTTTTCTTTGCCCACCATATTCTCATAAGGACACCT 3720

 51923121 TAAGCTCCTCAAAAGCACAAAACGCAAATTCTATTTCTTTGTCAACCCTCTCTCTAGTAA 51923180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 TAAGCTCCTCAAAAGCACAAAACGCAAATTCTATTTCTTTGTCAACCCTCTCTCTAGTAA 3780

 51923181 AGTTCTAGGTAAAGAATAAATGCATGACTGATTGTTTTAATGAGCGCTAATGGGTGTTGT 51923240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 AGTTCTAGGTAAAGAATAAATGCATGACTGATTGTTTTAATGAGCGCTAATGGGTGTTGT 3840

 51923241 TAAATCCCTTACTATCTGAGGAGATCGTTGCTTATGGCAGCCCCTGTGATTTTAAAAGCT 51923300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 TAAATCCCTTACTATCTGAGGAGATCGTTGCTTATGGCAGCCCCTGTGATTTTAAAAGCT 3900

 51923301 CTTCCATGTTGGAATAAAGGCAAAATACAGTGATTTCAAAGAACTGGGGAGAGAAATTTT 51923360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 CTTCCATGTTGGAATAAAGGCAAAATACAGTGATTTCAAAGAACTGGGGAGAGAAATTTT 3960

 51923361 AAGATTTCCTTTTGGGAAAATTTCAGGCAAAAAATTACATCTTATAATCCATTCCAGGCT 51923420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 AAGATTTCCTTTTGGGAAAATTTCAGGCAAAAAATTACATCTTATAATCCATTCCAGGCT 4020

 51923421 TTTGATTGTATGATTACCCCATTTACAATTGATGTTGAAAATAATATTTTCTCACTTGCC 51923480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 TTTGATTGTATGATTACCCCATTTACAATTGATGTTGAAAATAATATTTTCTCACTTGCC 4080

 51923481 ACAGCCTCTTCTTTGCATTCTCTCACCCTCAGCTATTATATATTAGCTCAGTACCTGCAT 51923540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 ACAGCCTCTTCTTTGCATTCTCTCACCCTCAGCTATTATATATTAGCTCAGTACCTGCAT 4140

 51923541 TATTTACAGGAACTGAAAAACAGGGTTGAAGATTATAAAATCTCACATTTGCTGACTTTT 51923600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 TATTTACAGGAACTGAAAAACAGGGTTGAAGATTATAAAATCTCACATTTGCTGACTTTT 4200

 51923601 ATGCAGGTTAAATGAAAGAGTTTTATAATTGTTTCTGCCAACCAGTAGGTTCAAAATGTT 51923660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 ATGCAGGTTAAATGAAAGAGTTTTATAATTGTTTCTGCCAACCAGTAGGTTCAAAATGTT 4260

 51923661 TATTAAAAGTGAATTCTGGATAAATTATGATTAATGTCCTTCTGGTTTGTTTTGCTTGAG 51923720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 TATTAAAAGTGAATTCTGGATAAATTATGATTAATGTCCTTCTGGTTTGTTTTGCTTGAG 4320

 51923721 CCTACACACACACACACACACACACACACACACACACACACATATACACACACATATATA 51923780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||
     4321 CCTACACACACACACACACACACACACACACACACACA----TATACACACACATATATA 4376

 51923781 TATAACTTTATATAAAACTATAAATACTAGGAACTAGCACTAGAACTGTACTTTTCACTA 51923840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4377 TATAACTTTATATAAAACTATAAATACTAGGAACTAGCACTAGAACTGTACTTTTCACTA 4436

 51923841 CAGTATCAGTAAAAAAAAAAAA-TTTAGGATTTTTTATGACTGATTTTACATTTAAACCT 51923899
          |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4437 CAGTATCAGTAAAAAAAAAAAAATTTAGGATTTTTTATGACTGATTTTACATTTAAACCT 4496

 51923900 AAAGGAAAAATAATCAGGAACAACACAGAGTTTTTTTTTTTAAATGAGTTGGCAAAGAAA 51923959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4497 AAAGGAAAAATAATCAGGAACAACACAGAGTTTTTTTTTTTAAATGAGTTGGCAAAGAAA 4556

 51923960 ATACCAAAGGCTCAAACCTGACAAAAGCATTGAGAATACCAGAAAAGAAATTTTAACCTT 51924019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4557 ATACCAAAGGCTCAAACCTGACAAAAGCATTGAGAATACCAGAAAAGAAATTTTAACCTT 4616

 51924020 TAAATTTAATTGAAACATGATATTTTTCTCTTTTGAAACATTTCTTTCTCTACAAAAATC 51924079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4617 TAAATTTAATTGAAACATGATATTTTTCTCTTTTGAAACATTTCTTTCTCTACAAAAATC 4676

 51924080 TGTTCCTTCAGAACCTGTTGATGCAATAATATTATATCATTTTTTTTTACTGGTCAATGT 51924139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4677 TGTTCCTTCAGAACCTGTTGATGCAATAATATTATATCATTTTTTTTTACTGGTCAATGT 4736

 51924140 ATTTATTTGTAATTGTTCTGAAATTGTTTCCTGCAAGGTTTTCTATTACTCAAACTGTCT 51924199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4737 ATTTATTTGTAATTGTTCTGAAATTGTTTCCTGCAAGGTTTTCTATTACTCAAACTGTCT 4796

 51924200 TTGTACACATAATTTTCCTTTCATGCCATTTATGAACCATTTTTTATTTCTATGGTTGAT 51924259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4797 TTGTACACATAATTTTCCTTTCATGCCATTTATGAACCATTTTTTATTTCTATGGTTGAT 4856

 51924260 AGAGAATGACTTCATAATTCATTTCTGAATAAGTGAAATAATTTAAAAACATTTTAAAGT 51924319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4857 AGAGAATGACTTCATAATTCATTTCTGAATAAGTGAAATAATTTAAAAACATTTTAAAGT 4916

 51924320 GGGTGTATCTACTTGCTTGGAGCTTTGTCGAATCATGTTTCTTATTTGGAGCCTCTGGAG 51924379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4917 GGGTGTATCTACTTGCTTGGAGCTTTGTCGAATCATGTTTCTTATTTGGAGCCTCTGGAG 4976

 51924380 GAATGTTGACTTACCATGGTAAAAATTAACTGGTGAAACTCTAAAGAAAACACAGACTCT 51924439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4977 GAATGTTGACTTACCATGGTAAAAATTAACTGGTGAAACTCTAAAGAAAACACAGACTCT 5036

 51924440 ACACGCAGTCTTGTCCGAAACTTACTCACCCTGAAACCAATGAATTTCAAAGACCTAGAT 51924499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5037 ACACGCAGTCTTGTCCGAAACTTACTCACCCTGAAACCAATGAATTTCAAAGACCTAGAT 5096

 51924500 ACTTCCTTCTGTGATGTCCCCTGAGATCAGAGAATAAAAGAAAAATCCCTCGTAAATATA 51924559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5097 ACTTCCTTCTGTGATGTCCCCTGAGATCAGAGAATAAAAGAAAAATCCCTCGTAAATATA 5156

 51924560 CATCACGTACAGCTGTTTGATTTATGCATTATGCAGAAACTAAGAAAACAGAGTTATATG 51924619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5157 CATCACGTACAGCTGTTTGATTTATGCATTATGCAGAAACTAAGAAAACAGAGTTATATG 5216

 51924620 TAACCTTGCAATGAGAAGTGCACCCACCAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCCCAAAACATTG 51924679
          ||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
     5217 TAACTTTGCAATGAGAAGTGCACCCACCAAAAAAAAAAAAAAAAAA-TCCCAAAACATTG 5275

 51924680 TTTCAAAAAGAAGTGGTATGAAGCATCTTAGTGTTTCATGAATATTGAAGAATAGTGCAA 51924739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5276 TTTCAAAAAGAAGTGGTATGAAGCATCTTAGTGTTTCATGAATATTGAAGAATAGTGCAA 5335

 51924740 TTATTGAAATTTGGCATTTAAAAAATGTTTTTAAATTATTAGGAAGCTACCGTGACCTGT 51924799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5336 TTATTGAAATTTGGCATTTAAAAAATGTTTTTAAATTATTAGGAAGCTACCGTGACCTGT 5395

 51924800 TTACTAAATCCTCAATTCTTTCTCTCTCAGTTTTTCTTACTATAAAATTTACTTTTCAAG 51924859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5396 TTACTAAATCCTCAATTCTTTCTCTCTCAGTTTTTCTTACTATAAAATTTACTTTTCAAG 5455

 51924860 CCAGAGAATTTTTCTTTCTGACAAGACGTAGATCTATATTGCGCTGTCAAGATGCAGCTT 51924919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5456 CCAGAGAATTTTTCTTTCTGACAAGACGTAGATCTATATTGCGCTGTCAAGATGCAGCTT 5515

 51924920 TTGCATCTCTGCTGCCATGTGGATAGAATAACTTTCTTTCCTCAAGAAGTGGACAAGCCC 51924979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5516 TTGCATCTCTGCTGCCATGTGGATAGAATAACTTTCTTTCCTCAAGAAGTGGACAAGCCC 5575

 51924980 TCATAGGGACTGATTTTCTGTGAAGTAGTGAGACTTAATCTTTGGGACCTTCACTTACAT 51925039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5576 TCATAGGGACTGATTTTCTGTGAAGTAGTGAGACTTAATCTTTGGGACCTTCACTTACAT 5635

 51925040 CACTTACATAGGACCTTTCAATACTCAGGGAGGGCCCTTGGCAATAAGTTCTTCTGACAA 51925099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5636 CACTTACATAGGACCTTTCAATACTCAGGGAGGGCCCTTGGCAATAAGTTCTTCTGACAA 5695

 51925100 TATATCTTGTGCTGATGGTGGTGTTAGCTTTCAAAATTTGTAATTATTTTGGTAATTTCT 51925159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5696 TATATCTTGTGCTGATGGTGGTGTTAGCTTTCAAAATTTGTAATTATTTTGGTAATTTCT 5755

 51925160 GTCATCCTAGAAAAATGTGTATAGTGTATTTGTTCCTAATTTCATTTTCATTATTTATAT 51925219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5756 GTCATCCTAGAAAAATGTGTATAGTGTATTTGTTCCTAATTTCATTTTCATTATTTATAT 5815

 51925220 ATTTTTTAATGAACACCCCCAGCATAGTATAAGTTTTATACCTCTACAATCTGAATCACC 51925279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5816 ATTTTTTAATGAACACCCCCAGCATAGTATAAGTTTTATACCTCTACAATCTGAATCACC 5875

 51925280 CGCTTGGCCCATGCCTAGGACTAGGTCTTATCATCCGCAGTGAGAGATTATAGGCTCTTA 51925339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5876 CGCTTGGCCCATGCCTAGGACTAGGTCTTATCATCCGCAGTGAGAGATTATAGGCTCTTA 5935

 51925340 CTAGGAATTTATGGTAACATGGGCTCCTAACAGTCATGATTTTTATAACATGATTGCCTA 51925399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5936 CTAGGAATTTATGGTAACATGGGCTCCTAACAGTCATGATTTTTATAACATGATTGCCTA 5995

 51925400 TGTATATAAAGTCCACTGGCTGAACAAGTATTTTCCCTCAAATCAGGAAGGAAAAAAAAA 51925459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5996 TGTATATAAAGTCCACTGGCTGAACAAGTATTTTCCCTCAAATCAGGAAGGAAAAAAAAA 6055

 51925460 AACACGAAGCAAATTGATCCTCTTCTAAAAGCTGTCACATCAGTAACCCATCATATTCTC 51925519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6056 AACACGAAGCAAATTGATCCTCTTCTAAAAGCTGTCACATCAGTAACCCATCATATTCTC 6115

 51925520 ATTTACTTATATACTGAGTAGGTAGTCACCTTTGATTCATATCTCTCAGGAGTTCAGAAG 51925579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6116 ATTTACTTATATACTGAGTAGGTAGTCACCTTTGATTCATATCTCTCAGGAGTTCAGAAG 6175

 51925580 TTTTTGAAAGTAATTTGTGATACAAAATATAGGGAAATTCAGAATGAGATTCTTTTGGCT 51925639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6176 TTTTTGAAAGTAATTTGTGATACAAAATATAGGGAAATTCAGAATGAGATTCTTTTGGCT 6235

 51925640 TGTCTTTCTTTTTCTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTATTTGTTGAACTCAAATCCGGAAA 51925699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6236 TGTCTTTCTTTTTCTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTATTTGTTGAACTCAAATCCGGAAA 6295

 51925700 TTGTGGAGGTTACTAGAACTCTAAGTCACAGACTTATAAGTACTGAAAAAGTAGTCAGTA 51925759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6296 TTGTGGAGGTTACTAGAACTCTAAGTCACAGACTTATAAGTACTGAAAAAGTAGTCAGTA 6355

 51925760 AAGAAAACATACAGTAAGAGACTAGGTTAATTTTCCTATAGTTCATTGATGTTTCCACTA 51925819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6356 AAGAAAACATACAGTAAGAGACTAGGTTAATTTTCCTATAGTTCATTGATGTTTCCACTA 6415

 51925820 TTACTGCCCCTGATTTTTAACTTTAGTTTTCCTTAGATTGTTGGAGTAATATATGTACCT 51925879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6416 TTACTGCCCCTGATTTTTAACTTTAGTTTTCCTTAGATTGTTGGAGTAATATATGTACCT 6475

 51925880 TAAAAATTAACTGTGGAACAAGTAGATGAACTTTTTACACAATTTCCTGCTTTTATAAAG 51925939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6476 TAAAAATTAACTGTGGAACAAGTAGATGAACTTTTTACACAATTTCCTGCTTTTATAAAG 6535

 51925940 TTCCTACTAGCTATATTTTCCCAAAAGTGCTCAACAATAGAGTCTGGTGCTAAAAAGCAG 51925999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6536 TTCCTACTAGCTATATTTTCCCAAAAGTGCTCAACAATAGAGTCTGGTGCTAAAAAGCAG 6595

 51926000 AGTAGGCTAAATTTAGATCAATGTGAAATGCCCTACTTATTTCCTATGAACTTAATTGAT 51926059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6596 AGTAGGCTAAATTTAGATCAATGTGAAATGCCCTACTTATTTCCTATGAACTTAATTGAT 6655

 51926060 TGAGCTCATTTTGGGGGTGTCTTTCTGATCGACCAGAAACTTGGCTCATTAGAGCAACTC 51926119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6656 TGAGCTCATTTTGGGGGTGTCTTTCTGATCGACCAGAAACTTGGCTCATTAGAGCAACTC 6715

 51926120 ACAAAGTGACCTTTTAAAAGAAAGAGTTTTCAATATATTTGTTCATGTTCCATTCCACTG 51926179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6716 ACAAAGTGACCTTTTAAAAGAAAGAGTTTTCAATATATTTGTTCATGTTCCATTCCACTG 6775

 51926180 AGAATGGTGCTATTTAAAACTAAATACAATAATTTTAGATATTGTACAGCAGATATAATT 51926239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6776 AGAATGGTGCTATTTAAAACTAAATACAATAATTTTAGATATTGTACAGCAGATATAATT 6835

 51926240 TTAAACATAATACATGGGATTTCGATTTTAGGTACTGTTTATAAGGCATTTCTCCTTATA 51926299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6836 TTAAACATAATACATGGGATTTCGATTTTAGGTACTGTTTATAAGGCATTTCTCCTTATA 6895

 51926300 TTATTCTAGACTTAAATATAACAAATTTCATGCAGAGGTTTCTTTCAAAAGTAAATTCAG 51926359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6896 TTATTCTAGACTTAAATATAACAAATTTCATGCAGAGGTTTCTTTCAAAAGTAAATTCAG 6955

 51926360 CCACATTTAGACTCAAATATTCCCTAATTTTTTAGTGTAGCTGAAGTCCTAATAATATAC 51926419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6956 CCACATTTAGACTCAAATATTCCCTAATTTTTTAGTGTAGCTGAAGTCCTAATAATATAC 7015

 51926420 TTGTGTTTCTTTTAAATTAAGTCCCACATGTTAACTTTACAACAGAAAGTCCATGTATCG 51926479
          |||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||||
     7016 TTGTGTTTCTTTTAAATTAAGTCCCACATGTCAACTTTACAGCAGAAAGTCCATGTATCG 7075

 51926480 TATTATTAGTCTAAATCTTCATTTTACTGTTTAGTTAACACAGACATTCATTTAACACAC 51926539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7076 TATTATTAGTCTAAATCTTCATTTTACTGTTTAGTTAACACAGACATTCATTTAACACAC 7135

 51926540 TATGTTTAATTTCCCACTCAGTTTTGGCTTATTGTAGTCTAATAA 51926584
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7136 TATGTTTAATTTCCCACTCAGTTTTGGCTTATTGTAGTCTAATAA 7180

EXCISED REGION

 51927768 ACATATAGTAAGTTGTCCATAAGTATTTGCTGGTAGATTTATTTATTTTTTAAAAAAACA 51927827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7181 ACATATAGTAAGTTGTCCATAAGTATTTGCTGGTAGATTTATTTATTTTTTAAAAAAACA 7240

 51927828 ACTTGGAAAGTTTTCTGTGTGCTTTTATATTAGAACTTGACCTTTGAAGTACCTCCAGGA 51927887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7241 ACTTGGAAAGTTTTCTGTGTGCTTTTATATTAGAACTTGACCTTTGAAGTACCTCCAGGA 7300

 51927888 AATTTTGAAGAGTGCTGGCATATGACAATGCGTAAGTTTATATTTCATGTCCATGCATGC 51927947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7301 AATTTTGAAGAGTGCTGGCATATGACAATGCGTAAGTTTATATTTCATGTCCATGCATGC 7360

 51927948 CATTAAAATTCTAATAATGTAGTTGACAGAGCCTTTCTTGTCCCTTAAGCACTAAATTTG 51928007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7361 CATTAAAATTCTAATAATGTAGTTGACAGAGCCTTTCTTGTCCCTTAAGCACTAAATTTG 7420

 51928008 TGGCTTGCTCTAGATTGTCCCACCTGGCACAAGCGAGGTGAAATTTCAGGTCTAGCCAAC 51928067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     7421 TGGCTTGCTCTAGATTGTCCCACCTGGCACAAGCTAGGTGAAATTTCAGGTCTAGCCAAC 7480

 51928068 TTTTTTCTTTTTTTTTTTTTAACAAGTATTAAAAACATTTTCATATATATTCCCTGTATT 51928127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7481 TTTTTTCTTTTTTTTTTTTTAACAAGTATTAAAAACATTTTCATATATATTCCCTGTATT 7540

 51928128 ATTTCACCTATTTTTGTGTGTGTGTTTCTATCACACTGCCACATCAAAAACCTCTTCTTG 51928187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7541 ATTTCACCTATTTTTGTGTGTGTGTTTCTATCACACTGCCACATCAAAAACCTCTTCTTG 7600

 51928188 AACGACTATAGTATAGTGGTTAATAGTTCAGTGTCTAGATCAAGACCACCTATGGACGTA 51928247
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7601 AACGACTATAGTATAGTGATTAATAGTTCAGTGTCTAGATCAAGACCACCTATGGACGTA 7660

 51928248 TCTTGGCTCTGATTTTACCAGCCGTACAATCCTGGAGAATCTGTTCAAGAGAAATGTGCC 51928307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7661 TCTTGGCTCTGATTTTACCAGCCGTACAATCCTGGAGAATCTGTTCAAGAGAAATGTGCC 7720

 51928308 TCAATTACGTATCTCTAAAGTAGTTGTAGCTATAGAACCTGTTCCATAGATGTGGATCAG 51928367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7721 TCAATTACGTATCTCTAAAGTAGTTGTAGCTATAGAACCTGTTCCATAGATGTGGATCAG 7780

 51928368 AACACTGCATGACATTTAGAAAATGTTTAATAAATGATGTTGCTGTACTTGTTGCTGTTA 51928427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7781 AACACTGCATGACATTTAGAAAATGTTTAATAAATGATGTTGCTGTACTTGTTGCTGTTA 7840

 51928428 TTGTTGCTCTGTCATGTTAGGAGAACTCTCATTTACCCTAGTGTTCTCTCAAAGTGAAAT 51928487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7841 TTGTTGCTCTGTCATGTTAGGAGAACTCTCATTTACCCTAGTGTTCTCTCAAAGTGAAAT 7900

 51928488 ACAGATCATTACCTCTTGAAATCATGTCCAAGTAACTTCAGAATTATTTAGAAATCATTT 51928547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7901 ACAGATCATTACCTCTTGAAATCATGTCCAAGTAACTTCAGAATTATTTAGAAATCATTT 7960

 51928548 ATCTAAATCAGAGTATTTCTTGATATAATTTAAAGTTGATTGTATTTGAAAGTACATATG 51928607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7961 ATCTAAATCAGAGTATTTCTTGATATAATTTAAAGTTGATTGTATTTGAAAGTACATATG 8020

 51928608 TCAATCTAGTATGAGATAATCTCAAGGAAATAAAAATGTATAGGTCTAATTTACATTTTT 51928667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8021 TCAATCTAGTATGAGATAATCTCAAGGAAATAAAAATGTATAGGTCTAATTTACATTTTT 8080

 51928668 ATATGGAAGGAGATAATTACTTTCTATCACAAATGATGAAGGCTGACGTTTGTTTCTTTT 51928727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8081 ATATGGAAGGAGATAATTACTTTCTATCACAAATGATGAAGGCTGACGTTTGTTTCTTTT 8140

 51928728 TTACTTTTAATTTTCACTTATATTTTGTTTATTATCAATATTTGCTTTTTAAAAGGTGGG 51928787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8141 TTACTTTTAATTTTCACTTATATTTTGTTTATTATCAATATTTGCTTTTTAAAAGGTGGG 8200

 51928788 AAGAAATCAACCAATCAAACATTAAAAAGCAATATGGAGGAGGGTGATATAATGCCCACT 51928847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8201 AAGAAATCAACCAATCAAACATTAAAAAGCAATATGGAGGAGGGTGATATAATGCCCACT 8260

 51928848 TATATTTCTCTTATAATTTTAAATATTTTCATAATTAACAGAATAATTAGCACTGGTAAT 51928907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8261 TATATTTCTCTTATAATTTTAAATATTTTCATAATTAACAGAATAATTAGCACTGGTAAT 8320

 51928908 ATTAAAATACCATCAAAAGAATCTAAATGTATGTGCTTTCTGTTGCAGCCTTGTTAGATG 51928967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8321 ATTAAAATACCATCAAAAGAATCTAAATGTATGTGCTTTCTGTTGCAGCCTTGTTAGATG 8380

 51928968 TTTCAGTGGATTCAAAGTGTTGTTATAAGAAAACGTGATTTATCAAGACTTTCATGTGTA 51929027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8381 TTTCAGTGGATTCAAAGTGTTGTTATAAGAAAACGTGATTTATCAAGACTTTCATGTGTA 8440

 51929028 AAATAAAAGGCATTTTCAATGACTACTTGGCCAGGCTTTCAGATTCCAATGCCAAGATGT 51929087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8441 AAATAAAAGGCATTTTCAATGACTACTTGGCCAGGCTTTCAGATTCCAATGCCAAGATGT 8500

 51929088 TGTATTTTGATATTGCAGTTTTCTAACAACAACAAAGTTGAGTGGACTTCTGGAACTAAA 51929147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8501 TGTATTTTGATATTGCAGTTTTCTAACAACAACAAAGTTGAGTGGACTTCTGGAACTAAA 8560

 51929148 ACTTAAATATTCAGAACTAATTATCACCACTCTATTTCTTACAGAGCATTTAAGGAACAC 51929207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8561 ACTTAAATATTCAGAACTAATTATCACCACTCTATTTCTTACAGAGCATTTAAGGAACAC 8620

 51929208 ATATATGCATATATCCTTGCACTTTGTGCTACAGGTTGTGAGCCAGGGTTACTTCCTTCT 51929267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8621 ATATATGCATATATCCTTGCACTTTGTGCTACAGGTTGTGAGCCAGGGTTACTTCCTTCT 8680

 51929268 GACCATGTGGGTTCATAATGAAGACCCAACCTTAAGGTACCCAGGGCTTAGAAATCAAAT 51929327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8681 GACCATGTGGGTTCATAATGAAGACCCAACCTTAAGGTACCCAGGGCTTAGAAATCAAAT 8740

 51929328 TTGTCCTTAGGACACTTTGGAAATCTATCTTGTAGTACAGGTGACCCAGCAGCAATCAAT 51929387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8741 TTGTCCTTAGGACACTTTGGAAATCTATCTTGTAGTACAGGTGACCCAGCAGCAATCAAT 8800

 51929388 CTTTCTGCCATCCCTAGTTTTAGTTCAGGACCCAGAAAAGTTGTAACTTGTTTCCTTTCC 51929447
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8801 CTTTCTGCCATCCCTAGTTTTACTTCAGGACCCAGAAAAGTTGTAACTTGTTTCCTTTCC 8860

 51929448 TGTGATCAAGCCTTTGTTTTCTCTTTTTTTCTCCACTTTTTGTAGCTTTTTAATTTGTTT 51929507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8861 TGTGATCAAGCCTTTGTTTTCTCTTTTTTTCTCCACTTTTTGTAGCTTTTTAATTTGTTT 8920

 51929508 CTCTGTTGATTACTAGCCCAATGCCTGAGCATCTTCGTCTTAAGACAAAGCCTCTGTGTT 51929567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8921 CTCTGTTGATTACTAGCCCAATGCCTGAGCATCTTCGTCTTAAGACAAAGCCTCTGTGTT 8980

 51929568 TCTTCAGCTCCTGAAATGACTGGCATGCTGAAAATGAGCTCAGGGCATTAGTCTTTGCTA 51929627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8981 TCTTCAGCTCCTGAAATGACTGGCATGCTGAAAATGAGCTCAGGGCATTAGTCTTTGCTA 9040

 51929628 CTAAGCCACTACAGATTCCATTCCCTTTCTTCTTGAGTATGCACACACCGCTTGTTCACA 51929687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     9041 CTAAGCCACTACAGATTCCATTCCCTTTCTTCCTGAGTATGCACACACCGCTTGTTCACA 9100

 51929688 GACTCCAGATTAGTTATTAAGCTACATCTGTATGCAGTTTGCACTCTCCTGCCTTCGACC 51929747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9101 GACTCCAGATTAGTTATTAAGCTACATCTGTATGCAGTTTGCACTCTCCTGCCTTCGACC 9160

 51929748 TGCTTGTCCCAGAAGTTATTCACCATATTCTACCTTGATCATATTTTCTACTTGTCAATG 51929807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9161 TGCTTGTCCCAGAAGTTATTCACCATATTCTACCTTGATCATATTTTCTACTTGTCAATG 9220

 51929808 CGCATGTCAATTAAGAACTTTTAACATTTATTGACCATTTATTATATACTAGCCAGTCTT 51929867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9221 CGCATGTCAATTAAGAACTTTTAACATTTATTGACCATTTATTATATACTAGCCAGTCTT 9280

 51929868 TTAATTGATTTATGAACAATTAACTTAATCATCATATAAGCATAGTAGGGTACAATTAGT 51929927
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9281 TTAATTGCTTTATGAACAATTAACTTAATCATCATATAAGCATAGTAGGGTACAATTAGT 9340

 51929928 TCCCCAACTTTATATATGAACAAATGGACTTTCAGAAAGGTAAGGTAAAATATCCACGGT 51929987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9341 TCCCCAACTTTATATATGAACAAATGGACTTTCAGAAAGGTAAGGTAAAATATCCACGGT 9400

 51929988 AAGAAAGCCTGCATATGTGGAACTGGGAATTGAACCCCTATGTCTGACCCGAGGGTCCAT 51930047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9401 AAGAAAGCCTGCATATGTGGAACTGGGAATTGAACCCCTATGTCTGACCCGAGGGTCCAT 9460

 51930048 ACACTTAAGCATTATGCTATCAAGTTTTCCACAGCCTGCTTTTCGGCTTCTCTCTCTTTC 51930107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9461 ACACTTAAGCATTATGCTATCAAGTTTTCCACAGCCTGCTTTTCGGCTTCTCTCTCTTTC 9520

 51930108 TTTCTTTCCTGATCTCTGTTGCAATTCCTACCTTTCAACTCCCTTCTGACCATGGATAGT 51930167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     9521 TTTCTTTCCTGATCTCTGTTGCAATTCCTACCTTTCAACTCCCTTCTGACCATGGACAGT 9580

 51930168 TTGCAAAATGCCAGAGGTACGTCTCAAAGAAGCTTCAAATAGGAGCGTGTACTACCATTA 51930227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9581 TTGCAAAATGCCAGAGGTACGTCTCAAAGAAGCTTCAAATAGGAGCGTGTACTACCATTA 9640

 51930228 AGTCAGCTCCTCAGTTGTCTTCTTTGGATTGAGAAGCACTTCATCACTTTTTACACAGGT 51930287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9641 AGTCAGCTCCTCAGTTGTCTTCTTTGGATTGAGAAGCACTTCATCACTTTTTACACAGGT 9700

 51930288 TTAATTA 51930294
          |||||||
     9701 TTAATTA 9707

Alignment time is 7.23033 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51916584,51937767] =>     21184 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [       1,    2527] =>      2527 nucs 'mol-32-2b13-104688_2527'

Score:        2471
Aligned:      2526        nucs
Identic:      2521 (100%) nucs =>       274 (100%)      2247 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51927768,51928041] EXCISED REGION [51928043,51930294]
 second seq =>  [       1,     274] EXCISED REGION [     276,    2527]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [51928042,51928042]
 second seq =>         1 nucs [275,275]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 51927768 ACATATAGTAAGTTGTCCATAAGTATTTGCTGGTAGATTTATTTATTTTTTAAAAAAACA 51927827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACATATAGTAAGTTGTCCATAAGTATTTGCTGGTAGATTTATTTATTTTTTAAAAAAACA 60

 51927828 ACTTGGAAAGTTTTCTGTGTGCTTTTATATTAGAACTTGACCTTTGAAGTACCTCCAGGA 51927887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACTTGGAAAGTTTTCTGTGTGCTTTTATATTAGAACTTGACCTTTGAAGTACCTCCAGGA 120

 51927888 AATTTTGAAGAGTGCTGGCATATGACAATGCGTAAGTTTATATTTCATGTCCATGCATGC 51927947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AATTTTGAAGAGTGCTGGCATATGACAATGCGTAAGTTTATATTTCATGTCCATGCATGC 180

 51927948 CATTAAAATTCTAATAATGTAGTTGACAGAGCCTTTCTTGTCCCTTAAGCACTAAATTTG 51928007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CATTAAAATTCTAATAATGTAGTTGACAGAGCCTTTCTTGTCCCTTAAGCACTAAATTTG 240

 51928008 TGGCTTGCTCTAGATTGTCCCACCTGGCACAAGC 51928041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGGCTTGCTCTAGATTGTCCCACCTGGCACAAGC 274

EXCISED REGION

 51928043 AGGTGAAATTTCAGGTCTAGCCAACTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTAACAAGTATTAAAAA 51928102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      276 AGGTGAAATTTCAGGTCTAGCCAACTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTAACAAGTATTAAAAA 335

 51928103 CATTTTCATATATATTCCCTGTATTATTTCACCTATTTTTGTGTGTGTGTTTCTATCACA 51928162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      336 CATTTTCATATATATTCCCTGTATTATTTCACCTATTTTTGTGTGTGTGTTTCTATCACA 395

 51928163 CTGCCACATCAAAAACCTCTTCTTGAACGACTATAGTATAGTGGTTAATAGTTCAGTGTC 51928222
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
      396 CTGCCACATCAAAAACCTCTTCTTGAACGACTATAGTATAGTGATTAATAGTTCAGTGTC 455

 51928223 TAGATCAAGACCACCTATGGACGTATCTTGGCTCTGATTTTACCAGCCGTACAATCCTGG 51928282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      456 TAGATCAAGACCACCTATGGACGTATCTTGGCTCTGATTTTACCAGCCGTACAATCCTGG 515

 51928283 AGAATCTGTTCAAGAGAAATGTGCCTCAATTACGTATCTCTAAAGTAGTTGTAGCTATAG 51928342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      516 AGAATCTGTTCAAGAGAAATGTGCCTCAATTACGTATCTCTAAAGTAGTTGTAGCTATAG 575

 51928343 AACCTGTTCCATAGATGTGGATCAGAACACTGCATGACATTTAGAAAATGTTTAATAAAT 51928402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      576 AACCTGTTCCATAGATGTGGATCAGAACACTGCATGACATTTAGAAAATGTTTAATAAAT 635

 51928403 GATGTTGCTGTACTTGTTGCTGTTATTGTTGCTCTGTCATGTTAGGAGAACTCTCATTTA 51928462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      636 GATGTTGCTGTACTTGTTGCTGTTATTGTTGCTCTGTCATGTTAGGAGAACTCTCATTTA 695

 51928463 CCCTAGTGTTCTCTCAAAGTGAAATACAGATCATTACCTCTTGAAATCATGTCCAAGTAA 51928522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      696 CCCTAGTGTTCTCTCAAAGTGAAATACAGATCATTACCTCTTGAAATCATGTCCAAGTAA 755

 51928523 CTTCAGAATTATTTAGAAATCATTTATCTAAATCAGAGTATTTCTTGATATAATTTAAAG 51928582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      756 CTTCAGAATTATTTAGAAATCATTTATCTAAATCAGAGTATTTCTTGATATAATTTAAAG 815

 51928583 TTGATTGTATTTGAAAGTACATATGTCAATCTAGTATGAGATAATCTCAAGGAAATAAAA 51928642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      816 TTGATTGTATTTGAAAGTACATATGTCAATCTAGTATGAGATAATCTCAAGGAAATAAAA 875

 51928643 ATGTATAGGTCTAATTTACATTTTTATATGGAAGGAGATAATTACTTTCTATCACAAATG 51928702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      876 ATGTATAGGTCTAATTTACATTTTTATATGGAAGGAGATAATTACTTTCTATCACAAATG 935

 51928703 ATGAAGGCTGACGTTTGTTTCTTTTTTACTTTTAATTTTCACTTATATTTTGTTTATTAT 51928762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      936 ATGAAGGCTGACGTTTGTTTCTTTTTTACTTTTAATTTTCACTTATATTTTGTTTATTAT 995

 51928763 CAATATTTGCTTTTTAAAAGGTGGGAAGAAATCAACCAATCAAACATTAAAAAGCAATAT 51928822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      996 CAATATTTGCTTTTTAAAAGGTGGGAAGAAATCAACCAATCAAACATTAAAAAGCAATAT 1055

 51928823 GGAGGAGGGTGATATAATGCCCACTTATATTTCTCTTATAATTTTAAATATTTTCATAAT 51928882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1056 GGAGGAGGGTGATATAATGCCCACTTATATTTCTCTTATAATTTTAAATATTTTCATAAT 1115

 51928883 TAACAGAATAATTAGCACTGGTAATATTAAAATACCATCAAAAGAATCTAAATGTATGTG 51928942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1116 TAACAGAATAATTAGCACTGGTAATATTAAAATACCATCAAAAGAATCTAAATGTATGTG 1175

 51928943 CTTTCTGTTGCAGCCTTGTTAGATGTTTCAGTGGATTCAAAGTGTTGTTATAAGAAAACG 51929002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1176 CTTTCTGTTGCAGCCTTGTTAGATGTTTCAGTGGATTCAAAGTGTTGTTATAAGAAAACG 1235

 51929003 TGATTTATCAAGACTTTCATGTGTAAAATAAAAGGCATTTTCAATGACTACTTGGCCAGG 51929062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1236 TGATTTATCAAGACTTTCATGTGTAAAATAAAAGGCATTTTCAATGACTACTTGGCCAGG 1295

 51929063 CTTTCAGATTCCAATGCCAAGATGTTGTATTTTGATATTGCAGTTTTCTAACAACAACAA 51929122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1296 CTTTCAGATTCCAATGCCAAGATGTTGTATTTTGATATTGCAGTTTTCTAACAACAACAA 1355

 51929123 AGTTGAGTGGACTTCTGGAACTAAAACTTAAATATTCAGAACTAATTATCACCACTCTAT 51929182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1356 AGTTGAGTGGACTTCTGGAACTAAAACTTAAATATTCAGAACTAATTATCACCACTCTAT 1415

 51929183 TTCTTACAGAGCATTTAAGGAACACATATATGCATATATCCTTGCACTTTGTGCTACAGG 51929242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1416 TTCTTACAGAGCATTTAAGGAACACATATATGCATATATCCTTGCACTTTGTGCTACAGG 1475

 51929243 TTGTGAGCCAGGGTTACTTCCTTCTGACCATGTGGGTTCATAATGAAGACCCAACCTTAA 51929302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1476 TTGTGAGCCAGGGTTACTTCCTTCTGACCATGTGGGTTCATAATGAAGACCCAACCTTAA 1535

 51929303 GGTACCCAGGGCTTAGAAATCAAATTTGTCCTTAGGACACTTTGGAAATCTATCTTGTAG 51929362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1536 GGTACCCAGGGCTTAGAAATCAAATTTGTCCTTAGGACACTTTGGAAATCTATCTTGTAG 1595

 51929363 TACAGGTGACCCAGCAGCAATCAATCTTTCTGCCATCCCTAGTTTTAGTTCAGGACCCAG 51929422
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     1596 TACAGGTGACCCAGCAGCAATCAATCTTTCTGCCATCCCTAGTTTTACTTCAGGACCCAG 1655

 51929423 AAAAGTTGTAACTTGTTTCCTTTCCTGTGATCAAGCCTTTGTTTTCTCTTTTTTTCTCCA 51929482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1656 AAAAGTTGTAACTTGTTTCCTTTCCTGTGATCAAGCCTTTGTTTTCTCTTTTTTTCTCCA 1715

 51929483 CTTTTTGTAGCTTTTTAATTTGTTTCTCTGTTGATTACTAGCCCAATGCCTGAGCATCTT 51929542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1716 CTTTTTGTAGCTTTTTAATTTGTTTCTCTGTTGATTACTAGCCCAATGCCTGAGCATCTT 1775

 51929543 CGTCTTAAGACAAAGCCTCTGTGTTTCTTCAGCTCCTGAAATGACTGGCATGCTGAAAAT 51929602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1776 CGTCTTAAGACAAAGCCTCTGTGTTTCTTCAGCTCCTGAAATGACTGGCATGCTGAAAAT 1835

 51929603 GAGCTCAGGGCATTAGTCTTTGCTACTAAGCCACTACAGATTCCATTCCCTTTCTTCTTG 51929662
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     1836 GAGCTCAGGGCATTAGTCTTTGCTACTAAGCCACTACAGATTCCATTCCCTTTCTTCCTG 1895

 51929663 AGTATGCACACACCGCTTGTTCACAGACTCCAGATTAGTTATTAAGCTACATCTGTATGC 51929722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1896 AGTATGCACACACCGCTTGTTCACAGACTCCAGATTAGTTATTAAGCTACATCTGTATGC 1955

 51929723 AGTTTGCACTCTCCTGCCTTCGACCTGCTTGTCCCAGAAGTTATTCACCATATTCTACCT 51929782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1956 AGTTTGCACTCTCCTGCCTTCGACCTGCTTGTCCCAGAAGTTATTCACCATATTCTACCT 2015

 51929783 TGATCATATTTTCTACTTGTCAATGCGCATGTCAATTAAGAACTTTTAACATTTATTGAC 51929842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2016 TGATCATATTTTCTACTTGTCAATGCGCATGTCAATTAAGAACTTTTAACATTTATTGAC 2075

 51929843 CATTTATTATATACTAGCCAGTCTTTTAATTGATTTATGAACAATTAACTTAATCATCAT 51929902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     2076 CATTTATTATATACTAGCCAGTCTTTTAATTGCTTTATGAACAATTAACTTAATCATCAT 2135

 51929903 ATAAGCATAGTAGGGTACAATTAGTTCCCCAACTTTATATATGAACAAATGGACTTTCAG 51929962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2136 ATAAGCATAGTAGGGTACAATTAGTTCCCCAACTTTATATATGAACAAATGGACTTTCAG 2195

 51929963 AAAGGTAAGGTAAAATATCCACGGTAAGAAAGCCTGCATATGTGGAACTGGGAATTGAAC 51930022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2196 AAAGGTAAGGTAAAATATCCACGGTAAGAAAGCCTGCATATGTGGAACTGGGAATTGAAC 2255

 51930023 CCCTATGTCTGACCCGAGGGTCCATACACTTAAGCATTATGCTATCAAGTTTTCCACAGC 51930082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2256 CCCTATGTCTGACCCGAGGGTCCATACACTTAAGCATTATGCTATCAAGTTTTCCACAGC 2315

 51930083 CTGCTTTTCGGCTTCTCTCTCTTTCTTTCTTTCCTGATCTCTGTTGCAATTCCTACCTTT 51930142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2316 CTGCTTTTCGGCTTCTCTCTCTTTCTTTCTTTCCTGATCTCTGTTGCAATTCCTACCTTT 2375

 51930143 CAACTCCCTTCTGACCATGGATAGTTTGCAAAATGCCAGAGGTACGTCTCAAAGAAGCTT 51930202
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2376 CAACTCCCTTCTGACCATGGACAGTTTGCAAAATGCCAGAGGTACGTCTCAAAGAAGCTT 2435

 51930203 CAAATAGGAGCGTGTACTACCATTAAGTCAGCTCCTCAGTTGTCTTCTTTGGATTGAGAA 51930262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2436 CAAATAGGAGCGTGTACTACCATTAAGTCAGCTCCTCAGTTGTCTTCTTTGGATTGAGAA 2495

 51930263 GCACTTCATCACTTTTTACACAGGTTTAATTA 51930294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||
     2496 GCACTTCATCACTTTTTACACAGGTTTAATTA 2527

Alignment time is 1.90305 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51916584,51937767] =>     21184 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [       1,    6019] =>      6019 nucs 'mol-32-2b55-155263_6019'

Score:        5921
Aligned:      6019        nucs
Identic:      6006 (100%) nucs =>       529 (100%)      5477 (100%)
Gaps:            8 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51921001,51921530] EXCISED REGION [51921538,51927025]
 second seq =>  [       1,     530] EXCISED REGION [     538,    6019]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         7 nucs [51921531,51921537]
 second seq =>         7 nucs [531,537]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         6 nucs [51923724,51923729]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [51921530,51921530] to [51921537,51921537]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [51921530,51921530] to [51921538,51921538]
 second seq =>         1 nucs [530,530] to [538,538]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 51921001 ATTTCTGCGTTGTGTAAATTTCATGATGCACTGCCAATACTTCATTTAAAATTTATAATA 51921060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATTTCTGCGTTGTGTAAATTTCATGATGCACTGCCAATACTTCATTTAAAATTTATAATA 60

 51921061 TATGATATGTAGACTGAGTTGGGCACTCCTGGGAAATCCATGTATTAAATATTAGTTATG 51921120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TATGATATGTAGACTGAGTTGGGCACTCCTGGGAAATCCATGTATTAAATATTAGTTATG 120

 51921121 CTATTATTGATTCTTTAAAATAATAATAAGGCCAGACTCACACCTGTAATCCCAGCACTT 51921180
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
      121 CTATTATTGATTCTTTAAAATAATAATAAGGCCAGACTCACACCTGTTATCCCAGCACTT 180

 51921181 TGGGAGGCCAAAGCAGGTGGATCATCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAAAA 51921240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGGGAGGCCAAAGCAGGTGGATCATCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAAAA 240

 51921241 TGGTGAAACCCTGTCGCTACTAAAAATACATAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCACACTCC 51921300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGGTGAAACCCTGTCGCTACTAAAAATACATAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCACACTCC 300

 51921301 TGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCGGAG 51921360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCGGAG 360

 51921361 GTTGCAGTGAGCCAAGGTTATGCCACTGCATCCCAGCCTGGGCGATAGAGTGAGACTCTG 51921420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTTGCAGTGAGCCAAGGTTATGCCACTGCATCCCAGCCTGGGCGATAGAGTGAGACTCTG 420

 51921421 TCTCAAAAAAATAAAATTAAATTAAAAATAAATAAATAAATAAATAGAATTAGAAATTCT 51921480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCTCAAAAAAATAAAATTAAATTAAAAATAAATAAATAAATAAATAGAATTAGAAATTCT 480

 51921481 AACATGTTCTCTCAGTACCACAAGAAATTATTTGGAGAACCCACTAGAAT 51921530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AACATGTTCTCTCAGTACCACAAGAAATTATTTGGAGAACCCACTAGAAT 530

EXCISED REGION

 51921538 TCTTGCTTGAGGAACCACTGGCCTCAGGACATAGGCTTAAAGTAAATCAACAAAAATTAA 51921597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      538 TCTTGCTTGAGGAACCACTGGCCTCAGGACATAGGCTTAAAGTAAATCAACAAAAATTAA 597

 51921598 CTACATACATATAAGCATATCTTCCTAATTTTTGCATTGCGTGACCTAACTATAATCTAT 51921657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      598 CTACATACATATAAGCATATCTTCCTAATTTTTGCATTGCGTGACCTAACTATAATCTAT 657

 51921658 AGCATATCTTTCCATGCCCAGATCTATTTCTGAACTGTTATATGACATCTCCACACAGTT 51921717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      658 AGCATATCTTTCCATGCCCAGATCTATTTCTGAACTGTTATATGACATCTCCACACAGTT 717

 51921718 CATACTTGCTTTGACTATGACCTAAATTCCTAGCCTGTTCCCTGGATAGTTTCTCAGTAG 51921777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      718 CATACTTGCTTTGACTATGACCTAAATTCCTAGCCTGTTCCCTGGATAGTTTCTCAGTAG 777

 51921778 TGCAGGACTATAAATGCACAGTCACTGTGTGTACAAGTTATATGGGAATATAACAAGTTA 51921837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      778 TGCAGGACTATAAATGCACAGTCACTGTGTGTACAAGTTATATGGGAATATAACAAGTTA 837

 51921838 TGTGTTAATAAAAGTTATTTAGAAATAAAACGAAAATTATAAACAATTTGTACTAATACT 51921897
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      838 TGTGTTAATAAAAATTATTTAGAAATAAAACGAAAATTATAAACAATTTGTACTAATACT 897

 51921898 ATATTTTTTCTGTTATACAACATAGTGACATGAAAAACAAATATAATAATGGCTTAATTG 51921957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      898 ATATTTTTTCTGTTATACAACATAGTGACATGAAAAACAAATATAATAATGGCTTAATTG 957

 51921958 TAAAGTATATAATAATAGTTTATCTGATTTGACCCTCCATATACTGTATGAGGGCCTTAA 51922017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      958 TAAAGTATATAATAATAGTTTATCTGATTTGACCCTCCATATACTGTATGAGGGCCTTAA 1017

 51922018 ACCTCTTTCATGATACTTTCCATCTAATTATGGCTATTGTCAGGGTGTGTCTGATGTATG 51922077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1018 ACCTCTTTCATGATACTTTCCATCTAATTATGGCTATTGTCAGGGTGTGTCTGATGTATG 1077

 51922078 CCTCAGGAAACATCCTCAGTCACCAGCTGGTATTAATAGTTTTGTCTCTCTGTTCTGATT 51922137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1078 CCTCAGGAAACATCCTCAGTCACCAGCTGGTATTAATAGTTTTGTCTCTCTGTTCTGATT 1137

 51922138 CTTTTCATAATATTTGGAATTTTGTCTTCCACTACCTGTACAAGGGCAAGGCAACTCATC 51922197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1138 CTTTTCATAATATTTGGAATTTTGTCTTCCACTACCTGTACAAGGGCAAGGCAACTCATC 1197

 51922198 TGTTACTAAGAGATAACTTGGCCGGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTGTG 51922257
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1198 TGTTAGTAAGAGATAACTTGGCCGGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTGTG 1257

 51922258 GGAGGCTGAGGTGGGGGGATCACTAGGTCAGGAGATCAAGACCATCGTGGCCAACATGGT 51922317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1258 GGAGGCTGAGGTGGGGGGATCACTAGGTCAGGAGATCAAGACCATCGTGGCCAACATGGT 1317

 51922318 GAAACCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTTGTGGGCACCTGTAAT 51922377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1318 GAAACCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTTGTGGGCACCTGTAAT 1377

 51922378 CCCACCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATAGCTTGAACCAGGGAGTTGGAGGTTACA 51922437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1378 CCCACCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATAGCTTGAACCAGGGAGTTGGAGGTTACA 1437

 51922438 GTGAGCCAAGATCACACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCCATCTCAA 51922497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1438 GTGAGCCAAGATCACACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCCATCTCAA 1497

 51922498 AAAAAAGATAGAGTTAACTTGAATTTACTTAAATCATAACTTGGGGGAATTTTACCATTA 51922557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1498 AAAAAAGATAGAGTTAACTTGAATTTACTTAAATCATAACTTGGGGGAATTTTACCATTA 1557

 51922558 AATCATTATACAATATTTTTATTACTCTGTTCAGAGTAATATACCAGAGTAAGTACCATT 51922617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1558 AATCATTATACAATATTTTTATTACTCTGTTCAGAGTAATATACCAGAGTAAGTACCATT 1617

 51922618 TTATAAGCTTCTATAGTTCAATGGCATCTCCATGAAACTTATATAAGTAGCTTTTAATTA 51922677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1618 TTATAAGCTTCTATAGTTCAATGGCATCTCCATGAAACTTATATAAGTAGCTTTTAATTA 1677

 51922678 AAAATTAAAGTTTTTTTCAGAAAGAATTTTTTTGTTAATTGGTCATTATCCATTTATTGA 51922737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1678 AAAATTAAAGTTTTTTTCAGAAAGAATTTTTTTGTTAATTGGTCATTATCCATTTATTGA 1737

 51922738 TTTCTTATGGCATGTTCAGCTTTATTCATAAAATAGGCATCATCTAAAAGAATTGTAAGC 51922797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1738 TTTCTTATGGCATGTTCAGCTTTATTCATAAAATAGGCATCATCTAAAAGAATTGTAAGC 1797

 51922798 ATGAATTCCTTTTCAGTGTGTGGGCAGTGTAATTGGAGAGCCAAGAGAAATACAGAGGAA 51922857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1798 ATGAATTCCTTTTCAGTGTGTGGGCAGTGTAATTGGAGAGCCAAGAGAAATACAGAGGAA 1857

 51922858 ATTACTGATGCCAAAAATACATAAAATGTAATAGAGAAAATAGAATTGGAAACTCTTCTT 51922917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1858 ATTACTGATGCCAAAAATACATAAAATGTAATAGAGAAAATAGAATTGGAAACTCTTCTT 1917

 51922918 GGTATACTCTCTTTCTTCATACTGAATCACATGGCTCGCTATCAGTTCAAATAGGAATTT 51922977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1918 GGTATACTCTCTTTCTTCATACTGAATCACATGGCTCGCTATCAGTTCAAATAGGAATTT 1977

 51922978 TTAAGGAAGTCCTTTATGGATTTCACCTCACTCCAATGTGTCCACACTCAGTGCTTTCTC 51923037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1978 TTAAGGAAGTCCTTTATGGATTTCACCTCACTCCAATGTGTCCACACTCAGTGCTTTCTC 2037

 51923038 AGGATAAAGAAACTCAATTCTATTACATAATTTTGTAAATTGTTTTCTTTTTCTTTGCCC 51923097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2038 AGGATAAAGAAACTCAATTCTATTACATAATTTTGTAAATTGTTTTCTTTTTCTTTGCCC 2097

 51923098 ACCATATTCTCATAAGGACACCTTAAGCTCCTCAAAAGCACAAAACGCAAATTCTATTTC 51923157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2098 ACCATATTCTCATAAGGACACCTTAAGCTCCTCAAAAGCACAAAACGCAAATTCTATTTC 2157

 51923158 TTTGTCAACCCTCTCTCTAGTAAAGTTCTAGGTAAAGAATAAATGCATGACTGATTGTTT 51923217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2158 TTTGTCAACCCTCTCTCTAGTAAAGTTCTAGGTAAAGAATAAATGCATGACTGATTGTTT 2217

 51923218 TAATGAGCGCTAATGGGTGTTGTTAAATCCCTTACTATCTGAGGAGATCGTTGCTTATGG 51923277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2218 TAATGAGCGCTAATGGGTGTTGTTAAATCCCTTACTATCTGAGGAGATCGTTGCTTATGG 2277

 51923278 CAGCCCCTGTGATTTTAAAAGCTCTTCCATGTTGGAATAAAGGCAAAATACAGTGATTTC 51923337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2278 CAGCCCCTGTGATTTTAAAAGCTCTTCCATGTTGGAATAAAGGCAAAATACAGTGATTTC 2337

 51923338 AAAGAACTGGGGAGAGAAATTTTAAGATTTCCTTTTGGGAAAATTTCAGGCAAAAAATTA 51923397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2338 AAAGAACTGGGGAGAGAAATTTTAAGATTTCCTTTTGGGAAAATTTCAGGCAAAAAATTA 2397

 51923398 CATCTTATAATCCATTCCAGGCTTTTGATTGTATGATTACCCCATTTACAATTGATGTTG 51923457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2398 CATCTTATAATCCATTCCAGGCTTTTGATTGTATGATTACCCCATTTACAATTGATGTTG 2457

 51923458 AAAATAATATTTTCTCACTTGCCACAGCCTCTTCTTTGCATTCTCTCACCCTCAGCTATT 51923517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2458 AAAATAATATTTTCTCACTTGCCACAGCCTCTTCTTTGCATTCTCTCACCCTCAGCTATT 2517

 51923518 ATATATTAGCTCAGTACCTGCATTATTTACAGGAACTGAAAAACAGGGTTGAAGATTATA 51923577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2518 ATATATTAGCTCAGTACCTGCATTATTTACAGGAACTGAAAAACAGGGTTGAAGATTATA 2577

 51923578 AAATCTCACATTTGCTGACTTTTATGCAGGTTAAATGAAAGAGTTTTATAATTGTTTCTG 51923637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2578 AAATCTCACATTTGCTGACTTTTATGCAGGTTAAATGAAAGAGTTTTATAATTGTTTCTG 2637

 51923638 CCAACCAGTAGGTTCAAAATGTTTATTAAAAGTGAATTCTGGATAAATTATGATTAATGT 51923697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2638 CCAACCAGTAGGTTCAAAATGTTTATTAAAAGTGAATTCTGGATAAATTATGATTAATGT 2697

 51923698 CCTTCTGGTTTGTTTTGCTTGAGCCTACACACACACACACACACACACACACACACACAC 51923757
          ||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||
     2698 CCTTCTGGTTTGTTTTGCTTGAGCCT------ACACACACACACACACACACACACACAC 2751

 51923758 ACACATATACACACACATATATATATAACTTTATATAAAACTATAAATACTAGGAACTAG 51923817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2752 ACACATATACACACACATATATATATAACTTTATATAAAACTATAAATACTAGGAACTAG 2811

 51923818 CACTAGAACTGTACTTTTCACTACAGTATCAGT-AAAAAAAAAAAATTTAGGATTTTTTA 51923876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
     2812 CACTAGAACTGTACTTTTCACTACAGTATCAGTAAAAAAAAAAAAATTTAGGATTTTTTA 2871

 51923877 TGACTGATTTTACATTTAAACCTAAAGGAAAAATAATCAGGAACAACACAGAGTTTTTTT 51923936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2872 TGACTGATTTTACATTTAAACCTAAAGGAAAAATAATCAGGAACAACACAGAGTTTTTTT 2931

 51923937 TTTTAAATGAGTTGGCAAAGAAAATACCAAAGGCTCAAACCTGACAAAAGCATTGAGAAT 51923996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2932 TTTTAAATGAGTTGGCAAAGAAAATACCAAAGGCTCAAACCTGACAAAAGCATTGAGAAT 2991

 51923997 ACCAGAAAAGAAATTTTAACCTTTAAATTTAATTGAAACATGATATTTTTCTCTTTTGAA 51924056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2992 ACCAGAAAAGAAATTTTAACCTTTAAATTTAATTGAAACATGATATTTTTCTCTTTTGAA 3051

 51924057 ACATTTCTTTCTCTACAAAAATCTGTTCCTTCAGAACCTGTTGATGCAATAATATTATAT 51924116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3052 ACATTTCTTTCTCTACAAAAATCTGTTCCTTCAGAACCTGTTGATGCAATAATATTATAT 3111

 51924117 CATTTTTTTTTACTGGTCAATGTATTTATTTGTAATTGTTCTGAAATTGTTTCCTGCAAG 51924176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3112 CATTTTTTTTTACTGGTCAATGTATTTATTTGTAATTGTTCTGAAATTGTTTCCTGCAAG 3171

 51924177 GTTTTCTATTACTCAAACTGTCTTTGTACACATAATTTTCCTTTCATGCCATTTATGAAC 51924236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3172 GTTTTCTATTACTCAAACTGTCTTTGTACACATAATTTTCCTTTCATGCCATTTATGAAC 3231

 51924237 CATTTTTTATTTCTATGGTTGATAGAGAATGACTTCATAATTCATTTCTGAATAAGTGAA 51924296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3232 CATTTTTTATTTCTATGGTTGATAGAGAATGACTTCATAATTCATTTCTGAATAAGTGAA 3291

 51924297 ATAATTTAAAAACATTTTAAAGTGGGTGTATCTACTTGCTTGGAGCTTTGTCGAATCATG 51924356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3292 ATAATTTAAAAACATTTTAAAGTGGGTGTATCTACTTGCTTGGAGCTTTGTCGAATCATG 3351

 51924357 TTTCTTATTTGGAGCCTCTGGAGGAATGTTGACTTACCATGGTAAAAATTAACTGGTGAA 51924416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3352 TTTCTTATTTGGAGCCTCTGGAGGAATGTTGACTTACCATGGTAAAAATTAACTGGTGAA 3411

 51924417 ACTCTAAAGAAAACACAGACTCTACACGCAGTCTTGTCCGAAACTTACTCACCCTGAAAC 51924476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3412 ACTCTAAAGAAAACACAGACTCTACACGCAGTCTTGTCCGAAACTTACTCACCCTGAAAC 3471

 51924477 CAATGAATTTCAAAGACCTAGATACTTCCTTCTGTGATGTCCCCTGAGATCAGAGAATAA 51924536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3472 CAATGAATTTCAAAGACCTAGATACTTCCTTCTGTGATGTCCCCTGAGATCAGAGAATAA 3531

 51924537 AAGAAAAATCCCTCGTAAATATACATCACGTACAGCTGTTTGATTTATGCATTATGCAGA 51924596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3532 AAGAAAAATCCCTCGTAAATATACATCACGTACAGCTGTTTGATTTATGCATTATGCAGA 3591

 51924597 AACTAAGAAAACAGAGTTATATGTAACCTTGCAATGAGAAGTGCACCCACCAAAAAAAAA 51924656
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||| ||||||||
     3592 AACTAAGAAAACAGAGTTATATGTAACTTTGCAATGAGAAGTGCACCCACC-AAAAAAAA 3650

 51924657 AAAAAAAAAATCCCAAAACATTGTTTCAAAAAGAAGTGGTATGAAGCATCTTAGTGTTTC 51924716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3651 AAAAAAAAAATCCCAAAACATTGTTTCAAAAAGAAGTGGTATGAAGCATCTTAGTGTTTC 3710

 51924717 ATGAATATTGAAGAATAGTGCAATTATTGAAATTTGGCATTTAAAAAATGTTTTTAAATT 51924776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3711 ATGAATATTGAAGAATAGTGCAATTATTGAAATTTGGCATTTAAAAAATGTTTTTAAATT 3770

 51924777 ATTAGGAAGCTACCGTGACCTGTTTACTAAATCCTCAATTCTTTCTCTCTCAGTTTTTCT 51924836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3771 ATTAGGAAGCTACCGTGACCTGTTTACTAAATCCTCAATTCTTTCTCTCTCAGTTTTTCT 3830

 51924837 TACTATAAAATTTACTTTTCAAGCCAGAGAATTTTTCTTTCTGACAAGACGTAGATCTAT 51924896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3831 TACTATAAAATTTACTTTTCAAGCCAGAGAATTTTTCTTTCTGACAAGACGTAGATCTAT 3890

 51924897 ATTGCGCTGTCAAGATGCAGCTTTTGCATCTCTGCTGCCATGTGGATAGAATAACTTTCT 51924956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3891 ATTGCGCTGTCAAGATGCAGCTTTTGCATCTCTGCTGCCATGTGGATAGAATAACTTTCT 3950

 51924957 TTCCTCAAGAAGTGGACAAGCCCTCATAGGGACTGATTTTCTGTGAAGTAGTGAGACTTA 51925016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3951 TTCCTCAAGAAGTGGACAAGCCCTCATAGGGACTGATTTTCTGTGAAGTAGTGAGACTTA 4010

 51925017 ATCTTTGGGACCTTCACTTACATCACTTACATAGGACCTTTCAATACTCAGGGAGGGCCC 51925076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4011 ATCTTTGGGACCTTCACTTACATCACTTACATAGGACCTTTCAATACTCAGGGAGGGCCC 4070

 51925077 TTGGCAATAAGTTCTTCTGACAATATATCTTGTGCTGATGGTGGTGTTAGCTTTCAAAAT 51925136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4071 TTGGCAATAAGTTCTTCTGACAATATATCTTGTGCTGATGGTGGTGTTAGCTTTCAAAAT 4130

 51925137 TTGTAATTATTTTGGTAATTTCTGTCATCCTAGAAAAATGTGTATAGTGTATTTGTTCCT 51925196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4131 TTGTAATTATTTTGGTAATTTCTGTCATCCTAGAAAAATGTGTATAGTGTATTTGTTCCT 4190

 51925197 AATTTCATTTTCATTATTTATATATTTTTTAATGAACACCCCCAGCATAGTATAAGTTTT 51925256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4191 AATTTCATTTTCATTATTTATATATTTTTTAATGAACACCCCCAGCATAGTATAAGTTTT 4250

 51925257 ATACCTCTACAATCTGAATCACCCGCTTGGCCCATGCCTAGGACTAGGTCTTATCATCCG 51925316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4251 ATACCTCTACAATCTGAATCACCCGCTTGGCCCATGCCTAGGACTAGGTCTTATCATCCG 4310

 51925317 CAGTGAGAGATTATAGGCTCTTACTAGGAATTTATGGTAACATGGGCTCCTAACAGTCAT 51925376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4311 CAGTGAGAGATTATAGGCTCTTACTAGGAATTTATGGTAACATGGGCTCCTAACAGTCAT 4370

 51925377 GATTTTTATAACATGATTGCCTATGTATATAAAGTCCACTGGCTGAACAAGTATTTTCCC 51925436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4371 GATTTTTATAACATGATTGCCTATGTATATAAAGTCCACTGGCTGAACAAGTATTTTCCC 4430

 51925437 TCAAATCAGGAAGGAAAAAAAAAAACACGAAGCAAATTGATCCTCTTCTAAAAGCTGTCA 51925496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4431 TCAAATCAGGAAGGAAAAAAAAAAACACGAAGCAAATTGATCCTCTTCTAAAAGCTGTCA 4490

 51925497 CATCAGTAACCCATCATATTCTCATTTACTTATATACTGAGTAGGTAGTCACCTTTGATT 51925556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4491 CATCAGTAACCCATCATATTCTCATTTACTTATATACTGAGTAGGTAGTCACCTTTGATT 4550

 51925557 CATATCTCTCAGGAGTTCAGAAGTTTTTGAAAGTAATTTGTGATACAAAATATAGGGAAA 51925616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4551 CATATCTCTCAGGAGTTCAGAAGTTTTTGAAAGTAATTTGTGATACAAAATATAGGGAAA 4610

 51925617 TTCAGAATGAGATTCTTTTGGCTTGTCTTTCTTTTTCTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTA 51925676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4611 TTCAGAATGAGATTCTTTTGGCTTGTCTTTCTTTTTCTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTA 4670

 51925677 TTTGTTGAACTCAAATCCGGAAATTGTGGAGGTTACTAGAACTCTAAGTCACAGACTTAT 51925736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4671 TTTGTTGAACTCAAATCCGGAAATTGTGGAGGTTACTAGAACTCTAAGTCACAGACTTAT 4730

 51925737 AAGTACTGAAAAAGTAGTCAGTAAAGAAAACATACAGTAAGAGACTAGGTTAATTTTCCT 51925796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4731 AAGTACTGAAAAAGTAGTCAGTAAAGAAAACATACAGTAAGAGACTAGGTTAATTTTCCT 4790

 51925797 ATAGTTCATTGATGTTTCCACTATTACTGCCCCTGATTTTTAACTTTAGTTTTCCTTAGA 51925856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4791 ATAGTTCATTGATGTTTCCACTATTACTGCCCCTGATTTTTAACTTTAGTTTTCCTTAGA 4850

 51925857 TTGTTGGAGTAATATATGTACCTTAAAAATTAACTGTGGAACAAGTAGATGAACTTTTTA 51925916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4851 TTGTTGGAGTAATATATGTACCTTAAAAATTAACTGTGGAACAAGTAGATGAACTTTTTA 4910

 51925917 CACAATTTCCTGCTTTTATAAAGTTCCTACTAGCTATATTTTCCCAAAAGTGCTCAACAA 51925976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4911 CACAATTTCCTGCTTTTATAAAGTTCCTACTAGCTATATTTTCCCAAAAGTGCTCAACAA 4970

 51925977 TAGAGTCTGGTGCTAAAAAGCAGAGTAGGCTAAATTTAGATCAATGTGAAATGCCCTACT 51926036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4971 TAGAGTCTGGTGCTAAAAAGCAGAGTAGGCTAAATTTAGATCAATGTGAAATGCCCTACT 5030

 51926037 TATTTCCTATGAACTTAATTGATTGAGCTCATTTTGGGGGTGTCTTTCTGATCGACCAGA 51926096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5031 TATTTCCTATGAACTTAATTGATTGAGCTCATTTTGGGGGTGTCTTTCTGATCGACCAGA 5090

 51926097 AACTTGGCTCATTAGAGCAACTCACAAAGTGACCTTTTAAAAGAAAGAGTTTTCAATATA 51926156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5091 AACTTGGCTCATTAGAGCAACTCACAAAGTGACCTTTTAAAAGAAAGAGTTTTCAATATA 5150

 51926157 TTTGTTCATGTTCCATTCCACTGAGAATGGTGCTATTTAAAACTAAATACAATAATTTTA 51926216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5151 TTTGTTCATGTTCCATTCCACTGAGAATGGTGCTATTTAAAACTAAATACAATAATTTTA 5210

 51926217 GATATTGTACAGCAGATATAATTTTAAACATAATACATGGGATTTCGATTTTAGGTACTG 51926276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5211 GATATTGTACAGCAGATATAATTTTAAACATAATACATGGGATTTCGATTTTAGGTACTG 5270

 51926277 TTTATAAGGCATTTCTCCTTATATTATTCTAGACTTAAATATAACAAATTTCATGCAGAG 51926336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5271 TTTATAAGGCATTTCTCCTTATATTATTCTAGACTTAAATATAACAAATTTCATGCAGAG 5330

 51926337 GTTTCTTTCAAAAGTAAATTCAGCCACATTTAGACTCAAATATTCCCTAATTTTTTAGTG 51926396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5331 GTTTCTTTCAAAAGTAAATTCAGCCACATTTAGACTCAAATATTCCCTAATTTTTTAGTG 5390

 51926397 TAGCTGAAGTCCTAATAATATACTTGTGTTTCTTTTAAATTAAGTCCCACATGTTAACTT 51926456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5391 TAGCTGAAGTCCTAATAATATACTTGTGTTTCTTTTAAATTAAGTCCCACATGTTAACTT 5450

 51926457 TACAACAGAAAGTCCATGTATCGTATTATTAGTCTAAATCTTCATTTTACTGTTTAGTTA 51926516
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5451 TACAGCAGAAAGTCCATGTATCGTATTATTAGTCTAAATCTTCATTTTACTGTTTAGTTA 5510

 51926517 ACACAGACATTCATTTAACACACTATGTTTAATTTCCCACTCAGTTTTGGCTTATTGTAG 51926576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5511 ACACAGACATTCATTTAACACACTATGTTTAATTTCCCACTCAGTTTTGGCTTATTGTAG 5570

 51926577 TCTAATAAACAATGATTAAACAATGCCCCACTTAATGCAGGTTGAGAAATAAGTGAAACT 51926636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5571 TCTAATAAACAATGATTAAACAATGCCCCACTTAATGCAGGTTGAGAAATAAGTGAAACT 5630

 51926637 ATGACATGGAAAAATATTACAATAAGCGAAAAATATTACAATAAAGGAAAAAATAATGGA 51926696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5631 ATGACATGGAAAAATATTACAATAAGCGAAAAATATTACAATAAAGGAAAAAATAATGGA 5690

 51926697 AGAATATCAGTATTTGATGCTATTATACGTGACCATATTGTTTAGCAAACTACTTCAAAA 51926756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5691 AGAATATCAGTATTTGATGCTATTATACGTGACCATATTGTTTAGCAAACTACTTCAAAA 5750

 51926757 ATGAAATTAGGAATTTCAGAGAATCATTTTATTCTCATATCAGAATGCTTGGAAAAGTGA 51926816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5751 ATGAAATTAGGAATTTCAGAGAATCATTTTATTCTCATATCAGAATGCTTGGAAAAGTGA 5810

 51926817 GGGCTAAATGTATTTGTTATTTGACTGTGTACATTATGCCCATGGAATAGCATTTTGGAA 51926876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5811 GGGCTAAATGTATTTGTTATTTGACTGTGTACATTATGCCCATGGAATAGCATTTTGGAA 5870

 51926877 GACCCAACATTAAGCTAGCTTTACATAACAATGAGTATGTCATGTTAACTTATGATACAC 51926936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5871 GACCCAACATTAAGCTAGCTTTACATAACAATGAGTATGTCATGTTAACTTATGATACAC 5930

 51926937 TTTAATCCTGGCTTGACTCTGGTAGCTGTGTGACTATAATCTTTCAGGCCTCCATTTACT 51926996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5931 TTTAATCCTGGCTTGACTCTGGTAGCTGTGTGACTATAATCTTTCAGGCCTCCATTTACT 5990

 51926997 TATCCAGAAAGTGGAAATAATAATATGTA 51927025
          |||||||||||||||||||||||||||||
     5991 TATCCAGAAAGTGGAAATAATAATATGTA 6019

Alignment time is 4.49432 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51916584,51937767] =>     21184 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [       1,    2839] =>      2839 nucs 'mol-32-2edb-101433_2839'

Score:        2786
Aligned:      2841        nucs
Identic:      2836 (100%) nucs =>       104 (100%)      2732 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51923747,51923850] EXCISED REGION [51923851,51926587]
 second seq =>  [       1,     104] EXCISED REGION [     106,    2839]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [105,105]
ALTERNATIVE REGION(S): 2
 first  seq =>         1 nucs [51924624,51924624]
 second seq =>         1 nucs [878,878]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        12 nucs [105,116] to [106,117]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 51923747 CACACACACACACACATATACACACACATATATATATAACTTTATATAAAACTATAAATA 51923806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CACACACACACACACATATACACACACATATATATATAACTTTATATAAAACTATAAATA 60

 51923807 CTAGGAACTAGCACTAGAACTGTACTTTTCACTACAGTATCAGT 51923850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTAGGAACTAGCACTAGAACTGTACTTTTCACTACAGTATCAGT 104

EXCISED REGION

 51923851 AAAAAAAAAAAATTTAGGATTTTTTATGACTGATTTTACATTTAAACCTAAAGGAAAAAT 51923910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      106 AAAAAAAAAAAATTTAGGATTTTTTATGACTGATTTTACATTTAAACCTAAAGGAAAAAT 165

 51923911 AATCAGGAACAACACAGAGTTTTTTTTTTTAAATGAGTTGGCAAAGAAAATACCAAAGGC 51923970
          ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      166 AATCAGGAACAACACAGAG-TTTTTTTTTTAAATGAGTTGGCAAAGAAAATACCAAAGGC 224

 51923971 TCAAACCTGACAAAAGCATTGAGAATACCAGAAAAGAAATTTTAACCTTTAAATTTAATT 51924030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      225 TCAAACCTGACAAAAGCATTGAGAATACCAGAAAAGAAATTTTAACCTTTAAATTTAATT 284

 51924031 GAAACATGATATTTTTCTCTTTTGAAACATTTCTTTCTCTACAAAAATCTGTTCCTTCAG 51924090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      285 GAAACATGATATTTTTCTCTTTTGAAACATTTCTTTCTCTACAAAAATCTGTTCCTTCAG 344

 51924091 AACCTGTTGATGCAATAATATTATATCATTTTTTTTTACTGGTCAATGTATTTATTTGTA 51924150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      345 AACCTGTTGATGCAATAATATTATATCATTTTTTTTTACTGGTCAATGTATTTATTTGTA 404

 51924151 ATTGTTCTGAAATTGTTTCCTGCAAGGTTTTCTATTACTCAAACTGTCTTTGTACACATA 51924210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      405 ATTGTTCTGAAATTGTTTCCTGCAAGGTTTTCTATTACTCAAACTGTCTTTGTACACATA 464

 51924211 ATTTTCCTTTCATGCCATTTATGAACCATTTTTTATTTCTATGGTTGATAGAGAATGACT 51924270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      465 ATTTTCCTTTCATGCCATTTATGAACCATTTTTTATTTCTATGGTTGATAGAGAATGACT 524

 51924271 TCATAATTCATTTCTGAATAAGTGAAATAATTTAAAAACATTTTAAAGTGGGTGTATCTA 51924330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      525 TCATAATTCATTTCTGAATAAGTGAAATAATTTAAAAACATTTTAAAGTGGGTGTATCTA 584

 51924331 CTTGCTTGGAGCTTTGTCGAATCATGTTTCTTATTTGGAGCCTCTGGAGGAATGTTGACT 51924390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      585 CTTGCTTGGAGCTTTGTCGAATCATGTTTCTTATTTGGAGCCTCTGGAGGAATGTTGACT 644

 51924391 TACCATGGTAAAAATTAACTGGTGAAACTCTAAAGAAAACACAGACTCTACACGCAGTCT 51924450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      645 TACCATGGTAAAAATTAACTGGTGAAACTCTAAAGAAAACACAGACTCTACACGCAGTCT 704

 51924451 TGTCCGAAACTTACTCACCCTGAAACCAATGAATTTCAAAGACCTAGATACTTCCTTCTG 51924510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      705 TGTCCGAAACTTACTCACCCTGAAACCAATGAATTTCAAAGACCTAGATACTTCCTTCTG 764

 51924511 TGATGTCCCCTGAGATCAGAGAATAAAAGAAAAATCCCTCGTAAATATACATCACGTACA 51924570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      765 TGATGTCCCCTGAGATCAGAGAATAAAAGAAAAATCCCTCGTAAATATACATCACGTACA 824

 51924571 GCTGTTTGATTTATGCATTATGCAGAAACTAAGAAAACAGAGTTATATGTAACCTTGCAA 51924630
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
      825 GCTGTTTGATTTATGCATTATGCAGAAACTAAGAAAACAGAGTTATATGTAACTTTGCAA 884

 51924631 TGAGAAGTGCACCCACCAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCCCAAAACATTGTTTCAAAAAGA 51924690
          ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      885 TGAGAAGTGCACCCACC-AAAAAAAAAAAAAAAAAATCCCAAAACATTGTTTCAAAAAGA 943

