
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [109679900,109705214] =>     25315 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [        1,     6827] =>      6827 nucs 'mol-32-1e71-086790_6827'

Score:        6694
Aligned:      6826        nucs
Identic:      6814 (100%) nucs =>        83 (100%)      6731 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [109695137,109695219] EXCISED REGION [109695221,109701962]
 second seq =>  [        1,       83] EXCISED REGION [       85,     6827]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [109695220,109695220]
 second seq =>         1 nucs [84,84]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [147,147]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

109695137 CACAAAAAGGTGACCATGTGGGCCGGGCGCGTTGGTGCGCGCCTGTAATCCCAGCACTTT 109695196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CACAAAAAGGTGACCATGTGGGCCGGGCGCGTTGGTGCGCGCCTGTAATCCCAGCACTTT 60

109695197 GGGAGGCCAAGGCGGGCAGATCA 109695219
          |||||||||||||||||||||||
       61 GGGAGGCCAAGGCGGGCAGATCA 83

EXCISED REGION

109695221 GAGGTCAGGAGATCGAGACCATTCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATTTCAACTAAAAAT 109695280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       85 GAGGTCAGGAGATCGAGACCATTCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATTTCAACTAAAAAT 144

109695281 AC-AAAAAAAAAAAAAAAATAGCCGGGTGTGGTGGCACACACCCGTAGTCCCAGCTACTT 109695339
          || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      145 ACAAAAAAAAAAAAAAAAATAGCCGGGTGTGGTGGCACACACCCGTAGTCCCAGCTACTT 204

109695340 GGGAGGCTGGGGCAGGAGAATGGCATGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGA 109695399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      205 GGGAGGCTGGGGCAGGAGAATGGCATGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGA 264

109695400 TCGCACAATTGCTTTCCAGCCTGGGCAACGGAGCGAGACTCTGTTTCAAAAAAAAAGGTG 109695459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      265 TCGCACAATTGCTTTCCAGCCTGGGCAACGGAGCGAGACTCTGTTTCAAAAAAAAAGGTG 324

109695460 ACCATGTGAAGGGATGGATATGTTAAGTAGCTTGACTGGTAATCGGTTCACGATGTATAT 109695519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      325 ACCATGTGAAGGGATGGATATGTTAAGTAGCTTGACTGGTAATCGGTTCACGATGTATAT 384

109695520 GTACAGTTGACCCTTGAACAACATGCGTTTAAATTACAAGAGTCCACTTATATGGGGATT 109695579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      385 GTACAGTTGACCCTTGAACAACATGCGTTTAAATTACAAGAGTCCACTTATATGGGGATT 444

109695580 TTCTTCTGCCTCTGCCAGCAAGGCCAACCCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCCCCTCAACTAA 109695639
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      445 TTCTTCTGCCTTTGCCAGCAAGGCCAACCCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCCCCTCAACTAA 504

109695640 AGACGAGGAGGATGAGGACCTTTAGGGTGATCCACTTCCACTTAATGAATAGTAAATACG 109695699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      505 AGACGAGGAGGATGAGGACCTTTAGGGTGATCCACTTCCACTTAATGAATAGTAAATACG 564

109695700 GTTTCTCTTCCTTATGATTTTCTTAATATTTTCTTTTCCCTAACTTACTTTGTTGTAAGA 109695759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      565 GTTTCTCTTCCTTATGATTTTCTTAATATTTTCTTTTCCCTAACTTACTTTGTTGTAAGA 624

109695760 ATGCAGTACTCAATACACGTAAGATACAAAATTTGTATGAATTGACTGTTTGTGTTATCT 109695819
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      625 ATGCAGTACACAATACACGTAAGATACAAAATTTGTATGAATTGACTGTTTGTGTTATCT 684

109695820 GCAAGGCTTCCTGTCAACACTAGGGTATTAATAGTTAAGTTTTGGGGGAGTCAAAAGTTA 109695879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      685 GCAAGGCTTCCTGTCAACACTAGGGTATTAATAGTTAAGTTTTGGGGGAGTCAAAAGTTA 744

109695880 TTTGTGGATTTTTTACTGTTCGGGGAGTTGGTGCCCCTAACCCCTTCGTTGTTAAAGAGT 109695939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      745 TTTGTGGATTTTTTACTGTTCGGGGAGTTGGTGCCCCTAACCCCTTCGTTGTTAAAGAGT 804

109695940 CAACTGTATATCAAAACATCGTGCTGTATACCTTAAATGTATATACTTTCAATTAAAATA 109695999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      805 CAACTGTATATCAAAACATCGTGCTGTATACCTTAAATGTATATACTTTCAATTAAAATA 864

109696000 TTTTAAAAACAAACCAATAAAAAGGCACTGCTTCTGGCCCAGGGTGAGCCATCAGATGGC 109696059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      865 TTTTAAAAACAAACCAATAAAAAGGCACTGCTTCTGGCCCAGGGTGAGCCATCAGATGGC 924

109696060 ACAGCTGGCCCTGTCCGGTCCCAACCAGCAGAGGGGACTGTCAATTGAGAAGCTCCAGTG 109696119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      925 ACAGCTGGCCCTGTCCGGTCCCAACCAGCAGAGGGGACTGTCAATTGAGAAGCTCCAGTG 984

109696120 CTAAACGCTGGAATATGAAGATATGCATGGTGGGGAGACAGCACACACACACATAACACT 109696179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      985 CTAAACGCTGGAATATGAAGATATGCATGGTGGGGAGACAGCACACACACACATAACACT 1044

109696180 CAAGGCCTGGTGGAGCCCACCCAGCTCAGCCTGGGTTGGGGAGGCTCCCTGGGAAGGGGA 109696239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1045 CAAGGCCTGGTGGAGCCCACCCAGCTCAGCCTGGGTTGGGGAGGCTCCCTGGGAAGGGGA 1104

109696240 TTCCTGATGTGAGCCTTCCAGGAGGGGTAGGAATTCTCTACACAGACAGGTGGGAACTCC 109696299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1105 TTCCTGATGTGAGCCTTCCAGGAGGGGTAGGAATTCTCTACACAGACAGGTGGGAACTCC 1164

109696300 AGGCAGAGGGGAGGCCTGAAACACATCACAGGCCACCCTGTCCCTAGACTGCTGAGAGGC 109696359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1165 AGGCAGAGGGGAGGCCTGAAACACATCACAGGCCACCCTGTCCCTAGACTGCTGAGAGGC 1224

109696360 AGGACGGGGCTACACGGCCATGGGTGTGAGTCACCAAGGACCCTGTGCCTGCTGAGGCAT 109696419
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1225 AGGACGGGGCTACACGGCCATGGGCGTGAGTCACCAAGGACCCTGTGCCTGCTGAGGCAT 1284

109696420 GAGGACGCATTTCTGGGACGACAGAAAGACAGCAAAGGGCTTCAGACTATGGAATACCCG 109696479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1285 GAGGACGCATTTCTGGGACGACAGAAAGACAGCAAAGGGCTTCAGACTATGGAATACCCG 1344

109696480 GAATAGGGCTCTAAGCATCTCCTCCGATGATTGTGGACTCAATGCAGGAAATGTGGAGGC 109696539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1345 GAATAGGGCTCTAAGCATCTCCTCCGATGATTGTGGACTCAATGCAGGAAATGTGGAGGC 1404

109696540 TTCGAGCTAGACCAGTGACAGAGGAGGGAAAAGGAGATGGGGCCCATCAATATTTGAAAC 109696599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1405 TTCGAGCTAGACCAGTGACAGAGGAGGGAAAAGGAGATGGGGCCCATCAATATTTGAAAC 1464

109696600 TTGGCAAAACGCAGCAAGATTTTAATGGTTAATCAAAAATGGGAGGTGAATGGGAGAAAG 109696659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1465 TTGGCAAAACGCAGCAAGATTTTAATGGTTAATCAAAAATGGGAGGTGAATGGGAGAAAG 1524

109696660 AGGAGCTGACAACCACTCCCACAATTCTGGTTTCCAGGGCGTGTTATAGCTGAGAGGGCA 109696719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1525 AGGAGCTGACAACCACTCCCACAATTCTGGTTTCCAGGGCGTGTTATAGCTGAGAGGGCA 1584

109696720 GCAGTTTGAGTGGCTGGGCAGCAGAGGCTGGGGTTGAGGCTGGGAAGTGGCGGCAGCAGG 109696779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1585 GCAGTTTGAGTGGCTGGGCAGCAGAGGCTGGGGTTGAGGCTGGGAAGTGGCGGCAGCAGG 1644

109696780 GGAGACTGCCCCATCAGGAGCCTGCCATAAGCGTGGGATGCAGAAGGACTGGAAGGTGCT 109696839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1645 GGAGACTGCCCCATCAGGAGCCTGCCATAAGCGTGGGATGCAGAAGGACTGGAAGGTGCT 1704

109696840 GGAGGTGATGTGGAGCTTTGGGAGAGTGTCGGAGGGATGGAATAAGTTGATGCCTGTTCC 109696899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1705 GGAGGTGATGTGGAGCTTTGGGAGAGTGTCGGAGGGATGGAATAAGTTGATGCCTGTTCC 1764

109696900 GAGACCAAGAAGTGGGGAGCAACTGAAGAAACTGGAGAGTGGGAACCAGGTTGCAGCTGG 109696959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1765 GAGACCAAGAAGTGGGGAGCAACTGAAGAAACTGGAGAGTGGGAACCAGGTTGCAGCTGG 1824

109696960 TCTCCAGATGCTGCACTCTCTGACAGCTCTCATCTATCTCACTGTCACCCAGGATTGGAC 109697019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1825 TCTCCAGATGCTGCACTCTCTGACAGCTCTCATCTATCTCACTGTCACCCAGGATTGGAC 1884

109697020 AGGACATCTACAAATGTGCATGTGTATTTGCTATAAGGTGCATTCTTTTCCCCTGGAGAT 109697079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1885 AGGACATCTACAAATGTGCATGTGTATTTGCTATAAGGTGCATTCTTTTCCCCTGGAGAT 1944

109697080 AGTGACCAACCTTTCAAGAACTATTCTTGGGTATATTTTATCATTTCTTTATTTTAGTAT 109697139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1945 AGTGACCAACCTTTCAAGAACTATTCTTGGGTATATTTTATCATTTCTTTATTTTAGTAT 2004

109697140 CTATGAAGGGAACATTATAGAAGCCATGTTAACACTGGAGAAATGTCTAATATTAAAAAA 109697199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2005 CTATGAAGGGAACATTATAGAAGCCATGTTAACACTGGAGAAATGTCTAATATTAAAAAA 2064

109697200 CCAGTACTCTAGCAAGTAAAATTATGTATGTGTGTAACCTCGTTCCTACATCCAGGAAAT 109697259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2065 CCAGTACTCTAGCAAGTAAAATTATGTATGTGTGTAACCTCGTTCCTACATCCAGGAAAT 2124

109697260 CATTAAACTAGTAGGGGGTTGTATTAATTAGAACTCTCTGTTGCAAACAACAGACAGTCT 109697319
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     2125 CATTAAACTAGTAGGGGGTTGTATTAATCAGAACTCTCTGTTGCAAACAACAGACAGTCT 2184

109697320 GGATGATTTAAAAGGAACAGAAATGTATTAAGAGGATATTGGATAGTTCACAAAACCTCC 109697379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2185 GGATGATTTAAAAGGAACAGAAATGTATTAAGAGGATATTGGATAGTTCACAAAACCTCC 2244

109697380 AGGAGGGCTGGAGAGCCAGGCTGGATGCTGTGCCACTGACACAACATTCAAAACTCACAG 109697439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2245 AGGAGGGCTGGAGAGCCAGGCTGGATGCTGTGCCACTGACACAACATTCAAAACTCACAG 2304

109697440 ATTCTTCTGCTGCCATCCACTATGCTAGCTACCAGCCATGCATGGCCATGCAGCACTTGA 109697499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2305 ATTCTTCTGCTGCCATCCACTATGCTAGCTACCAGCCATGCATGGCCATGCAGCACTTGA 2364

109697500 TGTGTGCCTGCCCAACTGAGATGTGCTGCAGGTGCACAATACTCACTGGACTTCGAAGAC 109697559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2365 TGTGTGCCTGCCCAACTGAGATGTGCTGCAGGTGCACAATACTCACTGGACTTCGAAGAC 2424

109697560 TAAACGTGAAGAAAGGACATAAAATCTCACTCAGGTTAAAATGATATCTGCACACACTGG 109697619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2425 TAAACGTGAAGAAAGGACATAAAATCTCACTCAGGTTAAAATGATATCTGCACACACTGG 2484

109697620 GTATTAAGTAAAATACATTGAAATTAATTTCACTTGTTTCTTTTTGCTTTTTAAATGCAG 109697679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2485 GTATTAAGTAAAATACATTGAAATTAATTTCACTTGTTTCTTTTTGCTTTTTAAATGCAG 2544

109697680 TTACTAGAAAATTTTACATTACCTGTGGGAAATTGGCTCCACATCATTTCCTCTGTTTTC 109697739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2545 TTACTAGAAAATTTTACATTACCTGTGGGAAATTGGCTCCACATCATTTCCTCTGTTTTC 2604

109697740 TATTGATCGAATTGAGTCCTAAGGCCACATCTGATATTTGGGGGAAAGGAAATATACATC 109697799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2605 TATTGATCGAATTGAGTCCTAAGGCCACATCTGATATTTGGGGGAAAGGAAATATACATC 2664

109697800 ACCTCCAGATGGGGGCAGCCCCCCATGCAGGGATGGGGAGCTGCCCGAGGCTGTTTTTGG 109697859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2665 ACCTCCAGATGGGGGCAGCCCCCCATGCAGGGATGGGGAGCTGCCCGAGGCTGTTTTTGG 2724

109697860 AAACATCTGTGGTCCCCAACAACAGTGCTTCTGGCCTGTTTTTTCACATGGGGCTCCGCG 109697919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2725 AAACATCTGTGGTCCCCAACAACAGTGCTTCTGGCCTGTTTTTTCACATGGGGCTCCGCG 2784

109697920 TCTGTGGCTGACTCAATGCTGGGCTTGAGGTGGGGGTGACTGTCACATGACAGATTAGGT 109697979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2785 TCTGTGGCTGACTCAATGCTGGGCTTGAGGTGGGGGTGACTGTCACATGACAGATTAGGT 2844

109697980 CAAGCCTCCATCGTGCTCAGGGTTTATGAGACAGATCACAAGGGCCTCTGGGGACTGCCT 109698039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2845 CAAGCCTCCATCGTGCTCAGGGTTTATGAGACAGATCACAAGGGCCTCTGGGGACTGCCT 2904

109698040 GTCGCTTGTGGTCCTGGGGAACCAACCCCATGGTCAACTCCACCTCTGAACCTCTCCTGC 109698099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2905 GTCGCTTGTGGTCCTGGGGAACCAACCCCATGGTCAACTCCACCTCTGAACCTCTCCTGC 2964

109698100 AAGGGGCAAGAGCATCCTGGTAACCTTGCCCATCCTGACACCTGCTGTGGTAACTCATTC 109698159
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2965 AAGGGGCCAGAGCATCCTGGTAACCTTGCCCATCCTGACACCTGCTGTGGTAACTCATTC 3024

109698160 CCTGCTCTGGCACTTGAGCAACCCCTCGGCCCCACCATCCCAGGACTTCACAACCTGCCG 109698219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3025 CCTGCTCTGGCACTTGAGCAACCCCTCGGCCCCACCATCCCAGGACTTCACAACCTGCCG 3084

109698220 CCGCCAGGGAGCCCTTTTTGCAACCACAGTGCCTGGCAGCAGTGACATGGCTTGCAGAAA 109698279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3085 CCGCCAGGGAGCCCTTTTTGCAACCACAGTGCCTGGCAGCAGTGACATGGCTTGCAGAAA 3144

109698280 CACATCCTTGCTATTCAGTTGCACTTGCCAACGAGGCATCTTCTGGGGTCTTGTCGGGGA 109698339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3145 CACATCCTTGCTATTCAGTTGCACTTGCCAACGAGGCATCTTCTGGGGTCTTGTCGGGGA 3204

109698340 GATCACTGGGGGATGGCCAGCTGTTTTCATAGGAAAAGTCTGTCTGGTTCTTCATCTCCG 109698399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3205 GATCACTGGGGGATGGCCAGCTGTTTTCATAGGAAAAGTCTGTCTGGTTCTTCATCTCCG 3264

109698400 TATTTGTCCTCCACACTGCTCACTGCATTTCTGCATCCTGGCTTTGTGTGGGGCATGCTG 109698459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3265 TATTTGTCCTCCACACTGCTCACTGCATTTCTGCATCCTGGCTTTGTGTGGGGCATGCTG 3324

109698460 CTGTGGACTCCAGCATCTGTCAACCCAAATGCAAAGGCGGAGCCCACCTCGGCTGCAGGA 109698519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3325 CTGTGGACTCCAGCATCTGTCAACCCAAATGCAAAGGCGGAGCCCACCTCGGCTGCAGGA 3384

109698520 ACTGCCACACTGAAGTGCTCTACCCATGCTTCAGCTGCCTCCAGAATCCATTCCCATATG 109698579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3385 ACTGCCACACTGAAGTGCTCTACCCATGCTTCAGCTGCCTCCAGAATCCATTCCCATATG 3444

109698580 GGCTAACCAGATGTGTGCAGCTAATCAACAGTTAGCATTTCTGTCTTTGGATAGTAAGGA 109698639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3445 GGCTAACCAGATGTGTGCAGCTAATCAACAGTTAGCATTTCTGTCTTTGGATAGTAAGGA 3504

109698640 CTTCTGCTTCCAGACTTCAGATCTCTCCTTAGGTAGCAGCTCTGACCCAAGGTTAGGATT 109698699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3505 CTTCTGCTTCCAGACTTCAGATCTCTCCTTAGGTAGCAGCTCTGACCCAAGGTTAGGATT 3564

109698700 CCAGGACTCAGTCAGCTCCTGGTATTCCTTAGCACCCCTTTTTTATTTTATTTTATTTTA 109698759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3565 CCAGGACTCAGTCAGCTCCTGGTATTCCTTAGCACCCCTTTTTTATTTTATTTTATTTTA 3624

109698760 TTTATTTATTTTTTTGAGACAGAGTCTCTCTCTGTGGCCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGC 109698819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3625 TTTATTTATTTTTTTGAGACAGAGTCTCTCTCTGTGGCCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGC 3684

109698820 TATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCTTCCCGGGTTCACACCATTCTCCTGCCTCAGCCTC 109698879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3685 TATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCTTCCCGGGTTCACACCATTCTCCTGCCTCAGCCTC 3744

109698880 CCGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCATGCCACCACATCTGGCCAATTTTTGTATTTTTAGT 109698939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3745 CCGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCATGCCACCACATCTGGCCAATTTTTGTATTTTTAGT 3804

109698940 AGAGATGGGGTTTCACCATGCTGGACAGGCTAGTGTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCAC 109698999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3805 AGAGATGGGGTTTCACCATGCTGGACAGGCTAGTGTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCAC 3864

109699000 CTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACACCCGGCCTAGCA 109699059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3865 CTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACACCCGGCCTAGCA 3924

109699060 CCCCTTTTTAAAACAAAAAGTTTTTATCATGGTAATATATACAAAACATAAAATTTACCA 109699119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3925 CCCCTTTTTAAAACAAAAAGTTTTTATCATGGTAATATATACAAAACATAAAATTTACCA 3984

109699120 TTTTGAGCGGGCACAGTGGCCTATGCCTATGGTCCCAGGTACTTCAGAGGCTGAGGCAGG 109699179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3985 TTTTGAGCGGGCACAGTGGCCTATGCCTATGGTCCCAGGTACTTCAGAGGCTGAGGCAGG 4044

109699180 AAAACTCTGTGAGGTTGGGAGTTGGAGGCTGCAGTGCACTATGATGGCACCTGTAAATAA 109699239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4045 AAAACTCTGTGAGGTTGGGAGTTGGAGGCTGCAGTGCACTATGATGGCACCTGTAAATAA 4104

109699240 TGACTGCACTCCAGCCTGGACGACATATCAAGACCCCATGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTT 109699299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4105 TGACTGCACTCCAGCCTGGACGACATATCAAGACCCCATGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTT 4164

109699300 GAGACGGAGTCTCACTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCCATCTCAGCTCACTG 109699359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4165 GAGACGGAGTCTCACTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCCATCTCAGCTCACTG 4224

109699360 CAAGCTCCGCCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGAC 109699419
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4225 CAAGCTCCGTCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGAC 4284

109699420 TACAGGCATCTGCCACCATACCTGGCTAATTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTT 109699479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4285 TACAGGCATCTGCCACCATACCTGGCTAATTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTT 4344

109699480 CGCTATGTTAGCCAGGATGGTCTCAATCTCCTGACCACGTGATCCACCTGCCTCGGCCTC 109699539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4345 CGCTATGTTAGCCAGGATGGTCTCAATCTCCTGACCACGTGATCCACCTGCCTCGGCCTC 4404

109699540 CCAAAGTGCTAGAATTACAGGCATGAGCCACCATGCCCGGCCAAGACCCCATCTCTTAAA 109699599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4405 CCAAAGTGCTAGAATTACAGGCATGAGCCACCATGCCCGGCCAAGACCCCATCTCTTAAA 4464

109699600 GAAAATTACCATTTAAACCATTTTAAGCATACAGGTCAGTGGCATTAAGTACATTCACAT 109699659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4465 GAAAATTACCATTTAAACCATTTTAAGCATACAGGTCAGTGGCATTAAGTACATTCACAT 4524

109699660 TGTTGTACAACCATCACCACCATCCATCTCTATAACTCTTTGTACCTTCTCAGACTGAAA 109699719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4525 TGTTGTACAACCATCACCACCATCCATCTCTATAACTCTTTGTACCTTCTCAGACTGAAA 4584

109699720 CCCTGTACCCATCAAGCGCTAACTCCTCATTCTCTCCACCCACCACAGCCCCTGGCACCC 109699779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4585 CCCTGTACCCATCAAGCGCTAACTCCTCATTCTCTCCACCCACCACAGCCCCTGGCACCC 4644

109699780 ACTATTCTACTTTCTGTCTCTGTGAACTTGTCTTCCCTAAGTACCTCATATTAATGAAAC 109699839
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     4645 ACTATTCTACTTTCTGTCTCTGTGAACTTGACTTCCCTAAGTACCTCATATTAATGAAAC 4704

109699840 CACACAGTATTTGTCGTTTAGTGACCAGCTTATTTCCCAGAGCATCACGGCCTCCAGCTT 109699899
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     4705 CACACAGTATTTGTCGTTTAGTGACCAGCTTATTTCCCAGACCATCACGGCCTCCAGCTT 4764

109699900 CATCCATGCTGCAGCGTGTGTCAGAATTTCCTTTCTTTTTAAGACTGAATCATATCCATT 109699959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4765 CATCCATGCTGCAGCGTGTGTCAGAATTTCCTTTCTTTTTAAGACTGAATCATATCCATT 4824

109699960 GTATGGATGTAGCACACTTTCTTTATTCATTCATCCTCTGATGGACACTTGGGATGCACA 109700019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4825 GTATGGATGTAGCACACTTTCTTTATTCATTCATCCTCTGATGGACACTTGGGATGCACA 4884

109700020 CTCGGCTTGCTTCTGCCTCTTTGCTGTTGTGAATAACGTTGCTGTGAACATGGGTGTGCA 109700079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4885 CTCGGCTTGCTTCTGCCTCTTTGCTGTTGTGAATAACGTTGCTGTGAACATGGGTGTGCA 4944

109700080 AATATCTCTCGGGGACTCTGCTTTCAGTTCTTCTGGATATACTCAGAAGTGGGACTGCTG 109700139
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4945 AATATTTCTCGGGGACTCTGCTTTCAGTTCTTCTGGATATACTCAGAAGTGGGACTGCTG 5004

109700140 GATCATATGGTGATTCTATATTTAATTTGCTGCAGAACCACCATCCTGTTTTCTGCCGTG 109700199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5005 GATCATATGGTGATTCTATATTTAATTTGCTGCAGAACCACCATCCTGTTTTCTGCCGTG 5064

109700200 GCTGCACCCTCTTACATTCCCACCTGCAGTGCACAACACAGCACTCCTCTTTACCCAGTG 109700259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5065 GCTGCACCCTCTTACATTCCCACCTGCAGTGCACAACACAGCACTCCTCTTTACCCAGTG 5124

109700260 TCATCACCTCCCTTTCTCATTTTCCTTGGCAGCTTTTCCAAAACATTTTTCAATTTCCCT 109700319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5125 TCATCACCTCCCTTTCTCATTTTCCTTGGCAGCTTTTCCAAAACATTTTTCAATTTCCCT 5184

109700320 CGGCTTCTCTCCTATCTGCATACTCTCCCCTCCTGTGCCCCAAACCCCACCCGGTCCAGT 109700379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5185 CGGCTTCTCTCCTATCTGCATACTCTCCCCTCCTGTGCCCCAAACCCCACCCGGTCCAGT 5244

109700380 AGCCAATCAGCTGCATAGCAAGAGGCCTGCCAGCATGAGTGGTCTCCAGCGAGATCATGA 109700439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5245 AGCCAATCAGCTGCATAGCAAGAGGCCTGCCAGCATGAGTGGTCTCCAGCGAGATCATGA 5304

109700440 TTTACCTTGATCTTAAAGCTTTGTGTCACCCTTTCCCTCCAGATGTCCTAAAACTGACAC 109700499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5305 TTTACCTTGATCTTAAAGCTTTGTGTCACCCTTTCCCTCCAGATGTCCTAAAACTGACAC 5364

109700500 CAGCCAATTGCAAAGCCAATTGGTGTGGAACTTTAGGAGTTAGGTTCCTGGCACAGCTTC 109700559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5365 CAGCCAATTGCAAAGCCAATTGGTGTGGAACTTTAGGAGTTAGGTTCCTGGCACAGCTTC 5424

109700560 GCCTCCCCCAAGTAGCTCCATCCATGGCACCTTCTGCTGCCTCTCAAAACTCCTCCTTCT 109700619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5425 GCCTCCCCCAAGTAGCTCCATCCATGGCACCTTCTGCTGCCTCTCAAAACTCCTCCTTCT 5484

109700620 TTTTCTGGAGGAAAACCTACAATTCAAGATCTCCAACAGAAATTGAACTAACTAGGTACC 109700679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5485 TTTTCTGGAGGAAAACCTACAATTCAAGATCTCCAACAGAAATTGAACTAACTAGGTACC 5544

109700680 AGCATGGCCTATTTCTCCAACTTCAAGTTAACGTCAACCAAACTCATCTGGAATGTTGAG 109700739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5545 AGCATGGCCTATTTCTCCAACTTCAAGTTAACGTCAACCAAACTCATCTGGAATGTTGAG 5604

109700740 ACCGAAAAACATCTAGGAAAATCTTCACAGTGGTGAGAAGGGCGTTGGATATTTGGAGAC 109700799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5605 ACCGAAAAACATCTAGGAAAATCTTCACAGTGGTGAGAAGGGCGTTGGATATTTGGAGAC 5664

109700800 GGAGAACAAAGAAGACTGATTTTCAAGTGAGAAAGGCATCTACATTGACTGATAGCAGCT 109700859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5665 GGAGAACAAAGAAGACTGATTTTCAAGTGAGAAAGGCATCTACATTGACTGATAGCAGCT 5724

109700860 GTGACTCTTTCAGGACAGAGGCTGTTGCTGTAAGCACTGGATGATACTGGAGTGACATGA 109700919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5725 GTGACTCTTTCAGGACAGAGGCTGTTGCTGTAAGCACTGGATGATACTGGAGTGACATGA 5784

109700920 CAGGCCTGAGGAGCCCTCCCCTAGTCATTCAGATTCCTGGAAGTCTCTACAACAGGAGCT 109700979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5785 CAGGCCTGAGGAGCCCTCCCCTAGTCATTCAGATTCCTGGAAGTCTCTACAACAGGAGCT 5844

109700980 GGCCCAAGACCAGGTTGATGTTGGCAGTGACATTGCCATCTCTGTAGGATACTAGAGTGT 109701039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     5845 GGCCCAAGACCAGGTTGATGTTGGCAGTGACATTGCCATCTCTGTAGGATTCTAGAGTGT 5904

109701040 AGCCTCTTGTCTTTGCTTCTCAGAGGTGAAACAAGTGGAGTGACTCAGACTGCCAGGTTG 109701099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5905 AGCCTCTTGTCTTTGCTTCTCAGAGGTGAAACAAGTGGAGTGACTCAGACTGCCAGGTTG 5964

109701100 TGCCAGCTGGGGTCCAGGTTCGAAGGAGCTGAGACCTGTGAGGCTGTTAGGAACAACACA 109701159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5965 TGCCAGCTGGGGTCCAGGTTCGAAGGAGCTGAGACCTGTGAGGCTGTTAGGAACAACACA 6024

109701160 AAGGGCGTTCCTCATCCTGAGGACCAGGAGGAGAGGCACGCAGGACCCACCACTTGTCAG 109701219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6025 AAGGGCGTTCCTCATCCTGAGGACCAGGAGGAGAGGCACGCAGGACCCACCACTTGTCAG 6084

109701220 CAGAAATGACAGCATGAACACTGTGGACGCCACTCATATTTTGTTCGTTTTTTCCATCAA 109701279
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6085 CAGAAATGACAGCATGAACACTGCGGACGCCACTCATATTTTGTTCGTTTTTTCCATCAA 6144

109701280 GGAGCATGAACTTCAAATAGTGGAGGGCACTGCCAAGAGGAAACTGATGCCTACGGAGGG 109701339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6145 GGAGCATGAACTTCAAATAGTGGAGGGCACTGCCAAGAGGAAACTGATGCCTACGGAGGG 6204

109701340 AGGCAAGTTAGTTGCAGAGGGAATTTATCTCTGCAGGCCTTGGCAAATTACAGTCCAGCA 109701399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6205 AGGCAAGTTAGTTGCAGAGGGAATTTATCTCTGCAGGCCTTGGCAAATTACAGTCCAGCA 6264

109701400 TTTTGAGTGAATCTCTGTTGATAACACCTGAGCCTGACCTGGTGAACCTTGGGCAATGAC 109701459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6265 TTTTGAGTGAATCTCTGTTGATAACACCTGAGCCTGACCTGGTGAACCTTGGGCAATGAC 6324

109701460 AGAGCAGTTGCTCTCACTGCGGGGGACAGAGAATCATCTGCCTGTATTGCTGAACAACAC 109701519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6325 AGAGCAGTTGCTCTCACTGCGGGGGACAGAGAATCATCTGCCTGTATTGCTGAACAACAC 6384

109701520 GGGTCCACCTCCTGGCCGCCAGGTAAGACCTCCAAAGGAATAAGAGACTCCAGGAAGCCG 109701579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6385 GGGTCCACCTCCTGGCCGCCAGGTAAGACCTCCAAAGGAATAAGAGACTCCAGGAAGCCG 6444

109701580 AGGAGGACCGGGTTTGAGCCCTTCCTGCTTCGTTATGAGGGAGCTGAGCCCATTCCCGTT 109701639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6445 AGGAGGACCGGGTTTGAGCCCTTCCTGCTTCGTTATGAGGGAGCTGAGCCCATTCCCGTT 6504

109701640 TGAGAGGCTGTGCTACTCTTCTTTGAGCTCCACCACTCCATAGCAGGGGGCACATCAGTG 109701699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6505 TGAGAGGCTGTGCTACTCTTCTTTGAGCTCCACCACTCCATAGCAGGGGGCACATCAGTG 6564

109701700 ATCAGTTAATCCAGTTTTTGTATTGTGGTAAAATATGCATAACAAAGTTTACCATCAAAA 109701759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6565 ATCAGTTAATCCAGTTTTTGTATTGTGGTAAAATATGCATAACAAAGTTTACCATCAAAA 6624

109701760 CCATTTATTTATTTTTTTTAGATAGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGG 109701819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6625 CCATTTATTTATTTTTTTTAGATAGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGG 6684

109701820 CGCAATCTCGGCTCACTGCAATCTCCGCCTCCTGAGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGC 109701879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6685 CGCAATCTCGGCTCACTGCAATCTCCGCCTCCTGAGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGC 6744

109701880 CTCCCAAGTAGCTGGGCCTACACGCGCCCGCCACCACGCCTCGCTAATTTTTTGTACTTT 109701939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6745 CTCCCAAGTAGCTGGGCCTACACGCGCCCGCCACCACGCCTCGCTAATTTTTTGTACTTT 6804

109701940 TAGTAGAGATGGGATTTCACCAT 109701962
          |||||||||||||||||||||||
     6805 TAGTAGAGATGGGATTTCACCAT 6827

Alignment time is 6.15447 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [109679900,109705214] =>     25315 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [        1,     2861] =>      2861 nucs 'mol-32-1e87-166940_2861'

Score:        2806
Aligned:      2861        nucs
Identic:      2856 (100%) nucs =>       464 (100%)      2392 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [109694756,109695219] EXCISED REGION [109695221,109697617]
 second seq =>  [        1,      464] EXCISED REGION [      466,     2861]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [109695220,109695220]
 second seq =>         1 nucs [465,465]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [109695283,109695283]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

109694756 AGCGTGTATATATATATGCAGTGGAGTATTATTCAGCCTTAAAAAAGAAGGAAGTTATGC 109694815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGCGTGTATATATATATGCAGTGGAGTATTATTCAGCCTTAAAAAAGAAGGAAGTTATGC 60

109694816 CATTTGCAACAACGTGGGACATTATGCTAAGTGAAAAAGCCAGACACAAAAAGCAAATAT 109694875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CATTTGCAACAACGTGGGACATTATGCTAAGTGAAAAAGCCAGACACAAAAAGCAAATAT 120

109694876 CATATGATCTCACTTGTTTGTAGAGTCAATAAAAGATGAATACATAGAAGCAGAGAGTAG 109694935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CATATGATCTCACTTGTTTGTAGAGTCAATAAAAGATGAATACATAGAAGCAGAGAGTAG 180

109694936 AATAATGGTTACCAGGGACAGGGGTGAGGTGAGGTGGGATGGGGGTAATTGTGGTGATGT 109694995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AATAATGGTTACCAGGGACAGGGGTGAGGTGAGGTGGGATGGGGGTAATTGTGGTGATGT 240

109694996 TGGTCAAAGGATATGAAGCTTCAGTTATGTAGGGTGGATAAGTTCTAGGGGTCTAAGGTA 109695055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGGTCAAAGGATATGAAGCTTCAGTTATGTAGGGTGGATAAGTTCTAGGGGTCTAAGGTA 300

109695056 AAGCATGAGGACTATGGTTAACAATACCCATGGCATATTTAAAATTTGCTAAGAGAGCAG 109695115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAGCATGAGGACTATGGTTAACAATACCCATGGCATATTTAAAATTTGCTAAGAGAGCAG 360

109695116 ATCCTAAGTATTCTCACCACACACAAAAAGGTGACCATGTGGGCCGGGCGCGTTGGTGCG 109695175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATCCTAAGTATTCTCACCACACACAAAAAGGTGACCATGTGGGCCGGGCGCGTTGGTGCG 420

109695176 CGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGGCAGATCA 109695219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGGCAGATCA 464

EXCISED REGION

109695221 GAGGTCAGGAGATCGAGACCATTCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATTTCAACTAAAAAT 109695280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      466 GAGGTCAGGAGATCGAGACCATTCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATTTCAACTAAAAAT 525

109695281 ACAAAAAAAAAAAAAAAATAGCCGGGTGTGGTGGCACACACCCGTAGTCCCAGCTACTTG 109695340
          || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      526 AC-AAAAAAAAAAAAAAATAGCCGGGTGTGGTGGCACACACCCGTAGTCCCAGCTACTTG 584

109695341 GGAGGCTGGGGCAGGAGAATGGCATGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGAT 109695400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      585 GGAGGCTGGGGCAGGAGAATGGCATGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGAT 644

109695401 CGCACAATTGCTTTCCAGCCTGGGCAACGGAGCGAGACTCTGTTTCAAAAAAAAAGGTGA 109695460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      645 CGCACAATTGCTTTCCAGCCTGGGCAACGGAGCGAGACTCTGTTTCAAAAAAAAAGGTGA 704

109695461 CCATGTGAAGGGATGGATATGTTAAGTAGCTTGACTGGTAATCGGTTCACGATGTATATG 109695520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      705 CCATGTGAAGGGATGGATATGTTAAGTAGCTTGACTGGTAATCGGTTCACGATGTATATG 764

109695521 TACAGTTGACCCTTGAACAACATGCGTTTAAATTACAAGAGTCCACTTATATGGGGATTT 109695580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      765 TACAGTTGACCCTTGAACAACATGCGTTTAAATTACAAGAGTCCACTTATATGGGGATTT 824

109695581 TCTTCTGCCTCTGCCAGCAAGGCCAACCCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCCCCTCAACTAAA 109695640
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      825 TCTTCTGCCTTTGCCAGCAAGGCCAACCCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCCCCTCAACTAAA 884

109695641 GACGAGGAGGATGAGGACCTTTAGGGTGATCCACTTCCACTTAATGAATAGTAAATACGG 109695700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      885 GACGAGGAGGATGAGGACCTTTAGGGTGATCCACTTCCACTTAATGAATAGTAAATACGG 944

109695701 TTTCTCTTCCTTATGATTTTCTTAATATTTTCTTTTCCCTAACTTACTTTGTTGTAAGAA 109695760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      945 TTTCTCTTCCTTATGATTTTCTTAATATTTTCTTTTCCCTAACTTACTTTGTTGTAAGAA 1004

109695761 TGCAGTACTCAATACACGTAAGATACAAAATTTGTATGAATTGACTGTTTGTGTTATCTG 109695820
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1005 TGCAGTACACAATACACGTAAGATACAAAATTTGTATGAATTGACTGTTTGTGTTATCTG 1064

109695821 CAAGGCTTCCTGTCAACACTAGGGTATTAATAGTTAAGTTTTGGGGGAGTCAAAAGTTAT 109695880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1065 CAAGGCTTCCTGTCAACACTAGGGTATTAATAGTTAAGTTTTGGGGGAGTCAAAAGTTAT 1124

109695881 TTGTGGATTTTTTACTGTTCGGGGAGTTGGTGCCCCTAACCCCTTCGTTGTTAAAGAGTC 109695940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1125 TTGTGGATTTTTTACTGTTCGGGGAGTTGGTGCCCCTAACCCCTTCGTTGTTAAAGAGTC 1184

109695941 AACTGTATATCAAAACATCGTGCTGTATACCTTAAATGTATATACTTTCAATTAAAATAT 109696000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1185 AACTGTATATCAAAACATCGTGCTGTATACCTTAAATGTATATACTTTCAATTAAAATAT 1244

109696001 TTTAAAAACAAACCAATAAAAAGGCACTGCTTCTGGCCCAGGGTGAGCCATCAGATGGCA 109696060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1245 TTTAAAAACAAACCAATAAAAAGGCACTGCTTCTGGCCCAGGGTGAGCCATCAGATGGCA 1304

109696061 CAGCTGGCCCTGTCCGGTCCCAACCAGCAGAGGGGACTGTCAATTGAGAAGCTCCAGTGC 109696120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1305 CAGCTGGCCCTGTCCGGTCCCAACCAGCAGAGGGGACTGTCAATTGAGAAGCTCCAGTGC 1364

109696121 TAAACGCTGGAATATGAAGATATGCATGGTGGGGAGACAGCACACACACACATAACACTC 109696180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1365 TAAACGCTGGAATATGAAGATATGCATGGTGGGGAGACAGCACACACACACATAACACTC 1424

109696181 AAGGCCTGGTGGAGCCCACCCAGCTCAGCCTGGGTTGGGGAGGCTCCCTGGGAAGGGGAT 109696240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1425 AAGGCCTGGTGGAGCCCACCCAGCTCAGCCTGGGTTGGGGAGGCTCCCTGGGAAGGGGAT 1484

109696241 TCCTGATGTGAGCCTTCCAGGAGGGGTAGGAATTCTCTACACAGACAGGTGGGAACTCCA 109696300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1485 TCCTGATGTGAGCCTTCCAGGAGGGGTAGGAATTCTCTACACAGACAGGTGGGAACTCCA 1544

109696301 GGCAGAGGGGAGGCCTGAAACACATCACAGGCCACCCTGTCCCTAGACTGCTGAGAGGCA 109696360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1545 GGCAGAGGGGAGGCCTGAAACACATCACAGGCCACCCTGTCCCTAGACTGCTGAGAGGCA 1604

109696361 GGACGGGGCTACACGGCCATGGGTGTGAGTCACCAAGGACCCTGTGCCTGCTGAGGCATG 109696420
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1605 GGACGGGGCTACACGGCCATGGGCGTGAGTCACCAAGGACCCTGTGCCTGCTGAGGCATG 1664

109696421 AGGACGCATTTCTGGGACGACAGAAAGACAGCAAAGGGCTTCAGACTATGGAATACCCGG 109696480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1665 AGGACGCATTTCTGGGACGACAGAAAGACAGCAAAGGGCTTCAGACTATGGAATACCCGG 1724

109696481 AATAGGGCTCTAAGCATCTCCTCCGATGATTGTGGACTCAATGCAGGAAATGTGGAGGCT 109696540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1725 AATAGGGCTCTAAGCATCTCCTCCGATGATTGTGGACTCAATGCAGGAAATGTGGAGGCT 1784

109696541 TCGAGCTAGACCAGTGACAGAGGAGGGAAAAGGAGATGGGGCCCATCAATATTTGAAACT 109696600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1785 TCGAGCTAGACCAGTGACAGAGGAGGGAAAAGGAGATGGGGCCCATCAATATTTGAAACT 1844

109696601 TGGCAAAACGCAGCAAGATTTTAATGGTTAATCAAAAATGGGAGGTGAATGGGAGAAAGA 109696660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1845 TGGCAAAACGCAGCAAGATTTTAATGGTTAATCAAAAATGGGAGGTGAATGGGAGAAAGA 1904

109696661 GGAGCTGACAACCACTCCCACAATTCTGGTTTCCAGGGCGTGTTATAGCTGAGAGGGCAG 109696720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1905 GGAGCTGACAACCACTCCCACAATTCTGGTTTCCAGGGCGTGTTATAGCTGAGAGGGCAG 1964

109696721 CAGTTTGAGTGGCTGGGCAGCAGAGGCTGGGGTTGAGGCTGGGAAGTGGCGGCAGCAGGG 109696780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1965 CAGTTTGAGTGGCTGGGCAGCAGAGGCTGGGGTTGAGGCTGGGAAGTGGCGGCAGCAGGG 2024

109696781 GAGACTGCCCCATCAGGAGCCTGCCATAAGCGTGGGATGCAGAAGGACTGGAAGGTGCTG 109696840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2025 GAGACTGCCCCATCAGGAGCCTGCCATAAGCGTGGGATGCAGAAGGACTGGAAGGTGCTG 2084

109696841 GAGGTGATGTGGAGCTTTGGGAGAGTGTCGGAGGGATGGAATAAGTTGATGCCTGTTCCG 109696900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2085 GAGGTGATGTGGAGCTTTGGGAGAGTGTCGGAGGGATGGAATAAGTTGATGCCTGTTCCG 2144

109696901 AGACCAAGAAGTGGGGAGCAACTGAAGAAACTGGAGAGTGGGAACCAGGTTGCAGCTGGT 109696960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2145 AGACCAAGAAGTGGGGAGCAACTGAAGAAACTGGAGAGTGGGAACCAGGTTGCAGCTGGT 2204

109696961 CTCCAGATGCTGCACTCTCTGACAGCTCTCATCTATCTCACTGTCACCCAGGATTGGACA 109697020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2205 CTCCAGATGCTGCACTCTCTGACAGCTCTCATCTATCTCACTGTCACCCAGGATTGGACA 2264

109697021 GGACATCTACAAATGTGCATGTGTATTTGCTATAAGGTGCATTCTTTTCCCCTGGAGATA 109697080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2265 GGACATCTACAAATGTGCATGTGTATTTGCTATAAGGTGCATTCTTTTCCCCTGGAGATA 2324

109697081 GTGACCAACCTTTCAAGAACTATTCTTGGGTATATTTTATCATTTCTTTATTTTAGTATC 109697140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2325 GTGACCAACCTTTCAAGAACTATTCTTGGGTATATTTTATCATTTCTTTATTTTAGTATC 2384

109697141 TATGAAGGGAACATTATAGAAGCCATGTTAACACTGGAGAAATGTCTAATATTAAAAAAC 109697200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2385 TATGAAGGGAACATTATAGAAGCCATGTTAACACTGGAGAAATGTCTAATATTAAAAAAC 2444

109697201 CAGTACTCTAGCAAGTAAAATTATGTATGTGTGTAACCTCGTTCCTACATCCAGGAAATC 109697260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2445 CAGTACTCTAGCAAGTAAAATTATGTATGTGTGTAACCTCGTTCCTACATCCAGGAAATC 2504

109697261 ATTAAACTAGTAGGGGGTTGTATTAATTAGAACTCTCTGTTGCAAACAACAGACAGTCTG 109697320
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     2505 ATTAAACTAGTAGGGGGTTGTATTAATCAGAACTCTCTGTTGCAAACAACAGACAGTCTG 2564

109697321 GATGATTTAAAAGGAACAGAAATGTATTAAGAGGATATTGGATAGTTCACAAAACCTCCA 109697380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2565 GATGATTTAAAAGGAACAGAAATGTATTAAGAGGATATTGGATAGTTCACAAAACCTCCA 2624

109697381 GGAGGGCTGGAGAGCCAGGCTGGATGCTGTGCCACTGACACAACATTCAAAACTCACAGA 109697440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2625 GGAGGGCTGGAGAGCCAGGCTGGATGCTGTGCCACTGACACAACATTCAAAACTCACAGA 2684

109697441 TTCTTCTGCTGCCATCCACTATGCTAGCTACCAGCCATGCATGGCCATGCAGCACTTGAT 109697500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2685 TTCTTCTGCTGCCATCCACTATGCTAGCTACCAGCCATGCATGGCCATGCAGCACTTGAT 2744

109697501 GTGTGCCTGCCCAACTGAGATGTGCTGCAGGTGCACAATACTCACTGGACTTCGAAGACT 109697560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2745 GTGTGCCTGCCCAACTGAGATGTGCTGCAGGTGCACAATACTCACTGGACTTCGAAGACT 2804

109697561 AAACGTGAAGAAAGGACATAAAATCTCACTCAGGTTAAAATGATATCTGCACACACT 109697617
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2805 AAACGTGAAGAAAGGACATAAAATCTCACTCAGGTTAAAATGATATCTGCACACACT 2861

Alignment time is 2.61424 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [109679900,109705214] =>     25315 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [        1,     4459] =>      4459 nucs 'mol-32-1e87-167060_4459'

Score:        4426
Aligned:      4459        nucs
Identic:      4456 (100%) nucs =>       490 (100%)      3966 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [109686825,109687314] EXCISED REGION [109687317,109691284]
 second seq =>  [        1,      490] EXCISED REGION [      491,     4459]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [109687315,109687316]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        16 nucs [109687315,109687330] to [109687317,109687332]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [109687315,109687315] to [109687316,109687316]
 second seq =>         0 nucs

109686825 GGATTATAGTGGGGTGATATAGTTTGGACGTTTGTCCTCTCCAAATCTCGTGTTGAAATG 109686884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGATTATAGTGGGGTGATATAGTTTGGACGTTTGTCCTCTCCAAATCTCGTGTTGAAATG 60

109686885 TGATGCTCAGTGTTGGAGGTGGGGTCTGGTGGGAGGTGATTGGGTCGTGGAGCAGATCCT 109686944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGATGCTCAGTGTTGGAGGTGGGGTCTGGTGGGAGGTGATTGGGTCGTGGAGCAGATCCT 120

109686945 TCATGAATGGCTGCTGACATCATCTTGGTGGTGAGTGAGTTCTCAGTCTGGTAGTTCACA 109687004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCATGAATGGCTGCTGACATCATCTTGGTGGTGAGTGAGTTCTCAGTCTGGTAGTTCACA 180

109687005 TGAGATCTGCCTGTTTTAAAGAGTATGGTGGCCAAGTGCCGTGGCTCACGCCTGTGATCC 109687064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGAGATCTGCCTGTTTTAAAGAGTATGGTGGCCAAGTGCCGTGGCTCACGCCTGTGATCC 240

109687065 CAGCACTTTGGGAGGTAAAGGCAGGAGGATCACTTGAGCTCAGGAGTTCGACACTAGCCT 109687124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CAGCACTTTGGGAGGTAAAGGCAGGAGGATCACTTGAGCTCAGGAGTTCGACACTAGCCT 300

109687125 GGGAAACAGGGTGAAACCCATCTCTACTAAAAATAGAAATATTAGGCGGGTGTGATGGTG 109687184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GGGAAACAGGGTGAAACCCATCTCTACTAAAAATAGAAATATTAGGCGGGTGTGATGGTG 360

109687185 CGCTGCCTATAGTCCCAGCTACCGGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGA 109687244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CGCTGCCTATAGTCCCAGCTACCGGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGA 420

109687245 GGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAGCCA 109687304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAGCCA 480

109687305 GACCCTATCT 109687314
          ||||||||||
      481 GACCCTATCT 490

EXCISED REGION

109687317 AAAAAAAAAAAAAAAATAGAGTGCGGCACCCCTCCCTTCCCACTGTTGCTCCCTCTCTCG 109687376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      491 AAAAAAAAAAAAAAAATAGAGTGCGGCACCCCTCCCTTCCCACTGTTGCTCCCTCTCTCG 550

109687377 CCATGTGGGGCACGGGCTGCTCCTTCATCTTCCACCATTATTGTGAGCTTCCTGAGGCCT 109687436
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      551 CCATGTGGGGCATGGGCTGCTCCTTCATCTTCCACCATTATTGTGAGCTTCCTGAGGCCT 610

109687437 CACCAGGAGCAGATGTGAGCAAATTAAACCTCTTTTCTTTATAAATTACCCATATTTAGG 109687496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      611 CACCAGGAGCAGATGTGAGCAAATTAAACCTCTTTTCTTTATAAATTACCCATATTTAGG 670

109687497 TATTTATTTATAGCTACTACAAGGGGGAAAGGGAGAGCAGGGAGATCAGTGGTGCTTTCA 109687556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      671 TATTTATTTATAGCTACTACAAGGGGGAAAGGGAGAGCAGGGAGATCAGTGGTGCTTTCA 730

109687557 CACTAGTACAGCAATAGAGCAGCATCTTGGACCAGGGTGGTGGCTGAGGAGACAGGATCA 109687616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      731 CACTAGTACAGCAATAGAGCAGCATCTTGGACCAGGGTGGTGGCTGAGGAGACAGGATCA 790

109687617 TGGCTTTGAGATACATTCTGAAGAAGAAAAGTAGGCCTTGCTGATAGAATAGTCACAAAC 109687676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      791 TGGCTTTGAGATACATTCTGAAGAAGAAAAGTAGGCCTTGCTGATAGAATAGTCACAAAC 850

109687677 TGTAATGGAAAAGGTAAATTCAAGGATGTCTCCTGGGTTTTTGGCTTAAGCATCTGGATA 109687736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      851 TGTAATGGAAAAGGTAAATTCAAGGATGTCTCCTGGGTTTTTGGCTTAAGCATCTGGATA 910

109687737 CAGAGATATGGAAGACTGGGAGGGAAATGGGTTTGGAGTATACATGCATGCAATCAACAA 109687796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      911 CAGAGATATGGAAGACTGGGAGGGAAATGGGTTTGGAGTATACATGCATGCAATCAACAA 970

109687797 TTCTGTCTTGCATGTGTGAAATTTAGATACCCATTAGACATCTGCATAGAGGGCCAGGCA 109687856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      971 TTCTGTCTTGCATGTGTGAAATTTAGATACCCATTAGACATCTGCATAGAGGGCCAGGCA 1030

109687857 CAGTGGCTCACGGCAGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCGGATCACTTGAG 109687916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1031 CAGTGGCTCACGGCAGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCGGATCACTTGAG 1090

109687917 GTTAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACTCTGTCTCTACTAAAAATACA 109687976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1091 GTTAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACTCTGTCTCTACTAAAAATACA 1150

109687977 AAAATTATCTGGGTGTGGTGGTGTGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCA 109688036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1151 AAAATTATCTGGGTGTGGTGGTGTGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCA 1210

109688037 TGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGTAGAGGTTGCAGCGAGCCAAGATCACACCACTGCAC 109688096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1211 TGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGTAGAGGTTGCAGCGAGCCAAGATCACACCACTGCAC 1270

109688097 TCTAGCAAGGGTGACAAAGCAAGACTCTATCTCAAAAAAAAAAAGACATTTATGTAGAGA 109688156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1271 TCTAGCAAGGGTGACAAAGCAAGACTCTATCTCAAAAAAAAAAAGACATTTATGTAGAGA 1330

109688157 TGTTAGGTTGGCAGTTGGATAACAGTCTTGAGTTTCGGGGTGAGGGCAGGACCAGAAATG 109688216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1331 TGTTAGGTTGGCAGTTGGATAACAGTCTTGAGTTTCGGGGTGAGGGCAGGACCAGAAATG 1390

109688217 AAGATTTGGGATTCATTAGCATGTAGATCATATTCAGAGCCACAATAATAGATGAAATAA 109688276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1391 AAGATTTGGGATTCATTAGCATGTAGATCATATTCAGAGCCACAATAATAGATGAAATAA 1450

109688277 CTGAGGAAGAGAGCTAGAGGGGCCAAGAGCAAACACAGGAACATGCCAGCATTTAGAGGA 109688336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1451 CTGAGGAAGAGAGCTAGAGGGGCCAAGAGCAAACACAGGAACATGCCAGCATTTAGAGGA 1510

109688337 CAATGGAGAAGGAGGAGATGGCAGAGATGTCAATAGGAGGAAAAGCAAAAGGGTGTTATC 109688396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1511 CAATGGAGAAGGAGGAGATGGCAGAGATGTCAATAGGAGGAAAAGCAAAAGGGTGTTATC 1570

109688397 ATAGAAGGTGACAACAGAATATATCACAAAGAGGAATATGTTTGAATGTGTCAAATGTTG 109688456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1571 ATAGAAGGTGACAACAGAATATATCACAAAGAGGAATATGTTTGAATGTGTCAAATGTTG 1630

109688457 TTATCACAGGCTATAGAAGTAAACACAAAGTCTTATGGGAATACTGAGGATGAGCTGCCT 109688516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1631 TTATCACAGGCTATAGAAGTAAACACAAAGTCTTATGGGAATACTGAGGATGAGCTGCCT 1690

109688517 CTAGTGTGTGTGAAACCCTGGCCAAATATTTGTTGTGGGGCCCCTGTCTATATATGCAAT 109688576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1691 CTAGTGTGTGTGAAACCCTGGCCAAATATTTGTTGTGGGGCCCCTGTCTATATATGCAAT 1750

109688577 GTTATTTAAAAACATACTACATATTCTTGGGCTTATGTGGGATGTAGTGATTTATTGATG 109688636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1751 GTTATTTAAAAACATACTACATATTCTTGGGCTTATGTGGGATGTAGTGATTTATTGATG 1810

109688637 AAGACTTAGAATACTGGGTAGGAAGAGATGCTTTTGGATTTGTTTATGAGCCAGTGAGTG 109688696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1811 AAGACTTAGAATACTGGGTAGGAAGAGATGCTTTTGGATTTGTTTATGAGCCAGTGAGTG 1870

109688697 TATCTGAGGATTCTTTATCCTGTGTCTAATGTGAGTGTGTTTTCCTGAATCAGTGCATCA 109688756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1871 TATCTGAGGATTCTTTATCCTGTGTCTAATGTGAGTGTGTTTTCCTGAATCAGTGCATCA 1930

109688757 GTGCTATTCTGGAGGCCCAAATCACACATGATTCCGTGAAAGAAACTCTGTGCTGGCCAG 109688816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1931 GTGCTATTCTGGAGGCCCAAATCACACATGATTCCGTGAAAGAAACTCTGTGCTGGCCAG 1990

109688817 AGGATGCACTCACTCTCCAGGCTTTCCTGCATGGGCCCTCACCATGGAGTCCTGGATACT 109688876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1991 AGGATGCACTCACTCTCCAGGCTTTCCTGCATGGGCCCTCACCATGGAGTCCTGGATACT 2050

109688877 TAGGGCATCTGGTTGACCACATGCTTGGGAGAGCACCAAAGAAGGTCCTGGTTTTCAAGC 109688936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2051 TAGGGCATCTGGTTGACCACATGCTTGGGAGAGCACCAAAGAAGGTCCTGGTTTTCAAGC 2110

109688937 CTCCAGCTTCTCCTTAGAAAGAGTTGACTACCTGTCTGGGCTCCAACTTTTCTGGCTGCT 109688996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2111 CTCCAGCTTCTCCTTAGAAAGAGTTGACTACCTGTCTGGGCTCCAACTTTTCTGGCTGCT 2170

109688997 ACCAGAGGGTCTGGCCTCTAAACCATCTGTGTCAAAGAACTGACAGGGCCTGACATTCAC 109689056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2171 ACCAGAGGGTCTGGCCTCTAAACCATCTGTGTCAAAGAACTGACAGGGCCTGACATTCAC 2230

109689057 TGGGACCCTAGGCTAGGGGTGACAGAGAGCAAAGCAAAAGTTTGAAAGAGTATGCAGTCT 109689116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2231 TGGGACCCTAGGCTAGGGGTGACAGAGAGCAAAGCAAAAGTTTGAAAGAGTATGCAGTCT 2290

109689117 GAATGAGCATGCAGACCTTTGCCACAGCTCCCCTTCCCAGCTCAGTGCAGAGCAAGTAGG 109689176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2291 GAATGAGCATGCAGACCTTTGCCACAGCTCCCCTTCCCAGCTCAGTGCAGAGCAAGTAGG 2350

109689177 AGATAAACTTCTGCTCTTAGCTTCTCTGTGAGGAGAGATGAAATGGACCACACATCTAGC 109689236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2351 AGATAAACTTCTGCTCTTAGCTTCTCTGTGAGGAGAGATGAAATGGACCACACATCTAGC 2410

109689237 ACCCCAACTTTTCTGACAACTACTAGAAGGACTGACTCCTGACTCACCTGTCTCAGGGCA 109689296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2411 ACCCCAACTTTTCTGACAACTACTAGAAGGACTGACTCCTGACTCACCTGTCTCAGGGCA 2470

109689297 CTGATGGTACTTGGCACACTCTAGTCTCCTGGGGCCACCAAGAACAAGAACAGCATTTTG 109689356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2471 CTGATGGTACTTGGCACACTCTAGTCTCCTGGGGCCACCAAGAACAAGAACAGCATTTTG 2530

109689357 GACAAACACACTGGTTTGAGAGGCACCCAGACTCTCTGACTGGGCTGTGAGGAGGCTCAT 109689416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2531 GACAAACACACTGGTTTGAGAGGCACCCAGACTCTCTGACTGGGCTGTGAGGAGGCTCAT 2590

109689417 CTGTGAAGACTGAGGGAGGTGGCTGTTTTATCAAATGTGCAGAAACCAACACAGAGAGTC 109689476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2591 CTGTGAAGACTGAGGGAGGTGGCTGTTTTATCAAATGTGCAGAAACCAACACAGAGAGTC 2650

109689477 AAAGACAATGAACAAACAGGAAATATGCCATAAATAAAAGAACAAGATAAATCTTCAGAA 109689536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2651 AAAGACAATGAACAAACAGGAAATATGCCATAAATAAAAGAACAAGATAAATCTTCAGAA 2710

109689537 ACTGACCCAAACAGAATGGAGATATGTGATTTACCAGACAAAAAATCAAAAGACCTGTCA 109689596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2711 ACTGACCCAAACAGAATGGAGATATGTGATTTACCAGACAAAAAATCAAAAGACCTGTCA 2770

109689597 CAAAGATGCTCAGTGAGGTCAGGAGAGCAATGCATGAATAAAGTGAGAATTTCAACCAAA 109689656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2771 CAAAGATGCTCAGTGAGGTCAGGAGAGCAATGCATGAATAAAGTGAGAATTTCAACCAAA 2830

109689657 AAGGTAGAAAATATTAAAAAGTGCCAAACAGAAATCACGGAGCTGAAGAATATAATAAAA 109689716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2831 AAGGTAGAAAATATTAAAAAGTGCCAAACAGAAATCACGGAGCTGAAGAATATAATAAAA 2890

109689717 GAACAGAAAAATTTAATAGAGGGGTTCAATAGCAGACTAGGTGAACTGAAAGAAAGGATT 109689776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2891 GAACAGAAAAATTTAATAGAGGGGTTCAATAGCAGACTAGGTGAACTGAAAGAAAGGATT 2950

109689777 AGTGAACTCAAGGACTGGTCATTGGCAATCATTCAGTCACAGCATTAAAAAGAAAAAAGA 109689836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2951 AGTGAACTCAAGGACTGGTCATTGGCAATCATTCAGTCACAGCATTAAAAAGAAAAAAGA 3010

109689837 ATGAAGGGCCAGGCACAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCTGAGGTG 109689896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3011 ATGAAGGGCCAGGCACAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCTGAGGTG 3070

109689897 GGTGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATCTC 109689956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3071 GGTGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATCTC 3130

109689957 TACTAAAAATACAAAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCACGCACCTGTAATCCCAGCTACT 109690016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3131 TACTAAAAATACAAAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCACGCACCTGTAATCCCAGCTACT 3190

109690017 CGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTACTTGAACCTGGGAGGCTGAGGTTGCAGTGAGCTGAG 109690076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3191 CGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTACTTGAACCTGGGAGGCTGAGGTTGCAGTGAGCTGAG 3250

109690077 ATTGCGCCACTGCACTCAGGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTCTGTCTCAAAAGAAAAAAA 109690136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3251 ATTGCGCCACTGCACTCAGGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTCTGTCTCAAAAGAAAAAAA 3310

109690137 AAGAGAGAGAGAAGAAAAGAAAAAAGAATGAAAAACAGTGAAGATACCTTTAAAAACTAA 109690196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3311 AAGAGAGAGAGAAGAAAAGAAAAAAGAATGAAAAACAGTGAAGATACCTTTAAAAACTAA 3370

109690197 TGAACACCACCCAGCAGATCTACATATGCATTATGAGACACTCAGACATTATGATATCAG 109690256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3371 TGAACACCACCCAGCAGATCTACATATGCATTATGAGACACTCAGACATTATGATATCAG 3430

109690257 TAACACAGAATGTGGAATAAGGAGAGGTAAAATTGCAGAGTACTTCTATAGAAGTGTTAT 109690316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3431 TAACACAGAATGTGGAATAAGGAGAGGTAAAATTGCAGAGTACTTCTATAGAAGTGTTAT 3490

109690317 CAGTTTAACCTGTTATAAATATATGTTATGTAAGCCCCTGGTAACCACAAAGAAACTACC 109690376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3491 CAGTTTAACCTGTTATAAATATATGTTATGTAAGCCCCTGGTAACCACAAAGAAACTACC 3550

109690377 TATAGAAATGACACAAAAGAAAAAAAGTTACAAAGCCTATCAATGCAAAACAGCACAACA 109690436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     3551 TATAGAAATGACACAAAAGAAAAAAAGTTACAAAGCCTGTCAATGCAAAACAGCACAACA 3610

109690437 AAAACAGGCAAACAAAACCCAACAATAAAACACAAAGGAAGACAGCAAGAGAGAAAAAGA 109690496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3611 AAAACAGGCAAACAAAACCCAACAATAAAACACAAAGGAAGACAGCAAGAGAGAAAAAGA 3670

109690497 GGGACAAAAGAACTACAAGACAAACAGAAAACAGTTTTAAAAAAATGGCAATATGGTGGT 109690556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3671 GGGACAAAAGAACTACAAGACAAACAGAAAACAGTTTTAAAAAAATGGCAATATGGTGGT 3730

109690557 TCATACCTGTAATCCCAACACTTAGGAAGGCCGAGACGAGCAGATCACTTGAGGTCAGGA 109690616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3731 TCATACCTGTAATCCCAACACTTAGGAAGGCCGAGACGAGCAGATCACTTGAGGTCAGGA 3790

109690617 GTTTGAGACCAACCTGGCCAACATAGTGAAACCTGGTCTCTACTAGAAATACACAAAATT 109690676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3791 GTTTGAGACCAACCTGGCCAACATAGTGAAACCTGGTCTCTACTAGAAATACACAAAATT 3850

109690677 TAGCCAGGTGTAGTGGCAGGAGCCTGTAATCCAGCTACTCGGGAGGCTGAAGCACAAGAA 109690736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3851 TAGCCAGGTGTAGTGGCAGGAGCCTGTAATCCAGCTACTCGGGAGGCTGAAGCACAAGAA 3910

109690737 TTGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAACTGAGATTGTACCACTGCACTCCAGC 109690796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3911 TTGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAACTGAGATTGTACCACTGCACTCCAGC 3970

109690797 CTGGACAACAGAGCAAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAGGCAATACTAAATCTTGCCCTAT 109690856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3971 CTGGACAACAGAGCAAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAGGCAATACTAAATCTTGCCCTAT 4030

109690857 CAATAATTACTTAAAATGGCTGAATGTGGCGGCTTATGCCTGTAATCCCAGCACTCTGGG 109690916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4031 CAATAATTACTTAAAATGGCTGAATGTGGCGGCTTATGCCTGTAATCCCAGCACTCTGGG 4090

109690917 AGGCCAAGGCAGGTAGATCACTTGAGACCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGAT 109690976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4091 AGGCCAAGGCAGGTAGATCACTTGAGACCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGAT 4150

109690977 GAAGCCCCATCTCTACTAAAAAATACAAAAATTAGCAGGGTGTGGTGGCATGTGCCTGTA 109691036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4151 GAAGCCCCATCTCTACTAAAAAATACAAAAATTAGCAGGGTGTGGTGGCATGTGCCTGTA 4210

109691037 ATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGAGAATAGCTTGAACCTGGGAAGTGGAGGCAGC 109691096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4211 ATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGAGAATAGCTTGAACCTGGGAAGTGGAGGCAGC 4270

109691097 AGTGAGCCAAGATCACACCGCTAGACTCCAGGCTGGGCAACAGAGCAAGACTGCATCTCA 109691156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4271 AGTGAGCCAAGATCACACCGCTAGACTCCAGGCTGGGCAACAGAGCAAGACTGCATCTCA 4330

109691157 AATAATAATAATAATAATAGTAATAATTACTTAAAATGTAAATGGATTGGCCAGGTTCAT 109691216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4331 AATAATAATAATAATAATAGTAATAATTACTTAAAATGTAAATGGATTGGCCAGGTTCAT 4390

109691217 GCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCTGAGTCAGGAGGATCAC-GAGGTCAGGAGTTCA 109691275
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
     4391 GCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCTGAGTCAGGAGGATCACTGAGGTCAGGAGTTCA 4450

109691276 AGACCAGCC 109691284
          |||||||||
     4451 AGACCAGCC 4459

Alignment time is 4.00622 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [109679900,109705214] =>     25315 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [        1,     2184] =>      2184 nucs 'mol-32-1eea-048866_2184'

Score:        2172
Aligned:      2183        nucs
Identic:      2182 (100%) nucs =>       873 (100%)      1309 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [109689272,109690144] EXCISED REGION [109690146,109691455]
 second seq =>  [        1,      873] EXCISED REGION [      875,     2184]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [109690145,109690145]
 second seq =>         1 nucs [874,874]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [109690142,109690144] to [109690146,109690148]
 second seq =>         3 nucs [871,873] to [875,877]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

109689272 CTCCTGACTCACCTGTCTCAGGGCACTGATGGTACTTGGCACACTCTAGTCTCCTGGGGC 109689331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTCCTGACTCACCTGTCTCAGGGCACTGATGGTACTTGGCACACTCTAGTCTCCTGGGGC 60

109689332 CACCAAGAACAAGAACAGCATTTTGGACAAACACACTGGTTTGAGAGGCACCCAGACTCT 109689391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CACCAAGAACAAGAACAGCATTTTGGACAAACACACTGGTTTGAGAGGCACCCAGACTCT 120

109689392 CTGACTGGGCTGTGAGGAGGCTCATCTGTGAAGACTGAGGGAGGTGGCTGTTTTATCAAA 109689451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTGACTGGGCTGTGAGGAGGCTCATCTGTGAAGACTGAGGGAGGTGGCTGTTTTATCAAA 180

109689452 TGTGCAGAAACCAACACAGAGAGTCAAAGACAATGAACAAACAGGAAATATGCCATAAAT 109689511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGTGCAGAAACCAACACAGAGAGTCAAAGACAATGAACAAACAGGAAATATGCCATAAAT 240

109689512 AAAAGAACAAGATAAATCTTCAGAAACTGACCCAAACAGAATGGAGATATGTGATTTACC 109689571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAAAGAACAAGATAAATCTTCAGAAACTGACCCAAACAGAATGGAGATATGTGATTTACC 300

109689572 AGACAAAAAATCAAAAGACCTGTCACAAAGATGCTCAGTGAGGTCAGGAGAGCAATGCAT 109689631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGACAAAAAATCAAAAGACCTGTCACAAAGATGCTCAGTGAGGTCAGGAGAGCAATGCAT 360

109689632 GAATAAAGTGAGAATTTCAACCAAAAAGGTAGAAAATATTAAAAAGTGCCAAACAGAAAT 109689691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GAATAAAGTGAGAATTTCAACCAAAAAGGTAGAAAATATTAAAAAGTGCCAAACAGAAAT 420

109689692 CACGGAGCTGAAGAATATAATAAAAGAACAGAAAAATTTAATAGAGGGGTTCAATAGCAG 109689751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CACGGAGCTGAAGAATATAATAAAAGAACAGAAAAATTTAATAGAGGGGTTCAATAGCAG 480

109689752 ACTAGGTGAACTGAAAGAAAGGATTAGTGAACTCAAGGACTGGTCATTGGCAATCATTCA 109689811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACTAGGTGAACTGAAAGAAAGGATTAGTGAACTCAAGGACTGGTCATTGGCAATCATTCA 540

109689812 GTCACAGCATTAAAAAGAAAAAAGAATGAAGGGCCAGGCACAGTGGCTCACACCTGTAAT 109689871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GTCACAGCATTAAAAAGAAAAAAGAATGAAGGGCCAGGCACAGTGGCTCACACCTGTAAT 600

109689872 CCCAACACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCT 109689931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CCCAACACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCT 660

109689932 GGCTAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTAGCTGGGTGTGGTG 109689991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGCTAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTAGCTGGGTGTGGTG 720

109689992 GCACGCACCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTACTTGAACCTGG 109690051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GCACGCACCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTACTTGAACCTGG 780

109690052 GAGGCTGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCGCCACTGCACTCAGGCCTGGGCAACAGAGC 109690111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GAGGCTGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCGCCACTGCACTCAGGCCTGGGCAACAGAGC 840

109690112 GAGACTCTGTCTCAAAAGAAAAAAAAAGAGAGA 109690144
          |||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GAGACTCTGTCTCAAAAGAAAAAAAAAGAGAGA 873

EXCISED REGION

109690146 AGAAGAAAAGAAAAAAGAATGAAAAACAGTGAAGATACCTTTAAAAACTAATGAACACCA 109690205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      875 AGAAGAAAAGAAAAAAGAATGAAAAACAGTGAAGATACCTTTAAAAACTAATGAACACCA 934

109690206 CCCAGCAGATCTACATATGCATTATGAGACACTCAGACATTATGATATCAGTAACACAGA 109690265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      935 CCCAGCAGATCTACATATGCATTATGAGACACTCAGACATTATGATATCAGTAACACAGA 994

109690266 ATGTGGAATAAGGAGAGGTAAAATTGCAGAGTACTTCTATAGAAGTGTTATCAGTTTAAC 109690325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      995 ATGTGGAATAAGGAGAGGTAAAATTGCAGAGTACTTCTATAGAAGTGTTATCAGTTTAAC 1054

109690326 CTGTTATAAATATATGTTATGTAAGCCCCTGGTAACCACAAAGAAACTACCTATAGAAAT 109690385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1055 CTGTTATAAATATATGTTATGTAAGCCCCTGGTAACCACAAAGAAACTACCTATAGAAAT 1114

109690386 GACACAAAAGAAAAAAAGTTACAAAGCCTATCAATGCAAAACAGCACAACAAAAACAGGC 109690445
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     1115 GACACAAAAGAAAAAAAGTTACAAAGCCTGTCAATGCAAAACAGCACAACAAAAACAGGC 1174

109690446 AAACAAAACCCAACAATAAAACACAAAGGAAGACAGCAAGAGAGAAAAAGAGGGACAAAA 109690505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1175 AAACAAAACCCAACAATAAAACACAAAGGAAGACAGCAAGAGAGAAAAAGAGGGACAAAA 1234

109690506 GAACTACAAGACAAACAGAAAACAGTTTTAAAAAAATGGCAATATGGTGGTTCATACCTG 109690565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1235 GAACTACAAGACAAACAGAAAACAGTTTTAAAAAAATGGCAATATGGTGGTTCATACCTG 1294

109690566 TAATCCCAACACTTAGGAAGGCCGAGACGAGCAGATCACTTGAGGTCAGGAGTTTGAGAC 109690625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1295 TAATCCCAACACTTAGGAAGGCCGAGACGAGCAGATCACTTGAGGTCAGGAGTTTGAGAC 1354

109690626 CAACCTGGCCAACATAGTGAAACCTGGTCTCTACTAGAAATACACAAAATTTAGCCAGGT 109690685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1355 CAACCTGGCCAACATAGTGAAACCTGGTCTCTACTAGAAATACACAAAATTTAGCCAGGT 1414

109690686 GTAGTGGCAGGAGCCTGTAATCCAGCTACTCGGGAGGCTGAAGCACAAGAATTGCTTGAA 109690745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1415 GTAGTGGCAGGAGCCTGTAATCCAGCTACTCGGGAGGCTGAAGCACAAGAATTGCTTGAA 1474

109690746 CCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAACTGAGATTGTACCACTGCACTCCAGCCTGGACAAC 109690805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1475 CCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAACTGAGATTGTACCACTGCACTCCAGCCTGGACAAC 1534

109690806 AGAGCAAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAGGCAATACTAAATCTTGCCCTATCAATAATTA 109690865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1535 AGAGCAAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAGGCAATACTAAATCTTGCCCTATCAATAATTA 1594

109690866 CTTAAAATGGCTGAATGTGGCGGCTTATGCCTGTAATCCCAGCACTCTGGGAGGCCAAGG 109690925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1595 CTTAAAATGGCTGAATGTGGCGGCTTATGCCTGTAATCCCAGCACTCTGGGAGGCCAAGG 1654

109690926 CAGGTAGATCACTTGAGACCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGATGAAGCCCCA 109690985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1655 CAGGTAGATCACTTGAGACCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGATGAAGCCCCA 1714

109690986 TCTCTACTAAAAAATACAAAAATTAGCAGGGTGTGGTGGCATGTGCCTGTAATCCCAGCT 109691045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1715 TCTCTACTAAAAAATACAAAAATTAGCAGGGTGTGGTGGCATGTGCCTGTAATCCCAGCT 1774

109691046 ACTTGGGAGGCTGAGGCAGAGAATAGCTTGAACCTGGGAAGTGGAGGCAGCAGTGAGCCA 109691105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1775 ACTTGGGAGGCTGAGGCAGAGAATAGCTTGAACCTGGGAAGTGGAGGCAGCAGTGAGCCA 1834

109691106 AGATCACACCGCTAGACTCCAGGCTGGGCAACAGAGCAAGACTGCATCTCAAATAATAAT 109691165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1835 AGATCACACCGCTAGACTCCAGGCTGGGCAACAGAGCAAGACTGCATCTCAAATAATAAT 1894

109691166 AATAATAATAGTAATAATTACTTAAAATGTAAATGGATTGGCCAGGTTCATGCCTGTAAT 109691225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1895 AATAATAATAGTAATAATTACTTAAAATGTAAATGGATTGGCCAGGTTCATGCCTGTAAT 1954

109691226 CTCAGCACTTTGGGAGGCTGAGTCAGGAGGATCACGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCT 109691285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1955 CTCAGCACTTTGGGAGGCTGAGTCAGGAGGATCACGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCT 2014

109691286 GGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGT 109691345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2015 GGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGT 2074

109691346 GGGCACCTGTAGCCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTAACCGGGATC 109691405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2075 GGGCACCTGTAGCCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTAACCGGGATC 2134

109691406 CGGGAGGTGGAGATTGTAGTGAGCCGAGATCACACCACTGCACTCCAGCC 109691455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2135 CGGGAGGTGGAGATTGTAGTGAGCCGAGATCACACCACTGCACTCCAGCC 2184

Alignment time is 1.96148 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [109679900,109705214] =>     25315 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [        1,     4602] =>      4602 nucs 'mol-32-1f00-215771_4602'

Score:        4536
Aligned:      4602        nucs
Identic:      4596 (100%) nucs =>       843 (100%)      3753 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [109689057,109689900] EXCISED REGION [109695215,109698972]
 second seq =>  [        1,      844] EXCISED REGION [      845,     4602]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      5314 nucs [109689901,109695214]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        28 nucs [109689901,109689928] to [109695215,109695242]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [109689900,109689900] to [109695215,109695215]
 second seq =>         1 nucs [844,844] to [845,845]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

109689057 TGGGACCCTAGGCTAGGGGTGACAGAGAGCAAAGCAAAAGTTTGAAAGAGTATGCAGTCT 109689116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGGGACCCTAGGCTAGGGGTGACAGAGAGCAAAGCAAAAGTTTGAAAGAGTATGCAGTCT 60

109689117 GAATGAGCATGCAGACCTTTGCCACAGCTCCCCTTCCCAGCTCAGTGCAGAGCAAGTAGG 109689176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAATGAGCATGCAGACCTTTGCCACAGCTCCCCTTCCCAGCTCAGTGCAGAGCAAGTAGG 120

109689177 AGATAAACTTCTGCTCTTAGCTTCTCTGTGAGGAGAGATGAAATGGACCACACATCTAGC 109689236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGATAAACTTCTGCTCTTAGCTTCTCTGTGAGGAGAGATGAAATGGACCACACATCTAGC 180

109689237 ACCCCAACTTTTCTGACAACTACTAGAAGGACTGACTCCTGACTCACCTGTCTCAGGGCA 109689296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACCCCAACTTTTCTGACAACTACTAGAAGGACTGACTCCTGACTCACCTGTCTCAGGGCA 240

109689297 CTGATGGTACTTGGCACACTCTAGTCTCCTGGGGCCACCAAGAACAAGAACAGCATTTTG 109689356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTGATGGTACTTGGCACACTCTAGTCTCCTGGGGCCACCAAGAACAAGAACAGCATTTTG 300

109689357 GACAAACACACTGGTTTGAGAGGCACCCAGACTCTCTGACTGGGCTGTGAGGAGGCTCAT 109689416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GACAAACACACTGGTTTGAGAGGCACCCAGACTCTCTGACTGGGCTGTGAGGAGGCTCAT 360

109689417 CTGTGAAGACTGAGGGAGGTGGCTGTTTTATCAAATGTGCAGAAACCAACACAGAGAGTC 109689476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTGTGAAGACTGAGGGAGGTGGCTGTTTTATCAAATGTGCAGAAACCAACACAGAGAGTC 420

109689477 AAAGACAATGAACAAACAGGAAATATGCCATAAATAAAAGAACAAGATAAATCTTCAGAA 109689536
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
      421 AAAGACAATGAACAAACAGGAAATATGCCATAAATAAAAGAACAAGATAAAACTTCAGAA 480

109689537 ACTGACCCAAACAGAATGGAGATATGTGATTTACCAGACAAAAAATCAAAAGACCTGTCA 109689596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACTGACCCAAACAGAATGGAGATATGTGATTTACCAGACAAAAAATCAAAAGACCTGTCA 540

109689597 CAAAGATGCTCAGTGAGGTCAGGAGAGCAATGCATGAATAAAGTGAGAATTTCAACCAAA 109689656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CAAAGATGCTCAGTGAGGTCAGGAGAGCAATGCATGAATAAAGTGAGAATTTCAACCAAA 600

109689657 AAGGTAGAAAATATTAAAAAGTGCCAAACAGAAATCACGGAGCTGAAGAATATAATAAAA 109689716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAGGTAGAAAATATTAAAAAGTGCCAAACAGAAATCACGGAGCTGAAGAATATAATAAAA 660

109689717 GAACAGAAAAATTTAATAGAGGGGTTCAATAGCAGACTAGGTGAACTGAAAGAAAGGATT 109689776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GAACAGAAAAATTTAATAGAGGGGTTCAATAGCAGACTAGGTGAACTGAAAGAAAGGATT 720

109689777 AGTGAACTCAAGGACTGGTCATTGGCAATCATTCAGTCACAGCATTAAAAAGAAAAAAGA 109689836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGTGAACTCAAGGACTGGTCATTGGCAATCATTCAGTCACAGCATTAAAAAGAAAAAAGA 780

109689837 ATGAAGGGCCAGGCACAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCTGAGGTG 109689896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATGAAGGGCCAGGCACAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCTGAGGTG 840

109689897 GGTG 109689900
          ||||
      841 GGTG 844

EXCISED REGION

109695215 GATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATTCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATTTCAACT 109695274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      845 GATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATTCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATTTCAACT 904

109695275 AAAAATACAAAAAAAAAAAAAAAATAGCCGGGTGTGGTGGCACACACCCGTAGTCCCAGC 109695334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      905 AAAAATACAAAAAAAAAAAAAAAATAGCCGGGTGTGGTGGCACACACCCGTAGTCCCAGC 964

109695335 TACTTGGGAGGCTGGGGCAGGAGAATGGCATGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGC 109695394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      965 TACTTGGGAGGCTGGGGCAGGAGAATGGCATGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGC 1024

109695395 CGAGATCGCACAATTGCTTTCCAGCCTGGGCAACGGAGCGAGACTCTGTTTCAAAAAAAA 109695454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1025 CGAGATCGCACAATTGCTTTCCAGCCTGGGCAACGGAGCGAGACTCTGTTTCAAAAAAAA 1084

109695455 AGGTGACCATGTGAAGGGATGGATATGTTAAGTAGCTTGACTGGTAATCGGTTCACGATG 109695514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1085 AGGTGACCATGTGAAGGGATGGATATGTTAAGTAGCTTGACTGGTAATCGGTTCACGATG 1144

109695515 TATATGTACAGTTGACCCTTGAACAACATGCGTTTAAATTACAAGAGTCCACTTATATGG 109695574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1145 TATATGTACAGTTGACCCTTGAACAACATGCGTTTAAATTACAAGAGTCCACTTATATGG 1204

109695575 GGATTTTCTTCTGCCTCTGCCAGCAAGGCCAACCCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCCCCTCA 109695634
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1205 GGATTTTCTTCTGCCTTTGCCAGCAAGGCCAACCCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCCCCTCA 1264

109695635 ACTAAAGACGAGGAGGATGAGGACCTTTAGGGTGATCCACTTCCACTTAATGAATAGTAA 109695694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1265 ACTAAAGACGAGGAGGATGAGGACCTTTAGGGTGATCCACTTCCACTTAATGAATAGTAA 1324

109695695 ATACGGTTTCTCTTCCTTATGATTTTCTTAATATTTTCTTTTCCCTAACTTACTTTGTTG 109695754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1325 ATACGGTTTCTCTTCCTTATGATTTTCTTAATATTTTCTTTTCCCTAACTTACTTTGTTG 1384

109695755 TAAGAATGCAGTACTCAATACACGTAAGATACAAAATTTGTATGAATTGACTGTTTGTGT 109695814
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1385 TAAGAATGCAGTACACAATACACGTAAGATACAAAATTTGTATGAATTGACTGTTTGTGT 1444

109695815 TATCTGCAAGGCTTCCTGTCAACACTAGGGTATTAATAGTTAAGTTTTGGGGGAGTCAAA 109695874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1445 TATCTGCAAGGCTTCCTGTCAACACTAGGGTATTAATAGTTAAGTTTTGGGGGAGTCAAA 1504

109695875 AGTTATTTGTGGATTTTTTACTGTTCGGGGAGTTGGTGCCCCTAACCCCTTCGTTGTTAA 109695934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1505 AGTTATTTGTGGATTTTTTACTGTTCGGGGAGTTGGTGCCCCTAACCCCTTCGTTGTTAA 1564

109695935 AGAGTCAACTGTATATCAAAACATCGTGCTGTATACCTTAAATGTATATACTTTCAATTA 109695994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1565 AGAGTCAACTGTATATCAAAACATCGTGCTGTATACCTTAAATGTATATACTTTCAATTA 1624

109695995 AAATATTTTAAAAACAAACCAATAAAAAGGCACTGCTTCTGGCCCAGGGTGAGCCATCAG 109696054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1625 AAATATTTTAAAAACAAACCAATAAAAAGGCACTGCTTCTGGCCCAGGGTGAGCCATCAG 1684

109696055 ATGGCACAGCTGGCCCTGTCCGGTCCCAACCAGCAGAGGGGACTGTCAATTGAGAAGCTC 109696114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1685 ATGGCACAGCTGGCCCTGTCCGGTCCCAACCAGCAGAGGGGACTGTCAATTGAGAAGCTC 1744

109696115 CAGTGCTAAACGCTGGAATATGAAGATATGCATGGTGGGGAGACAGCACACACACACATA 109696174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1745 CAGTGCTAAACGCTGGAATATGAAGATATGCATGGTGGGGAGACAGCACACACACACATA 1804

109696175 ACACTCAAGGCCTGGTGGAGCCCACCCAGCTCAGCCTGGGTTGGGGAGGCTCCCTGGGAA 109696234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1805 ACACTCAAGGCCTGGTGGAGCCCACCCAGCTCAGCCTGGGTTGGGGAGGCTCCCTGGGAA 1864

109696235 GGGGATTCCTGATGTGAGCCTTCCAGGAGGGGTAGGAATTCTCTACACAGACAGGTGGGA 109696294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1865 GGGGATTCCTGATGTGAGCCTTCCAGGAGGGGTAGGAATTCTCTACACAGACAGGTGGGA 1924

109696295 ACTCCAGGCAGAGGGGAGGCCTGAAACACATCACAGGCCACCCTGTCCCTAGACTGCTGA 109696354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1925 ACTCCAGGCAGAGGGGAGGCCTGAAACACATCACAGGCCACCCTGTCCCTAGACTGCTGA 1984

109696355 GAGGCAGGACGGGGCTACACGGCCATGGGTGTGAGTCACCAAGGACCCTGTGCCTGCTGA 109696414
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     1985 GAGGCAGGACGGGGCTACACGGCCATGGGCGTGAGTCACCAAGGACCCTGTGCCTGCTGA 2044

109696415 GGCATGAGGACGCATTTCTGGGACGACAGAAAGACAGCAAAGGGCTTCAGACTATGGAAT 109696474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2045 GGCATGAGGACGCATTTCTGGGACGACAGAAAGACAGCAAAGGGCTTCAGACTATGGAAT 2104

109696475 ACCCGGAATAGGGCTCTAAGCATCTCCTCCGATGATTGTGGACTCAATGCAGGAAATGTG 109696534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2105 ACCCGGAATAGGGCTCTAAGCATCTCCTCCGATGATTGTGGACTCAATGCAGGAAATGTG 2164

109696535 GAGGCTTCGAGCTAGACCAGTGACAGAGGAGGGAAAAGGAGATGGGGCCCATCAATATTT 109696594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2165 GAGGCTTCGAGCTAGACCAGTGACAGAGGAGGGAAAAGGAGATGGGGCCCATCAATATTT 2224

109696595 GAAACTTGGCAAAACGCAGCAAGATTTTAATGGTTAATCAAAAATGGGAGGTGAATGGGA 109696654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2225 GAAACTTGGCAAAACGCAGCAAGATTTTAATGGTTAATCAAAAATGGGAGGTGAATGGGA 2284

109696655 GAAAGAGGAGCTGACAACCACTCCCACAATTCTGGTTTCCAGGGCGTGTTATAGCTGAGA 109696714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2285 GAAAGAGGAGCTGACAACCACTCCCACAATTCTGGTTTCCAGGGCGTGTTATAGCTGAGA 2344

109696715 GGGCAGCAGTTTGAGTGGCTGGGCAGCAGAGGCTGGGGTTGAGGCTGGGAAGTGGCGGCA 109696774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2345 GGGCAGCAGTTTGAGTGGCTGGGCAGCAGAGGCTGGGGTTGAGGCTGGGAAGTGGCGGCA 2404

109696775 GCAGGGGAGACTGCCCCATCAGGAGCCTGCCATAAGCGTGGGATGCAGAAGGACTGGAAG 109696834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2405 GCAGGGGAGACTGCCCCATCAGGAGCCTGCCATAAGCGTGGGATGCAGAAGGACTGGAAG 2464

109696835 GTGCTGGAGGTGATGTGGAGCTTTGGGAGAGTGTCGGAGGGATGGAATAAGTTGATGCCT 109696894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2465 GTGCTGGAGGTGATGTGGAGCTTTGGGAGAGTGTCGGAGGGATGGAATAAGTTGATGCCT 2524

109696895 GTTCCGAGACCAAGAAGTGGGGAGCAACTGAAGAAACTGGAGAGTGGGAACCAGGTTGCA 109696954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2525 GTTCCGAGACCAAGAAGTGGGGAGCAACTGAAGAAACTGGAGAGTGGGAACCAGGTTGCA 2584

109696955 GCTGGTCTCCAGATGCTGCACTCTCTGACAGCTCTCATCTATCTCACTGTCACCCAGGAT 109697014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2585 GCTGGTCTCCAGATGCTGCACTCTCTGACAGCTCTCATCTATCTCACTGTCACCCAGGAT 2644

109697015 TGGACAGGACATCTACAAATGTGCATGTGTATTTGCTATAAGGTGCATTCTTTTCCCCTG 109697074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2645 TGGACAGGACATCTACAAATGTGCATGTGTATTTGCTATAAGGTGCATTCTTTTCCCCTG 2704

109697075 GAGATAGTGACCAACCTTTCAAGAACTATTCTTGGGTATATTTTATCATTTCTTTATTTT 109697134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2705 GAGATAGTGACCAACCTTTCAAGAACTATTCTTGGGTATATTTTATCATTTCTTTATTTT 2764

109697135 AGTATCTATGAAGGGAACATTATAGAAGCCATGTTAACACTGGAGAAATGTCTAATATTA 109697194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2765 AGTATCTATGAAGGGAACATTATAGAAGCCATGTTAACACTGGAGAAATGTCTAATATTA 2824

109697195 AAAAACCAGTACTCTAGCAAGTAAAATTATGTATGTGTGTAACCTCGTTCCTACATCCAG 109697254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2825 AAAAACCAGTACTCTAGCAAGTAAAATTATGTATGTGTGTAACCTCGTTCCTACATCCAG 2884

109697255 GAAATCATTAAACTAGTAGGGGGTTGTATTAATTAGAACTCTCTGTTGCAAACAACAGAC 109697314
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     2885 GAAATCATTAAACTAGTAGGGGGTTGTATTAATCAGAACTCTCTGTTGCAAACAACAGAC 2944

109697315 AGTCTGGATGATTTAAAAGGAACAGAAATGTATTAAGAGGATATTGGATAGTTCACAAAA 109697374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2945 AGTCTGGATGATTTAAAAGGAACAGAAATGTATTAAGAGGATATTGGATAGTTCACAAAA 3004

109697375 CCTCCAGGAGGGCTGGAGAGCCAGGCTGGATGCTGTGCCACTGACACAACATTCAAAACT 109697434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3005 CCTCCAGGAGGGCTGGAGAGCCAGGCTGGATGCTGTGCCACTGACACAACATTCAAAACT 3064

109697435 CACAGATTCTTCTGCTGCCATCCACTATGCTAGCTACCAGCCATGCATGGCCATGCAGCA 109697494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3065 CACAGATTCTTCTGCTGCCATCCACTATGCTAGCTACCAGCCATGCATGGCCATGCAGCA 3124

109697495 CTTGATGTGTGCCTGCCCAACTGAGATGTGCTGCAGGTGCACAATACTCACTGGACTTCG 109697554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3125 CTTGATGTGTGCCTGCCCAACTGAGATGTGCTGCAGGTGCACAATACTCACTGGACTTCG 3184

109697555 AAGACTAAACGTGAAGAAAGGACATAAAATCTCACTCAGGTTAAAATGATATCTGCACAC 109697614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3185 AAGACTAAACGTGAAGAAAGGACATAAAATCTCACTCAGGTTAAAATGATATCTGCACAC 3244

109697615 ACTGGGTATTAAGTAAAATACATTGAAATTAATTTCACTTGTTTCTTTTTGCTTTTTAAA 109697674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3245 ACTGGGTATTAAGTAAAATACATTGAAATTAATTTCACTTGTTTCTTTTTGCTTTTTAAA 3304

109697675 TGCAGTTACTAGAAAATTTTACATTACCTGTGGGAAATTGGCTCCACATCATTTCCTCTG 109697734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3305 TGCAGTTACTAGAAAATTTTACATTACCTGTGGGAAATTGGCTCCACATCATTTCCTCTG 3364

109697735 TTTTCTATTGATCGAATTGAGTCCTAAGGCCACATCTGATATTTGGGGGAAAGGAAATAT 109697794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3365 TTTTCTATTGATCGAATTGAGTCCTAAGGCCACATCTGATATTTGGGGGAAAGGAAATAT 3424

109697795 ACATCACCTCCAGATGGGGGCAGCCCCCCATGCAGGGATGGGGAGCTGCCCGAGGCTGTT 109697854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3425 ACATCACCTCCAGATGGGGGCAGCCCCCCATGCAGGGATGGGGAGCTGCCCGAGGCTGTT 3484

109697855 TTTGGAAACATCTGTGGTCCCCAACAACAGTGCTTCTGGCCTGTTTTTTCACATGGGGCT 109697914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3485 TTTGGAAACATCTGTGGTCCCCAACAACAGTGCTTCTGGCCTGTTTTTTCACATGGGGCT 3544

109697915 CCGCGTCTGTGGCTGACTCAATGCTGGGCTTGAGGTGGGGGTGACTGTCACATGACAGAT 109697974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3545 CCGCGTCTGTGGCTGACTCAATGCTGGGCTTGAGGTGGGGGTGACTGTCACATGACAGAT 3604

109697975 TAGGTCAAGCCTCCATCGTGCTCAGGGTTTATGAGACAGATCACAAGGGCCTCTGGGGAC 109698034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3605 TAGGTCAAGCCTCCATCGTGCTCAGGGTTTATGAGACAGATCACAAGGGCCTCTGGGGAC 3664

109698035 TGCCTGTCGCTTGTGGTCCTGGGGAACCAACCCCATGGTCAACTCCACCTCTGAACCTCT 109698094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3665 TGCCTGTCGCTTGTGGTCCTGGGGAACCAACCCCATGGTCAACTCCACCTCTGAACCTCT 3724

109698095 CCTGCAAGGGGCAAGAGCATCCTGGTAACCTTGCCCATCCTGACACCTGCTGTGGTAACT 109698154
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3725 CCTGCAAGGGGCCAGAGCATCCTGGTAACCTTGCCCATCCTGACACCTGCTGTGGTAACT 3784

109698155 CATTCCCTGCTCTGGCACTTGAGCAACCCCTCGGCCCCACCATCCCAGGACTTCACAACC 109698214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3785 CATTCCCTGCTCTGGCACTTGAGCAACCCCTCGGCCCCACCATCCCAGGACTTCACAACC 3844

109698215 TGCCGCCGCCAGGGAGCCCTTTTTGCAACCACAGTGCCTGGCAGCAGTGACATGGCTTGC 109698274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3845 TGCCGCCGCCAGGGAGCCCTTTTTGCAACCACAGTGCCTGGCAGCAGTGACATGGCTTGC 3904

109698275 AGAAACACATCCTTGCTATTCAGTTGCACTTGCCAACGAGGCATCTTCTGGGGTCTTGTC 109698334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3905 AGAAACACATCCTTGCTATTCAGTTGCACTTGCCAACGAGGCATCTTCTGGGGTCTTGTC 3964

109698335 GGGGAGATCACTGGGGGATGGCCAGCTGTTTTCATAGGAAAAGTCTGTCTGGTTCTTCAT 109698394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3965 GGGGAGATCACTGGGGGATGGCCAGCTGTTTTCATAGGAAAAGTCTGTCTGGTTCTTCAT 4024

109698395 CTCCGTATTTGTCCTCCACACTGCTCACTGCATTTCTGCATCCTGGCTTTGTGTGGGGCA 109698454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4025 CTCCGTATTTGTCCTCCACACTGCTCACTGCATTTCTGCATCCTGGCTTTGTGTGGGGCA 4084

109698455 TGCTGCTGTGGACTCCAGCATCTGTCAACCCAAATGCAAAGGCGGAGCCCACCTCGGCTG 109698514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4085 TGCTGCTGTGGACTCCAGCATCTGTCAACCCAAATGCAAAGGCGGAGCCCACCTCGGCTG 4144

109698515 CAGGAACTGCCACACTGAAGTGCTCTACCCATGCTTCAGCTGCCTCCAGAATCCATTCCC 109698574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4145 CAGGAACTGCCACACTGAAGTGCTCTACCCATGCTTCAGCTGCCTCCAGAATCCATTCCC 4204

109698575 ATATGGGCTAACCAGATGTGTGCAGCTAATCAACAGTTAGCATTTCTGTCTTTGGATAGT 109698634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4205 ATATGGGCTAACCAGATGTGTGCAGCTAATCAACAGTTAGCATTTCTGTCTTTGGATAGT 4264

109698635 AAGGACTTCTGCTTCCAGACTTCAGATCTCTCCTTAGGTAGCAGCTCTGACCCAAGGTTA 109698694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4265 AAGGACTTCTGCTTCCAGACTTCAGATCTCTCCTTAGGTAGCAGCTCTGACCCAAGGTTA 4324

109698695 GGATTCCAGGACTCAGTCAGCTCCTGGTATTCCTTAGCACCCCTTTTTTATTTTATTTTA 109698754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4325 GGATTCCAGGACTCAGTCAGCTCCTGGTATTCCTTAGCACCCCTTTTTTATTTTATTTTA 4384

109698755 TTTTATTTATTTATTTTTTTGAGACAGAGTCTCTCTCTGTGGCCCAGGCTAGAGTGCAGT 109698814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4385 TTTTATTTATTTATTTTTTTGAGACAGAGTCTCTCTCTGTGGCCCAGGCTAGAGTGCAGT 4444

109698815 GGTGCTATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCTTCCCGGGTTCACACCATTCTCCTGCCTCA 109698874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4445 GGTGCTATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCTTCCCGGGTTCACACCATTCTCCTGCCTCA 4504

109698875 GCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCATGCCACCACATCTGGCCAATTTTTGTATTT 109698934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4505 GCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCATGCCACCACATCTGGCCAATTTTTGTATTT 4564

109698935 TTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGCTGGACAGGCTAG 109698972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4565 TTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGCTGGACAGGCTAG 4602

Alignment time is 4.171 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [109679900,109705214] =>     25315 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [        1,     4702] =>      4702 nucs 'mol-32-1f21-147611_4702'

Score:        4637
Aligned:      4703        nucs
Identic:      4697 (100%) nucs =>      2104 (100%)      2593 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [109687796,109689900] EXCISED REGION [109695215,109697812]
 second seq =>  [        1,     2105] EXCISED REGION [     2106,     4702]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      5314 nucs [109689901,109695214]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        28 nucs [109689901,109689928] to [109695215,109695242]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [109689900,109689900] to [109695215,109695215]
 second seq =>         1 nucs [2105,2105] to [2106,2106]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

109687796 ATTCTGTCTTGCATGTGTGAAATTTAGATACCCATTAGACATCTGCATAGAGGGCCAGGC 109687855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATTCTGTCTTGCATGTGTGAAATTTAGATACCCATTAGACATCTGCATAGAGGGCCAGGC 60

109687856 ACAGTGGCTCACGGCAGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCGGATCACTTGA 109687915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACAGTGGCTCACGGCAGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCGGATCACTTGA 120

109687916 GGTTAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACTCTGTCTCTACTAAAAATAC 109687975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGTTAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACTCTGTCTCTACTAAAAATAC 180

109687976 AAAAATTATCTGGGTGTGGTGGTGTGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGC 109688035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAAAATTATCTGGGTGTGGTGGTGTGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGC 240

109688036 ATGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGTAGAGGTTGCAGCGAGCCAAGATCACACCACTGCA 109688095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGTAGAGGTTGCAGCGAGCCAAGATCACACCACTGCA 300

109688096 CTCTAGCAAGGGTGACAAAGCAAGACTCTATCTCAAAAAAAAAAAGACATTTATGTAGAG 109688155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTCTAGCAAGGGTGACAAAGCAAGACTCTATCTCAAAAAAAAAAAGACATTTATGTAGAG 360

109688156 ATGTTAGGTTGGCAGTTGGATAACAGTCTTGAGTTTCGGGGTGAGGGCAGGACCAGAAAT 109688215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATGTTAGGTTGGCAGTTGGATAACAGTCTTGAGTTTCGGGGTGAGGGCAGGACCAGAAAT 420

109688216 GAAGATTTGGGATTCATTAGCATGTAGATCATATTCAGAGCCACAATAATAGATGAAATA 109688275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GAAGATTTGGGATTCATTAGCATGTAGATCATATTCAGAGCCACAATAATAGATGAAATA 480

109688276 ACTGAGGAAGAGAGCTAGAGGGGCCAAGAGCAAACACAGGAACATGCCAGCATTTAGAGG 109688335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACTGAGGAAGAGAGCTAGAGGGGCCAAGAGCAAACACAGGAACATGCCAGCATTTAGAGG 540

109688336 ACAATGGAGAAGGAGGAGATGGCAGAGATGTCAATAGGAGGAAAAGCAAAAGGGTGTTAT 109688395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACAATGGAGAAGGAGGAGATGGCAGAGATGTCAATAGGAGGAAAAGCAAAAGGGTGTTAT 600

109688396 CATAGAAGGTGACAACAGAATATATCACAAAGAGGAATATGTTTGAATGTGTCAAATGTT 109688455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CATAGAAGGTGACAACAGAATATATCACAAAGAGGAATATGTTTGAATGTGTCAAATGTT 660

109688456 GTTATCACAGGCTATAGAAGTAAACACAAAGTCTTATGGGAATACTGAGGATGAGCTGCC 109688515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GTTATCACAGGCTATAGAAGTAAACACAAAGTCTTATGGGAATACTGAGGATGAGCTGCC 720

109688516 TCTAGTGTGTGTGAAACCCTGGCCAAATATTTGTTGTGGGGCCCCTGTCTATATATGCAA 109688575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCTAGTGTGTGTGAAACCCTGGCCAAATATTTGTTGTGGGGCCCCTGTCTATATATGCAA 780

