
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [3722805,3748028] =>     25224 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [      1,   3301] =>      3301 nucs 'mol-32-206b-108220_3301'

Score:        3301
Aligned:      3301        nucs
Identic:      3301 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [3731045,3734345]
 second seq =>  [      1,   3301]

  3731045 ATGTATAGCATATGCATAGACACGTGCAACCATCACCATACCTTTAGAACATTTTTATCA 3731104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATGTATAGCATATGCATAGACACGTGCAACCATCACCATACCTTTAGAACATTTTTATCA 60

  3731105 TCTCAGAAAGAAACCCCATATCCTTTAGCTATCATCCCTCATCTTCCCTATCCCAAAGCA 3731164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCTCAGAAAGAAACCCCATATCCTTTAGCTATCATCCCTCATCTTCCCTATCCCAAAGCA 120

  3731165 ACCACTAATTTGCTTTTTGTCTTGATAGTTTTGACTATTTTGGACATTTCATATAAGTAG 3731224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACCACTAATTTGCTTTTTGTCTTGATAGTTTTGACTATTTTGGACATTTCATATAAGTAG 180

  3731225 GAATTATATAATATTGGTCTTTTGTGTCTGACTTTTTCCACTTAGTATAATGTTTTCAAG 3731284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GAATTATATAATATTGGTCTTTTGTGTCTGACTTTTTCCACTTAGTATAATGTTTTCAAG 240

  3731285 ATTCATCCATGTTGTAACATGTATTAACACTTTCTTTCTTTTTGTGTAAGGCTAATATAG 3731344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATTCATCCATGTTGTAACATGTATTAACACTTTCTTTCTTTTTGTGTAAGGCTAATATAG 300

  3731345 GTTGAGCATCTCAAATCTGAAAGCCCCAAAATTTGAAATGTTCCAAAATCCAAAACTTTT 3731404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTTGAGCATCTCAAATCTGAAAGCCCCAAAATTTGAAATGTTCCAAAATCCAAAACTTTT 360

  3731405 TGAGTGCTGACATGATGCTCAAAGGAAATGCTCACTGGAATATTTCAGATTTTGGATTTG 3731464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGAGTGCTGACATGATGCTCAAAGGAAATGCTCACTGGAATATTTCAGATTTTGGATTTG 420

  3731465 GGACACTCTACCAGTAAGTATAATGCAAATATTTAAAAAAACTGAAATCCAAACACTTCT 3731524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGACACTCTACCAGTAAGTATAATGCAAATATTTAAAAAAACTGAAATCCAAACACTTCT 480

  3731525 GGTCTCAAGCATTTCAGATAAGGGATACTCAACCACTACCACATTTTGTTTACCCGTTCA 3731584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GGTCTCAAGCATTTCAGATAAGGGATACTCAACCACTACCACATTTTGTTTACCCGTTCA 540

  3731585 TTAGTTGACAGACACTTGTTTCCATCTGCTGGCTATTTTGAACAATGCTGCTGTAAACAT 3731644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTAGTTGACAGACACTTGTTTCCATCTGCTGGCTATTTTGAACAATGCTGCTGTAAACAT 600

  3731645 TTGTGTACAAGATTTTGTGTGGATATATGCTTTCTTTTGTTGAGTGTATGCCTAAGACTG 3731704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTGTGTACAAGATTTTGTGTGGATATATGCTTTCTTTTGTTGAGTGTATGCCTAAGACTG 660

  3731705 GACTTTCTGGGTCATATGATAACTCTGTGTTTAACTGTTTGAAGAATTACTAGGCTTTTC 3731764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GACTTTCTGGGTCATATGATAACTCTGTGTTTAACTGTTTGAAGAATTACTAGGCTTTTC 720

  3731765 CGAAAGTGCTGCACTATTTTACATTCTTAACAGCCACGTAAAGGAGTGCTGATTTCTCCC 3731824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CGAAAGTGCTGCACTATTTTACATTCTTAACAGCCACGTAAAGGAGTGCTGATTTCTCCC 780

  3731825 TGCCTTTCCCAGCACTCTCTGTCTTACTTTTTGTTTATAGTCATCCTAGTGGATGTGAGG 3731884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGCCTTTCCCAGCACTCTCTGTCTTACTTTTTGTTTATAGTCATCCTAGTGGATGTGAGG 840

  3731885 TGGTGTCTCATTGTGGTTTTGATGTGCATTTCCCTGATGACTAATGAGGAGGAACATCTT 3731944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGGTGTCTCATTGTGGTTTTGATGTGCATTTCCCTGATGACTAATGAGGAGGAACATCTT 900

  3731945 TTCATATGTTTATTGGCCATTTGTATGTTTTATTTGGAAAAATTTCTCTTCAGATCTCTA 3732004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTCATATGTTTATTGGCCATTTGTATGTTTTATTTGGAAAAATTTCTCTTCAGATCTCTA 960

  3732005 TTCACTTGTCTTAAATTTCAACAGGTTTTTGGGGGAACAGGTGGTGTTTGGTTACATGGA 3732064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTCACTTGTCTTAAATTTCAACAGGTTTTTGGGGGAACAGGTGGTGTTTGGTTACATGGA 1020

  3732065 TAAGTTCTTTAGTGGTGATTTCTGAGATTTTGGTGCACCCATCACCAGAGCAGTGTACAC 3732124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TAAGTTCTTTAGTGGTGATTTCTGAGATTTTGGTGCACCCATCACCAGAGCAGTGTACAC 1080

  3732125 TGTATCCAATGTGTAGCCTGTTATCCCTCACCCCCCACCCTTCCCCACATTGTATCATTC 3732184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGTATCCAATGTGTAGCCTGTTATCCCTCACCCCCCACCCTTCCCCACATTGTATCATTC 1140

  3732185 TTATGTCTTTGCATCCTAATAGCTTAGCTCCCACTTATAACTGAGAACATATGATGTTTG 3732244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTATGTCTTTGCATCCTAATAGCTTAGCTCCCACTTATAACTGAGAACATATGATGTTTG 1200

  3732245 CTTTTCCATTCCTGAACTACTTCATTTAGAATAATGGTCTCCAACTCCATCCAGGTTGCT 3732304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CTTTTCCATTCCTGAACTACTTCATTTAGAATAATGGTCTCCAACTCCATCCAGGTTGCT 1260

  3732305 GTGAATGCCATTATTTCATTCCTTTTTATGGCTGCATAGTATTCCATGGTATATGTATAT 3732364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GTGAATGCCATTATTTCATTCCTTTTTATGGCTGCATAGTATTCCATGGTATATGTATAT 1320

  3732365 ATACCATATTTTCTTTTTTAAAATATTTTCAATTATGGGCACATAGTAGGTATATATATA 3732424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ATACCATATTTTCTTTTTTAAAATATTTTCAATTATGGGCACATAGTAGGTATATATATA 1380

  3732425 TTTATGGGGTACATGAAATGTTTTAACACAGGCATGCAATGAATAATAATCACATCATGG 3732484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTTATGGGGTACATGAAATGTTTTAACACAGGCATGCAATGAATAATAATCACATCATGG 1440

  3732485 AGAATGAGGTATCCATCCCCAATCCATTGTGTATATATACCACTTTTAAAATCTATTCCT 3732544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AGAATGAGGTATCCATCCCCAATCCATTGTGTATATATACCACTTTTAAAATCTATTCCT 1500

  3732545 CTGTTAATGGGCACTTACTTTGATTTCATATTTTGGCTGTGACATTGTAAACAGTGTCAC 3732604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CTGTTAATGGGCACTTACTTTGATTTCATATTTTGGCTGTGACATTGTAAACAGTGTCAC 1560

  3732605 AGTAAACTTGGAAGTGCAGATATCTCTTCAATATATTGATTTACTTTCTTTTGGATATAT 3732664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AGTAAACTTGGAAGTGCAGATATCTCTTCAATATATTGATTTACTTTCTTTTGGATATAT 1620

  3732665 ACACAGTAGTGAGATTGCTGGATGAATCTATTGTTGTTCTATTTTTAGTTTTTTGAGGAG 3732724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ACACAGTAGTGAGATTGCTGGATGAATCTATTGTTGTTCTATTTTTAGTTTTTTGAGGAG 1680

  3732725 TTTTCATAGTTTTCCATAGTGAGTGTACTAATTTACATTCTCACCAATAGTGTACATGGG 3732784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTTTCATAGTTTTCCATAGTGAGTGTACTAATTTACATTCTCACCAATAGTGTACATGGG 1740

  3732785 CTTCACTTTCTCCACATCCTCGCTAGCATCCACTATTCCCCCGTCTTTTTAAATAAAAGC 3732844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CTTCACTTTCTCCACATCCTCGCTAGCATCCACTATTCCCCCGTCTTTTTAAATAAAAGC 1800

  3732845 GGTATTACTCTGCTCTCACGTTGCTATAAAGATACTACCTGAGACTGGGTAACTTACAAA 3732904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GGTATTACTCTGCTCTCACGTTGCTATAAAGATACTACCTGAGACTGGGTAACTTACAAA 1860

  3732905 CAAAAGAGGTTTAATTAACTCACAGTTCTACATGACTGGGGAGGCCTCAGGAAACTTACA 3732964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CAAAAGAGGTTTAATTAACTCACAGTTCTACATGACTGGGGAGGCCTCAGGAAACTTACA 1920

  3732965 ATCATGGCAGAAAGAGAAGGCGAAGCAAGGCATGTCTTACATGGCAGCAGGATCGAGAGA 3733024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ATCATGGCAGAAAGAGAAGGCGAAGCAAGGCATGTCTTACATGGCAGCAGGATCGAGAGA 1980

  3733025 GAGAGAGAGAGACAGAGAGAGAGAGAGACAGAGACAGACAGACAGAGAGAGACAGAGAAA 3733084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GAGAGAGAGAGACAGAGAGAGAGAGAGACAGAGACAGACAGACAGAGAGAGACAGAGAAA 2040

  3733085 GGGGGAAGAGCCACTTTTAAACATCAGATCTCACAAGAACTCCCTATCAGAAGAACAGCA 3733144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GGGGGAAGAGCCACTTTTAAACATCAGATCTCACAAGAACTCCCTATCAGAAGAACAGCA 2100

  3733145 TGGGGAAAACCACCCCATCATCCAATCACCTCTAAGCAGGTCCCTCCCTGGACATGTGGG 3733204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TGGGGAAAACCACCCCATCATCCAATCACCTCTAAGCAGGTCCCTCCCTGGACATGTGGG 2160

  3733205 GATTACAATTAGAGATGAGGTTTGAGTGGGGATACAGAACCAGACCATGTCAAAAGCCAT 3733264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GATTACAATTAGAGATGAGGTTTGAGTGGGGATACAGAACCAGACCATGTCAAAAGCCAT 2220

  3733265 TTCAACTGAGGTGGTATGACATTTCATTGTGGTTTTGAGTTGCATTTTTCTGATGATTAG 3733324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TTCAACTGAGGTGGTATGACATTTCATTGTGGTTTTGAGTTGCATTTTTCTGATGATTAG 2280

  3733325 AGATGTTGAGCATTTAAAAAATATACCTGTTGCCCATTTGTATGCCTTCTTTTGAGAAAT 3733384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AGATGTTGAGCATTTAAAAAATATACCTGTTGCCCATTTGTATGCCTTCTTTTGAGAAAT 2340

  3733385 ATCTATTCAGAACTTTTGCCCATTTATAAATTATTTTTTTTGCTACTGAGTTGTTAGCTA 3733444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 ATCTATTCAGAACTTTTGCCCATTTATAAATTATTTTTTTTGCTACTGAGTTGTTAGCTA 2400

  3733445 TTGAGTTGTCCTTATATATTCTTGTTATTAATCCCTTCTTAGATGGATAGTTTGCAAATA 3733504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TTGAGTTGTCCTTATATATTCTTGTTATTAATCCCTTCTTAGATGGATAGTTTGCAAATA 2460

  3733505 TATTTTTTTCCAACTCTATGGGTTGTCACTCCACTTTGTTATTTCCTTTGACAGCAGCCT 3733564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TATTTTTTTCCAACTCTATGGGTTGTCACTCCACTTTGTTATTTCCTTTGACAGCAGCCT 2520

  3733565 TTTAGCTTGATGTAATCCCATTTGTCTGTTTTTCCTGTTGTTGCCTGTGCTTTTGAGGTC 3733624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TTTAGCTTGATGTAATCCCATTTGTCTGTTTTTCCTGTTGTTGCCTGTGCTTTTGAGGTC 2580

  3733625 TTACACACAAATATTTGCCAAGACCAATGTCCTAGAGCATTTCCCCAAGGTTTTCTTCTA 3733684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TTACACACAAATATTTGCCAAGACCAATGTCCTAGAGCATTTCCCCAAGGTTTTCTTCTA 2640

  3733685 GAATGTTCATAGTTTTAGGTCTTAGATTTAAGTTTTTCATCCATTTTGATTTCATTTTGC 3733744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GAATGTTCATAGTTTTAGGTCTTAGATTTAAGTTTTTCATCCATTTTGATTTCATTTTGC 2700

  3733745 ATAAGGTGAGAGATAGGAGTCTAGTTTCATTCTTCGGCATGCAGTTATCTAGTTTCCCCA 3733804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 ATAAGGTGAGAGATAGGAGTCTAGTTTCATTCTTCGGCATGCAGTTATCTAGTTTCCCCA 2760

  3733805 GCACCATTTACTGAAGAGACTGTTCCCCATTGCGTGTTCTTGGTGCCTTTATTGAGAATG 3733864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GCACCATTTACTGAAGAGACTGTTCCCCATTGCGTGTTCTTGGTGCCTTTATTGAGAATG 2820

  3733865 AGTTGGCTGTAAATGTGTTGATTTATATCTGGGTTCTCTATTGTGTTGTCTGTTTTTATG 3733924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 AGTTGGCTGTAAATGTGTTGATTTATATCTGGGTTCTCTATTGTGTTGTCTGTTTTTATG 2880

  3733925 CCATAACCATTCTGATTTGCTTATATAGCTTCATAGTACATTTTGAAGTCAGGTAGTGTG 3733984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CCATAACCATTCTGATTTGCTTATATAGCTTCATAGTACATTTTGAAGTCAGGTAGTGTG 2940

  3733985 ATGCCTTCAGCTTTGTTTTTTTGCTTTGGTTATTCAGGGTCTTTCATTTAAATTTTACTT 3734044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 ATGCCTTCAGCTTTGTTTTTTTGCTTTGGTTATTCAGGGTCTTTCATTTAAATTTTACTT 3000

  3734045 TTTAAAAATATTTCTGAGAAGAATATCATTGGTATTTTAATAGGGATTGAATTGAATCTG 3734104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TTTAAAAATATTTCTGAGAAGAATATCATTGGTATTTTAATAGGGATTGAATTGAATCTG 3060

  3734105 TAAATTGCTTTGGATAGTACTGTCATTTTAACAATATTAATTCTTTCAATCTAGGAGCAC 3734164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TAAATTGCTTTGGATAGTACTGTCATTTTAACAATATTAATTCTTTCAATCTAGGAGCAC 3120

  3734165 GGAACATCTTTCCATTTTTTCTGTGTCCTCTTCAATATATTTCACCAGTGTTTTATAGTT 3734224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 GGAACATCTTTCCATTTTTTCTGTGTCCTCTTCAATATATTTCACCAGTGTTTTATAGTT 3180

  3734225 TTCCTTGTATAGCTCTTTCACTTCGTAGGATAAATGGATTCCTCAGTATTTTATAGTTTT 3734284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TTCCTTGTATAGCTCTTTCACTTCGTAGGATAAATGGATTCCTCAGTATTTTATAGTTTT 3240

  3734285 TGTAGCTATTGTATATGCGATTGCCTTCTTGTTTTATTTTGTAGATTATTCACTGTTGGT 3734344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TGTAGCTATTGTATATGCGATTGCCTTCTTGTTTTATTTTGTAGATTATTCACTGTTGGT 3300

  3734345 G 3734345
          |
     3301 G 3301

Alignment time is 3.20013 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [3722805,3748028] =>     25224 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [      1,   2795] =>      2795 nucs 'mol-32-2081-010855_2795'

Score:        2794
Aligned:      2794        nucs
Identic:      2794 (100%) nucs =>      2782 (100%)        12 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [3730333,3733114] EXCISED REGION [3733116,3733127]
 second seq =>  [      1,   2782] EXCISED REGION [   2784,   2795]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [3733115,3733115]
 second seq =>         1 nucs [2783,2783]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [2782,2783] to [2783,2784]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [3733114,3733114] to [3733116,3733116]
 second seq =>         1 nucs [2782,2782] to [2784,2784]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  3730333 TCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAGGTGCTGGGATTACAG 3730392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAGGTGCTGGGATTACAG 60

  3730393 GCGTGAGCCACCGTGCCCGGCATCCATCATTAATTTTTATTCCAAAGTATCTCCACACCT 3730452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCGTGAGCCACCGTGCCCGGCATCCATCATTAATTTTTATTCCAAAGTATCTCCACACCT 120

  3730453 TAAGTGCCACAGAGGCAATAGGATGACAGAATTTATTGTTTTCAAGAGCAATTGCTGACA 3730512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TAAGTGCCACAGAGGCAATAGGATGACAGAATTTATTGTTTTCAAGAGCAATTGCTGACA 180

  3730513 TTTCTATATTTATTGCTAGCTAAAATCCGACGACTGGAGTTACTTGGTTCCCATGACTGA 3730572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTTCTATATTTATTGCTAGCTAAAATCCGACGACTGGAGTTACTTGGTTCCCATGACTGA 240

  3730573 GCTTAAGCCAGGAAACCCTGCTTCCGGCCACAACTATTTTCTTGTCAATTCCCAGCAGAG 3730632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GCTTAAGCCAGGAAACCCTGCTTCCGGCCACAACTATTTTCTTGTCAATTCCCAGCAGAG 300

  3730633 ATGGACTCATATCAGACTCAACATTTTCCCAGGTAATCGTGACATGGACTTATCACCAGT 3730692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATGGACTCATATCAGACTCAACATTTTCCCAGGTAATCGTGACATGGACTTATCACCAGT 360

  3730693 TCCATGGCTTCTTTATTTTATGTTGACATGTTTATAAAATATAAAATGACTTGCTCTTTC 3730752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCCATGGCTTCTTTATTTTATGTTGACATGTTTATAAAATATAAAATGACTTGCTCTTTC 420

  3730753 CTTCTTGGTAATTGATCTCTCTAGCATTTCAGGATTGTAATTTCTCCTTTTTATGCTCTA 3730812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTTCTTGGTAATTGATCTCTCTAGCATTTCAGGATTGTAATTTCTCCTTTTTATGCTCTA 480

  3730813 GAAAATTCTTGTTTTAATCCACACATCAATAGGTGGTTATTGAAAAATTATCAAGTAAAT 3730872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GAAAATTCTTGTTTTAATCCACACATCAATAGGTGGTTATTGAAAAATTATCAAGTAAAT 540

  3730873 TAGGATGTGGTGGAACTAAGTTGTATTAGGTTAGATAGATCCTAACTAGATTTCACAAGT 3730932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TAGGATGTGGTGGAACTAAGTTGTATTAGGTTAGATAGATCCTAACTAGATTTCACAAGT 600

  3730933 ATGTTATATTAGCAGCTGAAGTGGTATGTACAAATGACTCATTTTATTTTTTAATAGCTT 3730992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATGTTATATTAGCAGCTGAAGTGGTATGTACAAATGACTCATTTTATTTTTTAATAGCTT 660

  3730993 TATTGTGATATAATTAACATGCAGTTCACCCATTTGAAGTGTACAATCAATGATGTATAG 3731052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TATTGTGATATAATTAACATGCAGTTCACCCATTTGAAGTGTACAATCAATGATGTATAG 720

  3731053 CATATGCATAGACACGTGCAACCATCACCATACCTTTAGAACATTTTTATCATCTCAGAA 3731112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CATATGCATAGACACGTGCAACCATCACCATACCTTTAGAACATTTTTATCATCTCAGAA 780

  3731113 AGAAACCCCATATCCTTTAGCTATCATCCCTCATCTTCCCTATCCCAAAGCAACCACTAA 3731172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGAAACCCCATATCCTTTAGCTATCATCCCTCATCTTCCCTATCCCAAAGCAACCACTAA 840

  3731173 TTTGCTTTTTGTCTTGATAGTTTTGACTATTTTGGACATTTCATATAAGTAGGAATTATA 3731232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTTGCTTTTTGTCTTGATAGTTTTGACTATTTTGGACATTTCATATAAGTAGGAATTATA 900

  3731233 TAATATTGGTCTTTTGTGTCTGACTTTTTCCACTTAGTATAATGTTTTCAAGATTCATCC 3731292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TAATATTGGTCTTTTGTGTCTGACTTTTTCCACTTAGTATAATGTTTTCAAGATTCATCC 960

  3731293 ATGTTGTAACATGTATTAACACTTTCTTTCTTTTTGTGTAAGGCTAATATAGGTTGAGCA 3731352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATGTTGTAACATGTATTAACACTTTCTTTCTTTTTGTGTAAGGCTAATATAGGTTGAGCA 1020

  3731353 TCTCAAATCTGAAAGCCCCAAAATTTGAAATGTTCCAAAATCCAAAACTTTTTGAGTGCT 3731412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TCTCAAATCTGAAAGCCCCAAAATTTGAAATGTTCCAAAATCCAAAACTTTTTGAGTGCT 1080

  3731413 GACATGATGCTCAAAGGAAATGCTCACTGGAATATTTCAGATTTTGGATTTGGGACACTC 3731472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GACATGATGCTCAAAGGAAATGCTCACTGGAATATTTCAGATTTTGGATTTGGGACACTC 1140

  3731473 TACCAGTAAGTATAATGCAAATATTTAAAAAAACTGAAATCCAAACACTTCTGGTCTCAA 3731532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TACCAGTAAGTATAATGCAAATATTTAAAAAAACTGAAATCCAAACACTTCTGGTCTCAA 1200

  3731533 GCATTTCAGATAAGGGATACTCAACCACTACCACATTTTGTTTACCCGTTCATTAGTTGA 3731592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GCATTTCAGATAAGGGATACTCAACCACTACCACATTTTGTTTACCCGTTCATTAGTTGA 1260

  3731593 CAGACACTTGTTTCCATCTGCTGGCTATTTTGAACAATGCTGCTGTAAACATTTGTGTAC 3731652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CAGACACTTGTTTCCATCTGCTGGCTATTTTGAACAATGCTGCTGTAAACATTTGTGTAC 1320

  3731653 AAGATTTTGTGTGGATATATGCTTTCTTTTGTTGAGTGTATGCCTAAGACTGGACTTTCT 3731712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AAGATTTTGTGTGGATATATGCTTTCTTTTGTTGAGTGTATGCCTAAGACTGGACTTTCT 1380

  3731713 GGGTCATATGATAACTCTGTGTTTAACTGTTTGAAGAATTACTAGGCTTTTCCGAAAGTG 3731772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GGGTCATATGATAACTCTGTGTTTAACTGTTTGAAGAATTACTAGGCTTTTCCGAAAGTG 1440

  3731773 CTGCACTATTTTACATTCTTAACAGCCACGTAAAGGAGTGCTGATTTCTCCCTGCCTTTC 3731832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTGCACTATTTTACATTCTTAACAGCCACGTAAAGGAGTGCTGATTTCTCCCTGCCTTTC 1500

  3731833 CCAGCACTCTCTGTCTTACTTTTTGTTTATAGTCATCCTAGTGGATGTGAGGTGGTGTCT 3731892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CCAGCACTCTCTGTCTTACTTTTTGTTTATAGTCATCCTAGTGGATGTGAGGTGGTGTCT 1560

  3731893 CATTGTGGTTTTGATGTGCATTTCCCTGATGACTAATGAGGAGGAACATCTTTTCATATG 3731952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CATTGTGGTTTTGATGTGCATTTCCCTGATGACTAATGAGGAGGAACATCTTTTCATATG 1620

  3731953 TTTATTGGCCATTTGTATGTTTTATTTGGAAAAATTTCTCTTCAGATCTCTATTCACTTG 3732012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTTATTGGCCATTTGTATGTTTTATTTGGAAAAATTTCTCTTCAGATCTCTATTCACTTG 1680

