
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38854779,38878343] =>     23565 nucs '18 dna:chromosome chromosome:GRCh37:18:1:78077248:1'
Second seq [       1,    3420] =>      3420 nucs 'mol-32-1f63-008635_3420'

Score:        3420
Aligned:      3420        nucs
Identic:      3420 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38864583,38868002]
 second seq =>  [       1,    3420]

 38864583 CCTCAAAATGTAATATTTCTGCATAAATTTAACAAAATATGTATATAATTTATATGAGGA 38864642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCTCAAAATGTAATATTTCTGCATAAATTTAACAAAATATGTATATAATTTATATGAGGA 60

 38864643 GAACTACAAAATTCTGAAGAAATATGTCAAAGACTAAATAAATGGAAAGATATCTCAGGT 38864702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAACTACAAAATTCTGAAGAAATATGTCAAAGACTAAATAAATGGAAAGATATCTCAGGT 120

 38864703 TCATGGGTAGAAAGACTCAATATTGTTGAAATGTTAATTCTTCCCAACTTAATCTATAGA 38864762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCATGGGTAGAAAGACTCAATATTGTTGAAATGTTAATTCTTCCCAACTTAATCTATAGA 180

 38864763 TTCAATGTAATTACAATCAAAAATGAAAGTAAGTTTTGTGTGTGTTTGTGTGAATCTTGA 38864822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTCAATGTAATTACAATCAAAAATGAAAGTAAGTTTTGTGTGTGTTTGTGTGAATCTTGA 240

 38864823 CAAACTGATTTTAAAGTTCATATGGAGAGGAAAATGACCCAGAATAGCCACCACAATGTT 38864882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CAAACTGATTTTAAAGTTCATATGGAGAGGAAAATGACCCAGAATAGCCACCACAATGTT 300

 38864883 GAGGGAGAACAAAGTGAGAAGACAGCACTACCCAACTTCAAGACTTGCTGAAAAGCTACA 38864942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GAGGGAGAACAAAGTGAGAAGACAGCACTACCCAACTTCAAGACTTGCTGAAAAGCTACA 360

 38864943 GCAATCAAGATAGTGAGGTATTGGTAAAAGATAAAAAAACAGGTCAATGAAACAACATAG 38865002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GCAATCAAGATAGTGAGGTATTGGTAAAAGATAAAAAAACAGGTCAATGAAACAACATAG 420

 38865003 TGTACTCAGACATAACCCACATAATATACTCAACTGATCTTTGACAAAGGTGCAAGTTCA 38865062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGTACTCAGACATAACCCACATAATATACTCAACTGATCTTTGACAAAGGTGCAAGTTCA 480

 38865063 AGACAATGGAGCAAAGATAGTCTTTTCAATAAATAGTGGTAAGAAAACTAGGCATAACAT 38865122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGACAATGGAGCAAAGATAGTCTTTTCAATAAATAGTGGTAAGAAAACTAGGCATAACAT 540

 38865123 GCAAGAATAAAATGTAAATCTAGATATAGACCTTATGATCTTCACAAAAATTAATTCAAA 38865182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GCAAGAATAAAATGTAAATCTAGATATAGACCTTATGATCTTCACAAAAATTAATTCAAA 600

 38865183 ATGAACTTTAGAGCTCAATTTAAAATGTAAAATTATAAAGCTCCTAGAAGGTAACATCAG 38865242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATGAACTTTAGAGCTCAATTTAAAATGTAAAATTATAAAGCTCCTAGAAGGTAACATCAG 660

 38865243 AGAGAAACTAGGTGACCTTGGTTTGGTGTTAACTTTTTAGAAACAACACCAGAAGTATGA 38865302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGAGAAACTAGGTGACCTTGGTTTGGTGTTAACTTTTTAGAAACAACACCAGAAGTATGA 720

 38865303 CCCATGAAAGAAAGAATTGATAAGCTGGACTTAACTAAAATTAAATACTTCTGTTTTGAG 38865362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CCCATGAAAGAAAGAATTGATAAGCTGGACTTAACTAAAATTAAATACTTCTGTTTTGAG 780

 38865363 AAAGGCACTATCAAGATCATTGGACCACAAGCAACAGACTGAAAGAAAATATCTGCAAAA 38865422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAAGGCACTATCAAGATCATTGGACCACAAGCAACAGACTGAAAGAAAATATCTGCAAAA 840

 38865423 GATAGATCTGATAAAGGCGAGTCATTTAAAATATTCAAATATCTTTGAAAACTCAACCAT 38865482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GATAGATCTGATAAAGGCGAGTCATTTAAAATATTCAAATATCTTTGAAAACTCAACCAT 900

 38865483 AAGAACCCAAAAAACCTAGTTAAAAAATGGGCAAAATGTCTGAATAGGCACCCTACCAAA 38865542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AAGAACCCAAAAAACCTAGTTAAAAAATGGGCAAAATGTCTGAATAGGCACCCTACCAAA 960

 38865543 GAAGATATAGATAAGGTAAATGATCATATGAAAAGATATTCAACATCTTATGTCATTAGG 38865602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GAAGATATAGATAAGGTAAATGATCATATGAAAAGATATTCAACATCTTATGTCATTAGG 1020

 38865603 GAATTGCAAACTCAAACAACAGTGAGATGCCGCTGCACACCAATTAGAATGGCCAAAATT 38865662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GAATTGCAAACTCAAACAACAGTGAGATGCCGCTGCACACCAATTAGAATGGCCAAAATT 1080

 38865663 CAAAACACAGCACCAAATACTGGCCAGGGTGTGATGAAACAGAAACTTACTCATCTTTGG 38865722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CAAAACACAGCACCAAATACTGGCCAGGGTGTGATGAAACAGAAACTTACTCATCTTTGG 1140

 38865723 TAGAAATGCAAAATGGTATAGCCACTTTGGAAGACAGTTTGATAGTTTCTTTAAAAAGTA 38865782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TAGAAATGCAAAATGGTATAGCCACTTTGGAAGACAGTTTGATAGTTTCTTTAAAAAGTA 1200

 38865783 AACATGTTCTTACCATACATATGATCTTGAAATCATGCCACTTGGCATTTACCCAAAGGA 38865842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AACATGTTCTTACCATACATATGATCTTGAAATCATGCCACTTGGCATTTACCCAAAGGA 1260

 38865843 GCTGAAAACTATATCCACACAAAATCCTGCACATGGATGTTTATGACAACTTTATTTACA 38865902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GCTGAAAACTATATCCACACAAAATCCTGCACATGGATGTTTATGACAACTTTATTTACA 1320

 38865903 ATTGCCAAAGGTTTGAAGCAACCAAGATGTCCTTTAGTAGATTGATACATAAACTGTGGT 38865962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ATTGCCAAAGGTTTGAAGCAACCAAGATGTCCTTTAGTAGATTGATACATAAACTGTGGT 1380

 38865963 ACATCCAGACAATGAAATATTGTATTTTTCCATTTTCACACTGCTGATAAAGACATACCC 38866022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ACATCCAGACAATGAAATATTGTATTTTTCCATTTTCACACTGCTGATAAAGACATACCC 1440

 38866023 AAGACTGCATAATTTATACAGGAAAAGGGTTTAATGGACTTACACTTCCATGTGGCTGGG 38866082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AAGACTGCATAATTTATACAGGAAAAGGGTTTAATGGACTTACACTTCCATGTGGCTGGG 1500

 38866083 GAGGCCTCACAATCATGGAAGAAGTCAAGGAGGAGCAAGTCACATCTTACATAGATGGCA 38866142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GAGGCCTCACAATCATGGAAGAAGTCAAGGAGGAGCAAGTCACATCTTACATAGATGGCA 1560

 38866143 GCAGGCAAAGAGAGCTTGTGCAGGGAAAAATCCCATTTTTAAAACCATAAAATCTCATGA 38866202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GCAGGCAAAGAGAGCTTGTGCAGGGAAAAATCCCATTTTTAAAACCATAAAATCTCATGA 1620

 38866203 GACGTATTCACTGTCAGAAGAACAGCACAGGAAAGACCTGCCCCCATGATTCACTACCTC 38866262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GACGTATTCACTGTCAGAAGAACAGCACAGGAAAGACCTGCCCCCATGATTCACTACCTC 1680

 38866263 CCACCAGGTTCCTCCTATGACATGTGGGAACTGTGGGAGTTACAATTCAAGATGAGATCT 38866322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CCACCAGGTTCCTCCTATGACATGTGGGAACTGTGGGAGTTACAATTCAAGATGAGATCT 1740

 38866323 GGGTGGGGACACAGCCAAACCTTATCAAATATTATTTAGCATTAAAAAAACTGTAAAGCC 38866382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GGGTGGGGACACAGCCAAACCTTATCAAATATTATTTAGCATTAAAAAAACTGTAAAGCC 1800

 38866383 ATAAAAATATATGGACAAAACTTAAATGAATATTATTAACTGAAAGAAGACAATCTTAAA 38866442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ATAAAAATATATGGACAAAACTTAAATGAATATTATTAACTGAAAGAAGACAATCTTAAA 1860

 38866443 AAAAGACATACTGTGTAATTCCAAATATACGGTATTCTGGAAAAGTCAAAATGTGGAGAT 38866502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AAAAGACATACTGTGTAATTCCAAATATACGGTATTCTGGAAAAGTCAAAATGTGGAGAT 1920

 38866503 AATACAATTAAAGTGGCTGAGAATGGTGGCTCACGTCTGTCATATTAGTACTTGGCAGGC 38866562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AATACAATTAAAGTGGCTGAGAATGGTGGCTCACGTCTGTCATATTAGTACTTGGCAGGC 1980

 38866563 TGATATGGCATCATCACTTAAGGCCAAGGGTTTGAGGCTAGCCTGGGCATCACAGCAAGA 38866622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TGATATGGCATCATCACTTAAGGCCAAGGGTTTGAGGCTAGCCTGGGCATCACAGCAAGA 2040

 38866623 ACCCATCCCTACAAGAAAAATTTTTAAAAGTTACCTAGACATGGTGGCATACGCCTGTAG 38866682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ACCCATCCCTACAAGAAAAATTTTTAAAAGTTACCTAGACATGGTGGCATACGCCTGTAG 2100

 38866683 TCATAGCTACTTGGGAGGCTGGGGCAAGAAGATTGCTTGAGCCCCGGAATTTCAGGCTGC 38866742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TCATAGCTACTTGGGAGGCTGGGGCAAGAAGATTGCTTGAGCCCCGGAATTTCAGGCTGC 2160

 38866743 AGTGACCTATGCTAATGCCACTGCTCTCCTGCCTGAGTGACAGAGTGAGATTCTGTCTCT 38866802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AGTGACCTATGCTAATGCCACTGCTCTCCTGCCTGAGTGACAGAGTGAGATTCTGTCTCT 2220

 38866803 TAAAAACAAACAAACAAACAAAAAGATTGAAGGGATGAATAGGTAGAGCACAGACAAGTC 38866862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TAAAAACAAACAAACAAACAAAAAGATTGAAGGGATGAATAGGTAGAGCACAGACAAGTC 2280

 38866863 TTAGGTCTGTCAATATTCTGTATGATACTATAATAATGGATGTATGTCATCATACATTTA 38866922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TTAGGTCTGTCAATATTCTGTATGATACTATAATAATGGATGTATGTCATCATACATTTA 2340

 38866923 TTTATATCCACAGAATGTAAAACACCAGGAGTAAATTCTATTTTAAACTCTGGGCGTTTT 38866982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TTTATATCCACAGAATGTAAAACACCAGGAGTAAATTCTATTTTAAACTCTGGGCGTTTT 2400

 38866983 GTGATAATGATGCATTAATGAAAGTTCATCAGTGATGTAACAAATGCACTACTGCCATGT 38867042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GTGATAATGATGCATTAATGAAAGTTCATCAGTGATGTAACAAATGCACTACTGCCATGT 2460

 38867043 GGAATGTTGATACTGGGGGAGTTTGCCATGTGTGAGGACAGCAGGTATATGAAAACTCCC 38867102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GGAATGTTGATACTGGGGGAGTTTGCCATGTGTGAGGACAGCAGGTATATGAAAACTCCC 2520

 38867103 TGCACTTTCTGCTTAATTTTGCTGTGAACCTAAAGCTGCTCTATATAATAAAGTTTATTA 38867162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TGCACTTTCTGCTTAATTTTGCTGTGAACCTAAAGCTGCTCTATATAATAAAGTTTATTA 2580

 38867163 ATTAAAAAAACCTCTGTTACAGCAAAATTGAGTAACAGACACCATATTTTTCCTCCTGCC 38867222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 ATTAAAAAAACCTCTGTTACAGCAAAATTGAGTAACAGACACCATATTTTTCCTCCTGCC 2640

 38867223 CCCCCCCCCAAAATTAACAAAGTATAGAAAACAATGACTCTGAGAAGAGTGAACATTAGA 38867282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CCCCCCCCCAAAATTAACAAAGTATAGAAAACAATGACTCTGAGAAGAGTGAACATTAGA 2700

 38867283 CAGTGAGGACATTGTTTCCTGAGAGAGGAAAAAATAATAATAATATGTAACAAATGATTT 38867342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CAGTGAGGACATTGTTTCCTGAGAGAGGAAAAAATAATAATAATATGTAACAAATGATTT 2760

 38867343 CCCCAGCTTACTGCTCACATAGTTTCTAAGCCATGATGCAAAAACAGGGCTAGTTCATGG 38867402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CCCCAGCTTACTGCTCACATAGTTTCTAAGCCATGATGCAAAAACAGGGCTAGTTCATGG 2820

 38867403 CAATTTTGACAGGATTCACTTATGTCACCCCAAATCTCTCAAGTTTTGTCAGTATTCCAG 38867462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CAATTTTGACAGGATTCACTTATGTCACCCCAAATCTCTCAAGTTTTGTCAGTATTCCAG 2880

 38867463 TTCAGTCAGGCAAAGAATGGCTGAGTAAACAAGAAGCTTTGTTATTTCTTTCAGTGTTGG 38867522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TTCAGTCAGGCAAAGAATGGCTGAGTAAACAAGAAGCTTTGTTATTTCTTTCAGTGTTGG 2940

 38867523 TTTCTATACCTCAAAATACCTCAGTAAATCTCAAGTAGAATAAATTGAAATAAGATAAAC 38867582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TTTCTATACCTCAAAATACCTCAGTAAATCTCAAGTAGAATAAATTGAAATAAGATAAAC 3000

 38867583 ACAAATAATCTTAACACATTATAGTTAAGTTGAATGCCACAGACAAAGGAAATATTTTGA 38867642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 ACAAATAATCTTAACACATTATAGTTAAGTTGAATGCCACAGACAAAGGAAATATTTTGA 3060

 38867643 AAGCAACAAGATGAAAACAACATATATGCAGATGTACAATATCATTAATGACTGTTTTTA 38867702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 AAGCAACAAGATGAAAACAACATATATGCAGATGTACAATATCATTAATGACTGTTTTTA 3120

 38867703 TGCCAGAAATAAAATAGGCCAGAAACCAATGCAATGACAAATTGTTTGAATGAAATGTCA 38867762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TGCCAGAAATAAAATAGGCCAGAAACCAATGCAATGACAAATTGTTTGAATGAAATGTCA 3180

 38867763 GCCAACTATTCTATATTCGGCAAAGCTACTTAAATGAAATGGACCACCACAGTGGCTCAC 38867822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 GCCAACTATTCTATATTCGGCAAAGCTACTTAAATGAAATGGACCACCACAGTGGCTCAC 3240

 38867823 GCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATCATGAGGTCAAGATATAGA 38867882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 GCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATCATGAGGTCAAGATATAGA 3300

 38867883 GACCATCCTGGACAACATGGTGAAATCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGG 38867942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 GACCATCCTGGACAACATGGTGAAATCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGG 3360

 38867943 CGTGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGGAGGAGAACCTCTTG 38868002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 CGTGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGGAGGAGAACCTCTTG 3420

Alignment time is 2.55886 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38854779,38878343] =>     23565 nucs '18 dna:chromosome chromosome:GRCh37:18:1:78077248:1'
Second seq [       1,    2516] =>      2516 nucs 'mol-32-1f63-220169_2516'

Score:        2516
Aligned:      2516        nucs
Identic:      2516 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38864535,38867050]
 second seq =>  [       1,    2516]

 38864535 AACAAATGGAATTTGAAATTAAAAACACATTATCATTTATATTAGCATCCTCAAAATGTA 38864594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AACAAATGGAATTTGAAATTAAAAACACATTATCATTTATATTAGCATCCTCAAAATGTA 60

 38864595 ATATTTCTGCATAAATTTAACAAAATATGTATATAATTTATATGAGGAGAACTACAAAAT 38864654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATATTTCTGCATAAATTTAACAAAATATGTATATAATTTATATGAGGAGAACTACAAAAT 120

 38864655 TCTGAAGAAATATGTCAAAGACTAAATAAATGGAAAGATATCTCAGGTTCATGGGTAGAA 38864714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCTGAAGAAATATGTCAAAGACTAAATAAATGGAAAGATATCTCAGGTTCATGGGTAGAA 180

 38864715 AGACTCAATATTGTTGAAATGTTAATTCTTCCCAACTTAATCTATAGATTCAATGTAATT 38864774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGACTCAATATTGTTGAAATGTTAATTCTTCCCAACTTAATCTATAGATTCAATGTAATT 240

 38864775 ACAATCAAAAATGAAAGTAAGTTTTGTGTGTGTTTGTGTGAATCTTGACAAACTGATTTT 38864834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACAATCAAAAATGAAAGTAAGTTTTGTGTGTGTTTGTGTGAATCTTGACAAACTGATTTT 300

 38864835 AAAGTTCATATGGAGAGGAAAATGACCCAGAATAGCCACCACAATGTTGAGGGAGAACAA 38864894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAAGTTCATATGGAGAGGAAAATGACCCAGAATAGCCACCACAATGTTGAGGGAGAACAA 360

 38864895 AGTGAGAAGACAGCACTACCCAACTTCAAGACTTGCTGAAAAGCTACAGCAATCAAGATA 38864954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGTGAGAAGACAGCACTACCCAACTTCAAGACTTGCTGAAAAGCTACAGCAATCAAGATA 420

 38864955 GTGAGGTATTGGTAAAAGATAAAAAAACAGGTCAATGAAACAACATAGTGTACTCAGACA 38865014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTGAGGTATTGGTAAAAGATAAAAAAACAGGTCAATGAAACAACATAGTGTACTCAGACA 480

 38865015 TAACCCACATAATATACTCAACTGATCTTTGACAAAGGTGCAAGTTCAAGACAATGGAGC 38865074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TAACCCACATAATATACTCAACTGATCTTTGACAAAGGTGCAAGTTCAAGACAATGGAGC 540

 38865075 AAAGATAGTCTTTTCAATAAATAGTGGTAAGAAAACTAGGCATAACATGCAAGAATAAAA 38865134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAAGATAGTCTTTTCAATAAATAGTGGTAAGAAAACTAGGCATAACATGCAAGAATAAAA 600

 38865135 TGTAAATCTAGATATAGACCTTATGATCTTCACAAAAATTAATTCAAAATGAACTTTAGA 38865194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGTAAATCTAGATATAGACCTTATGATCTTCACAAAAATTAATTCAAAATGAACTTTAGA 660

 38865195 GCTCAATTTAAAATGTAAAATTATAAAGCTCCTAGAAGGTAACATCAGAGAGAAACTAGG 38865254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GCTCAATTTAAAATGTAAAATTATAAAGCTCCTAGAAGGTAACATCAGAGAGAAACTAGG 720

 38865255 TGACCTTGGTTTGGTGTTAACTTTTTAGAAACAACACCAGAAGTATGACCCATGAAAGAA 38865314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGACCTTGGTTTGGTGTTAACTTTTTAGAAACAACACCAGAAGTATGACCCATGAAAGAA 780

 38865315 AGAATTGATAAGCTGGACTTAACTAAAATTAAATACTTCTGTTTTGAGAAAGGCACTATC 38865374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGAATTGATAAGCTGGACTTAACTAAAATTAAATACTTCTGTTTTGAGAAAGGCACTATC 840

 38865375 AAGATCATTGGACCACAAGCAACAGACTGAAAGAAAATATCTGCAAAAGATAGATCTGAT 38865434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAGATCATTGGACCACAAGCAACAGACTGAAAGAAAATATCTGCAAAAGATAGATCTGAT 900

 38865435 AAAGGCGAGTCATTTAAAATATTCAAATATCTTTGAAAACTCAACCATAAGAACCCAAAA 38865494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AAAGGCGAGTCATTTAAAATATTCAAATATCTTTGAAAACTCAACCATAAGAACCCAAAA 960

 38865495 AACCTAGTTAAAAAATGGGCAAAATGTCTGAATAGGCACCCTACCAAAGAAGATATAGAT 38865554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AACCTAGTTAAAAAATGGGCAAAATGTCTGAATAGGCACCCTACCAAAGAAGATATAGAT 1020

 38865555 AAGGTAAATGATCATATGAAAAGATATTCAACATCTTATGTCATTAGGGAATTGCAAACT 38865614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AAGGTAAATGATCATATGAAAAGATATTCAACATCTTATGTCATTAGGGAATTGCAAACT 1080

 38865615 CAAACAACAGTGAGATGCCGCTGCACACCAATTAGAATGGCCAAAATTCAAAACACAGCA 38865674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CAAACAACAGTGAGATGCCGCTGCACACCAATTAGAATGGCCAAAATTCAAAACACAGCA 1140

 38865675 CCAAATACTGGCCAGGGTGTGATGAAACAGAAACTTACTCATCTTTGGTAGAAATGCAAA 38865734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CCAAATACTGGCCAGGGTGTGATGAAACAGAAACTTACTCATCTTTGGTAGAAATGCAAA 1200

 38865735 ATGGTATAGCCACTTTGGAAGACAGTTTGATAGTTTCTTTAAAAAGTAAACATGTTCTTA 38865794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATGGTATAGCCACTTTGGAAGACAGTTTGATAGTTTCTTTAAAAAGTAAACATGTTCTTA 1260

 38865795 CCATACATATGATCTTGAAATCATGCCACTTGGCATTTACCCAAAGGAGCTGAAAACTAT 38865854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CCATACATATGATCTTGAAATCATGCCACTTGGCATTTACCCAAAGGAGCTGAAAACTAT 1320

 38865855 ATCCACACAAAATCCTGCACATGGATGTTTATGACAACTTTATTTACAATTGCCAAAGGT 38865914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ATCCACACAAAATCCTGCACATGGATGTTTATGACAACTTTATTTACAATTGCCAAAGGT 1380

 38865915 TTGAAGCAACCAAGATGTCCTTTAGTAGATTGATACATAAACTGTGGTACATCCAGACAA 38865974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTGAAGCAACCAAGATGTCCTTTAGTAGATTGATACATAAACTGTGGTACATCCAGACAA 1440

 38865975 TGAAATATTGTATTTTTCCATTTTCACACTGCTGATAAAGACATACCCAAGACTGCATAA 38866034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TGAAATATTGTATTTTTCCATTTTCACACTGCTGATAAAGACATACCCAAGACTGCATAA 1500

 38866035 TTTATACAGGAAAAGGGTTTAATGGACTTACACTTCCATGTGGCTGGGGAGGCCTCACAA 38866094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTTATACAGGAAAAGGGTTTAATGGACTTACACTTCCATGTGGCTGGGGAGGCCTCACAA 1560

 38866095 TCATGGAAGAAGTCAAGGAGGAGCAAGTCACATCTTACATAGATGGCAGCAGGCAAAGAG 38866154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TCATGGAAGAAGTCAAGGAGGAGCAAGTCACATCTTACATAGATGGCAGCAGGCAAAGAG 1620

 38866155 AGCTTGTGCAGGGAAAAATCCCATTTTTAAAACCATAAAATCTCATGAGACGTATTCACT 38866214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AGCTTGTGCAGGGAAAAATCCCATTTTTAAAACCATAAAATCTCATGAGACGTATTCACT 1680

 38866215 GTCAGAAGAACAGCACAGGAAAGACCTGCCCCCATGATTCACTACCTCCCACCAGGTTCC 38866274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GTCAGAAGAACAGCACAGGAAAGACCTGCCCCCATGATTCACTACCTCCCACCAGGTTCC 1740

 38866275 TCCTATGACATGTGGGAACTGTGGGAGTTACAATTCAAGATGAGATCTGGGTGGGGACAC 38866334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TCCTATGACATGTGGGAACTGTGGGAGTTACAATTCAAGATGAGATCTGGGTGGGGACAC 1800

 38866335 AGCCAAACCTTATCAAATATTATTTAGCATTAAAAAAACTGTAAAGCCATAAAAATATAT 38866394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AGCCAAACCTTATCAAATATTATTTAGCATTAAAAAAACTGTAAAGCCATAAAAATATAT 1860

 38866395 GGACAAAACTTAAATGAATATTATTAACTGAAAGAAGACAATCTTAAAAAAAGACATACT 38866454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GGACAAAACTTAAATGAATATTATTAACTGAAAGAAGACAATCTTAAAAAAAGACATACT 1920

 38866455 GTGTAATTCCAAATATACGGTATTCTGGAAAAGTCAAAATGTGGAGATAATACAATTAAA 38866514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GTGTAATTCCAAATATACGGTATTCTGGAAAAGTCAAAATGTGGAGATAATACAATTAAA 1980

 38866515 GTGGCTGAGAATGGTGGCTCACGTCTGTCATATTAGTACTTGGCAGGCTGATATGGCATC 38866574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GTGGCTGAGAATGGTGGCTCACGTCTGTCATATTAGTACTTGGCAGGCTGATATGGCATC 2040

 38866575 ATCACTTAAGGCCAAGGGTTTGAGGCTAGCCTGGGCATCACAGCAAGAACCCATCCCTAC 38866634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ATCACTTAAGGCCAAGGGTTTGAGGCTAGCCTGGGCATCACAGCAAGAACCCATCCCTAC 2100

 38866635 AAGAAAAATTTTTAAAAGTTACCTAGACATGGTGGCATACGCCTGTAGTCATAGCTACTT 38866694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AAGAAAAATTTTTAAAAGTTACCTAGACATGGTGGCATACGCCTGTAGTCATAGCTACTT 2160

 38866695 GGGAGGCTGGGGCAAGAAGATTGCTTGAGCCCCGGAATTTCAGGCTGCAGTGACCTATGC 38866754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GGGAGGCTGGGGCAAGAAGATTGCTTGAGCCCCGGAATTTCAGGCTGCAGTGACCTATGC 2220

 38866755 TAATGCCACTGCTCTCCTGCCTGAGTGACAGAGTGAGATTCTGTCTCTTAAAAACAAACA 38866814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TAATGCCACTGCTCTCCTGCCTGAGTGACAGAGTGAGATTCTGTCTCTTAAAAACAAACA 2280

 38866815 AACAAACAAAAAGATTGAAGGGATGAATAGGTAGAGCACAGACAAGTCTTAGGTCTGTCA 38866874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AACAAACAAAAAGATTGAAGGGATGAATAGGTAGAGCACAGACAAGTCTTAGGTCTGTCA 2340

 38866875 ATATTCTGTATGATACTATAATAATGGATGTATGTCATCATACATTTATTTATATCCACA 38866934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 ATATTCTGTATGATACTATAATAATGGATGTATGTCATCATACATTTATTTATATCCACA 2400

 38866935 GAATGTAAAACACCAGGAGTAAATTCTATTTTAAACTCTGGGCGTTTTGTGATAATGATG 38866994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GAATGTAAAACACCAGGAGTAAATTCTATTTTAAACTCTGGGCGTTTTGTGATAATGATG 2460

 38866995 CATTAATGAAAGTTCATCAGTGATGTAACAAATGCACTACTGCCATGTGGAATGTT 38867050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CATTAATGAAAGTTCATCAGTGATGTAACAAATGCACTACTGCCATGTGGAATGTT 2516

Alignment time is 1.87638 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38854779,38878343] =>     23565 nucs '18 dna:chromosome chromosome:GRCh37:18:1:78077248:1'
Second seq [       1,    3781] =>      3781 nucs 'mol-32-20fa-140323_3781'

Score:        3741
Aligned:      3788        nucs
Identic:      3778 (100%) nucs =>      2597 (100%)      1181 (100%)
Gaps:            9 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38861686,38864291] EXCISED REGION [38864298,38865479]
 second seq =>  [       1,    2597] EXCISED REGION [    2600,    3781]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         6 nucs [38864292,38864297]
 second seq =>         2 nucs [2598,2599]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [38864291,38864291] to [38864297,38864297]
 second seq =>         1 nucs [2598,2598] to [2600,2600]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>        19 nucs [38864273,38864291] to [38864298,38864316]
 second seq =>        15 nucs [2583,2597] to [2600,2614]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [38864292,38864293] to [38864296,38864297]
 second seq =>         0 nucs

 38861686 ACTGTGTAATCAGTTCAGTATGCACAAAAATAATCCATTATTTCTTTCATCCCAGAGCAG 38861745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACTGTGTAATCAGTTCAGTATGCACAAAAATAATCCATTATTTCTTTCATCCCAGAGCAG 60

 38861746 AATAATTTATGTTGGGATGGGTGATGTATGCTAGTGAAAAAGAAGGTAATCCACATAGTT 38861805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AATAATTTATGTTGGGATGGGTGATGTATGCTAGTGAAAAAGAAGGTAATCCACATAGTT 120

 38861806 CTTGGGAACGACCAGAAAAATCCAAATGCAGAGAATCCAGAGGTAAAAATAATAGTAACA 38861865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTTGGGAACGACCAGAAAAATCCAAATGCAGAGAATCCAGAGGTAAAAATAATAGTAACA 180

 38861866 TGAAGAATAGCAAAGACTGCAAGTTTCCAGTCTTGTATATTGTTTCAGAAAAACTCTCAT 38861925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGAAGAATAGCAAAGACTGCAAGTTTCCAGTCTTGTATATTGTTTCAGAAAAACTCTCAT 240

 38861926 ACCATGTTTTTCCTCTGCTCTTCTATTAGCACAACAATCAACACAGAAGACTTCTGTGAC 38861985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACCATGTTTTTCCTCTGCTCTTCTATTAGCACAACAATCAACACAGAAGACTTCTGTGAC 300

 38861986 CCCAAAATATGTGGGGACTCCTCCCCACAAGCAAGCAAACAATCAGTTCTGCAGCAGACA 38862045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCCAAAATATGTGGGGACTCCTCCCCACAAGCAAGCAAACAATCAGTTCTGCAGCAGACA 360

 38862046 TCAGCTGGGTGCCCTCTGATTCAATTCTGACACTAACTTCCTAAAGATAGCATCAGATCC 38862105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCAGCTGGGTGCCCTCTGATTCAATTCTGACACTAACTTCCTAAAGATAGCATCAGATCC 420

 38862106 CACAGGCTGAGGGCTCAGTCCCCAAGACTAACCCACTTAGACGTCAGTCACCAGTCCAGG 38862165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CACAGGCTGAGGGCTCAGTCCCCAAGACTAACCCACTTAGACGTCAGTCACCAGTCCAGG 480

 38862166 CCTTCGGAACTTCTGACCAAACAGCTTCAAGTTGTGGTTCCCACAACTTCTACTTTGGGT 38862225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCTTCGGAACTTCTGACCAAACAGCTTCAAGTTGTGGTTCCCACAACTTCTACTTTGGGT 540

 38862226 TTGATTAGTTTACTGGAGTGGCTCACAGAACTATAGGAAACTGGAAACATTTAGGTTTGC 38862285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTGATTAGTTTACTGGAGTGGCTCACAGAACTATAGGAAACTGGAAACATTTAGGTTTGC 600

 38862286 CAGTTTATTATAAAGGATGTTACAAAGAATACAGATAAACAGATGCATAGGGTGAGGTAC 38862345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CAGTTTATTATAAAGGATGTTACAAAGAATACAGATAAACAGATGCATAGGGTGAGGTAC 660

 38862346 TCGGGAAAGGTGCAGAGCTTCCATGCCCTTCCTGGCTACACCACTCTCCAGGAACCTCCA 38862405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCGGGAAAGGTGCAGAGCTTCCATGCCCTTCCTGGCTACACCACTCTCCAGGAACCTCCA 720

 38862406 TGTGTTCAACTATTCGGAAGCTCTCTGAACCCTGTCCTATAGGGGTTTTATGGAAACTTC 38862465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGTGTTCAACTATTCGGAAGCTCTCTGAACCCTGTCCTATAGGGGTTTTATGGAAACTTC 780

 38862466 ATGACATCAGCATTCCTTACTGCAGGGTATGAGGCGGGACCCTTTCTGGAATGAGGGTCT 38862525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATGACATCAGCATTCCTTACTGCAGGGTATGAGGCGGGACCCTTTCTGGAATGAGGGTCT 840

 38862526 TATGACCCACAGTCAGAAAGGCAGAAGAAGATTAGAGTCCTGCCTTGGGATAAGTAAAAG 38862585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TATGACCCACAGTCAGAAAGGCAGAAGAAGATTAGAGTCCTGCCTTGGGATAAGTAAAAG 900

 38862586 GAGGGCAGGAGAAAGTCAGAGAGATTTTTTTCCTGAGGTCTGCTTCTGAGTCCTGACATA 38862645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GAGGGCAGGAGAAAGTCAGAGAGATTTTTTTCCTGAGGTCTGCTTCTGAGTCCTGACATA 960

 38862646 TCTAGCATTATAACAAAAGATAGTAACGAGGATTATGGGAGTTATGAGGCAGGAAGCTTG 38862705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TCTAGCATTATAACAAAAGATAGTAACGAGGATTATGGGAGTTATGAGGCAGGAAGCTTG 1020

 38862706 GACAAAAATCTACATATATAAATTTGTGGGATACAGCAAAAGCAGTGCTTAGGGAGAAAT 38862765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GACAAAAATCTACATATATAAATTTGTGGGATACAGCAAAAGCAGTGCTTAGGGAGAAAT 1080

 38862766 TTAAAACATGATTACATGTATTTGAAAATAAGAAAGATCTGGCTGGGCATGGTGGCTCAT 38862825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTAAAACATGATTACATGTATTTGAAAATAAGAAAGATCTGGCTGGGCATGGTGGCTCAT 1140

 38862826 GCCTGTAATCCCAGAACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGCAGATCACCTGAGGTCAGGAGTTC 38862885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GCCTGTAATCCCAGAACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGCAGATCACCTGAGGTCAGGAGTTC 1200

 38862886 GAGACCAGACTGATCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCA 38862945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GAGACCAGACTGATCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCA 1260

 38862946 GGCGTGGTGGCATGACTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGACAGGAGAATTGCTTG 38863005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GGCGTGGTGGCATGACTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGACAGGAGAATTGCTTG 1320

 38863006 AACCTGGGAGGCAGAGATTGCAGTGAGCCAAGATTGGGACACTGCACTCCAGCCTGGGTG 38863065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AACCTGGGAGGCAGAGATTGCAGTGAGCCAAGATTGGGACACTGCACTCCAGCCTGGGTG 1380

 38863066 ACAGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAGAAAGAAAAGAAAGATCTAATACTAGTAA 38863125
          |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ACAGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAA-GAAAGAAAAGAAAGATCTAATACTAGTAA 1439

 38863126 TCTGTTTCCACTTTAGAACACTATAAAAAAGAGCAAATAATATGCAAAGTAAGAAGAATG 38863185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 TCTGTTTCCACTTTAGAACACTATAAAAAAGAGCAAATAATATGCAAAGTAAGAAGAATG 1499

 38863186 AAAGATATCATAAAAATAGAGCAAAAATTAAAGGAATTTAAAATAGAAAATTGATTTTAT 38863245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 AAAGATATCATAAAAATAGAGCAAAAATTAAAGGAATTTAAAATAGAAAATTGATTTTAT 1559

 38863246 AAAATCAGTTAAACCAAAAGCCAATTTTCTAAAAGGGTCAATAAAATTGATAAGCCTCTA 38863305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 AAAATCAGTTAAACCAAAAGCCAATTTTCTAAAAGGGTCAATAAAATTGATAAGCCTCTA 1619

 38863306 GCCAGGGTGGCTAAGACACAAAGAGGAAAAACACAAATTGCTAAGATCAGCAGTGAAAGA 38863365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 GCCAGGGTGGCTAAGACACAAAGAGGAAAAACACAAATTGCTAAGATCAGCAGTGAAAGA 1679

 38863366 GGGGACATCACTGCAGATCACATGGACATTAAAAGGAAAATAAATGAAGATTATGAACAA 38863425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 GGGGACATCACTGCAGATCACATGGACATTAAAAGGAAAATAAATGAAGATTATGAACAA 1739

 38863426 ACCTGTGCCCACACGTCTGATAACTTTGATGAAATGGACTAATTCCTTAAAAGGTCTAAT 38863485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 ACCTGTGCCCACACGTCTGATAACTTTGATGAAATGGACTAATTCCTTAAAAGGTCTAAT 1799

 38863486 CTTTTAAAACTCACACAAGAAGAAATAGAAAATATGAATAGGACTACATCTATTTTTAAA 38863545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 CTTTTAAAACTCACACAAGAAGAAATAGAAAATATGAATAGGACTACATCTATTTTTAAA 1859

 38863546 TTAATTAATAACCTCATAAAAATAAAGCATCAGGCTCAGCTAAGGAAGAAATTATGTTAA 38863605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 TTAATTAATAACCTCATAAAAATAAAGCATCAGGCTCAGCTAAGGAAGAAATTATGTTAA 1919

 38863606 TTCTCTCCCAGAAGATAGAAACAGAGGACATACTTCCTAACTCATTCTATGAGGCCAGCA 38863665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 TTCTCTCCCAGAAGATAGAAACAGAGGACATACTTCCTAACTCATTCTATGAGGCCAGCA 1979

 38863666 TGGCTCTAATGCCGAAGCCAGACAAAAAGATTATAAGAAAAAACAAACAAAACTACAGAT 38863725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 TGGCTCTAATGCCGAAGCCAGACAAAAAGATTATAAGAAAAAACAAACAAAACTACAGAT 2039

 38863726 CTATATATCTCAAAAACATTGGTGCAAAAATCCTCAACCAAATATTAGCAAATCAAATTC 38863785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 CTATATATCTCAAAAACATTGGTGCAAAAATCCTCAACCAAATATTAGCAAATCAAATTC 2099

 38863786 AGCAATGTGTAAAGTGATTTACACACTATGACCAAGTGGGATTTATCTCAAGTGTTTAAG 38863845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 AGCAATGTGTAAAGTGATTTACACACTATGACCAAGTGGGATTTATCTCAAGTGTTTAAG 2159

 38863846 TCTGGTTCAATGTTTGACAATTAATTAATGTAATCACCTGGTTAAAGAAGGAAAATTACA 38863905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 TCTGGTTCAATGTTTGACAATTAATTAATGTAATCACCTGGTTAAAGAAGGAAAATTACA 2219

 38863906 TGATCTTATCAATAGATGCAGGAAAAAGCATTTGACAAAATCTAACACCACCCATTCTTA 38863965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 TGATCTTATCAATAGATGCAGGAAAAAGCATTTGACAAAATCTAACACCACCCATTCTTA 2279

 38863966 AAACAAAATGTCTCTCAGAAAACTAGCAATACAGGGAAATATCCTCAACTTGGTAAAGAA 38864025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 AAACAAAATGTCTCTCAGAAAACTAGCAATACAGGGAAATATCCTCAACTTGGTAAAGAA 2339

 38864026 CATTTTAAGAAATCATAGTTAATAATGAGAAACTTGAAACTTCTTCACTACCATCGGGAA 38864085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 CATTTTAAGAAATCATAGTTAATAATGAGAAACTTGAAACTTCTTCACTACCATCGGGAA 2399

 38864086 AACAGCAAGTATACTACCTCTCACCAGTGCTTTTCGACTTGATATCAAAAGTACTAGCTA 38864145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 AACAGCAAGTATACTACCTCTCACCAGTGCTTTTCGACTTGATATCAAAAGTACTAGCTA 2459

 38864146 ATGCAGTAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAA 38864205
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
     2460 ATGCAGTAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAA------- 2512

 38864206 AAGAAAAAGAGAGAGAGAAAAGAAAGAGAGGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGA 38864265
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2513 -AGAAAAAGAGAGAGAGAAAAGAAAGAGAGGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGA 2571

 38864266 AAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAA 38864291
          ||||||||||||||||||||||||||
     2572 AAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAA 2597

EXCISED REGION

 38864298 AAAGAAAGAAAGAAAGAAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAG 38864357
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2600 AAAGAAAGAAAGAAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAG 2659

 38864358 GAAATACAGATTGGGAAGAAAAAATAAAATTGTGTTTGTTCACACATGACATGATTGTGT 38864417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2660 GAAATACAGATTGGGAAGAAAAAATAAAATTGTGTTTGTTCACACATGACATGATTGTGT 2719

 38864418 AGAAAATCCAAAAGAATCAACAAAAAAGCTTCCTGAAATTAACAAATAATTACAGCAAGT 38864477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2720 AGAAAATCCAAAAGAATCAACAAAAAAGCTTCCTGAAATTAACAAATAATTACAGCAAGT 2779

 38864478 TTGCTGGAAATGAAGTTCATATACAAAATTGAATTACTTTTCCATATATCCACAATCAAC 38864537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2780 TTGCTGGAAATGAAGTTCATATACAAAATTGAATTACTTTTCCATATATCCACAATCAAC 2839

 38864538 AAATGGAATTTGAAATTAAAAACACATTATCATTTATATTAGCATCCTCAAAATGTAATA 38864597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2840 AAATGGAATTTGAAATTAAAAACACATTATCATTTATATTAGCATCCTCAAAATGTAATA 2899

 38864598 TTTCTGCATAAATTTAACAAAATATGTATATAATTTATATGAGGAGAACTACAAAATTCT 38864657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2900 TTTCTGCATAAATTTAACAAAATATGTATATAATTTATATGAGGAGAACTACAAAATTCT 2959

 38864658 GAAGAAATATGTCAAAGACTAAATAAATGGAAAGATATCTCAGGTTCATGGGTAGAAAGA 38864717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2960 GAAGAAATATGTCAAAGACTAAATAAATGGAAAGATATCTCAGGTTCATGGGTAGAAAGA 3019

 38864718 CTCAATATTGTTGAAATGTTAATTCTTCCCAACTTAATCTATAGATTCAATGTAATTACA 38864777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3020 CTCAATATTGTTGAAATGTTAATTCTTCCCAACTTAATCTATAGATTCAATGTAATTACA 3079

 38864778 ATCAAAAATGAAAGTAAGTTTTGTGTGTGTTTGTGTGAATCTTGACAAACTGATTTTAAA 38864837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3080 ATCAAAAATGAAAGTAAGTTTTGTGTGTGTTTGTGTGAATCTTGACAAACTGATTTTAAA 3139

 38864838 GTTCATATGGAGAGGAAAATGACCCAGAATAGCCACCACAATGTTGAGGGAGAACAAAGT 38864897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3140 GTTCATATGGAGAGGAAAATGACCCAGAATAGCCACCACAATGTTGAGGGAGAACAAAGT 3199

 38864898 GAGAAGACAGCACTACCCAACTTCAAGACTTGCTGAAAAGCTACAGCAATCAAGATAGTG 38864957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3200 GAGAAGACAGCACTACCCAACTTCAAGACTTGCTGAAAAGCTACAGCAATCAAGATAGTG 3259

 38864958 AGGTATTGGTAAAAGATAAAAAAACAGGTCAATGAAACAACATAGTGTACTCAGACATAA 38865017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3260 AGGTATTGGTAAAAGATAAAAAAACAGGTCAATGAAACAACATAGTGTACTCAGACATAA 3319

 38865018 CCCACATAATATACTCAACTGATCTTTGACAAAGGTGCAAGTTCAAGACAATGGAGCAAA 38865077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3320 CCCACATAATATACTCAACTGATCTTTGACAAAGGTGCAAGTTCAAGACAATGGAGCAAA 3379

 38865078 GATAGTCTTTTCAATAAATAGTGGTAAGAAAACTAGGCATAACATGCAAGAATAAAATGT 38865137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3380 GATAGTCTTTTCAATAAATAGTGGTAAGAAAACTAGGCATAACATGCAAGAATAAAATGT 3439

 38865138 AAATCTAGATATAGACCTTATGATCTTCACAAAAATTAATTCAAAATGAACTTTAGAGCT 38865197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3440 AAATCTAGATATAGACCTTATGATCTTCACAAAAATTAATTCAAAATGAACTTTAGAGCT 3499

 38865198 CAATTTAAAATGTAAAATTATAAAGCTCCTAGAAGGTAACATCAGAGAGAAACTAGGTGA 38865257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3500 CAATTTAAAATGTAAAATTATAAAGCTCCTAGAAGGTAACATCAGAGAGAAACTAGGTGA 3559

 38865258 CCTTGGTTTGGTGTTAACTTTTTAGAAACAACACCAGAAGTATGACCCATGAAAGAAAGA 38865317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3560 CCTTGGTTTGGTGTTAACTTTTTAGAAACAACACCAGAAGTATGACCCATGAAAGAAAGA 3619

 38865318 ATTGATAAGCTGGACTTAACTAAAATTAAATACTTCTGTTTTGAGAAAGGCACTATCAAG 38865377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3620 ATTGATAAGCTGGACTTAACTAAAATTAAATACTTCTGTTTTGAGAAAGGCACTATCAAG 3679

 38865378 ATCATTGGACCACAAGCAACAGACTGAAAGAAAATATCTGCAAAAGATAGATCTGATAAA 38865437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3680 ATCATTGGACCACAAGCAACAGACTGAAAGAAAATATCTGCAAAAGATAGATCTGATAAA 3739

 38865438 GGCGAGTCATTTAAAATATTCAAATATCTTTGAAAACTCAAC 38865479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3740 GGCGAGTCATTTAAAATATTCAAATATCTTTGAAAACTCAAC 3781

Alignment time is 3.15639 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38854779,38878343] =>     23565 nucs '18 dna:chromosome chromosome:GRCh37:18:1:78077248:1'
Second seq [       1,    6302] =>      6302 nucs 'mol-32-22a7-025491_6302'

Score:        5959
Aligned:      6322        nucs
Identic:      6244 ( 99%) nucs =>      2818 ( 98%)      3426 ( 99%)
Gaps:           61 (  1%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38861928,38864779] EXCISED REGION [38868344,38871787]
 second seq =>  [       1,    2852] EXCISED REGION [    2868,    6302]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3564 nucs [38864780,38868343]
 second seq =>        15 nucs [2853,2867]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 38861928 CATGTTTTTCCTCTGCTCTTCTATTAGCACAACAATCAACACAGAAGACTTCTGTGACCC 38861987
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CATGTTTTTCCTCTGCTCTTCCATTAGCACAACAATCAACACAGAAGACTTCTGTGACCC 60

 38861988 CAAAATATGTGGGGACTCCTCCCCACAAGCAAGCAAACAATCAGTTCTGCAGCAGACATC 38862047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAAAATATGTGGGGACTCCTCCCCACAAGCAAGCAAACAATCAGTTCTGCAGCAGACATC 120

 38862048 AGCTGGGTGCCCTCTGATTCAATTCTGACACTAACTTCCTAAAGATAGCATCAGATCCCA 38862107
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGCTGGGTGCCCTCCGATTCAATTCTGACACTAACTTCCTAAAGATAGCATCAGATCCCA 180

 38862108 CAGGCTGAGGGCTCAGTCCCCAAGACTAACCCACTTAGACGTCAGTCACCAGTCCAGGCC 38862167
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
      181 CAGGCTGAGGGCTCAGTCCCCAAGACTAACCCACTTAGATGTCAGTCACCAGTCCAGGCC 240

 38862168 TTCGGAACTTCTGACCAAACAGCTTCAAGTTGTGGTTCCCACAACTTCTACTTTGGGTTT 38862227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTCGGAACTTCTGACCAAACAGCTTCAAGTTGTGGTTCCCACAACTTCTACTTTGGGTTT 300

 38862228 GATTAGTTTACTGGAGTGGCTCACAGAACTATAGGAAACTGGAAACATTTAGGTTTGCCA 38862287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GATTAGTTTACTGGAGTGGCTCACAGAACTATAGGAAACTGGAAACATTTAGGTTTGCCA 360

 38862288 GTTTATTATAAAGGATGTTACAAAGAATACAGATAAACAGATGCATAGGGTGAGGTACTC 38862347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTTTATTATAAAGGATGTTACAAAGAATACAGATAAACAGATGCATAGGGTGAGGTACTC 420

 38862348 GGGAAAGGTGCAGAGCTTCCATGCCCTTCCTGGCTACACCACTCTCCAGGAACCTCCATG 38862407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGGAAAGGTGCAGAGCTTCCATGCCCTTCCTGGCTACACCACTCTCCAGGAACCTCCATG 480

 38862408 TGTTCAACTATTCGGAAGCTCTCTGAACCCTGTCCTATAGGGGTTTTATGGAAACTTCAT 38862467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGTTCAACTATTCGGAAGCTCTCTGAACCCTGTCCTATAGGGGTTTTATGGAAACTTCAT 540

 38862468 GACATCAGCATTCCTTACTGCAGGGTATGAGGCGGGACCCTTTCTGGAATGAGGGTCTTA 38862527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GACATCAGCATTCCTTACTGCAGGGTATGAGGCGGGACCCTTTCTGGAATGAGGGTCTTA 600

 38862528 TGACCCACAGTCAGAAAGGCAGAAGAAGATTAGAGTCCTGCCTTGGGATAAGTAAAAGGA 38862587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGACCCACAGTCAGAAAGGCAGAAGAAGATTAGAGTCCTGCCTTGGGATAAGTAAAAGGA 660

 38862588 GGGCAGGAGAAAGTCAGAGAGATTTTTTTCCTGAGGTCTGCTTCTGAGTCCTGACATATC 38862647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGGCAGGAGAAAGTCAGAGAGATTTTTTTCCTGAGGTCTGCTTCTGAGTCCTGACATATC 720

 38862648 TAGCATTATAACAAAAGATAGTAACGAGGATTATGGGAGTTATGAGGCAGGAAGCTTGGA 38862707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TAGCATTATAACAAAAGATAGTAACGAGGATTATGGGAGTTATGAGGCAGGAAGCTTGGA 780

 38862708 CAAAAATCTACATATATAAATTTGTGGGATACAGCAAAAGCAGTGCTTAGGGAGAAATTT 38862767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CAAAAATCTACATATATAAATTTGTGGGATACAGCAAAAGCAGTGCTTAGGGAGAAATTT 840

 38862768 AAAACATGATTACATGTATTTGAAAATAAGAAAGATCTGGCTGGGCATGGTGGCTCATGC 38862827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAAACATGATTACATGTATTTGAAAATAAGAAAGATCTGGCTGGGCATGGTGGCTCATGC 900

 38862828 CTGTAATCCCAGAACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGCAGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGA 38862887
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTGTAATCCCAGAACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGA 960

 38862888 GACCAGACTGATCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGG 38862947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GACCAGACTGATCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGG 1020

 38862948 CGTGGTGGCATGACTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGACAGGAGAATTGCTTGAA 38863007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CGTGGTGGCATGACTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGACAGGAGAATTGCTTGAA 1080

 38863008 CCTGGGAGGCAGAGATTGCAGTGAGCCAAGATTGGGACACTGCACTCCAGCCTGGGTGAC 38863067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     1081 CCTGGGAGGCAGAGATTGCAGTGAGCCAAGATTGGGACACTGCACTCCAGCCTGGGTGGC 1140

 38863068 AGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAGAAAGAAAAGAAAGATCTAATACTAGTAATC 38863127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAGAAAGAAAAGAAAGATCTAATACTAGTAATC 1200

 38863128 TGTTTCCACTTTAGAACACTATAAAAAAGAGCAAATAATATGCAAAGTAAGAAGAATGAA 38863187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TGTTTCCACTTTAGAACACTATAAAAAAGAGCAAATAATATGCAAAGTAAGAAGAATGAA 1260

 38863188 AGATATCATAAAAATAGAGCAAAAATTAAAGGAATTTAAAATAGAAAATTGATTTTATAA 38863247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AGATATCATAAAAATAGAGCAAAAATTAAAGGAATTTAAAATAGAAAATTGATTTTATAA 1320

 38863248 AATCAGTTAAACCAAAAGCCAATTTTCTAAAAGGGTCAATAAAATTGATAAGCCTCTAGC 38863307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AATCAGTTAAACCAAAAGCCAATTTTCTAAAAGGGTCAATAAAATTGATAAGCCTCTAGC 1380

 38863308 CAGGGTGGCTAAGACACAAAGAGGAAAAACACAAATTGCTAAGATCAGCAGTGAAAGAGG 38863367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CAGGGTGGCTAAGACACAAAGAGGAAAAACACAAATTGCTAAGATCAGCAGTGAAAGAGG 1440

 38863368 GGACATCACTGCAGATCACATGGACATTAAAAGGAAAATAAATGAAGATTATGAACAAAC 38863427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GGACATCACTGCAGATCACATGGACATTAAAAGGAAAATAAATGAAGATTATGAACAAAC 1500

 38863428 CTGTGCCCACACGTCTGATAACTTTGATGAAATGGACTAATTCCTTAAAAGGTCTAATCT 38863487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CTGTGCCCACACGTCTGATAACTTTGATGAAATGGACTAATTCCTTAAAAGGTCTAATCT 1560

 38863488 TTTAAAACTCACACAAGAAGAAATAGAAAATATGAATAGGACTACATCTATTTTTAAATT 38863547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     1561 TTTAAAACTCACACAAGAAGAAATAGAAAATATGAATAGGACCACATCTATTTTTAAATT 1620

 38863548 AATTAATAACCTCATAAAAATAAAGCATCAGGCTCAGCTAAGGAAGAAATTATGTTAATT 38863607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AATTAATAACCTCATAAAAATAAAGCATCAGGCTCAGCTAAGGAAGAAATTATGTTAATT 1680

 38863608 CTCTCCCAGAAGATAGAAACAGAGGACATACTTCCTAACTCATTCTATGAGGCCAGCATG 38863667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CTCTCCCAGAAGATAGAAACAGAGGACATACTTCCTAACTCATTCTATGAGGCCAGCATG 1740

 38863668 GCTCTAATGCCGAAGCCAGACAAAAAGATTATAAGAAAAAACAAACAAAACTACAGATCT 38863727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GCTCTAATGCCGAAGCCAGACAAAAAGATTATAAGAAAAAACAAACAAAACTACAGATCT 1800

 38863728 ATATATCTCAAAAACATTGGTGCAAAAATCCTCAACCAAATATTAGCAAATCAAATTCAG 38863787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ATATATCTCAAAAACATTGGTGCAAAAATCCTCAACCAAATATTAGCAAATCAAATTCAG 1860

 38863788 CAATGTGTAAAGTGATTTACACACTATGACCAAGTGGGATTTATCTCAAGTGTTTAAGTC 38863847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CAATGTGTAAAGTGATTTACACACTATGACCAAGTGGGATTTATCTCAAGTGTTTAAGTC 1920

 38863848 TGGTTCAATGTTTGACAATTAATTAATGTAATCACCTGGTTAAAGAAGGAAAATTACATG 38863907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TGGTTCAATGTTTGACAATTAATTAATGTAATCACCTGGTTAAAGAAGGAAAATTACATG 1980

 38863908 ATCTTATCAATAGATGCAGGAAAAAGCATTTGACAAAATCTAACACCACCCATTCTTAAA 38863967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ATCTTATCAATAGATGCAGGAAAAAGCATTTGACAAAATCTAACACCACCCATTCTTAAA 2040

 38863968 ACAAAATGTCTCTCAGAAAACTAGCAATACAGGGAAATATCCTCAACTTGGTAAAGAACA 38864027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ACAAAATGTCTCTCAGAAAACTAGCAATACAGGGAAATATCCTCAACTTGGTAAAGAACA 2100

 38864028 TTTTAAGAAATCATAGTTAATAATGAGAAACTTGAAACTTCTTCACTACCATCGGGAAAA 38864087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     2101 TTTTAAGAAATCATAGTTAATAATGAGAAACTTGAAACTTCTTCACTACCATTGGGAAAA 2160

 38864088 CAGCAAGTATACTACCTCTCACCAGTGCTTTTCGACTTGATATCAAAAGTACTAGCTAAT 38864147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CAGCAAGTATACTACCTCTCACCAGTGCTTTTCGACTTGATATCAAAAGTACTAGCTAAT 2220

 38864148 GCAGTAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAA- 38864206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
     2221 GCAGTAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAG 2280

 38864207 -------AGAAAAAGAGAGAGAGAAAAGAAAGAGAGGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAA 38864259
                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AAAGAAAAGAAAAAGAGAGAGAGAAAAGAAAGAGAGGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAA 2340

 38864260 GAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAA------------AGAAAGAA 38864307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||||||||
     2341 GAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGGAAAGAAAGAA 2400

 38864308 AGAAAGAAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAAT--ACA 38864365
          |||||||||||||||||||||||||||||                            |||
     2401 AGAAAGAAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAA--------------------------ATACA 2434

 38864366 GATTGGGAAGAAAAAATAAAATTGTGTTTGTTCACACATGACATGATTGT----GTAGAA 38864421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||
     2435 GATTGGGAAGAAAAAATAAAATTGTGTTTGTTCACACATGACATGATTGTCTGTGTAGAA 2494

 38864422 AATCCAAAAGAATCAACAAAAAAGCTTCCTGAAATTAACAAATAATTACAGCAAGTTTGC 38864481
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2495 AATCCAAAAGAATCAACAAAAAAGCCTCCTGAAATTAACAAATAATTACAGCAAGTTTGC 2554

 38864482 TGGAAATGAAGTTCATATACAAAATTGAATTACTTTTCCATATATCCACAATCAACAAAT 38864541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2555 TGGAAATGAAGTTCATATACAAAATTGAATTACTTTTCCATATATCCACAATCAACAAAT 2614

 38864542 GGAATTTGAAATTAAAAACACATTATCATTTATATTAGCATCCTCAAAATGTAATATTTC 38864601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2615 GGAATTTGAAATTAAAAACACATTATCATTTATATTAGCATCCTCAAAATGTAATATTTC 2674

 38864602 TGCATAAATTTAACAAAATATGTATATAATTTATATGAGGAGAACTACAAAATTCTGAAG 38864661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2675 TGCATAAATTTAACAAAATATGTATATAATTTATATGAGGAGAACTACAAAATTCTGAAG 2734

 38864662 AAATATGTCAAAGACTAAATAAATGGAAAGATATCTCAGGTTCATGGGTAGAAAGACTCA 38864721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2735 AAATATGTCAAAGACTAAATAAATGGAAAGATATCTCAGGTTCATGGGTAGAAAGACTCA 2794

 38864722 ATATTGTTGAAATGTTAATTCTTCCCAACTTAATCTATAGATTCAATGTAATTACAAT 38864779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2795 ATATTGTTGAAATGTTAATTCTTCCCAACTTAATCTATAGATTCAATGTAATTACAAT 2852

EXCISED REGION

 38868344 AAAATATTATTGTGTAAACATAATTATAATATTATAGTGTTGGATTTATAACATATTTGG 38868403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2868 AAAATATTATTGTGTAAACATAATTATAATATTATAGTGTTGGATTTATAACATATTTGG 2927

 38868404 TGAAGTAATCGCACAAAGTAAAGAGAAGAAGAAAAGGGTATGTAAGTAAATAAAGATATT 38868463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2928 TGAAGTAATCGCACAAAGTAAAGAGAAGAAGAAAAGGGTATGTAAGTAAATAAAGATATT 2987

 38868464 ATATTTTACTGGAATTAAGTTGGTACTATTCTTAAATGGATTATGATTAGATGAGATGCA 38868523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2988 ATATTTTACTGGAATTAAGTTGGTACTATTCTTAAATGGATTATGATTAGATGAGATGCA 3047

 38868524 TATTGTAATTATTGTAGCAACCACTAAGAAATAATATTAACACAAACAACAGAGGAATTA 38868583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3048 TATTGTAATTATTGTAGCAACCACTAAGAAATAATATTAACACAAACAACAGAGGAATTA 3107

 38868584 AAATGATAGATTAGAAAAACCATTTATATATCACAAAATATAACAGTAAATGAGAAACAG 38868643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3108 AAATGATAGATTAGAAAAACCATTTATATATCACAAAATATAACAGTAAATGAGAAACAG 3167

 38868644 AGGAATATATTTAAAATGAGCCTGGTTGCAGCGGCTCACACCTGTAATCTTAGCAACTTG 38868703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3168 AGGAATATATTTAAAATGAGCCTGGTTGCAGCGGCTCACACCTGTAATCTTAGCAACTTG 3227

 38868704 GAAGGCCAAGGTAGGAGGAAGTCTTGAGCCCAGGAGTTCAAGATCAGCCTGAGCAACACA 38868763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3228 GAAGGCCAAGGTAGGAGGAAGTCTTGAGCCCAGGAGTTCAAGATCAGCCTGAGCAACACA 3287

 38868764 GTGAGACCCCCATCTCTACAAAAAGTAGAAATTTGGCAAGGCATCATGATAGGCACCTGT 38868823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3288 GTGAGACCCCCATCTCTACAAAAAGTAGAAATTTGGCAAGGCATCATGATAGGCACCTGT 3347

 38868824 AGTCCCAGCTACTGATGAAGCTAAGGCAAGAGGATTTCTTGAGCCTCTGAGGTCAAGGCT 38868883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3348 AGTCCCAGCTACTGATGAAGCTAAGGCAAGAGGATTTCTTGAGCCTCTGAGGTCAAGGCT 3407

 38868884 ACAGTGAGCTATGATCACACCACTGCGCTCCAGCTTTGGAGACAGAGCAAGACTCTACAG 38868943
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     3408 ACAGTGAGCTATGATCACACCACTGCACTCCAGCTTTGGAGACAGAGCAAGACTCTACAG 3467

 38868944 CAATAAATAAATAAATAGAAAGCAAATAGAAAAATGACAGGCATAAATCCAACTGTAGCA 38869003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3468 CAATAAATAAATAAATAGAAAGCAAATAGAAAAATGACAGGCATAAATCCAACTGTAGCA 3527

 38869004 ATACTTAATACATGAAAAGCAAATAAACCAAGCACAACACATAAAAGGAAAGGATTGTCA 38869063
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     3528 ATACTTAATACATGAAAAGCAAATAAACCAAGCACAACACATAAAAGGAAAGGTTTGTCA 3587

 38869064 GATTTGATAGAAACAAGACCCAAGTATACACTGTCTATAATAGACACACATTATATTCAA 38869123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3588 GATTTGATAGAAACAAGACCCAAGTATACACTGTCTATAATAGACACACATTATATTCAA 3647

 38869124 ATACATAAATAAATAAAAAGCAAAATGATGTAAAAAAGGTAAAGTATGAAATCAGTAACT 38869183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3648 ATACATAAATAAATAAAAAGCAAAATGATGTAAAAAAGGTAAAGTATGAAATCAGTAACT 3707

 38869184 CTATGACAGCTGAAGTAGCTGTATTAACATTATTTAAAATAGACTTTAATACAAGAAACA 38869243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3708 CTATGACAGCTGAAGTAGCTGTATTAACATTATTTAAAATAGACTTTAATACAAGAAACA 3767

 38869244 CTATCAGAGAAGAAAAGCCATATTTCATAATGATAAAACATGCCAATTCATCATAAAGAT 38869303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3768 CTATCAGAGAAGAAAAGCCATATTTCATAATGATAAAACATGCCAATTCATCATAAAGAT 3827

 38869304 GTAAGAGTTAAAAACATGTATACATTTAATCATAATGCCCCAAAATACCTGAAGCAAAAA 38869363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3828 GTAAGAGTTAAAAACATGTATACATTTAATCATAATGCCCCAAAATACCTGAAGCAAAAA 3887

 38869364 TGGACAGAACTGAAAAAAGAAATAGACAATTCAAAAATAATAGTTTGAAATTCAAACAAC 38869423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3888 TGGACAGAACTGAAAAAAGAAATAGACAATTCAAAAATAATAGTTTGAAATTCAAACAAC 3947

 38869424 TGACTATCCATAATGACTAGACAGAAGATTAATAAGTATATAGAAGACTTGAGTAACACT 38869483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3948 TGACTATCCATAATGACTAGACAGAAGATTAATAAGTATATAGAAGACTTGAGTAACACT 4007

 38869484 ATACACCAACAATACTTAACAAATATCTGGAGAACAGTCCTCCTGACAGCAGAAGAATAC 38869543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4008 ATACACCAACAATACTTAACAAATATCTGGAGAACAGTCCTCCTGACAGCAGAAGAATAC 4067

 38869544 ATGTTCTTCTCAAGTACAAAGGAACAGTCTTCAGGATAGACTATTTTATGCCATAAAACA 38869603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4068 ATGTTCTTCTCAAGTACAAAGGAACAGTCTTCAGGATAGACTATTTTATGCCATAAAACA 4127

 38869604 ACCTCAATAAATATAAAATGATTGAAATCATACAAAGTATATTTATCAACCACAATGGAA 38869663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4128 ACCTCAATAAATATAAAATGATTGAAATCATACAAAGTATATTTATCAACCACAATGGAA 4187

 38869664 TCAAATCAGAAATCAATAATGGAGAAATTTGGGGATATGAACAAAATGTGGAAATTAATC 38869723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4188 TCAAATCAGAAATCAATAATGGAGAAATTTGGGGATATGAACAAAATGTGGAAATTAATC 4247

 38869724 AATACCCTCTATATAGCCAATGAGTCAAAGAAGAAATCACAAGGAAAATTAGAGTGAAAT 38869783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4248 AATACCCTCTATATAGCCAATGAGTCAAAGAAGAAATCACAAGGAAAATTAGAGTGAAAT 4307

 38869784 TAAAAATCAATAGATCCCAACATTTTGGAAGGCCAAGATGGGAGGATCACTCCTGGGTAA 38869843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4308 TAAAAATCAATAGATCCCAACATTTTGGAAGGCCAAGATGGGAGGATCACTCCTGGGTAA 4367

 38869844 CATAGTGAGAGCCAATAAAAAAATTAGCCAGGGATGGTGGTGAGTGTCAGTAGTTCCAGC 38869903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4368 CATAGTGAGAGCCAATAAAAAAATTAGCCAGGGATGGTGGTGAGTGTCAGTAGTTCCAGC 4427

 38869904 TACTTGGGAGGCTGAGGTGGCAGGATCACTTGAGCCCAGAAGGTCAACATTGCAGTGAGC 38869963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4428 TACTTGGGAGGCTGAGGTGGCAGGATCACTTGAGCCCAGAAGGTCAACATTGCAGTGAGC 4487

 38869964 CTTGTTTGTACCACTGCACTCCAGCCTAGGCGAGACTGAGACCCTGTTTCAAAAATAAAT 38870023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
     4488 CTTGTTTGTACCACTGCACTCCAGCCTAGGCGAGACTGAGACCCTGTTTCAA-------- 4539

 38870024 AAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAGTGAAAATAAAAATAAATGAAACCAAAGTTC 38870083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4540 AAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAGTGAAAATAAAAATAAATGAAACCAAAGTTC 4599

 38870084 ACTCTAAAAAAAAAGTCAACAAAGTTGATAAATATGTAGCTAAATTAAACAAGAAAGTGA 38870143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4600 ACTCTAAAAAAAAAGTCAACAAAGTTGATAAATATGTAGCTAAATTAAACAAGAAAGTGA 4659

 38870144 GAGACGAAATCAGAAAAGGAAGTAGGTAACATCACTTCCAAAATCTCCAAAATTTAAAAA 38870203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4660 GAGACGAAATCAGAAAAGGAAGTAGGTAACATCACTTCCAAAATCTCCAAAATTTAAAAA 4719

