
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [116652076,116672656] =>     20581 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [        1,     3529] =>      3529 nucs 'mol-32-1e66-010561_3529'

Score:        3489
Aligned:      3522        nucs
Identic:      3519 (100%) nucs =>       588 (100%)      2931 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [116660040,116660627] EXCISED REGION [116660629,116663562]
 second seq =>  [        8,      595] EXCISED REGION [      596,     3529]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [116660628,116660628]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [116662090,116662090]
 second seq =>         1 nucs [2057,2057]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        10 nucs [116660628,116660637] to [116660629,116660638]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

116660040 CCCTCTTTCCCTTTCCCTTTCTTTTCTTTTATTTTTTCTTCTCTCTTCTCTTCTCTTTTT 116660099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        8 CCCTCTTTCCCTTTCCCTTTCTTTTCTTTTATTTTTTCTTCTCTCTTCTCTTCTCTTTTT 67

116660100 CTGGGTTGCACTCTGTTACCCAAGCTTGAATGCAATGGCAGGGATCACAGCTTACTGCAG 116660159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       68 CTGGGTTGCACTCTGTTACCCAAGCTTGAATGCAATGGCAGGGATCACAGCTTACTGCAG 127

116660160 TGTCAACCTCCTGGGCTCAGGTGATCATCCTCCTTCAGCCTCCTGTGTAGCTAGGACTGC 116660219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      128 TGTCAACCTCCTGGGCTCAGGTGATCATCCTCCTTCAGCCTCCTGTGTAGCTAGGACTGC 187

116660220 AGGCATGTACCACCACACATGGCTAATTTTAGTATTTTTTGTAGAAATGAGAGTCTCACT 116660279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      188 AGGCATGTACCACCACACATGGCTAATTTTAGTATTTTTTGTAGAAATGAGAGTCTCACT 247

116660280 GTGTTGTCCAGGTTTGTCTCAAACTCCCAGGTTCAAGCAATCCACCTGCCTCAGCCTCTC 116660339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      248 GTGTTGTCCAGGTTTGTCTCAAACTCCCAGGTTCAAGCAATCCACCTGCCTCAGCCTCTC 307

116660340 AAACTGCTGGGATTATAGGCATGTGCCACCATGCTGGGCCTCAAATTGACATTTTCTTAA 116660399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      308 AAACTGCTGGGATTATAGGCATGTGCCACCATGCTGGGCCTCAAATTGACATTTTCTTAA 367

116660400 AAATTGGACTGCCAAACAAGGACATTAGCCCTAGTAGGCAGAAGATACTATCTTGGTCTG 116660459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      368 AAATTGGACTGCCAAACAAGGACATTAGCCCTAGTAGGCAGAAGATACTATCTTGGTCTG 427

116660460 TGTTAGAGGCAATTGTTGAAATTTCTCTGAATCTCTATGGGATAGGCATAAATGTACTGA 116660519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      428 TGTTAGAGGCAATTGTTGAAATTTCTCTGAATCTCTATGGGATAGGCATAAATGTACTGA 487

116660520 TAAATTTGAGCAGTCCTGGGAATCCATAATCTCAATTTATTTGACCAATATCAATTAATA 116660579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      488 TAAATTTGAGCAGTCCTGGGAATCCATAATCTCAATTTATTTGACCAATATCAATTAATA 547

116660580 CCATGTTGAGAGGTCCTTCTATTTCTGAAGTCTGGTTCAGCAAAAAAT 116660627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      548 CCATGTTGAGAGGTCCTTCTATTTCTGAAGTCTGGTTCAGCAAAAAAT 595

EXCISED REGION

116660629 AAAAAAAAAATAAAATACCTGAAATAATGTAGCTATTCCTGAGGTATCATTAACAGAATA 116660688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      596 AAAAAAAAAATAAAATACCTGAAATAATGTAGCTATTCCTGAGGTATCATTAACAGAATA 655

116660689 GAAACTTAAAAAGCGCATGATATGGAAAAATCTTTGCTGATGGTTATACATGTTAAGTTT 116660748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      656 GAAACTTAAAAAGCGCATGATATGGAAAAATCTTTGCTGATGGTTATACATGTTAAGTTT 715

116660749 CCAGATAACTATTAATTAGACTTGCAGACATAAAAGGCTGTACCAAGTGGATATTTTAGA 116660808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      716 CCAGATAACTATTAATTAGACTTGCAGACATAAAAGGCTGTACCAAGTGGATATTTTAGA 775

116660809 GATAAATTTTTAGCACTTACAGACAATATTATGAAGTAGCTATGTGGGCATAGAGAAATT 116660868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      776 GATAAATTTTTAGCACTTACAGACAATATTATGAAGTAGCTATGTGGGCATAGAGAAATT 835

116660869 CGGGAAATTAGCAGGCTGGTTCTGCTATAATAGATCTCAGTTCACCCTTAGGATATCTTC 116660928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      836 CGGGAAATTAGCAGGCTGGTTCTGCTATAATAGATCTCAGTTCACCCTTAGGATATCTTC 895

116660929 ACTAAAGGAGCTTAACATAGCCCAGATGGTAGATTTGATTGCCCTCATTAGAGCTGGTCA 116660988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      896 ACTAAAGGAGCTTAACATAGCCCAGATGGTAGATTTGATTGCCCTCATTAGAGCTGGTCA 955

116660989 CTTGGCCAAAGACAAAAAAAATTATATTTACACAGAAAATAGCTCAAGTACCTGAACCTC 116661048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      956 CTTGGCCAAAGACAAAAAAAATTATATTTACACAGAAAATAGCTCAAGTACCTGAACCTC 1015

116661049 AGTATGACTATATATGGGGATAGAGTCTTTAAGGAAGTGATTAAGGTTAAATAAAGTCAT 116661108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1016 AGTATGACTATATATGGGGATAGAGTCTTTAAGGAAGTGATTAAGGTTAAATAAAGTCAT 1075

116661109 AATGATGGGGCCCTAATCTGATAAGATTAGCGTCCTTCTAAGAGGAGGAATCAACATCAG 116661168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1076 AATGATGGGGCCCTAATCTGATAAGATTAGCGTCCTTCTAAGAGGAGGAATCAACATCAG 1135

116661169 GGATTTTTTTTTCTCTCAACCCATGCCCAGAGGAAAGTCATATGAGGACGTAACACAAAG 116661228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1136 GGATTTTTTTTTCTCTCAACCCATGCCCAGAGGAAAGTCATATGAGGACGTAACACAAAG 1195

116661229 AGAGACATCTACAAATCACAGAGGTTGCACCAGAAATCAACCCTGCTAGCATATCGATCT 116661288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1196 AGAGACATCTACAAATCACAGAGGTTGCACCAGAAATCAACCCTGCTAGCATATCGATCT 1255

116661289 TGAACTTCTAGTCCCCAGAACTGTGAGGAAATAAATTTTTGTTGCTTATGCCACCAGATC 116661348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1256 TGAACTTCTAGTCCCCAGAACTGTGAGGAAATAAATTTTTGTTGCTTATGCCACCAGATC 1315

116661349 TGTGACATTTTGTTATGGAAGTCTGAGCTGACCAATACACTTGAATAACTATCAGTGTCA 116661408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1316 TGTGACATTTTGTTATGGAAGTCTGAGCTGACCAATACACTTGAATAACTATCAGTGTCA 1375

116661409 ATGTAAAACAAGCCATCTTTAGACTTAAGGAAACAGTCACCTGGCTCTCTAAGGCAGATG 116661468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1376 ATGTAAAACAAGCCATCTTTAGACTTAAGGAAACAGTCACCTGGCTCTCTAAGGCAGATG 1435

116661469 CAAATGGATTTTTCTTTGCCCGGGTTTAGTAATTCAGATTATGGCACTAAGTGTTTTGGG 116661528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1436 CAAATGGATTTTTCTTTGCCCGGGTTTAGTAATTCAGATTATGGCACTAAGTGTTTTGGG 1495

116661529 AAGGCTCCATGTCATTTTGATATAGTCACTGTGTGTTGCCATTCTTATGCATGTATTCTC 116661588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1496 AAGGCTCCATGTCATTTTGATATAGTCACTGTGTGTTGCCATTCTTATGCATGTATTCTC 1555

116661589 CACAGTCTCAGTCCTGCTCTGCAGCTGCTCTCGTGTCAAATGATCCATCACTCAACGGAA 116661648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1556 CACAGTCTCAGTCCTGCTCTGCAGCTGCTCTCGTGTCAAATGATCCATCACTCAACGGAA 1615

116661649 ATGAACTCATCACTCCATAAAAGGAATAGGAAGATCAGTCCATGATCCAATCCCAAACTA 116661708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1616 ATGAACTCATCACTCCATAAAAGGAATAGGAAGATCAGTCCATGATCCAATCCCAAACTA 1675

116661709 TTTTTTCTGAGGATGATAATGTTATCTAGAAATCACAACAGTGGTATACATCTGAACATG 116661768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1676 TTTTTTCTGAGGATGATAATGTTATCTAGAAATCACAACAGTGGTATACATCTGAACATG 1735

116661769 GCTGCTTTAGTAGCTGAACGACTCTTCTCATCTTCTCATCAGTTAGGAAAGACTGAGAAC 116661828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1736 GCTGCTTTAGTAGCTGAACGACTCTTCTCATCTTCTCATCAGTTAGGAAAGACTGAGAAC 1795

116661829 TGGTAGCATAAATCCATCAATTATGGGATTGCAATTGCAGAATGTTTTGTGACTCACATA 116661888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1796 TGGTAGCATAAATCCATCAATTATGGGATTGCAATTGCAGAATGTTTTGTGACTCACATA 1855

116661889 ATGTTTTCTTCTTTACTCAGAACTTCTCTATTTCACAGATTCTCACCTTAATAATTGAAG 116661948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1856 ATGTTTTCTTCTTTACTCAGAACTTCTCTATTTCACAGATTCTCACCTTAATAATTGAAG 1915

116661949 CAACTCAGGGTCACATCCTAGTTCTATAATTCTGCCTGAGGCACTCTGAGCCCAAACCAT 116662008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1916 CAACTCAGGGTCACATCCTAGTTCTATAATTCTGCCTGAGGCACTCTGAGCCCAAACCAT 1975

116662009 CAACAGGAAACAAACAAATAAAAAACCTGCTAATTTACTCTCCAATGAAACCTTTCCAGA 116662068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1976 CAACAGGAAACAAACAAATAAAAAACCTGCTAATTTACTCTCCAATGAAACCTTTCCAGA 2035

116662069 ATTATCTGTGTAGAGTTTCCTATTGCTGCAATAATTAATAAACTCAGTTTGCTTATATTG 116662128
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2036 ATTATCTGTGTAGAGTTTCCTGTTGCTGCAATAATTAATAAACTCAGTTTGCTTATATTG 2095

116662129 CAAATTTTAAAACTCGTAGTGGGAGATTTCCAGTTGCAAACAACAAGTCTTGGCTTTAAT 116662188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2096 CAAATTTTAAAACTCGTAGTGGGAGATTTCCAGTTGCAAACAACAAGTCTTGGCTTTAAT 2155

116662189 TATGAGTTCAACCAGTTTTTTTTCTCCTAATGTTTTAAATCTCAGTTCATCATAATGTCT 116662248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2156 TATGAGTTCAACCAGTTTTTTTTCTCCTAATGTTTTAAATCTCAGTTCATCATAATGTCT 2215

116662249 GAGCTTGTCTGATTTTGGCATAGGGAATATAATTAGAAGTAGTGAATGAAGGCCTAGCTG 116662308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2216 GAGCTTGTCTGATTTTGGCATAGGGAATATAATTAGAAGTAGTGAATGAAGGCCTAGCTG 2275

116662309 TTGCTTTGATGTCAGCAGACACCCATTTCTCTTTCCAAACTGCTTTTAAAAAGTCAAACA 116662368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2276 TTGCTTTGATGTCAGCAGACACCCATTTCTCTTTCCAAACTGCTTTTAAAAAGTCAAACA 2335

116662369 ACTTCCTTCTCTTCTTGCCTCACTCTCTACTTAATGTGATTTTCTTTTAATTTATGAAGG 116662428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2336 ACTTCCTTCTCTTCTTGCCTCACTCTCTACTTAATGTGATTTTCTTTTAATTTATGAAGG 2395

116662429 AAATAAAATCATTGCTTTTTAAGAATCATCCAACCAAGTCATTAAAGATATCTGGAATTC 116662488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2396 AAATAAAATCATTGCTTTTTAAGAATCATCCAACCAAGTCATTAAAGATATCTGGAATTC 2455

116662489 AAGATGTAGTCAAAATATTTCAAGGGCATTACAATATCCTCTGTCTTCTCTAATCTCTCA 116662548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2456 AAGATGTAGTCAAAATATTTCAAGGGCATTACAATATCCTCTGTCTTCTCTAATCTCTCA 2515

116662549 GGCAGTAAAACGGTACCAAGTGCAGAGATAGAAACACTGCTGTCAAAGTGGGTTAAAATC 116662608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2516 GGCAGTAAAACGGTACCAAGTGCAGAGATAGAAACACTGCTGTCAAAGTGGGTTAAAATC 2575

116662609 TTGACAGTATCGTGGCTTCTGATTTTAATTTCTCAATTAACTTATACAAATGAATAACTA 116662668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2576 TTGACAGTATCGTGGCTTCTGATTTTAATTTCTCAATTAACTTATACAAATGAATAACTA 2635

116662669 CCGTTATAGAAATAGCTTCTGGATTTCTTTGTCCTTTTTTTCCTGAAGTTAGGCTATATT 116662728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2636 CCGTTATAGAAATAGCTTCTGGATTTCTTTGTCCTTTTTTTCCTGAAGTTAGGCTATATT 2695

116662729 TGGTATCTCTATAGAGATAGGCTATATTTGGTAAATCTGTTCTCACCTCACATAAAAGGT 116662788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2696 TGGTATCTCTATAGAGATAGGCTATATTTGGTAAATCTGTTCTCACCTCACATAAAAGGT 2755

116662789 TAATATTCTACAAGTGGATAGATGTGGTGAGGACAACTAAAAGGAGATTGAATGATCTCA 116662848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2756 TAATATTCTACAAGTGGATAGATGTGGTGAGGACAACTAAAAGGAGATTGAATGATCTCA 2815

116662849 TCAAATTATATTACACAACCTTTCAAAGAAAGCTCAGTTGGATTAAGAGGTTTCTTTATG 116662908
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     2816 TCAAATTATATTACACAACCTTTCAAAGAAAGCTCAGTTGGATTAGGAGGTTTCTTTATG 2875

116662909 TTCATGCCCAAAATGCCAAATTCCAACAGCCCACAAAATTTCTTTGAAGTATTTTTCTCA 116662968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2876 TTCATGCCCAAAATGCCAAATTCCAACAGCCCACAAAATTTCTTTGAAGTATTTTTCTCA 2935

116662969 TACGTTTGTTTGATGAACAGCTTAAAGCTCCATTTCCATCCTAGCAAGTGGCAGACAAAA 116663028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2936 TACGTTTGTTTGATGAACAGCTTAAAGCTCCATTTCCATCCTAGCAAGTGGCAGACAAAA 2995

116663029 AGCCAGATAGTAAATCATATTTTAATAAAAATGATTTTAATAAGTGAAAGATATGATCCA 116663088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2996 AGCCAGATAGTAAATCATATTTTAATAAAAATGATTTTAATAAGTGAAAGATATGATCCA 3055

116663089 TTAAGTTAATCTTGTTAAGTAGAAGACCAAAATGAGAACTTAATGGGGTGCAAACATCAC 116663148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3056 TTAAGTTAATCTTGTTAAGTAGAAGACCAAAATGAGAACTTAATGGGGTGCAAACATCAC 3115

116663149 GGAGAATCAAAACACACACTAGAAACCATACTTGAGAACCAGAGATGAGTGAATGTTTGG 116663208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3116 GGAGAATCAAAACACACACTAGAAACCATACTTGAGAACCAGAGATGAGTGAATGTTTGG 3175

116663209 TCATCAATATCCATGCTAGCCTTAATCTTGTGGTTATCCCACCACATCCCCCTTTTCAAC 116663268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3176 TCATCAATATCCATGCTAGCCTTAATCTTGTGGTTATCCCACCACATCCCCCTTTTCAAC 3235

116663269 AGAAGTCAGTGAGCAGCAAGCCTCATTGAATGTTGGATATTAGCAAGCACATGTAGTTTT 116663328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3236 AGAAGTCAGTGAGCAGCAAGCCTCATTGAATGTTGGATATTAGCAAGCACATGTAGTTTT 3295

116663329 GCTTCAAGTACTCTTTATTTTCTTCCAATCCTCAGGGCCTTTCTCAACATATGGTTTATT 116663388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3296 GCTTCAAGTACTCTTTATTTTCTTCCAATCCTCAGGGCCTTTCTCAACATATGGTTTATT 3355

116663389 ATAGCGTTGTGAATGATTGGTCTTTCATAAGGACATTTTCCTTGGCAGAAGGCTATTTGA 116663448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3356 ATAGCGTTGTGAATGATTGGTCTTTCATAAGGACATTTTCCTTGGCAGAAGGCTATTTGA 3415

116663449 AGTTCATTGCTTTTACAAGGTAAGATTTCTGGAAGTTCTAAGCTATATAAATAGGTTTGG 116663508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3416 AGTTCATTGCTTTTACAAGGTAAGATTTCTGGAAGTTCTAAGCTATATAAATAGGTTTGG 3475

116663509 AGGAACTTTCTCTTAAACCACAGAAACTATTAATACTCTTGAGCAGGTGAGCTT 116663562
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3476 AGGAACATTCTCTTAAACCACAGAAACTATTAATACTCTTGAGCAGGTGAGCTT 3529

Alignment time is 4.20891 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [116652076,116672656] =>     20581 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [        1,     4639] =>      4639 nucs 'mol-32-1e66-060970_4639'

Score:        4639
Aligned:      4639        nucs
Identic:      4639 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [116657820,116662458]
 second seq =>  [        1,     4639]

116657820 AAATCTGATAATATGCTCATTTATAAATAAAAAAGCAAACAAAACCTCTAAATTGAAACA 116657879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAATCTGATAATATGCTCATTTATAAATAAAAAAGCAAACAAAACCTCTAAATTGAAACA 60

116657880 ACAGCCACCAGCCTACTCCCATCCTTTCCAAGATATTCTAATTCTCCTCTTCCTTTTCTC 116657939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACAGCCACCAGCCTACTCCCATCCTTTCCAAGATATTCTAATTCTCCTCTTCCTTTTCTC 120

116657940 CAAGGCATTTTCCTAAGGATAGCTCCATTTTATCTTTTACATATACTTCTTTTCTTTTCC 116657999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAAGGCATTTTCCTAAGGATAGCTCCATTTTATCTTTTACATATACTTCTTTTCTTTTCC 180

116658000 TATATTTTTCCACCTTCTTCTAATTTTCTTTGCTTTTCTATTGATTGTGGGTTAAGTAAG 116658059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TATATTTTTCCACCTTCTTCTAATTTTCTTTGCTTTTCTATTGATTGTGGGTTAAGTAAG 240

116658060 AAAAAAAGGCAAGGGTGGCAGTCAGAGTGCGTGCAGAATTCTTCAAAGCAATGAATGTTG 116658119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAAAAAAGGCAAGGGTGGCAGTCAGAGTGCGTGCAGAATTCTTCAAAGCAATGAATGTTG 300

116658120 AGAAAAGCCGTGTATATTTAGAAGTTAATGGTCTCCCCTCTAGATTTCTATGCAGCTTGA 116658179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGAAAAGCCGTGTATATTTAGAAGTTAATGGTCTCCCCTCTAGATTTCTATGCAGCTTGA 360

116658180 ATTCCTCAGTGTTTCTGAACTTCTTGTGTTTTTCTCTTATCTTTTAAATAATACTCTGCT 116658239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATTCCTCAGTGTTTCTGAACTTCTTGTGTTTTTCTCTTATCTTTTAAATAATACTCTGCT 420

116658240 ACTGTTTTTCTCTAGATTACCATTTCAGTGGATTTGAAAAATCTCTTTCCATTATTTTTC 116658299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACTGTTTTTCTCTAGATTACCATTTCAGTGGATTTGAAAAATCTCTTTCCATTATTTTTC 480

116658300 TTTTCTCCTTACTTCTTTCTTCCCCTTCTCTTATTTTTTCTCTTTCTCTCCAACTTCATC 116658359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTTCTCCTTACTTCTTTCTTCCCCTTCTCTTATTTTTTCTCTTTCTCTCCAACTTCATC 540

116658360 TCTTTATTAATTTCCTTCTCTCCTTTTAAGTTTTGGTAACTGTTTTTCATTTGGCCAGCT 116658419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCTTTATTAATTTCCTTCTCTCCTTTTAAGTTTTGGTAACTGTTTTTCATTTGGCCAGCT 600

116658420 CTCAGTATACCTTATTTGTGTTGGGTACCAAAGCAAACATCCTCACCAGTGATGCAAGAC 116658479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTCAGTATACCTTATTTGTGTTGGGTACCAAAGCAAACATCCTCACCAGTGATGCAAGAC 660

116658480 TGAAGAAGTGTGATCATTAGCTCTGCAATCACAACCACAAAACACCTGTGGCTTGCCTAA 116658539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGAAGAAGTGTGATCATTAGCTCTGCAATCACAACCACAAAACACCTGTGGCTTGCCTAA 720

116658540 AACCTTCTTCTGTTAGACCCTTTCCTTACTTGGAAACAATCTCATCTTAAGAAATCAAGC 116658599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AACCTTCTTCTGTTAGACCCTTTCCTTACTTGGAAACAATCTCATCTTAAGAAATCAAGC 780

116658600 AATACTTGAAGAAATTTTGAGGAACCCATAAGCAAGAAAAACTGTATACTCATTTCCCTT 116658659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AATACTTGAAGAAATTTTGAGGAACCCATAAGCAAGAAAAACTGTATACTCATTTCCCTT 840

116658660 AACATGATACCATTTCACAGTTACCTGTGTGGTGCTTTTCATTGCTATAGAAATCGAATT 116658719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AACATGATACCATTTCACAGTTACCTGTGTGGTGCTTTTCATTGCTATAGAAATCGAATT 900

116658720 AAACTCAGTGTGATTGTAGCATAATGGGATACTTCACTTGAGAAAGGGGATTTTTATAAT 116658779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AAACTCAGTGTGATTGTAGCATAATGGGATACTTCACTTGAGAAAGGGGATTTTTATAAT 960

116658780 TTGGAGAAGCATTGAGAGTCAGCAGTGAATATTCATGACACGGGCTAGGACCATTTAAAC 116658839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTGGAGAAGCATTGAGAGTCAGCAGTGAATATTCATGACACGGGCTAGGACCATTTAAAC 1020

116658840 AGACGACTTCTAGGAGAGTCTCTTGAGGACATTTAATCTCTTGTGCTTGACCATCCTGAC 116658899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGACGACTTCTAGGAGAGTCTCTTGAGGACATTTAATCTCTTGTGCTTGACCATCCTGAC 1080

116658900 CCAAGGTGAGTTTGAGTCTCAAATACATTAAAATTCTCAAACCATTAGTTTTATTTTGTT 116658959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CCAAGGTGAGTTTGAGTCTCAAATACATTAAAATTCTCAAACCATTAGTTTTATTTTGTT 1140

116658960 CCTGTAAACCTAAAGTTTAACTTTCAGAATACTTTTTCTCATTAGAATTATATGTTTAAA 116659019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CCTGTAAACCTAAAGTTTAACTTTCAGAATACTTTTTCTCATTAGAATTATATGTTTAAA 1200

116659020 AATTCTTGGTGACATTCCATTCTTCACCTAATCTCACGTTTGTCTTGTTCTGTTTTGTCA 116659079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AATTCTTGGTGACATTCCATTCTTCACCTAATCTCACGTTTGTCTTGTTCTGTTTTGTCA 1260

116659080 AAAATGTTTTCCTAAAAATGAAAAAGAAAACCTCTAGAATGATTAATCGAGTGAGATTCT 116659139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AAAATGTTTTCCTAAAAATGAAAAAGAAAACCTCTAGAATGATTAATCGAGTGAGATTCT 1320

116659140 CAATAAATCTGCAACTAAAACCATCCGTAAGTCCTAACAAGTTTCAATTTTTATCACGTT 116659199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CAATAAATCTGCAACTAAAACCATCCGTAAGTCCTAACAAGTTTCAATTTTTATCACGTT 1380

116659200 AGTGTCTTTTAGTAGATAAACTTTGCTCTAGGTCACTATCCAAAAAACTTATGTGAGTTC 116659259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AGTGTCTTTTAGTAGATAAACTTTGCTCTAGGTCACTATCCAAAAAACTTATGTGAGTTC 1440

116659260 TGTTGATTGTATCCTGCCTTTGTGTTCCTAAGAGTTGATTTGGGAAGCAAAATCCCCCAA 116659319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TGTTGATTGTATCCTGCCTTTGTGTTCCTAAGAGTTGATTTGGGAAGCAAAATCCCCCAA 1500

116659320 AAATCTATATTCTCAGGCCCATGGATAGTTAGAACGCAGGCTACAGATGTCAAACTCTCT 116659379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AAATCTATATTCTCAGGCCCATGGATAGTTAGAACGCAGGCTACAGATGTCAAACTCTCT 1560

116659380 AGTCAGGGGTCATGCCTAATAAAGTGCAGAAGGAATACATTGAACAGAATGTTATACACT 116659439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AGTCAGGGGTCATGCCTAATAAAGTGCAGAAGGAATACATTGAACAGAATGTTATACACT 1620

116659440 TTTAGGGCGTTTTAAAATTTTTGGTCTAAGTCATGTCTCTAGCAGGCTAGACACCTGTTC 116659499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTTAGGGCGTTTTAAAATTTTTGGTCTAAGTCATGTCTCTAGCAGGCTAGACACCTGTTC 1680

116659500 CAGATATGTATTCTTAATATAACAAAAATTATTTAAATATCTTACCATGTGTCACAGTTA 116659559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CAGATATGTATTCTTAATATAACAAAAATTATTTAAATATCTTACCATGTGTCACAGTTA 1740

116659560 CATCAATAATATTTGGAATCATACTGGACCCTTTGAAAATTTTCAGTATGAGTAAAAATG 116659619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CATCAATAATATTTGGAATCATACTGGACCCTTTGAAAATTTTCAGTATGAGTAAAAATG 1800

116659620 TTTATCTTAGAAGTAAGTGGAGGGGAAACATCCTTATTATTAAGTGCTAAGCCTTTTTAA 116659679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTTATCTTAGAAGTAAGTGGAGGGGAAACATCCTTATTATTAAGTGCTAAGCCTTTTTAA 1860

116659680 AATGGTCTATGAAGATTCTAAATAGACTTCTGATTCCAAAATACCTATAACAATGAAGTC 116659739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AATGGTCTATGAAGATTCTAAATAGACTTCTGATTCCAAAATACCTATAACAATGAAGTC 1920

116659740 TTTGGCCATGGCTAATTAAAAAAAAACATAAAACTCTAGAGACTGTCTCATTTATTAATT 116659799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTTGGCCATGGCTAATTAAAAAAAAACATAAAACTCTAGAGACTGTCTCATTTATTAATT 1980

116659800 TGCCAAATTCTTCTTTCTTTTAACATTTTCTTTATCCCACAGTATCTTTTCTTGCTTTTT 116659859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TGCCAAATTCTTCTTTCTTTTAACATTTTCTTTATCCCACAGTATCTTTTCTTGCTTTTT 2040

116659860 GTGCTACCACACTATCAAATTTTACTCTTTTTCTCCCAAATTTCTTTTTCTAACCATCGT 116659919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GTGCTACCACACTATCAAATTTTACTCTTTTTCTCCCAAATTTCTTTTTCTAACCATCGT 2100

116659920 CTTCCCCCTCTGATTGTATCTGAAAATAACCACTTGCTTTTCTTCTTTTTTCTTTTTCTT 116659979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CTTCCCCCTCTGATTGTATCTGAAAATAACCACTTGCTTTTCTTCTTTTTTCTTTTTCTT 2160

116659980 TTTCTTTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTT 116660039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TTTCTTTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTT 2220

116660040 CCCTCTTTCCCTTTCCCTTTCTTTTCTTTTATTTTTTCTTCTCTCTTCTCTTCTCTTTTT 116660099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CCCTCTTTCCCTTTCCCTTTCTTTTCTTTTATTTTTTCTTCTCTCTTCTCTTCTCTTTTT 2280

116660100 CTGGGTTGCACTCTGTTACCCAAGCTTGAATGCAATGGCAGGGATCACAGCTTACTGCAG 116660159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CTGGGTTGCACTCTGTTACCCAAGCTTGAATGCAATGGCAGGGATCACAGCTTACTGCAG 2340

116660160 TGTCAACCTCCTGGGCTCAGGTGATCATCCTCCTTCAGCCTCCTGTGTAGCTAGGACTGC 116660219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TGTCAACCTCCTGGGCTCAGGTGATCATCCTCCTTCAGCCTCCTGTGTAGCTAGGACTGC 2400

116660220 AGGCATGTACCACCACACATGGCTAATTTTAGTATTTTTTGTAGAAATGAGAGTCTCACT 116660279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AGGCATGTACCACCACACATGGCTAATTTTAGTATTTTTTGTAGAAATGAGAGTCTCACT 2460

116660280 GTGTTGTCCAGGTTTGTCTCAAACTCCCAGGTTCAAGCAATCCACCTGCCTCAGCCTCTC 116660339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GTGTTGTCCAGGTTTGTCTCAAACTCCCAGGTTCAAGCAATCCACCTGCCTCAGCCTCTC 2520

116660340 AAACTGCTGGGATTATAGGCATGTGCCACCATGCTGGGCCTCAAATTGACATTTTCTTAA 116660399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 AAACTGCTGGGATTATAGGCATGTGCCACCATGCTGGGCCTCAAATTGACATTTTCTTAA 2580

116660400 AAATTGGACTGCCAAACAAGGACATTAGCCCTAGTAGGCAGAAGATACTATCTTGGTCTG 116660459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AAATTGGACTGCCAAACAAGGACATTAGCCCTAGTAGGCAGAAGATACTATCTTGGTCTG 2640

116660460 TGTTAGAGGCAATTGTTGAAATTTCTCTGAATCTCTATGGGATAGGCATAAATGTACTGA 116660519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TGTTAGAGGCAATTGTTGAAATTTCTCTGAATCTCTATGGGATAGGCATAAATGTACTGA 2700

116660520 TAAATTTGAGCAGTCCTGGGAATCCATAATCTCAATTTATTTGACCAATATCAATTAATA 116660579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TAAATTTGAGCAGTCCTGGGAATCCATAATCTCAATTTATTTGACCAATATCAATTAATA 2760

116660580 CCATGTTGAGAGGTCCTTCTATTTCTGAAGTCTGGTTCAGCAAAAAATAAAAAAAAAAAT 116660639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CCATGTTGAGAGGTCCTTCTATTTCTGAAGTCTGGTTCAGCAAAAAATAAAAAAAAAAAT 2820

116660640 AAAATACCTGAAATAATGTAGCTATTCCTGAGGTATCATTAACAGAATAGAAACTTAAAA 116660699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 AAAATACCTGAAATAATGTAGCTATTCCTGAGGTATCATTAACAGAATAGAAACTTAAAA 2880

116660700 AGCGCATGATATGGAAAAATCTTTGCTGATGGTTATACATGTTAAGTTTCCAGATAACTA 116660759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 AGCGCATGATATGGAAAAATCTTTGCTGATGGTTATACATGTTAAGTTTCCAGATAACTA 2940

116660760 TTAATTAGACTTGCAGACATAAAAGGCTGTACCAAGTGGATATTTTAGAGATAAATTTTT 116660819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TTAATTAGACTTGCAGACATAAAAGGCTGTACCAAGTGGATATTTTAGAGATAAATTTTT 3000

116660820 AGCACTTACAGACAATATTATGAAGTAGCTATGTGGGCATAGAGAAATTCGGGAAATTAG 116660879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 AGCACTTACAGACAATATTATGAAGTAGCTATGTGGGCATAGAGAAATTCGGGAAATTAG 3060

116660880 CAGGCTGGTTCTGCTATAATAGATCTCAGTTCACCCTTAGGATATCTTCACTAAAGGAGC 116660939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 CAGGCTGGTTCTGCTATAATAGATCTCAGTTCACCCTTAGGATATCTTCACTAAAGGAGC 3120

116660940 TTAACATAGCCCAGATGGTAGATTTGATTGCCCTCATTAGAGCTGGTCACTTGGCCAAAG 116660999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TTAACATAGCCCAGATGGTAGATTTGATTGCCCTCATTAGAGCTGGTCACTTGGCCAAAG 3180

116661000 ACAAAAAAAATTATATTTACACAGAAAATAGCTCAAGTACCTGAACCTCAGTATGACTAT 116661059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 ACAAAAAAAATTATATTTACACAGAAAATAGCTCAAGTACCTGAACCTCAGTATGACTAT 3240

116661060 ATATGGGGATAGAGTCTTTAAGGAAGTGATTAAGGTTAAATAAAGTCATAATGATGGGGC 116661119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 ATATGGGGATAGAGTCTTTAAGGAAGTGATTAAGGTTAAATAAAGTCATAATGATGGGGC 3300

116661120 CCTAATCTGATAAGATTAGCGTCCTTCTAAGAGGAGGAATCAACATCAGGGATTTTTTTT 116661179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 CCTAATCTGATAAGATTAGCGTCCTTCTAAGAGGAGGAATCAACATCAGGGATTTTTTTT 3360

116661180 TCTCTCAACCCATGCCCAGAGGAAAGTCATATGAGGACGTAACACAAAGAGAGACATCTA 116661239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TCTCTCAACCCATGCCCAGAGGAAAGTCATATGAGGACGTAACACAAAGAGAGACATCTA 3420

116661240 CAAATCACAGAGGTTGCACCAGAAATCAACCCTGCTAGCATATCGATCTTGAACTTCTAG 116661299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 CAAATCACAGAGGTTGCACCAGAAATCAACCCTGCTAGCATATCGATCTTGAACTTCTAG 3480

116661300 TCCCCAGAACTGTGAGGAAATAAATTTTTGTTGCTTATGCCACCAGATCTGTGACATTTT 116661359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TCCCCAGAACTGTGAGGAAATAAATTTTTGTTGCTTATGCCACCAGATCTGTGACATTTT 3540

116661360 GTTATGGAAGTCTGAGCTGACCAATACACTTGAATAACTATCAGTGTCAATGTAAAACAA 116661419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 GTTATGGAAGTCTGAGCTGACCAATACACTTGAATAACTATCAGTGTCAATGTAAAACAA 3600

116661420 GCCATCTTTAGACTTAAGGAAACAGTCACCTGGCTCTCTAAGGCAGATGCAAATGGATTT 116661479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 GCCATCTTTAGACTTAAGGAAACAGTCACCTGGCTCTCTAAGGCAGATGCAAATGGATTT 3660

116661480 TTCTTTGCCCGGGTTTAGTAATTCAGATTATGGCACTAAGTGTTTTGGGAAGGCTCCATG 116661539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 TTCTTTGCCCGGGTTTAGTAATTCAGATTATGGCACTAAGTGTTTTGGGAAGGCTCCATG 3720

116661540 TCATTTTGATATAGTCACTGTGTGTTGCCATTCTTATGCATGTATTCTCCACAGTCTCAG 116661599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 TCATTTTGATATAGTCACTGTGTGTTGCCATTCTTATGCATGTATTCTCCACAGTCTCAG 3780

116661600 TCCTGCTCTGCAGCTGCTCTCGTGTCAAATGATCCATCACTCAACGGAAATGAACTCATC 116661659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 TCCTGCTCTGCAGCTGCTCTCGTGTCAAATGATCCATCACTCAACGGAAATGAACTCATC 3840

116661660 ACTCCATAAAAGGAATAGGAAGATCAGTCCATGATCCAATCCCAAACTATTTTTTCTGAG 116661719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 ACTCCATAAAAGGAATAGGAAGATCAGTCCATGATCCAATCCCAAACTATTTTTTCTGAG 3900

116661720 GATGATAATGTTATCTAGAAATCACAACAGTGGTATACATCTGAACATGGCTGCTTTAGT 116661779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 GATGATAATGTTATCTAGAAATCACAACAGTGGTATACATCTGAACATGGCTGCTTTAGT 3960

116661780 AGCTGAACGACTCTTCTCATCTTCTCATCAGTTAGGAAAGACTGAGAACTGGTAGCATAA 116661839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 AGCTGAACGACTCTTCTCATCTTCTCATCAGTTAGGAAAGACTGAGAACTGGTAGCATAA 4020

116661840 ATCCATCAATTATGGGATTGCAATTGCAGAATGTTTTGTGACTCACATAATGTTTTCTTC 116661899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 ATCCATCAATTATGGGATTGCAATTGCAGAATGTTTTGTGACTCACATAATGTTTTCTTC 4080

116661900 TTTACTCAGAACTTCTCTATTTCACAGATTCTCACCTTAATAATTGAAGCAACTCAGGGT 116661959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 TTTACTCAGAACTTCTCTATTTCACAGATTCTCACCTTAATAATTGAAGCAACTCAGGGT 4140

116661960 CACATCCTAGTTCTATAATTCTGCCTGAGGCACTCTGAGCCCAAACCATCAACAGGAAAC 116662019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 CACATCCTAGTTCTATAATTCTGCCTGAGGCACTCTGAGCCCAAACCATCAACAGGAAAC 4200

116662020 AAACAAATAAAAAACCTGCTAATTTACTCTCCAATGAAACCTTTCCAGAATTATCTGTGT 116662079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 AAACAAATAAAAAACCTGCTAATTTACTCTCCAATGAAACCTTTCCAGAATTATCTGTGT 4260

116662080 AGAGTTTCCTATTGCTGCAATAATTAATAAACTCAGTTTGCTTATATTGCAAATTTTAAA 116662139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 AGAGTTTCCTATTGCTGCAATAATTAATAAACTCAGTTTGCTTATATTGCAAATTTTAAA 4320

116662140 ACTCGTAGTGGGAGATTTCCAGTTGCAAACAACAAGTCTTGGCTTTAATTATGAGTTCAA 116662199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 ACTCGTAGTGGGAGATTTCCAGTTGCAAACAACAAGTCTTGGCTTTAATTATGAGTTCAA 4380

116662200 CCAGTTTTTTTTCTCCTAATGTTTTAAATCTCAGTTCATCATAATGTCTGAGCTTGTCTG 116662259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 CCAGTTTTTTTTCTCCTAATGTTTTAAATCTCAGTTCATCATAATGTCTGAGCTTGTCTG 4440

116662260 ATTTTGGCATAGGGAATATAATTAGAAGTAGTGAATGAAGGCCTAGCTGTTGCTTTGATG 116662319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 ATTTTGGCATAGGGAATATAATTAGAAGTAGTGAATGAAGGCCTAGCTGTTGCTTTGATG 4500

116662320 TCAGCAGACACCCATTTCTCTTTCCAAACTGCTTTTAAAAAGTCAAACAACTTCCTTCTC 116662379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 TCAGCAGACACCCATTTCTCTTTCCAAACTGCTTTTAAAAAGTCAAACAACTTCCTTCTC 4560

116662380 TTCTTGCCTCACTCTCTACTTAATGTGATTTTCTTTTAATTTATGAAGGAAATAAAATCA 116662439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 TTCTTGCCTCACTCTCTACTTAATGTGATTTTCTTTTAATTTATGAAGGAAATAAAATCA 4620

116662440 TTGCTTTTTAAGAATCATC 116662458
          |||||||||||||||||||
     4621 TTGCTTTTTAAGAATCATC 4639

Alignment time is 5.0736 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [116652076,116672656] =>     20581 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [        1,     4654] =>      4654 nucs 'mol-32-1e7c-202819_4654'

Score:        4527
Aligned:      4677        nucs
Identic:      4647 ( 99%) nucs =>      2483 ( 99%)      2164 (100%)
Gaps:           25 (  1%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [116659570,116662076] EXCISED REGION [116662657,116664825]
 second seq =>  [        1,     2487] EXCISED REGION [     2489,     4654]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       580 nucs [116662077,116662656]
 second seq =>         1 nucs [2488,2488]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [2487,2487] to [2488,2488]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

116659570 ATTTGGAATCATACTGGACCCTTTGAAAATTTTCAGTATGAGTAAAAATGTTTATCTTAG 116659629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATTTGGAATCATACTGGACCCTTTGAAAATTTTCAGTATGAGTAAAAATGTTTATCTTAG 60

116659630 AAGTAAGTGGAGGGGAAACATCCTTATTATTAAGTGCTAAGCCTTTTTAAAATGGTCTAT 116659689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAGTAAGTGGAGGGGAAACATCCTTATTATTAAGTGCTAAGCCTTTTTAAAATGGTCTAT 120

116659690 GAAGATTCTAAATAGACTTCTGATTCCAAAATACCTATAACAATGAAGTCTTTGGCCATG 116659749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GAAGATTCTAAATAGACTTCTGATTCCAAAATACCTATAACAATGAAGTCTTTGGCCATG 180

116659750 GCTAATTAAAAAAAAACATAAAACTCTAGAGACTGTCTCATTTATTAATTTGCCAAATTC 116659809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCTAATTAAAAAAAAACATAAAACTCTAGAGACTGTCTCATTTATTAATTTGCCAAATTC 240

116659810 TTCTTTCTTTTAACATTTTCTTTATCCCACAGTATCTTTTCTTGCTTTTTGTGCTACCAC 116659869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTCTTTCTTTTAACATTTTCTTTATCCCACAGTATCTTTTCTTGCTTTTTGTGCTACCAC 300

116659870 ACTATCAAATTTTACTCTTTTTCTCCCAAATTTCTTTTTCTAACCATCGTCTTCCCCCTC 116659929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACTATCAAATTTTACTCTTTTTCTCCCAAATTTCTTTTTCTAACCATCGTCTTCCCCCTC 360

116659930 TGATTGTATCTGAAAATAACCACTTGCTTTTCTTCTTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTCC 116659989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGATTGTATCTGAAAATAACCACTTGCTTTTCTTCTTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTCC 420

116659990 TTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCCTCTTTCC 116660049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||                    ||||||||
      421 TTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCC--------------------CTCTTTCC 460

116660050 CTTTCCCTTTCTTTTCTTTTATTTTTTCTTCTCTCTTCTCTTCTCTTTTTCTGGGTTGCA 116660109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      461 CTTTCCCTTTCTTTTCTTTTATTTTTTCTTCTCTCTTCTCTTCTCTTTTTCTGGGTTGCA 520

116660110 CTCTGTTACCCAAGCTTGAATGCAATGGCAGGGATCACAGCTTACTGCAGTGTCAACCTC 116660169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      521 CTCTGTTACCCAAGCTTGAATGCAATGGCAGGGATCACAGCTTACTGCAGTGTCAACCTC 580

116660170 CTGGGCTCAGGTGATCATCCTCCTTCAGCCTCCTGTGTAGCTAGGACTGCAGGCATGTAC 116660229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      581 CTGGGCTCAGGTGATCATCCTCCTTCAGCCTCCTGTGTAGCTAGGACTGCAGGCATGTAC 640

116660230 CACCACACATGGCTAATTTTAGTATTTTTTGTAGAAATGAGAGTCTCACTGTGTTGTCCA 116660289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      641 CACCACACATGGCTAATTTTAGTATTTTTTGTAGAAATGAGAGTCTCACTGTGTTGTCCA 700

116660290 GGTTTGTCTCAAACTCCCAGGTTCAAGCAATCCACCTGCCTCAGCCTCTCAAACTGCTGG 116660349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      701 GGTTTGTCTCAAACTCCCAGGTTCAAGCAATCCACCTGCCTCAGCCTCTCAAACTGCTGG 760

116660350 GATTATAGGCATGTGCCACCATGCTGGGCCTCAAATTGACATTTTCTTAAAAATTGGACT 116660409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      761 GATTATAGGCATGTGCCACCATGCTGGGCCTCAAATTGACATTTTCTTAAAAATTGGACT 820

116660410 GCCAAACAAGGACATTAGCCCTAGTAGGCAGAAGATACTATCTTGGTCTGTGTTAGAGGC 116660469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      821 GCCAAACAAGGACATTAGCCCTAGTAGGCAGAAGATACTATCTTGGTCTGTGTTAGAGGC 880

116660470 AATTGTTGAAATTTCTCTGAATCTCTATGGGATAGGCATAAATGTACTGATAAATTTGAG 116660529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      881 AATTGTTGAAATTTCTCTGAATCTCTATGGGATAGGCATAAATGTACTGATAAATTTGAG 940

116660530 CAGTCCTGGGAATCCATAATCTCAATTTATTTGACCAATATCAATTAATACCATGTTGAG 116660589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      941 CAGTCCTGGGAATCCATAATCTCAATTTATTTGACCAATATCAATTAATACCATGTTGAG 1000

116660590 AGGTCCTTCTATTTCTGAAGTCTGGTTCAGCAAAAAATAAAAAAAAAAA-TAAAATACCT 116660648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
     1001 AGGTCCTTCTATTTCTGAAGTCTGGTTCAGCAAAAAATAAAAAAAAAAAATAAAATACCT 1060

116660649 GAAATAATGTAGCTATTCCTGAGGTATCATTAACAGAATAGAAACTTAAAAAGCGCATGA 116660708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1061 GAAATAATGTAGCTATTCCTGAGGTATCATTAACAGAATAGAAACTTAAAAAGCGCATGA 1120

116660709 TATGGAAAAATCTTTGCTGATGGTTATACATGTTAAGTTTCCAGATAACTATTAATTAGA 116660768
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1121 TATGGAAAAACCTTTGCTGATGGTTATACATGTTAAGTTTCCAGATAACTATTAATTAGA 1180

116660769 CTTGCAGACATAAAAGGCTGTACCAAGTGGATATTTTAGAGATAAATTTTTAGCACTTAC 116660828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1181 CTTGCAGACATAAAAGGCTGTACCAAGTGGATATTTTAGAGATAAATTTTTAGCACTTAC 1240

116660829 AGACAATATTATGAAGTAGCTATGTGGGCATAGAGAAATTCGGGAAATTAGCAGGCTGGT 116660888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1241 AGACAATATTATGAAGTAGCTATGTGGGCATAGAGAAATTCGGGAAATTAGCAGGCTGGT 1300

116660889 TCTGCTATAATAGATCTCAGTTCACCCTTAGGATATCTTCACTAAAGGAGCTTAACATAG 116660948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1301 TCTGCTATAATAGATCTCAGTTCACCCTTAGGATATCTTCACTAAAGGAGCTTAACATAG 1360

116660949 CCCAGATGGTAGATTTGATTGCCCTCATTAGAGCTGGTCACTTGGCCAAAGACAAAAAAA 116661008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1361 CCCAGATGGTAGATTTGATTGCCCTCATTAGAGCTGGTCACTTGGCCAAAGACAAAAAAA 1420

116661009 ATTATATTTACACAGAAAATAGCTCAAGTACCTGAACCTCAGTATGACTATATATGGGGA 116661068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1421 ATTATATTTACACAGAAAATAGCTCAAGTACCTGAACCTCAGTATGACTATATATGGGGA 1480

116661069 TAGAGTCTTTAAGGAAGTGATTAAGGTTAAATAAAGTCATAATGATGGGGCCCTAATCTG 116661128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1481 TAGAGTCTTTAAGGAAGTGATTAAGGTTAAATAAAGTCATAATGATGGGGCCCTAATCTG 1540

116661129 ATAAGATTAGCGTCCTTCTAAGAGGAGGAATCAACATCAGGGATTTTTTTTTCTCTCAAC 116661188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1541 ATAAGATTAGCGTCCTTCTAAGAGGAGGAATCAACATCAGGGATTTTTTTTTCTCTCAAC 1600

116661189 CCATGCCCAGAGGAAAGTCATATGAGGACGTAACACAAAGAGAGACATCTACAAATCACA 116661248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1601 CCATGCCCAGAGGAAAGTCATATGAGGACGTAACACAAAGAGAGACATCTACAAATCACA 1660

116661249 GAGGTTGCACCAGAAATCAACCCTGCTAGCATATCGATCTTGAACTTCTAGTCCCCAGAA 116661308
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1661 GGGGTTGCACCAGAAATCAACCCTGCTAGCATATCGATCTTGAACTTCTAGTCCCCAGAA 1720

116661309 CTGTGAGGAAATAAATTTTTGTTGCTTATGCCACCAGATCTGTGACATTTTGTTATGGAA 116661368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1721 CTGTGAGGAAATAAATTTTTGTTGCTTATGCCACCAGATCTGTGACATTTTGTTATGGAA 1780

116661369 GTCTGAGCTGACCAATACACTTGAATAACTATCAGTGTCAATGTAAAACAAGCCATCTTT 116661428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1781 GTCTGAGCTGACCAATACACTTGAATAACTATCAGTGTCAATGTAAAACAAGCCATCTTT 1840

116661429 AGACTTAAGGAAACAGTCACCTGGCTCTCTAAGGCAGATGCAAATGGATTTTTCTTTGCC 116661488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1841 AGACTTAAGGAAACAGTCACCTGGCTCTCTAAGGCAGATGCAAATGGATTTTTCTTTGCC 1900

116661489 CGGGTTTAGTAATTCAGATTATGGCACTAAGTGTTTTGGGAAGGCTCCATGTCATTTTGA 116661548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1901 CGGGTTTAGTAATTCAGATTATGGCACTAAGTGTTTTGGGAAGGCTCCATGTCATTTTGA 1960

116661549 TATAGTCACTGTGTGTTGCCATTCTTATGCATGTATTCTCCACAGTCTCAGTCCTGCTCT 116661608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1961 TATAGTCACTGTGTGTTGCCATTCTTATGCATGTATTCTCCACAGTCTCAGTCCTGCTCT 2020

116661609 GCAGCTGCTCTCGTGTCAAATGATCCATCACTCAACGGAAATGAACTCATCACTCCATAA 116661668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2021 GCAGCTGCTCTCGTGTCAAATGATCCATCACTCAACGGAAATGAACTCATCACTCCATAA 2080

116661669 AAGGAATAGGAAGATCAGTCCATGATCCAATCCCAAACTATTTTTTCTGAGGATGATAAT 116661728
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     2081 AAGGAATAGGAAGATCAGTCCATGATCCAATCCCAAACTATTTTTTCCGAGGATGATAAT 2140

116661729 GTTATCTAGAAATCACAACAGTGGTATACATCTGAACATGGCTGCTTTAGTAGCTGAACG 116661788
          ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2141 GTTATCTAGAAATCACAACAG-GGTATACATCTGAACATGGCTGCTTTAGTAGCTGAACG 2199

116661789 ACTCTTCTCATCTTCTCATCAGTTAGGAAAGACTGAGAACTGGTAGCATAAATCCATCAA 116661848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2200 ACTCTTCTCATCTTCTCATCAGTTAGGAAAGACTGAGAACTGGTAGCATAAATCCATCAA 2259

116661849 TTATGGGATTGCAATTGCAGAATGTTTTGTGACTCACATAATGTTTTCTTCTTTACTCAG 116661908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2260 TTATGGGATTGCAATTGCAGAATGTTTTGTGACTCACATAATGTTTTCTTCTTTACTCAG 2319

116661909 AACTTCTCTATTTCACAGATTCTCACCTTAATAATTGAAGCAACTCAGGGTCACATCCTA 116661968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2320 AACTTCTCTATTTCACAGATTCTCACCTTAATAATTGAAGCAACTCAGGGTCACATCCTA 2379

116661969 GTTCTATAATTCTGCCTGAGGCACTCTGAGCCCAAACCATCAACAGGAAACAAACAAATA 116662028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2380 GTTCTATAATTCTGCCTGAGGCACTCTGAGCCCAAACCATCAACAGGAAACAAACAAATA 2439

116662029 AAAAACCTGCTAATTTACTCTCCAATGAAACCTTTCCAGAATTATCTG 116662076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2440 AAAAACCTGCTAATTTACTCTCCAATGAAACCTTTCCAGAATTATCTG 2487

EXCISED REGION

116662657 AATGAATAACTACCGTTATAGAAATAGCTTCTGGATTTCTTTGTCCTTTTTTTCCTGAAG 116662716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2489 AATGAATAACTACCGTTATAGAAATAGCTTCTGGATTTCTTTGTCCTTTTTTTCCTGAAG 2548

116662717 TTAGGCTATATTTGGTATCTCTATAGAGATAGGCTATATTTGGTAAATCTGTTCTCACCT 116662776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2549 TTAGGCTATATTTGGTATCTCTATAGAGATAGGCTATATTTGGTAAATCTGTTCTCACCT 2608

116662777 CACATAAAAGGTTAATATTCTACAAGTGGATAGATGTGGTGAGGACAACTAAAAGGAGAT 116662836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2609 CACATAAAAGGTTAATATTCTACAAGTGGATAGATGTGGTGAGGACAACTAAAAGGAGAT 2668

116662837 TGAATGATCTCATCAAATTATATTACACAACCTTTCAAAGAAAGCTCAGTTGGATTAAGA 116662896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2669 TGAATGATCTCATCAAATTATATTACACAACCTTTCAAAGAAAGCTCAGTTGGATTAAGA 2728

116662897 GGTTTCTTTATGTTCATGCCCAAAATGCCAAATTCCAACAGCCCACAAAATTTCTTTGAA 116662956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2729 GGTTTCTTTATGTTCATGCCCAAAATGCCAAATTCCAACAGCCCACAAAATTTCTTTGAA 2788

116662957 GTATTTTTCTCATACGTTTGTTTGATGAACAGCTTAAAGCTCCATTTCCATCCTAGCAAG 116663016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2789 GTATTTTTCTCATACGTTTGTTTGATGAACAGCTTAAAGCTCCATTTCCATCCTAGCAAG 2848

116663017 TGGCAGACAAAAAGCCAGATAGTAAATCATATTTTAATAAAAATGATTTTAATAAGTGAA 116663076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2849 TGGCAGACAAAAAGCCAGATAGTAAATCATATTTTAATAAAAATGATTTTAATAAGTGAA 2908

116663077 AGATATGATCCATTAAGTTAATCTTGTTAAGTAGAAGACCAAAATGAGAACTTAATGGGG 116663136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2909 AGATATGATCCATTAAGTTAATCTTGTTAAGTAGAAGACCAAAATGAGAACTTAATGGGG 2968

116663137 TGCAAACATCACGGAGAATCAAAACACACACTAGAAACCATACTTGAGAACCAGAGATGA 116663196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2969 TGCAAACATCACGGAGAATCAAAACACACACTAGAAACCATACTTGAGAACCAGAGATGA 3028

116663197 GTGAATGTTTGGTCATCAATATCCATGCTAGCCTTAATCTTGTGGTTATCCCACCACATC 116663256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3029 GTGAATGTTTGGTCATCAATATCCATGCTAGCCTTAATCTTGTGGTTATCCCACCACATC 3088

116663257 CCCCTTTTCAACAGAAGTCAGTGAGCAGCAAGCCTCATTGAATGTTGGATATTAGCAAGC 116663316
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3089 CCCCTTTTCAACAGAAGTCAGTGAGTAGCAAGCCTCATTGAATGTTGGATATTAGCAAGC 3148

116663317 ACATGTAGTTTTGCTTCAAGTACTCTTTATTTTCTTCCAATCCTCAGGGCCTTTCTCAAC 116663376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3149 ACATGTAGTTTTGCTTCAAGTACTCTTTATTTTCTTCCAATCCTCAGGGCCTTTCTCAAC 3208

116663377 ATATGGTTTATTATAGCGTTGTGAATGATTGGTCTTTCATAAGGACATTTTCCTTGGCAG 116663436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3209 ATATGGTTTATTATAGCGTTGTGAATGATTGGTCTTTCATAAGGACATTTTCCTTGGCAG 3268

116663437 AAGGCTATTTGAAGTTCATTGCTTTTACAAGGTAAGATTTCTGGAAGTTCTAAGCTATAT 116663496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3269 AAGGCTATTTGAAGTTCATTGCTTTTACAAGGTAAGATTTCTGGAAGTTCTAAGCTATAT 3328

116663497 AAATAGGTTTGGAGGAACTTTCTCTTAAACCACAGAAACTATTAATACTCTTGAGCAGGT 116663556
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3329 AAATAGGTTTGGAGGAACATTCTCTTAAACCACAGAAACTATTAATACTCTTGAGCAGGT 3388

116663557 GAGCTTATCAGATTCCTTAGTAGTCAACCAAAATGCTGAAGGATTTTTCTTTTTTTTTTT 116663616
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||
     3389 GAGCTTATCAGATTCCTTAGTAGTCAACCAAAATGCTGAAG--TTTTT-TTTTTTTTTTT 3445

116663617 TTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGATGGAGTCTCACTCTGTCACCAGGCTGGAGTGCAGTGG 116663676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3446 TTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGATGGAGTCTCACTCTGTCACCAGGCTGGAGTGCAGTGG 3505

116663677 TGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCCAGCAATTCTTCTGCCTCAGC 116663736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3506 TGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCCAGCAATTCTTCTGCCTCAGC 3565

116663737 CTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGGGCATGCCCACCAGGCCCAGCTAAGTTTTGTATTTT 116663796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3566 CTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGGGCATGCCCACCAGGCCCAGCTAAGTTTTGTATTTT 3625

116663797 TAGTAGAGATGGGGTTTCACCAAGTTGGCCAGAATGGTCTCGATCTCTTGACTTCATGAG 116663856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3626 TAGTAGAGATGGGGTTTCACCAAGTTGGCCAGAATGGTCTCGATCTCTTGACTTCATGAG 3685

116663857 CCGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAGCCACCGTGTCCGGCCA 116663916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3686 CCGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAGCCACCGTGTCCGGCCA 3745

116663917 AGAATTTTTCTAATGAGGTATGTGCAAAGCAGAAACATTTTATGTTAAGTACAGGCATGG 116663976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3746 AGAATTTTTCTAATGAGGTATGTGCAAAGCAGAAACATTTTATGTTAAGTACAGGCATGG 3805

116663977 CCACAAAAATATCACTTAAGAAGAGAAGAATTTTGGGGTTCTCAGTGTAACATGGAGATG 116664036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3806 CCACAAAAATATCACTTAAGAAGAGAAGAATTTTGGGGTTCTCAGTGTAACATGGAGATG 3865

116664037 AACAATATCTCACTCTTTTGAGGATAACAATAGATTTCTCTCTTCTGCTTTTGCAATGAT 116664096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3866 AACAATATCTCACTCTTTTGAGGATAACAATAGATTTCTCTCTTCTGCTTTTGCAATGAT 3925

116664097 TAAAATTTTGGAAATTTATATGAGAAAAGTAAAGATATTTTAAAAAGTTTTCTTGTTTTT 116664156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3926 TAAAATTTTGGAAATTTATATGAGAAAAGTAAAGATATTTTAAAAAGTTTTCTTGTTTTT 3985

116664157 TTTAACTCTTTATTCTCTTAAATCTTGACACTGTTCGTTGTAAGTTTGTGCTAGATACAG 116664216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3986 TTTAACTCTTTATTCTCTTAAATCTTGACACTGTTCGTTGTAAGTTTGTGCTAGATACAG 4045

116664217 CCACTGTTTGGTTGAGAAAATTTCTCTATGTCTGTGACATCCATGAGATAGAAACCGATG 116664276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4046 CCACTGTTTGGTTGAGAAAATTTCTCTATGTCTGTGACATCCATGAGATAGAAACCGATG 4105

116664277 GCTACATATGGCTATTTAAATTAAATTAATTAAACTTACATAAAATAAAAACTTGGTTCC 116664336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4106 GCTACATATGGCTATTTAAATTAAATTAATTAAACTTACATAAAATAAAAACTTGGTTCC 4165

116664337 ATAGTTGCACTAGACACATTTTAGGGCTCAATAGCCATAGTATAAACAGCATAGTATAGA 116664396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4166 ATAGTTGCACTAGACACATTTTAGGGCTCAATAGCCATAGTATAAACAGCATAGTATAGA 4225

116664397 ACTTTCTATCAGAGAAAGTTTGTCAGGGAGCTGTGCTAAAGGTGGTTTTCAAAATATAGC 116664456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4226 ACTTTCTATCAGAGAAAGTTTGTCAGGGAGCTGTGCTAAAGGTGGTTTTCAAAATATAGC 4285

116664457 TGTAGCCTGAGAATATTTCTATACTATTTTAATCAATTTTAACTAATTAATTAACTACAT 116664516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4286 TGTAGCCTGAGAATATTTCTATACTATTTTAATCAATTTTAACTAATTAATTAACTACAT 4345

116664517 TATACTTTGTTAACATAAAGTCAAAGGCATCTACTTCTGCAATTGGGAGGTAATAACTTG 116664576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4346 TATACTTTGTTAACATAAAGTCAAAGGCATCTACTTCTGCAATTGGGAGGTAATAACTTG 4405

116664577 CAATATAAAAATAGATGAGGCAGGTTGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGG 116664636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4406 CAATATAAAAATAGATGAGGCAGGTTGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGG 4465

116664637 GAGGCCGAAGTAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGG 116664696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4466 GAGGCCGAAGTAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGG 4525

116664697 TGAAACCCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTGGCCCGGCGCAGTGGCTCACGCCT 116664756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4526 TGAAACCCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTGGCCCGGCGCAGTGGCTCACGCCT 4585

116664757 GTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGACGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACC 116664816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4586 GTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGACGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACC 4645

116664817 ATCCTGGCT 116664825
          |||||||||
     4646 ATCCTGGCT 4654

Alignment time is 5.4825 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [116652076,116672656] =>     20581 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [        1,     2166] =>      2166 nucs 'mol-32-1e7c-202819_2166'

Score:        2139
Aligned:      2161        nucs
Identic:      2159 (100%) nucs =>       939 (100%)      1220 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [116662657,116663597] EXCISED REGION [116663606,116664825]
 second seq =>  [        1,      941] EXCISED REGION [      947,     2166]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         8 nucs [116663598,116663605]
 second seq =>         5 nucs [942,946]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        27 nucs [942,968] to [947,973]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [942,943] to [945,946]

116662657 AATGAATAACTACCGTTATAGAAATAGCTTCTGGATTTCTTTGTCCTTTTTTTCCTGAAG 116662716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AATGAATAACTACCGTTATAGAAATAGCTTCTGGATTTCTTTGTCCTTTTTTTCCTGAAG 60

116662717 TTAGGCTATATTTGGTATCTCTATAGAGATAGGCTATATTTGGTAAATCTGTTCTCACCT 116662776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTAGGCTATATTTGGTATCTCTATAGAGATAGGCTATATTTGGTAAATCTGTTCTCACCT 120

116662777 CACATAAAAGGTTAATATTCTACAAGTGGATAGATGTGGTGAGGACAACTAAAAGGAGAT 116662836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CACATAAAAGGTTAATATTCTACAAGTGGATAGATGTGGTGAGGACAACTAAAAGGAGAT 180

116662837 TGAATGATCTCATCAAATTATATTACACAACCTTTCAAAGAAAGCTCAGTTGGATTAAGA 116662896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGAATGATCTCATCAAATTATATTACACAACCTTTCAAAGAAAGCTCAGTTGGATTAAGA 240

116662897 GGTTTCTTTATGTTCATGCCCAAAATGCCAAATTCCAACAGCCCACAAAATTTCTTTGAA 116662956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGTTTCTTTATGTTCATGCCCAAAATGCCAAATTCCAACAGCCCACAAAATTTCTTTGAA 300

116662957 GTATTTTTCTCATACGTTTGTTTGATGAACAGCTTAAAGCTCCATTTCCATCCTAGCAAG 116663016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTATTTTTCTCATACGTTTGTTTGATGAACAGCTTAAAGCTCCATTTCCATCCTAGCAAG 360

116663017 TGGCAGACAAAAAGCCAGATAGTAAATCATATTTTAATAAAAATGATTTTAATAAGTGAA 116663076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGGCAGACAAAAAGCCAGATAGTAAATCATATTTTAATAAAAATGATTTTAATAAGTGAA 420

116663077 AGATATGATCCATTAAGTTAATCTTGTTAAGTAGAAGACCAAAATGAGAACTTAATGGGG 116663136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGATATGATCCATTAAGTTAATCTTGTTAAGTAGAAGACCAAAATGAGAACTTAATGGGG 480

116663137 TGCAAACATCACGGAGAATCAAAACACACACTAGAAACCATACTTGAGAACCAGAGATGA 116663196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGCAAACATCACGGAGAATCAAAACACACACTAGAAACCATACTTGAGAACCAGAGATGA 540

116663197 GTGAATGTTTGGTCATCAATATCCATGCTAGCCTTAATCTTGTGGTTATCCCACCACATC 116663256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GTGAATGTTTGGTCATCAATATCCATGCTAGCCTTAATCTTGTGGTTATCCCACCACATC 600

116663257 CCCCTTTTCAACAGAAGTCAGTGAGCAGCAAGCCTCATTGAATGTTGGATATTAGCAAGC 116663316
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CCCCTTTTCAACAGAAGTCAGTGAGTAGCAAGCCTCATTGAATGTTGGATATTAGCAAGC 660

116663317 ACATGTAGTTTTGCTTCAAGTACTCTTTATTTTCTTCCAATCCTCAGGGCCTTTCTCAAC 116663376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ACATGTAGTTTTGCTTCAAGTACTCTTTATTTTCTTCCAATCCTCAGGGCCTTTCTCAAC 720

116663377 ATATGGTTTATTATAGCGTTGTGAATGATTGGTCTTTCATAAGGACATTTTCCTTGGCAG 116663436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATATGGTTTATTATAGCGTTGTGAATGATTGGTCTTTCATAAGGACATTTTCCTTGGCAG 780

116663437 AAGGCTATTTGAAGTTCATTGCTTTTACAAGGTAAGATTTCTGGAAGTTCTAAGCTATAT 116663496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAGGCTATTTGAAGTTCATTGCTTTTACAAGGTAAGATTTCTGGAAGTTCTAAGCTATAT 840

116663497 AAATAGGTTTGGAGGAACTTTCTCTTAAACCACAGAAACTATTAATACTCTTGAGCAGGT 116663556
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAATAGGTTTGGAGGAACATTCTCTTAAACCACAGAAACTATTAATACTCTTGAGCAGGT 900

116663557 GAGCTTATCAGATTCCTTAGTAGTCAACCAAAATGCTGAAG 116663597
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GAGCTTATCAGATTCCTTAGTAGTCAACCAAAATGCTGAAG 941

EXCISED REGION

116663606 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGATGGAGTCTCACTCTGTCACCAGGCTG 116663665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      947 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGATGGAGTCTCACTCTGTCACCAGGCTG 1006

116663666 GAGTGCAGTGGTGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCCAGCAATTCT 116663725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1007 GAGTGCAGTGGTGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCCAGCAATTCT 1066

116663726 TCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGGGCATGCCCACCAGGCCCAGCTAAG 116663785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1067 TCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGGGCATGCCCACCAGGCCCAGCTAAG 1126

116663786 TTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCAAGTTGGCCAGAATGGTCTCGATCTCTT 116663845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1127 TTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCAAGTTGGCCAGAATGGTCTCGATCTCTT 1186

116663846 GACTTCATGAGCCGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAGCCACC 116663905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1187 GACTTCATGAGCCGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAGCCACC 1246

116663906 GTGTCCGGCCAAGAATTTTTCTAATGAGGTATGTGCAAAGCAGAAACATTTTATGTTAAG 116663965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1247 GTGTCCGGCCAAGAATTTTTCTAATGAGGTATGTGCAAAGCAGAAACATTTTATGTTAAG 1306

116663966 TACAGGCATGGCCACAAAAATATCACTTAAGAAGAGAAGAATTTTGGGGTTCTCAGTGTA 116664025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1307 TACAGGCATGGCCACAAAAATATCACTTAAGAAGAGAAGAATTTTGGGGTTCTCAGTGTA 1366

116664026 ACATGGAGATGAACAATATCTCACTCTTTTGAGGATAACAATAGATTTCTCTCTTCTGCT 116664085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1367 ACATGGAGATGAACAATATCTCACTCTTTTGAGGATAACAATAGATTTCTCTCTTCTGCT 1426

116664086 TTTGCAATGATTAAAATTTTGGAAATTTATATGAGAAAAGTAAAGATATTTTAAAAAGTT 116664145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1427 TTTGCAATGATTAAAATTTTGGAAATTTATATGAGAAAAGTAAAGATATTTTAAAAAGTT 1486

116664146 TTCTTGTTTTTTTTAACTCTTTATTCTCTTAAATCTTGACACTGTTCGTTGTAAGTTTGT 116664205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1487 TTCTTGTTTTTTTTAACTCTTTATTCTCTTAAATCTTGACACTGTTCGTTGTAAGTTTGT 1546

116664206 GCTAGATACAGCCACTGTTTGGTTGAGAAAATTTCTCTATGTCTGTGACATCCATGAGAT 116664265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1547 GCTAGATACAGCCACTGTTTGGTTGAGAAAATTTCTCTATGTCTGTGACATCCATGAGAT 1606

116664266 AGAAACCGATGGCTACATATGGCTATTTAAATTAAATTAATTAAACTTACATAAAATAAA 116664325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1607 AGAAACCGATGGCTACATATGGCTATTTAAATTAAATTAATTAAACTTACATAAAATAAA 1666

116664326 AACTTGGTTCCATAGTTGCACTAGACACATTTTAGGGCTCAATAGCCATAGTATAAACAG 116664385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1667 AACTTGGTTCCATAGTTGCACTAGACACATTTTAGGGCTCAATAGCCATAGTATAAACAG 1726

116664386 CATAGTATAGAACTTTCTATCAGAGAAAGTTTGTCAGGGAGCTGTGCTAAAGGTGGTTTT 116664445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1727 CATAGTATAGAACTTTCTATCAGAGAAAGTTTGTCAGGGAGCTGTGCTAAAGGTGGTTTT 1786

116664446 CAAAATATAGCTGTAGCCTGAGAATATTTCTATACTATTTTAATCAATTTTAACTAATTA 116664505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1787 CAAAATATAGCTGTAGCCTGAGAATATTTCTATACTATTTTAATCAATTTTAACTAATTA 1846

116664506 ATTAACTACATTATACTTTGTTAACATAAAGTCAAAGGCATCTACTTCTGCAATTGGGAG 116664565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1847 ATTAACTACATTATACTTTGTTAACATAAAGTCAAAGGCATCTACTTCTGCAATTGGGAG 1906

116664566 GTAATAACTTGCAATATAAAAATAGATGAGGCAGGTTGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCC 116664625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1907 GTAATAACTTGCAATATAAAAATAGATGAGGCAGGTTGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCC 1966

116664626 CAGCACTTTGGGAGGCCGAAGTAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCT 116664685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1967 CAGCACTTTGGGAGGCCGAAGTAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCT 2026

116664686 GGCCAACATGGTGAAACCCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTGGCCCGGCGCAGT 116664745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2027 GGCCAACATGGTGAAACCCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTGGCCCGGCGCAGT 2086

116664746 GGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGACGGATCACGAGGTCAGG 116664805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2087 GGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGACGGATCACGAGGTCAGG 2146

116664806 AGATCGAGACCATCCTGGCT 116664825
          ||||||||||||||||||||
     2147 AGATCGAGACCATCCTGGCT 2166

Alignment time is 2.80003 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [116652076,116672656] =>     20581 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [        1,     4892] =>      4892 nucs 'mol-32-1f58-206827_4892'

Score:        4892
Aligned:      4892        nucs
Identic:      4892 (100%) nucs =>      2507 (100%)      2385 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [116657479,116659985] EXCISED REGION [116660006,116662390]
 second seq =>  [        1,     2507] EXCISED REGION [     2508,     4892]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        20 nucs [116659986,116660005]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        36 nucs [116659986,116660021] to [116660006,116660041]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [116659984,116659985] to [116660006,116660007]
 second seq =>         2 nucs [2506,2507] to [2508,2509]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         8 nucs [116659986,116659993] to [116659998,116660005]
 second seq =>         0 nucs

116657479 TTGTTCTTTGATCCAGGTGATAGTTAAATAGATATGATCACCTAGTGAACACTCAAGACT 116657538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTGTTCTTTGATCCAGGTGATAGTTAAATAGATATGATCACCTAGTGAACACTCAAGACT 60

116657539 TATGCACTTGTCTGCGTGTAATGTACACAAAAATGTGTAACTACTTAGTAGTAGTCTTAT 116657598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TATGCACTTGTCTGCGTGTAATGTACACAAAAATGTGTAACTACTTAGTAGTAGTCTTAT 120

116657599 AAAAATAAACAAGATAATATGTGTGTATATATATGTAGTGTTAAGCAAAGTACCCAGTAC 116657658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAAAATAAACAAGATAATATGTGTGTATATATATGTAGTGTTAAGCAAAGTACCCAGTAC 180

116657659 ATGTTGGCCAAAACAAATGTCATCTCTCTCCTCCTGCCTTTTGTTCACTTTTTTTCCTAG 116657718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATGTTGGCCAAAACAAATGTCATCTCTCTCCTCCTGCCTTTTGTTCACTTTTTTTCCTAG 240

116657719 CCGAACAATCCTAGAGATTTTAAAGTACTTCTGCTTGTTTACTTTTGTTTCCAAAAAAGT 116657778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCGAACAATCCTAGAGATTTTAAAGTACTTCTGCTTGTTTACTTTTGTTTCCAAAAAAGT 300

116657779 TAATTATAAAGCAAATAAACTCGCTTTAGGAAAAATGCAAAAAATCTGATAATATGCTCA 116657838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TAATTATAAAGCAAATAAACTCGCTTTAGGAAAAATGCAAAAAATCTGATAATATGCTCA 360

116657839 TTTATAAATAAAAAAGCAAACAAAACCTCTAAATTGAAACAACAGCCACCAGCCTACTCC 116657898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTTATAAATAAAAAAGCAAACAAAACCTCTAAATTGAAACAACAGCCACCAGCCTACTCC 420

116657899 CATCCTTTCCAAGATATTCTAATTCTCCTCTTCCTTTTCTCCAAGGCATTTTCCTAAGGA 116657958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CATCCTTTCCAAGATATTCTAATTCTCCTCTTCCTTTTCTCCAAGGCATTTTCCTAAGGA 480

116657959 TAGCTCCATTTTATCTTTTACATATACTTCTTTTCTTTTCCTATATTTTTCCACCTTCTT 116658018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TAGCTCCATTTTATCTTTTACATATACTTCTTTTCTTTTCCTATATTTTTCCACCTTCTT 540

116658019 CTAATTTTCTTTGCTTTTCTATTGATTGTGGGTTAAGTAAGAAAAAAAGGCAAGGGTGGC 116658078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTAATTTTCTTTGCTTTTCTATTGATTGTGGGTTAAGTAAGAAAAAAAGGCAAGGGTGGC 600

116658079 AGTCAGAGTGCGTGCAGAATTCTTCAAAGCAATGAATGTTGAGAAAAGCCGTGTATATTT 116658138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGTCAGAGTGCGTGCAGAATTCTTCAAAGCAATGAATGTTGAGAAAAGCCGTGTATATTT 660

116658139 AGAAGTTAATGGTCTCCCCTCTAGATTTCTATGCAGCTTGAATTCCTCAGTGTTTCTGAA 116658198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGAAGTTAATGGTCTCCCCTCTAGATTTCTATGCAGCTTGAATTCCTCAGTGTTTCTGAA 720

116658199 CTTCTTGTGTTTTTCTCTTATCTTTTAAATAATACTCTGCTACTGTTTTTCTCTAGATTA 116658258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTTCTTGTGTTTTTCTCTTATCTTTTAAATAATACTCTGCTACTGTTTTTCTCTAGATTA 780

116658259 CCATTTCAGTGGATTTGAAAAATCTCTTTCCATTATTTTTCTTTTCTCCTTACTTCTTTC 116658318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CCATTTCAGTGGATTTGAAAAATCTCTTTCCATTATTTTTCTTTTCTCCTTACTTCTTTC 840

116658319 TTCCCCTTCTCTTATTTTTTCTCTTTCTCTCCAACTTCATCTCTTTATTAATTTCCTTCT 116658378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTCCCCTTCTCTTATTTTTTCTCTTTCTCTCCAACTTCATCTCTTTATTAATTTCCTTCT 900

116658379 CTCCTTTTAAGTTTTGGTAACTGTTTTTCATTTGGCCAGCTCTCAGTATACCTTATTTGT 116658438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTCCTTTTAAGTTTTGGTAACTGTTTTTCATTTGGCCAGCTCTCAGTATACCTTATTTGT 960

116658439 GTTGGGTACCAAAGCAAACATCCTCACCAGTGATGCAAGACTGAAGAAGTGTGATCATTA 116658498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GTTGGGTACCAAAGCAAACATCCTCACCAGTGATGCAAGACTGAAGAAGTGTGATCATTA 1020

116658499 GCTCTGCAATCACAACCACAAAACACCTGTGGCTTGCCTAAAACCTTCTTCTGTTAGACC 116658558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GCTCTGCAATCACAACCACAAAACACCTGTGGCTTGCCTAAAACCTTCTTCTGTTAGACC 1080

116658559 CTTTCCTTACTTGGAAACAATCTCATCTTAAGAAATCAAGCAATACTTGAAGAAATTTTG 116658618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTTTCCTTACTTGGAAACAATCTCATCTTAAGAAATCAAGCAATACTTGAAGAAATTTTG 1140

116658619 AGGAACCCATAAGCAAGAAAAACTGTATACTCATTTCCCTTAACATGATACCATTTCACA 116658678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGGAACCCATAAGCAAGAAAAACTGTATACTCATTTCCCTTAACATGATACCATTTCACA 1200

116658679 GTTACCTGTGTGGTGCTTTTCATTGCTATAGAAATCGAATTAAACTCAGTGTGATTGTAG 116658738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GTTACCTGTGTGGTGCTTTTCATTGCTATAGAAATCGAATTAAACTCAGTGTGATTGTAG 1260

116658739 CATAATGGGATACTTCACTTGAGAAAGGGGATTTTTATAATTTGGAGAAGCATTGAGAGT 116658798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CATAATGGGATACTTCACTTGAGAAAGGGGATTTTTATAATTTGGAGAAGCATTGAGAGT 1320

116658799 CAGCAGTGAATATTCATGACACGGGCTAGGACCATTTAAACAGACGACTTCTAGGAGAGT 116658858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CAGCAGTGAATATTCATGACACGGGCTAGGACCATTTAAACAGACGACTTCTAGGAGAGT 1380

116658859 CTCTTGAGGACATTTAATCTCTTGTGCTTGACCATCCTGACCCAAGGTGAGTTTGAGTCT 116658918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CTCTTGAGGACATTTAATCTCTTGTGCTTGACCATCCTGACCCAAGGTGAGTTTGAGTCT 1440

116658919 CAAATACATTAAAATTCTCAAACCATTAGTTTTATTTTGTTCCTGTAAACCTAAAGTTTA 116658978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CAAATACATTAAAATTCTCAAACCATTAGTTTTATTTTGTTCCTGTAAACCTAAAGTTTA 1500

116658979 ACTTTCAGAATACTTTTTCTCATTAGAATTATATGTTTAAAAATTCTTGGTGACATTCCA 116659038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ACTTTCAGAATACTTTTTCTCATTAGAATTATATGTTTAAAAATTCTTGGTGACATTCCA 1560

116659039 TTCTTCACCTAATCTCACGTTTGTCTTGTTCTGTTTTGTCAAAAATGTTTTCCTAAAAAT 116659098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTCTTCACCTAATCTCACGTTTGTCTTGTTCTGTTTTGTCAAAAATGTTTTCCTAAAAAT 1620

116659099 GAAAAAGAAAACCTCTAGAATGATTAATCGAGTGAGATTCTCAATAAATCTGCAACTAAA 116659158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GAAAAAGAAAACCTCTAGAATGATTAATCGAGTGAGATTCTCAATAAATCTGCAACTAAA 1680

116659159 ACCATCCGTAAGTCCTAACAAGTTTCAATTTTTATCACGTTAGTGTCTTTTAGTAGATAA 116659218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ACCATCCGTAAGTCCTAACAAGTTTCAATTTTTATCACGTTAGTGTCTTTTAGTAGATAA 1740

116659219 ACTTTGCTCTAGGTCACTATCCAAAAAACTTATGTGAGTTCTGTTGATTGTATCCTGCCT 116659278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ACTTTGCTCTAGGTCACTATCCAAAAAACTTATGTGAGTTCTGTTGATTGTATCCTGCCT 1800

116659279 TTGTGTTCCTAAGAGTTGATTTGGGAAGCAAAATCCCCCAAAAATCTATATTCTCAGGCC 116659338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTGTGTTCCTAAGAGTTGATTTGGGAAGCAAAATCCCCCAAAAATCTATATTCTCAGGCC 1860

116659339 CATGGATAGTTAGAACGCAGGCTACAGATGTCAAACTCTCTAGTCAGGGGTCATGCCTAA 116659398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CATGGATAGTTAGAACGCAGGCTACAGATGTCAAACTCTCTAGTCAGGGGTCATGCCTAA 1920

116659399 TAAAGTGCAGAAGGAATACATTGAACAGAATGTTATACACTTTTAGGGCGTTTTAAAATT 116659458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TAAAGTGCAGAAGGAATACATTGAACAGAATGTTATACACTTTTAGGGCGTTTTAAAATT 1980

116659459 TTTGGTCTAAGTCATGTCTCTAGCAGGCTAGACACCTGTTCCAGATATGTATTCTTAATA 116659518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TTTGGTCTAAGTCATGTCTCTAGCAGGCTAGACACCTGTTCCAGATATGTATTCTTAATA 2040

116659519 TAACAAAAATTATTTAAATATCTTACCATGTGTCACAGTTACATCAATAATATTTGGAAT 116659578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TAACAAAAATTATTTAAATATCTTACCATGTGTCACAGTTACATCAATAATATTTGGAAT 2100

116659579 CATACTGGACCCTTTGAAAATTTTCAGTATGAGTAAAAATGTTTATCTTAGAAGTAAGTG 116659638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CATACTGGACCCTTTGAAAATTTTCAGTATGAGTAAAAATGTTTATCTTAGAAGTAAGTG 2160

116659639 GAGGGGAAACATCCTTATTATTAAGTGCTAAGCCTTTTTAAAATGGTCTATGAAGATTCT 116659698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GAGGGGAAACATCCTTATTATTAAGTGCTAAGCCTTTTTAAAATGGTCTATGAAGATTCT 2220

116659699 AAATAGACTTCTGATTCCAAAATACCTATAACAATGAAGTCTTTGGCCATGGCTAATTAA 116659758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AAATAGACTTCTGATTCCAAAATACCTATAACAATGAAGTCTTTGGCCATGGCTAATTAA 2280

116659759 AAAAAAACATAAAACTCTAGAGACTGTCTCATTTATTAATTTGCCAAATTCTTCTTTCTT 116659818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AAAAAAACATAAAACTCTAGAGACTGTCTCATTTATTAATTTGCCAAATTCTTCTTTCTT 2340

116659819 TTAACATTTTCTTTATCCCACAGTATCTTTTCTTGCTTTTTGTGCTACCACACTATCAAA 116659878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TTAACATTTTCTTTATCCCACAGTATCTTTTCTTGCTTTTTGTGCTACCACACTATCAAA 2400

116659879 TTTTACTCTTTTTCTCCCAAATTTCTTTTTCTAACCATCGTCTTCCCCCTCTGATTGTAT 116659938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TTTTACTCTTTTTCTCCCAAATTTCTTTTTCTAACCATCGTCTTCCCCCTCTGATTGTAT 2460

116659939 CTGAAAATAACCACTTGCTTTTCTTCTTTTTTCTTTTTCTTTTTCTT 116659985
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CTGAAAATAACCACTTGCTTTTCTTCTTTTTTCTTTTTCTTTTTCTT 2507

EXCISED REGION

116660006 TTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCCTCTTTCCCTTTCCCTTTCTTTTC 116660065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2508 TTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCCTCTTTCCCTTTCCCTTTCTTTTC 2567

116660066 TTTTATTTTTTCTTCTCTCTTCTCTTCTCTTTTTCTGGGTTGCACTCTGTTACCCAAGCT 116660125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2568 TTTTATTTTTTCTTCTCTCTTCTCTTCTCTTTTTCTGGGTTGCACTCTGTTACCCAAGCT 2627

116660126 TGAATGCAATGGCAGGGATCACAGCTTACTGCAGTGTCAACCTCCTGGGCTCAGGTGATC 116660185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2628 TGAATGCAATGGCAGGGATCACAGCTTACTGCAGTGTCAACCTCCTGGGCTCAGGTGATC 2687

116660186 ATCCTCCTTCAGCCTCCTGTGTAGCTAGGACTGCAGGCATGTACCACCACACATGGCTAA 116660245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2688 ATCCTCCTTCAGCCTCCTGTGTAGCTAGGACTGCAGGCATGTACCACCACACATGGCTAA 2747

116660246 TTTTAGTATTTTTTGTAGAAATGAGAGTCTCACTGTGTTGTCCAGGTTTGTCTCAAACTC 116660305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2748 TTTTAGTATTTTTTGTAGAAATGAGAGTCTCACTGTGTTGTCCAGGTTTGTCTCAAACTC 2807

116660306 CCAGGTTCAAGCAATCCACCTGCCTCAGCCTCTCAAACTGCTGGGATTATAGGCATGTGC 116660365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2808 CCAGGTTCAAGCAATCCACCTGCCTCAGCCTCTCAAACTGCTGGGATTATAGGCATGTGC 2867

116660366 CACCATGCTGGGCCTCAAATTGACATTTTCTTAAAAATTGGACTGCCAAACAAGGACATT 116660425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2868 CACCATGCTGGGCCTCAAATTGACATTTTCTTAAAAATTGGACTGCCAAACAAGGACATT 2927

116660426 AGCCCTAGTAGGCAGAAGATACTATCTTGGTCTGTGTTAGAGGCAATTGTTGAAATTTCT 116660485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2928 AGCCCTAGTAGGCAGAAGATACTATCTTGGTCTGTGTTAGAGGCAATTGTTGAAATTTCT 2987

116660486 CTGAATCTCTATGGGATAGGCATAAATGTACTGATAAATTTGAGCAGTCCTGGGAATCCA 116660545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2988 CTGAATCTCTATGGGATAGGCATAAATGTACTGATAAATTTGAGCAGTCCTGGGAATCCA 3047

116660546 TAATCTCAATTTATTTGACCAATATCAATTAATACCATGTTGAGAGGTCCTTCTATTTCT 116660605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3048 TAATCTCAATTTATTTGACCAATATCAATTAATACCATGTTGAGAGGTCCTTCTATTTCT 3107

116660606 GAAGTCTGGTTCAGCAAAAAATAAAAAAAAAAATAAAATACCTGAAATAATGTAGCTATT 116660665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3108 GAAGTCTGGTTCAGCAAAAAATAAAAAAAAAAATAAAATACCTGAAATAATGTAGCTATT 3167

116660666 CCTGAGGTATCATTAACAGAATAGAAACTTAAAAAGCGCATGATATGGAAAAATCTTTGC 116660725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3168 CCTGAGGTATCATTAACAGAATAGAAACTTAAAAAGCGCATGATATGGAAAAATCTTTGC 3227

116660726 TGATGGTTATACATGTTAAGTTTCCAGATAACTATTAATTAGACTTGCAGACATAAAAGG 116660785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3228 TGATGGTTATACATGTTAAGTTTCCAGATAACTATTAATTAGACTTGCAGACATAAAAGG 3287

116660786 CTGTACCAAGTGGATATTTTAGAGATAAATTTTTAGCACTTACAGACAATATTATGAAGT 116660845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3288 CTGTACCAAGTGGATATTTTAGAGATAAATTTTTAGCACTTACAGACAATATTATGAAGT 3347

116660846 AGCTATGTGGGCATAGAGAAATTCGGGAAATTAGCAGGCTGGTTCTGCTATAATAGATCT 116660905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3348 AGCTATGTGGGCATAGAGAAATTCGGGAAATTAGCAGGCTGGTTCTGCTATAATAGATCT 3407

116660906 CAGTTCACCCTTAGGATATCTTCACTAAAGGAGCTTAACATAGCCCAGATGGTAGATTTG 116660965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3408 CAGTTCACCCTTAGGATATCTTCACTAAAGGAGCTTAACATAGCCCAGATGGTAGATTTG 3467