109688576 TGTTATTTAAAAACATACTACATATTCTTGGGCTTATGTGGGATGTAGTGATTTATTGAT 109688635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGTTATTTAAAAACATACTACATATTCTTGGGCTTATGTGGGATGTAGTGATTTATTGAT 840

109688636 GAAGACTTAGAATACTGGGTAGGAAGAGATGCTTTTGGATTTGTTTATGAGCCAGTGAGT 109688695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GAAGACTTAGAATACTGGGTAGGAAGAGATGCTTTTGGATTTGTTTATGAGCCAGTGAGT 900

109688696 GTATCTGAGGATTCTTTATCCTGTGTCTAATGTGAGTGTGTTTTCCTGAATCAGTGCATC 109688755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GTATCTGAGGATTCTTTATCCTGTGTCTAATGTGAGTGTGTTTTCCTGAATCAGTGCATC 960

109688756 AGTGCTATTCTGGAGGCCCAAATCACACATGATTCCGTGAAAGAAACTCTGTGCTGGCCA 109688815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AGTGCTATTCTGGAGGCCCAAATCACACATGATTCCGTGAAAGAAACTCTGTGCTGGCCA 1020

109688816 GAGGATGCACTCACTCTCCAGGCTTTCCTGCATGGGCCCTCACCATGGAGTCCTGGATAC 109688875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GAGGATGCACTCACTCTCCAGGCTTTCCTGCATGGGCCCTCACCATGGAGTCCTGGATAC 1080

109688876 TTAGGGCATCTGGTTGACCACATGCTTGGGAGAGCACCAAAGAAGGTCCTGGTTTTCAAG 109688935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTAGGGCATCTGGTTGACCACATGCTTGGGAGAGCACCAAAGAAGGTCCTGGTTTTCAAG 1140

109688936 CCTCCAGCTTCTCCTTAGAAAGAGTTGACTACCTGTCTGGGCTCCAACTTTTCTGGCTGC 109688995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CCTCCAGCTTCTCCTTAGAAAGAGTTGACTACCTGTCTGGGCTCCAACTTTTCTGGCTGC 1200

109688996 TACCAGAGGGTCTGGCCTCTAAACCATCTGTGTCAAAGAACTGACAGGGCCTGACATTCA 109689055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TACCAGAGGGTCTGGCCTCTAAACCATCTGTGTCAAAGAACTGACAGGGCCTGACATTCA 1260

109689056 CTGGGACCCTAGGCTAGGGGTGACAGAGAGCAAAGCAAAAGTTTGAAAGAGTATGCAGTC 109689115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTGGGACCCTAGGCTAGGGGTGACAGAGAGCAAAGCAAAAGTTTGAAAGAGTATGCAGTC 1320

109689116 TGAATGAGCATGCAGACCTTTGCCACAGCTCCCCTTCCCAGCTCAGTGCAGAGCAAGTAG 109689175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGAATGAGCATGCAGACCTTTGCCACAGCTCCCCTTCCCAGCTCAGTGCAGAGCAAGTAG 1380

109689176 GAGATAAACTTCTGCTCTTAGCTTCTCTGTGAGGAGAGATGAAATGGACCACACATCTAG 109689235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GAGATAAACTTCTGCTCTTAGCTTCTCTGTGAGGAGAGATGAAATGGACCACACATCTAG 1440

109689236 CACCCCAACTTTTCTGACAACTACTAGAAGGACTGACTCCTGACTCACCTGTCTCAGGGC 109689295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CACCCCAACTTTTCTGACAACTACTAGAAGGACTGACTCCTGACTCACCTGTCTCAGGGC 1500

109689296 ACTGATGGTACTTGGCACACTCTAGTCTCCTGGGGCCACCAAGAACAAGAACAGCATTTT 109689355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ACTGATGGTACTTGGCACACTCTAGTCTCCTGGGGCCACCAAGAACAAGAACAGCATTTT 1560

109689356 GGACAAACACACTGGTTTGAGAGGCACCCAGACTCTCTGACTGGGCTGTGAGGAGGCTCA 109689415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GGACAAACACACTGGTTTGAGAGGCACCCAGACTCTCTGACTGGGCTGTGAGGAGGCTCA 1620

109689416 TCTGTGAAGACTGAGGGAGGTGGCTGTTTTATCAAATGTGCAGAAACCAACACAGAGAGT 109689475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TCTGTGAAGACTGAGGGAGGTGGCTGTTTTATCAAATGTGCAGAAACCAACACAGAGAGT 1680

109689476 CAAAGACAATGAACAAACAGGAAATATGCCATAAATAAAAGAACAAGATAAATCTTCAGA 109689535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     1681 CAAAGACAATGAACAAACAGGAAATATGCCATAAATAAAAGAACAAGATAAAACTTCAGA 1740

109689536 AACTGACCCAAACAGAATGGAGATATGTGATTTACCAGACAAAAAATCAAAAGACCTGTC 109689595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AACTGACCCAAACAGAATGGAGATATGTGATTTACCAGACAAAAAATCAAAAGACCTGTC 1800

109689596 ACAAAGATGCTCAGTGAGGTCAGGAGAGCAATGCATGAATAAAGTGAGAATTTCAACCAA 109689655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ACAAAGATGCTCAGTGAGGTCAGGAGAGCAATGCATGAATAAAGTGAGAATTTCAACCAA 1860

109689656 AAAGGTAGAAAATATTAAAAAGTGCCAAACAGAAATCACGGAGCTGAAGAATATAATAAA 109689715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AAAGGTAGAAAATATTAAAAAGTGCCAAACAGAAATCACGGAGCTGAAGAATATAATAAA 1920

109689716 AGAACAGAAAAATTTAATAGAGGGGTTCAATAGCAGACTAGGTGAACTGAAAGAAAGGAT 109689775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AGAACAGAAAAATTTAATAGAGGGGTTCAATAGCAGACTAGGTGAACTGAAAGAAAGGAT 1980

109689776 TAGTGAACTCAAGGACTGGTCATTGGCAATCATTCAGTCACAGCATTAAAAAGAAAAAAG 109689835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TAGTGAACTCAAGGACTGGTCATTGGCAATCATTCAGTCACAGCATTAAAAAGAAAAAAG 2040

109689836 AATGAAGGGCCAGGCACAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCTGAGGT 109689895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AATGAAGGGCCAGGCACAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCTGAGGT 2100

109689896 GGGTG 109689900
          |||||
     2101 GGGTG 2105

EXCISED REGION

109695215 GATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATTCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATTTCAACT 109695274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2106 GATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATTCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATTTCAACT 2165

109695275 AAAAATACAAAAAAAAAAAAAAAATAGCCGGGTGTGGTGGCACACACCCGTAGTCCCAGC 109695334
          |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2166 AAAAATAC-AAAAAAAAAAAAAAATAGCCGGGTGTGGTGGCACACACCCGTAGTCCCAGC 2224

109695335 TACTTGGGAGGCTGGGGCAGGAGAATGGCATGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGC 109695394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2225 TACTTGGGAGGCTGGGGCAGGAGAATGGCATGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGC 2284

109695395 CGAGATCGCACAATTGCTTTCCAGCCTGGGCAACGGAGCGAGACTCTGTTTCAAAAAAAA 109695454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2285 CGAGATCGCACAATTGCTTTCCAGCCTGGGCAACGGAGCGAGACTCTGTTTCAAAAAAAA 2344

109695455 AGGTGACCATGTGAAGGGATGGATATGTTAAGTAGCTTGACTGGTAATCGGTTCACGATG 109695514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2345 AGGTGACCATGTGAAGGGATGGATATGTTAAGTAGCTTGACTGGTAATCGGTTCACGATG 2404

109695515 TATATGTACAGTTGACCCTTGAACAACATGCGTTTAAATTACAAGAGTCCACTTATATGG 109695574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2405 TATATGTACAGTTGACCCTTGAACAACATGCGTTTAAATTACAAGAGTCCACTTATATGG 2464

109695575 GGATTTTCTTCTGCCTCTGCCAGCAAGGCCAACCCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCCCCTCA 109695634
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2465 GGATTTTCTTCTGCCTTTGCCAGCAAGGCCAACCCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCCCCTCA 2524

109695635 ACTAAAGACGAGGAGGATGAGGACCTTTAGGGTGATCCACTTCCACTTAATGAATAGTAA 109695694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2525 ACTAAAGACGAGGAGGATGAGGACCTTTAGGGTGATCCACTTCCACTTAATGAATAGTAA 2584

109695695 ATACGGTTTCTCTTCCTTATGATTTTCTTAATATTTTCTTTTCCCTAACTTACTTTGTTG 109695754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2585 ATACGGTTTCTCTTCCTTATGATTTTCTTAATATTTTCTTTTCCCTAACTTACTTTGTTG 2644

109695755 TAAGAATGCAGTACTCAATACACGTAAGATACAAAATTTGTATGAATTGACTGTTTGTGT 109695814
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2645 TAAGAATGCAGTACACAATACACGTAAGATACAAAATTTGTATGAATTGACTGTTTGTGT 2704

109695815 TATCTGCAAGGCTTCCTGTCAACACTAGGGTATTAATAGTTAAGTTTTGGGGGAGTCAAA 109695874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2705 TATCTGCAAGGCTTCCTGTCAACACTAGGGTATTAATAGTTAAGTTTTGGGGGAGTCAAA 2764

109695875 AGTTATTTGTGGATTTTTTACTGTTCGGGGAGTTGGTGCCCCTAACCCCTTCGTTGTTAA 109695934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2765 AGTTATTTGTGGATTTTTTACTGTTCGGGGAGTTGGTGCCCCTAACCCCTTCGTTGTTAA 2824

109695935 AGAGTCAACTGTATATCAAAACATCGTGCTGTATACCTTAAATGTATATACTTTCAATTA 109695994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2825 AGAGTCAACTGTATATCAAAACATCGTGCTGTATACCTTAAATGTATATACTTTCAATTA 2884

109695995 AAATATTTTAAAAACAAACCAATAAAAAGGCACTGCTTCTGGCCCAGGGTGAGCCATCAG 109696054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2885 AAATATTTTAAAAACAAACCAATAAAAAGGCACTGCTTCTGGCCCAGGGTGAGCCATCAG 2944

109696055 ATGGCACAGCTGGCCCTGTCCGGTCCCAACCAGCAGAGGGGACTGTCAATTGAGAAGCTC 109696114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2945 ATGGCACAGCTGGCCCTGTCCGGTCCCAACCAGCAGAGGGGACTGTCAATTGAGAAGCTC 3004

109696115 CAGTGCTAAACGCTGGAATATGAAGATATGCATGGTGGGGAGACAGCACACACACACATA 109696174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3005 CAGTGCTAAACGCTGGAATATGAAGATATGCATGGTGGGGAGACAGCACACACACACATA 3064

109696175 ACACTCAAGGCCTGGTGGAGCCCACCCAGCTCAGCCTGGGTTGGGGAGGCTCCCTGGGAA 109696234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3065 ACACTCAAGGCCTGGTGGAGCCCACCCAGCTCAGCCTGGGTTGGGGAGGCTCCCTGGGAA 3124

109696235 GGGGATTCCTGATGTGAGCCTTCCAGGAGGGGTAGGAATTCTCTACACAGACAGGTGGGA 109696294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3125 GGGGATTCCTGATGTGAGCCTTCCAGGAGGGGTAGGAATTCTCTACACAGACAGGTGGGA 3184

109696295 ACTCCAGGCAGAGGGGAGGCCTGAAACACATCACAGGCCACCCTGTCCCTAGACTGCTGA 109696354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3185 ACTCCAGGCAGAGGGGAGGCCTGAAACACATCACAGGCCACCCTGTCCCTAGACTGCTGA 3244

109696355 GAGGCAGGACGGGGCTACACGGCCATGGGTGTGAGTCACCAAGGACCCTGTGCCTGCTGA 109696414
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     3245 GAGGCAGGACGGGGCTACACGGCCATGGGCGTGAGTCACCAAGGACCCTGTGCCTGCTGA 3304

109696415 GGCATGAGGACGCATTTCTGGGACGACAGAAAGACAGCAAAGGGCTTCAGACTATGGAAT 109696474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3305 GGCATGAGGACGCATTTCTGGGACGACAGAAAGACAGCAAAGGGCTTCAGACTATGGAAT 3364

109696475 ACCCGGAATAGGGCTCTAAGCATCTCCTCCGATGATTGTGGACTCAATGCAGGAAATGTG 109696534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3365 ACCCGGAATAGGGCTCTAAGCATCTCCTCCGATGATTGTGGACTCAATGCAGGAAATGTG 3424

109696535 GAGGCTTCGAGCTAGACCAGTGACAGAGGAGGGAAAAGGAGATGGGGCCCATCAATATTT 109696594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3425 GAGGCTTCGAGCTAGACCAGTGACAGAGGAGGGAAAAGGAGATGGGGCCCATCAATATTT 3484

109696595 GAAACTTGGCAAAACGCAGCAAGATTTTAATGGTTAATCAAAAATGGGAGGTGAATGGGA 109696654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3485 GAAACTTGGCAAAACGCAGCAAGATTTTAATGGTTAATCAAAAATGGGAGGTGAATGGGA 3544

109696655 GAAAGAGGAGCTGACAACCACTCCCACAATTCTGGTTTCCAGGGCGTGTTATAGCTGAGA 109696714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3545 GAAAGAGGAGCTGACAACCACTCCCACAATTCTGGTTTCCAGGGCGTGTTATAGCTGAGA 3604

109696715 GGGCAGCAGTTTGAGTGGCTGGGCAGCAGAGGCTGGGGTTGAGGCTGGGAAGTGGCGGCA 109696774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3605 GGGCAGCAGTTTGAGTGGCTGGGCAGCAGAGGCTGGGGTTGAGGCTGGGAAGTGGCGGCA 3664

109696775 GCAGGGGAGACTGCCCCATCAGGAGCCTGCCATAAGCGTGGGATGCAGAAGGACTGGAAG 109696834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3665 GCAGGGGAGACTGCCCCATCAGGAGCCTGCCATAAGCGTGGGATGCAGAAGGACTGGAAG 3724

109696835 GTGCTGGAGGTGATGTGGAGCTTTGGGAGAGTGTCGGAGGGATGGAATAAGTTGATGCCT 109696894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3725 GTGCTGGAGGTGATGTGGAGCTTTGGGAGAGTGTCGGAGGGATGGAATAAGTTGATGCCT 3784

109696895 GTTCCGAGACCAAGAAGTGGGGAGCAACTGAAGAAACTGGAGAGTGGGAACCAGGTTGCA 109696954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3785 GTTCCGAGACCAAGAAGTGGGGAGCAACTGAAGAAACTGGAGAGTGGGAACCAGGTTGCA 3844

109696955 GCTGGTCTCCAGATGCTGCACTCTCTGACAGCTCTCATCTATCTCACTGTCACCCAGGAT 109697014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3845 GCTGGTCTCCAGATGCTGCACTCTCTGACAGCTCTCATCTATCTCACTGTCACCCAGGAT 3904

109697015 TGGACAGGACATCTACAAATGTGCATGTGTATTTGCTATAAGGTGCATTCTTTTCCCCTG 109697074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3905 TGGACAGGACATCTACAAATGTGCATGTGTATTTGCTATAAGGTGCATTCTTTTCCCCTG 3964

109697075 GAGATAGTGACCAACCTTTCAAGAACTATTCTTGGGTATATTTTATCATTTCTTTATTTT 109697134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3965 GAGATAGTGACCAACCTTTCAAGAACTATTCTTGGGTATATTTTATCATTTCTTTATTTT 4024

109697135 AGTATCTATGAAGGGAACATTATAGAAGCCATGTTAACACTGGAGAAATGTCTAATATTA 109697194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4025 AGTATCTATGAAGGGAACATTATAGAAGCCATGTTAACACTGGAGAAATGTCTAATATTA 4084

109697195 AAAAACCAGTACTCTAGCAAGTAAAATTATGTATGTGTGTAACCTCGTTCCTACATCCAG 109697254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4085 AAAAACCAGTACTCTAGCAAGTAAAATTATGTATGTGTGTAACCTCGTTCCTACATCCAG 4144

109697255 GAAATCATTAAACTAGTAGGGGGTTGTATTAATTAGAACTCTCTGTTGCAAACAACAGAC 109697314
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     4145 GAAATCATTAAACTAGTAGGGGGTTGTATTAATCAGAACTCTCTGTTGCAAACAACAGAC 4204

109697315 AGTCTGGATGATTTAAAAGGAACAGAAATGTATTAAGAGGATATTGGATAGTTCACAAAA 109697374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4205 AGTCTGGATGATTTAAAAGGAACAGAAATGTATTAAGAGGATATTGGATAGTTCACAAAA 4264

109697375 CCTCCAGGAGGGCTGGAGAGCCAGGCTGGATGCTGTGCCACTGACACAACATTCAAAACT 109697434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4265 CCTCCAGGAGGGCTGGAGAGCCAGGCTGGATGCTGTGCCACTGACACAACATTCAAAACT 4324

109697435 CACAGATTCTTCTGCTGCCATCCACTATGCTAGCTACCAGCCATGCATGGCCATGCAGCA 109697494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4325 CACAGATTCTTCTGCTGCCATCCACTATGCTAGCTACCAGCCATGCATGGCCATGCAGCA 4384

109697495 CTTGATGTGTGCCTGCCCAACTGAGATGTGCTGCAGGTGCACAATACTCACTGGACTTCG 109697554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4385 CTTGATGTGTGCCTGCCCAACTGAGATGTGCTGCAGGTGCACAATACTCACTGGACTTCG 4444

109697555 AAGACTAAACGTGAAGAAAGGACATAAAATCTCACTCAGGTTAAAATGATATCTGCACAC 109697614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4445 AAGACTAAACGTGAAGAAAGGACATAAAATCTCACTCAGGTTAAAATGATATCTGCACAC 4504

109697615 ACTGGGTATTAAGTAAAATACATTGAAATTAATTTCACTTGTTTCTTTTTGCTTTTTAAA 109697674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4505 ACTGGGTATTAAGTAAAATACATTGAAATTAATTTCACTTGTTTCTTTTTGCTTTTTAAA 4564

109697675 TGCAGTTACTAGAAAATTTTACATTACCTGTGGGAAATTGGCTCCACATCATTTCCTCTG 109697734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4565 TGCAGTTACTAGAAAATTTTACATTACCTGTGGGAAATTGGCTCCACATCATTTCCTCTG 4624

109697735 TTTTCTATTGATCGAATTGAGTCCTAAGGCCACATCTGATATTTGGGGGAAAGGAAATAT 109697794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4625 TTTTCTATTGATCGAATTGAGTCCTAAGGCCACATCTGATATTTGGGGGAAAGGAAATAT 4684

109697795 ACATCACCTCCAGATGGG 109697812
          ||||||||||||||||||
     4685 ACATCACCTCCAGATGGG 4702

Alignment time is 4.23274 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [109679900,109705214] =>     25315 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [        1,     2290] =>      2290 nucs 'mol-32-1f21-147611_2290'

Score:        2269
Aligned:      2291        nucs
Identic:      2289 (100%) nucs =>      2104 (100%)       185 ( 99%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [109687796,109689900] EXCISED REGION [109695215,109695400]
 second seq =>  [        1,     2105] EXCISED REGION [     2106,     2290]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      5314 nucs [109689901,109695214]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        28 nucs [109689901,109689928] to [109695215,109695242]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [109689900,109689900] to [109695215,109695215]
 second seq =>         1 nucs [2105,2105] to [2106,2106]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

109687796 ATTCTGTCTTGCATGTGTGAAATTTAGATACCCATTAGACATCTGCATAGAGGGCCAGGC 109687855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATTCTGTCTTGCATGTGTGAAATTTAGATACCCATTAGACATCTGCATAGAGGGCCAGGC 60

109687856 ACAGTGGCTCACGGCAGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCGGATCACTTGA 109687915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACAGTGGCTCACGGCAGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCGGATCACTTGA 120

109687916 GGTTAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACTCTGTCTCTACTAAAAATAC 109687975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGTTAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACTCTGTCTCTACTAAAAATAC 180

109687976 AAAAATTATCTGGGTGTGGTGGTGTGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGC 109688035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAAAATTATCTGGGTGTGGTGGTGTGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGC 240

109688036 ATGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGTAGAGGTTGCAGCGAGCCAAGATCACACCACTGCA 109688095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGTAGAGGTTGCAGCGAGCCAAGATCACACCACTGCA 300

109688096 CTCTAGCAAGGGTGACAAAGCAAGACTCTATCTCAAAAAAAAAAAGACATTTATGTAGAG 109688155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTCTAGCAAGGGTGACAAAGCAAGACTCTATCTCAAAAAAAAAAAGACATTTATGTAGAG 360

109688156 ATGTTAGGTTGGCAGTTGGATAACAGTCTTGAGTTTCGGGGTGAGGGCAGGACCAGAAAT 109688215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATGTTAGGTTGGCAGTTGGATAACAGTCTTGAGTTTCGGGGTGAGGGCAGGACCAGAAAT 420

109688216 GAAGATTTGGGATTCATTAGCATGTAGATCATATTCAGAGCCACAATAATAGATGAAATA 109688275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GAAGATTTGGGATTCATTAGCATGTAGATCATATTCAGAGCCACAATAATAGATGAAATA 480

109688276 ACTGAGGAAGAGAGCTAGAGGGGCCAAGAGCAAACACAGGAACATGCCAGCATTTAGAGG 109688335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACTGAGGAAGAGAGCTAGAGGGGCCAAGAGCAAACACAGGAACATGCCAGCATTTAGAGG 540

109688336 ACAATGGAGAAGGAGGAGATGGCAGAGATGTCAATAGGAGGAAAAGCAAAAGGGTGTTAT 109688395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACAATGGAGAAGGAGGAGATGGCAGAGATGTCAATAGGAGGAAAAGCAAAAGGGTGTTAT 600

109688396 CATAGAAGGTGACAACAGAATATATCACAAAGAGGAATATGTTTGAATGTGTCAAATGTT 109688455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CATAGAAGGTGACAACAGAATATATCACAAAGAGGAATATGTTTGAATGTGTCAAATGTT 660

109688456 GTTATCACAGGCTATAGAAGTAAACACAAAGTCTTATGGGAATACTGAGGATGAGCTGCC 109688515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GTTATCACAGGCTATAGAAGTAAACACAAAGTCTTATGGGAATACTGAGGATGAGCTGCC 720

109688516 TCTAGTGTGTGTGAAACCCTGGCCAAATATTTGTTGTGGGGCCCCTGTCTATATATGCAA 109688575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCTAGTGTGTGTGAAACCCTGGCCAAATATTTGTTGTGGGGCCCCTGTCTATATATGCAA 780

109688576 TGTTATTTAAAAACATACTACATATTCTTGGGCTTATGTGGGATGTAGTGATTTATTGAT 109688635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGTTATTTAAAAACATACTACATATTCTTGGGCTTATGTGGGATGTAGTGATTTATTGAT 840

109688636 GAAGACTTAGAATACTGGGTAGGAAGAGATGCTTTTGGATTTGTTTATGAGCCAGTGAGT 109688695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GAAGACTTAGAATACTGGGTAGGAAGAGATGCTTTTGGATTTGTTTATGAGCCAGTGAGT 900

109688696 GTATCTGAGGATTCTTTATCCTGTGTCTAATGTGAGTGTGTTTTCCTGAATCAGTGCATC 109688755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GTATCTGAGGATTCTTTATCCTGTGTCTAATGTGAGTGTGTTTTCCTGAATCAGTGCATC 960

109688756 AGTGCTATTCTGGAGGCCCAAATCACACATGATTCCGTGAAAGAAACTCTGTGCTGGCCA 109688815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AGTGCTATTCTGGAGGCCCAAATCACACATGATTCCGTGAAAGAAACTCTGTGCTGGCCA 1020

109688816 GAGGATGCACTCACTCTCCAGGCTTTCCTGCATGGGCCCTCACCATGGAGTCCTGGATAC 109688875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GAGGATGCACTCACTCTCCAGGCTTTCCTGCATGGGCCCTCACCATGGAGTCCTGGATAC 1080

109688876 TTAGGGCATCTGGTTGACCACATGCTTGGGAGAGCACCAAAGAAGGTCCTGGTTTTCAAG 109688935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTAGGGCATCTGGTTGACCACATGCTTGGGAGAGCACCAAAGAAGGTCCTGGTTTTCAAG 1140

109688936 CCTCCAGCTTCTCCTTAGAAAGAGTTGACTACCTGTCTGGGCTCCAACTTTTCTGGCTGC 109688995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CCTCCAGCTTCTCCTTAGAAAGAGTTGACTACCTGTCTGGGCTCCAACTTTTCTGGCTGC 1200

109688996 TACCAGAGGGTCTGGCCTCTAAACCATCTGTGTCAAAGAACTGACAGGGCCTGACATTCA 109689055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TACCAGAGGGTCTGGCCTCTAAACCATCTGTGTCAAAGAACTGACAGGGCCTGACATTCA 1260

109689056 CTGGGACCCTAGGCTAGGGGTGACAGAGAGCAAAGCAAAAGTTTGAAAGAGTATGCAGTC 109689115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTGGGACCCTAGGCTAGGGGTGACAGAGAGCAAAGCAAAAGTTTGAAAGAGTATGCAGTC 1320

109689116 TGAATGAGCATGCAGACCTTTGCCACAGCTCCCCTTCCCAGCTCAGTGCAGAGCAAGTAG 109689175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGAATGAGCATGCAGACCTTTGCCACAGCTCCCCTTCCCAGCTCAGTGCAGAGCAAGTAG 1380

109689176 GAGATAAACTTCTGCTCTTAGCTTCTCTGTGAGGAGAGATGAAATGGACCACACATCTAG 109689235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GAGATAAACTTCTGCTCTTAGCTTCTCTGTGAGGAGAGATGAAATGGACCACACATCTAG 1440

109689236 CACCCCAACTTTTCTGACAACTACTAGAAGGACTGACTCCTGACTCACCTGTCTCAGGGC 109689295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CACCCCAACTTTTCTGACAACTACTAGAAGGACTGACTCCTGACTCACCTGTCTCAGGGC 1500

109689296 ACTGATGGTACTTGGCACACTCTAGTCTCCTGGGGCCACCAAGAACAAGAACAGCATTTT 109689355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ACTGATGGTACTTGGCACACTCTAGTCTCCTGGGGCCACCAAGAACAAGAACAGCATTTT 1560

109689356 GGACAAACACACTGGTTTGAGAGGCACCCAGACTCTCTGACTGGGCTGTGAGGAGGCTCA 109689415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GGACAAACACACTGGTTTGAGAGGCACCCAGACTCTCTGACTGGGCTGTGAGGAGGCTCA 1620

109689416 TCTGTGAAGACTGAGGGAGGTGGCTGTTTTATCAAATGTGCAGAAACCAACACAGAGAGT 109689475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TCTGTGAAGACTGAGGGAGGTGGCTGTTTTATCAAATGTGCAGAAACCAACACAGAGAGT 1680

109689476 CAAAGACAATGAACAAACAGGAAATATGCCATAAATAAAAGAACAAGATAAATCTTCAGA 109689535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     1681 CAAAGACAATGAACAAACAGGAAATATGCCATAAATAAAAGAACAAGATAAAACTTCAGA 1740

109689536 AACTGACCCAAACAGAATGGAGATATGTGATTTACCAGACAAAAAATCAAAAGACCTGTC 109689595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AACTGACCCAAACAGAATGGAGATATGTGATTTACCAGACAAAAAATCAAAAGACCTGTC 1800

109689596 ACAAAGATGCTCAGTGAGGTCAGGAGAGCAATGCATGAATAAAGTGAGAATTTCAACCAA 109689655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ACAAAGATGCTCAGTGAGGTCAGGAGAGCAATGCATGAATAAAGTGAGAATTTCAACCAA 1860

109689656 AAAGGTAGAAAATATTAAAAAGTGCCAAACAGAAATCACGGAGCTGAAGAATATAATAAA 109689715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AAAGGTAGAAAATATTAAAAAGTGCCAAACAGAAATCACGGAGCTGAAGAATATAATAAA 1920

109689716 AGAACAGAAAAATTTAATAGAGGGGTTCAATAGCAGACTAGGTGAACTGAAAGAAAGGAT 109689775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AGAACAGAAAAATTTAATAGAGGGGTTCAATAGCAGACTAGGTGAACTGAAAGAAAGGAT 1980

109689776 TAGTGAACTCAAGGACTGGTCATTGGCAATCATTCAGTCACAGCATTAAAAAGAAAAAAG 109689835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TAGTGAACTCAAGGACTGGTCATTGGCAATCATTCAGTCACAGCATTAAAAAGAAAAAAG 2040

109689836 AATGAAGGGCCAGGCACAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCTGAGGT 109689895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AATGAAGGGCCAGGCACAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCTGAGGT 2100

109689896 GGGTG 109689900
          |||||
     2101 GGGTG 2105

EXCISED REGION

109695215 GATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATTCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATTTCAACT 109695274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2106 GATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATTCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATTTCAACT 2165

109695275 AAAAATACAAAAAAAAAAAAAAAATAGCCGGGTGTGGTGGCACACACCCGTAGTCCCAGC 109695334
          |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2166 AAAAATAC-AAAAAAAAAAAAAAATAGCCGGGTGTGGTGGCACACACCCGTAGTCCCAGC 2224

109695335 TACTTGGGAGGCTGGGGCAGGAGAATGGCATGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGC 109695394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2225 TACTTGGGAGGCTGGGGCAGGAGAATGGCATGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGC 2284

109695395 CGAGAT 109695400
          ||||||
     2285 CGAGAT 2290

Alignment time is 2.03026 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [109679900,109705214] =>     25315 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [        1,     3914] =>      3914 nucs 'mol-32-1f21-157320_3914'

Score:        3913
Aligned:      3913        nucs
Identic:      3913 (100%) nucs =>      2979 (100%)       934 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [109687436,109690414] EXCISED REGION [109690416,109691349]
 second seq =>  [        1,     2979] EXCISED REGION [     2981,     3914]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [109690415,109690415]
 second seq =>         1 nucs [2980,2980]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [109690414,109690414] to [109690416,109690416]
 second seq =>         1 nucs [2979,2979] to [2981,2981]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

109687436 TCACCAGGAGCAGATGTGAGCAAATTAAACCTCTTTTCTTTATAAATTACCCATATTTAG 109687495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCACCAGGAGCAGATGTGAGCAAATTAAACCTCTTTTCTTTATAAATTACCCATATTTAG 60

109687496 GTATTTATTTATAGCTACTACAAGGGGGAAAGGGAGAGCAGGGAGATCAGTGGTGCTTTC 109687555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTATTTATTTATAGCTACTACAAGGGGGAAAGGGAGAGCAGGGAGATCAGTGGTGCTTTC 120

109687556 ACACTAGTACAGCAATAGAGCAGCATCTTGGACCAGGGTGGTGGCTGAGGAGACAGGATC 109687615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACACTAGTACAGCAATAGAGCAGCATCTTGGACCAGGGTGGTGGCTGAGGAGACAGGATC 180

109687616 ATGGCTTTGAGATACATTCTGAAGAAGAAAAGTAGGCCTTGCTGATAGAATAGTCACAAA 109687675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATGGCTTTGAGATACATTCTGAAGAAGAAAAGTAGGCCTTGCTGATAGAATAGTCACAAA 240

109687676 CTGTAATGGAAAAGGTAAATTCAAGGATGTCTCCTGGGTTTTTGGCTTAAGCATCTGGAT 109687735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTGTAATGGAAAAGGTAAATTCAAGGATGTCTCCTGGGTTTTTGGCTTAAGCATCTGGAT 300

109687736 ACAGAGATATGGAAGACTGGGAGGGAAATGGGTTTGGAGTATACATGCATGCAATCAACA 109687795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACAGAGATATGGAAGACTGGGAGGGAAATGGGTTTGGAGTATACATGCATGCAATCAACA 360

109687796 ATTCTGTCTTGCATGTGTGAAATTTAGATACCCATTAGACATCTGCATAGAGGGCCAGGC 109687855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATTCTGTCTTGCATGTGTGAAATTTAGATACCCATTAGACATCTGCATAGAGGGCCAGGC 420

109687856 ACAGTGGCTCACGGCAGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCGGATCACTTGA 109687915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACAGTGGCTCACGGCAGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCGGATCACTTGA 480

109687916 GGTTAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACTCTGTCTCTACTAAAAATAC 109687975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GGTTAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACTCTGTCTCTACTAAAAATAC 540

109687976 AAAAATTATCTGGGTGTGGTGGTGTGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGC 109688035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAAAATTATCTGGGTGTGGTGGTGTGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGC 600

109688036 ATGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGTAGAGGTTGCAGCGAGCCAAGATCACACCACTGCA 109688095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGTAGAGGTTGCAGCGAGCCAAGATCACACCACTGCA 660

109688096 CTCTAGCAAGGGTGACAAAGCAAGACTCTATCTCAAAAAAAAAAAGACATTTATGTAGAG 109688155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTCTAGCAAGGGTGACAAAGCAAGACTCTATCTCAAAAAAAAAAAGACATTTATGTAGAG 720

109688156 ATGTTAGGTTGGCAGTTGGATAACAGTCTTGAGTTTCGGGGTGAGGGCAGGACCAGAAAT 109688215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATGTTAGGTTGGCAGTTGGATAACAGTCTTGAGTTTCGGGGTGAGGGCAGGACCAGAAAT 780

109688216 GAAGATTTGGGATTCATTAGCATGTAGATCATATTCAGAGCCACAATAATAGATGAAATA 109688275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GAAGATTTGGGATTCATTAGCATGTAGATCATATTCAGAGCCACAATAATAGATGAAATA 840

109688276 ACTGAGGAAGAGAGCTAGAGGGGCCAAGAGCAAACACAGGAACATGCCAGCATTTAGAGG 109688335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ACTGAGGAAGAGAGCTAGAGGGGCCAAGAGCAAACACAGGAACATGCCAGCATTTAGAGG 900

109688336 ACAATGGAGAAGGAGGAGATGGCAGAGATGTCAATAGGAGGAAAAGCAAAAGGGTGTTAT 109688395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ACAATGGAGAAGGAGGAGATGGCAGAGATGTCAATAGGAGGAAAAGCAAAAGGGTGTTAT 960

109688396 CATAGAAGGTGACAACAGAATATATCACAAAGAGGAATATGTTTGAATGTGTCAAATGTT 109688455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CATAGAAGGTGACAACAGAATATATCACAAAGAGGAATATGTTTGAATGTGTCAAATGTT 1020

109688456 GTTATCACAGGCTATAGAAGTAAACACAAAGTCTTATGGGAATACTGAGGATGAGCTGCC 109688515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GTTATCACAGGCTATAGAAGTAAACACAAAGTCTTATGGGAATACTGAGGATGAGCTGCC 1080

109688516 TCTAGTGTGTGTGAAACCCTGGCCAAATATTTGTTGTGGGGCCCCTGTCTATATATGCAA 109688575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TCTAGTGTGTGTGAAACCCTGGCCAAATATTTGTTGTGGGGCCCCTGTCTATATATGCAA 1140

109688576 TGTTATTTAAAAACATACTACATATTCTTGGGCTTATGTGGGATGTAGTGATTTATTGAT 109688635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGTTATTTAAAAACATACTACATATTCTTGGGCTTATGTGGGATGTAGTGATTTATTGAT 1200

109688636 GAAGACTTAGAATACTGGGTAGGAAGAGATGCTTTTGGATTTGTTTATGAGCCAGTGAGT 109688695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GAAGACTTAGAATACTGGGTAGGAAGAGATGCTTTTGGATTTGTTTATGAGCCAGTGAGT 1260

109688696 GTATCTGAGGATTCTTTATCCTGTGTCTAATGTGAGTGTGTTTTCCTGAATCAGTGCATC 109688755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GTATCTGAGGATTCTTTATCCTGTGTCTAATGTGAGTGTGTTTTCCTGAATCAGTGCATC 1320

109688756 AGTGCTATTCTGGAGGCCCAAATCACACATGATTCCGTGAAAGAAACTCTGTGCTGGCCA 109688815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AGTGCTATTCTGGAGGCCCAAATCACACATGATTCCGTGAAAGAAACTCTGTGCTGGCCA 1380

109688816 GAGGATGCACTCACTCTCCAGGCTTTCCTGCATGGGCCCTCACCATGGAGTCCTGGATAC 109688875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GAGGATGCACTCACTCTCCAGGCTTTCCTGCATGGGCCCTCACCATGGAGTCCTGGATAC 1440

109688876 TTAGGGCATCTGGTTGACCACATGCTTGGGAGAGCACCAAAGAAGGTCCTGGTTTTCAAG 109688935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTAGGGCATCTGGTTGACCACATGCTTGGGAGAGCACCAAAGAAGGTCCTGGTTTTCAAG 1500

109688936 CCTCCAGCTTCTCCTTAGAAAGAGTTGACTACCTGTCTGGGCTCCAACTTTTCTGGCTGC 109688995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CCTCCAGCTTCTCCTTAGAAAGAGTTGACTACCTGTCTGGGCTCCAACTTTTCTGGCTGC 1560

109688996 TACCAGAGGGTCTGGCCTCTAAACCATCTGTGTCAAAGAACTGACAGGGCCTGACATTCA 109689055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TACCAGAGGGTCTGGCCTCTAAACCATCTGTGTCAAAGAACTGACAGGGCCTGACATTCA 1620

109689056 CTGGGACCCTAGGCTAGGGGTGACAGAGAGCAAAGCAAAAGTTTGAAAGAGTATGCAGTC 109689115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CTGGGACCCTAGGCTAGGGGTGACAGAGAGCAAAGCAAAAGTTTGAAAGAGTATGCAGTC 1680

109689116 TGAATGAGCATGCAGACCTTTGCCACAGCTCCCCTTCCCAGCTCAGTGCAGAGCAAGTAG 109689175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TGAATGAGCATGCAGACCTTTGCCACAGCTCCCCTTCCCAGCTCAGTGCAGAGCAAGTAG 1740

109689176 GAGATAAACTTCTGCTCTTAGCTTCTCTGTGAGGAGAGATGAAATGGACCACACATCTAG 109689235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GAGATAAACTTCTGCTCTTAGCTTCTCTGTGAGGAGAGATGAAATGGACCACACATCTAG 1800

109689236 CACCCCAACTTTTCTGACAACTACTAGAAGGACTGACTCCTGACTCACCTGTCTCAGGGC 109689295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CACCCCAACTTTTCTGACAACTACTAGAAGGACTGACTCCTGACTCACCTGTCTCAGGGC 1860

109689296 ACTGATGGTACTTGGCACACTCTAGTCTCCTGGGGCCACCAAGAACAAGAACAGCATTTT 109689355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ACTGATGGTACTTGGCACACTCTAGTCTCCTGGGGCCACCAAGAACAAGAACAGCATTTT 1920

109689356 GGACAAACACACTGGTTTGAGAGGCACCCAGACTCTCTGACTGGGCTGTGAGGAGGCTCA 109689415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GGACAAACACACTGGTTTGAGAGGCACCCAGACTCTCTGACTGGGCTGTGAGGAGGCTCA 1980

109689416 TCTGTGAAGACTGAGGGAGGTGGCTGTTTTATCAAATGTGCAGAAACCAACACAGAGAGT 109689475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TCTGTGAAGACTGAGGGAGGTGGCTGTTTTATCAAATGTGCAGAAACCAACACAGAGAGT 2040

109689476 CAAAGACAATGAACAAACAGGAAATATGCCATAAATAAAAGAACAAGATAAATCTTCAGA 109689535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CAAAGACAATGAACAAACAGGAAATATGCCATAAATAAAAGAACAAGATAAATCTTCAGA 2100

109689536 AACTGACCCAAACAGAATGGAGATATGTGATTTACCAGACAAAAAATCAAAAGACCTGTC 109689595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AACTGACCCAAACAGAATGGAGATATGTGATTTACCAGACAAAAAATCAAAAGACCTGTC 2160

109689596 ACAAAGATGCTCAGTGAGGTCAGGAGAGCAATGCATGAATAAAGTGAGAATTTCAACCAA 109689655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ACAAAGATGCTCAGTGAGGTCAGGAGAGCAATGCATGAATAAAGTGAGAATTTCAACCAA 2220

109689656 AAAGGTAGAAAATATTAAAAAGTGCCAAACAGAAATCACGGAGCTGAAGAATATAATAAA 109689715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AAAGGTAGAAAATATTAAAAAGTGCCAAACAGAAATCACGGAGCTGAAGAATATAATAAA 2280

109689716 AGAACAGAAAAATTTAATAGAGGGGTTCAATAGCAGACTAGGTGAACTGAAAGAAAGGAT 109689775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AGAACAGAAAAATTTAATAGAGGGGTTCAATAGCAGACTAGGTGAACTGAAAGAAAGGAT 2340

109689776 TAGTGAACTCAAGGACTGGTCATTGGCAATCATTCAGTCACAGCATTAAAAAGAAAAAAG 109689835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TAGTGAACTCAAGGACTGGTCATTGGCAATCATTCAGTCACAGCATTAAAAAGAAAAAAG 2400

109689836 AATGAAGGGCCAGGCACAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCTGAGGT 109689895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AATGAAGGGCCAGGCACAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCTGAGGT 2460

109689896 GGGTGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATCT 109689955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GGGTGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATCT 2520

109689956 CTACTAAAAATACAAAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCACGCACCTGTAATCCCAGCTAC 109690015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CTACTAAAAATACAAAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCACGCACCTGTAATCCCAGCTAC 2580

109690016 TCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTACTTGAACCTGGGAGGCTGAGGTTGCAGTGAGCTGA 109690075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTACTTGAACCTGGGAGGCTGAGGTTGCAGTGAGCTGA 2640

109690076 GATTGCGCCACTGCACTCAGGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTCTGTCTCAAAAGAAAAAA 109690135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GATTGCGCCACTGCACTCAGGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTCTGTCTCAAAAGAAAAAA 2700

109690136 AAAGAGAGAGAGAAGAAAAGAAAAAAGAATGAAAAACAGTGAAGATACCTTTAAAAACTA 109690195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AAAGAGAGAGAGAAGAAAAGAAAAAAGAATGAAAAACAGTGAAGATACCTTTAAAAACTA 2760

109690196 ATGAACACCACCCAGCAGATCTACATATGCATTATGAGACACTCAGACATTATGATATCA 109690255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 ATGAACACCACCCAGCAGATCTACATATGCATTATGAGACACTCAGACATTATGATATCA 2820

109690256 GTAACACAGAATGTGGAATAAGGAGAGGTAAAATTGCAGAGTACTTCTATAGAAGTGTTA 109690315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GTAACACAGAATGTGGAATAAGGAGAGGTAAAATTGCAGAGTACTTCTATAGAAGTGTTA 2880

109690316 TCAGTTTAACCTGTTATAAATATATGTTATGTAAGCCCCTGGTAACCACAAAGAAACTAC 109690375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TCAGTTTAACCTGTTATAAATATATGTTATGTAAGCCCCTGGTAACCACAAAGAAACTAC 2940

109690376 CTATAGAAATGACACAAAAGAAAAAAAGTTACAAAGCCT 109690414
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CTATAGAAATGACACAAAAGAAAAAAAGTTACAAAGCCT 2979

EXCISED REGION

109690416 TCAATGCAAAACAGCACAACAAAAACAGGCAAACAAAACCCAACAATAAAACACAAAGGA 109690475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2981 TCAATGCAAAACAGCACAACAAAAACAGGCAAACAAAACCCAACAATAAAACACAAAGGA 3040

109690476 AGACAGCAAGAGAGAAAAAGAGGGACAAAAGAACTACAAGACAAACAGAAAACAGTTTTA 109690535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3041 AGACAGCAAGAGAGAAAAAGAGGGACAAAAGAACTACAAGACAAACAGAAAACAGTTTTA 3100

109690536 AAAAAATGGCAATATGGTGGTTCATACCTGTAATCCCAACACTTAGGAAGGCCGAGACGA 109690595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3101 AAAAAATGGCAATATGGTGGTTCATACCTGTAATCCCAACACTTAGGAAGGCCGAGACGA 3160

109690596 GCAGATCACTTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAACCTGGCCAACATAGTGAAACCTGGTCT 109690655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3161 GCAGATCACTTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAACCTGGCCAACATAGTGAAACCTGGTCT 3220

109690656 CTACTAGAAATACACAAAATTTAGCCAGGTGTAGTGGCAGGAGCCTGTAATCCAGCTACT 109690715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3221 CTACTAGAAATACACAAAATTTAGCCAGGTGTAGTGGCAGGAGCCTGTAATCCAGCTACT 3280

109690716 CGGGAGGCTGAAGCACAAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAACTGAG 109690775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3281 CGGGAGGCTGAAGCACAAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAACTGAG 3340

109690776 ATTGTACCACTGCACTCCAGCCTGGACAACAGAGCAAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAGG 109690835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3341 ATTGTACCACTGCACTCCAGCCTGGACAACAGAGCAAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAGG 3400

109690836 CAATACTAAATCTTGCCCTATCAATAATTACTTAAAATGGCTGAATGTGGCGGCTTATGC 109690895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3401 CAATACTAAATCTTGCCCTATCAATAATTACTTAAAATGGCTGAATGTGGCGGCTTATGC 3460

109690896 CTGTAATCCCAGCACTCTGGGAGGCCAAGGCAGGTAGATCACTTGAGACCAGGAGTTCAA 109690955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3461 CTGTAATCCCAGCACTCTGGGAGGCCAAGGCAGGTAGATCACTTGAGACCAGGAGTTCAA 3520

109690956 GACCAGCCTGGCCAACATGATGAAGCCCCATCTCTACTAAAAAATACAAAAATTAGCAGG 109691015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3521 GACCAGCCTGGCCAACATGATGAAGCCCCATCTCTACTAAAAAATACAAAAATTAGCAGG 3580

109691016 GTGTGGTGGCATGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGAGAATAGCTTG 109691075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3581 GTGTGGTGGCATGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGAGAATAGCTTG 3640

109691076 AACCTGGGAAGTGGAGGCAGCAGTGAGCCAAGATCACACCGCTAGACTCCAGGCTGGGCA 109691135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3641 AACCTGGGAAGTGGAGGCAGCAGTGAGCCAAGATCACACCGCTAGACTCCAGGCTGGGCA 3700

109691136 ACAGAGCAAGACTGCATCTCAAATAATAATAATAATAATAGTAATAATTACTTAAAATGT 109691195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3701 ACAGAGCAAGACTGCATCTCAAATAATAATAATAATAATAGTAATAATTACTTAAAATGT 3760

109691196 AAATGGATTGGCCAGGTTCATGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCTGAGTCAGGAGG 109691255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3761 AAATGGATTGGCCAGGTTCATGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCTGAGTCAGGAGG 3820

109691256 ATCACGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTA 109691315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3821 ATCACGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTA 3880

109691316 AAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGTGGGC 109691349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3881 AAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGTGGGC 3914

Alignment time is 3.45888 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [109679900,109705214] =>     25315 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [        1,     4244] =>      4244 nucs 'mol-32-1f21-198139_4244'

Score:        4189
Aligned:      4244        nucs
Identic:      4239 (100%) nucs =>       284 (100%)      3955 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [109689617,109689900] EXCISED REGION [109695215,109699174]
 second seq =>  [        1,      284] EXCISED REGION [      285,     4244]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      5314 nucs [109689901,109695214]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        28 nucs [109689901,109689928] to [109695215,109695242]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [109689900,109689900] to [109695215,109695215]
 second seq =>         1 nucs [284,284] to [285,285]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

109689617 AGGAGAGCAATGCATGAATAAAGTGAGAATTTCAACCAAAAAGGTAGAAAATATTAAAAA 109689676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGGAGAGCAATGCATGAATAAAGTGAGAATTTCAACCAAAAAGGTAGAAAATATTAAAAA 60

109689677 GTGCCAAACAGAAATCACGGAGCTGAAGAATATAATAAAAGAACAGAAAAATTTAATAGA 109689736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTGCCAAACAGAAATCACGGAGCTGAAGAATATAATAAAAGAACAGAAAAATTTAATAGA 120

109689737 GGGGTTCAATAGCAGACTAGGTGAACTGAAAGAAAGGATTAGTGAACTCAAGGACTGGTC 109689796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGGGTTCAATAGCAGACTAGGTGAACTGAAAGAAAGGATTAGTGAACTCAAGGACTGGTC 180

109689797 ATTGGCAATCATTCAGTCACAGCATTAAAAAGAAAAAAGAATGAAGGGCCAGGCACAGTG 109689856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATTGGCAATCATTCAGTCACAGCATTAAAAAGAAAAAAGAATGAAGGGCCAGGCACAGTG 240

109689857 GCTCACACCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTG 109689900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GCTCACACCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTG 284

EXCISED REGION

109695215 GATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATTCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATTTCAACT 109695274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      285 GATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATTCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATTTCAACT 344

109695275 AAAAATACAAAAAAAAAAAAAAAATAGCCGGGTGTGGTGGCACACACCCGTAGTCCCAGC 109695334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      345 AAAAATACAAAAAAAAAAAAAAAATAGCCGGGTGTGGTGGCACACACCCGTAGTCCCAGC 404

109695335 TACTTGGGAGGCTGGGGCAGGAGAATGGCATGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGC 109695394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      405 TACTTGGGAGGCTGGGGCAGGAGAATGGCATGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGC 464

109695395 CGAGATCGCACAATTGCTTTCCAGCCTGGGCAACGGAGCGAGACTCTGTTTCAAAAAAAA 109695454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      465 CGAGATCGCACAATTGCTTTCCAGCCTGGGCAACGGAGCGAGACTCTGTTTCAAAAAAAA 524

109695455 AGGTGACCATGTGAAGGGATGGATATGTTAAGTAGCTTGACTGGTAATCGGTTCACGATG 109695514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      525 AGGTGACCATGTGAAGGGATGGATATGTTAAGTAGCTTGACTGGTAATCGGTTCACGATG 584

109695515 TATATGTACAGTTGACCCTTGAACAACATGCGTTTAAATTACAAGAGTCCACTTATATGG 109695574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      585 TATATGTACAGTTGACCCTTGAACAACATGCGTTTAAATTACAAGAGTCCACTTATATGG 644

109695575 GGATTTTCTTCTGCCTCTGCCAGCAAGGCCAACCCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCCCCTCA 109695634
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      645 GGATTTTCTTCTGCCTTTGCCAGCAAGGCCAACCCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCCCCTCA 704

109695635 ACTAAAGACGAGGAGGATGAGGACCTTTAGGGTGATCCACTTCCACTTAATGAATAGTAA 109695694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      705 ACTAAAGACGAGGAGGATGAGGACCTTTAGGGTGATCCACTTCCACTTAATGAATAGTAA 764

109695695 ATACGGTTTCTCTTCCTTATGATTTTCTTAATATTTTCTTTTCCCTAACTTACTTTGTTG 109695754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      765 ATACGGTTTCTCTTCCTTATGATTTTCTTAATATTTTCTTTTCCCTAACTTACTTTGTTG 824

109695755 TAAGAATGCAGTACTCAATACACGTAAGATACAAAATTTGTATGAATTGACTGTTTGTGT 109695814
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      825 TAAGAATGCAGTACACAATACACGTAAGATACAAAATTTGTATGAATTGACTGTTTGTGT 884

109695815 TATCTGCAAGGCTTCCTGTCAACACTAGGGTATTAATAGTTAAGTTTTGGGGGAGTCAAA 109695874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      885 TATCTGCAAGGCTTCCTGTCAACACTAGGGTATTAATAGTTAAGTTTTGGGGGAGTCAAA 944

109695875 AGTTATTTGTGGATTTTTTACTGTTCGGGGAGTTGGTGCCCCTAACCCCTTCGTTGTTAA 109695934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      945 AGTTATTTGTGGATTTTTTACTGTTCGGGGAGTTGGTGCCCCTAACCCCTTCGTTGTTAA 1004

109695935 AGAGTCAACTGTATATCAAAACATCGTGCTGTATACCTTAAATGTATATACTTTCAATTA 109695994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1005 AGAGTCAACTGTATATCAAAACATCGTGCTGTATACCTTAAATGTATATACTTTCAATTA 1064

109695995 AAATATTTTAAAAACAAACCAATAAAAAGGCACTGCTTCTGGCCCAGGGTGAGCCATCAG 109696054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1065 AAATATTTTAAAAACAAACCAATAAAAAGGCACTGCTTCTGGCCCAGGGTGAGCCATCAG 1124

109696055 ATGGCACAGCTGGCCCTGTCCGGTCCCAACCAGCAGAGGGGACTGTCAATTGAGAAGCTC 109696114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1125 ATGGCACAGCTGGCCCTGTCCGGTCCCAACCAGCAGAGGGGACTGTCAATTGAGAAGCTC 1184

109696115 CAGTGCTAAACGCTGGAATATGAAGATATGCATGGTGGGGAGACAGCACACACACACATA 109696174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1185 CAGTGCTAAACGCTGGAATATGAAGATATGCATGGTGGGGAGACAGCACACACACACATA 1244

109696175 ACACTCAAGGCCTGGTGGAGCCCACCCAGCTCAGCCTGGGTTGGGGAGGCTCCCTGGGAA 109696234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1245 ACACTCAAGGCCTGGTGGAGCCCACCCAGCTCAGCCTGGGTTGGGGAGGCTCCCTGGGAA 1304

109696235 GGGGATTCCTGATGTGAGCCTTCCAGGAGGGGTAGGAATTCTCTACACAGACAGGTGGGA 109696294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1305 GGGGATTCCTGATGTGAGCCTTCCAGGAGGGGTAGGAATTCTCTACACAGACAGGTGGGA 1364

109696295 ACTCCAGGCAGAGGGGAGGCCTGAAACACATCACAGGCCACCCTGTCCCTAGACTGCTGA 109696354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1365 ACTCCAGGCAGAGGGGAGGCCTGAAACACATCACAGGCCACCCTGTCCCTAGACTGCTGA 1424

109696355 GAGGCAGGACGGGGCTACACGGCCATGGGTGTGAGTCACCAAGGACCCTGTGCCTGCTGA 109696414
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     1425 GAGGCAGGACGGGGCTACACGGCCATGGGCGTGAGTCACCAAGGACCCTGTGCCTGCTGA 1484

109696415 GGCATGAGGACGCATTTCTGGGACGACAGAAAGACAGCAAAGGGCTTCAGACTATGGAAT 109696474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1485 GGCATGAGGACGCATTTCTGGGACGACAGAAAGACAGCAAAGGGCTTCAGACTATGGAAT 1544

109696475 ACCCGGAATAGGGCTCTAAGCATCTCCTCCGATGATTGTGGACTCAATGCAGGAAATGTG 109696534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1545 ACCCGGAATAGGGCTCTAAGCATCTCCTCCGATGATTGTGGACTCAATGCAGGAAATGTG 1604

109696535 GAGGCTTCGAGCTAGACCAGTGACAGAGGAGGGAAAAGGAGATGGGGCCCATCAATATTT 109696594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1605 GAGGCTTCGAGCTAGACCAGTGACAGAGGAGGGAAAAGGAGATGGGGCCCATCAATATTT 1664

109696595 GAAACTTGGCAAAACGCAGCAAGATTTTAATGGTTAATCAAAAATGGGAGGTGAATGGGA 109696654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1665 GAAACTTGGCAAAACGCAGCAAGATTTTAATGGTTAATCAAAAATGGGAGGTGAATGGGA 1724

109696655 GAAAGAGGAGCTGACAACCACTCCCACAATTCTGGTTTCCAGGGCGTGTTATAGCTGAGA 109696714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1725 GAAAGAGGAGCTGACAACCACTCCCACAATTCTGGTTTCCAGGGCGTGTTATAGCTGAGA 1784

109696715 GGGCAGCAGTTTGAGTGGCTGGGCAGCAGAGGCTGGGGTTGAGGCTGGGAAGTGGCGGCA 109696774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1785 GGGCAGCAGTTTGAGTGGCTGGGCAGCAGAGGCTGGGGTTGAGGCTGGGAAGTGGCGGCA 1844

109696775 GCAGGGGAGACTGCCCCATCAGGAGCCTGCCATAAGCGTGGGATGCAGAAGGACTGGAAG 109696834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1845 GCAGGGGAGACTGCCCCATCAGGAGCCTGCCATAAGCGTGGGATGCAGAAGGACTGGAAG 1904

109696835 GTGCTGGAGGTGATGTGGAGCTTTGGGAGAGTGTCGGAGGGATGGAATAAGTTGATGCCT 109696894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1905 GTGCTGGAGGTGATGTGGAGCTTTGGGAGAGTGTCGGAGGGATGGAATAAGTTGATGCCT 1964

109696895 GTTCCGAGACCAAGAAGTGGGGAGCAACTGAAGAAACTGGAGAGTGGGAACCAGGTTGCA 109696954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1965 GTTCCGAGACCAAGAAGTGGGGAGCAACTGAAGAAACTGGAGAGTGGGAACCAGGTTGCA 2024

109696955 GCTGGTCTCCAGATGCTGCACTCTCTGACAGCTCTCATCTATCTCACTGTCACCCAGGAT 109697014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2025 GCTGGTCTCCAGATGCTGCACTCTCTGACAGCTCTCATCTATCTCACTGTCACCCAGGAT 2084

109697015 TGGACAGGACATCTACAAATGTGCATGTGTATTTGCTATAAGGTGCATTCTTTTCCCCTG 109697074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2085 TGGACAGGACATCTACAAATGTGCATGTGTATTTGCTATAAGGTGCATTCTTTTCCCCTG 2144

109697075 GAGATAGTGACCAACCTTTCAAGAACTATTCTTGGGTATATTTTATCATTTCTTTATTTT 109697134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2145 GAGATAGTGACCAACCTTTCAAGAACTATTCTTGGGTATATTTTATCATTTCTTTATTTT 2204

109697135 AGTATCTATGAAGGGAACATTATAGAAGCCATGTTAACACTGGAGAAATGTCTAATATTA 109697194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2205 AGTATCTATGAAGGGAACATTATAGAAGCCATGTTAACACTGGAGAAATGTCTAATATTA 2264

109697195 AAAAACCAGTACTCTAGCAAGTAAAATTATGTATGTGTGTAACCTCGTTCCTACATCCAG 109697254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2265 AAAAACCAGTACTCTAGCAAGTAAAATTATGTATGTGTGTAACCTCGTTCCTACATCCAG 2324

109697255 GAAATCATTAAACTAGTAGGGGGTTGTATTAATTAGAACTCTCTGTTGCAAACAACAGAC 109697314
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     2325 GAAATCATTAAACTAGTAGGGGGTTGTATTAATCAGAACTCTCTGTTGCAAACAACAGAC 2384

109697315 AGTCTGGATGATTTAAAAGGAACAGAAATGTATTAAGAGGATATTGGATAGTTCACAAAA 109697374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2385 AGTCTGGATGATTTAAAAGGAACAGAAATGTATTAAGAGGATATTGGATAGTTCACAAAA 2444

109697375 CCTCCAGGAGGGCTGGAGAGCCAGGCTGGATGCTGTGCCACTGACACAACATTCAAAACT 109697434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2445 CCTCCAGGAGGGCTGGAGAGCCAGGCTGGATGCTGTGCCACTGACACAACATTCAAAACT 2504

109697435 CACAGATTCTTCTGCTGCCATCCACTATGCTAGCTACCAGCCATGCATGGCCATGCAGCA 109697494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2505 CACAGATTCTTCTGCTGCCATCCACTATGCTAGCTACCAGCCATGCATGGCCATGCAGCA 2564

109697495 CTTGATGTGTGCCTGCCCAACTGAGATGTGCTGCAGGTGCACAATACTCACTGGACTTCG 109697554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2565 CTTGATGTGTGCCTGCCCAACTGAGATGTGCTGCAGGTGCACAATACTCACTGGACTTCG 2624

109697555 AAGACTAAACGTGAAGAAAGGACATAAAATCTCACTCAGGTTAAAATGATATCTGCACAC 109697614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2625 AAGACTAAACGTGAAGAAAGGACATAAAATCTCACTCAGGTTAAAATGATATCTGCACAC 2684

109697615 ACTGGGTATTAAGTAAAATACATTGAAATTAATTTCACTTGTTTCTTTTTGCTTTTTAAA 109697674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2685 ACTGGGTATTAAGTAAAATACATTGAAATTAATTTCACTTGTTTCTTTTTGCTTTTTAAA 2744

109697675 TGCAGTTACTAGAAAATTTTACATTACCTGTGGGAAATTGGCTCCACATCATTTCCTCTG 109697734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2745 TGCAGTTACTAGAAAATTTTACATTACCTGTGGGAAATTGGCTCCACATCATTTCCTCTG 2804

109697735 TTTTCTATTGATCGAATTGAGTCCTAAGGCCACATCTGATATTTGGGGGAAAGGAAATAT 109697794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2805 TTTTCTATTGATCGAATTGAGTCCTAAGGCCACATCTGATATTTGGGGGAAAGGAAATAT 2864

109697795 ACATCACCTCCAGATGGGGGCAGCCCCCCATGCAGGGATGGGGAGCTGCCCGAGGCTGTT 109697854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2865 ACATCACCTCCAGATGGGGGCAGCCCCCCATGCAGGGATGGGGAGCTGCCCGAGGCTGTT 2924

109697855 TTTGGAAACATCTGTGGTCCCCAACAACAGTGCTTCTGGCCTGTTTTTTCACATGGGGCT 109697914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2925 TTTGGAAACATCTGTGGTCCCCAACAACAGTGCTTCTGGCCTGTTTTTTCACATGGGGCT 2984

109697915 CCGCGTCTGTGGCTGACTCAATGCTGGGCTTGAGGTGGGGGTGACTGTCACATGACAGAT 109697974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2985 CCGCGTCTGTGGCTGACTCAATGCTGGGCTTGAGGTGGGGGTGACTGTCACATGACAGAT 3044

109697975 TAGGTCAAGCCTCCATCGTGCTCAGGGTTTATGAGACAGATCACAAGGGCCTCTGGGGAC 109698034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3045 TAGGTCAAGCCTCCATCGTGCTCAGGGTTTATGAGACAGATCACAAGGGCCTCTGGGGAC 3104

109698035 TGCCTGTCGCTTGTGGTCCTGGGGAACCAACCCCATGGTCAACTCCACCTCTGAACCTCT 109698094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3105 TGCCTGTCGCTTGTGGTCCTGGGGAACCAACCCCATGGTCAACTCCACCTCTGAACCTCT 3164

109698095 CCTGCAAGGGGCAAGAGCATCCTGGTAACCTTGCCCATCCTGACACCTGCTGTGGTAACT 109698154
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3165 CCTGCAAGGGGCCAGAGCATCCTGGTAACCTTGCCCATCCTGACACCTGCTGTGGTAACT 3224

109698155 CATTCCCTGCTCTGGCACTTGAGCAACCCCTCGGCCCCACCATCCCAGGACTTCACAACC 109698214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3225 CATTCCCTGCTCTGGCACTTGAGCAACCCCTCGGCCCCACCATCCCAGGACTTCACAACC 3284

109698215 TGCCGCCGCCAGGGAGCCCTTTTTGCAACCACAGTGCCTGGCAGCAGTGACATGGCTTGC 109698274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3285 TGCCGCCGCCAGGGAGCCCTTTTTGCAACCACAGTGCCTGGCAGCAGTGACATGGCTTGC 3344

109698275 AGAAACACATCCTTGCTATTCAGTTGCACTTGCCAACGAGGCATCTTCTGGGGTCTTGTC 109698334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3345 AGAAACACATCCTTGCTATTCAGTTGCACTTGCCAACGAGGCATCTTCTGGGGTCTTGTC 3404

109698335 GGGGAGATCACTGGGGGATGGCCAGCTGTTTTCATAGGAAAAGTCTGTCTGGTTCTTCAT 109698394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3405 GGGGAGATCACTGGGGGATGGCCAGCTGTTTTCATAGGAAAAGTCTGTCTGGTTCTTCAT 3464

109698395 CTCCGTATTTGTCCTCCACACTGCTCACTGCATTTCTGCATCCTGGCTTTGTGTGGGGCA 109698454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3465 CTCCGTATTTGTCCTCCACACTGCTCACTGCATTTCTGCATCCTGGCTTTGTGTGGGGCA 3524

109698455 TGCTGCTGTGGACTCCAGCATCTGTCAACCCAAATGCAAAGGCGGAGCCCACCTCGGCTG 109698514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3525 TGCTGCTGTGGACTCCAGCATCTGTCAACCCAAATGCAAAGGCGGAGCCCACCTCGGCTG 3584

109698515 CAGGAACTGCCACACTGAAGTGCTCTACCCATGCTTCAGCTGCCTCCAGAATCCATTCCC 109698574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3585 CAGGAACTGCCACACTGAAGTGCTCTACCCATGCTTCAGCTGCCTCCAGAATCCATTCCC 3644

109698575 ATATGGGCTAACCAGATGTGTGCAGCTAATCAACAGTTAGCATTTCTGTCTTTGGATAGT 109698634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3645 ATATGGGCTAACCAGATGTGTGCAGCTAATCAACAGTTAGCATTTCTGTCTTTGGATAGT 3704

109698635 AAGGACTTCTGCTTCCAGACTTCAGATCTCTCCTTAGGTAGCAGCTCTGACCCAAGGTTA 109698694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3705 AAGGACTTCTGCTTCCAGACTTCAGATCTCTCCTTAGGTAGCAGCTCTGACCCAAGGTTA 3764

109698695 GGATTCCAGGACTCAGTCAGCTCCTGGTATTCCTTAGCACCCCTTTTTTATTTTATTTTA 109698754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3765 GGATTCCAGGACTCAGTCAGCTCCTGGTATTCCTTAGCACCCCTTTTTTATTTTATTTTA 3824

109698755 TTTTATTTATTTATTTTTTTGAGACAGAGTCTCTCTCTGTGGCCCAGGCTAGAGTGCAGT 109698814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3825 TTTTATTTATTTATTTTTTTGAGACAGAGTCTCTCTCTGTGGCCCAGGCTAGAGTGCAGT 3884

109698815 GGTGCTATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCTTCCCGGGTTCACACCATTCTCCTGCCTCA 109698874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3885 GGTGCTATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCTTCCCGGGTTCACACCATTCTCCTGCCTCA 3944

109698875 GCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCATGCCACCACATCTGGCCAATTTTTGTATTT 109698934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3945 GCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCATGCCACCACATCTGGCCAATTTTTGTATTT 4004

109698935 TTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGCTGGACAGGCTAGTGTCGATCTCCTGACCTCGTGA 109698994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4005 TTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGCTGGACAGGCTAGTGTCGATCTCCTGACCTCGTGA 4064

109698995 TCCACCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACACCCGGCC 109699054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4065 TCCACCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACACCCGGCC 4124

109699055 TAGCACCCCTTTTTAAAACAAAAAGTTTTTATCATGGTAATATATACAAAACATAAAATT 109699114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4125 TAGCACCCCTTTTTAAAACAAAAAGTTTTTATCATGGTAATATATACAAAACATAAAATT 4184

109699115 TACCATTTTGAGCGGGCACAGTGGCCTATGCCTATGGTCCCAGGTACTTCAGAGGCTGAG 109699174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4185 TACCATTTTGAGCGGGCACAGTGGCCTATGCCTATGGTCCCAGGTACTTCAGAGGCTGAG 4244

Alignment time is 3.72424 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [109679900,109705214] =>     25315 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [        1,     2133] =>      2133 nucs 'mol-32-2076-092783_2133'

Score:        2132
Aligned:      2132        nucs
Identic:      2132 (100%) nucs =>      1493 (100%)       639 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [109688922,109690414] EXCISED REGION [109690416,109691054]
 second seq =>  [        1,     1493] EXCISED REGION [     1495,     2133]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [109690415,109690415]
 second seq =>         1 nucs [1494,1494]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [109690414,109690414] to [109690416,109690416]
 second seq =>         1 nucs [1493,1493] to [1495,1495]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

109688922 TCCTGGTTTTCAAGCCTCCAGCTTCTCCTTAGAAAGAGTTGACTACCTGTCTGGGCTCCA 109688981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCCTGGTTTTCAAGCCTCCAGCTTCTCCTTAGAAAGAGTTGACTACCTGTCTGGGCTCCA 60

109688982 ACTTTTCTGGCTGCTACCAGAGGGTCTGGCCTCTAAACCATCTGTGTCAAAGAACTGACA 109689041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACTTTTCTGGCTGCTACCAGAGGGTCTGGCCTCTAAACCATCTGTGTCAAAGAACTGACA 120

109689042 GGGCCTGACATTCACTGGGACCCTAGGCTAGGGGTGACAGAGAGCAAAGCAAAAGTTTGA 109689101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGGCCTGACATTCACTGGGACCCTAGGCTAGGGGTGACAGAGAGCAAAGCAAAAGTTTGA 180

109689102 AAGAGTATGCAGTCTGAATGAGCATGCAGACCTTTGCCACAGCTCCCCTTCCCAGCTCAG 109689161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAGAGTATGCAGTCTGAATGAGCATGCAGACCTTTGCCACAGCTCCCCTTCCCAGCTCAG 240

109689162 TGCAGAGCAAGTAGGAGATAAACTTCTGCTCTTAGCTTCTCTGTGAGGAGAGATGAAATG 109689221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGCAGAGCAAGTAGGAGATAAACTTCTGCTCTTAGCTTCTCTGTGAGGAGAGATGAAATG 300

109689222 GACCACACATCTAGCACCCCAACTTTTCTGACAACTACTAGAAGGACTGACTCCTGACTC 109689281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GACCACACATCTAGCACCCCAACTTTTCTGACAACTACTAGAAGGACTGACTCCTGACTC 360

109689282 ACCTGTCTCAGGGCACTGATGGTACTTGGCACACTCTAGTCTCCTGGGGCCACCAAGAAC 109689341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACCTGTCTCAGGGCACTGATGGTACTTGGCACACTCTAGTCTCCTGGGGCCACCAAGAAC 420

109689342 AAGAACAGCATTTTGGACAAACACACTGGTTTGAGAGGCACCCAGACTCTCTGACTGGGC 109689401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAGAACAGCATTTTGGACAAACACACTGGTTTGAGAGGCACCCAGACTCTCTGACTGGGC 480

109689402 TGTGAGGAGGCTCATCTGTGAAGACTGAGGGAGGTGGCTGTTTTATCAAATGTGCAGAAA 109689461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGTGAGGAGGCTCATCTGTGAAGACTGAGGGAGGTGGCTGTTTTATCAAATGTGCAGAAA 540

109689462 CCAACACAGAGAGTCAAAGACAATGAACAAACAGGAAATATGCCATAAATAAAAGAACAA 109689521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CCAACACAGAGAGTCAAAGACAATGAACAAACAGGAAATATGCCATAAATAAAAGAACAA 600

109689522 GATAAATCTTCAGAAACTGACCCAAACAGAATGGAGATATGTGATTTACCAGACAAAAAA 109689581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GATAAATCTTCAGAAACTGACCCAAACAGAATGGAGATATGTGATTTACCAGACAAAAAA 660

109689582 TCAAAAGACCTGTCACAAAGATGCTCAGTGAGGTCAGGAGAGCAATGCATGAATAAAGTG 109689641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCAAAAGACCTGTCACAAAGATGCTCAGTGAGGTCAGGAGAGCAATGCATGAATAAAGTG 720

109689642 AGAATTTCAACCAAAAAGGTAGAAAATATTAAAAAGTGCCAAACAGAAATCACGGAGCTG 109689701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGAATTTCAACCAAAAAGGTAGAAAATATTAAAAAGTGCCAAACAGAAATCACGGAGCTG 780

109689702 AAGAATATAATAAAAGAACAGAAAAATTTAATAGAGGGGTTCAATAGCAGACTAGGTGAA 109689761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAGAATATAATAAAAGAACAGAAAAATTTAATAGAGGGGTTCAATAGCAGACTAGGTGAA 840

109689762 CTGAAAGAAAGGATTAGTGAACTCAAGGACTGGTCATTGGCAATCATTCAGTCACAGCAT 109689821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTGAAAGAAAGGATTAGTGAACTCAAGGACTGGTCATTGGCAATCATTCAGTCACAGCAT 900

109689822 TAAAAAGAAAAAAGAATGAAGGGCCAGGCACAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAACACTT 109689881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TAAAAAGAAAAAAGAATGAAGGGCCAGGCACAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAACACTT 960

109689882 TGGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACATG 109689941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACATG 1020

109689942 GTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCACGCACCT 109690001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCACGCACCT 1080

109690002 GTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTACTTGAACCTGGGAGGCTGAGG 109690061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTACTTGAACCTGGGAGGCTGAGG 1140

109690062 TTGCAGTGAGCTGAGATTGCGCCACTGCACTCAGGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTCTGT 109690121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTGCAGTGAGCTGAGATTGCGCCACTGCACTCAGGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTCTGT 1200

109690122 CTCAAAAGAAAAAAAAAGAGAGAGAGAAGAAAAGAAAAAAGAATGAAAAACAGTGAAGAT 109690181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CTCAAAAGAAAAAAAAAGAGAGAGAGAAGAAAAGAAAAAAGAATGAAAAACAGTGAAGAT 1260

109690182 ACCTTTAAAAACTAATGAACACCACCCAGCAGATCTACATATGCATTATGAGACACTCAG 109690241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ACCTTTAAAAACTAATGAACACCACCCAGCAGATCTACATATGCATTATGAGACACTCAG 1320

109690242 ACATTATGATATCAGTAACACAGAATGTGGAATAAGGAGAGGTAAAATTGCAGAGTACTT 109690301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ACATTATGATATCAGTAACACAGAATGTGGAATAAGGAGAGGTAAAATTGCAGAGTACTT 1380

109690302 CTATAGAAGTGTTATCAGTTTAACCTGTTATAAATATATGTTATGTAAGCCCCTGGTAAC 109690361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CTATAGAAGTGTTATCAGTTTAACCTGTTATAAATATATGTTATGTAAGCCCCTGGTAAC 1440

109690362 CACAAAGAAACTACCTATAGAAATGACACAAAAGAAAAAAAGTTACAAAGCCT 109690414
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CACAAAGAAACTACCTATAGAAATGACACAAAAGAAAAAAAGTTACAAAGCCT 1493

EXCISED REGION

109690416 TCAATGCAAAACAGCACAACAAAAACAGGCAAACAAAACCCAACAATAAAACACAAAGGA 109690475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1495 TCAATGCAAAACAGCACAACAAAAACAGGCAAACAAAACCCAACAATAAAACACAAAGGA 1554

109690476 AGACAGCAAGAGAGAAAAAGAGGGACAAAAGAACTACAAGACAAACAGAAAACAGTTTTA 109690535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1555 AGACAGCAAGAGAGAAAAAGAGGGACAAAAGAACTACAAGACAAACAGAAAACAGTTTTA 1614

109690536 AAAAAATGGCAATATGGTGGTTCATACCTGTAATCCCAACACTTAGGAAGGCCGAGACGA 109690595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1615 AAAAAATGGCAATATGGTGGTTCATACCTGTAATCCCAACACTTAGGAAGGCCGAGACGA 1674

109690596 GCAGATCACTTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAACCTGGCCAACATAGTGAAACCTGGTCT 109690655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1675 GCAGATCACTTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAACCTGGCCAACATAGTGAAACCTGGTCT 1734

109690656 CTACTAGAAATACACAAAATTTAGCCAGGTGTAGTGGCAGGAGCCTGTAATCCAGCTACT 109690715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1735 CTACTAGAAATACACAAAATTTAGCCAGGTGTAGTGGCAGGAGCCTGTAATCCAGCTACT 1794

109690716 CGGGAGGCTGAAGCACAAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAACTGAG 109690775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1795 CGGGAGGCTGAAGCACAAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAACTGAG 1854

109690776 ATTGTACCACTGCACTCCAGCCTGGACAACAGAGCAAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAGG 109690835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1855 ATTGTACCACTGCACTCCAGCCTGGACAACAGAGCAAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAGG 1914

109690836 CAATACTAAATCTTGCCCTATCAATAATTACTTAAAATGGCTGAATGTGGCGGCTTATGC 109690895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1915 CAATACTAAATCTTGCCCTATCAATAATTACTTAAAATGGCTGAATGTGGCGGCTTATGC 1974

109690896 CTGTAATCCCAGCACTCTGGGAGGCCAAGGCAGGTAGATCACTTGAGACCAGGAGTTCAA 109690955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1975 CTGTAATCCCAGCACTCTGGGAGGCCAAGGCAGGTAGATCACTTGAGACCAGGAGTTCAA 2034

109690956 GACCAGCCTGGCCAACATGATGAAGCCCCATCTCTACTAAAAAATACAAAAATTAGCAGG 109691015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2035 GACCAGCCTGGCCAACATGATGAAGCCCCATCTCTACTAAAAAATACAAAAATTAGCAGG 2094

109691016 GTGTGGTGGCATGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAG 109691054
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2095 GTGTGGTGGCATGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAG 2133

Alignment time is 1.91504 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [109679900,109705214] =>     25315 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [        1,     7613] =>      7613 nucs 'mol-32-23ba-052958_7613'

Score:        7504
Aligned:      7616        nucs
Identic:      7605 (100%) nucs =>      5175 (100%)      2430 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [109684720,109689900] EXCISED REGION [109695215,109697649]
 second seq =>  [        1,     5179] EXCISED REGION [     5180,     7613]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      5314 nucs [109689901,109695214]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        28 nucs [109689901,109689928] to [109695215,109695242]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [109689900,109689900] to [109695215,109695215]
 second seq =>         1 nucs [5179,5179] to [5180,5180]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

109684720 CATTTGGAGTGATCCTAACTGGGGGTGGGGTGTTCTAGGCACCCAGTGGGCACAGGCAGG 109684779
          ||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
        1 CATTTGGAGTGATCATAACTGGGGGTGGGGTGTTCTAGGCACCCAGTGGGCACAGACAGG 60

109684780 AGTGCACAGGATTAAGAACACCCACCCGAAGAACCCCCACCCCAGATGGCAACAGAGAAG 109684839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGTGCACAGGATTAAGAACACCCACCCGAAGAACCCCCACCCCAGATGGCAACAGAGAAG 120

109684840 AGGTTGAGAAACCCGCATCCAGACTGTAAGCCGTCTGAGGGCAAGGGCCCTGTCCCCTGT 109684899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGGTTGAGAAACCCGCATCCAGACTGTAAGCCGTCTGAGGGCAAGGGCCCTGTCCCCTGT 180

109684900 TTTGATCACTGCAACATCTCCAGCACCCAGAACAGGGCTTGACATCACGGATGCCCAGTA 109684959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTTGATCACTGCAACATCTCCAGCACCCAGAACAGGGCTTGACATCACGGATGCCCAGTA 240

109684960 AGTGGGGAACGAACAGAGACTGGCACATACACAGCACTGGGGAAATGTTGGTCATTATTA 109685019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGTGGGGAACGAACAGAGACTGGCACATACACAGCACTGGGGAAATGTTGGTCATTATTA 300

109685020 TCATTATTTCTCATGGGTTTGTATTGTTTCTGTGCCTCAGGTTTTCAGGAAAGTCTCTGC 109685079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCATTATTTCTCATGGGTTTGTATTGTTTCTGTGCCTCAGGTTTTCAGGAAAGTCTCTGC 360

109685080 TTTTCCCCTGGGCAGTGCAACAGAGGGGAAGAGTGTTGGACTTGGAGTCAGAGACCCATG 109685139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTTTCCCCTGGGCAGTGCAACAGAGGGGAAGAGTGTTGGACTTGGAGTCAGAGACCCATG 420

109685140 TCTGAGCCCCAGGTTGGCCATTATGAGCTGTGTAGCTCTGGGAAACTCACTTAACCTCTC 109685199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCTGAGCCCCAGGTTGGCCATTATGAGCTGTGTAGCTCTGGGAAACTCACTTAACCTCTC 480

109685200 TGAGGTTTTGTTTCCTCATTCGTTGAGTTGGAATACCATTTGTTTTCCTCCTCATCTGGC 109685259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGAGGTTTTGTTTCCTCATTCGTTGAGTTGGAATACCATTTGTTTTCCTCCTCATCTGGC 540

109685260 AAGCTGGTGAGATAAGCAAATATGATGATATGTCAAAATGCTTGTAAGTACTAAATACCT 109685319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAGCTGGTGAGATAAGCAAATATGATGATATGTCAAAATGCTTGTAAGTACTAAATACCT 600

109685320 TCCAGCTATTGTCATTATGTGGTCCCTCCTGCAAAATGGAAAAACCAATTGATTTTACCA 109685379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCCAGCTATTGTCATTATGTGGTCCCTCCTGCAAAATGGAAAAACCAATTGATTTTACCA 660

109685380 TGGCTGACAATCTTATATCGGTTGTGAGGAGCTTATTATTCATAATTTCAGTGTGTTTCC 109685439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGGCTGACAATCTTATATCGGTTGTGAGGAGCTTATTATTCATAATTTCAGTGTGTTTCC 720

109685440 ATTTCTGCCCATATGGCACTCCTCCCTTAGACAGGTATCTTGAGACAAGAAAAGGAGCAG 109685499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATTTCTGCCCATATGGCACTCCTCCCTTAGACAGGTATCTTGAGACAAGAAAAGGAGCAG 780

109685500 GTGGCCTTTAAAATACATTGCACATAACACATGCGTTTCACTGAACAGCTTTTTGCATTT 109685559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GTGGCCTTTAAAATACATTGCACATAACACATGCGTTTCACTGAACAGCTTTTTGCATTT 840

109685560 AAAATGCAGACAATATGCTCAAAATAGTACTAATAAATTTTCTATCTTGAGTAATGTATC 109685619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAAATGCAGACAATATGCTCAAAATAGTACTAATAAATTTTCTATCTTGAGTAATGTATC 900

109685620 TCAGACATATACCAAGGGAAAATAATTAAAGAAAAACCCAATAAAATAGAGATCATAAAA 109685679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TCAGACATATACCAAGGGAAAATAATTAAAGAAAAACCCAATAAAATAGAGATCATAAAA 960

109685680 AGGGGGGCTTATAAATCAAGAGAGTAGACTTCTAGCCATTCTCAATACAGCCTTTGAGTG 109685739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AGGGGGGCTTATAAATCAAGAGAGTAGACTTCTAGCCATTCTCAATACAGCCTTTGAGTG 1020

109685740 CAAGGATCCCAGATGTTTGATTTGGACACATGGAATTTTGCAATAGGATAGTGTACTTCT 109685799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CAAGGATCCCAGATGTTTGATTTGGACACATGGAATTTTGCAATAGGATAGTGTACTTCT 1080

109685800 TATGAATGAAACATCAAAAGGCATATGGTAGTAGATGCAATCATGTTGGCAGACGTGTGT 109685859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TATGAATGAAACATCAAAAGGCATATGGTAGTAGATGCAATCATGTTGGCAGACGTGTGT 1140

109685860 CTTGGAGAGCAGAAATGGCCAACTGAATGCTTCCTTCCTCACTCGTGAAGCCATCAGGAG 109685919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTTGGAGAGCAGAAATGGCCAACTGAATGCTTCCTTCCTCACTCGTGAAGCCATCAGGAG 1200

109685920 CAAAGCTCCAGGGAGTGCCTTCCGCCCTGCTGGCAATGAATGGCCTCTCCTGACAGATAG 109685979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CAAAGCTCCAGGGAGTGCCTTCCGCCCTGCTGGCAATGAATGGCCTCTCCTGACAGATAG 1260

109685980 CCTAAGAGCCTTTGGCTAAAGATTTGCAACATCAAAGAGTGAGTGGCATGGCCTGGCCAG 109686039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CCTAAGAGCCTTTGGCTAAAGATTTGCAACATCAAAGAGTGAGTGGCATGGCCTGGCCAG 1320

109686040 CCACCTGAGACAACGTACTTTGTTCCAGAACGTGGTTCAGAGTTTCACCTTGCTGGCTCA 109686099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CCACCTGAGACAACGTACTTTGTTCCAGAACGTGGTTCAGAGTTTCACCTTGCTGGCTCA 1380

109686100 GTGGGGATTAAGGCTGAAAGAGGCTTTGAAAATGTTGATAACAGATGAATGTAAATATTA 109686159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GTGGGGATTAAGGCTGAAAGAGGCTTTGAAAATGTTGATAACAGATGAATGTAAATATTA 1440

109686160 TTTACCTAGCAACATAACACTTTTTTTCTTCTTTTTTGGCTCTTTCATGGAGTCATTACT 109686219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTTACCTAGCAACATAACACTTTTTTTCTTCTTTTTTGGCTCTTTCATGGAGTCATTACT 1500

109686220 CTTTCCCTTGAGTTGTCAGTTCCTTCATTTAGTCTATTCCTTCAACAATTATTGATCAAA 109686279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CTTTCCCTTGAGTTGTCAGTTCCTTCATTTAGTCTATTCCTTCAACAATTATTGATCAAA 1560

109686280 TCATTATTTGTGCTGGGCAGTGTTCTATGTCCCAGGAATTTTGTACTGTAAACCAGTACT 109686339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TCATTATTTGTGCTGGGCAGTGTTCTATGTCCCAGGAATTTTGTACTGTAAACCAGTACT 1620

109686340 CTGTCCTCATAACGCCTATAATCTAGAGACATTGAACTGTGAGCACAGGAATAAGCAGTG 109686399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CTGTCCTCATAACGCCTATAATCTAGAGACATTGAACTGTGAGCACAGGAATAAGCAGTG 1680

109686400 TACTTTCAGAATGTAATCAGTGTTCTCAAGGGAGGAGATTATGATGTAACAGAGCTTCTT 109686459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TACTTTCAGAATGTAATCAGTGTTCTCAAGGGAGGAGATTATGATGTAACAGAGCTTCTT 1740

109686460 TTCATCTCAAAGGAAGGCCATTAAGAAGGGCCAGTCAGGACAGGTGATGCTGGCAGGAAG 109686519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TTCATCTCAAAGGAAGGCCATTAAGAAGGGCCAGTCAGGACAGGTGATGCTGGCAGGAAG 1800

109686520 GGAGCCAGCCTGCGACGTGCTGGGAAGACAGGCAGAGAGACTATACGTTCAAAGGGTGTG 109686579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GGAGCCAGCCTGCGACGTGCTGGGAAGACAGGCAGAGAGACTATACGTTCAAAGGGTGTG 1860

109686580 AGGCAGGCATGAGTTTGCAGAAAGTGTGCTAAGGGCCTGGAGCAGAGTGAGTGAGGGGGA 109686639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AGGCAGGCATGAGTTTGCAGAAAGTGTGCTAAGGGCCTGGAGCAGAGTGAGTGAGGGGGA 1920

109686640 ACAAAGACAGGGAGGTGTTAAAGGGCCAGGAGGGGCTGGACCCTCTGGAGCATTGATGAC 109686699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ACAAAGACAGGGAGGTGTTAAAGGGCCAGGAGGGGCTGGACCCTCTGGAGCATTGATGAC 1980

109686700 TATGCTGTGGAATGAATTTGGATGTTGTTTAAGGGGAATGGGAAGTCATTGAAATATTTT 109686759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TATGCTGTGGAATGAATTTGGATGTTGTTTAAGGGGAATGGGAAGTCATTGAAATATTTT 2040

109686760 AAGTAGAGAAATGGGATGCACTGATTTACCTTATGAAAAGAGTTCTCTAGCTGCTTTGAG 109686819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AAGTAGAGAAATGGGATGCACTGATTTACCTTATGAAAAGAGTTCTCTAGCTGCTTTGAG 2100

109686820 AGAATGGATTATAGTGGGGTGATATAGTTTGGACGTTTGTCCTCTCCAAATCTCGTGTTG 109686879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AGAATGGATTATAGTGGGGTGATATAGTTTGGACGTTTGTCCTCTCCAAATCTCGTGTTG 2160

109686880 AAATGTGATGCTCAGTGTTGGAGGTGGGGTCTGGTGGGAGGTGATTGGGTCGTGGAGCAG 109686939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AAATGTGATGCTCAGTGTTGGAGGTGGGGTCTGGTGGGAGGTGATTGGGTCGTGGAGCAG 2220

109686940 ATCCTTCATGAATGGCTGCTGACATCATCTTGGTGGTGAGTGAGTTCTCAGTCTGGTAGT 109686999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ATCCTTCATGAATGGCTGCTGACATCATCTTGGTGGTGAGTGAGTTCTCAGTCTGGTAGT 2280

109687000 TCACATGAGATCTGCCTGTTTTAAAGAGTATGGTGGCCAAGTGCCGTGGCTCACGCCTGT 109687059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TCACATGAGATCTGCCTGTTTTAAAGAGTATGGTGGCCAAGTGCCGTGGCTCACGCCTGT 2340

109687060 GATCCCAGCACTTTGGGAGGTAAAGGCAGGAGGATCACTTGAGCTCAGGAGTTCGACACT 109687119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GATCCCAGCACTTTGGGAGGTAAAGGCAGGAGGATCACTTGAGCTCAGGAGTTCGACACT 2400

109687120 AGCCTGGGAAACAGGGTGAAACCCATCTCTACTAAAAATAGAAATATTAGGCGGGTGTGA 109687179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AGCCTGGGAAACAGGGTGAAACCCATCTCTACTAAAAATAGAAATATTAGGCGGGTGTGA 2460

109687180 TGGTGCGCTGCCTATAGTCCCAGCTACCGGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAGCC 109687239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TGGTGCGCTGCCTATAGTCCCAGCTACCGGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAGCC 2520

109687240 CAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAA 109687299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAA 2580

109687300 AGCCAGACCCTATCTAAAAAAAAAAAAAAAAAATAGAGTGCGGCACCCCTCCCTTCCCAC 109687359
          |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||
     2581 AGCCAGACCCTATCTAAAAAAAAAAAAAAAA--TAGAGTGCGGCACCCCTCCCTTCCCAC 2638

109687360 TGTTGCTCCCTCTCTCGCCATGTGGGGCACGGGCTGCTCCTTCATCTTCCACCATTATTG 109687419
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     2639 TGTTGCTCCCTCTCTCGCCATGTGGGGCATGGGCTGCTCCTTCATCTTCCACCATTATTG 2698

109687420 TGAGCTTCCTGAGGCCTCACCAGGAGCAGATGTGAGCAAATTAAACCTCTTTTCTTTATA 109687479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2699 TGAGCTTCCTGAGGCCTCACCAGGAGCAGATGTGAGCAAATTAAACCTCTTTTCTTTATA 2758

109687480 AATTACCCATATTTAGGTATTTATTTATAGCTACTACAAGGGGGAAAGGGAGAGCAGGGA 109687539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2759 AATTACCCATATTTAGGTATTTATTTATAGCTACTACAAGGGGGAAAGGGAGAGCAGGGA 2818

109687540 GATCAGTGGTGCTTTCACACTAGTACAGCAATAGAGCAGCATCTTGGACCAGGGTGGTGG 109687599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2819 GATCAGTGGTGCTTTCACACTAGTACAGCAATAGAGCAGCATCTTGGACCAGGGTGGTGG 2878

109687600 CTGAGGAGACAGGATCATGGCTTTGAGATACATTCTGAAGAAGAAAAGTAGGCCTTGCTG 109687659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2879 CTGAGGAGACAGGATCATGGCTTTGAGATACATTCTGAAGAAGAAAAGTAGGCCTTGCTG 2938

109687660 ATAGAATAGTCACAAACTGTAATGGAAAAGGTAAATTCAAGGATGTCTCCTGGGTTTTTG 109687719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2939 ATAGAATAGTCACAAACTGTAATGGAAAAGGTAAATTCAAGGATGTCTCCTGGGTTTTTG 2998

109687720 GCTTAAGCATCTGGATACAGAGATATGGAAGACTGGGAGGGAAATGGGTTTGGAGTATAC 109687779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2999 GCTTAAGCATCTGGATACAGAGATATGGAAGACTGGGAGGGAAATGGGTTTGGAGTATAC 3058

109687780 ATGCATGCAATCAACAATTCTGTCTTGCATGTGTGAAATTTAGATACCCATTAGACATCT 109687839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3059 ATGCATGCAATCAACAATTCTGTCTTGCATGTGTGAAATTTAGATACCCATTAGACATCT 3118

109687840 GCATAGAGGGCCAGGCACAGTGGCTCACGGCAGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCCAAGG 109687899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3119 GCATAGAGGGCCAGGCACAGTGGCTCACGGCAGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCCAAGG 3178

109687900 TGGGCGGATCACTTGAGGTTAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACTCTG 109687959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3179 TGGGCGGATCACTTGAGGTTAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACTCTG 3238

109687960 TCTCTACTAAAAATACAAAAATTATCTGGGTGTGGTGGTGTGCACCTGTAATCCCAGCTA 109688019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3239 TCTCTACTAAAAATACAAAAATTATCTGGGTGTGGTGGTGTGCACCTGTAATCCCAGCTA 3298

109688020 CTCAGGAGGCTGAGGCATGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGTAGAGGTTGCAGCGAGCCA 109688079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3299 CTCAGGAGGCTGAGGCATGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGTAGAGGTTGCAGCGAGCCA 3358

109688080 AGATCACACCACTGCACTCTAGCAAGGGTGACAAAGCAAGACTCTATCTCAAAAAAAAAA 109688139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3359 AGATCACACCACTGCACTCTAGCAAGGGTGACAAAGCAAGACTCTATCTCAAAAAAAAAA 3418

109688140 AGACATTTATGTAGAGATGTTAGGTTGGCAGTTGGATAACAGTCTTGAGTTTCGGGGTGA 109688199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3419 AGACATTTATGTAGAGATGTTAGGTTGGCAGTTGGATAACAGTCTTGAGTTTCGGGGTGA 3478

109688200 GGGCAGGACCAGAAATGAAGATTTGGGATTCATTAGCATGTAGATCATATTCAGAGCCAC 109688259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3479 GGGCAGGACCAGAAATGAAGATTTGGGATTCATTAGCATGTAGATCATATTCAGAGCCAC 3538

109688260 AATAATAGATGAAATAACTGAGGAAGAGAGCTAGAGGGGCCAAGAGCAAACACAGGAACA 109688319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3539 AATAATAGATGAAATAACTGAGGAAGAGAGCTAGAGGGGCCAAGAGCAAACACAGGAACA 3598

109688320 TGCCAGCATTTAGAGGACAATGGAGAAGGAGGAGATGGCAGAGATGTCAATAGGAGGAAA 109688379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3599 TGCCAGCATTTAGAGGACAATGGAGAAGGAGGAGATGGCAGAGATGTCAATAGGAGGAAA 3658

109688380 AGCAAAAGGGTGTTATCATAGAAGGTGACAACAGAATATATCACAAAGAGGAATATGTTT 109688439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3659 AGCAAAAGGGTGTTATCATAGAAGGTGACAACAGAATATATCACAAAGAGGAATATGTTT 3718

109688440 GAATGTGTCAAATGTTGTTATCACAGGCTATAGAAGTAAACACAAAGTCTTATGGGAATA 109688499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3719 GAATGTGTCAAATGTTGTTATCACAGGCTATAGAAGTAAACACAAAGTCTTATGGGAATA 3778

109688500 CTGAGGATGAGCTGCCTCTAGTGTGTGTGAAACCCTGGCCAAATATTTGTTGTGGGGCCC 109688559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3779 CTGAGGATGAGCTGCCTCTAGTGTGTGTGAAACCCTGGCCAAATATTTGTTGTGGGGCCC 3838

109688560 CTGTCTATATATGCAATGTTATTTAAAAACATACTACATATTCTTGGGCTTATGTGGGAT 109688619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3839 CTGTCTATATATGCAATGTTATTTAAAAACATACTACATATTCTTGGGCTTATGTGGGAT 3898

109688620 GTAGTGATTTATTGATGAAGACTTAGAATACTGGGTAGGAAGAGATGCTTTTGGATTTGT 109688679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3899 GTAGTGATTTATTGATGAAGACTTAGAATACTGGGTAGGAAGAGATGCTTTTGGATTTGT 3958

109688680 TTATGAGCCAGTGAGTGTATCTGAGGATTCTTTATCCTGTGTCTAATGTGAGTGTGTTTT 109688739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3959 TTATGAGCCAGTGAGTGTATCTGAGGATTCTTTATCCTGTGTCTAATGTGAGTGTGTTTT 4018

109688740 CCTGAATCAGTGCATCAGTGCTATTCTGGAGGCCCAAATCACACATGATTCCGTGAAAGA 109688799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4019 CCTGAATCAGTGCATCAGTGCTATTCTGGAGGCCCAAATCACACATGATTCCGTGAAAGA 4078

109688800 AACTCTGTGCTGGCCAGAGGATGCACTCACTCTCCAGGCTTTCCTGCATGGGCCCTCACC 109688859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4079 AACTCTGTGCTGGCCAGAGGATGCACTCACTCTCCAGGCTTTCCTGCATGGGCCCTCACC 4138

109688860 ATGGAGTCCTGGATACTTAGGGCATCTGGTTGACCACATGCTTGGGAGAGCACCAAAGAA 109688919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4139 ATGGAGTCCTGGATACTTAGGGCATCTGGTTGACCACATGCTTGGGAGAGCACCAAAGAA 4198

109688920 GGTCCTGGTTTTCAAGCCTCCAGCTTCTCCTTAGAAAGAGTTGACTACCTGTCTGGGCTC 109688979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4199 GGTCCTGGTTTTCAAGCCTCCAGCTTCTCCTTAGAAAGAGTTGACTACCTGTCTGGGCTC 4258

109688980 CAACTTTTCTGGCTGCTACCAGAGGGTCTGGCCTCTAAACCATCTGTGTCAAAGAACTGA 109689039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4259 CAACTTTTCTGGCTGCTACCAGAGGGTCTGGCCTCTAAACCATCTGTGTCAAAGAACTGA 4318

109689040 CAGGGCCTGACATTCACTGGGACCCTAGGCTAGGGGTGACAGAGAGCAAAGCAAAAGTTT 109689099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4319 CAGGGCCTGACATTCACTGGGACCCTAGGCTAGGGGTGACAGAGAGCAAAGCAAAAGTTT 4378

109689100 GAAAGAGTATGCAGTCTGAATGAGCATGCAGACCTTTGCCACAGCTCCCCTTCCCAGCTC 109689159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4379 GAAAGAGTATGCAGTCTGAATGAGCATGCAGACCTTTGCCACAGCTCCCCTTCCCAGCTC 4438

109689160 AGTGCAGAGCAAGTAGGAGATAAACTTCTGCTCTTAGCTTCTCTGTGAGGAGAGATGAAA 109689219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4439 AGTGCAGAGCAAGTAGGAGATAAACTTCTGCTCTTAGCTTCTCTGTGAGGAGAGATGAAA 4498

109689220 TGGACCACACATCTAGCACCCCAACTTTTCTGACAACTACTAGAAGGACTGACTCCTGAC 109689279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4499 TGGACCACACATCTAGCACCCCAACTTTTCTGACAACTACTAGAAGGACTGACTCCTGAC 4558

109689280 TCACCTGTCTCAGGGCACTGATGGTACTTGGCACACTCTAGTCTCCTGGGGCCACCAAGA 109689339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4559 TCACCTGTCTCAGGGCACTGATGGTACTTGGCACACTCTAGTCTCCTGGGGCCACCAAGA 4618

109689340 ACAAGAACAGCATTTTGGACAAACACACTGGTTTGAGAGGCACCCAGACTCTCTGACTGG 109689399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4619 ACAAGAACAGCATTTTGGACAAACACACTGGTTTGAGAGGCACCCAGACTCTCTGACTGG 4678

109689400 GCTGTGAGGAGGCTCATCTGTGAAGACTGAGGGAGGTGGCTGTTTTATCAAATGTGCAGA 109689459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4679 GCTGTGAGGAGGCTCATCTGTGAAGACTGAGGGAGGTGGCTGTTTTATCAAATGTGCAGA 4738

109689460 AACCAACACAGAGAGTCAAAGACAATGAACAAACAGGAAATATGCCATAAATAAAAGAAC 109689519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4739 AACCAACACAGAGAGTCAAAGACAATGAACAAACAGGAAATATGCCATAAATAAAAGAAC 4798

109689520 AAGATAAATCTTCAGAAACTGACCCAAACAGAATGGAGATATGTGATTTACCAGACAAAA 109689579
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4799 AAGATAAAACTTCAGAAACTGACCCAAACAGAATGGAGATATGTGATTTACCAGACAAAA 4858

109689580 AATCAAAAGACCTGTCACAAAGATGCTCAGTGAGGTCAGGAGAGCAATGCATGAATAAAG 109689639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4859 AATCAAAAGACCTGTCACAAAGATGCTCAGTGAGGTCAGGAGAGCAATGCATGAATAAAG 4918

109689640 TGAGAATTTCAACCAAAAAGGTAGAAAATATTAAAAAGTGCCAAACAGAAATCACGGAGC 109689699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4919 TGAGAATTTCAACCAAAAAGGTAGAAAATATTAAAAAGTGCCAAACAGAAATCACGGAGC 4978

109689700 TGAAGAATATAATAAAAGAACAGAAAAATTTAATAGAGGGGTTCAATAGCAGACTAGGTG 109689759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4979 TGAAGAATATAATAAAAGAACAGAAAAATTTAATAGAGGGGTTCAATAGCAGACTAGGTG 5038

109689760 AACTGAAAGAAAGGATTAGTGAACTCAAGGACTGGTCATTGGCAATCATTCAGTCACAGC 109689819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5039 AACTGAAAGAAAGGATTAGTGAACTCAAGGACTGGTCATTGGCAATCATTCAGTCACAGC 5098

109689820 ATTAAAAAGAAAAAAGAATGAAGGGCCAGGCACAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAACAC 109689879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5099 ATTAAAAAGAAAAAAGAATGAAGGGCCAGGCACAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAACAC 5158

109689880 TTTGGGAGGCTGAGGTGGGTG 109689900
          |||||||||||||||||||||
     5159 TTTGGGAGGCTGAGGTGGGTG 5179

EXCISED REGION

109695215 GATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATTCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATTTCAACT 109695274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5180 GATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATTCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATTTCAACT 5239

109695275 AAAAATACAAAAAAAAAAAAAAAATAGCCGGGTGTGGTGGCACACACCCGTAGTCCCAGC 109695334
          |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5240 AAAAATAC-AAAAAAAAAAAAAAATAGCCGGGTGTGGTGGCACACACCCGTAGTCCCAGC 5298

109695335 TACTTGGGAGGCTGGGGCAGGAGAATGGCATGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGC 109695394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5299 TACTTGGGAGGCTGGGGCAGGAGAATGGCATGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGC 5358

109695395 CGAGATCGCACAATTGCTTTCCAGCCTGGGCAACGGAGCGAGACTCTGTTTCAAAAAAAA 109695454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5359 CGAGATCGCACAATTGCTTTCCAGCCTGGGCAACGGAGCGAGACTCTGTTTCAAAAAAAA 5418