 38870204 TGTTTTGAAGATGATGAACAACTTTATGAAAACAATCAAGATAATGTACACGAAATTTTA 38870263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4720 TGTTTTGAAGATGATGAACAACTTTATGAAAACAATCAAGATAATGTACACGAAATTTTA 4779

 38870264 TATTTTAATTCCAAAAGCAACCACTAGAAAAAATAACTCAAAACAATAATGTAAAAATCA 38870323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4780 TATTTTAATTCCAAAAGCAACCACTAGAAAAAATAACTCAAAACAATAATGTAAAAATCA 4839

 38870324 ACAGAAGATGGCCGGGCACGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTTTGTTAAATGT 38870383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4840 ACAGAAGATGGCCGGGCACGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTTTGTTAAATGT 4899

 38870384 TGTTTAATGTATTATGTTAAATCTTCTGGGTTTTTTTTTGTTGTTGTTGTTTTGAGACGG 38870443
          |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
     4900 TGTTTAATGTATTATGTTAAATCTTCTGGG-TTTTTTTTGTTGTTGTTGTTTTGAGACGG 4958

 38870444 AGTCTCGCTCTGTCGTCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTCGGCTCACTGCAAGCTC 38870503
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     4959 AGTCTCGCTCTGTCGTCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAGCTC 5018

 38870504 CGCCTCCCGGGTTCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGCAGATCACGAGGTCGGGAGATCAAG 38870563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5019 CGCCTCCCGGGTTCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGCAGATCACGAGGTCGGGAGATCAAG 5078

 38870564 ACCATCCTGGCTAAAATGGAGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAACAAAATTAGC 38870623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5079 ACCATCCTGGCTAAAATGGAGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAACAAAATTAGC 5138

 38870624 CGGGCCCGGTGTGGGGCACCTGTGGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTG 38870683
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5139 CGGGCCCGGTGTGGGGCACCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTG 5198

 38870684 CTTGAGCCCGGGATGTCCAGGCTACCGTGAGCCATATTCATGACACAGCACTCCAGCCTG 38870743
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5199 CTTGAGCCCGGGATGTCCAGGATACCGTGAGCCATATTCATGACACAGCACTCCAGCCTG 5258

 38870744 GGTGACAGAGTGAGATCCTGCCACAAAATAAAAAGAAAAGAGAAAATGATAAAGATTGTA 38870803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5259 GGTGACAGAGTGAGATCCTGCCACAAAATAAAAAGAAAAGAGAAAATGATAAAGATTGTA 5318

 38870804 AAAATACAATCGTATATGGCTACAACTGATTTGTTAAAAAGATGCAAAGGCAATCCAGTG 38870863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5319 AAAATACAATCGTATATGGCTACAACTGATTTGTTAAAAAGATGCAAAGGCAATCCAGTG 5378

 38870864 GAGAAATTACAGTGTTTTTAAAAATTTGTTAGATCAATTTAATACCTACACATAAAAATA 38870923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5379 GAGAAATTACAGTGTTTTTAAAAATTTGTTAGATCAATTTAATACCTACACATAAAAATA 5438

 38870924 TAAACTTCTACCCATACCTGTTGCCACATTTAAAAAAAAAATTAACTAATAGGCCTAAAC 38870983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5439 TAAACTTCTACCCATACCTGTTGCCACATTTAAAAAAAAAATTAACTAATAGGCCTAAAC 5498

 38870984 ATAAGCTAAAACTATAAAAGTTTTAGTTGAACACATACGAGAAAAAATTTTGTGACTGTG 38871043
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     5499 ATAAGCTAAAACTATAAAAGTTTTAGTTGAACACATATGAGAAAAAATTTTGTGACTGTG 5558

 38871044 GTTTAAGCAAAGAGTTCTTAGATAACAAAATCAAAGTCTGACTTACTTAAAAAATTATAA 38871103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5559 GTTTAAGCAAAGAGTTCTTAGATAACAAAATCAAAGTCTGACTTACTTAAAAAATTATAA 5618

 38871104 ATTAGACTTCACTAATATTAAGATCTTCTGTTCCTTGAAAGACAATGTTAAAAGAATAAA 38871163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5619 ATTAGACTTCACTAATATTAAGATCTTCTGTTCCTTGAAAGACAATGTTAAAAGAATAAA 5678

 38871164 AAACCAAGACATTAGGGAATATTTGCACATCACATTTTTGATAAACAACTTGTATCCTGA 38871223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5679 AAACCAAGACATTAGGGAATATTTGCACATCACATTTTTGATAAACAACTTGTATCCTGA 5738

 38871224 ATATATAATTTTCTAAATTCAATAATAATAAAAAAATTTAGCAACAGATTTTAACAGAAA 38871283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5739 ATATATAATTTTCTAAATTCAATAATAATAAAAAAATTTAGCAACAGATTTTAACAGAAA 5798

 38871284 CTTATCAAATAAATACAGAGATGACAGATAAGCACATAACACATGTTCAATATCATTATT 38871343
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5799 CTTATCAAATAAATACAGAGATGACTGATAAGCACATAACACATGTTCAATATCATTATT 5858

 38871344 CATTAGGGAAATGTAAATGAAACCACAATTAAACACTGCCTCACACATTAAAAGGTCTTA 38871403
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     5859 CATTAGGGAAATGTAAATGAAACCACAATTAGACACTGCCTCACACATTAAAAGGTCTTA 5918

 38871404 AATTGACACTACTGATGACATCAAGTACTGCAAGGATTTAAATCAAGTGGAAACTTCATA 38871463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5919 AATTGACACTACTGATGACATCAAGTACTGCAAGGATTTAAATCAAGTGGAAACTTCATA 5978

 38871464 AACTTCTGGGGGTTATGTAAACTGTTGTAAATACTTTGAAAAACAGTTCTGCAGTTTTGT 38871523
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5979 AACTTCTGGGAGTTATGTAAACTGTTGTAAATACTTTGAAAAACAGTTCTGCAGTTTTGT 6038

 38871524 AAAAAGGTAAACATACACTTAGGGCATAACTCAGCTATCCGACTCCCAAGTATTTACTAA 38871583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6039 AAAAAGGTAAACATACACTTAGGGCATAACTCAGCTATCCGACTCCCAAGTATTTACTAA 6098

 38871584 ACAGAAATGAAAGCCTATGTTTATAGAAAGAACTGAACATGAAATTTCATAGTAGCTTTT 38871643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6099 ACAGAAATGAAAGCCTATGTTTATAGAAAGAACTGAACATGAAATTTCATAGTAGCTTTT 6158

 38871644 TCTGTAATAGCCTCAAGGAAATCAACCCAAATGTCATACATAGGTAAATGGACAATAAAA 38871703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6159 TCTGTAATAGCCTCAAGGAAATCAACCCAAATGTCATACATAGGTAAATGGACAATAAAA 6218

 38871704 TTGTAATATATCTATATGCTAAAATGCTATTCAGAAACAAAAGGTATGAAGTCTTCAGAC 38871763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6219 TTGTAATATATCTATATGCTAAAATGCTATTCAGAAACAAAAGGTATGAAGTCTTCAGAC 6278

 38871764 ATCTATAGACACTGGTGAATCTTA 38871787
          ||||||||||||||||||||||||
     6279 ATCTATAGACACTGGTGAATCTTA 6302

Alignment time is 5.3152 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38854779,38878343] =>     23565 nucs '18 dna:chromosome chromosome:GRCh37:18:1:78077248:1'
Second seq [       1,    2852] =>      2852 nucs 'mol-32-22a7-025491_2852'

Score:        2695
Aligned:      2825        nucs
Identic:      2805 ( 99%) nucs =>      2365 ( 99%)       440 ( 99%)
Gaps:           12 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38861928,38864299] EXCISED REGION [38864339,38864779]
 second seq =>  [       1,    2380] EXCISED REGION [    2408,    2852]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        39 nucs [38864300,38864338]
 second seq =>        27 nucs [2381,2407]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [38864300,38864300] to [38864339,38864339]
 second seq =>         1 nucs [2380,2380] to [2407,2407]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [38864298,38864299] to [38864339,38864340]
 second seq =>         2 nucs [2379,2380] to [2408,2409]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         6 nucs [2381,2386] to [2402,2407]

 38861928 CATGTTTTTCCTCTGCTCTTCTATTAGCACAACAATCAACACAGAAGACTTCTGTGACCC 38861987
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CATGTTTTTCCTCTGCTCTTCCATTAGCACAACAATCAACACAGAAGACTTCTGTGACCC 60

 38861988 CAAAATATGTGGGGACTCCTCCCCACAAGCAAGCAAACAATCAGTTCTGCAGCAGACATC 38862047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAAAATATGTGGGGACTCCTCCCCACAAGCAAGCAAACAATCAGTTCTGCAGCAGACATC 120

 38862048 AGCTGGGTGCCCTCTGATTCAATTCTGACACTAACTTCCTAAAGATAGCATCAGATCCCA 38862107
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGCTGGGTGCCCTCCGATTCAATTCTGACACTAACTTCCTAAAGATAGCATCAGATCCCA 180

 38862108 CAGGCTGAGGGCTCAGTCCCCAAGACTAACCCACTTAGACGTCAGTCACCAGTCCAGGCC 38862167
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
      181 CAGGCTGAGGGCTCAGTCCCCAAGACTAACCCACTTAGATGTCAGTCACCAGTCCAGGCC 240

 38862168 TTCGGAACTTCTGACCAAACAGCTTCAAGTTGTGGTTCCCACAACTTCTACTTTGGGTTT 38862227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTCGGAACTTCTGACCAAACAGCTTCAAGTTGTGGTTCCCACAACTTCTACTTTGGGTTT 300

 38862228 GATTAGTTTACTGGAGTGGCTCACAGAACTATAGGAAACTGGAAACATTTAGGTTTGCCA 38862287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GATTAGTTTACTGGAGTGGCTCACAGAACTATAGGAAACTGGAAACATTTAGGTTTGCCA 360

 38862288 GTTTATTATAAAGGATGTTACAAAGAATACAGATAAACAGATGCATAGGGTGAGGTACTC 38862347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTTTATTATAAAGGATGTTACAAAGAATACAGATAAACAGATGCATAGGGTGAGGTACTC 420

 38862348 GGGAAAGGTGCAGAGCTTCCATGCCCTTCCTGGCTACACCACTCTCCAGGAACCTCCATG 38862407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGGAAAGGTGCAGAGCTTCCATGCCCTTCCTGGCTACACCACTCTCCAGGAACCTCCATG 480

 38862408 TGTTCAACTATTCGGAAGCTCTCTGAACCCTGTCCTATAGGGGTTTTATGGAAACTTCAT 38862467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGTTCAACTATTCGGAAGCTCTCTGAACCCTGTCCTATAGGGGTTTTATGGAAACTTCAT 540

 38862468 GACATCAGCATTCCTTACTGCAGGGTATGAGGCGGGACCCTTTCTGGAATGAGGGTCTTA 38862527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GACATCAGCATTCCTTACTGCAGGGTATGAGGCGGGACCCTTTCTGGAATGAGGGTCTTA 600

 38862528 TGACCCACAGTCAGAAAGGCAGAAGAAGATTAGAGTCCTGCCTTGGGATAAGTAAAAGGA 38862587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGACCCACAGTCAGAAAGGCAGAAGAAGATTAGAGTCCTGCCTTGGGATAAGTAAAAGGA 660

 38862588 GGGCAGGAGAAAGTCAGAGAGATTTTTTTCCTGAGGTCTGCTTCTGAGTCCTGACATATC 38862647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGGCAGGAGAAAGTCAGAGAGATTTTTTTCCTGAGGTCTGCTTCTGAGTCCTGACATATC 720

 38862648 TAGCATTATAACAAAAGATAGTAACGAGGATTATGGGAGTTATGAGGCAGGAAGCTTGGA 38862707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TAGCATTATAACAAAAGATAGTAACGAGGATTATGGGAGTTATGAGGCAGGAAGCTTGGA 780

 38862708 CAAAAATCTACATATATAAATTTGTGGGATACAGCAAAAGCAGTGCTTAGGGAGAAATTT 38862767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CAAAAATCTACATATATAAATTTGTGGGATACAGCAAAAGCAGTGCTTAGGGAGAAATTT 840

 38862768 AAAACATGATTACATGTATTTGAAAATAAGAAAGATCTGGCTGGGCATGGTGGCTCATGC 38862827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAAACATGATTACATGTATTTGAAAATAAGAAAGATCTGGCTGGGCATGGTGGCTCATGC 900

 38862828 CTGTAATCCCAGAACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGCAGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGA 38862887
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTGTAATCCCAGAACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGA 960

 38862888 GACCAGACTGATCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGG 38862947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GACCAGACTGATCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGG 1020

 38862948 CGTGGTGGCATGACTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGACAGGAGAATTGCTTGAA 38863007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CGTGGTGGCATGACTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGACAGGAGAATTGCTTGAA 1080

 38863008 CCTGGGAGGCAGAGATTGCAGTGAGCCAAGATTGGGACACTGCACTCCAGCCTGGGTGAC 38863067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     1081 CCTGGGAGGCAGAGATTGCAGTGAGCCAAGATTGGGACACTGCACTCCAGCCTGGGTGGC 1140

 38863068 AGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAGAAAGAAAAGAAAGATCTAATACTAGTAATC 38863127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAGAAAGAAAAGAAAGATCTAATACTAGTAATC 1200

 38863128 TGTTTCCACTTTAGAACACTATAAAAAAGAGCAAATAATATGCAAAGTAAGAAGAATGAA 38863187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TGTTTCCACTTTAGAACACTATAAAAAAGAGCAAATAATATGCAAAGTAAGAAGAATGAA 1260

 38863188 AGATATCATAAAAATAGAGCAAAAATTAAAGGAATTTAAAATAGAAAATTGATTTTATAA 38863247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AGATATCATAAAAATAGAGCAAAAATTAAAGGAATTTAAAATAGAAAATTGATTTTATAA 1320

 38863248 AATCAGTTAAACCAAAAGCCAATTTTCTAAAAGGGTCAATAAAATTGATAAGCCTCTAGC 38863307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AATCAGTTAAACCAAAAGCCAATTTTCTAAAAGGGTCAATAAAATTGATAAGCCTCTAGC 1380

 38863308 CAGGGTGGCTAAGACACAAAGAGGAAAAACACAAATTGCTAAGATCAGCAGTGAAAGAGG 38863367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CAGGGTGGCTAAGACACAAAGAGGAAAAACACAAATTGCTAAGATCAGCAGTGAAAGAGG 1440

 38863368 GGACATCACTGCAGATCACATGGACATTAAAAGGAAAATAAATGAAGATTATGAACAAAC 38863427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GGACATCACTGCAGATCACATGGACATTAAAAGGAAAATAAATGAAGATTATGAACAAAC 1500

 38863428 CTGTGCCCACACGTCTGATAACTTTGATGAAATGGACTAATTCCTTAAAAGGTCTAATCT 38863487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CTGTGCCCACACGTCTGATAACTTTGATGAAATGGACTAATTCCTTAAAAGGTCTAATCT 1560

 38863488 TTTAAAACTCACACAAGAAGAAATAGAAAATATGAATAGGACTACATCTATTTTTAAATT 38863547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     1561 TTTAAAACTCACACAAGAAGAAATAGAAAATATGAATAGGACCACATCTATTTTTAAATT 1620

 38863548 AATTAATAACCTCATAAAAATAAAGCATCAGGCTCAGCTAAGGAAGAAATTATGTTAATT 38863607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AATTAATAACCTCATAAAAATAAAGCATCAGGCTCAGCTAAGGAAGAAATTATGTTAATT 1680

 38863608 CTCTCCCAGAAGATAGAAACAGAGGACATACTTCCTAACTCATTCTATGAGGCCAGCATG 38863667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CTCTCCCAGAAGATAGAAACAGAGGACATACTTCCTAACTCATTCTATGAGGCCAGCATG 1740

 38863668 GCTCTAATGCCGAAGCCAGACAAAAAGATTATAAGAAAAAACAAACAAAACTACAGATCT 38863727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GCTCTAATGCCGAAGCCAGACAAAAAGATTATAAGAAAAAACAAACAAAACTACAGATCT 1800

 38863728 ATATATCTCAAAAACATTGGTGCAAAAATCCTCAACCAAATATTAGCAAATCAAATTCAG 38863787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ATATATCTCAAAAACATTGGTGCAAAAATCCTCAACCAAATATTAGCAAATCAAATTCAG 1860

 38863788 CAATGTGTAAAGTGATTTACACACTATGACCAAGTGGGATTTATCTCAAGTGTTTAAGTC 38863847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CAATGTGTAAAGTGATTTACACACTATGACCAAGTGGGATTTATCTCAAGTGTTTAAGTC 1920

 38863848 TGGTTCAATGTTTGACAATTAATTAATGTAATCACCTGGTTAAAGAAGGAAAATTACATG 38863907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TGGTTCAATGTTTGACAATTAATTAATGTAATCACCTGGTTAAAGAAGGAAAATTACATG 1980

 38863908 ATCTTATCAATAGATGCAGGAAAAAGCATTTGACAAAATCTAACACCACCCATTCTTAAA 38863967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ATCTTATCAATAGATGCAGGAAAAAGCATTTGACAAAATCTAACACCACCCATTCTTAAA 2040

 38863968 ACAAAATGTCTCTCAGAAAACTAGCAATACAGGGAAATATCCTCAACTTGGTAAAGAACA 38864027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ACAAAATGTCTCTCAGAAAACTAGCAATACAGGGAAATATCCTCAACTTGGTAAAGAACA 2100

 38864028 TTTTAAGAAATCATAGTTAATAATGAGAAACTTGAAACTTCTTCACTACCATCGGGAAAA 38864087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     2101 TTTTAAGAAATCATAGTTAATAATGAGAAACTTGAAACTTCTTCACTACCATTGGGAAAA 2160

 38864088 CAGCAAGTATACTACCTCTCACCAGTGCTTTTCGACTTGATATCAAAAGTACTAGCTAAT 38864147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CAGCAAGTATACTACCTCTCACCAGTGCTTTTCGACTTGATATCAAAAGTACTAGCTAAT 2220

 38864148 GCAGTAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAA- 38864206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
     2221 GCAGTAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAG 2280

 38864207 -------AGAAAAAGAGAGAGAGAAAAGAAAGAGAGGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAA 38864259
                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AAAGAAAAGAAAAAGAGAGAGAGAAAAGAAAGAGAGGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAA 2340

 38864260 GAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAA 38864299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAA 2380

EXCISED REGION

 38864339 AAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAATACAGATTGGGAAGAAAAAATAAAATTGTGTTTGTTC 38864398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2408 AAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAATACAGATTGGGAAGAAAAAATAAAATTGTGTTTGTTC 2467

 38864399 ACACATGACATGAT----TGTGTAGAAAATCCAAAAGAATCAACAAAAAAGCTTCCTGAA 38864454
          ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     2468 ACACATGACATGATTGTCTGTGTAGAAAATCCAAAAGAATCAACAAAAAAGCCTCCTGAA 2527

 38864455 ATTAACAAATAATTACAGCAAGTTTGCTGGAAATGAAGTTCATATACAAAATTGAATTAC 38864514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2528 ATTAACAAATAATTACAGCAAGTTTGCTGGAAATGAAGTTCATATACAAAATTGAATTAC 2587

 38864515 TTTTCCATATATCCACAATCAACAAATGGAATTTGAAATTAAAAACACATTATCATTTAT 38864574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2588 TTTTCCATATATCCACAATCAACAAATGGAATTTGAAATTAAAAACACATTATCATTTAT 2647

 38864575 ATTAGCATCCTCAAAATGTAATATTTCTGCATAAATTTAACAAAATATGTATATAATTTA 38864634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2648 ATTAGCATCCTCAAAATGTAATATTTCTGCATAAATTTAACAAAATATGTATATAATTTA 2707

 38864635 TATGAGGAGAACTACAAAATTCTGAAGAAATATGTCAAAGACTAAATAAATGGAAAGATA 38864694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2708 TATGAGGAGAACTACAAAATTCTGAAGAAATATGTCAAAGACTAAATAAATGGAAAGATA 2767

 38864695 TCTCAGGTTCATGGGTAGAAAGACTCAATATTGTTGAAATGTTAATTCTTCCCAACTTAA 38864754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2768 TCTCAGGTTCATGGGTAGAAAGACTCAATATTGTTGAAATGTTAATTCTTCCCAACTTAA 2827

 38864755 TCTATAGATTCAATGTAATTACAAT 38864779
          |||||||||||||||||||||||||
     2828 TCTATAGATTCAATGTAATTACAAT 2852

Alignment time is 2.39869 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38854779,38878343] =>     23565 nucs '18 dna:chromosome chromosome:GRCh37:18:1:78077248:1'
Second seq [       1,    3953] =>      3953 nucs 'mol-32-23c5-020762_3953'

Score:        3694
Aligned:      3992        nucs
Identic:      3915 ( 98%) nucs =>       688 ( 92%)      3227 ( 99%)
Gaps:           66 (  2%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38864045,38864779] EXCISED REGION [38868344,38871588]
 second seq =>  [       1,     702] EXCISED REGION [     718,    3953]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3564 nucs [38864780,38868343]
 second seq =>        15 nucs [703,717]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 38864045 TAATAATGAGAAACTTGAAACTTCTTCACTACCATCGGGAAAACAGCAAGTATACTACCT 38864104
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
        1 TAATAATGAGAAACTTGAAACTTCTTCACTACCATTGGGAAAACAGCAAGTATACTACCT 60

 38864105 CTCACCAGTGCTTTTCGACTTGATATCAAAAGTACTAGCTAATGCAGTAAGAAAGAAAGA 38864164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTCACCAGTGCTTTTCGACTTGATATCAAAAGTACTAGCTAATGCAGTAAGAAAGAAAGA 120

 38864165 AAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAA--------AGAAAAAGAG 38864216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||
      121 AAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAAGAAAAAGAG 180

 38864217 AGAGAGAAAAGAAAGAGAGGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAG 38864276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGAGAGAAAAGAAAGAGAGGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAG 240

 38864277 AAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAA 38864336
          ||||||||||||||||||||                                        
      241 AAAGAAAGAAAGAAAGAAAG---------------------------------------- 260

 38864337 GGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAATACAGATTGGGAAGAAAAAATAAAATTGTGTTTGT 38864396
               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      261 -----GAAGGAAGGAAGGAAGGAAATACAGATTGGGAAGAAAAAATAAAATTGTGTTTGT 315

 38864397 TCACACATGACATGATTGT----GTAGAAAATCCAAAAGAATCAACAAAAAAGCTTCCTG 38864452
          |||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
      316 TCACACATGACATGATTGTCTGTGTAGAAAATCCAAAAGAATCAACAAAAAAGCCTCCTG 375

 38864453 AAATTAACAAATAATTACAGCAAGTTTGCTGGAAATGAAGTTCATATACAAAATTGAATT 38864512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      376 AAATTAACAAATAATTACAGCAAGTTTGCTGGAAATGAAGTTCATATACAAAATTGAATT 435

 38864513 ACTTTTCCATATATCCACAATCAACAAATGGAATTTGAAATTAAAAACACATTATCATTT 38864572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      436 ACTTTTCCATATATCCACAATCAACAAATGGAATTTGAAATTAAAAACACATTATCATTT 495

 38864573 ATATTAGCATCCTCAAAATGTAATATTTCTGCATAAATTTAACAAAATATGTATATAATT 38864632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      496 ATATTAGCATCCTCAAAATGTAATATTTCTGCATAAATTTAACAAAATATGTATATAATT 555

 38864633 TATATGAGGAGAACTACAAAATTCTGAAGAAATATGTCAAAGACTAAATAAATGGAAAGA 38864692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      556 TATATGAGGAGAACTACAAAATTCTGAAGAAATATGTCAAAGACTAAATAAATGGAAAGA 615

 38864693 TATCTCAGGTTCATGGGTAGAAAGACTCAATATTGTTGAAATGTTAATTCTTCCCAACTT 38864752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      616 TATCTCAGGTTCATGGGTAGAAAGACTCAATATTGTTGAAATGTTAATTCTTCCCAACTT 675

 38864753 AATCTATAGATTCAATGTAATTACAAT 38864779
          |||||||||||||||||||||||||||
      676 AATCTATAGATTCAATGTAATTACAAT 702

EXCISED REGION

 38868344 AAAATATTATTGTGTAAACATAATTATAATATTATAGTGTTGGATTTATAACATATTTGG 38868403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      718 AAAATATTATTGTGTAAACATAATTATAATATTATAGTGTTGGATTTATAACATATTTGG 777

 38868404 TGAAGTAATCGCACAAAGTAAAGAGAAGAAGAAAAGGGTATGTAAGTAAATAAAGATATT 38868463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      778 TGAAGTAATCGCACAAAGTAAAGAGAAGAAGAAAAGGGTATGTAAGTAAATAAAGATATT 837

 38868464 ATATTTTACTGGAATTAAGTTGGTACTATTCTTAAATGGATTATGATTAGATGAGATGCA 38868523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      838 ATATTTTACTGGAATTAAGTTGGTACTATTCTTAAATGGATTATGATTAGATGAGATGCA 897

 38868524 TATTGTAATTATTGTAGCAACCACTAAGAAATAATATTAACACAAACAACAGAGGAATTA 38868583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      898 TATTGTAATTATTGTAGCAACCACTAAGAAATAATATTAACACAAACAACAGAGGAATTA 957

 38868584 AAATGATAGATTAGAAAAACCATTTATATATCACAAAATATAACAGTAAATGAGAAACAG 38868643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      958 AAATGATAGATTAGAAAAACCATTTATATATCACAAAATATAACAGTAAATGAGAAACAG 1017

 38868644 AGGAATATATTTAAAATGAGCCTGGTTGCAGCGGCTCACACCTGTAATCTTAGCAACTTG 38868703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1018 AGGAATATATTTAAAATGAGCCTGGTTGCAGCGGCTCACACCTGTAATCTTAGCAACTTG 1077

 38868704 GAAGGCCAAGGTAGGAGGAAGTCTTGAGCCCAGGAGTTCAAGATCAGCCTGAGCAACACA 38868763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1078 GAAGGCCAAGGTAGGAGGAAGTCTTGAGCCCAGGAGTTCAAGATCAGCCTGAGCAACACA 1137

 38868764 GTGAGACCCCCATCTCTACAAAAAGTAGAAATTTGGCAAGGCATCATGATAGGCACCTGT 38868823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1138 GTGAGACCCCCATCTCTACAAAAAGTAGAAATTTGGCAAGGCATCATGATAGGCACCTGT 1197

 38868824 AGTCCCAGCTACTGATGAAGCTAAGGCAAGAGGATTTCTTGAGCCTCTGAGGTCAAGGCT 38868883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1198 AGTCCCAGCTACTGATGAAGCTAAGGCAAGAGGATTTCTTGAGCCTCTGAGGTCAAGGCT 1257

 38868884 ACAGTGAGCTATGATCACACCACTGCGCTCCAGCTTTGGAGACAGAGCAAGACTCTACAG 38868943
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     1258 ACAGTGAGCTATGATCACACCACTGCACTCCAGCTTTGGAGACAGAGCAAGACTCTACAG 1317

 38868944 CAATAAATAAATAAATAGAAAGCAAATAGAAAAATGACAGGCATAAATCCAACTGTAGCA 38869003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1318 CAATAAATAAATAAATAGAAAGCAAATAGAAAAATGACAGGCATAAATCCAACTGTAGCA 1377

 38869004 ATACTTAATACATGAAAAGCAAATAAACCAAGCACAACACATAAAAGGAAAGGATTGTCA 38869063
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     1378 ATACTTAATACATGAAAAGCAAATAAACCAAGCACAACACATAAAAGGAAAGGTTTGTCA 1437

 38869064 GATTTGATAGAAACAAGACCCAAGTATACACTGTCTATAATAGACACACATTATATTCAA 38869123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1438 GATTTGATAGAAACAAGACCCAAGTATACACTGTCTATAATAGACACACATTATATTCAA 1497

 38869124 ATACATAAATAAATAAAAAGCAAAATGATGTAAAAAAGGTAAAGTATGAAATCAGTAACT 38869183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1498 ATACATAAATAAATAAAAAGCAAAATGATGTAAAAAAGGTAAAGTATGAAATCAGTAACT 1557

 38869184 CTATGACAGCTGAAGTAGCTGTATTAACATTATTTAAAATAGACTTTAATACAAGAAACA 38869243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1558 CTATGACAGCTGAAGTAGCTGTATTAACATTATTTAAAATAGACTTTAATACAAGAAACA 1617

 38869244 CTATCAGAGAAGAAAAGCCATATTTCATAATGATAAAACATGCCAATTCATCATAAAGAT 38869303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1618 CTATCAGAGAAGAAAAGCCATATTTCATAATGATAAAACATGCCAATTCATCATAAAGAT 1677

 38869304 GTAAGAGTTAAAAACATGTATACATTTAATCATAATGCCCCAAAATACCTGAAGCAAAAA 38869363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1678 GTAAGAGTTAAAAACATGTATACATTTAATCATAATGCCCCAAAATACCTGAAGCAAAAA 1737

 38869364 TGGACAGAACTGAAAAAAGAAATAGACAATTCAAAAATAATAGTTTGAAATTCAAACAAC 38869423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1738 TGGACAGAACTGAAAAAAGAAATAGACAATTCAAAAATAATAGTTTGAAATTCAAACAAC 1797

 38869424 TGACTATCCATAATGACTAGACAGAAGATTAATAAGTATATAGAAGACTTGAGTAACACT 38869483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1798 TGACTATCCATAATGACTAGACAGAAGATTAATAAGTATATAGAAGACTTGAGTAACACT 1857

 38869484 ATACACCAACAATACTTAACAAATATCTGGAGAACAGTCCTCCTGACAGCAGAAGAATAC 38869543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1858 ATACACCAACAATACTTAACAAATATCTGGAGAACAGTCCTCCTGACAGCAGAAGAATAC 1917

 38869544 ATGTTCTTCTCAAGTACAAAGGAACAGTCTTCAGGATAGACTATTTTATGCCATAAAACA 38869603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1918 ATGTTCTTCTCAAGTACAAAGGAACAGTCTTCAGGATAGACTATTTTATGCCATAAAACA 1977

 38869604 ACCTCAATAAATATAAAATGATTGAAATCATACAAAGTATATTTATCAACCACAATGGAA 38869663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1978 ACCTCAATAAATATAAAATGATTGAAATCATACAAAGTATATTTATCAACCACAATGGAA 2037

 38869664 TCAAATCAGAAATCAATAATGGAGAAATTTGGGGATATGAACAAAATGTGGAAATTAATC 38869723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2038 TCAAATCAGAAATCAATAATGGAGAAATTTGGGGATATGAACAAAATGTGGAAATTAATC 2097

 38869724 AATACCCTCTATATAGCCAATGAGTCAAAGAAGAAATCACAAGGAAAATTAGAGTGAAAT 38869783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2098 AATACCCTCTATATAGCCAATGAGTCAAAGAAGAAATCACAAGGAAAATTAGAGTGAAAT 2157

 38869784 TAAAAATCAATAGATCCCAACATTTTGGAAGGCCAAGATGGGAGGATCACTCCTGGGTAA 38869843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2158 TAAAAATCAATAGATCCCAACATTTTGGAAGGCCAAGATGGGAGGATCACTCCTGGGTAA 2217

 38869844 CATAGTGAGAGCCAATAAAAAAATTAGCCAGGGATGGTGGTGAGTGTCAGTAGTTCCAGC 38869903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2218 CATAGTGAGAGCCAATAAAAAAATTAGCCAGGGATGGTGGTGAGTGTCAGTAGTTCCAGC 2277

 38869904 TACTTGGGAGGCTGAGGTGGCAGGATCACTTGAGCCCAGAAGGTCAACATTGCAGTGAGC 38869963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2278 TACTTGGGAGGCTGAGGTGGCAGGATCACTTGAGCCCAGAAGGTCAACATTGCAGTGAGC 2337

 38869964 CTTGTTTGTACCACTGCACTCCAGCCTAGGCGAGACTGAGACCCTGTTTCAAAAATAAAT 38870023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
     2338 CTTGTTTGTACCACTGCACTCCAGCCTAGGCGAGACTGAGACCCTGTTTCAA-------- 2389

 38870024 AAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAGTGAAAATAAAAATAAATGAAACCAAAGTTC 38870083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2390 AAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAGTGAAAATAAAAATAAATGAAACCAAAGTTC 2449

 38870084 ACTCTAAAAAAAAAGTCAACAAAGTTGATAAATATGTAGCTAAATTAAACAAGAAAGTGA 38870143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2450 ACTCTAAAAAAAAAGTCAACAAAGTTGATAAATATGTAGCTAAATTAAACAAGAAAGTGA 2509

 38870144 GAGACGAAATCAGAAAAGGAAGTAGGTAACATCACTTCCAAAATCTCCAAAATTTAAAAA 38870203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2510 GAGACGAAATCAGAAAAGGAAGTAGGTAACATCACTTCCAAAATCTCCAAAATTTAAAAA 2569

 38870204 TGTTTTGAAGATGATGAACAACTTTATGAAAACAATCAAGATAATGTACACGAAATTTTA 38870263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2570 TGTTTTGAAGATGATGAACAACTTTATGAAAACAATCAAGATAATGTACACGAAATTTTA 2629

 38870264 TATTTTAATTCCAAAAGCAACCACTAGAAAAAATAACTCAAAACAATAATGTAAAAATCA 38870323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2630 TATTTTAATTCCAAAAGCAACCACTAGAAAAAATAACTCAAAACAATAATGTAAAAATCA 2689

 38870324 ACAGAAGATGGCCGGGCACGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTTTGTTAAATGT 38870383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2690 ACAGAAGATGGCCGGGCACGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTTTGTTAAATGT 2749

 38870384 TGTTTAATGTATTATGTTAAATCTTCTGGGTTTTTTTTTGTTGTTGTTGTTTTGAGACGG 38870443
          |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
     2750 TGTTTAATGTATTATGTTAAATCTTCTGGG-TTTTTTTTGTTGTTGTTGTTTTGAGACGG 2808

 38870444 AGTCTCGCTCTGTCGTCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTCGGCTCACTGCAAGCTC 38870503
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     2809 AGTCTCGCTCTGTCGTCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAGCTC 2868

 38870504 CGCCTCCCGGGTTCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGCAGATCACGAGGTCGGGAGATCAAG 38870563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2869 CGCCTCCCGGGTTCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGCAGATCACGAGGTCGGGAGATCAAG 2928

 38870564 ACCATCCTGGCTAAAATGGAGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAACAAAATTAGC 38870623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2929 ACCATCCTGGCTAAAATGGAGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAACAAAATTAGC 2988

 38870624 CGGGCCCGGTGTGGGGCACCTGTGGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTG 38870683
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2989 CGGGCCCGGTGTGGGGCACCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTG 3048

 38870684 CTTGAGCCCGGGATGTCCAGGCTACCGTGAGCCATATTCATGACACAGCACTCCAGCCTG 38870743
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3049 CTTGAGCCCGGGATGTCCAGGATACCGTGAGCCATATTCATGACACAGCACTCCAGCCTG 3108

 38870744 GGTGACAGAGTGAGATCCTGCCACAAAATAAAAAGAAAAGAGAAAATGATAAAGATTGTA 38870803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3109 GGTGACAGAGTGAGATCCTGCCACAAAATAAAAAGAAAAGAGAAAATGATAAAGATTGTA 3168

 38870804 AAAATACAATCGTATATGGCTACAACTGATTTGTTAAAAAGATGCAAAGGCAATCCAGTG 38870863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3169 AAAATACAATCGTATATGGCTACAACTGATTTGTTAAAAAGATGCAAAGGCAATCCAGTG 3228

 38870864 GAGAAATTACAGTGTTTTTAAAAATTTGTTAGATCAATTTAATACCTACACATAAAAATA 38870923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3229 GAGAAATTACAGTGTTTTTAAAAATTTGTTAGATCAATTTAATACCTACACATAAAAATA 3288

 38870924 TAAACTTCTACCCATACCTGTTGCCACATTTAAAAAAAAAATTAACTAATAGGCCTAAAC 38870983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3289 TAAACTTCTACCCATACCTGTTGCCACATTTAAAAAAAAAATTAACTAATAGGCCTAAAC 3348

 38870984 ATAAGCTAAAACTATAAAAGTTTTAGTTGAACACATACGAGAAAAAATTTTGTGACTGTG 38871043
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     3349 ATAAGCTAAAACTATAAAAGTTTTAGTTGAACACATATGAGAAAAAATTTTGTGACTGTG 3408

 38871044 GTTTAAGCAAAGAGTTCTTAGATAACAAAATCAAAGTCTGACTTACTTAAAAAATTATAA 38871103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3409 GTTTAAGCAAAGAGTTCTTAGATAACAAAATCAAAGTCTGACTTACTTAAAAAATTATAA 3468

 38871104 ATTAGACTTCACTAATATTAAGATCTTCTGTTCCTTGAAAGACAATGTTAAAAGAATAAA 38871163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3469 ATTAGACTTCACTAATATTAAGATCTTCTGTTCCTTGAAAGACAATGTTAAAAGAATAAA 3528

 38871164 AAACCAAGACATTAGGGAATATTTGCACATCACATTTTTGATAAACAACTTGTATCCTGA 38871223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3529 AAACCAAGACATTAGGGAATATTTGCACATCACATTTTTGATAAACAACTTGTATCCTGA 3588

 38871224 ATATATAATTTTCTAAATTCAATAATAATAAAAAAATTTAGCAACAGATTTTAACAGAAA 38871283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3589 ATATATAATTTTCTAAATTCAATAATAATAAAAAAATTTAGCAACAGATTTTAACAGAAA 3648

 38871284 CTTATCAAATAAATACAGAGATGACAGATAAGCACATAACACATGTTCAATATCATTATT 38871343
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3649 CTTATCAAATAAATACAGAGATGACTGATAAGCACATAACACATGTTCAATATCATTATT 3708

 38871344 CATTAGGGAAATGTAAATGAAACCACAATTAAACACTGCCTCACACATTAAAAGGTCTTA 38871403
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     3709 CATTAGGGAAATGTAAATGAAACCACAATTAGACACTGCCTCACACATTAAAAGGTCTTA 3768

 38871404 AATTGACACTACTGATGACATCAAGTACTGCAAGGATTTAAATCAAGTGGAAACTTCATA 38871463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3769 AATTGACACTACTGATGACATCAAGTACTGCAAGGATTTAAATCAAGTGGAAACTTCATA 3828

 38871464 AACTTCTGGGGGTTATGTAAACTGTTGTAAATACTTTGAAAAACAGTTCTGCAGTTTTGT 38871523
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3829 AACTTCTGGGAGTTATGTAAACTGTTGTAAATACTTTGAAAAACAGTTCTGCAGTTTTGT 3888

 38871524 AAAAAGGTAAACATACACTTAGGGCATAACTCAGCTATCCGACTCCCAAGTATTTACTAA 38871583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3889 AAAAAGGTAAACATACACTTAGGGCATAACTCAGCTATCCGACTCCCAAGTATTTACTAA 3948

 38871584 ACAGA 38871588
          |||||
     3949 ACAGA 3953

Alignment time is 3.28502 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38854779,38878343] =>     23565 nucs '18 dna:chromosome chromosome:GRCh37:18:1:78077248:1'
Second seq [       1,    3913] =>      3913 nucs 'mol-32-29df-030322_3913'

Score:        3905
Aligned:      3905        nucs
Identic:      3905 (100%) nucs =>      3373 (100%)       532 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38866643,38870015] EXCISED REGION [38870016,38870547]
 second seq =>  [       1,    3373] EXCISED REGION [    3382,    3913]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         8 nucs [3374,3381]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        37 nucs [3374,3410] to [3382,3418]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [38870014,38870015] to [38870016,38870017]
 second seq =>         2 nucs [3372,3373] to [3382,3383]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         4 nucs [3374,3377] to [3378,3381]

 38866643 TTTTTAAAAGTTACCTAGACATGGTGGCATACGCCTGTAGTCATAGCTACTTGGGAGGCT 38866702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTTTAAAAGTTACCTAGACATGGTGGCATACGCCTGTAGTCATAGCTACTTGGGAGGCT 60

 38866703 GGGGCAAGAAGATTGCTTGAGCCCCGGAATTTCAGGCTGCAGTGACCTATGCTAATGCCA 38866762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGGGCAAGAAGATTGCTTGAGCCCCGGAATTTCAGGCTGCAGTGACCTATGCTAATGCCA 120

 38866763 CTGCTCTCCTGCCTGAGTGACAGAGTGAGATTCTGTCTCTTAAAAACAAACAAACAAACA 38866822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTGCTCTCCTGCCTGAGTGACAGAGTGAGATTCTGTCTCTTAAAAACAAACAAACAAACA 180

 38866823 AAAAGATTGAAGGGATGAATAGGTAGAGCACAGACAAGTCTTAGGTCTGTCAATATTCTG 38866882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAAAGATTGAAGGGATGAATAGGTAGAGCACAGACAAGTCTTAGGTCTGTCAATATTCTG 240

 38866883 TATGATACTATAATAATGGATGTATGTCATCATACATTTATTTATATCCACAGAATGTAA 38866942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TATGATACTATAATAATGGATGTATGTCATCATACATTTATTTATATCCACAGAATGTAA 300

 38866943 AACACCAGGAGTAAATTCTATTTTAAACTCTGGGCGTTTTGTGATAATGATGCATTAATG 38867002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AACACCAGGAGTAAATTCTATTTTAAACTCTGGGCGTTTTGTGATAATGATGCATTAATG 360

 38867003 AAAGTTCATCAGTGATGTAACAAATGCACTACTGCCATGTGGAATGTTGATACTGGGGGA 38867062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAAGTTCATCAGTGATGTAACAAATGCACTACTGCCATGTGGAATGTTGATACTGGGGGA 420

 38867063 GTTTGCCATGTGTGAGGACAGCAGGTATATGAAAACTCCCTGCACTTTCTGCTTAATTTT 38867122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTTTGCCATGTGTGAGGACAGCAGGTATATGAAAACTCCCTGCACTTTCTGCTTAATTTT 480

 38867123 GCTGTGAACCTAAAGCTGCTCTATATAATAAAGTTTATTAATTAAAAAAACCTCTGTTAC 38867182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GCTGTGAACCTAAAGCTGCTCTATATAATAAAGTTTATTAATTAAAAAAACCTCTGTTAC 540

 38867183 AGCAAAATTGAGTAACAGACACCATATTTTTCCTCCTGCCCCCCCCCCCAAAATTAACAA 38867242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGCAAAATTGAGTAACAGACACCATATTTTTCCTCCTGCCCCCCCCCCCAAAATTAACAA 600

 38867243 AGTATAGAAAACAATGACTCTGAGAAGAGTGAACATTAGACAGTGAGGACATTGTTTCCT 38867302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGTATAGAAAACAATGACTCTGAGAAGAGTGAACATTAGACAGTGAGGACATTGTTTCCT 660

 38867303 GAGAGAGGAAAAAATAATAATAATATGTAACAAATGATTTCCCCAGCTTACTGCTCACAT 38867362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GAGAGAGGAAAAAATAATAATAATATGTAACAAATGATTTCCCCAGCTTACTGCTCACAT 720

 38867363 AGTTTCTAAGCCATGATGCAAAAACAGGGCTAGTTCATGGCAATTTTGACAGGATTCACT 38867422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGTTTCTAAGCCATGATGCAAAAACAGGGCTAGTTCATGGCAATTTTGACAGGATTCACT 780

 38867423 TATGTCACCCCAAATCTCTCAAGTTTTGTCAGTATTCCAGTTCAGTCAGGCAAAGAATGG 38867482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TATGTCACCCCAAATCTCTCAAGTTTTGTCAGTATTCCAGTTCAGTCAGGCAAAGAATGG 840

 38867483 CTGAGTAAACAAGAAGCTTTGTTATTTCTTTCAGTGTTGGTTTCTATACCTCAAAATACC 38867542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTGAGTAAACAAGAAGCTTTGTTATTTCTTTCAGTGTTGGTTTCTATACCTCAAAATACC 900

 38867543 TCAGTAAATCTCAAGTAGAATAAATTGAAATAAGATAAACACAAATAATCTTAACACATT 38867602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TCAGTAAATCTCAAGTAGAATAAATTGAAATAAGATAAACACAAATAATCTTAACACATT 960

 38867603 ATAGTTAAGTTGAATGCCACAGACAAAGGAAATATTTTGAAAGCAACAAGATGAAAACAA 38867662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATAGTTAAGTTGAATGCCACAGACAAAGGAAATATTTTGAAAGCAACAAGATGAAAACAA 1020

 38867663 CATATATGCAGATGTACAATATCATTAATGACTGTTTTTATGCCAGAAATAAAATAGGCC 38867722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CATATATGCAGATGTACAATATCATTAATGACTGTTTTTATGCCAGAAATAAAATAGGCC 1080

 38867723 AGAAACCAATGCAATGACAAATTGTTTGAATGAAATGTCAGCCAACTATTCTATATTCGG 38867782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AGAAACCAATGCAATGACAAATTGTTTGAATGAAATGTCAGCCAACTATTCTATATTCGG 1140

 38867783 CAAAGCTACTTAAATGAAATGGACCACCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTT 38867842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CAAAGCTACTTAAATGAAATGGACCACCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTT 1200

 38867843 GGGAGGCCAAGGTGGGCAGATCATGAGGTCAAGATATAGAGACCATCCTGGACAACATGG 38867902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GGGAGGCCAAGGTGGGCAGATCATGAGGTCAAGATATAGAGACCATCCTGGACAACATGG 1260

 38867903 TGAAATCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCGCGTGCCTGTA 38867962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGAAATCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCGCGTGCCTGTA 1320

 38867963 GTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGGAGGAGAACCTCTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTG 38868022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGGAGGAGAACCTCTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTG 1380

 38868023 CAGTGAGCAGAGATTGCACCACTACACTCCAGCCTGGTGACAAAGCGAGACACTGTCTCA 38868082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CAGTGAGCAGAGATTGCACCACTACACTCCAGCCTGGTGACAAAGCGAGACACTGTCTCA 1440

 38868083 AAAATATATATATATATATAATAAAAATAAGATGAAATACAGACATCCTCAGATGAACAA 38868142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AAAATATATATATATATATAATAAAAATAAGATGAAATACAGACATCCTCAGATGAACAA 1500

 38868143 AGACTCGAGTAATTCATGGCTAGCAGGCATGACTTAAAGGAAAAACTAACGGAAACCCTG 38868202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AGACTCGAGTAATTCATGGCTAGCAGGCATGACTTAAAGGAAAAACTAACGGAAACCCTG 1560

 38868203 TAGGCCAAAGGAACGTAACACTAGACAGTAACTCTAACTCTAATTCAAGAGAGAATGTGC 38868262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TAGGCCAAAGGAACGTAACACTAGACAGTAACTCTAACTCTAATTCAAGAGAGAATGTGC 1620

 38868263 AGGAAGCCATAAACAGTAAACATAATAATCTATATTATGTAATTTAATAAAAAATACATT 38868322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AGGAAGCCATAAACAGTAAACATAATAATCTATATTATGTAATTTAATAAAAAATACATT 1680

 38868323 GCTTTAAAAATCCTTTTCTTAAAAATATTATTGTGTAAACATAATTATAATATTATAGTG 38868382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GCTTTAAAAATCCTTTTCTTAAAAATATTATTGTGTAAACATAATTATAATATTATAGTG 1740

 38868383 TTGGATTTATAACATATTTGGTGAAGTAATCGCACAAAGTAAAGAGAAGAAGAAAAGGGT 38868442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TTGGATTTATAACATATTTGGTGAAGTAATCGCACAAAGTAAAGAGAAGAAGAAAAGGGT 1800

 38868443 ATGTAAGTAAATAAAGATATTATATTTTACTGGAATTAAGTTGGTACTATTCTTAAATGG 38868502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ATGTAAGTAAATAAAGATATTATATTTTACTGGAATTAAGTTGGTACTATTCTTAAATGG 1860

 38868503 ATTATGATTAGATGAGATGCATATTGTAATTATTGTAGCAACCACTAAGAAATAATATTA 38868562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ATTATGATTAGATGAGATGCATATTGTAATTATTGTAGCAACCACTAAGAAATAATATTA 1920

 38868563 ACACAAACAACAGAGGAATTAAAATGATAGATTAGAAAAACCATTTATATATCACAAAAT 38868622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ACACAAACAACAGAGGAATTAAAATGATAGATTAGAAAAACCATTTATATATCACAAAAT 1980

 38868623 ATAACAGTAAATGAGAAACAGAGGAATATATTTAAAATGAGCCTGGTTGCAGCGGCTCAC 38868682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ATAACAGTAAATGAGAAACAGAGGAATATATTTAAAATGAGCCTGGTTGCAGCGGCTCAC 2040

 38868683 ACCTGTAATCTTAGCAACTTGGAAGGCCAAGGTAGGAGGAAGTCTTGAGCCCAGGAGTTC 38868742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ACCTGTAATCTTAGCAACTTGGAAGGCCAAGGTAGGAGGAAGTCTTGAGCCCAGGAGTTC 2100

 38868743 AAGATCAGCCTGAGCAACACAGTGAGACCCCCATCTCTACAAAAAGTAGAAATTTGGCAA 38868802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AAGATCAGCCTGAGCAACACAGTGAGACCCCCATCTCTACAAAAAGTAGAAATTTGGCAA 2160

 38868803 GGCATCATGATAGGCACCTGTAGTCCCAGCTACTGATGAAGCTAAGGCAAGAGGATTTCT 38868862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GGCATCATGATAGGCACCTGTAGTCCCAGCTACTGATGAAGCTAAGGCAAGAGGATTTCT 2220

 38868863 TGAGCCTCTGAGGTCAAGGCTACAGTGAGCTATGATCACACCACTGCGCTCCAGCTTTGG 38868922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TGAGCCTCTGAGGTCAAGGCTACAGTGAGCTATGATCACACCACTGCGCTCCAGCTTTGG 2280

 38868923 AGACAGAGCAAGACTCTACAGCAATAAATAAATAAATAGAAAGCAAATAGAAAAATGACA 38868982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AGACAGAGCAAGACTCTACAGCAATAAATAAATAAATAGAAAGCAAATAGAAAAATGACA 2340

 38868983 GGCATAAATCCAACTGTAGCAATACTTAATACATGAAAAGCAAATAAACCAAGCACAACA 38869042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GGCATAAATCCAACTGTAGCAATACTTAATACATGAAAAGCAAATAAACCAAGCACAACA 2400

 38869043 CATAAAAGGAAAGGATTGTCAGATTTGATAGAAACAAGACCCAAGTATACACTGTCTATA 38869102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CATAAAAGGAAAGGATTGTCAGATTTGATAGAAACAAGACCCAAGTATACACTGTCTATA 2460

 38869103 ATAGACACACATTATATTCAAATACATAAATAAATAAAAAGCAAAATGATGTAAAAAAGG 38869162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 ATAGACACACATTATATTCAAATACATAAATAAATAAAAAGCAAAATGATGTAAAAAAGG 2520

 38869163 TAAAGTATGAAATCAGTAACTCTATGACAGCTGAAGTAGCTGTATTAACATTATTTAAAA 38869222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TAAAGTATGAAATCAGTAACTCTATGACAGCTGAAGTAGCTGTATTAACATTATTTAAAA 2580

 38869223 TAGACTTTAATACAAGAAACACTATCAGAGAAGAAAAGCCATATTTCATAATGATAAAAC 38869282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TAGACTTTAATACAAGAAACACTATCAGAGAAGAAAAGCCATATTTCATAATGATAAAAC 2640

 38869283 ATGCCAATTCATCATAAAGATGTAAGAGTTAAAAACATGTATACATTTAATCATAATGCC 38869342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 ATGCCAATTCATCATAAAGATGTAAGAGTTAAAAACATGTATACATTTAATCATAATGCC 2700

 38869343 CCAAAATACCTGAAGCAAAAATGGACAGAACTGAAAAAAGAAATAGACAATTCAAAAATA 38869402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CCAAAATACCTGAAGCAAAAATGGACAGAACTGAAAAAAGAAATAGACAATTCAAAAATA 2760

 38869403 ATAGTTTGAAATTCAAACAACTGACTATCCATAATGACTAGACAGAAGATTAATAAGTAT 38869462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 ATAGTTTGAAATTCAAACAACTGACTATCCATAATGACTAGACAGAAGATTAATAAGTAT 2820

 38869463 ATAGAAGACTTGAGTAACACTATACACCAACAATACTTAACAAATATCTGGAGAACAGTC 38869522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 ATAGAAGACTTGAGTAACACTATACACCAACAATACTTAACAAATATCTGGAGAACAGTC 2880

 38869523 CTCCTGACAGCAGAAGAATACATGTTCTTCTCAAGTACAAAGGAACAGTCTTCAGGATAG 38869582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CTCCTGACAGCAGAAGAATACATGTTCTTCTCAAGTACAAAGGAACAGTCTTCAGGATAG 2940

 38869583 ACTATTTTATGCCATAAAACAACCTCAATAAATATAAAATGATTGAAATCATACAAAGTA 38869642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 ACTATTTTATGCCATAAAACAACCTCAATAAATATAAAATGATTGAAATCATACAAAGTA 3000

 38869643 TATTTATCAACCACAATGGAATCAAATCAGAAATCAATAATGGAGAAATTTGGGGATATG 38869702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TATTTATCAACCACAATGGAATCAAATCAGAAATCAATAATGGAGAAATTTGGGGATATG 3060

 38869703 AACAAAATGTGGAAATTAATCAATACCCTCTATATAGCCAATGAGTCAAAGAAGAAATCA 38869762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 AACAAAATGTGGAAATTAATCAATACCCTCTATATAGCCAATGAGTCAAAGAAGAAATCA 3120

 38869763 CAAGGAAAATTAGAGTGAAATTAAAAATCAATAGATCCCAACATTTTGGAAGGCCAAGAT 38869822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 CAAGGAAAATTAGAGTGAAATTAAAAATCAATAGATCCCAACATTTTGGAAGGCCAAGAT 3180

 38869823 GGGAGGATCACTCCTGGGTAACATAGTGAGAGCCAATAAAAAAATTAGCCAGGGATGGTG 38869882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 GGGAGGATCACTCCTGGGTAACATAGTGAGAGCCAATAAAAAAATTAGCCAGGGATGGTG 3240

 38869883 GTGAGTGTCAGTAGTTCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGCAGGATCACTTGAGCCCAG 38869942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 GTGAGTGTCAGTAGTTCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGCAGGATCACTTGAGCCCAG 3300

 38869943 AAGGTCAACATTGCAGTGAGCCTTGTTTGTACCACTGCACTCCAGCCTAGGCGAGACTGA 38870002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 AAGGTCAACATTGCAGTGAGCCTTGTTTGTACCACTGCACTCCAGCCTAGGCGAGACTGA 3360

 38870003 GACCCTGTTTCAA 38870015
          |||||||||||||
     3361 GACCCTGTTTCAA 3373

EXCISED REGION

 38870016 AAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAGTGAAAATAAAAATAAATGAAAC 38870075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3382 AAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAGTGAAAATAAAAATAAATGAAAC 3441

 38870076 CAAAGTTCACTCTAAAAAAAAAGTCAACAAAGTTGATAAATATGTAGCTAAATTAAACAA 38870135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3442 CAAAGTTCACTCTAAAAAAAAAGTCAACAAAGTTGATAAATATGTAGCTAAATTAAACAA 3501

 38870136 GAAAGTGAGAGACGAAATCAGAAAAGGAAGTAGGTAACATCACTTCCAAAATCTCCAAAA 38870195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3502 GAAAGTGAGAGACGAAATCAGAAAAGGAAGTAGGTAACATCACTTCCAAAATCTCCAAAA 3561

 38870196 TTTAAAAATGTTTTGAAGATGATGAACAACTTTATGAAAACAATCAAGATAATGTACACG 38870255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3562 TTTAAAAATGTTTTGAAGATGATGAACAACTTTATGAAAACAATCAAGATAATGTACACG 3621

 38870256 AAATTTTATATTTTAATTCCAAAAGCAACCACTAGAAAAAATAACTCAAAACAATAATGT 38870315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3622 AAATTTTATATTTTAATTCCAAAAGCAACCACTAGAAAAAATAACTCAAAACAATAATGT 3681

 38870316 AAAAATCAACAGAAGATGGCCGGGCACGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTTTG 38870375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3682 AAAAATCAACAGAAGATGGCCGGGCACGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTTTG 3741

 38870376 TTAAATGTTGTTTAATGTATTATGTTAAATCTTCTGGGTTTTTTTTTGTTGTTGTTGTTT 38870435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3742 TTAAATGTTGTTTAATGTATTATGTTAAATCTTCTGGGTTTTTTTTTGTTGTTGTTGTTT 3801

 38870436 TGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGTCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTCGGCTCACT 38870495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3802 TGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGTCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTCGGCTCACT 3861

 38870496 GCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGCAGATCACG 38870547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3862 GCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGCAGATCACG 3913

Alignment time is 3.24132 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38854779,38878343] =>     23565 nucs '18 dna:chromosome chromosome:GRCh37:18:1:78077248:1'
Second seq [       1,    5543] =>      5543 nucs 'mol-32-2dff-012222_5543'

Score:        5532
Aligned:      5543        nucs
Identic:      5542 (100%) nucs =>      4866 (100%)       676 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38859286,38864152] EXCISED REGION [38864250,38864925]
 second seq =>  [       1,    4867] EXCISED REGION [    4868,    5543]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        97 nucs [38864153,38864249]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        50 nucs [38864153,38864202] to [38864250,38864299]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>        12 nucs [38864153,38864164] to [38864238,38864249]
 second seq =>         0 nucs

 38859286 CACGCCTGTAGTCCCAGCACTTTGGCAGGCCAAGGTGGGAGGATCGCTTGAGCCCAGAAG 38859345
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CACGCCTGTAGTCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGAGGATCGCTTGAGCCCAGAAG 60

 38859346 TTTGAGGCTGCAGTGAGCTATGATTGTACTACTGCAATTCAGCTTGGGAGACAGAGTCAG 38859405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTGAGGCTGCAGTGAGCTATGATTGTACTACTGCAATTCAGCTTGGGAGACAGAGTCAG 120

 38859406 AAATTGCCTCTGAAAAAAATAATAAAAATAAAAAATATAATTACACATGTGGCTAGGAGT 38859465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAATTGCCTCTGAAAAAAATAATAAAAATAAAAAATATAATTACACATGTGGCTAGGAGT 180

 38859466 GGCTTATATTGTATTTCTTTTAAACAGTGCTGCTTTAGGTTCTGAAAAATTTCTTTTATT 38859525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGCTTATATTGTATTTCTTTTAAACAGTGCTGCTTTAGGTTCTGAAAAATTTCTTTTATT 240

 38859526 TTCAAGATCTGAGAATGTACCAGTGTCTGAAAACTGTGCTCCATACTCTTCTTCAGACTA 38859585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTCAAGATCTGAGAATGTACCAGTGTCTGAAAACTGTGCTCCATACTCTTCTTCAGACTA 300

 38859586 CAATTTTCCCCTCTACAGTATCTACCATTTAAATACTAAGATCCACGCAATAAAGAGTAT 38859645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CAATTTTCCCCTCTACAGTATCTACCATTTAAATACTAAGATCCACGCAATAAAGAGTAT 360

 38859646 AATCTTAGGATCTATGAGTTCAGACATTGAGAATAACCGTAAGCCCATAATAAATCAGAG 38859705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AATCTTAGGATCTATGAGTTCAGACATTGAGAATAACCGTAAGCCCATAATAAATCAGAG 420

 38859706 GTTTTGATGCTGAATGATTGAGTTACATCATTGCCATTAACAAGTAACAAAGTAGGAGCA 38859765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTTTTGATGCTGAATGATTGAGTTACATCATTGCCATTAACAAGTAACAAAGTAGGAGCA 480

 38859766 GAAGAGAAATTGAGATTGAAGACAAGCTGTTAGCTTTTAAACAAGATGAATTTGGAAAAG 38859825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GAAGAGAAATTGAGATTGAAGACAAGCTGTTAGCTTTTAAACAAGATGAATTTGGAAAAG 540

 38859826 TGGATATGCGCAGCAAGCATTTGGATTAAGAAAATCAAAATGCAGATAAAAGTTTCAAAT 38859885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGGATATGCGCAGCAAGCATTTGGATTAAGAAAATCAAAATGCAGATAAAAGTTTCAAAT 600

 38859886 TGTGATTTAGGATGTGGAGTCATTCACATTTGGCATATGTTGGAAAACCATCTAATTGAA 38859945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGTGATTTAGGATGTGGAGTCATTCACATTTGGCATATGTTGGAAAACCATCTAATTGAA 660

 38859946 TTGATTTTAAAATATTCTATCATTAAATTTTGCAAAATTTATTTGGACTAAATTGTATTC 38860005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTGATTTTAAAATATTCTATCATTAAATTTTGCAAAATTTATTTGGACTAAATTGTATTC 720

 38860006 AAAATAATGTATTTAATGCTATGATGATGTTAATATATCCATGTCTATACACATTCTTAT 38860065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAAATAATGTATTTAATGCTATGATGATGTTAATATATCCATGTCTATACACATTCTTAT 780

 38860066 TGAGTTGTAAAATAAACAATAAACAAATAAAATATGTTTATCTCCACTATCAACCTAAAA 38860125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGAGTTGTAAAATAAACAATAAACAAATAAAATATGTTTATCTCCACTATCAACCTAAAA 840

 38860126 AAAAAAACACAATATGTATACATTTAGAAAAGGAGAGGAGACTTTTTTAATTTTTACAAA 38860185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAAAAAACACAATATGTATACATTTAGAAAAGGAGAGGAGACTTTTTTAATTTTTACAAA 900

 38860186 GGGTTACAGCCTGCAAGGTGGCCATACCATAGGCAAGGAAGCATGCCTCCAGCAAAAACC 38860245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GGGTTACAGCCTGCAAGGTGGCCATACCATAGGCAAGGAAGCATGCCTCCAGCAAAAACC 960

 38860246 AGGAACAGGCACTTTGAAGGAGGAAGGTTTGAGCTAGGAGTTTTATGCTGAACAGGTTTG 38860305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AGGAACAGGCACTTTGAAGGAGGAAGGTTTGAGCTAGGAGTTTTATGCTGAACAGGTTTG 1020

 38860306 CTAAACACACATATTCAACAGGTGACAGGAGGGGCTATGAATATTCATGAAGTTTGTCCC 38860365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTAAACACACATATTCAACAGGTGACAGGAGGGGCTATGAATATTCATGAAGTTTGTCCC 1080

 38860366 GACAACCTTCATGTATGTAACATATGACTCACGTTCACCTTGGGGTGGAAACTTAACATT 38860425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GACAACCTTCATGTATGTAACATATGACTCACGTTCACCTTGGGGTGGAAACTTAACATT 1140

 38860426 TAAATGTGTTACAATTAGGTCCTATGTGTCAAAAAGTCTTTTCAGAACTTGAGATCATGC 38860485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TAAATGTGTTACAATTAGGTCCTATGTGTCAAAAAGTCTTTTCAGAACTTGAGATCATGC 1200

 38860486 AAGTGTGCAATTTCTATAAACCTGCCAAAAGCAGTCCATGGTCGGGTTGGTGATCTTCTT 38860545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AAGTGTGCAATTTCTATAAACCTGCCAAAAGCAGTCCATGGTCGGGTTGGTGATCTTCTT 1260

 38860546 ATCAGGAGAAAGTTACTGAAATCAGTCTCTTGTCCAATGAAAGCTATAGTTATGGCTGGC 38860605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATCAGGAGAAAGTTACTGAAATCAGTCTCTTGTCCAATGAAAGCTATAGTTATGGCTGGC 1320

 38860606 GTTCAATTAGTCAGTGCCTGTGAGCTGGATAAGTTGTAATTGTTTTAAAATTGCTTATCT 38860665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GTTCAATTAGTCAGTGCCTGTGAGCTGGATAAGTTGTAATTGTTTTAAAATTGCTTATCT 1380

 38860666 TCAGACCAATGCTTGTGTAGCTGTTAGAGAAAAAGAAAAATCTTGTGGCAATTAGAACAT 38860725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TCAGACCAATGCTTGTGTAGCTGTTAGAGAAAAAGAAAAATCTTGTGGCAATTAGAACAT 1440

 38860726 AGTTTATTCTTTAAGTGTAGGTGTGCATGACTTAATCCTTGCCTGGCATGGCCTTAGGTC 38860785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AGTTTATTCTTTAAGTGTAGGTGTGCATGACTTAATCCTTGCCTGGCATGGCCTTAGGTC 1500

 38860786 CTGTTTATAATTTGGTATCTTATGTCACAATGAATCTATCCTGTCAGAGTTATAACCTCT 38860845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CTGTTTATAATTTGGTATCTTATGTCACAATGAATCTATCCTGTCAGAGTTATAACCTCT 1560

 38860846 ATTTATTTTTTATTTTTTATTTTTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCTCCCAGCCTGGA 38860905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ATTTATTTTTTATTTTTTATTTTTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCTCCCAGCCTGGA 1620

 38860906 GTGCAGTGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCC 38860965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GTGCAGTGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCC 1680

 38860966 TGCCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGGACTACAGGCACTCGCCACCACGCCTGGCTAATTTT 38861025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TGCCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGGACTACAGGCACTCGCCACCACGCCTGGCTAATTTT 1740

 38861026 TTTGTATCTTTAGTGGAGACGGGGTTTCACGGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTC 38861085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TTTGTATCTTTAGTGGAGACGGGGTTTCACGGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTC 1800

 38861086 ACCTTGTTATCCGCCCGCCGTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAGAGGCGTGAGCCACCG 38861145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ACCTTGTTATCCGCCCGCCGTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAGAGGCGTGAGCCACCG 1860

 38861146 CGCCCGGCCATGATCTCTATTTTAATATTAATGTTGATCAGTTGTTGTGTCTAAATCTAA 38861205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CGCCCGGCCATGATCTCTATTTTAATATTAATGTTGATCAGTTGTTGTGTCTAAATCTAA 1920

 38861206 AAGAGAGGGATATAATGAAGCATGTCTGAACTCCCTTCCAGTCATGTCTGGGAACTCAGT 38861265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AAGAGAGGGATATAATGAAGCATGTCTGAACTCCCTTCCAGTCATGTCTGGGAACTCAGT 1980

 38861266 TTTCAGGTTTTTCTGGGGTTCCCTTTGACAAGAGAGGGATCTGTTCAGTTGGAGGGAGGC 38861325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TTTCAGGTTTTTCTGGGGTTCCCTTTGACAAGAGAGGGATCTGTTCAGTTGGAGGGAGGC 2040

 38861326 TTAGGATTTTATTTTAAGTTTACATCAGATATGCCCATGATGTATGCTATTATTTTTAAA 38861385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TTAGGATTTTATTTTAAGTTTACATCAGATATGCCCATGATGTATGCTATTATTTTTAAA 2100

 38861386 AAGTATGACTTTACATCCTCCTATCCAATCACAATGTTCTTTCCTCATTTTTCAATTACT 38861445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AAGTATGACTTTACATCCTCCTATCCAATCACAATGTTCTTTCCTCATTTTTCAATTACT 2160

 38861446 TGATCAGACTTAATTTCACATGTACTTGACAGATATTGTCATTATAGATACATACATAAG 38861505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TGATCAGACTTAATTTCACATGTACTTGACAGATATTGTCATTATAGATACATACATAAG 2220

 38861506 AAGGTTATGATTAGAAGAGATATCCAAAACATCTACTTGGTTGAACATTTTACATATCAC 38861565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AAGGTTATGATTAGAAGAGATATCCAAAACATCTACTTGGTTGAACATTTTACATATCAC 2280