  3732013 TCTTAAATTTCAACAGGTTTTTGGGGGAACAGGTGGTGTTTGGTTACATGGATAAGTTCT 3732072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TCTTAAATTTCAACAGGTTTTTGGGGGAACAGGTGGTGTTTGGTTACATGGATAAGTTCT 1740

  3732073 TTAGTGGTGATTTCTGAGATTTTGGTGCACCCATCACCAGAGCAGTGTACACTGTATCCA 3732132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TTAGTGGTGATTTCTGAGATTTTGGTGCACCCATCACCAGAGCAGTGTACACTGTATCCA 1800

  3732133 ATGTGTAGCCTGTTATCCCTCACCCCCCACCCTTCCCCACATTGTATCATTCTTATGTCT 3732192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ATGTGTAGCCTGTTATCCCTCACCCCCCACCCTTCCCCACATTGTATCATTCTTATGTCT 1860

  3732193 TTGCATCCTAATAGCTTAGCTCCCACTTATAACTGAGAACATATGATGTTTGCTTTTCCA 3732252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTGCATCCTAATAGCTTAGCTCCCACTTATAACTGAGAACATATGATGTTTGCTTTTCCA 1920

  3732253 TTCCTGAACTACTTCATTTAGAATAATGGTCTCCAACTCCATCCAGGTTGCTGTGAATGC 3732312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTCCTGAACTACTTCATTTAGAATAATGGTCTCCAACTCCATCCAGGTTGCTGTGAATGC 1980

  3732313 CATTATTTCATTCCTTTTTATGGCTGCATAGTATTCCATGGTATATGTATATATACCATA 3732372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CATTATTTCATTCCTTTTTATGGCTGCATAGTATTCCATGGTATATGTATATATACCATA 2040

  3732373 TTTTCTTTTTTAAAATATTTTCAATTATGGGCACATAGTAGGTATATATATATTTATGGG 3732432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TTTTCTTTTTTAAAATATTTTCAATTATGGGCACATAGTAGGTATATATATATTTATGGG 2100

  3732433 GTACATGAAATGTTTTAACACAGGCATGCAATGAATAATAATCACATCATGGAGAATGAG 3732492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GTACATGAAATGTTTTAACACAGGCATGCAATGAATAATAATCACATCATGGAGAATGAG 2160

  3732493 GTATCCATCCCCAATCCATTGTGTATATATACCACTTTTAAAATCTATTCCTCTGTTAAT 3732552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GTATCCATCCCCAATCCATTGTGTATATATACCACTTTTAAAATCTATTCCTCTGTTAAT 2220

  3732553 GGGCACTTACTTTGATTTCATATTTTGGCTGTGACATTGTAAACAGTGTCACAGTAAACT 3732612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GGGCACTTACTTTGATTTCATATTTTGGCTGTGACATTGTAAACAGTGTCACAGTAAACT 2280

  3732613 TGGAAGTGCAGATATCTCTTCAATATATTGATTTACTTTCTTTTGGATATATACACAGTA 3732672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TGGAAGTGCAGATATCTCTTCAATATATTGATTTACTTTCTTTTGGATATATACACAGTA 2340

  3732673 GTGAGATTGCTGGATGAATCTATTGTTGTTCTATTTTTAGTTTTTTGAGGAGTTTTCATA 3732732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GTGAGATTGCTGGATGAATCTATTGTTGTTCTATTTTTAGTTTTTTGAGGAGTTTTCATA 2400

  3732733 GTTTTCCATAGTGAGTGTACTAATTTACATTCTCACCAATAGTGTACATGGGCTTCACTT 3732792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GTTTTCCATAGTGAGTGTACTAATTTACATTCTCACCAATAGTGTACATGGGCTTCACTT 2460

  3732793 TCTCCACATCCTCGCTAGCATCCACTATTCCCCCGTCTTTTTAAATAAAAGCGGTATTAC 3732852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TCTCCACATCCTCGCTAGCATCCACTATTCCCCCGTCTTTTTAAATAAAAGCGGTATTAC 2520

  3732853 TCTGCTCTCACGTTGCTATAAAGATACTACCTGAGACTGGGTAACTTACAAACAAAAGAG 3732912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TCTGCTCTCACGTTGCTATAAAGATACTACCTGAGACTGGGTAACTTACAAACAAAAGAG 2580

  3732913 GTTTAATTAACTCACAGTTCTACATGACTGGGGAGGCCTCAGGAAACTTACAATCATGGC 3732972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GTTTAATTAACTCACAGTTCTACATGACTGGGGAGGCCTCAGGAAACTTACAATCATGGC 2640

  3732973 AGAAAGAGAAGGCGAAGCAAGGCATGTCTTACATGGCAGCAGGATCGAGAGAGAGAGAGA 3733032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 AGAAAGAGAAGGCGAAGCAAGGCATGTCTTACATGGCAGCAGGATCGAGAGAGAGAGAGA 2700

  3733033 GAGACAGAGAGAGAGAGAGACAGAGACAGACAGACAGAGAGAGACAGAGAAAGGGGGAAG 3733092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GAGACAGAGAGAGAGAGAGACAGAGACAGACAGACAGAGAGAGACAGAGAAAGGGGGAAG 2760

  3733093 AGCCACTTTTAAACATCAGATC 3733114
          ||||||||||||||||||||||
     2761 AGCCACTTTTAAACATCAGATC 2782

EXCISED REGION

  3733116 CACAAGAACTCC 3733127
          ||||||||||||
     2784 CACAAGAACTCC 2795

Alignment time is 3.0902 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [3722805,3748028] =>     25224 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [      1,   3111] =>      3111 nucs 'mol-32-22bd-005789_3111'

Score:        3111
Aligned:      3111        nucs
Identic:      3111 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [3730353,3733463]
 second seq =>  [      1,   3111]

  3730353 GATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAGGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGTGCCCGG 3730412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAGGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGTGCCCGG 60

  3730413 CATCCATCATTAATTTTTATTCCAAAGTATCTCCACACCTTAAGTGCCACAGAGGCAATA 3730472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CATCCATCATTAATTTTTATTCCAAAGTATCTCCACACCTTAAGTGCCACAGAGGCAATA 120

  3730473 GGATGACAGAATTTATTGTTTTCAAGAGCAATTGCTGACATTTCTATATTTATTGCTAGC 3730532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGATGACAGAATTTATTGTTTTCAAGAGCAATTGCTGACATTTCTATATTTATTGCTAGC 180

  3730533 TAAAATCCGACGACTGGAGTTACTTGGTTCCCATGACTGAGCTTAAGCCAGGAAACCCTG 3730592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TAAAATCCGACGACTGGAGTTACTTGGTTCCCATGACTGAGCTTAAGCCAGGAAACCCTG 240

  3730593 CTTCCGGCCACAACTATTTTCTTGTCAATTCCCAGCAGAGATGGACTCATATCAGACTCA 3730652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTTCCGGCCACAACTATTTTCTTGTCAATTCCCAGCAGAGATGGACTCATATCAGACTCA 300

  3730653 ACATTTTCCCAGGTAATCGTGACATGGACTTATCACCAGTTCCATGGCTTCTTTATTTTA 3730712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACATTTTCCCAGGTAATCGTGACATGGACTTATCACCAGTTCCATGGCTTCTTTATTTTA 360

  3730713 TGTTGACATGTTTATAAAATATAAAATGACTTGCTCTTTCCTTCTTGGTAATTGATCTCT 3730772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGTTGACATGTTTATAAAATATAAAATGACTTGCTCTTTCCTTCTTGGTAATTGATCTCT 420

  3730773 CTAGCATTTCAGGATTGTAATTTCTCCTTTTTATGCTCTAGAAAATTCTTGTTTTAATCC 3730832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTAGCATTTCAGGATTGTAATTTCTCCTTTTTATGCTCTAGAAAATTCTTGTTTTAATCC 480

  3730833 ACACATCAATAGGTGGTTATTGAAAAATTATCAAGTAAATTAGGATGTGGTGGAACTAAG 3730892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACACATCAATAGGTGGTTATTGAAAAATTATCAAGTAAATTAGGATGTGGTGGAACTAAG 540

  3730893 TTGTATTAGGTTAGATAGATCCTAACTAGATTTCACAAGTATGTTATATTAGCAGCTGAA 3730952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTGTATTAGGTTAGATAGATCCTAACTAGATTTCACAAGTATGTTATATTAGCAGCTGAA 600

  3730953 GTGGTATGTACAAATGACTCATTTTATTTTTTAATAGCTTTATTGTGATATAATTAACAT 3731012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTGGTATGTACAAATGACTCATTTTATTTTTTAATAGCTTTATTGTGATATAATTAACAT 660

  3731013 GCAGTTCACCCATTTGAAGTGTACAATCAATGATGTATAGCATATGCATAGACACGTGCA 3731072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GCAGTTCACCCATTTGAAGTGTACAATCAATGATGTATAGCATATGCATAGACACGTGCA 720

  3731073 ACCATCACCATACCTTTAGAACATTTTTATCATCTCAGAAAGAAACCCCATATCCTTTAG 3731132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ACCATCACCATACCTTTAGAACATTTTTATCATCTCAGAAAGAAACCCCATATCCTTTAG 780

  3731133 CTATCATCCCTCATCTTCCCTATCCCAAAGCAACCACTAATTTGCTTTTTGTCTTGATAG 3731192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTATCATCCCTCATCTTCCCTATCCCAAAGCAACCACTAATTTGCTTTTTGTCTTGATAG 840

  3731193 TTTTGACTATTTTGGACATTTCATATAAGTAGGAATTATATAATATTGGTCTTTTGTGTC 3731252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTTTGACTATTTTGGACATTTCATATAAGTAGGAATTATATAATATTGGTCTTTTGTGTC 900

  3731253 TGACTTTTTCCACTTAGTATAATGTTTTCAAGATTCATCCATGTTGTAACATGTATTAAC 3731312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGACTTTTTCCACTTAGTATAATGTTTTCAAGATTCATCCATGTTGTAACATGTATTAAC 960

  3731313 ACTTTCTTTCTTTTTGTGTAAGGCTAATATAGGTTGAGCATCTCAAATCTGAAAGCCCCA 3731372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ACTTTCTTTCTTTTTGTGTAAGGCTAATATAGGTTGAGCATCTCAAATCTGAAAGCCCCA 1020

  3731373 AAATTTGAAATGTTCCAAAATCCAAAACTTTTTGAGTGCTGACATGATGCTCAAAGGAAA 3731432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AAATTTGAAATGTTCCAAAATCCAAAACTTTTTGAGTGCTGACATGATGCTCAAAGGAAA 1080

  3731433 TGCTCACTGGAATATTTCAGATTTTGGATTTGGGACACTCTACCAGTAAGTATAATGCAA 3731492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGCTCACTGGAATATTTCAGATTTTGGATTTGGGACACTCTACCAGTAAGTATAATGCAA 1140

  3731493 ATATTTAAAAAAACTGAAATCCAAACACTTCTGGTCTCAAGCATTTCAGATAAGGGATAC 3731552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATATTTAAAAAAACTGAAATCCAAACACTTCTGGTCTCAAGCATTTCAGATAAGGGATAC 1200

  3731553 TCAACCACTACCACATTTTGTTTACCCGTTCATTAGTTGACAGACACTTGTTTCCATCTG 3731612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TCAACCACTACCACATTTTGTTTACCCGTTCATTAGTTGACAGACACTTGTTTCCATCTG 1260

  3731613 CTGGCTATTTTGAACAATGCTGCTGTAAACATTTGTGTACAAGATTTTGTGTGGATATAT 3731672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTGGCTATTTTGAACAATGCTGCTGTAAACATTTGTGTACAAGATTTTGTGTGGATATAT 1320

  3731673 GCTTTCTTTTGTTGAGTGTATGCCTAAGACTGGACTTTCTGGGTCATATGATAACTCTGT 3731732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GCTTTCTTTTGTTGAGTGTATGCCTAAGACTGGACTTTCTGGGTCATATGATAACTCTGT 1380

  3731733 GTTTAACTGTTTGAAGAATTACTAGGCTTTTCCGAAAGTGCTGCACTATTTTACATTCTT 3731792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GTTTAACTGTTTGAAGAATTACTAGGCTTTTCCGAAAGTGCTGCACTATTTTACATTCTT 1440

  3731793 AACAGCCACGTAAAGGAGTGCTGATTTCTCCCTGCCTTTCCCAGCACTCTCTGTCTTACT 3731852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AACAGCCACGTAAAGGAGTGCTGATTTCTCCCTGCCTTTCCCAGCACTCTCTGTCTTACT 1500

  3731853 TTTTGTTTATAGTCATCCTAGTGGATGTGAGGTGGTGTCTCATTGTGGTTTTGATGTGCA 3731912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTTTGTTTATAGTCATCCTAGTGGATGTGAGGTGGTGTCTCATTGTGGTTTTGATGTGCA 1560

  3731913 TTTCCCTGATGACTAATGAGGAGGAACATCTTTTCATATGTTTATTGGCCATTTGTATGT 3731972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTTCCCTGATGACTAATGAGGAGGAACATCTTTTCATATGTTTATTGGCCATTTGTATGT 1620

  3731973 TTTATTTGGAAAAATTTCTCTTCAGATCTCTATTCACTTGTCTTAAATTTCAACAGGTTT 3732032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTTATTTGGAAAAATTTCTCTTCAGATCTCTATTCACTTGTCTTAAATTTCAACAGGTTT 1680

  3732033 TTGGGGGAACAGGTGGTGTTTGGTTACATGGATAAGTTCTTTAGTGGTGATTTCTGAGAT 3732092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTGGGGGAACAGGTGGTGTTTGGTTACATGGATAAGTTCTTTAGTGGTGATTTCTGAGAT 1740

  3732093 TTTGGTGCACCCATCACCAGAGCAGTGTACACTGTATCCAATGTGTAGCCTGTTATCCCT 3732152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TTTGGTGCACCCATCACCAGAGCAGTGTACACTGTATCCAATGTGTAGCCTGTTATCCCT 1800

  3732153 CACCCCCCACCCTTCCCCACATTGTATCATTCTTATGTCTTTGCATCCTAATAGCTTAGC 3732212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CACCCCCCACCCTTCCCCACATTGTATCATTCTTATGTCTTTGCATCCTAATAGCTTAGC 1860

  3732213 TCCCACTTATAACTGAGAACATATGATGTTTGCTTTTCCATTCCTGAACTACTTCATTTA 3732272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TCCCACTTATAACTGAGAACATATGATGTTTGCTTTTCCATTCCTGAACTACTTCATTTA 1920

  3732273 GAATAATGGTCTCCAACTCCATCCAGGTTGCTGTGAATGCCATTATTTCATTCCTTTTTA 3732332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GAATAATGGTCTCCAACTCCATCCAGGTTGCTGTGAATGCCATTATTTCATTCCTTTTTA 1980

  3732333 TGGCTGCATAGTATTCCATGGTATATGTATATATACCATATTTTCTTTTTTAAAATATTT 3732392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TGGCTGCATAGTATTCCATGGTATATGTATATATACCATATTTTCTTTTTTAAAATATTT 2040

  3732393 TCAATTATGGGCACATAGTAGGTATATATATATTTATGGGGTACATGAAATGTTTTAACA 3732452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TCAATTATGGGCACATAGTAGGTATATATATATTTATGGGGTACATGAAATGTTTTAACA 2100

  3732453 CAGGCATGCAATGAATAATAATCACATCATGGAGAATGAGGTATCCATCCCCAATCCATT 3732512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CAGGCATGCAATGAATAATAATCACATCATGGAGAATGAGGTATCCATCCCCAATCCATT 2160

  3732513 GTGTATATATACCACTTTTAAAATCTATTCCTCTGTTAATGGGCACTTACTTTGATTTCA 3732572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GTGTATATATACCACTTTTAAAATCTATTCCTCTGTTAATGGGCACTTACTTTGATTTCA 2220

  3732573 TATTTTGGCTGTGACATTGTAAACAGTGTCACAGTAAACTTGGAAGTGCAGATATCTCTT 3732632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TATTTTGGCTGTGACATTGTAAACAGTGTCACAGTAAACTTGGAAGTGCAGATATCTCTT 2280

  3732633 CAATATATTGATTTACTTTCTTTTGGATATATACACAGTAGTGAGATTGCTGGATGAATC 3732692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CAATATATTGATTTACTTTCTTTTGGATATATACACAGTAGTGAGATTGCTGGATGAATC 2340

  3732693 TATTGTTGTTCTATTTTTAGTTTTTTGAGGAGTTTTCATAGTTTTCCATAGTGAGTGTAC 3732752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TATTGTTGTTCTATTTTTAGTTTTTTGAGGAGTTTTCATAGTTTTCCATAGTGAGTGTAC 2400

  3732753 TAATTTACATTCTCACCAATAGTGTACATGGGCTTCACTTTCTCCACATCCTCGCTAGCA 3732812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TAATTTACATTCTCACCAATAGTGTACATGGGCTTCACTTTCTCCACATCCTCGCTAGCA 2460

  3732813 TCCACTATTCCCCCGTCTTTTTAAATAAAAGCGGTATTACTCTGCTCTCACGTTGCTATA 3732872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TCCACTATTCCCCCGTCTTTTTAAATAAAAGCGGTATTACTCTGCTCTCACGTTGCTATA 2520

  3732873 AAGATACTACCTGAGACTGGGTAACTTACAAACAAAAGAGGTTTAATTAACTCACAGTTC 3732932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 AAGATACTACCTGAGACTGGGTAACTTACAAACAAAAGAGGTTTAATTAACTCACAGTTC 2580

  3732933 TACATGACTGGGGAGGCCTCAGGAAACTTACAATCATGGCAGAAAGAGAAGGCGAAGCAA 3732992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TACATGACTGGGGAGGCCTCAGGAAACTTACAATCATGGCAGAAAGAGAAGGCGAAGCAA 2640

  3732993 GGCATGTCTTACATGGCAGCAGGATCGAGAGAGAGAGAGAGAGACAGAGAGAGAGAGAGA 3733052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GGCATGTCTTACATGGCAGCAGGATCGAGAGAGAGAGAGAGAGACAGAGAGAGAGAGAGA 2700

  3733053 CAGAGACAGACAGACAGAGAGAGACAGAGAAAGGGGGAAGAGCCACTTTTAAACATCAGA 3733112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CAGAGACAGACAGACAGAGAGAGACAGAGAAAGGGGGAAGAGCCACTTTTAAACATCAGA 2760

  3733113 TCTCACAAGAACTCCCTATCAGAAGAACAGCATGGGGAAAACCACCCCATCATCCAATCA 3733172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TCTCACAAGAACTCCCTATCAGAAGAACAGCATGGGGAAAACCACCCCATCATCCAATCA 2820

  3733173 CCTCTAAGCAGGTCCCTCCCTGGACATGTGGGGATTACAATTAGAGATGAGGTTTGAGTG 3733232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CCTCTAAGCAGGTCCCTCCCTGGACATGTGGGGATTACAATTAGAGATGAGGTTTGAGTG 2880

  3733233 GGGATACAGAACCAGACCATGTCAAAAGCCATTTCAACTGAGGTGGTATGACATTTCATT 3733292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 GGGATACAGAACCAGACCATGTCAAAAGCCATTTCAACTGAGGTGGTATGACATTTCATT 2940

  3733293 GTGGTTTTGAGTTGCATTTTTCTGATGATTAGAGATGTTGAGCATTTAAAAAATATACCT 3733352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 GTGGTTTTGAGTTGCATTTTTCTGATGATTAGAGATGTTGAGCATTTAAAAAATATACCT 3000

  3733353 GTTGCCCATTTGTATGCCTTCTTTTGAGAAATATCTATTCAGAACTTTTGCCCATTTATA 3733412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GTTGCCCATTTGTATGCCTTCTTTTGAGAAATATCTATTCAGAACTTTTGCCCATTTATA 3060

  3733413 AATTATTTTTTTTGCTACTGAGTTGTTAGCTATTGAGTTGTCCTTATATAT 3733463
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 AATTATTTTTTTTGCTACTGAGTTGTTAGCTATTGAGTTGTCCTTATATAT 3111

Alignment time is 3.0321 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [3722805,3748028] =>     25224 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [      1,   3732] =>      3732 nucs 'mol-32-2b4a-041523_3732'

Score:        3732
Aligned:      3732        nucs
Identic:      3732 (100%) nucs =>         5 (100%)      3727 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [3723501,3723505] EXCISED REGION [3730302,3734028]
 second seq =>  [      1,      5] EXCISED REGION [      6,   3732]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6796 nucs [3723506,3730301]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 10
 first  seq =>        55 nucs [3730247,3730301]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [3723504,3723505] to [3730302,3730303]
 second seq =>         2 nucs [4,5] to [6,7]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [3723506,3723506] to [3730301,3730301]
 second seq =>         0 nucs

  3723501 AGTAG 3723505
          |||||
        1 AGTAG 5

EXCISED REGION

  3730302 AGACGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCC 3730361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        6 AGACGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCC 65

  3730362 GCCTCGGCCTCCCAAGGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGTGCCCGGCATCCATCA 3730421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       66 GCCTCGGCCTCCCAAGGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGTGCCCGGCATCCATCA 125

  3730422 TTAATTTTTATTCCAAAGTATCTCCACACCTTAAGTGCCACAGAGGCAATAGGATGACAG 3730481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      126 TTAATTTTTATTCCAAAGTATCTCCACACCTTAAGTGCCACAGAGGCAATAGGATGACAG 185

  3730482 AATTTATTGTTTTCAAGAGCAATTGCTGACATTTCTATATTTATTGCTAGCTAAAATCCG 3730541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      186 AATTTATTGTTTTCAAGAGCAATTGCTGACATTTCTATATTTATTGCTAGCTAAAATCCG 245

  3730542 ACGACTGGAGTTACTTGGTTCCCATGACTGAGCTTAAGCCAGGAAACCCTGCTTCCGGCC 3730601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      246 ACGACTGGAGTTACTTGGTTCCCATGACTGAGCTTAAGCCAGGAAACCCTGCTTCCGGCC 305

  3730602 ACAACTATTTTCTTGTCAATTCCCAGCAGAGATGGACTCATATCAGACTCAACATTTTCC 3730661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      306 ACAACTATTTTCTTGTCAATTCCCAGCAGAGATGGACTCATATCAGACTCAACATTTTCC 365

  3730662 CAGGTAATCGTGACATGGACTTATCACCAGTTCCATGGCTTCTTTATTTTATGTTGACAT 3730721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      366 CAGGTAATCGTGACATGGACTTATCACCAGTTCCATGGCTTCTTTATTTTATGTTGACAT 425

  3730722 GTTTATAAAATATAAAATGACTTGCTCTTTCCTTCTTGGTAATTGATCTCTCTAGCATTT 3730781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      426 GTTTATAAAATATAAAATGACTTGCTCTTTCCTTCTTGGTAATTGATCTCTCTAGCATTT 485

  3730782 CAGGATTGTAATTTCTCCTTTTTATGCTCTAGAAAATTCTTGTTTTAATCCACACATCAA 3730841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      486 CAGGATTGTAATTTCTCCTTTTTATGCTCTAGAAAATTCTTGTTTTAATCCACACATCAA 545

  3730842 TAGGTGGTTATTGAAAAATTATCAAGTAAATTAGGATGTGGTGGAACTAAGTTGTATTAG 3730901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      546 TAGGTGGTTATTGAAAAATTATCAAGTAAATTAGGATGTGGTGGAACTAAGTTGTATTAG 605

  3730902 GTTAGATAGATCCTAACTAGATTTCACAAGTATGTTATATTAGCAGCTGAAGTGGTATGT 3730961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      606 GTTAGATAGATCCTAACTAGATTTCACAAGTATGTTATATTAGCAGCTGAAGTGGTATGT 665

  3730962 ACAAATGACTCATTTTATTTTTTAATAGCTTTATTGTGATATAATTAACATGCAGTTCAC 3731021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      666 ACAAATGACTCATTTTATTTTTTAATAGCTTTATTGTGATATAATTAACATGCAGTTCAC 725

  3731022 CCATTTGAAGTGTACAATCAATGATGTATAGCATATGCATAGACACGTGCAACCATCACC 3731081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      726 CCATTTGAAGTGTACAATCAATGATGTATAGCATATGCATAGACACGTGCAACCATCACC 785

  3731082 ATACCTTTAGAACATTTTTATCATCTCAGAAAGAAACCCCATATCCTTTAGCTATCATCC 3731141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      786 ATACCTTTAGAACATTTTTATCATCTCAGAAAGAAACCCCATATCCTTTAGCTATCATCC 845

