
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [220042323,220062913] =>     20591 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [        1,     2234] =>      2234 nucs 'mol-32-20fa-139069_2234'

Score:        2135
Aligned:      2235        nucs
Identic:      2221 ( 99%) nucs =>      2127 ( 99%)        94 (100%)
Gaps:            8 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [220050190,220052323] EXCISED REGION [220052914,220053007]
 second seq =>  [        1,     2140] EXCISED REGION [     2141,     2234]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       590 nucs [220052324,220052913]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         5 nucs [220052324,220052328] to [220052914,220052918]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [220052323,220052323] to [220052914,220052914]
 second seq =>         1 nucs [2140,2140] to [2141,2141]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [220052324,220052325] to [220052912,220052913]
 second seq =>         0 nucs

220050190 CAAAACAAGAAATGTGATAATTCTAGTGTCCTGTGCACGAATATCCTAATACTTCCAGAG 220050249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CAAAACAAGAAATGTGATAATTCTAGTGTCCTGTGCACGAATATCCTAATACTTCCAGAG 60

220050250 GATGGCTTGCTAGGCTTGTGGGCAAATTGTAGTATGTCCAGGAGATGACTGCTAGAAATG 220050309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GATGGCTTGCTAGGCTTGTGGGCAAATTGTAGTATGTCCAGGAGATGACTGCTAGAAATG 120

220050310 AAGGCTGAAAATCATCATAGGACAAACTGTTGGAGGAACTGGGAATCTCTAATCCAAGAA 220050369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAGGCTGAAAATCATCATAGGACAAACTGTTGGAGGAACTGGGAATCTCTAATCCAAGAA 180

220050370 GAGAGCTGAGTTGGTTCACATCAGCTGGCTTCAAACTTCAAAGGTTTGTCTGCAGGACTT 220050429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GAGAGCTGAGTTGGTTCACATCAGCTGGCTTCAAACTTCAAAGGTTTGTCTGCAGGACTT 240

220050430 CAGAGGGCAGATACGAGTTGAGTTTGGTTGATAATAGTGCTAGGTAGAATTTAATTTTCT 220050489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CAGAGGGCAGATACGAGTTGAGTTTGGTTGATAATAGTGCTAGGTAGAATTTAATTTTCT 300

220050490 AGTCAAGGGAATATTGCAAAGCAGATTTAAATGATCTGCAAAAGTATAATGATCAAGGGC 220050549
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
      301 AGTCAAGGGAATATTGCAAAGCAGATTTAAATGATCTTCAAAAGTATAATGATCAAGGGC 360

220050550 GGTAATTCTAAGAATAATTCCAACATGGAAGGACAATATTATCACCATGTTTTGCTTTTA 220050609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGTAATTCTAAGAATAATTCCAACATGGAAGGACAATATTATCACCATGTTTTGCTTTTA 420

220050610 ATGTCCAACTAAAGTCAGCTTGGACTTCTCTTCCTCTGTCTGCTCCCTTAAAAGTTGGTA 220050669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATGTCCAACTAAAGTCAGCTTGGACTTCTCTTCCTCTGTCTGCTCCCTTAAAAGTTGGTA 480

220050670 TTTTGGACCGGGTGCGGTGGCTGACGCCTGTAATCCCGGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAG 220050729
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
      481 TTTTGGACCGGGTGCGGTGGCTGACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAG 540

220050730 GCGGATCACAAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCTACATGGTGAAACCCCATCTCT 220050789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GCGGATCACAAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCTACATGGTGAAACCCCATCTCT 600

220050790 ACTAAAGTACAAAAATTATCCGGGTGTGGTGGCGCATGCCTGTAATCCCAGCTACTGGGG 220050849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ACTAAAGTACAAAAATTATCCGGGTGTGGTGGCGCATGCCTGTAATCCCAGCTACTGGGG 660

220050850 AGGCTGAGGCAGGATAATTGCTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTG 220050909
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGGCTGAGGCAGGATAATCGCTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTG 720

