
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [42336259,42357318] =>     21060 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [       1,    8418] =>      8418 nucs 'mol-32-1f00-166159_8418'

Score:        8206
Aligned:      8423        nucs
Identic:      8400 (100%) nucs =>       426 ( 99%)      7974 (100%)
Gaps:            9 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [42338515,42338943] EXCISED REGION [42338945,42346937]
 second seq =>  [       1,     428] EXCISED REGION [     432,    8418]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [42338944,42338944]
 second seq =>         3 nucs [429,431]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         4 nucs [42342647,42342650]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [42338941,42338943] to [42338945,42338947]
 second seq =>         3 nucs [426,428] to [432,434]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [429,429] to [431,431]

 42338515 GCCCTATGTGGTTCAGTGCAAGCAAAAAACACAGTAAAAGAAACAGCAGTCCTGCAGAAA 42338574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCCCTATGTGGTTCAGTGCAAGCAAAAAACACAGTAAAAGAAACAGCAGTCCTGCAGAAA 60

 42338575 AAAATGTAATTTAAATCCATTAAGATATTTACCCAGTCTCGAGGGGCGTGGTGGCTCACA 42338634
          ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
       61 AAA-TGTAATTTAAATCCATTAAGATATTTACCCAGTCTCGCGGGGCGTGGTGGCTCACA 119

 42338635 CCTGTAATACCAACACTTTGGGAGGCTGAAGTGGACGGATCACAAGGTCAGGAGTTCGAG 42338694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      120 CCTGTAATACCAACACTTTGGGAGGCTGAAGTGGACGGATCACAAGGTCAGGAGTTCGAG 179

 42338695 ACCAGCCTGGCAAATATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAATTACGCAAATTAGCTGGGC 42338754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      180 ACCAGCCTGGCAAATATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAATTACGCAAATTAGCTGGGC 239

 42338755 ATGGTGGCGCTCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGA 42338814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      240 ATGGTGGCGCTCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGA 299

 42338815 ACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAAATCTCACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAA 42338874
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
      300 ACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAAATCTCACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAG 359

 42338875 CAGAGTGAGACACTGTCTCTCATATGTGTGTGTGTATATATAAGTGTGTGTGTGTGTGTG 42338934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      360 CAGAGTGAGACACTGTCTCTCATATGTGTGTGTGTATATATAAGTGTGTGTGTGTGTGTG 419

 42338935 TGTGTGTGT 42338943
          |||||||||
      420 TGTGTGTGT 428

EXCISED REGION

 42338945 TGTATATATGTGTGTGTATATATATACGTATATATATGTGTATATATATATACATATCTA 42339004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      432 TGTATATATGTGTGTGTATATATATACGTATATATATGTGTATATATATATACATATCTA 491

 42339005 TATATGTGTGTGTGTATATATATATATATATACATATATATATTTACCCAGTTTCAAGAG 42339064
          ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      492 TATATGTGTGTGTG--TATATATATATATATACATATATATATTTACCCAGTTTCAAGAG 549

 42339065 AAAAAAGTCAAAGGGGTAAGAGTATTCTTCATACACAGTCTAACATCTCTTTCTTCCACT 42339124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      550 AAAAAAGTCAAAGGGGTAAGAGTATTCTTCATACACAGTCTAACATCTCTTTCTTCCACT 609

 42339125 CACAGTTGTCTTATTTTGTTCCTCTTCACTCTCCCAAAACTTAGCCCATGTTCCCCAGCT 42339184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      610 CACAGTTGTCTTATTTTGTTCCTCTTCACTCTCCCAAAACTTAGCCCATGTTCCCCAGCT 669

 42339185 CCCCTCTGCACCTGCATCTGCCACACACGTACATACATACACACACTTCACATACATGCA 42339244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      670 CCCCTCTGCACCTGCATCTGCCACACACGTACATACATACACACACTTCACATACATGCA 729

 42339245 CGCATATATACAAACACACACACATATGCGCGCACACACACACACACACACACACACACT 42339304
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
      730 CGCATATATACAAACACACACACATATGCGCACACACACACACACACACACACACACACT 789

 42339305 CTCTCTCCAGCCCTTGATGCTTTCCCCCTCTCTCTTCCTCCTGGACCTTTTCTTTGCTCC 42339364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      790 CTCTCTCCAGCCCTTGATGCTTTCCCCCTCTCTCTTCCTCCTGGACCTTTTCTTTGCTCC 849

 42339365 ATTCCCAACACACAGGTCCCTGGTCTGTCTCTGGCTCCTTCCAAGCCTTGGCTCTTCTTA 42339424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      850 ATTCCCAACACACAGGTCCCTGGTCTGTCTCTGGCTCCTTCCAAGCCTTGGCTCTTCTTA 909

 42339425 GGTATTATCCCCAGCAGCACAGCAGCAGACCAGCTGACCTGGACTATTTCTTAGGCAGTA 42339484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      910 GGTATTATCCCCAGCAGCACAGCAGCAGACCAGCTGACCTGGACTATTTCTTAGGCAGTA 969

 42339485 GTCAGGTAAGCTGTACCTACTCATATGGAGATATTGTTTGATCCTGAGCCTCTCCTGATG 42339544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      970 GTCAGGTAAGCTGTACCTACTCATATGGAGATATTGTTTGATCCTGAGCCTCTCCTGATG 1029

 42339545 TCTCTTTTTAGCCCCCAGGGGGAGGTTTTAATATCCACATCCACCAGCATCTTCTCCCTA 42339604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1030 TCTCTTTTTAGCCCCCAGGGGGAGGTTTTAATATCCACATCCACCAGCATCTTCTCCCTA 1089

 42339605 GGGGAGAAGGGAGTGAGATGGGGAGAAGAAAGTGAGAGGAATCGAAACATGTCTAAGGAA 42339664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1090 GGGGAGAAGGGAGTGAGATGGGGAGAAGAAAGTGAGAGGAATCGAAACATGTCTAAGGAA 1149

 42339665 ACTAAGAGGCAGAGGTTATTTCGATCTGCTCTTTATAATCATCTCAGATGCCTGCCCTGG 42339724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1150 ACTAAGAGGCAGAGGTTATTTCGATCTGCTCTTTATAATCATCTCAGATGCCTGCCCTGG 1209

 42339725 GCAATGTCTAGGTTATTACTGAATTCTGGGGACACTCCCATATTAGCCCAATGACTAATC 42339784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1210 GCAATGTCTAGGTTATTACTGAATTCTGGGGACACTCCCATATTAGCCCAATGACTAATC 1269

 42339785 AAAAAAAGCAAGCTGACCATAGTCAACTAGAGGGTAAGGAACCAAGTGAAAATAGAGAGA 42339844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1270 AAAAAAAGCAAGCTGACCATAGTCAACTAGAGGGTAAGGAACCAAGTGAAAATAGAGAGA 1329

 42339845 GTTCTCCGGACCTCTGAATCTGGGTACAATCATTCAGTATGAAGATAGGAGCTAGGAGAA 42339904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1330 GTTCTCCGGACCTCTGAATCTGGGTACAATCATTCAGTATGAAGATAGGAGCTAGGAGAA 1389

 42339905 GAGAGAAAACATGGAATTGTATTTTGATTGACTTTTTTCTGATTACAAAAGTCATATATG 42339964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1390 GAGAGAAAACATGGAATTGTATTTTGATTGACTTTTTTCTGATTACAAAAGTCATATATG 1449

 42339965 TTCAATGTAGAAAACCAGGAAGATACTGAAAAATACAAGAAGGTGTTAAAAAAAAAAAAC 42340024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1450 TTCAATGTAGAAAACCAGGAAGATACTGAAAAATACAAGAAGGTGTTAAAAAAAAAAAAC 1509

 42340025 ACTTATGACCCCACCACCTAGATTTAATCAAGATTAACATGTTAGTTTACCTTTCCAGTG 42340084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1510 ACTTATGACCCCACCACCTAGATTTAATCAAGATTAACATGTTAGTTTACCTTTCCAGTG 1569

 42340085 TGGTTTTCAATGCATATTCTTTTTAAAATCAAGTTAGAAACATAGTGTATATGCTATTTT 42340144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     1570 TGGTTTTCAATGCATATTCTTTTTAAAATCAAGTTAGAAACAGAGTGTATATGCTATTTT 1629

 42340145 AGAAATTCTTTCTCAGCTGGGCGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTAGGAGG 42340204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1630 AGAAATTCTTTCTCAGCTGGGCGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTAGGAGG 1689

 42340205 CCAAGGCAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAA 42340264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1690 CCAAGGCAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAA 1749

 42340265 ACCCCATCTCTACCAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGATGGCACACACCTGTAAATC 42340324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1750 ACCCCATCTCTACCAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGATGGCACACACCTGTAAATC 1809

 42340325 TCAGCTATTCTGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACTTGAGAGGTGGAGGTTGCAG 42340384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1810 TCAGCTATTCTGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACTTGAGAGGTGGAGGTTGCAG 1869

 42340385 TGAGCCAAGATCGCACCACTGCACTCCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGAGAGACTCTGTC 42340444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1870 TGAGCCAAGATCGCACCACTGCACTCCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGAGAGACTCTGTC 1929

 42340445 TCAAAAAATAAAAAAGAAAGAAAAGAAAGAAATTCTTTCTCATACATTACATCATAAATC 42340504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1930 TCAAAAAATAAAAAAGAAAGAAAAGAAAGAAATTCTTTCTCATACATTACATCATAAATC 1989

 42340505 TTTTCCCAAATCATTAAATATTCTTCTGCAATATGATTTGTTAAAGCTATATATGATTTT 42340564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1990 TTTTCCCAAATCATTAAATATTCTTCTGCAATATGATTTGTTAAAGCTATATATGATTTT 2049

 42340565 GTGCAATAGATATGCTATAATAGGCTTACCCAATTTTATATGGAAGAGCACTTACGCTGT 42340624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2050 GTGCAATAGATATGCTATAATAGGCTTACCCAATTTTATATGGAAGAGCACTTACGCTGT 2109

 42340625 TTCCAGGCATAGAATTCTAAATATGGCAAGGTTATCTGCACAACTCCTGTTTTCAGGCAT 42340684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2110 TTCCAGGCATAGAATTCTAAATATGGCAAGGTTATCTGCACAACTCCTGTTTTCAGGCAT 2169

 42340685 GCTGACCTCCATTCCTTACAAGCAGATAATGATCCCTTTAAAGTTCTCTGCTCAAGAGAA 42340744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2170 GCTGACCTCCATTCCTTACAAGCAGATAATGATCCCTTTAAAGTTCTCTGCTCAAGAGAA 2229

 42340745 CCGTGCCATAGCAGAAGTAATTCTTCCCCAAGCGTTCAGCTGTCCTGTGTTCTCCAGGGA 42340804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2230 CCGTGCCATAGCAGAAGTAATTCTTCCCCAAGCGTTCAGCTGTCCTGTGTTCTCCAGGGA 2289

 42340805 AAGCCTAGCATTGGGCGTTGGGCATGCTTGCCTCTAAATGGGAAGGCCAGTTCATTCTTA 42340864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2290 AAGCCTAGCATTGGGCGTTGGGCATGCTTGCCTCTAAATGGGAAGGCCAGTTCATTCTTA 2349

 42340865 AGCAGATGGAGAGAAAGCATTTGTCATTCTAAATCCGGGAAGTAGCTCAATTCAATTCAA 42340924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2350 AGCAGATGGAGAGAAAGCATTTGTCATTCTAAATCCGGGAAGTAGCTCAATTCAATTCAA 2409

 42340925 TTGCATAATTCTTAAAAACATATTTTGCGCCACTCCTGAAAATGGTATTATAGAAGAAAA 42340984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2410 TTGCATAATTCTTAAAAACATATTTTGCGCCACTCCTGAAAATGGTATTATAGAAGAAAA 2469

 42340985 GTATGGTTTCTACCTTTAAGAAGATTGCTGACCGGGCTGGGCGCAGTGGCTCATGCCTGT 42341044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2470 GTATGGTTTCTACCTTTAAGAAGATTGCTGACCGGGCTGGGCGCAGTGGCTCATGCCTGT 2529

 42341045 AATCCCAGAACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGCAGATCCCCTGAGGTCAGGAGTTAGAGGCT 42341104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2530 AATCCCAGAACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGCAGATCCCCTGAGGTCAGGAGTTAGAGGCT 2589

 42341105 AGCCCGACCAACATGGCAAAACCCCGTCTCTACTAAAAATATAAAAATTAGCTGGGCATG 42341164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2590 AGCCCGACCAACATGGCAAAACCCCGTCTCTACTAAAAATATAAAAATTAGCTGGGCATG 2649

 42341165 GTGGTGCATGCCTGTAGCCCCAGCTACTCAGGAGACTCAGGCATGAAAATCGCTTGAACC 42341224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2650 GTGGTGCATGCCTGTAGCCCCAGCTACTCAGGAGACTCAGGCATGAAAATCGCTTGAACC 2709

 42341225 CGAGACACGGAGGTGGTGGTGAGCTGAAATTGCGCCACTGCATTCCAGCCTGGGCGACAG 42341284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2710 CGAGACACGGAGGTGGTGGTGAGCTGAAATTGCGCCACTGCATTCCAGCCTGGGCGACAG 2769

 42341285 AGCAAGACTCTATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAGAAGAAGAAGATTGCTGGCGGGGT 42341344
          |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2770 AGCAAGACTCTATCTC-AAAAAAAAAAAAAAAAGAAGAAGAAGAAGATTGCTGGCGGGGT 2828

 42341345 GTTGTGGCTCATACTTGTAATCCTAGCACTTTGGGAGGCCAAGGAAGGAGGATCACTTGA 42341404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2829 GTTGTGGCTCATACTTGTAATCCTAGCACTTTGGGAGGCCAAGGAAGGAGGATCACTTGA 2888

 42341405 GCCAAAGAAGTCAAGGCTGCAGTGAGCTGTGATCACACCACTCCATGCCAGCCTGGGTGA 42341464
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2889 GCCAAAGAACTCAAGGCTGCAGTGAGCTGTGATCACACCACTCCATGCCAGCCTGGGTGA 2948

 42341465 CAGAGTGAAACCCTGTCTCAAAAAGAAAAAAGAAAAGATTGCCATCTTCCTGGGGTGACA 42341524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2949 CAGAGTGAAACCCTGTCTCAAAAAGAAAAAAGAAAAGATTGCCATCTTCCTGGGGTGACA 3008

 42341525 AACATAATTTTAAAAGAATCAGGTAGAAACATAGGACTGTATTTATGATGAAACAACTAT 42341584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3009 AACATAATTTTAAAAGAATCAGGTAGAAACATAGGACTGTATTTATGATGAAACAACTAT 3068

 42341585 GACTAAATGCTATGTTTTTCAGATTACACGTGCCTTAGGAAGTGAGAAAAGTATAAGTGC 42341644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3069 GACTAAATGCTATGTTTTTCAGATTACACGTGCCTTAGGAAGTGAGAAAAGTATAAGTGC 3128

 42341645 AATGTGGAATTGGGTGGTTGAGAAAACTCCAGAGAGGACCTGGTAGAGCTTGGAGGCAAG 42341704
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     3129 AATGTGGAATTGGGTGGTTGAGAAAACTCCAGAGAGGACATGGTAGAGCTTGGAGGCAAG 3188

 42341705 GTGGGCAAGGAACATTTCAAGAGGAGGGGACACTACAGCTGAGGCACAGAGGTGAGAAAG 42341764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3189 GTGGGCAAGGAACATTTCAAGAGGAGGGGACACTACAGCTGAGGCACAGAGGTGAGAAAG 3248

 42341765 CACAGGAAGCAAGAAAGAGGCTCATCTGGCTGCAGCAGAGGGAGAAATAGTAAATTAGAT 42341824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3249 CACAGGAAGCAAGAAAGAGGCTCATCTGGCTGCAGCAGAGGGAGAAATAGTAAATTAGAT 3308

 42341825 CAGATAACTCATATATTGGGCACGTGTGCAGAGGGCCAAAAAGATGTTTGGCCTTAATTC 42341884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3309 CAGATAACTCATATATTGGGCACGTGTGCAGAGGGCCAAAAAGATGTTTGGCCTTAATTC 3368

 42341885 TATAGGTATTCCCCTTTGCCATAGATGTTACACCAAGAAAGAACACATTGAATCAAGCAA 42341944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3369 TATAGGTATTCCCCTTTGCCATAGATGTTACACCAAGAAAGAACACATTGAATCAAGCAA 3428

 42341945 ATTTAAGCTGGGTTTTTGTTTTTGTTTTTTGGTGGTGGGGGGGATGATTTATAAGCAGGA 42342004
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3429 CTTTAAGCTGGGTTTTTGTTTTTGTTTTTTGGTGGTGGGGGGGATGATTTATAAGCAGGA 3488

 42342005 CTTCCCAAAGCTTTTAATATGCTTATATATGTGGCAGTGTTGAGAGGGGAAGATTTGATA 42342064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3489 CTTCCCAAAGCTTTTAATATGCTTATATATGTGGCAGTGTTGAGAGGGGAAGATTTGATA 3548

 42342065 TTCCAAGTATTTTTGGCCACAGAACTCTTTTTATCATGGAACATTTCCAGTGTTCCATGA 42342124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3549 TTCCAAGTATTTTTGGCCACAGAACTCTTTTTATCATGGAACATTTCCAGTGTTCCATGA 3608

 42342125 GACACAATTAGGGGCTAGTGAGCCACTGACTTTTGAGTTGGAAAGTGACACATGGGGAAA 42342184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3609 GACACAATTAGGGGCTAGTGAGCCACTGACTTTTGAGTTGGAAAGTGACACATGGGGAAA 3668

 42342185 GCAAAGTTTTGGAAGATTGATCTCACGGTAGAATATAAGGTGAACAGGAGAGAAAAGAGC 42342244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3669 GCAAAGTTTTGGAAGATTGATCTCACGGTAGAATATAAGGTGAACAGGAGAGAAAAGAGC 3728

 42342245 CTGGATTCAGGCAACACAATCAGATGATTGGATACAGGCTCAAGATTAGGGGGTGGGTTG 42342304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3729 CTGGATTCAGGCAACACAATCAGATGATTGGATACAGGCTCAAGATTAGGGGGTGGGTTG 3788

 42342305 CACTACACTGGAGCGGAGAATGGAGAGCAAAAGCACTGATTGAATGCACAGTCTTCTGTT 42342364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3789 CACTACACTGGAGCGGAGAATGGAGAGCAAAAGCACTGATTGAATGCACAGTCTTCTGTT 3848

 42342365 GGATCCTGGGATGATACAGAAGTGTCAGAGTTCCTGGGTCTTGTAGGAGTTCCAATGAGC 42342424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3849 GGATCCTGGGATGATACAGAAGTGTCAGAGTTCCTGGGTCTTGTAGGAGTTCCAATGAGC 3908

 42342425 ATCAATCAAAAGTTTGATTGTAAGGCACAGAAATCAACTTGGACCAGCTAAAGCAAAAAG 42342484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3909 ATCAATCAAAAGTTTGATTGTAAGGCACAGAAATCAACTTGGACCAGCTAAAGCAAAAAG 3968

 42342485 ACCATTTTTAGGGAAATAGGGATGTGTCACAAAGAACTGCATCTAGGTACTGGAAATCAA 42342544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3969 ACCATTTTTAGGGAAATAGGGATGTGTCACAAAGAACTGCATCTAGGTACTGGAAATCAA 4028

 42342545 CAAAAAGTTCCCCATCTGATCTCAGCTTCTCTGTGTGTCTACTACATACACTATCTTTCT 42342604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4029 CAAAAAGTTCCCCATCTGATCTCAGCTTCTCTGTGTGTCTACTACATACACTATCTTTCT 4088

 42342605 CCTCTTTTCTTTCCTCTCTACCCCCTACCTCCCTCCTCTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTG 42342664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||
     4089 CCTCTTTTCTTTCCTCTCTACCCCCTACCTCCCTCCTCTCTC----TTTTTTTTTTTTTG 4144

 42342665 TTTTTTGGTTTTTTTATGTTTGTTTGTTTGCTTTTGGAGACACGGTCTCCCTCTGTCACC 42342724
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     4145 TTTTTTGGTTTTTTTATGTTTGTTTGTTTGTTTTTGGAGACACGGTCTCCCTCTGTCACC 4204

 42342725 CAGGCTGGAGTGCAGTGGCTTAATTACTGCAGCCTCAATCTCCTGGGCTCAAGTGACCCT 42342784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4205 CAGGCTGGAGTGCAGTGGCTTAATTACTGCAGCCTCAATCTCCTGGGCTCAAGTGACCCT 4264

 42342785 CCCACCTCAGCCTCCTGAATAGCTGGGACCACAGGTGCAAGCCACAGTGCTCAGCTAATT 42342844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4265 CCCACCTCAGCCTCCTGAATAGCTGGGACCACAGGTGCAAGCCACAGTGCTCAGCTAATT 4324

 42342845 AAAAAAAATTTTTTTTTCAGAGATGGGGTCTCACTATGTTGTCCAGGCTGGTCTCAAACT 42342904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4325 AAAAAAAATTTTTTTTTCAGAGATGGGGTCTCACTATGTTGTCCAGGCTGGTCTCAAACT 4384

 42342905 CCTAGGCTCAAGCAGTCCTCCCGTTTCAGCCTCAAAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAG 42342964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4385 CCTAGGCTCAAGCAGTCCTCCCGTTTCAGCCTCAAAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAG 4444

 42342965 CCATCGCACTCCACCTTCTCTATAGTTACTGAGTTTGCGTGTTACACTGAGTTTACATCT 42343024
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4445 CCATCGCACTCCACTTTCTCTATAGTTACTGAGTTTGCGTGTTACACTGAGTTTACATCT 4504

 42343025 TACATTTCTAGCCATATCAGAAACGACCTCTGCACCTCTCTTTCCCAATTTGAGATTTCT 42343084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4505 TACATTTCTAGCCATATCAGAAACGACCTCTGCACCTCTCTTTCCCAATTTGAGATTTCT 4564

 42343085 AATAGAAAGAATCTTGTTCACCCAGCTTGGGACTCATTGAGTTATGACCAGTGGGATAGA 42343144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4565 AATAGAAAGAATCTTGTTCACCCAGCTTGGGACTCATTGAGTTATGACCAGTGGGATAGA 4624

 42343145 TTTTAGAAGATAAACATGTCTATAGGGACTTACCGTGTGAATTAGTGGGGGAGCCGCTTA 42343204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4625 TTTTAGAAGATAAACATGTCTATAGGGACTTACCGTGTGAATTAGTGGGGGAGCCGCTTA 4684

 42343205 CCAGGCAGAGGGGTCTGCTGTAAAGTGATACTGTGACTTTAAATTGAAAGTAAGCTTCTA 42343264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4685 CCAGGCAGAGGGGTCTGCTGTAAAGTGATACTGTGACTTTAAATTGAAAGTAAGCTTCTA 4744

 42343265 GAAGAGTTGAAGAGGAGTGGATTATTGTTGAATGGATGTATAACTAATGAAGCTTTAAAG 42343324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4745 GAAGAGTTGAAGAGGAGTGGATTATTGTTGAATGGATGTATAACTAATGAAGCTTTAAAG 4804

 42343325 GAAGTTTATTAGAAAGTCCATGTCCTTGTCTCTTTCCCAAACTCCTTTAGTTCCCAAGTC 42343384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4805 GAAGTTTATTAGAAAGTCCATGTCCTTGTCTCTTTCCCAAACTCCTTTAGTTCCCAAGTC 4864

 42343385 CTGAAAGAATCTATGGATAAGGGAAGCAGAATACTATAGTGGTTAAGAGCACATGCTCGA 42343444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4865 CTGAAAGAATCTATGGATAAGGGAAGCAGAATACTATAGTGGTTAAGAGCACATGCTCGA 4924

 42343445 GGTTAAACTGTCTGTATTTTGGATCCTGGCCTTGAGGACTTGGGCAAGTTACGTGACCTG 42343504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4925 GGTTAAACTGTCTGTATTTTGGATCCTGGCCTTGAGGACTTGGGCAAGTTACGTGACCTG 4984

 42343505 CCTGAGCCTCAGTTTCCTCACCTGTAATATGGGTATCACGAGGAATAAATAAGGTAATAT 42343564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4985 CCTGAGCCTCAGTTTCCTCACCTGTAATATGGGTATCACGAGGAATAAATAAGGTAATAT 5044

 42343565 GTGTAAAGTGCTTGGCACAATGCTCTTGATAATGTTAGCAACATAATTTTGTAATGAAAA 42343624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5045 GTGTAAAGTGCTTGGCACAATGCTCTTGATAATGTTAGCAACATAATTTTGTAATGAAAA 5104

 42343625 TTAACTGATGGGGCTGAAATGTGCATCAGCAGATCCAAATATCCTTGATAAACTGGCCAA 42343684
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5105 TTAACTGATGGGACTGAAATGTGCATCAGCAGATCCAAATATCCTTGATAAACTGGCCAA 5164

 42343685 AAGAAAGATGAATTGGCAGAGAGGCAAGTGTTCATCTCAGTTCTCCAGATATCCCTGCAA 42343744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5165 AAGAAAGATGAATTGGCAGAGAGGCAAGTGTTCATCTCAGTTCTCCAGATATCCCTGCAA 5224

 42343745 ATGTGGCCTCTGGAGTAGAAGATTTAGGGAGAAAAATAAGCCATGAAGCTCTTCTGGCAC 42343804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5225 ATGTGGCCTCTGGAGTAGAAGATTTAGGGAGAAAAATAAGCCATGAAGCTCTTCTGGCAC 5284

 42343805 CAACATGAACTTCAGGGATCATGGGACATTTGGGCCAGTAACATTCCTCTTTGTTCCTAG 42343864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5285 CAACATGAACTTCAGGGATCATGGGACATTTGGGCCAGTAACATTCCTCTTTGTTCCTAG 5344

 42343865 AGATTTAATATCTACCTACCAACTAAATGGCCTTGATTTGGAGGAGAGAAGACAAGAAGA 42343924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5345 AGATTTAATATCTACCTACCAACTAAATGGCCTTGATTTGGAGGAGAGAAGACAAGAAGA 5404

 42343925 GGAATTGCTTTCAGCTGGTCCTTGCCTTTAACTAACCAGGGGTACAAAAATTTTAAAATA 42343984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     5405 GGAATTGCTTTCAGCTGGTCCTTGCCTTTAACTAACCAGGGGTACAAAAATTTTAAAACA 5464

 42343985 CAAAGGAGACCATGTGTAAAACATTAGTTAAGCTCAGATATAAATCTAGTCTTTGACCAG 42344044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5465 CAAAGGAGACCATGTGTAAAACATTAGTTAAGCTCAGATATAAATCTAGTCTTTGACCAG 5524

 42344045 TCCAGAGCTAATCAATATGCTTTTCTACTCTCTTTGAACTTTTGAGTTTTCTGGCAACAA 42344104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5525 TCCAGAGCTAATCAATATGCTTTTCTACTCTCTTTGAACTTTTGAGTTTTCTGGCAACAA 5584

 42344105 CAAAAATCCCAAACCTCATCCAAAACCGTAGTCCAGACAGCCCAGTTTCTGCACTCCCTT 42344164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5585 CAAAAATCCCAAACCTCATCCAAAACCGTAGTCCAGACAGCCCAGTTTCTGCACTCCCTT 5644

 42344165 CCTTGTGTCACATATTGTTGACAGAACTACTCCCGTTACCACATTCATTCCAGTGGTGAT 42344224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5645 CCTTGTGTCACATATTGTTGACAGAACTACTCCCGTTACCACATTCATTCCAGTGGTGAT 5704

 42344225 TCAAATTCTTCTGCAGAAATGGACTTGAAAGACAGAAAACTGCTCCTGTAATCACTTAAT 42344284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5705 TCAAATTCTTCTGCAGAAATGGACTTGAAAGACAGAAAACTGCTCCTGTAATCACTTAAT 5764

 42344285 AAGGAATCTTGGATGAGGAATACAGAGCTATGAATATGGATTTACTCTTAGCCTTTATGG 42344344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5765 AAGGAATCTTGGATGAGGAATACAGAGCTATGAATATGGATTTACTCTTAGCCTTTATGG 5824

 42344345 ATGCCTTTTTCTCAGTTATTTTCACTGAAAATCATGATGAACTGATTTAAATATCAAGGT 42344404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5825 ATGCCTTTTTCTCAGTTATTTTCACTGAAAATCATGATGAACTGATTTAAATATCAAGGT 5884

 42344405 AAACTGAGATGGAAAATTACCGATAATAAGAGTTTTCTGAAAATATAGATTGGCCTCTTT 42344464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5885 AAACTGAGATGGAAAATTACCGATAATAAGAGTTTTCTGAAAATATAGATTGGCCTCTTT 5944

 42344465 AAAGCACATCGAGTTTGTTTTGTTTAAATTACAAATTCACATATATTTGAAATGTGTTTA 42344524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5945 AAAGCACATCGAGTTTGTTTTGTTTAAATTACAAATTCACATATATTTGAAATGTGTTTA 6004

 42344525 AATGTGTCAGTTTTAGGCAAAACTAAACTATTTGATTCCTTTCCAAAAATCAGGAATTTG 42344584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6005 AATGTGTCAGTTTTAGGCAAAACTAAACTATTTGATTCCTTTCCAAAAATCAGGAATTTG 6064

 42344585 CTTTGGAAAAAAACCATGCAGTTTGATTTACAAAGCAGAGCGGGGGGGAAGTAGTGGGTG 42344644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6065 CTTTGGAAAAAAACCATGCAGTTTGATTTACAAAGCAGAGCGGGGGGGAAGTAGTGGGTG 6124

 42344645 AGAAAGACCCACCCAAAGGCTGCAGCCAGCTTCCCCAGGAAGATTCATAACCATGCCACA 42344704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6125 AGAAAGACCCACCCAAAGGCTGCAGCCAGCTTCCCCAGGAAGATTCATAACCATGCCACA 6184

 42344705 ATACTGTCCTTCAATTCGTTCCAACAGATTTTACTATAACTCTAAATCATTAGAAGCAAC 42344764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6185 ATACTGTCCTTCAATTCGTTCCAACAGATTTTACTATAACTCTAAATCATTAGAAGCAAC 6244

 42344765 TGCTGCTATGACTAGTGCTATCTTTGCCTCAAAAAGAGGAAAAATCAGGACATACAATAT 42344824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6245 TGCTGCTATGACTAGTGCTATCTTTGCCTCAAAAAGAGGAAAAATCAGGACATACAATAT 6304

 42344825 AATCCCCTCAGGATCTAGGAGAGAAATCAGCCCATTTGTCATAAGAACTGAAAACCTCAG 42344884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6305 AATCCCCTCAGGATCTAGGAGAGAAATCAGCCCATTTGTCATAAGAACTGAAAACCTCAG 6364

 42344885 CTAAATAGTATATGAAACATTGGTATTTCATACCTTGACATTACATATTTTTGAAAATAA 42344944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6365 CTAAATAGTATATGAAACATTGGTATTTCATACCTTGACATTACATATTTTTGAAAATAA 6424

 42344945 AGTAAGCATACACACAAGAAGTGGCTAGATGCAGCAGTTATAAAGTGGCTTAAGTTGGGT 42345004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6425 AGTAAGCATACACACAAGAAGTGGCTAGATGCAGCAGTTATAAAGTGGCTTAAGTTGGGT 6484

 42345005 TAACTAAATATAACCTAGAAAAACCATCTTATCTATTGCAAATTATTTCCAGAAAAAGGT 42345064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6485 TAACTAAATATAACCTAGAAAAACCATCTTATCTATTGCAAATTATTTCCAGAAAAAGGT 6544

 42345065 AAGAAAAATCCAACCAACACTTTTTAAACATCCTGAGCTATTCACAGCAAGTGAATCTTT 42345124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6545 AAGAAAAATCCAACCAACACTTTTTAAACATCCTGAGCTATTCACAGCAAGTGAATCTTT 6604

 42345125 ACCCTTACCAGATGTATAAACATTTACATAAGGCAGGAGGTTCAACACTTGGAGAGTGTA 42345184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6605 ACCCTTACCAGATGTATAAACATTTACATAAGGCAGGAGGTTCAACACTTGGAGAGTGTA 6664

 42345185 ATCAAGGCAGTAGTAACGCAGTGCTCCTCTCTTTGACTTGAATGACTTCCTCCCCATTAG 42345244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6665 ATCAAGGCAGTAGTAACGCAGTGCTCCTCTCTTTGACTTGAATGACTTCCTCCCCATTAG 6724

 42345245 GGTCATTATTGTTTTGCAGTGTCCCAGGGATGAAAGGACTTTGAAAGGTCATGTGTCTTG 42345304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6725 GGTCATTATTGTTTTGCAGTGTCCCAGGGATGAAAGGACTTTGAAAGGTCATGTGTCTTG 6784

 42345305 TGACCCAACTAGCAGCATCAGCATCACTGGGGAGAAACTCAAGCAGAAGCTTGAGTCTAC 42345364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6785 TGACCCAACTAGCAGCATCAGCATCACTGGGGAGAAACTCAAGCAGAAGCTTGAGTCTAC 6844

 42345365 TCCACTCTTGCTGACACCAAATCTGCATTTTTACAGGATTCTTGGGTGAGTCACACACAT 42345424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6845 TCCACTCTTGCTGACACCAAATCTGCATTTTTACAGGATTCTTGGGTGAGTCACACACAT 6904

 42345425 ATTCAAGGTTAAAATATGCCACCCTAGGTCTTTCTCCTGCTTCTGAGCAAAACTGGGCAC 42345484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6905 ATTCAAGGTTAAAATATGCCACCCTAGGTCTTTCTCCTGCTTCTGAGCAAAACTGGGCAC 6964

 42345485 AAGGGACAAACTAGTTTCCTTCAGCCACTTTCAAATCCTTTATAGAGTGTACTGTGTGAG 42345544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6965 AAGGGACAAACTAGTTTCCTTCAGCCACTTTCAAATCCTTTATAGAGTGTACTGTGTGAG 7024

 42345545 TCACTGAGAGGAAAGAGGAAATAATACTTATTTAGGGAAGTCTTGCATAACTTAACAAAG 42345604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7025 TCACTGAGAGGAAAGAGGAAATAATACTTATTTAGGGAAGTCTTGCATAACTTAACAAAG 7084

 42345605 TTAGTAACTTCTTCAATACACTCAAGTACCTATTTTTGGAAGCCCTACAGGTTAGGTCAA 42345664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7085 TTAGTAACTTCTTCAATACACTCAAGTACCTATTTTTGGAAGCCCTACAGGTTAGGTCAA 7144

 42345665 AGTAAAGAGAAGCAAAAAATGGAGTGAGTTCTAGTAAAAAACTCTGACAAAATAAGGGAA 42345724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7145 AGTAAAGAGAAGCAAAAAATGGAGTGAGTTCTAGTAAAAAACTCTGACAAAATAAGGGAA 7204

 42345725 GTGTAGAAGCTGAGTCTATGAGGGATGAGAGAAGCAATTTACCAAATTATCAGATCCAAA 42345784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7205 GTGTAGAAGCTGAGTCTATGAGGGATGAGAGAAGCAATTTACCAAATTATCAGATCCAAA 7264

 42345785 ATCATCTCTGCACTGTAGATGATTTATAGCCCTGGAAGCTTAGAGGCTTGAGTCTCTTGC 42345844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7265 ATCATCTCTGCACTGTAGATGATTTATAGCCCTGGAAGCTTAGAGGCTTGAGTCTCTTGC 7324

 42345845 TGTATTTCATTTCAAATTAGTAATTTTTATCTAGGGCTTCCCTATGGCTTAAAGTGAAGG 42345904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7325 TGTATTTCATTTCAAATTAGTAATTTTTATCTAGGGCTTCCCTATGGCTTAAAGTGAAGG 7384

 42345905 CCCTGGAATTTCTGAAGTGAAATTATCTGATGATTTTTATGTATGGTCATTCTGTAGTTA 42345964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7385 CCCTGGAATTTCTGAAGTGAAATTATCTGATGATTTTTATGTATGGTCATTCTGTAGTTA 7444

 42345965 TCCTGTAAGTTTCATATTTGTAACAAGACTGGAATCCGAACAATAGAAAACTCTGTGGCA 42346024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7445 TCCTGTAAGTTTCATATTTGTAACAAGACTGGAATCCGAACAATAGAAAACTCTGTGGCA 7504

 42346025 GTAAGCCAAAACCTGATGGACTTAGGAGAGTTACGTATGTGTGTTTCAGTGGTCCTCAAA 42346084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7505 GTAAGCCAAAACCTGATGGACTTAGGAGAGTTACGTATGTGTGTTTCAGTGGTCCTCAAA 7564

 42346085 TTCAGCTGCCTATTAGAATCACCTGGACTTTGAAAAAAAAAGAGCTTTCTTGAGGTATAA 42346144
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7565 TTTAGCTGCCTATTAGAATCACCTGGACTTTGAAAAAAAAAGAGCTTTCTTGAGGTATAA 7624

 42346145 CTGACAAATAATAAGACAAACATATTTCAGTATACAATTGGATGAGTTTTGACATGTTAT 42346204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7625 CTGACAAATAATAAGACAAACATATTTCAGTATACAATTGGATGAGTTTTGACATGTTAT 7684

 42346205 ATTCTTGTGAAACCATCACCACAATCAAGCTATTCACCCCCCAAATTTTCGTGCCCCTTT 42346264
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7685 ATTCTTGTGAAACCATCGCCACAATCAAGCTATTCACCCCCCAAATTTTCGTGCCCCTTT 7744

 42346265 GTTGTCCCACCCTTCTTTCTGCAACCACTGATCTGCTTTCTATCACTATGGATTAATTTG 42346324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7745 GTTGTCCCACCCTTCTTTCTGCAACCACTGATCTGCTTTCTATCACTATGGATTAATTTG 7804

 42346325 TATTTTCTAGAAGCTTAAATAAGTGAAACCATATGGTGTGCATGTTTTGCAGGGAGAGGG 42346384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7805 TATTTTCTAGAAGCTTAAATAAGTGAAACCATATGGTGTGCATGTTTTGCAGGGAGAGGG 7864

 42346385 CAGGGGGAGCTGGTTTCTTTCACTCGGTGTAATTGTTCTGAGAGTCATCCGTGTTTGCAT 42346444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7865 CAGGGGGAGCTGGTTTCTTTCACTCGGTGTAATTGTTCTGAGAGTCATCCGTGTTTGCAT 7924

 42346445 GTGTTAATAGTTTATTCTTTTTATCGGTAAGTAGTATCCCATTGTGTGGATGTACCACAT 42346504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7925 GTGTTAATAGTTTATTCTTTTTATCGGTAAGTAGTATCCCATTGTGTGGATGTACCACAT 7984

 42346505 GTTGTCTAACCATTCACAACTAAAGGATACTTGGGTTGTTTCTCATTTGGGGCAATTGAA 42346564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7985 GTTGTCTAACCATTCACAACTAAAGGATACTTGGGTTGTTTCTCATTTGGGGCAATTGAA 8044

 42346565 AATAAGCAGTATAAACTGCTATAAACAGTCATGTACAGATATAAGCATGTATGTTTCCAT 42346624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8045 AATAAGCAGTATAAACTGCTATAAACAGTCATGTACAGATATAAGCATGTATGTTTCCAT 8104

 42346625 TTTTCAAGGTAAATACCTAGAAGTGGGTATGGTAAGTGTATGTTTAACTTGAAAAGAAAC 42346684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8105 TTTTCAAGGTAAATACCTAGAAGTGGGTATGGTAAGTGTATGTTTAACTTGAAAAGAAAC 8164

 42346685 TACCAAAATGTTTCCAAAGTGGTTGTACCATTTTGCTTACCTACCAGAAATGTGTAAGAG 42346744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8165 TACCAAAATGTTTCCAAAGTGGTTGTACCATTTTGCTTACCTACCAGAAATGTGTAAGAG 8224

 42346745 TTCTAGTTACTCCACATACTTCCTAGCAGTTGATATTCTCAG-TTTTTTTTTTTATTTTA 42346803
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
     8225 TTCTAGTTACTCCACATACTTCCTAGCAGTTGATATTCTCAGTTTTTTTTTTTTATTTTA 8284

 42346804 ACCGTTCTAATAGCTGTGTAATGGTATTCCATTACAGTACTAATTTAAATTTCCCTAATA 42346863
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     8285 ACCGTTCTAATAGCTGTGTAATGGTATTCCATTACGGTACTAATTTAAATTTCCCTAATA 8344

 42346864 ACTACTGAGGTTGAAAAAATCTTTCATGGGCATATTTGCCATCCTTGTATCTTCTCTGGT 42346923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8345 ACTACTGAGGTTGAAAAAATCTTTCATGGGCATATTTGCCATCCTTGTATCTTCTCTGGT 8404

 42346924 GACGAATCTTTCAT 42346937
          ||||||||||||||
     8405 GACGAATCTTTCAT 8418

Alignment time is 6.16684 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [42336259,42357318] =>     21060 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [       1,    5416] =>      5416 nucs 'mol-32-1f0b-203040_5416'

Score:        5317
Aligned:      5416        nucs
Identic:      5407 (100%) nucs =>      1167 (100%)      4240 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [42341479,42342646] EXCISED REGION [42342650,42346896]
 second seq =>  [       1,    1168] EXCISED REGION [    1169,    5416]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         3 nucs [42342647,42342649]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        14 nucs [42342647,42342660] to [42342650,42342663]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [42342647,42342647] to [42342649,42342649]
 second seq =>         0 nucs

 42341479 GTCTCAAAAAGAAAAAAGAAAAGATTGCCATCTTCCTGGGGTGACAAACATAATTTTAAA 42341538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTCTCAAAAAGAAAAAAGAAAAGATTGCCATCTTCCTGGGGTGACAAACATAATTTTAAA 60

 42341539 AGAATCAGGTAGAAACATAGGACTGTATTTATGATGAAACAACTATGACTAAATGCTATG 42341598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGAATCAGGTAGAAACATAGGACTGTATTTATGATGAAACAACTATGACTAAATGCTATG 120

 42341599 TTTTTCAGATTACACGTGCCTTAGGAAGTGAGAAAAGTATAAGTGCAATGTGGAATTGGG 42341658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTTTCAGATTACACGTGCCTTAGGAAGTGAGAAAAGTATAAGTGCAATGTGGAATTGGG 180

 42341659 TGGTTGAGAAAACTCCAGAGAGGACCTGGTAGAGCTTGGAGGCAAGGTGGGCAAGGAACA 42341718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGGTTGAGAAAACTCCAGAGAGGACCTGGTAGAGCTTGGAGGCAAGGTGGGCAAGGAACA 240

 42341719 TTTCAAGAGGAGGGGACACTACAGCTGAGGCACAGAGGTGAGAAAGCACAGGAAGCAAGA 42341778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTTCAAGAGGAGGGGACACTACAGCTGAGGCACAGAGGTGAGAAAGCACAGGAAGCAAGA 300

 42341779 AAGAGGCTCATCTGGCTGCAGCAGAGGGAGAAATAGTAAATTAGATCAGATAACTCATAT 42341838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAGAGGCTCATCTGGCTGCAGCAGAGGGAGAAATAGTAAATTAGATCAGATAACTCATAT 360

 42341839 ATTGGGCACGTGTGCAGAGGGCCAAAAAGATGTTTGGCCTTAATTCTATAGGTATTCCCC 42341898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATTGGGCACGTGTGCAGAGGGCCAAAAAGATGTTTGGCCTTAATTCTATAGGTATTCCCC 420

 42341899 TTTGCCATAGATGTTACACCAAGAAAGAACACATTGAATCAAGCAAATTTAAGCTGGGTT 42341958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
      421 TTTGCCATAGATGTTACACCAAGAAAGAACACATTGAATCAAGCAACTTTAAGCTGGGTT 480

 42341959 TTTGTTTTTGTTTTTTGGTGGTGGGGGGGATGATTTATAAGCAGGACTTCCCAAAGCTTT 42342018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTGTTTTTGTTTTTTGGTGGTGGGGGGGATGATTTATAAGCAGGACTTCCCAAAGCTTT 540

 42342019 TAATATGCTTATATATGTGGCAGTGTTGAGAGGGGAAGATTTGATATTCCAAGTATTTTT 42342078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TAATATGCTTATATATGTGGCAGTGTTGAGAGGGGAAGATTTGATATTCCAAGTATTTTT 600

 42342079 GGCCACAGAACTCTTTTTATCATGGAACATTTCCAGTGTTCCATGAGACACAATTAGGGG 42342138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GGCCACAGAACTCTTTTTATCATGGAACATTTCCAGTGTTCCATGAGACACAATTAGGGG 660

 42342139 CTAGTGAGCCACTGACTTTTGAGTTGGAAAGTGACACATGGGGAAAGCAAAGTTTTGGAA 42342198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTAGTGAGCCACTGACTTTTGAGTTGGAAAGTGACACATGGGGAAAGCAAAGTTTTGGAA 720

 42342199 GATTGATCTCACGGTAGAATATAAGGTGAACAGGAGAGAAAAGAGCCTGGATTCAGGCAA 42342258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GATTGATCTCACGGTAGAATATAAGGTGAACAGGAGAGAAAAGAGCCTGGATTCAGGCAA 780

 42342259 CACAATCAGATGATTGGATACAGGCTCAAGATTAGGGGGTGGGTTGCACTACACTGGAGC 42342318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CACAATCAGATGATTGGATACAGGCTCAAGATTAGGGGGTGGGTTGCACTACACTGGAGC 840

 42342319 GGAGAATGGAGAGCAAAAGCACTGATTGAATGCACAGTCTTCTGTTGGATCCTGGGATGA 42342378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GGAGAATGGAGAGCAAAAGCACTGATTGAATGCACAGTCTTCTGTTGGATCCTGGGATGA 900

 42342379 TACAGAAGTGTCAGAGTTCCTGGGTCTTGTAGGAGTTCCAATGAGCATCAATCAAAAGTT 42342438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TACAGAAGTGTCAGAGTTCCTGGGTCTTGTAGGAGTTCCAATGAGCATCAATCAAAAGTT 960

 42342439 TGATTGTAAGGCACAGAAATCAACTTGGACCAGCTAAAGCAAAAAGACCATTTTTAGGGA 42342498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGATTGTAAGGCACAGAAATCAACTTGGACCAGCTAAAGCAAAAAGACCATTTTTAGGGA 1020

 42342499 AATAGGGATGTGTCACAAAGAACTGCATCTAGGTACTGGAAATCAACAAAAAGTTCCCCA 42342558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AATAGGGATGTGTCACAAAGAACTGCATCTAGGTACTGGAAATCAACAAAAAGTTCCCCA 1080

 42342559 TCTGATCTCAGCTTCTCTGTGTGTCTACTACATACACTATCTTTCTCCTCTTTTCTTTCC 42342618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TCTGATCTCAGCTTCTCTGTGTGTCTACTACATACACTATCTTTCTCCTCTTTTCTTTCC 1140

 42342619 TCTCTACCCCCTACCTCCCTCCTCTCTC 42342646
          ||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TCTCTACCCCCTACCTCCCTCCTCTCTC 1168

EXCISED REGION

 42342650 TTTTTTTTTTTTTTGTTTTTTGGTTTTTTTATGTTTGTTTGTTTGCTTTTGGAGACACGG 42342709
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     1169 TTTTTTTTTTTTTTGTTTTTTGGTTTTTTTATGTTTGTTTGTTTGTTTTTGGAGACACGG 1228

 42342710 TCTCCCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCTTAATTACTGCAGCCTCAATCTCCTG 42342769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1229 TCTCCCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCTTAATTACTGCAGCCTCAATCTCCTG 1288

 42342770 GGCTCAAGTGACCCTCCCACCTCAGCCTCCTGAATAGCTGGGACCACAGGTGCAAGCCAC 42342829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1289 GGCTCAAGTGACCCTCCCACCTCAGCCTCCTGAATAGCTGGGACCACAGGTGCAAGCCAC 1348

 42342830 AGTGCTCAGCTAATTAAAAAAAATTTTTTTTTCAGAGATGGGGTCTCACTATGTTGTCCA 42342889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1349 AGTGCTCAGCTAATTAAAAAAAATTTTTTTTTCAGAGATGGGGTCTCACTATGTTGTCCA 1408

 42342890 GGCTGGTCTCAAACTCCTAGGCTCAAGCAGTCCTCCCGTTTCAGCCTCAAAAAGTGCTGG 42342949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1409 GGCTGGTCTCAAACTCCTAGGCTCAAGCAGTCCTCCCGTTTCAGCCTCAAAAAGTGCTGG 1468

 42342950 GATTACAGGTGTGAGCCATCGCACTCCACCTTCTCTATAGTTACTGAGTTTGCGTGTTAC 42343009
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     1469 GATTACAGGTGTGAGCCATCGCACTCCACTTTCTCTATAGTTACTGAGTTTGCGTGTTAC 1528

 42343010 ACTGAGTTTACATCTTACATTTCTAGCCATATCAGAAACGACCTCTGCACCTCTCTTTCC 42343069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1529 ACTGAGTTTACATCTTACATTTCTAGCCATATCAGAAACGACCTCTGCACCTCTCTTTCC 1588

 42343070 CAATTTGAGATTTCTAATAGAAAGAATCTTGTTCACCCAGCTTGGGACTCATTGAGTTAT 42343129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1589 CAATTTGAGATTTCTAATAGAAAGAATCTTGTTCACCCAGCTTGGGACTCATTGAGTTAT 1648

 42343130 GACCAGTGGGATAGATTTTAGAAGATAAACATGTCTATAGGGACTTACCGTGTGAATTAG 42343189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1649 GACCAGTGGGATAGATTTTAGAAGATAAACATGTCTATAGGGACTTACCGTGTGAATTAG 1708

 42343190 TGGGGGAGCCGCTTACCAGGCAGAGGGGTCTGCTGTAAAGTGATACTGTGACTTTAAATT 42343249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1709 TGGGGGAGCCGCTTACCAGGCAGAGGGGTCTGCTGTAAAGTGATACTGTGACTTTAAATT 1768

 42343250 GAAAGTAAGCTTCTAGAAGAGTTGAAGAGGAGTGGATTATTGTTGAATGGATGTATAACT 42343309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1769 GAAAGTAAGCTTCTAGAAGAGTTGAAGAGGAGTGGATTATTGTTGAATGGATGTATAACT 1828

 42343310 AATGAAGCTTTAAAGGAAGTTTATTAGAAAGTCCATGTCCTTGTCTCTTTCCCAAACTCC 42343369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1829 AATGAAGCTTTAAAGGAAGTTTATTAGAAAGTCCATGTCCTTGTCTCTTTCCCAAACTCC 1888

 42343370 TTTAGTTCCCAAGTCCTGAAAGAATCTATGGATAAGGGAAGCAGAATACTATAGTGGTTA 42343429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1889 TTTAGTTCCCAAGTCCTGAAAGAATCTATGGATAAGGGAAGCAGAATACTATAGTGGTTA 1948

 42343430 AGAGCACATGCTCGAGGTTAAACTGTCTGTATTTTGGATCCTGGCCTTGAGGACTTGGGC 42343489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1949 AGAGCACATGCTCGAGGTTAAACTGTCTGTATTTTGGATCCTGGCCTTGAGGACTTGGGC 2008

 42343490 AAGTTACGTGACCTGCCTGAGCCTCAGTTTCCTCACCTGTAATATGGGTATCACGAGGAA 42343549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2009 AAGTTACGTGACCTGCCTGAGCCTCAGTTTCCTCACCTGTAATATGGGTATCACGAGGAA 2068

 42343550 TAAATAAGGTAATATGTGTAAAGTGCTTGGCACAATGCTCTTGATAATGTTAGCAACATA 42343609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2069 TAAATAAGGTAATATGTGTAAAGTGCTTGGCACAATGCTCTTGATAATGTTAGCAACATA 2128

 42343610 ATTTTGTAATGAAAATTAACTGATGGGGCTGAAATGTGCATCAGCAGATCCAAATATCCT 42343669
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     2129 ATTTTGTAATGAAAATTAACTGATGGGACTGAAATGTGCATCAGCAGATCCAAATATCCT 2188

 42343670 TGATAAACTGGCCAAAAGAAAGATGAATTGGCAGAGAGGCAAGTGTTCATCTCAGTTCTC 42343729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2189 TGATAAACTGGCCAAAAGAAAGATGAATTGGCAGAGAGGCAAGTGTTCATCTCAGTTCTC 2248

 42343730 CAGATATCCCTGCAAATGTGGCCTCTGGAGTAGAAGATTTAGGGAGAAAAATAAGCCATG 42343789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2249 CAGATATCCCTGCAAATGTGGCCTCTGGAGTAGAAGATTTAGGGAGAAAAATAAGCCATG 2308

 42343790 AAGCTCTTCTGGCACCAACATGAACTTCAGGGATCATGGGACATTTGGGCCAGTAACATT 42343849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2309 AAGCTCTTCTGGCACCAACATGAACTTCAGGGATCATGGGACATTTGGGCCAGTAACATT 2368

 42343850 CCTCTTTGTTCCTAGAGATTTAATATCTACCTACCAACTAAATGGCCTTGATTTGGAGGA 42343909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2369 CCTCTTTGTTCCTAGAGATTTAATATCTACCTACCAACTAAATGGCCTTGATTTGGAGGA 2428

 42343910 GAGAAGACAAGAAGAGGAATTGCTTTCAGCTGGTCCTTGCCTTTAACTAACCAGGGGTAC 42343969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2429 GAGAAGACAAGAAGAGGAATTGCTTTCAGCTGGTCCTTGCCTTTAACTAACCAGGGGTAC 2488

 42343970 AAAAATTTTAAAATACAAAGGAGACCATGTGTAAAACATTAGTTAAGCTCAGATATAAAT 42344029
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2489 AAAAATTTTAAAACACAAAGGAGACCATGTGTAAAACATTAGTTAAGCTCAGATATAAAT 2548

 42344030 CTAGTCTTTGACCAGTCCAGAGCTAATCAATATGCTTTTCTACTCTCTTTGAACTTTTGA 42344089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2549 CTAGTCTTTGACCAGTCCAGAGCTAATCAATATGCTTTTCTACTCTCTTTGAACTTTTGA 2608

 42344090 GTTTTCTGGCAACAACAAAAATCCCAAACCTCATCCAAAACCGTAGTCCAGACAGCCCAG 42344149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2609 GTTTTCTGGCAACAACAAAAATCCCAAACCTCATCCAAAACCGTAGTCCAGACAGCCCAG 2668

 42344150 TTTCTGCACTCCCTTCCTTGTGTCACATATTGTTGACAGAACTACTCCCGTTACCACATT 42344209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2669 TTTCTGCACTCCCTTCCTTGTGTCACATATTGTTGACAGAACTACTCCCGTTACCACATT 2728

 42344210 CATTCCAGTGGTGATTCAAATTCTTCTGCAGAAATGGACTTGAAAGACAGAAAACTGCTC 42344269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2729 CATTCCAGTGGTGATTCAAATTCTTCTGCAGAAATGGACTTGAAAGACAGAAAACTGCTC 2788

 42344270 CTGTAATCACTTAATAAGGAATCTTGGATGAGGAATACAGAGCTATGAATATGGATTTAC 42344329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2789 CTGTAATCACTTAATAAGGAATCTTGGATGAGGAATACAGAGCTATGAATATGGATTTAC 2848

 42344330 TCTTAGCCTTTATGGATGCCTTTTTCTCAGTTATTTTCACTGAAAATCATGATGAACTGA 42344389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2849 TCTTAGCCTTTATGGATGCCTTTTTCTCAGTTATTTTCACTGAAAATCATGATGAACTGA 2908

 42344390 TTTAAATATCAAGGTAAACTGAGATGGAAAATTACCGATAATAAGAGTTTTCTGAAAATA 42344449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2909 TTTAAATATCAAGGTAAACTGAGATGGAAAATTACCGATAATAAGAGTTTTCTGAAAATA 2968

 42344450 TAGATTGGCCTCTTTAAAGCACATCGAGTTTGTTTTGTTTAAATTACAAATTCACATATA 42344509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2969 TAGATTGGCCTCTTTAAAGCACATCGAGTTTGTTTTGTTTAAATTACAAATTCACATATA 3028

 42344510 TTTGAAATGTGTTTAAATGTGTCAGTTTTAGGCAAAACTAAACTATTTGATTCCTTTCCA 42344569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3029 TTTGAAATGTGTTTAAATGTGTCAGTTTTAGGCAAAACTAAACTATTTGATTCCTTTCCA 3088

 42344570 AAAATCAGGAATTTGCTTTGGAAAAAAACCATGCAGTTTGATTTACAAAGCAGAGCGGGG 42344629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3089 AAAATCAGGAATTTGCTTTGGAAAAAAACCATGCAGTTTGATTTACAAAGCAGAGCGGGG 3148

 42344630 GGGAAGTAGTGGGTGAGAAAGACCCACCCAAAGGCTGCAGCCAGCTTCCCCAGGAAGATT 42344689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3149 GGGAAGTAGTGGGTGAGAAAGACCCACCCAAAGGCTGCAGCCAGCTTCCCCAGGAAGATT 3208

 42344690 CATAACCATGCCACAATACTGTCCTTCAATTCGTTCCAACAGATTTTACTATAACTCTAA 42344749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3209 CATAACCATGCCACAATACTGTCCTTCAATTCGTTCCAACAGATTTTACTATAACTCTAA 3268

 42344750 ATCATTAGAAGCAACTGCTGCTATGACTAGTGCTATCTTTGCCTCAAAAAGAGGAAAAAT 42344809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3269 ATCATTAGAAGCAACTGCTGCTATGACTAGTGCTATCTTTGCCTCAAAAAGAGGAAAAAT 3328

 42344810 CAGGACATACAATATAATCCCCTCAGGATCTAGGAGAGAAATCAGCCCATTTGTCATAAG 42344869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3329 CAGGACATACAATATAATCCCCTCAGGATCTAGGAGAGAAATCAGCCCATTTGTCATAAG 3388

 42344870 AACTGAAAACCTCAGCTAAATAGTATATGAAACATTGGTATTTCATACCTTGACATTACA 42344929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3389 AACTGAAAACCTCAGCTAAATAGTATATGAAACATTGGTATTTCATACCTTGACATTACA 3448

 42344930 TATTTTTGAAAATAAAGTAAGCATACACACAAGAAGTGGCTAGATGCAGCAGTTATAAAG 42344989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3449 TATTTTTGAAAATAAAGTAAGCATACACACAAGAAGTGGCTAGATGCAGCAGTTATAAAG 3508

 42344990 TGGCTTAAGTTGGGTTAACTAAATATAACCTAGAAAAACCATCTTATCTATTGCAAATTA 42345049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3509 TGGCTTAAGTTGGGTTAACTAAATATAACCTAGAAAAACCATCTTATCTATTGCAAATTA 3568

 42345050 TTTCCAGAAAAAGGTAAGAAAAATCCAACCAACACTTTTTAAACATCCTGAGCTATTCAC 42345109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3569 TTTCCAGAAAAAGGTAAGAAAAATCCAACCAACACTTTTTAAACATCCTGAGCTATTCAC 3628

 42345110 AGCAAGTGAATCTTTACCCTTACCAGATGTATAAACATTTACATAAGGCAGGAGGTTCAA 42345169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3629 AGCAAGTGAATCTTTACCCTTACCAGATGTATAAACATTTACATAAGGCAGGAGGTTCAA 3688

 42345170 CACTTGGAGAGTGTAATCAAGGCAGTAGTAACGCAGTGCTCCTCTCTTTGACTTGAATGA 42345229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3689 CACTTGGAGAGTGTAATCAAGGCAGTAGTAACGCAGTGCTCCTCTCTTTGACTTGAATGA 3748

 42345230 CTTCCTCCCCATTAGGGTCATTATTGTTTTGCAGTGTCCCAGGGATGAAAGGACTTTGAA 42345289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3749 CTTCCTCCCCATTAGGGTCATTATTGTTTTGCAGTGTCCCAGGGATGAAAGGACTTTGAA 3808

 42345290 AGGTCATGTGTCTTGTGACCCAACTAGCAGCATCAGCATCACTGGGGAGAAACTCAAGCA 42345349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3809 AGGTCATGTGTCTTGTGACCCAACTAGCAGCATCAGCATCACTGGGGAGAAACTCAAGCA 3868

 42345350 GAAGCTTGAGTCTACTCCACTCTTGCTGACACCAAATCTGCATTTTTACAGGATTCTTGG 42345409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3869 GAAGCTTGAGTCTACTCCACTCTTGCTGACACCAAATCTGCATTTTTACAGGATTCTTGG 3928

 42345410 GTGAGTCACACACATATTCAAGGTTAAAATATGCCACCCTAGGTCTTTCTCCTGCTTCTG 42345469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3929 GTGAGTCACACACATATTCAAGGTTAAAATATGCCACCCTAGGTCTTTCTCCTGCTTCTG 3988

 42345470 AGCAAAACTGGGCACAAGGGACAAACTAGTTTCCTTCAGCCACTTTCAAATCCTTTATAG 42345529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3989 AGCAAAACTGGGCACAAGGGACAAACTAGTTTCCTTCAGCCACTTTCAAATCCTTTATAG 4048

 42345530 AGTGTACTGTGTGAGTCACTGAGAGGAAAGAGGAAATAATACTTATTTAGGGAAGTCTTG 42345589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4049 AGTGTACTGTGTGAGTCACTGAGAGGAAAGAGGAAATAATACTTATTTAGGGAAGTCTTG 4108

 42345590 CATAACTTAACAAAGTTAGTAACTTCTTCAATACACTCAAGTACCTATTTTTGGAAGCCC 42345649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4109 CATAACTTAACAAAGTTAGTAACTTCTTCAATACACTCAAGTACCTATTTTTGGAAGCCC 4168

 42345650 TACAGGTTAGGTCAAAGTAAAGAGAAGCAAAAAATGGAGTGAGTTCTAGTAAAAAACTCT 42345709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4169 TACAGGTTAGGTCAAAGTAAAGAGAAGCAAAAAATGGAGTGAGTTCTAGTAAAAAACTCT 4228

 42345710 GACAAAATAAGGGAAGTGTAGAAGCTGAGTCTATGAGGGATGAGAGAAGCAATTTACCAA 42345769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4229 GACAAAATAAGGGAAGTGTAGAAGCTGAGTCTATGAGGGATGAGAGAAGCAATTTACCAA 4288

 42345770 ATTATCAGATCCAAAATCATCTCTGCACTGTAGATGATTTATAGCCCTGGAAGCTTAGAG 42345829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4289 ATTATCAGATCCAAAATCATCTCTGCACTGTAGATGATTTATAGCCCTGGAAGCTTAGAG 4348

 42345830 GCTTGAGTCTCTTGCTGTATTTCATTTCAAATTAGTAATTTTTATCTAGGGCTTCCCTAT 42345889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4349 GCTTGAGTCTCTTGCTGTATTTCATTTCAAATTAGTAATTTTTATCTAGGGCTTCCCTAT 4408

 42345890 GGCTTAAAGTGAAGGCCCTGGAATTTCTGAAGTGAAATTATCTGATGATTTTTATGTATG 42345949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4409 GGCTTAAAGTGAAGGCCCTGGAATTTCTGAAGTGAAATTATCTGATGATTTTTATGTATG 4468

 42345950 GTCATTCTGTAGTTATCCTGTAAGTTTCATATTTGTAACAAGACTGGAATCCGAACAATA 42346009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4469 GTCATTCTGTAGTTATCCTGTAAGTTTCATATTTGTAACAAGACTGGAATCCGAACAATA 4528

 42346010 GAAAACTCTGTGGCAGTAAGCCAAAACCTGATGGACTTAGGAGAGTTACGTATGTGTGTT 42346069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4529 GAAAACTCTGTGGCAGTAAGCCAAAACCTGATGGACTTAGGAGAGTTACGTATGTGTGTT 4588

 42346070 TCAGTGGTCCTCAAATTCAGCTGCCTATTAGAATCACCTGGACTTTGAAAAAAAAAGAGC 42346129
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4589 TCAGTGGTCCTCAAATTTAGCTGCCTATTAGAATCACCTGGACTTTGAAAAAAAAAGAGC 4648

 42346130 TTTCTTGAGGTATAACTGACAAATAATAAGACAAACATATTTCAGTATACAATTGGATGA 42346189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4649 TTTCTTGAGGTATAACTGACAAATAATAAGACAAACATATTTCAGTATACAATTGGATGA 4708

 42346190 GTTTTGACATGTTATATTCTTGTGAAACCATCACCACAATCAAGCTATTCACCCCCCAAA 42346249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     4709 GTTTTGACATGTTATATTCTTGTGAAACCATCGCCACAATCAAGCTATTCACCCCCCAAA 4768

 42346250 TTTTCGTGCCCCTTTGTTGTCCCACCCTTCTTTCTGCAACCACTGATCTGCTTTCTATCA 42346309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4769 TTTTCGTGCCCCTTTGTTGTCCCACCCTTCTTTCTGCAACCACTGATCTGCTTTCTATCA 4828

 42346310 CTATGGATTAATTTGTATTTTCTAGAAGCTTAAATAAGTGAAACCATATGGTGTGCATGT 42346369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4829 CTATGGATTAATTTGTATTTTCTAGAAGCTTAAATAAGTGAAACCATATGGTGTGCATGT 4888

 42346370 TTTGCAGGGAGAGGGCAGGGGGAGCTGGTTTCTTTCACTCGGTGTAATTGTTCTGAGAGT 42346429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4889 TTTGCAGGGAGAGGGCAGGGGGAGCTGGTTTCTTTCACTCGGTGTAATTGTTCTGAGAGT 4948

 42346430 CATCCGTGTTTGCATGTGTTAATAGTTTATTCTTTTTATCGGTAAGTAGTATCCCATTGT 42346489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4949 CATCCGTGTTTGCATGTGTTAATAGTTTATTCTTTTTATCGGTAAGTAGTATCCCATTGT 5008

 42346490 GTGGATGTACCACATGTTGTCTAACCATTCACAACTAAAGGATACTTGGGTTGTTTCTCA 42346549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5009 GTGGATGTACCACATGTTGTCTAACCATTCACAACTAAAGGATACTTGGGTTGTTTCTCA 5068

 42346550 TTTGGGGCAATTGAAAATAAGCAGTATAAACTGCTATAAACAGTCATGTACAGATATAAG 42346609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5069 TTTGGGGCAATTGAAAATAAGCAGTATAAACTGCTATAAACAGTCATGTACAGATATAAG 5128

 42346610 CATGTATGTTTCCATTTTTCAAGGTAAATACCTAGAAGTGGGTATGGTAAGTGTATGTTT 42346669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5129 CATGTATGTTTCCATTTTTCAAGGTAAATACCTAGAAGTGGGTATGGTAAGTGTATGTTT 5188

 42346670 AACTTGAAAAGAAACTACCAAAATGTTTCCAAAGTGGTTGTACCATTTTGCTTACCTACC 42346729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5189 AACTTGAAAAGAAACTACCAAAATGTTTCCAAAGTGGTTGTACCATTTTGCTTACCTACC 5248

 42346730 AGAAATGTGTAAGAGTTCTAGTTACTCCACATACTTCCTAGCAGTTGATATTCTCAG-TT 42346788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
     5249 AGAAATGTGTAAGAGTTCTAGTTACTCCACATACTTCCTAGCAGTTGATATTCTCAGTTT 5308

 42346789 TTTTTTTTTATTTTAACCGTTCTAATAGCTGTGTAATGGTATTCCATTACAGTACTAATT 42346848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     5309 TTTTTTTTTATTTTAACCGTTCTAATAGCTGTGTAATGGTATTCCATTACGGTACTAATT 5368

 42346849 TAAATTTCCCTAATAACTACTGAGGTTGAAAAAATCTTTCATGGGCAT 42346896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5369 TAAATTTCCCTAATAACTACTGAGGTTGAAAAAATCTTTCATGGGCAT 5416

Alignment time is 4.00825 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [42336259,42357318] =>     21060 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [       1,    9875] =>      9875 nucs 'mol-32-1f21-002114_9875'

Score:        9745
Aligned:      9891        nucs
Identic:      9863 (100%) nucs =>      7314 (100%)      2549 ( 99%)
Gaps:           20 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [42338932,42346259] EXCISED REGION [42347319,42349881]
 second seq =>  [       1,    7322] EXCISED REGION [    7327,    9875]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1059 nucs [42346260,42347318]
 second seq =>         4 nucs [7323,7326]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [7323,7323] to [7327,7327]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 42338932 GTGTGTGTGTGTATGTATATATGTGTGTGTATATATATACGTATATATATGTGTATATAT 42338991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTGTGTGTGTGTATGTATATATGTGTGTGTATATATATACGTATATATATGTGTATATAT 60

 42338992 ATATACATATCTATATATGTGTGTGTGTATATATATATATATATACATATATATATTTAC 42339051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATATACATATCTATATATGTGTGTGTGTATATATATATATATATACATATATATATTTAC 120

 42339052 CCAGTTTCAAGAGAAAAAAGTCAAAGGGGTAAGAGTATTCTTCATACACAGTCTAACATC 42339111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCAGTTTCAAGAGAAAAAAGTCAAAGGGGTAAGAGTATTCTTCATACACAGTCTAACATC 180

 42339112 TCTTTCTTCCACTCACAGTTGTCTTATTTTGTTCCTCTTCACTCTCCCAAAACTTAGCCC 42339171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCTTTCTTCCACTCACAGTTGTCTTATTTTGTTCCTCTTCACTCTCCCAAAACTTAGCCC 240

 42339172 ATGTTCCCCAGCTCCCCTCTGCACCTGCATCTGCCACACACGTACATACATACACACACT 42339231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATGTTCCCCAGCTCCCCTCTGCACCTGCATCTGCCACACACGTACATACATACACACACT 300

 42339232 TCACATACATGCACGCATATATACAAACACACACACATATGCGCGCACACACACACACAC 42339291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCACATACATGCACGCATATATACAAACACACACACATATGCGCGCACACACACACACAC 360

 42339292 ACACACACACACTCTCTCTCCAGCCCTTGATGCTTTCCCCCTCTCTCTTCCTCCTGGACC 42339351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACACACACACACTCTCTCTCCAGCCCTTGATGCTTTCCCCCTCTCTCTTCCTCCTGGACC 420

 42339352 TTTTCTTTGCTCCATTCCCAACACACAGGTCCCTGGTCTGTCTCTGGCTCCTTCCAAGCC 42339411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTTTCTTTGCTCCATTCCCAACACACAGGTCCCTGGTCTGTCTCTGGCTCCTTCCAAGCC 480

 42339412 TTGGCTCTTCTTAGGTATTATCCCCAGCAGCACAGCAGCAGACCAGCTGACCTGGACTAT 42339471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTGGCTCTTCTTAGGTATTATCCCCAGCAGCACAGCAGCAGACCAGCTGACCTGGACTAT 540

 42339472 TTCTTAGGCAGTAGTCAGGTAAGCTGTACCTACTCATATGGAGATATTGTTTGATCCTGA 42339531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTCTTAGGCAGTAGTCAGGTAAGCTGTACCTACTCATATGGAGATATTGTTTGATCCTGA 600

 42339532 GCCTCTCCTGATGTCTCTTTTTAGCCCCCAGGGGGAGGTTTTAATATCCACATCCACCAG 42339591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GCCTCTCCTGATGTCTCTTTTTAGCCCCCAGGGGGAGGTTTTAATATCCACATCCACCAG 660

 42339592 CATCTTCTCCCTAGGGGAGAAGGGAGTGAGATGGGGAGAAGAAAGTGAGAGGAATCGAAA 42339651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CATCTTCTCCCTAGGGGAGAAGGGAGTGAGATGGGGAGAAGAAAGTGAGAGGAATCGAAA 720

 42339652 CATGTCTAAGGAAACTAAGAGGCAGAGGTTATTTCGATCTGCTCTTTATAATCATCTCAG 42339711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CATGTCTAAGGAAACTAAGAGGCAGAGGTTATTTCGATCTGCTCTTTATAATCATCTCAG 780

 42339712 ATGCCTGCCCTGGGCAATGTCTAGGTTATTACTGAATTCTGGGGACACTCCCATATTAGC 42339771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATGCCTGCCCTGGGCAATGTCTAGGTTATTACTGAATTCTGGGGACACTCCCATATTAGC 840

 42339772 CCAATGACTAATCAAAAAAAGCAAGCTGACCATAGTCAACTAGAGGGTAAGGAACCAAGT 42339831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CCAATGACTAATCAAAAAAAGCAAGCTGACCATAGTCAACTAGAGGGTAAGGAACCAAGT 900

 42339832 GAAAATAGAGAGAGTTCTCCGGACCTCTGAATCTGGGTACAATCATTCAGTATGAAGATA 42339891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GAAAATAGAGAGAGTTCTCCGGACCTCTGAATCTGGGTACAATCATTCAGTATGAAGATA 960

 42339892 GGAGCTAGGAGAAGAGAGAAAACATGGAATTGTATTTTGATTGACTTTTTTCTGATTACA 42339951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GGAGCTAGGAGAAGAGAGAAAACATGGAATTGTATTTTGATTGACTTTTTTCTGATTACA 1020

 42339952 AAAGTCATATATGTTCAATGTAGAAAACCAGGAAGATACTGAAAAATACAAGAAGGTGTT 42340011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AAAGTCATATATGTTCAATGTAGAAAACCAGGAAGATACTGAAAAATACAAGAAGGTGTT 1080

 42340012 AAAAAAAAAAAACACTTATGACCCCACCACCTAGATTTAATCAAGATTAACATGTTAGTT 42340071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAAAAAAAAAAACACTTATGACCCCACCACCTAGATTTAATCAAGATTAACATGTTAGTT 1140

 42340072 TACCTTTCCAGTGTGGTTTTCAATGCATATTCTTTTTAAAATCAAGTTAGAAACATAGTG 42340131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TACCTTTCCAGTGTGGTTTTCAATGCATATTCTTTTTAAAATCAAGTTAGAAACATAGTG 1200

 42340132 TATATGCTATTTTAGAAATTCTTTCTCAGCTGGGCGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCA 42340191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TATATGCTATTTTAGAAATTCTTTCTCAGCTGGGCGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCA 1260

 42340192 GCACTTTAGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGG 42340251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GCACTTTAGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGG 1320

 42340252 CCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACCAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGATGGCAC 42340311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACCAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGATGGCAC 1380

 42340312 ACACCTGTAAATCTCAGCTATTCTGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACTTGAGAG 42340371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ACACCTGTAAATCTCAGCTATTCTGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACTTGAGAG 1440

 42340372 GTGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATCGCACCACTGCACTCCACTCCAGCCTGGGCAACAGA 42340431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GTGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATCGCACCACTGCACTCCACTCCAGCCTGGGCAACAGA 1500

 42340432 GAGAGACTCTGTCTCAAAAAATAAAAAAGAAAGAAAAGAAAGAAATTCTTTCTCATACAT 42340491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GAGAGACTCTGTCTCAAAAAATAAAAAAGAAAGAAAAGAAAGAAATTCTTTCTCATACAT 1560

 42340492 TACATCATAAATCTTTTCCCAAATCATTAAATATTCTTCTGCAATATGATTTGTTAAAGC 42340551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TACATCATAAATCTTTTCCCAAATCATTAAATATTCTTCTGCAATATGATTTGTTAAAGC 1620

 42340552 TATATATGATTTTGTGCAATAGATATGCTATAATAGGCTTACCCAATTTTATATGGAAGA 42340611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TATATATGATTTTGTGCAATAGATATGCTATAATAGGCTTACCCAATTTTATATGGAAGA 1680

 42340612 GCACTTACGCTGTTTCCAGGCATAGAATTCTAAATATGGCAAGGTTATCTGCACAACTCC 42340671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GCACTTACGCTGTTTCCAGGCATAGAATTCTAAATATGGCAAGGTTATCTGCACAACTCC 1740

 42340672 TGTTTTCAGGCATGCTGACCTCCATTCCTTACAAGCAGATAATGATCCCTTTAAAGTTCT 42340731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGTTTTCAGGCATGCTGACCTCCATTCCTTACAAGCAGATAATGATCCCTTTAAAGTTCT 1800

 42340732 CTGCTCAAGAGAACCGTGCCATAGCAGAAGTAATTCTTCCCCAAGCGTTCAGCTGTCCTG 42340791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CTGCTCAAGAGAACCGTGCCATAGCAGAAGTAATTCTTCCCCAAGCGTTCAGCTGTCCTG 1860

 42340792 TGTTCTCCAGGGAAAGCCTAGCATTGGGCGTTGGGCATGCTTGCCTCTAAATGGGAAGGC 42340851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TGTTCTCCAGGGAAAGCCTAGCATTGGGCGTTGGGCATGCTTGCCTCTAAATGGGAAGGC 1920

 42340852 CAGTTCATTCTTAAGCAGATGGAGAGAAAGCATTTGTCATTCTAAATCCGGGAAGTAGCT 42340911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CAGTTCATTCTTAAGCAGATGGAGAGAAAGCATTTGTCATTCTAAATCCGGGAAGTAGCT 1980

 42340912 CAATTCAATTCAATTGCATAATTCTTAAAAACATATTTTGCGCCACTCCTGAAAATGGTA 42340971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CAATTCAATTCAATTGCATAATTCTTAAAAACATATTTTGCGCCACTCCTGAAAATGGTA 2040

 42340972 TTATAGAAGAAAAGTATGGTTTCTACCTTTAAGAAGATTGCTGACCGGGCTGGGCGCAGT 42341031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TTATAGAAGAAAAGTATGGTTTCTACCTTTAAGAAGATTGCTGACCGGGCTGGGCGCAGT 2100

 42341032 GGCTCATGCCTGTAATCCCAGAACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGCAGATCCCCTGAGGTCA 42341091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GGCTCATGCCTGTAATCCCAGAACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGCAGATCCCCTGAGGTCA 2160

 42341092 GGAGTTAGAGGCTAGCCCGACCAACATGGCAAAACCCCGTCTCTACTAAAAATATAAAAA 42341151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GGAGTTAGAGGCTAGCCCGACCAACATGGCAAAACCCCGTCTCTACTAAAAATATAAAAA 2220

 42341152 TTAGCTGGGCATGGTGGTGCATGCCTGTAGCCCCAGCTACTCAGGAGACTCAGGCATGAA 42341211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TTAGCTGGGCATGGTGGTGCATGCCTGTAGCCCCAGCTACTCAGGAGACTCAGGCATGAA 2280

 42341212 AATCGCTTGAACCCGAGACACGGAGGTGGTGGTGAGCTGAAATTGCGCCACTGCATTCCA 42341271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AATCGCTTGAACCCGAGACACGGAGGTGGTGGTGAGCTGAAATTGCGCCACTGCATTCCA 2340

 42341272 GCCTGGGCGACAGAGCAAGACTCTATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAGAAGAAGAAGA 42341331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GCCTGGGCGACAGAGCAAGACTCTATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAGAAGAAGAAGA 2400

 42341332 TTGCTGGCGGGGTGTTGTGGCTCATACTTGTAATCCTAGCACTTTGGGAGGCCAAGGAAG 42341391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TTGCTGGCGGGGTGTTGTGGCTCATACTTGTAATCCTAGCACTTTGGGAGGCCAAGGAAG 2460

 42341392 GAGGATCACTTGAGCCAAAGAAGTCAAGGCTGCAGTGAGCTGTGATCACACCACTCCATG 42341451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GAGGATCACTTGAGCCAAAGAAGTCAAGGCTGCAGTGAGCTGTGATCACACCACTCCATG 2520

 42341452 CCAGCCTGGGTGACAGAGTGAAACCCTGTCTCAAAAAGAAAAAAGAAAAGATTGCCATCT 42341511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CCAGCCTGGGTGACAGAGTGAAACCCTGTCTCAAAAAGAAAAAAGAAAAGATTGCCATCT 2580

 42341512 TCCTGGGGTGACAAACATAATTTTAAAAGAATCAGGTAGAAACATAGGACTGTATTTATG 42341571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TCCTGGGGTGACAAACATAATTTTAAAAGAATCAGGTAGAAACATAGGACTGTATTTATG 2640

 42341572 ATGAAACAACTATGACTAAATGCTATGTTTTTCAGATTACACGTGCCTTAGGAAGTGAGA 42341631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 ATGAAACAACTATGACTAAATGCTATGTTTTTCAGATTACACGTGCCTTAGGAAGTGAGA 2700

 42341632 AAAGTATAAGTGCAATGTGGAATTGGGTGGTTGAGAAAACTCCAGAGAGGACCTGGTAGA 42341691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AAAGTATAAGTGCAATGTGGAATTGGGTGGTTGAGAAAACTCCAGAGAGGACCTGGTAGA 2760

 42341692 GCTTGGAGGCAAGGTGGGCAAGGAACATTTCAAGAGGAGGGGACACTACAGCTGAGGCAC 42341751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GCTTGGAGGCAAGGTGGGCAAGGAACATTTCAAGAGGAGGGGACACTACAGCTGAGGCAC 2820

 42341752 AGAGGTGAGAAAGCACAGGAAGCAAGAAAGAGGCTCATCTGGCTGCAGCAGAGGGAGAAA 42341811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 AGAGGTGAGAAAGCACAGGAAGCAAGAAAGAGGCTCATCTGGCTGCAGCAGAGGGAGAAA 2880

 42341812 TAGTAAATTAGATCAGATAACTCATATATTGGGCACGTGTGCAGAGGGCCAAAAAGATGT 42341871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TAGTAAATTAGATCAGATAACTCATATATTGGGCACGTGTGCAGAGGGCCAAAAAGATGT 2940

 42341872 TTGGCCTTAATTCTATAGGTATTCCCCTTTGCCATAGATGTTACACCAAGAAAGAACACA 42341931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TTGGCCTTAATTCTATAGGTATTCCCCTTTGCCATAGATGTTACACCAAGAAAGAACACA 3000

 42341932 TTGAATCAAGCAAATTTAAGCTGGGTTTTTGTTTTTGTTTTTTGGTGGTGGGGGGGATGA 42341991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TTGAATCAAGCAAATTTAAGCTGGGTTTTTGTTTTTGTTTTTTGGTGGTGGGGGGGATGA 3060

 42341992 TTTATAAGCAGGACTTCCCAAAGCTTTTAATATGCTTATATATGTGGCAGTGTTGAGAGG 42342051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TTTATAAGCAGGACTTCCCAAAGCTTTTAATATGCTTATATATGTGGCAGTGTTGAGAGG 3120

 42342052 GGAAGATTTGATATTCCAAGTATTTTTGGCCACAGAACTCTTTTTATCATGGAACATTTC 42342111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 GGAAGATTTGATATTCCAAGTATTTTTGGCCACAGAACTCTTTTTATCATGGAACATTTC 3180

 42342112 CAGTGTTCCATGAGACACAATTAGGGGCTAGTGAGCCACTGACTTTTGAGTTGGAAAGTG 42342171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 CAGTGTTCCATGAGACACAATTAGGGGCTAGTGAGCCACTGACTTTTGAGTTGGAAAGTG 3240

 42342172 ACACATGGGGAAAGCAAAGTTTTGGAAGATTGATCTCACGGTAGAATATAAGGTGAACAG 42342231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 ACACATGGGGAAAGCAAAGTTTTGGAAGATTGATCTCACGGTAGAATATAAGGTGAACAG 3300

 42342232 GAGAGAAAAGAGCCTGGATTCAGGCAACACAATCAGATGATTGGATACAGGCTCAAGATT 42342291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 GAGAGAAAAGAGCCTGGATTCAGGCAACACAATCAGATGATTGGATACAGGCTCAAGATT 3360

 42342292 AGGGGGTGGGTTGCACTACACTGGAGCGGAGAATGGAGAGCAAAAGCACTGATTGAATGC 42342351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 AGGGGGTGGGTTGCACTACACTGGAGCGGAGAATGGAGAGCAAAAGCACTGATTGAATGC 3420

 42342352 ACAGTCTTCTGTTGGATCCTGGGATGATACAGAAGTGTCAGAGTTCCTGGGTCTTGTAGG 42342411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 ACAGTCTTCTGTTGGATCCTGGGATGATACAGAAGTGTCAGAGTTCCTGGGTCTTGTAGG 3480

 42342412 AGTTCCAATGAGCATCAATCAAAAGTTTGATTGTAAGGCACAGAAATCAACTTGGACCAG 42342471
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 AGTTCCAATGCGCATCAATCAAAAGTTTGATTGTAAGGCACAGAAATCAACTTGGACCAG 3540

 42342472 CTAAAGCAAAAAGACCATTTTTAGGGAAATAGGGATGTGTCACAAAGAACTGCATCTAGG 42342531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 CTAAAGCAAAAAGACCATTTTTAGGGAAATAGGGATGTGTCACAAAGAACTGCATCTAGG 3600

 42342532 TACTGGAAATCAACAAAAAGTTCCCCATCTGATCTCAGCTTCTCTGTGTGTCTACTACAT 42342591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 TACTGGAAATCAACAAAAAGTTCCCCATCTGATCTCAGCTTCTCTGTGTGTCTACTACAT 3660

 42342592 ACACTATCTTTCTCCTCTTTTCTTTCCTCTCTACCCCCTACCTCCCTCCTCTCTCTTTTT 42342651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 ACACTATCTTTCTCCTCTTTTCTTTCCTCTCTACCCCCTACCTCCCTCCTCTCTCTTTTT 3720

 42342652 TTTTTTTTTTTTGTTTTTTGGTTTTTTTATGTTTGTTTGTTTGCTTTTGGAGACACGGTC 42342711
          ||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     3721 TTTTTT------GTTTTTTGGTTTTTTTATGTTTGTTTGTTTGTTTTTGGAGACACGGTC 3774

 42342712 TCCCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCTTAATTACTGCAGCCTCAATCTCCTGGG 42342771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3775 TCCCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCTTAATTACTGCAGCCTCAATCTCCTGGG 3834

 42342772 CTCAAGTGACCCTCCCACCTCAGCCTCCTGAATAGCTGGGACCACAGGTGCAAGCCACAG 42342831
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3835 CTCAAGTGACCCTCCCACTTCAGCCTCCTGAATAGCTGGGACCACAGGTGCAAGCCACAG 3894

 42342832 TGCTCAGCTAATTAAAAAAAATTTTTTTTTCAGAGATGGGGTCTCACTATGTTGTCCAGG 42342891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3895 TGCTCAGCTAATTAAAAAAAATTTTTTTTTCAGAGATGGGGTCTCACTATGTTGTCCAGG 3954

 42342892 CTGGTCTCAAACTCCTAGGCTCAAGCAGTCCTCCCGTTTCAGCCTCAAAAAGTGCTGGGA 42342951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3955 CTGGTCTCAAACTCCTAGGCTCAAGCAGTCCTCCCGTTTCAGCCTCAAAAAGTGCTGGGA 4014

 42342952 TTACAGGTGTGAGCCATCGCACTCCACCTTCTCTATAGTTACTGAGTTTGCGTGTTACAC 42343011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4015 TTACAGGTGTGAGCCATCGCACTCCACCTTCTCTATAGTTACTGAGTTTGCGTGTTACAC 4074

 42343012 TGAGTTTACATCTTACATTTCTAGCCATATCAGAAACGACCTCTGCACCTCTCTTTCCCA 42343071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4075 TGAGTTTACATCTTACATTTCTAGCCATATCAGAAACGACCTCTGCACCTCTCTTTCCCA 4134

 42343072 ATTTGAGATTTCTAATAGAAAGAATCTTGTTCACCCAGCTTGGGACTCATTGAGTTATGA 42343131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4135 ATTTGAGATTTCTAATAGAAAGAATCTTGTTCACCCAGCTTGGGACTCATTGAGTTATGA 4194

 42343132 CCAGTGGGATAGATTTTAGAAGATAAACATGTCTATAGGGACTTACCGTGTGAATTAGTG 42343191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4195 CCAGTGGGATAGATTTTAGAAGATAAACATGTCTATAGGGACTTACCGTGTGAATTAGTG 4254

 42343192 GGGGAGCCGCTTACCAGGCAGAGGGGTCTGCTGTAAAGTGATACTGTGACTTTAAATTGA 42343251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4255 GGGGAGCCGCTTACCAGGCAGAGGGGTCTGCTGTAAAGTGATACTGTGACTTTAAATTGA 4314

 42343252 AAGTAAGCTTCTAGAAGAGTTGAAGAGGAGTGGATTATTGTTGAATGGATGTATAACTAA 42343311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4315 AAGTAAGCTTCTAGAAGAGTTGAAGAGGAGTGGATTATTGTTGAATGGATGTATAACTAA 4374

 42343312 TGAAGCTTTAAAGGAAGTTTATTAGAAAGTCCATGTCCTTGTCTCTTTCCCAAACTCCTT 42343371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4375 TGAAGCTTTAAAGGAAGTTTATTAGAAAGTCCATGTCCTTGTCTCTTTCCCAAACTCCTT 4434

 42343372 TAGTTCCCAAGTCCTGAAAGAATCTATGGATAAGGGAAGCAGAATACTATAGTGGTTAAG 42343431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4435 TAGTTCCCAAGTCCTGAAAGAATCTATGGATAAGGGAAGCAGAATACTATAGTGGTTAAG 4494

 42343432 AGCACATGCTCGAGGTTAAACTGTCTGTATTTTGGATCCTGGCCTTGAGGACTTGGGCAA 42343491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4495 AGCACATGCTCGAGGTTAAACTGTCTGTATTTTGGATCCTGGCCTTGAGGACTTGGGCAA 4554

 42343492 GTTACGTGACCTGCCTGAGCCTCAGTTTCCTCACCTGTAATATGGGTATCACGAGGAATA 42343551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4555 GTTACGTGACCTGCCTGAGCCTCAGTTTCCTCACCTGTAATATGGGTATCACGAGGAATA 4614

 42343552 AATAAGGTAATATGTGTAAAGTGCTTGGCACAATGCTCTTGATAATGTTAGCAACATAAT 42343611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4615 AATAAGGTAATATGTGTAAAGTGCTTGGCACAATGCTCTTGATAATGTTAGCAACATAAT 4674

 42343612 TTTGTAATGAAAATTAACTGATGGGGCTGAAATGTGCATCAGCAGATCCAAATATCCTTG 42343671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     4675 TTTGTAATGAAAATTAACTGATGGGGCTGAAATGTGCATCAGCAGATCCAAATATCCTCG 4734

 42343672 ATAAACTGGCCAAAAGAAAGATGAATTGGCAGAGAGGCAAGTGTTCATCTCAGTTCTCCA 42343731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4735 ATAAACTGGCCAAAAGAAAGATGAATTGGCAGAGAGGCAAGTGTTCATCTCAGTTCTCCA 4794

 42343732 GATATCCCTGCAAATGTGGCCTCTGGAGTAGAAGATTTAGGGAGAAAAATAAGCCATGAA 42343791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4795 GATATCCCTGCAAATGTGGCCTCTGGAGTAGAAGATTTAGGGAGAAAAATAAGCCATGAA 4854

 42343792 GCTCTTCTGGCACCAACATGAACTTCAGGGATCATGGGACATTTGGGCCAGTAACATTCC 42343851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4855 GCTCTTCTGGCACCAACATGAACTTCAGGGATCATGGGACATTTGGGCCAGTAACATTCC 4914

 42343852 TCTTTGTTCCTAGAGATTTAATATCTACCTACCAACTAAATGGCCTTGATTTGGAGGAGA 42343911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4915 TCTTTGTTCCTAGAGATTTAATATCTACCTACCAACTAAATGGCCTTGATTTGGAGGAGA 4974

 42343912 GAAGACAAGAAGAGGAATTGCTTTCAGCTGGTCCTTGCCTTTAACTAACCAGGGGTACAA 42343971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4975 GAAGACAAGAAGAGGAATTGCTTTCAGCTGGTCCTTGCCTTTAACTAACCAGGGGTACAA 5034

 42343972 AAATTTTAAAATACAAAGGAGACCATGTGTAAAACATTAGTTAAGCTCAGATATAAATCT 42344031
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5035 AAATTTTAAAACACAAAGGAGACCATGTGTAAAACATTAGTTAAGCTCAGATATAAATCT 5094

 42344032 AGTCTTTGACCAGTCCAGAGCTAATCAATATGCTTTTCTACTCTCTTTGAACTTTTGAGT 42344091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5095 AGTCTTTGACCAGTCCAGAGCTAATCAATATGCTTTTCTACTCTCTTTGAACTTTTGAGT 5154

 42344092 TTTCTGGCAACAACAAAAATCCCAAACCTCATCCAAAACCGTAGTCCAGACAGCCCAGTT 42344151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5155 TTTCTGGCAACAACAAAAATCCCAAACCTCATCCAAAACCGTAGTCCAGACAGCCCAGTT 5214

 42344152 TCTGCACTCCCTTCCTTGTGTCACATATTGTTGACAGAACTACTCCCGTTACCACATTCA 42344211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5215 TCTGCACTCCCTTCCTTGTGTCACATATTGTTGACAGAACTACTCCCGTTACCACATTCA 5274

 42344212 TTCCAGTGGTGATTCAAATTCTTCTGCAGAAATGGACTTGAAAGACAGAAAACTGCTCCT 42344271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5275 TTCCAGTGGTGATTCAAATTCTTCTGCAGAAATGGACTTGAAAGACAGAAAACTGCTCCT 5334

 42344272 GTAATCACTTAATAAGGAATCTTGGATGAGGAATACAGAGCTATGAATATGGATTTACTC 42344331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5335 GTAATCACTTAATAAGGAATCTTGGATGAGGAATACAGAGCTATGAATATGGATTTACTC 5394

 42344332 TTAGCCTTTATGGATGCCTTTTTCTCAGTTATTTTCACTGAAAATCATGATGAACTGATT 42344391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5395 TTAGCCTTTATGGATGCCTTTTTCTCAGTTATTTTCACTGAAAATCATGATGAACTGATT 5454

 42344392 TAAATATCAAGGTAAACTGAGATGGAAAATTACCGATAATAAGAGTTTTCTGAAAATATA 42344451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5455 TAAATATCAAGGTAAACTGAGATGGAAAATTACCGATAATAAGAGTTTTCTGAAAATATA 5514

 42344452 GATTGGCCTCTTTAAAGCACATCGAGTTTGTTTTGTTTAAATTACAAATTCACATATATT 42344511
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5515 GATTGGCCTCTTTAAAACACATCGAGTTTGTTTTGTTTAAATTACAAATTCACATATATT 5574

 42344512 TGAAATGTGTTTAAATGTGTCAGTTTTAGGCAAAACTAAACTATTTGATTCCTTTCCAAA 42344571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5575 TGAAATGTGTTTAAATGTGTCAGTTTTAGGCAAAACTAAACTATTTGATTCCTTTCCAAA 5634

 42344572 AATCAGGAATTTGCTTTGGAAAAAAACCATGCAGTTTGATTTACAAAGCAGAGCGGGGGG 42344631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5635 AATCAGGAATTTGCTTTGGAAAAAAACCATGCAGTTTGATTTACAAAGCAGAGCGGGGGG 5694

 42344632 GAAGTAGTGGGTGAGAAAGACCCACCCAAAGGCTGCAGCCAGCTTCCCCAGGAAGATTCA 42344691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5695 GAAGTAGTGGGTGAGAAAGACCCACCCAAAGGCTGCAGCCAGCTTCCCCAGGAAGATTCA 5754

 42344692 TAACCATGCCACAATACTGTCCTTCAATTCGTTCCAACAGATTTTACTATAACTCTAAAT 42344751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5755 TAACCATGCCACAATACTGTCCTTCAATTCGTTCCAACAGATTTTACTATAACTCTAAAT 5814

 42344752 CATTAGAAGCAACTGCTGCTATGACTAGTGCTATCTTTGCCTCAAAAAGAGGAAAAATCA 42344811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5815 CATTAGAAGCAACTGCTGCTATGACTAGTGCTATCTTTGCCTCAAAAAGAGGAAAAATCA 5874

 42344812 GGACATACAATATAATCCCCTCAGGATCTAGGAGAGAAATCAGCCCATTTGTCATAAGAA 42344871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5875 GGACATACAATATAATCCCCTCAGGATCTAGGAGAGAAATCAGCCCATTTGTCATAAGAA 5934

 42344872 CTGAAAACCTCAGCTAAATAGTATATGAAACATTGGTATTTCATACCTTGACATTACATA 42344931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5935 CTGAAAACCTCAGCTAAATAGTATATGAAACATTGGTATTTCATACCTTGACATTACATA 5994

 42344932 TTTTTGAAAATAAAGTAAGCATACACACAAGAAGTGGCTAGATGCAGCAGTTATAAAGTG 42344991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5995 TTTTTGAAAATAAAGTAAGCATACACACAAGAAGTGGCTAGATGCAGCAGTTATAAAGTG 6054

 42344992 GCTTAAGTTGGGTTAACTAAATATAACCTAGAAAAACCATCTTATCTATTGCAAATTATT 42345051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6055 GCTTAAGTTGGGTTAACTAAATATAACCTAGAAAAACCATCTTATCTATTGCAAATTATT 6114

 42345052 TCCAGAAAAAGGTAAGAAAAATCCAACCAACACTTTTTAAACATCCTGAGCTATTCACAG 42345111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6115 TCCAGAAAAAGGTAAGAAAAATCCAACCAACACTTTTTAAACATCCTGAGCTATTCACAG 6174

 42345112 CAAGTGAATCTTTACCCTTACCAGATGTATAAACATTTACATAAGGCAGGAGGTTCAACA 42345171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6175 CAAGTGAATCTTTACCCTTACCAGATGTATAAACATTTACATAAGGCAGGAGGTTCAACA 6234

 42345172 CTTGGAGAGTGTAATCAAGGCAGTAGTAACGCAGTGCTCCTCTCTTTGACTTGAATGACT 42345231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6235 CTTGGAGAGTGTAATCAAGGCAGTAGTAACGCAGTGCTCCTCTCTTTGACTTGAATGACT 6294

 42345232 TCCTCCCCATTAGGGTCATTATTGTTTTGCAGTGTCCCAGGGATGAAAGGACTTTGAAAG 42345291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6295 TCCTCCCCATTAGGGTCATTATTGTTTTGCAGTGTCCCAGGGATGAAAGGACTTTGAAAG 6354

 42345292 GTCATGTGTCTTGTGACCCAACTAGCAGCATCAGCATCACTGGGGAGAAACTCAAGCAGA 42345351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6355 GTCATGTGTCTTGTGACCCAACTAGCAGCATCAGCATCACTGGGGAGAAACTCAAGCAGA 6414

 42345352 AGCTTGAGTCTACTCCACTCTTGCTGACACCAAATCTGCATTTTTACAGGATTCTTGGGT 42345411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6415 AGCTTGAGTCTACTCCACTCTTGCTGACACCAAATCTGCATTTTTACAGGATTCTTGGGT 6474

 42345412 GAGTCACACACATATTCAAGGTTAAAATATGCCACCCTAGGTCTTTCTCCTGCTTCTGAG 42345471
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6475 GAGTCACAGACATATTCAAGGTTAAAATATGCCACCCTAGGTCTTTCTCCTGCTTCTGAG 6534

 42345472 CAAAACTGGGCACAAGGGACAAACTAGTTTCCTTCAGCCACTTTCAAATCCTTTATAGAG 42345531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6535 CAAAACTGGGCACAAGGGACAAACTAGTTTCCTTCAGCCACTTTCAAATCCTTTATAGAG 6594

 42345532 TGTACTGTGTGAGTCACTGAGAGGAAAGAGGAAATAATACTTATTTAGGGAAGTCTTGCA 42345591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6595 TGTACTGTGTGAGTCACTGAGAGGAAAGAGGAAATAATACTTATTTAGGGAAGTCTTGCA 6654

 42345592 TAACTTAACAAAGTTAGTAACTTCTTCAATACACTCAAGTACCTATTTTTGGAAGCCCTA 42345651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6655 TAACTTAACAAAGTTAGTAACTTCTTCAATACACTCAAGTACCTATTTTTGGAAGCCCTA 6714

 42345652 CAGGTTAGGTCAAAGTAAAGAGAAGCAAAAAATGGAGTGAGTTCTAGTAAAAAACTCTGA 42345711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6715 CAGGTTAGGTCAAAGTAAAGAGAAGCAAAAAATGGAGTGAGTTCTAGTAAAAAACTCTGA 6774

 42345712 CAAAATAAGGGAAGTGTAGAAGCTGAGTCTATGAGGGATGAGAGAAGCAATTTACCAAAT 42345771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6775 CAAAATAAGGGAAGTGTAGAAGCTGAGTCTATGAGGGATGAGAGAAGCAATTTACCAAAT 6834

 42345772 TATCAGATCCAAAATCATCTCTGCACTGTAGATGATTTATAGCCCTGGAAGCTTAGAGGC 42345831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6835 TATCAGATCCAAAATCATCTCTGCACTGTAGATGATTTATAGCCCTGGAAGCTTAGAGGC 6894

 42345832 TTGAGTCTCTTGCTGTATTTCATTTCAAATTAGTAATTTTTATCTAGGGCTTCCCTATGG 42345891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6895 TTGAGTCTCTTGCTGTATTTCATTTCAAATTAGTAATTTTTATCTAGGGCTTCCCTATGG 6954

 42345892 CTTAAAGTGAAGGCCCTGGAATTTCTGAAGTGAAATTATCTGATGATTTTTATGTATGGT 42345951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6955 CTTAAAGTGAAGGCCCTGGAATTTCTGAAGTGAAATTATCTGATGATTTTTATGTATGGT 7014

 42345952 CATTCTGTAGTTATCCTGTAAGTTTCATATTTGTAACAAGACTGGAATCCGAACAATAGA 42346011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7015 CATTCTGTAGTTATCCTGTAAGTTTCATATTTGTAACAAGACTGGAATCCGAACAATAGA 7074

 42346012 AAACTCTGTGGCAGTAAGCCAAAACCTGATGGACTTAGGAGAGTTACGTATGTGTGTTTC 42346071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7075 AAACTCTGTGGCAGTAAGCCAAAACCTGATGGACTTAGGAGAGTTACGTATGTGTGTTTC 7134

 42346072 AGTGGTCCTCAAATTCAGCTGCCTATTAGAATCACCTGGACTTTGAAAAAAAAAGAGCTT 42346131
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7135 AGTGGTCCTCAAATTTAGCTGCCTATTAGAATCACCTGGACTTTGAAAAAAAAAGAGCTT 7194

 42346132 TCTTGAGGTATAACTGACAAATAATAAGACAAACATATTTCAGTATACAATTGGATGAGT 42346191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7195 TCTTGAGGTATAACTGACAAATAATAAGACAAACATATTTCAGTATACAATTGGATGAGT 7254

 42346192 TTTGACATGTTATATTCTTGTGAAACCATCACCACAATCAAGCTATTCACCCCCCAAATT 42346251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7255 TTTGACATGTTATATTCTTGTGAAACCATCACCACAATCAAGCTATTCACCCCCCAAATT 7314

 42346252 TTCGTGCC 42346259
          ||||||||
     7315 TTCGTGCC 7322

EXCISED REGION

 42347319 TTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGCTCTCAAACTCCTGA 42347378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7327 TTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGCTCTCAAACTCCTGA 7386

 42347379 CCTCAGGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACC 42347438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7387 CCTCAGGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACC 7446

 42347439 ATGCCCAGCGTATTAATTTTCTTGCATGGATGGTGCGTTTGGTGATCTGAGAAATCTTTA 42347498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7447 ATGCCCAGCGTATTAATTTTCTTGCATGGATGGTGCGTTTGGTGATCTGAGAAATCTTTA 7506

 42347499 CCTAACCCAAGGTCACAGAGATTTTCTCCTGTTTGCTTCCAAAATTTTTATACGTTTAGA 42347558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7507 CCTAACCCAAGGTCACAGAGATTTTCTCCTGTTTGCTTCCAAAATTTTTATACGTTTAGA 7566

 42347559 TTTTATATTTAAGTCTATTTTGAGTTAATTTTTGTATATAATGCAAAGTTTAGAATGATG 42347618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7567 TTTTATATTTAAGTCTATTTTGAGTTAATTTTTGTATATAATGCAAAGTTTAGAATGATG 7626

 42347619 TTTAGTTTTTTGTCTATAATCTATGAATATCCAATAGTTCTAGCACCATTTATTGAAAAG 42347678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7627 TTTAGTTTTTTGTCTATAATCTATGAATATCCAATAGTTCTAGCACCATTTATTGAAAAG 7686

 42347679 ACTGATCTTTATCTACTGAAGTGTCTTTGCACTTTTGTTGAAAGTCAATTGACAATTGAC 42347738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7687 ACTGATCTTTATCTACTGAAGTGTCTTTGCACTTTTGTTGAAAGTCAATTGACAATTGAC 7746

 42347739 CATATATTTGTGGGTCTATTCTGGATTCTCTATTCTGTTACATTGATCTATTTTTCTATC 42347798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7747 CATATATTTGTGGGTCTATTCTGGATTCTCTATTCTGTTACATTGATCTATTTTTCTATC 7806

 42347799 TCAATACAAATATCAAATTGGGTATTTGTATTAAGACAAATATAATTTGTCTGGGTATTT 42347858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7807 TCAATACAAATATCAAATTGGGTATTTGTATTAAGACAAATATAATTTGTCTGGGTATTT 7866

 42347859 GTCAAGACAAATAAAAATTGTCTTGATTACTGTAGCTTTATTGCAAGTCTTGAAATCTAA 42347918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7867 GTCAAGACAAATAAAAATTGTCTTGATTACTGTAGCTTTATTGCAAGTCTTGAAATCTAA 7926

 42347919 CTTTATTCTTTTTCTAAGAAAAATATGAATTCTAGATTAAGCTTGAATTTTAGAATAAGT 42347978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7927 CTTTATTCTTTTTCTAAGAAAAATATGAATTCTAGATTAAGCTTGAATTTTAGAATAAGT 7986

 42347979 TTGCCAGTTTCTGAGAGGGGAAAGCCTACTGGAATTTTGATGAGGATTGCATTGAATCTA 42348038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7987 TTGCCAGTTTCTGAGAGGGGAAAGCCTACTGGAATTTTGATGAGGATTGCATTGAATCTA 8046

 42348039 CAGATCTATTAGGGGAAAACTGACATCTTAACAATATTGAGTCTTTCAATCCATGAGCAC 42348098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8047 CAGATCTATTAGGGGAAAACTGACATCTTAACAATATTGAGTCTTTCAATCCATGAGCAC 8106

 42348099 AAAGTCTTTTTTCATTTTTCTCAGCAACGTTTTCTTAGTTTACAGATCTTACAGCTCTTT 42348158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8107 AAAGTCTTTTTTCATTTTTCTCAGCAACGTTTTCTTAGTTTACAGATCTTACAGCTCTTT 8166

 42348159 TGTAAGGTTTTTATCTAAATATTTAATTATTTTGTACTATCATAAGTGTTATTATTTATA 42348218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8167 TGTAAGGTTTTTATCTAAATATTTAATTATTTTGTACTATCATAAGTGTTATTATTTATA 8226

 42348219 TAATTTTAATTTCCAAGTATTTATTGAAACCATTTAGAAACAGTTGATTTTTTATATTGA 42348278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8227 TAATTTTAATTTCCAAGTATTTATTGAAACCATTTAGAAACAGTTGATTTTTTATATTGA 8286

 42348279 TCTTTTATCCTGCAGGCTTGTTAAACTCATTTATTAGTTCTGTAGCTTTTTTGTAGAGTC 42348338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8287 TCTTTTATCCTGCAGGCTTGTTAAACTCATTTATTAGTTCTGTAGCTTTTTTGTAGAGTC 8346

 42348339 CATCAAATTTTCTACATAGAGAGTCATGTTATCTGAGAATAAAAACAGTTTTGCTTCTTC 42348398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8347 CATCAAATTTTCTACATAGAGAGTCATGTTATCTGAGAATAAAAACAGTTTTGCTTCTTC 8406

 42348399 TGCTCCAATCTTAATTCATTTTATATTTTTTTCTTGACTTATTGCACTGGCTACAACCAG 42348458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8407 TGCTCCAATCTTAATTCATTTTATATTTTTTTCTTGACTTATTGCACTGGCTACAACCAG 8466

 42348459 TACAATGCTGAATAAATATAGTGACAGTGGATAGCCTTTCTTTGTTCATGGTCTTAAAGG 42348518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8467 TACAATGCTGAATAAATATAGTGACAGTGGATAGCCTTTCTTTGTTCATGGTCTTAAAGG 8526

 42348519 AAAAGCATTCAGTCTTTCCCATTAAGTATGATGTTAGCTTTAGGTTTTTCATAGATGCCC 42348578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8527 AAAAGCATTCAGTCTTTCCCATTAAGTATGATGTTAGCTTTAGGTTTTTCATAGATGCCC 8586

 42348579 TTTCTCAAATTAAAGAAGTTTCCTACTTTACTGAGAGTTGCTTTATTTAAAATCAGAAAT 42348638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8587 TTTCTCAAATTAAAGAAGTTTCCTACTTTACTGAGAGTTGCTTTATTTAAAATCAGAAAT 8646

 42348639 GAGGCCAGTCACAGTGACTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAGGGTGGGAA 42348698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8647 GAGGCCAGTCACAGTGACTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAGGGTGGGAA 8706

 42348699 GATTACCTGAAGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGACAACATGGTAAAACCCTGTCTGTA 42348758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8707 GATTACCTGAAGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGACAACATGGTAAAACCCTGTCTGTA 8766

 42348759 CTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAGTGGTGCATGCCTGTAGTCCCAGTTATTTGGG 42348818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8767 CTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAGTGGTGCATGCCTGTAGTCCCAGTTATTTGGG 8826

 42348819 AGGCCGATACAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGACTA 42348878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8827 AGGCCGATACAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGACTA 8886

 42348879 CACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAATGAGAAAAAAAAAAAGAGAGAGAGAGAGAA 42348938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8887 CACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAATGAGAAAAAAAAAAAGAGAGAGAGAGAGAA 8946

 42348939 GGAAAGAGAGAAGGAAAGAAAGACAGAAAGACCAAAAGAAAGAAAGAGAGAGAGAGAGAG 42348998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8947 GGAAAGAGAGAAGGAAAGAAAGACAGAAAGACCAAAAGAAAGAAAGAGAGAGAGAGAGAG 9006

 42348999 AGAGAGAGAGAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAG 42349058
          ||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9007 AGAGAGAG--------------AGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAG 9052

 42349059 AAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAGATCTTGGATTTTGTCAGATTCTTTTTCTGCATCTATTG 42349118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9053 AAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAGATCTTGGATTTTGTCAGATTCTTTTTCTGCATCTATTG 9112

 42349119 AGATATTCATATGGTTTTCCTTTTCGGCCTGTTACTGTGGTGAATCACTGAGTGACTTTC 42349178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9113 AGATATTCATATGGTTTTCCTTTTCGGCCTGTTACTGTGGTGAATCACTGAGTGACTTTC 9172

 42349179 AAATATTAAACTAACCTTGCATTCCTGGGCTATGGCTATAATGTACTATCCTTTTATATA 42349238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9173 AAATATTAAACTAACCTTGCATTCCTGGGCTATGGCTATAATGTACTATCCTTTTATATA 9232

 42349239 TTGTTATATTCTATTTGCTATATTTTCCTAAAAATTTTTGCATTTATACTCATGAAGGAT 42349298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9233 TTGTTATATTCTATTTGCTATATTTTCCTAAAAATTTTTGCATTTATACTCATGAAGGAT 9292

 42349299 ATTAGTCTGCAGTTTTGCTTTCTTGTTATATATTTGTCTGGGTTTGATATCAGAGATCAG 42349358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9293 ATTAGTCTGCAGTTTTGCTTTCTTGTTATATATTTGTCTGGGTTTGATATCAGAGATCAG 9352

 42349359 AGTAATATCAGTATTGTAGGCACCAGTAAATATTTCCTTATAATGCTTTTTATTTTTATT 42349418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9353 AGTAATATCAGTATTGTAGGCACCAGTAAATATTTCCTTATAATGCTTTTTATTTTTATT 9412

 42349419 TTTTAAATTTTTTTATTTTTGAGACGGTGTTTTGTTCTTGTTGCCTGGGCTGGAGTACAA 42349478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9413 TTTTAAATTTTTTTATTTTTGAGACGGTGTTTTGTTCTTGTTGCCTGGGCTGGAGTACAA 9472

 42349479 TGTCACGATCTCAGCTCGTTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTC 42349538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9473 TGTCACGATCTCAGCTCGTTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTC 9532

 42349539 AGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGACACACACCACCACACCTAGCTAATTTTGTATTT 42349598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9533 AGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGACACACACCACCACACCTAGCTAATTTTGTATTT 9592

 42349599 TTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGT 42349658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9593 TTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGT 9652

 42349659 GATCTGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCCGGGATTACAGGTGTGAGCCACCATGCCCAG 42349718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9653 GATCTGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCCGGGATTACAGGTGTGAGCCACCATGCCCAG 9712

 42349719 CGTACAATGCTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACCCAGGCAGAAGTGCAGTGGCATGA 42349778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9713 CGTACAATGCTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACCCAGGCAGAAGTGCAGTGGCATGA 9772

 42349779 TCTTGGCTCACTGCAACCTTTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCC 42349838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9773 TCTTGGCTCACTGCAACCTTTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCC 9832

 42349839 CAGTAGCTTGGACTACAGGCACACGCCACCACACCCGGCTAAT 42349881
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9833 CAGTAGCTTGGACTACAGGCACACGCCACCACACCCGGCTAAT 9875

Alignment time is 7.15611 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [42336259,42357318] =>     21060 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [       1,    2549] =>      2549 nucs 'mol-32-1f21-002114_2549'

Score:        2549
Aligned:      2549        nucs
Identic:      2549 (100%) nucs =>      1688 (100%)       861 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [42347319,42349006] EXCISED REGION [42349021,42349881]
 second seq =>  [       1,    1688] EXCISED REGION [    1689,    2549]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        14 nucs [42349007,42349020]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [42349007,42349009] to [42349021,42349023]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [42349005,42349006] to [42349021,42349022]
 second seq =>         2 nucs [1687,1688] to [1689,1690]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [42349007,42349007] to [42349020,42349020]
 second seq =>         0 nucs

 42347319 TTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGCTCTCAAACTCCTGA 42347378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGCTCTCAAACTCCTGA 60

 42347379 CCTCAGGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACC 42347438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCTCAGGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACC 120

 42347439 ATGCCCAGCGTATTAATTTTCTTGCATGGATGGTGCGTTTGGTGATCTGAGAAATCTTTA 42347498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATGCCCAGCGTATTAATTTTCTTGCATGGATGGTGCGTTTGGTGATCTGAGAAATCTTTA 180

 42347499 CCTAACCCAAGGTCACAGAGATTTTCTCCTGTTTGCTTCCAAAATTTTTATACGTTTAGA 42347558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCTAACCCAAGGTCACAGAGATTTTCTCCTGTTTGCTTCCAAAATTTTTATACGTTTAGA 240

 42347559 TTTTATATTTAAGTCTATTTTGAGTTAATTTTTGTATATAATGCAAAGTTTAGAATGATG 42347618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTTTATATTTAAGTCTATTTTGAGTTAATTTTTGTATATAATGCAAAGTTTAGAATGATG 300

 42347619 TTTAGTTTTTTGTCTATAATCTATGAATATCCAATAGTTCTAGCACCATTTATTGAAAAG 42347678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTAGTTTTTTGTCTATAATCTATGAATATCCAATAGTTCTAGCACCATTTATTGAAAAG 360

 42347679 ACTGATCTTTATCTACTGAAGTGTCTTTGCACTTTTGTTGAAAGTCAATTGACAATTGAC 42347738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACTGATCTTTATCTACTGAAGTGTCTTTGCACTTTTGTTGAAAGTCAATTGACAATTGAC 420

 42347739 CATATATTTGTGGGTCTATTCTGGATTCTCTATTCTGTTACATTGATCTATTTTTCTATC 42347798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CATATATTTGTGGGTCTATTCTGGATTCTCTATTCTGTTACATTGATCTATTTTTCTATC 480

 42347799 TCAATACAAATATCAAATTGGGTATTTGTATTAAGACAAATATAATTTGTCTGGGTATTT 42347858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCAATACAAATATCAAATTGGGTATTTGTATTAAGACAAATATAATTTGTCTGGGTATTT 540

 42347859 GTCAAGACAAATAAAAATTGTCTTGATTACTGTAGCTTTATTGCAAGTCTTGAAATCTAA 42347918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GTCAAGACAAATAAAAATTGTCTTGATTACTGTAGCTTTATTGCAAGTCTTGAAATCTAA 600

 42347919 CTTTATTCTTTTTCTAAGAAAAATATGAATTCTAGATTAAGCTTGAATTTTAGAATAAGT 42347978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTTTATTCTTTTTCTAAGAAAAATATGAATTCTAGATTAAGCTTGAATTTTAGAATAAGT 660

 42347979 TTGCCAGTTTCTGAGAGGGGAAAGCCTACTGGAATTTTGATGAGGATTGCATTGAATCTA 42348038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTGCCAGTTTCTGAGAGGGGAAAGCCTACTGGAATTTTGATGAGGATTGCATTGAATCTA 720

 42348039 CAGATCTATTAGGGGAAAACTGACATCTTAACAATATTGAGTCTTTCAATCCATGAGCAC 42348098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CAGATCTATTAGGGGAAAACTGACATCTTAACAATATTGAGTCTTTCAATCCATGAGCAC 780

 42348099 AAAGTCTTTTTTCATTTTTCTCAGCAACGTTTTCTTAGTTTACAGATCTTACAGCTCTTT 42348158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAAGTCTTTTTTCATTTTTCTCAGCAACGTTTTCTTAGTTTACAGATCTTACAGCTCTTT 840

 42348159 TGTAAGGTTTTTATCTAAATATTTAATTATTTTGTACTATCATAAGTGTTATTATTTATA 42348218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGTAAGGTTTTTATCTAAATATTTAATTATTTTGTACTATCATAAGTGTTATTATTTATA 900

 42348219 TAATTTTAATTTCCAAGTATTTATTGAAACCATTTAGAAACAGTTGATTTTTTATATTGA 42348278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TAATTTTAATTTCCAAGTATTTATTGAAACCATTTAGAAACAGTTGATTTTTTATATTGA 960

 42348279 TCTTTTATCCTGCAGGCTTGTTAAACTCATTTATTAGTTCTGTAGCTTTTTTGTAGAGTC 42348338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TCTTTTATCCTGCAGGCTTGTTAAACTCATTTATTAGTTCTGTAGCTTTTTTGTAGAGTC 1020

 42348339 CATCAAATTTTCTACATAGAGAGTCATGTTATCTGAGAATAAAAACAGTTTTGCTTCTTC 42348398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CATCAAATTTTCTACATAGAGAGTCATGTTATCTGAGAATAAAAACAGTTTTGCTTCTTC 1080

