
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38249892,38276749] =>     26858 nucs '18 dna:chromosome chromosome:GRCh37:18:1:78077248:1'
Second seq [       1,    2670] =>      2670 nucs 'mol-32-1e7c-221699_2670'

Score:        2524
Aligned:      2660        nucs
Identic:      2646 ( 99%) nucs =>      1803 ( 99%)       843 (100%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38264434,38266242] EXCISED REGION [38266251,38267097]
 second seq =>  [      12,    1823] EXCISED REGION [    1824,    2670]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         8 nucs [38266243,38266250]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         8 nucs [38266243,38266250] to [38266251,38266258]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [38266242,38266242] to [38266251,38266251]
 second seq =>         1 nucs [1823,1823] to [1824,1824]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 38264434 ATATATATATATCAACAATCTCAATGTTTAAGAGAAGCCCTCAAGCCAGAATTTCCAACA 38264493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
       12 ATATATATATATCAACAATCTCAATGTTTAAGAGAAGCCCTCAATCCAGAATTTCCAACA 71

 38264494 GTTGCAGATAAAACATTGTGCTTGCTTAACGTATTTAACCAAAAGACCCGAAAAGCAAGG 38264553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       72 GTTGCAGATAAAACATTGTGCTTGCTTAACGTATTTAACCAAAAGACCCGAAAAGCAAGG 131

 38264554 ATATAAAAGAATATTTTAATAATATCATTCTGTTCTTAAGGTGAACACTTCAAAGAAACC 38264613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      132 ATATAAAAGAATATTTTAATAATATCATTCTGTTCTTAAGGTGAACACTTCAAAGAAACC 191

 38264614 ACACCCCTCCCCTCCCCAATGCGTGCTGAAGCAGTGGAATCCATGAGTGGAACCTTGTCA 38264673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      192 ACACCCCTCCCCTCCCCAATGCGTGCTGAAGCAGTGGAATCCATGAGTGGAACCTTGTCA 251

 38264674 TATATAATCTCCACACTAAATTTATAGCAAAGCCCCCATCTCTCAACCTGTGTTGAAATT 38264733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      252 TATATAATCTCCACACTAAATTTATAGCAAAGCCCCCATCTCTCAACCTGTGTTGAAATT 311

 38264734 CTGACTTCCAGACACACCTTTCAGTAATGAGGAGGTACTCTTCCATGATAAACCCTGTGG 38264793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      312 CTGACTTCCAGACACACCTTTCAGTAATGAGGAGGTACTCTTCCATGATAAACCCTGTGG 371

 38264794 GCAAAGCTTCCACATTCATCCCACCCCTAAAGCAATAAATTTGCACCTTTCCCAAGTAGA 38264853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      372 GCAAAGCTTCCACATTCATCCCACCCCTAAAGCAATAAATTTGCACCTTTCCCAAGTAGA 431

 38264854 ATCAATGGGAAGAATTTTGACTTCTATCCCCACCTGATGGTAATGAGGCAGTATCTCTCT 38264913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      432 ATCAATGGGAAGAATTTTGACTTCTATCCCCACCTGATGGTAATGAGGCAGTATCTCTCT 491

 38264914 CTTTTTCCAGACAGTGTTTAAGAATTTGTTGTATAGAGCGCTATTACCTGAATAACACAT 38264973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      492 CTTTTTCCAGACAGTGTTTAAGAATTTGTTGTATAGAGCGCTATTACCTGAATAACACAT 551

 38264974 TGTGGCAGAGCAAAATAACCCTTAAGCATTTAGTTTTCAGATTTATTTTCAACTATTTAG 38265033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      552 TGTGGCAGAGCAAAATAACCCTTAAGCATTTAGTTTTCAGATTTATTTTCAACTATTTAG 611

 38265034 AGGGTTATTTCTTGACTACCACAGATAAGTCATTCCCTTCTCCATTGTTCTATAGTTTAC 38265093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      612 AGGGTTATTTCTTGACTACCACAGATAAGTCATTCCCTTCTCCATTGTTCTATAGTTTAC 671

 38265094 TGCCCTTTTTTTCTATCATGGCATTTACCCACTATTTCATATTGTTATTTATAGTTTACA 38265153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
      672 TGCCCTTTTTTTCTATCATGGCATTTACCCACTATTTCATATTGTTATTTTTAGTTTACA 731

 38265154 TGCTTAATATCTCCATCTCCCAACAAATATGGGAACATCATTAGGTCAGAGAAATTTTAT 38265213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      732 TGCTTAATATCTCCATCTCCCAACAAATATGGGAACATCATTAGGTCAGAGAAATTTTAT 791

 38265214 TTCTTTTCCCTCTGAAGTCTCAGTATTAGTTGTTACATTAATTAGCACTTATTTAAATTT 38265273
          ||||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
      792 TTCTTTCCCCTCTGAAGTCTCAGTACTAGTTGTTACATTAATTAGCACTTATTTAAATTT 851

 38265274 TTAGTTTTCTTTTTCTTTGCCTCATGTTACTGTTACACCCTTCCACTACCAAGCTTAAAG 38265333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      852 TTAGTTTTCTTTTTCTTTGCCTCATGTTACTGTTACACCCTTCCACTACCAAGCTTAAAG 911

 38265334 TTAGGAATGATTCATGTGACTGGAATTGAATGACTGCTCTGAGAAAGAAGTCCATAAAAG 38265393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      912 TTAGGAATGATTCATGTGACTGGAATTGAATGACTGCTCTGAGAAAGAAGTCCATAAAAG 971

 38265394 TCTGCATGCAATTTGCCATGTCTCCATCCTTTCTTTGCCATAGAAACTAAAGATCTTCCA 38265453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      972 TCTGCATGCAATTTGCCATGTCTCCATCCTTTCTTTGCCATAGAAACTAAAGATCTTCCA 1031

 38265454 GATAGTCGAGGCTCTGTTAATGTTATTTCTTGAATAACGACTATCTGAACAGAACATCTG 38265513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1032 GATAGTCGAGGCTCTGTTAATGTTATTTCTTGAATAACGACTATCTGAACAGAACATCTG 1091

 38265514 TGACTTGGAATGGGGACATGTAGCTTGGAGAAAAAGTAAGCACACAGTGTTTTAAGTTAC 38265573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1092 TGACTTGGAATGGGGACATGTAGCTTGGAGAAAAAGTAAGCACACAGTGTTTTAAGTTAC 1151

 38265574 TGTGGTTTTATGGTTATTTGTTACTGCAGCATAACCCACCCTGCCCTGACTTAAGTGATA 38265633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1152 TGTGGTTTTATGGTTATTTGTTACTGCAGCATAACCCACCCTGCCCTGACTTAAGTGATA 1211

 38265634 TAATATTTAACAAATATTTATAAAATAAATAAATTCAAATTCACTCTAATACCTAGAAAA 38265693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1212 TAATATTTAACAAATATTTATAAAATAAATAAATTCAAATTCACTCTAATACCTAGAAAA 1271

 38265694 TTATCAAGTATAGTAAACCAAATAATAAATATTTATTAAGGAATATGGAAACAGTGACCT 38265753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1272 TTATCAAGTATAGTAAACCAAATAATAAATATTTATTAAGGAATATGGAAACAGTGACCT 1331

 38265754 ATGAGAAGTCTTGATATACTGACCATCCATTGTTGCAGCAGATCTCACTATTGCTATTGT 38265813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1332 ATGAGAAGTCTTGATATACTGACCATCCATTGTTGCAGCAGATCTCACTATTGCTATTGT 1391

 38265814 GCTTAACATTTCAATTACAAAAATTAAAAAAAAAAAA-CACCATTCATCAGTGCAGGTCT 38265872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
     1392 GCTTAACATTTCAATTACAAAAATTAAAAAAAAAAAAACACCATTCATCAGTGCAGGTCT 1451

 38265873 GTGTATTTAAAGAAATAATTTACAAGTTTTTTTTTCCTTTGTAAACATATTGTTTTGAAG 38265932
          |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
     1452 GTGTATTTAAAGAAATAATTTACAAGTTTTTTTT-CCTTTGTAAACATATTGTTTTGAAG 1510

 38265933 TGCAAATATATATAATTTGCACTTTGGGATGGAATGGAATGGGATGCCCTATTGGCAGTC 38265992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1511 TGCAAATATATATAATTTGCACTTTGGGATGGAATGGAATGGGATGCCCTATTGGCAGTC 1570

 38265993 CATACATCTGGATTATAAATGGATTTCCATCCCATCTTCCTCCCCATCTCTTTCCCTTTT 38266052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1571 CATACATCTGGATTATAAATGGATTTCCATCCCATCTTCCTCCCCATCTCTTTCCCTTTT 1630

 38266053 TGATCATTCTATGGAAATGGAAAGCTAGCAGAAGTTTGAAGAATTGTCACGCAAACAACA 38266112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1631 TGATCATTCTATGGAAATGGAAAGCTAGCAGAAGTTTGAAGAATTGTCACGCAAACAACA 1690

 38266113 ACAACAA---AACTTTAGCATATTAACCTGTTGTCCAACCTTATATAAGCAGTTTGTATT 38266169
          |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1691 ACAACAACAAAACTTTAGCATATTAACCTGTTGTCCAACCTTATATAAGCAGTTTGTATT 1750

 38266170 TAAAACATCCCTAAGTGGATTTTAATTCCAGTTTCAATCATTGTTAACTATTTTTGAAAT 38266229
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     1751 TAAAACATCCCTAAGTGGATTTTAATTCCAATTTCAATCATTGTTAACTATTTTTGAAAT 1810

 38266230 ATTTAAAATCCCA 38266242
          |||||||||||||
     1811 ATTTAAAATCCCA 1823

EXCISED REGION

 38266251 ACCACTATTTCTCTTCAACTAGTCCTTACTTTTATAAACAAAAAAGTAACAGTAAATAAT 38266310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1824 ACCACTATTTCTCTTCAACTAGTCCTTACTTTTATAAACAAAAAAGTAACAGTAAATAAT 1883

 38266311 TTATAACTAGGTCTCTCTGAATCTAAAAACACGTTCTTATACACTATGTGATGCCATATT 38266370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     1884 TTATAACTAGGTCTCTCTGAATCTAAAAACACATTCTTATACACTATGTGATGCCATATT 1943

 38266371 TTTTACTCTTGTCTTTGTGAGTTTTTTGTGCCATTCTCTCCTCTGGAATGGTCTTCTGTG 38266430
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1944 TTTTACTCTTGACTTTGTGAGTTTTTTGTGCCATTCTCTCCTCTGGAATGGTCTTCTGTG 2003

 38266431 CTTACACATTCCAAGGGCTACTCCATTTTACAAGAAACAGTTCATGTTTGCTACTTTGGG 38266490
          .|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2004 TTTACACATTCCAAGGGCTAATCCATTTTACAAGAAACAGTTCATGTTTGCTACTTTGGG 2063

 38266491 GTTGATCCCATGATAATTCTGGTTCTCACTTGGTCTTTCCCTGTGAGATGCAGTAGCATT 38266550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2064 GTTGATCCCATGATAATTCTGGTTCTCACTTGGTCTTTCCCTGTGAGATGCAGTAGCATT 2123

 38266551 CAAAATTCTCAGACTATTCTATGCACCTTGGCAGATTTATGGTAATGGTCTATAATTGCT 38266610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2124 CAAAATTCTCAGACTATTCTATGCACCTTGGCAGATTTATGGTAATGGTCTATAATTGCT 2183

 38266611 TCATATCTGCTAACCTTGCTTCCAAAACTAGTTTTTGAGATTAATGAGACAGGAGCTTGG 38266670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2184 TCATATCTGCTAACCTTGCTTCCAAAACTAGTTTTTGAGATTAATGAGACAGGAGCTTGG 2243

 38266671 CTTTTTCTTTCTGTATAGCTTCCATAGCAACAAGAAAATATTAGACACACAGTAGGCATT 38266730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2244 CTTTTTCTTTCTGTATAGCTTCCATAGCAACAAGAAAATATTAGACACACAGTAGGCATT 2303

 38266731 GGAAGAAAATGTGTTCAGTTAAATGAACTTGATTTGAATGGAATGAGAGTTCAATGAAAC 38266790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2304 GGAAGAAAATGTGTTCAGTTAAATGAACTTGATTTGAATGGAATGAGAGTTCAATGAAAC 2363

 38266791 TGTATATATTGTGAAACGTGGCAACTTACACCTACTCAAGACATTAAAAGAGATCATGCT 38266850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2364 TGTATATATTGTGAAACGTGGCAACTTACACCTACTCAAGACATTAAAAGAGATCATGCT 2423

 38266851 TTCTTGCCTAAGTTTTATGTCCAATTTGTTCCTGTTTCAAACCCCTCGACAAAAACAAAA 38266910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2424 TTCTTGCCTAAGTTTTATGTCCAATTTGTTCCTGTTTCAAACCCCTCGACAAAAACAAAA 2483

 38266911 TCTTTTAATCTGTTTGCAAAATATTTCCTCCTTCCTCCCATCTTGCTGTTGCTGCTCTGT 38266970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2484 TCTTTTAATCTGTTTGCAAAATATTTCCTCCTTCCTCCCATCTTGCTGTTGCTGCTCTGT 2543

 38266971 GATATACTGCCCTTGCTTATTACCCCTTTATAGCTGTTTTGTTAAAGTTCATACCGCTAA 38267030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2544 GATATACTGCCCTTGCTTATTACCCCTTTATAGCTGTTTTGTTAAAGTTCATACCGCTAA 2603

 38267031 GACCTGTAAAAGAAATTTATGGCTCTAGGGATTTCAGCAAATTCTAAATAACCATAACAG 38267090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2604 GACCTGTAAAAGAAATTTATGGCTCTAGGGATTTCAGCAAATTCTAAATAACCATAACAG 2663

 38267091 GAACAGG 38267097
          |||||||
     2664 GAACAGG 2670

Alignment time is 2.72153 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38249892,38276749] =>     26858 nucs '18 dna:chromosome chromosome:GRCh37:18:1:78077248:1'
Second seq [       1,    2158] =>      2158 nucs 'mol-32-1f00-139650_2158'

Score:        2079
Aligned:      2156        nucs
Identic:      2149 (100%) nucs =>       238 ( 99%)      1911 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38259069,38259308] EXCISED REGION [38259311,38261226]
 second seq =>  [       1,     240] EXCISED REGION [     243,    2158]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [38259309,38259310]
 second seq =>         2 nucs [241,242]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [38259309,38259311] to [38259311,38259313]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [38259306,38259308] to [38259311,38259313]
 second seq =>         3 nucs [238,240] to [243,245]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 38259069 GTATAGAGAGAAGTTTCCAAAGTAGGGCAACTCAGAGATAAATCAAGAATGGGAAGATTC 38259128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTATAGAGAGAAGTTTCCAAAGTAGGGCAACTCAGAGATAAATCAAGAATGGGAAGATTC 60

 38259129 ACACACCTCAACTGTAAAAGAGAAATATGAGACTAAAAGCAGTGGATTAATTAAAACTTT 38259188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
       61 ACACACCTCAACTGTAAAAGAGAAATATGAGACTAAAAGCAGTGGATTCATTAAAACTTT 120

 38259189 GTTTGATGAGATATTATACATAGATGTCTTCTCCATCATTCCAAGCACTTAAGCAGCTGC 38259248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTTTGATGAGATATTATACATAGATGTCTTCTCCATCATTCCAAGCACTTAAGCAGCTGC 180

 38259249 CCTTTCCAAACACTCATAGAGGATAAGAGATTATTTTCTATAAAAATCAAACCAGATTGT 38259308
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCTTTACAAACACTCATAGAGGATAAGAGATTATTTTCTATAAAAATCAAACCAGATTGT 240

EXCISED REGION

 38259311 TGTACATCAAGCAAAGGAGGGATGGCAGGGAGGTGATATACTGAAACAGAATTACTGTAT 38259370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      243 TGTACATCAAGCAAAGGAGGGATGGCAGGGAGGTGATATACTGAAACAGAATTACTGTAT 302

 38259371 GAAAACCTGGAATGAACAATTAGATACTCAGTTCTCCTTACCTGCACAGTAATAGTAATT 38259430
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      303 GAAAACATGGAATGAACAATTAGATACTCAGTTCTCCTTACCTGCACAGTAATAGTAATT 362

 38259431 CTTACTACCAGACTGGATGCTGGAGGGCTCTCCTTCAGAGAAACAGAAAAGAAAAAAAAG 38259490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      363 CTTACTACCAGACTGGATGCTGGAGGGCTCTCCTTCAGAGAAACAGAAAAGAAAAAAAAG 422

 38259491 CCTATAGCCACTAATATTTGAATCTCTGCAATTAAATACCTGGGTCCCTTCCCAATCATA 38259550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      423 CCTATAGCCACTAATATTTGAATCTCTGCAATTAAATACCTGGGTCCCTTCCCAATCATA 482

 38259551 TAGCAGTGATGCTCACCAGTTAACAAGAACTGAAGACACATGACAGATTCCAATCAGTGA 38259610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      483 TAGCAGTGATGCTCACCAGTTAACAAGAACTGAAGACACATGACAGATTCCAATCAGTGA 542

 38259611 TTTATTACCACTGTCAAATAAGAATGGACACTCAAAGATTACCTGAAAAAGTCCTTTAAT 38259670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      543 TTTATTACCACTGTCAAATAAGAATGGACACTCAAAGATTACCTGAAAAAGTCCTTTAAT 602

 38259671 ATGGCCCCAGATTGAATAATTCCTAATTTCCTATATCATAAATTCAAAAATTATCTAAAA 38259730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      603 ATGGCCCCAGATTGAATAATTCCTAATTTCCTATATCATAAATTCAAAAATTATCTAAAA 662

 38259731 TTCAGTGAAATTAGTCCATATTATCAATGCCAACCTTACACATAAACAGAGTTGACATTC 38259790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      663 TTCAGTGAAATTAGTCCATATTATCAATGCCAACCTTACACATAAACAGAGTTGACATTC 722

 38259791 TCTTATGATGCTGAACAATGCAGATGAAGAACGCTGGCTTTGGATTAAGAAGACCCTTAG 38259850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      723 TCTTATGATGCTGAACAATGCAGATGAAGAACGCTGGCTTTGGATTAAGAAGACCCTTAG 782

 38259851 TTTGAATTTTAATTTTGACCCATGATAGCTGTGTAAACTTAGTCAAAATTCTTCAGTTAT 38259910
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
      783 TTTGAATTTTAATTTTGACCCATGATAGCTGTGTAAACTTAGTAAAAATTCTTCAGTTAT 842

 38259911 TGAGCTGATGCTTTAGCCTGAGTTAAACAGAGAACAGAGCCTAAGGTAGAGGGTTTCTAT 38259970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      843 TGAGCTGATGCTTTAGCCTGAGTTAAACAGAGAACAGAGCCTAAGGTAGAGGGTTTCTAT 902

 38259971 TCTATTCTTTCATAATGGATTGCTGGGCAAGATAACAAAAGCAATGGATAAGCACAGAAA 38260030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      903 TCTATTCTTTCATAATGGATTGCTGGGCAAGATAACAAAAGCAATGGATAAGCACAGAAA 962

 38260031 TGCAGGGCAGAAGAGAGAGCCATGAGGAAGATATATTATCAGGGTGGTTGCCATTAAGTG 38260090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      963 TGCAGGGCAGAAGAGAGAGCCATGAGGAAGATATATTATCAGGGTGGTTGCCATTAAGTG 1022

 38260091 AAACCAGTTACCCAGTTTAATGGAATTATCCCCAGGGAGCAAGGTCTGTGGCATCTCAAG 38260150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     1023 AAACCAGTTACCCAGTTTAATGGAATTATCCCCAGGGAGCAAGGTCAGTGGCATCTCAAG 1082

 38260151 ACTCTTTATCAAAGAGGAGAATGGGAGAAAAATCATCTTTTTTGTATTTCCTACTGTTCA 38260210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1083 ACTCTTTATCAAAGAGGAGAATGGGAGAAAAATCATCTTTTTTGTATTTCCTACTGTTCA 1142

 38260211 AAAGTTTGTCCCTTGCTTTCCTGGTTATGAATGCATGGAAGTCTAGTTGAAGTCCAGCAA 38260270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     1143 AAAGTTTGTCCCTTGCTTTCCTGGTTATGAATGCATGGAAGTCTAGTTGAAGTCCACCAA 1202

 38260271 AGACATCAACAAGGAATCATAGGAAAGAGATAAAAGGCCTGAGACATGGATATAAGGGAA 38260330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1203 AGACATCAACAAGGAATCATAGGAAAGAGATAAAAGGCCTGAGACATGGATATAAGGGAA 1262

 38260331 GGTAGTGTTAAGTGGCACCTTTTTGGGAGTCCAAACTGAGCAGGAGTAAAACTGAAGCAA 38260390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1263 GGTAGTGTTAAGTGGCACCTTTTTGGGAGTCCAAACTGAGCAGGAGTAAAACTGAAGCAA 1322

 38260391 CTGCTTTAACTAAGACATGTGTGCCCACAAAGACCTGAAGTGACACATGAGCTTTCACAG 38260450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1323 CTGCTTTAACTAAGACATGTGTGCCCACAAAGACCTGAAGTGACACATGAGCTTTCACAG 1382

 38260451 TTTTTTAACTGTAAAATGGTAATGATATCACCTATGTTTCTGGATTACTACAAATATTAA 38260510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1383 TTTTTTAACTGTAAAATGGTAATGATATCACCTATGTTTCTGGATTACTACAAATATTAA 1442

 38260511 ATAGCATAAATGGCACACTTGCAAAGCATATTTTAATAAACATATTTAATATTTCCCTTA 38260570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1443 ATAGCATAAATGGCACACTTGCAAAGCATATTTTAATAAACATATTTAATATTTCCCTTA 1502

 38260571 TTGATTTCTTTAATCAATAAAAGCATTTCTGAAATTTGTGTAAAGGTCTAGATGAAGGGA 38260630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1503 TTGATTTCTTTAATCAATAAAAGCATTTCTGAAATTTGTGTAAAGGTCTAGATGAAGGGA 1562

 38260631 CATTGGACATGCTTTGATAATCATTGAGACTGGGTGATAGATAAATGATTGTCATGGTCT 38260690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1563 CATTGGACATGCTTTGATAATCATTGAGACTGGGTGATAGATAAATGATTGTCATGGTCT 1622

 38260691 TTACTTTGATATGCATGTTTGACATCTTTGTAAACATAGTTTTAAAAATAATATTTGTAA 38260750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1623 TTACTTTGATATGCATGTTTGACATCTTTGTAAACATAGTTTTAAAAATAATATTTGTAA 1682

 38260751 AATTTAAAAACAGAAACAAATAATTCTGATTTCAAAGGTCAACTAATAGACTCCTAGTCA 38260810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1683 AATTTAAAAACAGAAACAAATAATTCTGATTTCAAAGGTCAACTAATAGACTCCTAGTCA 1742

 38260811 TGTCAGGATATCAATGCCTATCTCATTCACTTTCTGGTGCTTAAAAAATAATAAAAGTAA 38260870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1743 TGTCAGGATATCAATGCCTATCTCATTCACTTTCTGGTGCTTAAAAAATAATAAAAGTAA 1802

 38260871 TTATTTCCCAATCTTCACTTTCTACAATGCTAAACTATTTATTTCTCCTTTTCTGAGCCC 38260930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     1803 TTATTTCCCAATCTTCACTTTCTACAATGCTAAACTATTTATTTGTCCTTTTCTGAGCCC 1862

 38260931 ACATGCTTTCCTCAATGAATGTTACCGAGATGGAATTTATATCTTATATTTCAGGTGTAT 38260990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1863 ACATGCTTTCCTCAATGAATGTTACCGAGATGGAATTTATATCTTATATTTCAGGTGTAT 1922

 38260991 TTACATTCATTTCTTCCCCACTATGTTGCAAACAAGTTGTTTTGCCCATTTGTTCTTATC 38261050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1923 TTACATTCATTTCTTCCCCACTATGTTGCAAACAAGTTGTTTTGCCCATTTGTTCTTATC 1982

 38261051 CTGAGGTCATGAAAACATCTAACTCTACTATCTTCCAGAAGCTATATTGTCTTGCCTTTG 38261110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1983 CTGAGGTCATGAAAACATCTAACTCTACTATCTTCCAGAAGCTATATTGTCTTGCCTTTG 2042

 38261111 ACCTTAAGGATTATGGTCTTGAATTAATTTTTGTATGTGTAAGTGACCACACAAACTTGT 38261170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2043 ACCTTAAGGATTATGGTCTTGAATTAATTTTTGTATGTGTAAGTGACCACACAAACTTGT 2102

 38261171 TAGAAATCTAGTTTCAAGTATTTTTTTCATATGGATTCAAATTACACCACCAGTAC 38261226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2103 TAGAAATCTAGTTTCAAGTATTTTTTTCATATGGATTCAAATTACACCACCAGTAC 2158

Alignment time is 2.11524 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38249892,38276749] =>     26858 nucs '18 dna:chromosome chromosome:GRCh37:18:1:78077248:1'
Second seq [       1,    5714] =>      5714 nucs 'mol-32-1f00-154504_5714'

Score:        5419
Aligned:      5723        nucs
Identic:      5688 ( 99%) nucs =>      2256 ( 99%)      3432 (100%)
Gaps:           17 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38263974,38266242] EXCISED REGION [38266251,38269696]
 second seq =>  [       1,    2266] EXCISED REGION [    2267,    5714]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         8 nucs [38266243,38266250]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         8 nucs [38266243,38266250] to [38266251,38266258]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [38266242,38266242] to [38266251,38266251]
 second seq =>         1 nucs [2266,2266] to [2267,2267]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 38263974 TATGTTTATTTAAAGCAATACATTTCCATATTACCATGACCTTAGCTGCAGTGTATGTAT 38264033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TATGTTTATTTAAAGCAATACATTTCCATATTACCATGACCTTAGCTGCAGTGTATGTAT 60

 38264034 TTTGGTGTACAGTATTTTCTTTATTTTTCAATTAAAATTTGTCTTGACTTCCTCTATGAT 38264093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTGGTGTACAGTATTTTCTTTATTTTTCAATTAAAATTTGTCTTGACTTCCTCTATGAT 120

 38264094 GTCTTCTATGATTCTTCCTCTATAATTCTTCTTTTGACCATATAGAAGTGTATTCATTAA 38264153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTCTTCTATGATTCTTCCTCTATAATTCTTCTTTTGACCATATAGAAGTGTATTCATTAA 180

 38264154 TTCAATCACATATAAATATTCTCCTTTTATCTTTTTGCTACTGGTTTGTTTGTTTAGCTA 38264213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTCAATCACATATAAATATTCTCCTTTTATCTTTTTGCTACTGGTTTGTTTGTTTAGCTA 240

 38264214 CATTTAGGGAAAATTTCATTTCTGAGACGACAGAGGAAGCACATTCCATTTTATTCCTTC 38264273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CATTTAGGGAAAATTTCATTTCTGAGACGACAGAGGAAGCACATTCCATTTTATTCCTTC 300

 38264274 TGCTAATGACAAAAAAAAAAAAAAATTGGAAAAAACACAAAAGCCAGAGTCAAAAGACTC 38264333
          ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGCTAATGACAAAAAAAAAAAA---TTGGAAAAAACACAAAAGCCAGAGTCAAAAGACTC 357

 38264334 TGAAAAATGGAGAAAAAGTGCAGACAGGCTAAGGATTTGGGAGATTGAGGAACAACGACA 38264393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      358 TGAAAAATGGAGAAAAAGTGCAGACAGGCTAAGGATTTGGGAGATTGAGGAACAACGACA 417

 38264394 GGTGAGTTCTCTGTCTTTTTTTTT-CTTTCTTTTTTGATATATATATATATATCAACAAT 38264452
          |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||
      418 GGTGAGTTCTCTGTCTTTTTTTTTTCTTTCTTTTTTGATATATATATAT----CAACAAT 473

 38264453 CTCAATGTTTAAGAGAAGCCCTCAAGCCAGAATTTCCAACAGTTGCAGATAAAACATTGT 38264512
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
      474 CTCAATGTTTAAGAGAAGCCCTCAATCCAGAATTTCCAACAGTTGCAGATAAAACATTGT 533

 38264513 GCTTGCTTAACGTATTTAACCAAAAGACCCGAAAAGCAAGGATATAAAAGAATATTTTAA 38264572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      534 GCTTGCTTAACGTATTTAACCAAAAGACCCGAAAAGCAAGGATATAAAAGAATATTTTAA 593

 38264573 TAATATCATTCTGTTCTTAAGGTGAACACTTCAAAGAAACCACACCCCTCCCCTCCCCAA 38264632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      594 TAATATCATTCTGTTCTTAAGGTGAACACTTCAAAGAAACCACACCCCTCCCCTCCCCAA 653

 38264633 TGCGTGCTGAAGCAGTGGAATCCATGAGTGGAACCTTGTCATATATAATCTCCACACTAA 38264692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      654 TGCGTGCTGAAGCAGTGGAATCCATGAGTGGAACCTTGTCATATATAATCTCCACACTAA 713

 38264693 ATTTATAGCAAAGCCCCCATCTCTCAACCTGTGTTGAAATTCTGACTTCCAGACACACCT 38264752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      714 ATTTATAGCAAAGCCCCCATCTCTCAACCTGTGTTGAAATTCTGACTTCCAGACACACCT 773

 38264753 TTCAGTAATGAGGAGGTACTCTTCCATGATAAACCCTGTGGGCAAAGCTTCCACATTCAT 38264812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      774 TTCAGTAATGAGGAGGTACTCTTCCATGATAAACCCTGTGGGCAAAGCTTCCACATTCAT 833

 38264813 CCCACCCCTAAAGCAATAAATTTGCACCTTTCCCAAGTAGAATCAATGGGAAGAATTTTG 38264872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      834 CCCACCCCTAAAGCAATAAATTTGCACCTTTCCCAAGTAGAATCAATGGGAAGAATTTTG 893

 38264873 ACTTCTATCCCCACCTGATGGTAATGAGGCAGTATCTCTCTCTTTTTCCAGACAGTGTTT 38264932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      894 ACTTCTATCCCCACCTGATGGTAATGAGGCAGTATCTCTCTCTTTTTCCAGACAGTGTTT 953

 38264933 AAGAATTTGTTGTATAGAGCGCTATTACCTGAATAACACATTGTGGCAGAGCAAAATAAC 38264992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      954 AAGAATTTGTTGTATAGAGCGCTATTACCTGAATAACACATTGTGGCAGAGCAAAATAAC 1013

 38264993 CCTTAAGCATTTAGTTTTCAGATTTATTTTCAACTATTTAGAGGGTTATTTCTTGACTAC 38265052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1014 CCTTAAGCATTTAGTTTTCAGATTTATTTTCAACTATTTAGAGGGTTATTTCTTGACTAC 1073

 38265053 CACAGATAAGTCATTCCCTTCTCCATTGTTCTATAGTTTACTGCCCTTTTTTTCTATCAT 38265112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1074 CACAGATAAGTCATTCCCTTCTCCATTGTTCTATAGTTTACTGCCCTTTTTTTCTATCAT 1133

 38265113 GGCATTTACCCACTATTTCATATTGTTATTTATAGTTTACATGCTTAATATCTCCATCTC 38265172
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     1134 GGCATTTACCCACTATTTCATATTGTTATTTTTAGTTTACATGCTTAATATCTCCATCTC 1193

 38265173 CCAACAAATATGGGAACATCATTAGGTCAGAGAAATTTTATTTCTTTTCCCTCTGAAGTC 38265232
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     1194 CCAACAAATATGGGAACATCATTAGGTCAGAGAAATTTTATTTCTTTCCCCTCTGAAGTC 1253

 38265233 TCAGTATTAGTTGTTACATTAATTAGCACTTATTTAAATTTTTAGTTTTCTTTTTCTTTG 38265292
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1254 TCAGTACTAGTTGTTACATTAATTAGCACTTATTTAAATTTTTAGTTTTCTTTTTCTTTG 1313

 38265293 CCTCATGTTACTGTTACACCCTTCCACTACCAAGCTTAAAGTTAGGAATGATTCATGTGA 38265352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1314 CCTCATGTTACTGTTACACCCTTCCACTACCAAGCTTAAAGTTAGGAATGATTCATGTGA 1373

 38265353 CTGGAATTGAATGACTGCTCTGAGAAAGAAGTCCATAAAAGTCTGCATGCAATTTGCCAT 38265412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1374 CTGGAATTGAATGACTGCTCTGAGAAAGAAGTCCATAAAAGTCTGCATGCAATTTGCCAT 1433

 38265413 GTCTCCATCCTTTCTTTGCCATAGAAACTAAAGATCTTCCAGATAGTCGAGGCTCTGTTA 38265472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1434 GTCTCCATCCTTTCTTTGCCATAGAAACTAAAGATCTTCCAGATAGTCGAGGCTCTGTTA 1493

 38265473 ATGTTATTTCTTGAATAACGACTATCTGAACAGAACATCTGTGACTTGGAATGGGGACAT 38265532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1494 ATGTTATTTCTTGAATAACGACTATCTGAACAGAACATCTGTGACTTGGAATGGGGACAT 1553

 38265533 GTAGCTTGGAGAAAAAGTAAGCACACAGTGTTTTAAGTTACTGTGGTTTTATGGTTATTT 38265592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1554 GTAGCTTGGAGAAAAAGTAAGCACACAGTGTTTTAAGTTACTGTGGTTTTATGGTTATTT 1613

 38265593 GTTACTGCAGCATAACCCACCCTGCCCTGACTTAAGTGATATAATATTTAACAAATATTT 38265652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1614 GTTACTGCAGCATAACCCACCCTGCCCTGACTTAAGTGATATAATATTTAACAAATATTT 1673

 38265653 ATAAAATAAATAAATTCAAATTCACTCTAATACCTAGAAAATTATCAAGTATAGTAAACC 38265712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1674 ATAAAATAAATAAATTCAAATTCACTCTAATACCTAGAAAATTATCAAGTATAGTAAACC 1733

 38265713 AAATAATAAATATTTATTAAGGAATATGGAAACAGTGACCTATGAGAAGTCTTGATATAC 38265772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1734 AAATAATAAATATTTATTAAGGAATATGGAAACAGTGACCTATGAGAAGTCTTGATATAC 1793

 38265773 TGACCATCCATTGTTGCAGCAGATCTCACTATTGCTATTGTGCTTAACATTTCAATTACA 38265832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1794 TGACCATCCATTGTTGCAGCAGATCTCACTATTGCTATTGTGCTTAACATTTCAATTACA 1853

 38265833 AAAATTAAAAAAAAAAAA-CACCATTCATCAGTGCAGGTCTGTGTATTTAAAGAAATAAT 38265891
          |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1854 AAAATTAAAAAAAAAAAAACACCATTCATCAGTGCAGGTCTGTGTATTTAAAGAAATAAT 1913

 38265892 TTACAAGTTTTTTTTTCCTTTGTAAACATATTGTTTTGAAGTGCAAATATATATAATTTG 38265951
          ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1914 TTACAAGTTTTTTTT-CCTTTGTAAACATATTGTTTTGAAGTGCAAATATATATAATTTG 1972

 38265952 CACTTTGGGATGGAATGGAATGGGATGCCCTATTGGCAGTCCATACATCTGGATTATAAA 38266011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1973 CACTTTGGGATGGAATGGAATGGGATGCCCTATTGGCAGTCCATACATCTGGATTATAAA 2032

 38266012 TGGATTTCCATCCCATCTTCCTCCCCATCTCTTTCCCTTTTTGATCATTCTATGGAAATG 38266071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2033 TGGATTTCCATCCCATCTTCCTCCCCATCTCTTTCCCTTTTTGATCATTCTATGGAAATG 2092

 38266072 GAAAGCTAGCAGAAGTTTGAAGAATTGTCACGCAAACAACAACAACAA---AACTTTAGC 38266128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||
     2093 GAAAGCTAGCAGAAGTTTGAAGAATTGTCACGCAAACAACAACAACAACAAAACTTTAGC 2152

 38266129 ATATTAACCTGTTGTCCAACCTTATATAAGCAGTTTGTATTTAAAACATCCCTAAGTGGA 38266188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2153 ATATTAACCTGTTGTCCAACCTTATATAAGCAGTTTGTATTTAAAACATCCCTAAGTGGA 2212

 38266189 TTTTAATTCCAGTTTCAATCATTGTTAACTATTTTTGAAATATTTAAAATCCCA 38266242
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2213 TTTTAATTCCAATTTCAATCATTGTTAACTATTTTTGAAATATTTAAAATCCCA 2266

EXCISED REGION

 38266251 ACCACTATTTCTCTTCAACTAGTCCTTACTTTTATAAACAAAAAAGTAACAGTAAATAAT 38266310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2267 ACCACTATTTCTCTTCAACTAGTCCTTACTTTTATAAACAAAAAAGTAACAGTAAATAAT 2326

 38266311 TTATAACTAGGTCTCTCTGAATCTAAAAACACGTTCTTATACACTATGTGATGCCATATT 38266370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     2327 TTATAACTAGGTCTCTCTGAATCTAAAAACACATTCTTATACACTATGTGATGCCATATT 2386

 38266371 TTTTACTCTTGTCTTTGTGAGTTTTTTGTGCCATTCTCTCCTCTGGAATGGTCTTCTGTG 38266430
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2387 TTTTACTCTTGACTTTGTGAGTTTTTTGTGCCATTCTCTCCTCTGGAATGGTCTTCTGTG 2446

 38266431 CTTACACATTCCAAGGGCTACTCCATTTTACAAGAAACAGTTCATGTTTGCTACTTTGGG 38266490
          .|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2447 TTTACACATTCCAAGGGCTAATCCATTTTACAAGAAACAGTTCATGTTTGCTACTTTGGG 2506

 38266491 GTTGATCCCATGATAATTCTGGTTCTCACTTGGTCTTTCCCTGTGAGATGCAGTAGCATT 38266550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2507 GTTGATCCCATGATAATTCTGGTTCTCACTTGGTCTTTCCCTGTGAGATGCAGTAGCATT 2566

 38266551 CAAAATTCTCAGACTATTCTATGCACCTTGGCAGATTTATGGTAATGGTCTATAATTGCT 38266610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2567 CAAAATTCTCAGACTATTCTATGCACCTTGGCAGATTTATGGTAATGGTCTATAATTGCT 2626

 38266611 TCATATCTGCTAACCTTGCTTCCAAAACTAGTTTTTGAGATTAATGAGACAGGAGCTTGG 38266670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2627 TCATATCTGCTAACCTTGCTTCCAAAACTAGTTTTTGAGATTAATGAGACAGGAGCTTGG 2686

 38266671 CTTTTTCTTTCTGTATAGCTTCCATAGCAACAAGAAAATATTAGACACACAGTAGGCATT 38266730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2687 CTTTTTCTTTCTGTATAGCTTCCATAGCAACAAGAAAATATTAGACACACAGTAGGCATT 2746

 38266731 GGAAGAAAATGTGTTCAGTTAAATGAACTTGATTTGAATGGAATGAGAGTTCAATGAAAC 38266790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2747 GGAAGAAAATGTGTTCAGTTAAATGAACTTGATTTGAATGGAATGAGAGTTCAATGAAAC 2806

 38266791 TGTATATATTGTGAAACGTGGCAACTTACACCTACTCAAGACATTAAAAGAGATCATGCT 38266850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2807 TGTATATATTGTGAAACGTGGCAACTTACACCTACTCAAGACATTAAAAGAGATCATGCT 2866

 38266851 TTCTTGCCTAAGTTTTATGTCCAATTTGTTCCTGTTTCAAACCCCTCGACAAAAACAAAA 38266910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2867 TTCTTGCCTAAGTTTTATGTCCAATTTGTTCCTGTTTCAAACCCCTCGACAAAAACAAAA 2926

 38266911 TCTTTTAATCTGTTTGCAAAATATTTCCTCCTTCCTCCCATCTTGCTGTTGCTGCTCTGT 38266970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2927 TCTTTTAATCTGTTTGCAAAATATTTCCTCCTTCCTCCCATCTTGCTGTTGCTGCTCTGT 2986

 38266971 GATATACTGCCCTTGCTTATTACCCCTTTATAGCTGTTTTGTTAAAGTTCATACCGCTAA 38267030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2987 GATATACTGCCCTTGCTTATTACCCCTTTATAGCTGTTTTGTTAAAGTTCATACCGCTAA 3046

 38267031 GACCTGTAAAAGAAATTTATGGCTCTAGGGATTTCAGCAAATTCTAAATAACCATAACAG 38267090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3047 GACCTGTAAAAGAAATTTATGGCTCTAGGGATTTCAGCAAATTCTAAATAACCATAACAG 3106

 38267091 GAACAGGAAGCATTAATTAAAGACACTAGAGTCTAAGTTATAACAGAAATCCTGACATTT 38267150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3107 GAACAGGAAGCATTAATTAAAGACACTAGAGTCTAAGTTATAACAGAAATCCTGACATTT 3166

 38267151 AAGGCCCTGGTACCATTTAAATTTAAAATGGTATGACAAACAGAGAGTAATTTGATGGTC 38267210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3167 AAGGCCCTGGTACCATTTAAATTTAAAATGGTATGACAAACAGAGAGTAATTTGATGGTC 3226

 38267211 AGAAGGTTATAATGGATACCTTAATACCTTTGCCAAGAAAAAGTGTCTGTCCTTGCTCTA 38267270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3227 AGAAGGTTATAATGGATACCTTAATACCTTTGCCAAGAAAAAGTGTCTGTCCTTGCTCTA 3286

 38267271 ACCCCTACCCAGGGGCTTCAGGGGCCTCCTTCATAAAACATGGTGATGCCTAAATATTTT 38267330
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3287 ATCCCTACCCAGGGGCTTCAGGGGCCTCCTTCATAAAACATGGTGATGCCTAAATATTTT 3346

 38267331 TGCGATATCTCATATATAAGCTGGTCTTTTCTTTAAGAATACGAGAGATTAAACACCAAC 38267390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3347 TGCGATATCTCATATATAAGCTGGTCTTTTCTTTAAGAATACGAGAGATTAAACACCAAC 3406

 38267391 CCCCAACATTCATACACCAATTTTCAGATAAAACAGCTTAATATTTAAGATATATTTAGT 38267450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3407 CCCCAACATTCATACACCAATTTTCAGATAAAACAGCTTAATATTTAAGATATATTTAGT 3466

 38267451 GCAATTTGTCTATTTCTTGGTTTACTGGAGGGCTGTATTTAAAGCCAAGGGACCAAGGAA 38267510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3467 GCAATTTGTCTATTTCTTGGTTTACTGGAGGGCTGTATTTAAAGCCAAGGGACCAAGGAA 3526

 38267511 CATTCCACAACACACTAAAGCAATTTTTCCCCAGGGAATATGCTGATTCTTTCCTAAAGG 38267570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3527 CATTCCACAACACACTAAAGCAATTTTTCCCCAGGGAATATGCTGATTCTTTCCTAAAGG 3586

 38267571 CAGAAGCCGACATTCCTGACTCATTCTGCCAAACCAAGCAATGAAAAATGCTTCACCTAA 38267630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3587 CAGAAGCCGACATTCCTGACTCATTCTGCCAAACCAAGCAATGAAAAATGCTTCACCTAA 3646

 38267631 TTTGAAAGATAATTTGTAATACCAGAGACTCAACTTGTTTTGTGTATCCAATACTAGCAC 38267690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3647 TTTGAAAGATAATTTGTAATACCAGAGACTCAACTTGTTTTGTGTATCCAATACTAGCAC 3706

 38267691 CCTTTCCAGAATGTTGAAAGTACACACTGTATGATTTGTCTAATGTATATTCAAAAAAGG 38267750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3707 CCTTTCCAGAATGTTGAAAGTACACACTGTATGATTTGTCTAATGTATATTCAAAAAAGG 3766

 38267751 AATACAAATTGATCCTCAAAGTTCAAATCTGCAGTACATACTCTGTGTTCTGCCCCCACC 38267810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3767 AATACAAATTGATCCTCAAAGTTCAAATCTGCAGTACATACTCTGTGTTCTGCCCCCACC 3826

 38267811 CGTACCTTCATGAATTCTTTCACCTAGCACGCAGGCTGTTTTCCCTTTGCGAAATCCCAT 38267870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3827 CGTACCTTCATGAATTCTTTCACCTAGCACGCAGGCTGTTTTCCCTTTGCGAAATCCCAT 3886

 38267871 GGTACATTTATAGTATTAATACCACTCACTTAGAATATGCCGTATTTTGTCTAATATTGC 38267930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3887 GGTACATTTATAGTATTAATACCACTCACTTAGAATATGCCGTATTTTGTCTAATATTGC 3946

 38267931 TAGATTTTGTGTGTATAATCTTATTCCTCAAGTAAATTACAAGACAAGGACTATAATTTA 38267990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3947 TAGATTTTGTGTGTATAATCTTATTCCTCAAGTAAATTACAAGACAAGGACTATAATTTA 4006

 38267991 TACATCCTCTACAACACTTGACACTGGCTTTGATTAGGCTCTTAATAAATATTTGTTGGT 38268050
          ||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     4007 TACATCCTCTACAACACTTGGCACTGGCTTTGAGTAGGCTCTTAATAAATATTTGTTGGT 4066

 38268051 TGATTAATCAGTTGACCACACTTACTAATTGCAAGGTGACATCATTTATCATTAATAAAC 38268110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4067 TGATTAATCAGTTGACCACACTTACTAATTGCAAGGTGACATCATTTATCATTAATAAAC 4126

 38268111 ATATATGTGGATTACAAAAATATCATGTGAATTTGCATATAATCATATTAATCCCAAATT 38268170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4127 ATATATGTGGATTACAAAAATATCATGTGAATTTGCATATAATCATATTAATCCCAAATT 4186

 38268171 AGCACCTGAGAGTCCAACCACCCTCTCCTTTAGGCCCTTTTCACTTTTATGTCTACTTTT 38268230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4187 AGCACCTGAGAGTCCAACCACCCTCTCCTTTAGGCCCTTTTCACTTTTATGTCTACTTTT 4246

 38268231 GCCTCACTTACAATTCCACTACTTACTTGCCTTCTTTCTCTTTTCAGCTTTGTGCTGTTA 38268290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4247 GCCTCACTTACAATTCCACTACTTACTTGCCTTCTTTCTCTTTTCAGCTTTGTGCTGTTA 4306

 38268291 TTTAATATCTCACCAGTTGTGTAATTTCAGCTCCCAAATTGAATAAGACGTTCCCCCCAG 38268350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4307 TTTAATATCTCACCAGTTGTGTAATTTCAGCTCCCAAATTGAATAAGACGTTCCCCCCAG 4366

 38268351 TGGAACCCTCACCTTGACAAATAGCCAAATAGTA---ATTATTCCTTTCAGGGGTTGAGC 38268407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||
     4367 TGGAACCCTCACCTTGACAAATAGCCAAATAGTAATTATTATTCCTTTCAGGGGTTGAGC 4426

 38268408 TATGGAATCATGCTTGCAATATCCCAGGCTTGAGTGCCTAGATATTTATGCTATACTTCC 38268467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4427 TATGGAATCATGCTTGCAATATCCCAGGCTTGAGTGCCTAGATATTTATGCTATACTTCC 4486

 38268468 CTGTGTCGGAGTTTCCATCTGCGATTGTATTTCAAGCCCTCTCATTTTTTTTTTCAATAT 38268527
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
     4487 CTGTGTCGGAGTTTCCATCTGCGATTGTATTTCAAGCCCTCTCA-TTTTTTTTTCAATAT 4545

 38268528 GATTAAGATAATTCCTTTATGAAGTTGGAAACTCAGACATTCAGAAAGAAACTTGACGTT 38268587
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4546 GATTAAGATAATTCCTTTATGAAGCTGGAAACTCAGACATTCAGAAAGAAACTTGACGTT 4605

 38268588 TCATATTTTTGCTAACTTGCTCTTCCCATTTCCTTTCCTATCATTTTAGCCAGACTGAGG 38268647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4606 TCATATTTTTGCTAACTTGCTCTTCCCATTTCCTTTCCTATCATTTTAGCCAGACTGAGG 4665

 38268648 GAGAATTAATTTTGCAATGGTCTCTATTTTTTTTTCCAAATGTGTGACCTCCATATTAAT 38268707
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4666 GAGAATTAATTTTGCAACGGTCTCTATTTTTTTTTCCAAATGTGTGACCTCCATATTAAT 4725

 38268708 AGGAGCCAGAGTACTCATTCATCACATCTGGTCAGTGTGAAACTGACATTTACAGGGTGG 38268767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4726 AGGAGCCAGAGTACTCATTCATCACATCTGGTCAGTGTGAAACTGACATTTACAGGGTGG 4785

 38268768 AATGTTTCCCACTCAGGACAAATGGGGATCATTTGTAAAACATGCCGCACCCAATCATAG 38268827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     4786 AATGTTTCCCACTCAGGACAAATGGGGATCATTTGTAAAACATGCCACACCCAATCATAG 4845

 38268828 GTTCCCATGGATCTCCAACTACATTTTTAAGCAACAATATAAACCATTCCCGAAACTGAA 38268887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4846 GTTCCCATGGATCTCCAACTACATTTTTAAGCAACAATATAAACCATTCCCGAAACTGAA 4905

 38268888 AGGTCTTTTCAAATATTTACTGCCTACCTATGGAATTTTTATTCTGCTTGCTGCTGCCAT 38268947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4906 AGGTCTTTTCAAATATTTACTGCCTACCTATGGAATTTTTATTCTGCTTGCTGCTGCCAT 4965

 38268948 CAATAATCCTGGGAGTTCCTAGCTAAGTGTTGTGTATGACCTCCAAGGAAAGTCTTAGCA 38269007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4966 CAATAATCCTGGGAGTTCCTAGCTAAGTGTTGTGTATGACCTCCAAGGAAAGTCTTAGCA 5025

 38269008 TTGCAGAATGGGGAGGCGGGTTAGTATCCTGCATTTTTCATTCTGTCACTTTCTAGGGAC 38269067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5026 TTGCAGAATGGGGAGGCGGGTTAGTATCCTGCATTTTTCATTCTGTCACTTTCTAGGGAC 5085

 38269068 AATTACAAAGAAAATAATCATATAAGACTTATTTTTATGTTTATTATGAAAGCCTTCAGC 38269127
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5086 AATTACAAAGAAAATAATCGTATAAGACTTATTTTTATGTTTATTATGAAAGCCTTCAGC 5145

 38269128 TCTTGCATTTGCAAGTAAGCTCAATGATTTTAAGTTTGCTTTTTCCCCCATGAAATGAAA 38269187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5146 TCTTGCATTTGCAAGTAAGCTCAATGATTTTAAGTTTGCTTTTTCCCCCATGAAATGAAA 5205

 38269188 TATTATTTCCCACTTCTTCCATGAATCTATTGGGTAACTCCAGGCCACTGTGATCTTTCA 38269247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5206 TATTATTTCCCACTTCTTCCATGAATCTATTGGGTAACTCCAGGCCACTGTGATCTTTCA 5265

 38269248 TCTGGCATTTTGCTTTTATTTTTCTAGATCACAGTTGTGATTTAAAGCCCTCCTGGCACT 38269307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5266 TCTGGCATTTTGCTTTTATTTTTCTAGATCACAGTTGTGATTTAAAGCCCTCCTGGCACT 5325

 38269308 TGGACACCTTGGTGATCTTAGCTCATGCTCCTAGTTCCATAGTGATGAATTGACCAAACT 38269367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5326 TGGACACCTTGGTGATCTTAGCTCATGCTCCTAGTTCCATAGTGATGAATTGACCAAACT 5385

 38269368 TTTTCCCAAGGATATCTGCTAATTCTGGAGTTTCTGCTTTCTTATTATCTGTTCTGTCTT 38269427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5386 TTTTCCCAAGGATATCTGCTAATTCTGGAGTTTCTGCTTTCTTATTATCTGTTCTGTCTT 5445

 38269428 TTGGTTCTGTATTGATATAACAAGCTTTGTCCCCTTATCAATGAGGGCACAAAATGCAGC 38269487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     5446 TTGGTTCTGTATTGATATAACAAGCTTTGTCCCCTTATCAATGAGGGCACAAAATGAAGC 5505

 38269488 ACTTCAAATAATTTCTGCAAAAATTTACAGTTGCTGCATTAAGAATTTTGTGAGCTTCAA 38269547
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5506 ACTTCAAATAGTTTCTGCAAAAATTTACAGTTGCTGCATTAAGAATTTTGTGAGCTTCAA 5565

 38269548 TAATGTTATTGAAAAGTTGCAGATTCCCTCCTCCTTCTTTTTCTCCTTTCCTCCTCTTTC 38269607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5566 TAATGTTATTGAAAAGTTGCAGATTCCCTCCTCCTTCTTTTTCTCCTTTCCTCCTCTTTC 5625

 38269608 TGCCCTGTCTCCCCTTCATTATTCTCCTCTTCTTCTCAAAAGCAAACAATCATTTTTCTT 38269667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5626 TGCCCTGTCTCCCCTTCATTATTCTCCTCTTCTTCTCAAAAGCAAACAATCATTTTTCTT 5685

 38269668 GCCTACTGAAGAATACTTGTAATGTTATT 38269696
          |||||||||||||||||||||||||||||
     5686 GCCTACTGAAGAATACTTGTAATGTTATT 5714

Alignment time is 5.54258 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38249892,38276749] =>     26858 nucs '18 dna:chromosome chromosome:GRCh37:18:1:78077248:1'
Second seq [       1,    3213] =>      3213 nucs 'mol-32-1f63-006979_3213'

Score:        3089
Aligned:      3214        nucs
Identic:      3201 (100%) nucs =>       112 ( 99%)      3089 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38259780,38259892] EXCISED REGION [38266750,38269847]
 second seq =>  [       1,     113] EXCISED REGION [     114,    3213]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6857 nucs [38259893,38266749]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [38259893,38259893] to [38266750,38266750]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [38259893,38259893] to [38266749,38266749]
 second seq =>         0 nucs

 38259780 AGTTGACATTCTCTTATGATGCTGAACAATGCAGATGAAGAACGCTGGCTTTGGATTAAG 38259839
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGTTGACATTCTCTTATGATGCCGAACAATGCAGATGAAGAACGCTGGCTTTGGATTAAG 60

 38259840 AAGACCCTTAGTTTGAATTTTAATTTTGACCCATGATAGCTGTGTAAACTTAG 38259892
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAGACCCTTAGTTTGAATTTTAATTTTGACCCATGATAGCTGTGTAAACTTAG 113

EXCISED REGION

 38266750 TAAATGAACTTGATTTGAATGGAATGAGAGTTCAATGAAACTGTATATATTGTGAAACGT 38266809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      114 TAAATGAACTTGATTTGAATGGAATGAGAGTTCAATGAAACTGTATATATTGTGAAACGT 173

 38266810 GGCAACTTACACCTACTCAAGACATTAAAAGAGATCATGCTTTCTTGCCTAAGTTTTATG 38266869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      174 GGCAACTTACACCTACTCAAGACATTAAAAGAGATCATGCTTTCTTGCCTAAGTTTTATG 233

 38266870 TCCAATTTGTTCCTGTTTCAAACCCCTCGACAAAAACAAAATCTTTTAATCTGTTTGCAA 38266929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      234 TCCAATTTGTTCCTGTTTCAAACCCCTCGACAAAAACAAAATCTTTTAATCTGTTTGCAA 293

 38266930 AATATTTCCTCCTTCCTCCCATCTTGCTGTTGCTGCTCTGTGATATACTGCCCTTGCTTA 38266989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      294 AATATTTCCTCCTTCCTCCCATCTTGCTGTTGCTGCTCTGTGATATACTGCCCTTGCTTA 353

 38266990 TTACCCCTTTATAGCTGTTTTGTTAAAGTTCATACCGCTAAGACCTGTAAAAGAAATTTA 38267049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      354 TTACCCCTTTATAGCTGTTTTGTTAAAGTTCATACCGCTAAGACCTGTAAAAGAAATTTA 413

 38267050 TGGCTCTAGGGATTTCAGCAAATTCTAAATAACCATAACAGGAACAGGAAGCATTAATTA 38267109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      414 TGGCTCTAGGGATTTCAGCAAATTCTAAATAACCATAACAGGAACAGGAAGCATTAATTA 473

 38267110 AAGACACTAGAGTCTAAGTTATAACAGAAATCCTGACATTTAAGGCCCTGGTACCATTTA 38267169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      474 AAGACACTAGAGTCTAAGTTATAACAGAAATCCTGACATTTAAGGCCCTGGTACCATTTA 533

 38267170 AATTTAAAATGGTATGACAAACAGAGAGTAATTTGATGGTCAGAAGGTTATAATGGATAC 38267229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      534 AATTTAAAATGGTATGACAAACAGAGAGTAATTTGATGGTCAGAAGGTTATAATGGATAC 593

 38267230 CTTAATACCTTTGCCAAGAAAAAGTGTCTGTCCTTGCTCTAACCCCTACCCAGGGGCTTC 38267289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
      594 CTTAATACCTTTGCCAAGAAAAAGTGTCTGTCCTTGCTCTAATCCCTACCCAGGGGCTTC 653

 38267290 AGGGGCCTCCTTCATAAAACATGGTGATGCCTAAATATTTTTGCGATATCTCATATATAA 38267349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      654 AGGGGCCTCCTTCATAAAACATGGTGATGCCTAAATATTTTTGCGATATCTCATATATAA 713

 38267350 GCTGGTCTTTTCTTTAAGAATACGAGAGATTAAACACCAACCCCCAACATTCATACACCA 38267409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      714 GCTGGTCTTTTCTTTAAGAATACGAGAGATTAAACACCAACCCCCAACATTCATACACCA 773

 38267410 ATTTTCAGATAAAACAGCTTAATATTTAAGATATATTTAGTGCAATTTGTCTATTTCTTG 38267469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      774 ATTTTCAGATAAAACAGCTTAATATTTAAGATATATTTAGTGCAATTTGTCTATTTCTTG 833

 38267470 GTTTACTGGAGGGCTGTATTTAAAGCCAAGGGACCAAGGAACATTCCACAACACACTAAA 38267529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      834 GTTTACTGGAGGGCTGTATTTAAAGCCAAGGGACCAAGGAACATTCCACAACACACTAAA 893

 38267530 GCAATTTTTCCCCAGGGAATATGCTGATTCTTTCCTAAAGGCAGAAGCCGACATTCCTGA 38267589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      894 GCAATTTTTCCCCAGGGAATATGCTGATTCTTTCCTAAAGGCAGAAGCCGACATTCCTGA 953

 38267590 CTCATTCTGCCAAACCAAGCAATGAAAAATGCTTCACCTAATTTGAAAGATAATTTGTAA 38267649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      954 CTCATTCTGCCAAACCAAGCAATGAAAAATGCTTCACCTAATTTGAAAGATAATTTGTAA 1013

 38267650 TACCAGAGACTCAACTTGTTTTGTGTATCCAATACTAGCACCCTTTCCAGAATGTTGAAA 38267709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1014 TACCAGAGACTCAACTTGTTTTGTGTATCCAATACTAGCACCCTTTCCAGAATGTTGAAA 1073

 38267710 GTACACACTGTATGATTTGTCTAATGTATATTCAAAAAAGGAATACAAATTGATCCTCAA 38267769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1074 GTACACACTGTATGATTTGTCTAATGTATATTCAAAAAAGGAATACAAATTGATCCTCAA 1133

 38267770 AGTTCAAATCTGCAGTACATACTCTGTGTTCTGCCCCCACCCGTACCTTCATGAATTCTT 38267829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1134 AGTTCAAATCTGCAGTACATACTCTGTGTTCTGCCCCCACCCGTACCTTCATGAATTCTT 1193

 38267830 TCACCTAGCACGCAGGCTGTTTTCCCTTTGCGAAATCCCATGGTACATTTATAGTATTAA 38267889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1194 TCACCTAGCACGCAGGCTGTTTTCCCTTTGCGAAATCCCATGGTACATTTATAGTATTAA 1253

 38267890 TACCACTCACTTAGAATATGCCGTATTTTGTCTAATATTGCTAGATTTTGTGTGTATAAT 38267949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1254 TACCACTCACTTAGAATATGCCGTATTTTGTCTAATATTGCTAGATTTTGTGTGTATAAT 1313

 38267950 CTTATTCCTCAAGTAAATTACAAGACAAGGACTATAATTTATACATCCTCTACAACACTT 38268009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1314 CTTATTCCTCAAGTAAATTACAAGACAAGGACTATAATTTATACATCCTCTACAACACTT 1373

 38268010 GACACTGGCTTTGATTAGGCTCTTAATAAATATTTGTTGGTTGATTAATCAGTTGACCAC 38268069
          |.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1374 GGCACTGGCTTTGAGTAGGCTCTTAATAAATATTTGTTGGTTGATTAATCAGTTGACCAC 1433

 38268070 ACTTACTAATTGCAAGGTGACATCATTTATCATTAATAAACATATATGTGGATTACAAAA 38268129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1434 ACTTACTAATTGCAAGGTGACATCATTTATCATTAATAAACATATATGTGGATTACAAAA 1493

 38268130 ATATCATGTGAATTTGCATATAATCATATTAATCCCAAATTAGCACCTGAGAGTCCAACC 38268189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1494 ATATCATGTGAATTTGCATATAATCATATTAATCCCAAATTAGCACCTGAGAGTCCAACC 1553

 38268190 ACCCTCTCCTTTAGGCCCTTTTCACTTTTATGTCTACTTTTGCCTCACTTACAATTCCAC 38268249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1554 ACCCTCTCCTTTAGGCCCTTTTCACTTTTATGTCTACTTTTGCCTCACTTACAATTCCAC 1613

 38268250 TACTTACTTGCCTTCTTTCTCTTTTCAGCTTTGTGCTGTTATTTAATATCTCACCAGTTG 38268309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1614 TACTTACTTGCCTTCTTTCTCTTTTCAGCTTTGTGCTGTTATTTAATATCTCACCAGTTG 1673

 38268310 TGTAATTTCAGCTCCCAAATTGAATAAGACGTTCCCCCCAGTGGAACCCTCACCTTGACA 38268369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1674 TGTAATTTCAGCTCCCAAATTGAATAAGACGTTCCCCCCAGTGGAACCCTCACCTTGACA 1733

 38268370 AATAGCCAAATAGTA---ATTATTCCTTTCAGGGGTTGAGCTATGGAATCATGCTTGCAA 38268426
          |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1734 AATAGCCAAATAGTAATTATTATTCCTTTCAGGGGTTGAGCTATGGAATCATGCTTGCAA 1793

 38268427 TATCCCAGGCTTGAGTGCCTAGATATTTATGCTATACTTCCCTGTGTCGGAGTTTCCATC 38268486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1794 TATCCCAGGCTTGAGTGCCTAGATATTTATGCTATACTTCCCTGTGTCGGAGTTTCCATC 1853

 38268487 TGCGATTGTATTTCAAGCCCTCTCATTTTTTTTTTCAATATGATTAAGATAATTCCTTTA 38268546
          ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1854 TGCGATTGTATTTCAAGCCCTCTCA-TTTTTTTTTCAATATGATTAAGATAATTCCTTTA 1912

 38268547 TGAAGTTGGAAACTCAGACATTCAGAAAGAAACTTGACGTTTCATATTTTTGCTAACTTG 38268606
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1913 TGAAGCTGGAAACTCAGACATTCAGAAAGAAACTTGACGTTTCATATTTTTGCTAACTTG 1972

 38268607 CTCTTCCCATTTCCTTTCCTATCATTTTAGCCAGACTGAGGGAGAATTAATTTTGCAATG 38268666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     1973 CTCTTCCCATTTCCTTTCCTATCATTTTAGCCAGACTGAGGGAGAATTAATTTTGCAACG 2032

 38268667 GTCTCTATTTTTTTTTCCAAATGTGTGACCTCCATATTAATAGGAGCCAGAGTACTCATT 38268726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2033 GTCTCTATTTTTTTTTCCAAATGTGTGACCTCCATATTAATAGGAGCCAGAGTACTCATT 2092

 38268727 CATCACATCTGGTCAGTGTGAAACTGACATTTACAGGGTGGAATGTTTCCCACTCAGGAC 38268786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2093 CATCACATCTGGTCAGTGTGAAACTGACATTTACAGGGTGGAATGTTTCCCACTCAGGAC 2152

 38268787 AAATGGGGATCATTTGTAAAACATGCCGCACCCAATCATAGGTTCCCATGGATCTCCAAC 38268846
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     2153 AAATGGGGATCATTTGTAAAACATGCCACACCCAATCATAGGTTCCCATGGATCTCCAAC 2212

 38268847 TACATTTTTAAGCAACAATATAAACCATTCCCGAAACTGAAAGGTCTTTTCAAATATTTA 38268906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2213 TACATTTTTAAGCAACAATATAAACCATTCCCGAAACTGAAAGGTCTTTTCAAATATTTA 2272

 38268907 CTGCCTACCTATGGAATTTTTATTCTGCTTGCTGCTGCCATCAATAATCCTGGGAGTTCC 38268966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2273 CTGCCTACCTATGGAATTTTTATTCTGCTTGCTGCTGCCATCAATAATCCTGGGAGTTCC 2332

 38268967 TAGCTAAGTGTTGTGTATGACCTCCAAGGAAAGTCTTAGCATTGCAGAATGGGGAGGCGG 38269026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2333 TAGCTAAGTGTTGTGTATGACCTCCAAGGAAAGTCTTAGCATTGCAGAATGGGGAGGCGG 2392

 38269027 GTTAGTATCCTGCATTTTTCATTCTGTCACTTTCTAGGGACAATTACAAAGAAAATAATC 38269086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2393 GTTAGTATCCTGCATTTTTCATTCTGTCACTTTCTAGGGACAATTACAAAGAAAATAATC 2452

 38269087 ATATAAGACTTATTTTTATGTTTATTATGAAAGCCTTCAGCTCTTGCATTTGCAAGTAAG 38269146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2453 ATATAAGACTTATTTTTATGTTTATTATGAAAGCCTTCAGCTCTTGCATTTGCAAGTAAG 2512

 38269147 CTCAATGATTTTAAGTTTGCTTTTTCCCCCATGAAATGAAATATTATTTCCCACTTCTTC 38269206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2513 CTCAATGATTTTAAGTTTGCTTTTTCCCCCATGAAATGAAATATTATTTCCCACTTCTTC 2572

 38269207 CATGAATCTATTGGGTAACTCCAGGCCACTGTGATCTTTCATCTGGCATTTTGCTTTTAT 38269266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2573 CATGAATCTATTGGGTAACTCCAGGCCACTGTGATCTTTCATCTGGCATTTTGCTTTTAT 2632

 38269267 TTTTCTAGATCACAGTTGTGATTTAAAGCCCTCCTGGCACTTGGACACCTTGGTGATCTT 38269326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2633 TTTTCTAGATCACAGTTGTGATTTAAAGCCCTCCTGGCACTTGGACACCTTGGTGATCTT 2692

 38269327 AGCTCATGCTCCTAGTTCCATAGTGATGAATTGACCAAACTTTTTCCCAAGGATATCTGC 38269386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2693 AGCTCATGCTCCTAGTTCCATAGTGATGAATTGACCAAACTTTTTCCCAAGGATATCTGC 2752

 38269387 TAATTCTGGAGTTTCTGCTTTCTTATTATCTGTTCTGTCTTTTGGTTCTGTATTGATATA 38269446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2753 TAATTCTGGAGTTTCTGCTTTCTTATTATCTGTTCTGTCTTTTGGTTCTGTATTGATATA 2812

 38269447 ACAAGCTTTGTCCCCTTATCAATGAGGGCACAAAATGCAGCACTTCAAATAATTTCTGCA 38269506
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||
     2813 ACAAGCTTTGTCCCCTTATCAATGAGGGCACAAAATGAAGCACTTCAAATAGTTTCTGCA 2872

 38269507 AAAATTTACAGTTGCTGCATTAAGAATTTTGTGAGCTTCAATAATGTTATTGAAAAGTTG 38269566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2873 AAAATTTACAGTTGCTGCATTAAGAATTTTGTGAGCTTCAATAATGTTATTGAAAAGTTG 2932

 38269567 CAGATTCCCTCCTCCTTCTTTTTCTCCTTTCCTCCTCTTTCTGCCCTGTCTCCCCTTCAT 38269626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2933 CAGATTCCCTCCTCCTTCTTTTTCTCCTTTCCTCCTCTTTCTGCCCTGTCTCCCCTTCAT 2992

 38269627 TATTCTCCTCTTCTTCTCAAAAGCAAACAATCATTTTTCTTGCCTACTGAAGAATACTTG 38269686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2993 TATTCTCCTCTTCTTCTCAAAAGCAAACAATCATTTTTCTTGCCTACTGAAGAATACTTG 3052

 38269687 TAATGTTATTCTCAAAACCTGGACACCAGCTCAACTCCTTCTTTGTTCTACAAGTATTCA 38269746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3053 TAATGTTATTCTCAAAACCTGGACACCAGCTCAACTCCTTCTTTGTTCTACAAGTATTCA 3112

 38269747 CCCACCCTAATAGGGAGTTTATTCCAATGAAAAGACTGTGTTCCTCCTCAGAGGAATTTA 38269806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3113 CCCACCCTAATAGGGAGTTTATTCCAATGAAAAGACTGTGTTCCTCCTCAGAGGAATTTA 3172

 38269807 TGAGGTGGTAAGAGAGTAGAATTGCATTAATCTTATGCCAT 38269847
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3173 TGAGGTGGTAAGAGAGTAGAATTGCATTAATCTTATGCCAT 3213

Alignment time is 3.11818 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38249892,38276749] =>     26858 nucs '18 dna:chromosome chromosome:GRCh37:18:1:78077248:1'
Second seq [       1,    4008] =>      4008 nucs 'mol-32-2081-043085_4008'

Score:        3825
Aligned:      4017        nucs
Identic:      3993 ( 99%) nucs =>      2667 ( 99%)      1326 (100%)
Gaps:           14 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38263562,38266242] EXCISED REGION [38266251,38267581]
 second seq =>  [       1,    2677] EXCISED REGION [    2678,    4008]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         8 nucs [38266243,38266250]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         8 nucs [38266243,38266250] to [38266251,38266258]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [38266242,38266242] to [38266251,38266251]
 second seq =>         1 nucs [2677,2677] to [2678,2678]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 38263562 CTTTAATTTCAGTAGTTATATAAATCCTCATATTCTTTCTTTCTGTTTTCAGTTTTATCA 38263621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTTTAATTTCAGTAGTTATATAAATCCTCATATTCTTTCTTTCTGTTTTCAGTTTTATCA 60

 38263622 GTTCTATATTTTAGGAAATTATTTCAACTGAATTTTCAAACATATTATTTATAACATCAT 38263681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTTCTATATTTTAGGAAATTATTTCAACTGAATTTTCAAACATATTATTTATAACATCAT 120

 38263682 ATTATAATCTTCCTAATATCAGAGAGATCTGTAATTATGTCTCCTTTTCATCTGTACTGT 38263741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATTATAATCTTCCTAATATCAGAGAGATCTGTAATTATGTCTCCTTTTCATCTGTACTGT 180

 38263742 CGTTGATTTGTCCTATTTTTTTCTTTTTCTTCATCAGAAACACTAAAGAATTTTTTATTT 38263801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CGTTGATTTGTCCTATTTTTTTCTTTTTCTTCATCAGAAACACTAAAGAATTTTTTATTT 240

 38263802 TATTAGATTTTCTAAAAGTTAAGATCTTATTGATTTTGACTAGTATATAAGTCCTTTATT 38263861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TATTAGATTTTCTAAAAGTTAAGATCTTATTGATTTTGACTAGTATATAAGTCCTTTATT 300

 38263862 TTGTTAATTTCTAGTTGTATTTTTATTATTTCCTTCCTAGTTCTTCTTTTTATTTAATCG 38263921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTGTTAATTTCTAGTTGTATTTTTATTATTTCCTTCCTAGTTCTTCTTTTTATTTAATCG 360

 38263922 TTCTTAAGATGGATACTTAAGTAATTGATTTTCATCTTCTAAGCTTTATTAGTATGTTTA 38263981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTCTTAAGATGGATACTTAAGTAATTGATTTTCATCTTCTAAGCTTTATTAGTATGTTTA 420

 38263982 TTTAAAGCAATACATTTCCATATTACCATGACCTTAGCTGCAGTGTATGTATTTTGGTGT 38264041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTTAAAGCAATACATTTCCATATTACCATGACCTTAGCTGCAGTGTATGTATTTTGGTGT 480

 38264042 ACAGTATTTTCTTTATTTTTCAATTAAAATTTGTCTTGACTTCCTCTATGATGTCTTCTA 38264101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACAGTATTTTCTTTATTTTTCAATTAAAATTTGTCTTGACTTCCTCTATGATGTCTTCTA 540

 38264102 TGATTCTTCCTCTATAATTCTTCTTTTGACCATATAGAAGTGTATTCATTAATTCAATCA 38264161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGATTCTTCCTCTATAATTCTTCTTTTGACCATATAGAAGTGTATTCATTAATTCAATCA 600

 38264162 CATATAAATATTCTCCTTTTATCTTTTTGCTACTGGTTTGTTTGTTTAGCTACATTTAGG 38264221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CATATAAATATTCTCCTTTTATCTTTTTGCTACTGGTTTGTTTGTTTAGCTACATTTAGG 660

 38264222 GAAAATTTCATTTCTGAGACGACAGAGGAAGCACATTCCATTTTATTCCTTCTGCTAATG 38264281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GAAAATTTCATTTCTGAGACGACAGAGGAAGCACATTCCATTTTATTCCTTCTGCTAATG 720

 38264282 ACAAAAAAAAAAAAAAATTGGAAAAAACACAAAAGCCAGAGTCAAAAGACTCTGAAAAAT 38264341
          |||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ACAAAAAAAAAAA----TTGGAAAAAACACAAAAGCCAGAGTCAAAAGACTCTGAAAAAT 776

 38264342 GGAGAAAAAGTGCAGACAGGCTAAGGATTTGGGAGATTGAGGAACAACGACAGGTGAGTT 38264401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      777 GGAGAAAAAGTGCAGACAGGCTAAGGATTTGGGAGATTGAGGAACAACGACAGGTGAGTT 836

 38264402 CTCTGTCTTTTTTTTT-CTTTCTTTTTTGATATATATATATATATCAACAATCTCAATGT 38264460
          |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||
      837 CTCTGTCTTTTTTTTTTCTTTCTTTTTTGATATATATATAT----CAACAATCTCAATGT 892

 38264461 TTAAGAGAAGCCCTCAAGCCAGAATTTCCAACAGTTGCAGATAAAACATTGTGCTTGCTT 38264520
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      893 TTAAGAGAAGCCCTCAATCCAGAATTTCCAACAGTTGCAGATAAAACATTGTGCTTGCTT 952

 38264521 AACGTATTTAACCAAAAGACCCGAAAAGCAAGGATATAAAAGAATATTTTAATAATATCA 38264580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      953 AACGTATTTAACCAAAAGACCCGAAAAGCAAGGATATAAAAGAATATTTTAATAATATCA 1012

 38264581 TTCTGTTCTTAAGGTGAACACTTCAAAGAAACCACACCCCTCCCCTCCCCAATGCGTGCT 38264640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1013 TTCTGTTCTTAAGGTGAACACTTCAAAGAAACCACACCCCTCCCCTCCCCAATGCGTGCT 1072

 38264641 GAAGCAGTGGAATCCATGAGTGGAACCTTGTCATATATAATCTCCACACTAAATTTATAG 38264700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1073 GAAGCAGTGGAATCCATGAGTGGAACCTTGTCATATATAATCTCCACACTAAATTTATAG 1132

 38264701 CAAAGCCCCCATCTCTCAACCTGTGTTGAAATTCTGACTTCCAGACACACCTTTCAGTAA 38264760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1133 CAAAGCCCCCATCTCTCAACCTGTGTTGAAATTCTGACTTCCAGACACACCTTTCAGTAA 1192

 38264761 TGAGGAGGTACTCTTCCATGATAAACCCTGTGGGCAAAGCTTCCACATTCATCCCACCCC 38264820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1193 TGAGGAGGTACTCTTCCATGATAAACCCTGTGGGCAAAGCTTCCACATTCATCCCACCCC 1252

 38264821 TAAAGCAATAAATTTGCACCTTTCCCAAGTAGAATCAATGGGAAGAATTTTGACTTCTAT 38264880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1253 TAAAGCAATAAATTTGCACCTTTCCCAAGTAGAATCAATGGGAAGAATTTTGACTTCTAT 1312

 38264881 CCCCACCTGATGGTAATGAGGCAGTATCTCTCTCTTTTTCCAGACAGTGTTTAAGAATTT 38264940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1313 CCCCACCTGATGGTAATGAGGCAGTATCTCTCTCTTTTTCCAGACAGTGTTTAAGAATTT 1372

 38264941 GTTGTATAGAGCGCTATTACCTGAATAACACATTGTGGCAGAGCAAAATAACCCTTAAGC 38265000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1373 GTTGTATAGAGCGCTATTACCTGAATAACACATTGTGGCAGAGCAAAATAACCCTTAAGC 1432

 38265001 ATTTAGTTTTCAGATTTATTTTCAACTATTTAGAGGGTTATTTCTTGACTACCACAGATA 38265060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1433 ATTTAGTTTTCAGATTTATTTTCAACTATTTAGAGGGTTATTTCTTGACTACCACAGATA 1492

 38265061 AGTCATTCCCTTCTCCATTGTTCTATAGTTTACTGCCCTTTTTTTCTATCATGGCATTTA 38265120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1493 AGTCATTCCCTTCTCCATTGTTCTATAGTTTACTGCCCTTTTTTTCTATCATGGCATTTA 1552

 38265121 CCCACTATTTCATATTGTTATTTATAGTTTACATGCTTAATATCTCCATCTCCCAACAAA 38265180
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1553 CCCACTATTTCATATTGTTATTTTTAGTTTACATGCTTAATATCTCCATCTCCCAACAAA 1612

 38265181 TATGGGAACATCATTAGGTCAGAGAAATTTTATTTCTTTTCCCTCTGAAGTCTCAGTATT 38265240
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.|
     1613 TATGGGAACATCATTAGGTCAGAGAAATTTTATTTCTTTCCCCTCTGAAGTCTCAGTACT 1672

 38265241 AGTTGTTACATTAATTAGCACTTATTTAAATTTTTAGTTTTCTTTTTCTTTGCCTCATGT 38265300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1673 AGTTGTTACATTAATTAGCACTTATTTAAATTTTTAGTTTTCTTTTTCTTTGCCTCATGT 1732

 38265301 TACTGTTACACCCTTCCACTACCAAGCTTAAAGTTAGGAATGATTCATGTGACTGGAATT 38265360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1733 TACTGTTACACCCTTCCACTACCAAGCTTAAAGTTAGGAATGATTCATGTGACTGGAATT 1792

 38265361 GAATGACTGCTCTGAGAAAGAAGTCCATAAAAGTCTGCATGCAATTTGCCATGTCTCCAT 38265420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1793 GAATGACTGCTCTGAGAAAGAAGTCCATAAAAGTCTGCATGCAATTTGCCATGTCTCCAT 1852

 38265421 CCTTTCTTTGCCATAGAAACTAAAGATCTTCCAGATAGTCGAGGCTCTGTTAATGTTATT 38265480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1853 CCTTTCTTTGCCATAGAAACTAAAGATCTTCCAGATAGTCGAGGCTCTGTTAATGTTATT 1912

 38265481 TCTTGAATAACGACTATCTGAACAGAACATCTGTGACTTGGAATGGGGACATGTAGCTTG 38265540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1913 TCTTGAATAACGACTATCTGAACAGAACATCTGTGACTTGGAATGGGGACATGTAGCTTG 1972

 38265541 GAGAAAAAGTAAGCACACAGTGTTTTAAGTTACTGTGGTTTTATGGTTATTTGTTACTGC 38265600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1973 GAGAAAAAGTAAGCACACAGTGTTTTAAGTTACTGTGGTTTTATGGTTATTTGTTACTGC 2032

 38265601 AGCATAACCCACCCTGCCCTGACTTAAGTGATATAATATTTAACAAATATTTATAAAATA 38265660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2033 AGCATAACCCACCCTGCCCTGACTTAAGTGATATAATATTTAACAAATATTTATAAAATA 2092

 38265661 AATAAATTCAAATTCACTCTAATACCTAGAAAATTATCAAGTATAGTAAACCAAATAATA 38265720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2093 AATAAATTCAAATTCACTCTAATACCTAGAAAATTATCAAGTATAGTAAACCAAATAATA 2152

 38265721 AATATTTATTAAGGAATATGGAAACAGTGACCTATGAGAAGTCTTGATATACTGACCATC 38265780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2153 AATATTTATTAAGGAATATGGAAACAGTGACCTATGAGAAGTCTTGATATACTGACCATC 2212

 38265781 CATTGTTGCAGCAGATCTCACTATTGCTATTGTGCTTAACATTTCAATTACAAAAATTAA 38265840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2213 CATTGTTGCAGCAGATCTCACTATTGCTATTGTGCTTAACATTTCAATTACAAAAATTAA 2272

 38265841 AAAAAAAAAA-CACCATTCATCAGTGCAGGTCTGTGTATTTAAAGAAATAATTTACAAGT 38265899
          |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2273 AAAAAAAAAAACACCATTCATCAGTGCAGGTCTGTGTATTTAAAGAAATAATTTACAAGT 2332

 38265900 TTTTTTTTCCTTTGTAAACATATTGTTTTGAAGTGCAAATATATATAATTTGCACTTTGG 38265959
          ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2333 TTTTTTT-CCTTTGTAAACATATTGTTTTGAAGTGCAAATATATATAATTTGCACTTTGG 2391

 38265960 GATGGAATGGAATGGGATGCCCTATTGGCAGTCCATACATCTGGATTATAAATGGATTTC 38266019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2392 GATGGAATGGAATGGGATGCCCTATTGGCAGTCCATACATCTGGATTATAAATGGATTTC 2451

 38266020 CATCCCATCTTCCTCCCCATCTCTTTCCCTTTTTGATCATTCTATGGAAATGGAAAGCTA 38266079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2452 CATCCCATCTTCCTCCCCATCTCTTTCCCTTTTTGATCATTCTATGGAAATGGAAAGCTA 2511

 38266080 GCAGAAGTTTGAAGAATTGTCACGCAAACAACAACAACAA---AACTTTAGCATATTAAC 38266136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||
     2512 GCAGAAGTTTGAAGAATTGTCACGCAAACAACAACAACAACAAAACTTTAGCATATTAAC 2571

 38266137 CTGTTGTCCAACCTTATATAAGCAGTTTGTATTTAAAACATCCCTAAGTGGATTTTAATT 38266196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2572 CTGTTGTCCAACCTTATATAAGCAGTTTGTATTTAAAACATCCCTAAGTGGATTTTAATT 2631

 38266197 CCAGTTTCAATCATTGTTAACTATTTTTGAAATATTTAAAATCCCA 38266242
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2632 CCAATTTCAATCATTGTTAACTATTTTTGAAATATTTAAAATCCCA 2677

EXCISED REGION

 38266251 ACCACTATTTCTCTTCAACTAGTCCTTACTTTTATAAACAAAAAAGTAACAGTAAATAAT 38266310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2678 ACCACTATTTCTCTTCAACTAGTCCTTACTTTTATAAACAAAAAAGTAACAGTAAATAAT 2737

 38266311 TTATAACTAGGTCTCTCTGAATCTAAAAACACGTTCTTATACACTATGTGATGCCATATT 38266370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     2738 TTATAACTAGGTCTCTCTGAATCTAAAAACACATTCTTATACACTATGTGATGCCATATT 2797