116660966 ATTGCCCTCATTAGAGCTGGTCACTTGGCCAAAGACAAAAAAAATTATATTTACACAGAA 116661025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3468 ATTGCCCTCATTAGAGCTGGTCACTTGGCCAAAGACAAAAAAAATTATATTTACACAGAA 3527

116661026 AATAGCTCAAGTACCTGAACCTCAGTATGACTATATATGGGGATAGAGTCTTTAAGGAAG 116661085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3528 AATAGCTCAAGTACCTGAACCTCAGTATGACTATATATGGGGATAGAGTCTTTAAGGAAG 3587

116661086 TGATTAAGGTTAAATAAAGTCATAATGATGGGGCCCTAATCTGATAAGATTAGCGTCCTT 116661145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3588 TGATTAAGGTTAAATAAAGTCATAATGATGGGGCCCTAATCTGATAAGATTAGCGTCCTT 3647

116661146 CTAAGAGGAGGAATCAACATCAGGGATTTTTTTTTCTCTCAACCCATGCCCAGAGGAAAG 116661205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3648 CTAAGAGGAGGAATCAACATCAGGGATTTTTTTTTCTCTCAACCCATGCCCAGAGGAAAG 3707

116661206 TCATATGAGGACGTAACACAAAGAGAGACATCTACAAATCACAGAGGTTGCACCAGAAAT 116661265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3708 TCATATGAGGACGTAACACAAAGAGAGACATCTACAAATCACAGAGGTTGCACCAGAAAT 3767

116661266 CAACCCTGCTAGCATATCGATCTTGAACTTCTAGTCCCCAGAACTGTGAGGAAATAAATT 116661325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3768 CAACCCTGCTAGCATATCGATCTTGAACTTCTAGTCCCCAGAACTGTGAGGAAATAAATT 3827

116661326 TTTGTTGCTTATGCCACCAGATCTGTGACATTTTGTTATGGAAGTCTGAGCTGACCAATA 116661385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3828 TTTGTTGCTTATGCCACCAGATCTGTGACATTTTGTTATGGAAGTCTGAGCTGACCAATA 3887

116661386 CACTTGAATAACTATCAGTGTCAATGTAAAACAAGCCATCTTTAGACTTAAGGAAACAGT 116661445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3888 CACTTGAATAACTATCAGTGTCAATGTAAAACAAGCCATCTTTAGACTTAAGGAAACAGT 3947

116661446 CACCTGGCTCTCTAAGGCAGATGCAAATGGATTTTTCTTTGCCCGGGTTTAGTAATTCAG 116661505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3948 CACCTGGCTCTCTAAGGCAGATGCAAATGGATTTTTCTTTGCCCGGGTTTAGTAATTCAG 4007

116661506 ATTATGGCACTAAGTGTTTTGGGAAGGCTCCATGTCATTTTGATATAGTCACTGTGTGTT 116661565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4008 ATTATGGCACTAAGTGTTTTGGGAAGGCTCCATGTCATTTTGATATAGTCACTGTGTGTT 4067

116661566 GCCATTCTTATGCATGTATTCTCCACAGTCTCAGTCCTGCTCTGCAGCTGCTCTCGTGTC 116661625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4068 GCCATTCTTATGCATGTATTCTCCACAGTCTCAGTCCTGCTCTGCAGCTGCTCTCGTGTC 4127

116661626 AAATGATCCATCACTCAACGGAAATGAACTCATCACTCCATAAAAGGAATAGGAAGATCA 116661685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4128 AAATGATCCATCACTCAACGGAAATGAACTCATCACTCCATAAAAGGAATAGGAAGATCA 4187

116661686 GTCCATGATCCAATCCCAAACTATTTTTTCTGAGGATGATAATGTTATCTAGAAATCACA 116661745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4188 GTCCATGATCCAATCCCAAACTATTTTTTCTGAGGATGATAATGTTATCTAGAAATCACA 4247

116661746 ACAGTGGTATACATCTGAACATGGCTGCTTTAGTAGCTGAACGACTCTTCTCATCTTCTC 116661805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4248 ACAGTGGTATACATCTGAACATGGCTGCTTTAGTAGCTGAACGACTCTTCTCATCTTCTC 4307

116661806 ATCAGTTAGGAAAGACTGAGAACTGGTAGCATAAATCCATCAATTATGGGATTGCAATTG 116661865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4308 ATCAGTTAGGAAAGACTGAGAACTGGTAGCATAAATCCATCAATTATGGGATTGCAATTG 4367

116661866 CAGAATGTTTTGTGACTCACATAATGTTTTCTTCTTTACTCAGAACTTCTCTATTTCACA 116661925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4368 CAGAATGTTTTGTGACTCACATAATGTTTTCTTCTTTACTCAGAACTTCTCTATTTCACA 4427

116661926 GATTCTCACCTTAATAATTGAAGCAACTCAGGGTCACATCCTAGTTCTATAATTCTGCCT 116661985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4428 GATTCTCACCTTAATAATTGAAGCAACTCAGGGTCACATCCTAGTTCTATAATTCTGCCT 4487

116661986 GAGGCACTCTGAGCCCAAACCATCAACAGGAAACAAACAAATAAAAAACCTGCTAATTTA 116662045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4488 GAGGCACTCTGAGCCCAAACCATCAACAGGAAACAAACAAATAAAAAACCTGCTAATTTA 4547

116662046 CTCTCCAATGAAACCTTTCCAGAATTATCTGTGTAGAGTTTCCTATTGCTGCAATAATTA 116662105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4548 CTCTCCAATGAAACCTTTCCAGAATTATCTGTGTAGAGTTTCCTATTGCTGCAATAATTA 4607

116662106 ATAAACTCAGTTTGCTTATATTGCAAATTTTAAAACTCGTAGTGGGAGATTTCCAGTTGC 116662165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4608 ATAAACTCAGTTTGCTTATATTGCAAATTTTAAAACTCGTAGTGGGAGATTTCCAGTTGC 4667

116662166 AAACAACAAGTCTTGGCTTTAATTATGAGTTCAACCAGTTTTTTTTCTCCTAATGTTTTA 116662225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4668 AAACAACAAGTCTTGGCTTTAATTATGAGTTCAACCAGTTTTTTTTCTCCTAATGTTTTA 4727

116662226 AATCTCAGTTCATCATAATGTCTGAGCTTGTCTGATTTTGGCATAGGGAATATAATTAGA 116662285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4728 AATCTCAGTTCATCATAATGTCTGAGCTTGTCTGATTTTGGCATAGGGAATATAATTAGA 4787

116662286 AGTAGTGAATGAAGGCCTAGCTGTTGCTTTGATGTCAGCAGACACCCATTTCTCTTTCCA 116662345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4788 AGTAGTGAATGAAGGCCTAGCTGTTGCTTTGATGTCAGCAGACACCCATTTCTCTTTCCA 4847

116662346 AACTGCTTTTAAAAAGTCAAACAACTTCCTTCTCTTCTTGCCTCA 116662390
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4848 AACTGCTTTTAAAAAGTCAAACAACTTCCTTCTCTTCTTGCCTCA 4892

Alignment time is 5.86562 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [116652076,116672656] =>     20581 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [        1,     4382] =>      4382 nucs 'mol-32-2076-054804_4382'

Score:        4382
Aligned:      4382        nucs
Identic:      4382 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [116658306,116662687]
 second seq =>  [        1,     4382]

116658306 CCTTACTTCTTTCTTCCCCTTCTCTTATTTTTTCTCTTTCTCTCCAACTTCATCTCTTTA 116658365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCTTACTTCTTTCTTCCCCTTCTCTTATTTTTTCTCTTTCTCTCCAACTTCATCTCTTTA 60

116658366 TTAATTTCCTTCTCTCCTTTTAAGTTTTGGTAACTGTTTTTCATTTGGCCAGCTCTCAGT 116658425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTAATTTCCTTCTCTCCTTTTAAGTTTTGGTAACTGTTTTTCATTTGGCCAGCTCTCAGT 120

116658426 ATACCTTATTTGTGTTGGGTACCAAAGCAAACATCCTCACCAGTGATGCAAGACTGAAGA 116658485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATACCTTATTTGTGTTGGGTACCAAAGCAAACATCCTCACCAGTGATGCAAGACTGAAGA 180

116658486 AGTGTGATCATTAGCTCTGCAATCACAACCACAAAACACCTGTGGCTTGCCTAAAACCTT 116658545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGTGTGATCATTAGCTCTGCAATCACAACCACAAAACACCTGTGGCTTGCCTAAAACCTT 240

116658546 CTTCTGTTAGACCCTTTCCTTACTTGGAAACAATCTCATCTTAAGAAATCAAGCAATACT 116658605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTTCTGTTAGACCCTTTCCTTACTTGGAAACAATCTCATCTTAAGAAATCAAGCAATACT 300

116658606 TGAAGAAATTTTGAGGAACCCATAAGCAAGAAAAACTGTATACTCATTTCCCTTAACATG 116658665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGAAGAAATTTTGAGGAACCCATAAGCAAGAAAAACTGTATACTCATTTCCCTTAACATG 360

116658666 ATACCATTTCACAGTTACCTGTGTGGTGCTTTTCATTGCTATAGAAATCGAATTAAACTC 116658725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATACCATTTCACAGTTACCTGTGTGGTGCTTTTCATTGCTATAGAAATCGAATTAAACTC 420

116658726 AGTGTGATTGTAGCATAATGGGATACTTCACTTGAGAAAGGGGATTTTTATAATTTGGAG 116658785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGTGTGATTGTAGCATAATGGGATACTTCACTTGAGAAAGGGGATTTTTATAATTTGGAG 480

116658786 AAGCATTGAGAGTCAGCAGTGAATATTCATGACACGGGCTAGGACCATTTAAACAGACGA 116658845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAGCATTGAGAGTCAGCAGTGAATATTCATGACACGGGCTAGGACCATTTAAACAGACGA 540

116658846 CTTCTAGGAGAGTCTCTTGAGGACATTTAATCTCTTGTGCTTGACCATCCTGACCCAAGG 116658905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTTCTAGGAGAGTCTCTTGAGGACATTTAATCTCTTGTGCTTGACCATCCTGACCCAAGG 600

116658906 TGAGTTTGAGTCTCAAATACATTAAAATTCTCAAACCATTAGTTTTATTTTGTTCCTGTA 116658965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGAGTTTGAGTCTCAAATACATTAAAATTCTCAAACCATTAGTTTTATTTTGTTCCTGTA 660

116658966 AACCTAAAGTTTAACTTTCAGAATACTTTTTCTCATTAGAATTATATGTTTAAAAATTCT 116659025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AACCTAAAGTTTAACTTTCAGAATACTTTTTCTCATTAGAATTATATGTTTAAAAATTCT 720

116659026 TGGTGACATTCCATTCTTCACCTAATCTCACGTTTGTCTTGTTCTGTTTTGTCAAAAATG 116659085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGGTGACATTCCATTCTTCACCTAATCTCACGTTTGTCTTGTTCTGTTTTGTCAAAAATG 780

116659086 TTTTCCTAAAAATGAAAAAGAAAACCTCTAGAATGATTAATCGAGTGAGATTCTCAATAA 116659145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTTTCCTAAAAATGAAAAAGAAAACCTCTAGAATGATTAATCGAGTGAGATTCTCAATAA 840

116659146 ATCTGCAACTAAAACCATCCGTAAGTCCTAACAAGTTTCAATTTTTATCACGTTAGTGTC 116659205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATCTGCAACTAAAACCATCCGTAAGTCCTAACAAGTTTCAATTTTTATCACGTTAGTGTC 900

116659206 TTTTAGTAGATAAACTTTGCTCTAGGTCACTATCCAAAAAACTTATGTGAGTTCTGTTGA 116659265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTTTAGTAGATAAACTTTGCTCTAGGTCACTATCCAAAAAACTTATGTGAGTTCTGTTGA 960

116659266 TTGTATCCTGCCTTTGTGTTCCTAAGAGTTGATTTGGGAAGCAAAATCCCCCAAAAATCT 116659325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTGTATCCTGCCTTTGTGTTCCTAAGAGTTGATTTGGGAAGCAAAATCCCCCAAAAATCT 1020

116659326 ATATTCTCAGGCCCATGGATAGTTAGAACGCAGGCTACAGATGTCAAACTCTCTAGTCAG 116659385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATATTCTCAGGCCCATGGATAGTTAGAACGCAGGCTACAGATGTCAAACTCTCTAGTCAG 1080

116659386 GGGTCATGCCTAATAAAGTGCAGAAGGAATACATTGAACAGAATGTTATACACTTTTAGG 116659445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GGGTCATGCCTAATAAAGTGCAGAAGGAATACATTGAACAGAATGTTATACACTTTTAGG 1140

116659446 GCGTTTTAAAATTTTTGGTCTAAGTCATGTCTCTAGCAGGCTAGACACCTGTTCCAGATA 116659505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GCGTTTTAAAATTTTTGGTCTAAGTCATGTCTCTAGCAGGCTAGACACCTGTTCCAGATA 1200

116659506 TGTATTCTTAATATAACAAAAATTATTTAAATATCTTACCATGTGTCACAGTTACATCAA 116659565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TGTATTCTTAATATAACAAAAATTATTTAAATATCTTACCATGTGTCACAGTTACATCAA 1260

116659566 TAATATTTGGAATCATACTGGACCCTTTGAAAATTTTCAGTATGAGTAAAAATGTTTATC 116659625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TAATATTTGGAATCATACTGGACCCTTTGAAAATTTTCAGTATGAGTAAAAATGTTTATC 1320

116659626 TTAGAAGTAAGTGGAGGGGAAACATCCTTATTATTAAGTGCTAAGCCTTTTTAAAATGGT 116659685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTAGAAGTAAGTGGAGGGGAAACATCCTTATTATTAAGTGCTAAGCCTTTTTAAAATGGT 1380

116659686 CTATGAAGATTCTAAATAGACTTCTGATTCCAAAATACCTATAACAATGAAGTCTTTGGC 116659745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CTATGAAGATTCTAAATAGACTTCTGATTCCAAAATACCTATAACAATGAAGTCTTTGGC 1440

116659746 CATGGCTAATTAAAAAAAAACATAAAACTCTAGAGACTGTCTCATTTATTAATTTGCCAA 116659805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CATGGCTAATTAAAAAAAAACATAAAACTCTAGAGACTGTCTCATTTATTAATTTGCCAA 1500

116659806 ATTCTTCTTTCTTTTAACATTTTCTTTATCCCACAGTATCTTTTCTTGCTTTTTGTGCTA 116659865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATTCTTCTTTCTTTTAACATTTTCTTTATCCCACAGTATCTTTTCTTGCTTTTTGTGCTA 1560

116659866 CCACACTATCAAATTTTACTCTTTTTCTCCCAAATTTCTTTTTCTAACCATCGTCTTCCC 116659925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CCACACTATCAAATTTTACTCTTTTTCTCCCAAATTTCTTTTTCTAACCATCGTCTTCCC 1620

116659926 CCTCTGATTGTATCTGAAAATAACCACTTGCTTTTCTTCTTTTTTCTTTTTCTTTTTCTT 116659985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CCTCTGATTGTATCTGAAAATAACCACTTGCTTTTCTTCTTTTTTCTTTTTCTTTTTCTT 1680

116659986 TTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCCTCT 116660045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCCTCT 1740

116660046 TTCCCTTTCCCTTTCTTTTCTTTTATTTTTTCTTCTCTCTTCTCTTCTCTTTTTCTGGGT 116660105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TTCCCTTTCCCTTTCTTTTCTTTTATTTTTTCTTCTCTCTTCTCTTCTCTTTTTCTGGGT 1800

116660106 TGCACTCTGTTACCCAAGCTTGAATGCAATGGCAGGGATCACAGCTTACTGCAGTGTCAA 116660165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TGCACTCTGTTACCCAAGCTTGAATGCAATGGCAGGGATCACAGCTTACTGCAGTGTCAA 1860

116660166 CCTCCTGGGCTCAGGTGATCATCCTCCTTCAGCCTCCTGTGTAGCTAGGACTGCAGGCAT 116660225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CCTCCTGGGCTCAGGTGATCATCCTCCTTCAGCCTCCTGTGTAGCTAGGACTGCAGGCAT 1920

116660226 GTACCACCACACATGGCTAATTTTAGTATTTTTTGTAGAAATGAGAGTCTCACTGTGTTG 116660285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GTACCACCACACATGGCTAATTTTAGTATTTTTTGTAGAAATGAGAGTCTCACTGTGTTG 1980

116660286 TCCAGGTTTGTCTCAAACTCCCAGGTTCAAGCAATCCACCTGCCTCAGCCTCTCAAACTG 116660345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TCCAGGTTTGTCTCAAACTCCCAGGTTCAAGCAATCCACCTGCCTCAGCCTCTCAAACTG 2040

116660346 CTGGGATTATAGGCATGTGCCACCATGCTGGGCCTCAAATTGACATTTTCTTAAAAATTG 116660405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CTGGGATTATAGGCATGTGCCACCATGCTGGGCCTCAAATTGACATTTTCTTAAAAATTG 2100

116660406 GACTGCCAAACAAGGACATTAGCCCTAGTAGGCAGAAGATACTATCTTGGTCTGTGTTAG 116660465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GACTGCCAAACAAGGACATTAGCCCTAGTAGGCAGAAGATACTATCTTGGTCTGTGTTAG 2160

116660466 AGGCAATTGTTGAAATTTCTCTGAATCTCTATGGGATAGGCATAAATGTACTGATAAATT 116660525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AGGCAATTGTTGAAATTTCTCTGAATCTCTATGGGATAGGCATAAATGTACTGATAAATT 2220

116660526 TGAGCAGTCCTGGGAATCCATAATCTCAATTTATTTGACCAATATCAATTAATACCATGT 116660585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TGAGCAGTCCTGGGAATCCATAATCTCAATTTATTTGACCAATATCAATTAATACCATGT 2280

116660586 TGAGAGGTCCTTCTATTTCTGAAGTCTGGTTCAGCAAAAAATAAAAAAAAAAATAAAATA 116660645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TGAGAGGTCCTTCTATTTCTGAAGTCTGGTTCAGCAAAAAATAAAAAAAAAAATAAAATA 2340

116660646 CCTGAAATAATGTAGCTATTCCTGAGGTATCATTAACAGAATAGAAACTTAAAAAGCGCA 116660705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CCTGAAATAATGTAGCTATTCCTGAGGTATCATTAACAGAATAGAAACTTAAAAAGCGCA 2400

116660706 TGATATGGAAAAATCTTTGCTGATGGTTATACATGTTAAGTTTCCAGATAACTATTAATT 116660765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TGATATGGAAAAATCTTTGCTGATGGTTATACATGTTAAGTTTCCAGATAACTATTAATT 2460

116660766 AGACTTGCAGACATAAAAGGCTGTACCAAGTGGATATTTTAGAGATAAATTTTTAGCACT 116660825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AGACTTGCAGACATAAAAGGCTGTACCAAGTGGATATTTTAGAGATAAATTTTTAGCACT 2520

116660826 TACAGACAATATTATGAAGTAGCTATGTGGGCATAGAGAAATTCGGGAAATTAGCAGGCT 116660885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TACAGACAATATTATGAAGTAGCTATGTGGGCATAGAGAAATTCGGGAAATTAGCAGGCT 2580

116660886 GGTTCTGCTATAATAGATCTCAGTTCACCCTTAGGATATCTTCACTAAAGGAGCTTAACA 116660945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GGTTCTGCTATAATAGATCTCAGTTCACCCTTAGGATATCTTCACTAAAGGAGCTTAACA 2640

116660946 TAGCCCAGATGGTAGATTTGATTGCCCTCATTAGAGCTGGTCACTTGGCCAAAGACAAAA 116661005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TAGCCCAGATGGTAGATTTGATTGCCCTCATTAGAGCTGGTCACTTGGCCAAAGACAAAA 2700

116661006 AAAATTATATTTACACAGAAAATAGCTCAAGTACCTGAACCTCAGTATGACTATATATGG 116661065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AAAATTATATTTACACAGAAAATAGCTCAAGTACCTGAACCTCAGTATGACTATATATGG 2760

116661066 GGATAGAGTCTTTAAGGAAGTGATTAAGGTTAAATAAAGTCATAATGATGGGGCCCTAAT 116661125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GGATAGAGTCTTTAAGGAAGTGATTAAGGTTAAATAAAGTCATAATGATGGGGCCCTAAT 2820

116661126 CTGATAAGATTAGCGTCCTTCTAAGAGGAGGAATCAACATCAGGGATTTTTTTTTCTCTC 116661185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CTGATAAGATTAGCGTCCTTCTAAGAGGAGGAATCAACATCAGGGATTTTTTTTTCTCTC 2880

116661186 AACCCATGCCCAGAGGAAAGTCATATGAGGACGTAACACAAAGAGAGACATCTACAAATC 116661245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 AACCCATGCCCAGAGGAAAGTCATATGAGGACGTAACACAAAGAGAGACATCTACAAATC 2940

116661246 ACAGAGGTTGCACCAGAAATCAACCCTGCTAGCATATCGATCTTGAACTTCTAGTCCCCA 116661305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 ACAGAGGTTGCACCAGAAATCAACCCTGCTAGCATATCGATCTTGAACTTCTAGTCCCCA 3000

116661306 GAACTGTGAGGAAATAAATTTTTGTTGCTTATGCCACCAGATCTGTGACATTTTGTTATG 116661365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GAACTGTGAGGAAATAAATTTTTGTTGCTTATGCCACCAGATCTGTGACATTTTGTTATG 3060

116661366 GAAGTCTGAGCTGACCAATACACTTGAATAACTATCAGTGTCAATGTAAAACAAGCCATC 116661425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 GAAGTCTGAGCTGACCAATACACTTGAATAACTATCAGTGTCAATGTAAAACAAGCCATC 3120

116661426 TTTAGACTTAAGGAAACAGTCACCTGGCTCTCTAAGGCAGATGCAAATGGATTTTTCTTT 116661485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TTTAGACTTAAGGAAACAGTCACCTGGCTCTCTAAGGCAGATGCAAATGGATTTTTCTTT 3180

116661486 GCCCGGGTTTAGTAATTCAGATTATGGCACTAAGTGTTTTGGGAAGGCTCCATGTCATTT 116661545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 GCCCGGGTTTAGTAATTCAGATTATGGCACTAAGTGTTTTGGGAAGGCTCCATGTCATTT 3240

116661546 TGATATAGTCACTGTGTGTTGCCATTCTTATGCATGTATTCTCCACAGTCTCAGTCCTGC 116661605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TGATATAGTCACTGTGTGTTGCCATTCTTATGCATGTATTCTCCACAGTCTCAGTCCTGC 3300

116661606 TCTGCAGCTGCTCTCGTGTCAAATGATCCATCACTCAACGGAAATGAACTCATCACTCCA 116661665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TCTGCAGCTGCTCTCGTGTCAAATGATCCATCACTCAACGGAAATGAACTCATCACTCCA 3360

116661666 TAAAAGGAATAGGAAGATCAGTCCATGATCCAATCCCAAACTATTTTTTCTGAGGATGAT 116661725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TAAAAGGAATAGGAAGATCAGTCCATGATCCAATCCCAAACTATTTTTTCTGAGGATGAT 3420

116661726 AATGTTATCTAGAAATCACAACAGTGGTATACATCTGAACATGGCTGCTTTAGTAGCTGA 116661785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 AATGTTATCTAGAAATCACAACAGTGGTATACATCTGAACATGGCTGCTTTAGTAGCTGA 3480

116661786 ACGACTCTTCTCATCTTCTCATCAGTTAGGAAAGACTGAGAACTGGTAGCATAAATCCAT 116661845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 ACGACTCTTCTCATCTTCTCATCAGTTAGGAAAGACTGAGAACTGGTAGCATAAATCCAT 3540

116661846 CAATTATGGGATTGCAATTGCAGAATGTTTTGTGACTCACATAATGTTTTCTTCTTTACT 116661905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 CAATTATGGGATTGCAATTGCAGAATGTTTTGTGACTCACATAATGTTTTCTTCTTTACT 3600

116661906 CAGAACTTCTCTATTTCACAGATTCTCACCTTAATAATTGAAGCAACTCAGGGTCACATC 116661965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 CAGAACTTCTCTATTTCACAGATTCTCACCTTAATAATTGAAGCAACTCAGGGTCACATC 3660

116661966 CTAGTTCTATAATTCTGCCTGAGGCACTCTGAGCCCAAACCATCAACAGGAAACAAACAA 116662025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 CTAGTTCTATAATTCTGCCTGAGGCACTCTGAGCCCAAACCATCAACAGGAAACAAACAA 3720

116662026 ATAAAAAACCTGCTAATTTACTCTCCAATGAAACCTTTCCAGAATTATCTGTGTAGAGTT 116662085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 ATAAAAAACCTGCTAATTTACTCTCCAATGAAACCTTTCCAGAATTATCTGTGTAGAGTT 3780

116662086 TCCTATTGCTGCAATAATTAATAAACTCAGTTTGCTTATATTGCAAATTTTAAAACTCGT 116662145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 TCCTATTGCTGCAATAATTAATAAACTCAGTTTGCTTATATTGCAAATTTTAAAACTCGT 3840

116662146 AGTGGGAGATTTCCAGTTGCAAACAACAAGTCTTGGCTTTAATTATGAGTTCAACCAGTT 116662205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 AGTGGGAGATTTCCAGTTGCAAACAACAAGTCTTGGCTTTAATTATGAGTTCAACCAGTT 3900

116662206 TTTTTTCTCCTAATGTTTTAAATCTCAGTTCATCATAATGTCTGAGCTTGTCTGATTTTG 116662265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 TTTTTTCTCCTAATGTTTTAAATCTCAGTTCATCATAATGTCTGAGCTTGTCTGATTTTG 3960

116662266 GCATAGGGAATATAATTAGAAGTAGTGAATGAAGGCCTAGCTGTTGCTTTGATGTCAGCA 116662325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 GCATAGGGAATATAATTAGAAGTAGTGAATGAAGGCCTAGCTGTTGCTTTGATGTCAGCA 4020

116662326 GACACCCATTTCTCTTTCCAAACTGCTTTTAAAAAGTCAAACAACTTCCTTCTCTTCTTG 116662385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 GACACCCATTTCTCTTTCCAAACTGCTTTTAAAAAGTCAAACAACTTCCTTCTCTTCTTG 4080

116662386 CCTCACTCTCTACTTAATGTGATTTTCTTTTAATTTATGAAGGAAATAAAATCATTGCTT 116662445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 CCTCACTCTCTACTTAATGTGATTTTCTTTTAATTTATGAAGGAAATAAAATCATTGCTT 4140

116662446 TTTAAGAATCATCCAACCAAGTCATTAAAGATATCTGGAATTCAAGATGTAGTCAAAATA 116662505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 TTTAAGAATCATCCAACCAAGTCATTAAAGATATCTGGAATTCAAGATGTAGTCAAAATA 4200

116662506 TTTCAAGGGCATTACAATATCCTCTGTCTTCTCTAATCTCTCAGGCAGTAAAACGGTACC 116662565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 TTTCAAGGGCATTACAATATCCTCTGTCTTCTCTAATCTCTCAGGCAGTAAAACGGTACC 4260

116662566 AAGTGCAGAGATAGAAACACTGCTGTCAAAGTGGGTTAAAATCTTGACAGTATCGTGGCT 116662625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 AAGTGCAGAGATAGAAACACTGCTGTCAAAGTGGGTTAAAATCTTGACAGTATCGTGGCT 4320

116662626 TCTGATTTTAATTTCTCAATTAACTTATACAAATGAATAACTACCGTTATAGAAATAGCT 116662685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 TCTGATTTTAATTTCTCAATTAACTTATACAAATGAATAACTACCGTTATAGAAATAGCT 4380

116662686 TC 116662687
          ||
     4381 TC 4382

Alignment time is 4.80031 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [116652076,116672656] =>     20581 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [        1,     3579] =>      3579 nucs 'mol-32-220d-006601_3579'

Score:        3568
Aligned:      3579        nucs
Identic:      3578 (100%) nucs =>      2289 (100%)      1289 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [116661226,116663514] EXCISED REGION [116663516,116664805]
 second seq =>  [        1,     2289] EXCISED REGION [     2291,     3579]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [116663515,116663515]
 second seq =>         1 nucs [2290,2290]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [116663606,116663606]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [116663515,116663516] to [116663516,116663517]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

116661226 AAGAGAGACATCTACAAATCACAGAGGTTGCACCAGAAATCAACCCTGCTAGCATATCGA 116661285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAGAGAGACATCTACAAATCACAGAGGTTGCACCAGAAATCAACCCTGCTAGCATATCGA 60

116661286 TCTTGAACTTCTAGTCCCCAGAACTGTGAGGAAATAAATTTTTGTTGCTTATGCCACCAG 116661345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCTTGAACTTCTAGTCCCCAGAACTGTGAGGAAATAAATTTTTGTTGCTTATGCCACCAG 120

116661346 ATCTGTGACATTTTGTTATGGAAGTCTGAGCTGACCAATACACTTGAATAACTATCAGTG 116661405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATCTGTGACATTTTGTTATGGAAGTCTGAGCTGACCAATACACTTGAATAACTATCAGTG 180

116661406 TCAATGTAAAACAAGCCATCTTTAGACTTAAGGAAACAGTCACCTGGCTCTCTAAGGCAG 116661465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCAATGTAAAACAAGCCATCTTTAGACTTAAGGAAACAGTCACCTGGCTCTCTAAGGCAG 240

116661466 ATGCAAATGGATTTTTCTTTGCCCGGGTTTAGTAATTCAGATTATGGCACTAAGTGTTTT 116661525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATGCAAATGGATTTTTCTTTGCCCGGGTTTAGTAATTCAGATTATGGCACTAAGTGTTTT 300

116661526 GGGAAGGCTCCATGTCATTTTGATATAGTCACTGTGTGTTGCCATTCTTATGCATGTATT 116661585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GGGAAGGCTCCATGTCATTTTGATATAGTCACTGTGTGTTGCCATTCTTATGCATGTATT 360

116661586 CTCCACAGTCTCAGTCCTGCTCTGCAGCTGCTCTCGTGTCAAATGATCCATCACTCAACG 116661645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTCCACAGTCTCAGTCCTGCTCTGCAGCTGCTCTCGTGTCAAATGATCCATCACTCAACG 420

116661646 GAAATGAACTCATCACTCCATAAAAGGAATAGGAAGATCAGTCCATGATCCAATCCCAAA 116661705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GAAATGAACTCATCACTCCATAAAAGGAATAGGAAGATCAGTCCATGATCCAATCCCAAA 480

116661706 CTATTTTTTCTGAGGATGATAATGTTATCTAGAAATCACAACAGTGGTATACATCTGAAC 116661765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTATTTTTTCTGAGGATGATAATGTTATCTAGAAATCACAACAGTGGTATACATCTGAAC 540

116661766 ATGGCTGCTTTAGTAGCTGAACGACTCTTCTCATCTTCTCATCAGTTAGGAAAGACTGAG 116661825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATGGCTGCTTTAGTAGCTGAACGACTCTTCTCATCTTCTCATCAGTTAGGAAAGACTGAG 600

116661826 AACTGGTAGCATAAATCCATCAATTATGGGATTGCAATTGCAGAATGTTTTGTGACTCAC 116661885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AACTGGTAGCATAAATCCATCAATTATGGGATTGCAATTGCAGAATGTTTTGTGACTCAC 660

116661886 ATAATGTTTTCTTCTTTACTCAGAACTTCTCTATTTCACAGATTCTCACCTTAATAATTG 116661945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATAATGTTTTCTTCTTTACTCAGAACTTCTCTATTTCACAGATTCTCACCTTAATAATTG 720

116661946 AAGCAACTCAGGGTCACATCCTAGTTCTATAATTCTGCCTGAGGCACTCTGAGCCCAAAC 116662005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAGCAACTCAGGGTCACATCCTAGTTCTATAATTCTGCCTGAGGCACTCTGAGCCCAAAC 780

116662006 CATCAACAGGAAACAAACAAATAAAAAACCTGCTAATTTACTCTCCAATGAAACCTTTCC 116662065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CATCAACAGGAAACAAACAAATAAAAAACCTGCTAATTTACTCTCCAATGAAACCTTTCC 840

116662066 AGAATTATCTGTGTAGAGTTTCCTATTGCTGCAATAATTAATAAACTCAGTTTGCTTATA 116662125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGAATTATCTGTGTAGAGTTTCCTATTGCTGCAATAATTAATAAACTCAGTTTGCTTATA 900

116662126 TTGCAAATTTTAAAACTCGTAGTGGGAGATTTCCAGTTGCAAACAACAAGTCTTGGCTTT 116662185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTGCAAATTTTAAAACTCGTAGTGGGAGATTTCCAGTTGCAAACAACAAGTCTTGGCTTT 960

116662186 AATTATGAGTTCAACCAGTTTTTTTTCTCCTAATGTTTTAAATCTCAGTTCATCATAATG 116662245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AATTATGAGTTCAACCAGTTTTTTTTCTCCTAATGTTTTAAATCTCAGTTCATCATAATG 1020

116662246 TCTGAGCTTGTCTGATTTTGGCATAGGGAATATAATTAGAAGTAGTGAATGAAGGCCTAG 116662305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TCTGAGCTTGTCTGATTTTGGCATAGGGAATATAATTAGAAGTAGTGAATGAAGGCCTAG 1080

116662306 CTGTTGCTTTGATGTCAGCAGACACCCATTTCTCTTTCCAAACTGCTTTTAAAAAGTCAA 116662365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTGTTGCTTTGATGTCAGCAGACACCCATTTCTCTTTCCAAACTGCTTTTAAAAAGTCAA 1140

116662366 ACAACTTCCTTCTCTTCTTGCCTCACTCTCTACTTAATGTGATTTTCTTTTAATTTATGA 116662425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ACAACTTCCTTCTCTTCTTGCCTCACTCTCTACTTAATGTGATTTTCTTTTAATTTATGA 1200

116662426 AGGAAATAAAATCATTGCTTTTTAAGAATCATCCAACCAAGTCATTAAAGATATCTGGAA 116662485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AGGAAATAAAATCATTGCTTTTTAAGAATCATCCAACCAAGTCATTAAAGATATCTGGAA 1260

116662486 TTCAAGATGTAGTCAAAATATTTCAAGGGCATTACAATATCCTCTGTCTTCTCTAATCTC 116662545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTCAAGATGTAGTCAAAATATTTCAAGGGCATTACAATATCCTCTGTCTTCTCTAATCTC 1320

116662546 TCAGGCAGTAAAACGGTACCAAGTGCAGAGATAGAAACACTGCTGTCAAAGTGGGTTAAA 116662605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TCAGGCAGTAAAACGGTACCAAGTGCAGAGATAGAAACACTGCTGTCAAAGTGGGTTAAA 1380

116662606 ATCTTGACAGTATCGTGGCTTCTGATTTTAATTTCTCAATTAACTTATACAAATGAATAA 116662665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ATCTTGACAGTATCGTGGCTTCTGATTTTAATTTCTCAATTAACTTATACAAATGAATAA 1440

116662666 CTACCGTTATAGAAATAGCTTCTGGATTTCTTTGTCCTTTTTTTCCTGAAGTTAGGCTAT 116662725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTACCGTTATAGAAATAGCTTCTGGATTTCTTTGTCCTTTTTTTCCTGAAGTTAGGCTAT 1500

116662726 ATTTGGTATCTCTATAGAGATAGGCTATATTTGGTAAATCTGTTCTCACCTCACATAAAA 116662785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATTTGGTATCTCTATAGAGATAGGCTATATTTGGTAAATCTGTTCTCACCTCACATAAAA 1560

116662786 GGTTAATATTCTACAAGTGGATAGATGTGGTGAGGACAACTAAAAGGAGATTGAATGATC 116662845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GGTTAATATTCTACAAGTGGATAGATGTGGTGAGGACAACTAAAAGGAGATTGAATGATC 1620

116662846 TCATCAAATTATATTACACAACCTTTCAAAGAAAGCTCAGTTGGATTAAGAGGTTTCTTT 116662905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TCATCAAATTATATTACACAACCTTTCAAAGAAAGCTCAGTTGGATTAAGAGGTTTCTTT 1680

116662906 ATGTTCATGCCCAAAATGCCAAATTCCAACAGCCCACAAAATTTCTTTGAAGTATTTTTC 116662965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ATGTTCATGCCCAAAATGCCAAATTCCAACAGCCCACAAAATTTCTTTGAAGTATTTTTC 1740

116662966 TCATACGTTTGTTTGATGAACAGCTTAAAGCTCCATTTCCATCCTAGCAAGTGGCAGACA 116663025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TCATACGTTTGTTTGATGAACAGCTTAAAGCTCCATTTCCATCCTAGCAAGTGGCAGACA 1800

116663026 AAAAGCCAGATAGTAAATCATATTTTAATAAAAATGATTTTAATAAGTGAAAGATATGAT 116663085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AAAAGCCAGATAGTAAATCATATTTTAATAAAAATGATTTTAATAAGTGAAAGATATGAT 1860

116663086 CCATTAAGTTAATCTTGTTAAGTAGAAGACCAAAATGAGAACTTAATGGGGTGCAAACAT 116663145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CCATTAAGTTAATCTTGTTAAGTAGAAGACCAAAATGAGAACTTAATGGGGTGCAAACAT 1920

116663146 CACGGAGAATCAAAACACACACTAGAAACCATACTTGAGAACCAGAGATGAGTGAATGTT 116663205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CACGGAGAATCAAAACACACACTAGAAACCATACTTGAGAACCAGAGATGAGTGAATGTT 1980

116663206 TGGTCATCAATATCCATGCTAGCCTTAATCTTGTGGTTATCCCACCACATCCCCCTTTTC 116663265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TGGTCATCAATATCCATGCTAGCCTTAATCTTGTGGTTATCCCACCACATCCCCCTTTTC 2040

116663266 AACAGAAGTCAGTGAGCAGCAAGCCTCATTGAATGTTGGATATTAGCAAGCACATGTAGT 116663325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AACAGAAGTCAGTGAGCAGCAAGCCTCATTGAATGTTGGATATTAGCAAGCACATGTAGT 2100

116663326 TTTGCTTCAAGTACTCTTTATTTTCTTCCAATCCTCAGGGCCTTTCTCAACATATGGTTT 116663385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TTTGCTTCAAGTACTCTTTATTTTCTTCCAATCCTCAGGGCCTTTCTCAACATATGGTTT 2160

116663386 ATTATAGCGTTGTGAATGATTGGTCTTTCATAAGGACATTTTCCTTGGCAGAAGGCTATT 116663445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ATTATAGCGTTGTGAATGATTGGTCTTTCATAAGGACATTTTCCTTGGCAGAAGGCTATT 2220

116663446 TGAAGTTCATTGCTTTTACAAGGTAAGATTTCTGGAAGTTCTAAGCTATATAAATAGGTT 116663505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TGAAGTTCATTGCTTTTACAAGGTAAGATTTCTGGAAGTTCTAAGCTATATAAATAGGTT 2280

116663506 TGGAGGAAC 116663514
          |||||||||
     2281 TGGAGGAAC 2289

EXCISED REGION

116663516 TTCTCTTAAACCACAGAAACTATTAATACTCTTGAGCAGGTGAGCTTATCAGATTCCTTA 116663575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2291 TTCTCTTAAACCACAGAAACTATTAATACTCTTGAGCAGGTGAGCTTATCAGATTCCTTA 2350

116663576 GTAGTCAACCAAAATGCTGAAGGATTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAG 116663635
          |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
     2351 GTAGTCAACCAAAATGCTGAAGGATTTTTC-TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAG 2409

116663636 ATGATGGAGTCTCACTCTGTCACCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTCAGCTCACTGC 116663695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2410 ATGATGGAGTCTCACTCTGTCACCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTCAGCTCACTGC 2469

116663696 AACCTCCGCCTCCCGGGTTCCAGCAATTCTTCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACT 116663755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2470 AACCTCCGCCTCCCGGGTTCCAGCAATTCTTCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACT 2529

116663756 ACAGGGGCATGCCCACCAGGCCCAGCTAAGTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCA 116663815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2530 ACAGGGGCATGCCCACCAGGCCCAGCTAAGTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCA 2589

116663816 CCAAGTTGGCCAGAATGGTCTCGATCTCTTGACTTCATGAGCCGCCTGCCTTGGCCTCCC 116663875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2590 CCAAGTTGGCCAGAATGGTCTCGATCTCTTGACTTCATGAGCCGCCTGCCTTGGCCTCCC 2649

116663876 AAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAGCCACCGTGTCCGGCCAAGAATTTTTCTAATGAGGT 116663935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2650 AAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAGCCACCGTGTCCGGCCAAGAATTTTTCTAATGAGGT 2709

116663936 ATGTGCAAAGCAGAAACATTTTATGTTAAGTACAGGCATGGCCACAAAAATATCACTTAA 116663995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2710 ATGTGCAAAGCAGAAACATTTTATGTTAAGTACAGGCATGGCCACAAAAATATCACTTAA 2769

116663996 GAAGAGAAGAATTTTGGGGTTCTCAGTGTAACATGGAGATGAACAATATCTCACTCTTTT 116664055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2770 GAAGAGAAGAATTTTGGGGTTCTCAGTGTAACATGGAGATGAACAATATCTCACTCTTTT 2829

116664056 GAGGATAACAATAGATTTCTCTCTTCTGCTTTTGCAATGATTAAAATTTTGGAAATTTAT 116664115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2830 GAGGATAACAATAGATTTCTCTCTTCTGCTTTTGCAATGATTAAAATTTTGGAAATTTAT 2889

116664116 ATGAGAAAAGTAAAGATATTTTAAAAAGTTTTCTTGTTTTTTTTAACTCTTTATTCTCTT 116664175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2890 ATGAGAAAAGTAAAGATATTTTAAAAAGTTTTCTTGTTTTTTTTAACTCTTTATTCTCTT 2949

116664176 AAATCTTGACACTGTTCGTTGTAAGTTTGTGCTAGATACAGCCACTGTTTGGTTGAGAAA 116664235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2950 AAATCTTGACACTGTTCGTTGTAAGTTTGTGCTAGATACAGCCACTGTTTGGTTGAGAAA 3009

116664236 ATTTCTCTATGTCTGTGACATCCATGAGATAGAAACCGATGGCTACATATGGCTATTTAA 116664295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3010 ATTTCTCTATGTCTGTGACATCCATGAGATAGAAACCGATGGCTACATATGGCTATTTAA 3069

116664296 ATTAAATTAATTAAACTTACATAAAATAAAAACTTGGTTCCATAGTTGCACTAGACACAT 116664355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3070 ATTAAATTAATTAAACTTACATAAAATAAAAACTTGGTTCCATAGTTGCACTAGACACAT 3129

116664356 TTTAGGGCTCAATAGCCATAGTATAAACAGCATAGTATAGAACTTTCTATCAGAGAAAGT 116664415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3130 TTTAGGGCTCAATAGCCATAGTATAAACAGCATAGTATAGAACTTTCTATCAGAGAAAGT 3189

116664416 TTGTCAGGGAGCTGTGCTAAAGGTGGTTTTCAAAATATAGCTGTAGCCTGAGAATATTTC 116664475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3190 TTGTCAGGGAGCTGTGCTAAAGGTGGTTTTCAAAATATAGCTGTAGCCTGAGAATATTTC 3249

116664476 TATACTATTTTAATCAATTTTAACTAATTAATTAACTACATTATACTTTGTTAACATAAA 116664535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3250 TATACTATTTTAATCAATTTTAACTAATTAATTAACTACATTATACTTTGTTAACATAAA 3309

116664536 GTCAAAGGCATCTACTTCTGCAATTGGGAGGTAATAACTTGCAATATAAAAATAGATGAG 116664595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3310 GTCAAAGGCATCTACTTCTGCAATTGGGAGGTAATAACTTGCAATATAAAAATAGATGAG 3369

116664596 GCAGGTTGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAAGTAGGTGGAT 116664655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3370 GCAGGTTGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAAGTAGGTGGAT 3429

116664656 CACCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCCGTCTCTACT 116664715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3430 CACCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCCGTCTCTACT 3489

116664716 AAAAATACAAAAAAATTGGCCCGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGG 116664775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3490 AAAAATACAAAAAAATTGGCCCGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGG 3549

116664776 AGGCCGAGGCGGACGGATCACGAGGTCAGG 116664805
          ||||||||||||||||||||||||||||||
     3550 AGGCCGAGGCGGACGGATCACGAGGTCAGG 3579

Alignment time is 4.34563 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [116652076,116672656] =>     20581 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [        1,     4183] =>      4183 nucs 'mol-32-22b2-070885_4183'

Score:        4055
Aligned:      4203        nucs
Identic:      4174 ( 99%) nucs =>      3249 ( 99%)       925 (100%)
Gaps:           22 (  1%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [116658803,116662076] EXCISED REGION [116662657,116663584]
 second seq =>  [        1,     3254] EXCISED REGION [     3256,     4183]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       580 nucs [116662077,116662656]
 second seq =>         1 nucs [3255,3255]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [3254,3254] to [3255,3255]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

116658803 AGTGAATATTCATGACACGGGCTAGGACCATTTAAACAGACGACTTCTAGGAGAGTCTCT 116658862
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGTGAATATTCATGACACGAGCTAGGACCATTTAAACAGACGACTTCTAGGAGAGTCTCT 60

116658863 TGAGGACATTTAATCTCTTGTGCTTGACCATCCTGACCCAAGGTGAGTTTGAGTCTCAAA 116658922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGAGGACATTTAATCTCTTGTGCTTGACCATCCTGACCCAAGGTGAGTTTGAGTCTCAAA 120

116658923 TACATTAAAATTCTCAAACCATTAGTTTTATTTTGTTCCTGTAAACCTAAAGTTTAACTT 116658982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TACATTAAAATTCTCAAACCATTAGTTTTATTTTGTTCCTGTAAACCTAAAGTTTAACTT 180

116658983 TCAGAATACTTTTTCTCATTAGAATTATATGTTTAAAAATTCTTGGTGACATTCCATTCT 116659042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCAGAATACTTTTTCTCATTAGAATTATATGTTTAAAAATTCTTGGTGACATTCCATTCT 240

116659043 TCACCTAATCTCACGTTTGTCTTGTTCTGTTTTGTCAAAAATGTTTTCCTAAAAATGAAA 116659102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCACCTAATCTCACGTTTGTCTTGTTCTGTTTTGTCAAAAATGTTTTCCTAAAAATGAAA 300

116659103 AAGAAAACCTCTAGAATGATTAATCGAGTGAGATTCTCAATAAATCTGCAACTAAAACCA 116659162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAGAAAACCTCTAGAATGATTAATCGAGTGAGATTCTCAATAAATCTGCAACTAAAACCA 360

116659163 TCCGTAAGTCCTAACAAGTTTCAATTTTTATCACGTTAGTGTCTTTTAGTAGATAAACTT 116659222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCCGTAAGTCCTAACAAGTTTCAATTTTTATCACGTTAGTGTCTTTTAGTAGATAAACTT 420

116659223 TGCTCTAGGTCACTATCCAAAAAACTTATGTGAGTTCTGTTGATTGTATCCTGCCTTTGT 116659282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGCTCTAGGTCACTATCCAAAAAACTTATGTGAGTTCTGTTGATTGTATCCTGCCTTTGT 480

116659283 GTTCCTAAGAGTTGATTTGGGAAGCAAAATCCCCCAAAAATCTATATTCTCAGGCCCATG 116659342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTTCCTAAGAGTTGATTTGGGAAGCAAAATCCCCCAAAAATCTATATTCTCAGGCCCATG 540

116659343 GATAGTTAGAACGCAGGCTACAGATGTCAAACTCTCTAGTCAGGGGTCATGCCTAATAAA 116659402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GATAGTTAGAACGCAGGCTACAGATGTCAAACTCTCTAGTCAGGGGTCATGCCTAATAAA 600

116659403 GTGCAGAAGGAATACATTGAACAGAATGTTATACACTTTTAGGGCGTTTTAAAATTTTTG 116659462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTGCAGAAGGAATACATTGAACAGAATGTTATACACTTTTAGGGCGTTTTAAAATTTTTG 660

116659463 GTCTAAGTCATGTCTCTAGCAGGCTAGACACCTGTTCCAGATATGTATTCTTAATATAAC 116659522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GTCTAAGTCATGTCTCTAGCAGGCTAGACACCTGTTCCAGATATGTATTCTTAATATAAC 720

116659523 AAAAATTATTTAAATATCTTACCATGTGTCACAGTTACATCAATAATATTTGGAATCATA 116659582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAAAATTATTTAAATATCTTACCATGTGTCACAGTTACATCAATAATATTTGGAATCATA 780

116659583 CTGGACCCTTTGAAAATTTTCAGTATGAGTAAAAATGTTTATCTTAGAAGTAAGTGGAGG 116659642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTGGACCCTTTGAAAATTTTCAGTATGAGTAAAAATGTTTATCTTAGAAGTAAGTGGAGG 840

116659643 GGAAACATCCTTATTATTAAGTGCTAAGCCTTTTTAAAATGGTCTATGAAGATTCTAAAT 116659702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GGAAACATCCTTATTATTAAGTGCTAAGCCTTTTTAAAATGGTCTATGAAGATTCTAAAT 900

116659703 AGACTTCTGATTCCAAAATACCTATAACAATGAAGTCTTTGGCCATGGCTAATTAAAAAA 116659762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGACTTCTGATTCCAAAATACCTATAACAATGAAGTCTTTGGCCATGGCTAATTAAAAAA 960

116659763 AAACATAAAACTCTAGAGACTGTCTCATTTATTAATTTGCCAAATTCTTCTTTCTTTTAA 116659822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AAACATAAAACTCTAGAGACTGTCTCATTTATTAATTTGCCAAATTCTTCTTTCTTTTAA 1020

116659823 CATTTTCTTTATCCCACAGTATCTTTTCTTGCTTTTTGTGCTACCACACTATCAAATTTT 116659882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CATTTTCTTTATCCCACAGTATCTTTTCTTGCTTTTTGTGCTACCACACTATCAAATTTT 1080

116659883 ACTCTTTTTCTCCCAAATTTCTTTTTCTAACCATCGTCTTCCCCCTCTGATTGTATCTGA 116659942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ACTCTTTTTCTCCCAAATTTCTTTTTCTAACCATCGTCTTCCCCCTCTGATTGTATCTGA 1140

116659943 AAATAACCACTTGCTTTTCTTCTTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTCCTTCCTTCCTTCCT 116660002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AAATAACCACTTGCTTTTCTTCTTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTCCTTCCTTCCTTCCT 1200

116660003 TCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCCTCTTTCCCTTTCCCTTTCTT 116660062
          |||||||||||||||||||                    |||||||||||||||||||||
     1201 TCCTTCCTTCCTTCCTTCC--------------------CTCTTTCCCTTTCCCTTTCTT 1240

116660063 TTCTTTTATTTTTTCTTCTCTCTTCTCTTCTCTTTTTCTGGGTTGCACTCTGTTACCCAA 116660122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1241 TTCTTTTATTTTTTCTTCTCTCTTCTCTTCTCTTTTTCTGGGTTGCACTCTGTTACCCAA 1300

116660123 GCTTGAATGCAATGGCAGGGATCACAGCTTACTGCAGTGTCAACCTCCTGGGCTCAGGTG 116660182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1301 GCTTGAATGCAATGGCAGGGATCACAGCTTACTGCAGTGTCAACCTCCTGGGCTCAGGTG 1360

116660183 ATCATCCTCCTTCAGCCTCCTGTGTAGCTAGGACTGCAGGCATGTACCACCACACATGGC 116660242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1361 ATCATCCTCCTTCAGCCTCCTGTGTAGCTAGGACTGCAGGCATGTACCACCACACATGGC 1420

116660243 TAATTTTAGTATTTTTTGTAGAAATGAGAGTCTCACTGTGTTGTCCAGGTTTGTCTCAAA 116660302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1421 TAATTTTAGTATTTTTTGTAGAAATGAGAGTCTCACTGTGTTGTCCAGGTTTGTCTCAAA 1480

116660303 CTCCCAGGTTCAAGCAATCCACCTGCCTCAGCCTCTCAAACTGCTGGGATTATAGGCATG 116660362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1481 CTCCCAGGTTCAAGCAATCCACCTGCCTCAGCCTCTCAAACTGCTGGGATTATAGGCATG 1540

116660363 TGCCACCATGCTGGGCCTCAAATTGACATTTTCTTAAAAATTGGACTGCCAAACAAGGAC 116660422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1541 TGCCACCATGCTGGGCCTCAAATTGACATTTTCTTAAAAATTGGACTGCCAAACAAGGAC 1600

116660423 ATTAGCCCTAGTAGGCAGAAGATACTATCTTGGTCTGTGTTAGAGGCAATTGTTGAAATT 116660482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1601 ATTAGCCCTAGTAGGCAGAAGATACTATCTTGGTCTGTGTTAGAGGCAATTGTTGAAATT 1660

116660483 TCTCTGAATCTCTATGGGATAGGCATAAATGTACTGATAAATTTGAGCAGTCCTGGGAAT 116660542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1661 TCTCTGAATCTCTATGGGATAGGCATAAATGTACTGATAAATTTGAGCAGTCCTGGGAAT 1720

116660543 CCATAATCTCAATTTATTTGACCAATATCAATTAATACCATGTTGAGAGGTCCTTCTATT 116660602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1721 CCATAATCTCAATTTATTTGACCAATATCAATTAATACCATGTTGAGAGGTCCTTCTATT 1780

116660603 TCTGAAGTCTGGTTCAGCAAAAAATAAAAAAAAAAA-TAAAATACCTGAAATAATGTAGC 116660661
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
     1781 TCTGAAGTCTGGTTCAGCAAAAAATAAAAAAAAAAAATAAAATACCTGAAATAATGTAGC 1840

116660662 TATTCCTGAGGTATCATTAACAGAATAGAAACTTAAAAAGCGCATGATATGGAAAAATCT 116660721
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     1841 TATTCCTGAGGTATCATTAACAGAATAGAAACTTAAAAAGCGCATGATATGGAAAAACCT 1900

116660722 TTGCTGATGGTTATACATGTTAAGTTTCCAGATAACTATTAATTAGACTTGCAGACATAA 116660781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1901 TTGCTGATGGTTATACATGTTAAGTTTCCAGATAACTATTAATTAGACTTGCAGACATAA 1960

116660782 AAGGCTGTACCAAGTGGATATTTTAGAGATAAATTTTTAGCACTTACAGACAATATTATG 116660841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1961 AAGGCTGTACCAAGTGGATATTTTAGAGATAAATTTTTAGCACTTACAGACAATATTATG 2020

116660842 AAGTAGCTATGTGGGCATAGAGAAATTCGGGAAATTAGCAGGCTGGTTCTGCTATAATAG 116660901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2021 AAGTAGCTATGTGGGCATAGAGAAATTCGGGAAATTAGCAGGCTGGTTCTGCTATAATAG 2080

116660902 ATCTCAGTTCACCCTTAGGATATCTTCACTAAAGGAGCTTAACATAGCCCAGATGGTAGA 116660961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2081 ATCTCAGTTCACCCTTAGGATATCTTCACTAAAGGAGCTTAACATAGCCCAGATGGTAGA 2140

116660962 TTTGATTGCCCTCATTAGAGCTGGTCACTTGGCCAAAGACAAAAAAAATTATATTTACAC 116661021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2141 TTTGATTGCCCTCATTAGAGCTGGTCACTTGGCCAAAGACAAAAAAAATTATATTTACAC 2200

116661022 AGAAAATAGCTCAAGTACCTGAACCTCAGTATGACTATATATGGGGATAGAGTCTTTAAG 116661081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2201 AGAAAATAGCTCAAGTACCTGAACCTCAGTATGACTATATATGGGGATAGAGTCTTTAAG 2260

116661082 GAAGTGATTAAGGTTAAATAAAGTCATAATGATGGGGCCCTAATCTGATAAGATTAGCGT 116661141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2261 GAAGTGATTAAGGTTAAATAAAGTCATAATGATGGGGCCCTAATCTGATAAGATTAGCGT 2320

116661142 CCTTCTAAGAGGAGGAATCAACATCAGGGATTTTTTTTTCTCTCAACCCATGCCCAGAGG 116661201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2321 CCTTCTAAGAGGAGGAATCAACATCAGGGATTTTTTTTTCTCTCAACCCATGCCCAGAGG 2380

116661202 AAAGTCATATGAGGACGTAACACAAAGAGAGACATCTACAAATCACAGAGGTTGCACCAG 116661261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     2381 AAAGTCATATGAGGACGTAACACAAAGAGAGACATCTACAAATCACAGGGGTTGCACCAG 2440

116661262 AAATCAACCCTGCTAGCATATCGATCTTGAACTTCTAGTCCCCAGAACTGTGAGGAAATA 116661321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2441 AAATCAACCCTGCTAGCATATCGATCTTGAACTTCTAGTCCCCAGAACTGTGAGGAAATA 2500

116661322 AATTTTTGTTGCTTATGCCACCAGATCTGTGACATTTTGTTATGGAAGTCTGAGCTGACC 116661381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2501 AATTTTTGTTGCTTATGCCACCAGATCTGTGACATTTTGTTATGGAAGTCTGAGCTGACC 2560

116661382 AATACACTTGAATAACTATCAGTGTCAATGTAAAACAAGCCATCTTTAGACTTAAGGAAA 116661441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2561 AATACACTTGAATAACTATCAGTGTCAATGTAAAACAAGCCATCTTTAGACTTAAGGAAA 2620

116661442 CAGTCACCTGGCTCTCTAAGGCAGATGCAAATGGATTTTTCTTTGCCCGGGTTTAGTAAT 116661501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2621 CAGTCACCTGGCTCTCTAAGGCAGATGCAAATGGATTTTTCTTTGCCCGGGTTTAGTAAT 2680

116661502 TCAGATTATGGCACTAAGTGTTTTGGGAAGGCTCCATGTCATTTTGATATAGTCACTGTG 116661561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2681 TCAGATTATGGCACTAAGTGTTTTGGGAAGGCTCCATGTCATTTTGATATAGTCACTGTG 2740

116661562 TGTTGCCATTCTTATGCATGTATTCTCCACAGTCTCAGTCCTGCTCTGCAGCTGCTCTCG 116661621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2741 TGTTGCCATTCTTATGCATGTATTCTCCACAGTCTCAGTCCTGCTCTGCAGCTGCTCTCG 2800

116661622 TGTCAAATGATCCATCACTCAACGGAAATGAACTCATCACTCCATAAAAGGAATAGGAAG 116661681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2801 TGTCAAATGATCCATCACTCAACGGAAATGAACTCATCACTCCATAAAAGGAATAGGAAG 2860

116661682 ATCAGTCCATGATCCAATCCCAAACTATTTTTTCTGAGGATGATAATGTTATCTAGAAAT 116661741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     2861 ATCAGTCCATGATCCAATCCCAAACTATTTTTTCCGAGGATGATAATGTTATCTAGAAAT 2920

116661742 CACAACAGTGGTATACATCTGAACATGGCTGCTTTAGTAGCTGAACGACTCTTCTCATCT 116661801
          |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2921 CACAACAG-GGTATACATCTGAACATGGCTGCTTTAGTAGCTGAACGACTCTTCTCATCT 2979

116661802 TCTCATCAGTTAGGAAAGACTGAGAACTGGTAGCATAAATCCATCAATTATGGGATTGCA 116661861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2980 TCTCATCAGTTAGGAAAGACTGAGAACTGGTAGCATAAATCCATCAATTATGGGATTGCA 3039

116661862 ATTGCAGAATGTTTTGTGACTCACATAATGTTTTCTTCTTTACTCAGAACTTCTCTATTT 116661921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3040 ATTGCAGAATGTTTTGTGACTCACATAATGTTTTCTTCTTTACTCAGAACTTCTCTATTT 3099

116661922 CACAGATTCTCACCTTAATAATTGAAGCAACTCAGGGTCACATCCTAGTTCTATAATTCT 116661981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3100 CACAGATTCTCACCTTAATAATTGAAGCAACTCAGGGTCACATCCTAGTTCTATAATTCT 3159

116661982 GCCTGAGGCACTCTGAGCCCAAACCATCAACAGGAAACAAACAAATAAAAAACCTGCTAA 116662041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3160 GCCTGAGGCACTCTGAGCCCAAACCATCAACAGGAAACAAACAAATAAAAAACCTGCTAA 3219

116662042 TTTACTCTCCAATGAAACCTTTCCAGAATTATCTG 116662076
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3220 TTTACTCTCCAATGAAACCTTTCCAGAATTATCTG 3254

EXCISED REGION

116662657 AATGAATAACTACCGTTATAGAAATAGCTTCTGGATTTCTTTGTCCTTTTTTTCCTGAAG 116662716
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3256 AATGAATAACTACCGTTATAGAAACAGCTTCTGGATTTCTTTGTCCTTTTTTTCCTGAAG 3315

116662717 TTAGGCTATATTTGGTATCTCTATAGAGATAGGCTATATTTGGTAAATCTGTTCTCACCT 116662776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3316 TTAGGCTATATTTGGTATCTCTATAGAGATAGGCTATATTTGGTAAATCTGTTCTCACCT 3375

116662777 CACATAAAAGGTTAATATTCTACAAGTGGATAGATGTGGTGAGGACAACTAAAAGGAGAT 116662836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3376 CACATAAAAGGTTAATATTCTACAAGTGGATAGATGTGGTGAGGACAACTAAAAGGAGAT 3435

116662837 TGAATGATCTCATCAAATTATATTACACAACCTTTCAAAGAAAGCTCAGTTGGATTAAGA 116662896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3436 TGAATGATCTCATCAAATTATATTACACAACCTTTCAAAGAAAGCTCAGTTGGATTAAGA 3495

116662897 GGTTTCTTTATGTTCATGCCCAAAATGCCAAATTCCAACAGCCCACAAAATTTCTTTGAA 116662956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3496 GGTTTCTTTATGTTCATGCCCAAAATGCCAAATTCCAACAGCCCACAAAATTTCTTTGAA 3555

116662957 GTATTTTTCTCATACGTTTGTTTGATGAACAGCTTAAAGCTCCATTTCCATCCTAGCAAG 116663016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3556 GTATTTTTCTCATACGTTTGTTTGATGAACAGCTTAAAGCTCCATTTCCATCCTAGCAAG 3615

116663017 TGGCAGACAAAAAGCCAGATAGTAAATCATATTTTAATAAAAATGATTTTAATAAGTGAA 116663076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3616 TGGCAGACAAAAAGCCAGATAGTAAATCATATTTTAATAAAAATGATTTTAATAAGTGAA 3675

116663077 AGATATGATCCATTAAGTTAATCTTGTTAAGTAGAAGACCAAAATGAGAACTTAATGGGG 116663136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3676 AGATATGATCCATTAAGTTAATCTTGTTAAGTAGAAGACCAAAATGAGAACTTAATGGGG 3735

116663137 TGCAAACATCACGGAGAATCAAAACACACACTAGAAACCATACTTGAGAACCAGAGATGA 116663196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3736 TGCAAACATCACGGAGAATCAAAACACACACTAGAAACCATACTTGAGAACCAGAGATGA 3795

116663197 GTGAATGTTTGGTCATCAATATCCATGCTAGCCTTAATCTTGTGGTTATCCCACCACATC 116663256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3796 GTGAATGTTTGGTCATCAATATCCATGCTAGCCTTAATCTTGTGGTTATCCCACCACATC 3855

116663257 CCCCTTTTCAACAGAAGTCAGTGAGCAGCAAGCCTCATTGAATGTTGGATATTAGCAAGC 116663316
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3856 CCCCTTTTCAACAGAAGTCAGTGAGTAGCAAGCCTCATTGAATGTTGGATATTAGCAAGC 3915

116663317 ACATGTAGTTTTGCTTCAAGTACTCTTTATTTTCTTCCAATCCTCAGGGCCTTTCTCAAC 116663376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3916 ACATGTAGTTTTGCTTCAAGTACTCTTTATTTTCTTCCAATCCTCAGGGCCTTTCTCAAC 3975

116663377 ATATGGTTTATTATAGCGTTGTGAATGATTGGTCTTTCATAAGGACATTTTCCTTGGCAG 116663436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3976 ATATGGTTTATTATAGCGTTGTGAATGATTGGTCTTTCATAAGGACATTTTCCTTGGCAG 4035

116663437 AAGGCTATTTGAAGTTCATTGCTTTTACAAGGTAAGATTTCTGGAAGTTCTAAGCTATAT 116663496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4036 AAGGCTATTTGAAGTTCATTGCTTTTACAAGGTAAGATTTCTGGAAGTTCTAAGCTATAT 4095

116663497 AAATAGGTTTGGAGGAACTTTCTCTTAAACCACAGAAACTATTAATACTCTTGAGCAGGT 116663556
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4096 AAATAGGTTTGGAGGAACATTCTCTTAAACCACAGAAACTATTAATACTCTTGAGCAGGT 4155

116663557 GAGCTTATCAGATTCCTTAGTAGTCAAC 116663584
          ||||||||||||||||||||||||||||
     4156 GAGCTTATCAGATTCCTTAGTAGTCAAC 4183

Alignment time is 4.87572 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [116652076,116672656] =>     20581 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [        1,     6644] =>      6644 nucs 'mol-32-29b3-083797_6644'

Score:        6643
Aligned:      6643        nucs
Identic:      6643 (100%) nucs =>      6569 (100%)        74 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [116656946,116663514] EXCISED REGION [116663516,116663589]
 second seq =>  [        1,     6569] EXCISED REGION [     6571,     6644]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [116663515,116663515]
 second seq =>         1 nucs [6570,6570]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [116663515,116663516] to [116663516,116663517]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

116656946 AAATAAAGTTGGACAGAAGGTAGTCATTGGCCAGATCGTAGAAGAACATAAAATATGATT 116657005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAATAAAGTTGGACAGAAGGTAGTCATTGGCCAGATCGTAGAAGAACATAAAATATGATT 60

116657006 ACAATGCTCTCCATTATTTGAATATCTTGCATAATAATGATGTGGTCTTATATTATCTTT 116657065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACAATGCTCTCCATTATTTGAATATCTTGCATAATAATGATGTGGTCTTATATTATCTTT 120

116657066 TTTCTTTTTCTTTTTTGAGAATGAGTCTCACTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCA 116657125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTCTTTTTCTTTTTTGAGAATGAGTCTCACTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCA 180

116657126 CAATCTTGGCTGACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCT 116657185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CAATCTTGGCTGACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCT 240

116657186 CCCGAGTAGCTGGGATTACAGATGCTTGTCACTGCACCTGGCTAATTTTTTTTTTTTTTT 116657245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCCGAGTAGCTGGGATTACAGATGCTTGTCACTGCACCTGGCTAATTTTTTTTTTTTTTT 300

116657246 AAAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTACTGACCTCATGA 116657305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTACTGACCTCATGA 360

116657306 TCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTTGGATTACAGGTGTGAGCCACCACACCTGGCC 116657365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTTGGATTACAGGTGTGAGCCACCACACCTGGCC 420

116657366 ATATTATCTTTAAGTCTCAGGTTCCTCATCTTTGAAATCAACTAATATTATGTGTTTATT 116657425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATATTATCTTTAAGTCTCAGGTTCCTCATCTTTGAAATCAACTAATATTATGTGTTTATT 480

116657426 GTTATAAGTCAAAGACAGAAATTTGAAATGAGGCCTACGATGCTGATTATATTTTGTTCT 116657485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTTATAAGTCAAAGACAGAAATTTGAAATGAGGCCTACGATGCTGATTATATTTTGTTCT 540

116657486 TTGATCCAGGTGATAGTTAAATAGATATGATCACCTAGTGAACACTCAAGACTTATGCAC 116657545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTGATCCAGGTGATAGTTAAATAGATATGATCACCTAGTGAACACTCAAGACTTATGCAC 600

116657546 TTGTCTGCGTGTAATGTACACAAAAATGTGTAACTACTTAGTAGTAGTCTTATAAAAATA 116657605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTGTCTGCGTGTAATGTACACAAAAATGTGTAACTACTTAGTAGTAGTCTTATAAAAATA 660

116657606 AACAAGATAATATGTGTGTATATATATGTAGTGTTAAGCAAAGTACCCAGTACATGTTGG 116657665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AACAAGATAATATGTGTGTATATATATGTAGTGTTAAGCAAAGTACCCAGTACATGTTGG 720

116657666 CCAAAACAAATGTCATCTCTCTCCTCCTGCCTTTTGTTCACTTTTTTTCCTAGCCGAACA 116657725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CCAAAACAAATGTCATCTCTCTCCTCCTGCCTTTTGTTCACTTTTTTTCCTAGCCGAACA 780

116657726 ATCCTAGAGATTTTAAAGTACTTCTGCTTGTTTACTTTTGTTTCCAAAAAAGTTAATTAT 116657785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATCCTAGAGATTTTAAAGTACTTCTGCTTGTTTACTTTTGTTTCCAAAAAAGTTAATTAT 840

116657786 AAAGCAAATAAACTCGCTTTAGGAAAAATGCAAAAAATCTGATAATATGCTCATTTATAA 116657845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAAGCAAATAAACTCGCTTTAGGAAAAATGCAAAAAATCTGATAATATGCTCATTTATAA 900

116657846 ATAAAAAAGCAAACAAAACCTCTAAATTGAAACAACAGCCACCAGCCTACTCCCATCCTT 116657905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATAAAAAAGCAAACAAAACCTCTAAATTGAAACAACAGCCACCAGCCTACTCCCATCCTT 960

116657906 TCCAAGATATTCTAATTCTCCTCTTCCTTTTCTCCAAGGCATTTTCCTAAGGATAGCTCC 116657965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TCCAAGATATTCTAATTCTCCTCTTCCTTTTCTCCAAGGCATTTTCCTAAGGATAGCTCC 1020

116657966 ATTTTATCTTTTACATATACTTCTTTTCTTTTCCTATATTTTTCCACCTTCTTCTAATTT 116658025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATTTTATCTTTTACATATACTTCTTTTCTTTTCCTATATTTTTCCACCTTCTTCTAATTT 1080

116658026 TCTTTGCTTTTCTATTGATTGTGGGTTAAGTAAGAAAAAAAGGCAAGGGTGGCAGTCAGA 116658085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TCTTTGCTTTTCTATTGATTGTGGGTTAAGTAAGAAAAAAAGGCAAGGGTGGCAGTCAGA 1140

116658086 GTGCGTGCAGAATTCTTCAAAGCAATGAATGTTGAGAAAAGCCGTGTATATTTAGAAGTT 116658145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GTGCGTGCAGAATTCTTCAAAGCAATGAATGTTGAGAAAAGCCGTGTATATTTAGAAGTT 1200

116658146 AATGGTCTCCCCTCTAGATTTCTATGCAGCTTGAATTCCTCAGTGTTTCTGAACTTCTTG 116658205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AATGGTCTCCCCTCTAGATTTCTATGCAGCTTGAATTCCTCAGTGTTTCTGAACTTCTTG 1260

116658206 TGTTTTTCTCTTATCTTTTAAATAATACTCTGCTACTGTTTTTCTCTAGATTACCATTTC 116658265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGTTTTTCTCTTATCTTTTAAATAATACTCTGCTACTGTTTTTCTCTAGATTACCATTTC 1320

116658266 AGTGGATTTGAAAAATCTCTTTCCATTATTTTTCTTTTCTCCTTACTTCTTTCTTCCCCT 116658325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AGTGGATTTGAAAAATCTCTTTCCATTATTTTTCTTTTCTCCTTACTTCTTTCTTCCCCT 1380

116658326 TCTCTTATTTTTTCTCTTTCTCTCCAACTTCATCTCTTTATTAATTTCCTTCTCTCCTTT 116658385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TCTCTTATTTTTTCTCTTTCTCTCCAACTTCATCTCTTTATTAATTTCCTTCTCTCCTTT 1440

116658386 TAAGTTTTGGTAACTGTTTTTCATTTGGCCAGCTCTCAGTATACCTTATTTGTGTTGGGT 116658445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TAAGTTTTGGTAACTGTTTTTCATTTGGCCAGCTCTCAGTATACCTTATTTGTGTTGGGT 1500

116658446 ACCAAAGCAAACATCCTCACCAGTGATGCAAGACTGAAGAAGTGTGATCATTAGCTCTGC 116658505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ACCAAAGCAAACATCCTCACCAGTGATGCAAGACTGAAGAAGTGTGATCATTAGCTCTGC 1560

116658506 AATCACAACCACAAAACACCTGTGGCTTGCCTAAAACCTTCTTCTGTTAGACCCTTTCCT 116658565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AATCACAACCACAAAACACCTGTGGCTTGCCTAAAACCTTCTTCTGTTAGACCCTTTCCT 1620

116658566 TACTTGGAAACAATCTCATCTTAAGAAATCAAGCAATACTTGAAGAAATTTTGAGGAACC 116658625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TACTTGGAAACAATCTCATCTTAAGAAATCAAGCAATACTTGAAGAAATTTTGAGGAACC 1680

116658626 CATAAGCAAGAAAAACTGTATACTCATTTCCCTTAACATGATACCATTTCACAGTTACCT 116658685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CATAAGCAAGAAAAACTGTATACTCATTTCCCTTAACATGATACCATTTCACAGTTACCT 1740

116658686 GTGTGGTGCTTTTCATTGCTATAGAAATCGAATTAAACTCAGTGTGATTGTAGCATAATG 116658745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GTGTGGTGCTTTTCATTGCTATAGAAATCGAATTAAACTCAGTGTGATTGTAGCATAATG 1800

116658746 GGATACTTCACTTGAGAAAGGGGATTTTTATAATTTGGAGAAGCATTGAGAGTCAGCAGT 116658805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GGATACTTCACTTGAGAAAGGGGATTTTTATAATTTGGAGAAGCATTGAGAGTCAGCAGT 1860

116658806 GAATATTCATGACACGGGCTAGGACCATTTAAACAGACGACTTCTAGGAGAGTCTCTTGA 116658865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GAATATTCATGACACGGGCTAGGACCATTTAAACAGACGACTTCTAGGAGAGTCTCTTGA 1920

116658866 GGACATTTAATCTCTTGTGCTTGACCATCCTGACCCAAGGTGAGTTTGAGTCTCAAATAC 116658925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GGACATTTAATCTCTTGTGCTTGACCATCCTGACCCAAGGTGAGTTTGAGTCTCAAATAC 1980

116658926 ATTAAAATTCTCAAACCATTAGTTTTATTTTGTTCCTGTAAACCTAAAGTTTAACTTTCA 116658985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ATTAAAATTCTCAAACCATTAGTTTTATTTTGTTCCTGTAAACCTAAAGTTTAACTTTCA 2040

116658986 GAATACTTTTTCTCATTAGAATTATATGTTTAAAAATTCTTGGTGACATTCCATTCTTCA 116659045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GAATACTTTTTCTCATTAGAATTATATGTTTAAAAATTCTTGGTGACATTCCATTCTTCA 2100

116659046 CCTAATCTCACGTTTGTCTTGTTCTGTTTTGTCAAAAATGTTTTCCTAAAAATGAAAAAG 116659105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CCTAATCTCACGTTTGTCTTGTTCTGTTTTGTCAAAAATGTTTTCCTAAAAATGAAAAAG 2160

116659106 AAAACCTCTAGAATGATTAATCGAGTGAGATTCTCAATAAATCTGCAACTAAAACCATCC 116659165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AAAACCTCTAGAATGATTAATCGAGTGAGATTCTCAATAAATCTGCAACTAAAACCATCC 2220

116659166 GTAAGTCCTAACAAGTTTCAATTTTTATCACGTTAGTGTCTTTTAGTAGATAAACTTTGC 116659225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GTAAGTCCTAACAAGTTTCAATTTTTATCACGTTAGTGTCTTTTAGTAGATAAACTTTGC 2280

116659226 TCTAGGTCACTATCCAAAAAACTTATGTGAGTTCTGTTGATTGTATCCTGCCTTTGTGTT 116659285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TCTAGGTCACTATCCAAAAAACTTATGTGAGTTCTGTTGATTGTATCCTGCCTTTGTGTT 2340

116659286 CCTAAGAGTTGATTTGGGAAGCAAAATCCCCCAAAAATCTATATTCTCAGGCCCATGGAT 116659345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CCTAAGAGTTGATTTGGGAAGCAAAATCCCCCAAAAATCTATATTCTCAGGCCCATGGAT 2400

116659346 AGTTAGAACGCAGGCTACAGATGTCAAACTCTCTAGTCAGGGGTCATGCCTAATAAAGTG 116659405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AGTTAGAACGCAGGCTACAGATGTCAAACTCTCTAGTCAGGGGTCATGCCTAATAAAGTG 2460

116659406 CAGAAGGAATACATTGAACAGAATGTTATACACTTTTAGGGCGTTTTAAAATTTTTGGTC 116659465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CAGAAGGAATACATTGAACAGAATGTTATACACTTTTAGGGCGTTTTAAAATTTTTGGTC 2520

116659466 TAAGTCATGTCTCTAGCAGGCTAGACACCTGTTCCAGATATGTATTCTTAATATAACAAA 116659525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TAAGTCATGTCTCTAGCAGGCTAGACACCTGTTCCAGATATGTATTCTTAATATAACAAA 2580

116659526 AATTATTTAAATATCTTACCATGTGTCACAGTTACATCAATAATATTTGGAATCATACTG 116659585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AATTATTTAAATATCTTACCATGTGTCACAGTTACATCAATAATATTTGGAATCATACTG 2640

116659586 GACCCTTTGAAAATTTTCAGTATGAGTAAAAATGTTTATCTTAGAAGTAAGTGGAGGGGA 116659645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GACCCTTTGAAAATTTTCAGTATGAGTAAAAATGTTTATCTTAGAAGTAAGTGGAGGGGA 2700

116659646 AACATCCTTATTATTAAGTGCTAAGCCTTTTTAAAATGGTCTATGAAGATTCTAAATAGA 116659705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AACATCCTTATTATTAAGTGCTAAGCCTTTTTAAAATGGTCTATGAAGATTCTAAATAGA 2760

116659706 CTTCTGATTCCAAAATACCTATAACAATGAAGTCTTTGGCCATGGCTAATTAAAAAAAAA 116659765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CTTCTGATTCCAAAATACCTATAACAATGAAGTCTTTGGCCATGGCTAATTAAAAAAAAA 2820

116659766 CATAAAACTCTAGAGACTGTCTCATTTATTAATTTGCCAAATTCTTCTTTCTTTTAACAT 116659825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CATAAAACTCTAGAGACTGTCTCATTTATTAATTTGCCAAATTCTTCTTTCTTTTAACAT 2880

116659826 TTTCTTTATCCCACAGTATCTTTTCTTGCTTTTTGTGCTACCACACTATCAAATTTTACT 116659885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TTTCTTTATCCCACAGTATCTTTTCTTGCTTTTTGTGCTACCACACTATCAAATTTTACT 2940

116659886 CTTTTTCTCCCAAATTTCTTTTTCTAACCATCGTCTTCCCCCTCTGATTGTATCTGAAAA 116659945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CTTTTTCTCCCAAATTTCTTTTTCTAACCATCGTCTTCCCCCTCTGATTGTATCTGAAAA 3000

116659946 TAACCACTTGCTTTTCTTCTTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTCCTTCCTTCCTTCCTTCC 116660005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TAACCACTTGCTTTTCTTCTTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTCCTTCCTTCCTTCCTTCC 3060

116660006 TTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCCTCTTTCCCTTTCCCTTTCTTTTC 116660065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCCTCTTTCCCTTTCCCTTTCTTTTC 3120

116660066 TTTTATTTTTTCTTCTCTCTTCTCTTCTCTTTTTCTGGGTTGCACTCTGTTACCCAAGCT 116660125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TTTTATTTTTTCTTCTCTCTTCTCTTCTCTTTTTCTGGGTTGCACTCTGTTACCCAAGCT 3180

116660126 TGAATGCAATGGCAGGGATCACAGCTTACTGCAGTGTCAACCTCCTGGGCTCAGGTGATC 116660185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TGAATGCAATGGCAGGGATCACAGCTTACTGCAGTGTCAACCTCCTGGGCTCAGGTGATC 3240

116660186 ATCCTCCTTCAGCCTCCTGTGTAGCTAGGACTGCAGGCATGTACCACCACACATGGCTAA 116660245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 ATCCTCCTTCAGCCTCCTGTGTAGCTAGGACTGCAGGCATGTACCACCACACATGGCTAA 3300

116660246 TTTTAGTATTTTTTGTAGAAATGAGAGTCTCACTGTGTTGTCCAGGTTTGTCTCAAACTC 116660305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TTTTAGTATTTTTTGTAGAAATGAGAGTCTCACTGTGTTGTCCAGGTTTGTCTCAAACTC 3360

116660306 CCAGGTTCAAGCAATCCACCTGCCTCAGCCTCTCAAACTGCTGGGATTATAGGCATGTGC 116660365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 CCAGGTTCAAGCAATCCACCTGCCTCAGCCTCTCAAACTGCTGGGATTATAGGCATGTGC 3420

116660366 CACCATGCTGGGCCTCAAATTGACATTTTCTTAAAAATTGGACTGCCAAACAAGGACATT 116660425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 CACCATGCTGGGCCTCAAATTGACATTTTCTTAAAAATTGGACTGCCAAACAAGGACATT 3480

116660426 AGCCCTAGTAGGCAGAAGATACTATCTTGGTCTGTGTTAGAGGCAATTGTTGAAATTTCT 116660485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 AGCCCTAGTAGGCAGAAGATACTATCTTGGTCTGTGTTAGAGGCAATTGTTGAAATTTCT 3540

116660486 CTGAATCTCTATGGGATAGGCATAAATGTACTGATAAATTTGAGCAGTCCTGGGAATCCA 116660545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 CTGAATCTCTATGGGATAGGCATAAATGTACTGATAAATTTGAGCAGTCCTGGGAATCCA 3600

116660546 TAATCTCAATTTATTTGACCAATATCAATTAATACCATGTTGAGAGGTCCTTCTATTTCT 116660605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 TAATCTCAATTTATTTGACCAATATCAATTAATACCATGTTGAGAGGTCCTTCTATTTCT 3660

116660606 GAAGTCTGGTTCAGCAAAAAATAAAAAAAAAAATAAAATACCTGAAATAATGTAGCTATT 116660665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 GAAGTCTGGTTCAGCAAAAAATAAAAAAAAAAATAAAATACCTGAAATAATGTAGCTATT 3720

116660666 CCTGAGGTATCATTAACAGAATAGAAACTTAAAAAGCGCATGATATGGAAAAATCTTTGC 116660725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 CCTGAGGTATCATTAACAGAATAGAAACTTAAAAAGCGCATGATATGGAAAAATCTTTGC 3780

116660726 TGATGGTTATACATGTTAAGTTTCCAGATAACTATTAATTAGACTTGCAGACATAAAAGG 116660785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 TGATGGTTATACATGTTAAGTTTCCAGATAACTATTAATTAGACTTGCAGACATAAAAGG 3840

116660786 CTGTACCAAGTGGATATTTTAGAGATAAATTTTTAGCACTTACAGACAATATTATGAAGT 116660845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 CTGTACCAAGTGGATATTTTAGAGATAAATTTTTAGCACTTACAGACAATATTATGAAGT 3900

116660846 AGCTATGTGGGCATAGAGAAATTCGGGAAATTAGCAGGCTGGTTCTGCTATAATAGATCT 116660905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 AGCTATGTGGGCATAGAGAAATTCGGGAAATTAGCAGGCTGGTTCTGCTATAATAGATCT 3960

116660906 CAGTTCACCCTTAGGATATCTTCACTAAAGGAGCTTAACATAGCCCAGATGGTAGATTTG 116660965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 CAGTTCACCCTTAGGATATCTTCACTAAAGGAGCTTAACATAGCCCAGATGGTAGATTTG 4020

116660966 ATTGCCCTCATTAGAGCTGGTCACTTGGCCAAAGACAAAAAAAATTATATTTACACAGAA 116661025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 ATTGCCCTCATTAGAGCTGGTCACTTGGCCAAAGACAAAAAAAATTATATTTACACAGAA 4080

116661026 AATAGCTCAAGTACCTGAACCTCAGTATGACTATATATGGGGATAGAGTCTTTAAGGAAG 116661085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 AATAGCTCAAGTACCTGAACCTCAGTATGACTATATATGGGGATAGAGTCTTTAAGGAAG 4140

116661086 TGATTAAGGTTAAATAAAGTCATAATGATGGGGCCCTAATCTGATAAGATTAGCGTCCTT 116661145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 TGATTAAGGTTAAATAAAGTCATAATGATGGGGCCCTAATCTGATAAGATTAGCGTCCTT 4200

116661146 CTAAGAGGAGGAATCAACATCAGGGATTTTTTTTTCTCTCAACCCATGCCCAGAGGAAAG 116661205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 CTAAGAGGAGGAATCAACATCAGGGATTTTTTTTTCTCTCAACCCATGCCCAGAGGAAAG 4260

116661206 TCATATGAGGACGTAACACAAAGAGAGACATCTACAAATCACAGAGGTTGCACCAGAAAT 116661265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 TCATATGAGGACGTAACACAAAGAGAGACATCTACAAATCACAGAGGTTGCACCAGAAAT 4320

116661266 CAACCCTGCTAGCATATCGATCTTGAACTTCTAGTCCCCAGAACTGTGAGGAAATAAATT 116661325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 CAACCCTGCTAGCATATCGATCTTGAACTTCTAGTCCCCAGAACTGTGAGGAAATAAATT 4380

116661326 TTTGTTGCTTATGCCACCAGATCTGTGACATTTTGTTATGGAAGTCTGAGCTGACCAATA 116661385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 TTTGTTGCTTATGCCACCAGATCTGTGACATTTTGTTATGGAAGTCTGAGCTGACCAATA 4440

116661386 CACTTGAATAACTATCAGTGTCAATGTAAAACAAGCCATCTTTAGACTTAAGGAAACAGT 116661445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 CACTTGAATAACTATCAGTGTCAATGTAAAACAAGCCATCTTTAGACTTAAGGAAACAGT 4500

116661446 CACCTGGCTCTCTAAGGCAGATGCAAATGGATTTTTCTTTGCCCGGGTTTAGTAATTCAG 116661505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 CACCTGGCTCTCTAAGGCAGATGCAAATGGATTTTTCTTTGCCCGGGTTTAGTAATTCAG 4560

116661506 ATTATGGCACTAAGTGTTTTGGGAAGGCTCCATGTCATTTTGATATAGTCACTGTGTGTT 116661565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 ATTATGGCACTAAGTGTTTTGGGAAGGCTCCATGTCATTTTGATATAGTCACTGTGTGTT 4620

116661566 GCCATTCTTATGCATGTATTCTCCACAGTCTCAGTCCTGCTCTGCAGCTGCTCTCGTGTC 116661625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 GCCATTCTTATGCATGTATTCTCCACAGTCTCAGTCCTGCTCTGCAGCTGCTCTCGTGTC 4680

116661626 AAATGATCCATCACTCAACGGAAATGAACTCATCACTCCATAAAAGGAATAGGAAGATCA 116661685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 AAATGATCCATCACTCAACGGAAATGAACTCATCACTCCATAAAAGGAATAGGAAGATCA 4740

116661686 GTCCATGATCCAATCCCAAACTATTTTTTCTGAGGATGATAATGTTATCTAGAAATCACA 116661745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 GTCCATGATCCAATCCCAAACTATTTTTTCTGAGGATGATAATGTTATCTAGAAATCACA 4800

116661746 ACAGTGGTATACATCTGAACATGGCTGCTTTAGTAGCTGAACGACTCTTCTCATCTTCTC 116661805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 ACAGTGGTATACATCTGAACATGGCTGCTTTAGTAGCTGAACGACTCTTCTCATCTTCTC 4860

116661806 ATCAGTTAGGAAAGACTGAGAACTGGTAGCATAAATCCATCAATTATGGGATTGCAATTG 116661865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 ATCAGTTAGGAAAGACTGAGAACTGGTAGCATAAATCCATCAATTATGGGATTGCAATTG 4920

116661866 CAGAATGTTTTGTGACTCACATAATGTTTTCTTCTTTACTCAGAACTTCTCTATTTCACA 116661925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 CAGAATGTTTTGTGACTCACATAATGTTTTCTTCTTTACTCAGAACTTCTCTATTTCACA 4980

116661926 GATTCTCACCTTAATAATTGAAGCAACTCAGGGTCACATCCTAGTTCTATAATTCTGCCT 116661985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 GATTCTCACCTTAATAATTGAAGCAACTCAGGGTCACATCCTAGTTCTATAATTCTGCCT 5040