 42348399 TGCTCCAATCTTAATTCATTTTATATTTTTTTCTTGACTTATTGCACTGGCTACAACCAG 42348458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGCTCCAATCTTAATTCATTTTATATTTTTTTCTTGACTTATTGCACTGGCTACAACCAG 1140

 42348459 TACAATGCTGAATAAATATAGTGACAGTGGATAGCCTTTCTTTGTTCATGGTCTTAAAGG 42348518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TACAATGCTGAATAAATATAGTGACAGTGGATAGCCTTTCTTTGTTCATGGTCTTAAAGG 1200

 42348519 AAAAGCATTCAGTCTTTCCCATTAAGTATGATGTTAGCTTTAGGTTTTTCATAGATGCCC 42348578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AAAAGCATTCAGTCTTTCCCATTAAGTATGATGTTAGCTTTAGGTTTTTCATAGATGCCC 1260

 42348579 TTTCTCAAATTAAAGAAGTTTCCTACTTTACTGAGAGTTGCTTTATTTAAAATCAGAAAT 42348638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTTCTCAAATTAAAGAAGTTTCCTACTTTACTGAGAGTTGCTTTATTTAAAATCAGAAAT 1320

 42348639 GAGGCCAGTCACAGTGACTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAGGGTGGGAA 42348698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GAGGCCAGTCACAGTGACTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAGGGTGGGAA 1380

 42348699 GATTACCTGAAGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGACAACATGGTAAAACCCTGTCTGTA 42348758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GATTACCTGAAGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGACAACATGGTAAAACCCTGTCTGTA 1440

 42348759 CTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAGTGGTGCATGCCTGTAGTCCCAGTTATTTGGG 42348818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAGTGGTGCATGCCTGTAGTCCCAGTTATTTGGG 1500

 42348819 AGGCCGATACAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGACTA 42348878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AGGCCGATACAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGACTA 1560

 42348879 CACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAATGAGAAAAAAAAAAAGAGAGAGAGAGAGAA 42348938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAATGAGAAAAAAAAAAAGAGAGAGAGAGAGAA 1620

 42348939 GGAAAGAGAGAAGGAAAGAAAGACAGAAAGACCAAAAGAAAGAAAGAGAGAGAGAGAGAG 42348998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GGAAAGAGAGAAGGAAAGAAAGACAGAAAGACCAAAAGAAAGAAAGAGAGAGAGAGAGAG 1680

 42348999 AGAGAGAG 42349006
          ||||||||
     1681 AGAGAGAG 1688

EXCISED REGION

 42349021 AGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAG 42349080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1689 AGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAG 1748

 42349081 ATCTTGGATTTTGTCAGATTCTTTTTCTGCATCTATTGAGATATTCATATGGTTTTCCTT 42349140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1749 ATCTTGGATTTTGTCAGATTCTTTTTCTGCATCTATTGAGATATTCATATGGTTTTCCTT 1808

 42349141 TTCGGCCTGTTACTGTGGTGAATCACTGAGTGACTTTCAAATATTAAACTAACCTTGCAT 42349200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1809 TTCGGCCTGTTACTGTGGTGAATCACTGAGTGACTTTCAAATATTAAACTAACCTTGCAT 1868

 42349201 TCCTGGGCTATGGCTATAATGTACTATCCTTTTATATATTGTTATATTCTATTTGCTATA 42349260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1869 TCCTGGGCTATGGCTATAATGTACTATCCTTTTATATATTGTTATATTCTATTTGCTATA 1928

 42349261 TTTTCCTAAAAATTTTTGCATTTATACTCATGAAGGATATTAGTCTGCAGTTTTGCTTTC 42349320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1929 TTTTCCTAAAAATTTTTGCATTTATACTCATGAAGGATATTAGTCTGCAGTTTTGCTTTC 1988

 42349321 TTGTTATATATTTGTCTGGGTTTGATATCAGAGATCAGAGTAATATCAGTATTGTAGGCA 42349380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1989 TTGTTATATATTTGTCTGGGTTTGATATCAGAGATCAGAGTAATATCAGTATTGTAGGCA 2048

 42349381 CCAGTAAATATTTCCTTATAATGCTTTTTATTTTTATTTTTTAAATTTTTTTATTTTTGA 42349440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2049 CCAGTAAATATTTCCTTATAATGCTTTTTATTTTTATTTTTTAAATTTTTTTATTTTTGA 2108

 42349441 GACGGTGTTTTGTTCTTGTTGCCTGGGCTGGAGTACAATGTCACGATCTCAGCTCGTTGC 42349500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2109 GACGGTGTTTTGTTCTTGTTGCCTGGGCTGGAGTACAATGTCACGATCTCAGCTCGTTGC 2168

 42349501 AACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATT 42349560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2169 AACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATT 2228

 42349561 ACAGACACACACCACCACACCTAGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACC 42349620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2229 ACAGACACACACCACCACACCTAGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACC 2288

 42349621 ATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCTGCCTTGGCCTCCC 42349680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2289 ATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCTGCCTTGGCCTCCC 2348

 42349681 AAAGTGCCGGGATTACAGGTGTGAGCCACCATGCCCAGCGTACAATGCTTTTTTTTTTTG 42349740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2349 AAAGTGCCGGGATTACAGGTGTGAGCCACCATGCCCAGCGTACAATGCTTTTTTTTTTTG 2408

 42349741 AGACAGAGTCTCACCCAGGCAGAAGTGCAGTGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTTTG 42349800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2409 AGACAGAGTCTCACCCAGGCAGAAGTGCAGTGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTTTG 2468

 42349801 CCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGCTTGGACTACAGGCAC 42349860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2469 CCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGCTTGGACTACAGGCAC 2528

 42349861 ACGCCACCACACCCGGCTAAT 42349881
          |||||||||||||||||||||
     2529 ACGCCACCACACCCGGCTAAT 2549

Alignment time is 1.92052 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [42336259,42357318] =>     21060 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [       1,    2980] =>      2980 nucs 'mol-32-2081-096867_2980'

Score:        2942
Aligned:      2990        nucs
Identic:      2975 ( 99%) nucs =>       764 (100%)      2211 ( 99%)
Gaps:           14 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [42345495,42346259] EXCISED REGION [42347319,42349543]
 second seq =>  [       1,     765] EXCISED REGION [     770,    2980]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1059 nucs [42346260,42347318]
 second seq =>         4 nucs [766,769]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [766,766] to [770,770]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 42345495 CTAGTTTCCTTCAGCCACTTTCAAATCCTTTATAGAGTGTACTGTGTGAGTCACTGAGAG 42345554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTAGTTTCCTTCAGCCACTTTCAAATCCTTTATAGAGTGTACTGTGTGAGTCACTGAGAG 60

 42345555 GAAAGAGGAAATAATACTTATTTAGGGAAGTCTTGCATAACTTAACAAAGTTAGTAACTT 42345614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAAAGAGGAAATAATACTTATTTAGGGAAGTCTTGCATAACTTAACAAAGTTAGTAACTT 120

 42345615 CTTCAATACACTCAAGTACCTATTTTTGGAAGCCCTACAGGTTAGGTCAAAGTAAAGAGA 42345674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTTCAATACACTCAAGTACCTATTTTTGGAAGCCCTACAGGTTAGGTCAAAGTAAAGAGA 180

 42345675 AGCAAAAAATGGAGTGAGTTCTAGTAAAAAACTCTGACAAAATAAGGGAAGTGTAGAAGC 42345734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGCAAAAAATGGAGTGAGTTCTAGTAAAAAACTCTGACAAAATAAGGGAAGTGTAGAAGC 240

 42345735 TGAGTCTATGAGGGATGAGAGAAGCAATTTACCAAATTATCAGATCCAAAATCATCTCTG 42345794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGAGTCTATGAGGGATGAGAGAAGCAATTTACCAAATTATCAGATCCAAAATCATCTCTG 300

 42345795 CACTGTAGATGATTTATAGCCCTGGAAGCTTAGAGGCTTGAGTCTCTTGCTGTATTTCAT 42345854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CACTGTAGATGATTTATAGCCCTGGAAGCTTAGAGGCTTGAGTCTCTTGCTGTATTTCAT 360

 42345855 TTCAAATTAGTAATTTTTATCTAGGGCTTCCCTATGGCTTAAAGTGAAGGCCCTGGAATT 42345914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTCAAATTAGTAATTTTTATCTAGGGCTTCCCTATGGCTTAAAGTGAAGGCCCTGGAATT 420

 42345915 TCTGAAGTGAAATTATCTGATGATTTTTATGTATGGTCATTCTGTAGTTATCCTGTAAGT 42345974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCTGAAGTGAAATTATCTGATGATTTTTATGTATGGTCATTCTGTAGTTATCCTGTAAGT 480

 42345975 TTCATATTTGTAACAAGACTGGAATCCGAACAATAGAAAACTCTGTGGCAGTAAGCCAAA 42346034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTCATATTTGTAACAAGACTGGAATCCGAACAATAGAAAACTCTGTGGCAGTAAGCCAAA 540

 42346035 ACCTGATGGACTTAGGAGAGTTACGTATGTGTGTTTCAGTGGTCCTCAAATTCAGCTGCC 42346094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
      541 ACCTGATGGACTTAGGAGAGTTACGTATGTGTGTTTCAGTGGTCCTCAAATTTAGCTGCC 600

 42346095 TATTAGAATCACCTGGACTTTGAAAAAAAAAGAGCTTTCTTGAGGTATAACTGACAAATA 42346154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TATTAGAATCACCTGGACTTTGAAAAAAAAAGAGCTTTCTTGAGGTATAACTGACAAATA 660

 42346155 ATAAGACAAACATATTTCAGTATACAATTGGATGAGTTTTGACATGTTATATTCTTGTGA 42346214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATAAGACAAACATATTTCAGTATACAATTGGATGAGTTTTGACATGTTATATTCTTGTGA 720

 42346215 AACCATCACCACAATCAAGCTATTCACCCCCCAAATTTTCGTGCC 42346259
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AACCATCACCACAATCAAGCTATTCACCCCCCAAATTTTCGTGCC 765

EXCISED REGION

 42347319 TTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGCTCTCAAACTCCTGA 42347378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      770 TTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGCTCTCAAACTCCTGA 829

 42347379 CCTCAGGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACC 42347438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      830 CCTCAGGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACC 889

 42347439 ATGCCCAGCGTATTAATTTTCTTGCATGGATGGTGCGTTTGGTGATCTGAGAAATCTTTA 42347498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      890 ATGCCCAGCGTATTAATTTTCTTGCATGGATGGTGCGTTTGGTGATCTGAGAAATCTTTA 949

 42347499 CCTAACCCAAGGTCACAGAGATTTTCTCCTGTTTGCTTCCAAAATTTTTATACGTTTAGA 42347558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      950 CCTAACCCAAGGTCACAGAGATTTTCTCCTGTTTGCTTCCAAAATTTTTATACGTTTAGA 1009

 42347559 TTTTATATTTAAGTCTATTTTGAGTTAATTTTTGTATATAATGCAAAGTTTAGAATGATG 42347618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1010 TTTTATATTTAAGTCTATTTTGAGTTAATTTTTGTATATAATGCAAAGTTTAGAATGATG 1069

 42347619 TTTAGTTTTTTGTCTATAATCTATGAATATCCAATAGTTCTAGCACCATTTATTGAAAAG 42347678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1070 TTTAGTTTTTTGTCTATAATCTATGAATATCCAATAGTTCTAGCACCATTTATTGAAAAG 1129

 42347679 ACTGATCTTTATCTACTGAAGTGTCTTTGCACTTTTGTTGAAAGTCAATTGACAATTGAC 42347738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1130 ACTGATCTTTATCTACTGAAGTGTCTTTGCACTTTTGTTGAAAGTCAATTGACAATTGAC 1189

 42347739 CATATATTTGTGGGTCTATTCTGGATTCTCTATTCTGTTACATTGATCTATTTTTCTATC 42347798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1190 CATATATTTGTGGGTCTATTCTGGATTCTCTATTCTGTTACATTGATCTATTTTTCTATC 1249

 42347799 TCAATACAAATATCAAATTGGGTATTTGTATTAAGACAAATATAATTTGTCTGGGTATTT 42347858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1250 TCAATACAAATATCAAATTGGGTATTTGTATTAAGACAAATATAATTTGTCTGGGTATTT 1309

 42347859 GTCAAGACAAATAAAAATTGTCTTGATTACTGTAGCTTTATTGCAAGTCTTGAAATCTAA 42347918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1310 GTCAAGACAAATAAAAATTGTCTTGATTACTGTAGCTTTATTGCAAGTCTTGAAATCTAA 1369

 42347919 CTTTATTCTTTTTCTAAGAAAAATATGAATTCTAGATTAAGCTTGAATTTTAGAATAAGT 42347978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1370 CTTTATTCTTTTTCTAAGAAAAATATGAATTCTAGATTAAGCTTGAATTTTAGAATAAGT 1429

 42347979 TTGCCAGTTTCTGAGAGGGGAAAGCCTACTGGAATTTTGATGAGGATTGCATTGAATCTA 42348038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1430 TTGCCAGTTTCTGAGAGGGGAAAGCCTACTGGAATTTTGATGAGGATTGCATTGAATCTA 1489

 42348039 CAGATCTATTAGGGGAAAACTGACATCTTAACAATATTGAGTCTTTCAATCCATGAGCAC 42348098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1490 CAGATCTATTAGGGGAAAACTGACATCTTAACAATATTGAGTCTTTCAATCCATGAGCAC 1549

 42348099 AAAGTCTTTTTTCATTTTTCTCAGCAACGTTTTCTTAGTTTACAGATCTTACAGCTCTTT 42348158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1550 AAAGTCTTTTTTCATTTTTCTCAGCAACGTTTTCTTAGTTTACAGATCTTACAGCTCTTT 1609

 42348159 TGTAAGGTTTTTATCTAAATATTTAATTATTTTGTACTATCATAAGTGTTATTATTTATA 42348218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1610 TGTAAGGTTTTTATCTAAATATTTAATTATTTTGTACTATCATAAGTGTTATTATTTATA 1669

 42348219 TAATTTTAATTTCCAAGTATTTATTGAAACCATTTAGAAACAGTTGATTTTTTATATTGA 42348278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1670 TAATTTTAATTTCCAAGTATTTATTGAAACCATTTAGAAACAGTTGATTTTTTATATTGA 1729

 42348279 TCTTTTATCCTGCAGGCTTGTTAAACTCATTTATTAGTTCTGTAGCTTTTTTGTAGAGTC 42348338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1730 TCTTTTATCCTGCAGGCTTGTTAAACTCATTTATTAGTTCTGTAGCTTTTTTGTAGAGTC 1789

 42348339 CATCAAATTTTCTACATAGAGAGTCATGTTATCTGAGAATAAAAACAGTTTTGCTTCTTC 42348398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1790 CATCAAATTTTCTACATAGAGAGTCATGTTATCTGAGAATAAAAACAGTTTTGCTTCTTC 1849

 42348399 TGCTCCAATCTTAATTCATTTTATATTTTTTTCTTGACTTATTGCACTGGCTACAACCAG 42348458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1850 TGCTCCAATCTTAATTCATTTTATATTTTTTTCTTGACTTATTGCACTGGCTACAACCAG 1909

 42348459 TACAATGCTGAATAAATATAGTGACAGTGGATAGCCTTTCTTTGTTCATGGTCTTAAAGG 42348518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1910 TACAATGCTGAATAAATATAGTGACAGTGGATAGCCTTTCTTTGTTCATGGTCTTAAAGG 1969

 42348519 AAAAGCATTCAGTCTTTCCCATTAAGTATGATGTTAGCTTTAGGTTTTTCATAGATGCCC 42348578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1970 AAAAGCATTCAGTCTTTCCCATTAAGTATGATGTTAGCTTTAGGTTTTTCATAGATGCCC 2029

 42348579 TTTCTCAAATTAAAGAAGTTTCCTACTTTACTGAGAGTTGCTTTATTTAAAATCAGAAAT 42348638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2030 TTTCTCAAATTAAAGAAGTTTCCTACTTTACTGAGAGTTGCTTTATTTAAAATCAGAAAT 2089

 42348639 GAGGCCAGTCACAGTGACTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAGGGTGGGAA 42348698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2090 GAGGCCAGTCACAGTGACTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAGGGTGGGAA 2149

 42348699 GATTACCTGAAGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGACAACATGGTAAAACCCTGTCTGTA 42348758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2150 GATTACCTGAAGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGACAACATGGTAAAACCCTGTCTGTA 2209

 42348759 CTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAGTGGTGCATGCCTGTAGTCCCAGTTATTTGGG 42348818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2210 CTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAGTGGTGCATGCCTGTAGTCCCAGTTATTTGGG 2269

 42348819 AGGCCGATACAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGACTA 42348878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2270 AGGCCGATACAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGACTA 2329

 42348879 CACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAATGAGAAAAAAAAAAAGAGAGAGAGAGAGAA 42348938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2330 CACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAATGAGAAAAAAAAAAAGAGAGAGAGAGAGAA 2389

 42348939 GGAAAGAGAGAAGGAAAGAAAGACAGAAAGACCAAAAGAAAGAAAGAGAGAGAGAGAGAG 42348998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2390 GGAAAGAGAGAAGGAAAGAAAGACAGAAAGACCAAAAGAAAGAAAGAGAGAGAGAGAGAG 2449

 42348999 AGAGAGAGAGAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAG 42349058
          ||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2450 AGAGAGAG--------------AGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAG 2495

 42349059 AAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAGATCTTGGATTTTGTCAGATTCTTTTTCTGCATCTATTG 42349118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2496 AAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAGATCTTGGATTTTGTCAGATTCTTTTTCTGCATCTATTG 2555

 42349119 AGATATTCATATGGTTTTCCTTTTCGGCCTGTTACTGTGGTGAATCACTGAGTGACTTTC 42349178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2556 AGATATTCATATGGTTTTCCTTTTCGGCCTGTTACTGTGGTGAATCACTGAGTGACTTTC 2615

 42349179 AAATATTAAACTAACCTTGCATTCCTGGGCTATGGCTATAATGTACTATCCTTTTATATA 42349238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2616 AAATATTAAACTAACCTTGCATTCCTGGGCTATGGCTATAATGTACTATCCTTTTATATA 2675

 42349239 TTGTTATATTCTATTTGCTATATTTTCCTAAAAATTTTTGCATTTATACTCATGAAGGAT 42349298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2676 TTGTTATATTCTATTTGCTATATTTTCCTAAAAATTTTTGCATTTATACTCATGAAGGAT 2735

 42349299 ATTAGTCTGCAGTTTTGCTTTCTTGTTATATATTTGTCTGGGTTTGATATCAGAGATCAG 42349358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2736 ATTAGTCTGCAGTTTTGCTTTCTTGTTATATATTTGTCTGGGTTTGATATCAGAGATCAG 2795

 42349359 AGTAATATCAGTATTGTAGGCACCAGTAAATATTTCCTTATAATGCTTTTTATTTTTATT 42349418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2796 AGTAATATCAGTATTGTAGGCACCAGTAAATATTTCCTTATAATGCTTTTTATTTTTATT 2855

 42349419 TTTTAAATTTTTTTATTTTTGAGACGGTGTTTTGTTCTTGTTGCCTGGGCTGGAGTACAA 42349478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2856 TTTTAAATTTTTTTATTTTTGAGACGGTGTTTTGTTCTTGTTGCCTGGGCTGGAGTACAA 2915

 42349479 TGTCACGATCTCAGCTCGTTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTC 42349538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2916 TGTCACGATCTCAGCTCGTTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTC 2975

 42349539 AGCCT 42349543
          |||||
     2976 AGCCT 2980

Alignment time is 2.18678 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [42336259,42357318] =>     21060 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [       1,    2996] =>      2996 nucs 'mol-32-21f7-014461_2996'

Score:        2929
Aligned:      2995        nucs
Identic:      2989 (100%) nucs =>       102 (100%)      2887 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [42343881,42343982] EXCISED REGION [42343984,42346875]
 second seq =>  [       1,     102] EXCISED REGION [     104,    2996]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [42343983,42343983]
 second seq =>         1 nucs [103,103]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [2907,2907]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [42343982,42343982] to [42343984,42343984]
 second seq =>         1 nucs [102,102] to [104,104]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 42343881 TACCAACTAAATGGCCTTGATTTGGAGGAGAGAAGACAAGAAGAGGAATTGCTTTCAGCT 42343940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TACCAACTAAATGGCCTTGATTTGGAGGAGAGAAGACAAGAAGAGGAATTGCTTTCAGCT 60

 42343941 GGTCCTTGCCTTTAACTAACCAGGGGTACAAAAATTTTAAAA 42343982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGTCCTTGCCTTTAACTAACCAGGGGTACAAAAATTTTAAAA 102

EXCISED REGION

 42343984 ACAAAGGAGACCATGTGTAAAACATTAGTTAAGCTCAGATATAAATCTAGTCTTTGACCA 42344043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      104 ACAAAGGAGACCATGTGTAAAACATTAGTTAAGCTCAGATATAAATCTAGTCTTTGACCA 163

 42344044 GTCCAGAGCTAATCAATATGCTTTTCTACTCTCTTTGAACTTTTGAGTTTTCTGGCAACA 42344103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      164 GTCCAGAGCTAATCAATATGCTTTTCTACTCTCTTTGAACTTTTGAGTTTTCTGGCAACA 223

 42344104 ACAAAAATCCCAAACCTCATCCAAAACCGTAGTCCAGACAGCCCAGTTTCTGCACTCCCT 42344163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      224 ACAAAAATCCCAAACCTCATCCAAAACCGTAGTCCAGACAGCCCAGTTTCTGCACTCCCT 283

 42344164 TCCTTGTGTCACATATTGTTGACAGAACTACTCCCGTTACCACATTCATTCCAGTGGTGA 42344223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      284 TCCTTGTGTCACATATTGTTGACAGAACTACTCCCGTTACCACATTCATTCCAGTGGTGA 343

 42344224 TTCAAATTCTTCTGCAGAAATGGACTTGAAAGACAGAAAACTGCTCCTGTAATCACTTAA 42344283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      344 TTCAAATTCTTCTGCAGAAATGGACTTGAAAGACAGAAAACTGCTCCTGTAATCACTTAA 403

 42344284 TAAGGAATCTTGGATGAGGAATACAGAGCTATGAATATGGATTTACTCTTAGCCTTTATG 42344343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      404 TAAGGAATCTTGGATGAGGAATACAGAGCTATGAATATGGATTTACTCTTAGCCTTTATG 463

 42344344 GATGCCTTTTTCTCAGTTATTTTCACTGAAAATCATGATGAACTGATTTAAATATCAAGG 42344403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      464 GATGCCTTTTTCTCAGTTATTTTCACTGAAAATCATGATGAACTGATTTAAATATCAAGG 523

 42344404 TAAACTGAGATGGAAAATTACCGATAATAAGAGTTTTCTGAAAATATAGATTGGCCTCTT 42344463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      524 TAAACTGAGATGGAAAATTACCGATAATAAGAGTTTTCTGAAAATATAGATTGGCCTCTT 583

 42344464 TAAAGCACATCGAGTTTGTTTTGTTTAAATTACAAATTCACATATATTTGAAATGTGTTT 42344523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      584 TAAAGCACATCGAGTTTGTTTTGTTTAAATTACAAATTCACATATATTTGAAATGTGTTT 643

 42344524 AAATGTGTCAGTTTTAGGCAAAACTAAACTATTTGATTCCTTTCCAAAAATCAGGAATTT 42344583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      644 AAATGTGTCAGTTTTAGGCAAAACTAAACTATTTGATTCCTTTCCAAAAATCAGGAATTT 703

 42344584 GCTTTGGAAAAAAACCATGCAGTTTGATTTACAAAGCAGAGCGGGGGGGAAGTAGTGGGT 42344643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      704 GCTTTGGAAAAAAACCATGCAGTTTGATTTACAAAGCAGAGCGGGGGGGAAGTAGTGGGT 763

 42344644 GAGAAAGACCCACCCAAAGGCTGCAGCCAGCTTCCCCAGGAAGATTCATAACCATGCCAC 42344703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      764 GAGAAAGACCCACCCAAAGGCTGCAGCCAGCTTCCCCAGGAAGATTCATAACCATGCCAC 823

 42344704 AATACTGTCCTTCAATTCGTTCCAACAGATTTTACTATAACTCTAAATCATTAGAAGCAA 42344763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      824 AATACTGTCCTTCAATTCGTTCCAACAGATTTTACTATAACTCTAAATCATTAGAAGCAA 883

 42344764 CTGCTGCTATGACTAGTGCTATCTTTGCCTCAAAAAGAGGAAAAATCAGGACATACAATA 42344823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      884 CTGCTGCTATGACTAGTGCTATCTTTGCCTCAAAAAGAGGAAAAATCAGGACATACAATA 943

 42344824 TAATCCCCTCAGGATCTAGGAGAGAAATCAGCCCATTTGTCATAAGAACTGAAAACCTCA 42344883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      944 TAATCCCCTCAGGATCTAGGAGAGAAATCAGCCCATTTGTCATAAGAACTGAAAACCTCA 1003

 42344884 GCTAAATAGTATATGAAACATTGGTATTTCATACCTTGACATTACATATTTTTGAAAATA 42344943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1004 GCTAAATAGTATATGAAACATTGGTATTTCATACCTTGACATTACATATTTTTGAAAATA 1063

 42344944 AAGTAAGCATACACACAAGAAGTGGCTAGATGCAGCAGTTATAAAGTGGCTTAAGTTGGG 42345003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1064 AAGTAAGCATACACACAAGAAGTGGCTAGATGCAGCAGTTATAAAGTGGCTTAAGTTGGG 1123

 42345004 TTAACTAAATATAACCTAGAAAAACCATCTTATCTATTGCAAATTATTTCCAGAAAAAGG 42345063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1124 TTAACTAAATATAACCTAGAAAAACCATCTTATCTATTGCAAATTATTTCCAGAAAAAGG 1183

 42345064 TAAGAAAAATCCAACCAACACTTTTTAAACATCCTGAGCTATTCACAGCAAGTGAATCTT 42345123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1184 TAAGAAAAATCCAACCAACACTTTTTAAACATCCTGAGCTATTCACAGCAAGTGAATCTT 1243

 42345124 TACCCTTACCAGATGTATAAACATTTACATAAGGCAGGAGGTTCAACACTTGGAGAGTGT 42345183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1244 TACCCTTACCAGATGTATAAACATTTACATAAGGCAGGAGGTTCAACACTTGGAGAGTGT 1303

 42345184 AATCAAGGCAGTAGTAACGCAGTGCTCCTCTCTTTGACTTGAATGACTTCCTCCCCATTA 42345243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1304 AATCAAGGCAGTAGTAACGCAGTGCTCCTCTCTTTGACTTGAATGACTTCCTCCCCATTA 1363

 42345244 GGGTCATTATTGTTTTGCAGTGTCCCAGGGATGAAAGGACTTTGAAAGGTCATGTGTCTT 42345303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1364 GGGTCATTATTGTTTTGCAGTGTCCCAGGGATGAAAGGACTTTGAAAGGTCATGTGTCTT 1423

 42345304 GTGACCCAACTAGCAGCATCAGCATCACTGGGGAGAAACTCAAGCAGAAGCTTGAGTCTA 42345363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1424 GTGACCCAACTAGCAGCATCAGCATCACTGGGGAGAAACTCAAGCAGAAGCTTGAGTCTA 1483

 42345364 CTCCACTCTTGCTGACACCAAATCTGCATTTTTACAGGATTCTTGGGTGAGTCACACACA 42345423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1484 CTCCACTCTTGCTGACACCAAATCTGCATTTTTACAGGATTCTTGGGTGAGTCACACACA 1543

 42345424 TATTCAAGGTTAAAATATGCCACCCTAGGTCTTTCTCCTGCTTCTGAGCAAAACTGGGCA 42345483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1544 TATTCAAGGTTAAAATATGCCACCCTAGGTCTTTCTCCTGCTTCTGAGCAAAACTGGGCA 1603

 42345484 CAAGGGACAAACTAGTTTCCTTCAGCCACTTTCAAATCCTTTATAGAGTGTACTGTGTGA 42345543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1604 CAAGGGACAAACTAGTTTCCTTCAGCCACTTTCAAATCCTTTATAGAGTGTACTGTGTGA 1663

 42345544 GTCACTGAGAGGAAAGAGGAAATAATACTTATTTAGGGAAGTCTTGCATAACTTAACAAA 42345603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1664 GTCACTGAGAGGAAAGAGGAAATAATACTTATTTAGGGAAGTCTTGCATAACTTAACAAA 1723

 42345604 GTTAGTAACTTCTTCAATACACTCAAGTACCTATTTTTGGAAGCCCTACAGGTTAGGTCA 42345663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1724 GTTAGTAACTTCTTCAATACACTCAAGTACCTATTTTTGGAAGCCCTACAGGTTAGGTCA 1783

 42345664 AAGTAAAGAGAAGCAAAAAATGGAGTGAGTTCTAGTAAAAAACTCTGACAAAATAAGGGA 42345723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1784 AAGTAAAGAGAAGCAAAAAATGGAGTGAGTTCTAGTAAAAAACTCTGACAAAATAAGGGA 1843

 42345724 AGTGTAGAAGCTGAGTCTATGAGGGATGAGAGAAGCAATTTACCAAATTATCAGATCCAA 42345783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1844 AGTGTAGAAGCTGAGTCTATGAGGGATGAGAGAAGCAATTTACCAAATTATCAGATCCAA 1903

 42345784 AATCATCTCTGCACTGTAGATGATTTATAGCCCTGGAAGCTTAGAGGCTTGAGTCTCTTG 42345843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1904 AATCATCTCTGCACTGTAGATGATTTATAGCCCTGGAAGCTTAGAGGCTTGAGTCTCTTG 1963

 42345844 CTGTATTTCATTTCAAATTAGTAATTTTTATCTAGGGCTTCCCTATGGCTTAAAGTGAAG 42345903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1964 CTGTATTTCATTTCAAATTAGTAATTTTTATCTAGGGCTTCCCTATGGCTTAAAGTGAAG 2023

 42345904 GCCCTGGAATTTCTGAAGTGAAATTATCTGATGATTTTTATGTATGGTCATTCTGTAGTT 42345963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2024 GCCCTGGAATTTCTGAAGTGAAATTATCTGATGATTTTTATGTATGGTCATTCTGTAGTT 2083

 42345964 ATCCTGTAAGTTTCATATTTGTAACAAGACTGGAATCCGAACAATAGAAAACTCTGTGGC 42346023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2084 ATCCTGTAAGTTTCATATTTGTAACAAGACTGGAATCCGAACAATAGAAAACTCTGTGGC 2143

 42346024 AGTAAGCCAAAACCTGATGGACTTAGGAGAGTTACGTATGTGTGTTTCAGTGGTCCTCAA 42346083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2144 AGTAAGCCAAAACCTGATGGACTTAGGAGAGTTACGTATGTGTGTTTCAGTGGTCCTCAA 2203

 42346084 ATTCAGCTGCCTATTAGAATCACCTGGACTTTGAAAAAAAAAGAGCTTTCTTGAGGTATA 42346143
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2204 ATTTAGCTGCCTATTAGAATCACCTGGACTTTGAAAAAAAAAGAGCTTTCTTGAGGTATA 2263

 42346144 ACTGACAAATAATAAGACAAACATATTTCAGTATACAATTGGATGAGTTTTGACATGTTA 42346203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2264 ACTGACAAATAATAAGACAAACATATTTCAGTATACAATTGGATGAGTTTTGACATGTTA 2323

 42346204 TATTCTTGTGAAACCATCACCACAATCAAGCTATTCACCCCCCAAATTTTCGTGCCCCTT 42346263
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2324 TATTCTTGTGAAACCATCGCCACAATCAAGCTATTCACCCCCCAAATTTTCGTGCCCCTT 2383

 42346264 TGTTGTCCCACCCTTCTTTCTGCAACCACTGATCTGCTTTCTATCACTATGGATTAATTT 42346323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2384 TGTTGTCCCACCCTTCTTTCTGCAACCACTGATCTGCTTTCTATCACTATGGATTAATTT 2443

 42346324 GTATTTTCTAGAAGCTTAAATAAGTGAAACCATATGGTGTGCATGTTTTGCAGGGAGAGG 42346383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2444 GTATTTTCTAGAAGCTTAAATAAGTGAAACCATATGGTGTGCATGTTTTGCAGGGAGAGG 2503

 42346384 GCAGGGGGAGCTGGTTTCTTTCACTCGGTGTAATTGTTCTGAGAGTCATCCGTGTTTGCA 42346443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2504 GCAGGGGGAGCTGGTTTCTTTCACTCGGTGTAATTGTTCTGAGAGTCATCCGTGTTTGCA 2563

 42346444 TGTGTTAATAGTTTATTCTTTTTATCGGTAAGTAGTATCCCATTGTGTGGATGTACCACA 42346503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2564 TGTGTTAATAGTTTATTCTTTTTATCGGTAAGTAGTATCCCATTGTGTGGATGTACCACA 2623

 42346504 TGTTGTCTAACCATTCACAACTAAAGGATACTTGGGTTGTTTCTCATTTGGGGCAATTGA 42346563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2624 TGTTGTCTAACCATTCACAACTAAAGGATACTTGGGTTGTTTCTCATTTGGGGCAATTGA 2683

 42346564 AAATAAGCAGTATAAACTGCTATAAACAGTCATGTACAGATATAAGCATGTATGTTTCCA 42346623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2684 AAATAAGCAGTATAAACTGCTATAAACAGTCATGTACAGATATAAGCATGTATGTTTCCA 2743

 42346624 TTTTTCAAGGTAAATACCTAGAAGTGGGTATGGTAAGTGTATGTTTAACTTGAAAAGAAA 42346683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2744 TTTTTCAAGGTAAATACCTAGAAGTGGGTATGGTAAGTGTATGTTTAACTTGAAAAGAAA 2803

 42346684 CTACCAAAATGTTTCCAAAGTGGTTGTACCATTTTGCTTACCTACCAGAAATGTGTAAGA 42346743
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2804 CTACCAAAATGTTTCCAAAGTGGTCGTACCATTTTGCTTACCTACCAGAAATGTGTAAGA 2863

 42346744 GTTCTAGTTACTCCACATACTTCCTAGCAGTTGATATTCTCAG-TTTTTTTTTTTATTTT 42346802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
     2864 GTTCTAGTTACTCCACATACTTCCTAGCAGTTGATATTCTCAGTTTTTTTTTTTTATTTT 2923

 42346803 AACCGTTCTAATAGCTGTGTAATGGTATTCCATTACAGTACTAATTTAAATTTCCCTAAT 42346862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||
     2924 AACCGTTCTAATAGCTGTGTAATGGTATTCCATTACGGTACTAATTTAAAATTCCCTAAT 2983

 42346863 AACTACTGAGGTT 42346875
          |||||||||||||
     2984 AACTACTGAGGTT 2996

Alignment time is 2.21294 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [42336259,42357318] =>     21060 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [       1,    2064] =>      2064 nucs 'mol-32-22bd-049539_2064'

Score:        2019
Aligned:      2052        nucs
Identic:      2049 (100%) nucs =>       972 (100%)      1077 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [42345115,42346086] EXCISED REGION [42346088,42347166]
 second seq =>  [       1,     972] EXCISED REGION [     974,    2053]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [42346087,42346087]
 second seq =>         1 nucs [973,973]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [1673,1673]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [971,972] to [972,973]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 42345115 GTGAATCTTTACCCTTACCAGATGTATAAACATTTACATAAGGCAGGAGGTTCAACACTT 42345174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTGAATCTTTACCCTTACCAGATGTATAAACATTTACATAAGGCAGGAGGTTCAACACTT 60

 42345175 GGAGAGTGTAATCAAGGCAGTAGTAACGCAGTGCTCCTCTCTTTGACTTGAATGACTTCC 42345234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGAGAGTGTAATCAAGGCAGTAGTAACGCAGTGCTCCTCTCTTTGACTTGAATGACTTCC 120

 42345235 TCCCCATTAGGGTCATTATTGTTTTGCAGTGTCCCAGGGATGAAAGGACTTTGAAAGGTC 42345294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCCCCATTAGGGTCATTATTGTTTTGCAGTGTCCCAGGGATGAAAGGACTTTGAAAGGTC 180

 42345295 ATGTGTCTTGTGACCCAACTAGCAGCATCAGCATCACTGGGGAGAAACTCAAGCAGAAGC 42345354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATGTGTCTTGTGACCCAACTAGCAGCATCAGCATCACTGGGGAGAAACTCAAGCAGAAGC 240

 42345355 TTGAGTCTACTCCACTCTTGCTGACACCAAATCTGCATTTTTACAGGATTCTTGGGTGAG 42345414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTGAGTCTACTCCACTCTTGCTGACACCAAATCTGCATTTTTACAGGATTCTTGGGTGAG 300

 42345415 TCACACACATATTCAAGGTTAAAATATGCCACCCTAGGTCTTTCTCCTGCTTCTGAGCAA 42345474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCACACACATATTCAAGGTTAAAATATGCCACCCTAGGTCTTTCTCCTGCTTCTGAGCAA 360

 42345475 AACTGGGCACAAGGGACAAACTAGTTTCCTTCAGCCACTTTCAAATCCTTTATAGAGTGT 42345534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AACTGGGCACAAGGGACAAACTAGTTTCCTTCAGCCACTTTCAAATCCTTTATAGAGTGT 420

 42345535 ACTGTGTGAGTCACTGAGAGGAAAGAGGAAATAATACTTATTTAGGGAAGTCTTGCATAA 42345594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACTGTGTGAGTCACTGAGAGGAAAGAGGAAATAATACTTATTTAGGGAAGTCTTGCATAA 480

 42345595 CTTAACAAAGTTAGTAACTTCTTCAATACACTCAAGTACCTATTTTTGGAAGCCCTACAG 42345654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTTAACAAAGTTAGTAACTTCTTCAATACACTCAAGTACCTATTTTTGGAAGCCCTACAG 540

 42345655 GTTAGGTCAAAGTAAAGAGAAGCAAAAAATGGAGTGAGTTCTAGTAAAAAACTCTGACAA 42345714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GTTAGGTCAAAGTAAAGAGAAGCAAAAAATGGAGTGAGTTCTAGTAAAAAACTCTGACAA 600

 42345715 AATAAGGGAAGTGTAGAAGCTGAGTCTATGAGGGATGAGAGAAGCAATTTACCAAATTAT 42345774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AATAAGGGAAGTGTAGAAGCTGAGTCTATGAGGGATGAGAGAAGCAATTTACCAAATTAT 660

 42345775 CAGATCCAAAATCATCTCTGCACTGTAGATGATTTATAGCCCTGGAAGCTTAGAGGCTTG 42345834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CAGATCCAAAATCATCTCTGCACTGTAGATGATTTATAGCCCTGGAAGCTTAGAGGCTTG 720

 42345835 AGTCTCTTGCTGTATTTCATTTCAAATTAGTAATTTTTATCTAGGGCTTCCCTATGGCTT 42345894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGTCTCTTGCTGTATTTCATTTCAAATTAGTAATTTTTATCTAGGGCTTCCCTATGGCTT 780

 42345895 AAAGTGAAGGCCCTGGAATTTCTGAAGTGAAATTATCTGATGATTTTTATGTATGGTCAT 42345954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAAGTGAAGGCCCTGGAATTTCTGAAGTGAAATTATCTGATGATTTTTATGTATGGTCAT 840

 42345955 TCTGTAGTTATCCTGTAAGTTTCATATTTGTAACAAGACTGGAATCCGAACAATAGAAAA 42346014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCTGTAGTTATCCTGTAAGTTTCATATTTGTAACAAGACTGGAATCCGAACAATAGAAAA 900

 42346015 CTCTGTGGCAGTAAGCCAAAACCTGATGGACTTAGGAGAGTTACGTATGTGTGTTTCAGT 42346074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTCTGTGGCAGTAAGCCAAAACCTGATGGACTTAGGAGAGTTACGTATGTGTGTTTCAGT 960

 42346075 GGTCCTCAAATT 42346086
          ||||||||||||
      961 GGTCCTCAAATT 972

EXCISED REGION

 42346088 AGCTGCCTATTAGAATCACCTGGACTTTGAAAAAAAAAGAGCTTTCTTGAGGTATAACTG 42346147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      974 AGCTGCCTATTAGAATCACCTGGACTTTGAAAAAAAAAGAGCTTTCTTGAGGTATAACTG 1033

 42346148 ACAAATAATAAGACAAACATATTTCAGTATACAATTGGATGAGTTTTGACATGTTATATT 42346207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1034 ACAAATAATAAGACAAACATATTTCAGTATACAATTGGATGAGTTTTGACATGTTATATT 1093

 42346208 CTTGTGAAACCATCACCACAATCAAGCTATTCACCCCCCAAATTTTCGTGCCCCTTTGTT 42346267
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1094 CTTGTGAAACCATCGCCACAATCAAGCTATTCACCCCCCAAATTTTCGTGCCCCTTTGTT 1153

 42346268 GTCCCACCCTTCTTTCTGCAACCACTGATCTGCTTTCTATCACTATGGATTAATTTGTAT 42346327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1154 GTCCCACCCTTCTTTCTGCAACCACTGATCTGCTTTCTATCACTATGGATTAATTTGTAT 1213

 42346328 TTTCTAGAAGCTTAAATAAGTGAAACCATATGGTGTGCATGTTTTGCAGGGAGAGGGCAG 42346387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1214 TTTCTAGAAGCTTAAATAAGTGAAACCATATGGTGTGCATGTTTTGCAGGGAGAGGGCAG 1273

 42346388 GGGGAGCTGGTTTCTTTCACTCGGTGTAATTGTTCTGAGAGTCATCCGTGTTTGCATGTG 42346447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1274 GGGGAGCTGGTTTCTTTCACTCGGTGTAATTGTTCTGAGAGTCATCCGTGTTTGCATGTG 1333

 42346448 TTAATAGTTTATTCTTTTTATCGGTAAGTAGTATCCCATTGTGTGGATGTACCACATGTT 42346507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1334 TTAATAGTTTATTCTTTTTATCGGTAAGTAGTATCCCATTGTGTGGATGTACCACATGTT 1393

 42346508 GTCTAACCATTCACAACTAAAGGATACTTGGGTTGTTTCTCATTTGGGGCAATTGAAAAT 42346567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1394 GTCTAACCATTCACAACTAAAGGATACTTGGGTTGTTTCTCATTTGGGGCAATTGAAAAT 1453

 42346568 AAGCAGTATAAACTGCTATAAACAGTCATGTACAGATATAAGCATGTATGTTTCCATTTT 42346627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1454 AAGCAGTATAAACTGCTATAAACAGTCATGTACAGATATAAGCATGTATGTTTCCATTTT 1513

 42346628 TCAAGGTAAATACCTAGAAGTGGGTATGGTAAGTGTATGTTTAACTTGAAAAGAAACTAC 42346687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1514 TCAAGGTAAATACCTAGAAGTGGGTATGGTAAGTGTATGTTTAACTTGAAAAGAAACTAC 1573

 42346688 CAAAATGTTTCCAAAGTGGTTGTACCATTTTGCTTACCTACCAGAAATGTGTAAGAGTTC 42346747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1574 CAAAATGTTTCCAAAGTGGTTGTACCATTTTGCTTACCTACCAGAAATGTGTAAGAGTTC 1633

 42346748 TAGTTACTCCACATACTTCCTAGCAGTTGATATTCTCAG-TTTTTTTTTTTATTTTAACC 42346806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
     1634 TAGTTACTCCACATACTTCCTAGCAGTTGATATTCTCAGTTTTTTTTTTTTATTTTAACC 1693

 42346807 GTTCTAATAGCTGTGTAATGGTATTCCATTACAGTACTAATTTAAATTTCCCTAATAACT 42346866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     1694 GTTCTAATAGCTGTGTAATGGTATTCCATTACGGTACTAATTTAAATTTCCCTAATAACT 1753

 42346867 ACTGAGGTTGAAAAAATCTTTCATGGGCATATTTGCCATCCTTGTATCTTCTCTGGTGAC 42346926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1754 ACTGAGGTTGAAAAAATCTTTCATGGGCATATTTGCCATCCTTGTATCTTCTCTGGTGAC 1813

 42346927 GAATCTTTCATGCCTTCTGCTTATATTTTAACCAGGGTTTTGTTTTGCTTTTTCTTAACT 42346986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1814 GAATCTTTCATGCCTTCTGCTTATATTTTAACCAGGGTTTTGTTTTGCTTTTTCTTAACT 1873

 42346987 GTTGAGTTTTAAGAGTCTATATATACTGCAAACAACTCCTTGGTAAGATATATGATTGGC 42347046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1874 GTTGAGTTTTAAGAGTCTATATATACTGCAAACAACTCCTTGGTAAGATATATGATTGGC 1933

 42347047 AAATCCTTTCTCCTAATCTTTTTATTTCCTTAACAATGCCTTTCAAGAACAGAAATTCTT 42347106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1934 AAATCCTTTCTCCTAATCTTTTTATTTCCTTAACAATGCCTTTCAAGAACAGAAATTCTT 1993

 42347107 AATTTGATGCAATGCAATTTATTAGTTTTCTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT 42347166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1994 AATTTGATGCAATGCAATTTATTAGTTTTCTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT 2053

Alignment time is 1.53155 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [42336259,42357318] =>     21060 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [       1,    4690] =>      4690 nucs 'mol-32-2399-005179_4690'

Score:        4584
Aligned:      4691        nucs
Identic:      4678 (100%) nucs =>      4652 (100%)        26 (100%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [42341595,42346259] EXCISED REGION [42347319,42347344]
 second seq =>  [       1,    4660] EXCISED REGION [    4665,    4690]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1059 nucs [42346260,42347318]
 second seq =>         4 nucs [4661,4664]
ALTERNATIVE REGION(S): 2
 first  seq =>      3625 nucs [42346260,42349884]
 second seq =>         4 nucs [4661,4664]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [4661,4661] to [4665,4665]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 42341595 TATGTTTTTCAGATTACACGTGCCTTAGGAAGTGAGAAAAGTATAAGTGCAATGTGGAAT 42341654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TATGTTTTTCAGATTACACGTGCCTTAGGAAGTGAGAAAAGTATAAGTGCAATGTGGAAT 60

 42341655 TGGGTGGTTGAGAAAACTCCAGAGAGGACCTGGTAGAGCTTGGAGGCAAGGTGGGCAAGG 42341714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGGGTGGTTGAGAAAACTCCAGAGAGGACCTGGTAGAGCTTGGAGGCAAGGTGGGCAAGG 120

 42341715 AACATTTCAAGAGGAGGGGACACTACAGCTGAGGCACAGAGGTGAGAAAGCACAGGAAGC 42341774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AACATTTCAAGAGGAGGGGACACTACAGCTGAGGCACAGAGGTGAGAAAGCACAGGAAGC 180

 42341775 AAGAAAGAGGCTCATCTGGCTGCAGCAGAGGGAGAAATAGTAAATTAGATCAGATAACTC 42341834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAGAAAGAGGCTCATCTGGCTGCAGCAGAGGGAGAAATAGTAAATTAGATCAGATAACTC 240

 42341835 ATATATTGGGCACGTGTGCAGAGGGCCAAAAAGATGTTTGGCCTTAATTCTATAGGTATT 42341894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATATATTGGGCACGTGTGCAGAGGGCCAAAAAGATGTTTGGCCTTAATTCTATAGGTATT 300

 42341895 CCCCTTTGCCATAGATGTTACACCAAGAAAGAACACATTGAATCAAGCAAATTTAAGCTG 42341954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCCCTTTGCCATAGATGTTACACCAAGAAAGAACACATTGAATCAAGCAAATTTAAGCTG 360

 42341955 GGTTTTTGTTTTTGTTTTTTGGTGGTGGGGGGGATGATTTATAAGCAGGACTTCCCAAAG 42342014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGTTTTTGTTTTTGTTTTTTGGTGGTGGGGGGGATGATTTATAAGCAGGACTTCCCAAAG 420

 42342015 CTTTTAATATGCTTATATATGTGGCAGTGTTGAGAGGGGAAGATTTGATATTCCAAGTAT 42342074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTTTTAATATGCTTATATATGTGGCAGTGTTGAGAGGGGAAGATTTGATATTCCAAGTAT 480

 42342075 TTTTGGCCACAGAACTCTTTTTATCATGGAACATTTCCAGTGTTCCATGAGACACAATTA 42342134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTTGGCCACAGAACTCTTTTTATCATGGAACATTTCCAGTGTTCCATGAGACACAATTA 540

 42342135 GGGGCTAGTGAGCCACTGACTTTTGAGTTGGAAAGTGACACATGGGGAAAGCAAAGTTTT 42342194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGGGCTAGTGAGCCACTGACTTTTGAGTTGGAAAGTGACACATGGGGAAAGCAAAGTTTT 600

 42342195 GGAAGATTGATCTCACGGTAGAATATAAGGTGAACAGGAGAGAAAAGAGCCTGGATTCAG 42342254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GGAAGATTGATCTCACGGTAGAATATAAGGTGAACAGGAGAGAAAAGAGCCTGGATTCAG 660

 42342255 GCAACACAATCAGATGATTGGATACAGGCTCAAGATTAGGGGGTGGGTTGCACTACACTG 42342314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GCAACACAATCAGATGATTGGATACAGGCTCAAGATTAGGGGGTGGGTTGCACTACACTG 720

 42342315 GAGCGGAGAATGGAGAGCAAAAGCACTGATTGAATGCACAGTCTTCTGTTGGATCCTGGG 42342374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GAGCGGAGAATGGAGAGCAAAAGCACTGATTGAATGCACAGTCTTCTGTTGGATCCTGGG 780

 42342375 ATGATACAGAAGTGTCAGAGTTCCTGGGTCTTGTAGGAGTTCCAATGAGCATCAATCAAA 42342434
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
      781 ATGATACAGAAGTGTCAGAGTTCCTGGGTCTTGTAGGAGTTCCAATGCGCATCAATCAAA 840

 42342435 AGTTTGATTGTAAGGCACAGAAATCAACTTGGACCAGCTAAAGCAAAAAGACCATTTTTA 42342494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGTTTGATTGTAAGGCACAGAAATCAACTTGGACCAGCTAAAGCAAAAAGACCATTTTTA 900

 42342495 GGGAAATAGGGATGTGTCACAAAGAACTGCATCTAGGTACTGGAAATCAACAAAAAGTTC 42342554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GGGAAATAGGGATGTGTCACAAAGAACTGCATCTAGGTACTGGAAATCAACAAAAAGTTC 960

 42342555 CCCATCTGATCTCAGCTTCTCTGTGTGTCTACTACATACACTATCTTTCTCCTCTTTTCT 42342614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CCCATCTGATCTCAGCTTCTCTGTGTGTCTACTACATACACTATCTTTCTCCTCTTTTCT 1020

 42342615 TTCCTCTCTACCCCCTACCTCCCTCCTCTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTGTTTTTTGGTT 42342674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||
     1021 TTCCTCTCTACCCCCTACCTCCCTCCTCTCTCTTTTTTTTTTTT-----GTTTTTTGGTT 1075

 42342675 TTTTTATGTTTGTTTGTTTGCTTTTGGAGACACGGTCTCCCTCTGTCACCCAGGCTGGAG 42342734
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1076 TTTTTATGTTTGTTTGTTTGTTTTTGGAGACACGGTCTCCCTCTGTCACCCAGGCTGGAG 1135

 42342735 TGCAGTGGCTTAATTACTGCAGCCTCAATCTCCTGGGCTCAAGTGACCCTCCCACCTCAG 42342794
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     1136 TGCAGTGGCTTAATTACTGCAGCCTCAATCTCCTGGGCTCAAGTGACCCTCCCACTTCAG 1195

 42342795 CCTCCTGAATAGCTGGGACCACAGGTGCAAGCCACAGTGCTCAGCTAATTAAAAAAAATT 42342854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1196 CCTCCTGAATAGCTGGGACCACAGGTGCAAGCCACAGTGCTCAGCTAATTAAAAAAAATT 1255

 42342855 TTTTTTTCAGAGATGGGGTCTCACTATGTTGTCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTAGGCTCA 42342914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1256 TTTTTTTCAGAGATGGGGTCTCACTATGTTGTCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTAGGCTCA 1315

 42342915 AGCAGTCCTCCCGTTTCAGCCTCAAAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCATCGCACT 42342974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1316 AGCAGTCCTCCCGTTTCAGCCTCAAAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCATCGCACT 1375

 42342975 CCACCTTCTCTATAGTTACTGAGTTTGCGTGTTACACTGAGTTTACATCTTACATTTCTA 42343034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1376 CCACCTTCTCTATAGTTACTGAGTTTGCGTGTTACACTGAGTTTACATCTTACATTTCTA 1435

 42343035 GCCATATCAGAAACGACCTCTGCACCTCTCTTTCCCAATTTGAGATTTCTAATAGAAAGA 42343094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1436 GCCATATCAGAAACGACCTCTGCACCTCTCTTTCCCAATTTGAGATTTCTAATAGAAAGA 1495

 42343095 ATCTTGTTCACCCAGCTTGGGACTCATTGAGTTATGACCAGTGGGATAGATTTTAGAAGA 42343154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1496 ATCTTGTTCACCCAGCTTGGGACTCATTGAGTTATGACCAGTGGGATAGATTTTAGAAGA 1555

 42343155 TAAACATGTCTATAGGGACTTACCGTGTGAATTAGTGGGGGAGCCGCTTACCAGGCAGAG 42343214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1556 TAAACATGTCTATAGGGACTTACCGTGTGAATTAGTGGGGGAGCCGCTTACCAGGCAGAG 1615

 42343215 GGGTCTGCTGTAAAGTGATACTGTGACTTTAAATTGAAAGTAAGCTTCTAGAAGAGTTGA 42343274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1616 GGGTCTGCTGTAAAGTGATACTGTGACTTTAAATTGAAAGTAAGCTTCTAGAAGAGTTGA 1675

 42343275 AGAGGAGTGGATTATTGTTGAATGGATGTATAACTAATGAAGCTTTAAAGGAAGTTTATT 42343334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1676 AGAGGAGTGGATTATTGTTGAATGGATGTATAACTAATGAAGCTTTAAAGGAAGTTTATT 1735

 42343335 AGAAAGTCCATGTCCTTGTCTCTTTCCCAAACTCCTTTAGTTCCCAAGTCCTGAAAGAAT 42343394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1736 AGAAAGTCCATGTCCTTGTCTCTTTCCCAAACTCCTTTAGTTCCCAAGTCCTGAAAGAAT 1795

 42343395 CTATGGATAAGGGAAGCAGAATACTATAGTGGTTAAGAGCACATGCTCGAGGTTAAACTG 42343454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1796 CTATGGATAAGGGAAGCAGAATACTATAGTGGTTAAGAGCACATGCTCGAGGTTAAACTG 1855

 42343455 TCTGTATTTTGGATCCTGGCCTTGAGGACTTGGGCAAGTTACGTGACCTGCCTGAGCCTC 42343514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1856 TCTGTATTTTGGATCCTGGCCTTGAGGACTTGGGCAAGTTACGTGACCTGCCTGAGCCTC 1915

 42343515 AGTTTCCTCACCTGTAATATGGGTATCACGAGGAATAAATAAGGTAATATGTGTAAAGTG 42343574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1916 AGTTTCCTCACCTGTAATATGGGTATCACGAGGAATAAATAAGGTAATATGTGTAAAGTG 1975

 42343575 CTTGGCACAATGCTCTTGATAATGTTAGCAACATAATTTTGTAATGAAAATTAACTGATG 42343634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1976 CTTGGCACAATGCTCTTGATAATGTTAGCAACATAATTTTGTAATGAAAATTAACTGATG 2035

 42343635 GGGCTGAAATGTGCATCAGCAGATCCAAATATCCTTGATAAACTGGCCAAAAGAAAGATG 42343694
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     2036 GGGCTGAAATGTGCATCAGCAGATCCAAATATCCTCGATAAACTGGCCAAAAGAAAGATG 2095

 42343695 AATTGGCAGAGAGGCAAGTGTTCATCTCAGTTCTCCAGATATCCCTGCAAATGTGGCCTC 42343754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2096 AATTGGCAGAGAGGCAAGTGTTCATCTCAGTTCTCCAGATATCCCTGCAAATGTGGCCTC 2155

 42343755 TGGAGTAGAAGATTTAGGGAGAAAAATAAGCCATGAAGCTCTTCTGGCACCAACATGAAC 42343814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2156 TGGAGTAGAAGATTTAGGGAGAAAAATAAGCCATGAAGCTCTTCTGGCACCAACATGAAC 2215

 42343815 TTCAGGGATCATGGGACATTTGGGCCAGTAACATTCCTCTTTGTTCCTAGAGATTTAATA 42343874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2216 TTCAGGGATCATGGGACATTTGGGCCAGTAACATTCCTCTTTGTTCCTAGAGATTTAATA 2275

 42343875 TCTACCTACCAACTAAATGGCCTTGATTTGGAGGAGAGAAGACAAGAAGAGGAATTGCTT 42343934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2276 TCTACCTACCAACTAAATGGCCTTGATTTGGAGGAGAGAAGACAAGAAGAGGAATTGCTT 2335

 42343935 TCAGCTGGTCCTTGCCTTTAACTAACCAGGGGTACAAAAATTTTAAAATACAAAGGAGAC 42343994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     2336 TCAGCTGGTCCTTGCCTTTAACTAACCAGGGGTACAAAAATTTTAAAACACAAAGGAGAC 2395

 42343995 CATGTGTAAAACATTAGTTAAGCTCAGATATAAATCTAGTCTTTGACCAGTCCAGAGCTA 42344054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2396 CATGTGTAAAACATTAGTTAAGCTCAGATATAAATCTAGTCTTTGACCAGTCCAGAGCTA 2455

 42344055 ATCAATATGCTTTTCTACTCTCTTTGAACTTTTGAGTTTTCTGGCAACAACAAAAATCCC 42344114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2456 ATCAATATGCTTTTCTACTCTCTTTGAACTTTTGAGTTTTCTGGCAACAACAAAAATCCC 2515

 42344115 AAACCTCATCCAAAACCGTAGTCCAGACAGCCCAGTTTCTGCACTCCCTTCCTTGTGTCA 42344174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2516 AAACCTCATCCAAAACCGTAGTCCAGACAGCCCAGTTTCTGCACTCCCTTCCTTGTGTCA 2575

 42344175 CATATTGTTGACAGAACTACTCCCGTTACCACATTCATTCCAGTGGTGATTCAAATTCTT 42344234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2576 CATATTGTTGACAGAACTACTCCCGTTACCACATTCATTCCAGTGGTGATTCAAATTCTT 2635

 42344235 CTGCAGAAATGGACTTGAAAGACAGAAAACTGCTCCTGTAATCACTTAATAAGGAATCTT 42344294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2636 CTGCAGAAATGGACTTGAAAGACAGAAAACTGCTCCTGTAATCACTTAATAAGGAATCTT 2695

 42344295 GGATGAGGAATACAGAGCTATGAATATGGATTTACTCTTAGCCTTTATGGATGCCTTTTT 42344354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2696 GGATGAGGAATACAGAGCTATGAATATGGATTTACTCTTAGCCTTTATGGATGCCTTTTT 2755

 42344355 CTCAGTTATTTTCACTGAAAATCATGATGAACTGATTTAAATATCAAGGTAAACTGAGAT 42344414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2756 CTCAGTTATTTTCACTGAAAATCATGATGAACTGATTTAAATATCAAGGTAAACTGAGAT 2815

 42344415 GGAAAATTACCGATAATAAGAGTTTTCTGAAAATATAGATTGGCCTCTTTAAAGCACATC 42344474
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     2816 GGAAAATTACCGATAATAAGAGTTTTCTGAAAATATAGATTGGCCTCTTTAAAACACATC 2875

 42344475 GAGTTTGTTTTGTTTAAATTACAAATTCACATATATTTGAAATGTGTTTAAATGTGTCAG 42344534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2876 GAGTTTGTTTTGTTTAAATTACAAATTCACATATATTTGAAATGTGTTTAAATGTGTCAG 2935

 42344535 TTTTAGGCAAAACTAAACTATTTGATTCCTTTCCAAAAATCAGGAATTTGCTTTGGAAAA 42344594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2936 TTTTAGGCAAAACTAAACTATTTGATTCCTTTCCAAAAATCAGGAATTTGCTTTGGAAAA 2995

 42344595 AAACCATGCAGTTTGATTTACAAAGCAGAGCGGGGGGGAAGTAGTGGGTGAGAAAGACCC 42344654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2996 AAACCATGCAGTTTGATTTACAAAGCAGAGCGGGGGGGAAGTAGTGGGTGAGAAAGACCC 3055

 42344655 ACCCAAAGGCTGCAGCCAGCTTCCCCAGGAAGATTCATAACCATGCCACAATACTGTCCT 42344714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3056 ACCCAAAGGCTGCAGCCAGCTTCCCCAGGAAGATTCATAACCATGCCACAATACTGTCCT 3115

 42344715 TCAATTCGTTCCAACAGATTTTACTATAACTCTAAATCATTAGAAGCAACTGCTGCTATG 42344774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3116 TCAATTCGTTCCAACAGATTTTACTATAACTCTAAATCATTAGAAGCAACTGCTGCTATG 3175

 42344775 ACTAGTGCTATCTTTGCCTCAAAAAGAGGAAAAATCAGGACATACAATATAATCCCCTCA 42344834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3176 ACTAGTGCTATCTTTGCCTCAAAAAGAGGAAAAATCAGGACATACAATATAATCCCCTCA 3235

 42344835 GGATCTAGGAGAGAAATCAGCCCATTTGTCATAAGAACTGAAAACCTCAGCTAAATAGTA 42344894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3236 GGATCTAGGAGAGAAATCAGCCCATTTGTCATAAGAACTGAAAACCTCAGCTAAATAGTA 3295

 42344895 TATGAAACATTGGTATTTCATACCTTGACATTACATATTTTTGAAAATAAAGTAAGCATA 42344954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3296 TATGAAACATTGGTATTTCATACCTTGACATTACATATTTTTGAAAATAAAGTAAGCATA 3355

 42344955 CACACAAGAAGTGGCTAGATGCAGCAGTTATAAAGTGGCTTAAGTTGGGTTAACTAAATA 42345014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3356 CACACAAGAAGTGGCTAGATGCAGCAGTTATAAAGTGGCTTAAGTTGGGTTAACTAAATA 3415

 42345015 TAACCTAGAAAAACCATCTTATCTATTGCAAATTATTTCCAGAAAAAGGTAAGAAAAATC 42345074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3416 TAACCTAGAAAAACCATCTTATCTATTGCAAATTATTTCCAGAAAAAGGTAAGAAAAATC 3475

 42345075 CAACCAACACTTTTTAAACATCCTGAGCTATTCACAGCAAGTGAATCTTTACCCTTACCA 42345134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3476 CAACCAACACTTTTTAAACATCCTGAGCTATTCACAGCAAGTGAATCTTTACCCTTACCA 3535

 42345135 GATGTATAAACATTTACATAAGGCAGGAGGTTCAACACTTGGAGAGTGTAATCAAGGCAG 42345194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3536 GATGTATAAACATTTACATAAGGCAGGAGGTTCAACACTTGGAGAGTGTAATCAAGGCAG 3595

 42345195 TAGTAACGCAGTGCTCCTCTCTTTGACTTGAATGACTTCCTCCCCATTAGGGTCATTATT 42345254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3596 TAGTAACGCAGTGCTCCTCTCTTTGACTTGAATGACTTCCTCCCCATTAGGGTCATTATT 3655

 42345255 GTTTTGCAGTGTCCCAGGGATGAAAGGACTTTGAAAGGTCATGTGTCTTGTGACCCAACT 42345314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3656 GTTTTGCAGTGTCCCAGGGATGAAAGGACTTTGAAAGGTCATGTGTCTTGTGACCCAACT 3715

 42345315 AGCAGCATCAGCATCACTGGGGAGAAACTCAAGCAGAAGCTTGAGTCTACTCCACTCTTG 42345374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3716 AGCAGCATCAGCATCACTGGGGAGAAACTCAAGCAGAAGCTTGAGTCTACTCCACTCTTG 3775

 42345375 CTGACACCAAATCTGCATTTTTACAGGATTCTTGGGTGAGTCACACACATATTCAAGGTT 42345434
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     3776 CTGACACCAAATCTGCATTTTTACAGGATTCTTGGGTGAGTCACAGACATATTCAAGGTT 3835

 42345435 AAAATATGCCACCCTAGGTCTTTCTCCTGCTTCTGAGCAAAACTGGGCACAAGGGACAAA 42345494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3836 AAAATATGCCACCCTAGGTCTTTCTCCTGCTTCTGAGCAAAACTGGGCACAAGGGACAAA 3895

 42345495 CTAGTTTCCTTCAGCCACTTTCAAATCCTTTATAGAGTGTACTGTGTGAGTCACTGAGAG 42345554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3896 CTAGTTTCCTTCAGCCACTTTCAAATCCTTTATAGAGTGTACTGTGTGAGTCACTGAGAG 3955

 42345555 GAAAGAGGAAATAATACTTATTTAGGGAAGTCTTGCATAACTTAACAAAGTTAGTAACTT 42345614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3956 GAAAGAGGAAATAATACTTATTTAGGGAAGTCTTGCATAACTTAACAAAGTTAGTAACTT 4015

 42345615 CTTCAATACACTCAAGTACCTATTTTTGGAAGCCCTACAGGTTAGGTCAAAGTAAAGAGA 42345674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4016 CTTCAATACACTCAAGTACCTATTTTTGGAAGCCCTACAGGTTAGGTCAAAGTAAAGAGA 4075

 42345675 AGCAAAAAATGGAGTGAGTTCTAGTAAAAAACTCTGACAAAATAAGGGAAGTGTAGAAGC 42345734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4076 AGCAAAAAATGGAGTGAGTTCTAGTAAAAAACTCTGACAAAATAAGGGAAGTGTAGAAGC 4135

 42345735 TGAGTCTATGAGGGATGAGAGAAGCAATTTACCAAATTATCAGATCCAAAATCATCTCTG 42345794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4136 TGAGTCTATGAGGGATGAGAGAAGCAATTTACCAAATTATCAGATCCAAAATCATCTCTG 4195

 42345795 CACTGTAGATGATTTATAGCCCTGGAAGCTTAGAGGCTTGAGTCTCTTGCTGTATTTCAT 42345854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4196 CACTGTAGATGATTTATAGCCCTGGAAGCTTAGAGGCTTGAGTCTCTTGCTGTATTTCAT 4255

 42345855 TTCAAATTAGTAATTTTTATCTAGGGCTTCCCTATGGCTTAAAGTGAAGGCCCTGGAATT 42345914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4256 TTCAAATTAGTAATTTTTATCTAGGGCTTCCCTATGGCTTAAAGTGAAGGCCCTGGAATT 4315

 42345915 TCTGAAGTGAAATTATCTGATGATTTTTATGTATGGTCATTCTGTAGTTATCCTGTAAGT 42345974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4316 TCTGAAGTGAAATTATCTGATGATTTTTATGTATGGTCATTCTGTAGTTATCCTGTAAGT 4375

 42345975 TTCATATTTGTAACAAGACTGGAATCCGAACAATAGAAAACTCTGTGGCAGTAAGCCAAA 42346034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4376 TTCATATTTGTAACAAGACTGGAATCCGAACAATAGAAAACTCTGTGGCAGTAAGCCAAA 4435

 42346035 ACCTGATGGACTTAGGAGAGTTACGTATGTGTGTTTCAGTGGTCCTCAAATTCAGCTGCC 42346094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     4436 ACCTGATGGACTTAGGAGAGTTACGTATGTGTGTTTCAGTGGTCCTCAAATTTAGCTGCC 4495

 42346095 TATTAGAATCACCTGGACTTTGAAAAAAAAAGAGCTTTCTTGAGGTATAACTGACAAATA 42346154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4496 TATTAGAATCACCTGGACTTTGAAAAAAAAAGAGCTTTCTTGAGGTATAACTGACAAATA 4555

 42346155 ATAAGACAAACATATTTCAGTATACAATTGGATGAGTTTTGACATGTTATATTCTTGTGA 42346214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4556 ATAAGACAAACATATTTCAGTATACAATTGGATGAGTTTTGACATGTTATATTCTTGTGA 4615

 42346215 AACCATCACCACAATCAAGCTATTCACCCCCCAAATTTTCGTGCC 42346259
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4616 AACCATCACCACAATCAAGCTATTCACCCCCCAAATTTTCGTGCC 4660

EXCISED REGION

 42347319 TTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTT 42347344
          ||||||||||||||||||||||||||
     4665 TTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTT 4690

Alignment time is 3.4681 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [42336259,42357318] =>     21060 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [       1,    2995] =>      2995 nucs 'mol-32-2853-003558_2995'

Score:        2939
Aligned:      2994        nucs
Identic:      2989 (100%) nucs =>        17 (100%)      2972 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [42343966,42343982] EXCISED REGION [42343984,42346959]
 second seq =>  [       1,      17] EXCISED REGION [      19,    2995]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [42343983,42343983]
 second seq =>         1 nucs [18,18]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [2822,2822]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [42343982,42343982] to [42343984,42343984]
 second seq =>         1 nucs [17,17] to [19,19]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 42343966 GTACAAAAATTTTAAAA 42343982
          |||||||||||||||||
        1 GTACAAAAATTTTAAAA 17

EXCISED REGION

 42343984 ACAAAGGAGACCATGTGTAAAACATTAGTTAAGCTCAGATATAAATCTAGTCTTTGACCA 42344043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       19 ACAAAGGAGACCATGTGTAAAACATTAGTTAAGCTCAGATATAAATCTAGTCTTTGACCA 78

 42344044 GTCCAGAGCTAATCAATATGCTTTTCTACTCTCTTTGAACTTTTGAGTTTTCTGGCAACA 42344103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       79 GTCCAGAGCTAATCAATATGCTTTTCTACTCTCTTTGAACTTTTGAGTTTTCTGGCAACA 138

 42344104 ACAAAAATCCCAAACCTCATCCAAAACCGTAGTCCAGACAGCCCAGTTTCTGCACTCCCT 42344163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      139 ACAAAAATCCCAAACCTCATCCAAAACCGTAGTCCAGACAGCCCAGTTTCTGCACTCCCT 198

 42344164 TCCTTGTGTCACATATTGTTGACAGAACTACTCCCGTTACCACATTCATTCCAGTGGTGA 42344223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      199 TCCTTGTGTCACATATTGTTGACAGAACTACTCCCGTTACCACATTCATTCCAGTGGTGA 258

 42344224 TTCAAATTCTTCTGCAGAAATGGACTTGAAAGACAGAAAACTGCTCCTGTAATCACTTAA 42344283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      259 TTCAAATTCTTCTGCAGAAATGGACTTGAAAGACAGAAAACTGCTCCTGTAATCACTTAA 318

 42344284 TAAGGAATCTTGGATGAGGAATACAGAGCTATGAATATGGATTTACTCTTAGCCTTTATG 42344343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      319 TAAGGAATCTTGGATGAGGAATACAGAGCTATGAATATGGATTTACTCTTAGCCTTTATG 378

 42344344 GATGCCTTTTTCTCAGTTATTTTCACTGAAAATCATGATGAACTGATTTAAATATCAAGG 42344403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      379 GATGCCTTTTTCTCAGTTATTTTCACTGAAAATCATGATGAACTGATTTAAATATCAAGG 438

 42344404 TAAACTGAGATGGAAAATTACCGATAATAAGAGTTTTCTGAAAATATAGATTGGCCTCTT 42344463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      439 TAAACTGAGATGGAAAATTACCGATAATAAGAGTTTTCTGAAAATATAGATTGGCCTCTT 498

 42344464 TAAAGCACATCGAGTTTGTTTTGTTTAAATTACAAATTCACATATATTTGAAATGTGTTT 42344523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      499 TAAAGCACATCGAGTTTGTTTTGTTTAAATTACAAATTCACATATATTTGAAATGTGTTT 558

 42344524 AAATGTGTCAGTTTTAGGCAAAACTAAACTATTTGATTCCTTTCCAAAAATCAGGAATTT 42344583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      559 AAATGTGTCAGTTTTAGGCAAAACTAAACTATTTGATTCCTTTCCAAAAATCAGGAATTT 618

 42344584 GCTTTGGAAAAAAACCATGCAGTTTGATTTACAAAGCAGAGCGGGGGGGAAGTAGTGGGT 42344643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      619 GCTTTGGAAAAAAACCATGCAGTTTGATTTACAAAGCAGAGCGGGGGGGAAGTAGTGGGT 678

 42344644 GAGAAAGACCCACCCAAAGGCTGCAGCCAGCTTCCCCAGGAAGATTCATAACCATGCCAC 42344703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      679 GAGAAAGACCCACCCAAAGGCTGCAGCCAGCTTCCCCAGGAAGATTCATAACCATGCCAC 738

 42344704 AATACTGTCCTTCAATTCGTTCCAACAGATTTTACTATAACTCTAAATCATTAGAAGCAA 42344763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      739 AATACTGTCCTTCAATTCGTTCCAACAGATTTTACTATAACTCTAAATCATTAGAAGCAA 798

 42344764 CTGCTGCTATGACTAGTGCTATCTTTGCCTCAAAAAGAGGAAAAATCAGGACATACAATA 42344823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      799 CTGCTGCTATGACTAGTGCTATCTTTGCCTCAAAAAGAGGAAAAATCAGGACATACAATA 858

 42344824 TAATCCCCTCAGGATCTAGGAGAGAAATCAGCCCATTTGTCATAAGAACTGAAAACCTCA 42344883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      859 TAATCCCCTCAGGATCTAGGAGAGAAATCAGCCCATTTGTCATAAGAACTGAAAACCTCA 918

 42344884 GCTAAATAGTATATGAAACATTGGTATTTCATACCTTGACATTACATATTTTTGAAAATA 42344943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      919 GCTAAATAGTATATGAAACATTGGTATTTCATACCTTGACATTACATATTTTTGAAAATA 978

 42344944 AAGTAAGCATACACACAAGAAGTGGCTAGATGCAGCAGTTATAAAGTGGCTTAAGTTGGG 42345003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      979 AAGTAAGCATACACACAAGAAGTGGCTAGATGCAGCAGTTATAAAGTGGCTTAAGTTGGG 1038

 42345004 TTAACTAAATATAACCTAGAAAAACCATCTTATCTATTGCAAATTATTTCCAGAAAAAGG 42345063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1039 TTAACTAAATATAACCTAGAAAAACCATCTTATCTATTGCAAATTATTTCCAGAAAAAGG 1098

 42345064 TAAGAAAAATCCAACCAACACTTTTTAAACATCCTGAGCTATTCACAGCAAGTGAATCTT 42345123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1099 TAAGAAAAATCCAACCAACACTTTTTAAACATCCTGAGCTATTCACAGCAAGTGAATCTT 1158

 42345124 TACCCTTACCAGATGTATAAACATTTACATAAGGCAGGAGGTTCAACACTTGGAGAGTGT 42345183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1159 TACCCTTACCAGATGTATAAACATTTACATAAGGCAGGAGGTTCAACACTTGGAGAGTGT 1218

 42345184 AATCAAGGCAGTAGTAACGCAGTGCTCCTCTCTTTGACTTGAATGACTTCCTCCCCATTA 42345243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1219 AATCAAGGCAGTAGTAACGCAGTGCTCCTCTCTTTGACTTGAATGACTTCCTCCCCATTA 1278

 42345244 GGGTCATTATTGTTTTGCAGTGTCCCAGGGATGAAAGGACTTTGAAAGGTCATGTGTCTT 42345303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1279 GGGTCATTATTGTTTTGCAGTGTCCCAGGGATGAAAGGACTTTGAAAGGTCATGTGTCTT 1338

 42345304 GTGACCCAACTAGCAGCATCAGCATCACTGGGGAGAAACTCAAGCAGAAGCTTGAGTCTA 42345363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1339 GTGACCCAACTAGCAGCATCAGCATCACTGGGGAGAAACTCAAGCAGAAGCTTGAGTCTA 1398

 42345364 CTCCACTCTTGCTGACACCAAATCTGCATTTTTACAGGATTCTTGGGTGAGTCACACACA 42345423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1399 CTCCACTCTTGCTGACACCAAATCTGCATTTTTACAGGATTCTTGGGTGAGTCACACACA 1458

 42345424 TATTCAAGGTTAAAATATGCCACCCTAGGTCTTTCTCCTGCTTCTGAGCAAAACTGGGCA 42345483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1459 TATTCAAGGTTAAAATATGCCACCCTAGGTCTTTCTCCTGCTTCTGAGCAAAACTGGGCA 1518

 42345484 CAAGGGACAAACTAGTTTCCTTCAGCCACTTTCAAATCCTTTATAGAGTGTACTGTGTGA 42345543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1519 CAAGGGACAAACTAGTTTCCTTCAGCCACTTTCAAATCCTTTATAGAGTGTACTGTGTGA 1578

 42345544 GTCACTGAGAGGAAAGAGGAAATAATACTTATTTAGGGAAGTCTTGCATAACTTAACAAA 42345603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1579 GTCACTGAGAGGAAAGAGGAAATAATACTTATTTAGGGAAGTCTTGCATAACTTAACAAA 1638

 42345604 GTTAGTAACTTCTTCAATACACTCAAGTACCTATTTTTGGAAGCCCTACAGGTTAGGTCA 42345663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1639 GTTAGTAACTTCTTCAATACACTCAAGTACCTATTTTTGGAAGCCCTACAGGTTAGGTCA 1698

 42345664 AAGTAAAGAGAAGCAAAAAATGGAGTGAGTTCTAGTAAAAAACTCTGACAAAATAAGGGA 42345723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1699 AAGTAAAGAGAAGCAAAAAATGGAGTGAGTTCTAGTAAAAAACTCTGACAAAATAAGGGA 1758

 42345724 AGTGTAGAAGCTGAGTCTATGAGGGATGAGAGAAGCAATTTACCAAATTATCAGATCCAA 42345783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1759 AGTGTAGAAGCTGAGTCTATGAGGGATGAGAGAAGCAATTTACCAAATTATCAGATCCAA 1818

 42345784 AATCATCTCTGCACTGTAGATGATTTATAGCCCTGGAAGCTTAGAGGCTTGAGTCTCTTG 42345843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1819 AATCATCTCTGCACTGTAGATGATTTATAGCCCTGGAAGCTTAGAGGCTTGAGTCTCTTG 1878

 42345844 CTGTATTTCATTTCAAATTAGTAATTTTTATCTAGGGCTTCCCTATGGCTTAAAGTGAAG 42345903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1879 CTGTATTTCATTTCAAATTAGTAATTTTTATCTAGGGCTTCCCTATGGCTTAAAGTGAAG 1938

 42345904 GCCCTGGAATTTCTGAAGTGAAATTATCTGATGATTTTTATGTATGGTCATTCTGTAGTT 42345963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1939 GCCCTGGAATTTCTGAAGTGAAATTATCTGATGATTTTTATGTATGGTCATTCTGTAGTT 1998

 42345964 ATCCTGTAAGTTTCATATTTGTAACAAGACTGGAATCCGAACAATAGAAAACTCTGTGGC 42346023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1999 ATCCTGTAAGTTTCATATTTGTAACAAGACTGGAATCCGAACAATAGAAAACTCTGTGGC 2058

 42346024 AGTAAGCCAAAACCTGATGGACTTAGGAGAGTTACGTATGTGTGTTTCAGTGGTCCTCAA 42346083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2059 AGTAAGCCAAAACCTGATGGACTTAGGAGAGTTACGTATGTGTGTTTCAGTGGTCCTCAA 2118

 42346084 ATTCAGCTGCCTATTAGAATCACCTGGACTTTGAAAAAAAAAGAGCTTTCTTGAGGTATA 42346143
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2119 ATTTAGCTGCCTATTAGAATCACCTGGACTTTGAAAAAAAAAGAGCTTTCTTGAGGTATA 2178

 42346144 ACTGACAAATAATAAGACAAACATATTTCAGTATACAATTGGATGAGTTTTGACATGTTA 42346203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2179 ACTGACAAATAATAAGACAAACATATTTCAGTATACAATTGGATGAGTTTTGACATGTTA 2238

 42346204 TATTCTTGTGAAACCATCACCACAATCAAGCTATTCACCCCCCAAATTTTCGTGCCCCTT 42346263
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2239 TATTCTTGTGAAACCATCGCCACAATCAAGCTATTCACCCCCCAAATTTTCGTGCCCCTT 2298

 42346264 TGTTGTCCCACCCTTCTTTCTGCAACCACTGATCTGCTTTCTATCACTATGGATTAATTT 42346323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2299 TGTTGTCCCACCCTTCTTTCTGCAACCACTGATCTGCTTTCTATCACTATGGATTAATTT 2358

 42346324 GTATTTTCTAGAAGCTTAAATAAGTGAAACCATATGGTGTGCATGTTTTGCAGGGAGAGG 42346383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2359 GTATTTTCTAGAAGCTTAAATAAGTGAAACCATATGGTGTGCATGTTTTGCAGGGAGAGG 2418

 42346384 GCAGGGGGAGCTGGTTTCTTTCACTCGGTGTAATTGTTCTGAGAGTCATCCGTGTTTGCA 42346443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2419 GCAGGGGGAGCTGGTTTCTTTCACTCGGTGTAATTGTTCTGAGAGTCATCCGTGTTTGCA 2478

 42346444 TGTGTTAATAGTTTATTCTTTTTATCGGTAAGTAGTATCCCATTGTGTGGATGTACCACA 42346503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2479 TGTGTTAATAGTTTATTCTTTTTATCGGTAAGTAGTATCCCATTGTGTGGATGTACCACA 2538

 42346504 TGTTGTCTAACCATTCACAACTAAAGGATACTTGGGTTGTTTCTCATTTGGGGCAATTGA 42346563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2539 TGTTGTCTAACCATTCACAACTAAAGGATACTTGGGTTGTTTCTCATTTGGGGCAATTGA 2598

 42346564 AAATAAGCAGTATAAACTGCTATAAACAGTCATGTACAGATATAAGCATGTATGTTTCCA 42346623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2599 AAATAAGCAGTATAAACTGCTATAAACAGTCATGTACAGATATAAGCATGTATGTTTCCA 2658

 42346624 TTTTTCAAGGTAAATACCTAGAAGTGGGTATGGTAAGTGTATGTTTAACTTGAAAAGAAA 42346683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2659 TTTTTCAAGGTAAATACCTAGAAGTGGGTATGGTAAGTGTATGTTTAACTTGAAAAGAAA 2718

 42346684 CTACCAAAATGTTTCCAAAGTGGTTGTACCATTTTGCTTACCTACCAGAAATGTGTAAGA 42346743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2719 CTACCAAAATGTTTCCAAAGTGGTTGTACCATTTTGCTTACCTACCAGAAATGTGTAAGA 2778

 42346744 GTTCTAGTTACTCCACATACTTCCTAGCAGTTGATATTCTCAG-TTTTTTTTTTTATTTT 42346802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
     2779 GTTCTAGTTACTCCACATACTTCCTAGCAGTTGATATTCTCAGTTTTTTTTTTTTATTTT 2838

 42346803 AACCGTTCTAATAGCTGTGTAATGGTATTCCATTACAGTACTAATTTAAATTTCCCTAAT 42346862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|
     2839 AACCGTTCTAATAGCTGTGTAATGGTATTCCATTACGGTACTAATTTAAATTTCCCTAGT 2898

 42346863 AACTACTGAGGTTGAAAAAATCTTTCATGGGCATATTTGCCATCCTTGTATCTTCTCTGG 42346922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2899 AACTACTGAGGTTGAAAAAATCTTTCATGGGCATATTTGCCATCCTTGTATCTTCTCTGG 2958

 42346923 TGACGAATCTTTCATGCCTTCTGCTTATATTTTAACC 42346959
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2959 TGACGAATCTTTCATGCCTTCTGCTTATATTTTAACC 2995

Alignment time is 2.20787 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [42336259,42357318] =>     21060 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [       1,    5278] =>      5278 nucs 'mol-32-29be-044528_5278'

Score:        5191
Aligned:      5268        nucs
Identic:      5261 (100%) nucs =>      3601 (100%)      1660 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [42342652,42346259] EXCISED REGION [42347319,42348978]
 second seq =>  [       7,    3614] EXCISED REGION [    3619,    5278]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1059 nucs [42346260,42347318]
 second seq =>         4 nucs [3615,3618]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [3615,3615] to [3619,3619]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 42342652 TTTTTTTTTTTTGTTTTTTGGTTTTTTTATGTTTGTTTGTTTGCTTTTGGAGACACGGTC 42342711
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
        7 TTTTTTTTTTTTGTTTTTTGGTTTTTTTATGTTTGTTTGTTTGTTTTTGGAGACACGGTC 66

 42342712 TCCCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCTTAATTACTGCAGCCTCAATCTCCTGGG 42342771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       67 TCCCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCTTAATTACTGCAGCCTCAATCTCCTGGG 126

 42342772 CTCAAGTGACCCTCCCACCTCAGCCTCCTGAATAGCTGGGACCACAGGTGCAAGCCACAG 42342831
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      127 CTCAAGTGACCCTCCCACTTCAGCCTCCTGAATAGCTGGGACCACAGGTGCAAGCCACAG 186

 42342832 TGCTCAGCTAATTAAAAAAAATTTTTTTTTCAGAGATGGGGTCTCACTATGTTGTCCAGG 42342891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      187 TGCTCAGCTAATTAAAAAAAATTTTTTTTTCAGAGATGGGGTCTCACTATGTTGTCCAGG 246

 42342892 CTGGTCTCAAACTCCTAGGCTCAAGCAGTCCTCCCGTTTCAGCCTCAAAAAGTGCTGGGA 42342951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      247 CTGGTCTCAAACTCCTAGGCTCAAGCAGTCCTCCCGTTTCAGCCTCAAAAAGTGCTGGGA 306

 42342952 TTACAGGTGTGAGCCATCGCACTCCACCTTCTCTATAGTTACTGAGTTTGCGTGTTACAC 42343011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      307 TTACAGGTGTGAGCCATCGCACTCCACCTTCTCTATAGTTACTGAGTTTGCGTGTTACAC 366

 42343012 TGAGTTTACATCTTACATTTCTAGCCATATCAGAAACGACCTCTGCACCTCTCTTTCCCA 42343071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      367 TGAGTTTACATCTTACATTTCTAGCCATATCAGAAACGACCTCTGCACCTCTCTTTCCCA 426

 42343072 ATTTGAGATTTCTAATAGAAAGAATCTTGTTCACCCAGCTTGGGACTCATTGAGTTATGA 42343131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      427 ATTTGAGATTTCTAATAGAAAGAATCTTGTTCACCCAGCTTGGGACTCATTGAGTTATGA 486

 42343132 CCAGTGGGATAGATTTTAGAAGATAAACATGTCTATAGGGACTTACCGTGTGAATTAGTG 42343191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      487 CCAGTGGGATAGATTTTAGAAGATAAACATGTCTATAGGGACTTACCGTGTGAATTAGTG 546

 42343192 GGGGAGCCGCTTACCAGGCAGAGGGGTCTGCTGTAAAGTGATACTGTGACTTTAAATTGA 42343251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      547 GGGGAGCCGCTTACCAGGCAGAGGGGTCTGCTGTAAAGTGATACTGTGACTTTAAATTGA 606

 42343252 AAGTAAGCTTCTAGAAGAGTTGAAGAGGAGTGGATTATTGTTGAATGGATGTATAACTAA 42343311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      607 AAGTAAGCTTCTAGAAGAGTTGAAGAGGAGTGGATTATTGTTGAATGGATGTATAACTAA 666

 42343312 TGAAGCTTTAAAGGAAGTTTATTAGAAAGTCCATGTCCTTGTCTCTTTCCCAAACTCCTT 42343371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      667 TGAAGCTTTAAAGGAAGTTTATTAGAAAGTCCATGTCCTTGTCTCTTTCCCAAACTCCTT 726

 42343372 TAGTTCCCAAGTCCTGAAAGAATCTATGGATAAGGGAAGCAGAATACTATAGTGGTTAAG 42343431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      727 TAGTTCCCAAGTCCTGAAAGAATCTATGGATAAGGGAAGCAGAATACTATAGTGGTTAAG 786

 42343432 AGCACATGCTCGAGGTTAAACTGTCTGTATTTTGGATCCTGGCCTTGAGGACTTGGGCAA 42343491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      787 AGCACATGCTCGAGGTTAAACTGTCTGTATTTTGGATCCTGGCCTTGAGGACTTGGGCAA 846

 42343492 GTTACGTGACCTGCCTGAGCCTCAGTTTCCTCACCTGTAATATGGGTATCACGAGGAATA 42343551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      847 GTTACGTGACCTGCCTGAGCCTCAGTTTCCTCACCTGTAATATGGGTATCACGAGGAATA 906

 42343552 AATAAGGTAATATGTGTAAAGTGCTTGGCACAATGCTCTTGATAATGTTAGCAACATAAT 42343611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      907 AATAAGGTAATATGTGTAAAGTGCTTGGCACAATGCTCTTGATAATGTTAGCAACATAAT 966

 42343612 TTTGTAATGAAAATTAACTGATGGGGCTGAAATGTGCATCAGCAGATCCAAATATCCTTG 42343671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
      967 TTTGTAATGAAAATTAACTGATGGGGCTGAAATGTGCATCAGCAGATCCAAATATCCTCG 1026

 42343672 ATAAACTGGCCAAAAGAAAGATGAATTGGCAGAGAGGCAAGTGTTCATCTCAGTTCTCCA 42343731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1027 ATAAACTGGCCAAAAGAAAGATGAATTGGCAGAGAGGCAAGTGTTCATCTCAGTTCTCCA 1086

 42343732 GATATCCCTGCAAATGTGGCCTCTGGAGTAGAAGATTTAGGGAGAAAAATAAGCCATGAA 42343791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1087 GATATCCCTGCAAATGTGGCCTCTGGAGTAGAAGATTTAGGGAGAAAAATAAGCCATGAA 1146

 42343792 GCTCTTCTGGCACCAACATGAACTTCAGGGATCATGGGACATTTGGGCCAGTAACATTCC 42343851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1147 GCTCTTCTGGCACCAACATGAACTTCAGGGATCATGGGACATTTGGGCCAGTAACATTCC 1206

 42343852 TCTTTGTTCCTAGAGATTTAATATCTACCTACCAACTAAATGGCCTTGATTTGGAGGAGA 42343911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1207 TCTTTGTTCCTAGAGATTTAATATCTACCTACCAACTAAATGGCCTTGATTTGGAGGAGA 1266

 42343912 GAAGACAAGAAGAGGAATTGCTTTCAGCTGGTCCTTGCCTTTAACTAACCAGGGGTACAA 42343971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1267 GAAGACAAGAAGAGGAATTGCTTTCAGCTGGTCCTTGCCTTTAACTAACCAGGGGTACAA 1326

 42343972 AAATTTTAAAATACAAAGGAGACCATGTGTAAAACATTAGTTAAGCTCAGATATAAATCT 42344031
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1327 AAATTTTAAAACACAAAGGAGACCATGTGTAAAACATTAGTTAAGCTCAGATATAAATCT 1386

 42344032 AGTCTTTGACCAGTCCAGAGCTAATCAATATGCTTTTCTACTCTCTTTGAACTTTTGAGT 42344091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1387 AGTCTTTGACCAGTCCAGAGCTAATCAATATGCTTTTCTACTCTCTTTGAACTTTTGAGT 1446

 42344092 TTTCTGGCAACAACAAAAATCCCAAACCTCATCCAAAACCGTAGTCCAGACAGCCCAGTT 42344151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1447 TTTCTGGCAACAACAAAAATCCCAAACCTCATCCAAAACCGTAGTCCAGACAGCCCAGTT 1506

 42344152 TCTGCACTCCCTTCCTTGTGTCACATATTGTTGACAGAACTACTCCCGTTACCACATTCA 42344211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1507 TCTGCACTCCCTTCCTTGTGTCACATATTGTTGACAGAACTACTCCCGTTACCACATTCA 1566

 42344212 TTCCAGTGGTGATTCAAATTCTTCTGCAGAAATGGACTTGAAAGACAGAAAACTGCTCCT 42344271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1567 TTCCAGTGGTGATTCAAATTCTTCTGCAGAAATGGACTTGAAAGACAGAAAACTGCTCCT 1626

 42344272 GTAATCACTTAATAAGGAATCTTGGATGAGGAATACAGAGCTATGAATATGGATTTACTC 42344331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1627 GTAATCACTTAATAAGGAATCTTGGATGAGGAATACAGAGCTATGAATATGGATTTACTC 1686

 42344332 TTAGCCTTTATGGATGCCTTTTTCTCAGTTATTTTCACTGAAAATCATGATGAACTGATT 42344391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1687 TTAGCCTTTATGGATGCCTTTTTCTCAGTTATTTTCACTGAAAATCATGATGAACTGATT 1746

 42344392 TAAATATCAAGGTAAACTGAGATGGAAAATTACCGATAATAAGAGTTTTCTGAAAATATA 42344451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1747 TAAATATCAAGGTAAACTGAGATGGAAAATTACCGATAATAAGAGTTTTCTGAAAATATA 1806

 42344452 GATTGGCCTCTTTAAAGCACATCGAGTTTGTTTTGTTTAAATTACAAATTCACATATATT 42344511
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1807 GATTGGCCTCTTTAAAACACATCGAGTTTGTTTTGTTTAAATTACAAATTCACATATATT 1866

 42344512 TGAAATGTGTTTAAATGTGTCAGTTTTAGGCAAAACTAAACTATTTGATTCCTTTCCAAA 42344571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1867 TGAAATGTGTTTAAATGTGTCAGTTTTAGGCAAAACTAAACTATTTGATTCCTTTCCAAA 1926

 42344572 AATCAGGAATTTGCTTTGGAAAAAAACCATGCAGTTTGATTTACAAAGCAGAGCGGGGGG 42344631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1927 AATCAGGAATTTGCTTTGGAAAAAAACCATGCAGTTTGATTTACAAAGCAGAGCGGGGGG 1986

 42344632 GAAGTAGTGGGTGAGAAAGACCCACCCAAAGGCTGCAGCCAGCTTCCCCAGGAAGATTCA 42344691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1987 GAAGTAGTGGGTGAGAAAGACCCACCCAAAGGCTGCAGCCAGCTTCCCCAGGAAGATTCA 2046

 42344692 TAACCATGCCACAATACTGTCCTTCAATTCGTTCCAACAGATTTTACTATAACTCTAAAT 42344751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2047 TAACCATGCCACAATACTGTCCTTCAATTCGTTCCAACAGATTTTACTATAACTCTAAAT 2106

 42344752 CATTAGAAGCAACTGCTGCTATGACTAGTGCTATCTTTGCCTCAAAAAGAGGAAAAATCA 42344811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2107 CATTAGAAGCAACTGCTGCTATGACTAGTGCTATCTTTGCCTCAAAAAGAGGAAAAATCA 2166

 42344812 GGACATACAATATAATCCCCTCAGGATCTAGGAGAGAAATCAGCCCATTTGTCATAAGAA 42344871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2167 GGACATACAATATAATCCCCTCAGGATCTAGGAGAGAAATCAGCCCATTTGTCATAAGAA 2226

 42344872 CTGAAAACCTCAGCTAAATAGTATATGAAACATTGGTATTTCATACCTTGACATTACATA 42344931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2227 CTGAAAACCTCAGCTAAATAGTATATGAAACATTGGTATTTCATACCTTGACATTACATA 2286

 42344932 TTTTTGAAAATAAAGTAAGCATACACACAAGAAGTGGCTAGATGCAGCAGTTATAAAGTG 42344991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2287 TTTTTGAAAATAAAGTAAGCATACACACAAGAAGTGGCTAGATGCAGCAGTTATAAAGTG 2346

 42344992 GCTTAAGTTGGGTTAACTAAATATAACCTAGAAAAACCATCTTATCTATTGCAAATTATT 42345051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2347 GCTTAAGTTGGGTTAACTAAATATAACCTAGAAAAACCATCTTATCTATTGCAAATTATT 2406

 42345052 TCCAGAAAAAGGTAAGAAAAATCCAACCAACACTTTTTAAACATCCTGAGCTATTCACAG 42345111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2407 TCCAGAAAAAGGTAAGAAAAATCCAACCAACACTTTTTAAACATCCTGAGCTATTCACAG 2466

 42345112 CAAGTGAATCTTTACCCTTACCAGATGTATAAACATTTACATAAGGCAGGAGGTTCAACA 42345171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2467 CAAGTGAATCTTTACCCTTACCAGATGTATAAACATTTACATAAGGCAGGAGGTTCAACA 2526

 42345172 CTTGGAGAGTGTAATCAAGGCAGTAGTAACGCAGTGCTCCTCTCTTTGACTTGAATGACT 42345231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2527 CTTGGAGAGTGTAATCAAGGCAGTAGTAACGCAGTGCTCCTCTCTTTGACTTGAATGACT 2586

 42345232 TCCTCCCCATTAGGGTCATTATTGTTTTGCAGTGTCCCAGGGATGAAAGGACTTTGAAAG 42345291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2587 TCCTCCCCATTAGGGTCATTATTGTTTTGCAGTGTCCCAGGGATGAAAGGACTTTGAAAG 2646

 42345292 GTCATGTGTCTTGTGACCCAACTAGCAGCATCAGCATCACTGGGGAGAAACTCAAGCAGA 42345351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2647 GTCATGTGTCTTGTGACCCAACTAGCAGCATCAGCATCACTGGGGAGAAACTCAAGCAGA 2706

 42345352 AGCTTGAGTCTACTCCACTCTTGCTGACACCAAATCTGCATTTTTACAGGATTCTTGGGT 42345411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2707 AGCTTGAGTCTACTCCACTCTTGCTGACACCAAATCTGCATTTTTACAGGATTCTTGGGT 2766

 42345412 GAGTCACACACATATTCAAGGTTAAAATATGCCACCCTAGGTCTTTCTCCTGCTTCTGAG 42345471
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2767 GAGTCACAGACATATTCAAGGTTAAAATATGCCACCCTAGGTCTTTCTCCTGCTTCTGAG 2826

 42345472 CAAAACTGGGCACAAGGGACAAACTAGTTTCCTTCAGCCACTTTCAAATCCTTTATAGAG 42345531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2827 CAAAACTGGGCACAAGGGACAAACTAGTTTCCTTCAGCCACTTTCAAATCCTTTATAGAG 2886

 42345532 TGTACTGTGTGAGTCACTGAGAGGAAAGAGGAAATAATACTTATTTAGGGAAGTCTTGCA 42345591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2887 TGTACTGTGTGAGTCACTGAGAGGAAAGAGGAAATAATACTTATTTAGGGAAGTCTTGCA 2946

 42345592 TAACTTAACAAAGTTAGTAACTTCTTCAATACACTCAAGTACCTATTTTTGGAAGCCCTA 42345651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2947 TAACTTAACAAAGTTAGTAACTTCTTCAATACACTCAAGTACCTATTTTTGGAAGCCCTA 3006

 42345652 CAGGTTAGGTCAAAGTAAAGAGAAGCAAAAAATGGAGTGAGTTCTAGTAAAAAACTCTGA 42345711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3007 CAGGTTAGGTCAAAGTAAAGAGAAGCAAAAAATGGAGTGAGTTCTAGTAAAAAACTCTGA 3066

 42345712 CAAAATAAGGGAAGTGTAGAAGCTGAGTCTATGAGGGATGAGAGAAGCAATTTACCAAAT 42345771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3067 CAAAATAAGGGAAGTGTAGAAGCTGAGTCTATGAGGGATGAGAGAAGCAATTTACCAAAT 3126

 42345772 TATCAGATCCAAAATCATCTCTGCACTGTAGATGATTTATAGCCCTGGAAGCTTAGAGGC 42345831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3127 TATCAGATCCAAAATCATCTCTGCACTGTAGATGATTTATAGCCCTGGAAGCTTAGAGGC 3186

 42345832 TTGAGTCTCTTGCTGTATTTCATTTCAAATTAGTAATTTTTATCTAGGGCTTCCCTATGG 42345891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3187 TTGAGTCTCTTGCTGTATTTCATTTCAAATTAGTAATTTTTATCTAGGGCTTCCCTATGG 3246

 42345892 CTTAAAGTGAAGGCCCTGGAATTTCTGAAGTGAAATTATCTGATGATTTTTATGTATGGT 42345951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3247 CTTAAAGTGAAGGCCCTGGAATTTCTGAAGTGAAATTATCTGATGATTTTTATGTATGGT 3306

 42345952 CATTCTGTAGTTATCCTGTAAGTTTCATATTTGTAACAAGACTGGAATCCGAACAATAGA 42346011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3307 CATTCTGTAGTTATCCTGTAAGTTTCATATTTGTAACAAGACTGGAATCCGAACAATAGA 3366

 42346012 AAACTCTGTGGCAGTAAGCCAAAACCTGATGGACTTAGGAGAGTTACGTATGTGTGTTTC 42346071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3367 AAACTCTGTGGCAGTAAGCCAAAACCTGATGGACTTAGGAGAGTTACGTATGTGTGTTTC 3426

 42346072 AGTGGTCCTCAAATTCAGCTGCCTATTAGAATCACCTGGACTTTGAAAAAAAAAGAGCTT 42346131
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3427 AGTGGTCCTCAAATTTAGCTGCCTATTAGAATCACCTGGACTTTGAAAAAAAAAGAGCTT 3486

 42346132 TCTTGAGGTATAACTGACAAATAATAAGACAAACATATTTCAGTATACAATTGGATGAGT 42346191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3487 TCTTGAGGTATAACTGACAAATAATAAGACAAACATATTTCAGTATACAATTGGATGAGT 3546

 42346192 TTTGACATGTTATATTCTTGTGAAACCATCACCACAATCAAGCTATTCACCCCCCAAATT 42346251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3547 TTTGACATGTTATATTCTTGTGAAACCATCACCACAATCAAGCTATTCACCCCCCAAATT 3606

 42346252 TTCGTGCC 42346259
          ||||||||
     3607 TTCGTGCC 3614

EXCISED REGION

 42347319 TTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGCTCTCAAACTCCTGA 42347378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3619 TTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGCTCTCAAACTCCTGA 3678

 42347379 CCTCAGGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACC 42347438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3679 CCTCAGGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACC 3738

 42347439 ATGCCCAGCGTATTAATTTTCTTGCATGGATGGTGCGTTTGGTGATCTGAGAAATCTTTA 42347498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3739 ATGCCCAGCGTATTAATTTTCTTGCATGGATGGTGCGTTTGGTGATCTGAGAAATCTTTA 3798

 42347499 CCTAACCCAAGGTCACAGAGATTTTCTCCTGTTTGCTTCCAAAATTTTTATACGTTTAGA 42347558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3799 CCTAACCCAAGGTCACAGAGATTTTCTCCTGTTTGCTTCCAAAATTTTTATACGTTTAGA 3858

 42347559 TTTTATATTTAAGTCTATTTTGAGTTAATTTTTGTATATAATGCAAAGTTTAGAATGATG 42347618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3859 TTTTATATTTAAGTCTATTTTGAGTTAATTTTTGTATATAATGCAAAGTTTAGAATGATG 3918

 42347619 TTTAGTTTTTTGTCTATAATCTATGAATATCCAATAGTTCTAGCACCATTTATTGAAAAG 42347678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3919 TTTAGTTTTTTGTCTATAATCTATGAATATCCAATAGTTCTAGCACCATTTATTGAAAAG 3978

 42347679 ACTGATCTTTATCTACTGAAGTGTCTTTGCACTTTTGTTGAAAGTCAATTGACAATTGAC 42347738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3979 ACTGATCTTTATCTACTGAAGTGTCTTTGCACTTTTGTTGAAAGTCAATTGACAATTGAC 4038

 42347739 CATATATTTGTGGGTCTATTCTGGATTCTCTATTCTGTTACATTGATCTATTTTTCTATC 42347798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4039 CATATATTTGTGGGTCTATTCTGGATTCTCTATTCTGTTACATTGATCTATTTTTCTATC 4098

 42347799 TCAATACAAATATCAAATTGGGTATTTGTATTAAGACAAATATAATTTGTCTGGGTATTT 42347858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4099 TCAATACAAATATCAAATTGGGTATTTGTATTAAGACAAATATAATTTGTCTGGGTATTT 4158

 42347859 GTCAAGACAAATAAAAATTGTCTTGATTACTGTAGCTTTATTGCAAGTCTTGAAATCTAA 42347918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4159 GTCAAGACAAATAAAAATTGTCTTGATTACTGTAGCTTTATTGCAAGTCTTGAAATCTAA 4218

 42347919 CTTTATTCTTTTTCTAAGAAAAATATGAATTCTAGATTAAGCTTGAATTTTAGAATAAGT 42347978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4219 CTTTATTCTTTTTCTAAGAAAAATATGAATTCTAGATTAAGCTTGAATTTTAGAATAAGT 4278

 42347979 TTGCCAGTTTCTGAGAGGGGAAAGCCTACTGGAATTTTGATGAGGATTGCATTGAATCTA 42348038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4279 TTGCCAGTTTCTGAGAGGGGAAAGCCTACTGGAATTTTGATGAGGATTGCATTGAATCTA 4338

 42348039 CAGATCTATTAGGGGAAAACTGACATCTTAACAATATTGAGTCTTTCAATCCATGAGCAC 42348098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4339 CAGATCTATTAGGGGAAAACTGACATCTTAACAATATTGAGTCTTTCAATCCATGAGCAC 4398

 42348099 AAAGTCTTTTTTCATTTTTCTCAGCAACGTTTTCTTAGTTTACAGATCTTACAGCTCTTT 42348158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4399 AAAGTCTTTTTTCATTTTTCTCAGCAACGTTTTCTTAGTTTACAGATCTTACAGCTCTTT 4458

 42348159 TGTAAGGTTTTTATCTAAATATTTAATTATTTTGTACTATCATAAGTGTTATTATTTATA 42348218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4459 TGTAAGGTTTTTATCTAAATATTTAATTATTTTGTACTATCATAAGTGTTATTATTTATA 4518

 42348219 TAATTTTAATTTCCAAGTATTTATTGAAACCATTTAGAAACAGTTGATTTTTTATATTGA 42348278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4519 TAATTTTAATTTCCAAGTATTTATTGAAACCATTTAGAAACAGTTGATTTTTTATATTGA 4578

 42348279 TCTTTTATCCTGCAGGCTTGTTAAACTCATTTATTAGTTCTGTAGCTTTTTTGTAGAGTC 42348338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4579 TCTTTTATCCTGCAGGCTTGTTAAACTCATTTATTAGTTCTGTAGCTTTTTTGTAGAGTC 4638

 42348339 CATCAAATTTTCTACATAGAGAGTCATGTTATCTGAGAATAAAAACAGTTTTGCTTCTTC 42348398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4639 CATCAAATTTTCTACATAGAGAGTCATGTTATCTGAGAATAAAAACAGTTTTGCTTCTTC 4698

 42348399 TGCTCCAATCTTAATTCATTTTATATTTTTTTCTTGACTTATTGCACTGGCTACAACCAG 42348458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4699 TGCTCCAATCTTAATTCATTTTATATTTTTTTCTTGACTTATTGCACTGGCTACAACCAG 4758

 42348459 TACAATGCTGAATAAATATAGTGACAGTGGATAGCCTTTCTTTGTTCATGGTCTTAAAGG 42348518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4759 TACAATGCTGAATAAATATAGTGACAGTGGATAGCCTTTCTTTGTTCATGGTCTTAAAGG 4818

 42348519 AAAAGCATTCAGTCTTTCCCATTAAGTATGATGTTAGCTTTAGGTTTTTCATAGATGCCC 42348578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4819 AAAAGCATTCAGTCTTTCCCATTAAGTATGATGTTAGCTTTAGGTTTTTCATAGATGCCC 4878

 42348579 TTTCTCAAATTAAAGAAGTTTCCTACTTTACTGAGAGTTGCTTTATTTAAAATCAGAAAT 42348638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4879 TTTCTCAAATTAAAGAAGTTTCCTACTTTACTGAGAGTTGCTTTATTTAAAATCAGAAAT 4938

 42348639 GAGGCCAGTCACAGTGACTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAGGGTGGGAA 42348698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4939 GAGGCCAGTCACAGTGACTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAGGGTGGGAA 4998

 42348699 GATTACCTGAAGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGACAACATGGTAAAACCCTGTCTGTA 42348758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4999 GATTACCTGAAGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGACAACATGGTAAAACCCTGTCTGTA 5058

 42348759 CTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAGTGGTGCATGCCTGTAGTCCCAGTTATTTGGG 42348818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5059 CTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAGTGGTGCATGCCTGTAGTCCCAGTTATTTGGG 5118

 42348819 AGGCCGATACAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGACTA 42348878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5119 AGGCCGATACAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGACTA 5178

 42348879 CACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAATGAGAAAAAAAAAAAGAGAGAGAGAGAGAA 42348938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5179 CACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAATGAGAAAAAAAAAAAGAGAGAGAGAGAGAA 5238

 42348939 GGAAAGAGAGAAGGAAAGAAAGACAGAAAGACCAAAAGAA 42348978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5239 GGAAAGAGAGAAGGAAAGAAAGACAGAAAGACCAAAAGAA 5278

Alignment time is 3.84527 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [42336259,42357318] =>     21060 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [       1,    4012] =>      4012 nucs 'mol-32-2b3f-052845_4012'

Score:        3956
Aligned:      4011        nucs
Identic:      4006 (100%) nucs =>       256 (100%)      3750 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [42342723,42342978] EXCISED REGION [42342980,42346734]
 second seq =>  [       1,     256] EXCISED REGION [     258,    4012]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [42342979,42342979]
 second seq =>         1 nucs [257,257]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [42342978,42342978] to [42342979,42342979]
 second seq =>         2 nucs [257,258] to [258,259]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 42342723 CCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCTTAATTACTGCAGCCTCAATCTCCTGGGCTCAAGTGACC 42342782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCTTAATTACTGCAGCCTCAATCTCCTGGGCTCAAGTGACC 60

 42342783 CTCCCACCTCAGCCTCCTGAATAGCTGGGACCACAGGTGCAAGCCACAGTGCTCAGCTAA 42342842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTCCCACCTCAGCCTCCTGAATAGCTGGGACCACAGGTGCAAGCCACAGTGCTCAGCTAA 120

 42342843 TTAAAAAAAATTTTTTTTTCAGAGATGGGGTCTCACTATGTTGTCCAGGCTGGTCTCAAA 42342902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTAAAAAAAATTTTTTTTTCAGAGATGGGGTCTCACTATGTTGTCCAGGCTGGTCTCAAA 180

 42342903 CTCCTAGGCTCAAGCAGTCCTCCCGTTTCAGCCTCAAAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTG 42342962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTCCTAGGCTCAAGCAGTCCTCCCGTTTCAGCCTCAAAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTG 240

 42342963 AGCCATCGCACTCCAC 42342978
          ||||||||||||||||
      241 AGCCATCGCACTCCAC 256

EXCISED REGION

 42342980 TTCTCTATAGTTACTGAGTTTGCGTGTTACACTGAGTTTACATCTTACATTTCTAGCCAT 42343039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      258 TTCTCTATAGTTACTGAGTTTGCGTGTTACACTGAGTTTACATCTTACATTTCTAGCCAT 317

 42343040 ATCAGAAACGACCTCTGCACCTCTCTTTCCCAATTTGAGATTTCTAATAGAAAGAATCTT 42343099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      318 ATCAGAAACGACCTCTGCACCTCTCTTTCCCAATTTGAGATTTCTAATAGAAAGAATCTT 377

 42343100 GTTCACCCAGCTTGGGACTCATTGAGTTATGACCAGTGGGATAGATTTTAGAAGATAAAC 42343159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      378 GTTCACCCAGCTTGGGACTCATTGAGTTATGACCAGTGGGATAGATTTTAGAAGATAAAC 437

 42343160 ATGTCTATAGGGACTTACCGTGTGAATTAGTGGGGGAGCCGCTTACCAGGCAGAGGGGTC 42343219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      438 ATGTCTATAGGGACTTACCGTGTGAATTAGTGGGGGAGCCGCTTACCAGGCAGAGGGGTC 497

 42343220 TGCTGTAAAGTGATACTGTGACTTTAAATTGAAAGTAAGCTTCTAGAAGAGTTGAAGAGG 42343279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      498 TGCTGTAAAGTGATACTGTGACTTTAAATTGAAAGTAAGCTTCTAGAAGAGTTGAAGAGG 557

 42343280 AGTGGATTATTGTTGAATGGATGTATAACTAATGAAGCTTTAAAGGAAGTTTATTAGAAA 42343339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      558 AGTGGATTATTGTTGAATGGATGTATAACTAATGAAGCTTTAAAGGAAGTTTATTAGAAA 617

 42343340 GTCCATGTCCTTGTCTCTTTCCCAAACTCCTTTAGTTCCCAAGTCCTGAAAGAATCTATG 42343399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      618 GTCCATGTCCTTGTCTCTTTCCCAAACTCCTTTAGTTCCCAAGTCCTGAAAGAATCTATG 677

 42343400 GATAAGGGAAGCAGAATACTATAGTGGTTAAGAGCACATGCTCGAGGTTAAACTGTCTGT 42343459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      678 GATAAGGGAAGCAGAATACTATAGTGGTTAAGAGCACATGCTCGAGGTTAAACTGTCTGT 737

 42343460 ATTTTGGATCCTGGCCTTGAGGACTTGGGCAAGTTACGTGACCTGCCTGAGCCTCAGTTT 42343519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      738 ATTTTGGATCCTGGCCTTGAGGACTTGGGCAAGTTACGTGACCTGCCTGAGCCTCAGTTT 797

 42343520 CCTCACCTGTAATATGGGTATCACGAGGAATAAATAAGGTAATATGTGTAAAGTGCTTGG 42343579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      798 CCTCACCTGTAATATGGGTATCACGAGGAATAAATAAGGTAATATGTGTAAAGTGCTTGG 857

 42343580 CACAATGCTCTTGATAATGTTAGCAACATAATTTTGTAATGAAAATTAACTGATGGGGCT 42343639
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
      858 CACAATGCTCTTGATAATGTTAGCAACATAATTTTGTAATGAAAATTAACTGATGGGACT 917

 42343640 GAAATGTGCATCAGCAGATCCAAATATCCTTGATAAACTGGCCAAAAGAAAGATGAATTG 42343699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      918 GAAATGTGCATCAGCAGATCCAAATATCCTTGATAAACTGGCCAAAAGAAAGATGAATTG 977

 42343700 GCAGAGAGGCAAGTGTTCATCTCAGTTCTCCAGATATCCCTGCAAATGTGGCCTCTGGAG 42343759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      978 GCAGAGAGGCAAGTGTTCATCTCAGTTCTCCAGATATCCCTGCAAATGTGGCCTCTGGAG 1037

 42343760 TAGAAGATTTAGGGAGAAAAATAAGCCATGAAGCTCTTCTGGCACCAACATGAACTTCAG 42343819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1038 TAGAAGATTTAGGGAGAAAAATAAGCCATGAAGCTCTTCTGGCACCAACATGAACTTCAG 1097

 42343820 GGATCATGGGACATTTGGGCCAGTAACATTCCTCTTTGTTCCTAGAGATTTAATATCTAC 42343879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1098 GGATCATGGGACATTTGGGCCAGTAACATTCCTCTTTGTTCCTAGAGATTTAATATCTAC 1157

 42343880 CTACCAACTAAATGGCCTTGATTTGGAGGAGAGAAGACAAGAAGAGGAATTGCTTTCAGC 42343939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1158 CTACCAACTAAATGGCCTTGATTTGGAGGAGAGAAGACAAGAAGAGGAATTGCTTTCAGC 1217

 42343940 TGGTCCTTGCCTTTAACTAACCAGGGGTACAAAAATTTTAAAATACAAAGGAGACCATGT 42343999
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     1218 TGGTCCTTGCCTTTAACTAACCAGGGGTACAAAAATTTTAAAACACAAAGGAGACCATGT 1277

 42344000 GTAAAACATTAGTTAAGCTCAGATATAAATCTAGTCTTTGACCAGTCCAGAGCTAATCAA 42344059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1278 GTAAAACATTAGTTAAGCTCAGATATAAATCTAGTCTTTGACCAGTCCAGAGCTAATCAA 1337

 42344060 TATGCTTTTCTACTCTCTTTGAACTTTTGAGTTTTCTGGCAACAACAAAAATCCCAAACC 42344119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1338 TATGCTTTTCTACTCTCTTTGAACTTTTGAGTTTTCTGGCAACAACAAAAATCCCAAACC 1397

 42344120 TCATCCAAAACCGTAGTCCAGACAGCCCAGTTTCTGCACTCCCTTCCTTGTGTCACATAT 42344179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1398 TCATCCAAAACCGTAGTCCAGACAGCCCAGTTTCTGCACTCCCTTCCTTGTGTCACATAT 1457

 42344180 TGTTGACAGAACTACTCCCGTTACCACATTCATTCCAGTGGTGATTCAAATTCTTCTGCA 42344239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1458 TGTTGACAGAACTACTCCCGTTACCACATTCATTCCAGTGGTGATTCAAATTCTTCTGCA 1517

 42344240 GAAATGGACTTGAAAGACAGAAAACTGCTCCTGTAATCACTTAATAAGGAATCTTGGATG 42344299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1518 GAAATGGACTTGAAAGACAGAAAACTGCTCCTGTAATCACTTAATAAGGAATCTTGGATG 1577

 42344300 AGGAATACAGAGCTATGAATATGGATTTACTCTTAGCCTTTATGGATGCCTTTTTCTCAG 42344359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1578 AGGAATACAGAGCTATGAATATGGATTTACTCTTAGCCTTTATGGATGCCTTTTTCTCAG 1637

 42344360 TTATTTTCACTGAAAATCATGATGAACTGATTTAAATATCAAGGTAAACTGAGATGGAAA 42344419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1638 TTATTTTCACTGAAAATCATGATGAACTGATTTAAATATCAAGGTAAACTGAGATGGAAA 1697

 42344420 ATTACCGATAATAAGAGTTTTCTGAAAATATAGATTGGCCTCTTTAAAGCACATCGAGTT 42344479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1698 ATTACCGATAATAAGAGTTTTCTGAAAATATAGATTGGCCTCTTTAAAGCACATCGAGTT 1757

 42344480 TGTTTTGTTTAAATTACAAATTCACATATATTTGAAATGTGTTTAAATGTGTCAGTTTTA 42344539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1758 TGTTTTGTTTAAATTACAAATTCACATATATTTGAAATGTGTTTAAATGTGTCAGTTTTA 1817