 51924691 AGTGGTATGAAGCATCTTAGTGTTTCATGAATATTGAAGAATAGTGCAATTATTGAAATT 51924750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      944 AGTGGTATGAAGCATCTTAGTGTTTCATGAATATTGAAGAATAGTGCAATTATTGAAATT 1003

 51924751 TGGCATTTAAAAAATGTTTTTAAATTATTAGGAAGCTACCGTGACCTGTTTACTAAATCC 51924810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1004 TGGCATTTAAAAAATGTTTTTAAATTATTAGGAAGCTACCGTGACCTGTTTACTAAATCC 1063

 51924811 TCAATTCTTTCTCTCTCAGTTTTTCTTACTATAAAATTTACTTTTCAAGCCAGAGAATTT 51924870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1064 TCAATTCTTTCTCTCTCAGTTTTTCTTACTATAAAATTTACTTTTCAAGCCAGAGAATTT 1123

 51924871 TTCTTTCTGACAAGACGTAGATCTATATTGCGCTGTCAAGATGCAGCTTTTGCATCTCTG 51924930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1124 TTCTTTCTGACAAGACGTAGATCTATATTGCGCTGTCAAGATGCAGCTTTTGCATCTCTG 1183

 51924931 CTGCCATGTGGATAGAATAACTTTCTTTCCTCAAGAAGTGGACAAGCCCTCATAGGGACT 51924990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1184 CTGCCATGTGGATAGAATAACTTTCTTTCCTCAAGAAGTGGACAAGCCCTCATAGGGACT 1243

 51924991 GATTTTCTGTGAAGTAGTGAGACTTAATCTTTGGGACCTTCACTTACATCACTTACATAG 51925050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1244 GATTTTCTGTGAAGTAGTGAGACTTAATCTTTGGGACCTTCACTTACATCACTTACATAG 1303

 51925051 GACCTTTCAATACTCAGGGAGGGCCCTTGGCAATAAGTTCTTCTGACAATATATCTTGTG 51925110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1304 GACCTTTCAATACTCAGGGAGGGCCCTTGGCAATAAGTTCTTCTGACAATATATCTTGTG 1363

 51925111 CTGATGGTGGTGTTAGCTTTCAAAATTTGTAATTATTTTGGTAATTTCTGTCATCCTAGA 51925170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1364 CTGATGGTGGTGTTAGCTTTCAAAATTTGTAATTATTTTGGTAATTTCTGTCATCCTAGA 1423

 51925171 AAAATGTGTATAGTGTATTTGTTCCTAATTTCATTTTCATTATTTATATATTTTTTAATG 51925230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1424 AAAATGTGTATAGTGTATTTGTTCCTAATTTCATTTTCATTATTTATATATTTTTTAATG 1483

 51925231 AACACCCCCAGCATAGTATAAGTTTTATACCTCTACAATCTGAATCACCCGCTTGGCCCA 51925290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1484 AACACCCCCAGCATAGTATAAGTTTTATACCTCTACAATCTGAATCACCCGCTTGGCCCA 1543

 51925291 TGCCTAGGACTAGGTCTTATCATCCGCAGTGAGAGATTATAGGCTCTTACTAGGAATTTA 51925350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1544 TGCCTAGGACTAGGTCTTATCATCCGCAGTGAGAGATTATAGGCTCTTACTAGGAATTTA 1603

 51925351 TGGTAACATGGGCTCCTAACAGTCATGATTTTTATAACATGATTGCCTATGTATATAAAG 51925410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1604 TGGTAACATGGGCTCCTAACAGTCATGATTTTTATAACATGATTGCCTATGTATATAAAG 1663

 51925411 TCCACTGGCTGAACAAGTATTTTCCCTCAAATCAGGAAGGAAAAAAAAAAACACGAAGCA 51925470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1664 TCCACTGGCTGAACAAGTATTTTCCCTCAAATCAGGAAGGAAAAAAAAAAACACGAAGCA 1723

 51925471 AATTGATCCTCTTCTAAAAGCTGTCACATCAGTAACCCATCATATTCTCATTTACTTATA 51925530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1724 AATTGATCCTCTTCTAAAAGCTGTCACATCAGTAACCCATCATATTCTCATTTACTTATA 1783

 51925531 TACTGAGTAGGTAGTCACCTTTGATTCATATCTCTCAGGAGTTCAGAAGTTTTTGAAAGT 51925590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1784 TACTGAGTAGGTAGTCACCTTTGATTCATATCTCTCAGGAGTTCAGAAGTTTTTGAAAGT 1843

 51925591 AATTTGTGATACAAAATATAGGGAAATTCAGAATGAGATTCTTTTGGCTTGTCTTTCTTT 51925650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1844 AATTTGTGATACAAAATATAGGGAAATTCAGAATGAGATTCTTTTGGCTTGTCTTTCTTT 1903

 51925651 TTCTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTATTTGTTGAACTCAAATCCGGAAATTGTGGAGGTT 51925710
          ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1904 TTCTTTTTTTC-TTTTTTTTTTTTTATTTGTTGAACTCAAATCCGGAAATTGTGGAGGTT 1962

 51925711 ACTAGAACTCTAAGTCACAGACTTATAAGTACTGAAAAAGTAGTCAGTAAAGAAAACATA 51925770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1963 ACTAGAACTCTAAGTCACAGACTTATAAGTACTGAAAAAGTAGTCAGTAAAGAAAACATA 2022

 51925771 CAGTAAGAGACTAGGTTAATTTTCCTATAGTTCATTGATGTTTCCACTATTACTGCCCCT 51925830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2023 CAGTAAGAGACTAGGTTAATTTTCCTATAGTTCATTGATGTTTCCACTATTACTGCCCCT 2082

 51925831 GATTTTTAACTTTAGTTTTCCTTAGATTGTTGGAGTAATATATGTACCTTAAAAATTAAC 51925890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2083 GATTTTTAACTTTAGTTTTCCTTAGATTGTTGGAGTAATATATGTACCTTAAAAATTAAC 2142

 51925891 TGTGGAACAAGTAGATGAACTTTTTACACAATTTCCTGCTTTTATAAAGTTCCTACTAGC 51925950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2143 TGTGGAACAAGTAGATGAACTTTTTACACAATTTCCTGCTTTTATAAAGTTCCTACTAGC 2202

 51925951 TATATTTTCCCAAAAGTGCTCAACAATAGAGTCTGGTGCTAAAAAGCAGAGTAGGCTAAA 51926010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2203 TATATTTTCCCAAAAGTGCTCAACAATAGAGTCTGGTGCTAAAAAGCAGAGTAGGCTAAA 2262

 51926011 TTTAGATCAATGTGAAATGCCCTACTTATTTCCTATGAACTTAATTGATTGAGCTCATTT 51926070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2263 TTTAGATCAATGTGAAATGCCCTACTTATTTCCTATGAACTTAATTGATTGAGCTCATTT 2322

 51926071 TGGGGGTGTCTTTCTGATCGACCAGAAACTTGGCTCATTAGAGCAACTCACAAAGTGACC 51926130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2323 TGGGGGTGTCTTTCTGATCGACCAGAAACTTGGCTCATTAGAGCAACTCACAAAGTGACC 2382

 51926131 TTTTAAAAGAAAGAGTTTTCAATATATTTGTTCATGTTCCATTCCACTGAGAATGGTGCT 51926190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2383 TTTTAAAAGAAAGAGTTTTCAATATATTTGTTCATGTTCCATTCCACTGAGAATGGTGCT 2442

 51926191 ATTTAAAACTAAATACAATAATTTTAGATATTGTACAGCAGATATAATTTTAAACATAAT 51926250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2443 ATTTAAAACTAAATACAATAATTTTAGATATTGTACAGCAGATATAATTTTAAACATAAT 2502

 51926251 ACATGGGATTTCGATTTTAGGTACTGTTTATAAGGCATTTCTCCTTATATTATTCTAGAC 51926310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2503 ACATGGGATTTCGATTTTAGGTACTGTTTATAAGGCATTTCTCCTTATATTATTCTAGAC 2562

 51926311 TTAAATATAACAAATTTCATGCAGAGGTTTCTTTCAAAAGTAAATTCAGCCACATTTAGA 51926370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2563 TTAAATATAACAAATTTCATGCAGAGGTTTCTTTCAAAAGTAAATTCAGCCACATTTAGA 2622

 51926371 CTCAAATATTCCCTAATTTTTTAGTGTAGCTGAAGTCCTAATAATATACTTGTGTTTCTT 51926430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2623 CTCAAATATTCCCTAATTTTTTAGTGTAGCTGAAGTCCTAATAATATACTTGTGTTTCTT 2682

 51926431 TTAAATTAAGTCCCACATGTTAACTTTACAACAGAAAGTCCATGTATCGTATTATTAGTC 51926490
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     2683 TTAAATTAAGTCCCACATGTTAACTTTACAGCAGAAAGTCCATGTATCGTATTATTAGTC 2742

 51926491 TAAATCTTCATTTTACTGTTTAGTTAACACAGACATTCATTTAACACACTATGTTTAATT 51926550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2743 TAAATCTTCATTTTACTGTTTAGTTAACACAGACATTCATTTAACACACTATGTTTAATT 2802

 51926551 TCCCACTCAGTTTTGGCTTATTGTAGTCTAATAAACA 51926587
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2803 TCCCACTCAGTTTTGGCTTATTGTAGTCTAATAAACA 2839

Alignment time is 2.74664 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51916584,51937767] =>     21184 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [       1,    3765] =>      3765 nucs 'mol-32-2ee6-126267_3765'

Score:        3665
Aligned:      3764        nucs
Identic:      3755 (100%) nucs =>       579 (100%)      3176 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51927116,51927694] EXCISED REGION [51927696,51930880]
 second seq =>  [       1,     579] EXCISED REGION [     581,    3765]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [51927695,51927695]
 second seq =>         1 nucs [580,580]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [51927694,51927694] to [51927696,51927696]
 second seq =>         1 nucs [579,579] to [581,581]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 51927116 TAAGCACTCATATATGAATGTGTGTACATATTTATCGTAAACAGATCCTCAGTAATTAGT 51927175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TAAGCACTCATATATGAATGTGTGTACATATTTATCGTAAACAGATCCTCAGTAATTAGT 60

 51927176 GTAGAAATAAATGTTCTAGACAATCCAAAGTTATTTAAAGTTTTTCAGAAAGCTACCCTT 51927235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTAGAAATAAATGTTCTAGACAATCCAAAGTTATTTAAAGTTTTTCAGAAAGCTACCCTT 120

 51927236 CTATCATCTGGGGTAATTTTTTTTGTCATTTTGGCAAATATGTAGAGAATATATGTGAGT 51927295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTATCATCTGGGGTAATTTTTTTTGTCATTTTGGCAAATATGTAGAGAATATATGTGAGT 180

 51927296 CTTCCTATTAGTCTGAAGTAAGCAAAACTATAAAGGCACATTTATCGAGGTGGAATGTGA 51927355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTTCCTATTAGTCTGAAGTAAGCAAAACTATAAAGGCACATTTATCGAGGTGGAATGTGA 240

 51927356 AAAACAACAATCATTTTAACGTAAATCTATGATACTTTGGTCTCTTCCAGTGTCCAGGTA 51927415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAAACAACAATCATTTTAACGTAAATCTATGATACTTTGGTCTCTTCCAGTGTCCAGGTA 300

 51927416 ACTTATGCCACAACTTTCTTCTATCTTTGTTAATAATACAGTGTGTTTTATACCTGTGGG 51927475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACTTATGCCACAACTTTCTTCTATCTTTGTTAATAATACAGTGTGTTTTATACCTGTGGG 360

 51927476 CACTAACATTTTGTTACTATTTGTAGTAATGCTACTGCATTACTGATATGAGAATAAAAT 51927535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CACTAACATTTTGTTACTATTTGTAGTAATGCTACTGCATTACTGATATGAGAATAAAAT 420

 51927536 GATTCTCTGAAATTCCTAATTTCATTTTTGAAGTAATTTGCTAAACAATATGGTCACGTA 51927595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GATTCTCTGAAATTCCTAATTTCATTTTTGAAGTAATTTGCTAAACAATATGGTCACGTA 480

 51927596 TAATAGCATCAAATATTGATATTCTTCCATTATTTTTTCCTTTATTGTAATATTTTTCAC 51927655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TAATAGCATCAAATATTGATATTCTTCCATTATTTTTTCCTTTATTGTAATATTTTTCAC 540

 51927656 TTATTGTAATATTTTTCCATGTCATAGTTTCACTTATTT 51927694
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTATTGTAATATTTTTCCATGTCATAGTTTCACTTATTT 579

EXCISED REGION

 51927696 TCAACATACTATGTATCCATGAATGTCCTGAAGGGAAAAAAAAATCTCATATATACCTAA 51927755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      581 TCAACATACTATGTATCCATGAATGTCCTGAAGGGAAAAAAAAATCTCATATATACCTAA 640

 51927756 CTGATGTGCTTGACATATAGTAAGTTGTCCATAAGTATTTGCTGGTAGATTTATTTATTT 51927815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      641 CTGATGTGCTTGACATATAGTAAGTTGTCCATAAGTATTTGCTGGTAGATTTATTTATTT 700

 51927816 TTTAAAAAAACAACTTGGAAAGTTTTCTGTGTGCTTTTATATTAGAACTTGACCTTTGAA 51927875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      701 TTTAAAAAAACAACTTGGAAAGTTTTCTGTGTGCTTTTATATTAGAACTTGACCTTTGAA 760

 51927876 GTACCTCCAGGAAATTTTGAAGAGTGCTGGCATATGACAATGCGTAAGTTTATATTTCAT 51927935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      761 GTACCTCCAGGAAATTTTGAAGAGTGCTGGCATATGACAATGCGTAAGTTTATATTTCAT 820

 51927936 GTCCATGCATGCCATTAAAATTCTAATAATGTAGTTGACAGAGCCTTTCTTGTCCCTTAA 51927995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      821 GTCCATGCATGCCATTAAAATTCTAATAATGTAGTTGACAGAGCCTTTCTTGTCCCTTAA 880

 51927996 GCACTAAATTTGTGGCTTGCTCTAGATTGTCCCACCTGGCACAAGCGAGGTGAAATTTCA 51928055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
      881 GCACTAAATTTGTGGCTTGCTCTAGATTGTCCCACCTGGCACAAGCTAGGTGAAATTTCA 940

 51928056 GGTCTAGCCAACTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTAACAAGTATTAAAAACATTTTCATATAT 51928115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      941 GGTCTAGCCAACTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTAACAAGTATTAAAAACATTTTCATATAT 1000

 51928116 ATTCCCTGTATTATTTCACCTATTTTTGTGTGTGTGTTTCTATCACACTGCCACATCAAA 51928175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1001 ATTCCCTGTATTATTTCACCTATTTTTGTGTGTGTGTTTCTATCACACTGCCACATCAAA 1060

 51928176 AACCTCTTCTTGAACGACTATAGTATAGTGGTTAATAGTTCAGTGTCTAGATCAAGACCA 51928235
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     1061 AACCTCTTCTTGAACGACTATAGTATAGTGATTAATAGTTCAGTGTCTAGATCAAGACCA 1120

 51928236 CCTATGGACGTATCTTGGCTCTGATTTTACCAGCCGTACAATCCTGGAGAATCTGTTCAA 51928295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1121 CCTATGGACGTATCTTGGCTCTGATTTTACCAGCCGTACAATCCTGGAGAATCTGTTCAA 1180

 51928296 GAGAAATGTGCCTCAATTACGTATCTCTAAAGTAGTTGTAGCTATAGAACCTGTTCCATA 51928355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1181 GAGAAATGTGCCTCAATTACGTATCTCTAAAGTAGTTGTAGCTATAGAACCTGTTCCATA 1240

 51928356 GATGTGGATCAGAACACTGCATGACATTTAGAAAATGTTTAATAAATGATGTTGCTGTAC 51928415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1241 GATGTGGATCAGAACACTGCATGACATTTAGAAAATGTTTAATAAATGATGTTGCTGTAC 1300

 51928416 TTGTTGCTGTTATTGTTGCTCTGTCATGTTAGGAGAACTCTCATTTACCCTAGTGTTCTC 51928475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1301 TTGTTGCTGTTATTGTTGCTCTGTCATGTTAGGAGAACTCTCATTTACCCTAGTGTTCTC 1360

 51928476 TCAAAGTGAAATACAGATCATTACCTCTTGAAATCATGTCCAAGTAACTTCAGAATTATT 51928535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1361 TCAAAGTGAAATACAGATCATTACCTCTTGAAATCATGTCCAAGTAACTTCAGAATTATT 1420

 51928536 TAGAAATCATTTATCTAAATCAGAGTATTTCTTGATATAATTTAAAGTTGATTGTATTTG 51928595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1421 TAGAAATCATTTATCTAAATCAGAGTATTTCTTGATATAATTTAAAGTTGATTGTATTTG 1480

 51928596 AAAGTACATATGTCAATCTAGTATGAGATAATCTCAAGGAAATAAAAATGTATAGGTCTA 51928655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1481 AAAGTACATATGTCAATCTAGTATGAGATAATCTCAAGGAAATAAAAATGTATAGGTCTA 1540

 51928656 ATTTACATTTTTATATGGAAGGAGATAATTACTTTCTATCACAAATGATGAAGGCTGACG 51928715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1541 ATTTACATTTTTATATGGAAGGAGATAATTACTTTCTATCACAAATGATGAAGGCTGACG 1600

 51928716 TTTGTTTCTTTTTTACTTTTAATTTTCACTTATATTTTGTTTATTATCAATATTTGCTTT 51928775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1601 TTTGTTTCTTTTTTACTTTTAATTTTCACTTATATTTTGTTTATTATCAATATTTGCTTT 1660

 51928776 TTAAAAGGTGGGAAGAAATCAACCAATCAAACATTAAAAAGCAATATGGAGGAGGGTGAT 51928835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1661 TTAAAAGGTGGGAAGAAATCAACCAATCAAACATTAAAAAGCAATATGGAGGAGGGTGAT 1720

 51928836 ATAATGCCCACTTATATTTCTCTTATAATTTTAAATATTTTCATAATTAACAGAATAATT 51928895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1721 ATAATGCCCACTTATATTTCTCTTATAATTTTAAATATTTTCATAATTAACAGAATAATT 1780

 51928896 AGCACTGGTAATATTAAAATACCATCAAAAGAATCTAAATGTATGTGCTTTCTGTTGCAG 51928955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1781 AGCACTGGTAATATTAAAATACCATCAAAAGAATCTAAATGTATGTGCTTTCTGTTGCAG 1840

 51928956 CCTTGTTAGATGTTTCAGTGGATTCAAAGTGTTGTTATAAGAAAACGTGATTTATCAAGA 51929015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1841 CCTTGTTAGATGTTTCAGTGGATTCAAAGTGTTGTTATAAGAAAACGTGATTTATCAAGA 1900

 51929016 CTTTCATGTGTAAAATAAAAGGCATTTTCAATGACTACTTGGCCAGGCTTTCAGATTCCA 51929075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1901 CTTTCATGTGTAAAATAAAAGGCATTTTCAATGACTACTTGGCCAGGCTTTCAGATTCCA 1960

 51929076 ATGCCAAGATGTTGTATTTTGATATTGCAGTTTTCTAACAACAACAAAGTTGAGTGGACT 51929135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1961 ATGCCAAGATGTTGTATTTTGATATTGCAGTTTTCTAACAACAACAAAGTTGAGTGGACT 2020

 51929136 TCTGGAACTAAAACTTAAATATTCAGAACTAATTATCACCACTCTATTTCTTACAGAGCA 51929195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2021 TCTGGAACTAAAACTTAAATATTCAGAACTAATTATCACCACTCTATTTCTTACAGAGCA 2080

 51929196 TTTAAGGAACACATATATGCATATATCCTTGCACTTTGTGCTACAGGTTGTGAGCCAGGG 51929255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2081 TTTAAGGAACACATATATGCATATATCCTTGCACTTTGTGCTACAGGTTGTGAGCCAGGG 2140

 51929256 TTACTTCCTTCTGACCATGTGGGTTCATAATGAAGACCCAACCTTAAGGTACCCAGGGCT 51929315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2141 TTACTTCCTTCTGACCATGTGGGTTCATAATGAAGACCCAACCTTAAGGTACCCAGGGCT 2200

 51929316 TAGAAATCAAATTTGTCCTTAGGACACTTTGGAAATCTATCTTGTAGTACAGGTGACCCA 51929375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2201 TAGAAATCAAATTTGTCCTTAGGACACTTTGGAAATCTATCTTGTAGTACAGGTGACCCA 2260

 51929376 GCAGCAATCAATCTTTCTGCCATCCCTAGTTTTAGTTCAGGACCCAGAAAAGTTGTAACT 51929435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     2261 GCAGCAATCAATCTTTCTGCCATCCCTAGTTTTACTTCAGGACCCAGAAAAGTTGTAACT 2320

 51929436 TGTTTCCTTTCCTGTGATCAAGCCTTTGTTTTCTCTTTTTTTCTCCACTTTTTGTAGCTT 51929495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2321 TGTTTCCTTTCCTGTGATCAAGCCTTTGTTTTCTCTTTTTTTCTCCACTTTTTGTAGCTT 2380

 51929496 TTTAATTTGTTTCTCTGTTGATTACTAGCCCAATGCCTGAGCATCTTCGTCTTAAGACAA 51929555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2381 TTTAATTTGTTTCTCTGTTGATTACTAGCCCAATGCCTGAGCATCTTCGTCTTAAGACAA 2440

 51929556 AGCCTCTGTGTTTCTTCAGCTCCTGAAATGACTGGCATGCTGAAAATGAGCTCAGGGCAT 51929615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2441 AGCCTCTGTGTTTCTTCAGCTCCTGAAATGACTGGCATGCTGAAAATGAGCTCAGGGCAT 2500

 51929616 TAGTCTTTGCTACTAAGCCACTACAGATTCCATTCCCTTTCTTCTTGAGTATGCACACAC 51929675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     2501 TAGTCTTTGCTACTAAGCCACTACAGATTCCATTCCCTTTCTTCCTGAGTATGCACACAC 2560

 51929676 CGCTTGTTCACAGACTCCAGATTAGTTATTAAGCTACATCTGTATGCAGTTTGCACTCTC 51929735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2561 CGCTTGTTCACAGACTCCAGATTAGTTATTAAGCTACATCTGTATGCAGTTTGCACTCTC 2620

 51929736 CTGCCTTCGACCTGCTTGTCCCAGAAGTTATTCACCATATTCTACCTTGATCATATTTTC 51929795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2621 CTGCCTTCGACCTGCTTGTCCCAGAAGTTATTCACCATATTCTACCTTGATCATATTTTC 2680

 51929796 TACTTGTCAATGCGCATGTCAATTAAGAACTTTTAACATTTATTGACCATTTATTATATA 51929855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2681 TACTTGTCAATGCGCATGTCAATTAAGAACTTTTAACATTTATTGACCATTTATTATATA 2740

 51929856 CTAGCCAGTCTTTTAATTGATTTATGAACAATTAACTTAATCATCATATAAGCATAGTAG 51929915
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2741 CTAGCCAGTCTTTTAATTGCTTTATGAACAATTAACTTAATCATCATATAAGCATAGTAG 2800

 51929916 GGTACAATTAGTTCCCCAACTTTATATATGAACAAATGGACTTTCAGAAAGGTAAGGTAA 51929975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2801 GGTACAATTAGTTCCCCAACTTTATATATGAACAAATGGACTTTCAGAAAGGTAAGGTAA 2860

 51929976 AATATCCACGGTAAGAAAGCCTGCATATGTGGAACTGGGAATTGAACCCCTATGTCTGAC 51930035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     2861 AATATCCACGGTAAGAAAGCCTGCATATGTGGAACTGGGAATTGAACCCCTATGGCTGAC 2920

 51930036 CCGAGGGTCCATACACTTAAGCATTATGCTATCAAGTTTTCCACAGCCTGCTTTTCGGCT 51930095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2921 CCGAGGGTCCATACACTTAAGCATTATGCTATCAAGTTTTCCACAGCCTGCTTTTCGGCT 2980

 51930096 TCTCTCTCTTTCTTTCTTTCCTGATCTCTGTTGCAATTCCTACCTTTCAACTCCCTTCTG 51930155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2981 TCTCTCTCTTTCTTTCTTTCCTGATCTCTGTTGCAATTCCTACCTTTCAACTCCCTTCTG 3040

 51930156 ACCATGGATAGTTTGCAAAATGCCAGAGGTACGTCTCAAAGAAGCTTCAAATAGGAGCGT 51930215
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3041 ACCATGGACAGTTTGCAAAATGCCAGAGGTACGTCTCAAAGAAGCTTCAAATAGGAGCGT 3100

 51930216 GTACTACCATTAAGTCAGCTCCTCAGTTGTCTTCTTTGGATTGAGAAGCACTTCATCACT 51930275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3101 GTACTACCATTAAGTCAGCTCCTCAGTTGTCTTCTTTGGATTGAGAAGCACTTCATCACT 3160

 51930276 TTTTACACAGGTTTAATTATCAAATATGACTTTTCTAGTACTACAGCTAATATATGTCAA 51930335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3161 TTTTACACAGGTTTAATTATCAAATATGACTTTTCTAGTACTACAGCTAATATATGTCAA 3220

 51930336 TGTCAAAGGGTTAACAGAATACTAGGCCTATATTAAATTATACATATGAGCTTTCTCTTT 51930395
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3221 TGTCAAAGGGTTAGCAGAATACTAGGCCTATATTAAATTATACATATGAGCTTTCTCTTT 3280

 51930396 ACTCCTTTTTATGTTCATTAGCAAACAGATAAAGCCATAATAGATTTTTTAAGGAATATT 51930455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3281 ACTCCTTTTTATGTTCATTAGCAAACAGATAAAGCCATAATAGATTTTTTAAGGAATATT 3340

 51930456 TTGTTTTGTTTTGTTTTGGACTTATACATCTATTAACAATAAACCAAACATTGCAGATTA 51930515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3341 TTGTTTTGTTTTGTTTTGGACTTATACATCTATTAACAATAAACCAAACATTGCAGATTA 3400

 51930516 AAGCAAATCTGCCAATCTGTTTTACAAACACTATCTTCTGAAGGGTTCCTGGGCACAAGA 51930575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3401 AAGCAAATCTGCCAATCTGTTTTACAAACACTATCTTCTGAAGGGTTCCTGGGCACAAGA 3460

 51930576 TACTGTTCTAGTAATATTTCACAGCTTTTTTTTTTTTTTCATTTTAGAGAAAATATTCTA 51930635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3461 TACTGTTCTAGTAATATTTCACAGCTTTTTTTTTTTTTTCATTTTAGAGAAAATATTCTA 3520

 51930636 AGACTCCAAAGTTCGATAGTATTTGGTCAGTGTCTTAGTCAGTTTGAGCTAATATAACAA 51930695
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3521 AGACTCCAAAGTTAGATAGTATTTGGTCAGTGTCTTAGTCAGTTTGAGCTAATATAACAA 3580

 51930696 ATTATCATAGAATAAGTGTCTCAAGCAACAGAAATGTATTTTTTACAATCTGGAGGCTGC 51930755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3581 ATTATCATAGAATAAGTGTCTCAAGCAACAGAAATGTATTTTTTACAATCTGGAGGCTGC 3640

 51930756 AAAGTCCAGAATCAAGATGCTGGCAGATCTGGTGTCTGATGAGGACCCACCTTCTTATTT 51930815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3641 AAAGTCCAGAATCAAGATGCTGGCAGATCTGGTGTCTGATGAGGACCCACCTTCTTATTT 3700

 51930816 GCAAATGATCATTTTTGTTGTGTCCTCACATGACAAAGAGCAGAGAGAGCAAGCACTCTT 51930875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3701 GCAAATGATCATTTTTGTTGTGTCCTCACATGACAAAGAGCAGAGAGAGCAAGCACTCTT 3760

 51930876 GTGTC 51930880
          |||||
     3761 GTGTC 3765

Alignment time is 3.43198 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51916584,51937767] =>     21184 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [       1,    2588] =>      2588 nucs 'mol-32-2ee6-126268_2588'

Score:        2535
Aligned:      2590        nucs
Identic:      2585 (100%) nucs =>       449 (100%)      2136 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51924175,51924623] EXCISED REGION [51924625,51926765]
 second seq =>  [       1,     449] EXCISED REGION [     451,    2588]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [51924624,51924624]
 second seq =>         1 nucs [450,450]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [51924648,51924648]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [51924623,51924623] to [51924624,51924624]
 second seq =>         2 nucs [450,451] to [451,452]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 51924175 AGGTTTTCTATTACTCAAACTGTCTTTGTACACATAATTTTCCTTTCATGCCATTTATGA 51924234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGGTTTTCTATTACTCAAACTGTCTTTGTACACATAATTTTCCTTTCATGCCATTTATGA 60

 51924235 ACCATTTTTTATTTCTATGGTTGATAGAGAATGACTTCATAATTCATTTCTGAATAAGTG 51924294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACCATTTTTTATTTCTATGGTTGATAGAGAATGACTTCATAATTCATTTCTGAATAAGTG 120

 51924295 AAATAATTTAAAAACATTTTAAAGTGGGTGTATCTACTTGCTTGGAGCTTTGTCGAATCA 51924354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAATAATTTAAAAACATTTTAAAGTGGGTGTATCTACTTGCTTGGAGCTTTGTCGAATCA 180

 51924355 TGTTTCTTATTTGGAGCCTCTGGAGGAATGTTGACTTACCATGGTAAAAATTAACTGGTG 51924414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGTTTCTTATTTGGAGCCTCTGGAGGAATGTTGACTTACCATGGTAAAAATTAACTGGTG 240

 51924415 AAACTCTAAAGAAAACACAGACTCTACACGCAGTCTTGTCCGAAACTTACTCACCCTGAA 51924474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAACTCTAAAGAAAACACAGACTCTACACGCAGTCTTGTCCGAAACTTACTCACCCTGAA 300

 51924475 ACCAATGAATTTCAAAGACCTAGATACTTCCTTCTGTGATGTCCCCTGAGATCAGAGAAT 51924534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACCAATGAATTTCAAAGACCTAGATACTTCCTTCTGTGATGTCCCCTGAGATCAGAGAAT 360

 51924535 AAAAGAAAAATCCCTCGTAAATATACATCACGTACAGCTGTTTGATTTATGCATTATGCA 51924594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAAAGAAAAATCCCTCGTAAATATACATCACGTACAGCTGTTTGATTTATGCATTATGCA 420

 51924595 GAAACTAAGAAAACAGAGTTATATGTAAC 51924623
          |||||||||||||||||||||||||||||
      421 GAAACTAAGAAAACAGAGTTATATGTAAC 449

EXCISED REGION

 51924625 TTGCAATGAGAAGTGCACCCACCAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCCCAAAACATTGTTTCA 51924684
          ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      451 TTGCAATGAGAAGTGCACCCACC-AAAAAAAAAAAAAAAAAATCCCAAAACATTGTTTCA 509

 51924685 AAAAGAAGTGGTATGAAGCATCTTAGTGTTTCATGAATATTGAAGAATAGTGCAATTATT 51924744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      510 AAAAGAAGTGGTATGAAGCATCTTAGTGTTTCATGAATATTGAAGAATAGTGCAATTATT 569

 51924745 GAAATTTGGCATTTAAAAAATGTTTTTAAATTATTAGGAAGCTACCGTGACCTGTTTACT 51924804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      570 GAAATTTGGCATTTAAAAAATGTTTTTAAATTATTAGGAAGCTACCGTGACCTGTTTACT 629

 51924805 AAATCCTCAATTCTTTCTCTCTCAGTTTTTCTTACTATAAAATTTACTTTTCAAGCCAGA 51924864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      630 AAATCCTCAATTCTTTCTCTCTCAGTTTTTCTTACTATAAAATTTACTTTTCAAGCCAGA 689

 51924865 GAATTTTTCTTTCTGACAAGACGTAGATCTATATTGCGCTGTCAAGATGCAGCTTTTGCA 51924924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      690 GAATTTTTCTTTCTGACAAGACGTAGATCTATATTGCGCTGTCAAGATGCAGCTTTTGCA 749

 51924925 TCTCTGCTGCCATGTGGATAGAATAACTTTCTTTCCTCAAGAAGTGGACAAGCCCTCATA 51924984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      750 TCTCTGCTGCCATGTGGATAGAATAACTTTCTTTCCTCAAGAAGTGGACAAGCCCTCATA 809

 51924985 GGGACTGATTTTCTGTGAAGTAGTGAGACTTAATCTTTGGGACCTTCACTTACATCACTT 51925044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      810 GGGACTGATTTTCTGTGAAGTAGTGAGACTTAATCTTTGGGACCTTCACTTACATCACTT 869

 51925045 ACATAGGACCTTTCAATACTCAGGGAGGGCCCTTGGCAATAAGTTCTTCTGACAATATAT 51925104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      870 ACATAGGACCTTTCAATACTCAGGGAGGGCCCTTGGCAATAAGTTCTTCTGACAATATAT 929

 51925105 CTTGTGCTGATGGTGGTGTTAGCTTTCAAAATTTGTAATTATTTTGGTAATTTCTGTCAT 51925164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      930 CTTGTGCTGATGGTGGTGTTAGCTTTCAAAATTTGTAATTATTTTGGTAATTTCTGTCAT 989

 51925165 CCTAGAAAAATGTGTATAGTGTATTTGTTCCTAATTTCATTTTCATTATTTATATATTTT 51925224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      990 CCTAGAAAAATGTGTATAGTGTATTTGTTCCTAATTTCATTTTCATTATTTATATATTTT 1049

 51925225 TTAATGAACACCCCCAGCATAGTATAAGTTTTATACCTCTACAATCTGAATCACCCGCTT 51925284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1050 TTAATGAACACCCCCAGCATAGTATAAGTTTTATACCTCTACAATCTGAATCACCCGCTT 1109

 51925285 GGCCCATGCCTAGGACTAGGTCTTATCATCCGCAGTGAGAGATTATAGGCTCTTACTAGG 51925344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1110 GGCCCATGCCTAGGACTAGGTCTTATCATCCGCAGTGAGAGATTATAGGCTCTTACTAGG 1169

 51925345 AATTTATGGTAACATGGGCTCCTAACAGTCATGATTTTTATAACATGATTGCCTATGTAT 51925404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1170 AATTTATGGTAACATGGGCTCCTAACAGTCATGATTTTTATAACATGATTGCCTATGTAT 1229

 51925405 ATAAAGTCCACTGGCTGAACAAGTATTTTCCCTCAAATCAGGAAGGAAAAAAAAAAACAC 51925464
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
     1230 ATAAAGTCCACTGGCTGAACAAGTATTTTCCCTCAAATCAGGAAGG-AAAAAAAAAACAC 1288

 51925465 GAAGCAAATTGATCCTCTTCTAAAAGCTGTCACATCAGTAACCCATCATATTCTCATTTA 51925524
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1289 GAAGCAAATTGATCCTCTTCTAGAAGCTGTCACATCAGTAACCCATCATATTCTCATTTA 1348

 51925525 CTTATATACTGAGTAGGTAGTCACCTTTGATTCATATCTCTCAGGAGTTCAGAAGTTTTT 51925584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1349 CTTATATACTGAGTAGGTAGTCACCTTTGATTCATATCTCTCAGGAGTTCAGAAGTTTTT 1408

 51925585 GAAAGTAATTTGTGATACAAAATATAGGGAAATTCAGAATGAGATTCTTTTGGCTTGTCT 51925644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1409 GAAAGTAATTTGTGATACAAAATATAGGGAAATTCAGAATGAGATTCTTTTGGCTTGTCT 1468

 51925645 TTCTTTTTCTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTATTTGTTGAACTCAAATCCGGAAATTGTG 51925704
          ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1469 TTCTTTTTCTTTTTTTC-TTTTTTTTTTTTTATTTGTTGAACTCAAATCCGGAAATTGTG 1527

 51925705 GAGGTTACTAGAACTCTAAGTCACAGACTTATAAGTACTGAAAAAGTAGTCAGTAAAGAA 51925764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1528 GAGGTTACTAGAACTCTAAGTCACAGACTTATAAGTACTGAAAAAGTAGTCAGTAAAGAA 1587

 51925765 AACATACAGTAAGAGACTAGGTTAATTTTCCTATAGTTCATTGATGTTTCCACTATTACT 51925824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1588 AACATACAGTAAGAGACTAGGTTAATTTTCCTATAGTTCATTGATGTTTCCACTATTACT 1647

 51925825 GCCCCTGATTTTTAACTTTAGTTTTCCTTAGATTGTTGGAGTAATATATGTACCTTAAAA 51925884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1648 GCCCCTGATTTTTAACTTTAGTTTTCCTTAGATTGTTGGAGTAATATATGTACCTTAAAA 1707

 51925885 ATTAACTGTGGAACAAGTAGATGAACTTTTTACACAATTTCCTGCTTTTATAAAGTTCCT 51925944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1708 ATTAACTGTGGAACAAGTAGATGAACTTTTTACACAATTTCCTGCTTTTATAAAGTTCCT 1767

 51925945 ACTAGCTATATTTTCCCAAAAGTGCTCAACAATAGAGTCTGGTGCTAAAAAGCAGAGTAG 51926004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1768 ACTAGCTATATTTTCCCAAAAGTGCTCAACAATAGAGTCTGGTGCTAAAAAGCAGAGTAG 1827

 51926005 GCTAAATTTAGATCAATGTGAAATGCCCTACTTATTTCCTATGAACTTAATTGATTGAGC 51926064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1828 GCTAAATTTAGATCAATGTGAAATGCCCTACTTATTTCCTATGAACTTAATTGATTGAGC 1887

 51926065 TCATTTTGGGGGTGTCTTTCTGATCGACCAGAAACTTGGCTCATTAGAGCAACTCACAAA 51926124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1888 TCATTTTGGGGGTGTCTTTCTGATCGACCAGAAACTTGGCTCATTAGAGCAACTCACAAA 1947

 51926125 GTGACCTTTTAAAAGAAAGAGTTTTCAATATATTTGTTCATGTTCCATTCCACTGAGAAT 51926184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1948 GTGACCTTTTAAAAGAAAGAGTTTTCAATATATTTGTTCATGTTCCATTCCACTGAGAAT 2007

 51926185 GGTGCTATTTAAAACTAAATACAATAATTTTAGATATTGTACAGCAGATATAATTTTAAA 51926244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2008 GGTGCTATTTAAAACTAAATACAATAATTTTAGATATTGTACAGCAGATATAATTTTAAA 2067

 51926245 CATAATACATGGGATTTCGATTTTAGGTACTGTTTATAAGGCATTTCTCCTTATATTATT 51926304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2068 CATAATACATGGGATTTCGATTTTAGGTACTGTTTATAAGGCATTTCTCCTTATATTATT 2127

 51926305 CTAGACTTAAATATAACAAATTTCATGCAGAGGTTTCTTTCAAAAGTAAATTCAGCCACA 51926364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2128 CTAGACTTAAATATAACAAATTTCATGCAGAGGTTTCTTTCAAAAGTAAATTCAGCCACA 2187

 51926365 TTTAGACTCAAATATTCCCTAATTTTTTAGTGTAGCTGAAGTCCTAATAATATACTTGTG 51926424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2188 TTTAGACTCAAATATTCCCTAATTTTTTAGTGTAGCTGAAGTCCTAATAATATACTTGTG 2247

 51926425 TTTCTTTTAAATTAAGTCCCACATGTTAACTTTACAACAGAAAGTCCATGTATCGTATTA 51926484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     2248 TTTCTTTTAAATTAAGTCCCACATGTTAACTTTACAGCAGAAAGTCCATGTATCGTATTA 2307

 51926485 TTAGTCTAAATCTTCATTTTACTGTTTAGTTAACACAGACATTCATTTAACACACTATGT 51926544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2308 TTAGTCTAAATCTTCATTTTACTGTTTAGTTAACACAGACATTCATTTAACACACTATGT 2367

 51926545 TTAATTTCCCACTCAGTTTTGGCTTATTGTAGTCTAATAAACAATGATTAAACAATGCCC 51926604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2368 TTAATTTCCCACTCAGTTTTGGCTTATTGTAGTCTAATAAACAATGATTAAACAATGCCC 2427

 51926605 CACTTAATGCAGGTTGAGAAATAAGTGAAACTATGACATGGAAAAATATTACAATAAGCG 51926664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2428 CACTTAATGCAGGTTGAGAAATAAGTGAAACTATGACATGGAAAAATATTACAATAAGCG 2487

 51926665 AAAAATATTACAATAAAGGAAAAAATAATGGAAGAATATCAGTATTTGATGCTATTATAC 51926724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2488 AAAAATATTACAATAAAGGAAAAAATAATGGAAGAATATCAGTATTTGATGCTATTATAC 2547

 51926725 GTGACCATATTGTTTAGCAAACTACTTCAAAAATGAAATTA 51926765
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2548 GTGACCATATTGTTTAGCAAACTACTTCAAAAATGAAATTA 2588

Alignment time is 1.94517 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51916584,51937767] =>     21184 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [       1,    5184] =>      5184 nucs 'mol-32-2f1d-024011_5184'

Score:        5073
Aligned:      5183        nucs
Identic:      5173 (100%) nucs =>       759 (100%)      4414 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51925702,51926460] EXCISED REGION [51926462,51930885]
 second seq =>  [       1,     759] EXCISED REGION [     761,    5184]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [51926461,51926461]
 second seq =>         1 nucs [760,760]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [51926460,51926460] to [51926461,51926461]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [51926459,51926460] to [51926462,51926463]
 second seq =>         2 nucs [758,759] to [761,762]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 51925702 GTGGAGGTTACTAGAACTCTAAGTCACAGACTTATAAGTACTGAAAAAGTAGTCAGTAAA 51925761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTGGAGGTTACTAGAACTCTAAGTCACAGACTTATAAGTACTGAAAAAGTAGTCAGTAAA 60

 51925762 GAAAACATACAGTAAGAGACTAGGTTAATTTTCCTATAGTTCATTGATGTTTCCACTATT 51925821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAAAACATACAGTAAGAGACTAGGTTAATTTTCCTATAGTTCATTGATGTTTCCACTATT 120

 51925822 ACTGCCCCTGATTTTTAACTTTAGTTTTCCTTAGATTGTTGGAGTAATATATGTACCTTA 51925881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACTGCCCCTGATTTTTAACTTTAGTTTTCCTTAGATTGTTGGAGTAATATATGTACCTTA 180

 51925882 AAAATTAACTGTGGAACAAGTAGATGAACTTTTTACACAATTTCCTGCTTTTATAAAGTT 51925941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAAATTAACTGTGGAACAAGTAGATGAACTTTTTACACAATTTCCTGCTTTTATAAAGTT 240

 51925942 CCTACTAGCTATATTTTCCCAAAAGTGCTCAACAATAGAGTCTGGTGCTAAAAAGCAGAG 51926001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCTACTAGCTATATTTTCCCAAAAGTGCTCAACAATAGAGTCTGGTGCTAAAAAGCAGAG 300

 51926002 TAGGCTAAATTTAGATCAATGTGAAATGCCCTACTTATTTCCTATGAACTTAATTGATTG 51926061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TAGGCTAAATTTAGATCAATGTGAAATGCCCTACTTATTTCCTATGAACTTAATTGATTG 360

 51926062 AGCTCATTTTGGGGGTGTCTTTCTGATCGACCAGAAACTTGGCTCATTAGAGCAACTCAC 51926121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGCTCATTTTGGGGGTGTCTTTCTGATCGACCAGAAACTTGGCTCATTAGAGCAACTCAC 420

 51926122 AAAGTGACCTTTTAAAAGAAAGAGTTTTCAATATATTTGTTCATGTTCCATTCCACTGAG 51926181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAAGTGACCTTTTAAAAGAAAGAGTTTTCAATATATTTGTTCATGTTCCATTCCACTGAG 480

 51926182 AATGGTGCTATTTAAAACTAAATACAATAATTTTAGATATTGTACAGCAGATATAATTTT 51926241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AATGGTGCTATTTAAAACTAAATACAATAATTTTAGATATTGTACAGCAGATATAATTTT 540

 51926242 AAACATAATACATGGGATTTCGATTTTAGGTACTGTTTATAAGGCATTTCTCCTTATATT 51926301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAACATAATACATGGGATTTCGATTTTAGGTACTGTTTATAAGGCATTTCTCCTTATATT 600

 51926302 ATTCTAGACTTAAATATAACAAATTTCATGCAGAGGTTTCTTTCAAAAGTAAATTCAGCC 51926361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATTCTAGACTTAAATATAACAAATTTCATGCAGAGGTTTCTTTCAAAAGTAAATTCAGCC 660

 51926362 ACATTTAGACTCAAATATTCCCTAATTTTTTAGTGTAGCTGAAGTCCTAATAATATACTT 51926421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ACATTTAGACTCAAATATTCCCTAATTTTTTAGTGTAGCTGAAGTCCTAATAATATACTT 720

 51926422 GTGTTTCTTTTAAATTAAGTCCCACATGTTAACTTTACA 51926460
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GTGTTTCTTTTAAATTAAGTCCCACATGTTAACTTTACA 759

EXCISED REGION

 51926462 CAGAAAGTCCATGTATCGTATTATTAGTCTAAATCTTCATTTTACTGTTTAGTTAACACA 51926521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      761 CAGAAAGTCCATGTATCGTATTATTAGTCTAAATCTTCATTTTACTGTTTAGTTAACACA 820

 51926522 GACATTCATTTAACACACTATGTTTAATTTCCCACTCAGTTTTGGCTTATTGTAGTCTAA 51926581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      821 GACATTCATTTAACACACTATGTTTAATTTCCCACTCAGTTTTGGCTTATTGTAGTCTAA 880

 51926582 TAAACAATGATTAAACAATGCCCCACTTAATGCAGGTTGAGAAATAAGTGAAACTATGAC 51926641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      881 TAAACAATGATTAAACAATGCCCCACTTAATGCAGGTTGAGAAATAAGTGAAACTATGAC 940

 51926642 ATGGAAAAATATTACAATAAGCGAAAAATATTACAATAAAGGAAAAAATAATGGAAGAAT 51926701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      941 ATGGAAAAATATTACAATAAGCGAAAAATATTACAATAAAGGAAAAAATAATGGAAGAAT 1000

 51926702 ATCAGTATTTGATGCTATTATACGTGACCATATTGTTTAGCAAACTACTTCAAAAATGAA 51926761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     1001 ATCAGTATTTGATGCTATTATACGTGACCATATTGTTTAGCAAACTACTTCAAAAACGAA 1060

 51926762 ATTAGGAATTTCAGAGAATCATTTTATTCTCATATCAGAATGCTTGGAAAAGTGAGGGCT 51926821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1061 ATTAGGAATTTCAGAGAATCATTTTATTCTCATATCAGAATGCTTGGAAAAGTGAGGGCT 1120

 51926822 AAATGTATTTGTTATTTGACTGTGTACATTATGCCCATGGAATAGCATTTTGGAAGACCC 51926881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1121 AAATGTATTTGTTATTTGACTGTGTACATTATGCCCATGGAATAGCATTTTGGAAGACCC 1180

 51926882 AACATTAAGCTAGCTTTACATAACAATGAGTATGTCATGTTAACTTATGATACACTTTAA 51926941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1181 AACATTAAGCTAGCTTTACATAACAATGAGTATGTCATGTTAACTTATGATACACTTTAA 1240

 51926942 TCCTGGCTTGACTCTGGTAGCTGTGTGACTATAATCTTTCAGGCCTCCATTTACTTATCC 51927001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1241 TCCTGGCTTGACTCTGGTAGCTGTGTGACTATAATCTTTCAGGCCTCCATTTACTTATCC 1300

 51927002 AGAAAGTGGAAATAATAATATGTAATTAATAGATGCCTGGTGAATATTAAATTCATTAAT 51927061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1301 AGAAAGTGGAAATAATAATATGTAATTAATAGATGCCTGGTGAATATTAAATTCATTAAT 1360

 51927062 ATTTGTCAACTATTTTTCACAGACTTTTCATTTAGTTAAGTACACAATAATAAGTAAGCA 51927121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1361 ATTTGTCAACTATTTTTCACAGACTTTTCATTTAGTTAAGTACACAATAATAAGTAAGCA 1420

 51927122 CTCATATATGAATGTGTGTACATATTTATCGTAAACAGATCCTCAGTAATTAGTGTAGAA 51927181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1421 CTCATATATGAATGTGTGTACATATTTATCGTAAACAGATCCTCAGTAATTAGTGTAGAA 1480

 51927182 ATAAATGTTCTAGACAATCCAAAGTTATTTAAAGTTTTTCAGAAAGCTACCCTTCTATCA 51927241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1481 ATAAATGTTCTAGACAATCCAAAGTTATTTAAAGTTTTTCAGAAAGCTACCCTTCTATCA 1540

 51927242 TCTGGGGTAATTTTTTTTGTCATTTTGGCAAATATGTAGAGAATATATGTGAGTCTTCCT 51927301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1541 TCTGGGGTAATTTTTTTTGTCATTTTGGCAAATATGTAGAGAATATATGTGAGTCTTCCT 1600

 51927302 ATTAGTCTGAAGTAAGCAAAACTATAAAGGCACATTTATCGAGGTGGAATGTGAAAAACA 51927361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1601 ATTAGTCTGAAGTAAGCAAAACTATAAAGGCACATTTATCGAGGTGGAATGTGAAAAACA 1660

 51927362 ACAATCATTTTAACGTAAATCTATGATACTTTGGTCTCTTCCAGTGTCCAGGTAACTTAT 51927421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1661 ACAATCATTTTAACGTAAATCTATGATACTTTGGTCTCTTCCAGTGTCCAGGTAACTTAT 1720

 51927422 GCCACAACTTTCTTCTATCTTTGTTAATAATACAGTGTGTTTTATACCTGTGGGCACTAA 51927481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1721 GCCACAACTTTCTTCTATCTTTGTTAATAATACAGTGTGTTTTATACCTGTGGGCACTAA 1780

 51927482 CATTTTGTTACTATTTGTAGTAATGCTACTGCATTACTGATATGAGAATAAAATGATTCT 51927541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1781 CATTTTGTTACTATTTGTAGTAATGCTACTGCATTACTGATATGAGAATAAAATGATTCT 1840

 51927542 CTGAAATTCCTAATTTCATTTTTGAAGTAATTTGCTAAACAATATGGTCACGTATAATAG 51927601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1841 CTGAAATTCCTAATTTCATTTTTGAAGTAATTTGCTAAACAATATGGTCACGTATAATAG 1900

 51927602 CATCAAATATTGATATTCTTCCATTATTTTTTCCTTTATTGTAATATTTTTCACTTATTG 51927661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1901 CATCAAATATTGATATTCTTCCATTATTTTTTCCTTTATTGTAATATTTTTCACTTATTG 1960

 51927662 TAATATTTTTCCATGTCATAGTTTCACTTATTTCTCAACATACTATGTATCCATGAATGT 51927721
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     1961 TAATATTTTTCCATGTCATAGTTTCACTTATTTGTCAACATACTATGTATCCATGAATGT 2020

 51927722 CCTGAAGGGAAAAAAAAATCTCATATATACCTAACTGATGTGCTTGACATATAGTAAGTT 51927781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2021 CCTGAAGGGAAAAAAAAATCTCATATATACCTAACTGATGTGCTTGACATATAGTAAGTT 2080

 51927782 GTCCATAAGTATTTGCTGGTAGATTTATTTATTTTTTAAAAAAACAACTTGGAAAGTTTT 51927841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2081 GTCCATAAGTATTTGCTGGTAGATTTATTTATTTTTTAAAAAAACAACTTGGAAAGTTTT 2140

 51927842 CTGTGTGCTTTTATATTAGAACTTGACCTTTGAAGTACCTCCAGGAAATTTTGAAGAGTG 51927901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2141 CTGTGTGCTTTTATATTAGAACTTGACCTTTGAAGTACCTCCAGGAAATTTTGAAGAGTG 2200

 51927902 CTGGCATATGACAATGCGTAAGTTTATATTTCATGTCCATGCATGCCATTAAAATTCTAA 51927961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2201 CTGGCATATGACAATGCGTAAGTTTATATTTCATGTCCATGCATGCCATTAAAATTCTAA 2260

 51927962 TAATGTAGTTGACAGAGCCTTTCTTGTCCCTTAAGCACTAAATTTGTGGCTTGCTCTAGA 51928021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2261 TAATGTAGTTGACAGAGCCTTTCTTGTCCCTTAAGCACTAAATTTGTGGCTTGCTCTAGA 2320

 51928022 TTGTCCCACCTGGCACAAGCGAGGTGAAATTTCAGGTCTAGCCAACTTTTTTCTTTTTTT 51928081
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2321 TTGTCCCACCTGGCACAAGCTAGGTGAAATTTCAGGTCTAGCCAACTTTTTTCTTTTTTT 2380

 51928082 TTTTTTAACAAGTATTAAAAACATTTTCATATATATTCCCTGTATTATTTCACCTATTTT 51928141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2381 TTTTTTAACAAGTATTAAAAACATTTTCATATATATTCCCTGTATTATTTCACCTATTTT 2440

 51928142 TGTGTGTGTGTTTCTATCACACTGCCACATCAAAAACCTCTTCTTGAACGACTATAGTAT 51928201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2441 TGTGTGTGTGTTTCTATCACACTGCCACATCAAAAACCTCTTCTTGAACGACTATAGTAT 2500

 51928202 AGTGGTTAATAGTTCAGTGTCTAGATCAAGACCACCTATGGACGTATCTTGGCTCTGATT 51928261
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2501 AGTGATTAATAGTTCAGTGTCTAGATCAAGACCACCTATGGACGTATCTTGGCTCTGATT 2560

 51928262 TTACCAGCCGTACAATCCTGGAGAATCTGTTCAAGAGAAATGTGCCTCAATTACGTATCT 51928321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2561 TTACCAGCCGTACAATCCTGGAGAATCTGTTCAAGAGAAATGTGCCTCAATTACGTATCT 2620

 51928322 CTAAAGTAGTTGTAGCTATAGAACCTGTTCCATAGATGTGGATCAGAACACTGCATGACA 51928381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2621 CTAAAGTAGTTGTAGCTATAGAACCTGTTCCATAGATGTGGATCAGAACACTGCATGACA 2680

 51928382 TTTAGAAAATGTTTAATAAATGATGTTGCTGTACTTGTTGCTGTTATTGTTGCTCTGTCA 51928441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2681 TTTAGAAAATGTTTAATAAATGATGTTGCTGTACTTGTTGCTGTTATTGTTGCTCTGTCA 2740

 51928442 TGTTAGGAGAACTCTCATTTACCCTAGTGTTCTCTCAAAGTGAAATACAGATCATTACCT 51928501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2741 TGTTAGGAGAACTCTCATTTACCCTAGTGTTCTCTCAAAGTGAAATACAGATCATTACCT 2800

 51928502 CTTGAAATCATGTCCAAGTAACTTCAGAATTATTTAGAAATCATTTATCTAAATCAGAGT 51928561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2801 CTTGAAATCATGTCCAAGTAACTTCAGAATTATTTAGAAATCATTTATCTAAATCAGAGT 2860

 51928562 ATTTCTTGATATAATTTAAAGTTGATTGTATTTGAAAGTACATATGTCAATCTAGTATGA 51928621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2861 ATTTCTTGATATAATTTAAAGTTGATTGTATTTGAAAGTACATATGTCAATCTAGTATGA 2920

 51928622 GATAATCTCAAGGAAATAAAAATGTATAGGTCTAATTTACATTTTTATATGGAAGGAGAT 51928681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2921 GATAATCTCAAGGAAATAAAAATGTATAGGTCTAATTTACATTTTTATATGGAAGGAGAT 2980

 51928682 AATTACTTTCTATCACAAATGATGAAGGCTGACGTTTGTTTCTTTTTTACTTTTAATTTT 51928741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2981 AATTACTTTCTATCACAAATGATGAAGGCTGACGTTTGTTTCTTTTTTACTTTTAATTTT 3040

 51928742 CACTTATATTTTGTTTATTATCAATATTTGCTTTTTAAAAGGTGGGAAGAAATCAACCAA 51928801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3041 CACTTATATTTTGTTTATTATCAATATTTGCTTTTTAAAAGGTGGGAAGAAATCAACCAA 3100

 51928802 TCAAACATTAAAAAGCAATATGGAGGAGGGTGATATAATGCCCACTTATATTTCTCTTAT 51928861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3101 TCAAACATTAAAAAGCAATATGGAGGAGGGTGATATAATGCCCACTTATATTTCTCTTAT 3160

 51928862 AATTTTAAATATTTTCATAATTAACAGAATAATTAGCACTGGTAATATTAAAATACCATC 51928921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3161 AATTTTAAATATTTTCATAATTAACAGAATAATTAGCACTGGTAATATTAAAATACCATC 3220

 51928922 AAAAGAATCTAAATGTATGTGCTTTCTGTTGCAGCCTTGTTAGATGTTTCAGTGGATTCA 51928981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3221 AAAAGAATCTAAATGTATGTGCTTTCTGTTGCAGCCTTGTTAGATGTTTCAGTGGATTCA 3280

 51928982 AAGTGTTGTTATAAGAAAACGTGATTTATCAAGACTTTCATGTGTAAAATAAAAGGCATT 51929041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3281 AAGTGTTGTTATAAGAAAACGTGATTTATCAAGACTTTCATGTGTAAAATAAAAGGCATT 3340

 51929042 TTCAATGACTACTTGGCCAGGCTTTCAGATTCCAATGCCAAGATGTTGTATTTTGATATT 51929101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3341 TTCAATGACTACTTGGCCAGGCTTTCAGATTCCAATGCCAAGATGTTGTATTTTGATATT 3400

 51929102 GCAGTTTTCTAACAACAACAAAGTTGAGTGGACTTCTGGAACTAAAACTTAAATATTCAG 51929161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3401 GCAGTTTTCTAACAACAACAAAGTTGAGTGGACTTCTGGAACTAAAACTTAAATATTCAG 3460

 51929162 AACTAATTATCACCACTCTATTTCTTACAGAGCATTTAAGGAACACATATATGCATATAT 51929221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3461 AACTAATTATCACCACTCTATTTCTTACAGAGCATTTAAGGAACACATATATGCATATAT 3520

 51929222 CCTTGCACTTTGTGCTACAGGTTGTGAGCCAGGGTTACTTCCTTCTGACCATGTGGGTTC 51929281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3521 CCTTGCACTTTGTGCTACAGGTTGTGAGCCAGGGTTACTTCCTTCTGACCATGTGGGTTC 3580

 51929282 ATAATGAAGACCCAACCTTAAGGTACCCAGGGCTTAGAAATCAAATTTGTCCTTAGGACA 51929341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3581 ATAATGAAGACCCAACCTTAAGGTACCCAGGGCTTAGAAATCAAATTTGTCCTTAGGACA 3640

 51929342 CTTTGGAAATCTATCTTGTAGTACAGGTGACCCAGCAGCAATCAATCTTTCTGCCATCCC 51929401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3641 CTTTGGAAATCTATCTTGTAGTACAGGTGACCCAGCAGCAATCAATCTTTCTGCCATCCC 3700

 51929402 TAGTTTTAGTTCAGGACCCAGAAAAGTTGTAACTTGTTTCCTTTCCTGTGATCAAGCCTT 51929461
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3701 TAGTTTTACTTCAGGACCCAGAAAAGTTGTAACTTGTTTCCTTTCCTGTGATCAAGCCTT 3760

 51929462 TGTTTTCTCTTTTTTTCTCCACTTTTTGTAGCTTTTTAATTTGTTTCTCTGTTGATTACT 51929521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3761 TGTTTTCTCTTTTTTTCTCCACTTTTTGTAGCTTTTTAATTTGTTTCTCTGTTGATTACT 3820

 51929522 AGCCCAATGCCTGAGCATCTTCGTCTTAAGACAAAGCCTCTGTGTTTCTTCAGCTCCTGA 51929581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3821 AGCCCAATGCCTGAGCATCTTCGTCTTAAGACAAAGCCTCTGTGTTTCTTCAGCTCCTGA 3880

 51929582 AATGACTGGCATGCTGAAAATGAGCTCAGGGCATTAGTCTTTGCTACTAAGCCACTACAG 51929641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3881 AATGACTGGCATGCTGAAAATGAGCTCAGGGCATTAGTCTTTGCTACTAAGCCACTACAG 3940

 51929642 ATTCCATTCCCTTTCTTCTTGAGTATGCACACACCGCTTGTTCACAGACTCCAGATTAGT 51929701
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3941 ATTCCATTCCCTTTCTTCCTGAGTATGCACACACCGCTTGTTCACAGACTCCAGATTAGT 4000

 51929702 TATTAAGCTACATCTGTATGCAGTTTGCACTCTCCTGCCTTCGACCTGCTTGTCCCAGAA 51929761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4001 TATTAAGCTACATCTGTATGCAGTTTGCACTCTCCTGCCTTCGACCTGCTTGTCCCAGAA 4060

 51929762 GTTATTCACCATATTCTACCTTGATCATATTTTCTACTTGTCAATGCGCATGTCAATTAA 51929821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4061 GTTATTCACCATATTCTACCTTGATCATATTTTCTACTTGTCAATGCGCATGTCAATTAA 4120

 51929822 GAACTTTTAACATTTATTGACCATTTATTATATACTAGCCAGTCTTTTAATTGATTTATG 51929881
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     4121 GAACTTTTAACATTTATTGACCATTTATTATATACTAGCCAGTCTTTTAATTGCTTTATG 4180

 51929882 AACAATTAACTTAATCATCATATAAGCATAGTAGGGTACAATTAGTTCCCCAACTTTATA 51929941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4181 AACAATTAACTTAATCATCATATAAGCATAGTAGGGTACAATTAGTTCCCCAACTTTATA 4240

 51929942 TATGAACAAATGGACTTTCAGAAAGGTAAGGTAAAATATCCACGGTAAGAAAGCCTGCAT 51930001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4241 TATGAACAAATGGACTTTCAGAAAGGTAAGGTAAAATATCCACGGTAAGAAAGCCTGCAT 4300

 51930002 ATGTGGAACTGGGAATTGAACCCCTATGTCTGACCCGAGGGTCCATACACTTAAGCATTA 51930061
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     4301 ATGTGGAACTGGGAATTGAACCCCTATGGCTGACCCGAGGGTCCATACACTTAAGCATTA 4360

 51930062 TGCTATCAAGTTTTCCACAGCCTGCTTTTCGGCTTCTCTCTCTTTCTTTCTTTCCTGATC 51930121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4361 TGCTATCAAGTTTTCCACAGCCTGCTTTTCGGCTTCTCTCTCTTTCTTTCTTTCCTGATC 4420

 51930122 TCTGTTGCAATTCCTACCTTTCAACTCCCTTCTGACCATGGATAGTTTGCAAAATGCCAG 51930181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     4421 TCTGTTGCAATTCCTACCTTTCAACTCCCTTCTGACCATGGACAGTTTGCAAAATGCCAG 4480

 51930182 AGGTACGTCTCAAAGAAGCTTCAAATAGGAGCGTGTACTACCATTAAGTCAGCTCCTCAG 51930241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4481 AGGTACGTCTCAAAGAAGCTTCAAATAGGAGCGTGTACTACCATTAAGTCAGCTCCTCAG 4540

 51930242 TTGTCTTCTTTGGATTGAGAAGCACTTCATCACTTTTTACACAGGTTTAATTATCAAATA 51930301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4541 TTGTCTTCTTTGGATTGAGAAGCACTTCATCACTTTTTACACAGGTTTAATTATCAAATA 4600

 51930302 TGACTTTTCTAGTACTACAGCTAATATATGTCAATGTCAAAGGGTTAACAGAATACTAGG 51930361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4601 TGACTTTTCTAGTACTACAGCTAATATATGTCAATGTCAAAGGGTTAACAGAATACTAGG 4660

 51930362 CCTATATTAAATTATACATATGAGCTTTCTCTTTACTCCTTTTTATGTTCATTAGCAAAC 51930421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4661 CCTATATTAAATTATACATATGAGCTTTCTCTTTACTCCTTTTTATGTTCATTAGCAAAC 4720

 51930422 AGATAAAGCCATAATAGATTTTTTAAGGAATATTTTGTTTTGTTTTGTTTTGGACTTATA 51930481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4721 AGATAAAGCCATAATAGATTTTTTAAGGAATATTTTGTTTTGTTTTGTTTTGGACTTATA 4780

 51930482 CATCTATTAACAATAAACCAAACATTGCAGATTAAAGCAAATCTGCCAATCTGTTTTACA 51930541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4781 CATCTATTAACAATAAACCAAACATTGCAGATTAAAGCAAATCTGCCAATCTGTTTTACA 4840

 51930542 AACACTATCTTCTGAAGGGTTCCTGGGCACAAGATACTGTTCTAGTAATATTTCACAGCT 51930601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4841 AACACTATCTTCTGAAGGGTTCCTGGGCACAAGATACTGTTCTAGTAATATTTCACAGCT 4900

 51930602 TTTTTTTTTTTTTCATTTTAGAGAAAATATTCTAAGACTCCAAAGTTCGATAGTATTTGG 51930661
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     4901 TTTTTTTTTTTTTCATTTTAGAGAAAATATTCTAAGACTCCAAAGTTAGATAGTATTTGG 4960

 51930662 TCAGTGTCTTAGTCAGTTTGAGCTAATATAACAAATTATCATAGAATAAGTGTCTCAAGC 51930721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4961 TCAGTGTCTTAGTCAGTTTGAGCTAATATAACAAATTATCATAGAATAAGTGTCTCAAGC 5020

 51930722 AACAGAAATGTATTTTTTACAATCTGGAGGCTGCAAAGTCCAGAATCAAGATGCTGGCAG 51930781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5021 AACAGAAATGTATTTTTTACAATCTGGAGGCTGCAAAGTCCAGAATCAAGATGCTGGCAG 5080

 51930782 ATCTGGTGTCTGATGAGGACCCACCTTCTTATTTGCAAATGATCATTTTTGTTGTGTCCT 51930841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5081 ATCTGGTGTCTGATGAGGACCCACCTTCTTATTTGCAAATGATCATTTTTGTTGTGTCCT 5140

 51930842 CACATGACAAAGAGCAGAGAGAGCAAGCACTCTTGTGTCTCTTC 51930885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5141 CACATGACAAAGAGCAGAGAGAGCAAGCACTCTTGTGTCTCTTC 5184

Alignment time is 3.81731 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51916584,51937767] =>     21184 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [       1,    2518] =>      2518 nucs 'mol-32-2f1d-059167_2518'

Score:        2475
Aligned:      2519        nucs
Identic:      2515 (100%) nucs =>       529 (100%)      1986 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51924095,51924623] EXCISED REGION [51924625,51926614]
 second seq =>  [       1,     529] EXCISED REGION [     531,    2518]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [51924624,51924624]
 second seq =>         1 nucs [530,530]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [51924648,51924648]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [51924623,51924623] to [51924624,51924624]
 second seq =>         2 nucs [530,531] to [531,532]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 51924095 TGTTGATGCAATAATATTATATCATTTTTTTTTACTGGTCAATGTATTTATTTGTAATTG 51924154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGTTGATGCAATAATATTATATCATTTTTTTTTACTGGTCAATGTATTTATTTGTAATTG 60

 51924155 TTCTGAAATTGTTTCCTGCAAGGTTTTCTATTACTCAAACTGTCTTTGTACACATAATTT 51924214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTCTGAAATTGTTTCCTGCAAGGTTTTCTATTACTCAAACTGTCTTTGTACACATAATTT 120

 51924215 TCCTTTCATGCCATTTATGAACCATTTTTTATTTCTATGGTTGATAGAGAATGACTTCAT 51924274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCCTTTCATGCCATTTATGAACCATTTTTTATTTCTATGGTTGATAGAGAATGACTTCAT 180

 51924275 AATTCATTTCTGAATAAGTGAAATAATTTAAAAACATTTTAAAGTGGGTGTATCTACTTG 51924334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AATTCATTTCTGAATAAGTGAAATAATTTAAAAACATTTTAAAGTGGGTGTATCTACTTG 240

 51924335 CTTGGAGCTTTGTCGAATCATGTTTCTTATTTGGAGCCTCTGGAGGAATGTTGACTTACC 51924394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTTGGAGCTTTGTCGAATCATGTTTCTTATTTGGAGCCTCTGGAGGAATGTTGACTTACC 300

 51924395 ATGGTAAAAATTAACTGGTGAAACTCTAAAGAAAACACAGACTCTACACGCAGTCTTGTC 51924454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATGGTAAAAATTAACTGGTGAAACTCTAAAGAAAACACAGACTCTACACGCAGTCTTGTC 360

 51924455 CGAAACTTACTCACCCTGAAACCAATGAATTTCAAAGACCTAGATACTTCCTTCTGTGAT 51924514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CGAAACTTACTCACCCTGAAACCAATGAATTTCAAAGACCTAGATACTTCCTTCTGTGAT 420

 51924515 GTCCCCTGAGATCAGAGAATAAAAGAAAAATCCCTCGTAAATATACATCACGTACAGCTG 51924574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTCCCCTGAGATCAGAGAATAAAAGAAAAATCCCTCGTAAATATACATCACGTACAGCTG 480

 51924575 TTTGATTTATGCATTATGCAGAAACTAAGAAAACAGAGTTATATGTAAC 51924623
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTGATTTATGCATTATGCAGAAACTAAGAAAACAGAGTTATATGTAAC 529

EXCISED REGION

 51924625 TTGCAATGAGAAGTGCACCCACCAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCCCAAAACATTGTTTCA 51924684
          ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      531 TTGCAATGAGAAGTGCACCCACC-AAAAAAAAAAAAAAAAAATCCCAAAACATTGTTTCA 589

 51924685 AAAAGAAGTGGTATGAAGCATCTTAGTGTTTCATGAATATTGAAGAATAGTGCAATTATT 51924744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      590 AAAAGAAGTGGTATGAAGCATCTTAGTGTTTCATGAATATTGAAGAATAGTGCAATTATT 649

 51924745 GAAATTTGGCATTTAAAAAATGTTTTTAAATTATTAGGAAGCTACCGTGACCTGTTTACT 51924804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      650 GAAATTTGGCATTTAAAAAATGTTTTTAAATTATTAGGAAGCTACCGTGACCTGTTTACT 709

 51924805 AAATCCTCAATTCTTTCTCTCTCAGTTTTTCTTACTATAAAATTTACTTTTCAAGCCAGA 51924864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      710 AAATCCTCAATTCTTTCTCTCTCAGTTTTTCTTACTATAAAATTTACTTTTCAAGCCAGA 769

 51924865 GAATTTTTCTTTCTGACAAGACGTAGATCTATATTGCGCTGTCAAGATGCAGCTTTTGCA 51924924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      770 GAATTTTTCTTTCTGACAAGACGTAGATCTATATTGCGCTGTCAAGATGCAGCTTTTGCA 829

 51924925 TCTCTGCTGCCATGTGGATAGAATAACTTTCTTTCCTCAAGAAGTGGACAAGCCCTCATA 51924984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      830 TCTCTGCTGCCATGTGGATAGAATAACTTTCTTTCCTCAAGAAGTGGACAAGCCCTCATA 889

 51924985 GGGACTGATTTTCTGTGAAGTAGTGAGACTTAATCTTTGGGACCTTCACTTACATCACTT 51925044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      890 GGGACTGATTTTCTGTGAAGTAGTGAGACTTAATCTTTGGGACCTTCACTTACATCACTT 949

 51925045 ACATAGGACCTTTCAATACTCAGGGAGGGCCCTTGGCAATAAGTTCTTCTGACAATATAT 51925104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      950 ACATAGGACCTTTCAATACTCAGGGAGGGCCCTTGGCAATAAGTTCTTCTGACAATATAT 1009

 51925105 CTTGTGCTGATGGTGGTGTTAGCTTTCAAAATTTGTAATTATTTTGGTAATTTCTGTCAT 51925164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1010 CTTGTGCTGATGGTGGTGTTAGCTTTCAAAATTTGTAATTATTTTGGTAATTTCTGTCAT 1069

 51925165 CCTAGAAAAATGTGTATAGTGTATTTGTTCCTAATTTCATTTTCATTATTTATATATTTT 51925224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1070 CCTAGAAAAATGTGTATAGTGTATTTGTTCCTAATTTCATTTTCATTATTTATATATTTT 1129

 51925225 TTAATGAACACCCCCAGCATAGTATAAGTTTTATACCTCTACAATCTGAATCACCCGCTT 51925284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1130 TTAATGAACACCCCCAGCATAGTATAAGTTTTATACCTCTACAATCTGAATCACCCGCTT 1189

 51925285 GGCCCATGCCTAGGACTAGGTCTTATCATCCGCAGTGAGAGATTATAGGCTCTTACTAGG 51925344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1190 GGCCCATGCCTAGGACTAGGTCTTATCATCCGCAGTGAGAGATTATAGGCTCTTACTAGG 1249

 51925345 AATTTATGGTAACATGGGCTCCTAACAGTCATGATTTTTATAACATGATTGCCTATGTAT 51925404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1250 AATTTATGGTAACATGGGCTCCTAACAGTCATGATTTTTATAACATGATTGCCTATGTAT 1309

 51925405 ATAAAGTCCACTGGCTGAACAAGTATTTTCCCTCAAATCAGGAAGGAAAAAAAAAAACAC 51925464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1310 ATAAAGTCCACTGGCTGAACAAGTATTTTCCCTCAAATCAGGAAGGAAAAAAAAAAACAC 1369

 51925465 GAAGCAAATTGATCCTCTTCTAAAAGCTGTCACATCAGTAACCCATCATATTCTCATTTA 51925524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1370 GAAGCAAATTGATCCTCTTCTAAAAGCTGTCACATCAGTAACCCATCATATTCTCATTTA 1429

 51925525 CTTATATACTGAGTAGGTAGTCACCTTTGATTCATATCTCTCAGGAGTTCAGAAGTTTTT 51925584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1430 CTTATATACTGAGTAGGTAGTCACCTTTGATTCATATCTCTCAGGAGTTCAGAAGTTTTT 1489

 51925585 GAAAGTAATTTGTGATACAAAATATAGGGAAATTCAGAATGAGATTCTTTTGGCTTGTCT 51925644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1490 GAAAGTAATTTGTGATACAAAATATAGGGAAATTCAGAATGAGATTCTTTTGGCTTGTCT 1549

 51925645 TTCTTTTTCTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTATTTGTTGAACTCAAATCCGGAAATTGTG 51925704
          ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1550 TTCTTTTTCTTTTTTTC-TTTTTTTTTTTTTATTTGTTGAACTCAAATCCGGAAATTGTG 1608

 51925705 GAGGTTACTAGAACTCTAAGTCACAGACTTATAAGTACTGAAAAAGTAGTCAGTAAAGAA 51925764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1609 GAGGTTACTAGAACTCTAAGTCACAGACTTATAAGTACTGAAAAAGTAGTCAGTAAAGAA 1668

 51925765 AACATACAGTAAGAGACTAGGTTAATTTTCCTATAGTTCATTGATGTTTCCACTATTACT 51925824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1669 AACATACAGTAAGAGACTAGGTTAATTTTCCTATAGTTCATTGATGTTTCCACTATTACT 1728

 51925825 GCCCCTGATTTTTAACTTTAGTTTTCCTTAGATTGTTGGAGTAATATATGTACCTTAAAA 51925884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1729 GCCCCTGATTTTTAACTTTAGTTTTCCTTAGATTGTTGGAGTAATATATGTACCTTAAAA 1788