116661986 GAGGCACTCTGAGCCCAAACCATCAACAGGAAACAAACAAATAAAAAACCTGCTAATTTA 116662045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 GAGGCACTCTGAGCCCAAACCATCAACAGGAAACAAACAAATAAAAAACCTGCTAATTTA 5100

116662046 CTCTCCAATGAAACCTTTCCAGAATTATCTGTGTAGAGTTTCCTATTGCTGCAATAATTA 116662105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 CTCTCCAATGAAACCTTTCCAGAATTATCTGTGTAGAGTTTCCTATTGCTGCAATAATTA 5160

116662106 ATAAACTCAGTTTGCTTATATTGCAAATTTTAAAACTCGTAGTGGGAGATTTCCAGTTGC 116662165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 ATAAACTCAGTTTGCTTATATTGCAAATTTTAAAACTCGTAGTGGGAGATTTCCAGTTGC 5220

116662166 AAACAACAAGTCTTGGCTTTAATTATGAGTTCAACCAGTTTTTTTTCTCCTAATGTTTTA 116662225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 AAACAACAAGTCTTGGCTTTAATTATGAGTTCAACCAGTTTTTTTTCTCCTAATGTTTTA 5280

116662226 AATCTCAGTTCATCATAATGTCTGAGCTTGTCTGATTTTGGCATAGGGAATATAATTAGA 116662285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 AATCTCAGTTCATCATAATGTCTGAGCTTGTCTGATTTTGGCATAGGGAATATAATTAGA 5340

116662286 AGTAGTGAATGAAGGCCTAGCTGTTGCTTTGATGTCAGCAGACACCCATTTCTCTTTCCA 116662345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 AGTAGTGAATGAAGGCCTAGCTGTTGCTTTGATGTCAGCAGACACCCATTTCTCTTTCCA 5400

116662346 AACTGCTTTTAAAAAGTCAAACAACTTCCTTCTCTTCTTGCCTCACTCTCTACTTAATGT 116662405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 AACTGCTTTTAAAAAGTCAAACAACTTCCTTCTCTTCTTGCCTCACTCTCTACTTAATGT 5460

116662406 GATTTTCTTTTAATTTATGAAGGAAATAAAATCATTGCTTTTTAAGAATCATCCAACCAA 116662465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 GATTTTCTTTTAATTTATGAAGGAAATAAAATCATTGCTTTTTAAGAATCATCCAACCAA 5520

116662466 GTCATTAAAGATATCTGGAATTCAAGATGTAGTCAAAATATTTCAAGGGCATTACAATAT 116662525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 GTCATTAAAGATATCTGGAATTCAAGATGTAGTCAAAATATTTCAAGGGCATTACAATAT 5580

116662526 CCTCTGTCTTCTCTAATCTCTCAGGCAGTAAAACGGTACCAAGTGCAGAGATAGAAACAC 116662585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 CCTCTGTCTTCTCTAATCTCTCAGGCAGTAAAACGGTACCAAGTGCAGAGATAGAAACAC 5640

116662586 TGCTGTCAAAGTGGGTTAAAATCTTGACAGTATCGTGGCTTCTGATTTTAATTTCTCAAT 116662645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 TGCTGTCAAAGTGGGTTAAAATCTTGACAGTATCGTGGCTTCTGATTTTAATTTCTCAAT 5700

116662646 TAACTTATACAAATGAATAACTACCGTTATAGAAATAGCTTCTGGATTTCTTTGTCCTTT 116662705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5701 TAACTTATACAAATGAATAACTACCGTTATAGAAATAGCTTCTGGATTTCTTTGTCCTTT 5760

116662706 TTTTCCTGAAGTTAGGCTATATTTGGTATCTCTATAGAGATAGGCTATATTTGGTAAATC 116662765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5761 TTTTCCTGAAGTTAGGCTATATTTGGTATCTCTATAGAGATAGGCTATATTTGGTAAATC 5820

116662766 TGTTCTCACCTCACATAAAAGGTTAATATTCTACAAGTGGATAGATGTGGTGAGGACAAC 116662825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5821 TGTTCTCACCTCACATAAAAGGTTAATATTCTACAAGTGGATAGATGTGGTGAGGACAAC 5880

116662826 TAAAAGGAGATTGAATGATCTCATCAAATTATATTACACAACCTTTCAAAGAAAGCTCAG 116662885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5881 TAAAAGGAGATTGAATGATCTCATCAAATTATATTACACAACCTTTCAAAGAAAGCTCAG 5940

116662886 TTGGATTAAGAGGTTTCTTTATGTTCATGCCCAAAATGCCAAATTCCAACAGCCCACAAA 116662945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5941 TTGGATTAAGAGGTTTCTTTATGTTCATGCCCAAAATGCCAAATTCCAACAGCCCACAAA 6000

116662946 ATTTCTTTGAAGTATTTTTCTCATACGTTTGTTTGATGAACAGCTTAAAGCTCCATTTCC 116663005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6001 ATTTCTTTGAAGTATTTTTCTCATACGTTTGTTTGATGAACAGCTTAAAGCTCCATTTCC 6060

116663006 ATCCTAGCAAGTGGCAGACAAAAAGCCAGATAGTAAATCATATTTTAATAAAAATGATTT 116663065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6061 ATCCTAGCAAGTGGCAGACAAAAAGCCAGATAGTAAATCATATTTTAATAAAAATGATTT 6120

116663066 TAATAAGTGAAAGATATGATCCATTAAGTTAATCTTGTTAAGTAGAAGACCAAAATGAGA 116663125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6121 TAATAAGTGAAAGATATGATCCATTAAGTTAATCTTGTTAAGTAGAAGACCAAAATGAGA 6180

116663126 ACTTAATGGGGTGCAAACATCACGGAGAATCAAAACACACACTAGAAACCATACTTGAGA 116663185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6181 ACTTAATGGGGTGCAAACATCACGGAGAATCAAAACACACACTAGAAACCATACTTGAGA 6240

116663186 ACCAGAGATGAGTGAATGTTTGGTCATCAATATCCATGCTAGCCTTAATCTTGTGGTTAT 116663245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6241 ACCAGAGATGAGTGAATGTTTGGTCATCAATATCCATGCTAGCCTTAATCTTGTGGTTAT 6300

116663246 CCCACCACATCCCCCTTTTCAACAGAAGTCAGTGAGCAGCAAGCCTCATTGAATGTTGGA 116663305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6301 CCCACCACATCCCCCTTTTCAACAGAAGTCAGTGAGCAGCAAGCCTCATTGAATGTTGGA 6360

116663306 TATTAGCAAGCACATGTAGTTTTGCTTCAAGTACTCTTTATTTTCTTCCAATCCTCAGGG 116663365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6361 TATTAGCAAGCACATGTAGTTTTGCTTCAAGTACTCTTTATTTTCTTCCAATCCTCAGGG 6420

116663366 CCTTTCTCAACATATGGTTTATTATAGCGTTGTGAATGATTGGTCTTTCATAAGGACATT 116663425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6421 CCTTTCTCAACATATGGTTTATTATAGCGTTGTGAATGATTGGTCTTTCATAAGGACATT 6480

116663426 TTCCTTGGCAGAAGGCTATTTGAAGTTCATTGCTTTTACAAGGTAAGATTTCTGGAAGTT 116663485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6481 TTCCTTGGCAGAAGGCTATTTGAAGTTCATTGCTTTTACAAGGTAAGATTTCTGGAAGTT 6540

116663486 CTAAGCTATATAAATAGGTTTGGAGGAAC 116663514
          |||||||||||||||||||||||||||||
     6541 CTAAGCTATATAAATAGGTTTGGAGGAAC 6569

EXCISED REGION

116663516 TTCTCTTAAACCACAGAAACTATTAATACTCTTGAGCAGGTGAGCTTATCAGATTCCTTA 116663575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6571 TTCTCTTAAACCACAGAAACTATTAATACTCTTGAGCAGGTGAGCTTATCAGATTCCTTA 6630

116663576 GTAGTCAACCAAAA 116663589
          ||||||||||||||
     6631 GTAGTCAACCAAAA 6644

Alignment time is 8.20462 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [116652076,116672656] =>     20581 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [        1,     2606] =>      2606 nucs 'mol-32-2af2-047264_2606'

Score:        2580
Aligned:      2602        nucs
Identic:      2600 (100%) nucs =>      1477 (100%)      1123 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [116662120,116663597] EXCISED REGION [116663606,116664729]
 second seq =>  [        1,     1478] EXCISED REGION [     1484,     2606]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         8 nucs [116663598,116663605]
 second seq =>         5 nucs [1479,1483]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        27 nucs [1479,1505] to [1484,1510]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [1479,1480] to [1482,1483]

116662120 CTTATATTGCAAATTTTAAAACTCGTAGTGGGAGATTTCCAGTTGCAAACAACAAGTCTT 116662179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTTATATTGCAAATTTTAAAACTCGTAGTGGGAGATTTCCAGTTGCAAACAACAAGTCTT 60

116662180 GGCTTTAATTATGAGTTCAACCAGTTTTTTTTCTCCTAATGTTTTAAATCTCAGTTCATC 116662239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGCTTTAATTATGAGTTCAACCAGTTTTTTTTCTCCTAATGTTTTAAATCTCAGTTCATC 120

116662240 ATAATGTCTGAGCTTGTCTGATTTTGGCATAGGGAATATAATTAGAAGTAGTGAATGAAG 116662299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATAATGTCTGAGCTTGTCTGATTTTGGCATAGGGAATATAATTAGAAGTAGTGAATGAAG 180

116662300 GCCTAGCTGTTGCTTTGATGTCAGCAGACACCCATTTCTCTTTCCAAACTGCTTTTAAAA 116662359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCCTAGCTGTTGCTTTGATGTCAGCAGACACCCATTTCTCTTTCCAAACTGCTTTTAAAA 240

116662360 AGTCAAACAACTTCCTTCTCTTCTTGCCTCACTCTCTACTTAATGTGATTTTCTTTTAAT 116662419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGTCAAACAACTTCCTTCTCTTCTTGCCTCACTCTCTACTTAATGTGATTTTCTTTTAAT 300

116662420 TTATGAAGGAAATAAAATCATTGCTTTTTAAGAATCATCCAACCAAGTCATTAAAGATAT 116662479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTATGAAGGAAATAAAATCATTGCTTTTTAAGAATCATCCAACCAAGTCATTAAAGATAT 360

116662480 CTGGAATTCAAGATGTAGTCAAAATATTTCAAGGGCATTACAATATCCTCTGTCTTCTCT 116662539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTGGAATTCAAGATGTAGTCAAAATATTTCAAGGGCATTACAATATCCTCTGTCTTCTCT 420

116662540 AATCTCTCAGGCAGTAAAACGGTACCAAGTGCAGAGATAGAAACACTGCTGTCAAAGTGG 116662599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AATCTCTCAGGCAGTAAAACGGTACCAAGTGCAGAGATAGAAACACTGCTGTCAAAGTGG 480

116662600 GTTAAAATCTTGACAGTATCGTGGCTTCTGATTTTAATTTCTCAATTAACTTATACAAAT 116662659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTTAAAATCTTGACAGTATCGTGGCTTCTGATTTTAATTTCTCAATTAACTTATACAAAT 540

116662660 GAATAACTACCGTTATAGAAATAGCTTCTGGATTTCTTTGTCCTTTTTTTCCTGAAGTTA 116662719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GAATAACTACCGTTATAGAAATAGCTTCTGGATTTCTTTGTCCTTTTTTTCCTGAAGTTA 600

116662720 GGCTATATTTGGTATCTCTATAGAGATAGGCTATATTTGGTAAATCTGTTCTCACCTCAC 116662779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GGCTATATTTGGTATCTCTATAGAGATAGGCTATATTTGGTAAATCTGTTCTCACCTCAC 660

116662780 ATAAAAGGTTAATATTCTACAAGTGGATAGATGTGGTGAGGACAACTAAAAGGAGATTGA 116662839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATAAAAGGTTAATATTCTACAAGTGGATAGATGTGGTGAGGACAACTAAAAGGAGATTGA 720

116662840 ATGATCTCATCAAATTATATTACACAACCTTTCAAAGAAAGCTCAGTTGGATTAAGAGGT 116662899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATGATCTCATCAAATTATATTACACAACCTTTCAAAGAAAGCTCAGTTGGATTAAGAGGT 780

116662900 TTCTTTATGTTCATGCCCAAAATGCCAAATTCCAACAGCCCACAAAATTTCTTTGAAGTA 116662959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTCTTTATGTTCATGCCCAAAATGCCAAATTCCAACAGCCCACAAAATTTCTTTGAAGTA 840

116662960 TTTTTCTCATACGTTTGTTTGATGAACAGCTTAAAGCTCCATTTCCATCCTAGCAAGTGG 116663019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTTTTCTCATACGTTTGTTTGATGAACAGCTTAAAGCTCCATTTCCATCCTAGCAAGTGG 900

116663020 CAGACAAAAAGCCAGATAGTAAATCATATTTTAATAAAAATGATTTTAATAAGTGAAAGA 116663079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CAGACAAAAAGCCAGATAGTAAATCATATTTTAATAAAAATGATTTTAATAAGTGAAAGA 960

116663080 TATGATCCATTAAGTTAATCTTGTTAAGTAGAAGACCAAAATGAGAACTTAATGGGGTGC 116663139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TATGATCCATTAAGTTAATCTTGTTAAGTAGAAGACCAAAATGAGAACTTAATGGGGTGC 1020

116663140 AAACATCACGGAGAATCAAAACACACACTAGAAACCATACTTGAGAACCAGAGATGAGTG 116663199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AAACATCACGGAGAATCAAAACACACACTAGAAACCATACTTGAGAACCAGAGATGAGTG 1080

116663200 AATGTTTGGTCATCAATATCCATGCTAGCCTTAATCTTGTGGTTATCCCACCACATCCCC 116663259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AATGTTTGGTCATCAATATCCATGCTAGCCTTAATCTTGTGGTTATCCCACCACATCCCC 1140

116663260 CTTTTCAACAGAAGTCAGTGAGCAGCAAGCCTCATTGAATGTTGGATATTAGCAAGCACA 116663319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTTTTCAACAGAAGTCAGTGAGCAGCAAGCCTCATTGAATGTTGGATATTAGCAAGCACA 1200

116663320 TGTAGTTTTGCTTCAAGTACTCTTTATTTTCTTCCAATCCTCAGGGCCTTTCTCAACATA 116663379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TGTAGTTTTGCTTCAAGTACTCTTTATTTTCTTCCAATCCTCAGGGCCTTTCTCAACATA 1260

116663380 TGGTTTATTATAGCGTTGTGAATGATTGGTCTTTCATAAGGACATTTTCCTTGGCAGAAG 116663439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGGTTTATTATAGCGTTGTGAATGATTGGTCTTTCATAAGGACATTTTCCTTGGCAGAAG 1320

116663440 GCTATTTGAAGTTCATTGCTTTTACAAGGTAAGATTTCTGGAAGTTCTAAGCTATATAAA 116663499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GCTATTTGAAGTTCATTGCTTTTACAAGGTAAGATTTCTGGAAGTTCTAAGCTATATAAA 1380

116663500 TAGGTTTGGAGGAACTTTCTCTTAAACCACAGAAACTATTAATACTCTTGAGCAGGTGAG 116663559
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TAGGTTTGGAGGAACATTCTCTTAAACCACAGAAACTATTAATACTCTTGAGCAGGTGAG 1440

116663560 CTTATCAGATTCCTTAGTAGTCAACCAAAATGCTGAAG 116663597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTTATCAGATTCCTTAGTAGTCAACCAAAATGCTGAAG 1478

EXCISED REGION

116663606 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGATGGAGTCTCACTCTGTCACCAGGCTG 116663665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1484 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGATGGAGTCTCACTCTGTCACCAGGCTG 1543

116663666 GAGTGCAGTGGTGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCCAGCAATTCT 116663725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1544 GAGTGCAGTGGTGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCCAGCAATTCT 1603

116663726 TCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGGGCATGCCCACCAGGCCCAGCTAAG 116663785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1604 TCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGGGCATGCCCACCAGGCCCAGCTAAG 1663

116663786 TTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCAAGTTGGCCAGAATGGTCTCGATCTCTT 116663845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1664 TTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCAAGTTGGCCAGAATGGTCTCGATCTCTT 1723

116663846 GACTTCATGAGCCGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAGCCACC 116663905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1724 GACTTCATGAGCCGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAGCCACC 1783

116663906 GTGTCCGGCCAAGAATTTTTCTAATGAGGTATGTGCAAAGCAGAAACATTTTATGTTAAG 116663965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1784 GTGTCCGGCCAAGAATTTTTCTAATGAGGTATGTGCAAAGCAGAAACATTTTATGTTAAG 1843

116663966 TACAGGCATGGCCACAAAAATATCACTTAAGAAGAGAAGAATTTTGGGGTTCTCAGTGTA 116664025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1844 TACAGGCATGGCCACAAAAATATCACTTAAGAAGAGAAGAATTTTGGGGTTCTCAGTGTA 1903

116664026 ACATGGAGATGAACAATATCTCACTCTTTTGAGGATAACAATAGATTTCTCTCTTCTGCT 116664085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1904 ACATGGAGATGAACAATATCTCACTCTTTTGAGGATAACAATAGATTTCTCTCTTCTGCT 1963

116664086 TTTGCAATGATTAAAATTTTGGAAATTTATATGAGAAAAGTAAAGATATTTTAAAAAGTT 116664145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1964 TTTGCAATGATTAAAATTTTGGAAATTTATATGAGAAAAGTAAAGATATTTTAAAAAGTT 2023

116664146 TTCTTGTTTTTTTTAACTCTTTATTCTCTTAAATCTTGACACTGTTCGTTGTAAGTTTGT 116664205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2024 TTCTTGTTTTTTTTAACTCTTTATTCTCTTAAATCTTGACACTGTTCGTTGTAAGTTTGT 2083

116664206 GCTAGATACAGCCACTGTTTGGTTGAGAAAATTTCTCTATGTCTGTGACATCCATGAGAT 116664265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2084 GCTAGATACAGCCACTGTTTGGTTGAGAAAATTTCTCTATGTCTGTGACATCCATGAGAT 2143

116664266 AGAAACCGATGGCTACATATGGCTATTTAAATTAAATTAATTAAACTTACATAAAATAAA 116664325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2144 AGAAACCGATGGCTACATATGGCTATTTAAATTAAATTAATTAAACTTACATAAAATAAA 2203

116664326 AACTTGGTTCCATAGTTGCACTAGACACATTTTAGGGCTCAATAGCCATAGTATAAACAG 116664385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2204 AACTTGGTTCCATAGTTGCACTAGACACATTTTAGGGCTCAATAGCCATAGTATAAACAG 2263

116664386 CATAGTATAGAACTTTCTATCAGAGAAAGTTTGTCAGGGAGCTGTGCTAAAGGTGGTTTT 116664445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2264 CATAGTATAGAACTTTCTATCAGAGAAAGTTTGTCAGGGAGCTGTGCTAAAGGTGGTTTT 2323

116664446 CAAAATATAGCTGTAGCCTGAGAATATTTCTATACTATTTTAATCAATTTTAACTAATTA 116664505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2324 CAAAATATAGCTGTAGCCTGAGAATATTTCTATACTATTTTAATCAATTTTAACTAATTA 2383

116664506 ATTAACTACATTATACTTTGTTAACATAAAGTCAAAGGCATCTACTTCTGCAATTGGGAG 116664565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2384 ATTAACTACATTATACTTTGTTAACATAAAGTCAAAGGCATCTACTTCTGCAATTGGGAG 2443

116664566 GTAATAACTTGCAATATAAAAATAGATGAGGCAGGTTGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCC 116664625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2444 GTAATAACTTGCAATATAAAAATAGATGAGGCAGGTTGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCC 2503

116664626 CAGCACTTTGGGAGGCCGAAGTAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCT 116664685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2504 CAGCACTTTGGGAGGCCGAAGTAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCT 2563

116664686 GGCCAACATGGTGAAACCCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAA 116664729
          |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
     2564 GGCCAACATGGTGAAA-CCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAA 2606

Alignment time is 3.04504 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [116652076,116672656] =>     20581 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [        1,     5491] =>      5491 nucs 'mol-32-2b08-034254_5491'

Score:        5319
Aligned:      5511        nucs
Identic:      5478 ( 99%) nucs =>      4542 ( 99%)       936 (100%)
Gaps:           22 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [116657506,116662076] EXCISED REGION [116662657,116663595]
 second seq =>  [        1,     4551] EXCISED REGION [     4553,     5491]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       580 nucs [116662077,116662656]
 second seq =>         1 nucs [4552,4552]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [4551,4551] to [4552,4552]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

116657506 ATAGATATGATCACCTAGTGAACACTCAAGACTTATGCACTTGTCTGCGTGTAATGTACA 116657565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATAGATATGATCACCTAGTGAACACTCAAGACTTATGCACTTGTCTGCGTGTAATGTACA 60

116657566 CAAAAATGTGTAACTACTTAGTAGTAGTCTTATAAAAATAAACAAGATAATATGTGTGTA 116657625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAAAAATGTGTAACTACTTAGTAGTAGTCTTATAAAAATAAACAAGATAATATGTGTGTA 120

116657626 TATATATGTAGTGTTAAGCAAAGTACCCAGTACATGTTGGCCAAAACAAATGTCATCTCT 116657685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TATATATGTAGTGTTAAGCAAAGTACCCAGTACATGTTGGCCAAAACAAATGTCATCTCT 180

116657686 CTCCTCCTGCCTTTTGTTCACTTTTTTTCCTAGCCGAACAATCCTAGAGATTTTAAAGTA 116657745
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTCCTCCTGTCTTTTGTTCACTTTTTTTCCTAGCCGAACAATCCTAGAGATTTTAAAGTA 240

116657746 CTTCTGCTTGTTTACTTTTGTTTCCAAAAAAGTTAATTATAAAGCAAATAAACTCGCTTT 116657805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTTCTGCTTGTTTACTTTTGTTTCCAAAAAAGTTAATTATAAAGCAAATAAACTCGCTTT 300

116657806 AGGAAAAATGCAAAAAATCTGATAATATGCTCATTTATAAATAAAAAAGCAAACAAAACC 116657865
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGGAAAAATGCAAAAAATCTGATAATATGCCCATTTATAAATAAAAAAGCAAACAAAACC 360

116657866 TCTAAATTGAAACAACAGCCACCAGCCTACTCCCATCCTTTCCAAGATATTCTAATTCTC 116657925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCTAAATTGAAACAACAGCCACCAGCCTACTCCCATCCTTTCCAAGATATTCTAATTCTC 420

116657926 CTCTTCCTTTTCTCCAAGGCATTTTCCTAAGGATAGCTCCATTTTATCTTTTACATATAC 116657985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTCTTCCTTTTCTCCAAGGCATTTTCCTAAGGATAGCTCCATTTTATCTTTTACATATAC 480

116657986 TTCTTTTCTTTTCCTATATTTTTCCACCTTCTTCTAATTTTCTTTGCTTTTCTATTGATT 116658045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTCTTTTCTTTTCCTATATTTTTCCACCTTCTTCTAATTTTCTTTGCTTTTCTATTGATT 540

116658046 GTGGGTTAAGTAAGAAAAAAAGGCAAGGGTGGCAGTCAGAGTGCGTGCAGAATTCTTCAA 116658105
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATGGGTTAAGTAAGAAAAAAAGGCAAGGGTGGCAGTCAGAGTGCGTGCAGAATTCTTCAA 600

116658106 AGCAATGAATGTTGAGAAAAGCCGTGTATATTTAGAAGTTAATGGTCTCCCCTCTAGATT 116658165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGCAATGAATGTTGAGAAAAGCCGTGTATATTTAGAAGTTAATGGTCTCCCCTCTAGATT 660

116658166 TCTATGCAGCTTGAATTCCTCAGTGTTTCTGAACTTCTTGTGTTTTTCTCTTATCTTTTA 116658225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCTATGCAGCTTGAATTCCTCAGTGTTTCTGAACTTCTTGTGTTTTTCTCTTATCTTTTA 720

116658226 AATAATACTCTGCTACTGTTTTTCTCTAGATTACCATTTCAGTGGATTTGAAAAATCTCT 116658285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AATAATACTCTGCTACTGTTTTTCTCTAGATTACCATTTCAGTGGATTTGAAAAATCTCT 780

116658286 TTCCATTATTTTTCTTTTCTCCTTACTTCTTTCTTCCCCTTCTCTTATTTTTTCTCTTTC 116658345
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTCCATTATTTTTCTTTTCTCCTTACTCCTTTCTTCCCCTTCTCTTATTTTTTCTCTTTC 840

116658346 TCTCCAACTTCATCTCTTTATTAATTTCCTTCTCTCCTTTTAAGTTTTGGTAACTGTTTT 116658405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCTCCAACTTCATCTCTTTATTAATTTCCTTCTCTCCTTTTAAGTTTTGGTAACTGTTTT 900

116658406 TCATTTGGCCAGCTCTCAGTATACCTTATTTGTGTTGGGTACCAAAGCAAACATCCTCAC 116658465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TCATTTGGCCAGCTCTCAGTATACCTTATTTGTGTTGGGTACCAAAGCAAACATCCTCAC 960

116658466 CAGTGATGCAAGACTGAAGAAGTGTGATCATTAGCTCTGCAATCACAACCACAAAACACC 116658525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CAGTGATGCAAGACTGAAGAAGTGTGATCATTAGCTCTGCAATCACAACCACAAAACACC 1020

116658526 TGTGGCTTGCCTAAAACCTTCTTCTGTTAGACCCTTTCCTTACTTGGAAACAATCTCATC 116658585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGTGGCTTGCCTAAAACCTTCTTCTGTTAGACCCTTTCCTTACTTGGAAACAATCTCATC 1080

116658586 TTAAGAAATCAAGCAATACTTGAAGAAATTTTGAGGAACCCATAAGCAAGAAAAACTGTA 116658645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTAAGAAATCAAGCAATACTTGAAGAAATTTTGAGGAACCCATAAGCAAGAAAAACTGTA 1140

116658646 TACTCATTTCCCTTAACATGATACCATTTCACAGTTACCTGTGTGGTGCTTTTCATTGCT 116658705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TACTCATTTCCCTTAACATGATACCATTTCACAGTTACCTGTGTGGTGCTTTTCATTGCT 1200

116658706 ATAGAAATCGAATTAAACTCAGTGTGATTGTAGCATAATGGGATACTTCACTTGAGAAAG 116658765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATAGAAATCGAATTAAACTCAGTGTGATTGTAGCATAATGGGATACTTCACTTGAGAAAG 1260

116658766 GGGATTTTTATAATTTGGAGAAGCATTGAGAGTCAGCAGTGAATATTCATGACACGGGCT 116658825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     1261 GGGATTTTTATAATTTGGAGAAGCATTGAGAGTCAGCAGTGAATATTCATGACACGAGCT 1320

116658826 AGGACCATTTAAACAGACGACTTCTAGGAGAGTCTCTTGAGGACATTTAATCTCTTGTGC 116658885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AGGACCATTTAAACAGACGACTTCTAGGAGAGTCTCTTGAGGACATTTAATCTCTTGTGC 1380

116658886 TTGACCATCCTGACCCAAGGTGAGTTTGAGTCTCAAATACATTAAAATTCTCAAACCATT 116658945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTGACCATCCTGACCCAAGGTGAGTTTGAGTCTCAAATACATTAAAATTCTCAAACCATT 1440

116658946 AGTTTTATTTTGTTCCTGTAAACCTAAAGTTTAACTTTCAGAATACTTTTTCTCATTAGA 116659005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AGTTTTATTTTGTTCCTGTAAACCTAAAGTTTAACTTTCAGAATACTTTTTCTCATTAGA 1500

116659006 ATTATATGTTTAAAAATTCTTGGTGACATTCCATTCTTCACCTAATCTCACGTTTGTCTT 116659065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATTATATGTTTAAAAATTCTTGGTGACATTCCATTCTTCACCTAATCTCACGTTTGTCTT 1560

116659066 GTTCTGTTTTGTCAAAAATGTTTTCCTAAAAATGAAAAAGAAAACCTCTAGAATGATTAA 116659125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GTTCTGTTTTGTCAAAAATGTTTTCCTAAAAATGAAAAAGAAAACCTCTAGAATGATTAA 1620

116659126 TCGAGTGAGATTCTCAATAAATCTGCAACTAAAACCATCCGTAAGTCCTAACAAGTTTCA 116659185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TCGAGTGAGATTCTCAATAAATCTGCAACTAAAACCATCCGTAAGTCCTAACAAGTTTCA 1680

116659186 ATTTTTATCACGTTAGTGTCTTTTAGTAGATAAACTTTGCTCTAGGTCACTATCCAAAAA 116659245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ATTTTTATCACGTTAGTGTCTTTTAGTAGATAAACTTTGCTCTAGGTCACTATCCAAAAA 1740

116659246 ACTTATGTGAGTTCTGTTGATTGTATCCTGCCTTTGTGTTCCTAAGAGTTGATTTGGGAA 116659305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ACTTATGTGAGTTCTGTTGATTGTATCCTGCCTTTGTGTTCCTAAGAGTTGATTTGGGAA 1800

116659306 GCAAAATCCCCCAAAAATCTATATTCTCAGGCCCATGGATAGTTAGAACGCAGGCTACAG 116659365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GCAAAATCCCCCAAAAATCTATATTCTCAGGCCCATGGATAGTTAGAACGCAGGCTACAG 1860

116659366 ATGTCAAACTCTCTAGTCAGGGGTCATGCCTAATAAAGTGCAGAAGGAATACATTGAACA 116659425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ATGTCAAACTCTCTAGTCAGGGGTCATGCCTAATAAAGTGCAGAAGGAATACATTGAACA 1920

116659426 GAATGTTATACACTTTTAGGGCGTTTTAAAATTTTTGGTCTAAGTCATGTCTCTAGCAGG 116659485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GAATGTTATACACTTTTAGGGCGTTTTAAAATTTTTGGTCTAAGTCATGTCTCTAGCAGG 1980

116659486 CTAGACACCTGTTCCAGATATGTATTCTTAATATAACAAAAATTATTTAAATATCTTACC 116659545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CTAGACACCTGTTCCAGATATGTATTCTTAATATAACAAAAATTATTTAAATATCTTACC 2040

116659546 ATGTGTCACAGTTACATCAATAATATTTGGAATCATACTGGACCCTTTGAAAATTTTCAG 116659605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ATGTGTCACAGTTACATCAATAATATTTGGAATCATACTGGACCCTTTGAAAATTTTCAG 2100

116659606 TATGAGTAAAAATGTTTATCTTAGAAGTAAGTGGAGGGGAAACATCCTTATTATTAAGTG 116659665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TATGAGTAAAAATGTTTATCTTAGAAGTAAGTGGAGGGGAAACATCCTTATTATTAAGTG 2160

116659666 CTAAGCCTTTTTAAAATGGTCTATGAAGATTCTAAATAGACTTCTGATTCCAAAATACCT 116659725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CTAAGCCTTTTTAAAATGGTCTATGAAGATTCTAAATAGACTTCTGATTCCAAAATACCT 2220

116659726 ATAACAATGAAGTCTTTGGCCATGGCTAATTAAAAAAAAACATAAAACTCTAGAGACTGT 116659785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ATAACAATGAAGTCTTTGGCCATGGCTAATTAAAAAAAAACATAAAACTCTAGAGACTGT 2280

116659786 CTCATTTATTAATTTGCCAAATTCTTCTTTCTTTTAACATTTTCTTTATCCCACAGTATC 116659845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CTCATTTATTAATTTGCCAAATTCTTCTTTCTTTTAACATTTTCTTTATCCCACAGTATC 2340

116659846 TTTTCTTGCTTTTTGTGCTACCACACTATCAAATTTTACTCTTTTTCTCCCAAATTTCTT 116659905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TTTTCTTGCTTTTTGTGCTACCACACTATCAAATTTTACTCTTTTTCTCCCAAATTTCTT 2400

116659906 TTTCTAACCATCGTCTTCCCCCTCTGATTGTATCTGAAAATAACCACTTGCTTTTCTTCT 116659965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TTTCTAACCATCGTCTTCCCCCTCTGATTGTATCTGAAAATAACCACTTGCTTTTCTTCT 2460

116659966 TTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCC 116660025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
     2461 TTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCC---- 2516

116660026 TTCCTTCCTTCCTTCCCTCTTTCCCTTTCCCTTTCTTTTCTTTTATTTTTTCTTCTCTCT 116660085
                          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2517 ----------------CTCTTTCCCTTTCCCTTTCTTTTCTTTTATTTTTTCTTCTCTCT 2560

116660086 TCTCTTCTCTTTTTCTGGGTTGCACTCTGTTACCCAAGCTTGAATGCAATGGCAGGGATC 116660145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2561 TCTCTTCTCTTTTTCTGGGTTGCACTCTGTTACCCAAGCTTGAATGCAATGGCAGGGATC 2620

116660146 ACAGCTTACTGCAGTGTCAACCTCCTGGGCTCAGGTGATCATCCTCCTTCAGCCTCCTGT 116660205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2621 ACAGCTTACTGCAGTGTCAACCTCCTGGGCTCAGGTGATCATCCTCCTTCAGCCTCCTGT 2680

116660206 GTAGCTAGGACTGCAGGCATGTACCACCACACATGGCTAATTTTAGTATTTTTTGTAGAA 116660265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2681 GTAGCTAGGACTGCAGGCATGTACCACCACACATGGCTAATTTTAGTATTTTTTGTAGAA 2740

116660266 ATGAGAGTCTCACTGTGTTGTCCAGGTTTGTCTCAAACTCCCAGGTTCAAGCAATCCACC 116660325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2741 ATGAGAGTCTCACTGTGTTGTCCAGGTTTGTCTCAAACTCCCAGGTTCAAGCAATCCACC 2800

116660326 TGCCTCAGCCTCTCAAACTGCTGGGATTATAGGCATGTGCCACCATGCTGGGCCTCAAAT 116660385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2801 TGCCTCAGCCTCTCAAACTGCTGGGATTATAGGCATGTGCCACCATGCTGGGCCTCAAAT 2860

116660386 TGACATTTTCTTAAAAATTGGACTGCCAAACAAGGACATTAGCCCTAGTAGGCAGAAGAT 116660445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2861 TGACATTTTCTTAAAAATTGGACTGCCAAACAAGGACATTAGCCCTAGTAGGCAGAAGAT 2920

116660446 ACTATCTTGGTCTGTGTTAGAGGCAATTGTTGAAATTTCTCTGAATCTCTATGGGATAGG 116660505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2921 ACTATCTTGGTCTGTGTTAGAGGCAATTGTTGAAATTTCTCTGAATCTCTATGGGATAGG 2980

116660506 CATAAATGTACTGATAAATTTGAGCAGTCCTGGGAATCCATAATCTCAATTTATTTGACC 116660565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2981 CATAAATGTACTGATAAATTTGAGCAGTCCTGGGAATCCATAATCTCAATTTATTTGACC 3040

116660566 AATATCAATTAATACCATGTTGAGAGGTCCTTCTATTTCTGAAGTCTGGTTCAGCAAAAA 116660625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3041 AATATCAATTAATACCATGTTGAGAGGTCCTTCTATTTCTGAAGTCTGGTTCAGCAAAAA 3100

116660626 ATAAAAAAAAAAA-TAAAATACCTGAAATAATGTAGCTATTCCTGAGGTATCATTAACAG 116660684
          ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3101 ATAAAAAAAAAAAATAAAATACCTGAAATAATGTAGCTATTCCTGAGGTATCATTAACAG 3160

116660685 AATAGAAACTTAAAAAGCGCATGATATGGAAAAATCTTTGCTGATGGTTATACATGTTAA 116660744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     3161 AATAGAAACTTAAAAAGCGCATGATATGGAAAAACCTTTGCTGATGGTTATACATGTTAA 3220

116660745 GTTTCCAGATAACTATTAATTAGACTTGCAGACATAAAAGGCTGTACCAAGTGGATATTT 116660804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3221 GTTTCCAGATAACTATTAATTAGACTTGCAGACATAAAAGGCTGTACCAAGTGGATATTT 3280

116660805 TAGAGATAAATTTTTAGCACTTACAGACAATATTATGAAGTAGCTATGTGGGCATAGAGA 116660864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3281 TAGAGATAAATTTTTAGCACTTACAGACAATATTATGAAGTAGCTATGTGGGCATAGAGA 3340

116660865 AATTCGGGAAATTAGCAGGCTGGTTCTGCTATAATAGATCTCAGTTCACCCTTAGGATAT 116660924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3341 AATTCGGGAAATTAGCAGGCTGGTTCTGCTATAATAGATCTCAGTTCACCCTTAGGATAT 3400

116660925 CTTCACTAAAGGAGCTTAACATAGCCCAGATGGTAGATTTGATTGCCCTCATTAGAGCTG 116660984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3401 CTTCACTAAAGGAGCTTAACATAGCCCAGATGGTAGATTTGATTGCCCTCATTAGAGCTG 3460

116660985 GTCACTTGGCCAAAGACAAAAAAAATTATATTTACACAGAAAATAGCTCAAGTACCTGAA 116661044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3461 GTCACTTGGCCAAAGACAAAAAAAATTATATTTACACAGAAAATAGCTCAAGTACCTGAA 3520

116661045 CCTCAGTATGACTATATATGGGGATAGAGTCTTTAAGGAAGTGATTAAGGTTAAATAAAG 116661104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3521 CCTCAGTATGACTATATATGGGGATAGAGTCTTTAAGGAAGTGATTAAGGTTAAATAAAG 3580

116661105 TCATAATGATGGGGCCCTAATCTGATAAGATTAGCGTCCTTCTAAGAGGAGGAATCAACA 116661164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3581 TCATAATGATGGGGCCCTAATCTGATAAGATTAGCGTCCTTCTAAGAGGAGGAATCAACA 3640

116661165 TCAGGGATTTTTTTTTCTCTCAACCCATGCCCAGAGGAAAGTCATATGAGGACGTAACAC 116661224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3641 TCAGGGATTTTTTTTTCTCTCAACCCATGCCCAGAGGAAAGTCATATGAGGACGTAACAC 3700

116661225 AAAGAGAGACATCTACAAATCACAGAGGTTGCACCAGAAATCAACCCTGCTAGCATATCG 116661284
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3701 AAAGAGAGACATCTACAAATCACAGGGGTTGCACCAGAAATCAACCCTGCTAGCATATCG 3760

116661285 ATCTTGAACTTCTAGTCCCCAGAACTGTGAGGAAATAAATTTTTGTTGCTTATGCCACCA 116661344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3761 ATCTTGAACTTCTAGTCCCCAGAACTGTGAGGAAATAAATTTTTGTTGCTTATGCCACCA 3820

116661345 GATCTGTGACATTTTGTTATGGAAGTCTGAGCTGACCAATACACTTGAATAACTATCAGT 116661404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3821 GATCTGTGACATTTTGTTATGGAAGTCTGAGCTGACCAATACACTTGAATAACTATCAGT 3880

116661405 GTCAATGTAAAACAAGCCATCTTTAGACTTAAGGAAACAGTCACCTGGCTCTCTAAGGCA 116661464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3881 GTCAATGTAAAACAAGCCATCTTTAGACTTAAGGAAACAGTCACCTGGCTCTCTAAGGCA 3940

116661465 GATGCAAATGGATTTTTCTTTGCCCGGGTTTAGTAATTCAGATTATGGCACTAAGTGTTT 116661524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3941 GATGCAAATGGATTTTTCTTTGCCCGGGTTTAGTAATTCAGATTATGGCACTAAGTGTTT 4000

116661525 TGGGAAGGCTCCATGTCATTTTGATATAGTCACTGTGTGTTGCCATTCTTATGCATGTAT 116661584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4001 TGGGAAGGCTCCATGTCATTTTGATATAGTCACTGTGTGTTGCCATTCTTATGCATGTAT 4060

116661585 TCTCCACAGTCTCAGTCCTGCTCTGCAGCTGCTCTCGTGTCAAATGATCCATCACTCAAC 116661644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4061 TCTCCACAGTCTCAGTCCTGCTCTGCAGCTGCTCTCGTGTCAAATGATCCATCACTCAAC 4120

116661645 GGAAATGAACTCATCACTCCATAAAAGGAATAGGAAGATCAGTCCATGATCCAATCCCAA 116661704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4121 GGAAATGAACTCATCACTCCATAAAAGGAATAGGAAGATCAGTCCATGATCCAATCCCAA 4180

116661705 ACTATTTTTTCTGAGGATGATAATGTTATCTAGAAATCACAACAGTGGTATACATCTGAA 116661764
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
     4181 ACTATTTTTTCCGAGGATGATAATGTTATCTAGAAATCACAACAG-GGTATACATCTGAA 4239

116661765 CATGGCTGCTTTAGTAGCTGAACGACTCTTCTCATCTTCTCATCAGTTAGGAAAGACTGA 116661824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4240 CATGGCTGCTTTAGTAGCTGAACGACTCTTCTCATCTTCTCATCAGTTAGGAAAGACTGA 4299

116661825 GAACTGGTAGCATAAATCCATCAATTATGGGATTGCAATTGCAGAATGTTTTGTGACTCA 116661884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4300 GAACTGGTAGCATAAATCCATCAATTATGGGATTGCAATTGCAGAATGTTTTGTGACTCA 4359

116661885 CATAATGTTTTCTTCTTTACTCAGAACTTCTCTATTTCACAGATTCTCACCTTAATAATT 116661944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4360 CATAATGTTTTCTTCTTTACTCAGAACTTCTCTATTTCACAGATTCTCACCTTAATAATT 4419

116661945 GAAGCAACTCAGGGTCACATCCTAGTTCTATAATTCTGCCTGAGGCACTCTGAGCCCAAA 116662004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4420 GAAGCAACTCAGGGTCACATCCTAGTTCTATAATTCTGCCTGAGGCACTCTGAGCCCAAA 4479

116662005 CCATCAACAGGAAACAAACAAATAAAAAACCTGCTAATTTACTCTCCAATGAAACCTTTC 116662064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4480 CCATCAACAGGAAACAAACAAATAAAAAACCTGCTAATTTACTCTCCAATGAAACCTTTC 4539

116662065 CAGAATTATCTG 116662076
          ||||||||||||
     4540 CAGAATTATCTG 4551

EXCISED REGION

116662657 AATGAATAACTACCGTTATAGAAATAGCTTCTGGATTTCTTTGTCCTTTTTTTCCTGAAG 116662716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4553 AATGAATAACTACCGTTATAGAAATAGCTTCTGGATTTCTTTGTCCTTTTTTTCCTGAAG 4612

116662717 TTAGGCTATATTTGGTATCTCTATAGAGATAGGCTATATTTGGTAAATCTGTTCTCACCT 116662776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     4613 TTAGGCTATATTTGGTATCTCTATAGAGATAGGCTATATTTGGTAAATCTATTCTCACCT 4672

116662777 CACATAAAAGGTTAATATTCTACAAGTGGATAGATGTGGTGAGGACAACTAAAAGGAGAT 116662836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4673 CACATAAAAGGTTAATATTCTACAAGTGGATAGATGTGGTGAGGACAACTAAAAGGAGAT 4732

116662837 TGAATGATCTCATCAAATTATATTACACAACCTTTCAAAGAAAGCTCAGTTGGATTAAGA 116662896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4733 TGAATGATCTCATCAAATTATATTACACAACCTTTCAAAGAAAGCTCAGTTGGATTAAGA 4792

116662897 GGTTTCTTTATGTTCATGCCCAAAATGCCAAATTCCAACAGCCCACAAAATTTCTTTGAA 116662956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4793 GGTTTCTTTATGTTCATGCCCAAAATGCCAAATTCCAACAGCCCACAAAATTTCTTTGAA 4852

116662957 GTATTTTTCTCATACGTTTGTTTGATGAACAGCTTAAAGCTCCATTTCCATCCTAGCAAG 116663016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4853 GTATTTTTCTCATACGTTTGTTTGATGAACAGCTTAAAGCTCCATTTCCATCCTAGCAAG 4912

116663017 TGGCAGACAAAAAGCCAGATAGTAAATCATATTTTAATAAAAATGATTTTAATAAGTGAA 116663076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4913 TGGCAGACAAAAAGCCAGATAGTAAATCATATTTTAATAAAAATGATTTTAATAAGTGAA 4972

116663077 AGATATGATCCATTAAGTTAATCTTGTTAAGTAGAAGACCAAAATGAGAACTTAATGGGG 116663136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4973 AGATATGATCCATTAAGTTAATCTTGTTAAGTAGAAGACCAAAATGAGAACTTAATGGGG 5032

116663137 TGCAAACATCACGGAGAATCAAAACACACACTAGAAACCATACTTGAGAACCAGAGATGA 116663196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5033 TGCAAACATCACGGAGAATCAAAACACACACTAGAAACCATACTTGAGAACCAGAGATGA 5092

116663197 GTGAATGTTTGGTCATCAATATCCATGCTAGCCTTAATCTTGTGGTTATCCCACCACATC 116663256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5093 GTGAATGTTTGGTCATCAATATCCATGCTAGCCTTAATCTTGTGGTTATCCCACCACATC 5152

116663257 CCCCTTTTCAACAGAAGTCAGTGAGCAGCAAGCCTCATTGAATGTTGGATATTAGCAAGC 116663316
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5153 CCCCTTTTCAACAGAAGTCAGTGAGTAGCAAGCCTCATTGAATGTTGGATATTAGCAAGC 5212

116663317 ACATGTAGTTTTGCTTCAAGTACTCTTTATTTTCTTCCAATCCTCAGGGCCTTTCTCAAC 116663376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5213 ACATGTAGTTTTGCTTCAAGTACTCTTTATTTTCTTCCAATCCTCAGGGCCTTTCTCAAC 5272

116663377 ATATGGTTTATTATAGCGTTGTGAATGATTGGTCTTTCATAAGGACATTTTCCTTGGCAG 116663436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5273 ATATGGTTTATTATAGCGTTGTGAATGATTGGTCTTTCATAAGGACATTTTCCTTGGCAG 5332

116663437 AAGGCTATTTGAAGTTCATTGCTTTTACAAGGTAAGATTTCTGGAAGTTCTAAGCTATAT 116663496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5333 AAGGCTATTTGAAGTTCATTGCTTTTACAAGGTAAGATTTCTGGAAGTTCTAAGCTATAT 5392

116663497 AAATAGGTTTGGAGGAACTTTCTCTTAAACCACAGAAACTATTAATACTCTTGAGCAGGT 116663556
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5393 AAATAGGTTTGGAGGAACATTCTCTTAAACCACAGAAACTATTAATACTCTTGAGCAGGT 5452

116663557 GAGCTTATCAGATTCCTTAGTAGTCAACCAAAATGCTGA 116663595
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5453 GAGCTTATCAGATTCCTTAGTAGTCAACCAAAATGCTGA 5491

Alignment time is 6.61354 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [116652076,116672656] =>     20581 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [        1,     5122] =>      5122 nucs 'mol-32-2e0a-089997_5122'

Score:        4989
Aligned:      5142        nucs
Identic:      5106 ( 99%) nucs =>      3062 ( 99%)      2044 ( 99%)
Gaps:           31 (  1%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [116658991,116662076] EXCISED REGION [116662657,116664702]
 second seq =>  [        1,     3066] EXCISED REGION [     3068,     5122]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       580 nucs [116662077,116662656]
 second seq =>         1 nucs [3067,3067]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [3066,3066] to [3067,3067]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

116658991 CTTTTTCTCATTAGAATTATATGTTTAAAAATTCTTGGTGACATTCCATTCTTCACCTAA 116659050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTTTTTCTCATTAGAATTATATGTTTAAAAATTCTTGGTGACATTCCATTCTTCACCTAA 60

116659051 TCTCACGTTTGTCTTGTTCTGTTTTGTCAAAAATGTTTTCCTAAAAATGAAAAAGAAAAC 116659110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCTCACGTTTGTCTTGTTCTGTTTTGTCAAAAATGTTTTCCTAAAAATGAAAAAGAAAAC 120

116659111 CTCTAGAATGATTAATCGAGTGAGATTCTCAATAAATCTGCAACTAAAACCATCCGTAAG 116659170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTCTAGAATGATTAATCGAGTGAGATTCTCAATAAATCTGCAACTAAAACCATCCGTAAG 180

116659171 TCCTAACAAGTTTCAATTTTTATCACGTTAGTGTCTTTTAGTAGATAAACTTTGCTCTAG 116659230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCCTAACAAGTTTCAATTTTTATCACGTTAGTGTCTTTTAGTAGATAAACTTTGCTCTAG 240

116659231 GTCACTATCCAAAAAACTTATGTGAGTTCTGTTGATTGTATCCTGCCTTTGTGTTCCTAA 116659290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTCACTATCCAAAAAACTTATGTGAGTTCTGTTGATTGTATCCTGCCTTTGTGTTCCTAA 300

116659291 GAGTTGATTTGGGAAGCAAAATCCCCCAAAAATCTATATTCTCAGGCCCATGGATAGTTA 116659350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GAGTTGATTTGGGAAGCAAAATCCCCCAAAAATCTATATTCTCAGGCCCATGGATAGTTA 360

116659351 GAACGCAGGCTACAGATGTCAAACTCTCTAGTCAGGGGTCATGCCTAATAAAGTGCAGAA 116659410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GAACGCAGGCTACAGATGTCAAACTCTCTAGTCAGGGGTCATGCCTAATAAAGTGCAGAA 420

116659411 GGAATACATTGAACAGAATGTTATACACTTTTAGGGCGTTTTAAAATTTTTGGTCTAAGT 116659470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGAATACATTGAACAGAATGTTATACACTTTTAGGGCGTTTTAAAATTTTTGGTCTAAGT 480

116659471 CATGTCTCTAGCAGGCTAGACACCTGTTCCAGATATGTATTCTTAATATAACAAAAATTA 116659530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CATGTCTCTAGCAGGCTAGACACCTGTTCCAGATATGTATTCTTAATATAACAAAAATTA 540

116659531 TTTAAATATCTTACCATGTGTCACAGTTACATCAATAATATTTGGAATCATACTGGACCC 116659590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTTAAATATCTTACCATGTGTCACAGTTACATCAATAATATTTGGAATCATACTGGACCC 600

116659591 TTTGAAAATTTTCAGTATGAGTAAAAATGTTTATCTTAGAAGTAAGTGGAGGGGAAACAT 116659650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTTGAAAATTTTCAGTATGAGTAAAAATGTTTATCTTAGAAGTAAGTGGAGGGGAAACAT 660

116659651 CCTTATTATTAAGTGCTAAGCCTTTTTAAAATGGTCTATGAAGATTCTAAATAGACTTCT 116659710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCTTATTATTAAGTGCTAAGCCTTTTTAAAATGGTCTATGAAGATTCTAAATAGACTTCT 720

116659711 GATTCCAAAATACCTATAACAATGAAGTCTTTGGCCATGGCTAATTAAAAAAAAACATAA 116659770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GATTCCAAAATACCTATAACAATGAAGTCTTTGGCCATGGCTAATTAAAAAAAAACATAA 780

116659771 AACTCTAGAGACTGTCTCATTTATTAATTTGCCAAATTCTTCTTTCTTTTAACATTTTCT 116659830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AACTCTAGAGACTGTCTCATTTATTAATTTGCCAAATTCTTCTTTCTTTTAACATTTTCT 840

116659831 TTATCCCACAGTATCTTTTCTTGCTTTTTGTGCTACCACACTATCAAATTTTACTCTTTT 116659890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTATCCCACAGTATCTTTTCTTGCTTTTTGTGCTACCACACTATCAAATTTTACTCTTTT 900

116659891 TCTCCCAAATTTCTTTTTCTAACCATCGTCTTCCCCCTCTGATTGTATCTGAAAATAACC 116659950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TCTCCCAAATTTCTTTTTCTAACCATCGTCTTCCCCCTCTGATTGTATCTGAAAATAACC 960

116659951 ACTTGCTTTTCTTCTTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCT 116660010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ACTTGCTTTTCTTCTTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCT 1020

116660011 TCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCCTCTTTCCCTTTCCCTTTCTTTTCTTTTA 116660070
          |||||||||||                    |||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TCCTTCCTTCC--------------------CTCTTTCCCTTTCCCTTTCTTTTCTTTTA 1060

116660071 TTTTTTCTTCTCTCTTCTCTTCTCTTTTTCTGGGTTGCACTCTGTTACCCAAGCTTGAAT 116660130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1061 TTTTTTCTTCTCTCTTCTCTTCTCTTTTTCTGGGTTGCACTCTGTTACCCAAGCTTGAAT 1120

116660131 GCAATGGCAGGGATCACAGCTTACTGCAGTGTCAACCTCCTGGGCTCAGGTGATCATCCT 116660190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1121 GCAATGGCAGGGATCACAGCTTACTGCAGTGTCAACCTCCTGGGCTCAGGTGATCATCCT 1180

116660191 CCTTCAGCCTCCTGTGTAGCTAGGACTGCAGGCATGTACCACCACACATGGCTAATTTTA 116660250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1181 CCTTCAGCCTCCTGTGTAGCTAGGACTGCAGGCATGTACCACCACACATGGCTAATTTTA 1240

116660251 GTATTTTTTGTAGAAATGAGAGTCTCACTGTGTTGTCCAGGTTTGTCTCAAACTCCCAGG 116660310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1241 GTATTTTTTGTAGAAATGAGAGTCTCACTGTGTTGTCCAGGTTTGTCTCAAACTCCCAGG 1300

116660311 TTCAAGCAATCCACCTGCCTCAGCCTCTCAAACTGCTGGGATTATAGGCATGTGCCACCA 116660370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1301 TTCAAGCAATCCACCTGCCTCAGCCTCTCAAACTGCTGGGATTATAGGCATGTGCCACCA 1360

116660371 TGCTGGGCCTCAAATTGACATTTTCTTAAAAATTGGACTGCCAAACAAGGACATTAGCCC 116660430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1361 TGCTGGGCCTCAAATTGACATTTTCTTAAAAATTGGACTGCCAAACAAGGACATTAGCCC 1420

116660431 TAGTAGGCAGAAGATACTATCTTGGTCTGTGTTAGAGGCAATTGTTGAAATTTCTCTGAA 116660490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1421 TAGTAGGCAGAAGATACTATCTTGGTCTGTGTTAGAGGCAATTGTTGAAATTTCTCTGAA 1480

116660491 TCTCTATGGGATAGGCATAAATGTACTGATAAATTTGAGCAGTCCTGGGAATCCATAATC 116660550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1481 TCTCTATGGGATAGGCATAAATGTACTGATAAATTTGAGCAGTCCTGGGAATCCATAATC 1540

116660551 TCAATTTATTTGACCAATATCAATTAATACCATGTTGAGAGGTCCTTCTATTTCTGAAGT 116660610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1541 TCAATTTATTTGACCAATATCAATTAATACCATGTTGAGAGGTCCTTCTATTTCTGAAGT 1600

116660611 CTGGTTCAGCAAAAAATAAAAAAAAAAA-TAAAATACCTGAAATAATGTAGCTATTCCTG 116660669
          |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
     1601 CTGGTTCAGCAAAAAATAAAAAAAAAAAATAAAATACCTGAAATAATGTAGCTATTCCTG 1660

116660670 AGGTATCATTAACAGAATAGAAACTTAAAAAGCGCATGATATGGAAAAATCTTTGCTGAT 116660729
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     1661 AGGTATCATTAACAGAATAGAAACTTAAAAAGCGCATGATATGGAAAAACCTTTGCTGAT 1720

116660730 GGTTATACATGTTAAGTTTCCAGATAACTATTAATTAGACTTGCAGACATAAAAGGCTGT 116660789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1721 GGTTATACATGTTAAGTTTCCAGATAACTATTAATTAGACTTGCAGACATAAAAGGCTGT 1780

116660790 ACCAAGTGGATATTTTAGAGATAAATTTTTAGCACTTACAGACAATATTATGAAGTAGCT 116660849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1781 ACCAAGTGGATATTTTAGAGATAAATTTTTAGCACTTACAGACAATATTATGAAGTAGCT 1840

116660850 ATGTGGGCATAGAGAAATTCGGGAAATTAGCAGGCTGGTTCTGCTATAATAGATCTCAGT 116660909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1841 ATGTGGGCATAGAGAAATTCGGGAAATTAGCAGGCTGGTTCTGCTATAATAGATCTCAGT 1900

116660910 TCACCCTTAGGATATCTTCACTAAAGGAGCTTAACATAGCCCAGATGGTAGATTTGATTG 116660969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1901 TCACCCTTAGGATATCTTCACTAAAGGAGCTTAACATAGCCCAGATGGTAGATTTGATTG 1960

116660970 CCCTCATTAGAGCTGGTCACTTGGCCAAAGACAAAAAAAATTATATTTACACAGAAAATA 116661029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1961 CCCTCATTAGAGCTGGTCACTTGGCCAAAGACAAAAAAAATTATATTTACACAGAAAATA 2020

116661030 GCTCAAGTACCTGAACCTCAGTATGACTATATATGGGGATAGAGTCTTTAAGGAAGTGAT 116661089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2021 GCTCAAGTACCTGAACCTCAGTATGACTATATATGGGGATAGAGTCTTTAAGGAAGTGAT 2080

116661090 TAAGGTTAAATAAAGTCATAATGATGGGGCCCTAATCTGATAAGATTAGCGTCCTTCTAA 116661149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2081 TAAGGTTAAATAAAGTCATAATGATGGGGCCCTAATCTGATAAGATTAGCGTCCTTCTAA 2140

116661150 GAGGAGGAATCAACATCAGGGATTTTTTTTTCTCTCAACCCATGCCCAGAGGAAAGTCAT 116661209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2141 GAGGAGGAATCAACATCAGGGATTTTTTTTTCTCTCAACCCATGCCCAGAGGAAAGTCAT 2200

116661210 ATGAGGACGTAACACAAAGAGAGACATCTACAAATCACAGAGGTTGCACCAGAAATCAAC 116661269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     2201 ATGAGGACGTAACACAAAGAGAGACATCTACAAATCACAGGGGTTGCACCAGAAATCAAC 2260

116661270 CCTGCTAGCATATCGATCTTGAACTTCTAGTCCCCAGAACTGTGAGGAAATAAATTTTTG 116661329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2261 CCTGCTAGCATATCGATCTTGAACTTCTAGTCCCCAGAACTGTGAGGAAATAAATTTTTG 2320

116661330 TTGCTTATGCCACCAGATCTGTGACATTTTGTTATGGAAGTCTGAGCTGACCAATACACT 116661389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2321 TTGCTTATGCCACCAGATCTGTGACATTTTGTTATGGAAGTCTGAGCTGACCAATACACT 2380

116661390 TGAATAACTATCAGTGTCAATGTAAAACAAGCCATCTTTAGACTTAAGGAAACAGTCACC 116661449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2381 TGAATAACTATCAGTGTCAATGTAAAACAAGCCATCTTTAGACTTAAGGAAACAGTCACC 2440

116661450 TGGCTCTCTAAGGCAGATGCAAATGGATTTTTCTTTGCCCGGGTTTAGTAATTCAGATTA 116661509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2441 TGGCTCTCTAAGGCAGATGCAAATGGATTTTTCTTTGCCCGGGTTTAGTAATTCAGATTA 2500

116661510 TGGCACTAAGTGTTTTGGGAAGGCTCCATGTCATTTTGATATAGTCACTGTGTGTTGCCA 116661569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2501 TGGCACTAAGTGTTTTGGGAAGGCTCCATGTCATTTTGATATAGTCACTGTGTGTTGCCA 2560

116661570 TTCTTATGCATGTATTCTCCACAGTCTCAGTCCTGCTCTGCAGCTGCTCTCGTGTCAAAT 116661629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2561 TTCTTATGCATGTATTCTCCACAGTCTCAGTCCTGCTCTGCAGCTGCTCTCGTGTCAAAT 2620

116661630 GATCCATCACTCAACGGAAATGAACTCATCACTCCATAAAAGGAATAGGAAGATCAGTCC 116661689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2621 GATCCATCACTCAACGGAAATGAACTCATCACTCCATAAAAGGAATAGGAAGATCAGTCC 2680

116661690 ATGATCCAATCCCAAACTATTTTTTCTGAGGATGATAATGTTATCTAGAAATCACAACAG 116661749
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     2681 ATGATCCAATCCCAAACTATTTTTTCCGAGGATGATAATGTTATCTAGAAATCACAACAG 2740

116661750 TGGTATACATCTGAACATGGCTGCTTTAGTAGCTGAACGACTCTTCTCATCTTCTCATCA 116661809
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2741 -GGTATACATCTGAACATGGCTGCTTTAGTAGCTGAACGACTCTTCTCATCTTCTCATCA 2799

116661810 GTTAGGAAAGACTGAGAACTGGTAGCATAAATCCATCAATTATGGGATTGCAATTGCAGA 116661869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2800 GTTAGGAAAGACTGAGAACTGGTAGCATAAATCCATCAATTATGGGATTGCAATTGCAGA 2859

116661870 ATGTTTTGTGACTCACATAATGTTTTCTTCTTTACTCAGAACTTCTCTATTTCACAGATT 116661929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2860 ATGTTTTGTGACTCACATAATGTTTTCTTCTTTACTCAGAACTTCTCTATTTCACAGATT 2919

116661930 CTCACCTTAATAATTGAAGCAACTCAGGGTCACATCCTAGTTCTATAATTCTGCCTGAGG 116661989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2920 CTCACCTTAATAATTGAAGCAACTCAGGGTCACATCCTAGTTCTATAATTCTGCCTGAGG 2979

116661990 CACTCTGAGCCCAAACCATCAACAGGAAACAAACAAATAAAAAACCTGCTAATTTACTCT 116662049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2980 CACTCTGAGCCCAAACCATCAACAGGAAACAAACAAATAAAAAACCTGCTAATTTACTCT 3039

116662050 CCAATGAAACCTTTCCAGAATTATCTG 116662076
          |||||||||||||||||||||||||||
     3040 CCAATGAAACCTTTCCAGAATTATCTG 3066

EXCISED REGION

116662657 AATGAATAACTACCGTTATAGAAATAGCTTCTGGATTTCTTTGTCCTTTTTTTCCTGAAG 116662716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3068 AATGAATAACTACCGTTATAGAAATAGCTTCTGGATTTCTTTGTCCTTTTTTTCCTGAAG 3127

116662717 TTAGGCTATATTTGGTATCTCTATAGAGATAGGCTATATTTGGTAAATCTGTTCTCACCT 116662776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3128 TTAGGCTATATTTGGTATCTCTATAGAGATAGGCTATATTTGGTAAATCTGTTCTCACCT 3187

116662777 CACATAAAAGGTTAATATTCTACAAGTGGATAGATGTGGTGAGGACAACTAAAAGGAGAT 116662836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3188 CACATAAAAGGTTAATATTCTACAAGTGGATAGATGTGGTGAGGACAACTAAAAGGAGAT 3247

116662837 TGAATGATCTCATCAAATTATATTACACAACCTTTCAAAGAAAGCTCAGTTGGATTAAGA 116662896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3248 TGAATGATCTCATCAAATTATATTACACAACCTTTCAAAGAAAGCTCAGTTGGATTAAGA 3307

116662897 GGTTTCTTTATGTTCATGCCCAAAATGCCAAATTCCAACAGCCCACAAAATTTCTTTGAA 116662956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3308 GGTTTCTTTATGTTCATGCCCAAAATGCCAAATTCCAACAGCCCACAAAATTTCTTTGAA 3367

116662957 GTATTTTTCTCATACGTTTGTTTGATGAACAGCTTAAAGCTCCATTTCCATCCTAGCAAG 116663016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3368 GTATTTTTCTCATACGTTTGTTTGATGAACAGCTTAAAGCTCCATTTCCATCCTAGCAAG 3427

116663017 TGGCAGACAAAAAGCCAGATAGTAAATCATATTTTAATAAAAATGATTTTAATAAGTGAA 116663076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3428 TGGCAGACAAAAAGCCAGATAGTAAATCATATTTTAATAAAAATGATTTTAATAAGTGAA 3487

116663077 AGATATGATCCATTAAGTTAATCTTGTTAAGTAGAAGACCAAAATGAGAACTTAATGGGG 116663136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3488 AGATATGATCCATTAAGTTAATCTTGTTAAGTAGAAGACCAAAATGAGAACTTAATGGGG 3547

116663137 TGCAAACATCACGGAGAATCAAAACACACACTAGAAACCATACTTGAGAACCAGAGATGA 116663196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3548 TGCAAACATCACGGAGAATCAAAACACACACTAGAAACCATACTTGAGAACCAGAGATGA 3607

116663197 GTGAATGTTTGGTCATCAATATCCATGCTAGCCTTAATCTTGTGGTTATCCCACCACATC 116663256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3608 GTGAATGTTTGGTCATCAATATCCATGCTAGCCTTAATCTTGTGGTTATCCCACCACATC 3667

116663257 CCCCTTTTCAACAGAAGTCAGTGAGCAGCAAGCCTCATTGAATGTTGGATATTAGCAAGC 116663316
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3668 CCCCTTTTCAACAGAAGTCAGTGAGTAGCAAGCCTCATTGAATGTTGGATATTAGCAAGC 3727

116663317 ACATGTAGTTTTGCTTCAAGTACTCTTTATTTTCTTCCAATCCTCAGGGCCTTTCTCAAC 116663376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3728 ACATGTAGTTTTGCTTCAAGTACTCTTTATTTTCTTCCAATCCTCAGGGCCTTTCTCAAC 3787

116663377 ATATGGTTTATTATAGCGTTGTGAATGATTGGTCTTTCATAAGGACATTTTCCTTGGCAG 116663436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3788 ATATGGTTTATTATAGCGTTGTGAATGATTGGTCTTTCATAAGGACATTTTCCTTGGCAG 3847

116663437 AAGGCTATTTGAAGTTCATTGCTTTTACAAGGTAAGATTTCTGGAAGTTCTAAGCTATAT 116663496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3848 AAGGCTATTTGAAGTTCATTGCTTTTACAAGGTAAGATTTCTGGAAGTTCTAAGCTATAT 3907

116663497 AAATAGGTTTGGAGGAACTTTCTCTTAAACCACAGAAACTATTAATACTCTTGAGCAGGT 116663556
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3908 AAATAGGTTTGGAGGAACATTCTCTTAAACCACAGAAACTATTAATACTCTTGAGCAGGT 3967

116663557 GAGCTTATCAGATTCCTTAGTAGTCAACCAAAATGCTGAAGGATTTTTC---------TT 116663607
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||
     3968 GAGCTTATCAGATTCCTTAGTAGTCAACCAAAATGCTGAAGGATTTTTCTTTTTTTTTTT 4027

116663608 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGATGGAGTCTCACTCTGTCACCAGGCTGGA 116663667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4028 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGATGGAGTCTCACTCTGTCACCAGGCTGGA 4087

116663668 GTGCAGTGGTGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCCAGCAATTCTTC 116663727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4088 GTGCAGTGGTGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCCAGCAATTCTTC 4147

116663728 TGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGGGCATGCCCACCAGGCCCAGCTAAGTT 116663787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4148 TGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGGGCATGCCCACCAGGCCCAGCTAAGTT 4207

116663788 TTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCAAGTTGGCCAGAATGGTCTCGATCTCTTGA 116663847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4208 TTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCAAGTTGGCCAGAATGGTCTCGATCTCTTGA 4267

116663848 CTTCATGAGCCGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAGCCACCGT 116663907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4268 CTTCATGAGCCGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAGCCACCGT 4327

116663908 GTCCGGCCAAGAATTTTTCTAATGAGGTATGTGCAAAGCAGAAACATTTTATGTTAAGTA 116663967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4328 GTCCGGCCAAGAATTTTTCTAATGAGGTATGTGCAAAGCAGAAACATTTTATGTTAAGTA 4387

116663968 CAGGCATGGCCACAAAAATATCACTTAAGAAGAGAAGAATTTTGGGGTTCTCAGTGTAAC 116664027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4388 CAGGCATGGCCACAAAAATATCACTTAAGAAGAGAAGAATTTTGGGGTTCTCAGTGTAAC 4447

116664028 ATGGAGATGAACAATATCTCACTCTTTTGAGGATAACAATAGATTTCTCTCTTCTGCTTT 116664087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4448 ATGGAGATGAACAATATCTCACTCTTTTGAGGATAACAATAGATTTCTCTCTTCTGCTTT 4507

116664088 TGCAATGATTAAAATTTTGGAAATTTATATGAGAAAAGTAAAGATATTTTAAAAAGTTTT 116664147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4508 TGCAATGATTAAAATTTTGGAAATTTATATGAGAAAAGTAAAGATATTTTAAAAAGTTTT 4567

116664148 CTTGTTTTTTTTAACTCTTTATTCTCTTAAATCTTGACACTGTTCGTTGTAAGTTTGTGC 116664207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4568 CTTGTTTTTTTTAACTCTTTATTCTCTTAAATCTTGACACTGTTCGTTGTAAGTTTGTGC 4627

116664208 TAGATACAGCCACTGTTTGGTTGAGAAAATTTCTCTATGTCTGTGACATCCATGAGATAG 116664267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4628 TAGATACAGCCACTGTTTGGTTGAGAAAATTTCTCTATGTCTGTGACATCCATGAGATAG 4687

116664268 AAACCGATGGCTACATATGGCTATTTAAATTAAATTAATTAAACTTACATAAAATAAAAA 116664327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4688 AAACCGATGGCTACATATGGCTATTTAAATTAAATTAATTAAACTTACATAAAATAAAAA 4747

116664328 CTTGGTTCCATAGTTGCACTAGACACATTTTAGGGCTCAATAGCCATAGTATAAACAGCA 116664387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4748 CTTGGTTCCATAGTTGCACTAGACACATTTTAGGGCTCAATAGCCATAGTATAAACAGCA 4807

116664388 TAGTATAGAACTTTCTATCAGAGAAAGTTTGTCAGGGAGCTGTGCTAAAGGTGGTTTTCA 116664447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4808 TAGTATAGAACTTTCTATCAGAGAAAGTTTGTCAGGGAGCTGTGCTAAAGGTGGTTTTCA 4867

116664448 AAATATAGCTGTAGCCTGAGAATATTTCTATACTATTTTAATCAATTTTAACTAATTAAT 116664507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4868 AAATATAGCTGTAGCCTGAGAATATTTCTATACTATTTTAATCAATTTTAACTAATTAAT 4927

116664508 TAACTACATTATACTTTGTTAACATAAAGTCAAAGGCATCTACTTCTGCAATTGGGAGGT 116664567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4928 TAACTACATTATACTTTGTTAACATAAAGTCAAAGGCATCTACTTCTGCAATTGGGAGGT 4987

116664568 AATAACTTGCAATATAAAAATAGATGAGGCAGGTTGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCA 116664627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4988 AATAACTTGCAATATAAAAATAGATGAGGCAGGTTGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCA 5047

116664628 GCACTTTGGGAGGCCGAAGTAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGG 116664687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5048 GCACTTTGGGAGGCCGAAGTAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGG 5107

116664688 CCAACATGGTGAAAC 116664702
          |||||||||||||||
     5108 CCAACATGGTGAAAC 5122

Alignment time is 6.15328 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [116652076,116672656] =>     20581 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [        1,     2055] =>      2055 nucs 'mol-32-2e0a-089997_2055'

Score:        2024
Aligned:      2046        nucs
Identic:      2044 (100%) nucs =>       947 (100%)      1097 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [116662657,116663605] EXCISED REGION [116663606,116664702]
 second seq =>  [        1,      949] EXCISED REGION [      959,     2055]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         9 nucs [950,958]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        27 nucs [950,976] to [959,985]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         4 nucs [950,953] to [955,958]

116662657 AATGAATAACTACCGTTATAGAAATAGCTTCTGGATTTCTTTGTCCTTTTTTTCCTGAAG 116662716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AATGAATAACTACCGTTATAGAAATAGCTTCTGGATTTCTTTGTCCTTTTTTTCCTGAAG 60

116662717 TTAGGCTATATTTGGTATCTCTATAGAGATAGGCTATATTTGGTAAATCTGTTCTCACCT 116662776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTAGGCTATATTTGGTATCTCTATAGAGATAGGCTATATTTGGTAAATCTGTTCTCACCT 120

116662777 CACATAAAAGGTTAATATTCTACAAGTGGATAGATGTGGTGAGGACAACTAAAAGGAGAT 116662836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CACATAAAAGGTTAATATTCTACAAGTGGATAGATGTGGTGAGGACAACTAAAAGGAGAT 180

116662837 TGAATGATCTCATCAAATTATATTACACAACCTTTCAAAGAAAGCTCAGTTGGATTAAGA 116662896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGAATGATCTCATCAAATTATATTACACAACCTTTCAAAGAAAGCTCAGTTGGATTAAGA 240

116662897 GGTTTCTTTATGTTCATGCCCAAAATGCCAAATTCCAACAGCCCACAAAATTTCTTTGAA 116662956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGTTTCTTTATGTTCATGCCCAAAATGCCAAATTCCAACAGCCCACAAAATTTCTTTGAA 300

116662957 GTATTTTTCTCATACGTTTGTTTGATGAACAGCTTAAAGCTCCATTTCCATCCTAGCAAG 116663016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTATTTTTCTCATACGTTTGTTTGATGAACAGCTTAAAGCTCCATTTCCATCCTAGCAAG 360

116663017 TGGCAGACAAAAAGCCAGATAGTAAATCATATTTTAATAAAAATGATTTTAATAAGTGAA 116663076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGGCAGACAAAAAGCCAGATAGTAAATCATATTTTAATAAAAATGATTTTAATAAGTGAA 420

116663077 AGATATGATCCATTAAGTTAATCTTGTTAAGTAGAAGACCAAAATGAGAACTTAATGGGG 116663136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGATATGATCCATTAAGTTAATCTTGTTAAGTAGAAGACCAAAATGAGAACTTAATGGGG 480

116663137 TGCAAACATCACGGAGAATCAAAACACACACTAGAAACCATACTTGAGAACCAGAGATGA 116663196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGCAAACATCACGGAGAATCAAAACACACACTAGAAACCATACTTGAGAACCAGAGATGA 540

116663197 GTGAATGTTTGGTCATCAATATCCATGCTAGCCTTAATCTTGTGGTTATCCCACCACATC 116663256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GTGAATGTTTGGTCATCAATATCCATGCTAGCCTTAATCTTGTGGTTATCCCACCACATC 600

116663257 CCCCTTTTCAACAGAAGTCAGTGAGCAGCAAGCCTCATTGAATGTTGGATATTAGCAAGC 116663316
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CCCCTTTTCAACAGAAGTCAGTGAGTAGCAAGCCTCATTGAATGTTGGATATTAGCAAGC 660

116663317 ACATGTAGTTTTGCTTCAAGTACTCTTTATTTTCTTCCAATCCTCAGGGCCTTTCTCAAC 116663376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ACATGTAGTTTTGCTTCAAGTACTCTTTATTTTCTTCCAATCCTCAGGGCCTTTCTCAAC 720

116663377 ATATGGTTTATTATAGCGTTGTGAATGATTGGTCTTTCATAAGGACATTTTCCTTGGCAG 116663436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATATGGTTTATTATAGCGTTGTGAATGATTGGTCTTTCATAAGGACATTTTCCTTGGCAG 780

116663437 AAGGCTATTTGAAGTTCATTGCTTTTACAAGGTAAGATTTCTGGAAGTTCTAAGCTATAT 116663496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAGGCTATTTGAAGTTCATTGCTTTTACAAGGTAAGATTTCTGGAAGTTCTAAGCTATAT 840

116663497 AAATAGGTTTGGAGGAACTTTCTCTTAAACCACAGAAACTATTAATACTCTTGAGCAGGT 116663556
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAATAGGTTTGGAGGAACATTCTCTTAAACCACAGAAACTATTAATACTCTTGAGCAGGT 900

116663557 GAGCTTATCAGATTCCTTAGTAGTCAACCAAAATGCTGAAGGATTTTTC 116663605
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GAGCTTATCAGATTCCTTAGTAGTCAACCAAAATGCTGAAGGATTTTTC 949

EXCISED REGION

116663606 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGATGGAGTCTCACTCTGTCACCAGGCTG 116663665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      959 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGATGGAGTCTCACTCTGTCACCAGGCTG 1018

116663666 GAGTGCAGTGGTGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCCAGCAATTCT 116663725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1019 GAGTGCAGTGGTGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCCAGCAATTCT 1078

116663726 TCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGGGCATGCCCACCAGGCCCAGCTAAG 116663785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1079 TCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGGGCATGCCCACCAGGCCCAGCTAAG 1138

116663786 TTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCAAGTTGGCCAGAATGGTCTCGATCTCTT 116663845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1139 TTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCAAGTTGGCCAGAATGGTCTCGATCTCTT 1198

116663846 GACTTCATGAGCCGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAGCCACC 116663905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1199 GACTTCATGAGCCGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAGCCACC 1258

116663906 GTGTCCGGCCAAGAATTTTTCTAATGAGGTATGTGCAAAGCAGAAACATTTTATGTTAAG 116663965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1259 GTGTCCGGCCAAGAATTTTTCTAATGAGGTATGTGCAAAGCAGAAACATTTTATGTTAAG 1318

116663966 TACAGGCATGGCCACAAAAATATCACTTAAGAAGAGAAGAATTTTGGGGTTCTCAGTGTA 116664025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1319 TACAGGCATGGCCACAAAAATATCACTTAAGAAGAGAAGAATTTTGGGGTTCTCAGTGTA 1378

116664026 ACATGGAGATGAACAATATCTCACTCTTTTGAGGATAACAATAGATTTCTCTCTTCTGCT 116664085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1379 ACATGGAGATGAACAATATCTCACTCTTTTGAGGATAACAATAGATTTCTCTCTTCTGCT 1438

116664086 TTTGCAATGATTAAAATTTTGGAAATTTATATGAGAAAAGTAAAGATATTTTAAAAAGTT 116664145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1439 TTTGCAATGATTAAAATTTTGGAAATTTATATGAGAAAAGTAAAGATATTTTAAAAAGTT 1498

116664146 TTCTTGTTTTTTTTAACTCTTTATTCTCTTAAATCTTGACACTGTTCGTTGTAAGTTTGT 116664205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1499 TTCTTGTTTTTTTTAACTCTTTATTCTCTTAAATCTTGACACTGTTCGTTGTAAGTTTGT 1558

116664206 GCTAGATACAGCCACTGTTTGGTTGAGAAAATTTCTCTATGTCTGTGACATCCATGAGAT 116664265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1559 GCTAGATACAGCCACTGTTTGGTTGAGAAAATTTCTCTATGTCTGTGACATCCATGAGAT 1618

116664266 AGAAACCGATGGCTACATATGGCTATTTAAATTAAATTAATTAAACTTACATAAAATAAA 116664325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1619 AGAAACCGATGGCTACATATGGCTATTTAAATTAAATTAATTAAACTTACATAAAATAAA 1678

116664326 AACTTGGTTCCATAGTTGCACTAGACACATTTTAGGGCTCAATAGCCATAGTATAAACAG 116664385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1679 AACTTGGTTCCATAGTTGCACTAGACACATTTTAGGGCTCAATAGCCATAGTATAAACAG 1738

116664386 CATAGTATAGAACTTTCTATCAGAGAAAGTTTGTCAGGGAGCTGTGCTAAAGGTGGTTTT 116664445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1739 CATAGTATAGAACTTTCTATCAGAGAAAGTTTGTCAGGGAGCTGTGCTAAAGGTGGTTTT 1798

116664446 CAAAATATAGCTGTAGCCTGAGAATATTTCTATACTATTTTAATCAATTTTAACTAATTA 116664505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1799 CAAAATATAGCTGTAGCCTGAGAATATTTCTATACTATTTTAATCAATTTTAACTAATTA 1858

116664506 ATTAACTACATTATACTTTGTTAACATAAAGTCAAAGGCATCTACTTCTGCAATTGGGAG 116664565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 ATTAACTACATTATACTTTGTTAACATAAAGTCAAAGGCATCTACTTCTGCAATTGGGAG 1918

116664566 GTAATAACTTGCAATATAAAAATAGATGAGGCAGGTTGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCC 116664625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 GTAATAACTTGCAATATAAAAATAGATGAGGCAGGTTGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCC 1978

116664626 CAGCACTTTGGGAGGCCGAAGTAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCT 116664685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 CAGCACTTTGGGAGGCCGAAGTAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCT 2038

116664686 GGCCAACATGGTGAAAC 116664702
          |||||||||||||||||
     2039 GGCCAACATGGTGAAAC 2055

Alignment time is 2.673 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [116652076,116672656] =>     20581 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [        1,     2067] =>      2067 nucs 'mol-32-2e15-050054_2067'

Score:        2055
Aligned:      2066        nucs
Identic:      2065 (100%) nucs =>      1385 (100%)       680 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [116661529,116662913] EXCISED REGION [116662915,116663595]
 second seq =>  [        1,     1385] EXCISED REGION [     1387,     2067]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [116662914,116662914]
 second seq =>         1 nucs [1386,1386]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [1385,1385] to [1386,1386]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

116661529 AAGGCTCCATGTCATTTTGATATAGTCACTGTGTGTTGCCATTCTTATGCATGTATTCTC 116661588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAGGCTCCATGTCATTTTGATATAGTCACTGTGTGTTGCCATTCTTATGCATGTATTCTC 60

116661589 CACAGTCTCAGTCCTGCTCTGCAGCTGCTCTCGTGTCAAATGATCCATCACTCAACGGAA 116661648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CACAGTCTCAGTCCTGCTCTGCAGCTGCTCTCGTGTCAAATGATCCATCACTCAACGGAA 120

116661649 ATGAACTCATCACTCCATAAAAGGAATAGGAAGATCAGTCCATGATCCAATCCCAAACTA 116661708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATGAACTCATCACTCCATAAAAGGAATAGGAAGATCAGTCCATGATCCAATCCCAAACTA 180

116661709 TTTTTTCTGAGGATGATAATGTTATCTAGAAATCACAACAGTGGTATACATCTGAACATG 116661768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTTTTTCTGAGGATGATAATGTTATCTAGAAATCACAACAGTGGTATACATCTGAACATG 240

116661769 GCTGCTTTAGTAGCTGAACGACTCTTCTCATCTTCTCATCAGTTAGGAAAGACTGAGAAC 116661828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GCTGCTTTAGTAGCTGAACGACTCTTCTCATCTTCTCATCAGTTAGGAAAGACTGAGAAC 300

116661829 TGGTAGCATAAATCCATCAATTATGGGATTGCAATTGCAGAATGTTTTGTGACTCACATA 116661888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGGTAGCATAAATCCATCAATTATGGGATTGCAATTGCAGAATGTTTTGTGACTCACATA 360

116661889 ATGTTTTCTTCTTTACTCAGAACTTCTCTATTTCACAGATTCTCACCTTAATAATTGAAG 116661948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATGTTTTCTTCTTTACTCAGAACTTCTCTATTTCACAGATTCTCACCTTAATAATTGAAG 420

116661949 CAACTCAGGGTCACATCCTAGTTCTATAATTCTGCCTGAGGCACTCTGAGCCCAAACCAT 116662008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CAACTCAGGGTCACATCCTAGTTCTATAATTCTGCCTGAGGCACTCTGAGCCCAAACCAT 480

116662009 CAACAGGAAACAAACAAATAAAAAACCTGCTAATTTACTCTCCAATGAAACCTTTCCAGA 116662068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CAACAGGAAACAAACAAATAAAAAACCTGCTAATTTACTCTCCAATGAAACCTTTCCAGA 540

116662069 ATTATCTGTGTAGAGTTTCCTATTGCTGCAATAATTAATAAACTCAGTTTGCTTATATTG 116662128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATTATCTGTGTAGAGTTTCCTATTGCTGCAATAATTAATAAACTCAGTTTGCTTATATTG 600

116662129 CAAATTTTAAAACTCGTAGTGGGAGATTTCCAGTTGCAAACAACAAGTCTTGGCTTTAAT 116662188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CAAATTTTAAAACTCGTAGTGGGAGATTTCCAGTTGCAAACAACAAGTCTTGGCTTTAAT 660

116662189 TATGAGTTCAACCAGTTTTTTTTCTCCTAATGTTTTAAATCTCAGTTCATCATAATGTCT 116662248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TATGAGTTCAACCAGTTTTTTTTCTCCTAATGTTTTAAATCTCAGTTCATCATAATGTCT 720

116662249 GAGCTTGTCTGATTTTGGCATAGGGAATATAATTAGAAGTAGTGAATGAAGGCCTAGCTG 116662308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GAGCTTGTCTGATTTTGGCATAGGGAATATAATTAGAAGTAGTGAATGAAGGCCTAGCTG 780

116662309 TTGCTTTGATGTCAGCAGACACCCATTTCTCTTTCCAAACTGCTTTTAAAAAGTCAAACA 116662368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTGCTTTGATGTCAGCAGACACCCATTTCTCTTTCCAAACTGCTTTTAAAAAGTCAAACA 840

116662369 ACTTCCTTCTCTTCTTGCCTCACTCTCTACTTAATGTGATTTTCTTTTAATTTATGAAGG 116662428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ACTTCCTTCTCTTCTTGCCTCACTCTCTACTTAATGTGATTTTCTTTTAATTTATGAAGG 900

116662429 AAATAAAATCATTGCTTTTTAAGAATCATCCAACCAAGTCATTAAAGATATCTGGAATTC 116662488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AAATAAAATCATTGCTTTTTAAGAATCATCCAACCAAGTCATTAAAGATATCTGGAATTC 960

116662489 AAGATGTAGTCAAAATATTTCAAGGGCATTACAATATCCTCTGTCTTCTCTAATCTCTCA 116662548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AAGATGTAGTCAAAATATTTCAAGGGCATTACAATATCCTCTGTCTTCTCTAATCTCTCA 1020

116662549 GGCAGTAAAACGGTACCAAGTGCAGAGATAGAAACACTGCTGTCAAAGTGGGTTAAAATC 116662608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GGCAGTAAAACGGTACCAAGTGCAGAGATAGAAACACTGCTGTCAAAGTGGGTTAAAATC 1080

116662609 TTGACAGTATCGTGGCTTCTGATTTTAATTTCTCAATTAACTTATACAAATGAATAACTA 116662668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTGACAGTATCGTGGCTTCTGATTTTAATTTCTCAATTAACTTATACAAATGAATAACTA 1140

116662669 CCGTTATAGAAATAGCTTCTGGATTTCTTTGTCCTTTTTTTCCTGAAGTTAGGCTATATT 116662728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CCGTTATAGAAATAGCTTCTGGATTTCTTTGTCCTTTTTTTCCTGAAGTTAGGCTATATT 1200

116662729 TGGTATCTCTATAGAGATAGGCTATATTTGGTAAATCTGTTCTCACCTCACATAAAAGGT 116662788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TGGTATCTCTATAGAGATAGGCTATATTTGGTAAATCTGTTCTCACCTCACATAAAAGGT 1260

116662789 TAATATTCTACAAGTGGATAGATGTGGTGAGGACAACTAAAAGGAGATTGAATGATCTCA 116662848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TAATATTCTACAAGTGGATAGATGTGGTGAGGACAACTAAAAGGAGATTGAATGATCTCA 1320

116662849 TCAAATTATATTACACAACCTTTCAAAGAAAGCTCAGTTGGATTAAGAGGTTTCTTTATG 116662908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TCAAATTATATTACACAACCTTTCAAAGAAAGCTCAGTTGGATTAAGAGGTTTCTTTATG 1380

116662909 TTCAT 116662913
          |||||
     1381 TTCAT 1385

EXCISED REGION

116662915 CCCAAAATGCCAAATTCCAACAGCCCACAAAATTTCTTTGAAGTATTTTTCTCATACGTT 116662974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1387 CCCAAAATGCCAAATTCCAACAGCCCACAAAATTTCTTTGAAGTATTTTTCTCATACGTT 1446

116662975 TGTTTGATGAACAGCTTAAAGCTCCATTTCCATCCTAGCAAGTGGCAGACAAAAAGCCAG 116663034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1447 TGTTTGATGAACAGCTTAAAGCTCCATTTCCATCCTAGCAAGTGGCAGACAAAAAGCCAG 1506

116663035 ATAGTAAATCATATTTTAATAAAAATGATTTTAATAAGTGAAAGATATGATCCATTAAGT 116663094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1507 ATAGTAAATCATATTTTAATAAAAATGATTTTAATAAGTGAAAGATATGATCCATTAAGT 1566