 42344540 GGCAAAACTAAACTATTTGATTCCTTTCCAAAAATCAGGAATTTGCTTTGGAAAAAAACC 42344599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1818 GGCAAAACTAAACTATTTGATTCCTTTCCAAAAATCAGGAATTTGCTTTGGAAAAAAACC 1877

 42344600 ATGCAGTTTGATTTACAAAGCAGAGCGGGGGGGAAGTAGTGGGTGAGAAAGACCCACCCA 42344659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1878 ATGCAGTTTGATTTACAAAGCAGAGCGGGGGGGAAGTAGTGGGTGAGAAAGACCCACCCA 1937

 42344660 AAGGCTGCAGCCAGCTTCCCCAGGAAGATTCATAACCATGCCACAATACTGTCCTTCAAT 42344719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1938 AAGGCTGCAGCCAGCTTCCCCAGGAAGATTCATAACCATGCCACAATACTGTCCTTCAAT 1997

 42344720 TCGTTCCAACAGATTTTACTATAACTCTAAATCATTAGAAGCAACTGCTGCTATGACTAG 42344779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1998 TCGTTCCAACAGATTTTACTATAACTCTAAATCATTAGAAGCAACTGCTGCTATGACTAG 2057

 42344780 TGCTATCTTTGCCTCAAAAAGAGGAAAAATCAGGACATACAATATAATCCCCTCAGGATC 42344839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2058 TGCTATCTTTGCCTCAAAAAGAGGAAAAATCAGGACATACAATATAATCCCCTCAGGATC 2117

 42344840 TAGGAGAGAAATCAGCCCATTTGTCATAAGAACTGAAAACCTCAGCTAAATAGTATATGA 42344899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2118 TAGGAGAGAAATCAGCCCATTTGTCATAAGAACTGAAAACCTCAGCTAAATAGTATATGA 2177

 42344900 AACATTGGTATTTCATACCTTGACATTACATATTTTTGAAAATAAAGTAAGCATACACAC 42344959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2178 AACATTGGTATTTCATACCTTGACATTACATATTTTTGAAAATAAAGTAAGCATACACAC 2237

 42344960 AAGAAGTGGCTAGATGCAGCAGTTATAAAGTGGCTTAAGTTGGGTTAACTAAATATAACC 42345019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2238 AAGAAGTGGCTAGATGCAGCAGTTATAAAGTGGCTTAAGTTGGGTTAACTAAATATAACC 2297

 42345020 TAGAAAAACCATCTTATCTATTGCAAATTATTTCCAGAAAAAGGTAAGAAAAATCCAACC 42345079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2298 TAGAAAAACCATCTTATCTATTGCAAATTATTTCCAGAAAAAGGTAAGAAAAATCCAACC 2357

 42345080 AACACTTTTTAAACATCCTGAGCTATTCACAGCAAGTGAATCTTTACCCTTACCAGATGT 42345139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2358 AACACTTTTTAAACATCCTGAGCTATTCACAGCAAGTGAATCTTTACCCTTACCAGATGT 2417

 42345140 ATAAACATTTACATAAGGCAGGAGGTTCAACACTTGGAGAGTGTAATCAAGGCAGTAGTA 42345199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2418 ATAAACATTTACATAAGGCAGGAGGTTCAACACTTGGAGAGTGTAATCAAGGCAGTAGTA 2477

 42345200 ACGCAGTGCTCCTCTCTTTGACTTGAATGACTTCCTCCCCATTAGGGTCATTATTGTTTT 42345259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2478 ACGCAGTGCTCCTCTCTTTGACTTGAATGACTTCCTCCCCATTAGGGTCATTATTGTTTT 2537

 42345260 GCAGTGTCCCAGGGATGAAAGGACTTTGAAAGGTCATGTGTCTTGTGACCCAACTAGCAG 42345319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2538 GCAGTGTCCCAGGGATGAAAGGACTTTGAAAGGTCATGTGTCTTGTGACCCAACTAGCAG 2597

 42345320 CATCAGCATCACTGGGGAGAAACTCAAGCAGAAGCTTGAGTCTACTCCACTCTTGCTGAC 42345379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2598 CATCAGCATCACTGGGGAGAAACTCAAGCAGAAGCTTGAGTCTACTCCACTCTTGCTGAC 2657

 42345380 ACCAAATCTGCATTTTTACAGGATTCTTGGGTGAGTCACACACATATTCAAGGTTAAAAT 42345439
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     2658 ACCAAATCTGCATTTTTACAGGATTCTTGGGTGTGTCACACACATATTCAAGGTTAAAAT 2717

 42345440 ATGCCACCCTAGGTCTTTCTCCTGCTTCTGAGCAAAACTGGGCACAAGGGACAAACTAGT 42345499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2718 ATGCCACCCTAGGTCTTTCTCCTGCTTCTGAGCAAAACTGGGCACAAGGGACAAACTAGT 2777

 42345500 TTCCTTCAGCCACTTTCAAATCCTTTATAGAGTGTACTGTGTGAGTCACTGAGAGGAAAG 42345559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2778 TTCCTTCAGCCACTTTCAAATCCTTTATAGAGTGTACTGTGTGAGTCACTGAGAGGAAAG 2837

 42345560 AGGAAATAATACTTATTTAGGGAAGTCTTGCATAACTTAACAAAGTTAGTAACTTCTTCA 42345619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2838 AGGAAATAATACTTATTTAGGGAAGTCTTGCATAACTTAACAAAGTTAGTAACTTCTTCA 2897

 42345620 ATACACTCAAGTACCTATTTTTGGAAGCCCTACAGGTTAGGTCAAAGTAAAGAGAAGCAA 42345679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2898 ATACACTCAAGTACCTATTTTTGGAAGCCCTACAGGTTAGGTCAAAGTAAAGAGAAGCAA 2957

 42345680 AAAATGGAGTGAGTTCTAGTAAAAAACTCTGACAAAATAAGGGAAGTGTAGAAGCTGAGT 42345739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2958 AAAATGGAGTGAGTTCTAGTAAAAAACTCTGACAAAATAAGGGAAGTGTAGAAGCTGAGT 3017

 42345740 CTATGAGGGATGAGAGAAGCAATTTACCAAATTATCAGATCCAAAATCATCTCTGCACTG 42345799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3018 CTATGAGGGATGAGAGAAGCAATTTACCAAATTATCAGATCCAAAATCATCTCTGCACTG 3077

 42345800 TAGATGATTTATAGCCCTGGAAGCTTAGAGGCTTGAGTCTCTTGCTGTATTTCATTTCAA 42345859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3078 TAGATGATTTATAGCCCTGGAAGCTTAGAGGCTTGAGTCTCTTGCTGTATTTCATTTCAA 3137

 42345860 ATTAGTAATTTTTATCTAGGGCTTCCCTATGGCTTAAAGTGAAGGCCCTGGAATTTCTGA 42345919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3138 ATTAGTAATTTTTATCTAGGGCTTCCCTATGGCTTAAAGTGAAGGCCCTGGAATTTCTGA 3197

 42345920 AGTGAAATTATCTGATGATTTTTATGTATGGTCATTCTGTAGTTATCCTGTAAGTTTCAT 42345979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3198 AGTGAAATTATCTGATGATTTTTATGTATGGTCATTCTGTAGTTATCCTGTAAGTTTCAT 3257

 42345980 ATTTGTAACAAGACTGGAATCCGAACAATAGAAAACTCTGTGGCAGTAAGCCAAAACCTG 42346039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3258 ATTTGTAACAAGACTGGAATCCGAACAATAGAAAACTCTGTGGCAGTAAGCCAAAACCTG 3317

 42346040 ATGGACTTAGGAGAGTTACGTATGTGTGTTTCAGTGGTCCTCAAATTCAGCTGCCTATTA 42346099
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     3318 ATGGACTTAGGAGAGTTACGTATGTGTGTTTCAGTGGTCCTCAAATTTAGCTGCCTATTA 3377

 42346100 GAATCACCTGGACTTTGAAAAAAAAAGAGCTTTCTTGAGGTATAACTGACAAATAATAAG 42346159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3378 GAATCACCTGGACTTTGAAAAAAAAAGAGCTTTCTTGAGGTATAACTGACAAATAATAAG 3437

 42346160 ACAAACATATTTCAGTATACAATTGGATGAGTTTTGACATGTTATATTCTTGTGAAACCA 42346219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3438 ACAAACATATTTCAGTATACAATTGGATGAGTTTTGACATGTTATATTCTTGTGAAACCA 3497

 42346220 TCACCACAATCAAGCTATTCACCCCCCAAATTTTCGTGCCCCTTTGTTGTCCCACCCTTC 42346279
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3498 TCGCCACAATCAAGCTATTCACCCCCCAAATTTTCGTGCCCCTTTGTTGTCCCACCCTTC 3557

 42346280 TTTCTGCAACCACTGATCTGCTTTCTATCACTATGGATTAATTTGTATTTTCTAGAAGCT 42346339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3558 TTTCTGCAACCACTGATCTGCTTTCTATCACTATGGATTAATTTGTATTTTCTAGAAGCT 3617

 42346340 TAAATAAGTGAAACCATATGGTGTGCATGTTTTGCAGGGAGAGGGCAGGGGGAGCTGGTT 42346399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3618 TAAATAAGTGAAACCATATGGTGTGCATGTTTTGCAGGGAGAGGGCAGGGGGAGCTGGTT 3677

 42346400 TCTTTCACTCGGTGTAATTGTTCTGAGAGTCATCCGTGTTTGCATGTGTTAATAGTTTAT 42346459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3678 TCTTTCACTCGGTGTAATTGTTCTGAGAGTCATCCGTGTTTGCATGTGTTAATAGTTTAT 3737

 42346460 TCTTTTTATCGGTAAGTAGTATCCCATTGTGTGGATGTACCACATGTTGTCTAACCATTC 42346519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3738 TCTTTTTATCGGTAAGTAGTATCCCATTGTGTGGATGTACCACATGTTGTCTAACCATTC 3797

 42346520 ACAACTAAAGGATACTTGGGTTGTTTCTCATTTGGGGCAATTGAAAATAAGCAGTATAAA 42346579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3798 ACAACTAAAGGATACTTGGGTTGTTTCTCATTTGGGGCAATTGAAAATAAGCAGTATAAA 3857

 42346580 CTGCTATAAACAGTCATGTACAGATATAAGCATGTATGTTTCCATTTTTCAAGGTAAATA 42346639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3858 CTGCTATAAACAGTCATGTACAGATATAAGCATGTATGTTTCCATTTTTCAAGGTAAATA 3917

 42346640 CCTAGAAGTGGGTATGGTAAGTGTATGTTTAACTTGAAAAGAAACTACCAAAATGTTTCC 42346699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3918 CCTAGAAGTGGGTATGGTAAGTGTATGTTTAACTTGAAAAGAAACTACCAAAATGTTTCC 3977

 42346700 AAAGTGGTTGTACCATTTTGCTTACCTACCAGAAA 42346734
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3978 AAAGTGGTTGTACCATTTTGCTTACCTACCAGAAA 4012

Alignment time is 2.96379 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [42336259,42357318] =>     21060 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [       1,    8592] =>      8592 nucs 'mol-32-2fc2-132749_8592'

Score:        8464
Aligned:      8595        nucs
Identic:      8579 (100%) nucs =>      8495 (100%)        84 (100%)
Gaps:            7 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [42337749,42346259] EXCISED REGION [42347319,42347402]
 second seq =>  [       1,    8504] EXCISED REGION [    8509,    8592]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1059 nucs [42346260,42347318]
 second seq =>         4 nucs [8505,8508]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [8505,8505] to [8509,8509]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 42337749 ATTCTGCAGTAGCAGATATTTTGGGCAGCCCCCAGGCCCATTTCATCGGAGCCCTGTGAT 42337808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATTCTGCAGTAGCAGATATTTTGGGCAGCCCCCAGGCCCATTTCATCGGAGCCCTGTGAT 60

 42337809 CACTGGACGCAGATGAGTTAACAGTGCTGCTTGCCTGGCTCCCAGCATAGCACTGTAACA 42337868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CACTGGACGCAGATGAGTTAACAGTGCTGCTTGCCTGGCTCCCAGCATAGCACTGTAACA 120

 42337869 CCGGCCTGCCTTCCTTTCTCACAGGGATTGCAGCCTCCAGGCTGACTGCCAACATATCTT 42337928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCGGCCTGCCTTCCTTTCTCACAGGGATTGCAGCCTCCAGGCTGACTGCCAACATATCTT 180

 42337929 TCTTCCAAGATGCCAATGCTGTGCAAGGAGCCTCTGCACTCAGCACAAACCGAGTTAAAG 42337988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCTTCCAAGATGCCAATGCTGTGCAAGGAGCCTCTGCACTCAGCACAAACCGAGTTAAAG 240

 42337989 GAGCTCCTAAAGCCCCCTAGACATTTTGGTTACAGACCTGCAGTGTTAGCTGTGTTGCTG 42338048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GAGCTCCTAAAGCCCCCTAGACATTTTGGTTACAGACCTGCAGTGTTAGCTGTGTTGCTG 300

 42338049 CCCCGAGGGCTTGAGGCCAGAGCAGGGTCTGGGCCAGGAGGCCTTACTCGTCCTAGGGAA 42338108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCCCGAGGGCTTGAGGCCAGAGCAGGGTCTGGGCCAGGAGGCCTTACTCGTCCTAGGGAA 360

 42338109 ATAGAATCCCAGAGCCTTTTCAGTCTGGAGGCTTCACCTCACAACACACCCAACCAGCCC 42338168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATAGAATCCCAGAGCCTTTTCAGTCTGGAGGCTTCACCTCACAACACACCCAACCAGCCC 420

 42338169 CAGGCATCTCTTAGTTGCCACAGGACTCCTGGCAGAAGTTCCAGCAGGTCCCTCTTGACT 42338228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CAGGCATCTCTTAGTTGCCACAGGACTCCTGGCAGAAGTTCCAGCAGGTCCCTCTTGACT 480

 42338229 AGACCCCAGCTCATAAGAAGGACTCAAACCAAATCGCACTGCCTTTTGCCAAAACGGACT 42338288
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
      481 AGACCCCAGCTCATAAGAAGGACTCAAACCAAATCGCACTGCCTTTTGCCAAAACTGACT 540

 42338289 CAAACCAAATCAGCTATGCTTTTCATTTACGGTGTGCCTTTTCATTTAAAGCTGTGCCTT 42338348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CAAACCAAATCAGCTATGCTTTTCATTTACGGTGTGCCTTTTCATTTAAAGCTGTGCCTT 600

 42338349 TCATTTCATGTAAGGAATATACGTGCATCACTGGCGATCACCTAGGGCTGAGAGAGCAGC 42338408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCATTTCATGTAAGGAATATACGTGCATCACTGGCGATCACCTAGGGCTGAGAGAGCAGC 660

 42338409 CAATAAGCCTTGAAGTGGGGTAAGCCCGTATCATTTTCTCCATAAAATGGATAAGTTCGT 42338468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CAATAAGCCTTGAAGTGGGGTAAGCCCGTATCATTTTCTCCATAAAATGGATAAGTTCGT 720

 42338469 TCATGAGAAAGGCATTCGTATTTGTGCAAACCAGGCATGACAGAGAGCCCTATGTGGTTC 42338528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCATGAGAAAGGCATTCGTATTTGTGCAAACCAGGCATGACAGAGAGCCCTATGTGGTTC 780

 42338529 AGTGCAAGCAAAAAACACAGTAAAAGAAACAGCAGTCCTGCAGAAAAAAATGTAATTTAA 42338588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGTGCAAGCAAAAAACACAGTAAAAGAAACAGCAGTCCTGCAGAAAAAAATGTAATTTAA 840

 42338589 ATCCATTAAGATATTTACCCAGTCTCGAGGGGCGTGGTGGCTCACACCTGTAATACCAAC 42338648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATCCATTAAGATATTTACCCAGTCTCGAGGGGCGTGGTGGCTCACACCTGTAATACCAAC 900

 42338649 ACTTTGGGAGGCTGAAGTGGACGGATCACAAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCAAA 42338708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ACTTTGGGAGGCTGAAGTGGACGGATCACAAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCAAA 960

 42338709 TATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAATTACGCAAATTAGCTGGGCATGGTGGCGCTCAC 42338768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAATTACGCAAATTAGCTGGGCATGGTGGCGCTCAC 1020

 42338769 CTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCGGA 42338828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCGGA 1080

 42338829 GGTTGCAGTGAGCCGAAATCTCACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGACACT 42338888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GGTTGCAGTGAGCCGAAATCTCACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGACACT 1140

 42338889 GTCTCTCATATGTGTGTGTGTATATATAAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTA 42338948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GTCTCTCATATGTGTGTGTGTATATATAAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTA 1200

 42338949 TATATGTGTGTGTATATATATACGTATATATATGTGTATATATATATACATATCTATATA 42339008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TATATGTGTGTGTATATATATACGTATATATATGTGTATATATATATACATATCTATATA 1260

 42339009 TGTGTGTGTGTATATATATATATATATACATATATATATTTACCCAGTTTCAAGAGAAAA 42339068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGTGTGTGTGTATATATATATATATATACATATATATATTTACCCAGTTTCAAGAGAAAA 1320

 42339069 AAGTCAAAGGGGTAAGAGTATTCTTCATACACAGTCTAACATCTCTTTCTTCCACTCACA 42339128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AAGTCAAAGGGGTAAGAGTATTCTTCATACACAGTCTAACATCTCTTTCTTCCACTCACA 1380

 42339129 GTTGTCTTATTTTGTTCCTCTTCACTCTCCCAAAACTTAGCCCATGTTCCCCAGCTCCCC 42339188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GTTGTCTTATTTTGTTCCTCTTCACTCTCCCAAAACTTAGCCCATGTTCCCCAGCTCCCC 1440

 42339189 TCTGCACCTGCATCTGCCACACACGTACATACATACACACACTTCACATACATGCACGCA 42339248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TCTGCACCTGCATCTGCCACACACGTACATACATACACACACTTCACATACATGCACGCA 1500

 42339249 TATATACAAACACACACACATATGCGCGCACACACACACACACACACACACACACTCTCT 42339308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TATATACAAACACACACACATATGCGCGCACACACACACACACACACACACACACTCTCT 1560

 42339309 CTCCAGCCCTTGATGCTTTCCCCCTCTCTCTTCCTCCTGGACCTTTTCTTTGCTCCATTC 42339368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CTCCAGCCCTTGATGCTTTCCCCCTCTCTCTTCCTCCTGGACCTTTTCTTTGCTCCATTC 1620

 42339369 CCAACACACAGGTCCCTGGTCTGTCTCTGGCTCCTTCCAAGCCTTGGCTCTTCTTAGGTA 42339428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CCAACACACAGGTCCCTGGTCTGTCTCTGGCTCCTTCCAAGCCTTGGCTCTTCTTAGGTA 1680

 42339429 TTATCCCCAGCAGCACAGCAGCAGACCAGCTGACCTGGACTATTTCTTAGGCAGTAGTCA 42339488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTATCCCCAGCAGCACAGCAGCAGACCAGCTGACCTGGACTATTTCTTAGGCAGTAGTCA 1740

 42339489 GGTAAGCTGTACCTACTCATATGGAGATATTGTTTGATCCTGAGCCTCTCCTGATGTCTC 42339548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GGTAAGCTGTACCTACTCATATGGAGATATTGTTTGATCCTGAGCCTCTCCTGATGTCTC 1800

 42339549 TTTTTAGCCCCCAGGGGGAGGTTTTAATATCCACATCCACCAGCATCTTCTCCCTAGGGG 42339608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTTTTAGCCCCCAGGGGGAGGTTTTAATATCCACATCCACCAGCATCTTCTCCCTAGGGG 1860

 42339609 AGAAGGGAGTGAGATGGGGAGAAGAAAGTGAGAGGAATCGAAACATGTCTAAGGAAACTA 42339668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AGAAGGGAGTGAGATGGGGAGAAGAAAGTGAGAGGAATCGAAACATGTCTAAGGAAACTA 1920

 42339669 AGAGGCAGAGGTTATTTCGATCTGCTCTTTATAATCATCTCAGATGCCTGCCCTGGGCAA 42339728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AGAGGCAGAGGTTATTTCGATCTGCTCTTTATAATCATCTCAGATGCCTGCCCTGGGCAA 1980

 42339729 TGTCTAGGTTATTACTGAATTCTGGGGACACTCCCATATTAGCCCAATGACTAATCAAAA 42339788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TGTCTAGGTTATTACTGAATTCTGGGGACACTCCCATATTAGCCCAATGACTAATCAAAA 2040

 42339789 AAAGCAAGCTGACCATAGTCAACTAGAGGGTAAGGAACCAAGTGAAAATAGAGAGAGTTC 42339848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AAAGCAAGCTGACCATAGTCAACTAGAGGGTAAGGAACCAAGTGAAAATAGAGAGAGTTC 2100

 42339849 TCCGGACCTCTGAATCTGGGTACAATCATTCAGTATGAAGATAGGAGCTAGGAGAAGAGA 42339908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TCCGGACCTCTGAATCTGGGTACAATCATTCAGTATGAAGATAGGAGCTAGGAGAAGAGA 2160

 42339909 GAAAACATGGAATTGTATTTTGATTGACTTTTTTCTGATTACAAAAGTCATATATGTTCA 42339968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GAAAACATGGAATTGTATTTTGATTGACTTTTTTCTGATTACAAAAGTCATATATGTTCA 2220

 42339969 ATGTAGAAAACCAGGAAGATACTGAAAAATACAAGAAGGTGTTAAAAAAAAAAAACACTT 42340028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ATGTAGAAAACCAGGAAGATACTGAAAAATACAAGAAGGTGTTAAAAAAAAAAAACACTT 2280

 42340029 ATGACCCCACCACCTAGATTTAATCAAGATTAACATGTTAGTTTACCTTTCCAGTGTGGT 42340088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 ATGACCCCACCACCTAGATTTAATCAAGATTAACATGTTAGTTTACCTTTCCAGTGTGGT 2340

 42340089 TTTCAATGCATATTCTTTTTAAAATCAAGTTAGAAACATAGTGTATATGCTATTTTAGAA 42340148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TTTCAATGCATATTCTTTTTAAAATCAAGTTAGAAACATAGTGTATATGCTATTTTAGAA 2400

 42340149 ATTCTTTCTCAGCTGGGCGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTAGGAGGCCAA 42340208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ATTCTTTCTCAGCTGGGCGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTAGGAGGCCAA 2460

 42340209 GGCAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCC 42340268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GGCAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCC 2520

 42340269 CATCTCTACCAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGATGGCACACACCTGTAAATCTCAG 42340328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CATCTCTACCAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGATGGCACACACCTGTAAATCTCAG 2580

 42340329 CTATTCTGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACTTGAGAGGTGGAGGTTGCAGTGAG 42340388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CTATTCTGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACTTGAGAGGTGGAGGTTGCAGTGAG 2640

 42340389 CCAAGATCGCACCACTGCACTCCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGAGAGACTCTGTCTCAA 42340448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CCAAGATCGCACCACTGCACTCCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGAGAGACTCTGTCTCAA 2700

 42340449 AAAATAAAAAAGAAAGAAAAGAAAGAAATTCTTTCTCATACATTACATCATAAATCTTTT 42340508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AAAATAAAAAAGAAAGAAAAGAAAGAAATTCTTTCTCATACATTACATCATAAATCTTTT 2760

 42340509 CCCAAATCATTAAATATTCTTCTGCAATATGATTTGTTAAAGCTATATATGATTTTGTGC 42340568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CCCAAATCATTAAATATTCTTCTGCAATATGATTTGTTAAAGCTATATATGATTTTGTGC 2820

 42340569 AATAGATATGCTATAATAGGCTTACCCAATTTTATATGGAAGAGCACTTACGCTGTTTCC 42340628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 AATAGATATGCTATAATAGGCTTACCCAATTTTATATGGAAGAGCACTTACGCTGTTTCC 2880

 42340629 AGGCATAGAATTCTAAATATGGCAAGGTTATCTGCACAACTCCTGTTTTCAGGCATGCTG 42340688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 AGGCATAGAATTCTAAATATGGCAAGGTTATCTGCACAACTCCTGTTTTCAGGCATGCTG 2940

 42340689 ACCTCCATTCCTTACAAGCAGATAATGATCCCTTTAAAGTTCTCTGCTCAAGAGAACCGT 42340748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 ACCTCCATTCCTTACAAGCAGATAATGATCCCTTTAAAGTTCTCTGCTCAAGAGAACCGT 3000

 42340749 GCCATAGCAGAAGTAATTCTTCCCCAAGCGTTCAGCTGTCCTGTGTTCTCCAGGGAAAGC 42340808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GCCATAGCAGAAGTAATTCTTCCCCAAGCGTTCAGCTGTCCTGTGTTCTCCAGGGAAAGC 3060

 42340809 CTAGCATTGGGCGTTGGGCATGCTTGCCTCTAAATGGGAAGGCCAGTTCATTCTTAAGCA 42340868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 CTAGCATTGGGCGTTGGGCATGCTTGCCTCTAAATGGGAAGGCCAGTTCATTCTTAAGCA 3120

 42340869 GATGGAGAGAAAGCATTTGTCATTCTAAATCCGGGAAGTAGCTCAATTCAATTCAATTGC 42340928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 GATGGAGAGAAAGCATTTGTCATTCTAAATCCGGGAAGTAGCTCAATTCAATTCAATTGC 3180

 42340929 ATAATTCTTAAAAACATATTTTGCGCCACTCCTGAAAATGGTATTATAGAAGAAAAGTAT 42340988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 ATAATTCTTAAAAACATATTTTGCGCCACTCCTGAAAATGGTATTATAGAAGAAAAGTAT 3240

 42340989 GGTTTCTACCTTTAAGAAGATTGCTGACCGGGCTGGGCGCAGTGGCTCATGCCTGTAATC 42341048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 GGTTTCTACCTTTAAGAAGATTGCTGACCGGGCTGGGCGCAGTGGCTCATGCCTGTAATC 3300

 42341049 CCAGAACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGCAGATCCCCTGAGGTCAGGAGTTAGAGGCTAGCC 42341108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 CCAGAACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGCAGATCCCCTGAGGTCAGGAGTTAGAGGCTAGCC 3360

 42341109 CGACCAACATGGCAAAACCCCGTCTCTACTAAAAATATAAAAATTAGCTGGGCATGGTGG 42341168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 CGACCAACATGGCAAAACCCCGTCTCTACTAAAAATATAAAAATTAGCTGGGCATGGTGG 3420

 42341169 TGCATGCCTGTAGCCCCAGCTACTCAGGAGACTCAGGCATGAAAATCGCTTGAACCCGAG 42341228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TGCATGCCTGTAGCCCCAGCTACTCAGGAGACTCAGGCATGAAAATCGCTTGAACCCGAG 3480

 42341229 ACACGGAGGTGGTGGTGAGCTGAAATTGCGCCACTGCATTCCAGCCTGGGCGACAGAGCA 42341288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 ACACGGAGGTGGTGGTGAGCTGAAATTGCGCCACTGCATTCCAGCCTGGGCGACAGAGCA 3540

 42341289 AGACTCTATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAGAAGAAGAAGATTGCTGGCGGGGTGTTG 42341348
          |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 AGACTCTATCTCAAAAAAAAAAAAAAA--GAAGAAGAAGAAGATTGCTGGCGGGGTGTTG 3598

 42341349 TGGCTCATACTTGTAATCCTAGCACTTTGGGAGGCCAAGGAAGGAGGATCACTTGAGCCA 42341408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3599 TGGCTCATACTTGTAATCCTAGCACTTTGGGAGGCCAAGGAAGGAGGATCACTTGAGCCA 3658

 42341409 AAGAAGTCAAGGCTGCAGTGAGCTGTGATCACACCACTCCATGCCAGCCTGGGTGACAGA 42341468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3659 AAGAAGTCAAGGCTGCAGTGAGCTGTGATCACACCACTCCATGCCAGCCTGGGTGACAGA 3718

 42341469 GTGAAACCCTGTCTCAAAAAGAAAAAAGAAAAGATTGCCATCTTCCTGGGGTGACAAACA 42341528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3719 GTGAAACCCTGTCTCAAAAAGAAAAAAGAAAAGATTGCCATCTTCCTGGGGTGACAAACA 3778

 42341529 TAATTTTAAAAGAATCAGGTAGAAACATAGGACTGTATTTATGATGAAACAACTATGACT 42341588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3779 TAATTTTAAAAGAATCAGGTAGAAACATAGGACTGTATTTATGATGAAACAACTATGACT 3838

 42341589 AAATGCTATGTTTTTCAGATTACACGTGCCTTAGGAAGTGAGAAAAGTATAAGTGCAATG 42341648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3839 AAATGCTATGTTTTTCAGATTACACGTGCCTTAGGAAGTGAGAAAAGTATAAGTGCAATG 3898

 42341649 TGGAATTGGGTGGTTGAGAAAACTCCAGAGAGGACCTGGTAGAGCTTGGAGGCAAGGTGG 42341708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3899 TGGAATTGGGTGGTTGAGAAAACTCCAGAGAGGACCTGGTAGAGCTTGGAGGCAAGGTGG 3958

 42341709 GCAAGGAACATTTCAAGAGGAGGGGACACTACAGCTGAGGCACAGAGGTGAGAAAGCACA 42341768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3959 GCAAGGAACATTTCAAGAGGAGGGGACACTACAGCTGAGGCACAGAGGTGAGAAAGCACA 4018

 42341769 GGAAGCAAGAAAGAGGCTCATCTGGCTGCAGCAGAGGGAGAAATAGTAAATTAGATCAGA 42341828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4019 GGAAGCAAGAAAGAGGCTCATCTGGCTGCAGCAGAGGGAGAAATAGTAAATTAGATCAGA 4078

 42341829 TAACTCATATATTGGGCACGTGTGCAGAGGGCCAAAAAGATGTTTGGCCTTAATTCTATA 42341888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4079 TAACTCATATATTGGGCACGTGTGCAGAGGGCCAAAAAGATGTTTGGCCTTAATTCTATA 4138

 42341889 GGTATTCCCCTTTGCCATAGATGTTACACCAAGAAAGAACACATTGAATCAAGCAAATTT 42341948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4139 GGTATTCCCCTTTGCCATAGATGTTACACCAAGAAAGAACACATTGAATCAAGCAAATTT 4198

 42341949 AAGCTGGGTTTTTGTTTTTGTTTTTTGGTGGTGGGGGGGATGATTTATAAGCAGGACTTC 42342008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4199 AAGCTGGGTTTTTGTTTTTGTTTTTTGGTGGTGGGGGGGATGATTTATAAGCAGGACTTC 4258

 42342009 CCAAAGCTTTTAATATGCTTATATATGTGGCAGTGTTGAGAGGGGAAGATTTGATATTCC 42342068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4259 CCAAAGCTTTTAATATGCTTATATATGTGGCAGTGTTGAGAGGGGAAGATTTGATATTCC 4318

 42342069 AAGTATTTTTGGCCACAGAACTCTTTTTATCATGGAACATTTCCAGTGTTCCATGAGACA 42342128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4319 AAGTATTTTTGGCCACAGAACTCTTTTTATCATGGAACATTTCCAGTGTTCCATGAGACA 4378

 42342129 CAATTAGGGGCTAGTGAGCCACTGACTTTTGAGTTGGAAAGTGACACATGGGGAAAGCAA 42342188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4379 CAATTAGGGGCTAGTGAGCCACTGACTTTTGAGTTGGAAAGTGACACATGGGGAAAGCAA 4438

 42342189 AGTTTTGGAAGATTGATCTCACGGTAGAATATAAGGTGAACAGGAGAGAAAAGAGCCTGG 42342248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4439 AGTTTTGGAAGATTGATCTCACGGTAGAATATAAGGTGAACAGGAGAGAAAAGAGCCTGG 4498

 42342249 ATTCAGGCAACACAATCAGATGATTGGATACAGGCTCAAGATTAGGGGGTGGGTTGCACT 42342308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4499 ATTCAGGCAACACAATCAGATGATTGGATACAGGCTCAAGATTAGGGGGTGGGTTGCACT 4558

 42342309 ACACTGGAGCGGAGAATGGAGAGCAAAAGCACTGATTGAATGCACAGTCTTCTGTTGGAT 42342368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4559 ACACTGGAGCGGAGAATGGAGAGCAAAAGCACTGATTGAATGCACAGTCTTCTGTTGGAT 4618

 42342369 CCTGGGATGATACAGAAGTGTCAGAGTTCCTGGGTCTTGTAGGAGTTCCAATGAGCATCA 42342428
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     4619 CCTGGGATGATACAGAAGTGTCAGAGTTCCTGGGTCTTGTAGGAGTTCCAATGCGCATCA 4678

 42342429 ATCAAAAGTTTGATTGTAAGGCACAGAAATCAACTTGGACCAGCTAAAGCAAAAAGACCA 42342488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4679 ATCAAAAGTTTGATTGTAAGGCACAGAAATCAACTTGGACCAGCTAAAGCAAAAAGACCA 4738

 42342489 TTTTTAGGGAAATAGGGATGTGTCACAAAGAACTGCATCTAGGTACTGGAAATCAACAAA 42342548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4739 TTTTTAGGGAAATAGGGATGTGTCACAAAGAACTGCATCTAGGTACTGGAAATCAACAAA 4798

 42342549 AAGTTCCCCATCTGATCTCAGCTTCTCTGTGTGTCTACTACATACACTATCTTTCTCCTC 42342608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4799 AAGTTCCCCATCTGATCTCAGCTTCTCTGTGTGTCTACTACATACACTATCTTTCTCCTC 4858

 42342609 TTTTCTTTCCTCTCTACCCCCTACCTCCCTCCTCTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTGTTTT 42342668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||
     4859 TTTTCTTTCCTCTCTACCCCCTACCTCCCTCCTCTCTCTTTTTTTTTTTT-----GTTTT 4913

 42342669 TTGGTTTTTTTATGTTTGTTTGTTTGCTTTTGGAGACACGGTCTCCCTCTGTCACCCAGG 42342728
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     4914 TTGGTTTTTTTATGTTTGTTTGTTTGTTTTTGGAGACACGGTCTCCCTCTGTCACCCAGG 4973

 42342729 CTGGAGTGCAGTGGCTTAATTACTGCAGCCTCAATCTCCTGGGCTCAAGTGACCCTCCCA 42342788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4974 CTGGAGTGCAGTGGCTTAATTACTGCAGCCTCAATCTCCTGGGCTCAAGTGACCCTCCCA 5033

 42342789 CCTCAGCCTCCTGAATAGCTGGGACCACAGGTGCAAGCCACAGTGCTCAGCTAATTAAAA 42342848
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5034 CTTCAGCCTCCTGAATAGCTGGGACCACAGGTGCAAGCCACAGTGCTCAGCTAATTAAAA 5093

 42342849 AAAATTTTTTTTTCAGAGATGGGGTCTCACTATGTTGTCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTA 42342908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5094 AAAATTTTTTTTTCAGAGATGGGGTCTCACTATGTTGTCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTA 5153

 42342909 GGCTCAAGCAGTCCTCCCGTTTCAGCCTCAAAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCAT 42342968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5154 GGCTCAAGCAGTCCTCCCGTTTCAGCCTCAAAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCAT 5213

 42342969 CGCACTCCACCTTCTCTATAGTTACTGAGTTTGCGTGTTACACTGAGTTTACATCTTACA 42343028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5214 CGCACTCCACCTTCTCTATAGTTACTGAGTTTGCGTGTTACACTGAGTTTACATCTTACA 5273

 42343029 TTTCTAGCCATATCAGAAACGACCTCTGCACCTCTCTTTCCCAATTTGAGATTTCTAATA 42343088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5274 TTTCTAGCCATATCAGAAACGACCTCTGCACCTCTCTTTCCCAATTTGAGATTTCTAATA 5333

 42343089 GAAAGAATCTTGTTCACCCAGCTTGGGACTCATTGAGTTATGACCAGTGGGATAGATTTT 42343148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5334 GAAAGAATCTTGTTCACCCAGCTTGGGACTCATTGAGTTATGACCAGTGGGATAGATTTT 5393

 42343149 AGAAGATAAACATGTCTATAGGGACTTACCGTGTGAATTAGTGGGGGAGCCGCTTACCAG 42343208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5394 AGAAGATAAACATGTCTATAGGGACTTACCGTGTGAATTAGTGGGGGAGCCGCTTACCAG 5453

 42343209 GCAGAGGGGTCTGCTGTAAAGTGATACTGTGACTTTAAATTGAAAGTAAGCTTCTAGAAG 42343268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5454 GCAGAGGGGTCTGCTGTAAAGTGATACTGTGACTTTAAATTGAAAGTAAGCTTCTAGAAG 5513

 42343269 AGTTGAAGAGGAGTGGATTATTGTTGAATGGATGTATAACTAATGAAGCTTTAAAGGAAG 42343328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5514 AGTTGAAGAGGAGTGGATTATTGTTGAATGGATGTATAACTAATGAAGCTTTAAAGGAAG 5573

 42343329 TTTATTAGAAAGTCCATGTCCTTGTCTCTTTCCCAAACTCCTTTAGTTCCCAAGTCCTGA 42343388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5574 TTTATTAGAAAGTCCATGTCCTTGTCTCTTTCCCAAACTCCTTTAGTTCCCAAGTCCTGA 5633

 42343389 AAGAATCTATGGATAAGGGAAGCAGAATACTATAGTGGTTAAGAGCACATGCTCGAGGTT 42343448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5634 AAGAATCTATGGATAAGGGAAGCAGAATACTATAGTGGTTAAGAGCACATGCTCGAGGTT 5693

 42343449 AAACTGTCTGTATTTTGGATCCTGGCCTTGAGGACTTGGGCAAGTTACGTGACCTGCCTG 42343508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5694 AAACTGTCTGTATTTTGGATCCTGGCCTTGAGGACTTGGGCAAGTTACGTGACCTGCCTG 5753

 42343509 AGCCTCAGTTTCCTCACCTGTAATATGGGTATCACGAGGAATAAATAAGGTAATATGTGT 42343568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5754 AGCCTCAGTTTCCTCACCTGTAATATGGGTATCACGAGGAATAAATAAGGTAATATGTGT 5813

 42343569 AAAGTGCTTGGCACAATGCTCTTGATAATGTTAGCAACATAATTTTGTAATGAAAATTAA 42343628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5814 AAAGTGCTTGGCACAATGCTCTTGATAATGTTAGCAACATAATTTTGTAATGAAAATTAA 5873

 42343629 CTGATGGGGCTGAAATGTGCATCAGCAGATCCAAATATCCTTGATAAACTGGCCAAAAGA 42343688
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     5874 CTGATGGGGCTGAAATGTGCATCAGCAGATCCAAATATCCTCGATAAACTGGCCAAAAGA 5933

 42343689 AAGATGAATTGGCAGAGAGGCAAGTGTTCATCTCAGTTCTCCAGATATCCCTGCAAATGT 42343748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5934 AAGATGAATTGGCAGAGAGGCAAGTGTTCATCTCAGTTCTCCAGATATCCCTGCAAATGT 5993

 42343749 GGCCTCTGGAGTAGAAGATTTAGGGAGAAAAATAAGCCATGAAGCTCTTCTGGCACCAAC 42343808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5994 GGCCTCTGGAGTAGAAGATTTAGGGAGAAAAATAAGCCATGAAGCTCTTCTGGCACCAAC 6053

 42343809 ATGAACTTCAGGGATCATGGGACATTTGGGCCAGTAACATTCCTCTTTGTTCCTAGAGAT 42343868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6054 ATGAACTTCAGGGATCATGGGACATTTGGGCCAGTAACATTCCTCTTTGTTCCTAGAGAT 6113

 42343869 TTAATATCTACCTACCAACTAAATGGCCTTGATTTGGAGGAGAGAAGACAAGAAGAGGAA 42343928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6114 TTAATATCTACCTACCAACTAAATGGCCTTGATTTGGAGGAGAGAAGACAAGAAGAGGAA 6173

 42343929 TTGCTTTCAGCTGGTCCTTGCCTTTAACTAACCAGGGGTACAAAAATTTTAAAATACAAA 42343988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     6174 TTGCTTTCAGCTGGTCCTTGCCTTTAACTAACCAGGGGTACAAAAATTTTAAAACACAAA 6233

 42343989 GGAGACCATGTGTAAAACATTAGTTAAGCTCAGATATAAATCTAGTCTTTGACCAGTCCA 42344048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6234 GGAGACCATGTGTAAAACATTAGTTAAGCTCAGATATAAATCTAGTCTTTGACCAGTCCA 6293

 42344049 GAGCTAATCAATATGCTTTTCTACTCTCTTTGAACTTTTGAGTTTTCTGGCAACAACAAA 42344108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6294 GAGCTAATCAATATGCTTTTCTACTCTCTTTGAACTTTTGAGTTTTCTGGCAACAACAAA 6353

 42344109 AATCCCAAACCTCATCCAAAACCGTAGTCCAGACAGCCCAGTTTCTGCACTCCCTTCCTT 42344168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6354 AATCCCAAACCTCATCCAAAACCGTAGTCCAGACAGCCCAGTTTCTGCACTCCCTTCCTT 6413

 42344169 GTGTCACATATTGTTGACAGAACTACTCCCGTTACCACATTCATTCCAGTGGTGATTCAA 42344228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6414 GTGTCACATATTGTTGACAGAACTACTCCCGTTACCACATTCATTCCAGTGGTGATTCAA 6473

 42344229 ATTCTTCTGCAGAAATGGACTTGAAAGACAGAAAACTGCTCCTGTAATCACTTAATAAGG 42344288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6474 ATTCTTCTGCAGAAATGGACTTGAAAGACAGAAAACTGCTCCTGTAATCACTTAATAAGG 6533

 42344289 AATCTTGGATGAGGAATACAGAGCTATGAATATGGATTTACTCTTAGCCTTTATGGATGC 42344348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6534 AATCTTGGATGAGGAATACAGAGCTATGAATATGGATTTACTCTTAGCCTTTATGGATGC 6593

 42344349 CTTTTTCTCAGTTATTTTCACTGAAAATCATGATGAACTGATTTAAATATCAAGGTAAAC 42344408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6594 CTTTTTCTCAGTTATTTTCACTGAAAATCATGATGAACTGATTTAAATATCAAGGTAAAC 6653

 42344409 TGAGATGGAAAATTACCGATAATAAGAGTTTTCTGAAAATATAGATTGGCCTCTTTAAAG 42344468
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     6654 TGAGATGGAAAATTACCGATAATAAGAGTTTTCTGAAAATATAGATTGGCCTCTTTAAAA 6713

 42344469 CACATCGAGTTTGTTTTGTTTAAATTACAAATTCACATATATTTGAAATGTGTTTAAATG 42344528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6714 CACATCGAGTTTGTTTTGTTTAAATTACAAATTCACATATATTTGAAATGTGTTTAAATG 6773

 42344529 TGTCAGTTTTAGGCAAAACTAAACTATTTGATTCCTTTCCAAAAATCAGGAATTTGCTTT 42344588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6774 TGTCAGTTTTAGGCAAAACTAAACTATTTGATTCCTTTCCAAAAATCAGGAATTTGCTTT 6833

 42344589 GGAAAAAAACCATGCAGTTTGATTTACAAAGCAGAGCGGGGGGGAAGTAGTGGGTGAGAA 42344648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6834 GGAAAAAAACCATGCAGTTTGATTTACAAAGCAGAGCGGGGGGGAAGTAGTGGGTGAGAA 6893

 42344649 AGACCCACCCAAAGGCTGCAGCCAGCTTCCCCAGGAAGATTCATAACCATGCCACAATAC 42344708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6894 AGACCCACCCAAAGGCTGCAGCCAGCTTCCCCAGGAAGATTCATAACCATGCCACAATAC 6953

 42344709 TGTCCTTCAATTCGTTCCAACAGATTTTACTATAACTCTAAATCATTAGAAGCAACTGCT 42344768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6954 TGTCCTTCAATTCGTTCCAACAGATTTTACTATAACTCTAAATCATTAGAAGCAACTGCT 7013

 42344769 GCTATGACTAGTGCTATCTTTGCCTCAAAAAGAGGAAAAATCAGGACATACAATATAATC 42344828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7014 GCTATGACTAGTGCTATCTTTGCCTCAAAAAGAGGAAAAATCAGGACATACAATATAATC 7073

 42344829 CCCTCAGGATCTAGGAGAGAAATCAGCCCATTTGTCATAAGAACTGAAAACCTCAGCTAA 42344888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7074 CCCTCAGGATCTAGGAGAGAAATCAGCCCATTTGTCATAAGAACTGAAAACCTCAGCTAA 7133

 42344889 ATAGTATATGAAACATTGGTATTTCATACCTTGACATTACATATTTTTGAAAATAAAGTA 42344948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7134 ATAGTATATGAAACATTGGTATTTCATACCTTGACATTACATATTTTTGAAAATAAAGTA 7193

 42344949 AGCATACACACAAGAAGTGGCTAGATGCAGCAGTTATAAAGTGGCTTAAGTTGGGTTAAC 42345008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7194 AGCATACACACAAGAAGTGGCTAGATGCAGCAGTTATAAAGTGGCTTAAGTTGGGTTAAC 7253

 42345009 TAAATATAACCTAGAAAAACCATCTTATCTATTGCAAATTATTTCCAGAAAAAGGTAAGA 42345068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7254 TAAATATAACCTAGAAAAACCATCTTATCTATTGCAAATTATTTCCAGAAAAAGGTAAGA 7313

 42345069 AAAATCCAACCAACACTTTTTAAACATCCTGAGCTATTCACAGCAAGTGAATCTTTACCC 42345128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7314 AAAATCCAACCAACACTTTTTAAACATCCTGAGCTATTCACAGCAAGTGAATCTTTACCC 7373

 42345129 TTACCAGATGTATAAACATTTACATAAGGCAGGAGGTTCAACACTTGGAGAGTGTAATCA 42345188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7374 TTACCAGATGTATAAACATTTACATAAGGCAGGAGGTTCAACACTTGGAGAGTGTAATCA 7433

 42345189 AGGCAGTAGTAACGCAGTGCTCCTCTCTTTGACTTGAATGACTTCCTCCCCATTAGGGTC 42345248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7434 AGGCAGTAGTAACGCAGTGCTCCTCTCTTTGACTTGAATGACTTCCTCCCCATTAGGGTC 7493

 42345249 ATTATTGTTTTGCAGTGTCCCAGGGATGAAAGGACTTTGAAAGGTCATGTGTCTTGTGAC 42345308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7494 ATTATTGTTTTGCAGTGTCCCAGGGATGAAAGGACTTTGAAAGGTCATGTGTCTTGTGAC 7553

 42345309 CCAACTAGCAGCATCAGCATCACTGGGGAGAAACTCAAGCAGAAGCTTGAGTCTACTCCA 42345368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7554 CCAACTAGCAGCATCAGCATCACTGGGGAGAAACTCAAGCAGAAGCTTGAGTCTACTCCA 7613

 42345369 CTCTTGCTGACACCAAATCTGCATTTTTACAGGATTCTTGGGTGAGTCACACACATATTC 42345428
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     7614 CTCTTGCTGACACCAAATCTGCATTTTTACAGGATTCTTGGGTGAGTCACAGACATATTC 7673

 42345429 AAGGTTAAAATATGCCACCCTAGGTCTTTCTCCTGCTTCTGAGCAAAACTGGGCACAAGG 42345488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7674 AAGGTTAAAATATGCCACCCTAGGTCTTTCTCCTGCTTCTGAGCAAAACTGGGCACAAGG 7733

 42345489 GACAAACTAGTTTCCTTCAGCCACTTTCAAATCCTTTATAGAGTGTACTGTGTGAGTCAC 42345548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7734 GACAAACTAGTTTCCTTCAGCCACTTTCAAATCCTTTATAGAGTGTACTGTGTGAGTCAC 7793

 42345549 TGAGAGGAAAGAGGAAATAATACTTATTTAGGGAAGTCTTGCATAACTTAACAAAGTTAG 42345608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7794 TGAGAGGAAAGAGGAAATAATACTTATTTAGGGAAGTCTTGCATAACTTAACAAAGTTAG 7853

 42345609 TAACTTCTTCAATACACTCAAGTACCTATTTTTGGAAGCCCTACAGGTTAGGTCAAAGTA 42345668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7854 TAACTTCTTCAATACACTCAAGTACCTATTTTTGGAAGCCCTACAGGTTAGGTCAAAGTA 7913

 42345669 AAGAGAAGCAAAAAATGGAGTGAGTTCTAGTAAAAAACTCTGACAAAATAAGGGAAGTGT 42345728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7914 AAGAGAAGCAAAAAATGGAGTGAGTTCTAGTAAAAAACTCTGACAAAATAAGGGAAGTGT 7973

 42345729 AGAAGCTGAGTCTATGAGGGATGAGAGAAGCAATTTACCAAATTATCAGATCCAAAATCA 42345788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7974 AGAAGCTGAGTCTATGAGGGATGAGAGAAGCAATTTACCAAATTATCAGATCCAAAATCA 8033

 42345789 TCTCTGCACTGTAGATGATTTATAGCCCTGGAAGCTTAGAGGCTTGAGTCTCTTGCTGTA 42345848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8034 TCTCTGCACTGTAGATGATTTATAGCCCTGGAAGCTTAGAGGCTTGAGTCTCTTGCTGTA 8093

 42345849 TTTCATTTCAAATTAGTAATTTTTATCTAGGGCTTCCCTATGGCTTAAAGTGAAGGCCCT 42345908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8094 TTTCATTTCAAATTAGTAATTTTTATCTAGGGCTTCCCTATGGCTTAAAGTGAAGGCCCT 8153

 42345909 GGAATTTCTGAAGTGAAATTATCTGATGATTTTTATGTATGGTCATTCTGTAGTTATCCT 42345968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8154 GGAATTTCTGAAGTGAAATTATCTGATGATTTTTATGTATGGTCATTCTGTAGTTATCCT 8213

 42345969 GTAAGTTTCATATTTGTAACAAGACTGGAATCCGAACAATAGAAAACTCTGTGGCAGTAA 42346028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8214 GTAAGTTTCATATTTGTAACAAGACTGGAATCCGAACAATAGAAAACTCTGTGGCAGTAA 8273

 42346029 GCCAAAACCTGATGGACTTAGGAGAGTTACGTATGTGTGTTTCAGTGGTCCTCAAATTCA 42346088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     8274 GCCAAAACCTGATGGACTTAGGAGAGTTACGTATGTGTGTTTCAGTGGTCCTCAAATTTA 8333

 42346089 GCTGCCTATTAGAATCACCTGGACTTTGAAAAAAAAAGAGCTTTCTTGAGGTATAACTGA 42346148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8334 GCTGCCTATTAGAATCACCTGGACTTTGAAAAAAAAAGAGCTTTCTTGAGGTATAACTGA 8393

 42346149 CAAATAATAAGACAAACATATTTCAGTATACAATTGGATGAGTTTTGACATGTTATATTC 42346208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8394 CAAATAATAAGACAAACATATTTCAGTATACAATTGGATGAGTTTTGACATGTTATATTC 8453

 42346209 TTGTGAAACCATCACCACAATCAAGCTATTCACCCCCCAAATTTTCGTGCC 42346259
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8454 TTGTGAAACCATCACCACAATCAAGCTATTCACCCCCCAAATTTTCGTGCC 8504

EXCISED REGION

 42347319 TTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGCTCTCAAACTCCTGA 42347378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8509 TTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGCTCTCAAACTCCTGA 8568

 42347379 CCTCAGGTGATCCACCCGCCTCAG 42347402
          ||||||||||||||||||||||||
     8569 CCTCAGGTGATCCACCCGCCTCAG 8592

Alignment time is 6.31191 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [42336259,42357318] =>     21060 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [       1,    3486] =>      3486 nucs 'mol-32-2fcd-062457_3486'

Score:        3408
Aligned:      3485        nucs
Identic:      3478 (100%) nucs =>       122 (100%)      3356 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [42343515,42343636] EXCISED REGION [42343638,42346999]
 second seq =>  [       1,     122] EXCISED REGION [     124,    3486]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [42343637,42343637]
 second seq =>         1 nucs [123,123]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [3273,3273]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [42343634,42343636] to [42343635,42343637]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 42343515 AGTTTCCTCACCTGTAATATGGGTATCACGAGGAATAAATAAGGTAATATGTGTAAAGTG 42343574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGTTTCCTCACCTGTAATATGGGTATCACGAGGAATAAATAAGGTAATATGTGTAAAGTG 60

 42343575 CTTGGCACAATGCTCTTGATAATGTTAGCAACATAATTTTGTAATGAAAATTAACTGATG 42343634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTTGGCACAATGCTCTTGATAATGTTAGCAACATAATTTTGTAATGAAAATTAACTGATG 120

 42343635 GG 42343636
          ||
      121 GG 122

EXCISED REGION

 42343638 CTGAAATGTGCATCAGCAGATCCAAATATCCTTGATAAACTGGCCAAAAGAAAGATGAAT 42343697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      124 CTGAAATGTGCATCAGCAGATCCAAATATCCTTGATAAACTGGCCAAAAGAAAGATGAAT 183

 42343698 TGGCAGAGAGGCAAGTGTTCATCTCAGTTCTCCAGATATCCCTGCAAATGTGGCCTCTGG 42343757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      184 TGGCAGAGAGGCAAGTGTTCATCTCAGTTCTCCAGATATCCCTGCAAATGTGGCCTCTGG 243

 42343758 AGTAGAAGATTTAGGGAGAAAAATAAGCCATGAAGCTCTTCTGGCACCAACATGAACTTC 42343817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      244 AGTAGAAGATTTAGGGAGAAAAATAAGCCATGAAGCTCTTCTGGCACCAACATGAACTTC 303

 42343818 AGGGATCATGGGACATTTGGGCCAGTAACATTCCTCTTTGTTCCTAGAGATTTAATATCT 42343877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      304 AGGGATCATGGGACATTTGGGCCAGTAACATTCCTCTTTGTTCCTAGAGATTTAATATCT 363

 42343878 ACCTACCAACTAAATGGCCTTGATTTGGAGGAGAGAAGACAAGAAGAGGAATTGCTTTCA 42343937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      364 ACCTACCAACTAAATGGCCTTGATTTGGAGGAGAGAAGACAAGAAGAGGAATTGCTTTCA 423

 42343938 GCTGGTCCTTGCCTTTAACTAACCAGGGGTACAAAAATTTTAAAATACAAAGGAGACCAT 42343997
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
      424 GCTGGTCCTTGCCTTTAACTAACCAGGGGTACAAAAATTTTAAAACACAAAGGAGACCAT 483

 42343998 GTGTAAAACATTAGTTAAGCTCAGATATAAATCTAGTCTTTGACCAGTCCAGAGCTAATC 42344057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      484 GTGTAAAACATTAGTTAAGCTCAGATATAAATCTAGTCTTTGACCAGTCCAGAGCTAATC 543

 42344058 AATATGCTTTTCTACTCTCTTTGAACTTTTGAGTTTTCTGGCAACAACAAAAATCCCAAA 42344117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      544 AATATGCTTTTCTACTCTCTTTGAACTTTTGAGTTTTCTGGCAACAACAAAAATCCCAAA 603

 42344118 CCTCATCCAAAACCGTAGTCCAGACAGCCCAGTTTCTGCACTCCCTTCCTTGTGTCACAT 42344177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      604 CCTCATCCAAAACCGTAGTCCAGACAGCCCAGTTTCTGCACTCCCTTCCTTGTGTCACAT 663

 42344178 ATTGTTGACAGAACTACTCCCGTTACCACATTCATTCCAGTGGTGATTCAAATTCTTCTG 42344237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      664 ATTGTTGACAGAACTACTCCCGTTACCACATTCATTCCAGTGGTGATTCAAATTCTTCTG 723

 42344238 CAGAAATGGACTTGAAAGACAGAAAACTGCTCCTGTAATCACTTAATAAGGAATCTTGGA 42344297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      724 CAGAAATGGACTTGAAAGACAGAAAACTGCTCCTGTAATCACTTAATAAGGAATCTTGGA 783

 42344298 TGAGGAATACAGAGCTATGAATATGGATTTACTCTTAGCCTTTATGGATGCCTTTTTCTC 42344357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      784 TGAGGAATACAGAGCTATGAATATGGATTTACTCTTAGCCTTTATGGATGCCTTTTTCTC 843

 42344358 AGTTATTTTCACTGAAAATCATGATGAACTGATTTAAATATCAAGGTAAACTGAGATGGA 42344417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      844 AGTTATTTTCACTGAAAATCATGATGAACTGATTTAAATATCAAGGTAAACTGAGATGGA 903

 42344418 AAATTACCGATAATAAGAGTTTTCTGAAAATATAGATTGGCCTCTTTAAAGCACATCGAG 42344477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      904 AAATTACCGATAATAAGAGTTTTCTGAAAATATAGATTGGCCTCTTTAAAGCACATCGAG 963

 42344478 TTTGTTTTGTTTAAATTACAAATTCACATATATTTGAAATGTGTTTAAATGTGTCAGTTT 42344537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      964 TTTGTTTTGTTTAAATTACAAATTCACATATATTTGAAATGTGTTTAAATGTGTCAGTTT 1023

 42344538 TAGGCAAAACTAAACTATTTGATTCCTTTCCAAAAATCAGGAATTTGCTTTGGAAAAAAA 42344597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1024 TAGGCAAAACTAAACTATTTGATTCCTTTCCAAAAATCAGGAATTTGCTTTGGAAAAAAA 1083

 42344598 CCATGCAGTTTGATTTACAAAGCAGAGCGGGGGGGAAGTAGTGGGTGAGAAAGACCCACC 42344657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1084 CCATGCAGTTTGATTTACAAAGCAGAGCGGGGGGGAAGTAGTGGGTGAGAAAGACCCACC 1143

 42344658 CAAAGGCTGCAGCCAGCTTCCCCAGGAAGATTCATAACCATGCCACAATACTGTCCTTCA 42344717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1144 CAAAGGCTGCAGCCAGCTTCCCCAGGAAGATTCATAACCATGCCACAATACTGTCCTTCA 1203

 42344718 ATTCGTTCCAACAGATTTTACTATAACTCTAAATCATTAGAAGCAACTGCTGCTATGACT 42344777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1204 ATTCGTTCCAACAGATTTTACTATAACTCTAAATCATTAGAAGCAACTGCTGCTATGACT 1263

 42344778 AGTGCTATCTTTGCCTCAAAAAGAGGAAAAATCAGGACATACAATATAATCCCCTCAGGA 42344837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1264 AGTGCTATCTTTGCCTCAAAAAGAGGAAAAATCAGGACATACAATATAATCCCCTCAGGA 1323

 42344838 TCTAGGAGAGAAATCAGCCCATTTGTCATAAGAACTGAAAACCTCAGCTAAATAGTATAT 42344897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1324 TCTAGGAGAGAAATCAGCCCATTTGTCATAAGAACTGAAAACCTCAGCTAAATAGTATAT 1383

 42344898 GAAACATTGGTATTTCATACCTTGACATTACATATTTTTGAAAATAAAGTAAGCATACAC 42344957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1384 GAAACATTGGTATTTCATACCTTGACATTACATATTTTTGAAAATAAAGTAAGCATACAC 1443

 42344958 ACAAGAAGTGGCTAGATGCAGCAGTTATAAAGTGGCTTAAGTTGGGTTAACTAAATATAA 42345017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1444 ACAAGAAGTGGCTAGATGCAGCAGTTATAAAGTGGCTTAAGTTGGGTTAACTAAATATAA 1503

 42345018 CCTAGAAAAACCATCTTATCTATTGCAAATTATTTCCAGAAAAAGGTAAGAAAAATCCAA 42345077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1504 CCTAGAAAAACCATCTTATCTATTGCAAATTATTTCCAGAAAAAGGTAAGAAAAATCCAA 1563

 42345078 CCAACACTTTTTAAACATCCTGAGCTATTCACAGCAAGTGAATCTTTACCCTTACCAGAT 42345137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1564 CCAACACTTTTTAAACATCCTGAGCTATTCACAGCAAGTGAATCTTTACCCTTACCAGAT 1623

 42345138 GTATAAACATTTACATAAGGCAGGAGGTTCAACACTTGGAGAGTGTAATCAAGGCAGTAG 42345197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1624 GTATAAACATTTACATAAGGCAGGAGGTTCAACACTTGGAGAGTGTAATCAAGGCAGTAG 1683

 42345198 TAACGCAGTGCTCCTCTCTTTGACTTGAATGACTTCCTCCCCATTAGGGTCATTATTGTT 42345257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1684 TAACGCAGTGCTCCTCTCTTTGACTTGAATGACTTCCTCCCCATTAGGGTCATTATTGTT 1743

 42345258 TTGCAGTGTCCCAGGGATGAAAGGACTTTGAAAGGTCATGTGTCTTGTGACCCAACTAGC 42345317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1744 TTGCAGTGTCCCAGGGATGAAAGGACTTTGAAAGGTCATGTGTCTTGTGACCCAACTAGC 1803

 42345318 AGCATCAGCATCACTGGGGAGAAACTCAAGCAGAAGCTTGAGTCTACTCCACTCTTGCTG 42345377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1804 AGCATCAGCATCACTGGGGAGAAACTCAAGCAGAAGCTTGAGTCTACTCCACTCTTGCTG 1863

 42345378 ACACCAAATCTGCATTTTTACAGGATTCTTGGGTGAGTCACACACATATTCAAGGTTAAA 42345437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1864 ACACCAAATCTGCATTTTTACAGGATTCTTGGGTGAGTCACACACATATTCAAGGTTAAA 1923

 42345438 ATATGCCACCCTAGGTCTTTCTCCTGCTTCTGAGCAAAACTGGGCACAAGGGACAAACTA 42345497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1924 ATATGCCACCCTAGGTCTTTCTCCTGCTTCTGAGCAAAACTGGGCACAAGGGACAAACTA 1983

 42345498 GTTTCCTTCAGCCACTTTCAAATCCTTTATAGAGTGTACTGTGTGAGTCACTGAGAGGAA 42345557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1984 GTTTCCTTCAGCCACTTTCAAATCCTTTATAGAGTGTACTGTGTGAGTCACTGAGAGGAA 2043

 42345558 AGAGGAAATAATACTTATTTAGGGAAGTCTTGCATAACTTAACAAAGTTAGTAACTTCTT 42345617
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     2044 AGAGGAAATAATACTTATTTAGGGAAGTCTTGCTTAACTTAACAAAGTTAGTAACTTCTT 2103

 42345618 CAATACACTCAAGTACCTATTTTTGGAAGCCCTACAGGTTAGGTCAAAGTAAAGAGAAGC 42345677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2104 CAATACACTCAAGTACCTATTTTTGGAAGCCCTACAGGTTAGGTCAAAGTAAAGAGAAGC 2163

 42345678 AAAAAATGGAGTGAGTTCTAGTAAAAAACTCTGACAAAATAAGGGAAGTGTAGAAGCTGA 42345737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2164 AAAAAATGGAGTGAGTTCTAGTAAAAAACTCTGACAAAATAAGGGAAGTGTAGAAGCTGA 2223

 42345738 GTCTATGAGGGATGAGAGAAGCAATTTACCAAATTATCAGATCCAAAATCATCTCTGCAC 42345797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2224 GTCTATGAGGGATGAGAGAAGCAATTTACCAAATTATCAGATCCAAAATCATCTCTGCAC 2283

 42345798 TGTAGATGATTTATAGCCCTGGAAGCTTAGAGGCTTGAGTCTCTTGCTGTATTTCATTTC 42345857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2284 TGTAGATGATTTATAGCCCTGGAAGCTTAGAGGCTTGAGTCTCTTGCTGTATTTCATTTC 2343

 42345858 AAATTAGTAATTTTTATCTAGGGCTTCCCTATGGCTTAAAGTGAAGGCCCTGGAATTTCT 42345917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2344 AAATTAGTAATTTTTATCTAGGGCTTCCCTATGGCTTAAAGTGAAGGCCCTGGAATTTCT 2403

 42345918 GAAGTGAAATTATCTGATGATTTTTATGTATGGTCATTCTGTAGTTATCCTGTAAGTTTC 42345977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2404 GAAGTGAAATTATCTGATGATTTTTATGTATGGTCATTCTGTAGTTATCCTGTAAGTTTC 2463

 42345978 ATATTTGTAACAAGACTGGAATCCGAACAATAGAAAACTCTGTGGCAGTAAGCCAAAACC 42346037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2464 ATATTTGTAACAAGACTGGAATCCGAACAATAGAAAACTCTGTGGCAGTAAGCCAAAACC 2523

 42346038 TGATGGACTTAGGAGAGTTACGTATGTGTGTTTCAGTGGTCCTCAAATTCAGCTGCCTAT 42346097
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     2524 TGATGGACTTAGGAGAGTTACGTATGTGTGTTTCAGTGGTCCTCAAATTTAGCTGCCTAT 2583

 42346098 TAGAATCACCTGGACTTTGAAAAAAAAAGAGCTTTCTTGAGGTATAACTGACAAATAATA 42346157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2584 TAGAATCACCTGGACTTTGAAAAAAAAAGAGCTTTCTTGAGGTATAACTGACAAATAATA 2643

 42346158 AGACAAACATATTTCAGTATACAATTGGATGAGTTTTGACATGTTATATTCTTGTGAAAC 42346217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2644 AGACAAACATATTTCAGTATACAATTGGATGAGTTTTGACATGTTATATTCTTGTGAAAC 2703

 42346218 CATCACCACAATCAAGCTATTCACCCCCCAAATTTTCGTGCCCCTTTGTTGTCCCACCCT 42346277
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2704 CATCGCCACAATCAAGCTATTCACCCCCCAAATTTTCGTGCCCCTTTGTTGTCCCACCCT 2763

 42346278 TCTTTCTGCAACCACTGATCTGCTTTCTATCACTATGGATTAATTTGTATTTTCTAGAAG 42346337
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     2764 TCTTTCTGCAACCACTGATCTGCTTTCTATCACTATGGATTAATTTGTATTTTATAGAAG 2823

 42346338 CTTAAATAAGTGAAACCATATGGTGTGCATGTTTTGCAGGGAGAGGGCAGGGGGAGCTGG 42346397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2824 CTTAAATAAGTGAAACCATATGGTGTGCATGTTTTGCAGGGAGAGGGCAGGGGGAGCTGG 2883

 42346398 TTTCTTTCACTCGGTGTAATTGTTCTGAGAGTCATCCGTGTTTGCATGTGTTAATAGTTT 42346457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2884 TTTCTTTCACTCGGTGTAATTGTTCTGAGAGTCATCCGTGTTTGCATGTGTTAATAGTTT 2943

 42346458 ATTCTTTTTATCGGTAAGTAGTATCCCATTGTGTGGATGTACCACATGTTGTCTAACCAT 42346517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2944 ATTCTTTTTATCGGTAAGTAGTATCCCATTGTGTGGATGTACCACATGTTGTCTAACCAT 3003

 42346518 TCACAACTAAAGGATACTTGGGTTGTTTCTCATTTGGGGCAATTGAAAATAAGCAGTATA 42346577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3004 TCACAACTAAAGGATACTTGGGTTGTTTCTCATTTGGGGCAATTGAAAATAAGCAGTATA 3063

 42346578 AACTGCTATAAACAGTCATGTACAGATATAAGCATGTATGTTTCCATTTTTCAAGGTAAA 42346637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3064 AACTGCTATAAACAGTCATGTACAGATATAAGCATGTATGTTTCCATTTTTCAAGGTAAA 3123

 42346638 TACCTAGAAGTGGGTATGGTAAGTGTATGTTTAACTTGAAAAGAAACTACCAAAATGTTT 42346697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3124 TACCTAGAAGTGGGTATGGTAAGTGTATGTTTAACTTGAAAAGAAACTACCAAAATGTTT 3183

 42346698 CCAAAGTGGTTGTACCATTTTGCTTACCTACCAGAAATGTGTAAGAGTTCTAGTTACTCC 42346757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3184 CCAAAGTGGTTGTACCATTTTGCTTACCTACCAGAAATGTGTAAGAGTTCTAGTTACTCC 3243

 42346758 ACATACTTCCTAGCAGTTGATATTCTCAG-TTTTTTTTTTTATTTTAACCGTTCTAATAG 42346816
          ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
     3244 ACATACTTCCTAGCAGTTGATATTCTCAGTTTTTTTTTTTTATTTTAACCGTTCTAATAG 3303

 42346817 CTGTGTAATGGTATTCCATTACAGTACTAATTTAAATTTCCCTAATAACTACTGAGGTTG 42346876
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3304 CTGTGTAATGGTATTCCATTACGGTACTAATTTAAATTTCCCTAATAACTACTGAGGTTG 3363

 42346877 AAAAAATCTTTCATGGGCATATTTGCCATCCTTGTATCTTCTCTGGTGACGAATCTTTCA 42346936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3364 AAAAAATCTTTCATGGGCATATTTGCCATCCTTGTATCTTCTCTGGTGACGAATCTTTCA 3423

 42346937 TGCCTTCTGCTTATATTTTAACCAGGGTTTTGTTTTGCTTTTTCTTAACTGTTGAGTTTT 42346996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3424 TGCCTTCTGCTTATATTTTAACCAGGGTTTTGTTTTGCTTTTTCTTAACTGTTGAGTTTT 3483

 42346997 AAG 42346999
          |||
     3484 AAG 3486

Alignment time is 2.63511 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [42336259,42357318] =>     21060 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [       1,    3599] =>      3599 nucs 'mol-32-3004-335335_3599'

Score:        3543
Aligned:      3598        nucs
Identic:      3593 (100%) nucs =>        34 (100%)      3559 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [42342945,42342978] EXCISED REGION [42342980,42346543]
 second seq =>  [       1,      34] EXCISED REGION [      36,    3599]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [42342979,42342979]
 second seq =>         1 nucs [35,35]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [42342978,42342978] to [42342979,42342979]
 second seq =>         2 nucs [35,36] to [36,37]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 42342945 GCTGGGATTACAGGTGTGAGCCATCGCACTCCAC 42342978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCTGGGATTACAGGTGTGAGCCATCGCACTCCAC 34

EXCISED REGION

 42342980 TTCTCTATAGTTACTGAGTTTGCGTGTTACACTGAGTTTACATCTTACATTTCTAGCCAT 42343039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       36 TTCTCTATAGTTACTGAGTTTGCGTGTTACACTGAGTTTACATCTTACATTTCTAGCCAT 95

 42343040 ATCAGAAACGACCTCTGCACCTCTCTTTCCCAATTTGAGATTTCTAATAGAAAGAATCTT 42343099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       96 ATCAGAAACGACCTCTGCACCTCTCTTTCCCAATTTGAGATTTCTAATAGAAAGAATCTT 155

 42343100 GTTCACCCAGCTTGGGACTCATTGAGTTATGACCAGTGGGATAGATTTTAGAAGATAAAC 42343159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      156 GTTCACCCAGCTTGGGACTCATTGAGTTATGACCAGTGGGATAGATTTTAGAAGATAAAC 215

 42343160 ATGTCTATAGGGACTTACCGTGTGAATTAGTGGGGGAGCCGCTTACCAGGCAGAGGGGTC 42343219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      216 ATGTCTATAGGGACTTACCGTGTGAATTAGTGGGGGAGCCGCTTACCAGGCAGAGGGGTC 275

 42343220 TGCTGTAAAGTGATACTGTGACTTTAAATTGAAAGTAAGCTTCTAGAAGAGTTGAAGAGG 42343279
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      276 TGCTGTAAAGTGATACTGTGACTCTAAATTGAAAGTAAGCTTCTAGAAGAGTTGAAGAGG 335

 42343280 AGTGGATTATTGTTGAATGGATGTATAACTAATGAAGCTTTAAAGGAAGTTTATTAGAAA 42343339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      336 AGTGGATTATTGTTGAATGGATGTATAACTAATGAAGCTTTAAAGGAAGTTTATTAGAAA 395

 42343340 GTCCATGTCCTTGTCTCTTTCCCAAACTCCTTTAGTTCCCAAGTCCTGAAAGAATCTATG 42343399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      396 GTCCATGTCCTTGTCTCTTTCCCAAACTCCTTTAGTTCCCAAGTCCTGAAAGAATCTATG 455

 42343400 GATAAGGGAAGCAGAATACTATAGTGGTTAAGAGCACATGCTCGAGGTTAAACTGTCTGT 42343459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      456 GATAAGGGAAGCAGAATACTATAGTGGTTAAGAGCACATGCTCGAGGTTAAACTGTCTGT 515

 42343460 ATTTTGGATCCTGGCCTTGAGGACTTGGGCAAGTTACGTGACCTGCCTGAGCCTCAGTTT 42343519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      516 ATTTTGGATCCTGGCCTTGAGGACTTGGGCAAGTTACGTGACCTGCCTGAGCCTCAGTTT 575

 42343520 CCTCACCTGTAATATGGGTATCACGAGGAATAAATAAGGTAATATGTGTAAAGTGCTTGG 42343579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      576 CCTCACCTGTAATATGGGTATCACGAGGAATAAATAAGGTAATATGTGTAAAGTGCTTGG 635

 42343580 CACAATGCTCTTGATAATGTTAGCAACATAATTTTGTAATGAAAATTAACTGATGGGGCT 42343639
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
      636 CACAATGCTCTTGATAATGTTAGCAACATAATTTTGTAATGAAAATTAACTGATGGGACT 695

 42343640 GAAATGTGCATCAGCAGATCCAAATATCCTTGATAAACTGGCCAAAAGAAAGATGAATTG 42343699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      696 GAAATGTGCATCAGCAGATCCAAATATCCTTGATAAACTGGCCAAAAGAAAGATGAATTG 755

 42343700 GCAGAGAGGCAAGTGTTCATCTCAGTTCTCCAGATATCCCTGCAAATGTGGCCTCTGGAG 42343759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      756 GCAGAGAGGCAAGTGTTCATCTCAGTTCTCCAGATATCCCTGCAAATGTGGCCTCTGGAG 815

 42343760 TAGAAGATTTAGGGAGAAAAATAAGCCATGAAGCTCTTCTGGCACCAACATGAACTTCAG 42343819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      816 TAGAAGATTTAGGGAGAAAAATAAGCCATGAAGCTCTTCTGGCACCAACATGAACTTCAG 875

 42343820 GGATCATGGGACATTTGGGCCAGTAACATTCCTCTTTGTTCCTAGAGATTTAATATCTAC 42343879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      876 GGATCATGGGACATTTGGGCCAGTAACATTCCTCTTTGTTCCTAGAGATTTAATATCTAC 935

 42343880 CTACCAACTAAATGGCCTTGATTTGGAGGAGAGAAGACAAGAAGAGGAATTGCTTTCAGC 42343939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      936 CTACCAACTAAATGGCCTTGATTTGGAGGAGAGAAGACAAGAAGAGGAATTGCTTTCAGC 995

 42343940 TGGTCCTTGCCTTTAACTAACCAGGGGTACAAAAATTTTAAAATACAAAGGAGACCATGT 42343999
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
      996 TGGTCCTTGCCTTTAACTAACCAGGGGTACAAAAATTTTAAAACACAAAGGAGACCATGT 1055

 42344000 GTAAAACATTAGTTAAGCTCAGATATAAATCTAGTCTTTGACCAGTCCAGAGCTAATCAA 42344059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1056 GTAAAACATTAGTTAAGCTCAGATATAAATCTAGTCTTTGACCAGTCCAGAGCTAATCAA 1115

 42344060 TATGCTTTTCTACTCTCTTTGAACTTTTGAGTTTTCTGGCAACAACAAAAATCCCAAACC 42344119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1116 TATGCTTTTCTACTCTCTTTGAACTTTTGAGTTTTCTGGCAACAACAAAAATCCCAAACC 1175

 42344120 TCATCCAAAACCGTAGTCCAGACAGCCCAGTTTCTGCACTCCCTTCCTTGTGTCACATAT 42344179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1176 TCATCCAAAACCGTAGTCCAGACAGCCCAGTTTCTGCACTCCCTTCCTTGTGTCACATAT 1235

 42344180 TGTTGACAGAACTACTCCCGTTACCACATTCATTCCAGTGGTGATTCAAATTCTTCTGCA 42344239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1236 TGTTGACAGAACTACTCCCGTTACCACATTCATTCCAGTGGTGATTCAAATTCTTCTGCA 1295

 42344240 GAAATGGACTTGAAAGACAGAAAACTGCTCCTGTAATCACTTAATAAGGAATCTTGGATG 42344299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1296 GAAATGGACTTGAAAGACAGAAAACTGCTCCTGTAATCACTTAATAAGGAATCTTGGATG 1355

 42344300 AGGAATACAGAGCTATGAATATGGATTTACTCTTAGCCTTTATGGATGCCTTTTTCTCAG 42344359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1356 AGGAATACAGAGCTATGAATATGGATTTACTCTTAGCCTTTATGGATGCCTTTTTCTCAG 1415

 42344360 TTATTTTCACTGAAAATCATGATGAACTGATTTAAATATCAAGGTAAACTGAGATGGAAA 42344419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1416 TTATTTTCACTGAAAATCATGATGAACTGATTTAAATATCAAGGTAAACTGAGATGGAAA 1475

 42344420 ATTACCGATAATAAGAGTTTTCTGAAAATATAGATTGGCCTCTTTAAAGCACATCGAGTT 42344479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1476 ATTACCGATAATAAGAGTTTTCTGAAAATATAGATTGGCCTCTTTAAAGCACATCGAGTT 1535

 42344480 TGTTTTGTTTAAATTACAAATTCACATATATTTGAAATGTGTTTAAATGTGTCAGTTTTA 42344539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1536 TGTTTTGTTTAAATTACAAATTCACATATATTTGAAATGTGTTTAAATGTGTCAGTTTTA 1595

 42344540 GGCAAAACTAAACTATTTGATTCCTTTCCAAAAATCAGGAATTTGCTTTGGAAAAAAACC 42344599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1596 GGCAAAACTAAACTATTTGATTCCTTTCCAAAAATCAGGAATTTGCTTTGGAAAAAAACC 1655

 42344600 ATGCAGTTTGATTTACAAAGCAGAGCGGGGGGGAAGTAGTGGGTGAGAAAGACCCACCCA 42344659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1656 ATGCAGTTTGATTTACAAAGCAGAGCGGGGGGGAAGTAGTGGGTGAGAAAGACCCACCCA 1715

 42344660 AAGGCTGCAGCCAGCTTCCCCAGGAAGATTCATAACCATGCCACAATACTGTCCTTCAAT 42344719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1716 AAGGCTGCAGCCAGCTTCCCCAGGAAGATTCATAACCATGCCACAATACTGTCCTTCAAT 1775

 42344720 TCGTTCCAACAGATTTTACTATAACTCTAAATCATTAGAAGCAACTGCTGCTATGACTAG 42344779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1776 TCGTTCCAACAGATTTTACTATAACTCTAAATCATTAGAAGCAACTGCTGCTATGACTAG 1835

 42344780 TGCTATCTTTGCCTCAAAAAGAGGAAAAATCAGGACATACAATATAATCCCCTCAGGATC 42344839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1836 TGCTATCTTTGCCTCAAAAAGAGGAAAAATCAGGACATACAATATAATCCCCTCAGGATC 1895

 42344840 TAGGAGAGAAATCAGCCCATTTGTCATAAGAACTGAAAACCTCAGCTAAATAGTATATGA 42344899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1896 TAGGAGAGAAATCAGCCCATTTGTCATAAGAACTGAAAACCTCAGCTAAATAGTATATGA 1955

 42344900 AACATTGGTATTTCATACCTTGACATTACATATTTTTGAAAATAAAGTAAGCATACACAC 42344959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1956 AACATTGGTATTTCATACCTTGACATTACATATTTTTGAAAATAAAGTAAGCATACACAC 2015

 42344960 AAGAAGTGGCTAGATGCAGCAGTTATAAAGTGGCTTAAGTTGGGTTAACTAAATATAACC 42345019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2016 AAGAAGTGGCTAGATGCAGCAGTTATAAAGTGGCTTAAGTTGGGTTAACTAAATATAACC 2075

 42345020 TAGAAAAACCATCTTATCTATTGCAAATTATTTCCAGAAAAAGGTAAGAAAAATCCAACC 42345079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2076 TAGAAAAACCATCTTATCTATTGCAAATTATTTCCAGAAAAAGGTAAGAAAAATCCAACC 2135

 42345080 AACACTTTTTAAACATCCTGAGCTATTCACAGCAAGTGAATCTTTACCCTTACCAGATGT 42345139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2136 AACACTTTTTAAACATCCTGAGCTATTCACAGCAAGTGAATCTTTACCCTTACCAGATGT 2195

 42345140 ATAAACATTTACATAAGGCAGGAGGTTCAACACTTGGAGAGTGTAATCAAGGCAGTAGTA 42345199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2196 ATAAACATTTACATAAGGCAGGAGGTTCAACACTTGGAGAGTGTAATCAAGGCAGTAGTA 2255

 42345200 ACGCAGTGCTCCTCTCTTTGACTTGAATGACTTCCTCCCCATTAGGGTCATTATTGTTTT 42345259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2256 ACGCAGTGCTCCTCTCTTTGACTTGAATGACTTCCTCCCCATTAGGGTCATTATTGTTTT 2315

 42345260 GCAGTGTCCCAGGGATGAAAGGACTTTGAAAGGTCATGTGTCTTGTGACCCAACTAGCAG 42345319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2316 GCAGTGTCCCAGGGATGAAAGGACTTTGAAAGGTCATGTGTCTTGTGACCCAACTAGCAG 2375

 42345320 CATCAGCATCACTGGGGAGAAACTCAAGCAGAAGCTTGAGTCTACTCCACTCTTGCTGAC 42345379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2376 CATCAGCATCACTGGGGAGAAACTCAAGCAGAAGCTTGAGTCTACTCCACTCTTGCTGAC 2435

 42345380 ACCAAATCTGCATTTTTACAGGATTCTTGGGTGAGTCACACACATATTCAAGGTTAAAAT 42345439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2436 ACCAAATCTGCATTTTTACAGGATTCTTGGGTGAGTCACACACATATTCAAGGTTAAAAT 2495

 42345440 ATGCCACCCTAGGTCTTTCTCCTGCTTCTGAGCAAAACTGGGCACAAGGGACAAACTAGT 42345499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2496 ATGCCACCCTAGGTCTTTCTCCTGCTTCTGAGCAAAACTGGGCACAAGGGACAAACTAGT 2555

 42345500 TTCCTTCAGCCACTTTCAAATCCTTTATAGAGTGTACTGTGTGAGTCACTGAGAGGAAAG 42345559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2556 TTCCTTCAGCCACTTTCAAATCCTTTATAGAGTGTACTGTGTGAGTCACTGAGAGGAAAG 2615

 42345560 AGGAAATAATACTTATTTAGGGAAGTCTTGCATAACTTAACAAAGTTAGTAACTTCTTCA 42345619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2616 AGGAAATAATACTTATTTAGGGAAGTCTTGCATAACTTAACAAAGTTAGTAACTTCTTCA 2675

 42345620 ATACACTCAAGTACCTATTTTTGGAAGCCCTACAGGTTAGGTCAAAGTAAAGAGAAGCAA 42345679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2676 ATACACTCAAGTACCTATTTTTGGAAGCCCTACAGGTTAGGTCAAAGTAAAGAGAAGCAA 2735

 42345680 AAAATGGAGTGAGTTCTAGTAAAAAACTCTGACAAAATAAGGGAAGTGTAGAAGCTGAGT 42345739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2736 AAAATGGAGTGAGTTCTAGTAAAAAACTCTGACAAAATAAGGGAAGTGTAGAAGCTGAGT 2795

 42345740 CTATGAGGGATGAGAGAAGCAATTTACCAAATTATCAGATCCAAAATCATCTCTGCACTG 42345799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2796 CTATGAGGGATGAGAGAAGCAATTTACCAAATTATCAGATCCAAAATCATCTCTGCACTG 2855

 42345800 TAGATGATTTATAGCCCTGGAAGCTTAGAGGCTTGAGTCTCTTGCTGTATTTCATTTCAA 42345859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2856 TAGATGATTTATAGCCCTGGAAGCTTAGAGGCTTGAGTCTCTTGCTGTATTTCATTTCAA 2915

 42345860 ATTAGTAATTTTTATCTAGGGCTTCCCTATGGCTTAAAGTGAAGGCCCTGGAATTTCTGA 42345919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2916 ATTAGTAATTTTTATCTAGGGCTTCCCTATGGCTTAAAGTGAAGGCCCTGGAATTTCTGA 2975

 42345920 AGTGAAATTATCTGATGATTTTTATGTATGGTCATTCTGTAGTTATCCTGTAAGTTTCAT 42345979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2976 AGTGAAATTATCTGATGATTTTTATGTATGGTCATTCTGTAGTTATCCTGTAAGTTTCAT 3035

 42345980 ATTTGTAACAAGACTGGAATCCGAACAATAGAAAACTCTGTGGCAGTAAGCCAAAACCTG 42346039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3036 ATTTGTAACAAGACTGGAATCCGAACAATAGAAAACTCTGTGGCAGTAAGCCAAAACCTG 3095

 42346040 ATGGACTTAGGAGAGTTACGTATGTGTGTTTCAGTGGTCCTCAAATTCAGCTGCCTATTA 42346099
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     3096 ATGGACTTAGGAGAGTTACGTATGTGTGTTTCAGTGGTCCTCAAATTTAGCTGCCTATTA 3155

 42346100 GAATCACCTGGACTTTGAAAAAAAAAGAGCTTTCTTGAGGTATAACTGACAAATAATAAG 42346159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3156 GAATCACCTGGACTTTGAAAAAAAAAGAGCTTTCTTGAGGTATAACTGACAAATAATAAG 3215

 42346160 ACAAACATATTTCAGTATACAATTGGATGAGTTTTGACATGTTATATTCTTGTGAAACCA 42346219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3216 ACAAACATATTTCAGTATACAATTGGATGAGTTTTGACATGTTATATTCTTGTGAAACCA 3275

 42346220 TCACCACAATCAAGCTATTCACCCCCCAAATTTTCGTGCCCCTTTGTTGTCCCACCCTTC 42346279
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3276 TCGCCACAATCAAGCTATTCACCCCCCAAATTTTCGTGCCCCTTTGTTGTCCCACCCTTC 3335

 42346280 TTTCTGCAACCACTGATCTGCTTTCTATCACTATGGATTAATTTGTATTTTCTAGAAGCT 42346339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3336 TTTCTGCAACCACTGATCTGCTTTCTATCACTATGGATTAATTTGTATTTTCTAGAAGCT 3395

 42346340 TAAATAAGTGAAACCATATGGTGTGCATGTTTTGCAGGGAGAGGGCAGGGGGAGCTGGTT 42346399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3396 TAAATAAGTGAAACCATATGGTGTGCATGTTTTGCAGGGAGAGGGCAGGGGGAGCTGGTT 3455

 42346400 TCTTTCACTCGGTGTAATTGTTCTGAGAGTCATCCGTGTTTGCATGTGTTAATAGTTTAT 42346459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3456 TCTTTCACTCGGTGTAATTGTTCTGAGAGTCATCCGTGTTTGCATGTGTTAATAGTTTAT 3515

 42346460 TCTTTTTATCGGTAAGTAGTATCCCATTGTGTGGATGTACCACATGTTGTCTAACCATTC 42346519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3516 TCTTTTTATCGGTAAGTAGTATCCCATTGTGTGGATGTACCACATGTTGTCTAACCATTC 3575

 42346520 ACAACTAAAGGATACTTGGGTTGT 42346543
          ||||||||||||||||||||||||
     3576 ACAACTAAAGGATACTTGGGTTGT 3599

Alignment time is 2.74447 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [42336259,42357318] =>     21060 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [       1,    7538] =>      7538 nucs 'mol-32-300f-261720_7538'

Score:        7420
Aligned:      7542        nucs
Identic:      7526 (100%) nucs =>      6962 (100%)       564 (100%)
Gaps:            8 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [42339282,42346259] EXCISED REGION [42347319,42347882]
 second seq =>  [       1,    6970] EXCISED REGION [    6975,    7538]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1059 nucs [42346260,42347318]
 second seq =>         4 nucs [6971,6974]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [6971,6971] to [6975,6975]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 42339282 ACACACACACACACACACACACTCTCTCTCCAGCCCTTGATGCTTTCCCCCTCTCTCTTC 42339341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACACACACACACACACACACACTCTCTCTCCAGCCCTTGATGCTTTCCCCCTCTCTCTTC 60

 42339342 CTCCTGGACCTTTTCTTTGCTCCATTCCCAACACACAGGTCCCTGGTCTGTCTCTGGCTC 42339401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTCCTGGACCTTTTCTTTGCTCCATTCCCAACACACAGGTCCCTGGTCTGTCTCTGGCTC 120

 42339402 CTTCCAAGCCTTGGCTCTTCTTAGGTATTATCCCCAGCAGCACAGCAGCAGACCAGCTGA 42339461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTTCCAAGCCTTGGCTCTTCTTAGGTATTATCCCCAGCAGCACAGCAGCAGACCAGCTGA 180

 42339462 CCTGGACTATTTCTTAGGCAGTAGTCAGGTAAGCTGTACCTACTCATATGGAGATATTGT 42339521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCTGGACTATTTCTTAGGCAGTAGTCAGGTAAGCTGTACCTACTCATATGGAGATATTGT 240

 42339522 TTGATCCTGAGCCTCTCCTGATGTCTCTTTTTAGCCCCCAGGGGGAGGTTTTAATATCCA 42339581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTGATCCTGAGCCTCTCCTGATGTCTCTTTTTAGCCCCCAGGGGGAGGTTTTAATATCCA 300

 42339582 CATCCACCAGCATCTTCTCCCTAGGGGAGAAGGGAGTGAGATGGGGAGAAGAAAGTGAGA 42339641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CATCCACCAGCATCTTCTCCCTAGGGGAGAAGGGAGTGAGATGGGGAGAAGAAAGTGAGA 360

 42339642 GGAATCGAAACATGTCTAAGGAAACTAAGAGGCAGAGGTTATTTCGATCTGCTCTTTATA 42339701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGAATCGAAACATGTCTAAGGAAACTAAGAGGCAGAGGTTATTTCGATCTGCTCTTTATA 420

 42339702 ATCATCTCAGATGCCTGCCCTGGGCAATGTCTAGGTTATTACTGAATTCTGGGGACACTC 42339761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATCATCTCAGATGCCTGCCCTGGGCAATGTCTAGGTTATTACTGAATTCTGGGGACACTC 480

 42339762 CCATATTAGCCCAATGACTAATCAAAAAAAGCAAGCTGACCATAGTCAACTAGAGGGTAA 42339821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCATATTAGCCCAATGACTAATCAAAAAAAGCAAGCTGACCATAGTCAACTAGAGGGTAA 540

 42339822 GGAACCAAGTGAAAATAGAGAGAGTTCTCCGGACCTCTGAATCTGGGTACAATCATTCAG 42339881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGAACCAAGTGAAAATAGAGAGAGTTCTCCGGACCTCTGAATCTGGGTACAATCATTCAG 600

 42339882 TATGAAGATAGGAGCTAGGAGAAGAGAGAAAACATGGAATTGTATTTTGATTGACTTTTT 42339941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TATGAAGATAGGAGCTAGGAGAAGAGAGAAAACATGGAATTGTATTTTGATTGACTTTTT 660

 42339942 TCTGATTACAAAAGTCATATATGTTCAATGTAGAAAACCAGGAAGATACTGAAAAATACA 42340001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCTGATTACAAAAGTCATATATGTTCAATGTAGAAAACCAGGAAGATACTGAAAAATACA 720

 42340002 AGAAGGTGTTAAAAAAAAAAAACACTTATGACCCCACCACCTAGATTTAATCAAGATTAA 42340061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGAAGGTGTTAAAAAAAAAAAACACTTATGACCCCACCACCTAGATTTAATCAAGATTAA 780

 42340062 CATGTTAGTTTACCTTTCCAGTGTGGTTTTCAATGCATATTCTTTTTAAAATCAAGTTAG 42340121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CATGTTAGTTTACCTTTCCAGTGTGGTTTTCAATGCATATTCTTTTTAAAATCAAGTTAG 840

 42340122 AAACATAGTGTATATGCTATTTTAGAAATTCTTTCTCAGCTGGGCGTGGTGGCTCATGCC 42340181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAACATAGTGTATATGCTATTTTAGAAATTCTTTCTCAGCTGGGCGTGGTGGCTCATGCC 900

 42340182 TGTAATCCCAGCACTTTAGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCAAG 42340241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGTAATCCCAGCACTTTAGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCAAG 960

 42340242 ACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACCAAAAATACAAAAATTAGCTGGGC 42340301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACCAAAAATACAAAAATTAGCTGGGC 1020

 42340302 ATGATGGCACACACCTGTAAATCTCAGCTATTCTGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTG 42340361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATGATGGCACACACCTGTAAATCTCAGCTATTCTGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTG 1080

 42340362 AACTTGAGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATCGCACCACTGCACTCCACTCCAGCCT 42340421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AACTTGAGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATCGCACCACTGCACTCCACTCCAGCCT 1140

 42340422 GGGCAACAGAGAGAGACTCTGTCTCAAAAAATAAAAAAGAAAGAAAAGAAAGAAATTCTT 42340481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GGGCAACAGAGAGAGACTCTGTCTCAAAAAATAAAAAAGAAAGAAAAGAAAGAAATTCTT 1200

 42340482 TCTCATACATTACATCATAAATCTTTTCCCAAATCATTAAATATTCTTCTGCAATATGAT 42340541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TCTCATACATTACATCATAAATCTTTTCCCAAATCATTAAATATTCTTCTGCAATATGAT 1260

 42340542 TTGTTAAAGCTATATATGATTTTGTGCAATAGATATGCTATAATAGGCTTACCCAATTTT 42340601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTGTTAAAGCTATATATGATTTTGTGCAATAGATATGCTATAATAGGCTTACCCAATTTT 1320

 42340602 ATATGGAAGAGCACTTACGCTGTTTCCAGGCATAGAATTCTAAATATGGCAAGGTTATCT 42340661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ATATGGAAGAGCACTTACGCTGTTTCCAGGCATAGAATTCTAAATATGGCAAGGTTATCT 1380

 42340662 GCACAACTCCTGTTTTCAGGCATGCTGACCTCCATTCCTTACAAGCAGATAATGATCCCT 42340721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GCACAACTCCTGTTTTCAGGCATGCTGACCTCCATTCCTTACAAGCAGATAATGATCCCT 1440

 42340722 TTAAAGTTCTCTGCTCAAGAGAACCGTGCCATAGCAGAAGTAATTCTTCCCCAAGCGTTC 42340781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTAAAGTTCTCTGCTCAAGAGAACCGTGCCATAGCAGAAGTAATTCTTCCCCAAGCGTTC 1500

 42340782 AGCTGTCCTGTGTTCTCCAGGGAAAGCCTAGCATTGGGCGTTGGGCATGCTTGCCTCTAA 42340841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AGCTGTCCTGTGTTCTCCAGGGAAAGCCTAGCATTGGGCGTTGGGCATGCTTGCCTCTAA 1560

 42340842 ATGGGAAGGCCAGTTCATTCTTAAGCAGATGGAGAGAAAGCATTTGTCATTCTAAATCCG 42340901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ATGGGAAGGCCAGTTCATTCTTAAGCAGATGGAGAGAAAGCATTTGTCATTCTAAATCCG 1620

 42340902 GGAAGTAGCTCAATTCAATTCAATTGCATAATTCTTAAAAACATATTTTGCGCCACTCCT 42340961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GGAAGTAGCTCAATTCAATTCAATTGCATAATTCTTAAAAACATATTTTGCGCCACTCCT 1680

 42340962 GAAAATGGTATTATAGAAGAAAAGTATGGTTTCTACCTTTAAGAAGATTGCTGACCGGGC 42341021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GAAAATGGTATTATAGAAGAAAAGTATGGTTTCTACCTTTAAGAAGATTGCTGACCGGGC 1740

 42341022 TGGGCGCAGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGAACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGCAGATCC 42341081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGGGCGCAGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGAACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGCAGATCC 1800

 42341082 CCTGAGGTCAGGAGTTAGAGGCTAGCCCGACCAACATGGCAAAACCCCGTCTCTACTAAA 42341141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CCTGAGGTCAGGAGTTAGAGGCTAGCCCGACCAACATGGCAAAACCCCGTCTCTACTAAA 1860

 42341142 AATATAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGTGCATGCCTGTAGCCCCAGCTACTCAGGAGACT 42341201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AATATAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGTGCATGCCTGTAGCCCCAGCTACTCAGGAGACT 1920

 42341202 CAGGCATGAAAATCGCTTGAACCCGAGACACGGAGGTGGTGGTGAGCTGAAATTGCGCCA 42341261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CAGGCATGAAAATCGCTTGAACCCGAGACACGGAGGTGGTGGTGAGCTGAAATTGCGCCA 1980

 42341262 CTGCATTCCAGCCTGGGCGACAGAGCAAGACTCTATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAG 42341321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||
     1981 CTGCATTCCAGCCTGGGCGACAGAGCAAGACTCTATCTCAAAAAAAAAAAAAAA--GAAG 2038

 42341322 AAGAAGAAGATTGCTGGCGGGGTGTTGTGGCTCATACTTGTAATCCTAGCACTTTGGGAG 42341381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 AAGAAGAAGATTGCTGGCGGGGTGTTGTGGCTCATACTTGTAATCCTAGCACTTTGGGAG 2098

 42341382 GCCAAGGAAGGAGGATCACTTGAGCCAAAGAAGTCAAGGCTGCAGTGAGCTGTGATCACA 42341441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 GCCAAGGAAGGAGGATCACTTGAGCCAAAGAAGTCAAGGCTGCAGTGAGCTGTGATCACA 2158

 42341442 CCACTCCATGCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAAACCCTGTCTCAAAAAGAAAAAAGAAAAG 42341501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 CCACTCCATGCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAAACCCTGTCTCAAAAAGAAAAAAGAAAAG 2218

 42341502 ATTGCCATCTTCCTGGGGTGACAAACATAATTTTAAAAGAATCAGGTAGAAACATAGGAC 42341561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2219 ATTGCCATCTTCCTGGGGTGACAAACATAATTTTAAAAGAATCAGGTAGAAACATAGGAC 2278

 42341562 TGTATTTATGATGAAACAACTATGACTAAATGCTATGTTTTTCAGATTACACGTGCCTTA 42341621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 TGTATTTATGATGAAACAACTATGACTAAATGCTATGTTTTTCAGATTACACGTGCCTTA 2338

 42341622 GGAAGTGAGAAAAGTATAAGTGCAATGTGGAATTGGGTGGTTGAGAAAACTCCAGAGAGG 42341681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 GGAAGTGAGAAAAGTATAAGTGCAATGTGGAATTGGGTGGTTGAGAAAACTCCAGAGAGG 2398

 42341682 ACCTGGTAGAGCTTGGAGGCAAGGTGGGCAAGGAACATTTCAAGAGGAGGGGACACTACA 42341741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 ACCTGGTAGAGCTTGGAGGCAAGGTGGGCAAGGAACATTTCAAGAGGAGGGGACACTACA 2458

 42341742 GCTGAGGCACAGAGGTGAGAAAGCACAGGAAGCAAGAAAGAGGCTCATCTGGCTGCAGCA 42341801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2459 GCTGAGGCACAGAGGTGAGAAAGCACAGGAAGCAAGAAAGAGGCTCATCTGGCTGCAGCA 2518

 42341802 GAGGGAGAAATAGTAAATTAGATCAGATAACTCATATATTGGGCACGTGTGCAGAGGGCC 42341861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2519 GAGGGAGAAATAGTAAATTAGATCAGATAACTCATATATTGGGCACGTGTGCAGAGGGCC 2578

 42341862 AAAAAGATGTTTGGCCTTAATTCTATAGGTATTCCCCTTTGCCATAGATGTTACACCAAG 42341921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2579 AAAAAGATGTTTGGCCTTAATTCTATAGGTATTCCCCTTTGCCATAGATGTTACACCAAG 2638

 42341922 AAAGAACACATTGAATCAAGCAAATTTAAGCTGGGTTTTTGTTTTTGTTTTTTGGTGGTG 42341981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2639 AAAGAACACATTGAATCAAGCAAATTTAAGCTGGGTTTTTGTTTTTGTTTTTTGGTGGTG 2698

 42341982 GGGGGGATGATTTATAAGCAGGACTTCCCAAAGCTTTTAATATGCTTATATATGTGGCAG 42342041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2699 GGGGGGATGATTTATAAGCAGGACTTCCCAAAGCTTTTAATATGCTTATATATGTGGCAG 2758

 42342042 TGTTGAGAGGGGAAGATTTGATATTCCAAGTATTTTTGGCCACAGAACTCTTTTTATCAT 42342101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2759 TGTTGAGAGGGGAAGATTTGATATTCCAAGTATTTTTGGCCACAGAACTCTTTTTATCAT 2818

 42342102 GGAACATTTCCAGTGTTCCATGAGACACAATTAGGGGCTAGTGAGCCACTGACTTTTGAG 42342161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2819 GGAACATTTCCAGTGTTCCATGAGACACAATTAGGGGCTAGTGAGCCACTGACTTTTGAG 2878

 42342162 TTGGAAAGTGACACATGGGGAAAGCAAAGTTTTGGAAGATTGATCTCACGGTAGAATATA 42342221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2879 TTGGAAAGTGACACATGGGGAAAGCAAAGTTTTGGAAGATTGATCTCACGGTAGAATATA 2938

 42342222 AGGTGAACAGGAGAGAAAAGAGCCTGGATTCAGGCAACACAATCAGATGATTGGATACAG 42342281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2939 AGGTGAACAGGAGAGAAAAGAGCCTGGATTCAGGCAACACAATCAGATGATTGGATACAG 2998

 42342282 GCTCAAGATTAGGGGGTGGGTTGCACTACACTGGAGCGGAGAATGGAGAGCAAAAGCACT 42342341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2999 GCTCAAGATTAGGGGGTGGGTTGCACTACACTGGAGCGGAGAATGGAGAGCAAAAGCACT 3058

 42342342 GATTGAATGCACAGTCTTCTGTTGGATCCTGGGATGATACAGAAGTGTCAGAGTTCCTGG 42342401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3059 GATTGAATGCACAGTCTTCTGTTGGATCCTGGGATGATACAGAAGTGTCAGAGTTCCTGG 3118

 42342402 GTCTTGTAGGAGTTCCAATGAGCATCAATCAAAAGTTTGATTGTAAGGCACAGAAATCAA 42342461
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3119 GTCTTGTAGGAGTTCCAATGCGCATCAATCAAAAGTTTGATTGTAAGGCACAGAAATCAA 3178

 42342462 CTTGGACCAGCTAAAGCAAAAAGACCATTTTTAGGGAAATAGGGATGTGTCACAAAGAAC 42342521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3179 CTTGGACCAGCTAAAGCAAAAAGACCATTTTTAGGGAAATAGGGATGTGTCACAAAGAAC 3238

 42342522 TGCATCTAGGTACTGGAAATCAACAAAAAGTTCCCCATCTGATCTCAGCTTCTCTGTGTG 42342581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3239 TGCATCTAGGTACTGGAAATCAACAAAAAGTTCCCCATCTGATCTCAGCTTCTCTGTGTG 3298

 42342582 TCTACTACATACACTATCTTTCTCCTCTTTTCTTTCCTCTCTACCCCCTACCTCCCTCCT 42342641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3299 TCTACTACATACACTATCTTTCTCCTCTTTTCTTTCCTCTCTACCCCCTACCTCCCTCCT 3358

 42342642 CTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTGTTTTTTGGTTTTTTTATGTTTGTTTGTTTGCTTTTGG 42342701
          ||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     3359 CTCTCTTTTTTTTTTT------GTTTTTTGGTTTTTTTATGTTTGTTTGTTTGTTTTTGG 3412

 42342702 AGACACGGTCTCCCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCTTAATTACTGCAGCCTCA 42342761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3413 AGACACGGTCTCCCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCTTAATTACTGCAGCCTCA 3472

 42342762 ATCTCCTGGGCTCAAGTGACCCTCCCACCTCAGCCTCCTGAATAGCTGGGACCACAGGTG 42342821
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     3473 ATCTCCTGGGCTCAAGTGACCCTCCCACTTCAGCCTCCTGAATAGCTGGGACCACAGGTG 3532

 42342822 CAAGCCACAGTGCTCAGCTAATTAAAAAAAATTTTTTTTTCAGAGATGGGGTCTCACTAT 42342881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3533 CAAGCCACAGTGCTCAGCTAATTAAAAAAAATTTTTTTTTCAGAGATGGGGTCTCACTAT 3592

 42342882 GTTGTCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTAGGCTCAAGCAGTCCTCCCGTTTCAGCCTCAAAA 42342941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3593 GTTGTCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTAGGCTCAAGCAGTCCTCCCGTTTCAGCCTCAAAA 3652

 42342942 AGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCATCGCACTCCACCTTCTCTATAGTTACTGAGTTTG 42343001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3653 AGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCATCGCACTCCACCTTCTCTATAGTTACTGAGTTTG 3712

 42343002 CGTGTTACACTGAGTTTACATCTTACATTTCTAGCCATATCAGAAACGACCTCTGCACCT 42343061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3713 CGTGTTACACTGAGTTTACATCTTACATTTCTAGCCATATCAGAAACGACCTCTGCACCT 3772

 42343062 CTCTTTCCCAATTTGAGATTTCTAATAGAAAGAATCTTGTTCACCCAGCTTGGGACTCAT 42343121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3773 CTCTTTCCCAATTTGAGATTTCTAATAGAAAGAATCTTGTTCACCCAGCTTGGGACTCAT 3832

 42343122 TGAGTTATGACCAGTGGGATAGATTTTAGAAGATAAACATGTCTATAGGGACTTACCGTG 42343181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3833 TGAGTTATGACCAGTGGGATAGATTTTAGAAGATAAACATGTCTATAGGGACTTACCGTG 3892

 42343182 TGAATTAGTGGGGGAGCCGCTTACCAGGCAGAGGGGTCTGCTGTAAAGTGATACTGTGAC 42343241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3893 TGAATTAGTGGGGGAGCCGCTTACCAGGCAGAGGGGTCTGCTGTAAAGTGATACTGTGAC 3952

 42343242 TTTAAATTGAAAGTAAGCTTCTAGAAGAGTTGAAGAGGAGTGGATTATTGTTGAATGGAT 42343301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3953 TTTAAATTGAAAGTAAGCTTCTAGAAGAGTTGAAGAGGAGTGGATTATTGTTGAATGGAT 4012

 42343302 GTATAACTAATGAAGCTTTAAAGGAAGTTTATTAGAAAGTCCATGTCCTTGTCTCTTTCC 42343361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4013 GTATAACTAATGAAGCTTTAAAGGAAGTTTATTAGAAAGTCCATGTCCTTGTCTCTTTCC 4072

 42343362 CAAACTCCTTTAGTTCCCAAGTCCTGAAAGAATCTATGGATAAGGGAAGCAGAATACTAT 42343421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4073 CAAACTCCTTTAGTTCCCAAGTCCTGAAAGAATCTATGGATAAGGGAAGCAGAATACTAT 4132

 42343422 AGTGGTTAAGAGCACATGCTCGAGGTTAAACTGTCTGTATTTTGGATCCTGGCCTTGAGG 42343481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4133 AGTGGTTAAGAGCACATGCTCGAGGTTAAACTGTCTGTATTTTGGATCCTGGCCTTGAGG 4192

 42343482 ACTTGGGCAAGTTACGTGACCTGCCTGAGCCTCAGTTTCCTCACCTGTAATATGGGTATC 42343541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4193 ACTTGGGCAAGTTACGTGACCTGCCTGAGCCTCAGTTTCCTCACCTGTAATATGGGTATC 4252

 42343542 ACGAGGAATAAATAAGGTAATATGTGTAAAGTGCTTGGCACAATGCTCTTGATAATGTTA 42343601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4253 ACGAGGAATAAATAAGGTAATATGTGTAAAGTGCTTGGCACAATGCTCTTGATAATGTTA 4312

 42343602 GCAACATAATTTTGTAATGAAAATTAACTGATGGGGCTGAAATGTGCATCAGCAGATCCA 42343661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4313 GCAACATAATTTTGTAATGAAAATTAACTGATGGGGCTGAAATGTGCATCAGCAGATCCA 4372

 42343662 AATATCCTTGATAAACTGGCCAAAAGAAAGATGAATTGGCAGAGAGGCAAGTGTTCATCT 42343721
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4373 AATATCCTCGATAAACTGGCCAAAAGAAAGATGAATTGGCAGAGAGGCAAGTGTTCATCT 4432

 42343722 CAGTTCTCCAGATATCCCTGCAAATGTGGCCTCTGGAGTAGAAGATTTAGGGAGAAAAAT 42343781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4433 CAGTTCTCCAGATATCCCTGCAAATGTGGCCTCTGGAGTAGAAGATTTAGGGAGAAAAAT 4492

 42343782 AAGCCATGAAGCTCTTCTGGCACCAACATGAACTTCAGGGATCATGGGACATTTGGGCCA 42343841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4493 AAGCCATGAAGCTCTTCTGGCACCAACATGAACTTCAGGGATCATGGGACATTTGGGCCA 4552

 42343842 GTAACATTCCTCTTTGTTCCTAGAGATTTAATATCTACCTACCAACTAAATGGCCTTGAT 42343901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4553 GTAACATTCCTCTTTGTTCCTAGAGATTTAATATCTACCTACCAACTAAATGGCCTTGAT 4612

 42343902 TTGGAGGAGAGAAGACAAGAAGAGGAATTGCTTTCAGCTGGTCCTTGCCTTTAACTAACC 42343961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4613 TTGGAGGAGAGAAGACAAGAAGAGGAATTGCTTTCAGCTGGTCCTTGCCTTTAACTAACC 4672

 42343962 AGGGGTACAAAAATTTTAAAATACAAAGGAGACCATGTGTAAAACATTAGTTAAGCTCAG 42344021
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4673 AGGGGTACAAAAATTTTAAAACACAAAGGAGACCATGTGTAAAACATTAGTTAAGCTCAG 4732

 42344022 ATATAAATCTAGTCTTTGACCAGTCCAGAGCTAATCAATATGCTTTTCTACTCTCTTTGA 42344081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4733 ATATAAATCTAGTCTTTGACCAGTCCAGAGCTAATCAATATGCTTTTCTACTCTCTTTGA 4792

 42344082 ACTTTTGAGTTTTCTGGCAACAACAAAAATCCCAAACCTCATCCAAAACCGTAGTCCAGA 42344141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4793 ACTTTTGAGTTTTCTGGCAACAACAAAAATCCCAAACCTCATCCAAAACCGTAGTCCAGA 4852

 42344142 CAGCCCAGTTTCTGCACTCCCTTCCTTGTGTCACATATTGTTGACAGAACTACTCCCGTT 42344201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4853 CAGCCCAGTTTCTGCACTCCCTTCCTTGTGTCACATATTGTTGACAGAACTACTCCCGTT 4912

 42344202 ACCACATTCATTCCAGTGGTGATTCAAATTCTTCTGCAGAAATGGACTTGAAAGACAGAA 42344261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4913 ACCACATTCATTCCAGTGGTGATTCAAATTCTTCTGCAGAAATGGACTTGAAAGACAGAA 4972

 42344262 AACTGCTCCTGTAATCACTTAATAAGGAATCTTGGATGAGGAATACAGAGCTATGAATAT 42344321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4973 AACTGCTCCTGTAATCACTTAATAAGGAATCTTGGATGAGGAATACAGAGCTATGAATAT 5032

 42344322 GGATTTACTCTTAGCCTTTATGGATGCCTTTTTCTCAGTTATTTTCACTGAAAATCATGA 42344381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5033 GGATTTACTCTTAGCCTTTATGGATGCCTTTTTCTCAGTTATTTTCACTGAAAATCATGA 5092

 42344382 TGAACTGATTTAAATATCAAGGTAAACTGAGATGGAAAATTACCGATAATAAGAGTTTTC 42344441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5093 TGAACTGATTTAAATATCAAGGTAAACTGAGATGGAAAATTACCGATAATAAGAGTTTTC 5152

 42344442 TGAAAATATAGATTGGCCTCTTTAAAGCACATCGAGTTTGTTTTGTTTAAATTACAAATT 42344501
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     5153 TGAAAATATAGATTGGCCTCTTTAAAACACATCGAGTTTGTTTTGTTTAAATTACAAATT 5212

 42344502 CACATATATTTGAAATGTGTTTAAATGTGTCAGTTTTAGGCAAAACTAAACTATTTGATT 42344561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5213 CACATATATTTGAAATGTGTTTAAATGTGTCAGTTTTAGGCAAAACTAAACTATTTGATT 5272

 42344562 CCTTTCCAAAAATCAGGAATTTGCTTTGGAAAAAAACCATGCAGTTTGATTTACAAAGCA 42344621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5273 CCTTTCCAAAAATCAGGAATTTGCTTTGGAAAAAAACCATGCAGTTTGATTTACAAAGCA 5332

 42344622 GAGCGGGGGGGAAGTAGTGGGTGAGAAAGACCCACCCAAAGGCTGCAGCCAGCTTCCCCA 42344681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5333 GAGCGGGGGGGAAGTAGTGGGTGAGAAAGACCCACCCAAAGGCTGCAGCCAGCTTCCCCA 5392

 42344682 GGAAGATTCATAACCATGCCACAATACTGTCCTTCAATTCGTTCCAACAGATTTTACTAT 42344741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5393 GGAAGATTCATAACCATGCCACAATACTGTCCTTCAATTCGTTCCAACAGATTTTACTAT 5452

 42344742 AACTCTAAATCATTAGAAGCAACTGCTGCTATGACTAGTGCTATCTTTGCCTCAAAAAGA 42344801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5453 AACTCTAAATCATTAGAAGCAACTGCTGCTATGACTAGTGCTATCTTTGCCTCAAAAAGA 5512

 42344802 GGAAAAATCAGGACATACAATATAATCCCCTCAGGATCTAGGAGAGAAATCAGCCCATTT 42344861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5513 GGAAAAATCAGGACATACAATATAATCCCCTCAGGATCTAGGAGAGAAATCAGCCCATTT 5572

 42344862 GTCATAAGAACTGAAAACCTCAGCTAAATAGTATATGAAACATTGGTATTTCATACCTTG 42344921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5573 GTCATAAGAACTGAAAACCTCAGCTAAATAGTATATGAAACATTGGTATTTCATACCTTG 5632

 42344922 ACATTACATATTTTTGAAAATAAAGTAAGCATACACACAAGAAGTGGCTAGATGCAGCAG 42344981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5633 ACATTACATATTTTTGAAAATAAAGTAAGCATACACACAAGAAGTGGCTAGATGCAGCAG 5692

 42344982 TTATAAAGTGGCTTAAGTTGGGTTAACTAAATATAACCTAGAAAAACCATCTTATCTATT 42345041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5693 TTATAAAGTGGCTTAAGTTGGGTTAACTAAATATAACCTAGAAAAACCATCTTATCTATT 5752

 42345042 GCAAATTATTTCCAGAAAAAGGTAAGAAAAATCCAACCAACACTTTTTAAACATCCTGAG 42345101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5753 GCAAATTATTTCCAGAAAAAGGTAAGAAAAATCCAACCAACACTTTTTAAACATCCTGAG 5812

 42345102 CTATTCACAGCAAGTGAATCTTTACCCTTACCAGATGTATAAACATTTACATAAGGCAGG 42345161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5813 CTATTCACAGCAAGTGAATCTTTACCCTTACCAGATGTATAAACATTTACATAAGGCAGG 5872

 42345162 AGGTTCAACACTTGGAGAGTGTAATCAAGGCAGTAGTAACGCAGTGCTCCTCTCTTTGAC 42345221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5873 AGGTTCAACACTTGGAGAGTGTAATCAAGGCAGTAGTAACGCAGTGCTCCTCTCTTTGAC 5932

 42345222 TTGAATGACTTCCTCCCCATTAGGGTCATTATTGTTTTGCAGTGTCCCAGGGATGAAAGG 42345281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5933 TTGAATGACTTCCTCCCCATTAGGGTCATTATTGTTTTGCAGTGTCCCAGGGATGAAAGG 5992

 42345282 ACTTTGAAAGGTCATGTGTCTTGTGACCCAACTAGCAGCATCAGCATCACTGGGGAGAAA 42345341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5993 ACTTTGAAAGGTCATGTGTCTTGTGACCCAACTAGCAGCATCAGCATCACTGGGGAGAAA 6052

 42345342 CTCAAGCAGAAGCTTGAGTCTACTCCACTCTTGCTGACACCAAATCTGCATTTTTACAGG 42345401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6053 CTCAAGCAGAAGCTTGAGTCTACTCCACTCTTGCTGACACCAAATCTGCATTTTTACAGG 6112

 42345402 ATTCTTGGGTGAGTCACACACATATTCAAGGTTAAAATATGCCACCCTAGGTCTTTCTCC 42345461
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6113 ATTCTTGGGTGAGTCACAGACATATTCAAGGTTAAAATATGCCACCCTAGGTCTTTCTCC 6172

 42345462 TGCTTCTGAGCAAAACTGGGCACAAGGGACAAACTAGTTTCCTTCAGCCACTTTCAAATC 42345521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6173 TGCTTCTGAGCAAAACTGGGCACAAGGGACAAACTAGTTTCCTTCAGCCACTTTCAAATC 6232

 42345522 CTTTATAGAGTGTACTGTGTGAGTCACTGAGAGGAAAGAGGAAATAATACTTATTTAGGG 42345581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6233 CTTTATAGAGTGTACTGTGTGAGTCACTGAGAGGAAAGAGGAAATAATACTTATTTAGGG 6292

 42345582 AAGTCTTGCATAACTTAACAAAGTTAGTAACTTCTTCAATACACTCAAGTACCTATTTTT 42345641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6293 AAGTCTTGCATAACTTAACAAAGTTAGTAACTTCTTCAATACACTCAAGTACCTATTTTT 6352

 42345642 GGAAGCCCTACAGGTTAGGTCAAAGTAAAGAGAAGCAAAAAATGGAGTGAGTTCTAGTAA 42345701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6353 GGAAGCCCTACAGGTTAGGTCAAAGTAAAGAGAAGCAAAAAATGGAGTGAGTTCTAGTAA 6412

 42345702 AAAACTCTGACAAAATAAGGGAAGTGTAGAAGCTGAGTCTATGAGGGATGAGAGAAGCAA 42345761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6413 AAAACTCTGACAAAATAAGGGAAGTGTAGAAGCTGAGTCTATGAGGGATGAGAGAAGCAA 6472

 42345762 TTTACCAAATTATCAGATCCAAAATCATCTCTGCACTGTAGATGATTTATAGCCCTGGAA 42345821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6473 TTTACCAAATTATCAGATCCAAAATCATCTCTGCACTGTAGATGATTTATAGCCCTGGAA 6532