109695455 AGGTGACCATGTGAAGGGATGGATATGTTAAGTAGCTTGACTGGTAATCGGTTCACGATG 109695514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5419 AGGTGACCATGTGAAGGGATGGATATGTTAAGTAGCTTGACTGGTAATCGGTTCACGATG 5478

109695515 TATATGTACAGTTGACCCTTGAACAACATGCGTTTAAATTACAAGAGTCCACTTATATGG 109695574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5479 TATATGTACAGTTGACCCTTGAACAACATGCGTTTAAATTACAAGAGTCCACTTATATGG 5538

109695575 GGATTTTCTTCTGCCTCTGCCAGCAAGGCCAACCCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCCCCTCA 109695634
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5539 GGATTTTCTTCTGCCTTTGCCAGCAAGGCCAACCCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCCCCTCA 5598

109695635 ACTAAAGACGAGGAGGATGAGGACCTTTAGGGTGATCCACTTCCACTTAATGAATAGTAA 109695694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5599 ACTAAAGACGAGGAGGATGAGGACCTTTAGGGTGATCCACTTCCACTTAATGAATAGTAA 5658

109695695 ATACGGTTTCTCTTCCTTATGATTTTCTTAATATTTTCTTTTCCCTAACTTACTTTGTTG 109695754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5659 ATACGGTTTCTCTTCCTTATGATTTTCTTAATATTTTCTTTTCCCTAACTTACTTTGTTG 5718

109695755 TAAGAATGCAGTACTCAATACACGTAAGATACAAAATTTGTATGAATTGACTGTTTGTGT 109695814
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5719 TAAGAATGCAGTACACAATACACGTAAGATACAAAATTTGTATGAATTGACTGTTTGTGT 5778

109695815 TATCTGCAAGGCTTCCTGTCAACACTAGGGTATTAATAGTTAAGTTTTGGGGGAGTCAAA 109695874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5779 TATCTGCAAGGCTTCCTGTCAACACTAGGGTATTAATAGTTAAGTTTTGGGGGAGTCAAA 5838

109695875 AGTTATTTGTGGATTTTTTACTGTTCGGGGAGTTGGTGCCCCTAACCCCTTCGTTGTTAA 109695934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5839 AGTTATTTGTGGATTTTTTACTGTTCGGGGAGTTGGTGCCCCTAACCCCTTCGTTGTTAA 5898

109695935 AGAGTCAACTGTATATCAAAACATCGTGCTGTATACCTTAAATGTATATACTTTCAATTA 109695994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5899 AGAGTCAACTGTATATCAAAACATCGTGCTGTATACCTTAAATGTATATACTTTCAATTA 5958

109695995 AAATATTTTAAAAACAAACCAATAAAAAGGCACTGCTTCTGGCCCAGGGTGAGCCATCAG 109696054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5959 AAATATTTTAAAAACAAACCAATAAAAAGGCACTGCTTCTGGCCCAGGGTGAGCCATCAG 6018

109696055 ATGGCACAGCTGGCCCTGTCCGGTCCCAACCAGCAGAGGGGACTGTCAATTGAGAAGCTC 109696114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6019 ATGGCACAGCTGGCCCTGTCCGGTCCCAACCAGCAGAGGGGACTGTCAATTGAGAAGCTC 6078

109696115 CAGTGCTAAACGCTGGAATATGAAGATATGCATGGTGGGGAGACAGCACACACACACATA 109696174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6079 CAGTGCTAAACGCTGGAATATGAAGATATGCATGGTGGGGAGACAGCACACACACACATA 6138

109696175 ACACTCAAGGCCTGGTGGAGCCCACCCAGCTCAGCCTGGGTTGGGGAGGCTCCCTGGGAA 109696234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6139 ACACTCAAGGCCTGGTGGAGCCCACCCAGCTCAGCCTGGGTTGGGGAGGCTCCCTGGGAA 6198

109696235 GGGGATTCCTGATGTGAGCCTTCCAGGAGGGGTAGGAATTCTCTACACAGACAGGTGGGA 109696294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6199 GGGGATTCCTGATGTGAGCCTTCCAGGAGGGGTAGGAATTCTCTACACAGACAGGTGGGA 6258

109696295 ACTCCAGGCAGAGGGGAGGCCTGAAACACATCACAGGCCACCCTGTCCCTAGACTGCTGA 109696354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6259 ACTCCAGGCAGAGGGGAGGCCTGAAACACATCACAGGCCACCCTGTCCCTAGACTGCTGA 6318

109696355 GAGGCAGGACGGGGCTACACGGCCATGGGTGTGAGTCACCAAGGACCCTGTGCCTGCTGA 109696414
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     6319 GAGGCAGGACGGGGCTACACGGCCATGGGCGTGAGTCACCAAGGACCCTGTGCCTGCTGA 6378

109696415 GGCATGAGGACGCATTTCTGGGACGACAGAAAGACAGCAAAGGGCTTCAGACTATGGAAT 109696474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6379 GGCATGAGGACGCATTTCTGGGACGACAGAAAGACAGCAAAGGGCTTCAGACTATGGAAT 6438

109696475 ACCCGGAATAGGGCTCTAAGCATCTCCTCCGATGATTGTGGACTCAATGCAGGAAATGTG 109696534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6439 ACCCGGAATAGGGCTCTAAGCATCTCCTCCGATGATTGTGGACTCAATGCAGGAAATGTG 6498

109696535 GAGGCTTCGAGCTAGACCAGTGACAGAGGAGGGAAAAGGAGATGGGGCCCATCAATATTT 109696594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6499 GAGGCTTCGAGCTAGACCAGTGACAGAGGAGGGAAAAGGAGATGGGGCCCATCAATATTT 6558

109696595 GAAACTTGGCAAAACGCAGCAAGATTTTAATGGTTAATCAAAAATGGGAGGTGAATGGGA 109696654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6559 GAAACTTGGCAAAACGCAGCAAGATTTTAATGGTTAATCAAAAATGGGAGGTGAATGGGA 6618

109696655 GAAAGAGGAGCTGACAACCACTCCCACAATTCTGGTTTCCAGGGCGTGTTATAGCTGAGA 109696714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6619 GAAAGAGGAGCTGACAACCACTCCCACAATTCTGGTTTCCAGGGCGTGTTATAGCTGAGA 6678

109696715 GGGCAGCAGTTTGAGTGGCTGGGCAGCAGAGGCTGGGGTTGAGGCTGGGAAGTGGCGGCA 109696774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6679 GGGCAGCAGTTTGAGTGGCTGGGCAGCAGAGGCTGGGGTTGAGGCTGGGAAGTGGCGGCA 6738

109696775 GCAGGGGAGACTGCCCCATCAGGAGCCTGCCATAAGCGTGGGATGCAGAAGGACTGGAAG 109696834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6739 GCAGGGGAGACTGCCCCATCAGGAGCCTGCCATAAGCGTGGGATGCAGAAGGACTGGAAG 6798

109696835 GTGCTGGAGGTGATGTGGAGCTTTGGGAGAGTGTCGGAGGGATGGAATAAGTTGATGCCT 109696894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6799 GTGCTGGAGGTGATGTGGAGCTTTGGGAGAGTGTCGGAGGGATGGAATAAGTTGATGCCT 6858

109696895 GTTCCGAGACCAAGAAGTGGGGAGCAACTGAAGAAACTGGAGAGTGGGAACCAGGTTGCA 109696954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6859 GTTCCGAGACCAAGAAGTGGGGAGCAACTGAAGAAACTGGAGAGTGGGAACCAGGTTGCA 6918

109696955 GCTGGTCTCCAGATGCTGCACTCTCTGACAGCTCTCATCTATCTCACTGTCACCCAGGAT 109697014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6919 GCTGGTCTCCAGATGCTGCACTCTCTGACAGCTCTCATCTATCTCACTGTCACCCAGGAT 6978

109697015 TGGACAGGACATCTACAAATGTGCATGTGTATTTGCTATAAGGTGCATTCTTTTCCCCTG 109697074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6979 TGGACAGGACATCTACAAATGTGCATGTGTATTTGCTATAAGGTGCATTCTTTTCCCCTG 7038

109697075 GAGATAGTGACCAACCTTTCAAGAACTATTCTTGGGTATATTTTATCATTTCTTTATTTT 109697134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7039 GAGATAGTGACCAACCTTTCAAGAACTATTCTTGGGTATATTTTATCATTTCTTTATTTT 7098

109697135 AGTATCTATGAAGGGAACATTATAGAAGCCATGTTAACACTGGAGAAATGTCTAATATTA 109697194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7099 AGTATCTATGAAGGGAACATTATAGAAGCCATGTTAACACTGGAGAAATGTCTAATATTA 7158

109697195 AAAAACCAGTACTCTAGCAAGTAAAATTATGTATGTGTGTAACCTCGTTCCTACATCCAG 109697254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7159 AAAAACCAGTACTCTAGCAAGTAAAATTATGTATGTGTGTAACCTCGTTCCTACATCCAG 7218

109697255 GAAATCATTAAACTAGTAGGGGGTTGTATTAATTAGAACTCTCTGTTGCAAACAACAGAC 109697314
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     7219 GAAATCATTAAACTAGTAGGGGGTTGTATTAATCAGAACTCTCTGTTGCAAACAACAGAC 7278

109697315 AGTCTGGATGATTTAAAAGGAACAGAAATGTATTAAGAGGATATTGGATAGTTCACAAAA 109697374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7279 AGTCTGGATGATTTAAAAGGAACAGAAATGTATTAAGAGGATATTGGATAGTTCACAAAA 7338

109697375 CCTCCAGGAGGGCTGGAGAGCCAGGCTGGATGCTGTGCCACTGACACAACATTCAAAACT 109697434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7339 CCTCCAGGAGGGCTGGAGAGCCAGGCTGGATGCTGTGCCACTGACACAACATTCAAAACT 7398

109697435 CACAGATTCTTCTGCTGCCATCCACTATGCTAGCTACCAGCCATGCATGGCCATGCAGCA 109697494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7399 CACAGATTCTTCTGCTGCCATCCACTATGCTAGCTACCAGCCATGCATGGCCATGCAGCA 7458

109697495 CTTGATGTGTGCCTGCCCAACTGAGATGTGCTGCAGGTGCACAATACTCACTGGACTTCG 109697554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7459 CTTGATGTGTGCCTGCCCAACTGAGATGTGCTGCAGGTGCACAATACTCACTGGACTTCG 7518

109697555 AAGACTAAACGTGAAGAAAGGACATAAAATCTCACTCAGGTTAAAATGATATCTGCACAC 109697614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7519 AAGACTAAACGTGAAGAAAGGACATAAAATCTCACTCAGGTTAAAATGATATCTGCACAC 7578

109697615 ACTGGGTATTAAGTAAAATACATTGAAATTAATTT 109697649
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7579 ACTGGGTATTAAGTAAAATACATTGAAATTAATTT 7613

Alignment time is 6.69357 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [109679900,109705214] =>     25315 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [        1,     2471] =>      2471 nucs 'mol-32-23ba-052958_2471'

Score:        2417
Aligned:      2472        nucs
Identic:      2467 (100%) nucs =>        37 (100%)      2430 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [109689864,109689900] EXCISED REGION [109695215,109697649]
 second seq =>  [        1,       37] EXCISED REGION [       38,     2471]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      5314 nucs [109689901,109695214]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        28 nucs [109689901,109689928] to [109695215,109695242]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [109689900,109689900] to [109695215,109695215]
 second seq =>         1 nucs [37,37] to [38,38]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

109689864 CCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTG 109689900
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTG 37

EXCISED REGION

109695215 GATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATTCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATTTCAACT 109695274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       38 GATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATTCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATTTCAACT 97

109695275 AAAAATACAAAAAAAAAAAAAAAATAGCCGGGTGTGGTGGCACACACCCGTAGTCCCAGC 109695334
          |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       98 AAAAATAC-AAAAAAAAAAAAAAATAGCCGGGTGTGGTGGCACACACCCGTAGTCCCAGC 156

109695335 TACTTGGGAGGCTGGGGCAGGAGAATGGCATGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGC 109695394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      157 TACTTGGGAGGCTGGGGCAGGAGAATGGCATGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGC 216

109695395 CGAGATCGCACAATTGCTTTCCAGCCTGGGCAACGGAGCGAGACTCTGTTTCAAAAAAAA 109695454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      217 CGAGATCGCACAATTGCTTTCCAGCCTGGGCAACGGAGCGAGACTCTGTTTCAAAAAAAA 276

109695455 AGGTGACCATGTGAAGGGATGGATATGTTAAGTAGCTTGACTGGTAATCGGTTCACGATG 109695514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      277 AGGTGACCATGTGAAGGGATGGATATGTTAAGTAGCTTGACTGGTAATCGGTTCACGATG 336

109695515 TATATGTACAGTTGACCCTTGAACAACATGCGTTTAAATTACAAGAGTCCACTTATATGG 109695574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      337 TATATGTACAGTTGACCCTTGAACAACATGCGTTTAAATTACAAGAGTCCACTTATATGG 396

109695575 GGATTTTCTTCTGCCTCTGCCAGCAAGGCCAACCCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCCCCTCA 109695634
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      397 GGATTTTCTTCTGCCTTTGCCAGCAAGGCCAACCCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCCCCTCA 456

109695635 ACTAAAGACGAGGAGGATGAGGACCTTTAGGGTGATCCACTTCCACTTAATGAATAGTAA 109695694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      457 ACTAAAGACGAGGAGGATGAGGACCTTTAGGGTGATCCACTTCCACTTAATGAATAGTAA 516

109695695 ATACGGTTTCTCTTCCTTATGATTTTCTTAATATTTTCTTTTCCCTAACTTACTTTGTTG 109695754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      517 ATACGGTTTCTCTTCCTTATGATTTTCTTAATATTTTCTTTTCCCTAACTTACTTTGTTG 576

109695755 TAAGAATGCAGTACTCAATACACGTAAGATACAAAATTTGTATGAATTGACTGTTTGTGT 109695814
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      577 TAAGAATGCAGTACACAATACACGTAAGATACAAAATTTGTATGAATTGACTGTTTGTGT 636

109695815 TATCTGCAAGGCTTCCTGTCAACACTAGGGTATTAATAGTTAAGTTTTGGGGGAGTCAAA 109695874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      637 TATCTGCAAGGCTTCCTGTCAACACTAGGGTATTAATAGTTAAGTTTTGGGGGAGTCAAA 696

109695875 AGTTATTTGTGGATTTTTTACTGTTCGGGGAGTTGGTGCCCCTAACCCCTTCGTTGTTAA 109695934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      697 AGTTATTTGTGGATTTTTTACTGTTCGGGGAGTTGGTGCCCCTAACCCCTTCGTTGTTAA 756

109695935 AGAGTCAACTGTATATCAAAACATCGTGCTGTATACCTTAAATGTATATACTTTCAATTA 109695994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      757 AGAGTCAACTGTATATCAAAACATCGTGCTGTATACCTTAAATGTATATACTTTCAATTA 816

109695995 AAATATTTTAAAAACAAACCAATAAAAAGGCACTGCTTCTGGCCCAGGGTGAGCCATCAG 109696054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      817 AAATATTTTAAAAACAAACCAATAAAAAGGCACTGCTTCTGGCCCAGGGTGAGCCATCAG 876

109696055 ATGGCACAGCTGGCCCTGTCCGGTCCCAACCAGCAGAGGGGACTGTCAATTGAGAAGCTC 109696114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      877 ATGGCACAGCTGGCCCTGTCCGGTCCCAACCAGCAGAGGGGACTGTCAATTGAGAAGCTC 936

109696115 CAGTGCTAAACGCTGGAATATGAAGATATGCATGGTGGGGAGACAGCACACACACACATA 109696174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      937 CAGTGCTAAACGCTGGAATATGAAGATATGCATGGTGGGGAGACAGCACACACACACATA 996

109696175 ACACTCAAGGCCTGGTGGAGCCCACCCAGCTCAGCCTGGGTTGGGGAGGCTCCCTGGGAA 109696234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      997 ACACTCAAGGCCTGGTGGAGCCCACCCAGCTCAGCCTGGGTTGGGGAGGCTCCCTGGGAA 1056

109696235 GGGGATTCCTGATGTGAGCCTTCCAGGAGGGGTAGGAATTCTCTACACAGACAGGTGGGA 109696294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1057 GGGGATTCCTGATGTGAGCCTTCCAGGAGGGGTAGGAATTCTCTACACAGACAGGTGGGA 1116

109696295 ACTCCAGGCAGAGGGGAGGCCTGAAACACATCACAGGCCACCCTGTCCCTAGACTGCTGA 109696354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1117 ACTCCAGGCAGAGGGGAGGCCTGAAACACATCACAGGCCACCCTGTCCCTAGACTGCTGA 1176

109696355 GAGGCAGGACGGGGCTACACGGCCATGGGTGTGAGTCACCAAGGACCCTGTGCCTGCTGA 109696414
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     1177 GAGGCAGGACGGGGCTACACGGCCATGGGCGTGAGTCACCAAGGACCCTGTGCCTGCTGA 1236

109696415 GGCATGAGGACGCATTTCTGGGACGACAGAAAGACAGCAAAGGGCTTCAGACTATGGAAT 109696474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1237 GGCATGAGGACGCATTTCTGGGACGACAGAAAGACAGCAAAGGGCTTCAGACTATGGAAT 1296

109696475 ACCCGGAATAGGGCTCTAAGCATCTCCTCCGATGATTGTGGACTCAATGCAGGAAATGTG 109696534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1297 ACCCGGAATAGGGCTCTAAGCATCTCCTCCGATGATTGTGGACTCAATGCAGGAAATGTG 1356

109696535 GAGGCTTCGAGCTAGACCAGTGACAGAGGAGGGAAAAGGAGATGGGGCCCATCAATATTT 109696594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1357 GAGGCTTCGAGCTAGACCAGTGACAGAGGAGGGAAAAGGAGATGGGGCCCATCAATATTT 1416

109696595 GAAACTTGGCAAAACGCAGCAAGATTTTAATGGTTAATCAAAAATGGGAGGTGAATGGGA 109696654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1417 GAAACTTGGCAAAACGCAGCAAGATTTTAATGGTTAATCAAAAATGGGAGGTGAATGGGA 1476

109696655 GAAAGAGGAGCTGACAACCACTCCCACAATTCTGGTTTCCAGGGCGTGTTATAGCTGAGA 109696714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1477 GAAAGAGGAGCTGACAACCACTCCCACAATTCTGGTTTCCAGGGCGTGTTATAGCTGAGA 1536

109696715 GGGCAGCAGTTTGAGTGGCTGGGCAGCAGAGGCTGGGGTTGAGGCTGGGAAGTGGCGGCA 109696774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1537 GGGCAGCAGTTTGAGTGGCTGGGCAGCAGAGGCTGGGGTTGAGGCTGGGAAGTGGCGGCA 1596

109696775 GCAGGGGAGACTGCCCCATCAGGAGCCTGCCATAAGCGTGGGATGCAGAAGGACTGGAAG 109696834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1597 GCAGGGGAGACTGCCCCATCAGGAGCCTGCCATAAGCGTGGGATGCAGAAGGACTGGAAG 1656

109696835 GTGCTGGAGGTGATGTGGAGCTTTGGGAGAGTGTCGGAGGGATGGAATAAGTTGATGCCT 109696894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1657 GTGCTGGAGGTGATGTGGAGCTTTGGGAGAGTGTCGGAGGGATGGAATAAGTTGATGCCT 1716

109696895 GTTCCGAGACCAAGAAGTGGGGAGCAACTGAAGAAACTGGAGAGTGGGAACCAGGTTGCA 109696954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1717 GTTCCGAGACCAAGAAGTGGGGAGCAACTGAAGAAACTGGAGAGTGGGAACCAGGTTGCA 1776

109696955 GCTGGTCTCCAGATGCTGCACTCTCTGACAGCTCTCATCTATCTCACTGTCACCCAGGAT 109697014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1777 GCTGGTCTCCAGATGCTGCACTCTCTGACAGCTCTCATCTATCTCACTGTCACCCAGGAT 1836

109697015 TGGACAGGACATCTACAAATGTGCATGTGTATTTGCTATAAGGTGCATTCTTTTCCCCTG 109697074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1837 TGGACAGGACATCTACAAATGTGCATGTGTATTTGCTATAAGGTGCATTCTTTTCCCCTG 1896

109697075 GAGATAGTGACCAACCTTTCAAGAACTATTCTTGGGTATATTTTATCATTTCTTTATTTT 109697134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1897 GAGATAGTGACCAACCTTTCAAGAACTATTCTTGGGTATATTTTATCATTTCTTTATTTT 1956

109697135 AGTATCTATGAAGGGAACATTATAGAAGCCATGTTAACACTGGAGAAATGTCTAATATTA 109697194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1957 AGTATCTATGAAGGGAACATTATAGAAGCCATGTTAACACTGGAGAAATGTCTAATATTA 2016

109697195 AAAAACCAGTACTCTAGCAAGTAAAATTATGTATGTGTGTAACCTCGTTCCTACATCCAG 109697254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2017 AAAAACCAGTACTCTAGCAAGTAAAATTATGTATGTGTGTAACCTCGTTCCTACATCCAG 2076

109697255 GAAATCATTAAACTAGTAGGGGGTTGTATTAATTAGAACTCTCTGTTGCAAACAACAGAC 109697314
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     2077 GAAATCATTAAACTAGTAGGGGGTTGTATTAATCAGAACTCTCTGTTGCAAACAACAGAC 2136

109697315 AGTCTGGATGATTTAAAAGGAACAGAAATGTATTAAGAGGATATTGGATAGTTCACAAAA 109697374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2137 AGTCTGGATGATTTAAAAGGAACAGAAATGTATTAAGAGGATATTGGATAGTTCACAAAA 2196

109697375 CCTCCAGGAGGGCTGGAGAGCCAGGCTGGATGCTGTGCCACTGACACAACATTCAAAACT 109697434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2197 CCTCCAGGAGGGCTGGAGAGCCAGGCTGGATGCTGTGCCACTGACACAACATTCAAAACT 2256

109697435 CACAGATTCTTCTGCTGCCATCCACTATGCTAGCTACCAGCCATGCATGGCCATGCAGCA 109697494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2257 CACAGATTCTTCTGCTGCCATCCACTATGCTAGCTACCAGCCATGCATGGCCATGCAGCA 2316

109697495 CTTGATGTGTGCCTGCCCAACTGAGATGTGCTGCAGGTGCACAATACTCACTGGACTTCG 109697554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2317 CTTGATGTGTGCCTGCCCAACTGAGATGTGCTGCAGGTGCACAATACTCACTGGACTTCG 2376

109697555 AAGACTAAACGTGAAGAAAGGACATAAAATCTCACTCAGGTTAAAATGATATCTGCACAC 109697614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2377 AAGACTAAACGTGAAGAAAGGACATAAAATCTCACTCAGGTTAAAATGATATCTGCACAC 2436

109697615 ACTGGGTATTAAGTAAAATACATTGAAATTAATTT 109697649
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2437 ACTGGGTATTAAGTAAAATACATTGAAATTAATTT 2471

Alignment time is 2.20463 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [109679900,109705214] =>     25315 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [        1,     7289] =>      7289 nucs 'mol-32-29be-059063_7289'

Score:        7234
Aligned:      7289        nucs
Identic:      7284 (100%) nucs =>       750 (100%)      6534 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [109683984,109684733] EXCISED REGION [109684735,109691273]
 second seq =>  [        1,      750] EXCISED REGION [      752,     7289]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [109684734,109684734]
 second seq =>         1 nucs [751,751]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [109687315,109687315]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [109684733,109684733] to [109684734,109684734]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

109683984 CCACCGCTCTGCGTCTTGAAGTCTTCATCTGTAAGTGGGGATGTGACTGTGTCTGTCTCT 109684043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCACCGCTCTGCGTCTTGAAGTCTTCATCTGTAAGTGGGGATGTGACTGTGTCTGTCTCT 60

109684044 CCTGGGTGTTGGGAAGGTCACACAGGTCTAGATCTATATGTAGTCACTAAGAAGAATATT 109684103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCTGGGTGTTGGGAAGGTCACACAGGTCTAGATCTATATGTAGTCACTAAGAAGAATATT 120

109684104 TAGTAGATGTTGCCAGCTGACTGGAATCAACCCGGACTCTGCCCCTGCTCCCCAAACCAC 109684163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TAGTAGATGTTGCCAGCTGACTGGAATCAACCCGGACTCTGCCCCTGCTCCCCAAACCAC 180

109684164 CCTCTCCTGGCCGCGCAATCCTTCAGGTGCTCAGGCTGATTCCTGGAGTCATCTTGGATT 109684223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCTCTCCTGGCCGCGCAATCCTTCAGGTGCTCAGGCTGATTCCTGGAGTCATCTTGGATT 240

109684224 CATTTCTCCCTCTCACACCTCACATTTAGTCCACTAGCTAATGCTGTGGGCTCCAGCTTC 109684283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CATTTCTCCCTCTCACACCTCACATTTAGTCCACTAGCTAATGCTGTGGGCTCCAGCTTC 300

109684284 AAAATGCACCTGCAAGCCACCCTGCCCCCTCCTCCATCACGACCACCCTGTTCTGACCCT 109684343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAAATGCACCTGCAAGCCACCCTGCCCCCTCCTCCATCACGACCACCCTGTTCTGACCCT 360

109684344 GGCAATCCCAGCCCCTTCCTCCCTCAGCCACAGGGCTCCAGCTCCAGCTGCTGGGTGGAG 109684403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGCAATCCCAGCCCCTTCCTCCCTCAGCCACAGGGCTCCAGCTCCAGCTGCTGGGTGGAG 420

109684404 GCTGGGCTTGCTGCTGCTCTGGGGACTTTGCTCTTTGCTGTTCCTTCTCCTGGAATGCAC 109684463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GCTGGGCTTGCTGCTGCTCTGGGGACTTTGCTCTTTGCTGTTCCTTCTCCTGGAATGCAC 480

109684464 ATCCCCACACACCTGCCTGCTCACATGCTCCCCTGTAAGGCTTGCTCCAAGGTCACCTCC 109684523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATCCCCACACACCTGCCTGCTCACATGCTCCCCTGTAAGGCTTGCTCCAAGGTCACCTCC 540

109684524 TCAGTGAAGCTGCCCTGACTGCTGCCACCCACACCACCCCCTCACGGGGCTACCCCACTT 109684583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCAGTGAAGCTGCCCTGACTGCTGCCACCCACACCACCCCCTCACGGGGCTACCCCACTT 600

109684584 CCCTGGATCATTTTTATCCATAGTGTGTATTCCCCTCTGACACACCATGTCGTTTACTTT 109684643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CCCTGGATCATTTTTATCCATAGTGTGTATTCCCCTCTGACACACCATGTCGTTTACTTT 660

109684644 TTCATCTTTTCGCGGAACTGTTCTTCCCTCTAGAATGGCGGTTCTCAACCATGGGCCATC 109684703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTCATCTTTTCGCGGAACTGTTCTTCCCTCTAGAATGGCGGTTCTCAACCATGGGCCATC 720

109684704 TGTCAGTGTCTACAGACATTTGGAGTGATC 109684733
          ||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGTCAGTGTCTACAGACATTTGGAGTGATC 750

EXCISED REGION

109684735 TAACTGGGGGTGGGGTGTTCTAGGCACCCAGTGGGCACAGGCAGGAGTGCACAGGATTAA 109684794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
      752 TAACTGGGGGTGGGGTGTTCTAGGCACCCAGTGGGCACAGACAGGAGTGCACAGGATTAA 811

109684795 GAACACCCACCCGAAGAACCCCCACCCCAGATGGCAACAGAGAAGAGGTTGAGAAACCCG 109684854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      812 GAACACCCACCCGAAGAACCCCCACCCCAGATGGCAACAGAGAAGAGGTTGAGAAACCCG 871

109684855 CATCCAGACTGTAAGCCGTCTGAGGGCAAGGGCCCTGTCCCCTGTTTTGATCACTGCAAC 109684914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      872 CATCCAGACTGTAAGCCGTCTGAGGGCAAGGGCCCTGTCCCCTGTTTTGATCACTGCAAC 931

109684915 ATCTCCAGCACCCAGAACAGGGCTTGACATCACGGATGCCCAGTAAGTGGGGAACGAACA 109684974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      932 ATCTCCAGCACCCAGAACAGGGCTTGACATCACGGATGCCCAGTAAGTGGGGAACGAACA 991

109684975 GAGACTGGCACATACACAGCACTGGGGAAATGTTGGTCATTATTATCATTATTTCTCATG 109685034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      992 GAGACTGGCACATACACAGCACTGGGGAAATGTTGGTCATTATTATCATTATTTCTCATG 1051

109685035 GGTTTGTATTGTTTCTGTGCCTCAGGTTTTCAGGAAAGTCTCTGCTTTTCCCCTGGGCAG 109685094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1052 GGTTTGTATTGTTTCTGTGCCTCAGGTTTTCAGGAAAGTCTCTGCTTTTCCCCTGGGCAG 1111

109685095 TGCAACAGAGGGGAAGAGTGTTGGACTTGGAGTCAGAGACCCATGTCTGAGCCCCAGGTT 109685154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1112 TGCAACAGAGGGGAAGAGTGTTGGACTTGGAGTCAGAGACCCATGTCTGAGCCCCAGGTT 1171

109685155 GGCCATTATGAGCTGTGTAGCTCTGGGAAACTCACTTAACCTCTCTGAGGTTTTGTTTCC 109685214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1172 GGCCATTATGAGCTGTGTAGCTCTGGGAAACTCACTTAACCTCTCTGAGGTTTTGTTTCC 1231

109685215 TCATTCGTTGAGTTGGAATACCATTTGTTTTCCTCCTCATCTGGCAAGCTGGTGAGATAA 109685274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1232 TCATTCGTTGAGTTGGAATACCATTTGTTTTCCTCCTCATCTGGCAAGCTGGTGAGATAA 1291

109685275 GCAAATATGATGATATGTCAAAATGCTTGTAAGTACTAAATACCTTCCAGCTATTGTCAT 109685334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1292 GCAAATATGATGATATGTCAAAATGCTTGTAAGTACTAAATACCTTCCAGCTATTGTCAT 1351

109685335 TATGTGGTCCCTCCTGCAAAATGGAAAAACCAATTGATTTTACCATGGCTGACAATCTTA 109685394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1352 TATGTGGTCCCTCCTGCAAAATGGAAAAACCAATTGATTTTACCATGGCTGACAATCTTA 1411

109685395 TATCGGTTGTGAGGAGCTTATTATTCATAATTTCAGTGTGTTTCCATTTCTGCCCATATG 109685454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1412 TATCGGTTGTGAGGAGCTTATTATTCATAATTTCAGTGTGTTTCCATTTCTGCCCATATG 1471

109685455 GCACTCCTCCCTTAGACAGGTATCTTGAGACAAGAAAAGGAGCAGGTGGCCTTTAAAATA 109685514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1472 GCACTCCTCCCTTAGACAGGTATCTTGAGACAAGAAAAGGAGCAGGTGGCCTTTAAAATA 1531

109685515 CATTGCACATAACACATGCGTTTCACTGAACAGCTTTTTGCATTTAAAATGCAGACAATA 109685574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1532 CATTGCACATAACACATGCGTTTCACTGAACAGCTTTTTGCATTTAAAATGCAGACAATA 1591

109685575 TGCTCAAAATAGTACTAATAAATTTTCTATCTTGAGTAATGTATCTCAGACATATACCAA 109685634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1592 TGCTCAAAATAGTACTAATAAATTTTCTATCTTGAGTAATGTATCTCAGACATATACCAA 1651

109685635 GGGAAAATAATTAAAGAAAAACCCAATAAAATAGAGATCATAAAAAGGGGGGCTTATAAA 109685694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1652 GGGAAAATAATTAAAGAAAAACCCAATAAAATAGAGATCATAAAAAGGGGGGCTTATAAA 1711

109685695 TCAAGAGAGTAGACTTCTAGCCATTCTCAATACAGCCTTTGAGTGCAAGGATCCCAGATG 109685754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1712 TCAAGAGAGTAGACTTCTAGCCATTCTCAATACAGCCTTTGAGTGCAAGGATCCCAGATG 1771

109685755 TTTGATTTGGACACATGGAATTTTGCAATAGGATAGTGTACTTCTTATGAATGAAACATC 109685814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1772 TTTGATTTGGACACATGGAATTTTGCAATAGGATAGTGTACTTCTTATGAATGAAACATC 1831

109685815 AAAAGGCATATGGTAGTAGATGCAATCATGTTGGCAGACGTGTGTCTTGGAGAGCAGAAA 109685874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1832 AAAAGGCATATGGTAGTAGATGCAATCATGTTGGCAGACGTGTGTCTTGGAGAGCAGAAA 1891

109685875 TGGCCAACTGAATGCTTCCTTCCTCACTCGTGAAGCCATCAGGAGCAAAGCTCCAGGGAG 109685934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1892 TGGCCAACTGAATGCTTCCTTCCTCACTCGTGAAGCCATCAGGAGCAAAGCTCCAGGGAG 1951

109685935 TGCCTTCCGCCCTGCTGGCAATGAATGGCCTCTCCTGACAGATAGCCTAAGAGCCTTTGG 109685994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1952 TGCCTTCCGCCCTGCTGGCAATGAATGGCCTCTCCTGACAGATAGCCTAAGAGCCTTTGG 2011

109685995 CTAAAGATTTGCAACATCAAAGAGTGAGTGGCATGGCCTGGCCAGCCACCTGAGACAACG 109686054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2012 CTAAAGATTTGCAACATCAAAGAGTGAGTGGCATGGCCTGGCCAGCCACCTGAGACAACG 2071

109686055 TACTTTGTTCCAGAACGTGGTTCAGAGTTTCACCTTGCTGGCTCAGTGGGGATTAAGGCT 109686114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2072 TACTTTGTTCCAGAACGTGGTTCAGAGTTTCACCTTGCTGGCTCAGTGGGGATTAAGGCT 2131

109686115 GAAAGAGGCTTTGAAAATGTTGATAACAGATGAATGTAAATATTATTTACCTAGCAACAT 109686174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2132 GAAAGAGGCTTTGAAAATGTTGATAACAGATGAATGTAAATATTATTTACCTAGCAACAT 2191

109686175 AACACTTTTTTTCTTCTTTTTTGGCTCTTTCATGGAGTCATTACTCTTTCCCTTGAGTTG 109686234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2192 AACACTTTTTTTCTTCTTTTTTGGCTCTTTCATGGAGTCATTACTCTTTCCCTTGAGTTG 2251

109686235 TCAGTTCCTTCATTTAGTCTATTCCTTCAACAATTATTGATCAAATCATTATTTGTGCTG 109686294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2252 TCAGTTCCTTCATTTAGTCTATTCCTTCAACAATTATTGATCAAATCATTATTTGTGCTG 2311

109686295 GGCAGTGTTCTATGTCCCAGGAATTTTGTACTGTAAACCAGTACTCTGTCCTCATAACGC 109686354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2312 GGCAGTGTTCTATGTCCCAGGAATTTTGTACTGTAAACCAGTACTCTGTCCTCATAACGC 2371

109686355 CTATAATCTAGAGACATTGAACTGTGAGCACAGGAATAAGCAGTGTACTTTCAGAATGTA 109686414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2372 CTATAATCTAGAGACATTGAACTGTGAGCACAGGAATAAGCAGTGTACTTTCAGAATGTA 2431

109686415 ATCAGTGTTCTCAAGGGAGGAGATTATGATGTAACAGAGCTTCTTTTCATCTCAAAGGAA 109686474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2432 ATCAGTGTTCTCAAGGGAGGAGATTATGATGTAACAGAGCTTCTTTTCATCTCAAAGGAA 2491

109686475 GGCCATTAAGAAGGGCCAGTCAGGACAGGTGATGCTGGCAGGAAGGGAGCCAGCCTGCGA 109686534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2492 GGCCATTAAGAAGGGCCAGTCAGGACAGGTGATGCTGGCAGGAAGGGAGCCAGCCTGCGA 2551

109686535 CGTGCTGGGAAGACAGGCAGAGAGACTATACGTTCAAAGGGTGTGAGGCAGGCATGAGTT 109686594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2552 CGTGCTGGGAAGACAGGCAGAGAGACTATACGTTCAAAGGGTGTGAGGCAGGCATGAGTT 2611

109686595 TGCAGAAAGTGTGCTAAGGGCCTGGAGCAGAGTGAGTGAGGGGGAACAAAGACAGGGAGG 109686654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2612 TGCAGAAAGTGTGCTAAGGGCCTGGAGCAGAGTGAGTGAGGGGGAACAAAGACAGGGAGG 2671

109686655 TGTTAAAGGGCCAGGAGGGGCTGGACCCTCTGGAGCATTGATGACTATGCTGTGGAATGA 109686714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2672 TGTTAAAGGGCCAGGAGGGGCTGGACCCTCTGGAGCATTGATGACTATGCTGTGGAATGA 2731

109686715 ATTTGGATGTTGTTTAAGGGGAATGGGAAGTCATTGAAATATTTTAAGTAGAGAAATGGG 109686774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2732 ATTTGGATGTTGTTTAAGGGGAATGGGAAGTCATTGAAATATTTTAAGTAGAGAAATGGG 2791

109686775 ATGCACTGATTTACCTTATGAAAAGAGTTCTCTAGCTGCTTTGAGAGAATGGATTATAGT 109686834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2792 ATGCACTGATTTACCTTATGAAAAGAGTTCTCTAGCTGCTTTGAGAGAATGGATTATAGT 2851

109686835 GGGGTGATATAGTTTGGACGTTTGTCCTCTCCAAATCTCGTGTTGAAATGTGATGCTCAG 109686894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2852 GGGGTGATATAGTTTGGACGTTTGTCCTCTCCAAATCTCGTGTTGAAATGTGATGCTCAG 2911

109686895 TGTTGGAGGTGGGGTCTGGTGGGAGGTGATTGGGTCGTGGAGCAGATCCTTCATGAATGG 109686954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2912 TGTTGGAGGTGGGGTCTGGTGGGAGGTGATTGGGTCGTGGAGCAGATCCTTCATGAATGG 2971

109686955 CTGCTGACATCATCTTGGTGGTGAGTGAGTTCTCAGTCTGGTAGTTCACATGAGATCTGC 109687014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2972 CTGCTGACATCATCTTGGTGGTGAGTGAGTTCTCAGTCTGGTAGTTCACATGAGATCTGC 3031

109687015 CTGTTTTAAAGAGTATGGTGGCCAAGTGCCGTGGCTCACGCCTGTGATCCCAGCACTTTG 109687074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3032 CTGTTTTAAAGAGTATGGTGGCCAAGTGCCGTGGCTCACGCCTGTGATCCCAGCACTTTG 3091

109687075 GGAGGTAAAGGCAGGAGGATCACTTGAGCTCAGGAGTTCGACACTAGCCTGGGAAACAGG 109687134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3092 GGAGGTAAAGGCAGGAGGATCACTTGAGCTCAGGAGTTCGACACTAGCCTGGGAAACAGG 3151

109687135 GTGAAACCCATCTCTACTAAAAATAGAAATATTAGGCGGGTGTGATGGTGCGCTGCCTAT 109687194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3152 GTGAAACCCATCTCTACTAAAAATAGAAATATTAGGCGGGTGTGATGGTGCGCTGCCTAT 3211

109687195 AGTCCCAGCTACCGGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGGCAGAGGTT 109687254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3212 AGTCCCAGCTACCGGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGGCAGAGGTT 3271

109687255 GCAGTGAGCCAAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAGCCAGACCCTATCT 109687314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3272 GCAGTGAGCCAAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAGCCAGACCCTATCT 3331

109687315 AAAAAAAAAAAAAAAAAATAGAGTGCGGCACCCCTCCCTTCCCACTGTTGCTCCCTCTCT 109687374
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3332 -AAAAAAAAAAAAAAAAATAGAGTGCGGCACCCCTCCCTTCCCACTGTTGCTCCCTCTCT 3390

109687375 CGCCATGTGGGGCACGGGCTGCTCCTTCATCTTCCACCATTATTGTGAGCTTCCTGAGGC 109687434
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3391 CGCCATGTGGGGCATGGGCTGCTCCTTCATCTTCCACCATTATTGTGAGCTTCCTGAGGC 3450

109687435 CTCACCAGGAGCAGATGTGAGCAAATTAAACCTCTTTTCTTTATAAATTACCCATATTTA 109687494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3451 CTCACCAGGAGCAGATGTGAGCAAATTAAACCTCTTTTCTTTATAAATTACCCATATTTA 3510

109687495 GGTATTTATTTATAGCTACTACAAGGGGGAAAGGGAGAGCAGGGAGATCAGTGGTGCTTT 109687554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3511 GGTATTTATTTATAGCTACTACAAGGGGGAAAGGGAGAGCAGGGAGATCAGTGGTGCTTT 3570

109687555 CACACTAGTACAGCAATAGAGCAGCATCTTGGACCAGGGTGGTGGCTGAGGAGACAGGAT 109687614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3571 CACACTAGTACAGCAATAGAGCAGCATCTTGGACCAGGGTGGTGGCTGAGGAGACAGGAT 3630

109687615 CATGGCTTTGAGATACATTCTGAAGAAGAAAAGTAGGCCTTGCTGATAGAATAGTCACAA 109687674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3631 CATGGCTTTGAGATACATTCTGAAGAAGAAAAGTAGGCCTTGCTGATAGAATAGTCACAA 3690

109687675 ACTGTAATGGAAAAGGTAAATTCAAGGATGTCTCCTGGGTTTTTGGCTTAAGCATCTGGA 109687734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3691 ACTGTAATGGAAAAGGTAAATTCAAGGATGTCTCCTGGGTTTTTGGCTTAAGCATCTGGA 3750

109687735 TACAGAGATATGGAAGACTGGGAGGGAAATGGGTTTGGAGTATACATGCATGCAATCAAC 109687794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3751 TACAGAGATATGGAAGACTGGGAGGGAAATGGGTTTGGAGTATACATGCATGCAATCAAC 3810

109687795 AATTCTGTCTTGCATGTGTGAAATTTAGATACCCATTAGACATCTGCATAGAGGGCCAGG 109687854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3811 AATTCTGTCTTGCATGTGTGAAATTTAGATACCCATTAGACATCTGCATAGAGGGCCAGG 3870

109687855 CACAGTGGCTCACGGCAGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCGGATCACTTG 109687914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3871 CACAGTGGCTCACGGCAGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCGGATCACTTG 3930

109687915 AGGTTAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACTCTGTCTCTACTAAAAATA 109687974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3931 AGGTTAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACTCTGTCTCTACTAAAAATA 3990

109687975 CAAAAATTATCTGGGTGTGGTGGTGTGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGG 109688034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3991 CAAAAATTATCTGGGTGTGGTGGTGTGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGG 4050

109688035 CATGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGTAGAGGTTGCAGCGAGCCAAGATCACACCACTGC 109688094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4051 CATGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGTAGAGGTTGCAGCGAGCCAAGATCACACCACTGC 4110

109688095 ACTCTAGCAAGGGTGACAAAGCAAGACTCTATCTCAAAAAAAAAAAGACATTTATGTAGA 109688154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4111 ACTCTAGCAAGGGTGACAAAGCAAGACTCTATCTCAAAAAAAAAAAGACATTTATGTAGA 4170

109688155 GATGTTAGGTTGGCAGTTGGATAACAGTCTTGAGTTTCGGGGTGAGGGCAGGACCAGAAA 109688214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4171 GATGTTAGGTTGGCAGTTGGATAACAGTCTTGAGTTTCGGGGTGAGGGCAGGACCAGAAA 4230

109688215 TGAAGATTTGGGATTCATTAGCATGTAGATCATATTCAGAGCCACAATAATAGATGAAAT 109688274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4231 TGAAGATTTGGGATTCATTAGCATGTAGATCATATTCAGAGCCACAATAATAGATGAAAT 4290

109688275 AACTGAGGAAGAGAGCTAGAGGGGCCAAGAGCAAACACAGGAACATGCCAGCATTTAGAG 109688334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4291 AACTGAGGAAGAGAGCTAGAGGGGCCAAGAGCAAACACAGGAACATGCCAGCATTTAGAG 4350

109688335 GACAATGGAGAAGGAGGAGATGGCAGAGATGTCAATAGGAGGAAAAGCAAAAGGGTGTTA 109688394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4351 GACAATGGAGAAGGAGGAGATGGCAGAGATGTCAATAGGAGGAAAAGCAAAAGGGTGTTA 4410

109688395 TCATAGAAGGTGACAACAGAATATATCACAAAGAGGAATATGTTTGAATGTGTCAAATGT 109688454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4411 TCATAGAAGGTGACAACAGAATATATCACAAAGAGGAATATGTTTGAATGTGTCAAATGT 4470

109688455 TGTTATCACAGGCTATAGAAGTAAACACAAAGTCTTATGGGAATACTGAGGATGAGCTGC 109688514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4471 TGTTATCACAGGCTATAGAAGTAAACACAAAGTCTTATGGGAATACTGAGGATGAGCTGC 4530

109688515 CTCTAGTGTGTGTGAAACCCTGGCCAAATATTTGTTGTGGGGCCCCTGTCTATATATGCA 109688574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4531 CTCTAGTGTGTGTGAAACCCTGGCCAAATATTTGTTGTGGGGCCCCTGTCTATATATGCA 4590

109688575 ATGTTATTTAAAAACATACTACATATTCTTGGGCTTATGTGGGATGTAGTGATTTATTGA 109688634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4591 ATGTTATTTAAAAACATACTACATATTCTTGGGCTTATGTGGGATGTAGTGATTTATTGA 4650

109688635 TGAAGACTTAGAATACTGGGTAGGAAGAGATGCTTTTGGATTTGTTTATGAGCCAGTGAG 109688694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4651 TGAAGACTTAGAATACTGGGTAGGAAGAGATGCTTTTGGATTTGTTTATGAGCCAGTGAG 4710

109688695 TGTATCTGAGGATTCTTTATCCTGTGTCTAATGTGAGTGTGTTTTCCTGAATCAGTGCAT 109688754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4711 TGTATCTGAGGATTCTTTATCCTGTGTCTAATGTGAGTGTGTTTTCCTGAATCAGTGCAT 4770

109688755 CAGTGCTATTCTGGAGGCCCAAATCACACATGATTCCGTGAAAGAAACTCTGTGCTGGCC 109688814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4771 CAGTGCTATTCTGGAGGCCCAAATCACACATGATTCCGTGAAAGAAACTCTGTGCTGGCC 4830

109688815 AGAGGATGCACTCACTCTCCAGGCTTTCCTGCATGGGCCCTCACCATGGAGTCCTGGATA 109688874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4831 AGAGGATGCACTCACTCTCCAGGCTTTCCTGCATGGGCCCTCACCATGGAGTCCTGGATA 4890

109688875 CTTAGGGCATCTGGTTGACCACATGCTTGGGAGAGCACCAAAGAAGGTCCTGGTTTTCAA 109688934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4891 CTTAGGGCATCTGGTTGACCACATGCTTGGGAGAGCACCAAAGAAGGTCCTGGTTTTCAA 4950

109688935 GCCTCCAGCTTCTCCTTAGAAAGAGTTGACTACCTGTCTGGGCTCCAACTTTTCTGGCTG 109688994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4951 GCCTCCAGCTTCTCCTTAGAAAGAGTTGACTACCTGTCTGGGCTCCAACTTTTCTGGCTG 5010

109688995 CTACCAGAGGGTCTGGCCTCTAAACCATCTGTGTCAAAGAACTGACAGGGCCTGACATTC 109689054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5011 CTACCAGAGGGTCTGGCCTCTAAACCATCTGTGTCAAAGAACTGACAGGGCCTGACATTC 5070

109689055 ACTGGGACCCTAGGCTAGGGGTGACAGAGAGCAAAGCAAAAGTTTGAAAGAGTATGCAGT 109689114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5071 ACTGGGACCCTAGGCTAGGGGTGACAGAGAGCAAAGCAAAAGTTTGAAAGAGTATGCAGT 5130

109689115 CTGAATGAGCATGCAGACCTTTGCCACAGCTCCCCTTCCCAGCTCAGTGCAGAGCAAGTA 109689174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5131 CTGAATGAGCATGCAGACCTTTGCCACAGCTCCCCTTCCCAGCTCAGTGCAGAGCAAGTA 5190

109689175 GGAGATAAACTTCTGCTCTTAGCTTCTCTGTGAGGAGAGATGAAATGGACCACACATCTA 109689234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5191 GGAGATAAACTTCTGCTCTTAGCTTCTCTGTGAGGAGAGATGAAATGGACCACACATCTA 5250

109689235 GCACCCCAACTTTTCTGACAACTACTAGAAGGACTGACTCCTGACTCACCTGTCTCAGGG 109689294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5251 GCACCCCAACTTTTCTGACAACTACTAGAAGGACTGACTCCTGACTCACCTGTCTCAGGG 5310

109689295 CACTGATGGTACTTGGCACACTCTAGTCTCCTGGGGCCACCAAGAACAAGAACAGCATTT 109689354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5311 CACTGATGGTACTTGGCACACTCTAGTCTCCTGGGGCCACCAAGAACAAGAACAGCATTT 5370

109689355 TGGACAAACACACTGGTTTGAGAGGCACCCAGACTCTCTGACTGGGCTGTGAGGAGGCTC 109689414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5371 TGGACAAACACACTGGTTTGAGAGGCACCCAGACTCTCTGACTGGGCTGTGAGGAGGCTC 5430

109689415 ATCTGTGAAGACTGAGGGAGGTGGCTGTTTTATCAAATGTGCAGAAACCAACACAGAGAG 109689474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5431 ATCTGTGAAGACTGAGGGAGGTGGCTGTTTTATCAAATGTGCAGAAACCAACACAGAGAG 5490

109689475 TCAAAGACAATGAACAAACAGGAAATATGCCATAAATAAAAGAACAAGATAAATCTTCAG 109689534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5491 TCAAAGACAATGAACAAACAGGAAATATGCCATAAATAAAAGAACAAGATAAATCTTCAG 5550

109689535 AAACTGACCCAAACAGAATGGAGATATGTGATTTACCAGACAAAAAATCAAAAGACCTGT 109689594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5551 AAACTGACCCAAACAGAATGGAGATATGTGATTTACCAGACAAAAAATCAAAAGACCTGT 5610

109689595 CACAAAGATGCTCAGTGAGGTCAGGAGAGCAATGCATGAATAAAGTGAGAATTTCAACCA 109689654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5611 CACAAAGATGCTCAGTGAGGTCAGGAGAGCAATGCATGAATAAAGTGAGAATTTCAACCA 5670

109689655 AAAAGGTAGAAAATATTAAAAAGTGCCAAACAGAAATCACGGAGCTGAAGAATATAATAA 109689714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5671 AAAAGGTAGAAAATATTAAAAAGTGCCAAACAGAAATCACGGAGCTGAAGAATATAATAA 5730

109689715 AAGAACAGAAAAATTTAATAGAGGGGTTCAATAGCAGACTAGGTGAACTGAAAGAAAGGA 109689774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5731 AAGAACAGAAAAATTTAATAGAGGGGTTCAATAGCAGACTAGGTGAACTGAAAGAAAGGA 5790

109689775 TTAGTGAACTCAAGGACTGGTCATTGGCAATCATTCAGTCACAGCATTAAAAAGAAAAAA 109689834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5791 TTAGTGAACTCAAGGACTGGTCATTGGCAATCATTCAGTCACAGCATTAAAAAGAAAAAA 5850

109689835 GAATGAAGGGCCAGGCACAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCTGAGG 109689894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5851 GAATGAAGGGCCAGGCACAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCTGAGG 5910

109689895 TGGGTGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATC 109689954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5911 TGGGTGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATC 5970

109689955 TCTACTAAAAATACAAAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCACGCACCTGTAATCCCAGCTA 109690014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5971 TCTACTAAAAATACAAAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCACGCACCTGTAATCCCAGCTA 6030

109690015 CTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTACTTGAACCTGGGAGGCTGAGGTTGCAGTGAGCTG 109690074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6031 CTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTACTTGAACCTGGGAGGCTGAGGTTGCAGTGAGCTG 6090

109690075 AGATTGCGCCACTGCACTCAGGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTCTGTCTCAAAAGAAAAA 109690134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6091 AGATTGCGCCACTGCACTCAGGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTCTGTCTCAAAAGAAAAA 6150

109690135 AAAAGAGAGAGAGAAGAAAAGAAAAAAGAATGAAAAACAGTGAAGATACCTTTAAAAACT 109690194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6151 AAAAGAGAGAGAGAAGAAAAGAAAAAAGAATGAAAAACAGTGAAGATACCTTTAAAAACT 6210

109690195 AATGAACACCACCCAGCAGATCTACATATGCATTATGAGACACTCAGACATTATGATATC 109690254
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6211 AATGAACACCACCCAGCAGTTCTACATATGCATTATGAGACACTCAGACATTATGATATC 6270

109690255 AGTAACACAGAATGTGGAATAAGGAGAGGTAAAATTGCAGAGTACTTCTATAGAAGTGTT 109690314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6271 AGTAACACAGAATGTGGAATAAGGAGAGGTAAAATTGCAGAGTACTTCTATAGAAGTGTT 6330

109690315 ATCAGTTTAACCTGTTATAAATATATGTTATGTAAGCCCCTGGTAACCACAAAGAAACTA 109690374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6331 ATCAGTTTAACCTGTTATAAATATATGTTATGTAAGCCCCTGGTAACCACAAAGAAACTA 6390

109690375 CCTATAGAAATGACACAAAAGAAAAAAAGTTACAAAGCCTATCAATGCAAAACAGCACAA 109690434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     6391 CCTATAGAAATGACACAAAAGAAAAAAAGTTACAAAGCCTGTCAATGCAAAACAGCACAA 6450

109690435 CAAAAACAGGCAAACAAAACCCAACAATAAAACACAAAGGAAGACAGCAAGAGAGAAAAA 109690494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6451 CAAAAACAGGCAAACAAAACCCAACAATAAAACACAAAGGAAGACAGCAAGAGAGAAAAA 6510

109690495 GAGGGACAAAAGAACTACAAGACAAACAGAAAACAGTTTTAAAAAAATGGCAATATGGTG 109690554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6511 GAGGGACAAAAGAACTACAAGACAAACAGAAAACAGTTTTAAAAAAATGGCAATATGGTG 6570

109690555 GTTCATACCTGTAATCCCAACACTTAGGAAGGCCGAGACGAGCAGATCACTTGAGGTCAG 109690614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6571 GTTCATACCTGTAATCCCAACACTTAGGAAGGCCGAGACGAGCAGATCACTTGAGGTCAG 6630

109690615 GAGTTTGAGACCAACCTGGCCAACATAGTGAAACCTGGTCTCTACTAGAAATACACAAAA 109690674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6631 GAGTTTGAGACCAACCTGGCCAACATAGTGAAACCTGGTCTCTACTAGAAATACACAAAA 6690

109690675 TTTAGCCAGGTGTAGTGGCAGGAGCCTGTAATCCAGCTACTCGGGAGGCTGAAGCACAAG 109690734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6691 TTTAGCCAGGTGTAGTGGCAGGAGCCTGTAATCCAGCTACTCGGGAGGCTGAAGCACAAG 6750

109690735 AATTGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAACTGAGATTGTACCACTGCACTCCA 109690794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6751 AATTGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAACTGAGATTGTACCACTGCACTCCA 6810

109690795 GCCTGGACAACAGAGCAAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAGGCAATACTAAATCTTGCCCT 109690854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6811 GCCTGGACAACAGAGCAAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAGGCAATACTAAATCTTGCCCT 6870

109690855 ATCAATAATTACTTAAAATGGCTGAATGTGGCGGCTTATGCCTGTAATCCCAGCACTCTG 109690914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6871 ATCAATAATTACTTAAAATGGCTGAATGTGGCGGCTTATGCCTGTAATCCCAGCACTCTG 6930

109690915 GGAGGCCAAGGCAGGTAGATCACTTGAGACCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATG 109690974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6931 GGAGGCCAAGGCAGGTAGATCACTTGAGACCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATG 6990

109690975 ATGAAGCCCCATCTCTACTAAAAAATACAAAAATTAGCAGGGTGTGGTGGCATGTGCCTG 109691034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6991 ATGAAGCCCCATCTCTACTAAAAAATACAAAAATTAGCAGGGTGTGGTGGCATGTGCCTG 7050

109691035 TAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGAGAATAGCTTGAACCTGGGAAGTGGAGGCA 109691094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7051 TAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGAGAATAGCTTGAACCTGGGAAGTGGAGGCA 7110

109691095 GCAGTGAGCCAAGATCACACCGCTAGACTCCAGGCTGGGCAACAGAGCAAGACTGCATCT 109691154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7111 GCAGTGAGCCAAGATCACACCGCTAGACTCCAGGCTGGGCAACAGAGCAAGACTGCATCT 7170

109691155 CAAATAATAATAATAATAATAGTAATAATTACTTAAAATGTAAATGGATTGGCCAGGTTC 109691214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7171 CAAATAATAATAATAATAATAGTAATAATTACTTAAAATGTAAATGGATTGGCCAGGTTC 7230

109691215 ATGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCTGAGTCAGGAGGATCACGAGGTCAGGAGTT 109691273
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7231 ATGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCTGAGTCAGGAGGATCACGAGGTCAGGAGTT 7289

Alignment time is 6.53642 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [109679900,109705214] =>     25315 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [        1,     4476] =>      4476 nucs 'mol-32-2afd-042092_4476'

Score:        4411
Aligned:      4477        nucs
Identic:      4471 (100%) nucs =>      1970 (100%)      2501 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [109687930,109689900] EXCISED REGION [109695215,109697720]
 second seq =>  [        1,     1971] EXCISED REGION [     1972,     4476]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      5314 nucs [109689901,109695214]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        28 nucs [109689901,109689928] to [109695215,109695242]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [109689900,109689900] to [109695215,109695215]
 second seq =>         1 nucs [1971,1971] to [1972,1972]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

109687930 GACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACTCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTATCTGGG 109687989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACTCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTATCTGGG 60

109687990 TGTGGTGGTGTGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCATGAGAATCACTTG 109688049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGTGGTGGTGTGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCATGAGAATCACTTG 120

109688050 AACCTGGGAGGTAGAGGTTGCAGCGAGCCAAGATCACACCACTGCACTCTAGCAAGGGTG 109688109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AACCTGGGAGGTAGAGGTTGCAGCGAGCCAAGATCACACCACTGCACTCTAGCAAGGGTG 180

109688110 ACAAAGCAAGACTCTATCTCAAAAAAAAAAAGACATTTATGTAGAGATGTTAGGTTGGCA 109688169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACAAAGCAAGACTCTATCTCAAAAAAAAAAAGACATTTATGTAGAGATGTTAGGTTGGCA 240

109688170 GTTGGATAACAGTCTTGAGTTTCGGGGTGAGGGCAGGACCAGAAATGAAGATTTGGGATT 109688229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTTGGATAACAGTCTTGAGTTTCGGGGTGAGGGCAGGACCAGAAATGAAGATTTGGGATT 300

109688230 CATTAGCATGTAGATCATATTCAGAGCCACAATAATAGATGAAATAACTGAGGAAGAGAG 109688289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CATTAGCATGTAGATCATATTCAGAGCCACAATAATAGATGAAATAACTGAGGAAGAGAG 360

109688290 CTAGAGGGGCCAAGAGCAAACACAGGAACATGCCAGCATTTAGAGGACAATGGAGAAGGA 109688349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTAGAGGGGCCAAGAGCAAACACAGGAACATGCCAGCATTTAGAGGACAATGGAGAAGGA 420

109688350 GGAGATGGCAGAGATGTCAATAGGAGGAAAAGCAAAAGGGTGTTATCATAGAAGGTGACA 109688409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGAGATGGCAGAGATGTCAATAGGAGGAAAAGCAAAAGGGTGTTATCATAGAAGGTGACA 480

109688410 ACAGAATATATCACAAAGAGGAATATGTTTGAATGTGTCAAATGTTGTTATCACAGGCTA 109688469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACAGAATATATCACAAAGAGGAATATGTTTGAATGTGTCAAATGTTGTTATCACAGGCTA 540

109688470 TAGAAGTAAACACAAAGTCTTATGGGAATACTGAGGATGAGCTGCCTCTAGTGTGTGTGA 109688529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TAGAAGTAAACACAAAGTCTTATGGGAATACTGAGGATGAGCTGCCTCTAGTGTGTGTGA 600

109688530 AACCCTGGCCAAATATTTGTTGTGGGGCCCCTGTCTATATATGCAATGTTATTTAAAAAC 109688589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AACCCTGGCCAAATATTTGTTGTGGGGCCCCTGTCTATATATGCAATGTTATTTAAAAAC 660

109688590 ATACTACATATTCTTGGGCTTATGTGGGATGTAGTGATTTATTGATGAAGACTTAGAATA 109688649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATACTACATATTCTTGGGCTTATGTGGGATGTAGTGATTTATTGATGAAGACTTAGAATA 720

109688650 CTGGGTAGGAAGAGATGCTTTTGGATTTGTTTATGAGCCAGTGAGTGTATCTGAGGATTC 109688709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTGGGTAGGAAGAGATGCTTTTGGATTTGTTTATGAGCCAGTGAGTGTATCTGAGGATTC 780

109688710 TTTATCCTGTGTCTAATGTGAGTGTGTTTTCCTGAATCAGTGCATCAGTGCTATTCTGGA 109688769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTTATCCTGTGTCTAATGTGAGTGTGTTTTCCTGAATCAGTGCATCAGTGCTATTCTGGA 840

109688770 GGCCCAAATCACACATGATTCCGTGAAAGAAACTCTGTGCTGGCCAGAGGATGCACTCAC 109688829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GGCCCAAATCACACATGATTCCGTGAAAGAAACTCTGTGCTGGCCAGAGGATGCACTCAC 900

109688830 TCTCCAGGCTTTCCTGCATGGGCCCTCACCATGGAGTCCTGGATACTTAGGGCATCTGGT 109688889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TCTCCAGGCTTTCCTGCATGGGCCCTCACCATGGAGTCCTGGATACTTAGGGCATCTGGT 960

109688890 TGACCACATGCTTGGGAGAGCACCAAAGAAGGTCCTGGTTTTCAAGCCTCCAGCTTCTCC 109688949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGACCACATGCTTGGGAGAGCACCAAAGAAGGTCCTGGTTTTCAAGCCTCCAGCTTCTCC 1020

109688950 TTAGAAAGAGTTGACTACCTGTCTGGGCTCCAACTTTTCTGGCTGCTACCAGAGGGTCTG 109689009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTAGAAAGAGTTGACTACCTGTCTGGGCTCCAACTTTTCTGGCTGCTACCAGAGGGTCTG 1080

109689010 GCCTCTAAACCATCTGTGTCAAAGAACTGACAGGGCCTGACATTCACTGGGACCCTAGGC 109689069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GCCTCTAAACCATCTGTGTCAAAGAACTGACAGGGCCTGACATTCACTGGGACCCTAGGC 1140

109689070 TAGGGGTGACAGAGAGCAAAGCAAAAGTTTGAAAGAGTATGCAGTCTGAATGAGCATGCA 109689129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TAGGGGTGACAGAGAGCAAAGCAAAAGTTTGAAAGAGTATGCAGTCTGAATGAGCATGCA 1200

109689130 GACCTTTGCCACAGCTCCCCTTCCCAGCTCAGTGCAGAGCAAGTAGGAGATAAACTTCTG 109689189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GACCTTTGCCACAGCTCCCCTTCCCAGCTCAGTGCAGAGCAAGTAGGAGATAAACTTCTG 1260

109689190 CTCTTAGCTTCTCTGTGAGGAGAGATGAAATGGACCACACATCTAGCACCCCAACTTTTC 109689249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTCTTAGCTTCTCTGTGAGGAGAGATGAAATGGACCACACATCTAGCACCCCAACTTTTC 1320

109689250 TGACAACTACTAGAAGGACTGACTCCTGACTCACCTGTCTCAGGGCACTGATGGTACTTG 109689309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGACAACTACTAGAAGGACTGACTCCTGACTCACCTGTCTCAGGGCACTGATGGTACTTG 1380

109689310 GCACACTCTAGTCTCCTGGGGCCACCAAGAACAAGAACAGCATTTTGGACAAACACACTG 109689369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GCACACTCTAGTCTCCTGGGGCCACCAAGAACAAGAACAGCATTTTGGACAAACACACTG 1440

109689370 GTTTGAGAGGCACCCAGACTCTCTGACTGGGCTGTGAGGAGGCTCATCTGTGAAGACTGA 109689429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GTTTGAGAGGCACCCAGACTCTCTGACTGGGCTGTGAGGAGGCTCATCTGTGAAGACTGA 1500

109689430 GGGAGGTGGCTGTTTTATCAAATGTGCAGAAACCAACACAGAGAGTCAAAGACAATGAAC 109689489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GGGAGGTGGCTGTTTTATCAAATGTGCAGAAACCAACACAGAGAGTCAAAGACAATGAAC 1560

109689490 AAACAGGAAATATGCCATAAATAAAAGAACAAGATAAATCTTCAGAAACTGACCCAAACA 109689549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     1561 AAACAGGAAATATGCCATAAATAAAAGAACAAGATAAAACTTCAGAAACTGACCCAAACA 1620

109689550 GAATGGAGATATGTGATTTACCAGACAAAAAATCAAAAGACCTGTCACAAAGATGCTCAG 109689609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GAATGGAGATATGTGATTTACCAGACAAAAAATCAAAAGACCTGTCACAAAGATGCTCAG 1680

109689610 TGAGGTCAGGAGAGCAATGCATGAATAAAGTGAGAATTTCAACCAAAAAGGTAGAAAATA 109689669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TGAGGTCAGGAGAGCAATGCATGAATAAAGTGAGAATTTCAACCAAAAAGGTAGAAAATA 1740

109689670 TTAAAAAGTGCCAAACAGAAATCACGGAGCTGAAGAATATAATAAAAGAACAGAAAAATT 109689729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TTAAAAAGTGCCAAACAGAAATCACGGAGCTGAAGAATATAATAAAAGAACAGAAAAATT 1800

109689730 TAATAGAGGGGTTCAATAGCAGACTAGGTGAACTGAAAGAAAGGATTAGTGAACTCAAGG 109689789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TAATAGAGGGGTTCAATAGCAGACTAGGTGAACTGAAAGAAAGGATTAGTGAACTCAAGG 1860

109689790 ACTGGTCATTGGCAATCATTCAGTCACAGCATTAAAAAGAAAAAAGAATGAAGGGCCAGG 109689849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ACTGGTCATTGGCAATCATTCAGTCACAGCATTAAAAAGAAAAAAGAATGAAGGGCCAGG 1920

109689850 CACAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTG 109689900
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CACAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTG 1971

EXCISED REGION

109695215 GATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATTCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATTTCAACT 109695274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1972 GATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATTCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATTTCAACT 2031

109695275 AAAAATACAAAAAAAAAAAAAAAATAGCCGGGTGTGGTGGCACACACCCGTAGTCCCAGC 109695334
          |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2032 AAAAATAC-AAAAAAAAAAAAAAATAGCCGGGTGTGGTGGCACACACCCGTAGTCCCAGC 2090

109695335 TACTTGGGAGGCTGGGGCAGGAGAATGGCATGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGC 109695394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2091 TACTTGGGAGGCTGGGGCAGGAGAATGGCATGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGC 2150

109695395 CGAGATCGCACAATTGCTTTCCAGCCTGGGCAACGGAGCGAGACTCTGTTTCAAAAAAAA 109695454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2151 CGAGATCGCACAATTGCTTTCCAGCCTGGGCAACGGAGCGAGACTCTGTTTCAAAAAAAA 2210

109695455 AGGTGACCATGTGAAGGGATGGATATGTTAAGTAGCTTGACTGGTAATCGGTTCACGATG 109695514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2211 AGGTGACCATGTGAAGGGATGGATATGTTAAGTAGCTTGACTGGTAATCGGTTCACGATG 2270

109695515 TATATGTACAGTTGACCCTTGAACAACATGCGTTTAAATTACAAGAGTCCACTTATATGG 109695574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2271 TATATGTACAGTTGACCCTTGAACAACATGCGTTTAAATTACAAGAGTCCACTTATATGG 2330

109695575 GGATTTTCTTCTGCCTCTGCCAGCAAGGCCAACCCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCCCCTCA 109695634
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2331 GGATTTTCTTCTGCCTTTGCCAGCAAGGCCAACCCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCCCCTCA 2390

109695635 ACTAAAGACGAGGAGGATGAGGACCTTTAGGGTGATCCACTTCCACTTAATGAATAGTAA 109695694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2391 ACTAAAGACGAGGAGGATGAGGACCTTTAGGGTGATCCACTTCCACTTAATGAATAGTAA 2450

109695695 ATACGGTTTCTCTTCCTTATGATTTTCTTAATATTTTCTTTTCCCTAACTTACTTTGTTG 109695754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2451 ATACGGTTTCTCTTCCTTATGATTTTCTTAATATTTTCTTTTCCCTAACTTACTTTGTTG 2510

109695755 TAAGAATGCAGTACTCAATACACGTAAGATACAAAATTTGTATGAATTGACTGTTTGTGT 109695814
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2511 TAAGAATGCAGTACACAATACACGTAAGATACAAAATTTGTATGAATTGACTGTTTGTGT 2570

109695815 TATCTGCAAGGCTTCCTGTCAACACTAGGGTATTAATAGTTAAGTTTTGGGGGAGTCAAA 109695874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2571 TATCTGCAAGGCTTCCTGTCAACACTAGGGTATTAATAGTTAAGTTTTGGGGGAGTCAAA 2630

109695875 AGTTATTTGTGGATTTTTTACTGTTCGGGGAGTTGGTGCCCCTAACCCCTTCGTTGTTAA 109695934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2631 AGTTATTTGTGGATTTTTTACTGTTCGGGGAGTTGGTGCCCCTAACCCCTTCGTTGTTAA 2690

109695935 AGAGTCAACTGTATATCAAAACATCGTGCTGTATACCTTAAATGTATATACTTTCAATTA 109695994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2691 AGAGTCAACTGTATATCAAAACATCGTGCTGTATACCTTAAATGTATATACTTTCAATTA 2750

109695995 AAATATTTTAAAAACAAACCAATAAAAAGGCACTGCTTCTGGCCCAGGGTGAGCCATCAG 109696054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2751 AAATATTTTAAAAACAAACCAATAAAAAGGCACTGCTTCTGGCCCAGGGTGAGCCATCAG 2810

109696055 ATGGCACAGCTGGCCCTGTCCGGTCCCAACCAGCAGAGGGGACTGTCAATTGAGAAGCTC 109696114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2811 ATGGCACAGCTGGCCCTGTCCGGTCCCAACCAGCAGAGGGGACTGTCAATTGAGAAGCTC 2870

109696115 CAGTGCTAAACGCTGGAATATGAAGATATGCATGGTGGGGAGACAGCACACACACACATA 109696174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2871 CAGTGCTAAACGCTGGAATATGAAGATATGCATGGTGGGGAGACAGCACACACACACATA 2930

109696175 ACACTCAAGGCCTGGTGGAGCCCACCCAGCTCAGCCTGGGTTGGGGAGGCTCCCTGGGAA 109696234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2931 ACACTCAAGGCCTGGTGGAGCCCACCCAGCTCAGCCTGGGTTGGGGAGGCTCCCTGGGAA 2990

109696235 GGGGATTCCTGATGTGAGCCTTCCAGGAGGGGTAGGAATTCTCTACACAGACAGGTGGGA 109696294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2991 GGGGATTCCTGATGTGAGCCTTCCAGGAGGGGTAGGAATTCTCTACACAGACAGGTGGGA 3050

109696295 ACTCCAGGCAGAGGGGAGGCCTGAAACACATCACAGGCCACCCTGTCCCTAGACTGCTGA 109696354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3051 ACTCCAGGCAGAGGGGAGGCCTGAAACACATCACAGGCCACCCTGTCCCTAGACTGCTGA 3110

109696355 GAGGCAGGACGGGGCTACACGGCCATGGGTGTGAGTCACCAAGGACCCTGTGCCTGCTGA 109696414
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     3111 GAGGCAGGACGGGGCTACACGGCCATGGGCGTGAGTCACCAAGGACCCTGTGCCTGCTGA 3170

109696415 GGCATGAGGACGCATTTCTGGGACGACAGAAAGACAGCAAAGGGCTTCAGACTATGGAAT 109696474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3171 GGCATGAGGACGCATTTCTGGGACGACAGAAAGACAGCAAAGGGCTTCAGACTATGGAAT 3230

109696475 ACCCGGAATAGGGCTCTAAGCATCTCCTCCGATGATTGTGGACTCAATGCAGGAAATGTG 109696534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3231 ACCCGGAATAGGGCTCTAAGCATCTCCTCCGATGATTGTGGACTCAATGCAGGAAATGTG 3290

109696535 GAGGCTTCGAGCTAGACCAGTGACAGAGGAGGGAAAAGGAGATGGGGCCCATCAATATTT 109696594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3291 GAGGCTTCGAGCTAGACCAGTGACAGAGGAGGGAAAAGGAGATGGGGCCCATCAATATTT 3350

109696595 GAAACTTGGCAAAACGCAGCAAGATTTTAATGGTTAATCAAAAATGGGAGGTGAATGGGA 109696654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3351 GAAACTTGGCAAAACGCAGCAAGATTTTAATGGTTAATCAAAAATGGGAGGTGAATGGGA 3410

109696655 GAAAGAGGAGCTGACAACCACTCCCACAATTCTGGTTTCCAGGGCGTGTTATAGCTGAGA 109696714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3411 GAAAGAGGAGCTGACAACCACTCCCACAATTCTGGTTTCCAGGGCGTGTTATAGCTGAGA 3470

109696715 GGGCAGCAGTTTGAGTGGCTGGGCAGCAGAGGCTGGGGTTGAGGCTGGGAAGTGGCGGCA 109696774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3471 GGGCAGCAGTTTGAGTGGCTGGGCAGCAGAGGCTGGGGTTGAGGCTGGGAAGTGGCGGCA 3530

109696775 GCAGGGGAGACTGCCCCATCAGGAGCCTGCCATAAGCGTGGGATGCAGAAGGACTGGAAG 109696834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3531 GCAGGGGAGACTGCCCCATCAGGAGCCTGCCATAAGCGTGGGATGCAGAAGGACTGGAAG 3590

109696835 GTGCTGGAGGTGATGTGGAGCTTTGGGAGAGTGTCGGAGGGATGGAATAAGTTGATGCCT 109696894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3591 GTGCTGGAGGTGATGTGGAGCTTTGGGAGAGTGTCGGAGGGATGGAATAAGTTGATGCCT 3650

109696895 GTTCCGAGACCAAGAAGTGGGGAGCAACTGAAGAAACTGGAGAGTGGGAACCAGGTTGCA 109696954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3651 GTTCCGAGACCAAGAAGTGGGGAGCAACTGAAGAAACTGGAGAGTGGGAACCAGGTTGCA 3710

109696955 GCTGGTCTCCAGATGCTGCACTCTCTGACAGCTCTCATCTATCTCACTGTCACCCAGGAT 109697014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3711 GCTGGTCTCCAGATGCTGCACTCTCTGACAGCTCTCATCTATCTCACTGTCACCCAGGAT 3770

109697015 TGGACAGGACATCTACAAATGTGCATGTGTATTTGCTATAAGGTGCATTCTTTTCCCCTG 109697074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3771 TGGACAGGACATCTACAAATGTGCATGTGTATTTGCTATAAGGTGCATTCTTTTCCCCTG 3830

109697075 GAGATAGTGACCAACCTTTCAAGAACTATTCTTGGGTATATTTTATCATTTCTTTATTTT 109697134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3831 GAGATAGTGACCAACCTTTCAAGAACTATTCTTGGGTATATTTTATCATTTCTTTATTTT 3890

109697135 AGTATCTATGAAGGGAACATTATAGAAGCCATGTTAACACTGGAGAAATGTCTAATATTA 109697194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3891 AGTATCTATGAAGGGAACATTATAGAAGCCATGTTAACACTGGAGAAATGTCTAATATTA 3950

109697195 AAAAACCAGTACTCTAGCAAGTAAAATTATGTATGTGTGTAACCTCGTTCCTACATCCAG 109697254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3951 AAAAACCAGTACTCTAGCAAGTAAAATTATGTATGTGTGTAACCTCGTTCCTACATCCAG 4010

109697255 GAAATCATTAAACTAGTAGGGGGTTGTATTAATTAGAACTCTCTGTTGCAAACAACAGAC 109697314
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     4011 GAAATCATTAAACTAGTAGGGGGTTGTATTAATCAGAACTCTCTGTTGCAAACAACAGAC 4070

109697315 AGTCTGGATGATTTAAAAGGAACAGAAATGTATTAAGAGGATATTGGATAGTTCACAAAA 109697374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4071 AGTCTGGATGATTTAAAAGGAACAGAAATGTATTAAGAGGATATTGGATAGTTCACAAAA 4130

109697375 CCTCCAGGAGGGCTGGAGAGCCAGGCTGGATGCTGTGCCACTGACACAACATTCAAAACT 109697434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4131 CCTCCAGGAGGGCTGGAGAGCCAGGCTGGATGCTGTGCCACTGACACAACATTCAAAACT 4190

109697435 CACAGATTCTTCTGCTGCCATCCACTATGCTAGCTACCAGCCATGCATGGCCATGCAGCA 109697494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4191 CACAGATTCTTCTGCTGCCATCCACTATGCTAGCTACCAGCCATGCATGGCCATGCAGCA 4250

109697495 CTTGATGTGTGCCTGCCCAACTGAGATGTGCTGCAGGTGCACAATACTCACTGGACTTCG 109697554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4251 CTTGATGTGTGCCTGCCCAACTGAGATGTGCTGCAGGTGCACAATACTCACTGGACTTCG 4310

109697555 AAGACTAAACGTGAAGAAAGGACATAAAATCTCACTCAGGTTAAAATGATATCTGCACAC 109697614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4311 AAGACTAAACGTGAAGAAAGGACATAAAATCTCACTCAGGTTAAAATGATATCTGCACAC 4370

109697615 ACTGGGTATTAAGTAAAATACATTGAAATTAATTTCACTTGTTTCTTTTTGCTTTTTAAA 109697674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4371 ACTGGGTATTAAGTAAAATACATTGAAATTAATTTCACTTGTTTCTTTTTGCTTTTTAAA 4430

109697675 TGCAGTTACTAGAAAATTTTACATTACCTGTGGGAAATTGGCTCCA 109697720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4431 TGCAGTTACTAGAAAATTTTACATTACCTGTGGGAAATTGGCTCCA 4476

Alignment time is 4.04702 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [109679900,109705214] =>     25315 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [        1,     2156] =>      2156 nucs 'mol-32-2afd-042092_2156'

Score:        2135
Aligned:      2157        nucs
Identic:      2155 (100%) nucs =>      1970 (100%)       185 ( 99%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [109687930,109689900] EXCISED REGION [109695215,109695400]
 second seq =>  [        1,     1971] EXCISED REGION [     1972,     2156]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      5314 nucs [109689901,109695214]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        28 nucs [109689901,109689928] to [109695215,109695242]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [109689900,109689900] to [109695215,109695215]
 second seq =>         1 nucs [1971,1971] to [1972,1972]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

109687930 GACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACTCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTATCTGGG 109687989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACTCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTATCTGGG 60

109687990 TGTGGTGGTGTGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCATGAGAATCACTTG 109688049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGTGGTGGTGTGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCATGAGAATCACTTG 120

109688050 AACCTGGGAGGTAGAGGTTGCAGCGAGCCAAGATCACACCACTGCACTCTAGCAAGGGTG 109688109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AACCTGGGAGGTAGAGGTTGCAGCGAGCCAAGATCACACCACTGCACTCTAGCAAGGGTG 180

109688110 ACAAAGCAAGACTCTATCTCAAAAAAAAAAAGACATTTATGTAGAGATGTTAGGTTGGCA 109688169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACAAAGCAAGACTCTATCTCAAAAAAAAAAAGACATTTATGTAGAGATGTTAGGTTGGCA 240

109688170 GTTGGATAACAGTCTTGAGTTTCGGGGTGAGGGCAGGACCAGAAATGAAGATTTGGGATT 109688229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTTGGATAACAGTCTTGAGTTTCGGGGTGAGGGCAGGACCAGAAATGAAGATTTGGGATT 300

109688230 CATTAGCATGTAGATCATATTCAGAGCCACAATAATAGATGAAATAACTGAGGAAGAGAG 109688289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CATTAGCATGTAGATCATATTCAGAGCCACAATAATAGATGAAATAACTGAGGAAGAGAG 360

109688290 CTAGAGGGGCCAAGAGCAAACACAGGAACATGCCAGCATTTAGAGGACAATGGAGAAGGA 109688349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTAGAGGGGCCAAGAGCAAACACAGGAACATGCCAGCATTTAGAGGACAATGGAGAAGGA 420

109688350 GGAGATGGCAGAGATGTCAATAGGAGGAAAAGCAAAAGGGTGTTATCATAGAAGGTGACA 109688409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGAGATGGCAGAGATGTCAATAGGAGGAAAAGCAAAAGGGTGTTATCATAGAAGGTGACA 480

109688410 ACAGAATATATCACAAAGAGGAATATGTTTGAATGTGTCAAATGTTGTTATCACAGGCTA 109688469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACAGAATATATCACAAAGAGGAATATGTTTGAATGTGTCAAATGTTGTTATCACAGGCTA 540

109688470 TAGAAGTAAACACAAAGTCTTATGGGAATACTGAGGATGAGCTGCCTCTAGTGTGTGTGA 109688529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TAGAAGTAAACACAAAGTCTTATGGGAATACTGAGGATGAGCTGCCTCTAGTGTGTGTGA 600

109688530 AACCCTGGCCAAATATTTGTTGTGGGGCCCCTGTCTATATATGCAATGTTATTTAAAAAC 109688589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AACCCTGGCCAAATATTTGTTGTGGGGCCCCTGTCTATATATGCAATGTTATTTAAAAAC 660

109688590 ATACTACATATTCTTGGGCTTATGTGGGATGTAGTGATTTATTGATGAAGACTTAGAATA 109688649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATACTACATATTCTTGGGCTTATGTGGGATGTAGTGATTTATTGATGAAGACTTAGAATA 720

109688650 CTGGGTAGGAAGAGATGCTTTTGGATTTGTTTATGAGCCAGTGAGTGTATCTGAGGATTC 109688709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTGGGTAGGAAGAGATGCTTTTGGATTTGTTTATGAGCCAGTGAGTGTATCTGAGGATTC 780

109688710 TTTATCCTGTGTCTAATGTGAGTGTGTTTTCCTGAATCAGTGCATCAGTGCTATTCTGGA 109688769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTTATCCTGTGTCTAATGTGAGTGTGTTTTCCTGAATCAGTGCATCAGTGCTATTCTGGA 840

109688770 GGCCCAAATCACACATGATTCCGTGAAAGAAACTCTGTGCTGGCCAGAGGATGCACTCAC 109688829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GGCCCAAATCACACATGATTCCGTGAAAGAAACTCTGTGCTGGCCAGAGGATGCACTCAC 900

109688830 TCTCCAGGCTTTCCTGCATGGGCCCTCACCATGGAGTCCTGGATACTTAGGGCATCTGGT 109688889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TCTCCAGGCTTTCCTGCATGGGCCCTCACCATGGAGTCCTGGATACTTAGGGCATCTGGT 960

109688890 TGACCACATGCTTGGGAGAGCACCAAAGAAGGTCCTGGTTTTCAAGCCTCCAGCTTCTCC 109688949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGACCACATGCTTGGGAGAGCACCAAAGAAGGTCCTGGTTTTCAAGCCTCCAGCTTCTCC 1020

109688950 TTAGAAAGAGTTGACTACCTGTCTGGGCTCCAACTTTTCTGGCTGCTACCAGAGGGTCTG 109689009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTAGAAAGAGTTGACTACCTGTCTGGGCTCCAACTTTTCTGGCTGCTACCAGAGGGTCTG 1080

109689010 GCCTCTAAACCATCTGTGTCAAAGAACTGACAGGGCCTGACATTCACTGGGACCCTAGGC 109689069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GCCTCTAAACCATCTGTGTCAAAGAACTGACAGGGCCTGACATTCACTGGGACCCTAGGC 1140

109689070 TAGGGGTGACAGAGAGCAAAGCAAAAGTTTGAAAGAGTATGCAGTCTGAATGAGCATGCA 109689129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TAGGGGTGACAGAGAGCAAAGCAAAAGTTTGAAAGAGTATGCAGTCTGAATGAGCATGCA 1200

109689130 GACCTTTGCCACAGCTCCCCTTCCCAGCTCAGTGCAGAGCAAGTAGGAGATAAACTTCTG 109689189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GACCTTTGCCACAGCTCCCCTTCCCAGCTCAGTGCAGAGCAAGTAGGAGATAAACTTCTG 1260

109689190 CTCTTAGCTTCTCTGTGAGGAGAGATGAAATGGACCACACATCTAGCACCCCAACTTTTC 109689249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTCTTAGCTTCTCTGTGAGGAGAGATGAAATGGACCACACATCTAGCACCCCAACTTTTC 1320

109689250 TGACAACTACTAGAAGGACTGACTCCTGACTCACCTGTCTCAGGGCACTGATGGTACTTG 109689309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGACAACTACTAGAAGGACTGACTCCTGACTCACCTGTCTCAGGGCACTGATGGTACTTG 1380

109689310 GCACACTCTAGTCTCCTGGGGCCACCAAGAACAAGAACAGCATTTTGGACAAACACACTG 109689369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GCACACTCTAGTCTCCTGGGGCCACCAAGAACAAGAACAGCATTTTGGACAAACACACTG 1440

109689370 GTTTGAGAGGCACCCAGACTCTCTGACTGGGCTGTGAGGAGGCTCATCTGTGAAGACTGA 109689429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GTTTGAGAGGCACCCAGACTCTCTGACTGGGCTGTGAGGAGGCTCATCTGTGAAGACTGA 1500

109689430 GGGAGGTGGCTGTTTTATCAAATGTGCAGAAACCAACACAGAGAGTCAAAGACAATGAAC 109689489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GGGAGGTGGCTGTTTTATCAAATGTGCAGAAACCAACACAGAGAGTCAAAGACAATGAAC 1560

109689490 AAACAGGAAATATGCCATAAATAAAAGAACAAGATAAATCTTCAGAAACTGACCCAAACA 109689549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     1561 AAACAGGAAATATGCCATAAATAAAAGAACAAGATAAAACTTCAGAAACTGACCCAAACA 1620

109689550 GAATGGAGATATGTGATTTACCAGACAAAAAATCAAAAGACCTGTCACAAAGATGCTCAG 109689609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GAATGGAGATATGTGATTTACCAGACAAAAAATCAAAAGACCTGTCACAAAGATGCTCAG 1680

109689610 TGAGGTCAGGAGAGCAATGCATGAATAAAGTGAGAATTTCAACCAAAAAGGTAGAAAATA 109689669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TGAGGTCAGGAGAGCAATGCATGAATAAAGTGAGAATTTCAACCAAAAAGGTAGAAAATA 1740

109689670 TTAAAAAGTGCCAAACAGAAATCACGGAGCTGAAGAATATAATAAAAGAACAGAAAAATT 109689729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TTAAAAAGTGCCAAACAGAAATCACGGAGCTGAAGAATATAATAAAAGAACAGAAAAATT 1800

109689730 TAATAGAGGGGTTCAATAGCAGACTAGGTGAACTGAAAGAAAGGATTAGTGAACTCAAGG 109689789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TAATAGAGGGGTTCAATAGCAGACTAGGTGAACTGAAAGAAAGGATTAGTGAACTCAAGG 1860

109689790 ACTGGTCATTGGCAATCATTCAGTCACAGCATTAAAAAGAAAAAAGAATGAAGGGCCAGG 109689849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ACTGGTCATTGGCAATCATTCAGTCACAGCATTAAAAAGAAAAAAGAATGAAGGGCCAGG 1920

109689850 CACAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTG 109689900
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CACAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTG 1971

EXCISED REGION

109695215 GATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATTCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATTTCAACT 109695274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1972 GATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATTCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATTTCAACT 2031

109695275 AAAAATACAAAAAAAAAAAAAAAATAGCCGGGTGTGGTGGCACACACCCGTAGTCCCAGC 109695334
          |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2032 AAAAATAC-AAAAAAAAAAAAAAATAGCCGGGTGTGGTGGCACACACCCGTAGTCCCAGC 2090

109695335 TACTTGGGAGGCTGGGGCAGGAGAATGGCATGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGC 109695394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2091 TACTTGGGAGGCTGGGGCAGGAGAATGGCATGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGC 2150

109695395 CGAGAT 109695400
          ||||||
     2151 CGAGAT 2156

Alignment time is 1.95388 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [109679900,109705214] =>     25315 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [        1,     2932] =>      2932 nucs 'mol-32-2b4a-014905_2932'

Score:        2932
Aligned:      2932        nucs
Identic:      2932 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [109687411,109690342]
 second seq =>  [        1,     2932]

109687411 CCATTATTGTGAGCTTCCTGAGGCCTCACCAGGAGCAGATGTGAGCAAATTAAACCTCTT 109687470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCATTATTGTGAGCTTCCTGAGGCCTCACCAGGAGCAGATGTGAGCAAATTAAACCTCTT 60

109687471 TTCTTTATAAATTACCCATATTTAGGTATTTATTTATAGCTACTACAAGGGGGAAAGGGA 109687530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTCTTTATAAATTACCCATATTTAGGTATTTATTTATAGCTACTACAAGGGGGAAAGGGA 120

109687531 GAGCAGGGAGATCAGTGGTGCTTTCACACTAGTACAGCAATAGAGCAGCATCTTGGACCA 109687590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GAGCAGGGAGATCAGTGGTGCTTTCACACTAGTACAGCAATAGAGCAGCATCTTGGACCA 180

109687591 GGGTGGTGGCTGAGGAGACAGGATCATGGCTTTGAGATACATTCTGAAGAAGAAAAGTAG 109687650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGGTGGTGGCTGAGGAGACAGGATCATGGCTTTGAGATACATTCTGAAGAAGAAAAGTAG 240

109687651 GCCTTGCTGATAGAATAGTCACAAACTGTAATGGAAAAGGTAAATTCAAGGATGTCTCCT 109687710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GCCTTGCTGATAGAATAGTCACAAACTGTAATGGAAAAGGTAAATTCAAGGATGTCTCCT 300

109687711 GGGTTTTTGGCTTAAGCATCTGGATACAGAGATATGGAAGACTGGGAGGGAAATGGGTTT 109687770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GGGTTTTTGGCTTAAGCATCTGGATACAGAGATATGGAAGACTGGGAGGGAAATGGGTTT 360

109687771 GGAGTATACATGCATGCAATCAACAATTCTGTCTTGCATGTGTGAAATTTAGATACCCAT 109687830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGAGTATACATGCATGCAATCAACAATTCTGTCTTGCATGTGTGAAATTTAGATACCCAT 420

109687831 TAGACATCTGCATAGAGGGCCAGGCACAGTGGCTCACGGCAGTAATCCCAACACTTTGGG 109687890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TAGACATCTGCATAGAGGGCCAGGCACAGTGGCTCACGGCAGTAATCCCAACACTTTGGG 480

109687891 AGGCCAAGGTGGGCGGATCACTTGAGGTTAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGT 109687950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGGCCAAGGTGGGCGGATCACTTGAGGTTAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGT 540

109687951 GAAACTCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTATCTGGGTGTGGTGGTGTGCACCTGTAA 109688010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GAAACTCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTATCTGGGTGTGGTGGTGTGCACCTGTAA 600

109688011 TCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCATGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGTAGAGGTTGC 109688070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCATGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGTAGAGGTTGC 660

109688071 AGCGAGCCAAGATCACACCACTGCACTCTAGCAAGGGTGACAAAGCAAGACTCTATCTCA 109688130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGCGAGCCAAGATCACACCACTGCACTCTAGCAAGGGTGACAAAGCAAGACTCTATCTCA 720

109688131 AAAAAAAAAAGACATTTATGTAGAGATGTTAGGTTGGCAGTTGGATAACAGTCTTGAGTT 109688190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAAAAAAAAAGACATTTATGTAGAGATGTTAGGTTGGCAGTTGGATAACAGTCTTGAGTT 780

109688191 TCGGGGTGAGGGCAGGACCAGAAATGAAGATTTGGGATTCATTAGCATGTAGATCATATT 109688250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCGGGGTGAGGGCAGGACCAGAAATGAAGATTTGGGATTCATTAGCATGTAGATCATATT 840

109688251 CAGAGCCACAATAATAGATGAAATAACTGAGGAAGAGAGCTAGAGGGGCCAAGAGCAAAC 109688310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CAGAGCCACAATAATAGATGAAATAACTGAGGAAGAGAGCTAGAGGGGCCAAGAGCAAAC 900

109688311 ACAGGAACATGCCAGCATTTAGAGGACAATGGAGAAGGAGGAGATGGCAGAGATGTCAAT 109688370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ACAGGAACATGCCAGCATTTAGAGGACAATGGAGAAGGAGGAGATGGCAGAGATGTCAAT 960

109688371 AGGAGGAAAAGCAAAAGGGTGTTATCATAGAAGGTGACAACAGAATATATCACAAAGAGG 109688430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AGGAGGAAAAGCAAAAGGGTGTTATCATAGAAGGTGACAACAGAATATATCACAAAGAGG 1020

109688431 AATATGTTTGAATGTGTCAAATGTTGTTATCACAGGCTATAGAAGTAAACACAAAGTCTT 109688490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AATATGTTTGAATGTGTCAAATGTTGTTATCACAGGCTATAGAAGTAAACACAAAGTCTT 1080

109688491 ATGGGAATACTGAGGATGAGCTGCCTCTAGTGTGTGTGAAACCCTGGCCAAATATTTGTT 109688550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATGGGAATACTGAGGATGAGCTGCCTCTAGTGTGTGTGAAACCCTGGCCAAATATTTGTT 1140

109688551 GTGGGGCCCCTGTCTATATATGCAATGTTATTTAAAAACATACTACATATTCTTGGGCTT 109688610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GTGGGGCCCCTGTCTATATATGCAATGTTATTTAAAAACATACTACATATTCTTGGGCTT 1200

109688611 ATGTGGGATGTAGTGATTTATTGATGAAGACTTAGAATACTGGGTAGGAAGAGATGCTTT 109688670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATGTGGGATGTAGTGATTTATTGATGAAGACTTAGAATACTGGGTAGGAAGAGATGCTTT 1260

109688671 TGGATTTGTTTATGAGCCAGTGAGTGTATCTGAGGATTCTTTATCCTGTGTCTAATGTGA 109688730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGGATTTGTTTATGAGCCAGTGAGTGTATCTGAGGATTCTTTATCCTGTGTCTAATGTGA 1320

109688731 GTGTGTTTTCCTGAATCAGTGCATCAGTGCTATTCTGGAGGCCCAAATCACACATGATTC 109688790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GTGTGTTTTCCTGAATCAGTGCATCAGTGCTATTCTGGAGGCCCAAATCACACATGATTC 1380

109688791 CGTGAAAGAAACTCTGTGCTGGCCAGAGGATGCACTCACTCTCCAGGCTTTCCTGCATGG 109688850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CGTGAAAGAAACTCTGTGCTGGCCAGAGGATGCACTCACTCTCCAGGCTTTCCTGCATGG 1440

109688851 GCCCTCACCATGGAGTCCTGGATACTTAGGGCATCTGGTTGACCACATGCTTGGGAGAGC 109688910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GCCCTCACCATGGAGTCCTGGATACTTAGGGCATCTGGTTGACCACATGCTTGGGAGAGC 1500

109688911 ACCAAAGAAGGTCCTGGTTTTCAAGCCTCCAGCTTCTCCTTAGAAAGAGTTGACTACCTG 109688970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ACCAAAGAAGGTCCTGGTTTTCAAGCCTCCAGCTTCTCCTTAGAAAGAGTTGACTACCTG 1560

109688971 TCTGGGCTCCAACTTTTCTGGCTGCTACCAGAGGGTCTGGCCTCTAAACCATCTGTGTCA 109689030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TCTGGGCTCCAACTTTTCTGGCTGCTACCAGAGGGTCTGGCCTCTAAACCATCTGTGTCA 1620

109689031 AAGAACTGACAGGGCCTGACATTCACTGGGACCCTAGGCTAGGGGTGACAGAGAGCAAAG 109689090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AAGAACTGACAGGGCCTGACATTCACTGGGACCCTAGGCTAGGGGTGACAGAGAGCAAAG 1680

109689091 CAAAAGTTTGAAAGAGTATGCAGTCTGAATGAGCATGCAGACCTTTGCCACAGCTCCCCT 109689150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CAAAAGTTTGAAAGAGTATGCAGTCTGAATGAGCATGCAGACCTTTGCCACAGCTCCCCT 1740

109689151 TCCCAGCTCAGTGCAGAGCAAGTAGGAGATAAACTTCTGCTCTTAGCTTCTCTGTGAGGA 109689210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TCCCAGCTCAGTGCAGAGCAAGTAGGAGATAAACTTCTGCTCTTAGCTTCTCTGTGAGGA 1800

109689211 GAGATGAAATGGACCACACATCTAGCACCCCAACTTTTCTGACAACTACTAGAAGGACTG 109689270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GAGATGAAATGGACCACACATCTAGCACCCCAACTTTTCTGACAACTACTAGAAGGACTG 1860

109689271 ACTCCTGACTCACCTGTCTCAGGGCACTGATGGTACTTGGCACACTCTAGTCTCCTGGGG 109689330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ACTCCTGACTCACCTGTCTCAGGGCACTGATGGTACTTGGCACACTCTAGTCTCCTGGGG 1920

109689331 CCACCAAGAACAAGAACAGCATTTTGGACAAACACACTGGTTTGAGAGGCACCCAGACTC 109689390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CCACCAAGAACAAGAACAGCATTTTGGACAAACACACTGGTTTGAGAGGCACCCAGACTC 1980

109689391 TCTGACTGGGCTGTGAGGAGGCTCATCTGTGAAGACTGAGGGAGGTGGCTGTTTTATCAA 109689450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TCTGACTGGGCTGTGAGGAGGCTCATCTGTGAAGACTGAGGGAGGTGGCTGTTTTATCAA 2040

109689451 ATGTGCAGAAACCAACACAGAGAGTCAAAGACAATGAACAAACAGGAAATATGCCATAAA 109689510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ATGTGCAGAAACCAACACAGAGAGTCAAAGACAATGAACAAACAGGAAATATGCCATAAA 2100

109689511 TAAAAGAACAAGATAAATCTTCAGAAACTGACCCAAACAGAATGGAGATATGTGATTTAC 109689570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TAAAAGAACAAGATAAATCTTCAGAAACTGACCCAAACAGAATGGAGATATGTGATTTAC 2160

109689571 CAGACAAAAAATCAAAAGACCTGTCACAAAGATGCTCAGTGAGGTCAGGAGAGCAATGCA 109689630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CAGACAAAAAATCAAAAGACCTGTCACAAAGATGCTCAGTGAGGTCAGGAGAGCAATGCA 2220

109689631 TGAATAAAGTGAGAATTTCAACCAAAAAGGTAGAAAATATTAAAAAGTGCCAAACAGAAA 109689690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TGAATAAAGTGAGAATTTCAACCAAAAAGGTAGAAAATATTAAAAAGTGCCAAACAGAAA 2280

109689691 TCACGGAGCTGAAGAATATAATAAAAGAACAGAAAAATTTAATAGAGGGGTTCAATAGCA 109689750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TCACGGAGCTGAAGAATATAATAAAAGAACAGAAAAATTTAATAGAGGGGTTCAATAGCA 2340

109689751 GACTAGGTGAACTGAAAGAAAGGATTAGTGAACTCAAGGACTGGTCATTGGCAATCATTC 109689810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GACTAGGTGAACTGAAAGAAAGGATTAGTGAACTCAAGGACTGGTCATTGGCAATCATTC 2400

109689811 AGTCACAGCATTAAAAAGAAAAAAGAATGAAGGGCCAGGCACAGTGGCTCACACCTGTAA 109689870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AGTCACAGCATTAAAAAGAAAAAAGAATGAAGGGCCAGGCACAGTGGCTCACACCTGTAA 2460

109689871 TCCCAACACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCC 109689930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TCCCAACACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCC 2520

109689931 TGGCTAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTAGCTGGGTGTGGT 109689990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TGGCTAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTAGCTGGGTGTGGT 2580

109689991 GGCACGCACCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTACTTGAACCTG 109690050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GGCACGCACCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTACTTGAACCTG 2640

109690051 GGAGGCTGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCGCCACTGCACTCAGGCCTGGGCAACAGAG 109690110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GGAGGCTGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCGCCACTGCACTCAGGCCTGGGCAACAGAG 2700

109690111 CGAGACTCTGTCTCAAAAGAAAAAAAAAGAGAGAGAGAAGAAAAGAAAAAAGAATGAAAA 109690170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CGAGACTCTGTCTCAAAAGAAAAAAAAAGAGAGAGAGAAGAAAAGAAAAAAGAATGAAAA 2760

109690171 ACAGTGAAGATACCTTTAAAAACTAATGAACACCACCCAGCAGATCTACATATGCATTAT 109690230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 ACAGTGAAGATACCTTTAAAAACTAATGAACACCACCCAGCAGATCTACATATGCATTAT 2820

109690231 GAGACACTCAGACATTATGATATCAGTAACACAGAATGTGGAATAAGGAGAGGTAAAATT 109690290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GAGACACTCAGACATTATGATATCAGTAACACAGAATGTGGAATAAGGAGAGGTAAAATT 2880

109690291 GCAGAGTACTTCTATAGAAGTGTTATCAGTTTAACCTGTTATAAATATATGT 109690342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 GCAGAGTACTTCTATAGAAGTGTTATCAGTTTAACCTGTTATAAATATATGT 2932

Alignment time is 2.30774 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [109679900,109705214] =>     25315 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [        1,     4242] =>      4242 nucs 'mol-32-2e0a-048411_4242'

Score:        4172
Aligned:      4216        nucs
Identic:      4212 (100%) nucs =>        11 (100%)      4201 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [109680809,109680819] EXCISED REGION [109687251,109691455]
 second seq =>  [        1,       11] EXCISED REGION [       39,     4242]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6431 nucs [109680820,109687250]
 second seq =>        27 nucs [12,38]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [12,12] to [39,39]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [109680819,109680819] to [109687251,109687251]
 second seq =>         1 nucs [11,11] to [39,39]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [109680820,109680820] to [109687250,109687250]
 second seq =>         0 nucs

109680809 GGCTGAGGCAG 109680819
          |||||||||||
        1 GGCTGAGGCAG 11

EXCISED REGION

109687251 GGTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAGCCAGACCCT 109687310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       39 GGTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAGCCAGACCCT 98