116663095 TAATCTTGTTAAGTAGAAGACCAAAATGAGAACTTAATGGGGTGCAAACATCACGGAGAA 116663154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1567 TAATCTTGTTAAGTAGAAGACCAAAATGAGAACTTAATGGGGTGCAAACATCACGGAGAA 1626

116663155 TCAAAACACACACTAGAAACCATACTTGAGAACCAGAGATGAGTGAATGTTTGGTCATCA 116663214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1627 TCAAAACACACACTAGAAACCATACTTGAGAACCAGAGATGAGTGAATGTTTGGTCATCA 1686

116663215 ATATCCATGCTAGCCTTAATCTTGTGGTTATCCCACCACATCCCCCTTTTCAACAGAAGT 116663274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1687 ATATCCATGCTAGCCTTAATCTTGTGGTTATCCCACCACATCCCCCTTTTCAACAGAAGT 1746

116663275 CAGTGAGCAGCAAGCCTCATTGAATGTTGGATATTAGCAAGCACATGTAGTTTTGCTTCA 116663334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1747 CAGTGAGCAGCAAGCCTCATTGAATGTTGGATATTAGCAAGCACATGTAGTTTTGCTTCA 1806

116663335 AGTACTCTTTATTTTCTTCCAATCCTCAGGGCCTTTCTCAACATATGGTTTATTATAGCG 116663394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1807 AGTACTCTTTATTTTCTTCCAATCCTCAGGGCCTTTCTCAACATATGGTTTATTATAGCG 1866

116663395 TTGTGAATGATTGGTCTTTCATAAGGACATTTTCCTTGGCAGAAGGCTATTTGAAGTTCA 116663454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1867 TTGTGAATGATTGGTCTTTCATAAGGACATTTTCCTTGGCAGAAGGCTATTTGAAGTTCA 1926

116663455 TTGCTTTTACAAGGTAAGATTTCTGGAAGTTCTAAGCTATATAAATAGGTTTGGAGGAAC 116663514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1927 TTGCTTTTACAAGGTAAGATTTCTGGAAGTTCTAAGCTATATAAATAGGTTTGGAGGAAC 1986

116663515 TTTCTCTTAAACCACAGAAACTATTAATACTCTTGAGCAGGTGAGCTTATCAGATTCCTT 116663574
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1987 ATTCTCTTAAACCACAGAAACTATTAATACTCTTGAGCAGGTGAGCTTATCAGATTCCTT 2046

116663575 AGTAGTCAACCAAAATGCTGA 116663595
          |||||||||||||||||||||
     2047 AGTAGTCAACCAAAATGCTGA 2067

Alignment time is 2.43922 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [116652076,116672656] =>     20581 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [        1,     8809] =>      8809 nucs 'mol-32-2e4c-054239_8809'

Score:        8787
Aligned:      8809        nucs
Identic:      8807 (100%) nucs =>      2537 (100%)      6270 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [116653836,116656372] EXCISED REGION [116656374,116662645]
 second seq =>  [        1,     2537] EXCISED REGION [     2539,     8809]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [116656373,116656373]
 second seq =>         1 nucs [2538,2538]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [116659757,116659757]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

116653836 ACGTCTCAACAACAAAAAAATTCAGATAGCTTCACGGGTACATTTTATCAACCATTCCAA 116653895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACGTCTCAACAACAAAAAAATTCAGATAGCTTCACGGGTACATTTTATCAACCATTCCAA 60

116653896 ACATTTAATAAAAAATGAACACCAATCCTTCTGAAAAGCTTAAAATTACAGAAGAGGAAG 116653955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACATTTAATAAAAAATGAACACCAATCCTTCTGAAAAGCTTAAAATTACAGAAGAGGAAG 120

116653956 GAACATTTTCCAACTCATACTATTAGCCTAACATTAGCCTGATATTAAAGCCAGATAAGA 116654015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GAACATTTTCCAACTCATACTATTAGCCTAACATTAGCCTGATATTAAAGCCAGATAAGA 180

116654016 CATCACAAGAAAATTGCCGGACAATATTCTTTATGAATGTAGATACAAAAGCCTTCAATG 116654075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CATCACAAGAAAATTGCCGGACAATATTCTTTATGAATGTAGATACAAAAGCCTTCAATG 240

116654076 AAATACTGTCAACCTGGACCCAATAGTGTAGTAAAAGGATTATACACCATGACCTAGTGG 116654135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAATACTGTCAACCTGGACCCAATAGTGTAGTAAAAGGATTATACACCATGACCTAGTGG 300

116654136 GATTTATTCCAAGATTCAAGGGTTAGTCAATATAAGAACATCAGTGTAATAACTCTACAT 116654195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GATTTATTCCAAGATTCAAGGGTTAGTCAATATAAGAACATCAGTGTAATAACTCTACAT 360

116654196 TAATAGAATGAAGGAAAACATAAATGAACAAAATATGATCATCTCAATTGACAATAGGCA 116654255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TAATAGAATGAAGGAAAACATAAATGAACAAAATATGATCATCTCAATTGACAATAGGCA 420

116654256 TCTGCCAGAATTCAACACCTTTCCATGATAAAAACATCCAGAAAACTAGAAATAGAAGGG 116654315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCTGCCAGAATTCAACACCTTTCCATGATAAAAACATCCAGAAAACTAGAAATAGAAGGG 480

116654316 AACTTCCTTTATATGTTAAAGGACATTTTTTTCTTTCATCTTTTTGTTTCTGGAAACTGG 116654375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AACTTCCTTTATATGTTAAAGGACATTTTTTTCTTTCATCTTTTTGTTTCTGGAAACTGG 540

116654376 GCTTTGTCACTCTCTCTCTCTCTTTTTTGAGTTCAGCTATATATTTATTTATTCTTGTTA 116654435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GCTTTGTCACTCTCTCTCTCTCTTTTTTGAGTTCAGCTATATATTTATTTATTCTTGTTA 600

116654436 TATTAAACTTCAATCAATTTAAAAGTATACAGTAATTGTTACTGAATATAGACAAAGGAT 116654495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TATTAAACTTCAATCAATTTAAAAGTATACAGTAATTGTTACTGAATATAGACAAAGGAT 660

116654496 ATTGGTGTCAATCAATGAATTATAAATGGTGAAGGAAGAAATCTCTGATGCAGAAATATT 116654555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATTGGTGTCAATCAATGAATTATAAATGGTGAAGGAAGAAATCTCTGATGCAGAAATATT 720

116654556 TTAAATTAATTATGTACATACCATAGCCTAGAAGATAGGAAGCATAACTCCTCGTCTTTT 116654615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTAAATTAATTATGTACATACCATAGCCTAGAAGATAGGAAGCATAACTCCTCGTCTTTT 780

116654616 AGGTGTGGCCTGTGCATTTCAGAGTACAGTATAGAAAAGAAATAAAAGAGTAACTTTATA 116654675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGGTGTGGCCTGTGCATTTCAGAGTACAGTATAGAAAAGAAATAAAAGAGTAACTTTATA 840

116654676 GTAGAGAAATCTGGCAAATACTAGTTCAGCCAGGTGATCCAGGTCAACATCTATACTCAT 116654735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GTAGAGAAATCTGGCAAATACTAGTTCAGCCAGGTGATCCAGGTCAACATCTATACTCAT 900

116654736 AAACCATATTGATAGTATGTACCCTTGATATTATAGGATGTAAATAGCACTTTATCTCTG 116654795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AAACCATATTGATAGTATGTACCCTTGATATTATAGGATGTAAATAGCACTTTATCTCTG 960

116654796 TAGTCTTACTTCTAAAACACATAACTCCAGTGTAATCCTGAGAAAAATGTCAGACAAACT 116654855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TAGTCTTACTTCTAAAACACATAACTCCAGTGTAATCCTGAGAAAAATGTCAGACAAACT 1020

116654856 GTATTAGCAGGATATCTACAGTATACCTTACAAGTACTCTTCAAAACTGTGAGAGCCATC 116654915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GTATTAGCAGGATATCTACAGTATACCTTACAAGTACTCTTCAAAACTGTGAGAGCCATC 1080

116654916 AATAACAAAGTATGAGAAGCTGTCACAGTGCTGAGGAGCCTAAGGCGACATGATTACCAA 116654975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AATAACAAAGTATGAGAAGCTGTCACAGTGCTGAGGAGCCTAAGGCGACATGATTACCAA 1140

116654976 GTGCAATGTGATATCCTGGATGGGATCCTGGAAGAGAAAAAGGAAATTAGGTAAAAACTA 116655035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GTGCAATGTGATATCCTGGATGGGATCCTGGAAGAGAAAAAGGAAATTAGGTAAAAACTA 1200

116655036 AAGAAATCTGAATAAACTATACACTTTAATTAATTATAATATATAAATATCAGTCTGTTG 116655095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AAGAAATCTGAATAAACTATACACTTTAATTAATTATAATATATAAATATCAGTCTGTTG 1260

116655096 ATGTTTACAAATGTACCACTCATGTATAAATATCAGTCTGTTAATGTTTACAAATCTACC 116655155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATGTTTACAAATGTACCACTCATGTATAAATATCAGTCTGTTAATGTTTACAAATCTACC 1320

116655156 ACTCAAGTGTCTAATTTTAATAATAGGAAAAATAATGTATGAGGGGCACAGTGGAAATCT 116655215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ACTCAAGTGTCTAATTTTAATAATAGGAAAAATAATGTATGAGGGGCACAGTGGAAATCT 1380

116655216 GCAGTTCTGCACAATTTCTCTGGGAATCTAAAACTTGAAAAAAATAGTCTATTAATAATA 116655275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GCAGTTCTGCACAATTTCTCTGGGAATCTAAAACTTGAAAAAAATAGTCTATTAATAATA 1440

116655276 CCAACACAGAAGCAAGTTGAGGCATTTGTTTTTGGAATTCAGGGTTAAAGACAGTTGCTT 116655335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CCAACACAGAAGCAAGTTGAGGCATTTGTTTTTGGAATTCAGGGTTAAAGACAGTTGCTT 1500

116655336 CAGGGAGAGGTGCAAGTCACTATCTGACACTGGCACTGGAAATTTTTCTTTTCTTCTCAG 116655395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CAGGGAGAGGTGCAAGTCACTATCTGACACTGGCACTGGAAATTTTTCTTTTCTTCTCAG 1560

116655396 TTACTGGTCATTCTTGGAAAGTCAGGTGATACCCCTCAAGTAAATTTTCCCCAAAATGGA 116655455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTACTGGTCATTCTTGGAAAGTCAGGTGATACCCCTCAAGTAAATTTTCCCCAAAATGGA 1620

116655456 GCTAAAAATATACCCTGAGGGCAGACATAAATAAAAGGGCCAAAAGAAGGAGAGAAATAC 116655515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GCTAAAAATATACCCTGAGGGCAGACATAAATAAAAGGGCCAAAAGAAGGAGAGAAATAC 1680

116655516 AAAAGTCAATGTTAGTCTCTTTCCTCACGTCTCCACCTTTTCTTCTGTGTTCTCAATATA 116655575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AAAAGTCAATGTTAGTCTCTTTCCTCACGTCTCCACCTTTTCTTCTGTGTTCTCAATATA 1740

116655576 TTGATTTTCTGAAGGCATCCTTCACCATTGCCATCTGTGAGTGATATTACCACTGCTGGT 116655635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TTGATTTTCTGAAGGCATCCTTCACCATTGCCATCTGTGAGTGATATTACCACTGCTGGT 1800

116655636 CATGACCTTCCACAATGAGGATATTTGAACTAGATAGCTGGCAGGGTGCAGTGCCTTGAG 116655695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CATGACCTTCCACAATGAGGATATTTGAACTAGATAGCTGGCAGGGTGCAGTGCCTTGAG 1860

116655696 AGGCCAGTGAGGACAGAGATTTTTGCTGACTCTGAACTCAATCTTCCTCACTGAAGTGAA 116655755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AGGCCAGTGAGGACAGAGATTTTTGCTGACTCTGAACTCAATCTTCCTCACTGAAGTGAA 1920

116655756 AGTTTAAATTAGATTTTCAAATAGGGTATATGCAATTGTGTATTTCCTCATAATTTTTCC 116655815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AGTTTAAATTAGATTTTCAAATAGGGTATATGCAATTGTGTATTTCCTCATAATTTTTCC 1980

116655816 CTTGATGTGATGATTGCTTTCCAACAGGACAAAGCATTGTGACACGTAATATTAACCTAA 116655875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CTTGATGTGATGATTGCTTTCCAACAGGACAAAGCATTGTGACACGTAATATTAACCTAA 2040

116655876 GTGATATCTTTCCAGGCTTACAAGTGTGCTTGTTTTACTTTGTTATTTCCTGAAGACTTC 116655935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GTGATATCTTTCCAGGCTTACAAGTGTGCTTGTTTTACTTTGTTATTTCCTGAAGACTTC 2100

116655936 CTTTACACTTCTCTTGATTTCTGCCATTTTTATAATAATGTATGGTAAGAACAACATTGT 116655995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CTTTACACTTCTCTTGATTTCTGCCATTTTTATAATAATGTATGGTAAGAACAACATTGT 2160

116655996 GGGTACTAATTATATATTCTTTCAAACAAAGAATGCTATTATGTTTGCTTTCTTCTGAGG 116656055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GGGTACTAATTATATATTCTTTCAAACAAAGAATGCTATTATGTTTGCTTTCTTCTGAGG 2220

116656056 TAGCTTATGCATACATTTTTGTTGCCCTTTTAGCTTTGAGATCATATTAAGTTGAAATTT 116656115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TAGCTTATGCATACATTTTTGTTGCCCTTTTAGCTTTGAGATCATATTAAGTTGAAATTT 2280

116656116 TAAAAGTGACTGTCGCGGGCGTGGTGGCTTATGCCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCC 116656175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TAAAAGTGACTGTCGCGGGCGTGGTGGCTTATGCCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCC 2340

116656176 GAAGCAGGCAGATCACCTGAGGTCGGGAGTTCGAAACGAGCCTGACCAACATGGAGAAAC 116656235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GAAGCAGGCAGATCACCTGAGGTCGGGAGTTCGAAACGAGCCTGACCAACATGGAGAAAC 2400

116656236 CCCGTCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGTGCATACCTGTAATCCCAG 116656295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CCCGTCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGTGCATACCTGTAATCCCAG 2460

116656296 CTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCTCTTGAACCCGGGAGGCAGAGGTTGTGGTGAG 116656355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCTCTTGAACCCGGGAGGCAGAGGTTGTGGTGAG 2520

116656356 CCGAAATCACACCACTG 116656372
          |||||||||||||||||
     2521 CCGAAATCACACCACTG 2537

EXCISED REGION

116656374 ACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGTGAAAGTGAAACTCCGTCTCAAGAAAAAAAAAAAAAAA 116656433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2539 ACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGTGAAAGTGAAACTCCGTCTCAAGAAAAAAAAAAAAAAA 2598

116656434 TGACTATTAGAACCCATTCTTGAATTTGGCTAATTGATTAGAGAGAGACAAAAATGTTAT 116656493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2599 TGACTATTAGAACCCATTCTTGAATTTGGCTAATTGATTAGAGAGAGACAAAAATGTTAT 2658

116656494 AAGCAATTTCTCATTATTTTCTCTTATTTGCCTTGACTTTGATTGTGGCTGCCACTGTTC 116656553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2659 AAGCAATTTCTCATTATTTTCTCTTATTTGCCTTGACTTTGATTGTGGCTGCCACTGTTC 2718

116656554 TTCTTAATAATTCAATTAGCCAATACTTACAGAGCCATCTGCTCTGCATCAGACAACATT 116656613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2719 TTCTTAATAATTCAATTAGCCAATACTTACAGAGCCATCTGCTCTGCATCAGACAACATT 2778

116656614 CTATGTATTGCTAGACCAATAACAAGACTGATGACCTAAACTTTACATTCTAGTGAGGTA 116656673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2779 CTATGTATTGCTAGACCAATAACAAGACTGATGACCTAAACTTTACATTCTAGTGAGGTA 2838

116656674 GCAGATAATAAACAGTAAACATGTAAGTATATCATATAGTATAGGAAGTGATAAGTAACA 116656733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2839 GCAGATAATAAACAGTAAACATGTAAGTATATCATATAGTATAGGAAGTGATAAGTAACA 2898

116656734 TAGAGAAAGAAAAATCAGTTTTAGAAGATAGGCCAAGAGCAACAGTTTTATAAACAGTGG 116656793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2899 TAGAGAAAGAAAAATCAGTTTTAGAAGATAGGCCAAGAGCAACAGTTTTATAAACAGTGG 2958

116656794 TCTCTGAGGAGACAGCAATTGCTCAAAACCTGTGTGAGAAAAGTAAGCCACACAAATATC 116656853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2959 TCTCTGAGGAGACAGCAATTGCTCAAAACCTGTGTGAGAAAAGTAAGCCACACAAATATC 3018

116656854 TCAATATGGTCTGGGTAGAAATAAACTCAATTAGAAAGATTCTAGGCAAGAGCTTGCCTG 116656913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3019 TCAATATGGTCTGGGTAGAAATAAACTCAATTAGAAAGATTCTAGGCAAGAGCTTGCCTG 3078

116656914 CTTTTATTGAAAAACAGTAAGCATTTTTGAGCAAATAAAGTTGGACAGAAGGTAGTCATT 116656973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3079 CTTTTATTGAAAAACAGTAAGCATTTTTGAGCAAATAAAGTTGGACAGAAGGTAGTCATT 3138

116656974 GGCCAGATCGTAGAAGAACATAAAATATGATTACAATGCTCTCCATTATTTGAATATCTT 116657033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3139 GGCCAGATCGTAGAAGAACATAAAATATGATTACAATGCTCTCCATTATTTGAATATCTT 3198

116657034 GCATAATAATGATGTGGTCTTATATTATCTTTTTTCTTTTTCTTTTTTGAGAATGAGTCT 116657093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3199 GCATAATAATGATGTGGTCTTATATTATCTTTTTTCTTTTTCTTTTTTGAGAATGAGTCT 3258

116657094 CACTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAATCTTGGCTGACTGCAACCTCTGCCT 116657153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3259 CACTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAATCTTGGCTGACTGCAACCTCTGCCT 3318

116657154 CCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGATGCTTG 116657213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3319 CCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGATGCTTG 3378

116657214 TCACTGCACCTGGCTAATTTTTTTTTTTTTTTAAAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTG 116657273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3379 TCACTGCACCTGGCTAATTTTTTTTTTTTTTTAAAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTG 3438

116657274 GCCAGGCTGGTCTTGAACTACTGACCTCATGATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCT 116657333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3439 GCCAGGCTGGTCTTGAACTACTGACCTCATGATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCT 3498

116657334 TGGATTACAGGTGTGAGCCACCACACCTGGCCATATTATCTTTAAGTCTCAGGTTCCTCA 116657393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3499 TGGATTACAGGTGTGAGCCACCACACCTGGCCATATTATCTTTAAGTCTCAGGTTCCTCA 3558

116657394 TCTTTGAAATCAACTAATATTATGTGTTTATTGTTATAAGTCAAAGACAGAAATTTGAAA 116657453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3559 TCTTTGAAATCAACTAATATTATGTGTTTATTGTTATAAGTCAAAGACAGAAATTTGAAA 3618

116657454 TGAGGCCTACGATGCTGATTATATTTTGTTCTTTGATCCAGGTGATAGTTAAATAGATAT 116657513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3619 TGAGGCCTACGATGCTGATTATATTTTGTTCTTTGATCCAGGTGATAGTTAAATAGATAT 3678

116657514 GATCACCTAGTGAACACTCAAGACTTATGCACTTGTCTGCGTGTAATGTACACAAAAATG 116657573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3679 GATCACCTAGTGAACACTCAAGACTTATGCACTTGTCTGCGTGTAATGTACACAAAAATG 3738

116657574 TGTAACTACTTAGTAGTAGTCTTATAAAAATAAACAAGATAATATGTGTGTATATATATG 116657633
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     3739 TGTAACTACTTAGTAGTAGTCTTATAAAAATAAACAAGATAATATGTGTTTATATATATG 3798

116657634 TAGTGTTAAGCAAAGTACCCAGTACATGTTGGCCAAAACAAATGTCATCTCTCTCCTCCT 116657693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3799 TAGTGTTAAGCAAAGTACCCAGTACATGTTGGCCAAAACAAATGTCATCTCTCTCCTCCT 3858

116657694 GCCTTTTGTTCACTTTTTTTCCTAGCCGAACAATCCTAGAGATTTTAAAGTACTTCTGCT 116657753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3859 GCCTTTTGTTCACTTTTTTTCCTAGCCGAACAATCCTAGAGATTTTAAAGTACTTCTGCT 3918

116657754 TGTTTACTTTTGTTTCCAAAAAAGTTAATTATAAAGCAAATAAACTCGCTTTAGGAAAAA 116657813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3919 TGTTTACTTTTGTTTCCAAAAAAGTTAATTATAAAGCAAATAAACTCGCTTTAGGAAAAA 3978

116657814 TGCAAAAAATCTGATAATATGCTCATTTATAAATAAAAAAGCAAACAAAACCTCTAAATT 116657873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3979 TGCAAAAAATCTGATAATATGCTCATTTATAAATAAAAAAGCAAACAAAACCTCTAAATT 4038

116657874 GAAACAACAGCCACCAGCCTACTCCCATCCTTTCCAAGATATTCTAATTCTCCTCTTCCT 116657933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4039 GAAACAACAGCCACCAGCCTACTCCCATCCTTTCCAAGATATTCTAATTCTCCTCTTCCT 4098

116657934 TTTCTCCAAGGCATTTTCCTAAGGATAGCTCCATTTTATCTTTTACATATACTTCTTTTC 116657993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4099 TTTCTCCAAGGCATTTTCCTAAGGATAGCTCCATTTTATCTTTTACATATACTTCTTTTC 4158

116657994 TTTTCCTATATTTTTCCACCTTCTTCTAATTTTCTTTGCTTTTCTATTGATTGTGGGTTA 116658053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4159 TTTTCCTATATTTTTCCACCTTCTTCTAATTTTCTTTGCTTTTCTATTGATTGTGGGTTA 4218

116658054 AGTAAGAAAAAAAGGCAAGGGTGGCAGTCAGAGTGCGTGCAGAATTCTTCAAAGCAATGA 116658113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4219 AGTAAGAAAAAAAGGCAAGGGTGGCAGTCAGAGTGCGTGCAGAATTCTTCAAAGCAATGA 4278

116658114 ATGTTGAGAAAAGCCGTGTATATTTAGAAGTTAATGGTCTCCCCTCTAGATTTCTATGCA 116658173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4279 ATGTTGAGAAAAGCCGTGTATATTTAGAAGTTAATGGTCTCCCCTCTAGATTTCTATGCA 4338

116658174 GCTTGAATTCCTCAGTGTTTCTGAACTTCTTGTGTTTTTCTCTTATCTTTTAAATAATAC 116658233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4339 GCTTGAATTCCTCAGTGTTTCTGAACTTCTTGTGTTTTTCTCTTATCTTTTAAATAATAC 4398

116658234 TCTGCTACTGTTTTTCTCTAGATTACCATTTCAGTGGATTTGAAAAATCTCTTTCCATTA 116658293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4399 TCTGCTACTGTTTTTCTCTAGATTACCATTTCAGTGGATTTGAAAAATCTCTTTCCATTA 4458

116658294 TTTTTCTTTTCTCCTTACTTCTTTCTTCCCCTTCTCTTATTTTTTCTCTTTCTCTCCAAC 116658353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4459 TTTTTCTTTTCTCCTTACTTCTTTCTTCCCCTTCTCTTATTTTTTCTCTTTCTCTCCAAC 4518

116658354 TTCATCTCTTTATTAATTTCCTTCTCTCCTTTTAAGTTTTGGTAACTGTTTTTCATTTGG 116658413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4519 TTCATCTCTTTATTAATTTCCTTCTCTCCTTTTAAGTTTTGGTAACTGTTTTTCATTTGG 4578

116658414 CCAGCTCTCAGTATACCTTATTTGTGTTGGGTACCAAAGCAAACATCCTCACCAGTGATG 116658473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4579 CCAGCTCTCAGTATACCTTATTTGTGTTGGGTACCAAAGCAAACATCCTCACCAGTGATG 4638

116658474 CAAGACTGAAGAAGTGTGATCATTAGCTCTGCAATCACAACCACAAAACACCTGTGGCTT 116658533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4639 CAAGACTGAAGAAGTGTGATCATTAGCTCTGCAATCACAACCACAAAACACCTGTGGCTT 4698

116658534 GCCTAAAACCTTCTTCTGTTAGACCCTTTCCTTACTTGGAAACAATCTCATCTTAAGAAA 116658593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4699 GCCTAAAACCTTCTTCTGTTAGACCCTTTCCTTACTTGGAAACAATCTCATCTTAAGAAA 4758

116658594 TCAAGCAATACTTGAAGAAATTTTGAGGAACCCATAAGCAAGAAAAACTGTATACTCATT 116658653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4759 TCAAGCAATACTTGAAGAAATTTTGAGGAACCCATAAGCAAGAAAAACTGTATACTCATT 4818

116658654 TCCCTTAACATGATACCATTTCACAGTTACCTGTGTGGTGCTTTTCATTGCTATAGAAAT 116658713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4819 TCCCTTAACATGATACCATTTCACAGTTACCTGTGTGGTGCTTTTCATTGCTATAGAAAT 4878

116658714 CGAATTAAACTCAGTGTGATTGTAGCATAATGGGATACTTCACTTGAGAAAGGGGATTTT 116658773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4879 CGAATTAAACTCAGTGTGATTGTAGCATAATGGGATACTTCACTTGAGAAAGGGGATTTT 4938

116658774 TATAATTTGGAGAAGCATTGAGAGTCAGCAGTGAATATTCATGACACGGGCTAGGACCAT 116658833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4939 TATAATTTGGAGAAGCATTGAGAGTCAGCAGTGAATATTCATGACACGGGCTAGGACCAT 4998

116658834 TTAAACAGACGACTTCTAGGAGAGTCTCTTGAGGACATTTAATCTCTTGTGCTTGACCAT 116658893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4999 TTAAACAGACGACTTCTAGGAGAGTCTCTTGAGGACATTTAATCTCTTGTGCTTGACCAT 5058

116658894 CCTGACCCAAGGTGAGTTTGAGTCTCAAATACATTAAAATTCTCAAACCATTAGTTTTAT 116658953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5059 CCTGACCCAAGGTGAGTTTGAGTCTCAAATACATTAAAATTCTCAAACCATTAGTTTTAT 5118

116658954 TTTGTTCCTGTAAACCTAAAGTTTAACTTTCAGAATACTTTTTCTCATTAGAATTATATG 116659013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5119 TTTGTTCCTGTAAACCTAAAGTTTAACTTTCAGAATACTTTTTCTCATTAGAATTATATG 5178

116659014 TTTAAAAATTCTTGGTGACATTCCATTCTTCACCTAATCTCACGTTTGTCTTGTTCTGTT 116659073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5179 TTTAAAAATTCTTGGTGACATTCCATTCTTCACCTAATCTCACGTTTGTCTTGTTCTGTT 5238

116659074 TTGTCAAAAATGTTTTCCTAAAAATGAAAAAGAAAACCTCTAGAATGATTAATCGAGTGA 116659133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5239 TTGTCAAAAATGTTTTCCTAAAAATGAAAAAGAAAACCTCTAGAATGATTAATCGAGTGA 5298

116659134 GATTCTCAATAAATCTGCAACTAAAACCATCCGTAAGTCCTAACAAGTTTCAATTTTTAT 116659193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5299 GATTCTCAATAAATCTGCAACTAAAACCATCCGTAAGTCCTAACAAGTTTCAATTTTTAT 5358

116659194 CACGTTAGTGTCTTTTAGTAGATAAACTTTGCTCTAGGTCACTATCCAAAAAACTTATGT 116659253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5359 CACGTTAGTGTCTTTTAGTAGATAAACTTTGCTCTAGGTCACTATCCAAAAAACTTATGT 5418

116659254 GAGTTCTGTTGATTGTATCCTGCCTTTGTGTTCCTAAGAGTTGATTTGGGAAGCAAAATC 116659313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5419 GAGTTCTGTTGATTGTATCCTGCCTTTGTGTTCCTAAGAGTTGATTTGGGAAGCAAAATC 5478

116659314 CCCCAAAAATCTATATTCTCAGGCCCATGGATAGTTAGAACGCAGGCTACAGATGTCAAA 116659373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5479 CCCCAAAAATCTATATTCTCAGGCCCATGGATAGTTAGAACGCAGGCTACAGATGTCAAA 5538

116659374 CTCTCTAGTCAGGGGTCATGCCTAATAAAGTGCAGAAGGAATACATTGAACAGAATGTTA 116659433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5539 CTCTCTAGTCAGGGGTCATGCCTAATAAAGTGCAGAAGGAATACATTGAACAGAATGTTA 5598

116659434 TACACTTTTAGGGCGTTTTAAAATTTTTGGTCTAAGTCATGTCTCTAGCAGGCTAGACAC 116659493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5599 TACACTTTTAGGGCGTTTTAAAATTTTTGGTCTAAGTCATGTCTCTAGCAGGCTAGACAC 5658

116659494 CTGTTCCAGATATGTATTCTTAATATAACAAAAATTATTTAAATATCTTACCATGTGTCA 116659553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5659 CTGTTCCAGATATGTATTCTTAATATAACAAAAATTATTTAAATATCTTACCATGTGTCA 5718

116659554 CAGTTACATCAATAATATTTGGAATCATACTGGACCCTTTGAAAATTTTCAGTATGAGTA 116659613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5719 CAGTTACATCAATAATATTTGGAATCATACTGGACCCTTTGAAAATTTTCAGTATGAGTA 5778

116659614 AAAATGTTTATCTTAGAAGTAAGTGGAGGGGAAACATCCTTATTATTAAGTGCTAAGCCT 116659673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5779 AAAATGTTTATCTTAGAAGTAAGTGGAGGGGAAACATCCTTATTATTAAGTGCTAAGCCT 5838

116659674 TTTTAAAATGGTCTATGAAGATTCTAAATAGACTTCTGATTCCAAAATACCTATAACAAT 116659733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5839 TTTTAAAATGGTCTATGAAGATTCTAAATAGACTTCTGATTCCAAAATACCTATAACAAT 5898

116659734 GAAGTCTTTGGCCATGGCTAATTAAAAAAAAACATAAAACTCTAGAGACTGTCTCATTTA 116659793
          ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5899 GAAGTCTTTGGCCATGGCTAATT-AAAAAAAACATAAAACTCTAGAGACTGTCTCATTTA 5957

116659794 TTAATTTGCCAAATTCTTCTTTCTTTTAACATTTTCTTTATCCCACAGTATCTTTTCTTG 116659853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5958 TTAATTTGCCAAATTCTTCTTTCTTTTAACATTTTCTTTATCCCACAGTATCTTTTCTTG 6017

116659854 CTTTTTGTGCTACCACACTATCAAATTTTACTCTTTTTCTCCCAAATTTCTTTTTCTAAC 116659913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6018 CTTTTTGTGCTACCACACTATCAAATTTTACTCTTTTTCTCCCAAATTTCTTTTTCTAAC 6077

116659914 CATCGTCTTCCCCCTCTGATTGTATCTGAAAATAACCACTTGCTTTTCTTCTTTTTTCTT 116659973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6078 CATCGTCTTCCCCCTCTGATTGTATCTGAAAATAACCACTTGCTTTTCTTCTTTTTTCTT 6137

116659974 TTTCTTTTTCTTTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCC 116660033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6138 TTTCTTTTTCTTTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCC 6197

116660034 TTCCTTCCCTCTTTCCCTTTCCCTTTCTTTTCTTTTATTTTTTCTTCTCTCTTCTCTTCT 116660093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6198 TTCCTTCCCTCTTTCCCTTTCCCTTTCTTTTCTTTTATTTTTTCTTCTCTCTTCTCTTCT 6257

116660094 CTTTTTCTGGGTTGCACTCTGTTACCCAAGCTTGAATGCAATGGCAGGGATCACAGCTTA 116660153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6258 CTTTTTCTGGGTTGCACTCTGTTACCCAAGCTTGAATGCAATGGCAGGGATCACAGCTTA 6317

116660154 CTGCAGTGTCAACCTCCTGGGCTCAGGTGATCATCCTCCTTCAGCCTCCTGTGTAGCTAG 116660213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6318 CTGCAGTGTCAACCTCCTGGGCTCAGGTGATCATCCTCCTTCAGCCTCCTGTGTAGCTAG 6377

116660214 GACTGCAGGCATGTACCACCACACATGGCTAATTTTAGTATTTTTTGTAGAAATGAGAGT 116660273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6378 GACTGCAGGCATGTACCACCACACATGGCTAATTTTAGTATTTTTTGTAGAAATGAGAGT 6437

116660274 CTCACTGTGTTGTCCAGGTTTGTCTCAAACTCCCAGGTTCAAGCAATCCACCTGCCTCAG 116660333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6438 CTCACTGTGTTGTCCAGGTTTGTCTCAAACTCCCAGGTTCAAGCAATCCACCTGCCTCAG 6497

116660334 CCTCTCAAACTGCTGGGATTATAGGCATGTGCCACCATGCTGGGCCTCAAATTGACATTT 116660393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6498 CCTCTCAAACTGCTGGGATTATAGGCATGTGCCACCATGCTGGGCCTCAAATTGACATTT 6557

116660394 TCTTAAAAATTGGACTGCCAAACAAGGACATTAGCCCTAGTAGGCAGAAGATACTATCTT 116660453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6558 TCTTAAAAATTGGACTGCCAAACAAGGACATTAGCCCTAGTAGGCAGAAGATACTATCTT 6617

116660454 GGTCTGTGTTAGAGGCAATTGTTGAAATTTCTCTGAATCTCTATGGGATAGGCATAAATG 116660513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6618 GGTCTGTGTTAGAGGCAATTGTTGAAATTTCTCTGAATCTCTATGGGATAGGCATAAATG 6677

116660514 TACTGATAAATTTGAGCAGTCCTGGGAATCCATAATCTCAATTTATTTGACCAATATCAA 116660573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6678 TACTGATAAATTTGAGCAGTCCTGGGAATCCATAATCTCAATTTATTTGACCAATATCAA 6737

116660574 TTAATACCATGTTGAGAGGTCCTTCTATTTCTGAAGTCTGGTTCAGCAAAAAATAAAAAA 116660633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6738 TTAATACCATGTTGAGAGGTCCTTCTATTTCTGAAGTCTGGTTCAGCAAAAAATAAAAAA 6797

116660634 AAAAATAAAATACCTGAAATAATGTAGCTATTCCTGAGGTATCATTAACAGAATAGAAAC 116660693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6798 AAAAATAAAATACCTGAAATAATGTAGCTATTCCTGAGGTATCATTAACAGAATAGAAAC 6857

116660694 TTAAAAAGCGCATGATATGGAAAAATCTTTGCTGATGGTTATACATGTTAAGTTTCCAGA 116660753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6858 TTAAAAAGCGCATGATATGGAAAAATCTTTGCTGATGGTTATACATGTTAAGTTTCCAGA 6917

116660754 TAACTATTAATTAGACTTGCAGACATAAAAGGCTGTACCAAGTGGATATTTTAGAGATAA 116660813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6918 TAACTATTAATTAGACTTGCAGACATAAAAGGCTGTACCAAGTGGATATTTTAGAGATAA 6977

116660814 ATTTTTAGCACTTACAGACAATATTATGAAGTAGCTATGTGGGCATAGAGAAATTCGGGA 116660873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6978 ATTTTTAGCACTTACAGACAATATTATGAAGTAGCTATGTGGGCATAGAGAAATTCGGGA 7037

116660874 AATTAGCAGGCTGGTTCTGCTATAATAGATCTCAGTTCACCCTTAGGATATCTTCACTAA 116660933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7038 AATTAGCAGGCTGGTTCTGCTATAATAGATCTCAGTTCACCCTTAGGATATCTTCACTAA 7097

116660934 AGGAGCTTAACATAGCCCAGATGGTAGATTTGATTGCCCTCATTAGAGCTGGTCACTTGG 116660993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7098 AGGAGCTTAACATAGCCCAGATGGTAGATTTGATTGCCCTCATTAGAGCTGGTCACTTGG 7157

116660994 CCAAAGACAAAAAAAATTATATTTACACAGAAAATAGCTCAAGTACCTGAACCTCAGTAT 116661053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7158 CCAAAGACAAAAAAAATTATATTTACACAGAAAATAGCTCAAGTACCTGAACCTCAGTAT 7217

116661054 GACTATATATGGGGATAGAGTCTTTAAGGAAGTGATTAAGGTTAAATAAAGTCATAATGA 116661113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7218 GACTATATATGGGGATAGAGTCTTTAAGGAAGTGATTAAGGTTAAATAAAGTCATAATGA 7277

116661114 TGGGGCCCTAATCTGATAAGATTAGCGTCCTTCTAAGAGGAGGAATCAACATCAGGGATT 116661173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7278 TGGGGCCCTAATCTGATAAGATTAGCGTCCTTCTAAGAGGAGGAATCAACATCAGGGATT 7337

116661174 TTTTTTTCTCTCAACCCATGCCCAGAGGAAAGTCATATGAGGACGTAACACAAAGAGAGA 116661233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7338 TTTTTTTCTCTCAACCCATGCCCAGAGGAAAGTCATATGAGGACGTAACACAAAGAGAGA 7397

116661234 CATCTACAAATCACAGAGGTTGCACCAGAAATCAACCCTGCTAGCATATCGATCTTGAAC 116661293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7398 CATCTACAAATCACAGAGGTTGCACCAGAAATCAACCCTGCTAGCATATCGATCTTGAAC 7457

116661294 TTCTAGTCCCCAGAACTGTGAGGAAATAAATTTTTGTTGCTTATGCCACCAGATCTGTGA 116661353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7458 TTCTAGTCCCCAGAACTGTGAGGAAATAAATTTTTGTTGCTTATGCCACCAGATCTGTGA 7517

116661354 CATTTTGTTATGGAAGTCTGAGCTGACCAATACACTTGAATAACTATCAGTGTCAATGTA 116661413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7518 CATTTTGTTATGGAAGTCTGAGCTGACCAATACACTTGAATAACTATCAGTGTCAATGTA 7577

116661414 AAACAAGCCATCTTTAGACTTAAGGAAACAGTCACCTGGCTCTCTAAGGCAGATGCAAAT 116661473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7578 AAACAAGCCATCTTTAGACTTAAGGAAACAGTCACCTGGCTCTCTAAGGCAGATGCAAAT 7637

116661474 GGATTTTTCTTTGCCCGGGTTTAGTAATTCAGATTATGGCACTAAGTGTTTTGGGAAGGC 116661533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7638 GGATTTTTCTTTGCCCGGGTTTAGTAATTCAGATTATGGCACTAAGTGTTTTGGGAAGGC 7697

116661534 TCCATGTCATTTTGATATAGTCACTGTGTGTTGCCATTCTTATGCATGTATTCTCCACAG 116661593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7698 TCCATGTCATTTTGATATAGTCACTGTGTGTTGCCATTCTTATGCATGTATTCTCCACAG 7757

116661594 TCTCAGTCCTGCTCTGCAGCTGCTCTCGTGTCAAATGATCCATCACTCAACGGAAATGAA 116661653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7758 TCTCAGTCCTGCTCTGCAGCTGCTCTCGTGTCAAATGATCCATCACTCAACGGAAATGAA 7817

116661654 CTCATCACTCCATAAAAGGAATAGGAAGATCAGTCCATGATCCAATCCCAAACTATTTTT 116661713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7818 CTCATCACTCCATAAAAGGAATAGGAAGATCAGTCCATGATCCAATCCCAAACTATTTTT 7877

116661714 TCTGAGGATGATAATGTTATCTAGAAATCACAACAGTGGTATACATCTGAACATGGCTGC 116661773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7878 TCTGAGGATGATAATGTTATCTAGAAATCACAACAGTGGTATACATCTGAACATGGCTGC 7937

116661774 TTTAGTAGCTGAACGACTCTTCTCATCTTCTCATCAGTTAGGAAAGACTGAGAACTGGTA 116661833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7938 TTTAGTAGCTGAACGACTCTTCTCATCTTCTCATCAGTTAGGAAAGACTGAGAACTGGTA 7997

116661834 GCATAAATCCATCAATTATGGGATTGCAATTGCAGAATGTTTTGTGACTCACATAATGTT 116661893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7998 GCATAAATCCATCAATTATGGGATTGCAATTGCAGAATGTTTTGTGACTCACATAATGTT 8057

116661894 TTCTTCTTTACTCAGAACTTCTCTATTTCACAGATTCTCACCTTAATAATTGAAGCAACT 116661953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8058 TTCTTCTTTACTCAGAACTTCTCTATTTCACAGATTCTCACCTTAATAATTGAAGCAACT 8117

116661954 CAGGGTCACATCCTAGTTCTATAATTCTGCCTGAGGCACTCTGAGCCCAAACCATCAACA 116662013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8118 CAGGGTCACATCCTAGTTCTATAATTCTGCCTGAGGCACTCTGAGCCCAAACCATCAACA 8177

116662014 GGAAACAAACAAATAAAAAACCTGCTAATTTACTCTCCAATGAAACCTTTCCAGAATTAT 116662073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8178 GGAAACAAACAAATAAAAAACCTGCTAATTTACTCTCCAATGAAACCTTTCCAGAATTAT 8237

116662074 CTGTGTAGAGTTTCCTATTGCTGCAATAATTAATAAACTCAGTTTGCTTATATTGCAAAT 116662133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8238 CTGTGTAGAGTTTCCTATTGCTGCAATAATTAATAAACTCAGTTTGCTTATATTGCAAAT 8297

116662134 TTTAAAACTCGTAGTGGGAGATTTCCAGTTGCAAACAACAAGTCTTGGCTTTAATTATGA 116662193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8298 TTTAAAACTCGTAGTGGGAGATTTCCAGTTGCAAACAACAAGTCTTGGCTTTAATTATGA 8357

116662194 GTTCAACCAGTTTTTTTTCTCCTAATGTTTTAAATCTCAGTTCATCATAATGTCTGAGCT 116662253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8358 GTTCAACCAGTTTTTTTTCTCCTAATGTTTTAAATCTCAGTTCATCATAATGTCTGAGCT 8417

116662254 TGTCTGATTTTGGCATAGGGAATATAATTAGAAGTAGTGAATGAAGGCCTAGCTGTTGCT 116662313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8418 TGTCTGATTTTGGCATAGGGAATATAATTAGAAGTAGTGAATGAAGGCCTAGCTGTTGCT 8477

116662314 TTGATGTCAGCAGACACCCATTTCTCTTTCCAAACTGCTTTTAAAAAGTCAAACAACTTC 116662373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8478 TTGATGTCAGCAGACACCCATTTCTCTTTCCAAACTGCTTTTAAAAAGTCAAACAACTTC 8537

116662374 CTTCTCTTCTTGCCTCACTCTCTACTTAATGTGATTTTCTTTTAATTTATGAAGGAAATA 116662433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8538 CTTCTCTTCTTGCCTCACTCTCTACTTAATGTGATTTTCTTTTAATTTATGAAGGAAATA 8597

116662434 AAATCATTGCTTTTTAAGAATCATCCAACCAAGTCATTAAAGATATCTGGAATTCAAGAT 116662493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8598 AAATCATTGCTTTTTAAGAATCATCCAACCAAGTCATTAAAGATATCTGGAATTCAAGAT 8657

116662494 GTAGTCAAAATATTTCAAGGGCATTACAATATCCTCTGTCTTCTCTAATCTCTCAGGCAG 116662553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8658 GTAGTCAAAATATTTCAAGGGCATTACAATATCCTCTGTCTTCTCTAATCTCTCAGGCAG 8717

116662554 TAAAACGGTACCAAGTGCAGAGATAGAAACACTGCTGTCAAAGTGGGTTAAAATCTTGAC 116662613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8718 TAAAACGGTACCAAGTGCAGAGATAGAAACACTGCTGTCAAAGTGGGTTAAAATCTTGAC 8777

116662614 AGTATCGTGGCTTCTGATTTTAATTTCTCAAT 116662645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||
     8778 AGTATCGTGGCTTCTGATTTTAATTTCTCAAT 8809

Alignment time is 10.1693 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [116652076,116672656] =>     20581 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [        1,     4238] =>      4238 nucs 'mol-32-2ee6-086827_4238'

Score:        4091
Aligned:      4250        nucs
Identic:      4220 ( 99%) nucs =>      3246 ( 99%)       974 (100%)
Gaps:           22 (  1%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [116658804,116662076] EXCISED REGION [116662657,116663632]
 second seq =>  [        1,     3253] EXCISED REGION [     3255,     4230]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       580 nucs [116662077,116662656]
 second seq =>         1 nucs [3254,3254]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [3253,3253] to [3254,3254]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

116658804 GTGAATATTCATGACACGGGCTAGGACCATTTAAACAGACGACTTCTAGGAGAGTCTCTT 116658863
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTGAATATTCATGACACGAGCTAGGACCATTTAAACAGACGACTTCTAGGAGAGTCTCTT 60

116658864 GAGGACATTTAATCTCTTGTGCTTGACCATCCTGACCCAAGGTGAGTTTGAGTCTCAAAT 116658923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAGGACATTTAATCTCTTGTGCTTGACCATCCTGACCCAAGGTGAGTTTGAGTCTCAAAT 120

116658924 ACATTAAAATTCTCAAACCATTAGTTTTATTTTGTTCCTGTAAACCTAAAGTTTAACTTT 116658983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACATTAAAATTCTCAAACCATTAGTTTTATTTTGTTCCTGTAAACCTAAAGTTTAACTTT 180

116658984 CAGAATACTTTTTCTCATTAGAATTATATGTTTAAAAATTCTTGGTGACATTCCATTCTT 116659043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CAGAATACTTTTTCTCATTAGAATTATATGTTTAAAAATTCTTGGTGACATTCCATTCTT 240

116659044 CACCTAATCTCACGTTTGTCTTGTTCTGTTTTGTCAAAAATGTTTTCCTAAAAATGAAAA 116659103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CACCTAATCTCACGTTTGTCTTGTTCTGTTTTGTCAAAAATGTTTTCCTAAAAATGAAAA 300

116659104 AGAAAACCTCTAGAATGATTAATCGAGTGAGATTCTCAATAAATCTGCAACTAAAACCAT 116659163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGAAAACCTCTAGAATGATTAATCGAGTGAGATTCTCAATAAATCTGCAACTAAAACCAT 360

116659164 CCGTAAGTCCTAACAAGTTTCAATTTTTATCACGTTAGTGTCTTTTAGTAGATAAACTTT 116659223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CCGTAAGTCCTAACAAGTTTCAATTTTTATCACGTTAGTGTCTTTTAGTAGATAAACTTT 420

116659224 GCTCTAGGTCACTATCCAAAAAACTTATGTGAGTTCTGTTGATTGTATCCTGCCTTTGTG 116659283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GCTCTAGGTCACTATCCAAAAAACTTATGTGAGTTCTGTTGATTGTATCCTGCCTTTGTG 480

116659284 TTCCTAAGAGTTGATTTGGGAAGCAAAATCCCCCAAAAATCTATATTCTCAGGCCCATGG 116659343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTCCTAAGAGTTGATTTGGGAAGCAAAATCCCCCAAAAATCTATATTCTCAGGCCCATGG 540

116659344 ATAGTTAGAACGCAGGCTACAGATGTCAAACTCTCTAGTCAGGGGTCATGCCTAATAAAG 116659403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATAGTTAGAACGCAGGCTACAGATGTCAAACTCTCTAGTCAGGGGTCATGCCTAATAAAG 600

116659404 TGCAGAAGGAATACATTGAACAGAATGTTATACACTTTTAGGGCGTTTTAAAATTTTTGG 116659463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGCAGAAGGAATACATTGAACAGAATGTTATACACTTTTAGGGCGTTTTAAAATTTTTGG 660

116659464 TCTAAGTCATGTCTCTAGCAGGCTAGACACCTGTTCCAGATATGTATTCTTAATATAACA 116659523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCTAAGTCATGTCTCTAGCAGGCTAGACACCTGTTCCAGATATGTATTCTTAATATAACA 720

116659524 AAAATTATTTAAATATCTTACCATGTGTCACAGTTACATCAATAATATTTGGAATCATAC 116659583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAAATTATTTAAATATCTTACCATGTGTCACAGTTACATCAATAATATTTGGAATCATAC 780

116659584 TGGACCCTTTGAAAATTTTCAGTATGAGTAAAAATGTTTATCTTAGAAGTAAGTGGAGGG 116659643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGGACCCTTTGAAAATTTTCAGTATGAGTAAAAATGTTTATCTTAGAAGTAAGTGGAGGG 840

116659644 GAAACATCCTTATTATTAAGTGCTAAGCCTTTTTAAAATGGTCTATGAAGATTCTAAATA 116659703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GAAACATCCTTATTATTAAGTGCTAAGCCTTTTTAAAATGGTCTATGAAGATTCTAAATA 900

116659704 GACTTCTGATTCCAAAATACCTATAACAATGAAGTCTTTGGCCATGGCTAATTAAAAAAA 116659763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GACTTCTGATTCCAAAATACCTATAACAATGAAGTCTTTGGCCATGGCTAATTAAAAAAA 960

116659764 AACATAAAACTCTAGAGACTGTCTCATTTATTAATTTGCCAAATTCTTCTTTCTTTTAAC 116659823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AACATAAAACTCTAGAGACTGTCTCATTTATTAATTTGCCAAATTCTTCTTTCTTTTAAC 1020

116659824 ATTTTCTTTATCCCACAGTATCTTTTCTTGCTTTTTGTGCTACCACACTATCAAATTTTA 116659883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATTTTCTTTATCCCACAGTATCTTTTCTTGCTTTTTGTGCTACCACACTATCAAATTTTA 1080

116659884 CTCTTTTTCTCCCAAATTTCTTTTTCTAACCATCGTCTTCCCCCTCTGATTGTATCTGAA 116659943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTCTTTTTCTCCCAAATTTCTTTTTCTAACCATCGTCTTCCCCCTCTGATTGTATCTGAA 1140

116659944 AATAACCACTTGCTTTTCTTCTTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTCCTTCCTTCCTTCCTT 116660003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AATAACCACTTGCTTTTCTTCTTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTCCTTCCTTCCTTCCTT 1200

116660004 CCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCCTCTTTCCCTTTCCCTTTCTTT 116660063
          ||||||||||||||||||                    ||||||||||||||||||||||
     1201 CCTTCCTTCCTTCCTTCC--------------------CTCTTTCCCTTTCCCTTTCTTT 1240

116660064 TCTTTTATTTTTTCTTCTCTCTTCTCTTCTCTTTTTCTGGGTTGCACTCTGTTACCCAAG 116660123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1241 TCTTTTATTTTTTCTTCTCTCTTCTCTTCTCTTTTTCTGGGTTGCACTCTGTTACCCAAG 1300

116660124 CTTGAATGCAATGGCAGGGATCACAGCTTACTGCAGTGTCAACCTCCTGGGCTCAGGTGA 116660183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1301 CTTGAATGCAATGGCAGGGATCACAGCTTACTGCAGTGTCAACCTCCTGGGCTCAGGTGA 1360

116660184 TCATCCTCCTTCAGCCTCCTGTGTAGCTAGGACTGCAGGCATGTACCACCACACATGGCT 116660243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1361 TCATCCTCCTTCAGCCTCCTGTGTAGCTAGGACTGCAGGCATGTACCACCACACATGGCT 1420

116660244 AATTTTAGTATTTTTTGTAGAAATGAGAGTCTCACTGTGTTGTCCAGGTTTGTCTCAAAC 116660303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1421 AATTTTAGTATTTTTTGTAGAAATGAGAGTCTCACTGTGTTGTCCAGGTTTGTCTCAAAC 1480

116660304 TCCCAGGTTCAAGCAATCCACCTGCCTCAGCCTCTCAAACTGCTGGGATTATAGGCATGT 116660363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1481 TCCCAGGTTCAAGCAATCCACCTGCCTCAGCCTCTCAAACTGCTGGGATTATAGGCATGT 1540

116660364 GCCACCATGCTGGGCCTCAAATTGACATTTTCTTAAAAATTGGACTGCCAAACAAGGACA 116660423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1541 GCCACCATGCTGGGCCTCAAATTGACATTTTCTTAAAAATTGGACTGCCAAACAAGGACA 1600

116660424 TTAGCCCTAGTAGGCAGAAGATACTATCTTGGTCTGTGTTAGAGGCAATTGTTGAAATTT 116660483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1601 TTAGCCCTAGTAGGCAGAAGATACTATCTTGGTCTGTGTTAGAGGCAATTGTTGAAATTT 1660

116660484 CTCTGAATCTCTATGGGATAGGCATAAATGTACTGATAAATTTGAGCAGTCCTGGGAATC 116660543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1661 CTCTGAATCTCTATGGGATAGGCATAAATGTACTGATAAATTTGAGCAGTCCTGGGAATC 1720

116660544 CATAATCTCAATTTATTTGACCAATATCAATTAATACCATGTTGAGAGGTCCTTCTATTT 116660603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1721 CATAATCTCAATTTATTTGACCAATATCAATTAATACCATGTTGAGAGGTCCTTCTATTT 1780

116660604 CTGAAGTCTGGTTCAGCAAAAAATAAAAAAAAAAA-TAAAATACCTGAAATAATGTAGCT 116660662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
     1781 CTGAAGTCTGGTTCAGCAAAAAATAAAAAAAAAAAATAAAATACCTGAAATAATGTAGCT 1840

116660663 ATTCCTGAGGTATCATTAACAGAATAGAAACTTAAAAAGCGCATGATATGGAAAAATCTT 116660722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     1841 ATTCCTGAGGTATCATTAACAGAATAGAAACTTAAAAAGCGCATGATATGGAAAAACCTT 1900

116660723 TGCTGATGGTTATACATGTTAAGTTTCCAGATAACTATTAATTAGACTTGCAGACATAAA 116660782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1901 TGCTGATGGTTATACATGTTAAGTTTCCAGATAACTATTAATTAGACTTGCAGACATAAA 1960

116660783 AGGCTGTACCAAGTGGATATTTTAGAGATAAATTTTTAGCACTTACAGACAATATTATGA 116660842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1961 AGGCTGTACCAAGTGGATATTTTAGAGATAAATTTTTAGCACTTACAGACAATATTATGA 2020

116660843 AGTAGCTATGTGGGCATAGAGAAATTCGGGAAATTAGCAGGCTGGTTCTGCTATAATAGA 116660902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2021 AGTAGCTATGTGGGCATAGAGAAATTCGGGAAATTAGCAGGCTGGTTCTGCTATAATAGA 2080

116660903 TCTCAGTTCACCCTTAGGATATCTTCACTAAAGGAGCTTAACATAGCCCAGATGGTAGAT 116660962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2081 TCTCAGTTCACCCTTAGGATATCTTCACTAAAGGAGCTTAACATAGCCCAGATGGTAGAT 2140

116660963 TTGATTGCCCTCATTAGAGCTGGTCACTTGGCCAAAGACAAAAAAAATTATATTTACACA 116661022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2141 TTGATTGCCCTCATTAGAGCTGGTCACTTGGCCAAAGACAAAAAAAATTATATTTACACA 2200

116661023 GAAAATAGCTCAAGTACCTGAACCTCAGTATGACTATATATGGGGATAGAGTCTTTAAGG 116661082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2201 GAAAATAGCTCAAGTACCTGAACCTCAGTATGACTATATATGGGGATAGAGTCTTTAAGG 2260

116661083 AAGTGATTAAGGTTAAATAAAGTCATAATGATGGGGCCCTAATCTGATAAGATTAGCGTC 116661142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2261 AAGTGATTAAGGTTAAATAAAGTCATAATGATGGGGCCCTAATCTGATAAGATTAGCGTC 2320

116661143 CTTCTAAGAGGAGGAATCAACATCAGGGATTTTTTTTTCTCTCAACCCATGCCCAGAGGA 116661202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2321 CTTCTAAGAGGAGGAATCAACATCAGGGATTTTTTTTTCTCTCAACCCATGCCCAGAGGA 2380

116661203 AAGTCATATGAGGACGTAACACAAAGAGAGACATCTACAAATCACAGAGGTTGCACCAGA 116661262
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     2381 AAGTCATATGAGGACGTAACACAAAGAGAGACATCTACAAATCACAGGGGTTGCACCAGA 2440

116661263 AATCAACCCTGCTAGCATATCGATCTTGAACTTCTAGTCCCCAGAACTGTGAGGAAATAA 116661322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2441 AATCAACCCTGCTAGCATATCGATCTTGAACTTCTAGTCCCCAGAACTGTGAGGAAATAA 2500

116661323 ATTTTTGTTGCTTATGCCACCAGATCTGTGACATTTTGTTATGGAAGTCTGAGCTGACCA 116661382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2501 ATTTTTGTTGCTTATGCCACCAGATCTGTGACATTTTGTTATGGAAGTCTGAGCTGACCA 2560

116661383 ATACACTTGAATAACTATCAGTGTCAATGTAAAACAAGCCATCTTTAGACTTAAGGAAAC 116661442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2561 ATACACTTGAATAACTATCAGTGTCAATGTAAAACAAGCCATCTTTAGACTTAAGGAAAC 2620

116661443 AGTCACCTGGCTCTCTAAGGCAGATGCAAATGGATTTTTCTTTGCCCGGGTTTAGTAATT 116661502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2621 AGTCACCTGGCTCTCTAAGGCAGATGCAAATGGATTTTTCTTTGCCCGGGTTTAGTAATT 2680

116661503 CAGATTATGGCACTAAGTGTTTTGGGAAGGCTCCATGTCATTTTGATATAGTCACTGTGT 116661562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2681 CAGATTATGGCACTAAGTGTTTTGGGAAGGCTCCATGTCATTTTGATATAGTCACTGTGT 2740

116661563 GTTGCCATTCTTATGCATGTATTCTCCACAGTCTCAGTCCTGCTCTGCAGCTGCTCTCGT 116661622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2741 GTTGCCATTCTTATGCATGTATTCTCCACAGTCTCAGTCCTGCTCTGCAGCTGCTCTCGT 2800

116661623 GTCAAATGATCCATCACTCAACGGAAATGAACTCATCACTCCATAAAAGGAATAGGAAGA 116661682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2801 GTCAAATGATCCATCACTCAACGGAAATGAACTCATCACTCCATAAAAGGAATAGGAAGA 2860

116661683 TCAGTCCATGATCCAATCCCAAACTATTTTTTCTGAGGATGATAATGTTATCTAGAAATC 116661742
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||||||
     2861 TCAGTCCATGATCCAATCCCAAACTATTTTTTCCGAGGATGATAATGCTATCTAGAAATC 2920

116661743 ACAACAGTGGTATACATCTGAACATGGCTGCTTTAGTAGCTGAACGACTCTTCTCATCTT 116661802
          ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     2921 ACAACAG-GGTATACATCTGAACATGGCTGCTTTAGTAGCTGAACGACTCATCTCATCTT 2979

116661803 CTCATCAGTTAGGAAAGACTGAGAACTGGTAGCATAAATCCATCAATTATGGGATTGCAA 116661862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2980 CTCATCAGTTAGGAAAGACTGAGAACTGGTAGCATAAATCCATCAATTATGGGATTGCAA 3039

116661863 TTGCAGAATGTTTTGTGACTCACATAATGTTTTCTTCTTTACTCAGAACTTCTCTATTTC 116661922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3040 TTGCAGAATGTTTTGTGACTCACATAATGTTTTCTTCTTTACTCAGAACTTCTCTATTTC 3099

116661923 ACAGATTCTCACCTTAATAATTGAAGCAACTCAGGGTCACATCCTAGTTCTATAATTCTG 116661982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3100 ACAGATTCTCACCTTAATAATTGAAGCAACTCAGGGTCACATCCTAGTTCTATAATTCTG 3159

116661983 CCTGAGGCACTCTGAGCCCAAACCATCAACAGGAAACAAACAAATAAAAAACCTGCTAAT 116662042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3160 CCTGAGGCACTCTGAGCCCAAACCATCAACAGGAAACAAACAAATAAAAAACCTGCTAAT 3219

116662043 TTACTCTCCAATGAAACCTTTCCAGAATTATCTG 116662076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3220 TTACTCTCCAATGAAACCTTTCCAGAATTATCTG 3253

EXCISED REGION

116662657 AATGAATAACTACCGTTATAGAAATAGCTTCTGGATTTCTTTGTCCTTTTTTTCCTGAAG 116662716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3255 AATGAATAACTACCGTTATAGAAATAGCTTCTGGATTTCTTTGTCCTTTTTTTCCTGAAG 3314

116662717 TTAGGCTATATTTGGTATCTCTATAGAGATAGGCTATATTTGGTAAATCTGTTCTCACCT 116662776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3315 TTAGGCTATATTTGGTATCTCTATAGAGATAGGCTATATTTGGTAAATCTGTTCTCACCT 3374

116662777 CACATAAAAGGTTAATATTCTACAAGTGGATAGATGTGGTGAGGACAACTAAAAGGAGAT 116662836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3375 CACATAAAAGGTTAATATTCTACAAGTGGATAGATGTGGTGAGGACAACTAAAAGGAGAT 3434

116662837 TGAATGATCTCATCAAATTATATTACACAACCTTTCAAAGAAAGCTCAGTTGGATTAAGA 116662896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3435 TGAATGATCTCATCAAATTATATTACACAACCTTTCAAAGAAAGCTCAGTTGGATTAAGA 3494

116662897 GGTTTCTTTATGTTCATGCCCAAAATGCCAAATTCCAACAGCCCACAAAATTTCTTTGAA 116662956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3495 GGTTTCTTTATGTTCATGCCCAAAATGCCAAATTCCAACAGCCCACAAAATTTCTTTGAA 3554

116662957 GTATTTTTCTCATACGTTTGTTTGATGAACAGCTTAAAGCTCCATTTCCATCCTAGCAAG 116663016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3555 GTATTTTTCTCATACGTTTGTTTGATGAACAGCTTAAAGCTCCATTTCCATCCTAGCAAG 3614

116663017 TGGCAGACAAAAAGCCAGATAGTAAATCATATTTTAATAAAAATGATTTTAATAAGTGAA 116663076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3615 TGGCAGACAAAAAGCCAGATAGTAAATCATATTTTAATAAAAATGATTTTAATAAGTGAA 3674

116663077 AGATATGATCCATTAAGTTAATCTTGTTAAGTAGAAGACCAAAATGAGAACTTAATGGGG 116663136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3675 AGATATGATCCATTAAGTTAATCTTGTTAAGTAGAAGACCAAAATGAGAACTTAATGGGG 3734

116663137 TGCAAACATCACGGAGAATCAAAACACACACTAGAAACCATACTTGAGAACCAGAGATGA 116663196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3735 TGCAAACATCACGGAGAATCAAAACACACACTAGAAACCATACTTGAGAACCAGAGATGA 3794

116663197 GTGAATGTTTGGTCATCAATATCCATGCTAGCCTTAATCTTGTGGTTATCCCACCACATC 116663256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3795 GTGAATGTTTGGTCATCAATATCCATGCTAGCCTTAATCTTGTGGTTATCCCACCACATC 3854

116663257 CCCCTTTTCAACAGAAGTCAGTGAGCAGCAAGCCTCATTGAATGTTGGATATTAGCAAGC 116663316
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3855 CCCCTTTTCAACAGAAGTCAGTGAGTAGCAAGCCTCATTGAATGTTGGATATTAGCAAGC 3914

116663317 ACATGTAGTTTTGCTTCAAGTACTCTTTATTTTCTTCCAATCCTCAGGGCCTTTCTCAAC 116663376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3915 ACATGTAGTTTTGCTTCAAGTACTCTTTATTTTCTTCCAATCCTCAGGGCCTTTCTCAAC 3974

116663377 ATATGGTTTATTATAGCGTTGTGAATGATTGGTCTTTCATAAGGACATTTTCCTTGGCAG 116663436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3975 ATATGGTTTATTATAGCGTTGTGAATGATTGGTCTTTCATAAGGACATTTTCCTTGGCAG 4034

116663437 AAGGCTATTTGAAGTTCATTGCTTTTACAAGGTAAGATTTCTGGAAGTTCTAAGCTATAT 116663496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4035 AAGGCTATTTGAAGTTCATTGCTTTTACAAGGTAAGATTTCTGGAAGTTCTAAGCTATAT 4094

116663497 AAATAGGTTTGGAGGAACTTTCTCTTAAACCACAGAAACTATTAATACTCTTGAGCAGGT 116663556
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4095 AAATAGGTTTGGAGGAACATTCTCTTAAACCACAGAAACTATTAATACTCTTGAGCAGGT 4154

116663557 GAGCTTATCAGATTCCTTAGTAGTCAACCAAAATGCTGAAGGATTTTTCTTTTTTTTTTT 116663616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4155 GAGCTTATCAGATTCCTTAGTAGTCAACCAAAATGCTGAAGGATTTTTCTTTTTTTTTTT 4214

116663617 TTTTTTTTTTTTTTTT 116663632
          ||||||||||||||||
     4215 TTTTTTTTTTTTTTTT 4230

Alignment time is 4.96722 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [116652076,116672656] =>     20581 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [        1,     2369] =>      2369 nucs 'mol-32-2f28-009544_2369'

Score:        2369
Aligned:      2369        nucs
Identic:      2369 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [116660030,116662398]
 second seq =>  [        1,     2369]

116660030 TTCCTTCCTTCCCTCTTTCCCTTTCCCTTTCTTTTCTTTTATTTTTTCTTCTCTCTTCTC 116660089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTCCTTCCTTCCCTCTTTCCCTTTCCCTTTCTTTTCTTTTATTTTTTCTTCTCTCTTCTC 60

116660090 TTCTCTTTTTCTGGGTTGCACTCTGTTACCCAAGCTTGAATGCAATGGCAGGGATCACAG 116660149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTCTCTTTTTCTGGGTTGCACTCTGTTACCCAAGCTTGAATGCAATGGCAGGGATCACAG 120

116660150 CTTACTGCAGTGTCAACCTCCTGGGCTCAGGTGATCATCCTCCTTCAGCCTCCTGTGTAG 116660209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTTACTGCAGTGTCAACCTCCTGGGCTCAGGTGATCATCCTCCTTCAGCCTCCTGTGTAG 180

116660210 CTAGGACTGCAGGCATGTACCACCACACATGGCTAATTTTAGTATTTTTTGTAGAAATGA 116660269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTAGGACTGCAGGCATGTACCACCACACATGGCTAATTTTAGTATTTTTTGTAGAAATGA 240

116660270 GAGTCTCACTGTGTTGTCCAGGTTTGTCTCAAACTCCCAGGTTCAAGCAATCCACCTGCC 116660329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GAGTCTCACTGTGTTGTCCAGGTTTGTCTCAAACTCCCAGGTTCAAGCAATCCACCTGCC 300

116660330 TCAGCCTCTCAAACTGCTGGGATTATAGGCATGTGCCACCATGCTGGGCCTCAAATTGAC 116660389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCAGCCTCTCAAACTGCTGGGATTATAGGCATGTGCCACCATGCTGGGCCTCAAATTGAC 360

116660390 ATTTTCTTAAAAATTGGACTGCCAAACAAGGACATTAGCCCTAGTAGGCAGAAGATACTA 116660449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATTTTCTTAAAAATTGGACTGCCAAACAAGGACATTAGCCCTAGTAGGCAGAAGATACTA 420

116660450 TCTTGGTCTGTGTTAGAGGCAATTGTTGAAATTTCTCTGAATCTCTATGGGATAGGCATA 116660509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCTTGGTCTGTGTTAGAGGCAATTGTTGAAATTTCTCTGAATCTCTATGGGATAGGCATA 480

116660510 AATGTACTGATAAATTTGAGCAGTCCTGGGAATCCATAATCTCAATTTATTTGACCAATA 116660569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AATGTACTGATAAATTTGAGCAGTCCTGGGAATCCATAATCTCAATTTATTTGACCAATA 540

116660570 TCAATTAATACCATGTTGAGAGGTCCTTCTATTTCTGAAGTCTGGTTCAGCAAAAAATAA 116660629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCAATTAATACCATGTTGAGAGGTCCTTCTATTTCTGAAGTCTGGTTCAGCAAAAAATAA 600

116660630 AAAAAAAAATAAAATACCTGAAATAATGTAGCTATTCCTGAGGTATCATTAACAGAATAG 116660689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAAAAAAAATAAAATACCTGAAATAATGTAGCTATTCCTGAGGTATCATTAACAGAATAG 660

116660690 AAACTTAAAAAGCGCATGATATGGAAAAATCTTTGCTGATGGTTATACATGTTAAGTTTC 116660749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAACTTAAAAAGCGCATGATATGGAAAAATCTTTGCTGATGGTTATACATGTTAAGTTTC 720

116660750 CAGATAACTATTAATTAGACTTGCAGACATAAAAGGCTGTACCAAGTGGATATTTTAGAG 116660809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CAGATAACTATTAATTAGACTTGCAGACATAAAAGGCTGTACCAAGTGGATATTTTAGAG 780

116660810 ATAAATTTTTAGCACTTACAGACAATATTATGAAGTAGCTATGTGGGCATAGAGAAATTC 116660869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATAAATTTTTAGCACTTACAGACAATATTATGAAGTAGCTATGTGGGCATAGAGAAATTC 840

116660870 GGGAAATTAGCAGGCTGGTTCTGCTATAATAGATCTCAGTTCACCCTTAGGATATCTTCA 116660929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GGGAAATTAGCAGGCTGGTTCTGCTATAATAGATCTCAGTTCACCCTTAGGATATCTTCA 900

116660930 CTAAAGGAGCTTAACATAGCCCAGATGGTAGATTTGATTGCCCTCATTAGAGCTGGTCAC 116660989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTAAAGGAGCTTAACATAGCCCAGATGGTAGATTTGATTGCCCTCATTAGAGCTGGTCAC 960

116660990 TTGGCCAAAGACAAAAAAAATTATATTTACACAGAAAATAGCTCAAGTACCTGAACCTCA 116661049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTGGCCAAAGACAAAAAAAATTATATTTACACAGAAAATAGCTCAAGTACCTGAACCTCA 1020

116661050 GTATGACTATATATGGGGATAGAGTCTTTAAGGAAGTGATTAAGGTTAAATAAAGTCATA 116661109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GTATGACTATATATGGGGATAGAGTCTTTAAGGAAGTGATTAAGGTTAAATAAAGTCATA 1080

116661110 ATGATGGGGCCCTAATCTGATAAGATTAGCGTCCTTCTAAGAGGAGGAATCAACATCAGG 116661169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATGATGGGGCCCTAATCTGATAAGATTAGCGTCCTTCTAAGAGGAGGAATCAACATCAGG 1140

116661170 GATTTTTTTTTCTCTCAACCCATGCCCAGAGGAAAGTCATATGAGGACGTAACACAAAGA 116661229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GATTTTTTTTTCTCTCAACCCATGCCCAGAGGAAAGTCATATGAGGACGTAACACAAAGA 1200

116661230 GAGACATCTACAAATCACAGAGGTTGCACCAGAAATCAACCCTGCTAGCATATCGATCTT 116661289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GAGACATCTACAAATCACAGAGGTTGCACCAGAAATCAACCCTGCTAGCATATCGATCTT 1260

116661290 GAACTTCTAGTCCCCAGAACTGTGAGGAAATAAATTTTTGTTGCTTATGCCACCAGATCT 116661349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GAACTTCTAGTCCCCAGAACTGTGAGGAAATAAATTTTTGTTGCTTATGCCACCAGATCT 1320

116661350 GTGACATTTTGTTATGGAAGTCTGAGCTGACCAATACACTTGAATAACTATCAGTGTCAA 116661409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GTGACATTTTGTTATGGAAGTCTGAGCTGACCAATACACTTGAATAACTATCAGTGTCAA 1380

116661410 TGTAAAACAAGCCATCTTTAGACTTAAGGAAACAGTCACCTGGCTCTCTAAGGCAGATGC 116661469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TGTAAAACAAGCCATCTTTAGACTTAAGGAAACAGTCACCTGGCTCTCTAAGGCAGATGC 1440

116661470 AAATGGATTTTTCTTTGCCCGGGTTTAGTAATTCAGATTATGGCACTAAGTGTTTTGGGA 116661529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AAATGGATTTTTCTTTGCCCGGGTTTAGTAATTCAGATTATGGCACTAAGTGTTTTGGGA 1500

116661530 AGGCTCCATGTCATTTTGATATAGTCACTGTGTGTTGCCATTCTTATGCATGTATTCTCC 116661589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AGGCTCCATGTCATTTTGATATAGTCACTGTGTGTTGCCATTCTTATGCATGTATTCTCC 1560

116661590 ACAGTCTCAGTCCTGCTCTGCAGCTGCTCTCGTGTCAAATGATCCATCACTCAACGGAAA 116661649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ACAGTCTCAGTCCTGCTCTGCAGCTGCTCTCGTGTCAAATGATCCATCACTCAACGGAAA 1620

116661650 TGAACTCATCACTCCATAAAAGGAATAGGAAGATCAGTCCATGATCCAATCCCAAACTAT 116661709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TGAACTCATCACTCCATAAAAGGAATAGGAAGATCAGTCCATGATCCAATCCCAAACTAT 1680

116661710 TTTTTCTGAGGATGATAATGTTATCTAGAAATCACAACAGTGGTATACATCTGAACATGG 116661769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTTTTCTGAGGATGATAATGTTATCTAGAAATCACAACAGTGGTATACATCTGAACATGG 1740

116661770 CTGCTTTAGTAGCTGAACGACTCTTCTCATCTTCTCATCAGTTAGGAAAGACTGAGAACT 116661829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CTGCTTTAGTAGCTGAACGACTCTTCTCATCTTCTCATCAGTTAGGAAAGACTGAGAACT 1800

116661830 GGTAGCATAAATCCATCAATTATGGGATTGCAATTGCAGAATGTTTTGTGACTCACATAA 116661889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GGTAGCATAAATCCATCAATTATGGGATTGCAATTGCAGAATGTTTTGTGACTCACATAA 1860

116661890 TGTTTTCTTCTTTACTCAGAACTTCTCTATTTCACAGATTCTCACCTTAATAATTGAAGC 116661949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TGTTTTCTTCTTTACTCAGAACTTCTCTATTTCACAGATTCTCACCTTAATAATTGAAGC 1920

116661950 AACTCAGGGTCACATCCTAGTTCTATAATTCTGCCTGAGGCACTCTGAGCCCAAACCATC 116662009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AACTCAGGGTCACATCCTAGTTCTATAATTCTGCCTGAGGCACTCTGAGCCCAAACCATC 1980

116662010 AACAGGAAACAAACAAATAAAAAACCTGCTAATTTACTCTCCAATGAAACCTTTCCAGAA 116662069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AACAGGAAACAAACAAATAAAAAACCTGCTAATTTACTCTCCAATGAAACCTTTCCAGAA 2040

116662070 TTATCTGTGTAGAGTTTCCTATTGCTGCAATAATTAATAAACTCAGTTTGCTTATATTGC 116662129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TTATCTGTGTAGAGTTTCCTATTGCTGCAATAATTAATAAACTCAGTTTGCTTATATTGC 2100

116662130 AAATTTTAAAACTCGTAGTGGGAGATTTCCAGTTGCAAACAACAAGTCTTGGCTTTAATT 116662189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AAATTTTAAAACTCGTAGTGGGAGATTTCCAGTTGCAAACAACAAGTCTTGGCTTTAATT 2160

116662190 ATGAGTTCAACCAGTTTTTTTTCTCCTAATGTTTTAAATCTCAGTTCATCATAATGTCTG 116662249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ATGAGTTCAACCAGTTTTTTTTCTCCTAATGTTTTAAATCTCAGTTCATCATAATGTCTG 2220

116662250 AGCTTGTCTGATTTTGGCATAGGGAATATAATTAGAAGTAGTGAATGAAGGCCTAGCTGT 116662309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AGCTTGTCTGATTTTGGCATAGGGAATATAATTAGAAGTAGTGAATGAAGGCCTAGCTGT 2280

116662310 TGCTTTGATGTCAGCAGACACCCATTTCTCTTTCCAAACTGCTTTTAAAAAGTCAAACAA 116662369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TGCTTTGATGTCAGCAGACACCCATTTCTCTTTCCAAACTGCTTTTAAAAAGTCAAACAA 2340

116662370 CTTCCTTCTCTTCTTGCCTCACTCTCTAC 116662398
          |||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CTTCCTTCTCTTCTTGCCTCACTCTCTAC 2369

Alignment time is 2.54053 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [116652076,116672656] =>     20581 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [        1,     2743] =>      2743 nucs 'mol-32-2fb7-113564_2743'

Score:        2722
Aligned:      2733        nucs
Identic:      2732 (100%) nucs =>      1668 (100%)      1064 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [116661937,116663605] EXCISED REGION [116663606,116664669]
 second seq =>  [        1,     1669] EXCISED REGION [     1680,     2743]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        10 nucs [1670,1679]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        27 nucs [1670,1696] to [1680,1706]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         5 nucs [1670,1674] to [1675,1679]

116661937 TAATAATTGAAGCAACTCAGGGTCACATCCTAGTTCTATAATTCTGCCTGAGGCACTCTG 116661996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TAATAATTGAAGCAACTCAGGGTCACATCCTAGTTCTATAATTCTGCCTGAGGCACTCTG 60

116661997 AGCCCAAACCATCAACAGGAAACAAACAAATAAAAAACCTGCTAATTTACTCTCCAATGA 116662056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGCCCAAACCATCAACAGGAAACAAACAAATAAAAAACCTGCTAATTTACTCTCCAATGA 120

116662057 AACCTTTCCAGAATTATCTGTGTAGAGTTTCCTATTGCTGCAATAATTAATAAACTCAGT 116662116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AACCTTTCCAGAATTATCTGTGTAGAGTTTCCTATTGCTGCAATAATTAATAAACTCAGT 180

116662117 TTGCTTATATTGCAAATTTTAAAACTCGTAGTGGGAGATTTCCAGTTGCAAACAACAAGT 116662176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTGCTTATATTGCAAATTTTAAAACTCGTAGTGGGAGATTTCCAGTTGCAAACAACAAGT 240

116662177 CTTGGCTTTAATTATGAGTTCAACCAGTTTTTTTTCTCCTAATGTTTTAAATCTCAGTTC 116662236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTTGGCTTTAATTATGAGTTCAACCAGTTTTTTTTCTCCTAATGTTTTAAATCTCAGTTC 300

116662237 ATCATAATGTCTGAGCTTGTCTGATTTTGGCATAGGGAATATAATTAGAAGTAGTGAATG 116662296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATCATAATGTCTGAGCTTGTCTGATTTTGGCATAGGGAATATAATTAGAAGTAGTGAATG 360

116662297 AAGGCCTAGCTGTTGCTTTGATGTCAGCAGACACCCATTTCTCTTTCCAAACTGCTTTTA 116662356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAGGCCTAGCTGTTGCTTTGATGTCAGCAGACACCCATTTCTCTTTCCAAACTGCTTTTA 420

116662357 AAAAGTCAAACAACTTCCTTCTCTTCTTGCCTCACTCTCTACTTAATGTGATTTTCTTTT 116662416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAAAGTCAAACAACTTCCTTCTCTTCTTGCCTCACTCTCTACTTAATGTGATTTTCTTTT 480

116662417 AATTTATGAAGGAAATAAAATCATTGCTTTTTAAGAATCATCCAACCAAGTCATTAAAGA 116662476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AATTTATGAAGGAAATAAAATCATTGCTTTTTAAGAATCATCCAACCAAGTCATTAAAGA 540

116662477 TATCTGGAATTCAAGATGTAGTCAAAATATTTCAAGGGCATTACAATATCCTCTGTCTTC 116662536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TATCTGGAATTCAAGATGTAGTCAAAATATTTCAAGGGCATTACAATATCCTCTGTCTTC 600

116662537 TCTAATCTCTCAGGCAGTAAAACGGTACCAAGTGCAGAGATAGAAACACTGCTGTCAAAG 116662596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCTAATCTCTCAGGCAGTAAAACGGTACCAAGTGCAGAGATAGAAACACTGCTGTCAAAG 660

116662597 TGGGTTAAAATCTTGACAGTATCGTGGCTTCTGATTTTAATTTCTCAATTAACTTATACA 116662656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGGGTTAAAATCTTGACAGTATCGTGGCTTCTGATTTTAATTTCTCAATTAACTTATACA 720

116662657 AATGAATAACTACCGTTATAGAAATAGCTTCTGGATTTCTTTGTCCTTTTTTTCCTGAAG 116662716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AATGAATAACTACCGTTATAGAAATAGCTTCTGGATTTCTTTGTCCTTTTTTTCCTGAAG 780

116662717 TTAGGCTATATTTGGTATCTCTATAGAGATAGGCTATATTTGGTAAATCTGTTCTCACCT 116662776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTAGGCTATATTTGGTATCTCTATAGAGATAGGCTATATTTGGTAAATCTGTTCTCACCT 840

116662777 CACATAAAAGGTTAATATTCTACAAGTGGATAGATGTGGTGAGGACAACTAAAAGGAGAT 116662836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CACATAAAAGGTTAATATTCTACAAGTGGATAGATGTGGTGAGGACAACTAAAAGGAGAT 900

116662837 TGAATGATCTCATCAAATTATATTACACAACCTTTCAAAGAAAGCTCAGTTGGATTAAGA 116662896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGAATGATCTCATCAAATTATATTACACAACCTTTCAAAGAAAGCTCAGTTGGATTAAGA 960

116662897 GGTTTCTTTATGTTCATGCCCAAAATGCCAAATTCCAACAGCCCACAAAATTTCTTTGAA 116662956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GGTTTCTTTATGTTCATGCCCAAAATGCCAAATTCCAACAGCCCACAAAATTTCTTTGAA 1020

116662957 GTATTTTTCTCATACGTTTGTTTGATGAACAGCTTAAAGCTCCATTTCCATCCTAGCAAG 116663016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GTATTTTTCTCATACGTTTGTTTGATGAACAGCTTAAAGCTCCATTTCCATCCTAGCAAG 1080

116663017 TGGCAGACAAAAAGCCAGATAGTAAATCATATTTTAATAAAAATGATTTTAATAAGTGAA 116663076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGGCAGACAAAAAGCCAGATAGTAAATCATATTTTAATAAAAATGATTTTAATAAGTGAA 1140

116663077 AGATATGATCCATTAAGTTAATCTTGTTAAGTAGAAGACCAAAATGAGAACTTAATGGGG 116663136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGATATGATCCATTAAGTTAATCTTGTTAAGTAGAAGACCAAAATGAGAACTTAATGGGG 1200

116663137 TGCAAACATCACGGAGAATCAAAACACACACTAGAAACCATACTTGAGAACCAGAGATGA 116663196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TGCAAACATCACGGAGAATCAAAACACACACTAGAAACCATACTTGAGAACCAGAGATGA 1260

116663197 GTGAATGTTTGGTCATCAATATCCATGCTAGCCTTAATCTTGTGGTTATCCCACCACATC 116663256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GTGAATGTTTGGTCATCAATATCCATGCTAGCCTTAATCTTGTGGTTATCCCACCACATC 1320

116663257 CCCCTTTTCAACAGAAGTCAGTGAGCAGCAAGCCTCATTGAATGTTGGATATTAGCAAGC 116663316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CCCCTTTTCAACAGAAGTCAGTGAGCAGCAAGCCTCATTGAATGTTGGATATTAGCAAGC 1380

116663317 ACATGTAGTTTTGCTTCAAGTACTCTTTATTTTCTTCCAATCCTCAGGGCCTTTCTCAAC 116663376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ACATGTAGTTTTGCTTCAAGTACTCTTTATTTTCTTCCAATCCTCAGGGCCTTTCTCAAC 1440

116663377 ATATGGTTTATTATAGCGTTGTGAATGATTGGTCTTTCATAAGGACATTTTCCTTGGCAG 116663436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATATGGTTTATTATAGCGTTGTGAATGATTGGTCTTTCATAAGGACATTTTCCTTGGCAG 1500

116663437 AAGGCTATTTGAAGTTCATTGCTTTTACAAGGTAAGATTTCTGGAAGTTCTAAGCTATAT 116663496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AAGGCTATTTGAAGTTCATTGCTTTTACAAGGTAAGATTTCTGGAAGTTCTAAGCTATAT 1560

116663497 AAATAGGTTTGGAGGAACTTTCTCTTAAACCACAGAAACTATTAATACTCTTGAGCAGGT 116663556
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AAATAGGTTTGGAGGAACATTCTCTTAAACCACAGAAACTATTAATACTCTTGAGCAGGT 1620

116663557 GAGCTTATCAGATTCCTTAGTAGTCAACCAAAATGCTGAAGGATTTTTC 116663605
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GAGCTTATCAGATTCCTTAGTAGTCAACCAAAATGCTGAAGGATTTTTC 1669

EXCISED REGION

116663606 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGATGGAGTCTCACTCTGTCACCAGGCTG 116663665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGATGGAGTCTCACTCTGTCACCAGGCTG 1739

116663666 GAGTGCAGTGGTGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCCAGCAATTCT 116663725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 GAGTGCAGTGGTGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCCAGCAATTCT 1799

116663726 TCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGGGCATGCCCACCAGGCCCAGCTAAG 116663785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 TCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGGGCATGCCCACCAGGCCCAGCTAAG 1859

116663786 TTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCAAGTTGGCCAGAATGGTCTCGATCTCTT 116663845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 TTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCAAGTTGGCCAGAATGGTCTCGATCTCTT 1919

116663846 GACTTCATGAGCCGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAGCCACC 116663905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 GACTTCATGAGCCGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAGCCACC 1979

116663906 GTGTCCGGCCAAGAATTTTTCTAATGAGGTATGTGCAAAGCAGAAACATTTTATGTTAAG 116663965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 GTGTCCGGCCAAGAATTTTTCTAATGAGGTATGTGCAAAGCAGAAACATTTTATGTTAAG 2039

116663966 TACAGGCATGGCCACAAAAATATCACTTAAGAAGAGAAGAATTTTGGGGTTCTCAGTGTA 116664025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 TACAGGCATGGCCACAAAAATATCACTTAAGAAGAGAAGAATTTTGGGGTTCTCAGTGTA 2099

116664026 ACATGGAGATGAACAATATCTCACTCTTTTGAGGATAACAATAGATTTCTCTCTTCTGCT 116664085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 ACATGGAGATGAACAATATCTCACTCTTTTGAGGATAACAATAGATTTCTCTCTTCTGCT 2159

116664086 TTTGCAATGATTAAAATTTTGGAAATTTATATGAGAAAAGTAAAGATATTTTAAAAAGTT 116664145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 TTTGCAATGATTAAAATTTTGGAAATTTATATGAGAAAAGTAAAGATATTTTAAAAAGTT 2219

116664146 TTCTTGTTTTTTTTAACTCTTTATTCTCTTAAATCTTGACACTGTTCGTTGTAAGTTTGT 116664205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 TTCTTGTTTTTTTTAACTCTTTATTCTCTTAAATCTTGACACTGTTCGTTGTAAGTTTGT 2279

116664206 GCTAGATACAGCCACTGTTTGGTTGAGAAAATTTCTCTATGTCTGTGACATCCATGAGAT 116664265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 GCTAGATACAGCCACTGTTTGGTTGAGAAAATTTCTCTATGTCTGTGACATCCATGAGAT 2339

116664266 AGAAACCGATGGCTACATATGGCTATTTAAATTAAATTAATTAAACTTACATAAAATAAA 116664325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 AGAAACCGATGGCTACATATGGCTATTTAAATTAAATTAATTAAACTTACATAAAATAAA 2399

116664326 AACTTGGTTCCATAGTTGCACTAGACACATTTTAGGGCTCAATAGCCATAGTATAAACAG 116664385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 AACTTGGTTCCATAGTTGCACTAGACACATTTTAGGGCTCAATAGCCATAGTATAAACAG 2459

116664386 CATAGTATAGAACTTTCTATCAGAGAAAGTTTGTCAGGGAGCTGTGCTAAAGGTGGTTTT 116664445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 CATAGTATAGAACTTTCTATCAGAGAAAGTTTGTCAGGGAGCTGTGCTAAAGGTGGTTTT 2519

116664446 CAAAATATAGCTGTAGCCTGAGAATATTTCTATACTATTTTAATCAATTTTAACTAATTA 116664505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 CAAAATATAGCTGTAGCCTGAGAATATTTCTATACTATTTTAATCAATTTTAACTAATTA 2579