 42345822 GCTTAGAGGCTTGAGTCTCTTGCTGTATTTCATTTCAAATTAGTAATTTTTATCTAGGGC 42345881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6533 GCTTAGAGGCTTGAGTCTCTTGCTGTATTTCATTTCAAATTAGTAATTTTTATCTAGGGC 6592

 42345882 TTCCCTATGGCTTAAAGTGAAGGCCCTGGAATTTCTGAAGTGAAATTATCTGATGATTTT 42345941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6593 TTCCCTATGGCTTAAAGTGAAGGCCCTGGAATTTCTGAAGTGAAATTATCTGATGATTTT 6652

 42345942 TATGTATGGTCATTCTGTAGTTATCCTGTAAGTTTCATATTTGTAACAAGACTGGAATCC 42346001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6653 TATGTATGGTCATTCTGTAGTTATCCTGTAAGTTTCATATTTGTAACAAGACTGGAATCC 6712

 42346002 GAACAATAGAAAACTCTGTGGCAGTAAGCCAAAACCTGATGGACTTAGGAGAGTTACGTA 42346061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6713 GAACAATAGAAAACTCTGTGGCAGTAAGCCAAAACCTGATGGACTTAGGAGAGTTACGTA 6772

 42346062 TGTGTGTTTCAGTGGTCCTCAAATTCAGCTGCCTATTAGAATCACCTGGACTTTGAAAAA 42346121
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6773 TGTGTGTTTCAGTGGTCCTCAAATTTAGCTGCCTATTAGAATCACCTGGACTTTGAAAAA 6832

 42346122 AAAAGAGCTTTCTTGAGGTATAACTGACAAATAATAAGACAAACATATTTCAGTATACAA 42346181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6833 AAAAGAGCTTTCTTGAGGTATAACTGACAAATAATAAGACAAACATATTTCAGTATACAA 6892

 42346182 TTGGATGAGTTTTGACATGTTATATTCTTGTGAAACCATCACCACAATCAAGCTATTCAC 42346241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6893 TTGGATGAGTTTTGACATGTTATATTCTTGTGAAACCATCACCACAATCAAGCTATTCAC 6952

 42346242 CCCCCAAATTTTCGTGCC 42346259
          ||||||||||||||||||
     6953 CCCCCAAATTTTCGTGCC 6970

EXCISED REGION

 42347319 TTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGCTCTCAAACTCCTGA 42347378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6975 TTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGCTCTCAAACTCCTGA 7034

 42347379 CCTCAGGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACC 42347438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7035 CCTCAGGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACC 7094

 42347439 ATGCCCAGCGTATTAATTTTCTTGCATGGATGGTGCGTTTGGTGATCTGAGAAATCTTTA 42347498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7095 ATGCCCAGCGTATTAATTTTCTTGCATGGATGGTGCGTTTGGTGATCTGAGAAATCTTTA 7154

 42347499 CCTAACCCAAGGTCACAGAGATTTTCTCCTGTTTGCTTCCAAAATTTTTATACGTTTAGA 42347558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7155 CCTAACCCAAGGTCACAGAGATTTTCTCCTGTTTGCTTCCAAAATTTTTATACGTTTAGA 7214

 42347559 TTTTATATTTAAGTCTATTTTGAGTTAATTTTTGTATATAATGCAAAGTTTAGAATGATG 42347618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7215 TTTTATATTTAAGTCTATTTTGAGTTAATTTTTGTATATAATGCAAAGTTTAGAATGATG 7274

 42347619 TTTAGTTTTTTGTCTATAATCTATGAATATCCAATAGTTCTAGCACCATTTATTGAAAAG 42347678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7275 TTTAGTTTTTTGTCTATAATCTATGAATATCCAATAGTTCTAGCACCATTTATTGAAAAG 7334

 42347679 ACTGATCTTTATCTACTGAAGTGTCTTTGCACTTTTGTTGAAAGTCAATTGACAATTGAC 42347738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7335 ACTGATCTTTATCTACTGAAGTGTCTTTGCACTTTTGTTGAAAGTCAATTGACAATTGAC 7394

 42347739 CATATATTTGTGGGTCTATTCTGGATTCTCTATTCTGTTACATTGATCTATTTTTCTATC 42347798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7395 CATATATTTGTGGGTCTATTCTGGATTCTCTATTCTGTTACATTGATCTATTTTTCTATC 7454

 42347799 TCAATACAAATATCAAATTGGGTATTTGTATTAAGACAAATATAATTTGTCTGGGTATTT 42347858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7455 TCAATACAAATATCAAATTGGGTATTTGTATTAAGACAAATATAATTTGTCTGGGTATTT 7514

 42347859 GTCAAGACAAATAAAAATTGTCTT 42347882
          ||||||||||||||||||||||||
     7515 GTCAAGACAAATAAAAATTGTCTT 7538

Alignment time is 5.60445 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [42336259,42357318] =>     21060 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [       1,    6057] =>      6057 nucs 'mol-32-301a-228220_6057'

Score:        5948
Aligned:      6058        nucs
Identic:      6048 (100%) nucs =>      2067 (100%)      3981 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [42340576,42342646] EXCISED REGION [42342651,42346637]
 second seq =>  [       1,    2070] EXCISED REGION [    2071,    6057]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         4 nucs [42342647,42342650]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        13 nucs [42342647,42342659] to [42342651,42342663]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [42342647,42342648] to [42342649,42342650]
 second seq =>         0 nucs

 42340576 ATGCTATAATAGGCTTACCCAATTTTATATGGAAGAGCACTTACGCTGTTTCCAGGCATA 42340635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATGCTATAATAGGCTTACCCAATTTTATATGGAAGAGCACTTACGCTGTTTCCAGGCATA 60

 42340636 GAATTCTAAATATGGCAAGGTTATCTGCACAACTCCTGTTTTCAGGCATGCTGACCTCCA 42340695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAATTCTAAATATGGCAAGGTTATCTGCACAACTCCTGTTTTCAGGCATGCTGACCTCCA 120

 42340696 TTCCTTACAAGCAGATAATGATCCCTTTAAAGTTCTCTGCTCAAGAGAACCGTGCCATAG 42340755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTCCTTACAAGCAGATAATGATCCCTTTAAAGTTCTCTGCTCAAGAGAACCGTGCCATAG 180

 42340756 CAGAAGTAATTCTTCCCCAAGCGTTCAGCTGTCCTGTGTTCTCCAGGGAAAGCCTAGCAT 42340815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CAGAAGTAATTCTTCCCCAAGCGTTCAGCTGTCCTGTGTTCTCCAGGGAAAGCCTAGCAT 240

 42340816 TGGGCGTTGGGCATGCTTGCCTCTAAATGGGAAGGCCAGTTCATTCTTAAGCAGATGGAG 42340875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGGGCGTTGGGCATGCTTGCCTCTAAATGGGAAGGCCAGTTCATTCTTAAGCAGATGGAG 300

 42340876 AGAAAGCATTTGTCATTCTAAATCCGGGAAGTAGCTCAATTCAATTCAATTGCATAATTC 42340935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGAAAGCATTTGTCATTCTAAATCCGGGAAGTAGCTCAATTCAATTCAATTGCATAATTC 360

 42340936 TTAAAAACATATTTTGCGCCACTCCTGAAAATGGTATTATAGAAGAAAAGTATGGTTTCT 42340995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTAAAAACATATTTTGCGCCACTCCTGAAAATGGTATTATAGAAGAAAAGTATGGTTTCT 420

 42340996 ACCTTTAAGAAGATTGCTGACCGGGCTGGGCGCAGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGAAC 42341055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACCTTTAAGAAGATTGCTGACCGGGCTGGGCGCAGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGAAC 480

 42341056 TTTGGGAGGCCGAGGCAGGCAGATCCCCTGAGGTCAGGAGTTAGAGGCTAGCCCGACCAA 42341115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTGGGAGGCCGAGGCAGGCAGATCCCCTGAGGTCAGGAGTTAGAGGCTAGCCCGACCAA 540

 42341116 CATGGCAAAACCCCGTCTCTACTAAAAATATAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGTGCATGC 42341175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CATGGCAAAACCCCGTCTCTACTAAAAATATAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGTGCATGC 600

 42341176 CTGTAGCCCCAGCTACTCAGGAGACTCAGGCATGAAAATCGCTTGAACCCGAGACACGGA 42341235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTGTAGCCCCAGCTACTCAGGAGACTCAGGCATGAAAATCGCTTGAACCCGAGACACGGA 660

 42341236 GGTGGTGGTGAGCTGAAATTGCGCCACTGCATTCCAGCCTGGGCGACAGAGCAAGACTCT 42341295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGTGGTGGTGAGCTGAAATTGCGCCACTGCATTCCAGCCTGGGCGACAGAGCAAGACTCT 720

 42341296 ATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAGAAGAAGAAGATTGCTGGCGGGGTGTTGTGGCTCA 42341355
          ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATCTCAAAAAAAAAAAAAAAA-GAAGAAGAAGAAGATTGCTGGCGGGGTGTTGTGGCTCA 779

 42341356 TACTTGTAATCCTAGCACTTTGGGAGGCCAAGGAAGGAGGATCACTTGAGCCAAAGAAGT 42341415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
      780 TACTTGTAATCCTAGCACTTTGGGAGGCCAAGGAAGGAGGATCACTTGAGCCAAAGAACT 839

 42341416 CAAGGCTGCAGTGAGCTGTGATCACACCACTCCATGCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAAAC 42341475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 CAAGGCTGCAGTGAGCTGTGATCACACCACTCCATGCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAAAC 899

 42341476 CCTGTCTCAAAAAGAAAAAAGAAAAGATTGCCATCTTCCTGGGGTGACAAACATAATTTT 42341535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 CCTGTCTCAAAAAGAAAAAAGAAAAGATTGCCATCTTCCTGGGGTGACAAACATAATTTT 959

 42341536 AAAAGAATCAGGTAGAAACATAGGACTGTATTTATGATGAAACAACTATGACTAAATGCT 42341595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 AAAAGAATCAGGTAGAAACATAGGACTGTATTTATGATGAAACAACTATGACTAAATGCT 1019

 42341596 ATGTTTTTCAGATTACACGTGCCTTAGGAAGTGAGAAAAGTATAAGTGCAATGTGGAATT 42341655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 ATGTTTTTCAGATTACACGTGCCTTAGGAAGTGAGAAAAGTATAAGTGCAATGTGGAATT 1079

 42341656 GGGTGGTTGAGAAAACTCCAGAGAGGACCTGGTAGAGCTTGGAGGCAAGGTGGGCAAGGA 42341715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 GGGTGGTTGAGAAAACTCCAGAGAGGACCTGGTAGAGCTTGGAGGCAAGGTGGGCAAGGA 1139

 42341716 ACATTTCAAGAGGAGGGGACACTACAGCTGAGGCACAGAGGTGAGAAAGCACAGGAAGCA 42341775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 ACATTTCAAGAGGAGGGGACACTACAGCTGAGGCACAGAGGTGAGAAAGCACAGGAAGCA 1199

 42341776 AGAAAGAGGCTCATCTGGCTGCAGCAGAGGGAGAAATAGTAAATTAGATCAGATAACTCA 42341835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 AGAAAGAGGCTCATCTGGCTGCAGCAGAGGGAGAAATAGTAAATTAGATCAGATAACTCA 1259

 42341836 TATATTGGGCACGTGTGCAGAGGGCCAAAAAGATGTTTGGCCTTAATTCTATAGGTATTC 42341895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 TATATTGGGCACGTGTGCAGAGGGCCAAAAAGATGTTTGGCCTTAATTCTATAGGTATTC 1319

 42341896 CCCTTTGCCATAGATGTTACACCAAGAAAGAACACATTGAATCAAGCAAATTTAAGCTGG 42341955
          ||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||||
     1320 CCCTTTGCCATAGATGTTACACCAAGGAAGAACACATTGAATCAAGCAACTTTAAGCTGG 1379

 42341956 GTTTTTGTTTTTGTTTTTTGGTGGTGGGGGGGATGATTTATAAGCAGGACTTCCCAAAGC 42342015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 GTTTTTGTTTTTGTTTTTTGGTGGTGGGGGGGATGATTTATAAGCAGGACTTCCCAAAGC 1439

 42342016 TTTTAATATGCTTATATATGTGGCAGTGTTGAGAGGGGAAGATTTGATATTCCAAGTATT 42342075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 TTTTAATATGCTTATATATGTGGCAGTGTTGAGAGGGGAAGATTTGATATTCCAAGTATT 1499

 42342076 TTTGGCCACAGAACTCTTTTTATCATGGAACATTTCCAGTGTTCCATGAGACACAATTAG 42342135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 TTTGGCCACAGAACTCTTTTTATCATGGAACATTTCCAGTGTTCCATGAGACACAATTAG 1559

 42342136 GGGCTAGTGAGCCACTGACTTTTGAGTTGGAAAGTGACACATGGGGAAAGCAAAGTTTTG 42342195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 GGGCTAGTGAGCCACTGACTTTTGAGTTGGAAAGTGACACATGGGGAAAGCAAAGTTTTG 1619

 42342196 GAAGATTGATCTCACGGTAGAATATAAGGTGAACAGGAGAGAAAAGAGCCTGGATTCAGG 42342255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 GAAGATTGATCTCACGGTAGAATATAAGGTGAACAGGAGAGAAAAGAGCCTGGATTCAGG 1679

 42342256 CAACACAATCAGATGATTGGATACAGGCTCAAGATTAGGGGGTGGGTTGCACTACACTGG 42342315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 CAACACAATCAGATGATTGGATACAGGCTCAAGATTAGGGGGTGGGTTGCACTACACTGG 1739

 42342316 AGCGGAGAATGGAGAGCAAAAGCACTGATTGAATGCACAGTCTTCTGTTGGATCCTGGGA 42342375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 AGCGGAGAATGGAGAGCAAAAGCACTGATTGAATGCACAGTCTTCTGTTGGATCCTGGGA 1799

 42342376 TGATACAGAAGTGTCAGAGTTCCTGGGTCTTGTAGGAGTTCCAATGAGCATCAATCAAAA 42342435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 TGATACAGAAGTGTCAGAGTTCCTGGGTCTTGTAGGAGTTCCAATGAGCATCAATCAAAA 1859

 42342436 GTTTGATTGTAAGGCACAGAAATCAACTTGGACCAGCTAAAGCAAAAAGACCATTTTTAG 42342495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 GTTTGATTGTAAGGCACAGAAATCAACTTGGACCAGCTAAAGCAAAAAGACCATTTTTAG 1919

 42342496 GGAAATAGGGATGTGTCACAAAGAACTGCATCTAGGTACTGGAAATCAACAAAAAGTTCC 42342555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 GGAAATAGGGATGTGTCACAAAGAACTGCATCTAGGTACTGGAAATCAACAAAAAGTTCC 1979

 42342556 CCATCTGATCTCAGCTTCTCTGTGTGTCTACTACATACACTATCTTTCTCCTCTTTTCTT 42342615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 CCATCTGATCTCAGCTTCTCTGTGTGTCTACTACATACACTATCTTTCTCCTCTTTTCTT 2039

 42342616 TCCTCTCTACCCCCTACCTCCCTCCTCTCTC 42342646
          |||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 TCCTCTCTACCCCCTACCTCCCTCCTCTCTC 2070

EXCISED REGION

 42342651 TTTTTTTTTTTTTGTTTTTTGGTTTTTTTATGTTTGTTTGTTTGCTTTTGGAGACACGGT 42342710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     2071 TTTTTTTTTTTTTGTTTTTTGGTTTTTTTATGTTTGTTTGTTTGTTTTTGGAGACACGGT 2130

 42342711 CTCCCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCTTAATTACTGCAGCCTCAATCTCCTGG 42342770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2131 CTCCCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCTTAATTACTGCAGCCTCAATCTCCTGG 2190

 42342771 GCTCAAGTGACCCTCCCACCTCAGCCTCCTGAATAGCTGGGACCACAGGTGCAAGCCACA 42342830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2191 GCTCAAGTGACCCTCCCACCTCAGCCTCCTGAATAGCTGGGACCACAGGTGCAAGCCACA 2250

 42342831 GTGCTCAGCTAATTAAAAAAAATTTTTTTTTCAGAGATGGGGTCTCACTATGTTGTCCAG 42342890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2251 GTGCTCAGCTAATTAAAAAAAATTTTTTTTTCAGAGATGGGGTCTCACTATGTTGTCCAG 2310

 42342891 GCTGGTCTCAAACTCCTAGGCTCAAGCAGTCCTCCCGTTTCAGCCTCAAAAAGTGCTGGG 42342950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2311 GCTGGTCTCAAACTCCTAGGCTCAAGCAGTCCTCCCGTTTCAGCCTCAAAAAGTGCTGGG 2370

 42342951 ATTACAGGTGTGAGCCATCGCACTCCACCTTCTCTATAGTTACTGAGTTTGCGTGTTACA 42343010
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     2371 ATTACAGGTGTGAGCCATCGCACTCCACTTTCTCTATAGTTACTGAGTTTGCGTGTTACA 2430

 42343011 CTGAGTTTACATCTTACATTTCTAGCCATATCAGAAACGACCTCTGCACCTCTCTTTCCC 42343070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2431 CTGAGTTTACATCTTACATTTCTAGCCATATCAGAAACGACCTCTGCACCTCTCTTTCCC 2490

 42343071 AATTTGAGATTTCTAATAGAAAGAATCTTGTTCACCCAGCTTGGGACTCATTGAGTTATG 42343130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2491 AATTTGAGATTTCTAATAGAAAGAATCTTGTTCACCCAGCTTGGGACTCATTGAGTTATG 2550

 42343131 ACCAGTGGGATAGATTTTAGAAGATAAACATGTCTATAGGGACTTACCGTGTGAATTAGT 42343190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2551 ACCAGTGGGATAGATTTTAGAAGATAAACATGTCTATAGGGACTTACCGTGTGAATTAGT 2610

 42343191 GGGGGAGCCGCTTACCAGGCAGAGGGGTCTGCTGTAAAGTGATACTGTGACTTTAAATTG 42343250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2611 GGGGGAGCCGCTTACCAGGCAGAGGGGTCTGCTGTAAAGTGATACTGTGACTTTAAATTG 2670

 42343251 AAAGTAAGCTTCTAGAAGAGTTGAAGAGGAGTGGATTATTGTTGAATGGATGTATAACTA 42343310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2671 AAAGTAAGCTTCTAGAAGAGTTGAAGAGGAGTGGATTATTGTTGAATGGATGTATAACTA 2730

 42343311 ATGAAGCTTTAAAGGAAGTTTATTAGAAAGTCCATGTCCTTGTCTCTTTCCCAAACTCCT 42343370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2731 ATGAAGCTTTAAAGGAAGTTTATTAGAAAGTCCATGTCCTTGTCTCTTTCCCAAACTCCT 2790

 42343371 TTAGTTCCCAAGTCCTGAAAGAATCTATGGATAAGGGAAGCAGAATACTATAGTGGTTAA 42343430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2791 TTAGTTCCCAAGTCCTGAAAGAATCTATGGATAAGGGAAGCAGAATACTATAGTGGTTAA 2850

 42343431 GAGCACATGCTCGAGGTTAAACTGTCTGTATTTTGGATCCTGGCCTTGAGGACTTGGGCA 42343490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2851 GAGCACATGCTCGAGGTTAAACTGTCTGTATTTTGGATCCTGGCCTTGAGGACTTGGGCA 2910

 42343491 AGTTACGTGACCTGCCTGAGCCTCAGTTTCCTCACCTGTAATATGGGTATCACGAGGAAT 42343550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2911 AGTTACGTGACCTGCCTGAGCCTCAGTTTCCTCACCTGTAATATGGGTATCACGAGGAAT 2970

 42343551 AAATAAGGTAATATGTGTAAAGTGCTTGGCACAATGCTCTTGATAATGTTAGCAACATAA 42343610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2971 AAATAAGGTAATATGTGTAAAGTGCTTGGCACAATGCTCTTGATAATGTTAGCAACATAA 3030

 42343611 TTTTGTAATGAAAATTAACTGATGGGGCTGAAATGTGCATCAGCAGATCCAAATATCCTT 42343670
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     3031 TTTTGTAATGAAAATTAACTGATGGGACTGAAATGTGCATCAGCAGATCCAAATATCCTT 3090

 42343671 GATAAACTGGCCAAAAGAAAGATGAATTGGCAGAGAGGCAAGTGTTCATCTCAGTTCTCC 42343730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3091 GATAAACTGGCCAAAAGAAAGATGAATTGGCAGAGAGGCAAGTGTTCATCTCAGTTCTCC 3150

 42343731 AGATATCCCTGCAAATGTGGCCTCTGGAGTAGAAGATTTAGGGAGAAAAATAAGCCATGA 42343790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3151 AGATATCCCTGCAAATGTGGCCTCTGGAGTAGAAGATTTAGGGAGAAAAATAAGCCATGA 3210

 42343791 AGCTCTTCTGGCACCAACATGAACTTCAGGGATCATGGGACATTTGGGCCAGTAACATTC 42343850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3211 AGCTCTTCTGGCACCAACATGAACTTCAGGGATCATGGGACATTTGGGCCAGTAACATTC 3270

 42343851 CTCTTTGTTCCTAGAGATTTAATATCTACCTACCAACTAAATGGCCTTGATTTGGAGGAG 42343910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3271 CTCTTTGTTCCTAGAGATTTAATATCTACCTACCAACTAAATGGCCTTGATTTGGAGGAG 3330

 42343911 AGAAGACAAGAAGAGGAATTGCTTTCAGCTGGTCCTTGCCTTTAACTAACCAGGGGTACA 42343970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3331 AGAAGACAAGAAGAGGAATTGCTTTCAGCTGGTCCTTGCCTTTAACTAACCAGGGGTACA 3390

 42343971 AAAATTTTAAAATACAAAGGAGACCATGTGTAAAACATTAGTTAAGCTCAGATATAAATC 42344030
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3391 AAAATTTTAAAACACAAAGGAGACCATGTGTAAAACATTAGTTAAGCTCAGATATAAATC 3450

 42344031 TAGTCTTTGACCAGTCCAGAGCTAATCAATATGCTTTTCTACTCTCTTTGAACTTTTGAG 42344090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3451 TAGTCTTTGACCAGTCCAGAGCTAATCAATATGCTTTTCTACTCTCTTTGAACTTTTGAG 3510

 42344091 TTTTCTGGCAACAACAAAAATCCCAAACCTCATCCAAAACCGTAGTCCAGACAGCCCAGT 42344150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3511 TTTTCTGGCAACAACAAAAATCCCAAACCTCATCCAAAACCGTAGTCCAGACAGCCCAGT 3570

 42344151 TTCTGCACTCCCTTCCTTGTGTCACATATTGTTGACAGAACTACTCCCGTTACCACATTC 42344210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3571 TTCTGCACTCCCTTCCTTGTGTCACATATTGTTGACAGAACTACTCCCGTTACCACATTC 3630

 42344211 ATTCCAGTGGTGATTCAAATTCTTCTGCAGAAATGGACTTGAAAGACAGAAAACTGCTCC 42344270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3631 ATTCCAGTGGTGATTCAAATTCTTCTGCAGAAATGGACTTGAAAGACAGAAAACTGCTCC 3690

 42344271 TGTAATCACTTAATAAGGAATCTTGGATGAGGAATACAGAGCTATGAATATGGATTTACT 42344330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3691 TGTAATCACTTAATAAGGAATCTTGGATGAGGAATACAGAGCTATGAATATGGATTTACT 3750

 42344331 CTTAGCCTTTATGGATGCCTTTTTCTCAGTTATTTTCACTGAAAATCATGATGAACTGAT 42344390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3751 CTTAGCCTTTATGGATGCCTTTTTCTCAGTTATTTTCACTGAAAATCATGATGAACTGAT 3810

 42344391 TTAAATATCAAGGTAAACTGAGATGGAAAATTACCGATAATAAGAGTTTTCTGAAAATAT 42344450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3811 TTAAATATCAAGGTAAACTGAGATGGAAAATTACCGATAATAAGAGTTTTCTGAAAATAT 3870

 42344451 AGATTGGCCTCTTTAAAGCACATCGAGTTTGTTTTGTTTAAATTACAAATTCACATATAT 42344510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3871 AGATTGGCCTCTTTAAAGCACATCGAGTTTGTTTTGTTTAAATTACAAATTCACATATAT 3930

 42344511 TTGAAATGTGTTTAAATGTGTCAGTTTTAGGCAAAACTAAACTATTTGATTCCTTTCCAA 42344570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3931 TTGAAATGTGTTTAAATGTGTCAGTTTTAGGCAAAACTAAACTATTTGATTCCTTTCCAA 3990

 42344571 AAATCAGGAATTTGCTTTGGAAAAAAACCATGCAGTTTGATTTACAAAGCAGAGCGGGGG 42344630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3991 AAATCAGGAATTTGCTTTGGAAAAAAACCATGCAGTTTGATTTACAAAGCAGAGCGGGGG 4050

 42344631 GGAAGTAGTGGGTGAGAAAGACCCACCCAAAGGCTGCAGCCAGCTTCCCCAGGAAGATTC 42344690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4051 GGAAGTAGTGGGTGAGAAAGACCCACCCAAAGGCTGCAGCCAGCTTCCCCAGGAAGATTC 4110

 42344691 ATAACCATGCCACAATACTGTCCTTCAATTCGTTCCAACAGATTTTACTATAACTCTAAA 42344750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4111 ATAACCATGCCACAATACTGTCCTTCAATTCGTTCCAACAGATTTTACTATAACTCTAAA 4170

 42344751 TCATTAGAAGCAACTGCTGCTATGACTAGTGCTATCTTTGCCTCAAAAAGAGGAAAAATC 42344810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4171 TCATTAGAAGCAACTGCTGCTATGACTAGTGCTATCTTTGCCTCAAAAAGAGGAAAAATC 4230

 42344811 AGGACATACAATATAATCCCCTCAGGATCTAGGAGAGAAATCAGCCCATTTGTCATAAGA 42344870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4231 AGGACATACAATATAATCCCCTCAGGATCTAGGAGAGAAATCAGCCCATTTGTCATAAGA 4290

 42344871 ACTGAAAACCTCAGCTAAATAGTATATGAAACATTGGTATTTCATACCTTGACATTACAT 42344930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4291 ACTGAAAACCTCAGCTAAATAGTATATGAAACATTGGTATTTCATACCTTGACATTACAT 4350

 42344931 ATTTTTGAAAATAAAGTAAGCATACACACAAGAAGTGGCTAGATGCAGCAGTTATAAAGT 42344990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4351 ATTTTTGAAAATAAAGTAAGCATACACACAAGAAGTGGCTAGATGCAGCAGTTATAAAGT 4410

 42344991 GGCTTAAGTTGGGTTAACTAAATATAACCTAGAAAAACCATCTTATCTATTGCAAATTAT 42345050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4411 GGCTTAAGTTGGGTTAACTAAATATAACCTAGAAAAACCATCTTATCTATTGCAAATTAT 4470

 42345051 TTCCAGAAAAAGGTAAGAAAAATCCAACCAACACTTTTTAAACATCCTGAGCTATTCACA 42345110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4471 TTCCAGAAAAAGGTAAGAAAAATCCAACCAACACTTTTTAAACATCCTGAGCTATTCACA 4530

 42345111 GCAAGTGAATCTTTACCCTTACCAGATGTATAAACATTTACATAAGGCAGGAGGTTCAAC 42345170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4531 GCAAGTGAATCTTTACCCTTACCAGATGTATAAACATTTACATAAGGCAGGAGGTTCAAC 4590

 42345171 ACTTGGAGAGTGTAATCAAGGCAGTAGTAACGCAGTGCTCCTCTCTTTGACTTGAATGAC 42345230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4591 ACTTGGAGAGTGTAATCAAGGCAGTAGTAACGCAGTGCTCCTCTCTTTGACTTGAATGAC 4650

 42345231 TTCCTCCCCATTAGGGTCATTATTGTTTTGCAGTGTCCCAGGGATGAAAGGACTTTGAAA 42345290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4651 TTCCTCCCCATTAGGGTCATTATTGTTTTGCAGTGTCCCAGGGATGAAAGGACTTTGAAA 4710

 42345291 GGTCATGTGTCTTGTGACCCAACTAGCAGCATCAGCATCACTGGGGAGAAACTCAAGCAG 42345350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4711 GGTCATGTGTCTTGTGACCCAACTAGCAGCATCAGCATCACTGGGGAGAAACTCAAGCAG 4770

 42345351 AAGCTTGAGTCTACTCCACTCTTGCTGACACCAAATCTGCATTTTTACAGGATTCTTGGG 42345410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4771 AAGCTTGAGTCTACTCCACTCTTGCTGACACCAAATCTGCATTTTTACAGGATTCTTGGG 4830

 42345411 TGAGTCACACACATATTCAAGGTTAAAATATGCCACCCTAGGTCTTTCTCCTGCTTCTGA 42345470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4831 TGAGTCACACACATATTCAAGGTTAAAATATGCCACCCTAGGTCTTTCTCCTGCTTCTGA 4890

 42345471 GCAAAACTGGGCACAAGGGACAAACTAGTTTCCTTCAGCCACTTTCAAATCCTTTATAGA 42345530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4891 GCAAAACTGGGCACAAGGGACAAACTAGTTTCCTTCAGCCACTTTCAAATCCTTTATAGA 4950

 42345531 GTGTACTGTGTGAGTCACTGAGAGGAAAGAGGAAATAATACTTATTTAGGGAAGTCTTGC 42345590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4951 GTGTACTGTGTGAGTCACTGAGAGGAAAGAGGAAATAATACTTATTTAGGGAAGTCTTGC 5010

 42345591 ATAACTTAACAAAGTTAGTAACTTCTTCAATACACTCAAGTACCTATTTTTGGAAGCCCT 42345650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5011 ATAACTTAACAAAGTTAGTAACTTCTTCAATACACTCAAGTACCTATTTTTGGAAGCCCT 5070

 42345651 ACAGGTTAGGTCAAAGTAAAGAGAAGCAAAAAATGGAGTGAGTTCTAGTAAAAAACTCTG 42345710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5071 ACAGGTTAGGTCAAAGTAAAGAGAAGCAAAAAATGGAGTGAGTTCTAGTAAAAAACTCTG 5130

 42345711 ACAAAATAAGGGAAGTGTAGAAGCTGAGTCTATGAGGGATGAGAGAAGCAATTTACCAAA 42345770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5131 ACAAAATAAGGGAAGTGTAGAAGCTGAGTCTATGAGGGATGAGAGAAGCAATTTACCAAA 5190

 42345771 TTATCAGATCCAAAATCATCTCTGCACTGTAGATGATTTATAGCCCTGGAAGCTTAGAGG 42345830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5191 TTATCAGATCCAAAATCATCTCTGCACTGTAGATGATTTATAGCCCTGGAAGCTTAGAGG 5250

 42345831 CTTGAGTCTCTTGCTGTATTTCATTTCAAATTAGTAATTTTTATCTAGGGCTTCCCTATG 42345890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5251 CTTGAGTCTCTTGCTGTATTTCATTTCAAATTAGTAATTTTTATCTAGGGCTTCCCTATG 5310

 42345891 GCTTAAAGTGAAGGCCCTGGAATTTCTGAAGTGAAATTATCTGATGATTTTTATGTATGG 42345950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5311 GCTTAAAGTGAAGGCCCTGGAATTTCTGAAGTGAAATTATCTGATGATTTTTATGTATGG 5370

 42345951 TCATTCTGTAGTTATCCTGTAAGTTTCATATTTGTAACAAGACTGGAATCCGAACAATAG 42346010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5371 TCATTCTGTAGTTATCCTGTAAGTTTCATATTTGTAACAAGACTGGAATCCGAACAATAG 5430

 42346011 AAAACTCTGTGGCAGTAAGCCAAAACCTGATGGACTTAGGAGAGTTACGTATGTGTGTTT 42346070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5431 AAAACTCTGTGGCAGTAAGCCAAAACCTGATGGACTTAGGAGAGTTACGTATGTGTGTTT 5490

 42346071 CAGTGGTCCTCAAATTCAGCTGCCTATTAGAATCACCTGGACTTTGAAAAAAAAAGAGCT 42346130
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5491 CAGTGGTCCTCAAATTTAGCTGCCTATTAGAATCACCTGGACTTTGAAAAAAAAAGAGCT 5550

 42346131 TTCTTGAGGTATAACTGACAAATAATAAGACAAACATATTTCAGTATACAATTGGATGAG 42346190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5551 TTCTTGAGGTATAACTGACAAATAATAAGACAAACATATTTCAGTATACAATTGGATGAG 5610

 42346191 TTTTGACATGTTATATTCTTGTGAAACCATCACCACAATCAAGCTATTCACCCCCCAAAT 42346250
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     5611 TTTTGACATGTTATATTCTTGTGAAACCATCGCCACAATCAAGCTATTCACCCCCCAAAT 5670

 42346251 TTTCGTGCCCCTTTGTTGTCCCACCCTTCTTTCTGCAACCACTGATCTGCTTTCTATCAC 42346310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5671 TTTCGTGCCCCTTTGTTGTCCCACCCTTCTTTCTGCAACCACTGATCTGCTTTCTATCAC 5730

 42346311 TATGGATTAATTTGTATTTTCTAGAAGCTTAAATAAGTGAAACCATATGGTGTGCATGTT 42346370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5731 TATGGATTAATTTGTATTTTCTAGAAGCTTAAATAAGTGAAACCATATGGTGTGCATGTT 5790

 42346371 TTGCAGGGAGAGGGCAGGGGGAGCTGGTTTCTTTCACTCGGTGTAATTGTTCTGAGAGTC 42346430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5791 TTGCAGGGAGAGGGCAGGGGGAGCTGGTTTCTTTCACTCGGTGTAATTGTTCTGAGAGTC 5850

 42346431 ATCCGTGTTTGCATGTGTTAATAGTTTATTCTTTTTATCGGTAAGTAGTATCCCATTGTG 42346490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5851 ATCCGTGTTTGCATGTGTTAATAGTTTATTCTTTTTATCGGTAAGTAGTATCCCATTGTG 5910

 42346491 TGGATGTACCACATGTTGTCTAACCATTCACAACTAAAGGATACTTGGGTTGTTTCTCAT 42346550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5911 TGGATGTACCACATGTTGTCTAACCATTCACAACTAAAGGATACTTGGGTTGTTTCTCAT 5970

 42346551 TTGGGGCAATTGAAAATAAGCAGTATAAACTGCTATAAACAGTCATGTACAGATATAAGC 42346610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5971 TTGGGGCAATTGAAAATAAGCAGTATAAACTGCTATAAACAGTCATGTACAGATATAAGC 6030

 42346611 ATGTATGTTTCCATTTTTCAAGGTAAA 42346637
          |||||||||||||||||||||||||||
     6031 ATGTATGTTTCCATTTTTCAAGGTAAA 6057

Alignment time is 4.52487 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [42336259,42357318] =>     21060 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [       1,    5189] =>      5189 nucs 'mol-32-3030-156809_5189'

Score:        5090
Aligned:      5189        nucs
Identic:      5180 (100%) nucs =>       782 (100%)      4398 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [42341864,42342646] EXCISED REGION [42342650,42347054]
 second seq =>  [       1,     783] EXCISED REGION [     784,    5189]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         3 nucs [42342647,42342649]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        14 nucs [42342647,42342660] to [42342650,42342663]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [42342647,42342647] to [42342649,42342649]
 second seq =>         0 nucs

 42341864 AAAGATGTTTGGCCTTAATTCTATAGGTATTCCCCTTTGCCATAGATGTTACACCAAGAA 42341923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAAGATGTTTGGCCTTAATTCTATAGGTATTCCCCTTTGCCATAGATGTTACACCAAGAA 60

 42341924 AGAACACATTGAATCAAGCAAATTTAAGCTGGGTTTTTGTTTTTGTTTTTTGGTGGTGGG 42341983
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGAACACATTGAATCAAGCAACTTTAAGCTGGGTTTTTGTTTTTGTTTTTTGGTGGTGGG 120

 42341984 GGGGATGATTTATAAGCAGGACTTCCCAAAGCTTTTAATATGCTTATATATGTGGCAGTG 42342043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGGGATGATTTATAAGCAGGACTTCCCAAAGCTTTTAATATGCTTATATATGTGGCAGTG 180

 42342044 TTGAGAGGGGAAGATTTGATATTCCAAGTATTTTTGGCCACAGAACTCTTTTTATCATGG 42342103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTGAGAGGGGAAGATTTGATATTCCAAGTATTTTTGGCCACAGAACTCTTTTTATCATGG 240

 42342104 AACATTTCCAGTGTTCCATGAGACACAATTAGGGGCTAGTGAGCCACTGACTTTTGAGTT 42342163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AACATTTCCAGTGTTCCATGAGACACAATTAGGGGCTAGTGAGCCACTGACTTTTGAGTT 300

 42342164 GGAAAGTGACACATGGGGAAAGCAAAGTTTTGGAAGATTGATCTCACGGTAGAATATAAG 42342223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GGAAAGTGACACATGGGGAAAGCAAAGTTTTGGAAGATTGATCTCACGGTAGAATATAAG 360

 42342224 GTGAACAGGAGAGAAAAGAGCCTGGATTCAGGCAACACAATCAGATGATTGGATACAGGC 42342283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTGAACAGGAGAGAAAAGAGCCTGGATTCAGGCAACACAATCAGATGATTGGATACAGGC 420

 42342284 TCAAGATTAGGGGGTGGGTTGCACTACACTGGAGCGGAGAATGGAGAGCAAAAGCACTGA 42342343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCAAGATTAGGGGGTGGGTTGCACTACACTGGAGCGGAGAATGGAGAGCAAAAGCACTGA 480

 42342344 TTGAATGCACAGTCTTCTGTTGGATCCTGGGATGATACAGAAGTGTCAGAGTTCCTGGGT 42342403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTGAATGCACAGTCTTCTGTTGGATCCTGGGATGATACAGAAGTGTCAGAGTTCCTGGGT 540

 42342404 CTTGTAGGAGTTCCAATGAGCATCAATCAAAAGTTTGATTGTAAGGCACAGAAATCAACT 42342463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTTGTAGGAGTTCCAATGAGCATCAATCAAAAGTTTGATTGTAAGGCACAGAAATCAACT 600

 42342464 TGGACCAGCTAAAGCAAAAAGACCATTTTTAGGGAAATAGGGATGTGTCACAAAGAACTG 42342523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGGACCAGCTAAAGCAAAAAGACCATTTTTAGGGAAATAGGGATGTGTCACAAAGAACTG 660

 42342524 CATCTAGGTACTGGAAATCAACAAAAAGTTCCCCATCTGATCTCAGCTTCTCTGTGTGTC 42342583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CATCTAGGTACTGGAAATCAACAAAAAGTTCCCCATCTGATCTCAGCTTCTCTGTGTGTC 720

 42342584 TACTACATACACTATCTTTCTCCTCTTTTCTTTCCTCTCTACCCCCTACCTCCCTCCTCT 42342643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TACTACATACACTATCTTTCTCCTCTTTTCTTTCCTCTCTACCCCCTACCTCCCTCCTCT 780

 42342644 CTC 42342646
          |||
      781 CTC 783

EXCISED REGION

 42342650 TTTTTTTTTTTTTTGTTTTTTGGTTTTTTTATGTTTGTTTGTTTGCTTTTGGAGACACGG 42342709
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
      784 TTTTTTTTTTTTTTGTTTTTTGGTTTTTTTATGTTTGTTTGTTTGTTTTTGGAGACACGG 843

 42342710 TCTCCCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCTTAATTACTGCAGCCTCAATCTCCTG 42342769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      844 TCTCCCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCTTAATTACTGCAGCCTCAATCTCCTG 903

 42342770 GGCTCAAGTGACCCTCCCACCTCAGCCTCCTGAATAGCTGGGACCACAGGTGCAAGCCAC 42342829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      904 GGCTCAAGTGACCCTCCCACCTCAGCCTCCTGAATAGCTGGGACCACAGGTGCAAGCCAC 963

 42342830 AGTGCTCAGCTAATTAAAAAAAATTTTTTTTTCAGAGATGGGGTCTCACTATGTTGTCCA 42342889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      964 AGTGCTCAGCTAATTAAAAAAAATTTTTTTTTCAGAGATGGGGTCTCACTATGTTGTCCA 1023

 42342890 GGCTGGTCTCAAACTCCTAGGCTCAAGCAGTCCTCCCGTTTCAGCCTCAAAAAGTGCTGG 42342949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1024 GGCTGGTCTCAAACTCCTAGGCTCAAGCAGTCCTCCCGTTTCAGCCTCAAAAAGTGCTGG 1083

 42342950 GATTACAGGTGTGAGCCATCGCACTCCACCTTCTCTATAGTTACTGAGTTTGCGTGTTAC 42343009
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     1084 GATTACAGGTGTGAGCCATCGCACTCCACTTTCTCTATAGTTACTGAGTTTGCGTGTTAC 1143

 42343010 ACTGAGTTTACATCTTACATTTCTAGCCATATCAGAAACGACCTCTGCACCTCTCTTTCC 42343069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1144 ACTGAGTTTACATCTTACATTTCTAGCCATATCAGAAACGACCTCTGCACCTCTCTTTCC 1203

 42343070 CAATTTGAGATTTCTAATAGAAAGAATCTTGTTCACCCAGCTTGGGACTCATTGAGTTAT 42343129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1204 CAATTTGAGATTTCTAATAGAAAGAATCTTGTTCACCCAGCTTGGGACTCATTGAGTTAT 1263

 42343130 GACCAGTGGGATAGATTTTAGAAGATAAACATGTCTATAGGGACTTACCGTGTGAATTAG 42343189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1264 GACCAGTGGGATAGATTTTAGAAGATAAACATGTCTATAGGGACTTACCGTGTGAATTAG 1323

 42343190 TGGGGGAGCCGCTTACCAGGCAGAGGGGTCTGCTGTAAAGTGATACTGTGACTTTAAATT 42343249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1324 TGGGGGAGCCGCTTACCAGGCAGAGGGGTCTGCTGTAAAGTGATACTGTGACTTTAAATT 1383

 42343250 GAAAGTAAGCTTCTAGAAGAGTTGAAGAGGAGTGGATTATTGTTGAATGGATGTATAACT 42343309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1384 GAAAGTAAGCTTCTAGAAGAGTTGAAGAGGAGTGGATTATTGTTGAATGGATGTATAACT 1443

 42343310 AATGAAGCTTTAAAGGAAGTTTATTAGAAAGTCCATGTCCTTGTCTCTTTCCCAAACTCC 42343369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1444 AATGAAGCTTTAAAGGAAGTTTATTAGAAAGTCCATGTCCTTGTCTCTTTCCCAAACTCC 1503

 42343370 TTTAGTTCCCAAGTCCTGAAAGAATCTATGGATAAGGGAAGCAGAATACTATAGTGGTTA 42343429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1504 TTTAGTTCCCAAGTCCTGAAAGAATCTATGGATAAGGGAAGCAGAATACTATAGTGGTTA 1563

 42343430 AGAGCACATGCTCGAGGTTAAACTGTCTGTATTTTGGATCCTGGCCTTGAGGACTTGGGC 42343489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1564 AGAGCACATGCTCGAGGTTAAACTGTCTGTATTTTGGATCCTGGCCTTGAGGACTTGGGC 1623

 42343490 AAGTTACGTGACCTGCCTGAGCCTCAGTTTCCTCACCTGTAATATGGGTATCACGAGGAA 42343549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1624 AAGTTACGTGACCTGCCTGAGCCTCAGTTTCCTCACCTGTAATATGGGTATCACGAGGAA 1683

 42343550 TAAATAAGGTAATATGTGTAAAGTGCTTGGCACAATGCTCTTGATAATGTTAGCAACATA 42343609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1684 TAAATAAGGTAATATGTGTAAAGTGCTTGGCACAATGCTCTTGATAATGTTAGCAACATA 1743

 42343610 ATTTTGTAATGAAAATTAACTGATGGGGCTGAAATGTGCATCAGCAGATCCAAATATCCT 42343669
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     1744 ATTTTGTAATGAAAATTAACTGATGGGACTGAAATGTGCATCAGCAGATCCAAATATCCT 1803

 42343670 TGATAAACTGGCCAAAAGAAAGATGAATTGGCAGAGAGGCAAGTGTTCATCTCAGTTCTC 42343729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1804 TGATAAACTGGCCAAAAGAAAGATGAATTGGCAGAGAGGCAAGTGTTCATCTCAGTTCTC 1863

 42343730 CAGATATCCCTGCAAATGTGGCCTCTGGAGTAGAAGATTTAGGGAGAAAAATAAGCCATG 42343789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1864 CAGATATCCCTGCAAATGTGGCCTCTGGAGTAGAAGATTTAGGGAGAAAAATAAGCCATG 1923

 42343790 AAGCTCTTCTGGCACCAACATGAACTTCAGGGATCATGGGACATTTGGGCCAGTAACATT 42343849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1924 AAGCTCTTCTGGCACCAACATGAACTTCAGGGATCATGGGACATTTGGGCCAGTAACATT 1983

 42343850 CCTCTTTGTTCCTAGAGATTTAATATCTACCTACCAACTAAATGGCCTTGATTTGGAGGA 42343909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1984 CCTCTTTGTTCCTAGAGATTTAATATCTACCTACCAACTAAATGGCCTTGATTTGGAGGA 2043

 42343910 GAGAAGACAAGAAGAGGAATTGCTTTCAGCTGGTCCTTGCCTTTAACTAACCAGGGGTAC 42343969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2044 GAGAAGACAAGAAGAGGAATTGCTTTCAGCTGGTCCTTGCCTTTAACTAACCAGGGGTAC 2103

 42343970 AAAAATTTTAAAATACAAAGGAGACCATGTGTAAAACATTAGTTAAGCTCAGATATAAAT 42344029
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2104 AAAAATTTTAAAACACAAAGGAGACCATGTGTAAAACATTAGTTAAGCTCAGATATAAAT 2163

 42344030 CTAGTCTTTGACCAGTCCAGAGCTAATCAATATGCTTTTCTACTCTCTTTGAACTTTTGA 42344089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2164 CTAGTCTTTGACCAGTCCAGAGCTAATCAATATGCTTTTCTACTCTCTTTGAACTTTTGA 2223

 42344090 GTTTTCTGGCAACAACAAAAATCCCAAACCTCATCCAAAACCGTAGTCCAGACAGCCCAG 42344149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2224 GTTTTCTGGCAACAACAAAAATCCCAAACCTCATCCAAAACCGTAGTCCAGACAGCCCAG 2283

 42344150 TTTCTGCACTCCCTTCCTTGTGTCACATATTGTTGACAGAACTACTCCCGTTACCACATT 42344209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2284 TTTCTGCACTCCCTTCCTTGTGTCACATATTGTTGACAGAACTACTCCCGTTACCACATT 2343

 42344210 CATTCCAGTGGTGATTCAAATTCTTCTGCAGAAATGGACTTGAAAGACAGAAAACTGCTC 42344269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2344 CATTCCAGTGGTGATTCAAATTCTTCTGCAGAAATGGACTTGAAAGACAGAAAACTGCTC 2403

 42344270 CTGTAATCACTTAATAAGGAATCTTGGATGAGGAATACAGAGCTATGAATATGGATTTAC 42344329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2404 CTGTAATCACTTAATAAGGAATCTTGGATGAGGAATACAGAGCTATGAATATGGATTTAC 2463

 42344330 TCTTAGCCTTTATGGATGCCTTTTTCTCAGTTATTTTCACTGAAAATCATGATGAACTGA 42344389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2464 TCTTAGCCTTTATGGATGCCTTTTTCTCAGTTATTTTCACTGAAAATCATGATGAACTGA 2523

 42344390 TTTAAATATCAAGGTAAACTGAGATGGAAAATTACCGATAATAAGAGTTTTCTGAAAATA 42344449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2524 TTTAAATATCAAGGTAAACTGAGATGGAAAATTACCGATAATAAGAGTTTTCTGAAAATA 2583

 42344450 TAGATTGGCCTCTTTAAAGCACATCGAGTTTGTTTTGTTTAAATTACAAATTCACATATA 42344509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2584 TAGATTGGCCTCTTTAAAGCACATCGAGTTTGTTTTGTTTAAATTACAAATTCACATATA 2643

 42344510 TTTGAAATGTGTTTAAATGTGTCAGTTTTAGGCAAAACTAAACTATTTGATTCCTTTCCA 42344569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2644 TTTGAAATGTGTTTAAATGTGTCAGTTTTAGGCAAAACTAAACTATTTGATTCCTTTCCA 2703

 42344570 AAAATCAGGAATTTGCTTTGGAAAAAAACCATGCAGTTTGATTTACAAAGCAGAGCGGGG 42344629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2704 AAAATCAGGAATTTGCTTTGGAAAAAAACCATGCAGTTTGATTTACAAAGCAGAGCGGGG 2763

 42344630 GGGAAGTAGTGGGTGAGAAAGACCCACCCAAAGGCTGCAGCCAGCTTCCCCAGGAAGATT 42344689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2764 GGGAAGTAGTGGGTGAGAAAGACCCACCCAAAGGCTGCAGCCAGCTTCCCCAGGAAGATT 2823

 42344690 CATAACCATGCCACAATACTGTCCTTCAATTCGTTCCAACAGATTTTACTATAACTCTAA 42344749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2824 CATAACCATGCCACAATACTGTCCTTCAATTCGTTCCAACAGATTTTACTATAACTCTAA 2883

 42344750 ATCATTAGAAGCAACTGCTGCTATGACTAGTGCTATCTTTGCCTCAAAAAGAGGAAAAAT 42344809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2884 ATCATTAGAAGCAACTGCTGCTATGACTAGTGCTATCTTTGCCTCAAAAAGAGGAAAAAT 2943

 42344810 CAGGACATACAATATAATCCCCTCAGGATCTAGGAGAGAAATCAGCCCATTTGTCATAAG 42344869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2944 CAGGACATACAATATAATCCCCTCAGGATCTAGGAGAGAAATCAGCCCATTTGTCATAAG 3003

 42344870 AACTGAAAACCTCAGCTAAATAGTATATGAAACATTGGTATTTCATACCTTGACATTACA 42344929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3004 AACTGAAAACCTCAGCTAAATAGTATATGAAACATTGGTATTTCATACCTTGACATTACA 3063

 42344930 TATTTTTGAAAATAAAGTAAGCATACACACAAGAAGTGGCTAGATGCAGCAGTTATAAAG 42344989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3064 TATTTTTGAAAATAAAGTAAGCATACACACAAGAAGTGGCTAGATGCAGCAGTTATAAAG 3123

 42344990 TGGCTTAAGTTGGGTTAACTAAATATAACCTAGAAAAACCATCTTATCTATTGCAAATTA 42345049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3124 TGGCTTAAGTTGGGTTAACTAAATATAACCTAGAAAAACCATCTTATCTATTGCAAATTA 3183

 42345050 TTTCCAGAAAAAGGTAAGAAAAATCCAACCAACACTTTTTAAACATCCTGAGCTATTCAC 42345109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3184 TTTCCAGAAAAAGGTAAGAAAAATCCAACCAACACTTTTTAAACATCCTGAGCTATTCAC 3243

 42345110 AGCAAGTGAATCTTTACCCTTACCAGATGTATAAACATTTACATAAGGCAGGAGGTTCAA 42345169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3244 AGCAAGTGAATCTTTACCCTTACCAGATGTATAAACATTTACATAAGGCAGGAGGTTCAA 3303

 42345170 CACTTGGAGAGTGTAATCAAGGCAGTAGTAACGCAGTGCTCCTCTCTTTGACTTGAATGA 42345229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3304 CACTTGGAGAGTGTAATCAAGGCAGTAGTAACGCAGTGCTCCTCTCTTTGACTTGAATGA 3363

 42345230 CTTCCTCCCCATTAGGGTCATTATTGTTTTGCAGTGTCCCAGGGATGAAAGGACTTTGAA 42345289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3364 CTTCCTCCCCATTAGGGTCATTATTGTTTTGCAGTGTCCCAGGGATGAAAGGACTTTGAA 3423

 42345290 AGGTCATGTGTCTTGTGACCCAACTAGCAGCATCAGCATCACTGGGGAGAAACTCAAGCA 42345349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3424 AGGTCATGTGTCTTGTGACCCAACTAGCAGCATCAGCATCACTGGGGAGAAACTCAAGCA 3483

 42345350 GAAGCTTGAGTCTACTCCACTCTTGCTGACACCAAATCTGCATTTTTACAGGATTCTTGG 42345409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3484 GAAGCTTGAGTCTACTCCACTCTTGCTGACACCAAATCTGCATTTTTACAGGATTCTTGG 3543

 42345410 GTGAGTCACACACATATTCAAGGTTAAAATATGCCACCCTAGGTCTTTCTCCTGCTTCTG 42345469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3544 GTGAGTCACACACATATTCAAGGTTAAAATATGCCACCCTAGGTCTTTCTCCTGCTTCTG 3603

 42345470 AGCAAAACTGGGCACAAGGGACAAACTAGTTTCCTTCAGCCACTTTCAAATCCTTTATAG 42345529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3604 AGCAAAACTGGGCACAAGGGACAAACTAGTTTCCTTCAGCCACTTTCAAATCCTTTATAG 3663

 42345530 AGTGTACTGTGTGAGTCACTGAGAGGAAAGAGGAAATAATACTTATTTAGGGAAGTCTTG 42345589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3664 AGTGTACTGTGTGAGTCACTGAGAGGAAAGAGGAAATAATACTTATTTAGGGAAGTCTTG 3723

 42345590 CATAACTTAACAAAGTTAGTAACTTCTTCAATACACTCAAGTACCTATTTTTGGAAGCCC 42345649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3724 CATAACTTAACAAAGTTAGTAACTTCTTCAATACACTCAAGTACCTATTTTTGGAAGCCC 3783

 42345650 TACAGGTTAGGTCAAAGTAAAGAGAAGCAAAAAATGGAGTGAGTTCTAGTAAAAAACTCT 42345709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3784 TACAGGTTAGGTCAAAGTAAAGAGAAGCAAAAAATGGAGTGAGTTCTAGTAAAAAACTCT 3843

 42345710 GACAAAATAAGGGAAGTGTAGAAGCTGAGTCTATGAGGGATGAGAGAAGCAATTTACCAA 42345769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3844 GACAAAATAAGGGAAGTGTAGAAGCTGAGTCTATGAGGGATGAGAGAAGCAATTTACCAA 3903

 42345770 ATTATCAGATCCAAAATCATCTCTGCACTGTAGATGATTTATAGCCCTGGAAGCTTAGAG 42345829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3904 ATTATCAGATCCAAAATCATCTCTGCACTGTAGATGATTTATAGCCCTGGAAGCTTAGAG 3963

 42345830 GCTTGAGTCTCTTGCTGTATTTCATTTCAAATTAGTAATTTTTATCTAGGGCTTCCCTAT 42345889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3964 GCTTGAGTCTCTTGCTGTATTTCATTTCAAATTAGTAATTTTTATCTAGGGCTTCCCTAT 4023

 42345890 GGCTTAAAGTGAAGGCCCTGGAATTTCTGAAGTGAAATTATCTGATGATTTTTATGTATG 42345949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4024 GGCTTAAAGTGAAGGCCCTGGAATTTCTGAAGTGAAATTATCTGATGATTTTTATGTATG 4083

 42345950 GTCATTCTGTAGTTATCCTGTAAGTTTCATATTTGTAACAAGACTGGAATCCGAACAATA 42346009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4084 GTCATTCTGTAGTTATCCTGTAAGTTTCATATTTGTAACAAGACTGGAATCCGAACAATA 4143

 42346010 GAAAACTCTGTGGCAGTAAGCCAAAACCTGATGGACTTAGGAGAGTTACGTATGTGTGTT 42346069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4144 GAAAACTCTGTGGCAGTAAGCCAAAACCTGATGGACTTAGGAGAGTTACGTATGTGTGTT 4203

 42346070 TCAGTGGTCCTCAAATTCAGCTGCCTATTAGAATCACCTGGACTTTGAAAAAAAAAGAGC 42346129
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4204 TCAGTGGTCCTCAAATTTAGCTGCCTATTAGAATCACCTGGACTTTGAAAAAAAAAGAGC 4263

 42346130 TTTCTTGAGGTATAACTGACAAATAATAAGACAAACATATTTCAGTATACAATTGGATGA 42346189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4264 TTTCTTGAGGTATAACTGACAAATAATAAGACAAACATATTTCAGTATACAATTGGATGA 4323

 42346190 GTTTTGACATGTTATATTCTTGTGAAACCATCACCACAATCAAGCTATTCACCCCCCAAA 42346249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     4324 GTTTTGACATGTTATATTCTTGTGAAACCATCGCCACAATCAAGCTATTCACCCCCCAAA 4383

 42346250 TTTTCGTGCCCCTTTGTTGTCCCACCCTTCTTTCTGCAACCACTGATCTGCTTTCTATCA 42346309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4384 TTTTCGTGCCCCTTTGTTGTCCCACCCTTCTTTCTGCAACCACTGATCTGCTTTCTATCA 4443

 42346310 CTATGGATTAATTTGTATTTTCTAGAAGCTTAAATAAGTGAAACCATATGGTGTGCATGT 42346369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4444 CTATGGATTAATTTGTATTTTCTAGAAGCTTAAATAAGTGAAACCATATGGTGTGCATGT 4503

 42346370 TTTGCAGGGAGAGGGCAGGGGGAGCTGGTTTCTTTCACTCGGTGTAATTGTTCTGAGAGT 42346429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4504 TTTGCAGGGAGAGGGCAGGGGGAGCTGGTTTCTTTCACTCGGTGTAATTGTTCTGAGAGT 4563

 42346430 CATCCGTGTTTGCATGTGTTAATAGTTTATTCTTTTTATCGGTAAGTAGTATCCCATTGT 42346489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4564 CATCCGTGTTTGCATGTGTTAATAGTTTATTCTTTTTATCGGTAAGTAGTATCCCATTGT 4623

 42346490 GTGGATGTACCACATGTTGTCTAACCATTCACAACTAAAGGATACTTGGGTTGTTTCTCA 42346549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4624 GTGGATGTACCACATGTTGTCTAACCATTCACAACTAAAGGATACTTGGGTTGTTTCTCA 4683

 42346550 TTTGGGGCAATTGAAAATAAGCAGTATAAACTGCTATAAACAGTCATGTACAGATATAAG 42346609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4684 TTTGGGGCAATTGAAAATAAGCAGTATAAACTGCTATAAACAGTCATGTACAGATATAAG 4743

 42346610 CATGTATGTTTCCATTTTTCAAGGTAAATACCTAGAAGTGGGTATGGTAAGTGTATGTTT 42346669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4744 CATGTATGTTTCCATTTTTCAAGGTAAATACCTAGAAGTGGGTATGGTAAGTGTATGTTT 4803

 42346670 AACTTGAAAAGAAACTACCAAAATGTTTCCAAAGTGGTTGTACCATTTTGCTTACCTACC 42346729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4804 AACTTGAAAAGAAACTACCAAAATGTTTCCAAAGTGGTTGTACCATTTTGCTTACCTACC 4863

 42346730 AGAAATGTGTAAGAGTTCTAGTTACTCCACATACTTCCTAGCAGTTGATATTCTCAG-TT 42346788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
     4864 AGAAATGTGTAAGAGTTCTAGTTACTCCACATACTTCCTAGCAGTTGATATTCTCAGTTT 4923

 42346789 TTTTTTTTTATTTTAACCGTTCTAATAGCTGTGTAATGGTATTCCATTACAGTACTAATT 42346848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     4924 TTTTTTTTTATTTTAACCGTTCTAATAGCTGTGTAATGGTATTCCATTACGGTACTAATT 4983

 42346849 TAAATTTCCCTAATAACTACTGAGGTTGAAAAAATCTTTCATGGGCATATTTGCCATCCT 42346908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4984 TAAATTTCCCTAATAACTACTGAGGTTGAAAAAATCTTTCATGGGCATATTTGCCATCCT 5043

 42346909 TGTATCTTCTCTGGTGACGAATCTTTCATGCCTTCTGCTTATATTTTAACCAGGGTTTTG 42346968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5044 TGTATCTTCTCTGGTGACGAATCTTTCATGCCTTCTGCTTATATTTTAACCAGGGTTTTG 5103

 42346969 TTTTGCTTTTTCTTAACTGTTGAGTTTTAAGAGTCTATATATACTGCAAACAACTCCTTG 42347028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5104 TTTTGCTTTTTCTTAACTGTTGAGTTTTAAGAGTCTATATATACTGCAAACAACTCCTTG 5163

 42347029 GTAAGATATATGATTGGCAAATCCTT 42347054
          ||||||||||||||||||||||||||
     5164 GTAAGATATATGATTGGCAAATCCTT 5189

Alignment time is 4.22334 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [42336259,42357318] =>     21060 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [       1,    4102] =>      4102 nucs 'mol-32-303b-108132_4102'

Score:        3988
Aligned:      4098        nucs
Identic:      4088 (100%) nucs =>      3590 (100%)       498 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [42342660,42346259] EXCISED REGION [42347319,42347816]
 second seq =>  [       1,    3600] EXCISED REGION [    3605,    4102]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1059 nucs [42346260,42347318]
 second seq =>         4 nucs [3601,3604]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [3601,3601] to [3605,3605]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 42342660 TTTTGTTTTTTGGTTTTTTTATGTTTGTTTGTTTGCTTTTGGAGACACGGTCTCCCTCTG 42342719
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
        1 TTTTGTTTTTTGGTTTTTTTATGTTTGTTTGTTTGTTTTTGGAGACACGGTCTCCCTCTG 60

 42342720 TCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCTTAATTACTGCAGCCTCAATCTCCTGGGCTCAAGTG 42342779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCTTAATTACTGCAGCCTCAATCTCCTGGGCTCAAGTG 120

 42342780 ACCCTCCCACCTCAGCCTCCTGAATAGCTGGGACCACAGGTGCAAGCCACAGTGCTCAGC 42342839
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACCCTCCCACTTCAGCCTCCTGAATAGCTGGGACCACAGGTGCAAGCCACAGTGCTCAGC 180

 42342840 TAATTAAAAAAAATTTTTTTTTCAGAGATGGGGTCTCACTATGTTGTCCAGGCTGGTCTC 42342899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TAATTAAAAAAAATTTTTTTTTCAGAGATGGGGTCTCACTATGTTGTCCAGGCTGGTCTC 240

 42342900 AAACTCCTAGGCTCAAGCAGTCCTCCCGTTTCAGCCTCAAAAAGTGCTGGGATTACAGGT 42342959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAACTCCTAGGCTCAAGCAGTCCTCCCGTTTCAGCCTCAAAAAGTGCTGGGATTACAGGT 300

 42342960 GTGAGCCATCGCACTCCACCTTCTCTATAGTTACTGAGTTTGCGTGTTACACTGAGTTTA 42343019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTGAGCCATCGCACTCCACCTTCTCTATAGTTACTGAGTTTGCGTGTTACACTGAGTTTA 360

 42343020 CATCTTACATTTCTAGCCATATCAGAAACGACCTCTGCACCTCTCTTTCCCAATTTGAGA 42343079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CATCTTACATTTCTAGCCATATCAGAAACGACCTCTGCACCTCTCTTTCCCAATTTGAGA 420

 42343080 TTTCTAATAGAAAGAATCTTGTTCACCCAGCTTGGGACTCATTGAGTTATGACCAGTGGG 42343139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTTCTAATAGAAAGAATCTTGTTCACCCAGCTTGGGACTCATTGAGTTATGACCAGTGGG 480

 42343140 ATAGATTTTAGAAGATAAACATGTCTATAGGGACTTACCGTGTGAATTAGTGGGGGAGCC 42343199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATAGATTTTAGAAGATAAACATGTCTATAGGGACTTACCGTGTGAATTAGTGGGGGAGCC 540

 42343200 GCTTACCAGGCAGAGGGGTCTGCTGTAAAGTGATACTGTGACTTTAAATTGAAAGTAAGC 42343259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GCTTACCAGGCAGAGGGGTCTGCTGTAAAGTGATACTGTGACTTTAAATTGAAAGTAAGC 600

 42343260 TTCTAGAAGAGTTGAAGAGGAGTGGATTATTGTTGAATGGATGTATAACTAATGAAGCTT 42343319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTCTAGAAGAGTTGAAGAGGAGTGGATTATTGTTGAATGGATGTATAACTAATGAAGCTT 660

 42343320 TAAAGGAAGTTTATTAGAAAGTCCATGTCCTTGTCTCTTTCCCAAACTCCTTTAGTTCCC 42343379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TAAAGGAAGTTTATTAGAAAGTCCATGTCCTTGTCTCTTTCCCAAACTCCTTTAGTTCCC 720

 42343380 AAGTCCTGAAAGAATCTATGGATAAGGGAAGCAGAATACTATAGTGGTTAAGAGCACATG 42343439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAGTCCTGAAAGAATCTATGGATAAGGGAAGCAGAATACTATAGTGGTTAAGAGCACATG 780

 42343440 CTCGAGGTTAAACTGTCTGTATTTTGGATCCTGGCCTTGAGGACTTGGGCAAGTTACGTG 42343499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTCGAGGTTAAACTGTCTGTATTTTGGATCCTGGCCTTGAGGACTTGGGCAAGTTACGTG 840

 42343500 ACCTGCCTGAGCCTCAGTTTCCTCACCTGTAATATGGGTATCACGAGGAATAAATAAGGT 42343559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ACCTGCCTGAGCCTCAGTTTCCTCACCTGTAATATGGGTATCACGAGGAATAAATAAGGT 900

 42343560 AATATGTGTAAAGTGCTTGGCACAATGCTCTTGATAATGTTAGCAACATAATTTTGTAAT 42343619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AATATGTGTAAAGTGCTTGGCACAATGCTCTTGATAATGTTAGCAACATAATTTTGTAAT 960

 42343620 GAAAATTAACTGATGGGGCTGAAATGTGCATCAGCAGATCCAAATATCCTTGATAAACTG 42343679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
      961 GAAAATTAACTGATGGGGCTGAAATGTGCATCAGCAGATCCAAATATCCTCGATAAACTG 1020

 42343680 GCCAAAAGAAAGATGAATTGGCAGAGAGGCAAGTGTTCATCTCAGTTCTCCAGATATCCC 42343739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GCCAAAAGAAAGATGAATTGGCAGAGAGGCAAGTGTTCATCTCAGTTCTCCAGATATCCC 1080

 42343740 TGCAAATGTGGCCTCTGGAGTAGAAGATTTAGGGAGAAAAATAAGCCATGAAGCTCTTCT 42343799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGCAAATGTGGCCTCTGGAGTAGAAGATTTAGGGAGAAAAATAAGCCATGAAGCTCTTCT 1140

 42343800 GGCACCAACATGAACTTCAGGGATCATGGGACATTTGGGCCAGTAACATTCCTCTTTGTT 42343859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GGCACCAACATGAACTTCAGGGATCATGGGACATTTGGGCCAGTAACATTCCTCTTTGTT 1200

 42343860 CCTAGAGATTTAATATCTACCTACCAACTAAATGGCCTTGATTTGGAGGAGAGAAGACAA 42343919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CCTAGAGATTTAATATCTACCTACCAACTAAATGGCCTTGATTTGGAGGAGAGAAGACAA 1260

 42343920 GAAGAGGAATTGCTTTCAGCTGGTCCTTGCCTTTAACTAACCAGGGGTACAAAAATTTTA 42343979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GAAGAGGAATTGCTTTCAGCTGGTCCTTGCCTTTAACTAACCAGGGGTACAAAAATTTTA 1320

 42343980 AAATACAAAGGAGACCATGTGTAAAACATTAGTTAAGCTCAGATATAAATCTAGTCTTTG 42344039
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AAACACAAAGGAGACCATGTGTAAAACATTAGTTAAGCTCAGATATAAATCTAGTCTTTG 1380

 42344040 ACCAGTCCAGAGCTAATCAATATGCTTTTCTACTCTCTTTGAACTTTTGAGTTTTCTGGC 42344099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ACCAGTCCAGAGCTAATCAATATGCTTTTCTACTCTCTTTGAACTTTTGAGTTTTCTGGC 1440

 42344100 AACAACAAAAATCCCAAACCTCATCCAAAACCGTAGTCCAGACAGCCCAGTTTCTGCACT 42344159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AACAACAAAAATCCCAAACCTCATCCAAAACCGTAGTCCAGACAGCCCAGTTTCTGCACT 1500

 42344160 CCCTTCCTTGTGTCACATATTGTTGACAGAACTACTCCCGTTACCACATTCATTCCAGTG 42344219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CCCTTCCTTGTGTCACATATTGTTGACAGAACTACTCCCGTTACCACATTCATTCCAGTG 1560

 42344220 GTGATTCAAATTCTTCTGCAGAAATGGACTTGAAAGACAGAAAACTGCTCCTGTAATCAC 42344279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GTGATTCAAATTCTTCTGCAGAAATGGACTTGAAAGACAGAAAACTGCTCCTGTAATCAC 1620

 42344280 TTAATAAGGAATCTTGGATGAGGAATACAGAGCTATGAATATGGATTTACTCTTAGCCTT 42344339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTAATAAGGAATCTTGGATGAGGAATACAGAGCTATGAATATGGATTTACTCTTAGCCTT 1680

 42344340 TATGGATGCCTTTTTCTCAGTTATTTTCACTGAAAATCATGATGAACTGATTTAAATATC 42344399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TATGGATGCCTTTTTCTCAGTTATTTTCACTGAAAATCATGATGAACTGATTTAAATATC 1740

 42344400 AAGGTAAACTGAGATGGAAAATTACCGATAATAAGAGTTTTCTGAAAATATAGATTGGCC 42344459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AAGGTAAACTGAGATGGAAAATTACCGATAATAAGAGTTTTCTGAAAATATAGATTGGCC 1800

 42344460 TCTTTAAAGCACATCGAGTTTGTTTTGTTTAAATTACAAATTCACATATATTTGAAATGT 42344519
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TCTTTAAAACACATCGAGTTTGTTTTGTTTAAATTACAAATTCACATATATTTGAAATGT 1860

 42344520 GTTTAAATGTGTCAGTTTTAGGCAAAACTAAACTATTTGATTCCTTTCCAAAAATCAGGA 42344579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GTTTAAATGTGTCAGTTTTAGGCAAAACTAAACTATTTGATTCCTTTCCAAAAATCAGGA 1920

 42344580 ATTTGCTTTGGAAAAAAACCATGCAGTTTGATTTACAAAGCAGAGCGGGGGGGAAGTAGT 42344639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ATTTGCTTTGGAAAAAAACCATGCAGTTTGATTTACAAAGCAGAGCGGGGGGGAAGTAGT 1980

 42344640 GGGTGAGAAAGACCCACCCAAAGGCTGCAGCCAGCTTCCCCAGGAAGATTCATAACCATG 42344699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GGGTGAGAAAGACCCACCCAAAGGCTGCAGCCAGCTTCCCCAGGAAGATTCATAACCATG 2040

 42344700 CCACAATACTGTCCTTCAATTCGTTCCAACAGATTTTACTATAACTCTAAATCATTAGAA 42344759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CCACAATACTGTCCTTCAATTCGTTCCAACAGATTTTACTATAACTCTAAATCATTAGAA 2100

 42344760 GCAACTGCTGCTATGACTAGTGCTATCTTTGCCTCAAAAAGAGGAAAAATCAGGACATAC 42344819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GCAACTGCTGCTATGACTAGTGCTATCTTTGCCTCAAAAAGAGGAAAAATCAGGACATAC 2160

 42344820 AATATAATCCCCTCAGGATCTAGGAGAGAAATCAGCCCATTTGTCATAAGAACTGAAAAC 42344879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AATATAATCCCCTCAGGATCTAGGAGAGAAATCAGCCCATTTGTCATAAGAACTGAAAAC 2220

 42344880 CTCAGCTAAATAGTATATGAAACATTGGTATTTCATACCTTGACATTACATATTTTTGAA 42344939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CTCAGCTAAATAGTATATGAAACATTGGTATTTCATACCTTGACATTACATATTTTTGAA 2280

 42344940 AATAAAGTAAGCATACACACAAGAAGTGGCTAGATGCAGCAGTTATAAAGTGGCTTAAGT 42344999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AATAAAGTAAGCATACACACAAGAAGTGGCTAGATGCAGCAGTTATAAAGTGGCTTAAGT 2340

 42345000 TGGGTTAACTAAATATAACCTAGAAAAACCATCTTATCTATTGCAAATTATTTCCAGAAA 42345059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TGGGTTAACTAAATATAACCTAGAAAAACCATCTTATCTATTGCAAATTATTTCCAGAAA 2400

 42345060 AAGGTAAGAAAAATCCAACCAACACTTTTTAAACATCCTGAGCTATTCACAGCAAGTGAA 42345119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AAGGTAAGAAAAATCCAACCAACACTTTTTAAACATCCTGAGCTATTCACAGCAAGTGAA 2460

 42345120 TCTTTACCCTTACCAGATGTATAAACATTTACATAAGGCAGGAGGTTCAACACTTGGAGA 42345179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TCTTTACCCTTACCAGATGTATAAACATTTACATAAGGCAGGAGGTTCAACACTTGGAGA 2520

 42345180 GTGTAATCAAGGCAGTAGTAACGCAGTGCTCCTCTCTTTGACTTGAATGACTTCCTCCCC 42345239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GTGTAATCAAGGCAGTAGTAACGCAGTGCTCCTCTCTTTGACTTGAATGACTTCCTCCCC 2580

 42345240 ATTAGGGTCATTATTGTTTTGCAGTGTCCCAGGGATGAAAGGACTTTGAAAGGTCATGTG 42345299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 ATTAGGGTCATTATTGTTTTGCAGTGTCCCAGGGATGAAAGGACTTTGAAAGGTCATGTG 2640

 42345300 TCTTGTGACCCAACTAGCAGCATCAGCATCACTGGGGAGAAACTCAAGCAGAAGCTTGAG 42345359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TCTTGTGACCCAACTAGCAGCATCAGCATCACTGGGGAGAAACTCAAGCAGAAGCTTGAG 2700

 42345360 TCTACTCCACTCTTGCTGACACCAAATCTGCATTTTTACAGGATTCTTGGGTGAGTCACA 42345419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TCTACTCCACTCTTGCTGACACCAAATCTGCATTTTTACAGGATTCTTGGGTGAGTCACA 2760

 42345420 CACATATTCAAGGTTAAAATATGCCACCCTAGGTCTTTCTCCTGCTTCTGAGCAAAACTG 42345479
          .||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     2761 GACATATTCAAGGTTAAAATATGCCACCCTAGGTCTTTCTCCTGCTTCTGAGCAAAACTA 2820

 42345480 GGCACAAGGGACAAACTAGTTTCCTTCAGCCACTTTCAAATCCTTTATAGAGTGTACTGT 42345539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GGCACAAGGGACAAACTAGTTTCCTTCAGCCACTTTCAAATCCTTTATAGAGTGTACTGT 2880

 42345540 GTGAGTCACTGAGAGGAAAGAGGAAATAATACTTATTTAGGGAAGTCTTGCATAACTTAA 42345599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 GTGAGTCACTGAGAGGAAAGAGGAAATAATACTTATTTAGGGAAGTCTTGCATAACTTAA 2940

 42345600 CAAAGTTAGTAACTTCTTCAATACACTCAAGTACCTATTTTTGGAAGCCCTACAGGTTAG 42345659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CAAAGTTAGTAACTTCTTCAATACACTCAAGTACCTATTTTTGGAAGCCCTACAGGTTAG 3000

 42345660 GTCAAAGTAAAGAGAAGCAAAAAATGGAGTGAGTTCTAGTAAAAAACTCTGACAAAATAA 42345719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GTCAAAGTAAAGAGAAGCAAAAAATGGAGTGAGTTCTAGTAAAAAACTCTGACAAAATAA 3060

 42345720 GGGAAGTGTAGAAGCTGAGTCTATGAGGGATGAGAGAAGCAATTTACCAAATTATCAGAT 42345779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 GGGAAGTGTAGAAGCTGAGTCTATGAGGGATGAGAGAAGCAATTTACCAAATTATCAGAT 3120

 42345780 CCAAAATCATCTCTGCACTGTAGATGATTTATAGCCCTGGAAGCTTAGAGGCTTGAGTCT 42345839
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     3121 CCAAAATCATCTCTGCACTGTAGATGATTTATAGCCCTGGAAGCTTAGAGGCTTGGGTCT 3180

 42345840 CTTGCTGTATTTCATTTCAAATTAGTAATTTTTATCTAGGGCTTCCCTATGGCTTAAAGT 42345899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 CTTGCTGTATTTCATTTCAAATTAGTAATTTTTATCTAGGGCTTCCCTATGGCTTAAAGT 3240

 42345900 GAAGGCCCTGGAATTTCTGAAGTGAAATTATCTGATGATTTTTATGTATGGTCATTCTGT 42345959
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 GAAGGCCCTGGAATTTCTGAAGTGAAATCATCTGATGATTTTTATGTATGGTCATTCTGT 3300

 42345960 AGTTATCCTGTAAGTTTCATATTTGTAACAAGACTGGAATCCGAACAATAGAAAACTCTG 42346019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 AGTTATCCTGTAAGTTTCATATTTGTAACAAGACTGGAATCCGAACAATAGAAAACTCTG 3360

 42346020 TGGCAGTAAGCCAAAACCTGATGGACTTAGGAGAGTTACGTATGTGTGTTTCAGTGGTCC 42346079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TGGCAGTAAGCCAAAACCTGATGGACTTAGGAGAGTTACGTATGTGTGTTTCAGTGGTCC 3420

 42346080 TCAAATTCAGCTGCCTATTAGAATCACCTGGACTTTGAAAAAAAAAGAGCTTTCTTGAGG 42346139
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TCAAATTTAGCTGCCTATTAGAATCACCTGGACTTTGAAAAAAAAAGAGCTTTCTTGAGG 3480

 42346140 TATAACTGACAAATAATAAGACAAACATATTTCAGTATACAATTGGATGAGTTTTGACAT 42346199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TATAACTGACAAATAATAAGACAAACATATTTCAGTATACAATTGGATGAGTTTTGACAT 3540

 42346200 GTTATATTCTTGTGAAACCATCACCACAATCAAGCTATTCACCCCCCAAATTTTCGTGCC 42346259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 GTTATATTCTTGTGAAACCATCACCACAATCAAGCTATTCACCCCCCAAATTTTCGTGCC 3600

EXCISED REGION

 42347319 TTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGCTCTCAAACTCCTGA 42347378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3605 TTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGCTCTCAAACTCCTGA 3664

 42347379 CCTCAGGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACC 42347438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3665 CCTCAGGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACC 3724

 42347439 ATGCCCAGCGTATTAATTTTCTTGCATGGATGGTGCGTTTGGTGATCTGAGAAATCTTTA 42347498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3725 ATGCCCAGCGTATTAATTTTCTTGCATGGATGGTGCGTTTGGTGATCTGAGAAATCTTTA 3784

 42347499 CCTAACCCAAGGTCACAGAGATTTTCTCCTGTTTGCTTCCAAAATTTTTATACGTTTAGA 42347558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3785 CCTAACCCAAGGTCACAGAGATTTTCTCCTGTTTGCTTCCAAAATTTTTATACGTTTAGA 3844

 42347559 TTTTATATTTAAGTCTATTTTGAGTTAATTTTTGTATATAATGCAAAGTTTAGAATGATG 42347618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3845 TTTTATATTTAAGTCTATTTTGAGTTAATTTTTGTATATAATGCAAAGTTTAGAATGATG 3904

 42347619 TTTAGTTTTTTGTCTATAATCTATGAATATCCAATAGTTCTAGCACCATTTATTGAAAAG 42347678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3905 TTTAGTTTTTTGTCTATAATCTATGAATATCCAATAGTTCTAGCACCATTTATTGAAAAG 3964

 42347679 ACTGATCTTTATCTACTGAAGTGTCTTTGCACTTTTGTTGAAAGTCAATTGACAATTGAC 42347738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3965 ACTGATCTTTATCTACTGAAGTGTCTTTGCACTTTTGTTGAAAGTCAATTGACAATTGAC 4024

 42347739 CATATATTTGTGGGTCTATTCTGGATTCTCTATTCTGTTACATTGATCTATTTTTCTATC 42347798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4025 CATATATTTGTGGGTCTATTCTGGATTCTCTATTCTGTTACATTGATCTATTTTTCTATC 4084

 42347799 TCAATACAAATATCAAAT 42347816
          ||||||||||||||||||
     4085 TCAATACAAATATCAAAT 4102

Alignment time is 2.94445 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [42336259,42357318] =>     21060 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [       1,    7886] =>      7886 nucs 'mol-32-303b-135183_7886'

Score:        7628
Aligned:      7779        nucs
Identic:      7762 (100%) nucs =>      1551 (100%)      6211 (100%)
Gaps:            7 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [42338944,42340498] EXCISED REGION [42340499,42346722]
 second seq =>  [       1,    1553] EXCISED REGION [    1668,    7886]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>       114 nucs [1554,1667]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        37 nucs [1554,1590] to [1668,1704]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [1554,1554] to [1667,1667]

 42338944 ATGTATATATGTGTGTGTATATATATACGTATATATATGTGTATATATATATACATATCT 42339003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATGTATATATGTGTGTGTATATATATACGTATATATATGTGTATATATATATACATATCT 60

 42339004 ATATATGTGTGTGTGTATATATATATATATATACATATATATATTTACCCAGTTTCAAGA 42339063
          |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||
       61 ATATATGTGTGTGTGTATATATATATATATA--CATATATATATTTACCCAGTTTCAAGA 118

 42339064 GAAAAAAGTCAAAGGGGTAAGAGTATTCTTCATACACAGTCTAACATCTCTTTCTTCCAC 42339123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      119 GAAAAAAGTCAAAGGGGTAAGAGTATTCTTCATACACAGTCTAACATCTCTTTCTTCCAC 178

 42339124 TCACAGTTGTCTTATTTTGTTCCTCTTCACTCTCCCAAAACTTAGCCCATGTTCCCCAGC 42339183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      179 TCACAGTTGTCTTATTTTGTTCCTCTTCACTCTCCCAAAACTTAGCCCATGTTCCCCAGC 238

 42339184 TCCCCTCTGCACCTGCATCTGCCACACACGTACATACATACACACACTTCACATACATGC 42339243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      239 TCCCCTCTGCACCTGCATCTGCCACACACGTACATACATACACACACTTCACATACATGC 298

 42339244 ACGCATATATACAAACACACACACATATGCGCGCACACACACACACACACACACACACAC 42339303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
      299 ACGCATATATACAAACACACACACATATGCGCACACACACACACACACACACACACACAC 358

 42339304 TCTCTCTCCAGCCCTTGATGCTTTCCCCCTCTCTCTTCCTCCTGGACCTTTTCTTTGCTC 42339363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      359 TCTCTCTCCAGCCCTTGATGCTTTCCCCCTCTCTCTTCCTCCTGGACCTTTTCTTTGCTC 418

 42339364 CATTCCCAACACACAGGTCCCTGGTCTGTCTCTGGCTCCTTCCAAGCCTTGGCTCTTCTT 42339423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      419 CATTCCCAACACACAGGTCCCTGGTCTGTCTCTGGCTCCTTCCAAGCCTTGGCTCTTCTT 478

 42339424 AGGTATTATCCCCAGCAGCACAGCAGCAGACCAGCTGACCTGGACTATTTCTTAGGCAGT 42339483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      479 AGGTATTATCCCCAGCAGCACAGCAGCAGACCAGCTGACCTGGACTATTTCTTAGGCAGT 538

 42339484 AGTCAGGTAAGCTGTACCTACTCATATGGAGATATTGTTTGATCCTGAGCCTCTCCTGAT 42339543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      539 AGTCAGGTAAGCTGTACCTACTCATATGGAGATATTGTTTGATCCTGAGCCTCTCCTGAT 598

 42339544 GTCTCTTTTTAGCCCCCAGGGGGAGGTTTTAATATCCACATCCACCAGCATCTTCTCCCT 42339603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      599 GTCTCTTTTTAGCCCCCAGGGGGAGGTTTTAATATCCACATCCACCAGCATCTTCTCCCT 658

 42339604 AGGGGAGAAGGGAGTGAGATGGGGAGAAGAAAGTGAGAGGAATCGAAACATGTCTAAGGA 42339663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      659 AGGGGAGAAGGGAGTGAGATGGGGAGAAGAAAGTGAGAGGAATCGAAACATGTCTAAGGA 718

 42339664 AACTAAGAGGCAGAGGTTATTTCGATCTGCTCTTTATAATCATCTCAGATGCCTGCCCTG 42339723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      719 AACTAAGAGGCAGAGGTTATTTCGATCTGCTCTTTATAATCATCTCAGATGCCTGCCCTG 778

 42339724 GGCAATGTCTAGGTTATTACTGAATTCTGGGGACACTCCCATATTAGCCCAATGACTAAT 42339783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      779 GGCAATGTCTAGGTTATTACTGAATTCTGGGGACACTCCCATATTAGCCCAATGACTAAT 838

 42339784 CAAAAAAAGCAAGCTGACCATAGTCAACTAGAGGGTAAGGAACCAAGTGAAAATAGAGAG 42339843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      839 CAAAAAAAGCAAGCTGACCATAGTCAACTAGAGGGTAAGGAACCAAGTGAAAATAGAGAG 898

 42339844 AGTTCTCCGGACCTCTGAATCTGGGTACAATCATTCAGTATGAAGATAGGAGCTAGGAGA 42339903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      899 AGTTCTCCGGACCTCTGAATCTGGGTACAATCATTCAGTATGAAGATAGGAGCTAGGAGA 958

 42339904 AGAGAGAAAACATGGAATTGTATTTTGATTGACTTTTTTCTGATTACAAAAGTCATATAT 42339963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      959 AGAGAGAAAACATGGAATTGTATTTTGATTGACTTTTTTCTGATTACAAAAGTCATATAT 1018

 42339964 GTTCAATGTAGAAAACCAGGAAGATACTGAAAAATACAAGAAGGTGTTAAAAAAAAAAAA 42340023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1019 GTTCAATGTAGAAAACCAGGAAGATACTGAAAAATACAAGAAGGTGTTAAAAAAAAAAAA 1078

 42340024 CACTTATGACCCCACCACCTAGATTTAATCAAGATTAACATGTTAGTTTACCTTTCCAGT 42340083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1079 CACTTATGACCCCACCACCTAGATTTAATCAAGATTAACATGTTAGTTTACCTTTCCAGT 1138

 42340084 GTGGTTTTCAATGCATATTCTTTTTAAAATCAAGTTAGAAACATAGTGTATATGCTATTT 42340143
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     1139 GTGGTTTTCAATGCATATTCTTTTTAAAATCAAGTTAGAAACAGAGTGTATATGCTATTT 1198

 42340144 TAGAAATTCTTTCTCAGCTGGGCGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTAGGAG 42340203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1199 TAGAAATTCTTTCTCAGCTGGGCGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTAGGAG 1258

 42340204 GCCAAGGCAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGA 42340263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1259 GCCAAGGCAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGA 1318

 42340264 AACCCCATCTCTACCAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGATGGCACACACCTGTAAAT 42340323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1319 AACCCCATCTCTACCAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGATGGCACACACCTGTAAAT 1378

 42340324 CTCAGCTATTCTGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACTTGAGAGGTGGAGGTTGCA 42340383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1379 CTCAGCTATTCTGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACTTGAGAGGTGGAGGTTGCA 1438

 42340384 GTGAGCCAAGATCGCACCACTGCACTCCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGAGAGACTCTGT 42340443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1439 GTGAGCCAAGATCGCACCACTGCACTCCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGAGAGACTCTGT 1498

 42340444 CTCAAAAAATAAAAAAGAAAGAAAAGAAAGAAATTCTTTCTCATACATTACATCA 42340498
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1499 CTCAAAAAATAAAAAAGAAAGAAAAGAAAGAAATTCTTTCTCATACATTACATCA 1553

EXCISED REGION

 42340499 TAAATCTTTTCCCAAATCATTAAATATTCTTCTGCAATATGATTTGTTAAAGCTATATAT 42340558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1668 TAAATCTTTTCCCAAATCATTAAATATTCTTCTGCAATATGATTTGTTAAAGCTATATAT 1727

 42340559 GATTTTGTGCAATAGATATGCTATAATAGGCTTACCCAATTTTATATGGAAGAGCACTTA 42340618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1728 GATTTTGTGCAATAGATATGCTATAATAGGCTTACCCAATTTTATATGGAAGAGCACTTA 1787

 42340619 CGCTGTTTCCAGGCATAGAATTCTAAATATGGCAAGGTTATCTGCACAACTCCTGTTTTC 42340678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1788 CGCTGTTTCCAGGCATAGAATTCTAAATATGGCAAGGTTATCTGCACAACTCCTGTTTTC 1847

 42340679 AGGCATGCTGACCTCCATTCCTTACAAGCAGATAATGATCCCTTTAAAGTTCTCTGCTCA 42340738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1848 AGGCATGCTGACCTCCATTCCTTACAAGCAGATAATGATCCCTTTAAAGTTCTCTGCTCA 1907

 42340739 AGAGAACCGTGCCATAGCAGAAGTAATTCTTCCCCAAGCGTTCAGCTGTCCTGTGTTCTC 42340798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1908 AGAGAACCGTGCCATAGCAGAAGTAATTCTTCCCCAAGCGTTCAGCTGTCCTGTGTTCTC 1967

 42340799 CAGGGAAAGCCTAGCATTGGGCGTTGGGCATGCTTGCCTCTAAATGGGAAGGCCAGTTCA 42340858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1968 CAGGGAAAGCCTAGCATTGGGCGTTGGGCATGCTTGCCTCTAAATGGGAAGGCCAGTTCA 2027

 42340859 TTCTTAAGCAGATGGAGAGAAAGCATTTGTCATTCTAAATCCGGGAAGTAGCTCAATTCA 42340918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2028 TTCTTAAGCAGATGGAGAGAAAGCATTTGTCATTCTAAATCCGGGAAGTAGCTCAATTCA 2087

 42340919 ATTCAATTGCATAATTCTTAAAAACATATTTTGCGCCACTCCTGAAAATGGTATTATAGA 42340978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2088 ATTCAATTGCATAATTCTTAAAAACATATTTTGCGCCACTCCTGAAAATGGTATTATAGA 2147

 42340979 AGAAAAGTATGGTTTCTACCTTTAAGAAGATTGCTGACCGGGCTGGGCGCAGTGGCTCAT 42341038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2148 AGAAAAGTATGGTTTCTACCTTTAAGAAGATTGCTGACCGGGCTGGGCGCAGTGGCTCAT 2207

 42341039 GCCTGTAATCCCAGAACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGCAGATCCCCTGAGGTCAGGAGTTA 42341098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2208 GCCTGTAATCCCAGAACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGCAGATCCCCTGAGGTCAGGAGTTA 2267

 42341099 GAGGCTAGCCCGACCAACATGGCAAAACCCCGTCTCTACTAAAAATATAAAAATTAGCTG 42341158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2268 GAGGCTAGCCCGACCAACATGGCAAAACCCCGTCTCTACTAAAAATATAAAAATTAGCTG 2327

 42341159 GGCATGGTGGTGCATGCCTGTAGCCCCAGCTACTCAGGAGACTCAGGCATGAAAATCGCT 42341218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2328 GGCATGGTGGTGCATGCCTGTAGCCCCAGCTACTCAGGAGACTCAGGCATGAAAATCGCT 2387

 42341219 TGAACCCGAGACACGGAGGTGGTGGTGAGCTGAAATTGCGCCACTGCATTCCAGCCTGGG 42341278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2388 TGAACCCGAGACACGGAGGTGGTGGTGAGCTGAAATTGCGCCACTGCATTCCAGCCTGGG 2447

 42341279 CGACAGAGCAAGACTCTATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAGAAGAAGAAGATTGCTGG 42341338
          |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2448 CGACAGAGCAAGACTCTATCTC-AAAAAAAAAAAAAAAAGAAGAAGAAGAAGATTGCTGG 2506

 42341339 CGGGGTGTTGTGGCTCATACTTGTAATCCTAGCACTTTGGGAGGCCAAGGAAGGAGGATC 42341398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2507 CGGGGTGTTGTGGCTCATACTTGTAATCCTAGCACTTTGGGAGGCCAAGGAAGGAGGATC 2566

 42341399 ACTTGAGCCAAAGAAGTCAAGGCTGCAGTGAGCTGTGATCACACCACTCCATGCCAGCCT 42341458
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2567 ACTTGAGCCAAAGAACTCAAGGCTGCAGTGAGCTGTGATCACACCACTCCATGCCAGCCT 2626

 42341459 GGGTGACAGAGTGAAACCCTGTCTCAAAAAGAAAAAAGAAAAGATTGCCATCTTCCTGGG 42341518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2627 GGGTGACAGAGTGAAACCCTGTCTCAAAAAGAAAAAAGAAAAGATTGCCATCTTCCTGGG 2686

 42341519 GTGACAAACATAATTTTAAAAGAATCAGGTAGAAACATAGGACTGTATTTATGATGAAAC 42341578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2687 GTGACAAACATAATTTTAAAAGAATCAGGTAGAAACATAGGACTGTATTTATGATGAAAC 2746

 42341579 AACTATGACTAAATGCTATGTTTTTCAGATTACACGTGCCTTAGGAAGTGAGAAAAGTAT 42341638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2747 AACTATGACTAAATGCTATGTTTTTCAGATTACACGTGCCTTAGGAAGTGAGAAAAGTAT 2806

 42341639 AAGTGCAATGTGGAATTGGGTGGTTGAGAAAACTCCAGAGAGGACCTGGTAGAGCTTGGA 42341698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2807 AAGTGCAATGTGGAATTGGGTGGTTGAGAAAACTCCAGAGAGGACCTGGTAGAGCTTGGA 2866

 42341699 GGCAAGGTGGGCAAGGAACATTTCAAGAGGAGGGGACACTACAGCTGAGGCACAGAGGTG 42341758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2867 GGCAAGGTGGGCAAGGAACATTTCAAGAGGAGGGGACACTACAGCTGAGGCACAGAGGTG 2926

 42341759 AGAAAGCACAGGAAGCAAGAAAGAGGCTCATCTGGCTGCAGCAGAGGGAGAAATAGTAAA 42341818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2927 AGAAAGCACAGGAAGCAAGAAAGAGGCTCATCTGGCTGCAGCAGAGGGAGAAATAGTAAA 2986

 42341819 TTAGATCAGATAACTCATATATTGGGCACGTGTGCAGAGGGCCAAAAAGATGTTTGGCCT 42341878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2987 TTAGATCAGATAACTCATATATTGGGCACGTGTGCAGAGGGCCAAAAAGATGTTTGGCCT 3046

 42341879 TAATTCTATAGGTATTCCCCTTTGCCATAGATGTTACACCAAGAAAGAACACATTGAATC 42341938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3047 TAATTCTATAGGTATTCCCCTTTGCCATAGATGTTACACCAAGAAAGAACACATTGAATC 3106

 42341939 AAGCAAATTTAAGCTGGGTTTTTGTTTTTGTTTTTTGGTGGTGGGGGGGATGATTTATAA 42341998
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3107 AAGCAACTTTAAGCTGGGTTTTTGTTTTTGTTTTTTGGTGGTGGGGGGGATGATTTATAA 3166

 42341999 GCAGGACTTCCCAAAGCTTTTAATATGCTTATATATGTGGCAGTGTTGAGAGGGGAAGAT 42342058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3167 GCAGGACTTCCCAAAGCTTTTAATATGCTTATATATGTGGCAGTGTTGAGAGGGGAAGAT 3226

 42342059 TTGATATTCCAAGTATTTTTGGCCACAGAACTCTTTTTATCATGGAACATTTCCAGTGTT 42342118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3227 TTGATATTCCAAGTATTTTTGGCCACAGAACTCTTTTTATCATGGAACATTTCCAGTGTT 3286

 42342119 CCATGAGACACAATTAGGGGCTAGTGAGCCACTGACTTTTGAGTTGGAAAGTGACACATG 42342178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3287 CCATGAGACACAATTAGGGGCTAGTGAGCCACTGACTTTTGAGTTGGAAAGTGACACATG 3346

 42342179 GGGAAAGCAAAGTTTTGGAAGATTGATCTCACGGTAGAATATAAGGTGAACAGGAGAGAA 42342238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3347 GGGAAAGCAAAGTTTTGGAAGATTGATCTCACGGTAGAATATAAGGTGAACAGGAGAGAA 3406

 42342239 AAGAGCCTGGATTCAGGCAACACAATCAGATGATTGGATACAGGCTCAAGATTAGGGGGT 42342298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3407 AAGAGCCTGGATTCAGGCAACACAATCAGATGATTGGATACAGGCTCAAGATTAGGGGGT 3466

 42342299 GGGTTGCACTACACTGGAGCGGAGAATGGAGAGCAAAAGCACTGATTGAATGCACAGTCT 42342358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3467 GGGTTGCACTACACTGGAGCGGAGAATGGAGAGCAAAAGCACTGATTGAATGCACAGTCT 3526

 42342359 TCTGTTGGATCCTGGGATGATACAGAAGTGTCAGAGTTCCTGGGTCTTGTAGGAGTTCCA 42342418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3527 TCTGTTGGATCCTGGGATGATACAGAAGTGTCAGAGTTCCTGGGTCTTGTAGGAGTTCCA 3586

 42342419 ATGAGCATCAATCAAAAGTTTGATTGTAAGGCACAGAAATCAACTTGGACCAGCTAAAGC 42342478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3587 ATGAGCATCAATCAAAAGTTTGATTGTAAGGCACAGAAATCAACTTGGACCAGCTAAAGC 3646

 42342479 AAAAAGACCATTTTTAGGGAAATAGGGATGTGTCACAAAGAACTGCATCTAGGTACTGGA 42342538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3647 AAAAAGACCATTTTTAGGGAAATAGGGATGTGTCACAAAGAACTGCATCTAGGTACTGGA 3706

 42342539 AATCAACAAAAAGTTCCCCATCTGATCTCAGCTTCTCTGTGTGTCTACTACATACACTAT 42342598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3707 AATCAACAAAAAGTTCCCCATCTGATCTCAGCTTCTCTGTGTGTCTACTACATACACTAT 3766

 42342599 CTTTCTCCTCTTTTCTTTCCTCTCTACCCCCTACCTCCCTCCTCTCTCTTTTTTTTTTTT 42342658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||
     3767 CTTTCTCCTCTTTTCTTTCCTCTCTACCCCCTACCTCCCTCCTCTCTC----TTTTTTTT 3822

 42342659 TTTTTGTTTTTTGGTTTTTTTATGTTTGTTTGTTTGCTTTTGGAGACACGGTCTCCCTCT 42342718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     3823 TTTTTGTTTTTTGGTTTTTTTATGTTTGTTTGTTTGTTTTTGGAGACACGGTCTCCCTCT 3882

 42342719 GTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCTTAATTACTGCAGCCTCAATCTCCTGGGCTCAAGT 42342778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3883 GTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCTTAATTACTGCAGCCTCAATCTCCTGGGCTCAAGT 3942

 42342779 GACCCTCCCACCTCAGCCTCCTGAATAGCTGGGACCACAGGTGCAAGCCACAGTGCTCAG 42342838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3943 GACCCTCCCACCTCAGCCTCCTGAATAGCTGGGACCACAGGTGCAAGCCACAGTGCTCAG 4002

 42342839 CTAATTAAAAAAAATTTTTTTTTCAGAGATGGGGTCTCACTATGTTGTCCAGGCTGGTCT 42342898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4003 CTAATTAAAAAAAATTTTTTTTTCAGAGATGGGGTCTCACTATGTTGTCCAGGCTGGTCT 4062

 42342899 CAAACTCCTAGGCTCAAGCAGTCCTCCCGTTTCAGCCTCAAAAAGTGCTGGGATTACAGG 42342958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4063 CAAACTCCTAGGCTCAAGCAGTCCTCCCGTTTCAGCCTCAAAAAGTGCTGGGATTACAGG 4122

 42342959 TGTGAGCCATCGCACTCCACCTTCTCTATAGTTACTGAGTTTGCGTGTTACACTGAGTTT 42343018
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4123 TGTGAGCCATCGCACTCCACTTTCTCTATAGTTACTGAGTTTGCGTGTTACACTGAGTTT 4182

 42343019 ACATCTTACATTTCTAGCCATATCAGAAACGACCTCTGCACCTCTCTTTCCCAATTTGAG 42343078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4183 ACATCTTACATTTCTAGCCATATCAGAAACGACCTCTGCACCTCTCTTTCCCAATTTGAG 4242

 42343079 ATTTCTAATAGAAAGAATCTTGTTCACCCAGCTTGGGACTCATTGAGTTATGACCAGTGG 42343138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4243 ATTTCTAATAGAAAGAATCTTGTTCACCCAGCTTGGGACTCATTGAGTTATGACCAGTGG 4302

 42343139 GATAGATTTTAGAAGATAAACATGTCTATAGGGACTTACCGTGTGAATTAGTGGGGGAGC 42343198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4303 GATAGATTTTAGAAGATAAACATGTCTATAGGGACTTACCGTGTGAATTAGTGGGGGAGC 4362

 42343199 CGCTTACCAGGCAGAGGGGTCTGCTGTAAAGTGATACTGTGACTTTAAATTGAAAGTAAG 42343258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4363 CGCTTACCAGGCAGAGGGGTCTGCTGTAAAGTGATACTGTGACTTTAAATTGAAAGTAAG 4422

 42343259 CTTCTAGAAGAGTTGAAGAGGAGTGGATTATTGTTGAATGGATGTATAACTAATGAAGCT 42343318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4423 CTTCTAGAAGAGTTGAAGAGGAGTGGATTATTGTTGAATGGATGTATAACTAATGAAGCT 4482

 42343319 TTAAAGGAAGTTTATTAGAAAGTCCATGTCCTTGTCTCTTTCCCAAACTCCTTTAGTTCC 42343378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4483 TTAAAGGAAGTTTATTAGAAAGTCCATGTCCTTGTCTCTTTCCCAAACTCCTTTAGTTCC 4542

 42343379 CAAGTCCTGAAAGAATCTATGGATAAGGGAAGCAGAATACTATAGTGGTTAAGAGCACAT 42343438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4543 CAAGTCCTGAAAGAATCTATGGATAAGGGAAGCAGAATACTATAGTGGTTAAGAGCACAT 4602

 42343439 GCTCGAGGTTAAACTGTCTGTATTTTGGATCCTGGCCTTGAGGACTTGGGCAAGTTACGT 42343498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4603 GCTCGAGGTTAAACTGTCTGTATTTTGGATCCTGGCCTTGAGGACTTGGGCAAGTTACGT 4662

 42343499 GACCTGCCTGAGCCTCAGTTTCCTCACCTGTAATATGGGTATCACGAGGAATAAATAAGG 42343558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4663 GACCTGCCTGAGCCTCAGTTTCCTCACCTGTAATATGGGTATCACGAGGAATAAATAAGG 4722

 42343559 TAATATGTGTAAAGTGCTTGGCACAATGCTCTTGATAATGTTAGCAACATAATTTTGTAA 42343618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4723 TAATATGTGTAAAGTGCTTGGCACAATGCTCTTGATAATGTTAGCAACATAATTTTGTAA 4782

 42343619 TGAAAATTAACTGATGGGGCTGAAATGTGCATCAGCAGATCCAAATATCCTTGATAAACT 42343678
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4783 TGAAAATTAACTGATGGGACTGAAATGTGCATCAGCAGATCCAAATATCCTTGATAAACT 4842

 42343679 GGCCAAAAGAAAGATGAATTGGCAGAGAGGCAAGTGTTCATCTCAGTTCTCCAGATATCC 42343738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4843 GGCCAAAAGAAAGATGAATTGGCAGAGAGGCAAGTGTTCATCTCAGTTCTCCAGATATCC 4902

 42343739 CTGCAAATGTGGCCTCTGGAGTAGAAGATTTAGGGAGAAAAATAAGCCATGAAGCTCTTC 42343798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4903 CTGCAAATGTGGCCTCTGGAGTAGAAGATTTAGGGAGAAAAATAAGCCATGAAGCTCTTC 4962

 42343799 TGGCACCAACATGAACTTCAGGGATCATGGGACATTTGGGCCAGTAACATTCCTCTTTGT 42343858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4963 TGGCACCAACATGAACTTCAGGGATCATGGGACATTTGGGCCAGTAACATTCCTCTTTGT 5022

 42343859 TCCTAGAGATTTAATATCTACCTACCAACTAAATGGCCTTGATTTGGAGGAGAGAAGACA 42343918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5023 TCCTAGAGATTTAATATCTACCTACCAACTAAATGGCCTTGATTTGGAGGAGAGAAGACA 5082

 42343919 AGAAGAGGAATTGCTTTCAGCTGGTCCTTGCCTTTAACTAACCAGGGGTACAAAAATTTT 42343978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5083 AGAAGAGGAATTGCTTTCAGCTGGTCCTTGCCTTTAACTAACCAGGGGTACAAAAATTTT 5142

 42343979 AAAATACAAAGGAGACCATGTGTAAAACATTAGTTAAGCTCAGATATAAATCTAGTCTTT 42344038
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5143 AAAACACAAAGGAGACCATGTGTAAAACATTAGTTAAGCTCAGATATAAATCTAGTCTTT 5202

 42344039 GACCAGTCCAGAGCTAATCAATATGCTTTTCTACTCTCTTTGAACTTTTGAGTTTTCTGG 42344098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5203 GACCAGTCCAGAGCTAATCAATATGCTTTTCTACTCTCTTTGAACTTTTGAGTTTTCTGG 5262

 42344099 CAACAACAAAAATCCCAAACCTCATCCAAAACCGTAGTCCAGACAGCCCAGTTTCTGCAC 42344158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5263 CAACAACAAAAATCCCAAACCTCATCCAAAACCGTAGTCCAGACAGCCCAGTTTCTGCAC 5322

 42344159 TCCCTTCCTTGTGTCACATATTGTTGACAGAACTACTCCCGTTACCACATTCATTCCAGT 42344218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5323 TCCCTTCCTTGTGTCACATATTGTTGACAGAACTACTCCCGTTACCACATTCATTCCAGT 5382

 42344219 GGTGATTCAAATTCTTCTGCAGAAATGGACTTGAAAGACAGAAAACTGCTCCTGTAATCA 42344278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5383 GGTGATTCAAATTCTTCTGCAGAAATGGACTTGAAAGACAGAAAACTGCTCCTGTAATCA 5442

 42344279 CTTAATAAGGAATCTTGGATGAGGAATACAGAGCTATGAATATGGATTTACTCTTAGCCT 42344338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5443 CTTAATAAGGAATCTTGGATGAGGAATACAGAGCTATGAATATGGATTTACTCTTAGCCT 5502

 42344339 TTATGGATGCCTTTTTCTCAGTTATTTTCACTGAAAATCATGATGAACTGATTTAAATAT 42344398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5503 TTATGGATGCCTTTTTCTCAGTTATTTTCACTGAAAATCATGATGAACTGATTTAAATAT 5562

 42344399 CAAGGTAAACTGAGATGGAAAATTACCGATAATAAGAGTTTTCTGAAAATATAGATTGGC 42344458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5563 CAAGGTAAACTGAGATGGAAAATTACCGATAATAAGAGTTTTCTGAAAATATAGATTGGC 5622

 42344459 CTCTTTAAAGCACATCGAGTTTGTTTTGTTTAAATTACAAATTCACATATATTTGAAATG 42344518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5623 CTCTTTAAAGCACATCGAGTTTGTTTTGTTTAAATTACAAATTCACATATATTTGAAATG 5682

 42344519 TGTTTAAATGTGTCAGTTTTAGGCAAAACTAAACTATTTGATTCCTTTCCAAAAATCAGG 42344578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5683 TGTTTAAATGTGTCAGTTTTAGGCAAAACTAAACTATTTGATTCCTTTCCAAAAATCAGG 5742

 42344579 AATTTGCTTTGGAAAAAAACCATGCAGTTTGATTTACAAAGCAGAGCGGGGGGGAAGTAG 42344638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5743 AATTTGCTTTGGAAAAAAACCATGCAGTTTGATTTACAAAGCAGAGCGGGGGGGAAGTAG 5802

 42344639 TGGGTGAGAAAGACCCACCCAAAGGCTGCAGCCAGCTTCCCCAGGAAGATTCATAACCAT 42344698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5803 TGGGTGAGAAAGACCCACCCAAAGGCTGCAGCCAGCTTCCCCAGGAAGATTCATAACCAT 5862

 42344699 GCCACAATACTGTCCTTCAATTCGTTCCAACAGATTTTACTATAACTCTAAATCATTAGA 42344758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5863 GCCACAATACTGTCCTTCAATTCGTTCCAACAGATTTTACTATAACTCTAAATCATTAGA 5922

 42344759 AGCAACTGCTGCTATGACTAGTGCTATCTTTGCCTCAAAAAGAGGAAAAATCAGGACATA 42344818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5923 AGCAACTGCTGCTATGACTAGTGCTATCTTTGCCTCAAAAAGAGGAAAAATCAGGACATA 5982

 42344819 CAATATAATCCCCTCAGGATCTAGGAGAGAAATCAGCCCATTTGTCATAAGAACTGAAAA 42344878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5983 CAATATAATCCCCTCAGGATCTAGGAGAGAAATCAGCCCATTTGTCATAAGAACTGAAAA 6042

 42344879 CCTCAGCTAAATAGTATATGAAACATTGGTATTTCATACCTTGACATTACATATTTTTGA 42344938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6043 CCTCAGCTAAATAGTATATGAAACATTGGTATTTCATACCTTGACATTACATATTTTTGA 6102

 42344939 AAATAAAGTAAGCATACACACAAGAAGTGGCTAGATGCAGCAGTTATAAAGTGGCTTAAG 42344998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6103 AAATAAAGTAAGCATACACACAAGAAGTGGCTAGATGCAGCAGTTATAAAGTGGCTTAAG 6162

 42344999 TTGGGTTAACTAAATATAACCTAGAAAAACCATCTTATCTATTGCAAATTATTTCCAGAA 42345058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6163 TTGGGTTAACTAAATATAACCTAGAAAAACCATCTTATCTATTGCAAATTATTTCCAGAA 6222

 42345059 AAAGGTAAGAAAAATCCAACCAACACTTTTTAAACATCCTGAGCTATTCACAGCAAGTGA 42345118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6223 AAAGGTAAGAAAAATCCAACCAACACTTTTTAAACATCCTGAGCTATTCACAGCAAGTGA 6282

 42345119 ATCTTTACCCTTACCAGATGTATAAACATTTACATAAGGCAGGAGGTTCAACACTTGGAG 42345178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6283 ATCTTTACCCTTACCAGATGTATAAACATTTACATAAGGCAGGAGGTTCAACACTTGGAG 6342

 42345179 AGTGTAATCAAGGCAGTAGTAACGCAGTGCTCCTCTCTTTGACTTGAATGACTTCCTCCC 42345238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6343 AGTGTAATCAAGGCAGTAGTAACGCAGTGCTCCTCTCTTTGACTTGAATGACTTCCTCCC 6402

 42345239 CATTAGGGTCATTATTGTTTTGCAGTGTCCCAGGGATGAAAGGACTTTGAAAGGTCATGT 42345298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6403 CATTAGGGTCATTATTGTTTTGCAGTGTCCCAGGGATGAAAGGACTTTGAAAGGTCATGT 6462

 42345299 GTCTTGTGACCCAACTAGCAGCATCAGCATCACTGGGGAGAAACTCAAGCAGAAGCTTGA 42345358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6463 GTCTTGTGACCCAACTAGCAGCATCAGCATCACTGGGGAGAAACTCAAGCAGAAGCTTGA 6522

 42345359 GTCTACTCCACTCTTGCTGACACCAAATCTGCATTTTTACAGGATTCTTGGGTGAGTCAC 42345418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6523 GTCTACTCCACTCTTGCTGACACCAAATCTGCATTTTTACAGGATTCTTGGGTGAGTCAC 6582

 42345419 ACACATATTCAAGGTTAAAATATGCCACCCTAGGTCTTTCTCCTGCTTCTGAGCAAAACT 42345478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6583 ACACATATTCAAGGTTAAAATATGCCACCCTAGGTCTTTCTCCTGCTTCTGAGCAAAACT 6642

 42345479 GGGCACAAGGGACAAACTAGTTTCCTTCAGCCACTTTCAAATCCTTTATAGAGTGTACTG 42345538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6643 GGGCACAAGGGACAAACTAGTTTCCTTCAGCCACTTTCAAATCCTTTATAGAGTGTACTG 6702

 42345539 TGTGAGTCACTGAGAGGAAAGAGGAAATAATACTTATTTAGGGAAGTCTTGCATAACTTA 42345598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6703 TGTGAGTCACTGAGAGGAAAGAGGAAATAATACTTATTTAGGGAAGTCTTGCATAACTTA 6762

 42345599 ACAAAGTTAGTAACTTCTTCAATACACTCAAGTACCTATTTTTGGAAGCCCTACAGGTTA 42345658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6763 ACAAAGTTAGTAACTTCTTCAATACACTCAAGTACCTATTTTTGGAAGCCCTACAGGTTA 6822

 42345659 GGTCAAAGTAAAGAGAAGCAAAAAATGGAGTGAGTTCTAGTAAAAAACTCTGACAAAATA 42345718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6823 GGTCAAAGTAAAGAGAAGCAAAAAATGGAGTGAGTTCTAGTAAAAAACTCTGACAAAATA 6882

 42345719 AGGGAAGTGTAGAAGCTGAGTCTATGAGGGATGAGAGAAGCAATTTACCAAATTATCAGA 42345778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6883 AGGGAAGTGTAGAAGCTGAGTCTATGAGGGATGAGAGAAGCAATTTACCAAATTATCAGA 6942

 42345779 TCCAAAATCATCTCTGCACTGTAGATGATTTATAGCCCTGGAAGCTTAGAGGCTTGAGTC 42345838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6943 TCCAAAATCATCTCTGCACTGTAGATGATTTATAGCCCTGGAAGCTTAGAGGCTTGAGTC 7002

 42345839 TCTTGCTGTATTTCATTTCAAATTAGTAATTTTTATCTAGGGCTTCCCTATGGCTTAAAG 42345898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7003 TCTTGCTGTATTTCATTTCAAATTAGTAATTTTTATCTAGGGCTTCCCTATGGCTTAAAG 7062

 42345899 TGAAGGCCCTGGAATTTCTGAAGTGAAATTATCTGATGATTTTTATGTATGGTCATTCTG 42345958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7063 TGAAGGCCCTGGAATTTCTGAAGTGAAATTATCTGATGATTTTTATGTATGGTCATTCTG 7122

 42345959 TAGTTATCCTGTAAGTTTCATATTTGTAACAAGACTGGAATCCGAACAATAGAAAACTCT 42346018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7123 TAGTTATCCTGTAAGTTTCATATTTGTAACAAGACTGGAATCCGAACAATAGAAAACTCT 7182

 42346019 GTGGCAGTAAGCCAAAACCTGATGGACTTAGGAGAGTTACGTATGTGTGTTTCAGTGGTC 42346078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7183 GTGGCAGTAAGCCAAAACCTGATGGACTTAGGAGAGTTACGTATGTGTGTTTCAGTGGTC 7242

 42346079 CTCAAATTCAGCTGCCTATTAGAATCACCTGGACTTTGAAAAAAAAAGAGCTTTCTTGAG 42346138
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7243 CTCAAATTTAGCTGCCTATTAGAATCACCTGGACTTTGAAAAAAAAAGAGCTTTCTTGAG 7302

 42346139 GTATAACTGACAAATAATAAGACAAACATATTTCAGTATACAATTGGATGAGTTTTGACA 42346198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7303 GTATAACTGACAAATAATAAGACAAACATATTTCAGTATACAATTGGATGAGTTTTGACA 7362

 42346199 TGTTATATTCTTGTGAAACCATCACCACAATCAAGCTATTCACCCCCCAAATTTTCGTGC 42346258
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7363 TGTTATATTCTTGTGAAACCATCGCCACAATCAAGCTATTCACCCCCCAAATTTTCGTGC 7422

 42346259 CCCTTTGTTGTCCCACCCTTCTTTCTGCAACCACTGATCTGCTTTCTATCACTATGGATT 42346318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7423 CCCTTTGTTGTCCCACCCTTCTTTCTGCAACCACTGATCTGCTTTCTATCACTATGGATT 7482

 42346319 AATTTGTATTTTCTAGAAGCTTAAATAAGTGAAACCATATGGTGTGCATGTTTTGCAGGG 42346378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7483 AATTTGTATTTTCTAGAAGCTTAAATAAGTGAAACCATATGGTGTGCATGTTTTGCAGGG 7542

 42346379 AGAGGGCAGGGGGAGCTGGTTTCTTTCACTCGGTGTAATTGTTCTGAGAGTCATCCGTGT 42346438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7543 AGAGGGCAGGGGGAGCTGGTTTCTTTCACTCGGTGTAATTGTTCTGAGAGTCATCCGTGT 7602

 42346439 TTGCATGTGTTAATAGTTTATTCTTTTTATCGGTAAGTAGTATCCCATTGTGTGGATGTA 42346498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7603 TTGCATGTGTTAATAGTTTATTCTTTTTATCGGTAAGTAGTATCCCATTGTGTGGATGTA 7662

 42346499 CCACATGTTGTCTAACCATTCACAACTAAAGGATACTTGGGTTGTTTCTCATTTGGGGCA 42346558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7663 CCACATGTTGTCTAACCATTCACAACTAAAGGATACTTGGGTTGTTTCTCATTTGGGGCA 7722

 42346559 ATTGAAAATAAGCAGTATAAACTGCTATAAACAGTCATGTACAGATATAAGCATGTATGT 42346618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7723 ATTGAAAATAAGCAGTATAAACTGCTATAAACAGTCATGTACAGATATAAGCATGTATGT 7782

 42346619 TTCCATTTTTCAAGGTAAATACCTAGAAGTGGGTATGGTAAGTGTATGTTTAACTTGAAA 42346678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7783 TTCCATTTTTCAAGGTAAATACCTAGAAGTGGGTATGGTAAGTGTATGTTTAACTTGAAA 7842

 42346679 AGAAACTACCAAAATGTTTCCAAAGTGGTTGTACCATTTTGCTT 42346722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7843 AGAAACTACCAAAATGTTTCCAAAGTGGTTGTACCATTTTGCTT 7886

Alignment time is 5.60496 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [42336259,42357318] =>     21060 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [       1,    5096] =>      5096 nucs 'mol-32-30f6-227403_5096'