 38266371 TTTTACTCTTGTCTTTGTGAGTTTTTTGTGCCATTCTCTCCTCTGGAATGGTCTTCTGTG 38266430
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2798 TTTTACTCTTGACTTTGTGAGTTTTTTGTGCCATTCTCTCCTCTGGAATGGTCTTCTGTG 2857

 38266431 CTTACACATTCCAAGGGCTACTCCATTTTACAAGAAACAGTTCATGTTTGCTACTTTGGG 38266490
          .|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2858 TTTACACATTCCAAGGGCTAATCCATTTTACAAGAAACAGTTCATGTTTGCTACTTTGGG 2917

 38266491 GTTGATCCCATGATAATTCTGGTTCTCACTTGGTCTTTCCCTGTGAGATGCAGTAGCATT 38266550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2918 GTTGATCCCATGATAATTCTGGTTCTCACTTGGTCTTTCCCTGTGAGATGCAGTAGCATT 2977

 38266551 CAAAATTCTCAGACTATTCTATGCACCTTGGCAGATTTATGGTAATGGTCTATAATTGCT 38266610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2978 CAAAATTCTCAGACTATTCTATGCACCTTGGCAGATTTATGGTAATGGTCTATAATTGCT 3037

 38266611 TCATATCTGCTAACCTTGCTTCCAAAACTAGTTTTTGAGATTAATGAGACAGGAGCTTGG 38266670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3038 TCATATCTGCTAACCTTGCTTCCAAAACTAGTTTTTGAGATTAATGAGACAGGAGCTTGG 3097

 38266671 CTTTTTCTTTCTGTATAGCTTCCATAGCAACAAGAAAATATTAGACACACAGTAGGCATT 38266730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3098 CTTTTTCTTTCTGTATAGCTTCCATAGCAACAAGAAAATATTAGACACACAGTAGGCATT 3157

 38266731 GGAAGAAAATGTGTTCAGTTAAATGAACTTGATTTGAATGGAATGAGAGTTCAATGAAAC 38266790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3158 GGAAGAAAATGTGTTCAGTTAAATGAACTTGATTTGAATGGAATGAGAGTTCAATGAAAC 3217

 38266791 TGTATATATTGTGAAACGTGGCAACTTACACCTACTCAAGACATTAAAAGAGATCATGCT 38266850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3218 TGTATATATTGTGAAACGTGGCAACTTACACCTACTCAAGACATTAAAAGAGATCATGCT 3277

 38266851 TTCTTGCCTAAGTTTTATGTCCAATTTGTTCCTGTTTCAAACCCCTCGACAAAAACAAAA 38266910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3278 TTCTTGCCTAAGTTTTATGTCCAATTTGTTCCTGTTTCAAACCCCTCGACAAAAACAAAA 3337

 38266911 TCTTTTAATCTGTTTGCAAAATATTTCCTCCTTCCTCCCATCTTGCTGTTGCTGCTCTGT 38266970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3338 TCTTTTAATCTGTTTGCAAAATATTTCCTCCTTCCTCCCATCTTGCTGTTGCTGCTCTGT 3397

 38266971 GATATACTGCCCTTGCTTATTACCCCTTTATAGCTGTTTTGTTAAAGTTCATACCGCTAA 38267030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3398 GATATACTGCCCTTGCTTATTACCCCTTTATAGCTGTTTTGTTAAAGTTCATACCGCTAA 3457

 38267031 GACCTGTAAAAGAAATTTATGGCTCTAGGGATTTCAGCAAATTCTAAATAACCATAACAG 38267090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3458 GACCTGTAAAAGAAATTTATGGCTCTAGGGATTTCAGCAAATTCTAAATAACCATAACAG 3517

 38267091 GAACAGGAAGCATTAATTAAAGACACTAGAGTCTAAGTTATAACAGAAATCCTGACATTT 38267150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3518 GAACAGGAAGCATTAATTAAAGACACTAGAGTCTAAGTTATAACAGAAATCCTGACATTT 3577

 38267151 AAGGCCCTGGTACCATTTAAATTTAAAATGGTATGACAAACAGAGAGTAATTTGATGGTC 38267210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3578 AAGGCCCTGGTACCATTTAAATTTAAAATGGTATGACAAACAGAGAGTAATTTGATGGTC 3637

 38267211 AGAAGGTTATAATGGATACCTTAATACCTTTGCCAAGAAAAAGTGTCTGTCCTTGCTCTA 38267270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3638 AGAAGGTTATAATGGATACCTTAATACCTTTGCCAAGAAAAAGTGTCTGTCCTTGCTCTA 3697

 38267271 ACCCCTACCCAGGGGCTTCAGGGGCCTCCTTCATAAAACATGGTGATGCCTAAATATTTT 38267330
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3698 ATCCCTACCCAGGGGCTTCAGGGGCCTCCTTCATAAAACATGGTGATGCCTAAATATTTT 3757

 38267331 TGCGATATCTCATATATAAGCTGGTCTTTTCTTTAAGAATACGAGAGATTAAACACCAAC 38267390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3758 TGCGATATCTCATATATAAGCTGGTCTTTTCTTTAAGAATACGAGAGATTAAACACCAAC 3817

 38267391 CCCCAACATTCATACACCAATTTTCAGATAAAACAGCTTAATATTTAAGATATATTTAGT 38267450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3818 CCCCAACATTCATACACCAATTTTCAGATAAAACAGCTTAATATTTAAGATATATTTAGT 3877

 38267451 GCAATTTGTCTATTTCTTGGTTTACTGGAGGGCTGTATTTAAAGCCAAGGGACCAAGGAA 38267510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3878 GCAATTTGTCTATTTCTTGGTTTACTGGAGGGCTGTATTTAAAGCCAAGGGACCAAGGAA 3937

 38267511 CATTCCACAACACACTAAAGCAATTTTTCCCCAGGGAATATGCTGATTCTTTCCTAAAGG 38267570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3938 CATTCCACAACACACTAAAGCAATTTTTCCCCAGGGAATATGCTGATTCTTTCCTAAAGG 3997

 38267571 CAGAAGCCGAC 38267581
          |||||||||||
     3998 CAGAAGCCGAC 4008

Alignment time is 3.88817 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38249892,38276749] =>     26858 nucs '18 dna:chromosome chromosome:GRCh37:18:1:78077248:1'
Second seq [       1,    3345] =>      3345 nucs 'mol-32-22b2-056161_3345'

Score:        3199
Aligned:      3346        nucs
Identic:      3331 (100%) nucs =>      1797 ( 99%)      1534 (100%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38264440,38266242] EXCISED REGION [38266251,38267789]
 second seq =>  [       1,    1806] EXCISED REGION [    1807,    3345]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         8 nucs [38266243,38266250]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         8 nucs [38266243,38266250] to [38266251,38266258]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [38266242,38266242] to [38266251,38266251]
 second seq =>         1 nucs [1806,1806] to [1807,1807]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 38264440 ATATATCAACAATCTCAATGTTTAAGAGAAGCCCTCAAGCCAGAATTTCCAACAGTTGCA 38264499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
        1 ATATATCAACAATCTCAATGTTTAAGAGAAGCCCTCAATCCAGAATTTCCAACAGTTGCA 60

 38264500 GATAAAACATTGTGCTTGCTTAACGTATTTAACCAAAAGACCCGAAAAGCAAGGATATAA 38264559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GATAAAACATTGTGCTTGCTTAACGTATTTAACCAAAAGACCCGAAAAGCAAGGATATAA 120

 38264560 AAGAATATTTTAATAATATCATTCTGTTCTTAAGGTGAACACTTCAAAGAAACCACACCC 38264619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAGAATATTTTAATAATATCATTCTGTTCTTAAGGTGAACACTTCAAAGAAACCACACCC 180

 38264620 CTCCCCTCCCCAATGCGTGCTGAAGCAGTGGAATCCATGAGTGGAACCTTGTCATATATA 38264679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTCCCCTCCCCAATGCGTGCTGAAGCAGTGGAATCCATGAGTGGAACCTTGTCATATATA 240

 38264680 ATCTCCACACTAAATTTATAGCAAAGCCCCCATCTCTCAACCTGTGTTGAAATTCTGACT 38264739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATCTCCACACTAAATTTATAGCAAAGCCCCCATCTCTCAACCTGTGTTGAAATTCTGACT 300

 38264740 TCCAGACACACCTTTCAGTAATGAGGAGGTACTCTTCCATGATAAACCCTGTGGGCAAAG 38264799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCCAGACACACCTTTCAGTAATGAGGAGGTACTCTTCCATGATAAACCCTGTGGGCAAAG 360

 38264800 CTTCCACATTCATCCCACCCCTAAAGCAATAAATTTGCACCTTTCCCAAGTAGAATCAAT 38264859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTTCCACATTCATCCCACCCCTAAAGCAATAAATTTGCACCTTTCCCAAGTAGAATCAAT 420

 38264860 GGGAAGAATTTTGACTTCTATCCCCACCTGATGGTAATGAGGCAGTATCTCTCTCTTTTT 38264919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGGAAGAATTTTGACTTCTATCCCCACCTGATGGTAATGAGGCAGTATCTCTCTCTTTTT 480

 38264920 CCAGACAGTGTTTAAGAATTTGTTGTATAGAGCGCTATTACCTGAATAACACATTGTGGC 38264979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCAGACAGTGTTTAAGAATTTGTTGTATAGAGCGCTATTACCTGAATAACACATTGTGGC 540

 38264980 AGAGCAAAATAACCCTTAAGCATTTAGTTTTCAGATTTATTTTCAACTATTTAGAGGGTT 38265039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGAGCAAAATAACCCTTAAGCATTTAGTTTTCAGATTTATTTTCAACTATTTAGAGGGTT 600

 38265040 ATTTCTTGACTACCACAGATAAGTCATTCCCTTCTCCATTGTTCTATAGTTTACTGCCCT 38265099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATTTCTTGACTACCACAGATAAGTCATTCCCTTCTCCATTGTTCTATAGTTTACTGCCCT 660

 38265100 TTTTTTCTATCATGGCATTTACCCACTATTTCATATTGTTATTTATAGTTTACATGCTTA 38265159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
      661 TTTTTTCTATCATGGCATTTACCCACTATTTCATATTGTTATTTTTAGTTTACATGCTTA 720

 38265160 ATATCTCCATCTCCCAACAAATATGGGAACATCATTAGGTCAGAGAAATTTTATTTCTTT 38265219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATATCTCCATCTCCCAACAAATATGGGAACATCATTAGGTCAGAGAAATTTTATTTCTTT 780

 38265220 TCCCTCTGAAGTCTCAGTATTAGTTGTTACATTAATTAGCACTTATTTAAATTTTTAGTT 38265279
          .||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CCCCTCTGAAGTCTCAGTACTAGTTGTTACATTAATTAGCACTTATTTAAATTTTTAGTT 840

 38265280 TTCTTTTTCTTTGCCTCATGTTACTGTTACACCCTTCCACTACCAAGCTTAAAGTTAGGA 38265339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTCTTTTTCTTTGCCTCATGTTACTGTTACACCCTTCCACTACCAAGCTTAAAGTTAGGA 900

 38265340 ATGATTCATGTGACTGGAATTGAATGACTGCTCTGAGAAAGAAGTCCATAAAAGTCTGCA 38265399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATGATTCATGTGACTGGAATTGAATGACTGCTCTGAGAAAGAAGTCCATAAAAGTCTGCA 960

 38265400 TGCAATTTGCCATGTCTCCATCCTTTCTTTGCCATAGAAACTAAAGATCTTCCAGATAGT 38265459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGCAATTTGCCATGTCTCCATCCTTTCTTTGCCATAGAAACTAAAGATCTTCCAGATAGT 1020

 38265460 CGAGGCTCTGTTAATGTTATTTCTTGAATAACGACTATCTGAACAGAACATCTGTGACTT 38265519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CGAGGCTCTGTTAATGTTATTTCTTGAATAACGACTATCTGAACAGAACATCTGTGACTT 1080

 38265520 GGAATGGGGACATGTAGCTTGGAGAAAAAGTAAGCACACAGTGTTTTAAGTTACTGTGGT 38265579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GGAATGGGGACATGTAGCTTGGAGAAAAAGTAAGCACACAGTGTTTTAAGTTACTGTGGT 1140

 38265580 TTTATGGTTATTTGTTACTGCAGCATAACCCACCCTGCCCTGACTTAAGTGATATAATAT 38265639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTTATGGTTATTTGTTACTGCAGCATAACCCACCCTGCCCTGACTTAAGTGATATAATAT 1200

 38265640 TTAACAAATATTTATAAAATAAATAAATTCAAATTCACTCTAATACCTAGAAAATTATCA 38265699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTAACAAATATTTATAAAATAAATAAATTCAAATTCACTCTAATACCTAGAAAATTATCA 1260

 38265700 AGTATAGTAAACCAAATAATAAATATTTATTAAGGAATATGGAAACAGTGACCTATGAGA 38265759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AGTATAGTAAACCAAATAATAAATATTTATTAAGGAATATGGAAACAGTGACCTATGAGA 1320

 38265760 AGTCTTGATATACTGACCATCCATTGTTGCAGCAGATCTCACTATTGCTATTGTGCTTAA 38265819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AGTCTTGATATACTGACCATCCATTGTTGCAGCAGATCTCACTATTGCTATTGTGCTTAA 1380

 38265820 CATTTCAATTACAAAAATTAAAAAAAAAAAA-CACCATTCATCAGTGCAGGTCTGTGTAT 38265878
          ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CATTTCAATTACAAAAATTAAAAAAAAAAAAACACCATTCATCAGTGCAGGTCTGTGTAT 1440

 38265879 TTAAAGAAATAATTTACAAGTTTTTTTTTCCTTTGTAAACATATTGTTTTGAAGTGCAAA 38265938
          |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTAAAGAAATAATTTACAAGTTTTTTTT-CCTTTGTAAACATATTGTTTTGAAGTGCAAA 1499

 38265939 TATATATAATTTGCACTTTGGGATGGAATGGAATGGGATGCCCTATTGGCAGTCCATACA 38265998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 TATATATAATTTGCACTTTGGGATGGAATGGAATGGGATGCCCTATTGGCAGTCCATACA 1559

 38265999 TCTGGATTATAAATGGATTTCCATCCCATCTTCCTCCCCATCTCTTTCCCTTTTTGATCA 38266058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 TCTGGATTATAAATGGATTTCCATCCCATCTTCCTCCCCATCTCTTTCCCTTTTTGATCA 1619

 38266059 TTCTATGGAAATGGAAAGCTAGCAGAAGTTTGAAGAATTGTCACGCAAACAACAACAACA 38266118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 TTCTATGGAAATGGAAAGCTAGCAGAAGTTTGAAGAATTGTCACGCAAACAACAACAACA 1679

 38266119 A---AACTTTAGCATATTAACCTGTTGTCCAACCTTATATAAGCAGTTTGTATTTAAAAC 38266175
          |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 ACAAAACTTTAGCATATTAACCTGTTGTCCAACCTTATATAAGCAGTTTGTATTTAAAAC 1739

 38266176 ATCCCTAAGTGGATTTTAATTCCAGTTTCAATCATTGTTAACTATTTTTGAAATATTTAA 38266235
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 ATCCCTAAGTGGATTTTAATTCCAATTTCAATCATTGTTAACTATTTTTGAAATATTTAA 1799

 38266236 AATCCCA 38266242
          |||||||
     1800 AATCCCA 1806

EXCISED REGION

 38266251 ACCACTATTTCTCTTCAACTAGTCCTTACTTTTATAAACAAAAAAGTAACAGTAAATAAT 38266310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1807 ACCACTATTTCTCTTCAACTAGTCCTTACTTTTATAAACAAAAAAGTAACAGTAAATAAT 1866

 38266311 TTATAACTAGGTCTCTCTGAATCTAAAAACACGTTCTTATACACTATGTGATGCCATATT 38266370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     1867 TTATAACTAGGTCTCTCTGAATCTAAAAACACATTCTTATACACTATGTGATGCCATATT 1926

 38266371 TTTTACTCTTGTCTTTGTGAGTTTTTTGTGCCATTCTCTCCTCTGGAATGGTCTTCTGTG 38266430
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1927 TTTTACTCTTGACTTTGTGAGTTTTTTGTGCCATTCTCTCCTCTGGAATGGTCTTCTGTG 1986

 38266431 CTTACACATTCCAAGGGCTACTCCATTTTACAAGAAACAGTTCATGTTTGCTACTTTGGG 38266490
          .|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1987 TTTACACATTCCAAGGGCTAATCCATTTTACAAGAAACAGTTCATGTTTGCTACTTTGGG 2046

 38266491 GTTGATCCCATGATAATTCTGGTTCTCACTTGGTCTTTCCCTGTGAGATGCAGTAGCATT 38266550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2047 GTTGATCCCATGATAATTCTGGTTCTCACTTGGTCTTTCCCTGTGAGATGCAGTAGCATT 2106

 38266551 CAAAATTCTCAGACTATTCTATGCACCTTGGCAGATTTATGGTAATGGTCTATAATTGCT 38266610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2107 CAAAATTCTCAGACTATTCTATGCACCTTGGCAGATTTATGGTAATGGTCTATAATTGCT 2166

 38266611 TCATATCTGCTAACCTTGCTTCCAAAACTAGTTTTTGAGATTAATGAGACAGGAGCTTGG 38266670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2167 TCATATCTGCTAACCTTGCTTCCAAAACTAGTTTTTGAGATTAATGAGACAGGAGCTTGG 2226

 38266671 CTTTTTCTTTCTGTATAGCTTCCATAGCAACAAGAAAATATTAGACACACAGTAGGCATT 38266730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2227 CTTTTTCTTTCTGTATAGCTTCCATAGCAACAAGAAAATATTAGACACACAGTAGGCATT 2286

 38266731 GGAAGAAAATGTGTTCAGTTAAATGAACTTGATTTGAATGGAATGAGAGTTCAATGAAAC 38266790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2287 GGAAGAAAATGTGTTCAGTTAAATGAACTTGATTTGAATGGAATGAGAGTTCAATGAAAC 2346

 38266791 TGTATATATTGTGAAACGTGGCAACTTACACCTACTCAAGACATTAAAAGAGATCATGCT 38266850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2347 TGTATATATTGTGAAACGTGGCAACTTACACCTACTCAAGACATTAAAAGAGATCATGCT 2406

 38266851 TTCTTGCCTAAGTTTTATGTCCAATTTGTTCCTGTTTCAAACCCCTCGACAAAAACAAAA 38266910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2407 TTCTTGCCTAAGTTTTATGTCCAATTTGTTCCTGTTTCAAACCCCTCGACAAAAACAAAA 2466

 38266911 TCTTTTAATCTGTTTGCAAAATATTTCCTCCTTCCTCCCATCTTGCTGTTGCTGCTCTGT 38266970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2467 TCTTTTAATCTGTTTGCAAAATATTTCCTCCTTCCTCCCATCTTGCTGTTGCTGCTCTGT 2526

 38266971 GATATACTGCCCTTGCTTATTACCCCTTTATAGCTGTTTTGTTAAAGTTCATACCGCTAA 38267030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2527 GATATACTGCCCTTGCTTATTACCCCTTTATAGCTGTTTTGTTAAAGTTCATACCGCTAA 2586

 38267031 GACCTGTAAAAGAAATTTATGGCTCTAGGGATTTCAGCAAATTCTAAATAACCATAACAG 38267090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2587 GACCTGTAAAAGAAATTTATGGCTCTAGGGATTTCAGCAAATTCTAAATAACCATAACAG 2646

 38267091 GAACAGGAAGCATTAATTAAAGACACTAGAGTCTAAGTTATAACAGAAATCCTGACATTT 38267150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2647 GAACAGGAAGCATTAATTAAAGACACTAGAGTCTAAGTTATAACAGAAATCCTGACATTT 2706

 38267151 AAGGCCCTGGTACCATTTAAATTTAAAATGGTATGACAAACAGAGAGTAATTTGATGGTC 38267210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2707 AAGGCCCTGGTACCATTTAAATTTAAAATGGTATGACAAACAGAGAGTAATTTGATGGTC 2766

 38267211 AGAAGGTTATAATGGATACCTTAATACCTTTGCCAAGAAAAAGTGTCTGTCCTTGCTCTA 38267270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2767 AGAAGGTTATAATGGATACCTTAATACCTTTGCCAAGAAAAAGTGTCTGTCCTTGCTCTA 2826

 38267271 ACCCCTACCCAGGGGCTTCAGGGGCCTCCTTCATAAAACATGGTGATGCCTAAATATTTT 38267330
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2827 ATCCCTACCCAGGGGCTTCAGGGGCCTCCTTCATAAAACATGGTGATGCCTAAATATTTT 2886

 38267331 TGCGATATCTCATATATAAGCTGGTCTTTTCTTTAAGAATACGAGAGATTAAACACCAAC 38267390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2887 TGCGATATCTCATATATAAGCTGGTCTTTTCTTTAAGAATACGAGAGATTAAACACCAAC 2946

 38267391 CCCCAACATTCATACACCAATTTTCAGATAAAACAGCTTAATATTTAAGATATATTTAGT 38267450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2947 CCCCAACATTCATACACCAATTTTCAGATAAAACAGCTTAATATTTAAGATATATTTAGT 3006

 38267451 GCAATTTGTCTATTTCTTGGTTTACTGGAGGGCTGTATTTAAAGCCAAGGGACCAAGGAA 38267510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3007 GCAATTTGTCTATTTCTTGGTTTACTGGAGGGCTGTATTTAAAGCCAAGGGACCAAGGAA 3066

 38267511 CATTCCACAACACACTAAAGCAATTTTTCCCCAGGGAATATGCTGATTCTTTCCTAAAGG 38267570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3067 CATTCCACAACACACTAAAGCAATTTTTCCCCAGGGAATATGCTGATTCTTTCCTAAAGG 3126

 38267571 CAGAAGCCGACATTCCTGACTCATTCTGCCAAACCAAGCAATGAAAAATGCTTCACCTAA 38267630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3127 CAGAAGCCGACATTCCTGACTCATTCTGCCAAACCAAGCAATGAAAAATGCTTCACCTAA 3186

 38267631 TTTGAAAGATAATTTGTAATACCAGAGACTCAACTTGTTTTGTGTATCCAATACTAGCAC 38267690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3187 TTTGAAAGATAATTTGTAATACCAGAGACTCAACTTGTTTTGTGTATCCAATACTAGCAC 3246

 38267691 CCTTTCCAGAATGTTGAAAGTACACACTGTATGATTTGTCTAATGTATATTCAAAAAAGG 38267750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3247 CCTTTCCAGAATGTTGAAAGTACACACTGTATGATTTGTCTAATGTATATTCAAAAAAGG 3306

 38267751 AATACAAATTGATCCTCAAAGTTCAAATCTGCAGTACAT 38267789
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3307 AATACAAATTGATCCTCAAAGTTCAAATCTGCAGTACAT 3345

Alignment time is 3.24616 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38249892,38276749] =>     26858 nucs '18 dna:chromosome chromosome:GRCh37:18:1:78077248:1'
Second seq [       1,    7810] =>      7810 nucs 'mol-32-2874-096962_7810'

Score:        7393
Aligned:      7806        nucs
Identic:      7766 ( 99%) nucs =>      3992 (100%)      3774 ( 99%)
Gaps:            6 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38252882,38256892] EXCISED REGION [38256901,38260693]
 second seq =>  [       1,    4009] EXCISED REGION [    4018,    7810]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         8 nucs [38256893,38256900]
 second seq =>         8 nucs [4010,4017]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [38256893,38256894] to [38256901,38256902]
 second seq =>         1 nucs [4009,4009] to [4017,4017]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [4010,4011] to [4016,4017]

 38252882 GTTTGGTCTGCAAATTTCACAATCCCAGAATACTGTGCTGAAGATATGTCTACCTTGGTA 38252941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTTTGGTCTGCAAATTTCACAATCCCAGAATACTGTGCTGAAGATATGTCTACCTTGGTA 60

 38252942 AAAGTATTACCCCAGAAATACAGCTGTTGAAGCTATTTTTGTCTTAAACGGGTTAAATAT 38253001
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
       61 AAAGTAGTACCCCAGAAATACAGCTGTTGAAGCTATTTTTGTCTTAAAGGGGTTAAATAT 120

 38253002 GAAACCAGGACTTTACTGTTCTCATACAGCTCTTACCCTTTGAGCAAATACAGTATTCAT 38253061
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
      121 GAAACCAGGACTTTACTGTTCTCATACAGCTCTTACCCTTTGAGCAAGTACAGTATTCAT 180

 38253062 ACTTTCCGGAGTGACAAAAATTGAACAGAAGGTAACAGACACTTTAACTAGAAAGGCCAG 38253121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACTTTCCGGAGTGACAAAAATTGAACAGAAGGTAACAGACACTTTAACTAGAAAGGCCAG 240

 38253122 GATCGTATTTATATAGTTTCACATCACCATAGCACCTAGCACAGAGCCTCTGTGGACTAG 38253181
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 -ATCGTATTTATATAGTTTCACATCACCATAGCACCTAGCACAGAGCCTCTGTGGACTAG 299

 38253182 ACACATTAATATTTGTTAAATTTGAATGGATTGAATATAATCTGGCCTTTGTCCTCTATG 38253241
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      300 ACACATTAATATTTGTTAAATTAGAATGGATTGAATATAATCTGGCCTTTGTCCTCTATG 359

 38253242 CTGACTTTCTCATCTCCTATACCAATTATTCTGCAAATCTGTTTTTCCCTTGGTTTTAGA 38253301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      360 CTGACTTTCTCATCTCCTATACCAATTATTCTGCAAATCTGTTTTTCCCTTGGTTTTAGA 419

 38253302 AATTTGGCAGATGGCACTTTAATTTAATGTCTTTTTAAATATTCTGACTCCAACGTAAAT 38253361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      420 AATTTGGCAGATGGCACTTTAATTTAATGTCTTTTTAAATATTCTGACTCCAACGTAAAT 479

 38253362 TAAGACCATATGTGTACTGCGGTAAGATGAGACCTGGAGACATGAATCCAATTTGATTTT 38253421
          |||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      480 TAATACCATATGTGTACTGTGGTAAGATGAGACCTGGAGACATGAATCCAATTTGATTTT 539

 38253422 GCAAATGTTTATTTATCACCTACTATGTGTTAGTATCCTACCCAACATTGTCATAAAATA 38253481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      540 GCAAATGTTTATTTATCACCTACTATGTGTTAGTATCCTACCCAACATTGTCATAAAATA 599

 38253482 ATATCAAAATATTATCAATAAACAAGACAATAATTATTTCAGACCCCAACAATTCAGTAA 38253541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      600 ATATCAAAATATTATCAATAAACAAGACAATAATTATTTCAGACCCCAACAATTCAGTAA 659

 38253542 GTTACAACTTTGATTTTCAGCAGAGAACTTAATAAGAGTTTTAGAATATGAGCTACAGAA 38253601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      660 GTTACAACTTTGATTTTCAGCAGAGAACTTAATAAGAGTTTTAGAATATGAGCTACAGAA 719

 38253602 AGAAGTTTTTTTGTTTGTTCTATCAAATCTCAGAGTTAGAAGTAATCTGAGATATATGCA 38253661
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      720 AGAAATTTTTTTGTTTGTTCTATCAAATCTCAGAGTTAGAAGTAATCTGAGATATATGCA 779

 38253662 GTTCTAATTGAAACCCCATCCCACACAATCTTGAACAACGATCTTACAAATAGTGTACTG 38253721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      780 GTTCTAATTGAAACCCCATCCCACACAATCTTGAACAACGATCTTACAAATAGTGTACTG 839

 38253722 CCTACTTGAACACACCAAGATTAGAAACTTGACCAGCTTGCAGGAAACACAAATCTCTCA 38253781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 CCTACTTGAACACACCAAGATTAGAAACTTGACCAGCTTGCAGGAAACACAAATCTCTCA 899

 38253782 ATCAATATTTCTCCTCTGTAGGCTGTGTAATCTGTTCCAATCATGTGCTCTCTGTTTCAC 38253841
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
      900 ATCAATATTTCTCCTCTGTAGGTTGTGTAATCTGTTTCAATCATGTGCTCTCTGTTTCAC 959

 38253842 ATGGGAAGAAGGATAGGACTCTGTTTTTCTTCTTCCCTTCTCTAGAAGGAAACCATGAAT 38253901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 ATGGGAAGAAGGATAGGACTCTGTTTTTCTTCTTCCCTTCTCTAGAAGGAAACCATGAAT 1019

 38253902 CGTAAGAACAGGAGACAAATTAAGATCTTAGAAATGTAGTGCACAGAAGAGGCACATGCT 38253961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 CGTAAGAACAGGAGACAAATTAAGATCTTAGAAATGTAGTGCACAGAAGAGGCACATGCT 1079

 38253962 ATTACCAGTTGGCCAGAGCAGAAGGGATAATTATTTCACAAGTATCACAAGAGAACTTAG 38254021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 ATTACCAGTTGGCCAGAGCAGAAGGGATAATTATTTCACAAGTATCACAAGAGAACTTAG 1139

 38254022 GCCATGGTGAAGGTCTTTTGACTTTCCATCTGCCGCTCATTTAAAATAATTATGTACCAC 38254081
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     1140 GCCATGGTGAAGGTCTTTTGACTTTCCATCTGCTGCTCATTTAAAATAATTATGTACCAC 1199

 38254082 TTGTCAGAAAACTCTGTGCAGTTTACAGATTGAAAATAAGCATAAGAAAGTGTGGAAACC 38254141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 TTGTCAGAAAACTCTGTGCAGTTTACAGATTGAAAATAAGCATAAGAAAGTGTGGAAACC 1259

 38254142 TGGAGAAGAGACACCAACAAGGATAAAAGAGAGATTTCCATTTGGTGACTGAGGACTGGT 38254201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 TGGAGAAGAGACACCAACAAGGATAAAAGAGAGATTTCCATTTGGTGACTGAGGACTGGT 1319

 38254202 TTATGTCACAGATGTGTTCTATTTGGTCTCCAATGATGCTTTATTGTTGTTGATTTTGAG 38254261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 TTATGTCACAGATGTGTTCTATTTGGTCTCCAATGATGCTTTATTGTTGTTGATTTTGAG 1379

 38254262 GATTTATTTGCCAATATGTTAAATAGGGAAATATTTTTAGTACTCTTGAAATTCAGAAGA 38254321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     1380 GATTTATTTGCCAATATGTTAAATAGGGAAATATTTTTAGTACTGTTGAAATTCAGAAGA 1439

 38254322 TCCAGCAGCACAGAATCAGTATTTCCAGGGCATGAGCCAAGTGCAGTTGAAGGCATATAC 38254381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 TCCAGCAGCACAGAATCAGTATTTCCAGGGCATGAGCCAAGTGCAGTTGAAGGCATATAC 1499

 38254382 TCCTTGACATAGGGCTTAGAATTTCTTATTCGCCCCTAGATTACCTCCAGATTCTGTACT 38254441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 TCCTTGACATAGGGCTTAGAATTTCTTATTCGCCCCTAGATTACCTCCAGATTCTGTACT 1559

 38254442 CATTCAAGTACACTGCCTGTCCCTTAGAGGCACTGGGATTCTGTCTCTCTTGGAAAATAA 38254501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 CATTCAAGTACACTGCCTGTCCCTTAGAGGCACTGGGATTCTGTCTCTCTTGGAAAATAA 1619

 38254502 ACTCAAAAGCTATGGGAAAGGAAAAGAGGAGATAGGAGTTTAAGGGAAAAGAGTTTCTGA 38254561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 ACTCAAAAGCTATGGGAAAGGAAAAGAGGAGATAGGAGTTTAAGGGAAAAGAGTTTCTGA 1679

 38254562 GCCAATGAATGGAATGGGATGGCCACACTGGATCTCTGAGTGTGGCAAACAAAGACAGGC 38254621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 GCCAATGAATGGAATGGGATGGCCACACTGGATCTCTGAGTGTGGCAAACAAAGACAGGC 1739

 38254622 GACAAAGGGAAAAATAATGGAGCCAGAGGAAACTAGCAGAAGAGAGCAGACAAAAACCAT 38254681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 GACAAAGGGAAAAATAATGGAGCCAGAGGAAACTAGCAGAAGAGAGCAGACAAAAACCAT 1799

 38254682 ACACTGTCCCAGCAATTGCAAATAAACCAGTATTCTATGTGTACCTTTTGATTCTCAGAG 38254741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 ACACTGTCCCAGCAATTGCAAATAAACCAGTATTCTATGTGTACCTTTTGATTCTCAGAG 1859

 38254742 TGTCTGTGACTAGCTCTCAATAAGCCCATGAAGCAACAGGCTGTAACACTGGATCACACC 38254801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 TGTCTGTGACTAGCTCTCAATAAGCCCATGAAGCAACAGGCTGTAACACTGGATCACACC 1919

 38254802 AGACTTTATTATTTCCATTGTCATTTTCTATTCACTTGTATACTGAATATTGCATATATC 38254861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 AGACTTTATTATTTCCATTGTCATTTTCTATTCACTTGTATACTGAATATTGCATATATC 1979

 38254862 AACCAAAAAACTGAGGACATGATATTGTTCCCGTTATTGTGCTAACTTCTGAATATACCC 38254921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 AACCAAAAAACTGAGGACATGATATTGTTCCCGTTATTGTGCTAACTTCTGAATATACCC 2039

 38254922 TGTTCAATAAAATTAACTTAGTCCACTACTTCTCAGCCATGCTAGCTCAGCCTGGCCTGA 38254981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 TGTTCAATAAAATTAACTTAGTCCACTACTTCTCAGCCATGCTAGCTCAGCCTGGCCTGA 2099

 38254982 CCTGGTGGATTTGGTAGAAATAGTCAGTGGTGCCTGACACATGTGGTGACTCTAGCTGGC 38255041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 CCTGGTGGATTTGGTAGAAATAGTCAGTGGTGCCTGACACATGTGGTGACTCTAGCTGGC 2159

 38255042 TCCAGTCATCACTGTACTCAAGAATGACAGTGAAGGGTAAGAGATTCCTTGTTAATAGGA 38255101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 TCCAGTCATCACTGTACTCAAGAATGACAGTGAAGGGTAAGAGATTCCTTGTTAATAGGA 2219

 38255102 CAGGTAGAGCCACTGAAACATGGATAATTACTGTTTGAGGCTATTTGAGACTATAGAACA 38255161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 CAGGTAGAGCCACTGAAACATGGATAATTACTGTTTGAGGCTATTTGAGACTATAGAACA 2279

 38255162 TTTATGACATATTAAATCAAAGTATATGATGAAGGAGTTGTCTGCTTTCCTTTTATCATC 38255221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 TTTATGACATATTAAATCAAAGTATATGATGAAGGAGTTGTCTGCTTTCCTTTTATCATC 2339

 38255222 GGTAATTCTATCTGACACTGTTCCTTCCTTTTAAACAGATGTTTTAAACACCCTTTTAAT 38255281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 GGTAATTCTATCTGACACTGTTCCTTCCTTTTAAACAGATGTTTTAAACACCCTTTTAAT 2399

 38255282 AGTTCATTTCACATATTCCCAACATGCAGCCAAGTTAAGCTTTAGAATTTTTAAAGTTAT 38255341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 AGTTCATTTCACATATTCCCAACATGCAGCCAAGTTAAGCTTTAGAATTTTTAAAGTTAT 2459

 38255342 ACACATTTTGCCACATATATGTATCCACACTTGCATTCACATCTTTTTATACATTATTTT 38255401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 ACACATTTTGCCACATATATGTATCCACACTTGCATTCACATCTTTTTATACATTATTTT 2519

 38255402 GAATTATCTGGTACTCAGAGTTCCCTGAACAGTCTTGATAGAACTGGGTGCAAACAATTT 38255461
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     2520 GAATTATCTGGTACTCAGAGTTCCCTGAACAGTCTTGATAGAACTGGGTACAAACAATTT 2579

 38255462 TGAAATAAACTTTGGATGGATATGTAATCATACCAACTGGATTAAAAGTATAAGCAAAAA 38255521
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     2580 TGAAATAAACTTTGGATGGATATGTAATCATACCAACTGTATTAAAAGTATAAGCAAAAA 2639

 38255522 AAAATCAACTATTCCTCTCATGTTATTGTATCTTGCAGAAATTCATTTGCTTATTTTTTT 38255581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 AAAATCAACTATTCCTCTCATGTTATTGTATCTTGCAGAAATTCATTTGCTTATTTTTTT 2699

 38255582 ATTTATCATAGGTTTTCATTTGTATAGATATAACCACATTCCAAGGAATCATTTATACTA 38255641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 ATTTATCATAGGTTTTCATTTGTATAGATATAACCACATTCCAAGGAATCATTTATACTA 2759

 38255642 TTTGTCAGCATTTCCCCAAATAACTTTATGAATTCAAGTTTCTAAAAAGGCTGACTGACT 38255701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     2760 TTTGTCAGCATTTCCCCAAATAACTTTATGAATTCAAGTTTCTACAAAGGCTGACTGACT 2819

 38255702 TAAAAGTCAGTTAGCCTGCAGCAGGTGGATCCACTATATTGCATTATACTGTATAATCTG 38255761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2820 TAAAAGTCAGTTAGCCTGCAGCAGGTGGATCCACTATATTGCATTATACTGTATAATCTG 2879

 38255762 TGCTACGGAACCAGTTTCATTTGCTTCTTTTTCTTTAAGCCAAATTCTTTGCACATGAAA 38255821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2880 TGCTACGGAACCAGTTTCATTTGCTTCTTTTTCTTTAAGCCAAATTCTTTGCACATGAAA 2939

 38255822 GAATCCATTCTTTTCTTTGACACTTGAACTCTATAGATGGAGTAATGTAAGAGACTAGAG 38255881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2940 GAATCCATTCTTTTCTTTGACACTTGAACTCTATAGATGGAGTAATGTAAGAGACTAGAG 2999

 38255882 AATTAAAAACAGTGAATGTTGCCTAGTTTCTCTCTATATTATGGATATAACACAATGCAC 38255941
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     3000 AATTAAAAACAGTGAATGTTGCCTAGTTTCTCTATATATTATGGATATAACACAATGCAC 3059

 38255942 AGCTTTATTTCTCAAAAACATGACAATTTTAACAGAAAAATGAATATTAAAGGTAATTTT 38256001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3060 AGCTTTATTTCTCAAAAACATGACAATTTTAACAGAAAAATGAATATTAAAGGTAATTTT 3119

 38256002 CCTATTTATACACACTGTGAATAATATCAAAATATTTAATAAATAGATATTAATACAATT 38256061
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3120 CCTATTTATACACACTCTGAATAATATCAAAATATTTAATAAATAGATATTAATACAATT 3179

 38256062 CTTATAGAATTTTCATGAAAAGACAGCTATTCATAGTAGTGTTTTTTTTCCCTTAAATTT 38256121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3180 CTTATAGAATTTTCATGAAAAGACAGCTATTCATAGTAGTGTTTTTTTTCCCTTAAATTT 3239

 38256122 GTACCTAAAGTTTTTTTGAAACAATGAGAAGATGCTAGTCATGATCTTCAGAAGAGTTTT 38256181
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3240 GTACCCAAAGTTTTTTTGAAACAATGAGAAGATGCTAGTCATGATCTTCAGAAGAGTTTT 3299

 38256182 ATTTTATCCTAAGTTTATCATTAAAAAGTAATTCTTAGTAAGATAAAGTATATAATGATA 38256241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3300 ATTTTATCCTAAGTTTATCATTAAAAAGTAATTCTTAGTAAGATAAAGTATATAATGATA 3359

 38256242 TAATTAAAATTTAAAATCAGAATTATTAAATCTCAAAATTTGGAAGAATCACACCAGTCA 38256301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3360 TAATTAAAATTTAAAATCAGAATTATTAAATCTCAAAATTTGGAAGAATCACACCAGTCA 3419

 38256302 TTTAGACCAATCTCACTGCCTTTGTTTCTACCAAACACTAGTTACTATGTTTAGTATTAA 38256361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3420 TTTAGACCAATCTCACTGCCTTTGTTTCTACCAAACACTAGTTACTATGTTTAGTATTAA 3479

 38256362 TATATTCAACACCTATATGGATCCAATTTCTAGACTCTCACTTTGACATCTTCTTCTATC 38256421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3480 TATATTCAACACCTATATGGATCCAATTTCTAGACTCTCACTTTGACATCTTCTTCTATC 3539

 38256422 ATGAACATTTCTTCCACTCAGCTCCATTTATTTACTCCTATGGCCACTGCCGAAACTTTA 38256481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3540 ATGAACATTTCTTCCACTCAGCTCCATTTATTTACTCCTATGGCCACTGCCGAAACTTTA 3599

 38256482 CCAGCACCGGAAACTACATCTTAATGTCAGGGAACCAGTATCCACTTGTCTAGAATGACA 38256541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3600 CCAGCACCGGAAACTACATCTTAATGTCAGGGAACCAGTATCCACTTGTCTAGAATGACA 3659

 38256542 TCTTATCCTTGCAACTCACTTGATCTAAGATCTGCTCTGGAATTGTTTTTCAACTTATCA 38256601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3660 TCTTATCCTTGCAACTCACTTGATCTAAGATCTGCTCTGGAATTGTTTTTCAACTTATCA 3719

 38256602 AGAGCCCCAATTTACTTCTCTCTTTATATCAATCACCCCTCCACCACTCTGTTTTATCTC 38256661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3720 AGAGCCCCAATTTACTTCTCTCTTTATATCAATCACCCCTCCACCACTCTGTTTTATCTC 3779

 38256662 CATAATTATTGTCCTCATATGCTGTAGTTAGTAAATACAAACTTCAGTGTCTTTCTCTGA 38256721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3780 CATAATTATTGTCCTCATATGCTGTAGTTAGTAAATACAAACTTCAGTGTCTTTCTCTGA 3839

 38256722 AATCATTGTACTACCAGATAAAACCACACCCTTATATGCAATCAACTACTGGCTTTTTTT 38256781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3840 AATCATTGTACTACCAGATAAAACCACACCCTTATATGCAATCAACTACTGGCTTTTTTT 3899

 38256782 TTTTTTTAATCTTTGCACACATGCTCAGTGGAGACTGCTTGTGATTGTGCCTTACTGAGG 38256841
          |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3900 TTTTTT-AATCTTTGCACACATGCTCAGTGGAGACTGCTTGTGATTGTGCCTTACTGAGG 3958

 38256842 CAGATGATGATTCAGACAAGTTACTCTATTACTCATAGAACCAACTTCAAA 38256892
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3959 CAGATGATGATTCAGACAAGTTACTCTATTACTCATAGAACCAACTTCAAA 4009

EXCISED REGION

 38256901 TAACTCTACACAACAATACTATCTCACTATATTTTAAAAAATTATCCTCTCATTACCAGT 38256960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4018 TAACTCTACACAACAATACTATCTCACTATATTTTAAAAAATTATCCTCTCATTACCAGT 4077

 38256961 AATACTTTAGCATCTTCCCCACTCCCTTCAACCTCAACAACCTGGATAACTAGTATGAAG 38257020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4078 AATACTTTAGCATCTTCCCCACTCCCTTCAACCTCAACAACCTGGATAACTAGTATGAAG 4137

 38257021 GGCTTTACTGACAAAATGGAAGCCATGAAACAGAAATTCATCCTACCACCACCTTCTGTA 38257080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4138 GGCTTTACTGACAAAATGGAAGCCATGAAACAGAAATTCATCCTACCACCACCTTCTGTA 4197

 38257081 TCTCATTTCTTCTTGTTTCTCCTTTTTGCAGCAGAGAATGTGACCCTGCGGTCCCCTGAA 38257140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4198 TCTCATTTCTTCTTGTTTCTCCTTTTTGCAGCAGAGAATGTGACCCTGCGGTCCCCTGAA 4257

 38257141 GTCAGTTTCTCCAAACGTGGACTTTACTTTCTCAACACATTTGTTCCTTCAGTTATTCCC 38257200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4258 GTCAGTTTCTCCAAACGTGGACTTTACTTTCTCAACACATTTGTTCCTTCAGTTATTCCC 4317

 38257201 ACTGTAGCAACTTTGTCTCTGTCTCTCAATTAGATAATTCCTACTGACAAATAGGCTATA 38257260
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     4318 ACTGTAGCAACTTTGTCTCTGTCTCTCAACTAGATAATTCCTACTGACAAATAGGCTATA 4377

 38257261 ACACCTCACATCTTTAAAAGAATACACATTTCATGTAATTGCTGTCTGCACCAGTATCTC 38257320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4378 ACACCTCACATCTTTAAAAGAATACACATTTCATGTAATTGCTGTCTGCACCAGTATCTC 4437

 38257321 CAATTCTTTATCTCCTATTATCTTTGTCAACCCTCTCCAGCCTGCCTACTGTTCCCACTA 38257380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4438 CAATTCTTTATCTCCTATTATCTTTGTCAACCCTCTCCAGCCTGCCTACTGTTCCCACTA 4497

 38257381 CCCTACTCAATTCCTCCCGCCAAGGCATTGTTGGTCCTTACCTTTCAAAACTTTTTTTTG 38257440
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4498 CTCTACTCAATTCCTCCCGCCAAGGCATTGTTGGTCCTTACCTTTCAAAACTTTTTTTTG 4557

 38257441 TTTTTGTTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGAT 38257500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4558 TTTTTGTTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGAT 4617

 38257501 CTCTGCTTACTGCAACCTCCACCTCACCAGTTCAAGTGATTCACTAGTCTGAGCCTCCTG 38257560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4618 CTCTGCTTACTGCAACCTCCACCTCACCAGTTCAAGTGATTCACTAGTCTGAGCCTCCTG 4677

 38257561 AGTAGCTGGGACTACAGACACATGCCACCATGCCCGGCTAATTTTTGCATTTTTAGTAGA 38257620
          |||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     4678 AGTAGCTGGGACTACAGGCACATGCCACCATGCTCGGCTAATTTTTGCATTTTTAGTAGA 4737

 38257621 GACGAGGTTTCACCATGCTGGTCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCGTGATCCGCTTG 38257680
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     4738 GACGAGGTTTCACCATGCTGGTCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCGTGATCCGCCTG 4797

 38257681 CCTTGGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACCGGCGTGAGCCACTGCGCCCATAGAAAAGATT 38257740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4798 CCTTGGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACCGGCGTGAGCCACTGCGCCCATAGAAAAGATT 4857

 38257741 AGTTCTTTCTGAACTTTTAAACACCATTCAGCAGTGTTCACCATTCTCTCTAACTTAAAA 38257800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4858 AGTTCTTTCTGAACTTTTAAACACCATTCAGCAGTGTTCACCATTCTCTCTAACTTAAAA 4917

 38257801 CACTGTCCCTCATAACATATTTAAAAAATTCTATTTCTTACTGTTATTTCTCAGATTCTT 38257860
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     4918 CACTGTCCCTCATAACATATTTAAAAAATTATATTTCTTACTGTTATTTCTCAGATTCTT 4977

 38257861 GTATAGGCCACAGTTCTTTCAGTAGAACTCTAACCAATTTCCGTACATGTAAGTATCATA 38257920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     4978 GTATAGGCCACAGTTCTTTCAGTAGAACTCTAACCAATTTCCATACATGTAAGTATCATA 5037

 38257921 AATATACTAATGACTCTGAACATTATATATCTTGCCTCATGCATGAATACCCAAATGTTT 38257980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5038 AATATACTAATGACTCTGAACATTATATATCTTGCCTCATGCATGAATACCCAAATGTTT 5097

 38257981 TCCTGTAATCACAAAATGAACATCTCAAAGTGACCACAAATTTGACATGTTCCGAAGTAA 38258040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5098 TCCTGTAATCACAAAATGAACATCTCAAAGTGACCACAAATTTGACATGTTCCGAAGTAA 5157

 38258041 TTAAATTTTGATATTCTCTGCCAAAAGCTGCTCTAGAAATTTTGCCACTCCTTCTTCATC 38258100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5158 TTAAATTTTGATATTCTCTGCCAAAAGCTGCTCTAGAAATTTTGCCACTCCTTCTTCATC 5217

 38258101 TTAGAAAATGCTATTATTCTCCACCAAAGGCAAATAACCAAGAGTCATTACTAGAAAATT 38258160
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5218 TTAGAAAATGCTATCATTCTCCACCAAAGGCAAATAACCAAGAGTCATTACTAGAAAATT 5277

 38258161 TGTCTCCTTTACCACTCATGCCCAATATAGATCAAATTCTTTAAGATCTTTTCCTCAATA 38258220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5278 TGTCTCCTTTACCACTCATGCCCAATATAGATCAAATTCTTTAAGATCTTTTCCTCAATA 5337

 38258221 AACCTCAAGTCTGTCACCTTTTCTATTACCACATTTTTTCTAAGTCTCAATCATCTCTCA 38258280
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5338 AATCTCAAGTCTGTCACCTTTTCTATTACCACATTTTTTCTAAGTCTCAATCATCTCTCA 5397

 38258281 ATTAGATCATTATAGTAATCTTCTAAGTGGTGTTGGGGTGTCGTCTCCCGGCTACTTCAA 38258340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5398 ATTAGATCATTATAGTAATCTTCTAAGTGGTGTTGGGGTGTCGTCTCCCGGCTACTTCAA 5457

 38258341 TCCATTTTCCAATATTAAGTTTATTTGTTTAATTAAACATGTTAACTTGTGGTGCTCTTA 38258400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5458 TCCATTTTCCAATATTAAGTTTATTTGTTTAATTAAACATGTTAACTTGTGGTGCTCTTA 5517

 38258401 TGCTTAAAAAGTTTCATTAGCTTTCTATTTATATAATGAATGAAACCAATGTTTAGCCTA 38258460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5518 TGCTTAAAAAGTTTCATTAGCTTTCTATTTATATAATGAATGAAACCAATGTTTAGCCTA 5577

 38258461 GTTTAAGAAATGTAAGAACTCCTTTTACCCTAGCTTTCTTCCTGTTTACTTTTATTCATC 38258520
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5578 GTTTAAGAAATGTAAGAACTCCCTTTACCCTAGCTTTCTTCCTGTTTACTTTTATTCATC 5637

 38258521 ATGCCTTGAATCATACCTATCTTCTTTAATTTTCTCTAACACAAAATCCTCCTGTTTCTT 38258580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5638 ATGCCTTGAATCATACCTATCTTCTTTAATTTTCTCTAACACAAAATCCTCCTGTTTCTT 5697

 38258581 CTTTGCAATCCTGCAAACCCAAACCCAGCAGCTAGTAAATATTCAATATATATGAATTAA 38258640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5698 CTTTGCAATCCTGCAAACCCAAACCCAGCAGCTAGTAAATATTCAATATATATGAATTAA 5757

 38258641 TTAATTGATGAATGAGTGATTTTATTTCAGATTGCTATCAAATGCTCAATTCCCCTGCAT 38258700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5758 TTAATTGATGAATGAGTGATTTTATTTCAGATTGCTATCAAATGCTCAATTCCCCTGCAT 5817

 38258701 AGTATCTCCAATGAGTCAAATCCTGGAATTCCCTATAGGAACACCTGGGATATATAGTAT 38258760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5818 AGTATCTCCAATGAGTCAAATCCTGGAATTCCCTATAGGAACACCTGGGATATATAGTAT 5877

 38258761 CAACTTACAAATACCATTCTTTCTTAATTTTGAAAGAAAAACTGAGTAAAATATGAGAGC 38258820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5878 CAACTTACAAATACCATTCTTTCTTAATTTTGAAAGAAAAACTGAGTAAAATATGAGAGC 5937

 38258821 TGTAGCTTTTAAAAAAAATAGAAAATACACCATAAAAATTTTAGTCAAGCATGGCAGACT 38258880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5938 TGTAGCTTTTAAAAAAAATAGAAAATACACCATAAAAATTTTAGTCAAGCATGGCAGACT 5997

 38258881 AAATACATGTATTTATTTCTAATCTACTTCAAGCTCCAATATAATAACTGTTTACAAATG 38258940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5998 AAATACATGTATTTATTTCTAATCTACTTCAAGCTCCAATATAATAACTGTTTACAAATG 6057

 38258941 AAATGGTCTAATATCACAAGTTCAAAATTAATAAGAGTGGATGAGACATGCCAACAAATT 38259000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6058 AAATGGTCTAATATCACAAGTTCAAAATTAATAAGAGTGGATGAGACATGCCAACAAATT 6117

 38259001 TTTGGAATGTAAAAATAGATAAGACATTGTTAATGATTTGACAAAGCACAAAGCCTTAAA 38259060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6118 TTTGGAATGTAAAAATAGATAAGACATTGTTAATGATTTGACAAAGCACAAAGCCTTAAA 6177

 38259061 ATATTTCTGTATAGAGAGAAGTTTCCAAAGTAGGGCAACTCAGAGATAAATCAAGAATGG 38259120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6178 ATATTTCTGTATAGAGAGAAGTTTCCAAAGTAGGGCAACTCAGAGATAAATCAAGAATGG 6237

 38259121 GAAGATTCACACACCTCAACTGTAAAAGAGAAATATGAGACTAAAAGCAGTGGATTAATT 38259180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     6238 GAAGATTCACACACCTCAACTGTAAAAGAGAAATATGAGACTAAAAGCAGTGGATTCATT 6297

 38259181 AAAACTTTGTTTGATGAGATATTATACATAGATGTCTTCTCCATCATTCCAAGCACTTAA 38259240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6298 AAAACTTTGTTTGATGAGATATTATACATAGATGTCTTCTCCATCATTCCAAGCACTTAA 6357

 38259241 GCAGCTGCCCTTTCCAAACACTCATAGAGGATAAGAGATTATTTTCTATAAAAATCAAAC 38259300
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6358 GCAGCTGCCCTTTACAAACACTCATAGAGGATAAGAGATTATTTTCTATAAAAATCAAAC 6417

 38259301 CAGATTGTTG--TGTACATCAAGCAAAGGAGGGATGGCAGGGAGGTGATATACTGAAACA 38259358
          ||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6418 CAGATTGT--CATGTACATCAAGCAAAGGAGGGATGGCAGGGAGGTGATATACTGAAACA 6475

 38259359 GAATTACTGTATGAAAACCTGGAATGAACAATTAGATACTCAGTTCTCCTTACCTGCACA 38259418
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6476 GAATTACTGTATGAAAACATGGAATGAACAATTAGATACTCAGTTCTCCTTACCTGCACA 6535

 38259419 GTAATAGTAATTCTTACTACCAGACTGGATGCTGGAGGGCTCTCCTTCAGAGAAACAGAA 38259478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6536 GTAATAGTAATTCTTACTACCAGACTGGATGCTGGAGGGCTCTCCTTCAGAGAAACAGAA 6595

 38259479 AAGAAAAAAAAGCCTATAGCCACTAATATTTGAATCTCTGCAATTAAATACCTGGGTCCC 38259538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6596 AAGAAAAAAAAGCCTATAGCCACTAATATTTGAATCTCTGCAATTAAATACCTGGGTCCC 6655

 38259539 TTCCCAATCATATAGCAGTGATGCTCACCAGTTAACAAGAACTGAAGACACATGACAGAT 38259598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     6656 TTCCCAATCATATAGCAGTGATGCTCACCAGTTAACAAGAACCGAAGACACATGACAGAT 6715

 38259599 TCCAATCAGTGATTTATTACCACTGTCAAATAAGAATGGACACTCAAAGATTACCTGAAA 38259658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6716 TCCAATCAGTGATTTATTACCACTGTCAAATAAGAATGGACACTCAAAGATTACCTGAAA 6775

 38259659 AAGTCCTTTAATATGGCCCCAGATTGAATAATTCCTAATTTCCTATATCATAAATTCAAA 38259718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6776 AAGTCCTTTAATATGGCCCCAGATTGAATAATTCCTAATTTCCTATATCATAAATTCAAA 6835

 38259719 AATTATCTAAAATTCAGTGAAATTAGTCCATATTATCAATGCCAACCTTACACATAAACA 38259778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6836 AATTATCTAAAATTCAGTGAAATTAGTCCATATTATCAATGCCAACCTTACACATAAACA 6895

 38259779 GAGTTGACATTCTCTTATGATGCTGAACAATGCAGATGAAGAACGCTGGCTTTGGATTAA 38259838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6896 GAGTTGACATTCTCTTATGATGCTGAACAATGCAGATGAAGAACGCTGGCTTTGGATTAA 6955

 38259839 GAAGACCCTTAGTTTGAATTTTAATTTTGACCCATGATAGCTGTGTAAACTTAGTCAAAA 38259898
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     6956 GAAGACCCTTAGTTTGAATTTTAATTTTGACCCATGATAGCTGTGTAAACTTAGTAAAAA 7015

 38259899 TTCTTCAGTTATTGAGCTGATGCTTTAGCCTGAGTTAAACAGAGAACAGAGCCTAAGGTA 38259958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7016 TTCTTCAGTTATTGAGCTGATGCTTTAGCCTGAGTTAAACAGAGAACAGAGCCTAAGGTA 7075

 38259959 GAGGGTTTCTATTCTATTCTTTCATAATGGATTGCTGGGCAAGATAACAAAAGCAATGGA 38260018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7076 GAGGGTTTCTATTCTATTCTTTCATAATGGATTGCTGGGCAAGATAACAAAAGCAATGGA 7135

 38260019 TAAGCACAGAAATGCAGGGCAGAAGAGAGAGCCATGAGGAAGATATATTATCAGGGTGGT 38260078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7136 TAAGCACAGAAATGCAGGGCAGAAGAGAGAGCCATGAGGAAGATATATTATCAGGGTGGT 7195

 38260079 TGCCATTAAGTGAAACCAGTTACCCAGTTTAATGGAATTATCCCCAGGGAGCAAGGTCTG 38260138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     7196 TGCCATTAAGTGAAACCAGTTACCCAGTTTAATGGAATTATCCCCAGGGAGCAAGGTCAG 7255

 38260139 TGGCATCTCAAGACTCTTTATCAAAGAGGAGAATGGGAGAAAAATCATCTTTTTTGTATT 38260198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7256 TGGCATCTCAAGACTCTTTATCAAAGAGGAGAATGGGAGAAAAATCATCTTTTTTGTATT 7315

 38260199 TCCTACTGTTCAAAAGTTTGTCCCTTGCTTTCCTGGTTATGAATGCATGGAAGTCTAGTT 38260258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7316 TCCTACTGTTCAAAAGTTTGTCCCTTGCTTTCCTGGTTATGAATGCATGGAAGTCTAGTT 7375

 38260259 GAAGTCCAGCAAAGACATCAACAAGGAATCATAGGAAAGAGATAAAAGGCCTGAGACATG 38260318
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7376 GAAGTCCACCAAAGACATCAACAAGGAATCATAGGAAAGAGATAAAAGGCCTGAGACATG 7435

 38260319 GATATAAGGGAAGGTAGTGTTAAGTGGCACCTTTTTGGGAGTCCAAACTGAGCAGGAGTA 38260378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7436 GATATAAGGGAAGGTAGTGTTAAGTGGCACCTTTTTGGGAGTCCAAACTGAGCAGGAGTA 7495

 38260379 AAACTGAAGCAACTGCTTTAACTAAGACATGTGTGCCCACAAAGACCTGAAGTGACACAT 38260438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7496 AAACTGAAGCAACTGCTTTAACTAAGACATGTGTGCCCACAAAGACCTGAAGTGACACAT 7555

 38260439 GAGCTTTCACAGTTTTTTAACTGTAAAATGGTAATGATATCACCTATGTTTCTGGATTAC 38260498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7556 GAGCTTTCACAGTTTTTTAACTGTAAAATGGTAATGATATCACCTATGTTTCTGGATTAC 7615

 38260499 TACAAATATTAAATAGCATAAATGGCACACTTGCAAAGCATATTTTAATAAACATATTTA 38260558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7616 TACAAATATTAAATAGCATAAATGGCACACTTGCAAAGCATATTTTAATAAACATATTTA 7675

 38260559 ATATTTCCCTTATTGATTTCTTTAATCAATAAAAGCATTTCTGAAATTTGTGTAAAGGTC 38260618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7676 ATATTTCCCTTATTGATTTCTTTAATCAATAAAAGCATTTCTGAAATTTGTGTAAAGGTC 7735

 38260619 TAGATGAAGGGACATTGGACATGCTTTGATAATCATTGAGACTGGGTGATAGATAAATGA 38260678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7736 TAGATGAAGGGACATTGGACATGCTTTGATAATCATTGAGACTGGGTGATAGATAAATGA 7795

 38260679 TTGTCATGGTCTTTA 38260693
          |||||||||||||||
     7796 TTGTCATGGTCTTTA 7810

Alignment time is 7.44591 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38249892,38276749] =>     26858 nucs '18 dna:chromosome chromosome:GRCh37:18:1:78077248:1'
Second seq [       1,    7737] =>      7737 nucs 'mol-32-287f-020038_7737'

Score:        7409
Aligned:      7746        nucs
Identic:      7708 (100%) nucs =>      5209 (100%)      2499 ( 99%)
Gaps:           16 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38261013,38266242] EXCISED REGION [38266251,38268759]
 second seq =>  [       1,    5226] EXCISED REGION [    5227,    7737]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         8 nucs [38266243,38266250]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         8 nucs [38266243,38266250] to [38266251,38266258]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [38266242,38266242] to [38266251,38266251]
 second seq =>         1 nucs [5226,5226] to [5227,5227]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 38261013 ATGTTGCAAACAAGTTGTTTTGCCCATTTGTTCTTATCCTGAGGTCATGAAAACATCTAA 38261072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATGTTGCAAACAAGTTGTTTTGCCCATTTGTTCTTATCCTGAGGTCATGAAAACATCTAA 60

 38261073 CTCTACTATCTTCCAGAAGCTATATTGTCTTGCCTTTGACCTTAAGGATTATGGTCTTGA 38261132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTCTACTATCTTCCAGAAGCTATATTGTCTTGCCTTTGACCTTAAGGATTATGGTCTTGA 120

 38261133 ATTAATTTTTGTATGTGTAAGTGACCACACAAACTTGTTAGAAATCTAGTTTCAAGTATT 38261192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATTAATTTTTGTATGTGTAAGTGACCACACAAACTTGTTAGAAATCTAGTTTCAAGTATT 180

 38261193 TTTTTCATATGGATTCAAATTACACCACCAGTACACGCATATTGAAAAAAAGTATTTTTC 38261252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
      181 TTTTTCATATGGATTCAAATTACACCACCAGTACACACATATTGAAAAAAAGTATTTTTC 240

 38261253 TACTGTTTTGCAATGGAAATATTGATATAAATCAAGTACCCATATATGCACAGGTCAGTT 38261312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TACTGTTTTGCAATGGAAATATTGATATAAATCAAGTACCCATATATGCACAGGTCAGTT 300

 38261313 TATGAACTTGCTATTTTGTTGTACTGGTTTGTTTGTATATATTTTTTGCCCTGATAAGAC 38261372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TATGAACTTGCTATTTTGTTGTACTGGTTTGTTTGTATATATTTTTTGCCCTGATAAGAC 360

 38261373 ACTGCCTTAGTTATTGCAACTTCTGTTATAAGCTTTGAGATCTGAGAAAGAAAGTTATTC 38261432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACTGCCTTAGTTATTGCAACTTCTGTTATAAGCTTTGAGATCTGAGAAAGAAAGTTATTC 420

 38261433 CAGCTACTTATTTTGTATTTGCTATCTTTGGTCTTTTGCATTTATATAAATTTTATAATC 38261492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CAGCTACTTATTTTGTATTTGCTATCTTTGGTCTTTTGCATTTATATAAATTTTATAATC 480

 38261493 AGTTTGTCAATTACTAAAACAAAATGTACTGGGATTTTGATTGGGACTGCATTGAATATA 38261552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGTTTGTCAATTACTAAAACAAAATGTACTGGGATTTTGATTGGGACTGCATTGAATATA 540

 38261553 AAGATCAATATGGAGAGTATTGACTTCTTCAAAATGTTGAGTCTTCCAGGCCATGAAGAG 38261612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
      541 AAGATCAATATGGAGAGTATTGACTTCTTCAAAATGTTGAGTCTTCCAAGCCATGAAGAG 600

 38261613 GGAATATCCTTTTAATTATTTAGGACATCATTAATTTTTCTAAATAAATAAGTGCAATTC 38261672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GGAATATCCTTTTAATTATTTAGGACATCATTAATTTTTCTAAATAAATAAGTGCAATTC 660

 38261673 CTTTCCAGAGGTCTTCACATATCTGGTTAACTTTTGTTCTTGTGTATATTTATGCTATTA 38261732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTTTCCAGAGGTCTTCACATATCTGGTTAACTTTTGTTCTTGTGTATATTTATGCTATTA 720

 38261733 TAAATGCTAAACATGGTTACTTTCCCTTTCTGTTGGTTAGCGATACATAGAAATGGAATT 38261792
          |||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
      721 TAAATGCTAAACATGTTTACTTTCCCTTTCTATTGGTTAGCGATACATAGAAATGGAATT 780

 38261793 TCTTTTTGAATATTCAATCCGCGTATTAGTTTTCTAATGGTGTTGTGACGAATTACACCA 38261852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCTTTTTGAATATTCAATCCGCGTATTAGTTTTCTAATGGTGTTGTGACGAATTACACCA 840

 38261853 ACTTAGTGGCTTTAAAACAACACCCATTTATTATCTCACAGTTTAATCAGTTAGAAGTCT 38261912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ACTTAGTGGCTTTAAAACAACACCCATTTATTATCTCACAGTTTAATCAGTTAGAAGTCT 900

 38261913 GGACTCAGCGTGGCTCAGTTGGATGTCTTTCTAGAGGCTCTGTGGACGATTTTTTTCCCA 38261972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GGACTCAGCGTGGCTCAGTTGGATGTCTTTCTAGAGGCTCTGTGGACGATTTTTTTCCCA 960

 38261973 ACATCATGAAAATTATTGGCATAATTCAGTTCCACGGAGTTACAGGACTGATTTCCCTTT 38262032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ACATCATGAAAATTATTGGCATAATTCAGTTCCACGGAGTTACAGGACTGATTTCCCTTT 1020

 38262033 TTTTTCTTACTAGCTTTAGCCAGGGTTTATTCTCAGCTTCGAGAGGGCACTCACATTCTT 38262092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTTTTCTTACTAGCTTTAGCCAGGGTTTATTCTCAGCTTCGAGAGGGCACTCACATTCTT 1080

 38262093 GGCTCATTCCTCCATCTTGAAAGCCAGCAATAGTGAGTCAACTTCTTCTCTTGTTTTAAG 38262152
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GGTTCATTCCTCCATCTTGAAAGCCAGCAATAGTGAGTCAACTTCTTCTCTTGTTTTAAG 1140

 38262153 TTTCTGTGACCTCACTTTCTGCTTCATCTCTTTTCTGCTTCATCTCTTCTCCGCCTCCTT 38262212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTTCTGTGACCTCACTTTCTGCTTCATCTCTTTTCTGCTTCATCTCTTCTCCGCCTCCTT 1200

 38262213 CTCTGTCAGATCTCTCTTACTTTTCTGCCTTCCTTTTCTGCTTTTAAGTGCTCCAGTTAT 38262272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CTCTGTCAGATCTCTCTTACTTTTCTGCCTTCCTTTTCTGCTTTTAAGTGCTCCAGTTAT 1260

 38262273 TACATTGGGCCCGACCAGGTAACCCAGGTTAACCACTCCATTTTAAAGTTAACTGATTAA 38262332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TACATTGGGCCCGACCAGGTAACCCAGGTTAACCACTCCATTTTAAAGTTAACTGATTAA 1320

 38262333 TAATCTTAATAACTTCTGGCCAGGTGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGG 38262392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TAATCTTAATAACTTCTGGCCAGGTGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGG 1380

 38262393 AGGCCGAGTCGCGTGGATCACGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAAGATGCTGA 38262452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AGGCCGAGTCGCGTGGATCACGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAAGATGCTGA 1440

 38262453 AACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTAGCGGGGCGTGGTGGCAGGCCCCTGAAT 38262512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTAGCGGGGCGTGGTGGCAGGCCCCTGAAT 1500

 38262513 CCCAGCCACTCGGGAGGCTAAGGCAGAGAATTGCTTGAACCCAGGACGCAGAGCTTGCAG 38262572
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     1501 CCCAGCCACTCGGGAGGCTAAGGCAGAGAATTGCTTGAACCCAGGACGCAGAGCTTGCAA 1560

 38262573 TGAGCCGAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCGAGACTCGTCGAAAAA 38262632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TGAGCCGAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCGAGACTCGTCGAAAAA 1620

 38262633 TAAATAAATAACAAAATAAAAAATGACATCCAAACAATTCATGCACAATAGTATCTACAC 38262692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TAAATAAATAACAAAATAAAAAATGACATCCAAACAATTCATGCACAATAGTATCTACAC 1680

 38262693 ATGTGTTTGCTTGAATAATCAGAATATGGGACTCTTGAGAGTACATCACTAAAATTCTAC 38262752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ATGTGTTTGCTTGAATAATCAGAATATGGGACTCTTGAGAGTACATCACTAAAATTCTAC 1740

 38262753 CTACCACACCTTGTACCTGGCTTCCTTATCAAACTCACTTAACAATCTATTTATGTGTAG 38262812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CTACCACACCTTGTACCTGGCTTCCTTATCAAACTCACTTAACAATCTATTTATGTGTAG 1800

 38262813 AATTTAATTTTTAGATTTTTAAATATATATACACACACATATATATGTAATCTTAAAATT 38262872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AATTTAATTTTTAGATTTTTAAATATATATACACACACATATATATGTAATCTTAAAATT 1860

 38262873 TGACAGTTTTTATTTATTCCTTTGAAGTTATTATTTATTTTCCTTCTATTGATTACATGG 38262932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TGACAGTTTTTATTTATTCCTTTGAAGTTATTATTTATTTTCCTTCTATTGATTACATGG 1920

 38262933 GTTCACTAGTTAGGCCTTTTAATAAAACACAAAATATAAGTAATTTTTACTTTCAAAAGT 38262992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GTTCACTAGTTAGGCCTTTTAATAAAACACAAAATATAAGTAATTTTTACTTTCAAAAGT 1980

 38262993 TTTCAACATTTCCTCATAAGATATGTTTGTTATGTGATTGTTGTAGATTTTTAAAATCAA 38263052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TTTCAACATTTCCTCATAAGATATGTTTGTTATGTGATTGTTGTAGATTTTTAAAATCAA 2040

 38263053 ATTAAGGAAAATTCTTTCTTTTACAATTTTGCTAAGAGTTTTCCCACTAAAGGATGTTGA 38263112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ATTAAGGAAAATTCTTTCTTTTACAATTTTGCTAAGAGTTTTCCCACTAAAGGATGTTGA 2100

 38263113 ATTTTATCAAATGTAATTTCTGCATCTTTTTATGTCTGTGAATGTTCTCCTTTATTCTGT 38263172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ATTTTATCAAATGTAATTTCTGCATCTTTTTATGTCTGTGAATGTTCTCCTTTATTCTGT 2160

 38263173 TAAAATCCTGAATTATGTTAATTTGTCTTTTGATTTTTAACCCAATCTTGTTTTCTAAAA 38263232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TAAAATCCTGAATTATGTTAATTTGTCTTTTGATTTTTAACCCAATCTTGTTTTCTAAAA 2220

 38263233 ATAAACCTAACTTGGATATCTTGGTTTAAACTTTACATATGGTGTTGAATTCACTGTATT 38263292
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ATAAACCTAACTTGGATATCTTGGATTAAACTTTACATATGGTGTTGAATTCACTGTATT 2280

 38263293 AAAATTTGTGTAGGAATTTACAAAATGTTTATGAGTCAGACTGCCAGTAATTTGCCTTTA 38263352
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AAAATTTGTGTAGGAATATACAAAATGTTTATGAGTCAGACTGCCAGTAATTTGCCTTTA 2340

 38263353 GAAGAAAATACTATTGTCAGGTTTTGGTATCTGGGTGTTTGTTAGCACCAACAAATGATT 38263412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GAAGAAAATACTATTGTCAGGTTTTGGTATCTGGGTGTTTGTTAGCACCAACAAATGATT 2400

 38263413 TAGTAACCATTTCCTATTTTCAATTGTCTGGAAGAGTTTGTGTTAGAATGATGTTCTTTC 38263472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TAGTAACCATTTCCTATTTTCAATTGTCTGGAAGAGTTTGTGTTAGAATGATGTTCTTTC 2460

 38263473 TTCTATATGTGTTTGGTACAATTTACTGGTGAAGCCATCTGGACTTGATGTTTTCTTTAT 38263532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TTCTATATGTGTTTGGTACAATTTACTGGTGAAGCCATCTGGACTTGATGTTTTCTTTAT 2520

 38263533 GTAATGATTTTTAATTATAGACGTCATTTCTTTAATTTCAGTAGTTATATAAATCCTCAT 38263592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GTAATGATTTTTAATTATAGACGTCATTTCTTTAATTTCAGTAGTTATATAAATCCTCAT 2580

 38263593 ATTCTTTCTTTCTGTTTTCAGTTTTATCAGTTCTATATTTTAGGAAATTATTTCAACTGA 38263652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 ATTCTTTCTTTCTGTTTTCAGTTTTATCAGTTCTATATTTTAGGAAATTATTTCAACTGA 2640

 38263653 ATTTTCAAACATATTATTTATAACATCATATTATAATCTTCCTAATATCAGAGAGATCTG 38263712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 ATTTTCAAACATATTATTTATAACATCATATTATAATCTTCCTAATATCAGAGAGATCTG 2700

 38263713 TAATTATGTCTCCTTTTCATCTGTACTGTCGTTGATTTGTCCTATTTTTTTCTTTTTCTT 38263772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TAATTATGTCTCCTTTTCATCTGTACTGTCGTTGATTTGTCCTATTTTTTTCTTTTTCTT 2760

 38263773 CATCAGAAACACTAAAGAATTTTTTATTTTATTAGATTTTCTAAAAGTTAAGATCTTATT 38263832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CATCAGAAACACTAAAGAATTTTTTATTTTATTAGATTTTCTAAAAGTTAAGATCTTATT 2820

 38263833 GATTTTGACTAGTATATAAGTCCTTTATTTTGTTAATTTCTAGTTGTATTTTTATTATTT 38263892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GATTTTGACTAGTATATAAGTCCTTTATTTTGTTAATTTCTAGTTGTATTTTTATTATTT 2880

 38263893 CCTTCCTAGTTCTTCTTTTTATTTAATCGTTCTTAAGATGGATACTTAAGTAATTGATTT 38263952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CCTTCCTAGTTCTTCTTTTTATTTAATCGTTCTTAAGATGGATACTTAAGTAATTGATTT 2940

 38263953 TCATCTTCTAAGCTTTATTAGTATGTTTATTTAAAGCAATACATTTCCATATTACCATGA 38264012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TCATCTTCTAAGCTTTATTAGTATGTTTATTTAAAGCAATACATTTCCATATTACCATGA 3000

 38264013 CCTTAGCTGCAGTGTATGTATTTTGGTGTACAGTATTTTCTTTATTTTTCAATTAAAATT 38264072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CCTTAGCTGCAGTGTATGTATTTTGGTGTACAGTATTTTCTTTATTTTTCAATTAAAATT 3060

 38264073 TGTCTTGACTTCCTCTATGATGTCTTCTATGATTCTTCCTCTATAATTCTTCTTTTGACC 38264132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TGTCTTGACTTCCTCTATGATGTCTTCTATGATTCTTCCTCTATAATTCTTCTTTTGACC 3120

 38264133 ATATAGAAGTGTATTCATTAATTCAATCACATATAAATATTCTCCTTTTATCTTTTTGCT 38264192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 ATATAGAAGTGTATTCATTAATTCAATCACATATAAATATTCTCCTTTTATCTTTTTGCT 3180

 38264193 ACTGGTTTGTTTGTTTAGCTACATTTAGGGAAAATTTCATTTCTGAGACGACAGAGGAAG 38264252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 ACTGGTTTGTTTGTTTAGCTACATTTAGGGAAAATTTCATTTCTGAGACGACAGAGGAAG 3240

 38264253 CACATTCCATTTTATTCCTTCTGCTAATGACAAAAAAAAAAAAAAATTGGAAAAAACACA 38264312
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||
     3241 CACATTCCATTTTATTCCTTCTGCTAATGACAAAAAAAAAAAA---TTGGAAAAAACACA 3297

 38264313 AAAGCCAGAGTCAAAAGACTCTGAAAAATGGAGAAAAAGTGCAGACAGGCTAAGGATTTG 38264372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3298 AAAGCCAGAGTCAAAAGACTCTGAAAAATGGAGAAAAAGTGCAGACAGGCTAAGGATTTG 3357

 38264373 GGAGATTGAGGAACAACGACAGGTGAGTTCTCTGTCTTTTTTTTT-CTTTCTTTTTTGAT 38264431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
     3358 GGAGATTGAGGAACAACGACAGGTGAGTTCTCTGTCTTTTTTTTTTCTTTCTTTTTTGAT 3417

 38264432 ATATATATATATATCAACAATCTCAATGTTTAAGAGAAGCCCTCAAGCCAGAATTTCCAA 38264491
          ||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     3418 ATATATATAT----CAACAATCTCAATGTTTAAGAGAAGCCCTCAATCCAGAATTTCCAA 3473

 38264492 CAGTTGCAGATAAAACATTGTGCTTGCTTAACGTATTTAACCAAAAGACCCGAAAAGCAA 38264551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3474 CAGTTGCAGATAAAACATTGTGCTTGCTTAACGTATTTAACCAAAAGACCCGAAAAGCAA 3533

 38264552 GGATATAAAAGAATATTTTAATAATATCATTCTGTTCTTAAGGTGAACACTTCAAAGAAA 38264611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3534 GGATATAAAAGAATATTTTAATAATATCATTCTGTTCTTAAGGTGAACACTTCAAAGAAA 3593

 38264612 CCACACCCCTCCCCTCCCCAATGCGTGCTGAAGCAGTGGAATCCATGAGTGGAACCTTGT 38264671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3594 CCACACCCCTCCCCTCCCCAATGCGTGCTGAAGCAGTGGAATCCATGAGTGGAACCTTGT 3653

 38264672 CATATATAATCTCCACACTAAATTTATAGCAAAGCCCCCATCTCTCAACCTGTGTTGAAA 38264731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3654 CATATATAATCTCCACACTAAATTTATAGCAAAGCCCCCATCTCTCAACCTGTGTTGAAA 3713

 38264732 TTCTGACTTCCAGACACACCTTTCAGTAATGAGGAGGTACTCTTCCATGATAAACCCTGT 38264791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3714 TTCTGACTTCCAGACACACCTTTCAGTAATGAGGAGGTACTCTTCCATGATAAACCCTGT 3773

 38264792 GGGCAAAGCTTCCACATTCATCCCACCCCTAAAGCAATAAATTTGCACCTTTCCCAAGTA 38264851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3774 GGGCAAAGCTTCCACATTCATCCCACCCCTAAAGCAATAAATTTGCACCTTTCCCAAGTA 3833

 38264852 GAATCAATGGGAAGAATTTTGACTTCTATCCCCACCTGATGGTAATGAGGCAGTATCTCT 38264911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3834 GAATCAATGGGAAGAATTTTGACTTCTATCCCCACCTGATGGTAATGAGGCAGTATCTCT 3893

 38264912 CTCTTTTTCCAGACAGTGTTTAAGAATTTGTTGTATAGAGCGCTATTACCTGAATAACAC 38264971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3894 CTCTTTTTCCAGACAGTGTTTAAGAATTTGTTGTATAGAGCGCTATTACCTGAATAACAC 3953

 38264972 ATTGTGGCAGAGCAAAATAACCCTTAAGCATTTAGTTTTCAGATTTATTTTCAACTATTT 38265031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3954 ATTGTGGCAGAGCAAAATAACCCTTAAGCATTTAGTTTTCAGATTTATTTTCAACTATTT 4013

 38265032 AGAGGGTTATTTCTTGACTACCACAGATAAGTCATTCCCTTCTCCATTGTTCTATAGTTT 38265091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4014 AGAGGGTTATTTCTTGACTACCACAGATAAGTCATTCCCTTCTCCATTGTTCTATAGTTT 4073

 38265092 ACTGCCCTTTTTTTCTATCATGGCATTTACCCACTATTTCATATTGTTATTTATAGTTTA 38265151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     4074 ACTGCCCTTTTTTTCTATCATGGCATTTACCCACTATTTCATATTGTTATTTTTAGTTTA 4133

 38265152 CATGCTTAATATCTCCATCTCCCAACAAATATGGGAACATCATTAGGTCAGAGAAATTTT 38265211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4134 CATGCTTAATATCTCCATCTCCCAACAAATATGGGAACATCATTAGGTCAGAGAAATTTT 4193

 38265212 ATTTCTTTTCCCTCTGAAGTCTCAGTATTAGTTGTTACATTAATTAGCACTTATTTAAAT 38265271
          ||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     4194 ATTTCTTTCCCCTCTGAAGTCTCAGTACTAGTTGTTACATTAATTAGCACTTATTTAAAT 4253

 38265272 TTTTAGTTTTCTTTTTCTTTGCCTCATGTTACTGTTACACCCTTCCACTACCAAGCTTAA 38265331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4254 TTTTAGTTTTCTTTTTCTTTGCCTCATGTTACTGTTACACCCTTCCACTACCAAGCTTAA 4313

 38265332 AGTTAGGAATGATTCATGTGACTGGAATTGAATGACTGCTCTGAGAAAGAAGTCCATAAA 38265391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4314 AGTTAGGAATGATTCATGTGACTGGAATTGAATGACTGCTCTGAGAAAGAAGTCCATAAA 4373

 38265392 AGTCTGCATGCAATTTGCCATGTCTCCATCCTTTCTTTGCCATAGAAACTAAAGATCTTC 38265451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4374 AGTCTGCATGCAATTTGCCATGTCTCCATCCTTTCTTTGCCATAGAAACTAAAGATCTTC 4433

 38265452 CAGATAGTCGAGGCTCTGTTAATGTTATTTCTTGAATAACGACTATCTGAACAGAACATC 38265511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4434 CAGATAGTCGAGGCTCTGTTAATGTTATTTCTTGAATAACGACTATCTGAACAGAACATC 4493

 38265512 TGTGACTTGGAATGGGGACATGTAGCTTGGAGAAAAAGTAAGCACACAGTGTTTTAAGTT 38265571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4494 TGTGACTTGGAATGGGGACATGTAGCTTGGAGAAAAAGTAAGCACACAGTGTTTTAAGTT 4553

 38265572 ACTGTGGTTTTATGGTTATTTGTTACTGCAGCATAACCCACCCTGCCCTGACTTAAGTGA 38265631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4554 ACTGTGGTTTTATGGTTATTTGTTACTGCAGCATAACCCACCCTGCCCTGACTTAAGTGA 4613

 38265632 TATAATATTTAACAAATATTTATAAAATAAATAAATTCAAATTCACTCTAATACCTAGAA 38265691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4614 TATAATATTTAACAAATATTTATAAAATAAATAAATTCAAATTCACTCTAATACCTAGAA 4673

 38265692 AATTATCAAGTATAGTAAACCAAATAATAAATATTTATTAAGGAATATGGAAACAGTGAC 38265751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4674 AATTATCAAGTATAGTAAACCAAATAATAAATATTTATTAAGGAATATGGAAACAGTGAC 4733

 38265752 CTATGAGAAGTCTTGATATACTGACCATCCATTGTTGCAGCAGATCTCACTATTGCTATT 38265811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4734 CTATGAGAAGTCTTGATATACTGACCATCCATTGTTGCAGCAGATCTCACTATTGCTATT 4793

 38265812 GTGCTTAACATTTCAATTACAAAAATTAAAAAAAAAAAACACCATTCATCAGTGCAGGTC 38265871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4794 GTGCTTAACATTTCAATTACAAAAATTAAAAAAAAAAAACACCATTCATCAGTGCAGGTC 4853