116664506 ATTAACTACATTATACTTTGTTAACATAAAGTCAAAGGCATCTACTTCTGCAATTGGGAG 116664565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 ATTAACTACATTATACTTTGTTAACATAAAGTCAAAGGCATCTACTTCTGCAATTGGGAG 2639

116664566 GTAATAACTTGCAATATAAAAATAGATGAGGCAGGTTGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCC 116664625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 GTAATAACTTGCAATATAAAAATAGATGAGGCAGGTTGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCC 2699

116664626 CAGCACTTTGGGAGGCCGAAGTAGGTGGATCACCTGAGGTCAGG 116664669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 CAGCACTTTGGGAGGCCGAAGTAGGTGGATCACCTGAGGTCAGG 2743

Alignment time is 3.61574 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [116652076,116672656] =>     20581 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [        1,     2409] =>      2409 nucs 'mol-32-3004-254549_2409'

Score:        2365
Aligned:      2411        nucs
Identic:      2406 (100%) nucs =>       317 (100%)      2089 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [116661760,116662076] EXCISED REGION [116662657,116664750]
 second seq =>  [        1,      317] EXCISED REGION [      319,     2409]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       580 nucs [116662077,116662656]
 second seq =>         1 nucs [318,318]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [317,317] to [318,318]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

116661760 CTGAACATGGCTGCTTTAGTAGCTGAACGACTCTTCTCATCTTCTCATCAGTTAGGAAAG 116661819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTGAACATGGCTGCTTTAGTAGCTGAACGACTCTTCTCATCTTCTCATCAGTTAGGAAAG 60

116661820 ACTGAGAACTGGTAGCATAAATCCATCAATTATGGGATTGCAATTGCAGAATGTTTTGTG 116661879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACTGAGAACTGGTAGCATAAATCCATCAATTATGGGATTGCAATTGCAGAATGTTTTGTG 120

116661880 ACTCACATAATGTTTTCTTCTTTACTCAGAACTTCTCTATTTCACAGATTCTCACCTTAA 116661939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACTCACATAATGTTTTCTTCTTTACTCAGAACTTCTCTATTTCACAGATTCTCACCTTAA 180

116661940 TAATTGAAGCAACTCAGGGTCACATCCTAGTTCTATAATTCTGCCTGAGGCACTCTGAGC 116661999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TAATTGAAGCAACTCAGGGTCACATCCTAGTTCTATAATTCTGCCTGAGGCACTCTGAGC 240

116662000 CCAAACCATCAACAGGAAACAAACAAATAAAAAACCTGCTAATTTACTCTCCAATGAAAC 116662059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCAAACCATCAACAGGAAACAAACAAATAAAAAACCTGCTAATTTACTCTCCAATGAAAC 300

116662060 CTTTCCAGAATTATCTG 116662076
          |||||||||||||||||
      301 CTTTCCAGAATTATCTG 317

EXCISED REGION

116662657 AATGAATAACTACCGTTATAGAAATAGCTTCTGGATTTCTTTGTCCTTTTTTTCCTGAAG 116662716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      319 AATGAATAACTACCGTTATAGAAATAGCTTCTGGATTTCTTTGTCCTTTTTTTCCTGAAG 378

116662717 TTAGGCTATATTTGGTATCTCTATAGAGATAGGCTATATTTGGTAAATCTGTTCTCACCT 116662776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      379 TTAGGCTATATTTGGTATCTCTATAGAGATAGGCTATATTTGGTAAATCTGTTCTCACCT 438

116662777 CACATAAAAGGTTAATATTCTACAAGTGGATAGATGTGGTGAGGACAACTAAAAGGAGAT 116662836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      439 CACATAAAAGGTTAATATTCTACAAGTGGATAGATGTGGTGAGGACAACTAAAAGGAGAT 498

116662837 TGAATGATCTCATCAAATTATATTACACAACCTTTCAAAGAAAGCTCAGTTGGATTAAGA 116662896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      499 TGAATGATCTCATCAAATTATATTACACAACCTTTCAAAGAAAGCTCAGTTGGATTAAGA 558

116662897 GGTTTCTTTATGTTCATGCCCAAAATGCCAAATTCCAACAGCCCACAAAATTTCTTTGAA 116662956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      559 GGTTTCTTTATGTTCATGCCCAAAATGCCAAATTCCAACAGCCCACAAAATTTCTTTGAA 618

116662957 GTATTTTTCTCATACGTTTGTTTGATGAACAGCTTAAAGCTCCATTTCCATCCTAGCAAG 116663016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      619 GTATTTTTCTCATACGTTTGTTTGATGAACAGCTTAAAGCTCCATTTCCATCCTAGCAAG 678

116663017 TGGCAGACAAAAAGCCAGATAGTAAATCATATTTTAATAAAAATGATTTTAATAAGTGAA 116663076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      679 TGGCAGACAAAAAGCCAGATAGTAAATCATATTTTAATAAAAATGATTTTAATAAGTGAA 738

116663077 AGATATGATCCATTAAGTTAATCTTGTTAAGTAGAAGACCAAAATGAGAACTTAATGGGG 116663136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      739 AGATATGATCCATTAAGTTAATCTTGTTAAGTAGAAGACCAAAATGAGAACTTAATGGGG 798

116663137 TGCAAACATCACGGAGAATCAAAACACACACTAGAAACCATACTTGAGAACCAGAGATGA 116663196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      799 TGCAAACATCACGGAGAATCAAAACACACACTAGAAACCATACTTGAGAACCAGAGATGA 858

116663197 GTGAATGTTTGGTCATCAATATCCATGCTAGCCTTAATCTTGTGGTTATCCCACCACATC 116663256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      859 GTGAATGTTTGGTCATCAATATCCATGCTAGCCTTAATCTTGTGGTTATCCCACCACATC 918

116663257 CCCCTTTTCAACAGAAGTCAGTGAGCAGCAAGCCTCATTGAATGTTGGATATTAGCAAGC 116663316
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
      919 CCCCTTTTCAACAGAAGTCAGTGAGTAGCAAGCCTCATTGAATGTTGGATATTAGCAAGC 978

116663317 ACATGTAGTTTTGCTTCAAGTACTCTTTATTTTCTTCCAATCCTCAGGGCCTTTCTCAAC 116663376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      979 ACATGTAGTTTTGCTTCAAGTACTCTTTATTTTCTTCCAATCCTCAGGGCCTTTCTCAAC 1038

116663377 ATATGGTTTATTATAGCGTTGTGAATGATTGGTCTTTCATAAGGACATTTTCCTTGGCAG 116663436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1039 ATATGGTTTATTATAGCGTTGTGAATGATTGGTCTTTCATAAGGACATTTTCCTTGGCAG 1098

116663437 AAGGCTATTTGAAGTTCATTGCTTTTACAAGGTAAGATTTCTGGAAGTTCTAAGCTATAT 116663496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1099 AAGGCTATTTGAAGTTCATTGCTTTTACAAGGTAAGATTTCTGGAAGTTCTAAGCTATAT 1158

116663497 AAATAGGTTTGGAGGAACTTTCTCTTAAACCACAGAAACTATTAATACTCTTGAGCAGGT 116663556
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1159 AAATAGGTTTGGAGGAACATTCTCTTAAACCACAGAAACTATTAATACTCTTGAGCAGGT 1218

116663557 GAGCTTATCAGATTCCTTAGTAGTCAACCAAAATGCTGAAGGATTTTTCTTTTTTTTTTT 116663616
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||
     1219 GAGCTTATCAGATTCCTTAGTAGTCAACCAAAATGCTGAAGGATTTT--TTTTTTTTTTT 1276

116663617 TTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGATGGAGTCTCACTCTGTCACCAGGCTGGAGTGCAGTGG 116663676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1277 TTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGATGGAGTCTCACTCTGTCACCAGGCTGGAGTGCAGTGG 1336

116663677 TGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCCAGCAATTCTTCTGCCTCAGC 116663736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1337 TGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCCAGCAATTCTTCTGCCTCAGC 1396

116663737 CTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGGGCATGCCCACCAGGCCCAGCTAAGTTTTGTATTTT 116663796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1397 CTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGGGCATGCCCACCAGGCCCAGCTAAGTTTTGTATTTT 1456

116663797 TAGTAGAGATGGGGTTTCACCAAGTTGGCCAGAATGGTCTCGATCTCTTGACTTCATGAG 116663856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1457 TAGTAGAGATGGGGTTTCACCAAGTTGGCCAGAATGGTCTCGATCTCTTGACTTCATGAG 1516

116663857 CCGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAGCCACCGTGTCCGGCCA 116663916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1517 CCGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAGCCACCGTGTCCGGCCA 1576

116663917 AGAATTTTTCTAATGAGGTATGTGCAAAGCAGAAACATTTTATGTTAAGTACAGGCATGG 116663976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1577 AGAATTTTTCTAATGAGGTATGTGCAAAGCAGAAACATTTTATGTTAAGTACAGGCATGG 1636

116663977 CCACAAAAATATCACTTAAGAAGAGAAGAATTTTGGGGTTCTCAGTGTAACATGGAGATG 116664036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1637 CCACAAAAATATCACTTAAGAAGAGAAGAATTTTGGGGTTCTCAGTGTAACATGGAGATG 1696

116664037 AACAATATCTCACTCTTTTGAGGATAACAATAGATTTCTCTCTTCTGCTTTTGCAATGAT 116664096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1697 AACAATATCTCACTCTTTTGAGGATAACAATAGATTTCTCTCTTCTGCTTTTGCAATGAT 1756

116664097 TAAAATTTTGGAAATTTATATGAGAAAAGTAAAGATATTTTAAAAAGTTTTCTTGTTTTT 116664156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1757 TAAAATTTTGGAAATTTATATGAGAAAAGTAAAGATATTTTAAAAAGTTTTCTTGTTTTT 1816

116664157 TTTAACTCTTTATTCTCTTAAATCTTGACACTGTTCGTTGTAAGTTTGTGCTAGATACAG 116664216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1817 TTTAACTCTTTATTCTCTTAAATCTTGACACTGTTCGTTGTAAGTTTGTGCTAGATACAG 1876

116664217 CCACTGTTTGGTTGAGAAAATTTCTCTATGTCTGTGACATCCATGAGATAGAAACCGATG 116664276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1877 CCACTGTTTGGTTGAGAAAATTTCTCTATGTCTGTGACATCCATGAGATAGAAACCGATG 1936

116664277 GCTACATATGGCTATTTAAATTAAATTAATTAAACTTACATAAAATAAAAACTTGGTTCC 116664336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1937 GCTACATATGGCTATTTAAATTAAATTAATTAAACTTACATAAAATAAAAACTTGGTTCC 1996

116664337 ATAGTTGCACTAGACACATTTTAGGGCTCAATAGCCATAGTATAAACAGCATAGTATAGA 116664396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1997 ATAGTTGCACTAGACACATTTTAGGGCTCAATAGCCATAGTATAAACAGCATAGTATAGA 2056

116664397 ACTTTCTATCAGAGAAAGTTTGTCAGGGAGCTGTGCTAAAGGTGGTTTTCAAAATATAGC 116664456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2057 ACTTTCTATCAGAGAAAGTTTGTCAGGGAGCTGTGCTAAAGGTGGTTTTCAAAATATAGC 2116

116664457 TGTAGCCTGAGAATATTTCTATACTATTTTAATCAATTTTAACTAATTAATTAACTACAT 116664516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2117 TGTAGCCTGAGAATATTTCTATACTATTTTAATCAATTTTAACTAATTAATTAACTACAT 2176

116664517 TATACTTTGTTAACATAAAGTCAAAGGCATCTACTTCTGCAATTGGGAGGTAATAACTTG 116664576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2177 TATACTTTGTTAACATAAAGTCAAAGGCATCTACTTCTGCAATTGGGAGGTAATAACTTG 2236

116664577 CAATATAAAAATAGATGAGGCAGGTTGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGG 116664636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2237 CAATATAAAAATAGATGAGGCAGGTTGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGG 2296

116664637 GAGGCCGAAGTAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGG 116664696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2297 GAGGCCGAAGTAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGG 2356

116664697 TGAAACCCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTGGCCCGGCGCAGTGGCTC 116664750
          ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2357 TGAAA-CCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTGGCCCGGCGCAGTGGCTC 2409

Alignment time is 2.97707 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [116652076,116672656] =>     20581 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [        1,     2959] =>      2959 nucs 'mol-32-3030-077192_2959'

Score:        2957
Aligned:      2957        nucs
Identic:      2957 (100%) nucs =>      2233 (100%)       724 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [116660053,116662285] EXCISED REGION [116662287,116663010]
 second seq =>  [        2,     2234] EXCISED REGION [     2236,     2959]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [116662286,116662286]
 second seq =>         1 nucs [2235,2235]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [116662285,116662285] to [116662286,116662286]
 second seq =>         1 nucs [2235,2235] to [2236,2236]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

116660053 TCCCTTTCTTTTCTTTTATTTTTTCTTCTCTCTTCTCTTCTCTTTTTCTGGGTTGCACTC 116660112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        2 TCCCTTTCTTTTCTTTTATTTTTTCTTCTCTCTTCTCTTCTCTTTTTCTGGGTTGCACTC 61

116660113 TGTTACCCAAGCTTGAATGCAATGGCAGGGATCACAGCTTACTGCAGTGTCAACCTCCTG 116660172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       62 TGTTACCCAAGCTTGAATGCAATGGCAGGGATCACAGCTTACTGCAGTGTCAACCTCCTG 121

116660173 GGCTCAGGTGATCATCCTCCTTCAGCCTCCTGTGTAGCTAGGACTGCAGGCATGTACCAC 116660232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      122 GGCTCAGGTGATCATCCTCCTTCAGCCTCCTGTGTAGCTAGGACTGCAGGCATGTACCAC 181

116660233 CACACATGGCTAATTTTAGTATTTTTTGTAGAAATGAGAGTCTCACTGTGTTGTCCAGGT 116660292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      182 CACACATGGCTAATTTTAGTATTTTTTGTAGAAATGAGAGTCTCACTGTGTTGTCCAGGT 241

116660293 TTGTCTCAAACTCCCAGGTTCAAGCAATCCACCTGCCTCAGCCTCTCAAACTGCTGGGAT 116660352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      242 TTGTCTCAAACTCCCAGGTTCAAGCAATCCACCTGCCTCAGCCTCTCAAACTGCTGGGAT 301

116660353 TATAGGCATGTGCCACCATGCTGGGCCTCAAATTGACATTTTCTTAAAAATTGGACTGCC 116660412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      302 TATAGGCATGTGCCACCATGCTGGGCCTCAAATTGACATTTTCTTAAAAATTGGACTGCC 361

116660413 AAACAAGGACATTAGCCCTAGTAGGCAGAAGATACTATCTTGGTCTGTGTTAGAGGCAAT 116660472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      362 AAACAAGGACATTAGCCCTAGTAGGCAGAAGATACTATCTTGGTCTGTGTTAGAGGCAAT 421

116660473 TGTTGAAATTTCTCTGAATCTCTATGGGATAGGCATAAATGTACTGATAAATTTGAGCAG 116660532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      422 TGTTGAAATTTCTCTGAATCTCTATGGGATAGGCATAAATGTACTGATAAATTTGAGCAG 481

116660533 TCCTGGGAATCCATAATCTCAATTTATTTGACCAATATCAATTAATACCATGTTGAGAGG 116660592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      482 TCCTGGGAATCCATAATCTCAATTTATTTGACCAATATCAATTAATACCATGTTGAGAGG 541

116660593 TCCTTCTATTTCTGAAGTCTGGTTCAGCAAAAAATAAAAAAAAAAATAAAATACCTGAAA 116660652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      542 TCCTTCTATTTCTGAAGTCTGGTTCAGCAAAAAATAAAAAAAAAAATAAAATACCTGAAA 601

116660653 TAATGTAGCTATTCCTGAGGTATCATTAACAGAATAGAAACTTAAAAAGCGCATGATATG 116660712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      602 TAATGTAGCTATTCCTGAGGTATCATTAACAGAATAGAAACTTAAAAAGCGCATGATATG 661

116660713 GAAAAATCTTTGCTGATGGTTATACATGTTAAGTTTCCAGATAACTATTAATTAGACTTG 116660772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      662 GAAAAATCTTTGCTGATGGTTATACATGTTAAGTTTCCAGATAACTATTAATTAGACTTG 721

116660773 CAGACATAAAAGGCTGTACCAAGTGGATATTTTAGAGATAAATTTTTAGCACTTACAGAC 116660832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      722 CAGACATAAAAGGCTGTACCAAGTGGATATTTTAGAGATAAATTTTTAGCACTTACAGAC 781

116660833 AATATTATGAAGTAGCTATGTGGGCATAGAGAAATTCGGGAAATTAGCAGGCTGGTTCTG 116660892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      782 AATATTATGAAGTAGCTATGTGGGCATAGAGAAATTCGGGAAATTAGCAGGCTGGTTCTG 841

116660893 CTATAATAGATCTCAGTTCACCCTTAGGATATCTTCACTAAAGGAGCTTAACATAGCCCA 116660952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      842 CTATAATAGATCTCAGTTCACCCTTAGGATATCTTCACTAAAGGAGCTTAACATAGCCCA 901

116660953 GATGGTAGATTTGATTGCCCTCATTAGAGCTGGTCACTTGGCCAAAGACAAAAAAAATTA 116661012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      902 GATGGTAGATTTGATTGCCCTCATTAGAGCTGGTCACTTGGCCAAAGACAAAAAAAATTA 961

116661013 TATTTACACAGAAAATAGCTCAAGTACCTGAACCTCAGTATGACTATATATGGGGATAGA 116661072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      962 TATTTACACAGAAAATAGCTCAAGTACCTGAACCTCAGTATGACTATATATGGGGATAGA 1021

116661073 GTCTTTAAGGAAGTGATTAAGGTTAAATAAAGTCATAATGATGGGGCCCTAATCTGATAA 116661132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1022 GTCTTTAAGGAAGTGATTAAGGTTAAATAAAGTCATAATGATGGGGCCCTAATCTGATAA 1081

116661133 GATTAGCGTCCTTCTAAGAGGAGGAATCAACATCAGGGATTTTTTTTTCTCTCAACCCAT 116661192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1082 GATTAGCGTCCTTCTAAGAGGAGGAATCAACATCAGGGATTTTTTTTTCTCTCAACCCAT 1141

116661193 GCCCAGAGGAAAGTCATATGAGGACGTAACACAAAGAGAGACATCTACAAATCACAGAGG 116661252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1142 GCCCAGAGGAAAGTCATATGAGGACGTAACACAAAGAGAGACATCTACAAATCACAGAGG 1201

116661253 TTGCACCAGAAATCAACCCTGCTAGCATATCGATCTTGAACTTCTAGTCCCCAGAACTGT 116661312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1202 TTGCACCAGAAATCAACCCTGCTAGCATATCGATCTTGAACTTCTAGTCCCCAGAACTGT 1261

116661313 GAGGAAATAAATTTTTGTTGCTTATGCCACCAGATCTGTGACATTTTGTTATGGAAGTCT 116661372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1262 GAGGAAATAAATTTTTGTTGCTTATGCCACCAGATCTGTGACATTTTGTTATGGAAGTCT 1321

116661373 GAGCTGACCAATACACTTGAATAACTATCAGTGTCAATGTAAAACAAGCCATCTTTAGAC 116661432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1322 GAGCTGACCAATACACTTGAATAACTATCAGTGTCAATGTAAAACAAGCCATCTTTAGAC 1381

116661433 TTAAGGAAACAGTCACCTGGCTCTCTAAGGCAGATGCAAATGGATTTTTCTTTGCCCGGG 116661492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1382 TTAAGGAAACAGTCACCTGGCTCTCTAAGGCAGATGCAAATGGATTTTTCTTTGCCCGGG 1441

116661493 TTTAGTAATTCAGATTATGGCACTAAGTGTTTTGGGAAGGCTCCATGTCATTTTGATATA 116661552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1442 TTTAGTAATTCAGATTATGGCACTAAGTGTTTTGGGAAGGCTCCATGTCATTTTGATATA 1501

116661553 GTCACTGTGTGTTGCCATTCTTATGCATGTATTCTCCACAGTCTCAGTCCTGCTCTGCAG 116661612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1502 GTCACTGTGTGTTGCCATTCTTATGCATGTATTCTCCACAGTCTCAGTCCTGCTCTGCAG 1561

116661613 CTGCTCTCGTGTCAAATGATCCATCACTCAACGGAAATGAACTCATCACTCCATAAAAGG 116661672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1562 CTGCTCTCGTGTCAAATGATCCATCACTCAACGGAAATGAACTCATCACTCCATAAAAGG 1621

116661673 AATAGGAAGATCAGTCCATGATCCAATCCCAAACTATTTTTTCTGAGGATGATAATGTTA 116661732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1622 AATAGGAAGATCAGTCCATGATCCAATCCCAAACTATTTTTTCTGAGGATGATAATGTTA 1681

116661733 TCTAGAAATCACAACAGTGGTATACATCTGAACATGGCTGCTTTAGTAGCTGAACGACTC 116661792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1682 TCTAGAAATCACAACAGTGGTATACATCTGAACATGGCTGCTTTAGTAGCTGAACGACTC 1741

116661793 TTCTCATCTTCTCATCAGTTAGGAAAGACTGAGAACTGGTAGCATAAATCCATCAATTAT 116661852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1742 TTCTCATCTTCTCATCAGTTAGGAAAGACTGAGAACTGGTAGCATAAATCCATCAATTAT 1801

116661853 GGGATTGCAATTGCAGAATGTTTTGTGACTCACATAATGTTTTCTTCTTTACTCAGAACT 116661912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1802 GGGATTGCAATTGCAGAATGTTTTGTGACTCACATAATGTTTTCTTCTTTACTCAGAACT 1861

116661913 TCTCTATTTCACAGATTCTCACCTTAATAATTGAAGCAACTCAGGGTCACATCCTAGTTC 116661972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1862 TCTCTATTTCACAGATTCTCACCTTAATAATTGAAGCAACTCAGGGTCACATCCTAGTTC 1921

116661973 TATAATTCTGCCTGAGGCACTCTGAGCCCAAACCATCAACAGGAAACAAACAAATAAAAA 116662032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1922 TATAATTCTGCCTGAGGCACTCTGAGCCCAAACCATCAACAGGAAACAAACAAATAAAAA 1981

116662033 ACCTGCTAATTTACTCTCCAATGAAACCTTTCCAGAATTATCTGTGTAGAGTTTCCTATT 116662092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1982 ACCTGCTAATTTACTCTCCAATGAAACCTTTCCAGAATTATCTGTGTAGAGTTTCCTATT 2041

116662093 GCTGCAATAATTAATAAACTCAGTTTGCTTATATTGCAAATTTTAAAACTCGTAGTGGGA 116662152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2042 GCTGCAATAATTAATAAACTCAGTTTGCTTATATTGCAAATTTTAAAACTCGTAGTGGGA 2101

116662153 GATTTCCAGTTGCAAACAACAAGTCTTGGCTTTAATTATGAGTTCAACCAGTTTTTTTTC 116662212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2102 GATTTCCAGTTGCAAACAACAAGTCTTGGCTTTAATTATGAGTTCAACCAGTTTTTTTTC 2161

116662213 TCCTAATGTTTTAAATCTCAGTTCATCATAATGTCTGAGCTTGTCTGATTTTGGCATAGG 116662272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2162 TCCTAATGTTTTAAATCTCAGTTCATCATAATGTCTGAGCTTGTCTGATTTTGGCATAGG 2221

116662273 GAATATAATTAGA 116662285
          |||||||||||||
     2222 GAATATAATTAGA 2234

EXCISED REGION

116662287 GTAGTGAATGAAGGCCTAGCTGTTGCTTTGATGTCAGCAGACACCCATTTCTCTTTCCAA 116662346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2236 GTAGTGAATGAAGGCCTAGCTGTTGCTTTGATGTCAGCAGACACCCATTTCTCTTTCCAA 2295

116662347 ACTGCTTTTAAAAAGTCAAACAACTTCCTTCTCTTCTTGCCTCACTCTCTACTTAATGTG 116662406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2296 ACTGCTTTTAAAAAGTCAAACAACTTCCTTCTCTTCTTGCCTCACTCTCTACTTAATGTG 2355

116662407 ATTTTCTTTTAATTTATGAAGGAAATAAAATCATTGCTTTTTAAGAATCATCCAACCAAG 116662466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2356 ATTTTCTTTTAATTTATGAAGGAAATAAAATCATTGCTTTTTAAGAATCATCCAACCAAG 2415

116662467 TCATTAAAGATATCTGGAATTCAAGATGTAGTCAAAATATTTCAAGGGCATTACAATATC 116662526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2416 TCATTAAAGATATCTGGAATTCAAGATGTAGTCAAAATATTTCAAGGGCATTACAATATC 2475

116662527 CTCTGTCTTCTCTAATCTCTCAGGCAGTAAAACGGTACCAAGTGCAGAGATAGAAACACT 116662586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2476 CTCTGTCTTCTCTAATCTCTCAGGCAGTAAAACGGTACCAAGTGCAGAGATAGAAACACT 2535

116662587 GCTGTCAAAGTGGGTTAAAATCTTGACAGTATCGTGGCTTCTGATTTTAATTTCTCAATT 116662646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2536 GCTGTCAAAGTGGGTTAAAATCTTGACAGTATCGTGGCTTCTGATTTTAATTTCTCAATT 2595

116662647 AACTTATACAAATGAATAACTACCGTTATAGAAATAGCTTCTGGATTTCTTTGTCCTTTT 116662706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2596 AACTTATACAAATGAATAACTACCGTTATAGAAATAGCTTCTGGATTTCTTTGTCCTTTT 2655

116662707 TTTCCTGAAGTTAGGCTATATTTGGTATCTCTATAGAGATAGGCTATATTTGGTAAATCT 116662766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2656 TTTCCTGAAGTTAGGCTATATTTGGTATCTCTATAGAGATAGGCTATATTTGGTAAATCT 2715

116662767 GTTCTCACCTCACATAAAAGGTTAATATTCTACAAGTGGATAGATGTGGTGAGGACAACT 116662826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2716 GTTCTCACCTCACATAAAAGGTTAATATTCTACAAGTGGATAGATGTGGTGAGGACAACT 2775

116662827 AAAAGGAGATTGAATGATCTCATCAAATTATATTACACAACCTTTCAAAGAAAGCTCAGT 116662886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2776 AAAAGGAGATTGAATGATCTCATCAAATTATATTACACAACCTTTCAAAGAAAGCTCAGT 2835

116662887 TGGATTAAGAGGTTTCTTTATGTTCATGCCCAAAATGCCAAATTCCAACAGCCCACAAAA 116662946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2836 TGGATTAAGAGGTTTCTTTATGTTCATGCCCAAAATGCCAAATTCCAACAGCCCACAAAA 2895

116662947 TTTCTTTGAAGTATTTTTCTCATACGTTTGTTTGATGAACAGCTTAAAGCTCCATTTCCA 116663006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2896 TTTCTTTGAAGTATTTTTCTCATACGTTTGTTTGATGAACAGCTTAAAGCTCCATTTCCA 2955

116663007 TCCT 116663010
          ||||
     2956 TCCT 2959

Alignment time is 3.48476 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [116652076,116672656] =>     20581 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [        1,     4569] =>      4569 nucs 'mol-32-314e-116552_4569'

Score:        4452
Aligned:      4589        nucs
Identic:      4561 ( 99%) nucs =>      4176 ( 99%)       385 (100%)
Gaps:           22 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [116657874,116662076] EXCISED REGION [116662657,116663041]
 second seq =>  [        1,     4183] EXCISED REGION [     4185,     4569]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       580 nucs [116662077,116662656]
 second seq =>         1 nucs [4184,4184]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [4183,4183] to [4184,4184]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

116657874 GAAACAACAGCCACCAGCCTACTCCCATCCTTTCCAAGATATTCTAATTCTCCTCTTCCT 116657933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GAAACAACAGCCACCAGCCTACTCCCATCCTTTCCAAGATATTCTAATTCTCCTCTTCCT 60

116657934 TTTCTCCAAGGCATTTTCCTAAGGATAGCTCCATTTTATCTTTTACATATACTTCTTTTC 116657993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTCTCCAAGGCATTTTCCTAAGGATAGCTCCATTTTATCTTTTACATATACTTCTTTTC 120

116657994 TTTTCCTATATTTTTCCACCTTCTTCTAATTTTCTTTGCTTTTCTATTGATTGTGGGTTA 116658053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
      121 TTTTCCTATATTTTTCCACCTTCTTCTAATTTTCTTTGCTTTTCTATTGATTATGGGTTA 180

116658054 AGTAAGAAAAAAAGGCAAGGGTGGCAGTCAGAGTGCGTGCAGAATTCTTCAAAGCAATGA 116658113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGTAAGAAAAAAAGGCAAGGGTGGCAGTCAGAGTGCGTGCAGAATTCTTCAAAGCAATGA 240

116658114 ATGTTGAGAAAAGCCGTGTATATTTAGAAGTTAATGGTCTCCCCTCTAGATTTCTATGCA 116658173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATGTTGAGAAAAGCCGTGTATATTTAGAAGTTAATGGTCTCCCCTCTAGATTTCTATGCA 300

116658174 GCTTGAATTCCTCAGTGTTTCTGAACTTCTTGTGTTTTTCTCTTATCTTTTAAATAATAC 116658233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GCTTGAATTCCTCAGTGTTTCTGAACTTCTTGTGTTTTTCTCTTATCTTTTAAATAATAC 360

116658234 TCTGCTACTGTTTTTCTCTAGATTACCATTTCAGTGGATTTGAAAAATCTCTTTCCATTA 116658293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCTGCTACTGTTTTTCTCTAGATTACCATTTCAGTGGATTTGAAAAATCTCTTTCCATTA 420

116658294 TTTTTCTTTTCTCCTTACTTCTTTCTTCCCCTTCTCTTATTTTTTCTCTTTCTCTCCAAC 116658353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTTTTCTTTTCTCCTTACTTCTTTCTTCCCCTTCTCTTATTTTTTCTCTTTCTCTCCAAC 480

116658354 TTCATCTCTTTATTAATTTCCTTCTCTCCTTTTAAGTTTTGGTAACTGTTTTTCATTTGG 116658413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTCATCTCTTTATTAATTTCCTTCTCTCCTTTTAAGTTTTGGTAACTGTTTTTCATTTGG 540

116658414 CCAGCTCTCAGTATACCTTATTTGTGTTGGGTACCAAAGCAAACATCCTCACCAGTGATG 116658473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CCAGCTCTCAGTATACCTTATTTGTGTTGGGTACCAAAGCAAACATCCTCACCAGTGATG 600

116658474 CAAGACTGAAGAAGTGTGATCATTAGCTCTGCAATCACAACCACAAAACACCTGTGGCTT 116658533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CAAGACTGAAGAAGTGTGATCATTAGCTCTGCAATCACAACCACAAAACACCTGTGGCTT 660

116658534 GCCTAAAACCTTCTTCTGTTAGACCCTTTCCTTACTTGGAAACAATCTCATCTTAAGAAA 116658593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GCCTAAAACCTTCTTCTGTTAGACCCTTTCCTTACTTGGAAACAATCTCATCTTAAGAAA 720

116658594 TCAAGCAATACTTGAAGAAATTTTGAGGAACCCATAAGCAAGAAAAACTGTATACTCATT 116658653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCAAGCAATACTTGAAGAAATTTTGAGGAACCCATAAGCAAGAAAAACTGTATACTCATT 780

116658654 TCCCTTAACATGATACCATTTCACAGTTACCTGTGTGGTGCTTTTCATTGCTATAGAAAT 116658713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCCCTTAACATGATACCATTTCACAGTTACCTGTGTGGTGCTTTTCATTGCTATAGAAAT 840

116658714 CGAATTAAACTCAGTGTGATTGTAGCATAATGGGATACTTCACTTGAGAAAGGGGATTTT 116658773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CGAATTAAACTCAGTGTGATTGTAGCATAATGGGATACTTCACTTGAGAAAGGGGATTTT 900

116658774 TATAATTTGGAGAAGCATTGAGAGTCAGCAGTGAATATTCATGACACGGGCTAGGACCAT 116658833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
      901 TATAATTTGGAGAAGCATTGAGAGTCAGCAGTGAATATTCATGACACGAGCTAGGACCAT 960

116658834 TTAAACAGACGACTTCTAGGAGAGTCTCTTGAGGACATTTAATCTCTTGTGCTTGACCAT 116658893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTAAACAGACGACTTCTAGGAGAGTCTCTTGAGGACATTTAATCTCTTGTGCTTGACCAT 1020

116658894 CCTGACCCAAGGTGAGTTTGAGTCTCAAATACATTAAAATTCTCAAACCATTAGTTTTAT 116658953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CCTGACCCAAGGTGAGTTTGAGTCTCAAATACATTAAAATTCTCAAACCATTAGTTTTAT 1080

116658954 TTTGTTCCTGTAAACCTAAAGTTTAACTTTCAGAATACTTTTTCTCATTAGAATTATATG 116659013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTTGTTCCTGTAAACCTAAAGTTTAACTTTCAGAATACTTTTTCTCATTAGAATTATATG 1140

116659014 TTTAAAAATTCTTGGTGACATTCCATTCTTCACCTAATCTCACGTTTGTCTTGTTCTGTT 116659073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTTAAAAATTCTTGGTGACATTCCATTCTTCACCTAATCTCACGTTTGTCTTGTTCTGTT 1200

116659074 TTGTCAAAAATGTTTTCCTAAAAATGAAAAAGAAAACCTCTAGAATGATTAATCGAGTGA 116659133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTGTCAAAAATGTTTTCCTAAAAATGAAAAAGAAAACCTCTAGAATGATTAATCGAGTGA 1260

116659134 GATTCTCAATAAATCTGCAACTAAAACCATCCGTAAGTCCTAACAAGTTTCAATTTTTAT 116659193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GATTCTCAATAAATCTGCAACTAAAACCATCCGTAAGTCCTAACAAGTTTCAATTTTTAT 1320

116659194 CACGTTAGTGTCTTTTAGTAGATAAACTTTGCTCTAGGTCACTATCCAAAAAACTTATGT 116659253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CACGTTAGTGTCTTTTAGTAGATAAACTTTGCTCTAGGTCACTATCCAAAAAACTTATGT 1380

116659254 GAGTTCTGTTGATTGTATCCTGCCTTTGTGTTCCTAAGAGTTGATTTGGGAAGCAAAATC 116659313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GAGTTCTGTTGATTGTATCCTGCCTTTGTGTTCCTAAGAGTTGATTTGGGAAGCAAAATC 1440

116659314 CCCCAAAAATCTATATTCTCAGGCCCATGGATAGTTAGAACGCAGGCTACAGATGTCAAA 116659373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CCCCAAAAATCTATATTCTCAGGCCCATGGATAGTTAGAACGCAGGCTACAGATGTCAAA 1500

116659374 CTCTCTAGTCAGGGGTCATGCCTAATAAAGTGCAGAAGGAATACATTGAACAGAATGTTA 116659433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CTCTCTAGTCAGGGGTCATGCCTAATAAAGTGCAGAAGGAATACATTGAACAGAATGTTA 1560

116659434 TACACTTTTAGGGCGTTTTAAAATTTTTGGTCTAAGTCATGTCTCTAGCAGGCTAGACAC 116659493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TACACTTTTAGGGCGTTTTAAAATTTTTGGTCTAAGTCATGTCTCTAGCAGGCTAGACAC 1620

116659494 CTGTTCCAGATATGTATTCTTAATATAACAAAAATTATTTAAATATCTTACCATGTGTCA 116659553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CTGTTCCAGATATGTATTCTTAATATAACAAAAATTATTTAAATATCTTACCATGTGTCA 1680

116659554 CAGTTACATCAATAATATTTGGAATCATACTGGACCCTTTGAAAATTTTCAGTATGAGTA 116659613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CAGTTACATCAATAATATTTGGAATCATACTGGACCCTTTGAAAATTTTCAGTATGAGTA 1740

116659614 AAAATGTTTATCTTAGAAGTAAGTGGAGGGGAAACATCCTTATTATTAAGTGCTAAGCCT 116659673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AAAATGTTTATCTTAGAAGTAAGTGGAGGGGAAACATCCTTATTATTAAGTGCTAAGCCT 1800

116659674 TTTTAAAATGGTCTATGAAGATTCTAAATAGACTTCTGATTCCAAAATACCTATAACAAT 116659733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTTTAAAATGGTCTATGAAGATTCTAAATAGACTTCTGATTCCAAAATACCTATAACAAT 1860

116659734 GAAGTCTTTGGCCATGGCTAATTAAAAAAAAACATAAAACTCTAGAGACTGTCTCATTTA 116659793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GAAGTCTTTGGCCATGGCTAATTAAAAAAAAACATAAAACTCTAGAGACTGTCTCATTTA 1920

116659794 TTAATTTGCCAAATTCTTCTTTCTTTTAACATTTTCTTTATCCCACAGTATCTTTTCTTG 116659853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTAATTTGCCAAATTCTTCTTTCTTTTAACATTTTCTTTATCCCACAGTATCTTTTCTTG 1980

116659854 CTTTTTGTGCTACCACACTATCAAATTTTACTCTTTTTCTCCCAAATTTCTTTTTCTAAC 116659913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CTTTTTGTGCTACCACACTATCAAATTTTACTCTTTTTCTCCCAAATTTCTTTTTCTAAC 2040

116659914 CATCGTCTTCCCCCTCTGATTGTATCTGAAAATAACCACTTGCTTTTCTTCTTTTTTCTT 116659973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CATCGTCTTCCCCCTCTGATTGTATCTGAAAATAACCACTTGCTTTTCTTCTTTTTTCTT 2100

116659974 TTTCTTTTTCTTTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCC 116660033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            
     2101 TTTCTTTTTCTTTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCC------------ 2148

116660034 TTCCTTCCCTCTTTCCCTTTCCCTTTCTTTTCTTTTATTTTTTCTTCTCTCTTCTCTTCT 116660093
                  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2149 --------CTCTTTCCCTTTCCCTTTCTTTTCTTTTATTTTTTCTTCTCTCTTCTCTTCT 2200

116660094 CTTTTTCTGGGTTGCACTCTGTTACCCAAGCTTGAATGCAATGGCAGGGATCACAGCTTA 116660153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2201 CTTTTTCTGGGTTGCACTCTGTTACCCAAGCTTGAATGCAATGGCAGGGATCACAGCTTA 2260

116660154 CTGCAGTGTCAACCTCCTGGGCTCAGGTGATCATCCTCCTTCAGCCTCCTGTGTAGCTAG 116660213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2261 CTGCAGTGTCAACCTCCTGGGCTCAGGTGATCATCCTCCTTCAGCCTCCTGTGTAGCTAG 2320

116660214 GACTGCAGGCATGTACCACCACACATGGCTAATTTTAGTATTTTTTGTAGAAATGAGAGT 116660273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2321 GACTGCAGGCATGTACCACCACACATGGCTAATTTTAGTATTTTTTGTAGAAATGAGAGT 2380

116660274 CTCACTGTGTTGTCCAGGTTTGTCTCAAACTCCCAGGTTCAAGCAATCCACCTGCCTCAG 116660333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2381 CTCACTGTGTTGTCCAGGTTTGTCTCAAACTCCCAGGTTCAAGCAATCCACCTGCCTCAG 2440

116660334 CCTCTCAAACTGCTGGGATTATAGGCATGTGCCACCATGCTGGGCCTCAAATTGACATTT 116660393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2441 CCTCTCAAACTGCTGGGATTATAGGCATGTGCCACCATGCTGGGCCTCAAATTGACATTT 2500

116660394 TCTTAAAAATTGGACTGCCAAACAAGGACATTAGCCCTAGTAGGCAGAAGATACTATCTT 116660453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2501 TCTTAAAAATTGGACTGCCAAACAAGGACATTAGCCCTAGTAGGCAGAAGATACTATCTT 2560

116660454 GGTCTGTGTTAGAGGCAATTGTTGAAATTTCTCTGAATCTCTATGGGATAGGCATAAATG 116660513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2561 GGTCTGTGTTAGAGGCAATTGTTGAAATTTCTCTGAATCTCTATGGGATAGGCATAAATG 2620

116660514 TACTGATAAATTTGAGCAGTCCTGGGAATCCATAATCTCAATTTATTTGACCAATATCAA 116660573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2621 TACTGATAAATTTGAGCAGTCCTGGGAATCCATAATCTCAATTTATTTGACCAATATCAA 2680

116660574 TTAATACCATGTTGAGAGGTCCTTCTATTTCTGAAGTCTGGTTCAGCAAAAAATAAAAAA 116660633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2681 TTAATACCATGTTGAGAGGTCCTTCTATTTCTGAAGTCTGGTTCAGCAAAAAATAAAAAA 2740

116660634 AAAAA-TAAAATACCTGAAATAATGTAGCTATTCCTGAGGTATCATTAACAGAATAGAAA 116660692
          ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2741 AAAAAATAAAATACCTGAAATAATGTAGCTATTCCTGAGGTATCATTAACAGAATAGAAA 2800

116660693 CTTAAAAAGCGCATGATATGGAAAAATCTTTGCTGATGGTTATACATGTTAAGTTTCCAG 116660752
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     2801 CTTAAAAAGCGCATGATATGGAAAAACCTTTGCTGATGGTTATACATGTTAAGTTTCCAG 2860

116660753 ATAACTATTAATTAGACTTGCAGACATAAAAGGCTGTACCAAGTGGATATTTTAGAGATA 116660812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2861 ATAACTATTAATTAGACTTGCAGACATAAAAGGCTGTACCAAGTGGATATTTTAGAGATA 2920

116660813 AATTTTTAGCACTTACAGACAATATTATGAAGTAGCTATGTGGGCATAGAGAAATTCGGG 116660872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2921 AATTTTTAGCACTTACAGACAATATTATGAAGTAGCTATGTGGGCATAGAGAAATTCGGG 2980

116660873 AAATTAGCAGGCTGGTTCTGCTATAATAGATCTCAGTTCACCCTTAGGATATCTTCACTA 116660932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2981 AAATTAGCAGGCTGGTTCTGCTATAATAGATCTCAGTTCACCCTTAGGATATCTTCACTA 3040

116660933 AAGGAGCTTAACATAGCCCAGATGGTAGATTTGATTGCCCTCATTAGAGCTGGTCACTTG 116660992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3041 AAGGAGCTTAACATAGCCCAGATGGTAGATTTGATTGCCCTCATTAGAGCTGGTCACTTG 3100

116660993 GCCAAAGACAAAAAAAATTATATTTACACAGAAAATAGCTCAAGTACCTGAACCTCAGTA 116661052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3101 GCCAAAGACAAAAAAAATTATATTTACACAGAAAATAGCTCAAGTACCTGAACCTCAGTA 3160

116661053 TGACTATATATGGGGATAGAGTCTTTAAGGAAGTGATTAAGGTTAAATAAAGTCATAATG 116661112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3161 TGACTATATATGGGGATAGAGTCTTTAAGGAAGTGATTAAGGTTAAATAAAGTCATAATG 3220

116661113 ATGGGGCCCTAATCTGATAAGATTAGCGTCCTTCTAAGAGGAGGAATCAACATCAGGGAT 116661172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3221 ATGGGGCCCTAATCTGATAAGATTAGCGTCCTTCTAAGAGGAGGAATCAACATCAGGGAT 3280

116661173 TTTTTTTTCTCTCAACCCATGCCCAGAGGAAAGTCATATGAGGACGTAACACAAAGAGAG 116661232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3281 TTTTTTTTCTCTCAACCCATGCCCAGAGGAAAGTCATATGAGGACGTAACACAAAGAGAG 3340

116661233 ACATCTACAAATCACAGAGGTTGCACCAGAAATCAACCCTGCTAGCATATCGATCTTGAA 116661292
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3341 ACATCTACAAATCACAGGGGTTGCACCAGAAATCAACCCTGCTAGCATATCGATCTTGAA 3400

116661293 CTTCTAGTCCCCAGAACTGTGAGGAAATAAATTTTTGTTGCTTATGCCACCAGATCTGTG 116661352
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     3401 CTTCTAGTCCCCAGAACTGTGAGGAAATAAATTGTTGTTGCTTATGCCACCAGATCTGTG 3460

116661353 ACATTTTGTTATGGAAGTCTGAGCTGACCAATACACTTGAATAACTATCAGTGTCAATGT 116661412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3461 ACATTTTGTTATGGAAGTCTGAGCTGACCAATACACTTGAATAACTATCAGTGTCAATGT 3520

116661413 AAAACAAGCCATCTTTAGACTTAAGGAAACAGTCACCTGGCTCTCTAAGGCAGATGCAAA 116661472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3521 AAAACAAGCCATCTTTAGACTTAAGGAAACAGTCACCTGGCTCTCTAAGGCAGATGCAAA 3580

116661473 TGGATTTTTCTTTGCCCGGGTTTAGTAATTCAGATTATGGCACTAAGTGTTTTGGGAAGG 116661532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3581 TGGATTTTTCTTTGCCCGGGTTTAGTAATTCAGATTATGGCACTAAGTGTTTTGGGAAGG 3640

116661533 CTCCATGTCATTTTGATATAGTCACTGTGTGTTGCCATTCTTATGCATGTATTCTCCACA 116661592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3641 CTCCATGTCATTTTGATATAGTCACTGTGTGTTGCCATTCTTATGCATGTATTCTCCACA 3700

116661593 GTCTCAGTCCTGCTCTGCAGCTGCTCTCGTGTCAAATGATCCATCACTCAACGGAAATGA 116661652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3701 GTCTCAGTCCTGCTCTGCAGCTGCTCTCGTGTCAAATGATCCATCACTCAACGGAAATGA 3760

116661653 ACTCATCACTCCATAAAAGGAATAGGAAGATCAGTCCATGATCCAATCCCAAACTATTTT 116661712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3761 ACTCATCACTCCATAAAAGGAATAGGAAGATCAGTCCATGATCCAATCCCAAACTATTTT 3820

116661713 TTCTGAGGATGATAATGTTATCTAGAAATCACAACAGTGGTATACATCTGAACATGGCTG 116661772
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
     3821 TTCCGAGGATGATAATGTTATCTAGAAATCACAACAG-GGTATACATCTGAACATGGCTG 3879

116661773 CTTTAGTAGCTGAACGACTCTTCTCATCTTCTCATCAGTTAGGAAAGACTGAGAACTGGT 116661832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3880 CTTTAGTAGCTGAACGACTCTTCTCATCTTCTCATCAGTTAGGAAAGACTGAGAACTGGT 3939

116661833 AGCATAAATCCATCAATTATGGGATTGCAATTGCAGAATGTTTTGTGACTCACATAATGT 116661892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3940 AGCATAAATCCATCAATTATGGGATTGCAATTGCAGAATGTTTTGTGACTCACATAATGT 3999

116661893 TTTCTTCTTTACTCAGAACTTCTCTATTTCACAGATTCTCACCTTAATAATTGAAGCAAC 116661952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4000 TTTCTTCTTTACTCAGAACTTCTCTATTTCACAGATTCTCACCTTAATAATTGAAGCAAC 4059

116661953 TCAGGGTCACATCCTAGTTCTATAATTCTGCCTGAGGCACTCTGAGCCCAAACCATCAAC 116662012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4060 TCAGGGTCACATCCTAGTTCTATAATTCTGCCTGAGGCACTCTGAGCCCAAACCATCAAC 4119

116662013 AGGAAACAAACAAATAAAAAACCTGCTAATTTACTCTCCAATGAAACCTTTCCAGAATTA 116662072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4120 AGGAAACAAACAAATAAAAAACCTGCTAATTTACTCTCCAATGAAACCTTTCCAGAATTA 4179

116662073 TCTG 116662076
          ||||
     4180 TCTG 4183

EXCISED REGION

116662657 AATGAATAACTACCGTTATAGAAATAGCTTCTGGATTTCTTTGTCCTTTTTTTCCTGAAG 116662716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4185 AATGAATAACTACCGTTATAGAAATAGCTTCTGGATTTCTTTGTCCTTTTTTTCCTGAAG 4244

116662717 TTAGGCTATATTTGGTATCTCTATAGAGATAGGCTATATTTGGTAAATCTGTTCTCACCT 116662776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4245 TTAGGCTATATTTGGTATCTCTATAGAGATAGGCTATATTTGGTAAATCTGTTCTCACCT 4304

116662777 CACATAAAAGGTTAATATTCTACAAGTGGATAGATGTGGTGAGGACAACTAAAAGGAGAT 116662836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4305 CACATAAAAGGTTAATATTCTACAAGTGGATAGATGTGGTGAGGACAACTAAAAGGAGAT 4364

116662837 TGAATGATCTCATCAAATTATATTACACAACCTTTCAAAGAAAGCTCAGTTGGATTAAGA 116662896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4365 TGAATGATCTCATCAAATTATATTACACAACCTTTCAAAGAAAGCTCAGTTGGATTAAGA 4424

116662897 GGTTTCTTTATGTTCATGCCCAAAATGCCAAATTCCAACAGCCCACAAAATTTCTTTGAA 116662956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4425 GGTTTCTTTATGTTCATGCCCAAAATGCCAAATTCCAACAGCCCACAAAATTTCTTTGAA 4484

116662957 GTATTTTTCTCATACGTTTGTTTGATGAACAGCTTAAAGCTCCATTTCCATCCTAGCAAG 116663016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4485 GTATTTTTCTCATACGTTTGTTTGATGAACAGCTTAAAGCTCCATTTCCATCCTAGCAAG 4544

116663017 TGGCAGACAAAAAGCCAGATAGTAA 116663041
          |||||||||||||||||||||||||
     4545 TGGCAGACAAAAAGCCAGATAGTAA 4569

Alignment time is 5.51608 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [116652076,116672656] =>     20581 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [        1,     3344] =>      3344 nucs 'mol-32-3159-200931_3344'

Score:        3238
Aligned:      3364        nucs
Identic:      3337 ( 99%) nucs =>      2494 ( 99%)       843 (100%)
Gaps:           22 (  1%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [116659558,116662076] EXCISED REGION [116662657,116663500]
 second seq =>  [        1,     2499] EXCISED REGION [     2501,     3344]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       580 nucs [116662077,116662656]
 second seq =>         1 nucs [2500,2500]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [2499,2499] to [2500,2500]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

116659558 TACATCAATAATATTTGGAATCATACTGGACCCTTTGAAAATTTTCAGTATGAGTAAAAA 116659617
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TACATCAATAATATTTGGAATCACACTGGACCCTTTGAAAATTTTCAGTATGAGTAAAAA 60

116659618 TGTTTATCTTAGAAGTAAGTGGAGGGGAAACATCCTTATTATTAAGTGCTAAGCCTTTTT 116659677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGTTTATCTTAGAAGTAAGTGGAGGGGAAACATCCTTATTATTAAGTGCTAAGCCTTTTT 120

116659678 AAAATGGTCTATGAAGATTCTAAATAGACTTCTGATTCCAAAATACCTATAACAATGAAG 116659737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAAATGGTCTATGAAGATTCTAAATAGACTTCTGATTCCAAAATACCTATAACAATGAAG 180

116659738 TCTTTGGCCATGGCTAATTAAAAAAAAACATAAAACTCTAGAGACTGTCTCATTTATTAA 116659797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCTTTGGCCATGGCTAATTAAAAAAAAACATAAAACTCTAGAGACTGTCTCATTTATTAA 240

116659798 TTTGCCAAATTCTTCTTTCTTTTAACATTTTCTTTATCCCACAGTATCTTTTCTTGCTTT 116659857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTTGCCAAATTCTTCTTTCTTTTAACATTTTCTTTATCCCACAGTATCTTTTCTTGCTTT 300

116659858 TTGTGCTACCACACTATCAAATTTTACTCTTTTTCTCCCAAATTTCTTTTTCTAACCATC 116659917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTGTGCTACCACACTATCAAATTTTACTCTTTTTCTCCCAAATTTCTTTTTCTAACCATC 360

116659918 GTCTTCCCCCTCTGATTGTATCTGAAAATAACCACTTGCTTTTCTTCTTTTTTCTTTTTC 116659977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTCTTCCCCCTCTGATTGTATCTGAAAATAACCACTTGCTTTTCTTCTTTTTTCTTTTTC 420

116659978 TTTTTCTTTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCC 116660037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                
      421 TTTTTCTTTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCC---------------- 464

116660038 TTCCCTCTTTCCCTTTCCCTTTCTTTTCTTTTATTTTTTCTTCTCTCTTCTCTTCTCTTT 116660097
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      465 ----CTCTTTCCCTTTCCCTTTCTTTTCTTTTATTTTTTCTTCTCTCTTCTCTTCTCTTT 520

116660098 TTCTGGGTTGCACTCTGTTACCCAAGCTTGAATGCAATGGCAGGGATCACAGCTTACTGC 116660157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      521 TTCTGGGTTGCACTCTGTTACCCAAGCTTGAATGCAATGGCAGGGATCACAGCTTACTGC 580

116660158 AGTGTCAACCTCCTGGGCTCAGGTGATCATCCTCCTTCAGCCTCCTGTGTAGCTAGGACT 116660217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      581 AGTGTCAACCTCCTGGGCTCAGGTGATCATCCTCCTTCAGCCTCCTGTGTAGCTAGGACT 640

116660218 GCAGGCATGTACCACCACACATGGCTAATTTTAGTATTTTTTGTAGAAATGAGAGTCTCA 116660277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      641 GCAGGCATGTACCACCACACATGGCTAATTTTAGTATTTTTTGTAGAAATGAGAGTCTCA 700

116660278 CTGTGTTGTCCAGGTTTGTCTCAAACTCCCAGGTTCAAGCAATCCACCTGCCTCAGCCTC 116660337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      701 CTGTGTTGTCCAGGTTTGTCTCAAACTCCCAGGTTCAAGCAATCCACCTGCCTCAGCCTC 760

116660338 TCAAACTGCTGGGATTATAGGCATGTGCCACCATGCTGGGCCTCAAATTGACATTTTCTT 116660397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      761 TCAAACTGCTGGGATTATAGGCATGTGCCACCATGCTGGGCCTCAAATTGACATTTTCTT 820

116660398 AAAAATTGGACTGCCAAACAAGGACATTAGCCCTAGTAGGCAGAAGATACTATCTTGGTC 116660457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      821 AAAAATTGGACTGCCAAACAAGGACATTAGCCCTAGTAGGCAGAAGATACTATCTTGGTC 880

116660458 TGTGTTAGAGGCAATTGTTGAAATTTCTCTGAATCTCTATGGGATAGGCATAAATGTACT 116660517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      881 TGTGTTAGAGGCAATTGTTGAAATTTCTCTGAATCTCTATGGGATAGGCATAAATGTACT 940

116660518 GATAAATTTGAGCAGTCCTGGGAATCCATAATCTCAATTTATTTGACCAATATCAATTAA 116660577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      941 GATAAATTTGAGCAGTCCTGGGAATCCATAATCTCAATTTATTTGACCAATATCAATTAA 1000

116660578 TACCATGTTGAGAGGTCCTTCTATTTCTGAAGTCTGGTTCAGCAAAAAATAAAAAAAAAA 116660637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1001 TACCATGTTGAGAGGTCCTTCTATTTCTGAAGTCTGGTTCAGCAAAAAATAAAAAAAAAA 1060

116660638 A-TAAAATACCTGAAATAATGTAGCTATTCCTGAGGTATCATTAACAGAATAGAAACTTA 116660696
          | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1061 AATAAAATACCTGAAATAATGTAGCTATTCCTGAGGTATCATTAACAGAATAGAAACTTA 1120

116660697 AAAAGCGCATGATATGGAAAAATCTTTGCTGATGGTTATACATGTTAAGTTTCCAGATAA 116660756
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1121 AAAAGCGCATGATATGGAAAAACCTTTGCTGATGGTTATACATGTTAAGTTTCCAGATAA 1180

116660757 CTATTAATTAGACTTGCAGACATAAAAGGCTGTACCAAGTGGATATTTTAGAGATAAATT 116660816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1181 CTATTAATTAGACTTGCAGACATAAAAGGCTGTACCAAGTGGATATTTTAGAGATAAATT 1240

116660817 TTTAGCACTTACAGACAATATTATGAAGTAGCTATGTGGGCATAGAGAAATTCGGGAAAT 116660876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1241 TTTAGCACTTACAGACAATATTATGAAGTAGCTATGTGGGCATAGAGAAATTCGGGAAAT 1300

116660877 TAGCAGGCTGGTTCTGCTATAATAGATCTCAGTTCACCCTTAGGATATCTTCACTAAAGG 116660936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1301 TAGCAGGCTGGTTCTGCTATAATAGATCTCAGTTCACCCTTAGGATATCTTCACTAAAGG 1360

116660937 AGCTTAACATAGCCCAGATGGTAGATTTGATTGCCCTCATTAGAGCTGGTCACTTGGCCA 116660996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1361 AGCTTAACATAGCCCAGATGGTAGATTTGATTGCCCTCATTAGAGCTGGTCACTTGGCCA 1420

116660997 AAGACAAAAAAAATTATATTTACACAGAAAATAGCTCAAGTACCTGAACCTCAGTATGAC 116661056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1421 AAGACAAAAAAAATTATATTTACACAGAAAATAGCTCAAGTACCTGAACCTCAGTATGAC 1480

116661057 TATATATGGGGATAGAGTCTTTAAGGAAGTGATTAAGGTTAAATAAAGTCATAATGATGG 116661116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1481 TATATATGGGGATAGAGTCTTTAAGGAAGTGATTAAGGTTAAATAAAGTCATAATGATGG 1540

116661117 GGCCCTAATCTGATAAGATTAGCGTCCTTCTAAGAGGAGGAATCAACATCAGGGATTTTT 116661176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1541 GGCCCTAATCTGATAAGATTAGCGTCCTTCTAAGAGGAGGAATCAACATCAGGGATTTTT 1600

116661177 TTTTCTCTCAACCCATGCCCAGAGGAAAGTCATATGAGGACGTAACACAAAGAGAGACAT 116661236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1601 TTTTCTCTCAACCCATGCCCAGAGGAAAGTCATATGAGGACGTAACACAAAGAGAGACAT 1660

116661237 CTACAAATCACAGAGGTTGCACCAGAAATCAACCCTGCTAGCATATCGATCTTGAACTTC 116661296
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1661 CTACAAATCACAGGGGTTGCACCAGAAATCAACCCTGCTAGCATATCGATCTTGAACTTC 1720

116661297 TAGTCCCCAGAACTGTGAGGAAATAAATTTTTGTTGCTTATGCCACCAGATCTGTGACAT 116661356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1721 TAGTCCCCAGAACTGTGAGGAAATAAATTTTTGTTGCTTATGCCACCAGATCTGTGACAT 1780

116661357 TTTGTTATGGAAGTCTGAGCTGACCAATACACTTGAATAACTATCAGTGTCAATGTAAAA 116661416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1781 TTTGTTATGGAAGTCTGAGCTGACCAATACACTTGAATAACTATCAGTGTCAATGTAAAA 1840

116661417 CAAGCCATCTTTAGACTTAAGGAAACAGTCACCTGGCTCTCTAAGGCAGATGCAAATGGA 116661476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1841 CAAGCCATCTTTAGACTTAAGGAAACAGTCACCTGGCTCTCTAAGGCAGATGCAAATGGA 1900

116661477 TTTTTCTTTGCCCGGGTTTAGTAATTCAGATTATGGCACTAAGTGTTTTGGGAAGGCTCC 116661536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1901 TTTTTCTTTGCCCGGGTTTAGTAATTCAGATTATGGCACTAAGTGTTTTGGGAAGGCTCC 1960

116661537 ATGTCATTTTGATATAGTCACTGTGTGTTGCCATTCTTATGCATGTATTCTCCACAGTCT 116661596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1961 ATGTCATTTTGATATAGTCACTGTGTGTTGCCATTCTTATGCATGTATTCTCCACAGTCT 2020

116661597 CAGTCCTGCTCTGCAGCTGCTCTCGTGTCAAATGATCCATCACTCAACGGAAATGAACTC 116661656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2021 CAGTCCTGCTCTGCAGCTGCTCTCGTGTCAAATGATCCATCACTCAACGGAAATGAACTC 2080

116661657 ATCACTCCATAAAAGGAATAGGAAGATCAGTCCATGATCCAATCCCAAACTATTTTTTCT 116661716
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     2081 ATCACTCCATAAAAGGAATAGGAAGATCAGTCCATGATCCAATCCCAAACTATTTTTTCC 2140

116661717 GAGGATGATAATGTTATCTAGAAATCACAACAGTGGTATACATCTGAACATGGCTGCTTT 116661776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
     2141 GAGGATGATAATGTTATCTAGAAATCACAACAG-GGTATACATCTGAACATGGCTGCTTT 2199

116661777 AGTAGCTGAACGACTCTTCTCATCTTCTCATCAGTTAGGAAAGACTGAGAACTGGTAGCA 116661836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2200 AGTAGCTGAACGACTCTTCTCATCTTCTCATCAGTTAGGAAAGACTGAGAACTGGTAGCA 2259

116661837 TAAATCCATCAATTATGGGATTGCAATTGCAGAATGTTTTGTGACTCACATAATGTTTTC 116661896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2260 TAAATCCATCAATTATGGGATTGCAATTGCAGAATGTTTTGTGACTCACATAATGTTTTC 2319

116661897 TTCTTTACTCAGAACTTCTCTATTTCACAGATTCTCACCTTAATAATTGAAGCAACTCAG 116661956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2320 TTCTTTACTCAGAACTTCTCTATTTCACAGATTCTCACCTTAATAATTGAAGCAACTCAG 2379

116661957 GGTCACATCCTAGTTCTATAATTCTGCCTGAGGCACTCTGAGCCCAAACCATCAACAGGA 116662016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2380 GGTCACATCCTAGTTCTATAATTCTGCCTGAGGCACTCTGAGCCCAAACCATCAACAGGA 2439

116662017 AACAAACAAATAAAAAACCTGCTAATTTACTCTCCAATGAAACCTTTCCAGAATTATCTG 116662076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2440 AACAAACAAATAAAAAACCTGCTAATTTACTCTCCAATGAAACCTTTCCAGAATTATCTG 2499

EXCISED REGION

116662657 AATGAATAACTACCGTTATAGAAATAGCTTCTGGATTTCTTTGTCCTTTTTTTCCTGAAG 116662716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2501 AATGAATAACTACCGTTATAGAAATAGCTTCTGGATTTCTTTGTCCTTTTTTTCCTGAAG 2560

116662717 TTAGGCTATATTTGGTATCTCTATAGAGATAGGCTATATTTGGTAAATCTGTTCTCACCT 116662776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2561 TTAGGCTATATTTGGTATCTCTATAGAGATAGGCTATATTTGGTAAATCTGTTCTCACCT 2620

116662777 CACATAAAAGGTTAATATTCTACAAGTGGATAGATGTGGTGAGGACAACTAAAAGGAGAT 116662836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2621 CACATAAAAGGTTAATATTCTACAAGTGGATAGATGTGGTGAGGACAACTAAAAGGAGAT 2680

116662837 TGAATGATCTCATCAAATTATATTACACAACCTTTCAAAGAAAGCTCAGTTGGATTAAGA 116662896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2681 TGAATGATCTCATCAAATTATATTACACAACCTTTCAAAGAAAGCTCAGTTGGATTAAGA 2740

116662897 GGTTTCTTTATGTTCATGCCCAAAATGCCAAATTCCAACAGCCCACAAAATTTCTTTGAA 116662956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2741 GGTTTCTTTATGTTCATGCCCAAAATGCCAAATTCCAACAGCCCACAAAATTTCTTTGAA 2800

116662957 GTATTTTTCTCATACGTTTGTTTGATGAACAGCTTAAAGCTCCATTTCCATCCTAGCAAG 116663016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2801 GTATTTTTCTCATACGTTTGTTTGATGAACAGCTTAAAGCTCCATTTCCATCCTAGCAAG 2860

116663017 TGGCAGACAAAAAGCCAGATAGTAAATCATATTTTAATAAAAATGATTTTAATAAGTGAA 116663076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2861 TGGCAGACAAAAAGCCAGATAGTAAATCATATTTTAATAAAAATGATTTTAATAAGTGAA 2920

116663077 AGATATGATCCATTAAGTTAATCTTGTTAAGTAGAAGACCAAAATGAGAACTTAATGGGG 116663136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2921 AGATATGATCCATTAAGTTAATCTTGTTAAGTAGAAGACCAAAATGAGAACTTAATGGGG 2980

116663137 TGCAAACATCACGGAGAATCAAAACACACACTAGAAACCATACTTGAGAACCAGAGATGA 116663196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2981 TGCAAACATCACGGAGAATCAAAACACACACTAGAAACCATACTTGAGAACCAGAGATGA 3040

116663197 GTGAATGTTTGGTCATCAATATCCATGCTAGCCTTAATCTTGTGGTTATCCCACCACATC 116663256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3041 GTGAATGTTTGGTCATCAATATCCATGCTAGCCTTAATCTTGTGGTTATCCCACCACATC 3100

116663257 CCCCTTTTCAACAGAAGTCAGTGAGCAGCAAGCCTCATTGAATGTTGGATATTAGCAAGC 116663316
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3101 CCCCTTTTCAACAGAAGTCAGTGAGTAGCAAGCCTCATTGAATGTTGGATATTAGCAAGC 3160

116663317 ACATGTAGTTTTGCTTCAAGTACTCTTTATTTTCTTCCAATCCTCAGGGCCTTTCTCAAC 116663376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3161 ACATGTAGTTTTGCTTCAAGTACTCTTTATTTTCTTCCAATCCTCAGGGCCTTTCTCAAC 3220

116663377 ATATGGTTTATTATAGCGTTGTGAATGATTGGTCTTTCATAAGGACATTTTCCTTGGCAG 116663436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3221 ATATGGTTTATTATAGCGTTGTGAATGATTGGTCTTTCATAAGGACATTTTCCTTGGCAG 3280

116663437 AAGGCTATTTGAAGTTCATTGCTTTTACAAGGTAAGATTTCTGGAAGTTCTAAGCTATAT 116663496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3281 AAGGCTATTTGAAGTTCATTGCTTTTACAAGGTAAGATTTCTGGAAGTTCTAAGCTATAT 3340

116663497 AAAT 116663500
          ||||
     3341 AAAT 3344

Alignment time is 4.20692 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [116652076,116672656] =>     20581 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [        1,     4422] =>      4422 nucs 'mol-32-316f-210486_4422'

Score:        4400
Aligned:      4422        nucs
Identic:      4420 (100%) nucs =>       836 (100%)      3584 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [116659150,116659985] EXCISED REGION [116659994,116663579]
 second seq =>  [        1,      836] EXCISED REGION [      837,     4422]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         8 nucs [116659986,116659993]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        48 nucs [116659986,116660033] to [116659994,116660041]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [116659984,116659985] to [116659994,116659995]
 second seq =>         2 nucs [835,836] to [837,838]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [116659986,116659989] to [116659990,116659993]
 second seq =>         0 nucs

116659150 GCAACTAAAACCATCCGTAAGTCCTAACAAGTTTCAATTTTTATCACGTTAGTGTCTTTT 116659209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCAACTAAAACCATCCGTAAGTCCTAACAAGTTTCAATTTTTATCACGTTAGTGTCTTTT 60

116659210 AGTAGATAAACTTTGCTCTAGGTCACTATCCAAAAAACTTATGTGAGTTCTGTTGATTGT 116659269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGTAGATAAACTTTGCTCTAGGTCACTATCCAAAAAACTTATGTGAGTTCTGTTGATTGT 120

116659270 ATCCTGCCTTTGTGTTCCTAAGAGTTGATTTGGGAAGCAAAATCCCCCAAAAATCTATAT 116659329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATCCTGCCTTTGTGTTCCTAAGAGTTGATTTGGGAAGCAAAATCCCCCAAAAATCTATAT 180

116659330 TCTCAGGCCCATGGATAGTTAGAACGCAGGCTACAGATGTCAAACTCTCTAGTCAGGGGT 116659389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCTCAGGCCCATGGATAGTTAGAACGCAGGCTACAGATGTCAAACTCTCTAGTCAGGGGT 240

116659390 CATGCCTAATAAAGTGCAGAAGGAATACATTGAACAGAATGTTATACACTTTTAGGGCGT 116659449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CATGCCTAATAAAGTGCAGAAGGAATACATTGAACAGAATGTTATACACTTTTAGGGCGT 300

116659450 TTTAAAATTTTTGGTCTAAGTCATGTCTCTAGCAGGCTAGACACCTGTTCCAGATATGTA 116659509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTAAAATTTTTGGTCTAAGTCATGTCTCTAGCAGGCTAGACACCTGTTCCAGATATGTA 360

116659510 TTCTTAATATAACAAAAATTATTTAAATATCTTACCATGTGTCACAGTTACATCAATAAT 116659569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTCTTAATATAACAAAAATTATTTAAATATCTTACCATGTGTCACAGTTACATCAATAAT 420

116659570 ATTTGGAATCATACTGGACCCTTTGAAAATTTTCAGTATGAGTAAAAATGTTTATCTTAG 116659629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATTTGGAATCATACTGGACCCTTTGAAAATTTTCAGTATGAGTAAAAATGTTTATCTTAG 480

116659630 AAGTAAGTGGAGGGGAAACATCCTTATTATTAAGTGCTAAGCCTTTTTAAAATGGTCTAT 116659689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAGTAAGTGGAGGGGAAACATCCTTATTATTAAGTGCTAAGCCTTTTTAAAATGGTCTAT 540

116659690 GAAGATTCTAAATAGACTTCTGATTCCAAAATACCTATAACAATGAAGTCTTTGGCCATG 116659749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GAAGATTCTAAATAGACTTCTGATTCCAAAATACCTATAACAATGAAGTCTTTGGCCATG 600

116659750 GCTAATTAAAAAAAAACATAAAACTCTAGAGACTGTCTCATTTATTAATTTGCCAAATTC 116659809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GCTAATTAAAAAAAAACATAAAACTCTAGAGACTGTCTCATTTATTAATTTGCCAAATTC 660

116659810 TTCTTTCTTTTAACATTTTCTTTATCCCACAGTATCTTTTCTTGCTTTTTGTGCTACCAC 116659869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTCTTTCTTTTAACATTTTCTTTATCCCACAGTATCTTTTCTTGCTTTTTGTGCTACCAC 720

116659870 ACTATCAAATTTTACTCTTTTTCTCCCAAATTTCTTTTTCTAACCATCGTCTTCCCCCTC 116659929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ACTATCAAATTTTACTCTTTTTCTCCCAAATTTCTTTTTCTAACCATCGTCTTCCCCCTC 780

116659930 TGATTGTATCTGAAAATAACCACTTGCTTTTCTTCTTTTTTCTTTTTCTTTTTCTT 116659985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGATTGTATCTGAAAATAACCACTTGCTTTTCTTCTTTTTTCTTTTTCTTTTTCTT 836

EXCISED REGION

116659994 TTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCCTCTTTCCCTTT 116660053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      837 TTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCCTCTTTCCCTTT 896

116660054 CCCTTTCTTTTCTTTTATTTTTTCTTCTCTCTTCTCTTCTCTTTTTCTGGGTTGCACTCT 116660113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      897 CCCTTTCTTTTCTTTTATTTTTTCTTCTCTCTTCTCTTCTCTTTTTCTGGGTTGCACTCT 956

116660114 GTTACCCAAGCTTGAATGCAATGGCAGGGATCACAGCTTACTGCAGTGTCAACCTCCTGG 116660173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      957 GTTACCCAAGCTTGAATGCAATGGCAGGGATCACAGCTTACTGCAGTGTCAACCTCCTGG 1016

116660174 GCTCAGGTGATCATCCTCCTTCAGCCTCCTGTGTAGCTAGGACTGCAGGCATGTACCACC 116660233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1017 GCTCAGGTGATCATCCTCCTTCAGCCTCCTGTGTAGCTAGGACTGCAGGCATGTACCACC 1076

116660234 ACACATGGCTAATTTTAGTATTTTTTGTAGAAATGAGAGTCTCACTGTGTTGTCCAGGTT 116660293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1077 ACACATGGCTAATTTTAGTATTTTTTGTAGAAATGAGAGTCTCACTGTGTTGTCCAGGTT 1136

116660294 TGTCTCAAACTCCCAGGTTCAAGCAATCCACCTGCCTCAGCCTCTCAAACTGCTGGGATT 116660353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1137 TGTCTCAAACTCCCAGGTTCAAGCAATCCACCTGCCTCAGCCTCTCAAACTGCTGGGATT 1196

116660354 ATAGGCATGTGCCACCATGCTGGGCCTCAAATTGACATTTTCTTAAAAATTGGACTGCCA 116660413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1197 ATAGGCATGTGCCACCATGCTGGGCCTCAAATTGACATTTTCTTAAAAATTGGACTGCCA 1256

116660414 AACAAGGACATTAGCCCTAGTAGGCAGAAGATACTATCTTGGTCTGTGTTAGAGGCAATT 116660473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1257 AACAAGGACATTAGCCCTAGTAGGCAGAAGATACTATCTTGGTCTGTGTTAGAGGCAATT 1316

116660474 GTTGAAATTTCTCTGAATCTCTATGGGATAGGCATAAATGTACTGATAAATTTGAGCAGT 116660533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1317 GTTGAAATTTCTCTGAATCTCTATGGGATAGGCATAAATGTACTGATAAATTTGAGCAGT 1376

116660534 CCTGGGAATCCATAATCTCAATTTATTTGACCAATATCAATTAATACCATGTTGAGAGGT 116660593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1377 CCTGGGAATCCATAATCTCAATTTATTTGACCAATATCAATTAATACCATGTTGAGAGGT 1436

116660594 CCTTCTATTTCTGAAGTCTGGTTCAGCAAAAAATAAAAAAAAAAATAAAATACCTGAAAT 116660653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1437 CCTTCTATTTCTGAAGTCTGGTTCAGCAAAAAATAAAAAAAAAAATAAAATACCTGAAAT 1496

116660654 AATGTAGCTATTCCTGAGGTATCATTAACAGAATAGAAACTTAAAAAGCGCATGATATGG 116660713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1497 AATGTAGCTATTCCTGAGGTATCATTAACAGAATAGAAACTTAAAAAGCGCATGATATGG 1556

116660714 AAAAATCTTTGCTGATGGTTATACATGTTAAGTTTCCAGATAACTATTAATTAGACTTGC 116660773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1557 AAAAATCTTTGCTGATGGTTATACATGTTAAGTTTCCAGATAACTATTAATTAGACTTGC 1616

116660774 AGACATAAAAGGCTGTACCAAGTGGATATTTTAGAGATAAATTTTTAGCACTTACAGACA 116660833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1617 AGACATAAAAGGCTGTACCAAGTGGATATTTTAGAGATAAATTTTTAGCACTTACAGACA 1676

116660834 ATATTATGAAGTAGCTATGTGGGCATAGAGAAATTCGGGAAATTAGCAGGCTGGTTCTGC 116660893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1677 ATATTATGAAGTAGCTATGTGGGCATAGAGAAATTCGGGAAATTAGCAGGCTGGTTCTGC 1736

116660894 TATAATAGATCTCAGTTCACCCTTAGGATATCTTCACTAAAGGAGCTTAACATAGCCCAG 116660953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1737 TATAATAGATCTCAGTTCACCCTTAGGATATCTTCACTAAAGGAGCTTAACATAGCCCAG 1796

116660954 ATGGTAGATTTGATTGCCCTCATTAGAGCTGGTCACTTGGCCAAAGACAAAAAAAATTAT 116661013
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     1797 ATGGTAGATTTGATTGCCCTCATTAGAGCTTGTCACTTGGCCAAAGACAAAAAAAATTAT 1856

116661014 ATTTACACAGAAAATAGCTCAAGTACCTGAACCTCAGTATGACTATATATGGGGATAGAG 116661073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1857 ATTTACACAGAAAATAGCTCAAGTACCTGAACCTCAGTATGACTATATATGGGGATAGAG 1916

116661074 TCTTTAAGGAAGTGATTAAGGTTAAATAAAGTCATAATGATGGGGCCCTAATCTGATAAG 116661133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1917 TCTTTAAGGAAGTGATTAAGGTTAAATAAAGTCATAATGATGGGGCCCTAATCTGATAAG 1976

116661134 ATTAGCGTCCTTCTAAGAGGAGGAATCAACATCAGGGATTTTTTTTTCTCTCAACCCATG 116661193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1977 ATTAGCGTCCTTCTAAGAGGAGGAATCAACATCAGGGATTTTTTTTTCTCTCAACCCATG 2036

116661194 CCCAGAGGAAAGTCATATGAGGACGTAACACAAAGAGAGACATCTACAAATCACAGAGGT 116661253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2037 CCCAGAGGAAAGTCATATGAGGACGTAACACAAAGAGAGACATCTACAAATCACAGAGGT 2096

116661254 TGCACCAGAAATCAACCCTGCTAGCATATCGATCTTGAACTTCTAGTCCCCAGAACTGTG 116661313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2097 TGCACCAGAAATCAACCCTGCTAGCATATCGATCTTGAACTTCTAGTCCCCAGAACTGTG 2156

116661314 AGGAAATAAATTTTTGTTGCTTATGCCACCAGATCTGTGACATTTTGTTATGGAAGTCTG 116661373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2157 AGGAAATAAATTTTTGTTGCTTATGCCACCAGATCTGTGACATTTTGTTATGGAAGTCTG 2216

116661374 AGCTGACCAATACACTTGAATAACTATCAGTGTCAATGTAAAACAAGCCATCTTTAGACT 116661433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2217 AGCTGACCAATACACTTGAATAACTATCAGTGTCAATGTAAAACAAGCCATCTTTAGACT 2276

116661434 TAAGGAAACAGTCACCTGGCTCTCTAAGGCAGATGCAAATGGATTTTTCTTTGCCCGGGT 116661493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2277 TAAGGAAACAGTCACCTGGCTCTCTAAGGCAGATGCAAATGGATTTTTCTTTGCCCGGGT 2336

116661494 TTAGTAATTCAGATTATGGCACTAAGTGTTTTGGGAAGGCTCCATGTCATTTTGATATAG 116661553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2337 TTAGTAATTCAGATTATGGCACTAAGTGTTTTGGGAAGGCTCCATGTCATTTTGATATAG 2396

116661554 TCACTGTGTGTTGCCATTCTTATGCATGTATTCTCCACAGTCTCAGTCCTGCTCTGCAGC 116661613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2397 TCACTGTGTGTTGCCATTCTTATGCATGTATTCTCCACAGTCTCAGTCCTGCTCTGCAGC 2456

116661614 TGCTCTCGTGTCAAATGATCCATCACTCAACGGAAATGAACTCATCACTCCATAAAAGGA 116661673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2457 TGCTCTCGTGTCAAATGATCCATCACTCAACGGAAATGAACTCATCACTCCATAAAAGGA 2516

116661674 ATAGGAAGATCAGTCCATGATCCAATCCCAAACTATTTTTTCTGAGGATGATAATGTTAT 116661733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2517 ATAGGAAGATCAGTCCATGATCCAATCCCAAACTATTTTTTCTGAGGATGATAATGTTAT 2576

116661734 CTAGAAATCACAACAGTGGTATACATCTGAACATGGCTGCTTTAGTAGCTGAACGACTCT 116661793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2577 CTAGAAATCACAACAGTGGTATACATCTGAACATGGCTGCTTTAGTAGCTGAACGACTCT 2636

116661794 TCTCATCTTCTCATCAGTTAGGAAAGACTGAGAACTGGTAGCATAAATCCATCAATTATG 116661853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2637 TCTCATCTTCTCATCAGTTAGGAAAGACTGAGAACTGGTAGCATAAATCCATCAATTATG 2696

116661854 GGATTGCAATTGCAGAATGTTTTGTGACTCACATAATGTTTTCTTCTTTACTCAGAACTT 116661913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2697 GGATTGCAATTGCAGAATGTTTTGTGACTCACATAATGTTTTCTTCTTTACTCAGAACTT 2756

116661914 CTCTATTTCACAGATTCTCACCTTAATAATTGAAGCAACTCAGGGTCACATCCTAGTTCT 116661973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2757 CTCTATTTCACAGATTCTCACCTTAATAATTGAAGCAACTCAGGGTCACATCCTAGTTCT 2816

116661974 ATAATTCTGCCTGAGGCACTCTGAGCCCAAACCATCAACAGGAAACAAACAAATAAAAAA 116662033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2817 ATAATTCTGCCTGAGGCACTCTGAGCCCAAACCATCAACAGGAAACAAACAAATAAAAAA 2876

116662034 CCTGCTAATTTACTCTCCAATGAAACCTTTCCAGAATTATCTGTGTAGAGTTTCCTATTG 116662093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2877 CCTGCTAATTTACTCTCCAATGAAACCTTTCCAGAATTATCTGTGTAGAGTTTCCTATTG 2936

116662094 CTGCAATAATTAATAAACTCAGTTTGCTTATATTGCAAATTTTAAAACTCGTAGTGGGAG 116662153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2937 CTGCAATAATTAATAAACTCAGTTTGCTTATATTGCAAATTTTAAAACTCGTAGTGGGAG 2996

116662154 ATTTCCAGTTGCAAACAACAAGTCTTGGCTTTAATTATGAGTTCAACCAGTTTTTTTTCT 116662213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2997 ATTTCCAGTTGCAAACAACAAGTCTTGGCTTTAATTATGAGTTCAACCAGTTTTTTTTCT 3056

116662214 CCTAATGTTTTAAATCTCAGTTCATCATAATGTCTGAGCTTGTCTGATTTTGGCATAGGG 116662273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3057 CCTAATGTTTTAAATCTCAGTTCATCATAATGTCTGAGCTTGTCTGATTTTGGCATAGGG 3116

116662274 AATATAATTAGAAGTAGTGAATGAAGGCCTAGCTGTTGCTTTGATGTCAGCAGACACCCA 116662333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3117 AATATAATTAGAAGTAGTGAATGAAGGCCTAGCTGTTGCTTTGATGTCAGCAGACACCCA 3176

116662334 TTTCTCTTTCCAAACTGCTTTTAAAAAGTCAAACAACTTCCTTCTCTTCTTGCCTCACTC 116662393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3177 TTTCTCTTTCCAAACTGCTTTTAAAAAGTCAAACAACTTCCTTCTCTTCTTGCCTCACTC 3236

116662394 TCTACTTAATGTGATTTTCTTTTAATTTATGAAGGAAATAAAATCATTGCTTTTTAAGAA 116662453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3237 TCTACTTAATGTGATTTTCTTTTAATTTATGAAGGAAATAAAATCATTGCTTTTTAAGAA 3296

116662454 TCATCCAACCAAGTCATTAAAGATATCTGGAATTCAAGATGTAGTCAAAATATTTCAAGG 116662513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3297 TCATCCAACCAAGTCATTAAAGATATCTGGAATTCAAGATGTAGTCAAAATATTTCAAGG 3356

116662514 GCATTACAATATCCTCTGTCTTCTCTAATCTCTCAGGCAGTAAAACGGTACCAAGTGCAG 116662573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3357 GCATTACAATATCCTCTGTCTTCTCTAATCTCTCAGGCAGTAAAACGGTACCAAGTGCAG 3416

116662574 AGATAGAAACACTGCTGTCAAAGTGGGTTAAAATCTTGACAGTATCGTGGCTTCTGATTT 116662633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3417 AGATAGAAACACTGCTGTCAAAGTGGGTTAAAATCTTGACAGTATCGTGGCTTCTGATTT 3476

116662634 TAATTTCTCAATTAACTTATACAAATGAATAACTACCGTTATAGAAATAGCTTCTGGATT 116662693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3477 TAATTTCTCAATTAACTTATACAAATGAATAACTACCGTTATAGAAATAGCTTCTGGATT 3536

116662694 TCTTTGTCCTTTTTTTCCTGAAGTTAGGCTATATTTGGTATCTCTATAGAGATAGGCTAT 116662753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3537 TCTTTGTCCTTTTTTTCCTGAAGTTAGGCTATATTTGGTATCTCTATAGAGATAGGCTAT 3596

116662754 ATTTGGTAAATCTGTTCTCACCTCACATAAAAGGTTAATATTCTACAAGTGGATAGATGT 116662813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3597 ATTTGGTAAATCTGTTCTCACCTCACATAAAAGGTTAATATTCTACAAGTGGATAGATGT 3656

116662814 GGTGAGGACAACTAAAAGGAGATTGAATGATCTCATCAAATTATATTACACAACCTTTCA 116662873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3657 GGTGAGGACAACTAAAAGGAGATTGAATGATCTCATCAAATTATATTACACAACCTTTCA 3716

116662874 AAGAAAGCTCAGTTGGATTAAGAGGTTTCTTTATGTTCATGCCCAAAATGCCAAATTCCA 116662933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3717 AAGAAAGCTCAGTTGGATTAAGAGGTTTCTTTATGTTCATGCCCAAAATGCCAAATTCCA 3776

116662934 ACAGCCCACAAAATTTCTTTGAAGTATTTTTCTCATACGTTTGTTTGATGAACAGCTTAA 116662993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3777 ACAGCCCACAAAATTTCTTTGAAGTATTTTTCTCATACGTTTGTTTGATGAACAGCTTAA 3836

116662994 AGCTCCATTTCCATCCTAGCAAGTGGCAGACAAAAAGCCAGATAGTAAATCATATTTTAA 116663053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3837 AGCTCCATTTCCATCCTAGCAAGTGGCAGACAAAAAGCCAGATAGTAAATCATATTTTAA 3896

116663054 TAAAAATGATTTTAATAAGTGAAAGATATGATCCATTAAGTTAATCTTGTTAAGTAGAAG 116663113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3897 TAAAAATGATTTTAATAAGTGAAAGATATGATCCATTAAGTTAATCTTGTTAAGTAGAAG 3956

116663114 ACCAAAATGAGAACTTAATGGGGTGCAAACATCACGGAGAATCAAAACACACACTAGAAA 116663173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3957 ACCAAAATGAGAACTTAATGGGGTGCAAACATCACGGAGAATCAAAACACACACTAGAAA 4016

116663174 CCATACTTGAGAACCAGAGATGAGTGAATGTTTGGTCATCAATATCCATGCTAGCCTTAA 116663233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4017 CCATACTTGAGAACCAGAGATGAGTGAATGTTTGGTCATCAATATCCATGCTAGCCTTAA 4076

116663234 TCTTGTGGTTATCCCACCACATCCCCCTTTTCAACAGAAGTCAGTGAGCAGCAAGCCTCA 116663293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4077 TCTTGTGGTTATCCCACCACATCCCCCTTTTCAACAGAAGTCAGTGAGCAGCAAGCCTCA 4136

116663294 TTGAATGTTGGATATTAGCAAGCACATGTAGTTTTGCTTCAAGTACTCTTTATTTTCTTC 116663353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4137 TTGAATGTTGGATATTAGCAAGCACATGTAGTTTTGCTTCAAGTACTCTTTATTTTCTTC 4196

116663354 CAATCCTCAGGGCCTTTCTCAACATATGGTTTATTATAGCGTTGTGAATGATTGGTCTTT 116663413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4197 CAATCCTCAGGGCCTTTCTCAACATATGGTTTATTATAGCGTTGTGAATGATTGGTCTTT 4256

116663414 CATAAGGACATTTTCCTTGGCAGAAGGCTATTTGAAGTTCATTGCTTTTACAAGGTAAGA 116663473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4257 CATAAGGACATTTTCCTTGGCAGAAGGCTATTTGAAGTTCATTGCTTTTACAAGGTAAGA 4316

116663474 TTTCTGGAAGTTCTAAGCTATATAAATAGGTTTGGAGGAACTTTCTCTTAAACCACAGAA 116663533
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     4317 TTTCTGGAAGTTCTAAGCTATATAAATAGGTTTGGAGGAACATTCTCTTAAACCACAGAA 4376

116663534 ACTATTAATACTCTTGAGCAGGTGAGCTTATCAGATTCCTTAGTAG 116663579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4377 ACTATTAATACTCTTGAGCAGGTGAGCTTATCAGATTCCTTAGTAG 4422

Alignment time is 5.16899 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [116652076,116672656] =>     20581 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [        1,     5143] =>      5143 nucs 'mol-32-3190-049362_5143'

Score:        5006
Aligned:      5154        nucs
Identic:      5125 ( 99%) nucs =>      4214 ( 99%)       911 (100%)
Gaps:           22 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [116657837,116662076] EXCISED REGION [116662657,116663569]
 second seq =>  [       10,     4229] EXCISED REGION [     4231,     5143]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       580 nucs [116662077,116662656]
 second seq =>         1 nucs [4230,4230]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [4229,4229] to [4230,4230]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