 51925885 ATTAACTGTGGAACAAGTAGATGAACTTTTTACACAATTTCCTGCTTTTATAAAGTTCCT 51925944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1789 ATTAACTGTGGAACAAGTAGATGAACTTTTTACACAATTTCCTGCTTTTATAAAGTTCCT 1848

 51925945 ACTAGCTATATTTTCCCAAAAGTGCTCAACAATAGAGTCTGGTGCTAAAAAGCAGAGTAG 51926004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1849 ACTAGCTATATTTTCCCAAAAGTGCTCAACAATAGAGTCTGGTGCTAAAAAGCAGAGTAG 1908

 51926005 GCTAAATTTAGATCAATGTGAAATGCCCTACTTATTTCCTATGAACTTAATTGATTGAGC 51926064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1909 GCTAAATTTAGATCAATGTGAAATGCCCTACTTATTTCCTATGAACTTAATTGATTGAGC 1968

 51926065 TCATTTTGGGGGTGTCTTTCTGATCGACCAGAAACTTGGCTCATTAGAGCAACTCACAAA 51926124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1969 TCATTTTGGGGGTGTCTTTCTGATCGACCAGAAACTTGGCTCATTAGAGCAACTCACAAA 2028

 51926125 GTGACCTTTTAAAAGAAAGAGTTTTCAATATATTTGTTCATGTTCCATTCCACTGAGAAT 51926184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2029 GTGACCTTTTAAAAGAAAGAGTTTTCAATATATTTGTTCATGTTCCATTCCACTGAGAAT 2088

 51926185 GGTGCTATTTAAAACTAAATACAATAATTTTAGATATTGTACAGCAGATATAATTTTAAA 51926244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     2089 GGTGCTATTTAAAACTAAATACAATAATTTTAGATATTGTACAGCAGATATAATTTTAGA 2148

 51926245 CATAATACATGGGATTTCGATTTTAGGTACTGTTTATAAGGCATTTCTCCTTATATTATT 51926304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2149 CATAATACATGGGATTTCGATTTTAGGTACTGTTTATAAGGCATTTCTCCTTATATTATT 2208

 51926305 CTAGACTTAAATATAACAAATTTCATGCAGAGGTTTCTTTCAAAAGTAAATTCAGCCACA 51926364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2209 CTAGACTTAAATATAACAAATTTCATGCAGAGGTTTCTTTCAAAAGTAAATTCAGCCACA 2268

 51926365 TTTAGACTCAAATATTCCCTAATTTTTTAGTGTAGCTGAAGTCCTAATAATATACTTGTG 51926424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2269 TTTAGACTCAAATATTCCCTAATTTTTTAGTGTAGCTGAAGTCCTAATAATATACTTGTG 2328

 51926425 TTTCTTTTAAATTAAGTCCCACATGTTAACTTTACAACAGAAAGTCCATGTATCGTATTA 51926484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     2329 TTTCTTTTAAATTAAGTCCCACATGTTAACTTTACAGCAGAAAGTCCATGTATCGTATTA 2388

 51926485 TTAGTCTAAATCTTCATTTTACTGTTTAGTTAACACAGACATTCATTTAACACACTATGT 51926544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2389 TTAGTCTAAATCTTCATTTTACTGTTTAGTTAACACAGACATTCATTTAACACACTATGT 2448

 51926545 TTAATTTCCCACTCAGTTTTGGCTTATTGTAGTCTAATAAACAATGATTAAACAATGCCC 51926604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2449 TTAATTTCCCACTCAGTTTTGGCTTATTGTAGTCTAATAAACAATGATTAAACAATGCCC 2508

 51926605 CACTTAATGC 51926614
          ||||||||||
     2509 CACTTAATGC 2518

Alignment time is 1.87004 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51916584,51937767] =>     21184 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [       1,    3146] =>      3146 nucs 'mol-32-2f1d-059171_3146'

Score:        3025
Aligned:      3146        nucs
Identic:      3135 (100%) nucs =>        75 (100%)      3060 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51927620,51927694] EXCISED REGION [51927696,51930765]
 second seq =>  [       1,      75] EXCISED REGION [      77,    3146]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [51927695,51927695]
 second seq =>         1 nucs [76,76]
ALTERNATIVE REGION(S): 2
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [2981,2981]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [51927694,51927694] to [51927696,51927696]
 second seq =>         1 nucs [75,75] to [77,77]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 51927620 TTCCATTATTTTTTCCTTTATTGTAATATTTTTCACTTATTGTAATATTTTTCCATGTCA 51927679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTCCATTATTTTTTCCTTTATTGTAATATTTTTCACTTATTGTAATATTTTTCCATGTCA 60

 51927680 TAGTTTCACTTATTT 51927694
          |||||||||||||||
       61 TAGTTTCACTTATTT 75

EXCISED REGION

 51927696 TCAACATACTATGTATCCATGAATGTCCTGAAGGGAAAAAAAAATCTCATATATACCTAA 51927755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       77 TCAACATACTATGTATCCATGAATGTCCTGAAGGGAAAAAAAAATCTCATATATACCTAA 136

 51927756 CTGATGTGCTTGACATATAGTAAGTTGTCCATAAGTATTTGCTGGTAGATTTATTTATTT 51927815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      137 CTGATGTGCTTGACATATAGTAAGTTGTCCATAAGTATTTGCTGGTAGATTTATTTATTT 196

 51927816 TTTAAAAAAACAACTTGGAAAGTTTTCTGTGTGCTTTTATATTAGAACTTGACCTTTGAA 51927875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      197 TTTAAAAAAACAACTTGGAAAGTTTTCTGTGTGCTTTTATATTAGAACTTGACCTTTGAA 256

 51927876 GTACCTCCAGGAAATTTTGAAGAGTGCTGGCATATGACAATGCGTAAGTTTATATTTCAT 51927935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      257 GTACCTCCAGGAAATTTTGAAGAGTGCTGGCATATGACAATGCGTAAGTTTATATTTCAT 316

 51927936 GTCCATGCATGCCATTAAAATTCTAATAATGTAGTTGACAGAGCCTTTCTTGTCCCTTAA 51927995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      317 GTCCATGCATGCCATTAAAATTCTAATAATGTAGTTGACAGAGCCTTTCTTGTCCCTTAA 376

 51927996 GCACTAAATTTGTGGCTTGCTCTAGATTGTCCCACCTGGCACAAGCGAGGTGAAATTTCA 51928055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
      377 GCACTAAATTTGTGGCTTGCTCTAGATTGTCCCACCTGGCACAAGCTAGGTGAAATTTCA 436

 51928056 GGTCTAGCCAACTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTAACAAGTATTAAAAACATTTTCATATAT 51928115
          ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      437 GGTCTAGCCAACTTTTTTC-TTTTTTTTTTTTAACAAGTATTAAAAACATTTTCATATAT 495

 51928116 ATTCCCTGTATTATTTCACCTATTTTTGTGTGTGTGTTTCTATCACACTGCCACATCAAA 51928175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      496 ATTCCCTGTATTATTTCACCTATTTTTGTGTGTGTGTTTCTATCACACTGCCACATCAAA 555

 51928176 AACCTCTTCTTGAACGACTATAGTATAGTGGTTAATAGTTCAGTGTCTAGATCAAGACCA 51928235
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
      556 AACCTCTTCTTGAACGACTATAGTATAGTGATTAATAGTTCAGTGTCTAGATCAAGACCA 615

 51928236 CCTATGGACGTATCTTGGCTCTGATTTTACCAGCCGTACAATCCTGGAGAATCTGTTCAA 51928295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      616 CCTATGGACGTATCTTGGCTCTGATTTTACCAGCCGTACAATCCTGGAGAATCTGTTCAA 675

 51928296 GAGAAATGTGCCTCAATTACGTATCTCTAAAGTAGTTGTAGCTATAGAACCTGTTCCATA 51928355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      676 GAGAAATGTGCCTCAATTACGTATCTCTAAAGTAGTTGTAGCTATAGAACCTGTTCCATA 735

 51928356 GATGTGGATCAGAACACTGCATGACATTTAGAAAATGTTTAATAAATGATGTTGCTGTAC 51928415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      736 GATGTGGATCAGAACACTGCATGACATTTAGAAAATGTTTAATAAATGATGTTGCTGTAC 795

 51928416 TTGTTGCTGTTATTGTTGCTCTGTCATGTTAGGAGAACTCTCATTTACCCTAGTGTTCTC 51928475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      796 TTGTTGCTGTTATTGTTGCTCTGTCATGTTAGGAGAACTCTCATTTACCCTAGTGTTCTC 855

 51928476 TCAAAGTGAAATACAGATCATTACCTCTTGAAATCATGTCCAAGTAACTTCAGAATTATT 51928535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      856 TCAAAGTGAAATACAGATCATTACCTCTTGAAATCATGTCCAAGTAACTTCAGAATTATT 915

 51928536 TAGAAATCATTTATCTAAATCAGAGTATTTCTTGATATAATTTAAAGTTGATTGTATTTG 51928595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      916 TAGAAATCATTTATCTAAATCAGAGTATTTCTTGATATAATTTAAAGTTGATTGTATTTG 975

 51928596 AAAGTACATATGTCAATCTAGTATGAGATAATCTCAAGGAAATAAAAATGTATAGGTCTA 51928655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      976 AAAGTACATATGTCAATCTAGTATGAGATAATCTCAAGGAAATAAAAATGTATAGGTCTA 1035

 51928656 ATTTACATTTTTATATGGAAGGAGATAATTACTTTCTATCACAAATGATGAAGGCTGACG 51928715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1036 ATTTACATTTTTATATGGAAGGAGATAATTACTTTCTATCACAAATGATGAAGGCTGACG 1095

 51928716 TTTGTTTCTTTTTTACTTTTAATTTTCACTTATATTTTGTTTATTATCAATATTTGCTTT 51928775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1096 TTTGTTTCTTTTTTACTTTTAATTTTCACTTATATTTTGTTTATTATCAATATTTGCTTT 1155

 51928776 TTAAAAGGTGGGAAGAAATCAACCAATCAAACATTAAAAAGCAATATGGAGGAGGGTGAT 51928835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1156 TTAAAAGGTGGGAAGAAATCAACCAATCAAACATTAAAAAGCAATATGGAGGAGGGTGAT 1215

 51928836 ATAATGCCCACTTATATTTCTCTTATAATTTTAAATATTTTCATAATTAACAGAATAATT 51928895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1216 ATAATGCCCACTTATATTTCTCTTATAATTTTAAATATTTTCATAATTAACAGAATAATT 1275

 51928896 AGCACTGGTAATATTAAAATACCATCAAAAGAATCTAAATGTATGTGCTTTCTGTTGCAG 51928955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1276 AGCACTGGTAATATTAAAATACCATCAAAAGAATCTAAATGTATGTGCTTTCTGTTGCAG 1335

 51928956 CCTTGTTAGATGTTTCAGTGGATTCAAAGTGTTGTTATAAGAAAACGTGATTTATCAAGA 51929015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1336 CCTTGTTAGATGTTTCAGTGGATTCAAAGTGTTGTTATAAGAAAACGTGATTTATCAAGA 1395

 51929016 CTTTCATGTGTAAAATAAAAGGCATTTTCAATGACTACTTGGCCAGGCTTTCAGATTCCA 51929075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1396 CTTTCATGTGTAAAATAAAAGGCATTTTCAATGACTACTTGGCCAGGCTTTCAGATTCCA 1455

 51929076 ATGCCAAGATGTTGTATTTTGATATTGCAGTTTTCTAACAACAACAAAGTTGAGTGGACT 51929135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1456 ATGCCAAGATGTTGTATTTTGATATTGCAGTTTTCTAACAACAACAAAGTTGAGTGGACT 1515

 51929136 TCTGGAACTAAAACTTAAATATTCAGAACTAATTATCACCACTCTATTTCTTACAGAGCA 51929195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1516 TCTGGAACTAAAACTTAAATATTCAGAACTAATTATCACCACTCTATTTCTTACAGAGCA 1575

 51929196 TTTAAGGAACACATATATGCATATATCCTTGCACTTTGTGCTACAGGTTGTGAGCCAGGG 51929255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1576 TTTAAGGAACACATATATGCATATATCCTTGCACTTTGTGCTACAGGTTGTGAGCCAGGG 1635

 51929256 TTACTTCCTTCTGACCATGTGGGTTCATAATGAAGACCCAACCTTAAGGTACCCAGGGCT 51929315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1636 TTACTTCCTTCTGACCATGTGGGTTCATAATGAAGACCCAACCTTAAGGTACCCAGGGCT 1695

 51929316 TAGAAATCAAATTTGTCCTTAGGACACTTTGGAAATCTATCTTGTAGTACAGGTGACCCA 51929375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1696 TAGAAATCAAATTTGTCCTTAGGACACTTTGGAAATCTATCTTGTAGTACAGGTGACCCA 1755

 51929376 GCAGCAATCAATCTTTCTGCCATCCCTAGTTTTAGTTCAGGACCCAGAAAAGTTGTAACT 51929435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     1756 GCAGCAATCAATCTTTCTGCCATCCCTAGTTTTACTTCAGGACCCAGAAAAGTTGTAACT 1815

 51929436 TGTTTCCTTTCCTGTGATCAAGCCTTTGTTTTCTCTTTTTTTCTCCACTTTTTGTAGCTT 51929495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1816 TGTTTCCTTTCCTGTGATCAAGCCTTTGTTTTCTCTTTTTTTCTCCACTTTTTGTAGCTT 1875

 51929496 TTTAATTTGTTTCTCTGTTGATTACTAGCCCAATGCCTGAGCATCTTCGTCTTAAGACAA 51929555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1876 TTTAATTTGTTTCTCTGTTGATTACTAGCCCAATGCCTGAGCATCTTCGTCTTAAGACAA 1935

 51929556 AGCCTCTGTGTTTCTTCAGCTCCTGAAATGACTGGCATGCTGAAAATGAGCTCAGGGCAT 51929615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1936 AGCCTCTGTGTTTCTTCAGCTCCTGAAATGACTGGCATGCTGAAAATGAGCTCAGGGCAT 1995

 51929616 TAGTCTTTGCTACTAAGCCACTACAGATTCCATTCCCTTTCTTCTTGAGTATGCACACAC 51929675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     1996 TAGTCTTTGCTACTAAGCCACTACAGATTCCATTCCCTTTCTTCCTGAGTATGCACACAC 2055

 51929676 CGCTTGTTCACAGACTCCAGATTAGTTATTAAGCTACATCTGTATGCAGTTTGCACTCTC 51929735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2056 CGCTTGTTCACAGACTCCAGATTAGTTATTAAGCTACATCTGTATGCAGTTTGCACTCTC 2115

 51929736 CTGCCTTCGACCTGCTTGTCCCAGAAGTTATTCACCATATTCTACCTTGATCATATTTTC 51929795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2116 CTGCCTTCGACCTGCTTGTCCCAGAAGTTATTCACCATATTCTACCTTGATCATATTTTC 2175

 51929796 TACTTGTCAATGCGCATGTCAATTAAGAACTTTTAACATTTATTGACCATTTATTATATA 51929855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2176 TACTTGTCAATGCGCATGTCAATTAAGAACTTTTAACATTTATTGACCATTTATTATATA 2235

 51929856 CTAGCCAGTCTTTTAATTGATTTATGAACAATTAACTTAATCATCATATAAGCATAGTAG 51929915
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2236 CTAGCCAGTCTTTTAATTGCTTTATGAACAATTAACTTAATCATCATATAAGCATAGTAG 2295

 51929916 GGTACAATTAGTTCCCCAACTTTATATATGAACAAATGGACTTTCAGAAAGGTAAGGTAA 51929975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2296 GGTACAATTAGTTCCCCAACTTTATATATGAACAAATGGACTTTCAGAAAGGTAAGGTAA 2355

 51929976 AATATCCACGGTAAGAAAGCCTGCATATGTGGAACTGGGAATTGAACCCCTATGTCTGAC 51930035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     2356 AATATCCACGGTAAGAAAGCCTGCATATGTGGAACTGGGAATTGAACCCCTATGGCTGAC 2415

 51930036 CCGAGGGTCCATACACTTAAGCATTATGCTATCAAGTTTTCCACAGCCTGCTTTTCGGCT 51930095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2416 CCGAGGGTCCATACACTTAAGCATTATGCTATCAAGTTTTCCACAGCCTGCTTTTCGGCT 2475

 51930096 TCTCTCTCTTTCTTTCTTTCCTGATCTCTGTTGCAATTCCTACCTTTCAACTCCCTTCTG 51930155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2476 TCTCTCTCTTTCTTTCTTTCCTGATCTCTGTTGCAATTCCTACCTTTCAACTCCCTTCTG 2535

 51930156 ACCATGGATAGTTTGCAAAATGCCAGAGGTACGTCTCAAAGAAGCTTCAAATAGGAGCGT 51930215
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2536 ACCATGGACAGTTTGCAAAATGCCAGAGGTACGTCTCAAAGAAGCTTCAAATAGGAGCGT 2595

 51930216 GTACTACCATTAAGTCAGCTCCTCAGTTGTCTTCTTTGGATTGAGAAGCACTTCATCACT 51930275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2596 GTACTACCATTAAGTCAGCTCCTCAGTTGTCTTCTTTGGATTGAGAAGCACTTCATCACT 2655

 51930276 TTTTACACAGGTTTAATTATCAAATATGACTTTTCTAGTACTACAGCTAATATATGTCAA 51930335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2656 TTTTACACAGGTTTAATTATCAAATATGACTTTTCTAGTACTACAGCTAATATATGTCAA 2715

 51930336 TGTCAAAGGGTTAACAGAATACTAGGCCTATATTAAATTATACATATGAGCTTTCTCTTT 51930395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2716 TGTCAAAGGGTTAACAGAATACTAGGCCTATATTAAATTATACATATGAGCTTTCTCTTT 2775

 51930396 ACTCCTTTTTATGTTCATTAGCAAACAGATAAAGCCATAATAGATTTTTTAAGGAATATT 51930455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2776 ACTCCTTTTTATGTTCATTAGCAAACAGATAAAGCCATAATAGATTTTTTAAGGAATATT 2835

 51930456 TTGTTTTGTTTTGTTTTGGACTTATACATCTATTAACAATAAACCAAACATTGCAGATTA 51930515
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2836 TTGTTTTGTTTTATTTTGGACTTATACATCTATTAACAATAAACCAAACATTGCAGATTA 2895

 51930516 AAGCAAATCTGCCAATCTGTTTTACAAACACTATCTTCTGAAGGGTTCCTGGGCACAAGA 51930575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2896 AAGCAAATCTGCCAATCTGTTTTACAAACACTATCTTCTGAAGGGTTCCTGGGCACAAGA 2955

 51930576 TACTGTTCTAGTAATATTTCACAGC-TTTTTTTTTTTTTTCATTTTAGAGAAAATATTCT 51930634
          ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2956 TACTGTTCTAGTAATATTTCACAGCTTTTTTTTTTTTTTTCATTTTAGAGAAAATATTCT 3015

 51930635 AAGACTCCAAAGTTCGATAGTATTTGGTCAGTGTCTTAGTCAGTTTGAGCTAATATAACA 51930694
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3016 AAGACTCCAAAGTTAGATAGTATTTGGTCAGTGTCTTAGTCAGTTTGAGCTAATATAACA 3075

 51930695 AATTATCATAGAATAAGTGTCTCAAGCAACAGAAATGTATTTTTTACAATCTGGAGGCTG 51930754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3076 AATTATCATAGAATAAGTGTCTCAAGCAACAGAAATGTATTTTTTACAATCTGGAGGCTG 3135

 51930755 CAAAGTCCAGA 51930765
          |||||||||||
     3136 CAAAGTCCAGA 3146

Alignment time is 2.36381 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51916584,51937767] =>     21184 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [       1,    5266] =>      5266 nucs 'mol-32-2fd8-159170_5266'

Score:        5201
Aligned:      5267        nucs
Identic:      5261 (100%) nucs =>      1536 (100%)      3725 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51922187,51923723] EXCISED REGION [51923730,51927458]
 second seq =>  [       1,    1537] EXCISED REGION [    1538,    5266]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         6 nucs [51923724,51923729]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        33 nucs [51923724,51923756] to [51923730,51923762]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [51923724,51923725] to [51923728,51923729]
 second seq =>         0 nucs

 51922187 GGCAACTCATCTGTTACTAAGAGATAACTTGGCCGGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAATC 51922246
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGCAACTCATCTGTTAGTAAGAGATAACTTGGCCGGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAATC 60

 51922247 CCAGCACTGTGGGAGGCTGAGGTGGGGGGATCACTAGGTCAGGAGATCAAGACCATCGTG 51922306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCAGCACTGTGGGAGGCTGAGGTGGGGGGATCACTAGGTCAGGAGATCAAGACCATCGTG 120

 51922307 GCCAACATGGTGAAACCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTTGTGG 51922366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GCCAACATGGTGAAACCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTTGTGG 180

 51922367 GCACCTGTAATCCCACCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATAGCTTGAACCAGGGAGT 51922426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCACCTGTAATCCCACCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATAGCTTGAACCAGGGAGT 240

 51922427 TGGAGGTTACAGTGAGCCAAGATCACACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGA 51922486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGGAGGTTACAGTGAGCCAAGATCACACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGA 300

 51922487 CTCCATCTCAAAAAAAAGATAGAGTTAACTTGAATTTACTTAAATCATAACTTGGGGGAA 51922546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTCCATCTCAAAAAAAAGATAGAGTTAACTTGAATTTACTTAAATCATAACTTGGGGGAA 360

 51922547 TTTTACCATTAAATCATTATACAATATTTTTATTACTCTGTTCAGAGTAATATACCAGAG 51922606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTTTACCATTAAATCATTATACAATATTTTTATTACTCTGTTCAGAGTAATATACCAGAG 420

 51922607 TAAGTACCATTTTATAAGCTTCTATAGTTCAATGGCATCTCCATGAAACTTATATAAGTA 51922666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TAAGTACCATTTTATAAGCTTCTATAGTTCAATGGCATCTCCATGAAACTTATATAAGTA 480

 51922667 GCTTTTAATTAAAAATTAAAGTTTTTTTCAGAAAGAATTTTTTTGTTAATTGGTCATTAT 51922726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GCTTTTAATTAAAAATTAAAGTTTTTTTCAGAAAGAATTTTTTTGTTAATTGGTCATTAT 540

 51922727 CCATTTATTGATTTCTTATGGCATGTTCAGCTTTATTCATAAAATAGGCATCATCTAAAA 51922786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CCATTTATTGATTTCTTATGGCATGTTCAGCTTTATTCATAAAATAGGCATCATCTAAAA 600

 51922787 GAATTGTAAGCATGAATTCCTTTTCAGTGTGTGGGCAGTGTAATTGGAGAGCCAAGAGAA 51922846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GAATTGTAAGCATGAATTCCTTTTCAGTGTGTGGGCAGTGTAATTGGAGAGCCAAGAGAA 660

 51922847 ATACAGAGGAAATTACTGATGCCAAAAATACATAAAATGTAATAGAGAAAATAGAATTGG 51922906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATACAGAGGAAATTACTGATGCCAAAAATACATAAAATGTAATAGAGAAAATAGAATTGG 720

 51922907 AAACTCTTCTTGGTATACTCTCTTTCTTCATACTGAATCACATGGCTCGCTATCAGTTCA 51922966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAACTCTTCTTGGTATACTCTCTTTCTTCATACTGAATCACATGGCTCGCTATCAGTTCA 780

 51922967 AATAGGAATTTTTAAGGAAGTCCTTTATGGATTTCACCTCACTCCAATGTGTCCACACTC 51923026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AATAGGAATTTTTAAGGAAGTCCTTTATGGATTTCACCTCACTCCAATGTGTCCACACTC 840

 51923027 AGTGCTTTCTCAGGATAAAGAAACTCAATTCTATTACATAATTTTGTAAATTGTTTTCTT 51923086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGTGCTTTCTCAGGATAAAGAAACTCAATTCTATTACATAATTTTGTAAATTGTTTTCTT 900

 51923087 TTTCTTTGCCCACCATATTCTCATAAGGACACCTTAAGCTCCTCAAAAGCACAAAACGCA 51923146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTTCTTTGCCCACCATATTCTCATAAGGACACCTTAAGCTCCTCAAAAGCACAAAACGCA 960

 51923147 AATTCTATTTCTTTGTCAACCCTCTCTCTAGTAAAGTTCTAGGTAAAGAATAAATGCATG 51923206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AATTCTATTTCTTTGTCAACCCTCTCTCTAGTAAAGTTCTAGGTAAAGAATAAATGCATG 1020

 51923207 ACTGATTGTTTTAATGAGCGCTAATGGGTGTTGTTAAATCCCTTACTATCTGAGGAGATC 51923266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ACTGATTGTTTTAATGAGCGCTAATGGGTGTTGTTAAATCCCTTACTATCTGAGGAGATC 1080

 51923267 GTTGCTTATGGCAGCCCCTGTGATTTTAAAAGCTCTTCCATGTTGGAATAAAGGCAAAAT 51923326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GTTGCTTATGGCAGCCCCTGTGATTTTAAAAGCTCTTCCATGTTGGAATAAAGGCAAAAT 1140

 51923327 ACAGTGATTTCAAAGAACTGGGGAGAGAAATTTTAAGATTTCCTTTTGGGAAAATTTCAG 51923386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ACAGTGATTTCAAAGAACTGGGGAGAGAAATTTTAAGATTTCCTTTTGGGAAAATTTCAG 1200

 51923387 GCAAAAAATTACATCTTATAATCCATTCCAGGCTTTTGATTGTATGATTACCCCATTTAC 51923446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GCAAAAAATTACATCTTATAATCCATTCCAGGCTTTTGATTGTATGATTACCCCATTTAC 1260

 51923447 AATTGATGTTGAAAATAATATTTTCTCACTTGCCACAGCCTCTTCTTTGCATTCTCTCAC 51923506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AATTGATGTTGAAAATAATATTTTCTCACTTGCCACAGCCTCTTCTTTGCATTCTCTCAC 1320

 51923507 CCTCAGCTATTATATATTAGCTCAGTACCTGCATTATTTACAGGAACTGAAAAACAGGGT 51923566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CCTCAGCTATTATATATTAGCTCAGTACCTGCATTATTTACAGGAACTGAAAAACAGGGT 1380

 51923567 TGAAGATTATAAAATCTCACATTTGCTGACTTTTATGCAGGTTAAATGAAAGAGTTTTAT 51923626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TGAAGATTATAAAATCTCACATTTGCTGACTTTTATGCAGGTTAAATGAAAGAGTTTTAT 1440

 51923627 AATTGTTTCTGCCAACCAGTAGGTTCAAAATGTTTATTAAAAGTGAATTCTGGATAAATT 51923686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AATTGTTTCTGCCAACCAGTAGGTTCAAAATGTTTATTAAAAGTGAATTCTGGATAAATT 1500

 51923687 ATGATTAATGTCCTTCTGGTTTGTTTTGCTTGAGCCT 51923723
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATGATTAATGTCCTTCTGGTTTGTTTTGCTTGAGCCT 1537

EXCISED REGION

 51923730 ACACACACACACACACACACACACACACACACATATACACACACATATATATATAACTTT 51923789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1538 ACACACACACACACACACACACACACACACACATATACACACACATATATATATAACTTT 1597

 51923790 ATATAAAACTATAAATACTAGGAACTAGCACTAGAACTGTACTTTTCACTACAGTATCAG 51923849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1598 ATATAAAACTATAAATACTAGGAACTAGCACTAGAACTGTACTTTTCACTACAGTATCAG 1657

 51923850 T-AAAAAAAAAAAATTTAGGATTTTTTATGACTGATTTTACATTTAAACCTAAAGGAAAA 51923908
          | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1658 TAAAAAAAAAAAAATTTAGGATTTTTTATGACTGATTTTACATTTAAACCTAAAGGAAAA 1717

 51923909 ATAATCAGGAACAACACAGAGTTTTTTTTTTTAAATGAGTTGGCAAAGAAAATACCAAAG 51923968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1718 ATAATCAGGAACAACACAGAGTTTTTTTTTTTAAATGAGTTGGCAAAGAAAATACCAAAG 1777

 51923969 GCTCAAACCTGACAAAAGCATTGAGAATACCAGAAAAGAAATTTTAACCTTTAAATTTAA 51924028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1778 GCTCAAACCTGACAAAAGCATTGAGAATACCAGAAAAGAAATTTTAACCTTTAAATTTAA 1837

 51924029 TTGAAACATGATATTTTTCTCTTTTGAAACATTTCTTTCTCTACAAAAATCTGTTCCTTC 51924088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1838 TTGAAACATGATATTTTTCTCTTTTGAAACATTTCTTTCTCTACAAAAATCTGTTCCTTC 1897

 51924089 AGAACCTGTTGATGCAATAATATTATATCATTTTTTTTTACTGGTCAATGTATTTATTTG 51924148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1898 AGAACCTGTTGATGCAATAATATTATATCATTTTTTTTTACTGGTCAATGTATTTATTTG 1957

 51924149 TAATTGTTCTGAAATTGTTTCCTGCAAGGTTTTCTATTACTCAAACTGTCTTTGTACACA 51924208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1958 TAATTGTTCTGAAATTGTTTCCTGCAAGGTTTTCTATTACTCAAACTGTCTTTGTACACA 2017

 51924209 TAATTTTCCTTTCATGCCATTTATGAACCATTTTTTATTTCTATGGTTGATAGAGAATGA 51924268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2018 TAATTTTCCTTTCATGCCATTTATGAACCATTTTTTATTTCTATGGTTGATAGAGAATGA 2077

 51924269 CTTCATAATTCATTTCTGAATAAGTGAAATAATTTAAAAACATTTTAAAGTGGGTGTATC 51924328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2078 CTTCATAATTCATTTCTGAATAAGTGAAATAATTTAAAAACATTTTAAAGTGGGTGTATC 2137

 51924329 TACTTGCTTGGAGCTTTGTCGAATCATGTTTCTTATTTGGAGCCTCTGGAGGAATGTTGA 51924388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2138 TACTTGCTTGGAGCTTTGTCGAATCATGTTTCTTATTTGGAGCCTCTGGAGGAATGTTGA 2197

 51924389 CTTACCATGGTAAAAATTAACTGGTGAAACTCTAAAGAAAACACAGACTCTACACGCAGT 51924448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2198 CTTACCATGGTAAAAATTAACTGGTGAAACTCTAAAGAAAACACAGACTCTACACGCAGT 2257

 51924449 CTTGTCCGAAACTTACTCACCCTGAAACCAATGAATTTCAAAGACCTAGATACTTCCTTC 51924508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2258 CTTGTCCGAAACTTACTCACCCTGAAACCAATGAATTTCAAAGACCTAGATACTTCCTTC 2317

 51924509 TGTGATGTCCCCTGAGATCAGAGAATAAAAGAAAAATCCCTCGTAAATATACATCACGTA 51924568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2318 TGTGATGTCCCCTGAGATCAGAGAATAAAAGAAAAATCCCTCGTAAATATACATCACGTA 2377

 51924569 CAGCTGTTTGATTTATGCATTATGCAGAAACTAAGAAAACAGAGTTATATGTAACCTTGC 51924628
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     2378 CAGCTGTTTGATTTATGCATTATGCAGAAACTAAGAAAACAGAGTTATATGTAACTTTGC 2437

 51924629 AATGAGAAGTGCACCCACCAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCCCAAAACATTGTTTCAAAAA 51924688
          ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2438 AATGAGAAGTGCACCCACC-AAAAAAAAAAAAAAAAAATCCCAAAACATTGTTTCAAAAA 2496

 51924689 GAAGTGGTATGAAGCATCTTAGTGTTTCATGAATATTGAAGAATAGTGCAATTATTGAAA 51924748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2497 GAAGTGGTATGAAGCATCTTAGTGTTTCATGAATATTGAAGAATAGTGCAATTATTGAAA 2556

 51924749 TTTGGCATTTAAAAAATGTTTTTAAATTATTAGGAAGCTACCGTGACCTGTTTACTAAAT 51924808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2557 TTTGGCATTTAAAAAATGTTTTTAAATTATTAGGAAGCTACCGTGACCTGTTTACTAAAT 2616

 51924809 CCTCAATTCTTTCTCTCTCAGTTTTTCTTACTATAAAATTTACTTTTCAAGCCAGAGAAT 51924868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2617 CCTCAATTCTTTCTCTCTCAGTTTTTCTTACTATAAAATTTACTTTTCAAGCCAGAGAAT 2676

 51924869 TTTTCTTTCTGACAAGACGTAGATCTATATTGCGCTGTCAAGATGCAGCTTTTGCATCTC 51924928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2677 TTTTCTTTCTGACAAGACGTAGATCTATATTGCGCTGTCAAGATGCAGCTTTTGCATCTC 2736

 51924929 TGCTGCCATGTGGATAGAATAACTTTCTTTCCTCAAGAAGTGGACAAGCCCTCATAGGGA 51924988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2737 TGCTGCCATGTGGATAGAATAACTTTCTTTCCTCAAGAAGTGGACAAGCCCTCATAGGGA 2796

 51924989 CTGATTTTCTGTGAAGTAGTGAGACTTAATCTTTGGGACCTTCACTTACATCACTTACAT 51925048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2797 CTGATTTTCTGTGAAGTAGTGAGACTTAATCTTTGGGACCTTCACTTACATCACTTACAT 2856

 51925049 AGGACCTTTCAATACTCAGGGAGGGCCCTTGGCAATAAGTTCTTCTGACAATATATCTTG 51925108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2857 AGGACCTTTCAATACTCAGGGAGGGCCCTTGGCAATAAGTTCTTCTGACAATATATCTTG 2916

 51925109 TGCTGATGGTGGTGTTAGCTTTCAAAATTTGTAATTATTTTGGTAATTTCTGTCATCCTA 51925168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2917 TGCTGATGGTGGTGTTAGCTTTCAAAATTTGTAATTATTTTGGTAATTTCTGTCATCCTA 2976

 51925169 GAAAAATGTGTATAGTGTATTTGTTCCTAATTTCATTTTCATTATTTATATATTTTTTAA 51925228
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2977 GAAAAATGTGTATAGTTTATTTGTTCCTAATTTCATTTTCATTATTTATATATTTTTTAA 3036

 51925229 TGAACACCCCCAGCATAGTATAAGTTTTATACCTCTACAATCTGAATCACCCGCTTGGCC 51925288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3037 TGAACACCCCCAGCATAGTATAAGTTTTATACCTCTACAATCTGAATCACCCGCTTGGCC 3096

 51925289 CATGCCTAGGACTAGGTCTTATCATCCGCAGTGAGAGATTATAGGCTCTTACTAGGAATT 51925348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3097 CATGCCTAGGACTAGGTCTTATCATCCGCAGTGAGAGATTATAGGCTCTTACTAGGAATT 3156

 51925349 TATGGTAACATGGGCTCCTAACAGTCATGATTTTTATAACATGATTGCCTATGTATATAA 51925408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3157 TATGGTAACATGGGCTCCTAACAGTCATGATTTTTATAACATGATTGCCTATGTATATAA 3216

 51925409 AGTCCACTGGCTGAACAAGTATTTTCCCTCAAATCAGGAAGGAAAAAAAAAAACACGAAG 51925468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3217 AGTCCACTGGCTGAACAAGTATTTTCCCTCAAATCAGGAAGGAAAAAAAAAAACACGAAG 3276

 51925469 CAAATTGATCCTCTTCTAAAAGCTGTCACATCAGTAACCCATCATATTCTCATTTACTTA 51925528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3277 CAAATTGATCCTCTTCTAAAAGCTGTCACATCAGTAACCCATCATATTCTCATTTACTTA 3336

 51925529 TATACTGAGTAGGTAGTCACCTTTGATTCATATCTCTCAGGAGTTCAGAAGTTTTTGAAA 51925588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3337 TATACTGAGTAGGTAGTCACCTTTGATTCATATCTCTCAGGAGTTCAGAAGTTTTTGAAA 3396

 51925589 GTAATTTGTGATACAAAATATAGGGAAATTCAGAATGAGATTCTTTTGGCTTGTCTTTCT 51925648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3397 GTAATTTGTGATACAAAATATAGGGAAATTCAGAATGAGATTCTTTTGGCTTGTCTTTCT 3456

 51925649 TTTTCTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTATTTGTTGAACTCAAATCCGGAAATTGTGGAGG 51925708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3457 TTTTCTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTATTTGTTGAACTCAAATCCGGAAATTGTGGAGG 3516

 51925709 TTACTAGAACTCTAAGTCACAGACTTATAAGTACTGAAAAAGTAGTCAGTAAAGAAAACA 51925768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3517 TTACTAGAACTCTAAGTCACAGACTTATAAGTACTGAAAAAGTAGTCAGTAAAGAAAACA 3576

 51925769 TACAGTAAGAGACTAGGTTAATTTTCCTATAGTTCATTGATGTTTCCACTATTACTGCCC 51925828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3577 TACAGTAAGAGACTAGGTTAATTTTCCTATAGTTCATTGATGTTTCCACTATTACTGCCC 3636

 51925829 CTGATTTTTAACTTTAGTTTTCCTTAGATTGTTGGAGTAATATATGTACCTTAAAAATTA 51925888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3637 CTGATTTTTAACTTTAGTTTTCCTTAGATTGTTGGAGTAATATATGTACCTTAAAAATTA 3696

 51925889 ACTGTGGAACAAGTAGATGAACTTTTTACACAATTTCCTGCTTTTATAAAGTTCCTACTA 51925948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3697 ACTGTGGAACAAGTAGATGAACTTTTTACACAATTTCCTGCTTTTATAAAGTTCCTACTA 3756

 51925949 GCTATATTTTCCCAAAAGTGCTCAACAATAGAGTCTGGTGCTAAAAAGCAGAGTAGGCTA 51926008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3757 GCTATATTTTCCCAAAAGTGCTCAACAATAGAGTCTGGTGCTAAAAAGCAGAGTAGGCTA 3816

 51926009 AATTTAGATCAATGTGAAATGCCCTACTTATTTCCTATGAACTTAATTGATTGAGCTCAT 51926068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3817 AATTTAGATCAATGTGAAATGCCCTACTTATTTCCTATGAACTTAATTGATTGAGCTCAT 3876

 51926069 TTTGGGGGTGTCTTTCTGATCGACCAGAAACTTGGCTCATTAGAGCAACTCACAAAGTGA 51926128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3877 TTTGGGGGTGTCTTTCTGATCGACCAGAAACTTGGCTCATTAGAGCAACTCACAAAGTGA 3936

 51926129 CCTTTTAAAAGAAAGAGTTTTCAATATATTTGTTCATGTTCCATTCCACTGAGAATGGTG 51926188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3937 CCTTTTAAAAGAAAGAGTTTTCAATATATTTGTTCATGTTCCATTCCACTGAGAATGGTG 3996

 51926189 CTATTTAAAACTAAATACAATAATTTTAGATATTGTACAGCAGATATAATTTTAAACATA 51926248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3997 CTATTTAAAACTAAATACAATAATTTTAGATATTGTACAGCAGATATAATTTTAAACATA 4056

 51926249 ATACATGGGATTTCGATTTTAGGTACTGTTTATAAGGCATTTCTCCTTATATTATTCTAG 51926308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4057 ATACATGGGATTTCGATTTTAGGTACTGTTTATAAGGCATTTCTCCTTATATTATTCTAG 4116

 51926309 ACTTAAATATAACAAATTTCATGCAGAGGTTTCTTTCAAAAGTAAATTCAGCCACATTTA 51926368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4117 ACTTAAATATAACAAATTTCATGCAGAGGTTTCTTTCAAAAGTAAATTCAGCCACATTTA 4176

 51926369 GACTCAAATATTCCCTAATTTTTTAGTGTAGCTGAAGTCCTAATAATATACTTGTGTTTC 51926428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4177 GACTCAAATATTCCCTAATTTTTTAGTGTAGCTGAAGTCCTAATAATATACTTGTGTTTC 4236

 51926429 TTTTAAATTAAGTCCCACATGTTAACTTTACAACAGAAAGTCCATGTATCGTATTATTAG 51926488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     4237 TTTTAAATTAAGTCCCACATGTTAACTTTACAGCAGAAAGTCCATGTATCGTATTATTAG 4296

 51926489 TCTAAATCTTCATTTTACTGTTTAGTTAACACAGACATTCATTTAACACACTATGTTTAA 51926548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4297 TCTAAATCTTCATTTTACTGTTTAGTTAACACAGACATTCATTTAACACACTATGTTTAA 4356

 51926549 TTTCCCACTCAGTTTTGGCTTATTGTAGTCTAATAAACAATGATTAAACAATGCCCCACT 51926608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4357 TTTCCCACTCAGTTTTGGCTTATTGTAGTCTAATAAACAATGATTAAACAATGCCCCACT 4416

 51926609 TAATGCAGGTTGAGAAATAAGTGAAACTATGACATGGAAAAATATTACAATAAGCGAAAA 51926668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4417 TAATGCAGGTTGAGAAATAAGTGAAACTATGACATGGAAAAATATTACAATAAGCGAAAA 4476

 51926669 ATATTACAATAAAGGAAAAAATAATGGAAGAATATCAGTATTTGATGCTATTATACGTGA 51926728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4477 ATATTACAATAAAGGAAAAAATAATGGAAGAATATCAGTATTTGATGCTATTATACGTGA 4536

 51926729 CCATATTGTTTAGCAAACTACTTCAAAAATGAAATTAGGAATTTCAGAGAATCATTTTAT 51926788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4537 CCATATTGTTTAGCAAACTACTTCAAAAATGAAATTAGGAATTTCAGAGAATCATTTTAT 4596

 51926789 TCTCATATCAGAATGCTTGGAAAAGTGAGGGCTAAATGTATTTGTTATTTGACTGTGTAC 51926848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4597 TCTCATATCAGAATGCTTGGAAAAGTGAGGGCTAAATGTATTTGTTATTTGACTGTGTAC 4656

 51926849 ATTATGCCCATGGAATAGCATTTTGGAAGACCCAACATTAAGCTAGCTTTACATAACAAT 51926908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4657 ATTATGCCCATGGAATAGCATTTTGGAAGACCCAACATTAAGCTAGCTTTACATAACAAT 4716

 51926909 GAGTATGTCATGTTAACTTATGATACACTTTAATCCTGGCTTGACTCTGGTAGCTGTGTG 51926968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4717 GAGTATGTCATGTTAACTTATGATACACTTTAATCCTGGCTTGACTCTGGTAGCTGTGTG 4776

 51926969 ACTATAATCTTTCAGGCCTCCATTTACTTATCCAGAAAGTGGAAATAATAATATGTAATT 51927028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4777 ACTATAATCTTTCAGGCCTCCATTTACTTATCCAGAAAGTGGAAATAATAATATGTAATT 4836

 51927029 AATAGATGCCTGGTGAATATTAAATTCATTAATATTTGTCAACTATTTTTCACAGACTTT 51927088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4837 AATAGATGCCTGGTGAATATTAAATTCATTAATATTTGTCAACTATTTTTCACAGACTTT 4896

 51927089 TCATTTAGTTAAGTACACAATAATAAGTAAGCACTCATATATGAATGTGTGTACATATTT 51927148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4897 TCATTTAGTTAAGTACACAATAATAAGTAAGCACTCATATATGAATGTGTGTACATATTT 4956

 51927149 ATCGTAAACAGATCCTCAGTAATTAGTGTAGAAATAAATGTTCTAGACAATCCAAAGTTA 51927208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4957 ATCGTAAACAGATCCTCAGTAATTAGTGTAGAAATAAATGTTCTAGACAATCCAAAGTTA 5016

 51927209 TTTAAAGTTTTTCAGAAAGCTACCCTTCTATCATCTGGGGTAATTTTTTTTGTCATTTTG 51927268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5017 TTTAAAGTTTTTCAGAAAGCTACCCTTCTATCATCTGGGGTAATTTTTTTTGTCATTTTG 5076

 51927269 GCAAATATGTAGAGAATATATGTGAGTCTTCCTATTAGTCTGAAGTAAGCAAAACTATAA 51927328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5077 GCAAATATGTAGAGAATATATGTGAGTCTTCCTATTAGTCTGAAGTAAGCAAAACTATAA 5136

 51927329 AGGCACATTTATCGAGGTGGAATGTGAAAAACAACAATCATTTTAACGTAAATCTATGAT 51927388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5137 AGGCACATTTATCGAGGTGGAATGTGAAAAACAACAATCATTTTAACGTAAATCTATGAT 5196

 51927389 ACTTTGGTCTCTTCCAGTGTCCAGGTAACTTATGCCACAACTTTCTTCTATCTTTGTTAA 51927448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5197 ACTTTGGTCTCTTCCAGTGTCCAGGTAACTTATGCCACAACTTTCTTCTATCTTTGTTAA 5256

 51927449 TAATACAGTG 51927458
          ||||||||||
     5257 TAATACAGTG 5266

Alignment time is 3.93189 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51916584,51937767] =>     21184 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [       1,    7460] =>      7460 nucs 'mol-32-2fe3-266311_7460'

Score:        7296
Aligned:      7460        nucs
Identic:      7441 (100%) nucs =>      1281 (100%)      6160 (100%)
Gaps:            8 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51919131,51920411] EXCISED REGION [51920418,51926594]
 second seq =>  [       1,    1281] EXCISED REGION [    1288,    7460]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         6 nucs [51920412,51920417]
 second seq =>         6 nucs [1282,1287]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [51920412,51920412] to [51920418,51920418]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 51919131 ATTTCTTAATTATTAAAATATCCCAGAATTAAACCTCTTAAATTTTCTATGACTTTATAG 51919190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATTTCTTAATTATTAAAATATCCCAGAATTAAACCTCTTAAATTTTCTATGACTTTATAG 60

 51919191 CAAAACTTATTTTTAAAAATCTCCAGCAATGTTTTTAGTGTTATTTTAATAACAAATTTA 51919250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAAAACTTATTTTTAAAAATCTCCAGCAATGTTTTTAGTGTTATTTTAATAACAAATTTA 120

 51919251 TTTTAATTTGTGCCATACGATTTTATTTTATCCATTTTTACATAGAACAAAAAACAAAGC 51919310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTTAATTTGTGCCATACGATTTTATTTTATCCATTTTTACATAGAACAAAAAACAAAGC 180

 51919311 ACTTACCAGTAATATGTAGCTTTTGCCTTTCATTAAGAAAGAAACTTCATTTTAACAGTA 51919370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACTTACCAGTAATATGTAGCTTTTGCCTTTCATTAAGAAAGAAACTTCATTTTAACAGTA 240

 51919371 TTGATTCTTCCTATCCATGAACAAGAAATGTTTTTCATTTGTTGGTGTCATCTCTAATTT 51919430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTGATTCTTCCTATCCATGAACAAGAAATGTTTTTCATTTGTTGGTGTCATCTCTAATTT 300

 51919431 ATTTGAGCAGTGTTTTGTAATTCTCATCGGAGAGATTTTTCACCCCCTGGTTAGTGGAAT 51919490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATTTGAGCAGTGTTTTGTAATTCTCATCGGAGAGATTTTTCACCCCCTGGTTAGTGGAAT 360

 51919491 TCCTGGGTATTTTATTCTTTTTGTGACTATTTTGAATGGCACTGTGTTCTTGATTTGGGT 51919550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCCTGGGTATTTTATTCTTTTTGTGACTATTTTGAATGGCACTGTGTTCTTGATTTGGGT 420

 51919551 CTCGGCTTGGATGTTGTTGGTGTATATGAACATTAAAGATTTCTGTACATTGATTTTGTG 51919610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTCGGCTTGGATGTTGTTGGTGTATATGAACATTAAAGATTTCTGTACATTGATTTTGTG 480

 51919611 TTCTGAAACTTTGCTGAAGTTGTTTATCAGATAAAGGAGGTTTTGGGCAGAGATTATGAG 51919670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTCTGAAACTTTGCTGAAGTTGTTTATCAGATAAAGGAGGTTTTGGGCAGAGATTATGAG 540

 51919671 GTTTTCTAGGTATAGAATCATATTATATAAAAATGGGGATAACTTCCCTTCTTCCTATTT 51919730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GTTTTCTAGGTATAGAATCATATTATATAAAAATGGGGATAACTTCCCTTCTTCCTATTT 600

 51919731 GGATGACTTTTATTTCTTTCTCTTGCCTGATTGTTCTGGCCAGGACTTCCAGTACTATGC 51919790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GGATGACTTTTATTTCTTTCTCTTGCCTGATTGTTCTGGCCAGGACTTCCAGTACTATGC 660

 51919791 TGAATAGATGTGGGGAGAGAGGACATCCTTGTCTTGTGCCAGTTTTCAAGGGAAATGCTT 51919850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGAATAGATGTGGGGAGAGAGGACATCCTTGTCTTGTGCCAGTTTTCAAGGGAAATGCTT 720

 51919851 CCAGCTTTTACCCATTCAGTATGATGGTGGCTGTGGTTGTGTCATAGATAGCTCTTATTA 51919910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CCAGCTTTTACCCATTCAGTATGATGGTGGCTGTGGTTGTGTCATAGATAGCTCTTATTA 780

 51919911 TTTTGAACTATGTGATTGGACAATTCCTGGAAGAGCTTGAAACAGAATTACTATTCCACT 51919970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTTTGAACTATGTGATTGGACAATTCCTGGAAGAGCTTGAAACAGAATTACTATTCCACT 840

 51919971 CAGCAATCCATTATAGATTATATGCCCAAAGGAATATAAGTCGTTCTACCATGGAAACAC 51920030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CAGCAATCCATTATAGATTATATGCCCAAAGGAATATAAGTCGTTCTACCATGGAAACAC 900

 51920031 TATTCACAATAGCAGAGACATGGAATCAAGCTGAATGCCCAGCGATGGTAGATTAGAAAA 51920090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TATTCACAATAGCAGAGACATGGAATCAAGCTGAATGCCCAGCGATGGTAGATTAGAAAA 960

 51920091 AGAAAATGTGGTACATATATACTATGGAATACTGTGCATCCATAAAATGAATGATATCAT 51920150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AGAAAATGTGGTACATATATACTATGGAATACTGTGCATCCATAAAATGAATGATATCAT 1020

 51920151 GTCCTTTACAGCAACATGGATGGAGCTGGAGCCCATTATCCTAAGCAAACTAACACAGGA 51920210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GTCCTTTACAGCAACATGGATGGAGCTGGAGCCCATTATCCTAAGCAAACTAACACAGGA 1080

 51920211 AGAGAAAACCAAATACCACATGTTCTCACTCATAAGGGGAAGCTAAATGTCGAGTATACA 51920270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AGAGAAAACCAAATACCACATGTTCTCACTCATAAGGGGAAGCTAAATGTCGAGTATACA 1140

 51920271 TAAACACAAAGAAGAGAACAACAGCACCAGAGCTTCTTGAGGGTGGAGGGTGGGAGGAGG 51920330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TAAACACAAAGAAGAGAACAACAGCACCAGAGCTTCTTGAGGGTGGAGGGTGGGAGGAGG 1200

 51920331 GTGAGGATCAAAAAAACTGCCTATCAGGTGCTATGCTTATTACCTTGATGATGAAATAAT 51920390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GTGAGGATCAAAAAAACTGCCTATCAGGTGCTATGCTTATTACCTTGATGATGAAATAAT 1260

 51920391 ATGTACACCAAACCCCCCATG 51920411
          |||||||||||||||||||||
     1261 ATGTACACCAAACCCCCCATG 1281

EXCISED REGION

 51920418 AATTTACTTAAATAACAAACTTGCACATGTATTCCTAAACCTAAAATAACAGCTTTTTAA 51920477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1288 AATTTACTTAAATAACAAACTTGCACATGTATTCCTAAACCTAAAATAACAGCTTTTTAA 1347

 51920478 AAAAGAAAAGAGTAAAACTTCAACAGAGTTTTCTAAATTGTTATTACCAAGTTTGGACTG 51920537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1348 AAAAGAAAAGAGTAAAACTTCAACAGAGTTTTCTAAATTGTTATTACCAAGTTTGGACTG 1407

 51920538 AGTGTTACATTATCTTAAATATAAATGAAAAGCACGTAGTGTTTATGGCTGGATGTTCAG 51920597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1408 AGTGTTACATTATCTTAAATATAAATGAAAAGCACGTAGTGTTTATGGCTGGATGTTCAG 1467

 51920598 CTTTCATATGTAGACTGCTAAACATGATTGATTGTTCCACAAAATTCTTAGTTAATAATG 51920657
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     1468 CTTTCATATGTAGACTGCTAAACATGATTGATTGTTCCACAAAATTCTTAGTTAATAATA 1527

 51920658 TCTCAGGACATAGTTTATTCTTATCTGAAATTCTCTGTTAACTTTGCAGAGTAGAGATTA 51920717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1528 TCTCAGGACATAGTTTATTCTTATCTGAAATTCTCTGTTAACTTTGCAGAGTAGAGATTA 1587

 51920718 CATCATCTTGTTTTACCTCATAATATGGCTGCCAGGGCTTATAATTATGGTAGTAGTGCA 51920777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1588 CATCATCTTGTTTTACCTCATAATATGGCTGCCAGGGCTTATAATTATGGTAGTAGTGCA 1647

 51920778 GGCTTTACCAACCCCTTAGTTTTTGCTTTTGTTTTTGTTATTATTATTGTAATCACTCTG 51920837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1648 GGCTTTACCAACCCCTTAGTTTTTGCTTTTGTTTTTGTTATTATTATTGTAATCACTCTG 1707

 51920838 GTATTTATTTTTAGGTATTTTTTAAAGCCACTGTTTCTTATAGTGGAAGTTAGATAAGTT 51920897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1708 GTATTTATTTTTAGGTATTTTTTAAAGCCACTGTTTCTTATAGTGGAAGTTAGATAAGTT 1767

 51920898 AAAACTGGATATATTATATCCTAAAGTATTTTAATTGGATCAAACTGTTGTTAGTCAAAA 51920957
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     1768 AAAACTGGATATATTATATCCTAAAGTATTTTAATTGGAACAAACTGTTGTTAGTCAAAA 1827

 51920958 TATGTTGAAAGCCAGCAAAGCAGTGGATGACCTCATTTTGCAAATTTCTGCGTTGTGTAA 51921017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1828 TATGTTGAAAGCCAGCAAAGCAGTGGATGACCTCATTTTGCAAATTTCTGCGTTGTGTAA 1887

 51921018 ATTTCATGATGCACTGCCAATACTTCATTTAAAATTTATAATATATGATATGTAGACTGA 51921077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1888 ATTTCATGATGCACTGCCAATACTTCATTTAAAATTTATAATATATGATATGTAGACTGA 1947

 51921078 GTTGGGCACTCCTGGGAAATCCATGTATTAAATATTAGTTATGCTATTATTGATTCTTTA 51921137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1948 GTTGGGCACTCCTGGGAAATCCATGTATTAAATATTAGTTATGCTATTATTGATTCTTTA 2007

 51921138 AAATAATAATAAGGCCAGACTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAAGCAGG 51921197
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     2008 AAATAATAATAAGGCCAGACTCACACCTGTTATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAAGCAGG 2067

 51921198 TGGATCATCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAAAATGGTGAAACCCTGTCGC 51921257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2068 TGGATCATCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAAAATGGTGAAACCCTGTCGC 2127

 51921258 TACTAAAAATACATAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCACACTCCTGTAGTCCCAGCTACTC 51921317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2128 TACTAAAAATACATAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCACACTCCTGTAGTCCCAGCTACTC 2187

 51921318 AGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGG 51921377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2188 AGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGG 2247

 51921378 TTATGCCACTGCATCCCAGCCTGGGCGATAGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAAAATAAAAT 51921437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2248 TTATGCCACTGCATCCCAGCCTGGGCGATAGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAAAATAAAAT 2307

 51921438 TAAATTAAAAATAAATAAATAAATAAATAGAATTAGAAATTCTAACATGTTCTCTCAGTA 51921497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2308 TAAATTAAAAATAAATAAATAAATAAATAGAATTAGAAATTCTAACATGTTCTCTCAGTA 2367

 51921498 CCACAAGAAATTATTTGGAGAACCCACTAGAATACACACTTCTTGCTTGAGGAACCACTG 51921557
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||
     2368 CCACAAGAAATTATTTGGAGAACCCACTAGAATGCACACATCTTGCTTGAGGAACCACTG 2427

 51921558 GCCTCAGGACATAGGCTTAAAGTAAATCAACAAAAATTAACTACATACATATAAGCATAT 51921617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2428 GCCTCAGGACATAGGCTTAAAGTAAATCAACAAAAATTAACTACATACATATAAGCATAT 2487

 51921618 CTTCCTAATTTTTGCATTGCGTGACCTAACTATAATCTATAGCATATCTTTCCATGCCCA 51921677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2488 CTTCCTAATTTTTGCATTGCGTGACCTAACTATAATCTATAGCATATCTTTCCATGCCCA 2547

 51921678 GATCTATTTCTGAACTGTTATATGACATCTCCACACAGTTCATACTTGCTTTGACTATGA 51921737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2548 GATCTATTTCTGAACTGTTATATGACATCTCCACACAGTTCATACTTGCTTTGACTATGA 2607

 51921738 CCTAAATTCCTAGCCTGTTCCCTGGATAGTTTCTCAGTAGTGCAGGACTATAAATGCACA 51921797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2608 CCTAAATTCCTAGCCTGTTCCCTGGATAGTTTCTCAGTAGTGCAGGACTATAAATGCACA 2667

 51921798 GTCACTGTGTGTACAAGTTATATGGGAATATAACAAGTTATGTGTTAATAAAAGTTATTT 51921857
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     2668 GTCACTGTGTGTACAAGTTATATGGGAATATAACAAGTTATGTGTTAATAAAAATTATTT 2727

 51921858 AGAAATAAAACGAAAATTATAAACAATTTGTACTAATACTATATTTTTTCTGTTATACAA 51921917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2728 AGAAATAAAACGAAAATTATAAACAATTTGTACTAATACTATATTTTTTCTGTTATACAA 2787

 51921918 CATAGTGACATGAAAAACAAATATAATAATGGCTTAATTGTAAAGTATATAATAATAGTT 51921977
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2788 CATAGTGACAGGAAAAACAAATATAATAATGGCTTAATTGTAAAGTATATAATAATAGTT 2847

 51921978 TATCTGATTTGACCCTCCATATACTGTATGAGGGCCTTAAACCTCTTTCATGATACTTTC 51922037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2848 TATCTGATTTGACCCTCCATATACTGTATGAGGGCCTTAAACCTCTTTCATGATACTTTC 2907

 51922038 CATCTAATTATGGCTATTGTCAGGGTGTGTCTGATGTATGCCTCAGGAAACATCCTCAGT 51922097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2908 CATCTAATTATGGCTATTGTCAGGGTGTGTCTGATGTATGCCTCAGGAAACATCCTCAGT 2967

 51922098 CACCAGCTGGTATTAATAGTTTTGTCTCTCTGTTCTGATTCTTTTCATAATATTTGGAAT 51922157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2968 CACCAGCTGGTATTAATAGTTTTGTCTCTCTGTTCTGATTCTTTTCATAATATTTGGAAT 3027

 51922158 TTTGTCTTCCACTACCTGTACAAGGGCAAGGCAACTCATCTGTTACTAAGAGATAACTTG 51922217
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     3028 TTTGTCTTCCACTACCTGTACAAGGGCAAGGCAACTCATCTGTTAGTAAGAGATAACTTG 3087

 51922218 GCCGGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTGTGGGAGGCTGAGGTGGGGGGAT 51922277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3088 GCCGGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTGTGGGAGGCTGAGGTGGGGGGAT 3147

 51922278 CACTAGGTCAGGAGATCAAGACCATCGTGGCCAACATGGTGAAACCCGTCTCTACTAAAA 51922337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3148 CACTAGGTCAGGAGATCAAGACCATCGTGGCCAACATGGTGAAACCCGTCTCTACTAAAA 3207

 51922338 ATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTTGTGGGCACCTGTAATCCCACCTACTCGGGAGGCTG 51922397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3208 ATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTTGTGGGCACCTGTAATCCCACCTACTCGGGAGGCTG 3267

 51922398 AGGCAGGAGAATAGCTTGAACCAGGGAGTTGGAGGTTACAGTGAGCCAAGATCACACCAC 51922457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3268 AGGCAGGAGAATAGCTTGAACCAGGGAGTTGGAGGTTACAGTGAGCCAAGATCACACCAC 3327

 51922458 TGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCCATCTCAAAAAAAAGATAGAGTTAACTT 51922517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3328 TGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCCATCTCAAAAAAAAGATAGAGTTAACTT 3387

 51922518 GAATTTACTTAAATCATAACTTGGGGGAATTTTACCATTAAATCATTATACAATATTTTT 51922577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3388 GAATTTACTTAAATCATAACTTGGGGGAATTTTACCATTAAATCATTATACAATATTTTT 3447

 51922578 ATTACTCTGTTCAGAGTAATATACCAGAGTAAGTACCATTTTATAAGCTTCTATAGTTCA 51922637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3448 ATTACTCTGTTCAGAGTAATATACCAGAGTAAGTACCATTTTATAAGCTTCTATAGTTCA 3507

 51922638 ATGGCATCTCCATGAAACTTATATAAGTAGCTTTTAATTAAAAATTAAAGTTTTTTTCAG 51922697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3508 ATGGCATCTCCATGAAACTTATATAAGTAGCTTTTAATTAAAAATTAAAGTTTTTTTCAG 3567

 51922698 AAAGAATTTTTTTGTTAATTGGTCATTATCCATTTATTGATTTCTTATGGCATGTTCAGC 51922757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3568 AAAGAATTTTTTTGTTAATTGGTCATTATCCATTTATTGATTTCTTATGGCATGTTCAGC 3627

 51922758 TTTATTCATAAAATAGGCATCATCTAAAAGAATTGTAAGCATGAATTCCTTTTCAGTGTG 51922817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3628 TTTATTCATAAAATAGGCATCATCTAAAAGAATTGTAAGCATGAATTCCTTTTCAGTGTG 3687

 51922818 TGGGCAGTGTAATTGGAGAGCCAAGAGAAATACAGAGGAAATTACTGATGCCAAAAATAC 51922877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3688 TGGGCAGTGTAATTGGAGAGCCAAGAGAAATACAGAGGAAATTACTGATGCCAAAAATAC 3747

 51922878 ATAAAATGTAATAGAGAAAATAGAATTGGAAACTCTTCTTGGTATACTCTCTTTCTTCAT 51922937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3748 ATAAAATGTAATAGAGAAAATAGAATTGGAAACTCTTCTTGGTATACTCTCTTTCTTCAT 3807

 51922938 ACTGAATCACATGGCTCGCTATCAGTTCAAATAGGAATTTTTAAGGAAGTCCTTTATGGA 51922997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3808 ACTGAATCACATGGCTCGCTATCAGTTCAAATAGGAATTTTTAAGGAAGTCCTTTATGGA 3867

 51922998 TTTCACCTCACTCCAATGTGTCCACACTCAGTGCTTTCTCAGGATAAAGAAACTCAATTC 51923057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3868 TTTCACCTCACTCCAATGTGTCCACACTCAGTGCTTTCTCAGGATAAAGAAACTCAATTC 3927

 51923058 TATTACATAATTTTGTAAATTGTTTTCTTTTTCTTTGCCCACCATATTCTCATAAGGACA 51923117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3928 TATTACATAATTTTGTAAATTGTTTTCTTTTTCTTTGCCCACCATATTCTCATAAGGACA 3987

 51923118 CCTTAAGCTCCTCAAAAGCACAAAACGCAAATTCTATTTCTTTGTCAACCCTCTCTCTAG 51923177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3988 CCTTAAGCTCCTCAAAAGCACAAAACGCAAATTCTATTTCTTTGTCAACCCTCTCTCTAG 4047

 51923178 TAAAGTTCTAGGTAAAGAATAAATGCATGACTGATTGTTTTAATGAGCGCTAATGGGTGT 51923237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4048 TAAAGTTCTAGGTAAAGAATAAATGCATGACTGATTGTTTTAATGAGCGCTAATGGGTGT 4107

 51923238 TGTTAAATCCCTTACTATCTGAGGAGATCGTTGCTTATGGCAGCCCCTGTGATTTTAAAA 51923297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4108 TGTTAAATCCCTTACTATCTGAGGAGATCGTTGCTTATGGCAGCCCCTGTGATTTTAAAA 4167

 51923298 GCTCTTCCATGTTGGAATAAAGGCAAAATACAGTGATTTCAAAGAACTGGGGAGAGAAAT 51923357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4168 GCTCTTCCATGTTGGAATAAAGGCAAAATACAGTGATTTCAAAGAACTGGGGAGAGAAAT 4227

 51923358 TTTAAGATTTCCTTTTGGGAAAATTTCAGGCAAAAAATTACATCTTATAATCCATTCCAG 51923417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4228 TTTAAGATTTCCTTTTGGGAAAATTTCAGGCAAAAAATTACATCTTATAATCCATTCCAG 4287

 51923418 GCTTTTGATTGTATGATTACCCCATTTACAATTGATGTTGAAAATAATATTTTCTCACTT 51923477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4288 GCTTTTGATTGTATGATTACCCCATTTACAATTGATGTTGAAAATAATATTTTCTCACTT 4347

 51923478 GCCACAGCCTCTTCTTTGCATTCTCTCACCCTCAGCTATTATATATTAGCTCAGTACCTG 51923537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4348 GCCACAGCCTCTTCTTTGCATTCTCTCACCCTCAGCTATTATATATTAGCTCAGTACCTG 4407

 51923538 CATTATTTACAGGAACTGAAAAACAGGGTTGAAGATTATAAAATCTCACATTTGCTGACT 51923597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4408 CATTATTTACAGGAACTGAAAAACAGGGTTGAAGATTATAAAATCTCACATTTGCTGACT 4467

 51923598 TTTATGCAGGTTAAATGAAAGAGTTTTATAATTGTTTCTGCCAACCAGTAGGTTCAAAAT 51923657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4468 TTTATGCAGGTTAAATGAAAGAGTTTTATAATTGTTTCTGCCAACCAGTAGGTTCAAAAT 4527

 51923658 GTTTATTAAAAGTGAATTCTGGATAAATTATGATTAATGTCCTTCTGGTTTGTTTTGCTT 51923717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4528 GTTTATTAAAAGTGAATTCTGGATAAATTATGATTAATGTCCTTCTGGTTTGTTTTGCTT 4587

 51923718 GAGCCTACACACACACACACACACACACACACACACACACACACATATACACACACATAT 51923777
          ||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4588 GAGCCT------ACACACACACACACACACACACACACACACACATATACACACACATAT 4641

 51923778 ATATATAACTTTATATAAAACTATAAATACTAGGAACTAGCACTAGAACTGTACTTTTCA 51923837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4642 ATATATAACTTTATATAAAACTATAAATACTAGGAACTAGCACTAGAACTGTACTTTTCA 4701

 51923838 CTACAGTATCAGT-AAAAAAAAAAAATTTAGGATTTTTTATGACTGATTTTACATTTAAA 51923896
          ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4702 CTACAGTATCAGTAAAAAAAAAAAAATTTAGGATTTTTTATGACTGATTTTACATTTAAA 4761

 51923897 CCTAAAGGAAAAATAATCAGGAACAACACAGAGTTTTTTTTTTTAAATGAGTTGGCAAAG 51923956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4762 CCTAAAGGAAAAATAATCAGGAACAACACAGAGTTTTTTTTTTTAAATGAGTTGGCAAAG 4821

 51923957 AAAATACCAAAGGCTCAAACCTGACAAAAGCATTGAGAATACCAGAAAAGAAATTTTAAC 51924016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4822 AAAATACCAAAGGCTCAAACCTGACAAAAGCATTGAGAATACCAGAAAAGAAATTTTAAC 4881

 51924017 CTTTAAATTTAATTGAAACATGATATTTTTCTCTTTTGAAACATTTCTTTCTCTACAAAA 51924076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4882 CTTTAAATTTAATTGAAACATGATATTTTTCTCTTTTGAAACATTTCTTTCTCTACAAAA 4941

 51924077 ATCTGTTCCTTCAGAACCTGTTGATGCAATAATATTATATCATTTTTTTTTACTGGTCAA 51924136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4942 ATCTGTTCCTTCAGAACCTGTTGATGCAATAATATTATATCATTTTTTTTTACTGGTCAA 5001

 51924137 TGTATTTATTTGTAATTGTTCTGAAATTGTTTCCTGCAAGGTTTTCTATTACTCAAACTG 51924196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5002 TGTATTTATTTGTAATTGTTCTGAAATTGTTTCCTGCAAGGTTTTCTATTACTCAAACTG 5061

 51924197 TCTTTGTACACATAATTTTCCTTTCATGCCATTTATGAACCATTTTTTATTTCTATGGTT 51924256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5062 TCTTTGTACACATAATTTTCCTTTCATGCCATTTATGAACCATTTTTTATTTCTATGGTT 5121

 51924257 GATAGAGAATGACTTCATAATTCATTTCTGAATAAGTGAAATAATTTAAAAACATTTTAA 51924316
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5122 AATAGAGAATGACTTCATAATTCATTTCTGAATAAGTGAAATAATTTAAAAACATTTTAA 5181

 51924317 AGTGGGTGTATCTACTTGCTTGGAGCTTTGTCGAATCATGTTTCTTATTTGGAGCCTCTG 51924376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5182 AGTGGGTGTATCTACTTGCTTGGAGCTTTGTCGAATCATGTTTCTTATTTGGAGCCTCTG 5241

 51924377 GAGGAATGTTGACTTACCATGGTAAAAATTAACTGGTGAAACTCTAAAGAAAACACAGAC 51924436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5242 GAGGAATGTTGACTTACCATGGTAAAAATTAACTGGTGAAACTCTAAAGAAAACACAGAC 5301

 51924437 TCTACACGCAGTCTTGTCCGAAACTTACTCACCCTGAAACCAATGAATTTCAAAGACCTA 51924496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5302 TCTACACGCAGTCTTGTCCGAAACTTACTCACCCTGAAACCAATGAATTTCAAAGACCTA 5361

 51924497 GATACTTCCTTCTGTGATGTCCCCTGAGATCAGAGAATAAAAGAAAAATCCCTCGTAAAT 51924556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5362 GATACTTCCTTCTGTGATGTCCCCTGAGATCAGAGAATAAAAGAAAAATCCCTCGTAAAT 5421

 51924557 ATACATCACGTACAGCTGTTTGATTTATGCATTATGCAGAAACTAAGAAAACAGAGTTAT 51924616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5422 ATACATCACGTACAGCTGTTTGATTTATGCATTATGCAGAAACTAAGAAAACAGAGTTAT 5481

 51924617 ATGTAACCTTGCAATGAGAAGTGCACCCACC-AAAAAAAAAAAAAAAAAAATCCCAAAAC 51924675
          |||||||.||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
     5482 ATGTAACTTTGCAATGAGAAGTGCACCCACCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCCCAAAAC 5541

 51924676 ATTGTTTCAAAAAGAAGTGGTATGAAGCATCTTAGTGTTTCATGAATATTGAAGAATAGT 51924735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5542 ATTGTTTCAAAAAGAAGTGGTATGAAGCATCTTAGTGTTTCATGAATATTGAAGAATAGT 5601

 51924736 GCAATTATTGAAATTTGGCATTTAAAAAATGTTTTTAAATTATTAGGAAGCTACCGTGAC 51924795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5602 GCAATTATTGAAATTTGGCATTTAAAAAATGTTTTTAAATTATTAGGAAGCTACCGTGAC 5661

 51924796 CTGTTTACTAAATCCTCAATTCTTTCTCTCTCAGTTTTTCTTACTATAAAATTTACTTTT 51924855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5662 CTGTTTACTAAATCCTCAATTCTTTCTCTCTCAGTTTTTCTTACTATAAAATTTACTTTT 5721

 51924856 CAAGCCAGAGAATTTTTCTTTCTGACAAGACGTAGATCTATATTGCGCTGTCAAGATGCA 51924915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5722 CAAGCCAGAGAATTTTTCTTTCTGACAAGACGTAGATCTATATTGCGCTGTCAAGATGCA 5781

 51924916 GCTTTTGCATCTCTGCTGCCATGTGGATAGAATAACTTTCTTTCCTCAAGAAGTGGACAA 51924975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5782 GCTTTTGCATCTCTGCTGCCATGTGGATAGAATAACTTTCTTTCCTCAAGAAGTGGACAA 5841

 51924976 GCCCTCATAGGGACTGATTTTCTGTGAAGTAGTGAGACTTAATCTTTGGGACCTTCACTT 51925035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5842 GCCCTCATAGGGACTGATTTTCTGTGAAGTAGTGAGACTTAATCTTTGGGACCTTCACTT 5901

 51925036 ACATCACTTACATAGGACCTTTCAATACTCAGGGAGGGCCCTTGGCAATAAGTTCTTCTG 51925095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5902 ACATCACTTACATAGGACCTTTCAATACTCAGGGAGGGCCCTTGGCAATAAGTTCTTCTG 5961

 51925096 ACAATATATCTTGTGCTGATGGTGGTGTTAGCTTTCAAAATTTGTAATTATTTTGGTAAT 51925155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5962 ACAATATATCTTGTGCTGATGGTGGTGTTAGCTTTCAAAATTTGTAATTATTTTGGTAAT 6021

 51925156 TTCTGTCATCCTAGAAAAATGTGTATAGTGTATTTGTTCCTAATTTCATTTTCATTATTT 51925215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6022 TTCTGTCATCCTAGAAAAATGTGTATAGTGTATTTGTTCCTAATTTCATTTTCATTATTT 6081

 51925216 ATATATTTTTTAATGAACACCCCCAGCATAGTATAAGTTTTATACCTCTACAATCTGAAT 51925275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6082 ATATATTTTTTAATGAACACCCCCAGCATAGTATAAGTTTTATACCTCTACAATCTGAAT 6141

 51925276 CACCCGCTTGGCCCATGCCTAGGACTAGGTCTTATCATCCGCAGTGAGAGATTATAGGCT 51925335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6142 CACCCGCTTGGCCCATGCCTAGGACTAGGTCTTATCATCCGCAGTGAGAGATTATAGGCT 6201

 51925336 CTTACTAGGAATTTATGGTAACATGGGCTCCTAACAGTCATGATTTTTATAACATGATTG 51925395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6202 CTTACTAGGAATTTATGGTAACATGGGCTCCTAACAGTCATGATTTTTATAACATGATTG 6261

 51925396 CCTATGTATATAAAGTCCACTGGCTGAACAAGTATTTTCCCTCAAATCAGGAAGGAAAAA 51925455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6262 CCTATGTATATAAAGTCCACTGGCTGAACAAGTATTTTCCCTCAAATCAGGAAGGAAAAA 6321

 51925456 AAAAAACACGAAGCAAATTGATCCTCTTCTAAAAGCTGTCACATCAGTAACCCATCATAT 51925515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6322 AAAAAACACGAAGCAAATTGATCCTCTTCTAAAAGCTGTCACATCAGTAACCCATCATAT 6381

 51925516 TCTCATTTACTTATATACTGAGTAGGTAGTCACCTTTGATTCATATCTCTCAGGAGTTCA 51925575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6382 TCTCATTTACTTATATACTGAGTAGGTAGTCACCTTTGATTCATATCTCTCAGGAGTTCA 6441

 51925576 GAAGTTTTTGAAAGTAATTTGTGATACAAAATATAGGGAAATTCAGAATGAGATTCTTTT 51925635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6442 GAAGTTTTTGAAAGTAATTTGTGATACAAAATATAGGGAAATTCAGAATGAGATTCTTTT 6501