 38265872 TGTGTATTTAAAGAAATAATTTACAAGTTTTTTTTTCCTTTGTAAACATATTGTTTTGAA 38265931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
     4854 TGTGTATTTAAAGAAATAATTTACAAGTTTTTTTT-CCTTTGTAAACATATTGTTTTGAA 4912

 38265932 GTGCAAATATATATAATTTGCACTTTGGGATGGAATGGAATGGGATGCCCTATTGGCAGT 38265991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4913 GTGCAAATATATATAATTTGCACTTTGGGATGGAATGGAATGGGATGCCCTATTGGCAGT 4972

 38265992 CCATACATCTGGATTATAAATGGATTTCCATCCCATCTTCCTCCCCATCTCTTTCCCTTT 38266051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4973 CCATACATCTGGATTATAAATGGATTTCCATCCCATCTTCCTCCCCATCTCTTTCCCTTT 5032

 38266052 TTGATCATTCTATGGAAATGGAAAGCTAGCAGAAGTTTGAAGAATTGTCACGCAAACAAC 38266111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5033 TTGATCATTCTATGGAAATGGAAAGCTAGCAGAAGTTTGAAGAATTGTCACGCAAACAAC 5092

 38266112 AACAACAA---AACTTTAGCATATTAACCTGTTGTCCAACCTTATATAAGCAGTTTGTAT 38266168
          ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5093 AACAACAACAAAACTTTAGCATATTAACCTGTTGTCCAACCTTATATAAGCAGTTTGTAT 5152

 38266169 TTAAAACATCCCTAAGTGGATTTTAATTCCAGTTTCAATCATTGTTAACTATTTTTGAAA 38266228
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     5153 TTAAAACATCCCTAAGTGGATTTTAATTCCAATTTCAATCATTGTTAACTATTTTTGAAA 5212

 38266229 TATTTAAAATCCCA 38266242
          ||||||||||||||
     5213 TATTTAAAATCCCA 5226

EXCISED REGION

 38266251 ACCACTATTTCTCTTCAACTAGTCCTTACTTTTATAAACAAAAAAGTAACAGTAAATAAT 38266310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5227 ACCACTATTTCTCTTCAACTAGTCCTTACTTTTATAAACAAAAAAGTAACAGTAAATAAT 5286

 38266311 TTATAACTAGGTCTCTCTGAATCTAAAAACACGTTCTTATACACTATGTGATGCCATATT 38266370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     5287 TTATAACTAGGTCTCTCTGAATCTAAAAACACATTCTTATACACTATGTGATGCCATATT 5346

 38266371 TTTTACTCTTGTCTTTGTGAGTTTTTTGTGCCATTCTCTCCTCTGGAATGGTCTTCTGTG 38266430
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5347 TTTTACTCTTGACTTTGTGAGTTTTTTGTGCCATTCTCTCCTCTGGAATGGTCTTCTGTG 5406

 38266431 CTTACACATTCCAAGGGCTACTCCATTTTACAAGAAACAGTTCATGTTTGCTACTTTGGG 38266490
          .|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5407 TTTACACATTCCAAGGGCTAATCCATTTTACAAGAAACAGTTCATGTTTGCTACTTTGGG 5466

 38266491 GTTGATCCCATGATAATTCTGGTTCTCACTTGGTCTTTCCCTGTGAGATGCAGTAGCATT 38266550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5467 GTTGATCCCATGATAATTCTGGTTCTCACTTGGTCTTTCCCTGTGAGATGCAGTAGCATT 5526

 38266551 CAAAATTCTCAGACTATTCTATGCACCTTGGCAGATTTATGGTAATGGTCTATAATTGCT 38266610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5527 CAAAATTCTCAGACTATTCTATGCACCTTGGCAGATTTATGGTAATGGTCTATAATTGCT 5586

 38266611 TCATATCTGCTAACCTTGCTTCCAAAACTAGTTTTTGAGATTAATGAGACAGGAGCTTGG 38266670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5587 TCATATCTGCTAACCTTGCTTCCAAAACTAGTTTTTGAGATTAATGAGACAGGAGCTTGG 5646

 38266671 CTTTTTCTTTCTGTATAGCTTCCATAGCAACAAGAAAATATTAGACACACAGTAGGCATT 38266730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5647 CTTTTTCTTTCTGTATAGCTTCCATAGCAACAAGAAAATATTAGACACACAGTAGGCATT 5706

 38266731 GGAAGAAAATGTGTTCAGTTAAATGAACTTGATTTGAATGGAATGAGAGTTCAATGAAAC 38266790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5707 GGAAGAAAATGTGTTCAGTTAAATGAACTTGATTTGAATGGAATGAGAGTTCAATGAAAC 5766

 38266791 TGTATATATTGTGAAACGTGGCAACTTACACCTACTCAAGACATTAAAAGAGATCATGCT 38266850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5767 TGTATATATTGTGAAACGTGGCAACTTACACCTACTCAAGACATTAAAAGAGATCATGCT 5826

 38266851 TTCTTGCCTAAGTTTTATGTCCAATTTGTTCCTGTTTCAAACCCCTCGACAAAAACAAAA 38266910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5827 TTCTTGCCTAAGTTTTATGTCCAATTTGTTCCTGTTTCAAACCCCTCGACAAAAACAAAA 5886

 38266911 TCTTTTAATCTGTTTGCAAAATATTTCCTCCTTCCTCCCATCTTGCTGTTGCTGCTCTGT 38266970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5887 TCTTTTAATCTGTTTGCAAAATATTTCCTCCTTCCTCCCATCTTGCTGTTGCTGCTCTGT 5946

 38266971 GATATACTGCCCTTGCTTATTACCCCTTTATAGCTGTTTTGTTAAAGTTCATACCGCTAA 38267030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5947 GATATACTGCCCTTGCTTATTACCCCTTTATAGCTGTTTTGTTAAAGTTCATACCGCTAA 6006

 38267031 GACCTGTAAAAGAAATTTATGGCTCTAGGGATTTCAGCAAATTCTAAATAACCATAACAG 38267090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6007 GACCTGTAAAAGAAATTTATGGCTCTAGGGATTTCAGCAAATTCTAAATAACCATAACAG 6066

 38267091 GAACAGGAAGCATTAATTAAAGACACTAGAGTCTAAGTTATAACAGAAATCCTGACATTT 38267150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6067 GAACAGGAAGCATTAATTAAAGACACTAGAGTCTAAGTTATAACAGAAATCCTGACATTT 6126

 38267151 AAGGCCCTGGTACCATTTAAATTTAAAATGGTATGACAAACAGAGAGTAATTTGATGGTC 38267210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6127 AAGGCCCTGGTACCATTTAAATTTAAAATGGTATGACAAACAGAGAGTAATTTGATGGTC 6186

 38267211 AGAAGGTTATAATGGATACCTTAATACCTTTGCCAAGAAAAAGTGTCTGTCCTTGCTCTA 38267270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6187 AGAAGGTTATAATGGATACCTTAATACCTTTGCCAAGAAAAAGTGTCTGTCCTTGCTCTA 6246

 38267271 ACCCCTACCCAGGGGCTTCAGGGGCCTCCTTCATAAAACATGGTGATGCCTAAATATTTT 38267330
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6247 ATCCCTACCCAGGGGCTTCAGGGGCCTCCTTCATAAAACATGGTGATGCCTAAATATTTT 6306

 38267331 TGCGATATCTCATATATAAGCTGGTCTTTTCTTTAAGAATACGAGAGATTAAACACCAAC 38267390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6307 TGCGATATCTCATATATAAGCTGGTCTTTTCTTTAAGAATACGAGAGATTAAACACCAAC 6366

 38267391 CCCCAACATTCATACACCAATTTTCAGATAAAACAGCTTAATATTTAAGATATATTTAGT 38267450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6367 CCCCAACATTCATACACCAATTTTCAGATAAAACAGCTTAATATTTAAGATATATTTAGT 6426

 38267451 GCAATTTGTCTATTTCTTGGTTTACTGGAGGGCTGTATTTAAAGCCAAGGGACCAAGGAA 38267510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6427 GCAATTTGTCTATTTCTTGGTTTACTGGAGGGCTGTATTTAAAGCCAAGGGACCAAGGAA 6486

 38267511 CATTCCACAACACACTAAAGCAATTTTTCCCCAGGGAATATGCTGATTCTTTCCTAAAGG 38267570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6487 CATTCCACAACACACTAAAGCAATTTTTCCCCAGGGAATATGCTGATTCTTTCCTAAAGG 6546

 38267571 CAGAAGCCGACATTCCTGACTCATTCTGCCAAACCAAGCAATGAAAAATGCTTCACCTAA 38267630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6547 CAGAAGCCGACATTCCTGACTCATTCTGCCAAACCAAGCAATGAAAAATGCTTCACCTAA 6606

 38267631 TTTGAAAGATAATTTGTAATACCAGAGACTCAACTTGTTTTGTGTATCCAATACTAGCAC 38267690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6607 TTTGAAAGATAATTTGTAATACCAGAGACTCAACTTGTTTTGTGTATCCAATACTAGCAC 6666

 38267691 CCTTTCCAGAATGTTGAAAGTACACACTGTATGATTTGTCTAATGTATATTCAAAAAAGG 38267750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6667 CCTTTCCAGAATGTTGAAAGTACACACTGTATGATTTGTCTAATGTATATTCAAAAAAGG 6726

 38267751 AATACAAATTGATCCTCAAAGTTCAAATCTGCAGTACATACTCTGTGTTCTGCCCCCACC 38267810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6727 AATACAAATTGATCCTCAAAGTTCAAATCTGCAGTACATACTCTGTGTTCTGCCCCCACC 6786

 38267811 CGTACCTTCATGAATTCTTTCACCTAGCACGCAGGCTGTTTTCCCTTTGCGAAATCCCAT 38267870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6787 CGTACCTTCATGAATTCTTTCACCTAGCACGCAGGCTGTTTTCCCTTTGCGAAATCCCAT 6846

 38267871 GGTACATTTATAGTATTAATACCACTCACTTAGAATATGCCGTATTTTGTCTAATATTGC 38267930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6847 GGTACATTTATAGTATTAATACCACTCACTTAGAATATGCCGTATTTTGTCTAATATTGC 6906

 38267931 TAGATTTTGTGTGTATAATCTTATTCCTCAAGTAAATTACAAGACAAGGACTATAATTTA 38267990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6907 TAGATTTTGTGTGTATAATCTTATTCCTCAAGTAAATTACAAGACAAGGACTATAATTTA 6966

 38267991 TACATCCTCTACAACACTTGACACTGGCTTTGATTAGGCTCTTAATAAATATTTGTTGGT 38268050
          ||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     6967 TACATCCTCTACAACACTTGGCACTGGCTTTGAGTAGGCTCTTAATAAATATTTGTTGGT 7026

 38268051 TGATTAATCAGTTGACCACACTTACTAATTGCAAGGTGACATCATTTATCATTAATAAAC 38268110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7027 TGATTAATCAGTTGACCACACTTACTAATTGCAAGGTGACATCATTTATCATTAATAAAC 7086

 38268111 ATATATGTGGATTACAAAAATATCATGTGAATTTGCATATAATCATATTAATCCCAAATT 38268170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7087 ATATATGTGGATTACAAAAATATCATGTGAATTTGCATATAATCATATTAATCCCAAATT 7146

 38268171 AGCACCTGAGAGTCCAACCACCCTCTCCTTTAGGCCCTTTTCACTTTTATGTCTACTTTT 38268230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7147 AGCACCTGAGAGTCCAACCACCCTCTCCTTTAGGCCCTTTTCACTTTTATGTCTACTTTT 7206

 38268231 GCCTCACTTACAATTCCACTACTTACTTGCCTTCTTTCTCTTTTCAGCTTTGTGCTGTTA 38268290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7207 GCCTCACTTACAATTCCACTACTTACTTGCCTTCTTTCTCTTTTCAGCTTTGTGCTGTTA 7266

 38268291 TTTAATATCTCACCAGTTGTGTAATTTCAGCTCCCAAATTGAATAAGACGTTCCCCCCAG 38268350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7267 TTTAATATCTCACCAGTTGTGTAATTTCAGCTCCCAAATTGAATAAGACGTTCCCCCCAG 7326

 38268351 TGGAACCCTCACCTTGACAAATAGCCAAATAGTA---ATTATTCCTTTCAGGGGTTGAGC 38268407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||
     7327 TGGAACCCTCACCTTGACAAATAGCCAAATAGTAATTATTATTCCTTTCAGGGGTTGAGC 7386

 38268408 TATGGAATCATGCTTGCAATATCCCAGGCTTGAGTGCCTAGATATTTATGCTATACTTCC 38268467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7387 TATGGAATCATGCTTGCAATATCCCAGGCTTGAGTGCCTAGATATTTATGCTATACTTCC 7446

 38268468 CTGTGTCGGAGTTTCCATCTGCGATTGTATTTCAAGCCCTCTCATTTTTTTTTTCAATAT 38268527
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
     7447 CTGTGTCGGAGTTTCCATCTGCGATTGTATTTCAAGCCCTCTCA-TTTTTTTTTCAATAT 7505

 38268528 GATTAAGATAATTCCTTTATGAAGTTGGAAACTCAGACATTCAGAAAGAAACTTGACGTT 38268587
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7506 GATTAAGATAATTCCTTTATGAAGCTGGAAACTCAGACATTCAGAAAGAAACTTGACGTT 7565

 38268588 TCATATTTTTGCTAACTTGCTCTTCCCATTTCCTTTCCTATCATTTTAGCCAGACTGAGG 38268647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7566 TCATATTTTTGCTAACTTGCTCTTCCCATTTCCTTTCCTATCATTTTAGCCAGACTGAGG 7625

 38268648 GAGAATTAATTTTGCAATGGTCTCTATTTTTTTTTCCAAATGTGTGACCTCCATATTAAT 38268707
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7626 GAGAATTAATTTTGCAACGGTCTCTATTTTTTTTTCCAAATGTGTGACCTCCATATTAAT 7685

 38268708 AGGAGCCAGAGTACTCATTCATCACATCTGGTCAGTGTGAAACTGACATTTA 38268759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7686 AGGAGCCAGAGTACTCATTCATCACATCTGGTCAGTGTGAAACTGACATTTA 7737

Alignment time is 7.39176 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38249892,38276749] =>     26858 nucs '18 dna:chromosome chromosome:GRCh37:18:1:78077248:1'
Second seq [       1,    3030] =>      3030 nucs 'mol-32-29a8-023459_3030'

Score:        2842
Aligned:      3026        nucs
Identic:      3006 ( 99%) nucs =>       183 ( 98%)      2823 ( 99%)
Gaps:            7 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38266059,38266242] EXCISED REGION [38266251,38269086]
 second seq =>  [       1,     187] EXCISED REGION [     188,    3025]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         8 nucs [38266243,38266250]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         8 nucs [38266243,38266250] to [38266251,38266258]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [38266242,38266242] to [38266251,38266251]
 second seq =>         1 nucs [187,187] to [188,188]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 38266059 TTCTATGGAAATGGAAAGCTAGCAGAAGTTTGAAGAATTGTCACGCAAACAACAACAACA 38266118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTCTATGGAAATGGAAAGCTAGCAGAAGTTTGAAGAATTGTCACGCAAACAACAACAACA 60

 38266119 A---AACTTTAGCATATTAACCTGTTGTCCAACCTTATATAAGCAGTTTGTATTTAAAAC 38266175
          |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACAAAACTTTAGCATATTAACCTGTTGTCCAACCTTATATAAGCAGTTTGTATTTAAAAC 120

 38266176 ATCCCTAAGTGGATTTTAATTCCAGTTTCAATCATTGTTAACTATTTTTGAAATATTTAA 38266235
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATCCCTAAGTGGATTTTAATTCCAATTTCAATCATTGTTAACTATTTTTGAAATATTTAA 180

 38266236 AATCCCA 38266242
          |||||||
      181 AATCCCA 187

EXCISED REGION

 38266251 ACCACTATTTCTCTTCAACTAGTCCTTACTTTTATAAACAAAAAAGTAACAGTAAATAAT 38266310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      188 ACCACTATTTCTCTTCAACTAGTCCTTACTTTTATAAACAAAAAAGTAACAGTAAATAAT 247

 38266311 TTATAACTAGGTCTCTCTGAATCTAAAAACACGTTCTTATACACTATGTGATGCCATATT 38266370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
      248 TTATAACTAGGTCTCTCTGAATCTAAAAACACATTCTTATACACTATGTGATGCCATATT 307

 38266371 TTTTACTCTTGTCTTTGTGAGTTTTTTGTGCCATTCTCTCCTCTGGAATGGTCTTCTGTG 38266430
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      308 TTTTACTCTTGACTTTGTGAGTTTTTTGTGCCATTCTCTCCTCTGGAATGGTCTTCTGTG 367

 38266431 CTTACACATTCCAAGGGCTACTCCATTTTACAAGAAACAGTTCATGTTTGCTACTTTGGG 38266490
          .|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      368 TTTACACATTCCAAGGGCTAATCCATTTTACAAGAAACAGTTCATGTTTGCTACTTTGGG 427

 38266491 GTTGATCCCATGATAATTCTGGTTCTCACTTGGTCTTTCCCTGTGAGATGCAGTAGCATT 38266550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      428 GTTGATCCCATGATAATTCTGGTTCTCACTTGGTCTTTCCCTGTGAGATGCAGTAGCATT 487

 38266551 CAAAATTCTCAGACTATTCTATGCACCTTGGCAGATTTATGGTAATGGTCTATAATTGCT 38266610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      488 CAAAATTCTCAGACTATTCTATGCACCTTGGCAGATTTATGGTAATGGTCTATAATTGCT 547

 38266611 TCATATCTGCTAACCTTGCTTCCAAAACTAGTTTTTGAGATTAATGAGACAGGAGCTTGG 38266670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      548 TCATATCTGCTAACCTTGCTTCCAAAACTAGTTTTTGAGATTAATGAGACAGGAGCTTGG 607

 38266671 CTTTTTCTTTCTGTATAGCTTCCATAGCAACAAGAAAATATTAGACACACAGTAGGCATT 38266730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      608 CTTTTTCTTTCTGTATAGCTTCCATAGCAACAAGAAAATATTAGACACACAGTAGGCATT 667

 38266731 GGAAGAAAATGTGTTCAGTTAAATGAACTTGATTTGAATGGAATGAGAGTTCAATGAAAC 38266790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      668 GGAAGAAAATGTGTTCAGTTAAATGAACTTGATTTGAATGGAATGAGAGTTCAATGAAAC 727

 38266791 TGTATATATTGTGAAACGTGGCAACTTACACCTACTCAAGACATTAAAAGAGATCATGCT 38266850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
      728 TGTATATATTGTGAAACGTGGCAACTTACACCTACTCAAGACATAAAAAGAGATCATGCT 787

 38266851 TTCTTGCCTAAGTTTTATGTCCAATTTGTTCCTGTTTCAAACCCCTCGACAAAAACAAAA 38266910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      788 TTCTTGCCTAAGTTTTATGTCCAATTTGTTCCTGTTTCAAACCCCTCGACAAAAACAAAA 847

 38266911 TCTTTTAATCTGTTTGCAAAATATTTCCTCCTTCCTCCCATCTTGCTGTTGCTGCTCTGT 38266970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      848 TCTTTTAATCTGTTTGCAAAATATTTCCTCCTTCCTCCCATCTTGCTGTTGCTGCTCTGT 907

 38266971 GATATACTGCCCTTGCTTATTACCCCTTTATAGCTGTTTTGTTAAAGTTCATACCGCTAA 38267030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      908 GATATACTGCCCTTGCTTATTACCCCTTTATAGCTGTTTTGTTAAAGTTCATACCGCTAA 967

 38267031 GACCTGTAAAAGAAATTTATGGCTCTAGGGATTTCAGCAAATTCTAAATAACCATAACAG 38267090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      968 GACCTGTAAAAGAAATTTATGGCTCTAGGGATTTCAGCAAATTCTAAATAACCATAACAG 1027

 38267091 GAACAGGAAGCATTAATTAAAGACACTAGAGTCTAAGTTATAACAGAAATCCTGACATTT 38267150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1028 GAACAGGAAGCATTAATTAAAGACACTAGAGTCTAAGTTATAACAGAAATCCTGACATTT 1087

 38267151 AAGGCCCTGGTACCATTTAAATTTAAAATGGTATGACAAACAGAGAGTAATTTGATGGTC 38267210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1088 AAGGCCCTGGTACCATTTAAATTTAAAATGGTATGACAAACAGAGAGTAATTTGATGGTC 1147

 38267211 AGAAGGTTATAATGGATACCTTAATACCTTTGCCAAGAAAAAGTGTCTGTCCTTGCTCTA 38267270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1148 AGAAGGTTATAATGGATACCTTAATACCTTTGCCAAGAAAAAGTGTCTGTCCTTGCTCTA 1207

 38267271 ACCCCTACCCAGGGGCTTCAGGGGCCTCCTTCATAAAACATGGTGATGCCTAAATATTTT 38267330
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1208 ATCCCTACCCAGGGGCTTCAGGGGCCTCCTTCATAAAACATGGTGATGCCTAAATATTTT 1267

 38267331 TGCGATATCTCATATATAAGCTGGTCTTTTCTTTAAGAATACGAGAGATTAAACACCAAC 38267390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1268 TGCGATATCTCATATATAAGCTGGTCTTTTCTTTAAGAATACGAGAGATTAAACACCAAC 1327

 38267391 CCCCAACATTCATACACCAATTTTCAGATAAAACAGCTTAATATTTAAGATATATTTAGT 38267450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1328 CCCCAACATTCATACACCAATTTTCAGATAAAACAGCTTAATATTTAAGATATATTTAGT 1387

 38267451 GCAATTTGTCTATTTCTTGGTTTACTGGAGGGCTGTATTTAAAGCCAAGGGACCAAGGAA 38267510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1388 GCAATTTGTCTATTTCTTGGTTTACTGGAGGGCTGTATTTAAAGCCAAGGGACCAAGGAA 1447

 38267511 CATTCCACAACACACTAAAGCAATTTTTCCCCAGGGAATATGCTGATTCTTTCCTAAAGG 38267570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1448 CATTCCACAACACACTAAAGCAATTTTTCCCCAGGGAATATGCTGATTCTTTCCTAAAGG 1507

 38267571 CAGAAGCCGACATTCCTGACTCATTCTGCCAAACCAAGCAATGAAAAATGCTTCACCTAA 38267630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1508 CAGAAGCCGACATTCCTGACTCATTCTGCCAAACCAAGCAATGAAAAATGCTTCACCTAA 1567

 38267631 TTTGAAAGATAATTTGTAATACCAGAGACTCAACTTGTTTTGTGTATCCAATACTAGCAC 38267690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1568 TTTGAAAGATAATTTGTAATACCAGAGACTCAACTTGTTTTGTGTATCCAATACTAGCAC 1627

 38267691 CCTTTCCAGAATGTTGAAAGTACACACTGTATGATTTGTCTAATGTATATTCAAAAAAGG 38267750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1628 CCTTTCCAGAATGTTGAAAGTACACACTGTATGATTTGTCTAATGTATATTCAAAAAAGG 1687

 38267751 AATACAAATTGATCCTCAAAGTTCAAATCTGCAGTACATACTCTGTGTTCTGCCCCCACC 38267810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1688 AATACAAATTGATCCTCAAAGTTCAAATCTGCAGTACATACTCTGTGTTCTGCCCCCACC 1747

 38267811 CGTACCTTCATGAATTCTTTCACCTAGCACGCAGGCTGTTTTCCCTTTGCGAAATCCCAT 38267870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1748 CGTACCTTCATGAATTCTTTCACCTAGCACGCAGGCTGTTTTCCCTTTGCGAAATCCCAT 1807

 38267871 GGTACATTTATAGTATTAATACCACTCACTTAGAATATGCCGTATTTTGTCTAATATTGC 38267930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1808 GGTACATTTATAGTATTAATACCACTCACTTAGAATATGCCGTATTTTGTCTAATATTGC 1867

 38267931 TAGATTTTGTGTGTATAATCTTATTCCTCAAGTAAATTACAAGACAAGGACTATAATTTA 38267990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1868 TAGATTTTGTGTGTATAATCTTATTCCTCAAGTAAATTACAAGACAAGGACTATAATTTA 1927

 38267991 TACATCCTCTACAACACTTGACACTGGCTTTGATTAGGCTCTTAATAAATATTTGTTGGT 38268050
          ||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     1928 TACATCCTCTACAACACTTGGCACTGGCTTTGAGTAGGCTCTTAATAAATATTTGTTGGT 1987

 38268051 TGATTAATCAGTTGACCACACTTACTAATTGCAAGGTGACATCATTTATCATTAATAAAC 38268110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1988 TGATTAATCAGTTGACCACACTTACTAATTGCAAGGTGACATCATTTATCATTAATAAAC 2047

 38268111 ATATATGTGGATTACAAAAATATCATGTGAATTTGCATATAATCATATTAATCCCAAATT 38268170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2048 ATATATGTGGATTACAAAAATATCATGTGAATTTGCATATAATCATATTAATCCCAAATT 2107

 38268171 AGCACCTGAGAGTCCAACCACCCTCTCCTTTAGGCCCTTTTCACTTTTATGTCTACTTTT 38268230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2108 AGCACCTGAGAGTCCAACCACCCTCTCCTTTAGGCCCTTTTCACTTTTATGTCTACTTTT 2167

 38268231 GCCTCACTTACAATTCCACTACTTACTTGCCTTCTTTCTCTTTTCAGCTTTGTGCTGTTA 38268290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2168 GCCTCACTTACAATTCCACTACTTACTTGCCTTCTTTCTCTTTTCAGCTTTGTGCTGTTA 2227

 38268291 TTTAATATCTCACCAGTTGTGTAATTTCAGCTCCCAAATTGAATAAGACGTTCCCCCCAG 38268350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2228 TTTAATATCTCACCAGTTGTGTAATTTCAGCTCCCAAATTGAATAAGACGTTCCCCCCAG 2287

 38268351 TGGAACCCTCACCTTGACAAATAGCCAAATAGTA---ATTATTCCTTTCAGGGGTTGAGC 38268407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||
     2288 TGGAACCCTCACCTTGACAAATAGCCAAATAGTAATTATTATTCCTTTCAGGGGTTGAGC 2347

 38268408 TATGGAATCATGCTTGCAATATCCCAGGCTTGAGTGCCTAGATATTTATGCTATACTTCC 38268467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2348 TATGGAATCATGCTTGCAATATCCCAGGCTTGAGTGCCTAGATATTTATGCTATACTTCC 2407

 38268468 CTGTGTCGGAGTTTCCATCTGCGATTGTATTTCAAGCCCTCTCATTTTTTTTTTCAATAT 38268527
          ||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
     2408 CTGTGTCGGAGTTTCCGTCTGCGATTGTATTTCAAGCCCTCTCA-TTTTTTTTTCAATAT 2466

 38268528 GATTAAGATAATTCCTTTATGAAGTTGGAAACTCAGACATTCAGAAAGAAACTTGACGTT 38268587
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2467 GATTAAGATAATTCCTTTATGAAGCTGGAAACTCAGACATTCAGAAAGAAACTTGACGTT 2526

 38268588 TCATATTTTTGCTAACTTGCTCTTCCCATTTCCTTTCCTATCATTTTAGCCAGACTGAGG 38268647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2527 TCATATTTTTGCTAACTTGCTCTTCCCATTTCCTTTCCTATCATTTTAGCCAGACTGAGG 2586

 38268648 GAGAATTAATTTTGCAATGGTCTCTATTTTTTTTTCCAAATGTGTGACCTCCATATTAAT 38268707
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2587 GAGAATTAATTTTGCAACGGTCTCTATTTTTTTTTCCAAATGTGTGACCTCCATATTAAT 2646

 38268708 AGGAGCCAGAGTACTCATTCATCACATCTGGTCAGTGTGAAACTGACATTTACAGGGTGG 38268767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2647 AGGAGCCAGAGTACTCATTCATCACATCTGGTCAGTGTGAAACTGACATTTACAGGGTGG 2706

 38268768 AATGTTTCCCACTCAGGACAAATGGGGATCATTTGTAAAACATGCCGCACCCAATCATAG 38268827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     2707 AATGTTTCCCACTCAGGACAAATGGGGATCATTTGTAAAACATGCCACACCCAATCATAG 2766

 38268828 GTTCCCATGGATCTCCAACTACATTTTTAAGCAACAATATAAACCATTCCCGAAACTGAA 38268887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2767 GTTCCCATGGATCTCCAACTACATTTTTAAGCAACAATATAAACCATTCCCGAAACTGAA 2826

 38268888 AGGTCTTTTCAAATATTTACTGCCTACCTATGGAATTTTTATTCTGCTTGCTGCTGCCAT 38268947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2827 AGGTCTTTTCAAATATTTACTGCCTACCTATGGAATTTTTATTCTGCTTGCTGCTGCCAT 2886

 38268948 CAATAATCCTGGGAGTTCCTAGCTAAGTGTTGTGTATGACCTCCAAGGAAAGTCTTAGCA 38269007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2887 CAATAATCCTGGGAGTTCCTAGCTAAGTGTTGTGTATGACCTCCAAGGAAAGTCTTAGCA 2946

 38269008 TTGCAGAATGGGGAGGCGGGTTAGTATCCTGCATTTTTCATTCTGTCACTTTCTAGGGAC 38269067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2947 TTGCAGAATGGGGAGGCGGGTTAGTATCCTGCATTTTTCATTCTGTCACTTTCTAGGGAC 3006

 38269068 AATTACAAAGAAAATAATC 38269086
          |||||||||||||||||||
     3007 AATTACAAAGAAAATAATC 3025

Alignment time is 2.96844 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38249892,38276749] =>     26858 nucs '18 dna:chromosome chromosome:GRCh37:18:1:78077248:1'
Second seq [       1,    4697] =>      4697 nucs 'mol-32-29be-058538_4697'

Score:        4508
Aligned:      4695        nucs
Identic:      4678 (100%) nucs =>      1582 (100%)      3096 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38257720,38259308] EXCISED REGION [38259311,38262416]
 second seq =>  [       1,    1589] EXCISED REGION [    1592,    4697]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [38259309,38259310]
 second seq =>         2 nucs [1590,1591]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [38259309,38259311] to [38259311,38259313]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [38259306,38259308] to [38259311,38259313]
 second seq =>         3 nucs [1587,1589] to [1592,1594]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 38257720 ACTGCGCCCATAGAAAAGATTAGTTCTTTCTGAACTTTTAAACACCATTCAGCAGTGTTC 38257779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACTGCGCCCATAGAAAAGATTAGTTCTTTCTGAACTTTTAAACACCATTCAGCAGTGTTC 60

 38257780 ACCATTCTCTCTAACTTAAAACACTGTCCCTCATAACATATTTAAAAAATTCTATTTCTT 38257839
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
       61 ACCATTCTCTCTAACTTAAAACACTGTCCCTCATAACATATTTAAAAAATTATATTTCTT 120

 38257840 ACTGTTATTTCTCAGATTCTTGTATAGGCCACAGTTCTTTCAGTAGAACTCTAACCAATT 38257899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACTGTTATTTCTCAGATTCTTGTATAGGCCACAGTTCTTTCAGTAGAACTCTAACCAATT 180

 38257900 TCCGTACATGTAAGTATCATAAATATACTAATGACTCTGAACATTATATATCTTGCCTCA 38257959
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCCATACATGTAAGTATCATAAATATACTAATGACTCTGAACATTATATATCTTGCCTCA 240

 38257960 TGCATGAATACCCAAATGTTTTCCTGTAATCACAAAATGAACATCTCAAAGTGACCACAA 38258019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGCATGAATACCCAAATGTTTTCCTGTAATCACAAAATGAACATCTCAAAGTGACCACAA 300

 38258020 ATTTGACATGTTCCGAAGTAATTAAATTTTGATATTCTCTGCCAAAAGCTGCTCTAGAAA 38258079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATTTGACATGTTCCGAAGTAATTAAATTTTGATATTCTCTGCCAAAAGCTGCTCTAGAAA 360

 38258080 TTTTGCCACTCCTTCTTCATCTTAGAAAATGCTATTATTCTCCACCAAAGGCAAATAACC 38258139
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
      361 TTTTGCCACTCCTTCTTCATCTTAGAAAATGCTATCATTCTCCACCAAAGGCAAATAACC 420

 38258140 AAGAGTCATTACTAGAAAATTTGTCTCCTTTACCACTCATGCCCAATATAGATCAAATTC 38258199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAGAGTCATTACTAGAAAATTTGTCTCCTTTACCACTCATGCCCAATATAGATCAAATTC 480

 38258200 TTTAAGATCTTTTCCTCAATAAACCTCAAGTCTGTCACCTTTTCTATTACCACATTTTTT 38258259
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTAAGATCTTTTCCTCAATAAATCTCAAGTCTGTCACCTTTTCTATTACCACATTTTTT 540

 38258260 CTAAGTCTCAATCATCTCTCAATTAGATCATTATAGTAATCTTCTAAGTGGTGTTGGGGT 38258319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTAAGTCTCAATCATCTCTCAATTAGATCATTATAGTAATCTTCTAAGTGGTGTTGGGGT 600

 38258320 GTCGTCTCCCGGCTACTTCAATCCATTTTCCAATATTAAGTTTATTTGTTTAATTAAACA 38258379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTCGTCTCCCGGCTACTTCAATCCATTTTCCAATATTAAGTTTATTTGTTTAATTAAACA 660

 38258380 TGTTAACTTGTGGTGCTCTTATGCTTAAAAAGTTTCATTAGCTTTCTATTTATATAATGA 38258439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGTTAACTTGTGGTGCTCTTATGCTTAAAAAGTTTCATTAGCTTTCTATTTATATAATGA 720

 38258440 ATGAAACCAATGTTTAGCCTAGTTTAAGAAATGTAAGAACTCCTTTTACCCTAGCTTTCT 38258499
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
      721 ATGAAACCAATGTTTAGCCTAGTTTAAGAAATGTAAGAACTCCCTTTACCCTAGCTTTCT 780

 38258500 TCCTGTTTACTTTTATTCATCATGCCTTGAATCATACCTATCTTCTTTAATTTTCTCTAA 38258559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCCTGTTTACTTTTATTCATCATGCCTTGAATCATACCTATCTTCTTTAATTTTCTCTAA 840

 38258560 CACAAAATCCTCCTGTTTCTTCTTTGCAATCCTGCAAACCCAAACCCAGCAGCTAGTAAA 38258619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CACAAAATCCTCCTGTTTCTTCTTTGCAATCCTGCAAACCCAAACCCAGCAGCTAGTAAA 900

 38258620 TATTCAATATATATGAATTAATTAATTGATGAATGAGTGATTTTATTTCAGATTGCTATC 38258679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TATTCAATATATATGAATTAATTAATTGATGAATGAGTGATTTTATTTCAGATTGCTATC 960

 38258680 AAATGCTCAATTCCCCTGCATAGTATCTCCAATGAGTCAAATCCTGGAATTCCCTATAGG 38258739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AAATGCTCAATTCCCCTGCATAGTATCTCCAATGAGTCAAATCCTGGAATTCCCTATAGG 1020

 38258740 AACACCTGGGATATATAGTATCAACTTACAAATACCATTCTTTCTTAATTTTGAAAGAAA 38258799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AACACCTGGGATATATAGTATCAACTTACAAATACCATTCTTTCTTAATTTTGAAAGAAA 1080

 38258800 AACTGAGTAAAATATGAGAGCTGTAGCTTTTAAAAAAAATAGAAAATACACCATAAAAAT 38258859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AACTGAGTAAAATATGAGAGCTGTAGCTTTTAAAAAAAATAGAAAATACACCATAAAAAT 1140

 38258860 TTTAGTCAAGCATGGCAGACTAAATACATGTATTTATTTCTAATCTACTTCAAGCTCCAA 38258919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTTAGTCAAGCATGGCAGACTAAATACATGTATTTATTTCTAATCTACTTCAAGCTCCAA 1200

 38258920 TATAATAACTGTTTACAAATGAAATGGTCTAATATCACAAGTTCAAAATTAATAAGAGTG 38258979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TATAATAACTGTTTACAAATGAAATGGTCTAATATCACAAGTTCAAAATTAATAAGAGTG 1260

 38258980 GATGAGACATGCCAACAAATTTTTGGAATGTAAAAATAGATAAGACATTGTTAATGATTT 38259039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GATGAGACATGCCAACAAATTTTTGGAATGTAAAAATAGATAAGACATTGTTAATGATTT 1320

 38259040 GACAAAGCACAAAGCCTTAAAATATTTCTGTATAGAGAGAAGTTTCCAAAGTAGGGCAAC 38259099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GACAAAGCACAAAGCCTTAAAATATTTCTGTATAGAGAGAAGTTTCCAAAGTAGGGCAAC 1380

 38259100 TCAGAGATAAATCAAGAATGGGAAGATTCACACACCTCAACTGTAAAAGAGAAATATGAG 38259159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TCAGAGATAAATCAAGAATGGGAAGATTCACACACCTCAACTGTAAAAGAGAAATATGAG 1440

 38259160 ACTAAAAGCAGTGGATTAATTAAAACTTTGTTTGATGAGATATTATACATAGATGTCTTC 38259219
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ACTAAAAGCAGTGGATTCATTAAAACTTTGTTTGATGAGATATTATACATAGATGTCTTC 1500

 38259220 TCCATCATTCCAAGCACTTAAGCAGCTGCCCTTTCCAAACACTCATAGAGGATAAGAGAT 38259279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     1501 TCCATCATTCCAAGCACTTAAGCAGCTGCCCTTTACAAACACTCATAGAGGATAAGAGAT 1560

 38259280 TATTTTCTATAAAAATCAAACCAGATTGT 38259308
          |||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TATTTTCTATAAAAATCAAACCAGATTGT 1589

EXCISED REGION

 38259311 TGTACATCAAGCAAAGGAGGGATGGCAGGGAGGTGATATACTGAAACAGAATTACTGTAT 38259370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1592 TGTACATCAAGCAAAGGAGGGATGGCAGGGAGGTGATATACTGAAACAGAATTACTGTAT 1651

 38259371 GAAAACCTGGAATGAACAATTAGATACTCAGTTCTCCTTACCTGCACAGTAATAGTAATT 38259430
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1652 GAAAACATGGAATGAACAATTAGATACTCAGTTCTCCTTACCTGCACAGTAATAGTAATT 1711

 38259431 CTTACTACCAGACTGGATGCTGGAGGGCTCTCCTTCAGAGAAACAGAAAAGAAAAAAAAG 38259490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1712 CTTACTACCAGACTGGATGCTGGAGGGCTCTCCTTCAGAGAAACAGAAAAGAAAAAAAAG 1771

 38259491 CCTATAGCCACTAATATTTGAATCTCTGCAATTAAATACCTGGGTCCCTTCCCAATCATA 38259550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1772 CCTATAGCCACTAATATTTGAATCTCTGCAATTAAATACCTGGGTCCCTTCCCAATCATA 1831

 38259551 TAGCAGTGATGCTCACCAGTTAACAAGAACTGAAGACACATGACAGATTCCAATCAGTGA 38259610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1832 TAGCAGTGATGCTCACCAGTTAACAAGAACTGAAGACACATGACAGATTCCAATCAGTGA 1891

 38259611 TTTATTACCACTGTCAAATAAGAATGGACACTCAAAGATTACCTGAAAAAGTCCTTTAAT 38259670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1892 TTTATTACCACTGTCAAATAAGAATGGACACTCAAAGATTACCTGAAAAAGTCCTTTAAT 1951

 38259671 ATGGCCCCAGATTGAATAATTCCTAATTTCCTATATCATAAATTCAAAAATTATCTAAAA 38259730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1952 ATGGCCCCAGATTGAATAATTCCTAATTTCCTATATCATAAATTCAAAAATTATCTAAAA 2011

 38259731 TTCAGTGAAATTAGTCCATATTATCAATGCCAACCTTACACATAAACAGAGTTGACATTC 38259790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2012 TTCAGTGAAATTAGTCCATATTATCAATGCCAACCTTACACATAAACAGAGTTGACATTC 2071

 38259791 TCTTATGATGCTGAACAATGCAGATGAAGAACGCTGGCTTTGGATTAAGAAGACCCTTAG 38259850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2072 TCTTATGATGCTGAACAATGCAGATGAAGAACGCTGGCTTTGGATTAAGAAGACCCTTAG 2131

 38259851 TTTGAATTTTAATTTTGACCCATGATAGCTGTGTAAACTTAGTCAAAATTCTTCAGTTAT 38259910
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     2132 TTTGAATTTTAATTTTGACCCATGATAGCTGTGTAAACTTAGTAAAAATTCTTCAGTTAT 2191

 38259911 TGAGCTGATGCTTTAGCCTGAGTTAAACAGAGAACAGAGCCTAAGGTAGAGGGTTTCTAT 38259970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2192 TGAGCTGATGCTTTAGCCTGAGTTAAACAGAGAACAGAGCCTAAGGTAGAGGGTTTCTAT 2251

 38259971 TCTATTCTTTCATAATGGATTGCTGGGCAAGATAACAAAAGCAATGGATAAGCACAGAAA 38260030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2252 TCTATTCTTTCATAATGGATTGCTGGGCAAGATAACAAAAGCAATGGATAAGCACAGAAA 2311

 38260031 TGCAGGGCAGAAGAGAGAGCCATGAGGAAGATATATTATCAGGGTGGTTGCCATTAAGTG 38260090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2312 TGCAGGGCAGAAGAGAGAGCCATGAGGAAGATATATTATCAGGGTGGTTGCCATTAAGTG 2371

 38260091 AAACCAGTTACCCAGTTTAATGGAATTATCCCCAGGGAGCAAGGTCTGTGGCATCTCAAG 38260150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     2372 AAACCAGTTACCCAGTTTAATGGAATTATCCCCAGGGAGCAAGGTCAGTGGCATCTCAAG 2431

 38260151 ACTCTTTATCAAAGAGGAGAATGGGAGAAAAATCATCTTTTTTGTATTTCCTACTGTTCA 38260210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2432 ACTCTTTATCAAAGAGGAGAATGGGAGAAAAATCATCTTTTTTGTATTTCCTACTGTTCA 2491

 38260211 AAAGTTTGTCCCTTGCTTTCCTGGTTATGAATGCATGGAAGTCTAGTTGAAGTCCAGCAA 38260270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     2492 AAAGTTTGTCCCTTGCTTTCCTGGTTATGAATGCATGGAAGTCTAGTTGAAGTCCACCAA 2551

 38260271 AGACATCAACAAGGAATCATAGGAAAGAGATAAAAGGCCTGAGACATGGATATAAGGGAA 38260330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2552 AGACATCAACAAGGAATCATAGGAAAGAGATAAAAGGCCTGAGACATGGATATAAGGGAA 2611

 38260331 GGTAGTGTTAAGTGGCACCTTTTTGGGAGTCCAAACTGAGCAGGAGTAAAACTGAAGCAA 38260390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2612 GGTAGTGTTAAGTGGCACCTTTTTGGGAGTCCAAACTGAGCAGGAGTAAAACTGAAGCAA 2671

 38260391 CTGCTTTAACTAAGACATGTGTGCCCACAAAGACCTGAAGTGACACATGAGCTTTCACAG 38260450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2672 CTGCTTTAACTAAGACATGTGTGCCCACAAAGACCTGAAGTGACACATGAGCTTTCACAG 2731

 38260451 TTTTTTAACTGTAAAATGGTAATGATATCACCTATGTTTCTGGATTACTACAAATATTAA 38260510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2732 TTTTTTAACTGTAAAATGGTAATGATATCACCTATGTTTCTGGATTACTACAAATATTAA 2791

 38260511 ATAGCATAAATGGCACACTTGCAAAGCATATTTTAATAAACATATTTAATATTTCCCTTA 38260570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2792 ATAGCATAAATGGCACACTTGCAAAGCATATTTTAATAAACATATTTAATATTTCCCTTA 2851

 38260571 TTGATTTCTTTAATCAATAAAAGCATTTCTGAAATTTGTGTAAAGGTCTAGATGAAGGGA 38260630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2852 TTGATTTCTTTAATCAATAAAAGCATTTCTGAAATTTGTGTAAAGGTCTAGATGAAGGGA 2911

 38260631 CATTGGACATGCTTTGATAATCATTGAGACTGGGTGATAGATAAATGATTGTCATGGTCT 38260690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2912 CATTGGACATGCTTTGATAATCATTGAGACTGGGTGATAGATAAATGATTGTCATGGTCT 2971

 38260691 TTACTTTGATATGCATGTTTGACATCTTTGTAAACATAGTTTTAAAAATAATATTTGTAA 38260750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2972 TTACTTTGATATGCATGTTTGACATCTTTGTAAACATAGTTTTAAAAATAATATTTGTAA 3031

 38260751 AATTTAAAAACAGAAACAAATAATTCTGATTTCAAAGGTCAACTAATAGACTCCTAGTCA 38260810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3032 AATTTAAAAACAGAAACAAATAATTCTGATTTCAAAGGTCAACTAATAGACTCCTAGTCA 3091

 38260811 TGTCAGGATATCAATGCCTATCTCATTCACTTTCTGGTGCTTAAAAAATAATAAAAGTAA 38260870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3092 TGTCAGGATATCAATGCCTATCTCATTCACTTTCTGGTGCTTAAAAAATAATAAAAGTAA 3151

 38260871 TTATTTCCCAATCTTCACTTTCTACAATGCTAAACTATTTATTTCTCCTTTTCTGAGCCC 38260930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     3152 TTATTTCCCAATCTTCACTTTCTACAATGCTAAACTATTTATTTGTCCTTTTCTGAGCCC 3211

 38260931 ACATGCTTTCCTCAATGAATGTTACCGAGATGGAATTTATATCTTATATTTCAGGTGTAT 38260990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3212 ACATGCTTTCCTCAATGAATGTTACCGAGATGGAATTTATATCTTATATTTCAGGTGTAT 3271

 38260991 TTACATTCATTTCTTCCCCACTATGTTGCAAACAAGTTGTTTTGCCCATTTGTTCTTATC 38261050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3272 TTACATTCATTTCTTCCCCACTATGTTGCAAACAAGTTGTTTTGCCCATTTGTTCTTATC 3331

 38261051 CTGAGGTCATGAAAACATCTAACTCTACTATCTTCCAGAAGCTATATTGTCTTGCCTTTG 38261110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3332 CTGAGGTCATGAAAACATCTAACTCTACTATCTTCCAGAAGCTATATTGTCTTGCCTTTG 3391

 38261111 ACCTTAAGGATTATGGTCTTGAATTAATTTTTGTATGTGTAAGTGACCACACAAACTTGT 38261170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3392 ACCTTAAGGATTATGGTCTTGAATTAATTTTTGTATGTGTAAGTGACCACACAAACTTGT 3451

 38261171 TAGAAATCTAGTTTCAAGTATTTTTTTCATATGGATTCAAATTACACCACCAGTACACGC 38261230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     3452 TAGAAATCTAGTTTCAAGTATTTTTTTCATATGGATTCAAATTACACCACCAGTACACAC 3511

 38261231 ATATTGAAAAAAAGTATTTTTCTACTGTTTTGCAATGGAAATATTGATATAAATCAAGTA 38261290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3512 ATATTGAAAAAAAGTATTTTTCTACTGTTTTGCAATGGAAATATTGATATAAATCAAGTA 3571

 38261291 CCCATATATGCACAGGTCAGTTTATGAACTTGCTATTTTGTTGTACTGGTTTGTTTGTAT 38261350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3572 CCCATATATGCACAGGTCAGTTTATGAACTTGCTATTTTGTTGTACTGGTTTGTTTGTAT 3631

 38261351 ATATTTTTTGCCCTGATAAGACACTGCCTTAGTTATTGCAACTTCTGTTATAAGCTTTGA 38261410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3632 ATATTTTTTGCCCTGATAAGACACTGCCTTAGTTATTGCAACTTCTGTTATAAGCTTTGA 3691

 38261411 GATCTGAGAAAGAAAGTTATTCCAGCTACTTATTTTGTATTTGCTATCTTTGGTCTTTTG 38261470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3692 GATCTGAGAAAGAAAGTTATTCCAGCTACTTATTTTGTATTTGCTATCTTTGGTCTTTTG 3751

 38261471 CATTTATATAAATTTTATAATCAGTTTGTCAATTACTAAAACAAAATGTACTGGGATTTT 38261530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3752 CATTTATATAAATTTTATAATCAGTTTGTCAATTACTAAAACAAAATGTACTGGGATTTT 3811

 38261531 GATTGGGACTGCATTGAATATAAAGATCAATATGGAGAGTATTGACTTCTTCAAAATGTT 38261590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3812 GATTGGGACTGCATTGAATATAAAGATCAATATGGAGAGTATTGACTTCTTCAAAATGTT 3871

 38261591 GAGTCTTCCAGGCCATGAAGAGGGAATATCCTTTTAATTATTTAGGACATCATTAATTTT 38261650
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3872 GAGTCTTCCAAGCCATGAAGAGGGAATATCCTTTTAATTATTTAGGACATCATTAATTTT 3931

 38261651 TCTAAATAAATAAGTGCAATTCCTTTCCAGAGGTCTTCACATATCTGGTTAACTTTTGTT 38261710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3932 TCTAAATAAATAAGTGCAATTCCTTTCCAGAGGTCTTCACATATCTGGTTAACTTTTGTT 3991

 38261711 CTTGTGTATATTTATGCTATTATAAATGCTAAACATGGTTACTTTCCCTTTCTGTTGGTT 38261770
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||
     3992 CTTGTGTATATTTATGCTATTATAAATGCTAAACATGTTTACTTTCCCTTTCTATTGGTT 4051

 38261771 AGCGATACATAGAAATGGAATTTCTTTTTGAATATTCAATCCGCGTATTAGTTTTCTAAT 38261830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4052 AGCGATACATAGAAATGGAATTTCTTTTTGAATATTCAATCCGCGTATTAGTTTTCTAAT 4111

 38261831 GGTGTTGTGACGAATTACACCAACTTAGTGGCTTTAAAACAACACCCATTTATTATCTCA 38261890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4112 GGTGTTGTGACGAATTACACCAACTTAGTGGCTTTAAAACAACACCCATTTATTATCTCA 4171

 38261891 CAGTTTAATCAGTTAGAAGTCTGGACTCAGCGTGGCTCAGTTGGATGTCTTTCTAGAGGC 38261950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4172 CAGTTTAATCAGTTAGAAGTCTGGACTCAGCGTGGCTCAGTTGGATGTCTTTCTAGAGGC 4231

 38261951 TCTGTGGACGATTTTTTTCCCAACATCATGAAAATTATTGGCATAATTCAGTTCCACGGA 38262010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4232 TCTGTGGACGATTTTTTTCCCAACATCATGAAAATTATTGGCATAATTCAGTTCCACGGA 4291

 38262011 GTTACAGGACTGATTTCCCTTTTTTTTCTTACTAGCTTTAGCCAGGGTTTATTCTCAGCT 38262070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4292 GTTACAGGACTGATTTCCCTTTTTTTTCTTACTAGCTTTAGCCAGGGTTTATTCTCAGCT 4351

 38262071 TCGAGAGGGCACTCACATTCTTGGCTCATTCCTCCATCTTGAAAGCCAGCAATAGTGAGT 38262130
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4352 TCGAGAGGGCACTCACATTCTTGGTTCATTCCTCCATCTTGAAAGCCAGCAATAGTGAGT 4411

 38262131 CAACTTCTTCTCTTGTTTTAAGTTTCTGTGACCTCACTTTCTGCTTCATCTCTTTTCTGC 38262190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4412 CAACTTCTTCTCTTGTTTTAAGTTTCTGTGACCTCACTTTCTGCTTCATCTCTTTTCTGC 4471

 38262191 TTCATCTCTTCTCCGCCTCCTTCTCTGTCAGATCTCTCTTACTTTTCTGCCTTCCTTTTC 38262250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4472 TTCATCTCTTCTCCGCCTCCTTCTCTGTCAGATCTCTCTTACTTTTCTGCCTTCCTTTTC 4531

 38262251 TGCTTTTAAGTGCTCCAGTTATTACATTGGGCCCGACCAGGTAACCCAGGTTAACCACTC 38262310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4532 TGCTTTTAAGTGCTCCAGTTATTACATTGGGCCCGACCAGGTAACCCAGGTTAACCACTC 4591

 38262311 CATTTTAAAGTTAACTGATTAATAATCTTAATAACTTCTGGCCAGGTGCAGTGGCTCACG 38262370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4592 CATTTTAAAGTTAACTGATTAATAATCTTAATAACTTCTGGCCAGGTGCAGTGGCTCACG 4651

 38262371 CCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGTCGCGTGGATCACGAG 38262416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4652 CCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGTCGCGTGGATCACGAG 4697

Alignment time is 4.56264 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38249892,38276749] =>     26858 nucs '18 dna:chromosome chromosome:GRCh37:18:1:78077248:1'
Second seq [       1,    7509] =>      7509 nucs 'mol-32-29df-041385_7509'

Score:        7135
Aligned:      7518        nucs
Identic:      7475 ( 99%) nucs =>      3662 ( 99%)      3813 ( 99%)
Gaps:           16 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38256212,38259892] EXCISED REGION [38266750,38270579]
 second seq =>  [       1,    3680] EXCISED REGION [    3681,    7509]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6857 nucs [38259893,38266749]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [38259893,38259893] to [38266750,38266750]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [38259893,38259893] to [38266749,38266749]
 second seq =>         0 nucs

 38256212 ATTCTTAGTAAGATAAAGTATATAATGATATAATTAAAATTTAAAATCAGAATTATTAAA 38256271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATTCTTAGTAAGATAAAGTATATAATGATATAATTAAAATTTAAAATCAGAATTATTAAA 60

 38256272 TCTCAAAATTTGGAAGAATCACACCAGTCATTTAGACCAATCTCACTGCCTTTGTTTCTA 38256331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCTCAAAATTTGGAAGAATCACACCAGTCATTTAGACCAATCTCACTGCCTTTGTTTCTA 120

 38256332 CCAAACACTAGTTACTATGTTTAGTATTAATATATTCAACACCTATATGGATCCAATTTC 38256391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCAAACACTAGTTACTATGTTTAGTATTAATATATTCAACACCTATATGGATCCAATTTC 180

 38256392 TAGACTCTCACTTTGACATCTTCTTCTATCATGAACATTTCTTCCACTCAGCTCCATTTA 38256451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TAGACTCTCACTTTGACATCTTCTTCTATCATGAACATTTCTTCCACTCAGCTCCATTTA 240

 38256452 TTTACTCCTATGGCCACTGCCGAAACTTTACCAGCACCGGAAACTACATCTTAATGTCAG 38256511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTTACTCCTATGGCCACTGCCGAAACTTTACCAGCACCGGAAACTACATCTTAATGTCAG 300

 38256512 GGAACCAGTATCCACTTGTCTAGAATGACATCTTATCCTTGCAACTCACTTGATCTAAGA 38256571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GGAACCAGTATCCACTTGTCTAGAATGACATCTTATCCTTGCAACTCACTTGATCTAAGA 360

 38256572 TCTGCTCTGGAATTGTTTTTCAACTTATCAAGAGCCCCAATTTACTTCTCTCTTTATATC 38256631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCTGCTCTGGAATTGTTTTTCAACTTATCAAGAGCCCCAATTTACTTCTCTCTTTATATC 420

 38256632 AATCACCCCTCCACCACTCTGTTTTATCTCCATAATTATTGTCCTCATATGCTGTAGTTA 38256691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AATCACCCCTCCACCACTCTGTTTTATCTCCATAATTATTGTCCTCATATGCTGTAGTTA 480

 38256692 GTAAATACAAACTTCAGTGTCTTTCTCTGAAATCATTGTACTACCAGATAAAACCACACC 38256751
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTAAATACAAACTTCAGTGTCCTTCTCTGAAATCATTGTACTACCAGATAAAACCACACC 540

 38256752 CTTATATGCAATCAACTACTGGCTTTTTTTTTTTTTTAATCTTTGCACACATGCTCAGTG 38256811
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
      541 CTTATATGCAATCAACTACTGGCTTTTTTTTTTTTT-AATCTTTGCACACATGCTCAGTG 599

 38256812 GAGACTGCTTGTGATTGTGCCTTACTGAGGCAGATGATGATTCAGACAAGTTACTCTATT 38256871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      600 GAGACTGCTTGTGATTGTGCCTTACTGAGGCAGATGATGATTCAGACAAGTTACTCTATT 659

 38256872 ACTCATAGAACCAACTTCAAATAGGCACGTAACTCTACACAACAATACTATCTCACTATA 38256931
          |||||||||||||||||||||.||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
      660 ACTCATAGAACCAACTTCAAACAGGCACATAACTCTACACAACAATACTATCTCACTATA 719

 38256932 TTTTAAAAAATTATCCTCTCATTACCAGTAATACTTTAGCATCTTCCCCACTCCCTTCAA 38256991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      720 TTTTAAAAAATTATCCTCTCATTACCAGTAATACTTTAGCATCTTCCCCACTCCCTTCAA 779

 38256992 CCTCAACAACCTGGATAACTAGTATGAAGGGCTTTACTGACAAAATGGAAGCCATGAAAC 38257051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      780 CCTCAACAACCTGGATAACTAGTATGAAGGGCTTTACTGACAAAATGGAAGCCATGAAAC 839

 38257052 AGAAATTCATCCTACCACCACCTTCTGTATCTCATTTCTTCTTGTTTCTCCTTTTTGCAG 38257111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 AGAAATTCATCCTACCACCACCTTCTGTATCTCATTTCTTCTTGTTTCTCCTTTTTGCAG 899

 38257112 CAGAGAATGTGACCCTGCGGTCCCCTGAAGTCAGTTTCTCCAAACGTGGACTTTACTTTC 38257171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 CAGAGAATGTGACCCTGCGGTCCCCTGAAGTCAGTTTCTCCAAACGTGGACTTTACTTTC 959

 38257172 TCAACACATTTGTTCCTTCAGTTATTCCCACTGTAGCAACTTTGTCTCTGTCTCTCAATT 38257231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
      960 TCAACACATTTGTTCCTTCAGTTATTCCCACTGTAGCAACTTTGTCTCTGTCTCTCAACT 1019

 38257232 AGATAATTCCTACTGACAAATAGGCTATAACACCTCACATCTTTAAAAGAATACACATTT 38257291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 AGATAATTCCTACTGACAAATAGGCTATAACACCTCACATCTTTAAAAGAATACACATTT 1079

 38257292 CATGTAATTGCTGTCTGCACCAGTATCTCCAATTCTTTATCTCCTATTATCTTTGTCAAC 38257351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 CATGTAATTGCTGTCTGCACCAGTATCTCCAATTCTTTATCTCCTATTATCTTTGTCAAC 1139

 38257352 CCTCTCCAGCCTGCCTACTGTTCCCACTACCCTACTCAATTCCTCCCGCCAAGGCATTGT 38257411
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     1140 CCTCTCCAGCCTGCCTACTGTTCCCACTACTCTACTCAATTCCTCCCGCCAAGGCATTGT 1199

 38257412 TGGTCCTTACCTTTCAAAACTTTTTTTTGTTTTTGTTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCTG 38257471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 TGGTCCTTACCTTTCAAAACTTTTTTTTGTTTTTGTTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCTG 1259

 38257472 TCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGATCTCTGCTTACTGCAACCTCCACCTCACCAGT 38257531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 TCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGATCTCTGCTTACTGCAACCTCCACCTCACCAGT 1319

 38257532 TCAAGTGATTCACTAGTCTGAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGACACATGCCACCAT 38257591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     1320 TCAAGTGATTCACTAGTCTGAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGCACATGCCACCAT 1379

 38257592 GCCCGGCTAATTTTTGCATTTTTAGTAGAGACGAGGTTTCACCATGCTGGTCAGGCTGGT 38257651
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 GCTCGGCTAATTTTTGCATTTTTAGTAGAGACGAGGTTTCACCATGCTGGTCAGGCTGGT 1439

 38257652 CTCAAACTCCTGACCTCGTGATCCGCTTGCCTTGGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACCGG 38257711
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 CTCAAACTCCTGACCTCGTGATCCGCCTGCCTTGGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACCGG 1499

 38257712 CGTGAGCCACTGCGCCCATAGAAAAGATTAGTTCTTTCTGAACTTTTAAACACCATTCAG 38257771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 CGTGAGCCACTGCGCCCATAGAAAAGATTAGTTCTTTCTGAACTTTTAAACACCATTCAG 1559

 38257772 CAGTGTTCACCATTCTCTCTAACTTAAAACACTGTCCCTCATAACATATTTAAAAAATTC 38257831
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     1560 CAGTGTTCACCATTCTCTCTAACTTAAAACACTGTCCCTCATAACATATTTAAAAAATTA 1619

 38257832 TATTTCTTACTGTTATTTCTCAGATTCTTGTATAGGCCACAGTTCTTTCAGTAGAACTCT 38257891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 TATTTCTTACTGTTATTTCTCAGATTCTTGTATAGGCCACAGTTCTTTCAGTAGAACTCT 1679

 38257892 AACCAATTTCCGTACATGTAAGTATCATAAATATACTAATGACTCTGAACATTATATATC 38257951
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 AACCAATTTCCATACATGTAAGTATCATAAATATACTAATGACTCTGAACATTATATATC 1739

 38257952 TTGCCTCATGCATGAATACCCAAATGTTTTCCTGTAATCACAAAATGAACATCTCAAAGT 38258011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 TTGCCTCATGCATGAATACCCAAATGTTTTCCTGTAATCACAAAATGAACATCTCAAAGT 1799

 38258012 GACCACAAATTTGACATGTTCCGAAGTAATTAAATTTTGATATTCTCTGCCAAAAGCTGC 38258071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 GACCACAAATTTGACATGTTCCGAAGTAATTAAATTTTGATATTCTCTGCCAAAAGCTGC 1859

 38258072 TCTAGAAATTTTGCCACTCCTTCTTCATCTTAGAAAATGCTATTATTCTCCACCAAAGGC 38258131
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     1860 TCTAGAAATTTTGCCACTCCTTCTTCATCTTAGAAAATGCTATCATTCTCCACCAAAGGC 1919

 38258132 AAATAACCAAGAGTCATTACTAGAAAATTTGTCTCCTTTACCACTCATGCCCAATATAGA 38258191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 AAATAACCAAGAGTCATTACTAGAAAATTTGTCTCCTTTACCACTCATGCCCAATATAGA 1979

 38258192 TCAAATTCTTTAAGATCTTTTCCTCAATAAACCTCAAGTCTGTCACCTTTTCTATTACCA 38258251
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     1980 TCAAATTCTTTAAGATCTTTTCCTCAATAAATCTCAAGTCTGTCACCTTTTCTATTACCA 2039

 38258252 CATTTTTTCTAAGTCTCAATCATCTCTCAATTAGATCATTATAGTAATCTTCTAAGTGGT 38258311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 CATTTTTTCTAAGTCTCAATCATCTCTCAATTAGATCATTATAGTAATCTTCTAAGTGGT 2099

 38258312 GTTGGGGTGTCGTCTCCCGGCTACTTCAATCCATTTTCCAATATTAAGTTTATTTGTTTA 38258371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 GTTGGGGTGTCGTCTCCCGGCTACTTCAATCCATTTTCCAATATTAAGTTTATTTGTTTA 2159

 38258372 ATTAAACATGTTAACTTGTGGTGCTCTTATGCTTAAAAAGTTTCATTAGCTTTCTATTTA 38258431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 ATTAAACATGTTAACTTGTGGTGCTCTTATGCTTAAAAAGTTTCATTAGCTTTCTATTTA 2219

 38258432 TATAATGAATGAAACCAATGTTTAGCCTAGTTTAAGAAATGTAAGAACTCCTTTTACCCT 38258491
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     2220 TATAATGAATGAAACCAATGTTTAGCCTAGTTTAAGAAATGTAAGAACTCCCTTTACCCT 2279

 38258492 AGCTTTCTTCCTGTTTACTTTTATTCATCATGCCTTGAATCATACCTATCTTCTTTAATT 38258551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 AGCTTTCTTCCTGTTTACTTTTATTCATCATGCCTTGAATCATACCTATCTTCTTTAATT 2339

 38258552 TTCTCTAACACAAAATCCTCCTGTTTCTTCTTTGCAATCCTGCAAACCCAAACCCAGCAG 38258611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 TTCTCTAACACAAAATCCTCCTGTTTCTTCTTTGCAATCCTGCAAACCCAAACCCAGCAG 2399

 38258612 CTAGTAAATATTCAATATATATGAATTAATTAATTGATGAATGAGTGATTTTATTTCAGA 38258671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 CTAGTAAATATTCAATATATATGAATTAATTAATTGATGAATGAGTGATTTTATTTCAGA 2459

 38258672 TTGCTATCAAATGCTCAATTCCCCTGCATAGTATCTCCAATGAGTCAAATCCTGGAATTC 38258731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 TTGCTATCAAATGCTCAATTCCCCTGCATAGTATCTCCAATGAGTCAAATCCTGGAATTC 2519

 38258732 CCTATAGGAACACCTGGGATATATAGTATCAACTTACAAATACCATTCTTTCTTAATTTT 38258791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 CCTATAGGAACACCTGGGATATATAGTATCAACTTACAAATACCATTCTTTCTTAATTTT 2579

 38258792 GAAAGAAAAACTGAGTAAAATATGAGAGCTGTAGCTTTTAAAAAAAATAGAAAATACACC 38258851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 GAAAGAAAAACTGAGTAAAATATGAGAGCTGTAGCTTTTAAAAAAAATAGAAAATACACC 2639

 38258852 ATAAAAATTTTAGTCAAGCATGGCAGACTAAATACATGTATTTATTTCTAATCTACTTCA 38258911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 ATAAAAATTTTAGTCAAGCATGGCAGACTAAATACATGTATTTATTTCTAATCTACTTCA 2699

 38258912 AGCTCCAATATAATAACTGTTTACAAATGAAATGGTCTAATATCACAAGTTCAAAATTAA 38258971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 AGCTCCAATATAATAACTGTTTACAAATGAAATGGTCTAATATCACAAGTTCAAAATTAA 2759

 38258972 TAAGAGTGGATGAGACATGCCAACAAATTTTTGGAATGTAAAAATAGATAAGACATTGTT 38259031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 TAAGAGTGGATGAGACATGCCAACAAATTTTTGGAATGTAAAAATAGATAAGACATTGTT 2819

 38259032 AATGATTTGACAAAGCACAAAGCCTTAAAATATTTCTGTATAGAGAGAAGTTTCCAAAGT 38259091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2820 AATGATTTGACAAAGCACAAAGCCTTAAAATATTTCTGTATAGAGAGAAGTTTCCAAAGT 2879

 38259092 AGGGCAACTCAGAGATAAATCAAGAATGGGAAGATTCACACACCTCAACTGTAAAAGAGA 38259151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2880 AGGGCAACTCAGAGATAAATCAAGAATGGGAAGATTCACACACCTCAACTGTAAAAGAGA 2939

 38259152 AATATGAGACTAAAAGCAGTGGATTAATTAAAACTTTGTTTGATGAGATATTATACATAG 38259211
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2940 AATATGAGACTAAAAGCAGTGGATTCATTAAAACTTTGTTTGATGAGATATTATACATAG 2999

 38259212 ATGTCTTCTCCATCATTCCAAGCACTTAAGCAGCTGCCCTTTCCAAACACTCATAGAGGA 38259271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     3000 ATGTCTTCTCCATCATTCCAAGCACTTAAGCAGCTGCCCTTTACAAACACTCATAGAGGA 3059

 38259272 TAAGAGATTATTTTCTATAAAAATCAAACCAGATTGTTG--TGTACATCAAGCAAAGGAG 38259329
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||
     3060 TAAGAGATTATTTTCTATAAAAATCAAACCAGATTGT--CATGTACATCAAGCAAAGGAG 3117

 38259330 GGATGGCAGGGAGGTGATATACTGAAACAGAATTACTGTATGAAAACCTGGAATGAACAA 38259389
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     3118 GGATGGCAGGGAGGTGATATACTGAAACAGAATTACTGTATGAAAACATGGAATGAACAA 3177

 38259390 TTAGATACTCAGTTCTCCTTACCTGCACAGTAATAGTAATTCTTACTACCAGACTGGATG 38259449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3178 TTAGATACTCAGTTCTCCTTACCTGCACAGTAATAGTAATTCTTACTACCAGACTGGATG 3237

 38259450 CTGGAGGGCTCTCCTTCAGAGAAACAGAAAAGAAAAAAAAGCCTATAGCCACTAATATTT 38259509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3238 CTGGAGGGCTCTCCTTCAGAGAAACAGAAAAGAAAAAAAAGCCTATAGCCACTAATATTT 3297

 38259510 GAATCTCTGCAATTAAATACCTGGGTCCCTTCCCAATCATATAGCAGTGATGCTCACCAG 38259569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3298 GAATCTCTGCAATTAAATACCTGGGTCCCTTCCCAATCATATAGCAGTGATGCTCACCAG 3357

 38259570 TTAACAAGAACTGAAGACACATGACAGATTCCAATCAGTGATTTATTACCACTGTCAAAT 38259629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3358 TTAACAAGAACTGAAGACACATGACAGATTCCAATCAGTGATTTATTACCACTGTCAAAT 3417

 38259630 AAGAATGGACACTCAAAGATTACCTGAAAAAGTCCTTTAATATGGCCCCAGATTGAATAA 38259689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3418 AAGAATGGACACTCAAAGATTACCTGAAAAAGTCCTTTAATATGGCCCCAGATTGAATAA 3477

 38259690 TTCCTAATTTCCTATATCATAAATTCAAAAATTATCTAAAATTCAGTGAAATTAGTCCAT 38259749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3478 TTCCTAATTTCCTATATCATAAATTCAAAAATTATCTAAAATTCAGTGAAATTAGTCCAT 3537

 38259750 ATTATCAATGCCAACCTTACACATAAACAGAGTTGACATTCTCTTATGATGCTGAACAAT 38259809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3538 ATTATCAATGCCAACCTTACACATAAACAGAGTTGACATTCTCTTATGATGCTGAACAAT 3597

 38259810 GCAGATGAAGAACGCTGGCTTTGGATTAAGAAGACCCTTAGTTTGAATTTTAATTTTGAC 38259869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3598 GCAGATGAAGAACGCTGGCTTTGGATTAAGAAGACCCTTAGTTTGAATTTTAATTTTGAC 3657

 38259870 CCATGATAGCTGTGTAAACTTAG 38259892
          |||||||||||||||||||||||
     3658 CCATGATAGCTGTGTAAACTTAG 3680

EXCISED REGION

 38266750 TAAATGAACTTGATTTGAATGGAATGAGAGTTCAATGAAACTGTATATATTGTGAAACGT 38266809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3681 TAAATGAACTTGATTTGAATGGAATGAGAGTTCAATGAAACTGTATATATTGTGAAACGT 3740

 38266810 GGCAACTTACACCTACTCAAGACATTAAAAGAGATCATGCTTTCTTGCCTAAGTTTTATG 38266869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3741 GGCAACTTACACCTACTCAAGACATTAAAAGAGATCATGCTTTCTTGCCTAAGTTTTATG 3800

 38266870 TCCAATTTGTTCCTGTTTCAAACCCCTCGACAAAAACAAAATCTTTTAATCTGTTTGCAA 38266929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3801 TCCAATTTGTTCCTGTTTCAAACCCCTCGACAAAAACAAAATCTTTTAATCTGTTTGCAA 3860

 38266930 AATATTTCCTCCTTCCTCCCATCTTGCTGTTGCTGCTCTGTGATATACTGCCCTTGCTTA 38266989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3861 AATATTTCCTCCTTCCTCCCATCTTGCTGTTGCTGCTCTGTGATATACTGCCCTTGCTTA 3920

 38266990 TTACCCCTTTATAGCTGTTTTGTTAAAGTTCATACCGCTAAGACCTGTAAAAGAAATTTA 38267049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3921 TTACCCCTTTATAGCTGTTTTGTTAAAGTTCATACCGCTAAGACCTGTAAAAGAAATTTA 3980

 38267050 TGGCTCTAGGGATTTCAGCAAATTCTAAATAACCATAACAGGAACAGGAAGCATTAATTA 38267109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3981 TGGCTCTAGGGATTTCAGCAAATTCTAAATAACCATAACAGGAACAGGAAGCATTAATTA 4040

 38267110 AAGACACTAGAGTCTAAGTTATAACAGAAATCCTGACATTTAAGGCCCTGGTACCATTTA 38267169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4041 AAGACACTAGAGTCTAAGTTATAACAGAAATCCTGACATTTAAGGCCCTGGTACCATTTA 4100

 38267170 AATTTAAAATGGTATGACAAACAGAGAGTAATTTGATGGTCAGAAGGTTATAATGGATAC 38267229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4101 AATTTAAAATGGTATGACAAACAGAGAGTAATTTGATGGTCAGAAGGTTATAATGGATAC 4160

 38267230 CTTAATACCTTTGCCAAGAAAAAGTGTCTGTCCTTGCTCTAACCCCTACCCAGGGGCTTC 38267289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     4161 CTTAATACCTTTGCCAAGAAAAAGTGTCTGTCCTTGCTCTAATCCCTACCCAGGGGCTTC 4220

 38267290 AGGGGCCTCCTTCATAAAACATGGTGATGCCTAAATATTTTTGCGATATCTCATATATAA 38267349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4221 AGGGGCCTCCTTCATAAAACATGGTGATGCCTAAATATTTTTGCGATATCTCATATATAA 4280

 38267350 GCTGGTCTTTTCTTTAAGAATACGAGAGATTAAACACCAACCCCCAACATTCATACACCA 38267409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4281 GCTGGTCTTTTCTTTAAGAATACGAGAGATTAAACACCAACCCCCAACATTCATACACCA 4340

 38267410 ATTTTCAGATAAAACAGCTTAATATTTAAGATATATTTAGTGCAATTTGTCTATTTCTTG 38267469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4341 ATTTTCAGATAAAACAGCTTAATATTTAAGATATATTTAGTGCAATTTGTCTATTTCTTG 4400

 38267470 GTTTACTGGAGGGCTGTATTTAAAGCCAAGGGACCAAGGAACATTCCACAACACACTAAA 38267529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4401 GTTTACTGGAGGGCTGTATTTAAAGCCAAGGGACCAAGGAACATTCCACAACACACTAAA 4460

 38267530 GCAATTTTTCCCCAGGGAATATGCTGATTCTTTCCTAAAGGCAGAAGCCGACATTCCTGA 38267589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4461 GCAATTTTTCCCCAGGGAATATGCTGATTCTTTCCTAAAGGCAGAAGCCGACATTCCTGA 4520

 38267590 CTCATTCTGCCAAACCAAGCAATGAAAAATGCTTCACCTAATTTGAAAGATAATTTGTAA 38267649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4521 CTCATTCTGCCAAACCAAGCAATGAAAAATGCTTCACCTAATTTGAAAGATAATTTGTAA 4580

 38267650 TACCAGAGACTCAACTTGTTTTGTGTATCCAATACTAGCACCCTTTCCAGAATGTTGAAA 38267709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4581 TACCAGAGACTCAACTTGTTTTGTGTATCCAATACTAGCACCCTTTCCAGAATGTTGAAA 4640

 38267710 GTACACACTGTATGATTTGTCTAATGTATATTCAAAAAAGGAATACAAATTGATCCTCAA 38267769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4641 GTACACACTGTATGATTTGTCTAATGTATATTCAAAAAAGGAATACAAATTGATCCTCAA 4700

 38267770 AGTTCAAATCTGCAGTACATACTCTGTGTTCTGCCCCCACCCGTACCTTCATGAATTCTT 38267829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4701 AGTTCAAATCTGCAGTACATACTCTGTGTTCTGCCCCCACCCGTACCTTCATGAATTCTT 4760

 38267830 TCACCTAGCACGCAGGCTGTTTTCCCTTTGCGAAATCCCATGGTACATTTATAGTATTAA 38267889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4761 TCACCTAGCACGCAGGCTGTTTTCCCTTTGCGAAATCCCATGGTACATTTATAGTATTAA 4820

 38267890 TACCACTCACTTAGAATATGCCGTATTTTGTCTAATATTGCTAGATTTTGTGTGTATAAT 38267949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4821 TACCACTCACTTAGAATATGCCGTATTTTGTCTAATATTGCTAGATTTTGTGTGTATAAT 4880

 38267950 CTTATTCCTCAAGTAAATTACAAGACAAGGACTATAATTTATACATCCTCTACAACACTT 38268009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4881 CTTATTCCTCAAGTAAATTACAAGACAAGGACTATAATTTATACATCCTCTACAACACTT 4940

 38268010 GACACTGGCTTTGATTAGGCTCTTAATAAATATTTGTTGGTTGATTAATCAGTTGACCAC 38268069
          |.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4941 GGCACTGGCTTTGAGTAGGCTCTTAATAAATATTTGTTGGTTGATTAATCAGTTGACCAC 5000

 38268070 ACTTACTAATTGCAAGGTGACATCATTTATCATTAATAAACATATATGTGGATTACAAAA 38268129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5001 ACTTACTAATTGCAAGGTGACATCATTTATCATTAATAAACATATATGTGGATTACAAAA 5060

 38268130 ATATCATGTGAATTTGCATATAATCATATTAATCCCAAATTAGCACCTGAGAGTCCAACC 38268189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5061 ATATCATGTGAATTTGCATATAATCATATTAATCCCAAATTAGCACCTGAGAGTCCAACC 5120

 38268190 ACCCTCTCCTTTAGGCCCTTTTCACTTTTATGTCTACTTTTGCCTCACTTACAATTCCAC 38268249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5121 ACCCTCTCCTTTAGGCCCTTTTCACTTTTATGTCTACTTTTGCCTCACTTACAATTCCAC 5180

 38268250 TACTTACTTGCCTTCTTTCTCTTTTCAGCTTTGTGCTGTTATTTAATATCTCACCAGTTG 38268309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5181 TACTTACTTGCCTTCTTTCTCTTTTCAGCTTTGTGCTGTTATTTAATATCTCACCAGTTG 5240

 38268310 TGTAATTTCAGCTCCCAAATTGAATAAGACGTTCCCCCCAGTGGAACCCTCACCTTGACA 38268369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5241 TGTAATTTCAGCTCCCAAATTGAATAAGACGTTCCCCCCAGTGGAACCCTCACCTTGACA 5300

 38268370 AATAGCCAAATAGTA---ATTATTCCTTTCAGGGGTTGAGCTATGGAATCATGCTTGCAA 38268426
          |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5301 AATAGCCAAATAGTAATTATTATTCCTTTCAGGGGTTGAGCTATGGAATCATGCTTGCAA 5360

 38268427 TATCCCAGGCTTGAGTGCCTAGATATTTATGCTATACTTCCCTGTGTCGGAGTTTCCATC 38268486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5361 TATCCCAGGCTTGAGTGCCTAGATATTTATGCTATACTTCCCTGTGTCGGAGTTTCCATC 5420

 38268487 TGCGATTGTATTTCAAGCCCTCTCATTTTTTTTTTCAATATGATTAAGATAATTCCTTTA 38268546
          ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5421 TGCGATTGTATTTCAAGCCCTCTCA-TTTTTTTTTCAATATGATTAAGATAATTCCTTTA 5479

 38268547 TGAAGTTGGAAACTCAGACATTCAGAAAGAAACTTGACGTTTCATATTTTTGCTAACTTG 38268606
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5480 TGAAGCTGGAAACTCAGACATTCAGAAAGAAACTTGACGTTTCATATTTTTGCTAACTTG 5539

 38268607 CTCTTCCCATTTCCTTTCCTATCATTTTAGCCAGACTGAGGGAGAATTAATTTTGCAATG 38268666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     5540 CTCTTCCCATTTCCTTTCCTATCATTTTAGCCAGACTGAGGGAGAATTAATTTTGCAACG 5599

 38268667 GTCTCTATTTTTTTTTCCAAATGTGTGACCTCCATATTAATAGGAGCCAGAGTACTCATT 38268726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5600 GTCTCTATTTTTTTTTCCAAATGTGTGACCTCCATATTAATAGGAGCCAGAGTACTCATT 5659

 38268727 CATCACATCTGGTCAGTGTGAAACTGACATTTACAGGGTGGAATGTTTCCCACTCAGGAC 38268786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5660 CATCACATCTGGTCAGTGTGAAACTGACATTTACAGGGTGGAATGTTTCCCACTCAGGAC 5719

 38268787 AAATGGGGATCATTTGTAAAACATGCCGCACCCAATCATAGGTTCCCATGGATCTCCAAC 38268846
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     5720 AAATGGGGATCATTTGTAAAACATGCCACACCCAATCATAGGTTCCCATGGATCTCCAAC 5779

 38268847 TACATTTTTAAGCAACAATATAAACCATTCCCGAAACTGAAAGGTCTTTTCAAATATTTA 38268906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5780 TACATTTTTAAGCAACAATATAAACCATTCCCGAAACTGAAAGGTCTTTTCAAATATTTA 5839

 38268907 CTGCCTACCTATGGAATTTTTATTCTGCTTGCTGCTGCCATCAATAATCCTGGGAGTTCC 38268966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5840 CTGCCTACCTATGGAATTTTTATTCTGCTTGCTGCTGCCATCAATAATCCTGGGAGTTCC 5899

 38268967 TAGCTAAGTGTTGTGTATGACCTCCAAGGAAAGTCTTAGCATTGCAGAATGGGGAGGCGG 38269026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5900 TAGCTAAGTGTTGTGTATGACCTCCAAGGAAAGTCTTAGCATTGCAGAATGGGGAGGCGG 5959

 38269027 GTTAGTATCCTGCATTTTTCATTCTGTCACTTTCTAGGGACAATTACAAAGAAAATAATC 38269086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5960 GTTAGTATCCTGCATTTTTCATTCTGTCACTTTCTAGGGACAATTACAAAGAAAATAATC 6019

 38269087 ATATAAGACTTATTTTTATGTTTATTATGAAAGCCTTCAGCTCTTGCATTTGCAAGTAAG 38269146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6020 ATATAAGACTTATTTTTATGTTTATTATGAAAGCCTTCAGCTCTTGCATTTGCAAGTAAG 6079

 38269147 CTCAATGATTTTAAGTTTGCTTTTTCCCCCATGAAATGAAATATTATTTCCCACTTCTTC 38269206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6080 CTCAATGATTTTAAGTTTGCTTTTTCCCCCATGAAATGAAATATTATTTCCCACTTCTTC 6139

 38269207 CATGAATCTATTGGGTAACTCCAGGCCACTGTGATCTTTCATCTGGCATTTTGCTTTTAT 38269266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6140 CATGAATCTATTGGGTAACTCCAGGCCACTGTGATCTTTCATCTGGCATTTTGCTTTTAT 6199

 38269267 TTTTCTAGATCACAGTTGTGATTTAAAGCCCTCCTGGCACTTGGACACCTTGGTGATCTT 38269326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6200 TTTTCTAGATCACAGTTGTGATTTAAAGCCCTCCTGGCACTTGGACACCTTGGTGATCTT 6259

 38269327 AGCTCATGCTCCTAGTTCCATAGTGATGAATTGACCAAACTTTTTCCCAAGGATATCTGC 38269386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6260 AGCTCATGCTCCTAGTTCCATAGTGATGAATTGACCAAACTTTTTCCCAAGGATATCTGC 6319

 38269387 TAATTCTGGAGTTTCTGCTTTCTTATTATCTGTTCTGTCTTTTGGTTCTGTATTGATATA 38269446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6320 TAATTCTGGAGTTTCTGCTTTCTTATTATCTGTTCTGTCTTTTGGTTCTGTATTGATATA 6379

 38269447 ACAAGCTTTGTCCCCTTATCAATGAGGGCACAAAATGCAGCACTTCAAATAATTTCTGCA 38269506
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||
     6380 ACAAGCTTTGTCCCCTTATCAATGAGGGCACAAAATGAAGCACTTCAAATAGTTTCTGCA 6439