116657837 CATTTATAAATAAAAAAGCAAACAAAACCTCTAAATTGAAACAACAGCCACCAGCCTACT 116657896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       10 CATTTATAAATAAAAAAGCAAACAAAACCTCTAAATTGAAACAACAGCCACCAGCCTACT 69

116657897 CCCATCCTTTCCAAGATATTCTAATTCTCCTCTTCCTTTTCTCCAAGGCATTTTCCTAAG 116657956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       70 CCCATCCTTTCCAAGATATTCTAATTCTCCTCTTCCTTTTCTCCAAGGCATTTTCCTAAG 129

116657957 GATAGCTCCATTTTATCTTTTACATATACTTCTTTTCTTTTCCTATATTTTTCCACCTTC 116658016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      130 GATAGCTCCATTTTATCTTTTACATATACTTCTTTTCTTTTCCTATATTTTTCCACCTTC 189

116658017 TTCTAATTTTCTTTGCTTTTCTATTGATTGTGGGTTAAGTAAGAAAAAAAGGCAAGGGTG 116658076
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
      190 TTCTAATTTTCTTTGCTTTTCTATTGATTATGGGTTAAGTAAGAAAAAAAGGCAAGGGTG 249

116658077 GCAGTCAGAGTGCGTGCAGAATTCTTCAAAGCAATGAATGTTGAGAAAAGCCGTGTATAT 116658136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      250 GCAGTCAGAGTGCGTGCAGAATTCTTCAAAGCAATGAATGTTGAGAAAAGCCGTGTATAT 309

116658137 TTAGAAGTTAATGGTCTCCCCTCTAGATTTCTATGCAGCTTGAATTCCTCAGTGTTTCTG 116658196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      310 TTAGAAGTTAATGGTCTCCCCTCTAGATTTCTATGCAGCTTGAATTCCTCAGTGTTTCTG 369

116658197 AACTTCTTGTGTTTTTCTCTTATCTTTTAAATAATACTCTGCTACTGTTTTTCTCTAGAT 116658256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      370 AACTTCTTGTGTTTTTCTCTTATCTTTTAAATAATACTCTGCTACTGTTTTTCTCTAGAT 429

116658257 TACCATTTCAGTGGATTTGAAAAATCTCTTTCCATTATTTTTCTTTTCTCCTTACTTCTT 116658316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      430 TACCATTTCAGTGGATTTGAAAAATCTCTTTCCATTATTTTTCTTTTCTCCTTACTTCTT 489

116658317 TCTTCCCCTTCTCTTATTTTTTCTCTTTCTCTCCAACTTCATCTCTTTATTAATTTCCTT 116658376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      490 TCTTCCCCTTCTCTTATTTTTTCTCTTTCTCTCCAACTTCATCTCTTTATTAATTTCCTT 549

116658377 CTCTCCTTTTAAGTTTTGGTAACTGTTTTTCATTTGGCCAGCTCTCAGTATACCTTATTT 116658436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      550 CTCTCCTTTTAAGTTTTGGTAACTGTTTTTCATTTGGCCAGCTCTCAGTATACCTTATTT 609

116658437 GTGTTGGGTACCAAAGCAAACATCCTCACCAGTGATGCAAGACTGAAGAAGTGTGATCAT 116658496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      610 GTGTTGGGTACCAAAGCAAACATCCTCACCAGTGATGCAAGACTGAAGAAGTGTGATCAT 669

116658497 TAGCTCTGCAATCACAACCACAAAACACCTGTGGCTTGCCTAAAACCTTCTTCTGTTAGA 116658556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      670 TAGCTCTGCAATCACAACCACAAAACACCTGTGGCTTGCCTAAAACCTTCTTCTGTTAGA 729

116658557 CCCTTTCCTTACTTGGAAACAATCTCATCTTAAGAAATCAAGCAATACTTGAAGAAATTT 116658616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      730 CCCTTTCCTTACTTGGAAACAATCTCATCTTAAGAAATCAAGCAATACTTGAAGAAATTT 789

116658617 TGAGGAACCCATAAGCAAGAAAAACTGTATACTCATTTCCCTTAACATGATACCATTTCA 116658676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      790 TGAGGAACCCATAAGCAAGAAAAACTGTATACTCATTTCCCTTAACATGATACCATTTCA 849

116658677 CAGTTACCTGTGTGGTGCTTTTCATTGCTATAGAAATCGAATTAAACTCAGTGTGATTGT 116658736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      850 CAGTTACCTGTGTGGTGCTTTTCATTGCTATAGAAATCGAATTAAACTCAGTGTGATTGT 909

116658737 AGCATAATGGGATACTTCACTTGAGAAAGGGGATTTTTATAATTTGGAGAAGCATTGAGA 116658796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      910 AGCATAATGGGATACTTCACTTGAGAAAGGGGATTTTTATAATTTGGAGAAGCATTGAGA 969

116658797 GTCAGCAGTGAATATTCATGACACGGGCTAGGACCATTTAAACAGACGACTTCTAGGAGA 116658856
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
      970 GTCAGCAGTGAATATTCATGACACGAGCTAGGACCATTTAAACAGACGACTTCTAGGAGA 1029

116658857 GTCTCTTGAGGACATTTAATCTCTTGTGCTTGACCATCCTGACCCAAGGTGAGTTTGAGT 116658916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1030 GTCTCTTGAGGACATTTAATCTCTTGTGCTTGACCATCCTGACCCAAGGTGAGTTTGAGT 1089

116658917 CTCAAATACATTAAAATTCTCAAACCATTAGTTTTATTTTGTTCCTGTAAACCTAAAGTT 116658976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1090 CTCAAATACATTAAAATTCTCAAACCATTAGTTTTATTTTGTTCCTGTAAACCTAAAGTT 1149

116658977 TAACTTTCAGAATACTTTTTCTCATTAGAATTATATGTTTAAAAATTCTTGGTGACATTC 116659036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1150 TAACTTTCAGAATACTTTTTCTCATTAGAATTATATGTTTAAAAATTCTTGGTGACATTC 1209

116659037 CATTCTTCACCTAATCTCACGTTTGTCTTGTTCTGTTTTGTCAAAAATGTTTTCCTAAAA 116659096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1210 CATTCTTCACCTAATCTCACGTTTGTCTTGTTCTGTTTTGTCAAAAATGTTTTCCTAAAA 1269

116659097 ATGAAAAAGAAAACCTCTAGAATGATTAATCGAGTGAGATTCTCAATAAATCTGCAACTA 116659156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1270 ATGAAAAAGAAAACCTCTAGAATGATTAATCGAGTGAGATTCTCAATAAATCTGCAACTA 1329

116659157 AAACCATCCGTAAGTCCTAACAAGTTTCAATTTTTATCACGTTAGTGTCTTTTAGTAGAT 116659216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1330 AAACCATCCGTAAGTCCTAACAAGTTTCAATTTTTATCACGTTAGTGTCTTTTAGTAGAT 1389

116659217 AAACTTTGCTCTAGGTCACTATCCAAAAAACTTATGTGAGTTCTGTTGATTGTATCCTGC 116659276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1390 AAACTTTGCTCTAGGTCACTATCCAAAAAACTTATGTGAGTTCTGTTGATTGTATCCTGC 1449

116659277 CTTTGTGTTCCTAAGAGTTGATTTGGGAAGCAAAATCCCCCAAAAATCTATATTCTCAGG 116659336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1450 CTTTGTGTTCCTAAGAGTTGATTTGGGAAGCAAAATCCCCCAAAAATCTATATTCTCAGG 1509

116659337 CCCATGGATAGTTAGAACGCAGGCTACAGATGTCAAACTCTCTAGTCAGGGGTCATGCCT 116659396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1510 CCCATGGATAGTTAGAACGCAGGCTACAGATGTCAAACTCTCTAGTCAGGGGTCATGCCT 1569

116659397 AATAAAGTGCAGAAGGAATACATTGAACAGAATGTTATACACTTTTAGGGCGTTTTAAAA 116659456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1570 AATAAAGTGCAGAAGGAATACATTGAACAGAATGTTATACACTTTTAGGGCGTTTTAAAA 1629

116659457 TTTTTGGTCTAAGTCATGTCTCTAGCAGGCTAGACACCTGTTCCAGATATGTATTCTTAA 116659516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1630 TTTTTGGTCTAAGTCATGTCTCTAGCAGGCTAGACACCTGTTCCAGATATGTATTCTTAA 1689

116659517 TATAACAAAAATTATTTAAATATCTTACCATGTGTCACAGTTACATCAATAATATTTGGA 116659576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1690 TATAACAAAAATTATTTAAATATCTTACCATGTGTCACAGTTACATCAATAATATTTGGA 1749

116659577 ATCATACTGGACCCTTTGAAAATTTTCAGTATGAGTAAAAATGTTTATCTTAGAAGTAAG 116659636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1750 ATCATACTGGACCCTTTGAAAATTTTCAGTATGAGTAAAAATGTTTATCTTAGAAGTAAG 1809

116659637 TGGAGGGGAAACATCCTTATTATTAAGTGCTAAGCCTTTTTAAAATGGTCTATGAAGATT 116659696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1810 TGGAGGGGAAACATCCTTATTATTAAGTGCTAAGCCTTTTTAAAATGGTCTATGAAGATT 1869

116659697 CTAAATAGACTTCTGATTCCAAAATACCTATAACAATGAAGTCTTTGGCCATGGCTAATT 116659756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1870 CTAAATAGACTTCTGATTCCAAAATACCTATAACAATGAAGTCTTTGGCCATGGCTAATT 1929

116659757 AAAAAAAAACATAAAACTCTAGAGACTGTCTCATTTATTAATTTGCCAAATTCTTCTTTC 116659816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1930 AAAAAAAAACATAAAACTCTAGAGACTGTCTCATTTATTAATTTGCCAAATTCTTCTTTC 1989

116659817 TTTTAACATTTTCTTTATCCCACAGTATCTTTTCTTGCTTTTTGTGCTACCACACTATCA 116659876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1990 TTTTAACATTTTCTTTATCCCACAGTATCTTTTCTTGCTTTTTGTGCTACCACACTATCA 2049

116659877 AATTTTACTCTTTTTCTCCCAAATTTCTTTTTCTAACCATCGTCTTCCCCCTCTGATTGT 116659936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2050 AATTTTACTCTTTTTCTCCCAAATTTCTTTTTCTAACCATCGTCTTCCCCCTCTGATTGT 2109

116659937 ATCTGAAAATAACCACTTGCTTTTCTTCTTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTCCTTCCTTC 116659996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2110 ATCTGAAAATAACCACTTGCTTTTCTTCTTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTCCTTCCTTC 2169

116659997 CTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCCTCTTTCCCTTTCCC 116660056
          |||||||||||||||||||||||||                    |||||||||||||||
     2170 CTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCC--------------------CTCTTTCCCTTTCCC 2209

116660057 TTTCTTTTCTTTTATTTTTTCTTCTCTCTTCTCTTCTCTTTTTCTGGGTTGCACTCTGTT 116660116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2210 TTTCTTTTCTTTTATTTTTTCTTCTCTCTTCTCTTCTCTTTTTCTGGGTTGCACTCTGTT 2269

116660117 ACCCAAGCTTGAATGCAATGGCAGGGATCACAGCTTACTGCAGTGTCAACCTCCTGGGCT 116660176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2270 ACCCAAGCTTGAATGCAATGGCAGGGATCACAGCTTACTGCAGTGTCAACCTCCTGGGCT 2329

116660177 CAGGTGATCATCCTCCTTCAGCCTCCTGTGTAGCTAGGACTGCAGGCATGTACCACCACA 116660236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2330 CAGGTGATCATCCTCCTTCAGCCTCCTGTGTAGCTAGGACTGCAGGCATGTACCACCACA 2389

116660237 CATGGCTAATTTTAGTATTTTTTGTAGAAATGAGAGTCTCACTGTGTTGTCCAGGTTTGT 116660296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2390 CATGGCTAATTTTAGTATTTTTTGTAGAAATGAGAGTCTCACTGTGTTGTCCAGGTTTGT 2449

116660297 CTCAAACTCCCAGGTTCAAGCAATCCACCTGCCTCAGCCTCTCAAACTGCTGGGATTATA 116660356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2450 CTCAAACTCCCAGGTTCAAGCAATCCACCTGCCTCAGCCTCTCAAACTGCTGGGATTATA 2509

116660357 GGCATGTGCCACCATGCTGGGCCTCAAATTGACATTTTCTTAAAAATTGGACTGCCAAAC 116660416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2510 GGCATGTGCCACCATGCTGGGCCTCAAATTGACATTTTCTTAAAAATTGGACTGCCAAAC 2569

116660417 AAGGACATTAGCCCTAGTAGGCAGAAGATACTATCTTGGTCTGTGTTAGAGGCAATTGTT 116660476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2570 AAGGACATTAGCCCTAGTAGGCAGAAGATACTATCTTGGTCTGTGTTAGAGGCAATTGTT 2629

116660477 GAAATTTCTCTGAATCTCTATGGGATAGGCATAAATGTACTGATAAATTTGAGCAGTCCT 116660536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2630 GAAATTTCTCTGAATCTCTATGGGATAGGCATAAATGTACTGATAAATTTGAGCAGTCCT 2689

116660537 GGGAATCCATAATCTCAATTTATTTGACCAATATCAATTAATACCATGTTGAGAGGTCCT 116660596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2690 GGGAATCCATAATCTCAATTTATTTGACCAATATCAATTAATACCATGTTGAGAGGTCCT 2749

116660597 TCTATTTCTGAAGTCTGGTTCAGCAAAAAATAAAAAAAAAAA-TAAAATACCTGAAATAA 116660655
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
     2750 TCTATTTCTGAAGTCTGGTTCAGCAAAAAATAAAAAAAAAAAATAAAATACCTGAAATAA 2809

116660656 TGTAGCTATTCCTGAGGTATCATTAACAGAATAGAAACTTAAAAAGCGCATGATATGGAA 116660715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2810 TGTAGCTATTCCTGAGGTATCATTAACAGAATAGAAACTTAAAAAGCGCATGATATGGAA 2869

116660716 AAATCTTTGCTGATGGTTATACATGTTAAGTTTCCAGATAACTATTAATTAGACTTGCAG 116660775
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2870 AAACCTTTGCTGATGGTTATACATGTTAAGTTTCCAGATAACTATTAATTAGACTTGCAG 2929

116660776 ACATAAAAGGCTGTACCAAGTGGATATTTTAGAGATAAATTTTTAGCACTTACAGACAAT 116660835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2930 ACATAAAAGGCTGTACCAAGTGGATATTTTAGAGATAAATTTTTAGCACTTACAGACAAT 2989

116660836 ATTATGAAGTAGCTATGTGGGCATAGAGAAATTCGGGAAATTAGCAGGCTGGTTCTGCTA 116660895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2990 ATTATGAAGTAGCTATGTGGGCATAGAGAAATTCGGGAAATTAGCAGGCTGGTTCTGCTA 3049

116660896 TAATAGATCTCAGTTCACCCTTAGGATATCTTCACTAAAGGAGCTTAACATAGCCCAGAT 116660955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3050 TAATAGATCTCAGTTCACCCTTAGGATATCTTCACTAAAGGAGCTTAACATAGCCCAGAT 3109

116660956 GGTAGATTTGATTGCCCTCATTAGAGCTGGTCACTTGGCCAAAGACAAAAAAAATTATAT 116661015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3110 GGTAGATTTGATTGCCCTCATTAGAGCTGGTCACTTGGCCAAAGACAAAAAAAATTATAT 3169

116661016 TTACACAGAAAATAGCTCAAGTACCTGAACCTCAGTATGACTATATATGGGGATAGAGTC 116661075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3170 TTACACAGAAAATAGCTCAAGTACCTGAACCTCAGTATGACTATATATGGGGATAGAGTC 3229

116661076 TTTAAGGAAGTGATTAAGGTTAAATAAAGTCATAATGATGGGGCCCTAATCTGATAAGAT 116661135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3230 TTTAAGGAAGTGATTAAGGTTAAATAAAGTCATAATGATGGGGCCCTAATCTGATAAGAT 3289

116661136 TAGCGTCCTTCTAAGAGGAGGAATCAACATCAGGGATTTTTTTTTCTCTCAACCCATGCC 116661195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3290 TAGCGTCCTTCTAAGAGGAGGAATCAACATCAGGGATTTTTTTTTCTCTCAACCCATGCC 3349

116661196 CAGAGGAAAGTCATATGAGGACGTAACACAAAGAGAGACATCTACAAATCACAGAGGTTG 116661255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     3350 CAGAGGAAAGTCATATGAGGACGTAACACAAAGAGAGACATCTACAAATCACAGGGGTTG 3409

116661256 CACCAGAAATCAACCCTGCTAGCATATCGATCTTGAACTTCTAGTCCCCAGAACTGTGAG 116661315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3410 CACCAGAAATCAACCCTGCTAGCATATCGATCTTGAACTTCTAGTCCCCAGAACTGTGAG 3469

116661316 GAAATAAATTTTTGTTGCTTATGCCACCAGATCTGTGACATTTTGTTATGGAAGTCTGAG 116661375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3470 GAAATAAATTTTTGTTGCTTATGCCACCAGATCTGTGACATTTTGTTATGGAAGTCTGAG 3529

116661376 CTGACCAATACACTTGAATAACTATCAGTGTCAATGTAAAACAAGCCATCTTTAGACTTA 116661435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3530 CTGACCAATACACTTGAATAACTATCAGTGTCAATGTAAAACAAGCCATCTTTAGACTTA 3589

116661436 AGGAAACAGTCACCTGGCTCTCTAAGGCAGATGCAAATGGATTTTTCTTTGCCCGGGTTT 116661495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3590 AGGAAACAGTCACCTGGCTCTCTAAGGCAGATGCAAATGGATTTTTCTTTGCCCGGGTTT 3649

116661496 AGTAATTCAGATTATGGCACTAAGTGTTTTGGGAAGGCTCCATGTCATTTTGATATAGTC 116661555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3650 AGTAATTCAGATTATGGCACTAAGTGTTTTGGGAAGGCTCCATGTCATTTTGATATAGTC 3709

116661556 ACTGTGTGTTGCCATTCTTATGCATGTATTCTCCACAGTCTCAGTCCTGCTCTGCAGCTG 116661615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3710 ACTGTGTGTTGCCATTCTTATGCATGTATTCTCCACAGTCTCAGTCCTGCTCTGCAGCTG 3769

116661616 CTCTCGTGTCAAATGATCCATCACTCAACGGAAATGAACTCATCACTCCATAAAAGGAAT 116661675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3770 CTCTCGTGTCAAATGATCCATCACTCAACGGAAATGAACTCATCACTCCATAAAAGGAAT 3829

116661676 AGGAAGATCAGTCCATGATCCAATCCCAAACTATTTTTTCTGAGGATGATAATGTTATCT 116661735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     3830 AGGAAGATCAGTCCATGATCCAATCCCAAACTATTTTTTCCGAGGATGATAATGTTATCT 3889

116661736 AGAAATCACAACAGTGGTATACATCTGAACATGGCTGCTTTAGTAGCTGAACGACTCTTC 116661795
          |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3890 AGAAATCACAACAG-GGTATACATCTGAACATGGCTGCTTTAGTAGCTGAACGACTCTTC 3948

116661796 TCATCTTCTCATCAGTTAGGAAAGACTGAGAACTGGTAGCATAAATCCATCAATTATGGG 116661855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3949 TCATCTTCTCATCAGTTAGGAAAGACTGAGAACTGGTAGCATAAATCCATCAATTATGGG 4008

116661856 ATTGCAATTGCAGAATGTTTTGTGACTCACATAATGTTTTCTTCTTTACTCAGAACTTCT 116661915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4009 ATTGCAATTGCAGAATGTTTTGTGACTCACATAATGTTTTCTTCTTTACTCAGAACTTCT 4068

116661916 CTATTTCACAGATTCTCACCTTAATAATTGAAGCAACTCAGGGTCACATCCTAGTTCTAT 116661975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4069 CTATTTCACAGATTCTCACCTTAATAATTGAAGCAACTCAGGGTCACATCCTAGTTCTAT 4128

116661976 AATTCTGCCTGAGGCACTCTGAGCCCAAACCATCAACAGGAAACAAACAAATAAAAAACC 116662035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4129 AATTCTGCCTGAGGCACTCTGAGCCCAAACCATCAACAGGAAACAAACAAATAAAAAACC 4188

116662036 TGCTAATTTACTCTCCAATGAAACCTTTCCAGAATTATCTG 116662076
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4189 TGCTAATTTACTCTCCAATGAAACCTTTCCAGAATTATCTG 4229

EXCISED REGION

116662657 AATGAATAACTACCGTTATAGAAATAGCTTCTGGATTTCTTTGTCCTTTTTTTCCTGAAG 116662716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4231 AATGAATAACTACCGTTATAGAAATAGCTTCTGGATTTCTTTGTCCTTTTTTTCCTGAAG 4290

116662717 TTAGGCTATATTTGGTATCTCTATAGAGATAGGCTATATTTGGTAAATCTGTTCTCACCT 116662776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4291 TTAGGCTATATTTGGTATCTCTATAGAGATAGGCTATATTTGGTAAATCTGTTCTCACCT 4350

116662777 CACATAAAAGGTTAATATTCTACAAGTGGATAGATGTGGTGAGGACAACTAAAAGGAGAT 116662836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4351 CACATAAAAGGTTAATATTCTACAAGTGGATAGATGTGGTGAGGACAACTAAAAGGAGAT 4410

116662837 TGAATGATCTCATCAAATTATATTACACAACCTTTCAAAGAAAGCTCAGTTGGATTAAGA 116662896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4411 TGAATGATCTCATCAAATTATATTACACAACCTTTCAAAGAAAGCTCAGTTGGATTAAGA 4470

116662897 GGTTTCTTTATGTTCATGCCCAAAATGCCAAATTCCAACAGCCCACAAAATTTCTTTGAA 116662956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4471 GGTTTCTTTATGTTCATGCCCAAAATGCCAAATTCCAACAGCCCACAAAATTTCTTTGAA 4530

116662957 GTATTTTTCTCATACGTTTGTTTGATGAACAGCTTAAAGCTCCATTTCCATCCTAGCAAG 116663016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4531 GTATTTTTCTCATACGTTTGTTTGATGAACAGCTTAAAGCTCCATTTCCATCCTAGCAAG 4590

116663017 TGGCAGACAAAAAGCCAGATAGTAAATCATATTTTAATAAAAATGATTTTAATAAGTGAA 116663076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4591 TGGCAGACAAAAAGCCAGATAGTAAATCATATTTTAATAAAAATGATTTTAATAAGTGAA 4650

116663077 AGATATGATCCATTAAGTTAATCTTGTTAAGTAGAAGACCAAAATGAGAACTTAATGGGG 116663136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4651 AGATATGATCCATTAAGTTAATCTTGTTAAGTAGAAGACCAAAATGAGAACTTAATGGGG 4710

116663137 TGCAAACATCACGGAGAATCAAAACACACACTAGAAACCATACTTGAGAACCAGAGATGA 116663196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4711 TGCAAACATCACGGAGAATCAAAACACACACTAGAAACCATACTTGAGAACCAGAGATGA 4770

116663197 GTGAATGTTTGGTCATCAATATCCATGCTAGCCTTAATCTTGTGGTTATCCCACCACATC 116663256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4771 GTGAATGTTTGGTCATCAATATCCATGCTAGCCTTAATCTTGTGGTTATCCCACCACATC 4830

116663257 CCCCTTTTCAACAGAAGTCAGTGAGCAGCAAGCCTCATTGAATGTTGGATATTAGCAAGC 116663316
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4831 CCCCTTTTCAACAGAAGTCAGTGAGTAGCAAGCCTCATTGAATGTTGGATATTAGCAAGC 4890

116663317 ACATGTAGTTTTGCTTCAAGTACTCTTTATTTTCTTCCAATCCTCAGGGCCTTTCTCAAC 116663376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4891 ACATGTAGTTTTGCTTCAAGTACTCTTTATTTTCTTCCAATCCTCAGGGCCTTTCTCAAC 4950

116663377 ATATGGTTTATTATAGCGTTGTGAATGATTGGTCTTTCATAAGGACATTTTCCTTGGCAG 116663436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4951 ATATGGTTTATTATAGCGTTGTGAATGATTGGTCTTTCATAAGGACATTTTCCTTGGCAG 5010

116663437 AAGGCTATTTGAAGTTCATTGCTTTTACAAGGTAAGATTTCTGGAAGTTCTAAGCTATAT 116663496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5011 AAGGCTATTTGAAGTTCATTGCTTTTACAAGGTAAGATTTCTGGAAGTTCTAAGCTATAT 5070

116663497 AAATAGGTTTGGAGGAACTTTCTCTTAAACCACAGAAACTATTAATACTCTTGAGCAGGT 116663556
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5071 AAATAGGTTTGGAGGAACATTCTCTTAAACCACAGAAACTATTAATACTCTTGAGCAGGT 5130

116663557 GAGCTTATCAGAT 116663569
          |||||||||||||
     5131 GAGCTTATCAGAT 5143

Alignment time is 5.93943 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [116652076,116672656] =>     20581 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [        1,     5207] =>      5207 nucs 'mol-32-3190-071324_5207'

Score:        5068
Aligned:      5227        nucs
Identic:      5197 ( 99%) nucs =>      4273 ( 99%)       924 (100%)
Gaps:           22 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [116657777,116662076] EXCISED REGION [116662657,116663582]
 second seq =>  [        1,     4280] EXCISED REGION [     4282,     5207]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       580 nucs [116662077,116662656]
 second seq =>         1 nucs [4281,4281]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [4280,4280] to [4281,4281]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

116657777 GTTAATTATAAAGCAAATAAACTCGCTTTAGGAAAAATGCAAAAAATCTGATAATATGCT 116657836
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
        1 GTTAATTATAAAGCAAATAAACTCGCTTTAGGAAAAATGCAAAAAATCTGATAATATGCC 60

116657837 CATTTATAAATAAAAAAGCAAACAAAACCTCTAAATTGAAACAACAGCCACCAGCCTACT 116657896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CATTTATAAATAAAAAAGCAAACAAAACCTCTAAATTGAAACAACAGCCACCAGCCTACT 120

116657897 CCCATCCTTTCCAAGATATTCTAATTCTCCTCTTCCTTTTCTCCAAGGCATTTTCCTAAG 116657956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCCATCCTTTCCAAGATATTCTAATTCTCCTCTTCCTTTTCTCCAAGGCATTTTCCTAAG 180

116657957 GATAGCTCCATTTTATCTTTTACATATACTTCTTTTCTTTTCCTATATTTTTCCACCTTC 116658016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GATAGCTCCATTTTATCTTTTACATATACTTCTTTTCTTTTCCTATATTTTTCCACCTTC 240

116658017 TTCTAATTTTCTTTGCTTTTCTATTGATTGTGGGTTAAGTAAGAAAAAAAGGCAAGGGTG 116658076
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTCTAATTTTCTTTGCTTTTCTATTGATTATGGGTTAAGTAAGAAAAAAAGGCAAGGGTG 300

116658077 GCAGTCAGAGTGCGTGCAGAATTCTTCAAAGCAATGAATGTTGAGAAAAGCCGTGTATAT 116658136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GCAGTCAGAGTGCGTGCAGAATTCTTCAAAGCAATGAATGTTGAGAAAAGCCGTGTATAT 360

116658137 TTAGAAGTTAATGGTCTCCCCTCTAGATTTCTATGCAGCTTGAATTCCTCAGTGTTTCTG 116658196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTAGAAGTTAATGGTCTCCCCTCTAGATTTCTATGCAGCTTGAATTCCTCAGTGTTTCTG 420

116658197 AACTTCTTGTGTTTTTCTCTTATCTTTTAAATAATACTCTGCTACTGTTTTTCTCTAGAT 116658256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AACTTCTTGTGTTTTTCTCTTATCTTTTAAATAATACTCTGCTACTGTTTTTCTCTAGAT 480

116658257 TACCATTTCAGTGGATTTGAAAAATCTCTTTCCATTATTTTTCTTTTCTCCTTACTTCTT 116658316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TACCATTTCAGTGGATTTGAAAAATCTCTTTCCATTATTTTTCTTTTCTCCTTACTTCTT 540

116658317 TCTTCCCCTTCTCTTATTTTTTCTCTTTCTCTCCAACTTCATCTCTTTATTAATTTCCTT 116658376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCTTCCCCTTCTCTTATTTTTTCTCTTTCTCTCCAACTTCATCTCTTTATTAATTTCCTT 600

116658377 CTCTCCTTTTAAGTTTTGGTAACTGTTTTTCATTTGGCCAGCTCTCAGTATACCTTATTT 116658436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTCTCCTTTTAAGTTTTGGTAACTGTTTTTCATTTGGCCAGCTCTCAGTATACCTTATTT 660

116658437 GTGTTGGGTACCAAAGCAAACATCCTCACCAGTGATGCAAGACTGAAGAAGTGTGATCAT 116658496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GTGTTGGGTACCAAAGCAAACATCCTCACCAGTGATGCAAGACTGAAGAAGTGTGATCAT 720

116658497 TAGCTCTGCAATCACAACCACAAAACACCTGTGGCTTGCCTAAAACCTTCTTCTGTTAGA 116658556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TAGCTCTGCAATCACAACCACAAAACACCTGTGGCTTGCCTAAAACCTTCTTCTGTTAGA 780

116658557 CCCTTTCCTTACTTGGAAACAATCTCATCTTAAGAAATCAAGCAATACTTGAAGAAATTT 116658616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CCCTTTCCTTACTTGGAAACAATCTCATCTTAAGAAATCAAGCAATACTTGAAGAAATTT 840

116658617 TGAGGAACCCATAAGCAAGAAAAACTGTATACTCATTTCCCTTAACATGATACCATTTCA 116658676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGAGGAACCCATAAGCAAGAAAAACTGTATACTCATTTCCCTTAACATGATACCATTTCA 900

116658677 CAGTTACCTGTGTGGTGCTTTTCATTGCTATAGAAATCGAATTAAACTCAGTGTGATTGT 116658736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CAGTTACCTGTGTGGTGCTTTTCATTGCTATAGAAATCGAATTAAACTCAGTGTGATTGT 960

116658737 AGCATAATGGGATACTTCACTTGAGAAAGGGGATTTTTATAATTTGGAGAAGCATTGAGA 116658796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AGCATAATGGGATACTTCACTTGAGAAAGGGGATTTTTATAATTTGGAGAAGCATTGAGA 1020

116658797 GTCAGCAGTGAATATTCATGACACGGGCTAGGACCATTTAAACAGACGACTTCTAGGAGA 116658856
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GTCAGCAGTGAATATTCATGACACGAGCTAGGACCATTTAAACAGACGACTTCTAGGAGA 1080

116658857 GTCTCTTGAGGACATTTAATCTCTTGTGCTTGACCATCCTGACCCAAGGTGAGTTTGAGT 116658916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GTCTCTTGAGGACATTTAATCTCTTGTGCTTGACCATCCTGACCCAAGGTGAGTTTGAGT 1140

116658917 CTCAAATACATTAAAATTCTCAAACCATTAGTTTTATTTTGTTCCTGTAAACCTAAAGTT 116658976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTCAAATACATTAAAATTCTCAAACCATTAGTTTTATTTTGTTCCTGTAAACCTAAAGTT 1200

116658977 TAACTTTCAGAATACTTTTTCTCATTAGAATTATATGTTTAAAAATTCTTGGTGACATTC 116659036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TAACTTTCAGAATACTTTTTCTCATTAGAATTATATGTTTAAAAATTCTTGGTGACATTC 1260

116659037 CATTCTTCACCTAATCTCACGTTTGTCTTGTTCTGTTTTGTCAAAAATGTTTTCCTAAAA 116659096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CATTCTTCACCTAATCTCACGTTTGTCTTGTTCTGTTTTGTCAAAAATGTTTTCCTAAAA 1320

116659097 ATGAAAAAGAAAACCTCTAGAATGATTAATCGAGTGAGATTCTCAATAAATCTGCAACTA 116659156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ATGAAAAAGAAAACCTCTAGAATGATTAATCGAGTGAGATTCTCAATAAATCTGCAACTA 1380

116659157 AAACCATCCGTAAGTCCTAACAAGTTTCAATTTTTATCACGTTAGTGTCTTTTAGTAGAT 116659216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AAACCATCCGTAAGTCCTAACAAGTTTCAATTTTTATCACGTTAGTGTCTTTTAGTAGAT 1440

116659217 AAACTTTGCTCTAGGTCACTATCCAAAAAACTTATGTGAGTTCTGTTGATTGTATCCTGC 116659276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AAACTTTGCTCTAGGTCACTATCCAAAAAACTTATGTGAGTTCTGTTGATTGTATCCTGC 1500

116659277 CTTTGTGTTCCTAAGAGTTGATTTGGGAAGCAAAATCCCCCAAAAATCTATATTCTCAGG 116659336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CTTTGTGTTCCTAAGAGTTGATTTGGGAAGCAAAATCCCCCAAAAATCTATATTCTCAGG 1560

116659337 CCCATGGATAGTTAGAACGCAGGCTACAGATGTCAAACTCTCTAGTCAGGGGTCATGCCT 116659396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CCCATGGATAGTTAGAACGCAGGCTACAGATGTCAAACTCTCTAGTCAGGGGTCATGCCT 1620

116659397 AATAAAGTGCAGAAGGAATACATTGAACAGAATGTTATACACTTTTAGGGCGTTTTAAAA 116659456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AATAAAGTGCAGAAGGAATACATTGAACAGAATGTTATACACTTTTAGGGCGTTTTAAAA 1680

116659457 TTTTTGGTCTAAGTCATGTCTCTAGCAGGCTAGACACCTGTTCCAGATATGTATTCTTAA 116659516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTTTTGGTCTAAGTCATGTCTCTAGCAGGCTAGACACCTGTTCCAGATATGTATTCTTAA 1740

116659517 TATAACAAAAATTATTTAAATATCTTACCATGTGTCACAGTTACATCAATAATATTTGGA 116659576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TATAACAAAAATTATTTAAATATCTTACCATGTGTCACAGTTACATCAATAATATTTGGA 1800

116659577 ATCATACTGGACCCTTTGAAAATTTTCAGTATGAGTAAAAATGTTTATCTTAGAAGTAAG 116659636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ATCATACTGGACCCTTTGAAAATTTTCAGTATGAGTAAAAATGTTTATCTTAGAAGTAAG 1860

116659637 TGGAGGGGAAACATCCTTATTATTAAGTGCTAAGCCTTTTTAAAATGGTCTATGAAGATT 116659696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TGGAGGGGAAACATCCTTATTATTAAGTGCTAAGCCTTTTTAAAATGGTCTATGAAGATT 1920

116659697 CTAAATAGACTTCTGATTCCAAAATACCTATAACAATGAAGTCTTTGGCCATGGCTAATT 116659756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CTAAATAGACTTCTGATTCCAAAATACCTATAACAATGAAGTCTTTGGCCATGGCTAATT 1980

116659757 AAAAAAAAACATAAAACTCTAGAGACTGTCTCATTTATTAATTTGCCAAATTCTTCTTTC 116659816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AAAAAAAAACATAAAACTCTAGAGACTGTCTCATTTATTAATTTGCCAAATTCTTCTTTC 2040

116659817 TTTTAACATTTTCTTTATCCCACAGTATCTTTTCTTGCTTTTTGTGCTACCACACTATCA 116659876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TTTTAACATTTTCTTTATCCCACAGTATCTTTTCTTGCTTTTTGTGCTACCACACTATCA 2100

116659877 AATTTTACTCTTTTTCTCCCAAATTTCTTTTTCTAACCATCGTCTTCCCCCTCTGATTGT 116659936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AATTTTACTCTTTTTCTCCCAAATTTCTTTTTCTAACCATCGTCTTCCCCCTCTGATTGT 2160

116659937 ATCTGAAAATAACCACTTGCTTTTCTTCTTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTCCTTCCTTC 116659996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ATCTGAAAATAACCACTTGCTTTTCTTCTTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTCCTTCCTTC 2220

116659997 CTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCCTCTTTCCCTTTCCC 116660056
          |||||||||||||||||||||||||                    |||||||||||||||
     2221 CTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCC--------------------CTCTTTCCCTTTCCC 2260

116660057 TTTCTTTTCTTTTATTTTTTCTTCTCTCTTCTCTTCTCTTTTTCTGGGTTGCACTCTGTT 116660116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2261 TTTCTTTTCTTTTATTTTTTCTTCTCTCTTCTCTTCTCTTTTTCTGGGTTGCACTCTGTT 2320

116660117 ACCCAAGCTTGAATGCAATGGCAGGGATCACAGCTTACTGCAGTGTCAACCTCCTGGGCT 116660176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2321 ACCCAAGCTTGAATGCAATGGCAGGGATCACAGCTTACTGCAGTGTCAACCTCCTGGGCT 2380

116660177 CAGGTGATCATCCTCCTTCAGCCTCCTGTGTAGCTAGGACTGCAGGCATGTACCACCACA 116660236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2381 CAGGTGATCATCCTCCTTCAGCCTCCTGTGTAGCTAGGACTGCAGGCATGTACCACCACA 2440

116660237 CATGGCTAATTTTAGTATTTTTTGTAGAAATGAGAGTCTCACTGTGTTGTCCAGGTTTGT 116660296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2441 CATGGCTAATTTTAGTATTTTTTGTAGAAATGAGAGTCTCACTGTGTTGTCCAGGTTTGT 2500

116660297 CTCAAACTCCCAGGTTCAAGCAATCCACCTGCCTCAGCCTCTCAAACTGCTGGGATTATA 116660356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2501 CTCAAACTCCCAGGTTCAAGCAATCCACCTGCCTCAGCCTCTCAAACTGCTGGGATTATA 2560

116660357 GGCATGTGCCACCATGCTGGGCCTCAAATTGACATTTTCTTAAAAATTGGACTGCCAAAC 116660416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2561 GGCATGTGCCACCATGCTGGGCCTCAAATTGACATTTTCTTAAAAATTGGACTGCCAAAC 2620

116660417 AAGGACATTAGCCCTAGTAGGCAGAAGATACTATCTTGGTCTGTGTTAGAGGCAATTGTT 116660476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2621 AAGGACATTAGCCCTAGTAGGCAGAAGATACTATCTTGGTCTGTGTTAGAGGCAATTGTT 2680

116660477 GAAATTTCTCTGAATCTCTATGGGATAGGCATAAATGTACTGATAAATTTGAGCAGTCCT 116660536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2681 GAAATTTCTCTGAATCTCTATGGGATAGGCATAAATGTACTGATAAATTTGAGCAGTCCT 2740

116660537 GGGAATCCATAATCTCAATTTATTTGACCAATATCAATTAATACCATGTTGAGAGGTCCT 116660596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2741 GGGAATCCATAATCTCAATTTATTTGACCAATATCAATTAATACCATGTTGAGAGGTCCT 2800

116660597 TCTATTTCTGAAGTCTGGTTCAGCAAAAAATAAAAAAAAAAA-TAAAATACCTGAAATAA 116660655
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
     2801 TCTATTTCTGAAGTCTGGTTCAGCAAAAAATAAAAAAAAAAAATAAAATACCTGAAATAA 2860

116660656 TGTAGCTATTCCTGAGGTATCATTAACAGAATAGAAACTTAAAAAGCGCATGATATGGAA 116660715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2861 TGTAGCTATTCCTGAGGTATCATTAACAGAATAGAAACTTAAAAAGCGCATGATATGGAA 2920

116660716 AAATCTTTGCTGATGGTTATACATGTTAAGTTTCCAGATAACTATTAATTAGACTTGCAG 116660775
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2921 AAACCTTTGCTGATGGTTATACATGTTAAGTTTCCAGATAACTATTAATTAGACTTGCAG 2980

116660776 ACATAAAAGGCTGTACCAAGTGGATATTTTAGAGATAAATTTTTAGCACTTACAGACAAT 116660835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2981 ACATAAAAGGCTGTACCAAGTGGATATTTTAGAGATAAATTTTTAGCACTTACAGACAAT 3040

116660836 ATTATGAAGTAGCTATGTGGGCATAGAGAAATTCGGGAAATTAGCAGGCTGGTTCTGCTA 116660895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3041 ATTATGAAGTAGCTATGTGGGCATAGAGAAATTCGGGAAATTAGCAGGCTGGTTCTGCTA 3100

116660896 TAATAGATCTCAGTTCACCCTTAGGATATCTTCACTAAAGGAGCTTAACATAGCCCAGAT 116660955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3101 TAATAGATCTCAGTTCACCCTTAGGATATCTTCACTAAAGGAGCTTAACATAGCCCAGAT 3160

116660956 GGTAGATTTGATTGCCCTCATTAGAGCTGGTCACTTGGCCAAAGACAAAAAAAATTATAT 116661015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3161 GGTAGATTTGATTGCCCTCATTAGAGCTGGTCACTTGGCCAAAGACAAAAAAAATTATAT 3220

116661016 TTACACAGAAAATAGCTCAAGTACCTGAACCTCAGTATGACTATATATGGGGATAGAGTC 116661075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3221 TTACACAGAAAATAGCTCAAGTACCTGAACCTCAGTATGACTATATATGGGGATAGAGTC 3280

116661076 TTTAAGGAAGTGATTAAGGTTAAATAAAGTCATAATGATGGGGCCCTAATCTGATAAGAT 116661135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3281 TTTAAGGAAGTGATTAAGGTTAAATAAAGTCATAATGATGGGGCCCTAATCTGATAAGAT 3340

116661136 TAGCGTCCTTCTAAGAGGAGGAATCAACATCAGGGATTTTTTTTTCTCTCAACCCATGCC 116661195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3341 TAGCGTCCTTCTAAGAGGAGGAATCAACATCAGGGATTTTTTTTTCTCTCAACCCATGCC 3400

116661196 CAGAGGAAAGTCATATGAGGACGTAACACAAAGAGAGACATCTACAAATCACAGAGGTTG 116661255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     3401 CAGAGGAAAGTCATATGAGGACGTAACACAAAGAGAGACATCTACAAATCACAGGGGTTG 3460

116661256 CACCAGAAATCAACCCTGCTAGCATATCGATCTTGAACTTCTAGTCCCCAGAACTGTGAG 116661315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3461 CACCAGAAATCAACCCTGCTAGCATATCGATCTTGAACTTCTAGTCCCCAGAACTGTGAG 3520

116661316 GAAATAAATTTTTGTTGCTTATGCCACCAGATCTGTGACATTTTGTTATGGAAGTCTGAG 116661375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3521 GAAATAAATTTTTGTTGCTTATGCCACCAGATCTGTGACATTTTGTTATGGAAGTCTGAG 3580

116661376 CTGACCAATACACTTGAATAACTATCAGTGTCAATGTAAAACAAGCCATCTTTAGACTTA 116661435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3581 CTGACCAATACACTTGAATAACTATCAGTGTCAATGTAAAACAAGCCATCTTTAGACTTA 3640

116661436 AGGAAACAGTCACCTGGCTCTCTAAGGCAGATGCAAATGGATTTTTCTTTGCCCGGGTTT 116661495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3641 AGGAAACAGTCACCTGGCTCTCTAAGGCAGATGCAAATGGATTTTTCTTTGCCCGGGTTT 3700

116661496 AGTAATTCAGATTATGGCACTAAGTGTTTTGGGAAGGCTCCATGTCATTTTGATATAGTC 116661555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3701 AGTAATTCAGATTATGGCACTAAGTGTTTTGGGAAGGCTCCATGTCATTTTGATATAGTC 3760

116661556 ACTGTGTGTTGCCATTCTTATGCATGTATTCTCCACAGTCTCAGTCCTGCTCTGCAGCTG 116661615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3761 ACTGTGTGTTGCCATTCTTATGCATGTATTCTCCACAGTCTCAGTCCTGCTCTGCAGCTG 3820

116661616 CTCTCGTGTCAAATGATCCATCACTCAACGGAAATGAACTCATCACTCCATAAAAGGAAT 116661675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3821 CTCTCGTGTCAAATGATCCATCACTCAACGGAAATGAACTCATCACTCCATAAAAGGAAT 3880

116661676 AGGAAGATCAGTCCATGATCCAATCCCAAACTATTTTTTCTGAGGATGATAATGTTATCT 116661735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     3881 AGGAAGATCAGTCCATGATCCAATCCCAAACTATTTTTTCCGAGGATGATAATGTTATCT 3940

116661736 AGAAATCACAACAGTGGTATACATCTGAACATGGCTGCTTTAGTAGCTGAACGACTCTTC 116661795
          |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3941 AGAAATCACAACAG-GGTATACATCTGAACATGGCTGCTTTAGTAGCTGAACGACTCTTC 3999

116661796 TCATCTTCTCATCAGTTAGGAAAGACTGAGAACTGGTAGCATAAATCCATCAATTATGGG 116661855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4000 TCATCTTCTCATCAGTTAGGAAAGACTGAGAACTGGTAGCATAAATCCATCAATTATGGG 4059

116661856 ATTGCAATTGCAGAATGTTTTGTGACTCACATAATGTTTTCTTCTTTACTCAGAACTTCT 116661915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4060 ATTGCAATTGCAGAATGTTTTGTGACTCACATAATGTTTTCTTCTTTACTCAGAACTTCT 4119

116661916 CTATTTCACAGATTCTCACCTTAATAATTGAAGCAACTCAGGGTCACATCCTAGTTCTAT 116661975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4120 CTATTTCACAGATTCTCACCTTAATAATTGAAGCAACTCAGGGTCACATCCTAGTTCTAT 4179

116661976 AATTCTGCCTGAGGCACTCTGAGCCCAAACCATCAACAGGAAACAAACAAATAAAAAACC 116662035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4180 AATTCTGCCTGAGGCACTCTGAGCCCAAACCATCAACAGGAAACAAACAAATAAAAAACC 4239

116662036 TGCTAATTTACTCTCCAATGAAACCTTTCCAGAATTATCTG 116662076
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4240 TGCTAATTTACTCTCCAATGAAACCTTTCCAGAATTATCTG 4280

EXCISED REGION

116662657 AATGAATAACTACCGTTATAGAAATAGCTTCTGGATTTCTTTGTCCTTTTTTTCCTGAAG 116662716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4282 AATGAATAACTACCGTTATAGAAATAGCTTCTGGATTTCTTTGTCCTTTTTTTCCTGAAG 4341

116662717 TTAGGCTATATTTGGTATCTCTATAGAGATAGGCTATATTTGGTAAATCTGTTCTCACCT 116662776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4342 TTAGGCTATATTTGGTATCTCTATAGAGATAGGCTATATTTGGTAAATCTGTTCTCACCT 4401

116662777 CACATAAAAGGTTAATATTCTACAAGTGGATAGATGTGGTGAGGACAACTAAAAGGAGAT 116662836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4402 CACATAAAAGGTTAATATTCTACAAGTGGATAGATGTGGTGAGGACAACTAAAAGGAGAT 4461

116662837 TGAATGATCTCATCAAATTATATTACACAACCTTTCAAAGAAAGCTCAGTTGGATTAAGA 116662896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4462 TGAATGATCTCATCAAATTATATTACACAACCTTTCAAAGAAAGCTCAGTTGGATTAAGA 4521

116662897 GGTTTCTTTATGTTCATGCCCAAAATGCCAAATTCCAACAGCCCACAAAATTTCTTTGAA 116662956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4522 GGTTTCTTTATGTTCATGCCCAAAATGCCAAATTCCAACAGCCCACAAAATTTCTTTGAA 4581

116662957 GTATTTTTCTCATACGTTTGTTTGATGAACAGCTTAAAGCTCCATTTCCATCCTAGCAAG 116663016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4582 GTATTTTTCTCATACGTTTGTTTGATGAACAGCTTAAAGCTCCATTTCCATCCTAGCAAG 4641

116663017 TGGCAGACAAAAAGCCAGATAGTAAATCATATTTTAATAAAAATGATTTTAATAAGTGAA 116663076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4642 TGGCAGACAAAAAGCCAGATAGTAAATCATATTTTAATAAAAATGATTTTAATAAGTGAA 4701

116663077 AGATATGATCCATTAAGTTAATCTTGTTAAGTAGAAGACCAAAATGAGAACTTAATGGGG 116663136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4702 AGATATGATCCATTAAGTTAATCTTGTTAAGTAGAAGACCAAAATGAGAACTTAATGGGG 4761

116663137 TGCAAACATCACGGAGAATCAAAACACACACTAGAAACCATACTTGAGAACCAGAGATGA 116663196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4762 TGCAAACATCACGGAGAATCAAAACACACACTAGAAACCATACTTGAGAACCAGAGATGA 4821

116663197 GTGAATGTTTGGTCATCAATATCCATGCTAGCCTTAATCTTGTGGTTATCCCACCACATC 116663256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4822 GTGAATGTTTGGTCATCAATATCCATGCTAGCCTTAATCTTGTGGTTATCCCACCACATC 4881

116663257 CCCCTTTTCAACAGAAGTCAGTGAGCAGCAAGCCTCATTGAATGTTGGATATTAGCAAGC 116663316
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4882 CCCCTTTTCAACAGAAGTCAGTGAGTAGCAAGCCTCATTGAATGTTGGATATTAGCAAGC 4941

116663317 ACATGTAGTTTTGCTTCAAGTACTCTTTATTTTCTTCCAATCCTCAGGGCCTTTCTCAAC 116663376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4942 ACATGTAGTTTTGCTTCAAGTACTCTTTATTTTCTTCCAATCCTCAGGGCCTTTCTCAAC 5001

116663377 ATATGGTTTATTATAGCGTTGTGAATGATTGGTCTTTCATAAGGACATTTTCCTTGGCAG 116663436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5002 ATATGGTTTATTATAGCGTTGTGAATGATTGGTCTTTCATAAGGACATTTTCCTTGGCAG 5061

116663437 AAGGCTATTTGAAGTTCATTGCTTTTACAAGGTAAGATTTCTGGAAGTTCTAAGCTATAT 116663496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5062 AAGGCTATTTGAAGTTCATTGCTTTTACAAGGTAAGATTTCTGGAAGTTCTAAGCTATAT 5121

116663497 AAATAGGTTTGGAGGAACTTTCTCTTAAACCACAGAAACTATTAATACTCTTGAGCAGGT 116663556
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5122 AAATAGGTTTGGAGGAACATTCTCTTAAACCACAGAAACTATTAATACTCTTGAGCAGGT 5181

116663557 GAGCTTATCAGATTCCTTAGTAGTCA 116663582
          ||||||||||||||||||||||||||
     5182 GAGCTTATCAGATTCCTTAGTAGTCA 5207

Alignment time is 6.33118 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [116652076,116672656] =>     20581 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [        1,     7489] =>      7489 nucs 'mol-32-322a-154694_7489'

Score:        7468
Aligned:      7490        nucs
Identic:      7488 (100%) nucs =>      5113 (100%)      2375 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [116654871,116659985] EXCISED REGION [116659998,116662372]
 second seq =>  [        1,     5114] EXCISED REGION [     5115,     7489]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        12 nucs [116659986,116659997]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        44 nucs [116659986,116660029] to [116659998,116660041]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [116659984,116659985] to [116659998,116659999]
 second seq =>         2 nucs [5113,5114] to [5115,5116]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [116659986,116659989] to [116659994,116659997]
 second seq =>         0 nucs

116654871 CTACAGTATACCTTACAAGTACTCTTCAAAACTGTGAGAGCCATCAATAACAAAGTATGA 116654930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTACAGTATACCTTACAAGTACTCTTCAAAACTGTGAGAGCCATCAATAACAAAGTATGA 60

116654931 GAAGCTGTCACAGTGCTGAGGAGCCTAAGGCGACATGATTACCAAGTGCAATGTGATATC 116654990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAAGCTGTCACAGTGCTGAGGAGCCTAAGGCGACATGATTACCAAGTGCAATGTGATATC 120

116654991 CTGGATGGGATCCTGGAAGAGAAAAAGGAAATTAGGTAAAAACTAAAGAAATCTGAATAA 116655050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTGGATGGGATCCTGGAAGAGAAAAAGGAAATTAGGTAAAAACTAAAGAAATCTGAATAA 180

116655051 ACTATACACTTTAATTAATTATAATATATAAATATCAGTCTGTTGATGTTTACAAATGTA 116655110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACTATACACTTTAATTAATTATAATATATAAATATCAGTCTGTTGATGTTTACAAATGTA 240

116655111 CCACTCATGTATAAATATCAGTCTGTTAATGTTTACAAATCTACCACTCAAGTGTCTAAT 116655170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCACTCATGTATAAATATCAGTCTGTTAATGTTTACAAATCTACCACTCAAGTGTCTAAT 300

116655171 TTTAATAATAGGAAAAATAATGTATGAGGGGCACAGTGGAAATCTGCAGTTCTGCACAAT 116655230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTAATAATAGGAAAAATAATGTATGAGGGGCACAGTGGAAATCTGCAGTTCTGCACAAT 360

116655231 TTCTCTGGGAATCTAAAACTTGAAAAAAATAGTCTATTAATAATACCAACACAGAAGCAA 116655290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTCTCTGGGAATCTAAAACTTGAAAAAAATAGTCTATTAATAATACCAACACAGAAGCAA 420

116655291 GTTGAGGCATTTGTTTTTGGAATTCAGGGTTAAAGACAGTTGCTTCAGGGAGAGGTGCAA 116655350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTTGAGGCATTTGTTTTTGGAATTCAGGGTTAAAGACAGTTGCTTCAGGGAGAGGTGCAA 480

116655351 GTCACTATCTGACACTGGCACTGGAAATTTTTCTTTTCTTCTCAGTTACTGGTCATTCTT 116655410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTCACTATCTGACACTGGCACTGGAAATTTTTCTTTTCTTCTCAGTTACTGGTCATTCTT 540

116655411 GGAAAGTCAGGTGATACCCCTCAAGTAAATTTTCCCCAAAATGGAGCTAAAAATATACCC 116655470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGAAAGTCAGGTGATACCCCTCAAGTAAATTTTCCCCAAAATGGAGCTAAAAATATACCC 600

116655471 TGAGGGCAGACATAAATAAAAGGGCCAAAAGAAGGAGAGAAATACAAAAGTCAATGTTAG 116655530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGAGGGCAGACATAAATAAAAGGGCCAAAAGAAGGAGAGAAATACAAAAGTCAATGTTAG 660

116655531 TCTCTTTCCTCACGTCTCCACCTTTTCTTCTGTGTTCTCAATATATTGATTTTCTGAAGG 116655590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCTCTTTCCTCACGTCTCCACCTTTTCTTCTGTGTTCTCAATATATTGATTTTCTGAAGG 720

116655591 CATCCTTCACCATTGCCATCTGTGAGTGATATTACCACTGCTGGTCATGACCTTCCACAA 116655650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CATCCTTCACCATTGCCATCTGTGAGTGATATTACCACTGCTGGTCATGACCTTCCACAA 780

116655651 TGAGGATATTTGAACTAGATAGCTGGCAGGGTGCAGTGCCTTGAGAGGCCAGTGAGGACA 116655710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGAGGATATTTGAACTAGATAGCTGGCAGGGTGCAGTGCCTTGAGAGGCCAGTGAGGACA 840

116655711 GAGATTTTTGCTGACTCTGAACTCAATCTTCCTCACTGAAGTGAAAGTTTAAATTAGATT 116655770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GAGATTTTTGCTGACTCTGAACTCAATCTTCCTCACTGAAGTGAAAGTTTAAATTAGATT 900

116655771 TTCAAATAGGGTATATGCAATTGTGTATTTCCTCATAATTTTTCCCTTGATGTGATGATT 116655830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTCAAATAGGGTATATGCAATTGTGTATTTCCTCATAATTTTTCCCTTGATGTGATGATT 960

116655831 GCTTTCCAACAGGACAAAGCATTGTGACACGTAATATTAACCTAAGTGATATCTTTCCAG 116655890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GCTTTCCAACAGGACAAAGCATTGTGACACGTAATATTAACCTAAGTGATATCTTTCCAG 1020

116655891 GCTTACAAGTGTGCTTGTTTTACTTTGTTATTTCCTGAAGACTTCCTTTACACTTCTCTT 116655950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GCTTACAAGTGTGCTTGTTTTACTTTGTTATTTCCTGAAGACTTCCTTTACACTTCTCTT 1080

116655951 GATTTCTGCCATTTTTATAATAATGTATGGTAAGAACAACATTGTGGGTACTAATTATAT 116656010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GATTTCTGCCATTTTTATAATAATGTATGGTAAGAACAACATTGTGGGTACTAATTATAT 1140

116656011 ATTCTTTCAAACAAAGAATGCTATTATGTTTGCTTTCTTCTGAGGTAGCTTATGCATACA 116656070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATTCTTTCAAACAAAGAATGCTATTATGTTTGCTTTCTTCTGAGGTAGCTTATGCATACA 1200

116656071 TTTTTGTTGCCCTTTTAGCTTTGAGATCATATTAAGTTGAAATTTTAAAAGTGACTGTCG 116656130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTTTTGTTGCCCTTTTAGCTTTGAGATCATATTAAGTTGAAATTTTAAAAGTGACTGTCG 1260

116656131 CGGGCGTGGTGGCTTATGCCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCCGAAGCAGGCAGATCA 116656190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CGGGCGTGGTGGCTTATGCCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCCGAAGCAGGCAGATCA 1320

116656191 CCTGAGGTCGGGAGTTCGAAACGAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCCGTCTCTACTAAA 116656250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CCTGAGGTCGGGAGTTCGAAACGAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCCGTCTCTACTAAA 1380

116656251 AATACAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGTGCATACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTG 116656310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AATACAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGTGCATACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTG 1440

116656311 AGGCAGGAGAATCTCTTGAACCCGGGAGGCAGAGGTTGTGGTGAGCCGAAATCACACCAC 116656370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AGGCAGGAGAATCTCTTGAACCCGGGAGGCAGAGGTTGTGGTGAGCCGAAATCACACCAC 1500

116656371 TGTACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGTGAAAGTGAAACTCCGTCTCAAGAAAAAAAAAAAA 116656430
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGTGAAAGTGAAACTCCGTCTCAAGAAAAAAAAAAAA 1560

116656431 AAATGACTATTAGAACCCATTCTTGAATTTGGCTAATTGATTAGAGAGAGACAAAAATGT 116656490
          || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AA-TGACTATTAGAACCCATTCTTGAATTTGGCTAATTGATTAGAGAGAGACAAAAATGT 1619

116656491 TATAAGCAATTTCTCATTATTTTCTCTTATTTGCCTTGACTTTGATTGTGGCTGCCACTG 116656550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 TATAAGCAATTTCTCATTATTTTCTCTTATTTGCCTTGACTTTGATTGTGGCTGCCACTG 1679

116656551 TTCTTCTTAATAATTCAATTAGCCAATACTTACAGAGCCATCTGCTCTGCATCAGACAAC 116656610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 TTCTTCTTAATAATTCAATTAGCCAATACTTACAGAGCCATCTGCTCTGCATCAGACAAC 1739

116656611 ATTCTATGTATTGCTAGACCAATAACAAGACTGATGACCTAAACTTTACATTCTAGTGAG 116656670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 ATTCTATGTATTGCTAGACCAATAACAAGACTGATGACCTAAACTTTACATTCTAGTGAG 1799

116656671 GTAGCAGATAATAAACAGTAAACATGTAAGTATATCATATAGTATAGGAAGTGATAAGTA 116656730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 GTAGCAGATAATAAACAGTAAACATGTAAGTATATCATATAGTATAGGAAGTGATAAGTA 1859

116656731 ACATAGAGAAAGAAAAATCAGTTTTAGAAGATAGGCCAAGAGCAACAGTTTTATAAACAG 116656790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 ACATAGAGAAAGAAAAATCAGTTTTAGAAGATAGGCCAAGAGCAACAGTTTTATAAACAG 1919

116656791 TGGTCTCTGAGGAGACAGCAATTGCTCAAAACCTGTGTGAGAAAAGTAAGCCACACAAAT 116656850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 TGGTCTCTGAGGAGACAGCAATTGCTCAAAACCTGTGTGAGAAAAGTAAGCCACACAAAT 1979

116656851 ATCTCAATATGGTCTGGGTAGAAATAAACTCAATTAGAAAGATTCTAGGCAAGAGCTTGC 116656910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 ATCTCAATATGGTCTGGGTAGAAATAAACTCAATTAGAAAGATTCTAGGCAAGAGCTTGC 2039

116656911 CTGCTTTTATTGAAAAACAGTAAGCATTTTTGAGCAAATAAAGTTGGACAGAAGGTAGTC 116656970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 CTGCTTTTATTGAAAAACAGTAAGCATTTTTGAGCAAATAAAGTTGGACAGAAGGTAGTC 2099

116656971 ATTGGCCAGATCGTAGAAGAACATAAAATATGATTACAATGCTCTCCATTATTTGAATAT 116657030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 ATTGGCCAGATCGTAGAAGAACATAAAATATGATTACAATGCTCTCCATTATTTGAATAT 2159

116657031 CTTGCATAATAATGATGTGGTCTTATATTATCTTTTTTCTTTTTCTTTTTTGAGAATGAG 116657090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 CTTGCATAATAATGATGTGGTCTTATATTATCTTTTTTCTTTTTCTTTTTTGAGAATGAG 2219

116657091 TCTCACTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAATCTTGGCTGACTGCAACCTCTG 116657150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 TCTCACTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAATCTTGGCTGACTGCAACCTCTG 2279

116657151 CCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGATGC 116657210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 CCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGATGC 2339

116657211 TTGTCACTGCACCTGGCTAATTTTTTTTTTTTTTTAAAGTAGAGACGGGGTTTCACCATG 116657270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 TTGTCACTGCACCTGGCTAATTTTTTTTTTTTTTTAAAGTAGAGACGGGGTTTCACCATG 2399

116657271 TTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTACTGACCTCATGATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGT 116657330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 TTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTACTGACCTCATGATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGT 2459

116657331 GCTTGGATTACAGGTGTGAGCCACCACACCTGGCCATATTATCTTTAAGTCTCAGGTTCC 116657390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 GCTTGGATTACAGGTGTGAGCCACCACACCTGGCCATATTATCTTTAAGTCTCAGGTTCC 2519

116657391 TCATCTTTGAAATCAACTAATATTATGTGTTTATTGTTATAAGTCAAAGACAGAAATTTG 116657450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 TCATCTTTGAAATCAACTAATATTATGTGTTTATTGTTATAAGTCAAAGACAGAAATTTG 2579

116657451 AAATGAGGCCTACGATGCTGATTATATTTTGTTCTTTGATCCAGGTGATAGTTAAATAGA 116657510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 AAATGAGGCCTACGATGCTGATTATATTTTGTTCTTTGATCCAGGTGATAGTTAAATAGA 2639

116657511 TATGATCACCTAGTGAACACTCAAGACTTATGCACTTGTCTGCGTGTAATGTACACAAAA 116657570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 TATGATCACCTAGTGAACACTCAAGACTTATGCACTTGTCTGCGTGTAATGTACACAAAA 2699

116657571 ATGTGTAACTACTTAGTAGTAGTCTTATAAAAATAAACAAGATAATATGTGTGTATATAT 116657630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 ATGTGTAACTACTTAGTAGTAGTCTTATAAAAATAAACAAGATAATATGTGTGTATATAT 2759

116657631 ATGTAGTGTTAAGCAAAGTACCCAGTACATGTTGGCCAAAACAAATGTCATCTCTCTCCT 116657690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 ATGTAGTGTTAAGCAAAGTACCCAGTACATGTTGGCCAAAACAAATGTCATCTCTCTCCT 2819

116657691 CCTGCCTTTTGTTCACTTTTTTTCCTAGCCGAACAATCCTAGAGATTTTAAAGTACTTCT 116657750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2820 CCTGCCTTTTGTTCACTTTTTTTCCTAGCCGAACAATCCTAGAGATTTTAAAGTACTTCT 2879

116657751 GCTTGTTTACTTTTGTTTCCAAAAAAGTTAATTATAAAGCAAATAAACTCGCTTTAGGAA 116657810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2880 GCTTGTTTACTTTTGTTTCCAAAAAAGTTAATTATAAAGCAAATAAACTCGCTTTAGGAA 2939

116657811 AAATGCAAAAAATCTGATAATATGCTCATTTATAAATAAAAAAGCAAACAAAACCTCTAA 116657870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2940 AAATGCAAAAAATCTGATAATATGCTCATTTATAAATAAAAAAGCAAACAAAACCTCTAA 2999

116657871 ATTGAAACAACAGCCACCAGCCTACTCCCATCCTTTCCAAGATATTCTAATTCTCCTCTT 116657930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3000 ATTGAAACAACAGCCACCAGCCTACTCCCATCCTTTCCAAGATATTCTAATTCTCCTCTT 3059

116657931 CCTTTTCTCCAAGGCATTTTCCTAAGGATAGCTCCATTTTATCTTTTACATATACTTCTT 116657990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3060 CCTTTTCTCCAAGGCATTTTCCTAAGGATAGCTCCATTTTATCTTTTACATATACTTCTT 3119

116657991 TTCTTTTCCTATATTTTTCCACCTTCTTCTAATTTTCTTTGCTTTTCTATTGATTGTGGG 116658050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3120 TTCTTTTCCTATATTTTTCCACCTTCTTCTAATTTTCTTTGCTTTTCTATTGATTGTGGG 3179

116658051 TTAAGTAAGAAAAAAAGGCAAGGGTGGCAGTCAGAGTGCGTGCAGAATTCTTCAAAGCAA 116658110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3180 TTAAGTAAGAAAAAAAGGCAAGGGTGGCAGTCAGAGTGCGTGCAGAATTCTTCAAAGCAA 3239

116658111 TGAATGTTGAGAAAAGCCGTGTATATTTAGAAGTTAATGGTCTCCCCTCTAGATTTCTAT 116658170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3240 TGAATGTTGAGAAAAGCCGTGTATATTTAGAAGTTAATGGTCTCCCCTCTAGATTTCTAT 3299

116658171 GCAGCTTGAATTCCTCAGTGTTTCTGAACTTCTTGTGTTTTTCTCTTATCTTTTAAATAA 116658230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3300 GCAGCTTGAATTCCTCAGTGTTTCTGAACTTCTTGTGTTTTTCTCTTATCTTTTAAATAA 3359

116658231 TACTCTGCTACTGTTTTTCTCTAGATTACCATTTCAGTGGATTTGAAAAATCTCTTTCCA 116658290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3360 TACTCTGCTACTGTTTTTCTCTAGATTACCATTTCAGTGGATTTGAAAAATCTCTTTCCA 3419

116658291 TTATTTTTCTTTTCTCCTTACTTCTTTCTTCCCCTTCTCTTATTTTTTCTCTTTCTCTCC 116658350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3420 TTATTTTTCTTTTCTCCTTACTTCTTTCTTCCCCTTCTCTTATTTTTTCTCTTTCTCTCC 3479

116658351 AACTTCATCTCTTTATTAATTTCCTTCTCTCCTTTTAAGTTTTGGTAACTGTTTTTCATT 116658410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3480 AACTTCATCTCTTTATTAATTTCCTTCTCTCCTTTTAAGTTTTGGTAACTGTTTTTCATT 3539

116658411 TGGCCAGCTCTCAGTATACCTTATTTGTGTTGGGTACCAAAGCAAACATCCTCACCAGTG 116658470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3540 TGGCCAGCTCTCAGTATACCTTATTTGTGTTGGGTACCAAAGCAAACATCCTCACCAGTG 3599

116658471 ATGCAAGACTGAAGAAGTGTGATCATTAGCTCTGCAATCACAACCACAAAACACCTGTGG 116658530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3600 ATGCAAGACTGAAGAAGTGTGATCATTAGCTCTGCAATCACAACCACAAAACACCTGTGG 3659

116658531 CTTGCCTAAAACCTTCTTCTGTTAGACCCTTTCCTTACTTGGAAACAATCTCATCTTAAG 116658590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3660 CTTGCCTAAAACCTTCTTCTGTTAGACCCTTTCCTTACTTGGAAACAATCTCATCTTAAG 3719

116658591 AAATCAAGCAATACTTGAAGAAATTTTGAGGAACCCATAAGCAAGAAAAACTGTATACTC 116658650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3720 AAATCAAGCAATACTTGAAGAAATTTTGAGGAACCCATAAGCAAGAAAAACTGTATACTC 3779

116658651 ATTTCCCTTAACATGATACCATTTCACAGTTACCTGTGTGGTGCTTTTCATTGCTATAGA 116658710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3780 ATTTCCCTTAACATGATACCATTTCACAGTTACCTGTGTGGTGCTTTTCATTGCTATAGA 3839

116658711 AATCGAATTAAACTCAGTGTGATTGTAGCATAATGGGATACTTCACTTGAGAAAGGGGAT 116658770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3840 AATCGAATTAAACTCAGTGTGATTGTAGCATAATGGGATACTTCACTTGAGAAAGGGGAT 3899

116658771 TTTTATAATTTGGAGAAGCATTGAGAGTCAGCAGTGAATATTCATGACACGGGCTAGGAC 116658830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3900 TTTTATAATTTGGAGAAGCATTGAGAGTCAGCAGTGAATATTCATGACACGGGCTAGGAC 3959

116658831 CATTTAAACAGACGACTTCTAGGAGAGTCTCTTGAGGACATTTAATCTCTTGTGCTTGAC 116658890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3960 CATTTAAACAGACGACTTCTAGGAGAGTCTCTTGAGGACATTTAATCTCTTGTGCTTGAC 4019

116658891 CATCCTGACCCAAGGTGAGTTTGAGTCTCAAATACATTAAAATTCTCAAACCATTAGTTT 116658950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4020 CATCCTGACCCAAGGTGAGTTTGAGTCTCAAATACATTAAAATTCTCAAACCATTAGTTT 4079

116658951 TATTTTGTTCCTGTAAACCTAAAGTTTAACTTTCAGAATACTTTTTCTCATTAGAATTAT 116659010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4080 TATTTTGTTCCTGTAAACCTAAAGTTTAACTTTCAGAATACTTTTTCTCATTAGAATTAT 4139

116659011 ATGTTTAAAAATTCTTGGTGACATTCCATTCTTCACCTAATCTCACGTTTGTCTTGTTCT 116659070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4140 ATGTTTAAAAATTCTTGGTGACATTCCATTCTTCACCTAATCTCACGTTTGTCTTGTTCT 4199

116659071 GTTTTGTCAAAAATGTTTTCCTAAAAATGAAAAAGAAAACCTCTAGAATGATTAATCGAG 116659130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4200 GTTTTGTCAAAAATGTTTTCCTAAAAATGAAAAAGAAAACCTCTAGAATGATTAATCGAG 4259

116659131 TGAGATTCTCAATAAATCTGCAACTAAAACCATCCGTAAGTCCTAACAAGTTTCAATTTT 116659190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4260 TGAGATTCTCAATAAATCTGCAACTAAAACCATCCGTAAGTCCTAACAAGTTTCAATTTT 4319

116659191 TATCACGTTAGTGTCTTTTAGTAGATAAACTTTGCTCTAGGTCACTATCCAAAAAACTTA 116659250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4320 TATCACGTTAGTGTCTTTTAGTAGATAAACTTTGCTCTAGGTCACTATCCAAAAAACTTA 4379

116659251 TGTGAGTTCTGTTGATTGTATCCTGCCTTTGTGTTCCTAAGAGTTGATTTGGGAAGCAAA 116659310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4380 TGTGAGTTCTGTTGATTGTATCCTGCCTTTGTGTTCCTAAGAGTTGATTTGGGAAGCAAA 4439

116659311 ATCCCCCAAAAATCTATATTCTCAGGCCCATGGATAGTTAGAACGCAGGCTACAGATGTC 116659370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4440 ATCCCCCAAAAATCTATATTCTCAGGCCCATGGATAGTTAGAACGCAGGCTACAGATGTC 4499

116659371 AAACTCTCTAGTCAGGGGTCATGCCTAATAAAGTGCAGAAGGAATACATTGAACAGAATG 116659430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4500 AAACTCTCTAGTCAGGGGTCATGCCTAATAAAGTGCAGAAGGAATACATTGAACAGAATG 4559

116659431 TTATACACTTTTAGGGCGTTTTAAAATTTTTGGTCTAAGTCATGTCTCTAGCAGGCTAGA 116659490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4560 TTATACACTTTTAGGGCGTTTTAAAATTTTTGGTCTAAGTCATGTCTCTAGCAGGCTAGA 4619

116659491 CACCTGTTCCAGATATGTATTCTTAATATAACAAAAATTATTTAAATATCTTACCATGTG 116659550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4620 CACCTGTTCCAGATATGTATTCTTAATATAACAAAAATTATTTAAATATCTTACCATGTG 4679

116659551 TCACAGTTACATCAATAATATTTGGAATCATACTGGACCCTTTGAAAATTTTCAGTATGA 116659610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4680 TCACAGTTACATCAATAATATTTGGAATCATACTGGACCCTTTGAAAATTTTCAGTATGA 4739

116659611 GTAAAAATGTTTATCTTAGAAGTAAGTGGAGGGGAAACATCCTTATTATTAAGTGCTAAG 116659670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4740 GTAAAAATGTTTATCTTAGAAGTAAGTGGAGGGGAAACATCCTTATTATTAAGTGCTAAG 4799

116659671 CCTTTTTAAAATGGTCTATGAAGATTCTAAATAGACTTCTGATTCCAAAATACCTATAAC 116659730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4800 CCTTTTTAAAATGGTCTATGAAGATTCTAAATAGACTTCTGATTCCAAAATACCTATAAC 4859

116659731 AATGAAGTCTTTGGCCATGGCTAATTAAAAAAAAACATAAAACTCTAGAGACTGTCTCAT 116659790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4860 AATGAAGTCTTTGGCCATGGCTAATTAAAAAAAAACATAAAACTCTAGAGACTGTCTCAT 4919

116659791 TTATTAATTTGCCAAATTCTTCTTTCTTTTAACATTTTCTTTATCCCACAGTATCTTTTC 116659850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4920 TTATTAATTTGCCAAATTCTTCTTTCTTTTAACATTTTCTTTATCCCACAGTATCTTTTC 4979

116659851 TTGCTTTTTGTGCTACCACACTATCAAATTTTACTCTTTTTCTCCCAAATTTCTTTTTCT 116659910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4980 TTGCTTTTTGTGCTACCACACTATCAAATTTTACTCTTTTTCTCCCAAATTTCTTTTTCT 5039

116659911 AACCATCGTCTTCCCCCTCTGATTGTATCTGAAAATAACCACTTGCTTTTCTTCTTTTTT 116659970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5040 AACCATCGTCTTCCCCCTCTGATTGTATCTGAAAATAACCACTTGCTTTTCTTCTTTTTT 5099

116659971 CTTTTTCTTTTTCTT 116659985
          |||||||||||||||
     5100 CTTTTTCTTTTTCTT 5114

EXCISED REGION

116659998 TTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCCTCTTTCCCTTTCCCT 116660057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5115 TTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCCTCTTTCCCTTTCCCT 5174

116660058 TTCTTTTCTTTTATTTTTTCTTCTCTCTTCTCTTCTCTTTTTCTGGGTTGCACTCTGTTA 116660117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5175 TTCTTTTCTTTTATTTTTTCTTCTCTCTTCTCTTCTCTTTTTCTGGGTTGCACTCTGTTA 5234

116660118 CCCAAGCTTGAATGCAATGGCAGGGATCACAGCTTACTGCAGTGTCAACCTCCTGGGCTC 116660177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5235 CCCAAGCTTGAATGCAATGGCAGGGATCACAGCTTACTGCAGTGTCAACCTCCTGGGCTC 5294

116660178 AGGTGATCATCCTCCTTCAGCCTCCTGTGTAGCTAGGACTGCAGGCATGTACCACCACAC 116660237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5295 AGGTGATCATCCTCCTTCAGCCTCCTGTGTAGCTAGGACTGCAGGCATGTACCACCACAC 5354

116660238 ATGGCTAATTTTAGTATTTTTTGTAGAAATGAGAGTCTCACTGTGTTGTCCAGGTTTGTC 116660297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5355 ATGGCTAATTTTAGTATTTTTTGTAGAAATGAGAGTCTCACTGTGTTGTCCAGGTTTGTC 5414

116660298 TCAAACTCCCAGGTTCAAGCAATCCACCTGCCTCAGCCTCTCAAACTGCTGGGATTATAG 116660357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5415 TCAAACTCCCAGGTTCAAGCAATCCACCTGCCTCAGCCTCTCAAACTGCTGGGATTATAG 5474

116660358 GCATGTGCCACCATGCTGGGCCTCAAATTGACATTTTCTTAAAAATTGGACTGCCAAACA 116660417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5475 GCATGTGCCACCATGCTGGGCCTCAAATTGACATTTTCTTAAAAATTGGACTGCCAAACA 5534

116660418 AGGACATTAGCCCTAGTAGGCAGAAGATACTATCTTGGTCTGTGTTAGAGGCAATTGTTG 116660477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5535 AGGACATTAGCCCTAGTAGGCAGAAGATACTATCTTGGTCTGTGTTAGAGGCAATTGTTG 5594

116660478 AAATTTCTCTGAATCTCTATGGGATAGGCATAAATGTACTGATAAATTTGAGCAGTCCTG 116660537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5595 AAATTTCTCTGAATCTCTATGGGATAGGCATAAATGTACTGATAAATTTGAGCAGTCCTG 5654

116660538 GGAATCCATAATCTCAATTTATTTGACCAATATCAATTAATACCATGTTGAGAGGTCCTT 116660597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5655 GGAATCCATAATCTCAATTTATTTGACCAATATCAATTAATACCATGTTGAGAGGTCCTT 5714

116660598 CTATTTCTGAAGTCTGGTTCAGCAAAAAATAAAAAAAAAAATAAAATACCTGAAATAATG 116660657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5715 CTATTTCTGAAGTCTGGTTCAGCAAAAAATAAAAAAAAAAATAAAATACCTGAAATAATG 5774

116660658 TAGCTATTCCTGAGGTATCATTAACAGAATAGAAACTTAAAAAGCGCATGATATGGAAAA 116660717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5775 TAGCTATTCCTGAGGTATCATTAACAGAATAGAAACTTAAAAAGCGCATGATATGGAAAA 5834

116660718 ATCTTTGCTGATGGTTATACATGTTAAGTTTCCAGATAACTATTAATTAGACTTGCAGAC 116660777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5835 ATCTTTGCTGATGGTTATACATGTTAAGTTTCCAGATAACTATTAATTAGACTTGCAGAC 5894

116660778 ATAAAAGGCTGTACCAAGTGGATATTTTAGAGATAAATTTTTAGCACTTACAGACAATAT 116660837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5895 ATAAAAGGCTGTACCAAGTGGATATTTTAGAGATAAATTTTTAGCACTTACAGACAATAT 5954

116660838 TATGAAGTAGCTATGTGGGCATAGAGAAATTCGGGAAATTAGCAGGCTGGTTCTGCTATA 116660897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5955 TATGAAGTAGCTATGTGGGCATAGAGAAATTCGGGAAATTAGCAGGCTGGTTCTGCTATA 6014

116660898 ATAGATCTCAGTTCACCCTTAGGATATCTTCACTAAAGGAGCTTAACATAGCCCAGATGG 116660957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6015 ATAGATCTCAGTTCACCCTTAGGATATCTTCACTAAAGGAGCTTAACATAGCCCAGATGG 6074

116660958 TAGATTTGATTGCCCTCATTAGAGCTGGTCACTTGGCCAAAGACAAAAAAAATTATATTT 116661017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6075 TAGATTTGATTGCCCTCATTAGAGCTGGTCACTTGGCCAAAGACAAAAAAAATTATATTT 6134

116661018 ACACAGAAAATAGCTCAAGTACCTGAACCTCAGTATGACTATATATGGGGATAGAGTCTT 116661077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6135 ACACAGAAAATAGCTCAAGTACCTGAACCTCAGTATGACTATATATGGGGATAGAGTCTT 6194

116661078 TAAGGAAGTGATTAAGGTTAAATAAAGTCATAATGATGGGGCCCTAATCTGATAAGATTA 116661137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6195 TAAGGAAGTGATTAAGGTTAAATAAAGTCATAATGATGGGGCCCTAATCTGATAAGATTA 6254

116661138 GCGTCCTTCTAAGAGGAGGAATCAACATCAGGGATTTTTTTTTCTCTCAACCCATGCCCA 116661197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6255 GCGTCCTTCTAAGAGGAGGAATCAACATCAGGGATTTTTTTTTCTCTCAACCCATGCCCA 6314

116661198 GAGGAAAGTCATATGAGGACGTAACACAAAGAGAGACATCTACAAATCACAGAGGTTGCA 116661257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6315 GAGGAAAGTCATATGAGGACGTAACACAAAGAGAGACATCTACAAATCACAGAGGTTGCA 6374

116661258 CCAGAAATCAACCCTGCTAGCATATCGATCTTGAACTTCTAGTCCCCAGAACTGTGAGGA 116661317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6375 CCAGAAATCAACCCTGCTAGCATATCGATCTTGAACTTCTAGTCCCCAGAACTGTGAGGA 6434

116661318 AATAAATTTTTGTTGCTTATGCCACCAGATCTGTGACATTTTGTTATGGAAGTCTGAGCT 116661377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6435 AATAAATTTTTGTTGCTTATGCCACCAGATCTGTGACATTTTGTTATGGAAGTCTGAGCT 6494

116661378 GACCAATACACTTGAATAACTATCAGTGTCAATGTAAAACAAGCCATCTTTAGACTTAAG 116661437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6495 GACCAATACACTTGAATAACTATCAGTGTCAATGTAAAACAAGCCATCTTTAGACTTAAG 6554

116661438 GAAACAGTCACCTGGCTCTCTAAGGCAGATGCAAATGGATTTTTCTTTGCCCGGGTTTAG 116661497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6555 GAAACAGTCACCTGGCTCTCTAAGGCAGATGCAAATGGATTTTTCTTTGCCCGGGTTTAG 6614

116661498 TAATTCAGATTATGGCACTAAGTGTTTTGGGAAGGCTCCATGTCATTTTGATATAGTCAC 116661557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6615 TAATTCAGATTATGGCACTAAGTGTTTTGGGAAGGCTCCATGTCATTTTGATATAGTCAC 6674

116661558 TGTGTGTTGCCATTCTTATGCATGTATTCTCCACAGTCTCAGTCCTGCTCTGCAGCTGCT 116661617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6675 TGTGTGTTGCCATTCTTATGCATGTATTCTCCACAGTCTCAGTCCTGCTCTGCAGCTGCT 6734

116661618 CTCGTGTCAAATGATCCATCACTCAACGGAAATGAACTCATCACTCCATAAAAGGAATAG 116661677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6735 CTCGTGTCAAATGATCCATCACTCAACGGAAATGAACTCATCACTCCATAAAAGGAATAG 6794

116661678 GAAGATCAGTCCATGATCCAATCCCAAACTATTTTTTCTGAGGATGATAATGTTATCTAG 116661737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6795 GAAGATCAGTCCATGATCCAATCCCAAACTATTTTTTCTGAGGATGATAATGTTATCTAG 6854

116661738 AAATCACAACAGTGGTATACATCTGAACATGGCTGCTTTAGTAGCTGAACGACTCTTCTC 116661797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6855 AAATCACAACAGTGGTATACATCTGAACATGGCTGCTTTAGTAGCTGAACGACTCTTCTC 6914

116661798 ATCTTCTCATCAGTTAGGAAAGACTGAGAACTGGTAGCATAAATCCATCAATTATGGGAT 116661857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6915 ATCTTCTCATCAGTTAGGAAAGACTGAGAACTGGTAGCATAAATCCATCAATTATGGGAT 6974

116661858 TGCAATTGCAGAATGTTTTGTGACTCACATAATGTTTTCTTCTTTACTCAGAACTTCTCT 116661917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6975 TGCAATTGCAGAATGTTTTGTGACTCACATAATGTTTTCTTCTTTACTCAGAACTTCTCT 7034

116661918 ATTTCACAGATTCTCACCTTAATAATTGAAGCAACTCAGGGTCACATCCTAGTTCTATAA 116661977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7035 ATTTCACAGATTCTCACCTTAATAATTGAAGCAACTCAGGGTCACATCCTAGTTCTATAA 7094

116661978 TTCTGCCTGAGGCACTCTGAGCCCAAACCATCAACAGGAAACAAACAAATAAAAAACCTG 116662037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7095 TTCTGCCTGAGGCACTCTGAGCCCAAACCATCAACAGGAAACAAACAAATAAAAAACCTG 7154

116662038 CTAATTTACTCTCCAATGAAACCTTTCCAGAATTATCTGTGTAGAGTTTCCTATTGCTGC 116662097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7155 CTAATTTACTCTCCAATGAAACCTTTCCAGAATTATCTGTGTAGAGTTTCCTATTGCTGC 7214

116662098 AATAATTAATAAACTCAGTTTGCTTATATTGCAAATTTTAAAACTCGTAGTGGGAGATTT 116662157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7215 AATAATTAATAAACTCAGTTTGCTTATATTGCAAATTTTAAAACTCGTAGTGGGAGATTT 7274

116662158 CCAGTTGCAAACAACAAGTCTTGGCTTTAATTATGAGTTCAACCAGTTTTTTTTCTCCTA 116662217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7275 CCAGTTGCAAACAACAAGTCTTGGCTTTAATTATGAGTTCAACCAGTTTTTTTTCTCCTA 7334

116662218 ATGTTTTAAATCTCAGTTCATCATAATGTCTGAGCTTGTCTGATTTTGGCATAGGGAATA 116662277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7335 ATGTTTTAAATCTCAGTTCATCATAATGTCTGAGCTTGTCTGATTTTGGCATAGGGAATA 7394

116662278 TAATTAGAAGTAGTGAATGAAGGCCTAGCTGTTGCTTTGATGTCAGCAGACACCCATTTC 116662337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7395 TAATTAGAAGTAGTGAATGAAGGCCTAGCTGTTGCTTTGATGTCAGCAGACACCCATTTC 7454

116662338 TCTTTCCAAACTGCTTTTAAAAAGTCAAACAACTT 116662372
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7455 TCTTTCCAAACTGCTTTTAAAAAGTCAAACAACTT 7489

Alignment time is 9.0072 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [116652076,116672656] =>     20581 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [        1,     5729] =>      5729 nucs 'mol-32-322a-255262_5729'

Score:        5575
Aligned:      5745        nucs
Identic:      5714 ( 99%) nucs =>      4777 ( 99%)       937 (100%)
Gaps:           22 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [116657272,116662076] EXCISED REGION [116662657,116663595]
 second seq =>  [        5,     4789] EXCISED REGION [     4791,     5729]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       580 nucs [116662077,116662656]
 second seq =>         1 nucs [4790,4790]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [4789,4789] to [4790,4790]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

116657272 TGGCCAGGCTGGTCTTGAACTACTGACCTCATGATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTG 116657331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        5 TGGCCAGGCTGGTCTTGAACTACTGACCTCATGATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTG 64

116657332 CTTGGATTACAGGTGTGAGCCACCACACCTGGCCATATTATCTTTAAGTCTCAGGTTCCT 116657391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       65 CTTGGATTACAGGTGTGAGCCACCACACCTGGCCATATTATCTTTAAGTCTCAGGTTCCT 124

116657392 CATCTTTGAAATCAACTAATATTATGTGTTTATTGTTATAAGTCAAAGACAGAAATTTGA 116657451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      125 CATCTTTGAAATCAACTAATATTATGTGTTTATTGTTATAAGTCAAAGACAGAAATTTGA 184

116657452 AATGAGGCCTACGATGCTGATTATATTTTGTTCTTTGATCCAGGTGATAGTTAAATAGAT 116657511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      185 AATGAGGCCTACGATGCTGATTATATTTTGTTCTTTGATCCAGGTGATAGTTAAATAGAT 244

116657512 ATGATCACCTAGTGAACACTCAAGACTTATGCACTTGTCTGCGTGTAATGTACACAAAAA 116657571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      245 ATGATCACCTAGTGAACACTCAAGACTTATGCACTTGTCTGCGTGTAATGTACACAAAAA 304

116657572 TGTGTAACTACTTAGTAGTAGTCTTATAAAAATAAACAAGATAATATGTGTGTATATATA 116657631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      305 TGTGTAACTACTTAGTAGTAGTCTTATAAAAATAAACAAGATAATATGTGTGTATATATA 364