 51925636 GGCTTGTCTTTCTTTTTCTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTATTTGTTGAACTCAAATCCG 51925695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6502 GGCTTGTCTTTCTTTTTCTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTATTTGTTGAACTCAAATCCG 6561

 51925696 GAAATTGTGGAGGTTACTAGAACTCTAAGTCACAGACTTATAAGTACTGAAAAAGTAGTC 51925755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6562 GAAATTGTGGAGGTTACTAGAACTCTAAGTCACAGACTTATAAGTACTGAAAAAGTAGTC 6621

 51925756 AGTAAAGAAAACATACAGTAAGAGACTAGGTTAATTTTCCTATAGTTCATTGATGTTTCC 51925815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6622 AGTAAAGAAAACATACAGTAAGAGACTAGGTTAATTTTCCTATAGTTCATTGATGTTTCC 6681

 51925816 ACTATTACTGCCCCTGATTTTTAACTTTAGTTTTCCTTAGATTGTTGGAGTAATATATGT 51925875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6682 ACTATTACTGCCCCTGATTTTTAACTTTAGTTTTCCTTAGATTGTTGGAGTAATATATGT 6741

 51925876 ACCTTAAAAATTAACTGTGGAACAAGTAGATGAACTTTTTACACAATTTCCTGCTTTTAT 51925935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6742 ACCTTAAAAATTAACTGTGGAACAAGTAGATGAACTTTTTACACAATTTCCTGCTTTTAT 6801

 51925936 AAAGTTCCTACTAGCTATATTTTCCCAAAAGTGCTCAACAATAGAGTCTGGTGCTAAAAA 51925995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6802 AAAGTTCCTACTAGCTATATTTTCCCAAAAGTGCTCAACAATAGAGTCTGGTGCTAAAAA 6861

 51925996 GCAGAGTAGGCTAAATTTAGATCAATGTGAAATGCCCTACTTATTTCCTATGAACTTAAT 51926055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6862 GCAGAGTAGGCTAAATTTAGATCAATGTGAAATGCCCTACTTATTTCCTATGAACTTAAT 6921

 51926056 TGATTGAGCTCATTTTGGGGGTGTCTTTCTGATCGACCAGAAACTTGGCTCATTAGAGCA 51926115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6922 TGATTGAGCTCATTTTGGGGGTGTCTTTCTGATCGACCAGAAACTTGGCTCATTAGAGCA 6981

 51926116 ACTCACAAAGTGACCTTTTAAAAGAAAGAGTTTTCAATATATTTGTTCATGTTCCATTCC 51926175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6982 ACTCACAAAGTGACCTTTTAAAAGAAAGAGTTTTCAATATATTTGTTCATGTTCCATTCC 7041

 51926176 ACTGAGAATGGTGCTATTTAAAACTAAATACAATAATTTTAGATATTGTACAGCAGATAT 51926235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7042 ACTGAGAATGGTGCTATTTAAAACTAAATACAATAATTTTAGATATTGTACAGCAGATAT 7101

 51926236 AATTTTAAACATAATACATGGGATTTCGATTTTAGGTACTGTTTATAAGGCATTTCTCCT 51926295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7102 AATTTTAAACATAATACATGGGATTTCGATTTTAGGTACTGTTTATAAGGCATTTCTCCT 7161

 51926296 TATATTATTCTAGACTTAAATATAACAAATTTCATGCAGAGGTTTCTTTCAAAAGTAAAT 51926355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7162 TATATTATTCTAGACTTAAATATAACAAATTTCATGCAGAGGTTTCTTTCAAAAGTAAAT 7221

 51926356 TCAGCCACATTTAGACTCAAATATTCCCTAATTTTTTAGTGTAGCTGAAGTCCTAATAAT 51926415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7222 TCAGCCACATTTAGACTCAAATATTCCCTAATTTTTTAGTGTAGCTGAAGTCCTAATAAT 7281

 51926416 ATACTTGTGTTTCTTTTAAATTAAGTCCCACATGTTAACTTTACAACAGAAAGTCCATGT 51926475
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     7282 ATACTTGTGTTTCTTTTAAATTAAGTCCCACATGTTAACTTTACAGCAGAAAGTCCATGT 7341

 51926476 ATCGTATTATTAGTCTAAATCTTCATTTTACTGTTTAGTTAACACAGACATTCATTTAAC 51926535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7342 ATCGTATTATTAGTCTAAATCTTCATTTTACTGTTTAGTTAACACAGACATTCATTTAAC 7401

 51926536 ACACTATGTTTAATTTCCCACTCAGTTTTGGCTTATTGTAGTCTAATAAACAATGATTA 51926594
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7402 ACACTATGTTTAATTTCCCACTCAGTTTTGGCTTATTGTAGTCTAATAAACAATGATTA 7460

Alignment time is 5.71972 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51916584,51937767] =>     21184 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [       1,    5293] =>      5293 nucs 'mol-32-2fe3-336940_5293'

Score:        5151
Aligned:      5294        nucs
Identic:      5281 (100%) nucs =>      2363 (100%)      2918 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51924219,51926584] EXCISED REGION [51927768,51930693]
 second seq =>  [       1,    2367] EXCISED REGION [    2368,    5293]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1183 nucs [51926585,51927767]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [51926585,51926587] to [51927768,51927770]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [51926584,51926584] to [51927768,51927768]
 second seq =>         1 nucs [2367,2367] to [2368,2368]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 51924219 TTCATGCCATTTATGAACCATTTTTTATTTCTATGGTTGATAGAGAATGACTTCATAATT 51924278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTCATGCCATTTATGAACCATTTTTTATTTCTATGGTTGATAGAGAATGACTTCATAATT 60

 51924279 CATTTCTGAATAAGTGAAATAATTTAAAAACATTTTAAAGTGGGTGTATCTACTTGCTTG 51924338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CATTTCTGAATAAGTGAAATAATTTAAAAACATTTTAAAGTGGGTGTATCTACTTGCTTG 120

 51924339 GAGCTTTGTCGAATCATGTTTCTTATTTGGAGCCTCTGGAGGAATGTTGACTTACCATGG 51924398
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GAGCTTTGTCGAATCATGTTCCTTATTTGGAGCCTCTGGAGGAATGTTGACTTACCATGG 180

 51924399 TAAAAATTAACTGGTGAAACTCTAAAGAAAACACAGACTCTACACGCAGTCTTGTCCGAA 51924458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TAAAAATTAACTGGTGAAACTCTAAAGAAAACACAGACTCTACACGCAGTCTTGTCCGAA 240

 51924459 ACTTACTCACCCTGAAACCAATGAATTTCAAAGACCTAGATACTTCCTTCTGTGATGTCC 51924518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACTTACTCACCCTGAAACCAATGAATTTCAAAGACCTAGATACTTCCTTCTGTGATGTCC 300

 51924519 CCTGAGATCAGAGAATAAAAGAAAAATCCCTCGTAAATATACATCACGTACAGCTGTTTG 51924578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCTGAGATCAGAGAATAAAAGAAAAATCCCTCGTAAATATACATCACGTACAGCTGTTTG 360

 51924579 ATTTATGCATTATGCAGAAACTAAGAAAACAGAGTTATATGTAACCTTGCAATGAGAAGT 51924638
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
      361 ATTTATGCATTATGCAGAAACTAAGAAAACAGAGTTATATGTAACTTTGCAATGAGAAGT 420

 51924639 GCACCCACCAAAAAAAAAAAAAAAAAAA-TCCCAAAACATTGTTTCAAAAAGAAGTGGTA 51924697
          |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GCACCCACCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCCCAAAACATTGTTTCAAAAAGAAGTGGTA 480

 51924698 TGAAGCATCTTAGTGTTTCATGAATATTGAAGAATAGTGCAATTATTGAAATTTGGCATT 51924757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGAAGCATCTTAGTGTTTCATGAATATTGAAGAATAGTGCAATTATTGAAATTTGGCATT 540

 51924758 TAAAAAATGTTTTTAAATTATTAGGAAGCTACCGTGACCTGTTTACTAAATCCTCAATTC 51924817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TAAAAAATGTTTTTAAATTATTAGGAAGCTACCGTGACCTGTTTACTAAATCCTCAATTC 600

 51924818 TTTCTCTCTCAGTTTTTCTTACTATAAAATTTACTTTTCAAGCCAGAGAATTTTTCTTTC 51924877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTTCTCTCTCAGTTTTTCTTACTATAAAATTTACTTTTCAAGCCAGAGAATTTTTCTTTC 660

 51924878 TGACAAGACGTAGATCTATATTGCGCTGTCAAGATGCAGCTTTTGCATCTCTGCTGCCAT 51924937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGACAAGACGTAGATCTATATTGCGCTGTCAAGATGCAGCTTTTGCATCTCTGCTGCCAT 720

 51924938 GTGGATAGAATAACTTTCTTTCCTCAAGAAGTGGACAAGCCCTCATAGGGACTGATTTTC 51924997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GTGGATAGAATAACTTTCTTTCCTCAAGAAGTGGACAAGCCCTCATAGGGACTGATTTTC 780

 51924998 TGTGAAGTAGTGAGACTTAATCTTTGGGACCTTCACTTACATCACTTACATAGGACCTTT 51925057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGTGAAGTAGTGAGACTTAATCTTTGGGACCTTCACTTACATCACTTACATAGGACCTTT 840

 51925058 CAATACTCAGGGAGGGCCCTTGGCAATAAGTTCTTCTGACAATATATCTTGTGCTGATGG 51925117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CAATACTCAGGGAGGGCCCTTGGCAATAAGTTCTTCTGACAATATATCTTGTGCTGATGG 900

 51925118 TGGTGTTAGCTTTCAAAATTTGTAATTATTTTGGTAATTTCTGTCATCCTAGAAAAATGT 51925177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGGTGTTAGCTTTCAAAATTTGTAATTATTTTGGTAATTTCTGTCATCCTAGAAAAATGT 960

 51925178 GTATAGTGTATTTGTTCCTAATTTCATTTTCATTATTTATATATTTTTTAATGAACACCC 51925237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GTATAGTGTATTTGTTCCTAATTTCATTTTCATTATTTATATATTTTTTAATGAACACCC 1020

 51925238 CCAGCATAGTATAAGTTTTATACCTCTACAATCTGAATCACCCGCTTGGCCCATGCCTAG 51925297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CCAGCATAGTATAAGTTTTATACCTCTACAATCTGAATCACCCGCTTGGCCCATGCCTAG 1080

 51925298 GACTAGGTCTTATCATCCGCAGTGAGAGATTATAGGCTCTTACTAGGAATTTATGGTAAC 51925357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GACTAGGTCTTATCATCCGCAGTGAGAGATTATAGGCTCTTACTAGGAATTTATGGTAAC 1140

 51925358 ATGGGCTCCTAACAGTCATGATTTTTATAACATGATTGCCTATGTATATAAAGTCCACTG 51925417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATGGGCTCCTAACAGTCATGATTTTTATAACATGATTGCCTATGTATATAAAGTCCACTG 1200

 51925418 GCTGAACAAGTATTTTCCCTCAAATCAGGAAGGAAAAAAAAAAACACGAAGCAAATTGAT 51925477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GCTGAACAAGTATTTTCCCTCAAATCAGGAAGGAAAAAAAAAAACACGAAGCAAATTGAT 1260

 51925478 CCTCTTCTAAAAGCTGTCACATCAGTAACCCATCATATTCTCATTTACTTATATACTGAG 51925537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CCTCTTCTAAAAGCTGTCACATCAGTAACCCATCATATTCTCATTTACTTATATACTGAG 1320

 51925538 TAGGTAGTCACCTTTGATTCATATCTCTCAGGAGTTCAGAAGTTTTTGAAAGTAATTTGT 51925597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TAGGTAGTCACCTTTGATTCATATCTCTCAGGAGTTCAGAAGTTTTTGAAAGTAATTTGT 1380

 51925598 GATACAAAATATAGGGAAATTCAGAATGAGATTCTTTTGGCTTGTCTTTCTTTTTCTTTT 51925657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GATACAAAATATAGGGAAATTCAGAATGAGATTCTTTTGGCTTGTCTTTCTTTTTCTTTT 1440

 51925658 TTTCTTTTTTTTTTTTTTATTTGTTGAACTCAAATCCGGAAATTGTGGAGGTTACTAGAA 51925717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTTCTTTTTTTTTTTTTTATTTGTTGAACTCAAATCCGGAAATTGTGGAGGTTACTAGAA 1500

 51925718 CTCTAAGTCACAGACTTATAAGTACTGAAAAAGTAGTCAGTAAAGAAAACATACAGTAAG 51925777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CTCTAAGTCACAGACTTATAAGTACTGAAAAAGTAGTCAGTAAAGAAAACATACAGTAAG 1560

 51925778 AGACTAGGTTAATTTTCCTATAGTTCATTGATGTTTCCACTATTACTGCCCCTGATTTTT 51925837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AGACTAGGTTAATTTTCCTATAGTTCATTGATGTTTCCACTATTACTGCCCCTGATTTTT 1620

 51925838 AACTTTAGTTTTCCTTAGATTGTTGGAGTAATATATGTACCTTAAAAATTAACTGTGGAA 51925897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AACTTTAGTTTTCCTTAGATTGTTGGAGTAATATATGTACCTTAAAAATTAACTGTGGAA 1680

 51925898 CAAGTAGATGAACTTTTTACACAATTTCCTGCTTTTATAAAGTTCCTACTAGCTATATTT 51925957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CAAGTAGATGAACTTTTTACACAATTTCCTGCTTTTATAAAGTTCCTACTAGCTATATTT 1740

 51925958 TCCCAAAAGTGCTCAACAATAGAGTCTGGTGCTAAAAAGCAGAGTAGGCTAAATTTAGAT 51926017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TCCCAAAAGTGCTCAACAATAGAGTCTGGTGCTAAAAAGCAGAGTAGGCTAAATTTAGAT 1800

 51926018 CAATGTGAAATGCCCTACTTATTTCCTATGAACTTAATTGATTGAGCTCATTTTGGGGGT 51926077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CAATGTGAAATGCCCTACTTATTTCCTATGAACTTAATTGATTGAGCTCATTTTGGGGGT 1860

 51926078 GTCTTTCTGATCGACCAGAAACTTGGCTCATTAGAGCAACTCACAAAGTGACCTTTTAAA 51926137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GTCTTTCTGATCGACCAGAAACTTGGCTCATTAGAGCAACTCACAAAGTGACCTTTTAAA 1920

 51926138 AGAAAGAGTTTTCAATATATTTGTTCATGTTCCATTCCACTGAGAATGGTGCTATTTAAA 51926197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AGAAAGAGTTTTCAATATATTTGTTCATGTTCCATTCCACTGAGAATGGTGCTATTTAAA 1980

 51926198 ACTAAATACAATAATTTTAGATATTGTACAGCAGATATAATTTTAAACATAATACATGGG 51926257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ACTAAATACAATAATTTTAGATATTGTACAGCAGATATAATTTTAAACATAATACATGGG 2040

 51926258 ATTTCGATTTTAGGTACTGTTTATAAGGCATTTCTCCTTATATTATTCTAGACTTAAATA 51926317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ATTTCGATTTTAGGTACTGTTTATAAGGCATTTCTCCTTATATTATTCTAGACTTAAATA 2100

 51926318 TAACAAATTTCATGCAGAGGTTTCTTTCAAAAGTAAATTCAGCCACATTTAGACTCAAAT 51926377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TAACAAATTTCATGCAGAGGTTTCTTTCAAAAGTAAATTCAGCCACATTTAGACTCAAAT 2160

 51926378 ATTCCCTAATTTTTTAGTGTAGCTGAAGTCCTAATAATATACTTGTGTTTCTTTTAAATT 51926437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ATTCCCTAATTTTTTAGTGTAGCTGAAGTCCTAATAATATACTTGTGTTTCTTTTAAATT 2220

 51926438 AAGTCCCACATGTTAACTTTACAACAGAAAGTCCATGTATCGTATTATTAGTCTAAATCT 51926497
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AAGTCCCACATGTTAACTTTACAGCAGAAAGTCCATGTATCGTATTATTAGTCTAAATCT 2280

 51926498 TCATTTTACTGTTTAGTTAACACAGACATTCATTTAACACACTATGTTTAATTTCCCACT 51926557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TCATTTTACTGTTTAGTTAACACAGACATTCATTTAACACACTATGTTTAATTTCCCACT 2340

 51926558 CAGTTTTGGCTTATTGTAGTCTAATAA 51926584
          |||||||||||||||||||||||||||
     2341 CAGTTTTGGCTTATTGTAGTCTAATAA 2367

EXCISED REGION

 51927768 ACATATAGTAAGTTGTCCATAAGTATTTGCTGGTAGATTTATTTATTTTTTAAAAAAACA 51927827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2368 ACATATAGTAAGTTGTCCATAAGTATTTGCTGGTAGATTTATTTATTTTTTAAAAAAACA 2427

 51927828 ACTTGGAAAGTTTTCTGTGTGCTTTTATATTAGAACTTGACCTTTGAAGTACCTCCAGGA 51927887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2428 ACTTGGAAAGTTTTCTGTGTGCTTTTATATTAGAACTTGACCTTTGAAGTACCTCCAGGA 2487

 51927888 AATTTTGAAGAGTGCTGGCATATGACAATGCGTAAGTTTATATTTCATGTCCATGCATGC 51927947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2488 AATTTTGAAGAGTGCTGGCATATGACAATGCGTAAGTTTATATTTCATGTCCATGCATGC 2547

 51927948 CATTAAAATTCTAATAATGTAGTTGACAGAGCCTTTCTTGTCCCTTAAGCACTAAATTTG 51928007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2548 CATTAAAATTCTAATAATGTAGTTGACAGAGCCTTTCTTGTCCCTTAAGCACTAAATTTG 2607

 51928008 TGGCTTGCTCTAGATTGTCCCACCTGGCACAAGCGAGGTGAAATTTCAGGTCTAGCCAAC 51928067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     2608 TGGCTTGCTCTAGATTGTCCCACCTGGCACAAGCTAGGTGAAATTTCAGGTCTAGCCAAC 2667

 51928068 TTTTTTCTTTTTTTTTTTTTAACAAGTATTAAAAACATTTTCATATATATTCCCTGTATT 51928127
          ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2668 TTTTTTC-TTTTTTTTTTTTAACAAGTATTAAAAACATTTTCATATATATTCCCTGTATT 2726

 51928128 ATTTCACCTATTTTTGTGTGTGTGTTTCTATCACACTGCCACATCAAAAACCTCTTCTTG 51928187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2727 ATTTCACCTATTTTTGTGTGTGTGTTTCTATCACACTGCCACATCAAAAACCTCTTCTTG 2786

 51928188 AACGACTATAGTATAGTGGTTAATAGTTCAGTGTCTAGATCAAGACCACCTATGGACGTA 51928247
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2787 AACGACTATAGTATAGTGATTAATAGTTCAGTGTCTAGATCAAGACCACCTATGGACGTA 2846

 51928248 TCTTGGCTCTGATTTTACCAGCCGTACAATCCTGGAGAATCTGTTCAAGAGAAATGTGCC 51928307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2847 TCTTGGCTCTGATTTTACCAGCCGTACAATCCTGGAGAATCTGTTCAAGAGAAATGTGCC 2906

 51928308 TCAATTACGTATCTCTAAAGTAGTTGTAGCTATAGAACCTGTTCCATAGATGTGGATCAG 51928367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2907 TCAATTACGTATCTCTAAAGTAGTTGTAGCTATAGAACCTGTTCCATAGATGTGGATCAG 2966

 51928368 AACACTGCATGACATTTAGAAAATGTTTAATAAATGATGTTGCTGTACTTGTTGCTGTTA 51928427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2967 AACACTGCATGACATTTAGAAAATGTTTAATAAATGATGTTGCTGTACTTGTTGCTGTTA 3026

 51928428 TTGTTGCTCTGTCATGTTAGGAGAACTCTCATTTACCCTAGTGTTCTCTCAAAGTGAAAT 51928487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3027 TTGTTGCTCTGTCATGTTAGGAGAACTCTCATTTACCCTAGTGTTCTCTCAAAGTGAAAT 3086

 51928488 ACAGATCATTACCTCTTGAAATCATGTCCAAGTAACTTCAGAATTATTTAGAAATCATTT 51928547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3087 ACAGATCATTACCTCTTGAAATCATGTCCAAGTAACTTCAGAATTATTTAGAAATCATTT 3146

 51928548 ATCTAAATCAGAGTATTTCTTGATATAATTTAAAGTTGATTGTATTTGAAAGTACATATG 51928607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3147 ATCTAAATCAGAGTATTTCTTGATATAATTTAAAGTTGATTGTATTTGAAAGTACATATG 3206

 51928608 TCAATCTAGTATGAGATAATCTCAAGGAAATAAAAATGTATAGGTCTAATTTACATTTTT 51928667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3207 TCAATCTAGTATGAGATAATCTCAAGGAAATAAAAATGTATAGGTCTAATTTACATTTTT 3266

 51928668 ATATGGAAGGAGATAATTACTTTCTATCACAAATGATGAAGGCTGACGTTTGTTTCTTTT 51928727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3267 ATATGGAAGGAGATAATTACTTTCTATCACAAATGATGAAGGCTGACGTTTGTTTCTTTT 3326

 51928728 TTACTTTTAATTTTCACTTATATTTTGTTTATTATCAATATTTGCTTTTTAAAAGGTGGG 51928787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3327 TTACTTTTAATTTTCACTTATATTTTGTTTATTATCAATATTTGCTTTTTAAAAGGTGGG 3386

 51928788 AAGAAATCAACCAATCAAACATTAAAAAGCAATATGGAGGAGGGTGATATAATGCCCACT 51928847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3387 AAGAAATCAACCAATCAAACATTAAAAAGCAATATGGAGGAGGGTGATATAATGCCCACT 3446

 51928848 TATATTTCTCTTATAATTTTAAATATTTTCATAATTAACAGAATAATTAGCACTGGTAAT 51928907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3447 TATATTTCTCTTATAATTTTAAATATTTTCATAATTAACAGAATAATTAGCACTGGTAAT 3506

 51928908 ATTAAAATACCATCAAAAGAATCTAAATGTATGTGCTTTCTGTTGCAGCCTTGTTAGATG 51928967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3507 ATTAAAATACCATCAAAAGAATCTAAATGTATGTGCTTTCTGTTGCAGCCTTGTTAGATG 3566

 51928968 TTTCAGTGGATTCAAAGTGTTGTTATAAGAAAACGTGATTTATCAAGACTTTCATGTGTA 51929027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3567 TTTCAGTGGATTCAAAGTGTTGTTATAAGAAAACGTGATTTATCAAGACTTTCATGTGTA 3626

 51929028 AAATAAAAGGCATTTTCAATGACTACTTGGCCAGGCTTTCAGATTCCAATGCCAAGATGT 51929087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3627 AAATAAAAGGCATTTTCAATGACTACTTGGCCAGGCTTTCAGATTCCAATGCCAAGATGT 3686

 51929088 TGTATTTTGATATTGCAGTTTTCTAACAACAACAAAGTTGAGTGGACTTCTGGAACTAAA 51929147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3687 TGTATTTTGATATTGCAGTTTTCTAACAACAACAAAGTTGAGTGGACTTCTGGAACTAAA 3746

 51929148 ACTTAAATATTCAGAACTAATTATCACCACTCTATTTCTTACAGAGCATTTAAGGAACAC 51929207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3747 ACTTAAATATTCAGAACTAATTATCACCACTCTATTTCTTACAGAGCATTTAAGGAACAC 3806

 51929208 ATATATGCATATATCCTTGCACTTTGTGCTACAGGTTGTGAGCCAGGGTTACTTCCTTCT 51929267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3807 ATATATGCATATATCCTTGCACTTTGTGCTACAGGTTGTGAGCCAGGGTTACTTCCTTCT 3866

 51929268 GACCATGTGGGTTCATAATGAAGACCCAACCTTAAGGTACCCAGGGCTTAGAAATCAAAT 51929327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3867 GACCATGTGGGTTCATAATGAAGACCCAACCTTAAGGTACCCAGGGCTTAGAAATCAAAT 3926

 51929328 TTGTCCTTAGGACACTTTGGAAATCTATCTTGTAGTACAGGTGACCCAGCAGCAATCAAT 51929387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3927 TTGTCCTTAGGACACTTTGGAAATCTATCTTGTAGTACAGGTGACCCAGCAGCAATCAAT 3986

 51929388 CTTTCTGCCATCCCTAGTTTTAGTTCAGGACCCAGAAAAGTTGTAACTTGTTTCCTTTCC 51929447
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3987 CTTTCTGCCATCCCTAGTTTTACTTCAGGACCCAGAAAAGTTGTAACTTGTTTCCTTTCC 4046

 51929448 TGTGATCAAGCCTTTGTTTTCTCTTTTTTTCTCCACTTTTTGTAGCTTTTTAATTTGTTT 51929507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4047 TGTGATCAAGCCTTTGTTTTCTCTTTTTTTCTCCACTTTTTGTAGCTTTTTAATTTGTTT 4106

 51929508 CTCTGTTGATTACTAGCCCAATGCCTGAGCATCTTCGTCTTAAGACAAAGCCTCTGTGTT 51929567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4107 CTCTGTTGATTACTAGCCCAATGCCTGAGCATCTTCGTCTTAAGACAAAGCCTCTGTGTT 4166

 51929568 TCTTCAGCTCCTGAAATGACTGGCATGCTGAAAATGAGCTCAGGGCATTAGTCTTTGCTA 51929627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4167 TCTTCAGCTCCTGAAATGACTGGCATGCTGAAAATGAGCTCAGGGCATTAGTCTTTGCTA 4226

 51929628 CTAAGCCACTACAGATTCCATTCCCTTTCTTCTTGAGTATGCACACACCGCTTGTTCACA 51929687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     4227 CTAAGCCACTACAGATTCCATTCCCTTTCTTCCTGAGTATGCACACACCGCTTGTTCACA 4286

 51929688 GACTCCAGATTAGTTATTAAGCTACATCTGTATGCAGTTTGCACTCTCCTGCCTTCGACC 51929747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4287 GACTCCAGATTAGTTATTAAGCTACATCTGTATGCAGTTTGCACTCTCCTGCCTTCGACC 4346

 51929748 TGCTTGTCCCAGAAGTTATTCACCATATTCTACCTTGATCATATTTTCTACTTGTCAATG 51929807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4347 TGCTTGTCCCAGAAGTTATTCACCATATTCTACCTTGATCATATTTTCTACTTGTCAATG 4406

 51929808 CGCATGTCAATTAAGAACTTTTAACATTTATTGACCATTTATTATATACTAGCCAGTCTT 51929867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4407 CGCATGTCAATTAAGAACTTTTAACATTTATTGACCATTTATTATATACTAGCCAGTCTT 4466

 51929868 TTAATTGATTTATGAACAATTAACTTAATCATCATATAAGCATAGTAGGGTACAATTAGT 51929927
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4467 TTAATTGCTTTATGAACAATTAACTTAATCATCATATAAGCATAGTAGGGTACAATTAGT 4526

 51929928 TCCCCAACTTTATATATGAACAAATGGACTTTCAGAAAGGTAAGGTAAAATATCCACGGT 51929987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4527 TCCCCAACTTTATATATGAACAAATGGACTTTCAGAAAGGTAAGGTAAAATATCCACGGT 4586

 51929988 AAGAAAGCCTGCATATGTGGAACTGGGAATTGAACCCCTATGTCTGACCCGAGGGTCCAT 51930047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4587 AAGAAAGCCTGCATATGTGGAACTGGGAATTGAACCCCTATGTCTGACCCGAGGGTCCAT 4646

 51930048 ACACTTAAGCATTATGCTATCAAGTTTTCCACAGCCTGCTTTTCGGCTTCTCTCTCTTTC 51930107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4647 ACACTTAAGCATTATGCTATCAAGTTTTCCACAGCCTGCTTTTCGGCTTCTCTCTCTTTC 4706

 51930108 TTTCTTTCCTGATCTCTGTTGCAATTCCTACCTTTCAACTCCCTTCTGACCATGGATAGT 51930167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     4707 TTTCTTTCCTGATCTCTGTTGCAATTCCTACCTTTCAACTCCCTTCTGACCATGGACAGT 4766

 51930168 TTGCAAAATGCCAGAGGTACGTCTCAAAGAAGCTTCAAATAGGAGCGTGTACTACCATTA 51930227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4767 TTGCAAAATGCCAGAGGTACGTCTCAAAGAAGCTTCAAATAGGAGCGTGTACTACCATTA 4826

 51930228 AGTCAGCTCCTCAGTTGTCTTCTTTGGATTGAGAAGCACTTCATCACTTTTTACACAGGT 51930287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4827 AGTCAGCTCCTCAGTTGTCTTCTTTGGATTGAGAAGCACTTCATCACTTTTTACACAGGT 4886

 51930288 TTAATTATCAAATATGACTTTTCTAGTACTACAGCTAATATATGTCAATGTCAAAGGGTT 51930347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4887 TTAATTATCAAATATGACTTTTCTAGTACTACAGCTAATATATGTCAATGTCAAAGGGTT 4946

 51930348 AACAGAATACTAGGCCTATATTAAATTATACATATGAGCTTTCTCTTTACTCCTTTTTAT 51930407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4947 AACAGAATACTAGGCCTATATTAAATTATACATATGAGCTTTCTCTTTACTCCTTTTTAT 5006

 51930408 GTTCATTAGCAAACAGATAAAGCCATAATAGATTTTTTAAGGAATATTTTGTTTTGTTTT 51930467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5007 GTTCATTAGCAAACAGATAAAGCCATAATAGATTTTTTAAGGAATATTTTGTTTTGTTTT 5066

 51930468 GTTTTGGACTTATACATCTATTAACAATAAACCAAACATTGCAGATTAAAGCAAATCTGC 51930527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5067 GTTTTGGACTTATACATCTATTAACAATAAACCAAACATTGCAGATTAAAGCAAATCTGC 5126

 51930528 CAATCTGTTTTACAAACACTATCTTCTGAAGGGTTCCTGGGCACAAGATACTGTTCTAGT 51930587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5127 CAATCTGTTTTACAAACACTATCTTCTGAAGGGTTCCTGGGCACAAGATACTGTTCTAGT 5186

 51930588 AATATTTCACAGC-TTTTTTTTTTTTTTCATTTTAGAGAAAATATTCTAAGACTCCAAAG 51930646
          ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5187 AATATTTCACAGCTTTTTTTTTTTTTTTCATTTTAGAGAAAATATTCTAAGACTCCAAAG 5246

 51930647 TTCGATAGTATTTGGTCAGTGTCTTAGTCAGTTTGAGCTAATATAAC 51930693
          ||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5247 TTAGATAGTATTTGGTCAGTGTCTTAGTCAGTTTGAGCTAATATAAC 5293

Alignment time is 3.98669 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51916584,51937767] =>     21184 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [       1,    2370] =>      2370 nucs 'mol-32-2fe3-336940_2370'

Score:        2336
Aligned:      2369        nucs
Identic:      2366 (100%) nucs =>       140 (100%)      2226 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51924219,51924358] EXCISED REGION [51924360,51926587]
 second seq =>  [       1,     140] EXCISED REGION [     142,    2370]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [51924359,51924359]
 second seq =>         1 nucs [141,141]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [430,430]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [51924357,51924358] to [51924358,51924359]
 second seq =>         1 nucs [141,141] to [142,142]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 51924219 TTCATGCCATTTATGAACCATTTTTTATTTCTATGGTTGATAGAGAATGACTTCATAATT 51924278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTCATGCCATTTATGAACCATTTTTTATTTCTATGGTTGATAGAGAATGACTTCATAATT 60

 51924279 CATTTCTGAATAAGTGAAATAATTTAAAAACATTTTAAAGTGGGTGTATCTACTTGCTTG 51924338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CATTTCTGAATAAGTGAAATAATTTAAAAACATTTTAAAGTGGGTGTATCTACTTGCTTG 120

 51924339 GAGCTTTGTCGAATCATGTT 51924358
          ||||||||||||||||||||
      121 GAGCTTTGTCGAATCATGTT 140

EXCISED REGION

 51924360 CTTATTTGGAGCCTCTGGAGGAATGTTGACTTACCATGGTAAAAATTAACTGGTGAAACT 51924419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      142 CTTATTTGGAGCCTCTGGAGGAATGTTGACTTACCATGGTAAAAATTAACTGGTGAAACT 201

 51924420 CTAAAGAAAACACAGACTCTACACGCAGTCTTGTCCGAAACTTACTCACCCTGAAACCAA 51924479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      202 CTAAAGAAAACACAGACTCTACACGCAGTCTTGTCCGAAACTTACTCACCCTGAAACCAA 261

 51924480 TGAATTTCAAAGACCTAGATACTTCCTTCTGTGATGTCCCCTGAGATCAGAGAATAAAAG 51924539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      262 TGAATTTCAAAGACCTAGATACTTCCTTCTGTGATGTCCCCTGAGATCAGAGAATAAAAG 321

 51924540 AAAAATCCCTCGTAAATATACATCACGTACAGCTGTTTGATTTATGCATTATGCAGAAAC 51924599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      322 AAAAATCCCTCGTAAATATACATCACGTACAGCTGTTTGATTTATGCATTATGCAGAAAC 381

 51924600 TAAGAAAACAGAGTTATATGTAACCTTGCAATGAGAAGTGCACCCACC-AAAAAAAAAAA 51924658
          ||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||| |||||||||||
      382 TAAGAAAACAGAGTTATATGTAACTTTGCAATGAGAAGTGCACCCACCAAAAAAAAAAAA 441

 51924659 AAAAAAAATCCCAAAACATTGTTTCAAAAAGAAGTGGTATGAAGCATCTTAGTGTTTCAT 51924718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      442 AAAAAAAATCCCAAAACATTGTTTCAAAAAGAAGTGGTATGAAGCATCTTAGTGTTTCAT 501

 51924719 GAATATTGAAGAATAGTGCAATTATTGAAATTTGGCATTTAAAAAATGTTTTTAAATTAT 51924778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      502 GAATATTGAAGAATAGTGCAATTATTGAAATTTGGCATTTAAAAAATGTTTTTAAATTAT 561

 51924779 TAGGAAGCTACCGTGACCTGTTTACTAAATCCTCAATTCTTTCTCTCTCAGTTTTTCTTA 51924838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      562 TAGGAAGCTACCGTGACCTGTTTACTAAATCCTCAATTCTTTCTCTCTCAGTTTTTCTTA 621

 51924839 CTATAAAATTTACTTTTCAAGCCAGAGAATTTTTCTTTCTGACAAGACGTAGATCTATAT 51924898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      622 CTATAAAATTTACTTTTCAAGCCAGAGAATTTTTCTTTCTGACAAGACGTAGATCTATAT 681

 51924899 TGCGCTGTCAAGATGCAGCTTTTGCATCTCTGCTGCCATGTGGATAGAATAACTTTCTTT 51924958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      682 TGCGCTGTCAAGATGCAGCTTTTGCATCTCTGCTGCCATGTGGATAGAATAACTTTCTTT 741

 51924959 CCTCAAGAAGTGGACAAGCCCTCATAGGGACTGATTTTCTGTGAAGTAGTGAGACTTAAT 51925018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      742 CCTCAAGAAGTGGACAAGCCCTCATAGGGACTGATTTTCTGTGAAGTAGTGAGACTTAAT 801

 51925019 CTTTGGGACCTTCACTTACATCACTTACATAGGACCTTTCAATACTCAGGGAGGGCCCTT 51925078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      802 CTTTGGGACCTTCACTTACATCACTTACATAGGACCTTTCAATACTCAGGGAGGGCCCTT 861

 51925079 GGCAATAAGTTCTTCTGACAATATATCTTGTGCTGATGGTGGTGTTAGCTTTCAAAATTT 51925138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      862 GGCAATAAGTTCTTCTGACAATATATCTTGTGCTGATGGTGGTGTTAGCTTTCAAAATTT 921

 51925139 GTAATTATTTTGGTAATTTCTGTCATCCTAGAAAAATGTGTATAGTGTATTTGTTCCTAA 51925198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      922 GTAATTATTTTGGTAATTTCTGTCATCCTAGAAAAATGTGTATAGTGTATTTGTTCCTAA 981

 51925199 TTTCATTTTCATTATTTATATATTTTTTAATGAACACCCCCAGCATAGTATAAGTTTTAT 51925258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      982 TTTCATTTTCATTATTTATATATTTTTTAATGAACACCCCCAGCATAGTATAAGTTTTAT 1041

 51925259 ACCTCTACAATCTGAATCACCCGCTTGGCCCATGCCTAGGACTAGGTCTTATCATCCGCA 51925318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1042 ACCTCTACAATCTGAATCACCCGCTTGGCCCATGCCTAGGACTAGGTCTTATCATCCGCA 1101

 51925319 GTGAGAGATTATAGGCTCTTACTAGGAATTTATGGTAACATGGGCTCCTAACAGTCATGA 51925378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1102 GTGAGAGATTATAGGCTCTTACTAGGAATTTATGGTAACATGGGCTCCTAACAGTCATGA 1161

 51925379 TTTTTATAACATGATTGCCTATGTATATAAAGTCCACTGGCTGAACAAGTATTTTCCCTC 51925438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1162 TTTTTATAACATGATTGCCTATGTATATAAAGTCCACTGGCTGAACAAGTATTTTCCCTC 1221

 51925439 AAATCAGGAAGGAAAAAAAAAAACACGAAGCAAATTGATCCTCTTCTAAAAGCTGTCACA 51925498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1222 AAATCAGGAAGGAAAAAAAAAAACACGAAGCAAATTGATCCTCTTCTAAAAGCTGTCACA 1281

 51925499 TCAGTAACCCATCATATTCTCATTTACTTATATACTGAGTAGGTAGTCACCTTTGATTCA 51925558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1282 TCAGTAACCCATCATATTCTCATTTACTTATATACTGAGTAGGTAGTCACCTTTGATTCA 1341

 51925559 TATCTCTCAGGAGTTCAGAAGTTTTTGAAAGTAATTTGTGATACAAAATATAGGGAAATT 51925618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1342 TATCTCTCAGGAGTTCAGAAGTTTTTGAAAGTAATTTGTGATACAAAATATAGGGAAATT 1401

 51925619 CAGAATGAGATTCTTTTGGCTTGTCTTTCTTTTTCTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTATT 51925678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1402 CAGAATGAGATTCTTTTGGCTTGTCTTTCTTTTTCTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTATT 1461

 51925679 TGTTGAACTCAAATCCGGAAATTGTGGAGGTTACTAGAACTCTAAGTCACAGACTTATAA 51925738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1462 TGTTGAACTCAAATCCGGAAATTGTGGAGGTTACTAGAACTCTAAGTCACAGACTTATAA 1521

 51925739 GTACTGAAAAAGTAGTCAGTAAAGAAAACATACAGTAAGAGACTAGGTTAATTTTCCTAT 51925798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1522 GTACTGAAAAAGTAGTCAGTAAAGAAAACATACAGTAAGAGACTAGGTTAATTTTCCTAT 1581

 51925799 AGTTCATTGATGTTTCCACTATTACTGCCCCTGATTTTTAACTTTAGTTTTCCTTAGATT 51925858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1582 AGTTCATTGATGTTTCCACTATTACTGCCCCTGATTTTTAACTTTAGTTTTCCTTAGATT 1641

 51925859 GTTGGAGTAATATATGTACCTTAAAAATTAACTGTGGAACAAGTAGATGAACTTTTTACA 51925918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1642 GTTGGAGTAATATATGTACCTTAAAAATTAACTGTGGAACAAGTAGATGAACTTTTTACA 1701

 51925919 CAATTTCCTGCTTTTATAAAGTTCCTACTAGCTATATTTTCCCAAAAGTGCTCAACAATA 51925978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1702 CAATTTCCTGCTTTTATAAAGTTCCTACTAGCTATATTTTCCCAAAAGTGCTCAACAATA 1761

 51925979 GAGTCTGGTGCTAAAAAGCAGAGTAGGCTAAATTTAGATCAATGTGAAATGCCCTACTTA 51926038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1762 GAGTCTGGTGCTAAAAAGCAGAGTAGGCTAAATTTAGATCAATGTGAAATGCCCTACTTA 1821

 51926039 TTTCCTATGAACTTAATTGATTGAGCTCATTTTGGGGGTGTCTTTCTGATCGACCAGAAA 51926098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1822 TTTCCTATGAACTTAATTGATTGAGCTCATTTTGGGGGTGTCTTTCTGATCGACCAGAAA 1881

 51926099 CTTGGCTCATTAGAGCAACTCACAAAGTGACCTTTTAAAAGAAAGAGTTTTCAATATATT 51926158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1882 CTTGGCTCATTAGAGCAACTCACAAAGTGACCTTTTAAAAGAAAGAGTTTTCAATATATT 1941

 51926159 TGTTCATGTTCCATTCCACTGAGAATGGTGCTATTTAAAACTAAATACAATAATTTTAGA 51926218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1942 TGTTCATGTTCCATTCCACTGAGAATGGTGCTATTTAAAACTAAATACAATAATTTTAGA 2001

 51926219 TATTGTACAGCAGATATAATTTTAAACATAATACATGGGATTTCGATTTTAGGTACTGTT 51926278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2002 TATTGTACAGCAGATATAATTTTAAACATAATACATGGGATTTCGATTTTAGGTACTGTT 2061

 51926279 TATAAGGCATTTCTCCTTATATTATTCTAGACTTAAATATAACAAATTTCATGCAGAGGT 51926338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2062 TATAAGGCATTTCTCCTTATATTATTCTAGACTTAAATATAACAAATTTCATGCAGAGGT 2121

 51926339 TTCTTTCAAAAGTAAATTCAGCCACATTTAGACTCAAATATTCCCTAATTTTTTAGTGTA 51926398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2122 TTCTTTCAAAAGTAAATTCAGCCACATTTAGACTCAAATATTCCCTAATTTTTTAGTGTA 2181

 51926399 GCTGAAGTCCTAATAATATACTTGTGTTTCTTTTAAATTAAGTCCCACATGTTAACTTTA 51926458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2182 GCTGAAGTCCTAATAATATACTTGTGTTTCTTTTAAATTAAGTCCCACATGTTAACTTTA 2241

 51926459 CAACAGAAAGTCCATGTATCGTATTATTAGTCTAAATCTTCATTTTACTGTTTAGTTAAC 51926518
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2242 CAGCAGAAAGTCCATGTATCGTATTATTAGTCTAAATCTTCATTTTACTGTTTAGTTAAC 2301

 51926519 ACAGACATTCATTTAACACACTATGTTTAATTTCCCACTCAGTTTTGGCTTATTGTAGTC 51926578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2302 ACAGACATTCATTTAACACACTATGTTTAATTTCCCACTCAGTTTTGGCTTATTGTAGTC 2361

 51926579 TAATAAACA 51926587
          |||||||||
     2362 TAATAAACA 2370

Alignment time is 1.8243 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51916584,51937767] =>     21184 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [       1,    7172] =>      7172 nucs 'mol-32-2ff9-188966_7172'

Score:        7028
Aligned:      7177        nucs
Identic:      7161 (100%) nucs =>      5348 (100%)      1813 (100%)
Gaps:            6 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51921225,51926584] EXCISED REGION [51927768,51929583]
 second seq =>  [       1,    5356] EXCISED REGION [    5357,    7172]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1183 nucs [51926585,51927767]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [51926585,51926587] to [51927768,51927770]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [51926584,51926584] to [51927768,51927768]
 second seq =>         1 nucs [5356,5356] to [5357,5357]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 51921225 ACCAGCCTGGCCAAAATGGTGAAACCCTGTCGCTACTAAAAATACATAAAATTAGCCAGG 51921284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACCAGCCTGGCCAAAATGGTGAAACCCTGTCGCTACTAAAAATACATAAAATTAGCCAGG 60

 51921285 TGTGGTGGCACACTCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTG 51921344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGTGGTGGCACACTCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTG 120

 51921345 AACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGGTTATGCCACTGCATCCCAGCCTGGGCG 51921404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGGTTATGCCACTGCATCCCAGCCTGGGCG 180

 51921405 ATAGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAAAATAAAATTAAATTAAAAATAAATAAATAAATAAA 51921464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATAGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAAAATAAAATTAAATTAAAAATAAATAAATAAATAAA 240

 51921465 TAGAATTAGAAATTCTAACATGTTCTCTCAGTACCACAAGAAATTATTTGGAGAACCCAC 51921524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TAGAATTAGAAATTCTAACATGTTCTCTCAGTACCACAAGAAATTATTTGGAGAACCCAC 300

 51921525 TAGAATACACACTTCTTGCTTGAGGAACCACTGGCCTCAGGACATAGGCTTAAAGTAAAT 51921584
          ||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TAGAATGCACACATCTTGCTTGAGGAACCACTGGCCTCAGGACATAGGCTTAAAGTAAAT 360

 51921585 CAACAAAAATTAACTACATACATATAAGCATATCTTCCTAATTTTTGCATTGCGTGACCT 51921644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CAACAAAAATTAACTACATACATATAAGCATATCTTCCTAATTTTTGCATTGCGTGACCT 420

 51921645 AACTATAATCTATAGCATATCTTTCCATGCCCAGATCTATTTCTGAACTGTTATATGACA 51921704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AACTATAATCTATAGCATATCTTTCCATGCCCAGATCTATTTCTGAACTGTTATATGACA 480

 51921705 TCTCCACACAGTTCATACTTGCTTTGACTATGACCTAAATTCCTAGCCTGTTCCCTGGAT 51921764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCTCCACACAGTTCATACTTGCTTTGACTATGACCTAAATTCCTAGCCTGTTCCCTGGAT 540

 51921765 AGTTTCTCAGTAGTGCAGGACTATAAATGCACAGTCACTGTGTGTACAAGTTATATGGGA 51921824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGTTTCTCAGTAGTGCAGGACTATAAATGCACAGTCACTGTGTGTACAAGTTATATGGGA 600

 51921825 ATATAACAAGTTATGTGTTAATAAAAGTTATTTAGAAATAAAACGAAAATTATAAACAAT 51921884
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATATAACAAGTTATGTGTTAATAAAAATTATTTAGAAATAAAACGAAAATTATAAACAAT 660

 51921885 TTGTACTAATACTATATTTTTTCTGTTATACAACATAGTGACATGAAAAACAAATATAAT 51921944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTGTACTAATACTATATTTTTTCTGTTATACAACATAGTGACATGAAAAACAAATATAAT 720

 51921945 AATGGCTTAATTGTAAAGTATATAATAATAGTTTATCTGATTTGACCCTCCATATACTGT 51922004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AATGGCTTAATTGTAAAGTATATAATAATAGTTTATCTGATTTGACCCTCCATATACTGT 780

 51922005 ATGAGGGCCTTAAACCTCTTTCATGATACTTTCCATCTAATTATGGCTATTGTCAGGGTG 51922064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATGAGGGCCTTAAACCTCTTTCATGATACTTTCCATCTAATTATGGCTATTGTCAGGGTG 840

 51922065 TGTCTGATGTATGCCTCAGGAAACATCCTCAGTCACCAGCTGGTATTAATAGTTTTGTCT 51922124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGTCTGATGTATGCCTCAGGAAACATCCTCAGTCACCAGCTGGTATTAATAGTTTTGTCT 900

 51922125 CTCTGTTCTGATTCTTTTCATAATATTTGGAATTTTGTCTTCCACTACCTGTACAAGGGC 51922184
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATCTGTTCTGATTCTTTTCATAATATTTGGAATTTTGTCTTCCACTACCTGTACAAGGGC 960

 51922185 AAGGCAACTCATCTGTTACTAAGAGATAACTTGGCCGGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAA 51922244
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AAGGCAACTCATCTGTTAGTAAGAGATAACTTGGCCGGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAA 1020

 51922245 TCCCAGCACTGTGGGAGGCTGAGGTGGGGGGATCACTAGGTCAGGAGATCAAGACCATCG 51922304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TCCCAGCACTGTGGGAGGCTGAGGTGGGGGGATCACTAGGTCAGGAGATCAAGACCATCG 1080

 51922305 TGGCCAACATGGTGAAACCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTTGT 51922364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGGCCAACATGGTGAAACCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTTGT 1140

 51922365 GGGCACCTGTAATCCCACCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATAGCTTGAACCAGGGA 51922424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GGGCACCTGTAATCCCACCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATAGCTTGAACCAGGGA 1200

 51922425 GTTGGAGGTTACAGTGAGCCAAGATCACACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAA 51922484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GTTGGAGGTTACAGTGAGCCAAGATCACACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAA 1260

 51922485 GACTCCATCTCAAAAAAAAGATAGAGTTAACTTGAATTTACTTAAATCATAACTTGGGGG 51922544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GACTCCATCTCAAAAAAAAGATAGAGTTAACTTGAATTTACTTAAATCATAACTTGGGGG 1320

 51922545 AATTTTACCATTAAATCATTATACAATATTTTTATTACTCTGTTCAGAGTAATATACCAG 51922604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AATTTTACCATTAAATCATTATACAATATTTTTATTACTCTGTTCAGAGTAATATACCAG 1380

 51922605 AGTAAGTACCATTTTATAAGCTTCTATAGTTCAATGGCATCTCCATGAAACTTATATAAG 51922664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AGTAAGTACCATTTTATAAGCTTCTATAGTTCAATGGCATCTCCATGAAACTTATATAAG 1440

 51922665 TAGCTTTTAATTAAAAATTAAAGTTTTTTTCAGAAAGAATTTTTTTGTTAATTGGTCATT 51922724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TAGCTTTTAATTAAAAATTAAAGTTTTTTTCAGAAAGAATTTTTTTGTTAATTGGTCATT 1500

 51922725 ATCCATTTATTGATTTCTTATGGCATGTTCAGCTTTATTCATAAAATAGGCATCATCTAA 51922784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATCCATTTATTGATTTCTTATGGCATGTTCAGCTTTATTCATAAAATAGGCATCATCTAA 1560

 51922785 AAGAATTGTAAGCATGAATTCCTTTTCAGTGTGTGGGCAGTGTAATTGGAGAGCCAAGAG 51922844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AAGAATTGTAAGCATGAATTCCTTTTCAGTGTGTGGGCAGTGTAATTGGAGAGCCAAGAG 1620

 51922845 AAATACAGAGGAAATTACTGATGCCAAAAATACATAAAATGTAATAGAGAAAATAGAATT 51922904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AAATACAGAGGAAATTACTGATGCCAAAAATACATAAAATGTAATAGAGAAAATAGAATT 1680

 51922905 GGAAACTCTTCTTGGTATACTCTCTTTCTTCATACTGAATCACATGGCTCGCTATCAGTT 51922964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GGAAACTCTTCTTGGTATACTCTCTTTCTTCATACTGAATCACATGGCTCGCTATCAGTT 1740

 51922965 CAAATAGGAATTTTTAAGGAAGTCCTTTATGGATTTCACCTCACTCCAATGTGTCCACAC 51923024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CAAATAGGAATTTTTAAGGAAGTCCTTTATGGATTTCACCTCACTCCAATGTGTCCACAC 1800

 51923025 TCAGTGCTTTCTCAGGATAAAGAAACTCAATTCTATTACATAATTTTGTAAATTGTTTTC 51923084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TCAGTGCTTTCTCAGGATAAAGAAACTCAATTCTATTACATAATTTTGTAAATTGTTTTC 1860

 51923085 TTTTTCTTTGCCCACCATATTCTCATAAGGACACCTTAAGCTCCTCAAAAGCACAAAACG 51923144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTTTTCTTTGCCCACCATATTCTCATAAGGACACCTTAAGCTCCTCAAAAGCACAAAACG 1920

 51923145 CAAATTCTATTTCTTTGTCAACCCTCTCTCTAGTAAAGTTCTAGGTAAAGAATAAATGCA 51923204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CAAATTCTATTTCTTTGTCAACCCTCTCTCTAGTAAAGTTCTAGGTAAAGAATAAATGCA 1980

 51923205 TGACTGATTGTTTTAATGAGCGCTAATGGGTGTTGTTAAATCCCTTACTATCTGAGGAGA 51923264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TGACTGATTGTTTTAATGAGCGCTAATGGGTGTTGTTAAATCCCTTACTATCTGAGGAGA 2040

 51923265 TCGTTGCTTATGGCAGCCCCTGTGATTTTAAAAGCTCTTCCATGTTGGAATAAAGGCAAA 51923324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TCGTTGCTTATGGCAGCCCCTGTGATTTTAAAAGCTCTTCCATGTTGGAATAAAGGCAAA 2100

 51923325 ATACAGTGATTTCAAAGAACTGGGGAGAGAAATTTTAAGATTTCCTTTTGGGAAAATTTC 51923384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ATACAGTGATTTCAAAGAACTGGGGAGAGAAATTTTAAGATTTCCTTTTGGGAAAATTTC 2160

 51923385 AGGCAAAAAATTACATCTTATAATCCATTCCAGGCTTTTGATTGTATGATTACCCCATTT 51923444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AGGCAAAAAATTACATCTTATAATCCATTCCAGGCTTTTGATTGTATGATTACCCCATTT 2220

 51923445 ACAATTGATGTTGAAAATAATATTTTCTCACTTGCCACAGCCTCTTCTTTGCATTCTCTC 51923504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ACAATTGATGTTGAAAATAATATTTTCTCACTTGCCACAGCCTCTTCTTTGCATTCTCTC 2280

 51923505 ACCCTCAGCTATTATATATTAGCTCAGTACCTGCATTATTTACAGGAACTGAAAAACAGG 51923564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 ACCCTCAGCTATTATATATTAGCTCAGTACCTGCATTATTTACAGGAACTGAAAAACAGG 2340

 51923565 GTTGAAGATTATAAAATCTCACATTTGCTGACTTTTATGCAGGTTAAATGAAAGAGTTTT 51923624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GTTGAAGATTATAAAATCTCACATTTGCTGACTTTTATGCAGGTTAAATGAAAGAGTTTT 2400

 51923625 ATAATTGTTTCTGCCAACCAGTAGGTTCAAAATGTTTATTAAAAGTGAATTCTGGATAAA 51923684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ATAATTGTTTCTGCCAACCAGTAGGTTCAAAATGTTTATTAAAAGTGAATTCTGGATAAA 2460

 51923685 TTATGATTAATGTCCTTCTGGTTTGTTTTGCTTGAGCCTACACACACACACACACACACA 51923744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TTATGATTAATGTCCTTCTGGTTTGTTTTGCTTGAGCCTACACACACACACACACACACA 2520

 51923745 CACACACACACACACACATATACACACACATATATATATAACTTTATATAAAACTATAAA 51923804
          ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CACACACACACACA----TATACACACACATATATATATAACTTTATATAAAACTATAAA 2576

 51923805 TACTAGGAACTAGCACTAGAACTGTACTTTTCACTACAGTATCAGTAAAAAAAAAAAA-T 51923863
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
     2577 TACTAGGAACTAGCACTAGAACTGTACTTTTCACTACAGTATCAGTAAAAAAAAAAAAAT 2636

 51923864 TTAGGATTTTTTATGACTGATTTTACATTTAAACCTAAAGGAAAAATAATCAGGAACAAC 51923923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2637 TTAGGATTTTTTATGACTGATTTTACATTTAAACCTAAAGGAAAAATAATCAGGAACAAC 2696

 51923924 ACAGAGTTTTTTTTTTTAAATGAGTTGGCAAAGAAAATACCAAAGGCTCAAACCTGACAA 51923983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2697 ACAGAGTTTTTTTTTTTAAATGAGTTGGCAAAGAAAATACCAAAGGCTCAAACCTGACAA 2756

 51923984 AAGCATTGAGAATACCAGAAAAGAAATTTTAACCTTTAAATTTAATTGAAACATGATATT 51924043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2757 AAGCATTGAGAATACCAGAAAAGAAATTTTAACCTTTAAATTTAATTGAAACATGATATT 2816

 51924044 TTTCTCTTTTGAAACATTTCTTTCTCTACAAAAATCTGTTCCTTCAGAACCTGTTGATGC 51924103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2817 TTTCTCTTTTGAAACATTTCTTTCTCTACAAAAATCTGTTCCTTCAGAACCTGTTGATGC 2876

 51924104 AATAATATTATATCATTTTTTTTTACTGGTCAATGTATTTATTTGTAATTGTTCTGAAAT 51924163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2877 AATAATATTATATCATTTTTTTTTACTGGTCAATGTATTTATTTGTAATTGTTCTGAAAT 2936

 51924164 TGTTTCCTGCAAGGTTTTCTATTACTCAAACTGTCTTTGTACACATAATTTTCCTTTCAT 51924223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2937 TGTTTCCTGCAAGGTTTTCTATTACTCAAACTGTCTTTGTACACATAATTTTCCTTTCAT 2996

 51924224 GCCATTTATGAACCATTTTTTATTTCTATGGTTGATAGAGAATGACTTCATAATTCATTT 51924283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2997 GCCATTTATGAACCATTTTTTATTTCTATGGTTGATAGAGAATGACTTCATAATTCATTT 3056

 51924284 CTGAATAAGTGAAATAATTTAAAAACATTTTAAAGTGGGTGTATCTACTTGCTTGGAGCT 51924343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3057 CTGAATAAGTGAAATAATTTAAAAACATTTTAAAGTGGGTGTATCTACTTGCTTGGAGCT 3116

 51924344 TTGTCGAATCATGTTTCTTATTTGGAGCCTCTGGAGGAATGTTGACTTACCATGGTAAAA 51924403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3117 TTGTCGAATCATGTTTCTTATTTGGAGCCTCTGGAGGAATGTTGACTTACCATGGTAAAA 3176

 51924404 ATTAACTGGTGAAACTCTAAAGAAAACACAGACTCTACACGCAGTCTTGTCCGAAACTTA 51924463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3177 ATTAACTGGTGAAACTCTAAAGAAAACACAGACTCTACACGCAGTCTTGTCCGAAACTTA 3236

 51924464 CTCACCCTGAAACCAATGAATTTCAAAGACCTAGATACTTCCTTCTGTGATGTCCCCTGA 51924523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3237 CTCACCCTGAAACCAATGAATTTCAAAGACCTAGATACTTCCTTCTGTGATGTCCCCTGA 3296

 51924524 GATCAGAGAATAAAAGAAAAATCCCTCGTAAATATACATCACGTACAGCTGTTTGATTTA 51924583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3297 GATCAGAGAATAAAAGAAAAATCCCTCGTAAATATACATCACGTACAGCTGTTTGATTTA 3356

 51924584 TGCATTATGCAGAAACTAAGAAAACAGAGTTATATGTAACCTTGCAATGAGAAGTGCACC 51924643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     3357 TGCATTATGCAGAAACTAAGAAAACAGAGTTATATGTAACTTTGCAATGAGAAGTGCACC 3416

 51924644 CACCAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCCCAAAACATTGTTTCAAAAAGAAGTGGTATGAAGC 51924703
          |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3417 CACCAAAAAAAAAAAAAAAAAA-TCCCAAAACATTGTTTCAAAAAGAAGTGGTATGAAGC 3475

 51924704 ATCTTAGTGTTTCATGAATATTGAAGAATAGTGCAATTATTGAAATTTGGCATTTAAAAA 51924763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3476 ATCTTAGTGTTTCATGAATATTGAAGAATAGTGCAATTATTGAAATTTGGCATTTAAAAA 3535

 51924764 ATGTTTTTAAATTATTAGGAAGCTACCGTGACCTGTTTACTAAATCCTCAATTCTTTCTC 51924823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3536 ATGTTTTTAAATTATTAGGAAGCTACCGTGACCTGTTTACTAAATCCTCAATTCTTTCTC 3595

 51924824 TCTCAGTTTTTCTTACTATAAAATTTACTTTTCAAGCCAGAGAATTTTTCTTTCTGACAA 51924883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3596 TCTCAGTTTTTCTTACTATAAAATTTACTTTTCAAGCCAGAGAATTTTTCTTTCTGACAA 3655

 51924884 GACGTAGATCTATATTGCGCTGTCAAGATGCAGCTTTTGCATCTCTGCTGCCATGTGGAT 51924943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3656 GACGTAGATCTATATTGCGCTGTCAAGATGCAGCTTTTGCATCTCTGCTGCCATGTGGAT 3715

 51924944 AGAATAACTTTCTTTCCTCAAGAAGTGGACAAGCCCTCATAGGGACTGATTTTCTGTGAA 51925003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3716 AGAATAACTTTCTTTCCTCAAGAAGTGGACAAGCCCTCATAGGGACTGATTTTCTGTGAA 3775

 51925004 GTAGTGAGACTTAATCTTTGGGACCTTCACTTACATCACTTACATAGGACCTTTCAATAC 51925063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3776 GTAGTGAGACTTAATCTTTGGGACCTTCACTTACATCACTTACATAGGACCTTTCAATAC 3835

 51925064 TCAGGGAGGGCCCTTGGCAATAAGTTCTTCTGACAATATATCTTGTGCTGATGGTGGTGT 51925123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3836 TCAGGGAGGGCCCTTGGCAATAAGTTCTTCTGACAATATATCTTGTGCTGATGGTGGTGT 3895

 51925124 TAGCTTTCAAAATTTGTAATTATTTTGGTAATTTCTGTCATCCTAGAAAAATGTGTATAG 51925183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3896 TAGCTTTCAAAATTTGTAATTATTTTGGTAATTTCTGTCATCCTAGAAAAATGTGTATAG 3955

 51925184 TGTATTTGTTCCTAATTTCATTTTCATTATTTATATATTTTTTAATGAACACCCCCAGCA 51925243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3956 TGTATTTGTTCCTAATTTCATTTTCATTATTTATATATTTTTTAATGAACACCCCCAGCA 4015

 51925244 TAGTATAAGTTTTATACCTCTACAATCTGAATCACCCGCTTGGCCCATGCCTAGGACTAG 51925303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4016 TAGTATAAGTTTTATACCTCTACAATCTGAATCACCCGCTTGGCCCATGCCTAGGACTAG 4075

 51925304 GTCTTATCATCCGCAGTGAGAGATTATAGGCTCTTACTAGGAATTTATGGTAACATGGGC 51925363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4076 GTCTTATCATCCGCAGTGAGAGATTATAGGCTCTTACTAGGAATTTATGGTAACATGGGC 4135

 51925364 TCCTAACAGTCATGATTTTTATAACATGATTGCCTATGTATATAAAGTCCACTGGCTGAA 51925423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4136 TCCTAACAGTCATGATTTTTATAACATGATTGCCTATGTATATAAAGTCCACTGGCTGAA 4195

 51925424 CAAGTATTTTCCCTCAAATCAGGAAGGAAAAAAAAAAACACGAAGCAAATTGATCCTCTT 51925483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4196 CAAGTATTTTCCCTCAAATCAGGAAGGAAAAAAAAAAACACGAAGCAAATTGATCCTCTT 4255

 51925484 CTAAAAGCTGTCACATCAGTAACCCATCATATTCTCATTTACTTATATACTGAGTAGGTA 51925543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4256 CTAAAAGCTGTCACATCAGTAACCCATCATATTCTCATTTACTTATATACTGAGTAGGTA 4315

 51925544 GTCACCTTTGATTCATATCTCTCAGGAGTTCAGAAGTTTTTGAAAGTAATTTGTGATACA 51925603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4316 GTCACCTTTGATTCATATCTCTCAGGAGTTCAGAAGTTTTTGAAAGTAATTTGTGATACA 4375

 51925604 AAATATAGGGAAATTCAGAATGAGATTCTTTTGGCTTGTCTTTCTTTTTCTTTTTTTCTT 51925663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4376 AAATATAGGGAAATTCAGAATGAGATTCTTTTGGCTTGTCTTTCTTTTTCTTTTTTTCTT 4435

 51925664 TTTTTTTTTTTTATTTGTTGAACTCAAATCCGGAAATTGTGGAGGTTACTAGAACTCTAA 51925723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4436 TTTTTTTTTTTTATTTGTTGAACTCAAATCCGGAAATTGTGGAGGTTACTAGAACTCTAA 4495

 51925724 GTCACAGACTTATAAGTACTGAAAAAGTAGTCAGTAAAGAAAACATACAGTAAGAGACTA 51925783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4496 GTCACAGACTTATAAGTACTGAAAAAGTAGTCAGTAAAGAAAACATACAGTAAGAGACTA 4555

 51925784 GGTTAATTTTCCTATAGTTCATTGATGTTTCCACTATTACTGCCCCTGATTTTTAACTTT 51925843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4556 GGTTAATTTTCCTATAGTTCATTGATGTTTCCACTATTACTGCCCCTGATTTTTAACTTT 4615

 51925844 AGTTTTCCTTAGATTGTTGGAGTAATATATGTACCTTAAAAATTAACTGTGGAACAAGTA 51925903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4616 AGTTTTCCTTAGATTGTTGGAGTAATATATGTACCTTAAAAATTAACTGTGGAACAAGTA 4675

 51925904 GATGAACTTTTTACACAATTTCCTGCTTTTATAAAGTTCCTACTAGCTATATTTTCCCAA 51925963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4676 GATGAACTTTTTACACAATTTCCTGCTTTTATAAAGTTCCTACTAGCTATATTTTCCCAA 4735

 51925964 AAGTGCTCAACAATAGAGTCTGGTGCTAAAAAGCAGAGTAGGCTAAATTTAGATCAATGT 51926023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4736 AAGTGCTCAACAATAGAGTCTGGTGCTAAAAAGCAGAGTAGGCTAAATTTAGATCAATGT 4795

 51926024 GAAATGCCCTACTTATTTCCTATGAACTTAATTGATTGAGCTCATTTTGGGGGTGTCTTT 51926083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4796 GAAATGCCCTACTTATTTCCTATGAACTTAATTGATTGAGCTCATTTTGGGGGTGTCTTT 4855

 51926084 CTGATCGACCAGAAACTTGGCTCATTAGAGCAACTCACAAAGTGACCTTTTAAAAGAAAG 51926143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4856 CTGATCGACCAGAAACTTGGCTCATTAGAGCAACTCACAAAGTGACCTTTTAAAAGAAAG 4915

 51926144 AGTTTTCAATATATTTGTTCATGTTCCATTCCACTGAGAATGGTGCTATTTAAAACTAAA 51926203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4916 AGTTTTCAATATATTTGTTCATGTTCCATTCCACTGAGAATGGTGCTATTTAAAACTAAA 4975

 51926204 TACAATAATTTTAGATATTGTACAGCAGATATAATTTTAAACATAATACATGGGATTTCG 51926263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4976 TACAATAATTTTAGATATTGTACAGCAGATATAATTTTAAACATAATACATGGGATTTCG 5035

 51926264 ATTTTAGGTACTGTTTATAAGGCATTTCTCCTTATATTATTCTAGACTTAAATATAACAA 51926323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5036 ATTTTAGGTACTGTTTATAAGGCATTTCTCCTTATATTATTCTAGACTTAAATATAACAA 5095

 51926324 ATTTCATGCAGAGGTTTCTTTCAAAAGTAAATTCAGCCACATTTAGACTCAAATATTCCC 51926383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5096 ATTTCATGCAGAGGTTTCTTTCAAAAGTAAATTCAGCCACATTTAGACTCAAATATTCCC 5155

 51926384 TAATTTTTTAGTGTAGCTGAAGTCCTAATAATATACTTGTGTTTCTTTTAAATTAAGTCC 51926443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5156 TAATTTTTTAGTGTAGCTGAAGTCCTAATAATATACTTGTGTTTCTTTTAAATTAAGTCC 5215

 51926444 CACATGTTAACTTTACAACAGAAAGTCCATGTATCGTATTATTAGTCTAAATCTTCATTT 51926503
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5216 CACATGTTAACTTTACAGCAGAAAGTCCATGTATCGTATTATTAGTCTAAATCTTCATTT 5275

 51926504 TACTGTTTAGTTAACACAGACATTCATTTAACACACTATGTTTAATTTCCCACTCAGTTT 51926563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5276 TACTGTTTAGTTAACACAGACATTCATTTAACACACTATGTTTAATTTCCCACTCAGTTT 5335

 51926564 TGGCTTATTGTAGTCTAATAA 51926584
          |||||||||||||||||||||
     5336 TGGCTTATTGTAGTCTAATAA 5356

EXCISED REGION

 51927768 ACATATAGTAAGTTGTCCATAAGTATTTGCTGGTAGATTTATTTATTTTTTAAAAAAACA 51927827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5357 ACATATAGTAAGTTGTCCATAAGTATTTGCTGGTAGATTTATTTATTTTTTAAAAAAACA 5416

 51927828 ACTTGGAAAGTTTTCTGTGTGCTTTTATATTAGAACTTGACCTTTGAAGTACCTCCAGGA 51927887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5417 ACTTGGAAAGTTTTCTGTGTGCTTTTATATTAGAACTTGACCTTTGAAGTACCTCCAGGA 5476

 51927888 AATTTTGAAGAGTGCTGGCATATGACAATGCGTAAGTTTATATTTCATGTCCATGCATGC 51927947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5477 AATTTTGAAGAGTGCTGGCATATGACAATGCGTAAGTTTATATTTCATGTCCATGCATGC 5536

 51927948 CATTAAAATTCTAATAATGTAGTTGACAGAGCCTTTCTTGTCCCTTAAGCACTAAATTTG 51928007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5537 CATTAAAATTCTAATAATGTAGTTGACAGAGCCTTTCTTGTCCCTTAAGCACTAAATTTG 5596

 51928008 TGGCTTGCTCTAGATTGTCCCACCTGGCACAAGCGAGGTGAAATTTCAGGTCTAGCCAAC 51928067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     5597 TGGCTTGCTCTAGATTGTCCCACCTGGCACAAGCTAGGTGAAATTTCAGGTCTAGCCAAC 5656

 51928068 TTTTTTCTTTTTTTTTTTTTAACAAGTATTAAAAACATTTTCATATATATTCCCTGTATT 51928127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5657 TTTTTTCTTTTTTTTTTTTTAACAAGTATTAAAAACATTTTCATATATATTCCCTGTATT 5716

 51928128 ATTTCACCTATTTTTGTGTGTGTGTTTCTATCACACTGCCACATCAAAAACCTCTTCTTG 51928187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5717 ATTTCACCTATTTTTGTGTGTGTGTTTCTATCACACTGCCACATCAAAAACCTCTTCTTG 5776

 51928188 AACGACTATAGTATAGTGGTTAATAGTTCAGTGTCTAGATCAAGACCACCTATGGACGTA 51928247
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5777 AACGACTATAGTATAGTGATTAATAGTTCAGTGTCTAGATCAAGACCACCTATGGACGTA 5836

 51928248 TCTTGGCTCTGATTTTACCAGCCGTACAATCCTGGAGAATCTGTTCAAGAGAAATGTGCC 51928307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5837 TCTTGGCTCTGATTTTACCAGCCGTACAATCCTGGAGAATCTGTTCAAGAGAAATGTGCC 5896

 51928308 TCAATTACGTATCTCTAAAGTAGTTGTAGCTATAGAACCTGTTCCATAGATGTGGATCAG 51928367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5897 TCAATTACGTATCTCTAAAGTAGTTGTAGCTATAGAACCTGTTCCATAGATGTGGATCAG 5956

 51928368 AACACTGCATGACATTTAGAAAATGTTTAATAAATGATGTTGCTGTACTTGTTGCTGTTA 51928427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5957 AACACTGCATGACATTTAGAAAATGTTTAATAAATGATGTTGCTGTACTTGTTGCTGTTA 6016

 51928428 TTGTTGCTCTGTCATGTTAGGAGAACTCTCATTTACCCTAGTGTTCTCTCAAAGTGAAAT 51928487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6017 TTGTTGCTCTGTCATGTTAGGAGAACTCTCATTTACCCTAGTGTTCTCTCAAAGTGAAAT 6076

 51928488 ACAGATCATTACCTCTTGAAATCATGTCCAAGTAACTTCAGAATTATTTAGAAATCATTT 51928547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6077 ACAGATCATTACCTCTTGAAATCATGTCCAAGTAACTTCAGAATTATTTAGAAATCATTT 6136

 51928548 ATCTAAATCAGAGTATTTCTTGATATAATTTAAAGTTGATTGTATTTGAAAGTACATATG 51928607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6137 ATCTAAATCAGAGTATTTCTTGATATAATTTAAAGTTGATTGTATTTGAAAGTACATATG 6196

 51928608 TCAATCTAGTATGAGATAATCTCAAGGAAATAAAAATGTATAGGTCTAATTTACATTTTT 51928667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6197 TCAATCTAGTATGAGATAATCTCAAGGAAATAAAAATGTATAGGTCTAATTTACATTTTT 6256

 51928668 ATATGGAAGGAGATAATTACTTTCTATCACAAATGATGAAGGCTGACGTTTGTTTCTTTT 51928727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6257 ATATGGAAGGAGATAATTACTTTCTATCACAAATGATGAAGGCTGACGTTTGTTTCTTTT 6316

 51928728 TTACTTTTAATTTTCACTTATATTTTGTTTATTATCAATATTTGCTTTTTAAAAGGTGGG 51928787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6317 TTACTTTTAATTTTCACTTATATTTTGTTTATTATCAATATTTGCTTTTTAAAAGGTGGG 6376

 51928788 AAGAAATCAACCAATCAAACATTAAAAAGCAATATGGAGGAGGGTGATATAATGCCCACT 51928847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6377 AAGAAATCAACCAATCAAACATTAAAAAGCAATATGGAGGAGGGTGATATAATGCCCACT 6436

 51928848 TATATTTCTCTTATAATTTTAAATATTTTCATAATTAACAGAATAATTAGCACTGGTAAT 51928907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6437 TATATTTCTCTTATAATTTTAAATATTTTCATAATTAACAGAATAATTAGCACTGGTAAT 6496

 51928908 ATTAAAATACCATCAAAAGAATCTAAATGTATGTGCTTTCTGTTGCAGCCTTGTTAGATG 51928967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6497 ATTAAAATACCATCAAAAGAATCTAAATGTATGTGCTTTCTGTTGCAGCCTTGTTAGATG 6556

 51928968 TTTCAGTGGATTCAAAGTGTTGTTATAAGAAAACGTGATTTATCAAGACTTTCATGTGTA 51929027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6557 TTTCAGTGGATTCAAAGTGTTGTTATAAGAAAACGTGATTTATCAAGACTTTCATGTGTA 6616

 51929028 AAATAAAAGGCATTTTCAATGACTACTTGGCCAGGCTTTCAGATTCCAATGCCAAGATGT 51929087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6617 AAATAAAAGGCATTTTCAATGACTACTTGGCCAGGCTTTCAGATTCCAATGCCAAGATGT 6676

 51929088 TGTATTTTGATATTGCAGTTTTCTAACAACAACAAAGTTGAGTGGACTTCTGGAACTAAA 51929147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6677 TGTATTTTGATATTGCAGTTTTCTAACAACAACAAAGTTGAGTGGACTTCTGGAACTAAA 6736

 51929148 ACTTAAATATTCAGAACTAATTATCACCACTCTATTTCTTACAGAGCATTTAAGGAACAC 51929207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6737 ACTTAAATATTCAGAACTAATTATCACCACTCTATTTCTTACAGAGCATTTAAGGAACAC 6796

 51929208 ATATATGCATATATCCTTGCACTTTGTGCTACAGGTTGTGAGCCAGGGTTACTTCCTTCT 51929267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6797 ATATATGCATATATCCTTGCACTTTGTGCTACAGGTTGTGAGCCAGGGTTACTTCCTTCT 6856