109687311 ATCTAAAAAAAAAAAAAAAAAATAGAGTGCGGCACCCCTCCCTTCCCACTGTTGCTCCCT 109687370
          |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       99 ATCT-AAAAAAAAAAAAAAAAATAGAGTGCGGCACCCCTCCCTTCCCACTGTTGCTCCCT 157

109687371 CTCTCGCCATGTGGGGCACGGGCTGCTCCTTCATCTTCCACCATTATTGTGAGCTTCCTG 109687430
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      158 CTCTCGCCATGTGGGGCATGGGCTGCTCCTTCATCTTCCACCATTATTGTGAGCTTCCTG 217

109687431 AGGCCTCACCAGGAGCAGATGTGAGCAAATTAAACCTCTTTTCTTTATAAATTACCCATA 109687490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      218 AGGCCTCACCAGGAGCAGATGTGAGCAAATTAAACCTCTTTTCTTTATAAATTACCCATA 277

109687491 TTTAGGTATTTATTTATAGCTACTACAAGGGGGAAAGGGAGAGCAGGGAGATCAGTGGTG 109687550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      278 TTTAGGTATTTATTTATAGCTACTACAAGGGGGAAAGGGAGAGCAGGGAGATCAGTGGTG 337

109687551 CTTTCACACTAGTACAGCAATAGAGCAGCATCTTGGACCAGGGTGGTGGCTGAGGAGACA 109687610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      338 CTTTCACACTAGTACAGCAATAGAGCAGCATCTTGGACCAGGGTGGTGGCTGAGGAGACA 397

109687611 GGATCATGGCTTTGAGATACATTCTGAAGAAGAAAAGTAGGCCTTGCTGATAGAATAGTC 109687670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      398 GGATCATGGCTTTGAGATACATTCTGAAGAAGAAAAGTAGGCCTTGCTGATAGAATAGTC 457

109687671 ACAAACTGTAATGGAAAAGGTAAATTCAAGGATGTCTCCTGGGTTTTTGGCTTAAGCATC 109687730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      458 ACAAACTGTAATGGAAAAGGTAAATTCAAGGATGTCTCCTGGGTTTTTGGCTTAAGCATC 517

109687731 TGGATACAGAGATATGGAAGACTGGGAGGGAAATGGGTTTGGAGTATACATGCATGCAAT 109687790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      518 TGGATACAGAGATATGGAAGACTGGGAGGGAAATGGGTTTGGAGTATACATGCATGCAAT 577

109687791 CAACAATTCTGTCTTGCATGTGTGAAATTTAGATACCCATTAGACATCTGCATAGAGGGC 109687850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      578 CAACAATTCTGTCTTGCATGTGTGAAATTTAGATACCCATTAGACATCTGCATAGAGGGC 637

109687851 CAGGCACAGTGGCTCACGGCAGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCGGATCA 109687910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      638 CAGGCACAGTGGCTCACGGCAGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCGGATCA 697

109687911 CTTGAGGTTAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACTCTGTCTCTACTAAA 109687970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      698 CTTGAGGTTAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACTCTGTCTCTACTAAA 757

109687971 AATACAAAAATTATCTGGGTGTGGTGGTGTGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCT 109688030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      758 AATACAAAAATTATCTGGGTGTGGTGGTGTGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCT 817

109688031 GAGGCATGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGTAGAGGTTGCAGCGAGCCAAGATCACACCA 109688090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      818 GAGGCATGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGTAGAGGTTGCAGCGAGCCAAGATCACACCA 877

109688091 CTGCACTCTAGCAAGGGTGACAAAGCAAGACTCTATCTCAAAAAAAAAAAGACATTTATG 109688150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      878 CTGCACTCTAGCAAGGGTGACAAAGCAAGACTCTATCTCAAAAAAAAAAAGACATTTATG 937

109688151 TAGAGATGTTAGGTTGGCAGTTGGATAACAGTCTTGAGTTTCGGGGTGAGGGCAGGACCA 109688210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      938 TAGAGATGTTAGGTTGGCAGTTGGATAACAGTCTTGAGTTTCGGGGTGAGGGCAGGACCA 997

109688211 GAAATGAAGATTTGGGATTCATTAGCATGTAGATCATATTCAGAGCCACAATAATAGATG 109688270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      998 GAAATGAAGATTTGGGATTCATTAGCATGTAGATCATATTCAGAGCCACAATAATAGATG 1057

109688271 AAATAACTGAGGAAGAGAGCTAGAGGGGCCAAGAGCAAACACAGGAACATGCCAGCATTT 109688330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1058 AAATAACTGAGGAAGAGAGCTAGAGGGGCCAAGAGCAAACACAGGAACATGCCAGCATTT 1117

109688331 AGAGGACAATGGAGAAGGAGGAGATGGCAGAGATGTCAATAGGAGGAAAAGCAAAAGGGT 109688390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1118 AGAGGACAATGGAGAAGGAGGAGATGGCAGAGATGTCAATAGGAGGAAAAGCAAAAGGGT 1177

109688391 GTTATCATAGAAGGTGACAACAGAATATATCACAAAGAGGAATATGTTTGAATGTGTCAA 109688450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1178 GTTATCATAGAAGGTGACAACAGAATATATCACAAAGAGGAATATGTTTGAATGTGTCAA 1237

109688451 ATGTTGTTATCACAGGCTATAGAAGTAAACACAAAGTCTTATGGGAATACTGAGGATGAG 109688510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1238 ATGTTGTTATCACAGGCTATAGAAGTAAACACAAAGTCTTATGGGAATACTGAGGATGAG 1297

109688511 CTGCCTCTAGTGTGTGTGAAACCCTGGCCAAATATTTGTTGTGGGGCCCCTGTCTATATA 109688570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1298 CTGCCTCTAGTGTGTGTGAAACCCTGGCCAAATATTTGTTGTGGGGCCCCTGTCTATATA 1357

109688571 TGCAATGTTATTTAAAAACATACTACATATTCTTGGGCTTATGTGGGATGTAGTGATTTA 109688630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1358 TGCAATGTTATTTAAAAACATACTACATATTCTTGGGCTTATGTGGGATGTAGTGATTTA 1417

109688631 TTGATGAAGACTTAGAATACTGGGTAGGAAGAGATGCTTTTGGATTTGTTTATGAGCCAG 109688690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1418 TTGATGAAGACTTAGAATACTGGGTAGGAAGAGATGCTTTTGGATTTGTTTATGAGCCAG 1477

109688691 TGAGTGTATCTGAGGATTCTTTATCCTGTGTCTAATGTGAGTGTGTTTTCCTGAATCAGT 109688750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1478 TGAGTGTATCTGAGGATTCTTTATCCTGTGTCTAATGTGAGTGTGTTTTCCTGAATCAGT 1537

109688751 GCATCAGTGCTATTCTGGAGGCCCAAATCACACATGATTCCGTGAAAGAAACTCTGTGCT 109688810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1538 GCATCAGTGCTATTCTGGAGGCCCAAATCACACATGATTCCGTGAAAGAAACTCTGTGCT 1597

109688811 GGCCAGAGGATGCACTCACTCTCCAGGCTTTCCTGCATGGGCCCTCACCATGGAGTCCTG 109688870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1598 GGCCAGAGGATGCACTCACTCTCCAGGCTTTCCTGCATGGGCCCTCACCATGGAGTCCTG 1657

109688871 GATACTTAGGGCATCTGGTTGACCACATGCTTGGGAGAGCACCAAAGAAGGTCCTGGTTT 109688930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1658 GATACTTAGGGCATCTGGTTGACCACATGCTTGGGAGAGCACCAAAGAAGGTCCTGGTTT 1717

109688931 TCAAGCCTCCAGCTTCTCCTTAGAAAGAGTTGACTACCTGTCTGGGCTCCAACTTTTCTG 109688990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1718 TCAAGCCTCCAGCTTCTCCTTAGAAAGAGTTGACTACCTGTCTGGGCTCCAACTTTTCTG 1777

109688991 GCTGCTACCAGAGGGTCTGGCCTCTAAACCATCTGTGTCAAAGAACTGACAGGGCCTGAC 109689050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1778 GCTGCTACCAGAGGGTCTGGCCTCTAAACCATCTGTGTCAAAGAACTGACAGGGCCTGAC 1837

109689051 ATTCACTGGGACCCTAGGCTAGGGGTGACAGAGAGCAAAGCAAAAGTTTGAAAGAGTATG 109689110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1838 ATTCACTGGGACCCTAGGCTAGGGGTGACAGAGAGCAAAGCAAAAGTTTGAAAGAGTATG 1897

109689111 CAGTCTGAATGAGCATGCAGACCTTTGCCACAGCTCCCCTTCCCAGCTCAGTGCAGAGCA 109689170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1898 CAGTCTGAATGAGCATGCAGACCTTTGCCACAGCTCCCCTTCCCAGCTCAGTGCAGAGCA 1957

109689171 AGTAGGAGATAAACTTCTGCTCTTAGCTTCTCTGTGAGGAGAGATGAAATGGACCACACA 109689230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1958 AGTAGGAGATAAACTTCTGCTCTTAGCTTCTCTGTGAGGAGAGATGAAATGGACCACACA 2017

109689231 TCTAGCACCCCAACTTTTCTGACAACTACTAGAAGGACTGACTCCTGACTCACCTGTCTC 109689290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2018 TCTAGCACCCCAACTTTTCTGACAACTACTAGAAGGACTGACTCCTGACTCACCTGTCTC 2077

109689291 AGGGCACTGATGGTACTTGGCACACTCTAGTCTCCTGGGGCCACCAAGAACAAGAACAGC 109689350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2078 AGGGCACTGATGGTACTTGGCACACTCTAGTCTCCTGGGGCCACCAAGAACAAGAACAGC 2137

109689351 ATTTTGGACAAACACACTGGTTTGAGAGGCACCCAGACTCTCTGACTGGGCTGTGAGGAG 109689410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2138 ATTTTGGACAAACACACTGGTTTGAGAGGCACCCAGACTCTCTGACTGGGCTGTGAGGAG 2197

109689411 GCTCATCTGTGAAGACTGAGGGAGGTGGCTGTTTTATCAAATGTGCAGAAACCAACACAG 109689470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2198 GCTCATCTGTGAAGACTGAGGGAGGTGGCTGTTTTATCAAATGTGCAGAAACCAACACAG 2257

109689471 AGAGTCAAAGACAATGAACAAACAGGAAATATGCCATAAATAAAAGAACAAGATAAATCT 109689530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2258 AGAGTCAAAGACAATGAACAAACAGGAAATATGCCATAAATAAAAGAACAAGATAAATCT 2317

109689531 TCAGAAACTGACCCAAACAGAATGGAGATATGTGATTTACCAGACAAAAAATCAAAAGAC 109689590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2318 TCAGAAACTGACCCAAACAGAATGGAGATATGTGATTTACCAGACAAAAAATCAAAAGAC 2377

109689591 CTGTCACAAAGATGCTCAGTGAGGTCAGGAGAGCAATGCATGAATAAAGTGAGAATTTCA 109689650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2378 CTGTCACAAAGATGCTCAGTGAGGTCAGGAGAGCAATGCATGAATAAAGTGAGAATTTCA 2437

109689651 ACCAAAAAGGTAGAAAATATTAAAAAGTGCCAAACAGAAATCACGGAGCTGAAGAATATA 109689710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2438 ACCAAAAAGGTAGAAAATATTAAAAAGTGCCAAACAGAAATCACGGAGCTGAAGAATATA 2497

109689711 ATAAAAGAACAGAAAAATTTAATAGAGGGGTTCAATAGCAGACTAGGTGAACTGAAAGAA 109689770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2498 ATAAAAGAACAGAAAAATTTAATAGAGGGGTTCAATAGCAGACTAGGTGAACTGAAAGAA 2557

109689771 AGGATTAGTGAACTCAAGGACTGGTCATTGGCAATCATTCAGTCACAGCATTAAAAAGAA 109689830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2558 AGGATTAGTGAACTCAAGGACTGGTCATTGGCAATCATTCAGTCACAGCATTAAAAAGAA 2617

109689831 AAAAGAATGAAGGGCCAGGCACAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCT 109689890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2618 AAAAGAATGAAGGGCCAGGCACAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCT 2677

109689891 GAGGTGGGTGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCC 109689950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2678 GAGGTGGGTGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCC 2737

109689951 CATCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCACGCACCTGTAATCCCA 109690010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2738 CATCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCACGCACCTGTAATCCCA 2797

109690011 GCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTACTTGAACCTGGGAGGCTGAGGTTGCAGTGA 109690070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2798 GCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTACTTGAACCTGGGAGGCTGAGGTTGCAGTGA 2857

109690071 GCTGAGATTGCGCCACTGCACTCAGGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTCTGTCTCAAAAGA 109690130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2858 GCTGAGATTGCGCCACTGCACTCAGGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTCTGTCTCAAAAGA 2917

109690131 AAAAAAAAGAGAGAGAGAAGAAAAGAAAAAAGAATGAAAAACAGTGAAGATACCTTTAAA 109690190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2918 AAAAAAAAGAGAGAGAGAAGAAAAGAAAAAAGAATGAAAAACAGTGAAGATACCTTTAAA 2977

109690191 AACTAATGAACACCACCCAGCAGATCTACATATGCATTATGAGACACTCAGACATTATGA 109690250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2978 AACTAATGAACACCACCCAGCAGATCTACATATGCATTATGAGACACTCAGACATTATGA 3037

109690251 TATCAGTAACACAGAATGTGGAATAAGGAGAGGTAAAATTGCAGAGTACTTCTATAGAAG 109690310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3038 TATCAGTAACACAGAATGTGGAATAAGGAGAGGTAAAATTGCAGAGTACTTCTATAGAAG 3097

109690311 TGTTATCAGTTTAACCTGTTATAAATATATGTTATGTAAGCCCCTGGTAACCACAAAGAA 109690370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3098 TGTTATCAGTTTAACCTGTTATAAATATATGTTATGTAAGCCCCTGGTAACCACAAAGAA 3157

109690371 ACTACCTATAGAAATGACACAAAAGAAAAAAAGTTACAAAGCCTATCAATGCAAAACAGC 109690430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     3158 ACTACCTATAGAAATGACACAAAAGAAAAAAAGTTACAAAGCCTGTCAATGCAAAACAGC 3217

109690431 ACAACAAAAACAGGCAAACAAAACCCAACAATAAAACACAAAGGAAGACAGCAAGAGAGA 109690490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3218 ACAACAAAAACAGGCAAACAAAACCCAACAATAAAACACAAAGGAAGACAGCAAGAGAGA 3277

109690491 AAAAGAGGGACAAAAGAACTACAAGACAAACAGAAAACAGTTTTAAAAAAATGGCAATAT 109690550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3278 AAAAGAGGGACAAAAGAACTACAAGACAAACAGAAAACAGTTTTAAAAAAATGGCAATAT 3337

109690551 GGTGGTTCATACCTGTAATCCCAACACTTAGGAAGGCCGAGACGAGCAGATCACTTGAGG 109690610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3338 GGTGGTTCATACCTGTAATCCCAACACTTAGGAAGGCCGAGACGAGCAGATCACTTGAGG 3397

109690611 TCAGGAGTTTGAGACCAACCTGGCCAACATAGTGAAACCTGGTCTCTACTAGAAATACAC 109690670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3398 TCAGGAGTTTGAGACCAACCTGGCCAACATAGTGAAACCTGGTCTCTACTAGAAATACAC 3457

109690671 AAAATTTAGCCAGGTGTAGTGGCAGGAGCCTGTAATCCAGCTACTCGGGAGGCTGAAGCA 109690730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3458 AAAATTTAGCCAGGTGTAGTGGCAGGAGCCTGTAATCCAGCTACTCGGGAGGCTGAAGCA 3517

109690731 CAAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAACTGAGATTGTACCACTGCAC 109690790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3518 CAAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAACTGAGATTGTACCACTGCAC 3577

109690791 TCCAGCCTGGACAACAGAGCAAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAGGCAATACTAAATCTTG 109690850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3578 TCCAGCCTGGACAACAGAGCAAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAGGCAATACTAAATCTTG 3637

109690851 CCCTATCAATAATTACTTAAAATGGCTGAATGTGGCGGCTTATGCCTGTAATCCCAGCAC 109690910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3638 CCCTATCAATAATTACTTAAAATGGCTGAATGTGGCGGCTTATGCCTGTAATCCCAGCAC 3697

109690911 TCTGGGAGGCCAAGGCAGGTAGATCACTTGAGACCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAA 109690970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3698 TCTGGGAGGCCAAGGCAGGTAGATCACTTGAGACCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAA 3757

109690971 CATGATGAAGCCCCATCTCTACTAAAAAATACAAAAATTAGCAGGGTGTGGTGGCATGTG 109691030
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3758 CATGAAGAAGCCCCATCTCTACTAAAAAATACAAAAATTAGCAGGGTGTGGTGGCATGTG 3817

109691031 CCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGAGAATAGCTTGAACCTGGGAAGTGGA 109691090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3818 CCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGAGAATAGCTTGAACCTGGGAAGTGGA 3877

109691091 GGCAGCAGTGAGCCAAGATCACACCGCTAGACTCCAGGCTGGGCAACAGAGCAAGACTGC 109691150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3878 GGCAGCAGTGAGCCAAGATCACACCGCTAGACTCCAGGCTGGGCAACAGAGCAAGACTGC 3937

109691151 ATCTCAAATAATAATAATAATAATAGTAATAATTACTTAAAATGTAAATGGATTGGCCAG 109691210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3938 ATCTCAAATAATAATAATAATAATAGTAATAATTACTTAAAATGTAAATGGATTGGCCAG 3997

109691211 GTTCATGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCTGAGTCAGGAGGATCACGAGGTCAGGA 109691270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3998 GTTCATGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCTGAGTCAGGAGGATCACGAGGTCAGGA 4057

109691271 GTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTA 109691330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4058 GTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTA 4117

109691331 GCTGGGCATGGTGGTGGGCACCTGTAGCCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGGAGAAT 109691390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4118 GCTGGGCATGGTGGTGGGCACCTGTAGCCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGGAGAAT 4177

109691391 TGCTTAACCGGGATCCGGGAGGTGGAGATTGTAGTGAGCCGAGATCACACCACTGCACTC 109691450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4178 TGCTTAACCGGGATCCGGGAGGTGGAGATTGTAGTGAGCCGAGATCACACCACTGCACTC 4237

109691451 CAGCC 109691455
          |||||
     4238 CAGCC 4242

Alignment time is 3.79986 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [109679900,109705214] =>     25315 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [        1,     4056] =>      4056 nucs 'mol-32-2e20-082925_4056'

Score:        3945
Aligned:      4044        nucs
Identic:      4035 (100%) nucs =>       506 ( 99%)      3529 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [109694761,109695269] EXCISED REGION [109695283,109698817]
 second seq =>  [        3,      509] EXCISED REGION [      522,     4056]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        13 nucs [109695270,109695282]
 second seq =>        12 nucs [510,521]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [510,511] to [522,523]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [109695270,109695270] to [109695282,109695282]
 second seq =>         2 nucs [510,511] to [520,521]

109694761 GTATATATATATGCAGTGGAGTATTATTCAGCCTTAAAAAAGAAGGAAGTTATGCCATTT 109694820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        3 GTATATATATATGCAGTGGAGTATTATTCAGCCTTAAAAAAGAAGGAAGTTATGCCATTT 62

109694821 GCAACAACGTGGGACATTATGCTAAGTGAAAAAGCCAGACACAAAAAGCAAATATCATAT 109694880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       63 GCAACAACGTGGGACATTATGCTAAGTGAAAAAGCCAGACACAAAAAGCAAATATCATAT 122

109694881 GATCTCACTTGTTTGTAGAGTCAATAAAAGATGAATACATAGAAGCAGAGAGTAGAATAA 109694940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      123 GATCTCACTTGTTTGTAGAGTCAATAAAAGATGAATACATAGAAGCAGAGAGTAGAATAA 182

109694941 TGGTTACCAGGGACAGGGGTGAGGTGAGGTGGGATGGGGGTAATTGTGGTGATGTTGGTC 109695000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      183 TGGTTACCAGGGACAGGGGTGAGGTGAGGTGGGATGGGGGTAATTGTGGTGATGTTGGTC 242

109695001 AAAGGATATGAAGCTTCAGTTATGTAGGGTGGATAAGTTCTAGGGGTCTAAGGTAAAGCA 109695060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      243 AAAGGATATGAAGCTTCAGTTATGTAGGGTGGATAAGTTCTAGGGGTCTAAGGTAAAGCA 302

109695061 TGAGGACTATGGTTAACAATACCCATGGCATATTTAAAATTTGCTAAGAGAGCAGATCCT 109695120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      303 TGAGGACTATGGTTAACAATACCCATGGCATATTTAAAATTTGCTAAGAGAGCAGATCCT 362

109695121 AAGTATTCTCACCACACACAAAAAGGTGACCATGTGGGCCGGGCGCGTTGGTGCGCGCCT 109695180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      363 AAGTATTCTCACCACACACAAAAAGGTGACCATGTGGGCCGGGCGCGTTGGTGCGCGCCT 422

109695181 GTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGGCAGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACC 109695240
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
      423 GTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGGCAGATCATGAGGTCAGGAGATCGAGACC 482

109695241 ATTCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATTT 109695269
          ||| ||||||||||||| |||||||||||
      483 ATT-TGGCTAACATGGT-AAACCCCATTT 509

EXCISED REGION

109695283 AAAAAAAAAAAAAAAATAGCCGGGTGTGGTGGCACACACCCGTAGTCCCAGCTACTTGGG 109695342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      522 AAAAAAAAAAAAAAAATAGCCGGGTGTGGTGGCACACACCCGTAGTCCCAGCTACTTGGG 581

109695343 AGGCTGGGGCAGGAGAATGGCATGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATCG 109695402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      582 AGGCTGGGGCAGGAGAATGGCATGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATCG 641

109695403 CACAATTGCTTTCCAGCCTGGGCAACGGAGCGAGACTCTGTTTCAAAAAAAAAGGTGACC 109695462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      642 CACAATTGCTTTCCAGCCTGGGCAACGGAGCGAGACTCTGTTTCAAAAAAAAAGGTGACC 701

109695463 ATGTGAAGGGATGGATATGTTAAGTAGCTTGACTGGTAATCGGTTCACGATGTATATGTA 109695522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      702 ATGTGAAGGGATGGATATGTTAAGTAGCTTGACTGGTAATCGGTTCACGATGTATATGTA 761

109695523 CAGTTGACCCTTGAACAACATGCGTTTAAATTACAAGAGTCCACTTATATGGGGATTTTC 109695582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      762 CAGTTGACCCTTGAACAACATGCGTTTAAATTACAAGAGTCCACTTATATGGGGATTTTC 821

109695583 TTCTGCCTCTGCCAGCAAGGCCAACCCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCCCCTCAACTAAAGA 109695642
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      822 TTCTGCCTTTGCCAGCAAGGCCAACCCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCCCCTCAACTAAAGA 881

109695643 CGAGGAGGATGAGGACCTTTAGGGTGATCCACTTCCACTTAATGAATAGTAAATACGGTT 109695702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      882 CGAGGAGGATGAGGACCTTTAGGGTGATCCACTTCCACTTAATGAATAGTAAATACGGTT 941

109695703 TCTCTTCCTTATGATTTTCTTAATATTTTCTTTTCCCTAACTTACTTTGTTGTAAGAATG 109695762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      942 TCTCTTCCTTATGATTTTCTTAATATTTTCTTTTCCCTAACTTACTTTGTTGTAAGAATG 1001

109695763 CAGTACTCAATACACGTAAGATACAAAATTTGTATGAATTGACTGTTTGTGTTATCTGCA 109695822
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1002 CAGTACACAATACACGTAAGATACAAAATTTGTATGAATTGACTGTTTGTGTTATCTGCA 1061

109695823 AGGCTTCCTGTCAACACTAGGGTATTAATAGTTAAGTTTTGGGGGAGTCAAAAGTTATTT 109695882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1062 AGGCTTCCTGTCAACACTAGGGTATTAATAGTTAAGTTTTGGGGGAGTCAAAAGTTATTT 1121

109695883 GTGGATTTTTTACTGTTCGGGGAGTTGGTGCCCCTAACCCCTTCGTTGTTAAAGAGTCAA 109695942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1122 GTGGATTTTTTACTGTTCGGGGAGTTGGTGCCCCTAACCCCTTCGTTGTTAAAGAGTCAA 1181

109695943 CTGTATATCAAAACATCGTGCTGTATACCTTAAATGTATATACTTTCAATTAAAATATTT 109696002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1182 CTGTATATCAAAACATCGTGCTGTATACCTTAAATGTATATACTTTCAATTAAAATATTT 1241

109696003 TAAAAACAAACCAATAAAAAGGCACTGCTTCTGGCCCAGGGTGAGCCATCAGATGGCACA 109696062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1242 TAAAAACAAACCAATAAAAAGGCACTGCTTCTGGCCCAGGGTGAGCCATCAGATGGCACA 1301

109696063 GCTGGCCCTGTCCGGTCCCAACCAGCAGAGGGGACTGTCAATTGAGAAGCTCCAGTGCTA 109696122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1302 GCTGGCCCTGTCCGGTCCCAACCAGCAGAGGGGACTGTCAATTGAGAAGCTCCAGTGCTA 1361

109696123 AACGCTGGAATATGAAGATATGCATGGTGGGGAGACAGCACACACACACATAACACTCAA 109696182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1362 AACGCTGGAATATGAAGATATGCATGGTGGGGAGACAGCACACACACACATAACACTCAA 1421

109696183 GGCCTGGTGGAGCCCACCCAGCTCAGCCTGGGTTGGGGAGGCTCCCTGGGAAGGGGATTC 109696242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1422 GGCCTGGTGGAGCCCACCCAGCTCAGCCTGGGTTGGGGAGGCTCCCTGGGAAGGGGATTC 1481

109696243 CTGATGTGAGCCTTCCAGGAGGGGTAGGAATTCTCTACACAGACAGGTGGGAACTCCAGG 109696302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1482 CTGATGTGAGCCTTCCAGGAGGGGTAGGAATTCTCTACACAGACAGGTGGGAACTCCAGG 1541

109696303 CAGAGGGGAGGCCTGAAACACATCACAGGCCACCCTGTCCCTAGACTGCTGAGAGGCAGG 109696362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1542 CAGAGGGGAGGCCTGAAACACATCACAGGCCACCCTGTCCCTAGACTGCTGAGAGGCAGG 1601

109696363 ACGGGGCTACACGGCCATGGGTGTGAGTCACCAAGGACCCTGTGCCTGCTGAGGCATGAG 109696422
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1602 ACGGGGCTACACGGCCATGGGCGTGAGTCACCAAGGACCCTGTGCCTGCTGAGGCATGAG 1661

109696423 GACGCATTTCTGGGACGACAGAAAGACAGCAAAGGGCTTCAGACTATGGAATACCCGGAA 109696482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1662 GACGCATTTCTGGGACGACAGAAAGACAGCAAAGGGCTTCAGACTATGGAATACCCGGAA 1721

109696483 TAGGGCTCTAAGCATCTCCTCCGATGATTGTGGACTCAATGCAGGAAATGTGGAGGCTTC 109696542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1722 TAGGGCTCTAAGCATCTCCTCCGATGATTGTGGACTCAATGCAGGAAATGTGGAGGCTTC 1781

109696543 GAGCTAGACCAGTGACAGAGGAGGGAAAAGGAGATGGGGCCCATCAATATTTGAAACTTG 109696602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1782 GAGCTAGACCAGTGACAGAGGAGGGAAAAGGAGATGGGGCCCATCAATATTTGAAACTTG 1841

109696603 GCAAAACGCAGCAAGATTTTAATGGTTAATCAAAAATGGGAGGTGAATGGGAGAAAGAGG 109696662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1842 GCAAAACGCAGCAAGATTTTAATGGTTAATCAAAAATGGGAGGTGAATGGGAGAAAGAGG 1901

109696663 AGCTGACAACCACTCCCACAATTCTGGTTTCCAGGGCGTGTTATAGCTGAGAGGGCAGCA 109696722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1902 AGCTGACAACCACTCCCACAATTCTGGTTTCCAGGGCGTGTTATAGCTGAGAGGGCAGCA 1961

109696723 GTTTGAGTGGCTGGGCAGCAGAGGCTGGGGTTGAGGCTGGGAAGTGGCGGCAGCAGGGGA 109696782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1962 GTTTGAGTGGCTGGGCAGCAGAGGCTGGGGTTGAGGCTGGGAAGTGGCGGCAGCAGGGGA 2021

109696783 GACTGCCCCATCAGGAGCCTGCCATAAGCGTGGGATGCAGAAGGACTGGAAGGTGCTGGA 109696842
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2022 GGCTGCCCCATCAGGAGCCTGCCATAAGCGTGGGATGCAGAAGGACTGGAAGGTGCTGGA 2081

109696843 GGTGATGTGGAGCTTTGGGAGAGTGTCGGAGGGATGGAATAAGTTGATGCCTGTTCCGAG 109696902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2082 GGTGATGTGGAGCTTTGGGAGAGTGTCGGAGGGATGGAATAAGTTGATGCCTGTTCCGAG 2141

109696903 ACCAAGAAGTGGGGAGCAACTGAAGAAACTGGAGAGTGGGAACCAGGTTGCAGCTGGTCT 109696962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2142 ACCAAGAAGTGGGGAGCAACTGAAGAAACTGGAGAGTGGGAACCAGGTTGCAGCTGGTCT 2201

109696963 CCAGATGCTGCACTCTCTGACAGCTCTCATCTATCTCACTGTCACCCAGGATTGGACAGG 109697022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2202 CCAGATGCTGCACTCTCTGACAGCTCTCATCTATCTCACTGTCACCCAGGATTGGACAGG 2261

109697023 ACATCTACAAATGTGCATGTGTATTTGCTATAAGGTGCATTCTTTTCCCCTGGAGATAGT 109697082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2262 ACATCTACAAATGTGCATGTGTATTTGCTATAAGGTGCATTCTTTTCCCCTGGAGATAGT 2321

109697083 GACCAACCTTTCAAGAACTATTCTTGGGTATATTTTATCATTTCTTTATTTTAGTATCTA 109697142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2322 GACCAACCTTTCAAGAACTATTCTTGGGTATATTTTATCATTTCTTTATTTTAGTATCTA 2381

109697143 TGAAGGGAACATTATAGAAGCCATGTTAACACTGGAGAAATGTCTAATATTAAAAAACCA 109697202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2382 TGAAGGGAACATTATAGAAGCCATGTTAACACTGGAGAAATGTCTAATATTAAAAAACCA 2441

109697203 GTACTCTAGCAAGTAAAATTATGTATGTGTGTAACCTCGTTCCTACATCCAGGAAATCAT 109697262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2442 GTACTCTAGCAAGTAAAATTATGTATGTGTGTAACCTCGTTCCTACATCCAGGAAATCAT 2501

109697263 TAAACTAGTAGGGGGTTGTATTAATTAGAACTCTCTGTTGCAAACAACAGACAGTCTGGA 109697322
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2502 TAAACTAGTAGGGGGTTGTATTAATCAGAACTCTCTGTTGCAAACAACAGACAGTCTGGA 2561

109697323 TGATTTAAAAGGAACAGAAATGTATTAAGAGGATATTGGATAGTTCACAAAACCTCCAGG 109697382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2562 TGATTTAAAAGGAACAGAAATGTATTAAGAGGATATTGGATAGTTCACAAAACCTCCAGG 2621

109697383 AGGGCTGGAGAGCCAGGCTGGATGCTGTGCCACTGACACAACATTCAAAACTCACAGATT 109697442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2622 AGGGCTGGAGAGCCAGGCTGGATGCTGTGCCACTGACACAACATTCAAAACTCACAGATT 2681

109697443 CTTCTGCTGCCATCCACTATGCTAGCTACCAGCCATGCATGGCCATGCAGCACTTGATGT 109697502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2682 CTTCTGCTGCCATCCACTATGCTAGCTACCAGCCATGCATGGCCATGCAGCACTTGATGT 2741

109697503 GTGCCTGCCCAACTGAGATGTGCTGCAGGTGCACAATACTCACTGGACTTCGAAGACTAA 109697562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2742 GTGCCTGCCCAACTGAGATGTGCTGCAGGTGCACAATACTCACTGGACTTCGAAGACTAA 2801

109697563 ACGTGAAGAAAGGACATAAAATCTCACTCAGGTTAAAATGATATCTGCACACACTGGGTA 109697622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2802 ACGTGAAGAAAGGACATAAAATCTCACTCAGGTTAAAATGATATCTGCACACACTGGGTA 2861

109697623 TTAAGTAAAATACATTGAAATTAATTTCACTTGTTTCTTTTTGCTTTTTAAATGCAGTTA 109697682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2862 TTAAGTAAAATACATTGAAATTAATTTCACTTGTTTCTTTTTGCTTTTTAAATGCAGTTA 2921

109697683 CTAGAAAATTTTACATTACCTGTGGGAAATTGGCTCCACATCATTTCCTCTGTTTTCTAT 109697742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2922 CTAGAAAATTTTACATTACCTGTGGGAAATTGGCTCCACATCATTTCCTCTGTTTTCTAT 2981

109697743 TGATCGAATTGAGTCCTAAGGCCACATCTGATATTTGGGGGAAAGGAAATATACATCACC 109697802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2982 TGATCGAATTGAGTCCTAAGGCCACATCTGATATTTGGGGGAAAGGAAATATACATCACC 3041

109697803 TCCAGATGGGGGCAGCCCCCCATGCAGGGATGGGGAGCTGCCCGAGGCTGTTTTTGGAAA 109697862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3042 TCCAGATGGGGGCAGCCCCCCATGCAGGGATGGGGAGCTGCCCGAGGCTGTTTTTGGAAA 3101

109697863 CATCTGTGGTCCCCAACAACAGTGCTTCTGGCCTGTTTTTTCACATGGGGCTCCGCGTCT 109697922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3102 CATCTGTGGTCCCCAACAACAGTGCTTCTGGCCTGTTTTTTCACATGGGGCTCCGCGTCT 3161

109697923 GTGGCTGACTCAATGCTGGGCTTGAGGTGGGGGTGACTGTCACATGACAGATTAGGTCAA 109697982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3162 GTGGCTGACTCAATGCTGGGCTTGAGGTGGGGGTGACTGTCACATGACAGATTAGGTCAA 3221

109697983 GCCTCCATCGTGCTCAGGGTTTATGAGACAGATCACAAGGGCCTCTGGGGACTGCCTGTC 109698042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3222 GCCTCCATCGTGCTCAGGGTTTATGAGACAGATCACAAGGGCCTCTGGGGACTGCCTGTC 3281

109698043 GCTTGTGGTCCTGGGGAACCAACCCCATGGTCAACTCCACCTCTGAACCTCTCCTGCAAG 109698102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3282 GCTTGTGGTCCTGGGGAACCAACCCCATGGTCAACTCCACCTCTGAACCTCTCCTGCAAG 3341

109698103 GGGCAAGAGCATCCTGGTAACCTTGCCCATCCTGACACCTGCTGTGGTAACTCATTCCCT 109698162
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3342 GGGCCAGAGCATCCTGGTAACCTTGCCCATCCTGACACCTGCTGTGGTAACTCATTCCCT 3401

109698163 GCTCTGGCACTTGAGCAACCCCTCGGCCCCACCATCCCAGGACTTCACAACCTGCCGCCG 109698222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3402 GCTCTGGCACTTGAGCAACCCCTCGGCCCCACCATCCCAGGACTTCACAACCTGCCGCCG 3461

109698223 CCAGGGAGCCCTTTTTGCAACCACAGTGCCTGGCAGCAGTGACATGGCTTGCAGAAACAC 109698282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3462 CCAGGGAGCCCTTTTTGCAACCACAGTGCCTGGCAGCAGTGACATGGCTTGCAGAAACAC 3521

109698283 ATCCTTGCTATTCAGTTGCACTTGCCAACGAGGCATCTTCTGGGGTCTTGTCGGGGAGAT 109698342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3522 ATCCTTGCTATTCAGTTGCACTTGCCAACGAGGCATCTTCTGGGGTCTTGTCGGGGAGAT 3581

109698343 CACTGGGGGATGGCCAGCTGTTTTCATAGGAAAAGTCTGTCTGGTTCTTCATCTCCGTAT 109698402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3582 CACTGGGGGATGGCCAGCTGTTTTCATAGGAAAAGTCTGTCTGGTTCTTCATCTCCGTAT 3641

109698403 TTGTCCTCCACACTGCTCACTGCATTTCTGCATCCTGGCTTTGTGTGGGGCATGCTGCTG 109698462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3642 TTGTCCTCCACACTGCTCACTGCATTTCTGCATCCTGGCTTTGTGTGGGGCATGCTGCTG 3701

109698463 TGGACTCCAGCATCTGTCAACCCAAATGCAAAGGCGGAGCCCACCTCGGCTGCAGGAACT 109698522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3702 TGGACTCCAGCATCTGTCAACCCAAATGCAAAGGCGGAGCCCACCTCGGCTGCAGGAACT 3761

109698523 GCCACACTGAAGTGCTCTACCCATGCTTCAGCTGCCTCCAGAATCCATTCCCATATGGGC 109698582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3762 GCCACACTGAAGTGCTCTACCCATGCTTCAGCTGCCTCCAGAATCCATTCCCATATGGGC 3821

109698583 TAACCAGATGTGTGCAGCTAATCAACAGTTAGCATTTCTGTCTTTGGATAGTAAGGACTT 109698642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3822 TAACCAGATGTGTGCAGCTAATCAACAGTTAGCATTTCTGTCTTTGGATAGTAAGGACTT 3881

109698643 CTGCTTCCAGACTTCAGATCTCTCCTTAGGTAGCAGCTCTGACCCAAGGTTAGGATTCCA 109698702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3882 CTGCTTCCAGACTTCAGATCTCTCCTTAGGTAGCAGCTCTGACCCAAGGTTAGGATTCCA 3941

109698703 GGACTCAGTCAGCTCCTGGTATTCCTTAGCACCCCTTTTTTATTTTATTTTATTTTATTT 109698762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3942 GGACTCAGTCAGCTCCTGGTATTCCTTAGCACCCCTTTTTTATTTTATTTTATTTTATTT 4001

109698763 ATTTATTTTTTTGAGACAGAGTCTCTCTCTGTGGCCCAGGCTAGAGTGCAGTGGT 109698817
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4002 ATTTATTTTTTTGAGACAGAGTCTCTCTCTGTGGCCCAGGCTAGAGTGCAGTGGT 4056

Alignment time is 3.60368 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [109679900,109705214] =>     25315 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [        1,     5010] =>      5010 nucs 'mol-32-2ef1-022153_5010'

Score:        4951
Aligned:      5006        nucs
Identic:      5001 (100%) nucs =>        49 (100%)      4952 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [109684908,109684956] EXCISED REGION [109684963,109689919]
 second seq =>  [        1,       49] EXCISED REGION [       56,     5010]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         6 nucs [109684957,109684962]
 second seq =>         6 nucs [50,55]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [109684957,109684957] to [109684963,109684963]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [109684957,109684958] to [109684961,109684962]
 second seq =>         0 nucs

109684908 CTGCAACATCTCCAGCACCCAGAACAGGGCTTGACATCACGGATGCCCA 109684956
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTGCAACATCTCCAGCACCCAGAACAGGGCTTGACATCACGGATGCCCA 49

EXCISED REGION

109684963 GGGGAACGAACAGAGACTGGCACATACACAGCACTGGGGAAATGTTGGTCATTATTATCA 109685022
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
       56 GGGGAACGAACAGAGACTGGCACACACACAGCACTGGGGAAATGTTGGTCATTATTATCA 115

109685023 TTATTTCTCATGGGTTTGTATTGTTTCTGTGCCTCAGGTTTTCAGGAAAGTCTCTGCTTT 109685082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      116 TTATTTCTCATGGGTTTGTATTGTTTCTGTGCCTCAGGTTTTCAGGAAAGTCTCTGCTTT 175

109685083 TCCCCTGGGCAGTGCAACAGAGGGGAAGAGTGTTGGACTTGGAGTCAGAGACCCATGTCT 109685142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      176 TCCCCTGGGCAGTGCAACAGAGGGGAAGAGTGTTGGACTTGGAGTCAGAGACCCATGTCT 235

109685143 GAGCCCCAGGTTGGCCATTATGAGCTGTGTAGCTCTGGGAAACTCACTTAACCTCTCTGA 109685202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      236 GAGCCCCAGGTTGGCCATTATGAGCTGTGTAGCTCTGGGAAACTCACTTAACCTCTCTGA 295

109685203 GGTTTTGTTTCCTCATTCGTTGAGTTGGAATACCATTTGTTTTCCTCCTCATCTGGCAAG 109685262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      296 GGTTTTGTTTCCTCATTCGTTGAGTTGGAATACCATTTGTTTTCCTCCTCATCTGGCAAG 355

109685263 CTGGTGAGATAAGCAAATATGATGATATGTCAAAATGCTTGTAAGTACTAAATACCTTCC 109685322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      356 CTGGTGAGATAAGCAAATATGATGATATGTCAAAATGCTTGTAAGTACTAAATACCTTCC 415

109685323 AGCTATTGTCATTATGTGGTCCCTCCTGCAAAATGGAAAAACCAATTGATTTTACCATGG 109685382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      416 AGCTATTGTCATTATGTGGTCCCTCCTGCAAAATGGAAAAACCAATTGATTTTACCATGG 475

109685383 CTGACAATCTTATATCGGTTGTGAGGAGCTTATTATTCATAATTTCAGTGTGTTTCCATT 109685442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      476 CTGACAATCTTATATCGGTTGTGAGGAGCTTATTATTCATAATTTCAGTGTGTTTCCATT 535

109685443 TCTGCCCATATGGCACTCCTCCCTTAGACAGGTATCTTGAGACAAGAAAAGGAGCAGGTG 109685502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      536 TCTGCCCATATGGCACTCCTCCCTTAGACAGGTATCTTGAGACAAGAAAAGGAGCAGGTG 595

109685503 GCCTTTAAAATACATTGCACATAACACATGCGTTTCACTGAACAGCTTTTTGCATTTAAA 109685562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      596 GCCTTTAAAATACATTGCACATAACACATGCGTTTCACTGAACAGCTTTTTGCATTTAAA 655

109685563 ATGCAGACAATATGCTCAAAATAGTACTAATAAATTTTCTATCTTGAGTAATGTATCTCA 109685622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      656 ATGCAGACAATATGCTCAAAATAGTACTAATAAATTTTCTATCTTGAGTAATGTATCTCA 715

109685623 GACATATACCAAGGGAAAATAATTAAAGAAAAACCCAATAAAATAGAGATCATAAAAAGG 109685682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      716 GACATATACCAAGGGAAAATAATTAAAGAAAAACCCAATAAAATAGAGATCATAAAAAGG 775

109685683 GGGGCTTATAAATCAAGAGAGTAGACTTCTAGCCATTCTCAATACAGCCTTTGAGTGCAA 109685742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      776 GGGGCTTATAAATCAAGAGAGTAGACTTCTAGCCATTCTCAATACAGCCTTTGAGTGCAA 835

109685743 GGATCCCAGATGTTTGATTTGGACACATGGAATTTTGCAATAGGATAGTGTACTTCTTAT 109685802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      836 GGATCCCAGATGTTTGATTTGGACACATGGAATTTTGCAATAGGATAGTGTACTTCTTAT 895

109685803 GAATGAAACATCAAAAGGCATATGGTAGTAGATGCAATCATGTTGGCAGACGTGTGTCTT 109685862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      896 GAATGAAACATCAAAAGGCATATGGTAGTAGATGCAATCATGTTGGCAGACGTGTGTCTT 955

109685863 GGAGAGCAGAAATGGCCAACTGAATGCTTCCTTCCTCACTCGTGAAGCCATCAGGAGCAA 109685922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      956 GGAGAGCAGAAATGGCCAACTGAATGCTTCCTTCCTCACTCGTGAAGCCATCAGGAGCAA 1015

109685923 AGCTCCAGGGAGTGCCTTCCGCCCTGCTGGCAATGAATGGCCTCTCCTGACAGATAGCCT 109685982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1016 AGCTCCAGGGAGTGCCTTCCGCCCTGCTGGCAATGAATGGCCTCTCCTGACAGATAGCCT 1075

109685983 AAGAGCCTTTGGCTAAAGATTTGCAACATCAAAGAGTGAGTGGCATGGCCTGGCCAGCCA 109686042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1076 AAGAGCCTTTGGCTAAAGATTTGCAACATCAAAGAGTGAGTGGCATGGCCTGGCCAGCCA 1135

109686043 CCTGAGACAACGTACTTTGTTCCAGAACGTGGTTCAGAGTTTCACCTTGCTGGCTCAGTG 109686102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1136 CCTGAGACAACGTACTTTGTTCCAGAACGTGGTTCAGAGTTTCACCTTGCTGGCTCAGTG 1195

109686103 GGGATTAAGGCTGAAAGAGGCTTTGAAAATGTTGATAACAGATGAATGTAAATATTATTT 109686162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1196 GGGATTAAGGCTGAAAGAGGCTTTGAAAATGTTGATAACAGATGAATGTAAATATTATTT 1255

109686163 ACCTAGCAACATAACACTTTTTTTCTTCTTTTTTGGCTCTTTCATGGAGTCATTACTCTT 109686222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1256 ACCTAGCAACATAACACTTTTTTTCTTCTTTTTTGGCTCTTTCATGGAGTCATTACTCTT 1315

109686223 TCCCTTGAGTTGTCAGTTCCTTCATTTAGTCTATTCCTTCAACAATTATTGATCAAATCA 109686282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1316 TCCCTTGAGTTGTCAGTTCCTTCATTTAGTCTATTCCTTCAACAATTATTGATCAAATCA 1375

109686283 TTATTTGTGCTGGGCAGTGTTCTATGTCCCAGGAATTTTGTACTGTAAACCAGTACTCTG 109686342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1376 TTATTTGTGCTGGGCAGTGTTCTATGTCCCAGGAATTTTGTACTGTAAACCAGTACTCTG 1435

109686343 TCCTCATAACGCCTATAATCTAGAGACATTGAACTGTGAGCACAGGAATAAGCAGTGTAC 109686402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1436 TCCTCATAACGCCTATAATCTAGAGACATTGAACTGTGAGCACAGGAATAAGCAGTGTAC 1495

109686403 TTTCAGAATGTAATCAGTGTTCTCAAGGGAGGAGATTATGATGTAACAGAGCTTCTTTTC 109686462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1496 TTTCAGAATGTAATCAGTGTTCTCAAGGGAGGAGATTATGATGTAACAGAGCTTCTTTTC 1555

109686463 ATCTCAAAGGAAGGCCATTAAGAAGGGCCAGTCAGGACAGGTGATGCTGGCAGGAAGGGA 109686522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1556 ATCTCAAAGGAAGGCCATTAAGAAGGGCCAGTCAGGACAGGTGATGCTGGCAGGAAGGGA 1615

109686523 GCCAGCCTGCGACGTGCTGGGAAGACAGGCAGAGAGACTATACGTTCAAAGGGTGTGAGG 109686582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1616 GCCAGCCTGCGACGTGCTGGGAAGACAGGCAGAGAGACTATACGTTCAAAGGGTGTGAGG 1675

109686583 CAGGCATGAGTTTGCAGAAAGTGTGCTAAGGGCCTGGAGCAGAGTGAGTGAGGGGGAACA 109686642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1676 CAGGCATGAGTTTGCAGAAAGTGTGCTAAGGGCCTGGAGCAGAGTGAGTGAGGGGGAACA 1735

109686643 AAGACAGGGAGGTGTTAAAGGGCCAGGAGGGGCTGGACCCTCTGGAGCATTGATGACTAT 109686702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1736 AAGACAGGGAGGTGTTAAAGGGCCAGGAGGGGCTGGACCCTCTGGAGCATTGATGACTAT 1795

109686703 GCTGTGGAATGAATTTGGATGTTGTTTAAGGGGAATGGGAAGTCATTGAAATATTTTAAG 109686762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1796 GCTGTGGAATGAATTTGGATGTTGTTTAAGGGGAATGGGAAGTCATTGAAATATTTTAAG 1855

109686763 TAGAGAAATGGGATGCACTGATTTACCTTATGAAAAGAGTTCTCTAGCTGCTTTGAGAGA 109686822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1856 TAGAGAAATGGGATGCACTGATTTACCTTATGAAAAGAGTTCTCTAGCTGCTTTGAGAGA 1915

109686823 ATGGATTATAGTGGGGTGATATAGTTTGGACGTTTGTCCTCTCCAAATCTCGTGTTGAAA 109686882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1916 ATGGATTATAGTGGGGTGATATAGTTTGGACGTTTGTCCTCTCCAAATCTCGTGTTGAAA 1975

109686883 TGTGATGCTCAGTGTTGGAGGTGGGGTCTGGTGGGAGGTGATTGGGTCGTGGAGCAGATC 109686942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1976 TGTGATGCTCAGTGTTGGAGGTGGGGTCTGGTGGGAGGTGATTGGGTCGTGGAGCAGATC 2035

109686943 CTTCATGAATGGCTGCTGACATCATCTTGGTGGTGAGTGAGTTCTCAGTCTGGTAGTTCA 109687002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2036 CTTCATGAATGGCTGCTGACATCATCTTGGTGGTGAGTGAGTTCTCAGTCTGGTAGTTCA 2095

109687003 CATGAGATCTGCCTGTTTTAAAGAGTATGGTGGCCAAGTGCCGTGGCTCACGCCTGTGAT 109687062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2096 CATGAGATCTGCCTGTTTTAAAGAGTATGGTGGCCAAGTGCCGTGGCTCACGCCTGTGAT 2155

109687063 CCCAGCACTTTGGGAGGTAAAGGCAGGAGGATCACTTGAGCTCAGGAGTTCGACACTAGC 109687122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2156 CCCAGCACTTTGGGAGGTAAAGGCAGGAGGATCACTTGAGCTCAGGAGTTCGACACTAGC 2215

109687123 CTGGGAAACAGGGTGAAACCCATCTCTACTAAAAATAGAAATATTAGGCGGGTGTGATGG 109687182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2216 CTGGGAAACAGGGTGAAACCCATCTCTACTAAAAATAGAAATATTAGGCGGGTGTGATGG 2275

109687183 TGCGCTGCCTATAGTCCCAGCTACCGGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCCAG 109687242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2276 TGCGCTGCCTATAGTCCCAGCTACCGGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCCAG 2335

109687243 GAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAGC 109687302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2336 GAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAGC 2395

109687303 CAGACCCTATCTAAAAAAAAAAAAAAAAAATAGAGTGCGGCACCCCTCCCTTCCCACTGT 109687362
          |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2396 CAGACCCTATCT-AAAAAAAAAAAAAAAAATAGAGTGCGGCACCCCTCCCTTCCCACTGT 2454

109687363 TGCTCCCTCTCTCGCCATGTGGGGCACGGGCTGCTCCTTCATCTTCCACCATTATTGTGA 109687422
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     2455 TGCTCCCTCTCTCGCCATGTGGGGCATGGGCTGCTCCTTCATCTTCCACCATTATTGTGA 2514

109687423 GCTTCCTGAGGCCTCACCAGGAGCAGATGTGAGCAAATTAAACCTCTTTTCTTTATAAAT 109687482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2515 GCTTCCTGAGGCCTCACCAGGAGCAGATGTGAGCAAATTAAACCTCTTTTCTTTATAAAT 2574

109687483 TACCCATATTTAGGTATTTATTTATAGCTACTACAAGGGGGAAAGGGAGAGCAGGGAGAT 109687542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2575 TACCCATATTTAGGTATTTATTTATAGCTACTACAAGGGGGAAAGGGAGAGCAGGGAGAT 2634

109687543 CAGTGGTGCTTTCACACTAGTACAGCAATAGAGCAGCATCTTGGACCAGGGTGGTGGCTG 109687602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2635 CAGTGGTGCTTTCACACTAGTACAGCAATAGAGCAGCATCTTGGACCAGGGTGGTGGCTG 2694

109687603 AGGAGACAGGATCATGGCTTTGAGATACATTCTGAAGAAGAAAAGTAGGCCTTGCTGATA 109687662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2695 AGGAGACAGGATCATGGCTTTGAGATACATTCTGAAGAAGAAAAGTAGGCCTTGCTGATA 2754

109687663 GAATAGTCACAAACTGTAATGGAAAAGGTAAATTCAAGGATGTCTCCTGGGTTTTTGGCT 109687722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2755 GAATAGTCACAAACTGTAATGGAAAAGGTAAATTCAAGGATGTCTCCTGGGTTTTTGGCT 2814

109687723 TAAGCATCTGGATACAGAGATATGGAAGACTGGGAGGGAAATGGGTTTGGAGTATACATG 109687782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2815 TAAGCATCTGGATACAGAGATATGGAAGACTGGGAGGGAAATGGGTTTGGAGTATACATG 2874

109687783 CATGCAATCAACAATTCTGTCTTGCATGTGTGAAATTTAGATACCCATTAGACATCTGCA 109687842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2875 CATGCAATCAACAATTCTGTCTTGCATGTGTGAAATTTAGATACCCATTAGACATCTGCA 2934

109687843 TAGAGGGCCAGGCACAGTGGCTCACGGCAGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCCAAGGTGG 109687902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2935 TAGAGGGCCAGGCACAGTGGCTCACGGCAGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCCAAGGTGG 2994

109687903 GCGGATCACTTGAGGTTAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACTCTGTCT 109687962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2995 GCGGATCACTTGAGGTTAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACTCTGTCT 3054

109687963 CTACTAAAAATACAAAAATTATCTGGGTGTGGTGGTGTGCACCTGTAATCCCAGCTACTC 109688022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3055 CTACTAAAAATACAAAAATTATCTGGGTGTGGTGGTGTGCACCTGTAATCCCAGCTACTC 3114

109688023 AGGAGGCTGAGGCATGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGTAGAGGTTGCAGCGAGCCAAGA 109688082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3115 AGGAGGCTGAGGCATGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGTAGAGGTTGCAGCGAGCCAAGA 3174

109688083 TCACACCACTGCACTCTAGCAAGGGTGACAAAGCAAGACTCTATCTCAAAAAAAAAAAGA 109688142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
     3175 TCACACCACTGCACTCTAGCAAGGGTGACAAAGCAAGACTCTATCTC-AAAAAAAAAAGA 3233

109688143 CATTTATGTAGAGATGTTAGGTTGGCAGTTGGATAACAGTCTTGAGTTTCGGGGTGAGGG 109688202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3234 CATTTATGTAGAGATGTTAGGTTGGCAGTTGGATAACAGTCTTGAGTTTCGGGGTGAGGG 3293

109688203 CAGGACCAGAAATGAAGATTTGGGATTCATTAGCATGTAGATCATATTCAGAGCCACAAT 109688262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3294 CAGGACCAGAAATGAAGATTTGGGATTCATTAGCATGTAGATCATATTCAGAGCCACAAT 3353

109688263 AATAGATGAAATAACTGAGGAAGAGAGCTAGAGGGGCCAAGAGCAAACACAGGAACATGC 109688322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3354 AATAGATGAAATAACTGAGGAAGAGAGCTAGAGGGGCCAAGAGCAAACACAGGAACATGC 3413

109688323 CAGCATTTAGAGGACAATGGAGAAGGAGGAGATGGCAGAGATGTCAATAGGAGGAAAAGC 109688382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3414 CAGCATTTAGAGGACAATGGAGAAGGAGGAGATGGCAGAGATGTCAATAGGAGGAAAAGC 3473

109688383 AAAAGGGTGTTATCATAGAAGGTGACAACAGAATATATCACAAAGAGGAATATGTTTGAA 109688442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3474 AAAAGGGTGTTATCATAGAAGGTGACAACAGAATATATCACAAAGAGGAATATGTTTGAA 3533

109688443 TGTGTCAAATGTTGTTATCACAGGCTATAGAAGTAAACACAAAGTCTTATGGGAATACTG 109688502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3534 TGTGTCAAATGTTGTTATCACAGGCTATAGAAGTAAACACAAAGTCTTATGGGAATACTG 3593

109688503 AGGATGAGCTGCCTCTAGTGTGTGTGAAACCCTGGCCAAATATTTGTTGTGGGGCCCCTG 109688562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3594 AGGATGAGCTGCCTCTAGTGTGTGTGAAACCCTGGCCAAATATTTGTTGTGGGGCCCCTG 3653

109688563 TCTATATATGCAATGTTATTTAAAAACATACTACATATTCTTGGGCTTATGTGGGATGTA 109688622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3654 TCTATATATGCAATGTTATTTAAAAACATACTACATATTCTTGGGCTTATGTGGGATGTA 3713

109688623 GTGATTTATTGATGAAGACTTAGAATACTGGGTAGGAAGAGATGCTTTTGGATTTGTTTA 109688682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3714 GTGATTTATTGATGAAGACTTAGAATACTGGGTAGGAAGAGATGCTTTTGGATTTGTTTA 3773

109688683 TGAGCCAGTGAGTGTATCTGAGGATTCTTTATCCTGTGTCTAATGTGAGTGTGTTTTCCT 109688742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3774 TGAGCCAGTGAGTGTATCTGAGGATTCTTTATCCTGTGTCTAATGTGAGTGTGTTTTCCT 3833

109688743 GAATCAGTGCATCAGTGCTATTCTGGAGGCCCAAATCACACATGATTCCGTGAAAGAAAC 109688802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3834 GAATCAGTGCATCAGTGCTATTCTGGAGGCCCAAATCACACATGATTCCGTGAAAGAAAC 3893

109688803 TCTGTGCTGGCCAGAGGATGCACTCACTCTCCAGGCTTTCCTGCATGGGCCCTCACCATG 109688862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3894 TCTGTGCTGGCCAGAGGATGCACTCACTCTCCAGGCTTTCCTGCATGGGCCCTCACCATG 3953

109688863 GAGTCCTGGATACTTAGGGCATCTGGTTGACCACATGCTTGGGAGAGCACCAAAGAAGGT 109688922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3954 GAGTCCTGGATACTTAGGGCATCTGGTTGACCACATGCTTGGGAGAGCACCAAAGAAGGT 4013

109688923 CCTGGTTTTCAAGCCTCCAGCTTCTCCTTAGAAAGAGTTGACTACCTGTCTGGGCTCCAA 109688982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4014 CCTGGTTTTCAAGCCTCCAGCTTCTCCTTAGAAAGAGTTGACTACCTGTCTGGGCTCCAA 4073

109688983 CTTTTCTGGCTGCTACCAGAGGGTCTGGCCTCTAAACCATCTGTGTCAAAGAACTGACAG 109689042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4074 CTTTTCTGGCTGCTACCAGAGGGTCTGGCCTCTAAACCATCTGTGTCAAAGAACTGACAG 4133

109689043 GGCCTGACATTCACTGGGACCCTAGGCTAGGGGTGACAGAGAGCAAAGCAAAAGTTTGAA 109689102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4134 GGCCTGACATTCACTGGGACCCTAGGCTAGGGGTGACAGAGAGCAAAGCAAAAGTTTGAA 4193

109689103 AGAGTATGCAGTCTGAATGAGCATGCAGACCTTTGCCACAGCTCCCCTTCCCAGCTCAGT 109689162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4194 AGAGTATGCAGTCTGAATGAGCATGCAGACCTTTGCCACAGCTCCCCTTCCCAGCTCAGT 4253

109689163 GCAGAGCAAGTAGGAGATAAACTTCTGCTCTTAGCTTCTCTGTGAGGAGAGATGAAATGG 109689222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4254 GCAGAGCAAGTAGGAGATAAACTTCTGCTCTTAGCTTCTCTGTGAGGAGAGATGAAATGG 4313

109689223 ACCACACATCTAGCACCCCAACTTTTCTGACAACTACTAGAAGGACTGACTCCTGACTCA 109689282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4314 ACCACACATCTAGCACCCCAACTTTTCTGACAACTACTAGAAGGACTGACTCCTGACTCA 4373

109689283 CCTGTCTCAGGGCACTGATGGTACTTGGCACACTCTAGTCTCCTGGGGCCACCAAGAACA 109689342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4374 CCTGTCTCAGGGCACTGATGGTACTTGGCACACTCTAGTCTCCTGGGGCCACCAAGAACA 4433

109689343 AGAACAGCATTTTGGACAAACACACTGGTTTGAGAGGCACCCAGACTCTCTGACTGGGCT 109689402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4434 AGAACAGCATTTTGGACAAACACACTGGTTTGAGAGGCACCCAGACTCTCTGACTGGGCT 4493

109689403 GTGAGGAGGCTCATCTGTGAAGACTGAGGGAGGTGGCTGTTTTATCAAATGTGCAGAAAC 109689462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4494 GTGAGGAGGCTCATCTGTGAAGACTGAGGGAGGTGGCTGTTTTATCAAATGTGCAGAAAC 4553

109689463 CAACACAGAGAGTCAAAGACAATGAACAAACAGGAAATATGCCATAAATAAAAGAACAAG 109689522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4554 CAACACAGAGAGTCAAAGACAATGAACAAACAGGAAATATGCCATAAATAAAAGAACAAG 4613

109689523 ATAAATCTTCAGAAACTGACCCAAACAGAATGGAGATATGTGATTTACCAGACAAAAAAT 109689582
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4614 ATAAAACTTCAGAAACTGACCCAAACAGAATGGAGATATGTGATTTACCAGACAAAAAAT 4673

109689583 CAAAAGACCTGTCACAAAGATGCTCAGTGAGGTCAGGAGAGCAATGCATGAATAAAGTGA 109689642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4674 CAAAAGACCTGTCACAAAGATGCTCAGTGAGGTCAGGAGAGCAATGCATGAATAAAGTGA 4733

109689643 GAATTTCAACCAAAAAGGTAGAAAATATTAAAAAGTGCCAAACAGAAATCACGGAGCTGA 109689702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4734 GAATTTCAACCAAAAAGGTAGAAAATATTAAAAAGTGCCAAACAGAAATCACGGAGCTGA 4793

109689703 AGAATATAATAAAAGAACAGAAAAATTTAATAGAGGGGTTCAATAGCAGACTAGGTGAAC 109689762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4794 AGAATATAATAAAAGAACAGAAAAATTTAATAGAGGGGTTCAATAGCAGACTAGGTGAAC 4853

109689763 TGAAAGAAAGGATTAGTGAACTCAAGGACTGGTCATTGGCAATCATTCAGTCACAGCATT 109689822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4854 TGAAAGAAAGGATTAGTGAACTCAAGGACTGGTCATTGGCAATCATTCAGTCACAGCATT 4913

109689823 AAAAAGAAAAAAGAATGAAGGGCCAGGCACAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAACACTTT 109689882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4914 AAAAAGAAAAAAGAATGAAGGGCCAGGCACAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAACACTTT 4973

109689883 GGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCACGAGGTCAGGAGAT 109689919
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4974 GGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCACGAGGTCAGGAGAT 5010

Alignment time is 4.48758 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [109679900,109705214] =>     25315 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [        1,     8224] =>      8224 nucs 'mol-32-2f28-120556_8224'

Score:        8169
Aligned:      8224        nucs
Identic:      8219 (100%) nucs =>      4466 (100%)      3753 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [109682846,109687314] EXCISED REGION [109687318,109691072]
 second seq =>  [        1,     4469] EXCISED REGION [     4470,     8224]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         3 nucs [109687315,109687317]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        15 nucs [109687315,109687329] to [109687318,109687332]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [109687315,109687315] to [109687317,109687317]
 second seq =>         0 nucs

109682846 AGCCACCGTGCTGGCCGTGGATTCTTTTTTTATAAAGGCATGCCCTCTCCATCCACACCT 109682905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGCCACCGTGCTGGCCGTGGATTCTTTTTTTATAAAGGCATGCCCTCTCCATCCACACCT 60

109682906 CGCCACGCAAACAGCGCTAACTGTTCCCCCACCAACTTGTCCCTCACCACACTCAGCAGT 109682965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CGCCACGCAAACAGCGCTAACTGTTCCCCCACCAACTTGTCCCTCACCACACTCAGCAGT 120

109682966 GTTGTGGGGGGTGCCCTCTAAACTCAAGTAGGAGTGAGGCTCCCTCCTACTGAAAGAAAC 109683025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTTGTGGGGGGTGCCCTCTAAACTCAAGTAGGAGTGAGGCTCCCTCCTACTGAAAGAAAC 180

109683026 GCAGTTGGTGTCCGCTGCCCACAGGTCAATTCCGATTCCATTTGCAACTGGCCCCAGCTG 109683085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCAGTTGGTGTCCGCTGCCCACAGGTCAATTCCGATTCCATTTGCAACTGGCCCCAGCTG 240

109683086 CCTTTCTAGACCCAGGGCCCTTGTGTCTGTCCCCTCCTGCATTGTCACTCAGTCCCCTGG 109683145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCTTTCTAGACCCAGGGCCCTTGTGTCTGTCCCCTCCTGCATTGTCACTCAGTCCCCTGG 300

109683146 GGAAGTAATCATGTTGCATGTAGCAGATGGCTTCACTGGGGGATGGCGGGGCAGGGGCGA 109683205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GGAAGTAATCATGTTGCATGTAGCAGATGGCTTCACTGGGGGATGGCGGGGCAGGGGCGA 360

109683206 TGGGAGGCTGTGCCCAGGACTGCCTGAGTTACAGGAGGAGATTATGACAGAGCCGAGCGG 109683265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGGGAGGCTGTGCCCAGGACTGCCTGAGTTACAGGAGGAGATTATGACAGAGCCGAGCGG 420

109683266 TAAAGGAAGGAGGGGCCCCAGGGACAAAGGGAGAAGAGCAGCCCCAAAGGTTCCAAGAAC 109683325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TAAAGGAAGGAGGGGCCCCAGGGACAAAGGGAGAAGAGCAGCCCCAAAGGTTCCAAGAAC 480

109683326 CCCCCAGGAATAAGACTTCTCTGAGGCTGAGAGATGTCCAGGGTGCTCTGACAACAATAT 109683385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCCCCAGGAATAAGACTTCTCTGAGGCTGAGAGATGTCCAGGGTGCTCTGACAACAATAT 540

109683386 TATTTCCTTTCAACACGTTGATACTCCATTTTTTGTAAAGCGCACAAGACGCAGACAGAA 109683445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TATTTCCTTTCAACACGTTGATACTCCATTTTTTGTAAAGCGCACAAGACGCAGACAGAA 600

109683446 AACCTAATGTTTTATCCCAGGGCATAGGCTTGGAATTTCTCGGCAGAACACAACATATAG 109683505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AACCTAATGTTTTATCCCAGGGCATAGGCTTGGAATTTCTCGGCAGAACACAACATATAG 660

109683506 CAGAGAGGCAAAATAAAAAGGAATACAGAAAGAAAGAAAAAAAAAAACAACCTGATGTTG 109683565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CAGAGAGGCAAAATAAAAAGGAATACAGAAAGAAAGAAAAAAAAAAACAACCTGATGTTG 720

109683566 CAAAGAAAGAACACAAAAGTCGAGGGTGAGGCCAGCCTGGGTCGGCTTGTTCAGCGAAGG 109683625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CAAAGAAAGAACACAAAAGTCGAGGGTGAGGCCAGCCTGGGTCGGCTTGTTCAGCGAAGG 780

109683626 ACGCACAGTGAGGACGCAGGCCTAGTGAGGCCTGGTGACTTGAGGGCCCTGTTGTGCTTT 109683685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ACGCACAGTGAGGACGCAGGCCTAGTGAGGCCTGGTGACTTGAGGGCCCTGTTGTGCTTT 840

109683686 CCTAGGGGAAGGCCACTGCAATAAGGATTAGAAAAAGTCAGCCAATTTTGTCCTGCTGTG 109683745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CCTAGGGGAAGGCCACTGCAATAAGGATTAGAAAAAGTCAGCCAATTTTGTCCTGCTGTG 900

109683746 TATAATTACCTCTCCATCTATTTATAAAGCCTTGAGGAATTCAAGCAATTATTCATCCTA 109683805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TATAATTACCTCTCCATCTATTTATAAAGCCTTGAGGAATTCAAGCAATTATTCATCCTA 960

109683806 AAAACACCGTGGGCAGTGACGCCTCCAAAGATAGCTACTGCATAATCTCTCCGCTGCTCT 109683865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AAAACACCGTGGGCAGTGACGCCTCCAAAGATAGCTACTGCATAATCTCTCCGCTGCTCT 1020

109683866 CTCGCAGCCCCGCCTGTGCTGTACTTTCACCATGGGGGAGGCAGCGGAGGTGCAGGGGCC 109683925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTCGCAGCCCCGCCTGTGCTGTACTTTCACCATGGGGGAGGCAGCGGAGGTGCAGGGGCC 1080

109683926 ATGCCACCATCCCAGGGTCTCGGGAGTTCTCCCAGCTCCAGGACTCGGGCAAGTCCCTCC 109683985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATGCCACCATCCCAGGGTCTCGGGAGTTCTCCCAGCTCCAGGACTCGGGCAAGTCCCTCC 1140

109683986 ACCGCTCTGCGTCTTGAAGTCTTCATCTGTAAGTGGGGATGTGACTGTGTCTGTCTCTCC 109684045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ACCGCTCTGCGTCTTGAAGTCTTCATCTGTAAGTGGGGATGTGACTGTGTCTGTCTCTCC 1200

109684046 TGGGTGTTGGGAAGGTCACACAGGTCTAGATCTATATGTAGTCACTAAGAAGAATATTTA 109684105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TGGGTGTTGGGAAGGTCACACAGGTCTAGATCTATATGTAGTCACTAAGAAGAATATTTA 1260

109684106 GTAGATGTTGCCAGCTGACTGGAATCAACCCGGACTCTGCCCCTGCTCCCCAAACCACCC 109684165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GTAGATGTTGCCAGCTGACTGGAATCAACCCGGACTCTGCCCCTGCTCCCCAAACCACCC 1320

109684166 TCTCCTGGCCGCGCAATCCTTCAGGTGCTCAGGCTGATTCCTGGAGTCATCTTGGATTCA 109684225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TCTCCTGGCCGCGCAATCCTTCAGGTGCTCAGGCTGATTCCTGGAGTCATCTTGGATTCA 1380

109684226 TTTCTCCCTCTCACACCTCACATTTAGTCCACTAGCTAATGCTGTGGGCTCCAGCTTCAA 109684285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTTCTCCCTCTCACACCTCACATTTAGTCCACTAGCTAATGCTGTGGGCTCCAGCTTCAA 1440

109684286 AATGCACCTGCAAGCCACCCTGCCCCCTCCTCCATCACGACCACCCTGTTCTGACCCTGG 109684345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AATGCACCTGCAAGCCACCCTGCCCCCTCCTCCATCACGACCACCCTGTTCTGACCCTGG 1500

109684346 CAATCCCAGCCCCTTCCTCCCTCAGCCACAGGGCTCCAGCTCCAGCTGCTGGGTGGAGGC 109684405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CAATCCCAGCCCCTTCCTCCCTCAGCCACAGGGCTCCAGCTCCAGCTGCTGGGTGGAGGC 1560

109684406 TGGGCTTGCTGCTGCTCTGGGGACTTTGCTCTTTGCTGTTCCTTCTCCTGGAATGCACAT 109684465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TGGGCTTGCTGCTGCTCTGGGGACTTTGCTCTTTGCTGTTCCTTCTCCTGGAATGCACAT 1620

109684466 CCCCACACACCTGCCTGCTCACATGCTCCCCTGTAAGGCTTGCTCCAAGGTCACCTCCTC 109684525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CCCCACACACCTGCCTGCTCACATGCTCCCCTGTAAGGCTTGCTCCAAGGTCACCTCCTC 1680

109684526 AGTGAAGCTGCCCTGACTGCTGCCACCCACACCACCCCCTCACGGGGCTACCCCACTTCC 109684585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AGTGAAGCTGCCCTGACTGCTGCCACCCACACCACCCCCTCACGGGGCTACCCCACTTCC 1740

109684586 CTGGATCATTTTTATCCATAGTGTGTATTCCCCTCTGACACACCATGTCGTTTACTTTTT 109684645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CTGGATCATTTTTATCCATAGTGTGTATTCCCCTCTGACACACCATGTCGTTTACTTTTT 1800

109684646 CATCTTTTCGCGGAACTGTTCTTCCCTCTAGAATGGCGGTTCTCAACCATGGGCCATCTG 109684705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CATCTTTTCGCGGAACTGTTCTTCCCTCTAGAATGGCGGTTCTCAACCATGGGCCATCTG 1860

109684706 TCAGTGTCTACAGACATTTGGAGTGATCCTAACTGGGGGTGGGGTGTTCTAGGCACCCAG 109684765
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TCAGTGTCTACAGACATTTGGAGTGATCATAACTGGGGGTGGGGTGTTCTAGGCACCCAG 1920

109684766 TGGGCACAGGCAGGAGTGCACAGGATTAAGAACACCCACCCGAAGAACCCCCACCCCAGA 109684825
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TGGGCACAGACAGGAGTGCACAGGATTAAGAACACCCACCCGAAGAACCCCCACCCCAGA 1980

109684826 TGGCAACAGAGAAGAGGTTGAGAAACCCGCATCCAGACTGTAAGCCGTCTGAGGGCAAGG 109684885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TGGCAACAGAGAAGAGGTTGAGAAACCCGCATCCAGACTGTAAGCCGTCTGAGGGCAAGG 2040

109684886 GCCCTGTCCCCTGTTTTGATCACTGCAACATCTCCAGCACCCAGAACAGGGCTTGACATC 109684945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GCCCTGTCCCCTGTTTTGATCACTGCAACATCTCCAGCACCCAGAACAGGGCTTGACATC 2100

109684946 ACGGATGCCCAGTAAGTGGGGAACGAACAGAGACTGGCACATACACAGCACTGGGGAAAT 109685005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ACGGATGCCCAGTAAGTGGGGAACGAACAGAGACTGGCACATACACAGCACTGGGGAAAT 2160

109685006 GTTGGTCATTATTATCATTATTTCTCATGGGTTTGTATTGTTTCTGTGCCTCAGGTTTTC 109685065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     2161 GTTGGTCATTATTATCATTATTTCTCATGGGTTTGTATTGTTTCTGTGCCTCGGGTTTTC 2220

109685066 AGGAAAGTCTCTGCTTTTCCCCTGGGCAGTGCAACAGAGGGGAAGAGTGTTGGACTTGGA 109685125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AGGAAAGTCTCTGCTTTTCCCCTGGGCAGTGCAACAGAGGGGAAGAGTGTTGGACTTGGA 2280

109685126 GTCAGAGACCCATGTCTGAGCCCCAGGTTGGCCATTATGAGCTGTGTAGCTCTGGGAAAC 109685185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GTCAGAGACCCATGTCTGAGCCCCAGGTTGGCCATTATGAGCTGTGTAGCTCTGGGAAAC 2340

109685186 TCACTTAACCTCTCTGAGGTTTTGTTTCCTCATTCGTTGAGTTGGAATACCATTTGTTTT 109685245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TCACTTAACCTCTCTGAGGTTTTGTTTCCTCATTCGTTGAGTTGGAATACCATTTGTTTT 2400

109685246 CCTCCTCATCTGGCAAGCTGGTGAGATAAGCAAATATGATGATATGTCAAAATGCTTGTA 109685305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CCTCCTCATCTGGCAAGCTGGTGAGATAAGCAAATATGATGATATGTCAAAATGCTTGTA 2460

109685306 AGTACTAAATACCTTCCAGCTATTGTCATTATGTGGTCCCTCCTGCAAAATGGAAAAACC 109685365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AGTACTAAATACCTTCCAGCTATTGTCATTATGTGGTCCCTCCTGCAAAATGGAAAAACC 2520

109685366 AATTGATTTTACCATGGCTGACAATCTTATATCGGTTGTGAGGAGCTTATTATTCATAAT 109685425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 AATTGATTTTACCATGGCTGACAATCTTATATCGGTTGTGAGGAGCTTATTATTCATAAT 2580

109685426 TTCAGTGTGTTTCCATTTCTGCCCATATGGCACTCCTCCCTTAGACAGGTATCTTGAGAC 109685485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TTCAGTGTGTTTCCATTTCTGCCCATATGGCACTCCTCCCTTAGACAGGTATCTTGAGAC 2640

109685486 AAGAAAAGGAGCAGGTGGCCTTTAAAATACATTGCACATAACACATGCGTTTCACTGAAC 109685545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 AAGAAAAGGAGCAGGTGGCCTTTAAAATACATTGCACATAACACATGCGTTTCACTGAAC 2700

109685546 AGCTTTTTGCATTTAAAATGCAGACAATATGCTCAAAATAGTACTAATAAATTTTCTATC 109685605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AGCTTTTTGCATTTAAAATGCAGACAATATGCTCAAAATAGTACTAATAAATTTTCTATC 2760

109685606 TTGAGTAATGTATCTCAGACATATACCAAGGGAAAATAATTAAAGAAAAACCCAATAAAA 109685665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TTGAGTAATGTATCTCAGACATATACCAAGGGAAAATAATTAAAGAAAAACCCAATAAAA 2820

109685666 TAGAGATCATAAAAAGGGGGGCTTATAAATCAAGAGAGTAGACTTCTAGCCATTCTCAAT 109685725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TAGAGATCATAAAAAGGGGGGCTTATAAATCAAGAGAGTAGACTTCTAGCCATTCTCAAT 2880

109685726 ACAGCCTTTGAGTGCAAGGATCCCAGATGTTTGATTTGGACACATGGAATTTTGCAATAG 109685785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 ACAGCCTTTGAGTGCAAGGATCCCAGATGTTTGATTTGGACACATGGAATTTTGCAATAG 2940

109685786 GATAGTGTACTTCTTATGAATGAAACATCAAAAGGCATATGGTAGTAGATGCAATCATGT 109685845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 GATAGTGTACTTCTTATGAATGAAACATCAAAAGGCATATGGTAGTAGATGCAATCATGT 3000

109685846 TGGCAGACGTGTGTCTTGGAGAGCAGAAATGGCCAACTGAATGCTTCCTTCCTCACTCGT 109685905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TGGCAGACGTGTGTCTTGGAGAGCAGAAATGGCCAACTGAATGCTTCCTTCCTCACTCGT 3060

109685906 GAAGCCATCAGGAGCAAAGCTCCAGGGAGTGCCTTCCGCCCTGCTGGCAATGAATGGCCT 109685965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 GAAGCCATCAGGAGCAAAGCTCCAGGGAGTGCCTTCCGCCCTGCTGGCAATGAATGGCCT 3120

109685966 CTCCTGACAGATAGCCTAAGAGCCTTTGGCTAAAGATTTGCAACATCAAAGAGTGAGTGG 109686025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 CTCCTGACAGATAGCCTAAGAGCCTTTGGCTAAAGATTTGCAACATCAAAGAGTGAGTGG 3180

109686026 CATGGCCTGGCCAGCCACCTGAGACAACGTACTTTGTTCCAGAACGTGGTTCAGAGTTTC 109686085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 CATGGCCTGGCCAGCCACCTGAGACAACGTACTTTGTTCCAGAACGTGGTTCAGAGTTTC 3240

109686086 ACCTTGCTGGCTCAGTGGGGATTAAGGCTGAAAGAGGCTTTGAAAATGTTGATAACAGAT 109686145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 ACCTTGCTGGCTCAGTGGGGATTAAGGCTGAAAGAGGCTTTGAAAATGTTGATAACAGAT 3300

109686146 GAATGTAAATATTATTTACCTAGCAACATAACACTTTTTTTCTTCTTTTTTGGCTCTTTC 109686205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 GAATGTAAATATTATTTACCTAGCAACATAACACTTTTTTTCTTCTTTTTTGGCTCTTTC 3360

109686206 ATGGAGTCATTACTCTTTCCCTTGAGTTGTCAGTTCCTTCATTTAGTCTATTCCTTCAAC 109686265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 ATGGAGTCATTACTCTTTCCCTTGAGTTGTCAGTTCCTTCATTTAGTCTATTCCTTCAAC 3420

109686266 AATTATTGATCAAATCATTATTTGTGCTGGGCAGTGTTCTATGTCCCAGGAATTTTGTAC 109686325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 AATTATTGATCAAATCATTATTTGTGCTGGGCAGTGTTCTATGTCCCAGGAATTTTGTAC 3480

109686326 TGTAAACCAGTACTCTGTCCTCATAACGCCTATAATCTAGAGACATTGAACTGTGAGCAC 109686385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TGTAAACCAGTACTCTGTCCTCATAACGCCTATAATCTAGAGACATTGAACTGTGAGCAC 3540

109686386 AGGAATAAGCAGTGTACTTTCAGAATGTAATCAGTGTTCTCAAGGGAGGAGATTATGATG 109686445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 AGGAATAAGCAGTGTACTTTCAGAATGTAATCAGTGTTCTCAAGGGAGGAGATTATGATG 3600

109686446 TAACAGAGCTTCTTTTCATCTCAAAGGAAGGCCATTAAGAAGGGCCAGTCAGGACAGGTG 109686505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 TAACAGAGCTTCTTTTCATCTCAAAGGAAGGCCATTAAGAAGGGCCAGTCAGGACAGGTG 3660

109686506 ATGCTGGCAGGAAGGGAGCCAGCCTGCGACGTGCTGGGAAGACAGGCAGAGAGACTATAC 109686565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 ATGCTGGCAGGAAGGGAGCCAGCCTGCGACGTGCTGGGAAGACAGGCAGAGAGACTATAC 3720

109686566 GTTCAAAGGGTGTGAGGCAGGCATGAGTTTGCAGAAAGTGTGCTAAGGGCCTGGAGCAGA 109686625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 GTTCAAAGGGTGTGAGGCAGGCATGAGTTTGCAGAAAGTGTGCTAAGGGCCTGGAGCAGA 3780

109686626 GTGAGTGAGGGGGAACAAAGACAGGGAGGTGTTAAAGGGCCAGGAGGGGCTGGACCCTCT 109686685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 GTGAGTGAGGGGGAACAAAGACAGGGAGGTGTTAAAGGGCCAGGAGGGGCTGGACCCTCT 3840

109686686 GGAGCATTGATGACTATGCTGTGGAATGAATTTGGATGTTGTTTAAGGGGAATGGGAAGT 109686745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 GGAGCATTGATGACTATGCTGTGGAATGAATTTGGATGTTGTTTAAGGGGAATGGGAAGT 3900

109686746 CATTGAAATATTTTAAGTAGAGAAATGGGATGCACTGATTTACCTTATGAAAAGAGTTCT 109686805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 CATTGAAATATTTTAAGTAGAGAAATGGGATGCACTGATTTACCTTATGAAAAGAGTTCT 3960

109686806 CTAGCTGCTTTGAGAGAATGGATTATAGTGGGGTGATATAGTTTGGACGTTTGTCCTCTC 109686865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 CTAGCTGCTTTGAGAGAATGGATTATAGTGGGGTGATATAGTTTGGACGTTTGTCCTCTC 4020

109686866 CAAATCTCGTGTTGAAATGTGATGCTCAGTGTTGGAGGTGGGGTCTGGTGGGAGGTGATT 109686925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 CAAATCTCGTGTTGAAATGTGATGCTCAGTGTTGGAGGTGGGGTCTGGTGGGAGGTGATT 4080

109686926 GGGTCGTGGAGCAGATCCTTCATGAATGGCTGCTGACATCATCTTGGTGGTGAGTGAGTT 109686985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 GGGTCGTGGAGCAGATCCTTCATGAATGGCTGCTGACATCATCTTGGTGGTGAGTGAGTT 4140

109686986 CTCAGTCTGGTAGTTCACATGAGATCTGCCTGTTTTAAAGAGTATGGTGGCCAAGTGCCG 109687045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 CTCAGTCTGGTAGTTCACATGAGATCTGCCTGTTTTAAAGAGTATGGTGGCCAAGTGCCG 4200

109687046 TGGCTCACGCCTGTGATCCCAGCACTTTGGGAGGTAAAGGCAGGAGGATCACTTGAGCTC 109687105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 TGGCTCACGCCTGTGATCCCAGCACTTTGGGAGGTAAAGGCAGGAGGATCACTTGAGCTC 4260

109687106 AGGAGTTCGACACTAGCCTGGGAAACAGGGTGAAACCCATCTCTACTAAAAATAGAAATA 109687165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 AGGAGTTCGACACTAGCCTGGGAAACAGGGTGAAACCCATCTCTACTAAAAATAGAAATA 4320

109687166 TTAGGCGGGTGTGATGGTGCGCTGCCTATAGTCCCAGCTACCGGGGAGGCTGAGGTGGGA 109687225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 TTAGGCGGGTGTGATGGTGCGCTGCCTATAGTCCCAGCTACCGGGGAGGCTGAGGTGGGA 4380

109687226 GGATCACTTGAGCCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCACTGCACTCC 109687285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 GGATCACTTGAGCCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCACTGCACTCC 4440

109687286 AGCCTGGGCAACAAAGCCAGACCCTATCT 109687314
          |||||||||||||||||||||||||||||
     4441 AGCCTGGGCAACAAAGCCAGACCCTATCT 4469

EXCISED REGION

109687318 AAAAAAAAAAAAAAATAGAGTGCGGCACCCCTCCCTTCCCACTGTTGCTCCCTCTCTCGC 109687377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4470 AAAAAAAAAAAAAAATAGAGTGCGGCACCCCTCCCTTCCCACTGTTGCTCCCTCTCTCGC 4529

109687378 CATGTGGGGCACGGGCTGCTCCTTCATCTTCCACCATTATTGTGAGCTTCCTGAGGCCTC 109687437
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4530 CATGTGGGGCATGGGCTGCTCCTTCATCTTCCACCATTATTGTGAGCTTCCTGAGGCCTC 4589

109687438 ACCAGGAGCAGATGTGAGCAAATTAAACCTCTTTTCTTTATAAATTACCCATATTTAGGT 109687497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4590 ACCAGGAGCAGATGTGAGCAAATTAAACCTCTTTTCTTTATAAATTACCCATATTTAGGT 4649

109687498 ATTTATTTATAGCTACTACAAGGGGGAAAGGGAGAGCAGGGAGATCAGTGGTGCTTTCAC 109687557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4650 ATTTATTTATAGCTACTACAAGGGGGAAAGGGAGAGCAGGGAGATCAGTGGTGCTTTCAC 4709

109687558 ACTAGTACAGCAATAGAGCAGCATCTTGGACCAGGGTGGTGGCTGAGGAGACAGGATCAT 109687617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4710 ACTAGTACAGCAATAGAGCAGCATCTTGGACCAGGGTGGTGGCTGAGGAGACAGGATCAT 4769

109687618 GGCTTTGAGATACATTCTGAAGAAGAAAAGTAGGCCTTGCTGATAGAATAGTCACAAACT 109687677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4770 GGCTTTGAGATACATTCTGAAGAAGAAAAGTAGGCCTTGCTGATAGAATAGTCACAAACT 4829

109687678 GTAATGGAAAAGGTAAATTCAAGGATGTCTCCTGGGTTTTTGGCTTAAGCATCTGGATAC 109687737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4830 GTAATGGAAAAGGTAAATTCAAGGATGTCTCCTGGGTTTTTGGCTTAAGCATCTGGATAC 4889

109687738 AGAGATATGGAAGACTGGGAGGGAAATGGGTTTGGAGTATACATGCATGCAATCAACAAT 109687797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4890 AGAGATATGGAAGACTGGGAGGGAAATGGGTTTGGAGTATACATGCATGCAATCAACAAT 4949

109687798 TCTGTCTTGCATGTGTGAAATTTAGATACCCATTAGACATCTGCATAGAGGGCCAGGCAC 109687857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4950 TCTGTCTTGCATGTGTGAAATTTAGATACCCATTAGACATCTGCATAGAGGGCCAGGCAC 5009

109687858 AGTGGCTCACGGCAGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCGGATCACTTGAGG 109687917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5010 AGTGGCTCACGGCAGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCGGATCACTTGAGG 5069

109687918 TTAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACTCTGTCTCTACTAAAAATACAA 109687977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5070 TTAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACTCTGTCTCTACTAAAAATACAA 5129

109687978 AAATTATCTGGGTGTGGTGGTGTGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAT 109688037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5130 AAATTATCTGGGTGTGGTGGTGTGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAT 5189

109688038 GAGAATCACTTGAACCTGGGAGGTAGAGGTTGCAGCGAGCCAAGATCACACCACTGCACT 109688097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5190 GAGAATCACTTGAACCTGGGAGGTAGAGGTTGCAGCGAGCCAAGATCACACCACTGCACT 5249

109688098 CTAGCAAGGGTGACAAAGCAAGACTCTATCTCAAAAAAAAAAAGACATTTATGTAGAGAT 109688157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5250 CTAGCAAGGGTGACAAAGCAAGACTCTATCTCAAAAAAAAAAAGACATTTATGTAGAGAT 5309

109688158 GTTAGGTTGGCAGTTGGATAACAGTCTTGAGTTTCGGGGTGAGGGCAGGACCAGAAATGA 109688217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5310 GTTAGGTTGGCAGTTGGATAACAGTCTTGAGTTTCGGGGTGAGGGCAGGACCAGAAATGA 5369

109688218 AGATTTGGGATTCATTAGCATGTAGATCATATTCAGAGCCACAATAATAGATGAAATAAC 109688277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5370 AGATTTGGGATTCATTAGCATGTAGATCATATTCAGAGCCACAATAATAGATGAAATAAC 5429

109688278 TGAGGAAGAGAGCTAGAGGGGCCAAGAGCAAACACAGGAACATGCCAGCATTTAGAGGAC 109688337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5430 TGAGGAAGAGAGCTAGAGGGGCCAAGAGCAAACACAGGAACATGCCAGCATTTAGAGGAC 5489

109688338 AATGGAGAAGGAGGAGATGGCAGAGATGTCAATAGGAGGAAAAGCAAAAGGGTGTTATCA 109688397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5490 AATGGAGAAGGAGGAGATGGCAGAGATGTCAATAGGAGGAAAAGCAAAAGGGTGTTATCA 5549

109688398 TAGAAGGTGACAACAGAATATATCACAAAGAGGAATATGTTTGAATGTGTCAAATGTTGT 109688457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5550 TAGAAGGTGACAACAGAATATATCACAAAGAGGAATATGTTTGAATGTGTCAAATGTTGT 5609

109688458 TATCACAGGCTATAGAAGTAAACACAAAGTCTTATGGGAATACTGAGGATGAGCTGCCTC 109688517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5610 TATCACAGGCTATAGAAGTAAACACAAAGTCTTATGGGAATACTGAGGATGAGCTGCCTC 5669

109688518 TAGTGTGTGTGAAACCCTGGCCAAATATTTGTTGTGGGGCCCCTGTCTATATATGCAATG 109688577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5670 TAGTGTGTGTGAAACCCTGGCCAAATATTTGTTGTGGGGCCCCTGTCTATATATGCAATG 5729

109688578 TTATTTAAAAACATACTACATATTCTTGGGCTTATGTGGGATGTAGTGATTTATTGATGA 109688637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5730 TTATTTAAAAACATACTACATATTCTTGGGCTTATGTGGGATGTAGTGATTTATTGATGA 5789

109688638 AGACTTAGAATACTGGGTAGGAAGAGATGCTTTTGGATTTGTTTATGAGCCAGTGAGTGT 109688697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5790 AGACTTAGAATACTGGGTAGGAAGAGATGCTTTTGGATTTGTTTATGAGCCAGTGAGTGT 5849

109688698 ATCTGAGGATTCTTTATCCTGTGTCTAATGTGAGTGTGTTTTCCTGAATCAGTGCATCAG 109688757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5850 ATCTGAGGATTCTTTATCCTGTGTCTAATGTGAGTGTGTTTTCCTGAATCAGTGCATCAG 5909

109688758 TGCTATTCTGGAGGCCCAAATCACACATGATTCCGTGAAAGAAACTCTGTGCTGGCCAGA 109688817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5910 TGCTATTCTGGAGGCCCAAATCACACATGATTCCGTGAAAGAAACTCTGTGCTGGCCAGA 5969

109688818 GGATGCACTCACTCTCCAGGCTTTCCTGCATGGGCCCTCACCATGGAGTCCTGGATACTT 109688877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5970 GGATGCACTCACTCTCCAGGCTTTCCTGCATGGGCCCTCACCATGGAGTCCTGGATACTT 6029

109688878 AGGGCATCTGGTTGACCACATGCTTGGGAGAGCACCAAAGAAGGTCCTGGTTTTCAAGCC 109688937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6030 AGGGCATCTGGTTGACCACATGCTTGGGAGAGCACCAAAGAAGGTCCTGGTTTTCAAGCC 6089

109688938 TCCAGCTTCTCCTTAGAAAGAGTTGACTACCTGTCTGGGCTCCAACTTTTCTGGCTGCTA 109688997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6090 TCCAGCTTCTCCTTAGAAAGAGTTGACTACCTGTCTGGGCTCCAACTTTTCTGGCTGCTA 6149

109688998 CCAGAGGGTCTGGCCTCTAAACCATCTGTGTCAAAGAACTGACAGGGCCTGACATTCACT 109689057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6150 CCAGAGGGTCTGGCCTCTAAACCATCTGTGTCAAAGAACTGACAGGGCCTGACATTCACT 6209

109689058 GGGACCCTAGGCTAGGGGTGACAGAGAGCAAAGCAAAAGTTTGAAAGAGTATGCAGTCTG 109689117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6210 GGGACCCTAGGCTAGGGGTGACAGAGAGCAAAGCAAAAGTTTGAAAGAGTATGCAGTCTG 6269

109689118 AATGAGCATGCAGACCTTTGCCACAGCTCCCCTTCCCAGCTCAGTGCAGAGCAAGTAGGA 109689177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6270 AATGAGCATGCAGACCTTTGCCACAGCTCCCCTTCCCAGCTCAGTGCAGAGCAAGTAGGA 6329

109689178 GATAAACTTCTGCTCTTAGCTTCTCTGTGAGGAGAGATGAAATGGACCACACATCTAGCA 109689237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6330 GATAAACTTCTGCTCTTAGCTTCTCTGTGAGGAGAGATGAAATGGACCACACATCTAGCA 6389

109689238 CCCCAACTTTTCTGACAACTACTAGAAGGACTGACTCCTGACTCACCTGTCTCAGGGCAC 109689297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6390 CCCCAACTTTTCTGACAACTACTAGAAGGACTGACTCCTGACTCACCTGTCTCAGGGCAC 6449

109689298 TGATGGTACTTGGCACACTCTAGTCTCCTGGGGCCACCAAGAACAAGAACAGCATTTTGG 109689357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6450 TGATGGTACTTGGCACACTCTAGTCTCCTGGGGCCACCAAGAACAAGAACAGCATTTTGG 6509

109689358 ACAAACACACTGGTTTGAGAGGCACCCAGACTCTCTGACTGGGCTGTGAGGAGGCTCATC 109689417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6510 ACAAACACACTGGTTTGAGAGGCACCCAGACTCTCTGACTGGGCTGTGAGGAGGCTCATC 6569

109689418 TGTGAAGACTGAGGGAGGTGGCTGTTTTATCAAATGTGCAGAAACCAACACAGAGAGTCA 109689477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6570 TGTGAAGACTGAGGGAGGTGGCTGTTTTATCAAATGTGCAGAAACCAACACAGAGAGTCA 6629

109689478 AAGACAATGAACAAACAGGAAATATGCCATAAATAAAAGAACAAGATAAATCTTCAGAAA 109689537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6630 AAGACAATGAACAAACAGGAAATATGCCATAAATAAAAGAACAAGATAAATCTTCAGAAA 6689

109689538 CTGACCCAAACAGAATGGAGATATGTGATTTACCAGACAAAAAATCAAAAGACCTGTCAC 109689597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6690 CTGACCCAAACAGAATGGAGATATGTGATTTACCAGACAAAAAATCAAAAGACCTGTCAC 6749

109689598 AAAGATGCTCAGTGAGGTCAGGAGAGCAATGCATGAATAAAGTGAGAATTTCAACCAAAA 109689657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6750 AAAGATGCTCAGTGAGGTCAGGAGAGCAATGCATGAATAAAGTGAGAATTTCAACCAAAA 6809

109689658 AGGTAGAAAATATTAAAAAGTGCCAAACAGAAATCACGGAGCTGAAGAATATAATAAAAG 109689717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6810 AGGTAGAAAATATTAAAAAGTGCCAAACAGAAATCACGGAGCTGAAGAATATAATAAAAG 6869

109689718 AACAGAAAAATTTAATAGAGGGGTTCAATAGCAGACTAGGTGAACTGAAAGAAAGGATTA 109689777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6870 AACAGAAAAATTTAATAGAGGGGTTCAATAGCAGACTAGGTGAACTGAAAGAAAGGATTA 6929

109689778 GTGAACTCAAGGACTGGTCATTGGCAATCATTCAGTCACAGCATTAAAAAGAAAAAAGAA 109689837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6930 GTGAACTCAAGGACTGGTCATTGGCAATCATTCAGTCACAGCATTAAAAAGAAAAAAGAA 6989

109689838 TGAAGGGCCAGGCACAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCTGAGGTGG 109689897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6990 TGAAGGGCCAGGCACAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCTGAGGTGG 7049

109689898 GTGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATCTCT 109689957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7050 GTGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATCTCT 7109

109689958 ACTAAAAATACAAAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCACGCACCTGTAATCCCAGCTACTC 109690017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7110 ACTAAAAATACAAAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCACGCACCTGTAATCCCAGCTACTC 7169

109690018 GGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTACTTGAACCTGGGAGGCTGAGGTTGCAGTGAGCTGAGA 109690077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7170 GGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTACTTGAACCTGGGAGGCTGAGGTTGCAGTGAGCTGAGA 7229

109690078 TTGCGCCACTGCACTCAGGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTCTGTCTCAAAAGAAAAAAAA 109690137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7230 TTGCGCCACTGCACTCAGGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTCTGTCTCAAAAGAAAAAAAA 7289

109690138 AGAGAGAGAGAAGAAAAGAAAAAAGAATGAAAAACAGTGAAGATACCTTTAAAAACTAAT 109690197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7290 AGAGAGAGAGAAGAAAAGAAAAAAGAATGAAAAACAGTGAAGATACCTTTAAAAACTAAT 7349

109690198 GAACACCACCCAGCAGATCTACATATGCATTATGAGACACTCAGACATTATGATATCAGT 109690257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7350 GAACACCACCCAGCAGATCTACATATGCATTATGAGACACTCAGACATTATGATATCAGT 7409

109690258 AACACAGAATGTGGAATAAGGAGAGGTAAAATTGCAGAGTACTTCTATAGAAGTGTTATC 109690317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7410 AACACAGAATGTGGAATAAGGAGAGGTAAAATTGCAGAGTACTTCTATAGAAGTGTTATC 7469

109690318 AGTTTAACCTGTTATAAATATATGTTATGTAAGCCCCTGGTAACCACAAAGAAACTACCT 109690377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7470 AGTTTAACCTGTTATAAATATATGTTATGTAAGCCCCTGGTAACCACAAAGAAACTACCT 7529

109690378 ATAGAAATGACACAAAAGAAAAAAAGTTACAAAGCCTATCAATGCAAAACAGCACAACAA 109690437
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     7530 ATAGAAATGACACAAAAGAAAAAAAGTTACAAAGCCTGTCAATGCAAAACAGCACAACAA 7589

109690438 AAACAGGCAAACAAAACCCAACAATAAAACACAAAGGAAGACAGCAAGAGAGAAAAAGAG 109690497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7590 AAACAGGCAAACAAAACCCAACAATAAAACACAAAGGAAGACAGCAAGAGAGAAAAAGAG 7649

109690498 GGACAAAAGAACTACAAGACAAACAGAAAACAGTTTTAAAAAAATGGCAATATGGTGGTT 109690557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7650 GGACAAAAGAACTACAAGACAAACAGAAAACAGTTTTAAAAAAATGGCAATATGGTGGTT 7709

109690558 CATACCTGTAATCCCAACACTTAGGAAGGCCGAGACGAGCAGATCACTTGAGGTCAGGAG 109690617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7710 CATACCTGTAATCCCAACACTTAGGAAGGCCGAGACGAGCAGATCACTTGAGGTCAGGAG 7769

109690618 TTTGAGACCAACCTGGCCAACATAGTGAAACCTGGTCTCTACTAGAAATACACAAAATTT 109690677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7770 TTTGAGACCAACCTGGCCAACATAGTGAAACCTGGTCTCTACTAGAAATACACAAAATTT 7829

109690678 AGCCAGGTGTAGTGGCAGGAGCCTGTAATCCAGCTACTCGGGAGGCTGAAGCACAAGAAT 109690737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7830 AGCCAGGTGTAGTGGCAGGAGCCTGTAATCCAGCTACTCGGGAGGCTGAAGCACAAGAAT 7889

109690738 TGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAACTGAGATTGTACCACTGCACTCCAGCC 109690797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7890 TGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAACTGAGATTGTACCACTGCACTCCAGCC 7949

109690798 TGGACAACAGAGCAAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAGGCAATACTAAATCTTGCCCTATC 109690857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7950 TGGACAACAGAGCAAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAGGCAATACTAAATCTTGCCCTATC 8009

109690858 AATAATTACTTAAAATGGCTGAATGTGGCGGCTTATGCCTGTAATCCCAGCACTCTGGGA 109690917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8010 AATAATTACTTAAAATGGCTGAATGTGGCGGCTTATGCCTGTAATCCCAGCACTCTGGGA 8069

109690918 GGCCAAGGCAGGTAGATCACTTGAGACCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGATG 109690977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8070 GGCCAAGGCAGGTAGATCACTTGAGACCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGATG 8129

109690978 AAGCCCCATCTCTACTAAAAAATACAAAAATTAGCAGGGTGTGGTGGCATGTGCCTGTAA 109691037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8130 AAGCCCCATCTCTACTAAAAAATACAAAAATTAGCAGGGTGTGGTGGCATGTGCCTGTAA 8189

109691038 TCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGAGAATAGC 109691072
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8190 TCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGAGAATAGC 8224

Alignment time is 7.1945 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [109679900,109705214] =>     25315 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [        1,     4200] =>      4200 nucs 'mol-32-2fc2-002443_4200'

Score:        3985
Aligned:      4062        nucs
Identic:      4055 (100%) nucs =>      2708 (100%)      1347 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [109687190,109689900] EXCISED REGION [109695215,109696565]
 second seq =>  [      141,     2850] EXCISED REGION [     2851,     4200]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      5314 nucs [109689901,109695214]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        28 nucs [109689901,109689928] to [109695215,109695242]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [109689900,109689900] to [109695215,109695215]
 second seq =>         1 nucs [2850,2850] to [2851,2851]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

109687190 CCTATAGTCCCAGCTACCGGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGGCAG 109687249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      141 CCTATAGTCCCAGCTACCGGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGGCAG 200

109687250 AGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAGCCAGACCC 109687309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      201 AGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAGCCAGACCC 260