116657632 TGTAGTGTTAAGCAAAGTACCCAGTACATGTTGGCCAAAACAAATGTCATCTCTCTCCTC 116657691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      365 TGTAGTGTTAAGCAAAGTACCCAGTACATGTTGGCCAAAACAAATGTCATCTCTCTCCTC 424

116657692 CTGCCTTTTGTTCACTTTTTTTCCTAGCCGAACAATCCTAGAGATTTTAAAGTACTTCTG 116657751
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      425 CTGTCTTTTGTTCACTTTTTTTCCTAGCCGAACAATCCTAGAGATTTTAAAGTACTTCTG 484

116657752 CTTGTTTACTTTTGTTTCCAAAAAAGTTAATTATAAAGCAAATAAACTCGCTTTAGGAAA 116657811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      485 CTTGTTTACTTTTGTTTCCAAAAAAGTTAATTATAAAGCAAATAAACTCGCTTTAGGAAA 544

116657812 AATGCAAAAAATCTGATAATATGCTCATTTATAAATAAAAAAGCAAACAAAACCTCTAAA 116657871
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
      545 AATGCAAAAAATCTGATAATATGCCCATTTATAAATAAAAAAGCAAACAAAACCTCTAAA 604

116657872 TTGAAACAACAGCCACCAGCCTACTCCCATCCTTTCCAAGATATTCTAATTCTCCTCTTC 116657931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      605 TTGAAACAACAGCCACCAGCCTACTCCCATCCTTTCCAAGATATTCTAATTCTCCTCTTC 664

116657932 CTTTTCTCCAAGGCATTTTCCTAAGGATAGCTCCATTTTATCTTTTACATATACTTCTTT 116657991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      665 CTTTTCTCCAAGGCATTTTCCTAAGGATAGCTCCATTTTATCTTTTACATATACTTCTTT 724

116657992 TCTTTTCCTATATTTTTCCACCTTCTTCTAATTTTCTTTGCTTTTCTATTGATTGTGGGT 116658051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
      725 TCTTTTCCTATATTTTTCCACCTTCTTCTAATTTTCTTTGCTTTTCTATTGATTATGGGT 784

116658052 TAAGTAAGAAAAAAAGGCAAGGGTGGCAGTCAGAGTGCGTGCAGAATTCTTCAAAGCAAT 116658111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      785 TAAGTAAGAAAAAAAGGCAAGGGTGGCAGTCAGAGTGCGTGCAGAATTCTTCAAAGCAAT 844

116658112 GAATGTTGAGAAAAGCCGTGTATATTTAGAAGTTAATGGTCTCCCCTCTAGATTTCTATG 116658171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      845 GAATGTTGAGAAAAGCCGTGTATATTTAGAAGTTAATGGTCTCCCCTCTAGATTTCTATG 904

116658172 CAGCTTGAATTCCTCAGTGTTTCTGAACTTCTTGTGTTTTTCTCTTATCTTTTAAATAAT 116658231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      905 CAGCTTGAATTCCTCAGTGTTTCTGAACTTCTTGTGTTTTTCTCTTATCTTTTAAATAAT 964

116658232 ACTCTGCTACTGTTTTTCTCTAGATTACCATTTCAGTGGATTTGAAAAATCTCTTTCCAT 116658291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      965 ACTCTGCTACTGTTTTTCTCTAGATTACCATTTCAGTGGATTTGAAAAATCTCTTTCCAT 1024

116658292 TATTTTTCTTTTCTCCTTACTTCTTTCTTCCCCTTCTCTTATTTTTTCTCTTTCTCTCCA 116658351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1025 TATTTTTCTTTTCTCCTTACTTCTTTCTTCCCCTTCTCTTATTTTTTCTCTTTCTCTCCA 1084

116658352 ACTTCATCTCTTTATTAATTTCCTTCTCTCCTTTTAAGTTTTGGTAACTGTTTTTCATTT 116658411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1085 ACTTCATCTCTTTATTAATTTCCTTCTCTCCTTTTAAGTTTTGGTAACTGTTTTTCATTT 1144

116658412 GGCCAGCTCTCAGTATACCTTATTTGTGTTGGGTACCAAAGCAAACATCCTCACCAGTGA 116658471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1145 GGCCAGCTCTCAGTATACCTTATTTGTGTTGGGTACCAAAGCAAACATCCTCACCAGTGA 1204

116658472 TGCAAGACTGAAGAAGTGTGATCATTAGCTCTGCAATCACAACCACAAAACACCTGTGGC 116658531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1205 TGCAAGACTGAAGAAGTGTGATCATTAGCTCTGCAATCACAACCACAAAACACCTGTGGC 1264

116658532 TTGCCTAAAACCTTCTTCTGTTAGACCCTTTCCTTACTTGGAAACAATCTCATCTTAAGA 116658591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1265 TTGCCTAAAACCTTCTTCTGTTAGACCCTTTCCTTACTTGGAAACAATCTCATCTTAAGA 1324

116658592 AATCAAGCAATACTTGAAGAAATTTTGAGGAACCCATAAGCAAGAAAAACTGTATACTCA 116658651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1325 AATCAAGCAATACTTGAAGAAATTTTGAGGAACCCATAAGCAAGAAAAACTGTATACTCA 1384

116658652 TTTCCCTTAACATGATACCATTTCACAGTTACCTGTGTGGTGCTTTTCATTGCTATAGAA 116658711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1385 TTTCCCTTAACATGATACCATTTCACAGTTACCTGTGTGGTGCTTTTCATTGCTATAGAA 1444

116658712 ATCGAATTAAACTCAGTGTGATTGTAGCATAATGGGATACTTCACTTGAGAAAGGGGATT 116658771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1445 ATCGAATTAAACTCAGTGTGATTGTAGCATAATGGGATACTTCACTTGAGAAAGGGGATT 1504

116658772 TTTATAATTTGGAGAAGCATTGAGAGTCAGCAGTGAATATTCATGACACGGGCTAGGACC 116658831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     1505 TTTATAATTTGGAGAAGCATTGAGAGTCAGCAGTGAATATTCATGACACGAGCTAGGACC 1564

116658832 ATTTAAACAGACGACTTCTAGGAGAGTCTCTTGAGGACATTTAATCTCTTGTGCTTGACC 116658891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1565 ATTTAAACAGACGACTTCTAGGAGAGTCTCTTGAGGACATTTAATCTCTTGTGCTTGACC 1624

116658892 ATCCTGACCCAAGGTGAGTTTGAGTCTCAAATACATTAAAATTCTCAAACCATTAGTTTT 116658951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1625 ATCCTGACCCAAGGTGAGTTTGAGTCTCAAATACATTAAAATTCTCAAACCATTAGTTTT 1684

116658952 ATTTTGTTCCTGTAAACCTAAAGTTTAACTTTCAGAATACTTTTTCTCATTAGAATTATA 116659011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1685 ATTTTGTTCCTGTAAACCTAAAGTTTAACTTTCAGAATACTTTTTCTCATTAGAATTATA 1744

116659012 TGTTTAAAAATTCTTGGTGACATTCCATTCTTCACCTAATCTCACGTTTGTCTTGTTCTG 116659071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1745 TGTTTAAAAATTCTTGGTGACATTCCATTCTTCACCTAATCTCACGTTTGTCTTGTTCTG 1804

116659072 TTTTGTCAAAAATGTTTTCCTAAAAATGAAAAAGAAAACCTCTAGAATGATTAATCGAGT 116659131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1805 TTTTGTCAAAAATGTTTTCCTAAAAATGAAAAAGAAAACCTCTAGAATGATTAATCGAGT 1864

116659132 GAGATTCTCAATAAATCTGCAACTAAAACCATCCGTAAGTCCTAACAAGTTTCAATTTTT 116659191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1865 GAGATTCTCAATAAATCTGCAACTAAAACCATCCGTAAGTCCTAACAAGTTTCAATTTTT 1924

116659192 ATCACGTTAGTGTCTTTTAGTAGATAAACTTTGCTCTAGGTCACTATCCAAAAAACTTAT 116659251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1925 ATCACGTTAGTGTCTTTTAGTAGATAAACTTTGCTCTAGGTCACTATCCAAAAAACTTAT 1984

116659252 GTGAGTTCTGTTGATTGTATCCTGCCTTTGTGTTCCTAAGAGTTGATTTGGGAAGCAAAA 116659311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1985 GTGAGTTCTGTTGATTGTATCCTGCCTTTGTGTTCCTAAGAGTTGATTTGGGAAGCAAAA 2044

116659312 TCCCCCAAAAATCTATATTCTCAGGCCCATGGATAGTTAGAACGCAGGCTACAGATGTCA 116659371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2045 TCCCCCAAAAATCTATATTCTCAGGCCCATGGATAGTTAGAACGCAGGCTACAGATGTCA 2104

116659372 AACTCTCTAGTCAGGGGTCATGCCTAATAAAGTGCAGAAGGAATACATTGAACAGAATGT 116659431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2105 AACTCTCTAGTCAGGGGTCATGCCTAATAAAGTGCAGAAGGAATACATTGAACAGAATGT 2164

116659432 TATACACTTTTAGGGCGTTTTAAAATTTTTGGTCTAAGTCATGTCTCTAGCAGGCTAGAC 116659491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2165 TATACACTTTTAGGGCGTTTTAAAATTTTTGGTCTAAGTCATGTCTCTAGCAGGCTAGAC 2224

116659492 ACCTGTTCCAGATATGTATTCTTAATATAACAAAAATTATTTAAATATCTTACCATGTGT 116659551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2225 ACCTGTTCCAGATATGTATTCTTAATATAACAAAAATTATTTAAATATCTTACCATGTGT 2284

116659552 CACAGTTACATCAATAATATTTGGAATCATACTGGACCCTTTGAAAATTTTCAGTATGAG 116659611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2285 CACAGTTACATCAATAATATTTGGAATCATACTGGACCCTTTGAAAATTTTCAGTATGAG 2344

116659612 TAAAAATGTTTATCTTAGAAGTAAGTGGAGGGGAAACATCCTTATTATTAAGTGCTAAGC 116659671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2345 TAAAAATGTTTATCTTAGAAGTAAGTGGAGGGGAAACATCCTTATTATTAAGTGCTAAGC 2404

116659672 CTTTTTAAAATGGTCTATGAAGATTCTAAATAGACTTCTGATTCCAAAATACCTATAACA 116659731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2405 CTTTTTAAAATGGTCTATGAAGATTCTAAATAGACTTCTGATTCCAAAATACCTATAACA 2464

116659732 ATGAAGTCTTTGGCCATGGCTAATTAAAAAAAAACATAAAACTCTAGAGACTGTCTCATT 116659791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2465 ATGAAGTCTTTGGCCATGGCTAATTAAAAAAAAACATAAAACTCTAGAGACTGTCTCATT 2524

116659792 TATTAATTTGCCAAATTCTTCTTTCTTTTAACATTTTCTTTATCCCACAGTATCTTTTCT 116659851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2525 TATTAATTTGCCAAATTCTTCTTTCTTTTAACATTTTCTTTATCCCACAGTATCTTTTCT 2584

116659852 TGCTTTTTGTGCTACCACACTATCAAATTTTACTCTTTTTCTCCCAAATTTCTTTTTCTA 116659911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2585 TGCTTTTTGTGCTACCACACTATCAAATTTTACTCTTTTTCTCCCAAATTTCTTTTTCTA 2644

116659912 ACCATCGTCTTCCCCCTCTGATTGTATCTGAAAATAACCACTTGCTTTTCTTCTTTTTTC 116659971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2645 ACCATCGTCTTCCCCCTCTGATTGTATCTGAAAATAACCACTTGCTTTTCTTCTTTTTTC 2704

116659972 TTTTTCTTTTTCTTTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTT 116660031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          
     2705 TTTTTCTTTTTCTTTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCC---------- 2754

116660032 CCTTCCTTCCCTCTTTCCCTTTCCCTTTCTTTTCTTTTATTTTTTCTTCTCTCTTCTCTT 116660091
                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2755 ----------CTCTTTCCCTTTCCCTTTCTTTTCTTTTATTTTTTCTTCTCTCTTCTCTT 2804

116660092 CTCTTTTTCTGGGTTGCACTCTGTTACCCAAGCTTGAATGCAATGGCAGGGATCACAGCT 116660151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2805 CTCTTTTTCTGGGTTGCACTCTGTTACCCAAGCTTGAATGCAATGGCAGGGATCACAGCT 2864

116660152 TACTGCAGTGTCAACCTCCTGGGCTCAGGTGATCATCCTCCTTCAGCCTCCTGTGTAGCT 116660211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2865 TACTGCAGTGTCAACCTCCTGGGCTCAGGTGATCATCCTCCTTCAGCCTCCTGTGTAGCT 2924

116660212 AGGACTGCAGGCATGTACCACCACACATGGCTAATTTTAGTATTTTTTGTAGAAATGAGA 116660271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2925 AGGACTGCAGGCATGTACCACCACACATGGCTAATTTTAGTATTTTTTGTAGAAATGAGA 2984

116660272 GTCTCACTGTGTTGTCCAGGTTTGTCTCAAACTCCCAGGTTCAAGCAATCCACCTGCCTC 116660331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2985 GTCTCACTGTGTTGTCCAGGTTTGTCTCAAACTCCCAGGTTCAAGCAATCCACCTGCCTC 3044

116660332 AGCCTCTCAAACTGCTGGGATTATAGGCATGTGCCACCATGCTGGGCCTCAAATTGACAT 116660391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3045 AGCCTCTCAAACTGCTGGGATTATAGGCATGTGCCACCATGCTGGGCCTCAAATTGACAT 3104

116660392 TTTCTTAAAAATTGGACTGCCAAACAAGGACATTAGCCCTAGTAGGCAGAAGATACTATC 116660451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3105 TTTCTTAAAAATTGGACTGCCAAACAAGGACATTAGCCCTAGTAGGCAGAAGATACTATC 3164

116660452 TTGGTCTGTGTTAGAGGCAATTGTTGAAATTTCTCTGAATCTCTATGGGATAGGCATAAA 116660511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3165 TTGGTCTGTGTTAGAGGCAATTGTTGAAATTTCTCTGAATCTCTATGGGATAGGCATAAA 3224

116660512 TGTACTGATAAATTTGAGCAGTCCTGGGAATCCATAATCTCAATTTATTTGACCAATATC 116660571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3225 TGTACTGATAAATTTGAGCAGTCCTGGGAATCCATAATCTCAATTTATTTGACCAATATC 3284

116660572 AATTAATACCATGTTGAGAGGTCCTTCTATTTCTGAAGTCTGGTTCAGCAAAAAATAAAA 116660631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3285 AATTAATACCATGTTGAGAGGTCCTTCTATTTCTGAAGTCTGGTTCAGCAAAAAATAAAA 3344

116660632 AAAAAAA-TAAAATACCTGAAATAATGTAGCTATTCCTGAGGTATCATTAACAGAATAGA 116660690
          ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3345 AAAAAAAATAAAATACCTGAAATAATGTAGCTATTCCTGAGGTATCATTAACAGAATAGA 3404

116660691 AACTTAAAAAGCGCATGATATGGAAAAATCTTTGCTGATGGTTATACATGTTAAGTTTCC 116660750
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     3405 AACTTAAAAAGCGCATGATATGGAAAAACCTTTGCTGATGGTTATACATGTTAAGTTTCC 3464

116660751 AGATAACTATTAATTAGACTTGCAGACATAAAAGGCTGTACCAAGTGGATATTTTAGAGA 116660810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3465 AGATAACTATTAATTAGACTTGCAGACATAAAAGGCTGTACCAAGTGGATATTTTAGAGA 3524

116660811 TAAATTTTTAGCACTTACAGACAATATTATGAAGTAGCTATGTGGGCATAGAGAAATTCG 116660870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3525 TAAATTTTTAGCACTTACAGACAATATTATGAAGTAGCTATGTGGGCATAGAGAAATTCG 3584

116660871 GGAAATTAGCAGGCTGGTTCTGCTATAATAGATCTCAGTTCACCCTTAGGATATCTTCAC 116660930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3585 GGAAATTAGCAGGCTGGTTCTGCTATAATAGATCTCAGTTCACCCTTAGGATATCTTCAC 3644

116660931 TAAAGGAGCTTAACATAGCCCAGATGGTAGATTTGATTGCCCTCATTAGAGCTGGTCACT 116660990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3645 TAAAGGAGCTTAACATAGCCCAGATGGTAGATTTGATTGCCCTCATTAGAGCTGGTCACT 3704

116660991 TGGCCAAAGACAAAAAAAATTATATTTACACAGAAAATAGCTCAAGTACCTGAACCTCAG 116661050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3705 TGGCCAAAGACAAAAAAAATTATATTTACACAGAAAATAGCTCAAGTACCTGAACCTCAG 3764

116661051 TATGACTATATATGGGGATAGAGTCTTTAAGGAAGTGATTAAGGTTAAATAAAGTCATAA 116661110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3765 TATGACTATATATGGGGATAGAGTCTTTAAGGAAGTGATTAAGGTTAAATAAAGTCATAA 3824

116661111 TGATGGGGCCCTAATCTGATAAGATTAGCGTCCTTCTAAGAGGAGGAATCAACATCAGGG 116661170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3825 TGATGGGGCCCTAATCTGATAAGATTAGCGTCCTTCTAAGAGGAGGAATCAACATCAGGG 3884

116661171 ATTTTTTTTTCTCTCAACCCATGCCCAGAGGAAAGTCATATGAGGACGTAACACAAAGAG 116661230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3885 ATTTTTTTTTCTCTCAACCCATGCCCAGAGGAAAGTCATATGAGGACGTAACACAAAGAG 3944

116661231 AGACATCTACAAATCACAGAGGTTGCACCAGAAATCAACCCTGCTAGCATATCGATCTTG 116661290
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3945 AGACATCTACAAATCACAGGGGTTGCACCAGAAATCAACCCTGCTAGCATATCGATCTTG 4004

116661291 AACTTCTAGTCCCCAGAACTGTGAGGAAATAAATTTTTGTTGCTTATGCCACCAGATCTG 116661350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4005 AACTTCTAGTCCCCAGAACTGTGAGGAAATAAATTTTTGTTGCTTATGCCACCAGATCTG 4064

116661351 TGACATTTTGTTATGGAAGTCTGAGCTGACCAATACACTTGAATAACTATCAGTGTCAAT 116661410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4065 TGACATTTTGTTATGGAAGTCTGAGCTGACCAATACACTTGAATAACTATCAGTGTCAAT 4124

116661411 GTAAAACAAGCCATCTTTAGACTTAAGGAAACAGTCACCTGGCTCTCTAAGGCAGATGCA 116661470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4125 GTAAAACAAGCCATCTTTAGACTTAAGGAAACAGTCACCTGGCTCTCTAAGGCAGATGCA 4184

116661471 AATGGATTTTTCTTTGCCCGGGTTTAGTAATTCAGATTATGGCACTAAGTGTTTTGGGAA 116661530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4185 AATGGATTTTTCTTTGCCCGGGTTTAGTAATTCAGATTATGGCACTAAGTGTTTTGGGAA 4244

116661531 GGCTCCATGTCATTTTGATATAGTCACTGTGTGTTGCCATTCTTATGCATGTATTCTCCA 116661590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4245 GGCTCCATGTCATTTTGATATAGTCACTGTGTGTTGCCATTCTTATGCATGTATTCTCCA 4304

116661591 CAGTCTCAGTCCTGCTCTGCAGCTGCTCTCGTGTCAAATGATCCATCACTCAACGGAAAT 116661650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4305 CAGTCTCAGTCCTGCTCTGCAGCTGCTCTCGTGTCAAATGATCCATCACTCAACGGAAAT 4364

116661651 GAACTCATCACTCCATAAAAGGAATAGGAAGATCAGTCCATGATCCAATCCCAAACTATT 116661710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4365 GAACTCATCACTCCATAAAAGGAATAGGAAGATCAGTCCATGATCCAATCCCAAACTATT 4424

116661711 TTTTCTGAGGATGATAATGTTATCTAGAAATCACAACAGTGGTATACATCTGAACATGGC 116661770
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
     4425 TTTTCCGAGGATGATAATGTTATCTAGAAATCACAACAG-GGTATACATCTGAACATGGC 4483

116661771 TGCTTTAGTAGCTGAACGACTCTTCTCATCTTCTCATCAGTTAGGAAAGACTGAGAACTG 116661830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4484 TGCTTTAGTAGCTGAACGACTCTTCTCATCTTCTCATCAGTTAGGAAAGACTGAGAACTG 4543

116661831 GTAGCATAAATCCATCAATTATGGGATTGCAATTGCAGAATGTTTTGTGACTCACATAAT 116661890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4544 GTAGCATAAATCCATCAATTATGGGATTGCAATTGCAGAATGTTTTGTGACTCACATAAT 4603

116661891 GTTTTCTTCTTTACTCAGAACTTCTCTATTTCACAGATTCTCACCTTAATAATTGAAGCA 116661950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4604 GTTTTCTTCTTTACTCAGAACTTCTCTATTTCACAGATTCTCACCTTAATAATTGAAGCA 4663

116661951 ACTCAGGGTCACATCCTAGTTCTATAATTCTGCCTGAGGCACTCTGAGCCCAAACCATCA 116662010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4664 ACTCAGGGTCACATCCTAGTTCTATAATTCTGCCTGAGGCACTCTGAGCCCAAACCATCA 4723

116662011 ACAGGAAACAAACAAATAAAAAACCTGCTAATTTACTCTCCAATGAAACCTTTCCAGAAT 116662070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4724 ACAGGAAACAAACAAATAAAAAACCTGCTAATTTACTCTCCAATGAAACCTTTCCAGAAT 4783

116662071 TATCTG 116662076
          ||||||
     4784 TATCTG 4789

EXCISED REGION

116662657 AATGAATAACTACCGTTATAGAAATAGCTTCTGGATTTCTTTGTCCTTTTTTTCCTGAAG 116662716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4791 AATGAATAACTACCGTTATAGAAATAGCTTCTGGATTTCTTTGTCCTTTTTTTCCTGAAG 4850

116662717 TTAGGCTATATTTGGTATCTCTATAGAGATAGGCTATATTTGGTAAATCTGTTCTCACCT 116662776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4851 TTAGGCTATATTTGGTATCTCTATAGAGATAGGCTATATTTGGTAAATCTGTTCTCACCT 4910

116662777 CACATAAAAGGTTAATATTCTACAAGTGGATAGATGTGGTGAGGACAACTAAAAGGAGAT 116662836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4911 CACATAAAAGGTTAATATTCTACAAGTGGATAGATGTGGTGAGGACAACTAAAAGGAGAT 4970

116662837 TGAATGATCTCATCAAATTATATTACACAACCTTTCAAAGAAAGCTCAGTTGGATTAAGA 116662896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4971 TGAATGATCTCATCAAATTATATTACACAACCTTTCAAAGAAAGCTCAGTTGGATTAAGA 5030

116662897 GGTTTCTTTATGTTCATGCCCAAAATGCCAAATTCCAACAGCCCACAAAATTTCTTTGAA 116662956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5031 GGTTTCTTTATGTTCATGCCCAAAATGCCAAATTCCAACAGCCCACAAAATTTCTTTGAA 5090

116662957 GTATTTTTCTCATACGTTTGTTTGATGAACAGCTTAAAGCTCCATTTCCATCCTAGCAAG 116663016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5091 GTATTTTTCTCATACGTTTGTTTGATGAACAGCTTAAAGCTCCATTTCCATCCTAGCAAG 5150

116663017 TGGCAGACAAAAAGCCAGATAGTAAATCATATTTTAATAAAAATGATTTTAATAAGTGAA 116663076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5151 TGGCAGACAAAAAGCCAGATAGTAAATCATATTTTAATAAAAATGATTTTAATAAGTGAA 5210

116663077 AGATATGATCCATTAAGTTAATCTTGTTAAGTAGAAGACCAAAATGAGAACTTAATGGGG 116663136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5211 AGATATGATCCATTAAGTTAATCTTGTTAAGTAGAAGACCAAAATGAGAACTTAATGGGG 5270

116663137 TGCAAACATCACGGAGAATCAAAACACACACTAGAAACCATACTTGAGAACCAGAGATGA 116663196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5271 TGCAAACATCACGGAGAATCAAAACACACACTAGAAACCATACTTGAGAACCAGAGATGA 5330

116663197 GTGAATGTTTGGTCATCAATATCCATGCTAGCCTTAATCTTGTGGTTATCCCACCACATC 116663256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5331 GTGAATGTTTGGTCATCAATATCCATGCTAGCCTTAATCTTGTGGTTATCCCACCACATC 5390

116663257 CCCCTTTTCAACAGAAGTCAGTGAGCAGCAAGCCTCATTGAATGTTGGATATTAGCAAGC 116663316
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5391 CCCCTTTTCAACAGAAGTCAGTGAGTAGCAAGCCTCATTGAATGTTGGATATTAGCAAGC 5450

116663317 ACATGTAGTTTTGCTTCAAGTACTCTTTATTTTCTTCCAATCCTCAGGGCCTTTCTCAAC 116663376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5451 ACATGTAGTTTTGCTTCAAGTACTCTTTATTTTCTTCCAATCCTCAGGGCCTTTCTCAAC 5510

116663377 ATATGGTTTATTATAGCGTTGTGAATGATTGGTCTTTCATAAGGACATTTTCCTTGGCAG 116663436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5511 ATATGGTTTATTATAGCGTTGTGAATGATTGGTCTTTCATAAGGACATTTTCCTTGGCAG 5570

116663437 AAGGCTATTTGAAGTTCATTGCTTTTACAAGGTAAGATTTCTGGAAGTTCTAAGCTATAT 116663496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5571 AAGGCTATTTGAAGTTCATTGCTTTTACAAGGTAAGATTTCTGGAAGTTCTAAGCTATAT 5630

116663497 AAATAGGTTTGGAGGAACTTTCTCTTAAACCACAGAAACTATTAATACTCTTGAGCAGGT 116663556
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5631 AAATAGGTTTGGAGGAACATTCTCTTAAACCACAGAAACTATTAATACTCTTGAGCAGGT 5690

116663557 GAGCTTATCAGATTCCTTAGTAGTCAACCAAAATGCTGA 116663595
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5691 GAGCTTATCAGATTCCTTAGTAGTCAACCAAAATGCTGA 5729

Alignment time is 6.84299 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [116652076,116672656] =>     20581 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [        1,     3199] =>      3199 nucs 'mol-32-3235-029790_3199'

Score:        3091
Aligned:      3219        nucs
Identic:      3191 ( 99%) nucs =>      2268 ( 99%)       923 (100%)
Gaps:           23 (  1%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [116659785,116662076] EXCISED REGION [116662657,116663581]
 second seq =>  [        1,     2273] EXCISED REGION [     2275,     3199]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       580 nucs [116662077,116662656]
 second seq =>         1 nucs [2274,2274]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [2273,2273] to [2274,2274]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

116659785 TCTCATTTATTAATTTGCCAAATTCTTCTTTCTTTTAACATTTTCTTTATCCCACAGTAT 116659844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCTCATTTATTAATTTGCCAAATTCTTCTTTCTTTTAACATTTTCTTTATCCCACAGTAT 60

116659845 CTTTTCTTGCTTTTTGTGCTACCACACTATCAAATTTTACTCTTTTTCTCCCAAATTTCT 116659904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTTTTCTTGCTTTTTGTGCTACCACACTATCAAATTTTACTCTTTTTCTCCCAAATTTCT 120

116659905 TTTTCTAACCATCGTCTTCCCCCTCTGATTGTATCTGAAAATAACCACTTGCTTTTCTTC 116659964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTTCTAACCATCGTCTTCCCCCTCTGATTGTATCTGAAAATAACCACTTGCTTTTCTTC 180

116659965 TTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTC 116660024
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   
      181 TTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCC--- 237

116660025 CTTCCTTCCTTCCTTCCCTCTTTCCCTTTCCCTTTCTTTTCTTTTATTTTTTCTTCTCTC 116660084
                           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      238 -----------------CTCTTTCCCTTTCCCTTTCTTTTCTTTTATTTTTTCTTCTCTC 280

116660085 TTCTCTTCTCTTTTTCTGGGTTGCACTCTGTTACCCAAGCTTGAATGCAATGGCAGGGAT 116660144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      281 TTCTCTTCTCTTTTTCTGGGTTGCACTCTGTTACCCAAGCTTGAATGCAATGGCAGGGAT 340

116660145 CACAGCTTACTGCAGTGTCAACCTCCTGGGCTCAGGTGATCATCCTCCTTCAGCCTCCTG 116660204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      341 CACAGCTTACTGCAGTGTCAACCTCCTGGGCTCAGGTGATCATCCTCCTTCAGCCTCCTG 400

116660205 TGTAGCTAGGACTGCAGGCATGTACCACCACACATGGCTAATTTTAGTATTTTTTGTAGA 116660264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      401 TGTAGCTAGGACTGCAGGCATGTACCACCACACATGGCTAATTTTAGTATTTTTTGTAGA 460

116660265 AATGAGAGTCTCACTGTGTTGTCCAGGTTTGTCTCAAACTCCCAGGTTCAAGCAATCCAC 116660324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      461 AATGAGAGTCTCACTGTGTTGTCCAGGTTTGTCTCAAACTCCCAGGTTCAAGCAATCCAC 520

116660325 CTGCCTCAGCCTCTCAAACTGCTGGGATTATAGGCATGTGCCACCATGCTGGGCCTCAAA 116660384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      521 CTGCCTCAGCCTCTCAAACTGCTGGGATTATAGGCATGTGCCACCATGCTGGGCCTCAAA 580

116660385 TTGACATTTTCTTAAAAATTGGACTGCCAAACAAGGACATTAGCCCTAGTAGGCAGAAGA 116660444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      581 TTGACATTTTCTTAAAAATTGGACTGCCAAACAAGGACATTAGCCCTAGTAGGCAGAAGA 640

116660445 TACTATCTTGGTCTGTGTTAGAGGCAATTGTTGAAATTTCTCTGAATCTCTATGGGATAG 116660504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      641 TACTATCTTGGTCTGTGTTAGAGGCAATTGTTGAAATTTCTCTGAATCTCTATGGGATAG 700

116660505 GCATAAATGTACTGATAAATTTGAGCAGTCCTGGGAATCCATAATCTCAATTTATTTGAC 116660564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      701 GCATAAATGTACTGATAAATTTGAGCAGTCCTGGGAATCCATAATCTCAATTTATTTGAC 760

116660565 CAATATCAATTAATACCATGTTGAGAGGTCCTTCTATTTCTGAAGTCTGGTTCAGCAAAA 116660624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      761 CAATATCAATTAATACCATGTTGAGAGGTCCTTCTATTTCTGAAGTCTGGTTCAGCAAAA 820

116660625 AATAAAAAAAAAAA--TAAAATACCTGAAATAATGTAGCTATTCCTGAGGTATCATTAAC 116660682
          ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      821 AATAAAAAAAAAAAAATAAAATACCTGAAATAATGTAGCTATTCCTGAGGTATCATTAAC 880

116660683 AGAATAGAAACTTAAAAAGCGCATGATATGGAAAAATCTTTGCTGATGGTTATACATGTT 116660742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
      881 AGAATAGAAACTTAAAAAGCGCATGATATGGAAAAACCTTTGCTGATGGTTATACATGTT 940

116660743 AAGTTTCCAGATAACTATTAATTAGACTTGCAGACATAAAAGGCTGTACCAAGTGGATAT 116660802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      941 AAGTTTCCAGATAACTATTAATTAGACTTGCAGACATAAAAGGCTGTACCAAGTGGATAT 1000

116660803 TTTAGAGATAAATTTTTAGCACTTACAGACAATATTATGAAGTAGCTATGTGGGCATAGA 116660862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1001 TTTAGAGATAAATTTTTAGCACTTACAGACAATATTATGAAGTAGCTATGTGGGCATAGA 1060

116660863 GAAATTCGGGAAATTAGCAGGCTGGTTCTGCTATAATAGATCTCAGTTCACCCTTAGGAT 116660922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1061 GAAATTCGGGAAATTAGCAGGCTGGTTCTGCTATAATAGATCTCAGTTCACCCTTAGGAT 1120

116660923 ATCTTCACTAAAGGAGCTTAACATAGCCCAGATGGTAGATTTGATTGCCCTCATTAGAGC 116660982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1121 ATCTTCACTAAAGGAGCTTAACATAGCCCAGATGGTAGATTTGATTGCCCTCATTAGAGC 1180

116660983 TGGTCACTTGGCCAAAGACAAAAAAAATTATATTTACACAGAAAATAGCTCAAGTACCTG 116661042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1181 TGGTCACTTGGCCAAAGACAAAAAAAATTATATTTACACAGAAAATAGCTCAAGTACCTG 1240

116661043 AACCTCAGTATGACTATATATGGGGATAGAGTCTTTAAGGAAGTGATTAAGGTTAAATAA 116661102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1241 AACCTCAGTATGACTATATATGGGGATAGAGTCTTTAAGGAAGTGATTAAGGTTAAATAA 1300

116661103 AGTCATAATGATGGGGCCCTAATCTGATAAGATTAGCGTCCTTCTAAGAGGAGGAATCAA 116661162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1301 AGTCATAATGATGGGGCCCTAATCTGATAAGATTAGCGTCCTTCTAAGAGGAGGAATCAA 1360

116661163 CATCAGGGATTTTTTTTTCTCTCAACCCATGCCCAGAGGAAAGTCATATGAGGACGTAAC 116661222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1361 CATCAGGGATTTTTTTTTCTCTCAACCCATGCCCAGAGGAAAGTCATATGAGGACGTAAC 1420

116661223 ACAAAGAGAGACATCTACAAATCACAGAGGTTGCACCAGAAATCAACCCTGCTAGCATAT 116661282
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     1421 ACAAAGAGAGACATCTACAAATCACAGGGGTTGCACCAGAAATCAACCCTGCTAGCATAT 1480

116661283 CGATCTTGAACTTCTAGTCCCCAGAACTGTGAGGAAATAAATTTTTGTTGCTTATGCCAC 116661342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1481 CGATCTTGAACTTCTAGTCCCCAGAACTGTGAGGAAATAAATTTTTGTTGCTTATGCCAC 1540

116661343 CAGATCTGTGACATTTTGTTATGGAAGTCTGAGCTGACCAATACACTTGAATAACTATCA 116661402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1541 CAGATCTGTGACATTTTGTTATGGAAGTCTGAGCTGACCAATACACTTGAATAACTATCA 1600

116661403 GTGTCAATGTAAAACAAGCCATCTTTAGACTTAAGGAAACAGTCACCTGGCTCTCTAAGG 116661462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1601 GTGTCAATGTAAAACAAGCCATCTTTAGACTTAAGGAAACAGTCACCTGGCTCTCTAAGG 1660

116661463 CAGATGCAAATGGATTTTTCTTTGCCCGGGTTTAGTAATTCAGATTATGGCACTAAGTGT 116661522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1661 CAGATGCAAATGGATTTTTCTTTGCCCGGGTTTAGTAATTCAGATTATGGCACTAAGTGT 1720

116661523 TTTGGGAAGGCTCCATGTCATTTTGATATAGTCACTGTGTGTTGCCATTCTTATGCATGT 116661582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1721 TTTGGGAAGGCTCCATGTCATTTTGATATAGTCACTGTGTGTTGCCATTCTTATGCATGT 1780

116661583 ATTCTCCACAGTCTCAGTCCTGCTCTGCAGCTGCTCTCGTGTCAAATGATCCATCACTCA 116661642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1781 ATTCTCCACAGTCTCAGTCCTGCTCTGCAGCTGCTCTCGTGTCAAATGATCCATCACTCA 1840

116661643 ACGGAAATGAACTCATCACTCCATAAAAGGAATAGGAAGATCAGTCCATGATCCAATCCC 116661702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1841 ACGGAAATGAACTCATCACTCCATAAAAGGAATAGGAAGATCAGTCCATGATCCAATCCC 1900

116661703 AAACTATTTTTTCTGAGGATGATAATGTTATCTAGAAATCACAACAGTGGTATACATCTG 116661762
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
     1901 AAACTATTTTTTCCGAGGATGATAATGTTATCTAGAAATCACAACAG-GGTATACATCTG 1959

116661763 AACATGGCTGCTTTAGTAGCTGAACGACTCTTCTCATCTTCTCATCAGTTAGGAAAGACT 116661822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1960 AACATGGCTGCTTTAGTAGCTGAACGACTCTTCTCATCTTCTCATCAGTTAGGAAAGACT 2019

116661823 GAGAACTGGTAGCATAAATCCATCAATTATGGGATTGCAATTGCAGAATGTTTTGTGACT 116661882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2020 GAGAACTGGTAGCATAAATCCATCAATTATGGGATTGCAATTGCAGAATGTTTTGTGACT 2079

116661883 CACATAATGTTTTCTTCTTTACTCAGAACTTCTCTATTTCACAGATTCTCACCTTAATAA 116661942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2080 CACATAATGTTTTCTTCTTTACTCAGAACTTCTCTATTTCACAGATTCTCACCTTAATAA 2139

116661943 TTGAAGCAACTCAGGGTCACATCCTAGTTCTATAATTCTGCCTGAGGCACTCTGAGCCCA 116662002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2140 TTGAAGCAACTCAGGGTCACATCCTAGTTCTATAATTCTGCCTGAGGCACTCTGAGCCCA 2199

116662003 AACCATCAACAGGAAACAAACAAATAAAAAACCTGCTAATTTACTCTCCAATGAAACCTT 116662062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2200 AACCATCAACAGGAAACAAACAAATAAAAAACCTGCTAATTTACTCTCCAATGAAACCTT 2259

116662063 TCCAGAATTATCTG 116662076
          ||||||||||||||
     2260 TCCAGAATTATCTG 2273

EXCISED REGION

116662657 AATGAATAACTACCGTTATAGAAATAGCTTCTGGATTTCTTTGTCCTTTTTTTCCTGAAG 116662716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2275 AATGAATAACTACCGTTATAGAAATAGCTTCTGGATTTCTTTGTCCTTTTTTTCCTGAAG 2334

116662717 TTAGGCTATATTTGGTATCTCTATAGAGATAGGCTATATTTGGTAAATCTGTTCTCACCT 116662776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2335 TTAGGCTATATTTGGTATCTCTATAGAGATAGGCTATATTTGGTAAATCTGTTCTCACCT 2394

116662777 CACATAAAAGGTTAATATTCTACAAGTGGATAGATGTGGTGAGGACAACTAAAAGGAGAT 116662836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2395 CACATAAAAGGTTAATATTCTACAAGTGGATAGATGTGGTGAGGACAACTAAAAGGAGAT 2454

116662837 TGAATGATCTCATCAAATTATATTACACAACCTTTCAAAGAAAGCTCAGTTGGATTAAGA 116662896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2455 TGAATGATCTCATCAAATTATATTACACAACCTTTCAAAGAAAGCTCAGTTGGATTAAGA 2514

116662897 GGTTTCTTTATGTTCATGCCCAAAATGCCAAATTCCAACAGCCCACAAAATTTCTTTGAA 116662956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2515 GGTTTCTTTATGTTCATGCCCAAAATGCCAAATTCCAACAGCCCACAAAATTTCTTTGAA 2574

116662957 GTATTTTTCTCATACGTTTGTTTGATGAACAGCTTAAAGCTCCATTTCCATCCTAGCAAG 116663016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2575 GTATTTTTCTCATACGTTTGTTTGATGAACAGCTTAAAGCTCCATTTCCATCCTAGCAAG 2634

116663017 TGGCAGACAAAAAGCCAGATAGTAAATCATATTTTAATAAAAATGATTTTAATAAGTGAA 116663076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2635 TGGCAGACAAAAAGCCAGATAGTAAATCATATTTTAATAAAAATGATTTTAATAAGTGAA 2694

116663077 AGATATGATCCATTAAGTTAATCTTGTTAAGTAGAAGACCAAAATGAGAACTTAATGGGG 116663136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2695 AGATATGATCCATTAAGTTAATCTTGTTAAGTAGAAGACCAAAATGAGAACTTAATGGGG 2754

116663137 TGCAAACATCACGGAGAATCAAAACACACACTAGAAACCATACTTGAGAACCAGAGATGA 116663196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2755 TGCAAACATCACGGAGAATCAAAACACACACTAGAAACCATACTTGAGAACCAGAGATGA 2814

116663197 GTGAATGTTTGGTCATCAATATCCATGCTAGCCTTAATCTTGTGGTTATCCCACCACATC 116663256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2815 GTGAATGTTTGGTCATCAATATCCATGCTAGCCTTAATCTTGTGGTTATCCCACCACATC 2874

116663257 CCCCTTTTCAACAGAAGTCAGTGAGCAGCAAGCCTCATTGAATGTTGGATATTAGCAAGC 116663316
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2875 CCCCTTTTCAACAGAAGTCAGTGAGTAGCAAGCCTCATTGAATGTTGGATATTAGCAAGC 2934

116663317 ACATGTAGTTTTGCTTCAAGTACTCTTTATTTTCTTCCAATCCTCAGGGCCTTTCTCAAC 116663376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2935 ACATGTAGTTTTGCTTCAAGTACTCTTTATTTTCTTCCAATCCTCAGGGCCTTTCTCAAC 2994

116663377 ATATGGTTTATTATAGCGTTGTGAATGATTGGTCTTTCATAAGGACATTTTCCTTGGCAG 116663436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2995 ATATGGTTTATTATAGCGTTGTGAATGATTGGTCTTTCATAAGGACATTTTCCTTGGCAG 3054

116663437 AAGGCTATTTGAAGTTCATTGCTTTTACAAGGTAAGATTTCTGGAAGTTCTAAGCTATAT 116663496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3055 AAGGCTATTTGAAGTTCATTGCTTTTACAAGGTAAGATTTCTGGAAGTTCTAAGCTATAT 3114

116663497 AAATAGGTTTGGAGGAACTTTCTCTTAAACCACAGAAACTATTAATACTCTTGAGCAGGT 116663556
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3115 AAATAGGTTTGGAGGAACATTCTCTTAAACCACAGAAACTATTAATACTCTTGAGCAGGT 3174

116663557 GAGCTTATCAGATTCCTTAGTAGTC 116663581
          |||||||||||||||||||||||||
     3175 GAGCTTATCAGATTCCTTAGTAGTC 3199

Alignment time is 3.73517 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [116652076,116672656] =>     20581 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [        1,     8306] =>      8306 nucs 'mol-32-32fb-047120_8306'

Score:        8273
Aligned:      8306        nucs
Identic:      8303 (100%) nucs =>       267 (100%)      8036 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [116654625,116654891] EXCISED REGION [116654893,116662931]
 second seq =>  [        1,      267] EXCISED REGION [      269,     8306]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [116654892,116654892]
 second seq =>         1 nucs [268,268]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [116657231,116657231]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [268,268] to [269,269]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

116654625 CTGTGCATTTCAGAGTACAGTATAGAAAAGAAATAAAAGAGTAACTTTATAGTAGAGAAA 116654684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTGTGCATTTCAGAGTACAGTATAGAAAAGAAATAAAAGAGTAACTTTATAGTAGAGAAA 60

116654685 TCTGGCAAATACTAGTTCAGCCAGGTGATCCAGGTCAACATCTATACTCATAAACCATAT 116654744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCTGGCAAATACTAGTTCAGCCAGGTGATCCAGGTCAACATCTATACTCATAAACCATAT 120

116654745 TGATAGTATGTACCCTTGATATTATAGGATGTAAATAGCACTTTATCTCTGTAGTCTTAC 116654804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGATAGTATGTACCCTTGATATTATAGGATGTAAATAGCACTTTATCTCTGTAGTCTTAC 180

116654805 TTCTAAAACACATAACTCCAGTGTAATCCTGAGAAAAATGTCAGACAAACTGTATTAGCA 116654864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTCTAAAACACATAACTCCAGTGTAATCCTGAGAAAAATGTCAGACAAACTGTATTAGCA 240

116654865 GGATATCTACAGTATACCTTACAAGTA 116654891
          |||||||||||||||||||||||||||
      241 GGATATCTACAGTATACCTTACAAGTA 267

EXCISED REGION

116654893 TCTTCAAAACTGTGAGAGCCATCAATAACAAAGTATGAGAAGCTGTCACAGTGCTGAGGA 116654952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      269 TCTTCAAAACTGTGAGAGCCATCAATAACAAAGTATGAGAAGCTGTCACAGTGCTGAGGA 328

116654953 GCCTAAGGCGACATGATTACCAAGTGCAATGTGATATCCTGGATGGGATCCTGGAAGAGA 116655012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      329 GCCTAAGGCGACATGATTACCAAGTGCAATGTGATATCCTGGATGGGATCCTGGAAGAGA 388

116655013 AAAAGGAAATTAGGTAAAAACTAAAGAAATCTGAATAAACTATACACTTTAATTAATTAT 116655072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      389 AAAAGGAAATTAGGTAAAAACTAAAGAAATCTGAATAAACTATACACTTTAATTAATTAT 448

116655073 AATATATAAATATCAGTCTGTTGATGTTTACAAATGTACCACTCATGTATAAATATCAGT 116655132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      449 AATATATAAATATCAGTCTGTTGATGTTTACAAATGTACCACTCATGTATAAATATCAGT 508

116655133 CTGTTAATGTTTACAAATCTACCACTCAAGTGTCTAATTTTAATAATAGGAAAAATAATG 116655192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      509 CTGTTAATGTTTACAAATCTACCACTCAAGTGTCTAATTTTAATAATAGGAAAAATAATG 568

116655193 TATGAGGGGCACAGTGGAAATCTGCAGTTCTGCACAATTTCTCTGGGAATCTAAAACTTG 116655252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      569 TATGAGGGGCACAGTGGAAATCTGCAGTTCTGCACAATTTCTCTGGGAATCTAAAACTTG 628

116655253 AAAAAAATAGTCTATTAATAATACCAACACAGAAGCAAGTTGAGGCATTTGTTTTTGGAA 116655312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      629 AAAAAAATAGTCTATTAATAATACCAACACAGAAGCAAGTTGAGGCATTTGTTTTTGGAA 688

116655313 TTCAGGGTTAAAGACAGTTGCTTCAGGGAGAGGTGCAAGTCACTATCTGACACTGGCACT 116655372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      689 TTCAGGGTTAAAGACAGTTGCTTCAGGGAGAGGTGCAAGTCACTATCTGACACTGGCACT 748

116655373 GGAAATTTTTCTTTTCTTCTCAGTTACTGGTCATTCTTGGAAAGTCAGGTGATACCCCTC 116655432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      749 GGAAATTTTTCTTTTCTTCTCAGTTACTGGTCATTCTTGGAAAGTCAGGTGATACCCCTC 808

116655433 AAGTAAATTTTCCCCAAAATGGAGCTAAAAATATACCCTGAGGGCAGACATAAATAAAAG 116655492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      809 AAGTAAATTTTCCCCAAAATGGAGCTAAAAATATACCCTGAGGGCAGACATAAATAAAAG 868

116655493 GGCCAAAAGAAGGAGAGAAATACAAAAGTCAATGTTAGTCTCTTTCCTCACGTCTCCACC 116655552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      869 GGCCAAAAGAAGGAGAGAAATACAAAAGTCAATGTTAGTCTCTTTCCTCACGTCTCCACC 928

116655553 TTTTCTTCTGTGTTCTCAATATATTGATTTTCTGAAGGCATCCTTCACCATTGCCATCTG 116655612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      929 TTTTCTTCTGTGTTCTCAATATATTGATTTTCTGAAGGCATCCTTCACCATTGCCATCTG 988

116655613 TGAGTGATATTACCACTGCTGGTCATGACCTTCCACAATGAGGATATTTGAACTAGATAG 116655672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      989 TGAGTGATATTACCACTGCTGGTCATGACCTTCCACAATGAGGATATTTGAACTAGATAG 1048

116655673 CTGGCAGGGTGCAGTGCCTTGAGAGGCCAGTGAGGACAGAGATTTTTGCTGACTCTGAAC 116655732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1049 CTGGCAGGGTGCAGTGCCTTGAGAGGCCAGTGAGGACAGAGATTTTTGCTGACTCTGAAC 1108

116655733 TCAATCTTCCTCACTGAAGTGAAAGTTTAAATTAGATTTTCAAATAGGGTATATGCAATT 116655792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1109 TCAATCTTCCTCACTGAAGTGAAAGTTTAAATTAGATTTTCAAATAGGGTATATGCAATT 1168

116655793 GTGTATTTCCTCATAATTTTTCCCTTGATGTGATGATTGCTTTCCAACAGGACAAAGCAT 116655852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1169 GTGTATTTCCTCATAATTTTTCCCTTGATGTGATGATTGCTTTCCAACAGGACAAAGCAT 1228

116655853 TGTGACACGTAATATTAACCTAAGTGATATCTTTCCAGGCTTACAAGTGTGCTTGTTTTA 116655912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1229 TGTGACACGTAATATTAACCTAAGTGATATCTTTCCAGGCTTACAAGTGTGCTTGTTTTA 1288

116655913 CTTTGTTATTTCCTGAAGACTTCCTTTACACTTCTCTTGATTTCTGCCATTTTTATAATA 116655972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1289 CTTTGTTATTTCCTGAAGACTTCCTTTACACTTCTCTTGATTTCTGCCATTTTTATAATA 1348

116655973 ATGTATGGTAAGAACAACATTGTGGGTACTAATTATATATTCTTTCAAACAAAGAATGCT 116656032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1349 ATGTATGGTAAGAACAACATTGTGGGTACTAATTATATATTCTTTCAAACAAAGAATGCT 1408

116656033 ATTATGTTTGCTTTCTTCTGAGGTAGCTTATGCATACATTTTTGTTGCCCTTTTAGCTTT 116656092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1409 ATTATGTTTGCTTTCTTCTGAGGTAGCTTATGCATACATTTTTGTTGCCCTTTTAGCTTT 1468

116656093 GAGATCATATTAAGTTGAAATTTTAAAAGTGACTGTCGCGGGCGTGGTGGCTTATGCCTG 116656152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1469 GAGATCATATTAAGTTGAAATTTTAAAAGTGACTGTCGCGGGCGTGGTGGCTTATGCCTG 1528

116656153 TAATCCCAACACTTTGGGAGGCCGAAGCAGGCAGATCACCTGAGGTCGGGAGTTCGAAAC 116656212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1529 TAATCCCAACACTTTGGGAGGCCGAAGCAGGCAGATCACCTGAGGTCGGGAGTTCGAAAC 1588

116656213 GAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCAGGCGTG 116656272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1589 GAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCAGGCGTG 1648

116656273 GTGGTGCATACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCTCTTGAACC 116656332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1649 GTGGTGCATACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCTCTTGAACC 1708

116656333 CGGGAGGCAGAGGTTGTGGTGAGCCGAAATCACACCACTGTACTCCAGCCTGGGCAACAA 116656392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     1709 CGGGAGGCAGAGGTTGTGGTGAGCCGAAATCACACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAA 1768

116656393 GAGTGAAAGTGAAACTCCGTCTCAAGAAAAAAAAAAAAAAATGACTATTAGAACCCATTC 116656452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1769 GAGTGAAAGTGAAACTCCGTCTCAAGAAAAAAAAAAAAAAATGACTATTAGAACCCATTC 1828

116656453 TTGAATTTGGCTAATTGATTAGAGAGAGACAAAAATGTTATAAGCAATTTCTCATTATTT 116656512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1829 TTGAATTTGGCTAATTGATTAGAGAGAGACAAAAATGTTATAAGCAATTTCTCATTATTT 1888

116656513 TCTCTTATTTGCCTTGACTTTGATTGTGGCTGCCACTGTTCTTCTTAATAATTCAATTAG 116656572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1889 TCTCTTATTTGCCTTGACTTTGATTGTGGCTGCCACTGTTCTTCTTAATAATTCAATTAG 1948

116656573 CCAATACTTACAGAGCCATCTGCTCTGCATCAGACAACATTCTATGTATTGCTAGACCAA 116656632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1949 CCAATACTTACAGAGCCATCTGCTCTGCATCAGACAACATTCTATGTATTGCTAGACCAA 2008

116656633 TAACAAGACTGATGACCTAAACTTTACATTCTAGTGAGGTAGCAGATAATAAACAGTAAA 116656692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2009 TAACAAGACTGATGACCTAAACTTTACATTCTAGTGAGGTAGCAGATAATAAACAGTAAA 2068

116656693 CATGTAAGTATATCATATAGTATAGGAAGTGATAAGTAACATAGAGAAAGAAAAATCAGT 116656752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2069 CATGTAAGTATATCATATAGTATAGGAAGTGATAAGTAACATAGAGAAAGAAAAATCAGT 2128

116656753 TTTAGAAGATAGGCCAAGAGCAACAGTTTTATAAACAGTGGTCTCTGAGGAGACAGCAAT 116656812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2129 TTTAGAAGATAGGCCAAGAGCAACAGTTTTATAAACAGTGGTCTCTGAGGAGACAGCAAT 2188

116656813 TGCTCAAAACCTGTGTGAGAAAAGTAAGCCACACAAATATCTCAATATGGTCTGGGTAGA 116656872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2189 TGCTCAAAACCTGTGTGAGAAAAGTAAGCCACACAAATATCTCAATATGGTCTGGGTAGA 2248

116656873 AATAAACTCAATTAGAAAGATTCTAGGCAAGAGCTTGCCTGCTTTTATTGAAAAACAGTA 116656932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2249 AATAAACTCAATTAGAAAGATTCTAGGCAAGAGCTTGCCTGCTTTTATTGAAAAACAGTA 2308

116656933 AGCATTTTTGAGCAAATAAAGTTGGACAGAAGGTAGTCATTGGCCAGATCGTAGAAGAAC 116656992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2309 AGCATTTTTGAGCAAATAAAGTTGGACAGAAGGTAGTCATTGGCCAGATCGTAGAAGAAC 2368

116656993 ATAAAATATGATTACAATGCTCTCCATTATTTGAATATCTTGCATAATAATGATGTGGTC 116657052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2369 ATAAAATATGATTACAATGCTCTCCATTATTTGAATATCTTGCATAATAATGATGTGGTC 2428

116657053 TTATATTATCTTTTTTCTTTTTCTTTTTTGAGAATGAGTCTCACTCTGTCTCCCAGGCTG 116657112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2429 TTATATTATCTTTTTTCTTTTTCTTTTTTGAGAATGAGTCTCACTCTGTCTCCCAGGCTG 2488

116657113 GAGTGCAGTGGCACAATCTTGGCTGACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCT 116657172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2489 GAGTGCAGTGGCACAATCTTGGCTGACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCT 2548

116657173 CCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGATGCTTGTCACTGCACCTGGCTAATT 116657232
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
     2549 CCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGATGCTTGTCACTGCACCTGGCTAA-T 2607

116657233 TTTTTTTTTTTTTAAAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACT 116657292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2608 TTTTTTTTTTTTTAAAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACT 2667

116657293 ACTGACCTCATGATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTTGGATTACAGGTGTGAGCC 116657352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2668 ACTGACCTCATGATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTTGGATTACAGGTGTGAGCC 2727

116657353 ACCACACCTGGCCATATTATCTTTAAGTCTCAGGTTCCTCATCTTTGAAATCAACTAATA 116657412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2728 ACCACACCTGGCCATATTATCTTTAAGTCTCAGGTTCCTCATCTTTGAAATCAACTAATA 2787

116657413 TTATGTGTTTATTGTTATAAGTCAAAGACAGAAATTTGAAATGAGGCCTACGATGCTGAT 116657472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2788 TTATGTGTTTATTGTTATAAGTCAAAGACAGAAATTTGAAATGAGGCCTACGATGCTGAT 2847

116657473 TATATTTTGTTCTTTGATCCAGGTGATAGTTAAATAGATATGATCACCTAGTGAACACTC 116657532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2848 TATATTTTGTTCTTTGATCCAGGTGATAGTTAAATAGATATGATCACCTAGTGAACACTC 2907

116657533 AAGACTTATGCACTTGTCTGCGTGTAATGTACACAAAAATGTGTAACTACTTAGTAGTAG 116657592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2908 AAGACTTATGCACTTGTCTGCGTGTAATGTACACAAAAATGTGTAACTACTTAGTAGTAG 2967

116657593 TCTTATAAAAATAAACAAGATAATATGTGTGTATATATATGTAGTGTTAAGCAAAGTACC 116657652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2968 TCTTATAAAAATAAACAAGATAATATGTGTGTATATATATGTAGTGTTAAGCAAAGTACC 3027

116657653 CAGTACATGTTGGCCAAAACAAATGTCATCTCTCTCCTCCTGCCTTTTGTTCACTTTTTT 116657712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3028 CAGTACATGTTGGCCAAAACAAATGTCATCTCTCTCCTCCTGCCTTTTGTTCACTTTTTT 3087

116657713 TCCTAGCCGAACAATCCTAGAGATTTTAAAGTACTTCTGCTTGTTTACTTTTGTTTCCAA 116657772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3088 TCCTAGCCGAACAATCCTAGAGATTTTAAAGTACTTCTGCTTGTTTACTTTTGTTTCCAA 3147

116657773 AAAAGTTAATTATAAAGCAAATAAACTCGCTTTAGGAAAAATGCAAAAAATCTGATAATA 116657832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3148 AAAAGTTAATTATAAAGCAAATAAACTCGCTTTAGGAAAAATGCAAAAAATCTGATAATA 3207

116657833 TGCTCATTTATAAATAAAAAAGCAAACAAAACCTCTAAATTGAAACAACAGCCACCAGCC 116657892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3208 TGCTCATTTATAAATAAAAAAGCAAACAAAACCTCTAAATTGAAACAACAGCCACCAGCC 3267

116657893 TACTCCCATCCTTTCCAAGATATTCTAATTCTCCTCTTCCTTTTCTCCAAGGCATTTTCC 116657952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3268 TACTCCCATCCTTTCCAAGATATTCTAATTCTCCTCTTCCTTTTCTCCAAGGCATTTTCC 3327

116657953 TAAGGATAGCTCCATTTTATCTTTTACATATACTTCTTTTCTTTTCCTATATTTTTCCAC 116658012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3328 TAAGGATAGCTCCATTTTATCTTTTACATATACTTCTTTTCTTTTCCTATATTTTTCCAC 3387

116658013 CTTCTTCTAATTTTCTTTGCTTTTCTATTGATTGTGGGTTAAGTAAGAAAAAAAGGCAAG 116658072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3388 CTTCTTCTAATTTTCTTTGCTTTTCTATTGATTGTGGGTTAAGTAAGAAAAAAAGGCAAG 3447

116658073 GGTGGCAGTCAGAGTGCGTGCAGAATTCTTCAAAGCAATGAATGTTGAGAAAAGCCGTGT 116658132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3448 GGTGGCAGTCAGAGTGCGTGCAGAATTCTTCAAAGCAATGAATGTTGAGAAAAGCCGTGT 3507

116658133 ATATTTAGAAGTTAATGGTCTCCCCTCTAGATTTCTATGCAGCTTGAATTCCTCAGTGTT 116658192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3508 ATATTTAGAAGTTAATGGTCTCCCCTCTAGATTTCTATGCAGCTTGAATTCCTCAGTGTT 3567

116658193 TCTGAACTTCTTGTGTTTTTCTCTTATCTTTTAAATAATACTCTGCTACTGTTTTTCTCT 116658252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3568 TCTGAACTTCTTGTGTTTTTCTCTTATCTTTTAAATAATACTCTGCTACTGTTTTTCTCT 3627

116658253 AGATTACCATTTCAGTGGATTTGAAAAATCTCTTTCCATTATTTTTCTTTTCTCCTTACT 116658312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3628 AGATTACCATTTCAGTGGATTTGAAAAATCTCTTTCCATTATTTTTCTTTTCTCCTTACT 3687

116658313 TCTTTCTTCCCCTTCTCTTATTTTTTCTCTTTCTCTCCAACTTCATCTCTTTATTAATTT 116658372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3688 TCTTTCTTCCCCTTCTCTTATTTTTTCTCTTTCTCTCCAACTTCATCTCTTTATTAATTT 3747

116658373 CCTTCTCTCCTTTTAAGTTTTGGTAACTGTTTTTCATTTGGCCAGCTCTCAGTATACCTT 116658432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3748 CCTTCTCTCCTTTTAAGTTTTGGTAACTGTTTTTCATTTGGCCAGCTCTCAGTATACCTT 3807

116658433 ATTTGTGTTGGGTACCAAAGCAAACATCCTCACCAGTGATGCAAGACTGAAGAAGTGTGA 116658492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3808 ATTTGTGTTGGGTACCAAAGCAAACATCCTCACCAGTGATGCAAGACTGAAGAAGTGTGA 3867

116658493 TCATTAGCTCTGCAATCACAACCACAAAACACCTGTGGCTTGCCTAAAACCTTCTTCTGT 116658552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3868 TCATTAGCTCTGCAATCACAACCACAAAACACCTGTGGCTTGCCTAAAACCTTCTTCTGT 3927

116658553 TAGACCCTTTCCTTACTTGGAAACAATCTCATCTTAAGAAATCAAGCAATACTTGAAGAA 116658612
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3928 TAGACCCTTTCCTTACTTGCAAACAATCTCATCTTAAGAAATCAAGCAATACTTGAAGAA 3987

116658613 ATTTTGAGGAACCCATAAGCAAGAAAAACTGTATACTCATTTCCCTTAACATGATACCAT 116658672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3988 ATTTTGAGGAACCCATAAGCAAGAAAAACTGTATACTCATTTCCCTTAACATGATACCAT 4047

116658673 TTCACAGTTACCTGTGTGGTGCTTTTCATTGCTATAGAAATCGAATTAAACTCAGTGTGA 116658732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4048 TTCACAGTTACCTGTGTGGTGCTTTTCATTGCTATAGAAATCGAATTAAACTCAGTGTGA 4107

116658733 TTGTAGCATAATGGGATACTTCACTTGAGAAAGGGGATTTTTATAATTTGGAGAAGCATT 116658792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4108 TTGTAGCATAATGGGATACTTCACTTGAGAAAGGGGATTTTTATAATTTGGAGAAGCATT 4167

116658793 GAGAGTCAGCAGTGAATATTCATGACACGGGCTAGGACCATTTAAACAGACGACTTCTAG 116658852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4168 GAGAGTCAGCAGTGAATATTCATGACACGGGCTAGGACCATTTAAACAGACGACTTCTAG 4227

116658853 GAGAGTCTCTTGAGGACATTTAATCTCTTGTGCTTGACCATCCTGACCCAAGGTGAGTTT 116658912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4228 GAGAGTCTCTTGAGGACATTTAATCTCTTGTGCTTGACCATCCTGACCCAAGGTGAGTTT 4287

116658913 GAGTCTCAAATACATTAAAATTCTCAAACCATTAGTTTTATTTTGTTCCTGTAAACCTAA 116658972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4288 GAGTCTCAAATACATTAAAATTCTCAAACCATTAGTTTTATTTTGTTCCTGTAAACCTAA 4347

116658973 AGTTTAACTTTCAGAATACTTTTTCTCATTAGAATTATATGTTTAAAAATTCTTGGTGAC 116659032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4348 AGTTTAACTTTCAGAATACTTTTTCTCATTAGAATTATATGTTTAAAAATTCTTGGTGAC 4407

116659033 ATTCCATTCTTCACCTAATCTCACGTTTGTCTTGTTCTGTTTTGTCAAAAATGTTTTCCT 116659092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4408 ATTCCATTCTTCACCTAATCTCACGTTTGTCTTGTTCTGTTTTGTCAAAAATGTTTTCCT 4467

116659093 AAAAATGAAAAAGAAAACCTCTAGAATGATTAATCGAGTGAGATTCTCAATAAATCTGCA 116659152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4468 AAAAATGAAAAAGAAAACCTCTAGAATGATTAATCGAGTGAGATTCTCAATAAATCTGCA 4527

116659153 ACTAAAACCATCCGTAAGTCCTAACAAGTTTCAATTTTTATCACGTTAGTGTCTTTTAGT 116659212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4528 ACTAAAACCATCCGTAAGTCCTAACAAGTTTCAATTTTTATCACGTTAGTGTCTTTTAGT 4587

116659213 AGATAAACTTTGCTCTAGGTCACTATCCAAAAAACTTATGTGAGTTCTGTTGATTGTATC 116659272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4588 AGATAAACTTTGCTCTAGGTCACTATCCAAAAAACTTATGTGAGTTCTGTTGATTGTATC 4647

116659273 CTGCCTTTGTGTTCCTAAGAGTTGATTTGGGAAGCAAAATCCCCCAAAAATCTATATTCT 116659332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4648 CTGCCTTTGTGTTCCTAAGAGTTGATTTGGGAAGCAAAATCCCCCAAAAATCTATATTCT 4707

116659333 CAGGCCCATGGATAGTTAGAACGCAGGCTACAGATGTCAAACTCTCTAGTCAGGGGTCAT 116659392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4708 CAGGCCCATGGATAGTTAGAACGCAGGCTACAGATGTCAAACTCTCTAGTCAGGGGTCAT 4767

116659393 GCCTAATAAAGTGCAGAAGGAATACATTGAACAGAATGTTATACACTTTTAGGGCGTTTT 116659452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4768 GCCTAATAAAGTGCAGAAGGAATACATTGAACAGAATGTTATACACTTTTAGGGCGTTTT 4827

116659453 AAAATTTTTGGTCTAAGTCATGTCTCTAGCAGGCTAGACACCTGTTCCAGATATGTATTC 116659512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4828 AAAATTTTTGGTCTAAGTCATGTCTCTAGCAGGCTAGACACCTGTTCCAGATATGTATTC 4887

116659513 TTAATATAACAAAAATTATTTAAATATCTTACCATGTGTCACAGTTACATCAATAATATT 116659572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4888 TTAATATAACAAAAATTATTTAAATATCTTACCATGTGTCACAGTTACATCAATAATATT 4947

116659573 TGGAATCATACTGGACCCTTTGAAAATTTTCAGTATGAGTAAAAATGTTTATCTTAGAAG 116659632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4948 TGGAATCATACTGGACCCTTTGAAAATTTTCAGTATGAGTAAAAATGTTTATCTTAGAAG 5007

116659633 TAAGTGGAGGGGAAACATCCTTATTATTAAGTGCTAAGCCTTTTTAAAATGGTCTATGAA 116659692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5008 TAAGTGGAGGGGAAACATCCTTATTATTAAGTGCTAAGCCTTTTTAAAATGGTCTATGAA 5067

116659693 GATTCTAAATAGACTTCTGATTCCAAAATACCTATAACAATGAAGTCTTTGGCCATGGCT 116659752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5068 GATTCTAAATAGACTTCTGATTCCAAAATACCTATAACAATGAAGTCTTTGGCCATGGCT 5127

116659753 AATTAAAAAAAAACATAAAACTCTAGAGACTGTCTCATTTATTAATTTGCCAAATTCTTC 116659812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5128 AATTAAAAAAAAACATAAAACTCTAGAGACTGTCTCATTTATTAATTTGCCAAATTCTTC 5187

116659813 TTTCTTTTAACATTTTCTTTATCCCACAGTATCTTTTCTTGCTTTTTGTGCTACCACACT 116659872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5188 TTTCTTTTAACATTTTCTTTATCCCACAGTATCTTTTCTTGCTTTTTGTGCTACCACACT 5247

116659873 ATCAAATTTTACTCTTTTTCTCCCAAATTTCTTTTTCTAACCATCGTCTTCCCCCTCTGA 116659932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5248 ATCAAATTTTACTCTTTTTCTCCCAAATTTCTTTTTCTAACCATCGTCTTCCCCCTCTGA 5307

116659933 TTGTATCTGAAAATAACCACTTGCTTTTCTTCTTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTCCTTC 116659992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5308 TTGTATCTGAAAATAACCACTTGCTTTTCTTCTTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTCCTTC 5367

116659993 CTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCCTCTTTCCCTT 116660052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5368 CTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCCTCTTTCCCTT 5427

116660053 TCCCTTTCTTTTCTTTTATTTTTTCTTCTCTCTTCTCTTCTCTTTTTCTGGGTTGCACTC 116660112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5428 TCCCTTTCTTTTCTTTTATTTTTTCTTCTCTCTTCTCTTCTCTTTTTCTGGGTTGCACTC 5487

116660113 TGTTACCCAAGCTTGAATGCAATGGCAGGGATCACAGCTTACTGCAGTGTCAACCTCCTG 116660172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5488 TGTTACCCAAGCTTGAATGCAATGGCAGGGATCACAGCTTACTGCAGTGTCAACCTCCTG 5547

116660173 GGCTCAGGTGATCATCCTCCTTCAGCCTCCTGTGTAGCTAGGACTGCAGGCATGTACCAC 116660232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5548 GGCTCAGGTGATCATCCTCCTTCAGCCTCCTGTGTAGCTAGGACTGCAGGCATGTACCAC 5607

116660233 CACACATGGCTAATTTTAGTATTTTTTGTAGAAATGAGAGTCTCACTGTGTTGTCCAGGT 116660292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5608 CACACATGGCTAATTTTAGTATTTTTTGTAGAAATGAGAGTCTCACTGTGTTGTCCAGGT 5667

116660293 TTGTCTCAAACTCCCAGGTTCAAGCAATCCACCTGCCTCAGCCTCTCAAACTGCTGGGAT 116660352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5668 TTGTCTCAAACTCCCAGGTTCAAGCAATCCACCTGCCTCAGCCTCTCAAACTGCTGGGAT 5727

116660353 TATAGGCATGTGCCACCATGCTGGGCCTCAAATTGACATTTTCTTAAAAATTGGACTGCC 116660412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5728 TATAGGCATGTGCCACCATGCTGGGCCTCAAATTGACATTTTCTTAAAAATTGGACTGCC 5787

116660413 AAACAAGGACATTAGCCCTAGTAGGCAGAAGATACTATCTTGGTCTGTGTTAGAGGCAAT 116660472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5788 AAACAAGGACATTAGCCCTAGTAGGCAGAAGATACTATCTTGGTCTGTGTTAGAGGCAAT 5847

116660473 TGTTGAAATTTCTCTGAATCTCTATGGGATAGGCATAAATGTACTGATAAATTTGAGCAG 116660532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5848 TGTTGAAATTTCTCTGAATCTCTATGGGATAGGCATAAATGTACTGATAAATTTGAGCAG 5907

116660533 TCCTGGGAATCCATAATCTCAATTTATTTGACCAATATCAATTAATACCATGTTGAGAGG 116660592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5908 TCCTGGGAATCCATAATCTCAATTTATTTGACCAATATCAATTAATACCATGTTGAGAGG 5967

116660593 TCCTTCTATTTCTGAAGTCTGGTTCAGCAAAAAATAAAAAAAAAAATAAAATACCTGAAA 116660652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5968 TCCTTCTATTTCTGAAGTCTGGTTCAGCAAAAAATAAAAAAAAAAATAAAATACCTGAAA 6027

116660653 TAATGTAGCTATTCCTGAGGTATCATTAACAGAATAGAAACTTAAAAAGCGCATGATATG 116660712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6028 TAATGTAGCTATTCCTGAGGTATCATTAACAGAATAGAAACTTAAAAAGCGCATGATATG 6087

116660713 GAAAAATCTTTGCTGATGGTTATACATGTTAAGTTTCCAGATAACTATTAATTAGACTTG 116660772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6088 GAAAAATCTTTGCTGATGGTTATACATGTTAAGTTTCCAGATAACTATTAATTAGACTTG 6147

116660773 CAGACATAAAAGGCTGTACCAAGTGGATATTTTAGAGATAAATTTTTAGCACTTACAGAC 116660832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6148 CAGACATAAAAGGCTGTACCAAGTGGATATTTTAGAGATAAATTTTTAGCACTTACAGAC 6207

116660833 AATATTATGAAGTAGCTATGTGGGCATAGAGAAATTCGGGAAATTAGCAGGCTGGTTCTG 116660892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6208 AATATTATGAAGTAGCTATGTGGGCATAGAGAAATTCGGGAAATTAGCAGGCTGGTTCTG 6267

116660893 CTATAATAGATCTCAGTTCACCCTTAGGATATCTTCACTAAAGGAGCTTAACATAGCCCA 116660952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6268 CTATAATAGATCTCAGTTCACCCTTAGGATATCTTCACTAAAGGAGCTTAACATAGCCCA 6327

116660953 GATGGTAGATTTGATTGCCCTCATTAGAGCTGGTCACTTGGCCAAAGACAAAAAAAATTA 116661012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6328 GATGGTAGATTTGATTGCCCTCATTAGAGCTGGTCACTTGGCCAAAGACAAAAAAAATTA 6387

116661013 TATTTACACAGAAAATAGCTCAAGTACCTGAACCTCAGTATGACTATATATGGGGATAGA 116661072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6388 TATTTACACAGAAAATAGCTCAAGTACCTGAACCTCAGTATGACTATATATGGGGATAGA 6447

116661073 GTCTTTAAGGAAGTGATTAAGGTTAAATAAAGTCATAATGATGGGGCCCTAATCTGATAA 116661132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6448 GTCTTTAAGGAAGTGATTAAGGTTAAATAAAGTCATAATGATGGGGCCCTAATCTGATAA 6507

116661133 GATTAGCGTCCTTCTAAGAGGAGGAATCAACATCAGGGATTTTTTTTTCTCTCAACCCAT 116661192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6508 GATTAGCGTCCTTCTAAGAGGAGGAATCAACATCAGGGATTTTTTTTTCTCTCAACCCAT 6567

116661193 GCCCAGAGGAAAGTCATATGAGGACGTAACACAAAGAGAGACATCTACAAATCACAGAGG 116661252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6568 GCCCAGAGGAAAGTCATATGAGGACGTAACACAAAGAGAGACATCTACAAATCACAGAGG 6627

116661253 TTGCACCAGAAATCAACCCTGCTAGCATATCGATCTTGAACTTCTAGTCCCCAGAACTGT 116661312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6628 TTGCACCAGAAATCAACCCTGCTAGCATATCGATCTTGAACTTCTAGTCCCCAGAACTGT 6687

116661313 GAGGAAATAAATTTTTGTTGCTTATGCCACCAGATCTGTGACATTTTGTTATGGAAGTCT 116661372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6688 GAGGAAATAAATTTTTGTTGCTTATGCCACCAGATCTGTGACATTTTGTTATGGAAGTCT 6747

116661373 GAGCTGACCAATACACTTGAATAACTATCAGTGTCAATGTAAAACAAGCCATCTTTAGAC 116661432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6748 GAGCTGACCAATACACTTGAATAACTATCAGTGTCAATGTAAAACAAGCCATCTTTAGAC 6807

116661433 TTAAGGAAACAGTCACCTGGCTCTCTAAGGCAGATGCAAATGGATTTTTCTTTGCCCGGG 116661492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6808 TTAAGGAAACAGTCACCTGGCTCTCTAAGGCAGATGCAAATGGATTTTTCTTTGCCCGGG 6867

116661493 TTTAGTAATTCAGATTATGGCACTAAGTGTTTTGGGAAGGCTCCATGTCATTTTGATATA 116661552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6868 TTTAGTAATTCAGATTATGGCACTAAGTGTTTTGGGAAGGCTCCATGTCATTTTGATATA 6927

116661553 GTCACTGTGTGTTGCCATTCTTATGCATGTATTCTCCACAGTCTCAGTCCTGCTCTGCAG 116661612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6928 GTCACTGTGTGTTGCCATTCTTATGCATGTATTCTCCACAGTCTCAGTCCTGCTCTGCAG 6987

116661613 CTGCTCTCGTGTCAAATGATCCATCACTCAACGGAAATGAACTCATCACTCCATAAAAGG 116661672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6988 CTGCTCTCGTGTCAAATGATCCATCACTCAACGGAAATGAACTCATCACTCCATAAAAGG 7047

116661673 AATAGGAAGATCAGTCCATGATCCAATCCCAAACTATTTTTTCTGAGGATGATAATGTTA 116661732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7048 AATAGGAAGATCAGTCCATGATCCAATCCCAAACTATTTTTTCTGAGGATGATAATGTTA 7107

116661733 TCTAGAAATCACAACAGTGGTATACATCTGAACATGGCTGCTTTAGTAGCTGAACGACTC 116661792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7108 TCTAGAAATCACAACAGTGGTATACATCTGAACATGGCTGCTTTAGTAGCTGAACGACTC 7167

116661793 TTCTCATCTTCTCATCAGTTAGGAAAGACTGAGAACTGGTAGCATAAATCCATCAATTAT 116661852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7168 TTCTCATCTTCTCATCAGTTAGGAAAGACTGAGAACTGGTAGCATAAATCCATCAATTAT 7227

116661853 GGGATTGCAATTGCAGAATGTTTTGTGACTCACATAATGTTTTCTTCTTTACTCAGAACT 116661912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7228 GGGATTGCAATTGCAGAATGTTTTGTGACTCACATAATGTTTTCTTCTTTACTCAGAACT 7287

116661913 TCTCTATTTCACAGATTCTCACCTTAATAATTGAAGCAACTCAGGGTCACATCCTAGTTC 116661972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7288 TCTCTATTTCACAGATTCTCACCTTAATAATTGAAGCAACTCAGGGTCACATCCTAGTTC 7347

116661973 TATAATTCTGCCTGAGGCACTCTGAGCCCAAACCATCAACAGGAAACAAACAAATAAAAA 116662032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7348 TATAATTCTGCCTGAGGCACTCTGAGCCCAAACCATCAACAGGAAACAAACAAATAAAAA 7407

116662033 ACCTGCTAATTTACTCTCCAATGAAACCTTTCCAGAATTATCTGTGTAGAGTTTCCTATT 116662092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7408 ACCTGCTAATTTACTCTCCAATGAAACCTTTCCAGAATTATCTGTGTAGAGTTTCCTATT 7467

116662093 GCTGCAATAATTAATAAACTCAGTTTGCTTATATTGCAAATTTTAAAACTCGTAGTGGGA 116662152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7468 GCTGCAATAATTAATAAACTCAGTTTGCTTATATTGCAAATTTTAAAACTCGTAGTGGGA 7527

116662153 GATTTCCAGTTGCAAACAACAAGTCTTGGCTTTAATTATGAGTTCAACCAGTTTTTTTTC 116662212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7528 GATTTCCAGTTGCAAACAACAAGTCTTGGCTTTAATTATGAGTTCAACCAGTTTTTTTTC 7587

116662213 TCCTAATGTTTTAAATCTCAGTTCATCATAATGTCTGAGCTTGTCTGATTTTGGCATAGG 116662272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7588 TCCTAATGTTTTAAATCTCAGTTCATCATAATGTCTGAGCTTGTCTGATTTTGGCATAGG 7647

116662273 GAATATAATTAGAAGTAGTGAATGAAGGCCTAGCTGTTGCTTTGATGTCAGCAGACACCC 116662332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7648 GAATATAATTAGAAGTAGTGAATGAAGGCCTAGCTGTTGCTTTGATGTCAGCAGACACCC 7707

116662333 ATTTCTCTTTCCAAACTGCTTTTAAAAAGTCAAACAACTTCCTTCTCTTCTTGCCTCACT 116662392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7708 ATTTCTCTTTCCAAACTGCTTTTAAAAAGTCAAACAACTTCCTTCTCTTCTTGCCTCACT 7767

116662393 CTCTACTTAATGTGATTTTCTTTTAATTTATGAAGGAAATAAAATCATTGCTTTTTAAGA 116662452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7768 CTCTACTTAATGTGATTTTCTTTTAATTTATGAAGGAAATAAAATCATTGCTTTTTAAGA 7827

116662453 ATCATCCAACCAAGTCATTAAAGATATCTGGAATTCAAGATGTAGTCAAAATATTTCAAG 116662512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7828 ATCATCCAACCAAGTCATTAAAGATATCTGGAATTCAAGATGTAGTCAAAATATTTCAAG 7887

116662513 GGCATTACAATATCCTCTGTCTTCTCTAATCTCTCAGGCAGTAAAACGGTACCAAGTGCA 116662572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7888 GGCATTACAATATCCTCTGTCTTCTCTAATCTCTCAGGCAGTAAAACGGTACCAAGTGCA 7947

116662573 GAGATAGAAACACTGCTGTCAAAGTGGGTTAAAATCTTGACAGTATCGTGGCTTCTGATT 116662632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7948 GAGATAGAAACACTGCTGTCAAAGTGGGTTAAAATCTTGACAGTATCGTGGCTTCTGATT 8007

116662633 TTAATTTCTCAATTAACTTATACAAATGAATAACTACCGTTATAGAAATAGCTTCTGGAT 116662692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8008 TTAATTTCTCAATTAACTTATACAAATGAATAACTACCGTTATAGAAATAGCTTCTGGAT 8067

116662693 TTCTTTGTCCTTTTTTTCCTGAAGTTAGGCTATATTTGGTATCTCTATAGAGATAGGCTA 116662752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8068 TTCTTTGTCCTTTTTTTCCTGAAGTTAGGCTATATTTGGTATCTCTATAGAGATAGGCTA 8127

116662753 TATTTGGTAAATCTGTTCTCACCTCACATAAAAGGTTAATATTCTACAAGTGGATAGATG 116662812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8128 TATTTGGTAAATCTGTTCTCACCTCACATAAAAGGTTAATATTCTACAAGTGGATAGATG 8187

116662813 TGGTGAGGACAACTAAAAGGAGATTGAATGATCTCATCAAATTATATTACACAACCTTTC 116662872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8188 TGGTGAGGACAACTAAAAGGAGATTGAATGATCTCATCAAATTATATTACACAACCTTTC 8247

116662873 AAAGAAAGCTCAGTTGGATTAAGAGGTTTCTTTATGTTCATGCCCAAAATGCCAAATTC 116662931
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8248 AAAGAAAGCTCAGTTGGATTAAGAGGTTTCTTTATGTTCATGCCCAAAATGCCAAATTC 8306

Alignment time is 9.63805 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [116652076,116672656] =>     20581 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [        1,     3554] =>      3554 nucs 'mol-32-3306-139041_3554'

Score:        3553
Aligned:      3553        nucs
Identic:      3553 (100%) nucs =>      3504 (100%)        49 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [116660011,116663514] EXCISED REGION [116663516,116663564]
 second seq =>  [        1,     3504] EXCISED REGION [     3506,     3554]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [116663515,116663515]
 second seq =>         1 nucs [3505,3505]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [116663515,116663516] to [116663516,116663517]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

116660011 TCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCCTCTTTCCCTTTCCCTTTCTTTTCTTTTA 116660070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCCTCTTTCCCTTTCCCTTTCTTTTCTTTTA 60

116660071 TTTTTTCTTCTCTCTTCTCTTCTCTTTTTCTGGGTTGCACTCTGTTACCCAAGCTTGAAT 116660130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTTTTCTTCTCTCTTCTCTTCTCTTTTTCTGGGTTGCACTCTGTTACCCAAGCTTGAAT 120

116660131 GCAATGGCAGGGATCACAGCTTACTGCAGTGTCAACCTCCTGGGCTCAGGTGATCATCCT 116660190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GCAATGGCAGGGATCACAGCTTACTGCAGTGTCAACCTCCTGGGCTCAGGTGATCATCCT 180

116660191 CCTTCAGCCTCCTGTGTAGCTAGGACTGCAGGCATGTACCACCACACATGGCTAATTTTA 116660250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCTTCAGCCTCCTGTGTAGCTAGGACTGCAGGCATGTACCACCACACATGGCTAATTTTA 240

116660251 GTATTTTTTGTAGAAATGAGAGTCTCACTGTGTTGTCCAGGTTTGTCTCAAACTCCCAGG 116660310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTATTTTTTGTAGAAATGAGAGTCTCACTGTGTTGTCCAGGTTTGTCTCAAACTCCCAGG 300

116660311 TTCAAGCAATCCACCTGCCTCAGCCTCTCAAACTGCTGGGATTATAGGCATGTGCCACCA 116660370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTCAAGCAATCCACCTGCCTCAGCCTCTCAAACTGCTGGGATTATAGGCATGTGCCACCA 360

116660371 TGCTGGGCCTCAAATTGACATTTTCTTAAAAATTGGACTGCCAAACAAGGACATTAGCCC 116660430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGCTGGGCCTCAAATTGACATTTTCTTAAAAATTGGACTGCCAAACAAGGACATTAGCCC 420

116660431 TAGTAGGCAGAAGATACTATCTTGGTCTGTGTTAGAGGCAATTGTTGAAATTTCTCTGAA 116660490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TAGTAGGCAGAAGATACTATCTTGGTCTGTGTTAGAGGCAATTGTTGAAATTTCTCTGAA 480

116660491 TCTCTATGGGATAGGCATAAATGTACTGATAAATTTGAGCAGTCCTGGGAATCCATAATC 116660550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCTCTATGGGATAGGCATAAATGTACTGATAAATTTGAGCAGTCCTGGGAATCCATAATC 540

116660551 TCAATTTATTTGACCAATATCAATTAATACCATGTTGAGAGGTCCTTCTATTTCTGAAGT 116660610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCAATTTATTTGACCAATATCAATTAATACCATGTTGAGAGGTCCTTCTATTTCTGAAGT 600

116660611 CTGGTTCAGCAAAAAATAAAAAAAAAAATAAAATACCTGAAATAATGTAGCTATTCCTGA 116660670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTGGTTCAGCAAAAAATAAAAAAAAAAATAAAATACCTGAAATAATGTAGCTATTCCTGA 660

116660671 GGTATCATTAACAGAATAGAAACTTAAAAAGCGCATGATATGGAAAAATCTTTGCTGATG 116660730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGTATCATTAACAGAATAGAAACTTAAAAAGCGCATGATATGGAAAAATCTTTGCTGATG 720

116660731 GTTATACATGTTAAGTTTCCAGATAACTATTAATTAGACTTGCAGACATAAAAGGCTGTA 116660790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GTTATACATGTTAAGTTTCCAGATAACTATTAATTAGACTTGCAGACATAAAAGGCTGTA 780

116660791 CCAAGTGGATATTTTAGAGATAAATTTTTAGCACTTACAGACAATATTATGAAGTAGCTA 116660850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CCAAGTGGATATTTTAGAGATAAATTTTTAGCACTTACAGACAATATTATGAAGTAGCTA 840

116660851 TGTGGGCATAGAGAAATTCGGGAAATTAGCAGGCTGGTTCTGCTATAATAGATCTCAGTT 116660910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGTGGGCATAGAGAAATTCGGGAAATTAGCAGGCTGGTTCTGCTATAATAGATCTCAGTT 900

116660911 CACCCTTAGGATATCTTCACTAAAGGAGCTTAACATAGCCCAGATGGTAGATTTGATTGC 116660970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CACCCTTAGGATATCTTCACTAAAGGAGCTTAACATAGCCCAGATGGTAGATTTGATTGC 960

116660971 CCTCATTAGAGCTGGTCACTTGGCCAAAGACAAAAAAAATTATATTTACACAGAAAATAG 116661030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CCTCATTAGAGCTGGTCACTTGGCCAAAGACAAAAAAAATTATATTTACACAGAAAATAG 1020

116661031 CTCAAGTACCTGAACCTCAGTATGACTATATATGGGGATAGAGTCTTTAAGGAAGTGATT 116661090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTCAAGTACCTGAACCTCAGTATGACTATATATGGGGATAGAGTCTTTAAGGAAGTGATT 1080

116661091 AAGGTTAAATAAAGTCATAATGATGGGGCCCTAATCTGATAAGATTAGCGTCCTTCTAAG 116661150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAGGTTAAATAAAGTCATAATGATGGGGCCCTAATCTGATAAGATTAGCGTCCTTCTAAG 1140

116661151 AGGAGGAATCAACATCAGGGATTTTTTTTTCTCTCAACCCATGCCCAGAGGAAAGTCATA 116661210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGGAGGAATCAACATCAGGGATTTTTTTTTCTCTCAACCCATGCCCAGAGGAAAGTCATA 1200

116661211 TGAGGACGTAACACAAAGAGAGACATCTACAAATCACAGAGGTTGCACCAGAAATCAACC 116661270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TGAGGACGTAACACAAAGAGAGACATCTACAAATCACAGAGGTTGCACCAGAAATCAACC 1260

116661271 CTGCTAGCATATCGATCTTGAACTTCTAGTCCCCAGAACTGTGAGGAAATAAATTTTTGT 116661330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTGCTAGCATATCGATCTTGAACTTCTAGTCCCCAGAACTGTGAGGAAATAAATTTTTGT 1320

116661331 TGCTTATGCCACCAGATCTGTGACATTTTGTTATGGAAGTCTGAGCTGACCAATACACTT 116661390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGCTTATGCCACCAGATCTGTGACATTTTGTTATGGAAGTCTGAGCTGACCAATACACTT 1380