 51929268 GACCATGTGGGTTCATAATGAAGACCCAACCTTAAGGTACCCAGGGCTTAGAAATCAAAT 51929327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6857 GACCATGTGGGTTCATAATGAAGACCCAACCTTAAGGTACCCAGGGCTTAGAAATCAAAT 6916

 51929328 TTGTCCTTAGGACACTTTGGAAATCTATCTTGTAGTACAGGTGACCCAGCAGCAATCAAT 51929387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6917 TTGTCCTTAGGACACTTTGGAAATCTATCTTGTAGTACAGGTGACCCAGCAGCAATCAAT 6976

 51929388 CTTTCTGCCATCCCTAGTTTTAGTTCAGGACCCAGAAAAGTTGTAACTTGTTTCCTTTCC 51929447
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6977 CTTTCTGCCATCCCTAGTTTTACTTCAGGACCCAGAAAAGTTGTAACTTGTTTCCTTTCC 7036

 51929448 TGTGATCAAGCCTTTGTTTTCTCTTTTTTTCTCCACTTTTTGTAGCTTTTTAATTTGTTT 51929507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7037 TGTGATCAAGCCTTTGTTTTCTCTTTTTTTCTCCACTTTTTGTAGCTTTTTAATTTGTTT 7096

 51929508 CTCTGTTGATTACTAGCCCAATGCCTGAGCATCTTCGTCTTAAGACAAAGCCTCTGTGTT 51929567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7097 CTCTGTTGATTACTAGCCCAATGCCTGAGCATCTTCGTCTTAAGACAAAGCCTCTGTGTT 7156

 51929568 TCTTCAGCTCCTGAAA 51929583
          ||||||||||||||||
     7157 TCTTCAGCTCCTGAAA 7172

Alignment time is 5.45181 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51916584,51937767] =>     21184 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [       1,    2742] =>      2742 nucs 'mol-32-310c-024170_2742'

Score:        2653
Aligned:      2741        nucs
Identic:      2733 (100%) nucs =>        26 (100%)      2707 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51927669,51927694] EXCISED REGION [51927696,51930409]
 second seq =>  [       1,      26] EXCISED REGION [      28,    2742]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [51927695,51927695]
 second seq =>         1 nucs [27,27]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [407,407]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [51927694,51927694] to [51927696,51927696]
 second seq =>         1 nucs [26,26] to [28,28]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 51927669 TTTCCATGTCATAGTTTCACTTATTT 51927694
          ||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTCCATGTCATAGTTTCACTTATTT 26

EXCISED REGION

 51927696 TCAACATACTATGTATCCATGAATGTCCTGAAGGGAAAAAAAAATCTCATATATACCTAA 51927755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       28 TCAACATACTATGTATCCATGAATGTCCTGAAGGGAAAAAAAAATCTCATATATACCTAA 87

 51927756 CTGATGTGCTTGACATATAGTAAGTTGTCCATAAGTATTTGCTGGTAGATTTATTTATTT 51927815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       88 CTGATGTGCTTGACATATAGTAAGTTGTCCATAAGTATTTGCTGGTAGATTTATTTATTT 147

 51927816 TTTAAAAAAACAACTTGGAAAGTTTTCTGTGTGCTTTTATATTAGAACTTGACCTTTGAA 51927875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      148 TTTAAAAAAACAACTTGGAAAGTTTTCTGTGTGCTTTTATATTAGAACTTGACCTTTGAA 207

 51927876 GTACCTCCAGGAAATTTTGAAGAGTGCTGGCATATGACAATGCGTAAGTTTATATTTCAT 51927935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      208 GTACCTCCAGGAAATTTTGAAGAGTGCTGGCATATGACAATGCGTAAGTTTATATTTCAT 267

 51927936 GTCCATGCATGCCATTAAAATTCTAATAATGTAGTTGACAGAGCCTTTCTTGTCCCTTAA 51927995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      268 GTCCATGCATGCCATTAAAATTCTAATAATGTAGTTGACAGAGCCTTTCTTGTCCCTTAA 327

 51927996 GCACTAAATTTGTGGCTTGCTCTAGATTGTCCCACCTGGCACAAGCGAGGTGAAATTTCA 51928055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
      328 GCACTAAATTTGTGGCTTGCTCTAGATTGTCCCACCTGGCACAAGCTAGGTGAAATTTCA 387

 51928056 GGTCTAGCCAACTTTTTTC-TTTTTTTTTTTTTAACAAGTATTAAAAACATTTTCATATA 51928114
          ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      388 GGTCTAGCCAACTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTAACAAGTATTAAAAACATTTTCATATA 447

 51928115 TATTCCCTGTATTATTTCACCTATTTTTGTGTGTGTGTTTCTATCACACTGCCACATCAA 51928174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      448 TATTCCCTGTATTATTTCACCTATTTTTGTGTGTGTGTTTCTATCACACTGCCACATCAA 507

 51928175 AAACCTCTTCTTGAACGACTATAGTATAGTGGTTAATAGTTCAGTGTCTAGATCAAGACC 51928234
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
      508 AAACCTCTTCTTGAACGACTATAGTATAGTGATTAATAGTTCAGTGTCTAGATCAAGACC 567

 51928235 ACCTATGGACGTATCTTGGCTCTGATTTTACCAGCCGTACAATCCTGGAGAATCTGTTCA 51928294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      568 ACCTATGGACGTATCTTGGCTCTGATTTTACCAGCCGTACAATCCTGGAGAATCTGTTCA 627

 51928295 AGAGAAATGTGCCTCAATTACGTATCTCTAAAGTAGTTGTAGCTATAGAACCTGTTCCAT 51928354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      628 AGAGAAATGTGCCTCAATTACGTATCTCTAAAGTAGTTGTAGCTATAGAACCTGTTCCAT 687

 51928355 AGATGTGGATCAGAACACTGCATGACATTTAGAAAATGTTTAATAAATGATGTTGCTGTA 51928414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      688 AGATGTGGATCAGAACACTGCATGACATTTAGAAAATGTTTAATAAATGATGTTGCTGTA 747

 51928415 CTTGTTGCTGTTATTGTTGCTCTGTCATGTTAGGAGAACTCTCATTTACCCTAGTGTTCT 51928474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      748 CTTGTTGCTGTTATTGTTGCTCTGTCATGTTAGGAGAACTCTCATTTACCCTAGTGTTCT 807

 51928475 CTCAAAGTGAAATACAGATCATTACCTCTTGAAATCATGTCCAAGTAACTTCAGAATTAT 51928534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      808 CTCAAAGTGAAATACAGATCATTACCTCTTGAAATCATGTCCAAGTAACTTCAGAATTAT 867

 51928535 TTAGAAATCATTTATCTAAATCAGAGTATTTCTTGATATAATTTAAAGTTGATTGTATTT 51928594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      868 TTAGAAATCATTTATCTAAATCAGAGTATTTCTTGATATAATTTAAAGTTGATTGTATTT 927

 51928595 GAAAGTACATATGTCAATCTAGTATGAGATAATCTCAAGGAAATAAAAATGTATAGGTCT 51928654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      928 GAAAGTACATATGTCAATCTAGTATGAGATAATCTCAAGGAAATAAAAATGTATAGGTCT 987

 51928655 AATTTACATTTTTATATGGAAGGAGATAATTACTTTCTATCACAAATGATGAAGGCTGAC 51928714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      988 AATTTACATTTTTATATGGAAGGAGATAATTACTTTCTATCACAAATGATGAAGGCTGAC 1047

 51928715 GTTTGTTTCTTTTTTACTTTTAATTTTCACTTATATTTTGTTTATTATCAATATTTGCTT 51928774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1048 GTTTGTTTCTTTTTTACTTTTAATTTTCACTTATATTTTGTTTATTATCAATATTTGCTT 1107

 51928775 TTTAAAAGGTGGGAAGAAATCAACCAATCAAACATTAAAAAGCAATATGGAGGAGGGTGA 51928834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1108 TTTAAAAGGTGGGAAGAAATCAACCAATCAAACATTAAAAAGCAATATGGAGGAGGGTGA 1167

 51928835 TATAATGCCCACTTATATTTCTCTTATAATTTTAAATATTTTCATAATTAACAGAATAAT 51928894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1168 TATAATGCCCACTTATATTTCTCTTATAATTTTAAATATTTTCATAATTAACAGAATAAT 1227

 51928895 TAGCACTGGTAATATTAAAATACCATCAAAAGAATCTAAATGTATGTGCTTTCTGTTGCA 51928954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1228 TAGCACTGGTAATATTAAAATACCATCAAAAGAATCTAAATGTATGTGCTTTCTGTTGCA 1287

 51928955 GCCTTGTTAGATGTTTCAGTGGATTCAAAGTGTTGTTATAAGAAAACGTGATTTATCAAG 51929014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1288 GCCTTGTTAGATGTTTCAGTGGATTCAAAGTGTTGTTATAAGAAAACGTGATTTATCAAG 1347

 51929015 ACTTTCATGTGTAAAATAAAAGGCATTTTCAATGACTACTTGGCCAGGCTTTCAGATTCC 51929074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1348 ACTTTCATGTGTAAAATAAAAGGCATTTTCAATGACTACTTGGCCAGGCTTTCAGATTCC 1407

 51929075 AATGCCAAGATGTTGTATTTTGATATTGCAGTTTTCTAACAACAACAAAGTTGAGTGGAC 51929134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1408 AATGCCAAGATGTTGTATTTTGATATTGCAGTTTTCTAACAACAACAAAGTTGAGTGGAC 1467

 51929135 TTCTGGAACTAAAACTTAAATATTCAGAACTAATTATCACCACTCTATTTCTTACAGAGC 51929194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1468 TTCTGGAACTAAAACTTAAATATTCAGAACTAATTATCACCACTCTATTTCTTACAGAGC 1527

 51929195 ATTTAAGGAACACATATATGCATATATCCTTGCACTTTGTGCTACAGGTTGTGAGCCAGG 51929254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1528 ATTTAAGGAACACATATATGCATATATCCTTGCACTTTGTGCTACAGGTTGTGAGCCAGG 1587

 51929255 GTTACTTCCTTCTGACCATGTGGGTTCATAATGAAGACCCAACCTTAAGGTACCCAGGGC 51929314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1588 GTTACTTCCTTCTGACCATGTGGGTTCATAATGAAGACCCAACCTTAAGGTACCCAGGGC 1647

 51929315 TTAGAAATCAAATTTGTCCTTAGGACACTTTGGAAATCTATCTTGTAGTACAGGTGACCC 51929374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1648 TTAGAAATCAAATTTGTCCTTAGGACACTTTGGAAATCTATCTTGTAGTACAGGTGACCC 1707

 51929375 AGCAGCAATCAATCTTTCTGCCATCCCTAGTTTTAGTTCAGGACCCAGAAAAGTTGTAAC 51929434
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     1708 AGCAGCAATCAATCTTTCTGCCATCCCTAGTTTTACTTCAGGACCCAGAAAAGTTGTAAC 1767

 51929435 TTGTTTCCTTTCCTGTGATCAAGCCTTTGTTTTCTCTTTTTTTCTCCACTTTTTGTAGCT 51929494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1768 TTGTTTCCTTTCCTGTGATCAAGCCTTTGTTTTCTCTTTTTTTCTCCACTTTTTGTAGCT 1827

 51929495 TTTTAATTTGTTTCTCTGTTGATTACTAGCCCAATGCCTGAGCATCTTCGTCTTAAGACA 51929554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1828 TTTTAATTTGTTTCTCTGTTGATTACTAGCCCAATGCCTGAGCATCTTCGTCTTAAGACA 1887

 51929555 AAGCCTCTGTGTTTCTTCAGCTCCTGAAATGACTGGCATGCTGAAAATGAGCTCAGGGCA 51929614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1888 AAGCCTCTGTGTTTCTTCAGCTCCTGAAATGACTGGCATGCTGAAAATGAGCTCAGGGCA 1947

 51929615 TTAGTCTTTGCTACTAAGCCACTACAGATTCCATTCCCTTTCTTCTTGAGTATGCACACA 51929674
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     1948 TTAGTCTTTGCTACTAAGCCACTACAGATTCCATTCCCTTTCTTCCTGAGTATGCACACA 2007

 51929675 CCGCTTGTTCACAGACTCCAGATTAGTTATTAAGCTACATCTGTATGCAGTTTGCACTCT 51929734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2008 CCGCTTGTTCACAGACTCCAGATTAGTTATTAAGCTACATCTGTATGCAGTTTGCACTCT 2067

 51929735 CCTGCCTTCGACCTGCTTGTCCCAGAAGTTATTCACCATATTCTACCTTGATCATATTTT 51929794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2068 CCTGCCTTCGACCTGCTTGTCCCAGAAGTTATTCACCATATTCTACCTTGATCATATTTT 2127

 51929795 CTACTTGTCAATGCGCATGTCAATTAAGAACTTTTAACATTTATTGACCATTTATTATAT 51929854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2128 CTACTTGTCAATGCGCATGTCAATTAAGAACTTTTAACATTTATTGACCATTTATTATAT 2187

 51929855 ACTAGCCAGTCTTTTAATTGATTTATGAACAATTAACTTAATCATCATATAAGCATAGTA 51929914
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2188 ACTAGCCAGTCTTTTAATTGCTTTATGAACAATTAACTTAATCATCATATAAGCATAGTA 2247

 51929915 GGGTACAATTAGTTCCCCAACTTTATATATGAACAAATGGACTTTCAGAAAGGTAAGGTA 51929974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2248 GGGTACAATTAGTTCCCCAACTTTATATATGAACAAATGGACTTTCAGAAAGGTAAGGTA 2307

 51929975 AAATATCCACGGTAAGAAAGCCTGCATATGTGGAACTGGGAATTGAACCCCTATGTCTGA 51930034
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     2308 AAATATCCACGGTAAGAAAGCCTGCATATGTGGAACTGGGAATTGAACCCCTATGGCTGA 2367

 51930035 CCCGAGGGTCCATACACTTAAGCATTATGCTATCAAGTTTTCCACAGCCTGCTTTTCGGC 51930094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2368 CCCGAGGGTCCATACACTTAAGCATTATGCTATCAAGTTTTCCACAGCCTGCTTTTCGGC 2427

 51930095 TTCTCTCTCTTTCTTTCTTTCCTGATCTCTGTTGCAATTCCTACCTTTCAACTCCCTTCT 51930154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2428 TTCTCTCTCTTTCTTTCTTTCCTGATCTCTGTTGCAATTCCTACCTTTCAACTCCCTTCT 2487

 51930155 GACCATGGATAGTTTGCAAAATGCCAGAGGTACGTCTCAAAGAAGCTTCAAATAGGAGCG 51930214
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2488 GACCATGGACAGTTTGCAAAATGCCAGAGGTACGTCTCAAAGAAGCTTCAAATAGGAGCG 2547

 51930215 TGTACTACCATTAAGTCAGCTCCTCAGTTGTCTTCTTTGGATTGAGAAGCACTTCATCAC 51930274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2548 TGTACTACCATTAAGTCAGCTCCTCAGTTGTCTTCTTTGGATTGAGAAGCACTTCATCAC 2607

 51930275 TTTTTACACAGGTTTAATTATCAAATATGACTTTTCTAGTACTACAGCTAATATATGTCA 51930334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2608 TTTTTACACAGGTTTAATTATCAAATATGACTTTTCTAGTACTACAGCTAATATATGTCA 2667

 51930335 ATGTCAAAGGGTTAACAGAATACTAGGCCTATATTAAATTATACATATGAGCTTTCTCTT 51930394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2668 ATGTCAAAGGGTTAACAGAATACTAGGCCTATATTAAATTATACATATGAGCTTTCTCTT 2727

 51930395 TACTCCTTTTTATGT 51930409
          |||||||||||||||
     2728 TACTCCTTTTTATGT 2742

Alignment time is 2.08347 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51916584,51937767] =>     21184 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [       1,    2756] =>      2756 nucs 'mol-32-310c-041158_2756'

Score:        2722
Aligned:      2755        nucs
Identic:      2752 (100%) nucs =>       745 (100%)      2007 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51925716,51926460] EXCISED REGION [51926462,51928471]
 second seq =>  [       1,     745] EXCISED REGION [     747,    2756]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [51926461,51926461]
 second seq =>         1 nucs [746,746]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [51926460,51926460] to [51926461,51926461]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [51926459,51926460] to [51926462,51926463]
 second seq =>         2 nucs [744,745] to [747,748]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 51925716 AACTCTAAGTCACAGACTTATAAGTACTGAAAAAGTAGTCAGTAAAGAAAACATACAGTA 51925775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AACTCTAAGTCACAGACTTATAAGTACTGAAAAAGTAGTCAGTAAAGAAAACATACAGTA 60

 51925776 AGAGACTAGGTTAATTTTCCTATAGTTCATTGATGTTTCCACTATTACTGCCCCTGATTT 51925835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGAGACTAGGTTAATTTTCCTATAGTTCATTGATGTTTCCACTATTACTGCCCCTGATTT 120

 51925836 TTAACTTTAGTTTTCCTTAGATTGTTGGAGTAATATATGTACCTTAAAAATTAACTGTGG 51925895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTAACTTTAGTTTTCCTTAGATTGTTGGAGTAATATATGTACCTTAAAAATTAACTGTGG 180

 51925896 AACAAGTAGATGAACTTTTTACACAATTTCCTGCTTTTATAAAGTTCCTACTAGCTATAT 51925955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AACAAGTAGATGAACTTTTTACACAATTTCCTGCTTTTATAAAGTTCCTACTAGCTATAT 240

 51925956 TTTCCCAAAAGTGCTCAACAATAGAGTCTGGTGCTAAAAAGCAGAGTAGGCTAAATTTAG 51926015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTTCCCAAAAGTGCTCAACAATAGAGTCTGGTGCTAAAAAGCAGAGTAGGCTAAATTTAG 300

 51926016 ATCAATGTGAAATGCCCTACTTATTTCCTATGAACTTAATTGATTGAGCTCATTTTGGGG 51926075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATCAATGTGAAATGCCCTACTTATTTCCTATGAACTTAATTGATTGAGCTCATTTTGGGG 360

 51926076 GTGTCTTTCTGATCGACCAGAAACTTGGCTCATTAGAGCAACTCACAAAGTGACCTTTTA 51926135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTGTCTTTCTGATCGACCAGAAACTTGGCTCATTAGAGCAACTCACAAAGTGACCTTTTA 420

 51926136 AAAGAAAGAGTTTTCAATATATTTGTTCATGTTCCATTCCACTGAGAATGGTGCTATTTA 51926195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAAGAAAGAGTTTTCAATATATTTGTTCATGTTCCATTCCACTGAGAATGGTGCTATTTA 480

 51926196 AAACTAAATACAATAATTTTAGATATTGTACAGCAGATATAATTTTAAACATAATACATG 51926255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAACTAAATACAATAATTTTAGATATTGTACAGCAGATATAATTTTAAACATAATACATG 540

 51926256 GGATTTCGATTTTAGGTACTGTTTATAAGGCATTTCTCCTTATATTATTCTAGACTTAAA 51926315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGATTTCGATTTTAGGTACTGTTTATAAGGCATTTCTCCTTATATTATTCTAGACTTAAA 600

 51926316 TATAACAAATTTCATGCAGAGGTTTCTTTCAAAAGTAAATTCAGCCACATTTAGACTCAA 51926375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TATAACAAATTTCATGCAGAGGTTTCTTTCAAAAGTAAATTCAGCCACATTTAGACTCAA 660

 51926376 ATATTCCCTAATTTTTTAGTGTAGCTGAAGTCCTAATAATATACTTGTGTTTCTTTTAAA 51926435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATATTCCCTAATTTTTTAGTGTAGCTGAAGTCCTAATAATATACTTGTGTTTCTTTTAAA 720

 51926436 TTAAGTCCCACATGTTAACTTTACA 51926460
          |||||||||||||||||||||||||
      721 TTAAGTCCCACATGTTAACTTTACA 745

EXCISED REGION

 51926462 CAGAAAGTCCATGTATCGTATTATTAGTCTAAATCTTCATTTTACTGTTTAGTTAACACA 51926521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      747 CAGAAAGTCCATGTATCGTATTATTAGTCTAAATCTTCATTTTACTGTTTAGTTAACACA 806

 51926522 GACATTCATTTAACACACTATGTTTAATTTCCCACTCAGTTTTGGCTTATTGTAGTCTAA 51926581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      807 GACATTCATTTAACACACTATGTTTAATTTCCCACTCAGTTTTGGCTTATTGTAGTCTAA 866

 51926582 TAAACAATGATTAAACAATGCCCCACTTAATGCAGGTTGAGAAATAAGTGAAACTATGAC 51926641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      867 TAAACAATGATTAAACAATGCCCCACTTAATGCAGGTTGAGAAATAAGTGAAACTATGAC 926

 51926642 ATGGAAAAATATTACAATAAGCGAAAAATATTACAATAAAGGAAAAAATAATGGAAGAAT 51926701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      927 ATGGAAAAATATTACAATAAGCGAAAAATATTACAATAAAGGAAAAAATAATGGAAGAAT 986

 51926702 ATCAGTATTTGATGCTATTATACGTGACCATATTGTTTAGCAAACTACTTCAAAAATGAA 51926761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      987 ATCAGTATTTGATGCTATTATACGTGACCATATTGTTTAGCAAACTACTTCAAAAATGAA 1046

 51926762 ATTAGGAATTTCAGAGAATCATTTTATTCTCATATCAGAATGCTTGGAAAAGTGAGGGCT 51926821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1047 ATTAGGAATTTCAGAGAATCATTTTATTCTCATATCAGAATGCTTGGAAAAGTGAGGGCT 1106

 51926822 AAATGTATTTGTTATTTGACTGTGTACATTATGCCCATGGAATAGCATTTTGGAAGACCC 51926881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1107 AAATGTATTTGTTATTTGACTGTGTACATTATGCCCATGGAATAGCATTTTGGAAGACCC 1166

 51926882 AACATTAAGCTAGCTTTACATAACAATGAGTATGTCATGTTAACTTATGATACACTTTAA 51926941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1167 AACATTAAGCTAGCTTTACATAACAATGAGTATGTCATGTTAACTTATGATACACTTTAA 1226

 51926942 TCCTGGCTTGACTCTGGTAGCTGTGTGACTATAATCTTTCAGGCCTCCATTTACTTATCC 51927001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1227 TCCTGGCTTGACTCTGGTAGCTGTGTGACTATAATCTTTCAGGCCTCCATTTACTTATCC 1286

 51927002 AGAAAGTGGAAATAATAATATGTAATTAATAGATGCCTGGTGAATATTAAATTCATTAAT 51927061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1287 AGAAAGTGGAAATAATAATATGTAATTAATAGATGCCTGGTGAATATTAAATTCATTAAT 1346

 51927062 ATTTGTCAACTATTTTTCACAGACTTTTCATTTAGTTAAGTACACAATAATAAGTAAGCA 51927121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1347 ATTTGTCAACTATTTTTCACAGACTTTTCATTTAGTTAAGTACACAATAATAAGTAAGCA 1406

 51927122 CTCATATATGAATGTGTGTACATATTTATCGTAAACAGATCCTCAGTAATTAGTGTAGAA 51927181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1407 CTCATATATGAATGTGTGTACATATTTATCGTAAACAGATCCTCAGTAATTAGTGTAGAA 1466

 51927182 ATAAATGTTCTAGACAATCCAAAGTTATTTAAAGTTTTTCAGAAAGCTACCCTTCTATCA 51927241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1467 ATAAATGTTCTAGACAATCCAAAGTTATTTAAAGTTTTTCAGAAAGCTACCCTTCTATCA 1526

 51927242 TCTGGGGTAATTTTTTTTGTCATTTTGGCAAATATGTAGAGAATATATGTGAGTCTTCCT 51927301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1527 TCTGGGGTAATTTTTTTTGTCATTTTGGCAAATATGTAGAGAATATATGTGAGTCTTCCT 1586

 51927302 ATTAGTCTGAAGTAAGCAAAACTATAAAGGCACATTTATCGAGGTGGAATGTGAAAAACA 51927361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1587 ATTAGTCTGAAGTAAGCAAAACTATAAAGGCACATTTATCGAGGTGGAATGTGAAAAACA 1646

 51927362 ACAATCATTTTAACGTAAATCTATGATACTTTGGTCTCTTCCAGTGTCCAGGTAACTTAT 51927421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1647 ACAATCATTTTAACGTAAATCTATGATACTTTGGTCTCTTCCAGTGTCCAGGTAACTTAT 1706

 51927422 GCCACAACTTTCTTCTATCTTTGTTAATAATACAGTGTGTTTTATACCTGTGGGCACTAA 51927481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1707 GCCACAACTTTCTTCTATCTTTGTTAATAATACAGTGTGTTTTATACCTGTGGGCACTAA 1766

 51927482 CATTTTGTTACTATTTGTAGTAATGCTACTGCATTACTGATATGAGAATAAAATGATTCT 51927541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1767 CATTTTGTTACTATTTGTAGTAATGCTACTGCATTACTGATATGAGAATAAAATGATTCT 1826

 51927542 CTGAAATTCCTAATTTCATTTTTGAAGTAATTTGCTAAACAATATGGTCACGTATAATAG 51927601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1827 CTGAAATTCCTAATTTCATTTTTGAAGTAATTTGCTAAACAATATGGTCACGTATAATAG 1886

 51927602 CATCAAATATTGATATTCTTCCATTATTTTTTCCTTTATTGTAATATTTTTCACTTATTG 51927661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1887 CATCAAATATTGATATTCTTCCATTATTTTTTCCTTTATTGTAATATTTTTCACTTATTG 1946

 51927662 TAATATTTTTCCATGTCATAGTTTCACTTATTTCTCAACATACTATGTATCCATGAATGT 51927721
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     1947 TAATATTTTTCCATGTCATAGTTTCACTTATTTGTCAACATACTATGTATCCATGAATGT 2006

 51927722 CCTGAAGGGAAAAAAAAATCTCATATATACCTAACTGATGTGCTTGACATATAGTAAGTT 51927781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2007 CCTGAAGGGAAAAAAAAATCTCATATATACCTAACTGATGTGCTTGACATATAGTAAGTT 2066

 51927782 GTCCATAAGTATTTGCTGGTAGATTTATTTATTTTTTAAAAAAACAACTTGGAAAGTTTT 51927841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2067 GTCCATAAGTATTTGCTGGTAGATTTATTTATTTTTTAAAAAAACAACTTGGAAAGTTTT 2126

 51927842 CTGTGTGCTTTTATATTAGAACTTGACCTTTGAAGTACCTCCAGGAAATTTTGAAGAGTG 51927901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2127 CTGTGTGCTTTTATATTAGAACTTGACCTTTGAAGTACCTCCAGGAAATTTTGAAGAGTG 2186

 51927902 CTGGCATATGACAATGCGTAAGTTTATATTTCATGTCCATGCATGCCATTAAAATTCTAA 51927961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2187 CTGGCATATGACAATGCGTAAGTTTATATTTCATGTCCATGCATGCCATTAAAATTCTAA 2246

 51927962 TAATGTAGTTGACAGAGCCTTTCTTGTCCCTTAAGCACTAAATTTGTGGCTTGCTCTAGA 51928021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2247 TAATGTAGTTGACAGAGCCTTTCTTGTCCCTTAAGCACTAAATTTGTGGCTTGCTCTAGA 2306

 51928022 TTGTCCCACCTGGCACAAGCGAGGTGAAATTTCAGGTCTAGCCAACTTTTTTCTTTTTTT 51928081
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2307 TTGTCCCACCTGGCACAAGCTAGGTGAAATTTCAGGTCTAGCCAACTTTTTTCTTTTTTT 2366

 51928082 TTTTTTAACAAGTATTAAAAACATTTTCATATATATTCCCTGTATTATTTCACCTATTTT 51928141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2367 TTTTTTAACAAGTATTAAAAACATTTTCATATATATTCCCTGTATTATTTCACCTATTTT 2426

 51928142 TGTGTGTGTGTTTCTATCACACTGCCACATCAAAAACCTCTTCTTGAACGACTATAGTAT 51928201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2427 TGTGTGTGTGTTTCTATCACACTGCCACATCAAAAACCTCTTCTTGAACGACTATAGTAT 2486

 51928202 AGTGGTTAATAGTTCAGTGTCTAGATCAAGACCACCTATGGACGTATCTTGGCTCTGATT 51928261
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2487 AGTGATTAATAGTTCAGTGTCTAGATCAAGACCACCTATGGACGTATCTTGGCTCTGATT 2546

 51928262 TTACCAGCCGTACAATCCTGGAGAATCTGTTCAAGAGAAATGTGCCTCAATTACGTATCT 51928321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2547 TTACCAGCCGTACAATCCTGGAGAATCTGTTCAAGAGAAATGTGCCTCAATTACGTATCT 2606

 51928322 CTAAAGTAGTTGTAGCTATAGAACCTGTTCCATAGATGTGGATCAGAACACTGCATGACA 51928381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2607 CTAAAGTAGTTGTAGCTATAGAACCTGTTCCATAGATGTGGATCAGAACACTGCATGACA 2666

 51928382 TTTAGAAAATGTTTAATAAATGATGTTGCTGTACTTGTTGCTGTTATTGTTGCTCTGTCA 51928441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2667 TTTAGAAAATGTTTAATAAATGATGTTGCTGTACTTGTTGCTGTTATTGTTGCTCTGTCA 2726

 51928442 TGTTAGGAGAACTCTCATTTACCCTAGTGT 51928471
          ||||||||||||||||||||||||||||||
     2727 TGTTAGGAGAACTCTCATTTACCCTAGTGT 2756

Alignment time is 2.08481 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51916584,51937767] =>     21184 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [       1,    3858] =>      3858 nucs 'mol-32-316f-047468_3858'

Score:        3742
Aligned:      3858        nucs
Identic:      3845 (100%) nucs =>       699 (100%)      3146 (100%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51925885,51926584] EXCISED REGION [51927768,51930920]
 second seq =>  [       1,     700] EXCISED REGION [     701,    3858]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1183 nucs [51926585,51927767]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [51926585,51926587] to [51927768,51927770]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [51926584,51926584] to [51927768,51927768]
 second seq =>         1 nucs [700,700] to [701,701]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 51925885 ATTAACTGTGGAACAAGTAGATGAACTTTTTACACAATTTCCTGCTTTTATAAAGTTCCT 51925944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATTAACTGTGGAACAAGTAGATGAACTTTTTACACAATTTCCTGCTTTTATAAAGTTCCT 60

 51925945 ACTAGCTATATTTTCCCAAAAGTGCTCAACAATAGAGTCTGGTGCTAAAAAGCAGAGTAG 51926004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACTAGCTATATTTTCCCAAAAGTGCTCAACAATAGAGTCTGGTGCTAAAAAGCAGAGTAG 120

 51926005 GCTAAATTTAGATCAATGTGAAATGCCCTACTTATTTCCTATGAACTTAATTGATTGAGC 51926064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GCTAAATTTAGATCAATGTGAAATGCCCTACTTATTTCCTATGAACTTAATTGATTGAGC 180

 51926065 TCATTTTGGGGGTGTCTTTCTGATCGACCAGAAACTTGGCTCATTAGAGCAACTCACAAA 51926124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCATTTTGGGGGTGTCTTTCTGATCGACCAGAAACTTGGCTCATTAGAGCAACTCACAAA 240

 51926125 GTGACCTTTTAAAAGAAAGAGTTTTCAATATATTTGTTCATGTTCCATTCCACTGAGAAT 51926184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTGACCTTTTAAAAGAAAGAGTTTTCAATATATTTGTTCATGTTCCATTCCACTGAGAAT 300

 51926185 GGTGCTATTTAAAACTAAATACAATAATTTTAGATATTGTACAGCAGATATAATTTTAAA 51926244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GGTGCTATTTAAAACTAAATACAATAATTTTAGATATTGTACAGCAGATATAATTTTAAA 360

 51926245 CATAATACATGGGATTTCGATTTTAGGTACTGTTTATAAGGCATTTCTCCTTATATTATT 51926304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CATAATACATGGGATTTCGATTTTAGGTACTGTTTATAAGGCATTTCTCCTTATATTATT 420

 51926305 CTAGACTTAAATATAACAAATTTCATGCAGAGGTTTCTTTCAAAAGTAAATTCAGCCACA 51926364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTAGACTTAAATATAACAAATTTCATGCAGAGGTTTCTTTCAAAAGTAAATTCAGCCACA 480

 51926365 TTTAGACTCAAATATTCCCTAATTTTTTAGTGTAGCTGAAGTCCTAATAATATACTTGTG 51926424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTAGACTCAAATATTCCCTAATTTTTTAGTGTAGCTGAAGTCCTAATAATATACTTGTG 540

 51926425 TTTCTTTTAAATTAAGTCCCACATGTTAACTTTACAACAGAAAGTCCATGTATCGTATTA 51926484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
      541 TTTCTTTTAAATTAAGTCCCACATGTTAACTTTACAGCAGAAAGTCCATGTATCGTATTA 600

 51926485 TTAGTCTAAATCTTCATTTTACTGTTTAGTTAACACAGACATTCATTTAACACACTATGT 51926544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTAGTCTAAATCTTCATTTTACTGTTTAGTTAACACAGACATTCATTTAACACACTATGT 660

 51926545 TTAATTTCCCACTCAGTTTTGGCTTATTGTAGTCTAATAA 51926584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTAATTTCCCACTCAGTTTTGGCTTATTGTAGTCTAATAA 700

EXCISED REGION

 51927768 ACATATAGTAAGTTGTCCATAAGTATTTGCTGGTAGATTTATTTATTTTTTAAAAAAACA 51927827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      701 ACATATAGTAAGTTGTCCATAAGTATTTGCTGGTAGATTTATTTATTTTTTAAAAAAACA 760

 51927828 ACTTGGAAAGTTTTCTGTGTGCTTTTATATTAGAACTTGACCTTTGAAGTACCTCCAGGA 51927887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      761 ACTTGGAAAGTTTTCTGTGTGCTTTTATATTAGAACTTGACCTTTGAAGTACCTCCAGGA 820

 51927888 AATTTTGAAGAGTGCTGGCATATGACAATGCGTAAGTTTATATTTCATGTCCATGCATGC 51927947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      821 AATTTTGAAGAGTGCTGGCATATGACAATGCGTAAGTTTATATTTCATGTCCATGCATGC 880

 51927948 CATTAAAATTCTAATAATGTAGTTGACAGAGCCTTTCTTGTCCCTTAAGCACTAAATTTG 51928007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      881 CATTAAAATTCTAATAATGTAGTTGACAGAGCCTTTCTTGTCCCTTAAGCACTAAATTTG 940

 51928008 TGGCTTGCTCTAGATTGTCCCACCTGGCACAAGCGAGGTGAAATTTCAGGTCTAGCCAAC 51928067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
      941 TGGCTTGCTCTAGATTGTCCCACCTGGCACAAGCTAGGTGAAATTTCAGGTCTAGCCAAC 1000

 51928068 TTTTTTCTTTTTTTTTTTTTAACAAGTATTAAAAACATTTTCATATATATTCCCTGTATT 51928127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1001 TTTTTTCTTTTTTTTTTTTTAACAAGTATTAAAAACATTTTCATATATATTCCCTGTATT 1060

 51928128 ATTTCACCTATTTTTGTGTGTGTGTTTCTATCACACTGCCACATCAAAAACCTCTTCTTG 51928187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1061 ATTTCACCTATTTTTGTGTGTGTGTTTCTATCACACTGCCACATCAAAAACCTCTTCTTG 1120

 51928188 AACGACTATAGTATAGTGGTTAATAGTTCAGTGTCTAGATCAAGACCACCTATGGACGTA 51928247
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1121 AACGACTATAGTATAGTGATTAATAGTTCAGTGTCTAGATCAAGACCACCTATGGACGTA 1180

 51928248 TCTTGGCTCTGATTTTACCAGCCGTACAATCCTGGAGAATCTGTTCAAGAGAAATGTGCC 51928307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1181 TCTTGGCTCTGATTTTACCAGCCGTACAATCCTGGAGAATCTGTTCAAGAGAAATGTGCC 1240

 51928308 TCAATTACGTATCTCTAAAGTAGTTGTAGCTATAGAACCTGTTCCATAGATGTGGATCAG 51928367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1241 TCAATTACGTATCTCTAAAGTAGTTGTAGCTATAGAACCTGTTCCATAGATGTGGATCAG 1300

 51928368 AACACTGCATGACATTTAGAAAATGTTTAATAAATGATGTTGCTGTACTTGTTGCTGTTA 51928427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1301 AACACTGCATGACATTTAGAAAATGTTTAATAAATGATGTTGCTGTACTTGTTGCTGTTA 1360

 51928428 TTGTTGCTCTGTCATGTTAGGAGAACTCTCATTTACCCTAGTGTTCTCTCAAAGTGAAAT 51928487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1361 TTGTTGCTCTGTCATGTTAGGAGAACTCTCATTTACCCTAGTGTTCTCTCAAAGTGAAAT 1420

 51928488 ACAGATCATTACCTCTTGAAATCATGTCCAAGTAACTTCAGAATTATTTAGAAATCATTT 51928547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1421 ACAGATCATTACCTCTTGAAATCATGTCCAAGTAACTTCAGAATTATTTAGAAATCATTT 1480

 51928548 ATCTAAATCAGAGTATTTCTTGATATAATTTAAAGTTGATTGTATTTGAAAGTACATATG 51928607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1481 ATCTAAATCAGAGTATTTCTTGATATAATTTAAAGTTGATTGTATTTGAAAGTACATATG 1540

 51928608 TCAATCTAGTATGAGATAATCTCAAGGAAATAAAAATGTATAGGTCTAATTTACATTTTT 51928667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1541 TCAATCTAGTATGAGATAATCTCAAGGAAATAAAAATGTATAGGTCTAATTTACATTTTT 1600

 51928668 ATATGGAAGGAGATAATTACTTTCTATCACAAATGATGAAGGCTGACGTTTGTTTCTTTT 51928727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1601 ATATGGAAGGAGATAATTACTTTCTATCACAAATGATGAAGGCTGACGTTTGTTTCTTTT 1660

 51928728 TTACTTTTAATTTTCACTTATATTTTGTTTATTATCAATATTTGCTTTTTAAAAGGTGGG 51928787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1661 TTACTTTTAATTTTCACTTATATTTTGTTTATTATCAATATTTGCTTTTTAAAAGGTGGG 1720

 51928788 AAGAAATCAACCAATCAAACATTAAAAAGCAATATGGAGGAGGGTGATATAATGCCCACT 51928847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1721 AAGAAATCAACCAATCAAACATTAAAAAGCAATATGGAGGAGGGTGATATAATGCCCACT 1780

 51928848 TATATTTCTCTTATAATTTTAAATATTTTCATAATTAACAGAATAATTAGCACTGGTAAT 51928907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1781 TATATTTCTCTTATAATTTTAAATATTTTCATAATTAACAGAATAATTAGCACTGGTAAT 1840

 51928908 ATTAAAATACCATCAAAAGAATCTAAATGTATGTGCTTTCTGTTGCAGCCTTGTTAGATG 51928967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1841 ATTAAAATACCATCAAAAGAATCTAAATGTATGTGCTTTCTGTTGCAGCCTTGTTAGATG 1900

 51928968 TTTCAGTGGATTCAAAGTGTTGTTATAAGAAAACGTGATTTATCAAGACTTTCATGTGTA 51929027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1901 TTTCAGTGGATTCAAAGTGTTGTTATAAGAAAACGTGATTTATCAAGACTTTCATGTGTA 1960

 51929028 AAATAAAAGGCATTTTCAATGACTACTTGGCCAGGCTTTCAGATTCCAATGCCAAGATGT 51929087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1961 AAATAAAAGGCATTTTCAATGACTACTTGGCCAGGCTTTCAGATTCCAATGCCAAGATGT 2020

 51929088 TGTATTTTGATATTGCAGTTTTCTAACAACAACAAAGTTGAGTGGACTTCTGGAACTAAA 51929147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2021 TGTATTTTGATATTGCAGTTTTCTAACAACAACAAAGTTGAGTGGACTTCTGGAACTAAA 2080

 51929148 ACTTAAATATTCAGAACTAATTATCACCACTCTATTTCTTACAGAGCATTTAAGGAACAC 51929207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2081 ACTTAAATATTCAGAACTAATTATCACCACTCTATTTCTTACAGAGCATTTAAGGAACAC 2140

 51929208 ATATATGCATATATCCTTGCACTTTGTGCTACAGGTTGTGAGCCAGGGTTACTTCCTTCT 51929267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2141 ATATATGCATATATCCTTGCACTTTGTGCTACAGGTTGTGAGCCAGGGTTACTTCCTTCT 2200

 51929268 GACCATGTGGGTTCATAATGAAGACCCAACCTTAAGGTACCCAGGGCTTAGAAATCAAAT 51929327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2201 GACCATGTGGGTTCATAATGAAGACCCAACCTTAAGGTACCCAGGGCTTAGAAATCAAAT 2260

 51929328 TTGTCCTTAGGACACTTTGGAAATCTATCTTGTAGTACAGGTGACCCAGCAGCAATCAAT 51929387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2261 TTGTCCTTAGGACACTTTGGAAATCTATCTTGTAGTACAGGTGACCCAGCAGCAATCAAT 2320

 51929388 CTTTCTGCCATCCCTAGTTTTAGTTCAGGACCCAGAAAAGTTGTAACTTGTTTCCTTTCC 51929447
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2321 CTTTCTGCCATCCCTAGTTTTACTTCAGGACCCAGAAAAGTTGTAACTTGTTTCCTTTCC 2380

 51929448 TGTGATCAAGCCTTTGTTTTCTCTTTTTTTCTCCACTTTTTGTAGCTTTTTAATTTGTTT 51929507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2381 TGTGATCAAGCCTTTGTTTTCTCTTTTTTTCTCCACTTTTTGTAGCTTTTTAATTTGTTT 2440

 51929508 CTCTGTTGATTACTAGCCCAATGCCTGAGCATCTTCGTCTTAAGACAAAGCCTCTGTGTT 51929567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2441 CTCTGTTGATTACTAGCCCAATGCCTGAGCATCTTCGTCTTAAGACAAAGCCTCTGTGTT 2500

 51929568 TCTTCAGCTCCTGAAATGACTGGCATGCTGAAAATGAGCTCAGGGCATTAGTCTTTGCTA 51929627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2501 TCTTCAGCTCCTGAAATGACTGGCATGCTGAAAATGAGCTCAGGGCATTAGTCTTTGCTA 2560

 51929628 CTAAGCCACTACAGATTCCATTCCCTTTCTTCTTGAGTATGCACACACCGCTTGTTCACA 51929687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     2561 CTAAGCCACTACAGATTCCATTCCCTTTCTTCCTGAGTATGCACACACCGCTTGTTCACA 2620

 51929688 GACTCCAGATTAGTTATTAAGCTACATCTGTATGCAGTTTGCACTCTCCTGCCTTCGACC 51929747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2621 GACTCCAGATTAGTTATTAAGCTACATCTGTATGCAGTTTGCACTCTCCTGCCTTCGACC 2680

 51929748 TGCTTGTCCCAGAAGTTATTCACCATATTCTACCTTGATCATATTTTCTACTTGTCAATG 51929807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2681 TGCTTGTCCCAGAAGTTATTCACCATATTCTACCTTGATCATATTTTCTACTTGTCAATG 2740

 51929808 CGCATGTCAATTAAGAACTTTTAACATTTATTGACCATTTATTATATACTAGCCAGTCTT 51929867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2741 CGCATGTCAATTAAGAACTTTTAACATTTATTGACCATTTATTATATACTAGCCAGTCTT 2800

 51929868 TTAATTGATTTATGAACAATTAACTTAATCATCATATAAGCATAGTAGGGTACAATTAGT 51929927
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2801 TTAATTGCTTTATGAACAATTAACTTAATCATCATATAAGCATAGTAGGGTACAATTAGT 2860

 51929928 TCCCCAACTTTATATATGAACAAATGGACTTTCAGAAAGGTAAGGTAAAATATCCACGGT 51929987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2861 TCCCCAACTTTATATATGAACAAATGGACTTTCAGAAAGGTAAGGTAAAATATCCACGGT 2920

 51929988 AAGAAAGCCTGCATATGTGGAACTGGGAATTGAACCCCTATGTCTGACCCGAGGGTCCAT 51930047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2921 AAGAAAGCCTGCATATGTGGAACTGGGAATTGAACCCCTATGTCTGACCCGAGGGTCCAT 2980

 51930048 ACACTTAAGCATTATGCTATCAAGTTTTCCACAGCCTGCTTTTCGGCTTCTCTCTCTTTC 51930107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2981 ACACTTAAGCATTATGCTATCAAGTTTTCCACAGCCTGCTTTTCGGCTTCTCTCTCTTTC 3040

 51930108 TTTCTTTCCTGATCTCTGTTGCAATTCCTACCTTTCAACTCCCTTCTGACCATGGATAGT 51930167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     3041 TTTCTTTCCTGATCTCTGTTGCAATTCCTACCTTTCAACTCCCTTCTGACCATGGACAGT 3100

 51930168 TTGCAAAATGCCAGAGGTACGTCTCAAAGAAGCTTCAAATAGGAGCGTGTACTACCATTA 51930227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3101 TTGCAAAATGCCAGAGGTACGTCTCAAAGAAGCTTCAAATAGGAGCGTGTACTACCATTA 3160

 51930228 AGTCAGCTCCTCAGTTGTCTTCTTTGGATTGAGAAGCACTTCATCACTTTTTACACAGGT 51930287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3161 AGTCAGCTCCTCAGTTGTCTTCTTTGGATTGAGAAGCACTTCATCACTTTTTACACAGGT 3220

 51930288 TTAATTATCAAATATGACTTTTCTAGTACTACAGCTAATATATGTCAATGTCAAAGGGTT 51930347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3221 TTAATTATCAAATATGACTTTTCTAGTACTACAGCTAATATATGTCAATGTCAAAGGGTT 3280

 51930348 AACAGAATACTAGGCCTATATTAAATTATACATATGAGCTTTCTCTTTACTCCTTTTTAT 51930407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3281 AACAGAATACTAGGCCTATATTAAATTATACATATGAGCTTTCTCTTTACTCCTTTTTAT 3340

 51930408 GTTCATTAGCAAACAGATAAAGCCATAATAGATTTTTTAAGGAATATTTTGTTTTGTTTT 51930467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3341 GTTCATTAGCAAACAGATAAAGCCATAATAGATTTTTTAAGGAATATTTTGTTTTGTTTT 3400

 51930468 GTTTTGGACTTATACATCTATTAACAATAAACCAAACATTGCAGATTAAAGCAAATCTGC 51930527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3401 GTTTTGGACTTATACATCTATTAACAATAAACCAAACATTGCAGATTAAAGCAAATCTGC 3460

 51930528 CAATCTGTTTTACAAACACTATCTTCTGAAGGGTTCCTGGGCACAAGATACTGTTCTAGT 51930587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3461 CAATCTGTTTTACAAACACTATCTTCTGAAGGGTTCCTGGGCACAAGATACTGTTCTAGT 3520

 51930588 AATATTTCACAGC-TTTTTTTTTTTTTTCATTTTAGAGAAAATATTCTAAGACTCCAAAG 51930646
          ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3521 AATATTTCACAGCTTTTTTTTTTTTTTTCATTTTAGAGAAAATATTCTAAGACTCCAAAG 3580

 51930647 TTCGATAGTATTTGGTCAGTGTCTTAGTCAGTTTGAGCTAATATAACAAATTATCATAGA 51930706
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3581 TTAGATAGTATTTGGTCAGTGTCTTAGTCAGTTTGAGCTAATATAACAAATTATCATAGA 3640

 51930707 ATAAGTGTCTCAAGCAACAGAAATGTATTTTTTACAATCTGGAGGCTGCAAAGTCCAGAA 51930766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3641 ATAAGTGTCTCAAGCAACAGAAATGTATTTTTTACAATCTGGAGGCTGCAAAGTCCAGAA 3700

 51930767 TCAAGATGCTGGCAGATCTGGTGTCTGATGAGGACCCACCTTCTTATTTGCAAATGATCA 51930826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3701 TCAAGATGCTGGCAGATCTGGTGTCTGATGAGGACCCACCTTCTTATTTGCAAATGATCA 3760

 51930827 TTTTTGTTGTGTCCTCACATGACAAAGAGCAGAGAGAGCAAGCACTCTTGTGTCTCTTC- 51930885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
     3761 TTTTTGTTGTGTCCTCACATGACAAAGAGCAGAGAGAGCAAGCACTCTTGTGTCTCTTCT 3820

 51930886 ---TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCCGGC 51930920
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3821 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCCGGC 3858

Alignment time is 2.94466 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51916584,51937767] =>     21184 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [       1,    7370] =>      7370 nucs 'mol-32-3235-180924_7370'

Score:        7224
Aligned:      7377        nucs
Identic:      7359 (100%) nucs =>      4549 (100%)      2810 (100%)
Gaps:            7 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51922026,51926584] EXCISED REGION [51927768,51930585]
 second seq =>  [       1,    4553] EXCISED REGION [    4554,    7370]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1183 nucs [51926585,51927767]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [51926585,51926587] to [51927768,51927770]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [51926584,51926584] to [51927768,51927768]
 second seq =>         1 nucs [4553,4553] to [4554,4554]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 51922026 CATGATACTTTCCATCTAATTATGGCTATTGTCAGGGTGTGTCTGATGTATGCCTCAGGA 51922085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CATGATACTTTCCATCTAATTATGGCTATTGTCAGGGTGTGTCTGATGTATGCCTCAGGA 60

 51922086 AACATCCTCAGTCACCAGCTGGTATTAATAGTTTTGTCTCTCTGTTCTGATTCTTTTCAT 51922145
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
       61 AACATCCTCAGTCACCAGCTGGTATTAATAGTTTTGTCTATCTGTTCTGATTCTTTTCAT 120

 51922146 AATATTTGGAATTTTGTCTTCCACTACCTGTACAAGGGCAAGGCAACTCATCTGTTACTA 51922205
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
      121 AATATTTGGAATTTTGTCTTCCACTACCTGTACAAGGGCAAGGCAACTCATCTGTTAGTA 180

 51922206 AGAGATAACTTGGCCGGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTGTGGGAGGCTG 51922265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGAGATAACTTGGCCGGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTGTGGGAGGCTG 240

 51922266 AGGTGGGGGGATCACTAGGTCAGGAGATCAAGACCATCGTGGCCAACATGGTGAAACCCG 51922325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGGTGGGGGGATCACTAGGTCAGGAGATCAAGACCATCGTGGCCAACATGGTGAAACCCG 300

 51922326 TCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTTGTGGGCACCTGTAATCCCACCTA 51922385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTTGTGGGCACCTGTAATCCCACCTA 360

 51922386 CTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATAGCTTGAACCAGGGAGTTGGAGGTTACAGTGAGCCA 51922445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATAGCTTGAACCAGGGAGTTGGAGGTTACAGTGAGCCA 420

 51922446 AGATCACACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCCATCTCAAAAAAAAGA 51922505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGATCACACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCCATCTCAAAAAAAAGA 480

 51922506 TAGAGTTAACTTGAATTTACTTAAATCATAACTTGGGGGAATTTTACCATTAAATCATTA 51922565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TAGAGTTAACTTGAATTTACTTAAATCATAACTTGGGGGAATTTTACCATTAAATCATTA 540

 51922566 TACAATATTTTTATTACTCTGTTCAGAGTAATATACCAGAGTAAGTACCATTTTATAAGC 51922625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TACAATATTTTTATTACTCTGTTCAGAGTAATATACCAGAGTAAGTACCATTTTATAAGC 600

 51922626 TTCTATAGTTCAATGGCATCTCCATGAAACTTATATAAGTAGCTTTTAATTAAAAATTAA 51922685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTCTATAGTTCAATGGCATCTCCATGAAACTTATATAAGTAGCTTTTAATTAAAAATTAA 660

 51922686 AGTTTTTTTCAGAAAGAATTTTTTTGTTAATTGGTCATTATCCATTTATTGATTTCTTAT 51922745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGTTTTTTTCAGAAAGAATTTTTTTGTTAATTGGTCATTATCCATTTATTGATTTCTTAT 720

 51922746 GGCATGTTCAGCTTTATTCATAAAATAGGCATCATCTAAAAGAATTGTAAGCATGAATTC 51922805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GGCATGTTCAGCTTTATTCATAAAATAGGCATCATCTAAAAGAATTGTAAGCATGAATTC 780

 51922806 CTTTTCAGTGTGTGGGCAGTGTAATTGGAGAGCCAAGAGAAATACAGAGGAAATTACTGA 51922865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTTTTCAGTGTGTGGGCAGTGTAATTGGAGAGCCAAGAGAAATACAGAGGAAATTACTGA 840

 51922866 TGCCAAAAATACATAAAATGTAATAGAGAAAATAGAATTGGAAACTCTTCTTGGTATACT 51922925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGCCAAAAATACATAAAATGTAATAGAGAAAATAGAATTGGAAACTCTTCTTGGTATACT 900

 51922926 CTCTTTCTTCATACTGAATCACATGGCTCGCTATCAGTTCAAATAGGAATTTTTAAGGAA 51922985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTCTTTCTTCATACTGAATCACATGGCTCGCTATCAGTTCAAATAGGAATTTTTAAGGAA 960

 51922986 GTCCTTTATGGATTTCACCTCACTCCAATGTGTCCACACTCAGTGCTTTCTCAGGATAAA 51923045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GTCCTTTATGGATTTCACCTCACTCCAATGTGTCCACACTCAGTGCTTTCTCAGGATAAA 1020

 51923046 GAAACTCAATTCTATTACATAATTTTGTAAATTGTTTTCTTTTTCTTTGCCCACCATATT 51923105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GAAACTCAATTCTATTACATAATTTTGTAAATTGTTTTCTTTTTCTTTGCCCACCATATT 1080

 51923106 CTCATAAGGACACCTTAAGCTCCTCAAAAGCACAAAACGCAAATTCTATTTCTTTGTCAA 51923165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTCATAAGGACACCTTAAGCTCCTCAAAAGCACAAAACGCAAATTCTATTTCTTTGTCAA 1140

 51923166 CCCTCTCTCTAGTAAAGTTCTAGGTAAAGAATAAATGCATGACTGATTGTTTTAATGAGC 51923225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CCCTCTCTCTAGTAAAGTTCTAGGTAAAGAATAAATGCATGACTGATTGTTTTAATGAGC 1200

 51923226 GCTAATGGGTGTTGTTAAATCCCTTACTATCTGAGGAGATCGTTGCTTATGGCAGCCCCT 51923285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GCTAATGGGTGTTGTTAAATCCCTTACTATCTGAGGAGATCGTTGCTTATGGCAGCCCCT 1260

 51923286 GTGATTTTAAAAGCTCTTCCATGTTGGAATAAAGGCAAAATACAGTGATTTCAAAGAACT 51923345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GTGATTTTAAAAGCTCTTCCATGTTGGAATAAAGGCAAAATACAGTGATTTCAAAGAACT 1320

 51923346 GGGGAGAGAAATTTTAAGATTTCCTTTTGGGAAAATTTCAGGCAAAAAATTACATCTTAT 51923405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GGGGAGAGAAATTTTAAGATTTCCTTTTGGGAAAATTTCAGGCAAAAAATTACATCTTAT 1380

 51923406 AATCCATTCCAGGCTTTTGATTGTATGATTACCCCATTTACAATTGATGTTGAAAATAAT 51923465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AATCCATTCCAGGCTTTTGATTGTATGATTACCCCATTTACAATTGATGTTGAAAATAAT 1440

 51923466 ATTTTCTCACTTGCCACAGCCTCTTCTTTGCATTCTCTCACCCTCAGCTATTATATATTA 51923525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATTTTCTCACTTGCCACAGCCTCTTCTTTGCATTCTCTCACCCTCAGCTATTATATATTA 1500

 51923526 GCTCAGTACCTGCATTATTTACAGGAACTGAAAAACAGGGTTGAAGATTATAAAATCTCA 51923585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GCTCAGTACCTGCATTATTTACAGGAACTGAAAAACAGGGTTGAAGATTATAAAATCTCA 1560

 51923586 CATTTGCTGACTTTTATGCAGGTTAAATGAAAGAGTTTTATAATTGTTTCTGCCAACCAG 51923645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CATTTGCTGACTTTTATGCAGGTTAAATGAAAGAGTTTTATAATTGTTTCTGCCAACCAG 1620

 51923646 TAGGTTCAAAATGTTTATTAAAAGTGAATTCTGGATAAATTATGATTAATGTCCTTCTGG 51923705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TAGGTTCAAAATGTTTATTAAAAGTGAATTCTGGATAAATTATGATTAATGTCCTTCTGG 1680

 51923706 TTTGTTTTGCTTGAGCCTACACACACACACACACACACACACACACACACACACACATAT 51923765
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||
     1681 TTTGTTTTGCTTGAGCCTACACACACACACACACACACACACACACACACA------TAT 1734

 51923766 ACACACACATATATATATAACTTTATATAAAACTATAAATACTAGGAACTAGCACTAGAA 51923825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1735 ACACACACATATATATATAACTTTATATAAAACTATAAATACTAGGAACTAGCACTAGAA 1794

 51923826 CTGTACTTTTCACTACAGTATCAGTAAAAAAAAAAAATTTAGGATTTTTTATGACTGATT 51923885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1795 CTGTACTTTTCACTACAGTATCAGTAAAAAAAAAAAATTTAGGATTTTTTATGACTGATT 1854

 51923886 TTACATTTAAACCTAAAGGAAAAATAATCAGGAACAACACAGAGTTTTTTTTTTTAAATG 51923945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1855 TTACATTTAAACCTAAAGGAAAAATAATCAGGAACAACACAGAGTTTTTTTTTTTAAATG 1914

 51923946 AGTTGGCAAAGAAAATACCAAAGGCTCAAACCTGACAAAAGCATTGAGAATACCAGAAAA 51924005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1915 AGTTGGCAAAGAAAATACCAAAGGCTCAAACCTGACAAAAGCATTGAGAATACCAGAAAA 1974

 51924006 GAAATTTTAACCTTTAAATTTAATTGAAACATGATATTTTTCTCTTTTGAAACATTTCTT 51924065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1975 GAAATTTTAACCTTTAAATTTAATTGAAACATGATATTTTTCTCTTTTGAAACATTTCTT 2034

 51924066 TCTCTACAAAAATCTGTTCCTTCAGAACCTGTTGATGCAATAATATTATATCATTTTTTT 51924125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2035 TCTCTACAAAAATCTGTTCCTTCAGAACCTGTTGATGCAATAATATTATATCATTTTTTT 2094

 51924126 TTACTGGTCAATGTATTTATTTGTAATTGTTCTGAAATTGTTTCCTGCAAGGTTTTCTAT 51924185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2095 TTACTGGTCAATGTATTTATTTGTAATTGTTCTGAAATTGTTTCCTGCAAGGTTTTCTAT 2154

 51924186 TACTCAAACTGTCTTTGTACACATAATTTTCCTTTCATGCCATTTATGAACCATTTTTTA 51924245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2155 TACTCAAACTGTCTTTGTACACATAATTTTCCTTTCATGCCATTTATGAACCATTTTTTA 2214

 51924246 TTTCTATGGTTGATAGAGAATGACTTCATAATTCATTTCTGAATAAGTGAAATAATTTAA 51924305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2215 TTTCTATGGTTGATAGAGAATGACTTCATAATTCATTTCTGAATAAGTGAAATAATTTAA 2274

 51924306 AAACATTTTAAAGTGGGTGTATCTACTTGCTTGGAGCTTTGTCGAATCATGTTTCTTATT 51924365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2275 AAACATTTTAAAGTGGGTGTATCTACTTGCTTGGAGCTTTGTCGAATCATGTTTCTTATT 2334

 51924366 TGGAGCCTCTGGAGGAATGTTGACTTACCATGGTAAAAATTAACTGGTGAAACTCTAAAG 51924425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2335 TGGAGCCTCTGGAGGAATGTTGACTTACCATGGTAAAAATTAACTGGTGAAACTCTAAAG 2394

 51924426 AAAACACAGACTCTACACGCAGTCTTGTCCGAAACTTACTCACCCTGAAACCAATGAATT 51924485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2395 AAAACACAGACTCTACACGCAGTCTTGTCCGAAACTTACTCACCCTGAAACCAATGAATT 2454

 51924486 TCAAAGACCTAGATACTTCCTTCTGTGATGTCCCCTGAGATCAGAGAATAAAAGAAAAAT 51924545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2455 TCAAAGACCTAGATACTTCCTTCTGTGATGTCCCCTGAGATCAGAGAATAAAAGAAAAAT 2514

 51924546 CCCTCGTAAATATACATCACGTACAGCTGTTTGATTTATGCATTATGCAGAAACTAAGAA 51924605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2515 CCCTCGTAAATATACATCACGTACAGCTGTTTGATTTATGCATTATGCAGAAACTAAGAA 2574

 51924606 AACAGAGTTATATGTAACCTTGCAATGAGAAGTGCACCCACCAAAAAAAAAAAAAAAAAA 51924665
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2575 AACAGAGTTATATGTAACTTTGCAATGAGAAGTGCACCCACCAAAAAAAAAAAAAAAAAA 2634

 51924666 ATCCCAAAACATTGTTTCAAAAAGAAGTGGTATGAAGCATCTTAGTGTTTCATGAATATT 51924725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2635 ATCCCAAAACATTGTTTCAAAAAGAAGTGGTATGAAGCATCTTAGTGTTTCATGAATATT 2694

 51924726 GAAGAATAGTGCAATTATTGAAATTTGGCATTTAAAAAATGTTTTTAAATTATTAGGAAG 51924785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2695 GAAGAATAGTGCAATTATTGAAATTTGGCATTTAAAAAATGTTTTTAAATTATTAGGAAG 2754

 51924786 CTACCGTGACCTGTTTACTAAATCCTCAATTCTTTCTCTCTCAGTTTTTCTTACTATAAA 51924845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2755 CTACCGTGACCTGTTTACTAAATCCTCAATTCTTTCTCTCTCAGTTTTTCTTACTATAAA 2814

 51924846 ATTTACTTTTCAAGCCAGAGAATTTTTCTTTCTGACAAGACGTAGATCTATATTGCGCTG 51924905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2815 ATTTACTTTTCAAGCCAGAGAATTTTTCTTTCTGACAAGACGTAGATCTATATTGCGCTG 2874

 51924906 TCAAGATGCAGCTTTTGCATCTCTGCTGCCATGTGGATAGAATAACTTTCTTTCCTCAAG 51924965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2875 TCAAGATGCAGCTTTTGCATCTCTGCTGCCATGTGGATAGAATAACTTTCTTTCCTCAAG 2934

 51924966 AAGTGGACAAGCCCTCATAGGGACTGATTTTCTGTGAAGTAGTGAGACTTAATCTTTGGG 51925025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2935 AAGTGGACAAGCCCTCATAGGGACTGATTTTCTGTGAAGTAGTGAGACTTAATCTTTGGG 2994

 51925026 ACCTTCACTTACATCACTTACATAGGACCTTTCAATACTCAGGGAGGGCCCTTGGCAATA 51925085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2995 ACCTTCACTTACATCACTTACATAGGACCTTTCAATACTCAGGGAGGGCCCTTGGCAATA 3054

 51925086 AGTTCTTCTGACAATATATCTTGTGCTGATGGTGGTGTTAGCTTTCAAAATTTGTAATTA 51925145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3055 AGTTCTTCTGACAATATATCTTGTGCTGATGGTGGTGTTAGCTTTCAAAATTTGTAATTA 3114

 51925146 TTTTGGTAATTTCTGTCATCCTAGAAAAATGTGTATAGTGTATTTGTTCCTAATTTCATT 51925205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3115 TTTTGGTAATTTCTGTCATCCTAGAAAAATGTGTATAGTGTATTTGTTCCTAATTTCATT 3174

 51925206 TTCATTATTTATATATTTTTTAATGAACACCCCCAGCATAGTATAAGTTTTATACCTCTA 51925265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3175 TTCATTATTTATATATTTTTTAATGAACACCCCCAGCATAGTATAAGTTTTATACCTCTA 3234

 51925266 CAATCTGAATCACCCGCTTGGCCCATGCCTAGGACTAGGTCTTATCATCCGCAGTGAGAG 51925325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3235 CAATCTGAATCACCCGCTTGGCCCATGCCTAGGACTAGGTCTTATCATCCGCAGTGAGAG 3294

 51925326 ATTATAGGCTCTTACTAGGAATTTATGGTAACATGGGCTCCTAACAGTCATGATTTTTAT 51925385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3295 ATTATAGGCTCTTACTAGGAATTTATGGTAACATGGGCTCCTAACAGTCATGATTTTTAT 3354

 51925386 AACATGATTGCCTATGTATATAAAGTCCACTGGCTGAACAAGTATTTTCCCTCAAATCAG 51925445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3355 AACATGATTGCCTATGTATATAAAGTCCACTGGCTGAACAAGTATTTTCCCTCAAATCAG 3414

 51925446 GAAGGAAAAAAAAAAACACGAAGCAAATTGATCCTCTTCTAAAAGCTGTCACATCAGTAA 51925505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3415 GAAGGAAAAAAAAAAACACGAAGCAAATTGATCCTCTTCTAAAAGCTGTCACATCAGTAA 3474

 51925506 CCCATCATATTCTCATTTACTTATATACTGAGTAGGTAGTCACCTTTGATTCATATCTCT 51925565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3475 CCCATCATATTCTCATTTACTTATATACTGAGTAGGTAGTCACCTTTGATTCATATCTCT 3534

 51925566 CAGGAGTTCAGAAGTTTTTGAAAGTAATTTGTGATACAAAATATAGGGAAATTCAGAATG 51925625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3535 CAGGAGTTCAGAAGTTTTTGAAAGTAATTTGTGATACAAAATATAGGGAAATTCAGAATG 3594

 51925626 AGATTCTTTTGGCTTGTCTTTCTTTTTCTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTATTTGTTGAA 51925685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3595 AGATTCTTTTGGCTTGTCTTTCTTTTTCTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTATTTGTTGAA 3654

 51925686 CTCAAATCCGGAAATTGTGGAGGTTACTAGAACTCTAAGTCACAGACTTATAAGTACTGA 51925745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3655 CTCAAATCCGGAAATTGTGGAGGTTACTAGAACTCTAAGTCACAGACTTATAAGTACTGA 3714

 51925746 AAAAGTAGTCAGTAAAGAAAACATACAGTAAGAGACTAGGTTAATTTTCCTATAGTTCAT 51925805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3715 AAAAGTAGTCAGTAAAGAAAACATACAGTAAGAGACTAGGTTAATTTTCCTATAGTTCAT 3774

 51925806 TGATGTTTCCACTATTACTGCCCCTGATTTTTAACTTTAGTTTTCCTTAGATTGTTGGAG 51925865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3775 TGATGTTTCCACTATTACTGCCCCTGATTTTTAACTTTAGTTTTCCTTAGATTGTTGGAG 3834

 51925866 TAATATATGTACCTTAAAAATTAACTGTGGAACAAGTAGATGAACTTTTTACACAATTTC 51925925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3835 TAATATATGTACCTTAAAAATTAACTGTGGAACAAGTAGATGAACTTTTTACACAATTTC 3894

 51925926 CTGCTTTTATAAAGTTCCTACTAGCTATATTTTCCCAAAAGTGCTCAACAATAGAGTCTG 51925985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3895 CTGCTTTTATAAAGTTCCTACTAGCTATATTTTCCCAAAAGTGCTCAACAATAGAGTCTG 3954

 51925986 GTGCTAAAAAGCAGAGTAGGCTAAATTTAGATCAATGTGAAATGCCCTACTTATTTCCTA 51926045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3955 GTGCTAAAAAGCAGAGTAGGCTAAATTTAGATCAATGTGAAATGCCCTACTTATTTCCTA 4014

 51926046 TGAACTTAATTGATTGAGCTCATTTTGGGGGTGTCTTTCTGATCGACCAGAAACTTGGCT 51926105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4015 TGAACTTAATTGATTGAGCTCATTTTGGGGGTGTCTTTCTGATCGACCAGAAACTTGGCT 4074

 51926106 CATTAGAGCAACTCACAAAGTGACCTTTTAAAAGAAAGAGTTTTCAATATATTTGTTCAT 51926165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4075 CATTAGAGCAACTCACAAAGTGACCTTTTAAAAGAAAGAGTTTTCAATATATTTGTTCAT 4134

 51926166 GTTCCATTCCACTGAGAATGGTGCTATTTAAAACTAAATACAATAATTTTAGATATTGTA 51926225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4135 GTTCCATTCCACTGAGAATGGTGCTATTTAAAACTAAATACAATAATTTTAGATATTGTA 4194

 51926226 CAGCAGATATAATTTTAAACATAATACATGGGATTTCGATTTTAGGTACTGTTTATAAGG 51926285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4195 CAGCAGATATAATTTTAAACATAATACATGGGATTTCGATTTTAGGTACTGTTTATAAGG 4254

 51926286 CATTTCTCCTTATATTATTCTAGACTTAAATATAACAAATTTCATGCAGAGGTTTCTTTC 51926345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4255 CATTTCTCCTTATATTATTCTAGACTTAAATATAACAAATTTCATGCAGAGGTTTCTTTC 4314

 51926346 AAAAGTAAATTCAGCCACATTTAGACTCAAATATTCCCTAATTTTTTAGTGTAGCTGAAG 51926405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4315 AAAAGTAAATTCAGCCACATTTAGACTCAAATATTCCCTAATTTTTTAGTGTAGCTGAAG 4374

 51926406 TCCTAATAATATACTTGTGTTTCTTTTAAATTAAGTCCCACATGTTAACTTTACAACAGA 51926465
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     4375 TCCTAATAATATACTTGTGTTTCTTTTAAATTAAGTCCCACATGTTAACTTTACAGCAGA 4434

 51926466 AAGTCCATGTATCGTATTATTAGTCTAAATCTTCATTTTACTGTTTAGTTAACACAGACA 51926525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4435 AAGTCCATGTATCGTATTATTAGTCTAAATCTTCATTTTACTGTTTAGTTAACACAGACA 4494

 51926526 TTCATTTAACACACTATGTTTAATTTCCCACTCAGTTTTGGCTTATTGTAGTCTAATAA 51926584
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4495 TTCATTTAACACACTATGTTTAATTTCCCACTCAGTTTTGGCTTATTGTAGTCTAATAA 4553

EXCISED REGION

 51927768 ACATATAGTAAGTTGTCCATAAGTATTTGCTGGTAGATTTATTTATTTTTTAAAAAAACA 51927827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4554 ACATATAGTAAGTTGTCCATAAGTATTTGCTGGTAGATTTATTTATTTTTTAAAAAAACA 4613

 51927828 ACTTGGAAAGTTTTCTGTGTGCTTTTATATTAGAACTTGACCTTTGAAGTACCTCCAGGA 51927887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4614 ACTTGGAAAGTTTTCTGTGTGCTTTTATATTAGAACTTGACCTTTGAAGTACCTCCAGGA 4673

 51927888 AATTTTGAAGAGTGCTGGCATATGACAATGCGTAAGTTTATATTTCATGTCCATGCATGC 51927947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4674 AATTTTGAAGAGTGCTGGCATATGACAATGCGTAAGTTTATATTTCATGTCCATGCATGC 4733

 51927948 CATTAAAATTCTAATAATGTAGTTGACAGAGCCTTTCTTGTCCCTTAAGCACTAAATTTG 51928007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4734 CATTAAAATTCTAATAATGTAGTTGACAGAGCCTTTCTTGTCCCTTAAGCACTAAATTTG 4793

 51928008 TGGCTTGCTCTAGATTGTCCCACCTGGCACAAGCGAGGTGAAATTTCAGGTCTAGCCAAC 51928067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     4794 TGGCTTGCTCTAGATTGTCCCACCTGGCACAAGCTAGGTGAAATTTCAGGTCTAGCCAAC 4853

 51928068 TTTTTTCTTTTTTTTTTTTTAACAAGTATTAAAAACATTTTCATATATATTCCCTGTATT 51928127
          ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4854 TTTTTTC-TTTTTTTTTTTTAACAAGTATTAAAAACATTTTCATATATATTCCCTGTATT 4912

 51928128 ATTTCACCTATTTTTGTGTGTGTGTTTCTATCACACTGCCACATCAAAAACCTCTTCTTG 51928187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4913 ATTTCACCTATTTTTGTGTGTGTGTTTCTATCACACTGCCACATCAAAAACCTCTTCTTG 4972

 51928188 AACGACTATAGTATAGTGGTTAATAGTTCAGTGTCTAGATCAAGACCACCTATGGACGTA 51928247
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4973 AACGACTATAGTATAGTGATTAATAGTTCAGTGTCTAGATCAAGACCACCTATGGACGTA 5032

 51928248 TCTTGGCTCTGATTTTACCAGCCGTACAATCCTGGAGAATCTGTTCAAGAGAAATGTGCC 51928307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5033 TCTTGGCTCTGATTTTACCAGCCGTACAATCCTGGAGAATCTGTTCAAGAGAAATGTGCC 5092

 51928308 TCAATTACGTATCTCTAAAGTAGTTGTAGCTATAGAACCTGTTCCATAGATGTGGATCAG 51928367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5093 TCAATTACGTATCTCTAAAGTAGTTGTAGCTATAGAACCTGTTCCATAGATGTGGATCAG 5152

 51928368 AACACTGCATGACATTTAGAAAATGTTTAATAAATGATGTTGCTGTACTTGTTGCTGTTA 51928427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5153 AACACTGCATGACATTTAGAAAATGTTTAATAAATGATGTTGCTGTACTTGTTGCTGTTA 5212

 51928428 TTGTTGCTCTGTCATGTTAGGAGAACTCTCATTTACCCTAGTGTTCTCTCAAAGTGAAAT 51928487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5213 TTGTTGCTCTGTCATGTTAGGAGAACTCTCATTTACCCTAGTGTTCTCTCAAAGTGAAAT 5272

 51928488 ACAGATCATTACCTCTTGAAATCATGTCCAAGTAACTTCAGAATTATTTAGAAATCATTT 51928547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5273 ACAGATCATTACCTCTTGAAATCATGTCCAAGTAACTTCAGAATTATTTAGAAATCATTT 5332

 51928548 ATCTAAATCAGAGTATTTCTTGATATAATTTAAAGTTGATTGTATTTGAAAGTACATATG 51928607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5333 ATCTAAATCAGAGTATTTCTTGATATAATTTAAAGTTGATTGTATTTGAAAGTACATATG 5392

 51928608 TCAATCTAGTATGAGATAATCTCAAGGAAATAAAAATGTATAGGTCTAATTTACATTTTT 51928667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5393 TCAATCTAGTATGAGATAATCTCAAGGAAATAAAAATGTATAGGTCTAATTTACATTTTT 5452

 51928668 ATATGGAAGGAGATAATTACTTTCTATCACAAATGATGAAGGCTGACGTTTGTTTCTTTT 51928727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5453 ATATGGAAGGAGATAATTACTTTCTATCACAAATGATGAAGGCTGACGTTTGTTTCTTTT 5512

 51928728 TTACTTTTAATTTTCACTTATATTTTGTTTATTATCAATATTTGCTTTTTAAAAGGTGGG 51928787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5513 TTACTTTTAATTTTCACTTATATTTTGTTTATTATCAATATTTGCTTTTTAAAAGGTGGG 5572

 51928788 AAGAAATCAACCAATCAAACATTAAAAAGCAATATGGAGGAGGGTGATATAATGCCCACT 51928847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5573 AAGAAATCAACCAATCAAACATTAAAAAGCAATATGGAGGAGGGTGATATAATGCCCACT 5632