  3731142 CTCATCTTCCCTATCCCAAAGCAACCACTAATTTGCTTTTTGTCTTGATAGTTTTGACTA 3731201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      846 CTCATCTTCCCTATCCCAAAGCAACCACTAATTTGCTTTTTGTCTTGATAGTTTTGACTA 905

  3731202 TTTTGGACATTTCATATAAGTAGGAATTATATAATATTGGTCTTTTGTGTCTGACTTTTT 3731261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      906 TTTTGGACATTTCATATAAGTAGGAATTATATAATATTGGTCTTTTGTGTCTGACTTTTT 965

  3731262 CCACTTAGTATAATGTTTTCAAGATTCATCCATGTTGTAACATGTATTAACACTTTCTTT 3731321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      966 CCACTTAGTATAATGTTTTCAAGATTCATCCATGTTGTAACATGTATTAACACTTTCTTT 1025

  3731322 CTTTTTGTGTAAGGCTAATATAGGTTGAGCATCTCAAATCTGAAAGCCCCAAAATTTGAA 3731381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1026 CTTTTTGTGTAAGGCTAATATAGGTTGAGCATCTCAAATCTGAAAGCCCCAAAATTTGAA 1085

  3731382 ATGTTCCAAAATCCAAAACTTTTTGAGTGCTGACATGATGCTCAAAGGAAATGCTCACTG 3731441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1086 ATGTTCCAAAATCCAAAACTTTTTGAGTGCTGACATGATGCTCAAAGGAAATGCTCACTG 1145

  3731442 GAATATTTCAGATTTTGGATTTGGGACACTCTACCAGTAAGTATAATGCAAATATTTAAA 3731501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1146 GAATATTTCAGATTTTGGATTTGGGACACTCTACCAGTAAGTATAATGCAAATATTTAAA 1205

  3731502 AAAACTGAAATCCAAACACTTCTGGTCTCAAGCATTTCAGATAAGGGATACTCAACCACT 3731561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1206 AAAACTGAAATCCAAACACTTCTGGTCTCAAGCATTTCAGATAAGGGATACTCAACCACT 1265

  3731562 ACCACATTTTGTTTACCCGTTCATTAGTTGACAGACACTTGTTTCCATCTGCTGGCTATT 3731621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1266 ACCACATTTTGTTTACCCGTTCATTAGTTGACAGACACTTGTTTCCATCTGCTGGCTATT 1325

  3731622 TTGAACAATGCTGCTGTAAACATTTGTGTACAAGATTTTGTGTGGATATATGCTTTCTTT 3731681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1326 TTGAACAATGCTGCTGTAAACATTTGTGTACAAGATTTTGTGTGGATATATGCTTTCTTT 1385

  3731682 TGTTGAGTGTATGCCTAAGACTGGACTTTCTGGGTCATATGATAACTCTGTGTTTAACTG 3731741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1386 TGTTGAGTGTATGCCTAAGACTGGACTTTCTGGGTCATATGATAACTCTGTGTTTAACTG 1445

  3731742 TTTGAAGAATTACTAGGCTTTTCCGAAAGTGCTGCACTATTTTACATTCTTAACAGCCAC 3731801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1446 TTTGAAGAATTACTAGGCTTTTCCGAAAGTGCTGCACTATTTTACATTCTTAACAGCCAC 1505

  3731802 GTAAAGGAGTGCTGATTTCTCCCTGCCTTTCCCAGCACTCTCTGTCTTACTTTTTGTTTA 3731861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1506 GTAAAGGAGTGCTGATTTCTCCCTGCCTTTCCCAGCACTCTCTGTCTTACTTTTTGTTTA 1565

  3731862 TAGTCATCCTAGTGGATGTGAGGTGGTGTCTCATTGTGGTTTTGATGTGCATTTCCCTGA 3731921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1566 TAGTCATCCTAGTGGATGTGAGGTGGTGTCTCATTGTGGTTTTGATGTGCATTTCCCTGA 1625

  3731922 TGACTAATGAGGAGGAACATCTTTTCATATGTTTATTGGCCATTTGTATGTTTTATTTGG 3731981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1626 TGACTAATGAGGAGGAACATCTTTTCATATGTTTATTGGCCATTTGTATGTTTTATTTGG 1685

  3731982 AAAAATTTCTCTTCAGATCTCTATTCACTTGTCTTAAATTTCAACAGGTTTTTGGGGGAA 3732041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1686 AAAAATTTCTCTTCAGATCTCTATTCACTTGTCTTAAATTTCAACAGGTTTTTGGGGGAA 1745

  3732042 CAGGTGGTGTTTGGTTACATGGATAAGTTCTTTAGTGGTGATTTCTGAGATTTTGGTGCA 3732101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1746 CAGGTGGTGTTTGGTTACATGGATAAGTTCTTTAGTGGTGATTTCTGAGATTTTGGTGCA 1805

  3732102 CCCATCACCAGAGCAGTGTACACTGTATCCAATGTGTAGCCTGTTATCCCTCACCCCCCA 3732161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1806 CCCATCACCAGAGCAGTGTACACTGTATCCAATGTGTAGCCTGTTATCCCTCACCCCCCA 1865

  3732162 CCCTTCCCCACATTGTATCATTCTTATGTCTTTGCATCCTAATAGCTTAGCTCCCACTTA 3732221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1866 CCCTTCCCCACATTGTATCATTCTTATGTCTTTGCATCCTAATAGCTTAGCTCCCACTTA 1925

  3732222 TAACTGAGAACATATGATGTTTGCTTTTCCATTCCTGAACTACTTCATTTAGAATAATGG 3732281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1926 TAACTGAGAACATATGATGTTTGCTTTTCCATTCCTGAACTACTTCATTTAGAATAATGG 1985

  3732282 TCTCCAACTCCATCCAGGTTGCTGTGAATGCCATTATTTCATTCCTTTTTATGGCTGCAT 3732341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1986 TCTCCAACTCCATCCAGGTTGCTGTGAATGCCATTATTTCATTCCTTTTTATGGCTGCAT 2045

  3732342 AGTATTCCATGGTATATGTATATATACCATATTTTCTTTTTTAAAATATTTTCAATTATG 3732401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2046 AGTATTCCATGGTATATGTATATATACCATATTTTCTTTTTTAAAATATTTTCAATTATG 2105

  3732402 GGCACATAGTAGGTATATATATATTTATGGGGTACATGAAATGTTTTAACACAGGCATGC 3732461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2106 GGCACATAGTAGGTATATATATATTTATGGGGTACATGAAATGTTTTAACACAGGCATGC 2165

  3732462 AATGAATAATAATCACATCATGGAGAATGAGGTATCCATCCCCAATCCATTGTGTATATA 3732521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2166 AATGAATAATAATCACATCATGGAGAATGAGGTATCCATCCCCAATCCATTGTGTATATA 2225

  3732522 TACCACTTTTAAAATCTATTCCTCTGTTAATGGGCACTTACTTTGATTTCATATTTTGGC 3732581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2226 TACCACTTTTAAAATCTATTCCTCTGTTAATGGGCACTTACTTTGATTTCATATTTTGGC 2285

  3732582 TGTGACATTGTAAACAGTGTCACAGTAAACTTGGAAGTGCAGATATCTCTTCAATATATT 3732641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2286 TGTGACATTGTAAACAGTGTCACAGTAAACTTGGAAGTGCAGATATCTCTTCAATATATT 2345

  3732642 GATTTACTTTCTTTTGGATATATACACAGTAGTGAGATTGCTGGATGAATCTATTGTTGT 3732701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2346 GATTTACTTTCTTTTGGATATATACACAGTAGTGAGATTGCTGGATGAATCTATTGTTGT 2405

  3732702 TCTATTTTTAGTTTTTTGAGGAGTTTTCATAGTTTTCCATAGTGAGTGTACTAATTTACA 3732761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2406 TCTATTTTTAGTTTTTTGAGGAGTTTTCATAGTTTTCCATAGTGAGTGTACTAATTTACA 2465

  3732762 TTCTCACCAATAGTGTACATGGGCTTCACTTTCTCCACATCCTCGCTAGCATCCACTATT 3732821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2466 TTCTCACCAATAGTGTACATGGGCTTCACTTTCTCCACATCCTCGCTAGCATCCACTATT 2525

  3732822 CCCCCGTCTTTTTAAATAAAAGCGGTATTACTCTGCTCTCACGTTGCTATAAAGATACTA 3732881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2526 CCCCCGTCTTTTTAAATAAAAGCGGTATTACTCTGCTCTCACGTTGCTATAAAGATACTA 2585

  3732882 CCTGAGACTGGGTAACTTACAAACAAAAGAGGTTTAATTAACTCACAGTTCTACATGACT 3732941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2586 CCTGAGACTGGGTAACTTACAAACAAAAGAGGTTTAATTAACTCACAGTTCTACATGACT 2645

  3732942 GGGGAGGCCTCAGGAAACTTACAATCATGGCAGAAAGAGAAGGCGAAGCAAGGCATGTCT 3733001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2646 GGGGAGGCCTCAGGAAACTTACAATCATGGCAGAAAGAGAAGGCGAAGCAAGGCATGTCT 2705

  3733002 TACATGGCAGCAGGATCGAGAGAGAGAGAGAGAGACAGAGAGAGAGAGAGACAGAGACAG 3733061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2706 TACATGGCAGCAGGATCGAGAGAGAGAGAGAGAGACAGAGAGAGAGAGAGACAGAGACAG 2765

  3733062 ACAGACAGAGAGAGACAGAGAAAGGGGGAAGAGCCACTTTTAAACATCAGATCTCACAAG 3733121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2766 ACAGACAGAGAGAGACAGAGAAAGGGGGAAGAGCCACTTTTAAACATCAGATCTCACAAG 2825

  3733122 AACTCCCTATCAGAAGAACAGCATGGGGAAAACCACCCCATCATCCAATCACCTCTAAGC 3733181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2826 AACTCCCTATCAGAAGAACAGCATGGGGAAAACCACCCCATCATCCAATCACCTCTAAGC 2885

  3733182 AGGTCCCTCCCTGGACATGTGGGGATTACAATTAGAGATGAGGTTTGAGTGGGGATACAG 3733241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2886 AGGTCCCTCCCTGGACATGTGGGGATTACAATTAGAGATGAGGTTTGAGTGGGGATACAG 2945

  3733242 AACCAGACCATGTCAAAAGCCATTTCAACTGAGGTGGTATGACATTTCATTGTGGTTTTG 3733301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2946 AACCAGACCATGTCAAAAGCCATTTCAACTGAGGTGGTATGACATTTCATTGTGGTTTTG 3005

  3733302 AGTTGCATTTTTCTGATGATTAGAGATGTTGAGCATTTAAAAAATATACCTGTTGCCCAT 3733361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3006 AGTTGCATTTTTCTGATGATTAGAGATGTTGAGCATTTAAAAAATATACCTGTTGCCCAT 3065

  3733362 TTGTATGCCTTCTTTTGAGAAATATCTATTCAGAACTTTTGCCCATTTATAAATTATTTT 3733421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3066 TTGTATGCCTTCTTTTGAGAAATATCTATTCAGAACTTTTGCCCATTTATAAATTATTTT 3125

  3733422 TTTTGCTACTGAGTTGTTAGCTATTGAGTTGTCCTTATATATTCTTGTTATTAATCCCTT 3733481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3126 TTTTGCTACTGAGTTGTTAGCTATTGAGTTGTCCTTATATATTCTTGTTATTAATCCCTT 3185

  3733482 CTTAGATGGATAGTTTGCAAATATATTTTTTTCCAACTCTATGGGTTGTCACTCCACTTT 3733541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3186 CTTAGATGGATAGTTTGCAAATATATTTTTTTCCAACTCTATGGGTTGTCACTCCACTTT 3245

  3733542 GTTATTTCCTTTGACAGCAGCCTTTTAGCTTGATGTAATCCCATTTGTCTGTTTTTCCTG 3733601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3246 GTTATTTCCTTTGACAGCAGCCTTTTAGCTTGATGTAATCCCATTTGTCTGTTTTTCCTG 3305

  3733602 TTGTTGCCTGTGCTTTTGAGGTCTTACACACAAATATTTGCCAAGACCAATGTCCTAGAG 3733661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3306 TTGTTGCCTGTGCTTTTGAGGTCTTACACACAAATATTTGCCAAGACCAATGTCCTAGAG 3365

  3733662 CATTTCCCCAAGGTTTTCTTCTAGAATGTTCATAGTTTTAGGTCTTAGATTTAAGTTTTT 3733721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3366 CATTTCCCCAAGGTTTTCTTCTAGAATGTTCATAGTTTTAGGTCTTAGATTTAAGTTTTT 3425

  3733722 CATCCATTTTGATTTCATTTTGCATAAGGTGAGAGATAGGAGTCTAGTTTCATTCTTCGG 3733781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3426 CATCCATTTTGATTTCATTTTGCATAAGGTGAGAGATAGGAGTCTAGTTTCATTCTTCGG 3485

  3733782 CATGCAGTTATCTAGTTTCCCCAGCACCATTTACTGAAGAGACTGTTCCCCATTGCGTGT 3733841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3486 CATGCAGTTATCTAGTTTCCCCAGCACCATTTACTGAAGAGACTGTTCCCCATTGCGTGT 3545

  3733842 TCTTGGTGCCTTTATTGAGAATGAGTTGGCTGTAAATGTGTTGATTTATATCTGGGTTCT 3733901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3546 TCTTGGTGCCTTTATTGAGAATGAGTTGGCTGTAAATGTGTTGATTTATATCTGGGTTCT 3605

  3733902 CTATTGTGTTGTCTGTTTTTATGCCATAACCATTCTGATTTGCTTATATAGCTTCATAGT 3733961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3606 CTATTGTGTTGTCTGTTTTTATGCCATAACCATTCTGATTTGCTTATATAGCTTCATAGT 3665

  3733962 ACATTTTGAAGTCAGGTAGTGTGATGCCTTCAGCTTTGTTTTTTTGCTTTGGTTATTCAG 3734021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3666 ACATTTTGAAGTCAGGTAGTGTGATGCCTTCAGCTTTGTTTTTTTGCTTTGGTTATTCAG 3725

  3734022 GGTCTTT 3734028
          |||||||
     3726 GGTCTTT 3732

Alignment time is 4.11027 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [3722805,3748028] =>     25224 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [      1,   2909] =>      2909 nucs 'mol-32-2b55-117406_2909'

Score:        2908
Aligned:      2908        nucs
Identic:      2908 (100%) nucs =>      2894 (100%)        14 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [3731124,3734017] EXCISED REGION [3734019,3734032]
 second seq =>  [      1,   2894] EXCISED REGION [   2896,   2909]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [3734018,3734018]
 second seq =>         1 nucs [2895,2895]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [3734017,3734017] to [3734018,3734018]
 second seq =>         1 nucs [2895,2895] to [2896,2896]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  3731124 ATCCTTTAGCTATCATCCCTCATCTTCCCTATCCCAAAGCAACCACTAATTTGCTTTTTG 3731183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATCCTTTAGCTATCATCCCTCATCTTCCCTATCCCAAAGCAACCACTAATTTGCTTTTTG 60

  3731184 TCTTGATAGTTTTGACTATTTTGGACATTTCATATAAGTAGGAATTATATAATATTGGTC 3731243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCTTGATAGTTTTGACTATTTTGGACATTTCATATAAGTAGGAATTATATAATATTGGTC 120

  3731244 TTTTGTGTCTGACTTTTTCCACTTAGTATAATGTTTTCAAGATTCATCCATGTTGTAACA 3731303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTTGTGTCTGACTTTTTCCACTTAGTATAATGTTTTCAAGATTCATCCATGTTGTAACA 180

  3731304 TGTATTAACACTTTCTTTCTTTTTGTGTAAGGCTAATATAGGTTGAGCATCTCAAATCTG 3731363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGTATTAACACTTTCTTTCTTTTTGTGTAAGGCTAATATAGGTTGAGCATCTCAAATCTG 240

  3731364 AAAGCCCCAAAATTTGAAATGTTCCAAAATCCAAAACTTTTTGAGTGCTGACATGATGCT 3731423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAAGCCCCAAAATTTGAAATGTTCCAAAATCCAAAACTTTTTGAGTGCTGACATGATGCT 300

  3731424 CAAAGGAAATGCTCACTGGAATATTTCAGATTTTGGATTTGGGACACTCTACCAGTAAGT 3731483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CAAAGGAAATGCTCACTGGAATATTTCAGATTTTGGATTTGGGACACTCTACCAGTAAGT 360

  3731484 ATAATGCAAATATTTAAAAAAACTGAAATCCAAACACTTCTGGTCTCAAGCATTTCAGAT 3731543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATAATGCAAATATTTAAAAAAACTGAAATCCAAACACTTCTGGTCTCAAGCATTTCAGAT 420

  3731544 AAGGGATACTCAACCACTACCACATTTTGTTTACCCGTTCATTAGTTGACAGACACTTGT 3731603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAGGGATACTCAACCACTACCACATTTTGTTTACCCGTTCATTAGTTGACAGACACTTGT 480

  3731604 TTCCATCTGCTGGCTATTTTGAACAATGCTGCTGTAAACATTTGTGTACAAGATTTTGTG 3731663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTCCATCTGCTGGCTATTTTGAACAATGCTGCTGTAAACATTTGTGTACAAGATTTTGTG 540

  3731664 TGGATATATGCTTTCTTTTGTTGAGTGTATGCCTAAGACTGGACTTTCTGGGTCATATGA 3731723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGGATATATGCTTTCTTTTGTTGAGTGTATGCCTAAGACTGGACTTTCTGGGTCATATGA 600

  3731724 TAACTCTGTGTTTAACTGTTTGAAGAATTACTAGGCTTTTCCGAAAGTGCTGCACTATTT 3731783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TAACTCTGTGTTTAACTGTTTGAAGAATTACTAGGCTTTTCCGAAAGTGCTGCACTATTT 660

  3731784 TACATTCTTAACAGCCACGTAAAGGAGTGCTGATTTCTCCCTGCCTTTCCCAGCACTCTC 3731843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TACATTCTTAACAGCCACGTAAAGGAGTGCTGATTTCTCCCTGCCTTTCCCAGCACTCTC 720

  3731844 TGTCTTACTTTTTGTTTATAGTCATCCTAGTGGATGTGAGGTGGTGTCTCATTGTGGTTT 3731903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGTCTTACTTTTTGTTTATAGTCATCCTAGTGGATGTGAGGTGGTGTCTCATTGTGGTTT 780

  3731904 TGATGTGCATTTCCCTGATGACTAATGAGGAGGAACATCTTTTCATATGTTTATTGGCCA 3731963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGATGTGCATTTCCCTGATGACTAATGAGGAGGAACATCTTTTCATATGTTTATTGGCCA 840

  3731964 TTTGTATGTTTTATTTGGAAAAATTTCTCTTCAGATCTCTATTCACTTGTCTTAAATTTC 3732023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTTGTATGTTTTATTTGGAAAAATTTCTCTTCAGATCTCTATTCACTTGTCTTAAATTTC 900

  3732024 AACAGGTTTTTGGGGGAACAGGTGGTGTTTGGTTACATGGATAAGTTCTTTAGTGGTGAT 3732083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AACAGGTTTTTGGGGGAACAGGTGGTGTTTGGTTACATGGATAAGTTCTTTAGTGGTGAT 960

  3732084 TTCTGAGATTTTGGTGCACCCATCACCAGAGCAGTGTACACTGTATCCAATGTGTAGCCT 3732143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTCTGAGATTTTGGTGCACCCATCACCAGAGCAGTGTACACTGTATCCAATGTGTAGCCT 1020

  3732144 GTTATCCCTCACCCCCCACCCTTCCCCACATTGTATCATTCTTATGTCTTTGCATCCTAA 3732203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GTTATCCCTCACCCCCCACCCTTCCCCACATTGTATCATTCTTATGTCTTTGCATCCTAA 1080

  3732204 TAGCTTAGCTCCCACTTATAACTGAGAACATATGATGTTTGCTTTTCCATTCCTGAACTA 3732263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TAGCTTAGCTCCCACTTATAACTGAGAACATATGATGTTTGCTTTTCCATTCCTGAACTA 1140

  3732264 CTTCATTTAGAATAATGGTCTCCAACTCCATCCAGGTTGCTGTGAATGCCATTATTTCAT 3732323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTTCATTTAGAATAATGGTCTCCAACTCCATCCAGGTTGCTGTGAATGCCATTATTTCAT 1200

  3732324 TCCTTTTTATGGCTGCATAGTATTCCATGGTATATGTATATATACCATATTTTCTTTTTT 3732383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TCCTTTTTATGGCTGCATAGTATTCCATGGTATATGTATATATACCATATTTTCTTTTTT 1260

  3732384 AAAATATTTTCAATTATGGGCACATAGTAGGTATATATATATTTATGGGGTACATGAAAT 3732443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AAAATATTTTCAATTATGGGCACATAGTAGGTATATATATATTTATGGGGTACATGAAAT 1320

  3732444 GTTTTAACACAGGCATGCAATGAATAATAATCACATCATGGAGAATGAGGTATCCATCCC 3732503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GTTTTAACACAGGCATGCAATGAATAATAATCACATCATGGAGAATGAGGTATCCATCCC 1380

  3732504 CAATCCATTGTGTATATATACCACTTTTAAAATCTATTCCTCTGTTAATGGGCACTTACT 3732563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CAATCCATTGTGTATATATACCACTTTTAAAATCTATTCCTCTGTTAATGGGCACTTACT 1440

  3732564 TTGATTTCATATTTTGGCTGTGACATTGTAAACAGTGTCACAGTAAACTTGGAAGTGCAG 3732623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTGATTTCATATTTTGGCTGTGACATTGTAAACAGTGTCACAGTAAACTTGGAAGTGCAG 1500

  3732624 ATATCTCTTCAATATATTGATTTACTTTCTTTTGGATATATACACAGTAGTGAGATTGCT 3732683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATATCTCTTCAATATATTGATTTACTTTCTTTTGGATATATACACAGTAGTGAGATTGCT 1560

  3732684 GGATGAATCTATTGTTGTTCTATTTTTAGTTTTTTGAGGAGTTTTCATAGTTTTCCATAG 3732743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GGATGAATCTATTGTTGTTCTATTTTTAGTTTTTTGAGGAGTTTTCATAGTTTTCCATAG 1620

  3732744 TGAGTGTACTAATTTACATTCTCACCAATAGTGTACATGGGCTTCACTTTCTCCACATCC 3732803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TGAGTGTACTAATTTACATTCTCACCAATAGTGTACATGGGCTTCACTTTCTCCACATCC 1680

  3732804 TCGCTAGCATCCACTATTCCCCCGTCTTTTTAAATAAAAGCGGTATTACTCTGCTCTCAC 3732863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TCGCTAGCATCCACTATTCCCCCGTCTTTTTAAATAAAAGCGGTATTACTCTGCTCTCAC 1740

  3732864 GTTGCTATAAAGATACTACCTGAGACTGGGTAACTTACAAACAAAAGAGGTTTAATTAAC 3732923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GTTGCTATAAAGATACTACCTGAGACTGGGTAACTTACAAACAAAAGAGGTTTAATTAAC 1800

  3732924 TCACAGTTCTACATGACTGGGGAGGCCTCAGGAAACTTACAATCATGGCAGAAAGAGAAG 3732983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TCACAGTTCTACATGACTGGGGAGGCCTCAGGAAACTTACAATCATGGCAGAAAGAGAAG 1860

  3732984 GCGAAGCAAGGCATGTCTTACATGGCAGCAGGATCGAGAGAGAGAGAGAGAGACAGAGAG 3733043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GCGAAGCAAGGCATGTCTTACATGGCAGCAGGATCGAGAGAGAGAGAGAGAGACAGAGAG 1920

  3733044 AGAGAGAGACAGAGACAGACAGACAGAGAGAGACAGAGAAAGGGGGAAGAGCCACTTTTA 3733103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AGAGAGAGACAGAGACAGACAGACAGAGAGAGACAGAGAAAGGGGGAAGAGCCACTTTTA 1980

  3733104 AACATCAGATCTCACAAGAACTCCCTATCAGAAGAACAGCATGGGGAAAACCACCCCATC 3733163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AACATCAGATCTCACAAGAACTCCCTATCAGAAGAACAGCATGGGGAAAACCACCCCATC 2040