Score:        4992
Aligned:      5106        nucs
Identic:      5085 (100%) nucs =>      2975 (100%)      2110 ( 99%)
Gaps:           14 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [42343280,42346259] EXCISED REGION [42347319,42349444]
 second seq =>  [       1,    2980] EXCISED REGION [    2985,    5096]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1059 nucs [42346260,42347318]
 second seq =>         4 nucs [2981,2984]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [2981,2981] to [2985,2985]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 42343280 AGTGGATTATTGTTGAATGGATGTATAACTAATGAAGCTTTAAAGGAAGTTTATTAGAAA 42343339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGTGGATTATTGTTGAATGGATGTATAACTAATGAAGCTTTAAAGGAAGTTTATTAGAAA 60

 42343340 GTCCATGTCCTTGTCTCTTTCCCAAACTCCTTTAGTTCCCAAGTCCTGAAAGAATCTATG 42343399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTCCATGTCCTTGTCTCTTTCCCAAACTCCTTTAGTTCCCAAGTCCTGAAAGAATCTATG 120

 42343400 GATAAGGGAAGCAGAATACTATAGTGGTTAAGAGCACATGCTCGAGGTTAAACTGTCTGT 42343459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GATAAGGGAAGCAGAATACTATAGTGGTTAAGAGCACATGCTCGAGGTTAAACTGTCTGT 180

 42343460 ATTTTGGATCCTGGCCTTGAGGACTTGGGCAAGTTACGTGACCTGCCTGAGCCTCAGTTT 42343519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATTTTGGATCCTGGCCTTGAGGACTTGGGCAAGTTACGTGACCTGCCTGAGCCTCAGTTT 240

 42343520 CCTCACCTGTAATATGGGTATCACGAGGAATAAATAAGGTAATATGTGTAAAGTGCTTGG 42343579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCTCACCTGTAATATGGGTATCACGAGGAATAAATAAGGTAATATGTGTAAAGTGCTTGG 300

 42343580 CACAATGCTCTTGATAATGTTAGCAACATAATTTTGTAATGAAAATTAACTGATGGGGCT 42343639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CACAATGCTCTTGATAATGTTAGCAACATAATTTTGTAATGAAAATTAACTGATGGGGCT 360

 42343640 GAAATGTGCATCAGCAGATCCAAATATCCTTGATAAACTGGCCAAAAGAAAGATGAATTG 42343699
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
      361 GAAATGTGCATCAGCAGATCCAAATATCCTCGATAAACTGGCCAAAAGAAAGATGAATTG 420

 42343700 GCAGAGAGGCAAGTGTTCATCTCAGTTCTCCAGATATCCCTGCAAATGTGGCCTCTGGAG 42343759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GCAGAGAGGCAAGTGTTCATCTCAGTTCTCCAGATATCCCTGCAAATGTGGCCTCTGGAG 480

 42343760 TAGAAGATTTAGGGAGAAAAATAAGCCATGAAGCTCTTCTGGCACCAACATGAACTTCAG 42343819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TAGAAGATTTAGGGAGAAAAATAAGCCATGAAGCTCTTCTGGCACCAACATGAACTTCAG 540

 42343820 GGATCATGGGACATTTGGGCCAGTAACATTCCTCTTTGTTCCTAGAGATTTAATATCTAC 42343879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGATCATGGGACATTTGGGCCAGTAACATTCCTCTTTGTTCCTAGAGATTTAATATCTAC 600

 42343880 CTACCAACTAAATGGCCTTGATTTGGAGGAGAGAAGACAAGAAGAGGAATTGCTTTCAGC 42343939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTACCAACTAAATGGCCTTGATTTGGAGGAGAGAAGACAAGAAGAGGAATTGCTTTCAGC 660

 42343940 TGGTCCTTGCCTTTAACTAACCAGGGGTACAAAAATTTTAAAATACAAAGGAGACCATGT 42343999
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
      661 TGGTCCTTGCCTTTAACTAACCAGGGGTACAAAAATTTTAAAACACAAAGGAGACCATGT 720

 42344000 GTAAAACATTAGTTAAGCTCAGATATAAATCTAGTCTTTGACCAGTCCAGAGCTAATCAA 42344059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GTAAAACATTAGTTAAGCTCAGATATAAATCTAGTCTTTGACCAGTCCAGAGCTAATCAA 780

 42344060 TATGCTTTTCTACTCTCTTTGAACTTTTGAGTTTTCTGGCAACAACAAAAATCCCAAACC 42344119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TATGCTTTTCTACTCTCTTTGAACTTTTGAGTTTTCTGGCAACAACAAAAATCCCAAACC 840

 42344120 TCATCCAAAACCGTAGTCCAGACAGCCCAGTTTCTGCACTCCCTTCCTTGTGTCACATAT 42344179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCATCCAAAACCGTAGTCCAGACAGCCCAGTTTCTGCACTCCCTTCCTTGTGTCACATAT 900

 42344180 TGTTGACAGAACTACTCCCGTTACCACATTCATTCCAGTGGTGATTCAAATTCTTCTGCA 42344239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGTTGACAGAACTACTCCCGTTACCACATTCATTCCAGTGGTGATTCAAATTCTTCTGCA 960

 42344240 GAAATGGACTTGAAAGACAGAAAACTGCTCCTGTAATCACTTAATAAGGAATCTTGGATG 42344299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GAAATGGACTTGAAAGACAGAAAACTGCTCCTGTAATCACTTAATAAGGAATCTTGGATG 1020

 42344300 AGGAATACAGAGCTATGAATATGGATTTACTCTTAGCCTTTATGGATGCCTTTTTCTCAG 42344359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGGAATACAGAGCTATGAATATGGATTTACTCTTAGCCTTTATGGATGCCTTTTTCTCAG 1080

 42344360 TTATTTTCACTGAAAATCATGATGAACTGATTTAAATATCAAGGTAAACTGAGATGGAAA 42344419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTATTTTCACTGAAAATCATGATGAACTGATTTAAATATCAAGGTAAACTGAGATGGAAA 1140

 42344420 ATTACCGATAATAAGAGTTTTCTGAAAATATAGATTGGCCTCTTTAAAGCACATCGAGTT 42344479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     1141 ATTACCGATAATAAGAGTTTTCTGAAAATATAGATTGGCCTCTTTAAAACACATCGAGTT 1200

 42344480 TGTTTTGTTTAAATTACAAATTCACATATATTTGAAATGTGTTTAAATGTGTCAGTTTTA 42344539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TGTTTTGTTTAAATTACAAATTCACATATATTTGAAATGTGTTTAAATGTGTCAGTTTTA 1260

 42344540 GGCAAAACTAAACTATTTGATTCCTTTCCAAAAATCAGGAATTTGCTTTGGAAAAAAACC 42344599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GGCAAAACTAAACTATTTGATTCCTTTCCAAAAATCAGGAATTTGCTTTGGAAAAAAACC 1320

 42344600 ATGCAGTTTGATTTACAAAGCAGAGCGGGGGGGAAGTAGTGGGTGAGAAAGACCCACCCA 42344659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ATGCAGTTTGATTTACAAAGCAGAGCGGGGGGGAAGTAGTGGGTGAGAAAGACCCACCCA 1380

 42344660 AAGGCTGCAGCCAGCTTCCCCAGGAAGATTCATAACCATGCCACAATACTGTCCTTCAAT 42344719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AAGGCTGCAGCCAGCTTCCCCAGGAAGATTCATAACCATGCCACAATACTGTCCTTCAAT 1440

 42344720 TCGTTCCAACAGATTTTACTATAACTCTAAATCATTAGAAGCAACTGCTGCTATGACTAG 42344779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TCGTTCCAACAGATTTTACTATAACTCTAAATCATTAGAAGCAACTGCTGCTATGACTAG 1500

 42344780 TGCTATCTTTGCCTCAAAAAGAGGAAAAATCAGGACATACAATATAATCCCCTCAGGATC 42344839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TGCTATCTTTGCCTCAAAAAGAGGAAAAATCAGGACATACAATATAATCCCCTCAGGATC 1560

 42344840 TAGGAGAGAAATCAGCCCATTTGTCATAAGAACTGAAAACCTCAGCTAAATAGTATATGA 42344899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TAGGAGAGAAATCAGCCCATTTGTCATAAGAACTGAAAACCTCAGCTAAATAGTATATGA 1620

 42344900 AACATTGGTATTTCATACCTTGACATTACATATTTTTGAAAATAAAGTAAGCATACACAC 42344959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AACATTGGTATTTCATACCTTGACATTACATATTTTTGAAAATAAAGTAAGCATACACAC 1680

 42344960 AAGAAGTGGCTAGATGCAGCAGTTATAAAGTGGCTTAAGTTGGGTTAACTAAATATAACC 42345019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AAGAAGTGGCTAGATGCAGCAGTTATAAAGTGGCTTAAGTTGGGTTAACTAAATATAACC 1740

 42345020 TAGAAAAACCATCTTATCTATTGCAAATTATTTCCAGAAAAAGGTAAGAAAAATCCAACC 42345079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TAGAAAAACCATCTTATCTATTGCAAATTATTTCCAGAAAAAGGTAAGAAAAATCCAACC 1800

 42345080 AACACTTTTTAAACATCCTGAGCTATTCACAGCAAGTGAATCTTTACCCTTACCAGATGT 42345139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AACACTTTTTAAACATCCTGAGCTATTCACAGCAAGTGAATCTTTACCCTTACCAGATGT 1860

 42345140 ATAAACATTTACATAAGGCAGGAGGTTCAACACTTGGAGAGTGTAATCAAGGCAGTAGTA 42345199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ATAAACATTTACATAAGGCAGGAGGTTCAACACTTGGAGAGTGTAATCAAGGCAGTAGTA 1920

 42345200 ACGCAGTGCTCCTCTCTTTGACTTGAATGACTTCCTCCCCATTAGGGTCATTATTGTTTT 42345259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ACGCAGTGCTCCTCTCTTTGACTTGAATGACTTCCTCCCCATTAGGGTCATTATTGTTTT 1980

 42345260 GCAGTGTCCCAGGGATGAAAGGACTTTGAAAGGTCATGTGTCTTGTGACCCAACTAGCAG 42345319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GCAGTGTCCCAGGGATGAAAGGACTTTGAAAGGTCATGTGTCTTGTGACCCAACTAGCAG 2040

 42345320 CATCAGCATCACTGGGGAGAAACTCAAGCAGAAGCTTGAGTCTACTCCACTCTTGCTGAC 42345379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CATCAGCATCACTGGGGAGAAACTCAAGCAGAAGCTTGAGTCTACTCCACTCTTGCTGAC 2100

 42345380 ACCAAATCTGCATTTTTACAGGATTCTTGGGTGAGTCACACACATATTCAAGGTTAAAAT 42345439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     2101 ACCAAATCTGCATTTTTACAGGATTCTTGGGTGAGTCACAGACATATTCAAGGTTAAAAT 2160

 42345440 ATGCCACCCTAGGTCTTTCTCCTGCTTCTGAGCAAAACTGGGCACAAGGGACAAACTAGT 42345499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ATGCCACCCTAGGTCTTTCTCCTGCTTCTGAGCAAAACTGGGCACAAGGGACAAACTAGT 2220

 42345500 TTCCTTCAGCCACTTTCAAATCCTTTATAGAGTGTACTGTGTGAGTCACTGAGAGGAAAG 42345559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TTCCTTCAGCCACTTTCAAATCCTTTATAGAGTGTACTGTGTGAGTCACTGAGAGGAAAG 2280

 42345560 AGGAAATAATACTTATTTAGGGAAGTCTTGCATAACTTAACAAAGTTAGTAACTTCTTCA 42345619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AGGAAATAATACTTATTTAGGGAAGTCTTGCATAACTTAACAAAGTTAGTAACTTCTTCA 2340

 42345620 ATACACTCAAGTACCTATTTTTGGAAGCCCTACAGGTTAGGTCAAAGTAAAGAGAAGCAA 42345679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 ATACACTCAAGTACCTATTTTTGGAAGCCCTACAGGTTAGGTCAAAGTAAAGAGAAGCAA 2400

 42345680 AAAATGGAGTGAGTTCTAGTAAAAAACTCTGACAAAATAAGGGAAGTGTAGAAGCTGAGT 42345739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AAAATGGAGTGAGTTCTAGTAAAAAACTCTGACAAAATAAGGGAAGTGTAGAAGCTGAGT 2460

 42345740 CTATGAGGGATGAGAGAAGCAATTTACCAAATTATCAGATCCAAAATCATCTCTGCACTG 42345799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CTATGAGGGATGAGAGAAGCAATTTACCAAATTATCAGATCCAAAATCATCTCTGCACTG 2520

 42345800 TAGATGATTTATAGCCCTGGAAGCTTAGAGGCTTGAGTCTCTTGCTGTATTTCATTTCAA 42345859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TAGATGATTTATAGCCCTGGAAGCTTAGAGGCTTGAGTCTCTTGCTGTATTTCATTTCAA 2580

 42345860 ATTAGTAATTTTTATCTAGGGCTTCCCTATGGCTTAAAGTGAAGGCCCTGGAATTTCTGA 42345919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 ATTAGTAATTTTTATCTAGGGCTTCCCTATGGCTTAAAGTGAAGGCCCTGGAATTTCTGA 2640

 42345920 AGTGAAATTATCTGATGATTTTTATGTATGGTCATTCTGTAGTTATCCTGTAAGTTTCAT 42345979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 AGTGAAATTATCTGATGATTTTTATGTATGGTCATTCTGTAGTTATCCTGTAAGTTTCAT 2700

 42345980 ATTTGTAACAAGACTGGAATCCGAACAATAGAAAACTCTGTGGCAGTAAGCCAAAACCTG 42346039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 ATTTGTAACAAGACTGGAATCCGAACAATAGAAAACTCTGTGGCAGTAAGCCAAAACCTG 2760

 42346040 ATGGACTTAGGAGAGTTACGTATGTGTGTTTCAGTGGTCCTCAAATTCAGCTGCCTATTA 42346099
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     2761 ATGGACTTAGGAGAGTTACGTATGTGTGTTTCAGTGGTCCTCAAATTTAGCTGCCTATTA 2820

 42346100 GAATCACCTGGACTTTGAAAAAAAAAGAGCTTTCTTGAGGTATAACTGACAAATAATAAG 42346159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GAATCACCTGGACTTTGAAAAAAAAAGAGCTTTCTTGAGGTATAACTGACAAATAATAAG 2880

 42346160 ACAAACATATTTCAGTATACAATTGGATGAGTTTTGACATGTTATATTCTTGTGAAACCA 42346219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 ACAAACATATTTCAGTATACAATTGGATGAGTTTTGACATGTTATATTCTTGTGAAACCA 2940

 42346220 TCACCACAATCAAGCTATTCACCCCCCAAATTTTCGTGCC 42346259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TCACCACAATCAAGCTATTCACCCCCCAAATTTTCGTGCC 2980

EXCISED REGION

 42347319 TTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGCTCTCAAACTCCTGA 42347378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2985 TTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGCTCTCAAACTCCTGA 3044

 42347379 CCTCAGGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACC 42347438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3045 CCTCAGGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACC 3104

 42347439 ATGCCCAGCGTATTAATTTTCTTGCATGGATGGTGCGTTTGGTGATCTGAGAAATCTTTA 42347498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3105 ATGCCCAGCGTATTAATTTTCTTGCATGGATGGTGCGTTTGGTGATCTGAGAAATCTTTA 3164

 42347499 CCTAACCCAAGGTCACAGAGATTTTCTCCTGTTTGCTTCCAAAATTTTTATACGTTTAGA 42347558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3165 CCTAACCCAAGGTCACAGAGATTTTCTCCTGTTTGCTTCCAAAATTTTTATACGTTTAGA 3224

 42347559 TTTTATATTTAAGTCTATTTTGAGTTAATTTTTGTATATAATGCAAAGTTTAGAATGATG 42347618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3225 TTTTATATTTAAGTCTATTTTGAGTTAATTTTTGTATATAATGCAAAGTTTAGAATGATG 3284

 42347619 TTTAGTTTTTTGTCTATAATCTATGAATATCCAATAGTTCTAGCACCATTTATTGAAAAG 42347678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3285 TTTAGTTTTTTGTCTATAATCTATGAATATCCAATAGTTCTAGCACCATTTATTGAAAAG 3344

 42347679 ACTGATCTTTATCTACTGAAGTGTCTTTGCACTTTTGTTGAAAGTCAATTGACAATTGAC 42347738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3345 ACTGATCTTTATCTACTGAAGTGTCTTTGCACTTTTGTTGAAAGTCAATTGACAATTGAC 3404

 42347739 CATATATTTGTGGGTCTATTCTGGATTCTCTATTCTGTTACATTGATCTATTTTTCTATC 42347798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3405 CATATATTTGTGGGTCTATTCTGGATTCTCTATTCTGTTACATTGATCTATTTTTCTATC 3464

 42347799 TCAATACAAATATCAAATTGGGTATTTGTATTAAGACAAATATAATTTGTCTGGGTATTT 42347858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3465 TCAATACAAATATCAAATTGGGTATTTGTATTAAGACAAATATAATTTGTCTGGGTATTT 3524

 42347859 GTCAAGACAAATAAAAATTGTCTTGATTACTGTAGCTTTATTGCAAGTCTTGAAATCTAA 42347918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3525 GTCAAGACAAATAAAAATTGTCTTGATTACTGTAGCTTTATTGCAAGTCTTGAAATCTAA 3584

 42347919 CTTTATTCTTTTTCTAAGAAAAATATGAATTCTAGATTAAGCTTGAATTTTAGAATAAGT 42347978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3585 CTTTATTCTTTTTCTAAGAAAAATATGAATTCTAGATTAAGCTTGAATTTTAGAATAAGT 3644

 42347979 TTGCCAGTTTCTGAGAGGGGAAAGCCTACTGGAATTTTGATGAGGATTGCATTGAATCTA 42348038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3645 TTGCCAGTTTCTGAGAGGGGAAAGCCTACTGGAATTTTGATGAGGATTGCATTGAATCTA 3704

 42348039 CAGATCTATTAGGGGAAAACTGACATCTTAACAATATTGAGTCTTTCAATCCATGAGCAC 42348098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3705 CAGATCTATTAGGGGAAAACTGACATCTTAACAATATTGAGTCTTTCAATCCATGAGCAC 3764

 42348099 AAAGTCTTTTTTCATTTTTCTCAGCAACGTTTTCTTAGTTTACAGATCTTACAGCTCTTT 42348158
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3765 AAAGTCCTTTTTCATTTTTCTCAGCAACGTTTTCTTAGTTTACAGATCTTACAGCTCTTT 3824

 42348159 TGTAAGGTTTTTATCTAAATATTTAATTATTTTGTACTATCATAAGTGTTATTATTTATA 42348218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3825 TGTAAGGTTTTTATCTAAATATTTAATTATTTTGTACTATCATAAGTGTTATTATTTATA 3884

 42348219 TAATTTTAATTTCCAAGTATTTATTGAAACCATTTAGAAACAGTTGATTTTTTATATTGA 42348278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3885 TAATTTTAATTTCCAAGTATTTATTGAAACCATTTAGAAACAGTTGATTTTTTATATTGA 3944

 42348279 TCTTTTATCCTGCAGGCTTGTTAAACTCATTTATTAGTTCTGTAGCTTTTTTGTAGAGTC 42348338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3945 TCTTTTATCCTGCAGGCTTGTTAAACTCATTTATTAGTTCTGTAGCTTTTTTGTAGAGTC 4004

 42348339 CATCAAATTTTCTACATAGAGAGTCATGTTATCTGAGAATAAAAACAGTTTTGCTTCTTC 42348398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4005 CATCAAATTTTCTACATAGAGAGTCATGTTATCTGAGAATAAAAACAGTTTTGCTTCTTC 4064

 42348399 TGCTCCAATCTTAATTCATTTTATATTTTTTTCTTGACTTATTGCACTGGCTACAACCAG 42348458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4065 TGCTCCAATCTTAATTCATTTTATATTTTTTTCTTGACTTATTGCACTGGCTACAACCAG 4124

 42348459 TACAATGCTGAATAAATATAGTGACAGTGGATAGCCTTTCTTTGTTCATGGTCTTAAAGG 42348518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4125 TACAATGCTGAATAAATATAGTGACAGTGGATAGCCTTTCTTTGTTCATGGTCTTAAAGG 4184

 42348519 AAAAGCATTCAGTCTTTCCCATTAAGTATGATGTTAGCTTTAGGTTTTTCATAGATGCCC 42348578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4185 AAAAGCATTCAGTCTTTCCCATTAAGTATGATGTTAGCTTTAGGTTTTTCATAGATGCCC 4244

 42348579 TTTCTCAAATTAAAGAAGTTTCCTACTTTACTGAGAGTTGCTTTATTTAAAATCAGAAAT 42348638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4245 TTTCTCAAATTAAAGAAGTTTCCTACTTTACTGAGAGTTGCTTTATTTAAAATCAGAAAT 4304

 42348639 GAGGCCAGTCACAGTGACTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAGGGTGGGAA 42348698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4305 GAGGCCAGTCACAGTGACTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAGGGTGGGAA 4364

 42348699 GATTACCTGAAGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGACAACATGGTAAAACCCTGTCTGTA 42348758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4365 GATTACCTGAAGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGACAACATGGTAAAACCCTGTCTGTA 4424

 42348759 CTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAGTGGTGCATGCCTGTAGTCCCAGTTATTTGGG 42348818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4425 CTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAGTGGTGCATGCCTGTAGTCCCAGTTATTTGGG 4484

 42348819 AGGCCGATACAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGACTA 42348878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4485 AGGCCGATACAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGACTA 4544

 42348879 CACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAATGAGAAAAAAAAAAAGAGAGAGAGAGAGAA 42348938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4545 CACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAATGAGAAAAAAAAAAAGAGAGAGAGAGAGAA 4604

 42348939 GGAAAGAGAGAAGGAAAGAAAGACAGAAAGACCAAAAGAAAGAAAGAGAGAGAGAGAGAG 42348998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4605 GGAAAGAGAGAAGGAAAGAAAGACAGAAAGACCAAAAGAAAGAAAGAGAGAGAGAGAGAG 4664

 42348999 AGAGAGAGAGAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAG 42349058
          ||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4665 AGAGAGAG--------------AGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAG 4710

 42349059 AAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAGATCTTGGATTTTGTCAGATTCTTTTTCTGCATCTATTG 42349118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4711 AAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAGATCTTGGATTTTGTCAGATTCTTTTTCTGCATCTATTG 4770

 42349119 AGATATTCATATGGTTTTCCTTTTCGGCCTGTTACTGTGGTGAATCACTGAGTGACTTTC 42349178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4771 AGATATTCATATGGTTTTCCTTTTCGGCCTGTTACTGTGGTGAATCACTGAGTGACTTTC 4830

 42349179 AAATATTAAACTAACCTTGCATTCCTGGGCTATGGCTATAATGTACTATCCTTTTATATA 42349238
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     4831 AAATATTAAACTAACCTTGCATTCCTGGGCTATGGCTATAATGCACTATCCTTTTATATA 4890

 42349239 TTGTTATATTCTATTTGCTATATTTTCCTAAAAATTTTTGCATTTATACTCATGAAGGAT 42349298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4891 TTGTTATATTCTATTTGCTATATTTTCCTAAAAATTTTTGCATTTATACTCATGAAGGAT 4950

 42349299 ATTAGTCTGCAGTTTTGCTTTCTTGTTATATATTTGTCTGGGTTTGATATCAGAGATCAG 42349358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4951 ATTAGTCTGCAGTTTTGCTTTCTTGTTATATATTTGTCTGGGTTTGATATCAGAGATCAG 5010

 42349359 AGTAATATCAGTATTGTAGGCACCAGTAAATATTTCCTTATAATGCTTTTTATTTTTATT 42349418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5011 AGTAATATCAGTATTGTAGGCACCAGTAAATATTTCCTTATAATGCTTTTTATTTTTATT 5070

 42349419 TTTTAAATTTTTTTATTTTTGAGACG 42349444
          ||||||||||||||||||||||||||
     5071 TTTTAAATTTTTTTATTTTTGAGACG 5096

Alignment time is 4.15679 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [42336259,42357318] =>     21060 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [       1,    2112] =>      2112 nucs 'mol-32-30f6-227403_2112'

Score:        2090
Aligned:      2112        nucs
Identic:      2110 (100%) nucs =>      1687 (100%)       423 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [42347319,42349006] EXCISED REGION [42349021,42349444]
 second seq =>  [       1,    1688] EXCISED REGION [    1689,    2112]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        14 nucs [42349007,42349020]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [42349007,42349009] to [42349021,42349023]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [42349005,42349006] to [42349021,42349022]
 second seq =>         2 nucs [1687,1688] to [1689,1690]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [42349007,42349007] to [42349020,42349020]
 second seq =>         0 nucs

 42347319 TTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGCTCTCAAACTCCTGA 42347378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGCTCTCAAACTCCTGA 60

 42347379 CCTCAGGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACC 42347438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCTCAGGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACC 120

 42347439 ATGCCCAGCGTATTAATTTTCTTGCATGGATGGTGCGTTTGGTGATCTGAGAAATCTTTA 42347498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATGCCCAGCGTATTAATTTTCTTGCATGGATGGTGCGTTTGGTGATCTGAGAAATCTTTA 180

 42347499 CCTAACCCAAGGTCACAGAGATTTTCTCCTGTTTGCTTCCAAAATTTTTATACGTTTAGA 42347558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCTAACCCAAGGTCACAGAGATTTTCTCCTGTTTGCTTCCAAAATTTTTATACGTTTAGA 240

 42347559 TTTTATATTTAAGTCTATTTTGAGTTAATTTTTGTATATAATGCAAAGTTTAGAATGATG 42347618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTTTATATTTAAGTCTATTTTGAGTTAATTTTTGTATATAATGCAAAGTTTAGAATGATG 300

 42347619 TTTAGTTTTTTGTCTATAATCTATGAATATCCAATAGTTCTAGCACCATTTATTGAAAAG 42347678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTAGTTTTTTGTCTATAATCTATGAATATCCAATAGTTCTAGCACCATTTATTGAAAAG 360

 42347679 ACTGATCTTTATCTACTGAAGTGTCTTTGCACTTTTGTTGAAAGTCAATTGACAATTGAC 42347738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACTGATCTTTATCTACTGAAGTGTCTTTGCACTTTTGTTGAAAGTCAATTGACAATTGAC 420

 42347739 CATATATTTGTGGGTCTATTCTGGATTCTCTATTCTGTTACATTGATCTATTTTTCTATC 42347798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CATATATTTGTGGGTCTATTCTGGATTCTCTATTCTGTTACATTGATCTATTTTTCTATC 480

 42347799 TCAATACAAATATCAAATTGGGTATTTGTATTAAGACAAATATAATTTGTCTGGGTATTT 42347858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCAATACAAATATCAAATTGGGTATTTGTATTAAGACAAATATAATTTGTCTGGGTATTT 540

 42347859 GTCAAGACAAATAAAAATTGTCTTGATTACTGTAGCTTTATTGCAAGTCTTGAAATCTAA 42347918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GTCAAGACAAATAAAAATTGTCTTGATTACTGTAGCTTTATTGCAAGTCTTGAAATCTAA 600

 42347919 CTTTATTCTTTTTCTAAGAAAAATATGAATTCTAGATTAAGCTTGAATTTTAGAATAAGT 42347978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTTTATTCTTTTTCTAAGAAAAATATGAATTCTAGATTAAGCTTGAATTTTAGAATAAGT 660

 42347979 TTGCCAGTTTCTGAGAGGGGAAAGCCTACTGGAATTTTGATGAGGATTGCATTGAATCTA 42348038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTGCCAGTTTCTGAGAGGGGAAAGCCTACTGGAATTTTGATGAGGATTGCATTGAATCTA 720

 42348039 CAGATCTATTAGGGGAAAACTGACATCTTAACAATATTGAGTCTTTCAATCCATGAGCAC 42348098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CAGATCTATTAGGGGAAAACTGACATCTTAACAATATTGAGTCTTTCAATCCATGAGCAC 780

 42348099 AAAGTCTTTTTTCATTTTTCTCAGCAACGTTTTCTTAGTTTACAGATCTTACAGCTCTTT 42348158
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAAGTCCTTTTTCATTTTTCTCAGCAACGTTTTCTTAGTTTACAGATCTTACAGCTCTTT 840

 42348159 TGTAAGGTTTTTATCTAAATATTTAATTATTTTGTACTATCATAAGTGTTATTATTTATA 42348218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGTAAGGTTTTTATCTAAATATTTAATTATTTTGTACTATCATAAGTGTTATTATTTATA 900

 42348219 TAATTTTAATTTCCAAGTATTTATTGAAACCATTTAGAAACAGTTGATTTTTTATATTGA 42348278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TAATTTTAATTTCCAAGTATTTATTGAAACCATTTAGAAACAGTTGATTTTTTATATTGA 960

 42348279 TCTTTTATCCTGCAGGCTTGTTAAACTCATTTATTAGTTCTGTAGCTTTTTTGTAGAGTC 42348338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TCTTTTATCCTGCAGGCTTGTTAAACTCATTTATTAGTTCTGTAGCTTTTTTGTAGAGTC 1020

 42348339 CATCAAATTTTCTACATAGAGAGTCATGTTATCTGAGAATAAAAACAGTTTTGCTTCTTC 42348398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CATCAAATTTTCTACATAGAGAGTCATGTTATCTGAGAATAAAAACAGTTTTGCTTCTTC 1080

 42348399 TGCTCCAATCTTAATTCATTTTATATTTTTTTCTTGACTTATTGCACTGGCTACAACCAG 42348458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGCTCCAATCTTAATTCATTTTATATTTTTTTCTTGACTTATTGCACTGGCTACAACCAG 1140

 42348459 TACAATGCTGAATAAATATAGTGACAGTGGATAGCCTTTCTTTGTTCATGGTCTTAAAGG 42348518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TACAATGCTGAATAAATATAGTGACAGTGGATAGCCTTTCTTTGTTCATGGTCTTAAAGG 1200

 42348519 AAAAGCATTCAGTCTTTCCCATTAAGTATGATGTTAGCTTTAGGTTTTTCATAGATGCCC 42348578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AAAAGCATTCAGTCTTTCCCATTAAGTATGATGTTAGCTTTAGGTTTTTCATAGATGCCC 1260

 42348579 TTTCTCAAATTAAAGAAGTTTCCTACTTTACTGAGAGTTGCTTTATTTAAAATCAGAAAT 42348638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTTCTCAAATTAAAGAAGTTTCCTACTTTACTGAGAGTTGCTTTATTTAAAATCAGAAAT 1320

 42348639 GAGGCCAGTCACAGTGACTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAGGGTGGGAA 42348698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GAGGCCAGTCACAGTGACTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAGGGTGGGAA 1380

 42348699 GATTACCTGAAGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGACAACATGGTAAAACCCTGTCTGTA 42348758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GATTACCTGAAGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGACAACATGGTAAAACCCTGTCTGTA 1440

 42348759 CTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAGTGGTGCATGCCTGTAGTCCCAGTTATTTGGG 42348818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAGTGGTGCATGCCTGTAGTCCCAGTTATTTGGG 1500

 42348819 AGGCCGATACAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGACTA 42348878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AGGCCGATACAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGACTA 1560

 42348879 CACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAATGAGAAAAAAAAAAAGAGAGAGAGAGAGAA 42348938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAATGAGAAAAAAAAAAAGAGAGAGAGAGAGAA 1620

 42348939 GGAAAGAGAGAAGGAAAGAAAGACAGAAAGACCAAAAGAAAGAAAGAGAGAGAGAGAGAG 42348998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GGAAAGAGAGAAGGAAAGAAAGACAGAAAGACCAAAAGAAAGAAAGAGAGAGAGAGAGAG 1680

 42348999 AGAGAGAG 42349006
          ||||||||
     1681 AGAGAGAG 1688

EXCISED REGION

 42349021 AGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAG 42349080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1689 AGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAG 1748

 42349081 ATCTTGGATTTTGTCAGATTCTTTTTCTGCATCTATTGAGATATTCATATGGTTTTCCTT 42349140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1749 ATCTTGGATTTTGTCAGATTCTTTTTCTGCATCTATTGAGATATTCATATGGTTTTCCTT 1808

 42349141 TTCGGCCTGTTACTGTGGTGAATCACTGAGTGACTTTCAAATATTAAACTAACCTTGCAT 42349200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1809 TTCGGCCTGTTACTGTGGTGAATCACTGAGTGACTTTCAAATATTAAACTAACCTTGCAT 1868

 42349201 TCCTGGGCTATGGCTATAATGTACTATCCTTTTATATATTGTTATATTCTATTTGCTATA 42349260
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1869 TCCTGGGCTATGGCTATAATGCACTATCCTTTTATATATTGTTATATTCTATTTGCTATA 1928

 42349261 TTTTCCTAAAAATTTTTGCATTTATACTCATGAAGGATATTAGTCTGCAGTTTTGCTTTC 42349320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1929 TTTTCCTAAAAATTTTTGCATTTATACTCATGAAGGATATTAGTCTGCAGTTTTGCTTTC 1988

 42349321 TTGTTATATATTTGTCTGGGTTTGATATCAGAGATCAGAGTAATATCAGTATTGTAGGCA 42349380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1989 TTGTTATATATTTGTCTGGGTTTGATATCAGAGATCAGAGTAATATCAGTATTGTAGGCA 2048

 42349381 CCAGTAAATATTTCCTTATAATGCTTTTTATTTTTATTTTTTAAATTTTTTTATTTTTGA 42349440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2049 CCAGTAAATATTTCCTTATAATGCTTTTTATTTTTATTTTTTAAATTTTTTTATTTTTGA 2108

 42349441 GACG 42349444
          ||||
     2109 GACG 2112

Alignment time is 1.56 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [42336259,42357318] =>     21060 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [       1,    4810] =>      4810 nucs 'mol-32-3159-184572_4810'

Score:        4711
Aligned:      4810        nucs
Identic:      4801 (100%) nucs =>       550 (100%)      4251 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [42342097,42342646] EXCISED REGION [42342651,42346909]
 second seq =>  [       1,     550] EXCISED REGION [     551,    4810]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         4 nucs [42342647,42342650]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        13 nucs [42342647,42342659] to [42342651,42342663]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [42342647,42342648] to [42342649,42342650]
 second seq =>         0 nucs

 42342097 ATCATGGAACATTTCCAGTGTTCCATGAGACACAATTAGGGGCTAGTGAGCCACTGACTT 42342156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATCATGGAACATTTCCAGTGTTCCATGAGACACAATTAGGGGCTAGTGAGCCACTGACTT 60

 42342157 TTGAGTTGGAAAGTGACACATGGGGAAAGCAAAGTTTTGGAAGATTGATCTCACGGTAGA 42342216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTGAGTTGGAAAGTGACACATGGGGAAAGCAAAGTTTTGGAAGATTGATCTCACGGTAGA 120

 42342217 ATATAAGGTGAACAGGAGAGAAAAGAGCCTGGATTCAGGCAACACAATCAGATGATTGGA 42342276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATATAAGGTGAACAGGAGAGAAAAGAGCCTGGATTCAGGCAACACAATCAGATGATTGGA 180

 42342277 TACAGGCTCAAGATTAGGGGGTGGGTTGCACTACACTGGAGCGGAGAATGGAGAGCAAAA 42342336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TACAGGCTCAAGATTAGGGGGTGGGTTGCACTACACTGGAGCGGAGAATGGAGAGCAAAA 240

 42342337 GCACTGATTGAATGCACAGTCTTCTGTTGGATCCTGGGATGATACAGAAGTGTCAGAGTT 42342396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GCACTGATTGAATGCACAGTCTTCTGTTGGATCCTGGGATGATACAGAAGTGTCAGAGTT 300

 42342397 CCTGGGTCTTGTAGGAGTTCCAATGAGCATCAATCAAAAGTTTGATTGTAAGGCACAGAA 42342456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCTGGGTCTTGTAGGAGTTCCAATGAGCATCAATCAAAAGTTTGATTGTAAGGCACAGAA 360

 42342457 ATCAACTTGGACCAGCTAAAGCAAAAAGACCATTTTTAGGGAAATAGGGATGTGTCACAA 42342516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATCAACTTGGACCAGCTAAAGCAAAAAGACCATTTTTAGGGAAATAGGGATGTGTCACAA 420

 42342517 AGAACTGCATCTAGGTACTGGAAATCAACAAAAAGTTCCCCATCTGATCTCAGCTTCTCT 42342576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGAACTGCATCTAGGTACTGGAAATCAACAAAAAGTTCCCCATCTGATCTCAGCTTCTCT 480

 42342577 GTGTGTCTACTACATACACTATCTTTCTCCTCTTTTCTTTCCTCTCTACCCCCTACCTCC 42342636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTGTGTCTACTACATACACTATCTTTCTCCTCTTTTCTTTCCTCTCTACCCCCTACCTCC 540

 42342637 CTCCTCTCTC 42342646
          ||||||||||
      541 CTCCTCTCTC 550

EXCISED REGION

 42342651 TTTTTTTTTTTTTGTTTTTTGGTTTTTTTATGTTTGTTTGTTTGCTTTTGGAGACACGGT 42342710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
      551 TTTTTTTTTTTTTGTTTTTTGGTTTTTTTATGTTTGTTTGTTTGTTTTTGGAGACACGGT 610

 42342711 CTCCCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCTTAATTACTGCAGCCTCAATCTCCTGG 42342770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      611 CTCCCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCTTAATTACTGCAGCCTCAATCTCCTGG 670

 42342771 GCTCAAGTGACCCTCCCACCTCAGCCTCCTGAATAGCTGGGACCACAGGTGCAAGCCACA 42342830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      671 GCTCAAGTGACCCTCCCACCTCAGCCTCCTGAATAGCTGGGACCACAGGTGCAAGCCACA 730

 42342831 GTGCTCAGCTAATTAAAAAAAATTTTTTTTTCAGAGATGGGGTCTCACTATGTTGTCCAG 42342890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      731 GTGCTCAGCTAATTAAAAAAAATTTTTTTTTCAGAGATGGGGTCTCACTATGTTGTCCAG 790

 42342891 GCTGGTCTCAAACTCCTAGGCTCAAGCAGTCCTCCCGTTTCAGCCTCAAAAAGTGCTGGG 42342950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      791 GCTGGTCTCAAACTCCTAGGCTCAAGCAGTCCTCCCGTTTCAGCCTCAAAAAGTGCTGGG 850

 42342951 ATTACAGGTGTGAGCCATCGCACTCCACCTTCTCTATAGTTACTGAGTTTGCGTGTTACA 42343010
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
      851 ATTACAGGTGTGAGCCATCGCACTCCACTTTCTCTATAGTTACTGAGTTTGCGTGTTACA 910

 42343011 CTGAGTTTACATCTTACATTTCTAGCCATATCAGAAACGACCTCTGCACCTCTCTTTCCC 42343070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      911 CTGAGTTTACATCTTACATTTCTAGCCATATCAGAAACGACCTCTGCACCTCTCTTTCCC 970

 42343071 AATTTGAGATTTCTAATAGAAAGAATCTTGTTCACCCAGCTTGGGACTCATTGAGTTATG 42343130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      971 AATTTGAGATTTCTAATAGAAAGAATCTTGTTCACCCAGCTTGGGACTCATTGAGTTATG 1030

 42343131 ACCAGTGGGATAGATTTTAGAAGATAAACATGTCTATAGGGACTTACCGTGTGAATTAGT 42343190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1031 ACCAGTGGGATAGATTTTAGAAGATAAACATGTCTATAGGGACTTACCGTGTGAATTAGT 1090

 42343191 GGGGGAGCCGCTTACCAGGCAGAGGGGTCTGCTGTAAAGTGATACTGTGACTTTAAATTG 42343250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1091 GGGGGAGCCGCTTACCAGGCAGAGGGGTCTGCTGTAAAGTGATACTGTGACTTTAAATTG 1150

 42343251 AAAGTAAGCTTCTAGAAGAGTTGAAGAGGAGTGGATTATTGTTGAATGGATGTATAACTA 42343310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1151 AAAGTAAGCTTCTAGAAGAGTTGAAGAGGAGTGGATTATTGTTGAATGGATGTATAACTA 1210

 42343311 ATGAAGCTTTAAAGGAAGTTTATTAGAAAGTCCATGTCCTTGTCTCTTTCCCAAACTCCT 42343370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1211 ATGAAGCTTTAAAGGAAGTTTATTAGAAAGTCCATGTCCTTGTCTCTTTCCCAAACTCCT 1270

 42343371 TTAGTTCCCAAGTCCTGAAAGAATCTATGGATAAGGGAAGCAGAATACTATAGTGGTTAA 42343430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1271 TTAGTTCCCAAGTCCTGAAAGAATCTATGGATAAGGGAAGCAGAATACTATAGTGGTTAA 1330

 42343431 GAGCACATGCTCGAGGTTAAACTGTCTGTATTTTGGATCCTGGCCTTGAGGACTTGGGCA 42343490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1331 GAGCACATGCTCGAGGTTAAACTGTCTGTATTTTGGATCCTGGCCTTGAGGACTTGGGCA 1390

 42343491 AGTTACGTGACCTGCCTGAGCCTCAGTTTCCTCACCTGTAATATGGGTATCACGAGGAAT 42343550
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1391 AGTTACGTGACCTGTCTGAGCCTCAGTTTCCTCACCTGTAATATGGGTATCACGAGGAAT 1450

 42343551 AAATAAGGTAATATGTGTAAAGTGCTTGGCACAATGCTCTTGATAATGTTAGCAACATAA 42343610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1451 AAATAAGGTAATATGTGTAAAGTGCTTGGCACAATGCTCTTGATAATGTTAGCAACATAA 1510

 42343611 TTTTGTAATGAAAATTAACTGATGGGGCTGAAATGTGCATCAGCAGATCCAAATATCCTT 42343670
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     1511 TTTTGTAATGAAAATTAACTGATGGGACTGAAATGTGCATCAGCAGATCCAAATATCCTT 1570

 42343671 GATAAACTGGCCAAAAGAAAGATGAATTGGCAGAGAGGCAAGTGTTCATCTCAGTTCTCC 42343730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1571 GATAAACTGGCCAAAAGAAAGATGAATTGGCAGAGAGGCAAGTGTTCATCTCAGTTCTCC 1630

 42343731 AGATATCCCTGCAAATGTGGCCTCTGGAGTAGAAGATTTAGGGAGAAAAATAAGCCATGA 42343790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1631 AGATATCCCTGCAAATGTGGCCTCTGGAGTAGAAGATTTAGGGAGAAAAATAAGCCATGA 1690

 42343791 AGCTCTTCTGGCACCAACATGAACTTCAGGGATCATGGGACATTTGGGCCAGTAACATTC 42343850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1691 AGCTCTTCTGGCACCAACATGAACTTCAGGGATCATGGGACATTTGGGCCAGTAACATTC 1750

 42343851 CTCTTTGTTCCTAGAGATTTAATATCTACCTACCAACTAAATGGCCTTGATTTGGAGGAG 42343910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1751 CTCTTTGTTCCTAGAGATTTAATATCTACCTACCAACTAAATGGCCTTGATTTGGAGGAG 1810

 42343911 AGAAGACAAGAAGAGGAATTGCTTTCAGCTGGTCCTTGCCTTTAACTAACCAGGGGTACA 42343970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1811 AGAAGACAAGAAGAGGAATTGCTTTCAGCTGGTCCTTGCCTTTAACTAACCAGGGGTACA 1870

 42343971 AAAATTTTAAAATACAAAGGAGACCATGTGTAAAACATTAGTTAAGCTCAGATATAAATC 42344030
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1871 AAAATTTTAAAACACAAAGGAGACCATGTGTAAAACATTAGTTAAGCTCAGATATAAATC 1930

 42344031 TAGTCTTTGACCAGTCCAGAGCTAATCAATATGCTTTTCTACTCTCTTTGAACTTTTGAG 42344090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1931 TAGTCTTTGACCAGTCCAGAGCTAATCAATATGCTTTTCTACTCTCTTTGAACTTTTGAG 1990

 42344091 TTTTCTGGCAACAACAAAAATCCCAAACCTCATCCAAAACCGTAGTCCAGACAGCCCAGT 42344150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1991 TTTTCTGGCAACAACAAAAATCCCAAACCTCATCCAAAACCGTAGTCCAGACAGCCCAGT 2050

 42344151 TTCTGCACTCCCTTCCTTGTGTCACATATTGTTGACAGAACTACTCCCGTTACCACATTC 42344210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2051 TTCTGCACTCCCTTCCTTGTGTCACATATTGTTGACAGAACTACTCCCGTTACCACATTC 2110

 42344211 ATTCCAGTGGTGATTCAAATTCTTCTGCAGAAATGGACTTGAAAGACAGAAAACTGCTCC 42344270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2111 ATTCCAGTGGTGATTCAAATTCTTCTGCAGAAATGGACTTGAAAGACAGAAAACTGCTCC 2170

 42344271 TGTAATCACTTAATAAGGAATCTTGGATGAGGAATACAGAGCTATGAATATGGATTTACT 42344330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2171 TGTAATCACTTAATAAGGAATCTTGGATGAGGAATACAGAGCTATGAATATGGATTTACT 2230

 42344331 CTTAGCCTTTATGGATGCCTTTTTCTCAGTTATTTTCACTGAAAATCATGATGAACTGAT 42344390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2231 CTTAGCCTTTATGGATGCCTTTTTCTCAGTTATTTTCACTGAAAATCATGATGAACTGAT 2290

 42344391 TTAAATATCAAGGTAAACTGAGATGGAAAATTACCGATAATAAGAGTTTTCTGAAAATAT 42344450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2291 TTAAATATCAAGGTAAACTGAGATGGAAAATTACCGATAATAAGAGTTTTCTGAAAATAT 2350

 42344451 AGATTGGCCTCTTTAAAGCACATCGAGTTTGTTTTGTTTAAATTACAAATTCACATATAT 42344510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2351 AGATTGGCCTCTTTAAAGCACATCGAGTTTGTTTTGTTTAAATTACAAATTCACATATAT 2410

 42344511 TTGAAATGTGTTTAAATGTGTCAGTTTTAGGCAAAACTAAACTATTTGATTCCTTTCCAA 42344570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2411 TTGAAATGTGTTTAAATGTGTCAGTTTTAGGCAAAACTAAACTATTTGATTCCTTTCCAA 2470

 42344571 AAATCAGGAATTTGCTTTGGAAAAAAACCATGCAGTTTGATTTACAAAGCAGAGCGGGGG 42344630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2471 AAATCAGGAATTTGCTTTGGAAAAAAACCATGCAGTTTGATTTACAAAGCAGAGCGGGGG 2530

 42344631 GGAAGTAGTGGGTGAGAAAGACCCACCCAAAGGCTGCAGCCAGCTTCCCCAGGAAGATTC 42344690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2531 GGAAGTAGTGGGTGAGAAAGACCCACCCAAAGGCTGCAGCCAGCTTCCCCAGGAAGATTC 2590

 42344691 ATAACCATGCCACAATACTGTCCTTCAATTCGTTCCAACAGATTTTACTATAACTCTAAA 42344750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2591 ATAACCATGCCACAATACTGTCCTTCAATTCGTTCCAACAGATTTTACTATAACTCTAAA 2650

 42344751 TCATTAGAAGCAACTGCTGCTATGACTAGTGCTATCTTTGCCTCAAAAAGAGGAAAAATC 42344810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2651 TCATTAGAAGCAACTGCTGCTATGACTAGTGCTATCTTTGCCTCAAAAAGAGGAAAAATC 2710

 42344811 AGGACATACAATATAATCCCCTCAGGATCTAGGAGAGAAATCAGCCCATTTGTCATAAGA 42344870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2711 AGGACATACAATATAATCCCCTCAGGATCTAGGAGAGAAATCAGCCCATTTGTCATAAGA 2770

 42344871 ACTGAAAACCTCAGCTAAATAGTATATGAAACATTGGTATTTCATACCTTGACATTACAT 42344930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2771 ACTGAAAACCTCAGCTAAATAGTATATGAAACATTGGTATTTCATACCTTGACATTACAT 2830

 42344931 ATTTTTGAAAATAAAGTAAGCATACACACAAGAAGTGGCTAGATGCAGCAGTTATAAAGT 42344990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2831 ATTTTTGAAAATAAAGTAAGCATACACACAAGAAGTGGCTAGATGCAGCAGTTATAAAGT 2890

 42344991 GGCTTAAGTTGGGTTAACTAAATATAACCTAGAAAAACCATCTTATCTATTGCAAATTAT 42345050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2891 GGCTTAAGTTGGGTTAACTAAATATAACCTAGAAAAACCATCTTATCTATTGCAAATTAT 2950

 42345051 TTCCAGAAAAAGGTAAGAAAAATCCAACCAACACTTTTTAAACATCCTGAGCTATTCACA 42345110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2951 TTCCAGAAAAAGGTAAGAAAAATCCAACCAACACTTTTTAAACATCCTGAGCTATTCACA 3010

 42345111 GCAAGTGAATCTTTACCCTTACCAGATGTATAAACATTTACATAAGGCAGGAGGTTCAAC 42345170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3011 GCAAGTGAATCTTTACCCTTACCAGATGTATAAACATTTACATAAGGCAGGAGGTTCAAC 3070

 42345171 ACTTGGAGAGTGTAATCAAGGCAGTAGTAACGCAGTGCTCCTCTCTTTGACTTGAATGAC 42345230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3071 ACTTGGAGAGTGTAATCAAGGCAGTAGTAACGCAGTGCTCCTCTCTTTGACTTGAATGAC 3130

 42345231 TTCCTCCCCATTAGGGTCATTATTGTTTTGCAGTGTCCCAGGGATGAAAGGACTTTGAAA 42345290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3131 TTCCTCCCCATTAGGGTCATTATTGTTTTGCAGTGTCCCAGGGATGAAAGGACTTTGAAA 3190

 42345291 GGTCATGTGTCTTGTGACCCAACTAGCAGCATCAGCATCACTGGGGAGAAACTCAAGCAG 42345350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3191 GGTCATGTGTCTTGTGACCCAACTAGCAGCATCAGCATCACTGGGGAGAAACTCAAGCAG 3250

 42345351 AAGCTTGAGTCTACTCCACTCTTGCTGACACCAAATCTGCATTTTTACAGGATTCTTGGG 42345410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3251 AAGCTTGAGTCTACTCCACTCTTGCTGACACCAAATCTGCATTTTTACAGGATTCTTGGG 3310

 42345411 TGAGTCACACACATATTCAAGGTTAAAATATGCCACCCTAGGTCTTTCTCCTGCTTCTGA 42345470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3311 TGAGTCACACACATATTCAAGGTTAAAATATGCCACCCTAGGTCTTTCTCCTGCTTCTGA 3370

 42345471 GCAAAACTGGGCACAAGGGACAAACTAGTTTCCTTCAGCCACTTTCAAATCCTTTATAGA 42345530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3371 GCAAAACTGGGCACAAGGGACAAACTAGTTTCCTTCAGCCACTTTCAAATCCTTTATAGA 3430

 42345531 GTGTACTGTGTGAGTCACTGAGAGGAAAGAGGAAATAATACTTATTTAGGGAAGTCTTGC 42345590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3431 GTGTACTGTGTGAGTCACTGAGAGGAAAGAGGAAATAATACTTATTTAGGGAAGTCTTGC 3490

 42345591 ATAACTTAACAAAGTTAGTAACTTCTTCAATACACTCAAGTACCTATTTTTGGAAGCCCT 42345650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3491 ATAACTTAACAAAGTTAGTAACTTCTTCAATACACTCAAGTACCTATTTTTGGAAGCCCT 3550

 42345651 ACAGGTTAGGTCAAAGTAAAGAGAAGCAAAAAATGGAGTGAGTTCTAGTAAAAAACTCTG 42345710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3551 ACAGGTTAGGTCAAAGTAAAGAGAAGCAAAAAATGGAGTGAGTTCTAGTAAAAAACTCTG 3610

 42345711 ACAAAATAAGGGAAGTGTAGAAGCTGAGTCTATGAGGGATGAGAGAAGCAATTTACCAAA 42345770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3611 ACAAAATAAGGGAAGTGTAGAAGCTGAGTCTATGAGGGATGAGAGAAGCAATTTACCAAA 3670

 42345771 TTATCAGATCCAAAATCATCTCTGCACTGTAGATGATTTATAGCCCTGGAAGCTTAGAGG 42345830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3671 TTATCAGATCCAAAATCATCTCTGCACTGTAGATGATTTATAGCCCTGGAAGCTTAGAGG 3730

 42345831 CTTGAGTCTCTTGCTGTATTTCATTTCAAATTAGTAATTTTTATCTAGGGCTTCCCTATG 42345890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3731 CTTGAGTCTCTTGCTGTATTTCATTTCAAATTAGTAATTTTTATCTAGGGCTTCCCTATG 3790

 42345891 GCTTAAAGTGAAGGCCCTGGAATTTCTGAAGTGAAATTATCTGATGATTTTTATGTATGG 42345950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3791 GCTTAAAGTGAAGGCCCTGGAATTTCTGAAGTGAAATTATCTGATGATTTTTATGTATGG 3850

 42345951 TCATTCTGTAGTTATCCTGTAAGTTTCATATTTGTAACAAGACTGGAATCCGAACAATAG 42346010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3851 TCATTCTGTAGTTATCCTGTAAGTTTCATATTTGTAACAAGACTGGAATCCGAACAATAG 3910

 42346011 AAAACTCTGTGGCAGTAAGCCAAAACCTGATGGACTTAGGAGAGTTACGTATGTGTGTTT 42346070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3911 AAAACTCTGTGGCAGTAAGCCAAAACCTGATGGACTTAGGAGAGTTACGTATGTGTGTTT 3970

 42346071 CAGTGGTCCTCAAATTCAGCTGCCTATTAGAATCACCTGGACTTTGAAAAAAAAAGAGCT 42346130
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3971 CAGTGGTCCTCAAATTTAGCTGCCTATTAGAATCACCTGGACTTTGAAAAAAAAAGAGCT 4030

 42346131 TTCTTGAGGTATAACTGACAAATAATAAGACAAACATATTTCAGTATACAATTGGATGAG 42346190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4031 TTCTTGAGGTATAACTGACAAATAATAAGACAAACATATTTCAGTATACAATTGGATGAG 4090

 42346191 TTTTGACATGTTATATTCTTGTGAAACCATCACCACAATCAAGCTATTCACCCCCCAAAT 42346250
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     4091 TTTTGACATGTTATATTCTTGTGAAACCATCGCCACAATCAAGCTATTCACCCCCCAAAT 4150

 42346251 TTTCGTGCCCCTTTGTTGTCCCACCCTTCTTTCTGCAACCACTGATCTGCTTTCTATCAC 42346310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4151 TTTCGTGCCCCTTTGTTGTCCCACCCTTCTTTCTGCAACCACTGATCTGCTTTCTATCAC 4210

 42346311 TATGGATTAATTTGTATTTTCTAGAAGCTTAAATAAGTGAAACCATATGGTGTGCATGTT 42346370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4211 TATGGATTAATTTGTATTTTCTAGAAGCTTAAATAAGTGAAACCATATGGTGTGCATGTT 4270

 42346371 TTGCAGGGAGAGGGCAGGGGGAGCTGGTTTCTTTCACTCGGTGTAATTGTTCTGAGAGTC 42346430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4271 TTGCAGGGAGAGGGCAGGGGGAGCTGGTTTCTTTCACTCGGTGTAATTGTTCTGAGAGTC 4330

 42346431 ATCCGTGTTTGCATGTGTTAATAGTTTATTCTTTTTATCGGTAAGTAGTATCCCATTGTG 42346490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4331 ATCCGTGTTTGCATGTGTTAATAGTTTATTCTTTTTATCGGTAAGTAGTATCCCATTGTG 4390

 42346491 TGGATGTACCACATGTTGTCTAACCATTCACAACTAAAGGATACTTGGGTTGTTTCTCAT 42346550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4391 TGGATGTACCACATGTTGTCTAACCATTCACAACTAAAGGATACTTGGGTTGTTTCTCAT 4450

 42346551 TTGGGGCAATTGAAAATAAGCAGTATAAACTGCTATAAACAGTCATGTACAGATATAAGC 42346610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4451 TTGGGGCAATTGAAAATAAGCAGTATAAACTGCTATAAACAGTCATGTACAGATATAAGC 4510

 42346611 ATGTATGTTTCCATTTTTCAAGGTAAATACCTAGAAGTGGGTATGGTAAGTGTATGTTTA 42346670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4511 ATGTATGTTTCCATTTTTCAAGGTAAATACCTAGAAGTGGGTATGGTAAGTGTATGTTTA 4570

 42346671 ACTTGAAAAGAAACTACCAAAATGTTTCCAAAGTGGTTGTACCATTTTGCTTACCTACCA 42346730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4571 ACTTGAAAAGAAACTACCAAAATGTTTCCAAAGTGGTTGTACCATTTTGCTTACCTACCA 4630

 42346731 GAAATGTGTAAGAGTTCTAGTTACTCCACATACTTCCTAGCAGTTGATATTCTCAG-TTT 42346789
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
     4631 GAAATGTGTAAGAGTTCTAGTTACTCCACATACTTCCTAGCAGTTGATATTCTCAGTTTT 4690

 42346790 TTTTTTTTATTTTAACCGTTCTAATAGCTGTGTAATGGTATTCCATTACAGTACTAATTT 42346849
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     4691 TTTTTTTTATTTTAACCGTTCTAATAGCTGTGTAATGGTATTCCATTACGGTACTAATTT 4750

 42346850 AAATTTCCCTAATAACTACTGAGGTTGAAAAAATCTTTCATGGGCATATTTGCCATCCTT 42346909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4751 AAATTTCCCTAATAACTACTGAGGTTGAAAAAATCTTTCATGGGCATATTTGCCATCCTT 4810

Alignment time is 3.81955 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [42336259,42357318] =>     21060 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [       1,    7422] =>      7422 nucs 'mol-32-316f-171082_7422'

Score:        7270
Aligned:      7421        nucs
Identic:      7404 (100%) nucs =>      7080 (100%)       324 (100%)
Gaps:            7 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [42338984,42346079] EXCISED REGION [42346088,42346412]
 second seq =>  [       1,    7089] EXCISED REGION [    7098,    7422]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         8 nucs [42346080,42346087]
 second seq =>         8 nucs [7090,7097]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [42346079,42346079] to [42346087,42346087]
 second seq =>         1 nucs [7090,7090] to [7098,7098]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [42346080,42346081] to [42346086,42346087]
 second seq =>         0 nucs

 42338984 GTATATATATATACATATCTATATATGTGTGTGTGTATATATATATATATATACATATAT 42339043
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||
        1 GTATATATATATACATATCTATATATGTGTGTGTGTATATATATATATATA--CATATAT 58

 42339044 ATATTTACCCAGTTTCAAGAGAAAAAAGTCAAAGGGGTAAGAGTATTCTTCATACACAGT 42339103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       59 ATATTTACCCAGTTTCAAGAGAAAAAAGTCAAAGGGGTAAGAGTATTCTTCATACACAGT 118

 42339104 CTAACATCTCTTTCTTCCACTCACAGTTGTCTTATTTTGTTCCTCTTCACTCTCCCAAAA 42339163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      119 CTAACATCTCTTTCTTCCACTCACAGTTGTCTTATTTTGTTCCTCTTCACTCTCCCAAAA 178

 42339164 CTTAGCCCATGTTCCCCAGCTCCCCTCTGCACCTGCATCTGCCACACACGTACATACATA 42339223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      179 CTTAGCCCATGTTCCCCAGCTCCCCTCTGCACCTGCATCTGCCACACACGTACATACATA 238

 42339224 CACACACTTCACATACATGCACGCATATATACAAACACACACACATATGCGCGCACACAC 42339283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
      239 CACACACTTCACATACATGCACGCATATATACAAACACACACACATATGCGCACACACAC 298

 42339284 ACACACACACACACACACACTCTCTCTCCAGCCCTTGATGCTTTCCCCCTCTCTCTTCCT 42339343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      299 ACACACACACACACACACACTCTCTCTCCAGCCCTTGATGCTTTCCCCCTCTCTCTTCCT 358

 42339344 CCTGGACCTTTTCTTTGCTCCATTCCCAACACACAGGTCCCTGGTCTGTCTCTGGCTCCT 42339403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      359 CCTGGACCTTTTCTTTGCTCCATTCCCAACACACAGGTCCCTGGTCTGTCTCTGGCTCCT 418

 42339404 TCCAAGCCTTGGCTCTTCTTAGGTATTATCCCCAGCAGCACAGCAGCAGACCAGCTGACC 42339463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      419 TCCAAGCCTTGGCTCTTCTTAGGTATTATCCCCAGCAGCACAGCAGCAGACCAGCTGACC 478

 42339464 TGGACTATTTCTTAGGCAGTAGTCAGGTAAGCTGTACCTACTCATATGGAGATATTGTTT 42339523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      479 TGGACTATTTCTTAGGCAGTAGTCAGGTAAGCTGTACCTACTCATATGGAGATATTGTTT 538

 42339524 GATCCTGAGCCTCTCCTGATGTCTCTTTTTAGCCCCCAGGGGGAGGTTTTAATATCCACA 42339583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      539 GATCCTGAGCCTCTCCTGATGTCTCTTTTTAGCCCCCAGGGGGAGGTTTTAATATCCACA 598

 42339584 TCCACCAGCATCTTCTCCCTAGGGGAGAAGGGAGTGAGATGGGGAGAAGAAAGTGAGAGG 42339643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      599 TCCACCAGCATCTTCTCCCTAGGGGAGAAGGGAGTGAGATGGGGAGAAGAAAGTGAGAGG 658

 42339644 AATCGAAACATGTCTAAGGAAACTAAGAGGCAGAGGTTATTTCGATCTGCTCTTTATAAT 42339703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      659 AATCGAAACATGTCTAAGGAAACTAAGAGGCAGAGGTTATTTCGATCTGCTCTTTATAAT 718

 42339704 CATCTCAGATGCCTGCCCTGGGCAATGTCTAGGTTATTACTGAATTCTGGGGACACTCCC 42339763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      719 CATCTCAGATGCCTGCCCTGGGCAATGTCTAGGTTATTACTGAATTCTGGGGACACTCCC 778

 42339764 ATATTAGCCCAATGACTAATCAAAAAAAGCAAGCTGACCATAGTCAACTAGAGGGTAAGG 42339823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      779 ATATTAGCCCAATGACTAATCAAAAAAAGCAAGCTGACCATAGTCAACTAGAGGGTAAGG 838

 42339824 AACCAAGTGAAAATAGAGAGAGTTCTCCGGACCTCTGAATCTGGGTACAATCATTCAGTA 42339883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      839 AACCAAGTGAAAATAGAGAGAGTTCTCCGGACCTCTGAATCTGGGTACAATCATTCAGTA 898

 42339884 TGAAGATAGGAGCTAGGAGAAGAGAGAAAACATGGAATTGTATTTTGATTGACTTTTTTC 42339943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
      899 TGAAGATAGGAGCTAGGAGAAGAGAGAAAACACGGAATTGTATTTTGATTGACTTTTTTC 958

 42339944 TGATTACAAAAGTCATATATGTTCAATGTAGAAAACCAGGAAGATACTGAAAAATACAAG 42340003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      959 TGATTACAAAAGTCATATATGTTCAATGTAGAAAACCAGGAAGATACTGAAAAATACAAG 1018

 42340004 AAGGTGTTAAAAAAAAAAAACACTTATGACCCCACCACCTAGATTTAATCAAGATTAACA 42340063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1019 AAGGTGTTAAAAAAAAAAAACACTTATGACCCCACCACCTAGATTTAATCAAGATTAACA 1078

 42340064 TGTTAGTTTACCTTTCCAGTGTGGTTTTCAATGCATATTCTTTTTAAAATCAAGTTAGAA 42340123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1079 TGTTAGTTTACCTTTCCAGTGTGGTTTTCAATGCATATTCTTTTTAAAATCAAGTTAGAA 1138

 42340124 ACATAGTGTATATGCTATTTTAGAAATTCTTTCTCAGCTGGGCGTGGTGGCTCATGCCTG 42340183
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1139 ACAGAGTGTATATGCTATTTTAGAAATTCTTTCTCAGCTGGGCGTGGTGGCTCATGCCTG 1198

 42340184 TAATCCCAGCACTTTAGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCAAGAC 42340243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1199 TAATCCCAGCACTTTAGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCAAGAC 1258

 42340244 CAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACCAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCAT 42340303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1259 CAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACCAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCAT 1318

 42340304 GATGGCACACACCTGTAAATCTCAGCTATTCTGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAA 42340363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1319 GATGGCACACACCTGTAAATCTCAGCTATTCTGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAA 1378

 42340364 CTTGAGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATCGCACCACTGCACTCCACTCCAGCCTGG 42340423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1379 CTTGAGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATCGCACCACTGCACTCCACTCCAGCCTGG 1438

 42340424 GCAACAGAGAGAGACTCTGTCTCAAAAAATAAAAAAGAAAGAAAAGAAAGAAATTCTTTC 42340483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1439 GCAACAGAGAGAGACTCTGTCTCAAAAAATAAAAAAGAAAGAAAAGAAAGAAATTCTTTC 1498

 42340484 TCATACATTACATCATAAATCTTTTCCCAAATCATTAAATATTCTTCTGCAATATGATTT 42340543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1499 TCATACATTACATCATAAATCTTTTCCCAAATCATTAAATATTCTTCTGCAATATGATTT 1558

 42340544 GTTAAAGCTATATATGATTTTGTGCAATAGATATGCTATAATAGGCTTACCCAATTTTAT 42340603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1559 GTTAAAGCTATATATGATTTTGTGCAATAGATATGCTATAATAGGCTTACCCAATTTTAT 1618

 42340604 ATGGAAGAGCACTTACGCTGTTTCCAGGCATAGAATTCTAAATATGGCAAGGTTATCTGC 42340663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1619 ATGGAAGAGCACTTACGCTGTTTCCAGGCATAGAATTCTAAATATGGCAAGGTTATCTGC 1678

 42340664 ACAACTCCTGTTTTCAGGCATGCTGACCTCCATTCCTTACAAGCAGATAATGATCCCTTT 42340723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1679 ACAACTCCTGTTTTCAGGCATGCTGACCTCCATTCCTTACAAGCAGATAATGATCCCTTT 1738

 42340724 AAAGTTCTCTGCTCAAGAGAACCGTGCCATAGCAGAAGTAATTCTTCCCCAAGCGTTCAG 42340783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1739 AAAGTTCTCTGCTCAAGAGAACCGTGCCATAGCAGAAGTAATTCTTCCCCAAGCGTTCAG 1798

 42340784 CTGTCCTGTGTTCTCCAGGGAAAGCCTAGCATTGGGCGTTGGGCATGCTTGCCTCTAAAT 42340843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1799 CTGTCCTGTGTTCTCCAGGGAAAGCCTAGCATTGGGCGTTGGGCATGCTTGCCTCTAAAT 1858

 42340844 GGGAAGGCCAGTTCATTCTTAAGCAGATGGAGAGAAAGCATTTGTCATTCTAAATCCGGG 42340903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 GGGAAGGCCAGTTCATTCTTAAGCAGATGGAGAGAAAGCATTTGTCATTCTAAATCCGGG 1918

 42340904 AAGTAGCTCAATTCAATTCAATTGCATAATTCTTAAAAACATATTTTGCGCCACTCCTGA 42340963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 AAGTAGCTCAATTCAATTCAATTGCATAATTCTTAAAAACATATTTTGCGCCACTCCTGA 1978

 42340964 AAATGGTATTATAGAAGAAAAGTATGGTTTCTACCTTTAAGAAGATTGCTGACCGGGCTG 42341023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 AAATGGTATTATAGAAGAAAAGTATGGTTTCTACCTTTAAGAAGATTGCTGACCGGGCTG 2038

 42341024 GGCGCAGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGAACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGCAGATCCCC 42341083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 GGCGCAGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGAACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGCAGATCCCC 2098

 42341084 TGAGGTCAGGAGTTAGAGGCTAGCCCGACCAACATGGCAAAACCCCGTCTCTACTAAAAA 42341143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 TGAGGTCAGGAGTTAGAGGCTAGCCCGACCAACATGGCAAAACCCCGTCTCTACTAAAAA 2158

 42341144 TATAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGTGCATGCCTGTAGCCCCAGCTACTCAGGAGACTCA 42341203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 TATAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGTGCATGCCTGTAGCCCCAGCTACTCAGGAGACTCA 2218

 42341204 GGCATGAAAATCGCTTGAACCCGAGACACGGAGGTGGTGGTGAGCTGAAATTGCGCCACT 42341263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2219 GGCATGAAAATCGCTTGAACCCGAGACACGGAGGTGGTGGTGAGCTGAAATTGCGCCACT 2278

 42341264 GCATTCCAGCCTGGGCGACAGAGCAAGACTCTATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAGAA 42341323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
     2279 GCATTCCAGCCTGGGCGACAGAGCAAGACTCTATCTCAAAAAAAAAAAAAAAA-GAAGAA 2337

 42341324 GAAGAAGATTGCTGGCGGGGTGTTGTGGCTCATACTTGTAATCCTAGCACTTTGGGAGGC 42341383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2338 GAAGAAGATTGCTGGCGGGGTGTTGTGGCTCATACTTGTAATCCTAGCACTTTGGGAGGC 2397

 42341384 CAAGGAAGGAGGATCACTTGAGCCAAAGAAGTCAAGGCTGCAGTGAGCTGTGATCACACC 42341443
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     2398 CAAGGAAGGAGGATCACTTGAGCCAAAGAACTCAAGGCTGCAGTGAGCTGTGATCACACC 2457

 42341444 ACTCCATGCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAAACCCTGTCTCAAAAAGAAAAAAGAAAAGAT 42341503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2458 ACTCCATGCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAAACCCTGTCTCAAAAAGAAAAAAGAAAAGAT 2517

 42341504 TGCCATCTTCCTGGGGTGACAAACATAATTTTAAAAGAATCAGGTAGAAACATAGGACTG 42341563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2518 TGCCATCTTCCTGGGGTGACAAACATAATTTTAAAAGAATCAGGTAGAAACATAGGACTG 2577

 42341564 TATTTATGATGAAACAACTATGACTAAATGCTATGTTTTTCAGATTACACGTGCCTTAGG 42341623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2578 TATTTATGATGAAACAACTATGACTAAATGCTATGTTTTTCAGATTACACGTGCCTTAGG 2637

 42341624 AAGTGAGAAAAGTATAAGTGCAATGTGGAATTGGGTGGTTGAGAAAACTCCAGAGAGGAC 42341683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2638 AAGTGAGAAAAGTATAAGTGCAATGTGGAATTGGGTGGTTGAGAAAACTCCAGAGAGGAC 2697

 42341684 CTGGTAGAGCTTGGAGGCAAGGTGGGCAAGGAACATTTCAAGAGGAGGGGACACTACAGC 42341743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2698 CTGGTAGAGCTTGGAGGCAAGGTGGGCAAGGAACATTTCAAGAGGAGGGGACACTACAGC 2757

 42341744 TGAGGCACAGAGGTGAGAAAGCACAGGAAGCAAGAAAGAGGCTCATCTGGCTGCAGCAGA 42341803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2758 TGAGGCACAGAGGTGAGAAAGCACAGGAAGCAAGAAAGAGGCTCATCTGGCTGCAGCAGA 2817

 42341804 GGGAGAAATAGTAAATTAGATCAGATAACTCATATATTGGGCACGTGTGCAGAGGGCCAA 42341863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2818 GGGAGAAATAGTAAATTAGATCAGATAACTCATATATTGGGCACGTGTGCAGAGGGCCAA 2877

 42341864 AAAGATGTTTGGCCTTAATTCTATAGGTATTCCCCTTTGCCATAGATGTTACACCAAGAA 42341923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2878 AAAGATGTTTGGCCTTAATTCTATAGGTATTCCCCTTTGCCATAGATGTTACACCAAGAA 2937

 42341924 AGAACACATTGAATCAAGCAAATTTAAGCTGGGTTTTTGTTTTTGTTTTTTGGTGGTGGG 42341983
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2938 AGAACACATTGAATCAAGCAACTTTAAGCTGGGTTTTTGTTTTTGTTTTTTGGTGGTGGG 2997

 42341984 GGGGATGATTTATAAGCAGGACTTCCCAAAGCTTTTAATATGCTTATATATGTGGCAGTG 42342043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2998 GGGGATGATTTATAAGCAGGACTTCCCAAAGCTTTTAATATGCTTATATATGTGGCAGTG 3057

 42342044 TTGAGAGGGGAAGATTTGATATTCCAAGTATTTTTGGCCACAGAACTCTTTTTATCATGG 42342103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3058 TTGAGAGGGGAAGATTTGATATTCCAAGTATTTTTGGCCACAGAACTCTTTTTATCATGG 3117

 42342104 AACATTTCCAGTGTTCCATGAGACACAATTAGGGGCTAGTGAGCCACTGACTTTTGAGTT 42342163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3118 AACATTTCCAGTGTTCCATGAGACACAATTAGGGGCTAGTGAGCCACTGACTTTTGAGTT 3177

 42342164 GGAAAGTGACACATGGGGAAAGCAAAGTTTTGGAAGATTGATCTCACGGTAGAATATAAG 42342223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3178 GGAAAGTGACACATGGGGAAAGCAAAGTTTTGGAAGATTGATCTCACGGTAGAATATAAG 3237

 42342224 GTGAACAGGAGAGAAAAGAGCCTGGATTCAGGCAACACAATCAGATGATTGGATACAGGC 42342283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3238 GTGAACAGGAGAGAAAAGAGCCTGGATTCAGGCAACACAATCAGATGATTGGATACAGGC 3297

 42342284 TCAAGATTAGGGGGTGGGTTGCACTACACTGGAGCGGAGAATGGAGAGCAAAAGCACTGA 42342343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3298 TCAAGATTAGGGGGTGGGTTGCACTACACTGGAGCGGAGAATGGAGAGCAAAAGCACTGA 3357

 42342344 TTGAATGCACAGTCTTCTGTTGGATCCTGGGATGATACAGAAGTGTCAGAGTTCCTGGGT 42342403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3358 TTGAATGCACAGTCTTCTGTTGGATCCTGGGATGATACAGAAGTGTCAGAGTTCCTGGGT 3417

 42342404 CTTGTAGGAGTTCCAATGAGCATCAATCAAAAGTTTGATTGTAAGGCACAGAAATCAACT 42342463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3418 CTTGTAGGAGTTCCAATGAGCATCAATCAAAAGTTTGATTGTAAGGCACAGAAATCAACT 3477

 42342464 TGGACCAGCTAAAGCAAAAAGACCATTTTTAGGGAAATAGGGATGTGTCACAAAGAACTG 42342523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3478 TGGACCAGCTAAAGCAAAAAGACCATTTTTAGGGAAATAGGGATGTGTCACAAAGAACTG 3537

 42342524 CATCTAGGTACTGGAAATCAACAAAAAGTTCCCCATCTGATCTCAGCTTCTCTGTGTGTC 42342583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3538 CATCTAGGTACTGGAAATCAACAAAAAGTTCCCCATCTGATCTCAGCTTCTCTGTGTGTC 3597

 42342584 TACTACATACACTATCTTTCTCCTCTTTTCTTTCCTCTCTACCCCCTACCTCCCTCCTCT 42342643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3598 TACTACATACACTATCTTTCTCCTCTTTTCTTTCCTCTCTACCCCCTACCTCCCTCCTCT 3657

 42342644 CTCTTTTTTTTTTTTTTTTTGTTTTTTGGTTTTTTTATGTTTGTTTGTTTGCTTTTGGAG 42342703
          ||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     3658 CTCTTTTTTTTTTTTT----GTTTTTTGGTTTTTTTATGTTTGTTTGTTTGTTTTTGGAG 3713

 42342704 ACACGGTCTCCCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCTTAATTACTGCAGCCTCAAT 42342763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3714 ACACGGTCTCCCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCTTAATTACTGCAGCCTCAAT 3773

 42342764 CTCCTGGGCTCAAGTGACCCTCCCACCTCAGCCTCCTGAATAGCTGGGACCACAGGTGCA 42342823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3774 CTCCTGGGCTCAAGTGACCCTCCCACCTCAGCCTCCTGAATAGCTGGGACCACAGGTGCA 3833

 42342824 AGCCACAGTGCTCAGCTAATTAAAAAAAATTTTTTTTTCAGAGATGGGGTCTCACTATGT 42342883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3834 AGCCACAGTGCTCAGCTAATTAAAAAAAATTTTTTTTTCAGAGATGGGGTCTCACTATGT 3893

 42342884 TGTCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTAGGCTCAAGCAGTCCTCCCGTTTCAGCCTCAAAAAG 42342943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3894 TGTCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTAGGCTCAAGCAGTCCTCCCGTTTCAGCCTCAAAAAG 3953

 42342944 TGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCATCGCACTCCACCTTCTCTATAGTTACTGAGTTTGCG 42343003
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     3954 TGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCATCGCACTCCACTTTCTCTATAGTTACTGAGTTTGCG 4013

 42343004 TGTTACACTGAGTTTACATCTTACATTTCTAGCCATATCAGAAACGACCTCTGCACCTCT 42343063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4014 TGTTACACTGAGTTTACATCTTACATTTCTAGCCATATCAGAAACGACCTCTGCACCTCT 4073

 42343064 CTTTCCCAATTTGAGATTTCTAATAGAAAGAATCTTGTTCACCCAGCTTGGGACTCATTG 42343123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4074 CTTTCCCAATTTGAGATTTCTAATAGAAAGAATCTTGTTCACCCAGCTTGGGACTCATTG 4133

 42343124 AGTTATGACCAGTGGGATAGATTTTAGAAGATAAACATGTCTATAGGGACTTACCGTGTG 42343183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4134 AGTTATGACCAGTGGGATAGATTTTAGAAGATAAACATGTCTATAGGGACTTACCGTGTG 4193

 42343184 AATTAGTGGGGGAGCCGCTTACCAGGCAGAGGGGTCTGCTGTAAAGTGATACTGTGACTT 42343243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4194 AATTAGTGGGGGAGCCGCTTACCAGGCAGAGGGGTCTGCTGTAAAGTGATACTGTGACTT 4253

 42343244 TAAATTGAAAGTAAGCTTCTAGAAGAGTTGAAGAGGAGTGGATTATTGTTGAATGGATGT 42343303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4254 TAAATTGAAAGTAAGCTTCTAGAAGAGTTGAAGAGGAGTGGATTATTGTTGAATGGATGT 4313

 42343304 ATAACTAATGAAGCTTTAAAGGAAGTTTATTAGAAAGTCCATGTCCTTGTCTCTTTCCCA 42343363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4314 ATAACTAATGAAGCTTTAAAGGAAGTTTATTAGAAAGTCCATGTCCTTGTCTCTTTCCCA 4373

 42343364 AACTCCTTTAGTTCCCAAGTCCTGAAAGAATCTATGGATAAGGGAAGCAGAATACTATAG 42343423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4374 AACTCCTTTAGTTCCCAAGTCCTGAAAGAATCTATGGATAAGGGAAGCAGAATACTATAG 4433

 42343424 TGGTTAAGAGCACATGCTCGAGGTTAAACTGTCTGTATTTTGGATCCTGGCCTTGAGGAC 42343483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4434 TGGTTAAGAGCACATGCTCGAGGTTAAACTGTCTGTATTTTGGATCCTGGCCTTGAGGAC 4493

 42343484 TTGGGCAAGTTACGTGACCTGCCTGAGCCTCAGTTTCCTCACCTGTAATATGGGTATCAC 42343543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4494 TTGGGCAAGTTACGTGACCTGCCTGAGCCTCAGTTTCCTCACCTGTAATATGGGTATCAC 4553

 42343544 GAGGAATAAATAAGGTAATATGTGTAAAGTGCTTGGCACAATGCTCTTGATAATGTTAGC 42343603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4554 GAGGAATAAATAAGGTAATATGTGTAAAGTGCTTGGCACAATGCTCTTGATAATGTTAGC 4613

 42343604 AACATAATTTTGTAATGAAAATTAACTGATGGGGCTGAAATGTGCATCAGCAGATCCAAA 42343663
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     4614 AACATAATTTTGTAATGAAAATTAACTGATGGGACTGAAATGTGCATCAGCAGATCCAAA 4673

 42343664 TATCCTTGATAAACTGGCCAAAAGAAAGATGAATTGGCAGAGAGGCAAGTGTTCATCTCA 42343723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4674 TATCCTTGATAAACTGGCCAAAAGAAAGATGAATTGGCAGAGAGGCAAGTGTTCATCTCA 4733

 42343724 GTTCTCCAGATATCCCTGCAAATGTGGCCTCTGGAGTAGAAGATTTAGGGAGAAAAATAA 42343783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4734 GTTCTCCAGATATCCCTGCAAATGTGGCCTCTGGAGTAGAAGATTTAGGGAGAAAAATAA 4793

 42343784 GCCATGAAGCTCTTCTGGCACCAACATGAACTTCAGGGATCATGGGACATTTGGGCCAGT 42343843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4794 GCCATGAAGCTCTTCTGGCACCAACATGAACTTCAGGGATCATGGGACATTTGGGCCAGT 4853

 42343844 AACATTCCTCTTTGTTCCTAGAGATTTAATATCTACCTACCAACTAAATGGCCTTGATTT 42343903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4854 AACATTCCTCTTTGTTCCTAGAGATTTAATATCTACCTACCAACTAAATGGCCTTGATTT 4913

 42343904 GGAGGAGAGAAGACAAGAAGAGGAATTGCTTTCAGCTGGTCCTTGCCTTTAACTAACCAG 42343963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4914 GGAGGAGAGAAGACAAGAAGAGGAATTGCTTTCAGCTGGTCCTTGCCTTTAACTAACCAG 4973

 42343964 GGGTACAAAAATTTTAAAATACAAAGGAGACCATGTGTAAAACATTAGTTAAGCTCAGAT 42344023
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4974 GGGTACAAAAATTTTAAAACACAAAGGAGACCATGTGTAAAACATTAGTTAAGCTCAGAT 5033

 42344024 ATAAATCTAGTCTTTGACCAGTCCAGAGCTAATCAATATGCTTTTCTACTCTCTTTGAAC 42344083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5034 ATAAATCTAGTCTTTGACCAGTCCAGAGCTAATCAATATGCTTTTCTACTCTCTTTGAAC 5093

 42344084 TTTTGAGTTTTCTGGCAACAACAAAAATCCCAAACCTCATCCAAAACCGTAGTCCAGACA 42344143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5094 TTTTGAGTTTTCTGGCAACAACAAAAATCCCAAACCTCATCCAAAACCGTAGTCCAGACA 5153

 42344144 GCCCAGTTTCTGCACTCCCTTCCTTGTGTCACATATTGTTGACAGAACTACTCCCGTTAC 42344203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5154 GCCCAGTTTCTGCACTCCCTTCCTTGTGTCACATATTGTTGACAGAACTACTCCCGTTAC 5213

 42344204 CACATTCATTCCAGTGGTGATTCAAATTCTTCTGCAGAAATGGACTTGAAAGACAGAAAA 42344263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5214 CACATTCATTCCAGTGGTGATTCAAATTCTTCTGCAGAAATGGACTTGAAAGACAGAAAA 5273

 42344264 CTGCTCCTGTAATCACTTAATAAGGAATCTTGGATGAGGAATACAGAGCTATGAATATGG 42344323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5274 CTGCTCCTGTAATCACTTAATAAGGAATCTTGGATGAGGAATACAGAGCTATGAATATGG 5333

 42344324 ATTTACTCTTAGCCTTTATGGATGCCTTTTTCTCAGTTATTTTCACTGAAAATCATGATG 42344383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5334 ATTTACTCTTAGCCTTTATGGATGCCTTTTTCTCAGTTATTTTCACTGAAAATCATGATG 5393

 42344384 AACTGATTTAAATATCAAGGTAAACTGAGATGGAAAATTACCGATAATAAGAGTTTTCTG 42344443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5394 AACTGATTTAAATATCAAGGTAAACTGAGATGGAAAATTACCGATAATAAGAGTTTTCTG 5453

 42344444 AAAATATAGATTGGCCTCTTTAAAGCACATCGAGTTTGTTTTGTTTAAATTACAAATTCA 42344503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5454 AAAATATAGATTGGCCTCTTTAAAGCACATCGAGTTTGTTTTGTTTAAATTACAAATTCA 5513

 42344504 CATATATTTGAAATGTGTTTAAATGTGTCAGTTTTAGGCAAAACTAAACTATTTGATTCC 42344563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5514 CATATATTTGAAATGTGTTTAAATGTGTCAGTTTTAGGCAAAACTAAACTATTTGATTCC 5573

 42344564 TTTCCAAAAATCAGGAATTTGCTTTGGAAAAAAACCATGCAGTTTGATTTACAAAGCAGA 42344623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5574 TTTCCAAAAATCAGGAATTTGCTTTGGAAAAAAACCATGCAGTTTGATTTACAAAGCAGA 5633

 42344624 GCGGGGGGGAAGTAGTGGGTGAGAAAGACCCACCCAAAGGCTGCAGCCAGCTTCCCCAGG 42344683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5634 GCGGGGGGGAAGTAGTGGGTGAGAAAGACCCACCCAAAGGCTGCAGCCAGCTTCCCCAGG 5693

 42344684 AAGATTCATAACCATGCCACAATACTGTCCTTCAATTCGTTCCAACAGATTTTACTATAA 42344743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5694 AAGATTCATAACCATGCCACAATACTGTCCTTCAATTCGTTCCAACAGATTTTACTATAA 5753

 42344744 CTCTAAATCATTAGAAGCAACTGCTGCTATGACTAGTGCTATCTTTGCCTCAAAAAGAGG 42344803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5754 CTCTAAATCATTAGAAGCAACTGCTGCTATGACTAGTGCTATCTTTGCCTCAAAAAGAGG 5813

 42344804 AAAAATCAGGACATACAATATAATCCCCTCAGGATCTAGGAGAGAAATCAGCCCATTTGT 42344863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5814 AAAAATCAGGACATACAATATAATCCCCTCAGGATCTAGGAGAGAAATCAGCCCATTTGT 5873

 42344864 CATAAGAACTGAAAACCTCAGCTAAATAGTATATGAAACATTGGTATTTCATACCTTGAC 42344923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5874 CATAAGAACTGAAAACCTCAGCTAAATAGTATATGAAACATTGGTATTTCATACCTTGAC 5933

 42344924 ATTACATATTTTTGAAAATAAAGTAAGCATACACACAAGAAGTGGCTAGATGCAGCAGTT 42344983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5934 ATTACATATTTTTGAAAATAAAGTAAGCATACACACAAGAAGTGGCTAGATGCAGCAGTT 5993

 42344984 ATAAAGTGGCTTAAGTTGGGTTAACTAAATATAACCTAGAAAAACCATCTTATCTATTGC 42345043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5994 ATAAAGTGGCTTAAGTTGGGTTAACTAAATATAACCTAGAAAAACCATCTTATCTATTGC 6053

 42345044 AAATTATTTCCAGAAAAAGGTAAGAAAAATCCAACCAACACTTTTTAAACATCCTGAGCT 42345103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6054 AAATTATTTCCAGAAAAAGGTAAGAAAAATCCAACCAACACTTTTTAAACATCCTGAGCT 6113

 42345104 ATTCACAGCAAGTGAATCTTTACCCTTACCAGATGTATAAACATTTACATAAGGCAGGAG 42345163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6114 ATTCACAGCAAGTGAATCTTTACCCTTACCAGATGTATAAACATTTACATAAGGCAGGAG 6173

 42345164 GTTCAACACTTGGAGAGTGTAATCAAGGCAGTAGTAACGCAGTGCTCCTCTCTTTGACTT 42345223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6174 GTTCAACACTTGGAGAGTGTAATCAAGGCAGTAGTAACGCAGTGCTCCTCTCTTTGACTT 6233

 42345224 GAATGACTTCCTCCCCATTAGGGTCATTATTGTTTTGCAGTGTCCCAGGGATGAAAGGAC 42345283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6234 GAATGACTTCCTCCCCATTAGGGTCATTATTGTTTTGCAGTGTCCCAGGGATGAAAGGAC 6293

 42345284 TTTGAAAGGTCATGTGTCTTGTGACCCAACTAGCAGCATCAGCATCACTGGGGAGAAACT 42345343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6294 TTTGAAAGGTCATGTGTCTTGTGACCCAACTAGCAGCATCAGCATCACTGGGGAGAAACT 6353

 42345344 CAAGCAGAAGCTTGAGTCTACTCCACTCTTGCTGACACCAAATCTGCATTTTTACAGGAT 42345403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6354 CAAGCAGAAGCTTGAGTCTACTCCACTCTTGCTGACACCAAATCTGCATTTTTACAGGAT 6413

 42345404 TCTTGGGTGAGTCACACACATATTCAAGGTTAAAATATGCCACCCTAGGTCTTTCTCCTG 42345463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6414 TCTTGGGTGAGTCACACACATATTCAAGGTTAAAATATGCCACCCTAGGTCTTTCTCCTG 6473

 42345464 CTTCTGAGCAAAACTGGGCACAAGGGACAAACTAGTTTCCTTCAGCCACTTTCAAATCCT 42345523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6474 CTTCTGAGCAAAACTGGGCACAAGGGACAAACTAGTTTCCTTCAGCCACTTTCAAATCCT 6533

 42345524 TTATAGAGTGTACTGTGTGAGTCACTGAGAGGAAAGAGGAAATAATACTTATTTAGGGAA 42345583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6534 TTATAGAGTGTACTGTGTGAGTCACTGAGAGGAAAGAGGAAATAATACTTATTTAGGGAA 6593

 42345584 GTCTTGCATAACTTAACAAAGTTAGTAACTTCTTCAATACACTCAAGTACCTATTTTTGG 42345643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6594 GTCTTGCATAACTTAACAAAGTTAGTAACTTCTTCAATACACTCAAGTACCTATTTTTGG 6653

 42345644 AAGCCCTACAGGTTAGGTCAAAGTAAAGAGAAGCAAAAAATGGAGTGAGTTCTAGTAAAA 42345703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6654 AAGCCCTACAGGTTAGGTCAAAGTAAAGAGAAGCAAAAAATGGAGTGAGTTCTAGTAAAA 6713

 42345704 AACTCTGACAAAATAAGGGAAGTGTAGAAGCTGAGTCTATGAGGGATGAGAGAAGCAATT 42345763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6714 AACTCTGACAAAATAAGGGAAGTGTAGAAGCTGAGTCTATGAGGGATGAGAGAAGCAATT 6773

 42345764 TACCAAATTATCAGATCCAAAATCATCTCTGCACTGTAGATGATTTATAGCCCTGGAAGC 42345823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6774 TACCAAATTATCAGATCCAAAATCATCTCTGCACTGTAGATGATTTATAGCCCTGGAAGC 6833

 42345824 TTAGAGGCTTGAGTCTCTTGCTGTATTTCATTTCAAATTAGTAATTTTTATCTAGGGCTT 42345883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6834 TTAGAGGCTTGAGTCTCTTGCTGTATTTCATTTCAAATTAGTAATTTTTATCTAGGGCTT 6893

 42345884 CCCTATGGCTTAAAGTGAAGGCCCTGGAATTTCTGAAGTGAAATTATCTGATGATTTTTA 42345943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6894 CCCTATGGCTTAAAGTGAAGGCCCTGGAATTTCTGAAGTGAAATTATCTGATGATTTTTA 6953

 42345944 TGTATGGTCATTCTGTAGTTATCCTGTAAGTTTCATATTTGTAACAAGACTGGAATCCGA 42346003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6954 TGTATGGTCATTCTGTAGTTATCCTGTAAGTTTCATATTTGTAACAAGACTGGAATCCGA 7013

 42346004 ACAATAGAAAACTCTGTGGCAGTAAGCCAAAACCTGATGGACTTAGGAGAGTTACGTATG 42346063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7014 ACAATAGAAAACTCTGTGGCAGTAAGCCAAAACCTGATGGACTTAGGAGAGTTACGTATG 7073

 42346064 TGTGTTTCAGTGGTCC 42346079
          ||||||||||||||||
     7074 TGTGTTTCAGTGGTCC 7089

EXCISED REGION

 42346088 AGCTGCCTATTAGAATCACCTGGACTTTGAAAAAAAAAGAGCTTTCTTGAGGTATAACTG 42346147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7098 AGCTGCCTATTAGAATCACCTGGACTTTGAAAAAAAAAGAGCTTTCTTGAGGTATAACTG 7157

 42346148 ACAAATAATAAGACAAACATATTTCAGTATACAATTGGATGAGTTTTGACATGTTATATT 42346207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7158 ACAAATAATAAGACAAACATATTTCAGTATACAATTGGATGAGTTTTGACATGTTATATT 7217

 42346208 CTTGTGAAACCATCACCACAATCAAGCTATTCACCCCCCAAATTTTCGTGCCCCTTTGTT 42346267
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7218 CTTGTGAAACCATCGCCACAATCAAGCTATTCACCCCCCAAATTTTCGTGCCCCTTTGTT 7277

 42346268 GTCCCACCCTTCTTTCTGCAACCACTGATCTGCTTTCTATCACTATGGATTAATTTGTAT 42346327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7278 GTCCCACCCTTCTTTCTGCAACCACTGATCTGCTTTCTATCACTATGGATTAATTTGTAT 7337

 42346328 TTTCTAGAAGCTTAAATAAGTGAAACCATATGGTGTGCATGTTTTGCAGGGAGAGGGCAG 42346387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7338 TTTCTAGAAGCTTAAATAAGTGAAACCATATGGTGTGCATGTTTTGCAGGGAGAGGGCAG 7397

 42346388 GGGGAGCTGGTTTCTTTCACTCGGT 42346412
          |||||||||||||||||||||||||
     7398 GGGGAGCTGGTTTCTTTCACTCGGT 7422

Alignment time is 5.80344 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [42336259,42357318] =>     21060 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [       1,    2835] =>      2835 nucs 'mol-32-317a-227652_2835'

Score:        2807
Aligned:      2829        nucs
Identic:      2827 (100%) nucs =>      2077 (100%)       750 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [42344010,42346086] EXCISED REGION [42346088,42346838]
 second seq =>  [       1,    2077] EXCISED REGION [    2079,    2830]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [42346087,42346087]
 second seq =>         1 nucs [2078,2078]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [2778,2778]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [2076,2077] to [2077,2078]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 42344010 AGTTAAGCTCAGATATAAATCTAGTCTTTGACCAGTCCAGAGCTAATCAATATGCTTTTC 42344069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGTTAAGCTCAGATATAAATCTAGTCTTTGACCAGTCCAGAGCTAATCAATATGCTTTTC 60

 42344070 TACTCTCTTTGAACTTTTGAGTTTTCTGGCAACAACAAAAATCCCAAACCTCATCCAAAA 42344129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TACTCTCTTTGAACTTTTGAGTTTTCTGGCAACAACAAAAATCCCAAACCTCATCCAAAA 120

 42344130 CCGTAGTCCAGACAGCCCAGTTTCTGCACTCCCTTCCTTGTGTCACATATTGTTGACAGA 42344189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCGTAGTCCAGACAGCCCAGTTTCTGCACTCCCTTCCTTGTGTCACATATTGTTGACAGA 180

 42344190 ACTACTCCCGTTACCACATTCATTCCAGTGGTGATTCAAATTCTTCTGCAGAAATGGACT 42344249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACTACTCCCGTTACCACATTCATTCCAGTGGTGATTCAAATTCTTCTGCAGAAATGGACT 240

 42344250 TGAAAGACAGAAAACTGCTCCTGTAATCACTTAATAAGGAATCTTGGATGAGGAATACAG 42344309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGAAAGACAGAAAACTGCTCCTGTAATCACTTAATAAGGAATCTTGGATGAGGAATACAG 300

 42344310 AGCTATGAATATGGATTTACTCTTAGCCTTTATGGATGCCTTTTTCTCAGTTATTTTCAC 42344369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGCTATGAATATGGATTTACTCTTAGCCTTTATGGATGCCTTTTTCTCAGTTATTTTCAC 360

 42344370 TGAAAATCATGATGAACTGATTTAAATATCAAGGTAAACTGAGATGGAAAATTACCGATA 42344429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGAAAATCATGATGAACTGATTTAAATATCAAGGTAAACTGAGATGGAAAATTACCGATA 420

 42344430 ATAAGAGTTTTCTGAAAATATAGATTGGCCTCTTTAAAGCACATCGAGTTTGTTTTGTTT 42344489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATAAGAGTTTTCTGAAAATATAGATTGGCCTCTTTAAAGCACATCGAGTTTGTTTTGTTT 480

 42344490 AAATTACAAATTCACATATATTTGAAATGTGTTTAAATGTGTCAGTTTTAGGCAAAACTA 42344549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAATTACAAATTCACATATATTTGAAATGTGTTTAAATGTGTCAGTTTTAGGCAAAACTA 540

 42344550 AACTATTTGATTCCTTTCCAAAAATCAGGAATTTGCTTTGGAAAAAAACCATGCAGTTTG 42344609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AACTATTTGATTCCTTTCCAAAAATCAGGAATTTGCTTTGGAAAAAAACCATGCAGTTTG 600

 42344610 ATTTACAAAGCAGAGCGGGGGGGAAGTAGTGGGTGAGAAAGACCCACCCAAAGGCTGCAG 42344669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATTTACAAAGCAGAGCGGGGGGGAAGTAGTGGGTGAGAAAGACCCACCCAAAGGCTGCAG 660

 42344670 CCAGCTTCCCCAGGAAGATTCATAACCATGCCACAATACTGTCCTTCAATTCGTTCCAAC 42344729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCAGCTTCCCCAGGAAGATTCATAACCATGCCACAATACTGTCCTTCAATTCGTTCCAAC 720

 42344730 AGATTTTACTATAACTCTAAATCATTAGAAGCAACTGCTGCTATGACTAGTGCTATCTTT 42344789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGATTTTACTATAACTCTAAATCATTAGAAGCAACTGCTGCTATGACTAGTGCTATCTTT 780

 42344790 GCCTCAAAAAGAGGAAAAATCAGGACATACAATATAATCCCCTCAGGATCTAGGAGAGAA 42344849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GCCTCAAAAAGAGGAAAAATCAGGACATACAATATAATCCCCTCAGGATCTAGGAGAGAA 840

 42344850 ATCAGCCCATTTGTCATAAGAACTGAAAACCTCAGCTAAATAGTATATGAAACATTGGTA 42344909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATCAGCCCATTTGTCATAAGAACTGAAAACCTCAGCTAAATAGTATATGAAACATTGGTA 900

 42344910 TTTCATACCTTGACATTACATATTTTTGAAAATAAAGTAAGCATACACACAAGAAGTGGC 42344969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTTCATACCTTGACATTACATATTTTTGAAAATAAAGTAAGCATACACACAAGAAGTGGC 960

 42344970 TAGATGCAGCAGTTATAAAGTGGCTTAAGTTGGGTTAACTAAATATAACCTAGAAAAACC 42345029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TAGATGCAGCAGTTATAAAGTGGCTTAAGTTGGGTTAACTAAATATAACCTAGAAAAACC 1020

 42345030 ATCTTATCTATTGCAAATTATTTCCAGAAAAAGGTAAGAAAAATCCAACCAACACTTTTT 42345089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATCTTATCTATTGCAAATTATTTCCAGAAAAAGGTAAGAAAAATCCAACCAACACTTTTT 1080

 42345090 AAACATCCTGAGCTATTCACAGCAAGTGAATCTTTACCCTTACCAGATGTATAAACATTT 42345149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAACATCCTGAGCTATTCACAGCAAGTGAATCTTTACCCTTACCAGATGTATAAACATTT 1140

 42345150 ACATAAGGCAGGAGGTTCAACACTTGGAGAGTGTAATCAAGGCAGTAGTAACGCAGTGCT 42345209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ACATAAGGCAGGAGGTTCAACACTTGGAGAGTGTAATCAAGGCAGTAGTAACGCAGTGCT 1200

 42345210 CCTCTCTTTGACTTGAATGACTTCCTCCCCATTAGGGTCATTATTGTTTTGCAGTGTCCC 42345269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CCTCTCTTTGACTTGAATGACTTCCTCCCCATTAGGGTCATTATTGTTTTGCAGTGTCCC 1260

 42345270 AGGGATGAAAGGACTTTGAAAGGTCATGTGTCTTGTGACCCAACTAGCAGCATCAGCATC 42345329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AGGGATGAAAGGACTTTGAAAGGTCATGTGTCTTGTGACCCAACTAGCAGCATCAGCATC 1320

 42345330 ACTGGGGAGAAACTCAAGCAGAAGCTTGAGTCTACTCCACTCTTGCTGACACCAAATCTG 42345389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ACTGGGGAGAAACTCAAGCAGAAGCTTGAGTCTACTCCACTCTTGCTGACACCAAATCTG 1380

 42345390 CATTTTTACAGGATTCTTGGGTGAGTCACACACATATTCAAGGTTAAAATATGCCACCCT 42345449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CATTTTTACAGGATTCTTGGGTGAGTCACACACATATTCAAGGTTAAAATATGCCACCCT 1440

 42345450 AGGTCTTTCTCCTGCTTCTGAGCAAAACTGGGCACAAGGGACAAACTAGTTTCCTTCAGC 42345509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AGGTCTTTCTCCTGCTTCTGAGCAAAACTGGGCACAAGGGACAAACTAGTTTCCTTCAGC 1500

 42345510 CACTTTCAAATCCTTTATAGAGTGTACTGTGTGAGTCACTGAGAGGAAAGAGGAAATAAT 42345569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CACTTTCAAATCCTTTATAGAGTGTACTGTGTGAGTCACTGAGAGGAAAGAGGAAATAAT 1560

 42345570 ACTTATTTAGGGAAGTCTTGCATAACTTAACAAAGTTAGTAACTTCTTCAATACACTCAA 42345629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ACTTATTTAGGGAAGTCTTGCATAACTTAACAAAGTTAGTAACTTCTTCAATACACTCAA 1620

 42345630 GTACCTATTTTTGGAAGCCCTACAGGTTAGGTCAAAGTAAAGAGAAGCAAAAAATGGAGT 42345689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GTACCTATTTTTGGAAGCCCTACAGGTTAGGTCAAAGTAAAGAGAAGCAAAAAATGGAGT 1680

 42345690 GAGTTCTAGTAAAAAACTCTGACAAAATAAGGGAAGTGTAGAAGCTGAGTCTATGAGGGA 42345749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GAGTTCTAGTAAAAAACTCTGACAAAATAAGGGAAGTGTAGAAGCTGAGTCTATGAGGGA 1740

 42345750 TGAGAGAAGCAATTTACCAAATTATCAGATCCAAAATCATCTCTGCACTGTAGATGATTT 42345809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGAGAGAAGCAATTTACCAAATTATCAGATCCAAAATCATCTCTGCACTGTAGATGATTT 1800

 42345810 ATAGCCCTGGAAGCTTAGAGGCTTGAGTCTCTTGCTGTATTTCATTTCAAATTAGTAATT 42345869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ATAGCCCTGGAAGCTTAGAGGCTTGAGTCTCTTGCTGTATTTCATTTCAAATTAGTAATT 1860

 42345870 TTTATCTAGGGCTTCCCTATGGCTTAAAGTGAAGGCCCTGGAATTTCTGAAGTGAAATTA 42345929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTTATCTAGGGCTTCCCTATGGCTTAAAGTGAAGGCCCTGGAATTTCTGAAGTGAAATTA 1920

 42345930 TCTGATGATTTTTATGTATGGTCATTCTGTAGTTATCCTGTAAGTTTCATATTTGTAACA 42345989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TCTGATGATTTTTATGTATGGTCATTCTGTAGTTATCCTGTAAGTTTCATATTTGTAACA 1980

 42345990 AGACTGGAATCCGAACAATAGAAAACTCTGTGGCAGTAAGCCAAAACCTGATGGACTTAG 42346049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AGACTGGAATCCGAACAATAGAAAACTCTGTGGCAGTAAGCCAAAACCTGATGGACTTAG 2040

 42346050 GAGAGTTACGTATGTGTGTTTCAGTGGTCCTCAAATT 42346086
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GAGAGTTACGTATGTGTGTTTCAGTGGTCCTCAAATT 2077

EXCISED REGION

 42346088 AGCTGCCTATTAGAATCACCTGGACTTTGAAAAAAAAAGAGCTTTCTTGAGGTATAACTG 42346147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2079 AGCTGCCTATTAGAATCACCTGGACTTTGAAAAAAAAAGAGCTTTCTTGAGGTATAACTG 2138

 42346148 ACAAATAATAAGACAAACATATTTCAGTATACAATTGGATGAGTTTTGACATGTTATATT 42346207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2139 ACAAATAATAAGACAAACATATTTCAGTATACAATTGGATGAGTTTTGACATGTTATATT 2198

 42346208 CTTGTGAAACCATCACCACAATCAAGCTATTCACCCCCCAAATTTTCGTGCCCCTTTGTT 42346267
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2199 CTTGTGAAACCATCGCCACAATCAAGCTATTCACCCCCCAAATTTTCGTGCCCCTTTGTT 2258

 42346268 GTCCCACCCTTCTTTCTGCAACCACTGATCTGCTTTCTATCACTATGGATTAATTTGTAT 42346327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2259 GTCCCACCCTTCTTTCTGCAACCACTGATCTGCTTTCTATCACTATGGATTAATTTGTAT 2318

 42346328 TTTCTAGAAGCTTAAATAAGTGAAACCATATGGTGTGCATGTTTTGCAGGGAGAGGGCAG 42346387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2319 TTTCTAGAAGCTTAAATAAGTGAAACCATATGGTGTGCATGTTTTGCAGGGAGAGGGCAG 2378

 42346388 GGGGAGCTGGTTTCTTTCACTCGGTGTAATTGTTCTGAGAGTCATCCGTGTTTGCATGTG 42346447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2379 GGGGAGCTGGTTTCTTTCACTCGGTGTAATTGTTCTGAGAGTCATCCGTGTTTGCATGTG 2438

 42346448 TTAATAGTTTATTCTTTTTATCGGTAAGTAGTATCCCATTGTGTGGATGTACCACATGTT 42346507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2439 TTAATAGTTTATTCTTTTTATCGGTAAGTAGTATCCCATTGTGTGGATGTACCACATGTT 2498

 42346508 GTCTAACCATTCACAACTAAAGGATACTTGGGTTGTTTCTCATTTGGGGCAATTGAAAAT 42346567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2499 GTCTAACCATTCACAACTAAAGGATACTTGGGTTGTTTCTCATTTGGGGCAATTGAAAAT 2558

 42346568 AAGCAGTATAAACTGCTATAAACAGTCATGTACAGATATAAGCATGTATGTTTCCATTTT 42346627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2559 AAGCAGTATAAACTGCTATAAACAGTCATGTACAGATATAAGCATGTATGTTTCCATTTT 2618

 42346628 TCAAGGTAAATACCTAGAAGTGGGTATGGTAAGTGTATGTTTAACTTGAAAAGAAACTAC 42346687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2619 TCAAGGTAAATACCTAGAAGTGGGTATGGTAAGTGTATGTTTAACTTGAAAAGAAACTAC 2678

 42346688 CAAAATGTTTCCAAAGTGGTTGTACCATTTTGCTTACCTACCAGAAATGTGTAAGAGTTC 42346747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2679 CAAAATGTTTCCAAAGTGGTTGTACCATTTTGCTTACCTACCAGAAATGTGTAAGAGTTC 2738

 42346748 TAGTTACTCCACATACTTCCTAGCAGTTGATATTCTCAG-TTTTTTTTTTTATTTTAACC 42346806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
     2739 TAGTTACTCCACATACTTCCTAGCAGTTGATATTCTCAGTTTTTTTTTTTTATTTTAACC 2798

 42346807 GTTCTAATAGCTGTGTAATGGTATTCCATTAC 42346838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||
     2799 GTTCTAATAGCTGTGTAATGGTATTCCATTAC 2830

Alignment time is 2.09709 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [42336259,42357318] =>     21060 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [       1,    4586] =>      4586 nucs 'mol-32-322a-115688_4586'

Score:        4480
Aligned:      4587        nucs
Identic:      4574 (100%) nucs =>      4548 (100%)        26 (100%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [42341699,42346259] EXCISED REGION [42347319,42347344]
 second seq =>  [       1,    4556] EXCISED REGION [    4561,    4586]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1059 nucs [42346260,42347318]
 second seq =>         4 nucs [4557,4560]
ALTERNATIVE REGION(S): 2
 first  seq =>      3625 nucs [42346260,42349884]
 second seq =>         4 nucs [4557,4560]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [4557,4557] to [4561,4561]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 42341699 GGCAAGGTGGGCAAGGAACATTTCAAGAGGAGGGGACACTACAGCTGAGGCACAGAGGTG 42341758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGCAAGGTGGGCAAGGAACATTTCAAGAGGAGGGGACACTACAGCTGAGGCACAGAGGTG 60

 42341759 AGAAAGCACAGGAAGCAAGAAAGAGGCTCATCTGGCTGCAGCAGAGGGAGAAATAGTAAA 42341818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGAAAGCACAGGAAGCAAGAAAGAGGCTCATCTGGCTGCAGCAGAGGGAGAAATAGTAAA 120

 42341819 TTAGATCAGATAACTCATATATTGGGCACGTGTGCAGAGGGCCAAAAAGATGTTTGGCCT 42341878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTAGATCAGATAACTCATATATTGGGCACGTGTGCAGAGGGCCAAAAAGATGTTTGGCCT 180

 42341879 TAATTCTATAGGTATTCCCCTTTGCCATAGATGTTACACCAAGAAAGAACACATTGAATC 42341938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TAATTCTATAGGTATTCCCCTTTGCCATAGATGTTACACCAAGAAAGAACACATTGAATC 240

 42341939 AAGCAAATTTAAGCTGGGTTTTTGTTTTTGTTTTTTGGTGGTGGGGGGGATGATTTATAA 42341998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAGCAAATTTAAGCTGGGTTTTTGTTTTTGTTTTTTGGTGGTGGGGGGGATGATTTATAA 300

 42341999 GCAGGACTTCCCAAAGCTTTTAATATGCTTATATATGTGGCAGTGTTGAGAGGGGAAGAT 42342058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GCAGGACTTCCCAAAGCTTTTAATATGCTTATATATGTGGCAGTGTTGAGAGGGGAAGAT 360

 42342059 TTGATATTCCAAGTATTTTTGGCCACAGAACTCTTTTTATCATGGAACATTTCCAGTGTT 42342118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTGATATTCCAAGTATTTTTGGCCACAGAACTCTTTTTATCATGGAACATTTCCAGTGTT 420

 42342119 CCATGAGACACAATTAGGGGCTAGTGAGCCACTGACTTTTGAGTTGGAAAGTGACACATG 42342178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCATGAGACACAATTAGGGGCTAGTGAGCCACTGACTTTTGAGTTGGAAAGTGACACATG 480

 42342179 GGGAAAGCAAAGTTTTGGAAGATTGATCTCACGGTAGAATATAAGGTGAACAGGAGAGAA 42342238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GGGAAAGCAAAGTTTTGGAAGATTGATCTCACGGTAGAATATAAGGTGAACAGGAGAGAA 540

 42342239 AAGAGCCTGGATTCAGGCAACACAATCAGATGATTGGATACAGGCTCAAGATTAGGGGGT 42342298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAGAGCCTGGATTCAGGCAACACAATCAGATGATTGGATACAGGCTCAAGATTAGGGGGT 600

 42342299 GGGTTGCACTACACTGGAGCGGAGAATGGAGAGCAAAAGCACTGATTGAATGCACAGTCT 42342358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GGGTTGCACTACACTGGAGCGGAGAATGGAGAGCAAAAGCACTGATTGAATGCACAGTCT 660

 42342359 TCTGTTGGATCCTGGGATGATACAGAAGTGTCAGAGTTCCTGGGTCTTGTAGGAGTTCCA 42342418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCTGTTGGATCCTGGGATGATACAGAAGTGTCAGAGTTCCTGGGTCTTGTAGGAGTTCCA 720

 42342419 ATGAGCATCAATCAAAAGTTTGATTGTAAGGCACAGAAATCAACTTGGACCAGCTAAAGC 42342478
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATGCGCATCAATCAAAAGTTTGATTGTAAGGCACAGAAATCAACTTGGACCAGCTAAAGC 780

 42342479 AAAAAGACCATTTTTAGGGAAATAGGGATGTGTCACAAAGAACTGCATCTAGGTACTGGA 42342538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAAAAGACCATTTTTAGGGAAATAGGGATGTGTCACAAAGAACTGCATCTAGGTACTGGA 840

 42342539 AATCAACAAAAAGTTCCCCATCTGATCTCAGCTTCTCTGTGTGTCTACTACATACACTAT 42342598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AATCAACAAAAAGTTCCCCATCTGATCTCAGCTTCTCTGTGTGTCTACTACATACACTAT 900

 42342599 CTTTCTCCTCTTTTCTTTCCTCTCTACCCCCTACCTCCCTCCTCTCTCTTTTTTTTTTTT 42342658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTTTCTCCTCTTTTCTTTCCTCTCTACCCCCTACCTCCCTCCTCTCTCTTTTTTTTTTTT 960

 42342659 TTTTTGTTTTTTGGTTTTTTTATGTTTGTTTGTTTGCTTTTGGAGACACGGTCTCCCTCT 42342718
               |||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
      961 -----GTTTTTTGGTTTTTTTATGTTTGTTTGTTTGTTTTTGGAGACACGGTCTCCCTCT 1015

 42342719 GTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCTTAATTACTGCAGCCTCAATCTCCTGGGCTCAAGT 42342778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1016 GTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCTTAATTACTGCAGCCTCAATCTCCTGGGCTCAAGT 1075

 42342779 GACCCTCCCACCTCAGCCTCCTGAATAGCTGGGACCACAGGTGCAAGCCACAGTGCTCAG 42342838
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1076 GACCCTCCCACTTCAGCCTCCTGAATAGCTGGGACCACAGGTGCAAGCCACAGTGCTCAG 1135

 42342839 CTAATTAAAAAAAATTTTTTTTTCAGAGATGGGGTCTCACTATGTTGTCCAGGCTGGTCT 42342898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1136 CTAATTAAAAAAAATTTTTTTTTCAGAGATGGGGTCTCACTATGTTGTCCAGGCTGGTCT 1195

 42342899 CAAACTCCTAGGCTCAAGCAGTCCTCCCGTTTCAGCCTCAAAAAGTGCTGGGATTACAGG 42342958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1196 CAAACTCCTAGGCTCAAGCAGTCCTCCCGTTTCAGCCTCAAAAAGTGCTGGGATTACAGG 1255

 42342959 TGTGAGCCATCGCACTCCACCTTCTCTATAGTTACTGAGTTTGCGTGTTACACTGAGTTT 42343018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1256 TGTGAGCCATCGCACTCCACCTTCTCTATAGTTACTGAGTTTGCGTGTTACACTGAGTTT 1315

 42343019 ACATCTTACATTTCTAGCCATATCAGAAACGACCTCTGCACCTCTCTTTCCCAATTTGAG 42343078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1316 ACATCTTACATTTCTAGCCATATCAGAAACGACCTCTGCACCTCTCTTTCCCAATTTGAG 1375

 42343079 ATTTCTAATAGAAAGAATCTTGTTCACCCAGCTTGGGACTCATTGAGTTATGACCAGTGG 42343138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1376 ATTTCTAATAGAAAGAATCTTGTTCACCCAGCTTGGGACTCATTGAGTTATGACCAGTGG 1435

 42343139 GATAGATTTTAGAAGATAAACATGTCTATAGGGACTTACCGTGTGAATTAGTGGGGGAGC 42343198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1436 GATAGATTTTAGAAGATAAACATGTCTATAGGGACTTACCGTGTGAATTAGTGGGGGAGC 1495

 42343199 CGCTTACCAGGCAGAGGGGTCTGCTGTAAAGTGATACTGTGACTTTAAATTGAAAGTAAG 42343258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1496 CGCTTACCAGGCAGAGGGGTCTGCTGTAAAGTGATACTGTGACTTTAAATTGAAAGTAAG 1555

 42343259 CTTCTAGAAGAGTTGAAGAGGAGTGGATTATTGTTGAATGGATGTATAACTAATGAAGCT 42343318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1556 CTTCTAGAAGAGTTGAAGAGGAGTGGATTATTGTTGAATGGATGTATAACTAATGAAGCT 1615

 42343319 TTAAAGGAAGTTTATTAGAAAGTCCATGTCCTTGTCTCTTTCCCAAACTCCTTTAGTTCC 42343378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1616 TTAAAGGAAGTTTATTAGAAAGTCCATGTCCTTGTCTCTTTCCCAAACTCCTTTAGTTCC 1675

 42343379 CAAGTCCTGAAAGAATCTATGGATAAGGGAAGCAGAATACTATAGTGGTTAAGAGCACAT 42343438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1676 CAAGTCCTGAAAGAATCTATGGATAAGGGAAGCAGAATACTATAGTGGTTAAGAGCACAT 1735

 42343439 GCTCGAGGTTAAACTGTCTGTATTTTGGATCCTGGCCTTGAGGACTTGGGCAAGTTACGT 42343498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1736 GCTCGAGGTTAAACTGTCTGTATTTTGGATCCTGGCCTTGAGGACTTGGGCAAGTTACGT 1795

 42343499 GACCTGCCTGAGCCTCAGTTTCCTCACCTGTAATATGGGTATCACGAGGAATAAATAAGG 42343558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1796 GACCTGCCTGAGCCTCAGTTTCCTCACCTGTAATATGGGTATCACGAGGAATAAATAAGG 1855

 42343559 TAATATGTGTAAAGTGCTTGGCACAATGCTCTTGATAATGTTAGCAACATAATTTTGTAA 42343618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1856 TAATATGTGTAAAGTGCTTGGCACAATGCTCTTGATAATGTTAGCAACATAATTTTGTAA 1915

 42343619 TGAAAATTAACTGATGGGGCTGAAATGTGCATCAGCAGATCCAAATATCCTTGATAAACT 42343678
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     1916 TGAAAATTAACTGATGGGGCTGAAATGTGCATCAGCAGATCCAAATATCCTCGATAAACT 1975

 42343679 GGCCAAAAGAAAGATGAATTGGCAGAGAGGCAAGTGTTCATCTCAGTTCTCCAGATATCC 42343738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1976 GGCCAAAAGAAAGATGAATTGGCAGAGAGGCAAGTGTTCATCTCAGTTCTCCAGATATCC 2035

 42343739 CTGCAAATGTGGCCTCTGGAGTAGAAGATTTAGGGAGAAAAATAAGCCATGAAGCTCTTC 42343798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2036 CTGCAAATGTGGCCTCTGGAGTAGAAGATTTAGGGAGAAAAATAAGCCATGAAGCTCTTC 2095

 42343799 TGGCACCAACATGAACTTCAGGGATCATGGGACATTTGGGCCAGTAACATTCCTCTTTGT 42343858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2096 TGGCACCAACATGAACTTCAGGGATCATGGGACATTTGGGCCAGTAACATTCCTCTTTGT 2155