220050910 CACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCGAAACTCTGCCCCTCACCCCACAACCTAA 220050969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCGAAACTCTGCCCCTCACCCCACAACCTAA 780

220050970 AAATGTTGGTATTTTGTTGGGTGTCAGTGGCTCACTTGTCTTTGCCCTCTGCTCACTCAT 220051029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAATGTTGGTATTTTGTTGGGTGTCAGTGGCTCACTTGTCTTTGCCCTCTGCTCACTCAT 840

220051030 CATGGACGATTTCATATATTCACCCATATAGTTCCCACTCAGATGCGGATGCCTTCTAAA 220051089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CATGGACGATTTCATATATTCACCCATATAGTTCCCACTCAGATGCGGATGCCTTCTAAA 900

220051090 TCTTAGTTCATTTCCTTTCCCAGAACTCCCAACTAGGCATCTCCACTTGAATGTCCCATG 220051149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TCTTAGTTCATTTCCTTTCCCAGAACTCCCAACTAGGCATCTCCACTTGAATGTCCCATG 960

220051150 GGTACTGCTATGATTTGAATATTTGTCCCCTTCAAAACTCAGTTGAAATTTAATCCCTAA 220051209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GGTACTGCTATGATTTGAATATTTGTCCCCTTCAAAACTCAGTTGAAATTTAATCCCTAA 1020

220051210 TGTGGCAATATTGACAGATGGGCCTTTAAGAGGTGAGTGGAGGCTGGATGCAGTGGCTCA 220051269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1021 TGTGGCAATATTGACAGATGGGCCTTTAAGAGGTGAATGGAGGCTGGATGCAGTGGCTCA 1080

220051270 CACCTGAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCGGATCACTTGAGGTCAGGATTTC 220051329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CACCTGAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCGGATCACTTGAGGTCAGGATTTC 1140

220051330 GAGACTAGCCTGGCCAAGATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATAATCCG 220051389
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GAGACCAGCCTGGCCAAGATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATAATCCG 1200

220051390 GGTGTGCTGGCACGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCT 220051449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GGTGTGCTGGCACGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCT 1260

220051450 TGAACCAGGAAAGTGGAGGTTGCAGTGAGCCTAGATCATACCATTGCACTCCAGCCCAGG 220051509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGAACCAGGAAAGTGGAGGTTGCAGTGAGCCTAGATCATACCATTGCACTCCAGCCCAGG 1320

220051510 CGAAGAAGCAAGACTCTGTCTCAGAAAAAAAAAAAAAAAA-------GGTGAATGGATAA 220051562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||
     1321 CGAAGAAGCAAGACTCTGTCTCAGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGTGAATGGATAA 1380

220051563 ATCCGTTCATGAATTAATGGGGTGATGGAGTAATGAGTTATCATGGGAGTGGAACTCATG 220051622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ATCCGTTCATGAATTAATGGGGTGATGGAGTAATGAGTTATCATGGGAGTGGAACTCATG 1440

220051623 GCTATATAAAAAGAGGAAGAGAGATCTGAGCTAGCATGCTCAGCCCCCTCACCATGTGAT 220051682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GCTATATAAAAAGAGGAAGAGAGATCTGAGCTAGCATGCTCAGCCCCCTCACCATGTGAT 1500

220051683 CCTCTGTGCTACCTGAAGACTCTGCAGAGTCCCTATCAGCAAGAAGACCCTCACCAGATG 220051742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CCTCTGTGCTACCTGAAGACTCTGCAGAGTCCCTATCAGCAAGAAGACCCTCACCAGATG 1560

220051743 CGGCTCCTCAACCTTCGACTTCTCATTCCCCATCACTGTAAGAAATTATTTTCCTTTATG 220051802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CGGCTCCTCAACCTTCGACTTCTCATTCCCCATCACTGTAAGAAATTATTTTCCTTTATG 1620