109687310 TATCTAAAAAAAAAAAAAAAAAATAGAGTGCGGCACCCCTCCCTTCCCACTGTTGCTCCC 109687369
          |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      261 TATCTAAAAAAAAAAAAAAAAA-TAGAGTGCGGCACCCCTCCCTTCCCACTGTTGCTCCC 319

109687370 TCTCTCGCCATGTGGGGCACGGGCTGCTCCTTCATCTTCCACCATTATTGTGAGCTTCCT 109687429
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      320 TCTCTCGCCATGTGGGGCATGGGCTGCTCCTTCATCTTCCACCATTATTGTGAGCTTCCT 379

109687430 GAGGCCTCACCAGGAGCAGATGTGAGCAAATTAAACCTCTTTTCTTTATAAATTACCCAT 109687489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      380 GAGGCCTCACCAGGAGCAGATGTGAGCAAATTAAACCTCTTTTCTTTATAAATTACCCAT 439

109687490 ATTTAGGTATTTATTTATAGCTACTACAAGGGGGAAAGGGAGAGCAGGGAGATCAGTGGT 109687549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      440 ATTTAGGTATTTATTTATAGCTACTACAAGGGGGAAAGGGAGAGCAGGGAGATCAGTGGT 499

109687550 GCTTTCACACTAGTACAGCAATAGAGCAGCATCTTGGACCAGGGTGGTGGCTGAGGAGAC 109687609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      500 GCTTTCACACTAGTACAGCAATAGAGCAGCATCTTGGACCAGGGTGGTGGCTGAGGAGAC 559

109687610 AGGATCATGGCTTTGAGATACATTCTGAAGAAGAAAAGTAGGCCTTGCTGATAGAATAGT 109687669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      560 AGGATCATGGCTTTGAGATACATTCTGAAGAAGAAAAGTAGGCCTTGCTGATAGAATAGT 619

109687670 CACAAACTGTAATGGAAAAGGTAAATTCAAGGATGTCTCCTGGGTTTTTGGCTTAAGCAT 109687729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      620 CACAAACTGTAATGGAAAAGGTAAATTCAAGGATGTCTCCTGGGTTTTTGGCTTAAGCAT 679

109687730 CTGGATACAGAGATATGGAAGACTGGGAGGGAAATGGGTTTGGAGTATACATGCATGCAA 109687789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      680 CTGGATACAGAGATATGGAAGACTGGGAGGGAAATGGGTTTGGAGTATACATGCATGCAA 739

109687790 TCAACAATTCTGTCTTGCATGTGTGAAATTTAGATACCCATTAGACATCTGCATAGAGGG 109687849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      740 TCAACAATTCTGTCTTGCATGTGTGAAATTTAGATACCCATTAGACATCTGCATAGAGGG 799

109687850 CCAGGCACAGTGGCTCACGGCAGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCGGATC 109687909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      800 CCAGGCACAGTGGCTCACGGCAGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCGGATC 859

109687910 ACTTGAGGTTAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACTCTGTCTCTACTAA 109687969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      860 ACTTGAGGTTAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACTCTGTCTCTACTAA 919

109687970 AAATACAAAAATTATCTGGGTGTGGTGGTGTGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGC 109688029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      920 AAATACAAAAATTATCTGGGTGTGGTGGTGTGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGC 979

109688030 TGAGGCATGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGTAGAGGTTGCAGCGAGCCAAGATCACACC 109688089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      980 TGAGGCATGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGTAGAGGTTGCAGCGAGCCAAGATCACACC 1039

109688090 ACTGCACTCTAGCAAGGGTGACAAAGCAAGACTCTATCTCAAAAAAAAAAAGACATTTAT 109688149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1040 ACTGCACTCTAGCAAGGGTGACAAAGCAAGACTCTATCTCAAAAAAAAAAAGACATTTAT 1099

109688150 GTAGAGATGTTAGGTTGGCAGTTGGATAACAGTCTTGAGTTTCGGGGTGAGGGCAGGACC 109688209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1100 GTAGAGATGTTAGGTTGGCAGTTGGATAACAGTCTTGAGTTTCGGGGTGAGGGCAGGACC 1159

109688210 AGAAATGAAGATTTGGGATTCATTAGCATGTAGATCATATTCAGAGCCACAATAATAGAT 109688269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1160 AGAAATGAAGATTTGGGATTCATTAGCATGTAGATCATATTCAGAGCCACAATAATAGAT 1219

109688270 GAAATAACTGAGGAAGAGAGCTAGAGGGGCCAAGAGCAAACACAGGAACATGCCAGCATT 109688329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1220 GAAATAACTGAGGAAGAGAGCTAGAGGGGCCAAGAGCAAACACAGGAACATGCCAGCATT 1279

109688330 TAGAGGACAATGGAGAAGGAGGAGATGGCAGAGATGTCAATAGGAGGAAAAGCAAAAGGG 109688389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1280 TAGAGGACAATGGAGAAGGAGGAGATGGCAGAGATGTCAATAGGAGGAAAAGCAAAAGGG 1339

109688390 TGTTATCATAGAAGGTGACAACAGAATATATCACAAAGAGGAATATGTTTGAATGTGTCA 109688449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1340 TGTTATCATAGAAGGTGACAACAGAATATATCACAAAGAGGAATATGTTTGAATGTGTCA 1399

109688450 AATGTTGTTATCACAGGCTATAGAAGTAAACACAAAGTCTTATGGGAATACTGAGGATGA 109688509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1400 AATGTTGTTATCACAGGCTATAGAAGTAAACACAAAGTCTTATGGGAATACTGAGGATGA 1459

109688510 GCTGCCTCTAGTGTGTGTGAAACCCTGGCCAAATATTTGTTGTGGGGCCCCTGTCTATAT 109688569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1460 GCTGCCTCTAGTGTGTGTGAAACCCTGGCCAAATATTTGTTGTGGGGCCCCTGTCTATAT 1519

109688570 ATGCAATGTTATTTAAAAACATACTACATATTCTTGGGCTTATGTGGGATGTAGTGATTT 109688629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1520 ATGCAATGTTATTTAAAAACATACTACATATTCTTGGGCTTATGTGGGATGTAGTGATTT 1579

109688630 ATTGATGAAGACTTAGAATACTGGGTAGGAAGAGATGCTTTTGGATTTGTTTATGAGCCA 109688689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1580 ATTGATGAAGACTTAGAATACTGGGTAGGAAGAGATGCTTTTGGATTTGTTTATGAGCCA 1639

109688690 GTGAGTGTATCTGAGGATTCTTTATCCTGTGTCTAATGTGAGTGTGTTTTCCTGAATCAG 109688749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1640 GTGAGTGTATCTGAGGATTCTTTATCCTGTGTCTAATGTGAGTGTGTTTTCCTGAATCAG 1699

109688750 TGCATCAGTGCTATTCTGGAGGCCCAAATCACACATGATTCCGTGAAAGAAACTCTGTGC 109688809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1700 TGCATCAGTGCTATTCTGGAGGCCCAAATCACACATGATTCCGTGAAAGAAACTCTGTGC 1759

109688810 TGGCCAGAGGATGCACTCACTCTCCAGGCTTTCCTGCATGGGCCCTCACCATGGAGTCCT 109688869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1760 TGGCCAGAGGATGCACTCACTCTCCAGGCTTTCCTGCATGGGCCCTCACCATGGAGTCCT 1819

109688870 GGATACTTAGGGCATCTGGTTGACCACATGCTTGGGAGAGCACCAAAGAAGGTCCTGGTT 109688929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1820 GGATACTTAGGGCATCTGGTTGACCACATGCTTGGGAGAGCACCAAAGAAGGTCCTGGTT 1879

109688930 TTCAAGCCTCCAGCTTCTCCTTAGAAAGAGTTGACTACCTGTCTGGGCTCCAACTTTTCT 109688989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1880 TTCAAGCCTCCAGCTTCTCCTTAGAAAGAGTTGACTACCTGTCTGGGCTCCAACTTTTCT 1939

109688990 GGCTGCTACCAGAGGGTCTGGCCTCTAAACCATCTGTGTCAAAGAACTGACAGGGCCTGA 109689049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1940 GGCTGCTACCAGAGGGTCTGGCCTCTAAACCATCTGTGTCAAAGAACTGACAGGGCCTGA 1999

109689050 CATTCACTGGGACCCTAGGCTAGGGGTGACAGAGAGCAAAGCAAAAGTTTGAAAGAGTAT 109689109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2000 CATTCACTGGGACCCTAGGCTAGGGGTGACAGAGAGCAAAGCAAAAGTTTGAAAGAGTAT 2059

109689110 GCAGTCTGAATGAGCATGCAGACCTTTGCCACAGCTCCCCTTCCCAGCTCAGTGCAGAGC 109689169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2060 GCAGTCTGAATGAGCATGCAGACCTTTGCCACAGCTCCCCTTCCCAGCTCAGTGCAGAGC 2119

109689170 AAGTAGGAGATAAACTTCTGCTCTTAGCTTCTCTGTGAGGAGAGATGAAATGGACCACAC 109689229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2120 AAGTAGGAGATAAACTTCTGCTCTTAGCTTCTCTGTGAGGAGAGATGAAATGGACCACAC 2179

109689230 ATCTAGCACCCCAACTTTTCTGACAACTACTAGAAGGACTGACTCCTGACTCACCTGTCT 109689289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2180 ATCTAGCACCCCAACTTTTCTGACAACTACTAGAAGGACTGACTCCTGACTCACCTGTCT 2239

109689290 CAGGGCACTGATGGTACTTGGCACACTCTAGTCTCCTGGGGCCACCAAGAACAAGAACAG 109689349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2240 CAGGGCACTGATGGTACTTGGCACACTCTAGTCTCCTGGGGCCACCAAGAACAAGAACAG 2299

109689350 CATTTTGGACAAACACACTGGTTTGAGAGGCACCCAGACTCTCTGACTGGGCTGTGAGGA 109689409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2300 CATTTTGGACAAACACACTGGTTTGAGAGGCACCCAGACTCTCTGACTGGGCTGTGAGGA 2359

109689410 GGCTCATCTGTGAAGACTGAGGGAGGTGGCTGTTTTATCAAATGTGCAGAAACCAACACA 109689469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2360 GGCTCATCTGTGAAGACTGAGGGAGGTGGCTGTTTTATCAAATGTGCAGAAACCAACACA 2419

109689470 GAGAGTCAAAGACAATGAACAAACAGGAAATATGCCATAAATAAAAGAACAAGATAAATC 109689529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     2420 GAGAGTCAAAGACAATGAACAAACAGGAAATATGCCATAAATAAAAGAACAAGATAAAAC 2479

109689530 TTCAGAAACTGACCCAAACAGAATGGAGATATGTGATTTACCAGACAAAAAATCAAAAGA 109689589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2480 TTCAGAAACTGACCCAAACAGAATGGAGATATGTGATTTACCAGACAAAAAATCAAAAGA 2539

109689590 CCTGTCACAAAGATGCTCAGTGAGGTCAGGAGAGCAATGCATGAATAAAGTGAGAATTTC 109689649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2540 CCTGTCACAAAGATGCTCAGTGAGGTCAGGAGAGCAATGCATGAATAAAGTGAGAATTTC 2599

109689650 AACCAAAAAGGTAGAAAATATTAAAAAGTGCCAAACAGAAATCACGGAGCTGAAGAATAT 109689709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2600 AACCAAAAAGGTAGAAAATATTAAAAAGTGCCAAACAGAAATCACGGAGCTGAAGAATAT 2659

109689710 AATAAAAGAACAGAAAAATTTAATAGAGGGGTTCAATAGCAGACTAGGTGAACTGAAAGA 109689769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2660 AATAAAAGAACAGAAAAATTTAATAGAGGGGTTCAATAGCAGACTAGGTGAACTGAAAGA 2719

109689770 AAGGATTAGTGAACTCAAGGACTGGTCATTGGCAATCATTCAGTCACAGCATTAAAAAGA 109689829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2720 AAGGATTAGTGAACTCAAGGACTGGTCATTGGCAATCATTCAGTCACAGCATTAAAAAGA 2779

109689830 AAAAAGAATGAAGGGCCAGGCACAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGC 109689889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2780 AAAAAGAATGAAGGGCCAGGCACAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGC 2839

109689890 TGAGGTGGGTG 109689900
          |||||||||||
     2840 TGAGGTGGGTG 2850

EXCISED REGION

109695215 GATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATTCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATTTCAACT 109695274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2851 GATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATTCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATTTCAACT 2910

109695275 AAAAATACAAAAAAAAAAAAAAAATAGCCGGGTGTGGTGGCACACACCCGTAGTCCCAGC 109695334
          |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2911 AAAAATAC-AAAAAAAAAAAAAAATAGCCGGGTGTGGTGGCACACACCCGTAGTCCCAGC 2969

109695335 TACTTGGGAGGCTGGGGCAGGAGAATGGCATGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGC 109695394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2970 TACTTGGGAGGCTGGGGCAGGAGAATGGCATGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGC 3029

109695395 CGAGATCGCACAATTGCTTTCCAGCCTGGGCAACGGAGCGAGACTCTGTTTCAAAAAAAA 109695454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3030 CGAGATCGCACAATTGCTTTCCAGCCTGGGCAACGGAGCGAGACTCTGTTTCAAAAAAAA 3089

109695455 AGGTGACCATGTGAAGGGATGGATATGTTAAGTAGCTTGACTGGTAATCGGTTCACGATG 109695514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3090 AGGTGACCATGTGAAGGGATGGATATGTTAAGTAGCTTGACTGGTAATCGGTTCACGATG 3149

109695515 TATATGTACAGTTGACCCTTGAACAACATGCGTTTAAATTACAAGAGTCCACTTATATGG 109695574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3150 TATATGTACAGTTGACCCTTGAACAACATGCGTTTAAATTACAAGAGTCCACTTATATGG 3209

109695575 GGATTTTCTTCTGCCTCTGCCAGCAAGGCCAACCCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCCCCTCA 109695634
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3210 GGATTTTCTTCTGCCTTTGCCAGCAAGGCCAACCCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCCCCTCA 3269

109695635 ACTAAAGACGAGGAGGATGAGGACCTTTAGGGTGATCCACTTCCACTTAATGAATAGTAA 109695694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3270 ACTAAAGACGAGGAGGATGAGGACCTTTAGGGTGATCCACTTCCACTTAATGAATAGTAA 3329

109695695 ATACGGTTTCTCTTCCTTATGATTTTCTTAATATTTTCTTTTCCCTAACTTACTTTGTTG 109695754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3330 ATACGGTTTCTCTTCCTTATGATTTTCTTAATATTTTCTTTTCCCTAACTTACTTTGTTG 3389

109695755 TAAGAATGCAGTACTCAATACACGTAAGATACAAAATTTGTATGAATTGACTGTTTGTGT 109695814
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3390 TAAGAATGCAGTACACAATACACGTAAGATACAAAATTTGTATGAATTGACTGTTTGTGT 3449

109695815 TATCTGCAAGGCTTCCTGTCAACACTAGGGTATTAATAGTTAAGTTTTGGGGGAGTCAAA 109695874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3450 TATCTGCAAGGCTTCCTGTCAACACTAGGGTATTAATAGTTAAGTTTTGGGGGAGTCAAA 3509

109695875 AGTTATTTGTGGATTTTTTACTGTTCGGGGAGTTGGTGCCCCTAACCCCTTCGTTGTTAA 109695934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3510 AGTTATTTGTGGATTTTTTACTGTTCGGGGAGTTGGTGCCCCTAACCCCTTCGTTGTTAA 3569

109695935 AGAGTCAACTGTATATCAAAACATCGTGCTGTATACCTTAAATGTATATACTTTCAATTA 109695994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3570 AGAGTCAACTGTATATCAAAACATCGTGCTGTATACCTTAAATGTATATACTTTCAATTA 3629

109695995 AAATATTTTAAAAACAAACCAATAAAAAGGCACTGCTTCTGGCCCAGGGTGAGCCATCAG 109696054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3630 AAATATTTTAAAAACAAACCAATAAAAAGGCACTGCTTCTGGCCCAGGGTGAGCCATCAG 3689

109696055 ATGGCACAGCTGGCCCTGTCCGGTCCCAACCAGCAGAGGGGACTGTCAATTGAGAAGCTC 109696114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3690 ATGGCACAGCTGGCCCTGTCCGGTCCCAACCAGCAGAGGGGACTGTCAATTGAGAAGCTC 3749

109696115 CAGTGCTAAACGCTGGAATATGAAGATATGCATGGTGGGGAGACAGCACACACACACATA 109696174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3750 CAGTGCTAAACGCTGGAATATGAAGATATGCATGGTGGGGAGACAGCACACACACACATA 3809

109696175 ACACTCAAGGCCTGGTGGAGCCCACCCAGCTCAGCCTGGGTTGGGGAGGCTCCCTGGGAA 109696234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3810 ACACTCAAGGCCTGGTGGAGCCCACCCAGCTCAGCCTGGGTTGGGGAGGCTCCCTGGGAA 3869

109696235 GGGGATTCCTGATGTGAGCCTTCCAGGAGGGGTAGGAATTCTCTACACAGACAGGTGGGA 109696294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3870 GGGGATTCCTGATGTGAGCCTTCCAGGAGGGGTAGGAATTCTCTACACAGACAGGTGGGA 3929

109696295 ACTCCAGGCAGAGGGGAGGCCTGAAACACATCACAGGCCACCCTGTCCCTAGACTGCTGA 109696354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3930 ACTCCAGGCAGAGGGGAGGCCTGAAACACATCACAGGCCACCCTGTCCCTAGACTGCTGA 3989

109696355 GAGGCAGGACGGGGCTACACGGCCATGGGTGTGAGTCACCAAGGACCCTGTGCCTGCTGA 109696414
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     3990 GAGGCAGGACGGGGCTACACGGCCATGGGCGTGAGTCACCAAGGACCCTGTGCCTGCTGA 4049

109696415 GGCATGAGGACGCATTTCTGGGACGACAGAAAGACAGCAAAGGGCTTCAGACTATGGAAT 109696474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4050 GGCATGAGGACGCATTTCTGGGACGACAGAAAGACAGCAAAGGGCTTCAGACTATGGAAT 4109

109696475 ACCCGGAATAGGGCTCTAAGCATCTCCTCCGATGATTGTGGACTCAATGCAGGAAATGTG 109696534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4110 ACCCGGAATAGGGCTCTAAGCATCTCCTCCGATGATTGTGGACTCAATGCAGGAAATGTG 4169

109696535 GAGGCTTCGAGCTAGACCAGTGACAGAGGAG 109696565
          |||||||||||||||||||||||||||||||
     4170 GAGGCTTCGAGCTAGACCAGTGACAGAGGAG 4200

Alignment time is 3.73288 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [109679900,109705214] =>     25315 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [        1,     5436] =>      5436 nucs 'mol-32-2fc2-013511_5436'

Score:        5360
Aligned:      5437        nucs
Identic:      5430 (100%) nucs =>      1382 (100%)      4048 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [109688518,109689900] EXCISED REGION [109695215,109699268]
 second seq =>  [        1,     1383] EXCISED REGION [     1384,     5436]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      5314 nucs [109689901,109695214]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        28 nucs [109689901,109689928] to [109695215,109695242]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [109689900,109689900] to [109695215,109695215]
 second seq =>         1 nucs [1383,1383] to [1384,1384]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

109688518 TAGTGTGTGTGAAACCCTGGCCAAATATTTGTTGTGGGGCCCCTGTCTATATATGCAATG 109688577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TAGTGTGTGTGAAACCCTGGCCAAATATTTGTTGTGGGGCCCCTGTCTATATATGCAATG 60

109688578 TTATTTAAAAACATACTACATATTCTTGGGCTTATGTGGGATGTAGTGATTTATTGATGA 109688637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTATTTAAAAACATACTACATATTCTTGGGCTTATGTGGGATGTAGTGATTTATTGATGA 120

109688638 AGACTTAGAATACTGGGTAGGAAGAGATGCTTTTGGATTTGTTTATGAGCCAGTGAGTGT 109688697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGACTTAGAATACTGGGTAGGAAGAGATGCTTTTGGATTTGTTTATGAGCCAGTGAGTGT 180

109688698 ATCTGAGGATTCTTTATCCTGTGTCTAATGTGAGTGTGTTTTCCTGAATCAGTGCATCAG 109688757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATCTGAGGATTCTTTATCCTGTGTCTAATGTGAGTGTGTTTTCCTGAATCAGTGCATCAG 240

109688758 TGCTATTCTGGAGGCCCAAATCACACATGATTCCGTGAAAGAAACTCTGTGCTGGCCAGA 109688817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGCTATTCTGGAGGCCCAAATCACACATGATTCCGTGAAAGAAACTCTGTGCTGGCCAGA 300

109688818 GGATGCACTCACTCTCCAGGCTTTCCTGCATGGGCCCTCACCATGGAGTCCTGGATACTT 109688877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GGATGCACTCACTCTCCAGGCTTTCCTGCATGGGCCCTCACCATGGAGTCCTGGATACTT 360

109688878 AGGGCATCTGGTTGACCACATGCTTGGGAGAGCACCAAAGAAGGTCCTGGTTTTCAAGCC 109688937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGGGCATCTGGTTGACCACATGCTTGGGAGAGCACCAAAGAAGGTCCTGGTTTTCAAGCC 420

109688938 TCCAGCTTCTCCTTAGAAAGAGTTGACTACCTGTCTGGGCTCCAACTTTTCTGGCTGCTA 109688997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCCAGCTTCTCCTTAGAAAGAGTTGACTACCTGTCTGGGCTCCAACTTTTCTGGCTGCTA 480

109688998 CCAGAGGGTCTGGCCTCTAAACCATCTGTGTCAAAGAACTGACAGGGCCTGACATTCACT 109689057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCAGAGGGTCTGGCCTCTAAACCATCTGTGTCAAAGAACTGACAGGGCCTGACATTCACT 540

109689058 GGGACCCTAGGCTAGGGGTGACAGAGAGCAAAGCAAAAGTTTGAAAGAGTATGCAGTCTG 109689117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGGACCCTAGGCTAGGGGTGACAGAGAGCAAAGCAAAAGTTTGAAAGAGTATGCAGTCTG 600

109689118 AATGAGCATGCAGACCTTTGCCACAGCTCCCCTTCCCAGCTCAGTGCAGAGCAAGTAGGA 109689177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AATGAGCATGCAGACCTTTGCCACAGCTCCCCTTCCCAGCTCAGTGCAGAGCAAGTAGGA 660

109689178 GATAAACTTCTGCTCTTAGCTTCTCTGTGAGGAGAGATGAAATGGACCACACATCTAGCA 109689237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GATAAACTTCTGCTCTTAGCTTCTCTGTGAGGAGAGATGAAATGGACCACACATCTAGCA 720

109689238 CCCCAACTTTTCTGACAACTACTAGAAGGACTGACTCCTGACTCACCTGTCTCAGGGCAC 109689297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CCCCAACTTTTCTGACAACTACTAGAAGGACTGACTCCTGACTCACCTGTCTCAGGGCAC 780

109689298 TGATGGTACTTGGCACACTCTAGTCTCCTGGGGCCACCAAGAACAAGAACAGCATTTTGG 109689357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGATGGTACTTGGCACACTCTAGTCTCCTGGGGCCACCAAGAACAAGAACAGCATTTTGG 840

109689358 ACAAACACACTGGTTTGAGAGGCACCCAGACTCTCTGACTGGGCTGTGAGGAGGCTCATC 109689417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ACAAACACACTGGTTTGAGAGGCACCCAGACTCTCTGACTGGGCTGTGAGGAGGCTCATC 900

109689418 TGTGAAGACTGAGGGAGGTGGCTGTTTTATCAAATGTGCAGAAACCAACACAGAGAGTCA 109689477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGTGAAGACTGAGGGAGGTGGCTGTTTTATCAAATGTGCAGAAACCAACACAGAGAGTCA 960

109689478 AAGACAATGAACAAACAGGAAATATGCCATAAATAAAAGAACAAGATAAATCTTCAGAAA 109689537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
      961 AAGACAATGAACAAACAGGAAATATGCCATAAATAAAAGAACAAGATAAAACTTCAGAAA 1020

109689538 CTGACCCAAACAGAATGGAGATATGTGATTTACCAGACAAAAAATCAAAAGACCTGTCAC 109689597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTGACCCAAACAGAATGGAGATATGTGATTTACCAGACAAAAAATCAAAAGACCTGTCAC 1080

109689598 AAAGATGCTCAGTGAGGTCAGGAGAGCAATGCATGAATAAAGTGAGAATTTCAACCAAAA 109689657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAAGATGCTCAGTGAGGTCAGGAGAGCAATGCATGAATAAAGTGAGAATTTCAACCAAAA 1140

109689658 AGGTAGAAAATATTAAAAAGTGCCAAACAGAAATCACGGAGCTGAAGAATATAATAAAAG 109689717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGGTAGAAAATATTAAAAAGTGCCAAACAGAAATCACGGAGCTGAAGAATATAATAAAAG 1200

109689718 AACAGAAAAATTTAATAGAGGGGTTCAATAGCAGACTAGGTGAACTGAAAGAAAGGATTA 109689777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AACAGAAAAATTTAATAGAGGGGTTCAATAGCAGACTAGGTGAACTGAAAGAAAGGATTA 1260

109689778 GTGAACTCAAGGACTGGTCATTGGCAATCATTCAGTCACAGCATTAAAAAGAAAAAAGAA 109689837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GTGAACTCAAGGACTGGTCATTGGCAATCATTCAGTCACAGCATTAAAAAGAAAAAAGAA 1320

109689838 TGAAGGGCCAGGCACAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCTGAGGTGG 109689897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGAAGGGCCAGGCACAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCTGAGGTGG 1380

109689898 GTG 109689900
          |||
     1381 GTG 1383

EXCISED REGION

109695215 GATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATTCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATTTCAACT 109695274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1384 GATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATTCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATTTCAACT 1443

109695275 AAAAATACAAAAAAAAAAAAAAAATAGCCGGGTGTGGTGGCACACACCCGTAGTCCCAGC 109695334
          |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1444 AAAAATAC-AAAAAAAAAAAAAAATAGCCGGGTGTGGTGGCACACACCCGTAGTCCCAGC 1502

109695335 TACTTGGGAGGCTGGGGCAGGAGAATGGCATGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGC 109695394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1503 TACTTGGGAGGCTGGGGCAGGAGAATGGCATGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGC 1562

109695395 CGAGATCGCACAATTGCTTTCCAGCCTGGGCAACGGAGCGAGACTCTGTTTCAAAAAAAA 109695454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1563 CGAGATCGCACAATTGCTTTCCAGCCTGGGCAACGGAGCGAGACTCTGTTTCAAAAAAAA 1622

109695455 AGGTGACCATGTGAAGGGATGGATATGTTAAGTAGCTTGACTGGTAATCGGTTCACGATG 109695514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1623 AGGTGACCATGTGAAGGGATGGATATGTTAAGTAGCTTGACTGGTAATCGGTTCACGATG 1682

109695515 TATATGTACAGTTGACCCTTGAACAACATGCGTTTAAATTACAAGAGTCCACTTATATGG 109695574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1683 TATATGTACAGTTGACCCTTGAACAACATGCGTTTAAATTACAAGAGTCCACTTATATGG 1742

109695575 GGATTTTCTTCTGCCTCTGCCAGCAAGGCCAACCCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCCCCTCA 109695634
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1743 GGATTTTCTTCTGCCTTTGCCAGCAAGGCCAACCCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCCCCTCA 1802

109695635 ACTAAAGACGAGGAGGATGAGGACCTTTAGGGTGATCCACTTCCACTTAATGAATAGTAA 109695694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1803 ACTAAAGACGAGGAGGATGAGGACCTTTAGGGTGATCCACTTCCACTTAATGAATAGTAA 1862

109695695 ATACGGTTTCTCTTCCTTATGATTTTCTTAATATTTTCTTTTCCCTAACTTACTTTGTTG 109695754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1863 ATACGGTTTCTCTTCCTTATGATTTTCTTAATATTTTCTTTTCCCTAACTTACTTTGTTG 1922

109695755 TAAGAATGCAGTACTCAATACACGTAAGATACAAAATTTGTATGAATTGACTGTTTGTGT 109695814
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1923 TAAGAATGCAGTACACAATACACGTAAGATACAAAATTTGTATGAATTGACTGTTTGTGT 1982

109695815 TATCTGCAAGGCTTCCTGTCAACACTAGGGTATTAATAGTTAAGTTTTGGGGGAGTCAAA 109695874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1983 TATCTGCAAGGCTTCCTGTCAACACTAGGGTATTAATAGTTAAGTTTTGGGGGAGTCAAA 2042

109695875 AGTTATTTGTGGATTTTTTACTGTTCGGGGAGTTGGTGCCCCTAACCCCTTCGTTGTTAA 109695934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2043 AGTTATTTGTGGATTTTTTACTGTTCGGGGAGTTGGTGCCCCTAACCCCTTCGTTGTTAA 2102

109695935 AGAGTCAACTGTATATCAAAACATCGTGCTGTATACCTTAAATGTATATACTTTCAATTA 109695994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2103 AGAGTCAACTGTATATCAAAACATCGTGCTGTATACCTTAAATGTATATACTTTCAATTA 2162

109695995 AAATATTTTAAAAACAAACCAATAAAAAGGCACTGCTTCTGGCCCAGGGTGAGCCATCAG 109696054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2163 AAATATTTTAAAAACAAACCAATAAAAAGGCACTGCTTCTGGCCCAGGGTGAGCCATCAG 2222

109696055 ATGGCACAGCTGGCCCTGTCCGGTCCCAACCAGCAGAGGGGACTGTCAATTGAGAAGCTC 109696114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2223 ATGGCACAGCTGGCCCTGTCCGGTCCCAACCAGCAGAGGGGACTGTCAATTGAGAAGCTC 2282

109696115 CAGTGCTAAACGCTGGAATATGAAGATATGCATGGTGGGGAGACAGCACACACACACATA 109696174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2283 CAGTGCTAAACGCTGGAATATGAAGATATGCATGGTGGGGAGACAGCACACACACACATA 2342

109696175 ACACTCAAGGCCTGGTGGAGCCCACCCAGCTCAGCCTGGGTTGGGGAGGCTCCCTGGGAA 109696234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2343 ACACTCAAGGCCTGGTGGAGCCCACCCAGCTCAGCCTGGGTTGGGGAGGCTCCCTGGGAA 2402

109696235 GGGGATTCCTGATGTGAGCCTTCCAGGAGGGGTAGGAATTCTCTACACAGACAGGTGGGA 109696294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2403 GGGGATTCCTGATGTGAGCCTTCCAGGAGGGGTAGGAATTCTCTACACAGACAGGTGGGA 2462

109696295 ACTCCAGGCAGAGGGGAGGCCTGAAACACATCACAGGCCACCCTGTCCCTAGACTGCTGA 109696354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2463 ACTCCAGGCAGAGGGGAGGCCTGAAACACATCACAGGCCACCCTGTCCCTAGACTGCTGA 2522

109696355 GAGGCAGGACGGGGCTACACGGCCATGGGTGTGAGTCACCAAGGACCCTGTGCCTGCTGA 109696414
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     2523 GAGGCAGGACGGGGCTACACGGCCATGGGCGTGAGTCACCAAGGACCCTGTGCCTGCTGA 2582

109696415 GGCATGAGGACGCATTTCTGGGACGACAGAAAGACAGCAAAGGGCTTCAGACTATGGAAT 109696474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2583 GGCATGAGGACGCATTTCTGGGACGACAGAAAGACAGCAAAGGGCTTCAGACTATGGAAT 2642

109696475 ACCCGGAATAGGGCTCTAAGCATCTCCTCCGATGATTGTGGACTCAATGCAGGAAATGTG 109696534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2643 ACCCGGAATAGGGCTCTAAGCATCTCCTCCGATGATTGTGGACTCAATGCAGGAAATGTG 2702

109696535 GAGGCTTCGAGCTAGACCAGTGACAGAGGAGGGAAAAGGAGATGGGGCCCATCAATATTT 109696594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2703 GAGGCTTCGAGCTAGACCAGTGACAGAGGAGGGAAAAGGAGATGGGGCCCATCAATATTT 2762

109696595 GAAACTTGGCAAAACGCAGCAAGATTTTAATGGTTAATCAAAAATGGGAGGTGAATGGGA 109696654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2763 GAAACTTGGCAAAACGCAGCAAGATTTTAATGGTTAATCAAAAATGGGAGGTGAATGGGA 2822

109696655 GAAAGAGGAGCTGACAACCACTCCCACAATTCTGGTTTCCAGGGCGTGTTATAGCTGAGA 109696714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2823 GAAAGAGGAGCTGACAACCACTCCCACAATTCTGGTTTCCAGGGCGTGTTATAGCTGAGA 2882

109696715 GGGCAGCAGTTTGAGTGGCTGGGCAGCAGAGGCTGGGGTTGAGGCTGGGAAGTGGCGGCA 109696774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2883 GGGCAGCAGTTTGAGTGGCTGGGCAGCAGAGGCTGGGGTTGAGGCTGGGAAGTGGCGGCA 2942

109696775 GCAGGGGAGACTGCCCCATCAGGAGCCTGCCATAAGCGTGGGATGCAGAAGGACTGGAAG 109696834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2943 GCAGGGGAGACTGCCCCATCAGGAGCCTGCCATAAGCGTGGGATGCAGAAGGACTGGAAG 3002

109696835 GTGCTGGAGGTGATGTGGAGCTTTGGGAGAGTGTCGGAGGGATGGAATAAGTTGATGCCT 109696894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3003 GTGCTGGAGGTGATGTGGAGCTTTGGGAGAGTGTCGGAGGGATGGAATAAGTTGATGCCT 3062

109696895 GTTCCGAGACCAAGAAGTGGGGAGCAACTGAAGAAACTGGAGAGTGGGAACCAGGTTGCA 109696954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3063 GTTCCGAGACCAAGAAGTGGGGAGCAACTGAAGAAACTGGAGAGTGGGAACCAGGTTGCA 3122

109696955 GCTGGTCTCCAGATGCTGCACTCTCTGACAGCTCTCATCTATCTCACTGTCACCCAGGAT 109697014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3123 GCTGGTCTCCAGATGCTGCACTCTCTGACAGCTCTCATCTATCTCACTGTCACCCAGGAT 3182

109697015 TGGACAGGACATCTACAAATGTGCATGTGTATTTGCTATAAGGTGCATTCTTTTCCCCTG 109697074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3183 TGGACAGGACATCTACAAATGTGCATGTGTATTTGCTATAAGGTGCATTCTTTTCCCCTG 3242

109697075 GAGATAGTGACCAACCTTTCAAGAACTATTCTTGGGTATATTTTATCATTTCTTTATTTT 109697134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3243 GAGATAGTGACCAACCTTTCAAGAACTATTCTTGGGTATATTTTATCATTTCTTTATTTT 3302

109697135 AGTATCTATGAAGGGAACATTATAGAAGCCATGTTAACACTGGAGAAATGTCTAATATTA 109697194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3303 AGTATCTATGAAGGGAACATTATAGAAGCCATGTTAACACTGGAGAAATGTCTAATATTA 3362

109697195 AAAAACCAGTACTCTAGCAAGTAAAATTATGTATGTGTGTAACCTCGTTCCTACATCCAG 109697254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3363 AAAAACCAGTACTCTAGCAAGTAAAATTATGTATGTGTGTAACCTCGTTCCTACATCCAG 3422

109697255 GAAATCATTAAACTAGTAGGGGGTTGTATTAATTAGAACTCTCTGTTGCAAACAACAGAC 109697314
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     3423 GAAATCATTAAACTAGTAGGGGGTTGTATTAATCAGAACTCTCTGTTGCAAACAACAGAC 3482

109697315 AGTCTGGATGATTTAAAAGGAACAGAAATGTATTAAGAGGATATTGGATAGTTCACAAAA 109697374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3483 AGTCTGGATGATTTAAAAGGAACAGAAATGTATTAAGAGGATATTGGATAGTTCACAAAA 3542

109697375 CCTCCAGGAGGGCTGGAGAGCCAGGCTGGATGCTGTGCCACTGACACAACATTCAAAACT 109697434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3543 CCTCCAGGAGGGCTGGAGAGCCAGGCTGGATGCTGTGCCACTGACACAACATTCAAAACT 3602

109697435 CACAGATTCTTCTGCTGCCATCCACTATGCTAGCTACCAGCCATGCATGGCCATGCAGCA 109697494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3603 CACAGATTCTTCTGCTGCCATCCACTATGCTAGCTACCAGCCATGCATGGCCATGCAGCA 3662

109697495 CTTGATGTGTGCCTGCCCAACTGAGATGTGCTGCAGGTGCACAATACTCACTGGACTTCG 109697554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3663 CTTGATGTGTGCCTGCCCAACTGAGATGTGCTGCAGGTGCACAATACTCACTGGACTTCG 3722

109697555 AAGACTAAACGTGAAGAAAGGACATAAAATCTCACTCAGGTTAAAATGATATCTGCACAC 109697614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3723 AAGACTAAACGTGAAGAAAGGACATAAAATCTCACTCAGGTTAAAATGATATCTGCACAC 3782

109697615 ACTGGGTATTAAGTAAAATACATTGAAATTAATTTCACTTGTTTCTTTTTGCTTTTTAAA 109697674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3783 ACTGGGTATTAAGTAAAATACATTGAAATTAATTTCACTTGTTTCTTTTTGCTTTTTAAA 3842

109697675 TGCAGTTACTAGAAAATTTTACATTACCTGTGGGAAATTGGCTCCACATCATTTCCTCTG 109697734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3843 TGCAGTTACTAGAAAATTTTACATTACCTGTGGGAAATTGGCTCCACATCATTTCCTCTG 3902

109697735 TTTTCTATTGATCGAATTGAGTCCTAAGGCCACATCTGATATTTGGGGGAAAGGAAATAT 109697794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3903 TTTTCTATTGATCGAATTGAGTCCTAAGGCCACATCTGATATTTGGGGGAAAGGAAATAT 3962

109697795 ACATCACCTCCAGATGGGGGCAGCCCCCCATGCAGGGATGGGGAGCTGCCCGAGGCTGTT 109697854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3963 ACATCACCTCCAGATGGGGGCAGCCCCCCATGCAGGGATGGGGAGCTGCCCGAGGCTGTT 4022

109697855 TTTGGAAACATCTGTGGTCCCCAACAACAGTGCTTCTGGCCTGTTTTTTCACATGGGGCT 109697914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4023 TTTGGAAACATCTGTGGTCCCCAACAACAGTGCTTCTGGCCTGTTTTTTCACATGGGGCT 4082

109697915 CCGCGTCTGTGGCTGACTCAATGCTGGGCTTGAGGTGGGGGTGACTGTCACATGACAGAT 109697974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4083 CCGCGTCTGTGGCTGACTCAATGCTGGGCTTGAGGTGGGGGTGACTGTCACATGACAGAT 4142

109697975 TAGGTCAAGCCTCCATCGTGCTCAGGGTTTATGAGACAGATCACAAGGGCCTCTGGGGAC 109698034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4143 TAGGTCAAGCCTCCATCGTGCTCAGGGTTTATGAGACAGATCACAAGGGCCTCTGGGGAC 4202

109698035 TGCCTGTCGCTTGTGGTCCTGGGGAACCAACCCCATGGTCAACTCCACCTCTGAACCTCT 109698094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4203 TGCCTGTCGCTTGTGGTCCTGGGGAACCAACCCCATGGTCAACTCCACCTCTGAACCTCT 4262

109698095 CCTGCAAGGGGCAAGAGCATCCTGGTAACCTTGCCCATCCTGACACCTGCTGTGGTAACT 109698154
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4263 CCTGCAAGGGGCCAGAGCATCCTGGTAACCTTGCCCATCCTGACACCTGCTGTGGTAACT 4322

109698155 CATTCCCTGCTCTGGCACTTGAGCAACCCCTCGGCCCCACCATCCCAGGACTTCACAACC 109698214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4323 CATTCCCTGCTCTGGCACTTGAGCAACCCCTCGGCCCCACCATCCCAGGACTTCACAACC 4382

109698215 TGCCGCCGCCAGGGAGCCCTTTTTGCAACCACAGTGCCTGGCAGCAGTGACATGGCTTGC 109698274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4383 TGCCGCCGCCAGGGAGCCCTTTTTGCAACCACAGTGCCTGGCAGCAGTGACATGGCTTGC 4442

109698275 AGAAACACATCCTTGCTATTCAGTTGCACTTGCCAACGAGGCATCTTCTGGGGTCTTGTC 109698334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4443 AGAAACACATCCTTGCTATTCAGTTGCACTTGCCAACGAGGCATCTTCTGGGGTCTTGTC 4502

109698335 GGGGAGATCACTGGGGGATGGCCAGCTGTTTTCATAGGAAAAGTCTGTCTGGTTCTTCAT 109698394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4503 GGGGAGATCACTGGGGGATGGCCAGCTGTTTTCATAGGAAAAGTCTGTCTGGTTCTTCAT 4562

109698395 CTCCGTATTTGTCCTCCACACTGCTCACTGCATTTCTGCATCCTGGCTTTGTGTGGGGCA 109698454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4563 CTCCGTATTTGTCCTCCACACTGCTCACTGCATTTCTGCATCCTGGCTTTGTGTGGGGCA 4622

109698455 TGCTGCTGTGGACTCCAGCATCTGTCAACCCAAATGCAAAGGCGGAGCCCACCTCGGCTG 109698514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4623 TGCTGCTGTGGACTCCAGCATCTGTCAACCCAAATGCAAAGGCGGAGCCCACCTCGGCTG 4682

109698515 CAGGAACTGCCACACTGAAGTGCTCTACCCATGCTTCAGCTGCCTCCAGAATCCATTCCC 109698574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4683 CAGGAACTGCCACACTGAAGTGCTCTACCCATGCTTCAGCTGCCTCCAGAATCCATTCCC 4742

109698575 ATATGGGCTAACCAGATGTGTGCAGCTAATCAACAGTTAGCATTTCTGTCTTTGGATAGT 109698634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4743 ATATGGGCTAACCAGATGTGTGCAGCTAATCAACAGTTAGCATTTCTGTCTTTGGATAGT 4802

109698635 AAGGACTTCTGCTTCCAGACTTCAGATCTCTCCTTAGGTAGCAGCTCTGACCCAAGGTTA 109698694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4803 AAGGACTTCTGCTTCCAGACTTCAGATCTCTCCTTAGGTAGCAGCTCTGACCCAAGGTTA 4862

109698695 GGATTCCAGGACTCAGTCAGCTCCTGGTATTCCTTAGCACCCCTTTTTTATTTTATTTTA 109698754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4863 GGATTCCAGGACTCAGTCAGCTCCTGGTATTCCTTAGCACCCCTTTTTTATTTTATTTTA 4922

109698755 TTTTATTTATTTATTTTTTTGAGACAGAGTCTCTCTCTGTGGCCCAGGCTAGAGTGCAGT 109698814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4923 TTTTATTTATTTATTTTTTTGAGACAGAGTCTCTCTCTGTGGCCCAGGCTAGAGTGCAGT 4982

109698815 GGTGCTATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCTTCCCGGGTTCACACCATTCTCCTGCCTCA 109698874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4983 GGTGCTATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCTTCCCGGGTTCACACCATTCTCCTGCCTCA 5042

109698875 GCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCATGCCACCACATCTGGCCAATTTTTGTATTT 109698934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5043 GCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCATGCCACCACATCTGGCCAATTTTTGTATTT 5102

109698935 TTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGCTGGACAGGCTAGTGTCGATCTCCTGACCTCGTGA 109698994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5103 TTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGCTGGACAGGCTAGTGTCGATCTCCTGACCTCGTGA 5162

109698995 TCCACCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACACCCGGCC 109699054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5163 TCCACCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACACCCGGCC 5222

109699055 TAGCACCCCTTTTTAAAACAAAAAGTTTTTATCATGGTAATATATACAAAACATAAAATT 109699114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5223 TAGCACCCCTTTTTAAAACAAAAAGTTTTTATCATGGTAATATATACAAAACATAAAATT 5282

109699115 TACCATTTTGAGCGGGCACAGTGGCCTATGCCTATGGTCCCAGGTACTTCAGAGGCTGAG 109699174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5283 TACCATTTTGAGCGGGCACAGTGGCCTATGCCTATGGTCCCAGGTACTTCAGAGGCTGAG 5342

109699175 GCAGGAAAACTCTGTGAGGTTGGGAGTTGGAGGCTGCAGTGCACTATGATGGCACCTGTA 109699234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5343 GCAGGAAAACTCTGTGAGGTTGGGAGTTGGAGGCTGCAGTGCACTATGATGGCACCTGTA 5402

109699235 AATAATGACTGCACTCCAGCCTGGACGACATATC 109699268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5403 AATAATGACTGCACTCCAGCCTGGACGACATATC 5436

Alignment time is 4.81356 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [109679900,109705214] =>     25315 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [        1,     6932] =>      6932 nucs 'mol-32-2fd8-107406_6932'

Score:        6867
Aligned:      6935        nucs
Identic:      6928 (100%) nucs =>      6764 (100%)       164 ( 99%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [109683131,109689900] EXCISED REGION [109695215,109695379]
 second seq =>  [        1,     6768] EXCISED REGION [     6769,     6932]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      5314 nucs [109689901,109695214]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        28 nucs [109689901,109689928] to [109695215,109695242]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [109689900,109689900] to [109695215,109695215]
 second seq =>         1 nucs [6768,6768] to [6769,6769]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

109683131 CACTCAGTCCCCTGGGGAAGTAATCATGTTGCATGTAGCAGATGGCTTCACTGGGGGATG 109683190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CACTCAGTCCCCTGGGGAAGTAATCATGTTGCATGTAGCAGATGGCTTCACTGGGGGATG 60

109683191 GCGGGGCAGGGGCGATGGGAGGCTGTGCCCAGGACTGCCTGAGTTACAGGAGGAGATTAT 109683250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCGGGGCAGGGGCGATGGGAGGCTGTGCCCAGGACTGCCTGAGTTACAGGAGGAGATTAT 120

109683251 GACAGAGCCGAGCGGTAAAGGAAGGAGGGGCCCCAGGGACAAAGGGAGAAGAGCAGCCCC 109683310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GACAGAGCCGAGCGGTAAAGGAAGGAGGGGCCCCAGGGACAAAGGGAGAAGAGCAGCCCC 180

109683311 AAAGGTTCCAAGAACCCCCCAGGAATAAGACTTCTCTGAGGCTGAGAGATGTCCAGGGTG 109683370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAAGGTTCCAAGAACCCCCCAGGAATAAGACTTCTCTGAGGCTGAGAGATGTCCAGGGTG 240

109683371 CTCTGACAACAATATTATTTCCTTTCAACACGTTGATACTCCATTTTTTGTAAAGCGCAC 109683430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTCTGACAACAATATTATTTCCTTTCAACACGTTGATACTCCATTTTTTGTAAAGCGCAC 300

109683431 AAGACGCAGACAGAAAACCTAATGTTTTATCCCAGGGCATAGGCTTGGAATTTCTCGGCA 109683490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAGACGCAGACAGAAAACCTAATGTTTTATCCCAGGGCATAGGCTTGGAATTTCTCGGCA 360

109683491 GAACACAACATATAGCAGAGAGGCAAAATAAAAAGGAATACAGAAAGAAAGAAAAAAAAA 109683550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GAACACAACATATAGCAGAGAGGCAAAATAAAAAGGAATACAGAAAGAAAGAAAAAAAAA 420

109683551 AACAACCTGATGTTGCAAAGAAAGAACACAAAAGTCGAGGGTGAGGCCAGCCTGGGTCGG 109683610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AACAACCTGATGTTGCAAAGAAAGAACACAAAAGTCGAGGGTGAGGCCAGCCTGGGTCGG 480

109683611 CTTGTTCAGCGAAGGACGCACAGTGAGGACGCAGGCCTAGTGAGGCCTGGTGACTTGAGG 109683670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTTGTTCAGCGAAGGACGCACAGTGAGGACGCAGGCCTAGTGAGGCCTGGTGACTTGAGG 540

109683671 GCCCTGTTGTGCTTTCCTAGGGGAAGGCCACTGCAATAAGGATTAGAAAAAGTCAGCCAA 109683730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GCCCTGTTGTGCTTTCCTAGGGGAAGGCCACTGCAATAAGGATTAGAAAAAGTCAGCCAA 600

109683731 TTTTGTCCTGCTGTGTATAATTACCTCTCCATCTATTTATAAAGCCTTGAGGAATTCAAG 109683790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTTTGTCCTGCTGTGTATAATTACCTCTCCATCTATTTATAAAGCCTTGAGGAATTCAAG 660

109683791 CAATTATTCATCCTAAAAACACCGTGGGCAGTGACGCCTCCAAAGATAGCTACTGCATAA 109683850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CAATTATTCATCCTAAAAACACCGTGGGCAGTGACGCCTCCAAAGATAGCTACTGCATAA 720

109683851 TCTCTCCGCTGCTCTCTCGCAGCCCCGCCTGTGCTGTACTTTCACCATGGGGGAGGCAGC 109683910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCTCTCCGCTGCTCTCTCGCAGCCCCGCCTGTGCTGTACTTTCACCATGGGGGAGGCAGC 780

109683911 GGAGGTGCAGGGGCCATGCCACCATCCCAGGGTCTCGGGAGTTCTCCCAGCTCCAGGACT 109683970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GGAGGTGCAGGGGCCATGCCACCATCCCAGGGTCTCGGGAGTTCTCCCAGCTCCAGGACT 840

109683971 CGGGCAAGTCCCTCCACCGCTCTGCGTCTTGAAGTCTTCATCTGTAAGTGGGGATGTGAC 109684030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CGGGCAAGTCCCTCCACCGCTCTGCGTCTTGAAGTCTTCATCTGTAAGTGGGGATGTGAC 900

109684031 TGTGTCTGTCTCTCCTGGGTGTTGGGAAGGTCACACAGGTCTAGATCTATATGTAGTCAC 109684090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGTGTCTGTCTCTCCTGGGTGTTGGGAAGGTCACACAGGTCTAGATCTATATGTAGTCAC 960

109684091 TAAGAAGAATATTTAGTAGATGTTGCCAGCTGACTGGAATCAACCCGGACTCTGCCCCTG 109684150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TAAGAAGAATATTTAGTAGATGTTGCCAGCTGACTGGAATCAACCCGGACTCTGCCCCTG 1020

109684151 CTCCCCAAACCACCCTCTCCTGGCCGCGCAATCCTTCAGGTGCTCAGGCTGATTCCTGGA 109684210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTCCCCAAACCACCCTCTCCTGGCCGCGCAATCCTTCAGGTGCTCAGGCTGATTCCTGGA 1080

109684211 GTCATCTTGGATTCATTTCTCCCTCTCACACCTCACATTTAGTCCACTAGCTAATGCTGT 109684270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GTCATCTTGGATTCATTTCTCCCTCTCACACCTCACATTTAGTCCACTAGCTAATGCTGT 1140

109684271 GGGCTCCAGCTTCAAAATGCACCTGCAAGCCACCCTGCCCCCTCCTCCATCACGACCACC 109684330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GGGCTCCAGCTTCAAAATGCACCTGCAAGCCACCCTGCCCCCTCCTCCATCACGACCACC 1200

109684331 CTGTTCTGACCCTGGCAATCCCAGCCCCTTCCTCCCTCAGCCACAGGGCTCCAGCTCCAG 109684390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CTGTTCTGACCCTGGCAATCCCAGCCCCTTCCTCCCTCAGCCACAGGGCTCCAGCTCCAG 1260

109684391 CTGCTGGGTGGAGGCTGGGCTTGCTGCTGCTCTGGGGACTTTGCTCTTTGCTGTTCCTTC 109684450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTGCTGGGTGGAGGCTGGGCTTGCTGCTGCTCTGGGGACTTTGCTCTTTGCTGTTCCTTC 1320

109684451 TCCTGGAATGCACATCCCCACACACCTGCCTGCTCACATGCTCCCCTGTAAGGCTTGCTC 109684510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TCCTGGAATGCACATCCCCACACACCTGCCTGCTCACATGCTCCCCTGTAAGGCTTGCTC 1380

109684511 CAAGGTCACCTCCTCAGTGAAGCTGCCCTGACTGCTGCCACCCACACCACCCCCTCACGG 109684570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CAAGGTCACCTCCTCAGTGAAGCTGCCCTGACTGCTGCCACCCACACCACCCCCTCACGG 1440

109684571 GGCTACCCCACTTCCCTGGATCATTTTTATCCATAGTGTGTATTCCCCTCTGACACACCA 109684630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GGCTACCCCACTTCCCTGGATCATTTTTATCCATAGTGTGTATTCCCCTCTGACACACCA 1500

109684631 TGTCGTTTACTTTTTCATCTTTTCGCGGAACTGTTCTTCCCTCTAGAATGGCGGTTCTCA 109684690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TGTCGTTTACTTTTTCATCTTTTCGCGGAACTGTTCTTCCCTCTAGAATGGCGGTTCTCA 1560

109684691 ACCATGGGCCATCTGTCAGTGTCTACAGACATTTGGAGTGATCCTAACTGGGGGTGGGGT 109684750
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     1561 ACCATGGGCCATCTGTCAGTGTCTACAGACATTTGGAGTGATCATAACTGGGGGTGGGGT 1620

109684751 GTTCTAGGCACCCAGTGGGCACAGGCAGGAGTGCACAGGATTAAGAACACCCACCCGAAG 109684810
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GTTCTAGGCACCCAGTGGGCACAGACAGGAGTGCACAGGATTAAGAACACCCACCCGAAG 1680

109684811 AACCCCCACCCCAGATGGCAACAGAGAAGAGGTTGAGAAACCCGCATCCAGACTGTAAGC 109684870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AACCCCCACCCCAGATGGCAACAGAGAAGAGGTTGAGAAACCCGCATCCAGACTGTAAGC 1740

109684871 CGTCTGAGGGCAAGGGCCCTGTCCCCTGTTTTGATCACTGCAACATCTCCAGCACCCAGA 109684930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CGTCTGAGGGCAAGGGCCCTGTCCCCTGTTTTGATCACTGCAACATCTCCAGCACCCAGA 1800

109684931 ACAGGGCTTGACATCACGGATGCCCAGTAAGTGGGGAACGAACAGAGACTGGCACATACA 109684990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ACAGGGCTTGACATCACGGATGCCCAGTAAGTGGGGAACGAACAGAGACTGGCACATACA 1860

109684991 CAGCACTGGGGAAATGTTGGTCATTATTATCATTATTTCTCATGGGTTTGTATTGTTTCT 109685050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CAGCACTGGGGAAATGTTGGTCATTATTATCATTATTTCTCATGGGTTTGTATTGTTTCT 1920

109685051 GTGCCTCAGGTTTTCAGGAAAGTCTCTGCTTTTCCCCTGGGCAGTGCAACAGAGGGGAAG 109685110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GTGCCTCAGGTTTTCAGGAAAGTCTCTGCTTTTCCCCTGGGCAGTGCAACAGAGGGGAAG 1980

109685111 AGTGTTGGACTTGGAGTCAGAGACCCATGTCTGAGCCCCAGGTTGGCCATTATGAGCTGT 109685170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AGTGTTGGACTTGGAGTCAGAGACCCATGTCTGAGCCCCAGGTTGGCCATTATGAGCTGT 2040

109685171 GTAGCTCTGGGAAACTCACTTAACCTCTCTGAGGTTTTGTTTCCTCATTCGTTGAGTTGG 109685230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GTAGCTCTGGGAAACTCACTTAACCTCTCTGAGGTTTTGTTTCCTCATTCGTTGAGTTGG 2100

109685231 AATACCATTTGTTTTCCTCCTCATCTGGCAAGCTGGTGAGATAAGCAAATATGATGATAT 109685290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AATACCATTTGTTTTCCTCCTCATCTGGCAAGCTGGTGAGATAAGCAAATATGATGATAT 2160

109685291 GTCAAAATGCTTGTAAGTACTAAATACCTTCCAGCTATTGTCATTATGTGGTCCCTCCTG 109685350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GTCAAAATGCTTGTAAGTACTAAATACCTTCCAGCTATTGTCATTATGTGGTCCCTCCTG 2220

109685351 CAAAATGGAAAAACCAATTGATTTTACCATGGCTGACAATCTTATATCGGTTGTGAGGAG 109685410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CAAAATGGAAAAACCAATTGATTTTACCATGGCTGACAATCTTATATCGGTTGTGAGGAG 2280

109685411 CTTATTATTCATAATTTCAGTGTGTTTCCATTTCTGCCCATATGGCACTCCTCCCTTAGA 109685470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CTTATTATTCATAATTTCAGTGTGTTTCCATTTCTGCCCATATGGCACTCCTCCCTTAGA 2340

109685471 CAGGTATCTTGAGACAAGAAAAGGAGCAGGTGGCCTTTAAAATACATTGCACATAACACA 109685530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CAGGTATCTTGAGACAAGAAAAGGAGCAGGTGGCCTTTAAAATACATTGCACATAACACA 2400

109685531 TGCGTTTCACTGAACAGCTTTTTGCATTTAAAATGCAGACAATATGCTCAAAATAGTACT 109685590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TGCGTTTCACTGAACAGCTTTTTGCATTTAAAATGCAGACAATATGCTCAAAATAGTACT 2460

109685591 AATAAATTTTCTATCTTGAGTAATGTATCTCAGACATATACCAAGGGAAAATAATTAAAG 109685650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AATAAATTTTCTATCTTGAGTAATGTATCTCAGACATATACCAAGGGAAAATAATTAAAG 2520

109685651 AAAAACCCAATAAAATAGAGATCATAAAAAGGGGGGCTTATAAATCAAGAGAGTAGACTT 109685710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 AAAAACCCAATAAAATAGAGATCATAAAAAGGGGGGCTTATAAATCAAGAGAGTAGACTT 2580

109685711 CTAGCCATTCTCAATACAGCCTTTGAGTGCAAGGATCCCAGATGTTTGATTTGGACACAT 109685770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CTAGCCATTCTCAATACAGCCTTTGAGTGCAAGGATCCCAGATGTTTGATTTGGACACAT 2640

109685771 GGAATTTTGCAATAGGATAGTGTACTTCTTATGAATGAAACATCAAAAGGCATATGGTAG 109685830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GGAATTTTGCAATAGGATAGTGTACTTCTTATGAATGAAACATCAAAAGGCATATGGTAG 2700

109685831 TAGATGCAATCATGTTGGCAGACGTGTGTCTTGGAGAGCAGAAATGGCCAACTGAATGCT 109685890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TAGATGCAATCATGTTGGCAGACGTGTGTCTTGGAGAGCAGAAATGGCCAACTGAATGCT 2760

109685891 TCCTTCCTCACTCGTGAAGCCATCAGGAGCAAAGCTCCAGGGAGTGCCTTCCGCCCTGCT 109685950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TCCTTCCTCACTCGTGAAGCCATCAGGAGCAAAGCTCCAGGGAGTGCCTTCCGCCCTGCT 2820

109685951 GGCAATGAATGGCCTCTCCTGACAGATAGCCTAAGAGCCTTTGGCTAAAGATTTGCAACA 109686010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GGCAATGAATGGCCTCTCCTGACAGATAGCCTAAGAGCCTTTGGCTAAAGATTTGCAACA 2880

109686011 TCAAAGAGTGAGTGGCATGGCCTGGCCAGCCACCTGAGACAACGTACTTTGTTCCAGAAC 109686070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TCAAAGAGTGAGTGGCATGGCCTGGCCAGCCACCTGAGACAACGTACTTTGTTCCAGAAC 2940

109686071 GTGGTTCAGAGTTTCACCTTGCTGGCTCAGTGGGGATTAAGGCTGAAAGAGGCTTTGAAA 109686130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 GTGGTTCAGAGTTTCACCTTGCTGGCTCAGTGGGGATTAAGGCTGAAAGAGGCTTTGAAA 3000

109686131 ATGTTGATAACAGATGAATGTAAATATTATTTACCTAGCAACATAACACTTTTTTTCTTC 109686190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 ATGTTGATAACAGATGAATGTAAATATTATTTACCTAGCAACATAACACTTTTTTTCTTC 3060

109686191 TTTTTTGGCTCTTTCATGGAGTCATTACTCTTTCCCTTGAGTTGTCAGTTCCTTCATTTA 109686250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TTTTTTGGCTCTTTCATGGAGTCATTACTCTTTCCCTTGAGTTGTCAGTTCCTTCATTTA 3120

109686251 GTCTATTCCTTCAACAATTATTGATCAAATCATTATTTGTGCTGGGCAGTGTTCTATGTC 109686310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 GTCTATTCCTTCAACAATTATTGATCAAATCATTATTTGTGCTGGGCAGTGTTCTATGTC 3180

109686311 CCAGGAATTTTGTACTGTAAACCAGTACTCTGTCCTCATAACGCCTATAATCTAGAGACA 109686370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 CCAGGAATTTTGTACTGTAAACCAGTACTCTGTCCTCATAACGCCTATAATCTAGAGACA 3240

109686371 TTGAACTGTGAGCACAGGAATAAGCAGTGTACTTTCAGAATGTAATCAGTGTTCTCAAGG 109686430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TTGAACTGTGAGCACAGGAATAAGCAGTGTACTTTCAGAATGTAATCAGTGTTCTCAAGG 3300

109686431 GAGGAGATTATGATGTAACAGAGCTTCTTTTCATCTCAAAGGAAGGCCATTAAGAAGGGC 109686490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 GAGGAGATTATGATGTAACAGAGCTTCTTTTCATCTCAAAGGAAGGCCATTAAGAAGGGC 3360

109686491 CAGTCAGGACAGGTGATGCTGGCAGGAAGGGAGCCAGCCTGCGACGTGCTGGGAAGACAG 109686550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 CAGTCAGGACAGGTGATGCTGGCAGGAAGGGAGCCAGCCTGCGACGTGCTGGGAAGACAG 3420

109686551 GCAGAGAGACTATACGTTCAAAGGGTGTGAGGCAGGCATGAGTTTGCAGAAAGTGTGCTA 109686610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 GCAGAGAGACTATACGTTCAAAGGGTGTGAGGCAGGCATGAGTTTGCAGAAAGTGTGCTA 3480

109686611 AGGGCCTGGAGCAGAGTGAGTGAGGGGGAACAAAGACAGGGAGGTGTTAAAGGGCCAGGA 109686670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 AGGGCCTGGAGCAGAGTGAGTGAGGGGGAACAAAGACAGGGAGGTGTTAAAGGGCCAGGA 3540

109686671 GGGGCTGGACCCTCTGGAGCATTGATGACTATGCTGTGGAATGAATTTGGATGTTGTTTA 109686730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 GGGGCTGGACCCTCTGGAGCATTGATGACTATGCTGTGGAATGAATTTGGATGTTGTTTA 3600

109686731 AGGGGAATGGGAAGTCATTGAAATATTTTAAGTAGAGAAATGGGATGCACTGATTTACCT 109686790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 AGGGGAATGGGAAGTCATTGAAATATTTTAAGTAGAGAAATGGGATGCACTGATTTACCT 3660

109686791 TATGAAAAGAGTTCTCTAGCTGCTTTGAGAGAATGGATTATAGTGGGGTGATATAGTTTG 109686850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 TATGAAAAGAGTTCTCTAGCTGCTTTGAGAGAATGGATTATAGTGGGGTGATATAGTTTG 3720

109686851 GACGTTTGTCCTCTCCAAATCTCGTGTTGAAATGTGATGCTCAGTGTTGGAGGTGGGGTC 109686910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 GACGTTTGTCCTCTCCAAATCTCGTGTTGAAATGTGATGCTCAGTGTTGGAGGTGGGGTC 3780

109686911 TGGTGGGAGGTGATTGGGTCGTGGAGCAGATCCTTCATGAATGGCTGCTGACATCATCTT 109686970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 TGGTGGGAGGTGATTGGGTCGTGGAGCAGATCCTTCATGAATGGCTGCTGACATCATCTT 3840

109686971 GGTGGTGAGTGAGTTCTCAGTCTGGTAGTTCACATGAGATCTGCCTGTTTTAAAGAGTAT 109687030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 GGTGGTGAGTGAGTTCTCAGTCTGGTAGTTCACATGAGATCTGCCTGTTTTAAAGAGTAT 3900

109687031 GGTGGCCAAGTGCCGTGGCTCACGCCTGTGATCCCAGCACTTTGGGAGGTAAAGGCAGGA 109687090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 GGTGGCCAAGTGCCGTGGCTCACGCCTGTGATCCCAGCACTTTGGGAGGTAAAGGCAGGA 3960

109687091 GGATCACTTGAGCTCAGGAGTTCGACACTAGCCTGGGAAACAGGGTGAAACCCATCTCTA 109687150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 GGATCACTTGAGCTCAGGAGTTCGACACTAGCCTGGGAAACAGGGTGAAACCCATCTCTA 4020

109687151 CTAAAAATAGAAATATTAGGCGGGTGTGATGGTGCGCTGCCTATAGTCCCAGCTACCGGG 109687210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 CTAAAAATAGAAATATTAGGCGGGTGTGATGGTGCGCTGCCTATAGTCCCAGCTACCGGG 4080

109687211 GAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATT 109687270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 GAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATT 4140

109687271 GTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAGCCAGACCCTATCTAAAAAAAAAAAAAAAA 109687330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 GTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAGCCAGACCCTATCTAAAAAAAAAAAAAAAA 4200

109687331 AATAGAGTGCGGCACCCCTCCCTTCCCACTGTTGCTCCCTCTCTCGCCATGTGGGGCACG 109687390
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     4201 --TAGAGTGCGGCACCCCTCCCTTCCCACTGTTGCTCCCTCTCTCGCCATGTGGGGCATG 4258

109687391 GGCTGCTCCTTCATCTTCCACCATTATTGTGAGCTTCCTGAGGCCTCACCAGGAGCAGAT 109687450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4259 GGCTGCTCCTTCATCTTCCACCATTATTGTGAGCTTCCTGAGGCCTCACCAGGAGCAGAT 4318

109687451 GTGAGCAAATTAAACCTCTTTTCTTTATAAATTACCCATATTTAGGTATTTATTTATAGC 109687510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4319 GTGAGCAAATTAAACCTCTTTTCTTTATAAATTACCCATATTTAGGTATTTATTTATAGC 4378

109687511 TACTACAAGGGGGAAAGGGAGAGCAGGGAGATCAGTGGTGCTTTCACACTAGTACAGCAA 109687570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4379 TACTACAAGGGGGAAAGGGAGAGCAGGGAGATCAGTGGTGCTTTCACACTAGTACAGCAA 4438

109687571 TAGAGCAGCATCTTGGACCAGGGTGGTGGCTGAGGAGACAGGATCATGGCTTTGAGATAC 109687630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4439 TAGAGCAGCATCTTGGACCAGGGTGGTGGCTGAGGAGACAGGATCATGGCTTTGAGATAC 4498

109687631 ATTCTGAAGAAGAAAAGTAGGCCTTGCTGATAGAATAGTCACAAACTGTAATGGAAAAGG 109687690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4499 ATTCTGAAGAAGAAAAGTAGGCCTTGCTGATAGAATAGTCACAAACTGTAATGGAAAAGG 4558

109687691 TAAATTCAAGGATGTCTCCTGGGTTTTTGGCTTAAGCATCTGGATACAGAGATATGGAAG 109687750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4559 TAAATTCAAGGATGTCTCCTGGGTTTTTGGCTTAAGCATCTGGATACAGAGATATGGAAG 4618

109687751 ACTGGGAGGGAAATGGGTTTGGAGTATACATGCATGCAATCAACAATTCTGTCTTGCATG 109687810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4619 ACTGGGAGGGAAATGGGTTTGGAGTATACATGCATGCAATCAACAATTCTGTCTTGCATG 4678

109687811 TGTGAAATTTAGATACCCATTAGACATCTGCATAGAGGGCCAGGCACAGTGGCTCACGGC 109687870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4679 TGTGAAATTTAGATACCCATTAGACATCTGCATAGAGGGCCAGGCACAGTGGCTCACGGC 4738

109687871 AGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCGGATCACTTGAGGTTAGGAGTTCAAG 109687930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4739 AGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCGGATCACTTGAGGTTAGGAGTTCAAG 4798

109687931 ACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACTCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTATCTGGGT 109687990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4799 ACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACTCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTATCTGGGT 4858

109687991 GTGGTGGTGTGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCATGAGAATCACTTGA 109688050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4859 GTGGTGGTGTGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCATGAGAATCACTTGA 4918

109688051 ACCTGGGAGGTAGAGGTTGCAGCGAGCCAAGATCACACCACTGCACTCTAGCAAGGGTGA 109688110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4919 ACCTGGGAGGTAGAGGTTGCAGCGAGCCAAGATCACACCACTGCACTCTAGCAAGGGTGA 4978

109688111 CAAAGCAAGACTCTATCTCAAAAAAAAAAAGACATTTATGTAGAGATGTTAGGTTGGCAG 109688170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4979 CAAAGCAAGACTCTATCTCAAAAAAAAAAAGACATTTATGTAGAGATGTTAGGTTGGCAG 5038

109688171 TTGGATAACAGTCTTGAGTTTCGGGGTGAGGGCAGGACCAGAAATGAAGATTTGGGATTC 109688230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5039 TTGGATAACAGTCTTGAGTTTCGGGGTGAGGGCAGGACCAGAAATGAAGATTTGGGATTC 5098

109688231 ATTAGCATGTAGATCATATTCAGAGCCACAATAATAGATGAAATAACTGAGGAAGAGAGC 109688290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5099 ATTAGCATGTAGATCATATTCAGAGCCACAATAATAGATGAAATAACTGAGGAAGAGAGC 5158

109688291 TAGAGGGGCCAAGAGCAAACACAGGAACATGCCAGCATTTAGAGGACAATGGAGAAGGAG 109688350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5159 TAGAGGGGCCAAGAGCAAACACAGGAACATGCCAGCATTTAGAGGACAATGGAGAAGGAG 5218

109688351 GAGATGGCAGAGATGTCAATAGGAGGAAAAGCAAAAGGGTGTTATCATAGAAGGTGACAA 109688410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5219 GAGATGGCAGAGATGTCAATAGGAGGAAAAGCAAAAGGGTGTTATCATAGAAGGTGACAA 5278

109688411 CAGAATATATCACAAAGAGGAATATGTTTGAATGTGTCAAATGTTGTTATCACAGGCTAT 109688470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5279 CAGAATATATCACAAAGAGGAATATGTTTGAATGTGTCAAATGTTGTTATCACAGGCTAT 5338

109688471 AGAAGTAAACACAAAGTCTTATGGGAATACTGAGGATGAGCTGCCTCTAGTGTGTGTGAA 109688530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5339 AGAAGTAAACACAAAGTCTTATGGGAATACTGAGGATGAGCTGCCTCTAGTGTGTGTGAA 5398

109688531 ACCCTGGCCAAATATTTGTTGTGGGGCCCCTGTCTATATATGCAATGTTATTTAAAAACA 109688590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5399 ACCCTGGCCAAATATTTGTTGTGGGGCCCCTGTCTATATATGCAATGTTATTTAAAAACA 5458

109688591 TACTACATATTCTTGGGCTTATGTGGGATGTAGTGATTTATTGATGAAGACTTAGAATAC 109688650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5459 TACTACATATTCTTGGGCTTATGTGGGATGTAGTGATTTATTGATGAAGACTTAGAATAC 5518

109688651 TGGGTAGGAAGAGATGCTTTTGGATTTGTTTATGAGCCAGTGAGTGTATCTGAGGATTCT 109688710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5519 TGGGTAGGAAGAGATGCTTTTGGATTTGTTTATGAGCCAGTGAGTGTATCTGAGGATTCT 5578

109688711 TTATCCTGTGTCTAATGTGAGTGTGTTTTCCTGAATCAGTGCATCAGTGCTATTCTGGAG 109688770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5579 TTATCCTGTGTCTAATGTGAGTGTGTTTTCCTGAATCAGTGCATCAGTGCTATTCTGGAG 5638

109688771 GCCCAAATCACACATGATTCCGTGAAAGAAACTCTGTGCTGGCCAGAGGATGCACTCACT 109688830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5639 GCCCAAATCACACATGATTCCGTGAAAGAAACTCTGTGCTGGCCAGAGGATGCACTCACT 5698

109688831 CTCCAGGCTTTCCTGCATGGGCCCTCACCATGGAGTCCTGGATACTTAGGGCATCTGGTT 109688890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5699 CTCCAGGCTTTCCTGCATGGGCCCTCACCATGGAGTCCTGGATACTTAGGGCATCTGGTT 5758

109688891 GACCACATGCTTGGGAGAGCACCAAAGAAGGTCCTGGTTTTCAAGCCTCCAGCTTCTCCT 109688950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5759 GACCACATGCTTGGGAGAGCACCAAAGAAGGTCCTGGTTTTCAAGCCTCCAGCTTCTCCT 5818

109688951 TAGAAAGAGTTGACTACCTGTCTGGGCTCCAACTTTTCTGGCTGCTACCAGAGGGTCTGG 109689010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5819 TAGAAAGAGTTGACTACCTGTCTGGGCTCCAACTTTTCTGGCTGCTACCAGAGGGTCTGG 5878

109689011 CCTCTAAACCATCTGTGTCAAAGAACTGACAGGGCCTGACATTCACTGGGACCCTAGGCT 109689070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5879 CCTCTAAACCATCTGTGTCAAAGAACTGACAGGGCCTGACATTCACTGGGACCCTAGGCT 5938

109689071 AGGGGTGACAGAGAGCAAAGCAAAAGTTTGAAAGAGTATGCAGTCTGAATGAGCATGCAG 109689130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5939 AGGGGTGACAGAGAGCAAAGCAAAAGTTTGAAAGAGTATGCAGTCTGAATGAGCATGCAG 5998

109689131 ACCTTTGCCACAGCTCCCCTTCCCAGCTCAGTGCAGAGCAAGTAGGAGATAAACTTCTGC 109689190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5999 ACCTTTGCCACAGCTCCCCTTCCCAGCTCAGTGCAGAGCAAGTAGGAGATAAACTTCTGC 6058

109689191 TCTTAGCTTCTCTGTGAGGAGAGATGAAATGGACCACACATCTAGCACCCCAACTTTTCT 109689250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6059 TCTTAGCTTCTCTGTGAGGAGAGATGAAATGGACCACACATCTAGCACCCCAACTTTTCT 6118

109689251 GACAACTACTAGAAGGACTGACTCCTGACTCACCTGTCTCAGGGCACTGATGGTACTTGG 109689310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6119 GACAACTACTAGAAGGACTGACTCCTGACTCACCTGTCTCAGGGCACTGATGGTACTTGG 6178

109689311 CACACTCTAGTCTCCTGGGGCCACCAAGAACAAGAACAGCATTTTGGACAAACACACTGG 109689370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6179 CACACTCTAGTCTCCTGGGGCCACCAAGAACAAGAACAGCATTTTGGACAAACACACTGG 6238

109689371 TTTGAGAGGCACCCAGACTCTCTGACTGGGCTGTGAGGAGGCTCATCTGTGAAGACTGAG 109689430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6239 TTTGAGAGGCACCCAGACTCTCTGACTGGGCTGTGAGGAGGCTCATCTGTGAAGACTGAG 6298

109689431 GGAGGTGGCTGTTTTATCAAATGTGCAGAAACCAACACAGAGAGTCAAAGACAATGAACA 109689490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6299 GGAGGTGGCTGTTTTATCAAATGTGCAGAAACCAACACAGAGAGTCAAAGACAATGAACA 6358

109689491 AACAGGAAATATGCCATAAATAAAAGAACAAGATAAATCTTCAGAAACTGACCCAAACAG 109689550
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     6359 AACAGGAAATATGCCATAAATAAAAGAACAAGATAAAACTTCAGAAACTGACCCAAACAG 6418

109689551 AATGGAGATATGTGATTTACCAGACAAAAAATCAAAAGACCTGTCACAAAGATGCTCAGT 109689610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6419 AATGGAGATATGTGATTTACCAGACAAAAAATCAAAAGACCTGTCACAAAGATGCTCAGT 6478

109689611 GAGGTCAGGAGAGCAATGCATGAATAAAGTGAGAATTTCAACCAAAAAGGTAGAAAATAT 109689670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6479 GAGGTCAGGAGAGCAATGCATGAATAAAGTGAGAATTTCAACCAAAAAGGTAGAAAATAT 6538

109689671 TAAAAAGTGCCAAACAGAAATCACGGAGCTGAAGAATATAATAAAAGAACAGAAAAATTT 109689730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6539 TAAAAAGTGCCAAACAGAAATCACGGAGCTGAAGAATATAATAAAAGAACAGAAAAATTT 6598

109689731 AATAGAGGGGTTCAATAGCAGACTAGGTGAACTGAAAGAAAGGATTAGTGAACTCAAGGA 109689790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6599 AATAGAGGGGTTCAATAGCAGACTAGGTGAACTGAAAGAAAGGATTAGTGAACTCAAGGA 6658

109689791 CTGGTCATTGGCAATCATTCAGTCACAGCATTAAAAAGAAAAAAGAATGAAGGGCCAGGC 109689850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6659 CTGGTCATTGGCAATCATTCAGTCACAGCATTAAAAAGAAAAAAGAATGAAGGGCCAGGC 6718

109689851 ACAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTG 109689900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6719 ACAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTG 6768

EXCISED REGION

109695215 GATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATTCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATTTCAACT 109695274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6769 GATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATTCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATTTCAACT 6828

109695275 AAAAATACAAAAAAAAAAAAAAAATAGCCGGGTGTGGTGGCACACACCCGTAGTCCCAGC 109695334
          |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6829 AAAAATAC-AAAAAAAAAAAAAAATAGCCGGGTGTGGTGGCACACACCCGTAGTCCCAGC 6887

109695335 TACTTGGGAGGCTGGGGCAGGAGAATGGCATGAACCCGGGAGGCG 109695379
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6888 TACTTGGGAGGCTGGGGCAGGAGAATGGCATGAACCCGGGAGGCG 6932

Alignment time is 6.08659 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [109679900,109705214] =>     25315 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [        1,     9905] =>      9905 nucs 'mol-32-300f-077447_9905'

Score:        9795
Aligned:      9909        nucs
Identic:      9897 (100%) nucs =>      8341 (100%)      1556 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [109681552,109689900] EXCISED REGION [109695215,109696774]
 second seq =>  [        1,     8346] EXCISED REGION [     8347,     9905]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      5314 nucs [109689901,109695214]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        28 nucs [109689901,109689928] to [109695215,109695242]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [109689900,109689900] to [109695215,109695215]
 second seq =>         1 nucs [8346,8346] to [8347,8347]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

109681552 AAAGGCATAGCTGACCACAAAGCAAACTAGCAAATACTGTTGGCCCAGCTTCCAACAAAG 109681611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAAGGCATAGCTGACCACAAAGCAAACTAGCAAATACTGTTGGCCCAGCTTCCAACAAAG 60

109681612 CCAACATTAGGAGGCACTCTAGTTGAAGACTATATTCTTCATCAATGTGTGTTCTCTGAA 109681671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCAACATTAGGAGGCACTCTAGTTGAAGACTATATTCTTCATCAATGTGTGTTCTCTGAA 120

109681672 GTCCCTGGTCCTGTAGCTCATGGTCAGCTAGAGGTTTGACTGAGATTTCCACAAATGCTG 109681731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTCCCTGGTCCTGTAGCTCATGGTCAGCTAGAGGTTTGACTGAGATTTCCACAAATGCTG 180

109681732 TATTTAAGTCATTAGTGCACTTTTTTTTGCTTGCTTGCTGTAAATCTTTGATTATTTCCC 109681791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TATTTAAGTCATTAGTGCACTTTTTTTTGCTTGCTTGCTGTAAATCTTTGATTATTTCCC 240

109681792 AGAGTTCCACAAAGTTGATTCTGACGGCTTTTGCTTATCTTTGTGTGCGTGTTTCTGTGG 109681851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGAGTTCCACAAAGTTGATTCTGACGGCTTTTGCTTATCTTTGTGTGCGTGTTTCTGTGG 300

109681852 AGGACAGGTCCTTGGGGCTGCCGACTCTGCAGTTCTTGCTGGGCGTCACTCCCAACCCCG 109681911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGGACAGGTCCTTGGGGCTGCCGACTCTGCAGTTCTTGCTGGGCGTCACTCCCAACCCCG 360

109681912 CAGCATCCTGTGTAGAATGGAGGAATCAGCCCTCGTTCAGCCCAGCCAGGACATTTCTGC 109681971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CAGCATCCTGTGTAGAATGGAGGAATCAGCCCTCGTTCAGCCCAGCCAGGACATTTCTGC 420

109681972 TGGATCATGCGCAGCCCCAAGTGTCAGGGACTAACTGGAGGAGAGCAAGCTGGCAAAGGG 109682031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGGATCATGCGCAGCCCCAAGTGTCAGGGACTAACTGGAGGAGAGCAAGCTGGCAAAGGG 480

109682032 TCAAACACTGGTGGCACTCAGCCTGGAAAGGAGGCGGTCCAGTGGAGAGATGTAGTGGCT 109682091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCAAACACTGGTGGCACTCAGCCTGGAAAGGAGGCGGTCCAGTGGAGAGATGTAGTGGCT 540

109682092 GTTTAAAGATCGTGATGCTCTGACACCTGAGAGCTCCAGAGAGAAAAGTTAAGGATGCAT 109682151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GTTTAAAGATCGTGATGCTCTGACACCTGAGAGCTCCAGAGAGAAAAGTTAAGGATGCAT 600

109682152 GTAGGAAGTCTCAGAGATTCAAATTTGGACTCAATGTTAGGAAACCTTGTGCAAAGAGGG 109682211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTAGGAAGTCTCAGAGATTCAAATTTGGACTCAATGTTAGGAAACCTTGTGCAAAGAGGG 660

109682212 AAGAGCCTATCAGTGGAGTGCTGGCCTCCGCGTCTTACGAGCTGCTTGAGCTTCCTGTCA 109682271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAGAGCCTATCAGTGGAGTGCTGGCCTCCGCGTCTTACGAGCTGCTTGAGCTTCCTGTCA 720

109682272 TCTGCCTCAAATGCTGCCCAGCAATTCCTGCAGGCAGAGGCAACAAAGTGAGGTGATGTA 109682331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
      721 TCTGCCTCAAATGCTGCCCAGCAATTCCTGCAGGCAGAGGCAGCAAAGTGAGGTGATGTA 780

109682332 GGCCCTTTCCATCCTAAGATACTATCATTTTTTTCCACTCTAGTCTTCAGCTTCTGTTGC 109682391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GGCCCTTTCCATCCTAAGATACTATCATTTTTTTCCACTCTAGTCTTCAGCTTCTGTTGC 840

109682392 CAGCTCTTGTGGATTTTTTTTGACAGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAAT 109682451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CAGCTCTTGTGGATTTTTTTTGACAGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAAT 900

109682452 GGCATGATCTTGGCTCACCGTAACCTCTGCCTCCCGGATTCAAGCAATTCTCCTGCCTCG 109682511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GGCATGATCTTGGCTCACCGTAACCTCTGCCTCCCGGATTCAAGCAATTCTCCTGCCTCG 960

109682512 GCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCGCCACCATGCCCGGCTAATTCTGTATTTT 109682571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCGCCACCATGCCCGGCTAATTCTGTATTTT 1020

109682572 TTTTTTTTTCTGAGACATAGTATCGCTCTGTCCCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGAAATC 109682631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTTTTTTTTCTGAGACATAGTATCGCTCTGTCCCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGAAATC 1080

109682632 TTAGCTCACTGCAACCTCCGTCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTACTGA 109682691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTAGCTCACTGCAACCTCCGTCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTACTGA 1140

109682692 GTAGCTAGAATTACAGGTGTTTGCCACCACACCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAT 109682751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GTAGCTAGAATTACAGGTGTTTGCCACCACACCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAT 1200

109682752 ACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCTGCCCAC 109682811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCTGCCCAC 1260

109682812 CTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACCGTGCTGGCCGTGGATTCTT 109682871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACCGTGCTGGCCGTGGATTCTT 1320

109682872 TTTTTATAAAGGCATGCCCTCTCCATCCACACCTCGCCACGCAAACAGCGCTAACTGTTC 109682931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTTTTATAAAGGCATGCCCTCTCCATCCACACCTCGCCACGCAAACAGCGCTAACTGTTC 1380

109682932 CCCCACCAACTTGTCCCTCACCACACTCAGCAGTGTTGTGGGGGGTGCCCTCTAAACTCA 109682991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CCCCACCAACTTGTCCCTCACCACACTCAGCAGTGTTGTGGGGGGTGCCCTCTAAACTCA 1440

109682992 AGTAGGAGTGAGGCTCCCTCCTACTGAAAGAAACGCAGTTGGTGTCCGCTGCCCACAGGT 109683051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AGTAGGAGTGAGGCTCCCTCCTACTGAAAGAAACGCAGTTGGTGTCCGCTGCCCACAGGT 1500

109683052 CAATTCCGATTCCATTTGCAACTGGCCCCAGCTGCCTTTCTAGACCCAGGGCCCTTGTGT 109683111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CAATTCCGATTCCATTTGCAACTGGCCCCAGCTGCCTTTCTAGACCCAGGGCCCTTGTGT 1560

109683112 CTGTCCCCTCCTGCATTGTCACTCAGTCCCCTGGGGAAGTAATCATGTTGCATGTAGCAG 109683171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CTGTCCCCTCCTGCATTGTCACTCAGTCCCCTGGGGAAGTAATCATGTTGCATGTAGCAG 1620

109683172 ATGGCTTCACTGGGGGATGGCGGGGCAGGGGCGATGGGAGGCTGTGCCCAGGACTGCCTG 109683231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ATGGCTTCACTGGGGGATGGCGGGGCAGGGGCGATGGGAGGCTGTGCCCAGGACTGCCTG 1680

109683232 AGTTACAGGAGGAGATTATGACAGAGCCGAGCGGTAAAGGAAGGAGGGGCCCCAGGGACA 109683291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AGTTACAGGAGGAGATTATGACAGAGCCGAGCGGTAAAGGAAGGAGGGGCCCCAGGGACA 1740

109683292 AAGGGAGAAGAGCAGCCCCAAAGGTTCCAAGAACCCCCCAGGAATAAGACTTCTCTGAGG 109683351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AAGGGAGAAGAGCAGCCCCAAAGGTTCCAAGAACCCCCCAGGAATAAGACTTCTCTGAGG 1800

109683352 CTGAGAGATGTCCAGGGTGCTCTGACAACAATATTATTTCCTTTCAACACGTTGATACTC 109683411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CTGAGAGATGTCCAGGGTGCTCTGACAACAATATTATTTCCTTTCAACACGTTGATACTC 1860

109683412 CATTTTTTGTAAAGCGCACAAGACGCAGACAGAAAACCTAATGTTTTATCCCAGGGCATA 109683471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CATTTTTTGTAAAGCGCACAAGACGCAGACAGAAAACCTAATGTTTTATCCCAGGGCATA 1920

109683472 GGCTTGGAATTTCTCGGCAGAACACAACATATAGCAGAGAGGCAAAATAAAAAGGAATAC 109683531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GGCTTGGAATTTCTCGGCAGAACACAACATATAGCAGAGAGGCAAAATAAAAAGGAATAC 1980

109683532 AGAAAGAAAGAAAAAAAAAAACAACCTGATGTTGCAAAGAAAGAACACAAAAGTCGAGGG 109683591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AGAAAGAAAGAAAAAAAAAAACAACCTGATGTTGCAAAGAAAGAACACAAAAGTCGAGGG 2040

109683592 TGAGGCCAGCCTGGGTCGGCTTGTTCAGCGAAGGACGCACAGTGAGGACGCAGGCCTAGT 109683651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TGAGGCCAGCCTGGGTCGGCTTGTTCAGCGAAGGACGCACAGTGAGGACGCAGGCCTAGT 2100

109683652 GAGGCCTGGTGACTTGAGGGCCCTGTTGTGCTTTCCTAGGGGAAGGCCACTGCAATAAGG 109683711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GAGGCCTGGTGACTTGAGGGCCCTGTTGTGCTTTCCTAGGGGAAGGCCACTGCAATAAGG 2160

109683712 ATTAGAAAAAGTCAGCCAATTTTGTCCTGCTGTGTATAATTACCTCTCCATCTATTTATA 109683771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ATTAGAAAAAGTCAGCCAATTTTGTCCTGCTGTGTATAATTACCTCTCCATCTATTTATA 2220

109683772 AAGCCTTGAGGAATTCAAGCAATTATTCATCCTAAAAACACCGTGGGCAGTGACGCCTCC 109683831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AAGCCTTGAGGAATTCAAGCAATTATTCATCCTAAAAACACCGTGGGCAGTGACGCCTCC 2280

109683832 AAAGATAGCTACTGCATAATCTCTCCGCTGCTCTCTCGCAGCCCCGCCTGTGCTGTACTT 109683891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AAAGATAGCTACTGCATAATCTCTCCGCTGCTCTCTCGCAGCCCCGCCTGTGCTGTACTT 2340

109683892 TCACCATGGGGGAGGCAGCGGAGGTGCAGGGGCCATGCCACCATCCCAGGGTCTCGGGAG 109683951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TCACCATGGGGGAGGCAGCGGAGGTGCAGGGGCCATGCCACCATCCCAGGGTCTCGGGAG 2400

109683952 TTCTCCCAGCTCCAGGACTCGGGCAAGTCCCTCCACCGCTCTGCGTCTTGAAGTCTTCAT 109684011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TTCTCCCAGCTCCAGGACTCGGGCAAGTCCCTCCACCGCTCTGCGTCTTGAAGTCTTCAT 2460

109684012 CTGTAAGTGGGGATGTGACTGTGTCTGTCTCTCCTGGGTGTTGGGAAGGTCACACAGGTC 109684071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CTGTAAGTGGGGATGTGACTGTGTCTGTCTCTCCTGGGTGTTGGGAAGGTCACACAGGTC 2520

109684072 TAGATCTATATGTAGTCACTAAGAAGAATATTTAGTAGATGTTGCCAGCTGACTGGAATC 109684131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TAGATCTATATGTAGTCACTAAGAAGAATATTTAGTAGATGTTGCCAGCTGACTGGAATC 2580

109684132 AACCCGGACTCTGCCCCTGCTCCCCAAACCACCCTCTCCTGGCCGCGCAATCCTTCAGGT 109684191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AACCCGGACTCTGCCCCTGCTCCCCAAACCACCCTCTCCTGGCCGCGCAATCCTTCAGGT 2640

109684192 GCTCAGGCTGATTCCTGGAGTCATCTTGGATTCATTTCTCCCTCTCACACCTCACATTTA 109684251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GCTCAGGCTGATTCCTGGAGTCATCTTGGATTCATTTCTCCCTCTCACACCTCACATTTA 2700

109684252 GTCCACTAGCTAATGCTGTGGGCTCCAGCTTCAAAATGCACCTGCAAGCCACCCTGCCCC 109684311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GTCCACTAGCTAATGCTGTGGGCTCCAGCTTCAAAATGCACCTGCAAGCCACCCTGCCCC 2760

109684312 CTCCTCCATCACGACCACCCTGTTCTGACCCTGGCAATCCCAGCCCCTTCCTCCCTCAGC 109684371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CTCCTCCATCACGACCACCCTGTTCTGACCCTGGCAATCCCAGCCCCTTCCTCCCTCAGC 2820

109684372 CACAGGGCTCCAGCTCCAGCTGCTGGGTGGAGGCTGGGCTTGCTGCTGCTCTGGGGACTT 109684431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CACAGGGCTCCAGCTCCAGCTGCTGGGTGGAGGCTGGGCTTGCTGCTGCTCTGGGGACTT 2880

109684432 TGCTCTTTGCTGTTCCTTCTCCTGGAATGCACATCCCCACACACCTGCCTGCTCACATGC 109684491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TGCTCTTTGCTGTTCCTTCTCCTGGAATGCACATCCCCACACACCTGCCTGCTCACATGC 2940

109684492 TCCCCTGTAAGGCTTGCTCCAAGGTCACCTCCTCAGTGAAGCTGCCCTGACTGCTGCCAC 109684551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TCCCCTGTAAGGCTTGCTCCAAGGTCACCTCCTCAGTGAAGCTGCCCTGACTGCTGCCAC 3000

109684552 CCACACCACCCCCTCACGGGGCTACCCCACTTCCCTGGATCATTTTTATCCATAGTGTGT 109684611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CCACACCACCCCCTCACGGGGCTACCCCACTTCCCTGGATCATTTTTATCCATAGTGTGT 3060

109684612 ATTCCCCTCTGACACACCATGTCGTTTACTTTTTCATCTTTTCGCGGAACTGTTCTTCCC 109684671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 ATTCCCCTCTGACACACCATGTCGTTTACTTTTTCATCTTTTCGCGGAACTGTTCTTCCC 3120

109684672 TCTAGAATGGCGGTTCTCAACCATGGGCCATCTGTCAGTGTCTACAGACATTTGGAGTGA 109684731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TCTAGAATGGCGGTTCTCAACCATGGGCCATCTGTCAGTGTCTACAGACATTTGGAGTGA 3180

109684732 TCCTAACTGGGGGTGGGGTGTTCTAGGCACCCAGTGGGCACAGGCAGGAGTGCACAGGAT 109684791
          ||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     3181 TCATAACTGGGGGTGGGGTGTTCTAGGCACCCAGTGGGCACAGACAGGAGTGCACAGGAT 3240

109684792 TAAGAACACCCACCCGAAGAACCCCCACCCCAGATGGCAACAGAGAAGAGGTTGAGAAAC 109684851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TAAGAACACCCACCCGAAGAACCCCCACCCCAGATGGCAACAGAGAAGAGGTTGAGAAAC 3300

109684852 CCGCATCCAGACTGTAAGCCGTCTGAGGGCAAGGGCCCTGTCCCCTGTTTTGATCACTGC 109684911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 CCGCATCCAGACTGTAAGCCGTCTGAGGGCAAGGGCCCTGTCCCCTGTTTTGATCACTGC 3360

109684912 AACATCTCCAGCACCCAGAACAGGGCTTGACATCACGGATGCCCAGTAAGTGGGGAACGA 109684971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 AACATCTCCAGCACCCAGAACAGGGCTTGACATCACGGATGCCCAGTAAGTGGGGAACGA 3420

109684972 ACAGAGACTGGCACATACACAGCACTGGGGAAATGTTGGTCATTATTATCATTATTTCTC 109685031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 ACAGAGACTGGCACATACACAGCACTGGGGAAATGTTGGTCATTATTATCATTATTTCTC 3480

109685032 ATGGGTTTGTATTGTTTCTGTGCCTCAGGTTTTCAGGAAAGTCTCTGCTTTTCCCCTGGG 109685091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 ATGGGTTTGTATTGTTTCTGTGCCTCAGGTTTTCAGGAAAGTCTCTGCTTTTCCCCTGGG 3540

109685092 CAGTGCAACAGAGGGGAAGAGTGTTGGACTTGGAGTCAGAGACCCATGTCTGAGCCCCAG 109685151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 CAGTGCAACAGAGGGGAAGAGTGTTGGACTTGGAGTCAGAGACCCATGTCTGAGCCCCAG 3600

109685152 GTTGGCCATTATGAGCTGTGTAGCTCTGGGAAACTCACTTAACCTCTCTGAGGTTTTGTT 109685211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 GTTGGCCATTATGAGCTGTGTAGCTCTGGGAAACTCACTTAACCTCTCTGAGGTTTTGTT 3660

109685212 TCCTCATTCGTTGAGTTGGAATACCATTTGTTTTCCTCCTCATCTGGCAAGCTGGTGAGA 109685271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 TCCTCATTCGTTGAGTTGGAATACCATTTGTTTTCCTCCTCATCTGGCAAGCTGGTGAGA 3720

109685272 TAAGCAAATATGATGATATGTCAAAATGCTTGTAAGTACTAAATACCTTCCAGCTATTGT 109685331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 TAAGCAAATATGATGATATGTCAAAATGCTTGTAAGTACTAAATACCTTCCAGCTATTGT 3780

109685332 CATTATGTGGTCCCTCCTGCAAAATGGAAAAACCAATTGATTTTACCATGGCTGACAATC 109685391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 CATTATGTGGTCCCTCCTGCAAAATGGAAAAACCAATTGATTTTACCATGGCTGACAATC 3840

109685392 TTATATCGGTTGTGAGGAGCTTATTATTCATAATTTCAGTGTGTTTCCATTTCTGCCCAT 109685451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 TTATATCGGTTGTGAGGAGCTTATTATTCATAATTTCAGTGTGTTTCCATTTCTGCCCAT 3900

109685452 ATGGCACTCCTCCCTTAGACAGGTATCTTGAGACAAGAAAAGGAGCAGGTGGCCTTTAAA 109685511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 ATGGCACTCCTCCCTTAGACAGGTATCTTGAGACAAGAAAAGGAGCAGGTGGCCTTTAAA 3960

109685512 ATACATTGCACATAACACATGCGTTTCACTGAACAGCTTTTTGCATTTAAAATGCAGACA 109685571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 ATACATTGCACATAACACATGCGTTTCACTGAACAGCTTTTTGCATTTAAAATGCAGACA 4020

109685572 ATATGCTCAAAATAGTACTAATAAATTTTCTATCTTGAGTAATGTATCTCAGACATATAC 109685631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 ATATGCTCAAAATAGTACTAATAAATTTTCTATCTTGAGTAATGTATCTCAGACATATAC 4080

109685632 CAAGGGAAAATAATTAAAGAAAAACCCAATAAAATAGAGATCATAAAAAGGGGGGCTTAT 109685691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 CAAGGGAAAATAATTAAAGAAAAACCCAATAAAATAGAGATCATAAAAAGGGGGGCTTAT 4140

109685692 AAATCAAGAGAGTAGACTTCTAGCCATTCTCAATACAGCCTTTGAGTGCAAGGATCCCAG 109685751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 AAATCAAGAGAGTAGACTTCTAGCCATTCTCAATACAGCCTTTGAGTGCAAGGATCCCAG 4200

109685752 ATGTTTGATTTGGACACATGGAATTTTGCAATAGGATAGTGTACTTCTTATGAATGAAAC 109685811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 ATGTTTGATTTGGACACATGGAATTTTGCAATAGGATAGTGTACTTCTTATGAATGAAAC 4260

109685812 ATCAAAAGGCATATGGTAGTAGATGCAATCATGTTGGCAGACGTGTGTCTTGGAGAGCAG 109685871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 ATCAAAAGGCATATGGTAGTAGATGCAATCATGTTGGCAGACGTGTGTCTTGGAGAGCAG 4320

109685872 AAATGGCCAACTGAATGCTTCCTTCCTCACTCGTGAAGCCATCAGGAGCAAAGCTCCAGG 109685931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 AAATGGCCAACTGAATGCTTCCTTCCTCACTCGTGAAGCCATCAGGAGCAAAGCTCCAGG 4380

109685932 GAGTGCCTTCCGCCCTGCTGGCAATGAATGGCCTCTCCTGACAGATAGCCTAAGAGCCTT 109685991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 GAGTGCCTTCCGCCCTGCTGGCAATGAATGGCCTCTCCTGACAGATAGCCTAAGAGCCTT 4440

109685992 TGGCTAAAGATTTGCAACATCAAAGAGTGAGTGGCATGGCCTGGCCAGCCACCTGAGACA 109686051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 TGGCTAAAGATTTGCAACATCAAAGAGTGAGTGGCATGGCCTGGCCAGCCACCTGAGACA 4500

109686052 ACGTACTTTGTTCCAGAACGTGGTTCAGAGTTTCACCTTGCTGGCTCAGTGGGGATTAAG 109686111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 ACGTACTTTGTTCCAGAACGTGGTTCAGAGTTTCACCTTGCTGGCTCAGTGGGGATTAAG 4560

109686112 GCTGAAAGAGGCTTTGAAAATGTTGATAACAGATGAATGTAAATATTATTTACCTAGCAA 109686171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 GCTGAAAGAGGCTTTGAAAATGTTGATAACAGATGAATGTAAATATTATTTACCTAGCAA 4620

109686172 CATAACACTTTTTTTCTTCTTTTTTGGCTCTTTCATGGAGTCATTACTCTTTCCCTTGAG 109686231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 CATAACACTTTTTTTCTTCTTTTTTGGCTCTTTCATGGAGTCATTACTCTTTCCCTTGAG 4680

109686232 TTGTCAGTTCCTTCATTTAGTCTATTCCTTCAACAATTATTGATCAAATCATTATTTGTG 109686291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 TTGTCAGTTCCTTCATTTAGTCTATTCCTTCAACAATTATTGATCAAATCATTATTTGTG 4740

109686292 CTGGGCAGTGTTCTATGTCCCAGGAATTTTGTACTGTAAACCAGTACTCTGTCCTCATAA 109686351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 CTGGGCAGTGTTCTATGTCCCAGGAATTTTGTACTGTAAACCAGTACTCTGTCCTCATAA 4800

109686352 CGCCTATAATCTAGAGACATTGAACTGTGAGCACAGGAATAAGCAGTGTACTTTCAGAAT 109686411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 CGCCTATAATCTAGAGACATTGAACTGTGAGCACAGGAATAAGCAGTGTACTTTCAGAAT 4860

109686412 GTAATCAGTGTTCTCAAGGGAGGAGATTATGATGTAACAGAGCTTCTTTTCATCTCAAAG 109686471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 GTAATCAGTGTTCTCAAGGGAGGAGATTATGATGTAACAGAGCTTCTTTTCATCTCAAAG 4920

109686472 GAAGGCCATTAAGAAGGGCCAGTCAGGACAGGTGATGCTGGCAGGAAGGGAGCCAGCCTG 109686531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 GAAGGCCATTAAGAAGGGCCAGTCAGGACAGGTGATGCTGGCAGGAAGGGAGCCAGCCTG 4980

109686532 CGACGTGCTGGGAAGACAGGCAGAGAGACTATACGTTCAAAGGGTGTGAGGCAGGCATGA 109686591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 CGACGTGCTGGGAAGACAGGCAGAGAGACTATACGTTCAAAGGGTGTGAGGCAGGCATGA 5040

109686592 GTTTGCAGAAAGTGTGCTAAGGGCCTGGAGCAGAGTGAGTGAGGGGGAACAAAGACAGGG 109686651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 GTTTGCAGAAAGTGTGCTAAGGGCCTGGAGCAGAGTGAGTGAGGGGGAACAAAGACAGGG 5100

109686652 AGGTGTTAAAGGGCCAGGAGGGGCTGGACCCTCTGGAGCATTGATGACTATGCTGTGGAA 109686711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 AGGTGTTAAAGGGCCAGGAGGGGCTGGACCCTCTGGAGCATTGATGACTATGCTGTGGAA 5160

109686712 TGAATTTGGATGTTGTTTAAGGGGAATGGGAAGTCATTGAAATATTTTAAGTAGAGAAAT 109686771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 TGAATTTGGATGTTGTTTAAGGGGAATGGGAAGTCATTGAAATATTTTAAGTAGAGAAAT 5220