 38861566 GTTCTTAATAATTTATTGCTAAATTAATAAATTCTTTACTGCAGAATAGGAAAGTTACAG 38861625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GTTCTTAATAATTTATTGCTAAATTAATAAATTCTTTACTGCAGAATAGGAAAGTTACAG 2340

 38861626 AGTTTCAGAAAAAAGAAATATGTAATCTAATCATAGCCAAATTTGCTCCAGTCTCACAGC 38861685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AGTTTCAGAAAAAAGAAATATGTAATCTAATCATAGCCAAATTTGCTCCAGTCTCACAGC 2400

 38861686 ACTGTGTAATCAGTTCAGTATGCACAAAAATAATCCATTATTTCTTTCATCCCAGAGCAG 38861745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ACTGTGTAATCAGTTCAGTATGCACAAAAATAATCCATTATTTCTTTCATCCCAGAGCAG 2460

 38861746 AATAATTTATGTTGGGATGGGTGATGTATGCTAGTGAAAAAGAAGGTAATCCACATAGTT 38861805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AATAATTTATGTTGGGATGGGTGATGTATGCTAGTGAAAAAGAAGGTAATCCACATAGTT 2520

 38861806 CTTGGGAACGACCAGAAAAATCCAAATGCAGAGAATCCAGAGGTAAAAATAATAGTAACA 38861865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CTTGGGAACGACCAGAAAAATCCAAATGCAGAGAATCCAGAGGTAAAAATAATAGTAACA 2580

 38861866 TGAAGAATAGCAAAGACTGCAAGTTTCCAGTCTTGTATATTGTTTCAGAAAAACTCTCAT 38861925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TGAAGAATAGCAAAGACTGCAAGTTTCCAGTCTTGTATATTGTTTCAGAAAAACTCTCAT 2640

 38861926 ACCATGTTTTTCCTCTGCTCTTCTATTAGCACAACAATCAACACAGAAGACTTCTGTGAC 38861985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 ACCATGTTTTTCCTCTGCTCTTCTATTAGCACAACAATCAACACAGAAGACTTCTGTGAC 2700

 38861986 CCCAAAATATGTGGGGACTCCTCCCCACAAGCAAGCAAACAATCAGTTCTGCAGCAGACA 38862045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CCCAAAATATGTGGGGACTCCTCCCCACAAGCAAGCAAACAATCAGTTCTGCAGCAGACA 2760

 38862046 TCAGCTGGGTGCCCTCTGATTCAATTCTGACACTAACTTCCTAAAGATAGCATCAGATCC 38862105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TCAGCTGGGTGCCCTCTGATTCAATTCTGACACTAACTTCCTAAAGATAGCATCAGATCC 2820

 38862106 CACAGGCTGAGGGCTCAGTCCCCAAGACTAACCCACTTAGACGTCAGTCACCAGTCCAGG 38862165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CACAGGCTGAGGGCTCAGTCCCCAAGACTAACCCACTTAGACGTCAGTCACCAGTCCAGG 2880

 38862166 CCTTCGGAACTTCTGACCAAACAGCTTCAAGTTGTGGTTCCCACAACTTCTACTTTGGGT 38862225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CCTTCGGAACTTCTGACCAAACAGCTTCAAGTTGTGGTTCCCACAACTTCTACTTTGGGT 2940

 38862226 TTGATTAGTTTACTGGAGTGGCTCACAGAACTATAGGAAACTGGAAACATTTAGGTTTGC 38862285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TTGATTAGTTTACTGGAGTGGCTCACAGAACTATAGGAAACTGGAAACATTTAGGTTTGC 3000

 38862286 CAGTTTATTATAAAGGATGTTACAAAGAATACAGATAAACAGATGCATAGGGTGAGGTAC 38862345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CAGTTTATTATAAAGGATGTTACAAAGAATACAGATAAACAGATGCATAGGGTGAGGTAC 3060

 38862346 TCGGGAAAGGTGCAGAGCTTCCATGCCCTTCCTGGCTACACCACTCTCCAGGAACCTCCA 38862405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TCGGGAAAGGTGCAGAGCTTCCATGCCCTTCCTGGCTACACCACTCTCCAGGAACCTCCA 3120

 38862406 TGTGTTCAACTATTCGGAAGCTCTCTGAACCCTGTCCTATAGGGGTTTTATGGAAACTTC 38862465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TGTGTTCAACTATTCGGAAGCTCTCTGAACCCTGTCCTATAGGGGTTTTATGGAAACTTC 3180

 38862466 ATGACATCAGCATTCCTTACTGCAGGGTATGAGGCGGGACCCTTTCTGGAATGAGGGTCT 38862525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 ATGACATCAGCATTCCTTACTGCAGGGTATGAGGCGGGACCCTTTCTGGAATGAGGGTCT 3240

 38862526 TATGACCCACAGTCAGAAAGGCAGAAGAAGATTAGAGTCCTGCCTTGGGATAAGTAAAAG 38862585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TATGACCCACAGTCAGAAAGGCAGAAGAAGATTAGAGTCCTGCCTTGGGATAAGTAAAAG 3300

 38862586 GAGGGCAGGAGAAAGTCAGAGAGATTTTTTTCCTGAGGTCTGCTTCTGAGTCCTGACATA 38862645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 GAGGGCAGGAGAAAGTCAGAGAGATTTTTTTCCTGAGGTCTGCTTCTGAGTCCTGACATA 3360

 38862646 TCTAGCATTATAACAAAAGATAGTAACGAGGATTATGGGAGTTATGAGGCAGGAAGCTTG 38862705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TCTAGCATTATAACAAAAGATAGTAACGAGGATTATGGGAGTTATGAGGCAGGAAGCTTG 3420

 38862706 GACAAAAATCTACATATATAAATTTGTGGGATACAGCAAAAGCAGTGCTTAGGGAGAAAT 38862765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 GACAAAAATCTACATATATAAATTTGTGGGATACAGCAAAAGCAGTGCTTAGGGAGAAAT 3480

 38862766 TTAAAACATGATTACATGTATTTGAAAATAAGAAAGATCTGGCTGGGCATGGTGGCTCAT 38862825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TTAAAACATGATTACATGTATTTGAAAATAAGAAAGATCTGGCTGGGCATGGTGGCTCAT 3540

 38862826 GCCTGTAATCCCAGAACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGCAGATCACCTGAGGTCAGGAGTTC 38862885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 GCCTGTAATCCCAGAACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGCAGATCACCTGAGGTCAGGAGTTC 3600

 38862886 GAGACCAGACTGATCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCA 38862945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 GAGACCAGACTGATCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCA 3660

 38862946 GGCGTGGTGGCATGACTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGACAGGAGAATTGCTTG 38863005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 GGCGTGGTGGCATGACTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGACAGGAGAATTGCTTG 3720

 38863006 AACCTGGGAGGCAGAGATTGCAGTGAGCCAAGATTGGGACACTGCACTCCAGCCTGGGTG 38863065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 AACCTGGGAGGCAGAGATTGCAGTGAGCCAAGATTGGGACACTGCACTCCAGCCTGGGTG 3780

 38863066 ACAGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAGAAAGAAAAGAAAGATCTAATACTAGTAA 38863125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 ACAGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAGAAAGAAAAGAAAGATCTAATACTAGTAA 3840

 38863126 TCTGTTTCCACTTTAGAACACTATAAAAAAGAGCAAATAATATGCAAAGTAAGAAGAATG 38863185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 TCTGTTTCCACTTTAGAACACTATAAAAAAGAGCAAATAATATGCAAAGTAAGAAGAATG 3900

 38863186 AAAGATATCATAAAAATAGAGCAAAAATTAAAGGAATTTAAAATAGAAAATTGATTTTAT 38863245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 AAAGATATCATAAAAATAGAGCAAAAATTAAAGGAATTTAAAATAGAAAATTGATTTTAT 3960

 38863246 AAAATCAGTTAAACCAAAAGCCAATTTTCTAAAAGGGTCAATAAAATTGATAAGCCTCTA 38863305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 AAAATCAGTTAAACCAAAAGCCAATTTTCTAAAAGGGTCAATAAAATTGATAAGCCTCTA 4020

 38863306 GCCAGGGTGGCTAAGACACAAAGAGGAAAAACACAAATTGCTAAGATCAGCAGTGAAAGA 38863365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 GCCAGGGTGGCTAAGACACAAAGAGGAAAAACACAAATTGCTAAGATCAGCAGTGAAAGA 4080

 38863366 GGGGACATCACTGCAGATCACATGGACATTAAAAGGAAAATAAATGAAGATTATGAACAA 38863425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 GGGGACATCACTGCAGATCACATGGACATTAAAAGGAAAATAAATGAAGATTATGAACAA 4140

 38863426 ACCTGTGCCCACACGTCTGATAACTTTGATGAAATGGACTAATTCCTTAAAAGGTCTAAT 38863485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 ACCTGTGCCCACACGTCTGATAACTTTGATGAAATGGACTAATTCCTTAAAAGGTCTAAT 4200

 38863486 CTTTTAAAACTCACACAAGAAGAAATAGAAAATATGAATAGGACTACATCTATTTTTAAA 38863545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 CTTTTAAAACTCACACAAGAAGAAATAGAAAATATGAATAGGACTACATCTATTTTTAAA 4260

 38863546 TTAATTAATAACCTCATAAAAATAAAGCATCAGGCTCAGCTAAGGAAGAAATTATGTTAA 38863605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 TTAATTAATAACCTCATAAAAATAAAGCATCAGGCTCAGCTAAGGAAGAAATTATGTTAA 4320

 38863606 TTCTCTCCCAGAAGATAGAAACAGAGGACATACTTCCTAACTCATTCTATGAGGCCAGCA 38863665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 TTCTCTCCCAGAAGATAGAAACAGAGGACATACTTCCTAACTCATTCTATGAGGCCAGCA 4380

 38863666 TGGCTCTAATGCCGAAGCCAGACAAAAAGATTATAAGAAAAAACAAACAAAACTACAGAT 38863725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 TGGCTCTAATGCCGAAGCCAGACAAAAAGATTATAAGAAAAAACAAACAAAACTACAGAT 4440

 38863726 CTATATATCTCAAAAACATTGGTGCAAAAATCCTCAACCAAATATTAGCAAATCAAATTC 38863785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 CTATATATCTCAAAAACATTGGTGCAAAAATCCTCAACCAAATATTAGCAAATCAAATTC 4500

 38863786 AGCAATGTGTAAAGTGATTTACACACTATGACCAAGTGGGATTTATCTCAAGTGTTTAAG 38863845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 AGCAATGTGTAAAGTGATTTACACACTATGACCAAGTGGGATTTATCTCAAGTGTTTAAG 4560

 38863846 TCTGGTTCAATGTTTGACAATTAATTAATGTAATCACCTGGTTAAAGAAGGAAAATTACA 38863905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 TCTGGTTCAATGTTTGACAATTAATTAATGTAATCACCTGGTTAAAGAAGGAAAATTACA 4620

 38863906 TGATCTTATCAATAGATGCAGGAAAAAGCATTTGACAAAATCTAACACCACCCATTCTTA 38863965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 TGATCTTATCAATAGATGCAGGAAAAAGCATTTGACAAAATCTAACACCACCCATTCTTA 4680

 38863966 AAACAAAATGTCTCTCAGAAAACTAGCAATACAGGGAAATATCCTCAACTTGGTAAAGAA 38864025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 AAACAAAATGTCTCTCAGAAAACTAGCAATACAGGGAAATATCCTCAACTTGGTAAAGAA 4740

 38864026 CATTTTAAGAAATCATAGTTAATAATGAGAAACTTGAAACTTCTTCACTACCATCGGGAA 38864085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 CATTTTAAGAAATCATAGTTAATAATGAGAAACTTGAAACTTCTTCACTACCATCGGGAA 4800

 38864086 AACAGCAAGTATACTACCTCTCACCAGTGCTTTTCGACTTGATATCAAAAGTACTAGCTA 38864145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 AACAGCAAGTATACTACCTCTCACCAGTGCTTTTCGACTTGATATCAAAAGTACTAGCTA 4860

 38864146 ATGCAGT 38864152
          |||||||
     4861 ATGCAGT 4867

EXCISED REGION

 38864250 AAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAAGAAAGAAAG 38864309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4868 AAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAAGAAAGAAAG 4927

 38864310 AAAGAAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAATACAGATT 38864369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4928 AAAGAAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAATACAGATT 4987

 38864370 GGGAAGAAAAAATAAAATTGTGTTTGTTCACACATGACATGATTGTGTAGAAAATCCAAA 38864429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4988 GGGAAGAAAAAATAAAATTGTGTTTGTTCACACATGACATGATTGTGTAGAAAATCCAAA 5047

 38864430 AGAATCAACAAAAAAGCTTCCTGAAATTAACAAATAATTACAGCAAGTTTGCTGGAAATG 38864489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5048 AGAATCAACAAAAAAGCTTCCTGAAATTAACAAATAATTACAGCAAGTTTGCTGGAAATG 5107

 38864490 AAGTTCATATACAAAATTGAATTACTTTTCCATATATCCACAATCAACAAATGGAATTTG 38864549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5108 AAGTTCATATACAAAATTGAATTACTTTTCCATATATCCACAATCAACAAATGGAATTTG 5167

 38864550 AAATTAAAAACACATTATCATTTATATTAGCATCCTCAAAATGTAATATTTCTGCATAAA 38864609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5168 AAATTAAAAACACATTATCATTTATATTAGCATCCTCAAAATGTAATATTTCTGCATAAA 5227

 38864610 TTTAACAAAATATGTATATAATTTATATGAGGAGAACTACAAAATTCTGAAGAAATATGT 38864669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5228 TTTAACAAAATATGTATATAATTTATATGAGGAGAACTACAAAATTCTGAAGAAATATGT 5287

 38864670 CAAAGACTAAATAAATGGAAAGATATCTCAGGTTCATGGGTAGAAAGACTCAATATTGTT 38864729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5288 CAAAGACTAAATAAATGGAAAGATATCTCAGGTTCATGGGTAGAAAGACTCAATATTGTT 5347

 38864730 GAAATGTTAATTCTTCCCAACTTAATCTATAGATTCAATGTAATTACAATCAAAAATGAA 38864789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5348 GAAATGTTAATTCTTCCCAACTTAATCTATAGATTCAATGTAATTACAATCAAAAATGAA 5407

 38864790 AGTAAGTTTTGTGTGTGTTTGTGTGAATCTTGACAAACTGATTTTAAAGTTCATATGGAG 38864849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5408 AGTAAGTTTTGTGTGTGTTTGTGTGAATCTTGACAAACTGATTTTAAAGTTCATATGGAG 5467

 38864850 AGGAAAATGACCCAGAATAGCCACCACAATGTTGAGGGAGAACAAAGTGAGAAGACAGCA 38864909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5468 AGGAAAATGACCCAGAATAGCCACCACAATGTTGAGGGAGAACAAAGTGAGAAGACAGCA 5527

 38864910 CTACCCAACTTCAAGA 38864925
          ||||||||||||||||
     5528 CTACCCAACTTCAAGA 5543

Alignment time is 4.55719 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38854779,38878343] =>     23565 nucs '18 dna:chromosome chromosome:GRCh37:18:1:78077248:1'
Second seq [       1,    8449] =>      8449 nucs 'mol-32-2e0a-018263_8449'

Score:        8060
Aligned:      8445        nucs
Identic:      8401 ( 99%) nucs =>       407 ( 99%)      7994 (100%)
Gaps:           16 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38864372,38864779] EXCISED REGION [38868344,38876375]
 second seq =>  [       1,     412] EXCISED REGION [     428,    8449]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3564 nucs [38864780,38868343]
 second seq =>        15 nucs [413,427]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 38864372 GAAGAAAAAATAAAATTGTGTTTGTTCACACATGACATGATTGT----GTAGAAAATCCA 38864427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||
        1 GAAGAAAAAATAAAATTGTGTTTGTTCACACATGACATGATTGTCTGTGTAGAAAATCCA 60

 38864428 AAAGAATCAACAAAAAAGCTTCCTGAAATTAACAAATAATTACAGCAAGTTTGCTGGAAA 38864487
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAAGAATCAACAAAAAAGCCTCCTGAAATTAACAAATAATTACAGCAAGTTTGCTGGAAA 120

 38864488 TGAAGTTCATATACAAAATTGAATTACTTTTCCATATATCCACAATCAACAAATGGAATT 38864547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGAAGTTCATATACAAAATTGAATTACTTTTCCATATATCCACAATCAACAAATGGAATT 180

 38864548 TGAAATTAAAAACACATTATCATTTATATTAGCATCCTCAAAATGTAATATTTCTGCATA 38864607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGAAATTAAAAACACATTATCATTTATATTAGCATCCTCAAAATGTAATATTTCTGCATA 240

 38864608 AATTTAACAAAATATGTATATAATTTATATGAGGAGAACTACAAAATTCTGAAGAAATAT 38864667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AATTTAACAAAATATGTATATAATTTATATGAGGAGAACTACAAAATTCTGAAGAAATAT 300

 38864668 GTCAAAGACTAAATAAATGGAAAGATATCTCAGGTTCATGGGTAGAAAGACTCAATATTG 38864727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTCAAAGACTAAATAAATGGAAAGATATCTCAGGTTCATGGGTAGAAAGACTCAATATTG 360

 38864728 TTGAAATGTTAATTCTTCCCAACTTAATCTATAGATTCAATGTAATTACAAT 38864779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTGAAATGTTAATTCTTCCCAACTTAATCTATAGATTCAATGTAATTACAAT 412

EXCISED REGION

 38868344 AAAATATTATTGTGTAAACATAATTATAATATTATAGTGTTGGATTTATAACATATTTGG 38868403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      428 AAAATATTATTGTGTAAACATAATTATAATATTATAGTGTTGGATTTATAACATATTTGG 487

 38868404 TGAAGTAATCGCACAAAGTAAAGAGAAGAAGAAAAGGGTATGTAAGTAAATAAAGATATT 38868463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      488 TGAAGTAATCGCACAAAGTAAAGAGAAGAAGAAAAGGGTATGTAAGTAAATAAAGATATT 547

 38868464 ATATTTTACTGGAATTAAGTTGGTACTATTCTTAAATGGATTATGATTAGATGAGATGCA 38868523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      548 ATATTTTACTGGAATTAAGTTGGTACTATTCTTAAATGGATTATGATTAGATGAGATGCA 607

 38868524 TATTGTAATTATTGTAGCAACCACTAAGAAATAATATTAACACAAACAACAGAGGAATTA 38868583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      608 TATTGTAATTATTGTAGCAACCACTAAGAAATAATATTAACACAAACAACAGAGGAATTA 667

 38868584 AAATGATAGATTAGAAAAACCATTTATATATCACAAAATATAACAGTAAATGAGAAACAG 38868643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      668 AAATGATAGATTAGAAAAACCATTTATATATCACAAAATATAACAGTAAATGAGAAACAG 727

 38868644 AGGAATATATTTAAAATGAGCCTGGTTGCAGCGGCTCACACCTGTAATCTTAGCAACTTG 38868703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      728 AGGAATATATTTAAAATGAGCCTGGTTGCAGCGGCTCACACCTGTAATCTTAGCAACTTG 787

 38868704 GAAGGCCAAGGTAGGAGGAAGTCTTGAGCCCAGGAGTTCAAGATCAGCCTGAGCAACACA 38868763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      788 GAAGGCCAAGGTAGGAGGAAGTCTTGAGCCCAGGAGTTCAAGATCAGCCTGAGCAACACA 847

 38868764 GTGAGACCCCCATCTCTACAAAAAGTAGAAATTTGGCAAGGCATCATGATAGGCACCTGT 38868823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      848 GTGAGACCCCCATCTCTACAAAAAGTAGAAATTTGGCAAGGCATCATGATAGGCACCTGT 907

 38868824 AGTCCCAGCTACTGATGAAGCTAAGGCAAGAGGATTTCTTGAGCCTCTGAGGTCAAGGCT 38868883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      908 AGTCCCAGCTACTGATGAAGCTAAGGCAAGAGGATTTCTTGAGCCTCTGAGGTCAAGGCT 967

 38868884 ACAGTGAGCTATGATCACACCACTGCGCTCCAGCTTTGGAGACAGAGCAAGACTCTACAG 38868943
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
      968 ACAGTGAGCTATGATCACACCACTGCACTCCAGCTTTGGAGACAGAGCAAGACTCTACAG 1027

 38868944 CAATAAATAAATAAATAGAAAGCAAATAGAAAAATGACAGGCATAAATCCAACTGTAGCA 38869003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1028 CAATAAATAAATAAATAGAAAGCAAATAGAAAAATGACAGGCATAAATCCAACTGTAGCA 1087

 38869004 ATACTTAATACATGAAAAGCAAATAAACCAAGCACAACACATAAAAGGAAAGGATTGTCA 38869063
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     1088 ATACTTAATACATGAAAAGCAAATAAACCAAGCACAACACATAAAAGGAAAGGTTTGTCA 1147

 38869064 GATTTGATAGAAACAAGACCCAAGTATACACTGTCTATAATAGACACACATTATATTCAA 38869123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1148 GATTTGATAGAAACAAGACCCAAGTATACACTGTCTATAATAGACACACATTATATTCAA 1207

 38869124 ATACATAAATAAATAAAAAGCAAAATGATGTAAAAAAGGTAAAGTATGAAATCAGTAACT 38869183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1208 ATACATAAATAAATAAAAAGCAAAATGATGTAAAAAAGGTAAAGTATGAAATCAGTAACT 1267

 38869184 CTATGACAGCTGAAGTAGCTGTATTAACATTATTTAAAATAGACTTTAATACAAGAAACA 38869243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1268 CTATGACAGCTGAAGTAGCTGTATTAACATTATTTAAAATAGACTTTAATACAAGAAACA 1327

 38869244 CTATCAGAGAAGAAAAGCCATATTTCATAATGATAAAACATGCCAATTCATCATAAAGAT 38869303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1328 CTATCAGAGAAGAAAAGCCATATTTCATAATGATAAAACATGCCAATTCATCATAAAGAT 1387

 38869304 GTAAGAGTTAAAAACATGTATACATTTAATCATAATGCCCCAAAATACCTGAAGCAAAAA 38869363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1388 GTAAGAGTTAAAAACATGTATACATTTAATCATAATGCCCCAAAATACCTGAAGCAAAAA 1447

 38869364 TGGACAGAACTGAAAAAAGAAATAGACAATTCAAAAATAATAGTTTGAAATTCAAACAAC 38869423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1448 TGGACAGAACTGAAAAAAGAAATAGACAATTCAAAAATAATAGTTTGAAATTCAAACAAC 1507

 38869424 TGACTATCCATAATGACTAGACAGAAGATTAATAAGTATATAGAAGACTTGAGTAACACT 38869483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1508 TGACTATCCATAATGACTAGACAGAAGATTAATAAGTATATAGAAGACTTGAGTAACACT 1567

 38869484 ATACACCAACAATACTTAACAAATATCTGGAGAACAGTCCTCCTGACAGCAGAAGAATAC 38869543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1568 ATACACCAACAATACTTAACAAATATCTGGAGAACAGTCCTCCTGACAGCAGAAGAATAC 1627

 38869544 ATGTTCTTCTCAAGTACAAAGGAACAGTCTTCAGGATAGACTATTTTATGCCATAAAACA 38869603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1628 ATGTTCTTCTCAAGTACAAAGGAACAGTCTTCAGGATAGACTATTTTATGCCATAAAACA 1687

 38869604 ACCTCAATAAATATAAAATGATTGAAATCATACAAAGTATATTTATCAACCACAATGGAA 38869663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1688 ACCTCAATAAATATAAAATGATTGAAATCATACAAAGTATATTTATCAACCACAATGGAA 1747

 38869664 TCAAATCAGAAATCAATAATGGAGAAATTTGGGGATATGAACAAAATGTGGAAATTAATC 38869723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1748 TCAAATCAGAAATCAATAATGGAGAAATTTGGGGATATGAACAAAATGTGGAAATTAATC 1807

 38869724 AATACCCTCTATATAGCCAATGAGTCAAAGAAGAAATCACAAGGAAAATTAGAGTGAAAT 38869783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1808 AATACCCTCTATATAGCCAATGAGTCAAAGAAGAAATCACAAGGAAAATTAGAGTGAAAT 1867

 38869784 TAAAAATCAATAGATCCCAACATTTTGGAAGGCCAAGATGGGAGGATCACTCCTGGGTAA 38869843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1868 TAAAAATCAATAGATCCCAACATTTTGGAAGGCCAAGATGGGAGGATCACTCCTGGGTAA 1927

 38869844 CATAGTGAGAGCCAATAAAAAAATTAGCCAGGGATGGTGGTGAGTGTCAGTAGTTCCAGC 38869903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1928 CATAGTGAGAGCCAATAAAAAAATTAGCCAGGGATGGTGGTGAGTGTCAGTAGTTCCAGC 1987

 38869904 TACTTGGGAGGCTGAGGTGGCAGGATCACTTGAGCCCAGAAGGTCAACATTGCAGTGAGC 38869963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1988 TACTTGGGAGGCTGAGGTGGCAGGATCACTTGAGCCCAGAAGGTCAACATTGCAGTGAGC 2047

 38869964 CTTGTTTGTACCACTGCACTCCAGCCTAGGCGAGACTGAGACCCTGTTTCAAAAATAAAT 38870023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
     2048 CTTGTTTGTACCACTGCACTCCAGCCTAGGCGAGACTGAGACCCTGTTTCAA-------- 2099

 38870024 AAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAGTGAAAATAAAAATAAATGAAACCAAAGTTC 38870083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 AAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAGTGAAAATAAAAATAAATGAAACCAAAGTTC 2159

 38870084 ACTCTAAAAAAAAAGTCAACAAAGTTGATAAATATGTAGCTAAATTAAACAAGAAAGTGA 38870143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 ACTCTAAAAAAAAAGTCAACAAAGTTGATAAATATGTAGCTAAATTAAACAAGAAAGTGA 2219

 38870144 GAGACGAAATCAGAAAAGGAAGTAGGTAACATCACTTCCAAAATCTCCAAAATTTAAAAA 38870203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 GAGACGAAATCAGAAAAGGAAGTAGGTAACATCACTTCCAAAATCTCCAAAATTTAAAAA 2279

 38870204 TGTTTTGAAGATGATGAACAACTTTATGAAAACAATCAAGATAATGTACACGAAATTTTA 38870263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 TGTTTTGAAGATGATGAACAACTTTATGAAAACAATCAAGATAATGTACACGAAATTTTA 2339

 38870264 TATTTTAATTCCAAAAGCAACCACTAGAAAAAATAACTCAAAACAATAATGTAAAAATCA 38870323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 TATTTTAATTCCAAAAGCAACCACTAGAAAAAATAACTCAAAACAATAATGTAAAAATCA 2399

 38870324 ACAGAAGATGGCCGGGCACGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTTTGTTAAATGT 38870383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 ACAGAAGATGGCCGGGCACGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTTTGTTAAATGT 2459

 38870384 TGTTTAATGTATTATGTTAAATCTTCTGGGTTTTTTTTTGTTGTTGTTGTTTTGAGACGG 38870443
          |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
     2460 TGTTTAATGTATTATGTTAAATCTTCTGGG-TTTTTTTTGTTGTTGTTGTTTTGAGACGG 2518

 38870444 AGTCTCGCTCTGTCGTCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTCGGCTCACTGCAAGCTC 38870503
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     2519 AGTCTCGCTCTGTCGTCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAGCTC 2578

 38870504 CGCCTCCCGGGTTCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGCAGATCACGAGGTCGGGAGATCAAG 38870563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2579 CGCCTCCCGGGTTCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGCAGATCACGAGGTCGGGAGATCAAG 2638

 38870564 ACCATCCTGGCTAAAATGGAGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAACAAAATTAGC 38870623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2639 ACCATCCTGGCTAAAATGGAGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAACAAAATTAGC 2698

 38870624 CGGGCCCGGTGTGGGGCACCTGTGGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTG 38870683
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2699 CGGGCCCGGTGTGGGGCACCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTG 2758

 38870684 CTTGAGCCCGGGATGTCCAGGCTACCGTGAGCCATATTCATGACACAGCACTCCAGCCTG 38870743
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2759 CTTGAGCCCGGGATGTCCAGGATACCGTGAGCCATATTCATGACACAGCACTCCAGCCTG 2818

 38870744 GGTGACAGAGTGAGATCCTGCCACAAAATAAAAAGAAAAGAGAAAATGATAAAGATTGTA 38870803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2819 GGTGACAGAGTGAGATCCTGCCACAAAATAAAAAGAAAAGAGAAAATGATAAAGATTGTA 2878

 38870804 AAAATACAATCGTATATGGCTACAACTGATTTGTTAAAAAGATGCAAAGGCAATCCAGTG 38870863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2879 AAAATACAATCGTATATGGCTACAACTGATTTGTTAAAAAGATGCAAAGGCAATCCAGTG 2938

 38870864 GAGAAATTACAGTGTTTTTAAAAATTTGTTAGATCAATTTAATACCTACACATAAAAATA 38870923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2939 GAGAAATTACAGTGTTTTTAAAAATTTGTTAGATCAATTTAATACCTACACATAAAAATA 2998

 38870924 TAAACTTCTACCCATACCTGTTGCCACATTTAAAAAAAAAATTAACTAATAGGCCTAAAC 38870983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2999 TAAACTTCTACCCATACCTGTTGCCACATTTAAAAAAAAAATTAACTAATAGGCCTAAAC 3058

 38870984 ATAAGCTAAAACTATAAAAGTTTTAGTTGAACACATACGAGAAAAAATTTTGTGACTGTG 38871043
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     3059 ATAAGCTAAAACTATAAAAGTTTTAGTTGAACACATATGAGAAAAAATTTTGTGACTGTG 3118

 38871044 GTTTAAGCAAAGAGTTCTTAGATAACAAAATCAAAGTCTGACTTACTTAAAAAATTATAA 38871103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3119 GTTTAAGCAAAGAGTTCTTAGATAACAAAATCAAAGTCTGACTTACTTAAAAAATTATAA 3178

 38871104 ATTAGACTTCACTAATATTAAGATCTTCTGTTCCTTGAAAGACAATGTTAAAAGAATAAA 38871163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3179 ATTAGACTTCACTAATATTAAGATCTTCTGTTCCTTGAAAGACAATGTTAAAAGAATAAA 3238

 38871164 AAACCAAGACATTAGGGAATATTTGCACATCACATTTTTGATAAACAACTTGTATCCTGA 38871223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3239 AAACCAAGACATTAGGGAATATTTGCACATCACATTTTTGATAAACAACTTGTATCCTGA 3298

 38871224 ATATATAATTTTCTAAATTCAATAATAATAAAAAAATTTAGCAACAGATTTTAACAGAAA 38871283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3299 ATATATAATTTTCTAAATTCAATAATAATAAAAAAATTTAGCAACAGATTTTAACAGAAA 3358

 38871284 CTTATCAAATAAATACAGAGATGACAGATAAGCACATAACACATGTTCAATATCATTATT 38871343
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3359 CTTATCAAATAAATACAGAGATGACTGATAAGCACATAACACATGTTCAATATCATTATT 3418

 38871344 CATTAGGGAAATGTAAATGAAACCACAATTAAACACTGCCTCACACATTAAAAGGTCTTA 38871403
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     3419 CATTAGGGAAATGTAAATGAAACCACAATTAGACACTGCCTCACACATTAAAAGGTCTTA 3478

 38871404 AATTGACACTACTGATGACATCAAGTACTGCAAGGATTTAAATCAAGTGGAAACTTCATA 38871463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3479 AATTGACACTACTGATGACATCAAGTACTGCAAGGATTTAAATCAAGTGGAAACTTCATA 3538

 38871464 AACTTCTGGGGGTTATGTAAACTGTTGTAAATACTTTGAAAAACAGTTCTGCAGTTTTGT 38871523
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3539 AACTTCTGGGAGTTATGTAAACTGTTGTAAATACTTTGAAAAACAGTTCTGCAGTTTTGT 3598

 38871524 AAAAAGGTAAACATACACTTAGGGCATAACTCAGCTATCCGACTCCCAAGTATTTACTAA 38871583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3599 AAAAAGGTAAACATACACTTAGGGCATAACTCAGCTATCCGACTCCCAAGTATTTACTAA 3658

 38871584 ACAGAAATGAAAGCCTATGTTTATAGAAAGAACTGAACATGAAATTTCATAGTAGCTTTT 38871643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3659 ACAGAAATGAAAGCCTATGTTTATAGAAAGAACTGAACATGAAATTTCATAGTAGCTTTT 3718

 38871644 TCTGTAATAGCCTCAAGGAAATCAACCCAAATGTCATACATAGGTAAATGGACAATAAAA 38871703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3719 TCTGTAATAGCCTCAAGGAAATCAACCCAAATGTCATACATAGGTAAATGGACAATAAAA 3778

 38871704 TTGTAATATATCTATATGCTAAAATGCTATTCAGAAACAAAAGGTATGAAGTCTTCAGAC 38871763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3779 TTGTAATATATCTATATGCTAAAATGCTATTCAGAAACAAAAGGTATGAAGTCTTCAGAC 3838

 38871764 ATCTATAGACACTGGTGAATCTTAAATAGTGAGGCTAAGTGACAGAAACCCAAAAATAAC 38871823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3839 ATCTATAGACACTGGTGAATCTTAAATAGTGAGGCTAAGTGACAGAAACCCAAAAATAAC 3898

 38871824 AAAAAATACAGATTGCAAGATTCCATTTTTTAAAGATATTAGAAAATGAAAACTAATTTA 38871883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     3899 AAAAAATACAGATTGCAAGATTCCATTTTTTAAAGACATTAGAAAATGAAAACTAATTTA 3958

 38871884 TGTAAAGCAGACCAGTTGTTGTCTAGGGGTGGGGAGTTAGGACGGGGTCGGGGAGAGGGA 38871943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3959 TGTAAAGCAGACCAGTTGTTGTCTAGGGGTGGGGAGTTAGGACGGGGTCGGGGAGAGGGA 4018

 38871944 CTACAAAGTGTCATAAGGAAACTTTTGGGCGTGGACAGGTGCAGTGGCTCATACCTGTAA 38872003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4019 CTACAAAGTGTCATAAGGAAACTTTTGGGCGTGGACAGGTGCAGTGGCTCATACCTGTAA 4078

 38872004 TCCCAGCACTTTGGAAGGCCGAGGAGGGAGGATCACTTGAGGTCAGGGATTTGAGACCAG 38872063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4079 TCCCAGCACTTTGGAAGGCCGAGGAGGGAGGATCACTTGAGGTCAGGGATTTGAGACCAG 4138

 38872064 CCTGGGCAACAGGATAAAACCCCATCTCTACCAAAATTTCAAAAATTAGGCAGGCGTGCT 38872123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4139 CCTGGGCAACAGGATAAAACCCCATCTCTACCAAAATTTCAAAAATTAGGCAGGCGTGCT 4198

 38872124 AGCGAGCACCTGTAGTCCTAGCTACTGGAGAGGTTGAGGCAGGAGAATCACTTAAACATG 38872183
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4199 AGCGGGCACCTGTAGTCCTAGCTACTGGAGAGGTTGAGGCAGGAGAATCACTTAAACATG 4258

 38872184 AGAGGGAGAGTTGCAGTAAGCCAAAATTGTGCAACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGT 38872243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     4259 AGAGGGAGAGTTGCAGTAAGCCAAAATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGT 4318

 38872244 GAAGCTCTGTCTCCAAAACTAAAAATAAAATAAAATAAAAATGACACTTTCGGGTGTGAT 38872303
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4319 GAAGCTCCGTCTCCAAAACTAAAAATAAAATAAAATAAAAATGACACTTTCGGGTGTGAT 4378

 38872304 TGATATATTTGCTATCTTAATGTGTTGATAGTCTCACAGGTGTATACATACATTAGAACT 38872363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4379 TGATATATTTGCTATCTTAATGTGTTGATAGTCTCACAGGTGTATACATACATTAGAACT 4438

 38872364 TAACTGGTACATTTTAAATATGTGCAGTCCATTGTATGTCAATTATTCCACCATATAAGT 38872423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4439 TAACTGGTACATTTTAAATATGTGCAGTCCATTGTATGTCAATTATTCCACCATATAAGT 4498

 38872424 GTTTAAACACACACACACACACAAGACAGAAGTGAATGTTTCATTCACACAATCTTCATG 38872483
          ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4499 GTTTAA--ACACACACACACACAAGACAGAAGTGAATGTTTCATTCACACAATCTTCATG 4556

 38872484 GACAAATCTATGCTTCAAAGGTAGGAAAATCATGAGGTCAAAGAAAAAACACTGCATTTC 38872543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4557 GACAAATCTATGCTTCAAAGGTAGGAAAATCATGAGGTCAAAGAAAAAACACTGCATTTC 4616

 38872544 TGAGATAGTAATAGAGAGGTAAATATGTGTATTCGGTGTTCAATGTACAAATTATTGAAG 38872603
          |||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     4617 TGACATAGTAATAGAGAGGTAAATATGTGTATTCGATGTTCAATGTACAAATTATTGAAG 4676

 38872604 TCTTTTTGTCCTTTTTTCATCTCTCCCAACTTAATTGGAATAGATCCAGTTTACAATAAA 38872663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4677 TCTTTTTGTCCTTTTTTCATCTCTCCCAACTTAATTGGAATAGATCCAGTTTACAATAAA 4736

 38872664 AGAAATTCAGTGAAGTTTTCCAAACAGCAATGAGAATGAGCATTGTGGCTCATCCAGAGC 38872723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4737 AGAAATTCAGTGAAGTTTTCCAAACAGCAATGAGAATGAGCATTGTGGCTCATCCAGAGC 4796

 38872724 TCCAAAAAGCAACTGCTCTGTACCTAAGGAAATCTTGTTTTTGCTCAAAATTTTATTTGT 38872783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4797 TCCAAAAAGCAACTGCTCTGTACCTAAGGAAATCTTGTTTTTGCTCAAAATTTTATTTGT 4856

 38872784 CCTTGAGATTTTAATGACTTTTAAGAATGTTTTTCCTTATACCTTTGGGCTTCAGTTTCT 38872843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4857 CCTTGAGATTTTAATGACTTTTAAGAATGTTTTTCCTTATACCTTTGGGCTTCAGTTTCT 4916

 38872844 TCGTATGCAAAATCAAGTCATGAAGATATTTCCACACAGCCAAGATGTTATAGGATAATG 38872903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4917 TCGTATGCAAAATCAAGTCATGAAGATATTTCCACACAGCCAAGATGTTATAGGATAATG 4976

 38872904 AATTGCTTGATAACCCATTGTAATCTTTGGCAAAAGAACAAAGCATTATTATTGTTATTA 38872963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4977 AATTGCTTGATAACCCATTGTAATCTTTGGCAAAAGAACAAAGCATTATTATTGTTATTA 5036

 38872964 AATATTATTAGCTGGCGTATGGTGCTGAACTGATAATTACTTCAAGTAACACTTCATAAA 38873023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5037 AATATTATTAGCTGGCGTATGGTGCTGAACTGATAATTACTTCAAGTAACACTTCATAAA 5096

 38873024 ATGCTAACTGTAAAGTGTACATAAATTTATGTATTCATTAATATGATACCTGCTACGAAC 38873083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5097 ATGCTAACTGTAAAGTGTACATAAATTTATGTATTCATTAATATGATACCTGCTACGAAC 5156

 38873084 AAATATTTTGGAAGATTGCCAACATCATTTCTTTCACAGTGTTAGTAAATTTTAATTTAT 38873143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5157 AAATATTTTGGAAGATTGCCAACATCATTTCTTTCACAGTGTTAGTAAATTTTAATTTAT 5216

 38873144 ATTCAAACCCATTGCCTCAGTTCCTCACATTCAGCTCTCTTCAATACTAATTTAAGTTCT 38873203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5217 ATTCAAACCCATTGCCTCAGTTCCTCACATTCAGCTCTCTTCAATACTAATTTAAGTTCT 5276

 38873204 TTGGGTTGAATAAAACTAATTTATTTGCCTCTTTCATTATAAGGATAACAGCTTGCAATA 38873263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5277 TTGGGTTGAATAAAACTAATTTATTTGCCTCTTTCATTATAAGGATAACAGCTTGCAATA 5336

 38873264 CAGCATTATGAGAAGTTCCCCCA-TTCCCTTGAAACACAAGTTTCATTCTGTTACTTTTA 38873322
          ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5337 CAGCATTATGAGAAGTTCCCCCACTTCCCTTGAAACACAAGTTTCATTCTGTTACTTTTA 5396

 38873323 CGTTGTAATGTTTCATAAGTAAAAAACTAGCTATAGAAATTAAGGAAGTTGGGAGTTAGA 38873382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5397 CGTTGTAATGTTTCATAAGTAAAAAACTAGCTATAGAAATTAAGGAAGTTGGGAGTTAGA 5456

 38873383 ATTTGGGAAATTAAAACAATACTAATACATATTTAAATATGGTTATGTTAGCAGAACTGA 38873442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5457 ATTTGGGAAATTAAAACAATACTAATACATATTTAAATATGGTTATGTTAGCAGAACTGA 5516

 38873443 TCACACACGTTGTTGAATTTCTCAAAAATGCTTTTCATCAGAAATCAATTTTATTGTCAT 38873502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5517 TCACACACGTTGTTGAATTTCTCAAAAATGCTTTTCATCAGAAATCAATTTTATTGTCAT 5576

 38873503 TTCAAAATACATATCATGAACTCTGCAATCAAAACTGTAAGAGACCAACAACAGGCAAGA 38873562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5577 TTCAAAATACATATCATGAACTCTGCAATCAAAACTGTAAGAGACCAACAACAGGCAAGA 5636

 38873563 GGTGTGGTCCCTGCTATCAATCCATATAAATATTATTATACACACATCCCTGTATATGAT 38873622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5637 GGTGTGGTCCCTGCTATCAATCCATATAAATATTATTATACACACATCCCTGTATATGAT 5696

 38873623 CCAGAGGTGAAGTGCATCATTTATCAGCTACTTAAGGAAAGCCCCGGTGCCTATTGGCCA 38873682
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     5697 CCAGAGGTGAAGTGCATCATTTATCAGCTACTTAAGGAAAGCCCCGGTGCCTACTGGCCA 5756

 38873683 GAGTAGGCTGTTCTGATCTCAAGGAGACTGCCCCCACTTCTTTTATTTTGAAGAATTTCA 38873742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5757 GAGTAGGCTGTTCTGATCTCAAGGAGACTGCCCCCACTTCTTTTATTTTGAAGAATTTCA 5816

 38873743 ATACTGCAGAAAAGTTAAAAGACCAATATAATGAATATTTATGTACTCTTCATCTGACCC 38873802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5817 ATACTGCAGAAAAGTTAAAAGACCAATATAATGAATATTTATGTACTCTTCATCTGACCC 5876

 38873803 CACTAATGGTTTACGTCTCACCACATTTGCATGAAATCTCCTGCTCTGTTTCCATATTTA 38873862
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     5877 CACTAATGGTTTACGTCTCACCACATTTGTATGAAATCTCCTGCTCTGTTTCCATATTTA 5936

 38873863 CAAATCAATTTTAAAATAATTTGTACACATTTCTAAGGCTAATTATGTGTTCTGAACAAA 38873922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5937 CAAATCAATTTTAAAATAATTTGTACACATTTCTAAGGCTAATTATGTGTTCTGAACAAA 5996

 38873923 AGGAATTACTTTTGGCCATTGAGACCAAATTTTGTCACTGAGGGAAATAAGTCCAGGCTG 38873982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5997 AGGAATTACTTTTGGCCATTGAGACCAAATTTTGTCACTGAGGGAAATAAGTCCAGGCTG 6056

 38873983 ATGATGTATGGACCATACCTGAAGAAACCAGGTAAAGAGACTGCTGTTTGGGCATGGAAA 38874042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6057 ATGATGTATGGACCATACCTGAAGAAACCAGGTAAAGAGACTGCTGTTTGGGCATGGAAA 6116

 38874043 GTTTCCTTTGCTATCTGGATAAGCACCTAGTGTAGGGATGACTCCATAATTTATTTCCTG 38874102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6117 GTTTCCTTTGCTATCTGGATAAGCACCTAGTGTAGGGATGACTCCATAATTTATTTCCTG 6176

 38874103 AACCAGGGCACTTCTGAGAGTGAAAGAAGGCACTTTTAAGATGTACAGCAGGACTGAAAT 38874162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6177 AACCAGGGCACTTCTGAGAGTGAAAGAAGGCACTTTTAAGATGTACAGCAGGACTGAAAT 6236

 38874163 CCCAGGTATGCTGGGCCTTTGGGCCACTCCACCTTGAGTGCACAGTGTAGGAGCAGCTGC 38874222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6237 CCCAGGTATGCTGGGCCTTTGGGCCACTCCACCTTGAGTGCACAGTGTAGGAGCAGCTGC 6296

 38874223 TGAGAAGTAAGTTGGGCACTAACTTGAGTGCTTAATTTTCCTCTAACAGACATATTCCCA 38874282
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     6297 TGAGAAGTAAGTTGGGCACTAACTTGGGTGCTTAATTTTCCTCTAACAGACATATTCCCA 6356

 38874283 GATGACAACAGGTTTCTCTTCCAGCTCATGAATCTGGGGCACAACTTCCAGTGTAGACTA 38874342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     6357 GATGACAACAGGTTTCTCTTCCAGCTCATGAATCCGGGGCACAACTTCCAGTGTAGACTA 6416

 38874343 ACTTATTGGTCTTGAAAAAAAAGAGAGAATTTATTTCTTTACCTGAAAAGAATCCCATGC 38874402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6417 ACTTATTGGTCTTGAAAAAAAAGAGAGAATTTATTTCTTTACCTGAAAAGAATCCCATGC 6476

 38874403 AATTAAAAGATAATTTATGTCAGCTATAATCAAGGTGATGTTCTGGGTCAGCTAGTCAAT 38874462
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6477 AATTAAAAGACAATTTATGTCAGCTATAATCAAGGTGATGTTCTGGGTCAGCTAGTCAAT 6536

 38874463 GAGTTGCACTCACTGGACACTCAAATTCCACCACTGCTACCGAGTCTCCAACTAATTTGT 38874522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6537 GAGTTGCACTCACTGGACACTCAAATTCCACCACTGCTACCGAGTCTCCAACTAATTTGT 6596

 38874523 CATGAGTCCTTTAGACAGCCACATGAGAAATGATCAAAGGTCAGGTATCTGATCGCTGGA 38874582
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6597 CATGAGTCCTTTAGAAAGCCACATGAGAAATGATCAAAGGTCAGGTATCTGATCGCTGGA 6656

 38874583 CAACACAGGAGTCTTTATTCCTAAAGCAGGCATCTCCAAGGGAAGTATTTATCCAAGTCC 38874642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6657 CAACACAGGAGTCTTTATTCCTAAAGCAGGCATCTCCAAGGGAAGTATTTATCCAAGTCC 6716

 38874643 ATTTTTTATTTTTCCATCTGAATACAACTCTGCAAATCAAAATGACCACTTTCAACCACT 38874702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6717 ATTTTTTATTTTTCCATCTGAATACAACTCTGCAAATCAAAATGACCACTTTCAACCACT 6776

 38874703 GTCTGATCTGTGTACACCCTGTAAGTCACCCCTCCTATAAGTAGCAAGCAAGTGGGGGCA 38874762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6777 GTCTGATCTGTGTACACCCTGTAAGTCACCCCTCCTATAAGTAGCAAGCAAGTGGGGGCA 6836

 38874763 TGTTGTCTATTACCGGGAAAAACAAAATGCAACAATAATCAGAAAAGTTGGCAAACTCAA 38874822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6837 TGTTGTCTATTACCGGGAAAAACAAAATGCAACAATAATCAGAAAAGTTGGCAAACTCAA 6896

 38874823 GTGGACTTTCACCAACATCAAGGTATTTGTAGAAAAGACAGAGTAAAAAAGCATAAAAGA 38874882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     6897 GTGGACTTTCACCAACATCAAGGTATTTGTAGAAAAGACAGAGTTAAAAAGCATAAAAGA 6956

 38874883 TGTGGGTGTTTTAAAATAATCTAAATCTCTGGAGACTCTGTCTCAAGTCAGTATGGACTC 38874942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6957 TGTGGGTGTTTTAAAATAATCTAAATCTCTGGAGACTCTGTCTCAAGTCAGTATGGACTC 7016

 38874943 CTCTGGCTGTGCAAAGAAGTAACTGGAAAGCATGACTGCATGTAATCAGCAGGAAAACCA 38875002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7017 CTCTGGCTGTGCAAAGAAGTAACTGGAAAGCATGACTGCATGTAATCAGCAGGAAAACCA 7076

 38875003 TATCCTAATGACTGAATGTCCCCTCTTGGACCTCACAGAAAATCTCCTTTCCAGTTCAGG 38875062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7077 TATCCTAATGACTGAATGTCCCCTCTTGGACCTCACAGAAAATCTCCTTTCCAGTTCAGG 7136

 38875063 GCATTCCTTCAGCTACTACCCAGACCACATGGTCACTAGATCAAGGGACCAGTGAACTTC 38875122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7137 GCATTCCTTCAGCTACTACCCAGACCACATGGTCACTAGATCAAGGGACCAGTGAACTTC 7196

 38875123 ATGCTCAGGTGCATGTAAGGAGAGAAAGAGCAGCTTTCCTAAGAAGGGAGGTAAAGCATT 38875182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7197 ATGCTCAGGTGCATGTAAGGAGAGAAAGAGCAGCTTTCCTAAGAAGGGAGGTAAAGCATT 7256

 38875183 ATTTAAAACAACAACAACAAAACAAACAAAATCATGTGGCGTTAACTGATAAGTTAACAT 38875242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7257 ATTTAAAACAACAACAACAAAACAAACAAAATCATGTGGCGTTAACTGATAAGTTAACAT 7316

 38875243 GGTCTCCCATAAGAATCCATCTGTAACATATGGCTGGGCTCTGAGCTGCTCAAGGAGACA 38875302
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||||
     7317 GGTCTCCCATAAGAATCCATCTGTAACATATGGCTGGGCCCTGAGCTGCTCAGGGAGACA 7376

 38875303 TCAAGGAAGAGGTGTACACTGAGCTGTGATTTGACATGTGGATAAGAGGGGAATGGGTAT 38875362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7377 TCAAGGAAGAGGTGTACACTGAGCTGTGATTTGACATGTGGATAAGAGGGGAATGGGTAT 7436

 38875363 TGGGAATACCCATTCTTTCAAGGAAGGAATGAAAAAGATATGGAGACTGAAAACCAATGT 38875422
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     7437 TGGGAATACCCATTCTTTCAAGGAAGGAATGAAAAAGATATGGAGGCTGAAAACCAATGT 7496

 38875423 AAGTCAATGTGTTAAGTAGATGCATAAATTTGTATATGTTATGGGTTTCAAAGCACTTTT 38875482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7497 AAGTCAATGTGTTAAGTAGATGCATAAATTTGTATATGTTATGGGTTTCAAAGCACTTTT 7556

 38875483 ATTTGCATCATTTTATTTAGTCATCTTAACCAATATTGGAGACAAGCTGGAAAATATTAT 38875542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7557 ATTTGCATCATTTTATTTAGTCATCTTAACCAATATTGGAGACAAGCTGGAAAATATTAT 7616

 38875543 CATTTCAAAATTATAGATGAGGAAATTTAAACAAAGAGAAAATTAACCTGCTTAACTGTC 38875602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7617 CATTTCAAAATTATAGATGAGGAAATTTAAACAAAGAGAAAATTAACCTGCTTAACTGTC 7676

 38875603 TTTGGGTTTTAAATGACAGAGTTGAATCTAGTTGACACATATTTGAATGTATTATTCTTA 38875662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7677 TTTGGGTTTTAAATGACAGAGTTGAATCTAGTTGACACATATTTGAATGTATTATTCTTA 7736

 38875663 TACGTTTTAAGAACACAAATGTTTAAGTTTACAGATAAAGAAACTGAAGTTCAGAGAATT 38875722
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7737 TATGTTTTAAGAACACAAATGTTTAAGTTTACAGATAAAGAAACTGAAGTTCAGAGAATT 7796

 38875723 CAGCACATAAGTCATAGTCAATATTCAAACCAGGGGTCTCAGGTTCCATATTCCAGATCT 38875782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7797 CAGCACATAAGTCATAGTCAATATTCAAACCAGGGGTCTCAGGTTCCATATTCCAGATCT 7856

 38875783 CTCATTATTTCATATTGACTGAAGAAGAAGAAAATGAGAATGAGTGTTGAAAACTAATCC 38875842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7857 CTCATTATTTCATATTGACTGAAGAAGAAGAAAATGAGAATGAGTGTTGAAAACTAATCC 7916

 38875843 AAAAGGACAAAGTCAGGGGTGGGGGGAGTTGTGATCCAAATAAAATTATTGGTTCCTATA 38875902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7917 AAAAGGACAAAGTCAGGGGTGGGGGGAGTTGTGATCCAAATAAAATTATTGGTTCCTATA 7976

 38875903 AGAAATAGATGTAATCTCAGGGTAGAGATGAATCAGGTAAGTGCCCAGGGGCAGCAAACG 38875962
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     7977 AGAAATAGATGTAATCTCAGGGTAGAGATGAATCAGGTAAGTGCCCAGGGGCAGCAAACA 8036

 38875963 GGATTCCAAAGGTTGCCAGTGAGCTTCTCCAGCTTTTAGTCAATCCTGGAAACAAATCGT 38876022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8037 GGATTCCAAAGGTTGCCAGTGAGCTTCTCCAGCTTTTAGTCAATCCTGGAAACAAATCGT 8096

 38876023 GTATTTGTTTCTATCTCAGCTTTCTCACAAGTTCTCCTGTGCTTATGGAGTTCTTCTCCC 38876082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8097 GTATTTGTTTCTATCTCAGCTTTCTCACAAGTTCTCCTGTGCTTATGGAGTTCTTCTCCC 8156

 38876083 TGTACTTTCACCTGCACCATCCCTTGGGGTCTAATTCCACTATTGCTGCTCAGAATTCAT 38876142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8157 TGTACTTTCACCTGCACCATCCCTTGGGGTCTAATTCCACTATTGCTGCTCAGAATTCAT 8216

 38876143 CCATCTTGCCATGAGCTGAGCTTCTGCAGCACTCACCTCTGAAACTCACTTTAAAAGGGC 38876202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8217 CCATCTTGCCATGAGCTGAGCTTCTGCAGCACTCACCTCTGAAACTCACTTTAAAAGGGC 8276

 38876203 ATAGTTCTGTGTGCATTGATGAGGACCCACGTAAGTCTGTTGATGCCTGGGCCAAGGCAA 38876262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8277 ATAGTTCTGTGTGCATTGATGAGGACCCACGTAAGTCTGTTGATGCCTGGGCCAAGGCAA 8336

 38876263 CATAGAACATTGCTTTTTGGTTTTGCTGAGAGCAGGCTGTTTTCTCAGCAAATCATGCAG 38876322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8337 CATAGAACATTGCTTTTTGGTTTTGCTGAGAGCAGGCTGTTTTCTCAGCAAATCATGCAG 8396

 38876323 CTTCATTCCTGCTGCATTTACACAAATCAAGGAGTCATTTTACTCTCTAAATT 38876375
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8397 CTTCATTCCTGCTGCATTTACACAAATCAAGGAGTCATTTTACTCTCTAAATT 8449

Alignment time is 7.40363 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38854779,38878343] =>     23565 nucs '18 dna:chromosome chromosome:GRCh37:18:1:78077248:1'
Second seq [       1,    2859] =>      2859 nucs 'mol-32-2efc-017859_2859'

Score:        2826
Aligned:      2859        nucs
Identic:      2856 (100%) nucs =>       688 (100%)      2168 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38866138,38866825] EXCISED REGION [38866827,38868997]
 second seq =>  [       1,     688] EXCISED REGION [     690,    2859]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [38866826,38866826]
 second seq =>         1 nucs [689,689]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [38867221,38867221]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [38866822,38866825] to [38866823,38866826]
 second seq =>         1 nucs [689,689] to [690,690]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 38866138 TGGCAGCAGGCAAAGAGAGCTTGTGCAGGGAAAAATCCCATTTTTAAAACCATAAAATCT 38866197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGGCAGCAGGCAAAGAGAGCTTGTGCAGGGAAAAATCCCATTTTTAAAACCATAAAATCT 60

 38866198 CATGAGACGTATTCACTGTCAGAAGAACAGCACAGGAAAGACCTGCCCCCATGATTCACT 38866257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CATGAGACGTATTCACTGTCAGAAGAACAGCACAGGAAAGACCTGCCCCCATGATTCACT 120

 38866258 ACCTCCCACCAGGTTCCTCCTATGACATGTGGGAACTGTGGGAGTTACAATTCAAGATGA 38866317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACCTCCCACCAGGTTCCTCCTATGACATGTGGGAACTGTGGGAGTTACAATTCAAGATGA 180

 38866318 GATCTGGGTGGGGACACAGCCAAACCTTATCAAATATTATTTAGCATTAAAAAAACTGTA 38866377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GATCTGGGTGGGGACACAGCCAAACCTTATCAAATATTATTTAGCATTAAAAAAACTGTA 240

 38866378 AAGCCATAAAAATATATGGACAAAACTTAAATGAATATTATTAACTGAAAGAAGACAATC 38866437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAGCCATAAAAATATATGGACAAAACTTAAATGAATATTATTAACTGAAAGAAGACAATC 300

 38866438 TTAAAAAAAGACATACTGTGTAATTCCAAATATACGGTATTCTGGAAAAGTCAAAATGTG 38866497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTAAAAAAAGACATACTGTGTAATTCCAAATATACGGTATTCTGGAAAAGTCAAAATGTG 360

 38866498 GAGATAATACAATTAAAGTGGCTGAGAATGGTGGCTCACGTCTGTCATATTAGTACTTGG 38866557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GAGATAATACAATTAAAGTGGCTGAGAATGGTGGCTCACGTCTGTCATATTAGTACTTGG 420

 38866558 CAGGCTGATATGGCATCATCACTTAAGGCCAAGGGTTTGAGGCTAGCCTGGGCATCACAG 38866617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CAGGCTGATATGGCATCATCACTTAAGGCCAAGGGTTTGAGGCTAGCCTGGGCATCACAG 480

 38866618 CAAGAACCCATCCCTACAAGAAAAATTTTTAAAAGTTACCTAGACATGGTGGCATACGCC 38866677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CAAGAACCCATCCCTACAAGAAAAATTTTTAAAAGTTACCTAGACATGGTGGCATACGCC 540

 38866678 TGTAGTCATAGCTACTTGGGAGGCTGGGGCAAGAAGATTGCTTGAGCCCCGGAATTTCAG 38866737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGTAGTCATAGCTACTTGGGAGGCTGGGGCAAGAAGATTGCTTGAGCCCCGGAATTTCAG 600

 38866738 GCTGCAGTGACCTATGCTAATGCCACTGCTCTCCTGCCTGAGTGACAGAGTGAGATTCTG 38866797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GCTGCAGTGACCTATGCTAATGCCACTGCTCTCCTGCCTGAGTGACAGAGTGAGATTCTG 660

 38866798 TCTCTTAAAAACAAACAAACAAACAAAA 38866825
          ||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCTCTTAAAAACAAACAAACAAACAAAA 688

EXCISED REGION

 38866827 GATTGAAGGGATGAATAGGTAGAGCACAGACAAGTCTTAGGTCTGTCAATATTCTGTATG 38866886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      690 GATTGAAGGGATGAATAGGTAGAGCACAGACAAGTCTTAGGTCTGTCAATATTCTGTATG 749

 38866887 ATACTATAATAATGGATGTATGTCATCATACATTTATTTATATCCACAGAATGTAAAACA 38866946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      750 ATACTATAATAATGGATGTATGTCATCATACATTTATTTATATCCACAGAATGTAAAACA 809

 38866947 CCAGGAGTAAATTCTATTTTAAACTCTGGGCGTTTTGTGATAATGATGCATTAATGAAAG 38867006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      810 CCAGGAGTAAATTCTATTTTAAACTCTGGGCGTTTTGTGATAATGATGCATTAATGAAAG 869

 38867007 TTCATCAGTGATGTAACAAATGCACTACTGCCATGTGGAATGTTGATACTGGGGGAGTTT 38867066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      870 TTCATCAGTGATGTAACAAATGCACTACTGCCATGTGGAATGTTGATACTGGGGGAGTTT 929

 38867067 GCCATGTGTGAGGACAGCAGGTATATGAAAACTCCCTGCACTTTCTGCTTAATTTTGCTG 38867126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      930 GCCATGTGTGAGGACAGCAGGTATATGAAAACTCCCTGCACTTTCTGCTTAATTTTGCTG 989

 38867127 TGAACCTAAAGCTGCTCTATATAATAAAGTTTATTAATTAAAAAAACCTCTGTTACAGCA 38867186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      990 TGAACCTAAAGCTGCTCTATATAATAAAGTTTATTAATTAAAAAAACCTCTGTTACAGCA 1049

 38867187 AAATTGAGTAACAGACACCATATTTTTCCTCCTGCCCCCCCCCCCAAAATTAACAAAGTA 38867246
          |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
     1050 AAATTGAGTAACAGACACCATATTTTTCCTCCTG-CCCCCCCCCCAAAATTAACAAAGTA 1108

 38867247 TAGAAAACAATGACTCTGAGAAGAGTGAACATTAGACAGTGAGGACATTGTTTCCTGAGA 38867306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1109 TAGAAAACAATGACTCTGAGAAGAGTGAACATTAGACAGTGAGGACATTGTTTCCTGAGA 1168

 38867307 GAGGAAAAAATAATAATAATATGTAACAAATGATTTCCCCAGCTTACTGCTCACATAGTT 38867366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1169 GAGGAAAAAATAATAATAATATGTAACAAATGATTTCCCCAGCTTACTGCTCACATAGTT 1228

 38867367 TCTAAGCCATGATGCAAAAACAGGGCTAGTTCATGGCAATTTTGACAGGATTCACTTATG 38867426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1229 TCTAAGCCATGATGCAAAAACAGGGCTAGTTCATGGCAATTTTGACAGGATTCACTTATG 1288

 38867427 TCACCCCAAATCTCTCAAGTTTTGTCAGTATTCCAGTTCAGTCAGGCAAAGAATGGCTGA 38867486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1289 TCACCCCAAATCTCTCAAGTTTTGTCAGTATTCCAGTTCAGTCAGGCAAAGAATGGCTGA 1348

 38867487 GTAAACAAGAAGCTTTGTTATTTCTTTCAGTGTTGGTTTCTATACCTCAAAATACCTCAG 38867546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1349 GTAAACAAGAAGCTTTGTTATTTCTTTCAGTGTTGGTTTCTATACCTCAAAATACCTCAG 1408

 38867547 TAAATCTCAAGTAGAATAAATTGAAATAAGATAAACACAAATAATCTTAACACATTATAG 38867606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1409 TAAATCTCAAGTAGAATAAATTGAAATAAGATAAACACAAATAATCTTAACACATTATAG 1468

 38867607 TTAAGTTGAATGCCACAGACAAAGGAAATATTTTGAAAGCAACAAGATGAAAACAACATA 38867666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1469 TTAAGTTGAATGCCACAGACAAAGGAAATATTTTGAAAGCAACAAGATGAAAACAACATA 1528

 38867667 TATGCAGATGTACAATATCATTAATGACTGTTTTTATGCCAGAAATAAAATAGGCCAGAA 38867726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1529 TATGCAGATGTACAATATCATTAATGACTGTTTTTATGCCAGAAATAAAATAGGCCAGAA 1588

 38867727 ACCAATGCAATGACAAATTGTTTGAATGAAATGTCAGCCAACTATTCTATATTCGGCAAA 38867786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1589 ACCAATGCAATGACAAATTGTTTGAATGAAATGTCAGCCAACTATTCTATATTCGGCAAA 1648

 38867787 GCTACTTAAATGAAATGGACCACCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGA 38867846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1649 GCTACTTAAATGAAATGGACCACCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGA 1708

 38867847 GGCCAAGGTGGGCAGATCATGAGGTCAAGATATAGAGACCATCCTGGACAACATGGTGAA 38867906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1709 GGCCAAGGTGGGCAGATCATGAGGTCAAGATATAGAGACCATCCTGGACAACATGGTGAA 1768

 38867907 ATCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCC 38867966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1769 ATCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCC 1828

 38867967 CAGCTACTCAGGAGGCTGAGGGAGGAGAACCTCTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGT 38868026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1829 CAGCTACTCAGGAGGCTGAGGGAGGAGAACCTCTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGT 1888

 38868027 GAGCAGAGATTGCACCACTACACTCCAGCCTGGTGACAAAGCGAGACACTGTCTCAAAAA 38868086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1889 GAGCAGAGATTGCACCACTACACTCCAGCCTGGTGACAAAGCGAGACACTGTCTCAAAAA 1948

 38868087 TATATATATATATATAATAAAAATAAGATGAAATACAGACATCCTCAGATGAACAAAGAC 38868146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1949 TATATATATATATATAATAAAAATAAGATGAAATACAGACATCCTCAGATGAACAAAGAC 2008

 38868147 TCGAGTAATTCATGGCTAGCAGGCATGACTTAAAGGAAAAACTAACGGAAACCCTGTAGG 38868206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2009 TCGAGTAATTCATGGCTAGCAGGCATGACTTAAAGGAAAAACTAACGGAAACCCTGTAGG 2068

 38868207 CCAAAGGAACGTAACACTAGACAGTAACTCTAACTCTAATTCAAGAGAGAATGTGCAGGA 38868266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2069 CCAAAGGAACGTAACACTAGACAGTAACTCTAACTCTAATTCAAGAGAGAATGTGCAGGA 2128

 38868267 AGCCATAAACAGTAAACATAATAATCTATATTATGTAATTTAATAAAAAATACATTGCTT 38868326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2129 AGCCATAAACAGTAAACATAATAATCTATATTATGTAATTTAATAAAAAATACATTGCTT 2188

 38868327 TAAAAATCCTTTTCTTAAAAATATTATTGTGTAAACATAATTATAATATTATAGTGTTGG 38868386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2189 TAAAAATCCTTTTCTTAAAAATATTATTGTGTAAACATAATTATAATATTATAGTGTTGG 2248

 38868387 ATTTATAACATATTTGGTGAAGTAATCGCACAAAGTAAAGAGAAGAAGAAAAGGGTATGT 38868446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2249 ATTTATAACATATTTGGTGAAGTAATCGCACAAAGTAAAGAGAAGAAGAAAAGGGTATGT 2308

 38868447 AAGTAAATAAAGATATTATATTTTACTGGAATTAAGTTGGTACTATTCTTAAATGGATTA 38868506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2309 AAGTAAATAAAGATATTATATTTTACTGGAATTAAGTTGGTACTATTCTTAAATGGATTA 2368

 38868507 TGATTAGATGAGATGCATATTGTAATTATTGTAGCAACCACTAAGAAATAATATTAACAC 38868566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     2369 TGATTAGATGAGATGCATATTGTAATTATTGTAGCAACCACTAAGAGATAATATTAACAC 2428

 38868567 AAACAACAGAGGAATTAAAATGATAGATTAGAAAAACCATTTATATATCACAAAATATAA 38868626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2429 AAACAACAGAGGAATTAAAATGATAGATTAGAAAAACCATTTATATATCACAAAATATAA 2488

 38868627 CAGTAAATGAGAAACAGAGGAATATATTTAAAATGAGCCTGGTTGCAGCGGCTCACACCT 38868686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2489 CAGTAAATGAGAAACAGAGGAATATATTTAAAATGAGCCTGGTTGCAGCGGCTCACACCT 2548