220051803 AATTACCCAGTTTCAGGTATTCTGTTACGATACAAACAACGGAAAATGGATGAAGACAGG 220051862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AATTACCCAGTTTCAGGTATTCTGTTACGATACAAACAACGGAAAATGGATGAAGACAGG 1680

220051863 TAACCTTCTGCTCATTATATCCAAAACTGAACACATCCTCTTTCCACTCTGCACTCCACT 220051922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TAACCTTCTGCTCATTATATCCAAAACTGAACACATCCTCTTTCCACTCTGCACTCCACT 1740

220051923 CCCCCACCTCCCCAAAACAGAAGTCTTTTTCTGTAATTTCCATCTCACTTGCTGGTATAC 220051982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CCCCCACCTCCCCAAAACAGAAGTCTTTTTCTGTAATTTCCATCTCACTTGCTGGTATAC 1800

220051983 CAACCACGAAGGCCTCCTTCTCCCTCATCTCACACTCAGTTGATCACCAGTTGCTGCTGA 220052042
          |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CAACCACGAAGGCCTCCT-CTCCCTCATCTCACACTCAGTTGATCACCAGTTGCTGCTGA 1859

220052043 TTTCTTGACTGTCACCTCCATCACAGCCCTGACTCACATCCTCCTCATCTCATCTGGCCC 220052102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     1860 TTTCTTGACTGTCACCTCCATCACAGCCCTGACTCACATCCTCCTCGTCTCATCTGGCCC 1919

220052103 AGTGGGACAGTTTCCCTGCCATATTCTTGTCCCCCCACCTGAAATTTGTGCCCAAGAAGG 220052162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 AGTGGGACAGTTTCCCTGCCATATTCTTGTCCCCCCACCTGAAATTTGTGCCCAAGAAGG 1979

220052163 TGGCTGGATTATCTTAAAACACAAATCTGATGACCTCTCTACTACTTACTGTTAACTGAT 220052222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 TGGCTGGATTATCTTAAAACACAAATCTGATGACCTCTCTACTACTTACTGTTAACTGAT 2039

220052223 GGCTCTCCTCCTCTGAGACATAAATTCAACCTCCCTGATACAGTCAAGAAGTCTTCTGAG 220052282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 GGCTCTCCTCCTCTGAGACATAAATTCAACCTCCCTGATACAGTCAAGAAGTCTTCTGAG 2099

220052283 GCAGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTCGG 220052323
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 GCAGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTCGG 2140

EXCISED REGION

220052914 GAGGCCGAGGATGGCTCATTTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACCTAGTGA 220052973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2141 GAGGCCGAGGATGGCTCATTTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACCTAGTGA 2200

220052974 AACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCC 220053007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2201 AACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCC 2234

Alignment time is 1.64181 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [220042323,220062913] =>     20591 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [        1,     2623] =>      2623 nucs 'mol-32-285e-014176_2623'

Score:        2516
Aligned:      2625        nucs
Identic:      2611 ( 99%) nucs =>      2590 ( 99%)        21 (100%)
Gaps:            8 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [220049726,220052323] EXCISED REGION [220052914,220052934]
 second seq =>  [        1,     2602] EXCISED REGION [     2603,     2623]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       590 nucs [220052324,220052913]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         5 nucs [220052324,220052328] to [220052914,220052918]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [220052323,220052323] to [220052914,220052914]
 second seq =>         1 nucs [2602,2602] to [2603,2603]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [220052324,220052325] to [220052912,220052913]
 second seq =>         0 nucs

220049726 TTTAGTAGAGGTGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGG 220049785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTAGTAGAGGTGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGG 60

220049786 TGATTCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACGGCGCCCA 220049845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGATTCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACGGCGCCCA 120

220049846 GCCTCATGAGGGTCTATTCTTTACATTCACCATGGTCTGATGGTTGCTACATGTTTGTCT 220049905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GCCTCATGAGGGTCTATTCTTTACATTCACCATGGTCTGATGGTTGCTACATGTTTGTCT 180