  3733164 ATCCAATCACCTCTAAGCAGGTCCCTCCCTGGACATGTGGGGATTACAATTAGAGATGAG 3733223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ATCCAATCACCTCTAAGCAGGTCCCTCCCTGGACATGTGGGGATTACAATTAGAGATGAG 2100

  3733224 GTTTGAGTGGGGATACAGAACCAGACCATGTCAAAAGCCATTTCAACTGAGGTGGTATGA 3733283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GTTTGAGTGGGGATACAGAACCAGACCATGTCAAAAGCCATTTCAACTGAGGTGGTATGA 2160

  3733284 CATTTCATTGTGGTTTTGAGTTGCATTTTTCTGATGATTAGAGATGTTGAGCATTTAAAA 3733343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CATTTCATTGTGGTTTTGAGTTGCATTTTTCTGATGATTAGAGATGTTGAGCATTTAAAA 2220

  3733344 AATATACCTGTTGCCCATTTGTATGCCTTCTTTTGAGAAATATCTATTCAGAACTTTTGC 3733403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AATATACCTGTTGCCCATTTGTATGCCTTCTTTTGAGAAATATCTATTCAGAACTTTTGC 2280

  3733404 CCATTTATAAATTATTTTTTTTGCTACTGAGTTGTTAGCTATTGAGTTGTCCTTATATAT 3733463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CCATTTATAAATTATTTTTTTTGCTACTGAGTTGTTAGCTATTGAGTTGTCCTTATATAT 2340

  3733464 TCTTGTTATTAATCCCTTCTTAGATGGATAGTTTGCAAATATATTTTTTTCCAACTCTAT 3733523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TCTTGTTATTAATCCCTTCTTAGATGGATAGTTTGCAAATATATTTTTTTCCAACTCTAT 2400

  3733524 GGGTTGTCACTCCACTTTGTTATTTCCTTTGACAGCAGCCTTTTAGCTTGATGTAATCCC 3733583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GGGTTGTCACTCCACTTTGTTATTTCCTTTGACAGCAGCCTTTTAGCTTGATGTAATCCC 2460

  3733584 ATTTGTCTGTTTTTCCTGTTGTTGCCTGTGCTTTTGAGGTCTTACACACAAATATTTGCC 3733643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 ATTTGTCTGTTTTTCCTGTTGTTGCCTGTGCTTTTGAGGTCTTACACACAAATATTTGCC 2520

  3733644 AAGACCAATGTCCTAGAGCATTTCCCCAAGGTTTTCTTCTAGAATGTTCATAGTTTTAGG 3733703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 AAGACCAATGTCCTAGAGCATTTCCCCAAGGTTTTCTTCTAGAATGTTCATAGTTTTAGG 2580

  3733704 TCTTAGATTTAAGTTTTTCATCCATTTTGATTTCATTTTGCATAAGGTGAGAGATAGGAG 3733763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TCTTAGATTTAAGTTTTTCATCCATTTTGATTTCATTTTGCATAAGGTGAGAGATAGGAG 2640

  3733764 TCTAGTTTCATTCTTCGGCATGCAGTTATCTAGTTTCCCCAGCACCATTTACTGAAGAGA 3733823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TCTAGTTTCATTCTTCGGCATGCAGTTATCTAGTTTCCCCAGCACCATTTACTGAAGAGA 2700

  3733824 CTGTTCCCCATTGCGTGTTCTTGGTGCCTTTATTGAGAATGAGTTGGCTGTAAATGTGTT 3733883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CTGTTCCCCATTGCGTGTTCTTGGTGCCTTTATTGAGAATGAGTTGGCTGTAAATGTGTT 2760

  3733884 GATTTATATCTGGGTTCTCTATTGTGTTGTCTGTTTTTATGCCATAACCATTCTGATTTG 3733943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GATTTATATCTGGGTTCTCTATTGTGTTGTCTGTTTTTATGCCATAACCATTCTGATTTG 2820

  3733944 CTTATATAGCTTCATAGTACATTTTGAAGTCAGGTAGTGTGATGCCTTCAGCTTTGTTTT 3734003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CTTATATAGCTTCATAGTACATTTTGAAGTCAGGTAGTGTGATGCCTTCAGCTTTGTTTT 2880

  3734004 TTTGCTTTGGTTAT 3734017
          ||||||||||||||
     2881 TTTGCTTTGGTTAT 2894

EXCISED REGION

  3734019 CAGGGTCTTTCATT 3734032
          ||||||||||||||
     2896 CAGGGTCTTTCATT 2909

Alignment time is 3.61586 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [3722805,3748028] =>     25224 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [      1,   2451] =>      2451 nucs 'mol-32-2f07-015775_2451'

Score:        2407
Aligned:      2451        nucs
Identic:      2447 (100%) nucs =>      2419 (100%)        28 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [3730379,3732801] EXCISED REGION [3738018,3738045]
 second seq =>  [      1,   2423] EXCISED REGION [   2424,   2451]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      5216 nucs [3732802,3738017]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [3732802,3732805] to [3738018,3738021]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [3732802,3732803] to [3738016,3738017]
 second seq =>         0 nucs

  3730379 TGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGTGCCCGGCATCCATCATTAATTTTTATTCCAAA 3730438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGTGCCCGGCATCCATCATTAATTTTTATTCCAAA 60

  3730439 GTATCTCCACACCTTAAGTGCCACAGAGGCAATAGGATGACAGAATTTATTGTTTTCAAG 3730498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTATCTCCACACCTTAAGTGCCACAGAGGCAATAGGATGACAGAATTTATTGTTTTCAAG 120

  3730499 AGCAATTGCTGACATTTCTATATTTATTGCTAGCTAAAATCCGACGACTGGAGTTACTTG 3730558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGCAATTGCTGACATTTCTATATTTATTGCTAGCTAAAATCCGACGACTGGAGTTACTTG 180

  3730559 GTTCCCATGACTGAGCTTAAGCCAGGAAACCCTGCTTCCGGCCACAACTATTTTCTTGTC 3730618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTTCCCATGACTGAGCTTAAGCCAGGAAACCCTGCTTCCGGCCACAACTATTTTCTTGTC 240

  3730619 AATTCCCAGCAGAGATGGACTCATATCAGACTCAACATTTTCCCAGGTAATCGTGACATG 3730678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AATTCCCAGCAGAGATGGACTCATATCAGACTCAACATTTTCCCAGGTAATCGTGACATG 300

  3730679 GACTTATCACCAGTTCCATGGCTTCTTTATTTTATGTTGACATGTTTATAAAATATAAAA 3730738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GACTTATCACCAGTTCCATGGCTTCTTTATTTTATGTTGACATGTTTATAAAATATAAAA 360

  3730739 TGACTTGCTCTTTCCTTCTTGGTAATTGATCTCTCTAGCATTTCAGGATTGTAATTTCTC 3730798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGACTTGCTCTTTCCTTCTTGGTAATTGATCTCTCTAGCATTTCAGGATTGTAATTTCTC 420

  3730799 CTTTTTATGCTCTAGAAAATTCTTGTTTTAATCCACACATCAATAGGTGGTTATTGAAAA 3730858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTTTTTATGCTCTAGAAAATTCTTGTTTTAATCCACACATCAATAGGTGGTTATTGAAAA 480

  3730859 ATTATCAAGTAAATTAGGATGTGGTGGAACTAAGTTGTATTAGGTTAGATAGATCCTAAC 3730918
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATTATCAAGTAAATTAGGTTGTGGTGGAACTAAGTTGTATTAGGTTAGATAGATCCTAAC 540

  3730919 TAGATTTCACAAGTATGTTATATTAGCAGCTGAAGTGGTATGTACAAATGACTCATTTTA 3730978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TAGATTTCACAAGTATGTTATATTAGCAGCTGAAGTGGTATGTACAAATGACTCATTTTA 600

  3730979 TTTTTTAATAGCTTTATTGTGATATAATTAACATGCAGTTCACCCATTTGAAGTGTACAA 3731038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTTTTTAATAGCTTTATTGTGATATAATTAACATGCAGTTCACCCATTTGAAGTGTACAA 660

  3731039 TCAATGATGTATAGCATATGCATAGACACGTGCAACCATCACCATACCTTTAGAACATTT 3731098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCAATGATGTATAGCATATGCATAGACACGTGCAACCATCACCATACCTTTAGAACATTT 720

  3731099 TTATCATCTCAGAAAGAAACCCCATATCCTTTAGCTATCATCCCTCATCTTCCCTATCCC 3731158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTATCATCTCAGAAAGAAACCCCATATCCTTTAGCTATCATCCCTCATCTTCCCTATCCC 780

  3731159 AAAGCAACCACTAATTTGCTTTTTGTCTTGATAGTTTTGACTATTTTGGACATTTCATAT 3731218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAAGCAACCACTAATTTGCTTTTTGTCTTGATAGTTTTGACTATTTTGGACATTTCATAT 840

  3731219 AAGTAGGAATTATATAATATTGGTCTTTTGTGTCTGACTTTTTCCACTTAGTATAATGTT 3731278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAGTAGGAATTATATAATATTGGTCTTTTGTGTCTGACTTTTTCCACTTAGTATAATGTT 900

  3731279 TTCAAGATTCATCCATGTTGTAACATGTATTAACACTTTCTTTCTTTTTGTGTAAGGCTA 3731338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTCAAGATTCATCCATGTTGTAACATGTATTAACACTTTCTTTCTTTTTGTGTAAGGCTA 960

  3731339 ATATAGGTTGAGCATCTCAAATCTGAAAGCCCCAAAATTTGAAATGTTCCAAAATCCAAA 3731398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATATAGGTTGAGCATCTCAAATCTGAAAGCCCCAAAATTTGAAATGTTCCAAAATCCAAA 1020

  3731399 ACTTTTTGAGTGCTGACATGATGCTCAAAGGAAATGCTCACTGGAATATTTCAGATTTTG 3731458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ACTTTTTGAGTGCTGACATGATGCTCAAAGGAAATGCTCACTGGAATATTTCAGATTTTG 1080

  3731459 GATTTGGGACACTCTACCAGTAAGTATAATGCAAATATTTAAAAAAACTGAAATCCAAAC 3731518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GATTTGGGACACTCTACCAGTAAGTATAATGCAAATATTTAAAAAAACTGAAATCCAAAC 1140

  3731519 ACTTCTGGTCTCAAGCATTTCAGATAAGGGATACTCAACCACTACCACATTTTGTTTACC 3731578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ACTTCTGGTCTCAAGCATTTCAGATAAGGGATACTCAACCACTACCACATTTTGTTTACC 1200

  3731579 CGTTCATTAGTTGACAGACACTTGTTTCCATCTGCTGGCTATTTTGAACAATGCTGCTGT 3731638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CGTTCATTAGTTGACAGACACTTGTTTCCATCTGCTGGCTATTTTGAACAATGCTGCTGT 1260

  3731639 AAACATTTGTGTACAAGATTTTGTGTGGATATATGCTTTCTTTTGTTGAGTGTATGCCTA 3731698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AAACATTTGTGTACAAGATTTTGTGTGGATATATGCTTTCTTTTGTTGAGTGTATGCCTA 1320

  3731699 AGACTGGACTTTCTGGGTCATATGATAACTCTGTGTTTAACTGTTTGAAGAATTACTAGG 3731758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AGACTGGACTTTCTGGGTCATATGATAACTCTGTGTTTAACTGTTTGAAGAATTACTAGG 1380

  3731759 CTTTTCCGAAAGTGCTGCACTATTTTACATTCTTAACAGCCACGTAAAGGAGTGCTGATT 3731818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CTTTTCCGAAAGTGCTGCACTATTTTACATTCTTAACAGCCACGTAAAGGAGTGCTGATT 1440

  3731819 TCTCCCTGCCTTTCCCAGCACTCTCTGTCTTACTTTTTGTTTATAGTCATCCTAGTGGAT 3731878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TCTCCCTGCCTTTCCCAGCACTCTCTGTCTTACTTTTTGTTTATAGTCATCCTAGTGGAT 1500

  3731879 GTGAGGTGGTGTCTCATTGTGGTTTTGATGTGCATTTCCCTGATGACTAATGAGGAGGAA 3731938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GTGAGGTGGTGTCTCATTGTGGTTTTGATGTGCATTTCCCTGATGACTAATGAGGAGGAA 1560

  3731939 CATCTTTTCATATGTTTATTGGCCATTTGTATGTTTTATTTGGAAAAATTTCTCTTCAGA 3731998
          ||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     1561 CATCTTTTCATATGTTTATTCGCCATTTGTATGTTTTATGTGGAAAAATTTCTCTTCAGA 1620

  3731999 TCTCTATTCACTTGTCTTAAATTTCAACAGGTTTTTGGGGGAACAGGTGGTGTTTGGTTA 3732058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TCTCTATTCACTTGTCTTAAATTTCAACAGGTTTTTGGGGGAACAGGTGGTGTTTGGTTA 1680

  3732059 CATGGATAAGTTCTTTAGTGGTGATTTCTGAGATTTTGGTGCACCCATCACCAGAGCAGT 3732118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CATGGATAAGTTCTTTAGTGGTGATTTCTGAGATTTTGGTGCACCCATCACCAGAGCAGT 1740

  3732119 GTACACTGTATCCAATGTGTAGCCTGTTATCCCTCACCCCCCACCCTTCCCCACATTGTA 3732178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GTACACTGTATCCAATGTGTAGCCTGTTATCCCTCACCCCCCACCCTTCCCCACATTGTA 1800

  3732179 TCATTCTTATGTCTTTGCATCCTAATAGCTTAGCTCCCACTTATAACTGAGAACATATGA 3732238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TCATTCTTATGTCTTTGCATCCTAATAGCTTAGCTCCCACTTATAACTGAGAACATATGA 1860

  3732239 TGTTTGCTTTTCCATTCCTGAACTACTTCATTTAGAATAATGGTCTCCAACTCCATCCAG 3732298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TGTTTGCTTTTCCATTCCTGAACTACTTCATTTAGAATAATGGTCTCCAACTCCATCCAG 1920

  3732299 GTTGCTGTGAATGCCATTATTTCATTCCTTTTTATGGCTGCATAGTATTCCATGGTATAT 3732358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GTTGCTGTGAATGCCATTATTTCATTCCTTTTTATGGCTGCATAGTATTCCATGGTATAT 1980

  3732359 GTATATATACCATATTTTCTTTTTTAAAATATTTTCAATTATGGGCACATAGTAGGTATA 3732418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GTATATATACCATATTTTCTTTTTTAAAATATTTTCAATTATGGGCACATAGTAGGTATA 2040

  3732419 TATATATTTATGGGGTACATGAAATGTTTTAACACAGGCATGCAATGAATAATAATCACA 3732478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TATATATTTATGGGGTACATGAAATGTTTTAACACAGGCATGCAATGAATAATAATCACA 2100

  3732479 TCATGGAGAATGAGGTATCCATCCCCAATCCATTGTGTATATATACCACTTTTAAAATCT 3732538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TCATGGAGAATGAGGTATCCATCCCCAATCCATTGTGTATATATACCACTTTTAAAATCT 2160

  3732539 ATTCCTCTGTTAATGGGCACTTACTTTGATTTCATATTTTGGCTGTGACATTGTAAACAG 3732598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     2161 ATTCCTCTGTTAATGGGCACTTACTTTGATTTCATATTTTGGCTGTGATATTGTAAACAG 2220

  3732599 TGTCACAGTAAACTTGGAAGTGCAGATATCTCTTCAATATATTGATTTACTTTCTTTTGG 3732658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TGTCACAGTAAACTTGGAAGTGCAGATATCTCTTCAATATATTGATTTACTTTCTTTTGG 2280

  3732659 ATATATACACAGTAGTGAGATTGCTGGATGAATCTATTGTTGTTCTATTTTTAGTTTTTT 3732718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 ATATATACACAGTAGTGAGATTGCTGGATGAATCTATTGTTGTTCTATTTTTAGTTTTTT 2340

  3732719 GAGGAGTTTTCATAGTTTTCCATAGTGAGTGTACTAATTTACATTCTCACCAATAGTGTA 3732778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GAGGAGTTTTCATAGTTTTCCATAGTGAGTGTACTAATTTACATTCTCACCAATAGTGTA 2400

  3732779 CATGGGCTTCACTTTCTCCACAT 3732801
          |||||||||||||||||||||||
     2401 CATGGGCTTCACTTTCTCCACAT 2423

EXCISED REGION

  3738018 CCTCCCCCCCTCCCCTCCCCTCCCCTCC 3738045
          ||||||||||||||||||||||||||||
     2424 CCTCCCCCCCTCCCCTCCCCTCCCCTCC 2451

Alignment time is 2.7714 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [3722805,3748028] =>     25224 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [      1,   4109] =>      4109 nucs 'mol-32-2ff9-231508_4109'

Score:        4109
Aligned:      4109        nucs
Identic:      4109 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [3730378,3734486]
 second seq =>  [      1,   4109]

  3730378 GTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGTGCCCGGCATCCATCATTAATTTTTATTCCAA 3730437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGTGCCCGGCATCCATCATTAATTTTTATTCCAA 60

  3730438 AGTATCTCCACACCTTAAGTGCCACAGAGGCAATAGGATGACAGAATTTATTGTTTTCAA 3730497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGTATCTCCACACCTTAAGTGCCACAGAGGCAATAGGATGACAGAATTTATTGTTTTCAA 120

  3730498 GAGCAATTGCTGACATTTCTATATTTATTGCTAGCTAAAATCCGACGACTGGAGTTACTT 3730557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GAGCAATTGCTGACATTTCTATATTTATTGCTAGCTAAAATCCGACGACTGGAGTTACTT 180

  3730558 GGTTCCCATGACTGAGCTTAAGCCAGGAAACCCTGCTTCCGGCCACAACTATTTTCTTGT 3730617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGTTCCCATGACTGAGCTTAAGCCAGGAAACCCTGCTTCCGGCCACAACTATTTTCTTGT 240

  3730618 CAATTCCCAGCAGAGATGGACTCATATCAGACTCAACATTTTCCCAGGTAATCGTGACAT 3730677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CAATTCCCAGCAGAGATGGACTCATATCAGACTCAACATTTTCCCAGGTAATCGTGACAT 300

  3730678 GGACTTATCACCAGTTCCATGGCTTCTTTATTTTATGTTGACATGTTTATAAAATATAAA 3730737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GGACTTATCACCAGTTCCATGGCTTCTTTATTTTATGTTGACATGTTTATAAAATATAAA 360

  3730738 ATGACTTGCTCTTTCCTTCTTGGTAATTGATCTCTCTAGCATTTCAGGATTGTAATTTCT 3730797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATGACTTGCTCTTTCCTTCTTGGTAATTGATCTCTCTAGCATTTCAGGATTGTAATTTCT 420

  3730798 CCTTTTTATGCTCTAGAAAATTCTTGTTTTAATCCACACATCAATAGGTGGTTATTGAAA 3730857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCTTTTTATGCTCTAGAAAATTCTTGTTTTAATCCACACATCAATAGGTGGTTATTGAAA 480

  3730858 AATTATCAAGTAAATTAGGATGTGGTGGAACTAAGTTGTATTAGGTTAGATAGATCCTAA 3730917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AATTATCAAGTAAATTAGGATGTGGTGGAACTAAGTTGTATTAGGTTAGATAGATCCTAA 540

  3730918 CTAGATTTCACAAGTATGTTATATTAGCAGCTGAAGTGGTATGTACAAATGACTCATTTT 3730977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTAGATTTCACAAGTATGTTATATTAGCAGCTGAAGTGGTATGTACAAATGACTCATTTT 600

  3730978 ATTTTTTAATAGCTTTATTGTGATATAATTAACATGCAGTTCACCCATTTGAAGTGTACA 3731037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATTTTTTAATAGCTTTATTGTGATATAATTAACATGCAGTTCACCCATTTGAAGTGTACA 660

  3731038 ATCAATGATGTATAGCATATGCATAGACACGTGCAACCATCACCATACCTTTAGAACATT 3731097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATCAATGATGTATAGCATATGCATAGACACGTGCAACCATCACCATACCTTTAGAACATT 720

  3731098 TTTATCATCTCAGAAAGAAACCCCATATCCTTTAGCTATCATCCCTCATCTTCCCTATCC 3731157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTTATCATCTCAGAAAGAAACCCCATATCCTTTAGCTATCATCCCTCATCTTCCCTATCC 780

  3731158 CAAAGCAACCACTAATTTGCTTTTTGTCTTGATAGTTTTGACTATTTTGGACATTTCATA 3731217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CAAAGCAACCACTAATTTGCTTTTTGTCTTGATAGTTTTGACTATTTTGGACATTTCATA 840

  3731218 TAAGTAGGAATTATATAATATTGGTCTTTTGTGTCTGACTTTTTCCACTTAGTATAATGT 3731277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TAAGTAGGAATTATATAATATTGGTCTTTTGTGTCTGACTTTTTCCACTTAGTATAATGT 900

  3731278 TTTCAAGATTCATCCATGTTGTAACATGTATTAACACTTTCTTTCTTTTTGTGTAAGGCT 3731337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTTCAAGATTCATCCATGTTGTAACATGTATTAACACTTTCTTTCTTTTTGTGTAAGGCT 960

  3731338 AATATAGGTTGAGCATCTCAAATCTGAAAGCCCCAAAATTTGAAATGTTCCAAAATCCAA 3731397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AATATAGGTTGAGCATCTCAAATCTGAAAGCCCCAAAATTTGAAATGTTCCAAAATCCAA 1020

  3731398 AACTTTTTGAGTGCTGACATGATGCTCAAAGGAAATGCTCACTGGAATATTTCAGATTTT 3731457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AACTTTTTGAGTGCTGACATGATGCTCAAAGGAAATGCTCACTGGAATATTTCAGATTTT 1080

  3731458 GGATTTGGGACACTCTACCAGTAAGTATAATGCAAATATTTAAAAAAACTGAAATCCAAA 3731517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GGATTTGGGACACTCTACCAGTAAGTATAATGCAAATATTTAAAAAAACTGAAATCCAAA 1140

  3731518 CACTTCTGGTCTCAAGCATTTCAGATAAGGGATACTCAACCACTACCACATTTTGTTTAC 3731577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CACTTCTGGTCTCAAGCATTTCAGATAAGGGATACTCAACCACTACCACATTTTGTTTAC 1200

  3731578 CCGTTCATTAGTTGACAGACACTTGTTTCCATCTGCTGGCTATTTTGAACAATGCTGCTG 3731637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CCGTTCATTAGTTGACAGACACTTGTTTCCATCTGCTGGCTATTTTGAACAATGCTGCTG 1260

  3731638 TAAACATTTGTGTACAAGATTTTGTGTGGATATATGCTTTCTTTTGTTGAGTGTATGCCT 3731697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TAAACATTTGTGTACAAGATTTTGTGTGGATATATGCTTTCTTTTGTTGAGTGTATGCCT 1320

  3731698 AAGACTGGACTTTCTGGGTCATATGATAACTCTGTGTTTAACTGTTTGAAGAATTACTAG 3731757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AAGACTGGACTTTCTGGGTCATATGATAACTCTGTGTTTAACTGTTTGAAGAATTACTAG 1380

  3731758 GCTTTTCCGAAAGTGCTGCACTATTTTACATTCTTAACAGCCACGTAAAGGAGTGCTGAT 3731817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GCTTTTCCGAAAGTGCTGCACTATTTTACATTCTTAACAGCCACGTAAAGGAGTGCTGAT 1440

  3731818 TTCTCCCTGCCTTTCCCAGCACTCTCTGTCTTACTTTTTGTTTATAGTCATCCTAGTGGA 3731877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTCTCCCTGCCTTTCCCAGCACTCTCTGTCTTACTTTTTGTTTATAGTCATCCTAGTGGA 1500

  3731878 TGTGAGGTGGTGTCTCATTGTGGTTTTGATGTGCATTTCCCTGATGACTAATGAGGAGGA 3731937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TGTGAGGTGGTGTCTCATTGTGGTTTTGATGTGCATTTCCCTGATGACTAATGAGGAGGA 1560

  3731938 ACATCTTTTCATATGTTTATTGGCCATTTGTATGTTTTATTTGGAAAAATTTCTCTTCAG 3731997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ACATCTTTTCATATGTTTATTGGCCATTTGTATGTTTTATTTGGAAAAATTTCTCTTCAG 1620