 38868687 GTAATCTTAGCAACTTGGAAGGCCAAGGTAGGAGGAAGTCTTGAGCCCAGGAGTTCAAGA 38868746
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2549 GTAATCTTAGCCACTTGGAAGGCCAAGGTAGGAGGAAGTCTTGAGCCCAGGAGTTCAAGA 2608

 38868747 TCAGCCTGAGCAACACAGTGAGACCCCCATCTCTACAAAAAGTAGAAATTTGGCAAGGCA 38868806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2609 TCAGCCTGAGCAACACAGTGAGACCCCCATCTCTACAAAAAGTAGAAATTTGGCAAGGCA 2668

 38868807 TCATGATAGGCACCTGTAGTCCCAGCTACTGATGAAGCTAAGGCAAGAGGATTTCTTGAG 38868866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2669 TCATGATAGGCACCTGTAGTCCCAGCTACTGATGAAGCTAAGGCAAGAGGATTTCTTGAG 2728

 38868867 CCTCTGAGGTCAAGGCTACAGTGAGCTATGATCACACCACTGCGCTCCAGCTTTGGAGAC 38868926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2729 CCTCTGAGGTCAAGGCTACAGTGAGCTATGATCACACCACTGCGCTCCAGCTTTGGAGAC 2788

 38868927 AGAGCAAGACTCTACAGCAATAAATAAATAAATAGAAAGCAAATAGAAAAATGACAGGCA 38868986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2789 AGAGCAAGACTCTACAGCAATAAATAAATAAATAGAAAGCAAATAGAAAAATGACAGGCA 2848

 38868987 TAAATCCAACT 38868997
          |||||||||||
     2849 TAAATCCAACT 2859

Alignment time is 2.41581 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38854779,38878343] =>     23565 nucs '18 dna:chromosome chromosome:GRCh37:18:1:78077248:1'
Second seq [       1,    2230] =>      2230 nucs 'mol-32-2f1d-129854_2230'

Score:        2156
Aligned:      2214        nucs
Identic:      2203 (100%) nucs =>        79 (100%)      2124 ( 99%)
Gaps:            9 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38864701,38864779] EXCISED REGION [38868344,38870478]
 second seq =>  [       1,      79] EXCISED REGION [      95,    2220]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3564 nucs [38864780,38868343]
 second seq =>        15 nucs [80,94]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 38864701 GTTCATGGGTAGAAAGACTCAATATTGTTGAAATGTTAATTCTTCCCAACTTAATCTATA 38864760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTTCATGGGTAGAAAGACTCAATATTGTTGAAATGTTAATTCTTCCCAACTTAATCTATA 60

 38864761 GATTCAATGTAATTACAAT 38864779
          |||||||||||||||||||
       61 GATTCAATGTAATTACAAT 79

EXCISED REGION

 38868344 AAAATATTATTGTGTAAACATAATTATAATATTATAGTGTTGGATTTATAACATATTTGG 38868403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       95 AAAATATTATTGTGTAAACATAATTATAATATTATAGTGTTGGATTTATAACATATTTGG 154

 38868404 TGAAGTAATCGCACAAAGTAAAGAGAAGAAGAAAAGGGTATGTAAGTAAATAAAGATATT 38868463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      155 TGAAGTAATCGCACAAAGTAAAGAGAAGAAGAAAAGGGTATGTAAGTAAATAAAGATATT 214

 38868464 ATATTTTACTGGAATTAAGTTGGTACTATTCTTAAATGGATTATGATTAGATGAGATGCA 38868523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      215 ATATTTTACTGGAATTAAGTTGGTACTATTCTTAAATGGATTATGATTAGATGAGATGCA 274

 38868524 TATTGTAATTATTGTAGCAACCACTAAGAAATAATATTAACACAAACAACAGAGGAATTA 38868583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      275 TATTGTAATTATTGTAGCAACCACTAAGAAATAATATTAACACAAACAACAGAGGAATTA 334

 38868584 AAATGATAGATTAGAAAAACCATTTATATATCACAAAATATAACAGTAAATGAGAAACAG 38868643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      335 AAATGATAGATTAGAAAAACCATTTATATATCACAAAATATAACAGTAAATGAGAAACAG 394

 38868644 AGGAATATATTTAAAATGAGCCTGGTTGCAGCGGCTCACACCTGTAATCTTAGCAACTTG 38868703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      395 AGGAATATATTTAAAATGAGCCTGGTTGCAGCGGCTCACACCTGTAATCTTAGCAACTTG 454

 38868704 GAAGGCCAAGGTAGGAGGAAGTCTTGAGCCCAGGAGTTCAAGATCAGCCTGAGCAACACA 38868763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      455 GAAGGCCAAGGTAGGAGGAAGTCTTGAGCCCAGGAGTTCAAGATCAGCCTGAGCAACACA 514

 38868764 GTGAGACCCCCATCTCTACAAAAAGTAGAAATTTGGCAAGGCATCATGATAGGCACCTGT 38868823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      515 GTGAGACCCCCATCTCTACAAAAAGTAGAAATTTGGCAAGGCATCATGATAGGCACCTGT 574

 38868824 AGTCCCAGCTACTGATGAAGCTAAGGCAAGAGGATTTCTTGAGCCTCTGAGGTCAAGGCT 38868883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      575 AGTCCCAGCTACTGATGAAGCTAAGGCAAGAGGATTTCTTGAGCCTCTGAGGTCAAGGCT 634

 38868884 ACAGTGAGCTATGATCACACCACTGCGCTCCAGCTTTGGAGACAGAGCAAGACTCTACAG 38868943
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
      635 ACAGTGAGCTATGATCACACCACTGCACTCCAGCTTTGGAGACAGAGCAAGACTCTACAG 694

 38868944 CAATAAATAAATAAATAGAAAGCAAATAGAAAAATGACAGGCATAAATCCAACTGTAGCA 38869003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      695 CAATAAATAAATAAATAGAAAGCAAATAGAAAAATGACAGGCATAAATCCAACTGTAGCA 754

 38869004 ATACTTAATACATGAAAAGCAAATAAACCAAGCACAACACATAAAAGGAAAGGATTGTCA 38869063
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
      755 ATACTTAATACATGAAAAGCAAATAAACCAAGCACAACACATAAAAGGAAAGGTTTGTCA 814

 38869064 GATTTGATAGAAACAAGACCCAAGTATACACTGTCTATAATAGACACACATTATATTCAA 38869123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      815 GATTTGATAGAAACAAGACCCAAGTATACACTGTCTATAATAGACACACATTATATTCAA 874

 38869124 ATACATAAATAAATAAAAAGCAAAATGATGTAAAAAAGGTAAAGTATGAAATCAGTAACT 38869183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      875 ATACATAAATAAATAAAAAGCAAAATGATGTAAAAAAGGTAAAGTATGAAATCAGTAACT 934

 38869184 CTATGACAGCTGAAGTAGCTGTATTAACATTATTTAAAATAGACTTTAATACAAGAAACA 38869243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      935 CTATGACAGCTGAAGTAGCTGTATTAACATTATTTAAAATAGACTTTAATACAAGAAACA 994

 38869244 CTATCAGAGAAGAAAAGCCATATTTCATAATGATAAAACATGCCAATTCATCATAAAGAT 38869303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      995 CTATCAGAGAAGAAAAGCCATATTTCATAATGATAAAACATGCCAATTCATCATAAAGAT 1054

 38869304 GTAAGAGTTAAAAACATGTATACATTTAATCATAATGCCCCAAAATACCTGAAGCAAAAA 38869363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1055 GTAAGAGTTAAAAACATGTATACATTTAATCATAATGCCCCAAAATACCTGAAGCAAAAA 1114

 38869364 TGGACAGAACTGAAAAAAGAAATAGACAATTCAAAAATAATAGTTTGAAATTCAAACAAC 38869423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1115 TGGACAGAACTGAAAAAAGAAATAGACAATTCAAAAATAATAGTTTGAAATTCAAACAAC 1174

 38869424 TGACTATCCATAATGACTAGACAGAAGATTAATAAGTATATAGAAGACTTGAGTAACACT 38869483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1175 TGACTATCCATAATGACTAGACAGAAGATTAATAAGTATATAGAAGACTTGAGTAACACT 1234

 38869484 ATACACCAACAATACTTAACAAATATCTGGAGAACAGTCCTCCTGACAGCAGAAGAATAC 38869543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1235 ATACACCAACAATACTTAACAAATATCTGGAGAACAGTCCTCCTGACAGCAGAAGAATAC 1294

 38869544 ATGTTCTTCTCAAGTACAAAGGAACAGTCTTCAGGATAGACTATTTTATGCCATAAAACA 38869603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1295 ATGTTCTTCTCAAGTACAAAGGAACAGTCTTCAGGATAGACTATTTTATGCCATAAAACA 1354

 38869604 ACCTCAATAAATATAAAATGATTGAAATCATACAAAGTATATTTATCAACCACAATGGAA 38869663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1355 ACCTCAATAAATATAAAATGATTGAAATCATACAAAGTATATTTATCAACCACAATGGAA 1414

 38869664 TCAAATCAGAAATCAATAATGGAGAAATTTGGGGATATGAACAAAATGTGGAAATTAATC 38869723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1415 TCAAATCAGAAATCAATAATGGAGAAATTTGGGGATATGAACAAAATGTGGAAATTAATC 1474

 38869724 AATACCCTCTATATAGCCAATGAGTCAAAGAAGAAATCACAAGGAAAATTAGAGTGAAAT 38869783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1475 AATACCCTCTATATAGCCAATGAGTCAAAGAAGAAATCACAAGGAAAATTAGAGTGAAAT 1534

 38869784 TAAAAATCAATAGATCCCAACATTTTGGAAGGCCAAGATGGGAGGATCACTCCTGGGTAA 38869843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1535 TAAAAATCAATAGATCCCAACATTTTGGAAGGCCAAGATGGGAGGATCACTCCTGGGTAA 1594

 38869844 CATAGTGAGAGCCAATAAAAAAATTAGCCAGGGATGGTGGTGAGTGTCAGTAGTTCCAGC 38869903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1595 CATAGTGAGAGCCAATAAAAAAATTAGCCAGGGATGGTGGTGAGTGTCAGTAGTTCCAGC 1654

 38869904 TACTTGGGAGGCTGAGGTGGCAGGATCACTTGAGCCCAGAAGGTCAACATTGCAGTGAGC 38869963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1655 TACTTGGGAGGCTGAGGTGGCAGGATCACTTGAGCCCAGAAGGTCAACATTGCAGTGAGC 1714

 38869964 CTTGTTTGTACCACTGCACTCCAGCCTAGGCGAGACTGAGACCCTGTTTCAAAAATAAAT 38870023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
     1715 CTTGTTTGTACCACTGCACTCCAGCCTAGGCGAGACTGAGACCCTGTTTCAA-------- 1766

 38870024 AAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAGTGAAAATAAAAATAAATGAAACCAAAGTTC 38870083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1767 AAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAGTGAAAATAAAAATAAATGAAACCAAAGTTC 1826

 38870084 ACTCTAAAAAAAAAGTCAACAAAGTTGATAAATATGTAGCTAAATTAAACAAGAAAGTGA 38870143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1827 ACTCTAAAAAAAAAGTCAACAAAGTTGATAAATATGTAGCTAAATTAAACAAGAAAGTGA 1886

 38870144 GAGACGAAATCAGAAAAGGAAGTAGGTAACATCACTTCCAAAATCTCCAAAATTTAAAAA 38870203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1887 GAGACGAAATCAGAAAAGGAAGTAGGTAACATCACTTCCAAAATCTCCAAAATTTAAAAA 1946

 38870204 TGTTTTGAAGATGATGAACAACTTTATGAAAACAATCAAGATAATGTACACGAAATTTTA 38870263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1947 TGTTTTGAAGATGATGAACAACTTTATGAAAACAATCAAGATAATGTACACGAAATTTTA 2006

 38870264 TATTTTAATTCCAAAAGCAACCACTAGAAAAAATAACTCAAAACAATAATGTAAAAATCA 38870323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2007 TATTTTAATTCCAAAAGCAACCACTAGAAAAAATAACTCAAAACAATAATGTAAAAATCA 2066

 38870324 ACAGAAGATGGCCGGGCACGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTTTGTTAAATGT 38870383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2067 ACAGAAGATGGCCGGGCACGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTTTGTTAAATGT 2126

 38870384 TGTTTAATGTATTATGTTAAATCTTCTGGGTTTTTTTTTGTTGTTGTTGTTTTGAGACGG 38870443
          |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
     2127 TGTTTAATGTATTATGTTAAATCTTCTGGG-TTTTTTTTGTTGTTGTTGTTTTGAGACGG 2185

 38870444 AGTCTCGCTCTGTCGTCCAGGCTGGAGTGCAGTGG 38870478
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2186 AGTCTCGCTCTGTCGTCCAGGCTGGAGTGCAGTGG 2220

Alignment time is 2.08658 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38854779,38878343] =>     23565 nucs '18 dna:chromosome chromosome:GRCh37:18:1:78077248:1'
Second seq [       1,    4712] =>      4712 nucs 'mol-32-2f28-108417_4712'

Score:        4701
Aligned:      4712        nucs
Identic:      4711 (100%) nucs =>      2898 (100%)      1813 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38864323,38867220] EXCISED REGION [38867222,38869035]
 second seq =>  [       1,    2898] EXCISED REGION [    2899,    4712]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [38867221,38867221]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [38868710,38868710]
 second seq =>         1 nucs [4387,4387]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        10 nucs [38867221,38867230] to [38867222,38867231]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 38864323 AAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAATACAGATTGGGAAGAAAAAAT 38864382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAATACAGATTGGGAAGAAAAAAT 60

 38864383 AAAATTGTGTTTGTTCACACATGACATGATTGTGTAGAAAATCCAAAAGAATCAACAAAA 38864442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAAATTGTGTTTGTTCACACATGACATGATTGTGTAGAAAATCCAAAAGAATCAACAAAA 120

 38864443 AAGCTTCCTGAAATTAACAAATAATTACAGCAAGTTTGCTGGAAATGAAGTTCATATACA 38864502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAGCTTCCTGAAATTAACAAATAATTACAGCAAGTTTGCTGGAAATGAAGTTCATATACA 180

 38864503 AAATTGAATTACTTTTCCATATATCCACAATCAACAAATGGAATTTGAAATTAAAAACAC 38864562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAATTGAATTACTTTTCCATATATCCACAATCAACAAATGGAATTTGAAATTAAAAACAC 240

 38864563 ATTATCATTTATATTAGCATCCTCAAAATGTAATATTTCTGCATAAATTTAACAAAATAT 38864622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATTATCATTTATATTAGCATCCTCAAAATGTAATATTTCTGCATAAATTTAACAAAATAT 300

 38864623 GTATATAATTTATATGAGGAGAACTACAAAATTCTGAAGAAATATGTCAAAGACTAAATA 38864682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTATATAATTTATATGAGGAGAACTACAAAATTCTGAAGAAATATGTCAAAGACTAAATA 360

 38864683 AATGGAAAGATATCTCAGGTTCATGGGTAGAAAGACTCAATATTGTTGAAATGTTAATTC 38864742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AATGGAAAGATATCTCAGGTTCATGGGTAGAAAGACTCAATATTGTTGAAATGTTAATTC 420

 38864743 TTCCCAACTTAATCTATAGATTCAATGTAATTACAATCAAAAATGAAAGTAAGTTTTGTG 38864802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTCCCAACTTAATCTATAGATTCAATGTAATTACAATCAAAAATGAAAGTAAGTTTTGTG 480

 38864803 TGTGTTTGTGTGAATCTTGACAAACTGATTTTAAAGTTCATATGGAGAGGAAAATGACCC 38864862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGTGTTTGTGTGAATCTTGACAAACTGATTTTAAAGTTCATATGGAGAGGAAAATGACCC 540

 38864863 AGAATAGCCACCACAATGTTGAGGGAGAACAAAGTGAGAAGACAGCACTACCCAACTTCA 38864922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGAATAGCCACCACAATGTTGAGGGAGAACAAAGTGAGAAGACAGCACTACCCAACTTCA 600

 38864923 AGACTTGCTGAAAAGCTACAGCAATCAAGATAGTGAGGTATTGGTAAAAGATAAAAAAAC 38864982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGACTTGCTGAAAAGCTACAGCAATCAAGATAGTGAGGTATTGGTAAAAGATAAAAAAAC 660

 38864983 AGGTCAATGAAACAACATAGTGTACTCAGACATAACCCACATAATATACTCAACTGATCT 38865042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGGTCAATGAAACAACATAGTGTACTCAGACATAACCCACATAATATACTCAACTGATCT 720

 38865043 TTGACAAAGGTGCAAGTTCAAGACAATGGAGCAAAGATAGTCTTTTCAATAAATAGTGGT 38865102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTGACAAAGGTGCAAGTTCAAGACAATGGAGCAAAGATAGTCTTTTCAATAAATAGTGGT 780

 38865103 AAGAAAACTAGGCATAACATGCAAGAATAAAATGTAAATCTAGATATAGACCTTATGATC 38865162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAGAAAACTAGGCATAACATGCAAGAATAAAATGTAAATCTAGATATAGACCTTATGATC 840

 38865163 TTCACAAAAATTAATTCAAAATGAACTTTAGAGCTCAATTTAAAATGTAAAATTATAAAG 38865222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTCACAAAAATTAATTCAAAATGAACTTTAGAGCTCAATTTAAAATGTAAAATTATAAAG 900

 38865223 CTCCTAGAAGGTAACATCAGAGAGAAACTAGGTGACCTTGGTTTGGTGTTAACTTTTTAG 38865282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTCCTAGAAGGTAACATCAGAGAGAAACTAGGTGACCTTGGTTTGGTGTTAACTTTTTAG 960

 38865283 AAACAACACCAGAAGTATGACCCATGAAAGAAAGAATTGATAAGCTGGACTTAACTAAAA 38865342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AAACAACACCAGAAGTATGACCCATGAAAGAAAGAATTGATAAGCTGGACTTAACTAAAA 1020

 38865343 TTAAATACTTCTGTTTTGAGAAAGGCACTATCAAGATCATTGGACCACAAGCAACAGACT 38865402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTAAATACTTCTGTTTTGAGAAAGGCACTATCAAGATCATTGGACCACAAGCAACAGACT 1080

 38865403 GAAAGAAAATATCTGCAAAAGATAGATCTGATAAAGGCGAGTCATTTAAAATATTCAAAT 38865462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GAAAGAAAATATCTGCAAAAGATAGATCTGATAAAGGCGAGTCATTTAAAATATTCAAAT 1140

 38865463 ATCTTTGAAAACTCAACCATAAGAACCCAAAAAACCTAGTTAAAAAATGGGCAAAATGTC 38865522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATCTTTGAAAACTCAACCATAAGAACCCAAAAAACCTAGTTAAAAAATGGGCAAAATGTC 1200

 38865523 TGAATAGGCACCCTACCAAAGAAGATATAGATAAGGTAAATGATCATATGAAAAGATATT 38865582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TGAATAGGCACCCTACCAAAGAAGATATAGATAAGGTAAATGATCATATGAAAAGATATT 1260

 38865583 CAACATCTTATGTCATTAGGGAATTGCAAACTCAAACAACAGTGAGATGCCGCTGCACAC 38865642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CAACATCTTATGTCATTAGGGAATTGCAAACTCAAACAACAGTGAGATGCCGCTGCACAC 1320

 38865643 CAATTAGAATGGCCAAAATTCAAAACACAGCACCAAATACTGGCCAGGGTGTGATGAAAC 38865702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CAATTAGAATGGCCAAAATTCAAAACACAGCACCAAATACTGGCCAGGGTGTGATGAAAC 1380

 38865703 AGAAACTTACTCATCTTTGGTAGAAATGCAAAATGGTATAGCCACTTTGGAAGACAGTTT 38865762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AGAAACTTACTCATCTTTGGTAGAAATGCAAAATGGTATAGCCACTTTGGAAGACAGTTT 1440

 38865763 GATAGTTTCTTTAAAAAGTAAACATGTTCTTACCATACATATGATCTTGAAATCATGCCA 38865822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GATAGTTTCTTTAAAAAGTAAACATGTTCTTACCATACATATGATCTTGAAATCATGCCA 1500

 38865823 CTTGGCATTTACCCAAAGGAGCTGAAAACTATATCCACACAAAATCCTGCACATGGATGT 38865882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CTTGGCATTTACCCAAAGGAGCTGAAAACTATATCCACACAAAATCCTGCACATGGATGT 1560

 38865883 TTATGACAACTTTATTTACAATTGCCAAAGGTTTGAAGCAACCAAGATGTCCTTTAGTAG 38865942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTATGACAACTTTATTTACAATTGCCAAAGGTTTGAAGCAACCAAGATGTCCTTTAGTAG 1620

 38865943 ATTGATACATAAACTGTGGTACATCCAGACAATGAAATATTGTATTTTTCCATTTTCACA 38866002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ATTGATACATAAACTGTGGTACATCCAGACAATGAAATATTGTATTTTTCCATTTTCACA 1680

 38866003 CTGCTGATAAAGACATACCCAAGACTGCATAATTTATACAGGAAAAGGGTTTAATGGACT 38866062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CTGCTGATAAAGACATACCCAAGACTGCATAATTTATACAGGAAAAGGGTTTAATGGACT 1740

 38866063 TACACTTCCATGTGGCTGGGGAGGCCTCACAATCATGGAAGAAGTCAAGGAGGAGCAAGT 38866122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TACACTTCCATGTGGCTGGGGAGGCCTCACAATCATGGAAGAAGTCAAGGAGGAGCAAGT 1800

 38866123 CACATCTTACATAGATGGCAGCAGGCAAAGAGAGCTTGTGCAGGGAAAAATCCCATTTTT 38866182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CACATCTTACATAGATGGCAGCAGGCAAAGAGAGCTTGTGCAGGGAAAAATCCCATTTTT 1860

 38866183 AAAACCATAAAATCTCATGAGACGTATTCACTGTCAGAAGAACAGCACAGGAAAGACCTG 38866242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AAAACCATAAAATCTCATGAGACGTATTCACTGTCAGAAGAACAGCACAGGAAAGACCTG 1920

 38866243 CCCCCATGATTCACTACCTCCCACCAGGTTCCTCCTATGACATGTGGGAACTGTGGGAGT 38866302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CCCCCATGATTCACTACCTCCCACCAGGTTCCTCCTATGACATGTGGGAACTGTGGGAGT 1980

 38866303 TACAATTCAAGATGAGATCTGGGTGGGGACACAGCCAAACCTTATCAAATATTATTTAGC 38866362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TACAATTCAAGATGAGATCTGGGTGGGGACACAGCCAAACCTTATCAAATATTATTTAGC 2040

 38866363 ATTAAAAAAACTGTAAAGCCATAAAAATATATGGACAAAACTTAAATGAATATTATTAAC 38866422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ATTAAAAAAACTGTAAAGCCATAAAAATATATGGACAAAACTTAAATGAATATTATTAAC 2100

 38866423 TGAAAGAAGACAATCTTAAAAAAAGACATACTGTGTAATTCCAAATATACGGTATTCTGG 38866482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TGAAAGAAGACAATCTTAAAAAAAGACATACTGTGTAATTCCAAATATACGGTATTCTGG 2160

 38866483 AAAAGTCAAAATGTGGAGATAATACAATTAAAGTGGCTGAGAATGGTGGCTCACGTCTGT 38866542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AAAAGTCAAAATGTGGAGATAATACAATTAAAGTGGCTGAGAATGGTGGCTCACGTCTGT 2220

 38866543 CATATTAGTACTTGGCAGGCTGATATGGCATCATCACTTAAGGCCAAGGGTTTGAGGCTA 38866602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CATATTAGTACTTGGCAGGCTGATATGGCATCATCACTTAAGGCCAAGGGTTTGAGGCTA 2280

 38866603 GCCTGGGCATCACAGCAAGAACCCATCCCTACAAGAAAAATTTTTAAAAGTTACCTAGAC 38866662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GCCTGGGCATCACAGCAAGAACCCATCCCTACAAGAAAAATTTTTAAAAGTTACCTAGAC 2340

 38866663 ATGGTGGCATACGCCTGTAGTCATAGCTACTTGGGAGGCTGGGGCAAGAAGATTGCTTGA 38866722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 ATGGTGGCATACGCCTGTAGTCATAGCTACTTGGGAGGCTGGGGCAAGAAGATTGCTTGA 2400

 38866723 GCCCCGGAATTTCAGGCTGCAGTGACCTATGCTAATGCCACTGCTCTCCTGCCTGAGTGA 38866782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GCCCCGGAATTTCAGGCTGCAGTGACCTATGCTAATGCCACTGCTCTCCTGCCTGAGTGA 2460

 38866783 CAGAGTGAGATTCTGTCTCTTAAAAACAAACAAACAAACAAAAAGATTGAAGGGATGAAT 38866842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CAGAGTGAGATTCTGTCTCTTAAAAACAAACAAACAAACAAAAAGATTGAAGGGATGAAT 2520

 38866843 AGGTAGAGCACAGACAAGTCTTAGGTCTGTCAATATTCTGTATGATACTATAATAATGGA 38866902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 AGGTAGAGCACAGACAAGTCTTAGGTCTGTCAATATTCTGTATGATACTATAATAATGGA 2580

 38866903 TGTATGTCATCATACATTTATTTATATCCACAGAATGTAAAACACCAGGAGTAAATTCTA 38866962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TGTATGTCATCATACATTTATTTATATCCACAGAATGTAAAACACCAGGAGTAAATTCTA 2640

 38866963 TTTTAAACTCTGGGCGTTTTGTGATAATGATGCATTAATGAAAGTTCATCAGTGATGTAA 38867022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TTTTAAACTCTGGGCGTTTTGTGATAATGATGCATTAATGAAAGTTCATCAGTGATGTAA 2700

 38867023 CAAATGCACTACTGCCATGTGGAATGTTGATACTGGGGGAGTTTGCCATGTGTGAGGACA 38867082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CAAATGCACTACTGCCATGTGGAATGTTGATACTGGGGGAGTTTGCCATGTGTGAGGACA 2760

 38867083 GCAGGTATATGAAAACTCCCTGCACTTTCTGCTTAATTTTGCTGTGAACCTAAAGCTGCT 38867142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GCAGGTATATGAAAACTCCCTGCACTTTCTGCTTAATTTTGCTGTGAACCTAAAGCTGCT 2820

 38867143 CTATATAATAAAGTTTATTAATTAAAAAAACCTCTGTTACAGCAAAATTGAGTAACAGAC 38867202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CTATATAATAAAGTTTATTAATTAAAAAAACCTCTGTTACAGCAAAATTGAGTAACAGAC 2880

 38867203 ACCATATTTTTCCTCCTG 38867220
          ||||||||||||||||||
     2881 ACCATATTTTTCCTCCTG 2898

EXCISED REGION

 38867222 CCCCCCCCCCAAAATTAACAAAGTATAGAAAACAATGACTCTGAGAAGAGTGAACATTAG 38867281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2899 CCCCCCCCCCAAAATTAACAAAGTATAGAAAACAATGACTCTGAGAAGAGTGAACATTAG 2958

 38867282 ACAGTGAGGACATTGTTTCCTGAGAGAGGAAAAAATAATAATAATATGTAACAAATGATT 38867341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2959 ACAGTGAGGACATTGTTTCCTGAGAGAGGAAAAAATAATAATAATATGTAACAAATGATT 3018

 38867342 TCCCCAGCTTACTGCTCACATAGTTTCTAAGCCATGATGCAAAAACAGGGCTAGTTCATG 38867401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3019 TCCCCAGCTTACTGCTCACATAGTTTCTAAGCCATGATGCAAAAACAGGGCTAGTTCATG 3078

 38867402 GCAATTTTGACAGGATTCACTTATGTCACCCCAAATCTCTCAAGTTTTGTCAGTATTCCA 38867461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3079 GCAATTTTGACAGGATTCACTTATGTCACCCCAAATCTCTCAAGTTTTGTCAGTATTCCA 3138

 38867462 GTTCAGTCAGGCAAAGAATGGCTGAGTAAACAAGAAGCTTTGTTATTTCTTTCAGTGTTG 38867521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3139 GTTCAGTCAGGCAAAGAATGGCTGAGTAAACAAGAAGCTTTGTTATTTCTTTCAGTGTTG 3198

 38867522 GTTTCTATACCTCAAAATACCTCAGTAAATCTCAAGTAGAATAAATTGAAATAAGATAAA 38867581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3199 GTTTCTATACCTCAAAATACCTCAGTAAATCTCAAGTAGAATAAATTGAAATAAGATAAA 3258

 38867582 CACAAATAATCTTAACACATTATAGTTAAGTTGAATGCCACAGACAAAGGAAATATTTTG 38867641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3259 CACAAATAATCTTAACACATTATAGTTAAGTTGAATGCCACAGACAAAGGAAATATTTTG 3318

 38867642 AAAGCAACAAGATGAAAACAACATATATGCAGATGTACAATATCATTAATGACTGTTTTT 38867701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3319 AAAGCAACAAGATGAAAACAACATATATGCAGATGTACAATATCATTAATGACTGTTTTT 3378

 38867702 ATGCCAGAAATAAAATAGGCCAGAAACCAATGCAATGACAAATTGTTTGAATGAAATGTC 38867761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3379 ATGCCAGAAATAAAATAGGCCAGAAACCAATGCAATGACAAATTGTTTGAATGAAATGTC 3438

 38867762 AGCCAACTATTCTATATTCGGCAAAGCTACTTAAATGAAATGGACCACCACAGTGGCTCA 38867821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3439 AGCCAACTATTCTATATTCGGCAAAGCTACTTAAATGAAATGGACCACCACAGTGGCTCA 3498

 38867822 CGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATCATGAGGTCAAGATATAG 38867881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3499 CGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATCATGAGGTCAAGATATAG 3558

 38867882 AGACCATCCTGGACAACATGGTGAAATCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGG 38867941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3559 AGACCATCCTGGACAACATGGTGAAATCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGG 3618

 38867942 GCGTGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGGAGGAGAACCTCTT 38868001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3619 GCGTGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGGAGGAGAACCTCTT 3678

 38868002 GAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCAGAGATTGCACCACTACACTCCAGCCTGGTG 38868061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3679 GAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCAGAGATTGCACCACTACACTCCAGCCTGGTG 3738

 38868062 ACAAAGCGAGACACTGTCTCAAAAATATATATATATATATAATAAAAATAAGATGAAATA 38868121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3739 ACAAAGCGAGACACTGTCTCAAAAATATATATATATATATAATAAAAATAAGATGAAATA 3798

 38868122 CAGACATCCTCAGATGAACAAAGACTCGAGTAATTCATGGCTAGCAGGCATGACTTAAAG 38868181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3799 CAGACATCCTCAGATGAACAAAGACTCGAGTAATTCATGGCTAGCAGGCATGACTTAAAG 3858

 38868182 GAAAAACTAACGGAAACCCTGTAGGCCAAAGGAACGTAACACTAGACAGTAACTCTAACT 38868241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3859 GAAAAACTAACGGAAACCCTGTAGGCCAAAGGAACGTAACACTAGACAGTAACTCTAACT 3918

 38868242 CTAATTCAAGAGAGAATGTGCAGGAAGCCATAAACAGTAAACATAATAATCTATATTATG 38868301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3919 CTAATTCAAGAGAGAATGTGCAGGAAGCCATAAACAGTAAACATAATAATCTATATTATG 3978

 38868302 TAATTTAATAAAAAATACATTGCTTTAAAAATCCTTTTCTTAAAAATATTATTGTGTAAA 38868361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3979 TAATTTAATAAAAAATACATTGCTTTAAAAATCCTTTTCTTAAAAATATTATTGTGTAAA 4038

 38868362 CATAATTATAATATTATAGTGTTGGATTTATAACATATTTGGTGAAGTAATCGCACAAAG 38868421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4039 CATAATTATAATATTATAGTGTTGGATTTATAACATATTTGGTGAAGTAATCGCACAAAG 4098

 38868422 TAAAGAGAAGAAGAAAAGGGTATGTAAGTAAATAAAGATATTATATTTTACTGGAATTAA 38868481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4099 TAAAGAGAAGAAGAAAAGGGTATGTAAGTAAATAAAGATATTATATTTTACTGGAATTAA 4158

 38868482 GTTGGTACTATTCTTAAATGGATTATGATTAGATGAGATGCATATTGTAATTATTGTAGC 38868541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4159 GTTGGTACTATTCTTAAATGGATTATGATTAGATGAGATGCATATTGTAATTATTGTAGC 4218

 38868542 AACCACTAAGAAATAATATTAACACAAACAACAGAGGAATTAAAATGATAGATTAGAAAA 38868601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4219 AACCACTAAGAAATAATATTAACACAAACAACAGAGGAATTAAAATGATAGATTAGAAAA 4278

 38868602 ACCATTTATATATCACAAAATATAACAGTAAATGAGAAACAGAGGAATATATTTAAAATG 38868661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4279 ACCATTTATATATCACAAAATATAACAGTAAATGAGAAACAGAGGAATATATTTAAAATG 4338

 38868662 AGCCTGGTTGCAGCGGCTCACACCTGTAATCTTAGCAACTTGGAAGGCCAAGGTAGGAGG 38868721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     4339 AGCCTGGTTGCAGCGGCTCACACCTGTAATCTTAGCAACTTGGAAGGCTAAGGTAGGAGG 4398

 38868722 AAGTCTTGAGCCCAGGAGTTCAAGATCAGCCTGAGCAACACAGTGAGACCCCCATCTCTA 38868781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4399 AAGTCTTGAGCCCAGGAGTTCAAGATCAGCCTGAGCAACACAGTGAGACCCCCATCTCTA 4458

 38868782 CAAAAAGTAGAAATTTGGCAAGGCATCATGATAGGCACCTGTAGTCCCAGCTACTGATGA 38868841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4459 CAAAAAGTAGAAATTTGGCAAGGCATCATGATAGGCACCTGTAGTCCCAGCTACTGATGA 4518

 38868842 AGCTAAGGCAAGAGGATTTCTTGAGCCTCTGAGGTCAAGGCTACAGTGAGCTATGATCAC 38868901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4519 AGCTAAGGCAAGAGGATTTCTTGAGCCTCTGAGGTCAAGGCTACAGTGAGCTATGATCAC 4578

 38868902 ACCACTGCGCTCCAGCTTTGGAGACAGAGCAAGACTCTACAGCAATAAATAAATAAATAG 38868961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4579 ACCACTGCGCTCCAGCTTTGGAGACAGAGCAAGACTCTACAGCAATAAATAAATAAATAG 4638

 38868962 AAAGCAAATAGAAAAATGACAGGCATAAATCCAACTGTAGCAATACTTAATACATGAAAA 38869021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4639 AAAGCAAATAGAAAAATGACAGGCATAAATCCAACTGTAGCAATACTTAATACATGAAAA 4698

 38869022 GCAAATAAACCAAG 38869035
          ||||||||||||||
     4699 GCAAATAAACCAAG 4712

Alignment time is 4.19198 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38854779,38878343] =>     23565 nucs '18 dna:chromosome chromosome:GRCh37:18:1:78077248:1'
Second seq [       1,    2686] =>      2686 nucs 'mol-32-2fb7-194208_2686'

Score:        2675
Aligned:      2686        nucs
Identic:      2685 (100%) nucs =>       725 (100%)      1960 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38866586,38867310] EXCISED REGION [38867312,38869272]
 second seq =>  [       1,     725] EXCISED REGION [     726,    2686]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [38867311,38867311]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [38868797,38868797]
 second seq =>         1 nucs [2211,2211]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         5 nucs [38867311,38867315] to [38867312,38867316]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 38866586 CCAAGGGTTTGAGGCTAGCCTGGGCATCACAGCAAGAACCCATCCCTACAAGAAAAATTT 38866645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCAAGGGTTTGAGGCTAGCCTGGGCATCACAGCAAGAACCCATCCCTACAAGAAAAATTT 60

 38866646 TTAAAAGTTACCTAGACATGGTGGCATACGCCTGTAGTCATAGCTACTTGGGAGGCTGGG 38866705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTAAAAGTTACCTAGACATGGTGGCATACGCCTGTAGTCATAGCTACTTGGGAGGCTGGG 120

 38866706 GCAAGAAGATTGCTTGAGCCCCGGAATTTCAGGCTGCAGTGACCTATGCTAATGCCACTG 38866765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GCAAGAAGATTGCTTGAGCCCCGGAATTTCAGGCTGCAGTGACCTATGCTAATGCCACTG 180

 38866766 CTCTCCTGCCTGAGTGACAGAGTGAGATTCTGTCTCTTAAAAACAAACAAACAAACAAAA 38866825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTCTCCTGCCTGAGTGACAGAGTGAGATTCTGTCTCTTAAAAACAAACAAACAAACAAAA 240

 38866826 AGATTGAAGGGATGAATAGGTAGAGCACAGACAAGTCTTAGGTCTGTCAATATTCTGTAT 38866885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGATTGAAGGGATGAATAGGTAGAGCACAGACAAGTCTTAGGTCTGTCAATATTCTGTAT 300

 38866886 GATACTATAATAATGGATGTATGTCATCATACATTTATTTATATCCACAGAATGTAAAAC 38866945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GATACTATAATAATGGATGTATGTCATCATACATTTATTTATATCCACAGAATGTAAAAC 360

 38866946 ACCAGGAGTAAATTCTATTTTAAACTCTGGGCGTTTTGTGATAATGATGCATTAATGAAA 38867005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACCAGGAGTAAATTCTATTTTAAACTCTGGGCGTTTTGTGATAATGATGCATTAATGAAA 420

 38867006 GTTCATCAGTGATGTAACAAATGCACTACTGCCATGTGGAATGTTGATACTGGGGGAGTT 38867065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTTCATCAGTGATGTAACAAATGCACTACTGCCATGTGGAATGTTGATACTGGGGGAGTT 480

 38867066 TGCCATGTGTGAGGACAGCAGGTATATGAAAACTCCCTGCACTTTCTGCTTAATTTTGCT 38867125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGCCATGTGTGAGGACAGCAGGTATATGAAAACTCCCTGCACTTTCTGCTTAATTTTGCT 540

 38867126 GTGAACCTAAAGCTGCTCTATATAATAAAGTTTATTAATTAAAAAAACCTCTGTTACAGC 38867185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GTGAACCTAAAGCTGCTCTATATAATAAAGTTTATTAATTAAAAAAACCTCTGTTACAGC 600

 38867186 AAAATTGAGTAACAGACACCATATTTTTCCTCCTGCCCCCCCCCCCAAAATTAACAAAGT 38867245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAAATTGAGTAACAGACACCATATTTTTCCTCCTGCCCCCCCCCCCAAAATTAACAAAGT 660

 38867246 ATAGAAAACAATGACTCTGAGAAGAGTGAACATTAGACAGTGAGGACATTGTTTCCTGAG 38867305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATAGAAAACAATGACTCTGAGAAGAGTGAACATTAGACAGTGAGGACATTGTTTCCTGAG 720

 38867306 AGAGG 38867310
          |||||
      721 AGAGG 725

EXCISED REGION

 38867312 AAAAATAATAATAATATGTAACAAATGATTTCCCCAGCTTACTGCTCACATAGTTTCTAA 38867371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      726 AAAAATAATAATAATATGTAACAAATGATTTCCCCAGCTTACTGCTCACATAGTTTCTAA 785

 38867372 GCCATGATGCAAAAACAGGGCTAGTTCATGGCAATTTTGACAGGATTCACTTATGTCACC 38867431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      786 GCCATGATGCAAAAACAGGGCTAGTTCATGGCAATTTTGACAGGATTCACTTATGTCACC 845

 38867432 CCAAATCTCTCAAGTTTTGTCAGTATTCCAGTTCAGTCAGGCAAAGAATGGCTGAGTAAA 38867491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      846 CCAAATCTCTCAAGTTTTGTCAGTATTCCAGTTCAGTCAGGCAAAGAATGGCTGAGTAAA 905

 38867492 CAAGAAGCTTTGTTATTTCTTTCAGTGTTGGTTTCTATACCTCAAAATACCTCAGTAAAT 38867551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      906 CAAGAAGCTTTGTTATTTCTTTCAGTGTTGGTTTCTATACCTCAAAATACCTCAGTAAAT 965

 38867552 CTCAAGTAGAATAAATTGAAATAAGATAAACACAAATAATCTTAACACATTATAGTTAAG 38867611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      966 CTCAAGTAGAATAAATTGAAATAAGATAAACACAAATAATCTTAACACATTATAGTTAAG 1025

 38867612 TTGAATGCCACAGACAAAGGAAATATTTTGAAAGCAACAAGATGAAAACAACATATATGC 38867671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1026 TTGAATGCCACAGACAAAGGAAATATTTTGAAAGCAACAAGATGAAAACAACATATATGC 1085

 38867672 AGATGTACAATATCATTAATGACTGTTTTTATGCCAGAAATAAAATAGGCCAGAAACCAA 38867731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1086 AGATGTACAATATCATTAATGACTGTTTTTATGCCAGAAATAAAATAGGCCAGAAACCAA 1145

 38867732 TGCAATGACAAATTGTTTGAATGAAATGTCAGCCAACTATTCTATATTCGGCAAAGCTAC 38867791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1146 TGCAATGACAAATTGTTTGAATGAAATGTCAGCCAACTATTCTATATTCGGCAAAGCTAC 1205

 38867792 TTAAATGAAATGGACCACCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCA 38867851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1206 TTAAATGAAATGGACCACCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCA 1265

 38867852 AGGTGGGCAGATCATGAGGTCAAGATATAGAGACCATCCTGGACAACATGGTGAAATCCT 38867911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1266 AGGTGGGCAGATCATGAGGTCAAGATATAGAGACCATCCTGGACAACATGGTGAAATCCT 1325

 38867912 GTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCT 38867971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1326 GTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCT 1385

 38867972 ACTCAGGAGGCTGAGGGAGGAGAACCTCTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCA 38868031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1386 ACTCAGGAGGCTGAGGGAGGAGAACCTCTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCA 1445

 38868032 GAGATTGCACCACTACACTCCAGCCTGGTGACAAAGCGAGACACTGTCTCAAAAATATAT 38868091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1446 GAGATTGCACCACTACACTCCAGCCTGGTGACAAAGCGAGACACTGTCTCAAAAATATAT 1505

 38868092 ATATATATATAATAAAAATAAGATGAAATACAGACATCCTCAGATGAACAAAGACTCGAG 38868151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1506 ATATATATATAATAAAAATAAGATGAAATACAGACATCCTCAGATGAACAAAGACTCGAG 1565

 38868152 TAATTCATGGCTAGCAGGCATGACTTAAAGGAAAAACTAACGGAAACCCTGTAGGCCAAA 38868211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1566 TAATTCATGGCTAGCAGGCATGACTTAAAGGAAAAACTAACGGAAACCCTGTAGGCCAAA 1625

 38868212 GGAACGTAACACTAGACAGTAACTCTAACTCTAATTCAAGAGAGAATGTGCAGGAAGCCA 38868271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1626 GGAACGTAACACTAGACAGTAACTCTAACTCTAATTCAAGAGAGAATGTGCAGGAAGCCA 1685

 38868272 TAAACAGTAAACATAATAATCTATATTATGTAATTTAATAAAAAATACATTGCTTTAAAA 38868331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1686 TAAACAGTAAACATAATAATCTATATTATGTAATTTAATAAAAAATACATTGCTTTAAAA 1745

 38868332 ATCCTTTTCTTAAAAATATTATTGTGTAAACATAATTATAATATTATAGTGTTGGATTTA 38868391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1746 ATCCTTTTCTTAAAAATATTATTGTGTAAACATAATTATAATATTATAGTGTTGGATTTA 1805

 38868392 TAACATATTTGGTGAAGTAATCGCACAAAGTAAAGAGAAGAAGAAAAGGGTATGTAAGTA 38868451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1806 TAACATATTTGGTGAAGTAATCGCACAAAGTAAAGAGAAGAAGAAAAGGGTATGTAAGTA 1865

 38868452 AATAAAGATATTATATTTTACTGGAATTAAGTTGGTACTATTCTTAAATGGATTATGATT 38868511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1866 AATAAAGATATTATATTTTACTGGAATTAAGTTGGTACTATTCTTAAATGGATTATGATT 1925

 38868512 AGATGAGATGCATATTGTAATTATTGTAGCAACCACTAAGAAATAATATTAACACAAACA 38868571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1926 AGATGAGATGCATATTGTAATTATTGTAGCAACCACTAAGAAATAATATTAACACAAACA 1985

 38868572 ACAGAGGAATTAAAATGATAGATTAGAAAAACCATTTATATATCACAAAATATAACAGTA 38868631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1986 ACAGAGGAATTAAAATGATAGATTAGAAAAACCATTTATATATCACAAAATATAACAGTA 2045

 38868632 AATGAGAAACAGAGGAATATATTTAAAATGAGCCTGGTTGCAGCGGCTCACACCTGTAAT 38868691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2046 AATGAGAAACAGAGGAATATATTTAAAATGAGCCTGGTTGCAGCGGCTCACACCTGTAAT 2105

 38868692 CTTAGCAACTTGGAAGGCCAAGGTAGGAGGAAGTCTTGAGCCCAGGAGTTCAAGATCAGC 38868751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2106 CTTAGCAACTTGGAAGGCCAAGGTAGGAGGAAGTCTTGAGCCCAGGAGTTCAAGATCAGC 2165

 38868752 CTGAGCAACACAGTGAGACCCCCATCTCTACAAAAAGTAGAAATTTGGCAAGGCATCATG 38868811
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     2166 CTGAGCAACACAGTGAGACCCCCATCTCTACAAAAAGTAGAAATTCGGCAAGGCATCATG 2225

 38868812 ATAGGCACCTGTAGTCCCAGCTACTGATGAAGCTAAGGCAAGAGGATTTCTTGAGCCTCT 38868871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2226 ATAGGCACCTGTAGTCCCAGCTACTGATGAAGCTAAGGCAAGAGGATTTCTTGAGCCTCT 2285

 38868872 GAGGTCAAGGCTACAGTGAGCTATGATCACACCACTGCGCTCCAGCTTTGGAGACAGAGC 38868931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2286 GAGGTCAAGGCTACAGTGAGCTATGATCACACCACTGCGCTCCAGCTTTGGAGACAGAGC 2345

 38868932 AAGACTCTACAGCAATAAATAAATAAATAGAAAGCAAATAGAAAAATGACAGGCATAAAT 38868991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2346 AAGACTCTACAGCAATAAATAAATAAATAGAAAGCAAATAGAAAAATGACAGGCATAAAT 2405

 38868992 CCAACTGTAGCAATACTTAATACATGAAAAGCAAATAAACCAAGCACAACACATAAAAGG 38869051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2406 CCAACTGTAGCAATACTTAATACATGAAAAGCAAATAAACCAAGCACAACACATAAAAGG 2465

 38869052 AAAGGATTGTCAGATTTGATAGAAACAAGACCCAAGTATACACTGTCTATAATAGACACA 38869111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2466 AAAGGATTGTCAGATTTGATAGAAACAAGACCCAAGTATACACTGTCTATAATAGACACA 2525

 38869112 CATTATATTCAAATACATAAATAAATAAAAAGCAAAATGATGTAAAAAAGGTAAAGTATG 38869171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2526 CATTATATTCAAATACATAAATAAATAAAAAGCAAAATGATGTAAAAAAGGTAAAGTATG 2585

 38869172 AAATCAGTAACTCTATGACAGCTGAAGTAGCTGTATTAACATTATTTAAAATAGACTTTA 38869231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2586 AAATCAGTAACTCTATGACAGCTGAAGTAGCTGTATTAACATTATTTAAAATAGACTTTA 2645

 38869232 ATACAAGAAACACTATCAGAGAAGAAAAGCCATATTTCATA 38869272
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2646 ATACAAGAAACACTATCAGAGAAGAAAAGCCATATTTCATA 2686

Alignment time is 2.29995 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38854779,38878343] =>     23565 nucs '18 dna:chromosome chromosome:GRCh37:18:1:78077248:1'
Second seq [       1,    3347] =>      3347 nucs 'mol-32-2fd8-156528_3347'

Score:        3347
Aligned:      3347        nucs
Identic:      3347 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38864542,38867888]
 second seq =>  [       1,    3347]

 38864542 GGAATTTGAAATTAAAAACACATTATCATTTATATTAGCATCCTCAAAATGTAATATTTC 38864601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGAATTTGAAATTAAAAACACATTATCATTTATATTAGCATCCTCAAAATGTAATATTTC 60

 38864602 TGCATAAATTTAACAAAATATGTATATAATTTATATGAGGAGAACTACAAAATTCTGAAG 38864661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGCATAAATTTAACAAAATATGTATATAATTTATATGAGGAGAACTACAAAATTCTGAAG 120

 38864662 AAATATGTCAAAGACTAAATAAATGGAAAGATATCTCAGGTTCATGGGTAGAAAGACTCA 38864721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAATATGTCAAAGACTAAATAAATGGAAAGATATCTCAGGTTCATGGGTAGAAAGACTCA 180

 38864722 ATATTGTTGAAATGTTAATTCTTCCCAACTTAATCTATAGATTCAATGTAATTACAATCA 38864781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATATTGTTGAAATGTTAATTCTTCCCAACTTAATCTATAGATTCAATGTAATTACAATCA 240

 38864782 AAAATGAAAGTAAGTTTTGTGTGTGTTTGTGTGAATCTTGACAAACTGATTTTAAAGTTC 38864841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAAATGAAAGTAAGTTTTGTGTGTGTTTGTGTGAATCTTGACAAACTGATTTTAAAGTTC 300

 38864842 ATATGGAGAGGAAAATGACCCAGAATAGCCACCACAATGTTGAGGGAGAACAAAGTGAGA 38864901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATATGGAGAGGAAAATGACCCAGAATAGCCACCACAATGTTGAGGGAGAACAAAGTGAGA 360

 38864902 AGACAGCACTACCCAACTTCAAGACTTGCTGAAAAGCTACAGCAATCAAGATAGTGAGGT 38864961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGACAGCACTACCCAACTTCAAGACTTGCTGAAAAGCTACAGCAATCAAGATAGTGAGGT 420

 38864962 ATTGGTAAAAGATAAAAAAACAGGTCAATGAAACAACATAGTGTACTCAGACATAACCCA 38865021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATTGGTAAAAGATAAAAAAACAGGTCAATGAAACAACATAGTGTACTCAGACATAACCCA 480

 38865022 CATAATATACTCAACTGATCTTTGACAAAGGTGCAAGTTCAAGACAATGGAGCAAAGATA 38865081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CATAATATACTCAACTGATCTTTGACAAAGGTGCAAGTTCAAGACAATGGAGCAAAGATA 540

 38865082 GTCTTTTCAATAAATAGTGGTAAGAAAACTAGGCATAACATGCAAGAATAAAATGTAAAT 38865141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GTCTTTTCAATAAATAGTGGTAAGAAAACTAGGCATAACATGCAAGAATAAAATGTAAAT 600

 38865142 CTAGATATAGACCTTATGATCTTCACAAAAATTAATTCAAAATGAACTTTAGAGCTCAAT 38865201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTAGATATAGACCTTATGATCTTCACAAAAATTAATTCAAAATGAACTTTAGAGCTCAAT 660

 38865202 TTAAAATGTAAAATTATAAAGCTCCTAGAAGGTAACATCAGAGAGAAACTAGGTGACCTT 38865261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTAAAATGTAAAATTATAAAGCTCCTAGAAGGTAACATCAGAGAGAAACTAGGTGACCTT 720

 38865262 GGTTTGGTGTTAACTTTTTAGAAACAACACCAGAAGTATGACCCATGAAAGAAAGAATTG 38865321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GGTTTGGTGTTAACTTTTTAGAAACAACACCAGAAGTATGACCCATGAAAGAAAGAATTG 780

 38865322 ATAAGCTGGACTTAACTAAAATTAAATACTTCTGTTTTGAGAAAGGCACTATCAAGATCA 38865381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATAAGCTGGACTTAACTAAAATTAAATACTTCTGTTTTGAGAAAGGCACTATCAAGATCA 840

 38865382 TTGGACCACAAGCAACAGACTGAAAGAAAATATCTGCAAAAGATAGATCTGATAAAGGCG 38865441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTGGACCACAAGCAACAGACTGAAAGAAAATATCTGCAAAAGATAGATCTGATAAAGGCG 900

 38865442 AGTCATTTAAAATATTCAAATATCTTTGAAAACTCAACCATAAGAACCCAAAAAACCTAG 38865501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGTCATTTAAAATATTCAAATATCTTTGAAAACTCAACCATAAGAACCCAAAAAACCTAG 960

 38865502 TTAAAAAATGGGCAAAATGTCTGAATAGGCACCCTACCAAAGAAGATATAGATAAGGTAA 38865561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTAAAAAATGGGCAAAATGTCTGAATAGGCACCCTACCAAAGAAGATATAGATAAGGTAA 1020

 38865562 ATGATCATATGAAAAGATATTCAACATCTTATGTCATTAGGGAATTGCAAACTCAAACAA 38865621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATGATCATATGAAAAGATATTCAACATCTTATGTCATTAGGGAATTGCAAACTCAAACAA 1080

 38865622 CAGTGAGATGCCGCTGCACACCAATTAGAATGGCCAAAATTCAAAACACAGCACCAAATA 38865681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CAGTGAGATGCCGCTGCACACCAATTAGAATGGCCAAAATTCAAAACACAGCACCAAATA 1140

 38865682 CTGGCCAGGGTGTGATGAAACAGAAACTTACTCATCTTTGGTAGAAATGCAAAATGGTAT 38865741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTGGCCAGGGTGTGATGAAACAGAAACTTACTCATCTTTGGTAGAAATGCAAAATGGTAT 1200

 38865742 AGCCACTTTGGAAGACAGTTTGATAGTTTCTTTAAAAAGTAAACATGTTCTTACCATACA 38865801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AGCCACTTTGGAAGACAGTTTGATAGTTTCTTTAAAAAGTAAACATGTTCTTACCATACA 1260

 38865802 TATGATCTTGAAATCATGCCACTTGGCATTTACCCAAAGGAGCTGAAAACTATATCCACA 38865861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TATGATCTTGAAATCATGCCACTTGGCATTTACCCAAAGGAGCTGAAAACTATATCCACA 1320

 38865862 CAAAATCCTGCACATGGATGTTTATGACAACTTTATTTACAATTGCCAAAGGTTTGAAGC 38865921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CAAAATCCTGCACATGGATGTTTATGACAACTTTATTTACAATTGCCAAAGGTTTGAAGC 1380

 38865922 AACCAAGATGTCCTTTAGTAGATTGATACATAAACTGTGGTACATCCAGACAATGAAATA 38865981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AACCAAGATGTCCTTTAGTAGATTGATACATAAACTGTGGTACATCCAGACAATGAAATA 1440

 38865982 TTGTATTTTTCCATTTTCACACTGCTGATAAAGACATACCCAAGACTGCATAATTTATAC 38866041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTGTATTTTTCCATTTTCACACTGCTGATAAAGACATACCCAAGACTGCATAATTTATAC 1500

 38866042 AGGAAAAGGGTTTAATGGACTTACACTTCCATGTGGCTGGGGAGGCCTCACAATCATGGA 38866101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AGGAAAAGGGTTTAATGGACTTACACTTCCATGTGGCTGGGGAGGCCTCACAATCATGGA 1560

 38866102 AGAAGTCAAGGAGGAGCAAGTCACATCTTACATAGATGGCAGCAGGCAAAGAGAGCTTGT 38866161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AGAAGTCAAGGAGGAGCAAGTCACATCTTACATAGATGGCAGCAGGCAAAGAGAGCTTGT 1620

 38866162 GCAGGGAAAAATCCCATTTTTAAAACCATAAAATCTCATGAGACGTATTCACTGTCAGAA 38866221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GCAGGGAAAAATCCCATTTTTAAAACCATAAAATCTCATGAGACGTATTCACTGTCAGAA 1680

 38866222 GAACAGCACAGGAAAGACCTGCCCCCATGATTCACTACCTCCCACCAGGTTCCTCCTATG 38866281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GAACAGCACAGGAAAGACCTGCCCCCATGATTCACTACCTCCCACCAGGTTCCTCCTATG 1740

 38866282 ACATGTGGGAACTGTGGGAGTTACAATTCAAGATGAGATCTGGGTGGGGACACAGCCAAA 38866341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ACATGTGGGAACTGTGGGAGTTACAATTCAAGATGAGATCTGGGTGGGGACACAGCCAAA 1800

 38866342 CCTTATCAAATATTATTTAGCATTAAAAAAACTGTAAAGCCATAAAAATATATGGACAAA 38866401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CCTTATCAAATATTATTTAGCATTAAAAAAACTGTAAAGCCATAAAAATATATGGACAAA 1860

 38866402 ACTTAAATGAATATTATTAACTGAAAGAAGACAATCTTAAAAAAAGACATACTGTGTAAT 38866461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ACTTAAATGAATATTATTAACTGAAAGAAGACAATCTTAAAAAAAGACATACTGTGTAAT 1920

 38866462 TCCAAATATACGGTATTCTGGAAAAGTCAAAATGTGGAGATAATACAATTAAAGTGGCTG 38866521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TCCAAATATACGGTATTCTGGAAAAGTCAAAATGTGGAGATAATACAATTAAAGTGGCTG 1980

 38866522 AGAATGGTGGCTCACGTCTGTCATATTAGTACTTGGCAGGCTGATATGGCATCATCACTT 38866581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AGAATGGTGGCTCACGTCTGTCATATTAGTACTTGGCAGGCTGATATGGCATCATCACTT 2040

 38866582 AAGGCCAAGGGTTTGAGGCTAGCCTGGGCATCACAGCAAGAACCCATCCCTACAAGAAAA 38866641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AAGGCCAAGGGTTTGAGGCTAGCCTGGGCATCACAGCAAGAACCCATCCCTACAAGAAAA 2100

 38866642 ATTTTTAAAAGTTACCTAGACATGGTGGCATACGCCTGTAGTCATAGCTACTTGGGAGGC 38866701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ATTTTTAAAAGTTACCTAGACATGGTGGCATACGCCTGTAGTCATAGCTACTTGGGAGGC 2160

 38866702 TGGGGCAAGAAGATTGCTTGAGCCCCGGAATTTCAGGCTGCAGTGACCTATGCTAATGCC 38866761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TGGGGCAAGAAGATTGCTTGAGCCCCGGAATTTCAGGCTGCAGTGACCTATGCTAATGCC 2220

 38866762 ACTGCTCTCCTGCCTGAGTGACAGAGTGAGATTCTGTCTCTTAAAAACAAACAAACAAAC 38866821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ACTGCTCTCCTGCCTGAGTGACAGAGTGAGATTCTGTCTCTTAAAAACAAACAAACAAAC 2280

 38866822 AAAAAGATTGAAGGGATGAATAGGTAGAGCACAGACAAGTCTTAGGTCTGTCAATATTCT 38866881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AAAAAGATTGAAGGGATGAATAGGTAGAGCACAGACAAGTCTTAGGTCTGTCAATATTCT 2340

 38866882 GTATGATACTATAATAATGGATGTATGTCATCATACATTTATTTATATCCACAGAATGTA 38866941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GTATGATACTATAATAATGGATGTATGTCATCATACATTTATTTATATCCACAGAATGTA 2400

 38866942 AAACACCAGGAGTAAATTCTATTTTAAACTCTGGGCGTTTTGTGATAATGATGCATTAAT 38867001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AAACACCAGGAGTAAATTCTATTTTAAACTCTGGGCGTTTTGTGATAATGATGCATTAAT 2460

 38867002 GAAAGTTCATCAGTGATGTAACAAATGCACTACTGCCATGTGGAATGTTGATACTGGGGG 38867061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GAAAGTTCATCAGTGATGTAACAAATGCACTACTGCCATGTGGAATGTTGATACTGGGGG 2520

 38867062 AGTTTGCCATGTGTGAGGACAGCAGGTATATGAAAACTCCCTGCACTTTCTGCTTAATTT 38867121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 AGTTTGCCATGTGTGAGGACAGCAGGTATATGAAAACTCCCTGCACTTTCTGCTTAATTT 2580

 38867122 TGCTGTGAACCTAAAGCTGCTCTATATAATAAAGTTTATTAATTAAAAAAACCTCTGTTA 38867181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TGCTGTGAACCTAAAGCTGCTCTATATAATAAAGTTTATTAATTAAAAAAACCTCTGTTA 2640

 38867182 CAGCAAAATTGAGTAACAGACACCATATTTTTCCTCCTGCCCCCCCCCCCAAAATTAACA 38867241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CAGCAAAATTGAGTAACAGACACCATATTTTTCCTCCTGCCCCCCCCCCCAAAATTAACA 2700

 38867242 AAGTATAGAAAACAATGACTCTGAGAAGAGTGAACATTAGACAGTGAGGACATTGTTTCC 38867301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AAGTATAGAAAACAATGACTCTGAGAAGAGTGAACATTAGACAGTGAGGACATTGTTTCC 2760

 38867302 TGAGAGAGGAAAAAATAATAATAATATGTAACAAATGATTTCCCCAGCTTACTGCTCACA 38867361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TGAGAGAGGAAAAAATAATAATAATATGTAACAAATGATTTCCCCAGCTTACTGCTCACA 2820

 38867362 TAGTTTCTAAGCCATGATGCAAAAACAGGGCTAGTTCATGGCAATTTTGACAGGATTCAC 38867421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TAGTTTCTAAGCCATGATGCAAAAACAGGGCTAGTTCATGGCAATTTTGACAGGATTCAC 2880

 38867422 TTATGTCACCCCAAATCTCTCAAGTTTTGTCAGTATTCCAGTTCAGTCAGGCAAAGAATG 38867481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TTATGTCACCCCAAATCTCTCAAGTTTTGTCAGTATTCCAGTTCAGTCAGGCAAAGAATG 2940

 38867482 GCTGAGTAAACAAGAAGCTTTGTTATTTCTTTCAGTGTTGGTTTCTATACCTCAAAATAC 38867541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 GCTGAGTAAACAAGAAGCTTTGTTATTTCTTTCAGTGTTGGTTTCTATACCTCAAAATAC 3000

 38867542 CTCAGTAAATCTCAAGTAGAATAAATTGAAATAAGATAAACACAAATAATCTTAACACAT 38867601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CTCAGTAAATCTCAAGTAGAATAAATTGAAATAAGATAAACACAAATAATCTTAACACAT 3060

 38867602 TATAGTTAAGTTGAATGCCACAGACAAAGGAAATATTTTGAAAGCAACAAGATGAAAACA 38867661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TATAGTTAAGTTGAATGCCACAGACAAAGGAAATATTTTGAAAGCAACAAGATGAAAACA 3120

 38867662 ACATATATGCAGATGTACAATATCATTAATGACTGTTTTTATGCCAGAAATAAAATAGGC 38867721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 ACATATATGCAGATGTACAATATCATTAATGACTGTTTTTATGCCAGAAATAAAATAGGC 3180

 38867722 CAGAAACCAATGCAATGACAAATTGTTTGAATGAAATGTCAGCCAACTATTCTATATTCG 38867781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 CAGAAACCAATGCAATGACAAATTGTTTGAATGAAATGTCAGCCAACTATTCTATATTCG 3240

 38867782 GCAAAGCTACTTAAATGAAATGGACCACCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTT 38867841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 GCAAAGCTACTTAAATGAAATGGACCACCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTT 3300

 38867842 TGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATCATGAGGTCAAGATATAGAGACCAT 38867888
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATCATGAGGTCAAGATATAGAGACCAT 3347

Alignment time is 2.40159 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38854779,38878343] =>     23565 nucs '18 dna:chromosome chromosome:GRCh37:18:1:78077248:1'
Second seq [       1,    2308] =>      2308 nucs 'mol-32-2fee-161023_2308'

Score:        2296
Aligned:      2307        nucs
Identic:      2306 (100%) nucs =>       870 (100%)      1436 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38864593,38865462] EXCISED REGION [38865464,38866900]
 second seq =>  [       1,     870] EXCISED REGION [     872,    2308]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [38865463,38865463]
 second seq =>         1 nucs [871,871]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [38865462,38865462] to [38865464,38865464]
 second seq =>         1 nucs [870,870] to [872,872]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 38864593 TAATATTTCTGCATAAATTTAACAAAATATGTATATAATTTATATGAGGAGAACTACAAA 38864652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TAATATTTCTGCATAAATTTAACAAAATATGTATATAATTTATATGAGGAGAACTACAAA 60

 38864653 ATTCTGAAGAAATATGTCAAAGACTAAATAAATGGAAAGATATCTCAGGTTCATGGGTAG 38864712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATTCTGAAGAAATATGTCAAAGACTAAATAAATGGAAAGATATCTCAGGTTCATGGGTAG 120

 38864713 AAAGACTCAATATTGTTGAAATGTTAATTCTTCCCAACTTAATCTATAGATTCAATGTAA 38864772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAAGACTCAATATTGTTGAAATGTTAATTCTTCCCAACTTAATCTATAGATTCAATGTAA 180

 38864773 TTACAATCAAAAATGAAAGTAAGTTTTGTGTGTGTTTGTGTGAATCTTGACAAACTGATT 38864832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTACAATCAAAAATGAAAGTAAGTTTTGTGTGTGTTTGTGTGAATCTTGACAAACTGATT 240

 38864833 TTAAAGTTCATATGGAGAGGAAAATGACCCAGAATAGCCACCACAATGTTGAGGGAGAAC 38864892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTAAAGTTCATATGGAGAGGAAAATGACCCAGAATAGCCACCACAATGTTGAGGGAGAAC 300

 38864893 AAAGTGAGAAGACAGCACTACCCAACTTCAAGACTTGCTGAAAAGCTACAGCAATCAAGA 38864952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAAGTGAGAAGACAGCACTACCCAACTTCAAGACTTGCTGAAAAGCTACAGCAATCAAGA 360

 38864953 TAGTGAGGTATTGGTAAAAGATAAAAAAACAGGTCAATGAAACAACATAGTGTACTCAGA 38865012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TAGTGAGGTATTGGTAAAAGATAAAAAAACAGGTCAATGAAACAACATAGTGTACTCAGA 420

 38865013 CATAACCCACATAATATACTCAACTGATCTTTGACAAAGGTGCAAGTTCAAGACAATGGA 38865072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CATAACCCACATAATATACTCAACTGATCTTTGACAAAGGTGCAAGTTCAAGACAATGGA 480

 38865073 GCAAAGATAGTCTTTTCAATAAATAGTGGTAAGAAAACTAGGCATAACATGCAAGAATAA 38865132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GCAAAGATAGTCTTTTCAATAAATAGTGGTAAGAAAACTAGGCATAACATGCAAGAATAA 540

 38865133 AATGTAAATCTAGATATAGACCTTATGATCTTCACAAAAATTAATTCAAAATGAACTTTA 38865192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AATGTAAATCTAGATATAGACCTTATGATCTTCACAAAAATTAATTCAAAATGAACTTTA 600

 38865193 GAGCTCAATTTAAAATGTAAAATTATAAAGCTCCTAGAAGGTAACATCAGAGAGAAACTA 38865252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GAGCTCAATTTAAAATGTAAAATTATAAAGCTCCTAGAAGGTAACATCAGAGAGAAACTA 660

 38865253 GGTGACCTTGGTTTGGTGTTAACTTTTTAGAAACAACACCAGAAGTATGACCCATGAAAG 38865312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGTGACCTTGGTTTGGTGTTAACTTTTTAGAAACAACACCAGAAGTATGACCCATGAAAG 720

 38865313 AAAGAATTGATAAGCTGGACTTAACTAAAATTAAATACTTCTGTTTTGAGAAAGGCACTA 38865372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAAGAATTGATAAGCTGGACTTAACTAAAATTAAATACTTCTGTTTTGAGAAAGGCACTA 780