 38269507 AAAATTTACAGTTGCTGCATTAAGAATTTTGTGAGCTTCAATAATGTTATTGAAAAGTTG 38269566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6440 AAAATTTACAGTTGCTGCATTAAGAATTTTGTGAGCTTCAATAATGTTATTGAAAAGTTG 6499

 38269567 CAGATTCCCTCCTCCTTCTTTTTCTCCTTTCCTCCTCTTTCTGCCCTGTCTCCCCTTCAT 38269626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6500 CAGATTCCCTCCTCCTTCTTTTTCTCCTTTCCTCCTCTTTCTGCCCTGTCTCCCCTTCAT 6559

 38269627 TATTCTCCTCTTCTTCTCAAAAGCAAACAATCATTTTTCTTGCCTACTGAAGAATACTTG 38269686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6560 TATTCTCCTCTTCTTCTCAAAAGCAAACAATCATTTTTCTTGCCTACTGAAGAATACTTG 6619

 38269687 TAATGTTATTCTCAAAACCTGGACACCAGCTCAACTCCTTCTTTGTTCTACAAGTATTCA 38269746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6620 TAATGTTATTCTCAAAACCTGGACACCAGCTCAACTCCTTCTTTGTTCTACAAGTATTCA 6679

 38269747 CCCACCCTAATAGGGAGTTTATTCCAATGAAAAGACTGTGTTCCTCCTCAGAGGAATTTA 38269806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6680 CCCACCCTAATAGGGAGTTTATTCCAATGAAAAGACTGTGTTCCTCCTCAGAGGAATTTA 6739

 38269807 TGAGGTGGTAAGAGAGTAGAATTGCATTAATCTTATGCCATTCCTAGAGAATTCTTATTT 38269866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6740 TGAGGTGGTAAGAGAGTAGAATTGCATTAATCTTATGCCATTCCTAGAGAATTCTTATTT 6799

 38269867 CCTCAATTAAGGTTTAATTGCTCTGTTCTGAAAAAAAAAAAAAAATGGTGAGTCCAAGCA 38269926
          ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||
     6800 CCTCAATTAAGGTTTAATTGCTCTGTTCTG---AAAAAAAAAAAATGGTGAGTCCAAGCA 6856

 38269927 GATAATTTACAGTGACCTGTATCTGTGACTAGTTTTAAGGCTACCCTGAGGTCAGAATTT 38269986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6857 GATAATTTACAGTGACCTGTATCTGTGACTAGTTTTAAGGCTACCCTGAGGTCAGAATTT 6916

 38269987 AAACATGTTAATTCAGTACTGGACTTAATAGTAAACAAGATAGAGATATCTCTGTCTCAC 38270046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6917 AAACATGTTAATTCAGTACTGGACTTAATAGTAAACAAGATAGAGATATCTCTGTCTCAC 6976

 38270047 AAAGATTTGTAATACAACTCACAGAAGCTTTACTCCAAATGAAAGGGTCATAGTTAGAGG 38270106
          |.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6977 AGAGATTTGTAATACAACTCACAGACGCTTTACTCCAAATGAAAGGGTCATAGTTAGAGG 7036

 38270107 GAAATTCCATAATAATAGTACCTATCTGATAGGGTGAATGTGGGAATTAAACGAGTTCAT 38270166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7037 GAAATTCCATAATAATAGTACCTATCTGATAGGGTGAATGTGGGAATTAAACGAGTTCAT 7096

 38270167 AGCTATAAAGAATTTCAGAGGCCATCTGGCAATCACAAATAATAACTCTTAGTGGCAGCA 38270226
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     7097 AGCTATAAAGAATTTCAGAGGCCATCTGGCAATCACAAATAATAACTGTTAGTGGCAGCA 7156

 38270227 TTAGCTAGTTCCTGAATAGCCAAATATCTTGAATCCTCATAACAATGATTCAAATAAATG 38270286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7157 TTAGCTAGTTCCTGAATAGCCAAATATCTTGAATCCTCATAACAATGATTCAAATAAATG 7216

 38270287 TCATCATTATTTCACAGAGTAAGATACTTAAGCATTGGGAGTTATTAAGCAATTCTTTAA 38270346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7217 TCATCATTATTTCACAGAGTAAGATACTTAAGCATTGGGAGTTATTAAGCAATTCTTTAA 7276

 38270347 GGACATAGCAGCAACATGTAGAGGAGCTGAAATTACAACATGGTTCTTTCCGAACTTTAA 38270406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7277 GGACATAGCAGCAACATGTAGAGGAGCTGAAATTACAACATGGTTCTTTCCGAACTTTAA 7336

 38270407 GTCCCCTGTTTTTGTGTCTATGACTTTAAATATTCATAGTGGAATATCTATCTATCTACA 38270466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7337 GTCCCCTGTTTTTGTGTCTATGACTTTAAATATTCATAGTGGAATATCTATCTATCTACA 7396

 38270467 GATAATTTCATGAAACATTAAACTAAGTTTGG--TTTTTCTAAAATGCTAACCTCTGTTT 38270524
          ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||
     7397 GATAATTTCATGAAACATTAAACTAAGTTT--TTTTTTTCTAAAATGCTAACCTCTGTTT 7454

 38270525 AACTATCAACCTAGGCAAAAATGGACAATTCCCTGTACCTCAGAAGCTTTCCTAG 38270579
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7455 AACTATCAACCTAGGCAAAAATGGACAATTCCCTGTACCTCAGAAGCTTTCCTAG 7509

Alignment time is 7.1095 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38249892,38276749] =>     26858 nucs '18 dna:chromosome chromosome:GRCh37:18:1:78077248:1'
Second seq [       1,    3681] =>      3681 nucs 'mol-32-29df-041385_3681'

Score:        3494
Aligned:      3676        nucs
Identic:      3657 ( 99%) nucs =>       679 (100%)      2978 ( 99%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38256212,38256892] EXCISED REGION [38256901,38259893]
 second seq =>  [       1,     680] EXCISED REGION [     689,    3681]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         8 nucs [38256893,38256900]
 second seq =>         8 nucs [681,688]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [38256893,38256894] to [38256901,38256902]
 second seq =>         1 nucs [680,680] to [688,688]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [681,682] to [687,688]

 38256212 ATTCTTAGTAAGATAAAGTATATAATGATATAATTAAAATTTAAAATCAGAATTATTAAA 38256271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATTCTTAGTAAGATAAAGTATATAATGATATAATTAAAATTTAAAATCAGAATTATTAAA 60

 38256272 TCTCAAAATTTGGAAGAATCACACCAGTCATTTAGACCAATCTCACTGCCTTTGTTTCTA 38256331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCTCAAAATTTGGAAGAATCACACCAGTCATTTAGACCAATCTCACTGCCTTTGTTTCTA 120

 38256332 CCAAACACTAGTTACTATGTTTAGTATTAATATATTCAACACCTATATGGATCCAATTTC 38256391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCAAACACTAGTTACTATGTTTAGTATTAATATATTCAACACCTATATGGATCCAATTTC 180

 38256392 TAGACTCTCACTTTGACATCTTCTTCTATCATGAACATTTCTTCCACTCAGCTCCATTTA 38256451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TAGACTCTCACTTTGACATCTTCTTCTATCATGAACATTTCTTCCACTCAGCTCCATTTA 240

 38256452 TTTACTCCTATGGCCACTGCCGAAACTTTACCAGCACCGGAAACTACATCTTAATGTCAG 38256511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTTACTCCTATGGCCACTGCCGAAACTTTACCAGCACCGGAAACTACATCTTAATGTCAG 300

 38256512 GGAACCAGTATCCACTTGTCTAGAATGACATCTTATCCTTGCAACTCACTTGATCTAAGA 38256571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GGAACCAGTATCCACTTGTCTAGAATGACATCTTATCCTTGCAACTCACTTGATCTAAGA 360

 38256572 TCTGCTCTGGAATTGTTTTTCAACTTATCAAGAGCCCCAATTTACTTCTCTCTTTATATC 38256631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCTGCTCTGGAATTGTTTTTCAACTTATCAAGAGCCCCAATTTACTTCTCTCTTTATATC 420

 38256632 AATCACCCCTCCACCACTCTGTTTTATCTCCATAATTATTGTCCTCATATGCTGTAGTTA 38256691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AATCACCCCTCCACCACTCTGTTTTATCTCCATAATTATTGTCCTCATATGCTGTAGTTA 480

 38256692 GTAAATACAAACTTCAGTGTCTTTCTCTGAAATCATTGTACTACCAGATAAAACCACACC 38256751
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTAAATACAAACTTCAGTGTCCTTCTCTGAAATCATTGTACTACCAGATAAAACCACACC 540

 38256752 CTTATATGCAATCAACTACTGGCTTTTTTTTTTTTTTAATCTTTGCACACATGCTCAGTG 38256811
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
      541 CTTATATGCAATCAACTACTGGCTTTTTTTTTTTTT-AATCTTTGCACACATGCTCAGTG 599

 38256812 GAGACTGCTTGTGATTGTGCCTTACTGAGGCAGATGATGATTCAGACAAGTTACTCTATT 38256871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      600 GAGACTGCTTGTGATTGTGCCTTACTGAGGCAGATGATGATTCAGACAAGTTACTCTATT 659

 38256872 ACTCATAGAACCAACTTCAAA 38256892
          |||||||||||||||||||||
      660 ACTCATAGAACCAACTTCAAA 680

EXCISED REGION

 38256901 TAACTCTACACAACAATACTATCTCACTATATTTTAAAAAATTATCCTCTCATTACCAGT 38256960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      689 TAACTCTACACAACAATACTATCTCACTATATTTTAAAAAATTATCCTCTCATTACCAGT 748

 38256961 AATACTTTAGCATCTTCCCCACTCCCTTCAACCTCAACAACCTGGATAACTAGTATGAAG 38257020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      749 AATACTTTAGCATCTTCCCCACTCCCTTCAACCTCAACAACCTGGATAACTAGTATGAAG 808

 38257021 GGCTTTACTGACAAAATGGAAGCCATGAAACAGAAATTCATCCTACCACCACCTTCTGTA 38257080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      809 GGCTTTACTGACAAAATGGAAGCCATGAAACAGAAATTCATCCTACCACCACCTTCTGTA 868

 38257081 TCTCATTTCTTCTTGTTTCTCCTTTTTGCAGCAGAGAATGTGACCCTGCGGTCCCCTGAA 38257140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      869 TCTCATTTCTTCTTGTTTCTCCTTTTTGCAGCAGAGAATGTGACCCTGCGGTCCCCTGAA 928

 38257141 GTCAGTTTCTCCAAACGTGGACTTTACTTTCTCAACACATTTGTTCCTTCAGTTATTCCC 38257200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      929 GTCAGTTTCTCCAAACGTGGACTTTACTTTCTCAACACATTTGTTCCTTCAGTTATTCCC 988

 38257201 ACTGTAGCAACTTTGTCTCTGTCTCTCAATTAGATAATTCCTACTGACAAATAGGCTATA 38257260
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
      989 ACTGTAGCAACTTTGTCTCTGTCTCTCAACTAGATAATTCCTACTGACAAATAGGCTATA 1048

 38257261 ACACCTCACATCTTTAAAAGAATACACATTTCATGTAATTGCTGTCTGCACCAGTATCTC 38257320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1049 ACACCTCACATCTTTAAAAGAATACACATTTCATGTAATTGCTGTCTGCACCAGTATCTC 1108

 38257321 CAATTCTTTATCTCCTATTATCTTTGTCAACCCTCTCCAGCCTGCCTACTGTTCCCACTA 38257380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1109 CAATTCTTTATCTCCTATTATCTTTGTCAACCCTCTCCAGCCTGCCTACTGTTCCCACTA 1168

 38257381 CCCTACTCAATTCCTCCCGCCAAGGCATTGTTGGTCCTTACCTTTCAAAACTTTTTTTTG 38257440
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1169 CTCTACTCAATTCCTCCCGCCAAGGCATTGTTGGTCCTTACCTTTCAAAACTTTTTTTTG 1228

 38257441 TTTTTGTTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGAT 38257500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1229 TTTTTGTTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGAT 1288

 38257501 CTCTGCTTACTGCAACCTCCACCTCACCAGTTCAAGTGATTCACTAGTCTGAGCCTCCTG 38257560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1289 CTCTGCTTACTGCAACCTCCACCTCACCAGTTCAAGTGATTCACTAGTCTGAGCCTCCTG 1348

 38257561 AGTAGCTGGGACTACAGACACATGCCACCATGCCCGGCTAATTTTTGCATTTTTAGTAGA 38257620
          |||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     1349 AGTAGCTGGGACTACAGGCACATGCCACCATGCTCGGCTAATTTTTGCATTTTTAGTAGA 1408

 38257621 GACGAGGTTTCACCATGCTGGTCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCGTGATCCGCTTG 38257680
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     1409 GACGAGGTTTCACCATGCTGGTCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCGTGATCCGCCTG 1468

 38257681 CCTTGGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACCGGCGTGAGCCACTGCGCCCATAGAAAAGATT 38257740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1469 CCTTGGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACCGGCGTGAGCCACTGCGCCCATAGAAAAGATT 1528

 38257741 AGTTCTTTCTGAACTTTTAAACACCATTCAGCAGTGTTCACCATTCTCTCTAACTTAAAA 38257800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1529 AGTTCTTTCTGAACTTTTAAACACCATTCAGCAGTGTTCACCATTCTCTCTAACTTAAAA 1588

 38257801 CACTGTCCCTCATAACATATTTAAAAAATTCTATTTCTTACTGTTATTTCTCAGATTCTT 38257860
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     1589 CACTGTCCCTCATAACATATTTAAAAAATTATATTTCTTACTGTTATTTCTCAGATTCTT 1648

 38257861 GTATAGGCCACAGTTCTTTCAGTAGAACTCTAACCAATTTCCGTACATGTAAGTATCATA 38257920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     1649 GTATAGGCCACAGTTCTTTCAGTAGAACTCTAACCAATTTCCATACATGTAAGTATCATA 1708

 38257921 AATATACTAATGACTCTGAACATTATATATCTTGCCTCATGCATGAATACCCAAATGTTT 38257980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1709 AATATACTAATGACTCTGAACATTATATATCTTGCCTCATGCATGAATACCCAAATGTTT 1768

 38257981 TCCTGTAATCACAAAATGAACATCTCAAAGTGACCACAAATTTGACATGTTCCGAAGTAA 38258040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1769 TCCTGTAATCACAAAATGAACATCTCAAAGTGACCACAAATTTGACATGTTCCGAAGTAA 1828

 38258041 TTAAATTTTGATATTCTCTGCCAAAAGCTGCTCTAGAAATTTTGCCACTCCTTCTTCATC 38258100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1829 TTAAATTTTGATATTCTCTGCCAAAAGCTGCTCTAGAAATTTTGCCACTCCTTCTTCATC 1888

 38258101 TTAGAAAATGCTATTATTCTCCACCAAAGGCAAATAACCAAGAGTCATTACTAGAAAATT 38258160
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1889 TTAGAAAATGCTATCATTCTCCACCAAAGGCAAATAACCAAGAGTCATTACTAGAAAATT 1948

 38258161 TGTCTCCTTTACCACTCATGCCCAATATAGATCAAATTCTTTAAGATCTTTTCCTCAATA 38258220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1949 TGTCTCCTTTACCACTCATGCCCAATATAGATCAAATTCTTTAAGATCTTTTCCTCAATA 2008

 38258221 AACCTCAAGTCTGTCACCTTTTCTATTACCACATTTTTTCTAAGTCTCAATCATCTCTCA 38258280
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2009 AATCTCAAGTCTGTCACCTTTTCTATTACCACATTTTTTCTAAGTCTCAATCATCTCTCA 2068

 38258281 ATTAGATCATTATAGTAATCTTCTAAGTGGTGTTGGGGTGTCGTCTCCCGGCTACTTCAA 38258340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2069 ATTAGATCATTATAGTAATCTTCTAAGTGGTGTTGGGGTGTCGTCTCCCGGCTACTTCAA 2128

 38258341 TCCATTTTCCAATATTAAGTTTATTTGTTTAATTAAACATGTTAACTTGTGGTGCTCTTA 38258400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2129 TCCATTTTCCAATATTAAGTTTATTTGTTTAATTAAACATGTTAACTTGTGGTGCTCTTA 2188

 38258401 TGCTTAAAAAGTTTCATTAGCTTTCTATTTATATAATGAATGAAACCAATGTTTAGCCTA 38258460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2189 TGCTTAAAAAGTTTCATTAGCTTTCTATTTATATAATGAATGAAACCAATGTTTAGCCTA 2248

 38258461 GTTTAAGAAATGTAAGAACTCCTTTTACCCTAGCTTTCTTCCTGTTTACTTTTATTCATC 38258520
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2249 GTTTAAGAAATGTAAGAACTCCCTTTACCCTAGCTTTCTTCCTGTTTACTTTTATTCATC 2308

 38258521 ATGCCTTGAATCATACCTATCTTCTTTAATTTTCTCTAACACAAAATCCTCCTGTTTCTT 38258580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2309 ATGCCTTGAATCATACCTATCTTCTTTAATTTTCTCTAACACAAAATCCTCCTGTTTCTT 2368

 38258581 CTTTGCAATCCTGCAAACCCAAACCCAGCAGCTAGTAAATATTCAATATATATGAATTAA 38258640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2369 CTTTGCAATCCTGCAAACCCAAACCCAGCAGCTAGTAAATATTCAATATATATGAATTAA 2428

 38258641 TTAATTGATGAATGAGTGATTTTATTTCAGATTGCTATCAAATGCTCAATTCCCCTGCAT 38258700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2429 TTAATTGATGAATGAGTGATTTTATTTCAGATTGCTATCAAATGCTCAATTCCCCTGCAT 2488

 38258701 AGTATCTCCAATGAGTCAAATCCTGGAATTCCCTATAGGAACACCTGGGATATATAGTAT 38258760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2489 AGTATCTCCAATGAGTCAAATCCTGGAATTCCCTATAGGAACACCTGGGATATATAGTAT 2548

 38258761 CAACTTACAAATACCATTCTTTCTTAATTTTGAAAGAAAAACTGAGTAAAATATGAGAGC 38258820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2549 CAACTTACAAATACCATTCTTTCTTAATTTTGAAAGAAAAACTGAGTAAAATATGAGAGC 2608

 38258821 TGTAGCTTTTAAAAAAAATAGAAAATACACCATAAAAATTTTAGTCAAGCATGGCAGACT 38258880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2609 TGTAGCTTTTAAAAAAAATAGAAAATACACCATAAAAATTTTAGTCAAGCATGGCAGACT 2668

 38258881 AAATACATGTATTTATTTCTAATCTACTTCAAGCTCCAATATAATAACTGTTTACAAATG 38258940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2669 AAATACATGTATTTATTTCTAATCTACTTCAAGCTCCAATATAATAACTGTTTACAAATG 2728

 38258941 AAATGGTCTAATATCACAAGTTCAAAATTAATAAGAGTGGATGAGACATGCCAACAAATT 38259000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2729 AAATGGTCTAATATCACAAGTTCAAAATTAATAAGAGTGGATGAGACATGCCAACAAATT 2788

 38259001 TTTGGAATGTAAAAATAGATAAGACATTGTTAATGATTTGACAAAGCACAAAGCCTTAAA 38259060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2789 TTTGGAATGTAAAAATAGATAAGACATTGTTAATGATTTGACAAAGCACAAAGCCTTAAA 2848

 38259061 ATATTTCTGTATAGAGAGAAGTTTCCAAAGTAGGGCAACTCAGAGATAAATCAAGAATGG 38259120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2849 ATATTTCTGTATAGAGAGAAGTTTCCAAAGTAGGGCAACTCAGAGATAAATCAAGAATGG 2908

 38259121 GAAGATTCACACACCTCAACTGTAAAAGAGAAATATGAGACTAAAAGCAGTGGATTAATT 38259180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     2909 GAAGATTCACACACCTCAACTGTAAAAGAGAAATATGAGACTAAAAGCAGTGGATTCATT 2968

 38259181 AAAACTTTGTTTGATGAGATATTATACATAGATGTCTTCTCCATCATTCCAAGCACTTAA 38259240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2969 AAAACTTTGTTTGATGAGATATTATACATAGATGTCTTCTCCATCATTCCAAGCACTTAA 3028

 38259241 GCAGCTGCCCTTTCCAAACACTCATAGAGGATAAGAGATTATTTTCTATAAAAATCAAAC 38259300
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3029 GCAGCTGCCCTTTACAAACACTCATAGAGGATAAGAGATTATTTTCTATAAAAATCAAAC 3088

 38259301 CAGATTGTTG--TGTACATCAAGCAAAGGAGGGATGGCAGGGAGGTGATATACTGAAACA 38259358
          ||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3089 CAGATTGT--CATGTACATCAAGCAAAGGAGGGATGGCAGGGAGGTGATATACTGAAACA 3146

 38259359 GAATTACTGTATGAAAACCTGGAATGAACAATTAGATACTCAGTTCTCCTTACCTGCACA 38259418
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3147 GAATTACTGTATGAAAACATGGAATGAACAATTAGATACTCAGTTCTCCTTACCTGCACA 3206

 38259419 GTAATAGTAATTCTTACTACCAGACTGGATGCTGGAGGGCTCTCCTTCAGAGAAACAGAA 38259478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3207 GTAATAGTAATTCTTACTACCAGACTGGATGCTGGAGGGCTCTCCTTCAGAGAAACAGAA 3266

 38259479 AAGAAAAAAAAGCCTATAGCCACTAATATTTGAATCTCTGCAATTAAATACCTGGGTCCC 38259538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3267 AAGAAAAAAAAGCCTATAGCCACTAATATTTGAATCTCTGCAATTAAATACCTGGGTCCC 3326

 38259539 TTCCCAATCATATAGCAGTGATGCTCACCAGTTAACAAGAACTGAAGACACATGACAGAT 38259598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3327 TTCCCAATCATATAGCAGTGATGCTCACCAGTTAACAAGAACTGAAGACACATGACAGAT 3386

 38259599 TCCAATCAGTGATTTATTACCACTGTCAAATAAGAATGGACACTCAAAGATTACCTGAAA 38259658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3387 TCCAATCAGTGATTTATTACCACTGTCAAATAAGAATGGACACTCAAAGATTACCTGAAA 3446

 38259659 AAGTCCTTTAATATGGCCCCAGATTGAATAATTCCTAATTTCCTATATCATAAATTCAAA 38259718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3447 AAGTCCTTTAATATGGCCCCAGATTGAATAATTCCTAATTTCCTATATCATAAATTCAAA 3506

 38259719 AATTATCTAAAATTCAGTGAAATTAGTCCATATTATCAATGCCAACCTTACACATAAACA 38259778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3507 AATTATCTAAAATTCAGTGAAATTAGTCCATATTATCAATGCCAACCTTACACATAAACA 3566

 38259779 GAGTTGACATTCTCTTATGATGCTGAACAATGCAGATGAAGAACGCTGGCTTTGGATTAA 38259838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3567 GAGTTGACATTCTCTTATGATGCTGAACAATGCAGATGAAGAACGCTGGCTTTGGATTAA 3626

 38259839 GAAGACCCTTAGTTTGAATTTTAATTTTGACCCATGATAGCTGTGTAAACTTAGT 38259893
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3627 GAAGACCCTTAGTTTGAATTTTAATTTTGACCCATGATAGCTGTGTAAACTTAGT 3681

Alignment time is 3.51875 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38249892,38276749] =>     26858 nucs '18 dna:chromosome chromosome:GRCh37:18:1:78077248:1'
Second seq [       1,    4330] =>      4330 nucs 'mol-32-2e0a-108092_4330'

Score:        4126
Aligned:      4338        nucs
Identic:      4313 ( 99%) nucs =>      2294 ( 99%)      2019 (100%)
Gaps:           13 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38263936,38266242] EXCISED REGION [38266251,38268276]
 second seq =>  [       1,    2304] EXCISED REGION [    2305,    4330]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         8 nucs [38266243,38266250]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         8 nucs [38266243,38266250] to [38266251,38266258]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [38266242,38266242] to [38266251,38266251]
 second seq =>         1 nucs [2304,2304] to [2305,2305]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 38263936 ACTTAAGTAATTGATTTTCATCTTCTAAGCTTTATTAGTATGTTTATTTAAAGCAATACA 38263995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACTTAAGTAATTGATTTTCATCTTCTAAGCTTTATTAGTATGTTTATTTAAAGCAATACA 60

 38263996 TTTCCATATTACCATGACCTTAGCTGCAGTGTATGTATTTTGGTGTACAGTATTTTCTTT 38264055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTCCATATTACCATGACCTTAGCTGCAGTGTATGTATTTTGGTGTACAGTATTTTCTTT 120

 38264056 ATTTTTCAATTAAAATTTGTCTTGACTTCCTCTATGATGTCTTCTATGATTCTTCCTCTA 38264115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATTTTTCAATTAAAATTTGTCTTGACTTCCTCTATGATGTCTTCTATGATTCTTCCTCTA 180

 38264116 TAATTCTTCTTTTGACCATATAGAAGTGTATTCATTAATTCAATCACATATAAATATTCT 38264175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TAATTCTTCTTTTGACCATATAGAAGTGTATTCATTAATTCAATCACATATAAATATTCT 240

 38264176 CCTTTTATCTTTTTGCTACTGGTTTGTTTGTTTAGCTACATTTAGGGAAAATTTCATTTC 38264235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCTTTTATCTTTTTGCTACTGGTTTGTTTGTTTAGCTACATTTAGGGAAAATTTCATTTC 300

 38264236 TGAGACGACAGAGGAAGCACATTCCATTTTATTCCTTCTGCTAATGACAAAAAAAAAAAA 38264295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGAGACGACAGAGGAAGCACATTCCATTTTATTCCTTCTGCTAATGACAAAAAAAAAAAA 360

 38264296 AAATTGGAAAAAACACAAAAGCCAGAGTCAAAAGACTCTGAAAAATGGAGAAAAAGTGCA 38264355
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ---TTGGAAAAAACACAAAAGCCAGAGTCAAAAGACTCTGAAAAATGGAGAAAAAGTGCA 417

 38264356 GACAGGCTAAGGATTTGGGAGATTGAGGAACAACGACAGGTGAGTTCTCTGTCTTTTTTT 38264415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      418 GACAGGCTAAGGATTTGGGAGATTGAGGAACAACGACAGGTGAGTTCTCTGTCTTTTTTT 477

 38264416 TT-CTTTCTTTTTTGATATATATATATATATCAACAATCTCAATGTTTAAGAGAAGCCCT 38264474
          || ||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||
      478 TTTCTTTCTTTTTTGATATATATATAT----CAACAATCTCAATGTTTAAGAGAAGCCCT 533

 38264475 CAAGCCAGAATTTCCAACAGTTGCAGATAAAACATTGTGCTTGCTTAACGTATTTAACCA 38264534
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      534 CAATCCAGAATTTCCAACAGTTGCAGATAAAACATTGTGCTTGCTTAACGTATTTAACCA 593

 38264535 AAAGACCCGAAAAGCAAGGATATAAAAGAATATTTTAATAATATCATTCTGTTCTTAAGG 38264594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      594 AAAGACCCGAAAAGCAAGGATATAAAAGAATATTTTAATAATATCATTCTGTTCTTAAGG 653

 38264595 TGAACACTTCAAAGAAACCACACCCCTCCCCTCCCCAATGCGTGCTGAAGCAGTGGAATC 38264654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      654 TGAACACTTCAAAGAAACCACACCCCTCCCCTCCCCAATGCGTGCTGAAGCAGTGGAATC 713

 38264655 CATGAGTGGAACCTTGTCATATATAATCTCCACACTAAATTTATAGCAAAGCCCCCATCT 38264714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      714 CATGAGTGGAACCTTGTCATATATAATCTCCACACTAAATTTATAGCAAAGCCCCCATCT 773

 38264715 CTCAACCTGTGTTGAAATTCTGACTTCCAGACACACCTTTCAGTAATGAGGAGGTACTCT 38264774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      774 CTCAACCTGTGTTGAAATTCTGACTTCCAGACACACCTTTCAGTAATGAGGAGGTACTCT 833

 38264775 TCCATGATAAACCCTGTGGGCAAAGCTTCCACATTCATCCCACCCCTAAAGCAATAAATT 38264834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      834 TCCATGATAAACCCTGTGGGCAAAGCTTCCACATTCATCCCACCCCTAAAGCAATAAATT 893

 38264835 TGCACCTTTCCCAAGTAGAATCAATGGGAAGAATTTTGACTTCTATCCCCACCTGATGGT 38264894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      894 TGCACCTTTCCCAAGTAGAATCAATGGGAAGAATTTTGACTTCTATCCCCACCTGATGGT 953

 38264895 AATGAGGCAGTATCTCTCTCTTTTTCCAGACAGTGTTTAAGAATTTGTTGTATAGAGCGC 38264954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      954 AATGAGGCAGTATCTCTCTCTTTTTCCAGACAGTGTTTAAGAATTTGTTGTATAGAGCGC 1013

 38264955 TATTACCTGAATAACACATTGTGGCAGAGCAAAATAACCCTTAAGCATTTAGTTTTCAGA 38265014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1014 TATTACCTGAATAACACATTGTGGCAGAGCAAAATAACCCTTAAGCATTTAGTTTTCAGA 1073

 38265015 TTTATTTTCAACTATTTAGAGGGTTATTTCTTGACTACCACAGATAAGTCATTCCCTTCT 38265074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1074 TTTATTTTCAACTATTTAGAGGGTTATTTCTTGACTACCACAGATAAGTCATTCCCTTCT 1133

 38265075 CCATTGTTCTATAGTTTACTGCCCTTTTTTTCTATCATGGCATTTACCCACTATTTCATA 38265134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1134 CCATTGTTCTATAGTTTACTGCCCTTTTTTTCTATCATGGCATTTACCCACTATTTCATA 1193

 38265135 TTGTTATTTATAGTTTACATGCTTAATATCTCCATCTCCCAACAAATATGGGAACATCAT 38265194
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1194 TTGTTATTTTTAGTTTACATGCTTAATATCTCCATCTCCCAACAAATATGGGAACATCAT 1253

 38265195 TAGGTCAGAGAAATTTTATTTCTTTTCCCTCTGAAGTCTCAGTATTAGTTGTTACATTAA 38265254
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     1254 TAGGTCAGAGAAATTTTATTTCTTTCCCCTCTGAAGTCTCAGTACTAGTTGTTACATTAA 1313

 38265255 TTAGCACTTATTTAAATTTTTAGTTTTCTTTTTCTTTGCCTCATGTTACTGTTACACCCT 38265314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1314 TTAGCACTTATTTAAATTTTTAGTTTTCTTTTTCTTTGCCTCATGTTACTGTTACACCCT 1373

 38265315 TCCACTACCAAGCTTAAAGTTAGGAATGATTCATGTGACTGGAATTGAATGACTGCTCTG 38265374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1374 TCCACTACCAAGCTTAAAGTTAGGAATGATTCATGTGACTGGAATTGAATGACTGCTCTG 1433

 38265375 AGAAAGAAGTCCATAAAAGTCTGCATGCAATTTGCCATGTCTCCATCCTTTCTTTGCCAT 38265434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1434 AGAAAGAAGTCCATAAAAGTCTGCATGCAATTTGCCATGTCTCCATCCTTTCTTTGCCAT 1493

 38265435 AGAAACTAAAGATCTTCCAGATAGTCGAGGCTCTGTTAATGTTATTTCTTGAATAACGAC 38265494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1494 AGAAACTAAAGATCTTCCAGATAGTCGAGGCTCTGTTAATGTTATTTCTTGAATAACGAC 1553

 38265495 TATCTGAACAGAACATCTGTGACTTGGAATGGGGACATGTAGCTTGGAGAAAAAGTAAGC 38265554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1554 TATCTGAACAGAACATCTGTGACTTGGAATGGGGACATGTAGCTTGGAGAAAAAGTAAGC 1613

 38265555 ACACAGTGTTTTAAGTTACTGTGGTTTTATGGTTATTTGTTACTGCAGCATAACCCACCC 38265614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1614 ACACAGTGTTTTAAGTTACTGTGGTTTTATGGTTATTTGTTACTGCAGCATAACCCACCC 1673

 38265615 TGCCCTGACTTAAGTGATATAATATTTAACAAATATTTATAAAATAAATAAATTCAAATT 38265674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1674 TGCCCTGACTTAAGTGATATAATATTTAACAAATATTTATAAAATAAATAAATTCAAATT 1733

 38265675 CACTCTAATACCTAGAAAATTATCAAGTATAGTAAACCAAATAATAAATATTTATTAAGG 38265734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1734 CACTCTAATACCTAGAAAATTATCAAGTATAGTAAACCAAATAATAAATATTTATTAAGG 1793

 38265735 AATATGGAAACAGTGACCTATGAGAAGTCTTGATATACTGACCATCCATTGTTGCAGCAG 38265794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1794 AATATGGAAACAGTGACCTATGAGAAGTCTTGATATACTGACCATCCATTGTTGCAGCAG 1853

 38265795 ATCTCACTATTGCTATTGTGCTTAACATTTCAATTACAAAAATTAAAAAAAAAAAA-CAC 38265853
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
     1854 ATCTCACTATTGCTATTGTGCTTAACATTTCAATTACAAAAATTAAAAAAAAAAAAACAC 1913

 38265854 CATTCATCAGTGCAGGTCTGTGTATTTAAAGAAATAATTTACAAGTTTTTTTTTCCTTTG 38265913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
     1914 CATTCATCAGTGCAGGTCTGTGTATTTAAAGAAATAATTTACAAGTTTTTTTT-CCTTTG 1972

 38265914 TAAACATATTGTTTTGAAGTGCAAATATATATAATTTGCACTTTGGGATGGAATGGAATG 38265973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1973 TAAACATATTGTTTTGAAGTGCAAATATATATAATTTGCACTTTGGGATGGAATGGAATG 2032

 38265974 GGATGCCCTATTGGCAGTCCATACATCTGGATTATAAATGGATTTCCATCCCATCTTCCT 38266033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2033 GGATGCCCTATTGGCAGTCCATACATCTGGATTATAAATGGATTTCCATCCCATCTTCCT 2092

 38266034 CCCCATCTCTTTCCCTTTTTGATCATTCTATGGAAATGGAAAGCTAGCAGAAGTTTGAAG 38266093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2093 CCCCATCTCTTTCCCTTTTTGATCATTCTATGGAAATGGAAAGCTAGCAGAAGTTTGAAG 2152

 38266094 AATTGTCACGCAAACAACAACAACAA---AACTTTAGCATATTAACCTGTTGTCCAACCT 38266150
          ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||
     2153 AATTGTCACGCAAACAACAACAACAACAAAACTTTAGCATATTAACCTGTTGTCCAACCT 2212

 38266151 TATATAAGCAGTTTGTATTTAAAACATCCCTAAGTGGATTTTAATTCCAGTTTCAATCAT 38266210
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     2213 TATATAAGCAGTTTGTATTTAAAACATCCCTAAGTGGATTTTAATTCCAATTTCAATCAT 2272

 38266211 TGTTAACTATTTTTGAAATATTTAAAATCCCA 38266242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||
     2273 TGTTAACTATTTTTGAAATATTTAAAATCCCA 2304

EXCISED REGION

 38266251 ACCACTATTTCTCTTCAACTAGTCCTTACTTTTATAAACAAAAAAGTAACAGTAAATAAT 38266310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2305 ACCACTATTTCTCTTCAACTAGTCCTTACTTTTATAAACAAAAAAGTAACAGTAAATAAT 2364

 38266311 TTATAACTAGGTCTCTCTGAATCTAAAAACACGTTCTTATACACTATGTGATGCCATATT 38266370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     2365 TTATAACTAGGTCTCTCTGAATCTAAAAACACATTCTTATACACTATGTGATGCCATATT 2424

 38266371 TTTTACTCTTGTCTTTGTGAGTTTTTTGTGCCATTCTCTCCTCTGGAATGGTCTTCTGTG 38266430
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2425 TTTTACTCTTGACTTTGTGAGTTTTTTGTGCCATTCTCTCCTCTGGAATGGTCTTCTGTG 2484

 38266431 CTTACACATTCCAAGGGCTACTCCATTTTACAAGAAACAGTTCATGTTTGCTACTTTGGG 38266490
          .|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2485 TTTACACATTCCAAGGGCTAATCCATTTTACAAGAAACAGTTCATGTTTGCTACTTTGGG 2544

 38266491 GTTGATCCCATGATAATTCTGGTTCTCACTTGGTCTTTCCCTGTGAGATGCAGTAGCATT 38266550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2545 GTTGATCCCATGATAATTCTGGTTCTCACTTGGTCTTTCCCTGTGAGATGCAGTAGCATT 2604

 38266551 CAAAATTCTCAGACTATTCTATGCACCTTGGCAGATTTATGGTAATGGTCTATAATTGCT 38266610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2605 CAAAATTCTCAGACTATTCTATGCACCTTGGCAGATTTATGGTAATGGTCTATAATTGCT 2664

 38266611 TCATATCTGCTAACCTTGCTTCCAAAACTAGTTTTTGAGATTAATGAGACAGGAGCTTGG 38266670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2665 TCATATCTGCTAACCTTGCTTCCAAAACTAGTTTTTGAGATTAATGAGACAGGAGCTTGG 2724

 38266671 CTTTTTCTTTCTGTATAGCTTCCATAGCAACAAGAAAATATTAGACACACAGTAGGCATT 38266730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2725 CTTTTTCTTTCTGTATAGCTTCCATAGCAACAAGAAAATATTAGACACACAGTAGGCATT 2784

 38266731 GGAAGAAAATGTGTTCAGTTAAATGAACTTGATTTGAATGGAATGAGAGTTCAATGAAAC 38266790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2785 GGAAGAAAATGTGTTCAGTTAAATGAACTTGATTTGAATGGAATGAGAGTTCAATGAAAC 2844

 38266791 TGTATATATTGTGAAACGTGGCAACTTACACCTACTCAAGACATTAAAAGAGATCATGCT 38266850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2845 TGTATATATTGTGAAACGTGGCAACTTACACCTACTCAAGACATTAAAAGAGATCATGCT 2904

 38266851 TTCTTGCCTAAGTTTTATGTCCAATTTGTTCCTGTTTCAAACCCCTCGACAAAAACAAAA 38266910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2905 TTCTTGCCTAAGTTTTATGTCCAATTTGTTCCTGTTTCAAACCCCTCGACAAAAACAAAA 2964

 38266911 TCTTTTAATCTGTTTGCAAAATATTTCCTCCTTCCTCCCATCTTGCTGTTGCTGCTCTGT 38266970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2965 TCTTTTAATCTGTTTGCAAAATATTTCCTCCTTCCTCCCATCTTGCTGTTGCTGCTCTGT 3024

 38266971 GATATACTGCCCTTGCTTATTACCCCTTTATAGCTGTTTTGTTAAAGTTCATACCGCTAA 38267030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3025 GATATACTGCCCTTGCTTATTACCCCTTTATAGCTGTTTTGTTAAAGTTCATACCGCTAA 3084

 38267031 GACCTGTAAAAGAAATTTATGGCTCTAGGGATTTCAGCAAATTCTAAATAACCATAACAG 38267090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3085 GACCTGTAAAAGAAATTTATGGCTCTAGGGATTTCAGCAAATTCTAAATAACCATAACAG 3144

 38267091 GAACAGGAAGCATTAATTAAAGACACTAGAGTCTAAGTTATAACAGAAATCCTGACATTT 38267150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3145 GAACAGGAAGCATTAATTAAAGACACTAGAGTCTAAGTTATAACAGAAATCCTGACATTT 3204

 38267151 AAGGCCCTGGTACCATTTAAATTTAAAATGGTATGACAAACAGAGAGTAATTTGATGGTC 38267210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3205 AAGGCCCTGGTACCATTTAAATTTAAAATGGTATGACAAACAGAGAGTAATTTGATGGTC 3264

 38267211 AGAAGGTTATAATGGATACCTTAATACCTTTGCCAAGAAAAAGTGTCTGTCCTTGCTCTA 38267270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3265 AGAAGGTTATAATGGATACCTTAATACCTTTGCCAAGAAAAAGTGTCTGTCCTTGCTCTA 3324

 38267271 ACCCCTACCCAGGGGCTTCAGGGGCCTCCTTCATAAAACATGGTGATGCCTAAATATTTT 38267330
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3325 ATCCCTACCCAGGGGCTTCAGGGGCCTCCTTCATAAAACATGGTGATGCCTAAATATTTT 3384

 38267331 TGCGATATCTCATATATAAGCTGGTCTTTTCTTTAAGAATACGAGAGATTAAACACCAAC 38267390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3385 TGCGATATCTCATATATAAGCTGGTCTTTTCTTTAAGAATACGAGAGATTAAACACCAAC 3444

 38267391 CCCCAACATTCATACACCAATTTTCAGATAAAACAGCTTAATATTTAAGATATATTTAGT 38267450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3445 CCCCAACATTCATACACCAATTTTCAGATAAAACAGCTTAATATTTAAGATATATTTAGT 3504

 38267451 GCAATTTGTCTATTTCTTGGTTTACTGGAGGGCTGTATTTAAAGCCAAGGGACCAAGGAA 38267510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3505 GCAATTTGTCTATTTCTTGGTTTACTGGAGGGCTGTATTTAAAGCCAAGGGACCAAGGAA 3564

 38267511 CATTCCACAACACACTAAAGCAATTTTTCCCCAGGGAATATGCTGATTCTTTCCTAAAGG 38267570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3565 CATTCCACAACACACTAAAGCAATTTTTCCCCAGGGAATATGCTGATTCTTTCCTAAAGG 3624

 38267571 CAGAAGCCGACATTCCTGACTCATTCTGCCAAACCAAGCAATGAAAAATGCTTCACCTAA 38267630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3625 CAGAAGCCGACATTCCTGACTCATTCTGCCAAACCAAGCAATGAAAAATGCTTCACCTAA 3684

 38267631 TTTGAAAGATAATTTGTAATACCAGAGACTCAACTTGTTTTGTGTATCCAATACTAGCAC 38267690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3685 TTTGAAAGATAATTTGTAATACCAGAGACTCAACTTGTTTTGTGTATCCAATACTAGCAC 3744

 38267691 CCTTTCCAGAATGTTGAAAGTACACACTGTATGATTTGTCTAATGTATATTCAAAAAAGG 38267750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3745 CCTTTCCAGAATGTTGAAAGTACACACTGTATGATTTGTCTAATGTATATTCAAAAAAGG 3804

 38267751 AATACAAATTGATCCTCAAAGTTCAAATCTGCAGTACATACTCTGTGTTCTGCCCCCACC 38267810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3805 AATACAAATTGATCCTCAAAGTTCAAATCTGCAGTACATACTCTGTGTTCTGCCCCCACC 3864

 38267811 CGTACCTTCATGAATTCTTTCACCTAGCACGCAGGCTGTTTTCCCTTTGCGAAATCCCAT 38267870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3865 CGTACCTTCATGAATTCTTTCACCTAGCACGCAGGCTGTTTTCCCTTTGCGAAATCCCAT 3924

 38267871 GGTACATTTATAGTATTAATACCACTCACTTAGAATATGCCGTATTTTGTCTAATATTGC 38267930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3925 GGTACATTTATAGTATTAATACCACTCACTTAGAATATGCCGTATTTTGTCTAATATTGC 3984

 38267931 TAGATTTTGTGTGTATAATCTTATTCCTCAAGTAAATTACAAGACAAGGACTATAATTTA 38267990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3985 TAGATTTTGTGTGTATAATCTTATTCCTCAAGTAAATTACAAGACAAGGACTATAATTTA 4044

 38267991 TACATCCTCTACAACACTTGACACTGGCTTTGATTAGGCTCTTAATAAATATTTGTTGGT 38268050
          ||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     4045 TACATCCTCTACAACACTTGGCACTGGCTTTGAGTAGGCTCTTAATAAATATTTGTTGGT 4104

 38268051 TGATTAATCAGTTGACCACACTTACTAATTGCAAGGTGACATCATTTATCATTAATAAAC 38268110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4105 TGATTAATCAGTTGACCACACTTACTAATTGCAAGGTGACATCATTTATCATTAATAAAC 4164

 38268111 ATATATGTGGATTACAAAAATATCATGTGAATTTGCATATAATCATATTAATCCCAAATT 38268170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4165 ATATATGTGGATTACAAAAATATCATGTGAATTTGCATATAATCATATTAATCCCAAATT 4224

 38268171 AGCACCTGAGAGTCCAACCACCCTCTCCTTTAGGCCCTTTTCACTTTTATGTCTACTTTT 38268230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4225 AGCACCTGAGAGTCCAACCACCCTCTCCTTTAGGCCCTTTTCACTTTTATGTCTACTTTT 4284

 38268231 GCCTCACTTACAATTCCACTACTTACTTGCCTTCTTTCTCTTTTCA 38268276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4285 GCCTCACTTACAATTCCACTACTTACTTGCCTTCTTTCTCTTTTCA 4330

Alignment time is 4.11303 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38249892,38276749] =>     26858 nucs '18 dna:chromosome chromosome:GRCh37:18:1:78077248:1'
Second seq [       1,    4408] =>      4408 nucs 'mol-32-2e20-091901_4408'

Score:        4225
Aligned:      4411        nucs
Identic:      4390 (100%) nucs =>      1261 ( 99%)      3129 (100%)
Gaps:            8 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38258627,38259892] EXCISED REGION [38266750,38269889]
 second seq =>  [       1,    1266] EXCISED REGION [    1267,    4408]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6857 nucs [38259893,38266749]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [38259893,38259893] to [38266750,38266750]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [38259893,38259893] to [38266749,38266749]
 second seq =>         0 nucs

 38258627 TATATATGAATTAATTAATTGATGAATGAGTGATTTTATTTCAGATTGCTATCAAATGCT 38258686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TATATATGAATTAATTAATTGATGAATGAGTGATTTTATTTCAGATTGCTATCAAATGCT 60

 38258687 CAATTCCCCTGCATAGTATCTCCAATGAGTCAAATCCTGGAATTCCCTATAGGAACACCT 38258746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAATTCCCCTGCATAGTATCTCCAATGAGTCAAATCCTGGAATTCCCTATAGGAACACCT 120

 38258747 GGGATATATAGTATCAACTTACAAATACCATTCTTTCTTAATTTTGAAAGAAAAACTGAG 38258806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGGATATATAGTATCAACTTACAAATACCATTCTTTCTTAATTTTGAAAGAAAAACTGAG 180

 38258807 TAAAATATGAGAGCTGTAGCTTTTAAAAAAAATAGAAAATACACCATAAAAATTTTAGTC 38258866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TAAAATATGAGAGCTGTAGCTTTTAAAAAAAATAGAAAATACACCATAAAAATTTTAGTC 240

 38258867 AAGCATGGCAGACTAAATACATGTATTTATTTCTAATCTACTTCAAGCTCCAATATAATA 38258926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAGCATGGCAGACTAAATACATGTATTTATTTCTAATCTACTTCAAGCTCCAATATAATA 300

 38258927 ACTGTTTACAAATGAAATGGTCTAATATCACAAGTTCAAAATTAATAAGAGTGGATGAGA 38258986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACTGTTTACAAATGAAATGGTCTAATATCACAAGTTCAAAATTAATAAGAGTGGATGAGA 360

 38258987 CATGCCAACAAATTTTTGGAATGTAAAAATAGATAAGACATTGTTAATGATTTGACAAAG 38259046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CATGCCAACAAATTTTTGGAATGTAAAAATAGATAAGACATTGTTAATGATTTGACAAAG 420

 38259047 CACAAAGCCTTAAAATATTTCTGTATAGAGAGAAGTTTCCAAAGTAGGGCAACTCAGAGA 38259106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CACAAAGCCTTAAAATATTTCTGTATAGAGAGAAGTTTCCAAAGTAGGGCAACTCAGAGA 480

 38259107 TAAATCAAGAATGGGAAGATTCACACACCTCAACTGTAAAAGAGAAATATGAGACTAAAA 38259166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TAAATCAAGAATGGGAAGATTCACACACCTCAACTGTAAAAGAGAAATATGAGACTAAAA 540

 38259167 GCAGTGGATTAATTAAAACTTTGTTTGATGAGATATTATACATAGATGTCTTCTCCATCA 38259226
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GCAGTGGATTCATTAAAACTTTGTTTGATGAGATATTATACATAGATGTCTTCTCCATCA 600

 38259227 TTCCAAGCACTTAAGCAGCTGCCCTTTCCAAACACTCATAGAGGATAAGAGATTATTTTC 38259286
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTCCAAGCACTTAAGCAGCTGCCCTTTACAAACACTCATAGAGGATAAGAGATTATTTTC 660

 38259287 TATAAAAATCAAACCAGATTGTTG--TGTACATCAAGCAAAGGAGGGATGGCAGGGAGGT 38259344
          ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TATAAAAATCAAACCAGATTGT--CATGTACATCAAGCAAAGGAGGGATGGCAGGGAGGT 718

 38259345 GATATACTGAAACAGAATTACTGTATGAAAACCTGGAATGAACAATTAGATACTCAGTTC 38259404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
      719 GATATACTGAAACAGAATTACTGTATGAAAACATGGAATGAACAATTAGATACTCAGTTC 778

 38259405 TCCTTACCTGCACAGTAATAGTAATTCTTACTACCAGACTGGATGCTGGAGGGCTCTCCT 38259464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      779 TCCTTACCTGCACAGTAATAGTAATTCTTACTACCAGACTGGATGCTGGAGGGCTCTCCT 838

 38259465 TCAGAGAAACAGAAAAGAAAAAAAAGCCTATAGCCACTAATATTTGAATCTCTGCAATTA 38259524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      839 TCAGAGAAACAGAAAAGAAAAAAAAGCCTATAGCCACTAATATTTGAATCTCTGCAATTA 898

 38259525 AATACCTGGGTCCCTTCCCAATCATATAGCAGTGATGCTCACCAGTTAACAAGAACTGAA 38259584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      899 AATACCTGGGTCCCTTCCCAATCATATAGCAGTGATGCTCACCAGTTAACAAGAACTGAA 958

 38259585 GACACATGACAGATTCCAATCAGTGATTTATTACCACTGTCAAATAAGAATGGACACTCA 38259644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      959 GACACATGACAGATTCCAATCAGTGATTTATTACCACTGTCAAATAAGAATGGACACTCA 1018

 38259645 AAGATTACCTGAAAAAGTCCTTTAATATGGCCCCAGATTGAATAATTCCTAATTTCCTAT 38259704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1019 AAGATTACCTGAAAAAGTCCTTTAATATGGCCCCAGATTGAATAATTCCTAATTTCCTAT 1078

 38259705 ATCATAAATTCAAAAATTATCTAAAATTCAGTGAAATTAGTCCATATTATCAATGCCAAC 38259764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1079 ATCATAAATTCAAAAATTATCTAAAATTCAGTGAAATTAGTCCATATTATCAATGCCAAC 1138

 38259765 CTTACACATAAACAGAGTTGACATTCTCTTATGATGCTGAACAATGCAGATGAAGAACGC 38259824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1139 CTTACACATAAACAGAGTTGACATTCTCTTATGATGCTGAACAATGCAGATGAAGAACGC 1198

 38259825 TGGCTTTGGATTAAGAAGACCCTTAGTTTGAATTTTAATTTTGACCCATGATAGCTGTGT 38259884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1199 TGGCTTTGGATTAAGAAGACCCTTAGTTTGAATTTTAATTTTGACCCATGATAGCTGTGT 1258

 38259885 AAACTTAG 38259892
          ||||||||
     1259 AAACTTAG 1266

EXCISED REGION

 38266750 TAAATGAACTTGATTTGAATGGAATGAGAGTTCAATGAAACTGTATATATTGTGAAACGT 38266809
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     1267 TAAATGAACTTGATTTGAATGGAATGAGAGTTCAATGAAACTGTATATATTGTGAGACGT 1326

 38266810 GGCAACTTACACCTACTCAAGACATTAAAAGAGATCATGCTTTCTTGCCTAAGTTTTATG 38266869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1327 GGCAACTTACACCTACTCAAGACATTAAAAGAGATCATGCTTTCTTGCCTAAGTTTTATG 1386

 38266870 TCCAATTTGTTCCTGTTTCAAACCCCTCGACAAAAACAAAATCTTTTAATCTGTTTGCAA 38266929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1387 TCCAATTTGTTCCTGTTTCAAACCCCTCGACAAAAACAAAATCTTTTAATCTGTTTGCAA 1446

 38266930 AATATTTCCTCCTTCCTCCCATCTTGCTGTTGCTGCTCTGTGATATACTGCCCTTGCTTA 38266989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1447 AATATTTCCTCCTTCCTCCCATCTTGCTGTTGCTGCTCTGTGATATACTGCCCTTGCTTA 1506

 38266990 TTACCCCTTTATAGCTGTTTTGTTAAAGTTCATACCGCTAAGACCTGTAAAAGAAATTTA 38267049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1507 TTACCCCTTTATAGCTGTTTTGTTAAAGTTCATACCGCTAAGACCTGTAAAAGAAATTTA 1566

 38267050 TGGCTCTAGGGATTTCAGCAAATTCTAAATAACCATAACAGGAACAGGAAGCATTAATTA 38267109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1567 TGGCTCTAGGGATTTCAGCAAATTCTAAATAACCATAACAGGAACAGGAAGCATTAATTA 1626

 38267110 AAGACACTAGAGTCTAAGTTATAACAGAAATCCTGACATTTAAGGCCCTGGTACCATTTA 38267169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1627 AAGACACTAGAGTCTAAGTTATAACAGAAATCCTGACATTTAAGGCCCTGGTACCATTTA 1686

 38267170 AATTTAAAATGGTATGACAAACAGAGAGTAATTTGATGGTCAGAAGGTTATAATGGATAC 38267229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1687 AATTTAAAATGGTATGACAAACAGAGAGTAATTTGATGGTCAGAAGGTTATAATGGATAC 1746

 38267230 CTTAATACCTTTGCCAAGAAAAAGTGTCTGTCCTTGCTCTAACCCCTACCCAGGGGCTTC 38267289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     1747 CTTAATACCTTTGCCAAGAAAAAGTGTCTGTCCTTGCTCTAATCCCTACCCAGGGGCTTC 1806

 38267290 AGGGGCCTCCTTCATAAAACATGGTGATGCCTAAATATTTTTGCGATATCTCATATATAA 38267349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1807 AGGGGCCTCCTTCATAAAACATGGTGATGCCTAAATATTTTTGCGATATCTCATATATAA 1866

 38267350 GCTGGTCTTTTCTTTAAGAATACGAGAGATTAAACACCAACCCCCAACATTCATACACCA 38267409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1867 GCTGGTCTTTTCTTTAAGAATACGAGAGATTAAACACCAACCCCCAACATTCATACACCA 1926

 38267410 ATTTTCAGATAAAACAGCTTAATATTTAAGATATATTTAGTGCAATTTGTCTATTTCTTG 38267469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1927 ATTTTCAGATAAAACAGCTTAATATTTAAGATATATTTAGTGCAATTTGTCTATTTCTTG 1986

 38267470 GTTTACTGGAGGGCTGTATTTAAAGCCAAGGGACCAAGGAACATTCCACAACACACTAAA 38267529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1987 GTTTACTGGAGGGCTGTATTTAAAGCCAAGGGACCAAGGAACATTCCACAACACACTAAA 2046

 38267530 GCAATTTTTCCCCAGGGAATATGCTGATTCTTTCCTAAAGGCAGAAGCCGACATTCCTGA 38267589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2047 GCAATTTTTCCCCAGGGAATATGCTGATTCTTTCCTAAAGGCAGAAGCCGACATTCCTGA 2106

 38267590 CTCATTCTGCCAAACCAAGCAATGAAAAATGCTTCACCTAATTTGAAAGATAATTTGTAA 38267649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2107 CTCATTCTGCCAAACCAAGCAATGAAAAATGCTTCACCTAATTTGAAAGATAATTTGTAA 2166

 38267650 TACCAGAGACTCAACTTGTTTTGTGTATCCAATACTAGCACCCTTTCCAGAATGTTGAAA 38267709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2167 TACCAGAGACTCAACTTGTTTTGTGTATCCAATACTAGCACCCTTTCCAGAATGTTGAAA 2226

 38267710 GTACACACTGTATGATTTGTCTAATGTATATTCAAAAAAGGAATACAAATTGATCCTCAA 38267769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2227 GTACACACTGTATGATTTGTCTAATGTATATTCAAAAAAGGAATACAAATTGATCCTCAA 2286

 38267770 AGTTCAAATCTGCAGTACATACTCTGTGTTCTGCCCCCACCCGTACCTTCATGAATTCTT 38267829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2287 AGTTCAAATCTGCAGTACATACTCTGTGTTCTGCCCCCACCCGTACCTTCATGAATTCTT 2346

 38267830 TCACCTAGCACGCAGGCTGTTTTCCCTTTGCGAAATCCCATGGTACATTTATAGTATTAA 38267889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2347 TCACCTAGCACGCAGGCTGTTTTCCCTTTGCGAAATCCCATGGTACATTTATAGTATTAA 2406

 38267890 TACCACTCACTTAGAATATGCCGTATTTTGTCTAATATTGCTAGATTTTGTGTGTATAAT 38267949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2407 TACCACTCACTTAGAATATGCCGTATTTTGTCTAATATTGCTAGATTTTGTGTGTATAAT 2466

 38267950 CTTATTCCTCAAGTAAATTACAAGACAAGGACTATAATTTATACATCCTCTACAACACTT 38268009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2467 CTTATTCCTCAAGTAAATTACAAGACAAGGACTATAATTTATACATCCTCTACAACACTT 2526

 38268010 GACACTGGCTTTGATTAGGCTCTTAATAAATATTTGTTGGTTGATTAATCAGTTGACCAC 38268069
          |.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2527 GGCACTGGCTTTGAGTAGGCTCTTAATAAATATTTGTTGGTTGATTAATCAGTTGACCAC 2586

 38268070 ACTTACTAATTGCAAGGTGACATCATTTATCATTAATAAACATATATGTGGATTACAAAA 38268129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2587 ACTTACTAATTGCAAGGTGACATCATTTATCATTAATAAACATATATGTGGATTACAAAA 2646

 38268130 ATATCATGTGAATTTGCATATAATCATATTAATCCCAAATTAGCACCTGAGAGTCCAACC 38268189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2647 ATATCATGTGAATTTGCATATAATCATATTAATCCCAAATTAGCACCTGAGAGTCCAACC 2706

 38268190 ACCCTCTCCTTTAGGCCCTTTTCACTTTTATGTCTACTTTTGCCTCACTTACAATTCCAC 38268249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2707 ACCCTCTCCTTTAGGCCCTTTTCACTTTTATGTCTACTTTTGCCTCACTTACAATTCCAC 2766

 38268250 TACTTACTTGCCTTCTTTCTCTTTTCAGCTTTGTGCTGTTATTTAATATCTCACCAGTTG 38268309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2767 TACTTACTTGCCTTCTTTCTCTTTTCAGCTTTGTGCTGTTATTTAATATCTCACCAGTTG 2826

 38268310 TGTAATTTCAGCTCCCAAATTGAATAAGACGTTCCCCCCAGTGGAACCCTCACCTTGACA 38268369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2827 TGTAATTTCAGCTCCCAAATTGAATAAGACGTTCCCCCCAGTGGAACCCTCACCTTGACA 2886

 38268370 AATAGCCAAATAGTA---ATTATTCCTTTCAGGGGTTGAGCTATGGAATCATGCTTGCAA 38268426
          |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2887 AATAGCCAAATAGTAATTATTATTCCTTTCAGGGGTTGAGCTATGGAATCATGCTTGCAA 2946

 38268427 TATCCCAGGCTTGAGTGCCTAGATATTTATGCTATACTTCCCTGTGTCGGAGTTTCCATC 38268486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2947 TATCCCAGGCTTGAGTGCCTAGATATTTATGCTATACTTCCCTGTGTCGGAGTTTCCATC 3006

 38268487 TGCGATTGTATTTCAAGCCCTCTCATTTTTTTTTTCAATATGATTAAGATAATTCCTTTA 38268546
          ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3007 TGCGATTGTATTTCAAGCCCTCTCA-TTTTTTTTTCAATATGATTAAGATAATTCCTTTA 3065

 38268547 TGAAGTTGGAAACTCAGACATTCAGAAAGAAACTTGACGTTTCATATTTTTGCTAACTTG 38268606
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3066 TGAAGCTGGAAACTCAGACATTCAGAAAGAAACTTGACGTTTCATATTTTTGCTAACTTG 3125

 38268607 CTCTTCCCATTTCCTTTCCTATCATTTTAGCCAGACTGAGGGAGAATTAATTTTGCAATG 38268666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     3126 CTCTTCCCATTTCCTTTCCTATCATTTTAGCCAGACTGAGGGAGAATTAATTTTGCAACG 3185

 38268667 GTCTCTATTTTTTTTTCCAAATGTGTGACCTCCATATTAATAGGAGCCAGAGTACTCATT 38268726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3186 GTCTCTATTTTTTTTTCCAAATGTGTGACCTCCATATTAATAGGAGCCAGAGTACTCATT 3245

 38268727 CATCACATCTGGTCAGTGTGAAACTGACATTTACAGGGTGGAATGTTTCCCACTCAGGAC 38268786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3246 CATCACATCTGGTCAGTGTGAAACTGACATTTACAGGGTGGAATGTTTCCCACTCAGGAC 3305

 38268787 AAATGGGGATCATTTGTAAAACATGCCGCACCCAATCATAGGTTCCCATGGATCTCCAAC 38268846
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     3306 AAATGGGGATCATTTGTAAAACATGCCACACCCAATCATAGGTTCCCATGGATCTCCAAC 3365

 38268847 TACATTTTTAAGCAACAATATAAACCATTCCCGAAACTGAAAGGTCTTTTCAAATATTTA 38268906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3366 TACATTTTTAAGCAACAATATAAACCATTCCCGAAACTGAAAGGTCTTTTCAAATATTTA 3425

 38268907 CTGCCTACCTATGGAATTTTTATTCTGCTTGCTGCTGCCATCAATAATCCTGGGAGTTCC 38268966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3426 CTGCCTACCTATGGAATTTTTATTCTGCTTGCTGCTGCCATCAATAATCCTGGGAGTTCC 3485

 38268967 TAGCTAAGTGTTGTGTATGACCTCCAAGGAAAGTCTTAGCATTGCAGAATGGGGAGGCGG 38269026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3486 TAGCTAAGTGTTGTGTATGACCTCCAAGGAAAGTCTTAGCATTGCAGAATGGGGAGGCGG 3545

 38269027 GTTAGTATCCTGCATTTTTCATTCTGTCACTTTCTAGGGACAATTACAAAGAAAATAATC 38269086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3546 GTTAGTATCCTGCATTTTTCATTCTGTCACTTTCTAGGGACAATTACAAAGAAAATAATC 3605

 38269087 ATATAAGACTTATTTTTATGTTTATTATGAAAGCCTTCAGCTCTTGCATTTGCAAGTAAG 38269146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3606 ATATAAGACTTATTTTTATGTTTATTATGAAAGCCTTCAGCTCTTGCATTTGCAAGTAAG 3665

 38269147 CTCAATGATTTTAAGTTTGCTTTTTCCCCCATGAAATGAAATATTATTTCCCACTTCTTC 38269206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3666 CTCAATGATTTTAAGTTTGCTTTTTCCCCCATGAAATGAAATATTATTTCCCACTTCTTC 3725

 38269207 CATGAATCTATTGGGTAACTCCAGGCCACTGTGATCTTTCATCTGGCATTTTGCTTTTAT 38269266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3726 CATGAATCTATTGGGTAACTCCAGGCCACTGTGATCTTTCATCTGGCATTTTGCTTTTAT 3785

 38269267 TTTTCTAGATCACAGTTGTGATTTAAAGCCCTCCTGGCACTTGGACACCTTGGTGATCTT 38269326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3786 TTTTCTAGATCACAGTTGTGATTTAAAGCCCTCCTGGCACTTGGACACCTTGGTGATCTT 3845

 38269327 AGCTCATGCTCCTAGTTCCATAGTGATGAATTGACCAAACTTTTTCCCAAGGATATCTGC 38269386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3846 AGCTCATGCTCCTAGTTCCATAGTGATGAATTGACCAAACTTTTTCCCAAGGATATCTGC 3905

 38269387 TAATTCTGGAGTTTCTGCTTTCTTATTATCTGTTCTGTCTTTTGGTTCTGTATTGATATA 38269446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3906 TAATTCTGGAGTTTCTGCTTTCTTATTATCTGTTCTGTCTTTTGGTTCTGTATTGATATA 3965

 38269447 ACAAGCTTTGTCCCCTTATCAATGAGGGCACAAAATGCAGCACTTCAAATAATTTCTGCA 38269506
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||
     3966 ACAAGCTTTGTCCCCTTATCAATGAGGGCACAAAATGAAGCACTTCAAATAGTTTCTGCA 4025

 38269507 AAAATTTACAGTTGCTGCATTAAGAATTTTGTGAGCTTCAATAATGTTATTGAAAAGTTG 38269566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4026 AAAATTTACAGTTGCTGCATTAAGAATTTTGTGAGCTTCAATAATGTTATTGAAAAGTTG 4085

 38269567 CAGATTCCCTCCTCCTTCTTTTTCTCCTTTCCTCCTCTTTCTGCCCTGTCTCCCCTTCAT 38269626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4086 CAGATTCCCTCCTCCTTCTTTTTCTCCTTTCCTCCTCTTTCTGCCCTGTCTCCCCTTCAT 4145

 38269627 TATTCTCCTCTTCTTCTCAAAAGCAAACAATCATTTTTCTTGCCTACTGAAGAATACTTG 38269686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4146 TATTCTCCTCTTCTTCTCAAAAGCAAACAATCATTTTTCTTGCCTACTGAAGAATACTTG 4205

 38269687 TAATGTTATTCTCAAAACCTGGACACCAGCTCAACTCCTTCTTTGTTCTACAAGTATTCA 38269746
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     4206 TAATGTTATTCTCAAAACCTGGACACCGGCTCAACTCCTTCTTTGTTCTACAAGTATTCA 4265

 38269747 CCCACCCTAATAGGGAGTTTATTCCAATGAAAAGACTGTGTTCCTCCTCAGAGGAATTTA 38269806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4266 CCCACCCTAATAGGGAGTTTATTCCAATGAAAAGACTGTGTTCCTCCTCAGAGGAATTTA 4325

 38269807 TGAGGTGGTAAGAGAGTAGAATTGCATTAATCTTATGCCATTCCTAGAGAATTCTTATTT 38269866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4326 TGAGGTGGTAAGAGAGTAGAATTGCATTAATCTTATGCCATTCCTAGAGAATTCTTATTT 4385

 38269867 CCTCAATTAAGGTTTAATTGCTC 38269889
          |||||||||||||||||||||||
     4386 CCTCAATTAAGGTTTAATTGCTC 4408

Alignment time is 4.21952 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38249892,38276749] =>     26858 nucs '18 dna:chromosome chromosome:GRCh37:18:1:78077248:1'
Second seq [       1,    5619] =>      5619 nucs 'mol-32-2e57-007933_5619'

Score:        5357
Aligned:      5628        nucs
Identic:      5596 ( 99%) nucs =>      2480 ( 99%)      3116 (100%)
Gaps:           16 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38263750,38266242] EXCISED REGION [38266251,38269378]
 second seq =>  [       1,    2489] EXCISED REGION [    2490,    5619]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         8 nucs [38266243,38266250]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         8 nucs [38266243,38266250] to [38266251,38266258]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [38266242,38266242] to [38266251,38266251]
 second seq =>         1 nucs [2489,2489] to [2490,2490]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 38263750 TGTCCTATTTTTTTCTTTTTCTTCATCAGAAACACTAAAGAATTTTTTATTTTATTAGAT 38263809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGTCCTATTTTTTTCTTTTTCTTCATCAGAAACACTAAAGAATTTTTTATTTTATTAGAT 60

 38263810 TTTCTAAAAGTTAAGATCTTATTGATTTTGACTAGTATATAAGTCCTTTATTTTGTTAAT 38263869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTCTAAAAGTTAAGATCTTATTGATTTTGACTAGTATATAAGTCCTTTATTTTGTTAAT 120

 38263870 TTCTAGTTGTATTTTTATTATTTCCTTCCTAGTTCTTCTTTTTATTTAATCGTTCTTAAG 38263929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTCTAGTTGTATTTTTATTATTTCCTTCCTAGTTCTTCTTTTTATTTAATCGTTCTTAAG 180

 38263930 ATGGATACTTAAGTAATTGATTTTCATCTTCTAAGCTTTATTAGTATGTTTATTTAAAGC 38263989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATGGATACTTAAGTAATTGATTTTCATCTTCTAAGCTTTATTAGTATGTTTATTTAAAGC 240

 38263990 AATACATTTCCATATTACCATGACCTTAGCTGCAGTGTATGTATTTTGGTGTACAGTATT 38264049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AATACATTTCCATATTACCATGACCTTAGCTGCAGTGTATGTATTTTGGTGTACAGTATT 300

 38264050 TTCTTTATTTTTCAATTAAAATTTGTCTTGACTTCCTCTATGATGTCTTCTATGATTCTT 38264109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTCTTTATTTTTCAATTAAAATTTGTCTTGACTTCCTCTATGATGTCTTCTATGATTCTT 360

 38264110 CCTCTATAATTCTTCTTTTGACCATATAGAAGTGTATTCATTAATTCAATCACATATAAA 38264169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CCTCTATAATTCTTCTTTTGACCATATAGAAGTGTATTCATTAATTCAATCACATATAAA 420

 38264170 TATTCTCCTTTTATCTTTTTGCTACTGGTTTGTTTGTTTAGCTACATTTAGGGAAAATTT 38264229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TATTCTCCTTTTATCTTTTTGCTACTGGTTTGTTTGTTTAGCTACATTTAGGGAAAATTT 480

 38264230 CATTTCTGAGACGACAGAGGAAGCACATTCCATTTTATTCCTTCTGCTAATGACAAAAAA 38264289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CATTTCTGAGACGACAGAGGAAGCACATTCCATTTTATTCCTTCTGCTAATGACAAAAAA 540

 38264290 AAAAAAAAATTGGAAAAAACACAAAAGCCAGAGTCAAAAGACTCTGAAAAATGGAGAAAA 38264349
          ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAAAAA---TTGGAAAAAACACAAAAGCCAGAGTCAAAAGACTCTGAAAAATGGAGAAAA 597

 38264350 AGTGCAGACAGGCTAAGGATTTGGGAGATTGAGGAACAACGACAGGTGAGTTCTCTGTCT 38264409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      598 AGTGCAGACAGGCTAAGGATTTGGGAGATTGAGGAACAACGACAGGTGAGTTCTCTGTCT 657

 38264410 TTTTTTTT-CTTTCTTTTTTGATATATATATATATATCAACAATCTCAATGTTTAAGAGA 38264468
          |||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||
      658 TTTTTTTTTCTTTCTTTTTTGATATATATATAT----CAACAATCTCAATGTTTAAGAGA 713

 38264469 AGCCCTCAAGCCAGAATTTCCAACAGTTGCAGATAAAACATTGTGCTTGCTTAACGTATT 38264528
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      714 AGCCCTCAATCCAGAATTTCCAACAGTTGCAGATAAAACATTGTGCTTGCTTAACGTATT 773

 38264529 TAACCAAAAGACCCGAAAAGCAAGGATATAAAAGAATATTTTAATAATATCATTCTGTTC 38264588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      774 TAACCAAAAGACCCGAAAAGCAAGGATATAAAAGAATATTTTAATAATATCATTCTGTTC 833

 38264589 TTAAGGTGAACACTTCAAAGAAACCACACCCCTCCCCTCCCCAATGCGTGCTGAAGCAGT 38264648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      834 TTAAGGTGAACACTTCAAAGAAACCACACCCCTCCCCTCCCCAATGCGTGCTGAAGCAGT 893

 38264649 GGAATCCATGAGTGGAACCTTGTCATATATAATCTCCACACTAAATTTATAGCAAAGCCC 38264708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      894 GGAATCCATGAGTGGAACCTTGTCATATATAATCTCCACACTAAATTTATAGCAAAGCCC 953

 38264709 CCATCTCTCAACCTGTGTTGAAATTCTGACTTCCAGACACACCTTTCAGTAATGAGGAGG 38264768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      954 CCATCTCTCAACCTGTGTTGAAATTCTGACTTCCAGACACACCTTTCAGTAATGAGGAGG 1013

 38264769 TACTCTTCCATGATAAACCCTGTGGGCAAAGCTTCCACATTCATCCCACCCCTAAAGCAA 38264828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1014 TACTCTTCCATGATAAACCCTGTGGGCAAAGCTTCCACATTCATCCCACCCCTAAAGCAA 1073

 38264829 TAAATTTGCACCTTTCCCAAGTAGAATCAATGGGAAGAATTTTGACTTCTATCCCCACCT 38264888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1074 TAAATTTGCACCTTTCCCAAGTAGAATCAATGGGAAGAATTTTGACTTCTATCCCCACCT 1133

 38264889 GATGGTAATGAGGCAGTATCTCTCTCTTTTTCCAGACAGTGTTTAAGAATTTGTTGTATA 38264948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1134 GATGGTAATGAGGCAGTATCTCTCTCTTTTTCCAGACAGTGTTTAAGAATTTGTTGTATA 1193

 38264949 GAGCGCTATTACCTGAATAACACATTGTGGCAGAGCAAAATAACCCTTAAGCATTTAGTT 38265008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1194 GAGCGCTATTACCTGAATAACACATTGTGGCAGAGCAAAATAACCCTTAAGCATTTAGTT 1253

 38265009 TTCAGATTTATTTTCAACTATTTAGAGGGTTATTTCTTGACTACCACAGATAAGTCATTC 38265068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1254 TTCAGATTTATTTTCAACTATTTAGAGGGTTATTTCTTGACTACCACAGATAAGTCATTC 1313

 38265069 CCTTCTCCATTGTTCTATAGTTTACTGCCCTTTTTTTCTATCATGGCATTTACCCACTAT 38265128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1314 CCTTCTCCATTGTTCTATAGTTTACTGCCCTTTTTTTCTATCATGGCATTTACCCACTAT 1373

 38265129 TTCATATTGTTATTTATAGTTTACATGCTTAATATCTCCATCTCCCAACAAATATGGGAA 38265188
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1374 TTCATATTGTTATTTTTAGTTTACATGCTTAATATCTCCATCTCCCAACAAATATGGGAA 1433

 38265189 CATCATTAGGTCAGAGAAATTTTATTTCTTTTCCCTCTGAAGTCTCAGTATTAGTTGTTA 38265248
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||
     1434 CATCATTAGGTCAGAGAAATTTTATTTCTTTCCCCTCTGAAGTCTCAGTACTAGTTGTTA 1493

 38265249 CATTAATTAGCACTTATTTAAATTTTTAGTTTTCTTTTTCTTTGCCTCATGTTACTGTTA 38265308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1494 CATTAATTAGCACTTATTTAAATTTTTAGTTTTCTTTTTCTTTGCCTCATGTTACTGTTA 1553

 38265309 CACCCTTCCACTACCAAGCTTAAAGTTAGGAATGATTCATGTGACTGGAATTGAATGACT 38265368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1554 CACCCTTCCACTACCAAGCTTAAAGTTAGGAATGATTCATGTGACTGGAATTGAATGACT 1613

 38265369 GCTCTGAGAAAGAAGTCCATAAAAGTCTGCATGCAATTTGCCATGTCTCCATCCTTTCTT 38265428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1614 GCTCTGAGAAAGAAGTCCATAAAAGTCTGCATGCAATTTGCCATGTCTCCATCCTTTCTT 1673

 38265429 TGCCATAGAAACTAAAGATCTTCCAGATAGTCGAGGCTCTGTTAATGTTATTTCTTGAAT 38265488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1674 TGCCATAGAAACTAAAGATCTTCCAGATAGTCGAGGCTCTGTTAATGTTATTTCTTGAAT 1733

 38265489 AACGACTATCTGAACAGAACATCTGTGACTTGGAATGGGGACATGTAGCTTGGAGAAAAA 38265548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1734 AACGACTATCTGAACAGAACATCTGTGACTTGGAATGGGGACATGTAGCTTGGAGAAAAA 1793

 38265549 GTAAGCACACAGTGTTTTAAGTTACTGTGGTTTTATGGTTATTTGTTACTGCAGCATAAC 38265608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1794 GTAAGCACACAGTGTTTTAAGTTACTGTGGTTTTATGGTTATTTGTTACTGCAGCATAAC 1853

 38265609 CCACCCTGCCCTGACTTAAGTGATATAATATTTAACAAATATTTATAAAATAAATAAATT 38265668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1854 CCACCCTGCCCTGACTTAAGTGATATAATATTTAACAAATATTTATAAAATAAATAAATT 1913

 38265669 CAAATTCACTCTAATACCTAGAAAATTATCAAGTATAGTAAACCAAATAATAAATATTTA 38265728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1914 CAAATTCACTCTAATACCTAGAAAATTATCAAGTATAGTAAACCAAATAATAAATATTTA 1973

 38265729 TTAAGGAATATGGAAACAGTGACCTATGAGAAGTCTTGATATACTGACCATCCATTGTTG 38265788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1974 TTAAGGAATATGGAAACAGTGACCTATGAGAAGTCTTGATATACTGACCATCCATTGTTG 2033

 38265789 CAGCAGATCTCACTATTGCTATTGTGCTTAACATTTCAATTACAAAAATTAAAAAAAAAA 38265848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2034 CAGCAGATCTCACTATTGCTATTGTGCTTAACATTTCAATTACAAAAATTAAAAAAAAAA 2093

 38265849 AACACCATTCATCAGTGCAGGTCTGTGTATTTAAAGAAATAATTTACAAGTTTTTTTTTC 38265908
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
     2094 AACACCATTCATCAGTGCAGGTCTGTGTATTTAAAGAAATAATTTACAAGTTTTTTTT-C 2152

 38265909 CTTTGTAAACATATTGTTTTGAAGTGCAAATATATATAATTTGCACTTTGGGATGGAATG 38265968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2153 CTTTGTAAACATATTGTTTTGAAGTGCAAATATATATAATTTGCACTTTGGGATGGAATG 2212

 38265969 GAATGGGATGCCCTATTGGCAGTCCATACATCTGGATTATAAATGGATTTCCATCCCATC 38266028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2213 GAATGGGATGCCCTATTGGCAGTCCATACATCTGGATTATAAATGGATTTCCATCCCATC 2272

 38266029 TTCCTCCCCATCTCTTTCCCTTTTTGATCATTCTATGGAAATGGAAAGCTAGCAGAAGTT 38266088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2273 TTCCTCCCCATCTCTTTCCCTTTTTGATCATTCTATGGAAATGGAAAGCTAGCAGAAGTT 2332

 38266089 TGAAGAATTGTCACGCAAACAACAACAACAA---AACTTTAGCATATTAACCTGTTGTCC 38266145
          |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||
     2333 TGAAGAATTGTCACGCAAACAACAACAACAACAAAACTTTAGCATATTAACCTGTTGTCC 2392

 38266146 AACCTTATATAAGCAGTTTGTATTTAAAACATCCCTAAGTGGATTTTAATTCCAGTTTCA 38266205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     2393 AACCTTATATAAGCAGTTTGTATTTAAAACATCCCTAAGTGGATTTTAATTCCAATTTCA 2452

 38266206 ATCATTGTTAACTATTTTTGAAATATTTAAAATCCCA 38266242
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2453 ATCATTGTTAACTATTTTTGAAATATTTAAAATCCCA 2489

EXCISED REGION

 38266251 ACCACTATTTCTCTTCAACTAGTCCTTACTTTTATAAACAAAAAAGTAACAGTAAATAAT 38266310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2490 ACCACTATTTCTCTTCAACTAGTCCTTACTTTTATAAACAAAAAAGTAACAGTAAATAAT 2549

 38266311 TTATAACTAGGTCTCTCTGAATCTAAAAACACGTTCTTATACACTATGTGATGCCATATT 38266370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     2550 TTATAACTAGGTCTCTCTGAATCTAAAAACACATTCTTATACACTATGTGATGCCATATT 2609

 38266371 TTTTACTCTTGTCTTTGTGAGTTTTTTGTGCCATTCTCTCCTCTGGAATGGTCTTCTGTG 38266430
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2610 TTTTACTCTTGACTTTGTGAGTTTTTTGTGCCATTCTCTCCTCTGGAATGGTCTTCTGTG 2669

 38266431 CTTACACATTCCAAGGGCTACTCCATTTTACAAGAAACAGTTCATGTTTGCTACTTTGGG 38266490
          .|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2670 TTTACACATTCCAAGGGCTAATCCATTTTACAAGAAACAGTTCATGTTTGCTACTTTGGG 2729

 38266491 GTTGATCCCATGATAATTCTGGTTCTCACTTGGTCTTTCCCTGTGAGATGCAGTAGCATT 38266550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2730 GTTGATCCCATGATAATTCTGGTTCTCACTTGGTCTTTCCCTGTGAGATGCAGTAGCATT 2789

 38266551 CAAAATTCTCAGACTATTCTATGCACCTTGGCAGATTTATGGTAATGGTCTATAATTGCT 38266610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2790 CAAAATTCTCAGACTATTCTATGCACCTTGGCAGATTTATGGTAATGGTCTATAATTGCT 2849

 38266611 TCATATCTGCTAACCTTGCTTCCAAAACTAGTTTTTGAGATTAATGAGACAGGAGCTTGG 38266670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2850 TCATATCTGCTAACCTTGCTTCCAAAACTAGTTTTTGAGATTAATGAGACAGGAGCTTGG 2909

 38266671 CTTTTTCTTTCTGTATAGCTTCCATAGCAACAAGAAAATATTAGACACACAGTAGGCATT 38266730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2910 CTTTTTCTTTCTGTATAGCTTCCATAGCAACAAGAAAATATTAGACACACAGTAGGCATT 2969

 38266731 GGAAGAAAATGTGTTCAGTTAAATGAACTTGATTTGAATGGAATGAGAGTTCAATGAAAC 38266790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2970 GGAAGAAAATGTGTTCAGTTAAATGAACTTGATTTGAATGGAATGAGAGTTCAATGAAAC 3029

 38266791 TGTATATATTGTGAAACGTGGCAACTTACACCTACTCAAGACATTAAAAGAGATCATGCT 38266850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3030 TGTATATATTGTGAAACGTGGCAACTTACACCTACTCAAGACATTAAAAGAGATCATGCT 3089

 38266851 TTCTTGCCTAAGTTTTATGTCCAATTTGTTCCTGTTTCAAACCCCTCGACAAAAACAAAA 38266910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3090 TTCTTGCCTAAGTTTTATGTCCAATTTGTTCCTGTTTCAAACCCCTCGACAAAAACAAAA 3149

 38266911 TCTTTTAATCTGTTTGCAAAATATTTCCTCCTTCCTCCCATCTTGCTGTTGCTGCTCTGT 38266970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3150 TCTTTTAATCTGTTTGCAAAATATTTCCTCCTTCCTCCCATCTTGCTGTTGCTGCTCTGT 3209

 38266971 GATATACTGCCCTTGCTTATTACCCCTTTATAGCTGTTTTGTTAAAGTTCATACCGCTAA 38267030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3210 GATATACTGCCCTTGCTTATTACCCCTTTATAGCTGTTTTGTTAAAGTTCATACCGCTAA 3269

 38267031 GACCTGTAAAAGAAATTTATGGCTCTAGGGATTTCAGCAAATTCTAAATAACCATAACAG 38267090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3270 GACCTGTAAAAGAAATTTATGGCTCTAGGGATTTCAGCAAATTCTAAATAACCATAACAG 3329

 38267091 GAACAGGAAGCATTAATTAAAGACACTAGAGTCTAAGTTATAACAGAAATCCTGACATTT 38267150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3330 GAACAGGAAGCATTAATTAAAGACACTAGAGTCTAAGTTATAACAGAAATCCTGACATTT 3389