  3731998 ATCTCTATTCACTTGTCTTAAATTTCAACAGGTTTTTGGGGGAACAGGTGGTGTTTGGTT 3732057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ATCTCTATTCACTTGTCTTAAATTTCAACAGGTTTTTGGGGGAACAGGTGGTGTTTGGTT 1680

  3732058 ACATGGATAAGTTCTTTAGTGGTGATTTCTGAGATTTTGGTGCACCCATCACCAGAGCAG 3732117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ACATGGATAAGTTCTTTAGTGGTGATTTCTGAGATTTTGGTGCACCCATCACCAGAGCAG 1740

  3732118 TGTACACTGTATCCAATGTGTAGCCTGTTATCCCTCACCCCCCACCCTTCCCCACATTGT 3732177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGTACACTGTATCCAATGTGTAGCCTGTTATCCCTCACCCCCCACCCTTCCCCACATTGT 1800

  3732178 ATCATTCTTATGTCTTTGCATCCTAATAGCTTAGCTCCCACTTATAACTGAGAACATATG 3732237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ATCATTCTTATGTCTTTGCATCCTAATAGCTTAGCTCCCACTTATAACTGAGAACATATG 1860

  3732238 ATGTTTGCTTTTCCATTCCTGAACTACTTCATTTAGAATAATGGTCTCCAACTCCATCCA 3732297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ATGTTTGCTTTTCCATTCCTGAACTACTTCATTTAGAATAATGGTCTCCAACTCCATCCA 1920

  3732298 GGTTGCTGTGAATGCCATTATTTCATTCCTTTTTATGGCTGCATAGTATTCCATGGTATA 3732357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GGTTGCTGTGAATGCCATTATTTCATTCCTTTTTATGGCTGCATAGTATTCCATGGTATA 1980

  3732358 TGTATATATACCATATTTTCTTTTTTAAAATATTTTCAATTATGGGCACATAGTAGGTAT 3732417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TGTATATATACCATATTTTCTTTTTTAAAATATTTTCAATTATGGGCACATAGTAGGTAT 2040

  3732418 ATATATATTTATGGGGTACATGAAATGTTTTAACACAGGCATGCAATGAATAATAATCAC 3732477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ATATATATTTATGGGGTACATGAAATGTTTTAACACAGGCATGCAATGAATAATAATCAC 2100

  3732478 ATCATGGAGAATGAGGTATCCATCCCCAATCCATTGTGTATATATACCACTTTTAAAATC 3732537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ATCATGGAGAATGAGGTATCCATCCCCAATCCATTGTGTATATATACCACTTTTAAAATC 2160

  3732538 TATTCCTCTGTTAATGGGCACTTACTTTGATTTCATATTTTGGCTGTGACATTGTAAACA 3732597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TATTCCTCTGTTAATGGGCACTTACTTTGATTTCATATTTTGGCTGTGACATTGTAAACA 2220

  3732598 GTGTCACAGTAAACTTGGAAGTGCAGATATCTCTTCAATATATTGATTTACTTTCTTTTG 3732657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GTGTCACAGTAAACTTGGAAGTGCAGATATCTCTTCAATATATTGATTTACTTTCTTTTG 2280

  3732658 GATATATACACAGTAGTGAGATTGCTGGATGAATCTATTGTTGTTCTATTTTTAGTTTTT 3732717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GATATATACACAGTAGTGAGATTGCTGGATGAATCTATTGTTGTTCTATTTTTAGTTTTT 2340

  3732718 TGAGGAGTTTTCATAGTTTTCCATAGTGAGTGTACTAATTTACATTCTCACCAATAGTGT 3732777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TGAGGAGTTTTCATAGTTTTCCATAGTGAGTGTACTAATTTACATTCTCACCAATAGTGT 2400

  3732778 ACATGGGCTTCACTTTCTCCACATCCTCGCTAGCATCCACTATTCCCCCGTCTTTTTAAA 3732837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ACATGGGCTTCACTTTCTCCACATCCTCGCTAGCATCCACTATTCCCCCGTCTTTTTAAA 2460

  3732838 TAAAAGCGGTATTACTCTGCTCTCACGTTGCTATAAAGATACTACCTGAGACTGGGTAAC 3732897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TAAAAGCGGTATTACTCTGCTCTCACGTTGCTATAAAGATACTACCTGAGACTGGGTAAC 2520

  3732898 TTACAAACAAAAGAGGTTTAATTAACTCACAGTTCTACATGACTGGGGAGGCCTCAGGAA 3732957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TTACAAACAAAAGAGGTTTAATTAACTCACAGTTCTACATGACTGGGGAGGCCTCAGGAA 2580

  3732958 ACTTACAATCATGGCAGAAAGAGAAGGCGAAGCAAGGCATGTCTTACATGGCAGCAGGAT 3733017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 ACTTACAATCATGGCAGAAAGAGAAGGCGAAGCAAGGCATGTCTTACATGGCAGCAGGAT 2640

  3733018 CGAGAGAGAGAGAGAGAGACAGAGAGAGAGAGAGACAGAGACAGACAGACAGAGAGAGAC 3733077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CGAGAGAGAGAGAGAGAGACAGAGAGAGAGAGAGACAGAGACAGACAGACAGAGAGAGAC 2700

  3733078 AGAGAAAGGGGGAAGAGCCACTTTTAAACATCAGATCTCACAAGAACTCCCTATCAGAAG 3733137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AGAGAAAGGGGGAAGAGCCACTTTTAAACATCAGATCTCACAAGAACTCCCTATCAGAAG 2760

  3733138 AACAGCATGGGGAAAACCACCCCATCATCCAATCACCTCTAAGCAGGTCCCTCCCTGGAC 3733197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 AACAGCATGGGGAAAACCACCCCATCATCCAATCACCTCTAAGCAGGTCCCTCCCTGGAC 2820

  3733198 ATGTGGGGATTACAATTAGAGATGAGGTTTGAGTGGGGATACAGAACCAGACCATGTCAA 3733257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 ATGTGGGGATTACAATTAGAGATGAGGTTTGAGTGGGGATACAGAACCAGACCATGTCAA 2880

  3733258 AAGCCATTTCAACTGAGGTGGTATGACATTTCATTGTGGTTTTGAGTTGCATTTTTCTGA 3733317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 AAGCCATTTCAACTGAGGTGGTATGACATTTCATTGTGGTTTTGAGTTGCATTTTTCTGA 2940

  3733318 TGATTAGAGATGTTGAGCATTTAAAAAATATACCTGTTGCCCATTTGTATGCCTTCTTTT 3733377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TGATTAGAGATGTTGAGCATTTAAAAAATATACCTGTTGCCCATTTGTATGCCTTCTTTT 3000

  3733378 GAGAAATATCTATTCAGAACTTTTGCCCATTTATAAATTATTTTTTTTGCTACTGAGTTG 3733437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GAGAAATATCTATTCAGAACTTTTGCCCATTTATAAATTATTTTTTTTGCTACTGAGTTG 3060

  3733438 TTAGCTATTGAGTTGTCCTTATATATTCTTGTTATTAATCCCTTCTTAGATGGATAGTTT 3733497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TTAGCTATTGAGTTGTCCTTATATATTCTTGTTATTAATCCCTTCTTAGATGGATAGTTT 3120

  3733498 GCAAATATATTTTTTTCCAACTCTATGGGTTGTCACTCCACTTTGTTATTTCCTTTGACA 3733557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 GCAAATATATTTTTTTCCAACTCTATGGGTTGTCACTCCACTTTGTTATTTCCTTTGACA 3180

  3733558 GCAGCCTTTTAGCTTGATGTAATCCCATTTGTCTGTTTTTCCTGTTGTTGCCTGTGCTTT 3733617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 GCAGCCTTTTAGCTTGATGTAATCCCATTTGTCTGTTTTTCCTGTTGTTGCCTGTGCTTT 3240

  3733618 TGAGGTCTTACACACAAATATTTGCCAAGACCAATGTCCTAGAGCATTTCCCCAAGGTTT 3733677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TGAGGTCTTACACACAAATATTTGCCAAGACCAATGTCCTAGAGCATTTCCCCAAGGTTT 3300

  3733678 TCTTCTAGAATGTTCATAGTTTTAGGTCTTAGATTTAAGTTTTTCATCCATTTTGATTTC 3733737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TCTTCTAGAATGTTCATAGTTTTAGGTCTTAGATTTAAGTTTTTCATCCATTTTGATTTC 3360

  3733738 ATTTTGCATAAGGTGAGAGATAGGAGTCTAGTTTCATTCTTCGGCATGCAGTTATCTAGT 3733797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 ATTTTGCATAAGGTGAGAGATAGGAGTCTAGTTTCATTCTTCGGCATGCAGTTATCTAGT 3420

  3733798 TTCCCCAGCACCATTTACTGAAGAGACTGTTCCCCATTGCGTGTTCTTGGTGCCTTTATT 3733857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TTCCCCAGCACCATTTACTGAAGAGACTGTTCCCCATTGCGTGTTCTTGGTGCCTTTATT 3480

  3733858 GAGAATGAGTTGGCTGTAAATGTGTTGATTTATATCTGGGTTCTCTATTGTGTTGTCTGT 3733917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 GAGAATGAGTTGGCTGTAAATGTGTTGATTTATATCTGGGTTCTCTATTGTGTTGTCTGT 3540

  3733918 TTTTATGCCATAACCATTCTGATTTGCTTATATAGCTTCATAGTACATTTTGAAGTCAGG 3733977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 TTTTATGCCATAACCATTCTGATTTGCTTATATAGCTTCATAGTACATTTTGAAGTCAGG 3600

  3733978 TAGTGTGATGCCTTCAGCTTTGTTTTTTTGCTTTGGTTATTCAGGGTCTTTCATTTAAAT 3734037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 TAGTGTGATGCCTTCAGCTTTGTTTTTTTGCTTTGGTTATTCAGGGTCTTTCATTTAAAT 3660

  3734038 TTTACTTTTTAAAAATATTTCTGAGAAGAATATCATTGGTATTTTAATAGGGATTGAATT 3734097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 TTTACTTTTTAAAAATATTTCTGAGAAGAATATCATTGGTATTTTAATAGGGATTGAATT 3720

  3734098 GAATCTGTAAATTGCTTTGGATAGTACTGTCATTTTAACAATATTAATTCTTTCAATCTA 3734157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 GAATCTGTAAATTGCTTTGGATAGTACTGTCATTTTAACAATATTAATTCTTTCAATCTA 3780

  3734158 GGAGCACGGAACATCTTTCCATTTTTTCTGTGTCCTCTTCAATATATTTCACCAGTGTTT 3734217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 GGAGCACGGAACATCTTTCCATTTTTTCTGTGTCCTCTTCAATATATTTCACCAGTGTTT 3840

  3734218 TATAGTTTTCCTTGTATAGCTCTTTCACTTCGTAGGATAAATGGATTCCTCAGTATTTTA 3734277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 TATAGTTTTCCTTGTATAGCTCTTTCACTTCGTAGGATAAATGGATTCCTCAGTATTTTA 3900

  3734278 TAGTTTTTGTAGCTATTGTATATGCGATTGCCTTCTTGTTTTATTTTGTAGATTATTCAC 3734337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 TAGTTTTTGTAGCTATTGTATATGCGATTGCCTTCTTGTTTTATTTTGTAGATTATTCAC 3960

  3734338 TGTTGGTGTGTATAAATGCTACTGACTTTTGTATGTTGAATTTGTATCCTGAAAATCTAC 3734397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 TGTTGGTGTGTATAAATGCTACTGACTTTTGTATGTTGAATTTGTATCCTGAAAATCTAC 4020

  3734398 TGAATTAGTTTATCAGTTCTAATAGTTTTTGGGTGGAGTCTAGGTTTTTCTAAGTATAAG 3734457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 TGAATTAGTTTATCAGTTCTAATAGTTTTTGGGTGGAGTCTAGGTTTTTCTAAGTATAAG 4080

  3734458 ATCATATTGTCTATGAAGAAGGAGAACTT 3734486
          |||||||||||||||||||||||||||||
     4081 ATCATATTGTCTATGAAGAAGGAGAACTT 4109

Alignment time is 3.97138 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [3722805,3748028] =>     25224 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [      1,   4039] =>      4039 nucs 'mol-32-3025-051930_4039'

Score:        4039
Aligned:      4039        nucs
Identic:      4039 (100%) nucs =>         5 (100%)      4034 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [3723501,3723505] EXCISED REGION [3730302,3734335]
 second seq =>  [      1,      5] EXCISED REGION [      6,   4039]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6796 nucs [3723506,3730301]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 10
 first  seq =>        55 nucs [3730247,3730301]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [3723504,3723505] to [3730302,3730303]
 second seq =>         2 nucs [4,5] to [6,7]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [3723506,3723506] to [3730301,3730301]
 second seq =>         0 nucs

  3723501 AGTAG 3723505
          |||||
        1 AGTAG 5

EXCISED REGION

  3730302 AGACGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCC 3730361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        6 AGACGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCC 65

  3730362 GCCTCGGCCTCCCAAGGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGTGCCCGGCATCCATCA 3730421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       66 GCCTCGGCCTCCCAAGGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGTGCCCGGCATCCATCA 125

  3730422 TTAATTTTTATTCCAAAGTATCTCCACACCTTAAGTGCCACAGAGGCAATAGGATGACAG 3730481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      126 TTAATTTTTATTCCAAAGTATCTCCACACCTTAAGTGCCACAGAGGCAATAGGATGACAG 185

  3730482 AATTTATTGTTTTCAAGAGCAATTGCTGACATTTCTATATTTATTGCTAGCTAAAATCCG 3730541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      186 AATTTATTGTTTTCAAGAGCAATTGCTGACATTTCTATATTTATTGCTAGCTAAAATCCG 245

  3730542 ACGACTGGAGTTACTTGGTTCCCATGACTGAGCTTAAGCCAGGAAACCCTGCTTCCGGCC 3730601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      246 ACGACTGGAGTTACTTGGTTCCCATGACTGAGCTTAAGCCAGGAAACCCTGCTTCCGGCC 305

  3730602 ACAACTATTTTCTTGTCAATTCCCAGCAGAGATGGACTCATATCAGACTCAACATTTTCC 3730661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      306 ACAACTATTTTCTTGTCAATTCCCAGCAGAGATGGACTCATATCAGACTCAACATTTTCC 365

  3730662 CAGGTAATCGTGACATGGACTTATCACCAGTTCCATGGCTTCTTTATTTTATGTTGACAT 3730721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      366 CAGGTAATCGTGACATGGACTTATCACCAGTTCCATGGCTTCTTTATTTTATGTTGACAT 425

  3730722 GTTTATAAAATATAAAATGACTTGCTCTTTCCTTCTTGGTAATTGATCTCTCTAGCATTT 3730781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      426 GTTTATAAAATATAAAATGACTTGCTCTTTCCTTCTTGGTAATTGATCTCTCTAGCATTT 485

  3730782 CAGGATTGTAATTTCTCCTTTTTATGCTCTAGAAAATTCTTGTTTTAATCCACACATCAA 3730841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      486 CAGGATTGTAATTTCTCCTTTTTATGCTCTAGAAAATTCTTGTTTTAATCCACACATCAA 545

  3730842 TAGGTGGTTATTGAAAAATTATCAAGTAAATTAGGATGTGGTGGAACTAAGTTGTATTAG 3730901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      546 TAGGTGGTTATTGAAAAATTATCAAGTAAATTAGGATGTGGTGGAACTAAGTTGTATTAG 605

  3730902 GTTAGATAGATCCTAACTAGATTTCACAAGTATGTTATATTAGCAGCTGAAGTGGTATGT 3730961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      606 GTTAGATAGATCCTAACTAGATTTCACAAGTATGTTATATTAGCAGCTGAAGTGGTATGT 665

  3730962 ACAAATGACTCATTTTATTTTTTAATAGCTTTATTGTGATATAATTAACATGCAGTTCAC 3731021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      666 ACAAATGACTCATTTTATTTTTTAATAGCTTTATTGTGATATAATTAACATGCAGTTCAC 725

  3731022 CCATTTGAAGTGTACAATCAATGATGTATAGCATATGCATAGACACGTGCAACCATCACC 3731081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      726 CCATTTGAAGTGTACAATCAATGATGTATAGCATATGCATAGACACGTGCAACCATCACC 785

  3731082 ATACCTTTAGAACATTTTTATCATCTCAGAAAGAAACCCCATATCCTTTAGCTATCATCC 3731141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      786 ATACCTTTAGAACATTTTTATCATCTCAGAAAGAAACCCCATATCCTTTAGCTATCATCC 845

  3731142 CTCATCTTCCCTATCCCAAAGCAACCACTAATTTGCTTTTTGTCTTGATAGTTTTGACTA 3731201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      846 CTCATCTTCCCTATCCCAAAGCAACCACTAATTTGCTTTTTGTCTTGATAGTTTTGACTA 905

  3731202 TTTTGGACATTTCATATAAGTAGGAATTATATAATATTGGTCTTTTGTGTCTGACTTTTT 3731261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      906 TTTTGGACATTTCATATAAGTAGGAATTATATAATATTGGTCTTTTGTGTCTGACTTTTT 965

  3731262 CCACTTAGTATAATGTTTTCAAGATTCATCCATGTTGTAACATGTATTAACACTTTCTTT 3731321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      966 CCACTTAGTATAATGTTTTCAAGATTCATCCATGTTGTAACATGTATTAACACTTTCTTT 1025

  3731322 CTTTTTGTGTAAGGCTAATATAGGTTGAGCATCTCAAATCTGAAAGCCCCAAAATTTGAA 3731381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1026 CTTTTTGTGTAAGGCTAATATAGGTTGAGCATCTCAAATCTGAAAGCCCCAAAATTTGAA 1085

  3731382 ATGTTCCAAAATCCAAAACTTTTTGAGTGCTGACATGATGCTCAAAGGAAATGCTCACTG 3731441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1086 ATGTTCCAAAATCCAAAACTTTTTGAGTGCTGACATGATGCTCAAAGGAAATGCTCACTG 1145

  3731442 GAATATTTCAGATTTTGGATTTGGGACACTCTACCAGTAAGTATAATGCAAATATTTAAA 3731501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1146 GAATATTTCAGATTTTGGATTTGGGACACTCTACCAGTAAGTATAATGCAAATATTTAAA 1205

  3731502 AAAACTGAAATCCAAACACTTCTGGTCTCAAGCATTTCAGATAAGGGATACTCAACCACT 3731561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1206 AAAACTGAAATCCAAACACTTCTGGTCTCAAGCATTTCAGATAAGGGATACTCAACCACT 1265

  3731562 ACCACATTTTGTTTACCCGTTCATTAGTTGACAGACACTTGTTTCCATCTGCTGGCTATT 3731621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1266 ACCACATTTTGTTTACCCGTTCATTAGTTGACAGACACTTGTTTCCATCTGCTGGCTATT 1325

  3731622 TTGAACAATGCTGCTGTAAACATTTGTGTACAAGATTTTGTGTGGATATATGCTTTCTTT 3731681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1326 TTGAACAATGCTGCTGTAAACATTTGTGTACAAGATTTTGTGTGGATATATGCTTTCTTT 1385

  3731682 TGTTGAGTGTATGCCTAAGACTGGACTTTCTGGGTCATATGATAACTCTGTGTTTAACTG 3731741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1386 TGTTGAGTGTATGCCTAAGACTGGACTTTCTGGGTCATATGATAACTCTGTGTTTAACTG 1445

  3731742 TTTGAAGAATTACTAGGCTTTTCCGAAAGTGCTGCACTATTTTACATTCTTAACAGCCAC 3731801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1446 TTTGAAGAATTACTAGGCTTTTCCGAAAGTGCTGCACTATTTTACATTCTTAACAGCCAC 1505

  3731802 GTAAAGGAGTGCTGATTTCTCCCTGCCTTTCCCAGCACTCTCTGTCTTACTTTTTGTTTA 3731861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1506 GTAAAGGAGTGCTGATTTCTCCCTGCCTTTCCCAGCACTCTCTGTCTTACTTTTTGTTTA 1565

  3731862 TAGTCATCCTAGTGGATGTGAGGTGGTGTCTCATTGTGGTTTTGATGTGCATTTCCCTGA 3731921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1566 TAGTCATCCTAGTGGATGTGAGGTGGTGTCTCATTGTGGTTTTGATGTGCATTTCCCTGA 1625

  3731922 TGACTAATGAGGAGGAACATCTTTTCATATGTTTATTGGCCATTTGTATGTTTTATTTGG 3731981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1626 TGACTAATGAGGAGGAACATCTTTTCATATGTTTATTGGCCATTTGTATGTTTTATTTGG 1685

  3731982 AAAAATTTCTCTTCAGATCTCTATTCACTTGTCTTAAATTTCAACAGGTTTTTGGGGGAA 3732041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1686 AAAAATTTCTCTTCAGATCTCTATTCACTTGTCTTAAATTTCAACAGGTTTTTGGGGGAA 1745

  3732042 CAGGTGGTGTTTGGTTACATGGATAAGTTCTTTAGTGGTGATTTCTGAGATTTTGGTGCA 3732101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1746 CAGGTGGTGTTTGGTTACATGGATAAGTTCTTTAGTGGTGATTTCTGAGATTTTGGTGCA 1805

  3732102 CCCATCACCAGAGCAGTGTACACTGTATCCAATGTGTAGCCTGTTATCCCTCACCCCCCA 3732161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1806 CCCATCACCAGAGCAGTGTACACTGTATCCAATGTGTAGCCTGTTATCCCTCACCCCCCA 1865

  3732162 CCCTTCCCCACATTGTATCATTCTTATGTCTTTGCATCCTAATAGCTTAGCTCCCACTTA 3732221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1866 CCCTTCCCCACATTGTATCATTCTTATGTCTTTGCATCCTAATAGCTTAGCTCCCACTTA 1925

  3732222 TAACTGAGAACATATGATGTTTGCTTTTCCATTCCTGAACTACTTCATTTAGAATAATGG 3732281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1926 TAACTGAGAACATATGATGTTTGCTTTTCCATTCCTGAACTACTTCATTTAGAATAATGG 1985

  3732282 TCTCCAACTCCATCCAGGTTGCTGTGAATGCCATTATTTCATTCCTTTTTATGGCTGCAT 3732341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1986 TCTCCAACTCCATCCAGGTTGCTGTGAATGCCATTATTTCATTCCTTTTTATGGCTGCAT 2045

  3732342 AGTATTCCATGGTATATGTATATATACCATATTTTCTTTTTTAAAATATTTTCAATTATG 3732401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2046 AGTATTCCATGGTATATGTATATATACCATATTTTCTTTTTTAAAATATTTTCAATTATG 2105

  3732402 GGCACATAGTAGGTATATATATATTTATGGGGTACATGAAATGTTTTAACACAGGCATGC 3732461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2106 GGCACATAGTAGGTATATATATATTTATGGGGTACATGAAATGTTTTAACACAGGCATGC 2165

  3732462 AATGAATAATAATCACATCATGGAGAATGAGGTATCCATCCCCAATCCATTGTGTATATA 3732521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2166 AATGAATAATAATCACATCATGGAGAATGAGGTATCCATCCCCAATCCATTGTGTATATA 2225

  3732522 TACCACTTTTAAAATCTATTCCTCTGTTAATGGGCACTTACTTTGATTTCATATTTTGGC 3732581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2226 TACCACTTTTAAAATCTATTCCTCTGTTAATGGGCACTTACTTTGATTTCATATTTTGGC 2285

  3732582 TGTGACATTGTAAACAGTGTCACAGTAAACTTGGAAGTGCAGATATCTCTTCAATATATT 3732641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2286 TGTGACATTGTAAACAGTGTCACAGTAAACTTGGAAGTGCAGATATCTCTTCAATATATT 2345

  3732642 GATTTACTTTCTTTTGGATATATACACAGTAGTGAGATTGCTGGATGAATCTATTGTTGT 3732701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2346 GATTTACTTTCTTTTGGATATATACACAGTAGTGAGATTGCTGGATGAATCTATTGTTGT 2405

  3732702 TCTATTTTTAGTTTTTTGAGGAGTTTTCATAGTTTTCCATAGTGAGTGTACTAATTTACA 3732761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2406 TCTATTTTTAGTTTTTTGAGGAGTTTTCATAGTTTTCCATAGTGAGTGTACTAATTTACA 2465