 38865373 TCAAGATCATTGGACCACAAGCAACAGACTGAAAGAAAATATCTGCAAAAGATAGATCTG 38865432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCAAGATCATTGGACCACAAGCAACAGACTGAAAGAAAATATCTGCAAAAGATAGATCTG 840

 38865433 ATAAAGGCGAGTCATTTAAAATATTCAAAT 38865462
          ||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATAAAGGCGAGTCATTTAAAATATTCAAAT 870

EXCISED REGION

 38865464 TCTTTGAAAACTCAACCATAAGAACCCAAAAAACCTAGTTAAAAAATGGGCAAAATGTCT 38865523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      872 TCTTTGAAAACTCAACCATAAGAACCCAAAAAACCTAGTTAAAAAATGGGCAAAATGTCT 931

 38865524 GAATAGGCACCCTACCAAAGAAGATATAGATAAGGTAAATGATCATATGAAAAGATATTC 38865583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      932 GAATAGGCACCCTACCAAAGAAGATATAGATAAGGTAAATGATCATATGAAAAGATATTC 991

 38865584 AACATCTTATGTCATTAGGGAATTGCAAACTCAAACAACAGTGAGATGCCGCTGCACACC 38865643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      992 AACATCTTATGTCATTAGGGAATTGCAAACTCAAACAACAGTGAGATGCCGCTGCACACC 1051

 38865644 AATTAGAATGGCCAAAATTCAAAACACAGCACCAAATACTGGCCAGGGTGTGATGAAACA 38865703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1052 AATTAGAATGGCCAAAATTCAAAACACAGCACCAAATACTGGCCAGGGTGTGATGAAACA 1111

 38865704 GAAACTTACTCATCTTTGGTAGAAATGCAAAATGGTATAGCCACTTTGGAAGACAGTTTG 38865763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1112 GAAACTTACTCATCTTTGGTAGAAATGCAAAATGGTATAGCCACTTTGGAAGACAGTTTG 1171

 38865764 ATAGTTTCTTTAAAAAGTAAACATGTTCTTACCATACATATGATCTTGAAATCATGCCAC 38865823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1172 ATAGTTTCTTTAAAAAGTAAACATGTTCTTACCATACATATGATCTTGAAATCATGCCAC 1231

 38865824 TTGGCATTTACCCAAAGGAGCTGAAAACTATATCCACACAAAATCCTGCACATGGATGTT 38865883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1232 TTGGCATTTACCCAAAGGAGCTGAAAACTATATCCACACAAAATCCTGCACATGGATGTT 1291

 38865884 TATGACAACTTTATTTACAATTGCCAAAGGTTTGAAGCAACCAAGATGTCCTTTAGTAGA 38865943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1292 TATGACAACTTTATTTACAATTGCCAAAGGTTTGAAGCAACCAAGATGTCCTTTAGTAGA 1351

 38865944 TTGATACATAAACTGTGGTACATCCAGACAATGAAATATTGTATTTTTCCATTTTCACAC 38866003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1352 TTGATACATAAACTGTGGTACATCCAGACAATGAAATATTGTATTTTTCCATTTTCACAC 1411

 38866004 TGCTGATAAAGACATACCCAAGACTGCATAATTTATACAGGAAAAGGGTTTAATGGACTT 38866063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1412 TGCTGATAAAGACATACCCAAGACTGCATAATTTATACAGGAAAAGGGTTTAATGGACTT 1471

 38866064 ACACTTCCATGTGGCTGGGGAGGCCTCACAATCATGGAAGAAGTCAAGGAGGAGCAAGTC 38866123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1472 ACACTTCCATGTGGCTGGGGAGGCCTCACAATCATGGAAGAAGTCAAGGAGGAGCAAGTC 1531

 38866124 ACATCTTACATAGATGGCAGCAGGCAAAGAGAGCTTGTGCAGGGAAAAATCCCATTTTTA 38866183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1532 ACATCTTACATAGATGGCAGCAGGCAAAGAGAGCTTGTGCAGGGAAAAATCCCATTTTTA 1591

 38866184 AAACCATAAAATCTCATGAGACGTATTCACTGTCAGAAGAACAGCACAGGAAAGACCTGC 38866243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1592 AAACCATAAAATCTCATGAGACGTATTCACTGTCAGAAGAACAGCACAGGAAAGACCTGC 1651

 38866244 CCCCATGATTCACTACCTCCCACCAGGTTCCTCCTATGACATGTGGGAACTGTGGGAGTT 38866303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1652 CCCCATGATTCACTACCTCCCACCAGGTTCCTCCTATGACATGTGGGAACTGTGGGAGTT 1711

 38866304 ACAATTCAAGATGAGATCTGGGTGGGGACACAGCCAAACCTTATCAAATATTATTTAGCA 38866363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1712 ACAATTCAAGATGAGATCTGGGTGGGGACACAGCCAAACCTTATCAAATATTATTTAGCA 1771

 38866364 TTAAAAAAACTGTAAAGCCATAAAAATATATGGACAAAACTTAAATGAATATTATTAACT 38866423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1772 TTAAAAAAACTGTAAAGCCATAAAAATATATGGACAAAACTTAAATGAATATTATTAACT 1831

 38866424 GAAAGAAGACAATCTTAAAAAAAGACATACTGTGTAATTCCAAATATACGGTATTCTGGA 38866483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1832 GAAAGAAGACAATCTTAAAAAAAGACATACTGTGTAATTCCAAATATACGGTATTCTGGA 1891

 38866484 AAAGTCAAAATGTGGAGATAATACAATTAAAGTGGCTGAGAATGGTGGCTCACGTCTGTC 38866543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1892 AAAGTCAAAATGTGGAGATAATACAATTAAAGTGGCTGAGAATGGTGGCTCACGTCTGTC 1951

 38866544 ATATTAGTACTTGGCAGGCTGATATGGCATCATCACTTAAGGCCAAGGGTTTGAGGCTAG 38866603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1952 ATATTAGTACTTGGCAGGCTGATATGGCATCATCACTTAAGGCCAAGGGTTTGAGGCTAG 2011

 38866604 CCTGGGCATCACAGCAAGAACCCATCCCTACAAGAAAAATTTTTAAAAGTTACCTAGACA 38866663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2012 CCTGGGCATCACAGCAAGAACCCATCCCTACAAGAAAAATTTTTAAAAGTTACCTAGACA 2071

 38866664 TGGTGGCATACGCCTGTAGTCATAGCTACTTGGGAGGCTGGGGCAAGAAGATTGCTTGAG 38866723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2072 TGGTGGCATACGCCTGTAGTCATAGCTACTTGGGAGGCTGGGGCAAGAAGATTGCTTGAG 2131

 38866724 CCCCGGAATTTCAGGCTGCAGTGACCTATGCTAATGCCACTGCTCTCCTGCCTGAGTGAC 38866783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2132 CCCCGGAATTTCAGGCTGCAGTGACCTATGCTAATGCCACTGCTCTCCTGCCTGAGTGAC 2191

 38866784 AGAGTGAGATTCTGTCTCTTAAAAACAAACAAACAAACAAAAAGATTGAAGGGATGAATA 38866843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2192 AGAGTGAGATTCTGTCTCTTAAAAACAAACAAACAAACAAAAAGATTGAAGGGATGAATA 2251

 38866844 GGTAGAGCACAGACAAGTCTTAGGTCTGTCAATATTCTGTATGATACTATAATAATG 38866900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     2252 GGTAGAGCACAGACAAGTCTTAGGTCTGTCAATATTCTGTGTGATACTATAATAATG 2308

Alignment time is 1.93922 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38854779,38878343] =>     23565 nucs '18 dna:chromosome chromosome:GRCh37:18:1:78077248:1'
Second seq [       1,    4609] =>      4609 nucs 'mol-32-2fee-216987_4609'

Score:        4609
Aligned:      4609        nucs
Identic:      4609 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38864502,38869110]
 second seq =>  [       1,    4609]

 38864502 AAAATTGAATTACTTTTCCATATATCCACAATCAACAAATGGAATTTGAAATTAAAAACA 38864561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAAATTGAATTACTTTTCCATATATCCACAATCAACAAATGGAATTTGAAATTAAAAACA 60

 38864562 CATTATCATTTATATTAGCATCCTCAAAATGTAATATTTCTGCATAAATTTAACAAAATA 38864621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CATTATCATTTATATTAGCATCCTCAAAATGTAATATTTCTGCATAAATTTAACAAAATA 120

 38864622 TGTATATAATTTATATGAGGAGAACTACAAAATTCTGAAGAAATATGTCAAAGACTAAAT 38864681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGTATATAATTTATATGAGGAGAACTACAAAATTCTGAAGAAATATGTCAAAGACTAAAT 180

 38864682 AAATGGAAAGATATCTCAGGTTCATGGGTAGAAAGACTCAATATTGTTGAAATGTTAATT 38864741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAATGGAAAGATATCTCAGGTTCATGGGTAGAAAGACTCAATATTGTTGAAATGTTAATT 240

 38864742 CTTCCCAACTTAATCTATAGATTCAATGTAATTACAATCAAAAATGAAAGTAAGTTTTGT 38864801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTTCCCAACTTAATCTATAGATTCAATGTAATTACAATCAAAAATGAAAGTAAGTTTTGT 300

 38864802 GTGTGTTTGTGTGAATCTTGACAAACTGATTTTAAAGTTCATATGGAGAGGAAAATGACC 38864861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTGTGTTTGTGTGAATCTTGACAAACTGATTTTAAAGTTCATATGGAGAGGAAAATGACC 360

 38864862 CAGAATAGCCACCACAATGTTGAGGGAGAACAAAGTGAGAAGACAGCACTACCCAACTTC 38864921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CAGAATAGCCACCACAATGTTGAGGGAGAACAAAGTGAGAAGACAGCACTACCCAACTTC 420

 38864922 AAGACTTGCTGAAAAGCTACAGCAATCAAGATAGTGAGGTATTGGTAAAAGATAAAAAAA 38864981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAGACTTGCTGAAAAGCTACAGCAATCAAGATAGTGAGGTATTGGTAAAAGATAAAAAAA 480

 38864982 CAGGTCAATGAAACAACATAGTGTACTCAGACATAACCCACATAATATACTCAACTGATC 38865041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CAGGTCAATGAAACAACATAGTGTACTCAGACATAACCCACATAATATACTCAACTGATC 540

 38865042 TTTGACAAAGGTGCAAGTTCAAGACAATGGAGCAAAGATAGTCTTTTCAATAAATAGTGG 38865101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTTGACAAAGGTGCAAGTTCAAGACAATGGAGCAAAGATAGTCTTTTCAATAAATAGTGG 600

 38865102 TAAGAAAACTAGGCATAACATGCAAGAATAAAATGTAAATCTAGATATAGACCTTATGAT 38865161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TAAGAAAACTAGGCATAACATGCAAGAATAAAATGTAAATCTAGATATAGACCTTATGAT 660

 38865162 CTTCACAAAAATTAATTCAAAATGAACTTTAGAGCTCAATTTAAAATGTAAAATTATAAA 38865221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTTCACAAAAATTAATTCAAAATGAACTTTAGAGCTCAATTTAAAATGTAAAATTATAAA 720

 38865222 GCTCCTAGAAGGTAACATCAGAGAGAAACTAGGTGACCTTGGTTTGGTGTTAACTTTTTA 38865281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GCTCCTAGAAGGTAACATCAGAGAGAAACTAGGTGACCTTGGTTTGGTGTTAACTTTTTA 780

 38865282 GAAACAACACCAGAAGTATGACCCATGAAAGAAAGAATTGATAAGCTGGACTTAACTAAA 38865341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GAAACAACACCAGAAGTATGACCCATGAAAGAAAGAATTGATAAGCTGGACTTAACTAAA 840

 38865342 ATTAAATACTTCTGTTTTGAGAAAGGCACTATCAAGATCATTGGACCACAAGCAACAGAC 38865401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATTAAATACTTCTGTTTTGAGAAAGGCACTATCAAGATCATTGGACCACAAGCAACAGAC 900

 38865402 TGAAAGAAAATATCTGCAAAAGATAGATCTGATAAAGGCGAGTCATTTAAAATATTCAAA 38865461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGAAAGAAAATATCTGCAAAAGATAGATCTGATAAAGGCGAGTCATTTAAAATATTCAAA 960

 38865462 TATCTTTGAAAACTCAACCATAAGAACCCAAAAAACCTAGTTAAAAAATGGGCAAAATGT 38865521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TATCTTTGAAAACTCAACCATAAGAACCCAAAAAACCTAGTTAAAAAATGGGCAAAATGT 1020

 38865522 CTGAATAGGCACCCTACCAAAGAAGATATAGATAAGGTAAATGATCATATGAAAAGATAT 38865581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTGAATAGGCACCCTACCAAAGAAGATATAGATAAGGTAAATGATCATATGAAAAGATAT 1080

 38865582 TCAACATCTTATGTCATTAGGGAATTGCAAACTCAAACAACAGTGAGATGCCGCTGCACA 38865641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TCAACATCTTATGTCATTAGGGAATTGCAAACTCAAACAACAGTGAGATGCCGCTGCACA 1140

 38865642 CCAATTAGAATGGCCAAAATTCAAAACACAGCACCAAATACTGGCCAGGGTGTGATGAAA 38865701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CCAATTAGAATGGCCAAAATTCAAAACACAGCACCAAATACTGGCCAGGGTGTGATGAAA 1200

 38865702 CAGAAACTTACTCATCTTTGGTAGAAATGCAAAATGGTATAGCCACTTTGGAAGACAGTT 38865761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CAGAAACTTACTCATCTTTGGTAGAAATGCAAAATGGTATAGCCACTTTGGAAGACAGTT 1260

 38865762 TGATAGTTTCTTTAAAAAGTAAACATGTTCTTACCATACATATGATCTTGAAATCATGCC 38865821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGATAGTTTCTTTAAAAAGTAAACATGTTCTTACCATACATATGATCTTGAAATCATGCC 1320

 38865822 ACTTGGCATTTACCCAAAGGAGCTGAAAACTATATCCACACAAAATCCTGCACATGGATG 38865881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ACTTGGCATTTACCCAAAGGAGCTGAAAACTATATCCACACAAAATCCTGCACATGGATG 1380

 38865882 TTTATGACAACTTTATTTACAATTGCCAAAGGTTTGAAGCAACCAAGATGTCCTTTAGTA 38865941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTTATGACAACTTTATTTACAATTGCCAAAGGTTTGAAGCAACCAAGATGTCCTTTAGTA 1440

 38865942 GATTGATACATAAACTGTGGTACATCCAGACAATGAAATATTGTATTTTTCCATTTTCAC 38866001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GATTGATACATAAACTGTGGTACATCCAGACAATGAAATATTGTATTTTTCCATTTTCAC 1500

 38866002 ACTGCTGATAAAGACATACCCAAGACTGCATAATTTATACAGGAAAAGGGTTTAATGGAC 38866061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ACTGCTGATAAAGACATACCCAAGACTGCATAATTTATACAGGAAAAGGGTTTAATGGAC 1560

 38866062 TTACACTTCCATGTGGCTGGGGAGGCCTCACAATCATGGAAGAAGTCAAGGAGGAGCAAG 38866121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTACACTTCCATGTGGCTGGGGAGGCCTCACAATCATGGAAGAAGTCAAGGAGGAGCAAG 1620

 38866122 TCACATCTTACATAGATGGCAGCAGGCAAAGAGAGCTTGTGCAGGGAAAAATCCCATTTT 38866181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TCACATCTTACATAGATGGCAGCAGGCAAAGAGAGCTTGTGCAGGGAAAAATCCCATTTT 1680

 38866182 TAAAACCATAAAATCTCATGAGACGTATTCACTGTCAGAAGAACAGCACAGGAAAGACCT 38866241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TAAAACCATAAAATCTCATGAGACGTATTCACTGTCAGAAGAACAGCACAGGAAAGACCT 1740

 38866242 GCCCCCATGATTCACTACCTCCCACCAGGTTCCTCCTATGACATGTGGGAACTGTGGGAG 38866301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GCCCCCATGATTCACTACCTCCCACCAGGTTCCTCCTATGACATGTGGGAACTGTGGGAG 1800

 38866302 TTACAATTCAAGATGAGATCTGGGTGGGGACACAGCCAAACCTTATCAAATATTATTTAG 38866361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTACAATTCAAGATGAGATCTGGGTGGGGACACAGCCAAACCTTATCAAATATTATTTAG 1860

 38866362 CATTAAAAAAACTGTAAAGCCATAAAAATATATGGACAAAACTTAAATGAATATTATTAA 38866421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CATTAAAAAAACTGTAAAGCCATAAAAATATATGGACAAAACTTAAATGAATATTATTAA 1920

 38866422 CTGAAAGAAGACAATCTTAAAAAAAGACATACTGTGTAATTCCAAATATACGGTATTCTG 38866481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CTGAAAGAAGACAATCTTAAAAAAAGACATACTGTGTAATTCCAAATATACGGTATTCTG 1980

 38866482 GAAAAGTCAAAATGTGGAGATAATACAATTAAAGTGGCTGAGAATGGTGGCTCACGTCTG 38866541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GAAAAGTCAAAATGTGGAGATAATACAATTAAAGTGGCTGAGAATGGTGGCTCACGTCTG 2040

 38866542 TCATATTAGTACTTGGCAGGCTGATATGGCATCATCACTTAAGGCCAAGGGTTTGAGGCT 38866601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TCATATTAGTACTTGGCAGGCTGATATGGCATCATCACTTAAGGCCAAGGGTTTGAGGCT 2100

 38866602 AGCCTGGGCATCACAGCAAGAACCCATCCCTACAAGAAAAATTTTTAAAAGTTACCTAGA 38866661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AGCCTGGGCATCACAGCAAGAACCCATCCCTACAAGAAAAATTTTTAAAAGTTACCTAGA 2160

 38866662 CATGGTGGCATACGCCTGTAGTCATAGCTACTTGGGAGGCTGGGGCAAGAAGATTGCTTG 38866721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CATGGTGGCATACGCCTGTAGTCATAGCTACTTGGGAGGCTGGGGCAAGAAGATTGCTTG 2220

 38866722 AGCCCCGGAATTTCAGGCTGCAGTGACCTATGCTAATGCCACTGCTCTCCTGCCTGAGTG 38866781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AGCCCCGGAATTTCAGGCTGCAGTGACCTATGCTAATGCCACTGCTCTCCTGCCTGAGTG 2280

 38866782 ACAGAGTGAGATTCTGTCTCTTAAAAACAAACAAACAAACAAAAAGATTGAAGGGATGAA 38866841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 ACAGAGTGAGATTCTGTCTCTTAAAAACAAACAAACAAACAAAAAGATTGAAGGGATGAA 2340

 38866842 TAGGTAGAGCACAGACAAGTCTTAGGTCTGTCAATATTCTGTATGATACTATAATAATGG 38866901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TAGGTAGAGCACAGACAAGTCTTAGGTCTGTCAATATTCTGTATGATACTATAATAATGG 2400

 38866902 ATGTATGTCATCATACATTTATTTATATCCACAGAATGTAAAACACCAGGAGTAAATTCT 38866961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ATGTATGTCATCATACATTTATTTATATCCACAGAATGTAAAACACCAGGAGTAAATTCT 2460

 38866962 ATTTTAAACTCTGGGCGTTTTGTGATAATGATGCATTAATGAAAGTTCATCAGTGATGTA 38867021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 ATTTTAAACTCTGGGCGTTTTGTGATAATGATGCATTAATGAAAGTTCATCAGTGATGTA 2520

 38867022 ACAAATGCACTACTGCCATGTGGAATGTTGATACTGGGGGAGTTTGCCATGTGTGAGGAC 38867081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 ACAAATGCACTACTGCCATGTGGAATGTTGATACTGGGGGAGTTTGCCATGTGTGAGGAC 2580

 38867082 AGCAGGTATATGAAAACTCCCTGCACTTTCTGCTTAATTTTGCTGTGAACCTAAAGCTGC 38867141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AGCAGGTATATGAAAACTCCCTGCACTTTCTGCTTAATTTTGCTGTGAACCTAAAGCTGC 2640

 38867142 TCTATATAATAAAGTTTATTAATTAAAAAAACCTCTGTTACAGCAAAATTGAGTAACAGA 38867201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TCTATATAATAAAGTTTATTAATTAAAAAAACCTCTGTTACAGCAAAATTGAGTAACAGA 2700

 38867202 CACCATATTTTTCCTCCTGCCCCCCCCCCCAAAATTAACAAAGTATAGAAAACAATGACT 38867261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CACCATATTTTTCCTCCTGCCCCCCCCCCCAAAATTAACAAAGTATAGAAAACAATGACT 2760

 38867262 CTGAGAAGAGTGAACATTAGACAGTGAGGACATTGTTTCCTGAGAGAGGAAAAAATAATA 38867321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CTGAGAAGAGTGAACATTAGACAGTGAGGACATTGTTTCCTGAGAGAGGAAAAAATAATA 2820

 38867322 ATAATATGTAACAAATGATTTCCCCAGCTTACTGCTCACATAGTTTCTAAGCCATGATGC 38867381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 ATAATATGTAACAAATGATTTCCCCAGCTTACTGCTCACATAGTTTCTAAGCCATGATGC 2880

 38867382 AAAAACAGGGCTAGTTCATGGCAATTTTGACAGGATTCACTTATGTCACCCCAAATCTCT 38867441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 AAAAACAGGGCTAGTTCATGGCAATTTTGACAGGATTCACTTATGTCACCCCAAATCTCT 2940

 38867442 CAAGTTTTGTCAGTATTCCAGTTCAGTCAGGCAAAGAATGGCTGAGTAAACAAGAAGCTT 38867501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CAAGTTTTGTCAGTATTCCAGTTCAGTCAGGCAAAGAATGGCTGAGTAAACAAGAAGCTT 3000

 38867502 TGTTATTTCTTTCAGTGTTGGTTTCTATACCTCAAAATACCTCAGTAAATCTCAAGTAGA 38867561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TGTTATTTCTTTCAGTGTTGGTTTCTATACCTCAAAATACCTCAGTAAATCTCAAGTAGA 3060

 38867562 ATAAATTGAAATAAGATAAACACAAATAATCTTAACACATTATAGTTAAGTTGAATGCCA 38867621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 ATAAATTGAAATAAGATAAACACAAATAATCTTAACACATTATAGTTAAGTTGAATGCCA 3120

 38867622 CAGACAAAGGAAATATTTTGAAAGCAACAAGATGAAAACAACATATATGCAGATGTACAA 38867681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 CAGACAAAGGAAATATTTTGAAAGCAACAAGATGAAAACAACATATATGCAGATGTACAA 3180

 38867682 TATCATTAATGACTGTTTTTATGCCAGAAATAAAATAGGCCAGAAACCAATGCAATGACA 38867741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TATCATTAATGACTGTTTTTATGCCAGAAATAAAATAGGCCAGAAACCAATGCAATGACA 3240

 38867742 AATTGTTTGAATGAAATGTCAGCCAACTATTCTATATTCGGCAAAGCTACTTAAATGAAA 38867801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 AATTGTTTGAATGAAATGTCAGCCAACTATTCTATATTCGGCAAAGCTACTTAAATGAAA 3300

 38867802 TGGACCACCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAG 38867861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TGGACCACCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAG 3360

 38867862 ATCATGAGGTCAAGATATAGAGACCATCCTGGACAACATGGTGAAATCCTGTCTCTACTA 38867921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 ATCATGAGGTCAAGATATAGAGACCATCCTGGACAACATGGTGAAATCCTGTCTCTACTA 3420

 38867922 AAAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGG 38867981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 AAAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGG 3480

 38867982 CTGAGGGAGGAGAACCTCTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCAGAGATTGCAC 38868041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 CTGAGGGAGGAGAACCTCTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCAGAGATTGCAC 3540

 38868042 CACTACACTCCAGCCTGGTGACAAAGCGAGACACTGTCTCAAAAATATATATATATATAT 38868101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 CACTACACTCCAGCCTGGTGACAAAGCGAGACACTGTCTCAAAAATATATATATATATAT 3600

 38868102 AATAAAAATAAGATGAAATACAGACATCCTCAGATGAACAAAGACTCGAGTAATTCATGG 38868161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 AATAAAAATAAGATGAAATACAGACATCCTCAGATGAACAAAGACTCGAGTAATTCATGG 3660

 38868162 CTAGCAGGCATGACTTAAAGGAAAAACTAACGGAAACCCTGTAGGCCAAAGGAACGTAAC 38868221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 CTAGCAGGCATGACTTAAAGGAAAAACTAACGGAAACCCTGTAGGCCAAAGGAACGTAAC 3720

 38868222 ACTAGACAGTAACTCTAACTCTAATTCAAGAGAGAATGTGCAGGAAGCCATAAACAGTAA 38868281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 ACTAGACAGTAACTCTAACTCTAATTCAAGAGAGAATGTGCAGGAAGCCATAAACAGTAA 3780

 38868282 ACATAATAATCTATATTATGTAATTTAATAAAAAATACATTGCTTTAAAAATCCTTTTCT 38868341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 ACATAATAATCTATATTATGTAATTTAATAAAAAATACATTGCTTTAAAAATCCTTTTCT 3840

 38868342 TAAAAATATTATTGTGTAAACATAATTATAATATTATAGTGTTGGATTTATAACATATTT 38868401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 TAAAAATATTATTGTGTAAACATAATTATAATATTATAGTGTTGGATTTATAACATATTT 3900

 38868402 GGTGAAGTAATCGCACAAAGTAAAGAGAAGAAGAAAAGGGTATGTAAGTAAATAAAGATA 38868461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 GGTGAAGTAATCGCACAAAGTAAAGAGAAGAAGAAAAGGGTATGTAAGTAAATAAAGATA 3960

 38868462 TTATATTTTACTGGAATTAAGTTGGTACTATTCTTAAATGGATTATGATTAGATGAGATG 38868521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 TTATATTTTACTGGAATTAAGTTGGTACTATTCTTAAATGGATTATGATTAGATGAGATG 4020

 38868522 CATATTGTAATTATTGTAGCAACCACTAAGAAATAATATTAACACAAACAACAGAGGAAT 38868581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 CATATTGTAATTATTGTAGCAACCACTAAGAAATAATATTAACACAAACAACAGAGGAAT 4080

 38868582 TAAAATGATAGATTAGAAAAACCATTTATATATCACAAAATATAACAGTAAATGAGAAAC 38868641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 TAAAATGATAGATTAGAAAAACCATTTATATATCACAAAATATAACAGTAAATGAGAAAC 4140

 38868642 AGAGGAATATATTTAAAATGAGCCTGGTTGCAGCGGCTCACACCTGTAATCTTAGCAACT 38868701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 AGAGGAATATATTTAAAATGAGCCTGGTTGCAGCGGCTCACACCTGTAATCTTAGCAACT 4200

 38868702 TGGAAGGCCAAGGTAGGAGGAAGTCTTGAGCCCAGGAGTTCAAGATCAGCCTGAGCAACA 38868761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 TGGAAGGCCAAGGTAGGAGGAAGTCTTGAGCCCAGGAGTTCAAGATCAGCCTGAGCAACA 4260

 38868762 CAGTGAGACCCCCATCTCTACAAAAAGTAGAAATTTGGCAAGGCATCATGATAGGCACCT 38868821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 CAGTGAGACCCCCATCTCTACAAAAAGTAGAAATTTGGCAAGGCATCATGATAGGCACCT 4320

 38868822 GTAGTCCCAGCTACTGATGAAGCTAAGGCAAGAGGATTTCTTGAGCCTCTGAGGTCAAGG 38868881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 GTAGTCCCAGCTACTGATGAAGCTAAGGCAAGAGGATTTCTTGAGCCTCTGAGGTCAAGG 4380

 38868882 CTACAGTGAGCTATGATCACACCACTGCGCTCCAGCTTTGGAGACAGAGCAAGACTCTAC 38868941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 CTACAGTGAGCTATGATCACACCACTGCGCTCCAGCTTTGGAGACAGAGCAAGACTCTAC 4440

 38868942 AGCAATAAATAAATAAATAGAAAGCAAATAGAAAAATGACAGGCATAAATCCAACTGTAG 38869001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 AGCAATAAATAAATAAATAGAAAGCAAATAGAAAAATGACAGGCATAAATCCAACTGTAG 4500

 38869002 CAATACTTAATACATGAAAAGCAAATAAACCAAGCACAACACATAAAAGGAAAGGATTGT 38869061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 CAATACTTAATACATGAAAAGCAAATAAACCAAGCACAACACATAAAAGGAAAGGATTGT 4560

 38869062 CAGATTTGATAGAAACAAGACCCAAGTATACACTGTCTATAATAGACAC 38869110
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 CAGATTTGATAGAAACAAGACCCAAGTATACACTGTCTATAATAGACAC 4609

Alignment time is 3.36871 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38854779,38878343] =>     23565 nucs '18 dna:chromosome chromosome:GRCh37:18:1:78077248:1'
Second seq [       1,    5003] =>      5003 nucs 'mol-32-300f-122460_5003'

Score:        5003
Aligned:      5003        nucs
Identic:      5003 (100%) nucs =>         6 (100%)      4997 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38857650,38857655] EXCISED REGION [38864337,38869333]
 second seq =>  [       1,       6] EXCISED REGION [       7,    5003]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6681 nucs [38857656,38864336]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 3
 first  seq =>      1748 nucs [38862589,38864336]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [38857655,38857655] to [38864337,38864337]
 second seq =>         1 nucs [6,6] to [7,7]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [38857656,38857656] to [38864336,38864336]
 second seq =>         0 nucs

 38857650 AAGGAG 38857655
          ||||||
        1 AAGGAG 6

EXCISED REGION

 38864337 GGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAATACAGATTGGGAAGAAAAAATAAAATTGTGTTTGT 38864396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        7 GGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAATACAGATTGGGAAGAAAAAATAAAATTGTGTTTGT 66

 38864397 TCACACATGACATGATTGTGTAGAAAATCCAAAAGAATCAACAAAAAAGCTTCCTGAAAT 38864456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       67 TCACACATGACATGATTGTGTAGAAAATCCAAAAGAATCAACAAAAAAGCTTCCTGAAAT 126

 38864457 TAACAAATAATTACAGCAAGTTTGCTGGAAATGAAGTTCATATACAAAATTGAATTACTT 38864516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      127 TAACAAATAATTACAGCAAGTTTGCTGGAAATGAAGTTCATATACAAAATTGAATTACTT 186

 38864517 TTCCATATATCCACAATCAACAAATGGAATTTGAAATTAAAAACACATTATCATTTATAT 38864576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      187 TTCCATATATCCACAATCAACAAATGGAATTTGAAATTAAAAACACATTATCATTTATAT 246

 38864577 TAGCATCCTCAAAATGTAATATTTCTGCATAAATTTAACAAAATATGTATATAATTTATA 38864636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      247 TAGCATCCTCAAAATGTAATATTTCTGCATAAATTTAACAAAATATGTATATAATTTATA 306

 38864637 TGAGGAGAACTACAAAATTCTGAAGAAATATGTCAAAGACTAAATAAATGGAAAGATATC 38864696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      307 TGAGGAGAACTACAAAATTCTGAAGAAATATGTCAAAGACTAAATAAATGGAAAGATATC 366

 38864697 TCAGGTTCATGGGTAGAAAGACTCAATATTGTTGAAATGTTAATTCTTCCCAACTTAATC 38864756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      367 TCAGGTTCATGGGTAGAAAGACTCAATATTGTTGAAATGTTAATTCTTCCCAACTTAATC 426

 38864757 TATAGATTCAATGTAATTACAATCAAAAATGAAAGTAAGTTTTGTGTGTGTTTGTGTGAA 38864816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      427 TATAGATTCAATGTAATTACAATCAAAAATGAAAGTAAGTTTTGTGTGTGTTTGTGTGAA 486

 38864817 TCTTGACAAACTGATTTTAAAGTTCATATGGAGAGGAAAATGACCCAGAATAGCCACCAC 38864876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      487 TCTTGACAAACTGATTTTAAAGTTCATATGGAGAGGAAAATGACCCAGAATAGCCACCAC 546

 38864877 AATGTTGAGGGAGAACAAAGTGAGAAGACAGCACTACCCAACTTCAAGACTTGCTGAAAA 38864936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      547 AATGTTGAGGGAGAACAAAGTGAGAAGACAGCACTACCCAACTTCAAGACTTGCTGAAAA 606

 38864937 GCTACAGCAATCAAGATAGTGAGGTATTGGTAAAAGATAAAAAAACAGGTCAATGAAACA 38864996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      607 GCTACAGCAATCAAGATAGTGAGGTATTGGTAAAAGATAAAAAAACAGGTCAATGAAACA 666

 38864997 ACATAGTGTACTCAGACATAACCCACATAATATACTCAACTGATCTTTGACAAAGGTGCA 38865056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      667 ACATAGTGTACTCAGACATAACCCACATAATATACTCAACTGATCTTTGACAAAGGTGCA 726

 38865057 AGTTCAAGACAATGGAGCAAAGATAGTCTTTTCAATAAATAGTGGTAAGAAAACTAGGCA 38865116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      727 AGTTCAAGACAATGGAGCAAAGATAGTCTTTTCAATAAATAGTGGTAAGAAAACTAGGCA 786

 38865117 TAACATGCAAGAATAAAATGTAAATCTAGATATAGACCTTATGATCTTCACAAAAATTAA 38865176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      787 TAACATGCAAGAATAAAATGTAAATCTAGATATAGACCTTATGATCTTCACAAAAATTAA 846

 38865177 TTCAAAATGAACTTTAGAGCTCAATTTAAAATGTAAAATTATAAAGCTCCTAGAAGGTAA 38865236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      847 TTCAAAATGAACTTTAGAGCTCAATTTAAAATGTAAAATTATAAAGCTCCTAGAAGGTAA 906

 38865237 CATCAGAGAGAAACTAGGTGACCTTGGTTTGGTGTTAACTTTTTAGAAACAACACCAGAA 38865296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      907 CATCAGAGAGAAACTAGGTGACCTTGGTTTGGTGTTAACTTTTTAGAAACAACACCAGAA 966

 38865297 GTATGACCCATGAAAGAAAGAATTGATAAGCTGGACTTAACTAAAATTAAATACTTCTGT 38865356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      967 GTATGACCCATGAAAGAAAGAATTGATAAGCTGGACTTAACTAAAATTAAATACTTCTGT 1026

 38865357 TTTGAGAAAGGCACTATCAAGATCATTGGACCACAAGCAACAGACTGAAAGAAAATATCT 38865416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1027 TTTGAGAAAGGCACTATCAAGATCATTGGACCACAAGCAACAGACTGAAAGAAAATATCT 1086

 38865417 GCAAAAGATAGATCTGATAAAGGCGAGTCATTTAAAATATTCAAATATCTTTGAAAACTC 38865476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1087 GCAAAAGATAGATCTGATAAAGGCGAGTCATTTAAAATATTCAAATATCTTTGAAAACTC 1146

 38865477 AACCATAAGAACCCAAAAAACCTAGTTAAAAAATGGGCAAAATGTCTGAATAGGCACCCT 38865536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1147 AACCATAAGAACCCAAAAAACCTAGTTAAAAAATGGGCAAAATGTCTGAATAGGCACCCT 1206

 38865537 ACCAAAGAAGATATAGATAAGGTAAATGATCATATGAAAAGATATTCAACATCTTATGTC 38865596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1207 ACCAAAGAAGATATAGATAAGGTAAATGATCATATGAAAAGATATTCAACATCTTATGTC 1266

 38865597 ATTAGGGAATTGCAAACTCAAACAACAGTGAGATGCCGCTGCACACCAATTAGAATGGCC 38865656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1267 ATTAGGGAATTGCAAACTCAAACAACAGTGAGATGCCGCTGCACACCAATTAGAATGGCC 1326

 38865657 AAAATTCAAAACACAGCACCAAATACTGGCCAGGGTGTGATGAAACAGAAACTTACTCAT 38865716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1327 AAAATTCAAAACACAGCACCAAATACTGGCCAGGGTGTGATGAAACAGAAACTTACTCAT 1386

 38865717 CTTTGGTAGAAATGCAAAATGGTATAGCCACTTTGGAAGACAGTTTGATAGTTTCTTTAA 38865776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1387 CTTTGGTAGAAATGCAAAATGGTATAGCCACTTTGGAAGACAGTTTGATAGTTTCTTTAA 1446

 38865777 AAAGTAAACATGTTCTTACCATACATATGATCTTGAAATCATGCCACTTGGCATTTACCC 38865836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1447 AAAGTAAACATGTTCTTACCATACATATGATCTTGAAATCATGCCACTTGGCATTTACCC 1506

 38865837 AAAGGAGCTGAAAACTATATCCACACAAAATCCTGCACATGGATGTTTATGACAACTTTA 38865896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1507 AAAGGAGCTGAAAACTATATCCACACAAAATCCTGCACATGGATGTTTATGACAACTTTA 1566

 38865897 TTTACAATTGCCAAAGGTTTGAAGCAACCAAGATGTCCTTTAGTAGATTGATACATAAAC 38865956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1567 TTTACAATTGCCAAAGGTTTGAAGCAACCAAGATGTCCTTTAGTAGATTGATACATAAAC 1626

 38865957 TGTGGTACATCCAGACAATGAAATATTGTATTTTTCCATTTTCACACTGCTGATAAAGAC 38866016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1627 TGTGGTACATCCAGACAATGAAATATTGTATTTTTCCATTTTCACACTGCTGATAAAGAC 1686

 38866017 ATACCCAAGACTGCATAATTTATACAGGAAAAGGGTTTAATGGACTTACACTTCCATGTG 38866076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1687 ATACCCAAGACTGCATAATTTATACAGGAAAAGGGTTTAATGGACTTACACTTCCATGTG 1746

 38866077 GCTGGGGAGGCCTCACAATCATGGAAGAAGTCAAGGAGGAGCAAGTCACATCTTACATAG 38866136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1747 GCTGGGGAGGCCTCACAATCATGGAAGAAGTCAAGGAGGAGCAAGTCACATCTTACATAG 1806

 38866137 ATGGCAGCAGGCAAAGAGAGCTTGTGCAGGGAAAAATCCCATTTTTAAAACCATAAAATC 38866196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1807 ATGGCAGCAGGCAAAGAGAGCTTGTGCAGGGAAAAATCCCATTTTTAAAACCATAAAATC 1866

 38866197 TCATGAGACGTATTCACTGTCAGAAGAACAGCACAGGAAAGACCTGCCCCCATGATTCAC 38866256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1867 TCATGAGACGTATTCACTGTCAGAAGAACAGCACAGGAAAGACCTGCCCCCATGATTCAC 1926

 38866257 TACCTCCCACCAGGTTCCTCCTATGACATGTGGGAACTGTGGGAGTTACAATTCAAGATG 38866316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1927 TACCTCCCACCAGGTTCCTCCTATGACATGTGGGAACTGTGGGAGTTACAATTCAAGATG 1986

 38866317 AGATCTGGGTGGGGACACAGCCAAACCTTATCAAATATTATTTAGCATTAAAAAAACTGT 38866376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1987 AGATCTGGGTGGGGACACAGCCAAACCTTATCAAATATTATTTAGCATTAAAAAAACTGT 2046

 38866377 AAAGCCATAAAAATATATGGACAAAACTTAAATGAATATTATTAACTGAAAGAAGACAAT 38866436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2047 AAAGCCATAAAAATATATGGACAAAACTTAAATGAATATTATTAACTGAAAGAAGACAAT 2106

 38866437 CTTAAAAAAAGACATACTGTGTAATTCCAAATATACGGTATTCTGGAAAAGTCAAAATGT 38866496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2107 CTTAAAAAAAGACATACTGTGTAATTCCAAATATACGGTATTCTGGAAAAGTCAAAATGT 2166

 38866497 GGAGATAATACAATTAAAGTGGCTGAGAATGGTGGCTCACGTCTGTCATATTAGTACTTG 38866556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2167 GGAGATAATACAATTAAAGTGGCTGAGAATGGTGGCTCACGTCTGTCATATTAGTACTTG 2226

 38866557 GCAGGCTGATATGGCATCATCACTTAAGGCCAAGGGTTTGAGGCTAGCCTGGGCATCACA 38866616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2227 GCAGGCTGATATGGCATCATCACTTAAGGCCAAGGGTTTGAGGCTAGCCTGGGCATCACA 2286

 38866617 GCAAGAACCCATCCCTACAAGAAAAATTTTTAAAAGTTACCTAGACATGGTGGCATACGC 38866676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2287 GCAAGAACCCATCCCTACAAGAAAAATTTTTAAAAGTTACCTAGACATGGTGGCATACGC 2346

 38866677 CTGTAGTCATAGCTACTTGGGAGGCTGGGGCAAGAAGATTGCTTGAGCCCCGGAATTTCA 38866736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2347 CTGTAGTCATAGCTACTTGGGAGGCTGGGGCAAGAAGATTGCTTGAGCCCCGGAATTTCA 2406

 38866737 GGCTGCAGTGACCTATGCTAATGCCACTGCTCTCCTGCCTGAGTGACAGAGTGAGATTCT 38866796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2407 GGCTGCAGTGACCTATGCTAATGCCACTGCTCTCCTGCCTGAGTGACAGAGTGAGATTCT 2466

 38866797 GTCTCTTAAAAACAAACAAACAAACAAAAAGATTGAAGGGATGAATAGGTAGAGCACAGA 38866856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2467 GTCTCTTAAAAACAAACAAACAAACAAAAAGATTGAAGGGATGAATAGGTAGAGCACAGA 2526

 38866857 CAAGTCTTAGGTCTGTCAATATTCTGTATGATACTATAATAATGGATGTATGTCATCATA 38866916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2527 CAAGTCTTAGGTCTGTCAATATTCTGTATGATACTATAATAATGGATGTATGTCATCATA 2586

 38866917 CATTTATTTATATCCACAGAATGTAAAACACCAGGAGTAAATTCTATTTTAAACTCTGGG 38866976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2587 CATTTATTTATATCCACAGAATGTAAAACACCAGGAGTAAATTCTATTTTAAACTCTGGG 2646

 38866977 CGTTTTGTGATAATGATGCATTAATGAAAGTTCATCAGTGATGTAACAAATGCACTACTG 38867036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2647 CGTTTTGTGATAATGATGCATTAATGAAAGTTCATCAGTGATGTAACAAATGCACTACTG 2706

 38867037 CCATGTGGAATGTTGATACTGGGGGAGTTTGCCATGTGTGAGGACAGCAGGTATATGAAA 38867096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2707 CCATGTGGAATGTTGATACTGGGGGAGTTTGCCATGTGTGAGGACAGCAGGTATATGAAA 2766

 38867097 ACTCCCTGCACTTTCTGCTTAATTTTGCTGTGAACCTAAAGCTGCTCTATATAATAAAGT 38867156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2767 ACTCCCTGCACTTTCTGCTTAATTTTGCTGTGAACCTAAAGCTGCTCTATATAATAAAGT 2826

 38867157 TTATTAATTAAAAAAACCTCTGTTACAGCAAAATTGAGTAACAGACACCATATTTTTCCT 38867216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2827 TTATTAATTAAAAAAACCTCTGTTACAGCAAAATTGAGTAACAGACACCATATTTTTCCT 2886

 38867217 CCTGCCCCCCCCCCCAAAATTAACAAAGTATAGAAAACAATGACTCTGAGAAGAGTGAAC 38867276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2887 CCTGCCCCCCCCCCCAAAATTAACAAAGTATAGAAAACAATGACTCTGAGAAGAGTGAAC 2946

 38867277 ATTAGACAGTGAGGACATTGTTTCCTGAGAGAGGAAAAAATAATAATAATATGTAACAAA 38867336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2947 ATTAGACAGTGAGGACATTGTTTCCTGAGAGAGGAAAAAATAATAATAATATGTAACAAA 3006

 38867337 TGATTTCCCCAGCTTACTGCTCACATAGTTTCTAAGCCATGATGCAAAAACAGGGCTAGT 38867396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3007 TGATTTCCCCAGCTTACTGCTCACATAGTTTCTAAGCCATGATGCAAAAACAGGGCTAGT 3066

 38867397 TCATGGCAATTTTGACAGGATTCACTTATGTCACCCCAAATCTCTCAAGTTTTGTCAGTA 38867456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3067 TCATGGCAATTTTGACAGGATTCACTTATGTCACCCCAAATCTCTCAAGTTTTGTCAGTA 3126

 38867457 TTCCAGTTCAGTCAGGCAAAGAATGGCTGAGTAAACAAGAAGCTTTGTTATTTCTTTCAG 38867516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3127 TTCCAGTTCAGTCAGGCAAAGAATGGCTGAGTAAACAAGAAGCTTTGTTATTTCTTTCAG 3186

 38867517 TGTTGGTTTCTATACCTCAAAATACCTCAGTAAATCTCAAGTAGAATAAATTGAAATAAG 38867576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3187 TGTTGGTTTCTATACCTCAAAATACCTCAGTAAATCTCAAGTAGAATAAATTGAAATAAG 3246

 38867577 ATAAACACAAATAATCTTAACACATTATAGTTAAGTTGAATGCCACAGACAAAGGAAATA 38867636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3247 ATAAACACAAATAATCTTAACACATTATAGTTAAGTTGAATGCCACAGACAAAGGAAATA 3306

 38867637 TTTTGAAAGCAACAAGATGAAAACAACATATATGCAGATGTACAATATCATTAATGACTG 38867696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3307 TTTTGAAAGCAACAAGATGAAAACAACATATATGCAGATGTACAATATCATTAATGACTG 3366

 38867697 TTTTTATGCCAGAAATAAAATAGGCCAGAAACCAATGCAATGACAAATTGTTTGAATGAA 38867756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3367 TTTTTATGCCAGAAATAAAATAGGCCAGAAACCAATGCAATGACAAATTGTTTGAATGAA 3426

 38867757 ATGTCAGCCAACTATTCTATATTCGGCAAAGCTACTTAAATGAAATGGACCACCACAGTG 38867816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3427 ATGTCAGCCAACTATTCTATATTCGGCAAAGCTACTTAAATGAAATGGACCACCACAGTG 3486

 38867817 GCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATCATGAGGTCAAGA 38867876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3487 GCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATCATGAGGTCAAGA 3546

 38867877 TATAGAGACCATCCTGGACAACATGGTGAAATCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTA 38867936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3547 TATAGAGACCATCCTGGACAACATGGTGAAATCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTA 3606

 38867937 GCTGGGCGTGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGGAGGAGAAC 38867996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3607 GCTGGGCGTGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGGAGGAGAAC 3666

 38867997 CTCTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCAGAGATTGCACCACTACACTCCAGCC 38868056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3667 CTCTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCAGAGATTGCACCACTACACTCCAGCC 3726

 38868057 TGGTGACAAAGCGAGACACTGTCTCAAAAATATATATATATATATAATAAAAATAAGATG 38868116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3727 TGGTGACAAAGCGAGACACTGTCTCAAAAATATATATATATATATAATAAAAATAAGATG 3786

 38868117 AAATACAGACATCCTCAGATGAACAAAGACTCGAGTAATTCATGGCTAGCAGGCATGACT 38868176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3787 AAATACAGACATCCTCAGATGAACAAAGACTCGAGTAATTCATGGCTAGCAGGCATGACT 3846

 38868177 TAAAGGAAAAACTAACGGAAACCCTGTAGGCCAAAGGAACGTAACACTAGACAGTAACTC 38868236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3847 TAAAGGAAAAACTAACGGAAACCCTGTAGGCCAAAGGAACGTAACACTAGACAGTAACTC 3906

 38868237 TAACTCTAATTCAAGAGAGAATGTGCAGGAAGCCATAAACAGTAAACATAATAATCTATA 38868296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3907 TAACTCTAATTCAAGAGAGAATGTGCAGGAAGCCATAAACAGTAAACATAATAATCTATA 3966

 38868297 TTATGTAATTTAATAAAAAATACATTGCTTTAAAAATCCTTTTCTTAAAAATATTATTGT 38868356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3967 TTATGTAATTTAATAAAAAATACATTGCTTTAAAAATCCTTTTCTTAAAAATATTATTGT 4026

 38868357 GTAAACATAATTATAATATTATAGTGTTGGATTTATAACATATTTGGTGAAGTAATCGCA 38868416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4027 GTAAACATAATTATAATATTATAGTGTTGGATTTATAACATATTTGGTGAAGTAATCGCA 4086

 38868417 CAAAGTAAAGAGAAGAAGAAAAGGGTATGTAAGTAAATAAAGATATTATATTTTACTGGA 38868476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4087 CAAAGTAAAGAGAAGAAGAAAAGGGTATGTAAGTAAATAAAGATATTATATTTTACTGGA 4146

 38868477 ATTAAGTTGGTACTATTCTTAAATGGATTATGATTAGATGAGATGCATATTGTAATTATT 38868536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4147 ATTAAGTTGGTACTATTCTTAAATGGATTATGATTAGATGAGATGCATATTGTAATTATT 4206

 38868537 GTAGCAACCACTAAGAAATAATATTAACACAAACAACAGAGGAATTAAAATGATAGATTA 38868596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4207 GTAGCAACCACTAAGAAATAATATTAACACAAACAACAGAGGAATTAAAATGATAGATTA 4266

 38868597 GAAAAACCATTTATATATCACAAAATATAACAGTAAATGAGAAACAGAGGAATATATTTA 38868656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4267 GAAAAACCATTTATATATCACAAAATATAACAGTAAATGAGAAACAGAGGAATATATTTA 4326

 38868657 AAATGAGCCTGGTTGCAGCGGCTCACACCTGTAATCTTAGCAACTTGGAAGGCCAAGGTA 38868716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4327 AAATGAGCCTGGTTGCAGCGGCTCACACCTGTAATCTTAGCAACTTGGAAGGCCAAGGTA 4386

 38868717 GGAGGAAGTCTTGAGCCCAGGAGTTCAAGATCAGCCTGAGCAACACAGTGAGACCCCCAT 38868776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4387 GGAGGAAGTCTTGAGCCCAGGAGTTCAAGATCAGCCTGAGCAACACAGTGAGACCCCCAT 4446

 38868777 CTCTACAAAAAGTAGAAATTTGGCAAGGCATCATGATAGGCACCTGTAGTCCCAGCTACT 38868836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4447 CTCTACAAAAAGTAGAAATTTGGCAAGGCATCATGATAGGCACCTGTAGTCCCAGCTACT 4506

 38868837 GATGAAGCTAAGGCAAGAGGATTTCTTGAGCCTCTGAGGTCAAGGCTACAGTGAGCTATG 38868896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4507 GATGAAGCTAAGGCAAGAGGATTTCTTGAGCCTCTGAGGTCAAGGCTACAGTGAGCTATG 4566

 38868897 ATCACACCACTGCGCTCCAGCTTTGGAGACAGAGCAAGACTCTACAGCAATAAATAAATA 38868956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4567 ATCACACCACTGCGCTCCAGCTTTGGAGACAGAGCAAGACTCTACAGCAATAAATAAATA 4626

 38868957 AATAGAAAGCAAATAGAAAAATGACAGGCATAAATCCAACTGTAGCAATACTTAATACAT 38869016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4627 AATAGAAAGCAAATAGAAAAATGACAGGCATAAATCCAACTGTAGCAATACTTAATACAT 4686

 38869017 GAAAAGCAAATAAACCAAGCACAACACATAAAAGGAAAGGATTGTCAGATTTGATAGAAA 38869076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4687 GAAAAGCAAATAAACCAAGCACAACACATAAAAGGAAAGGATTGTCAGATTTGATAGAAA 4746

 38869077 CAAGACCCAAGTATACACTGTCTATAATAGACACACATTATATTCAAATACATAAATAAA 38869136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4747 CAAGACCCAAGTATACACTGTCTATAATAGACACACATTATATTCAAATACATAAATAAA 4806

 38869137 TAAAAAGCAAAATGATGTAAAAAAGGTAAAGTATGAAATCAGTAACTCTATGACAGCTGA 38869196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4807 TAAAAAGCAAAATGATGTAAAAAAGGTAAAGTATGAAATCAGTAACTCTATGACAGCTGA 4866

 38869197 AGTAGCTGTATTAACATTATTTAAAATAGACTTTAATACAAGAAACACTATCAGAGAAGA 38869256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4867 AGTAGCTGTATTAACATTATTTAAAATAGACTTTAATACAAGAAACACTATCAGAGAAGA 4926

 38869257 AAAGCCATATTTCATAATGATAAAACATGCCAATTCATCATAAAGATGTAAGAGTTAAAA 38869316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4927 AAAGCCATATTTCATAATGATAAAACATGCCAATTCATCATAAAGATGTAAGAGTTAAAA 4986

 38869317 ACATGTATACATTTAAT 38869333
          |||||||||||||||||
     4987 ACATGTATACATTTAAT 5003

Alignment time is 4.73658 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38854779,38878343] =>     23565 nucs '18 dna:chromosome chromosome:GRCh37:18:1:78077248:1'
Second seq [       1,    2271] =>      2271 nucs 'mol-32-30eb-136716_2271'

Score:        2196
Aligned:      2265        nucs
Identic:      2253 ( 99%) nucs =>       140 (100%)      2113 ( 99%)
Gaps:            9 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38864640,38864779] EXCISED REGION [38868344,38870468]
 second seq =>  [       1,     140] EXCISED REGION [     156,    2271]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3564 nucs [38864780,38868343]
 second seq =>        15 nucs [141,155]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 38864640 GGAGAACTACAAAATTCTGAAGAAATATGTCAAAGACTAAATAAATGGAAAGATATCTCA 38864699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGAGAACTACAAAATTCTGAAGAAATATGTCAAAGACTAAATAAATGGAAAGATATCTCA 60

 38864700 GGTTCATGGGTAGAAAGACTCAATATTGTTGAAATGTTAATTCTTCCCAACTTAATCTAT 38864759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGTTCATGGGTAGAAAGACTCAATATTGTTGAAATGTTAATTCTTCCCAACTTAATCTAT 120

 38864760 AGATTCAATGTAATTACAAT 38864779
          ||||||||||||||||||||
      121 AGATTCAATGTAATTACAAT 140

EXCISED REGION

 38868344 AAAATATTATTGTGTAAACATAATTATAATATTATAGTGTTGGATTTATAACATATTTGG 38868403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      156 AAAATATTATTGTGTAAACATAATTATAATATTATAGTGTTGGATTTATAACATATTTGG 215

 38868404 TGAAGTAATCGCACAAAGTAAAGAGAAGAAGAAAAGGGTATGTAAGTAAATAAAGATATT 38868463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      216 TGAAGTAATCGCACAAAGTAAAGAGAAGAAGAAAAGGGTATGTAAGTAAATAAAGATATT 275

 38868464 ATATTTTACTGGAATTAAGTTGGTACTATTCTTAAATGGATTATGATTAGATGAGATGCA 38868523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      276 ATATTTTACTGGAATTAAGTTGGTACTATTCTTAAATGGATTATGATTAGATGAGATGCA 335

 38868524 TATTGTAATTATTGTAGCAACCACTAAGAAATAATATTAACACAAACAACAGAGGAATTA 38868583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      336 TATTGTAATTATTGTAGCAACCACTAAGAAATAATATTAACACAAACAACAGAGGAATTA 395

 38868584 AAATGATAGATTAGAAAAACCATTTATATATCACAAAATATAACAGTAAATGAGAAACAG 38868643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      396 AAATGATAGATTAGAAAAACCATTTATATATCACAAAATATAACAGTAAATGAGAAACAG 455

 38868644 AGGAATATATTTAAAATGAGCCTGGTTGCAGCGGCTCACACCTGTAATCTTAGCAACTTG 38868703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      456 AGGAATATATTTAAAATGAGCCTGGTTGCAGCGGCTCACACCTGTAATCTTAGCAACTTG 515

 38868704 GAAGGCCAAGGTAGGAGGAAGTCTTGAGCCCAGGAGTTCAAGATCAGCCTGAGCAACACA 38868763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      516 GAAGGCCAAGGTAGGAGGAAGTCTTGAGCCCAGGAGTTCAAGATCAGCCTGAGCAACACA 575

 38868764 GTGAGACCCCCATCTCTACAAAAAGTAGAAATTTGGCAAGGCATCATGATAGGCACCTGT 38868823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      576 GTGAGACCCCCATCTCTACAAAAAGTAGAAATTTGGCAAGGCATCATGATAGGCACCTGT 635

 38868824 AGTCCCAGCTACTGATGAAGCTAAGGCAAGAGGATTTCTTGAGCCTCTGAGGTCAAGGCT 38868883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      636 AGTCCCAGCTACTGATGAAGCTAAGGCAAGAGGATTTCTTGAGCCTCTGAGGTCAAGGCT 695

 38868884 ACAGTGAGCTATGATCACACCACTGCGCTCCAGCTTTGGAGACAGAGCAAGACTCTACAG 38868943
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
      696 ACAGTGAGCTATGATCACACCACTGCACTCCAGCTTTGGAGACAGAGCAAGACTCTACAG 755

 38868944 CAATAAATAAATAAATAGAAAGCAAATAGAAAAATGACAGGCATAAATCCAACTGTAGCA 38869003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      756 CAATAAATAAATAAATAGAAAGCAAATAGAAAAATGACAGGCATAAATCCAACTGTAGCA 815

 38869004 ATACTTAATACATGAAAAGCAAATAAACCAAGCACAACACATAAAAGGAAAGGATTGTCA 38869063
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
      816 ATACTTAATACATGAAAAGCAAATAAACCAAGCACAACACATAAAAGGAAAGGTTTGTCA 875

 38869064 GATTTGATAGAAACAAGACCCAAGTATACACTGTCTATAATAGACACACATTATATTCAA 38869123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      876 GATTTGATAGAAACAAGACCCAAGTATACACTGTCTATAATAGACACACATTATATTCAA 935

 38869124 ATACATAAATAAATAAAAAGCAAAATGATGTAAAAAAGGTAAAGTATGAAATCAGTAACT 38869183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      936 ATACATAAATAAATAAAAAGCAAAATGATGTAAAAAAGGTAAAGTATGAAATCAGTAACT 995

 38869184 CTATGACAGCTGAAGTAGCTGTATTAACATTATTTAAAATAGACTTTAATACAAGAAACA 38869243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      996 CTATGACAGCTGAAGTAGCTGTATTAACATTATTTAAAATAGACTTTAATACAAGAAACA 1055

 38869244 CTATCAGAGAAGAAAAGCCATATTTCATAATGATAAAACATGCCAATTCATCATAAAGAT 38869303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1056 CTATCAGAGAAGAAAAGCCATATTTCATAATGATAAAACATGCCAATTCATCATAAAGAT 1115

 38869304 GTAAGAGTTAAAAACATGTATACATTTAATCATAATGCCCCAAAATACCTGAAGCAAAAA 38869363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1116 GTAAGAGTTAAAAACATGTATACATTTAATCATAATGCCCCAAAATACCTGAAGCAAAAA 1175

 38869364 TGGACAGAACTGAAAAAAGAAATAGACAATTCAAAAATAATAGTTTGAAATTCAAACAAC 38869423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1176 TGGACAGAACTGAAAAAAGAAATAGACAATTCAAAAATAATAGTTTGAAATTCAAACAAC 1235

 38869424 TGACTATCCATAATGACTAGACAGAAGATTAATAAGTATATAGAAGACTTGAGTAACACT 38869483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1236 TGACTATCCATAATGACTAGACAGAAGATTAATAAGTATATAGAAGACTTGAGTAACACT 1295

 38869484 ATACACCAACAATACTTAACAAATATCTGGAGAACAGTCCTCCTGACAGCAGAAGAATAC 38869543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1296 ATACACCAACAATACTTAACAAATATCTGGAGAACAGTCCTCCTGACAGCAGAAGAATAC 1355

 38869544 ATGTTCTTCTCAAGTACAAAGGAACAGTCTTCAGGATAGACTATTTTATGCCATAAAACA 38869603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1356 ATGTTCTTCTCAAGTACAAAGGAACAGTCTTCAGGATAGACTATTTTATGCCATAAAACA 1415

 38869604 ACCTCAATAAATATAAAATGATTGAAATCATACAAAGTATATTTATCAACCACAATGGAA 38869663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1416 ACCTCAATAAATATAAAATGATTGAAATCATACAAAGTATATTTATCAACCACAATGGAA 1475

 38869664 TCAAATCAGAAATCAATAATGGAGAAATTTGGGGATATGAACAAAATGTGGAAATTAATC 38869723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1476 TCAAATCAGAAATCAATAATGGAGAAATTTGGGGATATGAACAAAATGTGGAAATTAATC 1535

 38869724 AATACCCTCTATATAGCCAATGAGTCAAAGAAGAAATCACAAGGAAAATTAGAGTGAAAT 38869783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1536 AATACCCTCTATATAGCCAATGAGTCAAAGAAGAAATCACAAGGAAAATTAGAGTGAAAT 1595

 38869784 TAAAAATCAATAGATCCCAACATTTTGGAAGGCCAAGATGGGAGGATCACTCCTGGGTAA 38869843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1596 TAAAAATCAATAGATCCCAACATTTTGGAAGGCCAAGATGGGAGGATCACTCCTGGGTAA 1655

 38869844 CATAGTGAGAGCCAATAAAAAAATTAGCCAGGGATGGTGGTGAGTGTCAGTAGTTCCAGC 38869903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1656 CATAGTGAGAGCCAATAAAAAAATTAGCCAGGGATGGTGGTGAGTGTCAGTAGTTCCAGC 1715

 38869904 TACTTGGGAGGCTGAGGTGGCAGGATCACTTGAGCCCAGAAGGTCAACATTGCAGTGAGC 38869963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1716 TACTTGGGAGGCTGAGGTGGCAGGATCACTTGAGCCCAGAAGGTCAACATTGCAGTGAGC 1775

 38869964 CTTGTTTGTACCACTGCACTCCAGCCTAGGCGAGACTGAGACCCTGTTTCAAAAATAAAT 38870023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
     1776 CTTGTTTGTACCACTGCACTCCAGCCTAGGCGAGACTGAGACCCTGTTTCAA-------- 1827

 38870024 AAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAGTGAAAATAAAAATAAATGAAACCAAAGTTC 38870083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1828 AAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAGTGAAAATAAAAATAAATGAAACCAAAGTTC 1887

 38870084 ACTCTAAAAAAAAAGTCAACAAAGTTGATAAATATGTAGCTAAATTAAACAAGAAAGTGA 38870143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1888 ACTCTAAAAAAAAAGTCAACAAAGTTGATAAATATGTAGCTAAATTAAACAAGAAAGTGA 1947

 38870144 GAGACGAAATCAGAAAAGGAAGTAGGTAACATCACTTCCAAAATCTCCAAAATTTAAAAA 38870203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1948 GAGACGAAATCAGAAAAGGAAGTAGGTAACATCACTTCCAAAATCTCCAAAATTTAAAAA 2007

 38870204 TGTTTTGAAGATGATGAACAACTTTATGAAAACAATCAAGATAATGTACACGAAATTTTA 38870263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2008 TGTTTTGAAGATGATGAACAACTTTATGAAAACAATCAAGATAATGTACACGAAATTTTA 2067

 38870264 TATTTTAATTCCAAAAGCAACCACTAGAAAAAATAACTCAAAACAATAATGTAAAAATCA 38870323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2068 TATTTTAATTCCAAAAGCAACCACTAGAAAAAATAACTCAAAACAATAATGTAAAAATCA 2127

 38870324 ACAGAAGATGGCCGGGCACGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTTTGTTAAATGT 38870383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2128 ACAGAAGATGGCCGGGCACGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTTTGTTAAATGT 2187

 38870384 TGTTTAATGTATTATGTTAAATCTTCTGGGTTTTTTTTTGTTGTTGTTGTTTTGAGACGG 38870443
          |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
     2188 TGTTTAATGTATTATGTTAAATCTTCTGGG-TTTTTTTTGTTGTTGTTGTTTTGAGACGG 2246

 38870444 AGTCTCGCTCTGTCGTCCAGGCTGG 38870468
          ||.||||||||||||||||||||||
     2247 AGGCTCGCTCTGTCGTCCAGGCTGG 2271

Alignment time is 2.21808 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38854779,38878343] =>     23565 nucs '18 dna:chromosome chromosome:GRCh37:18:1:78077248:1'
Second seq [       1,    2116] =>      2116 nucs 'mol-32-30eb-188072_2116'

Score:        2115
Aligned:      2115        nucs
Identic:      2115 (100%) nucs =>      1260 (100%)       855 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38864410,38865669] EXCISED REGION [38865671,38866525]
 second seq =>  [       1,    1260] EXCISED REGION [    1262,    2116]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [38865670,38865670]
 second seq =>         1 nucs [1261,1261]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [38865669,38865669] to [38865671,38865671]
 second seq =>         1 nucs [1260,1260] to [1262,1262]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 38864410 GATTGTGTAGAAAATCCAAAAGAATCAACAAAAAAGCTTCCTGAAATTAACAAATAATTA 38864469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GATTGTGTAGAAAATCCAAAAGAATCAACAAAAAAGCTTCCTGAAATTAACAAATAATTA 60

 38864470 CAGCAAGTTTGCTGGAAATGAAGTTCATATACAAAATTGAATTACTTTTCCATATATCCA 38864529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAGCAAGTTTGCTGGAAATGAAGTTCATATACAAAATTGAATTACTTTTCCATATATCCA 120

 38864530 CAATCAACAAATGGAATTTGAAATTAAAAACACATTATCATTTATATTAGCATCCTCAAA 38864589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAATCAACAAATGGAATTTGAAATTAAAAACACATTATCATTTATATTAGCATCCTCAAA 180

 38864590 ATGTAATATTTCTGCATAAATTTAACAAAATATGTATATAATTTATATGAGGAGAACTAC 38864649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATGTAATATTTCTGCATAAATTTAACAAAATATGTATATAATTTATATGAGGAGAACTAC 240

 38864650 AAAATTCTGAAGAAATATGTCAAAGACTAAATAAATGGAAAGATATCTCAGGTTCATGGG 38864709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAAATTCTGAAGAAATATGTCAAAGACTAAATAAATGGAAAGATATCTCAGGTTCATGGG 300

 38864710 TAGAAAGACTCAATATTGTTGAAATGTTAATTCTTCCCAACTTAATCTATAGATTCAATG 38864769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TAGAAAGACTCAATATTGTTGAAATGTTAATTCTTCCCAACTTAATCTATAGATTCAATG 360

 38864770 TAATTACAATCAAAAATGAAAGTAAGTTTTGTGTGTGTTTGTGTGAATCTTGACAAACTG 38864829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TAATTACAATCAAAAATGAAAGTAAGTTTTGTGTGTGTTTGTGTGAATCTTGACAAACTG 420

 38864830 ATTTTAAAGTTCATATGGAGAGGAAAATGACCCAGAATAGCCACCACAATGTTGAGGGAG 38864889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATTTTAAAGTTCATATGGAGAGGAAAATGACCCAGAATAGCCACCACAATGTTGAGGGAG 480

 38864890 AACAAAGTGAGAAGACAGCACTACCCAACTTCAAGACTTGCTGAAAAGCTACAGCAATCA 38864949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AACAAAGTGAGAAGACAGCACTACCCAACTTCAAGACTTGCTGAAAAGCTACAGCAATCA 540

 38864950 AGATAGTGAGGTATTGGTAAAAGATAAAAAAACAGGTCAATGAAACAACATAGTGTACTC 38865009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGATAGTGAGGTATTGGTAAAAGATAAAAAAACAGGTCAATGAAACAACATAGTGTACTC 600

 38865010 AGACATAACCCACATAATATACTCAACTGATCTTTGACAAAGGTGCAAGTTCAAGACAAT 38865069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGACATAACCCACATAATATACTCAACTGATCTTTGACAAAGGTGCAAGTTCAAGACAAT 660