 42343859 TCCTAGAGATTTAATATCTACCTACCAACTAAATGGCCTTGATTTGGAGGAGAGAAGACA 42343918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2156 TCCTAGAGATTTAATATCTACCTACCAACTAAATGGCCTTGATTTGGAGGAGAGAAGACA 2215

 42343919 AGAAGAGGAATTGCTTTCAGCTGGTCCTTGCCTTTAACTAACCAGGGGTACAAAAATTTT 42343978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2216 AGAAGAGGAATTGCTTTCAGCTGGTCCTTGCCTTTAACTAACCAGGGGTACAAAAATTTT 2275

 42343979 AAAATACAAAGGAGACCATGTGTAAAACATTAGTTAAGCTCAGATATAAATCTAGTCTTT 42344038
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2276 AAAACACAAAGGAGACCATGTGTAAAACATTAGTTAAGCTCAGATATAAATCTAGTCTTT 2335

 42344039 GACCAGTCCAGAGCTAATCAATATGCTTTTCTACTCTCTTTGAACTTTTGAGTTTTCTGG 42344098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2336 GACCAGTCCAGAGCTAATCAATATGCTTTTCTACTCTCTTTGAACTTTTGAGTTTTCTGG 2395

 42344099 CAACAACAAAAATCCCAAACCTCATCCAAAACCGTAGTCCAGACAGCCCAGTTTCTGCAC 42344158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2396 CAACAACAAAAATCCCAAACCTCATCCAAAACCGTAGTCCAGACAGCCCAGTTTCTGCAC 2455

 42344159 TCCCTTCCTTGTGTCACATATTGTTGACAGAACTACTCCCGTTACCACATTCATTCCAGT 42344218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2456 TCCCTTCCTTGTGTCACATATTGTTGACAGAACTACTCCCGTTACCACATTCATTCCAGT 2515

 42344219 GGTGATTCAAATTCTTCTGCAGAAATGGACTTGAAAGACAGAAAACTGCTCCTGTAATCA 42344278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2516 GGTGATTCAAATTCTTCTGCAGAAATGGACTTGAAAGACAGAAAACTGCTCCTGTAATCA 2575

 42344279 CTTAATAAGGAATCTTGGATGAGGAATACAGAGCTATGAATATGGATTTACTCTTAGCCT 42344338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2576 CTTAATAAGGAATCTTGGATGAGGAATACAGAGCTATGAATATGGATTTACTCTTAGCCT 2635

 42344339 TTATGGATGCCTTTTTCTCAGTTATTTTCACTGAAAATCATGATGAACTGATTTAAATAT 42344398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2636 TTATGGATGCCTTTTTCTCAGTTATTTTCACTGAAAATCATGATGAACTGATTTAAATAT 2695

 42344399 CAAGGTAAACTGAGATGGAAAATTACCGATAATAAGAGTTTTCTGAAAATATAGATTGGC 42344458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2696 CAAGGTAAACTGAGATGGAAAATTACCGATAATAAGAGTTTTCTGAAAATATAGATTGGC 2755

 42344459 CTCTTTAAAGCACATCGAGTTTGTTTTGTTTAAATTACAAATTCACATATATTTGAAATG 42344518
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2756 CTCTTTAAAACACATCGAGTTTGTTTTGTTTAAATTACAAATTCACATATATTTGAAATG 2815

 42344519 TGTTTAAATGTGTCAGTTTTAGGCAAAACTAAACTATTTGATTCCTTTCCAAAAATCAGG 42344578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2816 TGTTTAAATGTGTCAGTTTTAGGCAAAACTAAACTATTTGATTCCTTTCCAAAAATCAGG 2875

 42344579 AATTTGCTTTGGAAAAAAACCATGCAGTTTGATTTACAAAGCAGAGCGGGGGGGAAGTAG 42344638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2876 AATTTGCTTTGGAAAAAAACCATGCAGTTTGATTTACAAAGCAGAGCGGGGGGGAAGTAG 2935

 42344639 TGGGTGAGAAAGACCCACCCAAAGGCTGCAGCCAGCTTCCCCAGGAAGATTCATAACCAT 42344698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2936 TGGGTGAGAAAGACCCACCCAAAGGCTGCAGCCAGCTTCCCCAGGAAGATTCATAACCAT 2995

 42344699 GCCACAATACTGTCCTTCAATTCGTTCCAACAGATTTTACTATAACTCTAAATCATTAGA 42344758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2996 GCCACAATACTGTCCTTCAATTCGTTCCAACAGATTTTACTATAACTCTAAATCATTAGA 3055

 42344759 AGCAACTGCTGCTATGACTAGTGCTATCTTTGCCTCAAAAAGAGGAAAAATCAGGACATA 42344818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3056 AGCAACTGCTGCTATGACTAGTGCTATCTTTGCCTCAAAAAGAGGAAAAATCAGGACATA 3115

 42344819 CAATATAATCCCCTCAGGATCTAGGAGAGAAATCAGCCCATTTGTCATAAGAACTGAAAA 42344878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3116 CAATATAATCCCCTCAGGATCTAGGAGAGAAATCAGCCCATTTGTCATAAGAACTGAAAA 3175

 42344879 CCTCAGCTAAATAGTATATGAAACATTGGTATTTCATACCTTGACATTACATATTTTTGA 42344938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3176 CCTCAGCTAAATAGTATATGAAACATTGGTATTTCATACCTTGACATTACATATTTTTGA 3235

 42344939 AAATAAAGTAAGCATACACACAAGAAGTGGCTAGATGCAGCAGTTATAAAGTGGCTTAAG 42344998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3236 AAATAAAGTAAGCATACACACAAGAAGTGGCTAGATGCAGCAGTTATAAAGTGGCTTAAG 3295

 42344999 TTGGGTTAACTAAATATAACCTAGAAAAACCATCTTATCTATTGCAAATTATTTCCAGAA 42345058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3296 TTGGGTTAACTAAATATAACCTAGAAAAACCATCTTATCTATTGCAAATTATTTCCAGAA 3355

 42345059 AAAGGTAAGAAAAATCCAACCAACACTTTTTAAACATCCTGAGCTATTCACAGCAAGTGA 42345118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3356 AAAGGTAAGAAAAATCCAACCAACACTTTTTAAACATCCTGAGCTATTCACAGCAAGTGA 3415

 42345119 ATCTTTACCCTTACCAGATGTATAAACATTTACATAAGGCAGGAGGTTCAACACTTGGAG 42345178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3416 ATCTTTACCCTTACCAGATGTATAAACATTTACATAAGGCAGGAGGTTCAACACTTGGAG 3475

 42345179 AGTGTAATCAAGGCAGTAGTAACGCAGTGCTCCTCTCTTTGACTTGAATGACTTCCTCCC 42345238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3476 AGTGTAATCAAGGCAGTAGTAACGCAGTGCTCCTCTCTTTGACTTGAATGACTTCCTCCC 3535

 42345239 CATTAGGGTCATTATTGTTTTGCAGTGTCCCAGGGATGAAAGGACTTTGAAAGGTCATGT 42345298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3536 CATTAGGGTCATTATTGTTTTGCAGTGTCCCAGGGATGAAAGGACTTTGAAAGGTCATGT 3595

 42345299 GTCTTGTGACCCAACTAGCAGCATCAGCATCACTGGGGAGAAACTCAAGCAGAAGCTTGA 42345358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3596 GTCTTGTGACCCAACTAGCAGCATCAGCATCACTGGGGAGAAACTCAAGCAGAAGCTTGA 3655

 42345359 GTCTACTCCACTCTTGCTGACACCAAATCTGCATTTTTACAGGATTCTTGGGTGAGTCAC 42345418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3656 GTCTACTCCACTCTTGCTGACACCAAATCTGCATTTTTACAGGATTCTTGGGTGAGTCAC 3715

 42345419 ACACATATTCAAGGTTAAAATATGCCACCCTAGGTCTTTCTCCTGCTTCTGAGCAAAACT 42345478
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3716 AGACATATTCAAGGTTAAAATATGCCACCCTAGGTCTTTCTCCTGCTTCTGAGCAAAACT 3775

 42345479 GGGCACAAGGGACAAACTAGTTTCCTTCAGCCACTTTCAAATCCTTTATAGAGTGTACTG 42345538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3776 GGGCACAAGGGACAAACTAGTTTCCTTCAGCCACTTTCAAATCCTTTATAGAGTGTACTG 3835

 42345539 TGTGAGTCACTGAGAGGAAAGAGGAAATAATACTTATTTAGGGAAGTCTTGCATAACTTA 42345598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3836 TGTGAGTCACTGAGAGGAAAGAGGAAATAATACTTATTTAGGGAAGTCTTGCATAACTTA 3895

 42345599 ACAAAGTTAGTAACTTCTTCAATACACTCAAGTACCTATTTTTGGAAGCCCTACAGGTTA 42345658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3896 ACAAAGTTAGTAACTTCTTCAATACACTCAAGTACCTATTTTTGGAAGCCCTACAGGTTA 3955

 42345659 GGTCAAAGTAAAGAGAAGCAAAAAATGGAGTGAGTTCTAGTAAAAAACTCTGACAAAATA 42345718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3956 GGTCAAAGTAAAGAGAAGCAAAAAATGGAGTGAGTTCTAGTAAAAAACTCTGACAAAATA 4015

 42345719 AGGGAAGTGTAGAAGCTGAGTCTATGAGGGATGAGAGAAGCAATTTACCAAATTATCAGA 42345778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4016 AGGGAAGTGTAGAAGCTGAGTCTATGAGGGATGAGAGAAGCAATTTACCAAATTATCAGA 4075

 42345779 TCCAAAATCATCTCTGCACTGTAGATGATTTATAGCCCTGGAAGCTTAGAGGCTTGAGTC 42345838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4076 TCCAAAATCATCTCTGCACTGTAGATGATTTATAGCCCTGGAAGCTTAGAGGCTTGAGTC 4135

 42345839 TCTTGCTGTATTTCATTTCAAATTAGTAATTTTTATCTAGGGCTTCCCTATGGCTTAAAG 42345898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4136 TCTTGCTGTATTTCATTTCAAATTAGTAATTTTTATCTAGGGCTTCCCTATGGCTTAAAG 4195

 42345899 TGAAGGCCCTGGAATTTCTGAAGTGAAATTATCTGATGATTTTTATGTATGGTCATTCTG 42345958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4196 TGAAGGCCCTGGAATTTCTGAAGTGAAATTATCTGATGATTTTTATGTATGGTCATTCTG 4255

 42345959 TAGTTATCCTGTAAGTTTCATATTTGTAACAAGACTGGAATCCGAACAATAGAAAACTCT 42346018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4256 TAGTTATCCTGTAAGTTTCATATTTGTAACAAGACTGGAATCCGAACAATAGAAAACTCT 4315

 42346019 GTGGCAGTAAGCCAAAACCTGATGGACTTAGGAGAGTTACGTATGTGTGTTTCAGTGGTC 42346078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4316 GTGGCAGTAAGCCAAAACCTGATGGACTTAGGAGAGTTACGTATGTGTGTTTCAGTGGTC 4375

 42346079 CTCAAATTCAGCTGCCTATTAGAATCACCTGGACTTTGAAAAAAAAAGAGCTTTCTTGAG 42346138
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4376 CTCAAATTTAGCTGCCTATTAGAATCACCTGGACTTTGAAAAAAAAAGAGCTTTCTTGAG 4435

 42346139 GTATAACTGACAAATAATAAGACAAACATATTTCAGTATACAATTGGATGAGTTTTGACA 42346198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4436 GTATAACTGACAAATAATAAGACAAACATATTTCAGTATACAATTGGATGAGTTTTGACA 4495

 42346199 TGTTATATTCTTGTGAAACCATCACCACAATCAAGCTATTCACCCCCCAAATTTTCGTGC 42346258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4496 TGTTATATTCTTGTGAAACCATCACCACAATCAAGCTATTCACCCCCCAAATTTTCGTGC 4555

 42346259 C 42346259
          |
     4556 C 4556

EXCISED REGION

 42347319 TTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTT 42347344
          ||||||||||||||||||||||||||
     4561 TTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTT 4586

Alignment time is 3.72113 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [42336259,42357318] =>     21060 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [       1,    2793] =>      2793 nucs 'mol-32-32f0-050398_2793'

Score:        2759
Aligned:      2792        nucs
Identic:      2789 (100%) nucs =>      1718 (100%)      1071 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [42344369,42346086] EXCISED REGION [42346088,42347160]
 second seq =>  [       1,    1718] EXCISED REGION [    1720,    2793]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [42346087,42346087]
 second seq =>         1 nucs [1719,1719]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [2419,2419]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [1717,1718] to [1718,1719]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 42344369 CTGAAAATCATGATGAACTGATTTAAATATCAAGGTAAACTGAGATGGAAAATTACCGAT 42344428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTGAAAATCATGATGAACTGATTTAAATATCAAGGTAAACTGAGATGGAAAATTACCGAT 60

 42344429 AATAAGAGTTTTCTGAAAATATAGATTGGCCTCTTTAAAGCACATCGAGTTTGTTTTGTT 42344488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AATAAGAGTTTTCTGAAAATATAGATTGGCCTCTTTAAAGCACATCGAGTTTGTTTTGTT 120

 42344489 TAAATTACAAATTCACATATATTTGAAATGTGTTTAAATGTGTCAGTTTTAGGCAAAACT 42344548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TAAATTACAAATTCACATATATTTGAAATGTGTTTAAATGTGTCAGTTTTAGGCAAAACT 180

 42344549 AAACTATTTGATTCCTTTCCAAAAATCAGGAATTTGCTTTGGAAAAAAACCATGCAGTTT 42344608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAACTATTTGATTCCTTTCCAAAAATCAGGAATTTGCTTTGGAAAAAAACCATGCAGTTT 240

 42344609 GATTTACAAAGCAGAGCGGGGGGGAAGTAGTGGGTGAGAAAGACCCACCCAAAGGCTGCA 42344668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GATTTACAAAGCAGAGCGGGGGGGAAGTAGTGGGTGAGAAAGACCCACCCAAAGGCTGCA 300

 42344669 GCCAGCTTCCCCAGGAAGATTCATAACCATGCCACAATACTGTCCTTCAATTCGTTCCAA 42344728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GCCAGCTTCCCCAGGAAGATTCATAACCATGCCACAATACTGTCCTTCAATTCGTTCCAA 360

 42344729 CAGATTTTACTATAACTCTAAATCATTAGAAGCAACTGCTGCTATGACTAGTGCTATCTT 42344788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CAGATTTTACTATAACTCTAAATCATTAGAAGCAACTGCTGCTATGACTAGTGCTATCTT 420

 42344789 TGCCTCAAAAAGAGGAAAAATCAGGACATACAATATAATCCCCTCAGGATCTAGGAGAGA 42344848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGCCTCAAAAAGAGGAAAAATCAGGACATACAATATAATCCCCTCAGGATCTAGGAGAGA 480

 42344849 AATCAGCCCATTTGTCATAAGAACTGAAAACCTCAGCTAAATAGTATATGAAACATTGGT 42344908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AATCAGCCCATTTGTCATAAGAACTGAAAACCTCAGCTAAATAGTATATGAAACATTGGT 540

 42344909 ATTTCATACCTTGACATTACATATTTTTGAAAATAAAGTAAGCATACACACAAGAAGTGG 42344968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATTTCATACCTTGACATTACATATTTTTGAAAATAAAGTAAGCATACACACAAGAAGTGG 600

 42344969 CTAGATGCAGCAGTTATAAAGTGGCTTAAGTTGGGTTAACTAAATATAACCTAGAAAAAC 42345028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTAGATGCAGCAGTTATAAAGTGGCTTAAGTTGGGTTAACTAAATATAACCTAGAAAAAC 660

 42345029 CATCTTATCTATTGCAAATTATTTCCAGAAAAAGGTAAGAAAAATCCAACCAACACTTTT 42345088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CATCTTATCTATTGCAAATTATTTCCAGAAAAAGGTAAGAAAAATCCAACCAACACTTTT 720

 42345089 TAAACATCCTGAGCTATTCACAGCAAGTGAATCTTTACCCTTACCAGATGTATAAACATT 42345148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TAAACATCCTGAGCTATTCACAGCAAGTGAATCTTTACCCTTACCAGATGTATAAACATT 780

 42345149 TACATAAGGCAGGAGGTTCAACACTTGGAGAGTGTAATCAAGGCAGTAGTAACGCAGTGC 42345208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TACATAAGGCAGGAGGTTCAACACTTGGAGAGTGTAATCAAGGCAGTAGTAACGCAGTGC 840

 42345209 TCCTCTCTTTGACTTGAATGACTTCCTCCCCATTAGGGTCATTATTGTTTTGCAGTGTCC 42345268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCCTCTCTTTGACTTGAATGACTTCCTCCCCATTAGGGTCATTATTGTTTTGCAGTGTCC 900

 42345269 CAGGGATGAAAGGACTTTGAAAGGTCATGTGTCTTGTGACCCAACTAGCAGCATCAGCAT 42345328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CAGGGATGAAAGGACTTTGAAAGGTCATGTGTCTTGTGACCCAACTAGCAGCATCAGCAT 960

 42345329 CACTGGGGAGAAACTCAAGCAGAAGCTTGAGTCTACTCCACTCTTGCTGACACCAAATCT 42345388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CACTGGGGAGAAACTCAAGCAGAAGCTTGAGTCTACTCCACTCTTGCTGACACCAAATCT 1020

 42345389 GCATTTTTACAGGATTCTTGGGTGAGTCACACACATATTCAAGGTTAAAATATGCCACCC 42345448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GCATTTTTACAGGATTCTTGGGTGAGTCACACACATATTCAAGGTTAAAATATGCCACCC 1080

 42345449 TAGGTCTTTCTCCTGCTTCTGAGCAAAACTGGGCACAAGGGACAAACTAGTTTCCTTCAG 42345508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TAGGTCTTTCTCCTGCTTCTGAGCAAAACTGGGCACAAGGGACAAACTAGTTTCCTTCAG 1140

 42345509 CCACTTTCAAATCCTTTATAGAGTGTACTGTGTGAGTCACTGAGAGGAAAGAGGAAATAA 42345568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CCACTTTCAAATCCTTTATAGAGTGTACTGTGTGAGTCACTGAGAGGAAAGAGGAAATAA 1200

 42345569 TACTTATTTAGGGAAGTCTTGCATAACTTAACAAAGTTAGTAACTTCTTCAATACACTCA 42345628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TACTTATTTAGGGAAGTCTTGCATAACTTAACAAAGTTAGTAACTTCTTCAATACACTCA 1260

 42345629 AGTACCTATTTTTGGAAGCCCTACAGGTTAGGTCAAAGTAAAGAGAAGCAAAAAATGGAG 42345688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AGTACCTATTTTTGGAAGCCCTACAGGTTAGGTCAAAGTAAAGAGAAGCAAAAAATGGAG 1320

 42345689 TGAGTTCTAGTAAAAAACTCTGACAAAATAAGGGAAGTGTAGAAGCTGAGTCTATGAGGG 42345748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGAGTTCTAGTAAAAAACTCTGACAAAATAAGGGAAGTGTAGAAGCTGAGTCTATGAGGG 1380

 42345749 ATGAGAGAAGCAATTTACCAAATTATCAGATCCAAAATCATCTCTGCACTGTAGATGATT 42345808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ATGAGAGAAGCAATTTACCAAATTATCAGATCCAAAATCATCTCTGCACTGTAGATGATT 1440

 42345809 TATAGCCCTGGAAGCTTAGAGGCTTGAGTCTCTTGCTGTATTTCATTTCAAATTAGTAAT 42345868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TATAGCCCTGGAAGCTTAGAGGCTTGAGTCTCTTGCTGTATTTCATTTCAAATTAGTAAT 1500

 42345869 TTTTATCTAGGGCTTCCCTATGGCTTAAAGTGAAGGCCCTGGAATTTCTGAAGTGAAATT 42345928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTTTATCTAGGGCTTCCCTATGGCTTAAAGTGAAGGCCCTGGAATTTCTGAAGTGAAATT 1560

 42345929 ATCTGATGATTTTTATGTATGGTCATTCTGTAGTTATCCTGTAAGTTTCATATTTGTAAC 42345988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ATCTGATGATTTTTATGTATGGTCATTCTGTAGTTATCCTGTAAGTTTCATATTTGTAAC 1620

 42345989 AAGACTGGAATCCGAACAATAGAAAACTCTGTGGCAGTAAGCCAAAACCTGATGGACTTA 42346048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AAGACTGGAATCCGAACAATAGAAAACTCTGTGGCAGTAAGCCAAAACCTGATGGACTTA 1680

 42346049 GGAGAGTTACGTATGTGTGTTTCAGTGGTCCTCAAATT 42346086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GGAGAGTTACGTATGTGTGTTTCAGTGGTCCTCAAATT 1718

EXCISED REGION

 42346088 AGCTGCCTATTAGAATCACCTGGACTTTGAAAAAAAAAGAGCTTTCTTGAGGTATAACTG 42346147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1720 AGCTGCCTATTAGAATCACCTGGACTTTGAAAAAAAAAGAGCTTTCTTGAGGTATAACTG 1779

 42346148 ACAAATAATAAGACAAACATATTTCAGTATACAATTGGATGAGTTTTGACATGTTATATT 42346207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1780 ACAAATAATAAGACAAACATATTTCAGTATACAATTGGATGAGTTTTGACATGTTATATT 1839

 42346208 CTTGTGAAACCATCACCACAATCAAGCTATTCACCCCCCAAATTTTCGTGCCCCTTTGTT 42346267
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1840 CTTGTGAAACCATCGCCACAATCAAGCTATTCACCCCCCAAATTTTCGTGCCCCTTTGTT 1899

 42346268 GTCCCACCCTTCTTTCTGCAACCACTGATCTGCTTTCTATCACTATGGATTAATTTGTAT 42346327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1900 GTCCCACCCTTCTTTCTGCAACCACTGATCTGCTTTCTATCACTATGGATTAATTTGTAT 1959

 42346328 TTTCTAGAAGCTTAAATAAGTGAAACCATATGGTGTGCATGTTTTGCAGGGAGAGGGCAG 42346387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1960 TTTCTAGAAGCTTAAATAAGTGAAACCATATGGTGTGCATGTTTTGCAGGGAGAGGGCAG 2019

 42346388 GGGGAGCTGGTTTCTTTCACTCGGTGTAATTGTTCTGAGAGTCATCCGTGTTTGCATGTG 42346447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2020 GGGGAGCTGGTTTCTTTCACTCGGTGTAATTGTTCTGAGAGTCATCCGTGTTTGCATGTG 2079

 42346448 TTAATAGTTTATTCTTTTTATCGGTAAGTAGTATCCCATTGTGTGGATGTACCACATGTT 42346507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2080 TTAATAGTTTATTCTTTTTATCGGTAAGTAGTATCCCATTGTGTGGATGTACCACATGTT 2139

 42346508 GTCTAACCATTCACAACTAAAGGATACTTGGGTTGTTTCTCATTTGGGGCAATTGAAAAT 42346567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2140 GTCTAACCATTCACAACTAAAGGATACTTGGGTTGTTTCTCATTTGGGGCAATTGAAAAT 2199

 42346568 AAGCAGTATAAACTGCTATAAACAGTCATGTACAGATATAAGCATGTATGTTTCCATTTT 42346627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2200 AAGCAGTATAAACTGCTATAAACAGTCATGTACAGATATAAGCATGTATGTTTCCATTTT 2259

 42346628 TCAAGGTAAATACCTAGAAGTGGGTATGGTAAGTGTATGTTTAACTTGAAAAGAAACTAC 42346687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2260 TCAAGGTAAATACCTAGAAGTGGGTATGGTAAGTGTATGTTTAACTTGAAAAGAAACTAC 2319

 42346688 CAAAATGTTTCCAAAGTGGTTGTACCATTTTGCTTACCTACCAGAAATGTGTAAGAGTTC 42346747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2320 CAAAATGTTTCCAAAGTGGTTGTACCATTTTGCTTACCTACCAGAAATGTGTAAGAGTTC 2379

 42346748 TAGTTACTCCACATACTTCCTAGCAGTTGATATTCTCAG-TTTTTTTTTTTATTTTAACC 42346806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
     2380 TAGTTACTCCACATACTTCCTAGCAGTTGATATTCTCAGTTTTTTTTTTTTATTTTAACC 2439

 42346807 GTTCTAATAGCTGTGTAATGGTATTCCATTACAGTACTAATTTAAATTTCCCTAATAACT 42346866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     2440 GTTCTAATAGCTGTGTAATGGTATTCCATTACGGTACTAATTTAAATTTCCCTAATAACT 2499

 42346867 ACTGAGGTTGAAAAAATCTTTCATGGGCATATTTGCCATCCTTGTATCTTCTCTGGTGAC 42346926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2500 ACTGAGGTTGAAAAAATCTTTCATGGGCATATTTGCCATCCTTGTATCTTCTCTGGTGAC 2559

 42346927 GAATCTTTCATGCCTTCTGCTTATATTTTAACCAGGGTTTTGTTTTGCTTTTTCTTAACT 42346986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2560 GAATCTTTCATGCCTTCTGCTTATATTTTAACCAGGGTTTTGTTTTGCTTTTTCTTAACT 2619

 42346987 GTTGAGTTTTAAGAGTCTATATATACTGCAAACAACTCCTTGGTAAGATATATGATTGGC 42347046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2620 GTTGAGTTTTAAGAGTCTATATATACTGCAAACAACTCCTTGGTAAGATATATGATTGGC 2679

 42347047 AAATCCTTTCTCCTAATCTTTTTATTTCCTTAACAATGCCTTTCAAGAACAGAAATTCTT 42347106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2680 AAATCCTTTCTCCTAATCTTTTTATTTCCTTAACAATGCCTTTCAAGAACAGAAATTCTT 2739

 42347107 AATTTGATGCAATGCAATTTATTAGTTTTCTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTT 42347160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2740 AATTTGATGCAATGCAATTTATTAGTTTTCTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTT 2793

Alignment time is 2.04997 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [42336259,42357318] =>     21060 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [       1,    4073] =>      4073 nucs 'mol-32-32f0-170525_4073'

Score:        4017
Aligned:      4072        nucs
Identic:      4067 (100%) nucs =>       592 (100%)      3475 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [42343045,42343636] EXCISED REGION [42343638,42347116]
 second seq =>  [       1,     592] EXCISED REGION [     594,    4073]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [42343637,42343637]
 second seq =>         1 nucs [593,593]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [3743,3743]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [42343634,42343636] to [42343635,42343637]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 42343045 AAACGACCTCTGCACCTCTCTTTCCCAATTTGAGATTTCTAATAGAAAGAATCTTGTTCA 42343104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAACGACCTCTGCACCTCTCTTTCCCAATTTGAGATTTCTAATAGAAAGAATCTTGTTCA 60

 42343105 CCCAGCTTGGGACTCATTGAGTTATGACCAGTGGGATAGATTTTAGAAGATAAACATGTC 42343164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCCAGCTTGGGACTCATTGAGTTATGACCAGTGGGATAGATTTTAGAAGATAAACATGTC 120

 42343165 TATAGGGACTTACCGTGTGAATTAGTGGGGGAGCCGCTTACCAGGCAGAGGGGTCTGCTG 42343224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TATAGGGACTTACCGTGTGAATTAGTGGGGGAGCCGCTTACCAGGCAGAGGGGTCTGCTG 180

 42343225 TAAAGTGATACTGTGACTTTAAATTGAAAGTAAGCTTCTAGAAGAGTTGAAGAGGAGTGG 42343284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TAAAGTGATACTGTGACTTTAAATTGAAAGTAAGCTTCTAGAAGAGTTGAAGAGGAGTGG 240

 42343285 ATTATTGTTGAATGGATGTATAACTAATGAAGCTTTAAAGGAAGTTTATTAGAAAGTCCA 42343344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATTATTGTTGAATGGATGTATAACTAATGAAGCTTTAAAGGAAGTTTATTAGAAAGTCCA 300

 42343345 TGTCCTTGTCTCTTTCCCAAACTCCTTTAGTTCCCAAGTCCTGAAAGAATCTATGGATAA 42343404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGTCCTTGTCTCTTTCCCAAACTCCTTTAGTTCCCAAGTCCTGAAAGAATCTATGGATAA 360

 42343405 GGGAAGCAGAATACTATAGTGGTTAAGAGCACATGCTCGAGGTTAAACTGTCTGTATTTT 42343464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGGAAGCAGAATACTATAGTGGTTAAGAGCACATGCTCGAGGTTAAACTGTCTGTATTTT 420

 42343465 GGATCCTGGCCTTGAGGACTTGGGCAAGTTACGTGACCTGCCTGAGCCTCAGTTTCCTCA 42343524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGATCCTGGCCTTGAGGACTTGGGCAAGTTACGTGACCTGCCTGAGCCTCAGTTTCCTCA 480

 42343525 CCTGTAATATGGGTATCACGAGGAATAAATAAGGTAATATGTGTAAAGTGCTTGGCACAA 42343584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCTGTAATATGGGTATCACGAGGAATAAATAAGGTAATATGTGTAAAGTGCTTGGCACAA 540

 42343585 TGCTCTTGATAATGTTAGCAACATAATTTTGTAATGAAAATTAACTGATGGG 42343636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGCTCTTGATAATGTTAGCAACATAATTTTGTAATGAAAATTAACTGATGGG 592

EXCISED REGION

 42343638 CTGAAATGTGCATCAGCAGATCCAAATATCCTTGATAAACTGGCCAAAAGAAAGATGAAT 42343697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      594 CTGAAATGTGCATCAGCAGATCCAAATATCCTTGATAAACTGGCCAAAAGAAAGATGAAT 653

 42343698 TGGCAGAGAGGCAAGTGTTCATCTCAGTTCTCCAGATATCCCTGCAAATGTGGCCTCTGG 42343757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      654 TGGCAGAGAGGCAAGTGTTCATCTCAGTTCTCCAGATATCCCTGCAAATGTGGCCTCTGG 713

 42343758 AGTAGAAGATTTAGGGAGAAAAATAAGCCATGAAGCTCTTCTGGCACCAACATGAACTTC 42343817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      714 AGTAGAAGATTTAGGGAGAAAAATAAGCCATGAAGCTCTTCTGGCACCAACATGAACTTC 773

 42343818 AGGGATCATGGGACATTTGGGCCAGTAACATTCCTCTTTGTTCCTAGAGATTTAATATCT 42343877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      774 AGGGATCATGGGACATTTGGGCCAGTAACATTCCTCTTTGTTCCTAGAGATTTAATATCT 833

 42343878 ACCTACCAACTAAATGGCCTTGATTTGGAGGAGAGAAGACAAGAAGAGGAATTGCTTTCA 42343937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      834 ACCTACCAACTAAATGGCCTTGATTTGGAGGAGAGAAGACAAGAAGAGGAATTGCTTTCA 893

 42343938 GCTGGTCCTTGCCTTTAACTAACCAGGGGTACAAAAATTTTAAAATACAAAGGAGACCAT 42343997
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
      894 GCTGGTCCTTGCCTTTAACTAACCAGGGGTACAAAAATTTTAAAACACAAAGGAGACCAT 953

 42343998 GTGTAAAACATTAGTTAAGCTCAGATATAAATCTAGTCTTTGACCAGTCCAGAGCTAATC 42344057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      954 GTGTAAAACATTAGTTAAGCTCAGATATAAATCTAGTCTTTGACCAGTCCAGAGCTAATC 1013

 42344058 AATATGCTTTTCTACTCTCTTTGAACTTTTGAGTTTTCTGGCAACAACAAAAATCCCAAA 42344117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1014 AATATGCTTTTCTACTCTCTTTGAACTTTTGAGTTTTCTGGCAACAACAAAAATCCCAAA 1073

 42344118 CCTCATCCAAAACCGTAGTCCAGACAGCCCAGTTTCTGCACTCCCTTCCTTGTGTCACAT 42344177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1074 CCTCATCCAAAACCGTAGTCCAGACAGCCCAGTTTCTGCACTCCCTTCCTTGTGTCACAT 1133

 42344178 ATTGTTGACAGAACTACTCCCGTTACCACATTCATTCCAGTGGTGATTCAAATTCTTCTG 42344237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1134 ATTGTTGACAGAACTACTCCCGTTACCACATTCATTCCAGTGGTGATTCAAATTCTTCTG 1193

 42344238 CAGAAATGGACTTGAAAGACAGAAAACTGCTCCTGTAATCACTTAATAAGGAATCTTGGA 42344297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1194 CAGAAATGGACTTGAAAGACAGAAAACTGCTCCTGTAATCACTTAATAAGGAATCTTGGA 1253

 42344298 TGAGGAATACAGAGCTATGAATATGGATTTACTCTTAGCCTTTATGGATGCCTTTTTCTC 42344357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1254 TGAGGAATACAGAGCTATGAATATGGATTTACTCTTAGCCTTTATGGATGCCTTTTTCTC 1313

 42344358 AGTTATTTTCACTGAAAATCATGATGAACTGATTTAAATATCAAGGTAAACTGAGATGGA 42344417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1314 AGTTATTTTCACTGAAAATCATGATGAACTGATTTAAATATCAAGGTAAACTGAGATGGA 1373

 42344418 AAATTACCGATAATAAGAGTTTTCTGAAAATATAGATTGGCCTCTTTAAAGCACATCGAG 42344477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1374 AAATTACCGATAATAAGAGTTTTCTGAAAATATAGATTGGCCTCTTTAAAGCACATCGAG 1433

 42344478 TTTGTTTTGTTTAAATTACAAATTCACATATATTTGAAATGTGTTTAAATGTGTCAGTTT 42344537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1434 TTTGTTTTGTTTAAATTACAAATTCACATATATTTGAAATGTGTTTAAATGTGTCAGTTT 1493

 42344538 TAGGCAAAACTAAACTATTTGATTCCTTTCCAAAAATCAGGAATTTGCTTTGGAAAAAAA 42344597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1494 TAGGCAAAACTAAACTATTTGATTCCTTTCCAAAAATCAGGAATTTGCTTTGGAAAAAAA 1553

 42344598 CCATGCAGTTTGATTTACAAAGCAGAGCGGGGGGGAAGTAGTGGGTGAGAAAGACCCACC 42344657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1554 CCATGCAGTTTGATTTACAAAGCAGAGCGGGGGGGAAGTAGTGGGTGAGAAAGACCCACC 1613

 42344658 CAAAGGCTGCAGCCAGCTTCCCCAGGAAGATTCATAACCATGCCACAATACTGTCCTTCA 42344717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1614 CAAAGGCTGCAGCCAGCTTCCCCAGGAAGATTCATAACCATGCCACAATACTGTCCTTCA 1673

 42344718 ATTCGTTCCAACAGATTTTACTATAACTCTAAATCATTAGAAGCAACTGCTGCTATGACT 42344777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1674 ATTCGTTCCAACAGATTTTACTATAACTCTAAATCATTAGAAGCAACTGCTGCTATGACT 1733

 42344778 AGTGCTATCTTTGCCTCAAAAAGAGGAAAAATCAGGACATACAATATAATCCCCTCAGGA 42344837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1734 AGTGCTATCTTTGCCTCAAAAAGAGGAAAAATCAGGACATACAATATAATCCCCTCAGGA 1793

 42344838 TCTAGGAGAGAAATCAGCCCATTTGTCATAAGAACTGAAAACCTCAGCTAAATAGTATAT 42344897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1794 TCTAGGAGAGAAATCAGCCCATTTGTCATAAGAACTGAAAACCTCAGCTAAATAGTATAT 1853

 42344898 GAAACATTGGTATTTCATACCTTGACATTACATATTTTTGAAAATAAAGTAAGCATACAC 42344957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1854 GAAACATTGGTATTTCATACCTTGACATTACATATTTTTGAAAATAAAGTAAGCATACAC 1913

 42344958 ACAAGAAGTGGCTAGATGCAGCAGTTATAAAGTGGCTTAAGTTGGGTTAACTAAATATAA 42345017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1914 ACAAGAAGTGGCTAGATGCAGCAGTTATAAAGTGGCTTAAGTTGGGTTAACTAAATATAA 1973

 42345018 CCTAGAAAAACCATCTTATCTATTGCAAATTATTTCCAGAAAAAGGTAAGAAAAATCCAA 42345077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1974 CCTAGAAAAACCATCTTATCTATTGCAAATTATTTCCAGAAAAAGGTAAGAAAAATCCAA 2033

 42345078 CCAACACTTTTTAAACATCCTGAGCTATTCACAGCAAGTGAATCTTTACCCTTACCAGAT 42345137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2034 CCAACACTTTTTAAACATCCTGAGCTATTCACAGCAAGTGAATCTTTACCCTTACCAGAT 2093

 42345138 GTATAAACATTTACATAAGGCAGGAGGTTCAACACTTGGAGAGTGTAATCAAGGCAGTAG 42345197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2094 GTATAAACATTTACATAAGGCAGGAGGTTCAACACTTGGAGAGTGTAATCAAGGCAGTAG 2153

 42345198 TAACGCAGTGCTCCTCTCTTTGACTTGAATGACTTCCTCCCCATTAGGGTCATTATTGTT 42345257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2154 TAACGCAGTGCTCCTCTCTTTGACTTGAATGACTTCCTCCCCATTAGGGTCATTATTGTT 2213

 42345258 TTGCAGTGTCCCAGGGATGAAAGGACTTTGAAAGGTCATGTGTCTTGTGACCCAACTAGC 42345317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2214 TTGCAGTGTCCCAGGGATGAAAGGACTTTGAAAGGTCATGTGTCTTGTGACCCAACTAGC 2273

 42345318 AGCATCAGCATCACTGGGGAGAAACTCAAGCAGAAGCTTGAGTCTACTCCACTCTTGCTG 42345377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2274 AGCATCAGCATCACTGGGGAGAAACTCAAGCAGAAGCTTGAGTCTACTCCACTCTTGCTG 2333

 42345378 ACACCAAATCTGCATTTTTACAGGATTCTTGGGTGAGTCACACACATATTCAAGGTTAAA 42345437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2334 ACACCAAATCTGCATTTTTACAGGATTCTTGGGTGAGTCACACACATATTCAAGGTTAAA 2393

 42345438 ATATGCCACCCTAGGTCTTTCTCCTGCTTCTGAGCAAAACTGGGCACAAGGGACAAACTA 42345497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2394 ATATGCCACCCTAGGTCTTTCTCCTGCTTCTGAGCAAAACTGGGCACAAGGGACAAACTA 2453

 42345498 GTTTCCTTCAGCCACTTTCAAATCCTTTATAGAGTGTACTGTGTGAGTCACTGAGAGGAA 42345557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2454 GTTTCCTTCAGCCACTTTCAAATCCTTTATAGAGTGTACTGTGTGAGTCACTGAGAGGAA 2513

 42345558 AGAGGAAATAATACTTATTTAGGGAAGTCTTGCATAACTTAACAAAGTTAGTAACTTCTT 42345617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2514 AGAGGAAATAATACTTATTTAGGGAAGTCTTGCATAACTTAACAAAGTTAGTAACTTCTT 2573

 42345618 CAATACACTCAAGTACCTATTTTTGGAAGCCCTACAGGTTAGGTCAAAGTAAAGAGAAGC 42345677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2574 CAATACACTCAAGTACCTATTTTTGGAAGCCCTACAGGTTAGGTCAAAGTAAAGAGAAGC 2633

 42345678 AAAAAATGGAGTGAGTTCTAGTAAAAAACTCTGACAAAATAAGGGAAGTGTAGAAGCTGA 42345737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2634 AAAAAATGGAGTGAGTTCTAGTAAAAAACTCTGACAAAATAAGGGAAGTGTAGAAGCTGA 2693

 42345738 GTCTATGAGGGATGAGAGAAGCAATTTACCAAATTATCAGATCCAAAATCATCTCTGCAC 42345797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2694 GTCTATGAGGGATGAGAGAAGCAATTTACCAAATTATCAGATCCAAAATCATCTCTGCAC 2753

 42345798 TGTAGATGATTTATAGCCCTGGAAGCTTAGAGGCTTGAGTCTCTTGCTGTATTTCATTTC 42345857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2754 TGTAGATGATTTATAGCCCTGGAAGCTTAGAGGCTTGAGTCTCTTGCTGTATTTCATTTC 2813

 42345858 AAATTAGTAATTTTTATCTAGGGCTTCCCTATGGCTTAAAGTGAAGGCCCTGGAATTTCT 42345917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2814 AAATTAGTAATTTTTATCTAGGGCTTCCCTATGGCTTAAAGTGAAGGCCCTGGAATTTCT 2873

 42345918 GAAGTGAAATTATCTGATGATTTTTATGTATGGTCATTCTGTAGTTATCCTGTAAGTTTC 42345977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2874 GAAGTGAAATTATCTGATGATTTTTATGTATGGTCATTCTGTAGTTATCCTGTAAGTTTC 2933

 42345978 ATATTTGTAACAAGACTGGAATCCGAACAATAGAAAACTCTGTGGCAGTAAGCCAAAACC 42346037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2934 ATATTTGTAACAAGACTGGAATCCGAACAATAGAAAACTCTGTGGCAGTAAGCCAAAACC 2993

 42346038 TGATGGACTTAGGAGAGTTACGTATGTGTGTTTCAGTGGTCCTCAAATTCAGCTGCCTAT 42346097
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     2994 TGATGGACTTAGGAGAGTTACGTATGTGTGTTTCAGTGGTCCTCAAATTTAGCTGCCTAT 3053

 42346098 TAGAATCACCTGGACTTTGAAAAAAAAAGAGCTTTCTTGAGGTATAACTGACAAATAATA 42346157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3054 TAGAATCACCTGGACTTTGAAAAAAAAAGAGCTTTCTTGAGGTATAACTGACAAATAATA 3113

 42346158 AGACAAACATATTTCAGTATACAATTGGATGAGTTTTGACATGTTATATTCTTGTGAAAC 42346217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3114 AGACAAACATATTTCAGTATACAATTGGATGAGTTTTGACATGTTATATTCTTGTGAAAC 3173

 42346218 CATCACCACAATCAAGCTATTCACCCCCCAAATTTTCGTGCCCCTTTGTTGTCCCACCCT 42346277
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3174 CATCGCCACAATCAAGCTATTCACCCCCCAAATTTTCGTGCCCCTTTGTTGTCCCACCCT 3233

 42346278 TCTTTCTGCAACCACTGATCTGCTTTCTATCACTATGGATTAATTTGTATTTTCTAGAAG 42346337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3234 TCTTTCTGCAACCACTGATCTGCTTTCTATCACTATGGATTAATTTGTATTTTCTAGAAG 3293

 42346338 CTTAAATAAGTGAAACCATATGGTGTGCATGTTTTGCAGGGAGAGGGCAGGGGGAGCTGG 42346397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3294 CTTAAATAAGTGAAACCATATGGTGTGCATGTTTTGCAGGGAGAGGGCAGGGGGAGCTGG 3353

 42346398 TTTCTTTCACTCGGTGTAATTGTTCTGAGAGTCATCCGTGTTTGCATGTGTTAATAGTTT 42346457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3354 TTTCTTTCACTCGGTGTAATTGTTCTGAGAGTCATCCGTGTTTGCATGTGTTAATAGTTT 3413

 42346458 ATTCTTTTTATCGGTAAGTAGTATCCCATTGTGTGGATGTACCACATGTTGTCTAACCAT 42346517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3414 ATTCTTTTTATCGGTAAGTAGTATCCCATTGTGTGGATGTACCACATGTTGTCTAACCAT 3473

 42346518 TCACAACTAAAGGATACTTGGGTTGTTTCTCATTTGGGGCAATTGAAAATAAGCAGTATA 42346577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3474 TCACAACTAAAGGATACTTGGGTTGTTTCTCATTTGGGGCAATTGAAAATAAGCAGTATA 3533

 42346578 AACTGCTATAAACAGTCATGTACAGATATAAGCATGTATGTTTCCATTTTTCAAGGTAAA 42346637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3534 AACTGCTATAAACAGTCATGTACAGATATAAGCATGTATGTTTCCATTTTTCAAGGTAAA 3593

 42346638 TACCTAGAAGTGGGTATGGTAAGTGTATGTTTAACTTGAAAAGAAACTACCAAAATGTTT 42346697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3594 TACCTAGAAGTGGGTATGGTAAGTGTATGTTTAACTTGAAAAGAAACTACCAAAATGTTT 3653

 42346698 CCAAAGTGGTTGTACCATTTTGCTTACCTACCAGAAATGTGTAAGAGTTCTAGTTACTCC 42346757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3654 CCAAAGTGGTTGTACCATTTTGCTTACCTACCAGAAATGTGTAAGAGTTCTAGTTACTCC 3713

 42346758 ACATACTTCCTAGCAGTTGATATTCTCAG-TTTTTTTTTTTATTTTAACCGTTCTAATAG 42346816
          ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
     3714 ACATACTTCCTAGCAGTTGATATTCTCAGTTTTTTTTTTTTATTTTAACCGTTCTAATAG 3773

 42346817 CTGTGTAATGGTATTCCATTACAGTACTAATTTAAATTTCCCTAATAACTACTGAGGTTG 42346876
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3774 CTGTGTAATGGTATTCCATTACGGTACTAATTTAAATTTCCCTAATAACTACTGAGGTTG 3833

 42346877 AAAAAATCTTTCATGGGCATATTTGCCATCCTTGTATCTTCTCTGGTGACGAATCTTTCA 42346936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3834 AAAAAATCTTTCATGGGCATATTTGCCATCCTTGTATCTTCTCTGGTGACGAATCTTTCA 3893

 42346937 TGCCTTCTGCTTATATTTTAACCAGGGTTTTGTTTTGCTTTTTCTTAACTGTTGAGTTTT 42346996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3894 TGCCTTCTGCTTATATTTTAACCAGGGTTTTGTTTTGCTTTTTCTTAACTGTTGAGTTTT 3953

 42346997 AAGAGTCTATATATACTGCAAACAACTCCTTGGTAAGATATATGATTGGCAAATCCTTTC 42347056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3954 AAGAGTCTATATATACTGCAAACAACTCCTTGGTAAGATATATGATTGGCAAATCCTTTC 4013

 42347057 TCCTAATCTTTTTATTTCCTTAACAATGCCTTTCAAGAACAGAAATTCTTAATTTGATGC 42347116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4014 TCCTAATCTTTTTATTTCCTTAACAATGCCTTTCAAGAACAGAAATTCTTAATTTGATGC 4073

Alignment time is 3.31332 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [42336259,42357318] =>     21060 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [       1,    3515] =>      3515 nucs 'mol-32-32fb-006787_3515'

Score:        3429
Aligned:      3506        nucs
Identic:      3499 (100%) nucs =>       915 (100%)      2584 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [42342747,42343663] EXCISED REGION [42343671,42346259]
 second seq =>  [       1,     917] EXCISED REGION [     925,    3513]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         7 nucs [42343664,42343670]
 second seq =>         7 nucs [918,924]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [42343664,42343664] to [42343670,42343670]
 second seq =>         1 nucs [918,918] to [924,924]

 42342747 ATTACTGCAGCCTCAATCTCCTGGGCTCAAGTGACCCTCCCACCTCAGCCTCCTGAATAG 42342806
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
        1 ATTACTGCAGCCTCAATCTCCTGGGCTCAAGTGACCCTCCCACTTCAGCCTCCTGAATAG 60

 42342807 CTGGGACCACAGGTGCAAGCCACAGTGCTCAGCTAATTAAAAAAAATTTTTTTTTCAGAG 42342866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTGGGACCACAGGTGCAAGCCACAGTGCTCAGCTAATTAAAAAAAATTTTTTTTTCAGAG 120

 42342867 ATGGGGTCTCACTATGTTGTCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTAGGCTCAAGCAGTCCTCCC 42342926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATGGGGTCTCACTATGTTGTCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTAGGCTCAAGCAGTCCTCCC 180

 42342927 GTTTCAGCCTCAAAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCATCGCACTCCACCTTCTCTA 42342986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTTTCAGCCTCAAAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCATCGCACTCCACCTTCTCTA 240

 42342987 TAGTTACTGAGTTTGCGTGTTACACTGAGTTTACATCTTACATTTCTAGCCATATCAGAA 42343046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TAGTTACTGAGTTTGCGTGTTACACTGAGTTTACATCTTACATTTCTAGCCATATCAGAA 300

 42343047 ACGACCTCTGCACCTCTCTTTCCCAATTTGAGATTTCTAATAGAAAGAATCTTGTTCACC 42343106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACGACCTCTGCACCTCTCTTTCCCAATTTGAGATTTCTAATAGAAAGAATCTTGTTCACC 360

 42343107 CAGCTTGGGACTCATTGAGTTATGACCAGTGGGATAGATTTTAGAAGATAAACATGTCTA 42343166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CAGCTTGGGACTCATTGAGTTATGACCAGTGGGATAGATTTTAGAAGATAAACATGTCTA 420

 42343167 TAGGGACTTACCGTGTGAATTAGTGGGGGAGCCGCTTACCAGGCAGAGGGGTCTGCTGTA 42343226
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
      421 TAGGGACTTACCGTGTGAATTAGTGGGGGAGCCGCATACCAGGCAGAGGGGTCTGCTGTA 480

 42343227 AAGTGATACTGTGACTTTAAATTGAAAGTAAGCTTCTAGAAGAGTTGAAGAGGAGTGGAT 42343286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAGTGATACTGTGACTTTAAATTGAAAGTAAGCTTCTAGAAGAGTTGAAGAGGAGTGGAT 540

 42343287 TATTGTTGAATGGATGTATAACTAATGAAGCTTTAAAGGAAGTTTATTAGAAAGTCCATG 42343346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TATTGTTGAATGGATGTATAACTAATGAAGCTTTAAAGGAAGTTTATTAGAAAGTCCATG 600

 42343347 TCCTTGTCTCTTTCCCAAACTCCTTTAGTTCCCAAGTCCTGAAAGAATCTATGGATAAGG 42343406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCCTTGTCTCTTTCCCAAACTCCTTTAGTTCCCAAGTCCTGAAAGAATCTATGGATAAGG 660

 42343407 GAAGCAGAATACTATAGTGGTTAAGAGCACATGCTCGAGGTTAAACTGTCTGTATTTTGG 42343466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GAAGCAGAATACTATAGTGGTTAAGAGCACATGCTCGAGGTTAAACTGTCTGTATTTTGG 720

 42343467 ATCCTGGCCTTGAGGACTTGGGCAAGTTACGTGACCTGCCTGAGCCTCAGTTTCCTCACC 42343526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATCCTGGCCTTGAGGACTTGGGCAAGTTACGTGACCTGCCTGAGCCTCAGTTTCCTCACC 780

 42343527 TGTAATATGGGTATCACGAGGAATAAATAAGGTAATATGTGTAAAGTGCTTGGCACAATG 42343586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGTAATATGGGTATCACGAGGAATAAATAAGGTAATATGTGTAAAGTGCTTGGCACAATG 840

 42343587 CTCTTGATAATGTTAGCAACATAATTTTGTAATGAAAATTAACTGATGGGGCTGAAATGT 42343646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTCTTGATAATGTTAGCAACATAATTTTGTAATGAAAATTAACTGATGGGGCTGAAATGT 900

 42343647 GCATCAGCAGATCCAAA 42343663
          |||||||||||||||||
      901 GCATCAGCAGATCCAAA 917

EXCISED REGION

 42343671 GATAAACTGGCCAAAAGAAAGATGAATTGGCAGAGAGGCAAGTGTTCATCTCAGTTCTCC 42343730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      925 GATAAACTGGCCAAAAGAAAGATGAATTGGCAGAGAGGCAAGTGTTCATCTCAGTTCTCC 984

 42343731 AGATATCCCTGCAAATGTGGCCTCTGGAGTAGAAGATTTAGGGAGAAAAATAAGCCATGA 42343790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      985 AGATATCCCTGCAAATGTGGCCTCTGGAGTAGAAGATTTAGGGAGAAAAATAAGCCATGA 1044

 42343791 AGCTCTTCTGGCACCAACATGAACTTCAGGGATCATGGGACATTTGGGCCAGTAACATTC 42343850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1045 AGCTCTTCTGGCACCAACATGAACTTCAGGGATCATGGGACATTTGGGCCAGTAACATTC 1104

 42343851 CTCTTTGTTCCTAGAGATTTAATATCTACCTACCAACTAAATGGCCTTGATTTGGAGGAG 42343910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1105 CTCTTTGTTCCTAGAGATTTAATATCTACCTACCAACTAAATGGCCTTGATTTGGAGGAG 1164

 42343911 AGAAGACAAGAAGAGGAATTGCTTTCAGCTGGTCCTTGCCTTTAACTAACCAGGGGTACA 42343970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1165 AGAAGACAAGAAGAGGAATTGCTTTCAGCTGGTCCTTGCCTTTAACTAACCAGGGGTACA 1224

 42343971 AAAATTTTAAAATACAAAGGAGACCATGTGTAAAACATTAGTTAAGCTCAGATATAAATC 42344030
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     1225 AAAATTTTAAAACACAAAGGAGACCATGTGTAAAGCATTAGTTAAGCTCAGATATAAATC 1284

 42344031 TAGTCTTTGACCAGTCCAGAGCTAATCAATATGCTTTTCTACTCTCTTTGAACTTTTGAG 42344090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1285 TAGTCTTTGACCAGTCCAGAGCTAATCAATATGCTTTTCTACTCTCTTTGAACTTTTGAG 1344

 42344091 TTTTCTGGCAACAACAAAAATCCCAAACCTCATCCAAAACCGTAGTCCAGACAGCCCAGT 42344150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1345 TTTTCTGGCAACAACAAAAATCCCAAACCTCATCCAAAACCGTAGTCCAGACAGCCCAGT 1404

 42344151 TTCTGCACTCCCTTCCTTGTGTCACATATTGTTGACAGAACTACTCCCGTTACCACATTC 42344210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1405 TTCTGCACTCCCTTCCTTGTGTCACATATTGTTGACAGAACTACTCCCGTTACCACATTC 1464

 42344211 ATTCCAGTGGTGATTCAAATTCTTCTGCAGAAATGGACTTGAAAGACAGAAAACTGCTCC 42344270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1465 ATTCCAGTGGTGATTCAAATTCTTCTGCAGAAATGGACTTGAAAGACAGAAAACTGCTCC 1524

 42344271 TGTAATCACTTAATAAGGAATCTTGGATGAGGAATACAGAGCTATGAATATGGATTTACT 42344330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1525 TGTAATCACTTAATAAGGAATCTTGGATGAGGAATACAGAGCTATGAATATGGATTTACT 1584

 42344331 CTTAGCCTTTATGGATGCCTTTTTCTCAGTTATTTTCACTGAAAATCATGATGAACTGAT 42344390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1585 CTTAGCCTTTATGGATGCCTTTTTCTCAGTTATTTTCACTGAAAATCATGATGAACTGAT 1644

 42344391 TTAAATATCAAGGTAAACTGAGATGGAAAATTACCGATAATAAGAGTTTTCTGAAAATAT 42344450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1645 TTAAATATCAAGGTAAACTGAGATGGAAAATTACCGATAATAAGAGTTTTCTGAAAATAT 1704

 42344451 AGATTGGCCTCTTTAAAGCACATCGAGTTTGTTTTGTTTAAATTACAAATTCACATATAT 42344510
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1705 AGATTGGCCTCTTTAAAACACATCGAGTTTGTTTTGTTTAAATTACAAATTCACATATAT 1764

 42344511 TTGAAATGTGTTTAAATGTGTCAGTTTTAGGCAAAACTAAACTATTTGATTCCTTTCCAA 42344570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1765 TTGAAATGTGTTTAAATGTGTCAGTTTTAGGCAAAACTAAACTATTTGATTCCTTTCCAA 1824

 42344571 AAATCAGGAATTTGCTTTGGAAAAAAACCATGCAGTTTGATTTACAAAGCAGAGCGGGGG 42344630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1825 AAATCAGGAATTTGCTTTGGAAAAAAACCATGCAGTTTGATTTACAAAGCAGAGCGGGGG 1884

 42344631 GGAAGTAGTGGGTGAGAAAGACCCACCCAAAGGCTGCAGCCAGCTTCCCCAGGAAGATTC 42344690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1885 GGAAGTAGTGGGTGAGAAAGACCCACCCAAAGGCTGCAGCCAGCTTCCCCAGGAAGATTC 1944

 42344691 ATAACCATGCCACAATACTGTCCTTCAATTCGTTCCAACAGATTTTACTATAACTCTAAA 42344750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1945 ATAACCATGCCACAATACTGTCCTTCAATTCGTTCCAACAGATTTTACTATAACTCTAAA 2004

 42344751 TCATTAGAAGCAACTGCTGCTATGACTAGTGCTATCTTTGCCTCAAAAAGAGGAAAAATC 42344810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2005 TCATTAGAAGCAACTGCTGCTATGACTAGTGCTATCTTTGCCTCAAAAAGAGGAAAAATC 2064

 42344811 AGGACATACAATATAATCCCCTCAGGATCTAGGAGAGAAATCAGCCCATTTGTCATAAGA 42344870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2065 AGGACATACAATATAATCCCCTCAGGATCTAGGAGAGAAATCAGCCCATTTGTCATAAGA 2124

 42344871 ACTGAAAACCTCAGCTAAATAGTATATGAAACATTGGTATTTCATACCTTGACATTACAT 42344930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2125 ACTGAAAACCTCAGCTAAATAGTATATGAAACATTGGTATTTCATACCTTGACATTACAT 2184

 42344931 ATTTTTGAAAATAAAGTAAGCATACACACAAGAAGTGGCTAGATGCAGCAGTTATAAAGT 42344990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2185 ATTTTTGAAAATAAAGTAAGCATACACACAAGAAGTGGCTAGATGCAGCAGTTATAAAGT 2244

 42344991 GGCTTAAGTTGGGTTAACTAAATATAACCTAGAAAAACCATCTTATCTATTGCAAATTAT 42345050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2245 GGCTTAAGTTGGGTTAACTAAATATAACCTAGAAAAACCATCTTATCTATTGCAAATTAT 2304

 42345051 TTCCAGAAAAAGGTAAGAAAAATCCAACCAACACTTTTTAAACATCCTGAGCTATTCACA 42345110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2305 TTCCAGAAAAAGGTAAGAAAAATCCAACCAACACTTTTTAAACATCCTGAGCTATTCACA 2364

 42345111 GCAAGTGAATCTTTACCCTTACCAGATGTATAAACATTTACATAAGGCAGGAGGTTCAAC 42345170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2365 GCAAGTGAATCTTTACCCTTACCAGATGTATAAACATTTACATAAGGCAGGAGGTTCAAC 2424

 42345171 ACTTGGAGAGTGTAATCAAGGCAGTAGTAACGCAGTGCTCCTCTCTTTGACTTGAATGAC 42345230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2425 ACTTGGAGAGTGTAATCAAGGCAGTAGTAACGCAGTGCTCCTCTCTTTGACTTGAATGAC 2484

 42345231 TTCCTCCCCATTAGGGTCATTATTGTTTTGCAGTGTCCCAGGGATGAAAGGACTTTGAAA 42345290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2485 TTCCTCCCCATTAGGGTCATTATTGTTTTGCAGTGTCCCAGGGATGAAAGGACTTTGAAA 2544

 42345291 GGTCATGTGTCTTGTGACCCAACTAGCAGCATCAGCATCACTGGGGAGAAACTCAAGCAG 42345350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2545 GGTCATGTGTCTTGTGACCCAACTAGCAGCATCAGCATCACTGGGGAGAAACTCAAGCAG 2604

 42345351 AAGCTTGAGTCTACTCCACTCTTGCTGACACCAAATCTGCATTTTTACAGGATTCTTGGG 42345410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2605 AAGCTTGAGTCTACTCCACTCTTGCTGACACCAAATCTGCATTTTTACAGGATTCTTGGG 2664

 42345411 TGAGTCACACACATATTCAAGGTTAAAATATGCCACCCTAGGTCTTTCTCCTGCTTCTGA 42345470
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2665 TGAGTCACAGACATATTCAAGGTTAAAATATGCCACCCTAGGTCTTTCTCCTGCTTCTGA 2724

 42345471 GCAAAACTGGGCACAAGGGACAAACTAGTTTCCTTCAGCCACTTTCAAATCCTTTATAGA 42345530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2725 GCAAAACTGGGCACAAGGGACAAACTAGTTTCCTTCAGCCACTTTCAAATCCTTTATAGA 2784

 42345531 GTGTACTGTGTGAGTCACTGAGAGGAAAGAGGAAATAATACTTATTTAGGGAAGTCTTGC 42345590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2785 GTGTACTGTGTGAGTCACTGAGAGGAAAGAGGAAATAATACTTATTTAGGGAAGTCTTGC 2844

 42345591 ATAACTTAACAAAGTTAGTAACTTCTTCAATACACTCAAGTACCTATTTTTGGAAGCCCT 42345650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2845 ATAACTTAACAAAGTTAGTAACTTCTTCAATACACTCAAGTACCTATTTTTGGAAGCCCT 2904

 42345651 ACAGGTTAGGTCAAAGTAAAGAGAAGCAAAAAATGGAGTGAGTTCTAGTAAAAAACTCTG 42345710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2905 ACAGGTTAGGTCAAAGTAAAGAGAAGCAAAAAATGGAGTGAGTTCTAGTAAAAAACTCTG 2964

 42345711 ACAAAATAAGGGAAGTGTAGAAGCTGAGTCTATGAGGGATGAGAGAAGCAATTTACCAAA 42345770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2965 ACAAAATAAGGGAAGTGTAGAAGCTGAGTCTATGAGGGATGAGAGAAGCAATTTACCAAA 3024

 42345771 TTATCAGATCCAAAATCATCTCTGCACTGTAGATGATTTATAGCCCTGGAAGCTTAGAGG 42345830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3025 TTATCAGATCCAAAATCATCTCTGCACTGTAGATGATTTATAGCCCTGGAAGCTTAGAGG 3084

 42345831 CTTGAGTCTCTTGCTGTATTTCATTTCAAATTAGTAATTTTTATCTAGGGCTTCCCTATG 42345890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3085 CTTGAGTCTCTTGCTGTATTTCATTTCAAATTAGTAATTTTTATCTAGGGCTTCCCTATG 3144

 42345891 GCTTAAAGTGAAGGCCCTGGAATTTCTGAAGTGAAATTATCTGATGATTTTTATGTATGG 42345950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3145 GCTTAAAGTGAAGGCCCTGGAATTTCTGAAGTGAAATTATCTGATGATTTTTATGTATGG 3204

 42345951 TCATTCTGTAGTTATCCTGTAAGTTTCATATTTGTAACAAGACTGGAATCCGAACAATAG 42346010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3205 TCATTCTGTAGTTATCCTGTAAGTTTCATATTTGTAACAAGACTGGAATCCGAACAATAG 3264

 42346011 AAAACTCTGTGGCAGTAAGCCAAAACCTGATGGACTTAGGAGAGTTACGTATGTGTGTTT 42346070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3265 AAAACTCTGTGGCAGTAAGCCAAAACCTGATGGACTTAGGAGAGTTACGTATGTGTGTTT 3324

 42346071 CAGTGGTCCTCAAATTCAGCTGCCTATTAGAATCACCTGGACTTTGAAAAAAAAAGAGCT 42346130
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3325 CAGTGGTCCTCAAATTTAGCTGCCTATTAGAATCACCTGGACTTTGAAAAAAAAAGAGCT 3384

 42346131 TTCTTGAGGTATAACTGACAAATAATAAGACAAACATATTTCAGTATACAATTGGATGAG 42346190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3385 TTCTTGAGGTATAACTGACAAATAATAAGACAAACATATTTCAGTATACAATTGGATGAG 3444

 42346191 TTTTGACATGTTATATTCTTGTGAAACCATCACCACAATCAAGCTATTCACCCCCCAAAT 42346250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3445 TTTTGACATGTTATATTCTTGTGAAACCATCACCACAATCAAGCTATTCACCCCCCAAAT 3504

 42346251 TTTCGTGCC 42346259
          |||||||||
     3505 TTTCGTGCC 3513

Alignment time is 2.96142 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [42336259,42357318] =>     21060 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [       1,    3526] =>      3526 nucs 'mol-32-3311-062478_3526'

Score:        3481
Aligned:      3525        nucs
Identic:      3521 (100%) nucs =>        18 (100%)      3503 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [42342961,42342978] EXCISED REGION [42342980,42346486]
 second seq =>  [       1,      18] EXCISED REGION [      20,    3526]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [42342979,42342979]
 second seq =>         1 nucs [19,19]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [42342978,42342978] to [42342979,42342979]
 second seq =>         2 nucs [19,20] to [20,21]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 42342961 TGAGCCATCGCACTCCAC 42342978
          ||||||||||||||||||
        1 TGAGCCATCGCACTCCAC 18

EXCISED REGION

 42342980 TTCTCTATAGTTACTGAGTTTGCGTGTTACACTGAGTTTACATCTTACATTTCTAGCCAT 42343039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       20 TTCTCTATAGTTACTGAGTTTGCGTGTTACACTGAGTTTACATCTTACATTTCTAGCCAT 79

 42343040 ATCAGAAACGACCTCTGCACCTCTCTTTCCCAATTTGAGATTTCTAATAGAAAGAATCTT 42343099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       80 ATCAGAAACGACCTCTGCACCTCTCTTTCCCAATTTGAGATTTCTAATAGAAAGAATCTT 139

 42343100 GTTCACCCAGCTTGGGACTCATTGAGTTATGACCAGTGGGATAGATTTTAGAAGATAAAC 42343159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      140 GTTCACCCAGCTTGGGACTCATTGAGTTATGACCAGTGGGATAGATTTTAGAAGATAAAC 199

 42343160 ATGTCTATAGGGACTTACCGTGTGAATTAGTGGGGGAGCCGCTTACCAGGCAGAGGGGTC 42343219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      200 ATGTCTATAGGGACTTACCGTGTGAATTAGTGGGGGAGCCGCTTACCAGGCAGAGGGGTC 259

 42343220 TGCTGTAAAGTGATACTGTGACTTTAAATTGAAAGTAAGCTTCTAGAAGAGTTGAAGAGG 42343279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      260 TGCTGTAAAGTGATACTGTGACTTTAAATTGAAAGTAAGCTTCTAGAAGAGTTGAAGAGG 319

 42343280 AGTGGATTATTGTTGAATGGATGTATAACTAATGAAGCTTTAAAGGAAGTTTATTAGAAA 42343339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      320 AGTGGATTATTGTTGAATGGATGTATAACTAATGAAGCTTTAAAGGAAGTTTATTAGAAA 379

 42343340 GTCCATGTCCTTGTCTCTTTCCCAAACTCCTTTAGTTCCCAAGTCCTGAAAGAATCTATG 42343399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      380 GTCCATGTCCTTGTCTCTTTCCCAAACTCCTTTAGTTCCCAAGTCCTGAAAGAATCTATG 439

 42343400 GATAAGGGAAGCAGAATACTATAGTGGTTAAGAGCACATGCTCGAGGTTAAACTGTCTGT 42343459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      440 GATAAGGGAAGCAGAATACTATAGTGGTTAAGAGCACATGCTCGAGGTTAAACTGTCTGT 499

 42343460 ATTTTGGATCCTGGCCTTGAGGACTTGGGCAAGTTACGTGACCTGCCTGAGCCTCAGTTT 42343519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      500 ATTTTGGATCCTGGCCTTGAGGACTTGGGCAAGTTACGTGACCTGCCTGAGCCTCAGTTT 559

 42343520 CCTCACCTGTAATATGGGTATCACGAGGAATAAATAAGGTAATATGTGTAAAGTGCTTGG 42343579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      560 CCTCACCTGTAATATGGGTATCACGAGGAATAAATAAGGTAATATGTGTAAAGTGCTTGG 619

 42343580 CACAATGCTCTTGATAATGTTAGCAACATAATTTTGTAATGAAAATTAACTGATGGGGCT 42343639
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
      620 CACAATGCTCTTGATAATGTTAGCAACATAATTTTGTAATGAAAATTAACTGATGGGACT 679

 42343640 GAAATGTGCATCAGCAGATCCAAATATCCTTGATAAACTGGCCAAAAGAAAGATGAATTG 42343699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      680 GAAATGTGCATCAGCAGATCCAAATATCCTTGATAAACTGGCCAAAAGAAAGATGAATTG 739

 42343700 GCAGAGAGGCAAGTGTTCATCTCAGTTCTCCAGATATCCCTGCAAATGTGGCCTCTGGAG 42343759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      740 GCAGAGAGGCAAGTGTTCATCTCAGTTCTCCAGATATCCCTGCAAATGTGGCCTCTGGAG 799

 42343760 TAGAAGATTTAGGGAGAAAAATAAGCCATGAAGCTCTTCTGGCACCAACATGAACTTCAG 42343819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      800 TAGAAGATTTAGGGAGAAAAATAAGCCATGAAGCTCTTCTGGCACCAACATGAACTTCAG 859

 42343820 GGATCATGGGACATTTGGGCCAGTAACATTCCTCTTTGTTCCTAGAGATTTAATATCTAC 42343879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      860 GGATCATGGGACATTTGGGCCAGTAACATTCCTCTTTGTTCCTAGAGATTTAATATCTAC 919

 42343880 CTACCAACTAAATGGCCTTGATTTGGAGGAGAGAAGACAAGAAGAGGAATTGCTTTCAGC 42343939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      920 CTACCAACTAAATGGCCTTGATTTGGAGGAGAGAAGACAAGAAGAGGAATTGCTTTCAGC 979

 42343940 TGGTCCTTGCCTTTAACTAACCAGGGGTACAAAAATTTTAAAATACAAAGGAGACCATGT 42343999
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
      980 TGGTCCTTGCCTTTAACTAACCAGGGGTACAAAAATTTTAAAACACAAAGGAGACCATGT 1039

 42344000 GTAAAACATTAGTTAAGCTCAGATATAAATCTAGTCTTTGACCAGTCCAGAGCTAATCAA 42344059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1040 GTAAAACATTAGTTAAGCTCAGATATAAATCTAGTCTTTGACCAGTCCAGAGCTAATCAA 1099

 42344060 TATGCTTTTCTACTCTCTTTGAACTTTTGAGTTTTCTGGCAACAACAAAAATCCCAAACC 42344119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1100 TATGCTTTTCTACTCTCTTTGAACTTTTGAGTTTTCTGGCAACAACAAAAATCCCAAACC 1159

 42344120 TCATCCAAAACCGTAGTCCAGACAGCCCAGTTTCTGCACTCCCTTCCTTGTGTCACATAT 42344179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1160 TCATCCAAAACCGTAGTCCAGACAGCCCAGTTTCTGCACTCCCTTCCTTGTGTCACATAT 1219

 42344180 TGTTGACAGAACTACTCCCGTTACCACATTCATTCCAGTGGTGATTCAAATTCTTCTGCA 42344239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1220 TGTTGACAGAACTACTCCCGTTACCACATTCATTCCAGTGGTGATTCAAATTCTTCTGCA 1279

 42344240 GAAATGGACTTGAAAGACAGAAAACTGCTCCTGTAATCACTTAATAAGGAATCTTGGATG 42344299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1280 GAAATGGACTTGAAAGACAGAAAACTGCTCCTGTAATCACTTAATAAGGAATCTTGGATG 1339

 42344300 AGGAATACAGAGCTATGAATATGGATTTACTCTTAGCCTTTATGGATGCCTTTTTCTCAG 42344359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1340 AGGAATACAGAGCTATGAATATGGATTTACTCTTAGCCTTTATGGATGCCTTTTTCTCAG 1399

 42344360 TTATTTTCACTGAAAATCATGATGAACTGATTTAAATATCAAGGTAAACTGAGATGGAAA 42344419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1400 TTATTTTCACTGAAAATCATGATGAACTGATTTAAATATCAAGGTAAACTGAGATGGAAA 1459

 42344420 ATTACCGATAATAAGAGTTTTCTGAAAATATAGATTGGCCTCTTTAAAGCACATCGAGTT 42344479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1460 ATTACCGATAATAAGAGTTTTCTGAAAATATAGATTGGCCTCTTTAAAGCACATCGAGTT 1519

 42344480 TGTTTTGTTTAAATTACAAATTCACATATATTTGAAATGTGTTTAAATGTGTCAGTTTTA 42344539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1520 TGTTTTGTTTAAATTACAAATTCACATATATTTGAAATGTGTTTAAATGTGTCAGTTTTA 1579

 42344540 GGCAAAACTAAACTATTTGATTCCTTTCCAAAAATCAGGAATTTGCTTTGGAAAAAAACC 42344599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1580 GGCAAAACTAAACTATTTGATTCCTTTCCAAAAATCAGGAATTTGCTTTGGAAAAAAACC 1639

 42344600 ATGCAGTTTGATTTACAAAGCAGAGCGGGGGGGAAGTAGTGGGTGAGAAAGACCCACCCA 42344659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1640 ATGCAGTTTGATTTACAAAGCAGAGCGGGGGGGAAGTAGTGGGTGAGAAAGACCCACCCA 1699

 42344660 AAGGCTGCAGCCAGCTTCCCCAGGAAGATTCATAACCATGCCACAATACTGTCCTTCAAT 42344719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1700 AAGGCTGCAGCCAGCTTCCCCAGGAAGATTCATAACCATGCCACAATACTGTCCTTCAAT 1759

 42344720 TCGTTCCAACAGATTTTACTATAACTCTAAATCATTAGAAGCAACTGCTGCTATGACTAG 42344779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1760 TCGTTCCAACAGATTTTACTATAACTCTAAATCATTAGAAGCAACTGCTGCTATGACTAG 1819

 42344780 TGCTATCTTTGCCTCAAAAAGAGGAAAAATCAGGACATACAATATAATCCCCTCAGGATC 42344839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1820 TGCTATCTTTGCCTCAAAAAGAGGAAAAATCAGGACATACAATATAATCCCCTCAGGATC 1879

 42344840 TAGGAGAGAAATCAGCCCATTTGTCATAAGAACTGAAAACCTCAGCTAAATAGTATATGA 42344899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1880 TAGGAGAGAAATCAGCCCATTTGTCATAAGAACTGAAAACCTCAGCTAAATAGTATATGA 1939

 42344900 AACATTGGTATTTCATACCTTGACATTACATATTTTTGAAAATAAAGTAAGCATACACAC 42344959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1940 AACATTGGTATTTCATACCTTGACATTACATATTTTTGAAAATAAAGTAAGCATACACAC 1999

 42344960 AAGAAGTGGCTAGATGCAGCAGTTATAAAGTGGCTTAAGTTGGGTTAACTAAATATAACC 42345019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2000 AAGAAGTGGCTAGATGCAGCAGTTATAAAGTGGCTTAAGTTGGGTTAACTAAATATAACC 2059

 42345020 TAGAAAAACCATCTTATCTATTGCAAATTATTTCCAGAAAAAGGTAAGAAAAATCCAACC 42345079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2060 TAGAAAAACCATCTTATCTATTGCAAATTATTTCCAGAAAAAGGTAAGAAAAATCCAACC 2119

 42345080 AACACTTTTTAAACATCCTGAGCTATTCACAGCAAGTGAATCTTTACCCTTACCAGATGT 42345139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2120 AACACTTTTTAAACATCCTGAGCTATTCACAGCAAGTGAATCTTTACCCTTACCAGATGT 2179

 42345140 ATAAACATTTACATAAGGCAGGAGGTTCAACACTTGGAGAGTGTAATCAAGGCAGTAGTA 42345199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2180 ATAAACATTTACATAAGGCAGGAGGTTCAACACTTGGAGAGTGTAATCAAGGCAGTAGTA 2239

 42345200 ACGCAGTGCTCCTCTCTTTGACTTGAATGACTTCCTCCCCATTAGGGTCATTATTGTTTT 42345259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2240 ACGCAGTGCTCCTCTCTTTGACTTGAATGACTTCCTCCCCATTAGGGTCATTATTGTTTT 2299

 42345260 GCAGTGTCCCAGGGATGAAAGGACTTTGAAAGGTCATGTGTCTTGTGACCCAACTAGCAG 42345319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2300 GCAGTGTCCCAGGGATGAAAGGACTTTGAAAGGTCATGTGTCTTGTGACCCAACTAGCAG 2359

 42345320 CATCAGCATCACTGGGGAGAAACTCAAGCAGAAGCTTGAGTCTACTCCACTCTTGCTGAC 42345379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2360 CATCAGCATCACTGGGGAGAAACTCAAGCAGAAGCTTGAGTCTACTCCACTCTTGCTGAC 2419

 42345380 ACCAAATCTGCATTTTTACAGGATTCTTGGGTGAGTCACACACATATTCAAGGTTAAAAT 42345439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2420 ACCAAATCTGCATTTTTACAGGATTCTTGGGTGAGTCACACACATATTCAAGGTTAAAAT 2479

 42345440 ATGCCACCCTAGGTCTTTCTCCTGCTTCTGAGCAAAACTGGGCACAAGGGACAAACTAGT 42345499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2480 ATGCCACCCTAGGTCTTTCTCCTGCTTCTGAGCAAAACTGGGCACAAGGGACAAACTAGT 2539

 42345500 TTCCTTCAGCCACTTTCAAATCCTTTATAGAGTGTACTGTGTGAGTCACTGAGAGGAAAG 42345559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2540 TTCCTTCAGCCACTTTCAAATCCTTTATAGAGTGTACTGTGTGAGTCACTGAGAGGAAAG 2599

 42345560 AGGAAATAATACTTATTTAGGGAAGTCTTGCATAACTTAACAAAGTTAGTAACTTCTTCA 42345619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2600 AGGAAATAATACTTATTTAGGGAAGTCTTGCATAACTTAACAAAGTTAGTAACTTCTTCA 2659

 42345620 ATACACTCAAGTACCTATTTTTGGAAGCCCTACAGGTTAGGTCAAAGTAAAGAGAAGCAA 42345679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2660 ATACACTCAAGTACCTATTTTTGGAAGCCCTACAGGTTAGGTCAAAGTAAAGAGAAGCAA 2719

 42345680 AAAATGGAGTGAGTTCTAGTAAAAAACTCTGACAAAATAAGGGAAGTGTAGAAGCTGAGT 42345739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2720 AAAATGGAGTGAGTTCTAGTAAAAAACTCTGACAAAATAAGGGAAGTGTAGAAGCTGAGT 2779

 42345740 CTATGAGGGATGAGAGAAGCAATTTACCAAATTATCAGATCCAAAATCATCTCTGCACTG 42345799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2780 CTATGAGGGATGAGAGAAGCAATTTACCAAATTATCAGATCCAAAATCATCTCTGCACTG 2839

 42345800 TAGATGATTTATAGCCCTGGAAGCTTAGAGGCTTGAGTCTCTTGCTGTATTTCATTTCAA 42345859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2840 TAGATGATTTATAGCCCTGGAAGCTTAGAGGCTTGAGTCTCTTGCTGTATTTCATTTCAA 2899

 42345860 ATTAGTAATTTTTATCTAGGGCTTCCCTATGGCTTAAAGTGAAGGCCCTGGAATTTCTGA 42345919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2900 ATTAGTAATTTTTATCTAGGGCTTCCCTATGGCTTAAAGTGAAGGCCCTGGAATTTCTGA 2959

 42345920 AGTGAAATTATCTGATGATTTTTATGTATGGTCATTCTGTAGTTATCCTGTAAGTTTCAT 42345979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2960 AGTGAAATTATCTGATGATTTTTATGTATGGTCATTCTGTAGTTATCCTGTAAGTTTCAT 3019

 42345980 ATTTGTAACAAGACTGGAATCCGAACAATAGAAAACTCTGTGGCAGTAAGCCAAAACCTG 42346039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3020 ATTTGTAACAAGACTGGAATCCGAACAATAGAAAACTCTGTGGCAGTAAGCCAAAACCTG 3079

 42346040 ATGGACTTAGGAGAGTTACGTATGTGTGTTTCAGTGGTCCTCAAATTCAGCTGCCTATTA 42346099
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     3080 ATGGACTTAGGAGAGTTACGTATGTGTGTTTCAGTGGTCCTCAAATTTAGCTGCCTATTA 3139

 42346100 GAATCACCTGGACTTTGAAAAAAAAAGAGCTTTCTTGAGGTATAACTGACAAATAATAAG 42346159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3140 GAATCACCTGGACTTTGAAAAAAAAAGAGCTTTCTTGAGGTATAACTGACAAATAATAAG 3199

 42346160 ACAAACATATTTCAGTATACAATTGGATGAGTTTTGACATGTTATATTCTTGTGAAACCA 42346219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3200 ACAAACATATTTCAGTATACAATTGGATGAGTTTTGACATGTTATATTCTTGTGAAACCA 3259

 42346220 TCACCACAATCAAGCTATTCACCCCCCAAATTTTCGTGCCCCTTTGTTGTCCCACCCTTC 42346279
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3260 TCGCCACAATCAAGCTATTCACCCCCCAAATTTTCGTGCCCCTTTGTTGTCCCACCCTTC 3319

 42346280 TTTCTGCAACCACTGATCTGCTTTCTATCACTATGGATTAATTTGTATTTTCTAGAAGCT 42346339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3320 TTTCTGCAACCACTGATCTGCTTTCTATCACTATGGATTAATTTGTATTTTCTAGAAGCT 3379

 42346340 TAAATAAGTGAAACCATATGGTGTGCATGTTTTGCAGGGAGAGGGCAGGGGGAGCTGGTT 42346399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3380 TAAATAAGTGAAACCATATGGTGTGCATGTTTTGCAGGGAGAGGGCAGGGGGAGCTGGTT 3439

 42346400 TCTTTCACTCGGTGTAATTGTTCTGAGAGTCATCCGTGTTTGCATGTGTTAATAGTTTAT 42346459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3440 TCTTTCACTCGGTGTAATTGTTCTGAGAGTCATCCGTGTTTGCATGTGTTAATAGTTTAT 3499

 42346460 TCTTTTTATCGGTAAGTAGTATCCCAT 42346486
          |||||||||||||||||||||||||||
     3500 TCTTTTTATCGGTAAGTAGTATCCCAT 3526

Alignment time is 2.60101 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [42336259,42357318] =>     21060 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [       1,   10998] =>     10998 nucs 'mol-32-331c-071864_10998'

Score:       10835
Aligned:     11016        nucs
Identic:     10984 (100%) nucs =>      4383 (100%)      6601 (100%)
Gaps:           22 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [42341862,42346259] EXCISED REGION [42347319,42353936]
 second seq =>  [       1,    4391] EXCISED REGION [    4396,   10998]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1059 nucs [42346260,42347318]
 second seq =>         4 nucs [4392,4395]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [4392,4392] to [4396,4396]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 42341862 AAAAAGATGTTTGGCCTTAATTCTATAGGTATTCCCCTTTGCCATAGATGTTACACCAAG 42341921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAAAAGATGTTTGGCCTTAATTCTATAGGTATTCCCCTTTGCCATAGATGTTACACCAAG 60

 42341922 AAAGAACACATTGAATCAAGCAAATTTAAGCTGGGTTTTTGTTTTTGTTTTTTGGTGGTG 42341981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAAGAACACATTGAATCAAGCAAATTTAAGCTGGGTTTTTGTTTTTGTTTTTTGGTGGTG 120

 42341982 GGGGGGATGATTTATAAGCAGGACTTCCCAAAGCTTTTAATATGCTTATATATGTGGCAG 42342041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGGGGGATGATTTATAAGCAGGACTTCCCAAAGCTTTTAATATGCTTATATATGTGGCAG 180

 42342042 TGTTGAGAGGGGAAGATTTGATATTCCAAGTATTTTTGGCCACAGAACTCTTTTTATCAT 42342101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGTTGAGAGGGGAAGATTTGATATTCCAAGTATTTTTGGCCACAGAACTCTTTTTATCAT 240

 42342102 GGAACATTTCCAGTGTTCCATGAGACACAATTAGGGGCTAGTGAGCCACTGACTTTTGAG 42342161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGAACATTTCCAGTGTTCCATGAGACACAATTAGGGGCTAGTGAGCCACTGACTTTTGAG 300

 42342162 TTGGAAAGTGACACATGGGGAAAGCAAAGTTTTGGAAGATTGATCTCACGGTAGAATATA 42342221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTGGAAAGTGACACATGGGGAAAGCAAAGTTTTGGAAGATTGATCTCACGGTAGAATATA 360

 42342222 AGGTGAACAGGAGAGAAAAGAGCCTGGATTCAGGCAACACAATCAGATGATTGGATACAG 42342281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGGTGAACAGGAGAGAAAAGAGCCTGGATTCAGGCAACACAATCAGATGATTGGATACAG 420

 42342282 GCTCAAGATTAGGGGGTGGGTTGCACTACACTGGAGCGGAGAATGGAGAGCAAAAGCACT 42342341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GCTCAAGATTAGGGGGTGGGTTGCACTACACTGGAGCGGAGAATGGAGAGCAAAAGCACT 480

 42342342 GATTGAATGCACAGTCTTCTGTTGGATCCTGGGATGATACAGAAGTGTCAGAGTTCCTGG 42342401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GATTGAATGCACAGTCTTCTGTTGGATCCTGGGATGATACAGAAGTGTCAGAGTTCCTGG 540

 42342402 GTCTTGTAGGAGTTCCAATGAGCATCAATCAAAAGTTTGATTGTAAGGCACAGAAATCAA 42342461
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GTCTTGTAGGAGTTCCAATGCGCATCAATCAAAAGTTTGATTGTAAGGCACAGAAATCAA 600

 42342462 CTTGGACCAGCTAAAGCAAAAAGACCATTTTTAGGGAAATAGGGATGTGTCACAAAGAAC 42342521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTTGGACCAGCTAAAGCAAAAAGACCATTTTTAGGGAAATAGGGATGTGTCACAAAGAAC 660

 42342522 TGCATCTAGGTACTGGAAATCAACAAAAAGTTCCCCATCTGATCTCAGCTTCTCTGTGTG 42342581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGCATCTAGGTACTGGAAATCAACAAAAAGTTCCCCATCTGATCTCAGCTTCTCTGTGTG 720

 42342582 TCTACTACATACACTATCTTTCTCCTCTTTTCTTTCCTCTCTACCCCCTACCTCCCTCCT 42342641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCTACTACATACACTATCTTTCTCCTCTTTTCTTTCCTCTCTACCCCCTACCTCCCTCCT 780

 42342642 CTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTGTTTTTTGGTTTTTTTATGTTTGTTTGTTTGCTTTTGG 42342701
          |||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
      781 CTCTCTTTTTTTTTT-------GTTTTTTGGTTTTTTTATGTTTGTTTGTTTGTTTTTGG 833

 42342702 AGACACGGTCTCCCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCTTAATTACTGCAGCCTCA 42342761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      834 AGACACGGTCTCCCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCTTAATTACTGCAGCCTCA 893

 42342762 ATCTCCTGGGCTCAAGTGACCCTCCCACCTCAGCCTCCTGAATAGCTGGGACCACAGGTG 42342821
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
      894 ATCTCCTGGGCTCAAGTGACCCTCCCACTTCAGCCTCCTGAATAGCTGGGACCACAGGTG 953

 42342822 CAAGCCACAGTGCTCAGCTAATTAAAAAAAATTTTTTTTTCAGAGATGGGGTCTCACTAT 42342881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      954 CAAGCCACAGTGCTCAGCTAATTAAAAAAAATTTTTTTTTCAGAGATGGGGTCTCACTAT 1013

 42342882 GTTGTCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTAGGCTCAAGCAGTCCTCCCGTTTCAGCCTCAAAA 42342941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1014 GTTGTCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTAGGCTCAAGCAGTCCTCCCGTTTCAGCCTCAAAA 1073

 42342942 AGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCATCGCACTCCACCTTCTCTATAGTTACTGAGTTTG 42343001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1074 AGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCATCGCACTCCACCTTCTCTATAGTTACTGAGTTTG 1133

 42343002 CGTGTTACACTGAGTTTACATCTTACATTTCTAGCCATATCAGAAACGACCTCTGCACCT 42343061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1134 CGTGTTACACTGAGTTTACATCTTACATTTCTAGCCATATCAGAAACGACCTCTGCACCT 1193

 42343062 CTCTTTCCCAATTTGAGATTTCTAATAGAAAGAATCTTGTTCACCCAGCTTGGGACTCAT 42343121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1194 CTCTTTCCCAATTTGAGATTTCTAATAGAAAGAATCTTGTTCACCCAGCTTGGGACTCAT 1253

 42343122 TGAGTTATGACCAGTGGGATAGATTTTAGAAGATAAACATGTCTATAGGGACTTACCGTG 42343181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1254 TGAGTTATGACCAGTGGGATAGATTTTAGAAGATAAACATGTCTATAGGGACTTACCGTG 1313

 42343182 TGAATTAGTGGGGGAGCCGCTTACCAGGCAGAGGGGTCTGCTGTAAAGTGATACTGTGAC 42343241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1314 TGAATTAGTGGGGGAGCCGCTTACCAGGCAGAGGGGTCTGCTGTAAAGTGATACTGTGAC 1373

 42343242 TTTAAATTGAAAGTAAGCTTCTAGAAGAGTTGAAGAGGAGTGGATTATTGTTGAATGGAT 42343301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1374 TTTAAATTGAAAGTAAGCTTCTAGAAGAGTTGAAGAGGAGTGGATTATTGTTGAATGGAT 1433

 42343302 GTATAACTAATGAAGCTTTAAAGGAAGTTTATTAGAAAGTCCATGTCCTTGTCTCTTTCC 42343361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1434 GTATAACTAATGAAGCTTTAAAGGAAGTTTATTAGAAAGTCCATGTCCTTGTCTCTTTCC 1493

 42343362 CAAACTCCTTTAGTTCCCAAGTCCTGAAAGAATCTATGGATAAGGGAAGCAGAATACTAT 42343421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1494 CAAACTCCTTTAGTTCCCAAGTCCTGAAAGAATCTATGGATAAGGGAAGCAGAATACTAT 1553

 42343422 AGTGGTTAAGAGCACATGCTCGAGGTTAAACTGTCTGTATTTTGGATCCTGGCCTTGAGG 42343481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1554 AGTGGTTAAGAGCACATGCTCGAGGTTAAACTGTCTGTATTTTGGATCCTGGCCTTGAGG 1613

 42343482 ACTTGGGCAAGTTACGTGACCTGCCTGAGCCTCAGTTTCCTCACCTGTAATATGGGTATC 42343541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1614 ACTTGGGCAAGTTACGTGACCTGCCTGAGCCTCAGTTTCCTCACCTGTAATATGGGTATC 1673

 42343542 ACGAGGAATAAATAAGGTAATATGTGTAAAGTGCTTGGCACAATGCTCTTGATAATGTTA 42343601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1674 ACGAGGAATAAATAAGGTAATATGTGTAAAGTGCTTGGCACAATGCTCTTGATAATGTTA 1733

 42343602 GCAACATAATTTTGTAATGAAAATTAACTGATGGGGCTGAAATGTGCATCAGCAGATCCA 42343661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1734 GCAACATAATTTTGTAATGAAAATTAACTGATGGGGCTGAAATGTGCATCAGCAGATCCA 1793

 42343662 AATATCCTTGATAAACTGGCCAAAAGAAAGATGAATTGGCAGAGAGGCAAGTGTTCATCT 42343721
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1794 AATATCCTCGATAAACTGGCCAAAAGAAAGATGAATTGGCAGAGAGGCAAGTGTTCATCT 1853

 42343722 CAGTTCTCCAGATATCCCTGCAAATGTGGCCTCTGGAGTAGAAGATTTAGGGAGAAAAAT 42343781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1854 CAGTTCTCCAGATATCCCTGCAAATGTGGCCTCTGGAGTAGAAGATTTAGGGAGAAAAAT 1913

 42343782 AAGCCATGAAGCTCTTCTGGCACCAACATGAACTTCAGGGATCATGGGACATTTGGGCCA 42343841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1914 AAGCCATGAAGCTCTTCTGGCACCAACATGAACTTCAGGGATCATGGGACATTTGGGCCA 1973

 42343842 GTAACATTCCTCTTTGTTCCTAGAGATTTAATATCTACCTACCAACTAAATGGCCTTGAT 42343901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1974 GTAACATTCCTCTTTGTTCCTAGAGATTTAATATCTACCTACCAACTAAATGGCCTTGAT 2033

 42343902 TTGGAGGAGAGAAGACAAGAAGAGGAATTGCTTTCAGCTGGTCCTTGCCTTTAACTAACC 42343961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2034 TTGGAGGAGAGAAGACAAGAAGAGGAATTGCTTTCAGCTGGTCCTTGCCTTTAACTAACC 2093

 42343962 AGGGGTACAAAAATTTTAAAATACAAAGGAGACCATGTGTAAAACATTAGTTAAGCTCAG 42344021
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2094 AGGGGTACAAAAATTTTAAAACACAAAGGAGACCATGTGTAAAACATTAGTTAAGCTCAG 2153

 42344022 ATATAAATCTAGTCTTTGACCAGTCCAGAGCTAATCAATATGCTTTTCTACTCTCTTTGA 42344081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2154 ATATAAATCTAGTCTTTGACCAGTCCAGAGCTAATCAATATGCTTTTCTACTCTCTTTGA 2213

 42344082 ACTTTTGAGTTTTCTGGCAACAACAAAAATCCCAAACCTCATCCAAAACCGTAGTCCAGA 42344141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2214 ACTTTTGAGTTTTCTGGCAACAACAAAAATCCCAAACCTCATCCAAAACCGTAGTCCAGA 2273

 42344142 CAGCCCAGTTTCTGCACTCCCTTCCTTGTGTCACATATTGTTGACAGAACTACTCCCGTT 42344201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2274 CAGCCCAGTTTCTGCACTCCCTTCCTTGTGTCACATATTGTTGACAGAACTACTCCCGTT 2333

 42344202 ACCACATTCATTCCAGTGGTGATTCAAATTCTTCTGCAGAAATGGACTTGAAAGACAGAA 42344261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2334 ACCACATTCATTCCAGTGGTGATTCAAATTCTTCTGCAGAAATGGACTTGAAAGACAGAA 2393

 42344262 AACTGCTCCTGTAATCACTTAATAAGGAATCTTGGATGAGGAATACAGAGCTATGAATAT 42344321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2394 AACTGCTCCTGTAATCACTTAATAAGGAATCTTGGATGAGGAATACAGAGCTATGAATAT 2453

 42344322 GGATTTACTCTTAGCCTTTATGGATGCCTTTTTCTCAGTTATTTTCACTGAAAATCATGA 42344381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2454 GGATTTACTCTTAGCCTTTATGGATGCCTTTTTCTCAGTTATTTTCACTGAAAATCATGA 2513

 42344382 TGAACTGATTTAAATATCAAGGTAAACTGAGATGGAAAATTACCGATAATAAGAGTTTTC 42344441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2514 TGAACTGATTTAAATATCAAGGTAAACTGAGATGGAAAATTACCGATAATAAGAGTTTTC 2573

 42344442 TGAAAATATAGATTGGCCTCTTTAAAGCACATCGAGTTTGTTTTGTTTAAATTACAAATT 42344501
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     2574 TGAAAATATAGATTGGCCTCTTTAAAACACATCGAGTTTGTTTTGTTTAAATTACAAATT 2633

 42344502 CACATATATTTGAAATGTGTTTAAATGTGTCAGTTTTAGGCAAAACTAAACTATTTGATT 42344561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2634 CACATATATTTGAAATGTGTTTAAATGTGTCAGTTTTAGGCAAAACTAAACTATTTGATT 2693

 42344562 CCTTTCCAAAAATCAGGAATTTGCTTTGGAAAAAAACCATGCAGTTTGATTTACAAAGCA 42344621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2694 CCTTTCCAAAAATCAGGAATTTGCTTTGGAAAAAAACCATGCAGTTTGATTTACAAAGCA 2753

 42344622 GAGCGGGGGGGAAGTAGTGGGTGAGAAAGACCCACCCAAAGGCTGCAGCCAGCTTCCCCA 42344681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2754 GAGCGGGGGGGAAGTAGTGGGTGAGAAAGACCCACCCAAAGGCTGCAGCCAGCTTCCCCA 2813

 42344682 GGAAGATTCATAACCATGCCACAATACTGTCCTTCAATTCGTTCCAACAGATTTTACTAT 42344741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2814 GGAAGATTCATAACCATGCCACAATACTGTCCTTCAATTCGTTCCAACAGATTTTACTAT 2873

 42344742 AACTCTAAATCATTAGAAGCAACTGCTGCTATGACTAGTGCTATCTTTGCCTCAAAAAGA 42344801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2874 AACTCTAAATCATTAGAAGCAACTGCTGCTATGACTAGTGCTATCTTTGCCTCAAAAAGA 2933

 42344802 GGAAAAATCAGGACATACAATATAATCCCCTCAGGATCTAGGAGAGAAATCAGCCCATTT 42344861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2934 GGAAAAATCAGGACATACAATATAATCCCCTCAGGATCTAGGAGAGAAATCAGCCCATTT 2993

 42344862 GTCATAAGAACTGAAAACCTCAGCTAAATAGTATATGAAACATTGGTATTTCATACCTTG 42344921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2994 GTCATAAGAACTGAAAACCTCAGCTAAATAGTATATGAAACATTGGTATTTCATACCTTG 3053

 42344922 ACATTACATATTTTTGAAAATAAAGTAAGCATACACACAAGAAGTGGCTAGATGCAGCAG 42344981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3054 ACATTACATATTTTTGAAAATAAAGTAAGCATACACACAAGAAGTGGCTAGATGCAGCAG 3113

 42344982 TTATAAAGTGGCTTAAGTTGGGTTAACTAAATATAACCTAGAAAAACCATCTTATCTATT 42345041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3114 TTATAAAGTGGCTTAAGTTGGGTTAACTAAATATAACCTAGAAAAACCATCTTATCTATT 3173

 42345042 GCAAATTATTTCCAGAAAAAGGTAAGAAAAATCCAACCAACACTTTTTAAACATCCTGAG 42345101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3174 GCAAATTATTTCCAGAAAAAGGTAAGAAAAATCCAACCAACACTTTTTAAACATCCTGAG 3233

 42345102 CTATTCACAGCAAGTGAATCTTTACCCTTACCAGATGTATAAACATTTACATAAGGCAGG 42345161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3234 CTATTCACAGCAAGTGAATCTTTACCCTTACCAGATGTATAAACATTTACATAAGGCAGG 3293

 42345162 AGGTTCAACACTTGGAGAGTGTAATCAAGGCAGTAGTAACGCAGTGCTCCTCTCTTTGAC 42345221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3294 AGGTTCAACACTTGGAGAGTGTAATCAAGGCAGTAGTAACGCAGTGCTCCTCTCTTTGAC 3353

 42345222 TTGAATGACTTCCTCCCCATTAGGGTCATTATTGTTTTGCAGTGTCCCAGGGATGAAAGG 42345281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3354 TTGAATGACTTCCTCCCCATTAGGGTCATTATTGTTTTGCAGTGTCCCAGGGATGAAAGG 3413

 42345282 ACTTTGAAAGGTCATGTGTCTTGTGACCCAACTAGCAGCATCAGCATCACTGGGGAGAAA 42345341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3414 ACTTTGAAAGGTCATGTGTCTTGTGACCCAACTAGCAGCATCAGCATCACTGGGGAGAAA 3473

 42345342 CTCAAGCAGAAGCTTGAGTCTACTCCACTCTTGCTGACACCAAATCTGCATTTTTACAGG 42345401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3474 CTCAAGCAGAAGCTTGAGTCTACTCCACTCTTGCTGACACCAAATCTGCATTTTTACAGG 3533

 42345402 ATTCTTGGGTGAGTCACACACATATTCAAGGTTAAAATATGCCACCCTAGGTCTTTCTCC 42345461
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3534 ATTCTTGGGTGAGTCACAGACATATTCAAGGTTAAAATATGCCACCCTAGGTCTTTCTCC 3593

 42345462 TGCTTCTGAGCAAAACTGGGCACAAGGGACAAACTAGTTTCCTTCAGCCACTTTCAAATC 42345521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3594 TGCTTCTGAGCAAAACTGGGCACAAGGGACAAACTAGTTTCCTTCAGCCACTTTCAAATC 3653

 42345522 CTTTATAGAGTGTACTGTGTGAGTCACTGAGAGGAAAGAGGAAATAATACTTATTTAGGG 42345581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3654 CTTTATAGAGTGTACTGTGTGAGTCACTGAGAGGAAAGAGGAAATAATACTTATTTAGGG 3713

 42345582 AAGTCTTGCATAACTTAACAAAGTTAGTAACTTCTTCAATACACTCAAGTACCTATTTTT 42345641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3714 AAGTCTTGCATAACTTAACAAAGTTAGTAACTTCTTCAATACACTCAAGTACCTATTTTT 3773

 42345642 GGAAGCCCTACAGGTTAGGTCAAAGTAAAGAGAAGCAAAAAATGGAGTGAGTTCTAGTAA 42345701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3774 GGAAGCCCTACAGGTTAGGTCAAAGTAAAGAGAAGCAAAAAATGGAGTGAGTTCTAGTAA 3833

 42345702 AAAACTCTGACAAAATAAGGGAAGTGTAGAAGCTGAGTCTATGAGGGATGAGAGAAGCAA 42345761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3834 AAAACTCTGACAAAATAAGGGAAGTGTAGAAGCTGAGTCTATGAGGGATGAGAGAAGCAA 3893

 42345762 TTTACCAAATTATCAGATCCAAAATCATCTCTGCACTGTAGATGATTTATAGCCCTGGAA 42345821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3894 TTTACCAAATTATCAGATCCAAAATCATCTCTGCACTGTAGATGATTTATAGCCCTGGAA 3953

 42345822 GCTTAGAGGCTTGAGTCTCTTGCTGTATTTCATTTCAAATTAGTAATTTTTATCTAGGGC 42345881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3954 GCTTAGAGGCTTGAGTCTCTTGCTGTATTTCATTTCAAATTAGTAATTTTTATCTAGGGC 4013

 42345882 TTCCCTATGGCTTAAAGTGAAGGCCCTGGAATTTCTGAAGTGAAATTATCTGATGATTTT 42345941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4014 TTCCCTATGGCTTAAAGTGAAGGCCCTGGAATTTCTGAAGTGAAATTATCTGATGATTTT 4073

 42345942 TATGTATGGTCATTCTGTAGTTATCCTGTAAGTTTCATATTTGTAACAAGACTGGAATCC 42346001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4074 TATGTATGGTCATTCTGTAGTTATCCTGTAAGTTTCATATTTGTAACAAGACTGGAATCC 4133

 42346002 GAACAATAGAAAACTCTGTGGCAGTAAGCCAAAACCTGATGGACTTAGGAGAGTTACGTA 42346061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4134 GAACAATAGAAAACTCTGTGGCAGTAAGCCAAAACCTGATGGACTTAGGAGAGTTACGTA 4193

 42346062 TGTGTGTTTCAGTGGTCCTCAAATTCAGCTGCCTATTAGAATCACCTGGACTTTGAAAAA 42346121
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4194 TGTGTGTTTCAGTGGTCCTCAAATTTAGCTGCCTATTAGAATCACCTGGACTTTGAAAAA 4253

 42346122 AAAAGAGCTTTCTTGAGGTATAACTGACAAATAATAAGACAAACATATTTCAGTATACAA 42346181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4254 AAAAGAGCTTTCTTGAGGTATAACTGACAAATAATAAGACAAACATATTTCAGTATACAA 4313

 42346182 TTGGATGAGTTTTGACATGTTATATTCTTGTGAAACCATCACCACAATCAAGCTATTCAC 42346241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4314 TTGGATGAGTTTTGACATGTTATATTCTTGTGAAACCATCACCACAATCAAGCTATTCAC 4373

 42346242 CCCCCAAATTTTCGTGCC 42346259
          ||||||||||||||||||
     4374 CCCCCAAATTTTCGTGCC 4391

EXCISED REGION

 42347319 TTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGCTCTCAAACTCCTGA 42347378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4396 TTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGCTCTCAAACTCCTGA 4455

 42347379 CCTCAGGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACC 42347438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4456 CCTCAGGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACC 4515

 42347439 ATGCCCAGCGTATTAATTTTCTTGCATGGATGGTGCGTTTGGTGATCTGAGAAATCTTTA 42347498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4516 ATGCCCAGCGTATTAATTTTCTTGCATGGATGGTGCGTTTGGTGATCTGAGAAATCTTTA 4575

 42347499 CCTAACCCAAGGTCACAGAGATTTTCTCCTGTTTGCTTCCAAAATTTTTATACGTTTAGA 42347558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4576 CCTAACCCAAGGTCACAGAGATTTTCTCCTGTTTGCTTCCAAAATTTTTATACGTTTAGA 4635

 42347559 TTTTATATTTAAGTCTATTTTGAGTTAATTTTTGTATATAATGCAAAGTTTAGAATGATG 42347618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4636 TTTTATATTTAAGTCTATTTTGAGTTAATTTTTGTATATAATGCAAAGTTTAGAATGATG 4695

 42347619 TTTAGTTTTTTGTCTATAATCTATGAATATCCAATAGTTCTAGCACCATTTATTGAAAAG 42347678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4696 TTTAGTTTTTTGTCTATAATCTATGAATATCCAATAGTTCTAGCACCATTTATTGAAAAG 4755

 42347679 ACTGATCTTTATCTACTGAAGTGTCTTTGCACTTTTGTTGAAAGTCAATTGACAATTGAC 42347738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4756 ACTGATCTTTATCTACTGAAGTGTCTTTGCACTTTTGTTGAAAGTCAATTGACAATTGAC 4815

 42347739 CATATATTTGTGGGTCTATTCTGGATTCTCTATTCTGTTACATTGATCTATTTTTCTATC 42347798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4816 CATATATTTGTGGGTCTATTCTGGATTCTCTATTCTGTTACATTGATCTATTTTTCTATC 4875

 42347799 TCAATACAAATATCAAATTGGGTATTTGTATTAAGACAAATATAATTTGTCTGGGTATTT 42347858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4876 TCAATACAAATATCAAATTGGGTATTTGTATTAAGACAAATATAATTTGTCTGGGTATTT 4935

 42347859 GTCAAGACAAATAAAAATTGTCTTGATTACTGTAGCTTTATTGCAAGTCTTGAAATCTAA 42347918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4936 GTCAAGACAAATAAAAATTGTCTTGATTACTGTAGCTTTATTGCAAGTCTTGAAATCTAA 4995

 42347919 CTTTATTCTTTTTCTAAGAAAAATATGAATTCTAGATTAAGCTTGAATTTTAGAATAAGT 42347978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4996 CTTTATTCTTTTTCTAAGAAAAATATGAATTCTAGATTAAGCTTGAATTTTAGAATAAGT 5055

 42347979 TTGCCAGTTTCTGAGAGGGGAAAGCCTACTGGAATTTTGATGAGGATTGCATTGAATCTA 42348038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5056 TTGCCAGTTTCTGAGAGGGGAAAGCCTACTGGAATTTTGATGAGGATTGCATTGAATCTA 5115

 42348039 CAGATCTATTAGGGGAAAACTGACATCTTAACAATATTGAGTCTTTCAATCCATGAGCAC 42348098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5116 CAGATCTATTAGGGGAAAACTGACATCTTAACAATATTGAGTCTTTCAATCCATGAGCAC 5175

 42348099 AAAGTCTTTTTTCATTTTTCTCAGCAACGTTTTCTTAGTTTACAGATCTTACAGCTCTTT 42348158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5176 AAAGTCTTTTTTCATTTTTCTCAGCAACGTTTTCTTAGTTTACAGATCTTACAGCTCTTT 5235

 42348159 TGTAAGGTTTTTATCTAAATATTTAATTATTTTGTACTATCATAAGTGTTATTATTTATA 42348218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5236 TGTAAGGTTTTTATCTAAATATTTAATTATTTTGTACTATCATAAGTGTTATTATTTATA 5295

 42348219 TAATTTTAATTTCCAAGTATTTATTGAAACCATTTAGAAACAGTTGATTTTTTATATTGA 42348278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5296 TAATTTTAATTTCCAAGTATTTATTGAAACCATTTAGAAACAGTTGATTTTTTATATTGA 5355

 42348279 TCTTTTATCCTGCAGGCTTGTTAAACTCATTTATTAGTTCTGTAGCTTTTTTGTAGAGTC 42348338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5356 TCTTTTATCCTGCAGGCTTGTTAAACTCATTTATTAGTTCTGTAGCTTTTTTGTAGAGTC 5415

 42348339 CATCAAATTTTCTACATAGAGAGTCATGTTATCTGAGAATAAAAACAGTTTTGCTTCTTC 42348398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5416 CATCAAATTTTCTACATAGAGAGTCATGTTATCTGAGAATAAAAACAGTTTTGCTTCTTC 5475

 42348399 TGCTCCAATCTTAATTCATTTTATATTTTTTTCTTGACTTATTGCACTGGCTACAACCAG 42348458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5476 TGCTCCAATCTTAATTCATTTTATATTTTTTTCTTGACTTATTGCACTGGCTACAACCAG 5535

 42348459 TACAATGCTGAATAAATATAGTGACAGTGGATAGCCTTTCTTTGTTCATGGTCTTAAAGG 42348518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5536 TACAATGCTGAATAAATATAGTGACAGTGGATAGCCTTTCTTTGTTCATGGTCTTAAAGG 5595

 42348519 AAAAGCATTCAGTCTTTCCCATTAAGTATGATGTTAGCTTTAGGTTTTTCATAGATGCCC 42348578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5596 AAAAGCATTCAGTCTTTCCCATTAAGTATGATGTTAGCTTTAGGTTTTTCATAGATGCCC 5655

 42348579 TTTCTCAAATTAAAGAAGTTTCCTACTTTACTGAGAGTTGCTTTATTTAAAATCAGAAAT 42348638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5656 TTTCTCAAATTAAAGAAGTTTCCTACTTTACTGAGAGTTGCTTTATTTAAAATCAGAAAT 5715

 42348639 GAGGCCAGTCACAGTGACTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAGGGTGGGAA 42348698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5716 GAGGCCAGTCACAGTGACTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAGGGTGGGAA 5775

 42348699 GATTACCTGAAGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGACAACATGGTAAAACCCTGTCTGTA 42348758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5776 GATTACCTGAAGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGACAACATGGTAAAACCCTGTCTGTA 5835

 42348759 CTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAGTGGTGCATGCCTGTAGTCCCAGTTATTTGGG 42348818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5836 CTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAGTGGTGCATGCCTGTAGTCCCAGTTATTTGGG 5895

 42348819 AGGCCGATACAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGACTA 42348878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5896 AGGCCGATACAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGACTA 5955

 42348879 CACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAATGAGAAAAAAAAAAAGAGAGAGAGAGAGAA 42348938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5956 CACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAATGAGAAAAAAAAAAAGAGAGAGAGAGAGAA 6015

 42348939 GGAAAGAGAGAAGGAAAGAAAGACAGAAAGACCAAAAGAAAGAAAGAGAGAGAGAGAGAG 42348998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6016 GGAAAGAGAGAAGGAAAGAAAGACAGAAAGACCAAAAGAAAGAAAGAGAGAGAGAGAGAG 6075

 42348999 AGAGAGAGAGAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAG 42349058
          ||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6076 AGAGAGAG--------------AGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAG 6121

 42349059 AAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAGATCTTGGATTTTGTCAGATTCTTTTTCTGCATCTATTG 42349118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6122 AAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAGATCTTGGATTTTGTCAGATTCTTTTTCTGCATCTATTG 6181

 42349119 AGATATTCATATGGTTTTCCTTTTCGGCCTGTTACTGTGGTGAATCACTGAGTGACTTTC 42349178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6182 AGATATTCATATGGTTTTCCTTTTCGGCCTGTTACTGTGGTGAATCACTGAGTGACTTTC 6241

 42349179 AAATATTAAACTAACCTTGCATTCCTGGGCTATGGCTATAATGTACTATCCTTTTATATA 42349238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6242 AAATATTAAACTAACCTTGCATTCCTGGGCTATGGCTATAATGTACTATCCTTTTATATA 6301

 42349239 TTGTTATATTCTATTTGCTATATTTTCCTAAAAATTTTTGCATTTATACTCATGAAGGAT 42349298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6302 TTGTTATATTCTATTTGCTATATTTTCCTAAAAATTTTTGCATTTATACTCATGAAGGAT 6361

 42349299 ATTAGTCTGCAGTTTTGCTTTCTTGTTATATATTTGTCTGGGTTTGATATCAGAGATCAG 42349358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6362 ATTAGTCTGCAGTTTTGCTTTCTTGTTATATATTTGTCTGGGTTTGATATCAGAGATCAG 6421

 42349359 AGTAATATCAGTATTGTAGGCACCAGTAAATATTTCCTTATAATGCTTTTTATTTTTATT 42349418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6422 AGTAATATCAGTATTGTAGGCACCAGTAAATATTTCCTTATAATGCTTTTTATTTTTATT 6481

 42349419 TTTTAAATTTTTTTATTTTTGAGACGGTGTTTTGTTCTTGTTGCCTGGGCTGGAGTACAA 42349478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6482 TTTTAAATTTTTTTATTTTTGAGACGGTGTTTTGTTCTTGTTGCCTGGGCTGGAGTACAA 6541

 42349479 TGTCACGATCTCAGCTCGTTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTC 42349538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6542 TGTCACGATCTCAGCTCGTTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTC 6601

 42349539 AGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGACACACACCACCACACCTAGCTAATTTTGTATTT 42349598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6602 AGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGACACACACCACCACACCTAGCTAATTTTGTATTT 6661

 42349599 TTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGT 42349658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6662 TTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGT 6721

 42349659 GATCTGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCCGGGATTACAGGTGTGAGCCACCATGCCCAG 42349718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6722 GATCTGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCCGGGATTACAGGTGTGAGCCACCATGCCCAG 6781

 42349719 CGTACAATGCTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACCCAGGCAGAAGTGCAGTGGCATGA 42349778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6782 CGTACAATGCTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACCCAGGCAGAAGTGCAGTGGCATGA 6841

 42349779 TCTTGGCTCACTGCAACCTTTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCC 42349838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6842 TCTTGGCTCACTGCAACCTTTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCC 6901

 42349839 CAGTAGCTTGGACTACAGGCACACGCCACCACACCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTA 42349898
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
     6902 CAGTAGCTTGGACTACAGGCACACGCCACCACACCCGGCTAA-TTTTTGTATTTTTAGTA 6960

 42349899 GAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTAATCTG 42349958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6961 GAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTAATCTG 7020

 42349959 CCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGCCCCCGGCCATGG 42350018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7021 CCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGCCCCCGGCCATGG 7080

 42350019 CTGGGATTTAAACCCAGGCTTCCTAAGTCAAAGTTTATTGCTGTATATATATACAGGTTT 42350078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7081 CTGGGATTTAAACCCAGGCTTCCTAAGTCAAAGTTTATTGCTGTATATATATACAGGTTT 7140

 42350079 TTTTTTCTTTTTTCTTTTTTTTTCTTTTTTTGAGGCAGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGA 42350138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7141 TTTTTTCTTTTTTCTTTTTTTTTCTTTTTTTGAGGCAGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGA 7200

 42350139 CTGGAATGCAATGGCATGATCTCGGCTCAACACAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGCAAT 42350198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7201 CTGGAATGCAATGGCATGATCTCGGCTCAACACAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGCAAT 7260

 42350199 TCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCGCCACCGCACCCAGCTA 42350258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7261 TCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCGCCACCGCACCCAGCTA 7320

 42350259 ATTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGTCTGGTCTCGAACTCC 42350318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7321 ATTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGTCTGGTCTCGAACTCC 7380

 42350319 CGACCTCAGATGATCTGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCC 42350378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7381 CGACCTCAGATGATCTGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCC 7440

 42350379 ACTGCGCCTGGCCAGTTTATTGCTATTTTTTAGCATATCATAGCTACTTATATTTTGTTC 42350438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7441 ACTGCGCCTGGCCAGTTTATTGCTATTTTTTAGCATATCATAGCTACTTATATTTTGTTC 7500

 42350439 TGTGACATGTGTTTATTGACTTGGATTCTGTCTGCATTTCTCTTTTGTCCCCTGAATACA 42350498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7501 TGTGACATGTGTTTATTGACTTGGATTCTGTCTGCATTTCTCTTTTGTCCCCTGAATACA 7560

 42350499 CTGTTTTGGGTTGTGGGCAGGAGCCCCATCTAACCCAAACCTTATAATTTTCACTGGACC 42350558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7561 CTGTTTTGGGTTGTGGGCAGGAGCCCCATCTAACCCAAACCTTATAATTTTCACTGGACC 7620

 42350559 TACCGCACTGTCTGTACCCAGAAGATGATTCTAGGGTTTTTCTTTTTCCTTTTGAGAGAT 42350618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7621 TACCGCACTGTCTGTACCCAGAAGATGATTCTAGGGTTTTTCTTTTTCCTTTTGAGAGAT 7680

 42350619 CTAAGTATCTGGGTTTATCTGACCACATAGTATTCATCAGTCTGCCTTTTTCATGGTCCC 42350678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7681 CTAAGTATCTGGGTTTATCTGACCACATAGTATTCATCAGTCTGCCTTTTTCATGGTCCC 7740

 42350679 TCCACAATCTAAGATTTAAATCAGGCTGTAATTAACTCTAGCACACAGGCTTTTCTACAG 42350738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7741 TCCACAATCTAAGATTTAAATCAGGCTGTAATTAACTCTAGCACACAGGCTTTTCTACAG 7800

 42350739 AAACCTTCCCAGGCTGCACTGTCAGCCTGCTTCTCTCCATTAATGCATGCCATTGGCAGC 42350798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7801 AAACCTTCCCAGGCTGCACTGTCAGCCTGCTTCTCTCCATTAATGCATGCCATTGGCAGC 7860

 42350799 CAGAAACCAGATTTTGCCCTGAGCTACCCACACAAGTTTGAGGCAAGATTATGGGTGAAG 42350858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7861 CAGAAACCAGATTTTGCCCTGAGCTACCCACACAAGTTTGAGGCAAGATTATGGGTGAAG 7920

 42350859 AAAAGCTTGGGGTGGATGCATCTCCTATATGTAAAGGCTGTTTTGTTTGAGTGATTCCAA 42350918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7921 AAAAGCTTGGGGTGGATGCATCTCCTATATGTAAAGGCTGTTTTGTTTGAGTGATTCCAA 7980

 42350919 GTGCTGGTACACTATGATTAATTAACTTGGTTAAGGATTAATTCTTAAAAATCAGGAATG 42350978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7981 GTGCTGGTACACTATGATTAATTAACTTGGTTAAGGATTAATTCTTAAAAATCAGGAATG 8040

 42350979 ATTTGAATCGTTCCTCCAAGTGAGTTGCTCAGCTGCCTCCAGGGAGAGGATCAGTTGAAA 42351038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8041 ATTTGAATCGTTCCTCCAAGTGAGTTGCTCAGCTGCCTCCAGGGAGAGGATCAGTTGAAA 8100