220049906 ATGATTTTTTTTTTCTATTATCAGGTGTCTTGGCCGGTTCATGCCCCACGATGAAAGGGC 220049965
          ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATGATTTTTTTTT-CTATTATCAGGTGTCTTGGCCGGTTCATGCCCCACGATGAAAGGGC 239

220049966 CAGAGGTTTTCATATGAGTAAAAGAAAAAAGCAGAAATGTGAAACCTACAATTAGGCTAA 220050025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      240 CAGAGGTTTTCATATGAGTAAAAGAAAAAAGCAGAAATGTGAAACCTACAATTAGGCTAA 299

220050026 ACAAAAATCAACTGGAAAAGTACAGGCTGAGGGGAGAAGAGTTGGCTACATGTTTATGTT 220050085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      300 ACAAAAATCAACTGGAAAAGTACAGGCTGAGGGGAGAAGAGTTGGCTACATGTTTATGTT 359

220050086 AGGGGAGGAGGGAGTACATTTTAGCTATGTATTCAAACAGCTAATAGTTTAATGTTGCTG 220050145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      360 AGGGGAGGAGGGAGTACATTTTAGCTATGTATTCAAACAGCTAATAGTTTAATGTTGCTG 419

220050146 CTTATAAACTTAATTTTAGGCTGCATTAATAAAAGTGTAGTCTCCAAAACAAGAAATGTG 220050205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      420 CTTATAAACTTAATTTTAGGCTGCATTAATAAAAGTGTAGTCTCCAAAACAAGAAATGTG 479

220050206 ATAATTCTAGTGTCCTGTGCACGAATATCCTAATACTTCCAGAGGATGGCTTGCTAGGCT 220050265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      480 ATAATTCTAGTGTCCTGTGCACGAATATCCTAATACTTCCAGAGGATGGCTTGCTAGGCT 539

220050266 TGTGGGCAAATTGTAGTATGTCCAGGAGATGACTGCTAGAAATGAAGGCTGAAAATCATC 220050325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      540 TGTGGGCAAATTGTAGTATGTCCAGGAGATGACTGCTAGAAATGAAGGCTGAAAATCATC 599

220050326 ATAGGACAAACTGTTGGAGGAACTGGGAATCTCTAATCCAAGAAGAGAGCTGAGTTGGTT 220050385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      600 ATAGGACAAACTGTTGGAGGAACTGGGAATCTCTAATCCAAGAAGAGAGCTGAGTTGGTT 659

220050386 CACATCAGCTGGCTTCAAACTTCAAAGGTTTGTCTGCAGGACTTCAGAGGGCAGATACGA 220050445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      660 CACATCAGCTGGCTTCAAACTTCAAAGGTTTGTCTGCAGGACTTCAGAGGGCAGATACGA 719

220050446 GTTGAGTTTGGTTGATAATAGTGCTAGGTAGAATTTAATTTTCTAGTCAAGGGAATATTG 220050505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      720 GTTGAGTTTGGTTGATAATAGTGCTAGGTAGAATTTAATTTTCTAGTCAAGGGAATATTG 779

220050506 CAAAGCAGATTTAAATGATCTGCAAAAGTATAATGATCAAGGGCGGTAATTCTAAGAATA 220050565
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      780 CAAAGCAGATTTAAATGATCTTCAAAAGTATAATGATCAAGGGCGGTAATTCTAAGAATA 839

220050566 ATTCCAACATGGAAGGACAATATTATCACCATGTTTTGCTTTTAATGTCCAACTAAAGTC 220050625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 ATTCCAACATGGAAGGACAATATTATCACCATGTTTTGCTTTTAATGTCCAACTAAAGTC 899