 38865070 GGAGCAAAGATAGTCTTTTCAATAAATAGTGGTAAGAAAACTAGGCATAACATGCAAGAA 38865129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGAGCAAAGATAGTCTTTTCAATAAATAGTGGTAAGAAAACTAGGCATAACATGCAAGAA 720

 38865130 TAAAATGTAAATCTAGATATAGACCTTATGATCTTCACAAAAATTAATTCAAAATGAACT 38865189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TAAAATGTAAATCTAGATATAGACCTTATGATCTTCACAAAAATTAATTCAAAATGAACT 780

 38865190 TTAGAGCTCAATTTAAAATGTAAAATTATAAAGCTCCTAGAAGGTAACATCAGAGAGAAA 38865249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTAGAGCTCAATTTAAAATGTAAAATTATAAAGCTCCTAGAAGGTAACATCAGAGAGAAA 840

 38865250 CTAGGTGACCTTGGTTTGGTGTTAACTTTTTAGAAACAACACCAGAAGTATGACCCATGA 38865309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTAGGTGACCTTGGTTTGGTGTTAACTTTTTAGAAACAACACCAGAAGTATGACCCATGA 900

 38865310 AAGAAAGAATTGATAAGCTGGACTTAACTAAAATTAAATACTTCTGTTTTGAGAAAGGCA 38865369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AAGAAAGAATTGATAAGCTGGACTTAACTAAAATTAAATACTTCTGTTTTGAGAAAGGCA 960

 38865370 CTATCAAGATCATTGGACCACAAGCAACAGACTGAAAGAAAATATCTGCAAAAGATAGAT 38865429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTATCAAGATCATTGGACCACAAGCAACAGACTGAAAGAAAATATCTGCAAAAGATAGAT 1020

 38865430 CTGATAAAGGCGAGTCATTTAAAATATTCAAATATCTTTGAAAACTCAACCATAAGAACC 38865489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTGATAAAGGCGAGTCATTTAAAATATTCAAATATCTTTGAAAACTCAACCATAAGAACC 1080

 38865490 CAAAAAACCTAGTTAAAAAATGGGCAAAATGTCTGAATAGGCACCCTACCAAAGAAGATA 38865549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CAAAAAACCTAGTTAAAAAATGGGCAAAATGTCTGAATAGGCACCCTACCAAAGAAGATA 1140

 38865550 TAGATAAGGTAAATGATCATATGAAAAGATATTCAACATCTTATGTCATTAGGGAATTGC 38865609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TAGATAAGGTAAATGATCATATGAAAAGATATTCAACATCTTATGTCATTAGGGAATTGC 1200

 38865610 AAACTCAAACAACAGTGAGATGCCGCTGCACACCAATTAGAATGGCCAAAATTCAAAACA 38865669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AAACTCAAACAACAGTGAGATGCCGCTGCACACCAATTAGAATGGCCAAAATTCAAAACA 1260

EXCISED REGION

 38865671 AGCACCAAATACTGGCCAGGGTGTGATGAAACAGAAACTTACTCATCTTTGGTAGAAATG 38865730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1262 AGCACCAAATACTGGCCAGGGTGTGATGAAACAGAAACTTACTCATCTTTGGTAGAAATG 1321

 38865731 CAAAATGGTATAGCCACTTTGGAAGACAGTTTGATAGTTTCTTTAAAAAGTAAACATGTT 38865790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1322 CAAAATGGTATAGCCACTTTGGAAGACAGTTTGATAGTTTCTTTAAAAAGTAAACATGTT 1381

 38865791 CTTACCATACATATGATCTTGAAATCATGCCACTTGGCATTTACCCAAAGGAGCTGAAAA 38865850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1382 CTTACCATACATATGATCTTGAAATCATGCCACTTGGCATTTACCCAAAGGAGCTGAAAA 1441

 38865851 CTATATCCACACAAAATCCTGCACATGGATGTTTATGACAACTTTATTTACAATTGCCAA 38865910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1442 CTATATCCACACAAAATCCTGCACATGGATGTTTATGACAACTTTATTTACAATTGCCAA 1501

 38865911 AGGTTTGAAGCAACCAAGATGTCCTTTAGTAGATTGATACATAAACTGTGGTACATCCAG 38865970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1502 AGGTTTGAAGCAACCAAGATGTCCTTTAGTAGATTGATACATAAACTGTGGTACATCCAG 1561

 38865971 ACAATGAAATATTGTATTTTTCCATTTTCACACTGCTGATAAAGACATACCCAAGACTGC 38866030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1562 ACAATGAAATATTGTATTTTTCCATTTTCACACTGCTGATAAAGACATACCCAAGACTGC 1621

 38866031 ATAATTTATACAGGAAAAGGGTTTAATGGACTTACACTTCCATGTGGCTGGGGAGGCCTC 38866090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1622 ATAATTTATACAGGAAAAGGGTTTAATGGACTTACACTTCCATGTGGCTGGGGAGGCCTC 1681

 38866091 ACAATCATGGAAGAAGTCAAGGAGGAGCAAGTCACATCTTACATAGATGGCAGCAGGCAA 38866150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1682 ACAATCATGGAAGAAGTCAAGGAGGAGCAAGTCACATCTTACATAGATGGCAGCAGGCAA 1741

 38866151 AGAGAGCTTGTGCAGGGAAAAATCCCATTTTTAAAACCATAAAATCTCATGAGACGTATT 38866210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1742 AGAGAGCTTGTGCAGGGAAAAATCCCATTTTTAAAACCATAAAATCTCATGAGACGTATT 1801

 38866211 CACTGTCAGAAGAACAGCACAGGAAAGACCTGCCCCCATGATTCACTACCTCCCACCAGG 38866270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1802 CACTGTCAGAAGAACAGCACAGGAAAGACCTGCCCCCATGATTCACTACCTCCCACCAGG 1861

 38866271 TTCCTCCTATGACATGTGGGAACTGTGGGAGTTACAATTCAAGATGAGATCTGGGTGGGG 38866330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1862 TTCCTCCTATGACATGTGGGAACTGTGGGAGTTACAATTCAAGATGAGATCTGGGTGGGG 1921

 38866331 ACACAGCCAAACCTTATCAAATATTATTTAGCATTAAAAAAACTGTAAAGCCATAAAAAT 38866390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1922 ACACAGCCAAACCTTATCAAATATTATTTAGCATTAAAAAAACTGTAAAGCCATAAAAAT 1981

 38866391 ATATGGACAAAACTTAAATGAATATTATTAACTGAAAGAAGACAATCTTAAAAAAAGACA 38866450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1982 ATATGGACAAAACTTAAATGAATATTATTAACTGAAAGAAGACAATCTTAAAAAAAGACA 2041

 38866451 TACTGTGTAATTCCAAATATACGGTATTCTGGAAAAGTCAAAATGTGGAGATAATACAAT 38866510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2042 TACTGTGTAATTCCAAATATACGGTATTCTGGAAAAGTCAAAATGTGGAGATAATACAAT 2101

 38866511 TAAAGTGGCTGAGAA 38866525
          |||||||||||||||
     2102 TAAAGTGGCTGAGAA 2116

Alignment time is 1.80006 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38854779,38878343] =>     23565 nucs '18 dna:chromosome chromosome:GRCh37:18:1:78077248:1'
Second seq [       1,    9733] =>      9733 nucs 'mol-32-30f6-004414_9733'

Score:        9714
Aligned:      9725        nucs
Identic:      9724 (100%) nucs =>      1918 (100%)      7806 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38868098,38870015] EXCISED REGION [38870016,38877822]
 second seq =>  [       1,    1918] EXCISED REGION [    1927,    9733]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         8 nucs [1919,1926]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        37 nucs [1919,1955] to [1927,1963]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [38870014,38870015] to [38870016,38870017]
 second seq =>         2 nucs [1917,1918] to [1927,1928]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         4 nucs [1919,1922] to [1923,1926]

 38868098 ATATAATAAAAATAAGATGAAATACAGACATCCTCAGATGAACAAAGACTCGAGTAATTC 38868157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATATAATAAAAATAAGATGAAATACAGACATCCTCAGATGAACAAAGACTCGAGTAATTC 60

 38868158 ATGGCTAGCAGGCATGACTTAAAGGAAAAACTAACGGAAACCCTGTAGGCCAAAGGAACG 38868217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATGGCTAGCAGGCATGACTTAAAGGAAAAACTAACGGAAACCCTGTAGGCCAAAGGAACG 120

 38868218 TAACACTAGACAGTAACTCTAACTCTAATTCAAGAGAGAATGTGCAGGAAGCCATAAACA 38868277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TAACACTAGACAGTAACTCTAACTCTAATTCAAGAGAGAATGTGCAGGAAGCCATAAACA 180

 38868278 GTAAACATAATAATCTATATTATGTAATTTAATAAAAAATACATTGCTTTAAAAATCCTT 38868337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTAAACATAATAATCTATATTATGTAATTTAATAAAAAATACATTGCTTTAAAAATCCTT 240

 38868338 TTCTTAAAAATATTATTGTGTAAACATAATTATAATATTATAGTGTTGGATTTATAACAT 38868397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTCTTAAAAATATTATTGTGTAAACATAATTATAATATTATAGTGTTGGATTTATAACAT 300

 38868398 ATTTGGTGAAGTAATCGCACAAAGTAAAGAGAAGAAGAAAAGGGTATGTAAGTAAATAAA 38868457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATTTGGTGAAGTAATCGCACAAAGTAAAGAGAAGAAGAAAAGGGTATGTAAGTAAATAAA 360

 38868458 GATATTATATTTTACTGGAATTAAGTTGGTACTATTCTTAAATGGATTATGATTAGATGA 38868517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GATATTATATTTTACTGGAATTAAGTTGGTACTATTCTTAAATGGATTATGATTAGATGA 420

 38868518 GATGCATATTGTAATTATTGTAGCAACCACTAAGAAATAATATTAACACAAACAACAGAG 38868577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GATGCATATTGTAATTATTGTAGCAACCACTAAGAAATAATATTAACACAAACAACAGAG 480

 38868578 GAATTAAAATGATAGATTAGAAAAACCATTTATATATCACAAAATATAACAGTAAATGAG 38868637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GAATTAAAATGATAGATTAGAAAAACCATTTATATATCACAAAATATAACAGTAAATGAG 540

 38868638 AAACAGAGGAATATATTTAAAATGAGCCTGGTTGCAGCGGCTCACACCTGTAATCTTAGC 38868697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAACAGAGGAATATATTTAAAATGAGCCTGGTTGCAGCGGCTCACACCTGTAATCTTAGC 600

 38868698 AACTTGGAAGGCCAAGGTAGGAGGAAGTCTTGAGCCCAGGAGTTCAAGATCAGCCTGAGC 38868757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AACTTGGAAGGCCAAGGTAGGAGGAAGTCTTGAGCCCAGGAGTTCAAGATCAGCCTGAGC 660

 38868758 AACACAGTGAGACCCCCATCTCTACAAAAAGTAGAAATTTGGCAAGGCATCATGATAGGC 38868817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AACACAGTGAGACCCCCATCTCTACAAAAAGTAGAAATTTGGCAAGGCATCATGATAGGC 720

 38868818 ACCTGTAGTCCCAGCTACTGATGAAGCTAAGGCAAGAGGATTTCTTGAGCCTCTGAGGTC 38868877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ACCTGTAGTCCCAGCTACTGATGAAGCTAAGGCAAGAGGATTTCTTGAGCCTCTGAGGTC 780

 38868878 AAGGCTACAGTGAGCTATGATCACACCACTGCGCTCCAGCTTTGGAGACAGAGCAAGACT 38868937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAGGCTACAGTGAGCTATGATCACACCACTGCGCTCCAGCTTTGGAGACAGAGCAAGACT 840

 38868938 CTACAGCAATAAATAAATAAATAGAAAGCAAATAGAAAAATGACAGGCATAAATCCAACT 38868997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTACAGCAATAAATAAATAAATAGAAAGCAAATAGAAAAATGACAGGCATAAATCCAACT 900

 38868998 GTAGCAATACTTAATACATGAAAAGCAAATAAACCAAGCACAACACATAAAAGGAAAGGA 38869057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GTAGCAATACTTAATACATGAAAAGCAAATAAACCAAGCACAACACATAAAAGGAAAGGA 960

 38869058 TTGTCAGATTTGATAGAAACAAGACCCAAGTATACACTGTCTATAATAGACACACATTAT 38869117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTGTCAGATTTGATAGAAACAAGACCCAAGTATACACTGTCTATAATAGACACACATTAT 1020

 38869118 ATTCAAATACATAAATAAATAAAAAGCAAAATGATGTAAAAAAGGTAAAGTATGAAATCA 38869177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATTCAAATACATAAATAAATAAAAAGCAAAATGATGTAAAAAAGGTAAAGTATGAAATCA 1080

 38869178 GTAACTCTATGACAGCTGAAGTAGCTGTATTAACATTATTTAAAATAGACTTTAATACAA 38869237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GTAACTCTATGACAGCTGAAGTAGCTGTATTAACATTATTTAAAATAGACTTTAATACAA 1140

 38869238 GAAACACTATCAGAGAAGAAAAGCCATATTTCATAATGATAAAACATGCCAATTCATCAT 38869297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GAAACACTATCAGAGAAGAAAAGCCATATTTCATAATGATAAAACATGCCAATTCATCAT 1200

 38869298 AAAGATGTAAGAGTTAAAAACATGTATACATTTAATCATAATGCCCCAAAATACCTGAAG 38869357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AAAGATGTAAGAGTTAAAAACATGTATACATTTAATCATAATGCCCCAAAATACCTGAAG 1260

 38869358 CAAAAATGGACAGAACTGAAAAAAGAAATAGACAATTCAAAAATAATAGTTTGAAATTCA 38869417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CAAAAATGGACAGAACTGAAAAAAGAAATAGACAATTCAAAAATAATAGTTTGAAATTCA 1320

 38869418 AACAACTGACTATCCATAATGACTAGACAGAAGATTAATAAGTATATAGAAGACTTGAGT 38869477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AACAACTGACTATCCATAATGACTAGACAGAAGATTAATAAGTATATAGAAGACTTGAGT 1380

 38869478 AACACTATACACCAACAATACTTAACAAATATCTGGAGAACAGTCCTCCTGACAGCAGAA 38869537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AACACTATACACCAACAATACTTAACAAATATCTGGAGAACAGTCCTCCTGACAGCAGAA 1440

 38869538 GAATACATGTTCTTCTCAAGTACAAAGGAACAGTCTTCAGGATAGACTATTTTATGCCAT 38869597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GAATACATGTTCTTCTCAAGTACAAAGGAACAGTCTTCAGGATAGACTATTTTATGCCAT 1500

 38869598 AAAACAACCTCAATAAATATAAAATGATTGAAATCATACAAAGTATATTTATCAACCACA 38869657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AAAACAACCTCAATAAATATAAAATGATTGAAATCATACAAAGTATATTTATCAACCACA 1560

 38869658 ATGGAATCAAATCAGAAATCAATAATGGAGAAATTTGGGGATATGAACAAAATGTGGAAA 38869717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ATGGAATCAAATCAGAAATCAATAATGGAGAAATTTGGGGATATGAACAAAATGTGGAAA 1620

 38869718 TTAATCAATACCCTCTATATAGCCAATGAGTCAAAGAAGAAATCACAAGGAAAATTAGAG 38869777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTAATCAATACCCTCTATATAGCCAATGAGTCAAAGAAGAAATCACAAGGAAAATTAGAG 1680

 38869778 TGAAATTAAAAATCAATAGATCCCAACATTTTGGAAGGCCAAGATGGGAGGATCACTCCT 38869837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TGAAATTAAAAATCAATAGATCCCAACATTTTGGAAGGCCAAGATGGGAGGATCACTCCT 1740

 38869838 GGGTAACATAGTGAGAGCCAATAAAAAAATTAGCCAGGGATGGTGGTGAGTGTCAGTAGT 38869897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GGGTAACATAGTGAGAGCCAATAAAAAAATTAGCCAGGGATGGTGGTGAGTGTCAGTAGT 1800

 38869898 TCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGCAGGATCACTTGAGCCCAGAAGGTCAACATTGCA 38869957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGCAGGATCACTTGAGCCCAGAAGGTCAACATTGCA 1860

 38869958 GTGAGCCTTGTTTGTACCACTGCACTCCAGCCTAGGCGAGACTGAGACCCTGTTTCAA 38870015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GTGAGCCTTGTTTGTACCACTGCACTCCAGCCTAGGCGAGACTGAGACCCTGTTTCAA 1918

EXCISED REGION

 38870016 AAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAGTGAAAATAAAAATAAATGAAAC 38870075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1927 AAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAGTGAAAATAAAAATAAATGAAAC 1986

 38870076 CAAAGTTCACTCTAAAAAAAAAGTCAACAAAGTTGATAAATATGTAGCTAAATTAAACAA 38870135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1987 CAAAGTTCACTCTAAAAAAAAAGTCAACAAAGTTGATAAATATGTAGCTAAATTAAACAA 2046

 38870136 GAAAGTGAGAGACGAAATCAGAAAAGGAAGTAGGTAACATCACTTCCAAAATCTCCAAAA 38870195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2047 GAAAGTGAGAGACGAAATCAGAAAAGGAAGTAGGTAACATCACTTCCAAAATCTCCAAAA 2106

 38870196 TTTAAAAATGTTTTGAAGATGATGAACAACTTTATGAAAACAATCAAGATAATGTACACG 38870255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2107 TTTAAAAATGTTTTGAAGATGATGAACAACTTTATGAAAACAATCAAGATAATGTACACG 2166

 38870256 AAATTTTATATTTTAATTCCAAAAGCAACCACTAGAAAAAATAACTCAAAACAATAATGT 38870315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2167 AAATTTTATATTTTAATTCCAAAAGCAACCACTAGAAAAAATAACTCAAAACAATAATGT 2226

 38870316 AAAAATCAACAGAAGATGGCCGGGCACGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTTTG 38870375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2227 AAAAATCAACAGAAGATGGCCGGGCACGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTTTG 2286

 38870376 TTAAATGTTGTTTAATGTATTATGTTAAATCTTCTGGGTTTTTTTTTGTTGTTGTTGTTT 38870435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2287 TTAAATGTTGTTTAATGTATTATGTTAAATCTTCTGGGTTTTTTTTTGTTGTTGTTGTTT 2346

 38870436 TGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGTCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTCGGCTCACT 38870495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2347 TGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGTCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTCGGCTCACT 2406

 38870496 GCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGCAGATCACGAGGTCGGG 38870555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2407 GCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGCAGATCACGAGGTCGGG 2466

 38870556 AGATCAAGACCATCCTGGCTAAAATGGAGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAACA 38870615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2467 AGATCAAGACCATCCTGGCTAAAATGGAGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAACA 2526

 38870616 AAATTAGCCGGGCCCGGTGTGGGGCACCTGTGGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAG 38870675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2527 AAATTAGCCGGGCCCGGTGTGGGGCACCTGTGGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAG 2586

 38870676 GAGAATTGCTTGAGCCCGGGATGTCCAGGCTACCGTGAGCCATATTCATGACACAGCACT 38870735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2587 GAGAATTGCTTGAGCCCGGGATGTCCAGGCTACCGTGAGCCATATTCATGACACAGCACT 2646

 38870736 CCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGATCCTGCCACAAAATAAAAAGAAAAGAGAAAATGATAA 38870795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2647 CCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGATCCTGCCACAAAATAAAAAGAAAAGAGAAAATGATAA 2706

 38870796 AGATTGTAAAAATACAATCGTATATGGCTACAACTGATTTGTTAAAAAGATGCAAAGGCA 38870855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2707 AGATTGTAAAAATACAATCGTATATGGCTACAACTGATTTGTTAAAAAGATGCAAAGGCA 2766

 38870856 ATCCAGTGGAGAAATTACAGTGTTTTTAAAAATTTGTTAGATCAATTTAATACCTACACA 38870915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2767 ATCCAGTGGAGAAATTACAGTGTTTTTAAAAATTTGTTAGATCAATTTAATACCTACACA 2826

 38870916 TAAAAATATAAACTTCTACCCATACCTGTTGCCACATTTAAAAAAAAAATTAACTAATAG 38870975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2827 TAAAAATATAAACTTCTACCCATACCTGTTGCCACATTTAAAAAAAAAATTAACTAATAG 2886

 38870976 GCCTAAACATAAGCTAAAACTATAAAAGTTTTAGTTGAACACATACGAGAAAAAATTTTG 38871035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2887 GCCTAAACATAAGCTAAAACTATAAAAGTTTTAGTTGAACACATACGAGAAAAAATTTTG 2946

 38871036 TGACTGTGGTTTAAGCAAAGAGTTCTTAGATAACAAAATCAAAGTCTGACTTACTTAAAA 38871095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2947 TGACTGTGGTTTAAGCAAAGAGTTCTTAGATAACAAAATCAAAGTCTGACTTACTTAAAA 3006

 38871096 AATTATAAATTAGACTTCACTAATATTAAGATCTTCTGTTCCTTGAAAGACAATGTTAAA 38871155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3007 AATTATAAATTAGACTTCACTAATATTAAGATCTTCTGTTCCTTGAAAGACAATGTTAAA 3066

 38871156 AGAATAAAAAACCAAGACATTAGGGAATATTTGCACATCACATTTTTGATAAACAACTTG 38871215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3067 AGAATAAAAAACCAAGACATTAGGGAATATTTGCACATCACATTTTTGATAAACAACTTG 3126

 38871216 TATCCTGAATATATAATTTTCTAAATTCAATAATAATAAAAAAATTTAGCAACAGATTTT 38871275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3127 TATCCTGAATATATAATTTTCTAAATTCAATAATAATAAAAAAATTTAGCAACAGATTTT 3186

 38871276 AACAGAAACTTATCAAATAAATACAGAGATGACAGATAAGCACATAACACATGTTCAATA 38871335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3187 AACAGAAACTTATCAAATAAATACAGAGATGACAGATAAGCACATAACACATGTTCAATA 3246

 38871336 TCATTATTCATTAGGGAAATGTAAATGAAACCACAATTAAACACTGCCTCACACATTAAA 38871395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3247 TCATTATTCATTAGGGAAATGTAAATGAAACCACAATTAAACACTGCCTCACACATTAAA 3306

 38871396 AGGTCTTAAATTGACACTACTGATGACATCAAGTACTGCAAGGATTTAAATCAAGTGGAA 38871455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3307 AGGTCTTAAATTGACACTACTGATGACATCAAGTACTGCAAGGATTTAAATCAAGTGGAA 3366

 38871456 ACTTCATAAACTTCTGGGGGTTATGTAAACTGTTGTAAATACTTTGAAAAACAGTTCTGC 38871515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3367 ACTTCATAAACTTCTGGGGGTTATGTAAACTGTTGTAAATACTTTGAAAAACAGTTCTGC 3426

 38871516 AGTTTTGTAAAAAGGTAAACATACACTTAGGGCATAACTCAGCTATCCGACTCCCAAGTA 38871575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3427 AGTTTTGTAAAAAGGTAAACATACACTTAGGGCATAACTCAGCTATCCGACTCCCAAGTA 3486

 38871576 TTTACTAAACAGAAATGAAAGCCTATGTTTATAGAAAGAACTGAACATGAAATTTCATAG 38871635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3487 TTTACTAAACAGAAATGAAAGCCTATGTTTATAGAAAGAACTGAACATGAAATTTCATAG 3546

 38871636 TAGCTTTTTCTGTAATAGCCTCAAGGAAATCAACCCAAATGTCATACATAGGTAAATGGA 38871695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3547 TAGCTTTTTCTGTAATAGCCTCAAGGAAATCAACCCAAATGTCATACATAGGTAAATGGA 3606

 38871696 CAATAAAATTGTAATATATCTATATGCTAAAATGCTATTCAGAAACAAAAGGTATGAAGT 38871755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3607 CAATAAAATTGTAATATATCTATATGCTAAAATGCTATTCAGAAACAAAAGGTATGAAGT 3666

 38871756 CTTCAGACATCTATAGACACTGGTGAATCTTAAATAGTGAGGCTAAGTGACAGAAACCCA 38871815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3667 CTTCAGACATCTATAGACACTGGTGAATCTTAAATAGTGAGGCTAAGTGACAGAAACCCA 3726

 38871816 AAAATAACAAAAAATACAGATTGCAAGATTCCATTTTTTAAAGATATTAGAAAATGAAAA 38871875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3727 AAAATAACAAAAAATACAGATTGCAAGATTCCATTTTTTAAAGATATTAGAAAATGAAAA 3786

 38871876 CTAATTTATGTAAAGCAGACCAGTTGTTGTCTAGGGGTGGGGAGTTAGGACGGGGTCGGG 38871935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3787 CTAATTTATGTAAAGCAGACCAGTTGTTGTCTAGGGGTGGGGAGTTAGGACGGGGTCGGG 3846

 38871936 GAGAGGGACTACAAAGTGTCATAAGGAAACTTTTGGGCGTGGACAGGTGCAGTGGCTCAT 38871995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3847 GAGAGGGACTACAAAGTGTCATAAGGAAACTTTTGGGCGTGGACAGGTGCAGTGGCTCAT 3906

 38871996 ACCTGTAATCCCAGCACTTTGGAAGGCCGAGGAGGGAGGATCACTTGAGGTCAGGGATTT 38872055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3907 ACCTGTAATCCCAGCACTTTGGAAGGCCGAGGAGGGAGGATCACTTGAGGTCAGGGATTT 3966

 38872056 GAGACCAGCCTGGGCAACAGGATAAAACCCCATCTCTACCAAAATTTCAAAAATTAGGCA 38872115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3967 GAGACCAGCCTGGGCAACAGGATAAAACCCCATCTCTACCAAAATTTCAAAAATTAGGCA 4026

 38872116 GGCGTGCTAGCGAGCACCTGTAGTCCTAGCTACTGGAGAGGTTGAGGCAGGAGAATCACT 38872175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4027 GGCGTGCTAGCGAGCACCTGTAGTCCTAGCTACTGGAGAGGTTGAGGCAGGAGAATCACT 4086

 38872176 TAAACATGAGAGGGAGAGTTGCAGTAAGCCAAAATTGTGCAACTGCACTCCAGCCTGGGC 38872235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4087 TAAACATGAGAGGGAGAGTTGCAGTAAGCCAAAATTGTGCAACTGCACTCCAGCCTGGGC 4146

 38872236 AACAGAGTGAAGCTCTGTCTCCAAAACTAAAAATAAAATAAAATAAAAATGACACTTTCG 38872295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4147 AACAGAGTGAAGCTCTGTCTCCAAAACTAAAAATAAAATAAAATAAAAATGACACTTTCG 4206

 38872296 GGTGTGATTGATATATTTGCTATCTTAATGTGTTGATAGTCTCACAGGTGTATACATACA 38872355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4207 GGTGTGATTGATATATTTGCTATCTTAATGTGTTGATAGTCTCACAGGTGTATACATACA 4266

 38872356 TTAGAACTTAACTGGTACATTTTAAATATGTGCAGTCCATTGTATGTCAATTATTCCACC 38872415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4267 TTAGAACTTAACTGGTACATTTTAAATATGTGCAGTCCATTGTATGTCAATTATTCCACC 4326

 38872416 ATATAAGTGTTTAAACACACACACACACACAAGACAGAAGTGAATGTTTCATTCACACAA 38872475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4327 ATATAAGTGTTTAAACACACACACACACACAAGACAGAAGTGAATGTTTCATTCACACAA 4386

 38872476 TCTTCATGGACAAATCTATGCTTCAAAGGTAGGAAAATCATGAGGTCAAAGAAAAAACAC 38872535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4387 TCTTCATGGACAAATCTATGCTTCAAAGGTAGGAAAATCATGAGGTCAAAGAAAAAACAC 4446

 38872536 TGCATTTCTGAGATAGTAATAGAGAGGTAAATATGTGTATTCGGTGTTCAATGTACAAAT 38872595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4447 TGCATTTCTGAGATAGTAATAGAGAGGTAAATATGTGTATTCGGTGTTCAATGTACAAAT 4506

 38872596 TATTGAAGTCTTTTTGTCCTTTTTTCATCTCTCCCAACTTAATTGGAATAGATCCAGTTT 38872655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4507 TATTGAAGTCTTTTTGTCCTTTTTTCATCTCTCCCAACTTAATTGGAATAGATCCAGTTT 4566

 38872656 ACAATAAAAGAAATTCAGTGAAGTTTTCCAAACAGCAATGAGAATGAGCATTGTGGCTCA 38872715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4567 ACAATAAAAGAAATTCAGTGAAGTTTTCCAAACAGCAATGAGAATGAGCATTGTGGCTCA 4626

 38872716 TCCAGAGCTCCAAAAAGCAACTGCTCTGTACCTAAGGAAATCTTGTTTTTGCTCAAAATT 38872775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4627 TCCAGAGCTCCAAAAAGCAACTGCTCTGTACCTAAGGAAATCTTGTTTTTGCTCAAAATT 4686

 38872776 TTATTTGTCCTTGAGATTTTAATGACTTTTAAGAATGTTTTTCCTTATACCTTTGGGCTT 38872835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4687 TTATTTGTCCTTGAGATTTTAATGACTTTTAAGAATGTTTTTCCTTATACCTTTGGGCTT 4746

 38872836 CAGTTTCTTCGTATGCAAAATCAAGTCATGAAGATATTTCCACACAGCCAAGATGTTATA 38872895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4747 CAGTTTCTTCGTATGCAAAATCAAGTCATGAAGATATTTCCACACAGCCAAGATGTTATA 4806

 38872896 GGATAATGAATTGCTTGATAACCCATTGTAATCTTTGGCAAAAGAACAAAGCATTATTAT 38872955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4807 GGATAATGAATTGCTTGATAACCCATTGTAATCTTTGGCAAAAGAACAAAGCATTATTAT 4866

 38872956 TGTTATTAAATATTATTAGCTGGCGTATGGTGCTGAACTGATAATTACTTCAAGTAACAC 38873015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4867 TGTTATTAAATATTATTAGCTGGCGTATGGTGCTGAACTGATAATTACTTCAAGTAACAC 4926

 38873016 TTCATAAAATGCTAACTGTAAAGTGTACATAAATTTATGTATTCATTAATATGATACCTG 38873075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4927 TTCATAAAATGCTAACTGTAAAGTGTACATAAATTTATGTATTCATTAATATGATACCTG 4986

 38873076 CTACGAACAAATATTTTGGAAGATTGCCAACATCATTTCTTTCACAGTGTTAGTAAATTT 38873135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4987 CTACGAACAAATATTTTGGAAGATTGCCAACATCATTTCTTTCACAGTGTTAGTAAATTT 5046

 38873136 TAATTTATATTCAAACCCATTGCCTCAGTTCCTCACATTCAGCTCTCTTCAATACTAATT 38873195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5047 TAATTTATATTCAAACCCATTGCCTCAGTTCCTCACATTCAGCTCTCTTCAATACTAATT 5106

 38873196 TAAGTTCTTTGGGTTGAATAAAACTAATTTATTTGCCTCTTTCATTATAAGGATAACAGC 38873255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5107 TAAGTTCTTTGGGTTGAATAAAACTAATTTATTTGCCTCTTTCATTATAAGGATAACAGC 5166

 38873256 TTGCAATACAGCATTATGAGAAGTTCCCCCATTCCCTTGAAACACAAGTTTCATTCTGTT 38873315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5167 TTGCAATACAGCATTATGAGAAGTTCCCCCATTCCCTTGAAACACAAGTTTCATTCTGTT 5226

 38873316 ACTTTTACGTTGTAATGTTTCATAAGTAAAAAACTAGCTATAGAAATTAAGGAAGTTGGG 38873375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5227 ACTTTTACGTTGTAATGTTTCATAAGTAAAAAACTAGCTATAGAAATTAAGGAAGTTGGG 5286

 38873376 AGTTAGAATTTGGGAAATTAAAACAATACTAATACATATTTAAATATGGTTATGTTAGCA 38873435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5287 AGTTAGAATTTGGGAAATTAAAACAATACTAATACATATTTAAATATGGTTATGTTAGCA 5346

 38873436 GAACTGATCACACACGTTGTTGAATTTCTCAAAAATGCTTTTCATCAGAAATCAATTTTA 38873495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5347 GAACTGATCACACACGTTGTTGAATTTCTCAAAAATGCTTTTCATCAGAAATCAATTTTA 5406

 38873496 TTGTCATTTCAAAATACATATCATGAACTCTGCAATCAAAACTGTAAGAGACCAACAACA 38873555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5407 TTGTCATTTCAAAATACATATCATGAACTCTGCAATCAAAACTGTAAGAGACCAACAACA 5466

 38873556 GGCAAGAGGTGTGGTCCCTGCTATCAATCCATATAAATATTATTATACACACATCCCTGT 38873615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5467 GGCAAGAGGTGTGGTCCCTGCTATCAATCCATATAAATATTATTATACACACATCCCTGT 5526

 38873616 ATATGATCCAGAGGTGAAGTGCATCATTTATCAGCTACTTAAGGAAAGCCCCGGTGCCTA 38873675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5527 ATATGATCCAGAGGTGAAGTGCATCATTTATCAGCTACTTAAGGAAAGCCCCGGTGCCTA 5586

 38873676 TTGGCCAGAGTAGGCTGTTCTGATCTCAAGGAGACTGCCCCCACTTCTTTTATTTTGAAG 38873735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5587 TTGGCCAGAGTAGGCTGTTCTGATCTCAAGGAGACTGCCCCCACTTCTTTTATTTTGAAG 5646

 38873736 AATTTCAATACTGCAGAAAAGTTAAAAGACCAATATAATGAATATTTATGTACTCTTCAT 38873795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5647 AATTTCAATACTGCAGAAAAGTTAAAAGACCAATATAATGAATATTTATGTACTCTTCAT 5706

 38873796 CTGACCCCACTAATGGTTTACGTCTCACCACATTTGCATGAAATCTCCTGCTCTGTTTCC 38873855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5707 CTGACCCCACTAATGGTTTACGTCTCACCACATTTGCATGAAATCTCCTGCTCTGTTTCC 5766

 38873856 ATATTTACAAATCAATTTTAAAATAATTTGTACACATTTCTAAGGCTAATTATGTGTTCT 38873915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5767 ATATTTACAAATCAATTTTAAAATAATTTGTACACATTTCTAAGGCTAATTATGTGTTCT 5826

 38873916 GAACAAAAGGAATTACTTTTGGCCATTGAGACCAAATTTTGTCACTGAGGGAAATAAGTC 38873975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5827 GAACAAAAGGAATTACTTTTGGCCATTGAGACCAAATTTTGTCACTGAGGGAAATAAGTC 5886

 38873976 CAGGCTGATGATGTATGGACCATACCTGAAGAAACCAGGTAAAGAGACTGCTGTTTGGGC 38874035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5887 CAGGCTGATGATGTATGGACCATACCTGAAGAAACCAGGTAAAGAGACTGCTGTTTGGGC 5946

 38874036 ATGGAAAGTTTCCTTTGCTATCTGGATAAGCACCTAGTGTAGGGATGACTCCATAATTTA 38874095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5947 ATGGAAAGTTTCCTTTGCTATCTGGATAAGCACCTAGTGTAGGGATGACTCCATAATTTA 6006

 38874096 TTTCCTGAACCAGGGCACTTCTGAGAGTGAAAGAAGGCACTTTTAAGATGTACAGCAGGA 38874155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6007 TTTCCTGAACCAGGGCACTTCTGAGAGTGAAAGAAGGCACTTTTAAGATGTACAGCAGGA 6066

 38874156 CTGAAATCCCAGGTATGCTGGGCCTTTGGGCCACTCCACCTTGAGTGCACAGTGTAGGAG 38874215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6067 CTGAAATCCCAGGTATGCTGGGCCTTTGGGCCACTCCACCTTGAGTGCACAGTGTAGGAG 6126

 38874216 CAGCTGCTGAGAAGTAAGTTGGGCACTAACTTGAGTGCTTAATTTTCCTCTAACAGACAT 38874275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6127 CAGCTGCTGAGAAGTAAGTTGGGCACTAACTTGAGTGCTTAATTTTCCTCTAACAGACAT 6186

 38874276 ATTCCCAGATGACAACAGGTTTCTCTTCCAGCTCATGAATCTGGGGCACAACTTCCAGTG 38874335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     6187 ATTCCCAGATGACAACAGGTTTCTCTTCCAGCTCATGAATCTGGGGCACAACTTTCAGTG 6246

 38874336 TAGACTAACTTATTGGTCTTGAAAAAAAAGAGAGAATTTATTTCTTTACCTGAAAAGAAT 38874395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6247 TAGACTAACTTATTGGTCTTGAAAAAAAAGAGAGAATTTATTTCTTTACCTGAAAAGAAT 6306

 38874396 CCCATGCAATTAAAAGATAATTTATGTCAGCTATAATCAAGGTGATGTTCTGGGTCAGCT 38874455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6307 CCCATGCAATTAAAAGATAATTTATGTCAGCTATAATCAAGGTGATGTTCTGGGTCAGCT 6366

 38874456 AGTCAATGAGTTGCACTCACTGGACACTCAAATTCCACCACTGCTACCGAGTCTCCAACT 38874515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6367 AGTCAATGAGTTGCACTCACTGGACACTCAAATTCCACCACTGCTACCGAGTCTCCAACT 6426

 38874516 AATTTGTCATGAGTCCTTTAGACAGCCACATGAGAAATGATCAAAGGTCAGGTATCTGAT 38874575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6427 AATTTGTCATGAGTCCTTTAGACAGCCACATGAGAAATGATCAAAGGTCAGGTATCTGAT 6486

 38874576 CGCTGGACAACACAGGAGTCTTTATTCCTAAAGCAGGCATCTCCAAGGGAAGTATTTATC 38874635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6487 CGCTGGACAACACAGGAGTCTTTATTCCTAAAGCAGGCATCTCCAAGGGAAGTATTTATC 6546

 38874636 CAAGTCCATTTTTTATTTTTCCATCTGAATACAACTCTGCAAATCAAAATGACCACTTTC 38874695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6547 CAAGTCCATTTTTTATTTTTCCATCTGAATACAACTCTGCAAATCAAAATGACCACTTTC 6606

 38874696 AACCACTGTCTGATCTGTGTACACCCTGTAAGTCACCCCTCCTATAAGTAGCAAGCAAGT 38874755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6607 AACCACTGTCTGATCTGTGTACACCCTGTAAGTCACCCCTCCTATAAGTAGCAAGCAAGT 6666

 38874756 GGGGGCATGTTGTCTATTACCGGGAAAAACAAAATGCAACAATAATCAGAAAAGTTGGCA 38874815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6667 GGGGGCATGTTGTCTATTACCGGGAAAAACAAAATGCAACAATAATCAGAAAAGTTGGCA 6726

 38874816 AACTCAAGTGGACTTTCACCAACATCAAGGTATTTGTAGAAAAGACAGAGTAAAAAAGCA 38874875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6727 AACTCAAGTGGACTTTCACCAACATCAAGGTATTTGTAGAAAAGACAGAGTAAAAAAGCA 6786

 38874876 TAAAAGATGTGGGTGTTTTAAAATAATCTAAATCTCTGGAGACTCTGTCTCAAGTCAGTA 38874935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6787 TAAAAGATGTGGGTGTTTTAAAATAATCTAAATCTCTGGAGACTCTGTCTCAAGTCAGTA 6846

 38874936 TGGACTCCTCTGGCTGTGCAAAGAAGTAACTGGAAAGCATGACTGCATGTAATCAGCAGG 38874995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6847 TGGACTCCTCTGGCTGTGCAAAGAAGTAACTGGAAAGCATGACTGCATGTAATCAGCAGG 6906

 38874996 AAAACCATATCCTAATGACTGAATGTCCCCTCTTGGACCTCACAGAAAATCTCCTTTCCA 38875055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6907 AAAACCATATCCTAATGACTGAATGTCCCCTCTTGGACCTCACAGAAAATCTCCTTTCCA 6966

 38875056 GTTCAGGGCATTCCTTCAGCTACTACCCAGACCACATGGTCACTAGATCAAGGGACCAGT 38875115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6967 GTTCAGGGCATTCCTTCAGCTACTACCCAGACCACATGGTCACTAGATCAAGGGACCAGT 7026

 38875116 GAACTTCATGCTCAGGTGCATGTAAGGAGAGAAAGAGCAGCTTTCCTAAGAAGGGAGGTA 38875175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7027 GAACTTCATGCTCAGGTGCATGTAAGGAGAGAAAGAGCAGCTTTCCTAAGAAGGGAGGTA 7086

 38875176 AAGCATTATTTAAAACAACAACAACAAAACAAACAAAATCATGTGGCGTTAACTGATAAG 38875235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7087 AAGCATTATTTAAAACAACAACAACAAAACAAACAAAATCATGTGGCGTTAACTGATAAG 7146

 38875236 TTAACATGGTCTCCCATAAGAATCCATCTGTAACATATGGCTGGGCTCTGAGCTGCTCAA 38875295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7147 TTAACATGGTCTCCCATAAGAATCCATCTGTAACATATGGCTGGGCTCTGAGCTGCTCAA 7206

 38875296 GGAGACATCAAGGAAGAGGTGTACACTGAGCTGTGATTTGACATGTGGATAAGAGGGGAA 38875355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7207 GGAGACATCAAGGAAGAGGTGTACACTGAGCTGTGATTTGACATGTGGATAAGAGGGGAA 7266

 38875356 TGGGTATTGGGAATACCCATTCTTTCAAGGAAGGAATGAAAAAGATATGGAGACTGAAAA 38875415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7267 TGGGTATTGGGAATACCCATTCTTTCAAGGAAGGAATGAAAAAGATATGGAGACTGAAAA 7326

 38875416 CCAATGTAAGTCAATGTGTTAAGTAGATGCATAAATTTGTATATGTTATGGGTTTCAAAG 38875475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7327 CCAATGTAAGTCAATGTGTTAAGTAGATGCATAAATTTGTATATGTTATGGGTTTCAAAG 7386

 38875476 CACTTTTATTTGCATCATTTTATTTAGTCATCTTAACCAATATTGGAGACAAGCTGGAAA 38875535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7387 CACTTTTATTTGCATCATTTTATTTAGTCATCTTAACCAATATTGGAGACAAGCTGGAAA 7446

 38875536 ATATTATCATTTCAAAATTATAGATGAGGAAATTTAAACAAAGAGAAAATTAACCTGCTT 38875595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7447 ATATTATCATTTCAAAATTATAGATGAGGAAATTTAAACAAAGAGAAAATTAACCTGCTT 7506

 38875596 AACTGTCTTTGGGTTTTAAATGACAGAGTTGAATCTAGTTGACACATATTTGAATGTATT 38875655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7507 AACTGTCTTTGGGTTTTAAATGACAGAGTTGAATCTAGTTGACACATATTTGAATGTATT 7566

 38875656 ATTCTTATACGTTTTAAGAACACAAATGTTTAAGTTTACAGATAAAGAAACTGAAGTTCA 38875715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7567 ATTCTTATACGTTTTAAGAACACAAATGTTTAAGTTTACAGATAAAGAAACTGAAGTTCA 7626

 38875716 GAGAATTCAGCACATAAGTCATAGTCAATATTCAAACCAGGGGTCTCAGGTTCCATATTC 38875775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7627 GAGAATTCAGCACATAAGTCATAGTCAATATTCAAACCAGGGGTCTCAGGTTCCATATTC 7686

 38875776 CAGATCTCTCATTATTTCATATTGACTGAAGAAGAAGAAAATGAGAATGAGTGTTGAAAA 38875835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7687 CAGATCTCTCATTATTTCATATTGACTGAAGAAGAAGAAAATGAGAATGAGTGTTGAAAA 7746

 38875836 CTAATCCAAAAGGACAAAGTCAGGGGTGGGGGGAGTTGTGATCCAAATAAAATTATTGGT 38875895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7747 CTAATCCAAAAGGACAAAGTCAGGGGTGGGGGGAGTTGTGATCCAAATAAAATTATTGGT 7806

 38875896 TCCTATAAGAAATAGATGTAATCTCAGGGTAGAGATGAATCAGGTAAGTGCCCAGGGGCA 38875955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7807 TCCTATAAGAAATAGATGTAATCTCAGGGTAGAGATGAATCAGGTAAGTGCCCAGGGGCA 7866

 38875956 GCAAACGGGATTCCAAAGGTTGCCAGTGAGCTTCTCCAGCTTTTAGTCAATCCTGGAAAC 38876015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7867 GCAAACGGGATTCCAAAGGTTGCCAGTGAGCTTCTCCAGCTTTTAGTCAATCCTGGAAAC 7926

 38876016 AAATCGTGTATTTGTTTCTATCTCAGCTTTCTCACAAGTTCTCCTGTGCTTATGGAGTTC 38876075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7927 AAATCGTGTATTTGTTTCTATCTCAGCTTTCTCACAAGTTCTCCTGTGCTTATGGAGTTC 7986

 38876076 TTCTCCCTGTACTTTCACCTGCACCATCCCTTGGGGTCTAATTCCACTATTGCTGCTCAG 38876135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7987 TTCTCCCTGTACTTTCACCTGCACCATCCCTTGGGGTCTAATTCCACTATTGCTGCTCAG 8046

 38876136 AATTCATCCATCTTGCCATGAGCTGAGCTTCTGCAGCACTCACCTCTGAAACTCACTTTA 38876195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8047 AATTCATCCATCTTGCCATGAGCTGAGCTTCTGCAGCACTCACCTCTGAAACTCACTTTA 8106

 38876196 AAAGGGCATAGTTCTGTGTGCATTGATGAGGACCCACGTAAGTCTGTTGATGCCTGGGCC 38876255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8107 AAAGGGCATAGTTCTGTGTGCATTGATGAGGACCCACGTAAGTCTGTTGATGCCTGGGCC 8166

 38876256 AAGGCAACATAGAACATTGCTTTTTGGTTTTGCTGAGAGCAGGCTGTTTTCTCAGCAAAT 38876315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8167 AAGGCAACATAGAACATTGCTTTTTGGTTTTGCTGAGAGCAGGCTGTTTTCTCAGCAAAT 8226

 38876316 CATGCAGCTTCATTCCTGCTGCATTTACACAAATCAAGGAGTCATTTTACTCTCTAAATT 38876375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8227 CATGCAGCTTCATTCCTGCTGCATTTACACAAATCAAGGAGTCATTTTACTCTCTAAATT 8286

 38876376 CTATTTCCTGACTTTTATTGTAGTAATTTTATATTTTGAATAATTTTGAGGGTGGATAGA 38876435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8287 CTATTTCCTGACTTTTATTGTAGTAATTTTATATTTTGAATAATTTTGAGGGTGGATAGA 8346

 38876436 TGCATTTTGGACATATCTGCTCCATATTTCAATAATCTTTTCAAAAGTGAAGGAAAGCCA 38876495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8347 TGCATTTTGGACATATCTGCTCCATATTTCAATAATCTTTTCAAAAGTGAAGGAAAGCCA 8406

 38876496 AAAGTTTACCGTGTGTGGAAACCTGAAATCTTGGCTGAGTCCACTTTTCCCTCGAACCTA 38876555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8407 AAAGTTTACCGTGTGTGGAAACCTGAAATCTTGGCTGAGTCCACTTTTCCCTCGAACCTA 8466

 38876556 GTGTACAATGGGATTTTCATCCAGTACCAGTTTTGATGGCAAGCTGGGAAAGCACGGGTG 38876615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8467 GTGTACAATGGGATTTTCATCCAGTACCAGTTTTGATGGCAAGCTGGGAAAGCACGGGTG 8526

 38876616 TTTGGAGGCTAAGGCTCCCATTCTTTCATATGCAGAAAATGAGCAATGTCTCCTGTTTCC 38876675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8527 TTTGGAGGCTAAGGCTCCCATTCTTTCATATGCAGAAAATGAGCAATGTCTCCTGTTTCC 8586

 38876676 TGGCACCCATCACCATTCCCCTCCTAGCACTGAAGGAACTGATCGGCATGATCACTTTGC 38876735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8587 TGGCACCCATCACCATTCCCCTCCTAGCACTGAAGGAACTGATCGGCATGATCACTTTGC 8646

 38876736 ATTTTGGCTCGTATCTCTCATCCTTGCTGAGGCCAGTCACCCTCCAAGTCTCTCACCATT 38876795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8647 ATTTTGGCTCGTATCTCTCATCCTTGCTGAGGCCAGTCACCCTCCAAGTCTCTCACCATT 8706

 38876796 TGGCTTTGCTCTTTGAAACTGGTGGAAACTTAAATATAAGATATTCAAGCTTTGTTTCCT 38876855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8707 TGGCTTTGCTCTTTGAAACTGGTGGAAACTTAAATATAAGATATTCAAGCTTTGTTTCCT 8766

 38876856 CATCACTATAAAGGGCAATGCTGTTGTCCTGGTATCACTTGGAGCTCTAGCTACGACCTG 38876915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8767 CATCACTATAAAGGGCAATGCTGTTGTCCTGGTATCACTTGGAGCTCTAGCTACGACCTG 8826

 38876916 TGTGCTCCAGAAATCTGTACTTCAAATGAGGCTTCTTGGTGTGGTGGTACAGATATTTTA 38876975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8827 TGTGCTCCAGAAATCTGTACTTCAAATGAGGCTTCTTGGTGTGGTGGTACAGATATTTTA 8886

 38876976 GAAGTGCTAAGAATCCATTGTAATTCCTAAAGGAATCTGAAAAGGCCCTTCTGAAGTCCT 38877035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8887 GAAGTGCTAAGAATCCATTGTAATTCCTAAAGGAATCTGAAAAGGCCCTTCTGAAGTCCT 8946

 38877036 TAGCTGGAGGCATCATGTAAGGGATAGGGGTGTGCAACCCAATATGGATGCAATTGTGAC 38877095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8947 TAGCTGGAGGCATCATGTAAGGGATAGGGGTGTGCAACCCAATATGGATGCAATTGTGAC 9006

 38877096 AAAGGTATATGGCCTATGTGACTTAGAACAAGTTTTTATTTACTCACAGAGGTTAAATAT 38877155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9007 AAAGGTATATGGCCTATGTGACTTAGAACAAGTTTTTATTTACTCACAGAGGTTAAATAT 9066

 38877156 TTTTTTCCATCATATACTTTACTTAGCACTTTAAAAGCATTTTTAATATTTAGCGTGGGT 38877215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9067 TTTTTTCCATCATATACTTTACTTAGCACTTTAAAAGCATTTTTAATATTTAGCGTGGGT 9126

 38877216 TTGATATCATTTTTATTCTCAGTATAGAGATTATGAGGCTCAGAGCTTTGAGTTACTTCT 38877275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9127 TTGATATCATTTTTATTCTCAGTATAGAGATTATGAGGCTCAGAGCTTTGAGTTACTTCT 9186

 38877276 AAAGGATTACATATACCTGGTAATTGTCAGCTGTAATTTGAACTCAAGTCTAAGTGATCT 38877335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9187 AAAGGATTACATATACCTGGTAATTGTCAGCTGTAATTTGAACTCAAGTCTAAGTGATCT 9246

 38877336 GAGAGTCAAAGCTCTTACTCACTACTTTGTGTTACTTTTACCCACTTATGTAGTCAGTTC 38877395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9247 GAGAGTCAAAGCTCTTACTCACTACTTTGTGTTACTTTTACCCACTTATGTAGTCAGTTC 9306

 38877396 TCTTTGTCCAGCAGGCATAACTGCCCTCTTTTCTCTTTGTAAGTGTCCTGCTAAATATTC 38877455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9307 TCTTTGTCCAGCAGGCATAACTGCCCTCTTTTCTCTTTGTAAGTGTCCTGCTAAATATTC 9366

 38877456 ATTGTTCATCTTTCTTTATGAAGCCACACTTTAAAAAAATTTCTCCTTCATCCAAAGTCA 38877515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9367 ATTGTTCATCTTTCTTTATGAAGCCACACTTTAAAAAAATTTCTCCTTCATCCAAAGTCA 9426

 38877516 TTCATTTACTTGATCACTCTTTGTTGAGTAGCTTCCAGTCTGAAGCACTGTGCTGAGGAT 38877575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9427 TTCATTTACTTGATCACTCTTTGTTGAGTAGCTTCCAGTCTGAAGCACTGTGCTGAGGAT 9486

 38877576 AGAATGAGACATAAATTGCCATTTCTGTTTTCAAAAATATTATTGTTTATTCAGGAAGAC 38877635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9487 AGAATGAGACATAAATTGCCATTTCTGTTTTCAAAAATATTATTGTTTATTCAGGAAGAC 9546

 38877636 AAATAAATAAACATTAGGGAATAGTAAGTATTTTAATGGAGGTCTTTCCATTGTGCTATA 38877695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9547 AAATAAATAAACATTAGGGAATAGTAAGTATTTTAATGGAGGTCTTTCCATTGTGCTATA 9606

 38877696 AGAGGACATACGAGTAGTACCTAGCATAGATGGGAAGAGAGATGGAAAGAAGGAAAGTCT 38877755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9607 AGAGGACATACGAGTAGTACCTAGCATAGATGGGAAGAGAGATGGAAAGAAGGAAAGTCT 9666

 38877756 TCTTGGAGGAAGATCAAACTGACAGTATAAAAAGAAAATATATTCTAGGCCAAGGAATGG 38877815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9667 TCTTGGAGGAAGATCAAACTGACAGTATAAAAAGAAAATATATTCTAGGCCAAGGAATGG 9726

 38877816 CAGAGAG 38877822
          |||||||
     9727 CAGAGAG 9733

Alignment time is 8.08279 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38854779,38878343] =>     23565 nucs '18 dna:chromosome chromosome:GRCh37:18:1:78077248:1'
Second seq [       1,    2450] =>      2450 nucs 'mol-32-30f6-062711_2450'

Score:        2409
Aligned:      2456        nucs
Identic:      2446 (100%) nucs =>      1236 ( 99%)      1210 (100%)
Gaps:            8 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38863047,38864291] EXCISED REGION [38864298,38865508]
 second seq =>  [       1,    1237] EXCISED REGION [    1240,    2450]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         6 nucs [38864292,38864297]
 second seq =>         2 nucs [1238,1239]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [38864291,38864291] to [38864297,38864297]
 second seq =>         1 nucs [1238,1238] to [1240,1240]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>        19 nucs [38864273,38864291] to [38864298,38864316]
 second seq =>        15 nucs [1223,1237] to [1240,1254]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [38864292,38864293] to [38864296,38864297]
 second seq =>         0 nucs

 38863047 CTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAGAAAGAAAAG 38863106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAGAAAGAAAAG 60

 38863107 AAAGATCTAATACTAGTAATCTGTTTCCACTTTAGAACACTATAAAAAAGAGCAAATAAT 38863166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAAGATCTAATACTAGTAATCTGTTTCCACTTTAGAACACTATAAAAAAGAGCAAATAAT 120

 38863167 ATGCAAAGTAAGAAGAATGAAAGATATCATAAAAATAGAGCAAAAATTAAAGGAATTTAA 38863226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATGCAAAGTAAGAAGAATGAAAGATATCATAAAAATAGAGCAAAAATTAAAGGAATTTAA 180

 38863227 AATAGAAAATTGATTTTATAAAATCAGTTAAACCAAAAGCCAATTTTCTAAAAGGGTCAA 38863286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AATAGAAAATTGATTTTATAAAATCAGTTAAACCAAAAGCCAATTTTCTAAAAGGGTCAA 240

 38863287 TAAAATTGATAAGCCTCTAGCCAGGGTGGCTAAGACACAAAGAGGAAAAACACAAATTGC 38863346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TAAAATTGATAAGCCTCTAGCCAGGGTGGCTAAGACACAAAGAGGAAAAACACAAATTGC 300

 38863347 TAAGATCAGCAGTGAAAGAGGGGACATCACTGCAGATCACATGGACATTAAAAGGAAAAT 38863406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TAAGATCAGCAGTGAAAGAGGGGACATCACTGCAGATCACATGGACATTAAAAGGAAAAT 360

 38863407 AAATGAAGATTATGAACAAACCTGTGCCCACACGTCTGATAACTTTGATGAAATGGACTA 38863466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAATGAAGATTATGAACAAACCTGTGCCCACACGTCTGATAACTTTGATGAAATGGACTA 420

 38863467 ATTCCTTAAAAGGTCTAATCTTTTAAAACTCACACAAGAAGAAATAGAAAATATGAATAG 38863526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATTCCTTAAAAGGTCTAATCTTTTAAAACTCACACAAGAAGAAATAGAAAATATGAATAG 480

 38863527 GACTACATCTATTTTTAAATTAATTAATAACCTCATAAAAATAAAGCATCAGGCTCAGCT 38863586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GACTACATCTATTTTTAAATTAATTAATAACCTCATAAAAATAAAGCATCAGGCTCAGCT 540

 38863587 AAGGAAGAAATTATGTTAATTCTCTCCCAGAAGATAGAAACAGAGGACATACTTCCTAAC 38863646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAGGAAGAAATTATGTTAATTCTCTCCCAGAAGATAGAAACAGAGGACATACTTCCTAAC 600

 38863647 TCATTCTATGAGGCCAGCATGGCTCTAATGCCGAAGCCAGACAAAAAGATTATAAGAAAA 38863706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCATTCTATGAGGCCAGCATGGCTCTAATGCCGAAGCCAGACAAAAAGATTATAAGAAAA 660

 38863707 AACAAACAAAACTACAGATCTATATATCTCAAAAACATTGGTGCAAAAATCCTCAACCAA 38863766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AACAAACAAAACTACAGATCTATATATCTCAAAAACATTGGTGCAAAAATCCTCAACCAA 720

 38863767 ATATTAGCAAATCAAATTCAGCAATGTGTAAAGTGATTTACACACTATGACCAAGTGGGA 38863826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATATTAGCAAATCAAATTCAGCAATGTGTAAAGTGATTTACACACTATGACCAAGTGGGA 780

 38863827 TTTATCTCAAGTGTTTAAGTCTGGTTCAATGTTTGACAATTAATTAATGTAATCACCTGG 38863886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTTATCTCAAGTGTTTAAGTCTGGTTCAATGTTTGACAATTAATTAATGTAATCACCTGG 840

 38863887 TTAAAGAAGGAAAATTACATGATCTTATCAATAGATGCAGGAAAAAGCATTTGACAAAAT 38863946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTAAAGAAGGAAAATTACATGATCTTATCAATAGATGCAGGAAAAAGCATTTGACAAAAT 900

 38863947 CTAACACCACCCATTCTTAAAACAAAATGTCTCTCAGAAAACTAGCAATACAGGGAAATA 38864006
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTAACACCACCCATTCTTAAAACAAAATGTCTCTCAGAAAACTAGCAATACAGGGAAATA 960

 38864007 TCCTCAACTTGGTAAAGAACATTTTAAGAAATCATAGTTAATAATGAGAAACTTGAAACT 38864066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TCCTCAACTTGGTAAAGAACATTTTAAGAAATCATAGTTAATAATGAGAAACTTGAAACT 1020

 38864067 TCTTCACTACCATCGGGAAAACAGCAAGTATACTACCTCTCACCAGTGCTTTTCGACTTG 38864126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TCTTCACTACCATCGGGAAAACAGCAAGTATACTACCTCTCACCAGTGCTTTTCGACTTG 1080

 38864127 ATATCAAAAGTACTAGCTAATGCAGTAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAA 38864186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATATCAAAAGTACTAGCTAATGCAGTAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAA 1140

 38864187 GAAAGAAAGAAAGAAAGAAAAGAAAAAGAGAGAGAGAAAAGAAAGAGAGGAAAGAAAGAA 38864246
          ||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GAAAGAAAGAAA--------AGAAAAAGAGAGAGAGAAAAGAAAGAGAGGAAAGAAAGAA 1192

 38864247 AGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAA 38864291
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1193 AGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAA 1237

EXCISED REGION

 38864298 AAAGAAAGAAAGAAAGAAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAG 38864357
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1240 AAAGAAAGAAAGAAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAG 1299

 38864358 GAAATACAGATTGGGAAGAAAAAATAAAATTGTGTTTGTTCACACATGACATGATTGTGT 38864417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1300 GAAATACAGATTGGGAAGAAAAAATAAAATTGTGTTTGTTCACACATGACATGATTGTGT 1359

 38864418 AGAAAATCCAAAAGAATCAACAAAAAAGCTTCCTGAAATTAACAAATAATTACAGCAAGT 38864477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1360 AGAAAATCCAAAAGAATCAACAAAAAAGCTTCCTGAAATTAACAAATAATTACAGCAAGT 1419

 38864478 TTGCTGGAAATGAAGTTCATATACAAAATTGAATTACTTTTCCATATATCCACAATCAAC 38864537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1420 TTGCTGGAAATGAAGTTCATATACAAAATTGAATTACTTTTCCATATATCCACAATCAAC 1479

 38864538 AAATGGAATTTGAAATTAAAAACACATTATCATTTATATTAGCATCCTCAAAATGTAATA 38864597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1480 AAATGGAATTTGAAATTAAAAACACATTATCATTTATATTAGCATCCTCAAAATGTAATA 1539

 38864598 TTTCTGCATAAATTTAACAAAATATGTATATAATTTATATGAGGAGAACTACAAAATTCT 38864657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1540 TTTCTGCATAAATTTAACAAAATATGTATATAATTTATATGAGGAGAACTACAAAATTCT 1599

 38864658 GAAGAAATATGTCAAAGACTAAATAAATGGAAAGATATCTCAGGTTCATGGGTAGAAAGA 38864717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1600 GAAGAAATATGTCAAAGACTAAATAAATGGAAAGATATCTCAGGTTCATGGGTAGAAAGA 1659

 38864718 CTCAATATTGTTGAAATGTTAATTCTTCCCAACTTAATCTATAGATTCAATGTAATTACA 38864777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1660 CTCAATATTGTTGAAATGTTAATTCTTCCCAACTTAATCTATAGATTCAATGTAATTACA 1719

 38864778 ATCAAAAATGAAAGTAAGTTTTGTGTGTGTTTGTGTGAATCTTGACAAACTGATTTTAAA 38864837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1720 ATCAAAAATGAAAGTAAGTTTTGTGTGTGTTTGTGTGAATCTTGACAAACTGATTTTAAA 1779

 38864838 GTTCATATGGAGAGGAAAATGACCCAGAATAGCCACCACAATGTTGAGGGAGAACAAAGT 38864897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1780 GTTCATATGGAGAGGAAAATGACCCAGAATAGCCACCACAATGTTGAGGGAGAACAAAGT 1839

 38864898 GAGAAGACAGCACTACCCAACTTCAAGACTTGCTGAAAAGCTACAGCAATCAAGATAGTG 38864957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1840 GAGAAGACAGCACTACCCAACTTCAAGACTTGCTGAAAAGCTACAGCAATCAAGATAGTG 1899

 38864958 AGGTATTGGTAAAAGATAAAAAAACAGGTCAATGAAACAACATAGTGTACTCAGACATAA 38865017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1900 AGGTATTGGTAAAAGATAAAAAAACAGGTCAATGAAACAACATAGTGTACTCAGACATAA 1959

 38865018 CCCACATAATATACTCAACTGATCTTTGACAAAGGTGCAAGTTCAAGACAATGGAGCAAA 38865077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1960 CCCACATAATATACTCAACTGATCTTTGACAAAGGTGCAAGTTCAAGACAATGGAGCAAA 2019

 38865078 GATAGTCTTTTCAATAAATAGTGGTAAGAAAACTAGGCATAACATGCAAGAATAAAATGT 38865137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2020 GATAGTCTTTTCAATAAATAGTGGTAAGAAAACTAGGCATAACATGCAAGAATAAAATGT 2079

 38865138 AAATCTAGATATAGACCTTATGATCTTCACAAAAATTAATTCAAAATGAACTTTAGAGCT 38865197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2080 AAATCTAGATATAGACCTTATGATCTTCACAAAAATTAATTCAAAATGAACTTTAGAGCT 2139

 38865198 CAATTTAAAATGTAAAATTATAAAGCTCCTAGAAGGTAACATCAGAGAGAAACTAGGTGA 38865257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2140 CAATTTAAAATGTAAAATTATAAAGCTCCTAGAAGGTAACATCAGAGAGAAACTAGGTGA 2199

 38865258 CCTTGGTTTGGTGTTAACTTTTTAGAAACAACACCAGAAGTATGACCCATGAAAGAAAGA 38865317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2200 CCTTGGTTTGGTGTTAACTTTTTAGAAACAACACCAGAAGTATGACCCATGAAAGAAAGA 2259

 38865318 ATTGATAAGCTGGACTTAACTAAAATTAAATACTTCTGTTTTGAGAAAGGCACTATCAAG 38865377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2260 ATTGATAAGCTGGACTTAACTAAAATTAAATACTTCTGTTTTGAGAAAGGCACTATCAAG 2319

 38865378 ATCATTGGACCACAAGCAACAGACTGAAAGAAAATATCTGCAAAAGATAGATCTGATAAA 38865437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2320 ATCATTGGACCACAAGCAACAGACTGAAAGAAAATATCTGCAAAAGATAGATCTGATAAA 2379

 38865438 GGCGAGTCATTTAAAATATTCAAATATCTTTGAAAACTCAACCATAAGAACCCAAAAAAC 38865497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2380 GGCGAGTCATTTAAAATATTCAAATATCTTTGAAAACTCAACCATAAGAACCCAAAAAAC 2439

 38865498 CTAGTTAAAAA 38865508
          |||||||||||
     2440 CTAGTTAAAAA 2450

Alignment time is 2.12309 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38854779,38878343] =>     23565 nucs '18 dna:chromosome chromosome:GRCh37:18:1:78077248:1'
Second seq [       1,    9252] =>      9252 nucs 'mol-32-310c-186445_9252'

Score:        8902
Aligned:      9248        nucs
Identic:      9210 (100%) nucs =>       141 (100%)      9069 (100%)
Gaps:           12 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38864639,38864779] EXCISED REGION [38868344,38877449]
 second seq =>  [       1,     141] EXCISED REGION [     157,    9252]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3564 nucs [38864780,38868343]
 second seq =>        15 nucs [142,156]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 38864639 AGGAGAACTACAAAATTCTGAAGAAATATGTCAAAGACTAAATAAATGGAAAGATATCTC 38864698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGGAGAACTACAAAATTCTGAAGAAATATGTCAAAGACTAAATAAATGGAAAGATATCTC 60

 38864699 AGGTTCATGGGTAGAAAGACTCAATATTGTTGAAATGTTAATTCTTCCCAACTTAATCTA 38864758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGGTTCATGGGTAGAAAGACTCAATATTGTTGAAATGTTAATTCTTCCCAACTTAATCTA 120

 38864759 TAGATTCAATGTAATTACAAT 38864779
          |||||||||||||||||||||
      121 TAGATTCAATGTAATTACAAT 141

EXCISED REGION

 38868344 AAAATATTATTGTGTAAACATAATTATAATATTATAGTGTTGGATTTATAACATATTTGG 38868403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      157 AAAATATTATTGTGTAAACATAATTATAATATTATAGTGTTGGATTTATAACATATTTGG 216

 38868404 TGAAGTAATCGCACAAAGTAAAGAGAAGAAGAAAAGGGTATGTAAGTAAATAAAGATATT 38868463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      217 TGAAGTAATCGCACAAAGTAAAGAGAAGAAGAAAAGGGTATGTAAGTAAATAAAGATATT 276

 38868464 ATATTTTACTGGAATTAAGTTGGTACTATTCTTAAATGGATTATGATTAGATGAGATGCA 38868523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      277 ATATTTTACTGGAATTAAGTTGGTACTATTCTTAAATGGATTATGATTAGATGAGATGCA 336