116661391 GAATAACTATCAGTGTCAATGTAAAACAAGCCATCTTTAGACTTAAGGAAACAGTCACCT 116661450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GAATAACTATCAGTGTCAATGTAAAACAAGCCATCTTTAGACTTAAGGAAACAGTCACCT 1440

116661451 GGCTCTCTAAGGCAGATGCAAATGGATTTTTCTTTGCCCGGGTTTAGTAATTCAGATTAT 116661510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GGCTCTCTAAGGCAGATGCAAATGGATTTTTCTTTGCCCGGGTTTAGTAATTCAGATTAT 1500

116661511 GGCACTAAGTGTTTTGGGAAGGCTCCATGTCATTTTGATATAGTCACTGTGTGTTGCCAT 116661570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GGCACTAAGTGTTTTGGGAAGGCTCCATGTCATTTTGATATAGTCACTGTGTGTTGCCAT 1560

116661571 TCTTATGCATGTATTCTCCACAGTCTCAGTCCTGCTCTGCAGCTGCTCTCGTGTCAAATG 116661630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TCTTATGCATGTATTCTCCACAGTCTCAGTCCTGCTCTGCAGCTGCTCTCGTGTCAAATG 1620

116661631 ATCCATCACTCAACGGAAATGAACTCATCACTCCATAAAAGGAATAGGAAGATCAGTCCA 116661690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ATCCATCACTCAACGGAAATGAACTCATCACTCCATAAAAGGAATAGGAAGATCAGTCCA 1680

116661691 TGATCCAATCCCAAACTATTTTTTCTGAGGATGATAATGTTATCTAGAAATCACAACAGT 116661750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TGATCCAATCCCAAACTATTTTTTCTGAGGATGATAATGTTATCTAGAAATCACAACAGT 1740

116661751 GGTATACATCTGAACATGGCTGCTTTAGTAGCTGAACGACTCTTCTCATCTTCTCATCAG 116661810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GGTATACATCTGAACATGGCTGCTTTAGTAGCTGAACGACTCTTCTCATCTTCTCATCAG 1800

116661811 TTAGGAAAGACTGAGAACTGGTAGCATAAATCCATCAATTATGGGATTGCAATTGCAGAA 116661870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTAGGAAAGACTGAGAACTGGTAGCATAAATCCATCAATTATGGGATTGCAATTGCAGAA 1860

116661871 TGTTTTGTGACTCACATAATGTTTTCTTCTTTACTCAGAACTTCTCTATTTCACAGATTC 116661930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TGTTTTGTGACTCACATAATGTTTTCTTCTTTACTCAGAACTTCTCTATTTCACAGATTC 1920

116661931 TCACCTTAATAATTGAAGCAACTCAGGGTCACATCCTAGTTCTATAATTCTGCCTGAGGC 116661990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TCACCTTAATAATTGAAGCAACTCAGGGTCACATCCTAGTTCTATAATTCTGCCTGAGGC 1980

116661991 ACTCTGAGCCCAAACCATCAACAGGAAACAAACAAATAAAAAACCTGCTAATTTACTCTC 116662050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ACTCTGAGCCCAAACCATCAACAGGAAACAAACAAATAAAAAACCTGCTAATTTACTCTC 2040

116662051 CAATGAAACCTTTCCAGAATTATCTGTGTAGAGTTTCCTATTGCTGCAATAATTAATAAA 116662110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CAATGAAACCTTTCCAGAATTATCTGTGTAGAGTTTCCTATTGCTGCAATAATTAATAAA 2100

116662111 CTCAGTTTGCTTATATTGCAAATTTTAAAACTCGTAGTGGGAGATTTCCAGTTGCAAACA 116662170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CTCAGTTTGCTTATATTGCAAATTTTAAAACTCGTAGTGGGAGATTTCCAGTTGCAAACA 2160

116662171 ACAAGTCTTGGCTTTAATTATGAGTTCAACCAGTTTTTTTTCTCCTAATGTTTTAAATCT 116662230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ACAAGTCTTGGCTTTAATTATGAGTTCAACCAGTTTTTTTTCTCCTAATGTTTTAAATCT 2220

116662231 CAGTTCATCATAATGTCTGAGCTTGTCTGATTTTGGCATAGGGAATATAATTAGAAGTAG 116662290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CAGTTCATCATAATGTCTGAGCTTGTCTGATTTTGGCATAGGGAATATAATTAGAAGTAG 2280

116662291 TGAATGAAGGCCTAGCTGTTGCTTTGATGTCAGCAGACACCCATTTCTCTTTCCAAACTG 116662350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TGAATGAAGGCCTAGCTGTTGCTTTGATGTCAGCAGACACCCATTTCTCTTTCCAAACTG 2340

116662351 CTTTTAAAAAGTCAAACAACTTCCTTCTCTTCTTGCCTCACTCTCTACTTAATGTGATTT 116662410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CTTTTAAAAAGTCAAACAACTTCCTTCTCTTCTTGCCTCACTCTCTACTTAATGTGATTT 2400

116662411 TCTTTTAATTTATGAAGGAAATAAAATCATTGCTTTTTAAGAATCATCCAACCAAGTCAT 116662470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TCTTTTAATTTATGAAGGAAATAAAATCATTGCTTTTTAAGAATCATCCAACCAAGTCAT 2460

116662471 TAAAGATATCTGGAATTCAAGATGTAGTCAAAATATTTCAAGGGCATTACAATATCCTCT 116662530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TAAAGATATCTGGAATTCAAGATGTAGTCAAAATATTTCAAGGGCATTACAATATCCTCT 2520

116662531 GTCTTCTCTAATCTCTCAGGCAGTAAAACGGTACCAAGTGCAGAGATAGAAACACTGCTG 116662590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GTCTTCTCTAATCTCTCAGGCAGTAAAACGGTACCAAGTGCAGAGATAGAAACACTGCTG 2580

116662591 TCAAAGTGGGTTAAAATCTTGACAGTATCGTGGCTTCTGATTTTAATTTCTCAATTAACT 116662650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TCAAAGTGGGTTAAAATCTTGACAGTATCGTGGCTTCTGATTTTAATTTCTCAATTAACT 2640

116662651 TATACAAATGAATAACTACCGTTATAGAAATAGCTTCTGGATTTCTTTGTCCTTTTTTTC 116662710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TATACAAATGAATAACTACCGTTATAGAAATAGCTTCTGGATTTCTTTGTCCTTTTTTTC 2700

116662711 CTGAAGTTAGGCTATATTTGGTATCTCTATAGAGATAGGCTATATTTGGTAAATCTGTTC 116662770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CTGAAGTTAGGCTATATTTGGTATCTCTATAGAGATAGGCTATATTTGGTAAATCTGTTC 2760

116662771 TCACCTCACATAAAAGGTTAATATTCTACAAGTGGATAGATGTGGTGAGGACAACTAAAA 116662830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TCACCTCACATAAAAGGTTAATATTCTACAAGTGGATAGATGTGGTGAGGACAACTAAAA 2820

116662831 GGAGATTGAATGATCTCATCAAATTATATTACACAACCTTTCAAAGAAAGCTCAGTTGGA 116662890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GGAGATTGAATGATCTCATCAAATTATATTACACAACCTTTCAAAGAAAGCTCAGTTGGA 2880

116662891 TTAAGAGGTTTCTTTATGTTCATGCCCAAAATGCCAAATTCCAACAGCCCACAAAATTTC 116662950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TTAAGAGGTTTCTTTATGTTCATGCCCAAAATGCCAAATTCCAACAGCCCACAAAATTTC 2940

116662951 TTTGAAGTATTTTTCTCATACGTTTGTTTGATGAACAGCTTAAAGCTCCATTTCCATCCT 116663010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TTTGAAGTATTTTTCTCATACGTTTGTTTGATGAACAGCTTAAAGCTCCATTTCCATCCT 3000

116663011 AGCAAGTGGCAGACAAAAAGCCAGATAGTAAATCATATTTTAATAAAAATGATTTTAATA 116663070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 AGCAAGTGGCAGACAAAAAGCCAGATAGTAAATCATATTTTAATAAAAATGATTTTAATA 3060

116663071 AGTGAAAGATATGATCCATTAAGTTAATCTTGTTAAGTAGAAGACCAAAATGAGAACTTA 116663130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 AGTGAAAGATATGATCCATTAAGTTAATCTTGTTAAGTAGAAGACCAAAATGAGAACTTA 3120

116663131 ATGGGGTGCAAACATCACGGAGAATCAAAACACACACTAGAAACCATACTTGAGAACCAG 116663190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 ATGGGGTGCAAACATCACGGAGAATCAAAACACACACTAGAAACCATACTTGAGAACCAG 3180

116663191 AGATGAGTGAATGTTTGGTCATCAATATCCATGCTAGCCTTAATCTTGTGGTTATCCCAC 116663250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 AGATGAGTGAATGTTTGGTCATCAATATCCATGCTAGCCTTAATCTTGTGGTTATCCCAC 3240

116663251 CACATCCCCCTTTTCAACAGAAGTCAGTGAGCAGCAAGCCTCATTGAATGTTGGATATTA 116663310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 CACATCCCCCTTTTCAACAGAAGTCAGTGAGCAGCAAGCCTCATTGAATGTTGGATATTA 3300

116663311 GCAAGCACATGTAGTTTTGCTTCAAGTACTCTTTATTTTCTTCCAATCCTCAGGGCCTTT 116663370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 GCAAGCACATGTAGTTTTGCTTCAAGTACTCTTTATTTTCTTCCAATCCTCAGGGCCTTT 3360

116663371 CTCAACATATGGTTTATTATAGCGTTGTGAATGATTGGTCTTTCATAAGGACATTTTCCT 116663430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 CTCAACATATGGTTTATTATAGCGTTGTGAATGATTGGTCTTTCATAAGGACATTTTCCT 3420

116663431 TGGCAGAAGGCTATTTGAAGTTCATTGCTTTTACAAGGTAAGATTTCTGGAAGTTCTAAG 116663490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TGGCAGAAGGCTATTTGAAGTTCATTGCTTTTACAAGGTAAGATTTCTGGAAGTTCTAAG 3480

116663491 CTATATAAATAGGTTTGGAGGAAC 116663514
          ||||||||||||||||||||||||
     3481 CTATATAAATAGGTTTGGAGGAAC 3504

EXCISED REGION

116663516 TTCTCTTAAACCACAGAAACTATTAATACTCTTGAGCAGGTGAGCTTAT 116663564
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3506 TTCTCTTAAACCACAGAAACTATTAATACTCTTGAGCAGGTGAGCTTAT 3554

Alignment time is 4.32229 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [116652076,116672656] =>     20581 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [        1,     3453] =>      3453 nucs 'mol-32-3311-238507_3453'

Score:        3441
Aligned:      3452        nucs
Identic:      3451 (100%) nucs =>      1607 (100%)      1844 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [116660132,116661738] EXCISED REGION [116661740,116663584]
 second seq =>  [        1,     1607] EXCISED REGION [     1609,     3453]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [116661739,116661739]
 second seq =>         1 nucs [1608,1608]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [116661738,116661739] to [116661739,116661740]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [116661738,116661738] to [116661740,116661740]
 second seq =>         1 nucs [1607,1607] to [1609,1609]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

116660132 CAATGGCAGGGATCACAGCTTACTGCAGTGTCAACCTCCTGGGCTCAGGTGATCATCCTC 116660191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CAATGGCAGGGATCACAGCTTACTGCAGTGTCAACCTCCTGGGCTCAGGTGATCATCCTC 60

116660192 CTTCAGCCTCCTGTGTAGCTAGGACTGCAGGCATGTACCACCACACATGGCTAATTTTAG 116660251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTTCAGCCTCCTGTGTAGCTAGGACTGCAGGCATGTACCACCACACATGGCTAATTTTAG 120

116660252 TATTTTTTGTAGAAATGAGAGTCTCACTGTGTTGTCCAGGTTTGTCTCAAACTCCCAGGT 116660311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TATTTTTTGTAGAAATGAGAGTCTCACTGTGTTGTCCAGGTTTGTCTCAAACTCCCAGGT 180

116660312 TCAAGCAATCCACCTGCCTCAGCCTCTCAAACTGCTGGGATTATAGGCATGTGCCACCAT 116660371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCAAGCAATCCACCTGCCTCAGCCTCTCAAACTGCTGGGATTATAGGCATGTGCCACCAT 240

116660372 GCTGGGCCTCAAATTGACATTTTCTTAAAAATTGGACTGCCAAACAAGGACATTAGCCCT 116660431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GCTGGGCCTCAAATTGACATTTTCTTAAAAATTGGACTGCCAAACAAGGACATTAGCCCT 300

116660432 AGTAGGCAGAAGATACTATCTTGGTCTGTGTTAGAGGCAATTGTTGAAATTTCTCTGAAT 116660491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGTAGGCAGAAGATACTATCTTGGTCTGTGTTAGAGGCAATTGTTGAAATTTCTCTGAAT 360

116660492 CTCTATGGGATAGGCATAAATGTACTGATAAATTTGAGCAGTCCTGGGAATCCATAATCT 116660551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTCTATGGGATAGGCATAAATGTACTGATAAATTTGAGCAGTCCTGGGAATCCATAATCT 420

116660552 CAATTTATTTGACCAATATCAATTAATACCATGTTGAGAGGTCCTTCTATTTCTGAAGTC 116660611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CAATTTATTTGACCAATATCAATTAATACCATGTTGAGAGGTCCTTCTATTTCTGAAGTC 480

116660612 TGGTTCAGCAAAAAATAAAAAAAAAAATAAAATACCTGAAATAATGTAGCTATTCCTGAG 116660671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGGTTCAGCAAAAAATAAAAAAAAAAATAAAATACCTGAAATAATGTAGCTATTCCTGAG 540

116660672 GTATCATTAACAGAATAGAAACTTAAAAAGCGCATGATATGGAAAAATCTTTGCTGATGG 116660731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GTATCATTAACAGAATAGAAACTTAAAAAGCGCATGATATGGAAAAATCTTTGCTGATGG 600

116660732 TTATACATGTTAAGTTTCCAGATAACTATTAATTAGACTTGCAGACATAAAAGGCTGTAC 116660791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTATACATGTTAAGTTTCCAGATAACTATTAATTAGACTTGCAGACATAAAAGGCTGTAC 660

116660792 CAAGTGGATATTTTAGAGATAAATTTTTAGCACTTACAGACAATATTATGAAGTAGCTAT 116660851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CAAGTGGATATTTTAGAGATAAATTTTTAGCACTTACAGACAATATTATGAAGTAGCTAT 720

116660852 GTGGGCATAGAGAAATTCGGGAAATTAGCAGGCTGGTTCTGCTATAATAGATCTCAGTTC 116660911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GTGGGCATAGAGAAATTCGGGAAATTAGCAGGCTGGTTCTGCTATAATAGATCTCAGTTC 780

116660912 ACCCTTAGGATATCTTCACTAAAGGAGCTTAACATAGCCCAGATGGTAGATTTGATTGCC 116660971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ACCCTTAGGATATCTTCACTAAAGGAGCTTAACATAGCCCAGATGGTAGATTTGATTGCC 840

116660972 CTCATTAGAGCTGGTCACTTGGCCAAAGACAAAAAAAATTATATTTACACAGAAAATAGC 116661031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTCATTAGAGCTGGTCACTTGGCCAAAGACAAAAAAAATTATATTTACACAGAAAATAGC 900

116661032 TCAAGTACCTGAACCTCAGTATGACTATATATGGGGATAGAGTCTTTAAGGAAGTGATTA 116661091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TCAAGTACCTGAACCTCAGTATGACTATATATGGGGATAGAGTCTTTAAGGAAGTGATTA 960

116661092 AGGTTAAATAAAGTCATAATGATGGGGCCCTAATCTGATAAGATTAGCGTCCTTCTAAGA 116661151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AGGTTAAATAAAGTCATAATGATGGGGCCCTAATCTGATAAGATTAGCGTCCTTCTAAGA 1020

116661152 GGAGGAATCAACATCAGGGATTTTTTTTTCTCTCAACCCATGCCCAGAGGAAAGTCATAT 116661211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GGAGGAATCAACATCAGGGATTTTTTTTTCTCTCAACCCATGCCCAGAGGAAAGTCATAT 1080

116661212 GAGGACGTAACACAAAGAGAGACATCTACAAATCACAGAGGTTGCACCAGAAATCAACCC 116661271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GAGGACGTAACACAAAGAGAGACATCTACAAATCACAGAGGTTGCACCAGAAATCAACCC 1140

116661272 TGCTAGCATATCGATCTTGAACTTCTAGTCCCCAGAACTGTGAGGAAATAAATTTTTGTT 116661331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGCTAGCATATCGATCTTGAACTTCTAGTCCCCAGAACTGTGAGGAAATAAATTTTTGTT 1200

116661332 GCTTATGCCACCAGATCTGTGACATTTTGTTATGGAAGTCTGAGCTGACCAATACACTTG 116661391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GCTTATGCCACCAGATCTGTGACATTTTGTTATGGAAGTCTGAGCTGACCAATACACTTG 1260

116661392 AATAACTATCAGTGTCAATGTAAAACAAGCCATCTTTAGACTTAAGGAAACAGTCACCTG 116661451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AATAACTATCAGTGTCAATGTAAAACAAGCCATCTTTAGACTTAAGGAAACAGTCACCTG 1320

116661452 GCTCTCTAAGGCAGATGCAAATGGATTTTTCTTTGCCCGGGTTTAGTAATTCAGATTATG 116661511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GCTCTCTAAGGCAGATGCAAATGGATTTTTCTTTGCCCGGGTTTAGTAATTCAGATTATG 1380

116661512 GCACTAAGTGTTTTGGGAAGGCTCCATGTCATTTTGATATAGTCACTGTGTGTTGCCATT 116661571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GCACTAAGTGTTTTGGGAAGGCTCCATGTCATTTTGATATAGTCACTGTGTGTTGCCATT 1440

116661572 CTTATGCATGTATTCTCCACAGTCTCAGTCCTGCTCTGCAGCTGCTCTCGTGTCAAATGA 116661631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTTATGCATGTATTCTCCACAGTCTCAGTCCTGCTCTGCAGCTGCTCTCGTGTCAAATGA 1500

116661632 TCCATCACTCAACGGAAATGAACTCATCACTCCATAAAAGGAATAGGAAGATCAGTCCAT 116661691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TCCATCACTCAACGGAAATGAACTCATCACTCCATAAAAGGAATAGGAAGATCAGTCCAT 1560

116661692 GATCCAATCCCAAACTATTTTTTCTGAGGATGATAATGTTATCTAGA 116661738
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GATCCAATCCCAAACTATTTTTTCTGAGGATGATAATGTTATCTAGA 1607

EXCISED REGION

116661740 ATCACAACAGTGGTATACATCTGAACATGGCTGCTTTAGTAGCTGAACGACTCTTCTCAT 116661799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1609 ATCACAACAGTGGTATACATCTGAACATGGCTGCTTTAGTAGCTGAACGACTCTTCTCAT 1668

116661800 CTTCTCATCAGTTAGGAAAGACTGAGAACTGGTAGCATAAATCCATCAATTATGGGATTG 116661859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1669 CTTCTCATCAGTTAGGAAAGACTGAGAACTGGTAGCATAAATCCATCAATTATGGGATTG 1728

116661860 CAATTGCAGAATGTTTTGTGACTCACATAATGTTTTCTTCTTTACTCAGAACTTCTCTAT 116661919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1729 CAATTGCAGAATGTTTTGTGACTCACATAATGTTTTCTTCTTTACTCAGAACTTCTCTAT 1788

116661920 TTCACAGATTCTCACCTTAATAATTGAAGCAACTCAGGGTCACATCCTAGTTCTATAATT 116661979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1789 TTCACAGATTCTCACCTTAATAATTGAAGCAACTCAGGGTCACATCCTAGTTCTATAATT 1848

116661980 CTGCCTGAGGCACTCTGAGCCCAAACCATCAACAGGAAACAAACAAATAAAAAACCTGCT 116662039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1849 CTGCCTGAGGCACTCTGAGCCCAAACCATCAACAGGAAACAAACAAATAAAAAACCTGCT 1908

116662040 AATTTACTCTCCAATGAAACCTTTCCAGAATTATCTGTGTAGAGTTTCCTATTGCTGCAA 116662099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1909 AATTTACTCTCCAATGAAACCTTTCCAGAATTATCTGTGTAGAGTTTCCTATTGCTGCAA 1968

116662100 TAATTAATAAACTCAGTTTGCTTATATTGCAAATTTTAAAACTCGTAGTGGGAGATTTCC 116662159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1969 TAATTAATAAACTCAGTTTGCTTATATTGCAAATTTTAAAACTCGTAGTGGGAGATTTCC 2028

116662160 AGTTGCAAACAACAAGTCTTGGCTTTAATTATGAGTTCAACCAGTTTTTTTTCTCCTAAT 116662219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2029 AGTTGCAAACAACAAGTCTTGGCTTTAATTATGAGTTCAACCAGTTTTTTTTCTCCTAAT 2088

116662220 GTTTTAAATCTCAGTTCATCATAATGTCTGAGCTTGTCTGATTTTGGCATAGGGAATATA 116662279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2089 GTTTTAAATCTCAGTTCATCATAATGTCTGAGCTTGTCTGATTTTGGCATAGGGAATATA 2148

116662280 ATTAGAAGTAGTGAATGAAGGCCTAGCTGTTGCTTTGATGTCAGCAGACACCCATTTCTC 116662339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2149 ATTAGAAGTAGTGAATGAAGGCCTAGCTGTTGCTTTGATGTCAGCAGACACCCATTTCTC 2208

116662340 TTTCCAAACTGCTTTTAAAAAGTCAAACAACTTCCTTCTCTTCTTGCCTCACTCTCTACT 116662399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2209 TTTCCAAACTGCTTTTAAAAAGTCAAACAACTTCCTTCTCTTCTTGCCTCACTCTCTACT 2268

116662400 TAATGTGATTTTCTTTTAATTTATGAAGGAAATAAAATCATTGCTTTTTAAGAATCATCC 116662459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2269 TAATGTGATTTTCTTTTAATTTATGAAGGAAATAAAATCATTGCTTTTTAAGAATCATCC 2328

116662460 AACCAAGTCATTAAAGATATCTGGAATTCAAGATGTAGTCAAAATATTTCAAGGGCATTA 116662519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2329 AACCAAGTCATTAAAGATATCTGGAATTCAAGATGTAGTCAAAATATTTCAAGGGCATTA 2388

116662520 CAATATCCTCTGTCTTCTCTAATCTCTCAGGCAGTAAAACGGTACCAAGTGCAGAGATAG 116662579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2389 CAATATCCTCTGTCTTCTCTAATCTCTCAGGCAGTAAAACGGTACCAAGTGCAGAGATAG 2448

116662580 AAACACTGCTGTCAAAGTGGGTTAAAATCTTGACAGTATCGTGGCTTCTGATTTTAATTT 116662639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2449 AAACACTGCTGTCAAAGTGGGTTAAAATCTTGACAGTATCGTGGCTTCTGATTTTAATTT 2508

116662640 CTCAATTAACTTATACAAATGAATAACTACCGTTATAGAAATAGCTTCTGGATTTCTTTG 116662699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2509 CTCAATTAACTTATACAAATGAATAACTACCGTTATAGAAATAGCTTCTGGATTTCTTTG 2568

116662700 TCCTTTTTTTCCTGAAGTTAGGCTATATTTGGTATCTCTATAGAGATAGGCTATATTTGG 116662759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2569 TCCTTTTTTTCCTGAAGTTAGGCTATATTTGGTATCTCTATAGAGATAGGCTATATTTGG 2628

116662760 TAAATCTGTTCTCACCTCACATAAAAGGTTAATATTCTACAAGTGGATAGATGTGGTGAG 116662819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2629 TAAATCTGTTCTCACCTCACATAAAAGGTTAATATTCTACAAGTGGATAGATGTGGTGAG 2688

116662820 GACAACTAAAAGGAGATTGAATGATCTCATCAAATTATATTACACAACCTTTCAAAGAAA 116662879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2689 GACAACTAAAAGGAGATTGAATGATCTCATCAAATTATATTACACAACCTTTCAAAGAAA 2748

116662880 GCTCAGTTGGATTAAGAGGTTTCTTTATGTTCATGCCCAAAATGCCAAATTCCAACAGCC 116662939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2749 GCTCAGTTGGATTAAGAGGTTTCTTTATGTTCATGCCCAAAATGCCAAATTCCAACAGCC 2808

116662940 CACAAAATTTCTTTGAAGTATTTTTCTCATACGTTTGTTTGATGAACAGCTTAAAGCTCC 116662999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2809 CACAAAATTTCTTTGAAGTATTTTTCTCATACGTTTGTTTGATGAACAGCTTAAAGCTCC 2868

116663000 ATTTCCATCCTAGCAAGTGGCAGACAAAAAGCCAGATAGTAAATCATATTTTAATAAAAA 116663059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2869 ATTTCCATCCTAGCAAGTGGCAGACAAAAAGCCAGATAGTAAATCATATTTTAATAAAAA 2928

116663060 TGATTTTAATAAGTGAAAGATATGATCCATTAAGTTAATCTTGTTAAGTAGAAGACCAAA 116663119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2929 TGATTTTAATAAGTGAAAGATATGATCCATTAAGTTAATCTTGTTAAGTAGAAGACCAAA 2988

116663120 ATGAGAACTTAATGGGGTGCAAACATCACGGAGAATCAAAACACACACTAGAAACCATAC 116663179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2989 ATGAGAACTTAATGGGGTGCAAACATCACGGAGAATCAAAACACACACTAGAAACCATAC 3048

116663180 TTGAGAACCAGAGATGAGTGAATGTTTGGTCATCAATATCCATGCTAGCCTTAATCTTGT 116663239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3049 TTGAGAACCAGAGATGAGTGAATGTTTGGTCATCAATATCCATGCTAGCCTTAATCTTGT 3108

116663240 GGTTATCCCACCACATCCCCCTTTTCAACAGAAGTCAGTGAGCAGCAAGCCTCATTGAAT 116663299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3109 GGTTATCCCACCACATCCCCCTTTTCAACAGAAGTCAGTGAGCAGCAAGCCTCATTGAAT 3168

116663300 GTTGGATATTAGCAAGCACATGTAGTTTTGCTTCAAGTACTCTTTATTTTCTTCCAATCC 116663359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3169 GTTGGATATTAGCAAGCACATGTAGTTTTGCTTCAAGTACTCTTTATTTTCTTCCAATCC 3228

116663360 TCAGGGCCTTTCTCAACATATGGTTTATTATAGCGTTGTGAATGATTGGTCTTTCATAAG 116663419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3229 TCAGGGCCTTTCTCAACATATGGTTTATTATAGCGTTGTGAATGATTGGTCTTTCATAAG 3288

116663420 GACATTTTCCTTGGCAGAAGGCTATTTGAAGTTCATTGCTTTTACAAGGTAAGATTTCTG 116663479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3289 GACATTTTCCTTGGCAGAAGGCTATTTGAAGTTCATTGCTTTTACAAGGTAAGATTTCTG 3348

116663480 GAAGTTCTAAGCTATATAAATAGGTTTGGAGGAACTTTCTCTTAAACCACAGAAACTATT 116663539
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     3349 GAAGTTCTAAGCTATATAAATAGGTTTGGAGGAACATTCTCTTAAACCACAGAAACTATT 3408

116663540 AATACTCTTGAGCAGGTGAGCTTATCAGATTCCTTAGTAGTCAAC 116663584
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3409 AATACTCTTGAGCAGGTGAGCTTATCAGATTCCTTAGTAGTCAAC 3453

Alignment time is 4.144 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [116652076,116672656] =>     20581 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [        1,     3888] =>      3888 nucs 'mol-32-331c-048458_3888'

Score:        3790
Aligned:      3888        nucs
Identic:      3875 (100%) nucs =>      1901 (100%)      1974 (100%)
Gaps:            8 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [116660172,116662076] EXCISED REGION [116662657,116664632]
 second seq =>  [        1,     1905] EXCISED REGION [     1907,     3888]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       580 nucs [116662077,116662656]
 second seq =>         1 nucs [1906,1906]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [1905,1905] to [1906,1906]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

116660172 GGGCTCAGGTGATCATCCTCCTTCAGCCTCCTGTGTAGCTAGGACTGCAGGCATGTACCA 116660231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGGCTCAGGTGATCATCCTCCTTCAGCCTCCTGTGTAGCTAGGACTGCAGGCATGTACCA 60

116660232 CCACACATGGCTAATTTTAGTATTTTTTGTAGAAATGAGAGTCTCACTGTGTTGTCCAGG 116660291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCACACATGGCTAATTTTAGTATTTTTTGTAGAAATGAGAGTCTCACTGTGTTGTCCAGG 120

116660292 TTTGTCTCAAACTCCCAGGTTCAAGCAATCCACCTGCCTCAGCCTCTCAAACTGCTGGGA 116660351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTGTCTCAAACTCCCAGGTTCAAGCAATCCACCTGCCTCAGCCTCTCAAACTGCTGGGA 180

116660352 TTATAGGCATGTGCCACCATGCTGGGCCTCAAATTGACATTTTCTTAAAAATTGGACTGC 116660411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTATAGGCATGTGCCACCATGCTGGGCCTCAAATTGACATTTTCTTAAAAATTGGACTGC 240

116660412 CAAACAAGGACATTAGCCCTAGTAGGCAGAAGATACTATCTTGGTCTGTGTTAGAGGCAA 116660471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CAAACAAGGACATTAGCCCTAGTAGGCAGAAGATACTATCTTGGTCTGTGTTAGAGGCAA 300

116660472 TTGTTGAAATTTCTCTGAATCTCTATGGGATAGGCATAAATGTACTGATAAATTTGAGCA 116660531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTGTTGAAATTTCTCTGAATCTCTATGGGATAGGCATAAATGTACTGATAAATTTGAGCA 360

116660532 GTCCTGGGAATCCATAATCTCAATTTATTTGACCAATATCAATTAATACCATGTTGAGAG 116660591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTCCTGGGAATCCATAATCTCAATTTATTTGACCAATATCAATTAATACCATGTTGAGAG 420

116660592 GTCCTTCTATTTCTGAAGTCTGGTTCAGCAAAAAATAAAAAAAAAAA-TAAAATACCTGA 116660650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
      421 GTCCTTCTATTTCTGAAGTCTGGTTCAGCAAAAAATAAAAAAAAAAAATAAAATACCTGA 480

116660651 AATAATGTAGCTATTCCTGAGGTATCATTAACAGAATAGAAACTTAAAAAGCGCATGATA 116660710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AATAATGTAGCTATTCCTGAGGTATCATTAACAGAATAGAAACTTAAAAAGCGCATGATA 540

116660711 TGGAAAAATCTTTGCTGATGGTTATACATGTTAAGTTTCCAGATAACTATTAATTAGACT 116660770
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGGAAAAACCTTTGCTGATGGTTATACATGTTAAGTTTCCAGATAACTATTAATTAGACT 600

116660771 TGCAGACATAAAAGGCTGTACCAAGTGGATATTTTAGAGATAAATTTTTAGCACTTACAG 116660830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGCAGACATAAAAGGCTGTACCAAGTGGATATTTTAGAGATAAATTTTTAGCACTTACAG 660

116660831 ACAATATTATGAAGTAGCTATGTGGGCATAGAGAAATTCGGGAAATTAGCAGGCTGGTTC 116660890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ACAATATTATGAAGTAGCTATGTGGGCATAGAGAAATTCGGGAAATTAGCAGGCTGGTTC 720

116660891 TGCTATAATAGATCTCAGTTCACCCTTAGGATATCTTCACTAAAGGAGCTTAACATAGCC 116660950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGCTATAATAGATCTCAGTTCACCCTTAGGATATCTTCACTAAAGGAGCTTAACATAGCC 780

116660951 CAGATGGTAGATTTGATTGCCCTCATTAGAGCTGGTCACTTGGCCAAAGACAAAAAAAAT 116661010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CAGATGGTAGATTTGATTGCCCTCATTAGAGCTGGTCACTTGGCCAAAGACAAAAAAAAT 840

116661011 TATATTTACACAGAAAATAGCTCAAGTACCTGAACCTCAGTATGACTATATATGGGGATA 116661070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TATATTTACACAGAAAATAGCTCAAGTACCTGAACCTCAGTATGACTATATATGGGGATA 900

116661071 GAGTCTTTAAGGAAGTGATTAAGGTTAAATAAAGTCATAATGATGGGGCCCTAATCTGAT 116661130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GAGTCTTTAAGGAAGTGATTAAGGTTAAATAAAGTCATAATGATGGGGCCCTAATCTGAT 960

116661131 AAGATTAGCGTCCTTCTAAGAGGAGGAATCAACATCAGGGATTTTTTTTTCTCTCAACCC 116661190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AAGATTAGCGTCCTTCTAAGAGGAGGAATCAACATCAGGGATTTTTTTTTCTCTCAACCC 1020

116661191 ATGCCCAGAGGAAAGTCATATGAGGACGTAACACAAAGAGAGACATCTACAAATCACAGA 116661250
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     1021 ATGCCCAGAGGAAAGTCATATGAGGACGTAACACAAAGAGAGACATCTACAAATCACAGG 1080

116661251 GGTTGCACCAGAAATCAACCCTGCTAGCATATCGATCTTGAACTTCTAGTCCCCAGAACT 116661310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GGTTGCACCAGAAATCAACCCTGCTAGCATATCGATCTTGAACTTCTAGTCCCCAGAACT 1140

116661311 GTGAGGAAATAAATTTTTGTTGCTTATGCCACCAGATCTGTGACATTTTGTTATGGAAGT 116661370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GTGAGGAAATAAATTTTTGTTGCTTATGCCACCAGATCTGTGACATTTTGTTATGGAAGT 1200

116661371 CTGAGCTGACCAATACACTTGAATAACTATCAGTGTCAATGTAAAACAAGCCATCTTTAG 116661430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CTGAGCTGACCAATACACTTGAATAACTATCAGTGTCAATGTAAAACAAGCCATCTTTAG 1260

116661431 ACTTAAGGAAACAGTCACCTGGCTCTCTAAGGCAGATGCAAATGGATTTTTCTTTGCCCG 116661490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ACTTAAGGAAACAGTCACCTGGCTCTCTAAGGCAGATGCAAATGGATTTTTCTTTGCCCG 1320

116661491 GGTTTAGTAATTCAGATTATGGCACTAAGTGTTTTGGGAAGGCTCCATGTCATTTTGATA 116661550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GGTTTAGTAATTCAGATTATGGCACTAAGTGTTTTGGGAAGGCTCCATGTCATTTTGATA 1380

116661551 TAGTCACTGTGTGTTGCCATTCTTATGCATGTATTCTCCACAGTCTCAGTCCTGCTCTGC 116661610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TAGTCACTGTGTGTTGCCATTCTTATGCATGTATTCTCCACAGTCTCAGTCCTGCTCTGC 1440

116661611 AGCTGCTCTCGTGTCAAATGATCCATCACTCAACGGAAATGAACTCATCACTCCATAAAA 116661670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AGCTGCTCTCGTGTCAAATGATCCATCACTCAACGGAAATGAACTCATCACTCCATAAAA 1500

116661671 GGAATAGGAAGATCAGTCCATGATCCAATCCCAAACTATTTTTTCTGAGGATGATAATGT 116661730
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     1501 GGAATAGGAAGATCAGTCCATGATCCAATCCCAAACTATTTTTTCCGAGGATGATAATGT 1560

116661731 TATCTAGAAATCACAACAGTGGTATACATCTGAACATGGCTGCTTTAGTAGCTGAACGAC 116661790
          ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TATCTAGAAATCACAACAG-GGTATACATCTGAACATGGCTGCTTTAGTAGCTGAACGAC 1619

116661791 TCTTCTCATCTTCTCATCAGTTAGGAAAGACTGAGAACTGGTAGCATAAATCCATCAATT 116661850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 TCTTCTCATCTTCTCATCAGTTAGGAAAGACTGAGAACTGGTAGCATAAATCCATCAATT 1679

116661851 ATGGGATTGCAATTGCAGAATGTTTTGTGACTCACATAATGTTTTCTTCTTTACTCAGAA 116661910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 ATGGGATTGCAATTGCAGAATGTTTTGTGACTCACATAATGTTTTCTTCTTTACTCAGAA 1739

116661911 CTTCTCTATTTCACAGATTCTCACCTTAATAATTGAAGCAACTCAGGGTCACATCCTAGT 116661970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 CTTCTCTATTTCACAGATTCTCACCTTAATAATTGAAGCAACTCAGGGTCACATCCTAGT 1799

116661971 TCTATAATTCTGCCTGAGGCACTCTGAGCCCAAACCATCAACAGGAAACAAACAAATAAA 116662030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 TCTATAATTCTGCCTGAGGCACTCTGAGCCCAAACCATCAACAGGAAACAAACAAATAAA 1859

116662031 AAACCTGCTAATTTACTCTCCAATGAAACCTTTCCAGAATTATCTG 116662076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 AAACCTGCTAATTTACTCTCCAATGAAACCTTTCCAGAATTATCTG 1905

EXCISED REGION

116662657 AATGAATAACTACCGTTATAGAAATAGCTTCTGGATTTCTTTGTCCTTTTTTTCCTGAAG 116662716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1907 AATGAATAACTACCGTTATAGAAATAGCTTCTGGATTTCTTTGTCCTTTTTTTCCTGAAG 1966

116662717 TTAGGCTATATTTGGTATCTCTATAGAGATAGGCTATATTTGGTAAATCTGTTCTCACCT 116662776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1967 TTAGGCTATATTTGGTATCTCTATAGAGATAGGCTATATTTGGTAAATCTGTTCTCACCT 2026

116662777 CACATAAAAGGTTAATATTCTACAAGTGGATAGATGTGGTGAGGACAACTAAAAGGAGAT 116662836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2027 CACATAAAAGGTTAATATTCTACAAGTGGATAGATGTGGTGAGGACAACTAAAAGGAGAT 2086

116662837 TGAATGATCTCATCAAATTATATTACACAACCTTTCAAAGAAAGCTCAGTTGGATTAAGA 116662896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2087 TGAATGATCTCATCAAATTATATTACACAACCTTTCAAAGAAAGCTCAGTTGGATTAAGA 2146

116662897 GGTTTCTTTATGTTCATGCCCAAAATGCCAAATTCCAACAGCCCACAAAATTTCTTTGAA 116662956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2147 GGTTTCTTTATGTTCATGCCCAAAATGCCAAATTCCAACAGCCCACAAAATTTCTTTGAA 2206

116662957 GTATTTTTCTCATACGTTTGTTTGATGAACAGCTTAAAGCTCCATTTCCATCCTAGCAAG 116663016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2207 GTATTTTTCTCATACGTTTGTTTGATGAACAGCTTAAAGCTCCATTTCCATCCTAGCAAG 2266

116663017 TGGCAGACAAAAAGCCAGATAGTAAATCATATTTTAATAAAAATGATTTTAATAAGTGAA 116663076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2267 TGGCAGACAAAAAGCCAGATAGTAAATCATATTTTAATAAAAATGATTTTAATAAGTGAA 2326

116663077 AGATATGATCCATTAAGTTAATCTTGTTAAGTAGAAGACCAAAATGAGAACTTAATGGGG 116663136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2327 AGATATGATCCATTAAGTTAATCTTGTTAAGTAGAAGACCAAAATGAGAACTTAATGGGG 2386

116663137 TGCAAACATCACGGAGAATCAAAACACACACTAGAAACCATACTTGAGAACCAGAGATGA 116663196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2387 TGCAAACATCACGGAGAATCAAAACACACACTAGAAACCATACTTGAGAACCAGAGATGA 2446

116663197 GTGAATGTTTGGTCATCAATATCCATGCTAGCCTTAATCTTGTGGTTATCCCACCACATC 116663256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2447 GTGAATGTTTGGTCATCAATATCCATGCTAGCCTTAATCTTGTGGTTATCCCACCACATC 2506

116663257 CCCCTTTTCAACAGAAGTCAGTGAGCAGCAAGCCTCATTGAATGTTGGATATTAGCAAGC 116663316
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2507 CCCCTTTTCAACAGAAGTCAGTGAGTAGCAAGCCTCATTGAATGTTGGATATTAGCAAGC 2566

116663317 ACATGTAGTTTTGCTTCAAGTACTCTTTATTTTCTTCCAATCCTCAGGGCCTTTCTCAAC 116663376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2567 ACATGTAGTTTTGCTTCAAGTACTCTTTATTTTCTTCCAATCCTCAGGGCCTTTCTCAAC 2626

116663377 ATATGGTTTATTATAGCGTTGTGAATGATTGGTCTTTCATAAGGACATTTTCCTTGGCAG 116663436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2627 ATATGGTTTATTATAGCGTTGTGAATGATTGGTCTTTCATAAGGACATTTTCCTTGGCAG 2686

116663437 AAGGCTATTTGAAGTTCATTGCTTTTACAAGGTAAGATTTCTGGAAGTTCTAAGCTATAT 116663496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2687 AAGGCTATTTGAAGTTCATTGCTTTTACAAGGTAAGATTTCTGGAAGTTCTAAGCTATAT 2746

116663497 AAATAGGTTTGGAGGAACTTTCTCTTAAACCACAGAAACTATTAATACTCTTGAGCAGGT 116663556
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2747 AAATAGGTTTGGAGGAACATTCTCTTAAACCACAGAAACTATTAATACTCTTGAGCAGGT 2806

116663557 GAGCTTATCAGATTCCTTAGTAGTCAACCAAAATGCTGAAGGATTTTTC------TTTTT 116663610
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||
     2807 GAGCTTATCAGATTCCTTAGTAGTCAACCAAAATGCTGAAGGATTTTTCTTTTTTTTTTT 2866

116663611 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGATGGAGTCTCACTCTGTCACCAGGCTGGAGTG 116663670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2867 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGATGGAGTCTCACTCTGTCACCAGGCTGGAGTG 2926

116663671 CAGTGGTGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCCAGCAATTCTTCTGC 116663730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2927 CAGTGGTGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCCAGCAATTCTTCTGC 2986

116663731 CTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGGGCATGCCCACCAGGCCCAGCTAAGTTTTG 116663790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2987 CTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGGGCATGCCCACCAGGCCCAGCTAAGTTTTG 3046

116663791 TATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCAAGTTGGCCAGAATGGTCTCGATCTCTTGACTT 116663850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3047 TATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCAAGTTGGCCAGAATGGTCTCGATCTCTTGACTT 3106

116663851 CATGAGCCGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAGCCACCGTGTC 116663910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3107 CATGAGCCGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAGCCACCGTGTC 3166

116663911 CGGCCAAGAATTTTTCTAATGAGGTATGTGCAAAGCAGAAACATTTTATGTTAAGTACAG 116663970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3167 CGGCCAAGAATTTTTCTAATGAGGTATGTGCAAAGCAGAAACATTTTATGTTAAGTACAG 3226

116663971 GCATGGCCACAAAAATATCACTTAAGAAGAGAAGAATTTTGGGGTTCTCAGTGTAACATG 116664030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3227 GCATGGCCACAAAAATATCACTTAAGAAGAGAAGAATTTTGGGGTTCTCAGTGTAACATG 3286

116664031 GAGATGAACAATATCTCACTCTTTTGAGGATAACAATAGATTTCTCTCTTCTGCTTTTGC 116664090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3287 GAGATGAACAATATCTCACTCTTTTGAGGATAACAATAGATTTCTCTCTTCTGCTTTTGC 3346

116664091 AATGATTAAAATTTTGGAAATTTATATGAGAAAAGTAAAGATATTTTAAAAAGTTTTCTT 116664150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3347 AATGATTAAAATTTTGGAAATTTATATGAGAAAAGTAAAGATATTTTAAAAAGTTTTCTT 3406

116664151 GTTTTTTTTAACTCTTTATTCTCTTAAATCTTGACACTGTTCGTTGTAAGTTTGTGCTAG 116664210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3407 GTTTTTTTTAACTCTTTATTCTCTTAAATCTTGACACTGTTCGTTGTAAGTTTGTGCTAG 3466

116664211 ATACAGCCACTGTTTGGTTGAGAAAATTTCTCTATGTCTGTGACATCCATGAGATAGAAA 116664270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3467 ATACAGCCACTGTTTGGTTGAGAAAATTTCTCTATGTCTGTGACATCCATGAGATAGAAA 3526

116664271 CCGATGGCTACATATGGCTATTTAAATTAAATTAATTAAACTTACATAAAATAAAAACTT 116664330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3527 CCGATGGCTACATATGGCTATTTAAATTAAATTAATTAAACTTACATAAAATAAAAACTT 3586

116664331 GGTTCCATAGTTGCACTAGACACATTTTAGGGCTCAATAGCCATAGTATAAACAGCATAG 116664390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3587 GGTTCCATAGTTGCACTAGACACATTTTAGGGCTCAATAGCCATAGTATAAACAGCATAG 3646

116664391 TATAGAACTTTCTATCAGAGAAAGTTTGTCAGGGAGCTGTGCTAAAGGTGGTTTTCAAAA 116664450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3647 TATAGAACTTTCTATCAGAGAAAGTTTGTCAGGGAGCTGTGCTAAAGGTGGTTTTCAAAA 3706

116664451 TATAGCTGTAGCCTGAGAATATTTCTATACTATTTTAATCAATTTTAACTAATTAATTAA 116664510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3707 TATAGCTGTAGCCTGAGAATATTTCTATACTATTTTAATCAATTTTAACTAATTAATTAA 3766

116664511 CTACATTATACTTTGTTAACATAAAGTCAAAGGCATCTACTTCTGCAATTGGGAGGTAAT 116664570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3767 CTACATTATACTTTGTTAACATAAAGTCAAAGGCATCTACTTCTGCAATTGGGAGGTAAT 3826

116664571 AACTTGCAATATAAAAATAGATGAGGCAGGTTGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCA 116664630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3827 AACTTGCAATATAAAAATAGATGAGGCAGGTTGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCA 3886

116664631 CT 116664632
          ||
     3887 CT 3888

Alignment time is 4.53634 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [116652076,116672656] =>     20581 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [        1,     3868] =>      3868 nucs 'mol-32-34c9-073099_3868'

Score:        3752
Aligned:      3889        nucs
Identic:      3861 ( 99%) nucs =>      2941 ( 99%)       920 (100%)
Gaps:           23 (  1%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [116659112,116662076] EXCISED REGION [116662657,116663579]
 second seq =>  [        1,     2945] EXCISED REGION [     2947,     3868]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       580 nucs [116662077,116662656]
 second seq =>         1 nucs [2946,2946]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [2945,2945] to [2946,2946]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

116659112 TCTAGAATGATTAATCGAGTGAGATTCTCAATAAATCTGCAACTAAAACCATCCGTAAGT 116659171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCTAGAATGATTAATCGAGTGAGATTCTCAATAAATCTGCAACTAAAACCATCCGTAAGT 60

116659172 CCTAACAAGTTTCAATTTTTATCACGTTAGTGTCTTTTAGTAGATAAACTTTGCTCTAGG 116659231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCTAACAAGTTTCAATTTTTATCACGTTAGTGTCTTTTAGTAGATAAACTTTGCTCTAGG 120

116659232 TCACTATCCAAAAAACTTATGTGAGTTCTGTTGATTGTATCCTGCCTTTGTGTTCCTAAG 116659291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCACTATCCAAAAAACTTATGTGAGTTCTGTTGATTGTATCCTGCCTTTGTGTTCCTAAG 180

116659292 AGTTGATTTGGGAAGCAAAATCCCCCAAAAATCTATATTCTCAGGCCCATGGATAGTTAG 116659351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGTTGATTTGGGAAGCAAAATCCCCCAAAAATCTATATTCTCAGGCCCATGGATAGTTAG 240

116659352 AACGCAGGCTACAGATGTCAAACTCTCTAGTCAGGGGTCATGCCTAATAAAGTGCAGAAG 116659411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AACGCAGGCTACAGATGTCAAACTCTCTAGTCAGGGGTCATGCCTAATAAAGTGCAGAAG 300

116659412 GAATACATTGAACAGAATGTTATACACTTTTAGGGCGTTTTAAAATTTTTGGTCTAAGTC 116659471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GAATACATTGAACAGAATGTTATACACTTTTAGGGCGTTTTAAAATTTTTGGTCTAAGTC 360

116659472 ATGTCTCTAGCAGGCTAGACACCTGTTCCAGATATGTATTCTTAATATAACAAAAATTAT 116659531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATGTCTCTAGCAGGCTAGACACCTGTTCCAGATATGTATTCTTAATATAACAAAAATTAT 420

116659532 TTAAATATCTTACCATGTGTCACAGTTACATCAATAATATTTGGAATCATACTGGACCCT 116659591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTAAATATCTTACCATGTGTCACAGTTACATCAATAATATTTGGAATCATACTGGACCCT 480

116659592 TTGAAAATTTTCAGTATGAGTAAAAATGTTTATCTTAGAAGTAAGTGGAGGGGAAACATC 116659651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTGAAAATTTTCAGTATGAGTAAAAATGTTTATCTTAGAAGTAAGTGGAGGGGAAACATC 540

116659652 CTTATTATTAAGTGCTAAGCCTTTTTAAAATGGTCTATGAAGATTCTAAATAGACTTCTG 116659711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTTATTATTAAGTGCTAAGCCTTTTTAAAATGGTCTATGAAGATTCTAAATAGACTTCTG 600

116659712 ATTCCAAAATACCTATAACAATGAAGTCTTTGGCCATGGCTAATTAAAAAAAAACATAAA 116659771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATTCCAAAATACCTATAACAATGAAGTCTTTGGCCATGGCTAATTAAAAAAAAACATAAA 660

116659772 ACTCTAGAGACTGTCTCATTTATTAATTTGCCAAATTCTTCTTTCTTTTAACATTTTCTT 116659831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ACTCTAGAGACTGTCTCATTTATTAATTTGCCAAATTCTTCTTTCTTTTAACATTTTCTT 720

116659832 TATCCCACAGTATCTTTTCTTGCTTTTTGTGCTACCACACTATCAAATTTTACTCTTTTT 116659891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TATCCCACAGTATCTTTTCTTGCTTTTTGTGCTACCACACTATCAAATTTTACTCTTTTT 780

116659892 CTCCCAAATTTCTTTTTCTAACCATCGTCTTCCCCCTCTGATTGTATCTGAAAATAACCA 116659951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTCCCAAATTTCTTTTTCTAACCATCGTCTTCCCCCTCTGATTGTATCTGAAAATAACCA 840

116659952 CTTGCTTTTCTTCTTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTT 116660011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTTGCTTTTCTTCTTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTT 900

116660012 CCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCCTCTTTCCCTTTCCCTTTCTTTTCTTTTAT 116660071
          ||||||||||                    ||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CCTTCCTTCC--------------------CTCTTTCCCTTTCCCTTTCTTTTCTTTTAT 940

116660072 TTTTTCTTCTCTCTTCTCTTCTCTTTTTCTGGGTTGCACTCTGTTACCCAAGCTTGAATG 116660131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      941 TTTTTCTTCTCTCTTCTCTTCTCTTTTTCTGGGTTGCACTCTGTTACCCAAGCTTGAATG 1000

116660132 CAATGGCAGGGATCACAGCTTACTGCAGTGTCAACCTCCTGGGCTCAGGTGATCATCCTC 116660191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1001 CAATGGCAGGGATCACAGCTTACTGCAGTGTCAACCTCCTGGGCTCAGGTGATCATCCTC 1060

116660192 CTTCAGCCTCCTGTGTAGCTAGGACTGCAGGCATGTACCACCACACATGGCTAATTTTAG 116660251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1061 CTTCAGCCTCCTGTGTAGCTAGGACTGCAGGCATGTACCACCACACATGGCTAATTTTAG 1120

116660252 TATTTTTTGTAGAAATGAGAGTCTCACTGTGTTGTCCAGGTTTGTCTCAAACTCCCAGGT 116660311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1121 TATTTTTTGTAGAAATGAGAGTCTCACTGTGTTGTCCAGGTTTGTCTCAAACTCCCAGGT 1180

116660312 TCAAGCAATCCACCTGCCTCAGCCTCTCAAACTGCTGGGATTATAGGCATGTGCCACCAT 116660371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1181 TCAAGCAATCCACCTGCCTCAGCCTCTCAAACTGCTGGGATTATAGGCATGTGCCACCAT 1240

116660372 GCTGGGCCTCAAATTGACATTTTCTTAAAAATTGGACTGCCAAACAAGGACATTAGCCCT 116660431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1241 GCTGGGCCTCAAATTGACATTTTCTTAAAAATTGGACTGCCAAACAAGGACATTAGCCCT 1300

116660432 AGTAGGCAGAAGATACTATCTTGGTCTGTGTTAGAGGCAATTGTTGAAATTTCTCTGAAT 116660491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1301 AGTAGGCAGAAGATACTATCTTGGTCTGTGTTAGAGGCAATTGTTGAAATTTCTCTGAAT 1360

116660492 CTCTATGGGATAGGCATAAATGTACTGATAAATTTGAGCAGTCCTGGGAATCCATAATCT 116660551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1361 CTCTATGGGATAGGCATAAATGTACTGATAAATTTGAGCAGTCCTGGGAATCCATAATCT 1420

116660552 CAATTTATTTGACCAATATCAATTAATACCATGTTGAGAGGTCCTTCTATTTCTGAAGTC 116660611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1421 CAATTTATTTGACCAATATCAATTAATACCATGTTGAGAGGTCCTTCTATTTCTGAAGTC 1480

116660612 TGGTTCAGCAAAAAATAAAAAAAAAAA-TAAAATACCTGAAATAATGTAGCTATTCCTGA 116660670
          ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
     1481 TGGTTCAGCAAAAAATAAAAAAAAAAAATAAAATACCTGAAATAATGTAGCTATTCCTGA 1540

116660671 GGTATCATTAACAGAATAGAAACTTAAAAAGCGCATGATATGGAAAAATCTTTGCTGATG 116660730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     1541 GGTATCATTAACAGAATAGAAACTTAAAAAGCGCATGATATGGAAAAACCTTTGCTGATG 1600

116660731 GTTATACATGTTAAGTTTCCAGATAACTATTAATTAGACTTGCAGACATAAAAGGCTGTA 116660790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1601 GTTATACATGTTAAGTTTCCAGATAACTATTAATTAGACTTGCAGACATAAAAGGCTGTA 1660

116660791 CCAAGTGGATATTTTAGAGATAAATTTTTAGCACTTACAGACAATATTATGAAGTAGCTA 116660850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1661 CCAAGTGGATATTTTAGAGATAAATTTTTAGCACTTACAGACAATATTATGAAGTAGCTA 1720

116660851 TGTGGGCATAGAGAAATTCGGGAAATTAGCAGGCTGGTTCTGCTATAATAGATCTCAGTT 116660910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1721 TGTGGGCATAGAGAAATTCGGGAAATTAGCAGGCTGGTTCTGCTATAATAGATCTCAGTT 1780

116660911 CACCCTTAGGATATCTTCACTAAAGGAGCTTAACATAGCCCAGATGGTAGATTTGATTGC 116660970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1781 CACCCTTAGGATATCTTCACTAAAGGAGCTTAACATAGCCCAGATGGTAGATTTGATTGC 1840

116660971 CCTCATTAGAGCTGGTCACTTGGCCAAAGACAAAAAAAATTATATTTACACAGAAAATAG 116661030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1841 CCTCATTAGAGCTGGTCACTTGGCCAAAGACAAAAAAAATTATATTTACACAGAAAATAG 1900

116661031 CTCAAGTACCTGAACCTCAGTATGACTATATATGGGGATAGAGTCTTTAAGGAAGTGATT 116661090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1901 CTCAAGTACCTGAACCTCAGTATGACTATATATGGGGATAGAGTCTTTAAGGAAGTGATT 1960

116661091 AAGGTTAAATAAAGTCATAATGATGGGGCCCTAATCTGATAAGATTAGCGTCCTTCTAAG 116661150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1961 AAGGTTAAATAAAGTCATAATGATGGGGCCCTAATCTGATAAGATTAGCGTCCTTCTAAG 2020

116661151 AGGAGGAATCAACATCAGGGATTTTTTTTTCTCTCAACCCATGCCCAGAGGAAAGTCATA 116661210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2021 AGGAGGAATCAACATCAGGGATTTTTTTTTCTCTCAACCCATGCCCAGAGGAAAGTCATA 2080

116661211 TGAGGACGTAACACAAAGAGAGACATCTACAAATCACAGAGGTTGCACCAGAAATCAACC 116661270
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     2081 TGAGGACGTAACACAAAGAGAGACATCTACAAATCACAGGGGTTGCACCAGAAATCAACC 2140

116661271 CTGCTAGCATATCGATCTTGAACTTCTAGTCCCCAGAACTGTGAGGAAATAAATTTTTGT 116661330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2141 CTGCTAGCATATCGATCTTGAACTTCTAGTCCCCAGAACTGTGAGGAAATAAATTTTTGT 2200

116661331 TGCTTATGCCACCAGATCTGTGACATTTTGTTATGGAAGTCTGAGCTGACCAATACACTT 116661390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2201 TGCTTATGCCACCAGATCTGTGACATTTTGTTATGGAAGTCTGAGCTGACCAATACACTT 2260

116661391 GAATAACTATCAGTGTCAATGTAAAACAAGCCATCTTTAGACTTAAGGAAACAGTCACCT 116661450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2261 GAATAACTATCAGTGTCAATGTAAAACAAGCCATCTTTAGACTTAAGGAAACAGTCACCT 2320

116661451 GGCTCTCTAAGGCAGATGCAAATGGATTTTTCTTTGCCCGGGTTTAGTAATTCAGATTAT 116661510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2321 GGCTCTCTAAGGCAGATGCAAATGGATTTTTCTTTGCCCGGGTTTAGTAATTCAGATTAT 2380

116661511 GGCACTAAGTGTTTTGGGAAGGCTCCATGTCATTTTGATATAGTCACTGTGTGTTGCCAT 116661570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2381 GGCACTAAGTGTTTTGGGAAGGCTCCATGTCATTTTGATATAGTCACTGTGTGTTGCCAT 2440

116661571 TCTTATGCATGTATTCTCCACAGTCTCAGTCCTGCTCTGCAGCTGCTCTCGTGTCAAATG 116661630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2441 TCTTATGCATGTATTCTCCACAGTCTCAGTCCTGCTCTGCAGCTGCTCTCGTGTCAAATG 2500

116661631 ATCCATCACTCAACGGAAATGAACTCATCACTCCATAAAAGGAATAGGAAGATCAGTCCA 116661690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2501 ATCCATCACTCAACGGAAATGAACTCATCACTCCATAAAAGGAATAGGAAGATCAGTCCA 2560

116661691 TGATCCAATCCCAAACTATTTTTTCTGAGGATGATAATGTTATCTAGAAATCACAACAGT 116661750
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||| 
     2561 TGATCCAATCCCAAACTATTTTTTCCGAGGATGATAATGTTATCTAGAAATCACAACAG- 2619

116661751 GGTATACATCTGAACATGGCTGCTTTAGTAGCTGAACGACTCTTCTCATCTTCTCATCAG 116661810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2620 GGTATACATCTGAACATGGCTGCTTTAGTAGCTGAACGACTCTTCTCATCTTCTCATCAG 2679

116661811 TTAGGAAAGACTGAGAACTGGTAGCATAAATCCATCAATTATGGGATTGCAATTGCAGAA 116661870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2680 TTAGGAAAGACTGAGAACTGGTAGCATAAATCCATCAATTATGGGATTGCAATTGCAGAA 2739

116661871 TGTTTTGTGACTCACATAATGTTTTCTTCTTTACTCAGAACTTCTCTATTTCACAGATTC 116661930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2740 TGTTTTGTGACTCACATAATGTTTTCTTCTTTACTCAGAACTTCTCTATTTCACAGATTC 2799

116661931 TCACCTTAATAATTGAAGCAACTCAGGGTCACATCCTAGTTCTATAATTCTGCCTGAGGC 116661990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2800 TCACCTTAATAATTGAAGCAACTCAGGGTCACATCCTAGTTCTATAATTCTGCCTGAGGC 2859

116661991 ACTCTGAGCCCAAACCATCAACAGGAAACAAACAAATAAAAAACCTGCTAATTTACTCTC 116662050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2860 ACTCTGAGCCCAAACCATCAACAGGAAACAAACAAATAAAAAACCTGCTAATTTACTCTC 2919

116662051 CAATGAAACCTTTCCAGAATTATCTG 116662076
          ||||||||||||||||||||||||||
     2920 CAATGAAACCTTTCCAGAATTATCTG 2945

EXCISED REGION

116662657 AATGAATAACTACCGTTATAGAAATAGCTTCTGGATTTCTTTGTCCTTTTTTTCCTGAAG 116662716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2947 AATGAATAACTACCGTTATAGAAATAGCTTCTGGATTTCTTTGTCCTTTTTTTCCTGAAG 3006

116662717 TTAGGCTATATTTGGTATCTCTATAGAGATAGGCTATATTTGGTAAATCTGTTCTCACCT 116662776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3007 TTAGGCTATATTTGGTATCTCTATAGAGATAGGCTATATTTGGTAAATCTGTTCTCACCT 3066

116662777 CACATAAAAGGTTAATATTCTACAAGTGGATAGATGTGGTGAGGACAACTAAAAGGAGAT 116662836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3067 CACATAAAAGGTTAATATTCTACAAGTGGATAGATGTGGTGAGGACAACTAAAAGGAGAT 3126

116662837 TGAATGATCTCATCAAATTATATTACACAACCTTTCAAAGAAAGCTCAGTTGGATTAAGA 116662896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3127 TGAATGATCTCATCAAATTATATTACACAACCTTTCAAAGAAAGCTCAGTTGGATTAAGA 3186

116662897 GGTTTCTTTATGTTCATGCCCAAAATGCCAAATTCCAACAGCCCACAAAATTTCTTTGAA 116662956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3187 GGTTTCTTTATGTTCATGCCCAAAATGCCAAATTCCAACAGCCCACAAAATTTCTTTGAA 3246

116662957 GTATTTTTCTCATACGTTTGTTTGATGAACAGCTTAAAGCTCCATTTCCATCCTAGCAAG 116663016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3247 GTATTTTTCTCATACGTTTGTTTGATGAACAGCTTAAAGCTCCATTTCCATCCTAGCAAG 3306

116663017 TGGCAGACAAAAAGCCAGATAGTAAATCATATTTTAATAAAAATGATTTTAATAAGTGAA 116663076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3307 TGGCAGACAAAAAGCCAGATAGTAAATCATATTTTAATAAAAATGATTTTAATAAGTGAA 3366

116663077 AGATATGATCCATTAAGTTAATCTTGTTAAGTAGAAGACCAAAATGAGAACTTAATGGGG 116663136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3367 AGATATGATCCATTAAGTTAATCTTGTTAAGTAGAAGACCAAAATGAGAACTTAATGGGG 3426

116663137 TGCAAACATCACGGAGAATCAAAACACACACTAGAAACCATACTTGAGAACCAGAGATGA 116663196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3427 TGCAAACATCACGGAGAATCAAAACACACACTAGAAACCATACTTGAGAACCAGAGATGA 3486

116663197 GTGAATGTTTGGTCATCAATATCCATGCTAGCCTTAATCTTGTGGTTATCCCACCACATC 116663256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3487 GTGAATGTTTGGTCATCAATATCCATGCTAGCCTTAATCTTGTGGTTATCCCACCACATC 3546

116663257 CCCCTTTTCAACAGAAGTCAGTGAGCAGCAAGCCTCATTGAATGTTGGATATTAGCAAGC 116663316
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3547 CCCCTTTTCAACAGAAGTCAGTGAGTAGCAAGCCTCATTGAATGTTGGATATTAGCAAGC 3606

116663317 ACATGTAGTTTTGCTTCAAGTACTCTTTATTTTCTTCCAATCCTCAGGGCCTTTCTCAAC 116663376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3607 ACATGTAGTTTTGCTTCAAGTACTCTTTATTTTCTTCCAATCCTCAGGGCCTTTCTCAAC 3666

116663377 ATATGGTTTATTATAGCGTTGTGAATGATTGGTCTTTCATAAGGACATTTTCCTTGGCAG 116663436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3667 ATATGGTTTATTATAGCGTTGTGAATGATTGGTCTTTCATAAGGACATTTTCCTTGGCAG 3726

116663437 AAGGCTATTTGAAGTTCATTGCTTTTACAAGGTAAGATTTCTGGAAGTTCTAAGCTATAT 116663496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3727 AAGGCTATTTGAAGTTCATTGCTTTTACAAGGTAAGATTTCTGGAAGTTCTAAGCTATAT 3786

116663497 AAATAGGTTTGGAGGAACTTTCTCTTAAACCACAGAAACTATTAATACTCTTGAGCAGGT 116663556
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3787 AAATAGGTTTGGAGGAACATTCTCTTAAACCACAGAAACTATTAATACTCTTGAGCAGGT 3846

116663557 GAGCTTATCAGATTCCTTAGTAG 116663579
           ||||||||||||||||||||||
     3847 -AGCTTATCAGATTCCTTAGTAG 3868

Alignment time is 5.1346 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [116652076,116672656] =>     20581 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [        1,     4898] =>      4898 nucs 'mol-32-34d4-194775_4898'

Score:        4897
Aligned:      4897        nucs
Identic:      4897 (100%) nucs =>      4796 (100%)       101 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [116658719,116663514] EXCISED REGION [116663516,116663616]
 second seq =>  [        1,     4796] EXCISED REGION [     4798,     4898]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [116663515,116663515]
 second seq =>         1 nucs [4797,4797]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [116663515,116663516] to [116663516,116663517]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

116658719 TAAACTCAGTGTGATTGTAGCATAATGGGATACTTCACTTGAGAAAGGGGATTTTTATAA 116658778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TAAACTCAGTGTGATTGTAGCATAATGGGATACTTCACTTGAGAAAGGGGATTTTTATAA 60

116658779 TTTGGAGAAGCATTGAGAGTCAGCAGTGAATATTCATGACACGGGCTAGGACCATTTAAA 116658838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTGGAGAAGCATTGAGAGTCAGCAGTGAATATTCATGACACGGGCTAGGACCATTTAAA 120

116658839 CAGACGACTTCTAGGAGAGTCTCTTGAGGACATTTAATCTCTTGTGCTTGACCATCCTGA 116658898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAGACGACTTCTAGGAGAGTCTCTTGAGGACATTTAATCTCTTGTGCTTGACCATCCTGA 180

116658899 CCCAAGGTGAGTTTGAGTCTCAAATACATTAAAATTCTCAAACCATTAGTTTTATTTTGT 116658958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCCAAGGTGAGTTTGAGTCTCAAATACATTAAAATTCTCAAACCATTAGTTTTATTTTGT 240

116658959 TCCTGTAAACCTAAAGTTTAACTTTCAGAATACTTTTTCTCATTAGAATTATATGTTTAA 116659018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCCTGTAAACCTAAAGTTTAACTTTCAGAATACTTTTTCTCATTAGAATTATATGTTTAA 300

116659019 AAATTCTTGGTGACATTCCATTCTTCACCTAATCTCACGTTTGTCTTGTTCTGTTTTGTC 116659078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAATTCTTGGTGACATTCCATTCTTCACCTAATCTCACGTTTGTCTTGTTCTGTTTTGTC 360

116659079 AAAAATGTTTTCCTAAAAATGAAAAAGAAAACCTCTAGAATGATTAATCGAGTGAGATTC 116659138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAAAATGTTTTCCTAAAAATGAAAAAGAAAACCTCTAGAATGATTAATCGAGTGAGATTC 420

116659139 TCAATAAATCTGCAACTAAAACCATCCGTAAGTCCTAACAAGTTTCAATTTTTATCACGT 116659198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCAATAAATCTGCAACTAAAACCATCCGTAAGTCCTAACAAGTTTCAATTTTTATCACGT 480

116659199 TAGTGTCTTTTAGTAGATAAACTTTGCTCTAGGTCACTATCCAAAAAACTTATGTGAGTT 116659258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TAGTGTCTTTTAGTAGATAAACTTTGCTCTAGGTCACTATCCAAAAAACTTATGTGAGTT 540

116659259 CTGTTGATTGTATCCTGCCTTTGTGTTCCTAAGAGTTGATTTGGGAAGCAAAATCCCCCA 116659318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTGTTGATTGTATCCTGCCTTTGTGTTCCTAAGAGTTGATTTGGGAAGCAAAATCCCCCA 600

116659319 AAAATCTATATTCTCAGGCCCATGGATAGTTAGAACGCAGGCTACAGATGTCAAACTCTC 116659378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAAATCTATATTCTCAGGCCCATGGATAGTTAGAACGCAGGCTACAGATGTCAAACTCTC 660

116659379 TAGTCAGGGGTCATGCCTAATAAAGTGCAGAAGGAATACATTGAACAGAATGTTATACAC 116659438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TAGTCAGGGGTCATGCCTAATAAAGTGCAGAAGGAATACATTGAACAGAATGTTATACAC 720

116659439 TTTTAGGGCGTTTTAAAATTTTTGGTCTAAGTCATGTCTCTAGCAGGCTAGACACCTGTT 116659498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTTTAGGGCGTTTTAAAATTTTTGGTCTAAGTCATGTCTCTAGCAGGCTAGACACCTGTT 780

116659499 CCAGATATGTATTCTTAATATAACAAAAATTATTTAAATATCTTACCATGTGTCACAGTT 116659558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CCAGATATGTATTCTTAATATAACAAAAATTATTTAAATATCTTACCATGTGTCACAGTT 840

116659559 ACATCAATAATATTTGGAATCATACTGGACCCTTTGAAAATTTTCAGTATGAGTAAAAAT 116659618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ACATCAATAATATTTGGAATCATACTGGACCCTTTGAAAATTTTCAGTATGAGTAAAAAT 900

116659619 GTTTATCTTAGAAGTAAGTGGAGGGGAAACATCCTTATTATTAAGTGCTAAGCCTTTTTA 116659678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GTTTATCTTAGAAGTAAGTGGAGGGGAAACATCCTTATTATTAAGTGCTAAGCCTTTTTA 960

116659679 AAATGGTCTATGAAGATTCTAAATAGACTTCTGATTCCAAAATACCTATAACAATGAAGT 116659738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AAATGGTCTATGAAGATTCTAAATAGACTTCTGATTCCAAAATACCTATAACAATGAAGT 1020

116659739 CTTTGGCCATGGCTAATTAAAAAAAAACATAAAACTCTAGAGACTGTCTCATTTATTAAT 116659798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTTTGGCCATGGCTAATTAAAAAAAAACATAAAACTCTAGAGACTGTCTCATTTATTAAT 1080

116659799 TTGCCAAATTCTTCTTTCTTTTAACATTTTCTTTATCCCACAGTATCTTTTCTTGCTTTT 116659858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTGCCAAATTCTTCTTTCTTTTAACATTTTCTTTATCCCACAGTATCTTTTCTTGCTTTT 1140

116659859 TGTGCTACCACACTATCAAATTTTACTCTTTTTCTCCCAAATTTCTTTTTCTAACCATCG 116659918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGTGCTACCACACTATCAAATTTTACTCTTTTTCTCCCAAATTTCTTTTTCTAACCATCG 1200

116659919 TCTTCCCCCTCTGATTGTATCTGAAAATAACCACTTGCTTTTCTTCTTTTTTCTTTTTCT 116659978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TCTTCCCCCTCTGATTGTATCTGAAAATAACCACTTGCTTTTCTTCTTTTTTCTTTTTCT 1260

116659979 TTTTCTTTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCT 116660038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTTTCTTTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCT 1320

116660039 TCCCTCTTTCCCTTTCCCTTTCTTTTCTTTTATTTTTTCTTCTCTCTTCTCTTCTCTTTT 116660098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TCCCTCTTTCCCTTTCCCTTTCTTTTCTTTTATTTTTTCTTCTCTCTTCTCTTCTCTTTT 1380

116660099 TCTGGGTTGCACTCTGTTACCCAAGCTTGAATGCAATGGCAGGGATCACAGCTTACTGCA 116660158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TCTGGGTTGCACTCTGTTACCCAAGCTTGAATGCAATGGCAGGGATCACAGCTTACTGCA 1440

116660159 GTGTCAACCTCCTGGGCTCAGGTGATCATCCTCCTTCAGCCTCCTGTGTAGCTAGGACTG 116660218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GTGTCAACCTCCTGGGCTCAGGTGATCATCCTCCTTCAGCCTCCTGTGTAGCTAGGACTG 1500

116660219 CAGGCATGTACCACCACACATGGCTAATTTTAGTATTTTTTGTAGAAATGAGAGTCTCAC 116660278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CAGGCATGTACCACCACACATGGCTAATTTTAGTATTTTTTGTAGAAATGAGAGTCTCAC 1560

116660279 TGTGTTGTCCAGGTTTGTCTCAAACTCCCAGGTTCAAGCAATCCACCTGCCTCAGCCTCT 116660338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TGTGTTGTCCAGGTTTGTCTCAAACTCCCAGGTTCAAGCAATCCACCTGCCTCAGCCTCT 1620

116660339 CAAACTGCTGGGATTATAGGCATGTGCCACCATGCTGGGCCTCAAATTGACATTTTCTTA 116660398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CAAACTGCTGGGATTATAGGCATGTGCCACCATGCTGGGCCTCAAATTGACATTTTCTTA 1680

116660399 AAAATTGGACTGCCAAACAAGGACATTAGCCCTAGTAGGCAGAAGATACTATCTTGGTCT 116660458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AAAATTGGACTGCCAAACAAGGACATTAGCCCTAGTAGGCAGAAGATACTATCTTGGTCT 1740

116660459 GTGTTAGAGGCAATTGTTGAAATTTCTCTGAATCTCTATGGGATAGGCATAAATGTACTG 116660518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GTGTTAGAGGCAATTGTTGAAATTTCTCTGAATCTCTATGGGATAGGCATAAATGTACTG 1800

116660519 ATAAATTTGAGCAGTCCTGGGAATCCATAATCTCAATTTATTTGACCAATATCAATTAAT 116660578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ATAAATTTGAGCAGTCCTGGGAATCCATAATCTCAATTTATTTGACCAATATCAATTAAT 1860

116660579 ACCATGTTGAGAGGTCCTTCTATTTCTGAAGTCTGGTTCAGCAAAAAATAAAAAAAAAAA 116660638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ACCATGTTGAGAGGTCCTTCTATTTCTGAAGTCTGGTTCAGCAAAAAATAAAAAAAAAAA 1920

116660639 TAAAATACCTGAAATAATGTAGCTATTCCTGAGGTATCATTAACAGAATAGAAACTTAAA 116660698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TAAAATACCTGAAATAATGTAGCTATTCCTGAGGTATCATTAACAGAATAGAAACTTAAA 1980

116660699 AAGCGCATGATATGGAAAAATCTTTGCTGATGGTTATACATGTTAAGTTTCCAGATAACT 116660758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AAGCGCATGATATGGAAAAATCTTTGCTGATGGTTATACATGTTAAGTTTCCAGATAACT 2040

116660759 ATTAATTAGACTTGCAGACATAAAAGGCTGTACCAAGTGGATATTTTAGAGATAAATTTT 116660818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ATTAATTAGACTTGCAGACATAAAAGGCTGTACCAAGTGGATATTTTAGAGATAAATTTT 2100

116660819 TAGCACTTACAGACAATATTATGAAGTAGCTATGTGGGCATAGAGAAATTCGGGAAATTA 116660878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TAGCACTTACAGACAATATTATGAAGTAGCTATGTGGGCATAGAGAAATTCGGGAAATTA 2160

116660879 GCAGGCTGGTTCTGCTATAATAGATCTCAGTTCACCCTTAGGATATCTTCACTAAAGGAG 116660938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GCAGGCTGGTTCTGCTATAATAGATCTCAGTTCACCCTTAGGATATCTTCACTAAAGGAG 2220

116660939 CTTAACATAGCCCAGATGGTAGATTTGATTGCCCTCATTAGAGCTGGTCACTTGGCCAAA 116660998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CTTAACATAGCCCAGATGGTAGATTTGATTGCCCTCATTAGAGCTGGTCACTTGGCCAAA 2280

116660999 GACAAAAAAAATTATATTTACACAGAAAATAGCTCAAGTACCTGAACCTCAGTATGACTA 116661058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GACAAAAAAAATTATATTTACACAGAAAATAGCTCAAGTACCTGAACCTCAGTATGACTA 2340

116661059 TATATGGGGATAGAGTCTTTAAGGAAGTGATTAAGGTTAAATAAAGTCATAATGATGGGG 116661118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TATATGGGGATAGAGTCTTTAAGGAAGTGATTAAGGTTAAATAAAGTCATAATGATGGGG 2400

116661119 CCCTAATCTGATAAGATTAGCGTCCTTCTAAGAGGAGGAATCAACATCAGGGATTTTTTT 116661178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CCCTAATCTGATAAGATTAGCGTCCTTCTAAGAGGAGGAATCAACATCAGGGATTTTTTT 2460

116661179 TTCTCTCAACCCATGCCCAGAGGAAAGTCATATGAGGACGTAACACAAAGAGAGACATCT 116661238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TTCTCTCAACCCATGCCCAGAGGAAAGTCATATGAGGACGTAACACAAAGAGAGACATCT 2520

116661239 ACAAATCACAGAGGTTGCACCAGAAATCAACCCTGCTAGCATATCGATCTTGAACTTCTA 116661298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 ACAAATCACAGAGGTTGCACCAGAAATCAACCCTGCTAGCATATCGATCTTGAACTTCTA 2580

116661299 GTCCCCAGAACTGTGAGGAAATAAATTTTTGTTGCTTATGCCACCAGATCTGTGACATTT 116661358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GTCCCCAGAACTGTGAGGAAATAAATTTTTGTTGCTTATGCCACCAGATCTGTGACATTT 2640

116661359 TGTTATGGAAGTCTGAGCTGACCAATACACTTGAATAACTATCAGTGTCAATGTAAAACA 116661418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TGTTATGGAAGTCTGAGCTGACCAATACACTTGAATAACTATCAGTGTCAATGTAAAACA 2700

116661419 AGCCATCTTTAGACTTAAGGAAACAGTCACCTGGCTCTCTAAGGCAGATGCAAATGGATT 116661478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AGCCATCTTTAGACTTAAGGAAACAGTCACCTGGCTCTCTAAGGCAGATGCAAATGGATT 2760

116661479 TTTCTTTGCCCGGGTTTAGTAATTCAGATTATGGCACTAAGTGTTTTGGGAAGGCTCCAT 116661538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TTTCTTTGCCCGGGTTTAGTAATTCAGATTATGGCACTAAGTGTTTTGGGAAGGCTCCAT 2820

116661539 GTCATTTTGATATAGTCACTGTGTGTTGCCATTCTTATGCATGTATTCTCCACAGTCTCA 116661598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GTCATTTTGATATAGTCACTGTGTGTTGCCATTCTTATGCATGTATTCTCCACAGTCTCA 2880

116661599 GTCCTGCTCTGCAGCTGCTCTCGTGTCAAATGATCCATCACTCAACGGAAATGAACTCAT 116661658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 GTCCTGCTCTGCAGCTGCTCTCGTGTCAAATGATCCATCACTCAACGGAAATGAACTCAT 2940

116661659 CACTCCATAAAAGGAATAGGAAGATCAGTCCATGATCCAATCCCAAACTATTTTTTCTGA 116661718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CACTCCATAAAAGGAATAGGAAGATCAGTCCATGATCCAATCCCAAACTATTTTTTCTGA 3000

116661719 GGATGATAATGTTATCTAGAAATCACAACAGTGGTATACATCTGAACATGGCTGCTTTAG 116661778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GGATGATAATGTTATCTAGAAATCACAACAGTGGTATACATCTGAACATGGCTGCTTTAG 3060

116661779 TAGCTGAACGACTCTTCTCATCTTCTCATCAGTTAGGAAAGACTGAGAACTGGTAGCATA 116661838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TAGCTGAACGACTCTTCTCATCTTCTCATCAGTTAGGAAAGACTGAGAACTGGTAGCATA 3120

116661839 AATCCATCAATTATGGGATTGCAATTGCAGAATGTTTTGTGACTCACATAATGTTTTCTT 116661898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 AATCCATCAATTATGGGATTGCAATTGCAGAATGTTTTGTGACTCACATAATGTTTTCTT 3180

116661899 CTTTACTCAGAACTTCTCTATTTCACAGATTCTCACCTTAATAATTGAAGCAACTCAGGG 116661958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 CTTTACTCAGAACTTCTCTATTTCACAGATTCTCACCTTAATAATTGAAGCAACTCAGGG 3240

116661959 TCACATCCTAGTTCTATAATTCTGCCTGAGGCACTCTGAGCCCAAACCATCAACAGGAAA 116662018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TCACATCCTAGTTCTATAATTCTGCCTGAGGCACTCTGAGCCCAAACCATCAACAGGAAA 3300

116662019 CAAACAAATAAAAAACCTGCTAATTTACTCTCCAATGAAACCTTTCCAGAATTATCTGTG 116662078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 CAAACAAATAAAAAACCTGCTAATTTACTCTCCAATGAAACCTTTCCAGAATTATCTGTG 3360

116662079 TAGAGTTTCCTATTGCTGCAATAATTAATAAACTCAGTTTGCTTATATTGCAAATTTTAA 116662138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TAGAGTTTCCTATTGCTGCAATAATTAATAAACTCAGTTTGCTTATATTGCAAATTTTAA 3420

116662139 AACTCGTAGTGGGAGATTTCCAGTTGCAAACAACAAGTCTTGGCTTTAATTATGAGTTCA 116662198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 AACTCGTAGTGGGAGATTTCCAGTTGCAAACAACAAGTCTTGGCTTTAATTATGAGTTCA 3480

116662199 ACCAGTTTTTTTTCTCCTAATGTTTTAAATCTCAGTTCATCATAATGTCTGAGCTTGTCT 116662258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 ACCAGTTTTTTTTCTCCTAATGTTTTAAATCTCAGTTCATCATAATGTCTGAGCTTGTCT 3540

116662259 GATTTTGGCATAGGGAATATAATTAGAAGTAGTGAATGAAGGCCTAGCTGTTGCTTTGAT 116662318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 GATTTTGGCATAGGGAATATAATTAGAAGTAGTGAATGAAGGCCTAGCTGTTGCTTTGAT 3600

116662319 GTCAGCAGACACCCATTTCTCTTTCCAAACTGCTTTTAAAAAGTCAAACAACTTCCTTCT 116662378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 GTCAGCAGACACCCATTTCTCTTTCCAAACTGCTTTTAAAAAGTCAAACAACTTCCTTCT 3660

116662379 CTTCTTGCCTCACTCTCTACTTAATGTGATTTTCTTTTAATTTATGAAGGAAATAAAATC 116662438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 CTTCTTGCCTCACTCTCTACTTAATGTGATTTTCTTTTAATTTATGAAGGAAATAAAATC 3720

116662439 ATTGCTTTTTAAGAATCATCCAACCAAGTCATTAAAGATATCTGGAATTCAAGATGTAGT 116662498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 ATTGCTTTTTAAGAATCATCCAACCAAGTCATTAAAGATATCTGGAATTCAAGATGTAGT 3780

116662499 CAAAATATTTCAAGGGCATTACAATATCCTCTGTCTTCTCTAATCTCTCAGGCAGTAAAA 116662558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 CAAAATATTTCAAGGGCATTACAATATCCTCTGTCTTCTCTAATCTCTCAGGCAGTAAAA 3840

116662559 CGGTACCAAGTGCAGAGATAGAAACACTGCTGTCAAAGTGGGTTAAAATCTTGACAGTAT 116662618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 CGGTACCAAGTGCAGAGATAGAAACACTGCTGTCAAAGTGGGTTAAAATCTTGACAGTAT 3900

116662619 CGTGGCTTCTGATTTTAATTTCTCAATTAACTTATACAAATGAATAACTACCGTTATAGA 116662678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 CGTGGCTTCTGATTTTAATTTCTCAATTAACTTATACAAATGAATAACTACCGTTATAGA 3960

116662679 AATAGCTTCTGGATTTCTTTGTCCTTTTTTTCCTGAAGTTAGGCTATATTTGGTATCTCT 116662738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 AATAGCTTCTGGATTTCTTTGTCCTTTTTTTCCTGAAGTTAGGCTATATTTGGTATCTCT 4020

116662739 ATAGAGATAGGCTATATTTGGTAAATCTGTTCTCACCTCACATAAAAGGTTAATATTCTA 116662798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 ATAGAGATAGGCTATATTTGGTAAATCTGTTCTCACCTCACATAAAAGGTTAATATTCTA 4080

116662799 CAAGTGGATAGATGTGGTGAGGACAACTAAAAGGAGATTGAATGATCTCATCAAATTATA 116662858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 CAAGTGGATAGATGTGGTGAGGACAACTAAAAGGAGATTGAATGATCTCATCAAATTATA 4140

116662859 TTACACAACCTTTCAAAGAAAGCTCAGTTGGATTAAGAGGTTTCTTTATGTTCATGCCCA 116662918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 TTACACAACCTTTCAAAGAAAGCTCAGTTGGATTAAGAGGTTTCTTTATGTTCATGCCCA 4200

116662919 AAATGCCAAATTCCAACAGCCCACAAAATTTCTTTGAAGTATTTTTCTCATACGTTTGTT 116662978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 AAATGCCAAATTCCAACAGCCCACAAAATTTCTTTGAAGTATTTTTCTCATACGTTTGTT 4260

116662979 TGATGAACAGCTTAAAGCTCCATTTCCATCCTAGCAAGTGGCAGACAAAAAGCCAGATAG 116663038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 TGATGAACAGCTTAAAGCTCCATTTCCATCCTAGCAAGTGGCAGACAAAAAGCCAGATAG 4320

116663039 TAAATCATATTTTAATAAAAATGATTTTAATAAGTGAAAGATATGATCCATTAAGTTAAT 116663098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 TAAATCATATTTTAATAAAAATGATTTTAATAAGTGAAAGATATGATCCATTAAGTTAAT 4380

116663099 CTTGTTAAGTAGAAGACCAAAATGAGAACTTAATGGGGTGCAAACATCACGGAGAATCAA 116663158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 CTTGTTAAGTAGAAGACCAAAATGAGAACTTAATGGGGTGCAAACATCACGGAGAATCAA 4440

116663159 AACACACACTAGAAACCATACTTGAGAACCAGAGATGAGTGAATGTTTGGTCATCAATAT 116663218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 AACACACACTAGAAACCATACTTGAGAACCAGAGATGAGTGAATGTTTGGTCATCAATAT 4500

116663219 CCATGCTAGCCTTAATCTTGTGGTTATCCCACCACATCCCCCTTTTCAACAGAAGTCAGT 116663278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 CCATGCTAGCCTTAATCTTGTGGTTATCCCACCACATCCCCCTTTTCAACAGAAGTCAGT 4560

116663279 GAGCAGCAAGCCTCATTGAATGTTGGATATTAGCAAGCACATGTAGTTTTGCTTCAAGTA 116663338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 GAGCAGCAAGCCTCATTGAATGTTGGATATTAGCAAGCACATGTAGTTTTGCTTCAAGTA 4620

116663339 CTCTTTATTTTCTTCCAATCCTCAGGGCCTTTCTCAACATATGGTTTATTATAGCGTTGT 116663398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 CTCTTTATTTTCTTCCAATCCTCAGGGCCTTTCTCAACATATGGTTTATTATAGCGTTGT 4680

116663399 GAATGATTGGTCTTTCATAAGGACATTTTCCTTGGCAGAAGGCTATTTGAAGTTCATTGC 116663458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 GAATGATTGGTCTTTCATAAGGACATTTTCCTTGGCAGAAGGCTATTTGAAGTTCATTGC 4740

116663459 TTTTACAAGGTAAGATTTCTGGAAGTTCTAAGCTATATAAATAGGTTTGGAGGAAC 116663514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 TTTTACAAGGTAAGATTTCTGGAAGTTCTAAGCTATATAAATAGGTTTGGAGGAAC 4796

EXCISED REGION

116663516 TTCTCTTAAACCACAGAAACTATTAATACTCTTGAGCAGGTGAGCTTATCAGATTCCTTA 116663575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4798 TTCTCTTAAACCACAGAAACTATTAATACTCTTGAGCAGGTGAGCTTATCAGATTCCTTA 4857

116663576 GTAGTCAACCAAAATGCTGAAGGATTTTTCTTTTTTTTTTT 116663616
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4858 GTAGTCAACCAAAATGCTGAAGGATTTTTCTTTTTTTTTTT 4898

Alignment time is 6.3163 s