220050626 AGCTTGGACTTCTCTTCCTCTGTCTGCTCCCTTAAAAGTTGGTATTTTGGACCGGGTGCG 220050685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 AGCTTGGACTTCTCTTCCTCTGTCTGCTCCCTTAAAAGTTGGTATTTTGGACCGGGTGCG 959

220050686 GTGGCTGACGCCTGTAATCCCGGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGCGGATCACAAGGTCA 220050745
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 GTGGCTGACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGCGGATCACAAGGTCA 1019

220050746 GGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCTACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAGTACAAAAAT 220050805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 GGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCTACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAGTACAAAAAT 1079

220050806 TATCCGGGTGTGGTGGCGCATGCCTGTAATCCCAGCTACTGGGGAGGCTGAGGCAGGATA 220050865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 TATCCGGGTGTGGTGGCGCATGCCTGTAATCCCAGCTACTGGGGAGGCTGAGGCAGGATA 1139

220050866 ATTGCTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGCACCACTGCACTCCAG 220050925
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 ATCGCTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGCACCACTGCACTCCAG 1199

220050926 CCTGGGTGACAGAGCGAAACTCTGCCCCTCACCCCACAACCTAAAAATGTTGGTATTTTG 220050985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 CCTGGGTGACAGAGCGAAACTCTGCCCCTCACCCCACAACCTAAAAATGTTGGTATTTTG 1259

220050986 TTGGGTGTCAGTGGCTCACTTGTCTTTGCCCTCTGCTCACTCATCATGGACGATTTCATA 220051045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 TTGGGTGTCAGTGGCTCACTTGTCTTTGCCCTCTGCTCACTCATCATGGACGATTTCATA 1319

220051046 TATTCACCCATATAGTTCCCACTCAGATGCGGATGCCTTCTAAATCTTAGTTCATTTCCT 220051105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 TATTCACCCATATAGTTCCCACTCAGATGCGGATGCCTTCTAAATCTTAGTTCATTTCCT 1379

220051106 TTCCCAGAACTCCCAACTAGGCATCTCCACTTGAATGTCCCATGGGTACTGCTATGATTT 220051165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 TTCCCAGAACTCCCAACTAGGCATCTCCACTTGAATGTCCCATGGGTACTGCTATGATTT 1439

220051166 GAATATTTGTCCCCTTCAAAACTCAGTTGAAATTTAATCCCTAATGTGGCAATATTGACA 220051225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 GAATATTTGTCCCCTTCAAAACTCAGTTGAAATTTAATCCCTAATGTGGCAATATTGACA 1499

220051226 GATGGGCCTTTAAGAGGTGAGTGGAGGCTGGATGCAGTGGCTCACACCTGAATCCCAGCA 220051285
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 GATGGGCCTTTAAGAGGTGAATGGAGGCTGGATGCAGTGGCTCACACCTGAATCCCAGCA 1559

220051286 CTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCGGATCACTTGAGGTCAGGATTTCGAGACTAGCCTGGCCA 220051345
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     1560 CTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCGGATCACTTGAGGTCAGGATTTCGAGACCAGCCTGGCCA 1619

220051346 AGATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATAATCCGGGTGTGCTGGCACGTG 220051405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 AGATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATAATCCGGGTGTGCTGGCACGTG 1679

220051406 CCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCAGGAAAGTGG 220051465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 CCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCAGGAAAGTGG 1739

220051466 AGGTTGCAGTGAGCCTAGATCATACCATTGCACTCCAGCCCAGGCGAAGAAGCAAGACTC 220051525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 AGGTTGCAGTGAGCCTAGATCATACCATTGCACTCCAGCCCAGGCGAAGAAGCAAGACTC 1799

220051526 TGTCTCAGAAAAAAAAAAAAAAAA------GGTGAATGGATAAATCCGTTCATGAATTAA 220051579
          ||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 TGTCTCAGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGTGAATGGATAAATCCGTTCATGAATTAA 1859