 38267151 AAGGCCCTGGTACCATTTAAATTTAAAATGGTATGACAAACAGAGAGTAATTTGATGGTC 38267210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3390 AAGGCCCTGGTACCATTTAAATTTAAAATGGTATGACAAACAGAGAGTAATTTGATGGTC 3449

 38267211 AGAAGGTTATAATGGATACCTTAATACCTTTGCCAAGAAAAAGTGTCTGTCCTTGCTCTA 38267270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3450 AGAAGGTTATAATGGATACCTTAATACCTTTGCCAAGAAAAAGTGTCTGTCCTTGCTCTA 3509

 38267271 ACCCCTACCCAGGGGCTTCAGGGGCCTCCTTCATAAAACATGGTGATGCCTAAATATTTT 38267330
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3510 ATCCCTACCCAGGGGCTTCAGGGGCCTCCTTCATAAAACATGGTGATGCCTAAATATTTT 3569

 38267331 TGCGATATCTCATATATAAGCTGGTCTTTTCTTTAAGAATACGAGAGATTAAACACCAAC 38267390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3570 TGCGATATCTCATATATAAGCTGGTCTTTTCTTTAAGAATACGAGAGATTAAACACCAAC 3629

 38267391 CCCCAACATTCATACACCAATTTTCAGATAAAACAGCTTAATATTTAAGATATATTTAGT 38267450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3630 CCCCAACATTCATACACCAATTTTCAGATAAAACAGCTTAATATTTAAGATATATTTAGT 3689

 38267451 GCAATTTGTCTATTTCTTGGTTTACTGGAGGGCTGTATTTAAAGCCAAGGGACCAAGGAA 38267510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3690 GCAATTTGTCTATTTCTTGGTTTACTGGAGGGCTGTATTTAAAGCCAAGGGACCAAGGAA 3749

 38267511 CATTCCACAACACACTAAAGCAATTTTTCCCCAGGGAATATGCTGATTCTTTCCTAAAGG 38267570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3750 CATTCCACAACACACTAAAGCAATTTTTCCCCAGGGAATATGCTGATTCTTTCCTAAAGG 3809

 38267571 CAGAAGCCGACATTCCTGACTCATTCTGCCAAACCAAGCAATGAAAAATGCTTCACCTAA 38267630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3810 CAGAAGCCGACATTCCTGACTCATTCTGCCAAACCAAGCAATGAAAAATGCTTCACCTAA 3869

 38267631 TTTGAAAGATAATTTGTAATACCAGAGACTCAACTTGTTTTGTGTATCCAATACTAGCAC 38267690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3870 TTTGAAAGATAATTTGTAATACCAGAGACTCAACTTGTTTTGTGTATCCAATACTAGCAC 3929

 38267691 CCTTTCCAGAATGTTGAAAGTACACACTGTATGATTTGTCTAATGTATATTCAAAAAAGG 38267750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3930 CCTTTCCAGAATGTTGAAAGTACACACTGTATGATTTGTCTAATGTATATTCAAAAAAGG 3989

 38267751 AATACAAATTGATCCTCAAAGTTCAAATCTGCAGTACATACTCTGTGTTCTGCCCCCACC 38267810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3990 AATACAAATTGATCCTCAAAGTTCAAATCTGCAGTACATACTCTGTGTTCTGCCCCCACC 4049

 38267811 CGTACCTTCATGAATTCTTTCACCTAGCACGCAGGCTGTTTTCCCTTTGCGAAATCCCAT 38267870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4050 CGTACCTTCATGAATTCTTTCACCTAGCACGCAGGCTGTTTTCCCTTTGCGAAATCCCAT 4109

 38267871 GGTACATTTATAGTATTAATACCACTCACTTAGAATATGCCGTATTTTGTCTAATATTGC 38267930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4110 GGTACATTTATAGTATTAATACCACTCACTTAGAATATGCCGTATTTTGTCTAATATTGC 4169

 38267931 TAGATTTTGTGTGTATAATCTTATTCCTCAAGTAAATTACAAGACAAGGACTATAATTTA 38267990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4170 TAGATTTTGTGTGTATAATCTTATTCCTCAAGTAAATTACAAGACAAGGACTATAATTTA 4229

 38267991 TACATCCTCTACAACACTTGACACTGGCTTTGATTAGGCTCTTAATAAATATTTGTTGGT 38268050
          ||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     4230 TACATCCTCTACAACACTTGGCACTGGCTTTGAGTAGGCTCTTAATAAATATTTGTTGGT 4289

 38268051 TGATTAATCAGTTGACCACACTTACTAATTGCAAGGTGACATCATTTATCATTAATAAAC 38268110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4290 TGATTAATCAGTTGACCACACTTACTAATTGCAAGGTGACATCATTTATCATTAATAAAC 4349

 38268111 ATATATGTGGATTACAAAAATATCATGTGAATTTGCATATAATCATATTAATCCCAAATT 38268170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4350 ATATATGTGGATTACAAAAATATCATGTGAATTTGCATATAATCATATTAATCCCAAATT 4409

 38268171 AGCACCTGAGAGTCCAACCACCCTCTCCTTTAGGCCCTTTTCACTTTTATGTCTACTTTT 38268230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4410 AGCACCTGAGAGTCCAACCACCCTCTCCTTTAGGCCCTTTTCACTTTTATGTCTACTTTT 4469

 38268231 GCCTCACTTACAATTCCACTACTTACTTGCCTTCTTTCTCTTTTCAGCTTTGTGCTGTTA 38268290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4470 GCCTCACTTACAATTCCACTACTTACTTGCCTTCTTTCTCTTTTCAGCTTTGTGCTGTTA 4529

 38268291 TTTAATATCTCACCAGTTGTGTAATTTCAGCTCCCAAATTGAATAAGACGTTCCCCCCAG 38268350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4530 TTTAATATCTCACCAGTTGTGTAATTTCAGCTCCCAAATTGAATAAGACGTTCCCCCCAG 4589

 38268351 TGGAACCCTCACCTTGACAAATAGCCAAATAGTA---ATTATTCCTTTCAGGGGTTGAGC 38268407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||
     4590 TGGAACCCTCACCTTGACAAATAGCCAAATAGTAATTATTATTCCTTTCAGGGGTTGAGC 4649

 38268408 TATGGAATCATGCTTGCAATATCCCAGGCTTGAGTGCCTAGATATTTATGCTATACTTCC 38268467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4650 TATGGAATCATGCTTGCAATATCCCAGGCTTGAGTGCCTAGATATTTATGCTATACTTCC 4709

 38268468 CTGTGTCGGAGTTTCCATCTGCGATTGTATTTCAAGCCCTCTCATTTTTTTTTTCAATAT 38268527
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
     4710 CTGTGTCGGAGTTTCCATCTGCGATTGTATTTCAAGCCCTCTCA-TTTTTTTTTCAATAT 4768

 38268528 GATTAAGATAATTCCTTTATGAAGTTGGAAACTCAGACATTCAGAAAGAAACTTGACGTT 38268587
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4769 GATTAAGATAATTCCTTTATGAAGCTGGAAACTCAGACATTCAGAAAGAAACTTGACGTT 4828

 38268588 TCATATTTTTGCTAACTTGCTCTTCCCATTTCCTTTCCTATCATTTTAGCCAGACTGAGG 38268647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4829 TCATATTTTTGCTAACTTGCTCTTCCCATTTCCTTTCCTATCATTTTAGCCAGACTGAGG 4888

 38268648 GAGAATTAATTTTGCAATGGTCTCTATTTTTTTTTCCAAATGTGTGACCTCCATATTAAT 38268707
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4889 GAGAATTAATTTTGCAACGGTCTCTATTTTTTTTTCCAAATGTGTGACCTCCATATTAAT 4948

 38268708 AGGAGCCAGAGTACTCATTCATCACATCTGGTCAGTGTGAAACTGACATTTACAGGGTGG 38268767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4949 AGGAGCCAGAGTACTCATTCATCACATCTGGTCAGTGTGAAACTGACATTTACAGGGTGG 5008

 38268768 AATGTTTCCCACTCAGGACAAATGGGGATCATTTGTAAAACATGCCGCACCCAATCATAG 38268827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     5009 AATGTTTCCCACTCAGGACAAATGGGGATCATTTGTAAAACATGCCACACCCAATCATAG 5068

 38268828 GTTCCCATGGATCTCCAACTACATTTTTAAGCAACAATATAAACCATTCCCGAAACTGAA 38268887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5069 GTTCCCATGGATCTCCAACTACATTTTTAAGCAACAATATAAACCATTCCCGAAACTGAA 5128

 38268888 AGGTCTTTTCAAATATTTACTGCCTACCTATGGAATTTTTATTCTGCTTGCTGCTGCCAT 38268947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5129 AGGTCTTTTCAAATATTTACTGCCTACCTATGGAATTTTTATTCTGCTTGCTGCTGCCAT 5188

 38268948 CAATAATCCTGGGAGTTCCTAGCTAAGTGTTGTGTATGACCTCCAAGGAAAGTCTTAGCA 38269007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5189 CAATAATCCTGGGAGTTCCTAGCTAAGTGTTGTGTATGACCTCCAAGGAAAGTCTTAGCA 5248

 38269008 TTGCAGAATGGGGAGGCGGGTTAGTATCCTGCATTTTTCATTCTGTCACTTTCTAGGGAC 38269067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5249 TTGCAGAATGGGGAGGCGGGTTAGTATCCTGCATTTTTCATTCTGTCACTTTCTAGGGAC 5308

 38269068 AATTACAAAGAAAATAATCATATAAGACTTATTTTTATGTTTATTATGAAAGCCTTCAGC 38269127
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5309 AATTACAAAGAAAATAATCGTATAAGACTTATTTTTATGTTTATTATGAAAGCCTTCAGC 5368

 38269128 TCTTGCATTTGCAAGTAAGCTCAATGATTTTAAGTTTGCTTTTTCCCCCATGAAATGAAA 38269187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5369 TCTTGCATTTGCAAGTAAGCTCAATGATTTTAAGTTTGCTTTTTCCCCCATGAAATGAAA 5428

 38269188 TATTATTTCCCACTTCTTCCATGAATCTATTGGGTAACTCCAGGCCACTGTGATCTTTCA 38269247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5429 TATTATTTCCCACTTCTTCCATGAATCTATTGGGTAACTCCAGGCCACTGTGATCTTTCA 5488

 38269248 TCTGGCATTTTGCTTTTATTTTTCTAGATCACAGTTGTGATTTAAAGCCCTCCTGGCACT 38269307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5489 TCTGGCATTTTGCTTTTATTTTTCTAGATCACAGTTGTGATTTAAAGCCCTCCTGGCACT 5548

 38269308 TGGACACCTTGGTGATCTTAGCTCATGCTCCTAGTTCCATAGTGATGAATTGACCAAACT 38269367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5549 TGGACACCTTGGTGATCTTAGCTCATGCTCCTAGTTCCATAGTGATGAATTGACCAAACT 5608

 38269368 TTTTCCCAAGG 38269378
          |||||||||||
     5609 TTTTCCCAAGG 5619

Alignment time is 5.28944 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38249892,38276749] =>     26858 nucs '18 dna:chromosome chromosome:GRCh37:18:1:78077248:1'
Second seq [       1,    4206] =>      4206 nucs 'mol-32-2ee6-029685_4206'

Score:        4021
Aligned:      4211        nucs
Identic:      4188 ( 99%) nucs =>       902 ( 99%)      3286 (100%)
Gaps:           11 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38258985,38259892] EXCISED REGION [38266750,38270047]
 second seq =>  [       1,     908] EXCISED REGION [     909,    4205]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6857 nucs [38259893,38266749]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [38259893,38259893] to [38266750,38266750]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [38259893,38259893] to [38266749,38266749]
 second seq =>         0 nucs

 38258985 GACATGCCAACAAATTTTTGGAATGTAAAAATAGATAAGACATTGTTAATGATTTGACAA 38259044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GACATGCCAACAAATTTTTGGAATGTAAAAATAGATAAGACATTGTTAATGATTTGACAA 60

 38259045 AGCACAAAGCCTTAAAATATTTCTGTATAGAGAGAAGTTTCCAAAGTAGGGCAACTCAGA 38259104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGCACAAAGCCTTAAAATATTTCTGTATAGAGAGAAGTTTCCAAAGTAGGGCAACTCAGA 120

 38259105 GATAAATCAAGAATGGGAAGATTCACACACCTCAACTGTAAAAGAGAAATATGAGACTAA 38259164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GATAAATCAAGAATGGGAAGATTCACACACCTCAACTGTAAAAGAGAAATATGAGACTAA 180

 38259165 AAGCAGTGGATTAATTAAAACTTTGTTTGATGAGATATTATACATAGATGTCTTCTCCAT 38259224
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAGCAGTGGATTCATTAAAACTTTGTTTGATGAGATATTATACATAGATGTCTTCTCCAT 240

 38259225 CATTCCAAGCACTTAAGCAGCTGCCCTTTCCAAACACTCATAGAGGATAAGAGATTATTT 38259284
          ||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CATTCCAAGCGCTTAAGCAGCTGCCCTTTACAAACACTCATAGAGGATAAGAGATTATTT 300

 38259285 TCTATAAAAATCAAACCAGATTGTTG--TGTACATCAAGCAAAGGAGGGATGGCAGGGAG 38259342
          ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCTATAAAAATCAAACCAGATTGT--CATGTACATCAAGCAAAGGAGGGATGGCAGGGAG 358

 38259343 GTGATATACTGAAACAGAATTACTGTATGAAAACCTGGAATGAACAATTAGATACTCAGT 38259402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
      359 GTGATATACTGAAACAGAATTACTGTATGAAAACATGGAATGAACAATTAGATACTCAGT 418

 38259403 TCTCCTTACCTGCACAGTAATAGTAATTCTTACTACCAGACTGGATGCTGGAGGGCTCTC 38259462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      419 TCTCCTTACCTGCACAGTAATAGTAATTCTTACTACCAGACTGGATGCTGGAGGGCTCTC 478

 38259463 CTTCAGAGAAACAGAAAAGAAAAAAAAGCCTATAGCCACTAATATTTGAATCTCTGCAAT 38259522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      479 CTTCAGAGAAACAGAAAAGAAAAAAAAGCCTATAGCCACTAATATTTGAATCTCTGCAAT 538

 38259523 TAAATACCTGGGTCCCTTCCCAATCATATAGCAGTGATGCTCACCAGTTAACAAGAACTG 38259582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      539 TAAATACCTGGGTCCCTTCCCAATCATATAGCAGTGATGCTCACCAGTTAACAAGAACTG 598

 38259583 AAGACACATGACAGATTCCAATCAGTGATTTATTACCACTGTCAAATAAGAATGGACACT 38259642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      599 AAGACACATGACAGATTCCAATCAGTGATTTATTACCACTGTCAAATAAGAATGGACACT 658

 38259643 CAAAGATTACCTGAAAAAGTCCTTTAATATGGCCCCAGATTGAATAATTCCTAATTTCCT 38259702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      659 CAAAGATTACCTGAAAAAGTCCTTTAATATGGCCCCAGATTGAATAATTCCTAATTTCCT 718

 38259703 ATATCATAAATTCAAAAATTATCTAAAATTCAGTGAAATTAGTCCATATTATCAATGCCA 38259762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      719 ATATCATAAATTCAAAAATTATCTAAAATTCAGTGAAATTAGTCCATATTATCAATGCCA 778

 38259763 ACCTTACACATAAACAGAGTTGACATTCTCTTATGATGCTGAACAATGCAGATGAAGAAC 38259822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      779 ACCTTACACATAAACAGAGTTGACATTCTCTTATGATGCTGAACAATGCAGATGAAGAAC 838

 38259823 GCTGGCTTTGGATTAAGAAGACCCTTAGTTTGAATTTTAATTTTGACCCATGATAGCTGT 38259882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      839 GCTGGCTTTGGATTAAGAAGACCCTTAGTTTGAATTTTAATTTTGACCCATGATAGCTGT 898

 38259883 GTAAACTTAG 38259892
          ||||||||||
      899 GTAAACTTAG 908

EXCISED REGION

 38266750 TAAATGAACTTGATTTGAATGGAATGAGAGTTCAATGAAACTGTATATATTGTGAAACGT 38266809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      909 TAAATGAACTTGATTTGAATGGAATGAGAGTTCAATGAAACTGTATATATTGTGAAACGT 968

 38266810 GGCAACTTACACCTACTCAAGACATTAAAAGAGATCATGCTTTCTTGCCTAAGTTTTATG 38266869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      969 GGCAACTTACACCTACTCAAGACATTAAAAGAGATCATGCTTTCTTGCCTAAGTTTTATG 1028

 38266870 TCCAATTTGTTCCTGTTTCAAACCCCTCGACAAAAACAAAATCTTTTAATCTGTTTGCAA 38266929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1029 TCCAATTTGTTCCTGTTTCAAACCCCTCGACAAAAACAAAATCTTTTAATCTGTTTGCAA 1088

 38266930 AATATTTCCTCCTTCCTCCCATCTTGCTGTTGCTGCTCTGTGATATACTGCCCTTGCTTA 38266989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1089 AATATTTCCTCCTTCCTCCCATCTTGCTGTTGCTGCTCTGTGATATACTGCCCTTGCTTA 1148

 38266990 TTACCCCTTTATAGCTGTTTTGTTAAAGTTCATACCGCTAAGACCTGTAAAAGAAATTTA 38267049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1149 TTACCCCTTTATAGCTGTTTTGTTAAAGTTCATACCGCTAAGACCTGTAAAAGAAATTTA 1208

 38267050 TGGCTCTAGGGATTTCAGCAAATTCTAAATAACCATAACAGGAACAGGAAGCATTAATTA 38267109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1209 TGGCTCTAGGGATTTCAGCAAATTCTAAATAACCATAACAGGAACAGGAAGCATTAATTA 1268

 38267110 AAGACACTAGAGTCTAAGTTATAACAGAAATCCTGACATTTAAGGCCCTGGTACCATTTA 38267169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1269 AAGACACTAGAGTCTAAGTTATAACAGAAATCCTGACATTTAAGGCCCTGGTACCATTTA 1328

 38267170 AATTTAAAATGGTATGACAAACAGAGAGTAATTTGATGGTCAGAAGGTTATAATGGATAC 38267229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1329 AATTTAAAATGGTATGACAAACAGAGAGTAATTTGATGGTCAGAAGGTTATAATGGATAC 1388

 38267230 CTTAATACCTTTGCCAAGAAAAAGTGTCTGTCCTTGCTCTAACCCCTACCCAGGGGCTTC 38267289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     1389 CTTAATACCTTTGCCAAGAAAAAGTGTCTGTCCTTGCTCTAATCCCTACCCAGGGGCTTC 1448

 38267290 AGGGGCCTCCTTCATAAAACATGGTGATGCCTAAATATTTTTGCGATATCTCATATATAA 38267349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1449 AGGGGCCTCCTTCATAAAACATGGTGATGCCTAAATATTTTTGCGATATCTCATATATAA 1508

 38267350 GCTGGTCTTTTCTTTAAGAATACGAGAGATTAAACACCAACCCCCAACATTCATACACCA 38267409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1509 GCTGGTCTTTTCTTTAAGAATACGAGAGATTAAACACCAACCCCCAACATTCATACACCA 1568

 38267410 ATTTTCAGATAAAACAGCTTAATATTTAAGATATATTTAGTGCAATTTGTCTATTTCTTG 38267469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1569 ATTTTCAGATAAAACAGCTTAATATTTAAGATATATTTAGTGCAATTTGTCTATTTCTTG 1628

 38267470 GTTTACTGGAGGGCTGTATTTAAAGCCAAGGGACCAAGGAACATTCCACAACACACTAAA 38267529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1629 GTTTACTGGAGGGCTGTATTTAAAGCCAAGGGACCAAGGAACATTCCACAACACACTAAA 1688

 38267530 GCAATTTTTCCCCAGGGAATATGCTGATTCTTTCCTAAAGGCAGAAGCCGACATTCCTGA 38267589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1689 GCAATTTTTCCCCAGGGAATATGCTGATTCTTTCCTAAAGGCAGAAGCCGACATTCCTGA 1748

 38267590 CTCATTCTGCCAAACCAAGCAATGAAAAATGCTTCACCTAATTTGAAAGATAATTTGTAA 38267649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1749 CTCATTCTGCCAAACCAAGCAATGAAAAATGCTTCACCTAATTTGAAAGATAATTTGTAA 1808

 38267650 TACCAGAGACTCAACTTGTTTTGTGTATCCAATACTAGCACCCTTTCCAGAATGTTGAAA 38267709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1809 TACCAGAGACTCAACTTGTTTTGTGTATCCAATACTAGCACCCTTTCCAGAATGTTGAAA 1868

 38267710 GTACACACTGTATGATTTGTCTAATGTATATTCAAAAAAGGAATACAAATTGATCCTCAA 38267769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1869 GTACACACTGTATGATTTGTCTAATGTATATTCAAAAAAGGAATACAAATTGATCCTCAA 1928

 38267770 AGTTCAAATCTGCAGTACATACTCTGTGTTCTGCCCCCACCCGTACCTTCATGAATTCTT 38267829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1929 AGTTCAAATCTGCAGTACATACTCTGTGTTCTGCCCCCACCCGTACCTTCATGAATTCTT 1988

 38267830 TCACCTAGCACGCAGGCTGTTTTCCCTTTGCGAAATCCCATGGTACATTTATAGTATTAA 38267889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1989 TCACCTAGCACGCAGGCTGTTTTCCCTTTGCGAAATCCCATGGTACATTTATAGTATTAA 2048

 38267890 TACCACTCACTTAGAATATGCCGTATTTTGTCTAATATTGCTAGATTTTGTGTGTATAAT 38267949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2049 TACCACTCACTTAGAATATGCCGTATTTTGTCTAATATTGCTAGATTTTGTGTGTATAAT 2108

 38267950 CTTATTCCTCAAGTAAATTACAAGACAAGGACTATAATTTATACATCCTCTACAACACTT 38268009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2109 CTTATTCCTCAAGTAAATTACAAGACAAGGACTATAATTTATACATCCTCTACAACACTT 2168

 38268010 GACACTGGCTTTGATTAGGCTCTTAATAAATATTTGTTGGTTGATTAATCAGTTGACCAC 38268069
          |.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2169 GGCACTGGCTTTGAGTAGGCTCTTAATAAATATTTGTTGGTTGATTAATCAGTTGACCAC 2228

 38268070 ACTTACTAATTGCAAGGTGACATCATTTATCATTAATAAACATATATGTGGATTACAAAA 38268129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2229 ACTTACTAATTGCAAGGTGACATCATTTATCATTAATAAACATATATGTGGATTACAAAA 2288

 38268130 ATATCATGTGAATTTGCATATAATCATATTAATCCCAAATTAGCACCTGAGAGTCCAACC 38268189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2289 ATATCATGTGAATTTGCATATAATCATATTAATCCCAAATTAGCACCTGAGAGTCCAACC 2348

 38268190 ACCCTCTCCTTTAGGCCCTTTTCACTTTTATGTCTACTTTTGCCTCACTTACAATTCCAC 38268249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2349 ACCCTCTCCTTTAGGCCCTTTTCACTTTTATGTCTACTTTTGCCTCACTTACAATTCCAC 2408

 38268250 TACTTACTTGCCTTCTTTCTCTTTTCAGCTTTGTGCTGTTATTTAATATCTCACCAGTTG 38268309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2409 TACTTACTTGCCTTCTTTCTCTTTTCAGCTTTGTGCTGTTATTTAATATCTCACCAGTTG 2468

 38268310 TGTAATTTCAGCTCCCAAATTGAATAAGACGTTCCCCCCAGTGGAACCCTCACCTTGACA 38268369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2469 TGTAATTTCAGCTCCCAAATTGAATAAGACGTTCCCCCCAGTGGAACCCTCACCTTGACA 2528

 38268370 AATAGCCAAATAGTA---ATTATTCCTTTCAGGGGTTGAGCTATGGAATCATGCTTGCAA 38268426
          |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2529 AATAGCCAAATAGTAATTATTATTCCTTTCAGGGGTTGAGCTATGGAATCATGCTTGCAA 2588

 38268427 TATCCCAGGCTTGAGTGCCTAGATATTTATGCTATACTTCCCTGTGTCGGAGTTTCCATC 38268486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2589 TATCCCAGGCTTGAGTGCCTAGATATTTATGCTATACTTCCCTGTGTCGGAGTTTCCATC 2648

 38268487 TGCGATTGTATTTCAAGCCCTCTCATTTTTTTTTTCAATATGATTAAGATAATTCCTTTA 38268546
          ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2649 TGCGATTGTATTTCAAGCCCTCTCA-TTTTTTTTTCAATATGATTAAGATAATTCCTTTA 2707

 38268547 TGAAGTTGGAAACTCAGACATTCAGAAAGAAACTTGACGTTTCATATTTTTGCTAACTTG 38268606
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2708 TGAAGCTGGAAACTCAGACATTCAGAAAGAAACTTGACGTTTCATATTTTTGCTAACTTG 2767

 38268607 CTCTTCCCATTTCCTTTCCTATCATTTTAGCCAGACTGAGGGAGAATTAATTTTGCAATG 38268666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     2768 CTCTTCCCATTTCCTTTCCTATCATTTTAGCCAGACTGAGGGAGAATTAATTTTGCAACG 2827

 38268667 GTCTCTATTTTTTTTTCCAAATGTGTGACCTCCATATTAATAGGAGCCAGAGTACTCATT 38268726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2828 GTCTCTATTTTTTTTTCCAAATGTGTGACCTCCATATTAATAGGAGCCAGAGTACTCATT 2887

 38268727 CATCACATCTGGTCAGTGTGAAACTGACATTTACAGGGTGGAATGTTTCCCACTCAGGAC 38268786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2888 CATCACATCTGGTCAGTGTGAAACTGACATTTACAGGGTGGAATGTTTCCCACTCAGGAC 2947

 38268787 AAATGGGGATCATTTGTAAAACATGCCGCACCCAATCATAGGTTCCCATGGATCTCCAAC 38268846
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     2948 AAATGGGGATCATTTGTAAAACATGCCACACCCAATCATAGGTTCCCATGGATCTCCAAC 3007

 38268847 TACATTTTTAAGCAACAATATAAACCATTCCCGAAACTGAAAGGTCTTTTCAAATATTTA 38268906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3008 TACATTTTTAAGCAACAATATAAACCATTCCCGAAACTGAAAGGTCTTTTCAAATATTTA 3067

 38268907 CTGCCTACCTATGGAATTTTTATTCTGCTTGCTGCTGCCATCAATAATCCTGGGAGTTCC 38268966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3068 CTGCCTACCTATGGAATTTTTATTCTGCTTGCTGCTGCCATCAATAATCCTGGGAGTTCC 3127

 38268967 TAGCTAAGTGTTGTGTATGACCTCCAAGGAAAGTCTTAGCATTGCAGAATGGGGAGGCGG 38269026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3128 TAGCTAAGTGTTGTGTATGACCTCCAAGGAAAGTCTTAGCATTGCAGAATGGGGAGGCGG 3187

 38269027 GTTAGTATCCTGCATTTTTCATTCTGTCACTTTCTAGGGACAATTACAAAGAAAATAATC 38269086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3188 GTTAGTATCCTGCATTTTTCATTCTGTCACTTTCTAGGGACAATTACAAAGAAAATAATC 3247

 38269087 ATATAAGACTTATTTTTATGTTTATTATGAAAGCCTTCAGCTCTTGCATTTGCAAGTAAG 38269146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3248 ATATAAGACTTATTTTTATGTTTATTATGAAAGCCTTCAGCTCTTGCATTTGCAAGTAAG 3307

 38269147 CTCAATGATTTTAAGTTTGCTTTTTCCCCCATGAAATGAAATATTATTTCCCACTTCTTC 38269206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3308 CTCAATGATTTTAAGTTTGCTTTTTCCCCCATGAAATGAAATATTATTTCCCACTTCTTC 3367

 38269207 CATGAATCTATTGGGTAACTCCAGGCCACTGTGATCTTTCATCTGGCATTTTGCTTTTAT 38269266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3368 CATGAATCTATTGGGTAACTCCAGGCCACTGTGATCTTTCATCTGGCATTTTGCTTTTAT 3427

 38269267 TTTTCTAGATCACAGTTGTGATTTAAAGCCCTCCTGGCACTTGGACACCTTGGTGATCTT 38269326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3428 TTTTCTAGATCACAGTTGTGATTTAAAGCCCTCCTGGCACTTGGACACCTTGGTGATCTT 3487

 38269327 AGCTCATGCTCCTAGTTCCATAGTGATGAATTGACCAAACTTTTTCCCAAGGATATCTGC 38269386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3488 AGCTCATGCTCCTAGTTCCATAGTGATGAATTGACCAAACTTTTTCCCAAGGATATCTGC 3547

 38269387 TAATTCTGGAGTTTCTGCTTTCTTATTATCTGTTCTGTCTTTTGGTTCTGTATTGATATA 38269446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3548 TAATTCTGGAGTTTCTGCTTTCTTATTATCTGTTCTGTCTTTTGGTTCTGTATTGATATA 3607

 38269447 ACAAGCTTTGTCCCCTTATCAATGAGGGCACAAAATGCAGCACTTCAAATAATTTCTGCA 38269506
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||
     3608 ACAAGCTTTGTCCCCTTATCAATGAGGGCACAAAATGAAGCACTTCAAATAGTTTCTGCA 3667

 38269507 AAAATTTACAGTTGCTGCATTAAGAATTTTGTGAGCTTCAATAATGTTATTGAAAAGTTG 38269566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3668 AAAATTTACAGTTGCTGCATTAAGAATTTTGTGAGCTTCAATAATGTTATTGAAAAGTTG 3727

 38269567 CAGATTCCCTCCTCCTTCTTTTTCTCCTTTCCTCCTCTTTCTGCCCTGTCTCCCCTTCAT 38269626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3728 CAGATTCCCTCCTCCTTCTTTTTCTCCTTTCCTCCTCTTTCTGCCCTGTCTCCCCTTCAT 3787

 38269627 TATTCTCCTCTTCTTCTCAAAAGCAAACAATCATTTTTCTTGCCTACTGAAGAATACTTG 38269686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3788 TATTCTCCTCTTCTTCTCAAAAGCAAACAATCATTTTTCTTGCCTACTGAAGAATACTTG 3847

 38269687 TAATGTTATTCTCAAAACCTGGACACCAGCTCAACTCCTTCTTTGTTCTACAAGTATTCA 38269746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3848 TAATGTTATTCTCAAAACCTGGACACCAGCTCAACTCCTTCTTTGTTCTACAAGTATTCA 3907

 38269747 CCCACCCTAATAGGGAGTTTATTCCAATGAAAAGACTGTGTTCCTCCTCAGAGGAATTTA 38269806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3908 CCCACCCTAATAGGGAGTTTATTCCAATGAAAAGACTGTGTTCCTCCTCAGAGGAATTTA 3967

 38269807 TGAGGTGGTAAGAGAGTAGAATTGCATTAATCTTATGCCATTCCTAGAGAATTCTTATTT 38269866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3968 TGAGGTGGTAAGAGAGTAGAATTGCATTAATCTTATGCCATTCCTAGAGAATTCTTATTT 4027

 38269867 CCTCAATTAAGGTTTAATTGCTCTGTTCTGAAAAAAAAAAAAAAATGGTGAGTCCAAGCA 38269926
          ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||
     4028 CCTCAATTAAGGTTTAATTGCTCTGTTCTG---AAAAAAAAAAAATGGTGAGTCCAAGCA 4084

 38269927 GATAATTTACAGTGACCTGTATCTGTGACTAGTTTTAAGGCTACCCTGAGGTCAGAATTT 38269986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4085 GATAATTTACAGTGACCTGTATCTGTGACTAGTTTTAAGGCTACCCTGAGGTCAGAATTT 4144

 38269987 AAACATGTTAATTCAGTACTGGACTTAATAGTAAACAAGATAGAGATATCTCTGTCTCAC 38270046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4145 AAACATGTTAATTCAGTACTGGACTTAATAGTAAACAAGATAGAGATATCTCTGTCTCAC 4204

 38270047 A 38270047
          |
     4205 A 4205

Alignment time is 4.00009 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38249892,38276749] =>     26858 nucs '18 dna:chromosome chromosome:GRCh37:18:1:78077248:1'
Second seq [       1,    2141] =>      2141 nucs 'mol-32-2f1d-097867_2141'

Score:        2062
Aligned:      2139        nucs
Identic:      2132 (100%) nucs =>       337 ( 99%)      1795 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38258970,38259308] EXCISED REGION [38259311,38261110]
 second seq =>  [       1,     339] EXCISED REGION [     342,    2141]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [38259309,38259310]
 second seq =>         2 nucs [340,341]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [38259309,38259311] to [38259311,38259313]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [38259306,38259308] to [38259311,38259313]
 second seq =>         3 nucs [337,339] to [342,344]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 38258970 AATAAGAGTGGATGAGACATGCCAACAAATTTTTGGAATGTAAAAATAGATAAGACATTG 38259029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AATAAGAGTGGATGAGACATGCCAACAAATTTTTGGAATGTAAAAATAGATAAGACATTG 60

 38259030 TTAATGATTTGACAAAGCACAAAGCCTTAAAATATTTCTGTATAGAGAGAAGTTTCCAAA 38259089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTAATGATTTGACAAAGCACAAAGCCTTAAAATATTTCTGTATAGAGAGAAGTTTCCAAA 120

 38259090 GTAGGGCAACTCAGAGATAAATCAAGAATGGGAAGATTCACACACCTCAACTGTAAAAGA 38259149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTAGGGCAACTCAGAGATAAATCAAGAATGGGAAGATTCACACACCTCAACTGTAAAAGA 180

 38259150 GAAATATGAGACTAAAAGCAGTGGATTAATTAAAACTTTGTTTGATGAGATATTATACAT 38259209
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GAAATATGAGACTAAAAGCAGTGGATTCATTAAAACTTTGTTTGATGAGATATTATACAT 240

 38259210 AGATGTCTTCTCCATCATTCCAAGCACTTAAGCAGCTGCCCTTTCCAAACACTCATAGAG 38259269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
      241 AGATGTCTTCTCCATCATTCCAAGCACTTAAGCAGCTGCCCTTTACAAACACTCATAGAG 300

 38259270 GATAAGAGATTATTTTCTATAAAAATCAAACCAGATTGT 38259308
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GATAAGAGATTATTTTCTATAAAAATCAAACCAGATTGT 339

EXCISED REGION

 38259311 TGTACATCAAGCAAAGGAGGGATGGCAGGGAGGTGATATACTGAAACAGAATTACTGTAT 38259370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      342 TGTACATCAAGCAAAGGAGGGATGGCAGGGAGGTGATATACTGAAACAGAATTACTGTAT 401

 38259371 GAAAACCTGGAATGAACAATTAGATACTCAGTTCTCCTTACCTGCACAGTAATAGTAATT 38259430
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      402 GAAAACATGGAATGAACAATTAGATACTCAGTTCTCCTTACCTGCACAGTAATAGTAATT 461

 38259431 CTTACTACCAGACTGGATGCTGGAGGGCTCTCCTTCAGAGAAACAGAAAAGAAAAAAAAG 38259490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      462 CTTACTACCAGACTGGATGCTGGAGGGCTCTCCTTCAGAGAAACAGAAAAGAAAAAAAAG 521

 38259491 CCTATAGCCACTAATATTTGAATCTCTGCAATTAAATACCTGGGTCCCTTCCCAATCATA 38259550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      522 CCTATAGCCACTAATATTTGAATCTCTGCAATTAAATACCTGGGTCCCTTCCCAATCATA 581

 38259551 TAGCAGTGATGCTCACCAGTTAACAAGAACTGAAGACACATGACAGATTCCAATCAGTGA 38259610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      582 TAGCAGTGATGCTCACCAGTTAACAAGAACTGAAGACACATGACAGATTCCAATCAGTGA 641

 38259611 TTTATTACCACTGTCAAATAAGAATGGACACTCAAAGATTACCTGAAAAAGTCCTTTAAT 38259670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      642 TTTATTACCACTGTCAAATAAGAATGGACACTCAAAGATTACCTGAAAAAGTCCTTTAAT 701

 38259671 ATGGCCCCAGATTGAATAATTCCTAATTTCCTATATCATAAATTCAAAAATTATCTAAAA 38259730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      702 ATGGCCCCAGATTGAATAATTCCTAATTTCCTATATCATAAATTCAAAAATTATCTAAAA 761

 38259731 TTCAGTGAAATTAGTCCATATTATCAATGCCAACCTTACACATAAACAGAGTTGACATTC 38259790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      762 TTCAGTGAAATTAGTCCATATTATCAATGCCAACCTTACACATAAACAGAGTTGACATTC 821

 38259791 TCTTATGATGCTGAACAATGCAGATGAAGAACGCTGGCTTTGGATTAAGAAGACCCTTAG 38259850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      822 TCTTATGATGCTGAACAATGCAGATGAAGAACGCTGGCTTTGGATTAAGAAGACCCTTAG 881

 38259851 TTTGAATTTTAATTTTGACCCATGATAGCTGTGTAAACTTAGTCAAAATTCTTCAGTTAT 38259910
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
      882 TTTGAATTTTAATTTTGACCCATGATAGCTGTGTAAACTTAGTAAAAATTCTTCAGTTAT 941

 38259911 TGAGCTGATGCTTTAGCCTGAGTTAAACAGAGAACAGAGCCTAAGGTAGAGGGTTTCTAT 38259970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      942 TGAGCTGATGCTTTAGCCTGAGTTAAACAGAGAACAGAGCCTAAGGTAGAGGGTTTCTAT 1001

 38259971 TCTATTCTTTCATAATGGATTGCTGGGCAAGATAACAAAAGCAATGGATAAGCACAGAAA 38260030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1002 TCTATTCTTTCATAATGGATTGCTGGGCAAGATAACAAAAGCAATGGATAAGCACAGAAA 1061

 38260031 TGCAGGGCAGAAGAGAGAGCCATGAGGAAGATATATTATCAGGGTGGTTGCCATTAAGTG 38260090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1062 TGCAGGGCAGAAGAGAGAGCCATGAGGAAGATATATTATCAGGGTGGTTGCCATTAAGTG 1121

 38260091 AAACCAGTTACCCAGTTTAATGGAATTATCCCCAGGGAGCAAGGTCTGTGGCATCTCAAG 38260150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     1122 AAACCAGTTACCCAGTTTAATGGAATTATCCCCAGGGAGCAAGGTCAGTGGCATCTCAAG 1181

 38260151 ACTCTTTATCAAAGAGGAGAATGGGAGAAAAATCATCTTTTTTGTATTTCCTACTGTTCA 38260210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1182 ACTCTTTATCAAAGAGGAGAATGGGAGAAAAATCATCTTTTTTGTATTTCCTACTGTTCA 1241

 38260211 AAAGTTTGTCCCTTGCTTTCCTGGTTATGAATGCATGGAAGTCTAGTTGAAGTCCAGCAA 38260270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     1242 AAAGTTTGTCCCTTGCTTTCCTGGTTATGAATGCATGGAAGTCTAGTTGAAGTCCACCAA 1301

 38260271 AGACATCAACAAGGAATCATAGGAAAGAGATAAAAGGCCTGAGACATGGATATAAGGGAA 38260330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1302 AGACATCAACAAGGAATCATAGGAAAGAGATAAAAGGCCTGAGACATGGATATAAGGGAA 1361

 38260331 GGTAGTGTTAAGTGGCACCTTTTTGGGAGTCCAAACTGAGCAGGAGTAAAACTGAAGCAA 38260390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1362 GGTAGTGTTAAGTGGCACCTTTTTGGGAGTCCAAACTGAGCAGGAGTAAAACTGAAGCAA 1421

 38260391 CTGCTTTAACTAAGACATGTGTGCCCACAAAGACCTGAAGTGACACATGAGCTTTCACAG 38260450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1422 CTGCTTTAACTAAGACATGTGTGCCCACAAAGACCTGAAGTGACACATGAGCTTTCACAG 1481

 38260451 TTTTTTAACTGTAAAATGGTAATGATATCACCTATGTTTCTGGATTACTACAAATATTAA 38260510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1482 TTTTTTAACTGTAAAATGGTAATGATATCACCTATGTTTCTGGATTACTACAAATATTAA 1541

 38260511 ATAGCATAAATGGCACACTTGCAAAGCATATTTTAATAAACATATTTAATATTTCCCTTA 38260570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1542 ATAGCATAAATGGCACACTTGCAAAGCATATTTTAATAAACATATTTAATATTTCCCTTA 1601

 38260571 TTGATTTCTTTAATCAATAAAAGCATTTCTGAAATTTGTGTAAAGGTCTAGATGAAGGGA 38260630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1602 TTGATTTCTTTAATCAATAAAAGCATTTCTGAAATTTGTGTAAAGGTCTAGATGAAGGGA 1661

 38260631 CATTGGACATGCTTTGATAATCATTGAGACTGGGTGATAGATAAATGATTGTCATGGTCT 38260690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1662 CATTGGACATGCTTTGATAATCATTGAGACTGGGTGATAGATAAATGATTGTCATGGTCT 1721

 38260691 TTACTTTGATATGCATGTTTGACATCTTTGTAAACATAGTTTTAAAAATAATATTTGTAA 38260750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1722 TTACTTTGATATGCATGTTTGACATCTTTGTAAACATAGTTTTAAAAATAATATTTGTAA 1781

 38260751 AATTTAAAAACAGAAACAAATAATTCTGATTTCAAAGGTCAACTAATAGACTCCTAGTCA 38260810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1782 AATTTAAAAACAGAAACAAATAATTCTGATTTCAAAGGTCAACTAATAGACTCCTAGTCA 1841

 38260811 TGTCAGGATATCAATGCCTATCTCATTCACTTTCTGGTGCTTAAAAAATAATAAAAGTAA 38260870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1842 TGTCAGGATATCAATGCCTATCTCATTCACTTTCTGGTGCTTAAAAAATAATAAAAGTAA 1901

 38260871 TTATTTCCCAATCTTCACTTTCTACAATGCTAAACTATTTATTTCTCCTTTTCTGAGCCC 38260930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     1902 TTATTTCCCAATCTTCACTTTCTACAATGCTAAACTATTTATTTGTCCTTTTCTGAGCCC 1961

 38260931 ACATGCTTTCCTCAATGAATGTTACCGAGATGGAATTTATATCTTATATTTCAGGTGTAT 38260990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1962 ACATGCTTTCCTCAATGAATGTTACCGAGATGGAATTTATATCTTATATTTCAGGTGTAT 2021

 38260991 TTACATTCATTTCTTCCCCACTATGTTGCAAACAAGTTGTTTTGCCCATTTGTTCTTATC 38261050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2022 TTACATTCATTTCTTCCCCACTATGTTGCAAACAAGTTGTTTTGCCCATTTGTTCTTATC 2081

 38261051 CTGAGGTCATGAAAACATCTAACTCTACTATCTTCCAGAAGCTATATTGTCTTGCCTTTG 38261110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2082 CTGAGGTCATGAAAACATCTAACTCTACTATCTTCCAGAAGCTATATTGTCTTGCCTTTG 2141

Alignment time is 2.05348 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38249892,38276749] =>     26858 nucs '18 dna:chromosome chromosome:GRCh37:18:1:78077248:1'
Second seq [       1,    3259] =>      3259 nucs 'mol-32-2f1d-097869_3259'

Score:        3099
Aligned:      3267        nucs
Identic:      3246 ( 99%) nucs =>      2376 ( 99%)       870 (100%)
Gaps:           12 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38263854,38266242] EXCISED REGION [38266251,38267124]
 second seq =>  [       1,    2385] EXCISED REGION [    2386,    3259]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         8 nucs [38266243,38266250]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         8 nucs [38266243,38266250] to [38266251,38266258]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [38266242,38266242] to [38266251,38266251]
 second seq =>         1 nucs [2385,2385] to [2386,2386]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 38263854 CCTTTATTTTGTTAATTTCTAGTTGTATTTTTATTATTTCCTTCCTAGTTCTTCTTTTTA 38263913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCTTTATTTTGTTAATTTCTAGTTGTATTTTTATTATTTCCTTCCTAGTTCTTCTTTTTA 60

 38263914 TTTAATCGTTCTTAAGATGGATACTTAAGTAATTGATTTTCATCTTCTAAGCTTTATTAG 38263973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTAATCGTTCTTAAGATGGATACTTAAGTAATTGATTTTCATCTTCTAAGCTTTATTAG 120

 38263974 TATGTTTATTTAAAGCAATACATTTCCATATTACCATGACCTTAGCTGCAGTGTATGTAT 38264033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TATGTTTATTTAAAGCAATACATTTCCATATTACCATGACCTTAGCTGCAGTGTATGTAT 180

 38264034 TTTGGTGTACAGTATTTTCTTTATTTTTCAATTAAAATTTGTCTTGACTTCCTCTATGAT 38264093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTTGGTGTACAGTATTTTCTTTATTTTTCAATTAAAATTTGTCTTGACTTCCTCTATGAT 240

 38264094 GTCTTCTATGATTCTTCCTCTATAATTCTTCTTTTGACCATATAGAAGTGTATTCATTAA 38264153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTCTTCTATGATTCTTCCTCTATAATTCTTCTTTTGACCATATAGAAGTGTATTCATTAA 300

 38264154 TTCAATCACATATAAATATTCTCCTTTTATCTTTTTGCTACTGGTTTGTTTGTTTAGCTA 38264213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTCAATCACATATAAATATTCTCCTTTTATCTTTTTGCTACTGGTTTGTTTGTTTAGCTA 360

 38264214 CATTTAGGGAAAATTTCATTTCTGAGACGACAGAGGAAGCACATTCCATTTTATTCCTTC 38264273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CATTTAGGGAAAATTTCATTTCTGAGACGACAGAGGAAGCACATTCCATTTTATTCCTTC 420

 38264274 TGCTAATGACAAAAAAAAAAAAAAATTGGAAAAAACACAAAAGCCAGAGTCAAAAGACTC 38264333
          ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGCTAATGACAAAAAAAAAAAA---TTGGAAAAAACACAAAAGCCAGAGTCAAAAGACTC 477

 38264334 TGAAAAATGGAGAAAAAGTGCAGACAGGCTAAGGATTTGGGAGATTGAGGAACAACGACA 38264393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      478 TGAAAAATGGAGAAAAAGTGCAGACAGGCTAAGGATTTGGGAGATTGAGGAACAACGACA 537

 38264394 GGTGAGTTCTCTGTCTTTTTTTTTCTTTCTTTTTTGATATATATATATATATCAACAATC 38264453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||
      538 GGTGAGTTCTCTGTCTTTTTTTTTCTTTCTTTTTTGATATATATATAT----CAACAATC 593

 38264454 TCAATGTTTAAGAGAAGCCCTCAAGCCAGAATTTCCAACAGTTGCAGATAAAACATTGTG 38264513
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
      594 TCAATGTTTAAGAGAAGCCCTCAATCCAGAATTTCCAACAGTTGCAGATAAAACATTGTG 653

 38264514 CTTGCTTAACGTATTTAACCAAAAGACCCGAAAAGCAAGGATATAAAAGAATATTTTAAT 38264573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      654 CTTGCTTAACGTATTTAACCAAAAGACCCGAAAAGCAAGGATATAAAAGAATATTTTAAT 713

 38264574 AATATCATTCTGTTCTTAAGGTGAACACTTCAAAGAAACCACACCCCTCCCCTCCCCAAT 38264633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      714 AATATCATTCTGTTCTTAAGGTGAACACTTCAAAGAAACCACACCCCTCCCCTCCCCAAT 773

 38264634 GCGTGCTGAAGCAGTGGAATCCATGAGTGGAACCTTGTCATATATAATCTCCACACTAAA 38264693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      774 GCGTGCTGAAGCAGTGGAATCCATGAGTGGAACCTTGTCATATATAATCTCCACACTAAA 833

 38264694 TTTATAGCAAAGCCCCCATCTCTCAACCTGTGTTGAAATTCTGACTTCCAGACACACCTT 38264753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      834 TTTATAGCAAAGCCCCCATCTCTCAACCTGTGTTGAAATTCTGACTTCCAGACACACCTT 893

 38264754 TCAGTAATGAGGAGGTACTCTTCCATGATAAACCCTGTGGGCAAAGCTTCCACATTCATC 38264813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      894 TCAGTAATGAGGAGGTACTCTTCCATGATAAACCCTGTGGGCAAAGCTTCCACATTCATC 953

 38264814 CCACCCCTAAAGCAATAAATTTGCACCTTTCCCAAGTAGAATCAATGGGAAGAATTTTGA 38264873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      954 CCACCCCTAAAGCAATAAATTTGCACCTTTCCCAAGTAGAATCAATGGGAAGAATTTTGA 1013

 38264874 CTTCTATCCCCACCTGATGGTAATGAGGCAGTATCTCTCTCTTTTTCCAGACAGTGTTTA 38264933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1014 CTTCTATCCCCACCTGATGGTAATGAGGCAGTATCTCTCTCTTTTTCCAGACAGTGTTTA 1073

 38264934 AGAATTTGTTGTATAGAGCGCTATTACCTGAATAACACATTGTGGCAGAGCAAAATAACC 38264993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1074 AGAATTTGTTGTATAGAGCGCTATTACCTGAATAACACATTGTGGCAGAGCAAAATAACC 1133

 38264994 CTTAAGCATTTAGTTTTCAGATTTATTTTCAACTATTTAGAGGGTTATTTCTTGACTACC 38265053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1134 CTTAAGCATTTAGTTTTCAGATTTATTTTCAACTATTTAGAGGGTTATTTCTTGACTACC 1193

 38265054 ACAGATAAGTCATTCCCTTCTCCATTGTTCTATAGTTTACTGCCCTTTTTTTCTATCATG 38265113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1194 ACAGATAAGTCATTCCCTTCTCCATTGTTCTATAGTTTACTGCCCTTTTTTTCTATCATG 1253

 38265114 GCATTTACCCACTATTTCATATTGTTATTTATAGTTTACATGCTTAATATCTCCATCTCC 38265173
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     1254 GCATTTACCCACTATTTCATATTGTTATTTTTAGTTTACATGCTTAATATCTCCATCTCC 1313

 38265174 CAACAAATATGGGAACATCATTAGGTCAGAGAAATTTTATTTCTTTTCCCTCTGAAGTCT 38265233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     1314 CAACAAATATGGGAACATCATTAGGTCAGAGAAATTTTATTTCTTTCCCCTCTGAAGTCT 1373

 38265234 CAGTATTAGTTGTTACATTAATTAGCACTTATTTAAATTTTTAGTTTTCTTTTTCTTTGC 38265293
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1374 CAGTACTAGTTGTTACATTAATTAGCACTTATTTAAATTTTTAGTTTTCTTTTTCTTTGC 1433

 38265294 CTCATGTTACTGTTACACCCTTCCACTACCAAGCTTAAAGTTAGGAATGATTCATGTGAC 38265353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1434 CTCATGTTACTGTTACACCCTTCCACTACCAAGCTTAAAGTTAGGAATGATTCATGTGAC 1493

 38265354 TGGAATTGAATGACTGCTCTGAGAAAGAAGTCCATAAAAGTCTGCATGCAATTTGCCATG 38265413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1494 TGGAATTGAATGACTGCTCTGAGAAAGAAGTCCATAAAAGTCTGCATGCAATTTGCCATG 1553

 38265414 TCTCCATCCTTTCTTTGCCATAGAAACTAAAGATCTTCCAGATAGTCGAGGCTCTGTTAA 38265473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1554 TCTCCATCCTTTCTTTGCCATAGAAACTAAAGATCTTCCAGATAGTCGAGGCTCTGTTAA 1613

 38265474 TGTTATTTCTTGAATAACGACTATCTGAACAGAACATCTGTGACTTGGAATGGGGACATG 38265533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1614 TGTTATTTCTTGAATAACGACTATCTGAACAGAACATCTGTGACTTGGAATGGGGACATG 1673

 38265534 TAGCTTGGAGAAAAAGTAAGCACACAGTGTTTTAAGTTACTGTGGTTTTATGGTTATTTG 38265593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1674 TAGCTTGGAGAAAAAGTAAGCACACAGTGTTTTAAGTTACTGTGGTTTTATGGTTATTTG 1733

 38265594 TTACTGCAGCATAACCCACCCTGCCCTGACTTAAGTGATATAATATTTAACAAATATTTA 38265653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1734 TTACTGCAGCATAACCCACCCTGCCCTGACTTAAGTGATATAATATTTAACAAATATTTA 1793

 38265654 TAAAATAAATAAATTCAAATTCACTCTAATACCTAGAAAATTATCAAGTATAGTAAACCA 38265713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1794 TAAAATAAATAAATTCAAATTCACTCTAATACCTAGAAAATTATCAAGTATAGTAAACCA 1853

 38265714 AATAATAAATATTTATTAAGGAATATGGAAACAGTGACCTATGAGAAGTCTTGATATACT 38265773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1854 AATAATAAATATTTATTAAGGAATATGGAAACAGTGACCTATGAGAAGTCTTGATATACT 1913

 38265774 GACCATCCATTGTTGCAGCAGATCTCACTATTGCTATTGTGCTTAACATTTCAATTACAA 38265833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1914 GACCATCCATTGTTGCAGCAGATCTCACTATTGCTATTGTGCTTAACATTTCAATTACAA 1973

 38265834 AAATTAAAAAAAAAAAA-CACCATTCATCAGTGCAGGTCTGTGTATTTAAAGAAATAATT 38265892
          ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1974 AAATTAAAAAAAAAAAAACACCATTCATCAGTGCAGGTCTGTGTATTTAAAGAAATAATT 2033

 38265893 TACAAGTTTTTTTTTCCTTTGTAAACATATTGTTTTGAAGTGCAAATATATATAATTTGC 38265952
          |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2034 TACAAGTTTTTTTT-CCTTTGTAAACATATTGTTTTGAAGTGCAAATATATATAATTTGC 2092

 38265953 ACTTTGGGATGGAATGGAATGGGATGCCCTATTGGCAGTCCATACATCTGGATTATAAAT 38266012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2093 ACTTTGGGATGGAATGGAATGGGATGCCCTATTGGCAGTCCATACATCTGGATTATAAAT 2152

 38266013 GGATTTCCATCCCATCTTCCTCCCCATCTCTTTCCCTTTTTGATCATTCTATGGAAATGG 38266072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2153 GGATTTCCATCCCATCTTCCTCCCCATCTCTTTCCCTTTTTGATCATTCTATGGAAATGG 2212

 38266073 AAAGCTAGCAGAAGTTTGAAGAATTGTCACGCAAACAACAACAACAA---AACTTTAGCA 38266129
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||
     2213 AAAGCTAGCAGAAGTTTGAAGAATTGTCACGCAAACAACAACAACAACAAAACTTTAGCA 2272

 38266130 TATTAACCTGTTGTCCAACCTTATATAAGCAGTTTGTATTTAAAACATCCCTAAGTGGAT 38266189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2273 TATTAACCTGTTGTCCAACCTTATATAAGCAGTTTGTATTTAAAACATCCCTAAGTGGAT 2332

 38266190 TTTAATTCCAGTTTCAATCATTGTTAACTATTTTTGAAATATTTAAAATCCCA 38266242
          ||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2333 TTTAATTCCAATTTCAATCATTGTTAACTATTTTTGAAATATTTAAAATCCCA 2385

EXCISED REGION

 38266251 ACCACTATTTCTCTTCAACTAGTCCTTACTTTTATAAACAAAAAAGTAACAGTAAATAAT 38266310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2386 ACCACTATTTCTCTTCAACTAGTCCTTACTTTTATAAACAAAAAAGTAACAGTAAATAAT 2445

 38266311 TTATAACTAGGTCTCTCTGAATCTAAAAACACGTTCTTATACACTATGTGATGCCATATT 38266370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     2446 TTATAACTAGGTCTCTCTGAATCTAAAAACACATTCTTATACACTATGTGATGCCATATT 2505

 38266371 TTTTACTCTTGTCTTTGTGAGTTTTTTGTGCCATTCTCTCCTCTGGAATGGTCTTCTGTG 38266430
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2506 TTTTACTCTTGACTTTGTGAGTTTTTTGTGCCATTCTCTCCTCTGGAATGGTCTTCTGTG 2565

 38266431 CTTACACATTCCAAGGGCTACTCCATTTTACAAGAAACAGTTCATGTTTGCTACTTTGGG 38266490
          .|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2566 TTTACACATTCCAAGGGCTAATCCATTTTACAAGAAACAGTTCATGTTTGCTACTTTGGG 2625

 38266491 GTTGATCCCATGATAATTCTGGTTCTCACTTGGTCTTTCCCTGTGAGATGCAGTAGCATT 38266550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2626 GTTGATCCCATGATAATTCTGGTTCTCACTTGGTCTTTCCCTGTGAGATGCAGTAGCATT 2685

 38266551 CAAAATTCTCAGACTATTCTATGCACCTTGGCAGATTTATGGTAATGGTCTATAATTGCT 38266610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2686 CAAAATTCTCAGACTATTCTATGCACCTTGGCAGATTTATGGTAATGGTCTATAATTGCT 2745

 38266611 TCATATCTGCTAACCTTGCTTCCAAAACTAGTTTTTGAGATTAATGAGACAGGAGCTTGG 38266670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2746 TCATATCTGCTAACCTTGCTTCCAAAACTAGTTTTTGAGATTAATGAGACAGGAGCTTGG 2805

 38266671 CTTTTTCTTTCTGTATAGCTTCCATAGCAACAAGAAAATATTAGACACACAGTAGGCATT 38266730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2806 CTTTTTCTTTCTGTATAGCTTCCATAGCAACAAGAAAATATTAGACACACAGTAGGCATT 2865

 38266731 GGAAGAAAATGTGTTCAGTTAAATGAACTTGATTTGAATGGAATGAGAGTTCAATGAAAC 38266790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2866 GGAAGAAAATGTGTTCAGTTAAATGAACTTGATTTGAATGGAATGAGAGTTCAATGAAAC 2925

 38266791 TGTATATATTGTGAAACGTGGCAACTTACACCTACTCAAGACATTAAAAGAGATCATGCT 38266850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2926 TGTATATATTGTGAAACGTGGCAACTTACACCTACTCAAGACATTAAAAGAGATCATGCT 2985

 38266851 TTCTTGCCTAAGTTTTATGTCCAATTTGTTCCTGTTTCAAACCCCTCGACAAAAACAAAA 38266910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2986 TTCTTGCCTAAGTTTTATGTCCAATTTGTTCCTGTTTCAAACCCCTCGACAAAAACAAAA 3045

 38266911 TCTTTTAATCTGTTTGCAAAATATTTCCTCCTTCCTCCCATCTTGCTGTTGCTGCTCTGT 38266970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3046 TCTTTTAATCTGTTTGCAAAATATTTCCTCCTTCCTCCCATCTTGCTGTTGCTGCTCTGT 3105

 38266971 GATATACTGCCCTTGCTTATTACCCCTTTATAGCTGTTTTGTTAAAGTTCATACCGCTAA 38267030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3106 GATATACTGCCCTTGCTTATTACCCCTTTATAGCTGTTTTGTTAAAGTTCATACCGCTAA 3165

 38267031 GACCTGTAAAAGAAATTTATGGCTCTAGGGATTTCAGCAAATTCTAAATAACCATAACAG 38267090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3166 GACCTGTAAAAGAAATTTATGGCTCTAGGGATTTCAGCAAATTCTAAATAACCATAACAG 3225

 38267091 GAACAGGAAGCATTAATTAAAGACACTAGAGTCT 38267124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3226 GAACAGGAAGCATTAATTAAAGACACTAGAGTCT 3259

Alignment time is 3.09746 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38249892,38276749] =>     26858 nucs '18 dna:chromosome chromosome:GRCh37:18:1:78077248:1'
Second seq [       1,    5892] =>      5892 nucs 'mol-32-2f33-021029_5892'

Score:        5597
Aligned:      5901        nucs
Identic:      5866 ( 99%) nucs =>      2341 ( 99%)      3525 (100%)
Gaps:           17 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38263889,38266242] EXCISED REGION [38266251,38269789]
 second seq =>  [       1,    2351] EXCISED REGION [    2352,    5892]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         8 nucs [38266243,38266250]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         8 nucs [38266243,38266250] to [38266251,38266258]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [38266242,38266242] to [38266251,38266251]
 second seq =>         1 nucs [2351,2351] to [2352,2352]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 38263889 ATTTCCTTCCTAGTTCTTCTTTTTATTTAATCGTTCTTAAGATGGATACTTAAGTAATTG 38263948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATTTCCTTCCTAGTTCTTCTTTTTATTTAATCGTTCTTAAGATGGATACTTAAGTAATTG 60

 38263949 ATTTTCATCTTCTAAGCTTTATTAGTATGTTTATTTAAAGCAATACATTTCCATATTACC 38264008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATTTTCATCTTCTAAGCTTTATTAGTATGTTTATTTAAAGCAATACATTTCCATATTACC 120

 38264009 ATGACCTTAGCTGCAGTGTATGTATTTTGGTGTACAGTATTTTCTTTATTTTTCAATTAA 38264068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATGACCTTAGCTGCAGTGTATGTATTTTGGTGTACAGTATTTTCTTTATTTTTCAATTAA 180

 38264069 AATTTGTCTTGACTTCCTCTATGATGTCTTCTATGATTCTTCCTCTATAATTCTTCTTTT 38264128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AATTTGTCTTGACTTCCTCTATGATGTCTTCTATGATTCTTCCTCTATAATTCTTCTTTT 240

 38264129 GACCATATAGAAGTGTATTCATTAATTCAATCACATATAAATATTCTCCTTTTATCTTTT 38264188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GACCATATAGAAGTGTATTCATTAATTCAATCACATATAAATATTCTCCTTTTATCTTTT 300

 38264189 TGCTACTGGTTTGTTTGTTTAGCTACATTTAGGGAAAATTTCATTTCTGAGACGACAGAG 38264248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGCTACTGGTTTGTTTGTTTAGCTACATTTAGGGAAAATTTCATTTCTGAGACGACAGAG 360

 38264249 GAAGCACATTCCATTTTATTCCTTCTGCTAATGACAAAAAAAAAAAAAAATTGGAAAAAA 38264308
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||
      361 GAAGCACATTCCATTTTATTCCTTCTGCTAATGACAAAAAAAAAAAA---TTGGAAAAAA 417

 38264309 CACAAAAGCCAGAGTCAAAAGACTCTGAAAAATGGAGAAAAAGTGCAGACAGGCTAAGGA 38264368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      418 CACAAAAGCCAGAGTCAAAAGACTCTGAAAAATGGAGAAAAAGTGCAGACAGGCTAAGGA 477

 38264369 TTTGGGAGATTGAGGAACAACGACAGGTGAGTTCTCTGTCTTTTTTTTT-CTTTCTTTTT 38264427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
      478 TTTGGGAGATTGAGGAACAACGACAGGTGAGTTCTCTGTCTTTTTTTTTTCTTTCTTTTT 537

 38264428 TGATATATATATATATATCAACAATCTCAATGTTTAAGAGAAGCCCTCAAGCCAGAATTT 38264487
          ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
      538 TGATATATATATAT----CAACAATCTCAATGTTTAAGAGAAGCCCTCAATCCAGAATTT 593

 38264488 CCAACAGTTGCAGATAAAACATTGTGCTTGCTTAACGTATTTAACCAAAAGACCCGAAAA 38264547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      594 CCAACAGTTGCAGATAAAACATTGTGCTTGCTTAACGTATTTAACCAAAAGACCCGAAAA 653

 38264548 GCAAGGATATAAAAGAATATTTTAATAATATCATTCTGTTCTTAAGGTGAACACTTCAAA 38264607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      654 GCAAGGATATAAAAGAATATTTTAATAATATCATTCTGTTCTTAAGGTGAACACTTCAAA 713

 38264608 GAAACCACACCCCTCCCCTCCCCAATGCGTGCTGAAGCAGTGGAATCCATGAGTGGAACC 38264667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      714 GAAACCACACCCCTCCCCTCCCCAATGCGTGCTGAAGCAGTGGAATCCATGAGTGGAACC 773

 38264668 TTGTCATATATAATCTCCACACTAAATTTATAGCAAAGCCCCCATCTCTCAACCTGTGTT 38264727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      774 TTGTCATATATAATCTCCACACTAAATTTATAGCAAAGCCCCCATCTCTCAACCTGTGTT 833

 38264728 GAAATTCTGACTTCCAGACACACCTTTCAGTAATGAGGAGGTACTCTTCCATGATAAACC 38264787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      834 GAAATTCTGACTTCCAGACACACCTTTCAGTAATGAGGAGGTACTCTTCCATGATAAACC 893

 38264788 CTGTGGGCAAAGCTTCCACATTCATCCCACCCCTAAAGCAATAAATTTGCACCTTTCCCA 38264847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      894 CTGTGGGCAAAGCTTCCACATTCATCCCACCCCTAAAGCAATAAATTTGCACCTTTCCCA 953

 38264848 AGTAGAATCAATGGGAAGAATTTTGACTTCTATCCCCACCTGATGGTAATGAGGCAGTAT 38264907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      954 AGTAGAATCAATGGGAAGAATTTTGACTTCTATCCCCACCTGATGGTAATGAGGCAGTAT 1013

 38264908 CTCTCTCTTTTTCCAGACAGTGTTTAAGAATTTGTTGTATAGAGCGCTATTACCTGAATA 38264967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1014 CTCTCTCTTTTTCCAGACAGTGTTTAAGAATTTGTTGTATAGAGCGCTATTACCTGAATA 1073

 38264968 ACACATTGTGGCAGAGCAAAATAACCCTTAAGCATTTAGTTTTCAGATTTATTTTCAACT 38265027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1074 ACACATTGTGGCAGAGCAAAATAACCCTTAAGCATTTAGTTTTCAGATTTATTTTCAACT 1133

 38265028 ATTTAGAGGGTTATTTCTTGACTACCACAGATAAGTCATTCCCTTCTCCATTGTTCTATA 38265087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1134 ATTTAGAGGGTTATTTCTTGACTACCACAGATAAGTCATTCCCTTCTCCATTGTTCTATA 1193

 38265088 GTTTACTGCCCTTTTTTTCTATCATGGCATTTACCCACTATTTCATATTGTTATTTATAG 38265147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     1194 GTTTACTGCCCTTTTTTTCTATCATGGCATTTACCCACTATTTCATATTGTTATTTTTAG 1253

 38265148 TTTACATGCTTAATATCTCCATCTCCCAACAAATATGGGAACATCATTAGGTCAGAGAAA 38265207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1254 TTTACATGCTTAATATCTCCATCTCCCAACAAATATGGGAACATCATTAGGTCAGAGAAA 1313

 38265208 TTTTATTTCTTTTCCCTCTGAAGTCTCAGTATTAGTTGTTACATTAATTAGCACTTATTT 38265267
          ||||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     1314 TTTTATTTCTTTCCCCTCTGAAGTCTCAGTACTAGTTGTTACATTAATTAGCACTTATTT 1373

 38265268 AAATTTTTAGTTTTCTTTTTCTTTGCCTCATGTTACTGTTACACCCTTCCACTACCAAGC 38265327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1374 AAATTTTTAGTTTTCTTTTTCTTTGCCTCATGTTACTGTTACACCCTTCCACTACCAAGC 1433

 38265328 TTAAAGTTAGGAATGATTCATGTGACTGGAATTGAATGACTGCTCTGAGAAAGAAGTCCA 38265387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1434 TTAAAGTTAGGAATGATTCATGTGACTGGAATTGAATGACTGCTCTGAGAAAGAAGTCCA 1493

 38265388 TAAAAGTCTGCATGCAATTTGCCATGTCTCCATCCTTTCTTTGCCATAGAAACTAAAGAT 38265447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1494 TAAAAGTCTGCATGCAATTTGCCATGTCTCCATCCTTTCTTTGCCATAGAAACTAAAGAT 1553

 38265448 CTTCCAGATAGTCGAGGCTCTGTTAATGTTATTTCTTGAATAACGACTATCTGAACAGAA 38265507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1554 CTTCCAGATAGTCGAGGCTCTGTTAATGTTATTTCTTGAATAACGACTATCTGAACAGAA 1613

 38265508 CATCTGTGACTTGGAATGGGGACATGTAGCTTGGAGAAAAAGTAAGCACACAGTGTTTTA 38265567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1614 CATCTGTGACTTGGAATGGGGACATGTAGCTTGGAGAAAAAGTAAGCACACAGTGTTTTA 1673

 38265568 AGTTACTGTGGTTTTATGGTTATTTGTTACTGCAGCATAACCCACCCTGCCCTGACTTAA 38265627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1674 AGTTACTGTGGTTTTATGGTTATTTGTTACTGCAGCATAACCCACCCTGCCCTGACTTAA 1733

 38265628 GTGATATAATATTTAACAAATATTTATAAAATAAATAAATTCAAATTCACTCTAATACCT 38265687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1734 GTGATATAATATTTAACAAATATTTATAAAATAAATAAATTCAAATTCACTCTAATACCT 1793

 38265688 AGAAAATTATCAAGTATAGTAAACCAAATAATAAATATTTATTAAGGAATATGGAAACAG 38265747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1794 AGAAAATTATCAAGTATAGTAAACCAAATAATAAATATTTATTAAGGAATATGGAAACAG 1853

 38265748 TGACCTATGAGAAGTCTTGATATACTGACCATCCATTGTTGCAGCAGATCTCACTATTGC 38265807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1854 TGACCTATGAGAAGTCTTGATATACTGACCATCCATTGTTGCAGCAGATCTCACTATTGC 1913

 38265808 TATTGTGCTTAACATTTCAATTACAAAAATTAAAAAAAAAAAA-CACCATTCATCAGTGC 38265866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
     1914 TATTGTGCTTAACATTTCAATTACAAAAATTAAAAAAAAAAAAACACCATTCATCAGTGC 1973

 38265867 AGGTCTGTGTATTTAAAGAAATAATTTACAAGTTTTTTTTTCCTTTGTAAACATATTGTT 38265926
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
     1974 AGGTCTGTGTATTTAAAGAAATAATTTACAAGTTTTTTTT-CCTTTGTAAACATATTGTT 2032

 38265927 TTGAAGTGCAAATATATATAATTTGCACTTTGGGATGGAATGGAATGGGATGCCCTATTG 38265986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2033 TTGAAGTGCAAATATATATAATTTGCACTTTGGGATGGAATGGAATGGGATGCCCTATTG 2092

 38265987 GCAGTCCATACATCTGGATTATAAATGGATTTCCATCCCATCTTCCTCCCCATCTCTTTC 38266046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2093 GCAGTCCATACATCTGGATTATAAATGGATTTCCATCCCATCTTCCTCCCCATCTCTTTC 2152

 38266047 CCTTTTTGATCATTCTATGGAAATGGAAAGCTAGCAGAAGTTTGAAGAATTGTCACGCAA 38266106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2153 CCTTTTTGATCATTCTATGGAAATGGAAAGCTAGCAGAAGTTTGAAGAATTGTCACGCAA 2212

 38266107 ACAACAACAACAA---AACTTTAGCATATTAACCTGTTGTCCAACCTTATATAAGCAGTT 38266163
          |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2213 ACAACAACAACAACAAAACTTTAGCATATTAACCTGTTGTCCAACCTTATATAAGCAGTT 2272

 38266164 TGTATTTAAAACATCCCTAAGTGGATTTTAATTCCAGTTTCAATCATTGTTAACTATTTT 38266223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     2273 TGTATTTAAAACATCCCTAAGTGGATTTTAATTCCAATTTCAATCATTGTTAACTATTTT 2332

 38266224 TGAAATATTTAAAATCCCA 38266242
          |||||||||||||||||||
     2333 TGAAATATTTAAAATCCCA 2351

EXCISED REGION

 38266251 ACCACTATTTCTCTTCAACTAGTCCTTACTTTTATAAACAAAAAAGTAACAGTAAATAAT 38266310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2352 ACCACTATTTCTCTTCAACTAGTCCTTACTTTTATAAACAAAAAAGTAACAGTAAATAAT 2411

 38266311 TTATAACTAGGTCTCTCTGAATCTAAAAACACGTTCTTATACACTATGTGATGCCATATT 38266370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     2412 TTATAACTAGGTCTCTCTGAATCTAAAAACACATTCTTATACACTATGTGATGCCATATT 2471

 38266371 TTTTACTCTTGTCTTTGTGAGTTTTTTGTGCCATTCTCTCCTCTGGAATGGTCTTCTGTG 38266430
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2472 TTTTACTCTTGACTTTGTGAGTTTTTTGTGCCATTCTCTCCTCTGGAATGGTCTTCTGTG 2531

 38266431 CTTACACATTCCAAGGGCTACTCCATTTTACAAGAAACAGTTCATGTTTGCTACTTTGGG 38266490
          .|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2532 TTTACACATTCCAAGGGCTAATCCATTTTACAAGAAACAGTTCATGTTTGCTACTTTGGG 2591

 38266491 GTTGATCCCATGATAATTCTGGTTCTCACTTGGTCTTTCCCTGTGAGATGCAGTAGCATT 38266550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2592 GTTGATCCCATGATAATTCTGGTTCTCACTTGGTCTTTCCCTGTGAGATGCAGTAGCATT 2651

 38266551 CAAAATTCTCAGACTATTCTATGCACCTTGGCAGATTTATGGTAATGGTCTATAATTGCT 38266610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2652 CAAAATTCTCAGACTATTCTATGCACCTTGGCAGATTTATGGTAATGGTCTATAATTGCT 2711

 38266611 TCATATCTGCTAACCTTGCTTCCAAAACTAGTTTTTGAGATTAATGAGACAGGAGCTTGG 38266670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2712 TCATATCTGCTAACCTTGCTTCCAAAACTAGTTTTTGAGATTAATGAGACAGGAGCTTGG 2771

 38266671 CTTTTTCTTTCTGTATAGCTTCCATAGCAACAAGAAAATATTAGACACACAGTAGGCATT 38266730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2772 CTTTTTCTTTCTGTATAGCTTCCATAGCAACAAGAAAATATTAGACACACAGTAGGCATT 2831

 38266731 GGAAGAAAATGTGTTCAGTTAAATGAACTTGATTTGAATGGAATGAGAGTTCAATGAAAC 38266790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2832 GGAAGAAAATGTGTTCAGTTAAATGAACTTGATTTGAATGGAATGAGAGTTCAATGAAAC 2891

 38266791 TGTATATATTGTGAAACGTGGCAACTTACACCTACTCAAGACATTAAAAGAGATCATGCT 38266850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2892 TGTATATATTGTGAAACGTGGCAACTTACACCTACTCAAGACATTAAAAGAGATCATGCT 2951

 38266851 TTCTTGCCTAAGTTTTATGTCCAATTTGTTCCTGTTTCAAACCCCTCGACAAAAACAAAA 38266910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2952 TTCTTGCCTAAGTTTTATGTCCAATTTGTTCCTGTTTCAAACCCCTCGACAAAAACAAAA 3011

 38266911 TCTTTTAATCTGTTTGCAAAATATTTCCTCCTTCCTCCCATCTTGCTGTTGCTGCTCTGT 38266970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3012 TCTTTTAATCTGTTTGCAAAATATTTCCTCCTTCCTCCCATCTTGCTGTTGCTGCTCTGT 3071

 38266971 GATATACTGCCCTTGCTTATTACCCCTTTATAGCTGTTTTGTTAAAGTTCATACCGCTAA 38267030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3072 GATATACTGCCCTTGCTTATTACCCCTTTATAGCTGTTTTGTTAAAGTTCATACCGCTAA 3131

 38267031 GACCTGTAAAAGAAATTTATGGCTCTAGGGATTTCAGCAAATTCTAAATAACCATAACAG 38267090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3132 GACCTGTAAAAGAAATTTATGGCTCTAGGGATTTCAGCAAATTCTAAATAACCATAACAG 3191

 38267091 GAACAGGAAGCATTAATTAAAGACACTAGAGTCTAAGTTATAACAGAAATCCTGACATTT 38267150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3192 GAACAGGAAGCATTAATTAAAGACACTAGAGTCTAAGTTATAACAGAAATCCTGACATTT 3251

 38267151 AAGGCCCTGGTACCATTTAAATTTAAAATGGTATGACAAACAGAGAGTAATTTGATGGTC 38267210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3252 AAGGCCCTGGTACCATTTAAATTTAAAATGGTATGACAAACAGAGAGTAATTTGATGGTC 3311

 38267211 AGAAGGTTATAATGGATACCTTAATACCTTTGCCAAGAAAAAGTGTCTGTCCTTGCTCTA 38267270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3312 AGAAGGTTATAATGGATACCTTAATACCTTTGCCAAGAAAAAGTGTCTGTCCTTGCTCTA 3371

 38267271 ACCCCTACCCAGGGGCTTCAGGGGCCTCCTTCATAAAACATGGTGATGCCTAAATATTTT 38267330
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3372 ATCCCTACCCAGGGGCTTCAGGGGCCTCCTTCATAAAACATGGTGATGCCTAAATATTTT 3431

 38267331 TGCGATATCTCATATATAAGCTGGTCTTTTCTTTAAGAATACGAGAGATTAAACACCAAC 38267390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3432 TGCGATATCTCATATATAAGCTGGTCTTTTCTTTAAGAATACGAGAGATTAAACACCAAC 3491

 38267391 CCCCAACATTCATACACCAATTTTCAGATAAAACAGCTTAATATTTAAGATATATTTAGT 38267450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3492 CCCCAACATTCATACACCAATTTTCAGATAAAACAGCTTAATATTTAAGATATATTTAGT 3551

 38267451 GCAATTTGTCTATTTCTTGGTTTACTGGAGGGCTGTATTTAAAGCCAAGGGACCAAGGAA 38267510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3552 GCAATTTGTCTATTTCTTGGTTTACTGGAGGGCTGTATTTAAAGCCAAGGGACCAAGGAA 3611

 38267511 CATTCCACAACACACTAAAGCAATTTTTCCCCAGGGAATATGCTGATTCTTTCCTAAAGG 38267570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3612 CATTCCACAACACACTAAAGCAATTTTTCCCCAGGGAATATGCTGATTCTTTCCTAAAGG 3671

 38267571 CAGAAGCCGACATTCCTGACTCATTCTGCCAAACCAAGCAATGAAAAATGCTTCACCTAA 38267630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3672 CAGAAGCCGACATTCCTGACTCATTCTGCCAAACCAAGCAATGAAAAATGCTTCACCTAA 3731

 38267631 TTTGAAAGATAATTTGTAATACCAGAGACTCAACTTGTTTTGTGTATCCAATACTAGCAC 38267690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3732 TTTGAAAGATAATTTGTAATACCAGAGACTCAACTTGTTTTGTGTATCCAATACTAGCAC 3791

 38267691 CCTTTCCAGAATGTTGAAAGTACACACTGTATGATTTGTCTAATGTATATTCAAAAAAGG 38267750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3792 CCTTTCCAGAATGTTGAAAGTACACACTGTATGATTTGTCTAATGTATATTCAAAAAAGG 3851

 38267751 AATACAAATTGATCCTCAAAGTTCAAATCTGCAGTACATACTCTGTGTTCTGCCCCCACC 38267810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3852 AATACAAATTGATCCTCAAAGTTCAAATCTGCAGTACATACTCTGTGTTCTGCCCCCACC 3911

 38267811 CGTACCTTCATGAATTCTTTCACCTAGCACGCAGGCTGTTTTCCCTTTGCGAAATCCCAT 38267870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3912 CGTACCTTCATGAATTCTTTCACCTAGCACGCAGGCTGTTTTCCCTTTGCGAAATCCCAT 3971

 38267871 GGTACATTTATAGTATTAATACCACTCACTTAGAATATGCCGTATTTTGTCTAATATTGC 38267930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3972 GGTACATTTATAGTATTAATACCACTCACTTAGAATATGCCGTATTTTGTCTAATATTGC 4031

 38267931 TAGATTTTGTGTGTATAATCTTATTCCTCAAGTAAATTACAAGACAAGGACTATAATTTA 38267990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4032 TAGATTTTGTGTGTATAATCTTATTCCTCAAGTAAATTACAAGACAAGGACTATAATTTA 4091

 38267991 TACATCCTCTACAACACTTGACACTGGCTTTGATTAGGCTCTTAATAAATATTTGTTGGT 38268050
          ||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     4092 TACATCCTCTACAACACTTGGCACTGGCTTTGAGTAGGCTCTTAATAAATATTTGTTGGT 4151

 38268051 TGATTAATCAGTTGACCACACTTACTAATTGCAAGGTGACATCATTTATCATTAATAAAC 38268110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4152 TGATTAATCAGTTGACCACACTTACTAATTGCAAGGTGACATCATTTATCATTAATAAAC 4211

 38268111 ATATATGTGGATTACAAAAATATCATGTGAATTTGCATATAATCATATTAATCCCAAATT 38268170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4212 ATATATGTGGATTACAAAAATATCATGTGAATTTGCATATAATCATATTAATCCCAAATT 4271

 38268171 AGCACCTGAGAGTCCAACCACCCTCTCCTTTAGGCCCTTTTCACTTTTATGTCTACTTTT 38268230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4272 AGCACCTGAGAGTCCAACCACCCTCTCCTTTAGGCCCTTTTCACTTTTATGTCTACTTTT 4331

 38268231 GCCTCACTTACAATTCCACTACTTACTTGCCTTCTTTCTCTTTTCAGCTTTGTGCTGTTA 38268290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4332 GCCTCACTTACAATTCCACTACTTACTTGCCTTCTTTCTCTTTTCAGCTTTGTGCTGTTA 4391

 38268291 TTTAATATCTCACCAGTTGTGTAATTTCAGCTCCCAAATTGAATAAGACGTTCCCCCCAG 38268350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4392 TTTAATATCTCACCAGTTGTGTAATTTCAGCTCCCAAATTGAATAAGACGTTCCCCCCAG 4451

 38268351 TGGAACCCTCACCTTGACAAATAGCCAAATAGTA---ATTATTCCTTTCAGGGGTTGAGC 38268407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||
     4452 TGGAACCCTCACCTTGACAAATAGCCAAATAGTAATTATTATTCCTTTCAGGGGTTGAGC 4511

 38268408 TATGGAATCATGCTTGCAATATCCCAGGCTTGAGTGCCTAGATATTTATGCTATACTTCC 38268467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4512 TATGGAATCATGCTTGCAATATCCCAGGCTTGAGTGCCTAGATATTTATGCTATACTTCC 4571

 38268468 CTGTGTCGGAGTTTCCATCTGCGATTGTATTTCAAGCCCTCTCATTTTTTTTTTCAATAT 38268527
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
     4572 CTGTGTCGGAGTTTCCATCTGCGATTGTATTTCAAGCCCTCTCA-TTTTTTTTTCAATAT 4630

 38268528 GATTAAGATAATTCCTTTATGAAGTTGGAAACTCAGACATTCAGAAAGAAACTTGACGTT 38268587
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4631 GATTAAGATAATTCCTTTATGAAGCTGGAAACTCAGACATTCAGAAAGAAACTTGACGTT 4690

 38268588 TCATATTTTTGCTAACTTGCTCTTCCCATTTCCTTTCCTATCATTTTAGCCAGACTGAGG 38268647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4691 TCATATTTTTGCTAACTTGCTCTTCCCATTTCCTTTCCTATCATTTTAGCCAGACTGAGG 4750

 38268648 GAGAATTAATTTTGCAATGGTCTCTATTTTTTTTTCCAAATGTGTGACCTCCATATTAAT 38268707
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4751 GAGAATTAATTTTGCAACGGTCTCTATTTTTTTTTCCAAATGTGTGACCTCCATATTAAT 4810

 38268708 AGGAGCCAGAGTACTCATTCATCACATCTGGTCAGTGTGAAACTGACATTTACAGGGTGG 38268767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4811 AGGAGCCAGAGTACTCATTCATCACATCTGGTCAGTGTGAAACTGACATTTACAGGGTGG 4870