  3732762 TTCTCACCAATAGTGTACATGGGCTTCACTTTCTCCACATCCTCGCTAGCATCCACTATT 3732821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2466 TTCTCACCAATAGTGTACATGGGCTTCACTTTCTCCACATCCTCGCTAGCATCCACTATT 2525

  3732822 CCCCCGTCTTTTTAAATAAAAGCGGTATTACTCTGCTCTCACGTTGCTATAAAGATACTA 3732881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2526 CCCCCGTCTTTTTAAATAAAAGCGGTATTACTCTGCTCTCACGTTGCTATAAAGATACTA 2585

  3732882 CCTGAGACTGGGTAACTTACAAACAAAAGAGGTTTAATTAACTCACAGTTCTACATGACT 3732941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2586 CCTGAGACTGGGTAACTTACAAACAAAAGAGGTTTAATTAACTCACAGTTCTACATGACT 2645

  3732942 GGGGAGGCCTCAGGAAACTTACAATCATGGCAGAAAGAGAAGGCGAAGCAAGGCATGTCT 3733001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2646 GGGGAGGCCTCAGGAAACTTACAATCATGGCAGAAAGAGAAGGCGAAGCAAGGCATGTCT 2705

  3733002 TACATGGCAGCAGGATCGAGAGAGAGAGAGAGAGACAGAGAGAGAGAGAGACAGAGACAG 3733061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2706 TACATGGCAGCAGGATCGAGAGAGAGAGAGAGAGACAGAGAGAGAGAGAGACAGAGACAG 2765

  3733062 ACAGACAGAGAGAGACAGAGAAAGGGGGAAGAGCCACTTTTAAACATCAGATCTCACAAG 3733121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2766 ACAGACAGAGAGAGACAGAGAAAGGGGGAAGAGCCACTTTTAAACATCAGATCTCACAAG 2825

  3733122 AACTCCCTATCAGAAGAACAGCATGGGGAAAACCACCCCATCATCCAATCACCTCTAAGC 3733181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2826 AACTCCCTATCAGAAGAACAGCATGGGGAAAACCACCCCATCATCCAATCACCTCTAAGC 2885

  3733182 AGGTCCCTCCCTGGACATGTGGGGATTACAATTAGAGATGAGGTTTGAGTGGGGATACAG 3733241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2886 AGGTCCCTCCCTGGACATGTGGGGATTACAATTAGAGATGAGGTTTGAGTGGGGATACAG 2945

  3733242 AACCAGACCATGTCAAAAGCCATTTCAACTGAGGTGGTATGACATTTCATTGTGGTTTTG 3733301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2946 AACCAGACCATGTCAAAAGCCATTTCAACTGAGGTGGTATGACATTTCATTGTGGTTTTG 3005

  3733302 AGTTGCATTTTTCTGATGATTAGAGATGTTGAGCATTTAAAAAATATACCTGTTGCCCAT 3733361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3006 AGTTGCATTTTTCTGATGATTAGAGATGTTGAGCATTTAAAAAATATACCTGTTGCCCAT 3065

  3733362 TTGTATGCCTTCTTTTGAGAAATATCTATTCAGAACTTTTGCCCATTTATAAATTATTTT 3733421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3066 TTGTATGCCTTCTTTTGAGAAATATCTATTCAGAACTTTTGCCCATTTATAAATTATTTT 3125

  3733422 TTTTGCTACTGAGTTGTTAGCTATTGAGTTGTCCTTATATATTCTTGTTATTAATCCCTT 3733481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3126 TTTTGCTACTGAGTTGTTAGCTATTGAGTTGTCCTTATATATTCTTGTTATTAATCCCTT 3185

  3733482 CTTAGATGGATAGTTTGCAAATATATTTTTTTCCAACTCTATGGGTTGTCACTCCACTTT 3733541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3186 CTTAGATGGATAGTTTGCAAATATATTTTTTTCCAACTCTATGGGTTGTCACTCCACTTT 3245

  3733542 GTTATTTCCTTTGACAGCAGCCTTTTAGCTTGATGTAATCCCATTTGTCTGTTTTTCCTG 3733601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3246 GTTATTTCCTTTGACAGCAGCCTTTTAGCTTGATGTAATCCCATTTGTCTGTTTTTCCTG 3305

  3733602 TTGTTGCCTGTGCTTTTGAGGTCTTACACACAAATATTTGCCAAGACCAATGTCCTAGAG 3733661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3306 TTGTTGCCTGTGCTTTTGAGGTCTTACACACAAATATTTGCCAAGACCAATGTCCTAGAG 3365

  3733662 CATTTCCCCAAGGTTTTCTTCTAGAATGTTCATAGTTTTAGGTCTTAGATTTAAGTTTTT 3733721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3366 CATTTCCCCAAGGTTTTCTTCTAGAATGTTCATAGTTTTAGGTCTTAGATTTAAGTTTTT 3425

  3733722 CATCCATTTTGATTTCATTTTGCATAAGGTGAGAGATAGGAGTCTAGTTTCATTCTTCGG 3733781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3426 CATCCATTTTGATTTCATTTTGCATAAGGTGAGAGATAGGAGTCTAGTTTCATTCTTCGG 3485

  3733782 CATGCAGTTATCTAGTTTCCCCAGCACCATTTACTGAAGAGACTGTTCCCCATTGCGTGT 3733841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3486 CATGCAGTTATCTAGTTTCCCCAGCACCATTTACTGAAGAGACTGTTCCCCATTGCGTGT 3545

  3733842 TCTTGGTGCCTTTATTGAGAATGAGTTGGCTGTAAATGTGTTGATTTATATCTGGGTTCT 3733901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3546 TCTTGGTGCCTTTATTGAGAATGAGTTGGCTGTAAATGTGTTGATTTATATCTGGGTTCT 3605

  3733902 CTATTGTGTTGTCTGTTTTTATGCCATAACCATTCTGATTTGCTTATATAGCTTCATAGT 3733961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3606 CTATTGTGTTGTCTGTTTTTATGCCATAACCATTCTGATTTGCTTATATAGCTTCATAGT 3665

  3733962 ACATTTTGAAGTCAGGTAGTGTGATGCCTTCAGCTTTGTTTTTTTGCTTTGGTTATTCAG 3734021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3666 ACATTTTGAAGTCAGGTAGTGTGATGCCTTCAGCTTTGTTTTTTTGCTTTGGTTATTCAG 3725

  3734022 GGTCTTTCATTTAAATTTTACTTTTTAAAAATATTTCTGAGAAGAATATCATTGGTATTT 3734081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3726 GGTCTTTCATTTAAATTTTACTTTTTAAAAATATTTCTGAGAAGAATATCATTGGTATTT 3785

  3734082 TAATAGGGATTGAATTGAATCTGTAAATTGCTTTGGATAGTACTGTCATTTTAACAATAT 3734141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3786 TAATAGGGATTGAATTGAATCTGTAAATTGCTTTGGATAGTACTGTCATTTTAACAATAT 3845

  3734142 TAATTCTTTCAATCTAGGAGCACGGAACATCTTTCCATTTTTTCTGTGTCCTCTTCAATA 3734201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3846 TAATTCTTTCAATCTAGGAGCACGGAACATCTTTCCATTTTTTCTGTGTCCTCTTCAATA 3905

  3734202 TATTTCACCAGTGTTTTATAGTTTTCCTTGTATAGCTCTTTCACTTCGTAGGATAAATGG 3734261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3906 TATTTCACCAGTGTTTTATAGTTTTCCTTGTATAGCTCTTTCACTTCGTAGGATAAATGG 3965

  3734262 ATTCCTCAGTATTTTATAGTTTTTGTAGCTATTGTATATGCGATTGCCTTCTTGTTTTAT 3734321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3966 ATTCCTCAGTATTTTATAGTTTTTGTAGCTATTGTATATGCGATTGCCTTCTTGTTTTAT 4025

  3734322 TTTGTAGATTATTC 3734335
          ||||||||||||||
     4026 TTTGTAGATTATTC 4039

Alignment time is 4.88773 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [3722805,3748028] =>     25224 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [      1,   2589] =>      2589 nucs 'mol-32-30f6-110925_2589'

Score:        2589
Aligned:      2589        nucs
Identic:      2589 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [3730303,3732891]
 second seq =>  [      1,   2589]

  3730303 GACGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCG 3730362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GACGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCG 60

  3730363 CCTCGGCCTCCCAAGGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGTGCCCGGCATCCATCAT 3730422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCTCGGCCTCCCAAGGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGTGCCCGGCATCCATCAT 120

  3730423 TAATTTTTATTCCAAAGTATCTCCACACCTTAAGTGCCACAGAGGCAATAGGATGACAGA 3730482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TAATTTTTATTCCAAAGTATCTCCACACCTTAAGTGCCACAGAGGCAATAGGATGACAGA 180

  3730483 ATTTATTGTTTTCAAGAGCAATTGCTGACATTTCTATATTTATTGCTAGCTAAAATCCGA 3730542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATTTATTGTTTTCAAGAGCAATTGCTGACATTTCTATATTTATTGCTAGCTAAAATCCGA 240

  3730543 CGACTGGAGTTACTTGGTTCCCATGACTGAGCTTAAGCCAGGAAACCCTGCTTCCGGCCA 3730602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CGACTGGAGTTACTTGGTTCCCATGACTGAGCTTAAGCCAGGAAACCCTGCTTCCGGCCA 300

  3730603 CAACTATTTTCTTGTCAATTCCCAGCAGAGATGGACTCATATCAGACTCAACATTTTCCC 3730662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CAACTATTTTCTTGTCAATTCCCAGCAGAGATGGACTCATATCAGACTCAACATTTTCCC 360

  3730663 AGGTAATCGTGACATGGACTTATCACCAGTTCCATGGCTTCTTTATTTTATGTTGACATG 3730722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGGTAATCGTGACATGGACTTATCACCAGTTCCATGGCTTCTTTATTTTATGTTGACATG 420

  3730723 TTTATAAAATATAAAATGACTTGCTCTTTCCTTCTTGGTAATTGATCTCTCTAGCATTTC 3730782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTTATAAAATATAAAATGACTTGCTCTTTCCTTCTTGGTAATTGATCTCTCTAGCATTTC 480

  3730783 AGGATTGTAATTTCTCCTTTTTATGCTCTAGAAAATTCTTGTTTTAATCCACACATCAAT 3730842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGGATTGTAATTTCTCCTTTTTATGCTCTAGAAAATTCTTGTTTTAATCCACACATCAAT 540

  3730843 AGGTGGTTATTGAAAAATTATCAAGTAAATTAGGATGTGGTGGAACTAAGTTGTATTAGG 3730902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGGTGGTTATTGAAAAATTATCAAGTAAATTAGGATGTGGTGGAACTAAGTTGTATTAGG 600

  3730903 TTAGATAGATCCTAACTAGATTTCACAAGTATGTTATATTAGCAGCTGAAGTGGTATGTA 3730962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTAGATAGATCCTAACTAGATTTCACAAGTATGTTATATTAGCAGCTGAAGTGGTATGTA 660

  3730963 CAAATGACTCATTTTATTTTTTAATAGCTTTATTGTGATATAATTAACATGCAGTTCACC 3731022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CAAATGACTCATTTTATTTTTTAATAGCTTTATTGTGATATAATTAACATGCAGTTCACC 720

  3731023 CATTTGAAGTGTACAATCAATGATGTATAGCATATGCATAGACACGTGCAACCATCACCA 3731082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CATTTGAAGTGTACAATCAATGATGTATAGCATATGCATAGACACGTGCAACCATCACCA 780

  3731083 TACCTTTAGAACATTTTTATCATCTCAGAAAGAAACCCCATATCCTTTAGCTATCATCCC 3731142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TACCTTTAGAACATTTTTATCATCTCAGAAAGAAACCCCATATCCTTTAGCTATCATCCC 840

  3731143 TCATCTTCCCTATCCCAAAGCAACCACTAATTTGCTTTTTGTCTTGATAGTTTTGACTAT 3731202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCATCTTCCCTATCCCAAAGCAACCACTAATTTGCTTTTTGTCTTGATAGTTTTGACTAT 900

  3731203 TTTGGACATTTCATATAAGTAGGAATTATATAATATTGGTCTTTTGTGTCTGACTTTTTC 3731262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTTGGACATTTCATATAAGTAGGAATTATATAATATTGGTCTTTTGTGTCTGACTTTTTC 960

  3731263 CACTTAGTATAATGTTTTCAAGATTCATCCATGTTGTAACATGTATTAACACTTTCTTTC 3731322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CACTTAGTATAATGTTTTCAAGATTCATCCATGTTGTAACATGTATTAACACTTTCTTTC 1020

  3731323 TTTTTGTGTAAGGCTAATATAGGTTGAGCATCTCAAATCTGAAAGCCCCAAAATTTGAAA 3731382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTTTTGTGTAAGGCTAATATAGGTTGAGCATCTCAAATCTGAAAGCCCCAAAATTTGAAA 1080

  3731383 TGTTCCAAAATCCAAAACTTTTTGAGTGCTGACATGATGCTCAAAGGAAATGCTCACTGG 3731442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGTTCCAAAATCCAAAACTTTTTGAGTGCTGACATGATGCTCAAAGGAAATGCTCACTGG 1140

  3731443 AATATTTCAGATTTTGGATTTGGGACACTCTACCAGTAAGTATAATGCAAATATTTAAAA 3731502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AATATTTCAGATTTTGGATTTGGGACACTCTACCAGTAAGTATAATGCAAATATTTAAAA 1200

  3731503 AAACTGAAATCCAAACACTTCTGGTCTCAAGCATTTCAGATAAGGGATACTCAACCACTA 3731562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AAACTGAAATCCAAACACTTCTGGTCTCAAGCATTTCAGATAAGGGATACTCAACCACTA 1260

  3731563 CCACATTTTGTTTACCCGTTCATTAGTTGACAGACACTTGTTTCCATCTGCTGGCTATTT 3731622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CCACATTTTGTTTACCCGTTCATTAGTTGACAGACACTTGTTTCCATCTGCTGGCTATTT 1320

  3731623 TGAACAATGCTGCTGTAAACATTTGTGTACAAGATTTTGTGTGGATATATGCTTTCTTTT 3731682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGAACAATGCTGCTGTAAACATTTGTGTACAAGATTTTGTGTGGATATATGCTTTCTTTT 1380

  3731683 GTTGAGTGTATGCCTAAGACTGGACTTTCTGGGTCATATGATAACTCTGTGTTTAACTGT 3731742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GTTGAGTGTATGCCTAAGACTGGACTTTCTGGGTCATATGATAACTCTGTGTTTAACTGT 1440

  3731743 TTGAAGAATTACTAGGCTTTTCCGAAAGTGCTGCACTATTTTACATTCTTAACAGCCACG 3731802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTGAAGAATTACTAGGCTTTTCCGAAAGTGCTGCACTATTTTACATTCTTAACAGCCACG 1500

  3731803 TAAAGGAGTGCTGATTTCTCCCTGCCTTTCCCAGCACTCTCTGTCTTACTTTTTGTTTAT 3731862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TAAAGGAGTGCTGATTTCTCCCTGCCTTTCCCAGCACTCTCTGTCTTACTTTTTGTTTAT 1560

  3731863 AGTCATCCTAGTGGATGTGAGGTGGTGTCTCATTGTGGTTTTGATGTGCATTTCCCTGAT 3731922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AGTCATCCTAGTGGATGTGAGGTGGTGTCTCATTGTGGTTTTGATGTGCATTTCCCTGAT 1620

  3731923 GACTAATGAGGAGGAACATCTTTTCATATGTTTATTGGCCATTTGTATGTTTTATTTGGA 3731982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GACTAATGAGGAGGAACATCTTTTCATATGTTTATTGGCCATTTGTATGTTTTATTTGGA 1680

  3731983 AAAATTTCTCTTCAGATCTCTATTCACTTGTCTTAAATTTCAACAGGTTTTTGGGGGAAC 3732042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AAAATTTCTCTTCAGATCTCTATTCACTTGTCTTAAATTTCAACAGGTTTTTGGGGGAAC 1740

  3732043 AGGTGGTGTTTGGTTACATGGATAAGTTCTTTAGTGGTGATTTCTGAGATTTTGGTGCAC 3732102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AGGTGGTGTTTGGTTACATGGATAAGTTCTTTAGTGGTGATTTCTGAGATTTTGGTGCAC 1800

  3732103 CCATCACCAGAGCAGTGTACACTGTATCCAATGTGTAGCCTGTTATCCCTCACCCCCCAC 3732162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CCATCACCAGAGCAGTGTACACTGTATCCAATGTGTAGCCTGTTATCCCTCACCCCCCAC 1860

  3732163 CCTTCCCCACATTGTATCATTCTTATGTCTTTGCATCCTAATAGCTTAGCTCCCACTTAT 3732222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CCTTCCCCACATTGTATCATTCTTATGTCTTTGCATCCTAATAGCTTAGCTCCCACTTAT 1920

  3732223 AACTGAGAACATATGATGTTTGCTTTTCCATTCCTGAACTACTTCATTTAGAATAATGGT 3732282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AACTGAGAACATATGATGTTTGCTTTTCCATTCCTGAACTACTTCATTTAGAATAATGGT 1980

  3732283 CTCCAACTCCATCCAGGTTGCTGTGAATGCCATTATTTCATTCCTTTTTATGGCTGCATA 3732342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CTCCAACTCCATCCAGGTTGCTGTGAATGCCATTATTTCATTCCTTTTTATGGCTGCATA 2040

  3732343 GTATTCCATGGTATATGTATATATACCATATTTTCTTTTTTAAAATATTTTCAATTATGG 3732402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GTATTCCATGGTATATGTATATATACCATATTTTCTTTTTTAAAATATTTTCAATTATGG 2100

  3732403 GCACATAGTAGGTATATATATATTTATGGGGTACATGAAATGTTTTAACACAGGCATGCA 3732462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GCACATAGTAGGTATATATATATTTATGGGGTACATGAAATGTTTTAACACAGGCATGCA 2160

  3732463 ATGAATAATAATCACATCATGGAGAATGAGGTATCCATCCCCAATCCATTGTGTATATAT 3732522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ATGAATAATAATCACATCATGGAGAATGAGGTATCCATCCCCAATCCATTGTGTATATAT 2220

  3732523 ACCACTTTTAAAATCTATTCCTCTGTTAATGGGCACTTACTTTGATTTCATATTTTGGCT 3732582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ACCACTTTTAAAATCTATTCCTCTGTTAATGGGCACTTACTTTGATTTCATATTTTGGCT 2280

  3732583 GTGACATTGTAAACAGTGTCACAGTAAACTTGGAAGTGCAGATATCTCTTCAATATATTG 3732642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GTGACATTGTAAACAGTGTCACAGTAAACTTGGAAGTGCAGATATCTCTTCAATATATTG 2340

  3732643 ATTTACTTTCTTTTGGATATATACACAGTAGTGAGATTGCTGGATGAATCTATTGTTGTT 3732702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 ATTTACTTTCTTTTGGATATATACACAGTAGTGAGATTGCTGGATGAATCTATTGTTGTT 2400

  3732703 CTATTTTTAGTTTTTTGAGGAGTTTTCATAGTTTTCCATAGTGAGTGTACTAATTTACAT 3732762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CTATTTTTAGTTTTTTGAGGAGTTTTCATAGTTTTCCATAGTGAGTGTACTAATTTACAT 2460

  3732763 TCTCACCAATAGTGTACATGGGCTTCACTTTCTCCACATCCTCGCTAGCATCCACTATTC 3732822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TCTCACCAATAGTGTACATGGGCTTCACTTTCTCCACATCCTCGCTAGCATCCACTATTC 2520

  3732823 CCCCGTCTTTTTAAATAAAAGCGGTATTACTCTGCTCTCACGTTGCTATAAAGATACTAC 3732882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CCCCGTCTTTTTAAATAAAAGCGGTATTACTCTGCTCTCACGTTGCTATAAAGATACTAC 2580

  3732883 CTGAGACTG 3732891
          |||||||||
     2581 CTGAGACTG 2589

Alignment time is 2.57562 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [3722805,3748028] =>     25224 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [      1,   4153] =>      4153 nucs 'mol-32-3487-089304_4153'

Score:        4153
Aligned:      4153        nucs
Identic:      4153 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [3730304,3734456]
 second seq =>  [      1,   4153]

  3730304 ACGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGC 3730363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGC 60

  3730364 CTCGGCCTCCCAAGGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGTGCCCGGCATCCATCATT 3730423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTCGGCCTCCCAAGGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGTGCCCGGCATCCATCATT 120

  3730424 AATTTTTATTCCAAAGTATCTCCACACCTTAAGTGCCACAGAGGCAATAGGATGACAGAA 3730483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AATTTTTATTCCAAAGTATCTCCACACCTTAAGTGCCACAGAGGCAATAGGATGACAGAA 180

  3730484 TTTATTGTTTTCAAGAGCAATTGCTGACATTTCTATATTTATTGCTAGCTAAAATCCGAC 3730543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTTATTGTTTTCAAGAGCAATTGCTGACATTTCTATATTTATTGCTAGCTAAAATCCGAC 240

  3730544 GACTGGAGTTACTTGGTTCCCATGACTGAGCTTAAGCCAGGAAACCCTGCTTCCGGCCAC 3730603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GACTGGAGTTACTTGGTTCCCATGACTGAGCTTAAGCCAGGAAACCCTGCTTCCGGCCAC 300

  3730604 AACTATTTTCTTGTCAATTCCCAGCAGAGATGGACTCATATCAGACTCAACATTTTCCCA 3730663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AACTATTTTCTTGTCAATTCCCAGCAGAGATGGACTCATATCAGACTCAACATTTTCCCA 360

  3730664 GGTAATCGTGACATGGACTTATCACCAGTTCCATGGCTTCTTTATTTTATGTTGACATGT 3730723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGTAATCGTGACATGGACTTATCACCAGTTCCATGGCTTCTTTATTTTATGTTGACATGT 420

  3730724 TTATAAAATATAAAATGACTTGCTCTTTCCTTCTTGGTAATTGATCTCTCTAGCATTTCA 3730783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTATAAAATATAAAATGACTTGCTCTTTCCTTCTTGGTAATTGATCTCTCTAGCATTTCA 480

  3730784 GGATTGTAATTTCTCCTTTTTATGCTCTAGAAAATTCTTGTTTTAATCCACACATCAATA 3730843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GGATTGTAATTTCTCCTTTTTATGCTCTAGAAAATTCTTGTTTTAATCCACACATCAATA 540

  3730844 GGTGGTTATTGAAAAATTATCAAGTAAATTAGGATGTGGTGGAACTAAGTTGTATTAGGT 3730903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGTGGTTATTGAAAAATTATCAAGTAAATTAGGATGTGGTGGAACTAAGTTGTATTAGGT 600

  3730904 TAGATAGATCCTAACTAGATTTCACAAGTATGTTATATTAGCAGCTGAAGTGGTATGTAC 3730963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TAGATAGATCCTAACTAGATTTCACAAGTATGTTATATTAGCAGCTGAAGTGGTATGTAC 660

  3730964 AAATGACTCATTTTATTTTTTAATAGCTTTATTGTGATATAATTAACATGCAGTTCACCC 3731023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAATGACTCATTTTATTTTTTAATAGCTTTATTGTGATATAATTAACATGCAGTTCACCC 720

  3731024 ATTTGAAGTGTACAATCAATGATGTATAGCATATGCATAGACACGTGCAACCATCACCAT 3731083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATTTGAAGTGTACAATCAATGATGTATAGCATATGCATAGACACGTGCAACCATCACCAT 780

  3731084 ACCTTTAGAACATTTTTATCATCTCAGAAAGAAACCCCATATCCTTTAGCTATCATCCCT 3731143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ACCTTTAGAACATTTTTATCATCTCAGAAAGAAACCCCATATCCTTTAGCTATCATCCCT 840

  3731144 CATCTTCCCTATCCCAAAGCAACCACTAATTTGCTTTTTGTCTTGATAGTTTTGACTATT 3731203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CATCTTCCCTATCCCAAAGCAACCACTAATTTGCTTTTTGTCTTGATAGTTTTGACTATT 900

  3731204 TTGGACATTTCATATAAGTAGGAATTATATAATATTGGTCTTTTGTGTCTGACTTTTTCC 3731263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTGGACATTTCATATAAGTAGGAATTATATAATATTGGTCTTTTGTGTCTGACTTTTTCC 960

  3731264 ACTTAGTATAATGTTTTCAAGATTCATCCATGTTGTAACATGTATTAACACTTTCTTTCT 3731323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ACTTAGTATAATGTTTTCAAGATTCATCCATGTTGTAACATGTATTAACACTTTCTTTCT 1020