 38868524 TATTGTAATTATTGTAGCAACCACTAAGAAATAATATTAACACAAACAACAGAGGAATTA 38868583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      337 TATTGTAATTATTGTAGCAACCACTAAGAAATAATATTAACACAAACAACAGAGGAATTA 396

 38868584 AAATGATAGATTAGAAAAACCATTTATATATCACAAAATATAACAGTAAATGAGAAACAG 38868643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      397 AAATGATAGATTAGAAAAACCATTTATATATCACAAAATATAACAGTAAATGAGAAACAG 456

 38868644 AGGAATATATTTAAAATGAGCCTGGTTGCAGCGGCTCACACCTGTAATCTTAGCAACTTG 38868703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      457 AGGAATATATTTAAAATGAGCCTGGTTGCAGCGGCTCACACCTGTAATCTTAGCAACTTG 516

 38868704 GAAGGCCAAGGTAGGAGGAAGTCTTGAGCCCAGGAGTTCAAGATCAGCCTGAGCAACACA 38868763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      517 GAAGGCCAAGGTAGGAGGAAGTCTTGAGCCCAGGAGTTCAAGATCAGCCTGAGCAACACA 576

 38868764 GTGAGACCCCCATCTCTACAAAAAGTAGAAATTTGGCAAGGCATCATGATAGGCACCTGT 38868823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      577 GTGAGACCCCCATCTCTACAAAAAGTAGAAATTTGGCAAGGCATCATGATAGGCACCTGT 636

 38868824 AGTCCCAGCTACTGATGAAGCTAAGGCAAGAGGATTTCTTGAGCCTCTGAGGTCAAGGCT 38868883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      637 AGTCCCAGCTACTGATGAAGCTAAGGCAAGAGGATTTCTTGAGCCTCTGAGGTCAAGGCT 696

 38868884 ACAGTGAGCTATGATCACACCACTGCGCTCCAGCTTTGGAGACAGAGCAAGACTCTACAG 38868943
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
      697 ACAGTGAGCTATGATCACACCACTGCACTCCAGCTTTGGAGACAGAGCAAGACTCTACAG 756

 38868944 CAATAAATAAATAAATAGAAAGCAAATAGAAAAATGACAGGCATAAATCCAACTGTAGCA 38869003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      757 CAATAAATAAATAAATAGAAAGCAAATAGAAAAATGACAGGCATAAATCCAACTGTAGCA 816

 38869004 ATACTTAATACATGAAAAGCAAATAAACCAAGCACAACACATAAAAGGAAAGGATTGTCA 38869063
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
      817 ATACTTAATACATGAAAAGCAAATAAACCAAGCACAACACATAAAAGGAAAGGTTTGTCA 876

 38869064 GATTTGATAGAAACAAGACCCAAGTATACACTGTCTATAATAGACACACATTATATTCAA 38869123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      877 GATTTGATAGAAACAAGACCCAAGTATACACTGTCTATAATAGACACACATTATATTCAA 936

 38869124 ATACATAAATAAATAAAAAGCAAAATGATGTAAAAAAGGTAAAGTATGAAATCAGTAACT 38869183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      937 ATACATAAATAAATAAAAAGCAAAATGATGTAAAAAAGGTAAAGTATGAAATCAGTAACT 996

 38869184 CTATGACAGCTGAAGTAGCTGTATTAACATTATTTAAAATAGACTTTAATACAAGAAACA 38869243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      997 CTATGACAGCTGAAGTAGCTGTATTAACATTATTTAAAATAGACTTTAATACAAGAAACA 1056

 38869244 CTATCAGAGAAGAAAAGCCATATTTCATAATGATAAAACATGCCAATTCATCATAAAGAT 38869303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1057 CTATCAGAGAAGAAAAGCCATATTTCATAATGATAAAACATGCCAATTCATCATAAAGAT 1116

 38869304 GTAAGAGTTAAAAACATGTATACATTTAATCATAATGCCCCAAAATACCTGAAGCAAAAA 38869363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1117 GTAAGAGTTAAAAACATGTATACATTTAATCATAATGCCCCAAAATACCTGAAGCAAAAA 1176

 38869364 TGGACAGAACTGAAAAAAGAAATAGACAATTCAAAAATAATAGTTTGAAATTCAAACAAC 38869423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1177 TGGACAGAACTGAAAAAAGAAATAGACAATTCAAAAATAATAGTTTGAAATTCAAACAAC 1236

 38869424 TGACTATCCATAATGACTAGACAGAAGATTAATAAGTATATAGAAGACTTGAGTAACACT 38869483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1237 TGACTATCCATAATGACTAGACAGAAGATTAATAAGTATATAGAAGACTTGAGTAACACT 1296

 38869484 ATACACCAACAATACTTAACAAATATCTGGAGAACAGTCCTCCTGACAGCAGAAGAATAC 38869543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1297 ATACACCAACAATACTTAACAAATATCTGGAGAACAGTCCTCCTGACAGCAGAAGAATAC 1356

 38869544 ATGTTCTTCTCAAGTACAAAGGAACAGTCTTCAGGATAGACTATTTTATGCCATAAAACA 38869603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1357 ATGTTCTTCTCAAGTACAAAGGAACAGTCTTCAGGATAGACTATTTTATGCCATAAAACA 1416

 38869604 ACCTCAATAAATATAAAATGATTGAAATCATACAAAGTATATTTATCAACCACAATGGAA 38869663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1417 ACCTCAATAAATATAAAATGATTGAAATCATACAAAGTATATTTATCAACCACAATGGAA 1476

 38869664 TCAAATCAGAAATCAATAATGGAGAAATTTGGGGATATGAACAAAATGTGGAAATTAATC 38869723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1477 TCAAATCAGAAATCAATAATGGAGAAATTTGGGGATATGAACAAAATGTGGAAATTAATC 1536

 38869724 AATACCCTCTATATAGCCAATGAGTCAAAGAAGAAATCACAAGGAAAATTAGAGTGAAAT 38869783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1537 AATACCCTCTATATAGCCAATGAGTCAAAGAAGAAATCACAAGGAAAATTAGAGTGAAAT 1596

 38869784 TAAAAATCAATAGATCCCAACATTTTGGAAGGCCAAGATGGGAGGATCACTCCTGGGTAA 38869843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1597 TAAAAATCAATAGATCCCAACATTTTGGAAGGCCAAGATGGGAGGATCACTCCTGGGTAA 1656

 38869844 CATAGTGAGAGCCAATAAAAAAATTAGCCAGGGATGGTGGTGAGTGTCAGTAGTTCCAGC 38869903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1657 CATAGTGAGAGCCAATAAAAAAATTAGCCAGGGATGGTGGTGAGTGTCAGTAGTTCCAGC 1716

 38869904 TACTTGGGAGGCTGAGGTGGCAGGATCACTTGAGCCCAGAAGGTCAACATTGCAGTGAGC 38869963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1717 TACTTGGGAGGCTGAGGTGGCAGGATCACTTGAGCCCAGAAGGTCAACATTGCAGTGAGC 1776

 38869964 CTTGTTTGTACCACTGCACTCCAGCCTAGGCGAGACTGAGACCCTGTTTCAAAAATAAAT 38870023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
     1777 CTTGTTTGTACCACTGCACTCCAGCCTAGGCGAGACTGAGACCCTGTTTCAA-------- 1828

 38870024 AAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAGTGAAAATAAAAATAAATGAAACCAAAGTTC 38870083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1829 AAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAGTGAAAATAAAAATAAATGAAACCAAAGTTC 1888

 38870084 ACTCTAAAAAAAAAGTCAACAAAGTTGATAAATATGTAGCTAAATTAAACAAGAAAGTGA 38870143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1889 ACTCTAAAAAAAAAGTCAACAAAGTTGATAAATATGTAGCTAAATTAAACAAGAAAGTGA 1948

 38870144 GAGACGAAATCAGAAAAGGAAGTAGGTAACATCACTTCCAAAATCTCCAAAATTTAAAAA 38870203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1949 GAGACGAAATCAGAAAAGGAAGTAGGTAACATCACTTCCAAAATCTCCAAAATTTAAAAA 2008

 38870204 TGTTTTGAAGATGATGAACAACTTTATGAAAACAATCAAGATAATGTACACGAAATTTTA 38870263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2009 TGTTTTGAAGATGATGAACAACTTTATGAAAACAATCAAGATAATGTACACGAAATTTTA 2068

 38870264 TATTTTAATTCCAAAAGCAACCACTAGAAAAAATAACTCAAAACAATAATGTAAAAATCA 38870323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2069 TATTTTAATTCCAAAAGCAACCACTAGAAAAAATAACTCAAAACAATAATGTAAAAATCA 2128

 38870324 ACAGAAGATGGCCGGGCACGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTTTGTTAAATGT 38870383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2129 ACAGAAGATGGCCGGGCACGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTTTGTTAAATGT 2188

 38870384 TGTTTAATGTATTATGTTAAATCTTCTGGGTTTTTTTTTGTTGTTGTTGTTTTGAGACGG 38870443
          |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
     2189 TGTTTAATGTATTATGTTAAATCTTCTGGG-TTTTTTTTGTTGTTGTTGTTTTGAGACGG 2247

 38870444 AGTCTCGCTCTGTCGTCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTCGGCTCACTGCAAGCTC 38870503
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     2248 AGTCTCGCTCTGTCGTCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAGCTC 2307

 38870504 CGCCTCCCGGGTTCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGCAGATCACGAGGTCGGGAGATCAAG 38870563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2308 CGCCTCCCGGGTTCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGCAGATCACGAGGTCGGGAGATCAAG 2367

 38870564 ACCATCCTGGCTAAAATGGAGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAACAAAATTAGC 38870623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2368 ACCATCCTGGCTAAAATGGAGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAACAAAATTAGC 2427

 38870624 CGGGCCCGGTGTGGGGCACCTGTGGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTG 38870683
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2428 CGGGCCCGGTGTGGGGCACCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTG 2487

 38870684 CTTGAGCCCGGGATGTCCAGGCTACCGTGAGCCATATTCATGACACAGCACTCCAGCCTG 38870743
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2488 CTTGAGCCCGGGATGTCCAGGATACCGTGAGCCATATTCATGACACAGCACTCCAGCCTG 2547

 38870744 GGTGACAGAGTGAGATCCTGCCACAAAATAAAAAGAAAAGAGAAAATGATAAAGATTGTA 38870803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2548 GGTGACAGAGTGAGATCCTGCCACAAAATAAAAAGAAAAGAGAAAATGATAAAGATTGTA 2607

 38870804 AAAATACAATCGTATATGGCTACAACTGATTTGTTAAAAAGATGCAAAGGCAATCCAGTG 38870863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2608 AAAATACAATCGTATATGGCTACAACTGATTTGTTAAAAAGATGCAAAGGCAATCCAGTG 2667

 38870864 GAGAAATTACAGTGTTTTTAAAAATTTGTTAGATCAATTTAATACCTACACATAAAAATA 38870923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2668 GAGAAATTACAGTGTTTTTAAAAATTTGTTAGATCAATTTAATACCTACACATAAAAATA 2727

 38870924 TAAACTTCTACCCATACCTGTTGCCACATTTAAAAAAAAAATTAACTAATAGGCCTAAAC 38870983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2728 TAAACTTCTACCCATACCTGTTGCCACATTTAAAAAAAAAATTAACTAATAGGCCTAAAC 2787

 38870984 ATAAGCTAAAACTATAAAAGTTTTAGTTGAACACATACGAGAAAAAATTTTGTGACTGTG 38871043
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     2788 ATAAGCTAAAACTATAAAAGTTTTAGTTGAACACATATGAGAAAAAATTTTGTGACTGTG 2847

 38871044 GTTTAAGCAAAGAGTTCTTAGATAACAAAATCAAAGTCTGACTTACTTAAAAAATTATAA 38871103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2848 GTTTAAGCAAAGAGTTCTTAGATAACAAAATCAAAGTCTGACTTACTTAAAAAATTATAA 2907

 38871104 ATTAGACTTCACTAATATTAAGATCTTCTGTTCCTTGAAAGACAATGTTAAAAGAATAAA 38871163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2908 ATTAGACTTCACTAATATTAAGATCTTCTGTTCCTTGAAAGACAATGTTAAAAGAATAAA 2967

 38871164 AAACCAAGACATTAGGGAATATTTGCACATCACATTTTTGATAAACAACTTGTATCCTGA 38871223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2968 AAACCAAGACATTAGGGAATATTTGCACATCACATTTTTGATAAACAACTTGTATCCTGA 3027

 38871224 ATATATAATTTTCTAAATTCAATAATAATAAAAAAATTTAGCAACAGATTTTAACAGAAA 38871283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3028 ATATATAATTTTCTAAATTCAATAATAATAAAAAAATTTAGCAACAGATTTTAACAGAAA 3087

 38871284 CTTATCAAATAAATACAGAGATGACAGATAAGCACATAACACATGTTCAATATCATTATT 38871343
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3088 CTTATCAAATAAATACAGAGATGACTGATAAGCACATAACACATGTTCAATATCATTATT 3147

 38871344 CATTAGGGAAATGTAAATGAAACCACAATTAAACACTGCCTCACACATTAAAAGGTCTTA 38871403
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     3148 CATTAGGGAAATGTAAATGAAACCACAATTAGACACTGCCTCACACATTAAAAGGTCTTA 3207

 38871404 AATTGACACTACTGATGACATCAAGTACTGCAAGGATTTAAATCAAGTGGAAACTTCATA 38871463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3208 AATTGACACTACTGATGACATCAAGTACTGCAAGGATTTAAATCAAGTGGAAACTTCATA 3267

 38871464 AACTTCTGGGGGTTATGTAAACTGTTGTAAATACTTTGAAAAACAGTTCTGCAGTTTTGT 38871523
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3268 AACTTCTGGGAGTTATGTAAACTGTTGTAAATACTTTGAAAAACAGTTCTGCAGTTTTGT 3327

 38871524 AAAAAGGTAAACATACACTTAGGGCATAACTCAGCTATCCGACTCCCAAGTATTTACTAA 38871583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3328 AAAAAGGTAAACATACACTTAGGGCATAACTCAGCTATCCGACTCCCAAGTATTTACTAA 3387

 38871584 ACAGAAATGAAAGCCTATGTTTATAGAAAGAACTGAACATGAAATTTCATAGTAGCTTTT 38871643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3388 ACAGAAATGAAAGCCTATGTTTATAGAAAGAACTGAACATGAAATTTCATAGTAGCTTTT 3447

 38871644 TCTGTAATAGCCTCAAGGAAATCAACCCAAATGTCATACATAGGTAAATGGACAATAAAA 38871703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3448 TCTGTAATAGCCTCAAGGAAATCAACCCAAATGTCATACATAGGTAAATGGACAATAAAA 3507

 38871704 TTGTAATATATCTATATGCTAAAATGCTATTCAGAAACAAAAGGTATGAAGTCTTCAGAC 38871763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3508 TTGTAATATATCTATATGCTAAAATGCTATTCAGAAACAAAAGGTATGAAGTCTTCAGAC 3567

 38871764 ATCTATAGACACTGGTGAATCTTAAATAGTGAGGCTAAGTGACAGAAACCCAAAAATAAC 38871823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3568 ATCTATAGACACTGGTGAATCTTAAATAGTGAGGCTAAGTGACAGAAACCCAAAAATAAC 3627

 38871824 AAAAAATACAGATTGCAAGATTCCATTTTTTAAAGATATTAGAAAATGAAAACTAATTTA 38871883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     3628 AAAAAATACAGATTGCAAGATTCCATTTTTTAAAGACATTAGAAAATGAAAACTAATTTA 3687

 38871884 TGTAAAGCAGACCAGTTGTTGTCTAGGGGTGGGGAGTTAGGACGGGGTCGGGGAGAGGGA 38871943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3688 TGTAAAGCAGACCAGTTGTTGTCTAGGGGTGGGGAGTTAGGACGGGGTCGGGGAGAGGGA 3747

 38871944 CTACAAAGTGTCATAAGGAAACTTTTGGGCGTGGACAGGTGCAGTGGCTCATACCTGTAA 38872003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3748 CTACAAAGTGTCATAAGGAAACTTTTGGGCGTGGACAGGTGCAGTGGCTCATACCTGTAA 3807

 38872004 TCCCAGCACTTTGGAAGGCCGAGGAGGGAGGATCACTTGAGGTCAGGGATTTGAGACCAG 38872063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3808 TCCCAGCACTTTGGAAGGCCGAGGAGGGAGGATCACTTGAGGTCAGGGATTTGAGACCAG 3867

 38872064 CCTGGGCAACAGGATAAAACCCCATCTCTACCAAAATTTCAAAAATTAGGCAGGCGTGCT 38872123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3868 CCTGGGCAACAGGATAAAACCCCATCTCTACCAAAATTTCAAAAATTAGGCAGGCGTGCT 3927

 38872124 AGCGAGCACCTGTAGTCCTAGCTACTGGAGAGGTTGAGGCAGGAGAATCACTTAAACATG 38872183
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3928 AGCGGGCACCTGTAGTCCTAGCTACTGGAGAGGTTGAGGCAGGAGAATCACTTAAACATG 3987

 38872184 AGAGGGAGAGTTGCAGTAAGCCAAAATTGTGCAACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGT 38872243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     3988 AGAGGGAGAGTTGCAGTAAGCCAAAATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGT 4047

 38872244 GAAGCTCTGTCTCCAAAACTAAAAATAAAATAAAATAAAAATGACACTTTCGGGTGTGAT 38872303
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4048 GAAGCTCCGTCTCCAAAACTAAAAATAAAATAAAATAAAAATGACACTTTCGGGTGTGAT 4107

 38872304 TGATATATTTGCTATCTTAATGTGTTGATAGTCTCACAGGTGTATACATACATTAGAACT 38872363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4108 TGATATATTTGCTATCTTAATGTGTTGATAGTCTCACAGGTGTATACATACATTAGAACT 4167

 38872364 TAACTGGTACATTTTAAATATGTGCAGTCCATTGTATGTCAATTATTCCACCATATAAGT 38872423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4168 TAACTGGTACATTTTAAATATGTGCAGTCCATTGTATGTCAATTATTCCACCATATAAGT 4227

 38872424 GTTTAAACACACACACACACACAAGACAGAAGTGAATGTTTCATTCACACAATCTTCATG 38872483
          ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4228 GTTTAA--ACACACACACACACAAGACAGAAGTGAATGTTTCATTCACACAATCTTCATG 4285

 38872484 GACAAATCTATGCTTCAAAGGTAGGAAAATCATGAGGTCAAAGAAAAAACACTGCATTTC 38872543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4286 GACAAATCTATGCTTCAAAGGTAGGAAAATCATGAGGTCAAAGAAAAAACACTGCATTTC 4345

 38872544 TGAGATAGTAATAGAGAGGTAAATATGTGTATTCGGTGTTCAATGTACAAATTATTGAAG 38872603
          |||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     4346 TGACATAGTAATAGAGAGGTAAATATGTGTATTCGATGTTCAATGTACAAATTATTGAAG 4405

 38872604 TCTTTTTGTCCTTTTTTCATCTCTCCCAACTTAATTGGAATAGATCCAGTTTACAATAAA 38872663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4406 TCTTTTTGTCCTTTTTTCATCTCTCCCAACTTAATTGGAATAGATCCAGTTTACAATAAA 4465

 38872664 AGAAATTCAGTGAAGTTTTCCAAACAGCAATGAGAATGAGCATTGTGGCTCATCCAGAGC 38872723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4466 AGAAATTCAGTGAAGTTTTCCAAACAGCAATGAGAATGAGCATTGTGGCTCATCCAGAGC 4525

 38872724 TCCAAAAAGCAACTGCTCTGTACCTAAGGAAATCTTGTTTTTGCTCAAAATTTTATTTGT 38872783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4526 TCCAAAAAGCAACTGCTCTGTACCTAAGGAAATCTTGTTTTTGCTCAAAATTTTATTTGT 4585

 38872784 CCTTGAGATTTTAATGACTTTTAAGAATGTTTTTCCTTATACCTTTGGGCTTCAGTTTCT 38872843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4586 CCTTGAGATTTTAATGACTTTTAAGAATGTTTTTCCTTATACCTTTGGGCTTCAGTTTCT 4645

 38872844 TCGTATGCAAAATCAAGTCATGAAGATATTTCCACACAGCCAAGATGTTATAGGATAATG 38872903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4646 TCGTATGCAAAATCAAGTCATGAAGATATTTCCACACAGCCAAGATGTTATAGGATAATG 4705

 38872904 AATTGCTTGATAACCCATTGTAATCTTTGGCAAAAGAACAAAGCATTATTATTGTTATTA 38872963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4706 AATTGCTTGATAACCCATTGTAATCTTTGGCAAAAGAACAAAGCATTATTATTGTTATTA 4765

 38872964 AATATTATTAGCTGGCGTATGGTGCTGAACTGATAATTACTTCAAGTAACACTTCATAAA 38873023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4766 AATATTATTAGCTGGCGTATGGTGCTGAACTGATAATTACTTCAAGTAACACTTCATAAA 4825

 38873024 ATGCTAACTGTAAAGTGTACATAAATTTATGTATTCATTAATATGATACCTGCTACGAAC 38873083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4826 ATGCTAACTGTAAAGTGTACATAAATTTATGTATTCATTAATATGATACCTGCTACGAAC 4885

 38873084 AAATATTTTGGAAGATTGCCAACATCATTTCTTTCACAGTGTTAGTAAATTTTAATTTAT 38873143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4886 AAATATTTTGGAAGATTGCCAACATCATTTCTTTCACAGTGTTAGTAAATTTTAATTTAT 4945

 38873144 ATTCAAACCCATTGCCTCAGTTCCTCACATTCAGCTCTCTTCAATACTAATTTAAGTTCT 38873203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4946 ATTCAAACCCATTGCCTCAGTTCCTCACATTCAGCTCTCTTCAATACTAATTTAAGTTCT 5005

 38873204 TTGGGTTGAATAAAACTAATTTATTTGCCTCTTTCATTATAAGGATAACAGCTTGCAATA 38873263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5006 TTGGGTTGAATAAAACTAATTTATTTGCCTCTTTCATTATAAGGATAACAGCTTGCAATA 5065

 38873264 CAGCATTATGAGAAGTTCCCCCA-TTCCCTTGAAACACAAGTTTCATTCTGTTACTTTTA 38873322
          ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5066 CAGCATTATGAGAAGTTCCCCCACTTCCCTTGAAACACAAGTTTCATTCTGTTACTTTTA 5125

 38873323 CGTTGTAATGTTTCATAAGTAAAAAACTAGCTATAGAAATTAAGGAAGTTGGGAGTTAGA 38873382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5126 CGTTGTAATGTTTCATAAGTAAAAAACTAGCTATAGAAATTAAGGAAGTTGGGAGTTAGA 5185

 38873383 ATTTGGGAAATTAAAACAATACTAATACATATTTAAATATGGTTATGTTAGCAGAACTGA 38873442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5186 ATTTGGGAAATTAAAACAATACTAATACATATTTAAATATGGTTATGTTAGCAGAACTGA 5245

 38873443 TCACACACGTTGTTGAATTTCTCAAAAATGCTTTTCATCAGAAATCAATTTTATTGTCAT 38873502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5246 TCACACACGTTGTTGAATTTCTCAAAAATGCTTTTCATCAGAAATCAATTTTATTGTCAT 5305

 38873503 TTCAAAATACATATCATGAACTCTGCAATCAAAACTGTAAGAGACCAACAACAGGCAAGA 38873562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5306 TTCAAAATACATATCATGAACTCTGCAATCAAAACTGTAAGAGACCAACAACAGGCAAGA 5365

 38873563 GGTGTGGTCCCTGCTATCAATCCATATAAATATTATTATACACACATCCCTGTATATGAT 38873622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5366 GGTGTGGTCCCTGCTATCAATCCATATAAATATTATTATACACACATCCCTGTATATGAT 5425

 38873623 CCAGAGGTGAAGTGCATCATTTATCAGCTACTTAAGGAAAGCCCCGGTGCCTATTGGCCA 38873682
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     5426 CCAGAGGTGAAGTGCATCATTTATCAGCTACTTAAGGAAAGCCCCGGTGCCTACTGGCCA 5485

 38873683 GAGTAGGCTGTTCTGATCTCAAGGAGACTGCCCCCACTTCTTTTATTTTGAAGAATTTCA 38873742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5486 GAGTAGGCTGTTCTGATCTCAAGGAGACTGCCCCCACTTCTTTTATTTTGAAGAATTTCA 5545

 38873743 ATACTGCAGAAAAGTTAAAAGACCAATATAATGAATATTTATGTACTCTTCATCTGACCC 38873802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5546 ATACTGCAGAAAAGTTAAAAGACCAATATAATGAATATTTATGTACTCTTCATCTGACCC 5605

 38873803 CACTAATGGTTTACGTCTCACCACATTTGCATGAAATCTCCTGCTCTGTTTCCATATTTA 38873862
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     5606 CACTAATGGTTTACGTCTCACCACATTTGTATGAAATCTCCTGCTCTGTTTCCATATTTA 5665

 38873863 CAAATCAATTTTAAAATAATTTGTACACATTTCTAAGGCTAATTATGTGTTCTGAACAAA 38873922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5666 CAAATCAATTTTAAAATAATTTGTACACATTTCTAAGGCTAATTATGTGTTCTGAACAAA 5725

 38873923 AGGAATTACTTTTGGCCATTGAGACCAAATTTTGTCACTGAGGGAAATAAGTCCAGGCTG 38873982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5726 AGGAATTACTTTTGGCCATTGAGACCAAATTTTGTCACTGAGGGAAATAAGTCCAGGCTG 5785

 38873983 ATGATGTATGGACCATACCTGAAGAAACCAGGTAAAGAGACTGCTGTTTGGGCATGGAAA 38874042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5786 ATGATGTATGGACCATACCTGAAGAAACCAGGTAAAGAGACTGCTGTTTGGGCATGGAAA 5845

 38874043 GTTTCCTTTGCTATCTGGATAAGCACCTAGTGTAGGGATGACTCCATAATTTATTTCCTG 38874102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5846 GTTTCCTTTGCTATCTGGATAAGCACCTAGTGTAGGGATGACTCCATAATTTATTTCCTG 5905

 38874103 AACCAGGGCACTTCTGAGAGTGAAAGAAGGCACTTTTAAGATGTACAGCAGGACTGAAAT 38874162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5906 AACCAGGGCACTTCTGAGAGTGAAAGAAGGCACTTTTAAGATGTACAGCAGGACTGAAAT 5965

 38874163 CCCAGGTATGCTGGGCCTTTGGGCCACTCCACCTTGAGTGCACAGTGTAGGAGCAGCTGC 38874222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5966 CCCAGGTATGCTGGGCCTTTGGGCCACTCCACCTTGAGTGCACAGTGTAGGAGCAGCTGC 6025

 38874223 TGAGAAGTAAGTTGGGCACTAACTTGAGTGCTTAATTTTCCTCTAACAGACATATTCCCA 38874282
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     6026 TGAGAAGTAAGTTGGGCACTAACTTGGGTGCTTAATTTTCCTCTAACAGACATATTCCCA 6085

 38874283 GATGACAACAGGTTTCTCTTCCAGCTCATGAATCTGGGGCACAACTTCCAGTGTAGACTA 38874342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6086 GATGACAACAGGTTTCTCTTCCAGCTCATGAATCTGGGGCACAACTTCCAGTGTAGACTA 6145

 38874343 ACTTATTGGTCTTGAAAAAAAAGAGAGAATTTATTTCTTTACCTGAAAAGAATCCCATGC 38874402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6146 ACTTATTGGTCTTGAAAAAAAAGAGAGAATTTATTTCTTTACCTGAAAAGAATCCCATGC 6205

 38874403 AATTAAAAGATAATTTATGTCAGCTATAATCAAGGTGATGTTCTGGGTCAGCTAGTCAAT 38874462
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6206 AATTAAAAGACAATTTATGTCAGCTATAATCAAGGTGATGTTCTGGGTCAGCTAGTCAAT 6265

 38874463 GAGTTGCACTCACTGGACACTCAAATTCCACCACTGCTACCGAGTCTCCAACTAATTTGT 38874522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6266 GAGTTGCACTCACTGGACACTCAAATTCCACCACTGCTACCGAGTCTCCAACTAATTTGT 6325

 38874523 CATGAGTCCTTTAGACAGCCACATGAGAAATGATCAAAGGTCAGGTATCTGATCGCTGGA 38874582
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6326 CATGAGTCCTTTAGAAAGCCACATGAGAAATGATCAAAGGTCAGGTATCTGATCGCTGGA 6385

 38874583 CAACACAGGAGTCTTTATTCCTAAAGCAGGCATCTCCAAGGGAAGTATTTATCCAAGTCC 38874642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6386 CAACACAGGAGTCTTTATTCCTAAAGCAGGCATCTCCAAGGGAAGTATTTATCCAAGTCC 6445

 38874643 ATTTTTTATTTTTCCATCTGAATACAACTCTGCAAATCAAAATGACCACTTTCAACCACT 38874702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6446 ATTTTTTATTTTTCCATCTGAATACAACTCTGCAAATCAAAATGACCACTTTCAACCACT 6505

 38874703 GTCTGATCTGTGTACACCCTGTAAGTCACCCCTCCTATAAGTAGCAAGCAAGTGGGGGCA 38874762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6506 GTCTGATCTGTGTACACCCTGTAAGTCACCCCTCCTATAAGTAGCAAGCAAGTGGGGGCA 6565

 38874763 TGTTGTCTATTACCGGGAAAAACAAAATGCAACAATAATCAGAAAAGTTGGCAAACTCAA 38874822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6566 TGTTGTCTATTACCGGGAAAAACAAAATGCAACAATAATCAGAAAAGTTGGCAAACTCAA 6625

 38874823 GTGGACTTTCACCAACATCAAGGTATTTGTAGAAAAGACAGAGTAAAAAAGCATAAAAGA 38874882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     6626 GTGGACTTTCACCAACATCAAGGTATTTGTAGAAAAGACAGAGTTAAAAAGCATAAAAGA 6685

 38874883 TGTGGGTGTTTTAAAATAATCTAAATCTCTGGAGACTCTGTCTCAAGTCAGTATGGACTC 38874942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6686 TGTGGGTGTTTTAAAATAATCTAAATCTCTGGAGACTCTGTCTCAAGTCAGTATGGACTC 6745

 38874943 CTCTGGCTGTGCAAAGAAGTAACTGGAAAGCATGACTGCATGTAATCAGCAGGAAAACCA 38875002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6746 CTCTGGCTGTGCAAAGAAGTAACTGGAAAGCATGACTGCATGTAATCAGCAGGAAAACCA 6805

 38875003 TATCCTAATGACTGAATGTCCCCTCTTGGACCTCACAGAAAATCTCCTTTCCAGTTCAGG 38875062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6806 TATCCTAATGACTGAATGTCCCCTCTTGGACCTCACAGAAAATCTCCTTTCCAGTTCAGG 6865

 38875063 GCATTCCTTCAGCTACTACCCAGACCACATGGTCACTAGATCAAGGGACCAGTGAACTTC 38875122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6866 GCATTCCTTCAGCTACTACCCAGACCACATGGTCACTAGATCAAGGGACCAGTGAACTTC 6925

 38875123 ATGCTCAGGTGCATGTAAGGAGAGAAAGAGCAGCTTTCCTAAGAAGGGAGGTAAAGCATT 38875182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6926 ATGCTCAGGTGCATGTAAGGAGAGAAAGAGCAGCTTTCCTAAGAAGGGAGGTAAAGCATT 6985

 38875183 ATTTAAAACAACAACAACAAAACAAACAAAATCATGTGGCGTTAACTGATAAGTTAACAT 38875242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6986 ATTTAAAACAACAACAACAAAACAAACAAAATCATGTGGCGTTAACTGATAAGTTAACAT 7045

 38875243 GGTCTCCCATAAGAATCCATCTGTAACATATGGCTGGGCTCTGAGCTGCTCAAGGAGACA 38875302
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||||
     7046 GGTCTCCCATAAGAATCCATCTGTAACATATGGCTGGGCCCTGAGCTGCTCAGGGAGACA 7105

 38875303 TCAAGGAAGAGGTGTACACTGAGCTGTGATTTGACATGTGGATAAGAGGGGAATGGGTAT 38875362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7106 TCAAGGAAGAGGTGTACACTGAGCTGTGATTTGACATGTGGATAAGAGGGGAATGGGTAT 7165

 38875363 TGGGAATACCCATTCTTTCAAGGAAGGAATGAAAAAGATATGGAGACTGAAAACCAATGT 38875422
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     7166 TGGGAATACCCATTCTTTCAAGGAAGGAATGAAAAAGATATGGAGGCTGAAAACCAATGT 7225

 38875423 AAGTCAATGTGTTAAGTAGATGCATAAATTTGTATATGTTATGGGTTTCAAAGCACTTTT 38875482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7226 AAGTCAATGTGTTAAGTAGATGCATAAATTTGTATATGTTATGGGTTTCAAAGCACTTTT 7285

 38875483 ATTTGCATCATTTTATTTAGTCATCTTAACCAATATTGGAGACAAGCTGGAAAATATTAT 38875542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7286 ATTTGCATCATTTTATTTAGTCATCTTAACCAATATTGGAGACAAGCTGGAAAATATTAT 7345

 38875543 CATTTCAAAATTATAGATGAGGAAATTTAAACAAAGAGAAAATTAACCTGCTTAACTGTC 38875602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7346 CATTTCAAAATTATAGATGAGGAAATTTAAACAAAGAGAAAATTAACCTGCTTAACTGTC 7405

 38875603 TTTGGGTTTTAAATGACAGAGTTGAATCTAGTTGACACATATTTGAATGTATTATTCTTA 38875662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7406 TTTGGGTTTTAAATGACAGAGTTGAATCTAGTTGACACATATTTGAATGTATTATTCTTA 7465

 38875663 TACGTTTTAAGAACACAAATGTTTAAGTTTACAGATAAAGAAACTGAAGTTCAGAGAATT 38875722
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7466 TATGTTTTAAGAACACAAATGTTTAAGTTTACAGATAAAGAAACTGAAGTTCAGAGAATT 7525

 38875723 CAGCACATAAGTCATAGTCAATATTCAAACCAGGGGTCTCAGGTTCCATATTCCAGATCT 38875782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7526 CAGCACATAAGTCATAGTCAATATTCAAACCAGGGGTCTCAGGTTCCATATTCCAGATCT 7585

 38875783 CTCATTATTTCATATTGACTGAAGAAGAAGAAAATGAGAATGAGTGTTGAAAACTAATCC 38875842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7586 CTCATTATTTCATATTGACTGAAGAAGAAGAAAATGAGAATGAGTGTTGAAAACTAATCC 7645

 38875843 AAAAGGACAAAGTCAGGGGTGGGGGGAGTTGTGATCCAAATAAAATTATTGGTTCCTATA 38875902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7646 AAAAGGACAAAGTCAGGGGTGGGGGGAGTTGTGATCCAAATAAAATTATTGGTTCCTATA 7705

 38875903 AGAAATAGATGTAATCTCAGGGTAGAGATGAATCAGGTAAGTGCCCAGGGGCAGCAAACG 38875962
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     7706 AGAAATAGATGTAATCTCAGGGTAGAGATGAATCAGGTAAGTGCCCAGGGGCAGCAAACA 7765

 38875963 GGATTCCAAAGGTTGCCAGTGAGCTTCTCCAGCTTTTAGTCAATCCTGGAAACAAATCGT 38876022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7766 GGATTCCAAAGGTTGCCAGTGAGCTTCTCCAGCTTTTAGTCAATCCTGGAAACAAATCGT 7825

 38876023 GTATTTGTTTCTATCTCAGCTTTCTCACAAGTTCTCCTGTGCTTATGGAGTTCTTCTCCC 38876082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7826 GTATTTGTTTCTATCTCAGCTTTCTCACAAGTTCTCCTGTGCTTATGGAGTTCTTCTCCC 7885

 38876083 TGTACTTTCACCTGCACCATCCCTTGGGGTCTAATTCCACTATTGCTGCTCAGAATTCAT 38876142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7886 TGTACTTTCACCTGCACCATCCCTTGGGGTCTAATTCCACTATTGCTGCTCAGAATTCAT 7945

 38876143 CCATCTTGCCATGAGCTGAGCTTCTGCAGCACTCACCTCTGAAACTCACTTTAAAAGGGC 38876202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7946 CCATCTTGCCATGAGCTGAGCTTCTGCAGCACTCACCTCTGAAACTCACTTTAAAAGGGC 8005

 38876203 ATAGTTCTGTGTGCATTGATGAGGACCCACGTAAGTCTGTTGATGCCTGGGCCAAGGCAA 38876262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8006 ATAGTTCTGTGTGCATTGATGAGGACCCACGTAAGTCTGTTGATGCCTGGGCCAAGGCAA 8065

 38876263 CATAGAACATTGCTTTTTGGTTTTGCTGAGAGCAGGCTGTTTTCTCAGCAAATCATGCAG 38876322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8066 CATAGAACATTGCTTTTTGGTTTTGCTGAGAGCAGGCTGTTTTCTCAGCAAATCATGCAG 8125

 38876323 CTTCATTCCTGCTGCATTTACACAAATCAAGGAGTCATTTTACTCTCTAAATTCTATTTC 38876382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8126 CTTCATTCCTGCTGCATTTACACAAATCAAGGAGTCATTTTACTCTCTAAATTCTATTTC 8185

 38876383 CTGACTTTTATTGTAGTAATTTTATATTTTGAATAATTTTGAGGGTGGATAGATGCATTT 38876442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8186 CTGACTTTTATTGTAGTAATTTTATATTTTGAATAATTTTGAGGGTGGATAGATGCATTT 8245

 38876443 TGGACATATCTGCTCCATATTTCAATAATCTTTTCAAAAGTGAAGGAAAGCCAAAAGTTT 38876502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8246 TGGACATATCTGCTCCATATTTCAATAATCTTTTCAAAAGTGAAGGAAAGCCAAAAGTTT 8305

 38876503 ACCGTGTGTGGAAACCTGAAATCTTGGCTGAGTCCACTTTTCCCTCGAACCTAGTGTACA 38876562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8306 ACCGTGTGTGGAAACCTGAAATCTTGGCTGAGTCCACTTTTCCCTCGAACCTAGTGTACA 8365

 38876563 ATGGGATTTTCATCCAGTACCAGTTTTGATGGCAAGCTGGGAAAGCACGGGTGTTTGGAG 38876622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8366 ATGGGATTTTCATCCAGTACCAGTTTTGATGGCAAGCTGGGAAAGCACGGGTGTTTGGAG 8425

 38876623 GCTAAGGCTCCCATTCTTTCATATGCAGAAAATGAGCAATGTCTCCTGTTTCCTGGCACC 38876682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8426 GCTAAGGCTCCCATTCTTTCATATGCAGAAAATGAGCAATGTCTCCTGTTTCCTGGCACC 8485

 38876683 CATCACCATTCCCCTCCTAGCACTGAAGGAACTGATCGGCATGATCACTTTGCATTTTGG 38876742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8486 CATCACCATTCCCCTCCTAGCACTGAAGGAACTGATCGGCATGATCACTTTGCATTTTGG 8545

 38876743 CTCGTATCTCTCATCCTTGCTGAGGCCAGTCACCCTCCAAGTCTCTCACCATTTGGCTTT 38876802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8546 CTCGTATCTCTCATCCTTGCTGAGGCCAGTCACCCTCCAAGTCTCTCACCATTTGGCTTT 8605

 38876803 GCTCTTTGAAACTGGTGGAAACTTAAATATAAGATATTCAAGCTTTGTTTCCTCATCACT 38876862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8606 GCTCTTTGAAACTGGTGGAAACTTAAATATAAGATATTCAAGCTTTGTTTCCTCATCACT 8665

 38876863 ATAAAGGGCAATGCTGTTGTCCTGGTATCACTTGGAGCTCTAGCTACGACCTGTGTGCTC 38876922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8666 ATAAAGGGCAATGCTGTTGTCCTGGTATCACTTGGAGCTCTAGCTACGACCTGTGTGCTC 8725

 38876923 CAGAAATCTGTACTTCAAATGAGGCTTCTTGGTGTGGTGGTACAGATATTTTAGAAGTGC 38876982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8726 CAGAAATCTGTACTTCAAATGAGGCTTCTTGGTGTGGTGGTACAGATATTTTAGAAGTGC 8785

 38876983 TAAGAATCCATTGTAATTCCTAAAGGAATCTGAAAAGGCCCTTCTGAAGTCCTTAGCTGG 38877042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8786 TAAGAATCCATTGTAATTCCTAAAGGAATCTGAAAAGGCCCTTCTGAAGTCCTTAGCTGG 8845

 38877043 AGGCATCATGTAAGGGATAGGGGTGTGCAACCCAATATGGATGCAATTGTGACAAAGGTA 38877102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8846 AGGCATCATGTAAGGGATAGGGGTGTGCAACCCAATATGGATGCAATTGTGACAAAGGTA 8905

 38877103 TATGGCCTATGTGACTTAGAACAAGTTTTTATTTACTCACAGAGGTTAAATATTTTTTTC 38877162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8906 TATGGCCTATGTGACTTAGAACAAGTTTTTATTTACTCACAGAGGTTAAATATTTTTTTC 8965

 38877163 CATCATATACTTTACTTAGCACTTTAAAAGCATTTTTAATATTTAGCGTGGGTTTGATAT 38877222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8966 CATCATATACTTTACTTAGCACTTTAAAAGCATTTTTAATATTTAGCGTGGGTTTGATAT 9025

 38877223 CATTTTTATTCTCAGTATAGAGATTATGAGGCTCAGAGCTTTGAGTTACTTCTAAAGGAT 38877282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9026 CATTTTTATTCTCAGTATAGAGATTATGAGGCTCAGAGCTTTGAGTTACTTCTAAAGGAT 9085

 38877283 TACATATACCTGGTAATTGTCAGCTGTAATTTGAACTCAAGTCTAAGTGATCTGAGAGTC 38877342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9086 TACATATACCTGGTAATTGTCAGCTGTAATTTGAACTCAAGTCTAAGTGATCTGAGAGTC 9145

 38877343 AAAGCTCTTACTCACTACTTTGTGTTACTTTTACCCACTTATGTAGTCAGTTCTCTTTGT 38877402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9146 AAAGCTCTTACTCACTACTTTGTGTTACTTTTACCCACTTATGTAGTCAGTTCTCTTTGT 9205

 38877403 CCAGCAGGCATAACTGCCCTCTTTTCTCTTTGTAAGTGTCCTGCTAA 38877449
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9206 CCAGCAGGCATAACTGCCCTCTTTTCTCTTTGTAAGTGTCCTGCTAA 9252

Alignment time is 7.71278 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38854779,38878343] =>     23565 nucs '18 dna:chromosome chromosome:GRCh37:18:1:78077248:1'
Second seq [       1,    2112] =>      2112 nucs 'mol-32-3143-117309_2112'

Score:        2112
Aligned:      2112        nucs
Identic:      2112 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38864544,38866655]
 second seq =>  [       1,    2112]

 38864544 AATTTGAAATTAAAAACACATTATCATTTATATTAGCATCCTCAAAATGTAATATTTCTG 38864603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AATTTGAAATTAAAAACACATTATCATTTATATTAGCATCCTCAAAATGTAATATTTCTG 60

 38864604 CATAAATTTAACAAAATATGTATATAATTTATATGAGGAGAACTACAAAATTCTGAAGAA 38864663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CATAAATTTAACAAAATATGTATATAATTTATATGAGGAGAACTACAAAATTCTGAAGAA 120

 38864664 ATATGTCAAAGACTAAATAAATGGAAAGATATCTCAGGTTCATGGGTAGAAAGACTCAAT 38864723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATATGTCAAAGACTAAATAAATGGAAAGATATCTCAGGTTCATGGGTAGAAAGACTCAAT 180

 38864724 ATTGTTGAAATGTTAATTCTTCCCAACTTAATCTATAGATTCAATGTAATTACAATCAAA 38864783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATTGTTGAAATGTTAATTCTTCCCAACTTAATCTATAGATTCAATGTAATTACAATCAAA 240

 38864784 AATGAAAGTAAGTTTTGTGTGTGTTTGTGTGAATCTTGACAAACTGATTTTAAAGTTCAT 38864843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AATGAAAGTAAGTTTTGTGTGTGTTTGTGTGAATCTTGACAAACTGATTTTAAAGTTCAT 300

 38864844 ATGGAGAGGAAAATGACCCAGAATAGCCACCACAATGTTGAGGGAGAACAAAGTGAGAAG 38864903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATGGAGAGGAAAATGACCCAGAATAGCCACCACAATGTTGAGGGAGAACAAAGTGAGAAG 360

 38864904 ACAGCACTACCCAACTTCAAGACTTGCTGAAAAGCTACAGCAATCAAGATAGTGAGGTAT 38864963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACAGCACTACCCAACTTCAAGACTTGCTGAAAAGCTACAGCAATCAAGATAGTGAGGTAT 420

 38864964 TGGTAAAAGATAAAAAAACAGGTCAATGAAACAACATAGTGTACTCAGACATAACCCACA 38865023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGGTAAAAGATAAAAAAACAGGTCAATGAAACAACATAGTGTACTCAGACATAACCCACA 480

 38865024 TAATATACTCAACTGATCTTTGACAAAGGTGCAAGTTCAAGACAATGGAGCAAAGATAGT 38865083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TAATATACTCAACTGATCTTTGACAAAGGTGCAAGTTCAAGACAATGGAGCAAAGATAGT 540

 38865084 CTTTTCAATAAATAGTGGTAAGAAAACTAGGCATAACATGCAAGAATAAAATGTAAATCT 38865143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTTTTCAATAAATAGTGGTAAGAAAACTAGGCATAACATGCAAGAATAAAATGTAAATCT 600

 38865144 AGATATAGACCTTATGATCTTCACAAAAATTAATTCAAAATGAACTTTAGAGCTCAATTT 38865203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGATATAGACCTTATGATCTTCACAAAAATTAATTCAAAATGAACTTTAGAGCTCAATTT 660

 38865204 AAAATGTAAAATTATAAAGCTCCTAGAAGGTAACATCAGAGAGAAACTAGGTGACCTTGG 38865263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAAATGTAAAATTATAAAGCTCCTAGAAGGTAACATCAGAGAGAAACTAGGTGACCTTGG 720

 38865264 TTTGGTGTTAACTTTTTAGAAACAACACCAGAAGTATGACCCATGAAAGAAAGAATTGAT 38865323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTTGGTGTTAACTTTTTAGAAACAACACCAGAAGTATGACCCATGAAAGAAAGAATTGAT 780

 38865324 AAGCTGGACTTAACTAAAATTAAATACTTCTGTTTTGAGAAAGGCACTATCAAGATCATT 38865383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAGCTGGACTTAACTAAAATTAAATACTTCTGTTTTGAGAAAGGCACTATCAAGATCATT 840

 38865384 GGACCACAAGCAACAGACTGAAAGAAAATATCTGCAAAAGATAGATCTGATAAAGGCGAG 38865443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GGACCACAAGCAACAGACTGAAAGAAAATATCTGCAAAAGATAGATCTGATAAAGGCGAG 900

 38865444 TCATTTAAAATATTCAAATATCTTTGAAAACTCAACCATAAGAACCCAAAAAACCTAGTT 38865503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TCATTTAAAATATTCAAATATCTTTGAAAACTCAACCATAAGAACCCAAAAAACCTAGTT 960

 38865504 AAAAAATGGGCAAAATGTCTGAATAGGCACCCTACCAAAGAAGATATAGATAAGGTAAAT 38865563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AAAAAATGGGCAAAATGTCTGAATAGGCACCCTACCAAAGAAGATATAGATAAGGTAAAT 1020

 38865564 GATCATATGAAAAGATATTCAACATCTTATGTCATTAGGGAATTGCAAACTCAAACAACA 38865623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GATCATATGAAAAGATATTCAACATCTTATGTCATTAGGGAATTGCAAACTCAAACAACA 1080

 38865624 GTGAGATGCCGCTGCACACCAATTAGAATGGCCAAAATTCAAAACACAGCACCAAATACT 38865683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GTGAGATGCCGCTGCACACCAATTAGAATGGCCAAAATTCAAAACACAGCACCAAATACT 1140

 38865684 GGCCAGGGTGTGATGAAACAGAAACTTACTCATCTTTGGTAGAAATGCAAAATGGTATAG 38865743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GGCCAGGGTGTGATGAAACAGAAACTTACTCATCTTTGGTAGAAATGCAAAATGGTATAG 1200

 38865744 CCACTTTGGAAGACAGTTTGATAGTTTCTTTAAAAAGTAAACATGTTCTTACCATACATA 38865803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CCACTTTGGAAGACAGTTTGATAGTTTCTTTAAAAAGTAAACATGTTCTTACCATACATA 1260

 38865804 TGATCTTGAAATCATGCCACTTGGCATTTACCCAAAGGAGCTGAAAACTATATCCACACA 38865863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGATCTTGAAATCATGCCACTTGGCATTTACCCAAAGGAGCTGAAAACTATATCCACACA 1320

 38865864 AAATCCTGCACATGGATGTTTATGACAACTTTATTTACAATTGCCAAAGGTTTGAAGCAA 38865923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AAATCCTGCACATGGATGTTTATGACAACTTTATTTACAATTGCCAAAGGTTTGAAGCAA 1380

 38865924 CCAAGATGTCCTTTAGTAGATTGATACATAAACTGTGGTACATCCAGACAATGAAATATT 38865983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CCAAGATGTCCTTTAGTAGATTGATACATAAACTGTGGTACATCCAGACAATGAAATATT 1440

 38865984 GTATTTTTCCATTTTCACACTGCTGATAAAGACATACCCAAGACTGCATAATTTATACAG 38866043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GTATTTTTCCATTTTCACACTGCTGATAAAGACATACCCAAGACTGCATAATTTATACAG 1500

 38866044 GAAAAGGGTTTAATGGACTTACACTTCCATGTGGCTGGGGAGGCCTCACAATCATGGAAG 38866103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GAAAAGGGTTTAATGGACTTACACTTCCATGTGGCTGGGGAGGCCTCACAATCATGGAAG 1560

 38866104 AAGTCAAGGAGGAGCAAGTCACATCTTACATAGATGGCAGCAGGCAAAGAGAGCTTGTGC 38866163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AAGTCAAGGAGGAGCAAGTCACATCTTACATAGATGGCAGCAGGCAAAGAGAGCTTGTGC 1620

 38866164 AGGGAAAAATCCCATTTTTAAAACCATAAAATCTCATGAGACGTATTCACTGTCAGAAGA 38866223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AGGGAAAAATCCCATTTTTAAAACCATAAAATCTCATGAGACGTATTCACTGTCAGAAGA 1680

 38866224 ACAGCACAGGAAAGACCTGCCCCCATGATTCACTACCTCCCACCAGGTTCCTCCTATGAC 38866283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ACAGCACAGGAAAGACCTGCCCCCATGATTCACTACCTCCCACCAGGTTCCTCCTATGAC 1740

 38866284 ATGTGGGAACTGTGGGAGTTACAATTCAAGATGAGATCTGGGTGGGGACACAGCCAAACC 38866343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ATGTGGGAACTGTGGGAGTTACAATTCAAGATGAGATCTGGGTGGGGACACAGCCAAACC 1800

 38866344 TTATCAAATATTATTTAGCATTAAAAAAACTGTAAAGCCATAAAAATATATGGACAAAAC 38866403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTATCAAATATTATTTAGCATTAAAAAAACTGTAAAGCCATAAAAATATATGGACAAAAC 1860

 38866404 TTAAATGAATATTATTAACTGAAAGAAGACAATCTTAAAAAAAGACATACTGTGTAATTC 38866463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTAAATGAATATTATTAACTGAAAGAAGACAATCTTAAAAAAAGACATACTGTGTAATTC 1920

 38866464 CAAATATACGGTATTCTGGAAAAGTCAAAATGTGGAGATAATACAATTAAAGTGGCTGAG 38866523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CAAATATACGGTATTCTGGAAAAGTCAAAATGTGGAGATAATACAATTAAAGTGGCTGAG 1980

 38866524 AATGGTGGCTCACGTCTGTCATATTAGTACTTGGCAGGCTGATATGGCATCATCACTTAA 38866583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AATGGTGGCTCACGTCTGTCATATTAGTACTTGGCAGGCTGATATGGCATCATCACTTAA 2040

 38866584 GGCCAAGGGTTTGAGGCTAGCCTGGGCATCACAGCAAGAACCCATCCCTACAAGAAAAAT 38866643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GGCCAAGGGTTTGAGGCTAGCCTGGGCATCACAGCAAGAACCCATCCCTACAAGAAAAAT 2100

 38866644 TTTTAAAAGTTA 38866655
          ||||||||||||
     2101 TTTTAAAAGTTA 2112

Alignment time is 1.55944 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38854779,38878343] =>     23565 nucs '18 dna:chromosome chromosome:GRCh37:18:1:78077248:1'
Second seq [       1,    4716] =>      4716 nucs 'mol-32-3185-077136_4716'

Score:        4704
Aligned:      4715        nucs
Identic:      4714 (100%) nucs =>      1165 (100%)      3549 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38864628,38865792] EXCISED REGION [38865794,38869343]
 second seq =>  [       1,    1165] EXCISED REGION [    1167,    4716]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [38865793,38865793]
 second seq =>         1 nucs [1166,1166]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [38865792,38865792] to [38865793,38865793]
 second seq =>         1 nucs [1166,1166] to [1167,1167]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 38864628 TAATTTATATGAGGAGAACTACAAAATTCTGAAGAAATATGTCAAAGACTAAATAAATGG 38864687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TAATTTATATGAGGAGAACTACAAAATTCTGAAGAAATATGTCAAAGACTAAATAAATGG 60

 38864688 AAAGATATCTCAGGTTCATGGGTAGAAAGACTCAATATTGTTGAAATGTTAATTCTTCCC 38864747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAAGATATCTCAGGTTCATGGGTAGAAAGACTCAATATTGTTGAAATGTTAATTCTTCCC 120

 38864748 AACTTAATCTATAGATTCAATGTAATTACAATCAAAAATGAAAGTAAGTTTTGTGTGTGT 38864807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AACTTAATCTATAGATTCAATGTAATTACAATCAAAAATGAAAGTAAGTTTTGTGTGTGT 180

 38864808 TTGTGTGAATCTTGACAAACTGATTTTAAAGTTCATATGGAGAGGAAAATGACCCAGAAT 38864867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTGTGTGAATCTTGACAAACTGATTTTAAAGTTCATATGGAGAGGAAAATGACCCAGAAT 240

 38864868 AGCCACCACAATGTTGAGGGAGAACAAAGTGAGAAGACAGCACTACCCAACTTCAAGACT 38864927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGCCACCACAATGTTGAGGGAGAACAAAGTGAGAAGACAGCACTACCCAACTTCAAGACT 300

 38864928 TGCTGAAAAGCTACAGCAATCAAGATAGTGAGGTATTGGTAAAAGATAAAAAAACAGGTC 38864987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGCTGAAAAGCTACAGCAATCAAGATAGTGAGGTATTGGTAAAAGATAAAAAAACAGGTC 360

 38864988 AATGAAACAACATAGTGTACTCAGACATAACCCACATAATATACTCAACTGATCTTTGAC 38865047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AATGAAACAACATAGTGTACTCAGACATAACCCACATAATATACTCAACTGATCTTTGAC 420

 38865048 AAAGGTGCAAGTTCAAGACAATGGAGCAAAGATAGTCTTTTCAATAAATAGTGGTAAGAA 38865107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAAGGTGCAAGTTCAAGACAATGGAGCAAAGATAGTCTTTTCAATAAATAGTGGTAAGAA 480

 38865108 AACTAGGCATAACATGCAAGAATAAAATGTAAATCTAGATATAGACCTTATGATCTTCAC 38865167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AACTAGGCATAACATGCAAGAATAAAATGTAAATCTAGATATAGACCTTATGATCTTCAC 540

 38865168 AAAAATTAATTCAAAATGAACTTTAGAGCTCAATTTAAAATGTAAAATTATAAAGCTCCT 38865227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAAAATTAATTCAAAATGAACTTTAGAGCTCAATTTAAAATGTAAAATTATAAAGCTCCT 600

 38865228 AGAAGGTAACATCAGAGAGAAACTAGGTGACCTTGGTTTGGTGTTAACTTTTTAGAAACA 38865287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGAAGGTAACATCAGAGAGAAACTAGGTGACCTTGGTTTGGTGTTAACTTTTTAGAAACA 660

 38865288 ACACCAGAAGTATGACCCATGAAAGAAAGAATTGATAAGCTGGACTTAACTAAAATTAAA 38865347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ACACCAGAAGTATGACCCATGAAAGAAAGAATTGATAAGCTGGACTTAACTAAAATTAAA 720

 38865348 TACTTCTGTTTTGAGAAAGGCACTATCAAGATCATTGGACCACAAGCAACAGACTGAAAG 38865407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TACTTCTGTTTTGAGAAAGGCACTATCAAGATCATTGGACCACAAGCAACAGACTGAAAG 780

 38865408 AAAATATCTGCAAAAGATAGATCTGATAAAGGCGAGTCATTTAAAATATTCAAATATCTT 38865467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAAATATCTGCAAAAGATAGATCTGATAAAGGCGAGTCATTTAAAATATTCAAATATCTT 840

 38865468 TGAAAACTCAACCATAAGAACCCAAAAAACCTAGTTAAAAAATGGGCAAAATGTCTGAAT 38865527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGAAAACTCAACCATAAGAACCCAAAAAACCTAGTTAAAAAATGGGCAAAATGTCTGAAT 900

 38865528 AGGCACCCTACCAAAGAAGATATAGATAAGGTAAATGATCATATGAAAAGATATTCAACA 38865587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGGCACCCTACCAAAGAAGATATAGATAAGGTAAATGATCATATGAAAAGATATTCAACA 960

 38865588 TCTTATGTCATTAGGGAATTGCAAACTCAAACAACAGTGAGATGCCGCTGCACACCAATT 38865647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TCTTATGTCATTAGGGAATTGCAAACTCAAACAACAGTGAGATGCCGCTGCACACCAATT 1020

 38865648 AGAATGGCCAAAATTCAAAACACAGCACCAAATACTGGCCAGGGTGTGATGAAACAGAAA 38865707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGAATGGCCAAAATTCAAAACACAGCACCAAATACTGGCCAGGGTGTGATGAAACAGAAA 1080

 38865708 CTTACTCATCTTTGGTAGAAATGCAAAATGGTATAGCCACTTTGGAAGACAGTTTGATAG 38865767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTTACTCATCTTTGGTAGAAATGCAAAATGGTATAGCCACTTTGGAAGACAGTTTGATAG 1140

 38865768 TTTCTTTAAAAAGTAAACATGTTCT 38865792
          |||||||||||||||||||||||||
     1141 TTTCTTTAAAAAGTAAACATGTTCT 1165

EXCISED REGION

 38865794 ACCATACATATGATCTTGAAATCATGCCACTTGGCATTTACCCAAAGGAGCTGAAAACTA 38865853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1167 ACCATACATATGATCTTGAAATCATGCCACTTGGCATTTACCCAAAGGAGCTGAAAACTA 1226

 38865854 TATCCACACAAAATCCTGCACATGGATGTTTATGACAACTTTATTTACAATTGCCAAAGG 38865913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1227 TATCCACACAAAATCCTGCACATGGATGTTTATGACAACTTTATTTACAATTGCCAAAGG 1286

 38865914 TTTGAAGCAACCAAGATGTCCTTTAGTAGATTGATACATAAACTGTGGTACATCCAGACA 38865973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1287 TTTGAAGCAACCAAGATGTCCTTTAGTAGATTGATACATAAACTGTGGTACATCCAGACA 1346

 38865974 ATGAAATATTGTATTTTTCCATTTTCACACTGCTGATAAAGACATACCCAAGACTGCATA 38866033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1347 ATGAAATATTGTATTTTTCCATTTTCACACTGCTGATAAAGACATACCCAAGACTGCATA 1406

 38866034 ATTTATACAGGAAAAGGGTTTAATGGACTTACACTTCCATGTGGCTGGGGAGGCCTCACA 38866093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1407 ATTTATACAGGAAAAGGGTTTAATGGACTTACACTTCCATGTGGCTGGGGAGGCCTCACA 1466

 38866094 ATCATGGAAGAAGTCAAGGAGGAGCAAGTCACATCTTACATAGATGGCAGCAGGCAAAGA 38866153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1467 ATCATGGAAGAAGTCAAGGAGGAGCAAGTCACATCTTACATAGATGGCAGCAGGCAAAGA 1526

 38866154 GAGCTTGTGCAGGGAAAAATCCCATTTTTAAAACCATAAAATCTCATGAGACGTATTCAC 38866213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1527 GAGCTTGTGCAGGGAAAAATCCCATTTTTAAAACCATAAAATCTCATGAGACGTATTCAC 1586

 38866214 TGTCAGAAGAACAGCACAGGAAAGACCTGCCCCCATGATTCACTACCTCCCACCAGGTTC 38866273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1587 TGTCAGAAGAACAGCACAGGAAAGACCTGCCCCCATGATTCACTACCTCCCACCAGGTTC 1646

 38866274 CTCCTATGACATGTGGGAACTGTGGGAGTTACAATTCAAGATGAGATCTGGGTGGGGACA 38866333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1647 CTCCTATGACATGTGGGAACTGTGGGAGTTACAATTCAAGATGAGATCTGGGTGGGGACA 1706

 38866334 CAGCCAAACCTTATCAAATATTATTTAGCATTAAAAAAACTGTAAAGCCATAAAAATATA 38866393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1707 CAGCCAAACCTTATCAAATATTATTTAGCATTAAAAAAACTGTAAAGCCATAAAAATATA 1766

 38866394 TGGACAAAACTTAAATGAATATTATTAACTGAAAGAAGACAATCTTAAAAAAAGACATAC 38866453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1767 TGGACAAAACTTAAATGAATATTATTAACTGAAAGAAGACAATCTTAAAAAAAGACATAC 1826

 38866454 TGTGTAATTCCAAATATACGGTATTCTGGAAAAGTCAAAATGTGGAGATAATACAATTAA 38866513
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1827 TGTGTAATTCCAAATATATGGTATTCTGGAAAAGTCAAAATGTGGAGATAATACAATTAA 1886

 38866514 AGTGGCTGAGAATGGTGGCTCACGTCTGTCATATTAGTACTTGGCAGGCTGATATGGCAT 38866573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1887 AGTGGCTGAGAATGGTGGCTCACGTCTGTCATATTAGTACTTGGCAGGCTGATATGGCAT 1946

 38866574 CATCACTTAAGGCCAAGGGTTTGAGGCTAGCCTGGGCATCACAGCAAGAACCCATCCCTA 38866633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1947 CATCACTTAAGGCCAAGGGTTTGAGGCTAGCCTGGGCATCACAGCAAGAACCCATCCCTA 2006

 38866634 CAAGAAAAATTTTTAAAAGTTACCTAGACATGGTGGCATACGCCTGTAGTCATAGCTACT 38866693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2007 CAAGAAAAATTTTTAAAAGTTACCTAGACATGGTGGCATACGCCTGTAGTCATAGCTACT 2066

 38866694 TGGGAGGCTGGGGCAAGAAGATTGCTTGAGCCCCGGAATTTCAGGCTGCAGTGACCTATG 38866753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2067 TGGGAGGCTGGGGCAAGAAGATTGCTTGAGCCCCGGAATTTCAGGCTGCAGTGACCTATG 2126

 38866754 CTAATGCCACTGCTCTCCTGCCTGAGTGACAGAGTGAGATTCTGTCTCTTAAAAACAAAC 38866813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2127 CTAATGCCACTGCTCTCCTGCCTGAGTGACAGAGTGAGATTCTGTCTCTTAAAAACAAAC 2186

 38866814 AAACAAACAAAAAGATTGAAGGGATGAATAGGTAGAGCACAGACAAGTCTTAGGTCTGTC 38866873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2187 AAACAAACAAAAAGATTGAAGGGATGAATAGGTAGAGCACAGACAAGTCTTAGGTCTGTC 2246

 38866874 AATATTCTGTATGATACTATAATAATGGATGTATGTCATCATACATTTATTTATATCCAC 38866933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2247 AATATTCTGTATGATACTATAATAATGGATGTATGTCATCATACATTTATTTATATCCAC 2306

 38866934 AGAATGTAAAACACCAGGAGTAAATTCTATTTTAAACTCTGGGCGTTTTGTGATAATGAT 38866993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2307 AGAATGTAAAACACCAGGAGTAAATTCTATTTTAAACTCTGGGCGTTTTGTGATAATGAT 2366

 38866994 GCATTAATGAAAGTTCATCAGTGATGTAACAAATGCACTACTGCCATGTGGAATGTTGAT 38867053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2367 GCATTAATGAAAGTTCATCAGTGATGTAACAAATGCACTACTGCCATGTGGAATGTTGAT 2426

 38867054 ACTGGGGGAGTTTGCCATGTGTGAGGACAGCAGGTATATGAAAACTCCCTGCACTTTCTG 38867113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2427 ACTGGGGGAGTTTGCCATGTGTGAGGACAGCAGGTATATGAAAACTCCCTGCACTTTCTG 2486

 38867114 CTTAATTTTGCTGTGAACCTAAAGCTGCTCTATATAATAAAGTTTATTAATTAAAAAAAC 38867173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2487 CTTAATTTTGCTGTGAACCTAAAGCTGCTCTATATAATAAAGTTTATTAATTAAAAAAAC 2546

 38867174 CTCTGTTACAGCAAAATTGAGTAACAGACACCATATTTTTCCTCCTGCCCCCCCCCCCAA 38867233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2547 CTCTGTTACAGCAAAATTGAGTAACAGACACCATATTTTTCCTCCTGCCCCCCCCCCCAA 2606

 38867234 AATTAACAAAGTATAGAAAACAATGACTCTGAGAAGAGTGAACATTAGACAGTGAGGACA 38867293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2607 AATTAACAAAGTATAGAAAACAATGACTCTGAGAAGAGTGAACATTAGACAGTGAGGACA 2666

 38867294 TTGTTTCCTGAGAGAGGAAAAAATAATAATAATATGTAACAAATGATTTCCCCAGCTTAC 38867353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2667 TTGTTTCCTGAGAGAGGAAAAAATAATAATAATATGTAACAAATGATTTCCCCAGCTTAC 2726

 38867354 TGCTCACATAGTTTCTAAGCCATGATGCAAAAACAGGGCTAGTTCATGGCAATTTTGACA 38867413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2727 TGCTCACATAGTTTCTAAGCCATGATGCAAAAACAGGGCTAGTTCATGGCAATTTTGACA 2786

 38867414 GGATTCACTTATGTCACCCCAAATCTCTCAAGTTTTGTCAGTATTCCAGTTCAGTCAGGC 38867473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2787 GGATTCACTTATGTCACCCCAAATCTCTCAAGTTTTGTCAGTATTCCAGTTCAGTCAGGC 2846

 38867474 AAAGAATGGCTGAGTAAACAAGAAGCTTTGTTATTTCTTTCAGTGTTGGTTTCTATACCT 38867533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2847 AAAGAATGGCTGAGTAAACAAGAAGCTTTGTTATTTCTTTCAGTGTTGGTTTCTATACCT 2906

 38867534 CAAAATACCTCAGTAAATCTCAAGTAGAATAAATTGAAATAAGATAAACACAAATAATCT 38867593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2907 CAAAATACCTCAGTAAATCTCAAGTAGAATAAATTGAAATAAGATAAACACAAATAATCT 2966

 38867594 TAACACATTATAGTTAAGTTGAATGCCACAGACAAAGGAAATATTTTGAAAGCAACAAGA 38867653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2967 TAACACATTATAGTTAAGTTGAATGCCACAGACAAAGGAAATATTTTGAAAGCAACAAGA 3026