 38268768 AATGTTTCCCACTCAGGACAAATGGGGATCATTTGTAAAACATGCCGCACCCAATCATAG 38268827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     4871 AATGTTTCCCACTCAGGACAAATGGGGATCATTTGTAAAACATGCCACACCCAATCATAG 4930

 38268828 GTTCCCATGGATCTCCAACTACATTTTTAAGCAACAATATAAACCATTCCCGAAACTGAA 38268887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4931 GTTCCCATGGATCTCCAACTACATTTTTAAGCAACAATATAAACCATTCCCGAAACTGAA 4990

 38268888 AGGTCTTTTCAAATATTTACTGCCTACCTATGGAATTTTTATTCTGCTTGCTGCTGCCAT 38268947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4991 AGGTCTTTTCAAATATTTACTGCCTACCTATGGAATTTTTATTCTGCTTGCTGCTGCCAT 5050

 38268948 CAATAATCCTGGGAGTTCCTAGCTAAGTGTTGTGTATGACCTCCAAGGAAAGTCTTAGCA 38269007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5051 CAATAATCCTGGGAGTTCCTAGCTAAGTGTTGTGTATGACCTCCAAGGAAAGTCTTAGCA 5110

 38269008 TTGCAGAATGGGGAGGCGGGTTAGTATCCTGCATTTTTCATTCTGTCACTTTCTAGGGAC 38269067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5111 TTGCAGAATGGGGAGGCGGGTTAGTATCCTGCATTTTTCATTCTGTCACTTTCTAGGGAC 5170

 38269068 AATTACAAAGAAAATAATCATATAAGACTTATTTTTATGTTTATTATGAAAGCCTTCAGC 38269127
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5171 AATTACAAAGAAAATAATCGTATAAGACTTATTTTTATGTTTATTATGAAAGCCTTCAGC 5230

 38269128 TCTTGCATTTGCAAGTAAGCTCAATGATTTTAAGTTTGCTTTTTCCCCCATGAAATGAAA 38269187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5231 TCTTGCATTTGCAAGTAAGCTCAATGATTTTAAGTTTGCTTTTTCCCCCATGAAATGAAA 5290

 38269188 TATTATTTCCCACTTCTTCCATGAATCTATTGGGTAACTCCAGGCCACTGTGATCTTTCA 38269247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5291 TATTATTTCCCACTTCTTCCATGAATCTATTGGGTAACTCCAGGCCACTGTGATCTTTCA 5350

 38269248 TCTGGCATTTTGCTTTTATTTTTCTAGATCACAGTTGTGATTTAAAGCCCTCCTGGCACT 38269307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5351 TCTGGCATTTTGCTTTTATTTTTCTAGATCACAGTTGTGATTTAAAGCCCTCCTGGCACT 5410

 38269308 TGGACACCTTGGTGATCTTAGCTCATGCTCCTAGTTCCATAGTGATGAATTGACCAAACT 38269367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5411 TGGACACCTTGGTGATCTTAGCTCATGCTCCTAGTTCCATAGTGATGAATTGACCAAACT 5470

 38269368 TTTTCCCAAGGATATCTGCTAATTCTGGAGTTTCTGCTTTCTTATTATCTGTTCTGTCTT 38269427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5471 TTTTCCCAAGGATATCTGCTAATTCTGGAGTTTCTGCTTTCTTATTATCTGTTCTGTCTT 5530

 38269428 TTGGTTCTGTATTGATATAACAAGCTTTGTCCCCTTATCAATGAGGGCACAAAATGCAGC 38269487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     5531 TTGGTTCTGTATTGATATAACAAGCTTTGTCCCCTTATCAATGAGGGCACAAAATGAAGC 5590

 38269488 ACTTCAAATAATTTCTGCAAAAATTTACAGTTGCTGCATTAAGAATTTTGTGAGCTTCAA 38269547
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5591 ACTTCAAATAGTTTCTGCAAAAATTTACAGTTGCTGCATTAAGAATTTTGTGAGCTTCAA 5650

 38269548 TAATGTTATTGAAAAGTTGCAGATTCCCTCCTCCTTCTTTTTCTCCTTTCCTCCTCTTTC 38269607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5651 TAATGTTATTGAAAAGTTGCAGATTCCCTCCTCCTTCTTTTTCTCCTTTCCTCCTCTTTC 5710

 38269608 TGCCCTGTCTCCCCTTCATTATTCTCCTCTTCTTCTCAAAAGCAAACAATCATTTTTCTT 38269667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5711 TGCCCTGTCTCCCCTTCATTATTCTCCTCTTCTTCTCAAAAGCAAACAATCATTTTTCTT 5770

 38269668 GCCTACTGAAGAATACTTGTAATGTTATTCTCAAAACCTGGACACCAGCTCAACTCCTTC 38269727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5771 GCCTACTGAAGAATACTTGTAATGTTATTCTCAAAACCTGGACACCAGCTCAACTCCTTC 5830

 38269728 TTTGTTCTACAAGTATTCACCCACCCTAATAGGGAGTTTATTCCAATGAAAAGACTGTGT 38269787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5831 TTTGTTCTACAAGTATTCACCCACCCTAATAGGGAGTTTATTCCAATGAAAAGACTGTGT 5890

 38269788 TC 38269789
          ||
     5891 TC 5892

Alignment time is 5.56662 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38249892,38276749] =>     26858 nucs '18 dna:chromosome chromosome:GRCh37:18:1:78077248:1'
Second seq [       1,    5485] =>      5485 nucs 'mol-32-2fb7-173500_5485'

Score:        5201
Aligned:      5494        nucs
Identic:      5460 ( 99%) nucs =>      2262 ( 99%)      3198 (100%)
Gaps:           17 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38263967,38266242] EXCISED REGION [38266251,38269460]
 second seq =>  [       1,    2273] EXCISED REGION [    2274,    5485]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         8 nucs [38266243,38266250]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         8 nucs [38266243,38266250] to [38266251,38266258]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [38266242,38266242] to [38266251,38266251]
 second seq =>         1 nucs [2273,2273] to [2274,2274]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 38263967 TTATTAGTATGTTTATTTAAAGCAATACATTTCCATATTACCATGACCTTAGCTGCAGTG 38264026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTATTAGTATGTTTATTTAAAGCAATACATTTCCATATTACCATGACCTTAGCTGCAGTG 60

 38264027 TATGTATTTTGGTGTACAGTATTTTCTTTATTTTTCAATTAAAATTTGTCTTGACTTCCT 38264086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TATGTATTTTGGTGTACAGTATTTTCTTTATTTTTCAATTAAAATTTGTCTTGACTTCCT 120

 38264087 CTATGATGTCTTCTATGATTCTTCCTCTATAATTCTTCTTTTGACCATATAGAAGTGTAT 38264146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTATGATGTCTTCTATGATTCTTCCTCTATAATTCTTCTTTTGACCATATAGAAGTGTAT 180

 38264147 TCATTAATTCAATCACATATAAATATTCTCCTTTTATCTTTTTGCTACTGGTTTGTTTGT 38264206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCATTAATTCAATCACATATAAATATTCTCCTTTTATCTTTTTGCTACTGGTTTGTTTGT 240

 38264207 TTAGCTACATTTAGGGAAAATTTCATTTCTGAGACGACAGAGGAAGCACATTCCATTTTA 38264266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTAGCTACATTTAGGGAAAATTTCATTTCTGAGACGACAGAGGAAGCACATTCCATTTTA 300

 38264267 TTCCTTCTGCTAATGACAAAAAAAAAAAAAAATTGGAAAAAACACAAAAGCCAGAGTCAA 38264326
          |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTCCTTCTGCTAATGACAAAAAAAAAAAA---TTGGAAAAAACACAAAAGCCAGAGTCAA 357

 38264327 AAGACTCTGAAAAATGGAGAAAAAGTGCAGACAGGCTAAGGATTTGGGAGATTGAGGAAC 38264386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      358 AAGACTCTGAAAAATGGAGAAAAAGTGCAGACAGGCTAAGGATTTGGGAGATTGAGGAAC 417

 38264387 AACGACAGGTGAGTTCTCTGTCTTTTTTTTT-CTTTCTTTTTTGATATATATATATATAT 38264445
          ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
      418 AACGACAGGTGAGTTCTCTGTCTTTTTTTTTTCTTTCTTTTTTGATATATATATAT---- 473

 38264446 CAACAATCTCAATGTTTAAGAGAAGCCCTCAAGCCAGAATTTCCAACAGTTGCAGATAAA 38264505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
      474 CAACAATCTCAATGTTTAAGAGAAGCCCTCAATCCAGAATTTCCAACAGTTGCAGATAAA 533

 38264506 ACATTGTGCTTGCTTAACGTATTTAACCAAAAGACCCGAAAAGCAAGGATATAAAAGAAT 38264565
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      534 ACATTGTGCTTGCATAACGTATTTAACCAAAAGACCCGAAAAGCAAGGATATAAAAGAAT 593

 38264566 ATTTTAATAATATCATTCTGTTCTTAAGGTGAACACTTCAAAGAAACCACACCCCTCCCC 38264625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      594 ATTTTAATAATATCATTCTGTTCTTAAGGTGAACACTTCAAAGAAACCACACCCCTCCCC 653

 38264626 TCCCCAATGCGTGCTGAAGCAGTGGAATCCATGAGTGGAACCTTGTCATATATAATCTCC 38264685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      654 TCCCCAATGCGTGCTGAAGCAGTGGAATCCATGAGTGGAACCTTGTCATATATAATCTCC 713

 38264686 ACACTAAATTTATAGCAAAGCCCCCATCTCTCAACCTGTGTTGAAATTCTGACTTCCAGA 38264745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      714 ACACTAAATTTATAGCAAAGCCCCCATCTCTCAACCTGTGTTGAAATTCTGACTTCCAGA 773

 38264746 CACACCTTTCAGTAATGAGGAGGTACTCTTCCATGATAAACCCTGTGGGCAAAGCTTCCA 38264805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      774 CACACCTTTCAGTAATGAGGAGGTACTCTTCCATGATAAACCCTGTGGGCAAAGCTTCCA 833

 38264806 CATTCATCCCACCCCTAAAGCAATAAATTTGCACCTTTCCCAAGTAGAATCAATGGGAAG 38264865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      834 CATTCATCCCACCCCTAAAGCAATAAATTTGCACCTTTCCCAAGTAGAATCAATGGGAAG 893

 38264866 AATTTTGACTTCTATCCCCACCTGATGGTAATGAGGCAGTATCTCTCTCTTTTTCCAGAC 38264925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      894 AATTTTGACTTCTATCCCCACCTGATGGTAATGAGGCAGTATCTCTCTCTTTTTCCAGAC 953

 38264926 AGTGTTTAAGAATTTGTTGTATAGAGCGCTATTACCTGAATAACACATTGTGGCAGAGCA 38264985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      954 AGTGTTTAAGAATTTGTTGTATAGAGCGCTATTACCTGAATAACACATTGTGGCAGAGCA 1013

 38264986 AAATAACCCTTAAGCATTTAGTTTTCAGATTTATTTTCAACTATTTAGAGGGTTATTTCT 38265045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1014 AAATAACCCTTAAGCATTTAGTTTTCAGATTTATTTTCAACTATTTAGAGGGTTATTTCT 1073

 38265046 TGACTACCACAGATAAGTCATTCCCTTCTCCATTGTTCTATAGTTTACTGCCCTTTTTTT 38265105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1074 TGACTACCACAGATAAGTCATTCCCTTCTCCATTGTTCTATAGTTTACTGCCCTTTTTTT 1133

 38265106 CTATCATGGCATTTACCCACTATTTCATATTGTTATTTATAGTTTACATGCTTAATATCT 38265165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     1134 CTATCATGGCATTTACCCACTATTTCATATTGTTATTTTTAGTTTACATGCTTAATATCT 1193

 38265166 CCATCTCCCAACAAATATGGGAACATCATTAGGTCAGAGAAATTTTATTTCTTTTCCCTC 38265225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     1194 CCATCTCCCAACAAATATGGGAACATCATTAGGTCAGAGAAATTTTATTTCTTTCCCCTC 1253

 38265226 TGAAGTCTCAGTATTAGTTGTTACATTAATTAGCACTTATTTAAATTTTTAGTTTTCTTT 38265285
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1254 TGAAGTCTCAGTACTAGTTGTTACATTAATTAGCACTTATTTAAATTTTTAGTTTTCTTT 1313

 38265286 TTCTTTGCCTCATGTTACTGTTACACCCTTCCACTACCAAGCTTAAAGTTAGGAATGATT 38265345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1314 TTCTTTGCCTCATGTTACTGTTACACCCTTCCACTACCAAGCTTAAAGTTAGGAATGATT 1373

 38265346 CATGTGACTGGAATTGAATGACTGCTCTGAGAAAGAAGTCCATAAAAGTCTGCATGCAAT 38265405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1374 CATGTGACTGGAATTGAATGACTGCTCTGAGAAAGAAGTCCATAAAAGTCTGCATGCAAT 1433

 38265406 TTGCCATGTCTCCATCCTTTCTTTGCCATAGAAACTAAAGATCTTCCAGATAGTCGAGGC 38265465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1434 TTGCCATGTCTCCATCCTTTCTTTGCCATAGAAACTAAAGATCTTCCAGATAGTCGAGGC 1493

 38265466 TCTGTTAATGTTATTTCTTGAATAACGACTATCTGAACAGAACATCTGTGACTTGGAATG 38265525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1494 TCTGTTAATGTTATTTCTTGAATAACGACTATCTGAACAGAACATCTGTGACTTGGAATG 1553

 38265526 GGGACATGTAGCTTGGAGAAAAAGTAAGCACACAGTGTTTTAAGTTACTGTGGTTTTATG 38265585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1554 GGGACATGTAGCTTGGAGAAAAAGTAAGCACACAGTGTTTTAAGTTACTGTGGTTTTATG 1613

 38265586 GTTATTTGTTACTGCAGCATAACCCACCCTGCCCTGACTTAAGTGATATAATATTTAACA 38265645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1614 GTTATTTGTTACTGCAGCATAACCCACCCTGCCCTGACTTAAGTGATATAATATTTAACA 1673

 38265646 AATATTTATAAAATAAATAAATTCAAATTCACTCTAATACCTAGAAAATTATCAAGTATA 38265705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1674 AATATTTATAAAATAAATAAATTCAAATTCACTCTAATACCTAGAAAATTATCAAGTATA 1733

 38265706 GTAAACCAAATAATAAATATTTATTAAGGAATATGGAAACAGTGACCTATGAGAAGTCTT 38265765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1734 GTAAACCAAATAATAAATATTTATTAAGGAATATGGAAACAGTGACCTATGAGAAGTCTT 1793

 38265766 GATATACTGACCATCCATTGTTGCAGCAGATCTCACTATTGCTATTGTGCTTAACATTTC 38265825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1794 GATATACTGACCATCCATTGTTGCAGCAGATCTCACTATTGCTATTGTGCTTAACATTTC 1853

 38265826 AATTACAAAAATTAAAAAAAAAAAA-CACCATTCATCAGTGCAGGTCTGTGTATTTAAAG 38265884
          ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1854 AATTACAAAAATTAAAAAAAAAAAAACACCATTCATCAGTGCAGGTCTGTGTATTTAAAG 1913

 38265885 AAATAATTTACAAGTTTTTTTTTCCTTTGTAAACATATTGTTTTGAAGTGCAAATATATA 38265944
          |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1914 AAATAATTTACAAGTTTTTTTT-CCTTTGTAAACATATTGTTTTGAAGTGCAAATATATA 1972

 38265945 TAATTTGCACTTTGGGATGGAATGGAATGGGATGCCCTATTGGCAGTCCATACATCTGGA 38266004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1973 TAATTTGCACTTTGGGATGGAATGGAATGGGATGCCCTATTGGCAGTCCATACATCTGGA 2032

 38266005 TTATAAATGGATTTCCATCCCATCTTCCTCCCCATCTCTTTCCCTTTTTGATCATTCTAT 38266064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2033 TTATAAATGGATTTCCATCCCATCTTCCTCCCCATCTCTTTCCCTTTTTGATCATTCTAT 2092

 38266065 GGAAATGGAAAGCTAGCAGAAGTTTGAAGAATTGTCACGCAAACAACAACAACAA---AA 38266121
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||
     2093 GGAAATGGAAAGCTAGCAGAAGTTTGAAGAATTGTCACGCAAACAACAACAACAACAAAA 2152

 38266122 CTTTAGCATATTAACCTGTTGTCCAACCTTATATAAGCAGTTTGTATTTAAAACATCCCT 38266181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2153 CTTTAGCATATTAACCTGTTGTCCAACCTTATATAAGCAGTTTGTATTTAAAACATCCCT 2212

 38266182 AAGTGGATTTTAATTCCAGTTTCAATCATTGTTAACTATTTTTGAAATATTTAAAATCCC 38266241
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2213 AAGTGGATTTTAATTCCAATTTCAATCATTGTTAACTATTTTTGAAATATTTAAAATCCC 2272

 38266242 A 38266242
          |
     2273 A 2273

EXCISED REGION

 38266251 ACCACTATTTCTCTTCAACTAGTCCTTACTTTTATAAACAAAAAAGTAACAGTAAATAAT 38266310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2274 ACCACTATTTCTCTTCAACTAGTCCTTACTTTTATAAACAAAAAAGTAACAGTAAATAAT 2333

 38266311 TTATAACTAGGTCTCTCTGAATCTAAAAACACGTTCTTATACACTATGTGATGCCATATT 38266370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     2334 TTATAACTAGGTCTCTCTGAATCTAAAAACACATTCTTATACACTATGTGATGCCATATT 2393

 38266371 TTTTACTCTTGTCTTTGTGAGTTTTTTGTGCCATTCTCTCCTCTGGAATGGTCTTCTGTG 38266430
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2394 TTTTACTCTTGACTTTGTGAGTTTTTTGTGCCATTCTCTCCTCTGGAATGGTCTTCTGTG 2453

 38266431 CTTACACATTCCAAGGGCTACTCCATTTTACAAGAAACAGTTCATGTTTGCTACTTTGGG 38266490
          .|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2454 TTTACACATTCCAAGGGCTAATCCATTTTACAAGAAACAGTTCATGTTTGCTACTTTGGG 2513

 38266491 GTTGATCCCATGATAATTCTGGTTCTCACTTGGTCTTTCCCTGTGAGATGCAGTAGCATT 38266550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2514 GTTGATCCCATGATAATTCTGGTTCTCACTTGGTCTTTCCCTGTGAGATGCAGTAGCATT 2573

 38266551 CAAAATTCTCAGACTATTCTATGCACCTTGGCAGATTTATGGTAATGGTCTATAATTGCT 38266610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2574 CAAAATTCTCAGACTATTCTATGCACCTTGGCAGATTTATGGTAATGGTCTATAATTGCT 2633

 38266611 TCATATCTGCTAACCTTGCTTCCAAAACTAGTTTTTGAGATTAATGAGACAGGAGCTTGG 38266670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2634 TCATATCTGCTAACCTTGCTTCCAAAACTAGTTTTTGAGATTAATGAGACAGGAGCTTGG 2693

 38266671 CTTTTTCTTTCTGTATAGCTTCCATAGCAACAAGAAAATATTAGACACACAGTAGGCATT 38266730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2694 CTTTTTCTTTCTGTATAGCTTCCATAGCAACAAGAAAATATTAGACACACAGTAGGCATT 2753

 38266731 GGAAGAAAATGTGTTCAGTTAAATGAACTTGATTTGAATGGAATGAGAGTTCAATGAAAC 38266790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2754 GGAAGAAAATGTGTTCAGTTAAATGAACTTGATTTGAATGGAATGAGAGTTCAATGAAAC 2813

 38266791 TGTATATATTGTGAAACGTGGCAACTTACACCTACTCAAGACATTAAAAGAGATCATGCT 38266850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2814 TGTATATATTGTGAAACGTGGCAACTTACACCTACTCAAGACATTAAAAGAGATCATGCT 2873

 38266851 TTCTTGCCTAAGTTTTATGTCCAATTTGTTCCTGTTTCAAACCCCTCGACAAAAACAAAA 38266910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2874 TTCTTGCCTAAGTTTTATGTCCAATTTGTTCCTGTTTCAAACCCCTCGACAAAAACAAAA 2933

 38266911 TCTTTTAATCTGTTTGCAAAATATTTCCTCCTTCCTCCCATCTTGCTGTTGCTGCTCTGT 38266970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2934 TCTTTTAATCTGTTTGCAAAATATTTCCTCCTTCCTCCCATCTTGCTGTTGCTGCTCTGT 2993

 38266971 GATATACTGCCCTTGCTTATTACCCCTTTATAGCTGTTTTGTTAAAGTTCATACCGCTAA 38267030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2994 GATATACTGCCCTTGCTTATTACCCCTTTATAGCTGTTTTGTTAAAGTTCATACCGCTAA 3053

 38267031 GACCTGTAAAAGAAATTTATGGCTCTAGGGATTTCAGCAAATTCTAAATAACCATAACAG 38267090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3054 GACCTGTAAAAGAAATTTATGGCTCTAGGGATTTCAGCAAATTCTAAATAACCATAACAG 3113

 38267091 GAACAGGAAGCATTAATTAAAGACACTAGAGTCTAAGTTATAACAGAAATCCTGACATTT 38267150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3114 GAACAGGAAGCATTAATTAAAGACACTAGAGTCTAAGTTATAACAGAAATCCTGACATTT 3173

 38267151 AAGGCCCTGGTACCATTTAAATTTAAAATGGTATGACAAACAGAGAGTAATTTGATGGTC 38267210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3174 AAGGCCCTGGTACCATTTAAATTTAAAATGGTATGACAAACAGAGAGTAATTTGATGGTC 3233

 38267211 AGAAGGTTATAATGGATACCTTAATACCTTTGCCAAGAAAAAGTGTCTGTCCTTGCTCTA 38267270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3234 AGAAGGTTATAATGGATACCTTAATACCTTTGCCAAGAAAAAGTGTCTGTCCTTGCTCTA 3293

 38267271 ACCCCTACCCAGGGGCTTCAGGGGCCTCCTTCATAAAACATGGTGATGCCTAAATATTTT 38267330
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3294 ATCCCTACCCAGGGGCTTCAGGGGCCTCCTTCATAAAACATGGTGATGCCTAAATATTTT 3353

 38267331 TGCGATATCTCATATATAAGCTGGTCTTTTCTTTAAGAATACGAGAGATTAAACACCAAC 38267390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3354 TGCGATATCTCATATATAAGCTGGTCTTTTCTTTAAGAATACGAGAGATTAAACACCAAC 3413

 38267391 CCCCAACATTCATACACCAATTTTCAGATAAAACAGCTTAATATTTAAGATATATTTAGT 38267450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3414 CCCCAACATTCATACACCAATTTTCAGATAAAACAGCTTAATATTTAAGATATATTTAGT 3473

 38267451 GCAATTTGTCTATTTCTTGGTTTACTGGAGGGCTGTATTTAAAGCCAAGGGACCAAGGAA 38267510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3474 GCAATTTGTCTATTTCTTGGTTTACTGGAGGGCTGTATTTAAAGCCAAGGGACCAAGGAA 3533

 38267511 CATTCCACAACACACTAAAGCAATTTTTCCCCAGGGAATATGCTGATTCTTTCCTAAAGG 38267570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3534 CATTCCACAACACACTAAAGCAATTTTTCCCCAGGGAATATGCTGATTCTTTCCTAAAGG 3593

 38267571 CAGAAGCCGACATTCCTGACTCATTCTGCCAAACCAAGCAATGAAAAATGCTTCACCTAA 38267630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3594 CAGAAGCCGACATTCCTGACTCATTCTGCCAAACCAAGCAATGAAAAATGCTTCACCTAA 3653

 38267631 TTTGAAAGATAATTTGTAATACCAGAGACTCAACTTGTTTTGTGTATCCAATACTAGCAC 38267690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3654 TTTGAAAGATAATTTGTAATACCAGAGACTCAACTTGTTTTGTGTATCCAATACTAGCAC 3713

 38267691 CCTTTCCAGAATGTTGAAAGTACACACTGTATGATTTGTCTAATGTATATTCAAAAAAGG 38267750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3714 CCTTTCCAGAATGTTGAAAGTACACACTGTATGATTTGTCTAATGTATATTCAAAAAAGG 3773

 38267751 AATACAAATTGATCCTCAAAGTTCAAATCTGCAGTACATACTCTGTGTTCTGCCCCCACC 38267810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3774 AATACAAATTGATCCTCAAAGTTCAAATCTGCAGTACATACTCTGTGTTCTGCCCCCACC 3833

 38267811 CGTACCTTCATGAATTCTTTCACCTAGCACGCAGGCTGTTTTCCCTTTGCGAAATCCCAT 38267870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3834 CGTACCTTCATGAATTCTTTCACCTAGCACGCAGGCTGTTTTCCCTTTGCGAAATCCCAT 3893

 38267871 GGTACATTTATAGTATTAATACCACTCACTTAGAATATGCCGTATTTTGTCTAATATTGC 38267930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3894 GGTACATTTATAGTATTAATACCACTCACTTAGAATATGCCGTATTTTGTCTAATATTGC 3953

 38267931 TAGATTTTGTGTGTATAATCTTATTCCTCAAGTAAATTACAAGACAAGGACTATAATTTA 38267990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3954 TAGATTTTGTGTGTATAATCTTATTCCTCAAGTAAATTACAAGACAAGGACTATAATTTA 4013

 38267991 TACATCCTCTACAACACTTGACACTGGCTTTGATTAGGCTCTTAATAAATATTTGTTGGT 38268050
          ||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     4014 TACATCCTCTACAACACTTGGCACTGGCTTTGAGTAGGCTCTTAATAAATATTTGTTGGT 4073

 38268051 TGATTAATCAGTTGACCACACTTACTAATTGCAAGGTGACATCATTTATCATTAATAAAC 38268110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4074 TGATTAATCAGTTGACCACACTTACTAATTGCAAGGTGACATCATTTATCATTAATAAAC 4133

 38268111 ATATATGTGGATTACAAAAATATCATGTGAATTTGCATATAATCATATTAATCCCAAATT 38268170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4134 ATATATGTGGATTACAAAAATATCATGTGAATTTGCATATAATCATATTAATCCCAAATT 4193

 38268171 AGCACCTGAGAGTCCAACCACCCTCTCCTTTAGGCCCTTTTCACTTTTATGTCTACTTTT 38268230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4194 AGCACCTGAGAGTCCAACCACCCTCTCCTTTAGGCCCTTTTCACTTTTATGTCTACTTTT 4253

 38268231 GCCTCACTTACAATTCCACTACTTACTTGCCTTCTTTCTCTTTTCAGCTTTGTGCTGTTA 38268290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4254 GCCTCACTTACAATTCCACTACTTACTTGCCTTCTTTCTCTTTTCAGCTTTGTGCTGTTA 4313

 38268291 TTTAATATCTCACCAGTTGTGTAATTTCAGCTCCCAAATTGAATAAGACGTTCCCCCCAG 38268350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4314 TTTAATATCTCACCAGTTGTGTAATTTCAGCTCCCAAATTGAATAAGACGTTCCCCCCAG 4373

 38268351 TGGAACCCTCACCTTGACAAATAGCCAAATAGTA---ATTATTCCTTTCAGGGGTTGAGC 38268407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||
     4374 TGGAACCCTCACCTTGACAAATAGCCAAATAGTAATTATTATTCCTTTCAGGGGTTGAGC 4433

 38268408 TATGGAATCATGCTTGCAATATCCCAGGCTTGAGTGCCTAGATATTTATGCTATACTTCC 38268467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4434 TATGGAATCATGCTTGCAATATCCCAGGCTTGAGTGCCTAGATATTTATGCTATACTTCC 4493

 38268468 CTGTGTCGGAGTTTCCATCTGCGATTGTATTTCAAGCCCTCTCATTTTTTTTTTCAATAT 38268527
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
     4494 CTGTGTCGGAGTTTCCATCTGCGATTGTATTTCAAGCCCTCTCA-TTTTTTTTTCAATAT 4552

 38268528 GATTAAGATAATTCCTTTATGAAGTTGGAAACTCAGACATTCAGAAAGAAACTTGACGTT 38268587
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4553 GATTAAGATAATTCCTTTATGAAGCTGGAAACTCAGACATTCAGAAAGAAACTTGACGTT 4612

 38268588 TCATATTTTTGCTAACTTGCTCTTCCCATTTCCTTTCCTATCATTTTAGCCAGACTGAGG 38268647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4613 TCATATTTTTGCTAACTTGCTCTTCCCATTTCCTTTCCTATCATTTTAGCCAGACTGAGG 4672

 38268648 GAGAATTAATTTTGCAATGGTCTCTATTTTTTTTTCCAAATGTGTGACCTCCATATTAAT 38268707
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4673 GAGAATTAATTTTGCAACGGTCTCTATTTTTTTTTCCAAATGTGTGACCTCCATATTAAT 4732

 38268708 AGGAGCCAGAGTACTCATTCATCACATCTGGTCAGTGTGAAACTGACATTTACAGGGTGG 38268767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4733 AGGAGCCAGAGTACTCATTCATCACATCTGGTCAGTGTGAAACTGACATTTACAGGGTGG 4792

 38268768 AATGTTTCCCACTCAGGACAAATGGGGATCATTTGTAAAACATGCCGCACCCAATCATAG 38268827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     4793 AATGTTTCCCACTCAGGACAAATGGGGATCATTTGTAAAACATGCCACACCCAATCATAG 4852

 38268828 GTTCCCATGGATCTCCAACTACATTTTTAAGCAACAATATAAACCATTCCCGAAACTGAA 38268887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4853 GTTCCCATGGATCTCCAACTACATTTTTAAGCAACAATATAAACCATTCCCGAAACTGAA 4912

 38268888 AGGTCTTTTCAAATATTTACTGCCTACCTATGGAATTTTTATTCTGCTTGCTGCTGCCAT 38268947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4913 AGGTCTTTTCAAATATTTACTGCCTACCTATGGAATTTTTATTCTGCTTGCTGCTGCCAT 4972

 38268948 CAATAATCCTGGGAGTTCCTAGCTAAGTGTTGTGTATGACCTCCAAGGAAAGTCTTAGCA 38269007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4973 CAATAATCCTGGGAGTTCCTAGCTAAGTGTTGTGTATGACCTCCAAGGAAAGTCTTAGCA 5032

 38269008 TTGCAGAATGGGGAGGCGGGTTAGTATCCTGCATTTTTCATTCTGTCACTTTCTAGGGAC 38269067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5033 TTGCAGAATGGGGAGGCGGGTTAGTATCCTGCATTTTTCATTCTGTCACTTTCTAGGGAC 5092

 38269068 AATTACAAAGAAAATAATCATATAAGACTTATTTTTATGTTTATTATGAAAGCCTTCAGC 38269127
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5093 AATTACAAAGAAAATAATCGTATAAGACTTATTTTTATGTTTATTATGAAAGCCTTCAGC 5152

 38269128 TCTTGCATTTGCAAGTAAGCTCAATGATTTTAAGTTTGCTTTTTCCCCCATGAAATGAAA 38269187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5153 TCTTGCATTTGCAAGTAAGCTCAATGATTTTAAGTTTGCTTTTTCCCCCATGAAATGAAA 5212

 38269188 TATTATTTCCCACTTCTTCCATGAATCTATTGGGTAACTCCAGGCCACTGTGATCTTTCA 38269247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5213 TATTATTTCCCACTTCTTCCATGAATCTATTGGGTAACTCCAGGCCACTGTGATCTTTCA 5272

 38269248 TCTGGCATTTTGCTTTTATTTTTCTAGATCACAGTTGTGATTTAAAGCCCTCCTGGCACT 38269307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5273 TCTGGCATTTTGCTTTTATTTTTCTAGATCACAGTTGTGATTTAAAGCCCTCCTGGCACT 5332

 38269308 TGGACACCTTGGTGATCTTAGCTCATGCTCCTAGTTCCATAGTGATGAATTGACCAAACT 38269367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5333 TGGACACCTTGGTGATCTTAGCTCATGCTCCTAGTTCCATAGTGATGAATTGACCAAACT 5392

 38269368 TTTTCCCAAGGATATCTGCTAATTCTGGAGTTTCTGCTTTCTTATTATCTGTTCTGTCTT 38269427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5393 TTTTCCCAAGGATATCTGCTAATTCTGGAGTTTCTGCTTTCTTATTATCTGTTCTGTCTT 5452

 38269428 TTGGTTCTGTATTGATATAACAAGCTTTGTCCC 38269460
          |||||||||||||||||||||||||||||||||
     5453 TTGGTTCTGTATTGATATAACAAGCTTTGTCCC 5485

Alignment time is 5.22929 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38249892,38276749] =>     26858 nucs '18 dna:chromosome chromosome:GRCh37:18:1:78077248:1'
Second seq [       1,    4624] =>      4624 nucs 'mol-32-2fee-224850_4624'

Score:        4373
Aligned:      4633        nucs
Identic:      4602 ( 99%) nucs =>      2132 ( 99%)      2470 ( 99%)
Gaps:           17 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38264098,38266242] EXCISED REGION [38266251,38268730]
 second seq =>  [       1,    2142] EXCISED REGION [    2143,    4624]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         8 nucs [38266243,38266250]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         8 nucs [38266243,38266250] to [38266251,38266258]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [38266242,38266242] to [38266251,38266251]
 second seq =>         1 nucs [2142,2142] to [2143,2143]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 38264098 TCTATGATTCTTCCTCTATAATTCTTCTTTTGACCATATAGAAGTGTATTCATTAATTCA 38264157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCTATGATTCTTCCTCTATAATTCTTCTTTTGACCATATAGAAGTGTATTCATTAATTCA 60

 38264158 ATCACATATAAATATTCTCCTTTTATCTTTTTGCTACTGGTTTGTTTGTTTAGCTACATT 38264217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATCACATATAAATATTCTCCTTTTATCTTTTTGCTACTGGTTTGTTTGTTTAGCTACATT 120

 38264218 TAGGGAAAATTTCATTTCTGAGACGACAGAGGAAGCACATTCCATTTTATTCCTTCTGCT 38264277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TAGGGAAAATTTCATTTCTGAGACGACAGAGGAAGCACATTCCATTTTATTCCTTCTGCT 180

 38264278 AATGACAAAAAAAAAAAAAAATTGGAAAAAACACAAAAGCCAGAGTCAAAAGACTCTGAA 38264337
          ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AATGACAAAAAAAAAAAA---TTGGAAAAAACACAAAAGCCAGAGTCAAAAGACTCTGAA 237

 38264338 AAATGGAGAAAAAGTGCAGACAGGCTAAGGATTTGGGAGATTGAGGAACAACGACAGGTG 38264397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      238 AAATGGAGAAAAAGTGCAGACAGGCTAAGGATTTGGGAGATTGAGGAACAACGACAGGTG 297

 38264398 AGTTCTCTGTCTTTTTTTTT-CTTTCTTTTTTGATATATATATATATATCAACAATCTCA 38264456
          |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||||||
      298 AGTTCTCTGTCTTTTTTTTTTCTTTCTTTTTTGATATATATATAT----CAACAATCTCA 353

 38264457 ATGTTTAAGAGAAGCCCTCAAGCCAGAATTTCCAACAGTTGCAGATAAAACATTGTGCTT 38264516
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      354 ATGTTTAAGAGAAGCCCTCAATCCAGAATTTCCAACAGTTGCAGATAAAACATTGTGCTT 413

 38264517 GCTTAACGTATTTAACCAAAAGACCCGAAAAGCAAGGATATAAAAGAATATTTTAATAAT 38264576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      414 GCTTAACGTATTTAACCAAAAGACCCGAAAAGCAAGGATATAAAAGAATATTTTAATAAT 473

 38264577 ATCATTCTGTTCTTAAGGTGAACACTTCAAAGAAACCACACCCCTCCCCTCCCCAATGCG 38264636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      474 ATCATTCTGTTCTTAAGGTGAACACTTCAAAGAAACCACACCCCTCCCCTCCCCAATGCG 533

 38264637 TGCTGAAGCAGTGGAATCCATGAGTGGAACCTTGTCATATATAATCTCCACACTAAATTT 38264696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      534 TGCTGAAGCAGTGGAATCCATGAGTGGAACCTTGTCATATATAATCTCCACACTAAATTT 593

 38264697 ATAGCAAAGCCCCCATCTCTCAACCTGTGTTGAAATTCTGACTTCCAGACACACCTTTCA 38264756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      594 ATAGCAAAGCCCCCATCTCTCAACCTGTGTTGAAATTCTGACTTCCAGACACACCTTTCA 653

 38264757 GTAATGAGGAGGTACTCTTCCATGATAAACCCTGTGGGCAAAGCTTCCACATTCATCCCA 38264816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      654 GTAATGAGGAGGTACTCTTCCATGATAAACCCTGTGGGCAAAGCTTCCACATTCATCCCA 713

 38264817 CCCCTAAAGCAATAAATTTGCACCTTTCCCAAGTAGAATCAATGGGAAGAATTTTGACTT 38264876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      714 CCCCTAAAGCAATAAATTTGCACCTTTCCCAAGTAGAATCAATGGGAAGAATTTTGACTT 773

 38264877 CTATCCCCACCTGATGGTAATGAGGCAGTATCTCTCTCTTTTTCCAGACAGTGTTTAAGA 38264936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      774 CTATCCCCACCTGATGGTAATGAGGCAGTATCTCTCTCTTTTTCCAGACAGTGTTTAAGA 833

 38264937 ATTTGTTGTATAGAGCGCTATTACCTGAATAACACATTGTGGCAGAGCAAAATAACCCTT 38264996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      834 ATTTGTTGTATAGAGCGCTATTACCTGAATAACACATTGTGGCAGAGCAAAATAACCCTT 893

 38264997 AAGCATTTAGTTTTCAGATTTATTTTCAACTATTTAGAGGGTTATTTCTTGACTACCACA 38265056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      894 AAGCATTTAGTTTTCAGATTTATTTTCAACTATTTAGAGGGTTATTTCTTGACTACCACA 953

 38265057 GATAAGTCATTCCCTTCTCCATTGTTCTATAGTTTACTGCCCTTTTTTTCTATCATGGCA 38265116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      954 GATAAGTCATTCCCTTCTCCATTGTTCTATAGTTTACTGCCCTTTTTTTCTATCATGGCA 1013

 38265117 TTTACCCACTATTTCATATTGTTATTTATAGTTTACATGCTTAATATCTCCATCTCCCAA 38265176
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     1014 TTTACCCACTATTTCATATTGTTATTTTTAGTTTACATGCTTAATATCTCCATCTCCCAA 1073

 38265177 CAAATATGGGAACATCATTAGGTCAGAGAAATTTTATTTCTTTTCCCTCTGAAGTCTCAG 38265236
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     1074 CAAATATGGGAACATCATTAGGTCAGAGAAATTTTATTTCTTTCCCCTCTGAAGTCTCAG 1133

 38265237 TATTAGTTGTTACATTAATTAGCACTTATTTAAATTTTTAGTTTTCTTTTTCTTTGCCTC 38265296
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1134 TACTAGTTGTTACATTAATTAGCACTTATTTAAATTTTTAGTTTTCTTTTTCTTTGCCTC 1193

 38265297 ATGTTACTGTTACACCCTTCCACTACCAAGCTTAAAGTTAGGAATGATTCATGTGACTGG 38265356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1194 ATGTTACTGTTACACCCTTCCACTACCAAGCTTAAAGTTAGGAATGATTCATGTGACTGG 1253

 38265357 AATTGAATGACTGCTCTGAGAAAGAAGTCCATAAAAGTCTGCATGCAATTTGCCATGTCT 38265416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1254 AATTGAATGACTGCTCTGAGAAAGAAGTCCATAAAAGTCTGCATGCAATTTGCCATGTCT 1313

 38265417 CCATCCTTTCTTTGCCATAGAAACTAAAGATCTTCCAGATAGTCGAGGCTCTGTTAATGT 38265476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1314 CCATCCTTTCTTTGCCATAGAAACTAAAGATCTTCCAGATAGTCGAGGCTCTGTTAATGT 1373

 38265477 TATTTCTTGAATAACGACTATCTGAACAGAACATCTGTGACTTGGAATGGGGACATGTAG 38265536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1374 TATTTCTTGAATAACGACTATCTGAACAGAACATCTGTGACTTGGAATGGGGACATGTAG 1433

 38265537 CTTGGAGAAAAAGTAAGCACACAGTGTTTTAAGTTACTGTGGTTTTATGGTTATTTGTTA 38265596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1434 CTTGGAGAAAAAGTAAGCACACAGTGTTTTAAGTTACTGTGGTTTTATGGTTATTTGTTA 1493

 38265597 CTGCAGCATAACCCACCCTGCCCTGACTTAAGTGATATAATATTTAACAAATATTTATAA 38265656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1494 CTGCAGCATAACCCACCCTGCCCTGACTTAAGTGATATAATATTTAACAAATATTTATAA 1553

 38265657 AATAAATAAATTCAAATTCACTCTAATACCTAGAAAATTATCAAGTATAGTAAACCAAAT 38265716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1554 AATAAATAAATTCAAATTCACTCTAATACCTAGAAAATTATCAAGTATAGTAAACCAAAT 1613

 38265717 AATAAATATTTATTAAGGAATATGGAAACAGTGACCTATGAGAAGTCTTGATATACTGAC 38265776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1614 AATAAATATTTATTAAGGAATATGGAAACAGTGACCTATGAGAAGTCTTGATATACTGAC 1673

 38265777 CATCCATTGTTGCAGCAGATCTCACTATTGCTATTGTGCTTAACATTTCAATTACAAAAA 38265836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1674 CATCCATTGTTGCAGCAGATCTCACTATTGCTATTGTGCTTAACATTTCAATTACAAAAA 1733

 38265837 TTAAAAAAAAAAAA-CACCATTCATCAGTGCAGGTCTGTGTATTTAAAGAAATAATTTAC 38265895
          |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1734 TTAAAAAAAAAAAAACACCATTCATCAGTGCAGGTCTGTGTATTTAAAGAAATAATTTAC 1793

 38265896 AAGTTTTTTTTTCCTTTGTAAACATATTGTTTTGAAGTGCAAATATATATAATTTGCACT 38265955
          ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1794 AAGTTTTTTTT-CCTTTGTAAACATATTGTTTTGAAGTGCAAATATATATAATTTGCACT 1852

 38265956 TTGGGATGGAATGGAATGGGATGCCCTATTGGCAGTCCATACATCTGGATTATAAATGGA 38266015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1853 TTGGGATGGAATGGAATGGGATGCCCTATTGGCAGTCCATACATCTGGATTATAAATGGA 1912

 38266016 TTTCCATCCCATCTTCCTCCCCATCTCTTTCCCTTTTTGATCATTCTATGGAAATGGAAA 38266075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1913 TTTCCATCCCATCTTCCTCCCCATCTCTTTCCCTTTTTGATCATTCTATGGAAATGGAAA 1972

 38266076 GCTAGCAGAAGTTTGAAGAATTGTCACGCAAACAACAACAACAA---AACTTTAGCATAT 38266132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||
     1973 GCTAGCAGAAGTTTGAAGAATTGTCACGCAAACAACAACAACAACAAAACTTTAGCATAT 2032

 38266133 TAACCTGTTGTCCAACCTTATATAAGCAGTTTGTATTTAAAACATCCCTAAGTGGATTTT 38266192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2033 TAACCTGTTGTCCAACCTTATATAAGCAGTTTGTATTTAAAACATCCCTAAGTGGATTTT 2092

 38266193 AATTCCAGTTTCAATCATTGTTAACTATTTTTGAAATATTTAAAATCCCA 38266242
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2093 AATTCCAATTTCAATCATTGTTAACTATTTTTGAAATATTTAAAATCCCA 2142

EXCISED REGION

 38266251 ACCACTATTTCTCTTCAACTAGTCCTTACTTTTATAAACAAAAAAGTAACAGTAAATAAT 38266310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2143 ACCACTATTTCTCTTCAACTAGTCCTTACTTTTATAAACAAAAAAGTAACAGTAAATAAT 2202

 38266311 TTATAACTAGGTCTCTCTGAATCTAAAAACACGTTCTTATACACTATGTGATGCCATATT 38266370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     2203 TTATAACTAGGTCTCTCTGAATCTAAAAACACATTCTTATACACTATGTGATGCCATATT 2262

 38266371 TTTTACTCTTGTCTTTGTGAGTTTTTTGTGCCATTCTCTCCTCTGGAATGGTCTTCTGTG 38266430
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2263 TTTTACTCTTGACTTTGTGAGTTTTTTGTGCCATTCTCTCCTCTGGAATGGTCTTCTGTG 2322

 38266431 CTTACACATTCCAAGGGCTACTCCATTTTACAAGAAACAGTTCATGTTTGCTACTTTGGG 38266490
          .|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2323 TTTACACATTCCAAGGGCTAATCCATTTTACAAGAAACAGTTCATGTTTGCTACTTTGGG 2382

 38266491 GTTGATCCCATGATAATTCTGGTTCTCACTTGGTCTTTCCCTGTGAGATGCAGTAGCATT 38266550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2383 GTTGATCCCATGATAATTCTGGTTCTCACTTGGTCTTTCCCTGTGAGATGCAGTAGCATT 2442

 38266551 CAAAATTCTCAGACTATTCTATGCACCTTGGCAGATTTATGGTAATGGTCTATAATTGCT 38266610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2443 CAAAATTCTCAGACTATTCTATGCACCTTGGCAGATTTATGGTAATGGTCTATAATTGCT 2502

 38266611 TCATATCTGCTAACCTTGCTTCCAAAACTAGTTTTTGAGATTAATGAGACAGGAGCTTGG 38266670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2503 TCATATCTGCTAACCTTGCTTCCAAAACTAGTTTTTGAGATTAATGAGACAGGAGCTTGG 2562

 38266671 CTTTTTCTTTCTGTATAGCTTCCATAGCAACAAGAAAATATTAGACACACAGTAGGCATT 38266730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2563 CTTTTTCTTTCTGTATAGCTTCCATAGCAACAAGAAAATATTAGACACACAGTAGGCATT 2622

 38266731 GGAAGAAAATGTGTTCAGTTAAATGAACTTGATTTGAATGGAATGAGAGTTCAATGAAAC 38266790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2623 GGAAGAAAATGTGTTCAGTTAAATGAACTTGATTTGAATGGAATGAGAGTTCAATGAAAC 2682

 38266791 TGTATATATTGTGAAACGTGGCAACTTACACCTACTCAAGACATTAAAAGAGATCATGCT 38266850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2683 TGTATATATTGTGAAACGTGGCAACTTACACCTACTCAAGACATTAAAAGAGATCATGCT 2742

 38266851 TTCTTGCCTAAGTTTTATGTCCAATTTGTTCCTGTTTCAAACCCCTCGACAAAAACAAAA 38266910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2743 TTCTTGCCTAAGTTTTATGTCCAATTTGTTCCTGTTTCAAACCCCTCGACAAAAACAAAA 2802

 38266911 TCTTTTAATCTGTTTGCAAAATATTTCCTCCTTCCTCCCATCTTGCTGTTGCTGCTCTGT 38266970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2803 TCTTTTAATCTGTTTGCAAAATATTTCCTCCTTCCTCCCATCTTGCTGTTGCTGCTCTGT 2862

 38266971 GATATACTGCCCTTGCTTATTACCCCTTTATAGCTGTTTTGTTAAAGTTCATACCGCTAA 38267030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2863 GATATACTGCCCTTGCTTATTACCCCTTTATAGCTGTTTTGTTAAAGTTCATACCGCTAA 2922

 38267031 GACCTGTAAAAGAAATTTATGGCTCTAGGGATTTCAGCAAATTCTAAATAACCATAACAG 38267090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2923 GACCTGTAAAAGAAATTTATGGCTCTAGGGATTTCAGCAAATTCTAAATAACCATAACAG 2982

 38267091 GAACAGGAAGCATTAATTAAAGACACTAGAGTCTAAGTTATAACAGAAATCCTGACATTT 38267150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2983 GAACAGGAAGCATTAATTAAAGACACTAGAGTCTAAGTTATAACAGAAATCCTGACATTT 3042

 38267151 AAGGCCCTGGTACCATTTAAATTTAAAATGGTATGACAAACAGAGAGTAATTTGATGGTC 38267210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3043 AAGGCCCTGGTACCATTTAAATTTAAAATGGTATGACAAACAGAGAGTAATTTGATGGTC 3102

 38267211 AGAAGGTTATAATGGATACCTTAATACCTTTGCCAAGAAAAAGTGTCTGTCCTTGCTCTA 38267270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3103 AGAAGGTTATAATGGATACCTTAATACCTTTGCCAAGAAAAAGTGTCTGTCCTTGCTCTA 3162

 38267271 ACCCCTACCCAGGGGCTTCAGGGGCCTCCTTCATAAAACATGGTGATGCCTAAATATTTT 38267330
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3163 ATCCCTACCCAGGGGCTTCAGGGGCCTCCTTCATAAAACATGGTGATGCCTAAATATTTT 3222

 38267331 TGCGATATCTCATATATAAGCTGGTCTTTTCTTTAAGAATACGAGAGATTAAACACCAAC 38267390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3223 TGCGATATCTCATATATAAGCTGGTCTTTTCTTTAAGAATACGAGAGATTAAACACCAAC 3282

 38267391 CCCCAACATTCATACACCAATTTTCAGATAAAACAGCTTAATATTTAAGATATATTTAGT 38267450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3283 CCCCAACATTCATACACCAATTTTCAGATAAAACAGCTTAATATTTAAGATATATTTAGT 3342

 38267451 GCAATTTGTCTATTTCTTGGTTTACTGGAGGGCTGTATTTAAAGCCAAGGGACCAAGGAA 38267510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3343 GCAATTTGTCTATTTCTTGGTTTACTGGAGGGCTGTATTTAAAGCCAAGGGACCAAGGAA 3402

 38267511 CATTCCACAACACACTAAAGCAATTTTTCCCCAGGGAATATGCTGATTCTTTCCTAAAGG 38267570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3403 CATTCCACAACACACTAAAGCAATTTTTCCCCAGGGAATATGCTGATTCTTTCCTAAAGG 3462

 38267571 CAGAAGCCGACATTCCTGACTCATTCTGCCAAACCAAGCAATGAAAAATGCTTCACCTAA 38267630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3463 CAGAAGCCGACATTCCTGACTCATTCTGCCAAACCAAGCAATGAAAAATGCTTCACCTAA 3522

 38267631 TTTGAAAGATAATTTGTAATACCAGAGACTCAACTTGTTTTGTGTATCCAATACTAGCAC 38267690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3523 TTTGAAAGATAATTTGTAATACCAGAGACTCAACTTGTTTTGTGTATCCAATACTAGCAC 3582

 38267691 CCTTTCCAGAATGTTGAAAGTACACACTGTATGATTTGTCTAATGTATATTCAAAAAAGG 38267750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3583 CCTTTCCAGAATGTTGAAAGTACACACTGTATGATTTGTCTAATGTATATTCAAAAAAGG 3642

 38267751 AATACAAATTGATCCTCAAAGTTCAAATCTGCAGTACATACTCTGTGTTCTGCCCCCACC 38267810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3643 AATACAAATTGATCCTCAAAGTTCAAATCTGCAGTACATACTCTGTGTTCTGCCCCCACC 3702

 38267811 CGTACCTTCATGAATTCTTTCACCTAGCACGCAGGCTGTTTTCCCTTTGCGAAATCCCAT 38267870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3703 CGTACCTTCATGAATTCTTTCACCTAGCACGCAGGCTGTTTTCCCTTTGCGAAATCCCAT 3762

 38267871 GGTACATTTATAGTATTAATACCACTCACTTAGAATATGCCGTATTTTGTCTAATATTGC 38267930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3763 GGTACATTTATAGTATTAATACCACTCACTTAGAATATGCCGTATTTTGTCTAATATTGC 3822

 38267931 TAGATTTTGTGTGTATAATCTTATTCCTCAAGTAAATTACAAGACAAGGACTATAATTTA 38267990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3823 TAGATTTTGTGTGTATAATCTTATTCCTCAAGTAAATTACAAGACAAGGACTATAATTTA 3882

 38267991 TACATCCTCTACAACACTTGACACTGGCTTTGATTAGGCTCTTAATAAATATTTGTTGGT 38268050
          ||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     3883 TACATCCTCTACAACACTTGGCACTGGCTTTGAGTAGGCTCTTAATAAATATTTGTTGGT 3942

 38268051 TGATTAATCAGTTGACCACACTTACTAATTGCAAGGTGACATCATTTATCATTAATAAAC 38268110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3943 TGATTAATCAGTTGACCACACTTACTAATTGCAAGGTGACATCATTTATCATTAATAAAC 4002

 38268111 ATATATGTGGATTACAAAAATATCATGTGAATTTGCATATAATCATATTAATCCCAAATT 38268170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4003 ATATATGTGGATTACAAAAATATCATGTGAATTTGCATATAATCATATTAATCCCAAATT 4062

 38268171 AGCACCTGAGAGTCCAACCACCCTCTCCTTTAGGCCCTTTTCACTTTTATGTCTACTTTT 38268230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4063 AGCACCTGAGAGTCCAACCACCCTCTCCTTTAGGCCCTTTTCACTTTTATGTCTACTTTT 4122

 38268231 GCCTCACTTACAATTCCACTACTTACTTGCCTTCTTTCTCTTTTCAGCTTTGTGCTGTTA 38268290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4123 GCCTCACTTACAATTCCACTACTTACTTGCCTTCTTTCTCTTTTCAGCTTTGTGCTGTTA 4182

 38268291 TTTAATATCTCACCAGTTGTGTAATTTCAGCTCCCAAATTGAATAAGACGTTCCCCCCAG 38268350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4183 TTTAATATCTCACCAGTTGTGTAATTTCAGCTCCCAAATTGAATAAGACGTTCCCCCCAG 4242

 38268351 TGGAACCCTCACCTTGACAAATAGCCAAATAGTA---ATTATTCCTTTCAGGGGTTGAGC 38268407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||
     4243 TGGAACCCTCACCTTGACAAATAGCCAAATAGTAATTATTATTCCTTTCAGGGGTTGAGC 4302

 38268408 TATGGAATCATGCTTGCAATATCCCAGGCTTGAGTGCCTAGATATTTATGCTATACTTCC 38268467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4303 TATGGAATCATGCTTGCAATATCCCAGGCTTGAGTGCCTAGATATTTATGCTATACTTCC 4362

 38268468 CTGTGTCGGAGTTTCCATCTGCGATTGTATTTCAAGCCCTCTCATTTTTTTTTTCAATAT 38268527
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
     4363 CTGTGTCGGAGTTTCCATCTGCGATTGTATTTCAAGCCCTCTCA-TTTTTTTTTCAATAT 4421

 38268528 GATTAAGATAATTCCTTTATGAAGTTGGAAACTCAGACATTCAGAAAGAAACTTGACGTT 38268587
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4422 GATTAAGATAATTCCTTTATGAAGCTGGAAACTCAGACATTCAGAAAGAAACTTGACGTT 4481

 38268588 TCATATTTTTGCTAACTTGCTCTTCCCATTTCCTTTCCTATCATTTTAGCCAGACTGAGG 38268647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4482 TCATATTTTTGCTAACTTGCTCTTCCCATTTCCTTTCCTATCATTTTAGCCAGACTGAGG 4541

 38268648 GAGAATTAATTTTGCAATGGTCTCTATTTTTTTTTCCAAATGTGTGACCTCCATATTAAT 38268707
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4542 GAGAATTAATTTTGCAACGGTCTCTATTTTTTTTTCCAAATGTGTGACCTCCATATTAAT 4601

 38268708 AGGAGCCAGAGTACTCATTCATC 38268730
          |||||||||||||||||||||||
     4602 AGGAGCCAGAGTACTCATTCATC 4624

Alignment time is 4.36639 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38249892,38276749] =>     26858 nucs '18 dna:chromosome chromosome:GRCh37:18:1:78077248:1'
Second seq [       1,    4365] =>      4365 nucs 'mol-32-2ff9-301013_4365'

Score:        4150
Aligned:      4367        nucs
Identic:      4344 ( 99%) nucs =>      1569 ( 99%)      2775 ( 99%)
Gaps:            9 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38264669,38266242] EXCISED REGION [38266251,38269036]
 second seq =>  [       1,    1577] EXCISED REGION [    1578,    4365]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         8 nucs [38266243,38266250]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         8 nucs [38266243,38266250] to [38266251,38266258]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [38266242,38266242] to [38266251,38266251]
 second seq =>         1 nucs [1577,1577] to [1578,1578]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 38264669 TGTCATATATAATCTCCACACTAAATTTATAGCAAAGCCCCCATCTCTCAACCTGTGTTG 38264728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGTCATATATAATCTCCACACTAAATTTATAGCAAAGCCCCCATCTCTCAACCTGTGTTG 60

 38264729 AAATTCTGACTTCCAGACACACCTTTCAGTAATGAGGAGGTACTCTTCCATGATAAACCC 38264788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAATTCTGACTTCCAGACACACCTTTCAGTAATGAGGAGGTACTCTTCCATGATAAACCC 120

 38264789 TGTGGGCAAAGCTTCCACATTCATCCCACCCCTAAAGCAATAAATTTGCACCTTTCCCAA 38264848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGTGGGCAAAGCTTCCACATTCATCCCACCCCTAAAGCAATAAATTTGCACCTTTCCCAA 180

 38264849 GTAGAATCAATGGGAAGAATTTTGACTTCTATCCCCACCTGATGGTAATGAGGCAGTATC 38264908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTAGAATCAATGGGAAGAATTTTGACTTCTATCCCCACCTGATGGTAATGAGGCAGTATC 240

 38264909 TCTCTCTTTTTCCAGACAGTGTTTAAGAATTTGTTGTATAGAGCGCTATTACCTGAATAA 38264968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCTCTCTTTTTCCAGACAGTGTTTAAGAATTTGTTGTATAGAGCGCTATTACCTGAATAA 300

 38264969 CACATTGTGGCAGAGCAAAATAACCCTTAAGCATTTAGTTTTCAGATTTATTTTCAACTA 38265028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CACATTGTGGCAGAGCAAAATAACCCTTAAGCATTTAGTTTTCAGATTTATTTTCAACTA 360

 38265029 TTTAGAGGGTTATTTCTTGACTACCACAGATAAGTCATTCCCTTCTCCATTGTTCTATAG 38265088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTTAGAGGGTTATTTCTTGACTACCACAGATAAGTCATTCCCTTCTCCATTGTTCTATAG 420

 38265089 TTTACTGCCCTTTTTTTCTATCATGGCATTTACCCACTATTTCATATTGTTATTTATAGT 38265148
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
      421 TTTACTGCCCTTTTTTTCTATCATGGCATTTACCCACTATTTCATATTGTTATTTTTAGT 480

 38265149 TTACATGCTTAATATCTCCATCTCCCAACAAATATGGGAACATCATTAGGTCAGAGAAAT 38265208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTACATGCTTAATATCTCCATCTCCCAACAAATATGGGAACATCATTAGGTCAGAGAAAT 540

 38265209 TTTATTTCTTTTCCCTCTGAAGTCTCAGTATTAGTTGTTACATTAATTAGCACTTATTTA 38265268
          |||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTTATTTCTTTCCCCTCTGAAGTCTCAGTACTAGTTGTTACATTAATTAGCACTTATTTA 600

 38265269 AATTTTTAGTTTTCTTTTTCTTTGCCTCATGTTACTGTTACACCCTTCCACTACCAAGCT 38265328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AATTTTTAGTTTTCTTTTTCTTTGCCTCATGTTACTGTTACACCCTTCCACTACCAAGCT 660

 38265329 TAAAGTTAGGAATGATTCATGTGACTGGAATTGAATGACTGCTCTGAGAAAGAAGTCCAT 38265388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TAAAGTTAGGAATGATTCATGTGACTGGAATTGAATGACTGCTCTGAGAAAGAAGTCCAT 720

 38265389 AAAAGTCTGCATGCAATTTGCCATGTCTCCATCCTTTCTTTGCCATAGAAACTAAAGATC 38265448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAAAGTCTGCATGCAATTTGCCATGTCTCCATCCTTTCTTTGCCATAGAAACTAAAGATC 780

 38265449 TTCCAGATAGTCGAGGCTCTGTTAATGTTATTTCTTGAATAACGACTATCTGAACAGAAC 38265508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTCCAGATAGTCGAGGCTCTGTTAATGTTATTTCTTGAATAACGACTATCTGAACAGAAC 840

 38265509 ATCTGTGACTTGGAATGGGGACATGTAGCTTGGAGAAAAAGTAAGCACACAGTGTTTTAA 38265568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATCTGTGACTTGGAATGGGGACATGTAGCTTGGAGAAAAAGTAAGCACACAGTGTTTTAA 900

 38265569 GTTACTGTGGTTTTATGGTTATTTGTTACTGCAGCATAACCCACCCTGCCCTGACTTAAG 38265628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GTTACTGTGGTTTTATGGTTATTTGTTACTGCAGCATAACCCACCCTGCCCTGACTTAAG 960

 38265629 TGATATAATATTTAACAAATATTTATAAAATAAATAAATTCAAATTCACTCTAATACCTA 38265688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGATATAATATTTAACAAATATTTATAAAATAAATAAATTCAAATTCACTCTAATACCTA 1020

 38265689 GAAAATTATCAAGTATAGTAAACCAAATAATAAATATTTATTAAGGAATATGGAAACAGT 38265748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GAAAATTATCAAGTATAGTAAACCAAATAATAAATATTTATTAAGGAATATGGAAACAGT 1080

 38265749 GACCTATGAGAAGTCTTGATATACTGACCATCCATTGTTGCAGCAGATCTCACTATTGCT 38265808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GACCTATGAGAAGTCTTGATATACTGACCATCCATTGTTGCAGCAGATCTCACTATTGCT 1140

 38265809 ATTGTGCTTAACATTTCAATTACAAAAATTAAAAAAAAAAAA-CACCATTCATCAGTGCA 38265867
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
     1141 ATTGTGCTTAACATTTCAATTACAAAAATTAAAAAAAAAAAAACACCATTCATCAGTGCA 1200

 38265868 GGTCTGTGTATTTAAAGAAATAATTTACAAGTTTTTTTTTCCTTTGTAAACATATTGTTT 38265927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
     1201 GGTCTGTGTATTTAAAGAAATAATTTACAAGTTTTTTTT-CCTTTGTAAACATATTGTTT 1259

 38265928 TGAAGTGCAAATATATATAATTTGCACTTTGGGATGGAATGGAATGGGATGCCCTATTGG 38265987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 TGAAGTGCAAATATATATAATTTGCACTTTGGGATGGAATGGAATGGGATGCCCTATTGG 1319

 38265988 CAGTCCATACATCTGGATTATAAATGGATTTCCATCCCATCTTCCTCCCCATCTCTTTCC 38266047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 CAGTCCATACATCTGGATTATAAATGGATTTCCATCCCATCTTCCTCCCCATCTCTTTCC 1379

 38266048 CTTTTTGATCATTCTATGGAAATGGAAAGCTAGCAGAAGTTTGAAGAATTGTCACGCAAA 38266107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 CTTTTTGATCATTCTATGGAAATGGAAAGCTAGCAGAAGTTTGAAGAATTGTCACGCAAA 1439

 38266108 CAACAACAACAA---AACTTTAGCATATTAACCTGTTGTCCAACCTTATATAAGCAGTTT 38266164
          ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 CAACAACAACAACAAAACTTTAGCATATTAACCTGTTGTCCAACCTTATATAAGCAGTTT 1499

 38266165 GTATTTAAAACATCCCTAAGTGGATTTTAATTCCAGTTTCAATCATTGTTAACTATTTTT 38266224
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     1500 GTATTTAAAACATCCCTAAGTGGATTTTAATTCCAATTTCAATCATTGTTAACTATTTTT 1559

 38266225 GAAATATTTAAAATCCCA 38266242
          ||||||||||||||||||
     1560 GAAATATTTAAAATCCCA 1577

EXCISED REGION

 38266251 ACCACTATTTCTCTTCAACTAGTCCTTACTTTTATAAACAAAAAAGTAACAGTAAATAAT 38266310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1578 ACCACTATTTCTCTTCAACTAGTCCTTACTTTTATAAACAAAAAAGTAACAGTAAATAAT 1637

 38266311 TTATAACTAGGTCTCTCTGAATCTAAAAACACGTTCTTATACACTATGTGATGCCATATT 38266370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     1638 TTATAACTAGGTCTCTCTGAATCTAAAAACACATTCTTATACACTATGTGATGCCATATT 1697

 38266371 TTTTACTCTTGTCTTTGTGAGTTTTTTGTGCCATTCTCTCCTCTGGAATGGTCTTCTGTG 38266430
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1698 TTTTACTCTTGACTTTGTGAGTTTTTTGTGCCATTCTCTCCTCTGGAATGGTCTTCTGTG 1757

 38266431 CTTACACATTCCAAGGGCTACTCCATTTTACAAGAAACAGTTCATGTTTGCTACTTTGGG 38266490
          .|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1758 TTTACACATTCCAAGGGCTAATCCATTTTACAAGAAACAGTTCATGTTTGCTACTTTGGG 1817

 38266491 GTTGATCCCATGATAATTCTGGTTCTCACTTGGTCTTTCCCTGTGAGATGCAGTAGCATT 38266550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1818 GTTGATCCCATGATAATTCTGGTTCTCACTTGGTCTTTCCCTGTGAGATGCAGTAGCATT 1877

 38266551 CAAAATTCTCAGACTATTCTATGCACCTTGGCAGATTTATGGTAATGGTCTATAATTGCT 38266610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1878 CAAAATTCTCAGACTATTCTATGCACCTTGGCAGATTTATGGTAATGGTCTATAATTGCT 1937

 38266611 TCATATCTGCTAACCTTGCTTCCAAAACTAGTTTTTGAGATTAATGAGACAGGAGCTTGG 38266670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1938 TCATATCTGCTAACCTTGCTTCCAAAACTAGTTTTTGAGATTAATGAGACAGGAGCTTGG 1997

 38266671 CTTTTTCTTTCTGTATAGCTTCCATAGCAACAAGAAAATATTAGACACACAGTAGGCATT 38266730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1998 CTTTTTCTTTCTGTATAGCTTCCATAGCAACAAGAAAATATTAGACACACAGTAGGCATT 2057

 38266731 GGAAGAAAATGTGTTCAGTTAAATGAACTTGATTTGAATGGAATGAGAGTTCAATGAAAC 38266790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2058 GGAAGAAAATGTGTTCAGTTAAATGAACTTGATTTGAATGGAATGAGAGTTCAATGAAAC 2117

 38266791 TGTATATATTGTGAAACGTGGCAACTTACACCTACTCAAGACATTAAAAGAGATCATGCT 38266850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2118 TGTATATATTGTGAAACGTGGCAACTTACACCTACTCAAGACATTAAAAGAGATCATGCT 2177

 38266851 TTCTTGCCTAAGTTTTATGTCCAATTTGTTCCTGTTTCAAACCCCTCGACAAAAACAAAA 38266910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2178 TTCTTGCCTAAGTTTTATGTCCAATTTGTTCCTGTTTCAAACCCCTCGACAAAAACAAAA 2237

 38266911 TCTTTTAATCTGTTTGCAAAATATTTCCTCCTTCCTCCCATCTTGCTGTTGCTGCTCTGT 38266970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2238 TCTTTTAATCTGTTTGCAAAATATTTCCTCCTTCCTCCCATCTTGCTGTTGCTGCTCTGT 2297

 38266971 GATATACTGCCCTTGCTTATTACCCCTTTATAGCTGTTTTGTTAAAGTTCATACCGCTAA 38267030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2298 GATATACTGCCCTTGCTTATTACCCCTTTATAGCTGTTTTGTTAAAGTTCATACCGCTAA 2357

 38267031 GACCTGTAAAAGAAATTTATGGCTCTAGGGATTTCAGCAAATTCTAAATAACCATAACAG 38267090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2358 GACCTGTAAAAGAAATTTATGGCTCTAGGGATTTCAGCAAATTCTAAATAACCATAACAG 2417

 38267091 GAACAGGAAGCATTAATTAAAGACACTAGAGTCTAAGTTATAACAGAAATCCTGACATTT 38267150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2418 GAACAGGAAGCATTAATTAAAGACACTAGAGTCTAAGTTATAACAGAAATCCTGACATTT 2477

 38267151 AAGGCCCTGGTACCATTTAAATTTAAAATGGTATGACAAACAGAGAGTAATTTGATGGTC 38267210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2478 AAGGCCCTGGTACCATTTAAATTTAAAATGGTATGACAAACAGAGAGTAATTTGATGGTC 2537

 38267211 AGAAGGTTATAATGGATACCTTAATACCTTTGCCAAGAAAAAGTGTCTGTCCTTGCTCTA 38267270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2538 AGAAGGTTATAATGGATACCTTAATACCTTTGCCAAGAAAAAGTGTCTGTCCTTGCTCTA 2597

 38267271 ACCCCTACCCAGGGGCTTCAGGGGCCTCCTTCATAAAACATGGTGATGCCTAAATATTTT 38267330
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2598 ATCCCTACCCAGGGGCTTCAGGGGCCTCCTTCATAAAACATGGTGATGCCTAAATATTTT 2657

 38267331 TGCGATATCTCATATATAAGCTGGTCTTTTCTTTAAGAATACGAGAGATTAAACACCAAC 38267390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2658 TGCGATATCTCATATATAAGCTGGTCTTTTCTTTAAGAATACGAGAGATTAAACACCAAC 2717

 38267391 CCCCAACATTCATACACCAATTTTCAGATAAAACAGCTTAATATTTAAGATATATTTAGT 38267450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2718 CCCCAACATTCATACACCAATTTTCAGATAAAACAGCTTAATATTTAAGATATATTTAGT 2777

 38267451 GCAATTTGTCTATTTCTTGGTTTACTGGAGGGCTGTATTTAAAGCCAAGGGACCAAGGAA 38267510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2778 GCAATTTGTCTATTTCTTGGTTTACTGGAGGGCTGTATTTAAAGCCAAGGGACCAAGGAA 2837

 38267511 CATTCCACAACACACTAAAGCAATTTTTCCCCAGGGAATATGCTGATTCTTTCCTAAAGG 38267570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2838 CATTCCACAACACACTAAAGCAATTTTTCCCCAGGGAATATGCTGATTCTTTCCTAAAGG 2897

 38267571 CAGAAGCCGACATTCCTGACTCATTCTGCCAAACCAAGCAATGAAAAATGCTTCACCTAA 38267630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2898 CAGAAGCCGACATTCCTGACTCATTCTGCCAAACCAAGCAATGAAAAATGCTTCACCTAA 2957

 38267631 TTTGAAAGATAATTTGTAATACCAGAGACTCAACTTGTTTTGTGTATCCAATACTAGCAC 38267690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2958 TTTGAAAGATAATTTGTAATACCAGAGACTCAACTTGTTTTGTGTATCCAATACTAGCAC 3017

 38267691 CCTTTCCAGAATGTTGAAAGTACACACTGTATGATTTGTCTAATGTATATTCAAAAAAGG 38267750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3018 CCTTTCCAGAATGTTGAAAGTACACACTGTATGATTTGTCTAATGTATATTCAAAAAAGG 3077

 38267751 AATACAAATTGATCCTCAAAGTTCAAATCTGCAGTACATACTCTGTGTTCTGCCCCCACC 38267810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3078 AATACAAATTGATCCTCAAAGTTCAAATCTGCAGTACATACTCTGTGTTCTGCCCCCACC 3137

 38267811 CGTACCTTCATGAATTCTTTCACCTAGCACGCAGGCTGTTTTCCCTTTGCGAAATCCCAT 38267870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3138 CGTACCTTCATGAATTCTTTCACCTAGCACGCAGGCTGTTTTCCCTTTGCGAAATCCCAT 3197

 38267871 GGTACATTTATAGTATTAATACCACTCACTTAGAATATGCCGTATTTTGTCTAATATTGC 38267930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3198 GGTACATTTATAGTATTAATACCACTCACTTAGAATATGCCGTATTTTGTCTAATATTGC 3257

 38267931 TAGATTTTGTGTGTATAATCTTATTCCTCAAGTAAATTACAAGACAAGGACTATAATTTA 38267990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3258 TAGATTTTGTGTGTATAATCTTATTCCTCAAGTAAATTACAAGACAAGGACTATAATTTA 3317

 38267991 TACATCCTCTACAACACTTGACACTGGCTTTGATTAGGCTCTTAATAAATATTTGTTGGT 38268050
          ||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     3318 TACATCCTCTACAACACTTGGCACTGGCTTTGAGTAGGCTCTTAATAAATATTTGTTGGT 3377

 38268051 TGATTAATCAGTTGACCACACTTACTAATTGCAAGGTGACATCATTTATCATTAATAAAC 38268110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3378 TGATTAATCAGTTGACCACACTTACTAATTGCAAGGTGACATCATTTATCATTAATAAAC 3437

 38268111 ATATATGTGGATTACAAAAATATCATGTGAATTTGCATATAATCATATTAATCCCAAATT 38268170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3438 ATATATGTGGATTACAAAAATATCATGTGAATTTGCATATAATCATATTAATCCCAAATT 3497

 38268171 AGCACCTGAGAGTCCAACCACCCTCTCCTTTAGGCCCTTTTCACTTTTATGTCTACTTTT 38268230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3498 AGCACCTGAGAGTCCAACCACCCTCTCCTTTAGGCCCTTTTCACTTTTATGTCTACTTTT 3557

 38268231 GCCTCACTTACAATTCCACTACTTACTTGCCTTCTTTCTCTTTTCAGCTTTGTGCTGTTA 38268290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3558 GCCTCACTTACAATTCCACTACTTACTTGCCTTCTTTCTCTTTTCAGCTTTGTGCTGTTA 3617

 38268291 TTTAATATCTCACCAGTTGTGTAATTTCAGCTCCCAAATTGAATAAGACGTTCCCCCCAG 38268350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3618 TTTAATATCTCACCAGTTGTGTAATTTCAGCTCCCAAATTGAATAAGACGTTCCCCCCAG 3677

 38268351 TGGAACCCTCACCTTGACAAATAGCCAAATAGTA---ATTATTCCTTTCAGGGGTTGAGC 38268407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||
     3678 TGGAACCCTCACCTTGACAAATAGCCAAATAGTAATTATTATTCCTTTCAGGGGTTGAGC 3737

 38268408 TATGGAATCATGCTTGCAATATCCCAGGCTTGAGTGCCTAGATATTTATGCTATACTTCC 38268467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3738 TATGGAATCATGCTTGCAATATCCCAGGCTTGAGTGCCTAGATATTTATGCTATACTTCC 3797

 38268468 CTGTGTCGGAGTTTCCATCTGCGATTGTATTTCAAGCCCTCTCATTTTTTTTTTCAATAT 38268527
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
     3798 CTGTGTCGGAGTTTCCATCTGCGATTGTATTTCAAGCCCTCTCA-TTTTTTTTTCAATAT 3856

 38268528 GATTAAGATAATTCCTTTATGAAGTTGGAAACTCAGACATTCAGAAAGAAACTTGACGTT 38268587
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3857 GATTAAGATAATTCCTTTATGAAGCTGGAAACTCAGACATTCAGAAAGAAACTTGACGTT 3916

 38268588 TCATATTTTTGCTAACTTGCTCTTCCCATTTCCTTTCCTATCATTTTAGCCAGACTGAGG 38268647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3917 TCATATTTTTGCTAACTTGCTCTTCCCATTTCCTTTCCTATCATTTTAGCCAGACTGAGG 3976

 38268648 GAGAATTAATTTTGCAATGGTCTCTATTTTTTTTTCCAAATGTGTGACCTCCATATTAAT 38268707
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3977 GAGAATTAATTTTGCAACGGTCTCTATTTTTTTTTCCAAATGTGTGACCTCCATATTAAT 4036

 38268708 AGGAGCCAGAGTACTCATTCATCACATCTGGTCAGTGTGAAACTGACATTTACAGGGTGG 38268767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4037 AGGAGCCAGAGTACTCATTCATCACATCTGGTCAGTGTGAAACTGACATTTACAGGGTGG 4096

 38268768 AATGTTTCCCACTCAGGACAAATGGGGATCATTTGTAAAACATGCCGCACCCAATCATAG 38268827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     4097 AATGTTTCCCACTCAGGACAAATGGGGATCATTTGTAAAACATGCCACACCCAATCATAG 4156

 38268828 GTTCCCATGGATCTCCAACTACATTTTTAAGCAACAATATAAACCATTCCCGAAACTGAA 38268887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4157 GTTCCCATGGATCTCCAACTACATTTTTAAGCAACAATATAAACCATTCCCGAAACTGAA 4216

 38268888 AGGTCTTTTCAAATATTTACTGCCTACCTATGGAATTTTTATTCTGCTTGCTGCTGCCAT 38268947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4217 AGGTCTTTTCAAATATTTACTGCCTACCTATGGAATTTTTATTCTGCTTGCTGCTGCCAT 4276

 38268948 CAATAATCCTGGGAGTTCCTAGCTAAGTGTTGTGTATGACCTCCAAGGAAAGTCTTAGCA 38269007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4277 CAATAATCCTGGGAGTTCCTAGCTAAGTGTTGTGTATGACCTCCAAGGAAAGTCTTAGCA 4336

 38269008 TTGCAGAATGGGGAGGCGGGTTAGTATCC 38269036
          |||||||||||||||||||||||||||||
     4337 TTGCAGAATGGGGAGGCGGGTTAGTATCC 4365

Alignment time is 4.11523 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38249892,38276749] =>     26858 nucs '18 dna:chromosome chromosome:GRCh37:18:1:78077248:1'
Second seq [       1,    4314] =>      4314 nucs 'mol-32-3004-380182_4314'

Score:        4097
Aligned:      4312        nucs
Identic:      4290 ( 99%) nucs =>      2311 ( 99%)      1979 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38257051,38259376] EXCISED REGION [38259381,38261364]
 second seq =>  [       1,    2326] EXCISED REGION [    2331,    4314]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         4 nucs [38259377,38259380]
 second seq =>         4 nucs [2327,2330]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [2327,2327] to [2331,2331]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 38257051 CAGAAATTCATCCTACCACCACCTTCTGTATCTCATTTCTTCTTGTTTCTCCTTTTTGCA 38257110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CAGAAATTCATCCTACCACCACCTTCTGTATCTCATTTCTTCTTGTTTCTCCTTTTTGCA 60

 38257111 GCAGAGAATGTGACCCTGCGGTCCCCTGAAGTCAGTTTCTCCAAACGTGGACTTTACTTT 38257170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCAGAGAATGTGACCCTGCGGTCCCCTGAAGTCAGTTTCTCCAAACGTGGACTTTACTTT 120

 38257171 CTCAACACATTTGTTCCTTCAGTTATTCCCACTGTAGCAACTTTGTCTCTGTCTCTCAAT 38257230
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
      121 CTCAACACATTTGTTCCTTCAGTTATTCCCACTGTAGCAACTTTGTCTCTGTCTCTCAAC 180

 38257231 TAGATAATTCCTACTGACAAATAGGCTATAACACCTCACATCTTTAAAAGAATACACATT 38257290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TAGATAATTCCTACTGACAAATAGGCTATAACACCTCACATCTTTAAAAGAATACACATT 240

 38257291 TCATGTAATTGCTGTCTGCACCAGTATCTCCAATTCTTTATCTCCTATTATCTTTGTCAA 38257350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCATGTAATTGCTGTCTGCACCAGTATCTCCAATTCTTTATCTCCTATTATCTTTGTCAA 300

 38257351 CCCTCTCCAGCCTGCCTACTGTTCCCACTACCCTACTCAATTCCTCCCGCCAAGGCATTG 38257410
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCCTCTCCAGCCTGCCTACTGTTCCCACTACTCTACTCAATTCCTCCCGCCAAGGCATTG 360

 38257411 TTGGTCCTTACCTTTCAAAACTTTTTTTTGTTTTTGTTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCT 38257470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTGGTCCTTACCTTTCAAAACTTTTTTTTGTTTTTGTTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCT 420

 38257471 GTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGATCTCTGCTTACTGCAACCTCCACCTCACCAG 38257530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGATCTCTGCTTACTGCAACCTCCACCTCACCAG 480

 38257531 TTCAAGTGATTCACTAGTCTGAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGACACATGCCACCA 38257590
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
      481 TTCAAGTGATTCACTAGTCTGAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGCACATGCCACCA 540

 38257591 TGCCCGGCTAATTTTTGCATTTTTAGTAGAGACGAGGTTTCACCATGCTGGTCAGGCTGG 38257650
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGCTCGGCTAATTTTTGCATTTTTAGTAGAGACGAGGTTTCACCATGCTGGTCAGGCTGG 600

 38257651 TCTCAAACTCCTGACCTCGTGATCCGCTTGCCTTGGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACCG 38257710
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCTCAAACTCCTGACCTCGTGATCCGCCTGCCTTGGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACCG 660

 38257711 GCGTGAGCCACTGCGCCCATAGAAAAGATTAGTTCTTTCTGAACTTTTAAACACCATTCA 38257770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GCGTGAGCCACTGCGCCCATAGAAAAGATTAGTTCTTTCTGAACTTTTAAACACCATTCA 720

 38257771 GCAGTGTTCACCATTCTCTCTAACTTAAAACACTGTCCCTCATAACATATTTAAAAAATT 38257830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GCAGTGTTCACCATTCTCTCTAACTTAAAACACTGTCCCTCATAACATATTTAAAAAATT 780

 38257831 CTATTTCTTACTGTTATTTCTCAGATTCTTGTATAGGCCACAGTTCTTTCAGTAGAACTC 38257890
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATATTTCTTACTGTTATTTCTCAGATTCTTGTATAGGCCACAGTTCTTTCAGTAGAACTC 840

 38257891 TAACCAATTTCCGTACATGTAAGTATCATAAATATACTAATGACTCTGAACATTATATAT 38257950
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TAACCAATTTCCATACATGTAAGTATCATAAATATACTAATGACTCTGAACATTATATAT 900

 38257951 CTTGCCTCATGCATGAATACCCAAATGTTTTCCTGTAATCACAAAATGAACATCTCAAAG 38258010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTTGCCTCATGCATGAATACCCAAATGTTTTCCTGTAATCACAAAATGAACATCTCAAAG 960

 38258011 TGACCACAAATTTGACATGTTCCGAAGTAATTAAATTTTGATATTCTCTGCCAAAAGCTG 38258070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGACCACAAATTTGACATGTTCCGAAGTAATTAAATTTTGATATTCTCTGCCAAAAGCTG 1020

 38258071 CTCTAGAAATTTTGCCACTCCTTCTTCATCTTAGAAAATGCTATTATTCTCCACCAAAGG 38258130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     1021 CTCTAGAAATTTTGCCACTCCTTCTTCATCTTAGAAAATGCTATCATTCTCCACCAAAGG 1080

 38258131 CAAATAACCAAGAGTCATTACTAGAAAATTTGTCTCCTTTACCACTCATGCCCAATATAG 38258190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CAAATAACCAAGAGTCATTACTAGAAAATTTGTCTCCTTTACCACTCATGCCCAATATAG 1140

 38258191 ATCAAATTCTTTAAGATCTTTTCCTCAATAAACCTCAAGTCTGTCACCTTTTCTATTACC 38258250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATCAAATTCTTTAAGATCTTTTCCTCAATAAATCTCAAGTCTGTCACCTTTTCTATTACC 1200

 38258251 ACATTTTTTCTAAGTCTCAATCATCTCTCAATTAGATCATTATAGTAATCTTCTAAGTGG 38258310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ACATTTTTTCTAAGTCTCAATCATCTCTCAATTAGATCATTATAGTAATCTTCTAAGTGG 1260

 38258311 TGTTGGGGTGTCGTCTCCCGGCTACTTCAATCCATTTTCCAATATTAAGTTTATTTGTTT 38258370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGTTGGGGTGTCGTCTCCCGGCTACTTCAATCCATTTTCCAATATTAAGTTTATTTGTTT 1320