 42351039 AAAGTGGACAATTAATGTCTTAGAGATGACATTATCTCTTTGACATTCCATAGAGATAAA 42351098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8101 AAAGTGGACAATTAATGTCTTAGAGATGACATTATCTCTTTGACATTCCATAGAGATAAA 8160

 42351099 GAGAAAGGCTAATGAGGCATCTCTTTGACACACACTTTCTCTCTCTGTTTTTATTTATTT 42351158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     8161 GAGAAAGGCTAATGAGGCATCTCTTTGACACACACTTTCTCTGTCTGTTTTTATTTATTT 8220

 42351159 ATTTATTTTTGGTTCACAGGTATCCTCAGCCCTAATATAGACTAATAAATCTAAGCCTGT 42351218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8221 ATTTATTTTTGGTTCACAGGTATCCTCAGCCCTAATATAGACTAATAAATCTAAGCCTGT 8280

 42351219 AAGCCTGTGAGTTTGTTTCTTTTCGTAAGTATTCAGCAATGCAAATCCTACCCCCAAAAC 42351278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8281 AAGCCTGTGAGTTTGTTTCTTTTCGTAAGTATTCAGCAATGCAAATCCTACCCCCAAAAC 8340

 42351279 TGTCTTCTTTGACCCATTTCCTGTATTCCTGTATCTGTTATCTTCAGATCTCTCCACCTG 42351338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8341 TGTCTTCTTTGACCCATTTCCTGTATTCCTGTATCTGTTATCTTCAGATCTCTCCACCTG 8400

 42351339 ACTGTCCTCATTATTGAAACGTCATATTTTGACCTCAACACTTCATAGTTGCTGATGTGA 42351398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8401 ACTGTCCTCATTATTGAAACGTCATATTTTGACCTCAACACTTCATAGTTGCTGATGTGA 8460

 42351399 CTTCCTCTATGTTTGAAATGTTTTCTCAGTTACTGCCCTAAGTAAAAAGCAAACACAACA 42351458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8461 CTTCCTCTATGTTTGAAATGTTTTCTCAGTTACTGCCCTAAGTAAAAAGCAAACACAACA 8520

 42351459 AGTTACGGCTTGGCTATCCTTTTTTTTTTTTTTTTCCAAAAAAGAGCTATTTATTACTAA 42351518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8521 AGTTACGGCTTGGCTATCCTTTTTTTTTTTTTTTTCCAAAAAAGAGCTATTTATTACTAA 8580

 42351519 GACAAGTCTACAACAACACTAAAAGTATTCAAAAAGAAAAACATCAGTCATATTTCTGCC 42351578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8581 GACAAGTCTACAACAACACTAAAAGTATTCAAAAAGAAAAACATCAGTCATATTTCTGCC 8640

 42351579 ACTTACCACAACCACTTTCTTTTCTCCCAGATTTTCTTCCAGTCTTCAGTCAGATATAGA 42351638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8641 ACTTACCACAACCACTTTCTTTTCTCCCAGATTTTCTTCCAGTCTTCAGTCAGATATAGA 8700

 42351639 AATATTTTATGTAAGCATAATTATAATGTTCATGTAATTTTTGTGTTCCACTTTTTGTTT 42351698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8701 AATATTTTATGTAAGCATAATTATAATGTTCATGTAATTTTTGTGTTCCACTTTTTGTTT 8760

 42351699 AACATCACTTAATAAACACTTTCTTGTCCTTACATAGTCTTCCTAATGATCTTTTTTTGT 42351758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8761 AACATCACTTAATAAACACTTTCTTGTCCTTACATAGTCTTCCTAATGATCTTTTTTTGT 8820

 42351759 GGCTTCGTGGTTTCCCATGGATATGCCATAACTTGTTTAATCATTTCCCCTGCTGCTACG 42351818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8821 GGCTTCGTGGTTTCCCATGGATATGCCATAACTTGTTTAATCATTTCCCCTGCTGCTACG 8880

 42351819 CATTAAGTTATTTCCAGTTTTTAACTATTATAAGTGGTTCTTTTTTTATTTTTTATTTTT 42351878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8881 CATTAAGTTATTTCCAGTTTTTAACTATTATAAGTGGTTCTTTTTTTATTTTTTATTTTT 8940

 42351879 TGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCACCAGGCTGGAGTGCATGGCATGATCTCGGCTCACTGC 42351938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8941 TGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCACCAGGCTGGAGTGCATGGCATGATCTCGGCTCACTGC 9000

 42351939 AACCTCCATCTCCCTGGTTCAGGCGATTCTCCTGTCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACT 42351998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9001 AACCTCCATCTCCCTGGTTCAGGCGATTCTCCTGTCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACT 9060

 42351999 ACAGGCAGGCGCCACCCCACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCAC 42352058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9061 ACAGGCAGGCGCCACCCCACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCAC 9120

 42352059 CATGTCGGCCAGGATGGTCTTAATCTCCTGACCTCATGATCTGCCCACCTTGGCCTCCCA 42352118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9121 CATGTCGGCCAGGATGGTCTTAATCTCCTGACCTCATGATCTGCCCACCTTGGCCTCCCA 9180

 42352119 AAGTGCTGGAATTATGGGCGTGAGCTGGCCATAACTATTATAAGTGGTTCTTCTATAAAC 42352178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9181 AAGTGCTGGAATTATGGGCGTGAGCTGGCCATAACTATTATAAGTGGTTCTTCTATAAAC 9240

 42352179 ATCTAGTGCATGCAAAGATTTCTTTTCTTCTTTTTAATTATTTCCTTTGTAGAAATGTCC 42352238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9241 ATCTAGTGCATGCAAAGATTTCTTTTCTTCTTTTTAATTATTTCCTTTGTAGAAATGTCC 9300

 42352239 AGGAGGGCTGTTGCCATGTTGAAGGGTTTGAATGATTTTCAGGGATGATGAGCTCTTAAA 42352298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9301 AGGAGGGCTGTTGCCATGTTGAAGGGTTTGAATGATTTTCAGGGATGATGAGCTCTTAAA 9360

 42352299 AAGGCAGTACCACAGAAGTTCATAACACATGTTATATCTTGATTTATAAAACTAATGGTG 42352358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9361 AAGGCAGTACCACAGAAGTTCATAACACATGTTATATCTTGATTTATAAAACTAATGGTG 9420

 42352359 GGGCCTGGCACAGTGACTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGTAG 42352418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9421 GGGCCTGGCACAGTGACTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGTAG 9480

 42352419 ATTGCTTGAGGTCAGGAGTTTCAGATCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGCCTCTAC 42352478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9481 ATTGCTTGAGGTCAGGAGTTTCAGATCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGCCTCTAC 9540

 42352479 TAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCAGGTGACTGTAATCTCAGCTACTCGGGA 42352538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9541 TAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCAGGTGACTGTAATCTCAGCTACTCGGGA 9600

 42352539 GGCTGAGGCAGAAGAATCACTTCAATCCAGGAGGCGGAGTTTGCAGTGAGCTGATATTGC 42352598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9601 GGCTGAGGCAGAAGAATCACTTCAATCCAGGAGGCGGAGTTTGCAGTGAGCTGATATTGC 9660

 42352599 GCCACTGCACTCCAGTTTGGGTGACAGAGCGAGACTCTGTCTCAAAAATAAATAAATAAA 42352658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9661 GCCACTGCACTCCAGTTTGGGTGACAGAGCGAGACTCTGTCTCAAAAATAAATAAATAAA 9720

 42352659 TATGAATAAATAAATAAAAATAAAACTAATGATGATACAGAAGGGCCAAGAAACTTCATA 42352718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9721 TATGAATAAATAAATAAAAATAAAACTAATGATGATACAGAAGGGCCAAGAAACTTCATA 9780

 42352719 AAGCATCACTAACTGTCCATTCTCATACTCCAGAGCAGTCCAAGCAATTCACAATAAATA 42352778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9781 AAGCATCACTAACTGTCCATTCTCATACTCCAGAGCAGTCCAAGCAATTCACAATAAATA 9840

 42352779 TATCTACATCGTCTTATTCTTTATTCTACTGAAGCCCATTAAAAGAAAATTAGCCAATTT 42352838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9841 TATCTACATCGTCTTATTCTTTATTCTACTGAAGCCCATTAAAAGAAAATTAGCCAATTT 9900

 42352839 TTTCCTGTATTTTAAGTGACGAGCTTTTGGAATAAGTTTCAAGAAACTCAAGAGCAAAGC 42352898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9901 TTTCCTGTATTTTAAGTGACGAGCTTTTGGAATAAGTTTCAAGAAACTCAAGAGCAAAGC 9960

 42352899 CATGAGCTAACCAAAGATCCACTTTCTGAGATAAATCTTGTCTTAGAAAGGAAATGAAGG 42352958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9961 CATGAGCTAACCAAAGATCCACTTTCTGAGATAAATCTTGTCTTAGAAAGGAAATGAAGG 10020

 42352959 CATACAATGTGTGTGGCAGGAGGGGCCATGAGGAGGGGGCTGAGGTCAGATATGATCGGA 42353018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10021 CATACAATGTGTGTGGCAGGAGGGGCCATGAGGAGGGGGCTGAGGTCAGATATGATCGGA 10080

 42353019 ACGCTAGTGTCACAGTTGTCTCCTGTAAACTGGTCTCTGGGAGCTGGGTCAAGGCAGAGG 42353078
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10081 ACGCTAGTGTCATAGTTGTCTCCTGTAAACTGGTCTCTGGGAGCTGGGTCAAGGCAGAGG 10140

 42353079 AGTTGAAAGCCAAACACAGACAGCAGCTGTTGAGGATGTAAAGTCTCTGGGCAGAGTGGA 42353138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10141 AGTTGAAAGCCAAACACAGACAGCAGCTGTTGAGGATGTAAAGTCTCTGGGCAGAGTGGA 10200

 42353139 TAGGGAGCTGGGTGTGGTCACCCAGAAGCCAATTTCCACCCCACCCTACAGACCTAGCGA 42353198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10201 TAGGGAGCTGGGTGTGGTCACCCAGAAGCCAATTTCCACCCCACCCTACAGACCTAGCGA 10260

 42353199 CTGGGGCTAAGAAGAACTTCCCGTGTTGCATTCCAGCCCTTCTGATTGGGCTTAGTGAGA 42353258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10261 CTGGGGCTAAGAAGAACTTCCCGTGTTGCATTCCAGCCCTTCTGATTGGGCTTAGTGAGA 10320

 42353259 CTGCCAAAGACTGGCTGCAAGCTGCCTGATTGCACTGCATACACCTCCCTCAATGGTGTC 42353318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10321 CTGCCAAAGACTGGCTGCAAGCTGCCTGATTGCACTGCATACACCTCCCTCAATGGTGTC 10380

 42353319 CCGGCTGGAAAACACTGAGGCTTTTAAGAATACCACGTCCAGATGGCCAGGATGCAGGAC 42353378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10381 CCGGCTGGAAAACACTGAGGCTTTTAAGAATACCACGTCCAGATGGCCAGGATGCAGGAC 10440

 42353379 TGACCTGCAATTGCCACACTGGGCACCAGGTACAAGTAGATTTCACTGAAGTCCTCGAGG 42353438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10441 TGACCTGCAATTGCCACACTGGGCACCAGGTACAAGTAGATTTCACTGAAGTCCTCGAGG 10500

 42353439 GACTGAGTGAAACTGCTGGGGTATGCGGGTCTTTCCTATGTTGCACAAATCAGTGCTGAG 42353498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10501 GACTGAGTGAAACTGCTGGGGTATGCGGGTCTTTCCTATGTTGCACAAATCAGTGCTGAG 10560

 42353499 CTGCATAGGTGACAATGATCACTTCCACAATTTCCCAGAACATTTGTCAAGAGCCTGAAA 42353558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10561 CTGCATAGGTGACAATGATCACTTCCACAATTTCCCAGAACATTTGTCAAGAGCCTGAAA 10620

 42353559 GGGCTGCATCACTGAGCAGGGAATCTTCATTATTCATTTCAACATCACTTTTCTTGGAAA 42353618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10621 GGGCTGCATCACTGAGCAGGGAATCTTCATTATTCATTTCAACATCACTTTTCTTGGAAA 10680

 42353619 CCTTGACTACTCCGCTCTCCAGAAATAATCCATCAAACTTTTCTCTTCGTTGAAGTCATA 42353678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10681 CCTTGACTACTCCGCTCTCCAGAAATAATCCATCAAACTTTTCTCTTCGTTGAAGTCATA 10740

 42353679 CTGCAAAAACTCCCATAATCAAATTCCCCACATTAGGATCCCTGTTTATTATGTAACAAC 42353738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10741 CTGCAAAAACTCCCATAATCAAATTCCCCACATTAGGATCCCTGTTTATTATGTAACAAC 10800

 42353739 AGAGTCAAGAGGGAAAAGAGTGCATCAGACATTGACATTTTTTTTCTCTCTCTCTCTCTT 42353798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10801 AGAGTCAAGAGGGAAAAGAGTGCATCAGACATTGACATTTTTTTTCTCTCTCTCTCTCTT 10860

 42353799 TTAAGTTTTTGTCATGAAAATTTTCAAACACACACAAAATGAGAGAAACGTAAAAATGAA 42353858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10861 TTAAGTTTTTGTCATGAAAATTTTCAAACACACACAAAATGAGAGAAACGTAAAAATGAA 10920

 42353859 CCCCCATGTACCCACCATCCAGCTTGGATAATCTCAACATACACCAATCTTGTTTCATCT 42353918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10921 CCCCCATGTACCCACCATCCAGCTTGGATAATCTCAACATACACCAATCTTGTTTCATCT 10980

 42353919 ATTGCCCCTCACCCCCAC 42353936
          ||||||||||||||||||
    10981 ATTGCCCCTCACCCCCAC 10998

Alignment time is 8.49683 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [42336259,42357318] =>     21060 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [       1,    4391] =>      4391 nucs 'mol-32-331c-071864_4391'

Score:        4303
Aligned:      4391        nucs
Identic:      4383 (100%) nucs =>       784 (100%)      3599 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [42341862,42342646] EXCISED REGION [42342654,42346259]
 second seq =>  [       1,     785] EXCISED REGION [     786,    4391]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         7 nucs [42342647,42342653]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        10 nucs [42342647,42342656] to [42342654,42342663]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [42342647,42342649] to [42342651,42342653]
 second seq =>         0 nucs

 42341862 AAAAAGATGTTTGGCCTTAATTCTATAGGTATTCCCCTTTGCCATAGATGTTACACCAAG 42341921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAAAAGATGTTTGGCCTTAATTCTATAGGTATTCCCCTTTGCCATAGATGTTACACCAAG 60

 42341922 AAAGAACACATTGAATCAAGCAAATTTAAGCTGGGTTTTTGTTTTTGTTTTTTGGTGGTG 42341981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAAGAACACATTGAATCAAGCAAATTTAAGCTGGGTTTTTGTTTTTGTTTTTTGGTGGTG 120

 42341982 GGGGGGATGATTTATAAGCAGGACTTCCCAAAGCTTTTAATATGCTTATATATGTGGCAG 42342041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGGGGGATGATTTATAAGCAGGACTTCCCAAAGCTTTTAATATGCTTATATATGTGGCAG 180

 42342042 TGTTGAGAGGGGAAGATTTGATATTCCAAGTATTTTTGGCCACAGAACTCTTTTTATCAT 42342101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGTTGAGAGGGGAAGATTTGATATTCCAAGTATTTTTGGCCACAGAACTCTTTTTATCAT 240

 42342102 GGAACATTTCCAGTGTTCCATGAGACACAATTAGGGGCTAGTGAGCCACTGACTTTTGAG 42342161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGAACATTTCCAGTGTTCCATGAGACACAATTAGGGGCTAGTGAGCCACTGACTTTTGAG 300

 42342162 TTGGAAAGTGACACATGGGGAAAGCAAAGTTTTGGAAGATTGATCTCACGGTAGAATATA 42342221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTGGAAAGTGACACATGGGGAAAGCAAAGTTTTGGAAGATTGATCTCACGGTAGAATATA 360

 42342222 AGGTGAACAGGAGAGAAAAGAGCCTGGATTCAGGCAACACAATCAGATGATTGGATACAG 42342281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGGTGAACAGGAGAGAAAAGAGCCTGGATTCAGGCAACACAATCAGATGATTGGATACAG 420

 42342282 GCTCAAGATTAGGGGGTGGGTTGCACTACACTGGAGCGGAGAATGGAGAGCAAAAGCACT 42342341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GCTCAAGATTAGGGGGTGGGTTGCACTACACTGGAGCGGAGAATGGAGAGCAAAAGCACT 480

 42342342 GATTGAATGCACAGTCTTCTGTTGGATCCTGGGATGATACAGAAGTGTCAGAGTTCCTGG 42342401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GATTGAATGCACAGTCTTCTGTTGGATCCTGGGATGATACAGAAGTGTCAGAGTTCCTGG 540

 42342402 GTCTTGTAGGAGTTCCAATGAGCATCAATCAAAAGTTTGATTGTAAGGCACAGAAATCAA 42342461
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GTCTTGTAGGAGTTCCAATGCGCATCAATCAAAAGTTTGATTGTAAGGCACAGAAATCAA 600

 42342462 CTTGGACCAGCTAAAGCAAAAAGACCATTTTTAGGGAAATAGGGATGTGTCACAAAGAAC 42342521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTTGGACCAGCTAAAGCAAAAAGACCATTTTTAGGGAAATAGGGATGTGTCACAAAGAAC 660

 42342522 TGCATCTAGGTACTGGAAATCAACAAAAAGTTCCCCATCTGATCTCAGCTTCTCTGTGTG 42342581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGCATCTAGGTACTGGAAATCAACAAAAAGTTCCCCATCTGATCTCAGCTTCTCTGTGTG 720

 42342582 TCTACTACATACACTATCTTTCTCCTCTTTTCTTTCCTCTCTACCCCCTACCTCCCTCCT 42342641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCTACTACATACACTATCTTTCTCCTCTTTTCTTTCCTCTCTACCCCCTACCTCCCTCCT 780

 42342642 CTCTC 42342646
          |||||
      781 CTCTC 785

EXCISED REGION

 42342654 TTTTTTTTTTGTTTTTTGGTTTTTTTATGTTTGTTTGTTTGCTTTTGGAGACACGGTCTC 42342713
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
      786 TTTTTTTTTTGTTTTTTGGTTTTTTTATGTTTGTTTGTTTGTTTTTGGAGACACGGTCTC 845

 42342714 CCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCTTAATTACTGCAGCCTCAATCTCCTGGGCT 42342773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      846 CCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCTTAATTACTGCAGCCTCAATCTCCTGGGCT 905

 42342774 CAAGTGACCCTCCCACCTCAGCCTCCTGAATAGCTGGGACCACAGGTGCAAGCCACAGTG 42342833
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      906 CAAGTGACCCTCCCACTTCAGCCTCCTGAATAGCTGGGACCACAGGTGCAAGCCACAGTG 965

 42342834 CTCAGCTAATTAAAAAAAATTTTTTTTTCAGAGATGGGGTCTCACTATGTTGTCCAGGCT 42342893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      966 CTCAGCTAATTAAAAAAAATTTTTTTTTCAGAGATGGGGTCTCACTATGTTGTCCAGGCT 1025

 42342894 GGTCTCAAACTCCTAGGCTCAAGCAGTCCTCCCGTTTCAGCCTCAAAAAGTGCTGGGATT 42342953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1026 GGTCTCAAACTCCTAGGCTCAAGCAGTCCTCCCGTTTCAGCCTCAAAAAGTGCTGGGATT 1085

 42342954 ACAGGTGTGAGCCATCGCACTCCACCTTCTCTATAGTTACTGAGTTTGCGTGTTACACTG 42343013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1086 ACAGGTGTGAGCCATCGCACTCCACCTTCTCTATAGTTACTGAGTTTGCGTGTTACACTG 1145

 42343014 AGTTTACATCTTACATTTCTAGCCATATCAGAAACGACCTCTGCACCTCTCTTTCCCAAT 42343073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1146 AGTTTACATCTTACATTTCTAGCCATATCAGAAACGACCTCTGCACCTCTCTTTCCCAAT 1205

 42343074 TTGAGATTTCTAATAGAAAGAATCTTGTTCACCCAGCTTGGGACTCATTGAGTTATGACC 42343133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1206 TTGAGATTTCTAATAGAAAGAATCTTGTTCACCCAGCTTGGGACTCATTGAGTTATGACC 1265

 42343134 AGTGGGATAGATTTTAGAAGATAAACATGTCTATAGGGACTTACCGTGTGAATTAGTGGG 42343193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1266 AGTGGGATAGATTTTAGAAGATAAACATGTCTATAGGGACTTACCGTGTGAATTAGTGGG 1325

 42343194 GGAGCCGCTTACCAGGCAGAGGGGTCTGCTGTAAAGTGATACTGTGACTTTAAATTGAAA 42343253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1326 GGAGCCGCTTACCAGGCAGAGGGGTCTGCTGTAAAGTGATACTGTGACTTTAAATTGAAA 1385

 42343254 GTAAGCTTCTAGAAGAGTTGAAGAGGAGTGGATTATTGTTGAATGGATGTATAACTAATG 42343313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1386 GTAAGCTTCTAGAAGAGTTGAAGAGGAGTGGATTATTGTTGAATGGATGTATAACTAATG 1445

 42343314 AAGCTTTAAAGGAAGTTTATTAGAAAGTCCATGTCCTTGTCTCTTTCCCAAACTCCTTTA 42343373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1446 AAGCTTTAAAGGAAGTTTATTAGAAAGTCCATGTCCTTGTCTCTTTCCCAAACTCCTTTA 1505

 42343374 GTTCCCAAGTCCTGAAAGAATCTATGGATAAGGGAAGCAGAATACTATAGTGGTTAAGAG 42343433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1506 GTTCCCAAGTCCTGAAAGAATCTATGGATAAGGGAAGCAGAATACTATAGTGGTTAAGAG 1565

 42343434 CACATGCTCGAGGTTAAACTGTCTGTATTTTGGATCCTGGCCTTGAGGACTTGGGCAAGT 42343493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1566 CACATGCTCGAGGTTAAACTGTCTGTATTTTGGATCCTGGCCTTGAGGACTTGGGCAAGT 1625

 42343494 TACGTGACCTGCCTGAGCCTCAGTTTCCTCACCTGTAATATGGGTATCACGAGGAATAAA 42343553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1626 TACGTGACCTGCCTGAGCCTCAGTTTCCTCACCTGTAATATGGGTATCACGAGGAATAAA 1685

 42343554 TAAGGTAATATGTGTAAAGTGCTTGGCACAATGCTCTTGATAATGTTAGCAACATAATTT 42343613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1686 TAAGGTAATATGTGTAAAGTGCTTGGCACAATGCTCTTGATAATGTTAGCAACATAATTT 1745

 42343614 TGTAATGAAAATTAACTGATGGGGCTGAAATGTGCATCAGCAGATCCAAATATCCTTGAT 42343673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     1746 TGTAATGAAAATTAACTGATGGGGCTGAAATGTGCATCAGCAGATCCAAATATCCTCGAT 1805

 42343674 AAACTGGCCAAAAGAAAGATGAATTGGCAGAGAGGCAAGTGTTCATCTCAGTTCTCCAGA 42343733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1806 AAACTGGCCAAAAGAAAGATGAATTGGCAGAGAGGCAAGTGTTCATCTCAGTTCTCCAGA 1865

 42343734 TATCCCTGCAAATGTGGCCTCTGGAGTAGAAGATTTAGGGAGAAAAATAAGCCATGAAGC 42343793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1866 TATCCCTGCAAATGTGGCCTCTGGAGTAGAAGATTTAGGGAGAAAAATAAGCCATGAAGC 1925

 42343794 TCTTCTGGCACCAACATGAACTTCAGGGATCATGGGACATTTGGGCCAGTAACATTCCTC 42343853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1926 TCTTCTGGCACCAACATGAACTTCAGGGATCATGGGACATTTGGGCCAGTAACATTCCTC 1985

 42343854 TTTGTTCCTAGAGATTTAATATCTACCTACCAACTAAATGGCCTTGATTTGGAGGAGAGA 42343913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1986 TTTGTTCCTAGAGATTTAATATCTACCTACCAACTAAATGGCCTTGATTTGGAGGAGAGA 2045

 42343914 AGACAAGAAGAGGAATTGCTTTCAGCTGGTCCTTGCCTTTAACTAACCAGGGGTACAAAA 42343973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2046 AGACAAGAAGAGGAATTGCTTTCAGCTGGTCCTTGCCTTTAACTAACCAGGGGTACAAAA 2105

 42343974 ATTTTAAAATACAAAGGAGACCATGTGTAAAACATTAGTTAAGCTCAGATATAAATCTAG 42344033
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2106 ATTTTAAAACACAAAGGAGACCATGTGTAAAACATTAGTTAAGCTCAGATATAAATCTAG 2165

 42344034 TCTTTGACCAGTCCAGAGCTAATCAATATGCTTTTCTACTCTCTTTGAACTTTTGAGTTT 42344093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2166 TCTTTGACCAGTCCAGAGCTAATCAATATGCTTTTCTACTCTCTTTGAACTTTTGAGTTT 2225

 42344094 TCTGGCAACAACAAAAATCCCAAACCTCATCCAAAACCGTAGTCCAGACAGCCCAGTTTC 42344153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2226 TCTGGCAACAACAAAAATCCCAAACCTCATCCAAAACCGTAGTCCAGACAGCCCAGTTTC 2285

 42344154 TGCACTCCCTTCCTTGTGTCACATATTGTTGACAGAACTACTCCCGTTACCACATTCATT 42344213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2286 TGCACTCCCTTCCTTGTGTCACATATTGTTGACAGAACTACTCCCGTTACCACATTCATT 2345

 42344214 CCAGTGGTGATTCAAATTCTTCTGCAGAAATGGACTTGAAAGACAGAAAACTGCTCCTGT 42344273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2346 CCAGTGGTGATTCAAATTCTTCTGCAGAAATGGACTTGAAAGACAGAAAACTGCTCCTGT 2405

 42344274 AATCACTTAATAAGGAATCTTGGATGAGGAATACAGAGCTATGAATATGGATTTACTCTT 42344333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2406 AATCACTTAATAAGGAATCTTGGATGAGGAATACAGAGCTATGAATATGGATTTACTCTT 2465

 42344334 AGCCTTTATGGATGCCTTTTTCTCAGTTATTTTCACTGAAAATCATGATGAACTGATTTA 42344393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2466 AGCCTTTATGGATGCCTTTTTCTCAGTTATTTTCACTGAAAATCATGATGAACTGATTTA 2525

 42344394 AATATCAAGGTAAACTGAGATGGAAAATTACCGATAATAAGAGTTTTCTGAAAATATAGA 42344453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2526 AATATCAAGGTAAACTGAGATGGAAAATTACCGATAATAAGAGTTTTCTGAAAATATAGA 2585

 42344454 TTGGCCTCTTTAAAGCACATCGAGTTTGTTTTGTTTAAATTACAAATTCACATATATTTG 42344513
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2586 TTGGCCTCTTTAAAACACATCGAGTTTGTTTTGTTTAAATTACAAATTCACATATATTTG 2645

 42344514 AAATGTGTTTAAATGTGTCAGTTTTAGGCAAAACTAAACTATTTGATTCCTTTCCAAAAA 42344573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2646 AAATGTGTTTAAATGTGTCAGTTTTAGGCAAAACTAAACTATTTGATTCCTTTCCAAAAA 2705

 42344574 TCAGGAATTTGCTTTGGAAAAAAACCATGCAGTTTGATTTACAAAGCAGAGCGGGGGGGA 42344633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2706 TCAGGAATTTGCTTTGGAAAAAAACCATGCAGTTTGATTTACAAAGCAGAGCGGGGGGGA 2765

 42344634 AGTAGTGGGTGAGAAAGACCCACCCAAAGGCTGCAGCCAGCTTCCCCAGGAAGATTCATA 42344693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2766 AGTAGTGGGTGAGAAAGACCCACCCAAAGGCTGCAGCCAGCTTCCCCAGGAAGATTCATA 2825

 42344694 ACCATGCCACAATACTGTCCTTCAATTCGTTCCAACAGATTTTACTATAACTCTAAATCA 42344753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2826 ACCATGCCACAATACTGTCCTTCAATTCGTTCCAACAGATTTTACTATAACTCTAAATCA 2885

 42344754 TTAGAAGCAACTGCTGCTATGACTAGTGCTATCTTTGCCTCAAAAAGAGGAAAAATCAGG 42344813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2886 TTAGAAGCAACTGCTGCTATGACTAGTGCTATCTTTGCCTCAAAAAGAGGAAAAATCAGG 2945

 42344814 ACATACAATATAATCCCCTCAGGATCTAGGAGAGAAATCAGCCCATTTGTCATAAGAACT 42344873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2946 ACATACAATATAATCCCCTCAGGATCTAGGAGAGAAATCAGCCCATTTGTCATAAGAACT 3005

 42344874 GAAAACCTCAGCTAAATAGTATATGAAACATTGGTATTTCATACCTTGACATTACATATT 42344933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3006 GAAAACCTCAGCTAAATAGTATATGAAACATTGGTATTTCATACCTTGACATTACATATT 3065

 42344934 TTTGAAAATAAAGTAAGCATACACACAAGAAGTGGCTAGATGCAGCAGTTATAAAGTGGC 42344993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3066 TTTGAAAATAAAGTAAGCATACACACAAGAAGTGGCTAGATGCAGCAGTTATAAAGTGGC 3125

 42344994 TTAAGTTGGGTTAACTAAATATAACCTAGAAAAACCATCTTATCTATTGCAAATTATTTC 42345053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3126 TTAAGTTGGGTTAACTAAATATAACCTAGAAAAACCATCTTATCTATTGCAAATTATTTC 3185

 42345054 CAGAAAAAGGTAAGAAAAATCCAACCAACACTTTTTAAACATCCTGAGCTATTCACAGCA 42345113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3186 CAGAAAAAGGTAAGAAAAATCCAACCAACACTTTTTAAACATCCTGAGCTATTCACAGCA 3245

 42345114 AGTGAATCTTTACCCTTACCAGATGTATAAACATTTACATAAGGCAGGAGGTTCAACACT 42345173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3246 AGTGAATCTTTACCCTTACCAGATGTATAAACATTTACATAAGGCAGGAGGTTCAACACT 3305

 42345174 TGGAGAGTGTAATCAAGGCAGTAGTAACGCAGTGCTCCTCTCTTTGACTTGAATGACTTC 42345233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3306 TGGAGAGTGTAATCAAGGCAGTAGTAACGCAGTGCTCCTCTCTTTGACTTGAATGACTTC 3365

 42345234 CTCCCCATTAGGGTCATTATTGTTTTGCAGTGTCCCAGGGATGAAAGGACTTTGAAAGGT 42345293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3366 CTCCCCATTAGGGTCATTATTGTTTTGCAGTGTCCCAGGGATGAAAGGACTTTGAAAGGT 3425

 42345294 CATGTGTCTTGTGACCCAACTAGCAGCATCAGCATCACTGGGGAGAAACTCAAGCAGAAG 42345353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3426 CATGTGTCTTGTGACCCAACTAGCAGCATCAGCATCACTGGGGAGAAACTCAAGCAGAAG 3485

 42345354 CTTGAGTCTACTCCACTCTTGCTGACACCAAATCTGCATTTTTACAGGATTCTTGGGTGA 42345413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3486 CTTGAGTCTACTCCACTCTTGCTGACACCAAATCTGCATTTTTACAGGATTCTTGGGTGA 3545

 42345414 GTCACACACATATTCAAGGTTAAAATATGCCACCCTAGGTCTTTCTCCTGCTTCTGAGCA 42345473
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3546 GTCACAGACATATTCAAGGTTAAAATATGCCACCCTAGGTCTTTCTCCTGCTTCTGAGCA 3605

 42345474 AAACTGGGCACAAGGGACAAACTAGTTTCCTTCAGCCACTTTCAAATCCTTTATAGAGTG 42345533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3606 AAACTGGGCACAAGGGACAAACTAGTTTCCTTCAGCCACTTTCAAATCCTTTATAGAGTG 3665

 42345534 TACTGTGTGAGTCACTGAGAGGAAAGAGGAAATAATACTTATTTAGGGAAGTCTTGCATA 42345593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3666 TACTGTGTGAGTCACTGAGAGGAAAGAGGAAATAATACTTATTTAGGGAAGTCTTGCATA 3725

 42345594 ACTTAACAAAGTTAGTAACTTCTTCAATACACTCAAGTACCTATTTTTGGAAGCCCTACA 42345653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3726 ACTTAACAAAGTTAGTAACTTCTTCAATACACTCAAGTACCTATTTTTGGAAGCCCTACA 3785

 42345654 GGTTAGGTCAAAGTAAAGAGAAGCAAAAAATGGAGTGAGTTCTAGTAAAAAACTCTGACA 42345713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3786 GGTTAGGTCAAAGTAAAGAGAAGCAAAAAATGGAGTGAGTTCTAGTAAAAAACTCTGACA 3845

 42345714 AAATAAGGGAAGTGTAGAAGCTGAGTCTATGAGGGATGAGAGAAGCAATTTACCAAATTA 42345773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3846 AAATAAGGGAAGTGTAGAAGCTGAGTCTATGAGGGATGAGAGAAGCAATTTACCAAATTA 3905

 42345774 TCAGATCCAAAATCATCTCTGCACTGTAGATGATTTATAGCCCTGGAAGCTTAGAGGCTT 42345833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3906 TCAGATCCAAAATCATCTCTGCACTGTAGATGATTTATAGCCCTGGAAGCTTAGAGGCTT 3965

 42345834 GAGTCTCTTGCTGTATTTCATTTCAAATTAGTAATTTTTATCTAGGGCTTCCCTATGGCT 42345893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3966 GAGTCTCTTGCTGTATTTCATTTCAAATTAGTAATTTTTATCTAGGGCTTCCCTATGGCT 4025

 42345894 TAAAGTGAAGGCCCTGGAATTTCTGAAGTGAAATTATCTGATGATTTTTATGTATGGTCA 42345953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4026 TAAAGTGAAGGCCCTGGAATTTCTGAAGTGAAATTATCTGATGATTTTTATGTATGGTCA 4085

 42345954 TTCTGTAGTTATCCTGTAAGTTTCATATTTGTAACAAGACTGGAATCCGAACAATAGAAA 42346013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4086 TTCTGTAGTTATCCTGTAAGTTTCATATTTGTAACAAGACTGGAATCCGAACAATAGAAA 4145

 42346014 ACTCTGTGGCAGTAAGCCAAAACCTGATGGACTTAGGAGAGTTACGTATGTGTGTTTCAG 42346073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4146 ACTCTGTGGCAGTAAGCCAAAACCTGATGGACTTAGGAGAGTTACGTATGTGTGTTTCAG 4205

 42346074 TGGTCCTCAAATTCAGCTGCCTATTAGAATCACCTGGACTTTGAAAAAAAAAGAGCTTTC 42346133
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4206 TGGTCCTCAAATTTAGCTGCCTATTAGAATCACCTGGACTTTGAAAAAAAAAGAGCTTTC 4265

 42346134 TTGAGGTATAACTGACAAATAATAAGACAAACATATTTCAGTATACAATTGGATGAGTTT 42346193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4266 TTGAGGTATAACTGACAAATAATAAGACAAACATATTTCAGTATACAATTGGATGAGTTT 4325

 42346194 TGACATGTTATATTCTTGTGAAACCATCACCACAATCAAGCTATTCACCCCCCAAATTTT 42346253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4326 TGACATGTTATATTCTTGTGAAACCATCACCACAATCAAGCTATTCACCCCCCAAATTTT 4385

 42346254 CGTGCC 42346259
          ||||||
     4386 CGTGCC 4391

Alignment time is 3.2384 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [42336259,42357318] =>     21060 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [       1,    2428] =>      2428 nucs 'mol-32-338a-169460_2428'

Score:        2380
Aligned:      2424        nucs
Identic:      2420 (100%) nucs =>      2386 (100%)        34 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [42343870,42346259] EXCISED REGION [42347319,42347352]
 second seq =>  [       1,    2390] EXCISED REGION [    2395,    2428]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1059 nucs [42346260,42347318]
 second seq =>         4 nucs [2391,2394]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>      3625 nucs [42346260,42349884]
 second seq =>         4 nucs [2391,2394]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [2391,2391] to [2395,2395]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 42343870 TAATATCTACCTACCAACTAAATGGCCTTGATTTGGAGGAGAGAAGACAAGAAGAGGAAT 42343929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TAATATCTACCTACCAACTAAATGGCCTTGATTTGGAGGAGAGAAGACAAGAAGAGGAAT 60

 42343930 TGCTTTCAGCTGGTCCTTGCCTTTAACTAACCAGGGGTACAAAAATTTTAAAATACAAAG 42343989
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
       61 TGCTTTCAGCTGGTCCTTGCCTTTAACTAACCAGGGGTACAAAAATTTTAAAACACAAAG 120

 42343990 GAGACCATGTGTAAAACATTAGTTAAGCTCAGATATAAATCTAGTCTTTGACCAGTCCAG 42344049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GAGACCATGTGTAAAACATTAGTTAAGCTCAGATATAAATCTAGTCTTTGACCAGTCCAG 180

 42344050 AGCTAATCAATATGCTTTTCTACTCTCTTTGAACTTTTGAGTTTTCTGGCAACAACAAAA 42344109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGCTAATCAATATGCTTTTCTACTCTCTTTGAACTTTTGAGTTTTCTGGCAACAACAAAA 240

 42344110 ATCCCAAACCTCATCCAAAACCGTAGTCCAGACAGCCCAGTTTCTGCACTCCCTTCCTTG 42344169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATCCCAAACCTCATCCAAAACCGTAGTCCAGACAGCCCAGTTTCTGCACTCCCTTCCTTG 300

 42344170 TGTCACATATTGTTGACAGAACTACTCCCGTTACCACATTCATTCCAGTGGTGATTCAAA 42344229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGTCACATATTGTTGACAGAACTACTCCCGTTACCACATTCATTCCAGTGGTGATTCAAA 360

 42344230 TTCTTCTGCAGAAATGGACTTGAAAGACAGAAAACTGCTCCTGTAATCACTTAATAAGGA 42344289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTCTTCTGCAGAAATGGACTTGAAAGACAGAAAACTGCTCCTGTAATCACTTAATAAGGA 420

 42344290 ATCTTGGATGAGGAATACAGAGCTATGAATATGGATTTACTCTTAGCCTTTATGGATGCC 42344349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATCTTGGATGAGGAATACAGAGCTATGAATATGGATTTACTCTTAGCCTTTATGGATGCC 480

 42344350 TTTTTCTCAGTTATTTTCACTGAAAATCATGATGAACTGATTTAAATATCAAGGTAAACT 42344409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTTTCTCAGTTATTTTCACTGAAAATCATGATGAACTGATTTAAATATCAAGGTAAACT 540

 42344410 GAGATGGAAAATTACCGATAATAAGAGTTTTCTGAAAATATAGATTGGCCTCTTTAAAGC 42344469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
      541 GAGATGGAAAATTACCGATAATAAGAGTTTTCTGAAAATATAGATTGGCCTCTTTAAAAC 600

 42344470 ACATCGAGTTTGTTTTGTTTAAATTACAAATTCACATATATTTGAAATGTGTTTAAATGT 42344529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ACATCGAGTTTGTTTTGTTTAAATTACAAATTCACATATATTTGAAATGTGTTTAAATGT 660

 42344530 GTCAGTTTTAGGCAAAACTAAACTATTTGATTCCTTTCCAAAAATCAGGAATTTGCTTTG 42344589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GTCAGTTTTAGGCAAAACTAAACTATTTGATTCCTTTCCAAAAATCAGGAATTTGCTTTG 720

 42344590 GAAAAAAACCATGCAGTTTGATTTACAAAGCAGAGCGGGGGGGAAGTAGTGGGTGAGAAA 42344649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GAAAAAAACCATGCAGTTTGATTTACAAAGCAGAGCGGGGGGGAAGTAGTGGGTGAGAAA 780

 42344650 GACCCACCCAAAGGCTGCAGCCAGCTTCCCCAGGAAGATTCATAACCATGCCACAATACT 42344709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GACCCACCCAAAGGCTGCAGCCAGCTTCCCCAGGAAGATTCATAACCATGCCACAATACT 840

 42344710 GTCCTTCAATTCGTTCCAACAGATTTTACTATAACTCTAAATCATTAGAAGCAACTGCTG 42344769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GTCCTTCAATTCGTTCCAACAGATTTTACTATAACTCTAAATCATTAGAAGCAACTGCTG 900

 42344770 CTATGACTAGTGCTATCTTTGCCTCAAAAAGAGGAAAAATCAGGACATACAATATAATCC 42344829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTATGACTAGTGCTATCTTTGCCTCAAAAAGAGGAAAAATCAGGACATACAATATAATCC 960

 42344830 CCTCAGGATCTAGGAGAGAAATCAGCCCATTTGTCATAAGAACTGAAAACCTCAGCTAAA 42344889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CCTCAGGATCTAGGAGAGAAATCAGCCCATTTGTCATAAGAACTGAAAACCTCAGCTAAA 1020

 42344890 TAGTATATGAAACATTGGTATTTCATACCTTGACATTACATATTTTTGAAAATAAAGTAA 42344949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TAGTATATGAAACATTGGTATTTCATACCTTGACATTACATATTTTTGAAAATAAAGTAA 1080

 42344950 GCATACACACAAGAAGTGGCTAGATGCAGCAGTTATAAAGTGGCTTAAGTTGGGTTAACT 42345009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GCATACACACAAGAAGTGGCTAGATGCAGCAGTTATAAAGTGGCTTAAGTTGGGTTAACT 1140

 42345010 AAATATAACCTAGAAAAACCATCTTATCTATTGCAAATTATTTCCAGAAAAAGGTAAGAA 42345069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AAATATAACCTAGAAAAACCATCTTATCTATTGCAAATTATTTCCAGAAAAAGGTAAGAA 1200

 42345070 AAATCCAACCAACACTTTTTAAACATCCTGAGCTATTCACAGCAAGTGAATCTTTACCCT 42345129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AAATCCAACCAACACTTTTTAAACATCCTGAGCTATTCACAGCAAGTGAATCTTTACCCT 1260

 42345130 TACCAGATGTATAAACATTTACATAAGGCAGGAGGTTCAACACTTGGAGAGTGTAATCAA 42345189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TACCAGATGTATAAACATTTACATAAGGCAGGAGGTTCAACACTTGGAGAGTGTAATCAA 1320

 42345190 GGCAGTAGTAACGCAGTGCTCCTCTCTTTGACTTGAATGACTTCCTCCCCATTAGGGTCA 42345249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GGCAGTAGTAACGCAGTGCTCCTCTCTTTGACTTGAATGACTTCCTCCCCATTAGGGTCA 1380

 42345250 TTATTGTTTTGCAGTGTCCCAGGGATGAAAGGACTTTGAAAGGTCATGTGTCTTGTGACC 42345309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTATTGTTTTGCAGTGTCCCAGGGATGAAAGGACTTTGAAAGGTCATGTGTCTTGTGACC 1440

 42345310 CAACTAGCAGCATCAGCATCACTGGGGAGAAACTCAAGCAGAAGCTTGAGTCTACTCCAC 42345369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CAACTAGCAGCATCAGCATCACTGGGGAGAAACTCAAGCAGAAGCTTGAGTCTACTCCAC 1500

 42345370 TCTTGCTGACACCAAATCTGCATTTTTACAGGATTCTTGGGTGAGTCACACACATATTCA 42345429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     1501 TCTTGCTGACACCAAATCTGCATTTTTACAGGATTCTTGGGTGAGTCACAGACATATTCA 1560

 42345430 AGGTTAAAATATGCCACCCTAGGTCTTTCTCCTGCTTCTGAGCAAAACTGGGCACAAGGG 42345489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AGGTTAAAATATGCCACCCTAGGTCTTTCTCCTGCTTCTGAGCAAAACTGGGCACAAGGG 1620

 42345490 ACAAACTAGTTTCCTTCAGCCACTTTCAAATCCTTTATAGAGTGTACTGTGTGAGTCACT 42345549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ACAAACTAGTTTCCTTCAGCCACTTTCAAATCCTTTATAGAGTGTACTGTGTGAGTCACT 1680

 42345550 GAGAGGAAAGAGGAAATAATACTTATTTAGGGAAGTCTTGCATAACTTAACAAAGTTAGT 42345609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GAGAGGAAAGAGGAAATAATACTTATTTAGGGAAGTCTTGCATAACTTAACAAAGTTAGT 1740

 42345610 AACTTCTTCAATACACTCAAGTACCTATTTTTGGAAGCCCTACAGGTTAGGTCAAAGTAA 42345669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AACTTCTTCAATACACTCAAGTACCTATTTTTGGAAGCCCTACAGGTTAGGTCAAAGTAA 1800

 42345670 AGAGAAGCAAAAAATGGAGTGAGTTCTAGTAAAAAACTCTGACAAAATAAGGGAAGTGTA 42345729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AGAGAAGCAAAAAATGGAGTGAGTTCTAGTAAAAAACTCTGACAAAATAAGGGAAGTGTA 1860

 42345730 GAAGCTGAGTCTATGAGGGATGAGAGAAGCAATTTACCAAATTATCAGATCCAAAATCAT 42345789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GAAGCTGAGTCTATGAGGGATGAGAGAAGCAATTTACCAAATTATCAGATCCAAAATCAT 1920

 42345790 CTCTGCACTGTAGATGATTTATAGCCCTGGAAGCTTAGAGGCTTGAGTCTCTTGCTGTAT 42345849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CTCTGCACTGTAGATGATTTATAGCCCTGGAAGCTTAGAGGCTTGAGTCTCTTGCTGTAT 1980

 42345850 TTCATTTCAAATTAGTAATTTTTATCTAGGGCTTCCCTATGGCTTAAAGTGAAGGCCCTG 42345909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TTCATTTCAAATTAGTAATTTTTATCTAGGGCTTCCCTATGGCTTAAAGTGAAGGCCCTG 2040

 42345910 GAATTTCTGAAGTGAAATTATCTGATGATTTTTATGTATGGTCATTCTGTAGTTATCCTG 42345969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GAATTTCTGAAGTGAAATTATCTGATGATTTTTATGTATGGTCATTCTGTAGTTATCCTG 2100

 42345970 TAAGTTTCATATTTGTAACAAGACTGGAATCCGAACAATAGAAAACTCTGTGGCAGTAAG 42346029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TAAGTTTCATATTTGTAACAAGACTGGAATCCGAACAATAGAAAACTCTGTGGCAGTAAG 2160

 42346030 CCAAAACCTGATGGACTTAGGAGAGTTACGTATGTGTGTTTCAGTGGTCCTCAAATTCAG 42346089
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     2161 CCAAAACCTGATGGACTTAGGAGAGTTACGTATGTGTGTTTCAGTGGTCCTCAAATTTAG 2220

 42346090 CTGCCTATTAGAATCACCTGGACTTTGAAAAAAAAAGAGCTTTCTTGAGGTATAACTGAC 42346149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CTGCCTATTAGAATCACCTGGACTTTGAAAAAAAAAGAGCTTTCTTGAGGTATAACTGAC 2280

 42346150 AAATAATAAGACAAACATATTTCAGTATACAATTGGATGAGTTTTGACATGTTATATTCT 42346209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AAATAATAAGACAAACATATTTCAGTATACAATTGGATGAGTTTTGACATGTTATATTCT 2340

 42346210 TGTGAAACCATCACCACAATCAAGCTATTCACCCCCCAAATTTTCGTGCC 42346259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TGTGAAACCATCACCACAATCAAGCTATTCACCCCCCAAATTTTCGTGCC 2390

EXCISED REGION

 42347319 TTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGT 42347352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2395 TTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGT 2428

Alignment time is 1.79009 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [42336259,42357318] =>     21060 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [       1,    5501] =>      5501 nucs 'mol-32-3395-192760_5501'

Score:        5384
Aligned:      5502        nucs
Identic:      5488 (100%) nucs =>      4925 (100%)       563 (100%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [42341321,42346259] EXCISED REGION [42347319,42347881]
 second seq =>  [       1,    4934] EXCISED REGION [    4939,    5501]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1059 nucs [42346260,42347318]
 second seq =>         4 nucs [4935,4938]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [4935,4935] to [4939,4939]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 42341321 GAAGAAGAAGATTGCTGGCGGGGTGTTGTGGCTCATACTTGTAATCCTAGCACTTTGGGA 42341380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GAAGAAGAAGATTGCTGGCGGGGTGTTGTGGCTCATACTTGTAATCCTAGCACTTTGGGA 60

 42341381 GGCCAAGGAAGGAGGATCACTTGAGCCAAAGAAGTCAAGGCTGCAGTGAGCTGTGATCAC 42341440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGCCAAGGAAGGAGGATCACTTGAGCCAAAGAAGTCAAGGCTGCAGTGAGCTGTGATCAC 120

 42341441 ACCACTCCATGCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAAACCCTGTCTCAAAAAGAAAAAAGAAAA 42341500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACCACTCCATGCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAAACCCTGTCTCAAAAAGAAAAAAGAAAA 180

 42341501 GATTGCCATCTTCCTGGGGTGACAAACATAATTTTAAAAGAATCAGGTAGAAACATAGGA 42341560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GATTGCCATCTTCCTGGGGTGACAAACATAATTTTAAAAGAATCAGGTAGAAACATAGGA 240

 42341561 CTGTATTTATGATGAAACAACTATGACTAAATGCTATGTTTTTCAGATTACACGTGCCTT 42341620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTGTATTTATGATGAAACAACTATGACTAAATGCTATGTTTTTCAGATTACACGTGCCTT 300

 42341621 AGGAAGTGAGAAAAGTATAAGTGCAATGTGGAATTGGGTGGTTGAGAAAACTCCAGAGAG 42341680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGGAAGTGAGAAAAGTATAAGTGCAATGTGGAATTGGGTGGTTGAGAAAACTCCAGAGAG 360

 42341681 GACCTGGTAGAGCTTGGAGGCAAGGTGGGCAAGGAACATTTCAAGAGGAGGGGACACTAC 42341740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GACCTGGTAGAGCTTGGAGGCAAGGTGGGCAAGGAACATTTCAAGAGGAGGGGACACTAC 420

 42341741 AGCTGAGGCACAGAGGTGAGAAAGCACAGGAAGCAAGAAAGAGGCTCATCTGGCTGCAGC 42341800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGCTGAGGCACAGAGGTGAGAAAGCACAGGAAGCAAGAAAGAGGCTCATCTGGCTGCAGC 480

 42341801 AGAGGGAGAAATAGTAAATTAGATCAGATAACTCATATATTGGGCACGTGTGCAGAGGGC 42341860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGAGGGAGAAATAGTAAATTAGATCAGATAACTCATATATTGGGCACGTGTGCAGAGGGC 540

 42341861 CAAAAAGATGTTTGGCCTTAATTCTATAGGTATTCCCCTTTGCCATAGATGTTACACCAA 42341920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CAAAAAGATGTTTGGCCTTAATTCTATAGGTATTCCCCTTTGCCATAGATGTTACACCAA 600

 42341921 GAAAGAACACATTGAATCAAGCAAATTTAAGCTGGGTTTTTGTTTTTGTTTTTTGGTGGT 42341980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GAAAGAACACATTGAATCAAGCAAATTTAAGCTGGGTTTTTGTTTTTGTTTTTTGGTGGT 660

 42341981 GGGGGGGATGATTTATAAGCAGGACTTCCCAAAGCTTTTAATATGCTTATATATGTGGCA 42342040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGGGGGGATGATTTATAAGCAGGACTTCCCAAAGCTTTTAATATGCTTATATATGTGGCA 720

 42342041 GTGTTGAGAGGGGAAGATTTGATATTCCAAGTATTTTTGGCCACAGAACTCTTTTTATCA 42342100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GTGTTGAGAGGGGAAGATTTGATATTCCAAGTATTTTTGGCCACAGAACTCTTTTTATCA 780

 42342101 TGGAACATTTCCAGTGTTCCATGAGACACAATTAGGGGCTAGTGAGCCACTGACTTTTGA 42342160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGGAACATTTCCAGTGTTCCATGAGACACAATTAGGGGCTAGTGAGCCACTGACTTTTGA 840

 42342161 GTTGGAAAGTGACACATGGGGAAAGCAAAGTTTTGGAAGATTGATCTCACGGTAGAATAT 42342220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GTTGGAAAGTGACACATGGGGAAAGCAAAGTTTTGGAAGATTGATCTCACGGTAGAATAT 900

 42342221 AAGGTGAACAGGAGAGAAAAGAGCCTGGATTCAGGCAACACAATCAGATGATTGGATACA 42342280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AAGGTGAACAGGAGAGAAAAGAGCCTGGATTCAGGCAACACAATCAGATGATTGGATACA 960

 42342281 GGCTCAAGATTAGGGGGTGGGTTGCACTACACTGGAGCGGAGAATGGAGAGCAAAAGCAC 42342340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GGCTCAAGATTAGGGGGTGGGTTGCACTACACTGGAGCGGAGAATGGAGAGCAAAAGCAC 1020

 42342341 TGATTGAATGCACAGTCTTCTGTTGGATCCTGGGATGATACAGAAGTGTCAGAGTTCCTG 42342400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGATTGAATGCACAGTCTTCTGTTGGATCCTGGGATGATACAGAAGTGTCAGAGTTCCTG 1080

 42342401 GGTCTTGTAGGAGTTCCAATGAGCATCAATCAAAAGTTTGATTGTAAGGCACAGAAATCA 42342460
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GGTCTTGTAGGAGTTCCAATGCGCATCAATCAAAAGTTTGATTGTAAGGCACAGAAATCA 1140

 42342461 ACTTGGACCAGCTAAAGCAAAAAGACCATTTTTAGGGAAATAGGGATGTGTCACAAAGAA 42342520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ACTTGGACCAGCTAAAGCAAAAAGACCATTTTTAGGGAAATAGGGATGTGTCACAAAGAA 1200

 42342521 CTGCATCTAGGTACTGGAAATCAACAAAAAGTTCCCCATCTGATCTCAGCTTCTCTGTGT 42342580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CTGCATCTAGGTACTGGAAATCAACAAAAAGTTCCCCATCTGATCTCAGCTTCTCTGTGT 1260

 42342581 GTCTACTACATACACTATCTTTCTCCTCTTTTCTTTCCTCTCTACCCCCTACCTCCCTCC 42342640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GTCTACTACATACACTATCTTTCTCCTCTTTTCTTTCCTCTCTACCCCCTACCTCCCTCC 1320

 42342641 TCTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTGTTTTTTGGTTTTTTTATGTTTGTTTGTTTGCTTTTG 42342700
          ||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     1321 TCTCTCTTTTTTTTTTTT-----GTTTTTTGGTTTTTTTATGTTTGTTTGTTTGTTTTTG 1375

 42342701 GAGACACGGTCTCCCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCTTAATTACTGCAGCCTC 42342760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1376 GAGACACGGTCTCCCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCTTAATTACTGCAGCCTC 1435

 42342761 AATCTCCTGGGCTCAAGTGACCCTCCCACCTCAGCCTCCTGAATAGCTGGGACCACAGGT 42342820
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     1436 AATCTCCTGGGCTCAAGTGACCCTCCCACTTCAGCCTCCTGAATAGCTGGGACCACAGGT 1495

 42342821 GCAAGCCACAGTGCTCAGCTAATTAAAAAAAATTTTTTTTTCAGAGATGGGGTCTCACTA 42342880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1496 GCAAGCCACAGTGCTCAGCTAATTAAAAAAAATTTTTTTTTCAGAGATGGGGTCTCACTA 1555

 42342881 TGTTGTCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTAGGCTCAAGCAGTCCTCCCGTTTCAGCCTCAAA 42342940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1556 TGTTGTCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTAGGCTCAAGCAGTCCTCCCGTTTCAGCCTCAAA 1615

 42342941 AAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCATCGCACTCCACCTTCTCTATAGTTACTGAGTTT 42343000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1616 AAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCATCGCACTCCACCTTCTCTATAGTTACTGAGTTT 1675

 42343001 GCGTGTTACACTGAGTTTACATCTTACATTTCTAGCCATATCAGAAACGACCTCTGCACC 42343060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1676 GCGTGTTACACTGAGTTTACATCTTACATTTCTAGCCATATCAGAAACGACCTCTGCACC 1735

 42343061 TCTCTTTCCCAATTTGAGATTTCTAATAGAAAGAATCTTGTTCACCCAGCTTGGGACTCA 42343120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1736 TCTCTTTCCCAATTTGAGATTTCTAATAGAAAGAATCTTGTTCACCCAGCTTGGGACTCA 1795

 42343121 TTGAGTTATGACCAGTGGGATAGATTTTAGAAGATAAACATGTCTATAGGGACTTACCGT 42343180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1796 TTGAGTTATGACCAGTGGGATAGATTTTAGAAGATAAACATGTCTATAGGGACTTACCGT 1855

 42343181 GTGAATTAGTGGGGGAGCCGCTTACCAGGCAGAGGGGTCTGCTGTAAAGTGATACTGTGA 42343240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1856 GTGAATTAGTGGGGGAGCCGCTTACCAGGCAGAGGGGTCTGCTGTAAAGTGATACTGTGA 1915

 42343241 CTTTAAATTGAAAGTAAGCTTCTAGAAGAGTTGAAGAGGAGTGGATTATTGTTGAATGGA 42343300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1916 CTTTAAATTGAAAGTAAGCTTCTAGAAGAGTTGAAGAGGAGTGGATTATTGTTGAATGGA 1975

 42343301 TGTATAACTAATGAAGCTTTAAAGGAAGTTTATTAGAAAGTCCATGTCCTTGTCTCTTTC 42343360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1976 TGTATAACTAATGAAGCTTTAAAGGAAGTTTATTAGAAAGTCCATGTCCTTGTCTCTTTC 2035

 42343361 CCAAACTCCTTTAGTTCCCAAGTCCTGAAAGAATCTATGGATAAGGGAAGCAGAATACTA 42343420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2036 CCAAACTCCTTTAGTTCCCAAGTCCTGAAAGAATCTATGGATAAGGGAAGCAGAATACTA 2095

 42343421 TAGTGGTTAAGAGCACATGCTCGAGGTTAAACTGTCTGTATTTTGGATCCTGGCCTTGAG 42343480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2096 TAGTGGTTAAGAGCACATGCTCGAGGTTAAACTGTCTGTATTTTGGATCCTGGCCTTGAG 2155

 42343481 GACTTGGGCAAGTTACGTGACCTGCCTGAGCCTCAGTTTCCTCACCTGTAATATGGGTAT 42343540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2156 GACTTGGGCAAGTTACGTGACCTGCCTGAGCCTCAGTTTCCTCACCTGTAATATGGGTAT 2215

 42343541 CACGAGGAATAAATAAGGTAATATGTGTAAAGTGCTTGGCACAATGCTCTTGATAATGTT 42343600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2216 CACGAGGAATAAATAAGGTAATATGTGTAAAGTGCTTGGCACAATGCTCTTGATAATGTT 2275

 42343601 AGCAACATAATTTTGTAATGAAAATTAACTGATGGGGCTGAAATGTGCATCAGCAGATCC 42343660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2276 AGCAACATAATTTTGTAATGAAAATTAACTGATGGGGCTGAAATGTGCATCAGCAGATCC 2335

 42343661 AAATATCCTTGATAAACTGGCCAAAAGAAAGATGAATTGGCAGAGAGGCAAGTGTTCATC 42343720
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2336 AAATATCCTCGATAAACTGGCCAAAAGAAAGATGAATTGGCAGAGAGGCAAGTGTTCATC 2395

 42343721 TCAGTTCTCCAGATATCCCTGCAAATGTGGCCTCTGGAGTAGAAGATTTAGGGAGAAAAA 42343780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2396 TCAGTTCTCCAGATATCCCTGCAAATGTGGCCTCTGGAGTAGAAGATTTAGGGAGAAAAA 2455

 42343781 TAAGCCATGAAGCTCTTCTGGCACCAACATGAACTTCAGGGATCATGGGACATTTGGGCC 42343840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2456 TAAGCCATGAAGCTCTTCTGGCACCAACATGAACTTCAGGGATCATGGGACATTTGGGCC 2515

 42343841 AGTAACATTCCTCTTTGTTCCTAGAGATTTAATATCTACCTACCAACTAAATGGCCTTGA 42343900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2516 AGTAACATTCCTCTTTGTTCCTAGAGATTTAATATCTACCTACCAACTAAATGGCCTTGA 2575

 42343901 TTTGGAGGAGAGAAGACAAGAAGAGGAATTGCTTTCAGCTGGTCCTTGCCTTTAACTAAC 42343960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2576 TTTGGAGGAGAGAAGACAAGAAGAGGAATTGCTTTCAGCTGGTCCTTGCCTTTAACTAAC 2635

 42343961 CAGGGGTACAAAAATTTTAAAATACAAAGGAGACCATGTGTAAAACATTAGTTAAGCTCA 42344020
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2636 CAGGGGTACAAAAATTTTAAAACACAAAGGAGACCATGTGTAAAACATTAGTTAAGCTCA 2695

 42344021 GATATAAATCTAGTCTTTGACCAGTCCAGAGCTAATCAATATGCTTTTCTACTCTCTTTG 42344080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2696 GATATAAATCTAGTCTTTGACCAGTCCAGAGCTAATCAATATGCTTTTCTACTCTCTTTG 2755

 42344081 AACTTTTGAGTTTTCTGGCAACAACAAAAATCCCAAACCTCATCCAAAACCGTAGTCCAG 42344140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2756 AACTTTTGAGTTTTCTGGCAACAACAAAAATCCCAAACCTCATCCAAAACCGTAGTCCAG 2815

 42344141 ACAGCCCAGTTTCTGCACTCCCTTCCTTGTGTCACATATTGTTGACAGAACTACTCCCGT 42344200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2816 ACAGCCCAGTTTCTGCACTCCCTTCCTTGTGTCACATATTGTTGACAGAACTACTCCCGT 2875

 42344201 TACCACATTCATTCCAGTGGTGATTCAAATTCTTCTGCAGAAATGGACTTGAAAGACAGA 42344260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2876 TACCACATTCATTCCAGTGGTGATTCAAATTCTTCTGCAGAAATGGACTTGAAAGACAGA 2935

 42344261 AAACTGCTCCTGTAATCACTTAATAAGGAATCTTGGATGAGGAATACAGAGCTATGAATA 42344320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2936 AAACTGCTCCTGTAATCACTTAATAAGGAATCTTGGATGAGGAATACAGAGCTATGAATA 2995

 42344321 TGGATTTACTCTTAGCCTTTATGGATGCCTTTTTCTCAGTTATTTTCACTGAAAATCATG 42344380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2996 TGGATTTACTCTTAGCCTTTATGGATGCCTTTTTCTCAGTTATTTTCACTGAAAATCATG 3055

 42344381 ATGAACTGATTTAAATATCAAGGTAAACTGAGATGGAAAATTACCGATAATAAGAGTTTT 42344440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3056 ATGAACTGATTTAAATATCAAGGTAAACTGAGATGGAAAATTACCGATAATAAGAGTTTT 3115

 42344441 CTGAAAATATAGATTGGCCTCTTTAAAGCACATCGAGTTTGTTTTGTTTAAATTACAAAT 42344500
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     3116 CTGAAAATATAGATTGGCCTCTTTAAAACACATCGAGTTTGTTTTGTTTAAATTACAAAT 3175

 42344501 TCACATATATTTGAAATGTGTTTAAATGTGTCAGTTTTAGGCAAAACTAAACTATTTGAT 42344560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3176 TCACATATATTTGAAATGTGTTTAAATGTGTCAGTTTTAGGCAAAACTAAACTATTTGAT 3235

 42344561 TCCTTTCCAAAAATCAGGAATTTGCTTTGGAAAAAAACCATGCAGTTTGATTTACAAAGC 42344620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3236 TCCTTTCCAAAAATCAGGAATTTGCTTTGGAAAAAAACCATGCAGTTTGATTTACAAAGC 3295

 42344621 AGAGCGGGGGGGAAGTAGTGGGTGAGAAAGACCCACCCAAAGGCTGCAGCCAGCTTCCCC 42344680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3296 AGAGCGGGGGGGAAGTAGTGGGTGAGAAAGACCCACCCAAAGGCTGCAGCCAGCTTCCCC 3355

 42344681 AGGAAGATTCATAACCATGCCACAATACTGTCCTTCAATTCGTTCCAACAGATTTTACTA 42344740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3356 AGGAAGATTCATAACCATGCCACAATACTGTCCTTCAATTCGTTCCAACAGATTTTACTA 3415

 42344741 TAACTCTAAATCATTAGAAGCAACTGCTGCTATGACTAGTGCTATCTTTGCCTCAAAAAG 42344800
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     3416 TAACTCTAAATCATTAGAAGCAACTGCCGCTATGACTAGTGCTATCTTTGCCTCAAAAAG 3475

 42344801 AGGAAAAATCAGGACATACAATATAATCCCCTCAGGATCTAGGAGAGAAATCAGCCCATT 42344860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3476 AGGAAAAATCAGGACATACAATATAATCCCCTCAGGATCTAGGAGAGAAATCAGCCCATT 3535

 42344861 TGTCATAAGAACTGAAAACCTCAGCTAAATAGTATATGAAACATTGGTATTTCATACCTT 42344920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3536 TGTCATAAGAACTGAAAACCTCAGCTAAATAGTATATGAAACATTGGTATTTCATACCTT 3595

 42344921 GACATTACATATTTTTGAAAATAAAGTAAGCATACACACAAGAAGTGGCTAGATGCAGCA 42344980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3596 GACATTACATATTTTTGAAAATAAAGTAAGCATACACACAAGAAGTGGCTAGATGCAGCA 3655

 42344981 GTTATAAAGTGGCTTAAGTTGGGTTAACTAAATATAACCTAGAAAAACCATCTTATCTAT 42345040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3656 GTTATAAAGTGGCTTAAGTTGGGTTAACTAAATATAACCTAGAAAAACCATCTTATCTAT 3715

 42345041 TGCAAATTATTTCCAGAAAAAGGTAAGAAAAATCCAACCAACACTTTTTAAACATCCTGA 42345100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3716 TGCAAATTATTTCCAGAAAAAGGTAAGAAAAATCCAACCAACACTTTTTAAACATCCTGA 3775

 42345101 GCTATTCACAGCAAGTGAATCTTTACCCTTACCAGATGTATAAACATTTACATAAGGCAG 42345160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3776 GCTATTCACAGCAAGTGAATCTTTACCCTTACCAGATGTATAAACATTTACATAAGGCAG 3835

 42345161 GAGGTTCAACACTTGGAGAGTGTAATCAAGGCAGTAGTAACGCAGTGCTCCTCTCTTTGA 42345220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3836 GAGGTTCAACACTTGGAGAGTGTAATCAAGGCAGTAGTAACGCAGTGCTCCTCTCTTTGA 3895

 42345221 CTTGAATGACTTCCTCCCCATTAGGGTCATTATTGTTTTGCAGTGTCCCAGGGATGAAAG 42345280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3896 CTTGAATGACTTCCTCCCCATTAGGGTCATTATTGTTTTGCAGTGTCCCAGGGATGAAAG 3955

 42345281 GACTTTGAAAGGTCATGTGTCTTGTGACCCAACTAGCAGCATCAGCATCACTGGGGAGAA 42345340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3956 GACTTTGAAAGGTCATGTGTCTTGTGACCCAACTAGCAGCATCAGCATCACTGGGGAGAA 4015

 42345341 ACTCAAGCAGAAGCTTGAGTCTACTCCACTCTTGCTGACACCAAATCTGCATTTTTACAG 42345400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4016 ACTCAAGCAGAAGCTTGAGTCTACTCCACTCTTGCTGACACCAAATCTGCATTTTTACAG 4075

 42345401 GATTCTTGGGTGAGTCACACACATATTCAAGGTTAAAATATGCCACCCTAGGTCTTTCTC 42345460
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4076 GATTCTTGGGTGAGTCACAGACATATTCAAGGTTAAAATATGCCACCCTAGGTCTTTCTC 4135

 42345461 CTGCTTCTGAGCAAAACTGGGCACAAGGGACAAACTAGTTTCCTTCAGCCACTTTCAAAT 42345520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4136 CTGCTTCTGAGCAAAACTGGGCACAAGGGACAAACTAGTTTCCTTCAGCCACTTTCAAAT 4195

 42345521 CCTTTATAGAGTGTACTGTGTGAGTCACTGAGAGGAAAGAGGAAATAATACTTATTTAGG 42345580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4196 CCTTTATAGAGTGTACTGTGTGAGTCACTGAGAGGAAAGAGGAAATAATACTTATTTAGG 4255

 42345581 GAAGTCTTGCATAACTTAACAAAGTTAGTAACTTCTTCAATACACTCAAGTACCTATTTT 42345640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4256 GAAGTCTTGCATAACTTAACAAAGTTAGTAACTTCTTCAATACACTCAAGTACCTATTTT 4315

 42345641 TGGAAGCCCTACAGGTTAGGTCAAAGTAAAGAGAAGCAAAAAATGGAGTGAGTTCTAGTA 42345700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4316 TGGAAGCCCTACAGGTTAGGTCAAAGTAAAGAGAAGCAAAAAATGGAGTGAGTTCTAGTA 4375

 42345701 AAAAACTCTGACAAAATAAGGGAAGTGTAGAAGCTGAGTCTATGAGGGATGAGAGAAGCA 42345760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4376 AAAAACTCTGACAAAATAAGGGAAGTGTAGAAGCTGAGTCTATGAGGGATGAGAGAAGCA 4435

 42345761 ATTTACCAAATTATCAGATCCAAAATCATCTCTGCACTGTAGATGATTTATAGCCCTGGA 42345820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4436 ATTTACCAAATTATCAGATCCAAAATCATCTCTGCACTGTAGATGATTTATAGCCCTGGA 4495

 42345821 AGCTTAGAGGCTTGAGTCTCTTGCTGTATTTCATTTCAAATTAGTAATTTTTATCTAGGG 42345880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4496 AGCTTAGAGGCTTGAGTCTCTTGCTGTATTTCATTTCAAATTAGTAATTTTTATCTAGGG 4555

 42345881 CTTCCCTATGGCTTAAAGTGAAGGCCCTGGAATTTCTGAAGTGAAATTATCTGATGATTT 42345940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4556 CTTCCCTATGGCTTAAAGTGAAGGCCCTGGAATTTCTGAAGTGAAATTATCTGATGATTT 4615

 42345941 TTATGTATGGTCATTCTGTAGTTATCCTGTAAGTTTCATATTTGTAACAAGACTGGAATC 42346000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4616 TTATGTATGGTCATTCTGTAGTTATCCTGTAAGTTTCATATTTGTAACAAGACTGGAATC 4675

 42346001 CGAACAATAGAAAACTCTGTGGCAGTAAGCCAAAACCTGATGGACTTAGGAGAGTTACGT 42346060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4676 CGAACAATAGAAAACTCTGTGGCAGTAAGCCAAAACCTGATGGACTTAGGAGAGTTACGT 4735

 42346061 ATGTGTGTTTCAGTGGTCCTCAAATTCAGCTGCCTATTAGAATCACCTGGACTTTGAAAA 42346120
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     4736 ATGTGTGTTTCAGTGGTCCTCAAATTTAGCTGCCTATTAGAATCACCTGGACTTTGAAAA 4795

 42346121 AAAAAGAGCTTTCTTGAGGTATAACTGACAAATAATAAGACAAACATATTTCAGTATACA 42346180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4796 AAAAAGAGCTTTCTTGAGGTATAACTGACAAATAATAAGACAAACATATTTCAGTATACA 4855

 42346181 ATTGGATGAGTTTTGACATGTTATATTCTTGTGAAACCATCACCACAATCAAGCTATTCA 42346240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4856 ATTGGATGAGTTTTGACATGTTATATTCTTGTGAAACCATCACCACAATCAAGCTATTCA 4915

 42346241 CCCCCCAAATTTTCGTGCC 42346259
          |||||||||||||||||||
     4916 CCCCCCAAATTTTCGTGCC 4934

EXCISED REGION

 42347319 TTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGCTCTCAAACTCCTGA 42347378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4939 TTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGCTCTCAAACTCCTGA 4998

 42347379 CCTCAGGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACC 42347438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4999 CCTCAGGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACC 5058

 42347439 ATGCCCAGCGTATTAATTTTCTTGCATGGATGGTGCGTTTGGTGATCTGAGAAATCTTTA 42347498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5059 ATGCCCAGCGTATTAATTTTCTTGCATGGATGGTGCGTTTGGTGATCTGAGAAATCTTTA 5118

 42347499 CCTAACCCAAGGTCACAGAGATTTTCTCCTGTTTGCTTCCAAAATTTTTATACGTTTAGA 42347558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5119 CCTAACCCAAGGTCACAGAGATTTTCTCCTGTTTGCTTCCAAAATTTTTATACGTTTAGA 5178

 42347559 TTTTATATTTAAGTCTATTTTGAGTTAATTTTTGTATATAATGCAAAGTTTAGAATGATG 42347618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5179 TTTTATATTTAAGTCTATTTTGAGTTAATTTTTGTATATAATGCAAAGTTTAGAATGATG 5238

 42347619 TTTAGTTTTTTGTCTATAATCTATGAATATCCAATAGTTCTAGCACCATTTATTGAAAAG 42347678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5239 TTTAGTTTTTTGTCTATAATCTATGAATATCCAATAGTTCTAGCACCATTTATTGAAAAG 5298

 42347679 ACTGATCTTTATCTACTGAAGTGTCTTTGCACTTTTGTTGAAAGTCAATTGACAATTGAC 42347738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5299 ACTGATCTTTATCTACTGAAGTGTCTTTGCACTTTTGTTGAAAGTCAATTGACAATTGAC 5358

 42347739 CATATATTTGTGGGTCTATTCTGGATTCTCTATTCTGTTACATTGATCTATTTTTCTATC 42347798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5359 CATATATTTGTGGGTCTATTCTGGATTCTCTATTCTGTTACATTGATCTATTTTTCTATC 5418

 42347799 TCAATACAAATATCAAATTGGGTATTTGTATTAAGACAAATATAATTTGTCTGGGTATTT 42347858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5419 TCAATACAAATATCAAATTGGGTATTTGTATTAAGACAAATATAATTTGTCTGGGTATTT 5478

 42347859 GTCAAGACAAATAAAAATTGTCT 42347881
          |||||||||||||||||||||||
     5479 GTCAAGACAAATAAAAATTGTCT 5501

Alignment time is 4.03955 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [42336259,42357318] =>     21060 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [       1,    6528] =>      6528 nucs 'mol-32-340e-117682_6528'

Score:        6412
Aligned:      6530        nucs
Identic:      6516 (100%) nucs =>      6071 (100%)       445 (100%)
Gaps:            6 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [42340175,42346259] EXCISED REGION [42347319,42347763]
 second seq =>  [       1,    6079] EXCISED REGION [    6084,    6528]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1059 nucs [42346260,42347318]
 second seq =>         4 nucs [6080,6083]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [6080,6080] to [6084,6084]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 42340175 TCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTAGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGA 42340234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTAGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGA 60

 42340235 GTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACCAAAAATACAAAAATTA 42340294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACCAAAAATACAAAAATTA 120

 42340295 GCTGGGCATGATGGCACACACCTGTAAATCTCAGCTATTCTGGAGGCTGAGGCAGGAGAA 42340354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GCTGGGCATGATGGCACACACCTGTAAATCTCAGCTATTCTGGAGGCTGAGGCAGGAGAA 180

 42340355 TTGCTTGAACTTGAGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATCGCACCACTGCACTCCACT 42340414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTGCTTGAACTTGAGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATCGCACCACTGCACTCCACT 240

 42340415 CCAGCCTGGGCAACAGAGAGAGACTCTGTCTCAAAAAATAAAAAAGAAAGAAAAGAAAGA 42340474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCAGCCTGGGCAACAGAGAGAGACTCTGTCTCAAAAAATAAAAAAGAAAGAAAAGAAAGA 300

 42340475 AATTCTTTCTCATACATTACATCATAAATCTTTTCCCAAATCATTAAATATTCTTCTGCA 42340534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AATTCTTTCTCATACATTACATCATAAATCTTTTCCCAAATCATTAAATATTCTTCTGCA 360

 42340535 ATATGATTTGTTAAAGCTATATATGATTTTGTGCAATAGATATGCTATAATAGGCTTACC 42340594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATATGATTTGTTAAAGCTATATATGATTTTGTGCAATAGATATGCTATAATAGGCTTACC 420

 42340595 CAATTTTATATGGAAGAGCACTTACGCTGTTTCCAGGCATAGAATTCTAAATATGGCAAG 42340654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CAATTTTATATGGAAGAGCACTTACGCTGTTTCCAGGCATAGAATTCTAAATATGGCAAG 480

 42340655 GTTATCTGCACAACTCCTGTTTTCAGGCATGCTGACCTCCATTCCTTACAAGCAGATAAT 42340714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTTATCTGCACAACTCCTGTTTTCAGGCATGCTGACCTCCATTCCTTACAAGCAGATAAT 540

 42340715 GATCCCTTTAAAGTTCTCTGCTCAAGAGAACCGTGCCATAGCAGAAGTAATTCTTCCCCA 42340774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GATCCCTTTAAAGTTCTCTGCTCAAGAGAACCGTGCCATAGCAGAAGTAATTCTTCCCCA 600

 42340775 AGCGTTCAGCTGTCCTGTGTTCTCCAGGGAAAGCCTAGCATTGGGCGTTGGGCATGCTTG 42340834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGCGTTCAGCTGTCCTGTGTTCTCCAGGGAAAGCCTAGCATTGGGCGTTGGGCATGCTTG 660

 42340835 CCTCTAAATGGGAAGGCCAGTTCATTCTTAAGCAGATGGAGAGAAAGCATTTGTCATTCT 42340894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCTCTAAATGGGAAGGCCAGTTCATTCTTAAGCAGATGGAGAGAAAGCATTTGTCATTCT 720

 42340895 AAATCCGGGAAGTAGCTCAATTCAATTCAATTGCATAATTCTTAAAAACATATTTTGCGC 42340954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAATCCGGGAAGTAGCTCAATTCAATTCAATTGCATAATTCTTAAAAACATATTTTGCGC 780

 42340955 CACTCCTGAAAATGGTATTATAGAAGAAAAGTATGGTTTCTACCTTTAAGAAGATTGCTG 42341014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CACTCCTGAAAATGGTATTATAGAAGAAAAGTATGGTTTCTACCTTTAAGAAGATTGCTG 840

 42341015 ACCGGGCTGGGCGCAGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGAACTTTGGGAGGCCGAGGCAGG 42341074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ACCGGGCTGGGCGCAGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGAACTTTGGGAGGCCGAGGCAGG 900

 42341075 CAGATCCCCTGAGGTCAGGAGTTAGAGGCTAGCCCGACCAACATGGCAAAACCCCGTCTC 42341134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CAGATCCCCTGAGGTCAGGAGTTAGAGGCTAGCCCGACCAACATGGCAAAACCCCGTCTC 960

 42341135 TACTAAAAATATAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGTGCATGCCTGTAGCCCCAGCTACTCA 42341194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TACTAAAAATATAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGTGCATGCCTGTAGCCCCAGCTACTCA 1020

 42341195 GGAGACTCAGGCATGAAAATCGCTTGAACCCGAGACACGGAGGTGGTGGTGAGCTGAAAT 42341254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GGAGACTCAGGCATGAAAATCGCTTGAACCCGAGACACGGAGGTGGTGGTGAGCTGAAAT 1080

 42341255 TGCGCCACTGCATTCCAGCCTGGGCGACAGAGCAAGACTCTATCTCAAAAAAAAAAAAAA 42341314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGCGCCACTGCATTCCAGCCTGGGCGACAGAGCAAGACTCTATCTCAAAAAAAAAAAAAA 1140

 42341315 AAAGAAGAAGAAGAAGATTGCTGGCGGGGTGTTGTGGCTCATACTTGTAATCCTAGCACT 42341374
          || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AA-GAAGAAGAAGAAGATTGCTGGCGGGGTGTTGTGGCTCATACTTGTAATCCTAGCACT 1199

 42341375 TTGGGAGGCCAAGGAAGGAGGATCACTTGAGCCAAAGAAGTCAAGGCTGCAGTGAGCTGT 42341434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 TTGGGAGGCCAAGGAAGGAGGATCACTTGAGCCAAAGAAGTCAAGGCTGCAGTGAGCTGT 1259

 42341435 GATCACACCACTCCATGCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAAACCCTGTCTCAAAAAGAAAAA 42341494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 GATCACACCACTCCATGCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAAACCCTGTCTCAAAAAGAAAAA 1319

 42341495 AGAAAAGATTGCCATCTTCCTGGGGTGACAAACATAATTTTAAAAGAATCAGGTAGAAAC 42341554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 AGAAAAGATTGCCATCTTCCTGGGGTGACAAACATAATTTTAAAAGAATCAGGTAGAAAC 1379

 42341555 ATAGGACTGTATTTATGATGAAACAACTATGACTAAATGCTATGTTTTTCAGATTACACG 42341614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 ATAGGACTGTATTTATGATGAAACAACTATGACTAAATGCTATGTTTTTCAGATTACACG 1439

 42341615 TGCCTTAGGAAGTGAGAAAAGTATAAGTGCAATGTGGAATTGGGTGGTTGAGAAAACTCC 42341674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 TGCCTTAGGAAGTGAGAAAAGTATAAGTGCAATGTGGAATTGGGTGGTTGAGAAAACTCC 1499

 42341675 AGAGAGGACCTGGTAGAGCTTGGAGGCAAGGTGGGCAAGGAACATTTCAAGAGGAGGGGA 42341734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 AGAGAGGACCTGGTAGAGCTTGGAGGCAAGGTGGGCAAGGAACATTTCAAGAGGAGGGGA 1559

 42341735 CACTACAGCTGAGGCACAGAGGTGAGAAAGCACAGGAAGCAAGAAAGAGGCTCATCTGGC 42341794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 CACTACAGCTGAGGCACAGAGGTGAGAAAGCACAGGAAGCAAGAAAGAGGCTCATCTGGC 1619

 42341795 TGCAGCAGAGGGAGAAATAGTAAATTAGATCAGATAACTCATATATTGGGCACGTGTGCA 42341854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 TGCAGCAGAGGGAGAAATAGTAAATTAGATCAGATAACTCATATATTGGGCACGTGTGCA 1679

 42341855 GAGGGCCAAAAAGATGTTTGGCCTTAATTCTATAGGTATTCCCCTTTGCCATAGATGTTA 42341914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 GAGGGCCAAAAAGATGTTTGGCCTTAATTCTATAGGTATTCCCCTTTGCCATAGATGTTA 1739

 42341915 CACCAAGAAAGAACACATTGAATCAAGCAAATTTAAGCTGGGTTTTTGTTTTTGTTTTTT 42341974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 CACCAAGAAAGAACACATTGAATCAAGCAAATTTAAGCTGGGTTTTTGTTTTTGTTTTTT 1799

 42341975 GGTGGTGGGGGGGATGATTTATAAGCAGGACTTCCCAAAGCTTTTAATATGCTTATATAT 42342034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 GGTGGTGGGGGGGATGATTTATAAGCAGGACTTCCCAAAGCTTTTAATATGCTTATATAT 1859

 42342035 GTGGCAGTGTTGAGAGGGGAAGATTTGATATTCCAAGTATTTTTGGCCACAGAACTCTTT 42342094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 GTGGCAGTGTTGAGAGGGGAAGATTTGATATTCCAAGTATTTTTGGCCACAGAACTCTTT 1919

 42342095 TTATCATGGAACATTTCCAGTGTTCCATGAGACACAATTAGGGGCTAGTGAGCCACTGAC 42342154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 TTATCATGGAACATTTCCAGTGTTCCATGAGACACAATTAGGGGCTAGTGAGCCACTGAC 1979

 42342155 TTTTGAGTTGGAAAGTGACACATGGGGAAAGCAAAGTTTTGGAAGATTGATCTCACGGTA 42342214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 TTTTGAGTTGGAAAGTGACACATGGGGAAAGCAAAGTTTTGGAAGATTGATCTCACGGTA 2039

 42342215 GAATATAAGGTGAACAGGAGAGAAAAGAGCCTGGATTCAGGCAACACAATCAGATGATTG 42342274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 GAATATAAGGTGAACAGGAGAGAAAAGAGCCTGGATTCAGGCAACACAATCAGATGATTG 2099

 42342275 GATACAGGCTCAAGATTAGGGGGTGGGTTGCACTACACTGGAGCGGAGAATGGAGAGCAA 42342334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 GATACAGGCTCAAGATTAGGGGGTGGGTTGCACTACACTGGAGCGGAGAATGGAGAGCAA 2159

 42342335 AAGCACTGATTGAATGCACAGTCTTCTGTTGGATCCTGGGATGATACAGAAGTGTCAGAG 42342394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 AAGCACTGATTGAATGCACAGTCTTCTGTTGGATCCTGGGATGATACAGAAGTGTCAGAG 2219

 42342395 TTCCTGGGTCTTGTAGGAGTTCCAATGAGCATCAATCAAAAGTTTGATTGTAAGGCACAG 42342454
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 TTCCTGGGTCTTGTAGGAGTTCCAATGCGCATCAATCAAAAGTTTGATTGTAAGGCACAG 2279

 42342455 AAATCAACTTGGACCAGCTAAAGCAAAAAGACCATTTTTAGGGAAATAGGGATGTGTCAC 42342514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 AAATCAACTTGGACCAGCTAAAGCAAAAAGACCATTTTTAGGGAAATAGGGATGTGTCAC 2339

 42342515 AAAGAACTGCATCTAGGTACTGGAAATCAACAAAAAGTTCCCCATCTGATCTCAGCTTCT 42342574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 AAAGAACTGCATCTAGGTACTGGAAATCAACAAAAAGTTCCCCATCTGATCTCAGCTTCT 2399

 42342575 CTGTGTGTCTACTACATACACTATCTTTCTCCTCTTTTCTTTCCTCTCTACCCCCTACCT 42342634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 CTGTGTGTCTACTACATACACTATCTTTCTCCTCTTTTCTTTCCTCTCTACCCCCTACCT 2459

 42342635 CCCTCCTCTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTGTTTTTTGGTTTTTTTATGTTTGTTTGTTTG 42342694
          ||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 CCCTCCTCTCTCTTTTTTTTTTTT-----GTTTTTTGGTTTTTTTATGTTTGTTTGTTTG 2514

 42342695 CTTTTGGAGACACGGTCTCCCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCTTAATTACTGC 42342754
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2515 TTTTTGGAGACACGGTCTCCCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCTTAATTACTGC 2574

 42342755 AGCCTCAATCTCCTGGGCTCAAGTGACCCTCCCACCTCAGCCTCCTGAATAGCTGGGACC 42342814
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     2575 AGCCTCAATCTCCTGGGCTCAAGTGACCCTCCCACTTCAGCCTCCTGAATAGCTGGGACC 2634

 42342815 ACAGGTGCAAGCCACAGTGCTCAGCTAATTAAAAAAAATTTTTTTTTCAGAGATGGGGTC 42342874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2635 ACAGGTGCAAGCCACAGTGCTCAGCTAATTAAAAAAAATTTTTTTTTCAGAGATGGGGTC 2694

 42342875 TCACTATGTTGTCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTAGGCTCAAGCAGTCCTCCCGTTTCAGC 42342934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2695 TCACTATGTTGTCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTAGGCTCAAGCAGTCCTCCCGTTTCAGC 2754

 42342935 CTCAAAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCATCGCACTCCACCTTCTCTATAGTTACT 42342994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2755 CTCAAAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCATCGCACTCCACCTTCTCTATAGTTACT 2814

 42342995 GAGTTTGCGTGTTACACTGAGTTTACATCTTACATTTCTAGCCATATCAGAAACGACCTC 42343054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2815 GAGTTTGCGTGTTACACTGAGTTTACATCTTACATTTCTAGCCATATCAGAAACGACCTC 2874

 42343055 TGCACCTCTCTTTCCCAATTTGAGATTTCTAATAGAAAGAATCTTGTTCACCCAGCTTGG 42343114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2875 TGCACCTCTCTTTCCCAATTTGAGATTTCTAATAGAAAGAATCTTGTTCACCCAGCTTGG 2934

 42343115 GACTCATTGAGTTATGACCAGTGGGATAGATTTTAGAAGATAAACATGTCTATAGGGACT 42343174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2935 GACTCATTGAGTTATGACCAGTGGGATAGATTTTAGAAGATAAACATGTCTATAGGGACT 2994

 42343175 TACCGTGTGAATTAGTGGGGGAGCCGCTTACCAGGCAGAGGGGTCTGCTGTAAAGTGATA 42343234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2995 TACCGTGTGAATTAGTGGGGGAGCCGCTTACCAGGCAGAGGGGTCTGCTGTAAAGTGATA 3054

 42343235 CTGTGACTTTAAATTGAAAGTAAGCTTCTAGAAGAGTTGAAGAGGAGTGGATTATTGTTG 42343294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3055 CTGTGACTTTAAATTGAAAGTAAGCTTCTAGAAGAGTTGAAGAGGAGTGGATTATTGTTG 3114

 42343295 AATGGATGTATAACTAATGAAGCTTTAAAGGAAGTTTATTAGAAAGTCCATGTCCTTGTC 42343354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3115 AATGGATGTATAACTAATGAAGCTTTAAAGGAAGTTTATTAGAAAGTCCATGTCCTTGTC 3174

 42343355 TCTTTCCCAAACTCCTTTAGTTCCCAAGTCCTGAAAGAATCTATGGATAAGGGAAGCAGA 42343414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3175 TCTTTCCCAAACTCCTTTAGTTCCCAAGTCCTGAAAGAATCTATGGATAAGGGAAGCAGA 3234

 42343415 ATACTATAGTGGTTAAGAGCACATGCTCGAGGTTAAACTGTCTGTATTTTGGATCCTGGC 42343474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3235 ATACTATAGTGGTTAAGAGCACATGCTCGAGGTTAAACTGTCTGTATTTTGGATCCTGGC 3294

 42343475 CTTGAGGACTTGGGCAAGTTACGTGACCTGCCTGAGCCTCAGTTTCCTCACCTGTAATAT 42343534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3295 CTTGAGGACTTGGGCAAGTTACGTGACCTGCCTGAGCCTCAGTTTCCTCACCTGTAATAT 3354

 42343535 GGGTATCACGAGGAATAAATAAGGTAATATGTGTAAAGTGCTTGGCACAATGCTCTTGAT 42343594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3355 GGGTATCACGAGGAATAAATAAGGTAATATGTGTAAAGTGCTTGGCACAATGCTCTTGAT 3414

 42343595 AATGTTAGCAACATAATTTTGTAATGAAAATTAACTGATGGGGCTGAAATGTGCATCAGC 42343654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3415 AATGTTAGCAACATAATTTTGTAATGAAAATTAACTGATGGGGCTGAAATGTGCATCAGC 3474

 42343655 AGATCCAAATATCCTTGATAAACTGGCCAAAAGAAAGATGAATTGGCAGAGAGGCAAGTG 42343714
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3475 AGATCCAAATATCCTCGATAAACTGGCCAAAAGAAAGATGAATTGGCAGAGAGGCAAGTG 3534

 42343715 TTCATCTCAGTTCTCCAGATATCCCTGCAAATGTGGCCTCTGGAGTAGAAGATTTAGGGA 42343774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3535 TTCATCTCAGTTCTCCAGATATCCCTGCAAATGTGGCCTCTGGAGTAGAAGATTTAGGGA 3594

 42343775 GAAAAATAAGCCATGAAGCTCTTCTGGCACCAACATGAACTTCAGGGATCATGGGACATT 42343834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3595 GAAAAATAAGCCATGAAGCTCTTCTGGCACCAACATGAACTTCAGGGATCATGGGACATT 3654

 42343835 TGGGCCAGTAACATTCCTCTTTGTTCCTAGAGATTTAATATCTACCTACCAACTAAATGG 42343894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3655 TGGGCCAGTAACATTCCTCTTTGTTCCTAGAGATTTAATATCTACCTACCAACTAAATGG 3714

 42343895 CCTTGATTTGGAGGAGAGAAGACAAGAAGAGGAATTGCTTTCAGCTGGTCCTTGCCTTTA 42343954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3715 CCTTGATTTGGAGGAGAGAAGACAAGAAGAGGAATTGCTTTCAGCTGGTCCTTGCCTTTA 3774

 42343955 ACTAACCAGGGGTACAAAAATTTTAAAATACAAAGGAGACCATGTGTAAAACATTAGTTA 42344014
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     3775 ACTAACCAGGGGTACAAAAATTTTAAAACACAAAGGAGACCATGTGTAAAACATTAGTTA 3834

 42344015 AGCTCAGATATAAATCTAGTCTTTGACCAGTCCAGAGCTAATCAATATGCTTTTCTACTC 42344074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3835 AGCTCAGATATAAATCTAGTCTTTGACCAGTCCAGAGCTAATCAATATGCTTTTCTACTC 3894

 42344075 TCTTTGAACTTTTGAGTTTTCTGGCAACAACAAAAATCCCAAACCTCATCCAAAACCGTA 42344134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3895 TCTTTGAACTTTTGAGTTTTCTGGCAACAACAAAAATCCCAAACCTCATCCAAAACCGTA 3954

 42344135 GTCCAGACAGCCCAGTTTCTGCACTCCCTTCCTTGTGTCACATATTGTTGACAGAACTAC 42344194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3955 GTCCAGACAGCCCAGTTTCTGCACTCCCTTCCTTGTGTCACATATTGTTGACAGAACTAC 4014

 42344195 TCCCGTTACCACATTCATTCCAGTGGTGATTCAAATTCTTCTGCAGAAATGGACTTGAAA 42344254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4015 TCCCGTTACCACATTCATTCCAGTGGTGATTCAAATTCTTCTGCAGAAATGGACTTGAAA 4074

 42344255 GACAGAAAACTGCTCCTGTAATCACTTAATAAGGAATCTTGGATGAGGAATACAGAGCTA 42344314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4075 GACAGAAAACTGCTCCTGTAATCACTTAATAAGGAATCTTGGATGAGGAATACAGAGCTA 4134

 42344315 TGAATATGGATTTACTCTTAGCCTTTATGGATGCCTTTTTCTCAGTTATTTTCACTGAAA 42344374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4135 TGAATATGGATTTACTCTTAGCCTTTATGGATGCCTTTTTCTCAGTTATTTTCACTGAAA 4194

 42344375 ATCATGATGAACTGATTTAAATATCAAGGTAAACTGAGATGGAAAATTACCGATAATAAG 42344434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4195 ATCATGATGAACTGATTTAAATATCAAGGTAAACTGAGATGGAAAATTACCGATAATAAG 4254

 42344435 AGTTTTCTGAAAATATAGATTGGCCTCTTTAAAGCACATCGAGTTTGTTTTGTTTAAATT 42344494
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     4255 AGTTTTCTGAAAATATAGATTGGCCTCTTTAAAACACATCGAGTTTGTTTTGTTTAAATT 4314

 42344495 ACAAATTCACATATATTTGAAATGTGTTTAAATGTGTCAGTTTTAGGCAAAACTAAACTA 42344554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4315 ACAAATTCACATATATTTGAAATGTGTTTAAATGTGTCAGTTTTAGGCAAAACTAAACTA 4374

 42344555 TTTGATTCCTTTCCAAAAATCAGGAATTTGCTTTGGAAAAAAACCATGCAGTTTGATTTA 42344614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4375 TTTGATTCCTTTCCAAAAATCAGGAATTTGCTTTGGAAAAAAACCATGCAGTTTGATTTA 4434

 42344615 CAAAGCAGAGCGGGGGGGAAGTAGTGGGTGAGAAAGACCCACCCAAAGGCTGCAGCCAGC 42344674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4435 CAAAGCAGAGCGGGGGGGAAGTAGTGGGTGAGAAAGACCCACCCAAAGGCTGCAGCCAGC 4494

 42344675 TTCCCCAGGAAGATTCATAACCATGCCACAATACTGTCCTTCAATTCGTTCCAACAGATT 42344734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4495 TTCCCCAGGAAGATTCATAACCATGCCACAATACTGTCCTTCAATTCGTTCCAACAGATT 4554

 42344735 TTACTATAACTCTAAATCATTAGAAGCAACTGCTGCTATGACTAGTGCTATCTTTGCCTC 42344794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4555 TTACTATAACTCTAAATCATTAGAAGCAACTGCTGCTATGACTAGTGCTATCTTTGCCTC 4614

 42344795 AAAAAGAGGAAAAATCAGGACATACAATATAATCCCCTCAGGATCTAGGAGAGAAATCAG 42344854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4615 AAAAAGAGGAAAAATCAGGACATACAATATAATCCCCTCAGGATCTAGGAGAGAAATCAG 4674

 42344855 CCCATTTGTCATAAGAACTGAAAACCTCAGCTAAATAGTATATGAAACATTGGTATTTCA 42344914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4675 CCCATTTGTCATAAGAACTGAAAACCTCAGCTAAATAGTATATGAAACATTGGTATTTCA 4734

 42344915 TACCTTGACATTACATATTTTTGAAAATAAAGTAAGCATACACACAAGAAGTGGCTAGAT 42344974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4735 TACCTTGACATTACATATTTTTGAAAATAAAGTAAGCATACACACAAGAAGTGGCTAGAT 4794

 42344975 GCAGCAGTTATAAAGTGGCTTAAGTTGGGTTAACTAAATATAACCTAGAAAAACCATCTT 42345034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4795 GCAGCAGTTATAAAGTGGCTTAAGTTGGGTTAACTAAATATAACCTAGAAAAACCATCTT 4854

 42345035 ATCTATTGCAAATTATTTCCAGAAAAAGGTAAGAAAAATCCAACCAACACTTTTTAAACA 42345094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4855 ATCTATTGCAAATTATTTCCAGAAAAAGGTAAGAAAAATCCAACCAACACTTTTTAAACA 4914

 42345095 TCCTGAGCTATTCACAGCAAGTGAATCTTTACCCTTACCAGATGTATAAACATTTACATA 42345154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4915 TCCTGAGCTATTCACAGCAAGTGAATCTTTACCCTTACCAGATGTATAAACATTTACATA 4974

 42345155 AGGCAGGAGGTTCAACACTTGGAGAGTGTAATCAAGGCAGTAGTAACGCAGTGCTCCTCT 42345214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4975 AGGCAGGAGGTTCAACACTTGGAGAGTGTAATCAAGGCAGTAGTAACGCAGTGCTCCTCT 5034

 42345215 CTTTGACTTGAATGACTTCCTCCCCATTAGGGTCATTATTGTTTTGCAGTGTCCCAGGGA 42345274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5035 CTTTGACTTGAATGACTTCCTCCCCATTAGGGTCATTATTGTTTTGCAGTGTCCCAGGGA 5094

 42345275 TGAAAGGACTTTGAAAGGTCATGTGTCTTGTGACCCAACTAGCAGCATCAGCATCACTGG 42345334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5095 TGAAAGGACTTTGAAAGGTCATGTGTCTTGTGACCCAACTAGCAGCATCAGCATCACTGG 5154

 42345335 GGAGAAACTCAAGCAGAAGCTTGAGTCTACTCCACTCTTGCTGACACCAAATCTGCATTT 42345394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5155 GGAGAAACTCAAGCAGAAGCTTGAGTCTACTCCACTCTTGCTGACACCAAATCTGCATTT 5214

 42345395 TTACAGGATTCTTGGGTGAGTCACACACATATTCAAGGTTAAAATATGCCACCCTAGGTC 42345454
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5215 TTACAGGATTCTTGGGTGAGTCACAGACATATTCAAGGTTAAAATATGCCACCCTAGGTC 5274

 42345455 TTTCTCCTGCTTCTGAGCAAAACTGGGCACAAGGGACAAACTAGTTTCCTTCAGCCACTT 42345514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5275 TTTCTCCTGCTTCTGAGCAAAACTGGGCACAAGGGACAAACTAGTTTCCTTCAGCCACTT 5334

 42345515 TCAAATCCTTTATAGAGTGTACTGTGTGAGTCACTGAGAGGAAAGAGGAAATAATACTTA 42345574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5335 TCAAATCCTTTATAGAGTGTACTGTGTGAGTCACTGAGAGGAAAGAGGAAATAATACTTA 5394

 42345575 TTTAGGGAAGTCTTGCATAACTTAACAAAGTTAGTAACTTCTTCAATACACTCAAGTACC 42345634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5395 TTTAGGGAAGTCTTGCATAACTTAACAAAGTTAGTAACTTCTTCAATACACTCAAGTACC 5454

 42345635 TATTTTTGGAAGCCCTACAGGTTAGGTCAAAGTAAAGAGAAGCAAAAAATGGAGTGAGTT 42345694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5455 TATTTTTGGAAGCCCTACAGGTTAGGTCAAAGTAAAGAGAAGCAAAAAATGGAGTGAGTT 5514

 42345695 CTAGTAAAAAACTCTGACAAAATAAGGGAAGTGTAGAAGCTGAGTCTATGAGGGATGAGA 42345754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5515 CTAGTAAAAAACTCTGACAAAATAAGGGAAGTGTAGAAGCTGAGTCTATGAGGGATGAGA 5574

 42345755 GAAGCAATTTACCAAATTATCAGATCCAAAATCATCTCTGCACTGTAGATGATTTATAGC 42345814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5575 GAAGCAATTTACCAAATTATCAGATCCAAAATCATCTCTGCACTGTAGATGATTTATAGC 5634

 42345815 CCTGGAAGCTTAGAGGCTTGAGTCTCTTGCTGTATTTCATTTCAAATTAGTAATTTTTAT 42345874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5635 CCTGGAAGCTTAGAGGCTTGAGTCTCTTGCTGTATTTCATTTCAAATTAGTAATTTTTAT 5694

 42345875 CTAGGGCTTCCCTATGGCTTAAAGTGAAGGCCCTGGAATTTCTGAAGTGAAATTATCTGA 42345934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5695 CTAGGGCTTCCCTATGGCTTAAAGTGAAGGCCCTGGAATTTCTGAAGTGAAATTATCTGA 5754

 42345935 TGATTTTTATGTATGGTCATTCTGTAGTTATCCTGTAAGTTTCATATTTGTAACAAGACT 42345994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5755 TGATTTTTATGTATGGTCATTCTGTAGTTATCCTGTAAGTTTCATATTTGTAACAAGACT 5814

 42345995 GGAATCCGAACAATAGAAAACTCTGTGGCAGTAAGCCAAAACCTGATGGACTTAGGAGAG 42346054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5815 GGAATCCGAACAATAGAAAACTCTGTGGCAGTAAGCCAAAACCTGATGGACTTAGGAGAG 5874

 42346055 TTACGTATGTGTGTTTCAGTGGTCCTCAAATTCAGCTGCCTATTAGAATCACCTGGACTT 42346114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     5875 TTACGTATGTGTGTTTCAGTGGTCCTCAAATTTAGCTGCCTATTAGAATCACCTGGACTT 5934

 42346115 TGAAAAAAAAAGAGCTTTCTTGAGGTATAACTGACAAATAATAAGACAAACATATTTCAG 42346174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5935 TGAAAAAAAAAGAGCTTTCTTGAGGTATAACTGACAAATAATAAGACAAACATATTTCAG 5994

 42346175 TATACAATTGGATGAGTTTTGACATGTTATATTCTTGTGAAACCATCACCACAATCAAGC 42346234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5995 TATACAATTGGATGAGTTTTGACATGTTATATTCTTGTGAAACCATCACCACAATCAAGC 6054

 42346235 TATTCACCCCCCAAATTTTCGTGCC 42346259
          |||||||||||||||||||||||||
     6055 TATTCACCCCCCAAATTTTCGTGCC 6079

EXCISED REGION

 42347319 TTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGCTCTCAAACTCCTGA 42347378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6084 TTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGCTCTCAAACTCCTGA 6143

 42347379 CCTCAGGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACC 42347438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6144 CCTCAGGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACC 6203

 42347439 ATGCCCAGCGTATTAATTTTCTTGCATGGATGGTGCGTTTGGTGATCTGAGAAATCTTTA 42347498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6204 ATGCCCAGCGTATTAATTTTCTTGCATGGATGGTGCGTTTGGTGATCTGAGAAATCTTTA 6263

 42347499 CCTAACCCAAGGTCACAGAGATTTTCTCCTGTTTGCTTCCAAAATTTTTATACGTTTAGA 42347558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6264 CCTAACCCAAGGTCACAGAGATTTTCTCCTGTTTGCTTCCAAAATTTTTATACGTTTAGA 6323

 42347559 TTTTATATTTAAGTCTATTTTGAGTTAATTTTTGTATATAATGCAAAGTTTAGAATGATG 42347618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6324 TTTTATATTTAAGTCTATTTTGAGTTAATTTTTGTATATAATGCAAAGTTTAGAATGATG 6383

 42347619 TTTAGTTTTTTGTCTATAATCTATGAATATCCAATAGTTCTAGCACCATTTATTGAAAAG 42347678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6384 TTTAGTTTTTTGTCTATAATCTATGAATATCCAATAGTTCTAGCACCATTTATTGAAAAG 6443

 42347679 ACTGATCTTTATCTACTGAAGTGTCTTTGCACTTTTGTTGAAAGTCAATTGACAATTGAC 42347738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6444 ACTGATCTTTATCTACTGAAGTGTCTTTGCACTTTTGTTGAAAGTCAATTGACAATTGAC 6503

 42347739 CATATATTTGTGGGTCTATTCTGGA 42347763
          |||||||||||||||||||||||||
     6504 CATATATTTGTGGGTCTATTCTGGA 6528

Alignment time is 4.80359 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [42336259,42357318] =>     21060 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [       1,    3830] =>      3830 nucs 'mol-32-349d-002258_3830'

Score:        3760
Aligned:      3826        nucs
Identic:      3820 (100%) nucs =>      3299 (100%)       521 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [42342955,42346259] EXCISED REGION [42347319,42347839]
 second seq =>  [       1,    3305] EXCISED REGION [    3310,    3830]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1059 nucs [42346260,42347318]
 second seq =>         4 nucs [3306,3309]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [3306,3306] to [3310,3310]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 42342955 CAGGTGTGAGCCATCGCACTCCACCTTCTCTATAGTTACTGAGTTTGCGTGTTACACTGA 42343014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CAGGTGTGAGCCATCGCACTCCACCTTCTCTATAGTTACTGAGTTTGCGTGTTACACTGA 60

 42343015 GTTTACATCTTACATTTCTAGCCATATCAGAAACGACCTCTGCACCTCTCTTTCCCAATT 42343074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTTTACATCTTACATTTCTAGCCATATCAGAAACGACCTCTGCACCTCTCTTTCCCAATT 120

 42343075 TGAGATTTCTAATAGAAAGAATCTTGTTCACCCAGCTTGGGACTCATTGAGTTATGACCA 42343134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGAGATTTCTAATAGAAAGAATCTTGTTCACCCAGCTTGGGACTCATTGAGTTATGACCA 180

 42343135 GTGGGATAGATTTTAGAAGATAAACATGTCTATAGGGACTTACCGTGTGAATTAGTGGGG 42343194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTGGGATAGATTTTAGAAGATAAACATGTCTATAGGGACTTACCGTGTGAATTAGTGGGG 240

 42343195 GAGCCGCTTACCAGGCAGAGGGGTCTGCTGTAAAGTGATACTGTGACTTTAAATTGAAAG 42343254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GAGCCGCTTACCAGGCAGAGGGGTCTGCTGTAAAGTGATACTGTGACTTTAAATTGAAAG 300

 42343255 TAAGCTTCTAGAAGAGTTGAAGAGGAGTGGATTATTGTTGAATGGATGTATAACTAATGA 42343314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TAAGCTTCTAGAAGAGTTGAAGAGGAGTGGATTATTGTTGAATGGATGTATAACTAATGA 360

 42343315 AGCTTTAAAGGAAGTTTATTAGAAAGTCCATGTCCTTGTCTCTTTCCCAAACTCCTTTAG 42343374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGCTTTAAAGGAAGTTTATTAGAAAGTCCATGTCCTTGTCTCTTTCCCAAACTCCTTTAG 420

 42343375 TTCCCAAGTCCTGAAAGAATCTATGGATAAGGGAAGCAGAATACTATAGTGGTTAAGAGC 42343434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTCCCAAGTCCTGAAAGAATCTATGGATAAGGGAAGCAGAATACTATAGTGGTTAAGAGC 480

 42343435 ACATGCTCGAGGTTAAACTGTCTGTATTTTGGATCCTGGCCTTGAGGACTTGGGCAAGTT 42343494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACATGCTCGAGGTTAAACTGTCTGTATTTTGGATCCTGGCCTTGAGGACTTGGGCAAGTT 540

 42343495 ACGTGACCTGCCTGAGCCTCAGTTTCCTCACCTGTAATATGGGTATCACGAGGAATAAAT 42343554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACGTGACCTGCCTGAGCCTCAGTTTCCTCACCTGTAATATGGGTATCACGAGGAATAAAT 600

 42343555 AAGGTAATATGTGTAAAGTGCTTGGCACAATGCTCTTGATAATGTTAGCAACATAATTTT 42343614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAGGTAATATGTGTAAAGTGCTTGGCACAATGCTCTTGATAATGTTAGCAACATAATTTT 660

 42343615 GTAATGAAAATTAACTGATGGGGCTGAAATGTGCATCAGCAGATCCAAATATCCTTGATA 42343674
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
      661 GTAATGAAAATTAACTGATGGGGCTGAAATGTGCATCAGCAGATCCAAATATCCTCGATA 720

 42343675 AACTGGCCAAAAGAAAGATGAATTGGCAGAGAGGCAAGTGTTCATCTCAGTTCTCCAGAT 42343734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AACTGGCCAAAAGAAAGATGAATTGGCAGAGAGGCAAGTGTTCATCTCAGTTCTCCAGAT 780

 42343735 ATCCCTGCAAATGTGGCCTCTGGAGTAGAAGATTTAGGGAGAAAAATAAGCCATGAAGCT 42343794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATCCCTGCAAATGTGGCCTCTGGAGTAGAAGATTTAGGGAGAAAAATAAGCCATGAAGCT 840

 42343795 CTTCTGGCACCAACATGAACTTCAGGGATCATGGGACATTTGGGCCAGTAACATTCCTCT 42343854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTTCTGGCACCAACATGAACTTCAGGGATCATGGGACATTTGGGCCAGTAACATTCCTCT 900

 42343855 TTGTTCCTAGAGATTTAATATCTACCTACCAACTAAATGGCCTTGATTTGGAGGAGAGAA 42343914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTGTTCCTAGAGATTTAATATCTACCTACCAACTAAATGGCCTTGATTTGGAGGAGAGAA 960

 42343915 GACAAGAAGAGGAATTGCTTTCAGCTGGTCCTTGCCTTTAACTAACCAGGGGTACAAAAA 42343974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GACAAGAAGAGGAATTGCTTTCAGCTGGTCCTTGCCTTTAACTAACCAGGGGTACAAAAA 1020

 42343975 TTTTAAAATACAAAGGAGACCATGTGTAAAACATTAGTTAAGCTCAGATATAAATCTAGT 42344034
          ||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     1021 TTTTAAAACACAAAGGAGACCATGTGTAAAACATTAGTTCAGCTCAGATATAAATCTAGT 1080

 42344035 CTTTGACCAGTCCAGAGCTAATCAATATGCTTTTCTACTCTCTTTGAACTTTTGAGTTTT 42344094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTTTGACCAGTCCAGAGCTAATCAATATGCTTTTCTACTCTCTTTGAACTTTTGAGTTTT 1140

 42344095 CTGGCAACAACAAAAATCCCAAACCTCATCCAAAACCGTAGTCCAGACAGCCCAGTTTCT 42344154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTGGCAACAACAAAAATCCCAAACCTCATCCAAAACCGTAGTCCAGACAGCCCAGTTTCT 1200

 42344155 GCACTCCCTTCCTTGTGTCACATATTGTTGACAGAACTACTCCCGTTACCACATTCATTC 42344214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GCACTCCCTTCCTTGTGTCACATATTGTTGACAGAACTACTCCCGTTACCACATTCATTC 1260

 42344215 CAGTGGTGATTCAAATTCTTCTGCAGAAATGGACTTGAAAGACAGAAAACTGCTCCTGTA 42344274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CAGTGGTGATTCAAATTCTTCTGCAGAAATGGACTTGAAAGACAGAAAACTGCTCCTGTA 1320

 42344275 ATCACTTAATAAGGAATCTTGGATGAGGAATACAGAGCTATGAATATGGATTTACTCTTA 42344334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ATCACTTAATAAGGAATCTTGGATGAGGAATACAGAGCTATGAATATGGATTTACTCTTA 1380

 42344335 GCCTTTATGGATGCCTTTTTCTCAGTTATTTTCACTGAAAATCATGATGAACTGATTTAA 42344394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GCCTTTATGGATGCCTTTTTCTCAGTTATTTTCACTGAAAATCATGATGAACTGATTTAA 1440

 42344395 ATATCAAGGTAAACTGAGATGGAAAATTACCGATAATAAGAGTTTTCTGAAAATATAGAT 42344454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATATCAAGGTAAACTGAGATGGAAAATTACCGATAATAAGAGTTTTCTGAAAATATAGAT 1500

 42344455 TGGCCTCTTTAAAGCACATCGAGTTTGTTTTGTTTAAATTACAAATTCACATATATTTGA 42344514
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TGGCCTCTTTAAAACACATCGAGTTTGTTTTGTTTAAATTACAAATTCACATATATTTGA 1560

 42344515 AATGTGTTTAAATGTGTCAGTTTTAGGCAAAACTAAACTATTTGATTCCTTTCCAAAAAT 42344574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AATGTGTTTAAATGTGTCAGTTTTAGGCAAAACTAAACTATTTGATTCCTTTCCAAAAAT 1620

 42344575 CAGGAATTTGCTTTGGAAAAAAACCATGCAGTTTGATTTACAAAGCAGAGCGGGGGGGAA 42344634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CAGGAATTTGCTTTGGAAAAAAACCATGCAGTTTGATTTACAAAGCAGAGCGGGGGGGAA 1680

 42344635 GTAGTGGGTGAGAAAGACCCACCCAAAGGCTGCAGCCAGCTTCCCCAGGAAGATTCATAA 42344694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GTAGTGGGTGAGAAAGACCCACCCAAAGGCTGCAGCCAGCTTCCCCAGGAAGATTCATAA 1740

 42344695 CCATGCCACAATACTGTCCTTCAATTCGTTCCAACAGATTTTACTATAACTCTAAATCAT 42344754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CCATGCCACAATACTGTCCTTCAATTCGTTCCAACAGATTTTACTATAACTCTAAATCAT 1800

 42344755 TAGAAGCAACTGCTGCTATGACTAGTGCTATCTTTGCCTCAAAAAGAGGAAAAATCAGGA 42344814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TAGAAGCAACTGCTGCTATGACTAGTGCTATCTTTGCCTCAAAAAGAGGAAAAATCAGGA 1860

 42344815 CATACAATATAATCCCCTCAGGATCTAGGAGAGAAATCAGCCCATTTGTCATAAGAACTG 42344874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CATACAATATAATCCCCTCAGGATCTAGGAGAGAAATCAGCCCATTTGTCATAAGAACTG 1920

 42344875 AAAACCTCAGCTAAATAGTATATGAAACATTGGTATTTCATACCTTGACATTACATATTT 42344934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AAAACCTCAGCTAAATAGTATATGAAACATTGGTATTTCATACCTTGACATTACATATTT 1980

 42344935 TTGAAAATAAAGTAAGCATACACACAAGAAGTGGCTAGATGCAGCAGTTATAAAGTGGCT 42344994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TTGAAAATAAAGTAAGCATACACACAAGAAGTGGCTAGATGCAGCAGTTATAAAGTGGCT 2040

 42344995 TAAGTTGGGTTAACTAAATATAACCTAGAAAAACCATCTTATCTATTGCAAATTATTTCC 42345054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TAAGTTGGGTTAACTAAATATAACCTAGAAAAACCATCTTATCTATTGCAAATTATTTCC 2100

 42345055 AGAAAAAGGTAAGAAAAATCCAACCAACACTTTTTAAACATCCTGAGCTATTCACAGCAA 42345114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AGAAAAAGGTAAGAAAAATCCAACCAACACTTTTTAAACATCCTGAGCTATTCACAGCAA 2160

 42345115 GTGAATCTTTACCCTTACCAGATGTATAAACATTTACATAAGGCAGGAGGTTCAACACTT 42345174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GTGAATCTTTACCCTTACCAGATGTATAAACATTTACATAAGGCAGGAGGTTCAACACTT 2220

 42345175 GGAGAGTGTAATCAAGGCAGTAGTAACGCAGTGCTCCTCTCTTTGACTTGAATGACTTCC 42345234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GGAGAGTGTAATCAAGGCAGTAGTAACGCAGTGCTCCTCTCTTTGACTTGAATGACTTCC 2280

 42345235 TCCCCATTAGGGTCATTATTGTTTTGCAGTGTCCCAGGGATGAAAGGACTTTGAAAGGTC 42345294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TCCCCATTAGGGTCATTATTGTTTTGCAGTGTCCCAGGGATGAAAGGACTTTGAAAGGTC 2340

 42345295 ATGTGTCTTGTGACCCAACTAGCAGCATCAGCATCACTGGGGAGAAACTCAAGCAGAAGC 42345354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 ATGTGTCTTGTGACCCAACTAGCAGCATCAGCATCACTGGGGAGAAACTCAAGCAGAAGC 2400

 42345355 TTGAGTCTACTCCACTCTTGCTGACACCAAATCTGCATTTTTACAGGATTCTTGGGTGAG 42345414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TTGAGTCTACTCCACTCTTGCTGACACCAAATCTGCATTTTTACAGGATTCTTGGGTGAG 2460

 42345415 TCACACACATATTCAAGGTTAAAATATGCCACCCTAGGTCTTTCTCCTGCTTCTGAGCAA 42345474
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TCACAGACATATTCAAGGTTAAAATATGCCACCCTAGGTCTTTCTCCTGCTTCTGAGCAA 2520

 42345475 AACTGGGCACAAGGGACAAACTAGTTTCCTTCAGCCACTTTCAAATCCTTTATAGAGTGT 42345534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 AACTGGGCACAAGGGACAAACTAGTTTCCTTCAGCCACTTTCAAATCCTTTATAGAGTGT 2580

 42345535 ACTGTGTGAGTCACTGAGAGGAAAGAGGAAATAATACTTATTTAGGGAAGTCTTGCATAA 42345594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 ACTGTGTGAGTCACTGAGAGGAAAGAGGAAATAATACTTATTTAGGGAAGTCTTGCATAA 2640