109686772 GGGATGCACTGATTTACCTTATGAAAAGAGTTCTCTAGCTGCTTTGAGAGAATGGATTAT 109686831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 GGGATGCACTGATTTACCTTATGAAAAGAGTTCTCTAGCTGCTTTGAGAGAATGGATTAT 5280

109686832 AGTGGGGTGATATAGTTTGGACGTTTGTCCTCTCCAAATCTCGTGTTGAAATGTGATGCT 109686891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 AGTGGGGTGATATAGTTTGGACGTTTGTCCTCTCCAAATCTCGTGTTGAAATGTGATGCT 5340

109686892 CAGTGTTGGAGGTGGGGTCTGGTGGGAGGTGATTGGGTCGTGGAGCAGATCCTTCATGAA 109686951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 CAGTGTTGGAGGTGGGGTCTGGTGGGAGGTGATTGGGTCGTGGAGCAGATCCTTCATGAA 5400

109686952 TGGCTGCTGACATCATCTTGGTGGTGAGTGAGTTCTCAGTCTGGTAGTTCACATGAGATC 109687011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 TGGCTGCTGACATCATCTTGGTGGTGAGTGAGTTCTCAGTCTGGTAGTTCACATGAGATC 5460

109687012 TGCCTGTTTTAAAGAGTATGGTGGCCAAGTGCCGTGGCTCACGCCTGTGATCCCAGCACT 109687071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 TGCCTGTTTTAAAGAGTATGGTGGCCAAGTGCCGTGGCTCACGCCTGTGATCCCAGCACT 5520

109687072 TTGGGAGGTAAAGGCAGGAGGATCACTTGAGCTCAGGAGTTCGACACTAGCCTGGGAAAC 109687131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 TTGGGAGGTAAAGGCAGGAGGATCACTTGAGCTCAGGAGTTCGACACTAGCCTGGGAAAC 5580

109687132 AGGGTGAAACCCATCTCTACTAAAAATAGAAATATTAGGCGGGTGTGATGGTGCGCTGCC 109687191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 AGGGTGAAACCCATCTCTACTAAAAATAGAAATATTAGGCGGGTGTGATGGTGCGCTGCC 5640

109687192 TATAGTCCCAGCTACCGGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGGCAGAG 109687251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 TATAGTCCCAGCTACCGGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGGCAGAG 5700

109687252 GTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAGCCAGACCCTA 109687311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5701 GTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAGCCAGACCCTA 5760

109687312 TCTAAAAAAAAAAAAAAAAAATAGAGTGCGGCACCCCTCCCTTCCCACTGTTGCTCCCTC 109687371
          ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5761 TCTAAAAAAAAAAAAAAA---TAGAGTGCGGCACCCCTCCCTTCCCACTGTTGCTCCCTC 5817

109687372 TCTCGCCATGTGGGGCACGGGCTGCTCCTTCATCTTCCACCATTATTGTGAGCTTCCTGA 109687431
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5818 TCTCGCCATGTGGGGCATGGGCTGCTCCTTCATCTTCCACCATTATTGTGAGCTTCCTGA 5877

109687432 GGCCTCACCAGGAGCAGATGTGAGCAAATTAAACCTCTTTTCTTTATAAATTACCCATAT 109687491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5878 GGCCTCACCAGGAGCAGATGTGAGCAAATTAAACCTCTTTTCTTTATAAATTACCCATAT 5937

109687492 TTAGGTATTTATTTATAGCTACTACAAGGGGGAAAGGGAGAGCAGGGAGATCAGTGGTGC 109687551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5938 TTAGGTATTTATTTATAGCTACTACAAGGGGGAAAGGGAGAGCAGGGAGATCAGTGGTGC 5997

109687552 TTTCACACTAGTACAGCAATAGAGCAGCATCTTGGACCAGGGTGGTGGCTGAGGAGACAG 109687611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5998 TTTCACACTAGTACAGCAATAGAGCAGCATCTTGGACCAGGGTGGTGGCTGAGGAGACAG 6057

109687612 GATCATGGCTTTGAGATACATTCTGAAGAAGAAAAGTAGGCCTTGCTGATAGAATAGTCA 109687671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6058 GATCATGGCTTTGAGATACATTCTGAAGAAGAAAAGTAGGCCTTGCTGATAGAATAGTCA 6117

109687672 CAAACTGTAATGGAAAAGGTAAATTCAAGGATGTCTCCTGGGTTTTTGGCTTAAGCATCT 109687731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6118 CAAACTGTAATGGAAAAGGTAAATTCAAGGATGTCTCCTGGGTTTTTGGCTTAAGCATCT 6177

109687732 GGATACAGAGATATGGAAGACTGGGAGGGAAATGGGTTTGGAGTATACATGCATGCAATC 109687791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6178 GGATACAGAGATATGGAAGACTGGGAGGGAAATGGGTTTGGAGTATACATGCATGCAATC 6237

109687792 AACAATTCTGTCTTGCATGTGTGAAATTTAGATACCCATTAGACATCTGCATAGAGGGCC 109687851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6238 AACAATTCTGTCTTGCATGTGTGAAATTTAGATACCCATTAGACATCTGCATAGAGGGCC 6297

109687852 AGGCACAGTGGCTCACGGCAGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCGGATCAC 109687911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6298 AGGCACAGTGGCTCACGGCAGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCGGATCAC 6357

109687912 TTGAGGTTAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACTCTGTCTCTACTAAAA 109687971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6358 TTGAGGTTAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACTCTGTCTCTACTAAAA 6417

109687972 ATACAAAAATTATCTGGGTGTGGTGGTGTGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTG 109688031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6418 ATACAAAAATTATCTGGGTGTGGTGGTGTGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTG 6477

109688032 AGGCATGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGTAGAGGTTGCAGCGAGCCAAGATCACACCAC 109688091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6478 AGGCATGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGTAGAGGTTGCAGCGAGCCAAGATCACACCAC 6537

109688092 TGCACTCTAGCAAGGGTGACAAAGCAAGACTCTATCTCAAAAAAAAAAAGACATTTATGT 109688151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6538 TGCACTCTAGCAAGGGTGACAAAGCAAGACTCTATCTCAAAAAAAAAAAGACATTTATGT 6597

109688152 AGAGATGTTAGGTTGGCAGTTGGATAACAGTCTTGAGTTTCGGGGTGAGGGCAGGACCAG 109688211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6598 AGAGATGTTAGGTTGGCAGTTGGATAACAGTCTTGAGTTTCGGGGTGAGGGCAGGACCAG 6657

109688212 AAATGAAGATTTGGGATTCATTAGCATGTAGATCATATTCAGAGCCACAATAATAGATGA 109688271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6658 AAATGAAGATTTGGGATTCATTAGCATGTAGATCATATTCAGAGCCACAATAATAGATGA 6717

109688272 AATAACTGAGGAAGAGAGCTAGAGGGGCCAAGAGCAAACACAGGAACATGCCAGCATTTA 109688331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6718 AATAACTGAGGAAGAGAGCTAGAGGGGCCAAGAGCAAACACAGGAACATGCCAGCATTTA 6777

109688332 GAGGACAATGGAGAAGGAGGAGATGGCAGAGATGTCAATAGGAGGAAAAGCAAAAGGGTG 109688391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6778 GAGGACAATGGAGAAGGAGGAGATGGCAGAGATGTCAATAGGAGGAAAAGCAAAAGGGTG 6837

109688392 TTATCATAGAAGGTGACAACAGAATATATCACAAAGAGGAATATGTTTGAATGTGTCAAA 109688451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6838 TTATCATAGAAGGTGACAACAGAATATATCACAAAGAGGAATATGTTTGAATGTGTCAAA 6897

109688452 TGTTGTTATCACAGGCTATAGAAGTAAACACAAAGTCTTATGGGAATACTGAGGATGAGC 109688511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6898 TGTTGTTATCACAGGCTATAGAAGTAAACACAAAGTCTTATGGGAATACTGAGGATGAGC 6957

109688512 TGCCTCTAGTGTGTGTGAAACCCTGGCCAAATATTTGTTGTGGGGCCCCTGTCTATATAT 109688571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6958 TGCCTCTAGTGTGTGTGAAACCCTGGCCAAATATTTGTTGTGGGGCCCCTGTCTATATAT 7017

109688572 GCAATGTTATTTAAAAACATACTACATATTCTTGGGCTTATGTGGGATGTAGTGATTTAT 109688631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7018 GCAATGTTATTTAAAAACATACTACATATTCTTGGGCTTATGTGGGATGTAGTGATTTAT 7077

109688632 TGATGAAGACTTAGAATACTGGGTAGGAAGAGATGCTTTTGGATTTGTTTATGAGCCAGT 109688691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7078 TGATGAAGACTTAGAATACTGGGTAGGAAGAGATGCTTTTGGATTTGTTTATGAGCCAGT 7137

109688692 GAGTGTATCTGAGGATTCTTTATCCTGTGTCTAATGTGAGTGTGTTTTCCTGAATCAGTG 109688751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7138 GAGTGTATCTGAGGATTCTTTATCCTGTGTCTAATGTGAGTGTGTTTTCCTGAATCAGTG 7197

109688752 CATCAGTGCTATTCTGGAGGCCCAAATCACACATGATTCCGTGAAAGAAACTCTGTGCTG 109688811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7198 CATCAGTGCTATTCTGGAGGCCCAAATCACACATGATTCCGTGAAAGAAACTCTGTGCTG 7257

109688812 GCCAGAGGATGCACTCACTCTCCAGGCTTTCCTGCATGGGCCCTCACCATGGAGTCCTGG 109688871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7258 GCCAGAGGATGCACTCACTCTCCAGGCTTTCCTGCATGGGCCCTCACCATGGAGTCCTGG 7317

109688872 ATACTTAGGGCATCTGGTTGACCACATGCTTGGGAGAGCACCAAAGAAGGTCCTGGTTTT 109688931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7318 ATACTTAGGGCATCTGGTTGACCACATGCTTGGGAGAGCACCAAAGAAGGTCCTGGTTTT 7377

109688932 CAAGCCTCCAGCTTCTCCTTAGAAAGAGTTGACTACCTGTCTGGGCTCCAACTTTTCTGG 109688991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7378 CAAGCCTCCAGCTTCTCCTTAGAAAGAGTTGACTACCTGTCTGGGCTCCAACTTTTCTGG 7437

109688992 CTGCTACCAGAGGGTCTGGCCTCTAAACCATCTGTGTCAAAGAACTGACAGGGCCTGACA 109689051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7438 CTGCTACCAGAGGGTCTGGCCTCTAAACCATCTGTGTCAAAGAACTGACAGGGCCTGACA 7497

109689052 TTCACTGGGACCCTAGGCTAGGGGTGACAGAGAGCAAAGCAAAAGTTTGAAAGAGTATGC 109689111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7498 TTCACTGGGACCCTAGGCTAGGGGTGACAGAGAGCAAAGCAAAAGTTTGAAAGAGTATGC 7557

109689112 AGTCTGAATGAGCATGCAGACCTTTGCCACAGCTCCCCTTCCCAGCTCAGTGCAGAGCAA 109689171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7558 AGTCTGAATGAGCATGCAGACCTTTGCCACAGCTCCCCTTCCCAGCTCAGTGCAGAGCAA 7617

109689172 GTAGGAGATAAACTTCTGCTCTTAGCTTCTCTGTGAGGAGAGATGAAATGGACCACACAT 109689231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7618 GTAGGAGATAAACTTCTGCTCTTAGCTTCTCTGTGAGGAGAGATGAAATGGACCACACAT 7677

109689232 CTAGCACCCCAACTTTTCTGACAACTACTAGAAGGACTGACTCCTGACTCACCTGTCTCA 109689291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7678 CTAGCACCCCAACTTTTCTGACAACTACTAGAAGGACTGACTCCTGACTCACCTGTCTCA 7737

109689292 GGGCACTGATGGTACTTGGCACACTCTAGTCTCCTGGGGCCACCAAGAACAAGAACAGCA 109689351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7738 GGGCACTGATGGTACTTGGCACACTCTAGTCTCCTGGGGCCACCAAGAACAAGAACAGCA 7797

109689352 TTTTGGACAAACACACTGGTTTGAGAGGCACCCAGACTCTCTGACTGGGCTGTGAGGAGG 109689411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7798 TTTTGGACAAACACACTGGTTTGAGAGGCACCCAGACTCTCTGACTGGGCTGTGAGGAGG 7857

109689412 CTCATCTGTGAAGACTGAGGGAGGTGGCTGTTTTATCAAATGTGCAGAAACCAACACAGA 109689471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7858 CTCATCTGTGAAGACTGAGGGAGGTGGCTGTTTTATCAAATGTGCAGAAACCAACACAGA 7917

109689472 GAGTCAAAGACAATGAACAAACAGGAAATATGCCATAAATAAAAGAACAAGATAAATCTT 109689531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     7918 GAGTCAAAGACAATGAACAAACAGGAAATATGCCATAAATAAAAGAACAAGATAAAACTT 7977

109689532 CAGAAACTGACCCAAACAGAATGGAGATATGTGATTTACCAGACAAAAAATCAAAAGACC 109689591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7978 CAGAAACTGACCCAAACAGAATGGAGATATGTGATTTACCAGACAAAAAATCAAAAGACC 8037

109689592 TGTCACAAAGATGCTCAGTGAGGTCAGGAGAGCAATGCATGAATAAAGTGAGAATTTCAA 109689651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8038 TGTCACAAAGATGCTCAGTGAGGTCAGGAGAGCAATGCATGAATAAAGTGAGAATTTCAA 8097

109689652 CCAAAAAGGTAGAAAATATTAAAAAGTGCCAAACAGAAATCACGGAGCTGAAGAATATAA 109689711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8098 CCAAAAAGGTAGAAAATATTAAAAAGTGCCAAACAGAAATCACGGAGCTGAAGAATATAA 8157

109689712 TAAAAGAACAGAAAAATTTAATAGAGGGGTTCAATAGCAGACTAGGTGAACTGAAAGAAA 109689771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8158 TAAAAGAACAGAAAAATTTAATAGAGGGGTTCAATAGCAGACTAGGTGAACTGAAAGAAA 8217

109689772 GGATTAGTGAACTCAAGGACTGGTCATTGGCAATCATTCAGTCACAGCATTAAAAAGAAA 109689831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8218 GGATTAGTGAACTCAAGGACTGGTCATTGGCAATCATTCAGTCACAGCATTAAAAAGAAA 8277

109689832 AAAGAATGAAGGGCCAGGCACAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCTG 109689891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8278 AAAGAATGAAGGGCCAGGCACAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCTG 8337

109689892 AGGTGGGTG 109689900
          |||||||||
     8338 AGGTGGGTG 8346

EXCISED REGION

109695215 GATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATTCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATTTCAACT 109695274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8347 GATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATTCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATTTCAACT 8406

109695275 AAAAATACAAAAAAAAAAAAAAAATAGCCGGGTGTGGTGGCACACACCCGTAGTCCCAGC 109695334
          |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8407 AAAAATAC-AAAAAAAAAAAAAAATAGCCGGGTGTGGTGGCACACACCCGTAGTCCCAGC 8465

109695335 TACTTGGGAGGCTGGGGCAGGAGAATGGCATGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGC 109695394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8466 TACTTGGGAGGCTGGGGCAGGAGAATGGCATGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGC 8525

109695395 CGAGATCGCACAATTGCTTTCCAGCCTGGGCAACGGAGCGAGACTCTGTTTCAAAAAAAA 109695454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8526 CGAGATCGCACAATTGCTTTCCAGCCTGGGCAACGGAGCGAGACTCTGTTTCAAAAAAAA 8585

109695455 AGGTGACCATGTGAAGGGATGGATATGTTAAGTAGCTTGACTGGTAATCGGTTCACGATG 109695514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8586 AGGTGACCATGTGAAGGGATGGATATGTTAAGTAGCTTGACTGGTAATCGGTTCACGATG 8645

109695515 TATATGTACAGTTGACCCTTGAACAACATGCGTTTAAATTACAAGAGTCCACTTATATGG 109695574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8646 TATATGTACAGTTGACCCTTGAACAACATGCGTTTAAATTACAAGAGTCCACTTATATGG 8705

109695575 GGATTTTCTTCTGCCTCTGCCAGCAAGGCCAACCCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCCCCTCA 109695634
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8706 GGATTTTCTTCTGCCTTTGCCAGCAAGGCCAACCCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCCCCTCA 8765

109695635 ACTAAAGACGAGGAGGATGAGGACCTTTAGGGTGATCCACTTCCACTTAATGAATAGTAA 109695694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8766 ACTAAAGACGAGGAGGATGAGGACCTTTAGGGTGATCCACTTCCACTTAATGAATAGTAA 8825

109695695 ATACGGTTTCTCTTCCTTATGATTTTCTTAATATTTTCTTTTCCCTAACTTACTTTGTTG 109695754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8826 ATACGGTTTCTCTTCCTTATGATTTTCTTAATATTTTCTTTTCCCTAACTTACTTTGTTG 8885

109695755 TAAGAATGCAGTACTCAATACACGTAAGATACAAAATTTGTATGAATTGACTGTTTGTGT 109695814
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8886 TAAGAATGCAGTACACAATACACGTAAGATACAAAATTTGTATGAATTGACTGTTTGTGT 8945

109695815 TATCTGCAAGGCTTCCTGTCAACACTAGGGTATTAATAGTTAAGTTTTGGGGGAGTCAAA 109695874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8946 TATCTGCAAGGCTTCCTGTCAACACTAGGGTATTAATAGTTAAGTTTTGGGGGAGTCAAA 9005

109695875 AGTTATTTGTGGATTTTTTACTGTTCGGGGAGTTGGTGCCCCTAACCCCTTCGTTGTTAA 109695934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9006 AGTTATTTGTGGATTTTTTACTGTTCGGGGAGTTGGTGCCCCTAACCCCTTCGTTGTTAA 9065

109695935 AGAGTCAACTGTATATCAAAACATCGTGCTGTATACCTTAAATGTATATACTTTCAATTA 109695994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9066 AGAGTCAACTGTATATCAAAACATCGTGCTGTATACCTTAAATGTATATACTTTCAATTA 9125

109695995 AAATATTTTAAAAACAAACCAATAAAAAGGCACTGCTTCTGGCCCAGGGTGAGCCATCAG 109696054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9126 AAATATTTTAAAAACAAACCAATAAAAAGGCACTGCTTCTGGCCCAGGGTGAGCCATCAG 9185

109696055 ATGGCACAGCTGGCCCTGTCCGGTCCCAACCAGCAGAGGGGACTGTCAATTGAGAAGCTC 109696114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9186 ATGGCACAGCTGGCCCTGTCCGGTCCCAACCAGCAGAGGGGACTGTCAATTGAGAAGCTC 9245

109696115 CAGTGCTAAACGCTGGAATATGAAGATATGCATGGTGGGGAGACAGCACACACACACATA 109696174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9246 CAGTGCTAAACGCTGGAATATGAAGATATGCATGGTGGGGAGACAGCACACACACACATA 9305

109696175 ACACTCAAGGCCTGGTGGAGCCCACCCAGCTCAGCCTGGGTTGGGGAGGCTCCCTGGGAA 109696234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9306 ACACTCAAGGCCTGGTGGAGCCCACCCAGCTCAGCCTGGGTTGGGGAGGCTCCCTGGGAA 9365

109696235 GGGGATTCCTGATGTGAGCCTTCCAGGAGGGGTAGGAATTCTCTACACAGACAGGTGGGA 109696294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9366 GGGGATTCCTGATGTGAGCCTTCCAGGAGGGGTAGGAATTCTCTACACAGACAGGTGGGA 9425

109696295 ACTCCAGGCAGAGGGGAGGCCTGAAACACATCACAGGCCACCCTGTCCCTAGACTGCTGA 109696354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9426 ACTCCAGGCAGAGGGGAGGCCTGAAACACATCACAGGCCACCCTGTCCCTAGACTGCTGA 9485

109696355 GAGGCAGGACGGGGCTACACGGCCATGGGTGTGAGTCACCAAGGACCCTGTGCCTGCTGA 109696414
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     9486 GAGGCAGGACGGGGCTACACGGCCATGGGCGTGAGTCACCAAGGACCCTGTGCCTGCTGA 9545

109696415 GGCATGAGGACGCATTTCTGGGACGACAGAAAGACAGCAAAGGGCTTCAGACTATGGAAT 109696474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9546 GGCATGAGGACGCATTTCTGGGACGACAGAAAGACAGCAAAGGGCTTCAGACTATGGAAT 9605

109696475 ACCCGGAATAGGGCTCTAAGCATCTCCTCCGATGATTGTGGACTCAATGCAGGAAATGTG 109696534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9606 ACCCGGAATAGGGCTCTAAGCATCTCCTCCGATGATTGTGGACTCAATGCAGGAAATGTG 9665

109696535 GAGGCTTCGAGCTAGACCAGTGACAGAGGAGGGAAAAGGAGATGGGGCCCATCAATATTT 109696594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9666 GAGGCTTCGAGCTAGACCAGTGACAGAGGAGGGAAAAGGAGATGGGGCCCATCAATATTT 9725

109696595 GAAACTTGGCAAAACGCAGCAAGATTTTAATGGTTAATCAAAAATGGGAGGTGAATGGGA 109696654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9726 GAAACTTGGCAAAACGCAGCAAGATTTTAATGGTTAATCAAAAATGGGAGGTGAATGGGA 9785

109696655 GAAAGAGGAGCTGACAACCACTCCCACAATTCTGGTTTCCAGGGCGTGTTATAGCTGAGA 109696714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9786 GAAAGAGGAGCTGACAACCACTCCCACAATTCTGGTTTCCAGGGCGTGTTATAGCTGAGA 9845

109696715 GGGCAGCAGTTTGAGTGGCTGGGCAGCAGAGGCTGGGGTTGAGGCTGGGAAGTGGCGGCA 109696774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9846 GGGCAGCAGTTTGAGTGGCTGGGCAGCAGAGGCTGGGGTTGAGGCTGGGAAGTGGCGGCA 9905

Alignment time is 8.61579 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [109679900,109705214] =>     25315 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [        1,     2470] =>      2470 nucs 'mol-32-3046-120127_2470'

Score:        2405
Aligned:      2460        nucs
Identic:      2455 (100%) nucs =>       321 (100%)      2134 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [109694959,109695280] EXCISED REGION [109695283,109697420]
 second seq =>  [       11,      332] EXCISED REGION [      333,     2470]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [109695281,109695282]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [109695281,109695281] to [109695283,109695283]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

109694959 GTGAGGTGAGGTGGGATGGGGGTAATTGTGGTGATGTTGGTCAAAGGATATGAAGCTTCA 109695018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       11 GTGAGGTGAGGTGGGATGGGGGTAATTGTGGTGATGTTGGTCAAAGGATATGAAGCTTCA 70

109695019 GTTATGTAGGGTGGATAAGTTCTAGGGGTCTAAGGTAAAGCATGAGGACTATGGTTAACA 109695078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       71 GTTATGTAGGGTGGATAAGTTCTAGGGGTCTAAGGTAAAGCATGAGGACTATGGTTAACA 130

109695079 ATACCCATGGCATATTTAAAATTTGCTAAGAGAGCAGATCCTAAGTATTCTCACCACACA 109695138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      131 ATACCCATGGCATATTTAAAATTTGCTAAGAGAGCAGATCCTAAGTATTCTCACCACACA 190

109695139 CAAAAAGGTGACCATGTGGGCCGGGCGCGTTGGTGCGCGCCTGTAATCCCAGCACTTTGG 109695198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      191 CAAAAAGGTGACCATGTGGGCCGGGCGCGTTGGTGCGCGCCTGTAATCCCAGCACTTTGG 250

109695199 GAGGCCAAGGCGGGCAGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATTCTGGCTAACATGGTG 109695258
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      251 GAGGCCAAGGCGGGCAGATCATGAGGTCAGGAGATCGAGACCATTCTGGCTAACATGGTG 310

109695259 AAACCCCATTTCAACTAAAAAT 109695280
          ||||||||||||||||||||||
      311 AAACCCCATTTCAACTAAAAAT 332

EXCISED REGION

109695283 AAAAAAAAAAAAAAAATAGCCGGGTGTGGTGGCACACACCCGTAGTCCCAGCTACTTGGG 109695342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      333 AAAAAAAAAAAAAAAATAGCCGGGTGTGGTGGCACACACCCGTAGTCCCAGCTACTTGGG 392

109695343 AGGCTGGGGCAGGAGAATGGCATGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATCG 109695402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      393 AGGCTGGGGCAGGAGAATGGCATGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATCG 452

109695403 CACAATTGCTTTCCAGCCTGGGCAACGGAGCGAGACTCTGTTTCAAAAAAAAAGGTGACC 109695462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      453 CACAATTGCTTTCCAGCCTGGGCAACGGAGCGAGACTCTGTTTCAAAAAAAAAGGTGACC 512

109695463 ATGTGAAGGGATGGATATGTTAAGTAGCTTGACTGGTAATCGGTTCACGATGTATATGTA 109695522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      513 ATGTGAAGGGATGGATATGTTAAGTAGCTTGACTGGTAATCGGTTCACGATGTATATGTA 572

109695523 CAGTTGACCCTTGAACAACATGCGTTTAAATTACAAGAGTCCACTTATATGGGGATTTTC 109695582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      573 CAGTTGACCCTTGAACAACATGCGTTTAAATTACAAGAGTCCACTTATATGGGGATTTTC 632

109695583 TTCTGCCTCTGCCAGCAAGGCCAACCCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCCCCTCAACTAAAGA 109695642
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      633 TTCTGCCTTTGCCAGCAAGGCCAACCCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCCCCTCAACTAAAGA 692

109695643 CGAGGAGGATGAGGACCTTTAGGGTGATCCACTTCCACTTAATGAATAGTAAATACGGTT 109695702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      693 CGAGGAGGATGAGGACCTTTAGGGTGATCCACTTCCACTTAATGAATAGTAAATACGGTT 752

109695703 TCTCTTCCTTATGATTTTCTTAATATTTTCTTTTCCCTAACTTACTTTGTTGTAAGAATG 109695762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      753 TCTCTTCCTTATGATTTTCTTAATATTTTCTTTTCCCTAACTTACTTTGTTGTAAGAATG 812

109695763 CAGTACTCAATACACGTAAGATACAAAATTTGTATGAATTGACTGTTTGTGTTATCTGCA 109695822
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      813 CAGTACACAATACACGTAAGATACAAAATTTGTATGAATTGACTGTTTGTGTTATCTGCA 872

109695823 AGGCTTCCTGTCAACACTAGGGTATTAATAGTTAAGTTTTGGGGGAGTCAAAAGTTATTT 109695882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      873 AGGCTTCCTGTCAACACTAGGGTATTAATAGTTAAGTTTTGGGGGAGTCAAAAGTTATTT 932

109695883 GTGGATTTTTTACTGTTCGGGGAGTTGGTGCCCCTAACCCCTTCGTTGTTAAAGAGTCAA 109695942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      933 GTGGATTTTTTACTGTTCGGGGAGTTGGTGCCCCTAACCCCTTCGTTGTTAAAGAGTCAA 992

109695943 CTGTATATCAAAACATCGTGCTGTATACCTTAAATGTATATACTTTCAATTAAAATATTT 109696002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      993 CTGTATATCAAAACATCGTGCTGTATACCTTAAATGTATATACTTTCAATTAAAATATTT 1052

109696003 TAAAAACAAACCAATAAAAAGGCACTGCTTCTGGCCCAGGGTGAGCCATCAGATGGCACA 109696062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1053 TAAAAACAAACCAATAAAAAGGCACTGCTTCTGGCCCAGGGTGAGCCATCAGATGGCACA 1112

109696063 GCTGGCCCTGTCCGGTCCCAACCAGCAGAGGGGACTGTCAATTGAGAAGCTCCAGTGCTA 109696122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1113 GCTGGCCCTGTCCGGTCCCAACCAGCAGAGGGGACTGTCAATTGAGAAGCTCCAGTGCTA 1172

109696123 AACGCTGGAATATGAAGATATGCATGGTGGGGAGACAGCACACACACACATAACACTCAA 109696182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1173 AACGCTGGAATATGAAGATATGCATGGTGGGGAGACAGCACACACACACATAACACTCAA 1232

109696183 GGCCTGGTGGAGCCCACCCAGCTCAGCCTGGGTTGGGGAGGCTCCCTGGGAAGGGGATTC 109696242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1233 GGCCTGGTGGAGCCCACCCAGCTCAGCCTGGGTTGGGGAGGCTCCCTGGGAAGGGGATTC 1292

109696243 CTGATGTGAGCCTTCCAGGAGGGGTAGGAATTCTCTACACAGACAGGTGGGAACTCCAGG 109696302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1293 CTGATGTGAGCCTTCCAGGAGGGGTAGGAATTCTCTACACAGACAGGTGGGAACTCCAGG 1352

109696303 CAGAGGGGAGGCCTGAAACACATCACAGGCCACCCTGTCCCTAGACTGCTGAGAGGCAGG 109696362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1353 CAGAGGGGAGGCCTGAAACACATCACAGGCCACCCTGTCCCTAGACTGCTGAGAGGCAGG 1412

109696363 ACGGGGCTACACGGCCATGGGTGTGAGTCACCAAGGACCCTGTGCCTGCTGAGGCATGAG 109696422
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1413 ACGGGGCTACACGGCCATGGGCGTGAGTCACCAAGGACCCTGTGCCTGCTGAGGCATGAG 1472

109696423 GACGCATTTCTGGGACGACAGAAAGACAGCAAAGGGCTTCAGACTATGGAATACCCGGAA 109696482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1473 GACGCATTTCTGGGACGACAGAAAGACAGCAAAGGGCTTCAGACTATGGAATACCCGGAA 1532

109696483 TAGGGCTCTAAGCATCTCCTCCGATGATTGTGGACTCAATGCAGGAAATGTGGAGGCTTC 109696542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1533 TAGGGCTCTAAGCATCTCCTCCGATGATTGTGGACTCAATGCAGGAAATGTGGAGGCTTC 1592

109696543 GAGCTAGACCAGTGACAGAGGAGGGAAAAGGAGATGGGGCCCATCAATATTTGAAACTTG 109696602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1593 GAGCTAGACCAGTGACAGAGGAGGGAAAAGGAGATGGGGCCCATCAATATTTGAAACTTG 1652

109696603 GCAAAACGCAGCAAGATTTTAATGGTTAATCAAAAATGGGAGGTGAATGGGAGAAAGAGG 109696662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1653 GCAAAACGCAGCAAGATTTTAATGGTTAATCAAAAATGGGAGGTGAATGGGAGAAAGAGG 1712

109696663 AGCTGACAACCACTCCCACAATTCTGGTTTCCAGGGCGTGTTATAGCTGAGAGGGCAGCA 109696722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1713 AGCTGACAACCACTCCCACAATTCTGGTTTCCAGGGCGTGTTATAGCTGAGAGGGCAGCA 1772

109696723 GTTTGAGTGGCTGGGCAGCAGAGGCTGGGGTTGAGGCTGGGAAGTGGCGGCAGCAGGGGA 109696782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1773 GTTTGAGTGGCTGGGCAGCAGAGGCTGGGGTTGAGGCTGGGAAGTGGCGGCAGCAGGGGA 1832

109696783 GACTGCCCCATCAGGAGCCTGCCATAAGCGTGGGATGCAGAAGGACTGGAAGGTGCTGGA 109696842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1833 GACTGCCCCATCAGGAGCCTGCCATAAGCGTGGGATGCAGAAGGACTGGAAGGTGCTGGA 1892

109696843 GGTGATGTGGAGCTTTGGGAGAGTGTCGGAGGGATGGAATAAGTTGATGCCTGTTCCGAG 109696902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1893 GGTGATGTGGAGCTTTGGGAGAGTGTCGGAGGGATGGAATAAGTTGATGCCTGTTCCGAG 1952

109696903 ACCAAGAAGTGGGGAGCAACTGAAGAAACTGGAGAGTGGGAACCAGGTTGCAGCTGGTCT 109696962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1953 ACCAAGAAGTGGGGAGCAACTGAAGAAACTGGAGAGTGGGAACCAGGTTGCAGCTGGTCT 2012

109696963 CCAGATGCTGCACTCTCTGACAGCTCTCATCTATCTCACTGTCACCCAGGATTGGACAGG 109697022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2013 CCAGATGCTGCACTCTCTGACAGCTCTCATCTATCTCACTGTCACCCAGGATTGGACAGG 2072

109697023 ACATCTACAAATGTGCATGTGTATTTGCTATAAGGTGCATTCTTTTCCCCTGGAGATAGT 109697082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2073 ACATCTACAAATGTGCATGTGTATTTGCTATAAGGTGCATTCTTTTCCCCTGGAGATAGT 2132

109697083 GACCAACCTTTCAAGAACTATTCTTGGGTATATTTTATCATTTCTTTATTTTAGTATCTA 109697142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2133 GACCAACCTTTCAAGAACTATTCTTGGGTATATTTTATCATTTCTTTATTTTAGTATCTA 2192

109697143 TGAAGGGAACATTATAGAAGCCATGTTAACACTGGAGAAATGTCTAATATTAAAAAACCA 109697202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2193 TGAAGGGAACATTATAGAAGCCATGTTAACACTGGAGAAATGTCTAATATTAAAAAACCA 2252

109697203 GTACTCTAGCAAGTAAAATTATGTATGTGTGTAACCTCGTTCCTACATCCAGGAAATCAT 109697262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2253 GTACTCTAGCAAGTAAAATTATGTATGTGTGTAACCTCGTTCCTACATCCAGGAAATCAT 2312

109697263 TAAACTAGTAGGGGGTTGTATTAATTAGAACTCTCTGTTGCAAACAACAGACAGTCTGGA 109697322
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2313 TAAACTAGTAGGGGGTTGTATTAATCAGAACTCTCTGTTGCAAACAACAGACAGTCTGGA 2372

109697323 TGATTTAAAAGGAACAGAAATGTATTAAGAGGATATTGGATAGTTCACAAAACCTCCAGG 109697382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2373 TGATTTAAAAGGAACAGAAATGTATTAAGAGGATATTGGATAGTTCACAAAACCTCCAGG 2432

109697383 AGGGCTGGAGAGCCAGGCTGGATGCTGTGCCACTGACA 109697420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2433 AGGGCTGGAGAGCCAGGCTGGATGCTGTGCCACTGACA 2470

Alignment time is 2.20237 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [109679900,109705214] =>     25315 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [        1,     4376] =>      4376 nucs 'mol-32-30f6-141093_4376'

Score:        4270
Aligned:      4381        nucs
Identic:      4366 (100%) nucs =>      2102 (100%)      2264 (100%)
Gaps:            9 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [109687795,109689900] EXCISED REGION [109695215,109697485]
 second seq =>  [        1,     2104] EXCISED REGION [     2105,     4376]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      5314 nucs [109689901,109695214]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        28 nucs [109689901,109689928] to [109695215,109695242]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [109689900,109689900] to [109695215,109695215]
 second seq =>         1 nucs [2104,2104] to [2105,2105]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

109687795 AATTCTGTCTTGCATGTGTGAAATTTAGATACCCATTAGACATCTGCATAGAGGGCCAGG 109687854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AATTCTGTCTTGCATGTGTGAAATTTAGATACCCATTAGACATCTGCATAGAGGGCCAGG 60

109687855 CACAGTGGCTCACGGCAGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCGGATCACTTG 109687914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CACAGTGGCTCACGGCAGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCGGATCACTTG 120

109687915 AGGTTAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACTCTGTCTCTACTAAAAATA 109687974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGGTTAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACTCTGTCTCTACTAAAAATA 180

109687975 CAAAAATTATCTGGGTGTGGTGGTGTGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGG 109688034
          |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CAAAAATTATCTGGGTGTGGTGGTGTGC-CCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGG 239

109688035 CATGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGTAGAGGTTGCAGCGAGCCAAGATCACACCACTGC 109688094
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
      240 CATGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGTAGAGGTTGCAGCGAACCAAGATCACACCACTGC 299

109688095 ACTCTAGCAAGGGTGACAAAGCAAGACTCTATCTCAAAAAAAAAAAGACATTTATGTAGA 109688154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
      300 ACTCTAGCAAGGGTGACAAAGCAAGACTCTATCTCAAAAAAAAAA-GACATTTATGTAGA 358

109688155 GATGTTAGGTTGGCAGTTGGATAACAGTCTTGAGTTTCGGGGTGAGGGCAGGACCAGAAA 109688214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      359 GATGTTAGGTTGGCAGTTGGATAACAGTCTTGAGTTTCGGGGTGAGGGCAGGACCAGAAA 418

109688215 TGAAGATTTGGGATTCATTAGCATGTAGATCATATTCAGAGCCACAATAATAGATGAAAT 109688274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      419 TGAAGATTTGGGATTCATTAGCATGTAGATCATATTCAGAGCCACAATAATAGATGAAAT 478

109688275 AACTGAGGAAGAGAGCTAGAGGGGCCAAGAGCAAACACAGGAACATGCCAGCATTTAGAG 109688334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      479 AACTGAGGAAGAGAGCTAGAGGGGCCAAGAGCAAACACAGGAACATGCCAGCATTTAGAG 538

109688335 GACAATGGAGAAGGAGGAGATGGCAGAGATGTCAATAGGAGGAAAAGCAAAAGGGTGTTA 109688394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      539 GACAATGGAGAAGGAGGAGATGGCAGAGATGTCAATAGGAGGAAAAGCAAAAGGGTGTTA 598

109688395 TCATAGAAGGTGACAACAGAATATATCACAAAGAGGAATATGTTTGAATGTGTCAAATGT 109688454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      599 TCATAGAAGGTGACAACAGAATATATCACAAAGAGGAATATGTTTGAATGTGTCAAATGT 658

109688455 TGTTATCACAGGCTATAGAAGTAAACACAAAGTCTTATGGGAATACTGAGGATGAGCTGC 109688514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      659 TGTTATCACAGGCTATAGAAGTAAACACAAAGTCTTATGGGAATACTGAGGATGAGCTGC 718

109688515 CTCTAGTGTGTGTGAAACCCTGGCCAAATATTTGTTGTGGGGCCCCTGTCTATATATGCA 109688574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      719 CTCTAGTGTGTGTGAAACCCTGGCCAAATATTTGTTGTGGGGCCCCTGTCTATATATGCA 778

109688575 ATGTTATTTAAAAACATACTACATATTCTTGGGCTTATGTGGGATGTAGTGATTTATTGA 109688634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      779 ATGTTATTTAAAAACATACTACATATTCTTGGGCTTATGTGGGATGTAGTGATTTATTGA 838

109688635 TGAAGACTTAGAATACTGGGTAGGAAGAGATGCTTTTGGATTTGTTTATGAGCCAGTGAG 109688694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      839 TGAAGACTTAGAATACTGGGTAGGAAGAGATGCTTTTGGATTTGTTTATGAGCCAGTGAG 898

109688695 TGTATCTGAGGATTCTTTATCCTGTGTCTAATGTGAGTGTGTTTTCCTGAATCAGTGCAT 109688754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      899 TGTATCTGAGGATTCTTTATCCTGTGTCTAATGTGAGTGTGTTTTCCTGAATCAGTGCAT 958

109688755 CAGTGCTATTCTGGAGGCCCAAATCACACATGATTCCGTGAAAGAAACTCTGTGCTGGCC 109688814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      959 CAGTGCTATTCTGGAGGCCCAAATCACACATGATTCCGTGAAAGAAACTCTGTGCTGGCC 1018

109688815 AGAGGATGCACTCACTCTCCAGGCTTTCCTGCATGGGCCCTCACCATGGAGTCCTGGATA 109688874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1019 AGAGGATGCACTCACTCTCCAGGCTTTCCTGCATGGGCCCTCACCATGGAGTCCTGGATA 1078

109688875 CTTAGGGCATCTGGTTGACCACATGCTTGGGAGAGCACCAAAGAAGGTCCTGGTTTTCAA 109688934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1079 CTTAGGGCATCTGGTTGACCACATGCTTGGGAGAGCACCAAAGAAGGTCCTGGTTTTCAA 1138

109688935 GCCTCCAGCTTCTCCTTAGAAAGAGTTGACTACCTGTCTGGGCTCCAACTTTTCTGGCTG 109688994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1139 GCCTCCAGCTTCTCCTTAGAAAGAGTTGACTACCTGTCTGGGCTCCAACTTTTCTGGCTG 1198

109688995 CTACCAGAGGGTCTGGCCTCTAAACCATCTGTGTCAAAGAACTGACAGGGCCTGACATTC 109689054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1199 CTACCAGAGGGTCTGGCCTCTAAACCATCTGTGTCAAAGAACTGACAGGGCCTGACATTC 1258

109689055 ACTGGGACCCTAGGCTAGGGGTGACAGAGAGCAAAGCAAAAGTTTGAAAGAGTATGCAGT 109689114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1259 ACTGGGACCCTAGGCTAGGGGTGACAGAGAGCAAAGCAAAAGTTTGAAAGAGTATGCAGT 1318

109689115 CTGAATGAGCATGCAGACCTTTGCCACAGCTCCCCTTCCCAGCTCAGTGCAGAGCAAGTA 109689174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1319 CTGAATGAGCATGCAGACCTTTGCCACAGCTCCCCTTCCCAGCTCAGTGCAGAGCAAGTA 1378

109689175 GGAGATAAACTTCTGCTCTTAGCTTCTCTGTGAGGAGAGATGAAATGGACCACACATCTA 109689234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1379 GGAGATAAACTTCTGCTCTTAGCTTCTCTGTGAGGAGAGATGAAATGGACCACACATCTA 1438

109689235 GCACCCCAACTTTTCTGACAACTACTAGAAGGACTGACTCCTGACTCACCTGTCTCAGGG 109689294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1439 GCACCCCAACTTTTCTGACAACTACTAGAAGGACTGACTCCTGACTCACCTGTCTCAGGG 1498

109689295 CACTGATGGTACTTGGCACACTCTAGTCTCCTGGGGCCACCAAGAACAAGAACAGCATTT 109689354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1499 CACTGATGGTACTTGGCACACTCTAGTCTCCTGGGGCCACCAAGAACAAGAACAGCATTT 1558

109689355 TGGACAAACACACTGGTTTGAGAGGCACCCAGACTCTCTGACTGGGCTGTGAGGAGGCTC 109689414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1559 TGGACAAACACACTGGTTTGAGAGGCACCCAGACTCTCTGACTGGGCTGTGAGGAGGCTC 1618

109689415 ATCTGTGAAGACTGAGGGAGGTGGCTGTTTTATCAAATGTGCAGAAACCAACACAGAGAG 109689474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1619 ATCTGTGAAGACTGAGGGAGGTGGCTGTTTTATCAAATGTGCAGAAACCAACACAGAGAG 1678

109689475 TCAAAGACAATGAACAAACAGGAAATATGCCATAAATAAAAGAACAAGATAAATCTTCAG 109689534
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     1679 TCAAAGACAATGAACAAACAGGAAATATGCCATAAATAAAAGAACAAGATAAAACTTCAG 1738

109689535 AAACTGACCCAAACAGAATGGAGATATGTGATTTACCAGACAAAAAATCAAAAGACCTGT 109689594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1739 AAACTGACCCAAACAGAATGGAGATATGTGATTTACCAGACAAAAAATCAAAAGACCTGT 1798

109689595 CACAAAGATGCTCAGTGAGGTCAGGAGAGCAATGCATGAATAAAGTGAGAATTTCAACCA 109689654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1799 CACAAAGATGCTCAGTGAGGTCAGGAGAGCAATGCATGAATAAAGTGAGAATTTCAACCA 1858

109689655 AAAAGGTAGAAAATATTAAAAAGTGCCAAACAGAAATCACGGAGCTGAAGAATATAATAA 109689714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 AAAAGGTAGAAAATATTAAAAAGTGCCAAACAGAAATCACGGAGCTGAAGAATATAATAA 1918

109689715 AAGAACAGAAAAATTTAATAGAGGGGTTCAATAGCAGACTAGGTGAACTGAAAGAAAGGA 109689774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 AAGAACAGAAAAATTTAATAGAGGGGTTCAATAGCAGACTAGGTGAACTGAAAGAAAGGA 1978

109689775 TTAGTGAACTCAAGGACTGGTCATTGGCAATCATTCAGTCACAGCATTAAAAAGAAAAAA 109689834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 TTAGTGAACTCAAGGACTGGTCATTGGCAATCATTCAGTCACAGCATTAAAAAGAAAAAA 2038

109689835 GAATGAAGGGCCAGGCACAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCTGAGG 109689894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 GAATGAAGGGCCAGGCACAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCTGAGG 2098

109689895 TGGGTG 109689900
          ||||||
     2099 TGGGTG 2104

EXCISED REGION

109695215 GATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATTCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATTTCAACT 109695274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2105 GATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATTCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATTTCAACT 2164

109695275 AAAAATAC----AAAAAAAAAAAAAAAATAGCCGGGTGTGGTGGCACACACCCGTAGTCC 109695330
          |||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2165 AAAAA---AAAAAAAAAAAAAAAAAAAATAGCCGGGTGTGGTGGCACACACCCGTAGTCC 2221

109695331 CAGCTACTTGGGAGGCTGGGGCAGGAGAATGGCATGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGT 109695390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2222 CAGCTACTTGGGAGGCTGGGGCAGGAGAATGGCATGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGT 2281

109695391 GAGCCGAGATCGCACAATTGCTTTCCAGCCTGGGCAACGGAGCGAGACTCTGTTTCAAAA 109695450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2282 GAGCCGAGATCGCACAATTGCTTTCCAGCCTGGGCAACGGAGCGAGACTCTGTTTCAAAA 2341

109695451 AAAAAGGTGACCATGTGAAGGGATGGATATGTTAAGTAGCTTGACTGGTAATCGGTTCAC 109695510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2342 AAAAAGGTGACCATGTGAAGGGATGGATATGTTAAGTAGCTTGACTGGTAATCGGTTCAC 2401

109695511 GATGTATATGTACAGTTGACCCTTGAACAACATGCGTTTAAATTACAAGAGTCCACTTAT 109695570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2402 GATGTATATGTACAGTTGACCCTTGAACAACATGCGTTTAAATTACAAGAGTCCACTTAT 2461

109695571 ATGGGGATTTTCTTCTGCCTCTGCCAGCAAGGCCAACCCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCCC 109695630
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2462 ATGGGGATTTTCTTCTGCCTTTGCCAGCAAGGCCAACCCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCCC 2521

109695631 CTCAACTAAAGACGAGGAGGATGAGGACCTTTAGGGTGATCCACTTCCACTTAATGAATA 109695690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2522 CTCAACTAAAGACGAGGAGGATGAGGACCTTTAGGGTGATCCACTTCCACTTAATGAATA 2581

109695691 GTAAATACGGTTTCTCTTCCTTATGATTTTCTTAATATTTTCTTTTCCCTAACTTACTTT 109695750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2582 GTAAATACGGTTTCTCTTCCTTATGATTTTCTTAATATTTTCTTTTCCCTAACTTACTTT 2641

109695751 GTTGTAAGAATGCAGTACTCAATACACGTAAGATACAAAATTTGTATGAATTGACTGTTT 109695810
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2642 GTTGTAAGAATGCAGTACACAATACACGTAAGATACAAAATTTGTATGAATTGACTGTTT 2701

109695811 GTGTTATCTGCAAGGCTTCCTGTCAACACTAGGGTATTAATAGTTAAGTTTTGGGGGAGT 109695870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2702 GTGTTATCTGCAAGGCTTCCTGTCAACACTAGGGTATTAATAGTTAAGTTTTGGGGGAGT 2761

109695871 CAAAAGTTATTTGTGGATTTTTTACTGTTCGGGGAGTTGGTGCCCCTAACCCCTTCGTTG 109695930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2762 CAAAAGTTATTTGTGGATTTTTTACTGTTCGGGGAGTTGGTGCCCCTAACCCCTTCGTTG 2821

109695931 TTAAAGAGTCAACTGTATATCAAAACATCGTGCTGTATACCTTAAATGTATATACTTTCA 109695990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2822 TTAAAGAGTCAACTGTATATCAAAACATCGTGCTGTATACCTTAAATGTATATACTTTCA 2881

109695991 ATTAAAATATTTTAAAAACAAACCAATAAAAAGGCACTGCTTCTGGCCCAGGGTGAGCCA 109696050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2882 ATTAAAATATTTTAAAAACAAACCAATAAAAAGGCACTGCTTCTGGCCCAGGGTGAGCCA 2941

109696051 TCAGATGGCACAGCTGGCCCTGTCCGGTCCCAACCAGCAGAGGGGACTGTCAATTGAGAA 109696110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2942 TCAGATGGCACAGCTGGCCCTGTCCGGTCCCAACCAGCAGAGGGGACTGTCAATTGAGAA 3001

109696111 GCTCCAGTGCTAAACGCTGGAATATGAAGATATGCATGGTGGGGAGACAGCACACACACA 109696170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3002 GCTCCAGTGCTAAACGCTGGAATATGAAGATATGCATGGTGGGGAGACAGCACACACACA 3061

109696171 CATAACACTCAAGGCCTGGTGGAGCCCACCCAGCTCAGCCTGGGTTGGGGAGGCTCCCTG 109696230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3062 CATAACACTCAAGGCCTGGTGGAGCCCACCCAGCTCAGCCTGGGTTGGGGAGGCTCCCTG 3121

109696231 GGAAGGGGATTCCTGATGTGAGCCTTCCAGGAGGGGTAGGAATTCTCTACACAGACAGGT 109696290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3122 GGAAGGGGATTCCTGATGTGAGCCTTCCAGGAGGGGTAGGAATTCTCTACACAGACAGGT 3181

109696291 GGGAACTCCAGGCAGAGGGGAGGCCTGAAACACATCACAGGCCACCCTGTCCCTAGACTG 109696350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3182 GGGAACTCCAGGCAGAGGGGAGGCCTGAAACACATCACAGGCCACCCTGTCCCTAGACTG 3241

109696351 CTGAGAGGCAGGACGGGGCTACACGGCCATGGGTGTGAGTCACCAAGGACCCTGTGCCTG 109696410
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     3242 CTGAGAGGCAGGACGGGGCTACACGGCCATGGGCGTGAGTCACCAAGGACCCTGTGCCTG 3301

109696411 CTGAGGCATGAGGACGCATTTCTGGGACGACAGAAAGACAGCAAAGGGCTTCAGACTATG 109696470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3302 CTGAGGCATGAGGACGCATTTCTGGGACGACAGAAAGACAGCAAAGGGCTTCAGACTATG 3361

109696471 GAATACCCGGAATAGGGCTCTAAGCATCTCCTCCGATGATTGTGGACTCAATGCAGGAAA 109696530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3362 GAATACCCGGAATAGGGCTCTAAGCATCTCCTCCGATGATTGTGGACTCAATGCAGGAAA 3421

109696531 TGTGGAGGCTTCGAGCTAGACCAGTGACAGAGGAGGGAAAAGGAGATGGGGCCCATCAAT 109696590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3422 TGTGGAGGCTTCGAGCTAGACCAGTGACAGAGGAGGGAAAAGGAGATGGGGCCCATCAAT 3481

109696591 ATTTGAAACTTGGCAAAACGCAGCAAGATTTTAATGGTTAATCAAAAATGGGAGGTGAAT 109696650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3482 ATTTGAAACTTGGCAAAACGCAGCAAGATTTTAATGGTTAATCAAAAATGGGAGGTGAAT 3541

109696651 GGGAGAAAGAGGAGCTGACAACCACTCCCACAATTCTGGTTTCCAGGGCGTGTTATAGCT 109696710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3542 GGGAGAAAGAGGAGCTGACAACCACTCCCACAATTCTGGTTTCCAGGGCGTGTTATAGCT 3601

109696711 GAGAGGGCAGCAGTTTGAGTGGCTGGGCAGCAGAGGCTGGGGTTGAGGCTGGGAAGTGGC 109696770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3602 GAGAGGGCAGCAGTTTGAGTGGCTGGGCAGCAGAGGCTGGGGTTGAGGCTGGGAAGTGGC 3661

109696771 GGCAGCAGGGGAGACTGCCCCATCAGGAGCCTGCCATAAGCGTGGGATGCAGAAGGACTG 109696830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3662 GGCAGCAGGGGAGACTGCCCCATCAGGAGCCTGCCATAAGCGTGGGATGCAGAAGGACTG 3721

109696831 GAAGGTGCTGGAGGTGATGTGGAGCTTTGGGAGAGTGTCGGAGGGATGGAATAAGTTGAT 109696890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3722 GAAGGTGCTGGAGGTGATGTGGAGCTTTGGGAGAGTGTCGGAGGGATGGAATAAGTTGAT 3781

109696891 GCCTGTTCCGAGACCAAGAAGTGGGGAGCAACTGAAGAAACTGGAGAGTGGGAACCAGGT 109696950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3782 GCCTGTTCCGAGACCAAGAAGTGGGGAGCAACTGAAGAAACTGGAGAGTGGGAACCAGGT 3841

109696951 TGCAGCTGGTCTCCAGATGCTGCACTCTCTGACAGCTCTCATCTATCTCACTGTCACCCA 109697010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3842 TGCAGCTGGTCTCCAGATGCTGCACTCTCTGACAGCTCTCATCTATCTCACTGTCACCCA 3901

109697011 GGATTGGACAGGACATCTACAAATGTGCATGTGTATTTGCTATAAGGTGCATTCTTTTCC 109697070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3902 GGATTGGACAGGACATCTACAAATGTGCATGTGTATTTGCTATAAGGTGCATTCTTTTCC 3961

109697071 CCTGGAGATAGTGACCAACCTTTCAAGAACTATTCTTGGGTATATTTTATCATTTCTTTA 109697130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3962 CCTGGAGATAGTGACCAACCTTTCAAGAACTATTCTTGGGTATATTTTATCATTTCTTTA 4021

109697131 TTTTAGTATCTATGAAGGGAACATTATAGAAGCCATGTTAACACTGGAGAAATGTCTAAT 109697190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4022 TTTTAGTATCTATGAAGGGAACATTATAGAAGCCATGTTAACACTGGAGAAATGTCTAAT 4081

109697191 ATTAAAAAACCAGTACTCTAGCAAGTAAAATTATGTATGTGTGTAACCTCGTTCCTACAT 109697250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4082 ATTAAAAAACCAGTACTCTAGCAAGTAAAATTATGTATGTGTGTAACCTCGTTCCTACAT 4141

109697251 CCAGGAAATCATTAAACTAGTAGGGGGTTGTATTAATTAGAACTCTCTGTTGCAAACAAC 109697310
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     4142 CCAGGAAATCATTAAACTAGTAGGGGGTTGTATTAATCAGAACTCTCTGTTGCAAACAAC 4201

109697311 AGACAGTCTGGATGATTTAAAAGGAACAGAAATGTATTAAGAGGATATTGGATAGTTCAC 109697370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4202 AGACAGTCTGGATGATTTAAAAGGAACAGAAATGTATTAAGAGGATATTGGATAGTTCAC 4261

109697371 AAAACCTCCAGGAGGGCTGGAGAGCCAGGCTGGATGCTGTGCCACTGACACAACATTCAA 109697430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4262 AAAACCTCCAGGAGGGCTGGAGAGCCAGGCTGGATGCTGTGCCACTGACACAACATTCAA 4321

109697431 AACTCACAGATTCTTCTGCTGCCATCCACTATGCTAGCTACCAGCCATGCATGGC 109697485
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4322 AACTCACAGATTCTTCTGCTGCCATCCACTATGCTAGCTACCAGCCATGCATGGC 4376

Alignment time is 3.88915 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [109679900,109705214] =>     25315 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [        1,     2291] =>      2291 nucs 'mol-32-30f6-141093_2291'

Score:        2229
Aligned:      2296        nucs
Identic:      2285 (100%) nucs =>      2102 (100%)       183 ( 96%)
Gaps:            9 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [109687795,109689900] EXCISED REGION [109695215,109695400]
 second seq =>  [        1,     2104] EXCISED REGION [     2105,     2291]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      5314 nucs [109689901,109695214]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        28 nucs [109689901,109689928] to [109695215,109695242]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [109689900,109689900] to [109695215,109695215]
 second seq =>         1 nucs [2104,2104] to [2105,2105]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

109687795 AATTCTGTCTTGCATGTGTGAAATTTAGATACCCATTAGACATCTGCATAGAGGGCCAGG 109687854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AATTCTGTCTTGCATGTGTGAAATTTAGATACCCATTAGACATCTGCATAGAGGGCCAGG 60

109687855 CACAGTGGCTCACGGCAGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCGGATCACTTG 109687914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CACAGTGGCTCACGGCAGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCGGATCACTTG 120

109687915 AGGTTAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACTCTGTCTCTACTAAAAATA 109687974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGGTTAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACTCTGTCTCTACTAAAAATA 180

109687975 CAAAAATTATCTGGGTGTGGTGGTGTGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGG 109688034
          |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CAAAAATTATCTGGGTGTGGTGGTGTGC-CCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGG 239

109688035 CATGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGTAGAGGTTGCAGCGAGCCAAGATCACACCACTGC 109688094
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
      240 CATGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGTAGAGGTTGCAGCGAACCAAGATCACACCACTGC 299

109688095 ACTCTAGCAAGGGTGACAAAGCAAGACTCTATCTCAAAAAAAAAAAGACATTTATGTAGA 109688154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
      300 ACTCTAGCAAGGGTGACAAAGCAAGACTCTATCTCAAAAAAAAAA-GACATTTATGTAGA 358

109688155 GATGTTAGGTTGGCAGTTGGATAACAGTCTTGAGTTTCGGGGTGAGGGCAGGACCAGAAA 109688214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      359 GATGTTAGGTTGGCAGTTGGATAACAGTCTTGAGTTTCGGGGTGAGGGCAGGACCAGAAA 418

109688215 TGAAGATTTGGGATTCATTAGCATGTAGATCATATTCAGAGCCACAATAATAGATGAAAT 109688274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      419 TGAAGATTTGGGATTCATTAGCATGTAGATCATATTCAGAGCCACAATAATAGATGAAAT 478

109688275 AACTGAGGAAGAGAGCTAGAGGGGCCAAGAGCAAACACAGGAACATGCCAGCATTTAGAG 109688334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      479 AACTGAGGAAGAGAGCTAGAGGGGCCAAGAGCAAACACAGGAACATGCCAGCATTTAGAG 538

109688335 GACAATGGAGAAGGAGGAGATGGCAGAGATGTCAATAGGAGGAAAAGCAAAAGGGTGTTA 109688394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      539 GACAATGGAGAAGGAGGAGATGGCAGAGATGTCAATAGGAGGAAAAGCAAAAGGGTGTTA 598

109688395 TCATAGAAGGTGACAACAGAATATATCACAAAGAGGAATATGTTTGAATGTGTCAAATGT 109688454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      599 TCATAGAAGGTGACAACAGAATATATCACAAAGAGGAATATGTTTGAATGTGTCAAATGT 658

109688455 TGTTATCACAGGCTATAGAAGTAAACACAAAGTCTTATGGGAATACTGAGGATGAGCTGC 109688514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      659 TGTTATCACAGGCTATAGAAGTAAACACAAAGTCTTATGGGAATACTGAGGATGAGCTGC 718

109688515 CTCTAGTGTGTGTGAAACCCTGGCCAAATATTTGTTGTGGGGCCCCTGTCTATATATGCA 109688574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      719 CTCTAGTGTGTGTGAAACCCTGGCCAAATATTTGTTGTGGGGCCCCTGTCTATATATGCA 778

109688575 ATGTTATTTAAAAACATACTACATATTCTTGGGCTTATGTGGGATGTAGTGATTTATTGA 109688634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      779 ATGTTATTTAAAAACATACTACATATTCTTGGGCTTATGTGGGATGTAGTGATTTATTGA 838

109688635 TGAAGACTTAGAATACTGGGTAGGAAGAGATGCTTTTGGATTTGTTTATGAGCCAGTGAG 109688694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      839 TGAAGACTTAGAATACTGGGTAGGAAGAGATGCTTTTGGATTTGTTTATGAGCCAGTGAG 898

109688695 TGTATCTGAGGATTCTTTATCCTGTGTCTAATGTGAGTGTGTTTTCCTGAATCAGTGCAT 109688754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      899 TGTATCTGAGGATTCTTTATCCTGTGTCTAATGTGAGTGTGTTTTCCTGAATCAGTGCAT 958

109688755 CAGTGCTATTCTGGAGGCCCAAATCACACATGATTCCGTGAAAGAAACTCTGTGCTGGCC 109688814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      959 CAGTGCTATTCTGGAGGCCCAAATCACACATGATTCCGTGAAAGAAACTCTGTGCTGGCC 1018

109688815 AGAGGATGCACTCACTCTCCAGGCTTTCCTGCATGGGCCCTCACCATGGAGTCCTGGATA 109688874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1019 AGAGGATGCACTCACTCTCCAGGCTTTCCTGCATGGGCCCTCACCATGGAGTCCTGGATA 1078

109688875 CTTAGGGCATCTGGTTGACCACATGCTTGGGAGAGCACCAAAGAAGGTCCTGGTTTTCAA 109688934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1079 CTTAGGGCATCTGGTTGACCACATGCTTGGGAGAGCACCAAAGAAGGTCCTGGTTTTCAA 1138

109688935 GCCTCCAGCTTCTCCTTAGAAAGAGTTGACTACCTGTCTGGGCTCCAACTTTTCTGGCTG 109688994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1139 GCCTCCAGCTTCTCCTTAGAAAGAGTTGACTACCTGTCTGGGCTCCAACTTTTCTGGCTG 1198

109688995 CTACCAGAGGGTCTGGCCTCTAAACCATCTGTGTCAAAGAACTGACAGGGCCTGACATTC 109689054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1199 CTACCAGAGGGTCTGGCCTCTAAACCATCTGTGTCAAAGAACTGACAGGGCCTGACATTC 1258

109689055 ACTGGGACCCTAGGCTAGGGGTGACAGAGAGCAAAGCAAAAGTTTGAAAGAGTATGCAGT 109689114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1259 ACTGGGACCCTAGGCTAGGGGTGACAGAGAGCAAAGCAAAAGTTTGAAAGAGTATGCAGT 1318

109689115 CTGAATGAGCATGCAGACCTTTGCCACAGCTCCCCTTCCCAGCTCAGTGCAGAGCAAGTA 109689174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1319 CTGAATGAGCATGCAGACCTTTGCCACAGCTCCCCTTCCCAGCTCAGTGCAGAGCAAGTA 1378

109689175 GGAGATAAACTTCTGCTCTTAGCTTCTCTGTGAGGAGAGATGAAATGGACCACACATCTA 109689234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1379 GGAGATAAACTTCTGCTCTTAGCTTCTCTGTGAGGAGAGATGAAATGGACCACACATCTA 1438

109689235 GCACCCCAACTTTTCTGACAACTACTAGAAGGACTGACTCCTGACTCACCTGTCTCAGGG 109689294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1439 GCACCCCAACTTTTCTGACAACTACTAGAAGGACTGACTCCTGACTCACCTGTCTCAGGG 1498

109689295 CACTGATGGTACTTGGCACACTCTAGTCTCCTGGGGCCACCAAGAACAAGAACAGCATTT 109689354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1499 CACTGATGGTACTTGGCACACTCTAGTCTCCTGGGGCCACCAAGAACAAGAACAGCATTT 1558

109689355 TGGACAAACACACTGGTTTGAGAGGCACCCAGACTCTCTGACTGGGCTGTGAGGAGGCTC 109689414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1559 TGGACAAACACACTGGTTTGAGAGGCACCCAGACTCTCTGACTGGGCTGTGAGGAGGCTC 1618

109689415 ATCTGTGAAGACTGAGGGAGGTGGCTGTTTTATCAAATGTGCAGAAACCAACACAGAGAG 109689474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1619 ATCTGTGAAGACTGAGGGAGGTGGCTGTTTTATCAAATGTGCAGAAACCAACACAGAGAG 1678

109689475 TCAAAGACAATGAACAAACAGGAAATATGCCATAAATAAAAGAACAAGATAAATCTTCAG 109689534
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     1679 TCAAAGACAATGAACAAACAGGAAATATGCCATAAATAAAAGAACAAGATAAAACTTCAG 1738

109689535 AAACTGACCCAAACAGAATGGAGATATGTGATTTACCAGACAAAAAATCAAAAGACCTGT 109689594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1739 AAACTGACCCAAACAGAATGGAGATATGTGATTTACCAGACAAAAAATCAAAAGACCTGT 1798

109689595 CACAAAGATGCTCAGTGAGGTCAGGAGAGCAATGCATGAATAAAGTGAGAATTTCAACCA 109689654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1799 CACAAAGATGCTCAGTGAGGTCAGGAGAGCAATGCATGAATAAAGTGAGAATTTCAACCA 1858

109689655 AAAAGGTAGAAAATATTAAAAAGTGCCAAACAGAAATCACGGAGCTGAAGAATATAATAA 109689714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 AAAAGGTAGAAAATATTAAAAAGTGCCAAACAGAAATCACGGAGCTGAAGAATATAATAA 1918

109689715 AAGAACAGAAAAATTTAATAGAGGGGTTCAATAGCAGACTAGGTGAACTGAAAGAAAGGA 109689774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 AAGAACAGAAAAATTTAATAGAGGGGTTCAATAGCAGACTAGGTGAACTGAAAGAAAGGA 1978

109689775 TTAGTGAACTCAAGGACTGGTCATTGGCAATCATTCAGTCACAGCATTAAAAAGAAAAAA 109689834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 TTAGTGAACTCAAGGACTGGTCATTGGCAATCATTCAGTCACAGCATTAAAAAGAAAAAA 2038

109689835 GAATGAAGGGCCAGGCACAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCTGAGG 109689894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 GAATGAAGGGCCAGGCACAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCTGAGG 2098

109689895 TGGGTG 109689900
          ||||||
     2099 TGGGTG 2104

EXCISED REGION

109695215 GATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATTCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATTTCAACT 109695274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2105 GATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATTCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATTTCAACT 2164

109695275 AAAAATAC----AAAAAAAAAAAAAAAATAGCCGGGTGTGGTGGCACACACCCGTAGTCC 109695330
          |||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2165 AAAAA---AAAAAAAAAAAAAAAAAAAATAGCCGGGTGTGGTGGCACACACCCGTAGTCC 2221

109695331 CAGCTACTTGGGAGGCTGGGGCAGGAGAATGGCATGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGT 109695390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2222 CAGCTACTTGGGAGGCTGGGGCAGGAGAATGGCATGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGT 2281

109695391 GAGCCGAGAT 109695400
          ||||||||||
     2282 GAGCCGAGAT 2291

Alignment time is 2.02803 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [109679900,109705214] =>     25315 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [        1,     4098] =>      4098 nucs 'mol-32-314e-096161_4098'

Score:        4021
Aligned:      4098        nucs
Identic:      4091 (100%) nucs =>       349 (100%)      3742 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [109694769,109695117] EXCISED REGION [109695119,109698867]
 second seq =>  [        1,      349] EXCISED REGION [      351,     4098]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [109695118,109695118]
 second seq =>         1 nucs [350,350]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [109695283,109695283]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [109695118,109695118] to [109695119,109695119]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

109694769 ATATGCAGTGGAGTATTATTCAGCCTTAAAAAAGAAGGAAGTTATGCCATTTGCAACAAC 109694828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATATGCAGTGGAGTATTATTCAGCCTTAAAAAAGAAGGAAGTTATGCCATTTGCAACAAC 60

109694829 GTGGGACATTATGCTAAGTGAAAAAGCCAGACACAAAAAGCAAATATCATATGATCTCAC 109694888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTGGGACATTATGCTAAGTGAAAAAGCCAGACACAAAAAGCAAATATCATATGATCTCAC 120

109694889 TTGTTTGTAGAGTCAATAAAAGATGAATACATAGAAGCAGAGAGTAGAATAATGGTTACC 109694948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTGTTTGTAGAGTCAATAAAAGATGAATACATAGAAGCAGAGAGTAGAATAATGGTTACC 180

109694949 AGGGACAGGGGTGAGGTGAGGTGGGATGGGGGTAATTGTGGTGATGTTGGTCAAAGGATA 109695008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGGGACAGGGGTGAGGTGAGGTGGGATGGGGGTAATTGTGGTGATGTTGGTCAAAGGATA 240

109695009 TGAAGCTTCAGTTATGTAGGGTGGATAAGTTCTAGGGGTCTAAGGTAAAGCATGAGGACT 109695068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGAAGCTTCAGTTATGTAGGGTGGATAAGTTCTAGGGGTCTAAGGTAAAGCATGAGGACT 300

109695069 ATGGTTAACAATACCCATGGCATATTTAAAATTTGCTAAGAGAGCAGAT 109695117
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATGGTTAACAATACCCATGGCATATTTAAAATTTGCTAAGAGAGCAGAT 349

EXCISED REGION

109695119 CTAAGTATTCTCACCACACACAAAAAGGTGACCATGTGGGCCGGGCGCGTTGGTGCGCGC 109695178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      351 CTAAGTATTCTCACCACACACAAAAAGGTGACCATGTGGGCCGGGCGCGTTGGTGCGCGC 410

109695179 CTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGGCAGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGA 109695238
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
      411 CTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGGCAGATCATGAGGTCAGGAGATCGAGA 470

109695239 CCATTCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATTTCAACTAAAAATACAAAAAAAAAAAAAAAA 109695298
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
      471 CCATTCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATTTCAACTAAAAATAC-AAAAAAAAAAAAAAA 529

109695299 TAGCCGGGTGTGGTGGCACACACCCGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGGGGCAGGAGA 109695358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      530 TAGCCGGGTGTGGTGGCACACACCCGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGGGGCAGGAGA 589

109695359 ATGGCATGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATCGCACAATTGCTTTCCAG 109695418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      590 ATGGCATGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATCGCACAATTGCTTTCCAG 649

109695419 CCTGGGCAACGGAGCGAGACTCTGTTTCAAAAAAAAAGGTGACCATGTGAAGGGATGGAT 109695478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      650 CCTGGGCAACGGAGCGAGACTCTGTTTCAAAAAAAAAGGTGACCATGTGAAGGGATGGAT 709

109695479 ATGTTAAGTAGCTTGACTGGTAATCGGTTCACGATGTATATGTACAGTTGACCCTTGAAC 109695538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      710 ATGTTAAGTAGCTTGACTGGTAATCGGTTCACGATGTATATGTACAGTTGACCCTTGAAC 769

109695539 AACATGCGTTTAAATTACAAGAGTCCACTTATATGGGGATTTTCTTCTGCCTCTGCCAGC 109695598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
      770 AACATGCGTTTAAATTACAAGAGTCCACTTATATGGGGATTTTCTTCTGCCTTTGCCAGC 829

109695599 AAGGCCAACCCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCCCCTCAACTAAAGACGAGGAGGATGAGGAC 109695658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      830 AAGGCCAACCCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCCCCTCAACTAAAGACGAGGAGGATGAGGAC 889

109695659 CTTTAGGGTGATCCACTTCCACTTAATGAATAGTAAATACGGTTTCTCTTCCTTATGATT 109695718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      890 CTTTAGGGTGATCCACTTCCACTTAATGAATAGTAAATACGGTTTCTCTTCCTTATGATT 949

109695719 TTCTTAATATTTTCTTTTCCCTAACTTACTTTGTTGTAAGAATGCAGTACTCAATACACG 109695778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
      950 TTCTTAATATTTTCTTTTCCCTAACTTACTTTGTTGTAAGAATGCAGTACACAATACACG 1009

109695779 TAAGATACAAAATTTGTATGAATTGACTGTTTGTGTTATCTGCAAGGCTTCCTGTCAACA 109695838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1010 TAAGATACAAAATTTGTATGAATTGACTGTTTGTGTTATCTGCAAGGCTTCCTGTCAACA 1069

109695839 CTAGGGTATTAATAGTTAAGTTTTGGGGGAGTCAAAAGTTATTTGTGGATTTTTTACTGT 109695898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1070 CTAGGGTATTAATAGTTAAGTTTTGGGGGAGTCAAAAGTTATTTGTGGATTTTTTACTGT 1129

109695899 TCGGGGAGTTGGTGCCCCTAACCCCTTCGTTGTTAAAGAGTCAACTGTATATCAAAACAT 109695958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1130 TCGGGGAGTTGGTGCCCCTAACCCCTTCGTTGTTAAAGAGTCAACTGTATATCAAAACAT 1189

109695959 CGTGCTGTATACCTTAAATGTATATACTTTCAATTAAAATATTTTAAAAACAAACCAATA 109696018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1190 CGTGCTGTATACCTTAAATGTATATACTTTCAATTAAAATATTTTAAAAACAAACCAATA 1249

109696019 AAAAGGCACTGCTTCTGGCCCAGGGTGAGCCATCAGATGGCACAGCTGGCCCTGTCCGGT 109696078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1250 AAAAGGCACTGCTTCTGGCCCAGGGTGAGCCATCAGATGGCACAGCTGGCCCTGTCCGGT 1309

109696079 CCCAACCAGCAGAGGGGACTGTCAATTGAGAAGCTCCAGTGCTAAACGCTGGAATATGAA 109696138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1310 CCCAACCAGCAGAGGGGACTGTCAATTGAGAAGCTCCAGTGCTAAACGCTGGAATATGAA 1369

109696139 GATATGCATGGTGGGGAGACAGCACACACACACATAACACTCAAGGCCTGGTGGAGCCCA 109696198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1370 GATATGCATGGTGGGGAGACAGCACACACACACATAACACTCAAGGCCTGGTGGAGCCCA 1429

109696199 CCCAGCTCAGCCTGGGTTGGGGAGGCTCCCTGGGAAGGGGATTCCTGATGTGAGCCTTCC 109696258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1430 CCCAGCTCAGCCTGGGTTGGGGAGGCTCCCTGGGAAGGGGATTCCTGATGTGAGCCTTCC 1489

109696259 AGGAGGGGTAGGAATTCTCTACACAGACAGGTGGGAACTCCAGGCAGAGGGGAGGCCTGA 109696318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1490 AGGAGGGGTAGGAATTCTCTACACAGACAGGTGGGAACTCCAGGCAGAGGGGAGGCCTGA 1549

109696319 AACACATCACAGGCCACCCTGTCCCTAGACTGCTGAGAGGCAGGACGGGGCTACACGGCC 109696378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1550 AACACATCACAGGCCACCCTGTCCCTAGACTGCTGAGAGGCAGGACGGGGCTACACGGCC 1609

109696379 ATGGGTGTGAGTCACCAAGGACCCTGTGCCTGCTGAGGCATGAGGACGCATTTCTGGGAC 109696438
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1610 ATGGGCGTGAGTCACCAAGGACCCTGTGCCTGCTGAGGCATGAGGACGCATTTCTGGGAC 1669

109696439 GACAGAAAGACAGCAAAGGGCTTCAGACTATGGAATACCCGGAATAGGGCTCTAAGCATC 109696498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1670 GACAGAAAGACAGCAAAGGGCTTCAGACTATGGAATACCCGGAATAGGGCTCTAAGCATC 1729

109696499 TCCTCCGATGATTGTGGACTCAATGCAGGAAATGTGGAGGCTTCGAGCTAGACCAGTGAC 109696558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1730 TCCTCCGATGATTGTGGACTCAATGCAGGAAATGTGGAGGCTTCGAGCTAGACCAGTGAC 1789

109696559 AGAGGAGGGAAAAGGAGATGGGGCCCATCAATATTTGAAACTTGGCAAAACGCAGCAAGA 109696618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1790 AGAGGAGGGAAAAGGAGATGGGGCCCATCAATATTTGAAACTTGGCAAAACGCAGCAAGA 1849

109696619 TTTTAATGGTTAATCAAAAATGGGAGGTGAATGGGAGAAAGAGGAGCTGACAACCACTCC 109696678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1850 TTTTAATGGTTAATCAAAAATGGGAGGTGAATGGGAGAAAGAGGAGCTGACAACCACTCC 1909

109696679 CACAATTCTGGTTTCCAGGGCGTGTTATAGCTGAGAGGGCAGCAGTTTGAGTGGCTGGGC 109696738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1910 CACAATTCTGGTTTCCAGGGCGTGTTATAGCTGAGAGGGCAGCAGTTTGAGTGGCTGGGC 1969

109696739 AGCAGAGGCTGGGGTTGAGGCTGGGAAGTGGCGGCAGCAGGGGAGACTGCCCCATCAGGA 109696798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1970 AGCAGAGGCTGGGGTTGAGGCTGGGAAGTGGCGGCAGCAGGGGAGACTGCCCCATCAGGA 2029

109696799 GCCTGCCATAAGCGTGGGATGCAGAAGGACTGGAAGGTGCTGGAGGTGATGTGGAGCTTT 109696858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2030 GCCTGCCATAAGCGTGGGATGCAGAAGGACTGGAAGGTGCTGGAGGTGATGTGGAGCTTT 2089

109696859 GGGAGAGTGTCGGAGGGATGGAATAAGTTGATGCCTGTTCCGAGACCAAGAAGTGGGGAG 109696918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2090 GGGAGAGTGTCGGAGGGATGGAATAAGTTGATGCCTGTTCCGAGACCAAGAAGTGGGGAG 2149

109696919 CAACTGAAGAAACTGGAGAGTGGGAACCAGGTTGCAGCTGGTCTCCAGATGCTGCACTCT 109696978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2150 CAACTGAAGAAACTGGAGAGTGGGAACCAGGTTGCAGCTGGTCTCCAGATGCTGCACTCT 2209

109696979 CTGACAGCTCTCATCTATCTCACTGTCACCCAGGATTGGACAGGACATCTACAAATGTGC 109697038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2210 CTGACAGCTCTCATCTATCTCACTGTCACCCAGGATTGGACAGGACATCTACAAATGTGC 2269

109697039 ATGTGTATTTGCTATAAGGTGCATTCTTTTCCCCTGGAGATAGTGACCAACCTTTCAAGA 109697098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2270 ATGTGTATTTGCTATAAGGTGCATTCTTTTCCCCTGGAGATAGTGACCAACCTTTCAAGA 2329

109697099 ACTATTCTTGGGTATATTTTATCATTTCTTTATTTTAGTATCTATGAAGGGAACATTATA 109697158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2330 ACTATTCTTGGGTATATTTTATCATTTCTTTATTTTAGTATCTATGAAGGGAACATTATA 2389

109697159 GAAGCCATGTTAACACTGGAGAAATGTCTAATATTAAAAAACCAGTACTCTAGCAAGTAA 109697218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2390 GAAGCCATGTTAACACTGGAGAAATGTCTAATATTAAAAAACCAGTACTCTAGCAAGTAA 2449

109697219 AATTATGTATGTGTGTAACCTCGTTCCTACATCCAGGAAATCATTAAACTAGTAGGGGGT 109697278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2450 AATTATGTATGTGTGTAACCTCGTTCCTACATCCAGGAAATCATTAAACTAGTAGGGGGT 2509

109697279 TGTATTAATTAGAACTCTCTGTTGCAAACAACAGACAGTCTGGATGATTTAAAAGGAACA 109697338
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2510 TGTATTAATCAGAACTCTCTGTTGCAAACAACAGACAGTCTGGATGATTTAAAAGGAACA 2569

109697339 GAAATGTATTAAGAGGATATTGGATAGTTCACAAAACCTCCAGGAGGGCTGGAGAGCCAG 109697398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2570 GAAATGTATTAAGAGGATATTGGATAGTTCACAAAACCTCCAGGAGGGCTGGAGAGCCAG 2629

109697399 GCTGGATGCTGTGCCACTGACACAACATTCAAAACTCACAGATTCTTCTGCTGCCATCCA 109697458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2630 GCTGGATGCTGTGCCACTGACACAACATTCAAAACTCACAGATTCTTCTGCTGCCATCCA 2689

109697459 CTATGCTAGCTACCAGCCATGCATGGCCATGCAGCACTTGATGTGTGCCTGCCCAACTGA 109697518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2690 CTATGCTAGCTACCAGCCATGCATGGCCATGCAGCACTTGATGTGTGCCTGCCCAACTGA 2749

109697519 GATGTGCTGCAGGTGCACAATACTCACTGGACTTCGAAGACTAAACGTGAAGAAAGGACA 109697578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2750 GATGTGCTGCAGGTGCACAATACTCACTGGACTTCGAAGACTAAACGTGAAGAAAGGACA 2809

109697579 TAAAATCTCACTCAGGTTAAAATGATATCTGCACACACTGGGTATTAAGTAAAATACATT 109697638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2810 TAAAATCTCACTCAGGTTAAAATGATATCTGCACACACTGGGTATTAAGTAAAATACATT 2869

109697639 GAAATTAATTTCACTTGTTTCTTTTTGCTTTTTAAATGCAGTTACTAGAAAATTTTACAT 109697698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2870 GAAATTAATTTCACTTGTTTCTTTTTGCTTTTTAAATGCAGTTACTAGAAAATTTTACAT 2929

109697699 TACCTGTGGGAAATTGGCTCCACATCATTTCCTCTGTTTTCTATTGATCGAATTGAGTCC 109697758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2930 TACCTGTGGGAAATTGGCTCCACATCATTTCCTCTGTTTTCTATTGATCGAATTGAGTCC 2989

109697759 TAAGGCCACATCTGATATTTGGGGGAAAGGAAATATACATCACCTCCAGATGGGGGCAGC 109697818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2990 TAAGGCCACATCTGATATTTGGGGGAAAGGAAATATACATCACCTCCAGATGGGGGCAGC 3049

109697819 CCCCCATGCAGGGATGGGGAGCTGCCCGAGGCTGTTTTTGGAAACATCTGTGGTCCCCAA 109697878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3050 CCCCCATGCAGGGATGGGGAGCTGCCCGAGGCTGTTTTTGGAAACATCTGTGGTCCCCAA 3109

109697879 CAACAGTGCTTCTGGCCTGTTTTTTCACATGGGGCTCCGCGTCTGTGGCTGACTCAATGC 109697938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3110 CAACAGTGCTTCTGGCCTGTTTTTTCACATGGGGCTCCGCGTCTGTGGCTGACTCAATGC 3169

109697939 TGGGCTTGAGGTGGGGGTGACTGTCACATGACAGATTAGGTCAAGCCTCCATCGTGCTCA 109697998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3170 TGGGCTTGAGGTGGGGGTGACTGTCACATGACAGATTAGGTCAAGCCTCCATCGTGCTCA 3229

109697999 GGGTTTATGAGACAGATCACAAGGGCCTCTGGGGACTGCCTGTCGCTTGTGGTCCTGGGG 109698058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3230 GGGTTTATGAGACAGATCACAAGGGCCTCTGGGGACTGCCTGTCGCTTGTGGTCCTGGGG 3289

109698059 AACCAACCCCATGGTCAACTCCACCTCTGAACCTCTCCTGCAAGGGGCAAGAGCATCCTG 109698118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     3290 AACCAACCCCATGGTCAACTCCACCTCTGAACCTCTCCTGCAAGGGGCCAGAGCATCCTG 3349

109698119 GTAACCTTGCCCATCCTGACACCTGCTGTGGTAACTCATTCCCTGCTCTGGCACTTGAGC 109698178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3350 GTAACCTTGCCCATCCTGACACCTGCTGTGGTAACTCATTCCCTGCTCTGGCACTTGAGC 3409

109698179 AACCCCTCGGCCCCACCATCCCAGGACTTCACAACCTGCCGCCGCCAGGGAGCCCTTTTT 109698238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3410 AACCCCTCGGCCCCACCATCCCAGGACTTCACAACCTGCCGCCGCCAGGGAGCCCTTTTT 3469

109698239 GCAACCACAGTGCCTGGCAGCAGTGACATGGCTTGCAGAAACACATCCTTGCTATTCAGT 109698298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3470 GCAACCACAGTGCCTGGCAGCAGTGACATGGCTTGCAGAAACACATCCTTGCTATTCAGT 3529

109698299 TGCACTTGCCAACGAGGCATCTTCTGGGGTCTTGTCGGGGAGATCACTGGGGGATGGCCA 109698358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3530 TGCACTTGCCAACGAGGCATCTTCTGGGGTCTTGTCGGGGAGATCACTGGGGGATGGCCA 3589

109698359 GCTGTTTTCATAGGAAAAGTCTGTCTGGTTCTTCATCTCCGTATTTGTCCTCCACACTGC 109698418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3590 GCTGTTTTCATAGGAAAAGTCTGTCTGGTTCTTCATCTCCGTATTTGTCCTCCACACTGC 3649

109698419 TCACTGCATTTCTGCATCCTGGCTTTGTGTGGGGCATGCTGCTGTGGACTCCAGCATCTG 109698478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3650 TCACTGCATTTCTGCATCCTGGCTTTGTGTGGGGCATGCTGCTGTGGACTCCAGCATCTG 3709

109698479 TCAACCCAAATGCAAAGGCGGAGCCCACCTCGGCTGCAGGAACTGCCACACTGAAGTGCT 109698538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3710 TCAACCCAAATGCAAAGGCGGAGCCCACCTCGGCTGCAGGAACTGCCACACTGAAGTGCT 3769

109698539 CTACCCATGCTTCAGCTGCCTCCAGAATCCATTCCCATATGGGCTAACCAGATGTGTGCA 109698598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3770 CTACCCATGCTTCAGCTGCCTCCAGAATCCATTCCCATATGGGCTAACCAGATGTGTGCA 3829

109698599 GCTAATCAACAGTTAGCATTTCTGTCTTTGGATAGTAAGGACTTCTGCTTCCAGACTTCA 109698658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3830 GCTAATCAACAGTTAGCATTTCTGTCTTTGGATAGTAAGGACTTCTGCTTCCAGACTTCA 3889

109698659 GATCTCTCCTTAGGTAGCAGCTCTGACCCAAGGTTAGGATTCCAGGACTCAGTCAGCTCC 109698718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3890 GATCTCTCCTTAGGTAGCAGCTCTGACCCAAGGTTAGGATTCCAGGACTCAGTCAGCTCC 3949

109698719 TGGTATTCCTTAGCACCCCTTTTTTATTTTATTTTATTTTATTTATTTATTTTTTTGAGA 109698778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3950 TGGTATTCCTTAGCACCCCTTTTTTATTTTATTTTATTTTATTTATTTATTTTTTTGAGA 4009

109698779 CAGAGTCTCTCTCTGTGGCCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGCTATCTTGGCTCACTGCAAC 109698838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4010 CAGAGTCTCTCTCTGTGGCCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGCTATCTTGGCTCACTGCAAC 4069

109698839 CTCCGCTTCCCGGGTTCACACCATTCTCC 109698867
          |||||||||||||||||||||||||||||
     4070 CTCCGCTTCCCGGGTTCACACCATTCTCC 4098

Alignment time is 3.60056 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [109679900,109705214] =>     25315 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [        1,     2883] =>      2883 nucs 'mol-32-32fb-071750_2883'

Score:        2861
Aligned:      2883        nucs
Identic:      2881 (100%) nucs =>      2447 (100%)       434 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [109687453,109689900] EXCISED REGION [109695215,109695649]
 second seq =>  [        1,     2448] EXCISED REGION [     2449,     2883]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      5314 nucs [109689901,109695214]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        28 nucs [109689901,109689928] to [109695215,109695242]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [109689900,109689900] to [109695215,109695215]
 second seq =>         1 nucs [2448,2448] to [2449,2449]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

109687453 GAGCAAATTAAACCTCTTTTCTTTATAAATTACCCATATTTAGGTATTTATTTATAGCTA 109687512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GAGCAAATTAAACCTCTTTTCTTTATAAATTACCCATATTTAGGTATTTATTTATAGCTA 60

109687513 CTACAAGGGGGAAAGGGAGAGCAGGGAGATCAGTGGTGCTTTCACACTAGTACAGCAATA 109687572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTACAAGGGGGAAAGGGAGAGCAGGGAGATCAGTGGTGCTTTCACACTAGTACAGCAATA 120

109687573 GAGCAGCATCTTGGACCAGGGTGGTGGCTGAGGAGACAGGATCATGGCTTTGAGATACAT 109687632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GAGCAGCATCTTGGACCAGGGTGGTGGCTGAGGAGACAGGATCATGGCTTTGAGATACAT 180

109687633 TCTGAAGAAGAAAAGTAGGCCTTGCTGATAGAATAGTCACAAACTGTAATGGAAAAGGTA 109687692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCTGAAGAAGAAAAGTAGGCCTTGCTGATAGAATAGTCACAAACTGTAATGGAAAAGGTA 240

109687693 AATTCAAGGATGTCTCCTGGGTTTTTGGCTTAAGCATCTGGATACAGAGATATGGAAGAC 109687752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AATTCAAGGATGTCTCCTGGGTTTTTGGCTTAAGCATCTGGATACAGAGATATGGAAGAC 300

109687753 TGGGAGGGAAATGGGTTTGGAGTATACATGCATGCAATCAACAATTCTGTCTTGCATGTG 109687812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGGGAGGGAAATGGGTTTGGAGTATACATGCATGCAATCAACAATTCTGTCTTGCATGTG 360

109687813 TGAAATTTAGATACCCATTAGACATCTGCATAGAGGGCCAGGCACAGTGGCTCACGGCAG 109687872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGAAATTTAGATACCCATTAGACATCTGCATAGAGGGCCAGGCACAGTGGCTCACGGCAG 420

109687873 TAATCCCAACACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCGGATCACTTGAGGTTAGGAGTTCAAGAC 109687932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TAATCCCAACACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCGGATCACTTGAGGTTAGGAGTTCAAGAC 480

109687933 CAGCCTGGCCAACATGGTGAAACTCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTATCTGGGTGT 109687992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CAGCCTGGCCAACATGGTGAAACTCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTATCTGGGTGT 540

109687993 GGTGGTGTGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCATGAGAATCACTTGAAC 109688052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGTGGTGTGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCATGAGAATCACTTGAAC 600

109688053 CTGGGAGGTAGAGGTTGCAGCGAGCCAAGATCACACCACTGCACTCTAGCAAGGGTGACA 109688112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTGGGAGGTAGAGGTTGCAGCGAGCCAAGATCACACCACTGCACTCTAGCAAGGGTGACA 660

109688113 AAGCAAGACTCTATCTCAAAAAAAAAAAGACATTTATGTAGAGATGTTAGGTTGGCAGTT 109688172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAGCAAGACTCTATCTCAAAAAAAAAAAGACATTTATGTAGAGATGTTAGGTTGGCAGTT 720

109688173 GGATAACAGTCTTGAGTTTCGGGGTGAGGGCAGGACCAGAAATGAAGATTTGGGATTCAT 109688232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GGATAACAGTCTTGAGTTTCGGGGTGAGGGCAGGACCAGAAATGAAGATTTGGGATTCAT 780

109688233 TAGCATGTAGATCATATTCAGAGCCACAATAATAGATGAAATAACTGAGGAAGAGAGCTA 109688292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TAGCATGTAGATCATATTCAGAGCCACAATAATAGATGAAATAACTGAGGAAGAGAGCTA 840

109688293 GAGGGGCCAAGAGCAAACACAGGAACATGCCAGCATTTAGAGGACAATGGAGAAGGAGGA 109688352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GAGGGGCCAAGAGCAAACACAGGAACATGCCAGCATTTAGAGGACAATGGAGAAGGAGGA 900

109688353 GATGGCAGAGATGTCAATAGGAGGAAAAGCAAAAGGGTGTTATCATAGAAGGTGACAACA 109688412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GATGGCAGAGATGTCAATAGGAGGAAAAGCAAAAGGGTGTTATCATAGAAGGTGACAACA 960

109688413 GAATATATCACAAAGAGGAATATGTTTGAATGTGTCAAATGTTGTTATCACAGGCTATAG 109688472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GAATATATCACAAAGAGGAATATGTTTGAATGTGTCAAATGTTGTTATCACAGGCTATAG 1020

109688473 AAGTAAACACAAAGTCTTATGGGAATACTGAGGATGAGCTGCCTCTAGTGTGTGTGAAAC 109688532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AAGTAAACACAAAGTCTTATGGGAATACTGAGGATGAGCTGCCTCTAGTGTGTGTGAAAC 1080

109688533 CCTGGCCAAATATTTGTTGTGGGGCCCCTGTCTATATATGCAATGTTATTTAAAAACATA 109688592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CCTGGCCAAATATTTGTTGTGGGGCCCCTGTCTATATATGCAATGTTATTTAAAAACATA 1140

109688593 CTACATATTCTTGGGCTTATGTGGGATGTAGTGATTTATTGATGAAGACTTAGAATACTG 109688652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTACATATTCTTGGGCTTATGTGGGATGTAGTGATTTATTGATGAAGACTTAGAATACTG 1200

109688653 GGTAGGAAGAGATGCTTTTGGATTTGTTTATGAGCCAGTGAGTGTATCTGAGGATTCTTT 109688712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GGTAGGAAGAGATGCTTTTGGATTTGTTTATGAGCCAGTGAGTGTATCTGAGGATTCTTT 1260

109688713 ATCCTGTGTCTAATGTGAGTGTGTTTTCCTGAATCAGTGCATCAGTGCTATTCTGGAGGC 109688772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATCCTGTGTCTAATGTGAGTGTGTTTTCCTGAATCAGTGCATCAGTGCTATTCTGGAGGC 1320

109688773 CCAAATCACACATGATTCCGTGAAAGAAACTCTGTGCTGGCCAGAGGATGCACTCACTCT 109688832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CCAAATCACACATGATTCCGTGAAAGAAACTCTGTGCTGGCCAGAGGATGCACTCACTCT 1380

109688833 CCAGGCTTTCCTGCATGGGCCCTCACCATGGAGTCCTGGATACTTAGGGCATCTGGTTGA 109688892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CCAGGCTTTCCTGCATGGGCCCTCACCATGGAGTCCTGGATACTTAGGGCATCTGGTTGA 1440

109688893 CCACATGCTTGGGAGAGCACCAAAGAAGGTCCTGGTTTTCAAGCCTCCAGCTTCTCCTTA 109688952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CCACATGCTTGGGAGAGCACCAAAGAAGGTCCTGGTTTTCAAGCCTCCAGCTTCTCCTTA 1500

109688953 GAAAGAGTTGACTACCTGTCTGGGCTCCAACTTTTCTGGCTGCTACCAGAGGGTCTGGCC 109689012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GAAAGAGTTGACTACCTGTCTGGGCTCCAACTTTTCTGGCTGCTACCAGAGGGTCTGGCC 1560

109689013 TCTAAACCATCTGTGTCAAAGAACTGACAGGGCCTGACATTCACTGGGACCCTAGGCTAG 109689072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TCTAAACCATCTGTGTCAAAGAACTGACAGGGCCTGACATTCACTGGGACCCTAGGCTAG 1620

109689073 GGGTGACAGAGAGCAAAGCAAAAGTTTGAAAGAGTATGCAGTCTGAATGAGCATGCAGAC 109689132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GGGTGACAGAGAGCAAAGCAAAAGTTTGAAAGAGTATGCAGTCTGAATGAGCATGCAGAC 1680

109689133 CTTTGCCACAGCTCCCCTTCCCAGCTCAGTGCAGAGCAAGTAGGAGATAAACTTCTGCTC 109689192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CTTTGCCACAGCTCCCCTTCCCAGCTCAGTGCAGAGCAAGTAGGAGATAAACTTCTGCTC 1740

109689193 TTAGCTTCTCTGTGAGGAGAGATGAAATGGACCACACATCTAGCACCCCAACTTTTCTGA 109689252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TTAGCTTCTCTGTGAGGAGAGATGAAATGGACCACACATCTAGCACCCCAACTTTTCTGA 1800

109689253 CAACTACTAGAAGGACTGACTCCTGACTCACCTGTCTCAGGGCACTGATGGTACTTGGCA 109689312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CAACTACTAGAAGGACTGACTCCTGACTCACCTGTCTCAGGGCACTGATGGTACTTGGCA 1860

109689313 CACTCTAGTCTCCTGGGGCCACCAAGAACAAGAACAGCATTTTGGACAAACACACTGGTT 109689372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CACTCTAGTCTCCTGGGGCCACCAAGAACAAGAACAGCATTTTGGACAAACACACTGGTT 1920

109689373 TGAGAGGCACCCAGACTCTCTGACTGGGCTGTGAGGAGGCTCATCTGTGAAGACTGAGGG 109689432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TGAGAGGCACCCAGACTCTCTGACTGGGCTGTGAGGAGGCTCATCTGTGAAGACTGAGGG 1980

109689433 AGGTGGCTGTTTTATCAAATGTGCAGAAACCAACACAGAGAGTCAAAGACAATGAACAAA 109689492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AGGTGGCTGTTTTATCAAATGTGCAGAAACCAACACAGAGAGTCAAAGACAATGAACAAA 2040

109689493 CAGGAAATATGCCATAAATAAAAGAACAAGATAAATCTTCAGAAACTGACCCAAACAGAA 109689552
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     2041 CAGGAAATATGCCATAAATAAAAGAACAAGATAAAACTTCAGAAACTGACCCAAACAGAA 2100

109689553 TGGAGATATGTGATTTACCAGACAAAAAATCAAAAGACCTGTCACAAAGATGCTCAGTGA 109689612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TGGAGATATGTGATTTACCAGACAAAAAATCAAAAGACCTGTCACAAAGATGCTCAGTGA 2160

109689613 GGTCAGGAGAGCAATGCATGAATAAAGTGAGAATTTCAACCAAAAAGGTAGAAAATATTA 109689672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GGTCAGGAGAGCAATGCATGAATAAAGTGAGAATTTCAACCAAAAAGGTAGAAAATATTA 2220

109689673 AAAAGTGCCAAACAGAAATCACGGAGCTGAAGAATATAATAAAAGAACAGAAAAATTTAA 109689732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AAAAGTGCCAAACAGAAATCACGGAGCTGAAGAATATAATAAAAGAACAGAAAAATTTAA 2280

109689733 TAGAGGGGTTCAATAGCAGACTAGGTGAACTGAAAGAAAGGATTAGTGAACTCAAGGACT 109689792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TAGAGGGGTTCAATAGCAGACTAGGTGAACTGAAAGAAAGGATTAGTGAACTCAAGGACT 2340

109689793 GGTCATTGGCAATCATTCAGTCACAGCATTAAAAAGAAAAAAGAATGAAGGGCCAGGCAC 109689852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GGTCATTGGCAATCATTCAGTCACAGCATTAAAAAGAAAAAAGAATGAAGGGCCAGGCAC 2400

109689853 AGTGGCTCACACCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTG 109689900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AGTGGCTCACACCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTG 2448

EXCISED REGION

109695215 GATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATTCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATTTCAACT 109695274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2449 GATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATTCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATTTCAACT 2508

109695275 AAAAATACAAAAAAAAAAAAAAAATAGCCGGGTGTGGTGGCACACACCCGTAGTCCCAGC 109695334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2509 AAAAATACAAAAAAAAAAAAAAAATAGCCGGGTGTGGTGGCACACACCCGTAGTCCCAGC 2568

109695335 TACTTGGGAGGCTGGGGCAGGAGAATGGCATGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGC 109695394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2569 TACTTGGGAGGCTGGGGCAGGAGAATGGCATGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGC 2628

109695395 CGAGATCGCACAATTGCTTTCCAGCCTGGGCAACGGAGCGAGACTCTGTTTCAAAAAAAA 109695454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2629 CGAGATCGCACAATTGCTTTCCAGCCTGGGCAACGGAGCGAGACTCTGTTTCAAAAAAAA 2688

109695455 AGGTGACCATGTGAAGGGATGGATATGTTAAGTAGCTTGACTGGTAATCGGTTCACGATG 109695514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2689 AGGTGACCATGTGAAGGGATGGATATGTTAAGTAGCTTGACTGGTAATCGGTTCACGATG 2748

109695515 TATATGTACAGTTGACCCTTGAACAACATGCGTTTAAATTACAAGAGTCCACTTATATGG 109695574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2749 TATATGTACAGTTGACCCTTGAACAACATGCGTTTAAATTACAAGAGTCCACTTATATGG 2808

109695575 GGATTTTCTTCTGCCTCTGCCAGCAAGGCCAACCCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCCCCTCA 109695634
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2809 GGATTTTCTTCTGCCTTTGCCAGCAAGGCCAACCCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCCCCTCA 2868

109695635 ACTAAAGACGAGGAG 109695649
          |||||||||||||||
     2869 ACTAAAGACGAGGAG 2883

Alignment time is 2.55257 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [109679900,109705214] =>     25315 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [        1,     4495] =>      4495 nucs 'mol-32-32fb-085429_4495'

Score:        4419
Aligned:      4496        nucs
Identic:      4489 (100%) nucs =>       280 (100%)      4209 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [109689621,109689900] EXCISED REGION [109695215,109699430]
 second seq =>  [        1,      280] EXCISED REGION [      281,     4495]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      5314 nucs [109689901,109695214]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        28 nucs [109689901,109689928] to [109695215,109695242]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [109689900,109689900] to [109695215,109695215]
 second seq =>         1 nucs [280,280] to [281,281]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

109689621 GAGCAATGCATGAATAAAGTGAGAATTTCAACCAAAAAGGTAGAAAATATTAAAAAGTGC 109689680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GAGCAATGCATGAATAAAGTGAGAATTTCAACCAAAAAGGTAGAAAATATTAAAAAGTGC 60

109689681 CAAACAGAAATCACGGAGCTGAAGAATATAATAAAAGAACAGAAAAATTTAATAGAGGGG 109689740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAAACAGAAATCACGGAGCTGAAGAATATAATAAAAGAACAGAAAAATTTAATAGAGGGG 120

109689741 TTCAATAGCAGACTAGGTGAACTGAAAGAAAGGATTAGTGAACTCAAGGACTGGTCATTG 109689800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTCAATAGCAGACTAGGTGAACTGAAAGAAAGGATTAGTGAACTCAAGGACTGGTCATTG 180

109689801 GCAATCATTCAGTCACAGCATTAAAAAGAAAAAAGAATGAAGGGCCAGGCACAGTGGCTC 109689860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCAATCATTCAGTCACAGCATTAAAAAGAAAAAAGAATGAAGGGCCAGGCACAGTGGCTC 240

109689861 ACACCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTG 109689900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACACCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTG 280

EXCISED REGION

109695215 GATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATTCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATTTCAACT 109695274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      281 GATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATTCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATTTCAACT 340

109695275 AAAAATACAAAAAAAAAAAAAAAATAGCCGGGTGTGGTGGCACACACCCGTAGTCCCAGC 109695334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      341 AAAAATACAAAAAAAAAAAAAAAATAGCCGGGTGTGGTGGCACACACCCGTAGTCCCAGC 400

109695335 TACTTGGGAGGCTGGGGCAGGAGAATGGCATGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGC 109695394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      401 TACTTGGGAGGCTGGGGCAGGAGAATGGCATGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGC 460