 51928848 TATATTTCTCTTATAATTTTAAATATTTTCATAATTAACAGAATAATTAGCACTGGTAAT 51928907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5633 TATATTTCTCTTATAATTTTAAATATTTTCATAATTAACAGAATAATTAGCACTGGTAAT 5692

 51928908 ATTAAAATACCATCAAAAGAATCTAAATGTATGTGCTTTCTGTTGCAGCCTTGTTAGATG 51928967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5693 ATTAAAATACCATCAAAAGAATCTAAATGTATGTGCTTTCTGTTGCAGCCTTGTTAGATG 5752

 51928968 TTTCAGTGGATTCAAAGTGTTGTTATAAGAAAACGTGATTTATCAAGACTTTCATGTGTA 51929027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5753 TTTCAGTGGATTCAAAGTGTTGTTATAAGAAAACGTGATTTATCAAGACTTTCATGTGTA 5812

 51929028 AAATAAAAGGCATTTTCAATGACTACTTGGCCAGGCTTTCAGATTCCAATGCCAAGATGT 51929087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5813 AAATAAAAGGCATTTTCAATGACTACTTGGCCAGGCTTTCAGATTCCAATGCCAAGATGT 5872

 51929088 TGTATTTTGATATTGCAGTTTTCTAACAACAACAAAGTTGAGTGGACTTCTGGAACTAAA 51929147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5873 TGTATTTTGATATTGCAGTTTTCTAACAACAACAAAGTTGAGTGGACTTCTGGAACTAAA 5932

 51929148 ACTTAAATATTCAGAACTAATTATCACCACTCTATTTCTTACAGAGCATTTAAGGAACAC 51929207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5933 ACTTAAATATTCAGAACTAATTATCACCACTCTATTTCTTACAGAGCATTTAAGGAACAC 5992

 51929208 ATATATGCATATATCCTTGCACTTTGTGCTACAGGTTGTGAGCCAGGGTTACTTCCTTCT 51929267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5993 ATATATGCATATATCCTTGCACTTTGTGCTACAGGTTGTGAGCCAGGGTTACTTCCTTCT 6052

 51929268 GACCATGTGGGTTCATAATGAAGACCCAACCTTAAGGTACCCAGGGCTTAGAAATCAAAT 51929327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6053 GACCATGTGGGTTCATAATGAAGACCCAACCTTAAGGTACCCAGGGCTTAGAAATCAAAT 6112

 51929328 TTGTCCTTAGGACACTTTGGAAATCTATCTTGTAGTACAGGTGACCCAGCAGCAATCAAT 51929387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6113 TTGTCCTTAGGACACTTTGGAAATCTATCTTGTAGTACAGGTGACCCAGCAGCAATCAAT 6172

 51929388 CTTTCTGCCATCCCTAGTTTTAGTTCAGGACCCAGAAAAGTTGTAACTTGTTTCCTTTCC 51929447
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6173 CTTTCTGCCATCCCTAGTTTTACTTCAGGACCCAGAAAAGTTGTAACTTGTTTCCTTTCC 6232

 51929448 TGTGATCAAGCCTTTGTTTTCTCTTTTTTTCTCCACTTTTTGTAGCTTTTTAATTTGTTT 51929507
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     6233 TGTGATCAAGCCTTTGTTTTCTCTTTTTTTCTCCACTTTTTGTAGCTCTTTAATTTGTTT 6292

 51929508 CTCTGTTGATTACTAGCCCAATGCCTGAGCATCTTCGTCTTAAGACAAAGCCTCTGTGTT 51929567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6293 CTCTGTTGATTACTAGCCCAATGCCTGAGCATCTTCGTCTTAAGACAAAGCCTCTGTGTT 6352

 51929568 TCTTCAGCTCCTGAAATGACTGGCATGCTGAAAATGAGCTCAGGGCATTAGTCTTTGCTA 51929627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6353 TCTTCAGCTCCTGAAATGACTGGCATGCTGAAAATGAGCTCAGGGCATTAGTCTTTGCTA 6412

 51929628 CTAAGCCACTACAGATTCCATTCCCTTTCTTCTTGAGTATGCACACACCGCTTGTTCACA 51929687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     6413 CTAAGCCACTACAGATTCCATTCCCTTTCTTCCTGAGTATGCACACACCGCTTGTTCACA 6472

 51929688 GACTCCAGATTAGTTATTAAGCTACATCTGTATGCAGTTTGCACTCTCCTGCCTTCGACC 51929747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6473 GACTCCAGATTAGTTATTAAGCTACATCTGTATGCAGTTTGCACTCTCCTGCCTTCGACC 6532

 51929748 TGCTTGTCCCAGAAGTTATTCACCATATTCTACCTTGATCATATTTTCTACTTGTCAATG 51929807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6533 TGCTTGTCCCAGAAGTTATTCACCATATTCTACCTTGATCATATTTTCTACTTGTCAATG 6592

 51929808 CGCATGTCAATTAAGAACTTTTAACATTTATTGACCATTTATTATATACTAGCCAGTCTT 51929867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6593 CGCATGTCAATTAAGAACTTTTAACATTTATTGACCATTTATTATATACTAGCCAGTCTT 6652

 51929868 TTAATTGATTTATGAACAATTAACTTAATCATCATATAAGCATAGTAGGGTACAATTAGT 51929927
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6653 TTAATTGCTTTATGAACAATTAACTTAATCATCATATAAGCATAGTAGGGTACAATTAGT 6712

 51929928 TCCCCAACTTTATATATGAACAAATGGACTTTCAGAAAGGTAAGGTAAAATATCCACGGT 51929987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6713 TCCCCAACTTTATATATGAACAAATGGACTTTCAGAAAGGTAAGGTAAAATATCCACGGT 6772

 51929988 AAGAAAGCCTGCATATGTGGAACTGGGAATTGAACCCCTATGTCTGACCCGAGGGTCCAT 51930047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6773 AAGAAAGCCTGCATATGTGGAACTGGGAATTGAACCCCTATGTCTGACCCGAGGGTCCAT 6832

 51930048 ACACTTAAGCATTATGCTATCAAGTTTTCCACAGCCTGCTTTTCGGCTTCTCTCTCTTTC 51930107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6833 ACACTTAAGCATTATGCTATCAAGTTTTCCACAGCCTGCTTTTCGGCTTCTCTCTCTTTC 6892

 51930108 TTTCTTTCCTGATCTCTGTTGCAATTCCTACCTTTCAACTCCCTTCTGACCATGGATAGT 51930167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     6893 TTTCTTTCCTGATCTCTGTTGCAATTCCTACCTTTCAACTCCCTTCTGACCATGGACAGT 6952

 51930168 TTGCAAAATGCCAGAGGTACGTCTCAAAGAAGCTTCAAATAGGAGCGTGTACTACCATTA 51930227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6953 TTGCAAAATGCCAGAGGTACGTCTCAAAGAAGCTTCAAATAGGAGCGTGTACTACCATTA 7012

 51930228 AGTCAGCTCCTCAGTTGTCTTCTTTGGATTGAGAAGCACTTCATCACTTTTTACACAGGT 51930287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7013 AGTCAGCTCCTCAGTTGTCTTCTTTGGATTGAGAAGCACTTCATCACTTTTTACACAGGT 7072

 51930288 TTAATTATCAAATATGACTTTTCTAGTACTACAGCTAATATATGTCAATGTCAAAGGGTT 51930347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7073 TTAATTATCAAATATGACTTTTCTAGTACTACAGCTAATATATGTCAATGTCAAAGGGTT 7132

 51930348 AACAGAATACTAGGCCTATATTAAATTATACATATGAGCTTTCTCTTTACTCCTTTTTAT 51930407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7133 AACAGAATACTAGGCCTATATTAAATTATACATATGAGCTTTCTCTTTACTCCTTTTTAT 7192

 51930408 GTTCATTAGCAAACAGATAAAGCCATAATAGATTTTTTAAGGAATATTTTGTTTTGTTTT 51930467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7193 GTTCATTAGCAAACAGATAAAGCCATAATAGATTTTTTAAGGAATATTTTGTTTTGTTTT 7252

 51930468 GTTTTGGACTTATACATCTATTAACAATAAACCAAACATTGCAGATTAAAGCAAATCTGC 51930527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7253 GTTTTGGACTTATACATCTATTAACAATAAACCAAACATTGCAGATTAAAGCAAATCTGC 7312

 51930528 CAATCTGTTTTACAAACACTATCTTCTGAAGGGTTCCTGGGCACAAGATACTGTTCTA 51930585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7313 CAATCTGTTTTACAAACACTATCTTCTGAAGGGTTCCTGGGCACAAGATACTGTTCTA 7370

Alignment time is 6.01201 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51916584,51937767] =>     21184 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [       1,    2817] =>      2817 nucs 'mol-32-3235-180924_2817'

Score:        2740
Aligned:      2817        nucs
Identic:      2810 (100%) nucs =>       274 (100%)      2536 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51927768,51928041] EXCISED REGION [51928043,51930585]
 second seq =>  [       1,     274] EXCISED REGION [     276,    2817]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [51928042,51928042]
 second seq =>         1 nucs [275,275]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [51928075,51928075]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 51927768 ACATATAGTAAGTTGTCCATAAGTATTTGCTGGTAGATTTATTTATTTTTTAAAAAAACA 51927827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACATATAGTAAGTTGTCCATAAGTATTTGCTGGTAGATTTATTTATTTTTTAAAAAAACA 60

 51927828 ACTTGGAAAGTTTTCTGTGTGCTTTTATATTAGAACTTGACCTTTGAAGTACCTCCAGGA 51927887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACTTGGAAAGTTTTCTGTGTGCTTTTATATTAGAACTTGACCTTTGAAGTACCTCCAGGA 120

 51927888 AATTTTGAAGAGTGCTGGCATATGACAATGCGTAAGTTTATATTTCATGTCCATGCATGC 51927947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AATTTTGAAGAGTGCTGGCATATGACAATGCGTAAGTTTATATTTCATGTCCATGCATGC 180

 51927948 CATTAAAATTCTAATAATGTAGTTGACAGAGCCTTTCTTGTCCCTTAAGCACTAAATTTG 51928007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CATTAAAATTCTAATAATGTAGTTGACAGAGCCTTTCTTGTCCCTTAAGCACTAAATTTG 240

 51928008 TGGCTTGCTCTAGATTGTCCCACCTGGCACAAGC 51928041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGGCTTGCTCTAGATTGTCCCACCTGGCACAAGC 274

EXCISED REGION

 51928043 AGGTGAAATTTCAGGTCTAGCCAACTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTAACAAGTATTAAAAA 51928102
          |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
      276 AGGTGAAATTTCAGGTCTAGCCAACTTTTTTC-TTTTTTTTTTTTAACAAGTATTAAAAA 334

 51928103 CATTTTCATATATATTCCCTGTATTATTTCACCTATTTTTGTGTGTGTGTTTCTATCACA 51928162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      335 CATTTTCATATATATTCCCTGTATTATTTCACCTATTTTTGTGTGTGTGTTTCTATCACA 394

 51928163 CTGCCACATCAAAAACCTCTTCTTGAACGACTATAGTATAGTGGTTAATAGTTCAGTGTC 51928222
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
      395 CTGCCACATCAAAAACCTCTTCTTGAACGACTATAGTATAGTGATTAATAGTTCAGTGTC 454

 51928223 TAGATCAAGACCACCTATGGACGTATCTTGGCTCTGATTTTACCAGCCGTACAATCCTGG 51928282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      455 TAGATCAAGACCACCTATGGACGTATCTTGGCTCTGATTTTACCAGCCGTACAATCCTGG 514

 51928283 AGAATCTGTTCAAGAGAAATGTGCCTCAATTACGTATCTCTAAAGTAGTTGTAGCTATAG 51928342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      515 AGAATCTGTTCAAGAGAAATGTGCCTCAATTACGTATCTCTAAAGTAGTTGTAGCTATAG 574

 51928343 AACCTGTTCCATAGATGTGGATCAGAACACTGCATGACATTTAGAAAATGTTTAATAAAT 51928402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      575 AACCTGTTCCATAGATGTGGATCAGAACACTGCATGACATTTAGAAAATGTTTAATAAAT 634

 51928403 GATGTTGCTGTACTTGTTGCTGTTATTGTTGCTCTGTCATGTTAGGAGAACTCTCATTTA 51928462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      635 GATGTTGCTGTACTTGTTGCTGTTATTGTTGCTCTGTCATGTTAGGAGAACTCTCATTTA 694

 51928463 CCCTAGTGTTCTCTCAAAGTGAAATACAGATCATTACCTCTTGAAATCATGTCCAAGTAA 51928522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      695 CCCTAGTGTTCTCTCAAAGTGAAATACAGATCATTACCTCTTGAAATCATGTCCAAGTAA 754

 51928523 CTTCAGAATTATTTAGAAATCATTTATCTAAATCAGAGTATTTCTTGATATAATTTAAAG 51928582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      755 CTTCAGAATTATTTAGAAATCATTTATCTAAATCAGAGTATTTCTTGATATAATTTAAAG 814

 51928583 TTGATTGTATTTGAAAGTACATATGTCAATCTAGTATGAGATAATCTCAAGGAAATAAAA 51928642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      815 TTGATTGTATTTGAAAGTACATATGTCAATCTAGTATGAGATAATCTCAAGGAAATAAAA 874

 51928643 ATGTATAGGTCTAATTTACATTTTTATATGGAAGGAGATAATTACTTTCTATCACAAATG 51928702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      875 ATGTATAGGTCTAATTTACATTTTTATATGGAAGGAGATAATTACTTTCTATCACAAATG 934

 51928703 ATGAAGGCTGACGTTTGTTTCTTTTTTACTTTTAATTTTCACTTATATTTTGTTTATTAT 51928762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      935 ATGAAGGCTGACGTTTGTTTCTTTTTTACTTTTAATTTTCACTTATATTTTGTTTATTAT 994

 51928763 CAATATTTGCTTTTTAAAAGGTGGGAAGAAATCAACCAATCAAACATTAAAAAGCAATAT 51928822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      995 CAATATTTGCTTTTTAAAAGGTGGGAAGAAATCAACCAATCAAACATTAAAAAGCAATAT 1054

 51928823 GGAGGAGGGTGATATAATGCCCACTTATATTTCTCTTATAATTTTAAATATTTTCATAAT 51928882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1055 GGAGGAGGGTGATATAATGCCCACTTATATTTCTCTTATAATTTTAAATATTTTCATAAT 1114

 51928883 TAACAGAATAATTAGCACTGGTAATATTAAAATACCATCAAAAGAATCTAAATGTATGTG 51928942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1115 TAACAGAATAATTAGCACTGGTAATATTAAAATACCATCAAAAGAATCTAAATGTATGTG 1174

 51928943 CTTTCTGTTGCAGCCTTGTTAGATGTTTCAGTGGATTCAAAGTGTTGTTATAAGAAAACG 51929002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1175 CTTTCTGTTGCAGCCTTGTTAGATGTTTCAGTGGATTCAAAGTGTTGTTATAAGAAAACG 1234

 51929003 TGATTTATCAAGACTTTCATGTGTAAAATAAAAGGCATTTTCAATGACTACTTGGCCAGG 51929062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1235 TGATTTATCAAGACTTTCATGTGTAAAATAAAAGGCATTTTCAATGACTACTTGGCCAGG 1294

 51929063 CTTTCAGATTCCAATGCCAAGATGTTGTATTTTGATATTGCAGTTTTCTAACAACAACAA 51929122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1295 CTTTCAGATTCCAATGCCAAGATGTTGTATTTTGATATTGCAGTTTTCTAACAACAACAA 1354

 51929123 AGTTGAGTGGACTTCTGGAACTAAAACTTAAATATTCAGAACTAATTATCACCACTCTAT 51929182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1355 AGTTGAGTGGACTTCTGGAACTAAAACTTAAATATTCAGAACTAATTATCACCACTCTAT 1414

 51929183 TTCTTACAGAGCATTTAAGGAACACATATATGCATATATCCTTGCACTTTGTGCTACAGG 51929242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1415 TTCTTACAGAGCATTTAAGGAACACATATATGCATATATCCTTGCACTTTGTGCTACAGG 1474

 51929243 TTGTGAGCCAGGGTTACTTCCTTCTGACCATGTGGGTTCATAATGAAGACCCAACCTTAA 51929302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1475 TTGTGAGCCAGGGTTACTTCCTTCTGACCATGTGGGTTCATAATGAAGACCCAACCTTAA 1534

 51929303 GGTACCCAGGGCTTAGAAATCAAATTTGTCCTTAGGACACTTTGGAAATCTATCTTGTAG 51929362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1535 GGTACCCAGGGCTTAGAAATCAAATTTGTCCTTAGGACACTTTGGAAATCTATCTTGTAG 1594

 51929363 TACAGGTGACCCAGCAGCAATCAATCTTTCTGCCATCCCTAGTTTTAGTTCAGGACCCAG 51929422
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     1595 TACAGGTGACCCAGCAGCAATCAATCTTTCTGCCATCCCTAGTTTTACTTCAGGACCCAG 1654

 51929423 AAAAGTTGTAACTTGTTTCCTTTCCTGTGATCAAGCCTTTGTTTTCTCTTTTTTTCTCCA 51929482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1655 AAAAGTTGTAACTTGTTTCCTTTCCTGTGATCAAGCCTTTGTTTTCTCTTTTTTTCTCCA 1714

 51929483 CTTTTTGTAGCTTTTTAATTTGTTTCTCTGTTGATTACTAGCCCAATGCCTGAGCATCTT 51929542
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1715 CTTTTTGTAGCTCTTTAATTTGTTTCTCTGTTGATTACTAGCCCAATGCCTGAGCATCTT 1774

 51929543 CGTCTTAAGACAAAGCCTCTGTGTTTCTTCAGCTCCTGAAATGACTGGCATGCTGAAAAT 51929602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1775 CGTCTTAAGACAAAGCCTCTGTGTTTCTTCAGCTCCTGAAATGACTGGCATGCTGAAAAT 1834

 51929603 GAGCTCAGGGCATTAGTCTTTGCTACTAAGCCACTACAGATTCCATTCCCTTTCTTCTTG 51929662
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     1835 GAGCTCAGGGCATTAGTCTTTGCTACTAAGCCACTACAGATTCCATTCCCTTTCTTCCTG 1894

 51929663 AGTATGCACACACCGCTTGTTCACAGACTCCAGATTAGTTATTAAGCTACATCTGTATGC 51929722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1895 AGTATGCACACACCGCTTGTTCACAGACTCCAGATTAGTTATTAAGCTACATCTGTATGC 1954

 51929723 AGTTTGCACTCTCCTGCCTTCGACCTGCTTGTCCCAGAAGTTATTCACCATATTCTACCT 51929782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1955 AGTTTGCACTCTCCTGCCTTCGACCTGCTTGTCCCAGAAGTTATTCACCATATTCTACCT 2014

 51929783 TGATCATATTTTCTACTTGTCAATGCGCATGTCAATTAAGAACTTTTAACATTTATTGAC 51929842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2015 TGATCATATTTTCTACTTGTCAATGCGCATGTCAATTAAGAACTTTTAACATTTATTGAC 2074

 51929843 CATTTATTATATACTAGCCAGTCTTTTAATTGATTTATGAACAATTAACTTAATCATCAT 51929902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     2075 CATTTATTATATACTAGCCAGTCTTTTAATTGCTTTATGAACAATTAACTTAATCATCAT 2134

 51929903 ATAAGCATAGTAGGGTACAATTAGTTCCCCAACTTTATATATGAACAAATGGACTTTCAG 51929962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2135 ATAAGCATAGTAGGGTACAATTAGTTCCCCAACTTTATATATGAACAAATGGACTTTCAG 2194

 51929963 AAAGGTAAGGTAAAATATCCACGGTAAGAAAGCCTGCATATGTGGAACTGGGAATTGAAC 51930022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2195 AAAGGTAAGGTAAAATATCCACGGTAAGAAAGCCTGCATATGTGGAACTGGGAATTGAAC 2254

 51930023 CCCTATGTCTGACCCGAGGGTCCATACACTTAAGCATTATGCTATCAAGTTTTCCACAGC 51930082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2255 CCCTATGTCTGACCCGAGGGTCCATACACTTAAGCATTATGCTATCAAGTTTTCCACAGC 2314

 51930083 CTGCTTTTCGGCTTCTCTCTCTTTCTTTCTTTCCTGATCTCTGTTGCAATTCCTACCTTT 51930142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2315 CTGCTTTTCGGCTTCTCTCTCTTTCTTTCTTTCCTGATCTCTGTTGCAATTCCTACCTTT 2374

 51930143 CAACTCCCTTCTGACCATGGATAGTTTGCAAAATGCCAGAGGTACGTCTCAAAGAAGCTT 51930202
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2375 CAACTCCCTTCTGACCATGGACAGTTTGCAAAATGCCAGAGGTACGTCTCAAAGAAGCTT 2434

 51930203 CAAATAGGAGCGTGTACTACCATTAAGTCAGCTCCTCAGTTGTCTTCTTTGGATTGAGAA 51930262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2435 CAAATAGGAGCGTGTACTACCATTAAGTCAGCTCCTCAGTTGTCTTCTTTGGATTGAGAA 2494

 51930263 GCACTTCATCACTTTTTACACAGGTTTAATTATCAAATATGACTTTTCTAGTACTACAGC 51930322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2495 GCACTTCATCACTTTTTACACAGGTTTAATTATCAAATATGACTTTTCTAGTACTACAGC 2554

 51930323 TAATATATGTCAATGTCAAAGGGTTAACAGAATACTAGGCCTATATTAAATTATACATAT 51930382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2555 TAATATATGTCAATGTCAAAGGGTTAACAGAATACTAGGCCTATATTAAATTATACATAT 2614

 51930383 GAGCTTTCTCTTTACTCCTTTTTATGTTCATTAGCAAACAGATAAAGCCATAATAGATTT 51930442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2615 GAGCTTTCTCTTTACTCCTTTTTATGTTCATTAGCAAACAGATAAAGCCATAATAGATTT 2674

 51930443 TTTAAGGAATATTTTGTTTTGTTTTGTTTTGGACTTATACATCTATTAACAATAAACCAA 51930502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2675 TTTAAGGAATATTTTGTTTTGTTTTGTTTTGGACTTATACATCTATTAACAATAAACCAA 2734

 51930503 ACATTGCAGATTAAAGCAAATCTGCCAATCTGTTTTACAAACACTATCTTCTGAAGGGTT 51930562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2735 ACATTGCAGATTAAAGCAAATCTGCCAATCTGTTTTACAAACACTATCTTCTGAAGGGTT 2794

 51930563 CCTGGGCACAAGATACTGTTCTA 51930585
          |||||||||||||||||||||||
     2795 CCTGGGCACAAGATACTGTTCTA 2817

Alignment time is 3.15266 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51916584,51937767] =>     21184 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [       1,   10549] =>     10549 nucs 'mol-32-3240-124387_10549'

Score:       10281
Aligned:     10559        nucs
Identic:     10528 (100%) nucs =>      5672 (100%)      4856 (100%)
Gaps:           12 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51920895,51926584] EXCISED REGION [51927768,51932634]
 second seq =>  [       1,    5682] EXCISED REGION [    5683,   10549]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1183 nucs [51926585,51927767]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [51926585,51926587] to [51927768,51927770]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [51926584,51926584] to [51927768,51927768]
 second seq =>         1 nucs [5682,5682] to [5683,5683]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 51920895 GTTAAAACTGGATATATTATATCCTAAAGTATTTTAATTGGATCAAACTGTTGTTAGTCA 51920954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
        1 GTTAAAACTGGATATATTATATCCTAAAGTATTTTAATTGGAACAAACTGTTGTTAGTCA 60

 51920955 AAATATGTTGAAAGCCAGCAAAGCAGTGGATGACCTCATTTTGCAAATTTCTGCGTTGTG 51921014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAATATGTTGAAAGCCAGCAAAGCAGTGGATGACCTCATTTTGCAAATTTCTGCGTTGTG 120

 51921015 TAAATTTCATGATGCACTGCCAATACTTCATTTAAAATTTATAATATATGATATGTAGAC 51921074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TAAATTTCATGATGCACTGCCAATACTTCATTTAAAATTTATAATATATGATATGTAGAC 180

 51921075 TGAGTTGGGCACTCCTGGGAAATCCATGTATTAAATATTAGTTATGCTATTATTGATTCT 51921134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGAGTTGGGCACTCCTGGGAAATCCATGTATTAAATATTAGTTATGCTATTATTGATTCT 240

 51921135 TTAAAATAATAATAAGGCCAGACTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAAGC 51921194
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
      241 TTAAAATAATAATAAGGCCAGACTCACACCTGTTATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAAGC 300

 51921195 AGGTGGATCATCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAAAATGGTGAAACCCTGT 51921254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGGTGGATCATCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAAAATGGTGAAACCCTGT 360

 51921255 CGCTACTAAAAATACATAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCACACTCCTGTAGTCCCAGCTA 51921314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CGCTACTAAAAATACATAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCACACTCCTGTAGTCCCAGCTA 420

 51921315 CTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCA 51921374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCA 480

 51921375 AGGTTATGCCACTGCATCCCAGCCTGGGCGATAGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAAAATAA 51921434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGGTTATGCCACTGCATCCCAGCCTGGGCGATAGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAAAATAA 540

 51921435 AATTAAATTAAAAATAAATAAATAAATAAATAGAATTAGAAATTCTAACATGTTCTCTCA 51921494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AATTAAATTAAAAATAAATAAATAAATAAATAGAATTAGAAATTCTAACATGTTCTCTCA 600

 51921495 GTACCACAAGAAATTATTTGGAGAACCCACTAGAATACACACTTCTTGCTTGAGGAACCA 51921554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||
      601 GTACCACAAGAAATTATTTGGAGAACCCACTAGAATGCACACATCTTGCTTGAGGAACCA 660

 51921555 CTGGCCTCAGGACATAGGCTTAAAGTAAATCAACAAAAATTAACTACATACATATAAGCA 51921614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTGGCCTCAGGACATAGGCTTAAAGTAAATCAACAAAAATTAACTACATACATATAAGCA 720

 51921615 TATCTTCCTAATTTTTGCATTGCGTGACCTAACTATAATCTATAGCATATCTTTCCATGC 51921674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TATCTTCCTAATTTTTGCATTGCGTGACCTAACTATAATCTATAGCATATCTTTCCATGC 780

 51921675 CCAGATCTATTTCTGAACTGTTATATGACATCTCCACACAGTTCATACTTGCTTTGACTA 51921734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CCAGATCTATTTCTGAACTGTTATATGACATCTCCACACAGTTCATACTTGCTTTGACTA 840

 51921735 TGACCTAAATTCCTAGCCTGTTCCCTGGATAGTTTCTCAGTAGTGCAGGACTATAAATGC 51921794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGACCTAAATTCCTAGCCTGTTCCCTGGATAGTTTCTCAGTAGTGCAGGACTATAAATGC 900

 51921795 ACAGTCACTGTGTGTACAAGTTATATGGGAATATAACAAGTTATGTGTTAATAAAAGTTA 51921854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
      901 ACAGTCACTGTGTGTACAAGTTATATGGGAATATAACAAGTTATGTGTTAATAAAAATTA 960

 51921855 TTTAGAAATAAAACGAAAATTATAAACAATTTGTACTAATACTATATTTTTTCTGTTATA 51921914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTTAGAAATAAAACGAAAATTATAAACAATTTGTACTAATACTATATTTTTTCTGTTATA 1020

 51921915 CAACATAGTGACATGAAAAACAAATATAATAATGGCTTAATTGTAAAGTATATAATAATA 51921974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CAACATAGTGACATGAAAAACAAATATAATAATGGCTTAATTGTAAAGTATATAATAATA 1080

 51921975 GTTTATCTGATTTGACCCTCCATATACTGTATGAGGGCCTTAAACCTCTTTCATGATACT 51922034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GTTTATCTGATTTGACCCTCCATATACTGTATGAGGGCCTTAAACCTCTTTCATGATACT 1140

 51922035 TTCCATCTAATTATGGCTATTGTCAGGGTGTGTCTGATGTATGCCTCAGGAAACATCCTC 51922094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTCCATCTAATTATGGCTATTGTCAGGGTGTGTCTGATGTATGCCTCAGGAAACATCCTC 1200

 51922095 AGTCACCAGCTGGTATTAATAGTTTTGTCTCTCTGTTCTGATTCTTTTCATAATATTTGG 51922154
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AGTCACCAGCTGGTATTAATAGTTTTGTCTATCTGTTCTGATTCTTTTCATAATATTTGG 1260

 51922155 AATTTTGTCTTCCACTACCTGTACAAGGGCAAGGCAACTCATCTGTTACTAAGAGATAAC 51922214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     1261 AATTTTGTCTTCCACTACCTGTACAAGGGCAAGGCAACTCATCTGTTAGTAAGAGATAAC 1320

 51922215 TTGGCCGGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTGTGGGAGGCTGAGGTGGGGG 51922274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTGGCCGGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTGTGGGAGGCTGAGGTGGGGG 1380

 51922275 GATCACTAGGTCAGGAGATCAAGACCATCGTGGCCAACATGGTGAAACCCGTCTCTACTA 51922334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GATCACTAGGTCAGGAGATCAAGACCATCGTGGCCAACATGGTGAAACCCGTCTCTACTA 1440

 51922335 AAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTTGTGGGCACCTGTAATCCCACCTACTCGGGAGG 51922394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTTGTGGGCACCTGTAATCCCACCTACTCGGGAGG 1500

 51922395 CTGAGGCAGGAGAATAGCTTGAACCAGGGAGTTGGAGGTTACAGTGAGCCAAGATCACAC 51922454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CTGAGGCAGGAGAATAGCTTGAACCAGGGAGTTGGAGGTTACAGTGAGCCAAGATCACAC 1560

 51922455 CACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCCATCTCAAAAAAAAGATAGAGTTAA 51922514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCCATCTCAAAAAAAAGATAGAGTTAA 1620

 51922515 CTTGAATTTACTTAAATCATAACTTGGGGGAATTTTACCATTAAATCATTATACAATATT 51922574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CTTGAATTTACTTAAATCATAACTTGGGGGAATTTTACCATTAAATCATTATACAATATT 1680

 51922575 TTTATTACTCTGTTCAGAGTAATATACCAGAGTAAGTACCATTTTATAAGCTTCTATAGT 51922634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTTATTACTCTGTTCAGAGTAATATACCAGAGTAAGTACCATTTTATAAGCTTCTATAGT 1740

 51922635 TCAATGGCATCTCCATGAAACTTATATAAGTAGCTTTTAATTAAAAATTAAAGTTTTTTT 51922694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TCAATGGCATCTCCATGAAACTTATATAAGTAGCTTTTAATTAAAAATTAAAGTTTTTTT 1800

 51922695 CAGAAAGAATTTTTTTGTTAATTGGTCATTATCCATTTATTGATTTCTTATGGCATGTTC 51922754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CAGAAAGAATTTTTTTGTTAATTGGTCATTATCCATTTATTGATTTCTTATGGCATGTTC 1860

 51922755 AGCTTTATTCATAAAATAGGCATCATCTAAAAGAATTGTAAGCATGAATTCCTTTTCAGT 51922814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AGCTTTATTCATAAAATAGGCATCATCTAAAAGAATTGTAAGCATGAATTCCTTTTCAGT 1920

 51922815 GTGTGGGCAGTGTAATTGGAGAGCCAAGAGAAATACAGAGGAAATTACTGATGCCAAAAA 51922874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GTGTGGGCAGTGTAATTGGAGAGCCAAGAGAAATACAGAGGAAATTACTGATGCCAAAAA 1980

 51922875 TACATAAAATGTAATAGAGAAAATAGAATTGGAAACTCTTCTTGGTATACTCTCTTTCTT 51922934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TACATAAAATGTAATAGAGAAAATAGAATTGGAAACTCTTCTTGGTATACTCTCTTTCTT 2040

 51922935 CATACTGAATCACATGGCTCGCTATCAGTTCAAATAGGAATTTTTAAGGAAGTCCTTTAT 51922994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CATACTGAATCACATGGCTCGCTATCAGTTCAAATAGGAATTTTTAAGGAAGTCCTTTAT 2100

 51922995 GGATTTCACCTCACTCCAATGTGTCCACACTCAGTGCTTTCTCAGGATAAAGAAACTCAA 51923054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GGATTTCACCTCACTCCAATGTGTCCACACTCAGTGCTTTCTCAGGATAAAGAAACTCAA 2160

 51923055 TTCTATTACATAATTTTGTAAATTGTTTTCTTTTTCTTTGCCCACCATATTCTCATAAGG 51923114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TTCTATTACATAATTTTGTAAATTGTTTTCTTTTTCTTTGCCCACCATATTCTCATAAGG 2220

 51923115 ACACCTTAAGCTCCTCAAAAGCACAAAACGCAAATTCTATTTCTTTGTCAACCCTCTCTC 51923174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ACACCTTAAGCTCCTCAAAAGCACAAAACGCAAATTCTATTTCTTTGTCAACCCTCTCTC 2280

 51923175 TAGTAAAGTTCTAGGTAAAGAATAAATGCATGACTGATTGTTTTAATGAGCGCTAATGGG 51923234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TAGTAAAGTTCTAGGTAAAGAATAAATGCATGACTGATTGTTTTAATGAGCGCTAATGGG 2340

 51923235 TGTTGTTAAATCCCTTACTATCTGAGGAGATCGTTGCTTATGGCAGCCCCTGTGATTTTA 51923294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TGTTGTTAAATCCCTTACTATCTGAGGAGATCGTTGCTTATGGCAGCCCCTGTGATTTTA 2400

 51923295 AAAGCTCTTCCATGTTGGAATAAAGGCAAAATACAGTGATTTCAAAGAACTGGGGAGAGA 51923354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AAAGCTCTTCCATGTTGGAATAAAGGCAAAATACAGTGATTTCAAAGAACTGGGGAGAGA 2460

 51923355 AATTTTAAGATTTCCTTTTGGGAAAATTTCAGGCAAAAAATTACATCTTATAATCCATTC 51923414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AATTTTAAGATTTCCTTTTGGGAAAATTTCAGGCAAAAAATTACATCTTATAATCCATTC 2520

 51923415 CAGGCTTTTGATTGTATGATTACCCCATTTACAATTGATGTTGAAAATAATATTTTCTCA 51923474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CAGGCTTTTGATTGTATGATTACCCCATTTACAATTGATGTTGAAAATAATATTTTCTCA 2580

 51923475 CTTGCCACAGCCTCTTCTTTGCATTCTCTCACCCTCAGCTATTATATATTAGCTCAGTAC 51923534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CTTGCCACAGCCTCTTCTTTGCATTCTCTCACCCTCAGCTATTATATATTAGCTCAGTAC 2640

 51923535 CTGCATTATTTACAGGAACTGAAAAACAGGGTTGAAGATTATAAAATCTCACATTTGCTG 51923594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CTGCATTATTTACAGGAACTGAAAAACAGGGTTGAAGATTATAAAATCTCACATTTGCTG 2700

 51923595 ACTTTTATGCAGGTTAAATGAAAGAGTTTTATAATTGTTTCTGCCAACCAGTAGGTTCAA 51923654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 ACTTTTATGCAGGTTAAATGAAAGAGTTTTATAATTGTTTCTGCCAACCAGTAGGTTCAA 2760

 51923655 AATGTTTATTAAAAGTGAATTCTGGATAAATTATGATTAATGTCCTTCTGGTTTGTTTTG 51923714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 AATGTTTATTAAAAGTGAATTCTGGATAAATTATGATTAATGTCCTTCTGGTTTGTTTTG 2820

 51923715 CTTGAGCCTACACACACACACACACACACACACACACACACACACACATATACACACACA 51923774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||
     2821 CTTGAGCCTACACACACACACACACACACACACACACACA--------TATACACACACA 2872

 51923775 TATATATATAACTTTATATAAAACTATAAATACTAGGAACTAGCACTAGAACTGTACTTT 51923834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2873 TATATATATAACTTTATATAAAACTATAAATACTAGGAACTAGCACTAGAACTGTACTTT 2932

 51923835 TCACTACAGTATCAGTAAAAAAAAAAAA-TTTAGGATTTTTTATGACTGATTTTACATTT 51923893
          |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
     2933 TCACTACAGTATCAGTAAAAAAAAAAAAATTTAGGATTTTTTATGACTGATTTTACATTT 2992

 51923894 AAACCTAAAGGAAAAATAATCAGGAACAACACAGAGTTTTTTTTTTTAAATGAGTTGGCA 51923953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2993 AAACCTAAAGGAAAAATAATCAGGAACAACACAGAGTTTTTTTTTTTAAATGAGTTGGCA 3052

 51923954 AAGAAAATACCAAAGGCTCAAACCTGACAAAAGCATTGAGAATACCAGAAAAGAAATTTT 51924013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3053 AAGAAAATACCAAAGGCTCAAACCTGACAAAAGCATTGAGAATACCAGAAAAGAAATTTT 3112

 51924014 AACCTTTAAATTTAATTGAAACATGATATTTTTCTCTTTTGAAACATTTCTTTCTCTACA 51924073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3113 AACCTTTAAATTTAATTGAAACATGATATTTTTCTCTTTTGAAACATTTCTTTCTCTACA 3172

 51924074 AAAATCTGTTCCTTCAGAACCTGTTGATGCAATAATATTATATCATTTTTTTTTACTGGT 51924133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3173 AAAATCTGTTCCTTCAGAACCTGTTGATGCAATAATATTATATCATTTTTTTTTACTGGT 3232

 51924134 CAATGTATTTATTTGTAATTGTTCTGAAATTGTTTCCTGCAAGGTTTTCTATTACTCAAA 51924193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3233 CAATGTATTTATTTGTAATTGTTCTGAAATTGTTTCCTGCAAGGTTTTCTATTACTCAAA 3292

 51924194 CTGTCTTTGTACACATAATTTTCCTTTCATGCCATTTATGAACCATTTTTTATTTCTATG 51924253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3293 CTGTCTTTGTACACATAATTTTCCTTTCATGCCATTTATGAACCATTTTTTATTTCTATG 3352

 51924254 GTTGATAGAGAATGACTTCATAATTCATTTCTGAATAAGTGAAATAATTTAAAAACATTT 51924313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3353 GTTGATAGAGAATGACTTCATAATTCATTTCTGAATAAGTGAAATAATTTAAAAACATTT 3412

 51924314 TAAAGTGGGTGTATCTACTTGCTTGGAGCTTTGTCGAATCATGTTTCTTATTTGGAGCCT 51924373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3413 TAAAGTGGGTGTATCTACTTGCTTGGAGCTTTGTCGAATCATGTTTCTTATTTGGAGCCT 3472

 51924374 CTGGAGGAATGTTGACTTACCATGGTAAAAATTAACTGGTGAAACTCTAAAGAAAACACA 51924433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3473 CTGGAGGAATGTTGACTTACCATGGTAAAAATTAACTGGTGAAACTCTAAAGAAAACACA 3532

 51924434 GACTCTACACGCAGTCTTGTCCGAAACTTACTCACCCTGAAACCAATGAATTTCAAAGAC 51924493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3533 GACTCTACACGCAGTCTTGTCCGAAACTTACTCACCCTGAAACCAATGAATTTCAAAGAC 3592

 51924494 CTAGATACTTCCTTCTGTGATGTCCCCTGAGATCAGAGAATAAAAGAAAAATCCCTCGTA 51924553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3593 CTAGATACTTCCTTCTGTGATGTCCCCTGAGATCAGAGAATAAAAGAAAAATCCCTCGTA 3652

 51924554 AATATACATCACGTACAGCTGTTTGATTTATGCATTATGCAGAAACTAAGAAAACAGAGT 51924613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3653 AATATACATCACGTACAGCTGTTTGATTTATGCATTATGCAGAAACTAAGAAAACAGAGT 3712

 51924614 TATATGTAACCTTGCAATGAGAAGTGCACCCACCAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCCCAAA 51924673
          ||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
     3713 TATATGTAACTTTGCAATGAGAAGTGCACCCACCAAAAAAAAAAAAAAAAAA-TCCCAAA 3771

 51924674 ACATTGTTTCAAAAAGAAGTGGTATGAAGCATCTTAGTGTTTCATGAATATTGAAGAATA 51924733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3772 ACATTGTTTCAAAAAGAAGTGGTATGAAGCATCTTAGTGTTTCATGAATATTGAAGAATA 3831

 51924734 GTGCAATTATTGAAATTTGGCATTTAAAAAATGTTTTTAAATTATTAGGAAGCTACCGTG 51924793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3832 GTGCAATTATTGAAATTTGGCATTTAAAAAATGTTTTTAAATTATTAGGAAGCTACCGTG 3891

 51924794 ACCTGTTTACTAAATCCTCAATTCTTTCTCTCTCAGTTTTTCTTACTATAAAATTTACTT 51924853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3892 ACCTGTTTACTAAATCCTCAATTCTTTCTCTCTCAGTTTTTCTTACTATAAAATTTACTT 3951

 51924854 TTCAAGCCAGAGAATTTTTCTTTCTGACAAGACGTAGATCTATATTGCGCTGTCAAGATG 51924913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3952 TTCAAGCCAGAGAATTTTTCTTTCTGACAAGACGTAGATCTATATTGCGCTGTCAAGATG 4011

 51924914 CAGCTTTTGCATCTCTGCTGCCATGTGGATAGAATAACTTTCTTTCCTCAAGAAGTGGAC 51924973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4012 CAGCTTTTGCATCTCTGCTGCCATGTGGATAGAATAACTTTCTTTCCTCAAGAAGTGGAC 4071

 51924974 AAGCCCTCATAGGGACTGATTTTCTGTGAAGTAGTGAGACTTAATCTTTGGGACCTTCAC 51925033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4072 AAGCCCTCATAGGGACTGATTTTCTGTGAAGTAGTGAGACTTAATCTTTGGGACCTTCAC 4131

 51925034 TTACATCACTTACATAGGACCTTTCAATACTCAGGGAGGGCCCTTGGCAATAAGTTCTTC 51925093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4132 TTACATCACTTACATAGGACCTTTCAATACTCAGGGAGGGCCCTTGGCAATAAGTTCTTC 4191

 51925094 TGACAATATATCTTGTGCTGATGGTGGTGTTAGCTTTCAAAATTTGTAATTATTTTGGTA 51925153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4192 TGACAATATATCTTGTGCTGATGGTGGTGTTAGCTTTCAAAATTTGTAATTATTTTGGTA 4251

 51925154 ATTTCTGTCATCCTAGAAAAATGTGTATAGTGTATTTGTTCCTAATTTCATTTTCATTAT 51925213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4252 ATTTCTGTCATCCTAGAAAAATGTGTATAGTGTATTTGTTCCTAATTTCATTTTCATTAT 4311

 51925214 TTATATATTTTTTAATGAACACCCCCAGCATAGTATAAGTTTTATACCTCTACAATCTGA 51925273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4312 TTATATATTTTTTAATGAACACCCCCAGCATAGTATAAGTTTTATACCTCTACAATCTGA 4371

 51925274 ATCACCCGCTTGGCCCATGCCTAGGACTAGGTCTTATCATCCGCAGTGAGAGATTATAGG 51925333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4372 ATCACCCGCTTGGCCCATGCCTAGGACTAGGTCTTATCATCCGCAGTGAGAGATTATAGG 4431

 51925334 CTCTTACTAGGAATTTATGGTAACATGGGCTCCTAACAGTCATGATTTTTATAACATGAT 51925393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4432 CTCTTACTAGGAATTTATGGTAACATGGGCTCCTAACAGTCATGATTTTTATAACATGAT 4491

 51925394 TGCCTATGTATATAAAGTCCACTGGCTGAACAAGTATTTTCCCTCAAATCAGGAAGGAAA 51925453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4492 TGCCTATGTATATAAAGTCCACTGGCTGAACAAGTATTTTCCCTCAAATCAGGAAGGAAA 4551

 51925454 AAAAAAAACACGAAGCAAATTGATCCTCTTCTAAAAGCTGTCACATCAGTAACCCATCAT 51925513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4552 AAAAAAAACACGAAGCAAATTGATCCTCTTCTAAAAGCTGTCACATCAGTAACCCATCAT 4611

 51925514 ATTCTCATTTACTTATATACTGAGTAGGTAGTCACCTTTGATTCATATCTCTCAGGAGTT 51925573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4612 ATTCTCATTTACTTATATACTGAGTAGGTAGTCACCTTTGATTCATATCTCTCAGGAGTT 4671

 51925574 CAGAAGTTTTTGAAAGTAATTTGTGATACAAAATATAGGGAAATTCAGAATGAGATTCTT 51925633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4672 CAGAAGTTTTTGAAAGTAATTTGTGATACAAAATATAGGGAAATTCAGAATGAGATTCTT 4731

 51925634 TTGGCTTGTCTTTCTTTTTCTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTATTTGTTGAACTCAAATC 51925693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4732 TTGGCTTGTCTTTCTTTTTCTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTATTTGTTGAACTCAAATC 4791

 51925694 CGGAAATTGTGGAGGTTACTAGAACTCTAAGTCACAGACTTATAAGTACTGAAAAAGTAG 51925753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4792 CGGAAATTGTGGAGGTTACTAGAACTCTAAGTCACAGACTTATAAGTACTGAAAAAGTAG 4851

 51925754 TCAGTAAAGAAAACATACAGTAAGAGACTAGGTTAATTTTCCTATAGTTCATTGATGTTT 51925813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4852 TCAGTAAAGAAAACATACAGTAAGAGACTAGGTTAATTTTCCTATAGTTCATTGATGTTT 4911

 51925814 CCACTATTACTGCCCCTGATTTTTAACTTTAGTTTTCCTTAGATTGTTGGAGTAATATAT 51925873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4912 CCACTATTACTGCCCCTGATTTTTAACTTTAGTTTTCCTTAGATTGTTGGAGTAATATAT 4971

 51925874 GTACCTTAAAAATTAACTGTGGAACAAGTAGATGAACTTTTTACACAATTTCCTGCTTTT 51925933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4972 GTACCTTAAAAATTAACTGTGGAACAAGTAGATGAACTTTTTACACAATTTCCTGCTTTT 5031

 51925934 ATAAAGTTCCTACTAGCTATATTTTCCCAAAAGTGCTCAACAATAGAGTCTGGTGCTAAA 51925993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5032 ATAAAGTTCCTACTAGCTATATTTTCCCAAAAGTGCTCAACAATAGAGTCTGGTGCTAAA 5091

 51925994 AAGCAGAGTAGGCTAAATTTAGATCAATGTGAAATGCCCTACTTATTTCCTATGAACTTA 51926053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5092 AAGCAGAGTAGGCTAAATTTAGATCAATGTGAAATGCCCTACTTATTTCCTATGAACTTA 5151

 51926054 ATTGATTGAGCTCATTTTGGGGGTGTCTTTCTGATCGACCAGAAACTTGGCTCATTAGAG 51926113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5152 ATTGATTGAGCTCATTTTGGGGGTGTCTTTCTGATCGACCAGAAACTTGGCTCATTAGAG 5211

 51926114 CAACTCACAAAGTGACCTTTTAAAAGAAAGAGTTTTCAATATATTTGTTCATGTTCCATT 51926173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5212 CAACTCACAAAGTGACCTTTTAAAAGAAAGAGTTTTCAATATATTTGTTCATGTTCCATT 5271

 51926174 CCACTGAGAATGGTGCTATTTAAAACTAAATACAATAATTTTAGATATTGTACAGCAGAT 51926233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5272 CCACTGAGAATGGTGCTATTTAAAACTAAATACAATAATTTTAGATATTGTACAGCAGAT 5331

 51926234 ATAATTTTAAACATAATACATGGGATTTCGATTTTAGGTACTGTTTATAAGGCATTTCTC 51926293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5332 ATAATTTTAAACATAATACATGGGATTTCGATTTTAGGTACTGTTTATAAGGCATTTCTC 5391

 51926294 CTTATATTATTCTAGACTTAAATATAACAAATTTCATGCAGAGGTTTCTTTCAAAAGTAA 51926353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5392 CTTATATTATTCTAGACTTAAATATAACAAATTTCATGCAGAGGTTTCTTTCAAAAGTAA 5451

 51926354 ATTCAGCCACATTTAGACTCAAATATTCCCTAATTTTTTAGTGTAGCTGAAGTCCTAATA 51926413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5452 ATTCAGCCACATTTAGACTCAAATATTCCCTAATTTTTTAGTGTAGCTGAAGTCCTAATA 5511

 51926414 ATATACTTGTGTTTCTTTTAAATTAAGTCCCACATGTTAACTTTACAACAGAAAGTCCAT 51926473
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     5512 ATATACTTGTGTTTCTTTTAAATTAAGTCCCACATGTTAACTTTACAGCAGAAAGTCCAT 5571

 51926474 GTATCGTATTATTAGTCTAAATCTTCATTTTACTGTTTAGTTAACACAGACATTCATTTA 51926533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5572 GTATCGTATTATTAGTCTAAATCTTCATTTTACTGTTTAGTTAACACAGACATTCATTTA 5631

 51926534 ACACACTATGTTTAATTTCCCACTCAGTTTTGGCTTATTGTAGTCTAATAA 51926584
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5632 ACACACTATGTTTAATTTCCCACTCAGTTTTGGCTTATTGTAGTCTAATAA 5682

EXCISED REGION

 51927768 ACATATAGTAAGTTGTCCATAAGTATTTGCTGGTAGATTTATTTATTTTTTAAAAAAACA 51927827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5683 ACATATAGTAAGTTGTCCATAAGTATTTGCTGGTAGATTTATTTATTTTTTAAAAAAACA 5742

 51927828 ACTTGGAAAGTTTTCTGTGTGCTTTTATATTAGAACTTGACCTTTGAAGTACCTCCAGGA 51927887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5743 ACTTGGAAAGTTTTCTGTGTGCTTTTATATTAGAACTTGACCTTTGAAGTACCTCCAGGA 5802

 51927888 AATTTTGAAGAGTGCTGGCATATGACAATGCGTAAGTTTATATTTCATGTCCATGCATGC 51927947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5803 AATTTTGAAGAGTGCTGGCATATGACAATGCGTAAGTTTATATTTCATGTCCATGCATGC 5862

 51927948 CATTAAAATTCTAATAATGTAGTTGACAGAGCCTTTCTTGTCCCTTAAGCACTAAATTTG 51928007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5863 CATTAAAATTCTAATAATGTAGTTGACAGAGCCTTTCTTGTCCCTTAAGCACTAAATTTG 5922

 51928008 TGGCTTGCTCTAGATTGTCCCACCTGGCACAAGCGAGGTGAAATTTCAGGTCTAGCCAAC 51928067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     5923 TGGCTTGCTCTAGATTGTCCCACCTGGCACAAGCTAGGTGAAATTTCAGGTCTAGCCAAC 5982

 51928068 TTTTTTCTTTTTTTTTTTTTAACAAGTATTAAAAACATTTTCATATATATTCCCTGTATT 51928127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5983 TTTTTTCTTTTTTTTTTTTTAACAAGTATTAAAAACATTTTCATATATATTCCCTGTATT 6042

 51928128 ATTTCACCTATTTTTGTGTGTGTGTTTCTATCACACTGCCACATCAAAAACCTCTTCTTG 51928187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6043 ATTTCACCTATTTTTGTGTGTGTGTTTCTATCACACTGCCACATCAAAAACCTCTTCTTG 6102

 51928188 AACGACTATAGTATAGTGGTTAATAGTTCAGTGTCTAGATCAAGACCACCTATGGACGTA 51928247
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6103 AACGACTATAGTATAGTGATTAATAGTTCAGTGTCTAGATCAAGACCACCTATGGACGTA 6162

 51928248 TCTTGGCTCTGATTTTACCAGCCGTACAATCCTGGAGAATCTGTTCAAGAGAAATGTGCC 51928307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6163 TCTTGGCTCTGATTTTACCAGCCGTACAATCCTGGAGAATCTGTTCAAGAGAAATGTGCC 6222

 51928308 TCAATTACGTATCTCTAAAGTAGTTGTAGCTATAGAACCTGTTCCATAGATGTGGATCAG 51928367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6223 TCAATTACGTATCTCTAAAGTAGTTGTAGCTATAGAACCTGTTCCATAGATGTGGATCAG 6282

 51928368 AACACTGCATGACATTTAGAAAATGTTTAATAAATGATGTTGCTGTACTTGTTGCTGTTA 51928427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6283 AACACTGCATGACATTTAGAAAATGTTTAATAAATGATGTTGCTGTACTTGTTGCTGTTA 6342

 51928428 TTGTTGCTCTGTCATGTTAGGAGAACTCTCATTTACCCTAGTGTTCTCTCAAAGTGAAAT 51928487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6343 TTGTTGCTCTGTCATGTTAGGAGAACTCTCATTTACCCTAGTGTTCTCTCAAAGTGAAAT 6402

 51928488 ACAGATCATTACCTCTTGAAATCATGTCCAAGTAACTTCAGAATTATTTAGAAATCATTT 51928547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6403 ACAGATCATTACCTCTTGAAATCATGTCCAAGTAACTTCAGAATTATTTAGAAATCATTT 6462

 51928548 ATCTAAATCAGAGTATTTCTTGATATAATTTAAAGTTGATTGTATTTGAAAGTACATATG 51928607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6463 ATCTAAATCAGAGTATTTCTTGATATAATTTAAAGTTGATTGTATTTGAAAGTACATATG 6522

 51928608 TCAATCTAGTATGAGATAATCTCAAGGAAATAAAAATGTATAGGTCTAATTTACATTTTT 51928667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6523 TCAATCTAGTATGAGATAATCTCAAGGAAATAAAAATGTATAGGTCTAATTTACATTTTT 6582

 51928668 ATATGGAAGGAGATAATTACTTTCTATCACAAATGATGAAGGCTGACGTTTGTTTCTTTT 51928727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6583 ATATGGAAGGAGATAATTACTTTCTATCACAAATGATGAAGGCTGACGTTTGTTTCTTTT 6642

 51928728 TTACTTTTAATTTTCACTTATATTTTGTTTATTATCAATATTTGCTTTTTAAAAGGTGGG 51928787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6643 TTACTTTTAATTTTCACTTATATTTTGTTTATTATCAATATTTGCTTTTTAAAAGGTGGG 6702

 51928788 AAGAAATCAACCAATCAAACATTAAAAAGCAATATGGAGGAGGGTGATATAATGCCCACT 51928847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6703 AAGAAATCAACCAATCAAACATTAAAAAGCAATATGGAGGAGGGTGATATAATGCCCACT 6762

 51928848 TATATTTCTCTTATAATTTTAAATATTTTCATAATTAACAGAATAATTAGCACTGGTAAT 51928907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6763 TATATTTCTCTTATAATTTTAAATATTTTCATAATTAACAGAATAATTAGCACTGGTAAT 6822

 51928908 ATTAAAATACCATCAAAAGAATCTAAATGTATGTGCTTTCTGTTGCAGCCTTGTTAGATG 51928967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6823 ATTAAAATACCATCAAAAGAATCTAAATGTATGTGCTTTCTGTTGCAGCCTTGTTAGATG 6882

 51928968 TTTCAGTGGATTCAAAGTGTTGTTATAAGAAAACGTGATTTATCAAGACTTTCATGTGTA 51929027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6883 TTTCAGTGGATTCAAAGTGTTGTTATAAGAAAACGTGATTTATCAAGACTTTCATGTGTA 6942

 51929028 AAATAAAAGGCATTTTCAATGACTACTTGGCCAGGCTTTCAGATTCCAATGCCAAGATGT 51929087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6943 AAATAAAAGGCATTTTCAATGACTACTTGGCCAGGCTTTCAGATTCCAATGCCAAGATGT 7002

 51929088 TGTATTTTGATATTGCAGTTTTCTAACAACAACAAAGTTGAGTGGACTTCTGGAACTAAA 51929147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7003 TGTATTTTGATATTGCAGTTTTCTAACAACAACAAAGTTGAGTGGACTTCTGGAACTAAA 7062

 51929148 ACTTAAATATTCAGAACTAATTATCACCACTCTATTTCTTACAGAGCATTTAAGGAACAC 51929207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7063 ACTTAAATATTCAGAACTAATTATCACCACTCTATTTCTTACAGAGCATTTAAGGAACAC 7122

 51929208 ATATATGCATATATCCTTGCACTTTGTGCTACAGGTTGTGAGCCAGGGTTACTTCCTTCT 51929267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7123 ATATATGCATATATCCTTGCACTTTGTGCTACAGGTTGTGAGCCAGGGTTACTTCCTTCT 7182

 51929268 GACCATGTGGGTTCATAATGAAGACCCAACCTTAAGGTACCCAGGGCTTAGAAATCAAAT 51929327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7183 GACCATGTGGGTTCATAATGAAGACCCAACCTTAAGGTACCCAGGGCTTAGAAATCAAAT 7242

 51929328 TTGTCCTTAGGACACTTTGGAAATCTATCTTGTAGTACAGGTGACCCAGCAGCAATCAAT 51929387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7243 TTGTCCTTAGGACACTTTGGAAATCTATCTTGTAGTACAGGTGACCCAGCAGCAATCAAT 7302

 51929388 CTTTCTGCCATCCCTAGTTTTAGTTCAGGACCCAGAAAAGTTGTAACTTGTTTCCTTTCC 51929447
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7303 CTTTCTGCCATCCCTAGTTTTACTTCAGGACCCAGAAAAGTTGTAACTTGTTTCCTTTCC 7362

 51929448 TGTGATCAAGCCTTTGTTTTCTCTTTTTTTCTCCACTTTTTGTAGCTTTTTAATTTGTTT 51929507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7363 TGTGATCAAGCCTTTGTTTTCTCTTTTTTTCTCCACTTTTTGTAGCTTTTTAATTTGTTT 7422

 51929508 CTCTGTTGATTACTAGCCCAATGCCTGAGCATCTTCGTCTTAAGACAAAGCCTCTGTGTT 51929567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7423 CTCTGTTGATTACTAGCCCAATGCCTGAGCATCTTCGTCTTAAGACAAAGCCTCTGTGTT 7482

 51929568 TCTTCAGCTCCTGAAATGACTGGCATGCTGAAAATGAGCTCAGGGCATTAGTCTTTGCTA 51929627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7483 TCTTCAGCTCCTGAAATGACTGGCATGCTGAAAATGAGCTCAGGGCATTAGTCTTTGCTA 7542

 51929628 CTAAGCCACTACAGATTCCATTCCCTTTCTTCTTGAGTATGCACACACCGCTTGTTCACA 51929687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     7543 CTAAGCCACTACAGATTCCATTCCCTTTCTTCCTGAGTATGCACACACCGCTTGTTCACA 7602

 51929688 GACTCCAGATTAGTTATTAAGCTACATCTGTATGCAGTTTGCACTCTCCTGCCTTCGACC 51929747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7603 GACTCCAGATTAGTTATTAAGCTACATCTGTATGCAGTTTGCACTCTCCTGCCTTCGACC 7662

 51929748 TGCTTGTCCCAGAAGTTATTCACCATATTCTACCTTGATCATATTTTCTACTTGTCAATG 51929807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7663 TGCTTGTCCCAGAAGTTATTCACCATATTCTACCTTGATCATATTTTCTACTTGTCAATG 7722

 51929808 CGCATGTCAATTAAGAACTTTTAACATTTATTGACCATTTATTATATACTAGCCAGTCTT 51929867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7723 CGCATGTCAATTAAGAACTTTTAACATTTATTGACCATTTATTATATACTAGCCAGTCTT 7782

 51929868 TTAATTGATTTATGAACAATTAACTTAATCATCATATAAGCATAGTAGGGTACAATTAGT 51929927
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7783 TTAATTGCTTTATGAACAATTAACTTAATCATCATATAAGCATAGTAGGGTACAATTAGT 7842

 51929928 TCCCCAACTTTATATATGAACAAATGGACTTTCAGAAAGGTAAGGTAAAATATCCACGGT 51929987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7843 TCCCCAACTTTATATATGAACAAATGGACTTTCAGAAAGGTAAGGTAAAATATCCACGGT 7902

 51929988 AAGAAAGCCTGCATATGTGGAACTGGGAATTGAACCCCTATGTCTGACCCGAGGGTCCAT 51930047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7903 AAGAAAGCCTGCATATGTGGAACTGGGAATTGAACCCCTATGTCTGACCCGAGGGTCCAT 7962

 51930048 ACACTTAAGCATTATGCTATCAAGTTTTCCACAGCCTGCTTTTCGGCTTCTCTCTCTTTC 51930107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7963 ACACTTAAGCATTATGCTATCAAGTTTTCCACAGCCTGCTTTTCGGCTTCTCTCTCTTTC 8022

 51930108 TTTCTTTCCTGATCTCTGTTGCAATTCCTACCTTTCAACTCCCTTCTGACCATGGATAGT 51930167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     8023 TTTCTTTCCTGATCTCTGTTGCAATTCCTACCTTTCAACTCCCTTCTGACCATGGACAGT 8082

 51930168 TTGCAAAATGCCAGAGGTACGTCTCAAAGAAGCTTCAAATAGGAGCGTGTACTACCATTA 51930227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8083 TTGCAAAATGCCAGAGGTACGTCTCAAAGAAGCTTCAAATAGGAGCGTGTACTACCATTA 8142

 51930228 AGTCAGCTCCTCAGTTGTCTTCTTTGGATTGAGAAGCACTTCATCACTTTTTACACAGGT 51930287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8143 AGTCAGCTCCTCAGTTGTCTTCTTTGGATTGAGAAGCACTTCATCACTTTTTACACAGGT 8202

 51930288 TTAATTATCAAATATGACTTTTCTAGTACTACAGCTAATATATGTCAATGTCAAAGGGTT 51930347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8203 TTAATTATCAAATATGACTTTTCTAGTACTACAGCTAATATATGTCAATGTCAAAGGGTT 8262

 51930348 AACAGAATACTAGGCCTATATTAAATTATACATATGAGCTTTCTCTTTACTCCTTTTTAT 51930407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8263 AACAGAATACTAGGCCTATATTAAATTATACATATGAGCTTTCTCTTTACTCCTTTTTAT 8322

 51930408 GTTCATTAGCAAACAGATAAAGCCATAATAGATTTTTTAAGGAATATTTTGTTTTGTTTT 51930467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8323 GTTCATTAGCAAACAGATAAAGCCATAATAGATTTTTTAAGGAATATTTTGTTTTGTTTT 8382

 51930468 GTTTTGGACTTATACATCTATTAACAATAAACCAAACATTGCAGATTAAAGCAAATCTGC 51930527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8383 GTTTTGGACTTATACATCTATTAACAATAAACCAAACATTGCAGATTAAAGCAAATCTGC 8442

 51930528 CAATCTGTTTTACAAACACTATCTTCTGAAGGGTTCCTGGGCACAAGATACTGTTCTAGT 51930587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8443 CAATCTGTTTTACAAACACTATCTTCTGAAGGGTTCCTGGGCACAAGATACTGTTCTAGT 8502

 51930588 AATATTTCACAGC-TTTTTTTTTTTTTTCATTTTAGAGAAAATATTCTAAGACTCCAAAG 51930646
          ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8503 AATATTTCACAGCTTTTTTTTTTTTTTTCATTTTAGAGAAAATATTCTAAGACTCCAAAG 8562

 51930647 TTCGATAGTATTTGGTCAGTGTCTTAGTCAGTTTGAGCTAATATAACAAATTATCATAGA 51930706
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8563 TTAGATAGTATTTGGTCAGTGTCTTAGTCAGTTTGAGCTAATATAACAAATTATCATAGA 8622

 51930707 ATAAGTGTCTCAAGCAACAGAAATGTATTTTTTACAATCTGGAGGCTGCAAAGTCCAGAA 51930766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8623 ATAAGTGTCTCAAGCAACAGAAATGTATTTTTTACAATCTGGAGGCTGCAAAGTCCAGAA 8682

 51930767 TCAAGATGCTGGCAGATCTGGTGTCTGATGAGGACCCACCTTCTTATTTGCAAATGATCA 51930826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8683 TCAAGATGCTGGCAGATCTGGTGTCTGATGAGGACCCACCTTCTTATTTGCAAATGATCA 8742

 51930827 TTTTTGTTGTGTCCTCACATGACAAAGAGCAGAGAGAGCAAGCACTCTTGTGTCTCTTCT 51930886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
     8743 TTTTTGTTGTGTCCTCACATGACAAAGAGCAGAGAGAGCAAGCACTCTTGTGTCTCTTC- 8801

 51930887 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCCGGCTCTTTAGCCCAGGCCGGATTGCAGTG 51930946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8802 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCCGGCTCTTTAGCCCAGGCCGGATTGCAGTG 8861

 51930947 GCACAATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCAAGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAG 51931006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8862 GCACAATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCAAGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAG 8921

 51931007 CCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTTGTATTT 51931066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8922 CCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTTGTATTT 8981

 51931067 TTAGTAGAGATGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAAGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGA 51931126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8982 TTAGTAGAGATGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAAGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGA 9041

 51931127 TCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGTGTCTCTTCTTATAC 51931186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9042 TCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGTGTCTCTTCTTATAC 9101

 51931187 AGGCACCAATTTCATCAAGAAAGTTCCACCTTCATGTCCTAATTAACTCTCAAATGCCCC 51931246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9102 AGGCACCAATTTCATCAAGAAAGTTCCACCTTCATGTCCTAATTAACTCTCAAATGCCCC 9161

 51931247 ATCTCTAAATACCGCCACATTCGGGGATTAGGATTTCAACATATGCATTTTGGTGGGATA 51931306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9162 ATCTCTAAATACCGCCACATTCGGGGATTAGGATTTCAACATATGCATTTTGGTGGGATA 9221

 51931307 CAAACATACAGTTCATAGCCACCAATACCTTTGTTGTATTTTCACAAAAATGATGTCTAA 51931366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9222 CAAACATACAGTTCATAGCCACCAATACCTTTGTTGTATTTTCACAAAAATGATGTCTAA 9281

 51931367 ACAATAAATGTTCAATTACTCATGCAATCTTAAACAAAGGGTTACTATTAGGAAAATGAG 51931426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9282 ACAATAAATGTTCAATTACTCATGCAATCTTAAACAAAGGGTTACTATTAGGAAAATGAG 9341

 51931427 TTAATTCCTTAGAAATTTTTCTTTTGGAGATTATTGGAGATGTGAGGTGATGAAGTGTAA 51931486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9342 TTAATTCCTTAGAAATTTTTCTTTTGGAGATTATTGGAGATGTGAGGTGATGAAGTGTAA 9401

 51931487 GTGACTTGGTGTTATTAAGAAGGACACCCCTGCAGGAGATAACATCCCTTAGTTCTAGTA 51931546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     9402 GTGACTTGGTGTTATTAAGAAGGACACCCCTGCAGGAGATAATATCCCTTAGTTCTAGTA 9461

 51931547 TCTATTCTATCAAAAATCCTTTAGTTCTATTATTCTGTCATTGACAGAACAATTGTCTCT 51931606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9462 TCTATTCTATCAAAAATCCTTTAGTTCTATTATTCTGTCATTGACAGAACAATTGTCTCT 9521

 51931607 AATATCATCAAAGTTCTTTAACAACTATGAAATGTGACAATAGAACTAAATAATTTCAGA 51931666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9522 AATATCATCAAAGTTCTTTAACAACTATGAAATGTGACAATAGAACTAAATAATTTCAGA 9581

 51931667 ATGCTTTTCCAGGACCAAATTATATTTTCTTGATAGCATAAATAGCAGAGAACAATTTTA 51931726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9582 ATGCTTTTCCAGGACCAAATTATATTTTCTTGATAGCATAAATAGCAGAGAACAATTTTA 9641

 51931727 ATTATAACACATAGTCAATATTGTTTTGTTCTTTGTTAGGAAAAATGTTGACTATTAACA 51931786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9642 ATTATAACACATAGTCAATATTGTTTTGTTCTTTGTTAGGAAAAATGTTGACTATTAACA 9701

 51931787 TGACTTCTCTGTACTTGCCTTAGGAATGTTTCTAAATGAAATATGCCTCATGTTGGTATT 51931846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9702 TGACTTCTCTGTACTTGCCTTAGGAATGTTTCTAAATGAAATATGCCTCATGTTGGTATT 9761

 51931847 TAAATATCTTTATCAATTATTTTATTTCAAAAGCAAGAACTTGTGTCCTTACTCTTCAGA 51931906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9762 TAAATATCTTTATCAATTATTTTATTTCAAAAGCAAGAACTTGTGTCCTTACTCTTCAGA 9821

 51931907 AAGTTTTATGTTTTCAATTTAATCTCCTACTGCTTAATATTTTCAGATAAAATGCTCACT 51931966
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     9822 AAGTTTTATGTTTTCAATTTAATCTCCTACTGCTTAATATTTTCAGATAAAATGCTCCCT 9881

 51931967 GGCTTTAGAAATCATTCATTAAATACAGGGGACAAGAAGTGGCATTAGAGGGCAGATTGT 51932026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9882 GGCTTTAGAAATCATTCATTAAATACAGGGGACAAGAAGTGGCATTAGAGGGCAGATTGT 9941

 51932027 GTTGTGATTGTTTTACTTTTGATTTCTTCTTTTAGCCTCCTAAGAAAGACTCTGTAGCCC 51932086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9942 GTTGTGATTGTTTTACTTTTGATTTCTTCTTTTAGCCTCCTAAGAAAGACTCTGTAGCCC 10001

 51932087 ATGGCTTCTGTTAATACTATATAGCAGGAGTCAGTTTTTGCATTATTGGTGTTAGTGATG 51932146
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
    10002 ATGGCTTCTGTTAATACTATATAGCAGGAGTCAGTTTTTGCATCATTGGTGTTAGTGATG 10061

 51932147 AGTGATACATCTGACAAAGGTTAGGATGCTTTTAGAACCATTTGACAGCAATGACCGCTG 51932206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10062 AGTGATACATCTGACAAAGGTTAGGATGCTTTTAGAACCATTTGACAGCAATGACCGCTG 10121

 51932207 AAGATAGAAGTGGTTTTCCACTAATTTTTCTGGAAATAGAGCAGTGATATCTTTGTTCAG 51932266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10122 AAGATAGAAGTGGTTTTCCACTAATTTTTCTGGAAATAGAGCAGTGATATCTTTGTTCAG 10181

 51932267 GAGTTTACATTTGACTTAGAAGGCCTTTATCCCATTTGCGTCTGTCAATAGTTTACTTAT 51932326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10182 GAGTTTACATTTGACTTAGAAGGCCTTTATCCCATTTGCGTCTGTCAATAGTTTACTTAT 10241

 51932327 TTTCTGAAATGCTGTATAAATAGTATTCTTTCCCTTTAAAATTTCTCCAGTTGGAATTAA 51932386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10242 TTTCTGAAATGCTGTATAAATAGTATTCTTTCCCTTTAAAATTTCTCCAGTTGGAATTAA 10301

 51932387 AATCTTTTTTTGTGTGTGGGATTAAAGGGAAAAAAAACTATAACAGCCATTCAATTGTAG 51932446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10302 AATCTTTTTTTGTGTGTGGGATTAAAGGGAAAAAAAACTATAACAGCCATTCAATTGTAG 10361

 51932447 TCCTATGAGAGTAAATTCTGTAATATATTTTTGACTTATGCTTGTATAAATTCTTATCTT 51932506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10362 TCCTATGAGAGTAAATTCTGTAATATATTTTTGACTTATGCTTGTATAAATTCTTATCTT 10421

 51932507 GTCTCTGCTTGTCAGTAAAGGAGGGCTGACAGCAGGAGTCATAGATTGATGGATTCTATA 51932566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10422 GTCTCTGCTTGTCAGTAAAGGAGGGCTGACAGCAGGAGTCATAGATTGATGGATTCTATA 10481

 51932567 CCCCCAAAATGCCTAGAGCAGTGCAATTAGTATGATGTTAACTTGTTCAGTATGAGTTAG 51932626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10482 CCCCCAAAATGCCTAGAGCAGTGCAATTAGTATGATGTTAACTTGTTCAGTATGAGTTAG 10541

 51932627 ATTGGATT 51932634
          ||||||||
    10542 ATTGGATT 10549

Alignment time is 8.29399 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51916584,51937767] =>     21184 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [       1,    4867] =>      4867 nucs 'mol-32-3240-124387_4867'

Score:        4746
Aligned:      4867        nucs
Identic:      4856 (100%) nucs =>       274 (100%)      4582 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51927768,51928041] EXCISED REGION [51928043,51932634]
 second seq =>  [       1,     274] EXCISED REGION [     276,    4867]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [51928042,51928042]
 second seq =>         1 nucs [275,275]
ALTERNATIVE REGION(S): 2
 first  seq =>         1 nucs [51930886,51930886]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 51927768 ACATATAGTAAGTTGTCCATAAGTATTTGCTGGTAGATTTATTTATTTTTTAAAAAAACA 51927827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACATATAGTAAGTTGTCCATAAGTATTTGCTGGTAGATTTATTTATTTTTTAAAAAAACA 60

 51927828 ACTTGGAAAGTTTTCTGTGTGCTTTTATATTAGAACTTGACCTTTGAAGTACCTCCAGGA 51927887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACTTGGAAAGTTTTCTGTGTGCTTTTATATTAGAACTTGACCTTTGAAGTACCTCCAGGA 120

 51927888 AATTTTGAAGAGTGCTGGCATATGACAATGCGTAAGTTTATATTTCATGTCCATGCATGC 51927947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AATTTTGAAGAGTGCTGGCATATGACAATGCGTAAGTTTATATTTCATGTCCATGCATGC 180

 51927948 CATTAAAATTCTAATAATGTAGTTGACAGAGCCTTTCTTGTCCCTTAAGCACTAAATTTG 51928007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CATTAAAATTCTAATAATGTAGTTGACAGAGCCTTTCTTGTCCCTTAAGCACTAAATTTG 240

 51928008 TGGCTTGCTCTAGATTGTCCCACCTGGCACAAGC 51928041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGGCTTGCTCTAGATTGTCCCACCTGGCACAAGC 274

EXCISED REGION

 51928043 AGGTGAAATTTCAGGTCTAGCCAACTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTAACAAGTATTAAAAA 51928102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      276 AGGTGAAATTTCAGGTCTAGCCAACTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTAACAAGTATTAAAAA 335

 51928103 CATTTTCATATATATTCCCTGTATTATTTCACCTATTTTTGTGTGTGTGTTTCTATCACA 51928162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      336 CATTTTCATATATATTCCCTGTATTATTTCACCTATTTTTGTGTGTGTGTTTCTATCACA 395

 51928163 CTGCCACATCAAAAACCTCTTCTTGAACGACTATAGTATAGTGGTTAATAGTTCAGTGTC 51928222
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
      396 CTGCCACATCAAAAACCTCTTCTTGAACGACTATAGTATAGTGATTAATAGTTCAGTGTC 455

 51928223 TAGATCAAGACCACCTATGGACGTATCTTGGCTCTGATTTTACCAGCCGTACAATCCTGG 51928282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      456 TAGATCAAGACCACCTATGGACGTATCTTGGCTCTGATTTTACCAGCCGTACAATCCTGG 515

 51928283 AGAATCTGTTCAAGAGAAATGTGCCTCAATTACGTATCTCTAAAGTAGTTGTAGCTATAG 51928342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      516 AGAATCTGTTCAAGAGAAATGTGCCTCAATTACGTATCTCTAAAGTAGTTGTAGCTATAG 575