 38258371 AATTAAACATGTTAACTTGTGGTGCTCTTATGCTTAAAAAGTTTCATTAGCTTTCTATTT 38258430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AATTAAACATGTTAACTTGTGGTGCTCTTATGCTTAAAAAGTTTCATTAGCTTTCTATTT 1380

 38258431 ATATAATGAATGAAACCAATGTTTAGCCTAGTTTAAGAAATGTAAGAACTCCTTTTACCC 38258490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     1381 ATATAATGAATGAAACCAATGTTTAGCCTAGTTTAAGAAATGTAAGAACTCCCTTTACCC 1440

 38258491 TAGCTTTCTTCCTGTTTACTTTTATTCATCATGCCTTGAATCATACCTATCTTCTTTAAT 38258550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1441 TAGCTTTCTTCCTGTTTACTTTTATTCATCATGCCTCGAATCATACCTATCTTCTTTAAT 1500

 38258551 TTTCTCTAACACAAAATCCTCCTGTTTCTTCTTTGCAATCCTGCAAACCCAAACCCAGCA 38258610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTTCTCTAACACAAAATCCTCCTGTTTCTTCTTTGCAATCCTGCAAACCCAAACCCAGCA 1560

 38258611 GCTAGTAAATATTCAATATATATGAATTAATTAATTGATGAATGAGTGATTTTATTTCAG 38258670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GCTAGTAAATATTCAATATATATGAATTAATTAATTGATGAATGAGTGATTTTATTTCAG 1620

 38258671 ATTGCTATCAAATGCTCAATTCCCCTGCATAGTATCTCCAATGAGTCAAATCCTGGAATT 38258730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ATTGCTATCAAATGCTCAATTCCCCTGCATAGTATCTCCAATGAGTCAAATCCTGGAATT 1680

 38258731 CCCTATAGGAACACCTGGGATATATAGTATCAACTTACAAATACCATTCTTTCTTAATTT 38258790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CCCTATAGGAACACCTGGGATATATAGTATCAACTTACAAATACCATTCTTTCTTAATTT 1740

 38258791 TGAAAGAAAAACTGAGTAAAATATGAGAGCTGTAGCTTTTAAAAAAAATAGAAAATACAC 38258850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGAAAGAAAAACTGAGTAAAATATGAGAGCTGTAGCTTTTAAAAAAAATAGAAAATACAC 1800

 38258851 CATAAAAATTTTAGTCAAGCATGGCAGACTAAATACATGTATTTATTTCTAATCTACTTC 38258910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CATAAAAATTTTAGTCAAGCATGGCAGACTAAATACATGTATTTATTTCTAATCTACTTC 1860

 38258911 AAGCTCCAATATAATAACTGTTTACAAATGAAATGGTCTAATATCACAAGTTCAAAATTA 38258970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AAGCTCCAATATAATAACTGTTTACAAATGAAATGGTCTAATATCACAAGTTCAAAATTA 1920

 38258971 ATAAGAGTGGATGAGACATGCCAACAAATTTTTGGAATGTAAAAATAGATAAGACATTGT 38259030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ATAAGAGTGGATGAGACATGCCAACAAATTTTTGGAATGTAAAAATAGATAAGACATTGT 1980

 38259031 TAATGATTTGACAAAGCACAAAGCCTTAAAATATTTCTGTATAGAGAGAAGTTTCCAAAG 38259090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TAATGATTTGACAAAGCACAAAGCCTTAAAATATTTCTGTATAGAGAGAAGTTTCCAAAG 2040

 38259091 TAGGGCAACTCAGAGATAAATCAAGAATGGGAAGATTCACACACCTCAACTGTAAAAGAG 38259150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TAGGGCAACTCAGAGATAAATCAAGAATGGGAAGATTCACACACCTCAACTGTAAAAGAG 2100

 38259151 AAATATGAGACTAAAAGCAGTGGATTAATTAAAACTTTGTTTGATGAGATATTATACATA 38259210
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AAATATGAGACTAAAAGCAGTGGATTCATTAAAACTTTGTTTGATGAGATATTATACATA 2160

 38259211 GATGTCTTCTCCATCATTCCAAGCACTTAAGCAGCTGCCCTTTCCAAACACTCATAGAGG 38259270
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     2161 GATGTCTTCTCCATCATTCCAAGCACTTAAGCAGCTGCCCTTTACAAACACTCATAGAGG 2220

 38259271 ATAAGAGATTATTTTCTATAAAAATCAAACCAGATTGTTG--TGTACATCAAGCAAAGGA 38259328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||
     2221 ATAAGAGATTATTTTCTATAAAAATCAAACCAGATTGT--CATGTACATCAAGCAAAGGA 2278

 38259329 GGGATGGCAGGGAGGTGATATACTGAAACAGAATTACTGTATGAAAAC 38259376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 GGGATGGCAGGGAGGTGATATACTGAAACAGAATTACTGTATGAAAAC 2326

EXCISED REGION

 38259381 AATGAACAATTAGATACTCAGTTCTCCTTACCTGCACAGTAATAGTAATTCTTACTACCA 38259440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2331 AATGAACAATTAGATACTCAGTTCTCCTTACCTGCACAGTAATAGTAATTCTTACTACCA 2390

 38259441 GACTGGATGCTGGAGGGCTCTCCTTCAGAGAAACAGAAAAGAAAAAAAAGCCTATAGCCA 38259500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2391 GACTGGATGCTGGAGGGCTCTCCTTCAGAGAAACAGAAAAGAAAAAAAAGCCTATAGCCA 2450

 38259501 CTAATATTTGAATCTCTGCAATTAAATACCTGGGTCCCTTCCCAATCATATAGCAGTGAT 38259560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2451 CTAATATTTGAATCTCTGCAATTAAATACCTGGGTCCCTTCCCAATCATATAGCAGTGAT 2510

 38259561 GCTCACCAGTTAACAAGAACTGAAGACACATGACAGATTCCAATCAGTGATTTATTACCA 38259620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2511 GCTCACCAGTTAACAAGAACTGAAGACACATGACAGATTCCAATCAGTGATTTATTACCA 2570

 38259621 CTGTCAAATAAGAATGGACACTCAAAGATTACCTGAAAAAGTCCTTTAATATGGCCCCAG 38259680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2571 CTGTCAAATAAGAATGGACACTCAAAGATTACCTGAAAAAGTCCTTTAATATGGCCCCAG 2630

 38259681 ATTGAATAATTCCTAATTTCCTATATCATAAATTCAAAAATTATCTAAAATTCAGTGAAA 38259740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2631 ATTGAATAATTCCTAATTTCCTATATCATAAATTCAAAAATTATCTAAAATTCAGTGAAA 2690

 38259741 TTAGTCCATATTATCAATGCCAACCTTACACATAAACAGAGTTGACATTCTCTTATGATG 38259800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2691 TTAGTCCATATTATCAATGCCAACCTTACACATAAACAGAGTTGACATTCTCTTATGATG 2750

 38259801 CTGAACAATGCAGATGAAGAACGCTGGCTTTGGATTAAGAAGACCCTTAGTTTGAATTTT 38259860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2751 CTGAACAATGCAGATGAAGAACGCTGGCTTTGGATTAAGAAGACCCTTAGTTTGAATTTT 2810

 38259861 AATTTTGACCCATGATAGCTGTGTAAACTTAGTCAAAATTCTTCAGTTATTGAGCTGATG 38259920
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     2811 AATTTTGACCCATGATAGCTGTGTAAACTTAGTAAAAATTCTTCAGTTATTGAGCTGATG 2870

 38259921 CTTTAGCCTGAGTTAAACAGAGAACAGAGCCTAAGGTAGAGGGTTTCTATTCTATTCTTT 38259980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2871 CTTTAGCCTGAGTTAAACAGAGAACAGAGCCTAAGGTAGAGGGTTTCTATTCTATTCTTT 2930

 38259981 CATAATGGATTGCTGGGCAAGATAACAAAAGCAATGGATAAGCACAGAAATGCAGGGCAG 38260040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2931 CATAATGGATTGCTGGGCAAGATAACAAAAGCAATGGATAAGCACAGAAATGCAGGGCAG 2990

 38260041 AAGAGAGAGCCATGAGGAAGATATATTATCAGGGTGGTTGCCATTAAGTGAAACCAGTTA 38260100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2991 AAGAGAGAGCCATGAGGAAGATATATTATCAGGGTGGTTGCCATTAAGTGAAACCAGTTA 3050

 38260101 CCCAGTTTAATGGAATTATCCCCAGGGAGCAAGGTCTGTGGCATCTCAAGACTCTTTATC 38260160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     3051 CCCAGTTTAATGGAATTATCCCCAGGGAGCAAGGTCAGTGGCATCTCAAGACTCTTTATC 3110

 38260161 AAAGAGGAGAATGGGAGAAAAATCATCTTTTTTGTATTTCCTACTGTTCAAAAGTTTGTC 38260220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3111 AAAGAGGAGAATGGGAGAAAAATCATCTTTTTTGTATTTCCTACTGTTCAAAAGTTTGTC 3170

 38260221 CCTTGCTTTCCTGGTTATGAATGCATGGAAGTCTAGTTGAAGTCCAGCAAAGACATCAAC 38260280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     3171 CCTTGCTTTCCTGGTTATGAATGCATGGAAGTCTAGTTGAAGTCCACCAAAGACATCAAC 3230

 38260281 AAGGAATCATAGGAAAGAGATAAAAGGCCTGAGACATGGATATAAGGGAAGGTAGTGTTA 38260340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3231 AAGGAATCATAGGAAAGAGATAAAAGGCCTGAGACATGGATATAAGGGAAGGTAGTGTTA 3290

 38260341 AGTGGCACCTTTTTGGGAGTCCAAACTGAGCAGGAGTAAAACTGAAGCAACTGCTTTAAC 38260400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3291 AGTGGCACCTTTTTGGGAGTCCAAACTGAGCAGGAGTAAAACTGAAGCAACTGCTTTAAC 3350

 38260401 TAAGACATGTGTGCCCACAAAGACCTGAAGTGACACATGAGCTTTCACAGTTTTTTAACT 38260460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3351 TAAGACATGTGTGCCCACAAAGACCTGAAGTGACACATGAGCTTTCACAGTTTTTTAACT 3410

 38260461 GTAAAATGGTAATGATATCACCTATGTTTCTGGATTACTACAAATATTAAATAGCATAAA 38260520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3411 GTAAAATGGTAATGATATCACCTATGTTTCTGGATTACTACAAATATTAAATAGCATAAA 3470

 38260521 TGGCACACTTGCAAAGCATATTTTAATAAACATATTTAATATTTCCCTTATTGATTTCTT 38260580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3471 TGGCACACTTGCAAAGCATATTTTAATAAACATATTTAATATTTCCCTTATTGATTTCTT 3530

 38260581 TAATCAATAAAAGCATTTCTGAAATTTGTGTAAAGGTCTAGATGAAGGGACATTGGACAT 38260640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3531 TAATCAATAAAAGCATTTCTGAAATTTGTGTAAAGGTCTAGATGAAGGGACATTGGACAT 3590

 38260641 GCTTTGATAATCATTGAGACTGGGTGATAGATAAATGATTGTCATGGTCTTTACTTTGAT 38260700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3591 GCTTTGATAATCATTGAGACTGGGTGATAGATAAATGATTGTCATGGTCTTTACTTTGAT 3650

 38260701 ATGCATGTTTGACATCTTTGTAAACATAGTTTTAAAAATAATATTTGTAAAATTTAAAAA 38260760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3651 ATGCATGTTTGACATCTTTGTAAACATAGTTTTAAAAATAATATTTGTAAAATTTAAAAA 3710

 38260761 CAGAAACAAATAATTCTGATTTCAAAGGTCAACTAATAGACTCCTAGTCATGTCAGGATA 38260820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3711 CAGAAACAAATAATTCTGATTTCAAAGGTCAACTAATAGACTCCTAGTCATGTCAGGATA 3770

 38260821 TCAATGCCTATCTCATTCACTTTCTGGTGCTTAAAAAATAATAAAAGTAATTATTTCCCA 38260880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3771 TCAATGCCTATCTCATTCACTTTCTGGTGCTTAAAAAATAATAAAAGTAATTATTTCCCA 3830

 38260881 ATCTTCACTTTCTACAATGCTAAACTATTTATTTCTCCTTTTCTGAGCCCACATGCTTTC 38260940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     3831 ATCTTCACTTTCTACAATGCTAAACTATTTATTTGTCCTTTTCTGAGCCCACATGCTTTC 3890

 38260941 CTCAATGAATGTTACCGAGATGGAATTTATATCTTATATTTCAGGTGTATTTACATTCAT 38261000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3891 CTCAATGAATGTTACCGAGATGGAATTTATATCTTATATTTCAGGTGTATTTACATTCAT 3950

 38261001 TTCTTCCCCACTATGTTGCAAACAAGTTGTTTTGCCCATTTGTTCTTATCCTGAGGTCAT 38261060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3951 TTCTTCCCCACTATGTTGCAAACAAGTTGTTTTGCCCATTTGTTCTTATCCTGAGGTCAT 4010

 38261061 GAAAACATCTAACTCTACTATCTTCCAGAAGCTATATTGTCTTGCCTTTGACCTTAAGGA 38261120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4011 GAAAACATCTAACTCTACTATCTTCCAGAAGCTATATTGTCTTGCCTTTGACCTTAAGGA 4070

 38261121 TTATGGTCTTGAATTAATTTTTGTATGTGTAAGTGACCACACAAACTTGTTAGAAATCTA 38261180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4071 TTATGGTCTTGAATTAATTTTTGTATGTGTAAGTGACCACACAAACTTGTTAGAAATCTA 4130

 38261181 GTTTCAAGTATTTTTTTCATATGGATTCAAATTACACCACCAGTACACGCATATTGAAAA 38261240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     4131 GTTTCAAGTATTTTTTTCATATGGATTCAAATTACACCACCAGTACACACATATTGAAAA 4190

 38261241 AAAGTATTTTTCTACTGTTTTGCAATGGAAATATTGATATAAATCAAGTACCCATATATG 38261300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4191 AAAGTATTTTTCTACTGTTTTGCAATGGAAATATTGATATAAATCAAGTACCCATATATG 4250

 38261301 CACAGGTCAGTTTATGAACTTGCTATTTTGTTGTACTGGTTTGTTTGTATATATTTTTTG 38261360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4251 CACAGGTCAGTTTATGAACTTGCTATTTTGTTGTACTGGTTTGTTTGTATATATTTTTTG 4310

 38261361 CCCT 38261364
          ||||
     4311 CCCT 4314

Alignment time is 3.95758 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38249892,38276749] =>     26858 nucs '18 dna:chromosome chromosome:GRCh37:18:1:78077248:1'
Second seq [       1,    2781] =>      2781 nucs 'mol-32-3004-380545_2781'

Score:        2646
Aligned:      2782        nucs
Identic:      2768 ( 99%) nucs =>      1794 ( 99%)       974 (100%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38264443,38266242] EXCISED REGION [38266251,38267228]
 second seq =>  [       1,    1803] EXCISED REGION [    1804,    2781]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         8 nucs [38266243,38266250]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         8 nucs [38266243,38266250] to [38266251,38266258]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [38266242,38266242] to [38266251,38266251]
 second seq =>         1 nucs [1803,1803] to [1804,1804]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 38264443 TATCAACAATCTCAATGTTTAAGAGAAGCCCTCAAGCCAGAATTTCCAACAGTTGCAGAT 38264502
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
        1 TATCAACAATCTCAATGTTTAAGAGAAGCCCTCAATCCAGAATTTCCAACAGTTGCAGAT 60

 38264503 AAAACATTGTGCTTGCTTAACGTATTTAACCAAAAGACCCGAAAAGCAAGGATATAAAAG 38264562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAAACATTGTGCTTGCTTAACGTATTTAACCAAAAGACCCGAAAAGCAAGGATATAAAAG 120

 38264563 AATATTTTAATAATATCATTCTGTTCTTAAGGTGAACACTTCAAAGAAACCACACCCCTC 38264622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AATATTTTAATAATATCATTCTGTTCTTAAGGTGAACACTTCAAAGAAACCACACCCCTC 180

 38264623 CCCTCCCCAATGCGTGCTGAAGCAGTGGAATCCATGAGTGGAACCTTGTCATATATAATC 38264682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCCTCCCCAATGCGTGCTGAAGCAGTGGAATCCATGAGTGGAACCTTGTCATATATAATC 240

 38264683 TCCACACTAAATTTATAGCAAAGCCCCCATCTCTCAACCTGTGTTGAAATTCTGACTTCC 38264742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCCACACTAAATTTATAGCAAAGCCCCCATCTCTCAACCTGTGTTGAAATTCTGACTTCC 300

 38264743 AGACACACCTTTCAGTAATGAGGAGGTACTCTTCCATGATAAACCCTGTGGGCAAAGCTT 38264802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGACACACCTTTCAGTAATGAGGAGGTACTCTTCCATGATAAACCCTGTGGGCAAAGCTT 360

 38264803 CCACATTCATCCCACCCCTAAAGCAATAAATTTGCACCTTTCCCAAGTAGAATCAATGGG 38264862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CCACATTCATCCCACCCCTAAAGCAATAAATTTGCACCTTTCCCAAGTAGAATCAATGGG 420

 38264863 AAGAATTTTGACTTCTATCCCCACCTGATGGTAATGAGGCAGTATCTCTCTCTTTTTCCA 38264922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAGAATTTTGACTTCTATCCCCACCTGATGGTAATGAGGCAGTATCTCTCTCTTTTTCCA 480

 38264923 GACAGTGTTTAAGAATTTGTTGTATAGAGCGCTATTACCTGAATAACACATTGTGGCAGA 38264982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GACAGTGTTTAAGAATTTGTTGTATAGAGCGCTATTACCTGAATAACACATTGTGGCAGA 540

 38264983 GCAAAATAACCCTTAAGCATTTAGTTTTCAGATTTATTTTCAACTATTTAGAGGGTTATT 38265042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GCAAAATAACCCTTAAGCATTTAGTTTTCAGATTTATTTTCAACTATTTAGAGGGTTATT 600

 38265043 TCTTGACTACCACAGATAAGTCATTCCCTTCTCCATTGTTCTATAGTTTACTGCCCTTTT 38265102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCTTGACTACCACAGATAAGTCATTCCCTTCTCCATTGTTCTATAGTTTACTGCCCTTTT 660

 38265103 TTTCTATCATGGCATTTACCCACTATTTCATATTGTTATTTATAGTTTACATGCTTAATA 38265162
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
      661 TTTCTATCATGGCATTTACCCACTATTTCATATTGTTATTTTTAGTTTACATGCTTAATA 720

 38265163 TCTCCATCTCCCAACAAATATGGGAACATCATTAGGTCAGAGAAATTTTATTTCTTTTCC 38265222
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
      721 TCTCCATCTCCCAACAAATATGGGAACATCATTAGGTCAGAGAAATTTTATTTCTTTCCC 780

 38265223 CTCTGAAGTCTCAGTATTAGTTGTTACATTAATTAGCACTTATTTAAATTTTTAGTTTTC 38265282
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTCTGAAGTCTCAGTACTAGTTGTTACATTAATTAGCACTTATTTAAATTTTTAGTTTTC 840

 38265283 TTTTTCTTTGCCTCATGTTACTGTTACACCCTTCCACTACCAAGCTTAAAGTTAGGAATG 38265342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTTTTCTTTGCCTCATGTTACTGTTACACCCTTCCACTACCAAGCTTAAAGTTAGGAATG 900

 38265343 ATTCATGTGACTGGAATTGAATGACTGCTCTGAGAAAGAAGTCCATAAAAGTCTGCATGC 38265402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATTCATGTGACTGGAATTGAATGACTGCTCTGAGAAAGAAGTCCATAAAAGTCTGCATGC 960

 38265403 AATTTGCCATGTCTCCATCCTTTCTTTGCCATAGAAACTAAAGATCTTCCAGATAGTCGA 38265462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AATTTGCCATGTCTCCATCCTTTCTTTGCCATAGAAACTAAAGATCTTCCAGATAGTCGA 1020

 38265463 GGCTCTGTTAATGTTATTTCTTGAATAACGACTATCTGAACAGAACATCTGTGACTTGGA 38265522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GGCTCTGTTAATGTTATTTCTTGAATAACGACTATCTGAACAGAACATCTGTGACTTGGA 1080

 38265523 ATGGGGACATGTAGCTTGGAGAAAAAGTAAGCACACAGTGTTTTAAGTTACTGTGGTTTT 38265582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATGGGGACATGTAGCTTGGAGAAAAAGTAAGCACACAGTGTTTTAAGTTACTGTGGTTTT 1140

 38265583 ATGGTTATTTGTTACTGCAGCATAACCCACCCTGCCCTGACTTAAGTGATATAATATTTA 38265642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATGGTTATTTGTTACTGCAGCATAACCCACCCTGCCCTGACTTAAGTGATATAATATTTA 1200

 38265643 ACAAATATTTATAAAATAAATAAATTCAAATTCACTCTAATACCTAGAAAATTATCAAGT 38265702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ACAAATATTTATAAAATAAATAAATTCAAATTCACTCTAATACCTAGAAAATTATCAAGT 1260

 38265703 ATAGTAAACCAAATAATAAATATTTATTAAGGAATATGGAAACAGTGACCTATGAGAAGT 38265762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATAGTAAACCAAATAATAAATATTTATTAAGGAATATGGAAACAGTGACCTATGAGAAGT 1320

 38265763 CTTGATATACTGACCATCCATTGTTGCAGCAGATCTCACTATTGCTATTGTGCTTAACAT 38265822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CTTGATATACTGACCATCCATTGTTGCAGCAGATCTCACTATTGCTATTGTGCTTAACAT 1380

 38265823 TTCAATTACAAAAATTAAAAAAAAAAAA-CACCATTCATCAGTGCAGGTCTGTGTATTTA 38265881
          |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTCAATTACAAAAATTAAAAAAAAAAAAACACCATTCATCAGTGCAGGTCTGTGTATTTA 1440

 38265882 AAGAAATAATTTACAAGTTTTTTTTTCCTTTGTAAACATATTGTTTTGAAGTGCAAATAT 38265941
          ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AAGAAATAATTTACAAGTTTTTTTT-CCTTTGTAAACATATTGTTTTGAAGTGCAAATAT 1499

 38265942 ATATAATTTGCACTTTGGGATGGAATGGAATGGGATGCCCTATTGGCAGTCCATACATCT 38266001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 ATATAATTTGCACTTTGGGATGGAATGGAATGGGATGCCCTATTGGCAGTCCATACATCT 1559

 38266002 GGATTATAAATGGATTTCCATCCCATCTTCCTCCCCATCTCTTTCCCTTTTTGATCATTC 38266061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 GGATTATAAATGGATTTCCATCCCATCTTCCTCCCCATCTCTTTCCCTTTTTGATCATTC 1619

 38266062 TATGGAAATGGAAAGCTAGCAGAAGTTTGAAGAATTGTCACGCAAACAACAACAACAA-- 38266119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  
     1620 TATGGAAATGGAAAGCTAGCAGAAGTTTGAAGAATTGTCACGCAAACAACAACAACAACA 1679

 38266120 -AACTTTAGCATATTAACCTGTTGTCCAACCTTATATAAGCAGTTTGTATTTAAAACATC 38266178
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 AAACTTTAGCATATTAACCTGTTGTCCAACCTTATATAAGCAGTTTGTATTTAAAACATC 1739

 38266179 CCTAAGTGGATTTTAATTCCAGTTTCAATCATTGTTAACTATTTTTGAAATATTTAAAAT 38266238
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 CCTAAGTGGATTTTAATTCCAATTTCAATCATTGTTAACTATTTTTGAAATATTTAAAAT 1799

 38266239 CCCA 38266242
          ||||
     1800 CCCA 1803

EXCISED REGION

 38266251 ACCACTATTTCTCTTCAACTAGTCCTTACTTTTATAAACAAAAAAGTAACAGTAAATAAT 38266310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1804 ACCACTATTTCTCTTCAACTAGTCCTTACTTTTATAAACAAAAAAGTAACAGTAAATAAT 1863

 38266311 TTATAACTAGGTCTCTCTGAATCTAAAAACACGTTCTTATACACTATGTGATGCCATATT 38266370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     1864 TTATAACTAGGTCTCTCTGAATCTAAAAACACATTCTTATACACTATGTGATGCCATATT 1923

 38266371 TTTTACTCTTGTCTTTGTGAGTTTTTTGTGCCATTCTCTCCTCTGGAATGGTCTTCTGTG 38266430
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1924 TTTTACTCTTGACTTTGTGAGTTTTTTGTGCCATTCTCTCCTCTGGAATGGTCTTCTGTG 1983

 38266431 CTTACACATTCCAAGGGCTACTCCATTTTACAAGAAACAGTTCATGTTTGCTACTTTGGG 38266490
          .|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1984 TTTACACATTCCAAGGGCTAATCCATTTTACAAGAAACAGTTCATGTTTGCTACTTTGGG 2043

 38266491 GTTGATCCCATGATAATTCTGGTTCTCACTTGGTCTTTCCCTGTGAGATGCAGTAGCATT 38266550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2044 GTTGATCCCATGATAATTCTGGTTCTCACTTGGTCTTTCCCTGTGAGATGCAGTAGCATT 2103

 38266551 CAAAATTCTCAGACTATTCTATGCACCTTGGCAGATTTATGGTAATGGTCTATAATTGCT 38266610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2104 CAAAATTCTCAGACTATTCTATGCACCTTGGCAGATTTATGGTAATGGTCTATAATTGCT 2163

 38266611 TCATATCTGCTAACCTTGCTTCCAAAACTAGTTTTTGAGATTAATGAGACAGGAGCTTGG 38266670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2164 TCATATCTGCTAACCTTGCTTCCAAAACTAGTTTTTGAGATTAATGAGACAGGAGCTTGG 2223

 38266671 CTTTTTCTTTCTGTATAGCTTCCATAGCAACAAGAAAATATTAGACACACAGTAGGCATT 38266730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2224 CTTTTTCTTTCTGTATAGCTTCCATAGCAACAAGAAAATATTAGACACACAGTAGGCATT 2283

 38266731 GGAAGAAAATGTGTTCAGTTAAATGAACTTGATTTGAATGGAATGAGAGTTCAATGAAAC 38266790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2284 GGAAGAAAATGTGTTCAGTTAAATGAACTTGATTTGAATGGAATGAGAGTTCAATGAAAC 2343

 38266791 TGTATATATTGTGAAACGTGGCAACTTACACCTACTCAAGACATTAAAAGAGATCATGCT 38266850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2344 TGTATATATTGTGAAACGTGGCAACTTACACCTACTCAAGACATTAAAAGAGATCATGCT 2403

 38266851 TTCTTGCCTAAGTTTTATGTCCAATTTGTTCCTGTTTCAAACCCCTCGACAAAAACAAAA 38266910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2404 TTCTTGCCTAAGTTTTATGTCCAATTTGTTCCTGTTTCAAACCCCTCGACAAAAACAAAA 2463

 38266911 TCTTTTAATCTGTTTGCAAAATATTTCCTCCTTCCTCCCATCTTGCTGTTGCTGCTCTGT 38266970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2464 TCTTTTAATCTGTTTGCAAAATATTTCCTCCTTCCTCCCATCTTGCTGTTGCTGCTCTGT 2523

 38266971 GATATACTGCCCTTGCTTATTACCCCTTTATAGCTGTTTTGTTAAAGTTCATACCGCTAA 38267030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2524 GATATACTGCCCTTGCTTATTACCCCTTTATAGCTGTTTTGTTAAAGTTCATACCGCTAA 2583

 38267031 GACCTGTAAAAGAAATTTATGGCTCTAGGGATTTCAGCAAATTCTAAATAACCATAACAG 38267090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2584 GACCTGTAAAAGAAATTTATGGCTCTAGGGATTTCAGCAAATTCTAAATAACCATAACAG 2643

 38267091 GAACAGGAAGCATTAATTAAAGACACTAGAGTCTAAGTTATAACAGAAATCCTGACATTT 38267150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2644 GAACAGGAAGCATTAATTAAAGACACTAGAGTCTAAGTTATAACAGAAATCCTGACATTT 2703

 38267151 AAGGCCCTGGTACCATTTAAATTTAAAATGGTATGACAAACAGAGAGTAATTTGATGGTC 38267210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2704 AAGGCCCTGGTACCATTTAAATTTAAAATGGTATGACAAACAGAGAGTAATTTGATGGTC 2763

 38267211 AGAAGGTTATAATGGATA 38267228
          ||||||||||||||||||
     2764 AGAAGGTTATAATGGATA 2781

Alignment time is 2.5874 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38249892,38276749] =>     26858 nucs '18 dna:chromosome chromosome:GRCh37:18:1:78077248:1'
Second seq [       1,    4590] =>      4590 nucs 'mol-32-3025-124164_4590'

Score:        4396
Aligned:      4593        nucs
Identic:      4571 (100%) nucs =>      2203 ( 99%)      2368 (100%)
Gaps:            8 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38257680,38259892] EXCISED REGION [38266750,38269124]
 second seq =>  [       1,    2213] EXCISED REGION [    2214,    4590]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6857 nucs [38259893,38266749]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [38259893,38259893] to [38266750,38266750]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [38259893,38259893] to [38266749,38266749]
 second seq =>         0 nucs

 38257680 GCCTTGGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACCGGCGTGAGCCACTGCGCCCATAGAAAAGAT 38257739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCCTTGGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACCGGCGTGAGCCACTGCGCCCATAGAAAAGAT 60

 38257740 TAGTTCTTTCTGAACTTTTAAACACCATTCAGCAGTGTTCACCATTCTCTCTAACTTAAA 38257799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAGTTCTTTCTGAACTTTTAAACACCATTCAGCAGTGTTCACCATTCTCTCTAACTTAAA 120

 38257800 ACACTGTCCCTCATAACATATTTAAAAAATTCTATTTCTTACTGTTATTTCTCAGATTCT 38257859
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACACTGTCCCTCATAACATATTTAAAAAATTATATTTCTTACTGTTATTTCTCAGATTCT 180

 38257860 TGTATAGGCCACAGTTCTTTCAGTAGAACTCTAACCAATTTCCGTACATGTAAGTATCAT 38257919
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
      181 TGTATAGGCCACAGTTCTTTCAGTAGAACTCTAACCAATTTCCATACATGTAAGTATCAT 240

 38257920 AAATATACTAATGACTCTGAACATTATATATCTTGCCTCATGCATGAATACCCAAATGTT 38257979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAATATACTAATGACTCTGAACATTATATATCTTGCCTCATGCATGAATACCCAAATGTT 300

 38257980 TTCCTGTAATCACAAAATGAACATCTCAAAGTGACCACAAATTTGACATGTTCCGAAGTA 38258039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTCCTGTAATCACAAAATGAACATCTCAAAGTGACCACAAATTTGACATGTTCCGAAGTA 360

 38258040 ATTAAATTTTGATATTCTCTGCCAAAAGCTGCTCTAGAAATTTTGCCACTCCTTCTTCAT 38258099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATTAAATTTTGATATTCTCTGCCAAAAGCTGCTCTAGAAATTTTGCCACTCCTTCTTCAT 420

 38258100 CTTAGAAAATGCTATTATTCTCCACCAAAGGCAAATAACCAAGAGTCATTACTAGAAAAT 38258159
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTTAGAAAATGCTATCATTCTCCACCAAAGGCAAATAACCAAGAGTCATTACTAGAAAAT 480

 38258160 TTGTCTCCTTTACCACTCATGCCCAATATAGATCAAATTCTTTAAGATCTTTTCCTCAAT 38258219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTGTCTCCTTTACCACTCATGCCCAATATAGATCAAATTCTTTAAGATCTTTTCCTCAAT 540

 38258220 AAACCTCAAGTCTGTCACCTTTTCTATTACCACATTTTTTCTAAGTCTCAATCATCTCTC 38258279
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAATCTCAAGTCTGTCACCTTTTCTATTACCACATTTTTTCTAAGTCTCAATCATCTCTC 600

 38258280 AATTAGATCATTATAGTAATCTTCTAAGTGGTGTTGGGGTGTCGTCTCCCGGCTACTTCA 38258339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AATTAGATCATTATAGTAATCTTCTAAGTGGTGTTGGGGTGTCGTCTCCCGGCTACTTCA 660

 38258340 ATCCATTTTCCAATATTAAGTTTATTTGTTTAATTAAACATGTTAACTTGTGGTGCTCTT 38258399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATCCATTTTCCAATATTAAGTTTATTTGTTTAATTAAACATGTTAACTTGTGGTGCTCTT 720

 38258400 ATGCTTAAAAAGTTTCATTAGCTTTCTATTTATATAATGAATGAAACCAATGTTTAGCCT 38258459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATGCTTAAAAAGTTTCATTAGCTTTCTATTTATATAATGAATGAAACCAATGTTTAGCCT 780

 38258460 AGTTTAAGAAATGTAAGAACTCCTTTTACCCTAGCTTTCTTCCTGTTTACTTTTATTCAT 38258519
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGTTTAAGAAATGTAAGAACTCCCTTTACCCTAGCTTTCTTCCTGTTTACTTTTATTCAT 840

 38258520 CATGCCTTGAATCATACCTATCTTCTTTAATTTTCTCTAACACAAAATCCTCCTGTTTCT 38258579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CATGCCTTGAATCATACCTATCTTCTTTAATTTTCTCTAACACAAAATCCTCCTGTTTCT 900

 38258580 TCTTTGCAATCCTGCAAACCCAAACCCAGCAGCTAGTAAATATTCAATATATATGAATTA 38258639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TCTTTGCAATCCTGCAAACCCAAACCCAGCAGCTAGTAAATATTCAATATATATGAATTA 960

 38258640 ATTAATTGATGAATGAGTGATTTTATTTCAGATTGCTATCAAATGCTCAATTCCCCTGCA 38258699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATTAATTGATGAATGAGTGATTTTATTTCAGATTGCTATCAAATGCTCAATTCCCCTGCA 1020

 38258700 TAGTATCTCCAATGAGTCAAATCCTGGAATTCCCTATAGGAACACCTGGGATATATAGTA 38258759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TAGTATCTCCAATGAGTCAAATCCTGGAATTCCCTATAGGAACACCTGGGATATATAGTA 1080

 38258760 TCAACTTACAAATACCATTCTTTCTTAATTTTGAAAGAAAAACTGAGTAAAATATGAGAG 38258819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TCAACTTACAAATACCATTCTTTCTTAATTTTGAAAGAAAAACTGAGTAAAATATGAGAG 1140

 38258820 CTGTAGCTTTTAAAAAAAATAGAAAATACACCATAAAAATTTTAGTCAAGCATGGCAGAC 38258879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTGTAGCTTTTAAAAAAAATAGAAAATACACCATAAAAATTTTAGTCAAGCATGGCAGAC 1200

 38258880 TAAATACATGTATTTATTTCTAATCTACTTCAAGCTCCAATATAATAACTGTTTACAAAT 38258939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TAAATACATGTATTTATTTCTAATCTACTTCAAGCTCCAATATAATAACTGTTTACAAAT 1260

 38258940 GAAATGGTCTAATATCACAAGTTCAAAATTAATAAGAGTGGATGAGACATGCCAACAAAT 38258999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GAAATGGTCTAATATCACAAGTTCAAAATTAATAAGAGTGGATGAGACATGCCAACAAAT 1320

 38259000 TTTTGGAATGTAAAAATAGATAAGACATTGTTAATGATTTGACAAAGCACAAAGCCTTAA 38259059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTTTGGAATGTAAAAATAGATAAGACATTGTTAATGATTTGACAAAGCACAAAGCCTTAA 1380

 38259060 AATATTTCTGTATAGAGAGAAGTTTCCAAAGTAGGGCAACTCAGAGATAAATCAAGAATG 38259119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AATATTTCTGTATAGAGAGAAGTTTCCAAAGTAGGGCAACTCAGAGATAAATCAAGAATG 1440

 38259120 GGAAGATTCACACACCTCAACTGTAAAAGAGAAATATGAGACTAAAAGCAGTGGATTAAT 38259179
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     1441 GGAAGATTCACACACCTCAACTGTAAAAGAGAAATATGAGACTAAAAGCAGTGGATTCAT 1500

 38259180 TAAAACTTTGTTTGATGAGATATTATACATAGATGTCTTCTCCATCATTCCAAGCACTTA 38259239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TAAAACTTTGTTTGATGAGATATTATACATAGATGTCTTCTCCATCATTCCAAGCACTTA 1560

 38259240 AGCAGCTGCCCTTTCCAAACACTCATAGAGGATAAGAGATTATTTTCTATAAAAATCAAA 38259299
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AGCAGCTGCCCTTTACAAACACTCATAGAGGATAAGAGATTATTTTCTATAAAAATCAAA 1620

 38259300 CCAGATTGTTG--TGTACATCAAGCAAAGGAGGGATGGCAGGGAGGTGATATACTGAAAC 38259357
          |||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CCAGATTGT--CATGTACATCAAGCAAAGGAGGGATGGCAGGGAGGTGATATACTGAAAC 1678

 38259358 AGAATTACTGTATGAAAACCTGGAATGAACAATTAGATACTCAGTTCTCCTTACCTGCAC 38259417
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1679 AGAATTACTGTATGAAAACATGGAATGAACAATTAGATACTCAGTTCTCCTTACCTGCAC 1738

 38259418 AGTAATAGTAATTCTTACTACCAGACTGGATGCTGGAGGGCTCTCCTTCAGAGAAACAGA 38259477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1739 AGTAATAGTAATTCTTACTACCAGACTGGATGCTGGAGGGCTCTCCTTCAGAGAAACAGA 1798

 38259478 AAAGAAAAAAAAGCCTATAGCCACTAATATTTGAATCTCTGCAATTAAATACCTGGGTCC 38259537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1799 AAAGAAAAAAAAGCCTATAGCCACTAATATTTGAATCTCTGCAATTAAATACCTGGGTCC 1858

 38259538 CTTCCCAATCATATAGCAGTGATGCTCACCAGTTAACAAGAACTGAAGACACATGACAGA 38259597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 CTTCCCAATCATATAGCAGTGATGCTCACCAGTTAACAAGAACTGAAGACACATGACAGA 1918

 38259598 TTCCAATCAGTGATTTATTACCACTGTCAAATAAGAATGGACACTCAAAGATTACCTGAA 38259657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 TTCCAATCAGTGATTTATTACCACTGTCAAATAAGAATGGACACTCAAAGATTACCTGAA 1978

 38259658 AAAGTCCTTTAATATGGCCCCAGATTGAATAATTCCTAATTTCCTATATCATAAATTCAA 38259717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 AAAGTCCTTTAATATGGCCCCAGATTGAATAATTCCTAATTTCCTATATCATAAATTCAA 2038

 38259718 AAATTATCTAAAATTCAGTGAAATTAGTCCATATTATCAATGCCAACCTTACACATAAAC 38259777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 AAATTATCTAAAATTCAGTGAAATTAGTCCATATTATCAATGCCAACCTTACACATAAAC 2098

 38259778 AGAGTTGACATTCTCTTATGATGCTGAACAATGCAGATGAAGAACGCTGGCTTTGGATTA 38259837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 AGAGTTGACATTCTCTTATGATGCTGAACAATGCAGATGAAGAACGCTGGCTTTGGATTA 2158

 38259838 AGAAGACCCTTAGTTTGAATTTTAATTTTGACCCATGATAGCTGTGTAAACTTAG 38259892
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 AGAAGACCCTTAGTTTGAATTTTAATTTTGACCCATGATAGCTGTGTAAACTTAG 2213

EXCISED REGION

 38266750 TAAATGAACTTGATTTGAATGGAATGAGAGTTCAATGAAACTGTATATATTGTGAAACGT 38266809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2214 TAAATGAACTTGATTTGAATGGAATGAGAGTTCAATGAAACTGTATATATTGTGAAACGT 2273

 38266810 GGCAACTTACACCTACTCAAGACATTAAAAGAGATCATGCTTTCTTGCCTAAGTTTTATG 38266869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2274 GGCAACTTACACCTACTCAAGACATTAAAAGAGATCATGCTTTCTTGCCTAAGTTTTATG 2333

 38266870 TCCAATTTGTTCCTGTTTCAAACCCCTCGACAAAAACAAAATCTTTTAATCTGTTTGCAA 38266929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2334 TCCAATTTGTTCCTGTTTCAAACCCCTCGACAAAAACAAAATCTTTTAATCTGTTTGCAA 2393

 38266930 AATATTTCCTCCTTCCTCCCATCTTGCTGTTGCTGCTCTGTGATATACTGCCCTTGCTTA 38266989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2394 AATATTTCCTCCTTCCTCCCATCTTGCTGTTGCTGCTCTGTGATATACTGCCCTTGCTTA 2453

 38266990 TTACCCCTTTATAGCTGTTTTGTTAAAGTTCATACCGCTAAGACCTGTAAAAGAAATTTA 38267049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2454 TTACCCCTTTATAGCTGTTTTGTTAAAGTTCATACCGCTAAGACCTGTAAAAGAAATTTA 2513

 38267050 TGGCTCTAGGGATTTCAGCAAATTCTAAATAACCATAACAGGAACAGGAAGCATTAATTA 38267109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2514 TGGCTCTAGGGATTTCAGCAAATTCTAAATAACCATAACAGGAACAGGAAGCATTAATTA 2573

 38267110 AAGACACTAGAGTCTAAGTTATAACAGAAATCCTGACATTTAAGGCCCTGGTACCATTTA 38267169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2574 AAGACACTAGAGTCTAAGTTATAACAGAAATCCTGACATTTAAGGCCCTGGTACCATTTA 2633

 38267170 AATTTAAAATGGTATGACAAACAGAGAGTAATTTGATGGTCAGAAGGTTATAATGGATAC 38267229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2634 AATTTAAAATGGTATGACAAACAGAGAGTAATTTGATGGTCAGAAGGTTATAATGGATAC 2693

 38267230 CTTAATACCTTTGCCAAGAAAAAGTGTCTGTCCTTGCTCTAACCCCTACCCAGGGGCTTC 38267289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     2694 CTTAATACCTTTGCCAAGAAAAAGTGTCTGTCCTTGCTCTAATCCCTACCCAGGGGCTTC 2753

 38267290 AGGGGCCTCCTTCATAAAACATGGTGATGCCTAAATATTTTTGCGATATCTCATATATAA 38267349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2754 AGGGGCCTCCTTCATAAAACATGGTGATGCCTAAATATTTTTGCGATATCTCATATATAA 2813

 38267350 GCTGGTCTTTTCTTTAAGAATACGAGAGATTAAACACCAACCCCCAACATTCATACACCA 38267409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2814 GCTGGTCTTTTCTTTAAGAATACGAGAGATTAAACACCAACCCCCAACATTCATACACCA 2873

 38267410 ATTTTCAGATAAAACAGCTTAATATTTAAGATATATTTAGTGCAATTTGTCTATTTCTTG 38267469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2874 ATTTTCAGATAAAACAGCTTAATATTTAAGATATATTTAGTGCAATTTGTCTATTTCTTG 2933

 38267470 GTTTACTGGAGGGCTGTATTTAAAGCCAAGGGACCAAGGAACATTCCACAACACACTAAA 38267529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2934 GTTTACTGGAGGGCTGTATTTAAAGCCAAGGGACCAAGGAACATTCCACAACACACTAAA 2993

 38267530 GCAATTTTTCCCCAGGGAATATGCTGATTCTTTCCTAAAGGCAGAAGCCGACATTCCTGA 38267589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2994 GCAATTTTTCCCCAGGGAATATGCTGATTCTTTCCTAAAGGCAGAAGCCGACATTCCTGA 3053

 38267590 CTCATTCTGCCAAACCAAGCAATGAAAAATGCTTCACCTAATTTGAAAGATAATTTGTAA 38267649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3054 CTCATTCTGCCAAACCAAGCAATGAAAAATGCTTCACCTAATTTGAAAGATAATTTGTAA 3113

 38267650 TACCAGAGACTCAACTTGTTTTGTGTATCCAATACTAGCACCCTTTCCAGAATGTTGAAA 38267709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3114 TACCAGAGACTCAACTTGTTTTGTGTATCCAATACTAGCACCCTTTCCAGAATGTTGAAA 3173

 38267710 GTACACACTGTATGATTTGTCTAATGTATATTCAAAAAAGGAATACAAATTGATCCTCAA 38267769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3174 GTACACACTGTATGATTTGTCTAATGTATATTCAAAAAAGGAATACAAATTGATCCTCAA 3233

 38267770 AGTTCAAATCTGCAGTACATACTCTGTGTTCTGCCCCCACCCGTACCTTCATGAATTCTT 38267829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3234 AGTTCAAATCTGCAGTACATACTCTGTGTTCTGCCCCCACCCGTACCTTCATGAATTCTT 3293

 38267830 TCACCTAGCACGCAGGCTGTTTTCCCTTTGCGAAATCCCATGGTACATTTATAGTATTAA 38267889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3294 TCACCTAGCACGCAGGCTGTTTTCCCTTTGCGAAATCCCATGGTACATTTATAGTATTAA 3353

 38267890 TACCACTCACTTAGAATATGCCGTATTTTGTCTAATATTGCTAGATTTTGTGTGTATAAT 38267949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3354 TACCACTCACTTAGAATATGCCGTATTTTGTCTAATATTGCTAGATTTTGTGTGTATAAT 3413

 38267950 CTTATTCCTCAAGTAAATTACAAGACAAGGACTATAATTTATACATCCTCTACAACACTT 38268009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3414 CTTATTCCTCAAGTAAATTACAAGACAAGGACTATAATTTATACATCCTCTACAACACTT 3473

 38268010 GACACTGGCTTTGATTAGGCTCTTAATAAATATTTGTTGGTTGATTAATCAGTTGACCAC 38268069
          |.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3474 GGCACTGGCTTTGAGTAGGCTCTTAATAAATATTTGTTGGTTGATTAATCAGTTGACCAC 3533

 38268070 ACTTACTAATTGCAAGGTGACATCATTTATCATTAATAAACATATATGTGGATTACAAAA 38268129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3534 ACTTACTAATTGCAAGGTGACATCATTTATCATTAATAAACATATATGTGGATTACAAAA 3593

 38268130 ATATCATGTGAATTTGCATATAATCATATTAATCCCAAATTAGCACCTGAGAGTCCAACC 38268189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3594 ATATCATGTGAATTTGCATATAATCATATTAATCCCAAATTAGCACCTGAGAGTCCAACC 3653

 38268190 ACCCTCTCCTTTAGGCCCTTTTCACTTTTATGTCTACTTTTGCCTCACTTACAATTCCAC 38268249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3654 ACCCTCTCCTTTAGGCCCTTTTCACTTTTATGTCTACTTTTGCCTCACTTACAATTCCAC 3713

 38268250 TACTTACTTGCCTTCTTTCTCTTTTCAGCTTTGTGCTGTTATTTAATATCTCACCAGTTG 38268309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3714 TACTTACTTGCCTTCTTTCTCTTTTCAGCTTTGTGCTGTTATTTAATATCTCACCAGTTG 3773

 38268310 TGTAATTTCAGCTCCCAAATTGAATAAGACGTTCCCCCCAGTGGAACCCTCACCTTGACA 38268369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3774 TGTAATTTCAGCTCCCAAATTGAATAAGACGTTCCCCCCAGTGGAACCCTCACCTTGACA 3833

 38268370 AATAGCCAAATAGTA---ATTATTCCTTTCAGGGGTTGAGCTATGGAATCATGCTTGCAA 38268426
          |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3834 AATAGCCAAATAGTAATTATTATTCCTTTCAGGGGTTGAGCTATGGAATCATGCTTGCAA 3893

 38268427 TATCCCAGGCTTGAGTGCCTAGATATTTATGCTATACTTCCCTGTGTCGGAGTTTCCATC 38268486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3894 TATCCCAGGCTTGAGTGCCTAGATATTTATGCTATACTTCCCTGTGTCGGAGTTTCCATC 3953

 38268487 TGCGATTGTATTTCAAGCCCTCTCATTTTTTTTTTCAATATGATTAAGATAATTCCTTTA 38268546
          ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3954 TGCGATTGTATTTCAAGCCCTCTCA-TTTTTTTTTCAATATGATTAAGATAATTCCTTTA 4012

 38268547 TGAAGTTGGAAACTCAGACATTCAGAAAGAAACTTGACGTTTCATATTTTTGCTAACTTG 38268606
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4013 TGAAGCTGGAAACTCAGACATTCAGAAAGAAACTTGACGTTTCATATTTTTGCTAACTTG 4072

 38268607 CTCTTCCCATTTCCTTTCCTATCATTTTAGCCAGACTGAGGGAGAATTAATTTTGCAATG 38268666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     4073 CTCTTCCCATTTCCTTTCCTATCATTTTAGCCAGACTGAGGGAGAATTAATTTTGCAACG 4132

 38268667 GTCTCTATTTTTTTTTCCAAATGTGTGACCTCCATATTAATAGGAGCCAGAGTACTCATT 38268726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4133 GTCTCTATTTTTTTTTCCAAATGTGTGACCTCCATATTAATAGGAGCCAGAGTACTCATT 4192

 38268727 CATCACATCTGGTCAGTGTGAAACTGACATTTACAGGGTGGAATGTTTCCCACTCAGGAC 38268786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4193 CATCACATCTGGTCAGTGTGAAACTGACATTTACAGGGTGGAATGTTTCCCACTCAGGAC 4252

 38268787 AAATGGGGATCATTTGTAAAACATGCCGCACCCAATCATAGGTTCCCATGGATCTCCAAC 38268846
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     4253 AAATGGGGATCATTTGTAAAACATGCCACACCCAATCATAGGTTCCCATGGATCTCCAAC 4312

 38268847 TACATTTTTAAGCAACAATATAAACCATTCCCGAAACTGAAAGGTCTTTTCAAATATTTA 38268906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4313 TACATTTTTAAGCAACAATATAAACCATTCCCGAAACTGAAAGGTCTTTTCAAATATTTA 4372

 38268907 CTGCCTACCTATGGAATTTTTATTCTGCTTGCTGCTGCCATCAATAATCCTGGGAGTTCC 38268966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4373 CTGCCTACCTATGGAATTTTTATTCTGCTTGCTGCTGCCATCAATAATCCTGGGAGTTCC 4432

 38268967 TAGCTAAGTGTTGTGTATGACCTCCAAGGAAAGTCTTAGCATTGCAGAATGGGGAGGCGG 38269026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4433 TAGCTAAGTGTTGTGTATGACCTCCAAGGAAAGTCTTAGCATTGCAGAATGGGGAGGCGG 4492

 38269027 GTTAGTATCCTGCATTTTTCATTCTGTCACTTTCTAGGGACAATTACAAAGAAAATAATC 38269086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4493 GTTAGTATCCTGCATTTTTCATTCTGTCACTTTCTAGGGACAATTACAAAGAAAATAATC 4552

 38269087 ATATAAGACTTATTTTTATGTTTATTATGAAAGCCTTC 38269124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4553 ATATAAGACTTATTTTTATGTTTATTATGAAAGCCTTC 4590

Alignment time is 4.24378 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38249892,38276749] =>     26858 nucs '18 dna:chromosome chromosome:GRCh37:18:1:78077248:1'
Second seq [       1,    2214] =>      2214 nucs 'mol-32-3025-124164_2214'

Score:        2124
Aligned:      2212        nucs
Identic:      2204 (100%) nucs =>      1622 (100%)       582 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38257680,38259308] EXCISED REGION [38259311,38259893]
 second seq =>  [       1,    1629] EXCISED REGION [    1632,    2214]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [38259309,38259310]
 second seq =>         2 nucs [1630,1631]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [38259309,38259311] to [38259311,38259313]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [38259306,38259308] to [38259311,38259313]
 second seq =>         3 nucs [1627,1629] to [1632,1634]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 38257680 GCCTTGGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACCGGCGTGAGCCACTGCGCCCATAGAAAAGAT 38257739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCCTTGGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACCGGCGTGAGCCACTGCGCCCATAGAAAAGAT 60

 38257740 TAGTTCTTTCTGAACTTTTAAACACCATTCAGCAGTGTTCACCATTCTCTCTAACTTAAA 38257799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAGTTCTTTCTGAACTTTTAAACACCATTCAGCAGTGTTCACCATTCTCTCTAACTTAAA 120

 38257800 ACACTGTCCCTCATAACATATTTAAAAAATTCTATTTCTTACTGTTATTTCTCAGATTCT 38257859
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACACTGTCCCTCATAACATATTTAAAAAATTATATTTCTTACTGTTATTTCTCAGATTCT 180

 38257860 TGTATAGGCCACAGTTCTTTCAGTAGAACTCTAACCAATTTCCGTACATGTAAGTATCAT 38257919
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
      181 TGTATAGGCCACAGTTCTTTCAGTAGAACTCTAACCAATTTCCATACATGTAAGTATCAT 240

 38257920 AAATATACTAATGACTCTGAACATTATATATCTTGCCTCATGCATGAATACCCAAATGTT 38257979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAATATACTAATGACTCTGAACATTATATATCTTGCCTCATGCATGAATACCCAAATGTT 300

 38257980 TTCCTGTAATCACAAAATGAACATCTCAAAGTGACCACAAATTTGACATGTTCCGAAGTA 38258039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTCCTGTAATCACAAAATGAACATCTCAAAGTGACCACAAATTTGACATGTTCCGAAGTA 360

 38258040 ATTAAATTTTGATATTCTCTGCCAAAAGCTGCTCTAGAAATTTTGCCACTCCTTCTTCAT 38258099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATTAAATTTTGATATTCTCTGCCAAAAGCTGCTCTAGAAATTTTGCCACTCCTTCTTCAT 420

 38258100 CTTAGAAAATGCTATTATTCTCCACCAAAGGCAAATAACCAAGAGTCATTACTAGAAAAT 38258159
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTTAGAAAATGCTATCATTCTCCACCAAAGGCAAATAACCAAGAGTCATTACTAGAAAAT 480

 38258160 TTGTCTCCTTTACCACTCATGCCCAATATAGATCAAATTCTTTAAGATCTTTTCCTCAAT 38258219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTGTCTCCTTTACCACTCATGCCCAATATAGATCAAATTCTTTAAGATCTTTTCCTCAAT 540

 38258220 AAACCTCAAGTCTGTCACCTTTTCTATTACCACATTTTTTCTAAGTCTCAATCATCTCTC 38258279
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAATCTCAAGTCTGTCACCTTTTCTATTACCACATTTTTTCTAAGTCTCAATCATCTCTC 600

 38258280 AATTAGATCATTATAGTAATCTTCTAAGTGGTGTTGGGGTGTCGTCTCCCGGCTACTTCA 38258339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AATTAGATCATTATAGTAATCTTCTAAGTGGTGTTGGGGTGTCGTCTCCCGGCTACTTCA 660

 38258340 ATCCATTTTCCAATATTAAGTTTATTTGTTTAATTAAACATGTTAACTTGTGGTGCTCTT 38258399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATCCATTTTCCAATATTAAGTTTATTTGTTTAATTAAACATGTTAACTTGTGGTGCTCTT 720

 38258400 ATGCTTAAAAAGTTTCATTAGCTTTCTATTTATATAATGAATGAAACCAATGTTTAGCCT 38258459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATGCTTAAAAAGTTTCATTAGCTTTCTATTTATATAATGAATGAAACCAATGTTTAGCCT 780

 38258460 AGTTTAAGAAATGTAAGAACTCCTTTTACCCTAGCTTTCTTCCTGTTTACTTTTATTCAT 38258519
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGTTTAAGAAATGTAAGAACTCCCTTTACCCTAGCTTTCTTCCTGTTTACTTTTATTCAT 840

 38258520 CATGCCTTGAATCATACCTATCTTCTTTAATTTTCTCTAACACAAAATCCTCCTGTTTCT 38258579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CATGCCTTGAATCATACCTATCTTCTTTAATTTTCTCTAACACAAAATCCTCCTGTTTCT 900

 38258580 TCTTTGCAATCCTGCAAACCCAAACCCAGCAGCTAGTAAATATTCAATATATATGAATTA 38258639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TCTTTGCAATCCTGCAAACCCAAACCCAGCAGCTAGTAAATATTCAATATATATGAATTA 960

 38258640 ATTAATTGATGAATGAGTGATTTTATTTCAGATTGCTATCAAATGCTCAATTCCCCTGCA 38258699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATTAATTGATGAATGAGTGATTTTATTTCAGATTGCTATCAAATGCTCAATTCCCCTGCA 1020

 38258700 TAGTATCTCCAATGAGTCAAATCCTGGAATTCCCTATAGGAACACCTGGGATATATAGTA 38258759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TAGTATCTCCAATGAGTCAAATCCTGGAATTCCCTATAGGAACACCTGGGATATATAGTA 1080

 38258760 TCAACTTACAAATACCATTCTTTCTTAATTTTGAAAGAAAAACTGAGTAAAATATGAGAG 38258819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TCAACTTACAAATACCATTCTTTCTTAATTTTGAAAGAAAAACTGAGTAAAATATGAGAG 1140

 38258820 CTGTAGCTTTTAAAAAAAATAGAAAATACACCATAAAAATTTTAGTCAAGCATGGCAGAC 38258879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTGTAGCTTTTAAAAAAAATAGAAAATACACCATAAAAATTTTAGTCAAGCATGGCAGAC 1200

 38258880 TAAATACATGTATTTATTTCTAATCTACTTCAAGCTCCAATATAATAACTGTTTACAAAT 38258939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TAAATACATGTATTTATTTCTAATCTACTTCAAGCTCCAATATAATAACTGTTTACAAAT 1260

 38258940 GAAATGGTCTAATATCACAAGTTCAAAATTAATAAGAGTGGATGAGACATGCCAACAAAT 38258999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GAAATGGTCTAATATCACAAGTTCAAAATTAATAAGAGTGGATGAGACATGCCAACAAAT 1320

 38259000 TTTTGGAATGTAAAAATAGATAAGACATTGTTAATGATTTGACAAAGCACAAAGCCTTAA 38259059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTTTGGAATGTAAAAATAGATAAGACATTGTTAATGATTTGACAAAGCACAAAGCCTTAA 1380

 38259060 AATATTTCTGTATAGAGAGAAGTTTCCAAAGTAGGGCAACTCAGAGATAAATCAAGAATG 38259119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AATATTTCTGTATAGAGAGAAGTTTCCAAAGTAGGGCAACTCAGAGATAAATCAAGAATG 1440

 38259120 GGAAGATTCACACACCTCAACTGTAAAAGAGAAATATGAGACTAAAAGCAGTGGATTAAT 38259179
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     1441 GGAAGATTCACACACCTCAACTGTAAAAGAGAAATATGAGACTAAAAGCAGTGGATTCAT 1500

 38259180 TAAAACTTTGTTTGATGAGATATTATACATAGATGTCTTCTCCATCATTCCAAGCACTTA 38259239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TAAAACTTTGTTTGATGAGATATTATACATAGATGTCTTCTCCATCATTCCAAGCACTTA 1560

 38259240 AGCAGCTGCCCTTTCCAAACACTCATAGAGGATAAGAGATTATTTTCTATAAAAATCAAA 38259299
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AGCAGCTGCCCTTTACAAACACTCATAGAGGATAAGAGATTATTTTCTATAAAAATCAAA 1620

 38259300 CCAGATTGT 38259308
          |||||||||
     1621 CCAGATTGT 1629

EXCISED REGION

 38259311 TGTACATCAAGCAAAGGAGGGATGGCAGGGAGGTGATATACTGAAACAGAATTACTGTAT 38259370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1632 TGTACATCAAGCAAAGGAGGGATGGCAGGGAGGTGATATACTGAAACAGAATTACTGTAT 1691

 38259371 GAAAACCTGGAATGAACAATTAGATACTCAGTTCTCCTTACCTGCACAGTAATAGTAATT 38259430
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1692 GAAAACATGGAATGAACAATTAGATACTCAGTTCTCCTTACCTGCACAGTAATAGTAATT 1751

 38259431 CTTACTACCAGACTGGATGCTGGAGGGCTCTCCTTCAGAGAAACAGAAAAGAAAAAAAAG 38259490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1752 CTTACTACCAGACTGGATGCTGGAGGGCTCTCCTTCAGAGAAACAGAAAAGAAAAAAAAG 1811

 38259491 CCTATAGCCACTAATATTTGAATCTCTGCAATTAAATACCTGGGTCCCTTCCCAATCATA 38259550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1812 CCTATAGCCACTAATATTTGAATCTCTGCAATTAAATACCTGGGTCCCTTCCCAATCATA 1871

 38259551 TAGCAGTGATGCTCACCAGTTAACAAGAACTGAAGACACATGACAGATTCCAATCAGTGA 38259610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1872 TAGCAGTGATGCTCACCAGTTAACAAGAACTGAAGACACATGACAGATTCCAATCAGTGA 1931

 38259611 TTTATTACCACTGTCAAATAAGAATGGACACTCAAAGATTACCTGAAAAAGTCCTTTAAT 38259670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1932 TTTATTACCACTGTCAAATAAGAATGGACACTCAAAGATTACCTGAAAAAGTCCTTTAAT 1991

 38259671 ATGGCCCCAGATTGAATAATTCCTAATTTCCTATATCATAAATTCAAAAATTATCTAAAA 38259730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1992 ATGGCCCCAGATTGAATAATTCCTAATTTCCTATATCATAAATTCAAAAATTATCTAAAA 2051

 38259731 TTCAGTGAAATTAGTCCATATTATCAATGCCAACCTTACACATAAACAGAGTTGACATTC 38259790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2052 TTCAGTGAAATTAGTCCATATTATCAATGCCAACCTTACACATAAACAGAGTTGACATTC 2111

 38259791 TCTTATGATGCTGAACAATGCAGATGAAGAACGCTGGCTTTGGATTAAGAAGACCCTTAG 38259850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2112 TCTTATGATGCTGAACAATGCAGATGAAGAACGCTGGCTTTGGATTAAGAAGACCCTTAG 2171

 38259851 TTTGAATTTTAATTTTGACCCATGATAGCTGTGTAAACTTAGT 38259893
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2172 TTTGAATTTTAATTTTGACCCATGATAGCTGTGTAAACTTAGT 2214

Alignment time is 2.06245 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38249892,38276749] =>     26858 nucs '18 dna:chromosome chromosome:GRCh37:18:1:78077248:1'
Second seq [       1,    3569] =>      3569 nucs 'mol-32-3025-207173_3569'

Score:        3398
Aligned:      3577        nucs
Identic:      3555 ( 99%) nucs =>      2044 ( 99%)      1511 (100%)
Gaps:           12 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38264186,38266242] EXCISED REGION [38266251,38267766]
 second seq =>  [       1,    2053] EXCISED REGION [    2054,    3569]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         8 nucs [38266243,38266250]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         8 nucs [38266243,38266250] to [38266251,38266258]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [38266242,38266242] to [38266251,38266251]
 second seq =>         1 nucs [2053,2053] to [2054,2054]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 38264186 TTTTGCTACTGGTTTGTTTGTTTAGCTACATTTAGGGAAAATTTCATTTCTGAGACGACA 38264245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTTGCTACTGGTTTGTTTGTTTAGCTACATTTAGGGAAAATTTCATTTCTGAGACGACA 60

 38264246 GAGGAAGCACATTCCATTTTATTCCTTCTGCTAATGACAAAAAAAAAAAAAAATTGGAAA 38264305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||
       61 GAGGAAGCACATTCCATTTTATTCCTTCTGCTAATGACAAAAAAAAAAAA---TTGGAAA 117

 38264306 AAACACAAAAGCCAGAGTCAAAAGACTCTGAAAAATGGAGAAAAAGTGCAGACAGGCTAA 38264365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      118 AAACACAAAAGCCAGAGTCAAAAGACTCTGAAAAATGGAGAAAAAGTGCAGACAGGCTAA 177

 38264366 GGATTTGGGAGATTGAGGAACAACGACAGGTGAGTTCTCTGTCTTTTTTTTTCTTTCTTT 38264425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      178 GGATTTGGGAGATTGAGGAACAACGACAGGTGAGTTCTCTGTCTTTTTTTTTCTTTCTTT 237

 38264426 TTTGATATATATATATATATCAACAATCTCAATGTTTAAGAGAAGCCCTCAAGCCAGAAT 38264485
          ||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
      238 TTTGATATATATATAT----CAACAATCTCAATGTTTAAGAGAAGCCCTCAATCCAGAAT 293

 38264486 TTCCAACAGTTGCAGATAAAACATTGTGCTTGCTTAACGTATTTAACCAAAAGACCCGAA 38264545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      294 TTCCAACAGTTGCAGATAAAACATTGTGCTTGCTTAACGTATTTAACCAAAAGACCCGAA 353

 38264546 AAGCAAGGATATAAAAGAATATTTTAATAATATCATTCTGTTCTTAAGGTGAACACTTCA 38264605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      354 AAGCAAGGATATAAAAGAATATTTTAATAATATCATTCTGTTCTTAAGGTGAACACTTCA 413

 38264606 AAGAAACCACACCCCTCCCCTCCCCAATGCGTGCTGAAGCAGTGGAATCCATGAGTGGAA 38264665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      414 AAGAAACCACACCCCTCCCCTCCCCAATGCGTGCTGAAGCAGTGGAATCCATGAGTGGAA 473

 38264666 CCTTGTCATATATAATCTCCACACTAAATTTATAGCAAAGCCCCCATCTCTCAACCTGTG 38264725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      474 CCTTGTCATATATAATCTCCACACTAAATTTATAGCAAAGCCCCCATCTCTCAACCTGTG 533

 38264726 TTGAAATTCTGACTTCCAGACACACCTTTCAGTAATGAGGAGGTACTCTTCCATGATAAA 38264785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      534 TTGAAATTCTGACTTCCAGACACACCTTTCAGTAATGAGGAGGTACTCTTCCATGATAAA 593

 38264786 CCCTGTGGGCAAAGCTTCCACATTCATCCCACCCCTAAAGCAATAAATTTGCACCTTTCC 38264845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      594 CCCTGTGGGCAAAGCTTCCACATTCATCCCACCCCTAAAGCAATAAATTTGCACCTTTCC 653

 38264846 CAAGTAGAATCAATGGGAAGAATTTTGACTTCTATCCCCACCTGATGGTAATGAGGCAGT 38264905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      654 CAAGTAGAATCAATGGGAAGAATTTTGACTTCTATCCCCACCTGATGGTAATGAGGCAGT 713

 38264906 ATCTCTCTCTTTTTCCAGACAGTGTTTAAGAATTTGTTGTATAGAGCGCTATTACCTGAA 38264965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      714 ATCTCTCTCTTTTTCCAGACAGTGTTTAAGAATTTGTTGTATAGAGCGCTATTACCTGAA 773

 38264966 TAACACATTGTGGCAGAGCAAAATAACCCTTAAGCATTTAGTTTTCAGATTTATTTTCAA 38265025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      774 TAACACATTGTGGCAGAGCAAAATAACCCTTAAGCATTTAGTTTTCAGATTTATTTTCAA 833

 38265026 CTATTTAGAGGGTTATTTCTTGACTACCACAGATAAGTCATTCCCTTCTCCATTGTTCTA 38265085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      834 CTATTTAGAGGGTTATTTCTTGACTACCACAGATAAGTCATTCCCTTCTCCATTGTTCTA 893

 38265086 TAGTTTACTGCCCTTTTTTTCTATCATGGCATTTACCCACTATTTCATATTGTTATTTAT 38265145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
      894 TAGTTTACTGCCCTTTTTTTCTATCATGGCATTTACCCACTATTTCATATTGTTATTTTT 953

 38265146 AGTTTACATGCTTAATATCTCCATCTCCCAACAAATATGGGAACATCATTAGGTCAGAGA 38265205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      954 AGTTTACATGCTTAATATCTCCATCTCCCAACAAATATGGGAACATCATTAGGTCAGAGA 1013

 38265206 AATTTTATTTCTTTTCCCTCTGAAGTCTCAGTATTAGTTGTTACATTAATTAGCACTTAT 38265265
          ||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     1014 AATTTTATTTCTTTCCCCTCTGAAGTCTCAGTACTAGTTGTTACATTAATTAGCACTTAT 1073

 38265266 TTAAATTTTTAGTTTTCTTTTTCTTTGCCTCATGTTACTGTTACACCCTTCCACTACCAA 38265325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1074 TTAAATTTTTAGTTTTCTTTTTCTTTGCCTCATGTTACTGTTACACCCTTCCACTACCAA 1133

 38265326 GCTTAAAGTTAGGAATGATTCATGTGACTGGAATTGAATGACTGCTCTGAGAAAGAAGTC 38265385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1134 GCTTAAAGTTAGGAATGATTCATGTGACTGGAATTGAATGACTGCTCTGAGAAAGAAGTC 1193

 38265386 CATAAAAGTCTGCATGCAATTTGCCATGTCTCCATCCTTTCTTTGCCATAGAAACTAAAG 38265445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1194 CATAAAAGTCTGCATGCAATTTGCCATGTCTCCATCCTTTCTTTGCCATAGAAACTAAAG 1253

 38265446 ATCTTCCAGATAGTCGAGGCTCTGTTAATGTTATTTCTTGAATAACGACTATCTGAACAG 38265505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1254 ATCTTCCAGATAGTCGAGGCTCTGTTAATGTTATTTCTTGAATAACGACTATCTGAACAG 1313

 38265506 AACATCTGTGACTTGGAATGGGGACATGTAGCTTGGAGAAAAAGTAAGCACACAGTGTTT 38265565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1314 AACATCTGTGACTTGGAATGGGGACATGTAGCTTGGAGAAAAAGTAAGCACACAGTGTTT 1373

 38265566 TAAGTTACTGTGGTTTTATGGTTATTTGTTACTGCAGCATAACCCACCCTGCCCTGACTT 38265625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1374 TAAGTTACTGTGGTTTTATGGTTATTTGTTACTGCAGCATAACCCACCCTGCCCTGACTT 1433

 38265626 AAGTGATATAATATTTAACAAATATTTATAAAATAAATAAATTCAAATTCACTCTAATAC 38265685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1434 AAGTGATATAATATTTAACAAATATTTATAAAATAAATAAATTCAAATTCACTCTAATAC 1493

 38265686 CTAGAAAATTATCAAGTATAGTAAACCAAATAATAAATATTTATTAAGGAATATGGAAAC 38265745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1494 CTAGAAAATTATCAAGTATAGTAAACCAAATAATAAATATTTATTAAGGAATATGGAAAC 1553

 38265746 AGTGACCTATGAGAAGTCTTGATATACTGACCATCCATTGTTGCAGCAGATCTCACTATT 38265805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1554 AGTGACCTATGAGAAGTCTTGATATACTGACCATCCATTGTTGCAGCAGATCTCACTATT 1613

 38265806 GCTATTGTGCTTAACATTTCAATTACAAAAATTAAAAAAAAAAAA-CACCATTCATCAGT 38265864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
     1614 GCTATTGTGCTTAACATTTCAATTACAAAAATTAAAAAAAAAAAAACACCATTCATCAGT 1673

 38265865 GCAGGTCTGTGTATTTAAAGAAATAATTTACAAGTTTTTTTTTCCTTTGTAAACATATTG 38265924
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
     1674 GCAGGTCTGTGTATTTAAAGAAATAATTTACAAGTTTTTTTT-CCTTTGTAAACATATTG 1732

 38265925 TTTTGAAGTGCAAATATATATAATTTGCACTTTGGGATGGAATGGAATGGGATGCCCTAT 38265984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1733 TTTTGAAGTGCAAATATATATAATTTGCACTTTGGGATGGAATGGAATGGGATGCCCTAT 1792

 38265985 TGGCAGTCCATACATCTGGATTATAAATGGATTTCCATCCCATCTTCCTCCCCATCTCTT 38266044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1793 TGGCAGTCCATACATCTGGATTATAAATGGATTTCCATCCCATCTTCCTCCCCATCTCTT 1852

 38266045 TCCCTTTTTGATCATTCTATGGAAATGGAAAGCTAGCAGAAGTTTGAAGAATTGTCACGC 38266104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1853 TCCCTTTTTGATCATTCTATGGAAATGGAAAGCTAGCAGAAGTTTGAAGAATTGTCACGC 1912

 38266105 AAACAACAACAACAA---AACTTTAGCATATTAACCTGTTGTCCAACCTTATATAAGCAG 38266161
          |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1913 AAACAACAACAACAACAAAACTTTAGCATATTAACCTGTTGTCCAACCTTATATAAGCAG 1972

 38266162 TTTGTATTTAAAACATCCCTAAGTGGATTTTAATTCCAGTTTCAATCATTGTTAACTATT 38266221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     1973 TTTGTATTTAAAACATCCCTAAGTGGATTTTAATTCCAATTTCAATCATTGTTAACTATT 2032

 38266222 TTTGAAATATTTAAAATCCCA 38266242
          |||||||||||||||||||||
     2033 TTTGAAATATTTAAAATCCCA 2053

EXCISED REGION

 38266251 ACCACTATTTCTCTTCAACTAGTCCTTACTTTTATAAACAAAAAAGTAACAGTAAATAAT 38266310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2054 ACCACTATTTCTCTTCAACTAGTCCTTACTTTTATAAACAAAAAAGTAACAGTAAATAAT 2113

 38266311 TTATAACTAGGTCTCTCTGAATCTAAAAACACGTTCTTATACACTATGTGATGCCATATT 38266370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     2114 TTATAACTAGGTCTCTCTGAATCTAAAAACACATTCTTATACACTATGTGATGCCATATT 2173

 38266371 TTTTACTCTTGTCTTTGTGAGTTTTTTGTGCCATTCTCTCCTCTGGAATGGTCTTCTGTG 38266430
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2174 TTTTACTCTTGACTTTGTGAGTTTTTTGTGCCATTCTCTCCTCTGGAATGGTCTTCTGTG 2233

 38266431 CTTACACATTCCAAGGGCTACTCCATTTTACAAGAAACAGTTCATGTTTGCTACTTTGGG 38266490
          .|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2234 TTTACACATTCCAAGGGCTAATCCATTTTACAAGAAACAGTTCATGTTTGCTACTTTGGG 2293

 38266491 GTTGATCCCATGATAATTCTGGTTCTCACTTGGTCTTTCCCTGTGAGATGCAGTAGCATT 38266550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2294 GTTGATCCCATGATAATTCTGGTTCTCACTTGGTCTTTCCCTGTGAGATGCAGTAGCATT 2353

 38266551 CAAAATTCTCAGACTATTCTATGCACCTTGGCAGATTTATGGTAATGGTCTATAATTGCT 38266610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2354 CAAAATTCTCAGACTATTCTATGCACCTTGGCAGATTTATGGTAATGGTCTATAATTGCT 2413

 38266611 TCATATCTGCTAACCTTGCTTCCAAAACTAGTTTTTGAGATTAATGAGACAGGAGCTTGG 38266670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2414 TCATATCTGCTAACCTTGCTTCCAAAACTAGTTTTTGAGATTAATGAGACAGGAGCTTGG 2473

 38266671 CTTTTTCTTTCTGTATAGCTTCCATAGCAACAAGAAAATATTAGACACACAGTAGGCATT 38266730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2474 CTTTTTCTTTCTGTATAGCTTCCATAGCAACAAGAAAATATTAGACACACAGTAGGCATT 2533

 38266731 GGAAGAAAATGTGTTCAGTTAAATGAACTTGATTTGAATGGAATGAGAGTTCAATGAAAC 38266790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2534 GGAAGAAAATGTGTTCAGTTAAATGAACTTGATTTGAATGGAATGAGAGTTCAATGAAAC 2593

 38266791 TGTATATATTGTGAAACGTGGCAACTTACACCTACTCAAGACATTAAAAGAGATCATGCT 38266850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2594 TGTATATATTGTGAAACGTGGCAACTTACACCTACTCAAGACATTAAAAGAGATCATGCT 2653

 38266851 TTCTTGCCTAAGTTTTATGTCCAATTTGTTCCTGTTTCAAACCCCTCGACAAAAACAAAA 38266910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2654 TTCTTGCCTAAGTTTTATGTCCAATTTGTTCCTGTTTCAAACCCCTCGACAAAAACAAAA 2713

 38266911 TCTTTTAATCTGTTTGCAAAATATTTCCTCCTTCCTCCCATCTTGCTGTTGCTGCTCTGT 38266970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2714 TCTTTTAATCTGTTTGCAAAATATTTCCTCCTTCCTCCCATCTTGCTGTTGCTGCTCTGT 2773

 38266971 GATATACTGCCCTTGCTTATTACCCCTTTATAGCTGTTTTGTTAAAGTTCATACCGCTAA 38267030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2774 GATATACTGCCCTTGCTTATTACCCCTTTATAGCTGTTTTGTTAAAGTTCATACCGCTAA 2833

 38267031 GACCTGTAAAAGAAATTTATGGCTCTAGGGATTTCAGCAAATTCTAAATAACCATAACAG 38267090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2834 GACCTGTAAAAGAAATTTATGGCTCTAGGGATTTCAGCAAATTCTAAATAACCATAACAG 2893

 38267091 GAACAGGAAGCATTAATTAAAGACACTAGAGTCTAAGTTATAACAGAAATCCTGACATTT 38267150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2894 GAACAGGAAGCATTAATTAAAGACACTAGAGTCTAAGTTATAACAGAAATCCTGACATTT 2953

 38267151 AAGGCCCTGGTACCATTTAAATTTAAAATGGTATGACAAACAGAGAGTAATTTGATGGTC 38267210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2954 AAGGCCCTGGTACCATTTAAATTTAAAATGGTATGACAAACAGAGAGTAATTTGATGGTC 3013

 38267211 AGAAGGTTATAATGGATACCTTAATACCTTTGCCAAGAAAAAGTGTCTGTCCTTGCTCTA 38267270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3014 AGAAGGTTATAATGGATACCTTAATACCTTTGCCAAGAAAAAGTGTCTGTCCTTGCTCTA 3073

 38267271 ACCCCTACCCAGGGGCTTCAGGGGCCTCCTTCATAAAACATGGTGATGCCTAAATATTTT 38267330
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3074 ATCCCTACCCAGGGGCTTCAGGGGCCTCCTTCATAAAACATGGTGATGCCTAAATATTTT 3133

 38267331 TGCGATATCTCATATATAAGCTGGTCTTTTCTTTAAGAATACGAGAGATTAAACACCAAC 38267390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3134 TGCGATATCTCATATATAAGCTGGTCTTTTCTTTAAGAATACGAGAGATTAAACACCAAC 3193

 38267391 CCCCAACATTCATACACCAATTTTCAGATAAAACAGCTTAATATTTAAGATATATTTAGT 38267450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3194 CCCCAACATTCATACACCAATTTTCAGATAAAACAGCTTAATATTTAAGATATATTTAGT 3253

 38267451 GCAATTTGTCTATTTCTTGGTTTACTGGAGGGCTGTATTTAAAGCCAAGGGACCAAGGAA 38267510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3254 GCAATTTGTCTATTTCTTGGTTTACTGGAGGGCTGTATTTAAAGCCAAGGGACCAAGGAA 3313

 38267511 CATTCCACAACACACTAAAGCAATTTTTCCCCAGGGAATATGCTGATTCTTTCCTAAAGG 38267570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3314 CATTCCACAACACACTAAAGCAATTTTTCCCCAGGGAATATGCTGATTCTTTCCTAAAGG 3373

 38267571 CAGAAGCCGACATTCCTGACTCATTCTGCCAAACCAAGCAATGAAAAATGCTTCACCTAA 38267630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3374 CAGAAGCCGACATTCCTGACTCATTCTGCCAAACCAAGCAATGAAAAATGCTTCACCTAA 3433

 38267631 TTTGAAAGATAATTTGTAATACCAGAGACTCAACTTGTTTTGTGTATCCAATACTAGCAC 38267690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3434 TTTGAAAGATAATTTGTAATACCAGAGACTCAACTTGTTTTGTGTATCCAATACTAGCAC 3493

 38267691 CCTTTCCAGAATGTTGAAAGTACACACTGTATGATTTGTCTAATGTATATTCAAAAAAGG 38267750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3494 CCTTTCCAGAATGTTGAAAGTACACACTGTATGATTTGTCTAATGTATATTCAAAAAAGG 3553

 38267751 AATACAAATTGATCCT 38267766
          ||||||||||||||||
     3554 AATACAAATTGATCCT 3569

Alignment time is 3.32646 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38249892,38276749] =>     26858 nucs '18 dna:chromosome chromosome:GRCh37:18:1:78077248:1'
Second seq [       1,    2451] =>      2451 nucs 'mol-32-3025-226232_2451'

Score:        2320
Aligned:      2445        nucs
Identic:      2432 ( 99%) nucs =>       102 ( 99%)      2330 ( 99%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38266140,38266242] EXCISED REGION [38266251,38268589]
 second seq =>  [       1,     103] EXCISED REGION [     104,    2444]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         8 nucs [38266243,38266250]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         8 nucs [38266243,38266250] to [38266251,38266258]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [38266242,38266242] to [38266251,38266251]
 second seq =>         1 nucs [103,103] to [104,104]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 38266140 TTGTCCAACCTTATATAAGCAGTTTGTATTTAAAACATCCCTAAGTGGATTTTAATTCCA 38266199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTGTCCAACCTTATATAAGCAGTTTGTATTTAAAACATCCCTAAGTGGATTTTAATTCCA 60

 38266200 GTTTCAATCATTGTTAACTATTTTTGAAATATTTAAAATCCCA 38266242
          .||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATTTCAATCATTGTTAACTATTTTTGAAATATTTAAAATCCCA 103

EXCISED REGION

 38266251 ACCACTATTTCTCTTCAACTAGTCCTTACTTTTATAAACAAAAAAGTAACAGTAAATAAT 38266310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      104 ACCACTATTTCTCTTCAACTAGTCCTTACTTTTATAAACAAAAAAGTAACAGTAAATAAT 163

 38266311 TTATAACTAGGTCTCTCTGAATCTAAAAACACGTTCTTATACACTATGTGATGCCATATT 38266370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
      164 TTATAACTAGGTCTCTCTGAATCTAAAAACACATTCTTATACACTATGTGATGCCATATT 223

 38266371 TTTTACTCTTGTCTTTGTGAGTTTTTTGTGCCATTCTCTCCTCTGGAATGGTCTTCTGTG 38266430
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      224 TTTTACTCTTGACTTTGTGAGTTTTTTGTGCCATTCTCTCCTCTGGAATGGTCTTCTGTG 283

 38266431 CTTACACATTCCAAGGGCTACTCCATTTTACAAGAAACAGTTCATGTTTGCTACTTTGGG 38266490
          .|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      284 TTTACACATTCCAAGGGCTAATCCATTTTACAAGAAACAGTTCATGTTTGCTACTTTGGG 343

 38266491 GTTGATCCCATGATAATTCTGGTTCTCACTTGGTCTTTCCCTGTGAGATGCAGTAGCATT 38266550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      344 GTTGATCCCATGATAATTCTGGTTCTCACTTGGTCTTTCCCTGTGAGATGCAGTAGCATT 403

 38266551 CAAAATTCTCAGACTATTCTATGCACCTTGGCAGATTTATGGTAATGGTCTATAATTGCT 38266610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      404 CAAAATTCTCAGACTATTCTATGCACCTTGGCAGATTTATGGTAATGGTCTATAATTGCT 463

 38266611 TCATATCTGCTAACCTTGCTTCCAAAACTAGTTTTTGAGATTAATGAGACAGGAGCTTGG 38266670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      464 TCATATCTGCTAACCTTGCTTCCAAAACTAGTTTTTGAGATTAATGAGACAGGAGCTTGG 523

 38266671 CTTTTTCTTTCTGTATAGCTTCCATAGCAACAAGAAAATATTAGACACACAGTAGGCATT 38266730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      524 CTTTTTCTTTCTGTATAGCTTCCATAGCAACAAGAAAATATTAGACACACAGTAGGCATT 583