109695395 CGAGATCGCACAATTGCTTTCCAGCCTGGGCAACGGAGCGAGACTCTGTTTCAAAAAAAA 109695454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      461 CGAGATCGCACAATTGCTTTCCAGCCTGGGCAACGGAGCGAGACTCTGTTTCAAAAAAAA 520

109695455 AGGTGACCATGTGAAGGGATGGATATGTTAAGTAGCTTGACTGGTAATCGGTTCACGATG 109695514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      521 AGGTGACCATGTGAAGGGATGGATATGTTAAGTAGCTTGACTGGTAATCGGTTCACGATG 580

109695515 TATATGTACAGTTGACCCTTGAACAACATGCGTTTAAATTACAAGAGTCCACTTATATGG 109695574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      581 TATATGTACAGTTGACCCTTGAACAACATGCGTTTAAATTACAAGAGTCCACTTATATGG 640

109695575 GGATTTTCTTCTGCCTCTGCCAGCAAGGCCAACCCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCCCCTCA 109695634
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      641 GGATTTTCTTCTGCCTTTGCCAGCAAGGCCAACCCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCCCCTCA 700

109695635 ACTAAAGACGAGGAGGATGAGGACCTTTAGGGTGATCCACTTCCACTTAATGAATAGTAA 109695694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      701 ACTAAAGACGAGGAGGATGAGGACCTTTAGGGTGATCCACTTCCACTTAATGAATAGTAA 760

109695695 ATACGGTTTCTCTTCCTTATGATTTTCTTAATATTTTCTTTTCCCTAACTTACTTTGTTG 109695754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      761 ATACGGTTTCTCTTCCTTATGATTTTCTTAATATTTTCTTTTCCCTAACTTACTTTGTTG 820

109695755 TAAGAATGCAGTACTCAATACACGTAAGATACAAAATTTGTATGAATTGACTGTTTGTGT 109695814
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      821 TAAGAATGCAGTACACAATACACGTAAGATACAAAATTTGTATGAATTGACTGTTTGTGT 880

109695815 TATCTGCAAGGCTTCCTGTCAACACTAGGGTATTAATAGTTAAGTTTTGGGGGAGTCAAA 109695874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      881 TATCTGCAAGGCTTCCTGTCAACACTAGGGTATTAATAGTTAAGTTTTGGGGGAGTCAAA 940

109695875 AGTTATTTGTGGATTTTTTACTGTTCGGGGAGTTGGTGCCCCTAACCCCTTCGTTGTTAA 109695934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      941 AGTTATTTGTGGATTTTTTACTGTTCGGGGAGTTGGTGCCCCTAACCCCTTCGTTGTTAA 1000

109695935 AGAGTCAACTGTATATCAAAACATCGTGCTGTATACCTTAAATGTATATACTTTCAATTA 109695994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1001 AGAGTCAACTGTATATCAAAACATCGTGCTGTATACCTTAAATGTATATACTTTCAATTA 1060

109695995 AAATATTTTAAAAACAAACCAATAAAAAGGCACTGCTTCTGGCCCAGGGTGAGCCATCAG 109696054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1061 AAATATTTTAAAAACAAACCAATAAAAAGGCACTGCTTCTGGCCCAGGGTGAGCCATCAG 1120

109696055 ATGGCACAGCTGGCCCTGTCCGGTCCCAACCAGCAGAGGGGACTGTCAATTGAGAAGCTC 109696114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1121 ATGGCACAGCTGGCCCTGTCCGGTCCCAACCAGCAGAGGGGACTGTCAATTGAGAAGCTC 1180

109696115 CAGTGCTAAACGCTGGAATATGAAGATATGCATGGTGGGGAGACAGCACACACACACATA 109696174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1181 CAGTGCTAAACGCTGGAATATGAAGATATGCATGGTGGGGAGACAGCACACACACACATA 1240

109696175 ACACTCAAGGCCTGGTGGAGCCCACCCAGCTCAGCCTGGGTTGGGGAGGCTCCCTGGGAA 109696234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1241 ACACTCAAGGCCTGGTGGAGCCCACCCAGCTCAGCCTGGGTTGGGGAGGCTCCCTGGGAA 1300

109696235 GGGGATTCCTGATGTGAGCCTTCCAGGAGGGGTAGGAATTCTCTACACAGACAGGTGGGA 109696294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1301 GGGGATTCCTGATGTGAGCCTTCCAGGAGGGGTAGGAATTCTCTACACAGACAGGTGGGA 1360

109696295 ACTCCAGGCAGAGGGGAGGCCTGAAACACATCACAGGCCACCCTGTCCCTAGACTGCTGA 109696354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1361 ACTCCAGGCAGAGGGGAGGCCTGAAACACATCACAGGCCACCCTGTCCCTAGACTGCTGA 1420

109696355 GAGGCAGGACGGGGCTACACGGCCATGGGTGTGAGTCACCAAGGACCCTGTGCCTGCTGA 109696414
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     1421 GAGGCAGGACGGGGCTACACGGCCATGGGCGTGAGTCACCAAGGACCCTGTGCCTGCTGA 1480

109696415 GGCATGAGGACGCATTTCTGGGACGACAGAAAGACAGCAAAGGGCTTCAGACTATGGAAT 109696474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1481 GGCATGAGGACGCATTTCTGGGACGACAGAAAGACAGCAAAGGGCTTCAGACTATGGAAT 1540

109696475 ACCCGGAATAGGGCTCTAAGCATCTCCTCCGATGATTGTGGACTCAATGCAGGAAATGTG 109696534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1541 ACCCGGAATAGGGCTCTAAGCATCTCCTCCGATGATTGTGGACTCAATGCAGGAAATGTG 1600

109696535 GAGGCTTCGAGCTAGACCAGTGACAGAGGAGGGAAAAGGAGATGGGGCCCATCAATATTT 109696594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1601 GAGGCTTCGAGCTAGACCAGTGACAGAGGAGGGAAAAGGAGATGGGGCCCATCAATATTT 1660

109696595 GAAACTTGGCAAAACGCAGCAAGATTTTAATGGTTAATCAAAAATGGGAGGTGAATGGGA 109696654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1661 GAAACTTGGCAAAACGCAGCAAGATTTTAATGGTTAATCAAAAATGGGAGGTGAATGGGA 1720

109696655 GAAAGAGGAGCTGACAACCACTCCCACAATTCTGGTTTCCAGGGCGTGTTATAGCTGAGA 109696714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1721 GAAAGAGGAGCTGACAACCACTCCCACAATTCTGGTTTCCAGGGCGTGTTATAGCTGAGA 1780

109696715 GGGCAGCAGTTTGAGTGGCTGGGCAGCAGAGGCTGGGGTTGAGGCTGGGAAGTGGCGGCA 109696774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1781 GGGCAGCAGTTTGAGTGGCTGGGCAGCAGAGGCTGGGGTTGAGGCTGGGAAGTGGCGGCA 1840

109696775 GCAGGGGAGACTGCCCCATCAGGAGCCTGCCATAAGCGTGGGATGCAGAAGGACTGGAAG 109696834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1841 GCAGGGGAGACTGCCCCATCAGGAGCCTGCCATAAGCGTGGGATGCAGAAGGACTGGAAG 1900

109696835 GTGCTGGAGGTGATGTGGAGCTTTGGGAGAGTGTCGGAGGGATGGAATAAGTTGATGCCT 109696894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1901 GTGCTGGAGGTGATGTGGAGCTTTGGGAGAGTGTCGGAGGGATGGAATAAGTTGATGCCT 1960

109696895 GTTCCGAGACCAAGAAGTGGGGAGCAACTGAAGAAACTGGAGAGTGGGAACCAGGTTGCA 109696954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1961 GTTCCGAGACCAAGAAGTGGGGAGCAACTGAAGAAACTGGAGAGTGGGAACCAGGTTGCA 2020

109696955 GCTGGTCTCCAGATGCTGCACTCTCTGACAGCTCTCATCTATCTCACTGTCACCCAGGAT 109697014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2021 GCTGGTCTCCAGATGCTGCACTCTCTGACAGCTCTCATCTATCTCACTGTCACCCAGGAT 2080

109697015 TGGACAGGACATCTACAAATGTGCATGTGTATTTGCTATAAGGTGCATTCTTTTCCCCTG 109697074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2081 TGGACAGGACATCTACAAATGTGCATGTGTATTTGCTATAAGGTGCATTCTTTTCCCCTG 2140

109697075 GAGATAGTGACCAACCTTTCAAGAACTATTCTTGGGTATATTTTATCATTTCTTTATTTT 109697134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2141 GAGATAGTGACCAACCTTTCAAGAACTATTCTTGGGTATATTTTATCATTTCTTTATTTT 2200

109697135 AGTATCTATGAAGGGAACATTATAGAAGCCATGTTAACACTGGAGAAATGTCTAATATTA 109697194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2201 AGTATCTATGAAGGGAACATTATAGAAGCCATGTTAACACTGGAGAAATGTCTAATATTA 2260

109697195 AAAAACCAGTACTCTAGCAAGTAAAATTATGTATGTGTGTAACCTCGTTCCTACATCCAG 109697254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2261 AAAAACCAGTACTCTAGCAAGTAAAATTATGTATGTGTGTAACCTCGTTCCTACATCCAG 2320

109697255 GAAATCATTAAACTAGTAGGGGGTTGTATTAATTAGAACTCTCTGTTGCAAACAACAGAC 109697314
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     2321 GAAATCATTAAACTAGTAGGGGGTTGTATTAATCAGAACTCTCTGTTGCAAACAACAGAC 2380

109697315 AGTCTGGATGATTTAAAAGGAACAGAAATGTATTAAGAGGATATTGGATAGTTCACAAAA 109697374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2381 AGTCTGGATGATTTAAAAGGAACAGAAATGTATTAAGAGGATATTGGATAGTTCACAAAA 2440

109697375 CCTCCAGGAGGGCTGGAGAGCCAGGCTGGATGCTGTGCCACTGACACAACATTCAAAACT 109697434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2441 CCTCCAGGAGGGCTGGAGAGCCAGGCTGGATGCTGTGCCACTGACACAACATTCAAAACT 2500

109697435 CACAGATTCTTCTGCTGCCATCCACTATGCTAGCTACCAGCCATGCATGGCCATGCAGCA 109697494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2501 CACAGATTCTTCTGCTGCCATCCACTATGCTAGCTACCAGCCATGCATGGCCATGCAGCA 2560

109697495 CTTGATGTGTGCCTGCCCAACTGAGATGTGCTGCAGGTGCACAATACTCACTGGACTTCG 109697554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2561 CTTGATGTGTGCCTGCCCAACTGAGATGTGCTGCAGGTGCACAATACTCACTGGACTTCG 2620

109697555 AAGACTAAACGTGAAGAAAGGACATAAAATCTCACTCAGGTTAAAATGATATCTGCACAC 109697614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2621 AAGACTAAACGTGAAGAAAGGACATAAAATCTCACTCAGGTTAAAATGATATCTGCACAC 2680

109697615 ACTGGGTATTAAGTAAAATACATTGAAATTAATTTCACTTGTTTCTTTTTGCTTTTTAAA 109697674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2681 ACTGGGTATTAAGTAAAATACATTGAAATTAATTTCACTTGTTTCTTTTTGCTTTTTAAA 2740

109697675 TGCAGTTACTAGAAAATTTTACATTACCTGTGGGAAATTGGCTCCACATCATTTCCTCTG 109697734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2741 TGCAGTTACTAGAAAATTTTACATTACCTGTGGGAAATTGGCTCCACATCATTTCCTCTG 2800

109697735 TTTTCTATTGATCGAATTGAGTCCTAAGGCCACATCTGATATTTGGGGGAAAGGAAATAT 109697794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2801 TTTTCTATTGATCGAATTGAGTCCTAAGGCCACATCTGATATTTGGGGGAAAGGAAATAT 2860

109697795 ACATCACCTCCAGATGGGGGCAGCCCCCCATGCAGGGATGGGGAGCTGCCCGAGGCTGTT 109697854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2861 ACATCACCTCCAGATGGGGGCAGCCCCCCATGCAGGGATGGGGAGCTGCCCGAGGCTGTT 2920

109697855 TTTGGAAACATCTGTGGTCCCCAACAACAGTGCTTCTGGCCTGTTTTTTCACATGGGGCT 109697914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2921 TTTGGAAACATCTGTGGTCCCCAACAACAGTGCTTCTGGCCTGTTTTTTCACATGGGGCT 2980

109697915 CCGCGTCTGTGGCTGACTCAATGCTGGGCTTGAGGTGGGGGTGACTGTCACATGACAGAT 109697974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2981 CCGCGTCTGTGGCTGACTCAATGCTGGGCTTGAGGTGGGGGTGACTGTCACATGACAGAT 3040

109697975 TAGGTCAAGCCTCCATCGTGCTCAGGGTTTATGAGACAGATCACAAGGGCCTCTGGGGAC 109698034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3041 TAGGTCAAGCCTCCATCGTGCTCAGGGTTTATGAGACAGATCACAAGGGCCTCTGGGGAC 3100

109698035 TGCCTGTCGCTTGTGGTCCTGGGGAACCAACCCCATGGTCAACTCCACCTCTGAACCTCT 109698094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3101 TGCCTGTCGCTTGTGGTCCTGGGGAACCAACCCCATGGTCAACTCCACCTCTGAACCTCT 3160

109698095 CCTGCAAGGGGCAAGAGCATCCTGGTAACCTTGCCCATCCTGACACCTGCTGTGGTAACT 109698154
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3161 CCTGCAAGGGGCCAGAGCATCCTGGTAACCTTGCCCATCCTGACACCTGCTGTGGTAACT 3220

109698155 CATTCCCTGCTCTGGCACTTGAGCAACCCCTCGGCCCCACCATCCCAGGACTTCACAACC 109698214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3221 CATTCCCTGCTCTGGCACTTGAGCAACCCCTCGGCCCCACCATCCCAGGACTTCACAACC 3280

109698215 TGCCGCCGCCAGGGAGCCCTTTTTGCAACCACAGTGCCTGGCAGCAGTGACATGGCTTGC 109698274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3281 TGCCGCCGCCAGGGAGCCCTTTTTGCAACCACAGTGCCTGGCAGCAGTGACATGGCTTGC 3340

109698275 AGAAACACATCCTTGCTATTCAGTTGCACTTGCCAACGAGGCATCTTCTGGGGTCTTGTC 109698334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3341 AGAAACACATCCTTGCTATTCAGTTGCACTTGCCAACGAGGCATCTTCTGGGGTCTTGTC 3400

109698335 GGGGAGATCACTGGGGGATGGCCAGCTGTTTTCATAGGAAAAGTCTGTCTGGTTCTTCAT 109698394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3401 GGGGAGATCACTGGGGGATGGCCAGCTGTTTTCATAGGAAAAGTCTGTCTGGTTCTTCAT 3460

109698395 CTCCGTATTTGTCCTCCACACTGCTCACTGCATTTCTGCATCCTGGCTTTGTGTGGGGCA 109698454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3461 CTCCGTATTTGTCCTCCACACTGCTCACTGCATTTCTGCATCCTGGCTTTGTGTGGGGCA 3520

109698455 TGCTGCTGTGGACTCCAGCATCTGTCAACCCAAATGCAAAGGCGGAGCCCACCTCGGCTG 109698514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3521 TGCTGCTGTGGACTCCAGCATCTGTCAACCCAAATGCAAAGGCGGAGCCCACCTCGGCTG 3580

109698515 CAGGAACTGCCACACTGAAGTGCTCTACCCATGCTTCAGCTGCCTCCAGAATCCATTCCC 109698574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3581 CAGGAACTGCCACACTGAAGTGCTCTACCCATGCTTCAGCTGCCTCCAGAATCCATTCCC 3640

109698575 ATATGGGCTAACCAGATGTGTGCAGCTAATCAACAGTTAGCATTTCTGTCTTTGGATAGT 109698634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3641 ATATGGGCTAACCAGATGTGTGCAGCTAATCAACAGTTAGCATTTCTGTCTTTGGATAGT 3700

109698635 AAGGACTTCTGCTTCCAGACTTCAGATCTCTCCTTAGGTAGCAGCTCTGACCCAAGGTTA 109698694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3701 AAGGACTTCTGCTTCCAGACTTCAGATCTCTCCTTAGGTAGCAGCTCTGACCCAAGGTTA 3760

109698695 GGATTCCAGGACTCAGTCAGCTCCTGGTATTCCTTAGCACCCCTTTTTTATTTTATTTTA 109698754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3761 GGATTCCAGGACTCAGTCAGCTCCTGGTATTCCTTAGCACCCCTTTTTTATTTTATTTTA 3820

109698755 TTTTATTTATTTATTTTTTTGAGACAGAGTCTCTCTCTGTGGCCCAGGCTAGAGTGCAGT 109698814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3821 TTTTATTTATTTATTTTTTTGAGACAGAGTCTCTCTCTGTGGCCCAGGCTAGAGTGCAGT 3880

109698815 GGTGCTATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCTTCCCGGGTTCACACCATTCTCCTGCCTCA 109698874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3881 GGTGCTATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCTTCCCGGGTTCACACCATTCTCCTGCCTCA 3940

109698875 GCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCATGCCACCACATCTGGCCAATTTTTGTATTT 109698934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3941 GCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCATGCCACCACATCTGGCCAATTTTTGTATTT 4000

109698935 TTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGCTGGACAGGCTAGTGTCGATCTCCTGACCTCGTGA 109698994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4001 TTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGCTGGACAGGCTAGTGTCGATCTCCTGACCTCGTGA 4060

109698995 TCCACCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACACCCGGCC 109699054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4061 TCCACCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACACCCGGCC 4120

109699055 TAGCACCCCTTTTTAAAACAAAAAGTTTTTATCATGGTAATATATACAAAACATAAAATT 109699114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4121 TAGCACCCCTTTTTAAAACAAAAAGTTTTTATCATGGTAATATATACAAAACATAAAATT 4180

109699115 TACCATTTTGAGCGGGCACAGTGGCCTATGCCTATGGTCCCAGGTACTTCAGAGGCTGAG 109699174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4181 TACCATTTTGAGCGGGCACAGTGGCCTATGCCTATGGTCCCAGGTACTTCAGAGGCTGAG 4240

109699175 GCAGGAAAACTCTGTGAGGTTGGGAGTTGGAGGCTGCAGTGCACTATGATGGCACCTGTA 109699234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4241 GCAGGAAAACTCTGTGAGGTTGGGAGTTGGAGGCTGCAGTGCACTATGATGGCACCTGTA 4300

109699235 AATAATGACTGCACTCCAGCCTGGACGACATATCAAGACCCCATGTCTTTTTTTTTTTTT 109699294
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
     4301 AATAATGACTGCACTCCAGCCTGGACGACATATCAAGACCCCATGT-TTTTTTTTTTTTT 4359

109699295 TTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCCATCTCAGCT 109699354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4360 TTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCCATCTCAGCT 4419

109699355 CACTGCAAGCTCCGCCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCT 109699414
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4420 CACTGCAAGCTCCGTCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCT 4479

109699415 GGGACTACAGGCATCT 109699430
          ||||||||||||||||
     4480 GGGACTACAGGCATCT 4495

Alignment time is 4.00355 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [109679900,109705214] =>     25315 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [        1,     5948] =>      5948 nucs 'mol-32-3306-020016_5948'

Score:        5915
Aligned:      5948        nucs
Identic:      5945 (100%) nucs =>      1915 (100%)      4030 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [109685400,109687314] EXCISED REGION [109687317,109691349]
 second seq =>  [        1,     1915] EXCISED REGION [     1916,     5948]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [109687315,109687316]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        16 nucs [109687315,109687330] to [109687317,109687332]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [109687315,109687315] to [109687316,109687316]
 second seq =>         0 nucs

109685400 GTTGTGAGGAGCTTATTATTCATAATTTCAGTGTGTTTCCATTTCTGCCCATATGGCACT 109685459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTTGTGAGGAGCTTATTATTCATAATTTCAGTGTGTTTCCATTTCTGCCCATATGGCACT 60

109685460 CCTCCCTTAGACAGGTATCTTGAGACAAGAAAAGGAGCAGGTGGCCTTTAAAATACATTG 109685519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCTCCCTTAGACAGGTATCTTGAGACAAGAAAAGGAGCAGGTGGCCTTTAAAATACATTG 120

109685520 CACATAACACATGCGTTTCACTGAACAGCTTTTTGCATTTAAAATGCAGACAATATGCTC 109685579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CACATAACACATGCGTTTCACTGAACAGCTTTTTGCATTTAAAATGCAGACAATATGCTC 180

109685580 AAAATAGTACTAATAAATTTTCTATCTTGAGTAATGTATCTCAGACATATACCAAGGGAA 109685639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAAATAGTACTAATAAATTTTCTATCTTGAGTAATGTATCTCAGACATATACCAAGGGAA 240

109685640 AATAATTAAAGAAAAACCCAATAAAATAGAGATCATAAAAAGGGGGGCTTATAAATCAAG 109685699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AATAATTAAAGAAAAACCCAATAAAATAGAGATCATAAAAAGGGGGGCTTATAAATCAAG 300

109685700 AGAGTAGACTTCTAGCCATTCTCAATACAGCCTTTGAGTGCAAGGATCCCAGATGTTTGA 109685759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGAGTAGACTTCTAGCCATTCTCAATACAGCCTTTGAGTGCAAGGATCCCAGATGTTTGA 360

109685760 TTTGGACACATGGAATTTTGCAATAGGATAGTGTACTTCTTATGAATGAAACATCAAAAG 109685819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTTGGACACATGGAATTTTGCAATAGGATAGTGTACTTCTTATGAATGAAACATCAAAAG 420

109685820 GCATATGGTAGTAGATGCAATCATGTTGGCAGACGTGTGTCTTGGAGAGCAGAAATGGCC 109685879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GCATATGGTAGTAGATGCAATCATGTTGGCAGACGTGTGTCTTGGAGAGCAGAAATGGCC 480

109685880 AACTGAATGCTTCCTTCCTCACTCGTGAAGCCATCAGGAGCAAAGCTCCAGGGAGTGCCT 109685939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AACTGAATGCTTCCTTCCTCACTCGTGAAGCCATCAGGAGCAAAGCTCCAGGGAGTGCCT 540

109685940 TCCGCCCTGCTGGCAATGAATGGCCTCTCCTGACAGATAGCCTAAGAGCCTTTGGCTAAA 109685999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCCGCCCTGCTGGCAATGAATGGCCTCTCCTGACAGATAGCCTAAGAGCCTTTGGCTAAA 600

109686000 GATTTGCAACATCAAAGAGTGAGTGGCATGGCCTGGCCAGCCACCTGAGACAACGTACTT 109686059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GATTTGCAACATCAAAGAGTGAGTGGCATGGCCTGGCCAGCCACCTGAGACAACGTACTT 660

109686060 TGTTCCAGAACGTGGTTCAGAGTTTCACCTTGCTGGCTCAGTGGGGATTAAGGCTGAAAG 109686119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGTTCCAGAACGTGGTTCAGAGTTTCACCTTGCTGGCTCAGTGGGGATTAAGGCTGAAAG 720

109686120 AGGCTTTGAAAATGTTGATAACAGATGAATGTAAATATTATTTACCTAGCAACATAACAC 109686179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGGCTTTGAAAATGTTGATAACAGATGAATGTAAATATTATTTACCTAGCAACATAACAC 780

109686180 TTTTTTTCTTCTTTTTTGGCTCTTTCATGGAGTCATTACTCTTTCCCTTGAGTTGTCAGT 109686239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTTTTTTCTTCTTTTTTGGCTCTTTCATGGAGTCATTACTCTTTCCCTTGAGTTGTCAGT 840

109686240 TCCTTCATTTAGTCTATTCCTTCAACAATTATTGATCAAATCATTATTTGTGCTGGGCAG 109686299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCCTTCATTTAGTCTATTCCTTCAACAATTATTGATCAAATCATTATTTGTGCTGGGCAG 900

109686300 TGTTCTATGTCCCAGGAATTTTGTACTGTAAACCAGTACTCTGTCCTCATAACGCCTATA 109686359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGTTCTATGTCCCAGGAATTTTGTACTGTAAACCAGTACTCTGTCCTCATAACGCCTATA 960

109686360 ATCTAGAGACATTGAACTGTGAGCACAGGAATAAGCAGTGTACTTTCAGAATGTAATCAG 109686419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATCTAGAGACATTGAACTGTGAGCACAGGAATAAGCAGTGTACTTTCAGAATGTAATCAG 1020

109686420 TGTTCTCAAGGGAGGAGATTATGATGTAACAGAGCTTCTTTTCATCTCAAAGGAAGGCCA 109686479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGTTCTCAAGGGAGGAGATTATGATGTAACAGAGCTTCTTTTCATCTCAAAGGAAGGCCA 1080

109686480 TTAAGAAGGGCCAGTCAGGACAGGTGATGCTGGCAGGAAGGGAGCCAGCCTGCGACGTGC 109686539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTAAGAAGGGCCAGTCAGGACAGGTGATGCTGGCAGGAAGGGAGCCAGCCTGCGACGTGC 1140

109686540 TGGGAAGACAGGCAGAGAGACTATACGTTCAAAGGGTGTGAGGCAGGCATGAGTTTGCAG 109686599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGGGAAGACAGGCAGAGAGACTATACGTTCAAAGGGTGTGAGGCAGGCATGAGTTTGCAG 1200

109686600 AAAGTGTGCTAAGGGCCTGGAGCAGAGTGAGTGAGGGGGAACAAAGACAGGGAGGTGTTA 109686659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AAAGTGTGCTAAGGGCCTGGAGCAGAGTGAGTGAGGGGGAACAAAGACAGGGAGGTGTTA 1260

109686660 AAGGGCCAGGAGGGGCTGGACCCTCTGGAGCATTGATGACTATGCTGTGGAATGAATTTG 109686719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AAGGGCCAGGAGGGGCTGGACCCTCTGGAGCATTGATGACTATGCTGTGGAATGAATTTG 1320

109686720 GATGTTGTTTAAGGGGAATGGGAAGTCATTGAAATATTTTAAGTAGAGAAATGGGATGCA 109686779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GATGTTGTTTAAGGGGAATGGGAAGTCATTGAAATATTTTAAGTAGAGAAATGGGATGCA 1380

109686780 CTGATTTACCTTATGAAAAGAGTTCTCTAGCTGCTTTGAGAGAATGGATTATAGTGGGGT 109686839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CTGATTTACCTTATGAAAAGAGTTCTCTAGCTGCTTTGAGAGAATGGATTATAGTGGGGT 1440

109686840 GATATAGTTTGGACGTTTGTCCTCTCCAAATCTCGTGTTGAAATGTGATGCTCAGTGTTG 109686899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GATATAGTTTGGACGTTTGTCCTCTCCAAATCTCGTGTTGAAATGTGATGCTCAGTGTTG 1500

109686900 GAGGTGGGGTCTGGTGGGAGGTGATTGGGTCGTGGAGCAGATCCTTCATGAATGGCTGCT 109686959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GAGGTGGGGTCTGGTGGGAGGTGATTGGGTCGTGGAGCAGATCCTTCATGAATGGCTGCT 1560

109686960 GACATCATCTTGGTGGTGAGTGAGTTCTCAGTCTGGTAGTTCACATGAGATCTGCCTGTT 109687019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GACATCATCTTGGTGGTGAGTGAGTTCTCAGTCTGGTAGTTCACATGAGATCTGCCTGTT 1620

109687020 TTAAAGAGTATGGTGGCCAAGTGCCGTGGCTCACGCCTGTGATCCCAGCACTTTGGGAGG 109687079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTAAAGAGTATGGTGGCCAAGTGCCGTGGCTCACGCCTGTGATCCCAGCACTTTGGGAGG 1680

109687080 TAAAGGCAGGAGGATCACTTGAGCTCAGGAGTTCGACACTAGCCTGGGAAACAGGGTGAA 109687139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TAAAGGCAGGAGGATCACTTGAGCTCAGGAGTTCGACACTAGCCTGGGAAACAGGGTGAA 1740

109687140 ACCCATCTCTACTAAAAATAGAAATATTAGGCGGGTGTGATGGTGCGCTGCCTATAGTCC 109687199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ACCCATCTCTACTAAAAATAGAAATATTAGGCGGGTGTGATGGTGCGCTGCCTATAGTCC 1800

109687200 CAGCTACCGGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGT 109687259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CAGCTACCGGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGT 1860

109687260 GAGCCAAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAGCCAGACCCTATCT 109687314
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GAGCCAAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAGCCAGACCCTATCT 1915

EXCISED REGION

109687317 AAAAAAAAAAAAAAAATAGAGTGCGGCACCCCTCCCTTCCCACTGTTGCTCCCTCTCTCG 109687376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1916 AAAAAAAAAAAAAAAATAGAGTGCGGCACCCCTCCCTTCCCACTGTTGCTCCCTCTCTCG 1975

109687377 CCATGTGGGGCACGGGCTGCTCCTTCATCTTCCACCATTATTGTGAGCTTCCTGAGGCCT 109687436
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1976 CCATGTGGGGCATGGGCTGCTCCTTCATCTTCCACCATTATTGTGAGCTTCCTGAGGCCT 2035

109687437 CACCAGGAGCAGATGTGAGCAAATTAAACCTCTTTTCTTTATAAATTACCCATATTTAGG 109687496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2036 CACCAGGAGCAGATGTGAGCAAATTAAACCTCTTTTCTTTATAAATTACCCATATTTAGG 2095

109687497 TATTTATTTATAGCTACTACAAGGGGGAAAGGGAGAGCAGGGAGATCAGTGGTGCTTTCA 109687556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2096 TATTTATTTATAGCTACTACAAGGGGGAAAGGGAGAGCAGGGAGATCAGTGGTGCTTTCA 2155

109687557 CACTAGTACAGCAATAGAGCAGCATCTTGGACCAGGGTGGTGGCTGAGGAGACAGGATCA 109687616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2156 CACTAGTACAGCAATAGAGCAGCATCTTGGACCAGGGTGGTGGCTGAGGAGACAGGATCA 2215

109687617 TGGCTTTGAGATACATTCTGAAGAAGAAAAGTAGGCCTTGCTGATAGAATAGTCACAAAC 109687676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2216 TGGCTTTGAGATACATTCTGAAGAAGAAAAGTAGGCCTTGCTGATAGAATAGTCACAAAC 2275

109687677 TGTAATGGAAAAGGTAAATTCAAGGATGTCTCCTGGGTTTTTGGCTTAAGCATCTGGATA 109687736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2276 TGTAATGGAAAAGGTAAATTCAAGGATGTCTCCTGGGTTTTTGGCTTAAGCATCTGGATA 2335

109687737 CAGAGATATGGAAGACTGGGAGGGAAATGGGTTTGGAGTATACATGCATGCAATCAACAA 109687796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2336 CAGAGATATGGAAGACTGGGAGGGAAATGGGTTTGGAGTATACATGCATGCAATCAACAA 2395

109687797 TTCTGTCTTGCATGTGTGAAATTTAGATACCCATTAGACATCTGCATAGAGGGCCAGGCA 109687856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2396 TTCTGTCTTGCATGTGTGAAATTTAGATACCCATTAGACATCTGCATAGAGGGCCAGGCA 2455

109687857 CAGTGGCTCACGGCAGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCGGATCACTTGAG 109687916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2456 CAGTGGCTCACGGCAGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCGGATCACTTGAG 2515

109687917 GTTAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACTCTGTCTCTACTAAAAATACA 109687976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2516 GTTAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACTCTGTCTCTACTAAAAATACA 2575

109687977 AAAATTATCTGGGTGTGGTGGTGTGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCA 109688036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2576 AAAATTATCTGGGTGTGGTGGTGTGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCA 2635

109688037 TGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGTAGAGGTTGCAGCGAGCCAAGATCACACCACTGCAC 109688096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2636 TGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGTAGAGGTTGCAGCGAGCCAAGATCACACCACTGCAC 2695

109688097 TCTAGCAAGGGTGACAAAGCAAGACTCTATCTCAAAAAAAAAAAGACATTTATGTAGAGA 109688156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2696 TCTAGCAAGGGTGACAAAGCAAGACTCTATCTCAAAAAAAAAAAGACATTTATGTAGAGA 2755

109688157 TGTTAGGTTGGCAGTTGGATAACAGTCTTGAGTTTCGGGGTGAGGGCAGGACCAGAAATG 109688216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2756 TGTTAGGTTGGCAGTTGGATAACAGTCTTGAGTTTCGGGGTGAGGGCAGGACCAGAAATG 2815

109688217 AAGATTTGGGATTCATTAGCATGTAGATCATATTCAGAGCCACAATAATAGATGAAATAA 109688276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2816 AAGATTTGGGATTCATTAGCATGTAGATCATATTCAGAGCCACAATAATAGATGAAATAA 2875

109688277 CTGAGGAAGAGAGCTAGAGGGGCCAAGAGCAAACACAGGAACATGCCAGCATTTAGAGGA 109688336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2876 CTGAGGAAGAGAGCTAGAGGGGCCAAGAGCAAACACAGGAACATGCCAGCATTTAGAGGA 2935

109688337 CAATGGAGAAGGAGGAGATGGCAGAGATGTCAATAGGAGGAAAAGCAAAAGGGTGTTATC 109688396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2936 CAATGGAGAAGGAGGAGATGGCAGAGATGTCAATAGGAGGAAAAGCAAAAGGGTGTTATC 2995

109688397 ATAGAAGGTGACAACAGAATATATCACAAAGAGGAATATGTTTGAATGTGTCAAATGTTG 109688456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2996 ATAGAAGGTGACAACAGAATATATCACAAAGAGGAATATGTTTGAATGTGTCAAATGTTG 3055

109688457 TTATCACAGGCTATAGAAGTAAACACAAAGTCTTATGGGAATACTGAGGATGAGCTGCCT 109688516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3056 TTATCACAGGCTATAGAAGTAAACACAAAGTCTTATGGGAATACTGAGGATGAGCTGCCT 3115

109688517 CTAGTGTGTGTGAAACCCTGGCCAAATATTTGTTGTGGGGCCCCTGTCTATATATGCAAT 109688576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3116 CTAGTGTGTGTGAAACCCTGGCCAAATATTTGTTGTGGGGCCCCTGTCTATATATGCAAT 3175

109688577 GTTATTTAAAAACATACTACATATTCTTGGGCTTATGTGGGATGTAGTGATTTATTGATG 109688636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3176 GTTATTTAAAAACATACTACATATTCTTGGGCTTATGTGGGATGTAGTGATTTATTGATG 3235

109688637 AAGACTTAGAATACTGGGTAGGAAGAGATGCTTTTGGATTTGTTTATGAGCCAGTGAGTG 109688696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3236 AAGACTTAGAATACTGGGTAGGAAGAGATGCTTTTGGATTTGTTTATGAGCCAGTGAGTG 3295

109688697 TATCTGAGGATTCTTTATCCTGTGTCTAATGTGAGTGTGTTTTCCTGAATCAGTGCATCA 109688756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3296 TATCTGAGGATTCTTTATCCTGTGTCTAATGTGAGTGTGTTTTCCTGAATCAGTGCATCA 3355

109688757 GTGCTATTCTGGAGGCCCAAATCACACATGATTCCGTGAAAGAAACTCTGTGCTGGCCAG 109688816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3356 GTGCTATTCTGGAGGCCCAAATCACACATGATTCCGTGAAAGAAACTCTGTGCTGGCCAG 3415

109688817 AGGATGCACTCACTCTCCAGGCTTTCCTGCATGGGCCCTCACCATGGAGTCCTGGATACT 109688876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3416 AGGATGCACTCACTCTCCAGGCTTTCCTGCATGGGCCCTCACCATGGAGTCCTGGATACT 3475

109688877 TAGGGCATCTGGTTGACCACATGCTTGGGAGAGCACCAAAGAAGGTCCTGGTTTTCAAGC 109688936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3476 TAGGGCATCTGGTTGACCACATGCTTGGGAGAGCACCAAAGAAGGTCCTGGTTTTCAAGC 3535

109688937 CTCCAGCTTCTCCTTAGAAAGAGTTGACTACCTGTCTGGGCTCCAACTTTTCTGGCTGCT 109688996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3536 CTCCAGCTTCTCCTTAGAAAGAGTTGACTACCTGTCTGGGCTCCAACTTTTCTGGCTGCT 3595

109688997 ACCAGAGGGTCTGGCCTCTAAACCATCTGTGTCAAAGAACTGACAGGGCCTGACATTCAC 109689056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3596 ACCAGAGGGTCTGGCCTCTAAACCATCTGTGTCAAAGAACTGACAGGGCCTGACATTCAC 3655

109689057 TGGGACCCTAGGCTAGGGGTGACAGAGAGCAAAGCAAAAGTTTGAAAGAGTATGCAGTCT 109689116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3656 TGGGACCCTAGGCTAGGGGTGACAGAGAGCAAAGCAAAAGTTTGAAAGAGTATGCAGTCT 3715

109689117 GAATGAGCATGCAGACCTTTGCCACAGCTCCCCTTCCCAGCTCAGTGCAGAGCAAGTAGG 109689176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3716 GAATGAGCATGCAGACCTTTGCCACAGCTCCCCTTCCCAGCTCAGTGCAGAGCAAGTAGG 3775

109689177 AGATAAACTTCTGCTCTTAGCTTCTCTGTGAGGAGAGATGAAATGGACCACACATCTAGC 109689236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3776 AGATAAACTTCTGCTCTTAGCTTCTCTGTGAGGAGAGATGAAATGGACCACACATCTAGC 3835

109689237 ACCCCAACTTTTCTGACAACTACTAGAAGGACTGACTCCTGACTCACCTGTCTCAGGGCA 109689296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3836 ACCCCAACTTTTCTGACAACTACTAGAAGGACTGACTCCTGACTCACCTGTCTCAGGGCA 3895

109689297 CTGATGGTACTTGGCACACTCTAGTCTCCTGGGGCCACCAAGAACAAGAACAGCATTTTG 109689356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3896 CTGATGGTACTTGGCACACTCTAGTCTCCTGGGGCCACCAAGAACAAGAACAGCATTTTG 3955

109689357 GACAAACACACTGGTTTGAGAGGCACCCAGACTCTCTGACTGGGCTGTGAGGAGGCTCAT 109689416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3956 GACAAACACACTGGTTTGAGAGGCACCCAGACTCTCTGACTGGGCTGTGAGGAGGCTCAT 4015

109689417 CTGTGAAGACTGAGGGAGGTGGCTGTTTTATCAAATGTGCAGAAACCAACACAGAGAGTC 109689476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4016 CTGTGAAGACTGAGGGAGGTGGCTGTTTTATCAAATGTGCAGAAACCAACACAGAGAGTC 4075

109689477 AAAGACAATGAACAAACAGGAAATATGCCATAAATAAAAGAACAAGATAAATCTTCAGAA 109689536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4076 AAAGACAATGAACAAACAGGAAATATGCCATAAATAAAAGAACAAGATAAATCTTCAGAA 4135

109689537 ACTGACCCAAACAGAATGGAGATATGTGATTTACCAGACAAAAAATCAAAAGACCTGTCA 109689596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4136 ACTGACCCAAACAGAATGGAGATATGTGATTTACCAGACAAAAAATCAAAAGACCTGTCA 4195

109689597 CAAAGATGCTCAGTGAGGTCAGGAGAGCAATGCATGAATAAAGTGAGAATTTCAACCAAA 109689656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4196 CAAAGATGCTCAGTGAGGTCAGGAGAGCAATGCATGAATAAAGTGAGAATTTCAACCAAA 4255

109689657 AAGGTAGAAAATATTAAAAAGTGCCAAACAGAAATCACGGAGCTGAAGAATATAATAAAA 109689716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4256 AAGGTAGAAAATATTAAAAAGTGCCAAACAGAAATCACGGAGCTGAAGAATATAATAAAA 4315

109689717 GAACAGAAAAATTTAATAGAGGGGTTCAATAGCAGACTAGGTGAACTGAAAGAAAGGATT 109689776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4316 GAACAGAAAAATTTAATAGAGGGGTTCAATAGCAGACTAGGTGAACTGAAAGAAAGGATT 4375

109689777 AGTGAACTCAAGGACTGGTCATTGGCAATCATTCAGTCACAGCATTAAAAAGAAAAAAGA 109689836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4376 AGTGAACTCAAGGACTGGTCATTGGCAATCATTCAGTCACAGCATTAAAAAGAAAAAAGA 4435

109689837 ATGAAGGGCCAGGCACAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCTGAGGTG 109689896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4436 ATGAAGGGCCAGGCACAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCTGAGGTG 4495

109689897 GGTGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATCTC 109689956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4496 GGTGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATCTC 4555

109689957 TACTAAAAATACAAAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCACGCACCTGTAATCCCAGCTACT 109690016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4556 TACTAAAAATACAAAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCACGCACCTGTAATCCCAGCTACT 4615

109690017 CGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTACTTGAACCTGGGAGGCTGAGGTTGCAGTGAGCTGAG 109690076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4616 CGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTACTTGAACCTGGGAGGCTGAGGTTGCAGTGAGCTGAG 4675

109690077 ATTGCGCCACTGCACTCAGGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTCTGTCTCAAAAGAAAAAAA 109690136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4676 ATTGCGCCACTGCACTCAGGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTCTGTCTCAAAAGAAAAAAA 4735

109690137 AAGAGAGAGAGAAGAAAAGAAAAAAGAATGAAAAACAGTGAAGATACCTTTAAAAACTAA 109690196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4736 AAGAGAGAGAGAAGAAAAGAAAAAAGAATGAAAAACAGTGAAGATACCTTTAAAAACTAA 4795

109690197 TGAACACCACCCAGCAGATCTACATATGCATTATGAGACACTCAGACATTATGATATCAG 109690256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4796 TGAACACCACCCAGCAGATCTACATATGCATTATGAGACACTCAGACATTATGATATCAG 4855

109690257 TAACACAGAATGTGGAATAAGGAGAGGTAAAATTGCAGAGTACTTCTATAGAAGTGTTAT 109690316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4856 TAACACAGAATGTGGAATAAGGAGAGGTAAAATTGCAGAGTACTTCTATAGAAGTGTTAT 4915

109690317 CAGTTTAACCTGTTATAAATATATGTTATGTAAGCCCCTGGTAACCACAAAGAAACTACC 109690376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4916 CAGTTTAACCTGTTATAAATATATGTTATGTAAGCCCCTGGTAACCACAAAGAAACTACC 4975

109690377 TATAGAAATGACACAAAAGAAAAAAAGTTACAAAGCCTATCAATGCAAAACAGCACAACA 109690436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     4976 TATAGAAATGACACAAAAGAAAAAAAGTTACAAAGCCTGTCAATGCAAAACAGCACAACA 5035

109690437 AAAACAGGCAAACAAAACCCAACAATAAAACACAAAGGAAGACAGCAAGAGAGAAAAAGA 109690496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5036 AAAACAGGCAAACAAAACCCAACAATAAAACACAAAGGAAGACAGCAAGAGAGAAAAAGA 5095

109690497 GGGACAAAAGAACTACAAGACAAACAGAAAACAGTTTTAAAAAAATGGCAATATGGTGGT 109690556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5096 GGGACAAAAGAACTACAAGACAAACAGAAAACAGTTTTAAAAAAATGGCAATATGGTGGT 5155

109690557 TCATACCTGTAATCCCAACACTTAGGAAGGCCGAGACGAGCAGATCACTTGAGGTCAGGA 109690616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5156 TCATACCTGTAATCCCAACACTTAGGAAGGCCGAGACGAGCAGATCACTTGAGGTCAGGA 5215

109690617 GTTTGAGACCAACCTGGCCAACATAGTGAAACCTGGTCTCTACTAGAAATACACAAAATT 109690676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5216 GTTTGAGACCAACCTGGCCAACATAGTGAAACCTGGTCTCTACTAGAAATACACAAAATT 5275

109690677 TAGCCAGGTGTAGTGGCAGGAGCCTGTAATCCAGCTACTCGGGAGGCTGAAGCACAAGAA 109690736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5276 TAGCCAGGTGTAGTGGCAGGAGCCTGTAATCCAGCTACTCGGGAGGCTGAAGCACAAGAA 5335

109690737 TTGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAACTGAGATTGTACCACTGCACTCCAGC 109690796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5336 TTGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAACTGAGATTGTACCACTGCACTCCAGC 5395

109690797 CTGGACAACAGAGCAAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAGGCAATACTAAATCTTGCCCTAT 109690856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5396 CTGGACAACAGAGCAAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAGGCAATACTAAATCTTGCCCTAT 5455

109690857 CAATAATTACTTAAAATGGCTGAATGTGGCGGCTTATGCCTGTAATCCCAGCACTCTGGG 109690916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5456 CAATAATTACTTAAAATGGCTGAATGTGGCGGCTTATGCCTGTAATCCCAGCACTCTGGG 5515

109690917 AGGCCAAGGCAGGTAGATCACTTGAGACCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGAT 109690976
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     5516 AGGCCAAGGCAGGTAGATCACTTGAGACCAGGAGTCCAAGACCAGCCTGGCCAACATGAT 5575

109690977 GAAGCCCCATCTCTACTAAAAAATACAAAAATTAGCAGGGTGTGGTGGCATGTGCCTGTA 109691036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5576 GAAGCCCCATCTCTACTAAAAAATACAAAAATTAGCAGGGTGTGGTGGCATGTGCCTGTA 5635

109691037 ATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGAGAATAGCTTGAACCTGGGAAGTGGAGGCAGC 109691096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5636 ATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGAGAATAGCTTGAACCTGGGAAGTGGAGGCAGC 5695

109691097 AGTGAGCCAAGATCACACCGCTAGACTCCAGGCTGGGCAACAGAGCAAGACTGCATCTCA 109691156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5696 AGTGAGCCAAGATCACACCGCTAGACTCCAGGCTGGGCAACAGAGCAAGACTGCATCTCA 5755

109691157 AATAATAATAATAATAATAGTAATAATTACTTAAAATGTAAATGGATTGGCCAGGTTCAT 109691216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5756 AATAATAATAATAATAATAGTAATAATTACTTAAAATGTAAATGGATTGGCCAGGTTCAT 5815

109691217 GCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCTGAGTCAGGAGGATCACGAGGTCAGGAGTTCAA 109691276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5816 GCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCTGAGTCAGGAGGATCACGAGGTCAGGAGTTCAA 5875

109691277 GACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGG 109691336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5876 GACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGG 5935

109691337 CATGGTGGTGGGC 109691349
          |||||||||||||
     5936 CATGGTGGTGGGC 5948

Alignment time is 5.20943 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [109679900,109705214] =>     25315 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [        1,     6320] =>      6320 nucs 'mol-32-3332-089757_6320'

Score:        6217
Aligned:      6316        nucs
Identic:      6307 (100%) nucs =>      2582 (100%)      3725 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [109687317,109689900] EXCISED REGION [109695215,109698946]
 second seq =>  [        5,     2588] EXCISED REGION [     2589,     6320]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      5314 nucs [109689901,109695214]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        28 nucs [109689901,109689928] to [109695215,109695242]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [109689900,109689900] to [109695215,109695215]
 second seq =>         1 nucs [2588,2588] to [2589,2589]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

109687317 AAAAAAAAAAAAAAAATAGAGTGCGGCACCCCTCCCTTCCCACTGTTGCTCCCTCTCTCG 109687376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        5 AAAAAAAAAAAAAAAATAGAGTGCGGCACCCCTCCCTTCCCACTGTTGCTCCCTCTCTCG 64

109687377 CCATGTGGGGCACGGGCTGCTCCTTCATCTTCCACCATTATTGTGAGCTTCCTGAGGCCT 109687436
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       65 CCATGTGGGGCATGGGCTGCTCCTTCATCTTCCACCATTATTGTGAGCTTCCTGAGGCCT 124

109687437 CACCAGGAGCAGATGTGAGCAAATTAAACCTCTTTTCTTTATAAATTACCCATATTTAGG 109687496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      125 CACCAGGAGCAGATGTGAGCAAATTAAACCTCTTTTCTTTATAAATTACCCATATTTAGG 184

109687497 TATTTATTTATAGCTACTACAAGGGGGAAAGGGAGAGCAGGGAGATCAGTGGTGCTTTCA 109687556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      185 TATTTATTTATAGCTACTACAAGGGGGAAAGGGAGAGCAGGGAGATCAGTGGTGCTTTCA 244

109687557 CACTAGTACAGCAATAGAGCAGCATCTTGGACCAGGGTGGTGGCTGAGGAGACAGGATCA 109687616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      245 CACTAGTACAGCAATAGAGCAGCATCTTGGACCAGGGTGGTGGCTGAGGAGACAGGATCA 304

109687617 TGGCTTTGAGATACATTCTGAAGAAGAAAAGTAGGCCTTGCTGATAGAATAGTCACAAAC 109687676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      305 TGGCTTTGAGATACATTCTGAAGAAGAAAAGTAGGCCTTGCTGATAGAATAGTCACAAAC 364

109687677 TGTAATGGAAAAGGTAAATTCAAGGATGTCTCCTGGGTTTTTGGCTTAAGCATCTGGATA 109687736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      365 TGTAATGGAAAAGGTAAATTCAAGGATGTCTCCTGGGTTTTTGGCTTAAGCATCTGGATA 424

109687737 CAGAGATATGGAAGACTGGGAGGGAAATGGGTTTGGAGTATACATGCATGCAATCAACAA 109687796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      425 CAGAGATATGGAAGACTGGGAGGGAAATGGGTTTGGAGTATACATGCATGCAATCAACAA 484

109687797 TTCTGTCTTGCATGTGTGAAATTTAGATACCCATTAGACATCTGCATAGAGGGCCAGGCA 109687856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      485 TTCTGTCTTGCATGTGTGAAATTTAGATACCCATTAGACATCTGCATAGAGGGCCAGGCA 544

109687857 CAGTGGCTCACGGCAGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCGGATCACTTGAG 109687916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      545 CAGTGGCTCACGGCAGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCGGATCACTTGAG 604

109687917 GTTAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACTCTGTCTCTACTAAAAATACA 109687976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      605 GTTAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACTCTGTCTCTACTAAAAATACA 664

109687977 AAAATTATCTGGGTGTGGTGGTGTGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCA 109688036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      665 AAAATTATCTGGGTGTGGTGGTGTGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCA 724

109688037 TGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGTAGAGGTTGCAGCGAGCCAAGATCACACCACTGCAC 109688096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      725 TGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGTAGAGGTTGCAGCGAGCCAAGATCACACCACTGCAC 784

109688097 TCTAGCAAGGGTGACAAAGCAAGACTCTATCTCAAAAAAAAAAAGACATTTATGTAGAGA 109688156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      785 TCTAGCAAGGGTGACAAAGCAAGACTCTATCTCAAAAAAAAAAAGACATTTATGTAGAGA 844

109688157 TGTTAGGTTGGCAGTTGGATAACAGTCTTGAGTTTCGGGGTGAGGGCAGGACCAGAAATG 109688216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      845 TGTTAGGTTGGCAGTTGGATAACAGTCTTGAGTTTCGGGGTGAGGGCAGGACCAGAAATG 904

109688217 AAGATTTGGGATTCATTAGCATGTAGATCATATTCAGAGCCACAATAATAGATGAAATAA 109688276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      905 AAGATTTGGGATTCATTAGCATGTAGATCATATTCAGAGCCACAATAATAGATGAAATAA 964

109688277 CTGAGGAAGAGAGCTAGAGGGGCCAAGAGCAAACACAGGAACATGCCAGCATTTAGAGGA 109688336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      965 CTGAGGAAGAGAGCTAGAGGGGCCAAGAGCAAACACAGGAACATGCCAGCATTTAGAGGA 1024

109688337 CAATGGAGAAGGAGGAGATGGCAGAGATGTCAATAGGAGGAAAAGCAAAAGGGTGTTATC 109688396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1025 CAATGGAGAAGGAGGAGATGGCAGAGATGTCAATAGGAGGAAAAGCAAAAGGGTGTTATC 1084

109688397 ATAGAAGGTGACAACAGAATATATCACAAAGAGGAATATGTTTGAATGTGTCAAATGTTG 109688456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1085 ATAGAAGGTGACAACAGAATATATCACAAAGAGGAATATGTTTGAATGTGTCAAATGTTG 1144

109688457 TTATCACAGGCTATAGAAGTAAACACAAAGTCTTATGGGAATACTGAGGATGAGCTGCCT 109688516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1145 TTATCACAGGCTATAGAAGTAAACACAAAGTCTTATGGGAATACTGAGGATGAGCTGCCT 1204

109688517 CTAGTGTGTGTGAAACCCTGGCCAAATATTTGTTGTGGGGCCCCTGTCTATATATGCAAT 109688576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1205 CTAGTGTGTGTGAAACCCTGGCCAAATATTTGTTGTGGGGCCCCTGTCTATATATGCAAT 1264

109688577 GTTATTTAAAAACATACTACATATTCTTGGGCTTATGTGGGATGTAGTGATTTATTGATG 109688636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1265 GTTATTTAAAAACATACTACATATTCTTGGGCTTATGTGGGATGTAGTGATTTATTGATG 1324

109688637 AAGACTTAGAATACTGGGTAGGAAGAGATGCTTTTGGATTTGTTTATGAGCCAGTGAGTG 109688696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1325 AAGACTTAGAATACTGGGTAGGAAGAGATGCTTTTGGATTTGTTTATGAGCCAGTGAGTG 1384

109688697 TATCTGAGGATTCTTTATCCTGTGTCTAATGTGAGTGTGTTTTCCTGAATCAGTGCATCA 109688756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1385 TATCTGAGGATTCTTTATCCTGTGTCTAATGTGAGTGTGTTTTCCTGAATCAGTGCATCA 1444

109688757 GTGCTATTCTGGAGGCCCAAATCACACATGATTCCGTGAAAGAAACTCTGTGCTGGCCAG 109688816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1445 GTGCTATTCTGGAGGCCCAAATCACACATGATTCCGTGAAAGAAACTCTGTGCTGGCCAG 1504

109688817 AGGATGCACTCACTCTCCAGGCTTTCCTGCATGGGCCCTCACCATGGAGTCCTGGATACT 109688876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1505 AGGATGCACTCACTCTCCAGGCTTTCCTGCATGGGCCCTCACCATGGAGTCCTGGATACT 1564

109688877 TAGGGCATCTGGTTGACCACATGCTTGGGAGAGCACCAAAGAAGGTCCTGGTTTTCAAGC 109688936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1565 TAGGGCATCTGGTTGACCACATGCTTGGGAGAGCACCAAAGAAGGTCCTGGTTTTCAAGC 1624

109688937 CTCCAGCTTCTCCTTAGAAAGAGTTGACTACCTGTCTGGGCTCCAACTTTTCTGGCTGCT 109688996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1625 CTCCAGCTTCTCCTTAGAAAGAGTTGACTACCTGTCTGGGCTCCAACTTTTCTGGCTGCT 1684

109688997 ACCAGAGGGTCTGGCCTCTAAACCATCTGTGTCAAAGAACTGACAGGGCCTGACATTCAC 109689056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1685 ACCAGAGGGTCTGGCCTCTAAACCATCTGTGTCAAAGAACTGACAGGGCCTGACATTCAC 1744

109689057 TGGGACCCTAGGCTAGGGGTGACAGAGAGCAAAGCAAAAGTTTGAAAGAGTATGCAGTCT 109689116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1745 TGGGACCCTAGGCTAGGGGTGACAGAGAGCAAAGCAAAAGTTTGAAAGAGTATGCAGTCT 1804

109689117 GAATGAGCATGCAGACCTTTGCCACAGCTCCCCTTCCCAGCTCAGTGCAGAGCAAGTAGG 109689176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1805 GAATGAGCATGCAGACCTTTGCCACAGCTCCCCTTCCCAGCTCAGTGCAGAGCAAGTAGG 1864

109689177 AGATAAACTTCTGCTCTTAGCTTCTCTGTGAGGAGAGATGAAATGGACCACACATCTAGC 109689236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1865 AGATAAACTTCTGCTCTTAGCTTCTCTGTGAGGAGAGATGAAATGGACCACACATCTAGC 1924

109689237 ACCCCAACTTTTCTGACAACTACTAGAAGGACTGACTCCTGACTCACCTGTCTCAGGGCA 109689296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1925 ACCCCAACTTTTCTGACAACTACTAGAAGGACTGACTCCTGACTCACCTGTCTCAGGGCA 1984

109689297 CTGATGGTACTTGGCACACTCTAGTCTCCTGGGGCCACCAAGAACAAGAACAGCATTTTG 109689356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1985 CTGATGGTACTTGGCACACTCTAGTCTCCTGGGGCCACCAAGAACAAGAACAGCATTTTG 2044

109689357 GACAAACACACTGGTTTGAGAGGCACCCAGACTCTCTGACTGGGCTGTGAGGAGGCTCAT 109689416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2045 GACAAACACACTGGTTTGAGAGGCACCCAGACTCTCTGACTGGGCTGTGAGGAGGCTCAT 2104

109689417 CTGTGAAGACTGAGGGAGGTGGCTGTTTTATCAAATGTGCAGAAACCAACACAGAGAGTC 109689476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2105 CTGTGAAGACTGAGGGAGGTGGCTGTTTTATCAAATGTGCAGAAACCAACACAGAGAGTC 2164

109689477 AAAGACAATGAACAAACAGGAAATATGCCATAAATAAAAGAACAAGATAAATCTTCAGAA 109689536
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     2165 AAAGACAATGAACAAACAGGAAATATGCCATAAATAAAAGAACAAGATAAAACTTCAGAA 2224

109689537 ACTGACCCAAACAGAATGGAGATATGTGATTTACCAGACAAAAAATCAAAAGACCTGTCA 109689596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2225 ACTGACCCAAACAGAATGGAGATATGTGATTTACCAGACAAAAAATCAAAAGACCTGTCA 2284

109689597 CAAAGATGCTCAGTGAGGTCAGGAGAGCAATGCATGAATAAAGTGAGAATTTCAACCAAA 109689656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2285 CAAAGATGCTCAGTGAGGTCAGGAGAGCAATGCATGAATAAAGTGAGAATTTCAACCAAA 2344

109689657 AAGGTAGAAAATATTAAAAAGTGCCAAACAGAAATCACGGAGCTGAAGAATATAATAAAA 109689716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2345 AAGGTAGAAAATATTAAAAAGTGCCAAACAGAAATCACGGAGCTGAAGAATATAATAAAA 2404

109689717 GAACAGAAAAATTTAATAGAGGGGTTCAATAGCAGACTAGGTGAACTGAAAGAAAGGATT 109689776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2405 GAACAGAAAAATTTAATAGAGGGGTTCAATAGCAGACTAGGTGAACTGAAAGAAAGGATT 2464

109689777 AGTGAACTCAAGGACTGGTCATTGGCAATCATTCAGTCACAGCATTAAAAAGAAAAAAGA 109689836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2465 AGTGAACTCAAGGACTGGTCATTGGCAATCATTCAGTCACAGCATTAAAAAGAAAAAAGA 2524

109689837 ATGAAGGGCCAGGCACAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCTGAGGTG 109689896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2525 ATGAAGGGCCAGGCACAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCTGAGGTG 2584

109689897 GGTG 109689900
          ||||
     2585 GGTG 2588

EXCISED REGION

109695215 GATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATTCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATTTCAACT 109695274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2589 GATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATTCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATTTCAACT 2648

109695275 AAAAATACAAAAAAAAAAAAAAAATAGCCGGGTGTGGTGGCACACACCCGTAGTCCCAGC 109695334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2649 AAAAATACAAAAAAAAAAAAAAAATAGCCGGGTGTGGTGGCACACACCCGTAGTCCCAGC 2708

109695335 TACTTGGGAGGCTGGGGCAGGAGAATGGCATGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGC 109695394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2709 TACTTGGGAGGCTGGGGCAGGAGAATGGCATGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGC 2768

109695395 CGAGATCGCACAATTGCTTTCCAGCCTGGGCAACGGAGCGAGACTCTGTTTCAAAAAAAA 109695454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2769 CGAGATCGCACAATTGCTTTCCAGCCTGGGCAACGGAGCGAGACTCTGTTTCAAAAAAAA 2828

109695455 AGGTGACCATGTGAAGGGATGGATATGTTAAGTAGCTTGACTGGTAATCGGTTCACGATG 109695514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2829 AGGTGACCATGTGAAGGGATGGATATGTTAAGTAGCTTGACTGGTAATCGGTTCACGATG 2888

109695515 TATATGTACAGTTGACCCTTGAACAACATGCGTTTAAATTACAAGAGTCCACTTATATGG 109695574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2889 TATATGTACAGTTGACCCTTGAACAACATGCGTTTAAATTACAAGAGTCCACTTATATGG 2948

109695575 GGATTTTCTTCTGCCTCTGCCAGCAAGGCCAACCCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCCCCTCA 109695634
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2949 GGATTTTCTTCTGCCTTTGCCAGCAAGGCCAACCCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCCCCTCA 3008

109695635 ACTAAAGACGAGGAGGATGAGGACCTTTAGGGTGATCCACTTCCACTTAATGAATAGTAA 109695694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3009 ACTAAAGACGAGGAGGATGAGGACCTTTAGGGTGATCCACTTCCACTTAATGAATAGTAA 3068

109695695 ATACGGTTTCTCTTCCTTATGATTTTCTTAATATTTTCTTTTCCCTAACTTACTTTGTTG 109695754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3069 ATACGGTTTCTCTTCCTTATGATTTTCTTAATATTTTCTTTTCCCTAACTTACTTTGTTG 3128

109695755 TAAGAATGCAGTACTCAATACACGTAAGATACAAAATTTGTATGAATTGACTGTTTGTGT 109695814
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3129 TAAGAATGCAGTACACAATACACGTAAGATACAAAATTTGTATGAATTGACTGTTTGTGT 3188

109695815 TATCTGCAAGGCTTCCTGTCAACACTAGGGTATTAATAGTTAAGTTTTGGGGGAGTCAAA 109695874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3189 TATCTGCAAGGCTTCCTGTCAACACTAGGGTATTAATAGTTAAGTTTTGGGGGAGTCAAA 3248

109695875 AGTTATTTGTGGATTTTTTACTGTTCGGGGAGTTGGTGCCCCTAACCCCTTCGTTGTTAA 109695934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3249 AGTTATTTGTGGATTTTTTACTGTTCGGGGAGTTGGTGCCCCTAACCCCTTCGTTGTTAA 3308

109695935 AGAGTCAACTGTATATCAAAACATCGTGCTGTATACCTTAAATGTATATACTTTCAATTA 109695994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3309 AGAGTCAACTGTATATCAAAACATCGTGCTGTATACCTTAAATGTATATACTTTCAATTA 3368

109695995 AAATATTTTAAAAACAAACCAATAAAAAGGCACTGCTTCTGGCCCAGGGTGAGCCATCAG 109696054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3369 AAATATTTTAAAAACAAACCAATAAAAAGGCACTGCTTCTGGCCCAGGGTGAGCCATCAG 3428

109696055 ATGGCACAGCTGGCCCTGTCCGGTCCCAACCAGCAGAGGGGACTGTCAATTGAGAAGCTC 109696114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3429 ATGGCACAGCTGGCCCTGTCCGGTCCCAACCAGCAGAGGGGACTGTCAATTGAGAAGCTC 3488

109696115 CAGTGCTAAACGCTGGAATATGAAGATATGCATGGTGGGGAGACAGCACACACACACATA 109696174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3489 CAGTGCTAAACGCTGGAATATGAAGATATGCATGGTGGGGAGACAGCACACACACACATA 3548

109696175 ACACTCAAGGCCTGGTGGAGCCCACCCAGCTCAGCCTGGGTTGGGGAGGCTCCCTGGGAA 109696234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3549 ACACTCAAGGCCTGGTGGAGCCCACCCAGCTCAGCCTGGGTTGGGGAGGCTCCCTGGGAA 3608

109696235 GGGGATTCCTGATGTGAGCCTTCCAGGAGGGGTAGGAATTCTCTACACAGACAGGTGGGA 109696294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3609 GGGGATTCCTGATGTGAGCCTTCCAGGAGGGGTAGGAATTCTCTACACAGACAGGTGGGA 3668

109696295 ACTCCAGGCAGAGGGGAGGCCTGAAACACATCACAGGCCACCCTGTCCCTAGACTGCTGA 109696354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3669 ACTCCAGGCAGAGGGGAGGCCTGAAACACATCACAGGCCACCCTGTCCCTAGACTGCTGA 3728

109696355 GAGGCAGGACGGGGCTACACGGCCATGGGTGTGAGTCACCAAGGACCCTGTGCCTGCTGA 109696414
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     3729 GAGGCAGGACGGGGCTACACGGCCATGGGCGTGAGTCACCAAGGACCCTGTGCCTGCTGA 3788

109696415 GGCATGAGGACGCATTTCTGGGACGACAGAAAGACAGCAAAGGGCTTCAGACTATGGAAT 109696474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3789 GGCATGAGGACGCATTTCTGGGACGACAGAAAGACAGCAAAGGGCTTCAGACTATGGAAT 3848

109696475 ACCCGGAATAGGGCTCTAAGCATCTCCTCCGATGATTGTGGACTCAATGCAGGAAATGTG 109696534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3849 ACCCGGAATAGGGCTCTAAGCATCTCCTCCGATGATTGTGGACTCAATGCAGGAAATGTG 3908

109696535 GAGGCTTCGAGCTAGACCAGTGACAGAGGAGGGAAAAGGAGATGGGGCCCATCAATATTT 109696594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3909 GAGGCTTCGAGCTAGACCAGTGACAGAGGAGGGAAAAGGAGATGGGGCCCATCAATATTT 3968

109696595 GAAACTTGGCAAAACGCAGCAAGATTTTAATGGTTAATCAAAAATGGGAGGTGAATGGGA 109696654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3969 GAAACTTGGCAAAACGCAGCAAGATTTTAATGGTTAATCAAAAATGGGAGGTGAATGGGA 4028

109696655 GAAAGAGGAGCTGACAACCACTCCCACAATTCTGGTTTCCAGGGCGTGTTATAGCTGAGA 109696714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4029 GAAAGAGGAGCTGACAACCACTCCCACAATTCTGGTTTCCAGGGCGTGTTATAGCTGAGA 4088

109696715 GGGCAGCAGTTTGAGTGGCTGGGCAGCAGAGGCTGGGGTTGAGGCTGGGAAGTGGCGGCA 109696774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4089 GGGCAGCAGTTTGAGTGGCTGGGCAGCAGAGGCTGGGGTTGAGGCTGGGAAGTGGCGGCA 4148

109696775 GCAGGGGAGACTGCCCCATCAGGAGCCTGCCATAAGCGTGGGATGCAGAAGGACTGGAAG 109696834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4149 GCAGGGGAGACTGCCCCATCAGGAGCCTGCCATAAGCGTGGGATGCAGAAGGACTGGAAG 4208

109696835 GTGCTGGAGGTGATGTGGAGCTTTGGGAGAGTGTCGGAGGGATGGAATAAGTTGATGCCT 109696894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4209 GTGCTGGAGGTGATGTGGAGCTTTGGGAGAGTGTCGGAGGGATGGAATAAGTTGATGCCT 4268

109696895 GTTCCGAGACCAAGAAGTGGGGAGCAACTGAAGAAACTGGAGAGTGGGAACCAGGTTGCA 109696954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4269 GTTCCGAGACCAAGAAGTGGGGAGCAACTGAAGAAACTGGAGAGTGGGAACCAGGTTGCA 4328

109696955 GCTGGTCTCCAGATGCTGCACTCTCTGACAGCTCTCATCTATCTCACTGTCACCCAGGAT 109697014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4329 GCTGGTCTCCAGATGCTGCACTCTCTGACAGCTCTCATCTATCTCACTGTCACCCAGGAT 4388

109697015 TGGACAGGACATCTACAAATGTGCATGTGTATTTGCTATAAGGTGCATTCTTTTCCCCTG 109697074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4389 TGGACAGGACATCTACAAATGTGCATGTGTATTTGCTATAAGGTGCATTCTTTTCCCCTG 4448

109697075 GAGATAGTGACCAACCTTTCAAGAACTATTCTTGGGTATATTTTATCATTTCTTTATTTT 109697134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4449 GAGATAGTGACCAACCTTTCAAGAACTATTCTTGGGTATATTTTATCATTTCTTTATTTT 4508

109697135 AGTATCTATGAAGGGAACATTATAGAAGCCATGTTAACACTGGAGAAATGTCTAATATTA 109697194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4509 AGTATCTATGAAGGGAACATTATAGAAGCCATGTTAACACTGGAGAAATGTCTAATATTA 4568

109697195 AAAAACCAGTACTCTAGCAAGTAAAATTATGTATGTGTGTAACCTCGTTCCTACATCCAG 109697254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4569 AAAAACCAGTACTCTAGCAAGTAAAATTATGTATGTGTGTAACCTCGTTCCTACATCCAG 4628

109697255 GAAATCATTAAACTAGTAGGGGGTTGTATTAATTAGAACTCTCTGTTGCAAACAACAGAC 109697314
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     4629 GAAATCATTAAACTAGTAGGGGGTTGTATTAATCAGAACTCTCTGTTGCAAACAACAGAC 4688

109697315 AGTCTGGATGATTTAAAAGGAACAGAAATGTATTAAGAGGATATTGGATAGTTCACAAAA 109697374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4689 AGTCTGGATGATTTAAAAGGAACAGAAATGTATTAAGAGGATATTGGATAGTTCACAAAA 4748

109697375 CCTCCAGGAGGGCTGGAGAGCCAGGCTGGATGCTGTGCCACTGACACAACATTCAAAACT 109697434
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     4749 CCTCCAGGAGGGCTGGAGAGCCAGGCTGGATGCTGTGCCACTGACACGACATTCAAAACT 4808

109697435 CACAGATTCTTCTGCTGCCATCCACTATGCTAGCTACCAGCCATGCATGGCCATGCAGCA 109697494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4809 CACAGATTCTTCTGCTGCCATCCACTATGCTAGCTACCAGCCATGCATGGCCATGCAGCA 4868

109697495 CTTGATGTGTGCCTGCCCAACTGAGATGTGCTGCAGGTGCACAATACTCACTGGACTTCG 109697554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4869 CTTGATGTGTGCCTGCCCAACTGAGATGTGCTGCAGGTGCACAATACTCACTGGACTTCG 4928

109697555 AAGACTAAACGTGAAGAAAGGACATAAAATCTCACTCAGGTTAAAATGATATCTGCACAC 109697614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4929 AAGACTAAACGTGAAGAAAGGACATAAAATCTCACTCAGGTTAAAATGATATCTGCACAC 4988

109697615 ACTGGGTATTAAGTAAAATACATTGAAATTAATTTCACTTGTTTCTTTTTGCTTTTTAAA 109697674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4989 ACTGGGTATTAAGTAAAATACATTGAAATTAATTTCACTTGTTTCTTTTTGCTTTTTAAA 5048

109697675 TGCAGTTACTAGAAAATTTTACATTACCTGTGGGAAATTGGCTCCACATCATTTCCTCTG 109697734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5049 TGCAGTTACTAGAAAATTTTACATTACCTGTGGGAAATTGGCTCCACATCATTTCCTCTG 5108

109697735 TTTTCTATTGATCGAATTGAGTCCTAAGGCCACATCTGATATTTGGGGGAAAGGAAATAT 109697794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5109 TTTTCTATTGATCGAATTGAGTCCTAAGGCCACATCTGATATTTGGGGGAAAGGAAATAT 5168

109697795 ACATCACCTCCAGATGGGGGCAGCCCCCCATGCAGGGATGGGGAGCTGCCCGAGGCTGTT 109697854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5169 ACATCACCTCCAGATGGGGGCAGCCCCCCATGCAGGGATGGGGAGCTGCCCGAGGCTGTT 5228

109697855 TTTGGAAACATCTGTGGTCCCCAACAACAGTGCTTCTGGCCTGTTTTTTCACATGGGGCT 109697914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5229 TTTGGAAACATCTGTGGTCCCCAACAACAGTGCTTCTGGCCTGTTTTTTCACATGGGGCT 5288

109697915 CCGCGTCTGTGGCTGACTCAATGCTGGGCTTGAGGTGGGGGTGACTGTCACATGACAGAT 109697974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5289 CCGCGTCTGTGGCTGACTCAATGCTGGGCTTGAGGTGGGGGTGACTGTCACATGACAGAT 5348

109697975 TAGGTCAAGCCTCCATCGTGCTCAGGGTTTATGAGACAGATCACAAGGGCCTCTGGGGAC 109698034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     5349 TAGGTCAAGCCTCCATCGTGCTCAGGGTTTATGAGACAGATCGCAAGGGCCTCTGGGGAC 5408

109698035 TGCCTGTCGCTTGTGGTCCTGGGGAACCAACCCCATGGTCAACTCCACCTCTGAACCTCT 109698094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5409 TGCCTGTCGCTTGTGGTCCTGGGGAACCAACCCCATGGTCAACTCCACCTCTGAACCTCT 5468

109698095 CCTGCAAGGGGCAAGAGCATCCTGGTAACCTTGCCCATCCTGACACCTGCTGTGGTAACT 109698154
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5469 CCTGCAAGGGGCCAGAGCATCCTGGTAACCTTGCCCATCCTGACACCTGCTGTGGTAACT 5528

109698155 CATTCCCTGCTCTGGCACTTGAGCAACCCCTCGGCCCCACCATCCCAGGACTTCACAACC 109698214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5529 CATTCCCTGCTCTGGCACTTGAGCAACCCCTCGGCCCCACCATCCCAGGACTTCACAACC 5588

109698215 TGCCGCCGCCAGGGAGCCCTTTTTGCAACCACAGTGCCTGGCAGCAGTGACATGGCTTGC 109698274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5589 TGCCGCCGCCAGGGAGCCCTTTTTGCAACCACAGTGCCTGGCAGCAGTGACATGGCTTGC 5648

109698275 AGAAACACATCCTTGCTATTCAGTTGCACTTGCCAACGAGGCATCTTCTGGGGTCTTGTC 109698334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5649 AGAAACACATCCTTGCTATTCAGTTGCACTTGCCAACGAGGCATCTTCTGGGGTCTTGTC 5708

109698335 GGGGAGATCACTGGGGGATGGCCAGCTGTTTTCATAGGAAAAGTCTGTCTGGTTCTTCAT 109698394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5709 GGGGAGATCACTGGGGGATGGCCAGCTGTTTTCATAGGAAAAGTCTGTCTGGTTCTTCAT 5768

109698395 CTCCGTATTTGTCCTCCACACTGCTCACTGCATTTCTGCATCCTGGCTTTGTGTGGGGCA 109698454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5769 CTCCGTATTTGTCCTCCACACTGCTCACTGCATTTCTGCATCCTGGCTTTGTGTGGGGCA 5828

109698455 TGCTGCTGTGGACTCCAGCATCTGTCAACCCAAATGCAAAGGCGGAGCCCACCTCGGCTG 109698514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5829 TGCTGCTGTGGACTCCAGCATCTGTCAACCCAAATGCAAAGGCGGAGCCCACCTCGGCTG 5888

109698515 CAGGAACTGCCACACTGAAGTGCTCTACCCATGCTTCAGCTGCCTCCAGAATCCATTCCC 109698574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5889 CAGGAACTGCCACACTGAAGTGCTCTACCCATGCTTCAGCTGCCTCCAGAATCCATTCCC 5948

109698575 ATATGGGCTAACCAGATGTGTGCAGCTAATCAACAGTTAGCATTTCTGTCTTTGGATAGT 109698634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5949 ATATGGGCTAACCAGATGTGTGCAGCTAATCAACAGTTAGCATTTCTGTCTTTGGATAGT 6008

109698635 AAGGACTTCTGCTTCCAGACTTCAGATCTCTCCTTAGGTAGCAGCTCTGACCCAAGGTTA 109698694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6009 AAGGACTTCTGCTTCCAGACTTCAGATCTCTCCTTAGGTAGCAGCTCTGACCCAAGGTTA 6068

109698695 GGATTCCAGGACTCAGTCAGCTCCTGGTATTCCTTAGCACCCCTTTTTTATTTTATTTTA 109698754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6069 GGATTCCAGGACTCAGTCAGCTCCTGGTATTCCTTAGCACCCCTTTTTTATTTTATTTTA 6128

109698755 TTTTATTTATTTATTTTTTTGAGACAGAGTCTCTCTCTGTGGCCCAGGCTAGAGTGCAGT 109698814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6129 TTTTATTTATTTATTTTTTTGAGACAGAGTCTCTCTCTGTGGCCCAGGCTAGAGTGCAGT 6188

109698815 GGTGCTATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCTTCCCGGGTTCACACCATTCTCCTGCCTCA 109698874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6189 GGTGCTATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCTTCCCGGGTTCACACCATTCTCCTGCCTCA 6248

109698875 GCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCATGCCACCACATCTGGCCAATTTTTGTATTT 109698934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6249 GCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCATGCCACCACATCTGGCCAATTTTTGTATTT 6308

109698935 TTAGTAGAGATG 109698946
          ||||||||||||
     6309 TTAGTAGAGATG 6320

Alignment time is 5.62575 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [109679900,109705214] =>     25315 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [        1,     2774] =>      2774 nucs 'mol-32-3332-089757_2774'

Score:        2748
Aligned:      2770        nucs
Identic:      2768 (100%) nucs =>      2582 (100%)       186 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [109687317,109689900] EXCISED REGION [109695215,109695400]
 second seq =>  [        5,     2588] EXCISED REGION [     2589,     2774]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      5314 nucs [109689901,109695214]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        28 nucs [109689901,109689928] to [109695215,109695242]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [109689900,109689900] to [109695215,109695215]
 second seq =>         1 nucs [2588,2588] to [2589,2589]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

109687317 AAAAAAAAAAAAAAAATAGAGTGCGGCACCCCTCCCTTCCCACTGTTGCTCCCTCTCTCG 109687376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        5 AAAAAAAAAAAAAAAATAGAGTGCGGCACCCCTCCCTTCCCACTGTTGCTCCCTCTCTCG 64

109687377 CCATGTGGGGCACGGGCTGCTCCTTCATCTTCCACCATTATTGTGAGCTTCCTGAGGCCT 109687436
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       65 CCATGTGGGGCATGGGCTGCTCCTTCATCTTCCACCATTATTGTGAGCTTCCTGAGGCCT 124

109687437 CACCAGGAGCAGATGTGAGCAAATTAAACCTCTTTTCTTTATAAATTACCCATATTTAGG 109687496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      125 CACCAGGAGCAGATGTGAGCAAATTAAACCTCTTTTCTTTATAAATTACCCATATTTAGG 184

109687497 TATTTATTTATAGCTACTACAAGGGGGAAAGGGAGAGCAGGGAGATCAGTGGTGCTTTCA 109687556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      185 TATTTATTTATAGCTACTACAAGGGGGAAAGGGAGAGCAGGGAGATCAGTGGTGCTTTCA 244

109687557 CACTAGTACAGCAATAGAGCAGCATCTTGGACCAGGGTGGTGGCTGAGGAGACAGGATCA 109687616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      245 CACTAGTACAGCAATAGAGCAGCATCTTGGACCAGGGTGGTGGCTGAGGAGACAGGATCA 304

109687617 TGGCTTTGAGATACATTCTGAAGAAGAAAAGTAGGCCTTGCTGATAGAATAGTCACAAAC 109687676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      305 TGGCTTTGAGATACATTCTGAAGAAGAAAAGTAGGCCTTGCTGATAGAATAGTCACAAAC 364

109687677 TGTAATGGAAAAGGTAAATTCAAGGATGTCTCCTGGGTTTTTGGCTTAAGCATCTGGATA 109687736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      365 TGTAATGGAAAAGGTAAATTCAAGGATGTCTCCTGGGTTTTTGGCTTAAGCATCTGGATA 424

109687737 CAGAGATATGGAAGACTGGGAGGGAAATGGGTTTGGAGTATACATGCATGCAATCAACAA 109687796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      425 CAGAGATATGGAAGACTGGGAGGGAAATGGGTTTGGAGTATACATGCATGCAATCAACAA 484

109687797 TTCTGTCTTGCATGTGTGAAATTTAGATACCCATTAGACATCTGCATAGAGGGCCAGGCA 109687856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      485 TTCTGTCTTGCATGTGTGAAATTTAGATACCCATTAGACATCTGCATAGAGGGCCAGGCA 544

109687857 CAGTGGCTCACGGCAGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCGGATCACTTGAG 109687916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      545 CAGTGGCTCACGGCAGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCGGATCACTTGAG 604

109687917 GTTAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACTCTGTCTCTACTAAAAATACA 109687976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      605 GTTAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACTCTGTCTCTACTAAAAATACA 664

109687977 AAAATTATCTGGGTGTGGTGGTGTGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCA 109688036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      665 AAAATTATCTGGGTGTGGTGGTGTGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCA 724

109688037 TGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGTAGAGGTTGCAGCGAGCCAAGATCACACCACTGCAC 109688096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      725 TGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGTAGAGGTTGCAGCGAGCCAAGATCACACCACTGCAC 784

109688097 TCTAGCAAGGGTGACAAAGCAAGACTCTATCTCAAAAAAAAAAAGACATTTATGTAGAGA 109688156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      785 TCTAGCAAGGGTGACAAAGCAAGACTCTATCTCAAAAAAAAAAAGACATTTATGTAGAGA 844

109688157 TGTTAGGTTGGCAGTTGGATAACAGTCTTGAGTTTCGGGGTGAGGGCAGGACCAGAAATG 109688216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      845 TGTTAGGTTGGCAGTTGGATAACAGTCTTGAGTTTCGGGGTGAGGGCAGGACCAGAAATG 904

109688217 AAGATTTGGGATTCATTAGCATGTAGATCATATTCAGAGCCACAATAATAGATGAAATAA 109688276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      905 AAGATTTGGGATTCATTAGCATGTAGATCATATTCAGAGCCACAATAATAGATGAAATAA 964

109688277 CTGAGGAAGAGAGCTAGAGGGGCCAAGAGCAAACACAGGAACATGCCAGCATTTAGAGGA 109688336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      965 CTGAGGAAGAGAGCTAGAGGGGCCAAGAGCAAACACAGGAACATGCCAGCATTTAGAGGA 1024

109688337 CAATGGAGAAGGAGGAGATGGCAGAGATGTCAATAGGAGGAAAAGCAAAAGGGTGTTATC 109688396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1025 CAATGGAGAAGGAGGAGATGGCAGAGATGTCAATAGGAGGAAAAGCAAAAGGGTGTTATC 1084

109688397 ATAGAAGGTGACAACAGAATATATCACAAAGAGGAATATGTTTGAATGTGTCAAATGTTG 109688456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1085 ATAGAAGGTGACAACAGAATATATCACAAAGAGGAATATGTTTGAATGTGTCAAATGTTG 1144

109688457 TTATCACAGGCTATAGAAGTAAACACAAAGTCTTATGGGAATACTGAGGATGAGCTGCCT 109688516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1145 TTATCACAGGCTATAGAAGTAAACACAAAGTCTTATGGGAATACTGAGGATGAGCTGCCT 1204

109688517 CTAGTGTGTGTGAAACCCTGGCCAAATATTTGTTGTGGGGCCCCTGTCTATATATGCAAT 109688576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1205 CTAGTGTGTGTGAAACCCTGGCCAAATATTTGTTGTGGGGCCCCTGTCTATATATGCAAT 1264

109688577 GTTATTTAAAAACATACTACATATTCTTGGGCTTATGTGGGATGTAGTGATTTATTGATG 109688636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1265 GTTATTTAAAAACATACTACATATTCTTGGGCTTATGTGGGATGTAGTGATTTATTGATG 1324

109688637 AAGACTTAGAATACTGGGTAGGAAGAGATGCTTTTGGATTTGTTTATGAGCCAGTGAGTG 109688696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1325 AAGACTTAGAATACTGGGTAGGAAGAGATGCTTTTGGATTTGTTTATGAGCCAGTGAGTG 1384

109688697 TATCTGAGGATTCTTTATCCTGTGTCTAATGTGAGTGTGTTTTCCTGAATCAGTGCATCA 109688756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1385 TATCTGAGGATTCTTTATCCTGTGTCTAATGTGAGTGTGTTTTCCTGAATCAGTGCATCA 1444

109688757 GTGCTATTCTGGAGGCCCAAATCACACATGATTCCGTGAAAGAAACTCTGTGCTGGCCAG 109688816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1445 GTGCTATTCTGGAGGCCCAAATCACACATGATTCCGTGAAAGAAACTCTGTGCTGGCCAG 1504

109688817 AGGATGCACTCACTCTCCAGGCTTTCCTGCATGGGCCCTCACCATGGAGTCCTGGATACT 109688876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1505 AGGATGCACTCACTCTCCAGGCTTTCCTGCATGGGCCCTCACCATGGAGTCCTGGATACT 1564

109688877 TAGGGCATCTGGTTGACCACATGCTTGGGAGAGCACCAAAGAAGGTCCTGGTTTTCAAGC 109688936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1565 TAGGGCATCTGGTTGACCACATGCTTGGGAGAGCACCAAAGAAGGTCCTGGTTTTCAAGC 1624

109688937 CTCCAGCTTCTCCTTAGAAAGAGTTGACTACCTGTCTGGGCTCCAACTTTTCTGGCTGCT 109688996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1625 CTCCAGCTTCTCCTTAGAAAGAGTTGACTACCTGTCTGGGCTCCAACTTTTCTGGCTGCT 1684

109688997 ACCAGAGGGTCTGGCCTCTAAACCATCTGTGTCAAAGAACTGACAGGGCCTGACATTCAC 109689056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1685 ACCAGAGGGTCTGGCCTCTAAACCATCTGTGTCAAAGAACTGACAGGGCCTGACATTCAC 1744

109689057 TGGGACCCTAGGCTAGGGGTGACAGAGAGCAAAGCAAAAGTTTGAAAGAGTATGCAGTCT 109689116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1745 TGGGACCCTAGGCTAGGGGTGACAGAGAGCAAAGCAAAAGTTTGAAAGAGTATGCAGTCT 1804

109689117 GAATGAGCATGCAGACCTTTGCCACAGCTCCCCTTCCCAGCTCAGTGCAGAGCAAGTAGG 109689176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1805 GAATGAGCATGCAGACCTTTGCCACAGCTCCCCTTCCCAGCTCAGTGCAGAGCAAGTAGG 1864

109689177 AGATAAACTTCTGCTCTTAGCTTCTCTGTGAGGAGAGATGAAATGGACCACACATCTAGC 109689236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1865 AGATAAACTTCTGCTCTTAGCTTCTCTGTGAGGAGAGATGAAATGGACCACACATCTAGC 1924

109689237 ACCCCAACTTTTCTGACAACTACTAGAAGGACTGACTCCTGACTCACCTGTCTCAGGGCA 109689296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1925 ACCCCAACTTTTCTGACAACTACTAGAAGGACTGACTCCTGACTCACCTGTCTCAGGGCA 1984

109689297 CTGATGGTACTTGGCACACTCTAGTCTCCTGGGGCCACCAAGAACAAGAACAGCATTTTG 109689356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1985 CTGATGGTACTTGGCACACTCTAGTCTCCTGGGGCCACCAAGAACAAGAACAGCATTTTG 2044

109689357 GACAAACACACTGGTTTGAGAGGCACCCAGACTCTCTGACTGGGCTGTGAGGAGGCTCAT 109689416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2045 GACAAACACACTGGTTTGAGAGGCACCCAGACTCTCTGACTGGGCTGTGAGGAGGCTCAT 2104

109689417 CTGTGAAGACTGAGGGAGGTGGCTGTTTTATCAAATGTGCAGAAACCAACACAGAGAGTC 109689476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2105 CTGTGAAGACTGAGGGAGGTGGCTGTTTTATCAAATGTGCAGAAACCAACACAGAGAGTC 2164

109689477 AAAGACAATGAACAAACAGGAAATATGCCATAAATAAAAGAACAAGATAAATCTTCAGAA 109689536
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     2165 AAAGACAATGAACAAACAGGAAATATGCCATAAATAAAAGAACAAGATAAAACTTCAGAA 2224

109689537 ACTGACCCAAACAGAATGGAGATATGTGATTTACCAGACAAAAAATCAAAAGACCTGTCA 109689596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2225 ACTGACCCAAACAGAATGGAGATATGTGATTTACCAGACAAAAAATCAAAAGACCTGTCA 2284

109689597 CAAAGATGCTCAGTGAGGTCAGGAGAGCAATGCATGAATAAAGTGAGAATTTCAACCAAA 109689656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2285 CAAAGATGCTCAGTGAGGTCAGGAGAGCAATGCATGAATAAAGTGAGAATTTCAACCAAA 2344

109689657 AAGGTAGAAAATATTAAAAAGTGCCAAACAGAAATCACGGAGCTGAAGAATATAATAAAA 109689716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2345 AAGGTAGAAAATATTAAAAAGTGCCAAACAGAAATCACGGAGCTGAAGAATATAATAAAA 2404

109689717 GAACAGAAAAATTTAATAGAGGGGTTCAATAGCAGACTAGGTGAACTGAAAGAAAGGATT 109689776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2405 GAACAGAAAAATTTAATAGAGGGGTTCAATAGCAGACTAGGTGAACTGAAAGAAAGGATT 2464

109689777 AGTGAACTCAAGGACTGGTCATTGGCAATCATTCAGTCACAGCATTAAAAAGAAAAAAGA 109689836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2465 AGTGAACTCAAGGACTGGTCATTGGCAATCATTCAGTCACAGCATTAAAAAGAAAAAAGA 2524

109689837 ATGAAGGGCCAGGCACAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCTGAGGTG 109689896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2525 ATGAAGGGCCAGGCACAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCTGAGGTG 2584

109689897 GGTG 109689900
          ||||
     2585 GGTG 2588

EXCISED REGION

109695215 GATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATTCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATTTCAACT 109695274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2589 GATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATTCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATTTCAACT 2648

109695275 AAAAATACAAAAAAAAAAAAAAAATAGCCGGGTGTGGTGGCACACACCCGTAGTCCCAGC 109695334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2649 AAAAATACAAAAAAAAAAAAAAAATAGCCGGGTGTGGTGGCACACACCCGTAGTCCCAGC 2708

109695335 TACTTGGGAGGCTGGGGCAGGAGAATGGCATGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGC 109695394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2709 TACTTGGGAGGCTGGGGCAGGAGAATGGCATGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGC 2768

109695395 CGAGAT 109695400
          ||||||
     2769 CGAGAT 2774

Alignment time is 2.48947 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [109679900,109705214] =>     25315 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [        1,     2334] =>      2334 nucs 'mol-32-338a-110909_2334'

Score:        2334
Aligned:      2334        nucs
Identic:      2334 (100%) nucs =>      2296 (100%)        38 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [109687673,109689968] EXCISED REGION [109689970,109690007]
 second seq =>  [        1,     2296] EXCISED REGION [     2297,     2334]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [109689969,109689969]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         6 nucs [109689969,109689974] to [109689970,109689975]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

109687673 AAACTGTAATGGAAAAGGTAAATTCAAGGATGTCTCCTGGGTTTTTGGCTTAAGCATCTG 109687732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAACTGTAATGGAAAAGGTAAATTCAAGGATGTCTCCTGGGTTTTTGGCTTAAGCATCTG 60

109687733 GATACAGAGATATGGAAGACTGGGAGGGAAATGGGTTTGGAGTATACATGCATGCAATCA 109687792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GATACAGAGATATGGAAGACTGGGAGGGAAATGGGTTTGGAGTATACATGCATGCAATCA 120

109687793 ACAATTCTGTCTTGCATGTGTGAAATTTAGATACCCATTAGACATCTGCATAGAGGGCCA 109687852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACAATTCTGTCTTGCATGTGTGAAATTTAGATACCCATTAGACATCTGCATAGAGGGCCA 180

109687853 GGCACAGTGGCTCACGGCAGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCGGATCACT 109687912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGCACAGTGGCTCACGGCAGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCGGATCACT 240

109687913 TGAGGTTAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACTCTGTCTCTACTAAAAA 109687972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGAGGTTAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACTCTGTCTCTACTAAAAA 300

109687973 TACAAAAATTATCTGGGTGTGGTGGTGTGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGA 109688032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TACAAAAATTATCTGGGTGTGGTGGTGTGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGA 360

109688033 GGCATGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGTAGAGGTTGCAGCGAGCCAAGATCACACCACT 109688092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGCATGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGTAGAGGTTGCAGCGAGCCAAGATCACACCACT 420

109688093 GCACTCTAGCAAGGGTGACAAAGCAAGACTCTATCTCAAAAAAAAAAAGACATTTATGTA 109688152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GCACTCTAGCAAGGGTGACAAAGCAAGACTCTATCTCAAAAAAAAAAAGACATTTATGTA 480

109688153 GAGATGTTAGGTTGGCAGTTGGATAACAGTCTTGAGTTTCGGGGTGAGGGCAGGACCAGA 109688212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GAGATGTTAGGTTGGCAGTTGGATAACAGTCTTGAGTTTCGGGGTGAGGGCAGGACCAGA 540

109688213 AATGAAGATTTGGGATTCATTAGCATGTAGATCATATTCAGAGCCACAATAATAGATGAA 109688272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AATGAAGATTTGGGATTCATTAGCATGTAGATCATATTCAGAGCCACAATAATAGATGAA 600

109688273 ATAACTGAGGAAGAGAGCTAGAGGGGCCAAGAGCAAACACAGGAACATGCCAGCATTTAG 109688332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATAACTGAGGAAGAGAGCTAGAGGGGCCAAGAGCAAACACAGGAACATGCCAGCATTTAG 660

109688333 AGGACAATGGAGAAGGAGGAGATGGCAGAGATGTCAATAGGAGGAAAAGCAAAAGGGTGT 109688392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGGACAATGGAGAAGGAGGAGATGGCAGAGATGTCAATAGGAGGAAAAGCAAAAGGGTGT 720

109688393 TATCATAGAAGGTGACAACAGAATATATCACAAAGAGGAATATGTTTGAATGTGTCAAAT 109688452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TATCATAGAAGGTGACAACAGAATATATCACAAAGAGGAATATGTTTGAATGTGTCAAAT 780

109688453 GTTGTTATCACAGGCTATAGAAGTAAACACAAAGTCTTATGGGAATACTGAGGATGAGCT 109688512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GTTGTTATCACAGGCTATAGAAGTAAACACAAAGTCTTATGGGAATACTGAGGATGAGCT 840

109688513 GCCTCTAGTGTGTGTGAAACCCTGGCCAAATATTTGTTGTGGGGCCCCTGTCTATATATG 109688572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GCCTCTAGTGTGTGTGAAACCCTGGCCAAATATTTGTTGTGGGGCCCCTGTCTATATATG 900

109688573 CAATGTTATTTAAAAACATACTACATATTCTTGGGCTTATGTGGGATGTAGTGATTTATT 109688632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CAATGTTATTTAAAAACATACTACATATTCTTGGGCTTATGTGGGATGTAGTGATTTATT 960

109688633 GATGAAGACTTAGAATACTGGGTAGGAAGAGATGCTTTTGGATTTGTTTATGAGCCAGTG 109688692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GATGAAGACTTAGAATACTGGGTAGGAAGAGATGCTTTTGGATTTGTTTATGAGCCAGTG 1020

109688693 AGTGTATCTGAGGATTCTTTATCCTGTGTCTAATGTGAGTGTGTTTTCCTGAATCAGTGC 109688752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGTGTATCTGAGGATTCTTTATCCTGTGTCTAATGTGAGTGTGTTTTCCTGAATCAGTGC 1080

109688753 ATCAGTGCTATTCTGGAGGCCCAAATCACACATGATTCCGTGAAAGAAACTCTGTGCTGG 109688812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATCAGTGCTATTCTGGAGGCCCAAATCACACATGATTCCGTGAAAGAAACTCTGTGCTGG 1140

109688813 CCAGAGGATGCACTCACTCTCCAGGCTTTCCTGCATGGGCCCTCACCATGGAGTCCTGGA 109688872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CCAGAGGATGCACTCACTCTCCAGGCTTTCCTGCATGGGCCCTCACCATGGAGTCCTGGA 1200

109688873 TACTTAGGGCATCTGGTTGACCACATGCTTGGGAGAGCACCAAAGAAGGTCCTGGTTTTC 109688932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TACTTAGGGCATCTGGTTGACCACATGCTTGGGAGAGCACCAAAGAAGGTCCTGGTTTTC 1260

109688933 AAGCCTCCAGCTTCTCCTTAGAAAGAGTTGACTACCTGTCTGGGCTCCAACTTTTCTGGC 109688992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AAGCCTCCAGCTTCTCCTTAGAAAGAGTTGACTACCTGTCTGGGCTCCAACTTTTCTGGC 1320

109688993 TGCTACCAGAGGGTCTGGCCTCTAAACCATCTGTGTCAAAGAACTGACAGGGCCTGACAT 109689052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGCTACCAGAGGGTCTGGCCTCTAAACCATCTGTGTCAAAGAACTGACAGGGCCTGACAT 1380

109689053 TCACTGGGACCCTAGGCTAGGGGTGACAGAGAGCAAAGCAAAAGTTTGAAAGAGTATGCA 109689112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TCACTGGGACCCTAGGCTAGGGGTGACAGAGAGCAAAGCAAAAGTTTGAAAGAGTATGCA 1440

109689113 GTCTGAATGAGCATGCAGACCTTTGCCACAGCTCCCCTTCCCAGCTCAGTGCAGAGCAAG 109689172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GTCTGAATGAGCATGCAGACCTTTGCCACAGCTCCCCTTCCCAGCTCAGTGCAGAGCAAG 1500

109689173 TAGGAGATAAACTTCTGCTCTTAGCTTCTCTGTGAGGAGAGATGAAATGGACCACACATC 109689232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TAGGAGATAAACTTCTGCTCTTAGCTTCTCTGTGAGGAGAGATGAAATGGACCACACATC 1560

109689233 TAGCACCCCAACTTTTCTGACAACTACTAGAAGGACTGACTCCTGACTCACCTGTCTCAG 109689292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TAGCACCCCAACTTTTCTGACAACTACTAGAAGGACTGACTCCTGACTCACCTGTCTCAG 1620

109689293 GGCACTGATGGTACTTGGCACACTCTAGTCTCCTGGGGCCACCAAGAACAAGAACAGCAT 109689352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GGCACTGATGGTACTTGGCACACTCTAGTCTCCTGGGGCCACCAAGAACAAGAACAGCAT 1680

109689353 TTTGGACAAACACACTGGTTTGAGAGGCACCCAGACTCTCTGACTGGGCTGTGAGGAGGC 109689412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTTGGACAAACACACTGGTTTGAGAGGCACCCAGACTCTCTGACTGGGCTGTGAGGAGGC 1740

109689413 TCATCTGTGAAGACTGAGGGAGGTGGCTGTTTTATCAAATGTGCAGAAACCAACACAGAG 109689472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TCATCTGTGAAGACTGAGGGAGGTGGCTGTTTTATCAAATGTGCAGAAACCAACACAGAG 1800

109689473 AGTCAAAGACAATGAACAAACAGGAAATATGCCATAAATAAAAGAACAAGATAAATCTTC 109689532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AGTCAAAGACAATGAACAAACAGGAAATATGCCATAAATAAAAGAACAAGATAAATCTTC 1860

109689533 AGAAACTGACCCAAACAGAATGGAGATATGTGATTTACCAGACAAAAAATCAAAAGACCT 109689592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AGAAACTGACCCAAACAGAATGGAGATATGTGATTTACCAGACAAAAAATCAAAAGACCT 1920

109689593 GTCACAAAGATGCTCAGTGAGGTCAGGAGAGCAATGCATGAATAAAGTGAGAATTTCAAC 109689652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GTCACAAAGATGCTCAGTGAGGTCAGGAGAGCAATGCATGAATAAAGTGAGAATTTCAAC 1980

109689653 CAAAAAGGTAGAAAATATTAAAAAGTGCCAAACAGAAATCACGGAGCTGAAGAATATAAT 109689712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CAAAAAGGTAGAAAATATTAAAAAGTGCCAAACAGAAATCACGGAGCTGAAGAATATAAT 2040

109689713 AAAAGAACAGAAAAATTTAATAGAGGGGTTCAATAGCAGACTAGGTGAACTGAAAGAAAG 109689772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AAAAGAACAGAAAAATTTAATAGAGGGGTTCAATAGCAGACTAGGTGAACTGAAAGAAAG 2100

109689773 GATTAGTGAACTCAAGGACTGGTCATTGGCAATCATTCAGTCACAGCATTAAAAAGAAAA 109689832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GATTAGTGAACTCAAGGACTGGTCATTGGCAATCATTCAGTCACAGCATTAAAAAGAAAA 2160

109689833 AAGAATGAAGGGCCAGGCACAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCTGA 109689892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AAGAATGAAGGGCCAGGCACAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCTGA 2220

109689893 GGTGGGTGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCA 109689952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GGTGGGTGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCA 2280

109689953 TCTCTACTAAAAATAC 109689968
          ||||||||||||||||
     2281 TCTCTACTAAAAATAC 2296

EXCISED REGION

109689970 AAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCACGCACCTGTAATC 109690007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2297 AAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCACGCACCTGTAATC 2334

Alignment time is 2.03629 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [109679900,109705214] =>     25315 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [        1,     5135] =>      5135 nucs 'mol-32-3492-112868_5135'

Score:        5008
Aligned:      5087        nucs
Identic:      5079 (100%) nucs =>      3188 (100%)      1891 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [109686709,109689900] EXCISED REGION [109695215,109697109]
 second seq =>  [       52,     3241] EXCISED REGION [     3242,     5135]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      5314 nucs [109689901,109695214]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        28 nucs [109689901,109689928] to [109695215,109695242]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [109689900,109689900] to [109695215,109695215]
 second seq =>         1 nucs [3241,3241] to [3242,3242]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

109686709 GAATGAATTTGGATGTTGTTTAAGGGGAATGGGAAGTCATTGAAATATTTTAAGTAGAGA 109686768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       52 GAATGAATTTGGATGTTGTTTAAGGGGAATGGGAAGTCATTGAAATATTTTAAGTAGAGA 111

109686769 AATGGGATGCACTGATTTACCTTATGAAAAGAGTTCTCTAGCTGCTTTGAGAGAATGGAT 109686828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      112 AATGGGATGCACTGATTTACCTTATGAAAAGAGTTCTCTAGCTGCTTTGAGAGAATGGAT 171

109686829 TATAGTGGGGTGATATAGTTTGGACGTTTGTCCTCTCCAAATCTCGTGTTGAAATGTGAT 109686888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      172 TATAGTGGGGTGATATAGTTTGGACGTTTGTCCTCTCCAAATCTCGTGTTGAAATGTGAT 231

109686889 GCTCAGTGTTGGAGGTGGGGTCTGGTGGGAGGTGATTGGGTCGTGGAGCAGATCCTTCAT 109686948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      232 GCTCAGTGTTGGAGGTGGGGTCTGGTGGGAGGTGATTGGGTCGTGGAGCAGATCCTTCAT 291

109686949 GAATGGCTGCTGACATCATCTTGGTGGTGAGTGAGTTCTCAGTCTGGTAGTTCACATGAG 109687008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      292 GAATGGCTGCTGACATCATCTTGGTGGTGAGTGAGTTCTCAGTCTGGTAGTTCACATGAG 351