 51928343 AACCTGTTCCATAGATGTGGATCAGAACACTGCATGACATTTAGAAAATGTTTAATAAAT 51928402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      576 AACCTGTTCCATAGATGTGGATCAGAACACTGCATGACATTTAGAAAATGTTTAATAAAT 635

 51928403 GATGTTGCTGTACTTGTTGCTGTTATTGTTGCTCTGTCATGTTAGGAGAACTCTCATTTA 51928462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      636 GATGTTGCTGTACTTGTTGCTGTTATTGTTGCTCTGTCATGTTAGGAGAACTCTCATTTA 695

 51928463 CCCTAGTGTTCTCTCAAAGTGAAATACAGATCATTACCTCTTGAAATCATGTCCAAGTAA 51928522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      696 CCCTAGTGTTCTCTCAAAGTGAAATACAGATCATTACCTCTTGAAATCATGTCCAAGTAA 755

 51928523 CTTCAGAATTATTTAGAAATCATTTATCTAAATCAGAGTATTTCTTGATATAATTTAAAG 51928582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      756 CTTCAGAATTATTTAGAAATCATTTATCTAAATCAGAGTATTTCTTGATATAATTTAAAG 815

 51928583 TTGATTGTATTTGAAAGTACATATGTCAATCTAGTATGAGATAATCTCAAGGAAATAAAA 51928642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      816 TTGATTGTATTTGAAAGTACATATGTCAATCTAGTATGAGATAATCTCAAGGAAATAAAA 875

 51928643 ATGTATAGGTCTAATTTACATTTTTATATGGAAGGAGATAATTACTTTCTATCACAAATG 51928702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      876 ATGTATAGGTCTAATTTACATTTTTATATGGAAGGAGATAATTACTTTCTATCACAAATG 935

 51928703 ATGAAGGCTGACGTTTGTTTCTTTTTTACTTTTAATTTTCACTTATATTTTGTTTATTAT 51928762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      936 ATGAAGGCTGACGTTTGTTTCTTTTTTACTTTTAATTTTCACTTATATTTTGTTTATTAT 995

 51928763 CAATATTTGCTTTTTAAAAGGTGGGAAGAAATCAACCAATCAAACATTAAAAAGCAATAT 51928822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      996 CAATATTTGCTTTTTAAAAGGTGGGAAGAAATCAACCAATCAAACATTAAAAAGCAATAT 1055

 51928823 GGAGGAGGGTGATATAATGCCCACTTATATTTCTCTTATAATTTTAAATATTTTCATAAT 51928882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1056 GGAGGAGGGTGATATAATGCCCACTTATATTTCTCTTATAATTTTAAATATTTTCATAAT 1115

 51928883 TAACAGAATAATTAGCACTGGTAATATTAAAATACCATCAAAAGAATCTAAATGTATGTG 51928942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1116 TAACAGAATAATTAGCACTGGTAATATTAAAATACCATCAAAAGAATCTAAATGTATGTG 1175

 51928943 CTTTCTGTTGCAGCCTTGTTAGATGTTTCAGTGGATTCAAAGTGTTGTTATAAGAAAACG 51929002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1176 CTTTCTGTTGCAGCCTTGTTAGATGTTTCAGTGGATTCAAAGTGTTGTTATAAGAAAACG 1235

 51929003 TGATTTATCAAGACTTTCATGTGTAAAATAAAAGGCATTTTCAATGACTACTTGGCCAGG 51929062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1236 TGATTTATCAAGACTTTCATGTGTAAAATAAAAGGCATTTTCAATGACTACTTGGCCAGG 1295

 51929063 CTTTCAGATTCCAATGCCAAGATGTTGTATTTTGATATTGCAGTTTTCTAACAACAACAA 51929122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1296 CTTTCAGATTCCAATGCCAAGATGTTGTATTTTGATATTGCAGTTTTCTAACAACAACAA 1355

 51929123 AGTTGAGTGGACTTCTGGAACTAAAACTTAAATATTCAGAACTAATTATCACCACTCTAT 51929182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1356 AGTTGAGTGGACTTCTGGAACTAAAACTTAAATATTCAGAACTAATTATCACCACTCTAT 1415

 51929183 TTCTTACAGAGCATTTAAGGAACACATATATGCATATATCCTTGCACTTTGTGCTACAGG 51929242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1416 TTCTTACAGAGCATTTAAGGAACACATATATGCATATATCCTTGCACTTTGTGCTACAGG 1475

 51929243 TTGTGAGCCAGGGTTACTTCCTTCTGACCATGTGGGTTCATAATGAAGACCCAACCTTAA 51929302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1476 TTGTGAGCCAGGGTTACTTCCTTCTGACCATGTGGGTTCATAATGAAGACCCAACCTTAA 1535

 51929303 GGTACCCAGGGCTTAGAAATCAAATTTGTCCTTAGGACACTTTGGAAATCTATCTTGTAG 51929362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1536 GGTACCCAGGGCTTAGAAATCAAATTTGTCCTTAGGACACTTTGGAAATCTATCTTGTAG 1595

 51929363 TACAGGTGACCCAGCAGCAATCAATCTTTCTGCCATCCCTAGTTTTAGTTCAGGACCCAG 51929422
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     1596 TACAGGTGACCCAGCAGCAATCAATCTTTCTGCCATCCCTAGTTTTACTTCAGGACCCAG 1655

 51929423 AAAAGTTGTAACTTGTTTCCTTTCCTGTGATCAAGCCTTTGTTTTCTCTTTTTTTCTCCA 51929482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1656 AAAAGTTGTAACTTGTTTCCTTTCCTGTGATCAAGCCTTTGTTTTCTCTTTTTTTCTCCA 1715

 51929483 CTTTTTGTAGCTTTTTAATTTGTTTCTCTGTTGATTACTAGCCCAATGCCTGAGCATCTT 51929542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1716 CTTTTTGTAGCTTTTTAATTTGTTTCTCTGTTGATTACTAGCCCAATGCCTGAGCATCTT 1775

 51929543 CGTCTTAAGACAAAGCCTCTGTGTTTCTTCAGCTCCTGAAATGACTGGCATGCTGAAAAT 51929602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1776 CGTCTTAAGACAAAGCCTCTGTGTTTCTTCAGCTCCTGAAATGACTGGCATGCTGAAAAT 1835

 51929603 GAGCTCAGGGCATTAGTCTTTGCTACTAAGCCACTACAGATTCCATTCCCTTTCTTCTTG 51929662
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     1836 GAGCTCAGGGCATTAGTCTTTGCTACTAAGCCACTACAGATTCCATTCCCTTTCTTCCTG 1895

 51929663 AGTATGCACACACCGCTTGTTCACAGACTCCAGATTAGTTATTAAGCTACATCTGTATGC 51929722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1896 AGTATGCACACACCGCTTGTTCACAGACTCCAGATTAGTTATTAAGCTACATCTGTATGC 1955

 51929723 AGTTTGCACTCTCCTGCCTTCGACCTGCTTGTCCCAGAAGTTATTCACCATATTCTACCT 51929782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1956 AGTTTGCACTCTCCTGCCTTCGACCTGCTTGTCCCAGAAGTTATTCACCATATTCTACCT 2015

 51929783 TGATCATATTTTCTACTTGTCAATGCGCATGTCAATTAAGAACTTTTAACATTTATTGAC 51929842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2016 TGATCATATTTTCTACTTGTCAATGCGCATGTCAATTAAGAACTTTTAACATTTATTGAC 2075

 51929843 CATTTATTATATACTAGCCAGTCTTTTAATTGATTTATGAACAATTAACTTAATCATCAT 51929902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     2076 CATTTATTATATACTAGCCAGTCTTTTAATTGCTTTATGAACAATTAACTTAATCATCAT 2135

 51929903 ATAAGCATAGTAGGGTACAATTAGTTCCCCAACTTTATATATGAACAAATGGACTTTCAG 51929962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2136 ATAAGCATAGTAGGGTACAATTAGTTCCCCAACTTTATATATGAACAAATGGACTTTCAG 2195

 51929963 AAAGGTAAGGTAAAATATCCACGGTAAGAAAGCCTGCATATGTGGAACTGGGAATTGAAC 51930022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2196 AAAGGTAAGGTAAAATATCCACGGTAAGAAAGCCTGCATATGTGGAACTGGGAATTGAAC 2255

 51930023 CCCTATGTCTGACCCGAGGGTCCATACACTTAAGCATTATGCTATCAAGTTTTCCACAGC 51930082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2256 CCCTATGTCTGACCCGAGGGTCCATACACTTAAGCATTATGCTATCAAGTTTTCCACAGC 2315

 51930083 CTGCTTTTCGGCTTCTCTCTCTTTCTTTCTTTCCTGATCTCTGTTGCAATTCCTACCTTT 51930142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2316 CTGCTTTTCGGCTTCTCTCTCTTTCTTTCTTTCCTGATCTCTGTTGCAATTCCTACCTTT 2375

 51930143 CAACTCCCTTCTGACCATGGATAGTTTGCAAAATGCCAGAGGTACGTCTCAAAGAAGCTT 51930202
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2376 CAACTCCCTTCTGACCATGGACAGTTTGCAAAATGCCAGAGGTACGTCTCAAAGAAGCTT 2435

 51930203 CAAATAGGAGCGTGTACTACCATTAAGTCAGCTCCTCAGTTGTCTTCTTTGGATTGAGAA 51930262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2436 CAAATAGGAGCGTGTACTACCATTAAGTCAGCTCCTCAGTTGTCTTCTTTGGATTGAGAA 2495

 51930263 GCACTTCATCACTTTTTACACAGGTTTAATTATCAAATATGACTTTTCTAGTACTACAGC 51930322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2496 GCACTTCATCACTTTTTACACAGGTTTAATTATCAAATATGACTTTTCTAGTACTACAGC 2555

 51930323 TAATATATGTCAATGTCAAAGGGTTAACAGAATACTAGGCCTATATTAAATTATACATAT 51930382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2556 TAATATATGTCAATGTCAAAGGGTTAACAGAATACTAGGCCTATATTAAATTATACATAT 2615

 51930383 GAGCTTTCTCTTTACTCCTTTTTATGTTCATTAGCAAACAGATAAAGCCATAATAGATTT 51930442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2616 GAGCTTTCTCTTTACTCCTTTTTATGTTCATTAGCAAACAGATAAAGCCATAATAGATTT 2675

 51930443 TTTAAGGAATATTTTGTTTTGTTTTGTTTTGGACTTATACATCTATTAACAATAAACCAA 51930502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2676 TTTAAGGAATATTTTGTTTTGTTTTGTTTTGGACTTATACATCTATTAACAATAAACCAA 2735

 51930503 ACATTGCAGATTAAAGCAAATCTGCCAATCTGTTTTACAAACACTATCTTCTGAAGGGTT 51930562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2736 ACATTGCAGATTAAAGCAAATCTGCCAATCTGTTTTACAAACACTATCTTCTGAAGGGTT 2795

 51930563 CCTGGGCACAAGATACTGTTCTAGTAATATTTCACAGC-TTTTTTTTTTTTTTCATTTTA 51930621
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
     2796 CCTGGGCACAAGATACTGTTCTAGTAATATTTCACAGCTTTTTTTTTTTTTTTCATTTTA 2855

 51930622 GAGAAAATATTCTAAGACTCCAAAGTTCGATAGTATTTGGTCAGTGTCTTAGTCAGTTTG 51930681
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     2856 GAGAAAATATTCTAAGACTCCAAAGTTAGATAGTATTTGGTCAGTGTCTTAGTCAGTTTG 2915

 51930682 AGCTAATATAACAAATTATCATAGAATAAGTGTCTCAAGCAACAGAAATGTATTTTTTAC 51930741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2916 AGCTAATATAACAAATTATCATAGAATAAGTGTCTCAAGCAACAGAAATGTATTTTTTAC 2975

 51930742 AATCTGGAGGCTGCAAAGTCCAGAATCAAGATGCTGGCAGATCTGGTGTCTGATGAGGAC 51930801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2976 AATCTGGAGGCTGCAAAGTCCAGAATCAAGATGCTGGCAGATCTGGTGTCTGATGAGGAC 3035

 51930802 CCACCTTCTTATTTGCAAATGATCATTTTTGTTGTGTCCTCACATGACAAAGAGCAGAGA 51930861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3036 CCACCTTCTTATTTGCAAATGATCATTTTTGTTGTGTCCTCACATGACAAAGAGCAGAGA 3095

 51930862 GAGCAAGCACTCTTGTGTCTCTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCCGGCT 51930921
          |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3096 GAGCAAGCACTCTTGTGTCTCTTC-TTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCCGGCT 3154

 51930922 CTTTAGCCCAGGCCGGATTGCAGTGGCACAATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCA 51930981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3155 CTTTAGCCCAGGCCGGATTGCAGTGGCACAATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCA 3214

 51930982 AGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCAC 51931041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3215 AGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCAC 3274

 51931042 CACGCCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAAGA 51931101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3275 CACGCCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAAGA 3334

 51931102 TGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTA 51931161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3335 TGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTA 3394

 51931162 CAGGCGTGAGTGTCTCTTCTTATACAGGCACCAATTTCATCAAGAAAGTTCCACCTTCAT 51931221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3395 CAGGCGTGAGTGTCTCTTCTTATACAGGCACCAATTTCATCAAGAAAGTTCCACCTTCAT 3454

 51931222 GTCCTAATTAACTCTCAAATGCCCCATCTCTAAATACCGCCACATTCGGGGATTAGGATT 51931281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3455 GTCCTAATTAACTCTCAAATGCCCCATCTCTAAATACCGCCACATTCGGGGATTAGGATT 3514

 51931282 TCAACATATGCATTTTGGTGGGATACAAACATACAGTTCATAGCCACCAATACCTTTGTT 51931341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3515 TCAACATATGCATTTTGGTGGGATACAAACATACAGTTCATAGCCACCAATACCTTTGTT 3574

 51931342 GTATTTTCACAAAAATGATGTCTAAACAATAAATGTTCAATTACTCATGCAATCTTAAAC 51931401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3575 GTATTTTCACAAAAATGATGTCTAAACAATAAATGTTCAATTACTCATGCAATCTTAAAC 3634

 51931402 AAAGGGTTACTATTAGGAAAATGAGTTAATTCCTTAGAAATTTTTCTTTTGGAGATTATT 51931461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3635 AAAGGGTTACTATTAGGAAAATGAGTTAATTCCTTAGAAATTTTTCTTTTGGAGATTATT 3694

 51931462 GGAGATGTGAGGTGATGAAGTGTAAGTGACTTGGTGTTATTAAGAAGGACACCCCTGCAG 51931521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3695 GGAGATGTGAGGTGATGAAGTGTAAGTGACTTGGTGTTATTAAGAAGGACACCCCTGCAG 3754

 51931522 GAGATAACATCCCTTAGTTCTAGTATCTATTCTATCAAAAATCCTTTAGTTCTATTATTC 51931581
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3755 GAGATAATATCCCTTAGTTCTAGTATCTATTCTATCAAAAATCCTTTAGTTCTATTATTC 3814

 51931582 TGTCATTGACAGAACAATTGTCTCTAATATCATCAAAGTTCTTTAACAACTATGAAATGT 51931641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3815 TGTCATTGACAGAACAATTGTCTCTAATATCATCAAAGTTCTTTAACAACTATGAAATGT 3874

 51931642 GACAATAGAACTAAATAATTTCAGAATGCTTTTCCAGGACCAAATTATATTTTCTTGATA 51931701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3875 GACAATAGAACTAAATAATTTCAGAATGCTTTTCCAGGACCAAATTATATTTTCTTGATA 3934

 51931702 GCATAAATAGCAGAGAACAATTTTAATTATAACACATAGTCAATATTGTTTTGTTCTTTG 51931761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3935 GCATAAATAGCAGAGAACAATTTTAATTATAACACATAGTCAATATTGTTTTGTTCTTTG 3994

 51931762 TTAGGAAAAATGTTGACTATTAACATGACTTCTCTGTACTTGCCTTAGGAATGTTTCTAA 51931821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3995 TTAGGAAAAATGTTGACTATTAACATGACTTCTCTGTACTTGCCTTAGGAATGTTTCTAA 4054

 51931822 ATGAAATATGCCTCATGTTGGTATTTAAATATCTTTATCAATTATTTTATTTCAAAAGCA 51931881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4055 ATGAAATATGCCTCATGTTGGTATTTAAATATCTTTATCAATTATTTTATTTCAAAAGCA 4114

 51931882 AGAACTTGTGTCCTTACTCTTCAGAAAGTTTTATGTTTTCAATTTAATCTCCTACTGCTT 51931941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4115 AGAACTTGTGTCCTTACTCTTCAGAAAGTTTTATGTTTTCAATTTAATCTCCTACTGCTT 4174

 51931942 AATATTTTCAGATAAAATGCTCACTGGCTTTAGAAATCATTCATTAAATACAGGGGACAA 51932001
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4175 AATATTTTCAGATAAAATGCTCCCTGGCTTTAGAAATCATTCATTAAATACAGGGGACAA 4234

 51932002 GAAGTGGCATTAGAGGGCAGATTGTGTTGTGATTGTTTTACTTTTGATTTCTTCTTTTAG 51932061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4235 GAAGTGGCATTAGAGGGCAGATTGTGTTGTGATTGTTTTACTTTTGATTTCTTCTTTTAG 4294

 51932062 CCTCCTAAGAAAGACTCTGTAGCCCATGGCTTCTGTTAATACTATATAGCAGGAGTCAGT 51932121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4295 CCTCCTAAGAAAGACTCTGTAGCCCATGGCTTCTGTTAATACTATATAGCAGGAGTCAGT 4354

 51932122 TTTTGCATTATTGGTGTTAGTGATGAGTGATACATCTGACAAAGGTTAGGATGCTTTTAG 51932181
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4355 TTTTGCATCATTGGTGTTAGTGATGAGTGATACATCTGACAAAGGTTAGGATGCTTTTAG 4414

 51932182 AACCATTTGACAGCAATGACCGCTGAAGATAGAAGTGGTTTTCCACTAATTTTTCTGGAA 51932241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4415 AACCATTTGACAGCAATGACCGCTGAAGATAGAAGTGGTTTTCCACTAATTTTTCTGGAA 4474

 51932242 ATAGAGCAGTGATATCTTTGTTCAGGAGTTTACATTTGACTTAGAAGGCCTTTATCCCAT 51932301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4475 ATAGAGCAGTGATATCTTTGTTCAGGAGTTTACATTTGACTTAGAAGGCCTTTATCCCAT 4534

 51932302 TTGCGTCTGTCAATAGTTTACTTATTTTCTGAAATGCTGTATAAATAGTATTCTTTCCCT 51932361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4535 TTGCGTCTGTCAATAGTTTACTTATTTTCTGAAATGCTGTATAAATAGTATTCTTTCCCT 4594

 51932362 TTAAAATTTCTCCAGTTGGAATTAAAATCTTTTTTTGTGTGTGGGATTAAAGGGAAAAAA 51932421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4595 TTAAAATTTCTCCAGTTGGAATTAAAATCTTTTTTTGTGTGTGGGATTAAAGGGAAAAAA 4654

 51932422 AACTATAACAGCCATTCAATTGTAGTCCTATGAGAGTAAATTCTGTAATATATTTTTGAC 51932481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4655 AACTATAACAGCCATTCAATTGTAGTCCTATGAGAGTAAATTCTGTAATATATTTTTGAC 4714

 51932482 TTATGCTTGTATAAATTCTTATCTTGTCTCTGCTTGTCAGTAAAGGAGGGCTGACAGCAG 51932541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4715 TTATGCTTGTATAAATTCTTATCTTGTCTCTGCTTGTCAGTAAAGGAGGGCTGACAGCAG 4774

 51932542 GAGTCATAGATTGATGGATTCTATACCCCCAAAATGCCTAGAGCAGTGCAATTAGTATGA 51932601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4775 GAGTCATAGATTGATGGATTCTATACCCCCAAAATGCCTAGAGCAGTGCAATTAGTATGA 4834

 51932602 TGTTAACTTGTTCAGTATGAGTTAGATTGGATT 51932634
          |||||||||||||||||||||||||||||||||
     4835 TGTTAACTTGTTCAGTATGAGTTAGATTGGATT 4867

Alignment time is 4.7617 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51916584,51937767] =>     21184 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [       1,    5092] =>      5092 nucs 'mol-32-32f0-075516_5092'

Score:        4983
Aligned:      5093        nucs
Identic:      5083 (100%) nucs =>      1907 (100%)      3176 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51924677,51926584] EXCISED REGION [51927768,51930951]
 second seq =>  [       1,    1908] EXCISED REGION [    1909,    5092]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1183 nucs [51926585,51927767]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [51926585,51926587] to [51927768,51927770]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [51926584,51926584] to [51927768,51927768]
 second seq =>         1 nucs [1908,1908] to [1909,1909]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 51924677 TTGTTTCAAAAAGAAGTGGTATGAAGCATCTTAGTGTTTCATGAATATTGAAGAATAGTG 51924736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTGTTTCAAAAAGAAGTGGTATGAAGCATCTTAGTGTTTCATGAATATTGAAGAATAGTG 60

 51924737 CAATTATTGAAATTTGGCATTTAAAAAATGTTTTTAAATTATTAGGAAGCTACCGTGACC 51924796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAATTATTGAAATTTGGCATTTAAAAAATGTTTTTAAATTATTAGGAAGCTACCGTGACC 120

 51924797 TGTTTACTAAATCCTCAATTCTTTCTCTCTCAGTTTTTCTTACTATAAAATTTACTTTTC 51924856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGTTTACTAAATCCTCAATTCTTTCTCTCTCAGTTTTTCTTACTATAAAATTTACTTTTC 180

 51924857 AAGCCAGAGAATTTTTCTTTCTGACAAGACGTAGATCTATATTGCGCTGTCAAGATGCAG 51924916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAGCCAGAGAATTTTTCTTTCTGACAAGACGTAGATCTATATTGCGCTGTCAAGATGCAG 240

 51924917 CTTTTGCATCTCTGCTGCCATGTGGATAGAATAACTTTCTTTCCTCAAGAAGTGGACAAG 51924976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTTTTGCATCTCTGCTGCCATGTGGATAGAATAACTTTCTTTCCTCAAGAAGTGGACAAG 300

 51924977 CCCTCATAGGGACTGATTTTCTGTGAAGTAGTGAGACTTAATCTTTGGGACCTTCACTTA 51925036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCCTCATAGGGACTGATTTTCTGTGAAGTAGTGAGACTTAATCTTTGGGACCTTCACTTA 360

 51925037 CATCACTTACATAGGACCTTTCAATACTCAGGGAGGGCCCTTGGCAATAAGTTCTTCTGA 51925096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CATCACTTACATAGGACCTTTCAATACTCAGGGAGGGCCCTTGGCAATAAGTTCTTCTGA 420

 51925097 CAATATATCTTGTGCTGATGGTGGTGTTAGCTTTCAAAATTTGTAATTATTTTGGTAATT 51925156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CAATATATCTTGTGCTGATGGTGGTGTTAGCTTTCAAAATTTGTAATTATTTTGGTAATT 480

 51925157 TCTGTCATCCTAGAAAAATGTGTATAGTGTATTTGTTCCTAATTTCATTTTCATTATTTA 51925216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCTGTCATCCTAGAAAAATGTGTATAGTGTATTTGTTCCTAATTTCATTTTCATTATTTA 540

 51925217 TATATTTTTTAATGAACACCCCCAGCATAGTATAAGTTTTATACCTCTACAATCTGAATC 51925276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TATATTTTTTAATGAACACCCCCAGCATAGTATAAGTTTTATACCTCTACAATCTGAATC 600

 51925277 ACCCGCTTGGCCCATGCCTAGGACTAGGTCTTATCATCCGCAGTGAGAGATTATAGGCTC 51925336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ACCCGCTTGGCCCATGCCTAGGACTAGGTCTTATCATCCGCAGTGAGAGATTATAGGCTC 660

 51925337 TTACTAGGAATTTATGGTAACATGGGCTCCTAACAGTCATGATTTTTATAACATGATTGC 51925396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTACTAGGAATTTATGGTAACATGGGCTCCTAACAGTCATGATTTTTATAACATGATTGC 720

 51925397 CTATGTATATAAAGTCCACTGGCTGAACAAGTATTTTCCCTCAAATCAGGAAGGAAAAAA 51925456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTATGTATATAAAGTCCACTGGCTGAACAAGTATTTTCCCTCAAATCAGGAAGGAAAAAA 780

 51925457 AAAAACACGAAGCAAATTGATCCTCTTCTAAAAGCTGTCACATCAGTAACCCATCATATT 51925516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAAAACACGAAGCAAATTGATCCTCTTCTAAAAGCTGTCACATCAGTAACCCATCATATT 840

 51925517 CTCATTTACTTATATACTGAGTAGGTAGTCACCTTTGATTCATATCTCTCAGGAGTTCAG 51925576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTCATTTACTTATATACTGAGTAGGTAGTCACCTTTGATTCATATCTCTCAGGAGTTCAG 900

 51925577 AAGTTTTTGAAAGTAATTTGTGATACAAAATATAGGGAAATTCAGAATGAGATTCTTTTG 51925636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AAGTTTTTGAAAGTAATTTGTGATACAAAATATAGGGAAATTCAGAATGAGATTCTTTTG 960

 51925637 GCTTGTCTTTCTTTTTCTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTATTTGTTGAACTCAAATCCGG 51925696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GCTTGTCTTTCTTTTTCTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTATTTGTTGAACTCAAATCCGG 1020

 51925697 AAATTGTGGAGGTTACTAGAACTCTAAGTCACAGACTTATAAGTACTGAAAAAGTAGTCA 51925756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AAATTGTGGAGGTTACTAGAACTCTAAGTCACAGACTTATAAGTACTGAAAAAGTAGTCA 1080

 51925757 GTAAAGAAAACATACAGTAAGAGACTAGGTTAATTTTCCTATAGTTCATTGATGTTTCCA 51925816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GTAAAGAAAACATACAGTAAGAGACTAGGTTAATTTTCCTATAGTTCATTGATGTTTCCA 1140

 51925817 CTATTACTGCCCCTGATTTTTAACTTTAGTTTTCCTTAGATTGTTGGAGTAATATATGTA 51925876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTATTACTGCCCCTGATTTTTAACTTTAGTTTTCCTTAGATTGTTGGAGTAATATATGTA 1200

 51925877 CCTTAAAAATTAACTGTGGAACAAGTAGATGAACTTTTTACACAATTTCCTGCTTTTATA 51925936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CCTTAAAAATTAACTGTGGAACAAGTAGATGAACTTTTTACACAATTTCCTGCTTTTATA 1260

 51925937 AAGTTCCTACTAGCTATATTTTCCCAAAAGTGCTCAACAATAGAGTCTGGTGCTAAAAAG 51925996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AAGTTCCTACTAGCTATATTTTCCCAAAAGTGCTCAACAATAGAGTCTGGTGCTAAAAAG 1320

 51925997 CAGAGTAGGCTAAATTTAGATCAATGTGAAATGCCCTACTTATTTCCTATGAACTTAATT 51926056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CAGAGTAGGCTAAATTTAGATCAATGTGAAATGCCCTACTTATTTCCTATGAACTTAATT 1380

 51926057 GATTGAGCTCATTTTGGGGGTGTCTTTCTGATCGACCAGAAACTTGGCTCATTAGAGCAA 51926116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GATTGAGCTCATTTTGGGGGTGTCTTTCTGATCGACCAGAAACTTGGCTCATTAGAGCAA 1440

 51926117 CTCACAAAGTGACCTTTTAAAAGAAAGAGTTTTCAATATATTTGTTCATGTTCCATTCCA 51926176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTCACAAAGTGACCTTTTAAAAGAAAGAGTTTTCAATATATTTGTTCATGTTCCATTCCA 1500

 51926177 CTGAGAATGGTGCTATTTAAAACTAAATACAATAATTTTAGATATTGTACAGCAGATATA 51926236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CTGAGAATGGTGCTATTTAAAACTAAATACAATAATTTTAGATATTGTACAGCAGATATA 1560

 51926237 ATTTTAAACATAATACATGGGATTTCGATTTTAGGTACTGTTTATAAGGCATTTCTCCTT 51926296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ATTTTAAACATAATACATGGGATTTCGATTTTAGGTACTGTTTATAAGGCATTTCTCCTT 1620

 51926297 ATATTATTCTAGACTTAAATATAACAAATTTCATGCAGAGGTTTCTTTCAAAAGTAAATT 51926356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ATATTATTCTAGACTTAAATATAACAAATTTCATGCAGAGGTTTCTTTCAAAAGTAAATT 1680

 51926357 CAGCCACATTTAGACTCAAATATTCCCTAATTTTTTAGTGTAGCTGAAGTCCTAATAATA 51926416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CAGCCACATTTAGACTCAAATATTCCCTAATTTTTTAGTGTAGCTGAAGTCCTAATAATA 1740

 51926417 TACTTGTGTTTCTTTTAAATTAAGTCCCACATGTTAACTTTACAACAGAAAGTCCATGTA 51926476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     1741 TACTTGTGTTTCTTTTAAATTAAGTCCCACATGTTAACTTTACAGCAGAAAGTCCATGTA 1800

 51926477 TCGTATTATTAGTCTAAATCTTCATTTTACTGTTTAGTTAACACAGACATTCATTTAACA 51926536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TCGTATTATTAGTCTAAATCTTCATTTTACTGTTTAGTTAACACAGACATTCATTTAACA 1860

 51926537 CACTATGTTTAATTTCCCACTCAGTTTTGGCTTATTGTAGTCTAATAA 51926584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CACTATGTTTAATTTCCCACTCAGTTTTGGCTTATTGTAGTCTAATAA 1908

EXCISED REGION

 51927768 ACATATAGTAAGTTGTCCATAAGTATTTGCTGGTAGATTTATTTATTTTTTAAAAAAACA 51927827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1909 ACATATAGTAAGTTGTCCATAAGTATTTGCTGGTAGATTTATTTATTTTTTAAAAAAACA 1968

 51927828 ACTTGGAAAGTTTTCTGTGTGCTTTTATATTAGAACTTGACCTTTGAAGTACCTCCAGGA 51927887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1969 ACTTGGAAAGTTTTCTGTGTGCTTTTATATTAGAACTTGACCTTTGAAGTACCTCCAGGA 2028

 51927888 AATTTTGAAGAGTGCTGGCATATGACAATGCGTAAGTTTATATTTCATGTCCATGCATGC 51927947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2029 AATTTTGAAGAGTGCTGGCATATGACAATGCGTAAGTTTATATTTCATGTCCATGCATGC 2088

 51927948 CATTAAAATTCTAATAATGTAGTTGACAGAGCCTTTCTTGTCCCTTAAGCACTAAATTTG 51928007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2089 CATTAAAATTCTAATAATGTAGTTGACAGAGCCTTTCTTGTCCCTTAAGCACTAAATTTG 2148

 51928008 TGGCTTGCTCTAGATTGTCCCACCTGGCACAAGCGAGGTGAAATTTCAGGTCTAGCCAAC 51928067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     2149 TGGCTTGCTCTAGATTGTCCCACCTGGCACAAGCTAGGTGAAATTTCAGGTCTAGCCAAC 2208

 51928068 TTTTTTCTTTTTTTTTTTTTAACAAGTATTAAAAACATTTTCATATATATTCCCTGTATT 51928127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2209 TTTTTTCTTTTTTTTTTTTTAACAAGTATTAAAAACATTTTCATATATATTCCCTGTATT 2268

 51928128 ATTTCACCTATTTTTGTGTGTGTGTTTCTATCACACTGCCACATCAAAAACCTCTTCTTG 51928187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2269 ATTTCACCTATTTTTGTGTGTGTGTTTCTATCACACTGCCACATCAAAAACCTCTTCTTG 2328

 51928188 AACGACTATAGTATAGTGGTTAATAGTTCAGTGTCTAGATCAAGACCACCTATGGACGTA 51928247
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2329 AACGACTATAGTATAGTGATTAATAGTTCAGTGTCTAGATCAAGACCACCTATGGACGTA 2388

 51928248 TCTTGGCTCTGATTTTACCAGCCGTACAATCCTGGAGAATCTGTTCAAGAGAAATGTGCC 51928307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2389 TCTTGGCTCTGATTTTACCAGCCGTACAATCCTGGAGAATCTGTTCAAGAGAAATGTGCC 2448

 51928308 TCAATTACGTATCTCTAAAGTAGTTGTAGCTATAGAACCTGTTCCATAGATGTGGATCAG 51928367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2449 TCAATTACGTATCTCTAAAGTAGTTGTAGCTATAGAACCTGTTCCATAGATGTGGATCAG 2508

 51928368 AACACTGCATGACATTTAGAAAATGTTTAATAAATGATGTTGCTGTACTTGTTGCTGTTA 51928427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2509 AACACTGCATGACATTTAGAAAATGTTTAATAAATGATGTTGCTGTACTTGTTGCTGTTA 2568

 51928428 TTGTTGCTCTGTCATGTTAGGAGAACTCTCATTTACCCTAGTGTTCTCTCAAAGTGAAAT 51928487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2569 TTGTTGCTCTGTCATGTTAGGAGAACTCTCATTTACCCTAGTGTTCTCTCAAAGTGAAAT 2628

 51928488 ACAGATCATTACCTCTTGAAATCATGTCCAAGTAACTTCAGAATTATTTAGAAATCATTT 51928547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2629 ACAGATCATTACCTCTTGAAATCATGTCCAAGTAACTTCAGAATTATTTAGAAATCATTT 2688

 51928548 ATCTAAATCAGAGTATTTCTTGATATAATTTAAAGTTGATTGTATTTGAAAGTACATATG 51928607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2689 ATCTAAATCAGAGTATTTCTTGATATAATTTAAAGTTGATTGTATTTGAAAGTACATATG 2748

 51928608 TCAATCTAGTATGAGATAATCTCAAGGAAATAAAAATGTATAGGTCTAATTTACATTTTT 51928667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2749 TCAATCTAGTATGAGATAATCTCAAGGAAATAAAAATGTATAGGTCTAATTTACATTTTT 2808

 51928668 ATATGGAAGGAGATAATTACTTTCTATCACAAATGATGAAGGCTGACGTTTGTTTCTTTT 51928727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2809 ATATGGAAGGAGATAATTACTTTCTATCACAAATGATGAAGGCTGACGTTTGTTTCTTTT 2868

 51928728 TTACTTTTAATTTTCACTTATATTTTGTTTATTATCAATATTTGCTTTTTAAAAGGTGGG 51928787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2869 TTACTTTTAATTTTCACTTATATTTTGTTTATTATCAATATTTGCTTTTTAAAAGGTGGG 2928

 51928788 AAGAAATCAACCAATCAAACATTAAAAAGCAATATGGAGGAGGGTGATATAATGCCCACT 51928847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2929 AAGAAATCAACCAATCAAACATTAAAAAGCAATATGGAGGAGGGTGATATAATGCCCACT 2988

 51928848 TATATTTCTCTTATAATTTTAAATATTTTCATAATTAACAGAATAATTAGCACTGGTAAT 51928907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2989 TATATTTCTCTTATAATTTTAAATATTTTCATAATTAACAGAATAATTAGCACTGGTAAT 3048

 51928908 ATTAAAATACCATCAAAAGAATCTAAATGTATGTGCTTTCTGTTGCAGCCTTGTTAGATG 51928967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3049 ATTAAAATACCATCAAAAGAATCTAAATGTATGTGCTTTCTGTTGCAGCCTTGTTAGATG 3108

 51928968 TTTCAGTGGATTCAAAGTGTTGTTATAAGAAAACGTGATTTATCAAGACTTTCATGTGTA 51929027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3109 TTTCAGTGGATTCAAAGTGTTGTTATAAGAAAACGTGATTTATCAAGACTTTCATGTGTA 3168

 51929028 AAATAAAAGGCATTTTCAATGACTACTTGGCCAGGCTTTCAGATTCCAATGCCAAGATGT 51929087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3169 AAATAAAAGGCATTTTCAATGACTACTTGGCCAGGCTTTCAGATTCCAATGCCAAGATGT 3228

 51929088 TGTATTTTGATATTGCAGTTTTCTAACAACAACAAAGTTGAGTGGACTTCTGGAACTAAA 51929147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3229 TGTATTTTGATATTGCAGTTTTCTAACAACAACAAAGTTGAGTGGACTTCTGGAACTAAA 3288

 51929148 ACTTAAATATTCAGAACTAATTATCACCACTCTATTTCTTACAGAGCATTTAAGGAACAC 51929207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3289 ACTTAAATATTCAGAACTAATTATCACCACTCTATTTCTTACAGAGCATTTAAGGAACAC 3348

 51929208 ATATATGCATATATCCTTGCACTTTGTGCTACAGGTTGTGAGCCAGGGTTACTTCCTTCT 51929267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3349 ATATATGCATATATCCTTGCACTTTGTGCTACAGGTTGTGAGCCAGGGTTACTTCCTTCT 3408

 51929268 GACCATGTGGGTTCATAATGAAGACCCAACCTTAAGGTACCCAGGGCTTAGAAATCAAAT 51929327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3409 GACCATGTGGGTTCATAATGAAGACCCAACCTTAAGGTACCCAGGGCTTAGAAATCAAAT 3468

 51929328 TTGTCCTTAGGACACTTTGGAAATCTATCTTGTAGTACAGGTGACCCAGCAGCAATCAAT 51929387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3469 TTGTCCTTAGGACACTTTGGAAATCTATCTTGTAGTACAGGTGACCCAGCAGCAATCAAT 3528

 51929388 CTTTCTGCCATCCCTAGTTTTAGTTCAGGACCCAGAAAAGTTGTAACTTGTTTCCTTTCC 51929447
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3529 CTTTCTGCCATCCCTAGTTTTACTTCAGGACCCAGAAAAGTTGTAACTTGTTTCCTTTCC 3588

 51929448 TGTGATCAAGCCTTTGTTTTCTCTTTTTTTCTCCACTTTTTGTAGCTTTTTAATTTGTTT 51929507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3589 TGTGATCAAGCCTTTGTTTTCTCTTTTTTTCTCCACTTTTTGTAGCTTTTTAATTTGTTT 3648

 51929508 CTCTGTTGATTACTAGCCCAATGCCTGAGCATCTTCGTCTTAAGACAAAGCCTCTGTGTT 51929567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3649 CTCTGTTGATTACTAGCCCAATGCCTGAGCATCTTCGTCTTAAGACAAAGCCTCTGTGTT 3708

 51929568 TCTTCAGCTCCTGAAATGACTGGCATGCTGAAAATGAGCTCAGGGCATTAGTCTTTGCTA 51929627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3709 TCTTCAGCTCCTGAAATGACTGGCATGCTGAAAATGAGCTCAGGGCATTAGTCTTTGCTA 3768

 51929628 CTAAGCCACTACAGATTCCATTCCCTTTCTTCTTGAGTATGCACACACCGCTTGTTCACA 51929687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     3769 CTAAGCCACTACAGATTCCATTCCCTTTCTTCCTGAGTATGCACACACCGCTTGTTCACA 3828

 51929688 GACTCCAGATTAGTTATTAAGCTACATCTGTATGCAGTTTGCACTCTCCTGCCTTCGACC 51929747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3829 GACTCCAGATTAGTTATTAAGCTACATCTGTATGCAGTTTGCACTCTCCTGCCTTCGACC 3888

 51929748 TGCTTGTCCCAGAAGTTATTCACCATATTCTACCTTGATCATATTTTCTACTTGTCAATG 51929807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3889 TGCTTGTCCCAGAAGTTATTCACCATATTCTACCTTGATCATATTTTCTACTTGTCAATG 3948

 51929808 CGCATGTCAATTAAGAACTTTTAACATTTATTGACCATTTATTATATACTAGCCAGTCTT 51929867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3949 CGCATGTCAATTAAGAACTTTTAACATTTATTGACCATTTATTATATACTAGCCAGTCTT 4008

 51929868 TTAATTGATTTATGAACAATTAACTTAATCATCATATAAGCATAGTAGGGTACAATTAGT 51929927
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4009 TTAATTGCTTTATGAACAATTAACTTAATCATCATATAAGCATAGTAGGGTACAATTAGT 4068

 51929928 TCCCCAACTTTATATATGAACAAATGGACTTTCAGAAAGGTAAGGTAAAATATCCACGGT 51929987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4069 TCCCCAACTTTATATATGAACAAATGGACTTTCAGAAAGGTAAGGTAAAATATCCACGGT 4128

 51929988 AAGAAAGCCTGCATATGTGGAACTGGGAATTGAACCCCTATGTCTGACCCGAGGGTCCAT 51930047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4129 AAGAAAGCCTGCATATGTGGAACTGGGAATTGAACCCCTATGTCTGACCCGAGGGTCCAT 4188

 51930048 ACACTTAAGCATTATGCTATCAAGTTTTCCACAGCCTGCTTTTCGGCTTCTCTCTCTTTC 51930107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4189 ACACTTAAGCATTATGCTATCAAGTTTTCCACAGCCTGCTTTTCGGCTTCTCTCTCTTTC 4248

 51930108 TTTCTTTCCTGATCTCTGTTGCAATTCCTACCTTTCAACTCCCTTCTGACCATGGATAGT 51930167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     4249 TTTCTTTCCTGATCTCTGTTGCAATTCCTACCTTTCAACTCCCTTCTGACCATGGACAGT 4308

 51930168 TTGCAAAATGCCAGAGGTACGTCTCAAAGAAGCTTCAAATAGGAGCGTGTACTACCATTA 51930227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4309 TTGCAAAATGCCAGAGGTACGTCTCAAAGAAGCTTCAAATAGGAGCGTGTACTACCATTA 4368

 51930228 AGTCAGCTCCTCAGTTGTCTTCTTTGGATTGAGAAGCACTTCATCACTTTTTACACAGGT 51930287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4369 AGTCAGCTCCTCAGTTGTCTTCTTTGGATTGAGAAGCACTTCATCACTTTTTACACAGGT 4428

 51930288 TTAATTATCAAATATGACTTTTCTAGTACTACAGCTAATATATGTCAATGTCAAAGGGTT 51930347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4429 TTAATTATCAAATATGACTTTTCTAGTACTACAGCTAATATATGTCAATGTCAAAGGGTT 4488

 51930348 AACAGAATACTAGGCCTATATTAAATTATACATATGAGCTTTCTCTTTACTCCTTTTTAT 51930407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4489 AACAGAATACTAGGCCTATATTAAATTATACATATGAGCTTTCTCTTTACTCCTTTTTAT 4548

 51930408 GTTCATTAGCAAACAGATAAAGCCATAATAGATTTTTTAAGGAATATTTTGTTTTGTTTT 51930467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4549 GTTCATTAGCAAACAGATAAAGCCATAATAGATTTTTTAAGGAATATTTTGTTTTGTTTT 4608

 51930468 GTTTTGGACTTATACATCTATTAACAATAAACCAAACATTGCAGATTAAAGCAAATCTGC 51930527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4609 GTTTTGGACTTATACATCTATTAACAATAAACCAAACATTGCAGATTAAAGCAAATCTGC 4668

 51930528 CAATCTGTTTTACAAACACTATCTTCTGAAGGGTTCCTGGGCACAAGATACTGTTCTAGT 51930587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4669 CAATCTGTTTTACAAACACTATCTTCTGAAGGGTTCCTGGGCACAAGATACTGTTCTAGT 4728

 51930588 AATATTTCACAGC-TTTTTTTTTTTTTTCATTTTAGAGAAAATATTCTAAGACTCCAAAG 51930646
          ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4729 AATATTTCACAGCTTTTTTTTTTTTTTTCATTTTAGAGAAAATATTCTAAGACTCCAAAG 4788

 51930647 TTCGATAGTATTTGGTCAGTGTCTTAGTCAGTTTGAGCTAATATAACAAATTATCATAGA 51930706
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4789 TTAGATAGTATTTGGTCAGTGTCTTAGTCAGTTTGAGCTAATATAACAAATTATCATAGA 4848

 51930707 ATAAGTGTCTCAAGCAACAGAAATGTATTTTTTACAATCTGGAGGCTGCAAAGTCCAGAA 51930766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4849 ATAAGTGTCTCAAGCAACAGAAATGTATTTTTTACAATCTGGAGGCTGCAAAGTCCAGAA 4908

 51930767 TCAAGATGCTGGCAGATCTGGTGTCTGATGAGGACCCACCTTCTTATTTGCAAATGATCA 51930826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4909 TCAAGATGCTGGCAGATCTGGTGTCTGATGAGGACCCACCTTCTTATTTGCAAATGATCA 4968

 51930827 TTTTTGTTGTGTCCTCACATGACAAAGAGCAGAGAGAGCAAGCACTCTTGTGTCTCTTCT 51930886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
     4969 TTTTTGTTGTGTCCTCACATGACAAAGAGCAGAGAGAGCAAGCACTCTTGTGTCTCTTC- 5027

 51930887 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCCGGCTCTTTAGCCCAGGCCGGATTGCAGTG 51930946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5028 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCCGGCTCTTTAGCCCAGGCCGGATTGCAGTG 5087

 51930947 GCACA 51930951
          |||||
     5088 GCACA 5092

Alignment time is 4.60782 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51916584,51937767] =>     21184 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [       1,    2417] =>      2417 nucs 'mol-32-33a0-099289_2417'

Score:        2385
Aligned:      2418        nucs
Identic:      2415 (100%) nucs =>       438 (100%)      1977 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51924186,51924623] EXCISED REGION [51924625,51926604]
 second seq =>  [       1,     438] EXCISED REGION [     440,    2417]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [51924624,51924624]
 second seq =>         1 nucs [439,439]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [51924648,51924648]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [51924623,51924623] to [51924624,51924624]
 second seq =>         2 nucs [439,440] to [440,441]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 51924186 TACTCAAACTGTCTTTGTACACATAATTTTCCTTTCATGCCATTTATGAACCATTTTTTA 51924245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TACTCAAACTGTCTTTGTACACATAATTTTCCTTTCATGCCATTTATGAACCATTTTTTA 60

 51924246 TTTCTATGGTTGATAGAGAATGACTTCATAATTCATTTCTGAATAAGTGAAATAATTTAA 51924305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTCTATGGTTGATAGAGAATGACTTCATAATTCATTTCTGAATAAGTGAAATAATTTAA 120

 51924306 AAACATTTTAAAGTGGGTGTATCTACTTGCTTGGAGCTTTGTCGAATCATGTTTCTTATT 51924365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAACATTTTAAAGTGGGTGTATCTACTTGCTTGGAGCTTTGTCGAATCATGTTTCTTATT 180

 51924366 TGGAGCCTCTGGAGGAATGTTGACTTACCATGGTAAAAATTAACTGGTGAAACTCTAAAG 51924425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGGAGCCTCTGGAGGAATGTTGACTTACCATGGTAAAAATTAACTGGTGAAACTCTAAAG 240

 51924426 AAAACACAGACTCTACACGCAGTCTTGTCCGAAACTTACTCACCCTGAAACCAATGAATT 51924485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAAACACAGACTCTACACGCAGTCTTGTCCGAAACTTACTCACCCTGAAACCAATGAATT 300

 51924486 TCAAAGACCTAGATACTTCCTTCTGTGATGTCCCCTGAGATCAGAGAATAAAAGAAAAAT 51924545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCAAAGACCTAGATACTTCCTTCTGTGATGTCCCCTGAGATCAGAGAATAAAAGAAAAAT 360

 51924546 CCCTCGTAAATATACATCACGTACAGCTGTTTGATTTATGCATTATGCAGAAACTAAGAA 51924605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CCCTCGTAAATATACATCACGTACAGCTGTTTGATTTATGCATTATGCAGAAACTAAGAA 420

 51924606 AACAGAGTTATATGTAAC 51924623
          ||||||||||||||||||
      421 AACAGAGTTATATGTAAC 438

EXCISED REGION

 51924625 TTGCAATGAGAAGTGCACCCACCAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCCCAAAACATTGTTTCA 51924684
          ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      440 TTGCAATGAGAAGTGCACCCACC-AAAAAAAAAAAAAAAAAATCCCAAAACATTGTTTCA 498

 51924685 AAAAGAAGTGGTATGAAGCATCTTAGTGTTTCATGAATATTGAAGAATAGTGCAATTATT 51924744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      499 AAAAGAAGTGGTATGAAGCATCTTAGTGTTTCATGAATATTGAAGAATAGTGCAATTATT 558

 51924745 GAAATTTGGCATTTAAAAAATGTTTTTAAATTATTAGGAAGCTACCGTGACCTGTTTACT 51924804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      559 GAAATTTGGCATTTAAAAAATGTTTTTAAATTATTAGGAAGCTACCGTGACCTGTTTACT 618

 51924805 AAATCCTCAATTCTTTCTCTCTCAGTTTTTCTTACTATAAAATTTACTTTTCAAGCCAGA 51924864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      619 AAATCCTCAATTCTTTCTCTCTCAGTTTTTCTTACTATAAAATTTACTTTTCAAGCCAGA 678

 51924865 GAATTTTTCTTTCTGACAAGACGTAGATCTATATTGCGCTGTCAAGATGCAGCTTTTGCA 51924924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      679 GAATTTTTCTTTCTGACAAGACGTAGATCTATATTGCGCTGTCAAGATGCAGCTTTTGCA 738

 51924925 TCTCTGCTGCCATGTGGATAGAATAACTTTCTTTCCTCAAGAAGTGGACAAGCCCTCATA 51924984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      739 TCTCTGCTGCCATGTGGATAGAATAACTTTCTTTCCTCAAGAAGTGGACAAGCCCTCATA 798

 51924985 GGGACTGATTTTCTGTGAAGTAGTGAGACTTAATCTTTGGGACCTTCACTTACATCACTT 51925044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      799 GGGACTGATTTTCTGTGAAGTAGTGAGACTTAATCTTTGGGACCTTCACTTACATCACTT 858

 51925045 ACATAGGACCTTTCAATACTCAGGGAGGGCCCTTGGCAATAAGTTCTTCTGACAATATAT 51925104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      859 ACATAGGACCTTTCAATACTCAGGGAGGGCCCTTGGCAATAAGTTCTTCTGACAATATAT 918

 51925105 CTTGTGCTGATGGTGGTGTTAGCTTTCAAAATTTGTAATTATTTTGGTAATTTCTGTCAT 51925164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      919 CTTGTGCTGATGGTGGTGTTAGCTTTCAAAATTTGTAATTATTTTGGTAATTTCTGTCAT 978

 51925165 CCTAGAAAAATGTGTATAGTGTATTTGTTCCTAATTTCATTTTCATTATTTATATATTTT 51925224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      979 CCTAGAAAAATGTGTATAGTGTATTTGTTCCTAATTTCATTTTCATTATTTATATATTTT 1038

 51925225 TTAATGAACACCCCCAGCATAGTATAAGTTTTATACCTCTACAATCTGAATCACCCGCTT 51925284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1039 TTAATGAACACCCCCAGCATAGTATAAGTTTTATACCTCTACAATCTGAATCACCCGCTT 1098

 51925285 GGCCCATGCCTAGGACTAGGTCTTATCATCCGCAGTGAGAGATTATAGGCTCTTACTAGG 51925344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1099 GGCCCATGCCTAGGACTAGGTCTTATCATCCGCAGTGAGAGATTATAGGCTCTTACTAGG 1158

 51925345 AATTTATGGTAACATGGGCTCCTAACAGTCATGATTTTTATAACATGATTGCCTATGTAT 51925404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1159 AATTTATGGTAACATGGGCTCCTAACAGTCATGATTTTTATAACATGATTGCCTATGTAT 1218

 51925405 ATAAAGTCCACTGGCTGAACAAGTATTTTCCCTCAAATCAGGAAGGAAAAAAAAAAACAC 51925464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1219 ATAAAGTCCACTGGCTGAACAAGTATTTTCCCTCAAATCAGGAAGGAAAAAAAAAAACAC 1278

 51925465 GAAGCAAATTGATCCTCTTCTAAAAGCTGTCACATCAGTAACCCATCATATTCTCATTTA 51925524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1279 GAAGCAAATTGATCCTCTTCTAAAAGCTGTCACATCAGTAACCCATCATATTCTCATTTA 1338

 51925525 CTTATATACTGAGTAGGTAGTCACCTTTGATTCATATCTCTCAGGAGTTCAGAAGTTTTT 51925584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1339 CTTATATACTGAGTAGGTAGTCACCTTTGATTCATATCTCTCAGGAGTTCAGAAGTTTTT 1398

 51925585 GAAAGTAATTTGTGATACAAAATATAGGGAAATTCAGAATGAGATTCTTTTGGCTTGTCT 51925644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1399 GAAAGTAATTTGTGATACAAAATATAGGGAAATTCAGAATGAGATTCTTTTGGCTTGTCT 1458

 51925645 TTCTTTTTCTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTATTTGTTGAACTCAAATCCGGAAATTGTG 51925704
          ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1459 TTCTTTTTCTTTTTTTC-TTTTTTTTTTTTTATTTGTTGAACTCAAATCCGGAAATTGTG 1517

 51925705 GAGGTTACTAGAACTCTAAGTCACAGACTTATAAGTACTGAAAAAGTAGTCAGTAAAGAA 51925764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1518 GAGGTTACTAGAACTCTAAGTCACAGACTTATAAGTACTGAAAAAGTAGTCAGTAAAGAA 1577

 51925765 AACATACAGTAAGAGACTAGGTTAATTTTCCTATAGTTCATTGATGTTTCCACTATTACT 51925824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1578 AACATACAGTAAGAGACTAGGTTAATTTTCCTATAGTTCATTGATGTTTCCACTATTACT 1637

 51925825 GCCCCTGATTTTTAACTTTAGTTTTCCTTAGATTGTTGGAGTAATATATGTACCTTAAAA 51925884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1638 GCCCCTGATTTTTAACTTTAGTTTTCCTTAGATTGTTGGAGTAATATATGTACCTTAAAA 1697

 51925885 ATTAACTGTGGAACAAGTAGATGAACTTTTTACACAATTTCCTGCTTTTATAAAGTTCCT 51925944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1698 ATTAACTGTGGAACAAGTAGATGAACTTTTTACACAATTTCCTGCTTTTATAAAGTTCCT 1757

 51925945 ACTAGCTATATTTTCCCAAAAGTGCTCAACAATAGAGTCTGGTGCTAAAAAGCAGAGTAG 51926004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1758 ACTAGCTATATTTTCCCAAAAGTGCTCAACAATAGAGTCTGGTGCTAAAAAGCAGAGTAG 1817

 51926005 GCTAAATTTAGATCAATGTGAAATGCCCTACTTATTTCCTATGAACTTAATTGATTGAGC 51926064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1818 GCTAAATTTAGATCAATGTGAAATGCCCTACTTATTTCCTATGAACTTAATTGATTGAGC 1877

 51926065 TCATTTTGGGGGTGTCTTTCTGATCGACCAGAAACTTGGCTCATTAGAGCAACTCACAAA 51926124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1878 TCATTTTGGGGGTGTCTTTCTGATCGACCAGAAACTTGGCTCATTAGAGCAACTCACAAA 1937

 51926125 GTGACCTTTTAAAAGAAAGAGTTTTCAATATATTTGTTCATGTTCCATTCCACTGAGAAT 51926184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1938 GTGACCTTTTAAAAGAAAGAGTTTTCAATATATTTGTTCATGTTCCATTCCACTGAGAAT 1997

 51926185 GGTGCTATTTAAAACTAAATACAATAATTTTAGATATTGTACAGCAGATATAATTTTAAA 51926244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1998 GGTGCTATTTAAAACTAAATACAATAATTTTAGATATTGTACAGCAGATATAATTTTAAA 2057

 51926245 CATAATACATGGGATTTCGATTTTAGGTACTGTTTATAAGGCATTTCTCCTTATATTATT 51926304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2058 CATAATACATGGGATTTCGATTTTAGGTACTGTTTATAAGGCATTTCTCCTTATATTATT 2117

 51926305 CTAGACTTAAATATAACAAATTTCATGCAGAGGTTTCTTTCAAAAGTAAATTCAGCCACA 51926364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2118 CTAGACTTAAATATAACAAATTTCATGCAGAGGTTTCTTTCAAAAGTAAATTCAGCCACA 2177

 51926365 TTTAGACTCAAATATTCCCTAATTTTTTAGTGTAGCTGAAGTCCTAATAATATACTTGTG 51926424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2178 TTTAGACTCAAATATTCCCTAATTTTTTAGTGTAGCTGAAGTCCTAATAATATACTTGTG 2237

 51926425 TTTCTTTTAAATTAAGTCCCACATGTTAACTTTACAACAGAAAGTCCATGTATCGTATTA 51926484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     2238 TTTCTTTTAAATTAAGTCCCACATGTTAACTTTACAGCAGAAAGTCCATGTATCGTATTA 2297

 51926485 TTAGTCTAAATCTTCATTTTACTGTTTAGTTAACACAGACATTCATTTAACACACTATGT 51926544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2298 TTAGTCTAAATCTTCATTTTACTGTTTAGTTAACACAGACATTCATTTAACACACTATGT 2357

 51926545 TTAATTTCCCACTCAGTTTTGGCTTATTGTAGTCTAATAAACAATGATTAAACAATGCCC 51926604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2358 TTAATTTCCCACTCAGTTTTGGCTTATTGTAGTCTAATAAACAATGATTAAACAATGCCC 2417

Alignment time is 2.70215 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51916584,51937767] =>     21184 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [       1,    4567] =>      4567 nucs 'mol-32-33b6-076694_4567'

Score:        4491
Aligned:      4568        nucs
Identic:      4561 (100%) nucs =>      2587 (100%)      1974 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51923995,51926584] EXCISED REGION [51927768,51929745]
 second seq =>  [       1,    2589] EXCISED REGION [    2590,    4567]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1183 nucs [51926585,51927767]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [51926585,51926587] to [51927768,51927770]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [51926584,51926584] to [51927768,51927768]
 second seq =>         1 nucs [2589,2589] to [2590,2590]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 51923995 ATACCAGAAAAGAAATTTTAACCTTTAAATTTAATTGAAACATGATATTTTTCTCTTTTG 51924054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATACCAGAAAAGAAATTTTAACCTTTAAATTTAATTGAAACATGATATTTTTCTCTTTTG 60

 51924055 AAACATTTCTTTCTCTACAAAAATCTGTTCCTTCAGAACCTGTTGATGCAATAATATTAT 51924114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAACATTTCTTTCTCTACAAAAATCTGTTCCTTCAGAACCTGTTGATGCAATAATATTAT 120

 51924115 ATCATTTTTTTTTACTGGTCAATGTATTTATTTGTAATTGTTCTGAAATTGTTTCCTGCA 51924174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATCATTTTTTTTTACTGGTCAATGTATTTATTTGTAATTGTTCTGAAATTGTTTCCTGCA 180

 51924175 AGGTTTTCTATTACTCAAACTGTCTTTGTACACATAATTTTCCTTTCATGCCATTTATGA 51924234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGGTTTTCTATTACTCAAACTGTCTTTGTACACATAATTTTCCTTTCATGCCATTTATGA 240

 51924235 ACCATTTTTTATTTCTATGGTTGATAGAGAATGACTTCATAATTCATTTCTGAATAAGTG 51924294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACCATTTTTTATTTCTATGGTTGATAGAGAATGACTTCATAATTCATTTCTGAATAAGTG 300

 51924295 AAATAATTTAAAAACATTTTAAAGTGGGTGTATCTACTTGCTTGGAGCTTTGTCGAATCA 51924354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAATAATTTAAAAACATTTTAAAGTGGGTGTATCTACTTGCTTGGAGCTTTGTCGAATCA 360

 51924355 TGTTTCTTATTTGGAGCCTCTGGAGGAATGTTGACTTACCATGGTAAAAATTAACTGGTG 51924414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGTTTCTTATTTGGAGCCTCTGGAGGAATGTTGACTTACCATGGTAAAAATTAACTGGTG 420

 51924415 AAACTCTAAAGAAAACACAGACTCTACACGCAGTCTTGTCCGAAACTTACTCACCCTGAA 51924474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAACTCTAAAGAAAACACAGACTCTACACGCAGTCTTGTCCGAAACTTACTCACCCTGAA 480

 51924475 ACCAATGAATTTCAAAGACCTAGATACTTCCTTCTGTGATGTCCCCTGAGATCAGAGAAT 51924534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACCAATGAATTTCAAAGACCTAGATACTTCCTTCTGTGATGTCCCCTGAGATCAGAGAAT 540

 51924535 AAAAGAAAAATCCCTCGTAAATATACATCACGTACAGCTGTTTGATTTATGCATTATGCA 51924594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAAAGAAAAATCCCTCGTAAATATACATCACGTACAGCTGTTTGATTTATGCATTATGCA 600

 51924595 GAAACTAAGAAAACAGAGTTATATGTAACCTTGCAATGAGAAGTGCACCCACCAAAAAAA 51924654
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GAAACTAAGAAAACAGAGTTATATGTAACTTTGCAATGAGAAGTGCACCCACCAAAAAAA 660

 51924655 AAAAAAAAAAAATCCCAAAACATTGTTTCAAAAAGAAGTGGTATGAAGCATCTTAGTGTT 51924714
          ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAAAAAAAAAA-TCCCAAAACATTGTTTCAAAAAGAAGTGGTATGAAGCATCTTAGTGTT 719

 51924715 TCATGAATATTGAAGAATAGTGCAATTATTGAAATTTGGCATTTAAAAAATGTTTTTAAA 51924774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      720 TCATGAATATTGAAGAATAGTGCAATTATTGAAATTTGGCATTTAAAAAATGTTTTTAAA 779

 51924775 TTATTAGGAAGCTACCGTGACCTGTTTACTAAATCCTCAATTCTTTCTCTCTCAGTTTTT 51924834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      780 TTATTAGGAAGCTACCGTGACCTGTTTACTAAATCCTCAATTCTTTCTCTCTCAGTTTTT 839

 51924835 CTTACTATAAAATTTACTTTTCAAGCCAGAGAATTTTTCTTTCTGACAAGACGTAGATCT 51924894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 CTTACTATAAAATTTACTTTTCAAGCCAGAGAATTTTTCTTTCTGACAAGACGTAGATCT 899

 51924895 ATATTGCGCTGTCAAGATGCAGCTTTTGCATCTCTGCTGCCATGTGGATAGAATAACTTT 51924954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 ATATTGCGCTGTCAAGATGCAGCTTTTGCATCTCTGCTGCCATGTGGATAGAATAACTTT 959

 51924955 CTTTCCTCAAGAAGTGGACAAGCCCTCATAGGGACTGATTTTCTGTGAAGTAGTGAGACT 51925014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 CTTTCCTCAAGAAGTGGACAAGCCCTCATAGGGACTGATTTTCTGTGAAGTAGTGAGACT 1019

 51925015 TAATCTTTGGGACCTTCACTTACATCACTTACATAGGACCTTTCAATACTCAGGGAGGGC 51925074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 TAATCTTTGGGACCTTCACTTACATCACTTACATAGGACCTTTCAATACTCAGGGAGGGC 1079

 51925075 CCTTGGCAATAAGTTCTTCTGACAATATATCTTGTGCTGATGGTGGTGTTAGCTTTCAAA 51925134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 CCTTGGCAATAAGTTCTTCTGACAATATATCTTGTGCTGATGGTGGTGTTAGCTTTCAAA 1139

 51925135 ATTTGTAATTATTTTGGTAATTTCTGTCATCCTAGAAAAATGTGTATAGTGTATTTGTTC 51925194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 ATTTGTAATTATTTTGGTAATTTCTGTCATCCTAGAAAAATGTGTATAGTGTATTTGTTC 1199

 51925195 CTAATTTCATTTTCATTATTTATATATTTTTTAATGAACACCCCCAGCATAGTATAAGTT 51925254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 CTAATTTCATTTTCATTATTTATATATTTTTTAATGAACACCCCCAGCATAGTATAAGTT 1259

 51925255 TTATACCTCTACAATCTGAATCACCCGCTTGGCCCATGCCTAGGACTAGGTCTTATCATC 51925314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 TTATACCTCTACAATCTGAATCACCCGCTTGGCCCATGCCTAGGACTAGGTCTTATCATC 1319

 51925315 CGCAGTGAGAGATTATAGGCTCTTACTAGGAATTTATGGTAACATGGGCTCCTAACAGTC 51925374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 CGCAGTGAGAGATTATAGGCTCTTACTAGGAATTTATGGTAACATGGGCTCCTAACAGTC 1379

 51925375 ATGATTTTTATAACATGATTGCCTATGTATATAAAGTCCACTGGCTGAACAAGTATTTTC 51925434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 ATGATTTTTATAACATGATTGCCTATGTATATAAAGTCCACTGGCTGAACAAGTATTTTC 1439

 51925435 CCTCAAATCAGGAAGGAAAAAAAAAAACACGAAGCAAATTGATCCTCTTCTAAAAGCTGT 51925494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 CCTCAAATCAGGAAGGAAAAAAAAAAACACGAAGCAAATTGATCCTCTTCTAAAAGCTGT 1499

 51925495 CACATCAGTAACCCATCATATTCTCATTTACTTATATACTGAGTAGGTAGTCACCTTTGA 51925554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 CACATCAGTAACCCATCATATTCTCATTTACTTATATACTGAGTAGGTAGTCACCTTTGA 1559

 51925555 TTCATATCTCTCAGGAGTTCAGAAGTTTTTGAAAGTAATTTGTGATACAAAATATAGGGA 51925614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 TTCATATCTCTCAGGAGTTCAGAAGTTTTTGAAAGTAATTTGTGATACAAAATATAGGGA 1619

 51925615 AATTCAGAATGAGATTCTTTTGGCTTGTCTTTCTTTTTCTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTT 51925674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 AATTCAGAATGAGATTCTTTTGGCTTGTCTTTCTTTTTCTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTT 1679

 51925675 TATTTGTTGAACTCAAATCCGGAAATTGTGGAGGTTACTAGAACTCTAAGTCACAGACTT 51925734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 TATTTGTTGAACTCAAATCCGGAAATTGTGGAGGTTACTAGAACTCTAAGTCACAGACTT 1739

 51925735 ATAAGTACTGAAAAAGTAGTCAGTAAAGAAAACATACAGTAAGAGACTAGGTTAATTTTC 51925794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 ATAAGTACTGAAAAAGTAGTCAGTAAAGAAAACATACAGTAAGAGACTAGGTTAATTTTC 1799

 51925795 CTATAGTTCATTGATGTTTCCACTATTACTGCCCCTGATTTTTAACTTTAGTTTTCCTTA 51925854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 CTATAGTTCATTGATGTTTCCACTATTACTGCCCCTGATTTTTAACTTTAGTTTTCCTTA 1859

 51925855 GATTGTTGGAGTAATATATGTACCTTAAAAATTAACTGTGGAACAAGTAGATGAACTTTT 51925914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 GATTGTTGGAGTAATATATGTACCTTAAAAATTAACTGTGGAACAAGTAGATGAACTTTT 1919

 51925915 TACACAATTTCCTGCTTTTATAAAGTTCCTACTAGCTATATTTTCCCAAAAGTGCTCAAC 51925974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 TACACAATTTCCTGCTTTTATAAAGTTCCTACTAGCTATATTTTCCCAAAAGTGCTCAAC 1979

 51925975 AATAGAGTCTGGTGCTAAAAAGCAGAGTAGGCTAAATTTAGATCAATGTGAAATGCCCTA 51926034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 AATAGAGTCTGGTGCTAAAAAGCAGAGTAGGCTAAATTTAGATCAATGTGAAATGCCCTA 2039

 51926035 CTTATTTCCTATGAACTTAATTGATTGAGCTCATTTTGGGGGTGTCTTTCTGATCGACCA 51926094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 CTTATTTCCTATGAACTTAATTGATTGAGCTCATTTTGGGGGTGTCTTTCTGATCGACCA 2099

 51926095 GAAACTTGGCTCATTAGAGCAACTCACAAAGTGACCTTTTAAAAGAAAGAGTTTTCAATA 51926154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 GAAACTTGGCTCATTAGAGCAACTCACAAAGTGACCTTTTAAAAGAAAGAGTTTTCAATA 2159

 51926155 TATTTGTTCATGTTCCATTCCACTGAGAATGGTGCTATTTAAAACTAAATACAATAATTT 51926214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 TATTTGTTCATGTTCCATTCCACTGAGAATGGTGCTATTTAAAACTAAATACAATAATTT 2219

 51926215 TAGATATTGTACAGCAGATATAATTTTAAACATAATACATGGGATTTCGATTTTAGGTAC 51926274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 TAGATATTGTACAGCAGATATAATTTTAAACATAATACATGGGATTTCGATTTTAGGTAC 2279

 51926275 TGTTTATAAGGCATTTCTCCTTATATTATTCTAGACTTAAATATAACAAATTTCATGCAG 51926334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 TGTTTATAAGGCATTTCTCCTTATATTATTCTAGACTTAAATATAACAAATTTCATGCAG 2339

 51926335 AGGTTTCTTTCAAAAGTAAATTCAGCCACATTTAGACTCAAATATTCCCTAATTTTTTAG 51926394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 AGGTTTCTTTCAAAAGTAAATTCAGCCACATTTAGACTCAAATATTCCCTAATTTTTTAG 2399

 51926395 TGTAGCTGAAGTCCTAATAATATACTTGTGTTTCTTTTAAATTAAGTCCCACATGTTAAC 51926454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 TGTAGCTGAAGTCCTAATAATATACTTGTGTTTCTTTTAAATTAAGTCCCACATGTTAAC 2459

 51926455 TTTACAACAGAAAGTCCATGTATCGTATTATTAGTCTAAATCTTCATTTTACTGTTTAGT 51926514
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 TTTACAGCAGAAAGTCCATGTATCGTATTATTAGTCTAAATCTTCATTTTACTGTTTAGT 2519

 51926515 TAACACAGACATTCATTTAACACACTATGTTTAATTTCCCACTCAGTTTTGGCTTATTGT 51926574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 TAACACAGACATTCATTTAACACACTATGTTTAATTTCCCACTCAGTTTTGGCTTATTGT 2579

 51926575 AGTCTAATAA 51926584
          ||||||||||
     2580 AGTCTAATAA 2589

EXCISED REGION

 51927768 ACATATAGTAAGTTGTCCATAAGTATTTGCTGGTAGATTTATTTATTTTTTAAAAAAACA 51927827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2590 ACATATAGTAAGTTGTCCATAAGTATTTGCTGGTAGATTTATTTATTTTTTAAAAAAACA 2649

 51927828 ACTTGGAAAGTTTTCTGTGTGCTTTTATATTAGAACTTGACCTTTGAAGTACCTCCAGGA 51927887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2650 ACTTGGAAAGTTTTCTGTGTGCTTTTATATTAGAACTTGACCTTTGAAGTACCTCCAGGA 2709

 51927888 AATTTTGAAGAGTGCTGGCATATGACAATGCGTAAGTTTATATTTCATGTCCATGCATGC 51927947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2710 AATTTTGAAGAGTGCTGGCATATGACAATGCGTAAGTTTATATTTCATGTCCATGCATGC 2769

 51927948 CATTAAAATTCTAATAATGTAGTTGACAGAGCCTTTCTTGTCCCTTAAGCACTAAATTTG 51928007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2770 CATTAAAATTCTAATAATGTAGTTGACAGAGCCTTTCTTGTCCCTTAAGCACTAAATTTG 2829

 51928008 TGGCTTGCTCTAGATTGTCCCACCTGGCACAAGCGAGGTGAAATTTCAGGTCTAGCCAAC 51928067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     2830 TGGCTTGCTCTAGATTGTCCCACCTGGCACAAGCTAGGTGAAATTTCAGGTCTAGCCAAC 2889

 51928068 TTTTTTCTTTTTTTTTTTTTAACAAGTATTAAAAACATTTTCATATATATTCCCTGTATT 51928127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2890 TTTTTTCTTTTTTTTTTTTTAACAAGTATTAAAAACATTTTCATATATATTCCCTGTATT 2949

 51928128 ATTTCACCTATTTTTGTGTGTGTGTTTCTATCACACTGCCACATCAAAAACCTCTTCTTG 51928187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2950 ATTTCACCTATTTTTGTGTGTGTGTTTCTATCACACTGCCACATCAAAAACCTCTTCTTG 3009

 51928188 AACGACTATAGTATAGTGGTTAATAGTTCAGTGTCTAGATCAAGACCACCTATGGACGTA 51928247
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3010 AACGACTATAGTATAGTGATTAATAGTTCAGTGTCTAGATCAAGACCACCTATGGACGTA 3069

 51928248 TCTTGGCTCTGATTTTACCAGCCGTACAATCCTGGAGAATCTGTTCAAGAGAAATGTGCC 51928307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3070 TCTTGGCTCTGATTTTACCAGCCGTACAATCCTGGAGAATCTGTTCAAGAGAAATGTGCC 3129

 51928308 TCAATTACGTATCTCTAAAGTAGTTGTAGCTATAGAACCTGTTCCATAGATGTGGATCAG 51928367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3130 TCAATTACGTATCTCTAAAGTAGTTGTAGCTATAGAACCTGTTCCATAGATGTGGATCAG 3189

 51928368 AACACTGCATGACATTTAGAAAATGTTTAATAAATGATGTTGCTGTACTTGTTGCTGTTA 51928427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3190 AACACTGCATGACATTTAGAAAATGTTTAATAAATGATGTTGCTGTACTTGTTGCTGTTA 3249

 51928428 TTGTTGCTCTGTCATGTTAGGAGAACTCTCATTTACCCTAGTGTTCTCTCAAAGTGAAAT 51928487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3250 TTGTTGCTCTGTCATGTTAGGAGAACTCTCATTTACCCTAGTGTTCTCTCAAAGTGAAAT 3309

 51928488 ACAGATCATTACCTCTTGAAATCATGTCCAAGTAACTTCAGAATTATTTAGAAATCATTT 51928547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3310 ACAGATCATTACCTCTTGAAATCATGTCCAAGTAACTTCAGAATTATTTAGAAATCATTT 3369

 51928548 ATCTAAATCAGAGTATTTCTTGATATAATTTAAAGTTGATTGTATTTGAAAGTACATATG 51928607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3370 ATCTAAATCAGAGTATTTCTTGATATAATTTAAAGTTGATTGTATTTGAAAGTACATATG 3429

 51928608 TCAATCTAGTATGAGATAATCTCAAGGAAATAAAAATGTATAGGTCTAATTTACATTTTT 51928667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3430 TCAATCTAGTATGAGATAATCTCAAGGAAATAAAAATGTATAGGTCTAATTTACATTTTT 3489

 51928668 ATATGGAAGGAGATAATTACTTTCTATCACAAATGATGAAGGCTGACGTTTGTTTCTTTT 51928727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3490 ATATGGAAGGAGATAATTACTTTCTATCACAAATGATGAAGGCTGACGTTTGTTTCTTTT 3549

 51928728 TTACTTTTAATTTTCACTTATATTTTGTTTATTATCAATATTTGCTTTTTAAAAGGTGGG 51928787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3550 TTACTTTTAATTTTCACTTATATTTTGTTTATTATCAATATTTGCTTTTTAAAAGGTGGG 3609

 51928788 AAGAAATCAACCAATCAAACATTAAAAAGCAATATGGAGGAGGGTGATATAATGCCCACT 51928847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3610 AAGAAATCAACCAATCAAACATTAAAAAGCAATATGGAGGAGGGTGATATAATGCCCACT 3669

 51928848 TATATTTCTCTTATAATTTTAAATATTTTCATAATTAACAGAATAATTAGCACTGGTAAT 51928907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3670 TATATTTCTCTTATAATTTTAAATATTTTCATAATTAACAGAATAATTAGCACTGGTAAT 3729