 38867654 TGAAAACAACATATATGCAGATGTACAATATCATTAATGACTGTTTTTATGCCAGAAATA 38867713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3027 TGAAAACAACATATATGCAGATGTACAATATCATTAATGACTGTTTTTATGCCAGAAATA 3086

 38867714 AAATAGGCCAGAAACCAATGCAATGACAAATTGTTTGAATGAAATGTCAGCCAACTATTC 38867773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3087 AAATAGGCCAGAAACCAATGCAATGACAAATTGTTTGAATGAAATGTCAGCCAACTATTC 3146

 38867774 TATATTCGGCAAAGCTACTTAAATGAAATGGACCACCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCC 38867833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3147 TATATTCGGCAAAGCTACTTAAATGAAATGGACCACCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCC 3206

 38867834 CAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATCATGAGGTCAAGATATAGAGACCATCCTGG 38867893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3207 CAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATCATGAGGTCAAGATATAGAGACCATCCTGG 3266

 38867894 ACAACATGGTGAAATCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCGC 38867953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3267 ACAACATGGTGAAATCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCGC 3326

 38867954 GTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGGAGGAGAACCTCTTGAACCCGGGAGG 38868013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3327 GTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGGAGGAGAACCTCTTGAACCCGGGAGG 3386

 38868014 CGGAGGTTGCAGTGAGCAGAGATTGCACCACTACACTCCAGCCTGGTGACAAAGCGAGAC 38868073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3387 CGGAGGTTGCAGTGAGCAGAGATTGCACCACTACACTCCAGCCTGGTGACAAAGCGAGAC 3446

 38868074 ACTGTCTCAAAAATATATATATATATATAATAAAAATAAGATGAAATACAGACATCCTCA 38868133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3447 ACTGTCTCAAAAATATATATATATATATAATAAAAATAAGATGAAATACAGACATCCTCA 3506

 38868134 GATGAACAAAGACTCGAGTAATTCATGGCTAGCAGGCATGACTTAAAGGAAAAACTAACG 38868193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3507 GATGAACAAAGACTCGAGTAATTCATGGCTAGCAGGCATGACTTAAAGGAAAAACTAACG 3566

 38868194 GAAACCCTGTAGGCCAAAGGAACGTAACACTAGACAGTAACTCTAACTCTAATTCAAGAG 38868253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3567 GAAACCCTGTAGGCCAAAGGAACGTAACACTAGACAGTAACTCTAACTCTAATTCAAGAG 3626

 38868254 AGAATGTGCAGGAAGCCATAAACAGTAAACATAATAATCTATATTATGTAATTTAATAAA 38868313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3627 AGAATGTGCAGGAAGCCATAAACAGTAAACATAATAATCTATATTATGTAATTTAATAAA 3686

 38868314 AAATACATTGCTTTAAAAATCCTTTTCTTAAAAATATTATTGTGTAAACATAATTATAAT 38868373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3687 AAATACATTGCTTTAAAAATCCTTTTCTTAAAAATATTATTGTGTAAACATAATTATAAT 3746

 38868374 ATTATAGTGTTGGATTTATAACATATTTGGTGAAGTAATCGCACAAAGTAAAGAGAAGAA 38868433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3747 ATTATAGTGTTGGATTTATAACATATTTGGTGAAGTAATCGCACAAAGTAAAGAGAAGAA 3806

 38868434 GAAAAGGGTATGTAAGTAAATAAAGATATTATATTTTACTGGAATTAAGTTGGTACTATT 38868493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3807 GAAAAGGGTATGTAAGTAAATAAAGATATTATATTTTACTGGAATTAAGTTGGTACTATT 3866

 38868494 CTTAAATGGATTATGATTAGATGAGATGCATATTGTAATTATTGTAGCAACCACTAAGAA 38868553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3867 CTTAAATGGATTATGATTAGATGAGATGCATATTGTAATTATTGTAGCAACCACTAAGAA 3926

 38868554 ATAATATTAACACAAACAACAGAGGAATTAAAATGATAGATTAGAAAAACCATTTATATA 38868613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3927 ATAATATTAACACAAACAACAGAGGAATTAAAATGATAGATTAGAAAAACCATTTATATA 3986

 38868614 TCACAAAATATAACAGTAAATGAGAAACAGAGGAATATATTTAAAATGAGCCTGGTTGCA 38868673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3987 TCACAAAATATAACAGTAAATGAGAAACAGAGGAATATATTTAAAATGAGCCTGGTTGCA 4046

 38868674 GCGGCTCACACCTGTAATCTTAGCAACTTGGAAGGCCAAGGTAGGAGGAAGTCTTGAGCC 38868733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4047 GCGGCTCACACCTGTAATCTTAGCAACTTGGAAGGCCAAGGTAGGAGGAAGTCTTGAGCC 4106

 38868734 CAGGAGTTCAAGATCAGCCTGAGCAACACAGTGAGACCCCCATCTCTACAAAAAGTAGAA 38868793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4107 CAGGAGTTCAAGATCAGCCTGAGCAACACAGTGAGACCCCCATCTCTACAAAAAGTAGAA 4166

 38868794 ATTTGGCAAGGCATCATGATAGGCACCTGTAGTCCCAGCTACTGATGAAGCTAAGGCAAG 38868853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4167 ATTTGGCAAGGCATCATGATAGGCACCTGTAGTCCCAGCTACTGATGAAGCTAAGGCAAG 4226

 38868854 AGGATTTCTTGAGCCTCTGAGGTCAAGGCTACAGTGAGCTATGATCACACCACTGCGCTC 38868913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4227 AGGATTTCTTGAGCCTCTGAGGTCAAGGCTACAGTGAGCTATGATCACACCACTGCGCTC 4286

 38868914 CAGCTTTGGAGACAGAGCAAGACTCTACAGCAATAAATAAATAAATAGAAAGCAAATAGA 38868973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4287 CAGCTTTGGAGACAGAGCAAGACTCTACAGCAATAAATAAATAAATAGAAAGCAAATAGA 4346

 38868974 AAAATGACAGGCATAAATCCAACTGTAGCAATACTTAATACATGAAAAGCAAATAAACCA 38869033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4347 AAAATGACAGGCATAAATCCAACTGTAGCAATACTTAATACATGAAAAGCAAATAAACCA 4406

 38869034 AGCACAACACATAAAAGGAAAGGATTGTCAGATTTGATAGAAACAAGACCCAAGTATACA 38869093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4407 AGCACAACACATAAAAGGAAAGGATTGTCAGATTTGATAGAAACAAGACCCAAGTATACA 4466

 38869094 CTGTCTATAATAGACACACATTATATTCAAATACATAAATAAATAAAAAGCAAAATGATG 38869153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4467 CTGTCTATAATAGACACACATTATATTCAAATACATAAATAAATAAAAAGCAAAATGATG 4526

 38869154 TAAAAAAGGTAAAGTATGAAATCAGTAACTCTATGACAGCTGAAGTAGCTGTATTAACAT 38869213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4527 TAAAAAAGGTAAAGTATGAAATCAGTAACTCTATGACAGCTGAAGTAGCTGTATTAACAT 4586

 38869214 TATTTAAAATAGACTTTAATACAAGAAACACTATCAGAGAAGAAAAGCCATATTTCATAA 38869273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4587 TATTTAAAATAGACTTTAATACAAGAAACACTATCAGAGAAGAAAAGCCATATTTCATAA 4646

 38869274 TGATAAAACATGCCAATTCATCATAAAGATGTAAGAGTTAAAAACATGTATACATTTAAT 38869333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4647 TGATAAAACATGCCAATTCATCATAAAGATGTAAGAGTTAAAAACATGTATACATTTAAT 4706

 38869334 CATAATGCCC 38869343
          ||||||||||
     4707 CATAATGCCC 4716

Alignment time is 3.95977 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38854779,38878343] =>     23565 nucs '18 dna:chromosome chromosome:GRCh37:18:1:78077248:1'
Second seq [       1,    3746] =>      3746 nucs 'mol-32-3185-259091_3746'

Score:        3735
Aligned:      3746        nucs
Identic:      3745 (100%) nucs =>      2741 (100%)      1004 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38864480,38867220] EXCISED REGION [38867222,38868226]
 second seq =>  [       1,    2741] EXCISED REGION [    2742,    3746]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [38867221,38867221]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [38867596,38867596]
 second seq =>         1 nucs [3116,3116]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        10 nucs [38867221,38867230] to [38867222,38867231]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 38864480 GCTGGAAATGAAGTTCATATACAAAATTGAATTACTTTTCCATATATCCACAATCAACAA 38864539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCTGGAAATGAAGTTCATATACAAAATTGAATTACTTTTCCATATATCCACAATCAACAA 60

 38864540 ATGGAATTTGAAATTAAAAACACATTATCATTTATATTAGCATCCTCAAAATGTAATATT 38864599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATGGAATTTGAAATTAAAAACACATTATCATTTATATTAGCATCCTCAAAATGTAATATT 120

 38864600 TCTGCATAAATTTAACAAAATATGTATATAATTTATATGAGGAGAACTACAAAATTCTGA 38864659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCTGCATAAATTTAACAAAATATGTATATAATTTATATGAGGAGAACTACAAAATTCTGA 180

 38864660 AGAAATATGTCAAAGACTAAATAAATGGAAAGATATCTCAGGTTCATGGGTAGAAAGACT 38864719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGAAATATGTCAAAGACTAAATAAATGGAAAGATATCTCAGGTTCATGGGTAGAAAGACT 240

 38864720 CAATATTGTTGAAATGTTAATTCTTCCCAACTTAATCTATAGATTCAATGTAATTACAAT 38864779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CAATATTGTTGAAATGTTAATTCTTCCCAACTTAATCTATAGATTCAATGTAATTACAAT 300

 38864780 CAAAAATGAAAGTAAGTTTTGTGTGTGTTTGTGTGAATCTTGACAAACTGATTTTAAAGT 38864839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CAAAAATGAAAGTAAGTTTTGTGTGTGTTTGTGTGAATCTTGACAAACTGATTTTAAAGT 360

 38864840 TCATATGGAGAGGAAAATGACCCAGAATAGCCACCACAATGTTGAGGGAGAACAAAGTGA 38864899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCATATGGAGAGGAAAATGACCCAGAATAGCCACCACAATGTTGAGGGAGAACAAAGTGA 420

 38864900 GAAGACAGCACTACCCAACTTCAAGACTTGCTGAAAAGCTACAGCAATCAAGATAGTGAG 38864959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GAAGACAGCACTACCCAACTTCAAGACTTGCTGAAAAGCTACAGCAATCAAGATAGTGAG 480

 38864960 GTATTGGTAAAAGATAAAAAAACAGGTCAATGAAACAACATAGTGTACTCAGACATAACC 38865019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTATTGGTAAAAGATAAAAAAACAGGTCAATGAAACAACATAGTGTACTCAGACATAACC 540

 38865020 CACATAATATACTCAACTGATCTTTGACAAAGGTGCAAGTTCAAGACAATGGAGCAAAGA 38865079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CACATAATATACTCAACTGATCTTTGACAAAGGTGCAAGTTCAAGACAATGGAGCAAAGA 600

 38865080 TAGTCTTTTCAATAAATAGTGGTAAGAAAACTAGGCATAACATGCAAGAATAAAATGTAA 38865139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TAGTCTTTTCAATAAATAGTGGTAAGAAAACTAGGCATAACATGCAAGAATAAAATGTAA 660

 38865140 ATCTAGATATAGACCTTATGATCTTCACAAAAATTAATTCAAAATGAACTTTAGAGCTCA 38865199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATCTAGATATAGACCTTATGATCTTCACAAAAATTAATTCAAAATGAACTTTAGAGCTCA 720

 38865200 ATTTAAAATGTAAAATTATAAAGCTCCTAGAAGGTAACATCAGAGAGAAACTAGGTGACC 38865259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATTTAAAATGTAAAATTATAAAGCTCCTAGAAGGTAACATCAGAGAGAAACTAGGTGACC 780

 38865260 TTGGTTTGGTGTTAACTTTTTAGAAACAACACCAGAAGTATGACCCATGAAAGAAAGAAT 38865319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTGGTTTGGTGTTAACTTTTTAGAAACAACACCAGAAGTATGACCCATGAAAGAAAGAAT 840

 38865320 TGATAAGCTGGACTTAACTAAAATTAAATACTTCTGTTTTGAGAAAGGCACTATCAAGAT 38865379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGATAAGCTGGACTTAACTAAAATTAAATACTTCTGTTTTGAGAAAGGCACTATCAAGAT 900

 38865380 CATTGGACCACAAGCAACAGACTGAAAGAAAATATCTGCAAAAGATAGATCTGATAAAGG 38865439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CATTGGACCACAAGCAACAGACTGAAAGAAAATATCTGCAAAAGATAGATCTGATAAAGG 960

 38865440 CGAGTCATTTAAAATATTCAAATATCTTTGAAAACTCAACCATAAGAACCCAAAAAACCT 38865499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CGAGTCATTTAAAATATTCAAATATCTTTGAAAACTCAACCATAAGAACCCAAAAAACCT 1020

 38865500 AGTTAAAAAATGGGCAAAATGTCTGAATAGGCACCCTACCAAAGAAGATATAGATAAGGT 38865559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGTTAAAAAATGGGCAAAATGTCTGAATAGGCACCCTACCAAAGAAGATATAGATAAGGT 1080

 38865560 AAATGATCATATGAAAAGATATTCAACATCTTATGTCATTAGGGAATTGCAAACTCAAAC 38865619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAATGATCATATGAAAAGATATTCAACATCTTATGTCATTAGGGAATTGCAAACTCAAAC 1140

 38865620 AACAGTGAGATGCCGCTGCACACCAATTAGAATGGCCAAAATTCAAAACACAGCACCAAA 38865679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AACAGTGAGATGCCGCTGCACACCAATTAGAATGGCCAAAATTCAAAACACAGCACCAAA 1200

 38865680 TACTGGCCAGGGTGTGATGAAACAGAAACTTACTCATCTTTGGTAGAAATGCAAAATGGT 38865739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TACTGGCCAGGGTGTGATGAAACAGAAACTTACTCATCTTTGGTAGAAATGCAAAATGGT 1260

 38865740 ATAGCCACTTTGGAAGACAGTTTGATAGTTTCTTTAAAAAGTAAACATGTTCTTACCATA 38865799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATAGCCACTTTGGAAGACAGTTTGATAGTTTCTTTAAAAAGTAAACATGTTCTTACCATA 1320

 38865800 CATATGATCTTGAAATCATGCCACTTGGCATTTACCCAAAGGAGCTGAAAACTATATCCA 38865859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CATATGATCTTGAAATCATGCCACTTGGCATTTACCCAAAGGAGCTGAAAACTATATCCA 1380

 38865860 CACAAAATCCTGCACATGGATGTTTATGACAACTTTATTTACAATTGCCAAAGGTTTGAA 38865919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CACAAAATCCTGCACATGGATGTTTATGACAACTTTATTTACAATTGCCAAAGGTTTGAA 1440

 38865920 GCAACCAAGATGTCCTTTAGTAGATTGATACATAAACTGTGGTACATCCAGACAATGAAA 38865979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GCAACCAAGATGTCCTTTAGTAGATTGATACATAAACTGTGGTACATCCAGACAATGAAA 1500

 38865980 TATTGTATTTTTCCATTTTCACACTGCTGATAAAGACATACCCAAGACTGCATAATTTAT 38866039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TATTGTATTTTTCCATTTTCACACTGCTGATAAAGACATACCCAAGACTGCATAATTTAT 1560

 38866040 ACAGGAAAAGGGTTTAATGGACTTACACTTCCATGTGGCTGGGGAGGCCTCACAATCATG 38866099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ACAGGAAAAGGGTTTAATGGACTTACACTTCCATGTGGCTGGGGAGGCCTCACAATCATG 1620

 38866100 GAAGAAGTCAAGGAGGAGCAAGTCACATCTTACATAGATGGCAGCAGGCAAAGAGAGCTT 38866159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GAAGAAGTCAAGGAGGAGCAAGTCACATCTTACATAGATGGCAGCAGGCAAAGAGAGCTT 1680

 38866160 GTGCAGGGAAAAATCCCATTTTTAAAACCATAAAATCTCATGAGACGTATTCACTGTCAG 38866219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GTGCAGGGAAAAATCCCATTTTTAAAACCATAAAATCTCATGAGACGTATTCACTGTCAG 1740

 38866220 AAGAACAGCACAGGAAAGACCTGCCCCCATGATTCACTACCTCCCACCAGGTTCCTCCTA 38866279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AAGAACAGCACAGGAAAGACCTGCCCCCATGATTCACTACCTCCCACCAGGTTCCTCCTA 1800

 38866280 TGACATGTGGGAACTGTGGGAGTTACAATTCAAGATGAGATCTGGGTGGGGACACAGCCA 38866339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TGACATGTGGGAACTGTGGGAGTTACAATTCAAGATGAGATCTGGGTGGGGACACAGCCA 1860

 38866340 AACCTTATCAAATATTATTTAGCATTAAAAAAACTGTAAAGCCATAAAAATATATGGACA 38866399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AACCTTATCAAATATTATTTAGCATTAAAAAAACTGTAAAGCCATAAAAATATATGGACA 1920

 38866400 AAACTTAAATGAATATTATTAACTGAAAGAAGACAATCTTAAAAAAAGACATACTGTGTA 38866459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AAACTTAAATGAATATTATTAACTGAAAGAAGACAATCTTAAAAAAAGACATACTGTGTA 1980

 38866460 ATTCCAAATATACGGTATTCTGGAAAAGTCAAAATGTGGAGATAATACAATTAAAGTGGC 38866519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ATTCCAAATATACGGTATTCTGGAAAAGTCAAAATGTGGAGATAATACAATTAAAGTGGC 2040

 38866520 TGAGAATGGTGGCTCACGTCTGTCATATTAGTACTTGGCAGGCTGATATGGCATCATCAC 38866579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TGAGAATGGTGGCTCACGTCTGTCATATTAGTACTTGGCAGGCTGATATGGCATCATCAC 2100

 38866580 TTAAGGCCAAGGGTTTGAGGCTAGCCTGGGCATCACAGCAAGAACCCATCCCTACAAGAA 38866639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TTAAGGCCAAGGGTTTGAGGCTAGCCTGGGCATCACAGCAAGAACCCATCCCTACAAGAA 2160

 38866640 AAATTTTTAAAAGTTACCTAGACATGGTGGCATACGCCTGTAGTCATAGCTACTTGGGAG 38866699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AAATTTTTAAAAGTTACCTAGACATGGTGGCATACGCCTGTAGTCATAGCTACTTGGGAG 2220

 38866700 GCTGGGGCAAGAAGATTGCTTGAGCCCCGGAATTTCAGGCTGCAGTGACCTATGCTAATG 38866759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GCTGGGGCAAGAAGATTGCTTGAGCCCCGGAATTTCAGGCTGCAGTGACCTATGCTAATG 2280

 38866760 CCACTGCTCTCCTGCCTGAGTGACAGAGTGAGATTCTGTCTCTTAAAAACAAACAAACAA 38866819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CCACTGCTCTCCTGCCTGAGTGACAGAGTGAGATTCTGTCTCTTAAAAACAAACAAACAA 2340

 38866820 ACAAAAAGATTGAAGGGATGAATAGGTAGAGCACAGACAAGTCTTAGGTCTGTCAATATT 38866879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 ACAAAAAGATTGAAGGGATGAATAGGTAGAGCACAGACAAGTCTTAGGTCTGTCAATATT 2400

 38866880 CTGTATGATACTATAATAATGGATGTATGTCATCATACATTTATTTATATCCACAGAATG 38866939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CTGTATGATACTATAATAATGGATGTATGTCATCATACATTTATTTATATCCACAGAATG 2460

 38866940 TAAAACACCAGGAGTAAATTCTATTTTAAACTCTGGGCGTTTTGTGATAATGATGCATTA 38866999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TAAAACACCAGGAGTAAATTCTATTTTAAACTCTGGGCGTTTTGTGATAATGATGCATTA 2520

 38867000 ATGAAAGTTCATCAGTGATGTAACAAATGCACTACTGCCATGTGGAATGTTGATACTGGG 38867059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 ATGAAAGTTCATCAGTGATGTAACAAATGCACTACTGCCATGTGGAATGTTGATACTGGG 2580

 38867060 GGAGTTTGCCATGTGTGAGGACAGCAGGTATATGAAAACTCCCTGCACTTTCTGCTTAAT 38867119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GGAGTTTGCCATGTGTGAGGACAGCAGGTATATGAAAACTCCCTGCACTTTCTGCTTAAT 2640

 38867120 TTTGCTGTGAACCTAAAGCTGCTCTATATAATAAAGTTTATTAATTAAAAAAACCTCTGT 38867179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TTTGCTGTGAACCTAAAGCTGCTCTATATAATAAAGTTTATTAATTAAAAAAACCTCTGT 2700

 38867180 TACAGCAAAATTGAGTAACAGACACCATATTTTTCCTCCTG 38867220
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TACAGCAAAATTGAGTAACAGACACCATATTTTTCCTCCTG 2741

EXCISED REGION

 38867222 CCCCCCCCCCAAAATTAACAAAGTATAGAAAACAATGACTCTGAGAAGAGTGAACATTAG 38867281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2742 CCCCCCCCCCAAAATTAACAAAGTATAGAAAACAATGACTCTGAGAAGAGTGAACATTAG 2801

 38867282 ACAGTGAGGACATTGTTTCCTGAGAGAGGAAAAAATAATAATAATATGTAACAAATGATT 38867341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2802 ACAGTGAGGACATTGTTTCCTGAGAGAGGAAAAAATAATAATAATATGTAACAAATGATT 2861

 38867342 TCCCCAGCTTACTGCTCACATAGTTTCTAAGCCATGATGCAAAAACAGGGCTAGTTCATG 38867401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2862 TCCCCAGCTTACTGCTCACATAGTTTCTAAGCCATGATGCAAAAACAGGGCTAGTTCATG 2921

 38867402 GCAATTTTGACAGGATTCACTTATGTCACCCCAAATCTCTCAAGTTTTGTCAGTATTCCA 38867461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2922 GCAATTTTGACAGGATTCACTTATGTCACCCCAAATCTCTCAAGTTTTGTCAGTATTCCA 2981

 38867462 GTTCAGTCAGGCAAAGAATGGCTGAGTAAACAAGAAGCTTTGTTATTTCTTTCAGTGTTG 38867521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2982 GTTCAGTCAGGCAAAGAATGGCTGAGTAAACAAGAAGCTTTGTTATTTCTTTCAGTGTTG 3041

 38867522 GTTTCTATACCTCAAAATACCTCAGTAAATCTCAAGTAGAATAAATTGAAATAAGATAAA 38867581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3042 GTTTCTATACCTCAAAATACCTCAGTAAATCTCAAGTAGAATAAATTGAAATAAGATAAA 3101

 38867582 CACAAATAATCTTAACACATTATAGTTAAGTTGAATGCCACAGACAAAGGAAATATTTTG 38867641
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3102 CACAAATAATCTTAGCACATTATAGTTAAGTTGAATGCCACAGACAAAGGAAATATTTTG 3161

 38867642 AAAGCAACAAGATGAAAACAACATATATGCAGATGTACAATATCATTAATGACTGTTTTT 38867701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3162 AAAGCAACAAGATGAAAACAACATATATGCAGATGTACAATATCATTAATGACTGTTTTT 3221

 38867702 ATGCCAGAAATAAAATAGGCCAGAAACCAATGCAATGACAAATTGTTTGAATGAAATGTC 38867761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3222 ATGCCAGAAATAAAATAGGCCAGAAACCAATGCAATGACAAATTGTTTGAATGAAATGTC 3281

 38867762 AGCCAACTATTCTATATTCGGCAAAGCTACTTAAATGAAATGGACCACCACAGTGGCTCA 38867821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3282 AGCCAACTATTCTATATTCGGCAAAGCTACTTAAATGAAATGGACCACCACAGTGGCTCA 3341

 38867822 CGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATCATGAGGTCAAGATATAG 38867881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3342 CGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATCATGAGGTCAAGATATAG 3401

 38867882 AGACCATCCTGGACAACATGGTGAAATCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGG 38867941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3402 AGACCATCCTGGACAACATGGTGAAATCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGG 3461

 38867942 GCGTGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGGAGGAGAACCTCTT 38868001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3462 GCGTGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGGAGGAGAACCTCTT 3521

 38868002 GAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCAGAGATTGCACCACTACACTCCAGCCTGGTG 38868061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3522 GAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCAGAGATTGCACCACTACACTCCAGCCTGGTG 3581

 38868062 ACAAAGCGAGACACTGTCTCAAAAATATATATATATATATAATAAAAATAAGATGAAATA 38868121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3582 ACAAAGCGAGACACTGTCTCAAAAATATATATATATATATAATAAAAATAAGATGAAATA 3641

 38868122 CAGACATCCTCAGATGAACAAAGACTCGAGTAATTCATGGCTAGCAGGCATGACTTAAAG 38868181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3642 CAGACATCCTCAGATGAACAAAGACTCGAGTAATTCATGGCTAGCAGGCATGACTTAAAG 3701

 38868182 GAAAAACTAACGGAAACCCTGTAGGCCAAAGGAACGTAACACTAG 38868226
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3702 GAAAAACTAACGGAAACCCTGTAGGCCAAAGGAACGTAACACTAG 3746

Alignment time is 3.0755 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38854779,38878343] =>     23565 nucs '18 dna:chromosome chromosome:GRCh37:18:1:78077248:1'
Second seq [       1,    4357] =>      4357 nucs 'mol-32-3332-175231_4357'

Score:        4356
Aligned:      4356        nucs
Identic:      4356 (100%) nucs =>      1026 (100%)      3330 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38864410,38865435] EXCISED REGION [38865437,38868766]
 second seq =>  [       1,    1026] EXCISED REGION [    1028,    4357]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [38865436,38865436]
 second seq =>         1 nucs [1027,1027]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [38865435,38865436] to [38865436,38865437]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [38865435,38865435] to [38865437,38865437]
 second seq =>         1 nucs [1026,1026] to [1028,1028]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 38864410 GATTGTGTAGAAAATCCAAAAGAATCAACAAAAAAGCTTCCTGAAATTAACAAATAATTA 38864469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GATTGTGTAGAAAATCCAAAAGAATCAACAAAAAAGCTTCCTGAAATTAACAAATAATTA 60

 38864470 CAGCAAGTTTGCTGGAAATGAAGTTCATATACAAAATTGAATTACTTTTCCATATATCCA 38864529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAGCAAGTTTGCTGGAAATGAAGTTCATATACAAAATTGAATTACTTTTCCATATATCCA 120

 38864530 CAATCAACAAATGGAATTTGAAATTAAAAACACATTATCATTTATATTAGCATCCTCAAA 38864589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAATCAACAAATGGAATTTGAAATTAAAAACACATTATCATTTATATTAGCATCCTCAAA 180

 38864590 ATGTAATATTTCTGCATAAATTTAACAAAATATGTATATAATTTATATGAGGAGAACTAC 38864649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATGTAATATTTCTGCATAAATTTAACAAAATATGTATATAATTTATATGAGGAGAACTAC 240

 38864650 AAAATTCTGAAGAAATATGTCAAAGACTAAATAAATGGAAAGATATCTCAGGTTCATGGG 38864709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAAATTCTGAAGAAATATGTCAAAGACTAAATAAATGGAAAGATATCTCAGGTTCATGGG 300

 38864710 TAGAAAGACTCAATATTGTTGAAATGTTAATTCTTCCCAACTTAATCTATAGATTCAATG 38864769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TAGAAAGACTCAATATTGTTGAAATGTTAATTCTTCCCAACTTAATCTATAGATTCAATG 360

 38864770 TAATTACAATCAAAAATGAAAGTAAGTTTTGTGTGTGTTTGTGTGAATCTTGACAAACTG 38864829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TAATTACAATCAAAAATGAAAGTAAGTTTTGTGTGTGTTTGTGTGAATCTTGACAAACTG 420

 38864830 ATTTTAAAGTTCATATGGAGAGGAAAATGACCCAGAATAGCCACCACAATGTTGAGGGAG 38864889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATTTTAAAGTTCATATGGAGAGGAAAATGACCCAGAATAGCCACCACAATGTTGAGGGAG 480

 38864890 AACAAAGTGAGAAGACAGCACTACCCAACTTCAAGACTTGCTGAAAAGCTACAGCAATCA 38864949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AACAAAGTGAGAAGACAGCACTACCCAACTTCAAGACTTGCTGAAAAGCTACAGCAATCA 540

 38864950 AGATAGTGAGGTATTGGTAAAAGATAAAAAAACAGGTCAATGAAACAACATAGTGTACTC 38865009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGATAGTGAGGTATTGGTAAAAGATAAAAAAACAGGTCAATGAAACAACATAGTGTACTC 600

 38865010 AGACATAACCCACATAATATACTCAACTGATCTTTGACAAAGGTGCAAGTTCAAGACAAT 38865069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGACATAACCCACATAATATACTCAACTGATCTTTGACAAAGGTGCAAGTTCAAGACAAT 660

 38865070 GGAGCAAAGATAGTCTTTTCAATAAATAGTGGTAAGAAAACTAGGCATAACATGCAAGAA 38865129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGAGCAAAGATAGTCTTTTCAATAAATAGTGGTAAGAAAACTAGGCATAACATGCAAGAA 720

 38865130 TAAAATGTAAATCTAGATATAGACCTTATGATCTTCACAAAAATTAATTCAAAATGAACT 38865189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TAAAATGTAAATCTAGATATAGACCTTATGATCTTCACAAAAATTAATTCAAAATGAACT 780

 38865190 TTAGAGCTCAATTTAAAATGTAAAATTATAAAGCTCCTAGAAGGTAACATCAGAGAGAAA 38865249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTAGAGCTCAATTTAAAATGTAAAATTATAAAGCTCCTAGAAGGTAACATCAGAGAGAAA 840

 38865250 CTAGGTGACCTTGGTTTGGTGTTAACTTTTTAGAAACAACACCAGAAGTATGACCCATGA 38865309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTAGGTGACCTTGGTTTGGTGTTAACTTTTTAGAAACAACACCAGAAGTATGACCCATGA 900

 38865310 AAGAAAGAATTGATAAGCTGGACTTAACTAAAATTAAATACTTCTGTTTTGAGAAAGGCA 38865369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AAGAAAGAATTGATAAGCTGGACTTAACTAAAATTAAATACTTCTGTTTTGAGAAAGGCA 960

 38865370 CTATCAAGATCATTGGACCACAAGCAACAGACTGAAAGAAAATATCTGCAAAAGATAGAT 38865429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTATCAAGATCATTGGACCACAAGCAACAGACTGAAAGAAAATATCTGCAAAAGATAGAT 1020

 38865430 CTGATA 38865435
          ||||||
     1021 CTGATA 1026

EXCISED REGION

 38865437 AGGCGAGTCATTTAAAATATTCAAATATCTTTGAAAACTCAACCATAAGAACCCAAAAAA 38865496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1028 AGGCGAGTCATTTAAAATATTCAAATATCTTTGAAAACTCAACCATAAGAACCCAAAAAA 1087

 38865497 CCTAGTTAAAAAATGGGCAAAATGTCTGAATAGGCACCCTACCAAAGAAGATATAGATAA 38865556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1088 CCTAGTTAAAAAATGGGCAAAATGTCTGAATAGGCACCCTACCAAAGAAGATATAGATAA 1147

 38865557 GGTAAATGATCATATGAAAAGATATTCAACATCTTATGTCATTAGGGAATTGCAAACTCA 38865616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1148 GGTAAATGATCATATGAAAAGATATTCAACATCTTATGTCATTAGGGAATTGCAAACTCA 1207

 38865617 AACAACAGTGAGATGCCGCTGCACACCAATTAGAATGGCCAAAATTCAAAACACAGCACC 38865676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1208 AACAACAGTGAGATGCCGCTGCACACCAATTAGAATGGCCAAAATTCAAAACACAGCACC 1267

 38865677 AAATACTGGCCAGGGTGTGATGAAACAGAAACTTACTCATCTTTGGTAGAAATGCAAAAT 38865736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1268 AAATACTGGCCAGGGTGTGATGAAACAGAAACTTACTCATCTTTGGTAGAAATGCAAAAT 1327

 38865737 GGTATAGCCACTTTGGAAGACAGTTTGATAGTTTCTTTAAAAAGTAAACATGTTCTTACC 38865796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1328 GGTATAGCCACTTTGGAAGACAGTTTGATAGTTTCTTTAAAAAGTAAACATGTTCTTACC 1387

 38865797 ATACATATGATCTTGAAATCATGCCACTTGGCATTTACCCAAAGGAGCTGAAAACTATAT 38865856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1388 ATACATATGATCTTGAAATCATGCCACTTGGCATTTACCCAAAGGAGCTGAAAACTATAT 1447

 38865857 CCACACAAAATCCTGCACATGGATGTTTATGACAACTTTATTTACAATTGCCAAAGGTTT 38865916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1448 CCACACAAAATCCTGCACATGGATGTTTATGACAACTTTATTTACAATTGCCAAAGGTTT 1507

 38865917 GAAGCAACCAAGATGTCCTTTAGTAGATTGATACATAAACTGTGGTACATCCAGACAATG 38865976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1508 GAAGCAACCAAGATGTCCTTTAGTAGATTGATACATAAACTGTGGTACATCCAGACAATG 1567

 38865977 AAATATTGTATTTTTCCATTTTCACACTGCTGATAAAGACATACCCAAGACTGCATAATT 38866036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1568 AAATATTGTATTTTTCCATTTTCACACTGCTGATAAAGACATACCCAAGACTGCATAATT 1627

 38866037 TATACAGGAAAAGGGTTTAATGGACTTACACTTCCATGTGGCTGGGGAGGCCTCACAATC 38866096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1628 TATACAGGAAAAGGGTTTAATGGACTTACACTTCCATGTGGCTGGGGAGGCCTCACAATC 1687

 38866097 ATGGAAGAAGTCAAGGAGGAGCAAGTCACATCTTACATAGATGGCAGCAGGCAAAGAGAG 38866156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1688 ATGGAAGAAGTCAAGGAGGAGCAAGTCACATCTTACATAGATGGCAGCAGGCAAAGAGAG 1747

 38866157 CTTGTGCAGGGAAAAATCCCATTTTTAAAACCATAAAATCTCATGAGACGTATTCACTGT 38866216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1748 CTTGTGCAGGGAAAAATCCCATTTTTAAAACCATAAAATCTCATGAGACGTATTCACTGT 1807

 38866217 CAGAAGAACAGCACAGGAAAGACCTGCCCCCATGATTCACTACCTCCCACCAGGTTCCTC 38866276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1808 CAGAAGAACAGCACAGGAAAGACCTGCCCCCATGATTCACTACCTCCCACCAGGTTCCTC 1867

 38866277 CTATGACATGTGGGAACTGTGGGAGTTACAATTCAAGATGAGATCTGGGTGGGGACACAG 38866336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1868 CTATGACATGTGGGAACTGTGGGAGTTACAATTCAAGATGAGATCTGGGTGGGGACACAG 1927

 38866337 CCAAACCTTATCAAATATTATTTAGCATTAAAAAAACTGTAAAGCCATAAAAATATATGG 38866396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1928 CCAAACCTTATCAAATATTATTTAGCATTAAAAAAACTGTAAAGCCATAAAAATATATGG 1987

 38866397 ACAAAACTTAAATGAATATTATTAACTGAAAGAAGACAATCTTAAAAAAAGACATACTGT 38866456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1988 ACAAAACTTAAATGAATATTATTAACTGAAAGAAGACAATCTTAAAAAAAGACATACTGT 2047

 38866457 GTAATTCCAAATATACGGTATTCTGGAAAAGTCAAAATGTGGAGATAATACAATTAAAGT 38866516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2048 GTAATTCCAAATATACGGTATTCTGGAAAAGTCAAAATGTGGAGATAATACAATTAAAGT 2107

 38866517 GGCTGAGAATGGTGGCTCACGTCTGTCATATTAGTACTTGGCAGGCTGATATGGCATCAT 38866576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2108 GGCTGAGAATGGTGGCTCACGTCTGTCATATTAGTACTTGGCAGGCTGATATGGCATCAT 2167

 38866577 CACTTAAGGCCAAGGGTTTGAGGCTAGCCTGGGCATCACAGCAAGAACCCATCCCTACAA 38866636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2168 CACTTAAGGCCAAGGGTTTGAGGCTAGCCTGGGCATCACAGCAAGAACCCATCCCTACAA 2227

 38866637 GAAAAATTTTTAAAAGTTACCTAGACATGGTGGCATACGCCTGTAGTCATAGCTACTTGG 38866696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2228 GAAAAATTTTTAAAAGTTACCTAGACATGGTGGCATACGCCTGTAGTCATAGCTACTTGG 2287

 38866697 GAGGCTGGGGCAAGAAGATTGCTTGAGCCCCGGAATTTCAGGCTGCAGTGACCTATGCTA 38866756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2288 GAGGCTGGGGCAAGAAGATTGCTTGAGCCCCGGAATTTCAGGCTGCAGTGACCTATGCTA 2347

 38866757 ATGCCACTGCTCTCCTGCCTGAGTGACAGAGTGAGATTCTGTCTCTTAAAAACAAACAAA 38866816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2348 ATGCCACTGCTCTCCTGCCTGAGTGACAGAGTGAGATTCTGTCTCTTAAAAACAAACAAA 2407

 38866817 CAAACAAAAAGATTGAAGGGATGAATAGGTAGAGCACAGACAAGTCTTAGGTCTGTCAAT 38866876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2408 CAAACAAAAAGATTGAAGGGATGAATAGGTAGAGCACAGACAAGTCTTAGGTCTGTCAAT 2467

 38866877 ATTCTGTATGATACTATAATAATGGATGTATGTCATCATACATTTATTTATATCCACAGA 38866936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2468 ATTCTGTATGATACTATAATAATGGATGTATGTCATCATACATTTATTTATATCCACAGA 2527

 38866937 ATGTAAAACACCAGGAGTAAATTCTATTTTAAACTCTGGGCGTTTTGTGATAATGATGCA 38866996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2528 ATGTAAAACACCAGGAGTAAATTCTATTTTAAACTCTGGGCGTTTTGTGATAATGATGCA 2587

 38866997 TTAATGAAAGTTCATCAGTGATGTAACAAATGCACTACTGCCATGTGGAATGTTGATACT 38867056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2588 TTAATGAAAGTTCATCAGTGATGTAACAAATGCACTACTGCCATGTGGAATGTTGATACT 2647

 38867057 GGGGGAGTTTGCCATGTGTGAGGACAGCAGGTATATGAAAACTCCCTGCACTTTCTGCTT 38867116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2648 GGGGGAGTTTGCCATGTGTGAGGACAGCAGGTATATGAAAACTCCCTGCACTTTCTGCTT 2707

 38867117 AATTTTGCTGTGAACCTAAAGCTGCTCTATATAATAAAGTTTATTAATTAAAAAAACCTC 38867176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2708 AATTTTGCTGTGAACCTAAAGCTGCTCTATATAATAAAGTTTATTAATTAAAAAAACCTC 2767

 38867177 TGTTACAGCAAAATTGAGTAACAGACACCATATTTTTCCTCCTGCCCCCCCCCCCAAAAT 38867236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2768 TGTTACAGCAAAATTGAGTAACAGACACCATATTTTTCCTCCTGCCCCCCCCCCCAAAAT 2827

 38867237 TAACAAAGTATAGAAAACAATGACTCTGAGAAGAGTGAACATTAGACAGTGAGGACATTG 38867296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2828 TAACAAAGTATAGAAAACAATGACTCTGAGAAGAGTGAACATTAGACAGTGAGGACATTG 2887

 38867297 TTTCCTGAGAGAGGAAAAAATAATAATAATATGTAACAAATGATTTCCCCAGCTTACTGC 38867356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2888 TTTCCTGAGAGAGGAAAAAATAATAATAATATGTAACAAATGATTTCCCCAGCTTACTGC 2947

 38867357 TCACATAGTTTCTAAGCCATGATGCAAAAACAGGGCTAGTTCATGGCAATTTTGACAGGA 38867416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2948 TCACATAGTTTCTAAGCCATGATGCAAAAACAGGGCTAGTTCATGGCAATTTTGACAGGA 3007

 38867417 TTCACTTATGTCACCCCAAATCTCTCAAGTTTTGTCAGTATTCCAGTTCAGTCAGGCAAA 38867476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3008 TTCACTTATGTCACCCCAAATCTCTCAAGTTTTGTCAGTATTCCAGTTCAGTCAGGCAAA 3067

 38867477 GAATGGCTGAGTAAACAAGAAGCTTTGTTATTTCTTTCAGTGTTGGTTTCTATACCTCAA 38867536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3068 GAATGGCTGAGTAAACAAGAAGCTTTGTTATTTCTTTCAGTGTTGGTTTCTATACCTCAA 3127

 38867537 AATACCTCAGTAAATCTCAAGTAGAATAAATTGAAATAAGATAAACACAAATAATCTTAA 38867596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3128 AATACCTCAGTAAATCTCAAGTAGAATAAATTGAAATAAGATAAACACAAATAATCTTAA 3187

 38867597 CACATTATAGTTAAGTTGAATGCCACAGACAAAGGAAATATTTTGAAAGCAACAAGATGA 38867656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3188 CACATTATAGTTAAGTTGAATGCCACAGACAAAGGAAATATTTTGAAAGCAACAAGATGA 3247

 38867657 AAACAACATATATGCAGATGTACAATATCATTAATGACTGTTTTTATGCCAGAAATAAAA 38867716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3248 AAACAACATATATGCAGATGTACAATATCATTAATGACTGTTTTTATGCCAGAAATAAAA 3307

 38867717 TAGGCCAGAAACCAATGCAATGACAAATTGTTTGAATGAAATGTCAGCCAACTATTCTAT 38867776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3308 TAGGCCAGAAACCAATGCAATGACAAATTGTTTGAATGAAATGTCAGCCAACTATTCTAT 3367

 38867777 ATTCGGCAAAGCTACTTAAATGAAATGGACCACCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAG 38867836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3368 ATTCGGCAAAGCTACTTAAATGAAATGGACCACCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAG 3427

 38867837 CACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATCATGAGGTCAAGATATAGAGACCATCCTGGACA 38867896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3428 CACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATCATGAGGTCAAGATATAGAGACCATCCTGGACA 3487

 38867897 ACATGGTGAAATCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCGCGTG 38867956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3488 ACATGGTGAAATCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCGCGTG 3547

 38867957 CCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGGAGGAGAACCTCTTGAACCCGGGAGGCGG 38868016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3548 CCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGGAGGAGAACCTCTTGAACCCGGGAGGCGG 3607

 38868017 AGGTTGCAGTGAGCAGAGATTGCACCACTACACTCCAGCCTGGTGACAAAGCGAGACACT 38868076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3608 AGGTTGCAGTGAGCAGAGATTGCACCACTACACTCCAGCCTGGTGACAAAGCGAGACACT 3667

 38868077 GTCTCAAAAATATATATATATATATAATAAAAATAAGATGAAATACAGACATCCTCAGAT 38868136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3668 GTCTCAAAAATATATATATATATATAATAAAAATAAGATGAAATACAGACATCCTCAGAT 3727

 38868137 GAACAAAGACTCGAGTAATTCATGGCTAGCAGGCATGACTTAAAGGAAAAACTAACGGAA 38868196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3728 GAACAAAGACTCGAGTAATTCATGGCTAGCAGGCATGACTTAAAGGAAAAACTAACGGAA 3787

 38868197 ACCCTGTAGGCCAAAGGAACGTAACACTAGACAGTAACTCTAACTCTAATTCAAGAGAGA 38868256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3788 ACCCTGTAGGCCAAAGGAACGTAACACTAGACAGTAACTCTAACTCTAATTCAAGAGAGA 3847

 38868257 ATGTGCAGGAAGCCATAAACAGTAAACATAATAATCTATATTATGTAATTTAATAAAAAA 38868316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3848 ATGTGCAGGAAGCCATAAACAGTAAACATAATAATCTATATTATGTAATTTAATAAAAAA 3907

 38868317 TACATTGCTTTAAAAATCCTTTTCTTAAAAATATTATTGTGTAAACATAATTATAATATT 38868376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3908 TACATTGCTTTAAAAATCCTTTTCTTAAAAATATTATTGTGTAAACATAATTATAATATT 3967

 38868377 ATAGTGTTGGATTTATAACATATTTGGTGAAGTAATCGCACAAAGTAAAGAGAAGAAGAA 38868436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3968 ATAGTGTTGGATTTATAACATATTTGGTGAAGTAATCGCACAAAGTAAAGAGAAGAAGAA 4027

 38868437 AAGGGTATGTAAGTAAATAAAGATATTATATTTTACTGGAATTAAGTTGGTACTATTCTT 38868496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4028 AAGGGTATGTAAGTAAATAAAGATATTATATTTTACTGGAATTAAGTTGGTACTATTCTT 4087

 38868497 AAATGGATTATGATTAGATGAGATGCATATTGTAATTATTGTAGCAACCACTAAGAAATA 38868556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4088 AAATGGATTATGATTAGATGAGATGCATATTGTAATTATTGTAGCAACCACTAAGAAATA 4147

 38868557 ATATTAACACAAACAACAGAGGAATTAAAATGATAGATTAGAAAAACCATTTATATATCA 38868616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4148 ATATTAACACAAACAACAGAGGAATTAAAATGATAGATTAGAAAAACCATTTATATATCA 4207

 38868617 CAAAATATAACAGTAAATGAGAAACAGAGGAATATATTTAAAATGAGCCTGGTTGCAGCG 38868676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4208 CAAAATATAACAGTAAATGAGAAACAGAGGAATATATTTAAAATGAGCCTGGTTGCAGCG 4267

 38868677 GCTCACACCTGTAATCTTAGCAACTTGGAAGGCCAAGGTAGGAGGAAGTCTTGAGCCCAG 38868736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4268 GCTCACACCTGTAATCTTAGCAACTTGGAAGGCCAAGGTAGGAGGAAGTCTTGAGCCCAG 4327

 38868737 GAGTTCAAGATCAGCCTGAGCAACACAGTG 38868766
          ||||||||||||||||||||||||||||||
     4328 GAGTTCAAGATCAGCCTGAGCAACACAGTG 4357

Alignment time is 3.63984 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38854779,38878343] =>     23565 nucs '18 dna:chromosome chromosome:GRCh37:18:1:78077248:1'
Second seq [       1,    4630] =>      4630 nucs 'mol-32-33ab-188516_4630'

Score:        4630
Aligned:      4630        nucs
Identic:      4630 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38864671,38869300]
 second seq =>  [       1,    4630]

 38864671 AAAGACTAAATAAATGGAAAGATATCTCAGGTTCATGGGTAGAAAGACTCAATATTGTTG 38864730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAAGACTAAATAAATGGAAAGATATCTCAGGTTCATGGGTAGAAAGACTCAATATTGTTG 60

 38864731 AAATGTTAATTCTTCCCAACTTAATCTATAGATTCAATGTAATTACAATCAAAAATGAAA 38864790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAATGTTAATTCTTCCCAACTTAATCTATAGATTCAATGTAATTACAATCAAAAATGAAA 120

 38864791 GTAAGTTTTGTGTGTGTTTGTGTGAATCTTGACAAACTGATTTTAAAGTTCATATGGAGA 38864850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTAAGTTTTGTGTGTGTTTGTGTGAATCTTGACAAACTGATTTTAAAGTTCATATGGAGA 180

 38864851 GGAAAATGACCCAGAATAGCCACCACAATGTTGAGGGAGAACAAAGTGAGAAGACAGCAC 38864910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGAAAATGACCCAGAATAGCCACCACAATGTTGAGGGAGAACAAAGTGAGAAGACAGCAC 240

 38864911 TACCCAACTTCAAGACTTGCTGAAAAGCTACAGCAATCAAGATAGTGAGGTATTGGTAAA 38864970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TACCCAACTTCAAGACTTGCTGAAAAGCTACAGCAATCAAGATAGTGAGGTATTGGTAAA 300

 38864971 AGATAAAAAAACAGGTCAATGAAACAACATAGTGTACTCAGACATAACCCACATAATATA 38865030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGATAAAAAAACAGGTCAATGAAACAACATAGTGTACTCAGACATAACCCACATAATATA 360

 38865031 CTCAACTGATCTTTGACAAAGGTGCAAGTTCAAGACAATGGAGCAAAGATAGTCTTTTCA 38865090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTCAACTGATCTTTGACAAAGGTGCAAGTTCAAGACAATGGAGCAAAGATAGTCTTTTCA 420

 38865091 ATAAATAGTGGTAAGAAAACTAGGCATAACATGCAAGAATAAAATGTAAATCTAGATATA 38865150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATAAATAGTGGTAAGAAAACTAGGCATAACATGCAAGAATAAAATGTAAATCTAGATATA 480

 38865151 GACCTTATGATCTTCACAAAAATTAATTCAAAATGAACTTTAGAGCTCAATTTAAAATGT 38865210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GACCTTATGATCTTCACAAAAATTAATTCAAAATGAACTTTAGAGCTCAATTTAAAATGT 540

 38865211 AAAATTATAAAGCTCCTAGAAGGTAACATCAGAGAGAAACTAGGTGACCTTGGTTTGGTG 38865270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAAATTATAAAGCTCCTAGAAGGTAACATCAGAGAGAAACTAGGTGACCTTGGTTTGGTG 600

 38865271 TTAACTTTTTAGAAACAACACCAGAAGTATGACCCATGAAAGAAAGAATTGATAAGCTGG 38865330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTAACTTTTTAGAAACAACACCAGAAGTATGACCCATGAAAGAAAGAATTGATAAGCTGG 660

 38865331 ACTTAACTAAAATTAAATACTTCTGTTTTGAGAAAGGCACTATCAAGATCATTGGACCAC 38865390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ACTTAACTAAAATTAAATACTTCTGTTTTGAGAAAGGCACTATCAAGATCATTGGACCAC 720

 38865391 AAGCAACAGACTGAAAGAAAATATCTGCAAAAGATAGATCTGATAAAGGCGAGTCATTTA 38865450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAGCAACAGACTGAAAGAAAATATCTGCAAAAGATAGATCTGATAAAGGCGAGTCATTTA 780

 38865451 AAATATTCAAATATCTTTGAAAACTCAACCATAAGAACCCAAAAAACCTAGTTAAAAAAT 38865510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAATATTCAAATATCTTTGAAAACTCAACCATAAGAACCCAAAAAACCTAGTTAAAAAAT 840

 38865511 GGGCAAAATGTCTGAATAGGCACCCTACCAAAGAAGATATAGATAAGGTAAATGATCATA 38865570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GGGCAAAATGTCTGAATAGGCACCCTACCAAAGAAGATATAGATAAGGTAAATGATCATA 900

 38865571 TGAAAAGATATTCAACATCTTATGTCATTAGGGAATTGCAAACTCAAACAACAGTGAGAT 38865630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGAAAAGATATTCAACATCTTATGTCATTAGGGAATTGCAAACTCAAACAACAGTGAGAT 960

 38865631 GCCGCTGCACACCAATTAGAATGGCCAAAATTCAAAACACAGCACCAAATACTGGCCAGG 38865690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GCCGCTGCACACCAATTAGAATGGCCAAAATTCAAAACACAGCACCAAATACTGGCCAGG 1020

 38865691 GTGTGATGAAACAGAAACTTACTCATCTTTGGTAGAAATGCAAAATGGTATAGCCACTTT 38865750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GTGTGATGAAACAGAAACTTACTCATCTTTGGTAGAAATGCAAAATGGTATAGCCACTTT 1080

 38865751 GGAAGACAGTTTGATAGTTTCTTTAAAAAGTAAACATGTTCTTACCATACATATGATCTT 38865810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GGAAGACAGTTTGATAGTTTCTTTAAAAAGTAAACATGTTCTTACCATACATATGATCTT 1140

 38865811 GAAATCATGCCACTTGGCATTTACCCAAAGGAGCTGAAAACTATATCCACACAAAATCCT 38865870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GAAATCATGCCACTTGGCATTTACCCAAAGGAGCTGAAAACTATATCCACACAAAATCCT 1200

 38865871 GCACATGGATGTTTATGACAACTTTATTTACAATTGCCAAAGGTTTGAAGCAACCAAGAT 38865930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GCACATGGATGTTTATGACAACTTTATTTACAATTGCCAAAGGTTTGAAGCAACCAAGAT 1260

 38865931 GTCCTTTAGTAGATTGATACATAAACTGTGGTACATCCAGACAATGAAATATTGTATTTT 38865990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GTCCTTTAGTAGATTGATACATAAACTGTGGTACATCCAGACAATGAAATATTGTATTTT 1320

 38865991 TCCATTTTCACACTGCTGATAAAGACATACCCAAGACTGCATAATTTATACAGGAAAAGG 38866050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TCCATTTTCACACTGCTGATAAAGACATACCCAAGACTGCATAATTTATACAGGAAAAGG 1380

 38866051 GTTTAATGGACTTACACTTCCATGTGGCTGGGGAGGCCTCACAATCATGGAAGAAGTCAA 38866110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GTTTAATGGACTTACACTTCCATGTGGCTGGGGAGGCCTCACAATCATGGAAGAAGTCAA 1440

 38866111 GGAGGAGCAAGTCACATCTTACATAGATGGCAGCAGGCAAAGAGAGCTTGTGCAGGGAAA 38866170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GGAGGAGCAAGTCACATCTTACATAGATGGCAGCAGGCAAAGAGAGCTTGTGCAGGGAAA 1500

 38866171 AATCCCATTTTTAAAACCATAAAATCTCATGAGACGTATTCACTGTCAGAAGAACAGCAC 38866230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AATCCCATTTTTAAAACCATAAAATCTCATGAGACGTATTCACTGTCAGAAGAACAGCAC 1560

 38866231 AGGAAAGACCTGCCCCCATGATTCACTACCTCCCACCAGGTTCCTCCTATGACATGTGGG 38866290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AGGAAAGACCTGCCCCCATGATTCACTACCTCCCACCAGGTTCCTCCTATGACATGTGGG 1620

 38866291 AACTGTGGGAGTTACAATTCAAGATGAGATCTGGGTGGGGACACAGCCAAACCTTATCAA 38866350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AACTGTGGGAGTTACAATTCAAGATGAGATCTGGGTGGGGACACAGCCAAACCTTATCAA 1680

 38866351 ATATTATTTAGCATTAAAAAAACTGTAAAGCCATAAAAATATATGGACAAAACTTAAATG 38866410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ATATTATTTAGCATTAAAAAAACTGTAAAGCCATAAAAATATATGGACAAAACTTAAATG 1740

 38866411 AATATTATTAACTGAAAGAAGACAATCTTAAAAAAAGACATACTGTGTAATTCCAAATAT 38866470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AATATTATTAACTGAAAGAAGACAATCTTAAAAAAAGACATACTGTGTAATTCCAAATAT 1800

 38866471 ACGGTATTCTGGAAAAGTCAAAATGTGGAGATAATACAATTAAAGTGGCTGAGAATGGTG 38866530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ACGGTATTCTGGAAAAGTCAAAATGTGGAGATAATACAATTAAAGTGGCTGAGAATGGTG 1860

 38866531 GCTCACGTCTGTCATATTAGTACTTGGCAGGCTGATATGGCATCATCACTTAAGGCCAAG 38866590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GCTCACGTCTGTCATATTAGTACTTGGCAGGCTGATATGGCATCATCACTTAAGGCCAAG 1920

 38866591 GGTTTGAGGCTAGCCTGGGCATCACAGCAAGAACCCATCCCTACAAGAAAAATTTTTAAA 38866650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GGTTTGAGGCTAGCCTGGGCATCACAGCAAGAACCCATCCCTACAAGAAAAATTTTTAAA 1980

 38866651 AGTTACCTAGACATGGTGGCATACGCCTGTAGTCATAGCTACTTGGGAGGCTGGGGCAAG 38866710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AGTTACCTAGACATGGTGGCATACGCCTGTAGTCATAGCTACTTGGGAGGCTGGGGCAAG 2040

 38866711 AAGATTGCTTGAGCCCCGGAATTTCAGGCTGCAGTGACCTATGCTAATGCCACTGCTCTC 38866770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AAGATTGCTTGAGCCCCGGAATTTCAGGCTGCAGTGACCTATGCTAATGCCACTGCTCTC 2100

 38866771 CTGCCTGAGTGACAGAGTGAGATTCTGTCTCTTAAAAACAAACAAACAAACAAAAAGATT 38866830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CTGCCTGAGTGACAGAGTGAGATTCTGTCTCTTAAAAACAAACAAACAAACAAAAAGATT 2160

 38866831 GAAGGGATGAATAGGTAGAGCACAGACAAGTCTTAGGTCTGTCAATATTCTGTATGATAC 38866890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GAAGGGATGAATAGGTAGAGCACAGACAAGTCTTAGGTCTGTCAATATTCTGTATGATAC 2220

 38866891 TATAATAATGGATGTATGTCATCATACATTTATTTATATCCACAGAATGTAAAACACCAG 38866950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TATAATAATGGATGTATGTCATCATACATTTATTTATATCCACAGAATGTAAAACACCAG 2280

 38866951 GAGTAAATTCTATTTTAAACTCTGGGCGTTTTGTGATAATGATGCATTAATGAAAGTTCA 38867010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GAGTAAATTCTATTTTAAACTCTGGGCGTTTTGTGATAATGATGCATTAATGAAAGTTCA 2340

 38867011 TCAGTGATGTAACAAATGCACTACTGCCATGTGGAATGTTGATACTGGGGGAGTTTGCCA 38867070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TCAGTGATGTAACAAATGCACTACTGCCATGTGGAATGTTGATACTGGGGGAGTTTGCCA 2400

 38867071 TGTGTGAGGACAGCAGGTATATGAAAACTCCCTGCACTTTCTGCTTAATTTTGCTGTGAA 38867130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TGTGTGAGGACAGCAGGTATATGAAAACTCCCTGCACTTTCTGCTTAATTTTGCTGTGAA 2460

 38867131 CCTAAAGCTGCTCTATATAATAAAGTTTATTAATTAAAAAAACCTCTGTTACAGCAAAAT 38867190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CCTAAAGCTGCTCTATATAATAAAGTTTATTAATTAAAAAAACCTCTGTTACAGCAAAAT 2520

 38867191 TGAGTAACAGACACCATATTTTTCCTCCTGCCCCCCCCCCCAAAATTAACAAAGTATAGA 38867250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TGAGTAACAGACACCATATTTTTCCTCCTGCCCCCCCCCCCAAAATTAACAAAGTATAGA 2580

 38867251 AAACAATGACTCTGAGAAGAGTGAACATTAGACAGTGAGGACATTGTTTCCTGAGAGAGG 38867310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AAACAATGACTCTGAGAAGAGTGAACATTAGACAGTGAGGACATTGTTTCCTGAGAGAGG 2640

 38867311 AAAAAATAATAATAATATGTAACAAATGATTTCCCCAGCTTACTGCTCACATAGTTTCTA 38867370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 AAAAAATAATAATAATATGTAACAAATGATTTCCCCAGCTTACTGCTCACATAGTTTCTA 2700

 38867371 AGCCATGATGCAAAAACAGGGCTAGTTCATGGCAATTTTGACAGGATTCACTTATGTCAC 38867430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AGCCATGATGCAAAAACAGGGCTAGTTCATGGCAATTTTGACAGGATTCACTTATGTCAC 2760

 38867431 CCCAAATCTCTCAAGTTTTGTCAGTATTCCAGTTCAGTCAGGCAAAGAATGGCTGAGTAA 38867490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CCCAAATCTCTCAAGTTTTGTCAGTATTCCAGTTCAGTCAGGCAAAGAATGGCTGAGTAA 2820

 38867491 ACAAGAAGCTTTGTTATTTCTTTCAGTGTTGGTTTCTATACCTCAAAATACCTCAGTAAA 38867550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 ACAAGAAGCTTTGTTATTTCTTTCAGTGTTGGTTTCTATACCTCAAAATACCTCAGTAAA 2880

 38867551 TCTCAAGTAGAATAAATTGAAATAAGATAAACACAAATAATCTTAACACATTATAGTTAA 38867610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TCTCAAGTAGAATAAATTGAAATAAGATAAACACAAATAATCTTAACACATTATAGTTAA 2940

 38867611 GTTGAATGCCACAGACAAAGGAAATATTTTGAAAGCAACAAGATGAAAACAACATATATG 38867670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 GTTGAATGCCACAGACAAAGGAAATATTTTGAAAGCAACAAGATGAAAACAACATATATG 3000

 38867671 CAGATGTACAATATCATTAATGACTGTTTTTATGCCAGAAATAAAATAGGCCAGAAACCA 38867730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CAGATGTACAATATCATTAATGACTGTTTTTATGCCAGAAATAAAATAGGCCAGAAACCA 3060

 38867731 ATGCAATGACAAATTGTTTGAATGAAATGTCAGCCAACTATTCTATATTCGGCAAAGCTA 38867790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 ATGCAATGACAAATTGTTTGAATGAAATGTCAGCCAACTATTCTATATTCGGCAAAGCTA 3120

 38867791 CTTAAATGAAATGGACCACCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCC 38867850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 CTTAAATGAAATGGACCACCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCC 3180

 38867851 AAGGTGGGCAGATCATGAGGTCAAGATATAGAGACCATCCTGGACAACATGGTGAAATCC 38867910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 AAGGTGGGCAGATCATGAGGTCAAGATATAGAGACCATCCTGGACAACATGGTGAAATCC 3240

 38867911 TGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGC 38867970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGC 3300

 38867971 TACTCAGGAGGCTGAGGGAGGAGAACCTCTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGC 38868030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TACTCAGGAGGCTGAGGGAGGAGAACCTCTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGC 3360

 38868031 AGAGATTGCACCACTACACTCCAGCCTGGTGACAAAGCGAGACACTGTCTCAAAAATATA 38868090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 AGAGATTGCACCACTACACTCCAGCCTGGTGACAAAGCGAGACACTGTCTCAAAAATATA 3420

 38868091 TATATATATATAATAAAAATAAGATGAAATACAGACATCCTCAGATGAACAAAGACTCGA 38868150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TATATATATATAATAAAAATAAGATGAAATACAGACATCCTCAGATGAACAAAGACTCGA 3480

 38868151 GTAATTCATGGCTAGCAGGCATGACTTAAAGGAAAAACTAACGGAAACCCTGTAGGCCAA 38868210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 GTAATTCATGGCTAGCAGGCATGACTTAAAGGAAAAACTAACGGAAACCCTGTAGGCCAA 3540

 38868211 AGGAACGTAACACTAGACAGTAACTCTAACTCTAATTCAAGAGAGAATGTGCAGGAAGCC 38868270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 AGGAACGTAACACTAGACAGTAACTCTAACTCTAATTCAAGAGAGAATGTGCAGGAAGCC 3600

 38868271 ATAAACAGTAAACATAATAATCTATATTATGTAATTTAATAAAAAATACATTGCTTTAAA 38868330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 ATAAACAGTAAACATAATAATCTATATTATGTAATTTAATAAAAAATACATTGCTTTAAA 3660

 38868331 AATCCTTTTCTTAAAAATATTATTGTGTAAACATAATTATAATATTATAGTGTTGGATTT 38868390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 AATCCTTTTCTTAAAAATATTATTGTGTAAACATAATTATAATATTATAGTGTTGGATTT 3720

 38868391 ATAACATATTTGGTGAAGTAATCGCACAAAGTAAAGAGAAGAAGAAAAGGGTATGTAAGT 38868450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 ATAACATATTTGGTGAAGTAATCGCACAAAGTAAAGAGAAGAAGAAAAGGGTATGTAAGT 3780

 38868451 AAATAAAGATATTATATTTTACTGGAATTAAGTTGGTACTATTCTTAAATGGATTATGAT 38868510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 AAATAAAGATATTATATTTTACTGGAATTAAGTTGGTACTATTCTTAAATGGATTATGAT 3840

 38868511 TAGATGAGATGCATATTGTAATTATTGTAGCAACCACTAAGAAATAATATTAACACAAAC 38868570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 TAGATGAGATGCATATTGTAATTATTGTAGCAACCACTAAGAAATAATATTAACACAAAC 3900

 38868571 AACAGAGGAATTAAAATGATAGATTAGAAAAACCATTTATATATCACAAAATATAACAGT 38868630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 AACAGAGGAATTAAAATGATAGATTAGAAAAACCATTTATATATCACAAAATATAACAGT 3960

 38868631 AAATGAGAAACAGAGGAATATATTTAAAATGAGCCTGGTTGCAGCGGCTCACACCTGTAA 38868690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 AAATGAGAAACAGAGGAATATATTTAAAATGAGCCTGGTTGCAGCGGCTCACACCTGTAA 4020

 38868691 TCTTAGCAACTTGGAAGGCCAAGGTAGGAGGAAGTCTTGAGCCCAGGAGTTCAAGATCAG 38868750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 TCTTAGCAACTTGGAAGGCCAAGGTAGGAGGAAGTCTTGAGCCCAGGAGTTCAAGATCAG 4080

 38868751 CCTGAGCAACACAGTGAGACCCCCATCTCTACAAAAAGTAGAAATTTGGCAAGGCATCAT 38868810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 CCTGAGCAACACAGTGAGACCCCCATCTCTACAAAAAGTAGAAATTTGGCAAGGCATCAT 4140

 38868811 GATAGGCACCTGTAGTCCCAGCTACTGATGAAGCTAAGGCAAGAGGATTTCTTGAGCCTC 38868870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 GATAGGCACCTGTAGTCCCAGCTACTGATGAAGCTAAGGCAAGAGGATTTCTTGAGCCTC 4200

 38868871 TGAGGTCAAGGCTACAGTGAGCTATGATCACACCACTGCGCTCCAGCTTTGGAGACAGAG 38868930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 TGAGGTCAAGGCTACAGTGAGCTATGATCACACCACTGCGCTCCAGCTTTGGAGACAGAG 4260

 38868931 CAAGACTCTACAGCAATAAATAAATAAATAGAAAGCAAATAGAAAAATGACAGGCATAAA 38868990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 CAAGACTCTACAGCAATAAATAAATAAATAGAAAGCAAATAGAAAAATGACAGGCATAAA 4320

 38868991 TCCAACTGTAGCAATACTTAATACATGAAAAGCAAATAAACCAAGCACAACACATAAAAG 38869050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 TCCAACTGTAGCAATACTTAATACATGAAAAGCAAATAAACCAAGCACAACACATAAAAG 4380

 38869051 GAAAGGATTGTCAGATTTGATAGAAACAAGACCCAAGTATACACTGTCTATAATAGACAC 38869110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 GAAAGGATTGTCAGATTTGATAGAAACAAGACCCAAGTATACACTGTCTATAATAGACAC 4440

 38869111 ACATTATATTCAAATACATAAATAAATAAAAAGCAAAATGATGTAAAAAAGGTAAAGTAT 38869170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 ACATTATATTCAAATACATAAATAAATAAAAAGCAAAATGATGTAAAAAAGGTAAAGTAT 4500

 38869171 GAAATCAGTAACTCTATGACAGCTGAAGTAGCTGTATTAACATTATTTAAAATAGACTTT 38869230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 GAAATCAGTAACTCTATGACAGCTGAAGTAGCTGTATTAACATTATTTAAAATAGACTTT 4560

 38869231 AATACAAGAAACACTATCAGAGAAGAAAAGCCATATTTCATAATGATAAAACATGCCAAT 38869290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 AATACAAGAAACACTATCAGAGAAGAAAAGCCATATTTCATAATGATAAAACATGCCAAT 4620

 38869291 TCATCATAAA 38869300
          ||||||||||
     4621 TCATCATAAA 4630

Alignment time is 3.30514 s