  3731324 TTTTGTGTAAGGCTAATATAGGTTGAGCATCTCAAATCTGAAAGCCCCAAAATTTGAAAT 3731383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTTTGTGTAAGGCTAATATAGGTTGAGCATCTCAAATCTGAAAGCCCCAAAATTTGAAAT 1080

  3731384 GTTCCAAAATCCAAAACTTTTTGAGTGCTGACATGATGCTCAAAGGAAATGCTCACTGGA 3731443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GTTCCAAAATCCAAAACTTTTTGAGTGCTGACATGATGCTCAAAGGAAATGCTCACTGGA 1140

  3731444 ATATTTCAGATTTTGGATTTGGGACACTCTACCAGTAAGTATAATGCAAATATTTAAAAA 3731503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATATTTCAGATTTTGGATTTGGGACACTCTACCAGTAAGTATAATGCAAATATTTAAAAA 1200

  3731504 AACTGAAATCCAAACACTTCTGGTCTCAAGCATTTCAGATAAGGGATACTCAACCACTAC 3731563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AACTGAAATCCAAACACTTCTGGTCTCAAGCATTTCAGATAAGGGATACTCAACCACTAC 1260

  3731564 CACATTTTGTTTACCCGTTCATTAGTTGACAGACACTTGTTTCCATCTGCTGGCTATTTT 3731623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CACATTTTGTTTACCCGTTCATTAGTTGACAGACACTTGTTTCCATCTGCTGGCTATTTT 1320

  3731624 GAACAATGCTGCTGTAAACATTTGTGTACAAGATTTTGTGTGGATATATGCTTTCTTTTG 3731683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GAACAATGCTGCTGTAAACATTTGTGTACAAGATTTTGTGTGGATATATGCTTTCTTTTG 1380

  3731684 TTGAGTGTATGCCTAAGACTGGACTTTCTGGGTCATATGATAACTCTGTGTTTAACTGTT 3731743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTGAGTGTATGCCTAAGACTGGACTTTCTGGGTCATATGATAACTCTGTGTTTAACTGTT 1440

  3731744 TGAAGAATTACTAGGCTTTTCCGAAAGTGCTGCACTATTTTACATTCTTAACAGCCACGT 3731803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TGAAGAATTACTAGGCTTTTCCGAAAGTGCTGCACTATTTTACATTCTTAACAGCCACGT 1500

  3731804 AAAGGAGTGCTGATTTCTCCCTGCCTTTCCCAGCACTCTCTGTCTTACTTTTTGTTTATA 3731863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AAAGGAGTGCTGATTTCTCCCTGCCTTTCCCAGCACTCTCTGTCTTACTTTTTGTTTATA 1560

  3731864 GTCATCCTAGTGGATGTGAGGTGGTGTCTCATTGTGGTTTTGATGTGCATTTCCCTGATG 3731923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GTCATCCTAGTGGATGTGAGGTGGTGTCTCATTGTGGTTTTGATGTGCATTTCCCTGATG 1620

  3731924 ACTAATGAGGAGGAACATCTTTTCATATGTTTATTGGCCATTTGTATGTTTTATTTGGAA 3731983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ACTAATGAGGAGGAACATCTTTTCATATGTTTATTGGCCATTTGTATGTTTTATTTGGAA 1680

  3731984 AAATTTCTCTTCAGATCTCTATTCACTTGTCTTAAATTTCAACAGGTTTTTGGGGGAACA 3732043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AAATTTCTCTTCAGATCTCTATTCACTTGTCTTAAATTTCAACAGGTTTTTGGGGGAACA 1740

  3732044 GGTGGTGTTTGGTTACATGGATAAGTTCTTTAGTGGTGATTTCTGAGATTTTGGTGCACC 3732103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GGTGGTGTTTGGTTACATGGATAAGTTCTTTAGTGGTGATTTCTGAGATTTTGGTGCACC 1800

  3732104 CATCACCAGAGCAGTGTACACTGTATCCAATGTGTAGCCTGTTATCCCTCACCCCCCACC 3732163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CATCACCAGAGCAGTGTACACTGTATCCAATGTGTAGCCTGTTATCCCTCACCCCCCACC 1860

  3732164 CTTCCCCACATTGTATCATTCTTATGTCTTTGCATCCTAATAGCTTAGCTCCCACTTATA 3732223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CTTCCCCACATTGTATCATTCTTATGTCTTTGCATCCTAATAGCTTAGCTCCCACTTATA 1920

  3732224 ACTGAGAACATATGATGTTTGCTTTTCCATTCCTGAACTACTTCATTTAGAATAATGGTC 3732283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ACTGAGAACATATGATGTTTGCTTTTCCATTCCTGAACTACTTCATTTAGAATAATGGTC 1980

  3732284 TCCAACTCCATCCAGGTTGCTGTGAATGCCATTATTTCATTCCTTTTTATGGCTGCATAG 3732343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TCCAACTCCATCCAGGTTGCTGTGAATGCCATTATTTCATTCCTTTTTATGGCTGCATAG 2040

  3732344 TATTCCATGGTATATGTATATATACCATATTTTCTTTTTTAAAATATTTTCAATTATGGG 3732403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TATTCCATGGTATATGTATATATACCATATTTTCTTTTTTAAAATATTTTCAATTATGGG 2100

  3732404 CACATAGTAGGTATATATATATTTATGGGGTACATGAAATGTTTTAACACAGGCATGCAA 3732463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CACATAGTAGGTATATATATATTTATGGGGTACATGAAATGTTTTAACACAGGCATGCAA 2160

  3732464 TGAATAATAATCACATCATGGAGAATGAGGTATCCATCCCCAATCCATTGTGTATATATA 3732523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TGAATAATAATCACATCATGGAGAATGAGGTATCCATCCCCAATCCATTGTGTATATATA 2220

  3732524 CCACTTTTAAAATCTATTCCTCTGTTAATGGGCACTTACTTTGATTTCATATTTTGGCTG 3732583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CCACTTTTAAAATCTATTCCTCTGTTAATGGGCACTTACTTTGATTTCATATTTTGGCTG 2280

  3732584 TGACATTGTAAACAGTGTCACAGTAAACTTGGAAGTGCAGATATCTCTTCAATATATTGA 3732643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TGACATTGTAAACAGTGTCACAGTAAACTTGGAAGTGCAGATATCTCTTCAATATATTGA 2340

  3732644 TTTACTTTCTTTTGGATATATACACAGTAGTGAGATTGCTGGATGAATCTATTGTTGTTC 3732703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TTTACTTTCTTTTGGATATATACACAGTAGTGAGATTGCTGGATGAATCTATTGTTGTTC 2400

  3732704 TATTTTTAGTTTTTTGAGGAGTTTTCATAGTTTTCCATAGTGAGTGTACTAATTTACATT 3732763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TATTTTTAGTTTTTTGAGGAGTTTTCATAGTTTTCCATAGTGAGTGTACTAATTTACATT 2460

  3732764 CTCACCAATAGTGTACATGGGCTTCACTTTCTCCACATCCTCGCTAGCATCCACTATTCC 3732823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CTCACCAATAGTGTACATGGGCTTCACTTTCTCCACATCCTCGCTAGCATCCACTATTCC 2520

  3732824 CCCGTCTTTTTAAATAAAAGCGGTATTACTCTGCTCTCACGTTGCTATAAAGATACTACC 3732883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CCCGTCTTTTTAAATAAAAGCGGTATTACTCTGCTCTCACGTTGCTATAAAGATACTACC 2580

  3732884 TGAGACTGGGTAACTTACAAACAAAAGAGGTTTAATTAACTCACAGTTCTACATGACTGG 3732943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TGAGACTGGGTAACTTACAAACAAAAGAGGTTTAATTAACTCACAGTTCTACATGACTGG 2640

  3732944 GGAGGCCTCAGGAAACTTACAATCATGGCAGAAAGAGAAGGCGAAGCAAGGCATGTCTTA 3733003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GGAGGCCTCAGGAAACTTACAATCATGGCAGAAAGAGAAGGCGAAGCAAGGCATGTCTTA 2700

  3733004 CATGGCAGCAGGATCGAGAGAGAGAGAGAGAGACAGAGAGAGAGAGAGACAGAGACAGAC 3733063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CATGGCAGCAGGATCGAGAGAGAGAGAGAGAGACAGAGAGAGAGAGAGACAGAGACAGAC 2760

  3733064 AGACAGAGAGAGACAGAGAAAGGGGGAAGAGCCACTTTTAAACATCAGATCTCACAAGAA 3733123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 AGACAGAGAGAGACAGAGAAAGGGGGAAGAGCCACTTTTAAACATCAGATCTCACAAGAA 2820

  3733124 CTCCCTATCAGAAGAACAGCATGGGGAAAACCACCCCATCATCCAATCACCTCTAAGCAG 3733183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CTCCCTATCAGAAGAACAGCATGGGGAAAACCACCCCATCATCCAATCACCTCTAAGCAG 2880

  3733184 GTCCCTCCCTGGACATGTGGGGATTACAATTAGAGATGAGGTTTGAGTGGGGATACAGAA 3733243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 GTCCCTCCCTGGACATGTGGGGATTACAATTAGAGATGAGGTTTGAGTGGGGATACAGAA 2940

  3733244 CCAGACCATGTCAAAAGCCATTTCAACTGAGGTGGTATGACATTTCATTGTGGTTTTGAG 3733303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CCAGACCATGTCAAAAGCCATTTCAACTGAGGTGGTATGACATTTCATTGTGGTTTTGAG 3000

  3733304 TTGCATTTTTCTGATGATTAGAGATGTTGAGCATTTAAAAAATATACCTGTTGCCCATTT 3733363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TTGCATTTTTCTGATGATTAGAGATGTTGAGCATTTAAAAAATATACCTGTTGCCCATTT 3060

  3733364 GTATGCCTTCTTTTGAGAAATATCTATTCAGAACTTTTGCCCATTTATAAATTATTTTTT 3733423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 GTATGCCTTCTTTTGAGAAATATCTATTCAGAACTTTTGCCCATTTATAAATTATTTTTT 3120

  3733424 TTGCTACTGAGTTGTTAGCTATTGAGTTGTCCTTATATATTCTTGTTATTAATCCCTTCT 3733483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TTGCTACTGAGTTGTTAGCTATTGAGTTGTCCTTATATATTCTTGTTATTAATCCCTTCT 3180

  3733484 TAGATGGATAGTTTGCAAATATATTTTTTTCCAACTCTATGGGTTGTCACTCCACTTTGT 3733543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TAGATGGATAGTTTGCAAATATATTTTTTTCCAACTCTATGGGTTGTCACTCCACTTTGT 3240

  3733544 TATTTCCTTTGACAGCAGCCTTTTAGCTTGATGTAATCCCATTTGTCTGTTTTTCCTGTT 3733603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TATTTCCTTTGACAGCAGCCTTTTAGCTTGATGTAATCCCATTTGTCTGTTTTTCCTGTT 3300

  3733604 GTTGCCTGTGCTTTTGAGGTCTTACACACAAATATTTGCCAAGACCAATGTCCTAGAGCA 3733663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 GTTGCCTGTGCTTTTGAGGTCTTACACACAAATATTTGCCAAGACCAATGTCCTAGAGCA 3360

  3733664 TTTCCCCAAGGTTTTCTTCTAGAATGTTCATAGTTTTAGGTCTTAGATTTAAGTTTTTCA 3733723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TTTCCCCAAGGTTTTCTTCTAGAATGTTCATAGTTTTAGGTCTTAGATTTAAGTTTTTCA 3420

  3733724 TCCATTTTGATTTCATTTTGCATAAGGTGAGAGATAGGAGTCTAGTTTCATTCTTCGGCA 3733783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TCCATTTTGATTTCATTTTGCATAAGGTGAGAGATAGGAGTCTAGTTTCATTCTTCGGCA 3480

  3733784 TGCAGTTATCTAGTTTCCCCAGCACCATTTACTGAAGAGACTGTTCCCCATTGCGTGTTC 3733843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TGCAGTTATCTAGTTTCCCCAGCACCATTTACTGAAGAGACTGTTCCCCATTGCGTGTTC 3540

  3733844 TTGGTGCCTTTATTGAGAATGAGTTGGCTGTAAATGTGTTGATTTATATCTGGGTTCTCT 3733903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 TTGGTGCCTTTATTGAGAATGAGTTGGCTGTAAATGTGTTGATTTATATCTGGGTTCTCT 3600

  3733904 ATTGTGTTGTCTGTTTTTATGCCATAACCATTCTGATTTGCTTATATAGCTTCATAGTAC 3733963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 ATTGTGTTGTCTGTTTTTATGCCATAACCATTCTGATTTGCTTATATAGCTTCATAGTAC 3660

  3733964 ATTTTGAAGTCAGGTAGTGTGATGCCTTCAGCTTTGTTTTTTTGCTTTGGTTATTCAGGG 3734023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 ATTTTGAAGTCAGGTAGTGTGATGCCTTCAGCTTTGTTTTTTTGCTTTGGTTATTCAGGG 3720

  3734024 TCTTTCATTTAAATTTTACTTTTTAAAAATATTTCTGAGAAGAATATCATTGGTATTTTA 3734083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 TCTTTCATTTAAATTTTACTTTTTAAAAATATTTCTGAGAAGAATATCATTGGTATTTTA 3780

  3734084 ATAGGGATTGAATTGAATCTGTAAATTGCTTTGGATAGTACTGTCATTTTAACAATATTA 3734143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 ATAGGGATTGAATTGAATCTGTAAATTGCTTTGGATAGTACTGTCATTTTAACAATATTA 3840

  3734144 ATTCTTTCAATCTAGGAGCACGGAACATCTTTCCATTTTTTCTGTGTCCTCTTCAATATA 3734203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 ATTCTTTCAATCTAGGAGCACGGAACATCTTTCCATTTTTTCTGTGTCCTCTTCAATATA 3900

  3734204 TTTCACCAGTGTTTTATAGTTTTCCTTGTATAGCTCTTTCACTTCGTAGGATAAATGGAT 3734263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 TTTCACCAGTGTTTTATAGTTTTCCTTGTATAGCTCTTTCACTTCGTAGGATAAATGGAT 3960

  3734264 TCCTCAGTATTTTATAGTTTTTGTAGCTATTGTATATGCGATTGCCTTCTTGTTTTATTT 3734323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 TCCTCAGTATTTTATAGTTTTTGTAGCTATTGTATATGCGATTGCCTTCTTGTTTTATTT 4020

  3734324 TGTAGATTATTCACTGTTGGTGTGTATAAATGCTACTGACTTTTGTATGTTGAATTTGTA 3734383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 TGTAGATTATTCACTGTTGGTGTGTATAAATGCTACTGACTTTTGTATGTTGAATTTGTA 4080

  3734384 TCCTGAAAATCTACTGAATTAGTTTATCAGTTCTAATAGTTTTTGGGTGGAGTCTAGGTT 3734443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 TCCTGAAAATCTACTGAATTAGTTTATCAGTTCTAATAGTTTTTGGGTGGAGTCTAGGTT 4140

  3734444 TTTCTAAGTATAA 3734456
          |||||||||||||
     4141 TTTCTAAGTATAA 4153

Alignment time is 3.97639 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [3722805,3748028] =>     25224 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [      1,   6737] =>      6737 nucs 'mol-32-34be-076645_6737'

Score:        6720
Aligned:      6731        nucs
Identic:      6730 (100%) nucs =>        18 (100%)      6712 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [3724545,3724562] EXCISED REGION [3730302,3737014]
 second seq =>  [      7,     24] EXCISED REGION [     25,   6737]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      5739 nucs [3724563,3730301]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [3724563,3724565] to [3730302,3730304]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [3724561,3724562] to [3730302,3730303]
 second seq =>         2 nucs [23,24] to [25,26]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  3724545 TTTTTGTATTTTTAGTAG 3724562
          ||||||||||||||||||
        7 TTTTTGTATTTTTAGTAG 24

EXCISED REGION

  3730302 AGACGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCC 3730361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       25 AGACGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCC 84

  3730362 GCCTCGGCCTCCCAAGGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGTGCCCGGCATCCATCA 3730421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       85 GCCTCGGCCTCCCAAGGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGTGCCCGGCATCCATCA 144

  3730422 TTAATTTTTATTCCAAAGTATCTCCACACCTTAAGTGCCACAGAGGCAATAGGATGACAG 3730481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      145 TTAATTTTTATTCCAAAGTATCTCCACACCTTAAGTGCCACAGAGGCAATAGGATGACAG 204

  3730482 AATTTATTGTTTTCAAGAGCAATTGCTGACATTTCTATATTTATTGCTAGCTAAAATCCG 3730541
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
      205 AATTTATTGTTTTCAAGAGCAATTGCTAACATTTCTATATTTATTGCTAGCTAAAATCCG 264

  3730542 ACGACTGGAGTTACTTGGTTCCCATGACTGAGCTTAAGCCAGGAAACCCTGCTTCCGGCC 3730601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      265 ACGACTGGAGTTACTTGGTTCCCATGACTGAGCTTAAGCCAGGAAACCCTGCTTCCGGCC 324

  3730602 ACAACTATTTTCTTGTCAATTCCCAGCAGAGATGGACTCATATCAGACTCAACATTTTCC 3730661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      325 ACAACTATTTTCTTGTCAATTCCCAGCAGAGATGGACTCATATCAGACTCAACATTTTCC 384

  3730662 CAGGTAATCGTGACATGGACTTATCACCAGTTCCATGGCTTCTTTATTTTATGTTGACAT 3730721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      385 CAGGTAATCGTGACATGGACTTATCACCAGTTCCATGGCTTCTTTATTTTATGTTGACAT 444

  3730722 GTTTATAAAATATAAAATGACTTGCTCTTTCCTTCTTGGTAATTGATCTCTCTAGCATTT 3730781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      445 GTTTATAAAATATAAAATGACTTGCTCTTTCCTTCTTGGTAATTGATCTCTCTAGCATTT 504

  3730782 CAGGATTGTAATTTCTCCTTTTTATGCTCTAGAAAATTCTTGTTTTAATCCACACATCAA 3730841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      505 CAGGATTGTAATTTCTCCTTTTTATGCTCTAGAAAATTCTTGTTTTAATCCACACATCAA 564

  3730842 TAGGTGGTTATTGAAAAATTATCAAGTAAATTAGGATGTGGTGGAACTAAGTTGTATTAG 3730901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      565 TAGGTGGTTATTGAAAAATTATCAAGTAAATTAGGATGTGGTGGAACTAAGTTGTATTAG 624

  3730902 GTTAGATAGATCCTAACTAGATTTCACAAGTATGTTATATTAGCAGCTGAAGTGGTATGT 3730961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      625 GTTAGATAGATCCTAACTAGATTTCACAAGTATGTTATATTAGCAGCTGAAGTGGTATGT 684

  3730962 ACAAATGACTCATTTTATTTTTTAATAGCTTTATTGTGATATAATTAACATGCAGTTCAC 3731021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      685 ACAAATGACTCATTTTATTTTTTAATAGCTTTATTGTGATATAATTAACATGCAGTTCAC 744

  3731022 CCATTTGAAGTGTACAATCAATGATGTATAGCATATGCATAGACACGTGCAACCATCACC 3731081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      745 CCATTTGAAGTGTACAATCAATGATGTATAGCATATGCATAGACACGTGCAACCATCACC 804

  3731082 ATACCTTTAGAACATTTTTATCATCTCAGAAAGAAACCCCATATCCTTTAGCTATCATCC 3731141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      805 ATACCTTTAGAACATTTTTATCATCTCAGAAAGAAACCCCATATCCTTTAGCTATCATCC 864

  3731142 CTCATCTTCCCTATCCCAAAGCAACCACTAATTTGCTTTTTGTCTTGATAGTTTTGACTA 3731201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      865 CTCATCTTCCCTATCCCAAAGCAACCACTAATTTGCTTTTTGTCTTGATAGTTTTGACTA 924

  3731202 TTTTGGACATTTCATATAAGTAGGAATTATATAATATTGGTCTTTTGTGTCTGACTTTTT 3731261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      925 TTTTGGACATTTCATATAAGTAGGAATTATATAATATTGGTCTTTTGTGTCTGACTTTTT 984

  3731262 CCACTTAGTATAATGTTTTCAAGATTCATCCATGTTGTAACATGTATTAACACTTTCTTT 3731321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      985 CCACTTAGTATAATGTTTTCAAGATTCATCCATGTTGTAACATGTATTAACACTTTCTTT 1044

  3731322 CTTTTTGTGTAAGGCTAATATAGGTTGAGCATCTCAAATCTGAAAGCCCCAAAATTTGAA 3731381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1045 CTTTTTGTGTAAGGCTAATATAGGTTGAGCATCTCAAATCTGAAAGCCCCAAAATTTGAA 1104

  3731382 ATGTTCCAAAATCCAAAACTTTTTGAGTGCTGACATGATGCTCAAAGGAAATGCTCACTG 3731441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1105 ATGTTCCAAAATCCAAAACTTTTTGAGTGCTGACATGATGCTCAAAGGAAATGCTCACTG 1164

  3731442 GAATATTTCAGATTTTGGATTTGGGACACTCTACCAGTAAGTATAATGCAAATATTTAAA 3731501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1165 GAATATTTCAGATTTTGGATTTGGGACACTCTACCAGTAAGTATAATGCAAATATTTAAA 1224

  3731502 AAAACTGAAATCCAAACACTTCTGGTCTCAAGCATTTCAGATAAGGGATACTCAACCACT 3731561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1225 AAAACTGAAATCCAAACACTTCTGGTCTCAAGCATTTCAGATAAGGGATACTCAACCACT 1284

  3731562 ACCACATTTTGTTTACCCGTTCATTAGTTGACAGACACTTGTTTCCATCTGCTGGCTATT 3731621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1285 ACCACATTTTGTTTACCCGTTCATTAGTTGACAGACACTTGTTTCCATCTGCTGGCTATT 1344

  3731622 TTGAACAATGCTGCTGTAAACATTTGTGTACAAGATTTTGTGTGGATATATGCTTTCTTT 3731681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1345 TTGAACAATGCTGCTGTAAACATTTGTGTACAAGATTTTGTGTGGATATATGCTTTCTTT 1404

  3731682 TGTTGAGTGTATGCCTAAGACTGGACTTTCTGGGTCATATGATAACTCTGTGTTTAACTG 3731741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1405 TGTTGAGTGTATGCCTAAGACTGGACTTTCTGGGTCATATGATAACTCTGTGTTTAACTG 1464

  3731742 TTTGAAGAATTACTAGGCTTTTCCGAAAGTGCTGCACTATTTTACATTCTTAACAGCCAC 3731801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1465 TTTGAAGAATTACTAGGCTTTTCCGAAAGTGCTGCACTATTTTACATTCTTAACAGCCAC 1524

  3731802 GTAAAGGAGTGCTGATTTCTCCCTGCCTTTCCCAGCACTCTCTGTCTTACTTTTTGTTTA 3731861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1525 GTAAAGGAGTGCTGATTTCTCCCTGCCTTTCCCAGCACTCTCTGTCTTACTTTTTGTTTA 1584

  3731862 TAGTCATCCTAGTGGATGTGAGGTGGTGTCTCATTGTGGTTTTGATGTGCATTTCCCTGA 3731921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1585 TAGTCATCCTAGTGGATGTGAGGTGGTGTCTCATTGTGGTTTTGATGTGCATTTCCCTGA 1644

  3731922 TGACTAATGAGGAGGAACATCTTTTCATATGTTTATTGGCCATTTGTATGTTTTATTTGG 3731981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1645 TGACTAATGAGGAGGAACATCTTTTCATATGTTTATTGGCCATTTGTATGTTTTATTTGG 1704

  3731982 AAAAATTTCTCTTCAGATCTCTATTCACTTGTCTTAAATTTCAACAGGTTTTTGGGGGAA 3732041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1705 AAAAATTTCTCTTCAGATCTCTATTCACTTGTCTTAAATTTCAACAGGTTTTTGGGGGAA 1764

  3732042 CAGGTGGTGTTTGGTTACATGGATAAGTTCTTTAGTGGTGATTTCTGAGATTTTGGTGCA 3732101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1765 CAGGTGGTGTTTGGTTACATGGATAAGTTCTTTAGTGGTGATTTCTGAGATTTTGGTGCA 1824