 51928908 ATTAAAATACCATCAAAAGAATCTAAATGTATGTGCTTTCTGTTGCAGCCTTGTTAGATG 51928967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3730 ATTAAAATACCATCAAAAGAATCTAAATGTATGTGCTTTCTGTTGCAGCCTTGTTAGATG 3789

 51928968 TTTCAGTGGATTCAAAGTGTTGTTATAAGAAAACGTGATTTATCAAGACTTTCATGTGTA 51929027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3790 TTTCAGTGGATTCAAAGTGTTGTTATAAGAAAACGTGATTTATCAAGACTTTCATGTGTA 3849

 51929028 AAATAAAAGGCATTTTCAATGACTACTTGGCCAGGCTTTCAGATTCCAATGCCAAGATGT 51929087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3850 AAATAAAAGGCATTTTCAATGACTACTTGGCCAGGCTTTCAGATTCCAATGCCAAGATGT 3909

 51929088 TGTATTTTGATATTGCAGTTTTCTAACAACAACAAAGTTGAGTGGACTTCTGGAACTAAA 51929147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3910 TGTATTTTGATATTGCAGTTTTCTAACAACAACAAAGTTGAGTGGACTTCTGGAACTAAA 3969

 51929148 ACTTAAATATTCAGAACTAATTATCACCACTCTATTTCTTACAGAGCATTTAAGGAACAC 51929207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3970 ACTTAAATATTCAGAACTAATTATCACCACTCTATTTCTTACAGAGCATTTAAGGAACAC 4029

 51929208 ATATATGCATATATCCTTGCACTTTGTGCTACAGGTTGTGAGCCAGGGTTACTTCCTTCT 51929267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4030 ATATATGCATATATCCTTGCACTTTGTGCTACAGGTTGTGAGCCAGGGTTACTTCCTTCT 4089

 51929268 GACCATGTGGGTTCATAATGAAGACCCAACCTTAAGGTACCCAGGGCTTAGAAATCAAAT 51929327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4090 GACCATGTGGGTTCATAATGAAGACCCAACCTTAAGGTACCCAGGGCTTAGAAATCAAAT 4149

 51929328 TTGTCCTTAGGACACTTTGGAAATCTATCTTGTAGTACAGGTGACCCAGCAGCAATCAAT 51929387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4150 TTGTCCTTAGGACACTTTGGAAATCTATCTTGTAGTACAGGTGACCCAGCAGCAATCAAT 4209

 51929388 CTTTCTGCCATCCCTAGTTTTAGTTCAGGACCCAGAAAAGTTGTAACTTGTTTCCTTTCC 51929447
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4210 CTTTCTGCCATCCCTAGTTTTACTTCAGGACCCAGAAAAGTTGTAACTTGTTTCCTTTCC 4269

 51929448 TGTGATCAAGCCTTTGTTTTCTCTTTTTTTCTCCACTTTTTGTAGCTTTTTAATTTGTTT 51929507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4270 TGTGATCAAGCCTTTGTTTTCTCTTTTTTTCTCCACTTTTTGTAGCTTTTTAATTTGTTT 4329

 51929508 CTCTGTTGATTACTAGCCCAATGCCTGAGCATCTTCGTCTTAAGACAAAGCCTCTGTGTT 51929567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4330 CTCTGTTGATTACTAGCCCAATGCCTGAGCATCTTCGTCTTAAGACAAAGCCTCTGTGTT 4389

 51929568 TCTTCAGCTCCTGAAATGACTGGCATGCTGAAAATGAGCTCAGGGCATTAGTCTTTGCTA 51929627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4390 TCTTCAGCTCCTGAAATGACTGGCATGCTGAAAATGAGCTCAGGGCATTAGTCTTTGCTA 4449

 51929628 CTAAGCCACTACAGATTCCATTCCCTTTCTTCTTGAGTATGCACACACCGCTTGTTCACA 51929687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     4450 CTAAGCCACTACAGATTCCATTCCCTTTCTTCCTGAGTATGCACACACCGCTTGTTCACA 4509

 51929688 GACTCCAGATTAGTTATTAAGCTACATCTGTATGCAGTTTGCACTCTCCTGCCTTCGA 51929745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4510 GACTCCAGATTAGTTATTAAGCTACATCTGTATGCAGTTTGCACTCTCCTGCCTTCGA 4567

Alignment time is 3.93172 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51916584,51937767] =>     21184 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [       1,    4729] =>      4729 nucs 'mol-32-34a8-191955_4729'

Score:        4595
Aligned:      4727        nucs
Identic:      4715 (100%) nucs =>      1608 (100%)      3107 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51924976,51926584] EXCISED REGION [51927768,51930884]
 second seq =>  [       1,    1610] EXCISED REGION [    1611,    4726]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1183 nucs [51926585,51927767]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [51926585,51926587] to [51927768,51927770]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [51926584,51926584] to [51927768,51927768]
 second seq =>         1 nucs [1610,1610] to [1611,1611]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 51924976 GCCCTCATAGGGACTGATTTTCTGTGAAGTAGTGAGACTTAATCTTTGGGACCTTCACTT 51925035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCCCTCATAGGGACTGATTTTCTGTGAAGTAGTGAGACTTAATCTTTGGGACCTTCACTT 60

 51925036 ACATCACTTACATAGGACCTTTCAATACTCAGGGAGGGCCCTTGGCAATAAGTTCTTCTG 51925095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACATCACTTACATAGGACCTTTCAATACTCAGGGAGGGCCCTTGGCAATAAGTTCTTCTG 120

 51925096 ACAATATATCTTGTGCTGATGGTGGTGTTAGCTTTCAAAATTTGTAATTATTTTGGTAAT 51925155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACAATATATCTTGTGCTGATGGTGGTGTTAGCTTTCAAAATTTGTAATTATTTTGGTAAT 180

 51925156 TTCTGTCATCCTAGAAAAATGTGTATAGTGTATTTGTTCCTAATTTCATTTTCATTATTT 51925215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTCTGTCATCCTAGAAAAATGTGTATAGTGTATTTGTTCCTAATTTCATTTTCATTATTT 240

 51925216 ATATATTTTTTAATGAACACCCCCAGCATAGTATAAGTTTTATACCTCTACAATCTGAAT 51925275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATATATTTTTTAATGAACACCCCCAGCATAGTATAAGTTTTATACCTCTACAATCTGAAT 300

 51925276 CACCCGCTTGGCCCATGCCTAGGACTAGGTCTTATCATCCGCAGTGAGAGATTATAGGCT 51925335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CACCCGCTTGGCCCATGCCTAGGACTAGGTCTTATCATCCGCAGTGAGAGATTATAGGCT 360

 51925336 CTTACTAGGAATTTATGGTAACATGGGCTCCTAACAGTCATGATTTTTATAACATGATTG 51925395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTTACTAGGAATTTATGGTAACATGGGCTCCTAACAGTCATGATTTTTATAACATGATTG 420

 51925396 CCTATGTATATAAAGTCCACTGGCTGAACAAGTATTTTCCCTCAAATCAGGAAGGAAAAA 51925455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCTATGTATATAAAGTCCACTGGCTGAACAAGTATTTTCCCTCAAATCAGGAAGGAAAAA 480

 51925456 AAAAAACACGAAGCAAATTGATCCTCTTCTAAAAGCTGTCACATCAGTAACCCATCATAT 51925515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAAAAACACGAAGCAAATTGATCCTCTTCTAAAAGCTGTCACATCAGTAACCCATCATAT 540

 51925516 TCTCATTTACTTATATACTGAGTAGGTAGTCACCTTTGATTCATATCTCTCAGGAGTTCA 51925575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCTCATTTACTTATATACTGAGTAGGTAGTCACCTTTGATTCATATCTCTCAGGAGTTCA 600

 51925576 GAAGTTTTTGAAAGTAATTTGTGATACAAAATATAGGGAAATTCAGAATGAGATTCTTTT 51925635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GAAGTTTTTGAAAGTAATTTGTGATACAAAATATAGGGAAATTCAGAATGAGATTCTTTT 660

 51925636 GGCTTGTCTTTCTTTTTCTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTT-ATTTGTTGAACTCAAATCC 51925694
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
      661 GGCTTGTCTTTCTTTTTCTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTATTTGTTGAACTCAAATCC 720

 51925695 GGAAATTGTGGAGGTTACTAGAACTCTAAGTCACAGACTTATAAGTACTGAAAAAGTAGT 51925754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GGAAATTGTGGAGGTTACTAGAACTCTAAGTCACAGACTTATAAGTACTGAAAAAGTAGT 780

 51925755 CAGTAAAGAAAACATACAGTAAGAGACTAGGTTAATTTTCCTATAGTTCATTGATGTTTC 51925814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CAGTAAAGAAAACATACAGTAAGAGACTAGGTTAATTTTCCTATAGTTCATTGATGTTTC 840

 51925815 CACTATTACTGCCCCTGATTTTTAACTTTAGTTTTCCTTAGATTGTTGGAGTAATATATG 51925874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CACTATTACTGCCCCTGATTTTTAACTTTAGTTTTCCTTAGATTGTTGGAGTAATATATG 900

 51925875 TACCTTAAAAATTAACTGTGGAACAAGTAGATGAACTTTTTACACAATTTCCTGCTTTTA 51925934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TACCTTAAAAATTAACTGTGGAACAAGTAGATGAACTTTTTACACAATTTCCTGCTTTTA 960

 51925935 TAAAGTTCCTACTAGCTATATTTTCCCAAAAGTGCTCAACAATAGAGTCTGGTGCTAAAA 51925994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TAAAGTTCCTACTAGCTATATTTTCCCAAAAGTGCTCAACAATAGAGTCTGGTGCTAAAA 1020

 51925995 AGCAGAGTAGGCTAAATTTAGATCAATGTGAAATGCCCTACTTATTTCCTATGAACTTAA 51926054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGCAGAGTAGGCTAAATTTAGATCAATGTGAAATGCCCTACTTATTTCCTATGAACTTAA 1080

 51926055 TTGATTGAGCTCATTTTGGGGGTGTCTTTCTGATCGACCAGAAACTTGGCTCATTAGAGC 51926114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTGATTGAGCTCATTTTGGGGGTGTCTTTCTGATCGACCAGAAACTTGGCTCATTAGAGC 1140

 51926115 AACTCACAAAGTGACCTTTTAAAAGAAAGAGTTTTCAATATATTTGTTCATGTTCCATTC 51926174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AACTCACAAAGTGACCTTTTAAAAGAAAGAGTTTTCAATATATTTGTTCATGTTCCATTC 1200

 51926175 CACTGAGAATGGTGCTATTTAAAACTAAATACAATAATTTTAGATATTGTACAGCAGATA 51926234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CACTGAGAATGGTGCTATTTAAAACTAAATACAATAATTTTAGATATTGTACAGCAGATA 1260

 51926235 TAATTTTAAACATAATACATGGGATTTCGATTTTAGGTACTGTTTATAAGGCATTTCTCC 51926294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TAATTTTAAACATAATACATGGGATTTCGATTTTAGGTACTGTTTATAAGGCATTTCTCC 1320

 51926295 TTATATTATTCTAGACTTAAATATAACAAATTTCATGCAGAGGTTTCTTTCAAAAGTAAA 51926354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTATATTATTCTAGACTTAAATATAACAAATTTCATGCAGAGGTTTCTTTCAAAAGTAAA 1380

 51926355 TTCAGCCACATTTAGACTCAAATATTCCCTAATTTTTTAGTGTAGCTGAAGTCCTAATAA 51926414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTCAGCCACATTTAGACTCAAATATTCCCTAATTTTTTAGTGTAGCTGAAGTCCTAATAA 1440

 51926415 TATACTTGTGTTTCTTTTAAATTAAGTCCCACATGTTAACTTTACAACAGAAAGTCCATG 51926474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     1441 TATACTTGTGTTTCTTTTAAATTAAGTCCCACATGTTAACTTTACAGCAGAAAGTCCATG 1500

 51926475 TATCGTATTATTAGTCTAAATCTTCATTTTACTGTTTAGTTAACACAGACATTCATTTAA 51926534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TATCGTATTATTAGTCTAAATCTTCATTTTACTGTTTAGTTAACACAGACATTCATTTAA 1560

 51926535 CACACTATGTTTAATTTCCCACTCAGTTTTGGCTTATTGTAGTCTAATAA 51926584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CACACTATGTTTAATTTCCCACTCAGTTTTGGCTTATTGTAGTCTAATAA 1610

EXCISED REGION

 51927768 ACATATAGTAAGTTGTCCATAAGTATTTGCTGGTAGATTTATTTATTTTTTAAAAAAACA 51927827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1611 ACATATAGTAAGTTGTCCATAAGTATTTGCTGGTAGATTTATTTATTTTTTAAAAAAACA 1670

 51927828 ACTTGGAAAGTTTTCTGTGTGCTTTTATATTAGAACTTGACCTTTGAAGTACCTCCAGGA 51927887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1671 ACTTGGAAAGTTTTCTGTGTGCTTTTATATTAGAACTTGACCTTTGAAGTACCTCCAGGA 1730

 51927888 AATTTTGAAGAGTGCTGGCATATGACAATGCGTAAGTTTATATTTCATGTCCATGCATGC 51927947
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     1731 AATTTTGAAGAGTGCTGGCATATGACAATGCATAAGTTTATATTTCATGTCCATGCATGC 1790

 51927948 CATTAAAATTCTAATAATGTAGTTGACAGAGCCTTTCTTGTCCCTTAAGCACTAAATTTG 51928007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1791 CATTAAAATTCTAATAATGTAGTTGACAGAGCCTTTCTTGTCCCTTAAGCACTAAATTTG 1850

 51928008 TGGCTTGCTCTAGATTGTCCCACCTGGCACAAGCGAGGTGAAATTTCAGGTCTAGCCAAC 51928067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     1851 TGGCTTGCTCTAGATTGTCCCACCTGGCACAAGCTAGGTGAAATTTCAGGTCTAGCCAAC 1910

 51928068 TTTTTTCTTTTTTTTTTTTTAACAAGTATTAAAAACATTTTCATATATATTCCCTGTATT 51928127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1911 TTTTTTCTTTTTTTTTTTTTAACAAGTATTAAAAACATTTTCATATATATTCCCTGTATT 1970

 51928128 ATTTCACCTATTTTTGTGTGTGTGTTTCTATCACACTGCCACATCAAAAACCTCTTCTTG 51928187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1971 ATTTCACCTATTTTTGTGTGTGTGTTTCTATCACACTGCCACATCAAAAACCTCTTCTTG 2030

 51928188 AACGACTATAGTATAGTGGTTAATAGTTCAGTGTCTAGATCAAGACCACCTATGGACGTA 51928247
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2031 AACGACTATAGTATAGTGATTAATAGTTCAGTGTCTAGATCAAGACCACCTATGGACGTA 2090

 51928248 TCTTGGCTCTGATTTTACCAGCCGTACAATCCTGGAGAATCTGTTCAAGAGAAATGTGCC 51928307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2091 TCTTGGCTCTGATTTTACCAGCCGTACAATCCTGGAGAATCTGTTCAAGAGAAATGTGCC 2150

 51928308 TCAATTACGTATCTCTAAAGTAGTTGTAGCTATAGAACCTGTTCCATAGATGTGGATCAG 51928367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2151 TCAATTACGTATCTCTAAAGTAGTTGTAGCTATAGAACCTGTTCCATAGATGTGGATCAG 2210

 51928368 AACACTGCATGACATTTAGAAAATGTTTAATAAATGATGTTGCTGTACTTGTTGCTGTTA 51928427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2211 AACACTGCATGACATTTAGAAAATGTTTAATAAATGATGTTGCTGTACTTGTTGCTGTTA 2270

 51928428 TTGTTGCTCTGTCATGTTAGGAGAACTCTCATTTACCCTAGTGTTCTCTCAAAGTGAAAT 51928487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2271 TTGTTGCTCTGTCATGTTAGGAGAACTCTCATTTACCCTAGTGTTCTCTCAAAGTGAAAT 2330

 51928488 ACAGATCATTACCTCTTGAAATCATGTCCAAGTAACTTCAGAATTATTTAGAAATCATTT 51928547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2331 ACAGATCATTACCTCTTGAAATCATGTCCAAGTAACTTCAGAATTATTTAGAAATCATTT 2390

 51928548 ATCTAAATCAGAGTATTTCTTGATATAATTTAAAGTTGATTGTATTTGAAAGTACATATG 51928607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2391 ATCTAAATCAGAGTATTTCTTGATATAATTTAAAGTTGATTGTATTTGAAAGTACATATG 2450

 51928608 TCAATCTAGTATGAGATAATCTCAAGGAAATAAAAATGTATAGGTCTAATTTACATTTTT 51928667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2451 TCAATCTAGTATGAGATAATCTCAAGGAAATAAAAATGTATAGGTCTAATTTACATTTTT 2510

 51928668 ATATGGAAGGAGATAATTACTTTCTATCACAAATGATGAAGGCTGACGTTTGTTTCTTTT 51928727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2511 ATATGGAAGGAGATAATTACTTTCTATCACAAATGATGAAGGCTGACGTTTGTTTCTTTT 2570

 51928728 TTACTTTTAATTTTCACTTATATTTTGTTTATTATCAATATTTGCTTTTTAAAAGGTGGG 51928787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2571 TTACTTTTAATTTTCACTTATATTTTGTTTATTATCAATATTTGCTTTTTAAAAGGTGGG 2630

 51928788 AAGAAATCAACCAATCAAACATTAAAAAGCAATATGGAGGAGGGTGATATAATGCCCACT 51928847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2631 AAGAAATCAACCAATCAAACATTAAAAAGCAATATGGAGGAGGGTGATATAATGCCCACT 2690

 51928848 TATATTTCTCTTATAATTTTAAATATTTTCATAATTAACAGAATAATTAGCACTGGTAAT 51928907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2691 TATATTTCTCTTATAATTTTAAATATTTTCATAATTAACAGAATAATTAGCACTGGTAAT 2750

 51928908 ATTAAAATACCATCAAAAGAATCTAAATGTATGTGCTTTCTGTTGCAGCCTTGTTAGATG 51928967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2751 ATTAAAATACCATCAAAAGAATCTAAATGTATGTGCTTTCTGTTGCAGCCTTGTTAGATG 2810

 51928968 TTTCAGTGGATTCAAAGTGTTGTTATAAGAAAACGTGATTTATCAAGACTTTCATGTGTA 51929027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2811 TTTCAGTGGATTCAAAGTGTTGTTATAAGAAAACGTGATTTATCAAGACTTTCATGTGTA 2870

 51929028 AAATAAAAGGCATTTTCAATGACTACTTGGCCAGGCTTTCAGATTCCAATGCCAAGATGT 51929087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2871 AAATAAAAGGCATTTTCAATGACTACTTGGCCAGGCTTTCAGATTCCAATGCCAAGATGT 2930

 51929088 TGTATTTTGATATTGCAGTTTTCTAACAACAACAAAGTTGAGTGGACTTCTGGAACTAAA 51929147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2931 TGTATTTTGATATTGCAGTTTTCTAACAACAACAAAGTTGAGTGGACTTCTGGAACTAAA 2990

 51929148 ACTTAAATATTCAGAACTAATTATCACCACTCTATTTCTTACAGAGCATTTAAGGAACAC 51929207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2991 ACTTAAATATTCAGAACTAATTATCACCACTCTATTTCTTACAGAGCATTTAAGGAACAC 3050

 51929208 ATATATGCATATATCCTTGCACTTTGTGCTACAGGTTGTGAGCCAGGGTTACTTCCTTCT 51929267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3051 ATATATGCATATATCCTTGCACTTTGTGCTACAGGTTGTGAGCCAGGGTTACTTCCTTCT 3110

 51929268 GACCATGTGGGTTCATAATGAAGACCCAACCTTAAGGTACCCAGGGCTTAGAAATCAAAT 51929327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3111 GACCATGTGGGTTCATAATGAAGACCCAACCTTAAGGTACCCAGGGCTTAGAAATCAAAT 3170

 51929328 TTGTCCTTAGGACACTTTGGAAATCTATCTTGTAGTACAGGTGACCCAGCAGCAATCAAT 51929387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3171 TTGTCCTTAGGACACTTTGGAAATCTATCTTGTAGTACAGGTGACCCAGCAGCAATCAAT 3230

 51929388 CTTTCTGCCATCCCTAGTTTTAGTTCAGGACCCAGAAAAGTTGTAACTTGTTTCCTTTCC 51929447
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3231 CTTTCTGCCATCCCTAGTTTTACTTCAGGACCCAGAAAAGTTGTAACTTGTTTCCTTTCC 3290

 51929448 TGTGATCAAGCCTTTGTTTTCTCTTTTTTTCTCCACTTTTTGTAGCTTTTTAATTTGTTT 51929507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3291 TGTGATCAAGCCTTTGTTTTCTCTTTTTTTCTCCACTTTTTGTAGCTTTTTAATTTGTTT 3350

 51929508 CTCTGTTGATTACTAGCCCAATGCCTGAGCATCTTCGTCTTAAGACAAAGCCTCTGTGTT 51929567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3351 CTCTGTTGATTACTAGCCCAATGCCTGAGCATCTTCGTCTTAAGACAAAGCCTCTGTGTT 3410

 51929568 TCTTCAGCTCCTGAAATGACTGGCATGCTGAAAATGAGCTCAGGGCATTAGTCTTTGCTA 51929627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3411 TCTTCAGCTCCTGAAATGACTGGCATGCTGAAAATGAGCTCAGGGCATTAGTCTTTGCTA 3470

 51929628 CTAAGCCACTACAGATTCCATTCCCTTTCTTCTTGAGTATGCACACACCGCTTGTTCACA 51929687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     3471 CTAAGCCACTACAGATTCCATTCCCTTTCTTCCTGAGTATGCACACACCGCTTGTTCACA 3530

 51929688 GACTCCAGATTAGTTATTAAGCTACATCTGTATGCAGTTTGCACTCTCCTGCCTTCGACC 51929747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3531 GACTCCAGATTAGTTATTAAGCTACATCTGTATGCAGTTTGCACTCTCCTGCCTTCGACC 3590

 51929748 TGCTTGTCCCAGAAGTTATTCACCATATTCTACCTTGATCATATTTTCTACTTGTCAATG 51929807
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     3591 TGCTTGTCCCAGAAGTTATTCACCATACTCTACCTTGATCATATTTTCTACTTGTCAATG 3650

 51929808 CGCATGTCAATTAAGAACTTTTAACATTTATTGACCATTTATTATATACTAGCCAGTCTT 51929867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3651 CGCATGTCAATTAAGAACTTTTAACATTTATTGACCATTTATTATATACTAGCCAGTCTT 3710

 51929868 TTAATTGATTTATGAACAATTAACTTAATCATCATATAAGCATAGTAGGGTACAATTAGT 51929927
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3711 TTAATTGCTTTATGAACAATTAACTTAATCATCATATAAGCATAGTAGGGTACAATTAGT 3770

 51929928 TCCCCAACTTTATATATGAACAAATGGACTTTCAGAAAGGTAAGGTAAAATATCCACGGT 51929987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3771 TCCCCAACTTTATATATGAACAAATGGACTTTCAGAAAGGTAAGGTAAAATATCCACGGT 3830

 51929988 AAGAAAGCCTGCATATGTGGAACTGGGAATTGAACCCCTATGTCTGACCCGAGGGTCCAT 51930047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3831 AAGAAAGCCTGCATATGTGGAACTGGGAATTGAACCCCTATGTCTGACCCGAGGGTCCAT 3890

 51930048 ACACTTAAGCATTATGCTATCAAGTTTTCCACAGCCTGCTTTTCGGCTTCTCTCTCTTTC 51930107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3891 ACACTTAAGCATTATGCTATCAAGTTTTCCACAGCCTGCTTTTCGGCTTCTCTCTCTTTC 3950

 51930108 TTTCTTTCCTGATCTCTGTTGCAATTCCTACCTTTCAACTCCCTTCTGACCATGGATAGT 51930167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     3951 TTTCTTTCCTGATCTCTGTTGCAATTCCTACCTTTCAACTCCCTTCTGACCATGGACAGT 4010

 51930168 TTGCAAAATGCCAGAGGTACGTCTCAAAGAAGCTTCAAATAGGAGCGTGTACTACCATTA 51930227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4011 TTGCAAAATGCCAGAGGTACGTCTCAAAGAAGCTTCAAATAGGAGCGTGTACTACCATTA 4070

 51930228 AGTCAGCTCCTCAGTTGTCTTCTTTGGATTGAGAAGCACTTCATCACTTTTTACACAGGT 51930287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4071 AGTCAGCTCCTCAGTTGTCTTCTTTGGATTGAGAAGCACTTCATCACTTTTTACACAGGT 4130

 51930288 TTAATTATCAAATATGACTTTTCTAGTACTACAGCTAATATATGTCAATGTCAAAGGGTT 51930347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4131 TTAATTATCAAATATGACTTTTCTAGTACTACAGCTAATATATGTCAATGTCAAAGGGTT 4190

 51930348 AACAGAATACTAGGCCTATATTAAATTATACATATGAGCTTTCTCTTTACTCCTTTTTAT 51930407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4191 AACAGAATACTAGGCCTATATTAAATTATACATATGAGCTTTCTCTTTACTCCTTTTTAT 4250

 51930408 GTTCATTAGCAAACAGATAAAGCCATAATAGATTTTTTAAGGAATATTTTGTTTTGTTTT 51930467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4251 GTTCATTAGCAAACAGATAAAGCCATAATAGATTTTTTAAGGAATATTTTGTTTTGTTTT 4310

 51930468 GTTTTGGACTTATACATCTATTAACAATAAACCAAACATTGCAGATTAAAGCAAATCTGC 51930527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4311 GTTTTGGACTTATACATCTATTAACAATAAACCAAACATTGCAGATTAAAGCAAATCTGC 4370

 51930528 CAATCTGTTTTACAAACACTATCTTCTGAAGGGTTCCTGGGCACAAGATACTGTTCTAGT 51930587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4371 CAATCTGTTTTACAAACACTATCTTCTGAAGGGTTCCTGGGCACAAGATACTGTTCTAGT 4430

 51930588 AATATTTCACAGCTTTTTTTTTTTTTTCATTTTAGAGAAAATATTCTAAGACTCCAAAGT 51930647
          ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4431 AATATTTCACAGC-TTTTTTTTTTTTTCATTTTAGAGAAAATATTCTAAGACTCCAAAGT 4489

 51930648 TCGATAGTATTTGGTCAGTGTCTTAGTCAGTTTGAGCTAATATAACAAATTATCATAGAA 51930707
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4490 TAGATAGTATTTGGTCAGTGTCTTAGTCAGTTTGAGCTAATATAACAAATTATCATAGAA 4549

 51930708 TAAGTGTCTCAAGCAACAGAAATGTATTTTTTACAATCTGGAGGCTGCAAAGTCCAGAAT 51930767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4550 TAAGTGTCTCAAGCAACAGAAATGTATTTTTTACAATCTGGAGGCTGCAAAGTCCAGAAT 4609

 51930768 CAAGATGCTGGCAGATCTGGTGTCTGATGAGGACCCACCTTCTTATTTGCAAATGATCAT 51930827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4610 CAAGATGCTGGCAGATCTGGTGTCTGATGAGGACCCACCTTCTTATTTGCAAATGATCAT 4669

 51930828 TTTTGTTGTGTCCTCACATGACAAAGAGCAGAGAGAGCAAGCACTCTTGTGTCTCTT 51930884
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4670 TTTTGTTGTGTCCTCACATGACAAAGAGCAGAGAGAGCAAGCACTCTTGTGTCTCTT 4726

Alignment time is 4.65106 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51916584,51937767] =>     21184 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [       1,    6572] =>      6572 nucs 'mol-32-34b3-061793_6572'

Score:        6392
Aligned:      6591        nucs
Identic:      6559 (100%) nucs =>      3448 ( 99%)      3111 (100%)
Gaps:           21 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51923115,51926584] EXCISED REGION [51927768,51930886]
 second seq =>  [       1,    3452] EXCISED REGION [    3453,    6572]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1183 nucs [51926585,51927767]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [51926585,51926587] to [51927768,51927770]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [51926584,51926584] to [51927768,51927768]
 second seq =>         1 nucs [3452,3452] to [3453,3453]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 51923115 ACACCTTAAGCTCCTCAAAAGCACAAAACGCAAATTCTATTTCTTTGTCAACCCTCTCTC 51923174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACACCTTAAGCTCCTCAAAAGCACAAAACGCAAATTCTATTTCTTTGTCAACCCTCTCTC 60

 51923175 TAGTAAAGTTCTAGGTAAAGAATAAATGCATGACTGATTGTTTTAATGAGCGCTAATGGG 51923234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAGTAAAGTTCTAGGTAAAGAATAAATGCATGACTGATTGTTTTAATGAGCGCTAATGGG 120

 51923235 TGTTGTTAAATCCCTTACTATCTGAGGAGATCGTTGCTTATGGCAGCCCCTGTGATTTTA 51923294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGTTGTTAAATCCCTTACTATCTGAGGAGATCGTTGCTTATGGCAGCCCCTGTGATTTTA 180

 51923295 AAAGCTCTTCCATGTTGGAATAAAGGCAAAATACAGTGATTTCAAAGAACTGGGGAGAGA 51923354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAAGCTCTTCCATGTTGGAATAAAGGCAAAATACAGTGATTTCAAAGAACTGGGGAGAGA 240

 51923355 AATTTTAAGATTTCCTTTTGGGAAAATTTCAGGCAAAAAATTACATCTTATAATCCATTC 51923414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AATTTTAAGATTTCCTTTTGGGAAAATTTCAGGCAAAAAATTACATCTTATAATCCATTC 300

 51923415 CAGGCTTTTGATTGTATGATTACCCCATTTACAATTGATGTTGAAAATAATATTTTCTCA 51923474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CAGGCTTTTGATTGTATGATTACCCCATTTACAATTGATGTTGAAAATAATATTTTCTCA 360

 51923475 CTTGCCACAGCCTCTTCTTTGCATTCTCTCACCCTCAGCTATTATATATTAGCTCAGTAC 51923534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTTGCCACAGCCTCTTCTTTGCATTCTCTCACCCTCAGCTATTATATATTAGCTCAGTAC 420

 51923535 CTGCATTATTTACAGGAACTGAAAAACAGGGTTGAAGATTATAAAATCTCACATTTGCTG 51923594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTGCATTATTTACAGGAACTGAAAAACAGGGTTGAAGATTATAAAATCTCACATTTGCTG 480

 51923595 ACTTTTATGCAGGTTAAATGAAAGAGTTTTATAATTGTTTCTGCCAACCAGTAGGTTCAA 51923654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACTTTTATGCAGGTTAAATGAAAGAGTTTTATAATTGTTTCTGCCAACCAGTAGGTTCAA 540

 51923655 AATGTTTATTAAAAGTGAATTCTGGATAAATTATGATTAATGTCCTTCTGGTTTGTTTTG 51923714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AATGTTTATTAAAAGTGAATTCTGGATAAATTATGATTAATGTCCTTCTGGTTTGTTTTG 600

 51923715 CTTGAGCCTACACACACACACACACACACACACACACACACACACACATATACACACACA 51923774
          ||||||||||||||||||||||||||||||                  ||||||||||||
      601 CTTGAGCCTACACACACACACACACACACA------------------TATACACACACA 642

 51923775 TATATATATAACTTTATATAAAACTATAAATACTAGGAACTAGCACTAGAACTGTACTTT 51923834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      643 TATATATATAACTTTATATAAAACTATAAATACTAGGAACTAGCACTAGAACTGTACTTT 702

 51923835 TCACTACAGTATCAGTAAAAAAAAAAAA-TTTAGGATTTTTTATGACTGATTTTACATTT 51923893
          |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
      703 TCACTACAGTATCAGTAAAAAAAAAAAAATTTAGGATTTTTTATGACTGATTTTACATTT 762

 51923894 AAACCTAAAGGAAAAATAATCAGGAACAACACAGAGTTTTTTTTTTTAAATGAGTTGGCA 51923953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      763 AAACCTAAAGGAAAAATAATCAGGAACAACACAGAGTTTTTTTTTTTAAATGAGTTGGCA 822

 51923954 AAGAAAATACCAAAGGCTCAAACCTGACAAAAGCATTGAGAATACCAGAAAAGAAATTTT 51924013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      823 AAGAAAATACCAAAGGCTCAAACCTGACAAAAGCATTGAGAATACCAGAAAAGAAATTTT 882

 51924014 AACCTTTAAATTTAATTGAAACATGATATTTTTCTCTTTTGAAACATTTCTTTCTCTACA 51924073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      883 AACCTTTAAATTTAATTGAAACATGATATTTTTCTCTTTTGAAACATTTCTTTCTCTACA 942

 51924074 AAAATCTGTTCCTTCAGAACCTGTTGATGCAATAATATTATATCATTTTTTTTTACTGGT 51924133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      943 AAAATCTGTTCCTTCAGAACCTGTTGATGCAATAATATTATATCATTTTTTTTTACTGGT 1002

 51924134 CAATGTATTTATTTGTAATTGTTCTGAAATTGTTTCCTGCAAGGTTTTCTATTACTCAAA 51924193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1003 CAATGTATTTATTTGTAATTGTTCTGAAATTGTTTCCTGCAAGGTTTTCTATTACTCAAA 1062

 51924194 CTGTCTTTGTACACATAATTTTCCTTTCATGCCATTTATGAACCATTTTTTATTTCTATG 51924253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1063 CTGTCTTTGTACACATAATTTTCCTTTCATGCCATTTATGAACCATTTTTTATTTCTATG 1122

 51924254 GTTGATAGAGAATGACTTCATAATTCATTTCTGAATAAGTGAAATAATTTAAAAACATTT 51924313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1123 GTTGATAGAGAATGACTTCATAATTCATTTCTGAATAAGTGAAATAATTTAAAAACATTT 1182

 51924314 TAAAGTGGGTGTATCTACTTGCTTGGAGCTTTGTCGAATCATGTTTCTTATTTGGAGCCT 51924373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1183 TAAAGTGGGTGTATCTACTTGCTTGGAGCTTTGTCGAATCATGTTTCTTATTTGGAGCCT 1242

 51924374 CTGGAGGAATGTTGACTTACCATGGTAAAAATTAACTGGTGAAACTCTAAAGAAAACACA 51924433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1243 CTGGAGGAATGTTGACTTACCATGGTAAAAATTAACTGGTGAAACTCTAAAGAAAACACA 1302

 51924434 GACTCTACACGCAGTCTTGTCCGAAACTTACTCACCCTGAAACCAATGAATTTCAAAGAC 51924493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1303 GACTCTACACGCAGTCTTGTCCGAAACTTACTCACCCTGAAACCAATGAATTTCAAAGAC 1362

 51924494 CTAGATACTTCCTTCTGTGATGTCCCCTGAGATCAGAGAATAAAAGAAAAATCCCTCGTA 51924553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1363 CTAGATACTTCCTTCTGTGATGTCCCCTGAGATCAGAGAATAAAAGAAAAATCCCTCGTA 1422

 51924554 AATATACATCACGTACAGCTGTTTGATTTATGCATTATGCAGAAACTAAGAAAACAGAGT 51924613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1423 AATATACATCACGTACAGCTGTTTGATTTATGCATTATGCAGAAACTAAGAAAACAGAGT 1482

 51924614 TATATGTAACCTTGCAATGAGAAGTGCACCCACCAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCCCAAA 51924673
          ||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
     1483 TATATGTAACTTTGCAATGAGAAGTGCACCCACCAAAAAAAAAAAAAAAAAA-TCCCAAA 1541

 51924674 ACATTGTTTCAAAAAGAAGTGGTATGAAGCATCTTAGTGTTTCATGAATATTGAAGAATA 51924733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1542 ACATTGTTTCAAAAAGAAGTGGTATGAAGCATCTTAGTGTTTCATGAATATTGAAGAATA 1601

 51924734 GTGCAATTATTGAAATTTGGCATTTAAAAAATGTTTTTAAATTATTAGGAAGCTACCGTG 51924793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1602 GTGCAATTATTGAAATTTGGCATTTAAAAAATGTTTTTAAATTATTAGGAAGCTACCGTG 1661

 51924794 ACCTGTTTACTAAATCCTCAATTCTTTCTCTCTCAGTTTTTCTTACTATAAAATTTACTT 51924853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1662 ACCTGTTTACTAAATCCTCAATTCTTTCTCTCTCAGTTTTTCTTACTATAAAATTTACTT 1721

 51924854 TTCAAGCCAGAGAATTTTTCTTTCTGACAAGACGTAGATCTATATTGCGCTGTCAAGATG 51924913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1722 TTCAAGCCAGAGAATTTTTCTTTCTGACAAGACGTAGATCTATATTGCGCTGTCAAGATG 1781

 51924914 CAGCTTTTGCATCTCTGCTGCCATGTGGATAGAATAACTTTCTTTCCTCAAGAAGTGGAC 51924973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1782 CAGCTTTTGCATCTCTGCTGCCATGTGGATAGAATAACTTTCTTTCCTCAAGAAGTGGAC 1841

 51924974 AAGCCCTCATAGGGACTGATTTTCTGTGAAGTAGTGAGACTTAATCTTTGGGACCTTCAC 51925033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1842 AAGCCCTCATAGGGACTGATTTTCTGTGAAGTAGTGAGACTTAATCTTTGGGACCTTCAC 1901

 51925034 TTACATCACTTACATAGGACCTTTCAATACTCAGGGAGGGCCCTTGGCAATAAGTTCTTC 51925093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1902 TTACATCACTTACATAGGACCTTTCAATACTCAGGGAGGGCCCTTGGCAATAAGTTCTTC 1961

 51925094 TGACAATATATCTTGTGCTGATGGTGGTGTTAGCTTTCAAAATTTGTAATTATTTTGGTA 51925153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1962 TGACAATATATCTTGTGCTGATGGTGGTGTTAGCTTTCAAAATTTGTAATTATTTTGGTA 2021

 51925154 ATTTCTGTCATCCTAGAAAAATGTGTATAGTGTATTTGTTCCTAATTTCATTTTCATTAT 51925213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2022 ATTTCTGTCATCCTAGAAAAATGTGTATAGTGTATTTGTTCCTAATTTCATTTTCATTAT 2081

 51925214 TTATATATTTTTTAATGAACACCCCCAGCATAGTATAAGTTTTATACCTCTACAATCTGA 51925273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2082 TTATATATTTTTTAATGAACACCCCCAGCATAGTATAAGTTTTATACCTCTACAATCTGA 2141

 51925274 ATCACCCGCTTGGCCCATGCCTAGGACTAGGTCTTATCATCCGCAGTGAGAGATTATAGG 51925333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2142 ATCACCCGCTTGGCCCATGCCTAGGACTAGGTCTTATCATCCGCAGTGAGAGATTATAGG 2201

 51925334 CTCTTACTAGGAATTTATGGTAACATGGGCTCCTAACAGTCATGATTTTTATAACATGAT 51925393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2202 CTCTTACTAGGAATTTATGGTAACATGGGCTCCTAACAGTCATGATTTTTATAACATGAT 2261

 51925394 TGCCTATGTATATAAAGTCCACTGGCTGAACAAGTATTTTCCCTCAAATCAGGAAGGAAA 51925453
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2262 TGCCTGTGTATATAAAGTCCACTGGCTGAACAAGTATTTTCCCTCAAATCAGGAAGGAAA 2321

 51925454 AAAAAAAACACGAAGCAAATTGATCCTCTTCTAAAAGCTGTCACATCAGTAACCCATCAT 51925513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2322 AAAAAAAACACGAAGCAAATTGATCCTCTTCTAAAAGCTGTCACATCAGTAACCCATCAT 2381

 51925514 ATTCTCATTTACTTATATACTGAGTAGGTAGTCACCTTTGATTCATATCTCTCAGGAGTT 51925573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2382 ATTCTCATTTACTTATATACTGAGTAGGTAGTCACCTTTGATTCATATCTCTCAGGAGTT 2441

 51925574 CAGAAGTTTTTGAAAGTAATTTGTGATACAAAATATAGGGAAATTCAGAATGAGATTCTT 51925633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2442 CAGAAGTTTTTGAAAGTAATTTGTGATACAAAATATAGGGAAATTCAGAATGAGATTCTT 2501

 51925634 TTGGCTTGTCTTTCTTTTTCTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTATTTGTTGAACTCAAATC 51925693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2502 TTGGCTTGTCTTTCTTTTTCTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTATTTGTTGAACTCAAATC 2561

 51925694 CGGAAATTGTGGAGGTTACTAGAACTCTAAGTCACAGACTTATAAGTACTGAAAAAGTAG 51925753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2562 CGGAAATTGTGGAGGTTACTAGAACTCTAAGTCACAGACTTATAAGTACTGAAAAAGTAG 2621

 51925754 TCAGTAAAGAAAACATACAGTAAGAGACTAGGTTAATTTTCCTATAGTTCATTGATGTTT 51925813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2622 TCAGTAAAGAAAACATACAGTAAGAGACTAGGTTAATTTTCCTATAGTTCATTGATGTTT 2681

 51925814 CCACTATTACTGCCCCTGATTTTTAACTTTAGTTTTCCTTAGATTGTTGGAGTAATATAT 51925873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2682 CCACTATTACTGCCCCTGATTTTTAACTTTAGTTTTCCTTAGATTGTTGGAGTAATATAT 2741

 51925874 GTACCTTAAAAATTAACTGTGGAACAAGTAGATGAACTTTTTACACAATTTCCTGCTTTT 51925933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2742 GTACCTTAAAAATTAACTGTGGAACAAGTAGATGAACTTTTTACACAATTTCCTGCTTTT 2801

 51925934 ATAAAGTTCCTACTAGCTATATTTTCCCAAAAGTGCTCAACAATAGAGTCTGGTGCTAAA 51925993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2802 ATAAAGTTCCTACTAGCTATATTTTCCCAAAAGTGCTCAACAATAGAGTCTGGTGCTAAA 2861

 51925994 AAGCAGAGTAGGCTAAATTTAGATCAATGTGAAATGCCCTACTTATTTCCTATGAACTTA 51926053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2862 AAGCAGAGTAGGCTAAATTTAGATCAATGTGAAATGCCCTACTTATTTCCTATGAACTTA 2921

 51926054 ATTGATTGAGCTCATTTTGGGGGTGTCTTTCTGATCGACCAGAAACTTGGCTCATTAGAG 51926113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2922 ATTGATTGAGCTCATTTTGGGGGTGTCTTTCTGATCGACCAGAAACTTGGCTCATTAGAG 2981

 51926114 CAACTCACAAAGTGACCTTTTAAAAGAAAGAGTTTTCAATATATTTGTTCATGTTCCATT 51926173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2982 CAACTCACAAAGTGACCTTTTAAAAGAAAGAGTTTTCAATATATTTGTTCATGTTCCATT 3041

 51926174 CCACTGAGAATGGTGCTATTTAAAACTAAATACAATAATTTTAGATATTGTACAGCAGAT 51926233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3042 CCACTGAGAATGGTGCTATTTAAAACTAAATACAATAATTTTAGATATTGTACAGCAGAT 3101

 51926234 ATAATTTTAAACATAATACATGGGATTTCGATTTTAGGTACTGTTTATAAGGCATTTCTC 51926293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3102 ATAATTTTAAACATAATACATGGGATTTCGATTTTAGGTACTGTTTATAAGGCATTTCTC 3161

 51926294 CTTATATTATTCTAGACTTAAATATAACAAATTTCATGCAGAGGTTTCTTTCAAAAGTAA 51926353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3162 CTTATATTATTCTAGACTTAAATATAACAAATTTCATGCAGAGGTTTCTTTCAAAAGTAA 3221

 51926354 ATTCAGCCACATTTAGACTCAAATATTCCCTAATTTTTTAGTGTAGCTGAAGTCCTAATA 51926413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3222 ATTCAGCCACATTTAGACTCAAATATTCCCTAATTTTTTAGTGTAGCTGAAGTCCTAATA 3281

 51926414 ATATACTTGTGTTTCTTTTAAATTAAGTCCCACATGTTAACTTTACAACAGAAAGTCCAT 51926473
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     3282 ATATACTTGTGTTTCTTTTAAATTAAGTCCCACATGTTAACTTTACAGCAGAAAGTCCAT 3341

 51926474 GTATCGTATTATTAGTCTAAATCTTCATTTTACTGTTTAGTTAACACAGACATTCATTTA 51926533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3342 GTATCGTATTATTAGTCTAAATCTTCATTTTACTGTTTAGTTAACACAGACATTCATTTA 3401

 51926534 ACACACTATGTTTAATTTCCCACTCAGTTTTGGCTTATTGTAGTCTAATAA 51926584
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3402 ACACACTATGTTTAATTTCCCACTCAGTTTTGGCTTATTGTAGTCTAATAA 3452

EXCISED REGION

 51927768 ACATATAGTAAGTTGTCCATAAGTATTTGCTGGTAGATTTATTTATTTTTTAAAAAAACA 51927827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3453 ACATATAGTAAGTTGTCCATAAGTATTTGCTGGTAGATTTATTTATTTTTTAAAAAAACA 3512

 51927828 ACTTGGAAAGTTTTCTGTGTGCTTTTATATTAGAACTTGACCTTTGAAGTACCTCCAGGA 51927887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3513 ACTTGGAAAGTTTTCTGTGTGCTTTTATATTAGAACTTGACCTTTGAAGTACCTCCAGGA 3572

 51927888 AATTTTGAAGAGTGCTGGCATATGACAATGCGTAAGTTTATATTTCATGTCCATGCATGC 51927947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3573 AATTTTGAAGAGTGCTGGCATATGACAATGCGTAAGTTTATATTTCATGTCCATGCATGC 3632

 51927948 CATTAAAATTCTAATAATGTAGTTGACAGAGCCTTTCTTGTCCCTTAAGCACTAAATTTG 51928007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3633 CATTAAAATTCTAATAATGTAGTTGACAGAGCCTTTCTTGTCCCTTAAGCACTAAATTTG 3692

 51928008 TGGCTTGCTCTAGATTGTCCCACCTGGCACAAGCGAGGTGAAATTTCAGGTCTAGCCAAC 51928067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     3693 TGGCTTGCTCTAGATTGTCCCACCTGGCACAAGCTAGGTGAAATTTCAGGTCTAGCCAAC 3752

 51928068 TTTTTTCTTTTTTTTTTTTTAACAAGTATTAAAAACATTTTCATATATATTCCCTGTATT 51928127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3753 TTTTTTCTTTTTTTTTTTTTAACAAGTATTAAAAACATTTTCATATATATTCCCTGTATT 3812

 51928128 ATTTCACCTATTTTTGTGTGTGTGTTTCTATCACACTGCCACATCAAAAACCTCTTCTTG 51928187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3813 ATTTCACCTATTTTTGTGTGTGTGTTTCTATCACACTGCCACATCAAAAACCTCTTCTTG 3872

 51928188 AACGACTATAGTATAGTGGTTAATAGTTCAGTGTCTAGATCAAGACCACCTATGGACGTA 51928247
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3873 AACGACTATAGTATAGTGATTAATAGTTCAGTGTCTAGATCAAGACCACCTATGGACGTA 3932

 51928248 TCTTGGCTCTGATTTTACCAGCCGTACAATCCTGGAGAATCTGTTCAAGAGAAATGTGCC 51928307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3933 TCTTGGCTCTGATTTTACCAGCCGTACAATCCTGGAGAATCTGTTCAAGAGAAATGTGCC 3992

 51928308 TCAATTACGTATCTCTAAAGTAGTTGTAGCTATAGAACCTGTTCCATAGATGTGGATCAG 51928367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3993 TCAATTACGTATCTCTAAAGTAGTTGTAGCTATAGAACCTGTTCCATAGATGTGGATCAG 4052

 51928368 AACACTGCATGACATTTAGAAAATGTTTAATAAATGATGTTGCTGTACTTGTTGCTGTTA 51928427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4053 AACACTGCATGACATTTAGAAAATGTTTAATAAATGATGTTGCTGTACTTGTTGCTGTTA 4112

 51928428 TTGTTGCTCTGTCATGTTAGGAGAACTCTCATTTACCCTAGTGTTCTCTCAAAGTGAAAT 51928487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4113 TTGTTGCTCTGTCATGTTAGGAGAACTCTCATTTACCCTAGTGTTCTCTCAAAGTGAAAT 4172

 51928488 ACAGATCATTACCTCTTGAAATCATGTCCAAGTAACTTCAGAATTATTTAGAAATCATTT 51928547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4173 ACAGATCATTACCTCTTGAAATCATGTCCAAGTAACTTCAGAATTATTTAGAAATCATTT 4232

 51928548 ATCTAAATCAGAGTATTTCTTGATATAATTTAAAGTTGATTGTATTTGAAAGTACATATG 51928607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4233 ATCTAAATCAGAGTATTTCTTGATATAATTTAAAGTTGATTGTATTTGAAAGTACATATG 4292

 51928608 TCAATCTAGTATGAGATAATCTCAAGGAAATAAAAATGTATAGGTCTAATTTACATTTTT 51928667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4293 TCAATCTAGTATGAGATAATCTCAAGGAAATAAAAATGTATAGGTCTAATTTACATTTTT 4352

 51928668 ATATGGAAGGAGATAATTACTTTCTATCACAAATGATGAAGGCTGACGTTTGTTTCTTTT 51928727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4353 ATATGGAAGGAGATAATTACTTTCTATCACAAATGATGAAGGCTGACGTTTGTTTCTTTT 4412

 51928728 TTACTTTTAATTTTCACTTATATTTTGTTTATTATCAATATTTGCTTTTTAAAAGGTGGG 51928787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4413 TTACTTTTAATTTTCACTTATATTTTGTTTATTATCAATATTTGCTTTTTAAAAGGTGGG 4472

 51928788 AAGAAATCAACCAATCAAACATTAAAAAGCAATATGGAGGAGGGTGATATAATGCCCACT 51928847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4473 AAGAAATCAACCAATCAAACATTAAAAAGCAATATGGAGGAGGGTGATATAATGCCCACT 4532

 51928848 TATATTTCTCTTATAATTTTAAATATTTTCATAATTAACAGAATAATTAGCACTGGTAAT 51928907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4533 TATATTTCTCTTATAATTTTAAATATTTTCATAATTAACAGAATAATTAGCACTGGTAAT 4592

 51928908 ATTAAAATACCATCAAAAGAATCTAAATGTATGTGCTTTCTGTTGCAGCCTTGTTAGATG 51928967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4593 ATTAAAATACCATCAAAAGAATCTAAATGTATGTGCTTTCTGTTGCAGCCTTGTTAGATG 4652

 51928968 TTTCAGTGGATTCAAAGTGTTGTTATAAGAAAACGTGATTTATCAAGACTTTCATGTGTA 51929027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4653 TTTCAGTGGATTCAAAGTGTTGTTATAAGAAAACGTGATTTATCAAGACTTTCATGTGTA 4712

 51929028 AAATAAAAGGCATTTTCAATGACTACTTGGCCAGGCTTTCAGATTCCAATGCCAAGATGT 51929087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4713 AAATAAAAGGCATTTTCAATGACTACTTGGCCAGGCTTTCAGATTCCAATGCCAAGATGT 4772

 51929088 TGTATTTTGATATTGCAGTTTTCTAACAACAACAAAGTTGAGTGGACTTCTGGAACTAAA 51929147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4773 TGTATTTTGATATTGCAGTTTTCTAACAACAACAAAGTTGAGTGGACTTCTGGAACTAAA 4832

 51929148 ACTTAAATATTCAGAACTAATTATCACCACTCTATTTCTTACAGAGCATTTAAGGAACAC 51929207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4833 ACTTAAATATTCAGAACTAATTATCACCACTCTATTTCTTACAGAGCATTTAAGGAACAC 4892

 51929208 ATATATGCATATATCCTTGCACTTTGTGCTACAGGTTGTGAGCCAGGGTTACTTCCTTCT 51929267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4893 ATATATGCATATATCCTTGCACTTTGTGCTACAGGTTGTGAGCCAGGGTTACTTCCTTCT 4952

 51929268 GACCATGTGGGTTCATAATGAAGACCCAACCTTAAGGTACCCAGGGCTTAGAAATCAAAT 51929327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4953 GACCATGTGGGTTCATAATGAAGACCCAACCTTAAGGTACCCAGGGCTTAGAAATCAAAT 5012

 51929328 TTGTCCTTAGGACACTTTGGAAATCTATCTTGTAGTACAGGTGACCCAGCAGCAATCAAT 51929387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5013 TTGTCCTTAGGACACTTTGGAAATCTATCTTGTAGTACAGGTGACCCAGCAGCAATCAAT 5072

 51929388 CTTTCTGCCATCCCTAGTTTTAGTTCAGGACCCAGAAAAGTTGTAACTTGTTTCCTTTCC 51929447
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5073 CTTTCTGCCATCCCTAGTTTTACTTCAGGACCCAGAAAAGTTGTAACTTGTTTCCTTTCC 5132

 51929448 TGTGATCAAGCCTTTGTTTTCTCTTTTTTTCTCCACTTTTTGTAGCTTTTTAATTTGTTT 51929507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5133 TGTGATCAAGCCTTTGTTTTCTCTTTTTTTCTCCACTTTTTGTAGCTTTTTAATTTGTTT 5192

 51929508 CTCTGTTGATTACTAGCCCAATGCCTGAGCATCTTCGTCTTAAGACAAAGCCTCTGTGTT 51929567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5193 CTCTGTTGATTACTAGCCCAATGCCTGAGCATCTTCGTCTTAAGACAAAGCCTCTGTGTT 5252

 51929568 TCTTCAGCTCCTGAAATGACTGGCATGCTGAAAATGAGCTCAGGGCATTAGTCTTTGCTA 51929627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5253 TCTTCAGCTCCTGAAATGACTGGCATGCTGAAAATGAGCTCAGGGCATTAGTCTTTGCTA 5312

 51929628 CTAAGCCACTACAGATTCCATTCCCTTTCTTCTTGAGTATGCACACACCGCTTGTTCACA 51929687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     5313 CTAAGCCACTACAGATTCCATTCCCTTTCTTCCTGAGTATGCACACACCGCTTGTTCACA 5372

 51929688 GACTCCAGATTAGTTATTAAGCTACATCTGTATGCAGTTTGCACTCTCCTGCCTTCGACC 51929747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5373 GACTCCAGATTAGTTATTAAGCTACATCTGTATGCAGTTTGCACTCTCCTGCCTTCGACC 5432

 51929748 TGCTTGTCCCAGAAGTTATTCACCATATTCTACCTTGATCATATTTTCTACTTGTCAATG 51929807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5433 TGCTTGTCCCAGAAGTTATTCACCATATTCTACCTTGATCATATTTTCTACTTGTCAATG 5492

 51929808 CGCATGTCAATTAAGAACTTTTAACATTTATTGACCATTTATTATATACTAGCCAGTCTT 51929867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5493 CGCATGTCAATTAAGAACTTTTAACATTTATTGACCATTTATTATATACTAGCCAGTCTT 5552

 51929868 TTAATTGATTTATGAACAATTAACTTAATCATCATATAAGCATAGTAGGGTACAATTAGT 51929927
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5553 TTAATTGCTTTATGAACAATTAACTTAATCATCATATAAGCATAGTAGGGTACAATTAGT 5612

 51929928 TCCCCAACTTTATATATGAACAAATGGACTTTCAGAAAGGTAAGGTAAAATATCCACGGT 51929987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5613 TCCCCAACTTTATATATGAACAAATGGACTTTCAGAAAGGTAAGGTAAAATATCCACGGT 5672

 51929988 AAGAAAGCCTGCATATGTGGAACTGGGAATTGAACCCCTATGTCTGACCCGAGGGTCCAT 51930047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5673 AAGAAAGCCTGCATATGTGGAACTGGGAATTGAACCCCTATGTCTGACCCGAGGGTCCAT 5732

 51930048 ACACTTAAGCATTATGCTATCAAGTTTTCCACAGCCTGCTTTTCGGCTTCTCTCTCTTTC 51930107
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5733 ATACTTAAGCATTATGCTATCAAGTTTTCCACAGCCTGCTTTTCGGCTTCTCTCTCTTTC 5792

 51930108 TTTCTTTCCTGATCTCTGTTGCAATTCCTACCTTTCAACTCCCTTCTGACCATGGATAGT 51930167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     5793 TTTCTTTCCTGATCTCTGTTGCAATTCCTACCTTTCAACTCCCTTCTGACCATGGACAGT 5852

 51930168 TTGCAAAATGCCAGAGGTACGTCTCAAAGAAGCTTCAAATAGGAGCGTGTACTACCATTA 51930227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5853 TTGCAAAATGCCAGAGGTACGTCTCAAAGAAGCTTCAAATAGGAGCGTGTACTACCATTA 5912

 51930228 AGTCAGCTCCTCAGTTGTCTTCTTTGGATTGAGAAGCACTTCATCACTTTTTACACAGGT 51930287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5913 AGTCAGCTCCTCAGTTGTCTTCTTTGGATTGAGAAGCACTTCATCACTTTTTACACAGGT 5972

 51930288 TTAATTATCAAATATGACTTTTCTAGTACTACAGCTAATATATGTCAATGTCAAAGGGTT 51930347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5973 TTAATTATCAAATATGACTTTTCTAGTACTACAGCTAATATATGTCAATGTCAAAGGGTT 6032

 51930348 AACAGAATACTAGGCCTATATTAAATTATACATATGAGCTTTCTCTTTACTCCTTTTTAT 51930407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6033 AACAGAATACTAGGCCTATATTAAATTATACATATGAGCTTTCTCTTTACTCCTTTTTAT 6092

 51930408 GTTCATTAGCAAACAGATAAAGCCATAATAGATTTTTTAAGGAATATTTTGTTTTGTTTT 51930467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6093 GTTCATTAGCAAACAGATAAAGCCATAATAGATTTTTTAAGGAATATTTTGTTTTGTTTT 6152

 51930468 GTTTTGGACTTATACATCTATTAACAATAAACCAAACATTGCAGATTAAAGCAAATCTGC 51930527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6153 GTTTTGGACTTATACATCTATTAACAATAAACCAAACATTGCAGATTAAAGCAAATCTGC 6212

 51930528 CAATCTGTTTTACAAACACTATCTTCTGAAGGGTTCCTGGGCACAAGATACTGTTCTAGT 51930587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6213 CAATCTGTTTTACAAACACTATCTTCTGAAGGGTTCCTGGGCACAAGATACTGTTCTAGT 6272

 51930588 AATATTTCACAGC-TTTTTTTTTTTTTTCATTTTAGAGAAAATATTCTAAGACTCCAAAG 51930646
          ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6273 AATATTTCACAGCTTTTTTTTTTTTTTTCATTTTAGAGAAAATATTCTAAGACTCCAAAG 6332

 51930647 TTCGATAGTATTTGGTCAGTGTCTTAGTCAGTTTGAGCTAATATAACAAATTATCATAGA 51930706
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6333 TTAGATAGTATTTGGTCAGTGTCTTAGTCAGTTTGAGCTAATATAACAAATTATCATAGA 6392

 51930707 ATAAGTGTCTCAAGCAACAGAAATGTATTTTTTACAATCTGGAGGCTGCAAAGTCCAGAA 51930766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6393 ATAAGTGTCTCAAGCAACAGAAATGTATTTTTTACAATCTGGAGGCTGCAAAGTCCAGAA 6452

 51930767 TCAAGATGCTGGCAGATCTGGTGTCTGATGAGGACCCACCTTCTTATTTGCAAATGATCA 51930826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6453 TCAAGATGCTGGCAGATCTGGTGTCTGATGAGGACCCACCTTCTTATTTGCAAATGATCA 6512

 51930827 TTTTTGTTGTGTCCTCACATGACAAAGAGCAGAGAGAGCAAGCACTCTTGTGTCTCTTCT 51930886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6513 TTTTTGTTGTGTCCTCACATGACAAAGAGCAGAGAGAGCAAGCACTCTTGTGTCTCTTCT 6572

Alignment time is 5.67339 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51916584,51937767] =>     21184 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [       1,    3120] =>      3120 nucs 'mol-32-34b3-061793_3120'

Score:        3031
Aligned:      3119        nucs
Identic:      3111 (100%) nucs =>       274 (100%)      2837 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51927768,51928041] EXCISED REGION [51928043,51930886]
 second seq =>  [       1,     274] EXCISED REGION [     276,    3120]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [51928042,51928042]
 second seq =>         1 nucs [275,275]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [2834,2834]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 51927768 ACATATAGTAAGTTGTCCATAAGTATTTGCTGGTAGATTTATTTATTTTTTAAAAAAACA 51927827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACATATAGTAAGTTGTCCATAAGTATTTGCTGGTAGATTTATTTATTTTTTAAAAAAACA 60

 51927828 ACTTGGAAAGTTTTCTGTGTGCTTTTATATTAGAACTTGACCTTTGAAGTACCTCCAGGA 51927887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACTTGGAAAGTTTTCTGTGTGCTTTTATATTAGAACTTGACCTTTGAAGTACCTCCAGGA 120

 51927888 AATTTTGAAGAGTGCTGGCATATGACAATGCGTAAGTTTATATTTCATGTCCATGCATGC 51927947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AATTTTGAAGAGTGCTGGCATATGACAATGCGTAAGTTTATATTTCATGTCCATGCATGC 180

 51927948 CATTAAAATTCTAATAATGTAGTTGACAGAGCCTTTCTTGTCCCTTAAGCACTAAATTTG 51928007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CATTAAAATTCTAATAATGTAGTTGACAGAGCCTTTCTTGTCCCTTAAGCACTAAATTTG 240

 51928008 TGGCTTGCTCTAGATTGTCCCACCTGGCACAAGC 51928041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGGCTTGCTCTAGATTGTCCCACCTGGCACAAGC 274

EXCISED REGION

 51928043 AGGTGAAATTTCAGGTCTAGCCAACTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTAACAAGTATTAAAAA 51928102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      276 AGGTGAAATTTCAGGTCTAGCCAACTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTAACAAGTATTAAAAA 335

 51928103 CATTTTCATATATATTCCCTGTATTATTTCACCTATTTTTGTGTGTGTGTTTCTATCACA 51928162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      336 CATTTTCATATATATTCCCTGTATTATTTCACCTATTTTTGTGTGTGTGTTTCTATCACA 395

 51928163 CTGCCACATCAAAAACCTCTTCTTGAACGACTATAGTATAGTGGTTAATAGTTCAGTGTC 51928222
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
      396 CTGCCACATCAAAAACCTCTTCTTGAACGACTATAGTATAGTGATTAATAGTTCAGTGTC 455

 51928223 TAGATCAAGACCACCTATGGACGTATCTTGGCTCTGATTTTACCAGCCGTACAATCCTGG 51928282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      456 TAGATCAAGACCACCTATGGACGTATCTTGGCTCTGATTTTACCAGCCGTACAATCCTGG 515

 51928283 AGAATCTGTTCAAGAGAAATGTGCCTCAATTACGTATCTCTAAAGTAGTTGTAGCTATAG 51928342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      516 AGAATCTGTTCAAGAGAAATGTGCCTCAATTACGTATCTCTAAAGTAGTTGTAGCTATAG 575

 51928343 AACCTGTTCCATAGATGTGGATCAGAACACTGCATGACATTTAGAAAATGTTTAATAAAT 51928402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      576 AACCTGTTCCATAGATGTGGATCAGAACACTGCATGACATTTAGAAAATGTTTAATAAAT 635

 51928403 GATGTTGCTGTACTTGTTGCTGTTATTGTTGCTCTGTCATGTTAGGAGAACTCTCATTTA 51928462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      636 GATGTTGCTGTACTTGTTGCTGTTATTGTTGCTCTGTCATGTTAGGAGAACTCTCATTTA 695

 51928463 CCCTAGTGTTCTCTCAAAGTGAAATACAGATCATTACCTCTTGAAATCATGTCCAAGTAA 51928522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      696 CCCTAGTGTTCTCTCAAAGTGAAATACAGATCATTACCTCTTGAAATCATGTCCAAGTAA 755

 51928523 CTTCAGAATTATTTAGAAATCATTTATCTAAATCAGAGTATTTCTTGATATAATTTAAAG 51928582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      756 CTTCAGAATTATTTAGAAATCATTTATCTAAATCAGAGTATTTCTTGATATAATTTAAAG 815

 51928583 TTGATTGTATTTGAAAGTACATATGTCAATCTAGTATGAGATAATCTCAAGGAAATAAAA 51928642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      816 TTGATTGTATTTGAAAGTACATATGTCAATCTAGTATGAGATAATCTCAAGGAAATAAAA 875

 51928643 ATGTATAGGTCTAATTTACATTTTTATATGGAAGGAGATAATTACTTTCTATCACAAATG 51928702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      876 ATGTATAGGTCTAATTTACATTTTTATATGGAAGGAGATAATTACTTTCTATCACAAATG 935

 51928703 ATGAAGGCTGACGTTTGTTTCTTTTTTACTTTTAATTTTCACTTATATTTTGTTTATTAT 51928762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      936 ATGAAGGCTGACGTTTGTTTCTTTTTTACTTTTAATTTTCACTTATATTTTGTTTATTAT 995

 51928763 CAATATTTGCTTTTTAAAAGGTGGGAAGAAATCAACCAATCAAACATTAAAAAGCAATAT 51928822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      996 CAATATTTGCTTTTTAAAAGGTGGGAAGAAATCAACCAATCAAACATTAAAAAGCAATAT 1055

 51928823 GGAGGAGGGTGATATAATGCCCACTTATATTTCTCTTATAATTTTAAATATTTTCATAAT 51928882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1056 GGAGGAGGGTGATATAATGCCCACTTATATTTCTCTTATAATTTTAAATATTTTCATAAT 1115

 51928883 TAACAGAATAATTAGCACTGGTAATATTAAAATACCATCAAAAGAATCTAAATGTATGTG 51928942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1116 TAACAGAATAATTAGCACTGGTAATATTAAAATACCATCAAAAGAATCTAAATGTATGTG 1175

 51928943 CTTTCTGTTGCAGCCTTGTTAGATGTTTCAGTGGATTCAAAGTGTTGTTATAAGAAAACG 51929002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1176 CTTTCTGTTGCAGCCTTGTTAGATGTTTCAGTGGATTCAAAGTGTTGTTATAAGAAAACG 1235

 51929003 TGATTTATCAAGACTTTCATGTGTAAAATAAAAGGCATTTTCAATGACTACTTGGCCAGG 51929062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1236 TGATTTATCAAGACTTTCATGTGTAAAATAAAAGGCATTTTCAATGACTACTTGGCCAGG 1295

 51929063 CTTTCAGATTCCAATGCCAAGATGTTGTATTTTGATATTGCAGTTTTCTAACAACAACAA 51929122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1296 CTTTCAGATTCCAATGCCAAGATGTTGTATTTTGATATTGCAGTTTTCTAACAACAACAA 1355

 51929123 AGTTGAGTGGACTTCTGGAACTAAAACTTAAATATTCAGAACTAATTATCACCACTCTAT 51929182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1356 AGTTGAGTGGACTTCTGGAACTAAAACTTAAATATTCAGAACTAATTATCACCACTCTAT 1415

 51929183 TTCTTACAGAGCATTTAAGGAACACATATATGCATATATCCTTGCACTTTGTGCTACAGG 51929242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1416 TTCTTACAGAGCATTTAAGGAACACATATATGCATATATCCTTGCACTTTGTGCTACAGG 1475

 51929243 TTGTGAGCCAGGGTTACTTCCTTCTGACCATGTGGGTTCATAATGAAGACCCAACCTTAA 51929302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1476 TTGTGAGCCAGGGTTACTTCCTTCTGACCATGTGGGTTCATAATGAAGACCCAACCTTAA 1535

 51929303 GGTACCCAGGGCTTAGAAATCAAATTTGTCCTTAGGACACTTTGGAAATCTATCTTGTAG 51929362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1536 GGTACCCAGGGCTTAGAAATCAAATTTGTCCTTAGGACACTTTGGAAATCTATCTTGTAG 1595

 51929363 TACAGGTGACCCAGCAGCAATCAATCTTTCTGCCATCCCTAGTTTTAGTTCAGGACCCAG 51929422
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     1596 TACAGGTGACCCAGCAGCAATCAATCTTTCTGCCATCCCTAGTTTTACTTCAGGACCCAG 1655

 51929423 AAAAGTTGTAACTTGTTTCCTTTCCTGTGATCAAGCCTTTGTTTTCTCTTTTTTTCTCCA 51929482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1656 AAAAGTTGTAACTTGTTTCCTTTCCTGTGATCAAGCCTTTGTTTTCTCTTTTTTTCTCCA 1715

 51929483 CTTTTTGTAGCTTTTTAATTTGTTTCTCTGTTGATTACTAGCCCAATGCCTGAGCATCTT 51929542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1716 CTTTTTGTAGCTTTTTAATTTGTTTCTCTGTTGATTACTAGCCCAATGCCTGAGCATCTT 1775

 51929543 CGTCTTAAGACAAAGCCTCTGTGTTTCTTCAGCTCCTGAAATGACTGGCATGCTGAAAAT 51929602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1776 CGTCTTAAGACAAAGCCTCTGTGTTTCTTCAGCTCCTGAAATGACTGGCATGCTGAAAAT 1835

 51929603 GAGCTCAGGGCATTAGTCTTTGCTACTAAGCCACTACAGATTCCATTCCCTTTCTTCTTG 51929662
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     1836 GAGCTCAGGGCATTAGTCTTTGCTACTAAGCCACTACAGATTCCATTCCCTTTCTTCCTG 1895

 51929663 AGTATGCACACACCGCTTGTTCACAGACTCCAGATTAGTTATTAAGCTACATCTGTATGC 51929722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1896 AGTATGCACACACCGCTTGTTCACAGACTCCAGATTAGTTATTAAGCTACATCTGTATGC 1955

 51929723 AGTTTGCACTCTCCTGCCTTCGACCTGCTTGTCCCAGAAGTTATTCACCATATTCTACCT 51929782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1956 AGTTTGCACTCTCCTGCCTTCGACCTGCTTGTCCCAGAAGTTATTCACCATATTCTACCT 2015

 51929783 TGATCATATTTTCTACTTGTCAATGCGCATGTCAATTAAGAACTTTTAACATTTATTGAC 51929842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2016 TGATCATATTTTCTACTTGTCAATGCGCATGTCAATTAAGAACTTTTAACATTTATTGAC 2075

 51929843 CATTTATTATATACTAGCCAGTCTTTTAATTGATTTATGAACAATTAACTTAATCATCAT 51929902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     2076 CATTTATTATATACTAGCCAGTCTTTTAATTGCTTTATGAACAATTAACTTAATCATCAT 2135

 51929903 ATAAGCATAGTAGGGTACAATTAGTTCCCCAACTTTATATATGAACAAATGGACTTTCAG 51929962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2136 ATAAGCATAGTAGGGTACAATTAGTTCCCCAACTTTATATATGAACAAATGGACTTTCAG 2195

 51929963 AAAGGTAAGGTAAAATATCCACGGTAAGAAAGCCTGCATATGTGGAACTGGGAATTGAAC 51930022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2196 AAAGGTAAGGTAAAATATCCACGGTAAGAAAGCCTGCATATGTGGAACTGGGAATTGAAC 2255

 51930023 CCCTATGTCTGACCCGAGGGTCCATACACTTAAGCATTATGCTATCAAGTTTTCCACAGC 51930082
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     2256 CCCTATGTCTGACCCGAGGGTCCATATACTTAAGCATTATGCTATCAAGTTTTCCACAGC 2315

 51930083 CTGCTTTTCGGCTTCTCTCTCTTTCTTTCTTTCCTGATCTCTGTTGCAATTCCTACCTTT 51930142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2316 CTGCTTTTCGGCTTCTCTCTCTTTCTTTCTTTCCTGATCTCTGTTGCAATTCCTACCTTT 2375

 51930143 CAACTCCCTTCTGACCATGGATAGTTTGCAAAATGCCAGAGGTACGTCTCAAAGAAGCTT 51930202
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2376 CAACTCCCTTCTGACCATGGACAGTTTGCAAAATGCCAGAGGTACGTCTCAAAGAAGCTT 2435

 51930203 CAAATAGGAGCGTGTACTACCATTAAGTCAGCTCCTCAGTTGTCTTCTTTGGATTGAGAA 51930262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2436 CAAATAGGAGCGTGTACTACCATTAAGTCAGCTCCTCAGTTGTCTTCTTTGGATTGAGAA 2495

 51930263 GCACTTCATCACTTTTTACACAGGTTTAATTATCAAATATGACTTTTCTAGTACTACAGC 51930322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2496 GCACTTCATCACTTTTTACACAGGTTTAATTATCAAATATGACTTTTCTAGTACTACAGC 2555

 51930323 TAATATATGTCAATGTCAAAGGGTTAACAGAATACTAGGCCTATATTAAATTATACATAT 51930382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2556 TAATATATGTCAATGTCAAAGGGTTAACAGAATACTAGGCCTATATTAAATTATACATAT 2615

 51930383 GAGCTTTCTCTTTACTCCTTTTTATGTTCATTAGCAAACAGATAAAGCCATAATAGATTT 51930442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2616 GAGCTTTCTCTTTACTCCTTTTTATGTTCATTAGCAAACAGATAAAGCCATAATAGATTT 2675

 51930443 TTTAAGGAATATTTTGTTTTGTTTTGTTTTGGACTTATACATCTATTAACAATAAACCAA 51930502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2676 TTTAAGGAATATTTTGTTTTGTTTTGTTTTGGACTTATACATCTATTAACAATAAACCAA 2735

 51930503 ACATTGCAGATTAAAGCAAATCTGCCAATCTGTTTTACAAACACTATCTTCTGAAGGGTT 51930562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2736 ACATTGCAGATTAAAGCAAATCTGCCAATCTGTTTTACAAACACTATCTTCTGAAGGGTT 2795

 51930563 CCTGGGCACAAGATACTGTTCTAGTAATATTTCACAGC-TTTTTTTTTTTTTTCATTTTA 51930621
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
     2796 CCTGGGCACAAGATACTGTTCTAGTAATATTTCACAGCTTTTTTTTTTTTTTTCATTTTA 2855

 51930622 GAGAAAATATTCTAAGACTCCAAAGTTCGATAGTATTTGGTCAGTGTCTTAGTCAGTTTG 51930681
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     2856 GAGAAAATATTCTAAGACTCCAAAGTTAGATAGTATTTGGTCAGTGTCTTAGTCAGTTTG 2915

 51930682 AGCTAATATAACAAATTATCATAGAATAAGTGTCTCAAGCAACAGAAATGTATTTTTTAC 51930741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2916 AGCTAATATAACAAATTATCATAGAATAAGTGTCTCAAGCAACAGAAATGTATTTTTTAC 2975

 51930742 AATCTGGAGGCTGCAAAGTCCAGAATCAAGATGCTGGCAGATCTGGTGTCTGATGAGGAC 51930801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2976 AATCTGGAGGCTGCAAAGTCCAGAATCAAGATGCTGGCAGATCTGGTGTCTGATGAGGAC 3035

 51930802 CCACCTTCTTATTTGCAAATGATCATTTTTGTTGTGTCCTCACATGACAAAGAGCAGAGA 51930861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3036 CCACCTTCTTATTTGCAAATGATCATTTTTGTTGTGTCCTCACATGACAAAGAGCAGAGA 3095

 51930862 GAGCAAGCACTCTTGTGTCTCTTCT 51930886
          |||||||||||||||||||||||||
     3096 GAGCAAGCACTCTTGTGTCTCTTCT 3120

Alignment time is 3.35712 s