220051580 TGGGGTGATGGAGTAATGAGTTATCATGGGAGTGGAACTCATGGCTATATAAAAAGAGGA 220051639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 TGGGGTGATGGAGTAATGAGTTATCATGGGAGTGGAACTCATGGCTATATAAAAAGAGGA 1919

220051640 AGAGAGATCTGAGCTAGCATGCTCAGCCCCCTCACCATGTGATCCTCTGTGCTACCTGAA 220051699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 AGAGAGATCTGAGCTAGCATGCTCAGCCCCCTCACCATGTGATCCTCTGTGCTACCTGAA 1979

220051700 GACTCTGCAGAGTCCCTATCAGCAAGAAGACCCTCACCAGATGCGGCTCCTCAACCTTCG 220051759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 GACTCTGCAGAGTCCCTATCAGCAAGAAGACCCTCACCAGATGCGGCTCCTCAACCTTCG 2039

220051760 ACTTCTCATTCCCCATCACTGTAAGAAATTATTTTCCTTTATGAATTACCCAGTTTCAGG 220051819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 ACTTCTCATTCCCCATCACTGTAAGAAATTATTTTCCTTTATGAATTACCCAGTTTCAGG 2099

220051820 TATTCTGTTACGATACAAACAACGGAAAATGGATGAAGACAGGTAACCTTCTGCTCATTA 220051879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 TATTCTGTTACGATACAAACAACGGAAAATGGATGAAGACAGGTAACCTTCTGCTCATTA 2159

220051880 TATCCAAAACTGAACACATCCTCTTTCCACTCTGCACTCCACTCCCCCACCTCCCCAAAA 220051939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 TATCCAAAACTGAACACATCCTCTTTCCACTCTGCACTCCACTCCCCCACCTCCCCAAAA 2219

220051940 CAGAAGTCTTTTTCTGTAATTTCCATCTCACTTGCTGGTATACCAACCACGAAGGCCTCC 220051999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 CAGAAGTCTTTTTCTGTAATTTCCATCTCACTTGCTGGTATACCAACCACGAAGGCCTCC 2279

220052000 TTCTCCCTCATCTCACACTCAGTTGATCACCAGTTGCTGCTGATTTCTTGACTGTCACCT 220052059
          | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 T-CTCCCTCATCTCACACTCAGTTGATCACCAGTTGCTGCTGATTTCTTGACTGTCACCT 2338

220052060 CCATCACAGCCCTGACTCACATCCTCCTCATCTCATCTGGCCCAGTGGGACAGTTTCCCT 220052119
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 CCATCACAGCCCTGACTCACATCCTCCTCGTCTCATCTGGCCCAGTGGGACAGTTTCCCT 2398

220052120 GCCATATTCTTGTCCCCCCACCTGAAATTTGTGCCCAAGAAGGTGGCTGGATTATCTTAA 220052179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 GCCATATTCTTGTCCCCCCACCTGAAATTTGTGCCCAAGAAGGTGGCTGGATTATCTTAA 2458

220052180 AACACAAATCTGATGACCTCTCTACTACTTACTGTTAACTGATGGCTCTCCTCCTCTGAG 220052239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2459 AACACAAATCTGATGACCTCTCTACTACTTACTGTTAACTGATGGCTCTCCTCCTCTGAG 2518

220052240 ACATAAATTCAACCTCCCTGATACAGTCAAGAAGTCTTCTGAGGCAGGGCACAGTGGCTC 220052299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2519 ACATAAATTCAACCTCCCTGATACAGTCAAGAAGTCTTCTGAGGCAGGGCACAGTGGCTC 2578

220052300 ACGCCTGTAATCCCAGCACTTCGG 220052323
          ||||||||||||||||||||||||
     2579 ACGCCTGTAATCCCAGCACTTCGG 2602

EXCISED REGION

220052914 GAGGCCGAGGATGGCTCATTT 220052934
          |||||||||||||||||||||
     2603 GAGGCCGAGGATGGCTCATTT 2623

Alignment time is 1.92989 s