  3732102 CCCATCACCAGAGCAGTGTACACTGTATCCAATGTGTAGCCTGTTATCCCTCACCCCCCA 3732161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1825 CCCATCACCAGAGCAGTGTACACTGTATCCAATGTGTAGCCTGTTATCCCTCACCCCCCA 1884

  3732162 CCCTTCCCCACATTGTATCATTCTTATGTCTTTGCATCCTAATAGCTTAGCTCCCACTTA 3732221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1885 CCCTTCCCCACATTGTATCATTCTTATGTCTTTGCATCCTAATAGCTTAGCTCCCACTTA 1944

  3732222 TAACTGAGAACATATGATGTTTGCTTTTCCATTCCTGAACTACTTCATTTAGAATAATGG 3732281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1945 TAACTGAGAACATATGATGTTTGCTTTTCCATTCCTGAACTACTTCATTTAGAATAATGG 2004

  3732282 TCTCCAACTCCATCCAGGTTGCTGTGAATGCCATTATTTCATTCCTTTTTATGGCTGCAT 3732341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2005 TCTCCAACTCCATCCAGGTTGCTGTGAATGCCATTATTTCATTCCTTTTTATGGCTGCAT 2064

  3732342 AGTATTCCATGGTATATGTATATATACCATATTTTCTTTTTTAAAATATTTTCAATTATG 3732401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2065 AGTATTCCATGGTATATGTATATATACCATATTTTCTTTTTTAAAATATTTTCAATTATG 2124

  3732402 GGCACATAGTAGGTATATATATATTTATGGGGTACATGAAATGTTTTAACACAGGCATGC 3732461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2125 GGCACATAGTAGGTATATATATATTTATGGGGTACATGAAATGTTTTAACACAGGCATGC 2184

  3732462 AATGAATAATAATCACATCATGGAGAATGAGGTATCCATCCCCAATCCATTGTGTATATA 3732521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2185 AATGAATAATAATCACATCATGGAGAATGAGGTATCCATCCCCAATCCATTGTGTATATA 2244

  3732522 TACCACTTTTAAAATCTATTCCTCTGTTAATGGGCACTTACTTTGATTTCATATTTTGGC 3732581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2245 TACCACTTTTAAAATCTATTCCTCTGTTAATGGGCACTTACTTTGATTTCATATTTTGGC 2304

  3732582 TGTGACATTGTAAACAGTGTCACAGTAAACTTGGAAGTGCAGATATCTCTTCAATATATT 3732641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2305 TGTGACATTGTAAACAGTGTCACAGTAAACTTGGAAGTGCAGATATCTCTTCAATATATT 2364

  3732642 GATTTACTTTCTTTTGGATATATACACAGTAGTGAGATTGCTGGATGAATCTATTGTTGT 3732701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2365 GATTTACTTTCTTTTGGATATATACACAGTAGTGAGATTGCTGGATGAATCTATTGTTGT 2424

  3732702 TCTATTTTTAGTTTTTTGAGGAGTTTTCATAGTTTTCCATAGTGAGTGTACTAATTTACA 3732761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2425 TCTATTTTTAGTTTTTTGAGGAGTTTTCATAGTTTTCCATAGTGAGTGTACTAATTTACA 2484

  3732762 TTCTCACCAATAGTGTACATGGGCTTCACTTTCTCCACATCCTCGCTAGCATCCACTATT 3732821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2485 TTCTCACCAATAGTGTACATGGGCTTCACTTTCTCCACATCCTCGCTAGCATCCACTATT 2544

  3732822 CCCCCGTCTTTTTAAATAAAAGCGGTATTACTCTGCTCTCACGTTGCTATAAAGATACTA 3732881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2545 CCCCCGTCTTTTTAAATAAAAGCGGTATTACTCTGCTCTCACGTTGCTATAAAGATACTA 2604

  3732882 CCTGAGACTGGGTAACTTACAAACAAAAGAGGTTTAATTAACTCACAGTTCTACATGACT 3732941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2605 CCTGAGACTGGGTAACTTACAAACAAAAGAGGTTTAATTAACTCACAGTTCTACATGACT 2664

  3732942 GGGGAGGCCTCAGGAAACTTACAATCATGGCAGAAAGAGAAGGCGAAGCAAGGCATGTCT 3733001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2665 GGGGAGGCCTCAGGAAACTTACAATCATGGCAGAAAGAGAAGGCGAAGCAAGGCATGTCT 2724

  3733002 TACATGGCAGCAGGATCGAGAGAGAGAGAGAGAGACAGAGAGAGAGAGAGACAGAGACAG 3733061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2725 TACATGGCAGCAGGATCGAGAGAGAGAGAGAGAGACAGAGAGAGAGAGAGACAGAGACAG 2784

  3733062 ACAGACAGAGAGAGACAGAGAAAGGGGGAAGAGCCACTTTTAAACATCAGATCTCACAAG 3733121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2785 ACAGACAGAGAGAGACAGAGAAAGGGGGAAGAGCCACTTTTAAACATCAGATCTCACAAG 2844

  3733122 AACTCCCTATCAGAAGAACAGCATGGGGAAAACCACCCCATCATCCAATCACCTCTAAGC 3733181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2845 AACTCCCTATCAGAAGAACAGCATGGGGAAAACCACCCCATCATCCAATCACCTCTAAGC 2904

  3733182 AGGTCCCTCCCTGGACATGTGGGGATTACAATTAGAGATGAGGTTTGAGTGGGGATACAG 3733241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2905 AGGTCCCTCCCTGGACATGTGGGGATTACAATTAGAGATGAGGTTTGAGTGGGGATACAG 2964

  3733242 AACCAGACCATGTCAAAAGCCATTTCAACTGAGGTGGTATGACATTTCATTGTGGTTTTG 3733301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2965 AACCAGACCATGTCAAAAGCCATTTCAACTGAGGTGGTATGACATTTCATTGTGGTTTTG 3024

  3733302 AGTTGCATTTTTCTGATGATTAGAGATGTTGAGCATTTAAAAAATATACCTGTTGCCCAT 3733361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3025 AGTTGCATTTTTCTGATGATTAGAGATGTTGAGCATTTAAAAAATATACCTGTTGCCCAT 3084

  3733362 TTGTATGCCTTCTTTTGAGAAATATCTATTCAGAACTTTTGCCCATTTATAAATTATTTT 3733421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3085 TTGTATGCCTTCTTTTGAGAAATATCTATTCAGAACTTTTGCCCATTTATAAATTATTTT 3144

  3733422 TTTTGCTACTGAGTTGTTAGCTATTGAGTTGTCCTTATATATTCTTGTTATTAATCCCTT 3733481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3145 TTTTGCTACTGAGTTGTTAGCTATTGAGTTGTCCTTATATATTCTTGTTATTAATCCCTT 3204

  3733482 CTTAGATGGATAGTTTGCAAATATATTTTTTTCCAACTCTATGGGTTGTCACTCCACTTT 3733541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3205 CTTAGATGGATAGTTTGCAAATATATTTTTTTCCAACTCTATGGGTTGTCACTCCACTTT 3264

  3733542 GTTATTTCCTTTGACAGCAGCCTTTTAGCTTGATGTAATCCCATTTGTCTGTTTTTCCTG 3733601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3265 GTTATTTCCTTTGACAGCAGCCTTTTAGCTTGATGTAATCCCATTTGTCTGTTTTTCCTG 3324

  3733602 TTGTTGCCTGTGCTTTTGAGGTCTTACACACAAATATTTGCCAAGACCAATGTCCTAGAG 3733661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3325 TTGTTGCCTGTGCTTTTGAGGTCTTACACACAAATATTTGCCAAGACCAATGTCCTAGAG 3384

  3733662 CATTTCCCCAAGGTTTTCTTCTAGAATGTTCATAGTTTTAGGTCTTAGATTTAAGTTTTT 3733721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3385 CATTTCCCCAAGGTTTTCTTCTAGAATGTTCATAGTTTTAGGTCTTAGATTTAAGTTTTT 3444

  3733722 CATCCATTTTGATTTCATTTTGCATAAGGTGAGAGATAGGAGTCTAGTTTCATTCTTCGG 3733781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3445 CATCCATTTTGATTTCATTTTGCATAAGGTGAGAGATAGGAGTCTAGTTTCATTCTTCGG 3504

  3733782 CATGCAGTTATCTAGTTTCCCCAGCACCATTTACTGAAGAGACTGTTCCCCATTGCGTGT 3733841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3505 CATGCAGTTATCTAGTTTCCCCAGCACCATTTACTGAAGAGACTGTTCCCCATTGCGTGT 3564

  3733842 TCTTGGTGCCTTTATTGAGAATGAGTTGGCTGTAAATGTGTTGATTTATATCTGGGTTCT 3733901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3565 TCTTGGTGCCTTTATTGAGAATGAGTTGGCTGTAAATGTGTTGATTTATATCTGGGTTCT 3624

  3733902 CTATTGTGTTGTCTGTTTTTATGCCATAACCATTCTGATTTGCTTATATAGCTTCATAGT 3733961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3625 CTATTGTGTTGTCTGTTTTTATGCCATAACCATTCTGATTTGCTTATATAGCTTCATAGT 3684

  3733962 ACATTTTGAAGTCAGGTAGTGTGATGCCTTCAGCTTTGTTTTTTTGCTTTGGTTATTCAG 3734021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3685 ACATTTTGAAGTCAGGTAGTGTGATGCCTTCAGCTTTGTTTTTTTGCTTTGGTTATTCAG 3744

  3734022 GGTCTTTCATTTAAATTTTACTTTTTAAAAATATTTCTGAGAAGAATATCATTGGTATTT 3734081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3745 GGTCTTTCATTTAAATTTTACTTTTTAAAAATATTTCTGAGAAGAATATCATTGGTATTT 3804

  3734082 TAATAGGGATTGAATTGAATCTGTAAATTGCTTTGGATAGTACTGTCATTTTAACAATAT 3734141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3805 TAATAGGGATTGAATTGAATCTGTAAATTGCTTTGGATAGTACTGTCATTTTAACAATAT 3864

  3734142 TAATTCTTTCAATCTAGGAGCACGGAACATCTTTCCATTTTTTCTGTGTCCTCTTCAATA 3734201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3865 TAATTCTTTCAATCTAGGAGCACGGAACATCTTTCCATTTTTTCTGTGTCCTCTTCAATA 3924

  3734202 TATTTCACCAGTGTTTTATAGTTTTCCTTGTATAGCTCTTTCACTTCGTAGGATAAATGG 3734261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3925 TATTTCACCAGTGTTTTATAGTTTTCCTTGTATAGCTCTTTCACTTCGTAGGATAAATGG 3984

  3734262 ATTCCTCAGTATTTTATAGTTTTTGTAGCTATTGTATATGCGATTGCCTTCTTGTTTTAT 3734321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3985 ATTCCTCAGTATTTTATAGTTTTTGTAGCTATTGTATATGCGATTGCCTTCTTGTTTTAT 4044

  3734322 TTTGTAGATTATTCACTGTTGGTGTGTATAAATGCTACTGACTTTTGTATGTTGAATTTG 3734381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4045 TTTGTAGATTATTCACTGTTGGTGTGTATAAATGCTACTGACTTTTGTATGTTGAATTTG 4104

  3734382 TATCCTGAAAATCTACTGAATTAGTTTATCAGTTCTAATAGTTTTTGGGTGGAGTCTAGG 3734441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4105 TATCCTGAAAATCTACTGAATTAGTTTATCAGTTCTAATAGTTTTTGGGTGGAGTCTAGG 4164

  3734442 TTTTTCTAAGTATAAGATCATATTGTCTATGAAGAAGGAGAACTTCACTTCTTTCTTTTC 3734501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4165 TTTTTCTAAGTATAAGATCATATTGTCTATGAAGAAGGAGAACTTCACTTCTTTCTTTTC 4224

  3734502 AATTTGGATGCCATTTATTTCTCTTGCATAATTGCTCCAGCCAGGACTTCCAATATTATG 3734561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4225 AATTTGGATGCCATTTATTTCTCTTGCATAATTGCTCCAGCCAGGACTTCCAATATTATG 4284

  3734562 TTAATAAAAGCGGTGAAAGTGGGCATCCTTGTCTTGTTCCGGATCTTAGAGAAAAGGCTT 3734621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4285 TTAATAAAAGCGGTGAAAGTGGGCATCCTTGTCTTGTTCCGGATCTTAGAGAAAAGGCTT 4344

  3734622 TCATTTTTTGTCCATTAAGTATGATGTTACCTGTGGGTTTGTCATATGTGGCTTTTGTTA 3734681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4345 TCATTTTTTGTCCATTAAGTATGATGTTACCTGTGGGTTTGTCATATGTGGCTTTTGTTA 4404

  3734682 TTTTGAGGTAGTTTTTTTTTCTATACCCAATTTATTGAGGGTTTTTTTCTTATCATGAAG 3734741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4405 TTTTGAGGTAGTTTTTTTTTCTATACCCAATTTATTGAGGGTTTTTTTCTTATCATGAAG 4464

  3734742 TGACGTTAAATTTTATCAAATGCTTTCCAGCATTTATCGAAATGATCATATGGTTTTTGT 3734801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4465 TGACGTTAAATTTTATCAAATGCTTTCCAGCATTTATCGAAATGATCATATGGTTTTTGT 4524

  3734802 TCTTGGTTCAGTTAGTGATGTGTCATGTTTATTGATTCATGTATGTTGAGACATGCTTGC 3734861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4525 TCTTGGTTCAGTTAGTGATGTGTCATGTTTATTGATTCATGTATGTTGAGACATGCTTGC 4584

  3734862 CTTCCTGGAATGAATTCCACTTGATCATGGTGAGTGATCTGTTTATTGTGTTGTTAAATT 3734921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4585 CTTCCTGGAATGAATTCCACTTGATCATGGTGAGTGATCTGTTTATTGTGTTGTTAAATT 4644

  3734922 CAGTTTGCTGGTATTTTGTTGAGGATTTTTGCATCTATGTCCATCAGTGATATTAACCTG 3734981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4645 CAGTTTGCTGGTATTTTGTTGAGGATTTTTGCATCTATGTCCATCAGTGATATTAACCTG 4704

  3734982 TAGTTTTCTTTTTTTGTTGTTGTCTTTGTCTGGTTTTGGTATCAGGGTAATACTGGCCTT 3735041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4705 TAGTTTTCTTTTTTTGTTGTTGTCTTTGTCTGGTTTTGGTATCAGGGTAATACTGGCCTT 4764

  3735042 GTAGAATGAGTTTGGAAGTACTCCTGCTTCAATTTTCTTGAAGAGTTTGAGTAAAATTGG 3735101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4765 GTAGAATGAGTTTGGAAGTACTCCTGCTTCAATTTTCTTGAAGAGTTTGAGTAAAATTGG 4824

  3735102 TATTAGTTATTCCTTTTATGTTTGGTAGAATTCAGCAGGGAAGCCATTAGGTCCTGGAAT 3735161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4825 TATTAGTTATTCCTTTTATGTTTGGTAGAATTCAGCAGGGAAGCCATTAGGTCCTGGAAT 4884

  3735162 TTTCTTTAATGGGAGACTTTTTAAATTTCAGCTTTTATCTCATCATTCATTATTGGTTTA 3735221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4885 TTTCTTTAATGGGAGACTTTTTAAATTTCAGCTTTTATCTCATCATTCATTATTGGTTTA 4944

  3735222 TTAAGGTTTTCTATTTCTTCATGGTTCAATCTTGGTAGATTGTATGTGTCCAGAAATGTA 3735281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4945 TTAAGGTTTTCTATTTCTTCATGGTTCAATCTTGGTAGATTGTATGTGTCCAGAAATGTA 5004

  3735282 TCCATTTCTTCTAGGTTTTCCAATTTGTTGGTATGTAGTTGTTCATAATAGTCTCTAATT 3735341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5005 TCCATTTCTTCTAGGTTTTCCAATTTGTTGGTATGTAGTTGTTCATAATAGTCTCTAATT 5064

  3735342 GATCTTTGTAATTCTGTGGTCACATTTCCTTTTGGCTGAGTACAGTGGACTTTATTGATG 3735401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5065 GATCTTTGTAATTCTGTGGTCACATTTCCTTTTGGCTGAGTACAGTGGACTTTATTGATG 5124

  3735402 GTATGTGACAGGATGTGGCTCCCTAGGCCCCTCTCTTTTCAGGGGGCCTGGCATGGAAAC 3735461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5125 GTATGTGACAGGATGTGGCTCCCTAGGCCCCTCTCTTTTCAGGGGGCCTGGCATGGAAAC 5184

  3735462 TGTGTCAGGGGGAGATTCTCAGTATGGTGGGAGAGTGAGTGTGGCAGGGACTCCCTAGCA 3735521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5185 TGTGTCAGGGGGAGATTCTCAGTATGGTGGGAGAGTGAGTGTGGCAGGGACTCCCTAGCA 5244

  3735522 GCTGAGAACCTCTCTAATCTTCTTGTGCTCTTGCTGGGGCTGGTGGTCCAGGGGCTCTTA 3735581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5245 GCTGAGAACCTCTCTAATCTTCTTGTGCTCTTGCTGGGGCTGGTGGTCCAGGGGCTCTTA 5304

  3735582 CTCTTTGGAGGCCATGTGGACCATGAGGCCTCCACTACCCTGTTGCCAAATTCATTGTCA 3735641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5305 CTCTTTGGAGGCCATGTGGACCATGAGGCCTCCACTACCCTGTTGCCAAATTCATTGTCA 5364

  3735642 TACCAGGGAATAAGCTTGACAAAGTAGTCATTGAGGGAAATGCCAGCCCCAGCATCAAAG 3735701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5365 TACCAGGGAATAAGCTTGACAAAGTAGTCATTGAGGGAAATGCCAGCCCCAGCATCAAAG 5424

  3735702 CTGGAAGAGTGAATGTCTGTTAAAGTCAGAGGAGACAACCTGGCACTCACTATAGCCCAA 3735761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5425 CTGGAAGAGTGAATGTCTGTTAAAGTCAGAGGAGACAACCTGGCACTCACTATAGCCCAA 5484

  3735762 GATGCCCTTGAGGGGGCCCTCCAATGCCTGCTTCACCGCCTTTTTGATGGTGTCATATTT 3735821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5485 GATGCCCTTGAGGGGGCCCTCCAATGCCTGCTTCACCGCCTTTTTGATGGTGTCATATTT 5544

  3735822 GTCAAGTTTCTCCAGATGGCAAGTCAGGTCCAAAATGACACAGAGGTGGGGATATGGAAC 3735881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5545 GTCAAGTTTCTCCAGATGGCAAGTCAGGTCCAAAATGACACAGAGGTGGGGATATGGAAC 5604

  3735882 ACCATGCTAGTGAGCTTCCATTCAGCTTGGGGATGACCTTTCCAACAGCTTTGGCAGTGC 3735941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5605 ACCATGCTAGTGAGCTTCCATTCAGCTTGGGGATGACCTTTCCAACAGCTTTGGCAGTGC 5664

  3735942 AAGTAGATGCAGAGATGATGTTCTGTAGAGCCCTGTGGCCATCCTGCCAACGTTTCCAAG 3736001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5665 AAGTAGATGCAGAGATGATGTTCTGTAGAGCCCTGTGGCCATCCTGCCAACGTTTCCAAG 5724

  3736002 AAGGGGCACCCATGGTCTTCGGAGTGGTAGTGATTGCATAGGCTGTGGTCATGAGTCCCT 3736061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5725 AAGGGGCACCCATGGTCTTCGGAGTGGTAGTGATTGCATAGGCTGTGGTCATGAGTCCCT 5784

  3736062 CCATAGTGCCAAAGTTGTCATGGATGACCTTGGCCAGAAGGGCTAAGTAGTAGGTGGTGT 3736121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5785 CCATAGTGCCAAAGTTGTCATGGATGACCTTGGCCAGAAGGGCTAAGTAGTAGGTGGTGT 5844

  3736122 ATGAGGCACTACTAAGGATCTTGAGGTTGTTTTCATACTTCTCATGATTCACACCCCACA 3736181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5845 ATGAGGCACTACTAAGGATCTTGAGGTTGTTTTCATACTTCTCATGATTCACACCCCACA 5904

  3736182 TAAACATAAGGGGCATCAGCAGAGGGGGCAGAGATGGTGGCTCTTTTGGCTTACCCCTCT 3736241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5905 TAAACATAAGGGGCATCAGCAGAGGGGGCAGAGATGGTGGCTCTTTTGGCTTACCCCTCT 5964

  3736242 AAGTGAGCCTCAGCCTTCTCCATGGTAATGGAGATTCTAGTGGGCTCAACAACATAATCA 3736301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5965 AAGTGAGCCTCAGCCTTCTCCATGGTAATGGAGATTCTAGTGGGCTCAACAACATAATCA 6024

  3736302 GCACCGCTGTCATTTCACTCGATTTTGGGGGGGATCTTGCTCCTGGAAGATAATGATGGG 3736361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6025 GCACCGCTGTCATTTCACTCGATTTTGGGGGGGATCTTGCTCCTGGAAGATAATGATGGG 6084

  3736362 ATTTCCATTGATGTCAGTCTTCTCATTCTGAGCCTTGATGATACTGTGGAACTTGCCATG 3736421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6085 ATTTCCATTGATGTCAGTCTTCTCATTCTGAGCCTTGATGATACTGTGGAACTTGCCATG 6144

  3736422 GGTGGAAGCCTACTGGAACATGTAGGCCAGGTAGTTGAGGTCAATGAAGGCATCATTGAT 3736481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6145 GGTGGAAGCCTACTGGAACATGTAGGCCAGGTAGTTGAGGTCAATGAAGGCATCATTGAT 6204

  3736482 GATGACAATATCCACTTTGCCAGAGCTAAAAGCAGCCTTGGTGACCAGGTGCTTAATGTG 3736541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6205 GATGACAATATCCACTTTGCCAGAGCTAAAAGCAGCCTTGGTGACCAGGTGCTTAATGTG 6264

  3736542 GCCAAATTTGTTTACTCTGGCCTTCATTTTCACCTTGTTGCCTCAGGAACCCAGCTGGCA 3736601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6265 GCCAAATTTGTTTACTCTGGCCTTCATTTTCACCTTGTTGCCTCAGGAACCCAGCTGGCA 6324

  3736602 CTGCATAAAAATATGCAGGTGTCTGTCAAATGGAAAAGAGAAGAGAGCCAGTCTCATTTT 3736661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6325 CTGCATAAAAATATGCAGGTGTCTGTCAAATGGAAAAGAGAAGAGAGCCAGTCTCATTTT 6384

  3736662 TTATGTATCCTTCTCTATTTCTGATTTTTTGGGGTCTTTTCTCTTTGTAATTAGTCTAGC 3736721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6385 TTATGTATCCTTCTCTATTTCTGATTTTTTGGGGTCTTTTCTCTTTGTAATTAGTCTAGC 6444

  3736722 TAAAGGTCCATCACTTTTGTTTCTTTTTAAAAAAACAAGTTTTTTGTTTTGTTGATCCTC 3736781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6445 TAAAGGTCCATCACTTTTGTTTCTTTTTAAAAAAACAAGTTTTTTGTTTTGTTGATCCTC 6504

  3736782 TGTATTATTTTAGTTGCCATTTATTTATCCTCTGATCTTTATTTTTTTCTTCTACTAGTA 3736841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6505 TGTATTATTTTAGTTGCCATTTATTTATCCTCTGATCTTTATTTTTTTCTTCTACTAGTA 6564

  3736842 ATTTTGGGATTGGTTTATACTTGCTTTTCTAGTTTATTGAGATGCATTGTTATATTAATT 3736901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6565 ATTTTGGGATTGGTTTATACTTGCTTTTCTAGTTTATTGAGATGCATTGTTATATTAATT 6624

  3736902 TGAAGTCTTTCTACTTCTTTGGTATAGGTATTTATTGCTATAAACTTCCCTCTTAGTACT 3736961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6625 TGAAGTCTTTCTACTTCTTTGGTATAGGTATTTATTGCTATAAACTTCCCTCTTAGTACT 6684

  3736962 GCCTTTGTTGTATCCCATATATTTTTGTATGTTGTATTTCCATTTTCATTTGT 3737014
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6685 GCCTTTGTTGTATCCCATATATTTTTGTATGTTGTATTTCCATTTTCATTTGT 6737

Alignment time is 7.30393 s