109687009 ATCTGCCTGTTTTAAAGAGTATGGTGGCCAAGTGCCGTGGCTCACGCCTGTGATCCCAGC 109687068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      352 ATCTGCCTGTTTTAAAGAGTATGGTGGCCAAGTGCCGTGGCTCACGCCTGTGATCCCAGC 411

109687069 ACTTTGGGAGGTAAAGGCAGGAGGATCACTTGAGCTCAGGAGTTCGACACTAGCCTGGGA 109687128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      412 ACTTTGGGAGGTAAAGGCAGGAGGATCACTTGAGCTCAGGAGTTCGACACTAGCCTGGGA 471

109687129 AACAGGGTGAAACCCATCTCTACTAAAAATAGAAATATTAGGCGGGTGTGATGGTGCGCT 109687188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      472 AACAGGGTGAAACCCATCTCTACTAAAAATAGAAATATTAGGCGGGTGTGATGGTGCGCT 531

109687189 GCCTATAGTCCCAGCTACCGGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGGCA 109687248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      532 GCCTATAGTCCCAGCTACCGGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGGCA 591

109687249 GAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAGCCAGACC 109687308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      592 GAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAGCCAGACC 651

109687309 CTATCTAAAAAAAAAAAAAAAAAATAGAGTGCGGCACCCCTCCCTTCCCACTGTTGCTCC 109687368
          ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      652 CTATCTAAAAAAAAAAAAAAAA--TAGAGTGCGGCACCCCTCCCTTCCCACTGTTGCTCC 709

109687369 CTCTCTCGCCATGTGGGGCACGGGCTGCTCCTTCATCTTCCACCATTATTGTGAGCTTCC 109687428
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      710 CTCTCTCGCCATGTGGGGCATGGGCTGCTCCTTCATCTTCCACCATTATTGTGAGCTTCC 769

109687429 TGAGGCCTCACCAGGAGCAGATGTGAGCAAATTAAACCTCTTTTCTTTATAAATTACCCA 109687488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      770 TGAGGCCTCACCAGGAGCAGATGTGAGCAAATTAAACCTCTTTTCTTTATAAATTACCCA 829

109687489 TATTTAGGTATTTATTTATAGCTACTACAAGGGGGAAAGGGAGAGCAGGGAGATCAGTGG 109687548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      830 TATTTAGGTATTTATTTATAGCTACTACAAGGGGGAAAGGGAGAGCAGGGAGATCAGTGG 889

109687549 TGCTTTCACACTAGTACAGCAATAGAGCAGCATCTTGGACCAGGGTGGTGGCTGAGGAGA 109687608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      890 TGCTTTCACACTAGTACAGCAATAGAGCAGCATCTTGGACCAGGGTGGTGGCTGAGGAGA 949

109687609 CAGGATCATGGCTTTGAGATACATTCTGAAGAAGAAAAGTAGGCCTTGCTGATAGAATAG 109687668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      950 CAGGATCATGGCTTTGAGATACATTCTGAAGAAGAAAAGTAGGCCTTGCTGATAGAATAG 1009

109687669 TCACAAACTGTAATGGAAAAGGTAAATTCAAGGATGTCTCCTGGGTTTTTGGCTTAAGCA 109687728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1010 TCACAAACTGTAATGGAAAAGGTAAATTCAAGGATGTCTCCTGGGTTTTTGGCTTAAGCA 1069

109687729 TCTGGATACAGAGATATGGAAGACTGGGAGGGAAATGGGTTTGGAGTATACATGCATGCA 109687788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1070 TCTGGATACAGAGATATGGAAGACTGGGAGGGAAATGGGTTTGGAGTATACATGCATGCA 1129

109687789 ATCAACAATTCTGTCTTGCATGTGTGAAATTTAGATACCCATTAGACATCTGCATAGAGG 109687848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1130 ATCAACAATTCTGTCTTGCATGTGTGAAATTTAGATACCCATTAGACATCTGCATAGAGG 1189

109687849 GCCAGGCACAGTGGCTCACGGCAGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCGGAT 109687908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1190 GCCAGGCACAGTGGCTCACGGCAGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCGGAT 1249

109687909 CACTTGAGGTTAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACTCTGTCTCTACTA 109687968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1250 CACTTGAGGTTAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACTCTGTCTCTACTA 1309

109687969 AAAATACAAAAATTATCTGGGTGTGGTGGTGTGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGG 109688028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1310 AAAATACAAAAATTATCTGGGTGTGGTGGTGTGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGG 1369

109688029 CTGAGGCATGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGTAGAGGTTGCAGCGAGCCAAGATCACAC 109688088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1370 CTGAGGCATGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGTAGAGGTTGCAGCGAGCCAAGATCACAC 1429

109688089 CACTGCACTCTAGCAAGGGTGACAAAGCAAGACTCTATCTCAAAAAAAAAAAGACATTTA 109688148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1430 CACTGCACTCTAGCAAGGGTGACAAAGCAAGACTCTATCTCAAAAAAAAAAAGACATTTA 1489

109688149 TGTAGAGATGTTAGGTTGGCAGTTGGATAACAGTCTTGAGTTTCGGGGTGAGGGCAGGAC 109688208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1490 TGTAGAGATGTTAGGTTGGCAGTTGGATAACAGTCTTGAGTTTCGGGGTGAGGGCAGGAC 1549

109688209 CAGAAATGAAGATTTGGGATTCATTAGCATGTAGATCATATTCAGAGCCACAATAATAGA 109688268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1550 CAGAAATGAAGATTTGGGATTCATTAGCATGTAGATCATATTCAGAGCCACAATAATAGA 1609

109688269 TGAAATAACTGAGGAAGAGAGCTAGAGGGGCCAAGAGCAAACACAGGAACATGCCAGCAT 109688328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1610 TGAAATAACTGAGGAAGAGAGCTAGAGGGGCCAAGAGCAAACACAGGAACATGCCAGCAT 1669

109688329 TTAGAGGACAATGGAGAAGGAGGAGATGGCAGAGATGTCAATAGGAGGAAAAGCAAAAGG 109688388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1670 TTAGAGGACAATGGAGAAGGAGGAGATGGCAGAGATGTCAATAGGAGGAAAAGCAAAAGG 1729

109688389 GTGTTATCATAGAAGGTGACAACAGAATATATCACAAAGAGGAATATGTTTGAATGTGTC 109688448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1730 GTGTTATCATAGAAGGTGACAACAGAATATATCACAAAGAGGAATATGTTTGAATGTGTC 1789

109688449 AAATGTTGTTATCACAGGCTATAGAAGTAAACACAAAGTCTTATGGGAATACTGAGGATG 109688508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1790 AAATGTTGTTATCACAGGCTATAGAAGTAAACACAAAGTCTTATGGGAATACTGAGGATG 1849

109688509 AGCTGCCTCTAGTGTGTGTGAAACCCTGGCCAAATATTTGTTGTGGGGCCCCTGTCTATA 109688568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1850 AGCTGCCTCTAGTGTGTGTGAAACCCTGGCCAAATATTTGTTGTGGGGCCCCTGTCTATA 1909

109688569 TATGCAATGTTATTTAAAAACATACTACATATTCTTGGGCTTATGTGGGATGTAGTGATT 109688628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1910 TATGCAATGTTATTTAAAAACATACTACATATTCTTGGGCTTATGTGGGATGTAGTGATT 1969

109688629 TATTGATGAAGACTTAGAATACTGGGTAGGAAGAGATGCTTTTGGATTTGTTTATGAGCC 109688688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1970 TATTGATGAAGACTTAGAATACTGGGTAGGAAGAGATGCTTTTGGATTTGTTTATGAGCC 2029

109688689 AGTGAGTGTATCTGAGGATTCTTTATCCTGTGTCTAATGTGAGTGTGTTTTCCTGAATCA 109688748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2030 AGTGAGTGTATCTGAGGATTCTTTATCCTGTGTCTAATGTGAGTGTGTTTTCCTGAATCA 2089

109688749 GTGCATCAGTGCTATTCTGGAGGCCCAAATCACACATGATTCCGTGAAAGAAACTCTGTG 109688808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2090 GTGCATCAGTGCTATTCTGGAGGCCCAAATCACACATGATTCCGTGAAAGAAACTCTGTG 2149

109688809 CTGGCCAGAGGATGCACTCACTCTCCAGGCTTTCCTGCATGGGCCCTCACCATGGAGTCC 109688868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2150 CTGGCCAGAGGATGCACTCACTCTCCAGGCTTTCCTGCATGGGCCCTCACCATGGAGTCC 2209

109688869 TGGATACTTAGGGCATCTGGTTGACCACATGCTTGGGAGAGCACCAAAGAAGGTCCTGGT 109688928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2210 TGGATACTTAGGGCATCTGGTTGACCACATGCTTGGGAGAGCACCAAAGAAGGTCCTGGT 2269

109688929 TTTCAAGCCTCCAGCTTCTCCTTAGAAAGAGTTGACTACCTGTCTGGGCTCCAACTTTTC 109688988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2270 TTTCAAGCCTCCAGCTTCTCCTTAGAAAGAGTTGACTACCTGTCTGGGCTCCAACTTTTC 2329

109688989 TGGCTGCTACCAGAGGGTCTGGCCTCTAAACCATCTGTGTCAAAGAACTGACAGGGCCTG 109689048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2330 TGGCTGCTACCAGAGGGTCTGGCCTCTAAACCATCTGTGTCAAAGAACTGACAGGGCCTG 2389

109689049 ACATTCACTGGGACCCTAGGCTAGGGGTGACAGAGAGCAAAGCAAAAGTTTGAAAGAGTA 109689108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2390 ACATTCACTGGGACCCTAGGCTAGGGGTGACAGAGAGCAAAGCAAAAGTTTGAAAGAGTA 2449

109689109 TGCAGTCTGAATGAGCATGCAGACCTTTGCCACAGCTCCCCTTCCCAGCTCAGTGCAGAG 109689168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2450 TGCAGTCTGAATGAGCATGCAGACCTTTGCCACAGCTCCCCTTCCCAGCTCAGTGCAGAG 2509

109689169 CAAGTAGGAGATAAACTTCTGCTCTTAGCTTCTCTGTGAGGAGAGATGAAATGGACCACA 109689228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2510 CAAGTAGGAGATAAACTTCTGCTCTTAGCTTCTCTGTGAGGAGAGATGAAATGGACCACA 2569

109689229 CATCTAGCACCCCAACTTTTCTGACAACTACTAGAAGGACTGACTCCTGACTCACCTGTC 109689288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2570 CATCTAGCACCCCAACTTTTCTGACAACTACTAGAAGGACTGACTCCTGACTCACCTGTC 2629

109689289 TCAGGGCACTGATGGTACTTGGCACACTCTAGTCTCCTGGGGCCACCAAGAACAAGAACA 109689348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2630 TCAGGGCACTGATGGTACTTGGCACACTCTAGTCTCCTGGGGCCACCAAGAACAAGAACA 2689

109689349 GCATTTTGGACAAACACACTGGTTTGAGAGGCACCCAGACTCTCTGACTGGGCTGTGAGG 109689408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2690 GCATTTTGGACAAACACACTGGTTTGAGAGGCACCCAGACTCTCTGACTGGGCTGTGAGG 2749

109689409 AGGCTCATCTGTGAAGACTGAGGGAGGTGGCTGTTTTATCAAATGTGCAGAAACCAACAC 109689468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2750 AGGCTCATCTGTGAAGACTGAGGGAGGTGGCTGTTTTATCAAATGTGCAGAAACCAACAC 2809

109689469 AGAGAGTCAAAGACAATGAACAAACAGGAAATATGCCATAAATAAAAGAACAAGATAAAT 109689528
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     2810 AGAGAGTCAAAGACAATGAACAAACAGGAAATATGCCATAAATAAAAGAACAAGATAAAA 2869

109689529 CTTCAGAAACTGACCCAAACAGAATGGAGATATGTGATTTACCAGACAAAAAATCAAAAG 109689588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2870 CTTCAGAAACTGACCCAAACAGAATGGAGATATGTGATTTACCAGACAAAAAATCAAAAG 2929

109689589 ACCTGTCACAAAGATGCTCAGTGAGGTCAGGAGAGCAATGCATGAATAAAGTGAGAATTT 109689648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2930 ACCTGTCACAAAGATGCTCAGTGAGGTCAGGAGAGCAATGCATGAATAAAGTGAGAATTT 2989

109689649 CAACCAAAAAGGTAGAAAATATTAAAAAGTGCCAAACAGAAATCACGGAGCTGAAGAATA 109689708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2990 CAACCAAAAAGGTAGAAAATATTAAAAAGTGCCAAACAGAAATCACGGAGCTGAAGAATA 3049

109689709 TAATAAAAGAACAGAAAAATTTAATAGAGGGGTTCAATAGCAGACTAGGTGAACTGAAAG 109689768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3050 TAATAAAAGAACAGAAAAATTTAATAGAGGGGTTCAATAGCAGACTAGGTGAACTGAAAG 3109

109689769 AAAGGATTAGTGAACTCAAGGACTGGTCATTGGCAATCATTCAGTCACAGCATTAAAAAG 109689828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3110 AAAGGATTAGTGAACTCAAGGACTGGTCATTGGCAATCATTCAGTCACAGCATTAAAAAG 3169

109689829 AAAAAAGAATGAAGGGCCAGGCACAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGG 109689888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3170 AAAAAAGAATGAAGGGCCAGGCACAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGG 3229

109689889 CTGAGGTGGGTG 109689900
          ||||||||||||
     3230 CTGAGGTGGGTG 3241

EXCISED REGION

109695215 GATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATTCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATTTCAACT 109695274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3242 GATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATTCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATTTCAACT 3301

109695275 AAAAATACAAAAAAAAAAAAAAAATAGCCGGGTGTGGTGGCACACACCCGTAGTCCCAGC 109695334
          |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3302 AAAAATAC-AAAAAAAAAAAAAAATAGCCGGGTGTGGTGGCACACACCCGTAGTCCCAGC 3360

109695335 TACTTGGGAGGCTGGGGCAGGAGAATGGCATGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGC 109695394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TACTTGGGAGGCTGGGGCAGGAGAATGGCATGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGC 3420

109695395 CGAGATCGCACAATTGCTTTCCAGCCTGGGCAACGGAGCGAGACTCTGTTTCAAAAAAAA 109695454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 CGAGATCGCACAATTGCTTTCCAGCCTGGGCAACGGAGCGAGACTCTGTTTCAAAAAAAA 3480

109695455 AGGTGACCATGTGAAGGGATGGATATGTTAAGTAGCTTGACTGGTAATCGGTTCACGATG 109695514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 AGGTGACCATGTGAAGGGATGGATATGTTAAGTAGCTTGACTGGTAATCGGTTCACGATG 3540

109695515 TATATGTACAGTTGACCCTTGAACAACATGCGTTTAAATTACAAGAGTCCACTTATATGG 109695574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 TATATGTACAGTTGACCCTTGAACAACATGCGTTTAAATTACAAGAGTCCACTTATATGG 3600

109695575 GGATTTTCTTCTGCCTCTGCCAGCAAGGCCAACCCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCCCCTCA 109695634
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 GGATTTTCTTCTGCCTTTGCCAGCAAGGCCAACCCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCCCCTCA 3660

109695635 ACTAAAGACGAGGAGGATGAGGACCTTTAGGGTGATCCACTTCCACTTAATGAATAGTAA 109695694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 ACTAAAGACGAGGAGGATGAGGACCTTTAGGGTGATCCACTTCCACTTAATGAATAGTAA 3720

109695695 ATACGGTTTCTCTTCCTTATGATTTTCTTAATATTTTCTTTTCCCTAACTTACTTTGTTG 109695754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 ATACGGTTTCTCTTCCTTATGATTTTCTTAATATTTTCTTTTCCCTAACTTACTTTGTTG 3780

109695755 TAAGAATGCAGTACTCAATACACGTAAGATACAAAATTTGTATGAATTGACTGTTTGTGT 109695814
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 TAAGAATGCAGTACACAATACACGTAAGATACAAAATTTGTATGAATTGACTGTTTGTGT 3840

109695815 TATCTGCAAGGCTTCCTGTCAACACTAGGGTATTAATAGTTAAGTTTTGGGGGAGTCAAA 109695874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 TATCTGCAAGGCTTCCTGTCAACACTAGGGTATTAATAGTTAAGTTTTGGGGGAGTCAAA 3900

109695875 AGTTATTTGTGGATTTTTTACTGTTCGGGGAGTTGGTGCCCCTAACCCCTTCGTTGTTAA 109695934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 AGTTATTTGTGGATTTTTTACTGTTCGGGGAGTTGGTGCCCCTAACCCCTTCGTTGTTAA 3960

109695935 AGAGTCAACTGTATATCAAAACATCGTGCTGTATACCTTAAATGTATATACTTTCAATTA 109695994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 AGAGTCAACTGTATATCAAAACATCGTGCTGTATACCTTAAATGTATATACTTTCAATTA 4020

109695995 AAATATTTTAAAAACAAACCAATAAAAAGGCACTGCTTCTGGCCCAGGGTGAGCCATCAG 109696054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 AAATATTTTAAAAACAAACCAATAAAAAGGCACTGCTTCTGGCCCAGGGTGAGCCATCAG 4080

109696055 ATGGCACAGCTGGCCCTGTCCGGTCCCAACCAGCAGAGGGGACTGTCAATTGAGAAGCTC 109696114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 ATGGCACAGCTGGCCCTGTCCGGTCCCAACCAGCAGAGGGGACTGTCAATTGAGAAGCTC 4140

109696115 CAGTGCTAAACGCTGGAATATGAAGATATGCATGGTGGGGAGACAGCACACACACACATA 109696174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 CAGTGCTAAACGCTGGAATATGAAGATATGCATGGTGGGGAGACAGCACACACACACATA 4200

109696175 ACACTCAAGGCCTGGTGGAGCCCACCCAGCTCAGCCTGGGTTGGGGAGGCTCCCTGGGAA 109696234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 ACACTCAAGGCCTGGTGGAGCCCACCCAGCTCAGCCTGGGTTGGGGAGGCTCCCTGGGAA 4260

109696235 GGGGATTCCTGATGTGAGCCTTCCAGGAGGGGTAGGAATTCTCTACACAGACAGGTGGGA 109696294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 GGGGATTCCTGATGTGAGCCTTCCAGGAGGGGTAGGAATTCTCTACACAGACAGGTGGGA 4320

109696295 ACTCCAGGCAGAGGGGAGGCCTGAAACACATCACAGGCCACCCTGTCCCTAGACTGCTGA 109696354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 ACTCCAGGCAGAGGGGAGGCCTGAAACACATCACAGGCCACCCTGTCCCTAGACTGCTGA 4380

109696355 GAGGCAGGACGGGGCTACACGGCCATGGGTGTGAGTCACCAAGGACCCTGTGCCTGCTGA 109696414
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 GAGGCAGGACGGGGCTACACGGCCATGGGCGTGAGTCACCAAGGACCCTGTGCCTGCTGA 4440

109696415 GGCATGAGGACGCATTTCTGGGACGACAGAAAGACAGCAAAGGGCTTCAGACTATGGAAT 109696474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 GGCATGAGGACGCATTTCTGGGACGACAGAAAGACAGCAAAGGGCTTCAGACTATGGAAT 4500

109696475 ACCCGGAATAGGGCTCTAAGCATCTCCTCCGATGATTGTGGACTCAATGCAGGAAATGTG 109696534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 ACCCGGAATAGGGCTCTAAGCATCTCCTCCGATGATTGTGGACTCAATGCAGGAAATGTG 4560

109696535 GAGGCTTCGAGCTAGACCAGTGACAGAGGAGGGAAAAGGAGATGGGGCCCATCAATATTT 109696594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 GAGGCTTCGAGCTAGACCAGTGACAGAGGAGGGAAAAGGAGATGGGGCCCATCAATATTT 4620

109696595 GAAACTTGGCAAAACGCAGCAAGATTTTAATGGTTAATCAAAAATGGGAGGTGAATGGGA 109696654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 GAAACTTGGCAAAACGCAGCAAGATTTTAATGGTTAATCAAAAATGGGAGGTGAATGGGA 4680

109696655 GAAAGAGGAGCTGACAACCACTCCCACAATTCTGGTTTCCAGGGCGTGTTATAGCTGAGA 109696714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 GAAAGAGGAGCTGACAACCACTCCCACAATTCTGGTTTCCAGGGCGTGTTATAGCTGAGA 4740

109696715 GGGCAGCAGTTTGAGTGGCTGGGCAGCAGAGGCTGGGGTTGAGGCTGGGAAGTGGCGGCA 109696774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 GGGCAGCAGTTTGAGTGGCTGGGCAGCAGAGGCTGGGGTTGAGGCTGGGAAGTGGCGGCA 4800

109696775 GCAGGGGAGACTGCCCCATCAGGAGCCTGCCATAAGCGTGGGATGCAGAAGGACTGGAAG 109696834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 GCAGGGGAGACTGCCCCATCAGGAGCCTGCCATAAGCGTGGGATGCAGAAGGACTGGAAG 4860

109696835 GTGCTGGAGGTGATGTGGAGCTTTGGGAGAGTGTCGGAGGGATGGAATAAGTTGATGCCT 109696894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 GTGCTGGAGGTGATGTGGAGCTTTGGGAGAGTGTCGGAGGGATGGAATAAGTTGATGCCT 4920

109696895 GTTCCGAGACCAAGAAGTGGGGAGCAACTGAAGAAACTGGAGAGTGGGAACCAGGTTGCA 109696954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 GTTCCGAGACCAAGAAGTGGGGAGCAACTGAAGAAACTGGAGAGTGGGAACCAGGTTGCA 4980

109696955 GCTGGTCTCCAGATGCTGCACTCTCTGACAGCTCTCATCTATCTCACTGTCACCCAGGAT 109697014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 GCTGGTCTCCAGATGCTGCACTCTCTGACAGCTCTCATCTATCTCACTGTCACCCAGGAT 5040

109697015 TGGACAGGACATCTACAAATGTGCATGTGTATTTGCTATAAGGTGCATTCTTTTCCCCTG 109697074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 TGGACAGGACATCTACAAATGTGCATGTGTATTTGCTATAAGGTGCATTCTTTTCCCCTG 5100

109697075 GAGATAGTGACCAACCTTTCAAGAACTATTCTTGG 109697109
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 GAGATAGTGACCAACCTTTCAAGAACTATTCTTGG 5135

Alignment time is 4.50127 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [109679900,109705214] =>     25315 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [        1,     9234] =>      9234 nucs 'mol-32-3492-186267_9234'

Score:        9071
Aligned:      9238        nucs
Identic:      9222 (100%) nucs =>      5538 (100%)      3684 (100%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [109684354,109689900] EXCISED REGION [109695215,109698904]
 second seq =>  [        1,     5545] EXCISED REGION [     5546,     9234]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      5314 nucs [109689901,109695214]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        28 nucs [109689901,109689928] to [109695215,109695242]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [109689900,109689900] to [109695215,109695215]
 second seq =>         1 nucs [5545,5545] to [5546,5546]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

109684354 GCCCCTTCCTCCCTCAGCCACAGGGCTCCAGCTCCAGCTGCTGGGTGGAGGCTGGGCTTG 109684413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCCCCTTCCTCCCTCAGCCACAGGGCTCCAGCTCCAGCTGCTGGGTGGAGGCTGGGCTTG 60

109684414 CTGCTGCTCTGGGGACTTTGCTCTTTGCTGTTCCTTCTCCTGGAATGCACATCCCCACAC 109684473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTGCTGCTCTGGGGACTTTGCTCTTTGCTGTTCCTTCTCCTGGAATGCACATCCCCACAC 120

109684474 ACCTGCCTGCTCACATGCTCCCCTGTAAGGCTTGCTCCAAGGTCACCTCCTCAGTGAAGC 109684533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACCTGCCTGCTCACATGCTCCCCTGTAAGGCTTGCTCCAAGGTCACCTCCTCAGTGAAGC 180

109684534 TGCCCTGACTGCTGCCACCCACACCACCCCCTCACGGGGCTACCCCACTTCCCTGGATCA 109684593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGCCCTGACTGCTGCCACCCACACCACCCCCTCACGGGGCTACCCCACTTCCCTGGATCA 240

109684594 TTTTTATCCATAGTGTGTATTCCCCTCTGACACACCATGTCGTTTACTTTTTCATCTTTT 109684653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTTTTATCCATAGTGTGTATTCCCCTCTGACACACCATGTCGTTTACTTTTTCATCTTTT 300

109684654 CGCGGAACTGTTCTTCCCTCTAGAATGGCGGTTCTCAACCATGGGCCATCTGTCAGTGTC 109684713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CGCGGAACTGTTCTTCCCTCTAGAATGGCGGTTCTCAACCATGGGCCATCTGTCAGTGTC 360

109684714 TACAGACATTTGGAGTGATCCTAACTGGGGGTGGGGTGTTCTAGGCACCCAGTGGGCACA 109684773
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TACAGACATTTGGAGTGATCATAACTGGGGGTGGGGTGTTCTAGGCACCCAGTGGGCACA 420

109684774 GGCAGGAGTGCACAGGATTAAGAACACCCACCCGAAGAACCCCCACCCCAGATGGCAACA 109684833
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GACAGGAGTGCACAGGATTAAGAACACCCACCCGAAGAACCCCCACCCCAGATGGCAACA 480

109684834 GAGAAGAGGTTGAGAAACCCGCATCCAGACTGTAAGCCGTCTGAGGGCAAGGGCCCTGTC 109684893
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GGGAAGAGGTTGAGAAACCCGCATCCAGACTGTAAGCCGTCTGAGGGCAAGGGCCCTGTC 540

109684894 CCCTGTTTTGATCACTGCAACATCTCCAGCACCCAGAACAGGGCTTGACATCACGGATGC 109684953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CCCTGTTTTGATCACTGCAACATCTCCAGCACCCAGAACAGGGCTTGACATCACGGATGC 600

109684954 CCAGTAAGTGGGGAACGAACAGAGACTGGCACATACACAGCACTGGGGAAATGTTGGTCA 109685013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CCAGTAAGTGGGGAACGAACAGAGACTGGCACATACACAGCACTGGGGAAATGTTGGTCA 660

109685014 TTATTATCATTATTTCTCATGGGTTTGTATTGTTTCTGTGCCTCAGGTTTTCAGGAAAGT 109685073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTATTATCATTATTTCTCATGGGTTTGTATTGTTTCTGTGCCTCAGGTTTTCAGGAAAGT 720

109685074 CTCTGCTTTTCCCCTGGGCAGTGCAACAGAGGGGAAGAGTGTTGGACTTGGAGTCAGAGA 109685133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTCTGCTTTTCCCCTGGGCAGTGCAACAGAGGGGAAGAGTGTTGGACTTGGAGTCAGAGA 780

109685134 CCCATGTCTGAGCCCCAGGTTGGCCATTATGAGCTGTGTAGCTCTGGGAAACTCACTTAA 109685193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CCCATGTCTGAGCCCCAGGTTGGCCATTATGAGCTGTGTAGCTCTGGGAAACTCACTTAA 840

109685194 CCTCTCTGAGGTTTTGTTTCCTCATTCGTTGAGTTGGAATACCATTTGTTTTCCTCCTCA 109685253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CCTCTCTGAGGTTTTGTTTCCTCATTCGTTGAGTTGGAATACCATTTGTTTTCCTCCTCA 900

109685254 TCTGGCAAGCTGGTGAGATAAGCAAATATGATGATATGTCAAAATGCTTGTAAGTACTAA 109685313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TCTGGCAAGCTGGTGAGATAAGCAAATATGATGATATGTCAAAATGCTTGTAAGTACTAA 960

109685314 ATACCTTCCAGCTATTGTCATTATGTGGTCCCTCCTGCAAAATGGAAAAACCAATTGATT 109685373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATACCTTCCAGCTATTGTCATTATGTGGTCCCTCCTGCAAAATGGAAAAACCAATTGATT 1020

109685374 TTACCATGGCTGACAATCTTATATCGGTTGTGAGGAGCTTATTATTCATAATTTCAGTGT 109685433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTACCATGGCTGACAATCTTATATCGGTTGTGAGGAGCTTATTATTCATAATTTCAGTGT 1080

109685434 GTTTCCATTTCTGCCCATATGGCACTCCTCCCTTAGACAGGTATCTTGAGACAAGAAAAG 109685493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GTTTCCATTTCTGCCCATATGGCACTCCTCCCTTAGACAGGTATCTTGAGACAAGAAAAG 1140

109685494 GAGCAGGTGGCCTTTAAAATACATTGCACATAACACATGCGTTTCACTGAACAGCTTTTT 109685553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GAGCAGGTGGCCTTTAAAATACATTGCACATAACACATGCGTTTCACTGAACAGCTTTTT 1200

109685554 GCATTTAAAATGCAGACAATATGCTCAAAATAGTACTAATAAATTTTCTATCTTGAGTAA 109685613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GCATTTAAAATGCAGACAATATGCTCAAAATAGTACTAATAAATTTTCTATCTTGAGTAA 1260

109685614 TGTATCTCAGACATATACCAAGGGAAAATAATTAAAGAAAAACCCAATAAAATAGAGATC 109685673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGTATCTCAGACATATACCAAGGGAAAATAATTAAAGAAAAACCCAATAAAATAGAGATC 1320

109685674 ATAAAAAGGGGGGCTTATAAATCAAGAGAGTAGACTTCTAGCCATTCTCAATACAGCCTT 109685733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ATAAAAAGGGGGGCTTATAAATCAAGAGAGTAGACTTCTAGCCATTCTCAATACAGCCTT 1380

109685734 TGAGTGCAAGGATCCCAGATGTTTGATTTGGACACATGGAATTTTGCAATAGGATAGTGT 109685793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TGAGTGCAAGGATCCCAGATGTTTGATTTGGACACATGGAATTTTGCAATAGGATAGTGT 1440

109685794 ACTTCTTATGAATGAAACATCAAAAGGCATATGGTAGTAGATGCAATCATGTTGGCAGAC 109685853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ACTTCTTATGAATGAAACATCAAAAGGCATATGGTAGTAGATGCAATCATGTTGGCAGAC 1500

109685854 GTGTGTCTTGGAGAGCAGAAATGGCCAACTGAATGCTTCCTTCCTCACTCGTGAAGCCAT 109685913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GTGTGTCTTGGAGAGCAGAAATGGCCAACTGAATGCTTCCTTCCTCACTCGTGAAGCCAT 1560

109685914 CAGGAGCAAAGCTCCAGGGAGTGCCTTCCGCCCTGCTGGCAATGAATGGCCTCTCCTGAC 109685973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CAGGAGCAAAGCTCCAGGGAGTGCCTTCCGCCCTGCTGGCAATGAATGGCCTCTCCTGAC 1620

109685974 AGATAGCCTAAGAGCCTTTGGCTAAAGATTTGCAACATCAAAGAGTGAGTGGCATGGCCT 109686033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AGATAGCCTAAGAGCCTTTGGCTAAAGATTTGCAACATCAAAGAGTGAGTGGCATGGCCT 1680

109686034 GGCCAGCCACCTGAGACAACGTACTTTGTTCCAGAACGTGGTTCAGAGTTTCACCTTGCT 109686093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GGCCAGCCACCTGAGACAACGTACTTTGTTCCAGAACGTGGTTCAGAGTTTCACCTTGCT 1740

109686094 GGCTCAGTGGGGATTAAGGCTGAAAGAGGCTTTGAAAATGTTGATAACAGATGAATGTAA 109686153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GGCTCAGTGGGGATTAAGGCTGAAAGAGGCTTTGAAAATGTTGATAACAGATGAATGTAA 1800

109686154 ATATTATTTACCTAGCAACATAACACTTTTTTTCTTCTTTTTTGGCTCTTTCATGGAGTC 109686213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ATATTATTTACCTAGCAACATAACACTTTTTTTCTTCTTTTTTGGCTCTTTCATGGAGTC 1860

109686214 ATTACTCTTTCCCTTGAGTTGTCAGTTCCTTCATTTAGTCTATTCCTTCAACAATTATTG 109686273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ATTACTCTTTCCCTTGAGTTGTCAGTTCCTTCATTTAGTCTATTCCTTCAACAATTATTG 1920

109686274 ATCAAATCATTATTTGTGCTGGGCAGTGTTCTATGTCCCAGGAATTTTGTACTGTAAACC 109686333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ATCAAATCATTATTTGTGCTGGGCAGTGTTCTATGTCCCAGGAATTTTGTACTGTAAACC 1980

109686334 AGTACTCTGTCCTCATAACGCCTATAATCTAGAGACATTGAACTGTGAGCACAGGAATAA 109686393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AGTACTCTGTCCTCATAACGCCTATAATCTAGAGACATTGAACTGTGAGCACAGGAATAA 2040

109686394 GCAGTGTACTTTCAGAATGTAATCAGTGTTCTCAAGGGAGGAGATTATGATGTAACAGAG 109686453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GCAGTGTACTTTCAGAATGTAATCAGTGTTCTCAAGGGAGGAGATTATGATGTAACAGAG 2100

109686454 CTTCTTTTCATCTCAAAGGAAGGCCATTAAGAAGGGCCAGTCAGGACAGGTGATGCTGGC 109686513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CTTCTTTTCATCTCAAAGGAAGGCCATTAAGAAGGGCCAGTCAGGACAGGTGATGCTGGC 2160

109686514 AGGAAGGGAGCCAGCCTGCGACGTGCTGGGAAGACAGGCAGAGAGACTATACGTTCAAAG 109686573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AGGAAGGGAGCCAGCCTGCGACGTGCTGGGAAGACAGGCAGAGAGACTATACGTTCAAAG 2220

109686574 GGTGTGAGGCAGGCATGAGTTTGCAGAAAGTGTGCTAAGGGCCTGGAGCAGAGTGAGTGA 109686633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GGTGTGAGGCAGGCATGAGTTTGCAGAAAGTGTGCTAAGGGCCTGGAGCAGAGTGAGTGA 2280

109686634 GGGGGAACAAAGACAGGGAGGTGTTAAAGGGCCAGGAGGGGCTGGACCCTCTGGAGCATT 109686693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GGGGGAACAAAGACAGGGAGGTGTTAAAGGGCCAGGAGGGGCTGGACCCTCTGGAGCATT 2340

109686694 GATGACTATGCTGTGGAATGAATTTGGATGTTGTTTAAGGGGAATGGGAAGTCATTGAAA 109686753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GATGACTATGCTGTGGAATGAATTTGGATGTTGTTTAAGGGGAATGGGAAGTCATTGAAA 2400

109686754 TATTTTAAGTAGAGAAATGGGATGCACTGATTTACCTTATGAAAAGAGTTCTCTAGCTGC 109686813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TATTTTAAGTAGAGAAATGGGATGCACTGATTTACCTTATGAAAAGAGTTCTCTAGCTGC 2460

109686814 TTTGAGAGAATGGATTATAGTGGGGTGATATAGTTTGGACGTTTGTCCTCTCCAAATCTC 109686873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TTTGAGAGAATGGATTATAGTGGGGTGATATAGTTTGGACGTTTGTCCTCTCCAAATCTC 2520

109686874 GTGTTGAAATGTGATGCTCAGTGTTGGAGGTGGGGTCTGGTGGGAGGTGATTGGGTCGTG 109686933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GTGTTGAAATGTGATGCTCAGTGTTGGAGGTGGGGTCTGGTGGGAGGTGATTGGGTCGTG 2580

109686934 GAGCAGATCCTTCATGAATGGCTGCTGACATCATCTTGGTGGTGAGTGAGTTCTCAGTCT 109686993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GAGCAGATCCTTCATGAATGGCTGCTGACATCATCTTGGTGGTGAGTGAGTTCTCAGTCT 2640

109686994 GGTAGTTCACATGAGATCTGCCTGTTTTAAAGAGTATGGTGGCCAAGTGCCGTGGCTCAC 109687053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GGTAGTTCACATGAGATCTGCCTGTTTTAAAGAGTATGGTGGCCAAGTGCCGTGGCTCAC 2700

109687054 GCCTGTGATCCCAGCACTTTGGGAGGTAAAGGCAGGAGGATCACTTGAGCTCAGGAGTTC 109687113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GCCTGTGATCCCAGCACTTTGGGAGGTAAAGGCAGGAGGATCACTTGAGCTCAGGAGTTC 2760

109687114 GACACTAGCCTGGGAAACAGGGTGAAACCCATCTCTACTAAAAATAGAAATATTAGGCGG 109687173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GACACTAGCCTGGGAAACAGGGTGAAACCCATCTCTACTAAAAATAGAAATATTAGGCGG 2820

109687174 GTGTGATGGTGCGCTGCCTATAGTCCCAGCTACCGGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACT 109687233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GTGTGATGGTGCGCTGCCTATAGTCCCAGCTACCGGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACT 2880

109687234 TGAGCCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAA-GATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGG 109687292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
     2881 TGAGCCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGG 2940

109687293 GCAACAAAGCCAGACCCTATCTAAAAAAAAAAAAAAAAAATAGAGTGCGGCACCCCTCCC 109687352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||
     2941 GCAACAAAGCCAGACCCTATCTAAAAAAAAAAAAAAAA--TAGAGTGCGGCACCCCTCCC 2998

109687353 TTCCCACTGTTGCTCCCTCTCTCGCCATGTGGGGCACGGGCTGCTCCTTCATCTTCCACC 109687412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     2999 TTCCCACTGTTGCTCCCTCTCTCGCCATGTGGGGCATGGGCTGCTCCTTCATCTTCCACC 3058

109687413 ATTATTGTGAGCTTCCTGAGGCCTCACCAGGAGCAGATGTGAGCAAATTAAACCTCTTTT 109687472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3059 ATTATTGTGAGCTTCCTGAGGCCTCACCAGGAGCAGATGTGAGCAAATTAAACCTCTTTT 3118

109687473 CTTTATAAATTACCCATATTTAGGTATTTATTTATAGCTACTACAAGGGGGAAAGGGAGA 109687532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3119 CTTTATAAATTACCCATATTTAGGTATTTATTTATAGCTACTACAAGGGGGAAAGGGAGA 3178

109687533 GCAGGGAGATCAGTGGTGCTTTCACACTAGTACAGCAATAGAGCAGCATCTTGGACCAGG 109687592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3179 GCAGGGAGATCAGTGGTGCTTTCACACTAGTACAGCAATAGAGCAGCATCTTGGACCAGG 3238

109687593 GTGGTGGCTGAGGAGACAGGATCATGGCTTTGAGATACATTCTGAAGAAGAAAAGTAGGC 109687652
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3239 GTGGTGGCTGAGGAGACAGGATCATTGCTTTGAGATACATTCTGAAGAAGAAAAGTAGGC 3298

109687653 CTTGCTGATAGAATAGTCACAAACTGTAATGGAAAAGGTAAATTCAAGGATGTCTCCTGG 109687712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3299 CTTGCTGATAGAATAGTCACAAACTGTAATGGAAAAGGTAAATTCAAGGATGTCTCCTGG 3358

109687713 GTTTTTGGCTTAAGCATCTGGATACAGAGATATGGAAGACTGGGAGGGAAATGGGTTTGG 109687772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3359 GTTTTTGGCTTAAGCATCTGGATACAGAGATATGGAAGACTGGGAGGGAAATGGGTTTGG 3418

109687773 AGTATACATGCATGCAATCAACAATTCTGTCTTGCATGTGTGAAATTTAGATACCCATTA 109687832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3419 AGTATACATGCATGCAATCAACAATTCTGTCTTGCATGTGTGAAATTTAGATACCCATTA 3478

109687833 GACATCTGCATAGAGGGCCAGGCACAGTGGCTCACGGCAGTAATCCCAACACTTTGGGAG 109687892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3479 GACATCTGCATAGAGGGCCAGGCACAGTGGCTCACGGCAGTAATCCCAACACTTTGGGAG 3538

109687893 GCCAAGGTGGGCGGATCACTTGAGGTTAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGA 109687952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3539 GCCAAGGTGGGCGGATCACTTGAGGTTAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGA 3598

109687953 AACTCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTATCTGGGTGTGGTGGTGTGCACCTGTAATC 109688012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3599 AACTCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTATCTGGGTGTGGTGGTGTGCACCTGTAATC 3658

109688013 CCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCATGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGTAGAGGTTGCAG 109688072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3659 CCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCATGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGTAGAGGTTGCAG 3718

109688073 CGAGCCAAGATCACACCACTGCACTCTAGCAAGGGTGACAAAGCAAGACTCTATCTCAAA 109688132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3719 CGAGCCAAGATCACACCACTGCACTCTAGCAAGGGTGACAAAGCAAGACTCTATCTCAAA 3778

109688133 AAAAAAAAGACATTTATGTAGAGATGTTAGGTTGGCAGTTGGATAACAGTCTTGAGTTTC 109688192
          ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3779 AAAAAAA-GACATTTATGTAGAGATGTTAGGTTGGCAGTTGGATAACAGTCTTGAGTTTC 3837

109688193 GGGGTGAGGGCAGGACCAGAAATGAAGATTTGGGATTCATTAGCATGTAGATCATATTCA 109688252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3838 GGGGTGAGGGCAGGACCAGAAATGAAGATTTGGGATTCATTAGCATGTAGATCATATTCA 3897

109688253 GAGCCACAATAATAGATGAAATAACTGAGGAAGAGAGCTAGAGGGGCCAAGAGCAAACAC 109688312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3898 GAGCCACAATAATAGATGAAATAACTGAGGAAGAGAGCTAGAGGGGCCAAGAGCAAACAC 3957

109688313 AGGAACATGCCAGCATTTAGAGGACAATGGAGAAGGAGGAGATGGCAGAGATGTCAATAG 109688372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3958 AGGAACATGCCAGCATTTAGAGGACAATGGAGAAGGAGGAGATGGCAGAGATGTCAATAG 4017

109688373 GAGGAAAAGCAAAAGGGTGTTATCATAGAAGGTGACAACAGAATATATCACAAAGAGGAA 109688432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4018 GAGGAAAAGCAAAAGGGTGTTATCATAGAAGGTGACAACAGAATATATCACAAAGAGGAA 4077

109688433 TATGTTTGAATGTGTCAAATGTTGTTATCACAGGCTATAGAAGTAAACACAAAGTCTTAT 109688492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4078 TATGTTTGAATGTGTCAAATGTTGTTATCACAGGCTATAGAAGTAAACACAAAGTCTTAT 4137

109688493 GGGAATACTGAGGATGAGCTGCCTCTAGTGTGTGTGAAACCCTGGCCAAATATTTGTTGT 109688552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4138 GGGAATACTGAGGATGAGCTGCCTCTAGTGTGTGTGAAACCCTGGCCAAATATTTGTTGT 4197

109688553 GGGGCCCCTGTCTATATATGCAATGTTATTTAAAAACATACTACATATTCTTGGGCTTAT 109688612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4198 GGGGCCCCTGTCTATATATGCAATGTTATTTAAAAACATACTACATATTCTTGGGCTTAT 4257

109688613 GTGGGATGTAGTGATTTATTGATGAAGACTTAGAATACTGGGTAGGAAGAGATGCTTTTG 109688672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4258 GTGGGATGTAGTGATTTATTGATGAAGACTTAGAATACTGGGTAGGAAGAGATGCTTTTG 4317

109688673 GATTTGTTTATGAGCCAGTGAGTGTATCTGAGGATTCTTTATCCTGTGTCTAATGTGAGT 109688732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4318 GATTTGTTTATGAGCCAGTGAGTGTATCTGAGGATTCTTTATCCTGTGTCTAATGTGAGT 4377

109688733 GTGTTTTCCTGAATCAGTGCATCAGTGCTATTCTGGAGGCCCAAATCACACATGATTCCG 109688792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4378 GTGTTTTCCTGAATCAGTGCATCAGTGCTATTCTGGAGGCCCAAATCACACATGATTCCG 4437

109688793 TGAAAGAAACTCTGTGCTGGCCAGAGGATGCACTCACTCTCCAGGCTTTCCTGCATGGGC 109688852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4438 TGAAAGAAACTCTGTGCTGGCCAGAGGATGCACTCACTCTCCAGGCTTTCCTGCATGGGC 4497

109688853 CCTCACCATGGAGTCCTGGATACTTAGGGCATCTGGTTGACCACATGCTTGGGAGAGCAC 109688912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4498 CCTCACCATGGAGTCCTGGATACTTAGGGCATCTGGTTGACCACATGCTTGGGAGAGCAC 4557

109688913 CAAAGAAGGTCCTGGTTTTCAAGCCTCCAGCTTCTCCTTAGAAAGAGTTGACTACCTGTC 109688972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4558 CAAAGAAGGTCCTGGTTTTCAAGCCTCCAGCTTCTCCTTAGAAAGAGTTGACTACCTGTC 4617

109688973 TGGGCTCCAACTTTTCTGGCTGCTACCAGAGGGTCTGGCCTCTAAACCATCTGTGTCAAA 109689032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4618 TGGGCTCCAACTTTTCTGGCTGCTACCAGAGGGTCTGGCCTCTAAACCATCTGTGTCAAA 4677

109689033 GAACTGACAGGGCCTGACATTCACTGGGACCCTAGGCTAGGGGTGACAGAGAGCAAAGCA 109689092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4678 GAACTGACAGGGCCTGACATTCACTGGGACCCTAGGCTAGGGGTGACAGAGAGCAAAGCA 4737

109689093 AAAGTTTGAAAGAGTATGCAGTCTGAATGAGCATGCAGACCTTTGCCACAGCTCCCCTTC 109689152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4738 AAAGTTTGAAAGAGTATGCAGTCTGAATGAGCATGCAGACCTTTGCCACAGCTCCCCTTC 4797

109689153 CCAGCTCAGTGCAGAGCAAGTAGGAGATAAACTTCTGCTCTTAGCTTCTCTGTGAGGAGA 109689212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4798 CCAGCTCAGTGCAGAGCAAGTAGGAGATAAACTTCTGCTCTTAGCTTCTCTGTGAGGAGA 4857

109689213 GATGAAATGGACCACACATCTAGCACCCCAACTTTTCTGACAACTACTAGAAGGACTGAC 109689272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4858 GATGAAATGGACCACACATCTAGCACCCCAACTTTTCTGACAACTACTAGAAGGACTGAC 4917

109689273 TCCTGACTCACCTGTCTCAGGGCACTGATGGTACTTGGCACACTCTAGTCTCCTGGGGCC 109689332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4918 TCCTGACTCACCTGTCTCAGGGCACTGATGGTACTTGGCACACTCTAGTCTCCTGGGGCC 4977

109689333 ACCAAGAACAAGAACAGCATTTTGGACAAACACACTGGTTTGAGAGGCACCCAGACTCTC 109689392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4978 ACCAAGAACAAGAACAGCATTTTGGACAAACACACTGGTTTGAGAGGCACCCAGACTCTC 5037

109689393 TGACTGGGCTGTGAGGAGGCTCATCTGTGAAGACTGAGGGAGGTGGCTGTTTTATCAAAT 109689452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5038 TGACTGGGCTGTGAGGAGGCTCATCTGTGAAGACTGAGGGAGGTGGCTGTTTTATCAAAT 5097

109689453 GTGCAGAAACCAACACAGAGAGTCAAAGACAATGAACAAACAGGAAATATGCCATAAATA 109689512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5098 GTGCAGAAACCAACACAGAGAGTCAAAGACAATGAACAAACAGGAAATATGCCATAAATA 5157

109689513 AAAGAACAAGATAAATCTTCAGAAACTGACCCAAACAGAATGGAGATATGTGATTTACCA 109689572
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5158 AAAGAACAAGATAAAACTTCAGAAACTGACCCAAACAGAATGGAGATATGTGATTTACCA 5217

109689573 GACAAAAAATCAAAAGACCTGTCACAAAGATGCTCAGTGAGGTCAGGAGAGCAATGCATG 109689632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5218 GACAAAAAATCAAAAGACCTGTCACAAAGATGCTCAGTGAGGTCAGGAGAGCAATGCATG 5277

109689633 AATAAAGTGAGAATTTCAACCAAAAAGGTAGAAAATATTAAAAAGTGCCAAACAGAAATC 109689692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5278 AATAAAGTGAGAATTTCAACCAAAAAGGTAGAAAATATTAAAAAGTGCCAAACAGAAATC 5337

109689693 ACGGAGCTGAAGAATATAATAAAAGAACAGAAAAATTTAATAGAGGGGTTCAATAGCAGA 109689752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5338 ACGGAGCTGAAGAATATAATAAAAGAACAGAAAAATTTAATAGAGGGGTTCAATAGCAGA 5397

109689753 CTAGGTGAACTGAAAGAAAGGATTAGTGAACTCAAGGACTGGTCATTGGCAATCATTCAG 109689812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5398 CTAGGTGAACTGAAAGAAAGGATTAGTGAACTCAAGGACTGGTCATTGGCAATCATTCAG 5457

109689813 TCACAGCATTAAAAAGAAAAAAGAATGAAGGGCCAGGCACAGTGGCTCACACCTGTAATC 109689872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5458 TCACAGCATTAAAAAGAAAAAAGAATGAAGGGCCAGGCACAGTGGCTCACACCTGTAATC 5517

109689873 CCAACACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTG 109689900
          ||||||||||||||||||||||||||||
     5518 CCAACACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTG 5545

EXCISED REGION

109695215 GATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATTCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATTTCAACT 109695274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5546 GATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATTCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATTTCAACT 5605

109695275 AAAAATACAAAAAAAAAAAAAAAATAGCCGGGTGTGGTGGCACACACCCGTAGTCCCAGC 109695334
          |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5606 AAAAATAC-AAAAAAAAAAAAAAATAGCCGGGTGTGGTGGCACACACCCGTAGTCCCAGC 5664

109695335 TACTTGGGAGGCTGGGGCAGGAGAATGGCATGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGC 109695394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5665 TACTTGGGAGGCTGGGGCAGGAGAATGGCATGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGC 5724

109695395 CGAGATCGCACAATTGCTTTCCAGCCTGGGCAACGGAGCGAGACTCTGTTTCAAAAAAAA 109695454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5725 CGAGATCGCACAATTGCTTTCCAGCCTGGGCAACGGAGCGAGACTCTGTTTCAAAAAAAA 5784

109695455 AGGTGACCATGTGAAGGGATGGATATGTTAAGTAGCTTGACTGGTAATCGGTTCACGATG 109695514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5785 AGGTGACCATGTGAAGGGATGGATATGTTAAGTAGCTTGACTGGTAATCGGTTCACGATG 5844

109695515 TATATGTACAGTTGACCCTTGAACAACATGCGTTTAAATTACAAGAGTCCACTTATATGG 109695574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5845 TATATGTACAGTTGACCCTTGAACAACATGCGTTTAAATTACAAGAGTCCACTTATATGG 5904

109695575 GGATTTTCTTCTGCCTCTGCCAGCAAGGCCAACCCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCCCCTCA 109695634
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5905 GGATTTTCTTCTGCCTTTGCCAGCAAGGCCAACCCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCCCCTCA 5964

109695635 ACTAAAGACGAGGAGGATGAGGACCTTTAGGGTGATCCACTTCCACTTAATGAATAGTAA 109695694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5965 ACTAAAGACGAGGAGGATGAGGACCTTTAGGGTGATCCACTTCCACTTAATGAATAGTAA 6024

109695695 ATACGGTTTCTCTTCCTTATGATTTTCTTAATATTTTCTTTTCCCTAACTTACTTTGTTG 109695754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6025 ATACGGTTTCTCTTCCTTATGATTTTCTTAATATTTTCTTTTCCCTAACTTACTTTGTTG 6084

109695755 TAAGAATGCAGTACTCAATACACGTAAGATACAAAATTTGTATGAATTGACTGTTTGTGT 109695814
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6085 TAAGAATGCAGTACACAATACACGTAAGATACAAAATTTGTATGAATTGACTGTTTGTGT 6144

109695815 TATCTGCAAGGCTTCCTGTCAACACTAGGGTATTAATAGTTAAGTTTTGGGGGAGTCAAA 109695874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6145 TATCTGCAAGGCTTCCTGTCAACACTAGGGTATTAATAGTTAAGTTTTGGGGGAGTCAAA 6204

109695875 AGTTATTTGTGGATTTTTTACTGTTCGGGGAGTTGGTGCCCCTAACCCCTTCGTTGTTAA 109695934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6205 AGTTATTTGTGGATTTTTTACTGTTCGGGGAGTTGGTGCCCCTAACCCCTTCGTTGTTAA 6264

109695935 AGAGTCAACTGTATATCAAAACATCGTGCTGTATACCTTAAATGTATATACTTTCAATTA 109695994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6265 AGAGTCAACTGTATATCAAAACATCGTGCTGTATACCTTAAATGTATATACTTTCAATTA 6324

109695995 AAATATTTTAAAAACAAACCAATAAAAAGGCACTGCTTCTGGCCCAGGGTGAGCCATCAG 109696054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6325 AAATATTTTAAAAACAAACCAATAAAAAGGCACTGCTTCTGGCCCAGGGTGAGCCATCAG 6384

109696055 ATGGCACAGCTGGCCCTGTCCGGTCCCAACCAGCAGAGGGGACTGTCAATTGAGAAGCTC 109696114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6385 ATGGCACAGCTGGCCCTGTCCGGTCCCAACCAGCAGAGGGGACTGTCAATTGAGAAGCTC 6444

109696115 CAGTGCTAAACGCTGGAATATGAAGATATGCATGGTGGGGAGACAGCACACACACACATA 109696174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6445 CAGTGCTAAACGCTGGAATATGAAGATATGCATGGTGGGGAGACAGCACACACACACATA 6504

109696175 ACACTCAAGGCCTGGTGGAGCCCACCCAGCTCAGCCTGGGTTGGGGAGGCTCCCTGGGAA 109696234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6505 ACACTCAAGGCCTGGTGGAGCCCACCCAGCTCAGCCTGGGTTGGGGAGGCTCCCTGGGAA 6564

109696235 GGGGATTCCTGATGTGAGCCTTCCAGGAGGGGTAGGAATTCTCTACACAGACAGGTGGGA 109696294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6565 GGGGATTCCTGATGTGAGCCTTCCAGGAGGGGTAGGAATTCTCTACACAGACAGGTGGGA 6624

109696295 ACTCCAGGCAGAGGGGAGGCCTGAAACACATCACAGGCCACCCTGTCCCTAGACTGCTGA 109696354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6625 ACTCCAGGCAGAGGGGAGGCCTGAAACACATCACAGGCCACCCTGTCCCTAGACTGCTGA 6684

109696355 GAGGCAGGACGGGGCTACACGGCCATGGGTGTGAGTCACCAAGGACCCTGTGCCTGCTGA 109696414
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     6685 GAGGCAGGACGGGGCTACACGGCCATGGGCGTGAGTCACCAAGGACCCTGTGCCTGCTGA 6744

109696415 GGCATGAGGACGCATTTCTGGGACGACAGAAAGACAGCAAAGGGCTTCAGACTATGGAAT 109696474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6745 GGCATGAGGACGCATTTCTGGGACGACAGAAAGACAGCAAAGGGCTTCAGACTATGGAAT 6804

109696475 ACCCGGAATAGGGCTCTAAGCATCTCCTCCGATGATTGTGGACTCAATGCAGGAAATGTG 109696534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6805 ACCCGGAATAGGGCTCTAAGCATCTCCTCCGATGATTGTGGACTCAATGCAGGAAATGTG 6864

109696535 GAGGCTTCGAGCTAGACCAGTGACAGAGGAGGGAAAAGGAGATGGGGCCCATCAATATTT 109696594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6865 GAGGCTTCGAGCTAGACCAGTGACAGAGGAGGGAAAAGGAGATGGGGCCCATCAATATTT 6924

109696595 GAAACTTGGCAAAACGCAGCAAGATTTTAATGGTTAATCAAAAATGGGAGGTGAATGGGA 109696654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6925 GAAACTTGGCAAAACGCAGCAAGATTTTAATGGTTAATCAAAAATGGGAGGTGAATGGGA 6984

109696655 GAAAGAGGAGCTGACAACCACTCCCACAATTCTGGTTTCCAGGGCGTGTTATAGCTGAGA 109696714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6985 GAAAGAGGAGCTGACAACCACTCCCACAATTCTGGTTTCCAGGGCGTGTTATAGCTGAGA 7044

109696715 GGGCAGCAGTTTGAGTGGCTGGGCAGCAGAGGCTGGGGTTGAGGCTGGGAAGTGGCGGCA 109696774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7045 GGGCAGCAGTTTGAGTGGCTGGGCAGCAGAGGCTGGGGTTGAGGCTGGGAAGTGGCGGCA 7104

109696775 GCAGGGGAGACTGCCCCATCAGGAGCCTGCCATAAGCGTGGGATGCAGAAGGACTGGAAG 109696834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7105 GCAGGGGAGACTGCCCCATCAGGAGCCTGCCATAAGCGTGGGATGCAGAAGGACTGGAAG 7164

109696835 GTGCTGGAGGTGATGTGGAGCTTTGGGAGAGTGTCGGAGGGATGGAATAAGTTGATGCCT 109696894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7165 GTGCTGGAGGTGATGTGGAGCTTTGGGAGAGTGTCGGAGGGATGGAATAAGTTGATGCCT 7224

109696895 GTTCCGAGACCAAGAAGTGGGGAGCAACTGAAGAAACTGGAGAGTGGGAACCAGGTTGCA 109696954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7225 GTTCCGAGACCAAGAAGTGGGGAGCAACTGAAGAAACTGGAGAGTGGGAACCAGGTTGCA 7284

109696955 GCTGGTCTCCAGATGCTGCACTCTCTGACAGCTCTCATCTATCTCACTGTCACCCAGGAT 109697014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7285 GCTGGTCTCCAGATGCTGCACTCTCTGACAGCTCTCATCTATCTCACTGTCACCCAGGAT 7344

109697015 TGGACAGGACATCTACAAATGTGCATGTGTATTTGCTATAAGGTGCATTCTTTTCCCCTG 109697074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7345 TGGACAGGACATCTACAAATGTGCATGTGTATTTGCTATAAGGTGCATTCTTTTCCCCTG 7404

109697075 GAGATAGTGACCAACCTTTCAAGAACTATTCTTGGGTATATTTTATCATTTCTTTATTTT 109697134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7405 GAGATAGTGACCAACCTTTCAAGAACTATTCTTGGGTATATTTTATCATTTCTTTATTTT 7464

109697135 AGTATCTATGAAGGGAACATTATAGAAGCCATGTTAACACTGGAGAAATGTCTAATATTA 109697194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7465 AGTATCTATGAAGGGAACATTATAGAAGCCATGTTAACACTGGAGAAATGTCTAATATTA 7524

109697195 AAAAACCAGTACTCTAGCAAGTAAAATTATGTATGTGTGTAACCTCGTTCCTACATCCAG 109697254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7525 AAAAACCAGTACTCTAGCAAGTAAAATTATGTATGTGTGTAACCTCGTTCCTACATCCAG 7584

109697255 GAAATCATTAAACTAGTAGGGGGTTGTATTAATTAGAACTCTCTGTTGCAAACAACAGAC 109697314
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     7585 GAAATCATTAAACTAGTAGGGGGTTGTATTAATCAGAACTCTCTGTTGCAAACAACAGAC 7644

109697315 AGTCTGGATGATTTAAAAGGAACAGAAATGTATTAAGAGGATATTGGATAGTTCACAAAA 109697374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7645 AGTCTGGATGATTTAAAAGGAACAGAAATGTATTAAGAGGATATTGGATAGTTCACAAAA 7704

109697375 CCTCCAGGAGGGCTGGAGAGCCAGGCTGGATGCTGTGCCACTGACACAACATTCAAAACT 109697434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7705 CCTCCAGGAGGGCTGGAGAGCCAGGCTGGATGCTGTGCCACTGACACAACATTCAAAACT 7764

109697435 CACAGATTCTTCTGCTGCCATCCACTATGCTAGCTACCAGCCATGCATGGCCATGCAGCA 109697494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7765 CACAGATTCTTCTGCTGCCATCCACTATGCTAGCTACCAGCCATGCATGGCCATGCAGCA 7824

109697495 CTTGATGTGTGCCTGCCCAACTGAGATGTGCTGCAGGTGCACAATACTCACTGGACTTCG 109697554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7825 CTTGATGTGTGCCTGCCCAACTGAGATGTGCTGCAGGTGCACAATACTCACTGGACTTCG 7884

109697555 AAGACTAAACGTGAAGAAAGGACATAAAATCTCACTCAGGTTAAAATGATATCTGCACAC 109697614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7885 AAGACTAAACGTGAAGAAAGGACATAAAATCTCACTCAGGTTAAAATGATATCTGCACAC 7944

109697615 ACTGGGTATTAAGTAAAATACATTGAAATTAATTTCACTTGTTTCTTTTTGCTTTTTAAA 109697674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7945 ACTGGGTATTAAGTAAAATACATTGAAATTAATTTCACTTGTTTCTTTTTGCTTTTTAAA 8004

109697675 TGCAGTTACTAGAAAATTTTACATTACCTGTGGGAAATTGGCTCCACATCATTTCCTCTG 109697734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8005 TGCAGTTACTAGAAAATTTTACATTACCTGTGGGAAATTGGCTCCACATCATTTCCTCTG 8064

109697735 TTTTCTATTGATCGAATTGAGTCCTAAGGCCACATCTGATATTTGGGGGAAAGGAAATAT 109697794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8065 TTTTCTATTGATCGAATTGAGTCCTAAGGCCACATCTGATATTTGGGGGAAAGGAAATAT 8124

109697795 ACATCACCTCCAGATGGGGGCAGCCCCCCATGCAGGGATGGGGAGCTGCCCGAGGCTGTT 109697854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8125 ACATCACCTCCAGATGGGGGCAGCCCCCCATGCAGGGATGGGGAGCTGCCCGAGGCTGTT 8184

109697855 TTTGGAAACATCTGTGGTCCCCAACAACAGTGCTTCTGGCCTGTTTTTTCACATGGGGCT 109697914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8185 TTTGGAAACATCTGTGGTCCCCAACAACAGTGCTTCTGGCCTGTTTTTTCACATGGGGCT 8244

109697915 CCGCGTCTGTGGCTGACTCAATGCTGGGCTTGAGGTGGGGGTGACTGTCACATGACAGAT 109697974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8245 CCGCGTCTGTGGCTGACTCAATGCTGGGCTTGAGGTGGGGGTGACTGTCACATGACAGAT 8304

109697975 TAGGTCAAGCCTCCATCGTGCTCAGGGTTTATGAGACAGATCACAAGGGCCTCTGGGGAC 109698034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8305 TAGGTCAAGCCTCCATCGTGCTCAGGGTTTATGAGACAGATCACAAGGGCCTCTGGGGAC 8364

109698035 TGCCTGTCGCTTGTGGTCCTGGGGAACCAACCCCATGGTCAACTCCACCTCTGAACCTCT 109698094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8365 TGCCTGTCGCTTGTGGTCCTGGGGAACCAACCCCATGGTCAACTCCACCTCTGAACCTCT 8424

109698095 CCTGCAAGGGGCAAGAGCATCCTGGTAACCTTGCCCATCCTGACACCTGCTGTGGTAACT 109698154
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8425 CCTGCAAGGGGCCAGAGCATCCTGGTAACCTTGCCCATCCTGACACCTGCTGTGGTAACT 8484

109698155 CATTCCCTGCTCTGGCACTTGAGCAACCCCTCGGCCCCACCATCCCAGGACTTCACAACC 109698214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8485 CATTCCCTGCTCTGGCACTTGAGCAACCCCTCGGCCCCACCATCCCAGGACTTCACAACC 8544

109698215 TGCCGCCGCCAGGGAGCCCTTTTTGCAACCACAGTGCCTGGCAGCAGTGACATGGCTTGC 109698274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8545 TGCCGCCGCCAGGGAGCCCTTTTTGCAACCACAGTGCCTGGCAGCAGTGACATGGCTTGC 8604

109698275 AGAAACACATCCTTGCTATTCAGTTGCACTTGCCAACGAGGCATCTTCTGGGGTCTTGTC 109698334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8605 AGAAACACATCCTTGCTATTCAGTTGCACTTGCCAACGAGGCATCTTCTGGGGTCTTGTC 8664

109698335 GGGGAGATCACTGGGGGATGGCCAGCTGTTTTCATAGGAAAAGTCTGTCTGGTTCTTCAT 109698394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8665 GGGGAGATCACTGGGGGATGGCCAGCTGTTTTCATAGGAAAAGTCTGTCTGGTTCTTCAT 8724

109698395 CTCCGTATTTGTCCTCCACACTGCTCACTGCATTTCTGCATCCTGGCTTTGTGTGGGGCA 109698454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8725 CTCCGTATTTGTCCTCCACACTGCTCACTGCATTTCTGCATCCTGGCTTTGTGTGGGGCA 8784

109698455 TGCTGCTGTGGACTCCAGCATCTGTCAACCCAAATGCAAAGGCGGAGCCCACCTCGGCTG 109698514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8785 TGCTGCTGTGGACTCCAGCATCTGTCAACCCAAATGCAAAGGCGGAGCCCACCTCGGCTG 8844

109698515 CAGGAACTGCCACACTGAAGTGCTCTACCCATGCTTCAGCTGCCTCCAGAATCCATTCCC 109698574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8845 CAGGAACTGCCACACTGAAGTGCTCTACCCATGCTTCAGCTGCCTCCAGAATCCATTCCC 8904

109698575 ATATGGGCTAACCAGATGTGTGCAGCTAATCAACAGTTAGCATTTCTGTCTTTGGATAGT 109698634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8905 ATATGGGCTAACCAGATGTGTGCAGCTAATCAACAGTTAGCATTTCTGTCTTTGGATAGT 8964

109698635 AAGGACTTCTGCTTCCAGACTTCAGATCTCTCCTTAGGTAGCAGCTCTGACCCAAGGTTA 109698694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8965 AAGGACTTCTGCTTCCAGACTTCAGATCTCTCCTTAGGTAGCAGCTCTGACCCAAGGTTA 9024

109698695 GGATTCCAGGACTCAGTCAGCTCCTGGTATTCCTTAGCACCCCTTTTTTATTTTATTTTA 109698754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9025 GGATTCCAGGACTCAGTCAGCTCCTGGTATTCCTTAGCACCCCTTTTTTATTTTATTTTA 9084

109698755 TTTTATTTATTTATTTTTTTGAGACAGAGTCTCTCTCTGTGGCCCAGGCTAGAGTGCAGT 109698814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9085 TTTTATTTATTTATTTTTTTGAGACAGAGTCTCTCTCTGTGGCCCAGGCTAGAGTGCAGT 9144

109698815 GGTGCTATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCTTCCCGGGTTCACACCATTCTCCTGCCTCA 109698874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9145 GGTGCTATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCTTCCCGGGTTCACACCATTCTCCTGCCTCA 9204

109698875 GCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCA 109698904
          ||||||||||||||||||||||||||||||
     9205 GCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCA 9234

Alignment time is 8.04775 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [109679900,109705214] =>     25315 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [        1,     3726] =>      3726 nucs 'mol-32-3492-186267_3726'

Score:        3661
Aligned:      3727        nucs
Identic:      3721 (100%) nucs =>        37 (100%)      3684 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [109689864,109689900] EXCISED REGION [109695215,109698904]
 second seq =>  [        1,       37] EXCISED REGION [       38,     3726]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      5314 nucs [109689901,109695214]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        28 nucs [109689901,109689928] to [109695215,109695242]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [109689900,109689900] to [109695215,109695215]
 second seq =>         1 nucs [37,37] to [38,38]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

109689864 CCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTG 109689900
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTG 37

EXCISED REGION

109695215 GATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATTCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATTTCAACT 109695274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       38 GATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATTCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATTTCAACT 97

109695275 AAAAATACAAAAAAAAAAAAAAAATAGCCGGGTGTGGTGGCACACACCCGTAGTCCCAGC 109695334
          |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       98 AAAAATAC-AAAAAAAAAAAAAAATAGCCGGGTGTGGTGGCACACACCCGTAGTCCCAGC 156

109695335 TACTTGGGAGGCTGGGGCAGGAGAATGGCATGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGC 109695394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      157 TACTTGGGAGGCTGGGGCAGGAGAATGGCATGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGC 216

109695395 CGAGATCGCACAATTGCTTTCCAGCCTGGGCAACGGAGCGAGACTCTGTTTCAAAAAAAA 109695454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      217 CGAGATCGCACAATTGCTTTCCAGCCTGGGCAACGGAGCGAGACTCTGTTTCAAAAAAAA 276

109695455 AGGTGACCATGTGAAGGGATGGATATGTTAAGTAGCTTGACTGGTAATCGGTTCACGATG 109695514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      277 AGGTGACCATGTGAAGGGATGGATATGTTAAGTAGCTTGACTGGTAATCGGTTCACGATG 336

109695515 TATATGTACAGTTGACCCTTGAACAACATGCGTTTAAATTACAAGAGTCCACTTATATGG 109695574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      337 TATATGTACAGTTGACCCTTGAACAACATGCGTTTAAATTACAAGAGTCCACTTATATGG 396

109695575 GGATTTTCTTCTGCCTCTGCCAGCAAGGCCAACCCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCCCCTCA 109695634
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      397 GGATTTTCTTCTGCCTTTGCCAGCAAGGCCAACCCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCCCCTCA 456

109695635 ACTAAAGACGAGGAGGATGAGGACCTTTAGGGTGATCCACTTCCACTTAATGAATAGTAA 109695694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      457 ACTAAAGACGAGGAGGATGAGGACCTTTAGGGTGATCCACTTCCACTTAATGAATAGTAA 516

109695695 ATACGGTTTCTCTTCCTTATGATTTTCTTAATATTTTCTTTTCCCTAACTTACTTTGTTG 109695754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      517 ATACGGTTTCTCTTCCTTATGATTTTCTTAATATTTTCTTTTCCCTAACTTACTTTGTTG 576

109695755 TAAGAATGCAGTACTCAATACACGTAAGATACAAAATTTGTATGAATTGACTGTTTGTGT 109695814
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      577 TAAGAATGCAGTACACAATACACGTAAGATACAAAATTTGTATGAATTGACTGTTTGTGT 636

109695815 TATCTGCAAGGCTTCCTGTCAACACTAGGGTATTAATAGTTAAGTTTTGGGGGAGTCAAA 109695874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      637 TATCTGCAAGGCTTCCTGTCAACACTAGGGTATTAATAGTTAAGTTTTGGGGGAGTCAAA 696

109695875 AGTTATTTGTGGATTTTTTACTGTTCGGGGAGTTGGTGCCCCTAACCCCTTCGTTGTTAA 109695934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      697 AGTTATTTGTGGATTTTTTACTGTTCGGGGAGTTGGTGCCCCTAACCCCTTCGTTGTTAA 756

109695935 AGAGTCAACTGTATATCAAAACATCGTGCTGTATACCTTAAATGTATATACTTTCAATTA 109695994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      757 AGAGTCAACTGTATATCAAAACATCGTGCTGTATACCTTAAATGTATATACTTTCAATTA 816

109695995 AAATATTTTAAAAACAAACCAATAAAAAGGCACTGCTTCTGGCCCAGGGTGAGCCATCAG 109696054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      817 AAATATTTTAAAAACAAACCAATAAAAAGGCACTGCTTCTGGCCCAGGGTGAGCCATCAG 876

109696055 ATGGCACAGCTGGCCCTGTCCGGTCCCAACCAGCAGAGGGGACTGTCAATTGAGAAGCTC 109696114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      877 ATGGCACAGCTGGCCCTGTCCGGTCCCAACCAGCAGAGGGGACTGTCAATTGAGAAGCTC 936

109696115 CAGTGCTAAACGCTGGAATATGAAGATATGCATGGTGGGGAGACAGCACACACACACATA 109696174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      937 CAGTGCTAAACGCTGGAATATGAAGATATGCATGGTGGGGAGACAGCACACACACACATA 996

109696175 ACACTCAAGGCCTGGTGGAGCCCACCCAGCTCAGCCTGGGTTGGGGAGGCTCCCTGGGAA 109696234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      997 ACACTCAAGGCCTGGTGGAGCCCACCCAGCTCAGCCTGGGTTGGGGAGGCTCCCTGGGAA 1056

109696235 GGGGATTCCTGATGTGAGCCTTCCAGGAGGGGTAGGAATTCTCTACACAGACAGGTGGGA 109696294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1057 GGGGATTCCTGATGTGAGCCTTCCAGGAGGGGTAGGAATTCTCTACACAGACAGGTGGGA 1116

109696295 ACTCCAGGCAGAGGGGAGGCCTGAAACACATCACAGGCCACCCTGTCCCTAGACTGCTGA 109696354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1117 ACTCCAGGCAGAGGGGAGGCCTGAAACACATCACAGGCCACCCTGTCCCTAGACTGCTGA 1176

109696355 GAGGCAGGACGGGGCTACACGGCCATGGGTGTGAGTCACCAAGGACCCTGTGCCTGCTGA 109696414
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     1177 GAGGCAGGACGGGGCTACACGGCCATGGGCGTGAGTCACCAAGGACCCTGTGCCTGCTGA 1236

109696415 GGCATGAGGACGCATTTCTGGGACGACAGAAAGACAGCAAAGGGCTTCAGACTATGGAAT 109696474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1237 GGCATGAGGACGCATTTCTGGGACGACAGAAAGACAGCAAAGGGCTTCAGACTATGGAAT 1296

109696475 ACCCGGAATAGGGCTCTAAGCATCTCCTCCGATGATTGTGGACTCAATGCAGGAAATGTG 109696534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1297 ACCCGGAATAGGGCTCTAAGCATCTCCTCCGATGATTGTGGACTCAATGCAGGAAATGTG 1356

109696535 GAGGCTTCGAGCTAGACCAGTGACAGAGGAGGGAAAAGGAGATGGGGCCCATCAATATTT 109696594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1357 GAGGCTTCGAGCTAGACCAGTGACAGAGGAGGGAAAAGGAGATGGGGCCCATCAATATTT 1416

109696595 GAAACTTGGCAAAACGCAGCAAGATTTTAATGGTTAATCAAAAATGGGAGGTGAATGGGA 109696654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1417 GAAACTTGGCAAAACGCAGCAAGATTTTAATGGTTAATCAAAAATGGGAGGTGAATGGGA 1476

109696655 GAAAGAGGAGCTGACAACCACTCCCACAATTCTGGTTTCCAGGGCGTGTTATAGCTGAGA 109696714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1477 GAAAGAGGAGCTGACAACCACTCCCACAATTCTGGTTTCCAGGGCGTGTTATAGCTGAGA 1536

109696715 GGGCAGCAGTTTGAGTGGCTGGGCAGCAGAGGCTGGGGTTGAGGCTGGGAAGTGGCGGCA 109696774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1537 GGGCAGCAGTTTGAGTGGCTGGGCAGCAGAGGCTGGGGTTGAGGCTGGGAAGTGGCGGCA 1596

109696775 GCAGGGGAGACTGCCCCATCAGGAGCCTGCCATAAGCGTGGGATGCAGAAGGACTGGAAG 109696834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1597 GCAGGGGAGACTGCCCCATCAGGAGCCTGCCATAAGCGTGGGATGCAGAAGGACTGGAAG 1656

109696835 GTGCTGGAGGTGATGTGGAGCTTTGGGAGAGTGTCGGAGGGATGGAATAAGTTGATGCCT 109696894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1657 GTGCTGGAGGTGATGTGGAGCTTTGGGAGAGTGTCGGAGGGATGGAATAAGTTGATGCCT 1716

109696895 GTTCCGAGACCAAGAAGTGGGGAGCAACTGAAGAAACTGGAGAGTGGGAACCAGGTTGCA 109696954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1717 GTTCCGAGACCAAGAAGTGGGGAGCAACTGAAGAAACTGGAGAGTGGGAACCAGGTTGCA 1776

109696955 GCTGGTCTCCAGATGCTGCACTCTCTGACAGCTCTCATCTATCTCACTGTCACCCAGGAT 109697014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1777 GCTGGTCTCCAGATGCTGCACTCTCTGACAGCTCTCATCTATCTCACTGTCACCCAGGAT 1836

109697015 TGGACAGGACATCTACAAATGTGCATGTGTATTTGCTATAAGGTGCATTCTTTTCCCCTG 109697074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1837 TGGACAGGACATCTACAAATGTGCATGTGTATTTGCTATAAGGTGCATTCTTTTCCCCTG 1896

109697075 GAGATAGTGACCAACCTTTCAAGAACTATTCTTGGGTATATTTTATCATTTCTTTATTTT 109697134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1897 GAGATAGTGACCAACCTTTCAAGAACTATTCTTGGGTATATTTTATCATTTCTTTATTTT 1956

109697135 AGTATCTATGAAGGGAACATTATAGAAGCCATGTTAACACTGGAGAAATGTCTAATATTA 109697194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1957 AGTATCTATGAAGGGAACATTATAGAAGCCATGTTAACACTGGAGAAATGTCTAATATTA 2016

109697195 AAAAACCAGTACTCTAGCAAGTAAAATTATGTATGTGTGTAACCTCGTTCCTACATCCAG 109697254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2017 AAAAACCAGTACTCTAGCAAGTAAAATTATGTATGTGTGTAACCTCGTTCCTACATCCAG 2076

109697255 GAAATCATTAAACTAGTAGGGGGTTGTATTAATTAGAACTCTCTGTTGCAAACAACAGAC 109697314
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     2077 GAAATCATTAAACTAGTAGGGGGTTGTATTAATCAGAACTCTCTGTTGCAAACAACAGAC 2136

109697315 AGTCTGGATGATTTAAAAGGAACAGAAATGTATTAAGAGGATATTGGATAGTTCACAAAA 109697374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2137 AGTCTGGATGATTTAAAAGGAACAGAAATGTATTAAGAGGATATTGGATAGTTCACAAAA 2196

109697375 CCTCCAGGAGGGCTGGAGAGCCAGGCTGGATGCTGTGCCACTGACACAACATTCAAAACT 109697434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2197 CCTCCAGGAGGGCTGGAGAGCCAGGCTGGATGCTGTGCCACTGACACAACATTCAAAACT 2256

109697435 CACAGATTCTTCTGCTGCCATCCACTATGCTAGCTACCAGCCATGCATGGCCATGCAGCA 109697494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2257 CACAGATTCTTCTGCTGCCATCCACTATGCTAGCTACCAGCCATGCATGGCCATGCAGCA 2316

109697495 CTTGATGTGTGCCTGCCCAACTGAGATGTGCTGCAGGTGCACAATACTCACTGGACTTCG 109697554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2317 CTTGATGTGTGCCTGCCCAACTGAGATGTGCTGCAGGTGCACAATACTCACTGGACTTCG 2376

109697555 AAGACTAAACGTGAAGAAAGGACATAAAATCTCACTCAGGTTAAAATGATATCTGCACAC 109697614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2377 AAGACTAAACGTGAAGAAAGGACATAAAATCTCACTCAGGTTAAAATGATATCTGCACAC 2436

109697615 ACTGGGTATTAAGTAAAATACATTGAAATTAATTTCACTTGTTTCTTTTTGCTTTTTAAA 109697674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2437 ACTGGGTATTAAGTAAAATACATTGAAATTAATTTCACTTGTTTCTTTTTGCTTTTTAAA 2496

109697675 TGCAGTTACTAGAAAATTTTACATTACCTGTGGGAAATTGGCTCCACATCATTTCCTCTG 109697734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2497 TGCAGTTACTAGAAAATTTTACATTACCTGTGGGAAATTGGCTCCACATCATTTCCTCTG 2556

109697735 TTTTCTATTGATCGAATTGAGTCCTAAGGCCACATCTGATATTTGGGGGAAAGGAAATAT 109697794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2557 TTTTCTATTGATCGAATTGAGTCCTAAGGCCACATCTGATATTTGGGGGAAAGGAAATAT 2616

109697795 ACATCACCTCCAGATGGGGGCAGCCCCCCATGCAGGGATGGGGAGCTGCCCGAGGCTGTT 109697854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2617 ACATCACCTCCAGATGGGGGCAGCCCCCCATGCAGGGATGGGGAGCTGCCCGAGGCTGTT 2676

109697855 TTTGGAAACATCTGTGGTCCCCAACAACAGTGCTTCTGGCCTGTTTTTTCACATGGGGCT 109697914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2677 TTTGGAAACATCTGTGGTCCCCAACAACAGTGCTTCTGGCCTGTTTTTTCACATGGGGCT 2736

109697915 CCGCGTCTGTGGCTGACTCAATGCTGGGCTTGAGGTGGGGGTGACTGTCACATGACAGAT 109697974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2737 CCGCGTCTGTGGCTGACTCAATGCTGGGCTTGAGGTGGGGGTGACTGTCACATGACAGAT 2796

109697975 TAGGTCAAGCCTCCATCGTGCTCAGGGTTTATGAGACAGATCACAAGGGCCTCTGGGGAC 109698034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2797 TAGGTCAAGCCTCCATCGTGCTCAGGGTTTATGAGACAGATCACAAGGGCCTCTGGGGAC 2856

109698035 TGCCTGTCGCTTGTGGTCCTGGGGAACCAACCCCATGGTCAACTCCACCTCTGAACCTCT 109698094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2857 TGCCTGTCGCTTGTGGTCCTGGGGAACCAACCCCATGGTCAACTCCACCTCTGAACCTCT 2916

109698095 CCTGCAAGGGGCAAGAGCATCCTGGTAACCTTGCCCATCCTGACACCTGCTGTGGTAACT 109698154
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2917 CCTGCAAGGGGCCAGAGCATCCTGGTAACCTTGCCCATCCTGACACCTGCTGTGGTAACT 2976

109698155 CATTCCCTGCTCTGGCACTTGAGCAACCCCTCGGCCCCACCATCCCAGGACTTCACAACC 109698214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2977 CATTCCCTGCTCTGGCACTTGAGCAACCCCTCGGCCCCACCATCCCAGGACTTCACAACC 3036

109698215 TGCCGCCGCCAGGGAGCCCTTTTTGCAACCACAGTGCCTGGCAGCAGTGACATGGCTTGC 109698274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3037 TGCCGCCGCCAGGGAGCCCTTTTTGCAACCACAGTGCCTGGCAGCAGTGACATGGCTTGC 3096

109698275 AGAAACACATCCTTGCTATTCAGTTGCACTTGCCAACGAGGCATCTTCTGGGGTCTTGTC 109698334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3097 AGAAACACATCCTTGCTATTCAGTTGCACTTGCCAACGAGGCATCTTCTGGGGTCTTGTC 3156

109698335 GGGGAGATCACTGGGGGATGGCCAGCTGTTTTCATAGGAAAAGTCTGTCTGGTTCTTCAT 109698394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3157 GGGGAGATCACTGGGGGATGGCCAGCTGTTTTCATAGGAAAAGTCTGTCTGGTTCTTCAT 3216

109698395 CTCCGTATTTGTCCTCCACACTGCTCACTGCATTTCTGCATCCTGGCTTTGTGTGGGGCA 109698454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3217 CTCCGTATTTGTCCTCCACACTGCTCACTGCATTTCTGCATCCTGGCTTTGTGTGGGGCA 3276

109698455 TGCTGCTGTGGACTCCAGCATCTGTCAACCCAAATGCAAAGGCGGAGCCCACCTCGGCTG 109698514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3277 TGCTGCTGTGGACTCCAGCATCTGTCAACCCAAATGCAAAGGCGGAGCCCACCTCGGCTG 3336

109698515 CAGGAACTGCCACACTGAAGTGCTCTACCCATGCTTCAGCTGCCTCCAGAATCCATTCCC 109698574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3337 CAGGAACTGCCACACTGAAGTGCTCTACCCATGCTTCAGCTGCCTCCAGAATCCATTCCC 3396

109698575 ATATGGGCTAACCAGATGTGTGCAGCTAATCAACAGTTAGCATTTCTGTCTTTGGATAGT 109698634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3397 ATATGGGCTAACCAGATGTGTGCAGCTAATCAACAGTTAGCATTTCTGTCTTTGGATAGT 3456

109698635 AAGGACTTCTGCTTCCAGACTTCAGATCTCTCCTTAGGTAGCAGCTCTGACCCAAGGTTA 109698694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3457 AAGGACTTCTGCTTCCAGACTTCAGATCTCTCCTTAGGTAGCAGCTCTGACCCAAGGTTA 3516

109698695 GGATTCCAGGACTCAGTCAGCTCCTGGTATTCCTTAGCACCCCTTTTTTATTTTATTTTA 109698754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3517 GGATTCCAGGACTCAGTCAGCTCCTGGTATTCCTTAGCACCCCTTTTTTATTTTATTTTA 3576

109698755 TTTTATTTATTTATTTTTTTGAGACAGAGTCTCTCTCTGTGGCCCAGGCTAGAGTGCAGT 109698814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3577 TTTTATTTATTTATTTTTTTGAGACAGAGTCTCTCTCTGTGGCCCAGGCTAGAGTGCAGT 3636

109698815 GGTGCTATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCTTCCCGGGTTCACACCATTCTCCTGCCTCA 109698874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3637 GGTGCTATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCTTCCCGGGTTCACACCATTCTCCTGCCTCA 3696

109698875 GCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCA 109698904
          ||||||||||||||||||||||||||||||
     3697 GCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCA 3726

Alignment time is 3.25771 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [109679900,109705214] =>     25315 nucs '2 dna:chromosome chromosome:GRCh37:2:1:243199373:1'
Second seq [        1,     3729] =>      3729 nucs 'mol-32-34b3-117629_3729'

Score:        3649
Aligned:      3704        nucs
Identic:      3699 (100%) nucs =>      2660 (100%)      1039 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [109687238,109689900] EXCISED REGION [109695215,109696255]
 second seq =>  [        1,     2662] EXCISED REGION [     2663,     3703]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      5314 nucs [109689901,109695214]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        28 nucs [109689901,109689928] to [109695215,109695242]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [109689900,109689900] to [109695215,109695215]
 second seq =>         1 nucs [2662,2662] to [2663,2663]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

109687238 CCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAAC 109687297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAAC 60

109687298 AAAGCCAGACCCTATCTAAAAAAAAAAAAAAAAAATAGAGTGCGGCACCCCTCCCTTCCC 109687357
          |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
       61 AAAGCCAGACCCTATCTAAAAAAAAAAAAAAAAA-TAGAGTGCGGCACCCCTCCCTTCCC 119

109687358 ACTGTTGCTCCCTCTCTCGCCATGTGGGGCACGGGCTGCTCCTTCATCTTCCACCATTAT 109687417
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
      120 ACTGTTGCTCCCTCTCTCGCCATGTGGGGCATGGGCTGCTCCTTCATCTTCCACCATTAT 179

109687418 TGTGAGCTTCCTGAGGCCTCACCAGGAGCAGATGTGAGCAAATTAAACCTCTTTTCTTTA 109687477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      180 TGTGAGCTTCCTGAGGCCTCACCAGGAGCAGATGTGAGCAAATTAAACCTCTTTTCTTTA 239

109687478 TAAATTACCCATATTTAGGTATTTATTTATAGCTACTACAAGGGGGAAAGGGAGAGCAGG 109687537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      240 TAAATTACCCATATTTAGGTATTTATTTATAGCTACTACAAGGGGGAAAGGGAGAGCAGG 299

109687538 GAGATCAGTGGTGCTTTCACACTAGTACAGCAATAGAGCAGCATCTTGGACCAGGGTGGT 109687597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      300 GAGATCAGTGGTGCTTTCACACTAGTACAGCAATAGAGCAGCATCTTGGACCAGGGTGGT 359

109687598 GGCTGAGGAGACAGGATCATGGCTTTGAGATACATTCTGAAGAAGAAAAGTAGGCCTTGC 109687657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      360 GGCTGAGGAGACAGGATCATGGCTTTGAGATACATTCTGAAGAAGAAAAGTAGGCCTTGC 419

109687658 TGATAGAATAGTCACAAACTGTAATGGAAAAGGTAAATTCAAGGATGTCTCCTGGGTTTT 109687717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      420 TGATAGAATAGTCACAAACTGTAATGGAAAAGGTAAATTCAAGGATGTCTCCTGGGTTTT 479

109687718 TGGCTTAAGCATCTGGATACAGAGATATGGAAGACTGGGAGGGAAATGGGTTTGGAGTAT 109687777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      480 TGGCTTAAGCATCTGGATACAGAGATATGGAAGACTGGGAGGGAAATGGGTTTGGAGTAT 539

109687778 ACATGCATGCAATCAACAATTCTGTCTTGCATGTGTGAAATTTAGATACCCATTAGACAT 109687837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      540 ACATGCATGCAATCAACAATTCTGTCTTGCATGTGTGAAATTTAGATACCCATTAGACAT 599

109687838 CTGCATAGAGGGCCAGGCACAGTGGCTCACGGCAGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCCAA 109687897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      600 CTGCATAGAGGGCCAGGCACAGTGGCTCACGGCAGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCCAA 659

109687898 GGTGGGCGGATCACTTGAGGTTAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACTC 109687957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      660 GGTGGGCGGATCACTTGAGGTTAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACTC 719

109687958 TGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTATCTGGGTGTGGTGGTGTGCACCTGTAATCCCAGC 109688017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      720 TGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTATCTGGGTGTGGTGGTGTGCACCTGTAATCCCAGC 779

109688018 TACTCAGGAGGCTGAGGCATGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGTAGAGGTTGCAGCGAGC 109688077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      780 TACTCAGGAGGCTGAGGCATGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGTAGAGGTTGCAGCGAGC 839

109688078 CAAGATCACACCACTGCACTCTAGCAAGGGTGACAAAGCAAGACTCTATCTCAAAAAAAA 109688137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 CAAGATCACACCACTGCACTCTAGCAAGGGTGACAAAGCAAGACTCTATCTCAAAAAAAA 899

109688138 AAAGACATTTATGTAGAGATGTTAGGTTGGCAGTTGGATAACAGTCTTGAGTTTCGGGGT 109688197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 AAAGACATTTATGTAGAGATGTTAGGTTGGCAGTTGGATAACAGTCTTGAGTTTCGGGGT 959

109688198 GAGGGCAGGACCAGAAATGAAGATTTGGGATTCATTAGCATGTAGATCATATTCAGAGCC 109688257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 GAGGGCAGGACCAGAAATGAAGATTTGGGATTCATTAGCATGTAGATCATATTCAGAGCC 1019

109688258 ACAATAATAGATGAAATAACTGAGGAAGAGAGCTAGAGGGGCCAAGAGCAAACACAGGAA 109688317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 ACAATAATAGATGAAATAACTGAGGAAGAGAGCTAGAGGGGCCAAGAGCAAACACAGGAA 1079

109688318 CATGCCAGCATTTAGAGGACAATGGAGAAGGAGGAGATGGCAGAGATGTCAATAGGAGGA 109688377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 CATGCCAGCATTTAGAGGACAATGGAGAAGGAGGAGATGGCAGAGATGTCAATAGGAGGA 1139

109688378 AAAGCAAAAGGGTGTTATCATAGAAGGTGACAACAGAATATATCACAAAGAGGAATATGT 109688437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 AAAGCAAAAGGGTGTTATCATAGAAGGTGACAACAGAATATATCACAAAGAGGAATATGT 1199

109688438 TTGAATGTGTCAAATGTTGTTATCACAGGCTATAGAAGTAAACACAAAGTCTTATGGGAA 109688497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 TTGAATGTGTCAAATGTTGTTATCACAGGCTATAGAAGTAAACACAAAGTCTTATGGGAA 1259

109688498 TACTGAGGATGAGCTGCCTCTAGTGTGTGTGAAACCCTGGCCAAATATTTGTTGTGGGGC 109688557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 TACTGAGGATGAGCTGCCTCTAGTGTGTGTGAAACCCTGGCCAAATATTTGTTGTGGGGC 1319

109688558 CCCTGTCTATATATGCAATGTTATTTAAAAACATACTACATATTCTTGGGCTTATGTGGG 109688617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 CCCTGTCTATATATGCAATGTTATTTAAAAACATACTACATATTCTTGGGCTTATGTGGG 1379

109688618 ATGTAGTGATTTATTGATGAAGACTTAGAATACTGGGTAGGAAGAGATGCTTTTGGATTT 109688677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 ATGTAGTGATTTATTGATGAAGACTTAGAATACTGGGTAGGAAGAGATGCTTTTGGATTT 1439

109688678 GTTTATGAGCCAGTGAGTGTATCTGAGGATTCTTTATCCTGTGTCTAATGTGAGTGTGTT 109688737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 GTTTATGAGCCAGTGAGTGTATCTGAGGATTCTTTATCCTGTGTCTAATGTGAGTGTGTT 1499

109688738 TTCCTGAATCAGTGCATCAGTGCTATTCTGGAGGCCCAAATCACACATGATTCCGTGAAA 109688797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 TTCCTGAATCAGTGCATCAGTGCTATTCTGGAGGCCCAAATCACACATGATTCCGTGAAA 1559

109688798 GAAACTCTGTGCTGGCCAGAGGATGCACTCACTCTCCAGGCTTTCCTGCATGGGCCCTCA 109688857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 GAAACTCTGTGCTGGCCAGAGGATGCACTCACTCTCCAGGCTTTCCTGCATGGGCCCTCA 1619

109688858 CCATGGAGTCCTGGATACTTAGGGCATCTGGTTGACCACATGCTTGGGAGAGCACCAAAG 109688917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 CCATGGAGTCCTGGATACTTAGGGCATCTGGTTGACCACATGCTTGGGAGAGCACCAAAG 1679

109688918 AAGGTCCTGGTTTTCAAGCCTCCAGCTTCTCCTTAGAAAGAGTTGACTACCTGTCTGGGC 109688977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 AAGGTCCTGGTTTTCAAGCCTCCAGCTTCTCCTTAGAAAGAGTTGACTACCTGTCTGGGC 1739

109688978 TCCAACTTTTCTGGCTGCTACCAGAGGGTCTGGCCTCTAAACCATCTGTGTCAAAGAACT 109689037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 TCCAACTTTTCTGGCTGCTACCAGAGGGTCTGGCCTCTAAACCATCTGTGTCAAAGAACT 1799

109689038 GACAGGGCCTGACATTCACTGGGACCCTAGGCTAGGGGTGACAGAGAGCAAAGCAAAAGT 109689097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 GACAGGGCCTGACATTCACTGGGACCCTAGGCTAGGGGTGACAGAGAGCAAAGCAAAAGT 1859

109689098 TTGAAAGAGTATGCAGTCTGAATGAGCATGCAGACCTTTGCCACAGCTCCCCTTCCCAGC 109689157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 TTGAAAGAGTATGCAGTCTGAATGAGCATGCAGACCTTTGCCACAGCTCCCCTTCCCAGC 1919

109689158 TCAGTGCAGAGCAAGTAGGAGATAAACTTCTGCTCTTAGCTTCTCTGTGAGGAGAGATGA 109689217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 TCAGTGCAGAGCAAGTAGGAGATAAACTTCTGCTCTTAGCTTCTCTGTGAGGAGAGATGA 1979

109689218 AATGGACCACACATCTAGCACCCCAACTTTTCTGACAACTACTAGAAGGACTGACTCCTG 109689277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 AATGGACCACACATCTAGCACCCCAACTTTTCTGACAACTACTAGAAGGACTGACTCCTG 2039

109689278 ACTCACCTGTCTCAGGGCACTGATGGTACTTGGCACACTCTAGTCTCCTGGGGCCACCAA 109689337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 ACTCACCTGTCTCAGGGCACTGATGGTACTTGGCACACTCTAGTCTCCTGGGGCCACCAA 2099

109689338 GAACAAGAACAGCATTTTGGACAAACACACTGGTTTGAGAGGCACCCAGACTCTCTGACT 109689397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 GAACAAGAACAGCATTTTGGACAAACACACTGGTTTGAGAGGCACCCAGACTCTCTGACT 2159

109689398 GGGCTGTGAGGAGGCTCATCTGTGAAGACTGAGGGAGGTGGCTGTTTTATCAAATGTGCA 109689457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 GGGCTGTGAGGAGGCTCATCTGTGAAGACTGAGGGAGGTGGCTGTTTTATCAAATGTGCA 2219

109689458 GAAACCAACACAGAGAGTCAAAGACAATGAACAAACAGGAAATATGCCATAAATAAAAGA 109689517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 GAAACCAACACAGAGAGTCAAAGACAATGAACAAACAGGAAATATGCCATAAATAAAAGA 2279

109689518 ACAAGATAAATCTTCAGAAACTGACCCAAACAGAATGGAGATATGTGATTTACCAGACAA 109689577
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 ACAAGATAAAACTTCAGAAACTGACCCAAACAGAATGGAGATATGTGATTTACCAGACAA 2339

109689578 AAAATCAAAAGACCTGTCACAAAGATGCTCAGTGAGGTCAGGAGAGCAATGCATGAATAA 109689637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 AAAATCAAAAGACCTGTCACAAAGATGCTCAGTGAGGTCAGGAGAGCAATGCATGAATAA 2399

109689638 AGTGAGAATTTCAACCAAAAAGGTAGAAAATATTAAAAAGTGCCAAACAGAAATCACGGA 109689697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 AGTGAGAATTTCAACCAAAAAGGTAGAAAATATTAAAAAGTGCCAAACAGAAATCACGGA 2459

109689698 GCTGAAGAATATAATAAAAGAACAGAAAAATTTAATAGAGGGGTTCAATAGCAGACTAGG 109689757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 GCTGAAGAATATAATAAAAGAACAGAAAAATTTAATAGAGGGGTTCAATAGCAGACTAGG 2519

109689758 TGAACTGAAAGAAAGGATTAGTGAACTCAAGGACTGGTCATTGGCAATCATTCAGTCACA 109689817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 TGAACTGAAAGAAAGGATTAGTGAACTCAAGGACTGGTCATTGGCAATCATTCAGTCACA 2579

109689818 GCATTAAAAAGAAAAAAGAATGAAGGGCCAGGCACAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAAC 109689877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 GCATTAAAAAGAAAAAAGAATGAAGGGCCAGGCACAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAAC 2639

109689878 ACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTG 109689900
          |||||||||||||||||||||||
     2640 ACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTG 2662

EXCISED REGION

109695215 GATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATTCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATTTCAACT 109695274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2663 GATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATTCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATTTCAACT 2722

109695275 AAAAATACAAAAAAAAAAAAAAAATAGCCGGGTGTGGTGGCACACACCCGTAGTCCCAGC 109695334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2723 AAAAATACAAAAAAAAAAAAAAAATAGCCGGGTGTGGTGGCACACACCCGTAGTCCCAGC 2782

109695335 TACTTGGGAGGCTGGGGCAGGAGAATGGCATGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGC 109695394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2783 TACTTGGGAGGCTGGGGCAGGAGAATGGCATGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGC 2842

109695395 CGAGATCGCACAATTGCTTTCCAGCCTGGGCAACGGAGCGAGACTCTGTTTCAAAAAAAA 109695454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2843 CGAGATCGCACAATTGCTTTCCAGCCTGGGCAACGGAGCGAGACTCTGTTTCAAAAAAAA 2902

109695455 AGGTGACCATGTGAAGGGATGGATATGTTAAGTAGCTTGACTGGTAATCGGTTCACGATG 109695514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2903 AGGTGACCATGTGAAGGGATGGATATGTTAAGTAGCTTGACTGGTAATCGGTTCACGATG 2962

109695515 TATATGTACAGTTGACCCTTGAACAACATGCGTTTAAATTACAAGAGTCCACTTATATGG 109695574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2963 TATATGTACAGTTGACCCTTGAACAACATGCGTTTAAATTACAAGAGTCCACTTATATGG 3022

109695575 GGATTTTCTTCTGCCTCTGCCAGCAAGGCCAACCCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCCCCTCA 109695634
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3023 GGATTTTCTTCTGCCTTTGCCAGCAAGGCCAACCCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCCCCTCA 3082

109695635 ACTAAAGACGAGGAGGATGAGGACCTTTAGGGTGATCCACTTCCACTTAATGAATAGTAA 109695694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3083 ACTAAAGACGAGGAGGATGAGGACCTTTAGGGTGATCCACTTCCACTTAATGAATAGTAA 3142

109695695 ATACGGTTTCTCTTCCTTATGATTTTCTTAATATTTTCTTTTCCCTAACTTACTTTGTTG 109695754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3143 ATACGGTTTCTCTTCCTTATGATTTTCTTAATATTTTCTTTTCCCTAACTTACTTTGTTG 3202

109695755 TAAGAATGCAGTACTCAATACACGTAAGATACAAAATTTGTATGAATTGACTGTTTGTGT 109695814
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3203 TAAGAATGCAGTACACAATACACGTAAGATACAAAATTTGTATGAATTGACTGTTTGTGT 3262

109695815 TATCTGCAAGGCTTCCTGTCAACACTAGGGTATTAATAGTTAAGTTTTGGGGGAGTCAAA 109695874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3263 TATCTGCAAGGCTTCCTGTCAACACTAGGGTATTAATAGTTAAGTTTTGGGGGAGTCAAA 3322

109695875 AGTTATTTGTGGATTTTTTACTGTTCGGGGAGTTGGTGCCCCTAACCCCTTCGTTGTTAA 109695934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3323 AGTTATTTGTGGATTTTTTACTGTTCGGGGAGTTGGTGCCCCTAACCCCTTCGTTGTTAA 3382

109695935 AGAGTCAACTGTATATCAAAACATCGTGCTGTATACCTTAAATGTATATACTTTCAATTA 109695994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3383 AGAGTCAACTGTATATCAAAACATCGTGCTGTATACCTTAAATGTATATACTTTCAATTA 3442

109695995 AAATATTTTAAAAACAAACCAATAAAAAGGCACTGCTTCTGGCCCAGGGTGAGCCATCAG 109696054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3443 AAATATTTTAAAAACAAACCAATAAAAAGGCACTGCTTCTGGCCCAGGGTGAGCCATCAG 3502

109696055 ATGGCACAGCTGGCCCTGTCCGGTCCCAACCAGCAGAGGGGACTGTCAATTGAGAAGCTC 109696114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3503 ATGGCACAGCTGGCCCTGTCCGGTCCCAACCAGCAGAGGGGACTGTCAATTGAGAAGCTC 3562

109696115 CAGTGCTAAACGCTGGAATATGAAGATATGCATGGTGGGGAGACAGCACACACACACATA 109696174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3563 CAGTGCTAAACGCTGGAATATGAAGATATGCATGGTGGGGAGACAGCACACACACACATA 3622

109696175 ACACTCAAGGCCTGGTGGAGCCCACCCAGCTCAGCCTGGGTTGGGGAGGCTCCCTGGGAA 109696234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3623 ACACTCAAGGCCTGGTGGAGCCCACCCAGCTCAGCCTGGGTTGGGGAGGCTCCCTGGGAA 3682

109696235 GGGGATTCCTGATGTGAGCCT 109696255
          |||||||||||||||||||||
     3683 GGGGATTCCTGATGTGAGCCT 3703

Alignment time is 3.35983 s