 42345595 CTTAACAAAGTTAGTAACTTCTTCAATACACTCAAGTACCTATTTTTGGAAGCCCTACAG 42345654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CTTAACAAAGTTAGTAACTTCTTCAATACACTCAAGTACCTATTTTTGGAAGCCCTACAG 2700

 42345655 GTTAGGTCAAAGTAAAGAGAAGCAAAAAATGGAGTGAGTTCTAGTAAAAAACTCTGACAA 42345714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GTTAGGTCAAAGTAAAGAGAAGCAAAAAATGGAGTGAGTTCTAGTAAAAAACTCTGACAA 2760

 42345715 AATAAGGGAAGTGTAGAAGCTGAGTCTATGAGGGATGAGAGAAGCAATTTACCAAATTAT 42345774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 AATAAGGGAAGTGTAGAAGCTGAGTCTATGAGGGATGAGAGAAGCAATTTACCAAATTAT 2820

 42345775 CAGATCCAAAATCATCTCTGCACTGTAGATGATTTATAGCCCTGGAAGCTTAGAGGCTTG 42345834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CAGATCCAAAATCATCTCTGCACTGTAGATGATTTATAGCCCTGGAAGCTTAGAGGCTTG 2880

 42345835 AGTCTCTTGCTGTATTTCATTTCAAATTAGTAATTTTTATCTAGGGCTTCCCTATGGCTT 42345894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 AGTCTCTTGCTGTATTTCATTTCAAATTAGTAATTTTTATCTAGGGCTTCCCTATGGCTT 2940

 42345895 AAAGTGAAGGCCCTGGAATTTCTGAAGTGAAATTATCTGATGATTTTTATGTATGGTCAT 42345954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 AAAGTGAAGGCCCTGGAATTTCTGAAGTGAAATTATCTGATGATTTTTATGTATGGTCAT 3000

 42345955 TCTGTAGTTATCCTGTAAGTTTCATATTTGTAACAAGACTGGAATCCGAACAATAGAAAA 42346014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TCTGTAGTTATCCTGTAAGTTTCATATTTGTAACAAGACTGGAATCCGAACAATAGAAAA 3060

 42346015 CTCTGTGGCAGTAAGCCAAAACCTGATGGACTTAGGAGAGTTACGTATGTGTGTTTCAGT 42346074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 CTCTGTGGCAGTAAGCCAAAACCTGATGGACTTAGGAGAGTTACGTATGTGTGTTTCAGT 3120

 42346075 GGTCCTCAAATTCAGCTGCCTATTAGAATCACCTGGACTTTGAAAAAAAAAGAGCTTTCT 42346134
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 GGTCCTCAAATTTAGCTGCCTATTAGAATCACCTGGACTTTGAAAAAAAAAGAGCTTTCT 3180

 42346135 TGAGGTATAACTGACAAATAATAAGACAAACATATTTCAGTATACAATTGGATGAGTTTT 42346194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TGAGGTATAACTGACAAATAATAAGACAAACATATTTCAGTATACAATTGGATGAGTTTT 3240

 42346195 GACATGTTATATTCTTGTGAAACCATCACCACAATCAAGCTATTCACCCCCCAAATTTTC 42346254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 GACATGTTATATTCTTGTGAAACCATCACCACAATCAAGCTATTCACCCCCCAAATTTTC 3300

 42346255 GTGCC 42346259
          |||||
     3301 GTGCC 3305

EXCISED REGION

 42347319 TTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGCTCTCAAACTCCTGA 42347378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3310 TTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGCTCTCAAACTCCTGA 3369

 42347379 CCTCAGGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACC 42347438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3370 CCTCAGGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACC 3429

 42347439 ATGCCCAGCGTATTAATTTTCTTGCATGGATGGTGCGTTTGGTGATCTGAGAAATCTTTA 42347498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3430 ATGCCCAGCGTATTAATTTTCTTGCATGGATGGTGCGTTTGGTGATCTGAGAAATCTTTA 3489

 42347499 CCTAACCCAAGGTCACAGAGATTTTCTCCTGTTTGCTTCCAAAATTTTTATACGTTTAGA 42347558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3490 CCTAACCCAAGGTCACAGAGATTTTCTCCTGTTTGCTTCCAAAATTTTTATACGTTTAGA 3549

 42347559 TTTTATATTTAAGTCTATTTTGAGTTAATTTTTGTATATAATGCAAAGTTTAGAATGATG 42347618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3550 TTTTATATTTAAGTCTATTTTGAGTTAATTTTTGTATATAATGCAAAGTTTAGAATGATG 3609

 42347619 TTTAGTTTTTTGTCTATAATCTATGAATATCCAATAGTTCTAGCACCATTTATTGAAAAG 42347678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3610 TTTAGTTTTTTGTCTATAATCTATGAATATCCAATAGTTCTAGCACCATTTATTGAAAAG 3669

 42347679 ACTGATCTTTATCTACTGAAGTGTCTTTGCACTTTTGTTGAAAGTCAATTGACAATTGAC 42347738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3670 ACTGATCTTTATCTACTGAAGTGTCTTTGCACTTTTGTTGAAAGTCAATTGACAATTGAC 3729

 42347739 CATATATTTGTGGGTCTATTCTGGATTCTCTATTCTGTTACATTGATCTATTTTTCTATC 42347798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3730 CATATATTTGTGGGTCTATTCTGGATTCTCTATTCTGTTACATTGATCTATTTTTCTATC 3789

 42347799 TCAATACAAATATCAAATTGGGTATTTGTATTAAGACAAAT 42347839
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3790 TCAATACAAATATCAAATTGGGTATTTGTATTAAGACAAAT 3830

Alignment time is 2.83206 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [42336259,42357318] =>     21060 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [       1,    9133] =>      9133 nucs 'mol-32-34b3-066047_9133'

Score:        8991
Aligned:      9150        nucs
Identic:      9120 (100%) nucs =>      4687 (100%)      4433 (100%)
Gaps:           21 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [42341560,42346259] EXCISED REGION [42347319,42351768]
 second seq =>  [       1,    4695] EXCISED REGION [    4700,    9133]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1059 nucs [42346260,42347318]
 second seq =>         4 nucs [4696,4699]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [4696,4696] to [4700,4700]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 42341560 ACTGTATTTATGATGAAACAACTATGACTAAATGCTATGTTTTTCAGATTACACGTGCCT 42341619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACTGTATTTATGATGAAACAACTATGACTAAATGCTATGTTTTTCAGATTACACGTGCCT 60

 42341620 TAGGAAGTGAGAAAAGTATAAGTGCAATGTGGAATTGGGTGGTTGAGAAAACTCCAGAGA 42341679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAGGAAGTGAGAAAAGTATAAGTGCAATGTGGAATTGGGTGGTTGAGAAAACTCCAGAGA 120

 42341680 GGACCTGGTAGAGCTTGGAGGCAAGGTGGGCAAGGAACATTTCAAGAGGAGGGGACACTA 42341739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGACCTGGTAGAGCTTGGAGGCAAGGTGGGCAAGGAACATTTCAAGAGGAGGGGACACTA 180

 42341740 CAGCTGAGGCACAGAGGTGAGAAAGCACAGGAAGCAAGAAAGAGGCTCATCTGGCTGCAG 42341799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CAGCTGAGGCACAGAGGTGAGAAAGCACAGGAAGCAAGAAAGAGGCTCATCTGGCTGCAG 240

 42341800 CAGAGGGAGAAATAGTAAATTAGATCAGATAACTCATATATTGGGCACGTGTGCAGAGGG 42341859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CAGAGGGAGAAATAGTAAATTAGATCAGATAACTCATATATTGGGCACGTGTGCAGAGGG 300

 42341860 CCAAAAAGATGTTTGGCCTTAATTCTATAGGTATTCCCCTTTGCCATAGATGTTACACCA 42341919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCAAAAAGATGTTTGGCCTTAATTCTATAGGTATTCCCCTTTGCCATAGATGTTACACCA 360

 42341920 AGAAAGAACACATTGAATCAAGCAAATTTAAGCTGGGTTTTTGTTTTTGTTTTTTGGTGG 42341979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGAAAGAACACATTGAATCAAGCAAATTTAAGCTGGGTTTTTGTTTTTGTTTTTTGGTGG 420

 42341980 TGGGGGGGATGATTTATAAGCAGGACTTCCCAAAGCTTTTAATATGCTTATATATGTGGC 42342039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGGGGGGGATGATTTATAAGCAGGACTTCCCAAAGCTTTTAATATGCTTATATATGTGGC 480

 42342040 AGTGTTGAGAGGGGAAGATTTGATATTCCAAGTATTTTTGGCCACAGAACTCTTTTTATC 42342099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGTGTTGAGAGGGGAAGATTTGATATTCCAAGTATTTTTGGCCACAGAACTCTTTTTATC 540

 42342100 ATGGAACATTTCCAGTGTTCCATGAGACACAATTAGGGGCTAGTGAGCCACTGACTTTTG 42342159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATGGAACATTTCCAGTGTTCCATGAGACACAATTAGGGGCTAGTGAGCCACTGACTTTTG 600

 42342160 AGTTGGAAAGTGACACATGGGGAAAGCAAAGTTTTGGAAGATTGATCTCACGGTAGAATA 42342219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGTTGGAAAGTGACACATGGGGAAAGCAAAGTTTTGGAAGATTGATCTCACGGTAGAATA 660

 42342220 TAAGGTGAACAGGAGAGAAAAGAGCCTGGATTCAGGCAACACAATCAGATGATTGGATAC 42342279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TAAGGTGAACAGGAGAGAAAAGAGCCTGGATTCAGGCAACACAATCAGATGATTGGATAC 720

 42342280 AGGCTCAAGATTAGGGGGTGGGTTGCACTACACTGGAGCGGAGAATGGAGAGCAAAAGCA 42342339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGGCTCAAGATTAGGGGGTGGGTTGCACTACACTGGAGCGGAGAATGGAGAGCAAAAGCA 780

 42342340 CTGATTGAATGCACAGTCTTCTGTTGGATCCTGGGATGATACAGAAGTGTCAGAGTTCCT 42342399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTGATTGAATGCACAGTCTTCTGTTGGATCCTGGGATGATACAGAAGTGTCAGAGTTCCT 840

 42342400 GGGTCTTGTAGGAGTTCCAATGAGCATCAATCAAAAGTTTGATTGTAAGGCACAGAAATC 42342459
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GGGTCTTGTAGGAGTTCCAATGCGCATCAATCAAAAGTTTGATTGTAAGGCACAGAAATC 900

 42342460 AACTTGGACCAGCTAAAGCAAAAAGACCATTTTTAGGGAAATAGGGATGTGTCACAAAGA 42342519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AACTTGGACCAGCTAAAGCAAAAAGACCATTTTTAGGGAAATAGGGATGTGTCACAAAGA 960

 42342520 ACTGCATCTAGGTACTGGAAATCAACAAAAAGTTCCCCATCTGATCTCAGCTTCTCTGTG 42342579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ACTGCATCTAGGTACTGGAAATCAACAAAAAGTTCCCCATCTGATCTCAGCTTCTCTGTG 1020

 42342580 TGTCTACTACATACACTATCTTTCTCCTCTTTTCTTTCCTCTCTACCCCCTACCTCCCTC 42342639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGTCTACTACATACACTATCTTTCTCCTCTTTTCTTTCCTCTCTACCCCCTACCTCCCTC 1080

 42342640 CTCTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTGTTTTTTGGTTTTTTTATGTTTGTTTGTTTGCTTTT 42342699
          |||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     1081 CTCTCTCTTTTTTTTTTTT-----GTTTTTTGGTTTTTTTATGTTTGTTTGTTTGTTTTT 1135

 42342700 GGAGACACGGTCTCCCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCTTAATTACTGCAGCCT 42342759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1136 GGAGACACGGTCTCCCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCTTAATTACTGCAGCCT 1195

 42342760 CAATCTCCTGGGCTCAAGTGACCCTCCCACCTCAGCCTCCTGAATAGCTGGGACCACAGG 42342819
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     1196 CAATCTCCTGGGCTCAAGTGACCCTCCCACTTCAGCCTCCTGAATAGCTGGGACCACAGG 1255

 42342820 TGCAAGCCACAGTGCTCAGCTAATTAAAAAAAATTTTTTTTTCAGAGATGGGGTCTCACT 42342879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1256 TGCAAGCCACAGTGCTCAGCTAATTAAAAAAAATTTTTTTTTCAGAGATGGGGTCTCACT 1315

 42342880 ATGTTGTCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTAGGCTCAAGCAGTCCTCCCGTTTCAGCCTCAA 42342939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1316 ATGTTGTCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTAGGCTCAAGCAGTCCTCCCGTTTCAGCCTCAA 1375

 42342940 AAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCATCGCACTCCACCTTCTCTATAGTTACTGAGTT 42342999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1376 AAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCATCGCACTCCACCTTCTCTATAGTTACTGAGTT 1435

 42343000 TGCGTGTTACACTGAGTTTACATCTTACATTTCTAGCCATATCAGAAACGACCTCTGCAC 42343059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1436 TGCGTGTTACACTGAGTTTACATCTTACATTTCTAGCCATATCAGAAACGACCTCTGCAC 1495

 42343060 CTCTCTTTCCCAATTTGAGATTTCTAATAGAAAGAATCTTGTTCACCCAGCTTGGGACTC 42343119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1496 CTCTCTTTCCCAATTTGAGATTTCTAATAGAAAGAATCTTGTTCACCCAGCTTGGGACTC 1555

 42343120 ATTGAGTTATGACCAGTGGGATAGATTTTAGAAGATAAACATGTCTATAGGGACTTACCG 42343179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1556 ATTGAGTTATGACCAGTGGGATAGATTTTAGAAGATAAACATGTCTATAGGGACTTACCG 1615

 42343180 TGTGAATTAGTGGGGGAGCCGCTTACCAGGCAGAGGGGTCTGCTGTAAAGTGATACTGTG 42343239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1616 TGTGAATTAGTGGGGGAGCCGCTTACCAGGCAGAGGGGTCTGCTGTAAAGTGATACTGTG 1675

 42343240 ACTTTAAATTGAAAGTAAGCTTCTAGAAGAGTTGAAGAGGAGTGGATTATTGTTGAATGG 42343299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1676 ACTTTAAATTGAAAGTAAGCTTCTAGAAGAGTTGAAGAGGAGTGGATTATTGTTGAATGG 1735

 42343300 ATGTATAACTAATGAAGCTTTAAAGGAAGTTTATTAGAAAGTCCATGTCCTTGTCTCTTT 42343359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1736 ATGTATAACTAATGAAGCTTTAAAGGAAGTTTATTAGAAAGTCCATGTCCTTGTCTCTTT 1795

 42343360 CCCAAACTCCTTTAGTTCCCAAGTCCTGAAAGAATCTATGGATAAGGGAAGCAGAATACT 42343419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1796 CCCAAACTCCTTTAGTTCCCAAGTCCTGAAAGAATCTATGGATAAGGGAAGCAGAATACT 1855

 42343420 ATAGTGGTTAAGAGCACATGCTCGAGGTTAAACTGTCTGTATTTTGGATCCTGGCCTTGA 42343479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1856 ATAGTGGTTAAGAGCACATGCTCGAGGTTAAACTGTCTGTATTTTGGATCCTGGCCTTGA 1915

 42343480 GGACTTGGGCAAGTTACGTGACCTGCCTGAGCCTCAGTTTCCTCACCTGTAATATGGGTA 42343539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1916 GGACTTGGGCAAGTTACGTGACCTGCCTGAGCCTCAGTTTCCTCACCTGTAATATGGGTA 1975

 42343540 TCACGAGGAATAAATAAGGTAATATGTGTAAAGTGCTTGGCACAATGCTCTTGATAATGT 42343599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1976 TCACGAGGAATAAATAAGGTAATATGTGTAAAGTGCTTGGCACAATGCTCTTGATAATGT 2035

 42343600 TAGCAACATAATTTTGTAATGAAAATTAACTGATGGGGCTGAAATGTGCATCAGCAGATC 42343659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2036 TAGCAACATAATTTTGTAATGAAAATTAACTGATGGGGCTGAAATGTGCATCAGCAGATC 2095

 42343660 CAAATATCCTTGATAAACTGGCCAAAAGAAAGATGAATTGGCAGAGAGGCAAGTGTTCAT 42343719
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2096 CAAATATCCTCGATAAACTGGCCAAAAGAAAGATGAATTGGCAGAGAGGCAAGTGTTCAT 2155

 42343720 CTCAGTTCTCCAGATATCCCTGCAAATGTGGCCTCTGGAGTAGAAGATTTAGGGAGAAAA 42343779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2156 CTCAGTTCTCCAGATATCCCTGCAAATGTGGCCTCTGGAGTAGAAGATTTAGGGAGAAAA 2215

 42343780 ATAAGCCATGAAGCTCTTCTGGCACCAACATGAACTTCAGGGATCATGGGACATTTGGGC 42343839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2216 ATAAGCCATGAAGCTCTTCTGGCACCAACATGAACTTCAGGGATCATGGGACATTTGGGC 2275

 42343840 CAGTAACATTCCTCTTTGTTCCTAGAGATTTAATATCTACCTACCAACTAAATGGCCTTG 42343899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2276 CAGTAACATTCCTCTTTGTTCCTAGAGATTTAATATCTACCTACCAACTAAATGGCCTTG 2335

 42343900 ATTTGGAGGAGAGAAGACAAGAAGAGGAATTGCTTTCAGCTGGTCCTTGCCTTTAACTAA 42343959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2336 ATTTGGAGGAGAGAAGACAAGAAGAGGAATTGCTTTCAGCTGGTCCTTGCCTTTAACTAA 2395

 42343960 CCAGGGGTACAAAAATTTTAAAATACAAAGGAGACCATGTGTAAAACATTAGTTAAGCTC 42344019
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2396 CCAGGGGTACAAAAATTTTAAAACACAAAGGAGACCATGTGTAAAACATTAGTTAAGCTC 2455

 42344020 AGATATAAATCTAGTCTTTGACCAGTCCAGAGCTAATCAATATGCTTTTCTACTCTCTTT 42344079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2456 AGATATAAATCTAGTCTTTGACCAGTCCAGAGCTAATCAATATGCTTTTCTACTCTCTTT 2515

 42344080 GAACTTTTGAGTTTTCTGGCAACAACAAAAATCCCAAACCTCATCCAAAACCGTAGTCCA 42344139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2516 GAACTTTTGAGTTTTCTGGCAACAACAAAAATCCCAAACCTCATCCAAAACCGTAGTCCA 2575

 42344140 GACAGCCCAGTTTCTGCACTCCCTTCCTTGTGTCACATATTGTTGACAGAACTACTCCCG 42344199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2576 GACAGCCCAGTTTCTGCACTCCCTTCCTTGTGTCACATATTGTTGACAGAACTACTCCCG 2635

 42344200 TTACCACATTCATTCCAGTGGTGATTCAAATTCTTCTGCAGAAATGGACTTGAAAGACAG 42344259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2636 TTACCACATTCATTCCAGTGGTGATTCAAATTCTTCTGCAGAAATGGACTTGAAAGACAG 2695

 42344260 AAAACTGCTCCTGTAATCACTTAATAAGGAATCTTGGATGAGGAATACAGAGCTATGAAT 42344319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2696 AAAACTGCTCCTGTAATCACTTAATAAGGAATCTTGGATGAGGAATACAGAGCTATGAAT 2755

 42344320 ATGGATTTACTCTTAGCCTTTATGGATGCCTTTTTCTCAGTTATTTTCACTGAAAATCAT 42344379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2756 ATGGATTTACTCTTAGCCTTTATGGATGCCTTTTTCTCAGTTATTTTCACTGAAAATCAT 2815

 42344380 GATGAACTGATTTAAATATCAAGGTAAACTGAGATGGAAAATTACCGATAATAAGAGTTT 42344439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2816 GATGAACTGATTTAAATATCAAGGTAAACTGAGATGGAAAATTACCGATAATAAGAGTTT 2875

 42344440 TCTGAAAATATAGATTGGCCTCTTTAAAGCACATCGAGTTTGTTTTGTTTAAATTACAAA 42344499
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     2876 TCTGAAAATATAGATTGGCCTCTTTAAAACACATCGAGTTTGTTTTGTTTAAATTACAAA 2935

 42344500 TTCACATATATTTGAAATGTGTTTAAATGTGTCAGTTTTAGGCAAAACTAAACTATTTGA 42344559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2936 TTCACATATATTTGAAATGTGTTTAAATGTGTCAGTTTTAGGCAAAACTAAACTATTTGA 2995

 42344560 TTCCTTTCCAAAAATCAGGAATTTGCTTTGGAAAAAAACCATGCAGTTTGATTTACAAAG 42344619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2996 TTCCTTTCCAAAAATCAGGAATTTGCTTTGGAAAAAAACCATGCAGTTTGATTTACAAAG 3055

 42344620 CAGAGCGGGGGGGAAGTAGTGGGTGAGAAAGACCCACCCAAAGGCTGCAGCCAGCTTCCC 42344679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3056 CAGAGCGGGGGGGAAGTAGTGGGTGAGAAAGACCCACCCAAAGGCTGCAGCCAGCTTCCC 3115

 42344680 CAGGAAGATTCATAACCATGCCACAATACTGTCCTTCAATTCGTTCCAACAGATTTTACT 42344739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3116 CAGGAAGATTCATAACCATGCCACAATACTGTCCTTCAATTCGTTCCAACAGATTTTACT 3175

 42344740 ATAACTCTAAATCATTAGAAGCAACTGCTGCTATGACTAGTGCTATCTTTGCCTCAAAAA 42344799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3176 ATAACTCTAAATCATTAGAAGCAACTGCTGCTATGACTAGTGCTATCTTTGCCTCAAAAA 3235

 42344800 GAGGAAAAATCAGGACATACAATATAATCCCCTCAGGATCTAGGAGAGAAATCAGCCCAT 42344859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3236 GAGGAAAAATCAGGACATACAATATAATCCCCTCAGGATCTAGGAGAGAAATCAGCCCAT 3295

 42344860 TTGTCATAAGAACTGAAAACCTCAGCTAAATAGTATATGAAACATTGGTATTTCATACCT 42344919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3296 TTGTCATAAGAACTGAAAACCTCAGCTAAATAGTATATGAAACATTGGTATTTCATACCT 3355

 42344920 TGACATTACATATTTTTGAAAATAAAGTAAGCATACACACAAGAAGTGGCTAGATGCAGC 42344979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3356 TGACATTACATATTTTTGAAAATAAAGTAAGCATACACACAAGAAGTGGCTAGATGCAGC 3415

 42344980 AGTTATAAAGTGGCTTAAGTTGGGTTAACTAAATATAACCTAGAAAAACCATCTTATCTA 42345039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3416 AGTTATAAAGTGGCTTAAGTTGGGTTAACTAAATATAACCTAGAAAAACCATCTTATCTA 3475

 42345040 TTGCAAATTATTTCCAGAAAAAGGTAAGAAAAATCCAACCAACACTTTTTAAACATCCTG 42345099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3476 TTGCAAATTATTTCCAGAAAAAGGTAAGAAAAATCCAACCAACACTTTTTAAACATCCTG 3535

 42345100 AGCTATTCACAGCAAGTGAATCTTTACCCTTACCAGATGTATAAACATTTACATAAGGCA 42345159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3536 AGCTATTCACAGCAAGTGAATCTTTACCCTTACCAGATGTATAAACATTTACATAAGGCA 3595

 42345160 GGAGGTTCAACACTTGGAGAGTGTAATCAAGGCAGTAGTAACGCAGTGCTCCTCTCTTTG 42345219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3596 GGAGGTTCAACACTTGGAGAGTGTAATCAAGGCAGTAGTAACGCAGTGCTCCTCTCTTTG 3655

 42345220 ACTTGAATGACTTCCTCCCCATTAGGGTCATTATTGTTTTGCAGTGTCCCAGGGATGAAA 42345279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3656 ACTTGAATGACTTCCTCCCCATTAGGGTCATTATTGTTTTGCAGTGTCCCAGGGATGAAA 3715

 42345280 GGACTTTGAAAGGTCATGTGTCTTGTGACCCAACTAGCAGCATCAGCATCACTGGGGAGA 42345339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3716 GGACTTTGAAAGGTCATGTGTCTTGTGACCCAACTAGCAGCATCAGCATCACTGGGGAGA 3775

 42345340 AACTCAAGCAGAAGCTTGAGTCTACTCCACTCTTGCTGACACCAAATCTGCATTTTTACA 42345399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3776 AACTCAAGCAGAAGCTTGAGTCTACTCCACTCTTGCTGACACCAAATCTGCATTTTTACA 3835

 42345400 GGATTCTTGGGTGAGTCACACACATATTCAAGGTTAAAATATGCCACCCTAGGTCTTTCT 42345459
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3836 GGATTCTTGGGTGAGTCACAGACATATTCAAGGTTAAAATATGCCACCCTAGGTCTTTCT 3895

 42345460 CCTGCTTCTGAGCAAAACTGGGCACAAGGGACAAACTAGTTTCCTTCAGCCACTTTCAAA 42345519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3896 CCTGCTTCTGAGCAAAACTGGGCACAAGGGACAAACTAGTTTCCTTCAGCCACTTTCAAA 3955

 42345520 TCCTTTATAGAGTGTACTGTGTGAGTCACTGAGAGGAAAGAGGAAATAATACTTATTTAG 42345579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3956 TCCTTTATAGAGTGTACTGTGTGAGTCACTGAGAGGAAAGAGGAAATAATACTTATTTAG 4015

 42345580 GGAAGTCTTGCATAACTTAACAAAGTTAGTAACTTCTTCAATACACTCAAGTACCTATTT 42345639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4016 GGAAGTCTTGCATAACTTAACAAAGTTAGTAACTTCTTCAATACACTCAAGTACCTATTT 4075

 42345640 TTGGAAGCCCTACAGGTTAGGTCAAAGTAAAGAGAAGCAAAAAATGGAGTGAGTTCTAGT 42345699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4076 TTGGAAGCCCTACAGGTTAGGTCAAAGTAAAGAGAAGCAAAAAATGGAGTGAGTTCTAGT 4135

 42345700 AAAAAACTCTGACAAAATAAGGGAAGTGTAGAAGCTGAGTCTATGAGGGATGAGAGAAGC 42345759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4136 AAAAAACTCTGACAAAATAAGGGAAGTGTAGAAGCTGAGTCTATGAGGGATGAGAGAAGC 4195

 42345760 AATTTACCAAATTATCAGATCCAAAATCATCTCTGCACTGTAGATGATTTATAGCCCTGG 42345819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4196 AATTTACCAAATTATCAGATCCAAAATCATCTCTGCACTGTAGATGATTTATAGCCCTGG 4255

 42345820 AAGCTTAGAGGCTTGAGTCTCTTGCTGTATTTCATTTCAAATTAGTAATTTTTATCTAGG 42345879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4256 AAGCTTAGAGGCTTGAGTCTCTTGCTGTATTTCATTTCAAATTAGTAATTTTTATCTAGG 4315

 42345880 GCTTCCCTATGGCTTAAAGTGAAGGCCCTGGAATTTCTGAAGTGAAATTATCTGATGATT 42345939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4316 GCTTCCCTATGGCTTAAAGTGAAGGCCCTGGAATTTCTGAAGTGAAATTATCTGATGATT 4375

 42345940 TTTATGTATGGTCATTCTGTAGTTATCCTGTAAGTTTCATATTTGTAACAAGACTGGAAT 42345999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4376 TTTATGTATGGTCATTCTGTAGTTATCCTGTAAGTTTCATATTTGTAACAAGACTGGAAT 4435

 42346000 CCGAACAATAGAAAACTCTGTGGCAGTAAGCCAAAACCTGATGGACTTAGGAGAGTTACG 42346059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4436 CCGAACAATAGAAAACTCTGTGGCAGTAAGCCAAAACCTGATGGACTTAGGAGAGTTACG 4495

 42346060 TATGTGTGTTTCAGTGGTCCTCAAATTCAGCTGCCTATTAGAATCACCTGGACTTTGAAA 42346119
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     4496 TATGTGTGTTTCAGTGGTCCTCAAATTTAGCTGCCTATTAGAATCACCTGGACTTTGAAA 4555

 42346120 AAAAAAGAGCTTTCTTGAGGTATAACTGACAAATAATAAGACAAACATATTTCAGTATAC 42346179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4556 AAAAAAGAGCTTTCTTGAGGTATAACTGACAAATAATAAGACAAACATATTTCAGTATAC 4615

 42346180 AATTGGATGAGTTTTGACATGTTATATTCTTGTGAAACCATCACCACAATCAAGCTATTC 42346239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4616 AATTGGATGAGTTTTGACATGTTATATTCTTGTGAAACCATCACCACAATCAAGCTATTC 4675

 42346240 ACCCCCCAAATTTTCGTGCC 42346259
          ||||||||||||||||||||
     4676 ACCCCCCAAATTTTCGTGCC 4695

EXCISED REGION

 42347319 TTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGCTCTCAAACTCCTGA 42347378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4700 TTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGCTCTCAAACTCCTGA 4759

 42347379 CCTCAGGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACC 42347438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4760 CCTCAGGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACC 4819

 42347439 ATGCCCAGCGTATTAATTTTCTTGCATGGATGGTGCGTTTGGTGATCTGAGAAATCTTTA 42347498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4820 ATGCCCAGCGTATTAATTTTCTTGCATGGATGGTGCGTTTGGTGATCTGAGAAATCTTTA 4879

 42347499 CCTAACCCAAGGTCACAGAGATTTTCTCCTGTTTGCTTCCAAAATTTTTATACGTTTAGA 42347558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4880 CCTAACCCAAGGTCACAGAGATTTTCTCCTGTTTGCTTCCAAAATTTTTATACGTTTAGA 4939

 42347559 TTTTATATTTAAGTCTATTTTGAGTTAATTTTTGTATATAATGCAAAGTTTAGAATGATG 42347618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4940 TTTTATATTTAAGTCTATTTTGAGTTAATTTTTGTATATAATGCAAAGTTTAGAATGATG 4999

 42347619 TTTAGTTTTTTGTCTATAATCTATGAATATCCAATAGTTCTAGCACCATTTATTGAAAAG 42347678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5000 TTTAGTTTTTTGTCTATAATCTATGAATATCCAATAGTTCTAGCACCATTTATTGAAAAG 5059

 42347679 ACTGATCTTTATCTACTGAAGTGTCTTTGCACTTTTGTTGAAAGTCAATTGACAATTGAC 42347738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5060 ACTGATCTTTATCTACTGAAGTGTCTTTGCACTTTTGTTGAAAGTCAATTGACAATTGAC 5119

 42347739 CATATATTTGTGGGTCTATTCTGGATTCTCTATTCTGTTACATTGATCTATTTTTCTATC 42347798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5120 CATATATTTGTGGGTCTATTCTGGATTCTCTATTCTGTTACATTGATCTATTTTTCTATC 5179

 42347799 TCAATACAAATATCAAATTGGGTATTTGTATTAAGACAAATATAATTTGTCTGGGTATTT 42347858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5180 TCAATACAAATATCAAATTGGGTATTTGTATTAAGACAAATATAATTTGTCTGGGTATTT 5239

 42347859 GTCAAGACAAATAAAAATTGTCTTGATTACTGTAGCTTTATTGCAAGTCTTGAAATCTAA 42347918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5240 GTCAAGACAAATAAAAATTGTCTTGATTACTGTAGCTTTATTGCAAGTCTTGAAATCTAA 5299

 42347919 CTTTATTCTTTTTCTAAGAAAAATATGAATTCTAGATTAAGCTTGAATTTTAGAATAAGT 42347978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5300 CTTTATTCTTTTTCTAAGAAAAATATGAATTCTAGATTAAGCTTGAATTTTAGAATAAGT 5359

 42347979 TTGCCAGTTTCTGAGAGGGGAAAGCCTACTGGAATTTTGATGAGGATTGCATTGAATCTA 42348038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5360 TTGCCAGTTTCTGAGAGGGGAAAGCCTACTGGAATTTTGATGAGGATTGCATTGAATCTA 5419

 42348039 CAGATCTATTAGGGGAAAACTGACATCTTAACAATATTGAGTCTTTCAATCCATGAGCAC 42348098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5420 CAGATCTATTAGGGGAAAACTGACATCTTAACAATATTGAGTCTTTCAATCCATGAGCAC 5479

 42348099 AAAGTCTTTTTTCATTTTTCTCAGCAACGTTTTCTTAGTTTACAGATCTTACAGCTCTTT 42348158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5480 AAAGTCTTTTTTCATTTTTCTCAGCAACGTTTTCTTAGTTTACAGATCTTACAGCTCTTT 5539

 42348159 TGTAAGGTTTTTATCTAAATATTTAATTATTTTGTACTATCATAAGTGTTATTATTTATA 42348218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5540 TGTAAGGTTTTTATCTAAATATTTAATTATTTTGTACTATCATAAGTGTTATTATTTATA 5599

 42348219 TAATTTTAATTTCCAAGTATTTATTGAAACCATTTAGAAACAGTTGATTTTTTATATTGA 42348278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5600 TAATTTTAATTTCCAAGTATTTATTGAAACCATTTAGAAACAGTTGATTTTTTATATTGA 5659

 42348279 TCTTTTATCCTGCAGGCTTGTTAAACTCATTTATTAGTTCTGTAGCTTTTTTGTAGAGTC 42348338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5660 TCTTTTATCCTGCAGGCTTGTTAAACTCATTTATTAGTTCTGTAGCTTTTTTGTAGAGTC 5719

 42348339 CATCAAATTTTCTACATAGAGAGTCATGTTATCTGAGAATAAAAACAGTTTTGCTTCTTC 42348398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5720 CATCAAATTTTCTACATAGAGAGTCATGTTATCTGAGAATAAAAACAGTTTTGCTTCTTC 5779

 42348399 TGCTCCAATCTTAATTCATTTTATATTTTTTTCTTGACTTATTGCACTGGCTACAACCAG 42348458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5780 TGCTCCAATCTTAATTCATTTTATATTTTTTTCTTGACTTATTGCACTGGCTACAACCAG 5839

 42348459 TACAATGCTGAATAAATATAGTGACAGTGGATAGCCTTTCTTTGTTCATGGTCTTAAAGG 42348518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5840 TACAATGCTGAATAAATATAGTGACAGTGGATAGCCTTTCTTTGTTCATGGTCTTAAAGG 5899

 42348519 AAAAGCATTCAGTCTTTCCCATTAAGTATGATGTTAGCTTTAGGTTTTTCATAGATGCCC 42348578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5900 AAAAGCATTCAGTCTTTCCCATTAAGTATGATGTTAGCTTTAGGTTTTTCATAGATGCCC 5959

 42348579 TTTCTCAAATTAAAGAAGTTTCCTACTTTACTGAGAGTTGCTTTATTTAAAATCAGAAAT 42348638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5960 TTTCTCAAATTAAAGAAGTTTCCTACTTTACTGAGAGTTGCTTTATTTAAAATCAGAAAT 6019

 42348639 GAGGCCAGTCACAGTGACTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAGGGTGGGAA 42348698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6020 GAGGCCAGTCACAGTGACTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAGGGTGGGAA 6079

 42348699 GATTACCTGAAGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGACAACATGGTAAAACCCTGTCTGTA 42348758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6080 GATTACCTGAAGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGACAACATGGTAAAACCCTGTCTGTA 6139

 42348759 CTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAGTGGTGCATGCCTGTAGTCCCAGTTATTTGGG 42348818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6140 CTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAGTGGTGCATGCCTGTAGTCCCAGTTATTTGGG 6199

 42348819 AGGCCGATACAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGACTA 42348878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6200 AGGCCGATACAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGACTA 6259

 42348879 CACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAATGAGAAAAAAAAAAAGAGAGAGAGAGAGAA 42348938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6260 CACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAATGAGAAAAAAAAAAAGAGAGAGAGAGAGAA 6319

 42348939 GGAAAGAGAGAAGGAAAGAAAGACAGAAAGACCAAAAGAAAGAAAGAGAGAGAGAGAGAG 42348998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6320 GGAAAGAGAGAAGGAAAGAAAGACAGAAAGACCAAAAGAAAGAAAGAGAGAGAGAGAGAG 6379

 42348999 AGAGAGAGAGAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAG 42349058
          ||||||                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6380 AGAGAG----------------AGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAG 6423

 42349059 AAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAGATCTTGGATTTTGTCAGATTCTTTTTCTGCATCTATTG 42349118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6424 AAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAGATCTTGGATTTTGTCAGATTCTTTTTCTGCATCTATTG 6483

 42349119 AGATATTCATATGGTTTTCCTTTTCGGCCTGTTACTGTGGTGAATCACTGAGTGACTTTC 42349178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6484 AGATATTCATATGGTTTTCCTTTTCGGCCTGTTACTGTGGTGAATCACTGAGTGACTTTC 6543

 42349179 AAATATTAAACTAACCTTGCATTCCTGGGCTATGGCTATAATGTACTATCCTTTTATATA 42349238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6544 AAATATTAAACTAACCTTGCATTCCTGGGCTATGGCTATAATGTACTATCCTTTTATATA 6603

 42349239 TTGTTATATTCTATTTGCTATATTTTCCTAAAAATTTTTGCATTTATACTCATGAAGGAT 42349298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6604 TTGTTATATTCTATTTGCTATATTTTCCTAAAAATTTTTGCATTTATACTCATGAAGGAT 6663

 42349299 ATTAGTCTGCAGTTTTGCTTTCTTGTTATATATTTGTCTGGGTTTGATATCAGAGATCAG 42349358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6664 ATTAGTCTGCAGTTTTGCTTTCTTGTTATATATTTGTCTGGGTTTGATATCAGAGATCAG 6723

 42349359 AGTAATATCAGTATTGTAGGCACCAGTAAATATTTCCTTATAATGCTTTTTATTTTTATT 42349418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6724 AGTAATATCAGTATTGTAGGCACCAGTAAATATTTCCTTATAATGCTTTTTATTTTTATT 6783

 42349419 TTTTAAATTTTTTTATTTTTGAGACGGTGTTTTGTTCTTGTTGCCTGGGCTGGAGTACAA 42349478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6784 TTTTAAATTTTTTTATTTTTGAGACGGTGTTTTGTTCTTGTTGCCTGGGCTGGAGTACAA 6843

 42349479 TGTCACGATCTCAGCTCGTTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTC 42349538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6844 TGTCACGATCTCAGCTCGTTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTC 6903

 42349539 AGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGACACACACCACCACACCTAGCTAATTTTGTATTT 42349598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6904 AGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGACACACACCACCACACCTAGCTAATTTTGTATTT 6963

 42349599 TTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGT 42349658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6964 TTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGT 7023

 42349659 GATCTGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCCGGGATTACAGGTGTGAGCCACCATGCCCAG 42349718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7024 GATCTGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCCGGGATTACAGGTGTGAGCCACCATGCCCAG 7083

 42349719 CGTACAATGCTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACCCAGGCAGAAGTGCAGTGGCATGA 42349778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7084 CGTACAATGCTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACCCAGGCAGAAGTGCAGTGGCATGA 7143

 42349779 TCTTGGCTCACTGCAACCTTTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCC 42349838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7144 TCTTGGCTCACTGCAACCTTTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCC 7203

 42349839 CAGTAGCTTGGACTACAGGCACACGCCACCACACCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTA 42349898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7204 CAGTAGCTTGGACTACAGGCACACGCCACCACACCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTA 7263

 42349899 GAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTAATCTG 42349958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7264 GAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTAATCTG 7323

 42349959 CCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGCCCCCGGCCATGG 42350018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7324 CCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGCCCCCGGCCATGG 7383

 42350019 CTGGGATTTAAACCCAGGCTTCCTAAGTCAAAGTTTATTGCTGTATATATATACAGGTTT 42350078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7384 CTGGGATTTAAACCCAGGCTTCCTAAGTCAAAGTTTATTGCTGTATATATATACAGGTTT 7443

 42350079 TTTTTTCTTTTTTCTTTTTTTTTCTTTTTTTGAGGCAGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGA 42350138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7444 TTTTTTCTTTTTTCTTTTTTTTTCTTTTTTTGAGGCAGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGA 7503

 42350139 CTGGAATGCAATGGCATGATCTCGGCTCAACACAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGCAAT 42350198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7504 CTGGAATGCAATGGCATGATCTCGGCTCAACACAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGCAAT 7563

 42350199 TCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCGCCACCGCACCCAGCTA 42350258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7564 TCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCGCCACCGCACCCAGCTA 7623

 42350259 ATTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGTCTGGTCTCGAACTCC 42350318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7624 ATTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGTCTGGTCTCGAACTCC 7683

 42350319 CGACCTCAGATGATCTGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCC 42350378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7684 CGACCTCAGATGATCTGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCC 7743

 42350379 ACTGCGCCTGGCCAGTTTATTGCTATTTTTTAGCATATCATAGCTACTTATATTTTGTTC 42350438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7744 ACTGCGCCTGGCCAGTTTATTGCTATTTTTTAGCATATCATAGCTACTTATATTTTGTTC 7803

 42350439 TGTGACATGTGTTTATTGACTTGGATTCTGTCTGCATTTCTCTTTTGTCCCCTGAATACA 42350498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7804 TGTGACATGTGTTTATTGACTTGGATTCTGTCTGCATTTCTCTTTTGTCCCCTGAATACA 7863

 42350499 CTGTTTTGGGTTGTGGGCAGGAGCCCCATCTAACCCAAACCTTATAATTTTCACTGGACC 42350558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7864 CTGTTTTGGGTTGTGGGCAGGAGCCCCATCTAACCCAAACCTTATAATTTTCACTGGACC 7923

 42350559 TACCGCACTGTCTGTACCCAGAAGATGATTCTAGGGTTTTTCTTTTTCCTTTTGAGAGAT 42350618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7924 TACCGCACTGTCTGTACCCAGAAGATGATTCTAGGGTTTTTCTTTTTCCTTTTGAGAGAT 7983

 42350619 CTAAGTATCTGGGTTTATCTGACCACATAGTATTCATCAGTCTGCCTTTTTCATGGTCCC 42350678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7984 CTAAGTATCTGGGTTTATCTGACCACATAGTATTCATCAGTCTGCCTTTTTCATGGTCCC 8043

 42350679 TCCACAATCTAAGATTTAAATCAGGCTGTAATTAACTCTAGCACACAGGCTTTTCTACAG 42350738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8044 TCCACAATCTAAGATTTAAATCAGGCTGTAATTAACTCTAGCACACAGGCTTTTCTACAG 8103

 42350739 AAACCTTCCCAGGCTGCACTGTCAGCCTGCTTCTCTCCATTAATGCATGCCATTGGCAGC 42350798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8104 AAACCTTCCCAGGCTGCACTGTCAGCCTGCTTCTCTCCATTAATGCATGCCATTGGCAGC 8163

 42350799 CAGAAACCAGATTTTGCCCTGAGCTACCCACACAAGTTTGAGGCAAGATTATGGGTGAAG 42350858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8164 CAGAAACCAGATTTTGCCCTGAGCTACCCACACAAGTTTGAGGCAAGATTATGGGTGAAG 8223

 42350859 AAAAGCTTGGGGTGGATGCATCTCCTATATGTAAAGGCTGTTTTGTTTGAGTGATTCCAA 42350918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8224 AAAAGCTTGGGGTGGATGCATCTCCTATATGTAAAGGCTGTTTTGTTTGAGTGATTCCAA 8283

 42350919 GTGCTGGTACACTATGATTAATTAACTTGGTTAAGGATTAATTCTTAAAAATCAGGAATG 42350978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8284 GTGCTGGTACACTATGATTAATTAACTTGGTTAAGGATTAATTCTTAAAAATCAGGAATG 8343

 42350979 ATTTGAATCGTTCCTCCAAGTGAGTTGCTCAGCTGCCTCCAGGGAGAGGATCAGTTGAAA 42351038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8344 ATTTGAATCGTTCCTCCAAGTGAGTTGCTCAGCTGCCTCCAGGGAGAGGATCAGTTGAAA 8403

 42351039 AAAGTGGACAATTAATGTCTTAGAGATGACATTATCTCTTTGACATTCCATAGAGATAAA 42351098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8404 AAAGTGGACAATTAATGTCTTAGAGATGACATTATCTCTTTGACATTCCATAGAGATAAA 8463

 42351099 GAGAAAGGCTAATGAGGCATCTCTTTGACACACACTTTCTCTCTCTGTTTTTATTTATTT 42351158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     8464 GAGAAAGGCTAATGAGGCATCTCTTTGACACACACTTTCTCTGTCTGTTTTTATTTATTT 8523

 42351159 ATTTATTTTTGGTTCACAGGTATCCTCAGCCCTAATATAGACTAATAAATCTAAGCCTGT 42351218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8524 ATTTATTTTTGGTTCACAGGTATCCTCAGCCCTAATATAGACTAATAAATCTAAGCCTGT 8583

 42351219 AAGCCTGTGAGTTTGTTTCTTTTCGTAAGTATTCAGCAATGCAAATCCTACCCCCAAAAC 42351278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8584 AAGCCTGTGAGTTTGTTTCTTTTCGTAAGTATTCAGCAATGCAAATCCTACCCCCAAAAC 8643

 42351279 TGTCTTCTTTGACCCATTTCCTGTATTCCTGTATCTGTTATCTTCAGATCTCTCCACCTG 42351338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8644 TGTCTTCTTTGACCCATTTCCTGTATTCCTGTATCTGTTATCTTCAGATCTCTCCACCTG 8703

 42351339 ACTGTCCTCATTATTGAAACGTCATATTTTGACCTCAACACTTCATAGTTGCTGATGTGA 42351398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8704 ACTGTCCTCATTATTGAAACGTCATATTTTGACCTCAACACTTCATAGTTGCTGATGTGA 8763

 42351399 CTTCCTCTATGTTTGAAATGTTTTCTCAGTTACTGCCCTAAGTAAAAAGCAAACACAACA 42351458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8764 CTTCCTCTATGTTTGAAATGTTTTCTCAGTTACTGCCCTAAGTAAAAAGCAAACACAACA 8823

 42351459 AGTTACGGCTTGGCTATCCTTTTTTTTTTTTTTTTCCAAAAAAGAGCTATTTATTACTAA 42351518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8824 AGTTACGGCTTGGCTATCCTTTTTTTTTTTTTTTTCCAAAAAAGAGCTATTTATTACTAA 8883

 42351519 GACAAGTCTACAACAACACTAAAAGTATTCAAAAAGAAAAACATCAGTCATATTTCTGCC 42351578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8884 GACAAGTCTACAACAACACTAAAAGTATTCAAAAAGAAAAACATCAGTCATATTTCTGCC 8943

 42351579 ACTTACCACAACCACTTTCTTTTCTCCCAGATTTTCTTCCAGTCTTCAGTCAGATATAGA 42351638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8944 ACTTACCACAACCACTTTCTTTTCTCCCAGATTTTCTTCCAGTCTTCAGTCAGATATAGA 9003

 42351639 AATATTTTATGTAAGCATAATTATAATGTTCATGTAATTTTTGTGTTCCACTTTTTGTTT 42351698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9004 AATATTTTATGTAAGCATAATTATAATGTTCATGTAATTTTTGTGTTCCACTTTTTGTTT 9063

 42351699 AACATCACTTAATAAACACTTTCTTGTCCTTACATAGTCTTCCTAATGATCTTTTTTTGT 42351758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9064 AACATCACTTAATAAACACTTTCTTGTCCTTACATAGTCTTCCTAATGATCTTTTTTTGT 9123

 42351759 GGCTTCGTGG 42351768
          ||||||||||
     9124 GGCTTCGTGG 9133

Alignment time is 6.6036 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [42336259,42357318] =>     21060 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [       1,    4434] =>      4434 nucs 'mol-32-34b3-066047_4434'

Score:        4423
Aligned:      4434        nucs
Identic:      4433 (100%) nucs =>      1686 (100%)      2747 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [42347319,42349004] EXCISED REGION [42349021,42351768]
 second seq =>  [       1,    1686] EXCISED REGION [    1687,    4434]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        16 nucs [42349005,42349020]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [42349005,42349007] to [42349021,42349023]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [42349003,42349004] to [42349021,42349022]
 second seq =>         2 nucs [1685,1686] to [1687,1688]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [42349005,42349005] to [42349020,42349020]
 second seq =>         0 nucs

 42347319 TTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGCTCTCAAACTCCTGA 42347378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGCTCTCAAACTCCTGA 60

 42347379 CCTCAGGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACC 42347438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCTCAGGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACC 120

 42347439 ATGCCCAGCGTATTAATTTTCTTGCATGGATGGTGCGTTTGGTGATCTGAGAAATCTTTA 42347498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATGCCCAGCGTATTAATTTTCTTGCATGGATGGTGCGTTTGGTGATCTGAGAAATCTTTA 180

 42347499 CCTAACCCAAGGTCACAGAGATTTTCTCCTGTTTGCTTCCAAAATTTTTATACGTTTAGA 42347558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCTAACCCAAGGTCACAGAGATTTTCTCCTGTTTGCTTCCAAAATTTTTATACGTTTAGA 240

 42347559 TTTTATATTTAAGTCTATTTTGAGTTAATTTTTGTATATAATGCAAAGTTTAGAATGATG 42347618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTTTATATTTAAGTCTATTTTGAGTTAATTTTTGTATATAATGCAAAGTTTAGAATGATG 300

 42347619 TTTAGTTTTTTGTCTATAATCTATGAATATCCAATAGTTCTAGCACCATTTATTGAAAAG 42347678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTAGTTTTTTGTCTATAATCTATGAATATCCAATAGTTCTAGCACCATTTATTGAAAAG 360

 42347679 ACTGATCTTTATCTACTGAAGTGTCTTTGCACTTTTGTTGAAAGTCAATTGACAATTGAC 42347738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACTGATCTTTATCTACTGAAGTGTCTTTGCACTTTTGTTGAAAGTCAATTGACAATTGAC 420

 42347739 CATATATTTGTGGGTCTATTCTGGATTCTCTATTCTGTTACATTGATCTATTTTTCTATC 42347798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CATATATTTGTGGGTCTATTCTGGATTCTCTATTCTGTTACATTGATCTATTTTTCTATC 480

 42347799 TCAATACAAATATCAAATTGGGTATTTGTATTAAGACAAATATAATTTGTCTGGGTATTT 42347858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCAATACAAATATCAAATTGGGTATTTGTATTAAGACAAATATAATTTGTCTGGGTATTT 540

 42347859 GTCAAGACAAATAAAAATTGTCTTGATTACTGTAGCTTTATTGCAAGTCTTGAAATCTAA 42347918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GTCAAGACAAATAAAAATTGTCTTGATTACTGTAGCTTTATTGCAAGTCTTGAAATCTAA 600

 42347919 CTTTATTCTTTTTCTAAGAAAAATATGAATTCTAGATTAAGCTTGAATTTTAGAATAAGT 42347978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTTTATTCTTTTTCTAAGAAAAATATGAATTCTAGATTAAGCTTGAATTTTAGAATAAGT 660

 42347979 TTGCCAGTTTCTGAGAGGGGAAAGCCTACTGGAATTTTGATGAGGATTGCATTGAATCTA 42348038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTGCCAGTTTCTGAGAGGGGAAAGCCTACTGGAATTTTGATGAGGATTGCATTGAATCTA 720

 42348039 CAGATCTATTAGGGGAAAACTGACATCTTAACAATATTGAGTCTTTCAATCCATGAGCAC 42348098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CAGATCTATTAGGGGAAAACTGACATCTTAACAATATTGAGTCTTTCAATCCATGAGCAC 780

 42348099 AAAGTCTTTTTTCATTTTTCTCAGCAACGTTTTCTTAGTTTACAGATCTTACAGCTCTTT 42348158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAAGTCTTTTTTCATTTTTCTCAGCAACGTTTTCTTAGTTTACAGATCTTACAGCTCTTT 840

 42348159 TGTAAGGTTTTTATCTAAATATTTAATTATTTTGTACTATCATAAGTGTTATTATTTATA 42348218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGTAAGGTTTTTATCTAAATATTTAATTATTTTGTACTATCATAAGTGTTATTATTTATA 900

 42348219 TAATTTTAATTTCCAAGTATTTATTGAAACCATTTAGAAACAGTTGATTTTTTATATTGA 42348278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TAATTTTAATTTCCAAGTATTTATTGAAACCATTTAGAAACAGTTGATTTTTTATATTGA 960

 42348279 TCTTTTATCCTGCAGGCTTGTTAAACTCATTTATTAGTTCTGTAGCTTTTTTGTAGAGTC 42348338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TCTTTTATCCTGCAGGCTTGTTAAACTCATTTATTAGTTCTGTAGCTTTTTTGTAGAGTC 1020

 42348339 CATCAAATTTTCTACATAGAGAGTCATGTTATCTGAGAATAAAAACAGTTTTGCTTCTTC 42348398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CATCAAATTTTCTACATAGAGAGTCATGTTATCTGAGAATAAAAACAGTTTTGCTTCTTC 1080

 42348399 TGCTCCAATCTTAATTCATTTTATATTTTTTTCTTGACTTATTGCACTGGCTACAACCAG 42348458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGCTCCAATCTTAATTCATTTTATATTTTTTTCTTGACTTATTGCACTGGCTACAACCAG 1140

 42348459 TACAATGCTGAATAAATATAGTGACAGTGGATAGCCTTTCTTTGTTCATGGTCTTAAAGG 42348518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TACAATGCTGAATAAATATAGTGACAGTGGATAGCCTTTCTTTGTTCATGGTCTTAAAGG 1200

 42348519 AAAAGCATTCAGTCTTTCCCATTAAGTATGATGTTAGCTTTAGGTTTTTCATAGATGCCC 42348578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AAAAGCATTCAGTCTTTCCCATTAAGTATGATGTTAGCTTTAGGTTTTTCATAGATGCCC 1260

 42348579 TTTCTCAAATTAAAGAAGTTTCCTACTTTACTGAGAGTTGCTTTATTTAAAATCAGAAAT 42348638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTTCTCAAATTAAAGAAGTTTCCTACTTTACTGAGAGTTGCTTTATTTAAAATCAGAAAT 1320

 42348639 GAGGCCAGTCACAGTGACTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAGGGTGGGAA 42348698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GAGGCCAGTCACAGTGACTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAGGGTGGGAA 1380

 42348699 GATTACCTGAAGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGACAACATGGTAAAACCCTGTCTGTA 42348758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GATTACCTGAAGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGACAACATGGTAAAACCCTGTCTGTA 1440

 42348759 CTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAGTGGTGCATGCCTGTAGTCCCAGTTATTTGGG 42348818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAGTGGTGCATGCCTGTAGTCCCAGTTATTTGGG 1500

 42348819 AGGCCGATACAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGACTA 42348878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AGGCCGATACAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGACTA 1560

 42348879 CACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAATGAGAAAAAAAAAAAGAGAGAGAGAGAGAA 42348938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAATGAGAAAAAAAAAAAGAGAGAGAGAGAGAA 1620

 42348939 GGAAAGAGAGAAGGAAAGAAAGACAGAAAGACCAAAAGAAAGAAAGAGAGAGAGAGAGAG 42348998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GGAAAGAGAGAAGGAAAGAAAGACAGAAAGACCAAAAGAAAGAAAGAGAGAGAGAGAGAG 1680

 42348999 AGAGAG 42349004
          ||||||
     1681 AGAGAG 1686

EXCISED REGION

 42349021 AGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAG 42349080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1687 AGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAG 1746

 42349081 ATCTTGGATTTTGTCAGATTCTTTTTCTGCATCTATTGAGATATTCATATGGTTTTCCTT 42349140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1747 ATCTTGGATTTTGTCAGATTCTTTTTCTGCATCTATTGAGATATTCATATGGTTTTCCTT 1806

 42349141 TTCGGCCTGTTACTGTGGTGAATCACTGAGTGACTTTCAAATATTAAACTAACCTTGCAT 42349200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1807 TTCGGCCTGTTACTGTGGTGAATCACTGAGTGACTTTCAAATATTAAACTAACCTTGCAT 1866

 42349201 TCCTGGGCTATGGCTATAATGTACTATCCTTTTATATATTGTTATATTCTATTTGCTATA 42349260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1867 TCCTGGGCTATGGCTATAATGTACTATCCTTTTATATATTGTTATATTCTATTTGCTATA 1926

 42349261 TTTTCCTAAAAATTTTTGCATTTATACTCATGAAGGATATTAGTCTGCAGTTTTGCTTTC 42349320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1927 TTTTCCTAAAAATTTTTGCATTTATACTCATGAAGGATATTAGTCTGCAGTTTTGCTTTC 1986

 42349321 TTGTTATATATTTGTCTGGGTTTGATATCAGAGATCAGAGTAATATCAGTATTGTAGGCA 42349380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1987 TTGTTATATATTTGTCTGGGTTTGATATCAGAGATCAGAGTAATATCAGTATTGTAGGCA 2046

 42349381 CCAGTAAATATTTCCTTATAATGCTTTTTATTTTTATTTTTTAAATTTTTTTATTTTTGA 42349440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2047 CCAGTAAATATTTCCTTATAATGCTTTTTATTTTTATTTTTTAAATTTTTTTATTTTTGA 2106

 42349441 GACGGTGTTTTGTTCTTGTTGCCTGGGCTGGAGTACAATGTCACGATCTCAGCTCGTTGC 42349500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2107 GACGGTGTTTTGTTCTTGTTGCCTGGGCTGGAGTACAATGTCACGATCTCAGCTCGTTGC 2166

 42349501 AACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATT 42349560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2167 AACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATT 2226

 42349561 ACAGACACACACCACCACACCTAGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACC 42349620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2227 ACAGACACACACCACCACACCTAGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACC 2286

 42349621 ATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCTGCCTTGGCCTCCC 42349680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2287 ATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCTGCCTTGGCCTCCC 2346

 42349681 AAAGTGCCGGGATTACAGGTGTGAGCCACCATGCCCAGCGTACAATGCTTTTTTTTTTTG 42349740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2347 AAAGTGCCGGGATTACAGGTGTGAGCCACCATGCCCAGCGTACAATGCTTTTTTTTTTTG 2406

 42349741 AGACAGAGTCTCACCCAGGCAGAAGTGCAGTGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTTTG 42349800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2407 AGACAGAGTCTCACCCAGGCAGAAGTGCAGTGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTTTG 2466

 42349801 CCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGCTTGGACTACAGGCAC 42349860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2467 CCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGCTTGGACTACAGGCAC 2526

 42349861 ACGCCACCACACCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTG 42349920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2527 ACGCCACCACACCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTG 2586

 42349921 GCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTAATCTGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTG 42349980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2587 GCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTAATCTGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTG 2646

 42349981 CTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGCCCCCGGCCATGGCTGGGATTTAAACCCAGGCTTC 42350040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2647 CTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGCCCCCGGCCATGGCTGGGATTTAAACCCAGGCTTC 2706

 42350041 CTAAGTCAAAGTTTATTGCTGTATATATATACAGGTTTTTTTTTCTTTTTTCTTTTTTTT 42350100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2707 CTAAGTCAAAGTTTATTGCTGTATATATATACAGGTTTTTTTTTCTTTTTTCTTTTTTTT 2766

 42350101 TCTTTTTTTGAGGCAGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGACTGGAATGCAATGGCATGATCT 42350160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2767 TCTTTTTTTGAGGCAGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGACTGGAATGCAATGGCATGATCT 2826

 42350161 CGGCTCAACACAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAG 42350220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2827 CGGCTCAACACAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAG 2886

 42350221 TAGCTGGGATTACAGGCATGCGCCACCGCACCCAGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGAT 42350280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2887 TAGCTGGGATTACAGGCATGCGCCACCGCACCCAGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGAT 2946

 42350281 GGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGTCTGGTCTCGAACTCCCGACCTCAGATGATCTGCCCGC 42350340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2947 GGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGTCTGGTCTCGAACTCCCGACCTCAGATGATCTGCCCGC 3006

 42350341 CTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCGCCTGGCCAGTTTATTG 42350400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3007 CTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCGCCTGGCCAGTTTATTG 3066

 42350401 CTATTTTTTAGCATATCATAGCTACTTATATTTTGTTCTGTGACATGTGTTTATTGACTT 42350460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3067 CTATTTTTTAGCATATCATAGCTACTTATATTTTGTTCTGTGACATGTGTTTATTGACTT 3126

 42350461 GGATTCTGTCTGCATTTCTCTTTTGTCCCCTGAATACACTGTTTTGGGTTGTGGGCAGGA 42350520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3127 GGATTCTGTCTGCATTTCTCTTTTGTCCCCTGAATACACTGTTTTGGGTTGTGGGCAGGA 3186

 42350521 GCCCCATCTAACCCAAACCTTATAATTTTCACTGGACCTACCGCACTGTCTGTACCCAGA 42350580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3187 GCCCCATCTAACCCAAACCTTATAATTTTCACTGGACCTACCGCACTGTCTGTACCCAGA 3246

 42350581 AGATGATTCTAGGGTTTTTCTTTTTCCTTTTGAGAGATCTAAGTATCTGGGTTTATCTGA 42350640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3247 AGATGATTCTAGGGTTTTTCTTTTTCCTTTTGAGAGATCTAAGTATCTGGGTTTATCTGA 3306

 42350641 CCACATAGTATTCATCAGTCTGCCTTTTTCATGGTCCCTCCACAATCTAAGATTTAAATC 42350700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3307 CCACATAGTATTCATCAGTCTGCCTTTTTCATGGTCCCTCCACAATCTAAGATTTAAATC 3366

 42350701 AGGCTGTAATTAACTCTAGCACACAGGCTTTTCTACAGAAACCTTCCCAGGCTGCACTGT 42350760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3367 AGGCTGTAATTAACTCTAGCACACAGGCTTTTCTACAGAAACCTTCCCAGGCTGCACTGT 3426

 42350761 CAGCCTGCTTCTCTCCATTAATGCATGCCATTGGCAGCCAGAAACCAGATTTTGCCCTGA 42350820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3427 CAGCCTGCTTCTCTCCATTAATGCATGCCATTGGCAGCCAGAAACCAGATTTTGCCCTGA 3486

 42350821 GCTACCCACACAAGTTTGAGGCAAGATTATGGGTGAAGAAAAGCTTGGGGTGGATGCATC 42350880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3487 GCTACCCACACAAGTTTGAGGCAAGATTATGGGTGAAGAAAAGCTTGGGGTGGATGCATC 3546

 42350881 TCCTATATGTAAAGGCTGTTTTGTTTGAGTGATTCCAAGTGCTGGTACACTATGATTAAT 42350940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3547 TCCTATATGTAAAGGCTGTTTTGTTTGAGTGATTCCAAGTGCTGGTACACTATGATTAAT 3606

 42350941 TAACTTGGTTAAGGATTAATTCTTAAAAATCAGGAATGATTTGAATCGTTCCTCCAAGTG 42351000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3607 TAACTTGGTTAAGGATTAATTCTTAAAAATCAGGAATGATTTGAATCGTTCCTCCAAGTG 3666

 42351001 AGTTGCTCAGCTGCCTCCAGGGAGAGGATCAGTTGAAAAAAGTGGACAATTAATGTCTTA 42351060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3667 AGTTGCTCAGCTGCCTCCAGGGAGAGGATCAGTTGAAAAAAGTGGACAATTAATGTCTTA 3726

 42351061 GAGATGACATTATCTCTTTGACATTCCATAGAGATAAAGAGAAAGGCTAATGAGGCATCT 42351120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3727 GAGATGACATTATCTCTTTGACATTCCATAGAGATAAAGAGAAAGGCTAATGAGGCATCT 3786

 42351121 CTTTGACACACACTTTCTCTCTCTGTTTTTATTTATTTATTTATTTTTGGTTCACAGGTA 42351180
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3787 CTTTGACACACACTTTCTCTGTCTGTTTTTATTTATTTATTTATTTTTGGTTCACAGGTA 3846

 42351181 TCCTCAGCCCTAATATAGACTAATAAATCTAAGCCTGTAAGCCTGTGAGTTTGTTTCTTT 42351240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3847 TCCTCAGCCCTAATATAGACTAATAAATCTAAGCCTGTAAGCCTGTGAGTTTGTTTCTTT 3906

 42351241 TCGTAAGTATTCAGCAATGCAAATCCTACCCCCAAAACTGTCTTCTTTGACCCATTTCCT 42351300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3907 TCGTAAGTATTCAGCAATGCAAATCCTACCCCCAAAACTGTCTTCTTTGACCCATTTCCT 3966

 42351301 GTATTCCTGTATCTGTTATCTTCAGATCTCTCCACCTGACTGTCCTCATTATTGAAACGT 42351360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3967 GTATTCCTGTATCTGTTATCTTCAGATCTCTCCACCTGACTGTCCTCATTATTGAAACGT 4026

 42351361 CATATTTTGACCTCAACACTTCATAGTTGCTGATGTGACTTCCTCTATGTTTGAAATGTT 42351420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4027 CATATTTTGACCTCAACACTTCATAGTTGCTGATGTGACTTCCTCTATGTTTGAAATGTT 4086

 42351421 TTCTCAGTTACTGCCCTAAGTAAAAAGCAAACACAACAAGTTACGGCTTGGCTATCCTTT 42351480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4087 TTCTCAGTTACTGCCCTAAGTAAAAAGCAAACACAACAAGTTACGGCTTGGCTATCCTTT 4146

 42351481 TTTTTTTTTTTTTCCAAAAAAGAGCTATTTATTACTAAGACAAGTCTACAACAACACTAA 42351540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4147 TTTTTTTTTTTTTCCAAAAAAGAGCTATTTATTACTAAGACAAGTCTACAACAACACTAA 4206

 42351541 AAGTATTCAAAAAGAAAAACATCAGTCATATTTCTGCCACTTACCACAACCACTTTCTTT 42351600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4207 AAGTATTCAAAAAGAAAAACATCAGTCATATTTCTGCCACTTACCACAACCACTTTCTTT 4266

 42351601 TCTCCCAGATTTTCTTCCAGTCTTCAGTCAGATATAGAAATATTTTATGTAAGCATAATT 42351660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4267 TCTCCCAGATTTTCTTCCAGTCTTCAGTCAGATATAGAAATATTTTATGTAAGCATAATT 4326

 42351661 ATAATGTTCATGTAATTTTTGTGTTCCACTTTTTGTTTAACATCACTTAATAAACACTTT 42351720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4327 ATAATGTTCATGTAATTTTTGTGTTCCACTTTTTGTTTAACATCACTTAATAAACACTTT 4386

 42351721 CTTGTCCTTACATAGTCTTCCTAATGATCTTTTTTTGTGGCTTCGTGG 42351768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4387 CTTGTCCTTACATAGTCTTCCTAATGATCTTTTTTTGTGGCTTCGTGG 4434

Alignment time is 3.19931 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [42336259,42357318] =>     21060 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [       1,    4518] =>      4518 nucs 'mol-32-34b3-171681_4518'

Score:        4421
Aligned:      4532        nucs
Identic:      4508 ( 99%) nucs =>      2291 (100%)      2217 ( 99%)
Gaps:           19 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [42343965,42346259] EXCISED REGION [42347319,42349554]
 second seq =>  [       1,    2296] EXCISED REGION [    2301,    4518]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1059 nucs [42346260,42347318]
 second seq =>         4 nucs [2297,2300]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [2297,2297] to [2301,2301]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 42343965 GGTACAAAAATTTTAAAATACAAAGGAGACCATGTGTAAAACATTAGTTAAGCTCAGATA 42344024
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGTACAAAAATTTTAAAACACAAAGGAGACCATGTGTAAAACATTAGTTAAGCTCAGATA 60

 42344025 TAAATCTAGTCTTTGACCAGTCCAGAGCTAATCAATATGCTTTTCTACTCTCTTTGAACT 42344084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAAATCTAGTCTTTGACCAGTCCAGAGCTAATCAATATGCTTTTCTACTCTCTTTGAACT 120

 42344085 TTTGAGTTTTCTGGCAACAACAAAAATCCCAAACCTCATCCAAAACCGTAGTCCAGACAG 42344144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTGAGTTTTCTGGCAACAACAAAAATCCCAAACCTCATCCAAAACCGTAGTCCAGACAG 180

 42344145 CCCAGTTTCTGCACTCCCTTCCTTGTGTCACATATTGTTGACAGAACTACTCCCGTTACC 42344204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCCAGTTTCTGCACTCCCTTCCTTGTGTCACATATTGTTGACAGAACTACTCCCGTTACC 240

 42344205 ACATTCATTCCAGTGGTGATTCAAATTCTTCTGCAGAAATGGACTTGAAAGACAGAAAAC 42344264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACATTCATTCCAGTGGTGATTCAAATTCTTCTGCAGAAATGGACTTGAAAGACAGAAAAC 300

 42344265 TGCTCCTGTAATCACTTAATAAGGAATCTTGGATGAGGAATACAGAGCTATGAATATGGA 42344324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGCTCCTGTAATCACTTAATAAGGAATCTTGGATGAGGAATACAGAGCTATGAATATGGA 360

 42344325 TTTACTCTTAGCCTTTATGGATGCCTTTTTCTCAGTTATTTTCACTGAAAATCATGATGA 42344384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTTACTCTTAGCCTTTATGGATGCCTTTTTCTCAGTTATTTTCACTGAAAATCATGATGA 420

 42344385 ACTGATTTAAATATCAAGGTAAACTGAGATGGAAAATTACCGATAATAAGAGTTTTCTGA 42344444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACTGATTTAAATATCAAGGTAAACTGAGATGGAAAATTACCGATAATAAGAGTTTTCTGA 480

 42344445 AAATATAGATTGGCCTCTTTAAAGCACATCGAGTTTGTTTTGTTTAAATTACAAATTCAC 42344504
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAATATAGATTGGCCTCTTTAAAACACATCGAGTTTGTTTTGTTTAAATTACAAATTCAC 540

 42344505 ATATATTTGAAATGTGTTTAAATGTGTCAGTTTTAGGCAAAACTAAACTATTTGATTCCT 42344564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATATATTTGAAATGTGTTTAAATGTGTCAGTTTTAGGCAAAACTAAACTATTTGATTCCT 600

 42344565 TTCCAAAAATCAGGAATTTGCTTTGGAAAAAAACCATGCAGTTTGATTTACAAAGCAGAG 42344624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTCCAAAAATCAGGAATTTGCTTTGGAAAAAAACCATGCAGTTTGATTTACAAAGCAGAG 660

 42344625 CGGGGGGG-AAGTAGTGGGTGAGAAAGACCCACCCAAAGGCTGCAGCCAGCTTCCCCAGG 42344683
          |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CGGGGGGGGAAGTAGTGGGTGAGAAAGACCCACCCAAAGGCTGCAGCCAGCTTCCCCAGG 720

 42344684 AAGATTCATAACCATGCCACAATACTGTCCTTCAATTCGTTCCAACAGATTTTACTATAA 42344743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAGATTCATAACCATGCCACAATACTGTCCTTCAATTCGTTCCAACAGATTTTACTATAA 780

 42344744 CTCTAAATCATTAGAAGCAACTGCTGCTATGACTAGTGCTATCTTTGCCTCAAAAAGAGG 42344803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTCTAAATCATTAGAAGCAACTGCTGCTATGACTAGTGCTATCTTTGCCTCAAAAAGAGG 840

 42344804 AAAAATCAGGACATACAATATAATCCCCTCAGGATCTAGGAGAGAAATCAGCCCATTTGT 42344863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAAAATCAGGACATACAATATAATCCCCTCAGGATCTAGGAGAGAAATCAGCCCATTTGT 900

 42344864 CATAAGAACTGAAAACCTCAGCTAAATAGTATATGAAACATTGGTATTTCATACCTTGAC 42344923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CATAAGAACTGAAAACCTCAGCTAAATAGTATATGAAACATTGGTATTTCATACCTTGAC 960

 42344924 ATTACATATTTTTGAAAATAAAGTAAGCATACACACAAGAAGTGGCTAGATGCAGCAGTT 42344983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATTACATATTTTTGAAAATAAAGTAAGCATACACACAAGAAGTGGCTAGATGCAGCAGTT 1020

 42344984 ATAAAGTGGCTTAAGTTGGGTTAACTAAATATAACCTAGAAAAACCATCTTATCTATTGC 42345043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATAAAGTGGCTTAAGTTGGGTTAACTAAATATAACCTAGAAAAACCATCTTATCTATTGC 1080

 42345044 AAATTATTTCCAGAAAAAGGTAAGAAAAATCCAACCAACACTTTTTAAACATCCTGAGCT 42345103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAATTATTTCCAGAAAAAGGTAAGAAAAATCCAACCAACACTTTTTAAACATCCTGAGCT 1140

 42345104 ATTCACAGCAAGTGAATCTTTACCCTTACCAGATGTATAAACATTTACATAAGGCAGGAG 42345163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATTCACAGCAAGTGAATCTTTACCCTTACCAGATGTATAAACATTTACATAAGGCAGGAG 1200

 42345164 GTTCAACACTTGGAGAGTGTAATCAAGGCAGTAGTAACGCAGTGCTCCTCTCTTTGACTT 42345223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GTTCAACACTTGGAGAGTGTAATCAAGGCAGTAGTAACGCAGTGCTCCTCTCTTTGACTT 1260

 42345224 GAATGACTTCCTCCCCATTAGGGTCATTATTGTTTTGCAGTGTCCCAGGGATGAAAGGAC 42345283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GAATGACTTCCTCCCCATTAGGGTCATTATTGTTTTGCAGTGTCCCAGGGATGAAAGGAC 1320

 42345284 TTTGAAAGGTCATGTGTCTTGTGACCCAACTAGCAGCATCAGCATCACTGGGGAGAAACT 42345343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTTGAAAGGTCATGTGTCTTGTGACCCAACTAGCAGCATCAGCATCACTGGGGAGAAACT 1380

 42345344 CAAGCAGAAGCTTGAGTCTACTCCACTCTTGCTGACACCAAATCTGCATTTTTACAGGAT 42345403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CAAGCAGAAGCTTGAGTCTACTCCACTCTTGCTGACACCAAATCTGCATTTTTACAGGAT 1440

 42345404 TCTTGGGTGAGTCACACACATATTCAAGGTTAAAATATGCCACCCTAGGTCTTTCTCCTG 42345463
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TCTTGGGTGAGTCACAGACATATTCAAGGTTAAAATATGCCACCCTAGGTCTTTCTCCTG 1500

 42345464 CTTCTGAGCAAAACTGGGCACAAGGGACAAACTAGTTTCCTTCAGCCACTTTCAAATCCT 42345523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CTTCTGAGCAAAACTGGGCACAAGGGACAAACTAGTTTCCTTCAGCCACTTTCAAATCCT 1560

 42345524 TTATAGAGTGTACTGTGTGAGTCACTGAGAGGAAAGAGGAAATAATACTTATTTAGGGAA 42345583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTATAGAGTGTACTGTGTGAGTCACTGAGAGGAAAGAGGAAATAATACTTATTTAGGGAA 1620

 42345584 GTCTTGCATAACTTAACAAAGTTAGTAACTTCTTCAATACACTCAAGTACCTATTTTTGG 42345643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GTCTTGCATAACTTAACAAAGTTAGTAACTTCTTCAATACACTCAAGTACCTATTTTTGG 1680

 42345644 AAGCCCTACAGGTTAGGTCAAAGTAAAGAGAAGCAAAAAATGGAGTGAGTTCTAGTAAAA 42345703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AAGCCCTACAGGTTAGGTCAAAGTAAAGAGAAGCAAAAAATGGAGTGAGTTCTAGTAAAA 1740

 42345704 AACTCTGACAAAATAAGGGAAGTGTAGAAGCTGAGTCTATGAGGGATGAGAGAAGCAATT 42345763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AACTCTGACAAAATAAGGGAAGTGTAGAAGCTGAGTCTATGAGGGATGAGAGAAGCAATT 1800

 42345764 TACCAAATTATCAGATCCAAAATCATCTCTGCACTGTAGATGATTTATAGCCCTGGAAGC 42345823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TACCAAATTATCAGATCCAAAATCATCTCTGCACTGTAGATGATTTATAGCCCTGGAAGC 1860

 42345824 TTAGAGGCTTGAGTCTCTTGCTGTATTTCATTTCAAATTAGTAATTTTTATCTAGGGCTT 42345883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTAGAGGCTTGAGTCTCTTGCTGTATTTCATTTCAAATTAGTAATTTTTATCTAGGGCTT 1920

 42345884 CCCTATGGCTTAAAGTGAAGGCCCTGGAATTTCTGAAGTGAAATTATCTGATGATTTTTA 42345943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CCCTATGGCTTAAAGTGAAGGCCCTGGAATTTCTGAAGTGAAATTATCTGATGATTTTTA 1980

 42345944 TGTATGGTCATTCTGTAGTTATCCTGTAAGTTTCATATTTGTAACAAGACTGGAATCCGA 42346003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TGTATGGTCATTCTGTAGTTATCCTGTAAGTTTCATATTTGTAACAAGACTGGAATCCGA 2040

 42346004 ACAATAGAAAACTCTGTGGCAGTAAGCCAAAACCTGATGGACTTAGGAGAGTTACGTATG 42346063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ACAATAGAAAACTCTGTGGCAGTAAGCCAAAACCTGATGGACTTAGGAGAGTTACGTATG 2100

 42346064 TGTGTTTCAGTGGTCCTCAAATTCAGCTGCCTATTAGAATCACCTGGACTTTGAAAAAAA 42346123
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TGTGTTTCAGTGGTCCTCAAATTTAGCTGCCTATTAGAATCACCTGGACTTTGAAAAAAA 2160

 42346124 AAGAGCTTTCTTGAGGTATAACTGACAAATAATAAGACAAACATATTTCAGTATACAATT 42346183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AAGAGCTTTCTTGAGGTATAACTGACAAATAATAAGACAAACATATTTCAGTATACAATT 2220

 42346184 GGATGAGTTTTGACATGTTATATTCTTGTGAAACCATCACCACAATCAAGCTATTCACCC 42346243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GGATGAGTTTTGACATGTTATATTCTTGTGAAACCATCACCACAATCAAGCTATTCACCC 2280

 42346244 CCCAAATTTTCGTGCC 42346259
          ||||||||||||||||
     2281 CCCAAATTTTCGTGCC 2296

EXCISED REGION

 42347319 TTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGCTCTCAAACTCCTGA 42347378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2301 TTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGCTCTCAAACTCCTGA 2360

 42347379 CCTCAGGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACC 42347438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2361 CCTCAGGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACC 2420

 42347439 ATGCCCAGCGTATTAATTTTCTTGCATGGATGGTGCGTTTGGTGATCTGAGAAATCTTTA 42347498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     2421 ATGCCCAGCGTATTAATTTTCTTGCATGGATGGTGCGTTTGGTGATCTGAGAAATCTTCA 2480

 42347499 CCTAACCCAAGGTCACAGAGATTTTCTCCTGTTTGCTTCCAAAATTTTTATACGTTTAGA 42347558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2481 CCTAACCCAAGGTCACAGAGATTTTCTCCTGTTTGCTTCCAAAATTTTTATACGTTTAGA 2540

 42347559 TTTTATATTTAAGTCTATTTTGAGTTAATTTTTGTATATAATGCAAAGTTTAGAATGATG 42347618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2541 TTTTATATTTAAGTCTATTTTGAGTTAATTTTTGTATATAATGCAAAGTTTAGAATGATG 2600

 42347619 TTTAGTTTTTTGTCTATAATCTATGAATATCCAATAGTTCTAGCACCATTTATTGAAAAG 42347678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2601 TTTAGTTTTTTGTCTATAATCTATGAATATCCAATAGTTCTAGCACCATTTATTGAAAAG 2660

 42347679 ACTGATCTTTATCTACTGAAGTGTCTTTGCACTTTTGTTGAAAGTCAATTGACAATTGAC 42347738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2661 ACTGATCTTTATCTACTGAAGTGTCTTTGCACTTTTGTTGAAAGTCAATTGACAATTGAC 2720

 42347739 CATATATTTGTGGGTCTATTCTGGATTCTCTATTCTGTTACATTGATCTATTTTTCTATC 42347798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2721 CATATATTTGTGGGTCTATTCTGGATTCTCTATTCTGTTACATTGATCTATTTTTCTATC 2780

 42347799 TCAATACAAATATCAAATTGGGTATTTGTATTAAGACAAATATAATTTGTCTGGGTATTT 42347858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2781 TCAATACAAATATCAAATTGGGTATTTGTATTAAGACAAATATAATTTGTCTGGGTATTT 2840

 42347859 GTCAAGACAAATAAAAATTGTCTTGATTACTGTAGCTTTATTGCAAGTCTTGAAATCTAA 42347918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2841 GTCAAGACAAATAAAAATTGTCTTGATTACTGTAGCTTTATTGCAAGTCTTGAAATCTAA 2900

 42347919 CTTTATTCTTTTTCTAAGAAAAATATGAATTCTAGATTAAGCTTGAATTTTAGAATAAGT 42347978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2901 CTTTATTCTTTTTCTAAGAAAAATATGAATTCTAGATTAAGCTTGAATTTTAGAATAAGT 2960

 42347979 TTGCCAGTTTCTGAGAGGGGAAAGCCTACTGGAATTTTGATGAGGATTGCATTGAATCTA 42348038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2961 TTGCCAGTTTCTGAGAGGGGAAAGCCTACTGGAATTTTGATGAGGATTGCATTGAATCTA 3020

 42348039 CAGATCTATTAGGGGAAAACTGACATCTTAACAATATTGAGTCTTTCAATCCATGAGCAC 42348098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3021 CAGATCTATTAGGGGAAAACTGACATCTTAACAATATTGAGTCTTTCAATCCATGAGCAC 3080

 42348099 AAAGTCTTTTTTCATTTTTCTCAGCAACGTTTTCTTAGTTTACAGATCTTACAGCTCTTT 42348158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3081 AAAGTCTTTTTTCATTTTTCTCAGCAACGTTTTCTTAGTTTACAGATCTTACAGCTCTTT 3140

 42348159 TGTAAGGTTTTTATCTAAATATTTAATTATTTTGTACTATCATAAGTGTTATTATTTATA 42348218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3141 TGTAAGGTTTTTATCTAAATATTTAATTATTTTGTACTATCATAAGTGTTATTATTTATA 3200

 42348219 TAATTTTAATTTCCAAGTATTTATTGAAACCATTTAGAAACAGTTGATTTTTTATATTGA 42348278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3201 TAATTTTAATTTCCAAGTATTTATTGAAACCATTTAGAAACAGTTGATTTTTTATATTGA 3260

 42348279 TCTTTTATCCTGCAGGCTTGTTAAACTCATTTATTAGTTCTGTAGCTTTTTTGTAGAGTC 42348338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3261 TCTTTTATCCTGCAGGCTTGTTAAACTCATTTATTAGTTCTGTAGCTTTTTTGTAGAGTC 3320

 42348339 CATCAAATTTTCTACATAGAGAGTCATGTTATCTGAGAATAAAAACAGTTTTGCTTCTTC 42348398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3321 CATCAAATTTTCTACATAGAGAGTCATGTTATCTGAGAATAAAAACAGTTTTGCTTCTTC 3380

 42348399 TGCTCCAATCTTAATTCATTTTATATTTTTTTCTTGACTTATTGCACTGGCTACAACCAG 42348458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3381 TGCTCCAATCTTAATTCATTTTATATTTTTTTCTTGACTTATTGCACTGGCTACAACCAG 3440

 42348459 TACAATGCTGAATAAATATAGTGACAGTGGATAGCCTTTCTTTGTTCATGGTCTTAAAGG 42348518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3441 TACAATGCTGAATAAATATAGTGACAGTGGATAGCCTTTCTTTGTTCATGGTCTTAAAGG 3500

 42348519 AAAAGCATTCAGTCTTTCCCATTAAGTATGATGTTAGCTTTAGGTTTTTCATAGATGCCC 42348578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3501 AAAAGCATTCAGTCTTTCCCATTAAGTATGATGTTAGCTTTAGGTTTTTCATAGATGCCC 3560

 42348579 TTTCTCAAATTAAAGAAGTTTCCTACTTTACTGAGAGTTGCTTTATTTAAAATCAGAAAT 42348638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3561 TTTCTCAAATTAAAGAAGTTTCCTACTTTACTGAGAGTTGCTTTATTTAAAATCAGAAAT 3620

 42348639 GAGGCCAGTCACAGTGACTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAGGGTGGGAA 42348698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3621 GAGGCCAGTCACAGTGACTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAGGGTGGGAA 3680

 42348699 GATTACCTGAAGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGACAACATGGTAAAACCCTGTCTGTA 42348758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3681 GATTACCTGAAGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGACAACATGGTAAAACCCTGTCTGTA 3740

 42348759 CTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAGTGGTGCATGCCTGTAGTCCCAGTTATTTGGG 42348818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3741 CTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAGTGGTGCATGCCTGTAGTCCCAGTTATTTGGG 3800

 42348819 AGGCCGATACAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGACTA 42348878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3801 AGGCCGATACAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGACTA 3860

 42348879 CACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAATGAGAAAAAAAAAAAGAGAGAGAGAGAGAA 42348938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3861 CACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAATGAGAAAAAAAAAAAGAGAGAGAGAGAGAA 3920

 42348939 GGAAAGAGAGAAGGAAAGAAAGACAGAAAGACCAAAAGAAAGAAAGAGAGAGAGAGAGAG 42348998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3921 GGAAAGAGAGAAGGAAAGAAAGACAGAAAGACCAAAAGAAAGAAAGAGAGAGAGAGAGAG 3980

 42348999 AGAGAGAGAGAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAG 42349058
          ||||||||                  ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3981 AGAGAGAG------------------AGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAG 4022

 42349059 AAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAGATCTTGGATTTTGTCAGATTCTTTTTCTGCATCTATTG 42349118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4023 AAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAGATCTTGGATTTTGTCAGATTCTTTTTCTGCATCTATTG 4082

 42349119 AGATATTCATATGGTTTTCCTTTTCGGCCTGTTACTGTGGTGAATCACTGAGTGACTTTC 42349178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4083 AGATATTCATATGGTTTTCCTTTTCGGCCTGTTACTGTGGTGAATCACTGAGTGACTTTC 4142

 42349179 AAATATTAAACTAACCTTGCATTCCTGGGCTATGGCTATAATGTACTATCCTTTTATATA 42349238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4143 AAATATTAAACTAACCTTGCATTCCTGGGCTATGGCTATAATGTACTATCCTTTTATATA 4202

 42349239 TTGTTATATTCTATTTGCTATATTTTCCTAAAAATTTTTGCATTTATACTCATGAAGGAT 42349298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4203 TTGTTATATTCTATTTGCTATATTTTCCTAAAAATTTTTGCATTTATACTCATGAAGGAT 4262

 42349299 ATTAGTCTGCAGTTTTGCTTTCTTGTTATATATTTGTCTGGGTTTGATATCAGAGATCAG 42349358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4263 ATTAGTCTGCAGTTTTGCTTTCTTGTTATATATTTGTCTGGGTTTGATATCAGAGATCAG 4322

 42349359 AGTAATATCAGTATTGTAGGCACCAGTAAATATTTCCTTATAATGCTTTTTATTTTTATT 42349418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4323 AGTAATATCAGTATTGTAGGCACCAGTAAATATTTCCTTATAATGCTTTTTATTTTTATT 4382

 42349419 TTTTAAATTTTTTTATTTTTGAGACGGTGTTTTGTTCTTGTTGCCTGGGCTGGAGTACAA 42349478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4383 TTTTAAATTTTTTTATTTTTGAGACGGTGTTTTGTTCTTGTTGCCTGGGCTGGAGTACAA 4442

 42349479 TGTCACGATCTCAGCTCGTTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTC 42349538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4443 TGTCACGATCTCAGCTCGTTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTC 4502

 42349539 AGCCTCCCGAGTAGCT 42349554
          ||||||||||||||||
     4503 AGCCTCCCGAGTAGCT 4518

Alignment time is 3.23033 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [42336259,42357318] =>     21060 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [       1,    2218] =>      2218 nucs 'mol-32-34b3-171681_2218'

Score:        2207
Aligned:      2218        nucs
Identic:      2217 (100%) nucs =>      1687 (100%)       530 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [42347319,42349006] EXCISED REGION [42349025,42349554]
 second seq =>  [       1,    1688] EXCISED REGION [    1689,    2218]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        18 nucs [42349007,42349024]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [42349007,42349009] to [42349025,42349027]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [42349005,42349006] to [42349025,42349026]
 second seq =>         2 nucs [1687,1688] to [1689,1690]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [42349007,42349007] to [42349024,42349024]
 second seq =>         0 nucs

 42347319 TTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGCTCTCAAACTCCTGA 42347378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGCTCTCAAACTCCTGA 60

 42347379 CCTCAGGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACC 42347438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCTCAGGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACC 120

 42347439 ATGCCCAGCGTATTAATTTTCTTGCATGGATGGTGCGTTTGGTGATCTGAGAAATCTTTA 42347498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
      121 ATGCCCAGCGTATTAATTTTCTTGCATGGATGGTGCGTTTGGTGATCTGAGAAATCTTCA 180

 42347499 CCTAACCCAAGGTCACAGAGATTTTCTCCTGTTTGCTTCCAAAATTTTTATACGTTTAGA 42347558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCTAACCCAAGGTCACAGAGATTTTCTCCTGTTTGCTTCCAAAATTTTTATACGTTTAGA 240

 42347559 TTTTATATTTAAGTCTATTTTGAGTTAATTTTTGTATATAATGCAAAGTTTAGAATGATG 42347618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTTTATATTTAAGTCTATTTTGAGTTAATTTTTGTATATAATGCAAAGTTTAGAATGATG 300

 42347619 TTTAGTTTTTTGTCTATAATCTATGAATATCCAATAGTTCTAGCACCATTTATTGAAAAG 42347678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTAGTTTTTTGTCTATAATCTATGAATATCCAATAGTTCTAGCACCATTTATTGAAAAG 360

 42347679 ACTGATCTTTATCTACTGAAGTGTCTTTGCACTTTTGTTGAAAGTCAATTGACAATTGAC 42347738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACTGATCTTTATCTACTGAAGTGTCTTTGCACTTTTGTTGAAAGTCAATTGACAATTGAC 420

 42347739 CATATATTTGTGGGTCTATTCTGGATTCTCTATTCTGTTACATTGATCTATTTTTCTATC 42347798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CATATATTTGTGGGTCTATTCTGGATTCTCTATTCTGTTACATTGATCTATTTTTCTATC 480

 42347799 TCAATACAAATATCAAATTGGGTATTTGTATTAAGACAAATATAATTTGTCTGGGTATTT 42347858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCAATACAAATATCAAATTGGGTATTTGTATTAAGACAAATATAATTTGTCTGGGTATTT 540

 42347859 GTCAAGACAAATAAAAATTGTCTTGATTACTGTAGCTTTATTGCAAGTCTTGAAATCTAA 42347918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GTCAAGACAAATAAAAATTGTCTTGATTACTGTAGCTTTATTGCAAGTCTTGAAATCTAA 600

 42347919 CTTTATTCTTTTTCTAAGAAAAATATGAATTCTAGATTAAGCTTGAATTTTAGAATAAGT 42347978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTTTATTCTTTTTCTAAGAAAAATATGAATTCTAGATTAAGCTTGAATTTTAGAATAAGT 660

 42347979 TTGCCAGTTTCTGAGAGGGGAAAGCCTACTGGAATTTTGATGAGGATTGCATTGAATCTA 42348038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTGCCAGTTTCTGAGAGGGGAAAGCCTACTGGAATTTTGATGAGGATTGCATTGAATCTA 720

 42348039 CAGATCTATTAGGGGAAAACTGACATCTTAACAATATTGAGTCTTTCAATCCATGAGCAC 42348098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CAGATCTATTAGGGGAAAACTGACATCTTAACAATATTGAGTCTTTCAATCCATGAGCAC 780

 42348099 AAAGTCTTTTTTCATTTTTCTCAGCAACGTTTTCTTAGTTTACAGATCTTACAGCTCTTT 42348158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAAGTCTTTTTTCATTTTTCTCAGCAACGTTTTCTTAGTTTACAGATCTTACAGCTCTTT 840

 42348159 TGTAAGGTTTTTATCTAAATATTTAATTATTTTGTACTATCATAAGTGTTATTATTTATA 42348218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGTAAGGTTTTTATCTAAATATTTAATTATTTTGTACTATCATAAGTGTTATTATTTATA 900

 42348219 TAATTTTAATTTCCAAGTATTTATTGAAACCATTTAGAAACAGTTGATTTTTTATATTGA 42348278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TAATTTTAATTTCCAAGTATTTATTGAAACCATTTAGAAACAGTTGATTTTTTATATTGA 960

 42348279 TCTTTTATCCTGCAGGCTTGTTAAACTCATTTATTAGTTCTGTAGCTTTTTTGTAGAGTC 42348338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TCTTTTATCCTGCAGGCTTGTTAAACTCATTTATTAGTTCTGTAGCTTTTTTGTAGAGTC 1020

 42348339 CATCAAATTTTCTACATAGAGAGTCATGTTATCTGAGAATAAAAACAGTTTTGCTTCTTC 42348398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CATCAAATTTTCTACATAGAGAGTCATGTTATCTGAGAATAAAAACAGTTTTGCTTCTTC 1080

 42348399 TGCTCCAATCTTAATTCATTTTATATTTTTTTCTTGACTTATTGCACTGGCTACAACCAG 42348458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGCTCCAATCTTAATTCATTTTATATTTTTTTCTTGACTTATTGCACTGGCTACAACCAG 1140

 42348459 TACAATGCTGAATAAATATAGTGACAGTGGATAGCCTTTCTTTGTTCATGGTCTTAAAGG 42348518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TACAATGCTGAATAAATATAGTGACAGTGGATAGCCTTTCTTTGTTCATGGTCTTAAAGG 1200

 42348519 AAAAGCATTCAGTCTTTCCCATTAAGTATGATGTTAGCTTTAGGTTTTTCATAGATGCCC 42348578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AAAAGCATTCAGTCTTTCCCATTAAGTATGATGTTAGCTTTAGGTTTTTCATAGATGCCC 1260

 42348579 TTTCTCAAATTAAAGAAGTTTCCTACTTTACTGAGAGTTGCTTTATTTAAAATCAGAAAT 42348638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTTCTCAAATTAAAGAAGTTTCCTACTTTACTGAGAGTTGCTTTATTTAAAATCAGAAAT 1320

 42348639 GAGGCCAGTCACAGTGACTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAGGGTGGGAA 42348698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GAGGCCAGTCACAGTGACTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAGGGTGGGAA 1380

 42348699 GATTACCTGAAGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGACAACATGGTAAAACCCTGTCTGTA 42348758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GATTACCTGAAGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGACAACATGGTAAAACCCTGTCTGTA 1440

 42348759 CTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAGTGGTGCATGCCTGTAGTCCCAGTTATTTGGG 42348818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAGTGGTGCATGCCTGTAGTCCCAGTTATTTGGG 1500

 42348819 AGGCCGATACAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGACTA 42348878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AGGCCGATACAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGACTA 1560

 42348879 CACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAATGAGAAAAAAAAAAAGAGAGAGAGAGAGAA 42348938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAATGAGAAAAAAAAAAAGAGAGAGAGAGAGAA 1620

 42348939 GGAAAGAGAGAAGGAAAGAAAGACAGAAAGACCAAAAGAAAGAAAGAGAGAGAGAGAGAG 42348998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GGAAAGAGAGAAGGAAAGAAAGACAGAAAGACCAAAAGAAAGAAAGAGAGAGAGAGAGAG 1680

 42348999 AGAGAGAG 42349006
          ||||||||
     1681 AGAGAGAG 1688

EXCISED REGION

 42349025 AGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAGATCT 42349084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1689 AGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAGATCT 1748

 42349085 TGGATTTTGTCAGATTCTTTTTCTGCATCTATTGAGATATTCATATGGTTTTCCTTTTCG 42349144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1749 TGGATTTTGTCAGATTCTTTTTCTGCATCTATTGAGATATTCATATGGTTTTCCTTTTCG 1808

 42349145 GCCTGTTACTGTGGTGAATCACTGAGTGACTTTCAAATATTAAACTAACCTTGCATTCCT 42349204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1809 GCCTGTTACTGTGGTGAATCACTGAGTGACTTTCAAATATTAAACTAACCTTGCATTCCT 1868

 42349205 GGGCTATGGCTATAATGTACTATCCTTTTATATATTGTTATATTCTATTTGCTATATTTT 42349264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1869 GGGCTATGGCTATAATGTACTATCCTTTTATATATTGTTATATTCTATTTGCTATATTTT 1928

 42349265 CCTAAAAATTTTTGCATTTATACTCATGAAGGATATTAGTCTGCAGTTTTGCTTTCTTGT 42349324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1929 CCTAAAAATTTTTGCATTTATACTCATGAAGGATATTAGTCTGCAGTTTTGCTTTCTTGT 1988

 42349325 TATATATTTGTCTGGGTTTGATATCAGAGATCAGAGTAATATCAGTATTGTAGGCACCAG 42349384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1989 TATATATTTGTCTGGGTTTGATATCAGAGATCAGAGTAATATCAGTATTGTAGGCACCAG 2048

 42349385 TAAATATTTCCTTATAATGCTTTTTATTTTTATTTTTTAAATTTTTTTATTTTTGAGACG 42349444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2049 TAAATATTTCCTTATAATGCTTTTTATTTTTATTTTTTAAATTTTTTTATTTTTGAGACG 2108

 42349445 GTGTTTTGTTCTTGTTGCCTGGGCTGGAGTACAATGTCACGATCTCAGCTCGTTGCAACC 42349504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2109 GTGTTTTGTTCTTGTTGCCTGGGCTGGAGTACAATGTCACGATCTCAGCTCGTTGCAACC 2168

 42349505 TCTGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCT 42349554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2169 TCTGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCT 2218

Alignment time is 1.61881 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [42336259,42357318] =>     21060 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [       1,    4248] =>      4248 nucs 'mol-32-34d4-145466_4248'

Score:        4142
Aligned:      4249        nucs
Identic:      4236 (100%) nucs =>      4207 (100%)        29 (100%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [42342040,42346259] EXCISED REGION [42347319,42347347]
 second seq =>  [       1,    4215] EXCISED REGION [    4220,    4248]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1059 nucs [42346260,42347318]
 second seq =>         4 nucs [4216,4219]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>      3625 nucs [42346260,42349884]
 second seq =>         4 nucs [4216,4219]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [4216,4216] to [4220,4220]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 42342040 AGTGTTGAGAGGGGAAGATTTGATATTCCAAGTATTTTTGGCCACAGAACTCTTTTTATC 42342099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGTGTTGAGAGGGGAAGATTTGATATTCCAAGTATTTTTGGCCACAGAACTCTTTTTATC 60

 42342100 ATGGAACATTTCCAGTGTTCCATGAGACACAATTAGGGGCTAGTGAGCCACTGACTTTTG 42342159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATGGAACATTTCCAGTGTTCCATGAGACACAATTAGGGGCTAGTGAGCCACTGACTTTTG 120

 42342160 AGTTGGAAAGTGACACATGGGGAAAGCAAAGTTTTGGAAGATTGATCTCACGGTAGAATA 42342219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGTTGGAAAGTGACACATGGGGAAAGCAAAGTTTTGGAAGATTGATCTCACGGTAGAATA 180

 42342220 TAAGGTGAACAGGAGAGAAAAGAGCCTGGATTCAGGCAACACAATCAGATGATTGGATAC 42342279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TAAGGTGAACAGGAGAGAAAAGAGCCTGGATTCAGGCAACACAATCAGATGATTGGATAC 240

 42342280 AGGCTCAAGATTAGGGGGTGGGTTGCACTACACTGGAGCGGAGAATGGAGAGCAAAAGCA 42342339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGGCTCAAGATTAGGGGGTGGGTTGCACTACACTGGAGCGGAGAATGGAGAGCAAAAGCA 300

 42342340 CTGATTGAATGCACAGTCTTCTGTTGGATCCTGGGATGATACAGAAGTGTCAGAGTTCCT 42342399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTGATTGAATGCACAGTCTTCTGTTGGATCCTGGGATGATACAGAAGTGTCAGAGTTCCT 360

 42342400 GGGTCTTGTAGGAGTTCCAATGAGCATCAATCAAAAGTTTGATTGTAAGGCACAGAAATC 42342459
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGGTCTTGTAGGAGTTCCAATGCGCATCAATCAAAAGTTTGATTGTAAGGCACAGAAATC 420

 42342460 AACTTGGACCAGCTAAAGCAAAAAGACCATTTTTAGGGAAATAGGGATGTGTCACAAAGA 42342519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AACTTGGACCAGCTAAAGCAAAAAGACCATTTTTAGGGAAATAGGGATGTGTCACAAAGA 480

 42342520 ACTGCATCTAGGTACTGGAAATCAACAAAAAGTTCCCCATCTGATCTCAGCTTCTCTGTG 42342579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACTGCATCTAGGTACTGGAAATCAACAAAAAGTTCCCCATCTGATCTCAGCTTCTCTGTG 540

 42342580 TGTCTACTACATACACTATCTTTCTCCTCTTTTCTTTCCTCTCTACCCCCTACCTCCCTC 42342639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGTCTACTACATACACTATCTTTCTCCTCTTTTCTTTCCTCTCTACCCCCTACCTCCCTC 600

 42342640 CTCTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTGTTTTTTGGTTTTTTTATGTTTGTTTGTTTGCTTTT 42342699
          ||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||.||||
      601 CTCTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTT-----TTGGTTTTTTTATGTTTGTTTGTTTGTTTTT 655

 42342700 GGAGACACGGTCTCCCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCTTAATTACTGCAGCCT 42342759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      656 GGAGACACGGTCTCCCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCTTAATTACTGCAGCCT 715

 42342760 CAATCTCCTGGGCTCAAGTGACCCTCCCACCTCAGCCTCCTGAATAGCTGGGACCACAGG 42342819
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
      716 CAATCTCCTGGGCTCAAGTGACCCTCCCACTTCAGCCTCCTGAATAGCTGGGACCACAGG 775

 42342820 TGCAAGCCACAGTGCTCAGCTAATTAAAAAAAATTTTTTTTTCAGAGATGGGGTCTCACT 42342879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      776 TGCAAGCCACAGTGCTCAGCTAATTAAAAAAAATTTTTTTTTCAGAGATGGGGTCTCACT 835

 42342880 ATGTTGTCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTAGGCTCAAGCAGTCCTCCCGTTTCAGCCTCAA 42342939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      836 ATGTTGTCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTAGGCTCAAGCAGTCCTCCCGTTTCAGCCTCAA 895

 42342940 AAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCATCGCACTCCACCTTCTCTATAGTTACTGAGTT 42342999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      896 AAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCATCGCACTCCACCTTCTCTATAGTTACTGAGTT 955

 42343000 TGCGTGTTACACTGAGTTTACATCTTACATTTCTAGCCATATCAGAAACGACCTCTGCAC 42343059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      956 TGCGTGTTACACTGAGTTTACATCTTACATTTCTAGCCATATCAGAAACGACCTCTGCAC 1015

 42343060 CTCTCTTTCCCAATTTGAGATTTCTAATAGAAAGAATCTTGTTCACCCAGCTTGGGACTC 42343119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1016 CTCTCTTTCCCAATTTGAGATTTCTAATAGAAAGAATCTTGTTCACCCAGCTTGGGACTC 1075

 42343120 ATTGAGTTATGACCAGTGGGATAGATTTTAGAAGATAAACATGTCTATAGGGACTTACCG 42343179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1076 ATTGAGTTATGACCAGTGGGATAGATTTTAGAAGATAAACATGTCTATAGGGACTTACCG 1135

 42343180 TGTGAATTAGTGGGGGAGCCGCTTACCAGGCAGAGGGGTCTGCTGTAAAGTGATACTGTG 42343239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1136 TGTGAATTAGTGGGGGAGCCGCTTACCAGGCAGAGGGGTCTGCTGTAAAGTGATACTGTG 1195

 42343240 ACTTTAAATTGAAAGTAAGCTTCTAGAAGAGTTGAAGAGGAGTGGATTATTGTTGAATGG 42343299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1196 ACTTTAAATTGAAAGTAAGCTTCTAGAAGAGTTGAAGAGGAGTGGATTATTGTTGAATGG 1255

 42343300 ATGTATAACTAATGAAGCTTTAAAGGAAGTTTATTAGAAAGTCCATGTCCTTGTCTCTTT 42343359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1256 ATGTATAACTAATGAAGCTTTAAAGGAAGTTTATTAGAAAGTCCATGTCCTTGTCTCTTT 1315

 42343360 CCCAAACTCCTTTAGTTCCCAAGTCCTGAAAGAATCTATGGATAAGGGAAGCAGAATACT 42343419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1316 CCCAAACTCCTTTAGTTCCCAAGTCCTGAAAGAATCTATGGATAAGGGAAGCAGAATACT 1375

 42343420 ATAGTGGTTAAGAGCACATGCTCGAGGTTAAACTGTCTGTATTTTGGATCCTGGCCTTGA 42343479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1376 ATAGTGGTTAAGAGCACATGCTCGAGGTTAAACTGTCTGTATTTTGGATCCTGGCCTTGA 1435

 42343480 GGACTTGGGCAAGTTACGTGACCTGCCTGAGCCTCAGTTTCCTCACCTGTAATATGGGTA 42343539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1436 GGACTTGGGCAAGTTACGTGACCTGCCTGAGCCTCAGTTTCCTCACCTGTAATATGGGTA 1495

 42343540 TCACGAGGAATAAATAAGGTAATATGTGTAAAGTGCTTGGCACAATGCTCTTGATAATGT 42343599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1496 TCACGAGGAATAAATAAGGTAATATGTGTAAAGTGCTTGGCACAATGCTCTTGATAATGT 1555

 42343600 TAGCAACATAATTTTGTAATGAAAATTAACTGATGGGGCTGAAATGTGCATCAGCAGATC 42343659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1556 TAGCAACATAATTTTGTAATGAAAATTAACTGATGGGGCTGAAATGTGCATCAGCAGATC 1615

 42343660 CAAATATCCTTGATAAACTGGCCAAAAGAAAGATGAATTGGCAGAGAGGCAAGTGTTCAT 42343719
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1616 CAAATATCCTCGATAAACTGGCCAAAAGAAAGATGAATTGGCAGAGAGGCAAGTGTTCAT 1675

 42343720 CTCAGTTCTCCAGATATCCCTGCAAATGTGGCCTCTGGAGTAGAAGATTTAGGGAGAAAA 42343779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1676 CTCAGTTCTCCAGATATCCCTGCAAATGTGGCCTCTGGAGTAGAAGATTTAGGGAGAAAA 1735

 42343780 ATAAGCCATGAAGCTCTTCTGGCACCAACATGAACTTCAGGGATCATGGGACATTTGGGC 42343839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1736 ATAAGCCATGAAGCTCTTCTGGCACCAACATGAACTTCAGGGATCATGGGACATTTGGGC 1795

 42343840 CAGTAACATTCCTCTTTGTTCCTAGAGATTTAATATCTACCTACCAACTAAATGGCCTTG 42343899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1796 CAGTAACATTCCTCTTTGTTCCTAGAGATTTAATATCTACCTACCAACTAAATGGCCTTG 1855

 42343900 ATTTGGAGGAGAGAAGACAAGAAGAGGAATTGCTTTCAGCTGGTCCTTGCCTTTAACTAA 42343959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1856 ATTTGGAGGAGAGAAGACAAGAAGAGGAATTGCTTTCAGCTGGTCCTTGCCTTTAACTAA 1915

 42343960 CCAGGGGTACAAAAATTTTAAAATACAAAGGAGACCATGTGTAAAACATTAGTTAAGCTC 42344019
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1916 CCAGGGGTACAAAAATTTTAAAACACAAAGGAGACCATGTGTAAAACATTAGTTAAGCTC 1975

 42344020 AGATATAAATCTAGTCTTTGACCAGTCCAGAGCTAATCAATATGCTTTTCTACTCTCTTT 42344079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1976 AGATATAAATCTAGTCTTTGACCAGTCCAGAGCTAATCAATATGCTTTTCTACTCTCTTT 2035

 42344080 GAACTTTTGAGTTTTCTGGCAACAACAAAAATCCCAAACCTCATCCAAAACCGTAGTCCA 42344139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2036 GAACTTTTGAGTTTTCTGGCAACAACAAAAATCCCAAACCTCATCCAAAACCGTAGTCCA 2095

 42344140 GACAGCCCAGTTTCTGCACTCCCTTCCTTGTGTCACATATTGTTGACAGAACTACTCCCG 42344199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2096 GACAGCCCAGTTTCTGCACTCCCTTCCTTGTGTCACATATTGTTGACAGAACTACTCCCG 2155

 42344200 TTACCACATTCATTCCAGTGGTGATTCAAATTCTTCTGCAGAAATGGACTTGAAAGACAG 42344259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2156 TTACCACATTCATTCCAGTGGTGATTCAAATTCTTCTGCAGAAATGGACTTGAAAGACAG 2215

 42344260 AAAACTGCTCCTGTAATCACTTAATAAGGAATCTTGGATGAGGAATACAGAGCTATGAAT 42344319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2216 AAAACTGCTCCTGTAATCACTTAATAAGGAATCTTGGATGAGGAATACAGAGCTATGAAT 2275

 42344320 ATGGATTTACTCTTAGCCTTTATGGATGCCTTTTTCTCAGTTATTTTCACTGAAAATCAT 42344379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2276 ATGGATTTACTCTTAGCCTTTATGGATGCCTTTTTCTCAGTTATTTTCACTGAAAATCAT 2335

 42344380 GATGAACTGATTTAAATATCAAGGTAAACTGAGATGGAAAATTACCGATAATAAGAGTTT 42344439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2336 GATGAACTGATTTAAATATCAAGGTAAACTGAGATGGAAAATTACCGATAATAAGAGTTT 2395

 42344440 TCTGAAAATATAGATTGGCCTCTTTAAAGCACATCGAGTTTGTTTTGTTTAAATTACAAA 42344499
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     2396 TCTGAAAATATAGATTGGCCTCTTTAAAACACATCGAGTTTGTTTTGTTTAAATTACAAA 2455

 42344500 TTCACATATATTTGAAATGTGTTTAAATGTGTCAGTTTTAGGCAAAACTAAACTATTTGA 42344559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2456 TTCACATATATTTGAAATGTGTTTAAATGTGTCAGTTTTAGGCAAAACTAAACTATTTGA 2515

 42344560 TTCCTTTCCAAAAATCAGGAATTTGCTTTGGAAAAAAACCATGCAGTTTGATTTACAAAG 42344619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2516 TTCCTTTCCAAAAATCAGGAATTTGCTTTGGAAAAAAACCATGCAGTTTGATTTACAAAG 2575

 42344620 CAGAGCGGGGGGGAAGTAGTGGGTGAGAAAGACCCACCCAAAGGCTGCAGCCAGCTTCCC 42344679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2576 CAGAGCGGGGGGGAAGTAGTGGGTGAGAAAGACCCACCCAAAGGCTGCAGCCAGCTTCCC 2635

 42344680 CAGGAAGATTCATAACCATGCCACAATACTGTCCTTCAATTCGTTCCAACAGATTTTACT 42344739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2636 CAGGAAGATTCATAACCATGCCACAATACTGTCCTTCAATTCGTTCCAACAGATTTTACT 2695

 42344740 ATAACTCTAAATCATTAGAAGCAACTGCTGCTATGACTAGTGCTATCTTTGCCTCAAAAA 42344799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2696 ATAACTCTAAATCATTAGAAGCAACTGCTGCTATGACTAGTGCTATCTTTGCCTCAAAAA 2755

 42344800 GAGGAAAAATCAGGACATACAATATAATCCCCTCAGGATCTAGGAGAGAAATCAGCCCAT 42344859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2756 GAGGAAAAATCAGGACATACAATATAATCCCCTCAGGATCTAGGAGAGAAATCAGCCCAT 2815

 42344860 TTGTCATAAGAACTGAAAACCTCAGCTAAATAGTATATGAAACATTGGTATTTCATACCT 42344919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2816 TTGTCATAAGAACTGAAAACCTCAGCTAAATAGTATATGAAACATTGGTATTTCATACCT 2875

 42344920 TGACATTACATATTTTTGAAAATAAAGTAAGCATACACACAAGAAGTGGCTAGATGCAGC 42344979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2876 TGACATTACATATTTTTGAAAATAAAGTAAGCATACACACAAGAAGTGGCTAGATGCAGC 2935

 42344980 AGTTATAAAGTGGCTTAAGTTGGGTTAACTAAATATAACCTAGAAAAACCATCTTATCTA 42345039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2936 AGTTATAAAGTGGCTTAAGTTGGGTTAACTAAATATAACCTAGAAAAACCATCTTATCTA 2995

 42345040 TTGCAAATTATTTCCAGAAAAAGGTAAGAAAAATCCAACCAACACTTTTTAAACATCCTG 42345099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2996 TTGCAAATTATTTCCAGAAAAAGGTAAGAAAAATCCAACCAACACTTTTTAAACATCCTG 3055

 42345100 AGCTATTCACAGCAAGTGAATCTTTACCCTTACCAGATGTATAAACATTTACATAAGGCA 42345159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3056 AGCTATTCACAGCAAGTGAATCTTTACCCTTACCAGATGTATAAACATTTACATAAGGCA 3115

 42345160 GGAGGTTCAACACTTGGAGAGTGTAATCAAGGCAGTAGTAACGCAGTGCTCCTCTCTTTG 42345219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3116 GGAGGTTCAACACTTGGAGAGTGTAATCAAGGCAGTAGTAACGCAGTGCTCCTCTCTTTG 3175

 42345220 ACTTGAATGACTTCCTCCCCATTAGGGTCATTATTGTTTTGCAGTGTCCCAGGGATGAAA 42345279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3176 ACTTGAATGACTTCCTCCCCATTAGGGTCATTATTGTTTTGCAGTGTCCCAGGGATGAAA 3235

 42345280 GGACTTTGAAAGGTCATGTGTCTTGTGACCCAACTAGCAGCATCAGCATCACTGGGGAGA 42345339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3236 GGACTTTGAAAGGTCATGTGTCTTGTGACCCAACTAGCAGCATCAGCATCACTGGGGAGA 3295

 42345340 AACTCAAGCAGAAGCTTGAGTCTACTCCACTCTTGCTGACACCAAATCTGCATTTTTACA 42345399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3296 AACTCAAGCAGAAGCTTGAGTCTACTCCACTCTTGCTGACACCAAATCTGCATTTTTACA 3355

 42345400 GGATTCTTGGGTGAGTCACACACATATTCAAGGTTAAAATATGCCACCCTAGGTCTTTCT 42345459
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3356 GGATTCTTGGGTGAGTCACAGACATATTCAAGGTTAAAATATGCCACCCTAGGTCTTTCT 3415

 42345460 CCTGCTTCTGAGCAAAACTGGGCACAAGGGACAAACTAGTTTCCTTCAGCCACTTTCAAA 42345519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3416 CCTGCTTCTGAGCAAAACTGGGCACAAGGGACAAACTAGTTTCCTTCAGCCACTTTCAAA 3475

 42345520 TCCTTTATAGAGTGTACTGTGTGAGTCACTGAGAGGAAAGAGGAAATAATACTTATTTAG 42345579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3476 TCCTTTATAGAGTGTACTGTGTGAGTCACTGAGAGGAAAGAGGAAATAATACTTATTTAG 3535

 42345580 GGAAGTCTTGCATAACTTAACAAAGTTAGTAACTTCTTCAATACACTCAAGTACCTATTT 42345639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3536 GGAAGTCTTGCATAACTTAACAAAGTTAGTAACTTCTTCAATACACTCAAGTACCTATTT 3595

 42345640 TTGGAAGCCCTACAGGTTAGGTCAAAGTAAAGAGAAGCAAAAAATGGAGTGAGTTCTAGT 42345699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3596 TTGGAAGCCCTACAGGTTAGGTCAAAGTAAAGAGAAGCAAAAAATGGAGTGAGTTCTAGT 3655

 42345700 AAAAAACTCTGACAAAATAAGGGAAGTGTAGAAGCTGAGTCTATGAGGGATGAGAGAAGC 42345759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3656 AAAAAACTCTGACAAAATAAGGGAAGTGTAGAAGCTGAGTCTATGAGGGATGAGAGAAGC 3715

 42345760 AATTTACCAAATTATCAGATCCAAAATCATCTCTGCACTGTAGATGATTTATAGCCCTGG 42345819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3716 AATTTACCAAATTATCAGATCCAAAATCATCTCTGCACTGTAGATGATTTATAGCCCTGG 3775

 42345820 AAGCTTAGAGGCTTGAGTCTCTTGCTGTATTTCATTTCAAATTAGTAATTTTTATCTAGG 42345879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3776 AAGCTTAGAGGCTTGAGTCTCTTGCTGTATTTCATTTCAAATTAGTAATTTTTATCTAGG 3835

 42345880 GCTTCCCTATGGCTTAAAGTGAAGGCCCTGGAATTTCTGAAGTGAAATTATCTGATGATT 42345939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3836 GCTTCCCTATGGCTTAAAGTGAAGGCCCTGGAATTTCTGAAGTGAAATTATCTGATGATT 3895

 42345940 TTTATGTATGGTCATTCTGTAGTTATCCTGTAAGTTTCATATTTGTAACAAGACTGGAAT 42345999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3896 TTTATGTATGGTCATTCTGTAGTTATCCTGTAAGTTTCATATTTGTAACAAGACTGGAAT 3955

 42346000 CCGAACAATAGAAAACTCTGTGGCAGTAAGCCAAAACCTGATGGACTTAGGAGAGTTACG 42346059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3956 CCGAACAATAGAAAACTCTGTGGCAGTAAGCCAAAACCTGATGGACTTAGGAGAGTTACG 4015

 42346060 TATGTGTGTTTCAGTGGTCCTCAAATTCAGCTGCCTATTAGAATCACCTGGACTTTGAAA 42346119
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     4016 TATGTGTGTTTCAGTGGTCCTCAAATTTAGCTGCCTATTAGAATCACCTGGACTTTGAAA 4075

 42346120 AAAAAAGAGCTTTCTTGAGGTATAACTGACAAATAATAAGACAAACATATTTCAGTATAC 42346179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4076 AAAAAAGAGCTTTCTTGAGGTATAACTGACAAATAATAAGACAAACATATTTCAGTATAC 4135

 42346180 AATTGGATGAGTTTTGACATGTTATATTCTTGTGAAACCATCACCACAATCAAGCTATTC 42346239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4136 AATTGGATGAGTTTTGACATGTTATATTCTTGTGAAACCATCACCACAATCAAGCTATTC 4195

 42346240 ACCCCCCAAATTTTCGTGCC 42346259
          ||||||||||||||||||||
     4196 ACCCCCCAAATTTTCGTGCC 4215

EXCISED REGION

 42347319 TTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCAC 42347347
          |||||||||||||||||||||||||||||
     4220 TTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCAC 4248

Alignment time is 3.10933 s