 38266731 GGAAGAAAATGTGTTCAGTTAAATGAACTTGATTTGAATGGAATGAGAGTTCAATGAAAC 38266790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      584 GGAAGAAAATGTGTTCAGTTAAATGAACTTGATTTGAATGGAATGAGAGTTCAATGAAAC 643

 38266791 TGTATATATTGTGAAACGTGGCAACTTACACCTACTCAAGACATTAAAAGAGATCATGCT 38266850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      644 TGTATATATTGTGAAACGTGGCAACTTACACCTACTCAAGACATTAAAAGAGATCATGCT 703

 38266851 TTCTTGCCTAAGTTTTATGTCCAATTTGTTCCTGTTTCAAACCCCTCGACAAAAACAAAA 38266910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      704 TTCTTGCCTAAGTTTTATGTCCAATTTGTTCCTGTTTCAAACCCCTCGACAAAAACAAAA 763

 38266911 TCTTTTAATCTGTTTGCAAAATATTTCCTCCTTCCTCCCATCTTGCTGTTGCTGCTCTGT 38266970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      764 TCTTTTAATCTGTTTGCAAAATATTTCCTCCTTCCTCCCATCTTGCTGTTGCTGCTCTGT 823

 38266971 GATATACTGCCCTTGCTTATTACCCCTTTATAGCTGTTTTGTTAAAGTTCATACCGCTAA 38267030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      824 GATATACTGCCCTTGCTTATTACCCCTTTATAGCTGTTTTGTTAAAGTTCATACCGCTAA 883

 38267031 GACCTGTAAAAGAAATTTATGGCTCTAGGGATTTCAGCAAATTCTAAATAACCATAACAG 38267090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      884 GACCTGTAAAAGAAATTTATGGCTCTAGGGATTTCAGCAAATTCTAAATAACCATAACAG 943

 38267091 GAACAGGAAGCATTAATTAAAGACACTAGAGTCTAAGTTATAACAGAAATCCTGACATTT 38267150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      944 GAACAGGAAGCATTAATTAAAGACACTAGAGTCTAAGTTATAACAGAAATCCTGACATTT 1003

 38267151 AAGGCCCTGGTACCATTTAAATTTAAAATGGTATGACAAACAGAGAGTAATTTGATGGTC 38267210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1004 AAGGCCCTGGTACCATTTAAATTTAAAATGGTATGACAAACAGAGAGTAATTTGATGGTC 1063

 38267211 AGAAGGTTATAATGGATACCTTAATACCTTTGCCAAGAAAAAGTGTCTGTCCTTGCTCTA 38267270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1064 AGAAGGTTATAATGGATACCTTAATACCTTTGCCAAGAAAAAGTGTCTGTCCTTGCTCTA 1123

 38267271 ACCCCTACCCAGGGGCTTCAGGGGCCTCCTTCATAAAACATGGTGATGCCTAAATATTTT 38267330
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1124 ATCCCTACCCAGGGGCTTCAGGGGCCTCCTTCATAAAACATGGTGATGCCTAAATATTTT 1183

 38267331 TGCGATATCTCATATATAAGCTGGTCTTTTCTTTAAGAATACGAGAGATTAAACACCAAC 38267390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1184 TGCGATATCTCATATATAAGCTGGTCTTTTCTTTAAGAATACGAGAGATTAAACACCAAC 1243

 38267391 CCCCAACATTCATACACCAATTTTCAGATAAAACAGCTTAATATTTAAGATATATTTAGT 38267450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1244 CCCCAACATTCATACACCAATTTTCAGATAAAACAGCTTAATATTTAAGATATATTTAGT 1303

 38267451 GCAATTTGTCTATTTCTTGGTTTACTGGAGGGCTGTATTTAAAGCCAAGGGACCAAGGAA 38267510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1304 GCAATTTGTCTATTTCTTGGTTTACTGGAGGGCTGTATTTAAAGCCAAGGGACCAAGGAA 1363

 38267511 CATTCCACAACACACTAAAGCAATTTTTCCCCAGGGAATATGCTGATTCTTTCCTAAAGG 38267570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1364 CATTCCACAACACACTAAAGCAATTTTTCCCCAGGGAATATGCTGATTCTTTCCTAAAGG 1423

 38267571 CAGAAGCCGACATTCCTGACTCATTCTGCCAAACCAAGCAATGAAAAATGCTTCACCTAA 38267630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1424 CAGAAGCCGACATTCCTGACTCATTCTGCCAAACCAAGCAATGAAAAATGCTTCACCTAA 1483

 38267631 TTTGAAAGATAATTTGTAATACCAGAGACTCAACTTGTTTTGTGTATCCAATACTAGCAC 38267690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1484 TTTGAAAGATAATTTGTAATACCAGAGACTCAACTTGTTTTGTGTATCCAATACTAGCAC 1543

 38267691 CCTTTCCAGAATGTTGAAAGTACACACTGTATGATTTGTCTAATGTATATTCAAAAAAGG 38267750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1544 CCTTTCCAGAATGTTGAAAGTACACACTGTATGATTTGTCTAATGTATATTCAAAAAAGG 1603

 38267751 AATACAAATTGATCCTCAAAGTTCAAATCTGCAGTACATACTCTGTGTTCTGCCCCCACC 38267810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1604 AATACAAATTGATCCTCAAAGTTCAAATCTGCAGTACATACTCTGTGTTCTGCCCCCACC 1663

 38267811 CGTACCTTCATGAATTCTTTCACCTAGCACGCAGGCTGTTTTCCCTTTGCGAAATCCCAT 38267870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1664 CGTACCTTCATGAATTCTTTCACCTAGCACGCAGGCTGTTTTCCCTTTGCGAAATCCCAT 1723

 38267871 GGTACATTTATAGTATTAATACCACTCACTTAGAATATGCCGTATTTTGTCTAATATTGC 38267930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1724 GGTACATTTATAGTATTAATACCACTCACTTAGAATATGCCGTATTTTGTCTAATATTGC 1783

 38267931 TAGATTTTGTGTGTATAATCTTATTCCTCAAGTAAATTACAAGACAAGGACTATAATTTA 38267990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1784 TAGATTTTGTGTGTATAATCTTATTCCTCAAGTAAATTACAAGACAAGGACTATAATTTA 1843

 38267991 TACATCCTCTACAACACTTGACACTGGCTTTGATTAGGCTCTTAATAAATATTTGTTGGT 38268050
          ||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     1844 TACATCCTCTACAACACTTGGCACTGGCTTTGAGTAGGCTCTTAATAAATATTTGTTGGT 1903

 38268051 TGATTAATCAGTTGACCACACTTACTAATTGCAAGGTGACATCATTTATCATTAATAAAC 38268110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1904 TGATTAATCAGTTGACCACACTTACTAATTGCAAGGTGACATCATTTATCATTAATAAAC 1963

 38268111 ATATATGTGGATTACAAAAATATCATGTGAATTTGCATATAATCATATTAATCCCAAATT 38268170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1964 ATATATGTGGATTACAAAAATATCATGTGAATTTGCATATAATCATATTAATCCCAAATT 2023

 38268171 AGCACCTGAGAGTCCAACCACCCTCTCCTTTAGGCCCTTTTCACTTTTATGTCTACTTTT 38268230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2024 AGCACCTGAGAGTCCAACCACCCTCTCCTTTAGGCCCTTTTCACTTTTATGTCTACTTTT 2083

 38268231 GCCTCACTTACAATTCCACTACTTACTTGCCTTCTTTCTCTTTTCAGCTTTGTGCTGTTA 38268290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2084 GCCTCACTTACAATTCCACTACTTACTTGCCTTCTTTCTCTTTTCAGCTTTGTGCTGTTA 2143

 38268291 TTTAATATCTCACCAGTTGTGTAATTTCAGCTCCCAAATTGAATAAGACGTTCCCCCCAG 38268350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2144 TTTAATATCTCACCAGTTGTGTAATTTCAGCTCCCAAATTGAATAAGACGTTCCCCCCAG 2203

 38268351 TGGAACCCTCACCTTGACAAATAGCCAAATAGTA---ATTATTCCTTTCAGGGGTTGAGC 38268407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||
     2204 TGGAACCCTCACCTTGACAAATAGCCAAATAGTAATTATTATTCCTTTCAGGGGTTGAGC 2263

 38268408 TATGGAATCATGCTTGCAATATCCCAGGCTTGAGTGCCTAGATATTTATGCTATACTTCC 38268467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2264 TATGGAATCATGCTTGCAATATCCCAGGCTTGAGTGCCTAGATATTTATGCTATACTTCC 2323

 38268468 CTGTGTCGGAGTTTCCATCTGCGATTGTATTTCAAGCCCTCTCATTTTTTTTTTCAATAT 38268527
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
     2324 CTGTGTCGGAGTTTCCATCTGCGATTGTATTTCAAGCCCTCTCA-TTTTTTTTTCAATAT 2382

 38268528 GATTAAGATAATTCCTTTATGAAGTTGGAAACTCAGACATTCAGAAAGAAACTTGACGTT 38268587
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2383 GATTAAGATAATTCCTTTATGAAGCTGGAAACTCAGACATTCAGAAAGAAACTTGACGTT 2442

 38268588 TC 38268589
          ||
     2443 TC 2444

Alignment time is 2.28704 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38249892,38276749] =>     26858 nucs '18 dna:chromosome chromosome:GRCh37:18:1:78077248:1'
Second seq [       1,    5129] =>      5129 nucs 'mol-32-3030-148734_5129'

Score:        4867
Aligned:      5138        nucs
Identic:      5106 ( 99%) nucs =>      2374 ( 99%)      2732 ( 99%)
Gaps:           17 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38263856,38266242] EXCISED REGION [38266251,38268993]
 second seq =>  [       1,    2384] EXCISED REGION [    2385,    5129]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         8 nucs [38266243,38266250]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         8 nucs [38266243,38266250] to [38266251,38266258]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [38266242,38266242] to [38266251,38266251]
 second seq =>         1 nucs [2384,2384] to [2385,2385]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 38263856 TTTATTTTGTTAATTTCTAGTTGTATTTTTATTATTTCCTTCCTAGTTCTTCTTTTTATT 38263915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTATTTTGTTAATTTCTAGTTGTATTTTTATTATTTCCTTCCTAGTTCTTCTTTTTATT 60

 38263916 TAATCGTTCTTAAGATGGATACTTAAGTAATTGATTTTCATCTTCTAAGCTTTATTAGTA 38263975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAATCGTTCTTAAGATGGATACTTAAGTAATTGATTTTCATCTTCTAAGCTTTATTAGTA 120

 38263976 TGTTTATTTAAAGCAATACATTTCCATATTACCATGACCTTAGCTGCAGTGTATGTATTT 38264035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGTTTATTTAAAGCAATACATTTCCATATTACCATGACCTTAGCTGCAGTGTATGTATTT 180

 38264036 TGGTGTACAGTATTTTCTTTATTTTTCAATTAAAATTTGTCTTGACTTCCTCTATGATGT 38264095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGGTGTACAGTATTTTCTTTATTTTTCAATTAAAATTTGTCTTGACTTCCTCTATGATGT 240

 38264096 CTTCTATGATTCTTCCTCTATAATTCTTCTTTTGACCATATAGAAGTGTATTCATTAATT 38264155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTTCTATGATTCTTCCTCTATAATTCTTCTTTTGACCATATAGAAGTGTATTCATTAATT 300

 38264156 CAATCACATATAAATATTCTCCTTTTATCTTTTTGCTACTGGTTTGTTTGTTTAGCTACA 38264215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CAATCACATATAAATATTCTCCTTTTATCTTTTTGCTACTGGTTTGTTTGTTTAGCTACA 360

 38264216 TTTAGGGAAAATTTCATTTCTGAGACGACAGAGGAAGCACATTCCATTTTATTCCTTCTG 38264275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTTAGGGAAAATTTCATTTCTGAGACGACAGAGGAAGCACATTCCATTTTATTCCTTCTG 420

 38264276 CTAATGACAAAAAAAAAAAAAAATTGGAAAAAACACAAAAGCCAGAGTCAAAAGACTCTG 38264335
          ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTAATGACAAAAAAAAAAAA---TTGGAAAAAACACAAAAGCCAGAGTCAAAAGACTCTG 477

 38264336 AAAAATGGAGAAAAAGTGCAGACAGGCTAAGGATTTGGGAGATTGAGGAACAACGACAGG 38264395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      478 AAAAATGGAGAAAAAGTGCAGACAGGCTAAGGATTTGGGAGATTGAGGAACAACGACAGG 537

 38264396 TGAGTTCTCTGTCTTTTTTTTT-CTTTCTTTTTTGATATATATATATATATCAACAATCT 38264454
          |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||||
      538 TGAGTTCTCTGTCTTTTTTTTTTCTTTCTTTTTTGATATATATATAT----CAACAATCT 593

 38264455 CAATGTTTAAGAGAAGCCCTCAAGCCAGAATTTCCAACAGTTGCAGATAAAACATTGTGC 38264514
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      594 CAATGTTTAAGAGAAGCCCTCAATCCAGAATTTCCAACAGTTGCAGATAAAACATTGTGC 653

 38264515 TTGCTTAACGTATTTAACCAAAAGACCCGAAAAGCAAGGATATAAAAGAATATTTTAATA 38264574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      654 TTGCTTAACGTATTTAACCAAAAGACCCGAAAAGCAAGGATATAAAAGAATATTTTAATA 713

 38264575 ATATCATTCTGTTCTTAAGGTGAACACTTCAAAGAAACCACACCCCTCCCCTCCCCAATG 38264634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      714 ATATCATTCTGTTCTTAAGGTGAACACTTCAAAGAAACCACACCCCTCCCCTCCCCAATG 773

 38264635 CGTGCTGAAGCAGTGGAATCCATGAGTGGAACCTTGTCATATATAATCTCCACACTAAAT 38264694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      774 CGTGCTGAAGCAGTGGAATCCATGAGTGGAACCTTGTCATATATAATCTCCACACTAAAT 833

 38264695 TTATAGCAAAGCCCCCATCTCTCAACCTGTGTTGAAATTCTGACTTCCAGACACACCTTT 38264754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      834 TTATAGCAAAGCCCCCATCTCTCAACCTGTGTTGAAATTCTGACTTCCAGACACACCTTT 893

 38264755 CAGTAATGAGGAGGTACTCTTCCATGATAAACCCTGTGGGCAAAGCTTCCACATTCATCC 38264814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      894 CAGTAATGAGGAGGTACTCTTCCATGATAAACCCTGTGGGCAAAGCTTCCACATTCATCC 953

 38264815 CACCCCTAAAGCAATAAATTTGCACCTTTCCCAAGTAGAATCAATGGGAAGAATTTTGAC 38264874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      954 CACCCCTAAAGCAATAAATTTGCACCTTTCCCAAGTAGAATCAATGGGAAGAATTTTGAC 1013

 38264875 TTCTATCCCCACCTGATGGTAATGAGGCAGTATCTCTCTCTTTTTCCAGACAGTGTTTAA 38264934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1014 TTCTATCCCCACCTGATGGTAATGAGGCAGTATCTCTCTCTTTTTCCAGACAGTGTTTAA 1073

 38264935 GAATTTGTTGTATAGAGCGCTATTACCTGAATAACACATTGTGGCAGAGCAAAATAACCC 38264994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1074 GAATTTGTTGTATAGAGCGCTATTACCTGAATAACACATTGTGGCAGAGCAAAATAACCC 1133

 38264995 TTAAGCATTTAGTTTTCAGATTTATTTTCAACTATTTAGAGGGTTATTTCTTGACTACCA 38265054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1134 TTAAGCATTTAGTTTTCAGATTTATTTTCAACTATTTAGAGGGTTATTTCTTGACTACCA 1193

 38265055 CAGATAAGTCATTCCCTTCTCCATTGTTCTATAGTTTACTGCCCTTTTTTTCTATCATGG 38265114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1194 CAGATAAGTCATTCCCTTCTCCATTGTTCTATAGTTTACTGCCCTTTTTTTCTATCATGG 1253

 38265115 CATTTACCCACTATTTCATATTGTTATTTATAGTTTACATGCTTAATATCTCCATCTCCC 38265174
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     1254 CATTTACCCACTATTTCATATTGTTATTTTTAGTTTACATGCTTAATATCTCCATCTCCC 1313

 38265175 AACAAATATGGGAACATCATTAGGTCAGAGAAATTTTATTTCTTTTCCCTCTGAAGTCTC 38265234
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     1314 AACAAATATGGGAACATCATTAGGTCAGAGAAATTTTATTTCTTTCCCCTCTGAAGTCTC 1373

 38265235 AGTATTAGTTGTTACATTAATTAGCACTTATTTAAATTTTTAGTTTTCTTTTTCTTTGCC 38265294
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1374 AGTACTAGTTGTTACATTAATTAGCACTTATTTAAATTTTTAGTTTTCTTTTTCTTTGCC 1433

 38265295 TCATGTTACTGTTACACCCTTCCACTACCAAGCTTAAAGTTAGGAATGATTCATGTGACT 38265354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1434 TCATGTTACTGTTACACCCTTCCACTACCAAGCTTAAAGTTAGGAATGATTCATGTGACT 1493

 38265355 GGAATTGAATGACTGCTCTGAGAAAGAAGTCCATAAAAGTCTGCATGCAATTTGCCATGT 38265414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1494 GGAATTGAATGACTGCTCTGAGAAAGAAGTCCATAAAAGTCTGCATGCAATTTGCCATGT 1553

 38265415 CTCCATCCTTTCTTTGCCATAGAAACTAAAGATCTTCCAGATAGTCGAGGCTCTGTTAAT 38265474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1554 CTCCATCCTTTCTTTGCCATAGAAACTAAAGATCTTCCAGATAGTCGAGGCTCTGTTAAT 1613

 38265475 GTTATTTCTTGAATAACGACTATCTGAACAGAACATCTGTGACTTGGAATGGGGACATGT 38265534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1614 GTTATTTCTTGAATAACGACTATCTGAACAGAACATCTGTGACTTGGAATGGGGACATGT 1673

 38265535 AGCTTGGAGAAAAAGTAAGCACACAGTGTTTTAAGTTACTGTGGTTTTATGGTTATTTGT 38265594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1674 AGCTTGGAGAAAAAGTAAGCACACAGTGTTTTAAGTTACTGTGGTTTTATGGTTATTTGT 1733

 38265595 TACTGCAGCATAACCCACCCTGCCCTGACTTAAGTGATATAATATTTAACAAATATTTAT 38265654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1734 TACTGCAGCATAACCCACCCTGCCCTGACTTAAGTGATATAATATTTAACAAATATTTAT 1793

 38265655 AAAATAAATAAATTCAAATTCACTCTAATACCTAGAAAATTATCAAGTATAGTAAACCAA 38265714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1794 AAAATAAATAAATTCAAATTCACTCTAATACCTAGAAAATTATCAAGTATAGTAAACCAA 1853

 38265715 ATAATAAATATTTATTAAGGAATATGGAAACAGTGACCTATGAGAAGTCTTGATATACTG 38265774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1854 ATAATAAATATTTATTAAGGAATATGGAAACAGTGACCTATGAGAAGTCTTGATATACTG 1913

 38265775 ACCATCCATTGTTGCAGCAGATCTCACTATTGCTATTGTGCTTAACATTTCAATTACAAA 38265834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1914 ACCATCCATTGTTGCAGCAGATCTCACTATTGCTATTGTGCTTAACATTTCAATTACAAA 1973

 38265835 AATTAAAAAAAAAAAA-CACCATTCATCAGTGCAGGTCTGTGTATTTAAAGAAATAATTT 38265893
          |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1974 AATTAAAAAAAAAAAAACACCATTCATCAGTGCAGGTCTGTGTATTTAAAGAAATAATTT 2033

 38265894 ACAAGTTTTTTTTTCCTTTGTAAACATATTGTTTTGAAGTGCAAATATATATAATTTGCA 38265953
          ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2034 ACAAGTTTTTTTT-CCTTTGTAAACATATTGTTTTGAAGTGCAAATATATATAATTTGCA 2092

 38265954 CTTTGGGATGGAATGGAATGGGATGCCCTATTGGCAGTCCATACATCTGGATTATAAATG 38266013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2093 CTTTGGGATGGAATGGAATGGGATGCCCTATTGGCAGTCCATACATCTGGATTATAAATG 2152

 38266014 GATTTCCATCCCATCTTCCTCCCCATCTCTTTCCCTTTTTGATCATTCTATGGAAATGGA 38266073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2153 GATTTCCATCCCATCTTCCTCCCCATCTCTTTCCCTTTTTGATCATTCTATGGAAATGGA 2212

 38266074 AAGCTAGCAGAAGTTTGAAGAATTGTCACGCAAACAACAACAACAA---AACTTTAGCAT 38266130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||
     2213 AAGCTAGCAGAAGTTTGAAGAATTGTCACGCAAACAACAACAACAACAAAACTTTAGCAT 2272

 38266131 ATTAACCTGTTGTCCAACCTTATATAAGCAGTTTGTATTTAAAACATCCCTAAGTGGATT 38266190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2273 ATTAACCTGTTGTCCAACCTTATATAAGCAGTTTGTATTTAAAACATCCCTAAGTGGATT 2332

 38266191 TTAATTCCAGTTTCAATCATTGTTAACTATTTTTGAAATATTTAAAATCCCA 38266242
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2333 TTAATTCCAATTTCAATCATTGTTAACTATTTTTGAAATATTTAAAATCCCA 2384

EXCISED REGION

 38266251 ACCACTATTTCTCTTCAACTAGTCCTTACTTTTATAAACAAAAAAGTAACAGTAAATAAT 38266310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2385 ACCACTATTTCTCTTCAACTAGTCCTTACTTTTATAAACAAAAAAGTAACAGTAAATAAT 2444

 38266311 TTATAACTAGGTCTCTCTGAATCTAAAAACACGTTCTTATACACTATGTGATGCCATATT 38266370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     2445 TTATAACTAGGTCTCTCTGAATCTAAAAACACATTCTTATACACTATGTGATGCCATATT 2504

 38266371 TTTTACTCTTGTCTTTGTGAGTTTTTTGTGCCATTCTCTCCTCTGGAATGGTCTTCTGTG 38266430
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2505 TTTTACTCTTGACTTTGTGAGTTTTTTGTGCCATTCTCTCCTCTGGAATGGTCTTCTGTG 2564

 38266431 CTTACACATTCCAAGGGCTACTCCATTTTACAAGAAACAGTTCATGTTTGCTACTTTGGG 38266490
          .|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2565 TTTACACATTCCAAGGGCTAATCCATTTTACAAGAAACAGTTCATGTTTGCTACTTTGGG 2624

 38266491 GTTGATCCCATGATAATTCTGGTTCTCACTTGGTCTTTCCCTGTGAGATGCAGTAGCATT 38266550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2625 GTTGATCCCATGATAATTCTGGTTCTCACTTGGTCTTTCCCTGTGAGATGCAGTAGCATT 2684

 38266551 CAAAATTCTCAGACTATTCTATGCACCTTGGCAGATTTATGGTAATGGTCTATAATTGCT 38266610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2685 CAAAATTCTCAGACTATTCTATGCACCTTGGCAGATTTATGGTAATGGTCTATAATTGCT 2744

 38266611 TCATATCTGCTAACCTTGCTTCCAAAACTAGTTTTTGAGATTAATGAGACAGGAGCTTGG 38266670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2745 TCATATCTGCTAACCTTGCTTCCAAAACTAGTTTTTGAGATTAATGAGACAGGAGCTTGG 2804

 38266671 CTTTTTCTTTCTGTATAGCTTCCATAGCAACAAGAAAATATTAGACACACAGTAGGCATT 38266730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2805 CTTTTTCTTTCTGTATAGCTTCCATAGCAACAAGAAAATATTAGACACACAGTAGGCATT 2864

 38266731 GGAAGAAAATGTGTTCAGTTAAATGAACTTGATTTGAATGGAATGAGAGTTCAATGAAAC 38266790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2865 GGAAGAAAATGTGTTCAGTTAAATGAACTTGATTTGAATGGAATGAGAGTTCAATGAAAC 2924

 38266791 TGTATATATTGTGAAACGTGGCAACTTACACCTACTCAAGACATTAAAAGAGATCATGCT 38266850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2925 TGTATATATTGTGAAACGTGGCAACTTACACCTACTCAAGACATTAAAAGAGATCATGCT 2984

 38266851 TTCTTGCCTAAGTTTTATGTCCAATTTGTTCCTGTTTCAAACCCCTCGACAAAAACAAAA 38266910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2985 TTCTTGCCTAAGTTTTATGTCCAATTTGTTCCTGTTTCAAACCCCTCGACAAAAACAAAA 3044

 38266911 TCTTTTAATCTGTTTGCAAAATATTTCCTCCTTCCTCCCATCTTGCTGTTGCTGCTCTGT 38266970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3045 TCTTTTAATCTGTTTGCAAAATATTTCCTCCTTCCTCCCATCTTGCTGTTGCTGCTCTGT 3104

 38266971 GATATACTGCCCTTGCTTATTACCCCTTTATAGCTGTTTTGTTAAAGTTCATACCGCTAA 38267030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3105 GATATACTGCCCTTGCTTATTACCCCTTTATAGCTGTTTTGTTAAAGTTCATACCGCTAA 3164

 38267031 GACCTGTAAAAGAAATTTATGGCTCTAGGGATTTCAGCAAATTCTAAATAACCATAACAG 38267090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3165 GACCTGTAAAAGAAATTTATGGCTCTAGGGATTTCAGCAAATTCTAAATAACCATAACAG 3224

 38267091 GAACAGGAAGCATTAATTAAAGACACTAGAGTCTAAGTTATAACAGAAATCCTGACATTT 38267150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3225 GAACAGGAAGCATTAATTAAAGACACTAGAGTCTAAGTTATAACAGAAATCCTGACATTT 3284

 38267151 AAGGCCCTGGTACCATTTAAATTTAAAATGGTATGACAAACAGAGAGTAATTTGATGGTC 38267210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3285 AAGGCCCTGGTACCATTTAAATTTAAAATGGTATGACAAACAGAGAGTAATTTGATGGTC 3344

 38267211 AGAAGGTTATAATGGATACCTTAATACCTTTGCCAAGAAAAAGTGTCTGTCCTTGCTCTA 38267270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3345 AGAAGGTTATAATGGATACCTTAATACCTTTGCCAAGAAAAAGTGTCTGTCCTTGCTCTA 3404

 38267271 ACCCCTACCCAGGGGCTTCAGGGGCCTCCTTCATAAAACATGGTGATGCCTAAATATTTT 38267330
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3405 ATCCCTACCCAGGGGCTTCAGGGGCCTCCTTCATAAAACATGGTGATGCCTAAATATTTT 3464

 38267331 TGCGATATCTCATATATAAGCTGGTCTTTTCTTTAAGAATACGAGAGATTAAACACCAAC 38267390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3465 TGCGATATCTCATATATAAGCTGGTCTTTTCTTTAAGAATACGAGAGATTAAACACCAAC 3524

 38267391 CCCCAACATTCATACACCAATTTTCAGATAAAACAGCTTAATATTTAAGATATATTTAGT 38267450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3525 CCCCAACATTCATACACCAATTTTCAGATAAAACAGCTTAATATTTAAGATATATTTAGT 3584

 38267451 GCAATTTGTCTATTTCTTGGTTTACTGGAGGGCTGTATTTAAAGCCAAGGGACCAAGGAA 38267510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3585 GCAATTTGTCTATTTCTTGGTTTACTGGAGGGCTGTATTTAAAGCCAAGGGACCAAGGAA 3644

 38267511 CATTCCACAACACACTAAAGCAATTTTTCCCCAGGGAATATGCTGATTCTTTCCTAAAGG 38267570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3645 CATTCCACAACACACTAAAGCAATTTTTCCCCAGGGAATATGCTGATTCTTTCCTAAAGG 3704

 38267571 CAGAAGCCGACATTCCTGACTCATTCTGCCAAACCAAGCAATGAAAAATGCTTCACCTAA 38267630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3705 CAGAAGCCGACATTCCTGACTCATTCTGCCAAACCAAGCAATGAAAAATGCTTCACCTAA 3764

 38267631 TTTGAAAGATAATTTGTAATACCAGAGACTCAACTTGTTTTGTGTATCCAATACTAGCAC 38267690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3765 TTTGAAAGATAATTTGTAATACCAGAGACTCAACTTGTTTTGTGTATCCAATACTAGCAC 3824

 38267691 CCTTTCCAGAATGTTGAAAGTACACACTGTATGATTTGTCTAATGTATATTCAAAAAAGG 38267750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3825 CCTTTCCAGAATGTTGAAAGTACACACTGTATGATTTGTCTAATGTATATTCAAAAAAGG 3884

 38267751 AATACAAATTGATCCTCAAAGTTCAAATCTGCAGTACATACTCTGTGTTCTGCCCCCACC 38267810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3885 AATACAAATTGATCCTCAAAGTTCAAATCTGCAGTACATACTCTGTGTTCTGCCCCCACC 3944

 38267811 CGTACCTTCATGAATTCTTTCACCTAGCACGCAGGCTGTTTTCCCTTTGCGAAATCCCAT 38267870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3945 CGTACCTTCATGAATTCTTTCACCTAGCACGCAGGCTGTTTTCCCTTTGCGAAATCCCAT 4004

 38267871 GGTACATTTATAGTATTAATACCACTCACTTAGAATATGCCGTATTTTGTCTAATATTGC 38267930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4005 GGTACATTTATAGTATTAATACCACTCACTTAGAATATGCCGTATTTTGTCTAATATTGC 4064

 38267931 TAGATTTTGTGTGTATAATCTTATTCCTCAAGTAAATTACAAGACAAGGACTATAATTTA 38267990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4065 TAGATTTTGTGTGTATAATCTTATTCCTCAAGTAAATTACAAGACAAGGACTATAATTTA 4124

 38267991 TACATCCTCTACAACACTTGACACTGGCTTTGATTAGGCTCTTAATAAATATTTGTTGGT 38268050
          ||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     4125 TACATCCTCTACAACACTTGGCACTGGCTTTGAGTAGGCTCTTAATAAATATTTGTTGGT 4184

 38268051 TGATTAATCAGTTGACCACACTTACTAATTGCAAGGTGACATCATTTATCATTAATAAAC 38268110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4185 TGATTAATCAGTTGACCACACTTACTAATTGCAAGGTGACATCATTTATCATTAATAAAC 4244

 38268111 ATATATGTGGATTACAAAAATATCATGTGAATTTGCATATAATCATATTAATCCCAAATT 38268170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4245 ATATATGTGGATTACAAAAATATCATGTGAATTTGCATATAATCATATTAATCCCAAATT 4304

 38268171 AGCACCTGAGAGTCCAACCACCCTCTCCTTTAGGCCCTTTTCACTTTTATGTCTACTTTT 38268230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4305 AGCACCTGAGAGTCCAACCACCCTCTCCTTTAGGCCCTTTTCACTTTTATGTCTACTTTT 4364

 38268231 GCCTCACTTACAATTCCACTACTTACTTGCCTTCTTTCTCTTTTCAGCTTTGTGCTGTTA 38268290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4365 GCCTCACTTACAATTCCACTACTTACTTGCCTTCTTTCTCTTTTCAGCTTTGTGCTGTTA 4424

 38268291 TTTAATATCTCACCAGTTGTGTAATTTCAGCTCCCAAATTGAATAAGACGTTCCCCCCAG 38268350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4425 TTTAATATCTCACCAGTTGTGTAATTTCAGCTCCCAAATTGAATAAGACGTTCCCCCCAG 4484

 38268351 TGGAACCCTCACCTTGACAAATAGCCAAATAGTA---ATTATTCCTTTCAGGGGTTGAGC 38268407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||
     4485 TGGAACCCTCACCTTGACAAATAGCCAAATAGTAATTATTATTCCTTTCAGGGGTTGAGC 4544

 38268408 TATGGAATCATGCTTGCAATATCCCAGGCTTGAGTGCCTAGATATTTATGCTATACTTCC 38268467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4545 TATGGAATCATGCTTGCAATATCCCAGGCTTGAGTGCCTAGATATTTATGCTATACTTCC 4604

 38268468 CTGTGTCGGAGTTTCCATCTGCGATTGTATTTCAAGCCCTCTCATTTTTTTTTTCAATAT 38268527
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
     4605 CTGTGTCGGAGTTTCCATCTGCGATTGTATTTCAAGCCCTCTCA-TTTTTTTTTCAATAT 4663

 38268528 GATTAAGATAATTCCTTTATGAAGTTGGAAACTCAGACATTCAGAAAGAAACTTGACGTT 38268587
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4664 GATTAAGATAATTCCTTTATGAAGCTGGAAACTCAGACATTCAGAAAGAAACTTGACGTT 4723

 38268588 TCATATTTTTGCTAACTTGCTCTTCCCATTTCCTTTCCTATCATTTTAGCCAGACTGAGG 38268647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4724 TCATATTTTTGCTAACTTGCTCTTCCCATTTCCTTTCCTATCATTTTAGCCAGACTGAGG 4783

 38268648 GAGAATTAATTTTGCAATGGTCTCTATTTTTTTTTCCAAATGTGTGACCTCCATATTAAT 38268707
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4784 GAGAATTAATTTTGCAACGGTCTCTATTTTTTTTTCCAAATGTGTGACCTCCATATTAAT 4843

 38268708 AGGAGCCAGAGTACTCATTCATCACATCTGGTCAGTGTGAAACTGACATTTACAGGGTGG 38268767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4844 AGGAGCCAGAGTACTCATTCATCACATCTGGTCAGTGTGAAACTGACATTTACAGGGTGG 4903

 38268768 AATGTTTCCCACTCAGGACAAATGGGGATCATTTGTAAAACATGCCGCACCCAATCATAG 38268827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     4904 AATGTTTCCCACTCAGGACAAATGGGGATCATTTGTAAAACATGCCACACCCAATCATAG 4963

 38268828 GTTCCCATGGATCTCCAACTACATTTTTAAGCAACAATATAAACCATTCCCGAAACTGAA 38268887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4964 GTTCCCATGGATCTCCAACTACATTTTTAAGCAACAATATAAACCATTCCCGAAACTGAA 5023

 38268888 AGGTCTTTTCAAATATTTACTGCCTACCTATGGAATTTTTATTCTGCTTGCTGCTGCCAT 38268947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5024 AGGTCTTTTCAAATATTTACTGCCTACCTATGGAATTTTTATTCTGCTTGCTGCTGCCAT 5083

 38268948 CAATAATCCTGGGAGTTCCTAGCTAAGTGTTGTGTATGACCTCCAA 38268993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5084 CAATAATCCTGGGAGTTCCTAGCTAAGTGTTGTGTATGACCTCCAA 5129

Alignment time is 5.34327 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38249892,38276749] =>     26858 nucs '18 dna:chromosome chromosome:GRCh37:18:1:78077248:1'
Second seq [       1,    6396] =>      6396 nucs 'mol-32-30eb-073347_6396'

Score:        6021
Aligned:      6404        nucs
Identic:      6361 ( 99%) nucs =>       711 ( 99%)      5650 ( 99%)
Gaps:           18 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38265530,38266242] EXCISED REGION [38266251,38271931]
 second seq =>  [       1,     716] EXCISED REGION [     717,    6396]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         8 nucs [38266243,38266250]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         8 nucs [38266243,38266250] to [38266251,38266258]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [38266242,38266242] to [38266251,38266251]
 second seq =>         1 nucs [716,716] to [717,717]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 38265530 CATGTAGCTTGGAGAAAAAGTAAGCACACAGTGTTTTAAGTTACTGTGGTTTTATGGTTA 38265589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CATGTAGCTTGGAGAAAAAGTAAGCACACAGTGTTTTAAGTTACTGTGGTTTTATGGTTA 60

 38265590 TTTGTTACTGCAGCATAACCCACCCTGCCCTGACTTAAGTGATATAATATTTAACAAATA 38265649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTGTTACTGCAGCATAACCCACCCTGCCCTGACTTAAGTGATATAATATTTAACAAATA 120

 38265650 TTTATAAAATAAATAAATTCAAATTCACTCTAATACCTAGAAAATTATCAAGTATAGTAA 38265709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTATAAAATAAATAAATTCAAATTCACTCTAATACCTAGAAAATTATCAAGTATAGTAA 180

 38265710 ACCAAATAATAAATATTTATTAAGGAATATGGAAACAGTGACCTATGAGAAGTCTTGATA 38265769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACCAAATAATAAATATTTATTAAGGAATATGGAAACAGTGACCTATGAGAAGTCTTGATA 240

 38265770 TACTGACCATCCATTGTTGCAGCAGATCTCACTATTGCTATTGTGCTTAACATTTCAATT 38265829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TACTGACCATCCATTGTTGCAGCAGATCTCACTATTGCTATTGTGCTTAACATTTCAATT 300

 38265830 ACAAAAATTAAAAAAAAAAAA-CACCATTCATCAGTGCAGGTCTGTGTATTTAAAGAAAT 38265888
          ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACAAAAATTAAAAAAAAAAAAACACCATTCATCAGTGCAGGTCTGTGTATTTAAAGAAAT 360

 38265889 AATTTACAAGTTTTTTTTTCCTTTGTAAACATATTGTTTTGAAGTGCAAATATATATAAT 38265948
          |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AATTTACAAGTTTTTTTT-CCTTTGTAAACATATTGTTTTGAAGTGCAAATATATATAAT 419

 38265949 TTGCACTTTGGGATGGAATGGAATGGGATGCCCTATTGGCAGTCCATACATCTGGATTAT 38266008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      420 TTGCACTTTGGGATGGAATGGAATGGGATGCCCTATTGGCAGTCCATACATCTGGATTAT 479

 38266009 AAATGGATTTCCATCCCATCTTCCTCCCCATCTCTTTCCCTTTTTGATCATTCTATGGAA 38266068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      480 AAATGGATTTCCATCCCATCTTCCTCCCCATCTCTTTCCCTTTTTGATCATTCTATGGAA 539

 38266069 ATGGAAAGCTAGCAGAAGTTTGAAGAATTGTCACGCAAACAACAACAACAA---AACTTT 38266125
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||
      540 ATGGAAAGCTAGCAGAAGTTTGAAGAATTGTCACGCAAACAACAACAACAACAAAACTTT 599

 38266126 AGCATATTAACCTGTTGTCCAACCTTATATAAGCAGTTTGTATTTAAAACATCCCTAAGT 38266185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      600 AGCATATTAACCTGTTGTCCAACCTTATATAAGCAGTTTGTATTTAAAACATCCCTAAGT 659

 38266186 GGATTTTAATTCCAGTTTCAATCATTGTTAACTATTTTTGAAATATTTAAAATCCCA 38266242
          ||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      660 GGATTTTAATTCCAATTTCAATCATTGTTAACTATTTTTGAAATATTTAAAATCCCA 716

EXCISED REGION

 38266251 ACCACTATTTCTCTTCAACTAGTCCTTACTTTTATAAACAAAAAAGTAACAGTAAATAAT 38266310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      717 ACCACTATTTCTCTTCAACTAGTCCTTACTTTTATAAACAAAAAAGTAACAGTAAATAAT 776

 38266311 TTATAACTAGGTCTCTCTGAATCTAAAAACACGTTCTTATACACTATGTGATGCCATATT 38266370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
      777 TTATAACTAGGTCTCTCTGAATCTAAAAACACATTCTTATACACTATGTGATGCCATATT 836

 38266371 TTTTACTCTTGTCTTTGTGAGTTTTTTGTGCCATTCTCTCCTCTGGAATGGTCTTCTGTG 38266430
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      837 TTTTACTCTTGACTTTGTGAGTTTTTTGTGCCATTCTCTCCTCTGGAATGGTCTTCTGTG 896

 38266431 CTTACACATTCCAAGGGCTACTCCATTTTACAAGAAACAGTTCATGTTTGCTACTTTGGG 38266490
          .|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      897 TTTACACATTCCAAGGGCTAATCCATTTTACAAGAAACAGTTCATGTTTGCTACTTTGGG 956

 38266491 GTTGATCCCATGATAATTCTGGTTCTCACTTGGTCTTTCCCTGTGAGATGCAGTAGCATT 38266550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      957 GTTGATCCCATGATAATTCTGGTTCTCACTTGGTCTTTCCCTGTGAGATGCAGTAGCATT 1016

 38266551 CAAAATTCTCAGACTATTCTATGCACCTTGGCAGATTTATGGTAATGGTCTATAATTGCT 38266610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1017 CAAAATTCTCAGACTATTCTATGCACCTTGGCAGATTTATGGTAATGGTCTATAATTGCT 1076

 38266611 TCATATCTGCTAACCTTGCTTCCAAAACTAGTTTTTGAGATTAATGAGACAGGAGCTTGG 38266670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1077 TCATATCTGCTAACCTTGCTTCCAAAACTAGTTTTTGAGATTAATGAGACAGGAGCTTGG 1136

 38266671 CTTTTTCTTTCTGTATAGCTTCCATAGCAACAAGAAAATATTAGACACACAGTAGGCATT 38266730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1137 CTTTTTCTTTCTGTATAGCTTCCATAGCAACAAGAAAATATTAGACACACAGTAGGCATT 1196

 38266731 GGAAGAAAATGTGTTCAGTTAAATGAACTTGATTTGAATGGAATGAGAGTTCAATGAAAC 38266790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1197 GGAAGAAAATGTGTTCAGTTAAATGAACTTGATTTGAATGGAATGAGAGTTCAATGAAAC 1256

 38266791 TGTATATATTGTGAAACGTGGCAACTTACACCTACTCAAGACATTAAAAGAGATCATGCT 38266850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1257 TGTATATATTGTGAAACGTGGCAACTTACACCTACTCAAGACATTAAAAGAGATCATGCT 1316

 38266851 TTCTTGCCTAAGTTTTATGTCCAATTTGTTCCTGTTTCAAACCCCTCGACAAAAACAAAA 38266910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1317 TTCTTGCCTAAGTTTTATGTCCAATTTGTTCCTGTTTCAAACCCCTCGACAAAAACAAAA 1376

 38266911 TCTTTTAATCTGTTTGCAAAATATTTCCTCCTTCCTCCCATCTTGCTGTTGCTGCTCTGT 38266970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1377 TCTTTTAATCTGTTTGCAAAATATTTCCTCCTTCCTCCCATCTTGCTGTTGCTGCTCTGT 1436

 38266971 GATATACTGCCCTTGCTTATTACCCCTTTATAGCTGTTTTGTTAAAGTTCATACCGCTAA 38267030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1437 GATATACTGCCCTTGCTTATTACCCCTTTATAGCTGTTTTGTTAAAGTTCATACCGCTAA 1496

 38267031 GACCTGTAAAAGAAATTTATGGCTCTAGGGATTTCAGCAAATTCTAAATAACCATAACAG 38267090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1497 GACCTGTAAAAGAAATTTATGGCTCTAGGGATTTCAGCAAATTCTAAATAACCATAACAG 1556

 38267091 GAACAGGAAGCATTAATTAAAGACACTAGAGTCTAAGTTATAACAGAAATCCTGACATTT 38267150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1557 GAACAGGAAGCATTAATTAAAGACACTAGAGTCTAAGTTATAACAGAAATCCTGACATTT 1616

 38267151 AAGGCCCTGGTACCATTTAAATTTAAAATGGTATGACAAACAGAGAGTAATTTGATGGTC 38267210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1617 AAGGCCCTGGTACCATTTAAATTTAAAATGGTATGACAAACAGAGAGTAATTTGATGGTC 1676

 38267211 AGAAGGTTATAATGGATACCTTAATACCTTTGCCAAGAAAAAGTGTCTGTCCTTGCTCTA 38267270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1677 AGAAGGTTATAATGGATACCTTAATACCTTTGCCAAGAAAAAGTGTCTGTCCTTGCTCTA 1736

 38267271 ACCCCTACCCAGGGGCTTCAGGGGCCTCCTTCATAAAACATGGTGATGCCTAAATATTTT 38267330
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1737 ATCCCTACCCAGGGGCTTCAGGGGCCTCCTTCATAAAACATGGTGATGCCTAAATATTTT 1796

 38267331 TGCGATATCTCATATATAAGCTGGTCTTTTCTTTAAGAATACGAGAGATTAAACACCAAC 38267390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1797 TGCGATATCTCATATATAAGCTGGTCTTTTCTTTAAGAATACGAGAGATTAAACACCAAC 1856

 38267391 CCCCAACATTCATACACCAATTTTCAGATAAAACAGCTTAATATTTAAGATATATTTAGT 38267450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1857 CCCCAACATTCATACACCAATTTTCAGATAAAACAGCTTAATATTTAAGATATATTTAGT 1916

 38267451 GCAATTTGTCTATTTCTTGGTTTACTGGAGGGCTGTATTTAAAGCCAAGGGACCAAGGAA 38267510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1917 GCAATTTGTCTATTTCTTGGTTTACTGGAGGGCTGTATTTAAAGCCAAGGGACCAAGGAA 1976

 38267511 CATTCCACAACACACTAAAGCAATTTTTCCCCAGGGAATATGCTGATTCTTTCCTAAAGG 38267570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1977 CATTCCACAACACACTAAAGCAATTTTTCCCCAGGGAATATGCTGATTCTTTCCTAAAGG 2036

 38267571 CAGAAGCCGACATTCCTGACTCATTCTGCCAAACCAAGCAATGAAAAATGCTTCACCTAA 38267630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2037 CAGAAGCCGACATTCCTGACTCATTCTGCCAAACCAAGCAATGAAAAATGCTTCACCTAA 2096

 38267631 TTTGAAAGATAATTTGTAATACCAGAGACTCAACTTGTTTTGTGTATCCAATACTAGCAC 38267690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2097 TTTGAAAGATAATTTGTAATACCAGAGACTCAACTTGTTTTGTGTATCCAATACTAGCAC 2156

 38267691 CCTTTCCAGAATGTTGAAAGTACACACTGTATGATTTGTCTAATGTATATTCAAAAAAGG 38267750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2157 CCTTTCCAGAATGTTGAAAGTACACACTGTATGATTTGTCTAATGTATATTCAAAAAAGG 2216

 38267751 AATACAAATTGATCCTCAAAGTTCAAATCTGCAGTACATACTCTGTGTTCTGCCCCCACC 38267810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2217 AATACAAATTGATCCTCAAAGTTCAAATCTGCAGTACATACTCTGTGTTCTGCCCCCACC 2276

 38267811 CGTACCTTCATGAATTCTTTCACCTAGCACGCAGGCTGTTTTCCCTTTGCGAAATCCCAT 38267870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2277 CGTACCTTCATGAATTCTTTCACCTAGCACGCAGGCTGTTTTCCCTTTGCGAAATCCCAT 2336

 38267871 GGTACATTTATAGTATTAATACCACTCACTTAGAATATGCCGTATTTTGTCTAATATTGC 38267930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2337 GGTACATTTATAGTATTAATACCACTCACTTAGAATATGCCGTATTTTGTCTAATATTGC 2396

 38267931 TAGATTTTGTGTGTATAATCTTATTCCTCAAGTAAATTACAAGACAAGGACTATAATTTA 38267990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2397 TAGATTTTGTGTGTATAATCTTATTCCTCAAGTAAATTACAAGACAAGGACTATAATTTA 2456

 38267991 TACATCCTCTACAACACTTGACACTGGCTTTGATTAGGCTCTTAATAAATATTTGTTGGT 38268050
          ||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     2457 TACATCCTCTACAACACTTGGCACTGGCTTTGAGTAGGCTCTTAATAAATATTTGTTGGT 2516

 38268051 TGATTAATCAGTTGACCACACTTACTAATTGCAAGGTGACATCATTTATCATTAATAAAC 38268110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2517 TGATTAATCAGTTGACCACACTTACTAATTGCAAGGTGACATCATTTATCATTAATAAAC 2576

 38268111 ATATATGTGGATTACAAAAATATCATGTGAATTTGCATATAATCATATTAATCCCAAATT 38268170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2577 ATATATGTGGATTACAAAAATATCATGTGAATTTGCATATAATCATATTAATCCCAAATT 2636

 38268171 AGCACCTGAGAGTCCAACCACCCTCTCCTTTAGGCCCTTTTCACTTTTATGTCTACTTTT 38268230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2637 AGCACCTGAGAGTCCAACCACCCTCTCCTTTAGGCCCTTTTCACTTTTATGTCTACTTTT 2696

 38268231 GCCTCACTTACAATTCCACTACTTACTTGCCTTCTTTCTCTTTTCAGCTTTGTGCTGTTA 38268290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2697 GCCTCACTTACAATTCCACTACTTACTTGCCTTCTTTCTCTTTTCAGCTTTGTGCTGTTA 2756

 38268291 TTTAATATCTCACCAGTTGTGTAATTTCAGCTCCCAAATTGAATAAGACGTTCCCCCCAG 38268350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2757 TTTAATATCTCACCAGTTGTGTAATTTCAGCTCCCAAATTGAATAAGACGTTCCCCCCAG 2816

 38268351 TGGAACCCTCACCTTGACAAATAGCCAAATAGTA---ATTATTCCTTTCAGGGGTTGAGC 38268407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||
     2817 TGGAACCCTCACCTTGACAAATAGCCAAATAGTAATTATTATTCCTTTCAGGGGTTGAGC 2876

 38268408 TATGGAATCATGCTTGCAATATCCCAGGCTTGAGTGCCTAGATATTTATGCTATACTTCC 38268467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2877 TATGGAATCATGCTTGCAATATCCCAGGCTTGAGTGCCTAGATATTTATGCTATACTTCC 2936

 38268468 CTGTGTCGGAGTTTCCATCTGCGATTGTATTTCAAGCCCTCTCATTTTTTTTTTCAATAT 38268527
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
     2937 CTGTGTCGGAGTTTCCATCTGCGATTGTATTTCAAGCCCTCTCA-TTTTTTTTTCAATAT 2995

 38268528 GATTAAGATAATTCCTTTATGAAGTTGGAAACTCAGACATTCAGAAAGAAACTTGACGTT 38268587
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2996 GATTAAGATAATTCCTTTATGAAGCTGGAAACTCAGACATTCAGAAAGAAACTTGACGTT 3055

 38268588 TCATATTTTTGCTAACTTGCTCTTCCCATTTCCTTTCCTATCATTTTAGCCAGACTGAGG 38268647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3056 TCATATTTTTGCTAACTTGCTCTTCCCATTTCCTTTCCTATCATTTTAGCCAGACTGAGG 3115

 38268648 GAGAATTAATTTTGCAATGGTCTCTATTTTTTTTTCCAAATGTGTGACCTCCATATTAAT 38268707
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3116 GAGAATTAATTTTGCAACGGTCTCTATTTTTTTTTCCAAATGTGTGACCTCCATATTAAT 3175

 38268708 AGGAGCCAGAGTACTCATTCATCACATCTGGTCAGTGTGAAACTGACATTTACAGGGTGG 38268767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3176 AGGAGCCAGAGTACTCATTCATCACATCTGGTCAGTGTGAAACTGACATTTACAGGGTGG 3235

 38268768 AATGTTTCCCACTCAGGACAAATGGGGATCATTTGTAAAACATGCCGCACCCAATCATAG 38268827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     3236 AATGTTTCCCACTCAGGACAAATGGGGATCATTTGTAAAACATGCCACACCCAATCATAG 3295

 38268828 GTTCCCATGGATCTCCAACTACATTTTTAAGCAACAATATAAACCATTCCCGAAACTGAA 38268887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3296 GTTCCCATGGATCTCCAACTACATTTTTAAGCAACAATATAAACCATTCCCGAAACTGAA 3355

 38268888 AGGTCTTTTCAAATATTTACTGCCTACCTATGGAATTTTTATTCTGCTTGCTGCTGCCAT 38268947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3356 AGGTCTTTTCAAATATTTACTGCCTACCTATGGAATTTTTATTCTGCTTGCTGCTGCCAT 3415

 38268948 CAATAATCCTGGGAGTTCCTAGCTAAGTGTTGTGTATGACCTCCAAGGAAAGTCTTAGCA 38269007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3416 CAATAATCCTGGGAGTTCCTAGCTAAGTGTTGTGTATGACCTCCAAGGAAAGTCTTAGCA 3475

 38269008 TTGCAGAATGGGGAGGCGGGTTAGTATCCTGCATTTTTCATTCTGTCACTTTCTAGGGAC 38269067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3476 TTGCAGAATGGGGAGGCGGGTTAGTATCCTGCATTTTTCATTCTGTCACTTTCTAGGGAC 3535

 38269068 AATTACAAAGAAAATAATCATATAAGACTTATTTTTATGTTTATTATGAAAGCCTTCAGC 38269127
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3536 AATTACAAAGAAAATAATCGTATAAGACTTATTTTTATGTTTATTATGAAAGCCTTCAGC 3595

 38269128 TCTTGCATTTGCAAGTAAGCTCAATGATTTTAAGTTTGCTTTTTCCCCCATGAAATGAAA 38269187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3596 TCTTGCATTTGCAAGTAAGCTCAATGATTTTAAGTTTGCTTTTTCCCCCATGAAATGAAA 3655

 38269188 TATTATTTCCCACTTCTTCCATGAATCTATTGGGTAACTCCAGGCCACTGTGATCTTTCA 38269247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3656 TATTATTTCCCACTTCTTCCATGAATCTATTGGGTAACTCCAGGCCACTGTGATCTTTCA 3715

 38269248 TCTGGCATTTTGCTTTTATTTTTCTAGATCACAGTTGTGATTTAAAGCCCTCCTGGCACT 38269307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3716 TCTGGCATTTTGCTTTTATTTTTCTAGATCACAGTTGTGATTTAAAGCCCTCCTGGCACT 3775

 38269308 TGGACACCTTGGTGATCTTAGCTCATGCTCCTAGTTCCATAGTGATGAATTGACCAAACT 38269367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3776 TGGACACCTTGGTGATCTTAGCTCATGCTCCTAGTTCCATAGTGATGAATTGACCAAACT 3835

 38269368 TTTTCCCAAGGATATCTGCTAATTCTGGAGTTTCTGCTTTCTTATTATCTGTTCTGTCTT 38269427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3836 TTTTCCCAAGGATATCTGCTAATTCTGGAGTTTCTGCTTTCTTATTATCTGTTCTGTCTT 3895

 38269428 TTGGTTCTGTATTGATATAACAAGCTTTGTCCCCTTATCAATGAGGGCACAAAATGCAGC 38269487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     3896 TTGGTTCTGTATTGATATAACAAGCTTTGTCCCCTTATCAATGAGGGCACAAAATGAAGC 3955

 38269488 ACTTCAAATAATTTCTGCAAAAATTTACAGTTGCTGCATTAAGAATTTTGTGAGCTTCAA 38269547
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3956 ACTTCAAATAGTTTCTGCAAAAATTTACAGTTGCTGCATTAAGAATTTTGTGAGCTTCAA 4015

 38269548 TAATGTTATTGAAAAGTTGCAGATTCCCTCCTCCTTCTTTTTCTCCTTTCCTCCTCTTTC 38269607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4016 TAATGTTATTGAAAAGTTGCAGATTCCCTCCTCCTTCTTTTTCTCCTTTCCTCCTCTTTC 4075

 38269608 TGCCCTGTCTCCCCTTCATTATTCTCCTCTTCTTCTCAAAAGCAAACAATCATTTTTCTT 38269667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4076 TGCCCTGTCTCCCCTTCATTATTCTCCTCTTCTTCTCAAAAGCAAACAATCATTTTTCTT 4135

 38269668 GCCTACTGAAGAATACTTGTAATGTTATTCTCAAAACCTGGACACCAGCTCAACTCCTTC 38269727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4136 GCCTACTGAAGAATACTTGTAATGTTATTCTCAAAACCTGGACACCAGCTCAACTCCTTC 4195

 38269728 TTTGTTCTACAAGTATTCACCCACCCTAATAGGGAGTTTATTCCAATGAAAAGACTGTGT 38269787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4196 TTTGTTCTACAAGTATTCACCCACCCTAATAGGGAGTTTATTCCAATGAAAAGACTGTGT 4255

 38269788 TCCTCCTCAGAGGAATTTATGAGGTGGTAAGAGAGTAGAATTGCATTAATCTTATGCCAT 38269847
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4256 TCCTCCTCAGAGGAATTTATGAGGAGGTAAGAGAGTAGAATTGCATTAATCTTATGCCAT 4315

 38269848 TCCTAGAGAATTCTTATTTCCTCAATTAAGGTTTAATTGCTCTGTTCTGAAAAAAAAAAA 38269907
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||
     4316 TCCTAGAGAATTCTTATTTCCTCAATTAAGGTTTAATTGCTCTGTTCTG----AAAAAAA 4371

 38269908 AAAATGGTGAGTCCAAGCAGATAATTTACAGTGACCTGTATCTGTGACTAGTTTTAAGGC 38269967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4372 AAAATGGTGAGTCCAAGCAGATAATTTACAGTGACCTGTATCTGTGACTAGTTTTAAGGC 4431

 38269968 TACCCTGAGGTCAGAATTTAAACATGTTAATTCAGTACTGGACTTAATAGTAAACAAGAT 38270027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4432 TACCCTGAGGTCAGAATTTAAACATGTTAATTCAGTACTGGACTTAATAGTAAACAAGAT 4491

 38270028 AGAGATATCTCTGTCTCACAAAGATTTGTAATACAACTCACAGAAGCTTTACTCCAAATG 38270087
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     4492 AGAGATATCTCTGTCTCACAGAGATTTGTAATACAACTCACAGACGCTTTACTCCAAATG 4551

 38270088 AAAGGGTCATAGTTAGAGGGAAATTCCATAATAATAGTACCTATCTGATAGGGTGAATGT 38270147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4552 AAAGGGTCATAGTTAGAGGGAAATTCCATAATAATAGTACCTATCTGATAGGGTGAATGT 4611

 38270148 GGGAATTAAACGAGTTCATAGCTATAAAGAATTTCAGAGGCCATCTGGCAATCACAAATA 38270207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4612 GGGAATTAAACGAGTTCATAGCTATAAAGAATTTCAGAGGCCATCTGGCAATCACAAATA 4671

 38270208 ATAACTCTTAGTGGCAGCATTAGCTAGTTCCTGAATAGCCAAATATCTTGAATCCTCATA 38270267
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4672 ATAACTGTTAGTGGCAGCATTAGCTAGTTCCTGAATAGCCAAATATCTTGAATCCTCATA 4731

 38270268 ACAATGATTCAAATAAATGTCATCATTATTTCACAGAGTAAGATACTTAAGCATTGGGAG 38270327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4732 ACAATGATTCAAATAAATGTCATCATTATTTCACAGAGTAAGATACTTAAGCATTGGGAG 4791

 38270328 TTATTAAGCAATTCTTTAAGGACATAGCAGCAACATGTAGAGGAGCTGAAATTACAACAT 38270387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4792 TTATTAAGCAATTCTTTAAGGACATAGCAGCAACATGTAGAGGAGCTGAAATTACAACAT 4851

 38270388 GGTTCTTTCCGAACTTTAAGTCCCCTGTTTTTGTGTCTATGACTTTAAATATTCATAGTG 38270447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4852 GGTTCTTTCCGAACTTTAAGTCCCCTGTTTTTGTGTCTATGACTTTAAATATTCATAGTG 4911

 38270448 GAATATCTATCTATCTACAGATAATTTCATGAAACATTAAACTAAGTTTGG--TTTTTCT 38270505
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||
     4912 GAATATCTATCTATCTACAGATAATTTCATGAAACATTAAACTAAGTTT--TTTTTTTCT 4969

 38270506 AAAATGCTAACCTCTGTTTAACTATCAACCTAGGCAAAAATGGACAATTCCCTGTACCTC 38270565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4970 AAAATGCTAACCTCTGTTTAACTATCAACCTAGGCAAAAATGGACAATTCCCTGTACCTC 5029

 38270566 AGAAGCTTTCCTAGTGCTCCTCCCATTCATAAAAATCTCCCATCCTTGGAAAATAGCCAC 38270625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5030 AGAAGCTTTCCTAGTGCTCCTCCCATTCATAAAAATCTCCCATCCTTGGAAAATAGCCAC 5089

 38270626 GATAAAAATTATATCAAATCCCAACTTTTTATTTGTCCTTTTAACCAAATGACTTATGCT 38270685
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     5090 GATAAAAATTATATCAAATCCCAACTTTTTATTTGCCCTTTTAACCAAATGACTTATGCT 5149

 38270686 TTTCTAAATGATACAGATTTGCTTTGCCTATTTGGGAATGTTACATAACTAGAATCCTAG 38270745
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     5150 TTTCTAAATGATACAGATTTGCTTTGCCTATTTGGGAATGTTATATAACTAGAATCCTAG 5209

 38270746 ACAGAGCTCTTAATTGTAACATTGTCATACATCAAATGTCAAGTGTCTACAAAGGGATGG 38270805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5210 ACAGAGCTCTTAATTGTAACATTGTCATACATCAAATGTCAAGTGTCTACAAAGGGATGG 5269

 38270806 ATCACTCTGGGCTTTCAATGTTCTTCCATTGGTCTATTAAATTCCCTTAGAGCAATAATC 38270865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5270 ATCACTCTGGGCTTTCAATGTTCTTCCATTGGTCTATTAAATTCCCTTAGAGCAATAATC 5329

 38270866 CTAGTATCTCATTTACTGAAGTGTTACAATAGGATTTATTTTTTGGTGGAATAAGTCCAA 38270925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5330 CTAGTATCTCATTTACTGAAGTGTTACAATAGGATTTATTTTTTGGTGGAATAAGTCCAA 5389

 38270926 CCATCTTCTTGTTTGTTCTTCAAGAATGCATGGACTATTCTCTGTACTTTGCCTTATCAC 38270985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5390 CCATCTTCTTGTTTGTTCTTCAAGAATGCATGGACTATTCTCTGTACTTTGCCTTATCAC 5449

 38270986 ATACATTTAAAAATAAACCTATTATTGCTATGAAATAATAATAAATAAAAGACTTGGGTT 38271045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5450 ATACATTTAAAAATAAACCTATTATTGCTATGAAATAATAATAAATAAAAGACTTGGGTT 5509

 38271046 TTGTTTGATGTTACATTATGTCTATAAAGTAAGGATCACTGACATCTGTAAAATTTGAAT 38271105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5510 TTGTTTGATGTTACATTATGTCTATAAAGTAAGGATCACTGACATCTGTAAAATTTGAAT 5569

 38271106 CTCCTAGTCTATAAAAAATTGAATATTTTTTGCTTATTCTGGGATCATTTCGATTATCTC 38271165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5570 CTCCTAGTCTATAAAAAATTGAATATTTTTTGCTTATTCTGGGATCATTTCGATTATCTC 5629

 38271166 CCAATAATGATTTTTGGTTGTCTCTGTAAAGATCTAGTACATAGTTTGCTAGATTTATTG 38271225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5630 CCAATAATGATTTTTGGTTGTCTCTGTAAAGATCTAGTACATAGTTTGCTAGATTTATTG 5689

 38271226 TTAGAATTTTAATGTTTATGTTATTTTAAATAGTGTAAGTTTTATTTTTACTTATTTATT 38271285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5690 TTAGAATTTTAATGTTTATGTTATTTTAAATAGTGTAAGTTTTATTTTTACTTATTTATT 5749

 38271286 TATTTTAC-TTTTTCATGTCATTCACCTTTTAATCTTACAATGGTTTCTCATTGCTTAAA 38271344
          |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5750 TATTTTACTTTTTTCATGTCATTCACCTTTTAATCTTACAATGGTTTCTCATTGCTTAAA 5809

 38271345 AACTCGAGATACATAACATGCACAATATAAGTGCACAAAACACATTCTATGAATTTTTGC 38271404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5810 AACTCGAGATACATAACATGCACAATATAAGTGCACAAAACACATTCTATGAATTTTTGC 5869

 38271405 ACATGCATACACTCATGAAACTACCAACCAGATCAAAATAAAGAATTTTTTGTTTTGTTT 38271464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5870 ACATGCATACACTCATGAAACTACCAACCAGATCAAAATAAAGAATTTTTTGTTTTGTTT 5929

 38271465 TGAGACAGGGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCCATCATATGTGTCC 38271524
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5930 TGAGACAGGGTCTTGCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCCATCATATGTGTCC 5989

 38271525 TCTTTATTGTAATATGCAAAATACTATTAACTTTTGAATAATAATAAACTTGTACAATCC 38271584
          |||||.||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     5990 TCTTTGTTGTAATATGTAAAATACTATTAATTTTTGAATAATAATAAACTTGTACAATCC 6049

 38271585 CCTTTTCAAGTGTAATAGTTTTTGAAGATTCTCTTGGACCTTCTGTGTGTATGATTGCAT 38271644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6050 CCTTTTCAAGTGTAATAGTTTTTGAAGATTCTCTTGGACCTTCTGTGTGTATGATTGCAT 6109

 38271645 TATATGCAGATAATAAGACCTTTAATTCTTCTTTTCACTTCCTTATACATCATTTCTTAT 38271704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6110 TATATGCAGATAATAAGACCTTTAATTCTTCTTTTCACTTCCTTATACATCATTTCTTAT 6169

 38271705 TTATGTAGTTATAAATTTATATGTGTATTTATGCATATGTATATTATTTGTTTAAGGACA 38271764
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6170 TTATGTAGTTATAAATTTATATGCGTATTTATGCATATGTATATTATTTGTTTAAGGACA 6229

 38271765 TATCATTAAAATGTAGAGAAGCTGGAATTATGGTTATTTCTGAACTTAAAGACTATTCAT 38271824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6230 TATCATTAAAATGTAGAGAAGCTGGAATTATGGTTATTTCTGAACTTAAAGACTATTCAT 6289

 38271825 ATTTAATTATCAATTTCATAGGGAATGCTTTGTTTCAACAGTAAGTATTAATTTTGCTAT 38271884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6290 ATTTAATTATCAATTTCATAGGGAATGCTTTGTTTCAACAGTAAGTATTAATTTTGCTAT 6349

 38271885 AAGTGTTTGTGTGTTTGTTAGGTTTTAATGAGATCGTTTACTGGATA 38271931
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6350 AAGTGTTTGTGTGTTTGTTAGGTTTTAATGAGATCGTTTACTGGATA 6396

Alignment time is 6.46875 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38249892,38276749] =>     26858 nucs '18 dna:chromosome chromosome:GRCh37:18:1:78077248:1'
Second seq [       1,    2630] =>      2630 nucs 'mol-32-30eb-087814_2630'

Score:        2471
Aligned:      2635        nucs
Identic:      2616 ( 99%) nucs =>      1913 ( 99%)       703 ( 99%)
Gaps:            9 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38264319,38266242] EXCISED REGION [38266251,38266957]
 second seq =>  [       1,    1923] EXCISED REGION [    1924,    2630]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         8 nucs [38266243,38266250]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         8 nucs [38266243,38266250] to [38266251,38266258]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [38266242,38266242] to [38266251,38266251]
 second seq =>         1 nucs [1923,1923] to [1924,1924]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 38264319 AGAGTCAAAAGACTCTGAAAAATGGAGAAAAAGTGCAGACAGGCTAAGGATTTGGGAGAT 38264378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGAGTCAAAAGACTCTGAAAAATGGAGAAAAAGTGCAGACAGGCTAAGGATTTGGGAGAT 60

 38264379 TGAGGAACAACGACAGGTGAGTTCTCTGTCTTTTTTTTT-CTTTCTTTTTTGATATATAT 38264437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
       61 TGAGGAACAACGACAGGTGAGTTCTCTGTCTTTTTTTTTTCTTTCTTTTTTGATATATAT 120

 38264438 ATATATATCAACAATCTCAATGTTTAAGAGAAGCCCTCAAGCCAGAATTTCCAACAGTTG 38264497
          ||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
      121 ATAT----CAACAATCTCAATGTTTAAGAGAAGCCCTCAATCCAGAATTTCCAACAGTTG 176

 38264498 CAGATAAAACATTGTGCTTGCTTAACGTATTTAACCAAAAGACCCGAAAAGCAAGGATAT 38264557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      177 CAGATAAAACATTGTGCTTGCTTAACGTATTTAACCAAAAGACCCGAAAAGCAAGGATAT 236

 38264558 AAAAGAATATTTTAATAATATCATTCTGTTCTTAAGGTGAACACTTCAAAGAAACCACAC 38264617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      237 AAAAGAATATTTTAATAATATCATTCTGTTCTTAAGGTGAACACTTCAAAGAAACCACAC 296

 38264618 CCCTCCCCTCCCCAATGCGTGCTGAAGCAGTGGAATCCATGAGTGGAACCTTGTCATATA 38264677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      297 CCCTCCCCTCCCCAATGCGTGCTGAAGCAGTGGAATCCATGAGTGGAACCTTGTCATATA 356

 38264678 TAATCTCCACACTAAATTTATAGCAAAGCCCCCATCTCTCAACCTGTGTTGAAATTCTGA 38264737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      357 TAATCTCCACACTAAATTTATAGCAAAGCCCCCATCTCTCAACCTGTGTTGAAATTCTGA 416

 38264738 CTTCCAGACACACCTTTCAGTAATGAGGAGGTACTCTTCCATGATAAACCCTGTGGGCAA 38264797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      417 CTTCCAGACACACCTTTCAGTAATGAGGAGGTACTCTTCCATGATAAACCCTGTGGGCAA 476

 38264798 AGCTTCCACATTCATCCCACCCCTAAAGCAATAAATTTGCACCTTTCCCAAGTAGAATCA 38264857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      477 AGCTTCCACATTCATCCCACCCCTAAAGCAATAAATTTGCACCTTTCCCAAGTAGAATCA 536

 38264858 ATGGGAAGAATTTTGACTTCTATCCCCACCTGATGGTAATGAGGCAGTATCTCTCTCTTT 38264917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      537 ATGGGAAGAATTTTGACTTCTATCCCCACCTGATGGTAATGAGGCAGTATCTCTCTCTTT 596

 38264918 TTCCAGACAGTGTTTAAGAATTTGTTGTATAGAGCGCTATTACCTGAATAACACATTGTG 38264977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      597 TTCCAGACAGTGTTTAAGAATTTGTTGTATAGAGCGCTATTACCTGAATAACACATTGTG 656

 38264978 GCAGAGCAAAATAACCCTTAAGCATTTAGTTTTCAGATTTATTTTCAACTATTTAGAGGG 38265037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      657 GCAGAGCAAAATAACCCTTAAGCATTTAGTTTTCAGATTTATTTTCAACTATTTAGAGGG 716

 38265038 TTATTTCTTGACTACCACAGATAAGTCATTCCCTTCTCCATTGTTCTATAGTTTACTGCC 38265097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      717 TTATTTCTTGACTACCACAGATAAGTCATTCCCTTCTCCATTGTTCTATAGTTTACTGCC 776

 38265098 CTTTTTTTCTATCATGGCATTTACCCACTATTTCATATTGTTATTTATAGTTTACATGCT 38265157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
      777 CTTTTTTTCTATCATGGCATTTACCCACTATTTCATATTGTTATTTTTAGTTTACATGCT 836

 38265158 TAATATCTCCATCTCCCAACAAATATGGGAACATCATTAGGTCAGAGAAATTTTATTTCT 38265217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      837 TAATATCTCCATCTCCCAACAAATATGGGAACATCATTAGGTCAGAGAAATTTTATTTCT 896

 38265218 TTTCCCTCTGAAGTCTCAGTATTAGTTGTTACATTAATTAGCACTTATTTAAATTTTTAG 38265277
          ||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      897 TTCCCCTCTGAAGTCTCAGTACTAGTTGTTACATTAATTAGCACTTATTTAAATTTTTAG 956

 38265278 TTTTCTTTTTCTTTGCCTCATGTTACTGTTACACCCTTCCACTACCAAGCTTAAAGTTAG 38265337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      957 TTTTCTTTTTCTTTGCCTCATGTTACTGTTACACCCTTCCACTACCAAGCTTAAAGTTAG 1016

 38265338 GAATGATTCATGTGACTGGAATTGAATGACTGCTCTGAGAAAGAAGTCCATAAAAGTCTG 38265397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1017 GAATGATTCATGTGACTGGAATTGAATGACTGCTCTGAGAAAGAAGTCCATAAAAGTCTG 1076

 38265398 CATGCAATTTGCCATGTCTCCATCCTTTCTTTGCCATAGAAACTAAAGATCTTCCAGATA 38265457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     1077 CATGCAATTTGCCATGTCTCCATCCTTTCTTTGCCATAGAAACTAAAGCTCTTCCAGATA 1136

 38265458 GTCGAGGCTCTGTTAATGTTATTTCTTGAATAACGACTATCTGAACAGAACATCTGTGAC 38265517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1137 GTCGAGGCTCTGTTAATGTTATTTCTTGAATAACGACTATCTGAACAGAACATCTGTGAC 1196

 38265518 TTGGAATGGGGACATGTAGCTTGGAGAAAAAGTAAGCACACAGTGTTTTAAGTTACTGTG 38265577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1197 TTGGAATGGGGACATGTAGCTTGGAGAAAAAGTAAGCACACAGTGTTTTAAGTTACTGTG 1256

 38265578 GTTTTATGGTTATTTGTTACTGCAGCATAACCCACCCTGCCCTGACTTAAGTGATATAAT 38265637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1257 GTTTTATGGTTATTTGTTACTGCAGCATAACCCACCCTGCCCTGACTTAAGTGATATAAT 1316

 38265638 ATTTAACAAATATTTATAAAATAAATAAATTCAAATTCACTCTAATACCTAGAAAATTAT 38265697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1317 ATTTAACAAATATTTATAAAATAAATAAATTCAAATTCACTCTAATACCTAGAAAATTAT 1376

 38265698 CAAGTATAGTAAACCAAATAATAAATATTTATTAAGGAATATGGAAACAGTGACCTATGA 38265757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1377 CAAGTATAGTAAACCAAATAATAAATATTTATTAAGGAATATGGAAACAGTGACCTATGA 1436

 38265758 GAAGTCTTGATATACTGACCATCCATTGTTGCAGCAGATCTCACTATTGCTATTGTGCTT 38265817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1437 GAAGTCTTGATATACTGACCATCCATTGTTGCAGCAGATCTCACTATTGCTATTGTGCTT 1496

 38265818 AACATTTCAATTACAAAAATTAAAAAAAAAAAACACCATTCATCAGTGCAGGTCTGTGTA 38265877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1497 AACATTTCAATTACAAAAATTAAAAAAAAAAAACACCATTCATCAGTGCAGGTCTGTGTA 1556

 38265878 TTTAAAGAAATAATTTACAAGTTTTTTTTTCCTTTGTAAACATATTGTTTTGAAGTGCAA 38265937
          ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
     1557 TTTAAAGAAATAATTTACAAGTTTTTTTT-CCTTTGTAAACATATTGTTTTGAAGTGCAA 1615

 38265938 ATATATATAATTTGCACTTTGGGATGGAATGGAATGGGATGCCCTATTGGCAGTCCATAC 38265997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1616 ATATATATAATTTGCACTTTGGGATGGAATGGAATGGGATGCCCTATTGGCAGTCCATAC 1675

 38265998 ATCTGGATTATAAATGGATTTCCATCCCATCTTCCTCCCCATCTCTTTCCCTTTTTGATC 38266057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1676 ATCTGGATTATAAATGGATTTCCATCCCATCTTCCTCCCCATCTCTTTCCCTTTTTGATC 1735

 38266058 ATTCTATGGAAATGGAAAGCTAGCAGAAGTTTGAAGAATTGTCACGCAAACAACAACAAC 38266117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1736 ATTCTATGGAAATGGAAAGCTAGCAGAAGTTTGAAGAATTGTCACGCAAACAACAACAAC 1795

 38266118 AA---AACTTTAGCATATTAACCTGTTGTCCAACCTTATATAAGCAGTTTGTATTTAAAA 38266174
          ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1796 AACAAAACTTTAGCATATTAACCTGTTGTCCAACCTTATATAAGCAGTTTGTATTTAAAA 1855

 38266175 CATCCCTAAGTGGATTTTAATTCCAGTTTCAATCATTGTTAACTATTTTTGAAATATTTA 38266234
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1856 CATCCCTAAGTGGATTTTAATTCCAATTTCAATCATTGTTAACTATTTTTGAAATATTTA 1915

 38266235 AAATCCCA 38266242
          ||||||||
     1916 AAATCCCA 1923

EXCISED REGION

 38266251 ACCACTATTTCTCTTCAACTAGTCCTTACTTTTATAAACAAAAAAGTAACAGTAAATAAT 38266310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1924 ACCACTATTTCTCTTCAACTAGTCCTTACTTTTATAAACAAAAAAGTAACAGTAAATAAT 1983

 38266311 TTATAACTAGGTCTCTCTGAATCTAAAAACACGTTCTTATACACTATGTGATGCCATATT 38266370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     1984 TTATAACTAGGTCTCTCTGAATCTAAAAACACATTCTTATACACTATGTGATGCCATATT 2043

 38266371 TTTTACTCTTGTCTTTGTGAGTTTTTTGTGCCATTCTCTCCTCTGGAATGGTCTTCTGTG 38266430
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2044 TTTTACTCTTGACTTTGTGAGTTTTTTGTGCCATTCTCTCCTCTGGAATGGTCTTCTGTG 2103

 38266431 CTTACACATTCCAAGGGCTACTCCATTTTACAAGAAACAGTTCATGTTTGCTACTTTGGG 38266490
          .|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2104 TTTACACATTCCAAGGGCTAATCCATTTTACAAGAAACAGTTCATGTTTGCTACTTTGGG 2163

 38266491 GTTGATCCCATGATAATTCTGGTTCTCACTTGGTCTTTCCCTGTGAGATGCAGTAGCATT 38266550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2164 GTTGATCCCATGATAATTCTGGTTCTCACTTGGTCTTTCCCTGTGAGATGCAGTAGCATT 2223

 38266551 CAAAATTCTCAGACTATTCTATGCACCTTGGCAGATTTATGGTAATGGTCTATAATTGCT 38266610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2224 CAAAATTCTCAGACTATTCTATGCACCTTGGCAGATTTATGGTAATGGTCTATAATTGCT 2283

 38266611 TCATATCTGCTAACCTTGCTTCCAAAACTAGTTTTTGAGATTAATGAGACAGGAGCTTGG 38266670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2284 TCATATCTGCTAACCTTGCTTCCAAAACTAGTTTTTGAGATTAATGAGACAGGAGCTTGG 2343

 38266671 CTTTTTCTTTCTGTATAGCTTCCATAGCAACAAGAAAATATTAGACACACAGTAGGCATT 38266730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2344 CTTTTTCTTTCTGTATAGCTTCCATAGCAACAAGAAAATATTAGACACACAGTAGGCATT 2403

 38266731 GGAAGAAAATGTGTTCAGTTAAATGAACTTGATTTGAATGGAATGAGAGTTCAATGAAAC 38266790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2404 GGAAGAAAATGTGTTCAGTTAAATGAACTTGATTTGAATGGAATGAGAGTTCAATGAAAC 2463

 38266791 TGTATATATTGTGAAACGTGGCAACTTACACCTACTCAAGACATTAAAAGAGATCATGCT 38266850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2464 TGTATATATTGTGAAACGTGGCAACTTACACCTACTCAAGACATTAAAAGAGATCATGCT 2523

 38266851 TTCTTGCCTAAGTTTTATGTCCAATTTGTTCCTGTTTCAAACCCCTCGACAAAAACAAAA 38266910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2524 TTCTTGCCTAAGTTTTATGTCCAATTTGTTCCTGTTTCAAACCCCTCGACAAAAACAAAA 2583

 38266911 TCTTTTAATCTGTTTGCAAAATATTTCCTCCTTCCTCCCATCTTGCT 38266957
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2584 TCTTTTAATCTGTTTGCAAAATATTTCCTCCTTCCTCCCATCTTGCT 2630

Alignment time is 2.43679 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38249892,38276749] =>     26858 nucs '18 dna:chromosome chromosome:GRCh37:18:1:78077248:1'
Second seq [       1,    2769] =>      2769 nucs 'mol-32-3101-012455_2769'

Score:        2678
Aligned:      2770        nucs
Identic:      2760 (100%) nucs =>       104 (100%)      2656 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38259789,38259892] EXCISED REGION [38266750,38269412]
 second seq =>  [       1,     104] EXCISED REGION [     105,    2769]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6857 nucs [38259893,38266749]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [38259893,38259893] to [38266750,38266750]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [38259893,38259893] to [38266749,38266749]
 second seq =>         0 nucs

 38259789 TCTCTTATGATGCTGAACAATGCAGATGAAGAACGCTGGCTTTGGATTAAGAAGACCCTT 38259848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCTCTTATGATGCTGAACAATGCAGATGAAGAACGCTGGCTTTGGATTAAGAAGACCCTT 60

 38259849 AGTTTGAATTTTAATTTTGACCCATGATAGCTGTGTAAACTTAG 38259892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGTTTGAATTTTAATTTTGACCCATGATAGCTGTGTAAACTTAG 104

EXCISED REGION

 38266750 TAAATGAACTTGATTTGAATGGAATGAGAGTTCAATGAAACTGTATATATTGTGAAACGT 38266809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      105 TAAATGAACTTGATTTGAATGGAATGAGAGTTCAATGAAACTGTATATATTGTGAAACGT 164

 38266810 GGCAACTTACACCTACTCAAGACATTAAAAGAGATCATGCTTTCTTGCCTAAGTTTTATG 38266869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      165 GGCAACTTACACCTACTCAAGACATTAAAAGAGATCATGCTTTCTTGCCTAAGTTTTATG 224

 38266870 TCCAATTTGTTCCTGTTTCAAACCCCTCGACAAAAACAAAATCTTTTAATCTGTTTGCAA 38266929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      225 TCCAATTTGTTCCTGTTTCAAACCCCTCGACAAAAACAAAATCTTTTAATCTGTTTGCAA 284

 38266930 AATATTTCCTCCTTCCTCCCATCTTGCTGTTGCTGCTCTGTGATATACTGCCCTTGCTTA 38266989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      285 AATATTTCCTCCTTCCTCCCATCTTGCTGTTGCTGCTCTGTGATATACTGCCCTTGCTTA 344

 38266990 TTACCCCTTTATAGCTGTTTTGTTAAAGTTCATACCGCTAAGACCTGTAAAAGAAATTTA 38267049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      345 TTACCCCTTTATAGCTGTTTTGTTAAAGTTCATACCGCTAAGACCTGTAAAAGAAATTTA 404

 38267050 TGGCTCTAGGGATTTCAGCAAATTCTAAATAACCATAACAGGAACAGGAAGCATTAATTA 38267109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      405 TGGCTCTAGGGATTTCAGCAAATTCTAAATAACCATAACAGGAACAGGAAGCATTAATTA 464

 38267110 AAGACACTAGAGTCTAAGTTATAACAGAAATCCTGACATTTAAGGCCCTGGTACCATTTA 38267169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      465 AAGACACTAGAGTCTAAGTTATAACAGAAATCCTGACATTTAAGGCCCTGGTACCATTTA 524

 38267170 AATTTAAAATGGTATGACAAACAGAGAGTAATTTGATGGTCAGAAGGTTATAATGGATAC 38267229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      525 AATTTAAAATGGTATGACAAACAGAGAGTAATTTGATGGTCAGAAGGTTATAATGGATAC 584

 38267230 CTTAATACCTTTGCCAAGAAAAAGTGTCTGTCCTTGCTCTAACCCCTACCCAGGGGCTTC 38267289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
      585 CTTAATACCTTTGCCAAGAAAAAGTGTCTGTCCTTGCTCTAATCCCTACCCAGGGGCTTC 644

 38267290 AGGGGCCTCCTTCATAAAACATGGTGATGCCTAAATATTTTTGCGATATCTCATATATAA 38267349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      645 AGGGGCCTCCTTCATAAAACATGGTGATGCCTAAATATTTTTGCGATATCTCATATATAA 704

 38267350 GCTGGTCTTTTCTTTAAGAATACGAGAGATTAAACACCAACCCCCAACATTCATACACCA 38267409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      705 GCTGGTCTTTTCTTTAAGAATACGAGAGATTAAACACCAACCCCCAACATTCATACACCA 764

 38267410 ATTTTCAGATAAAACAGCTTAATATTTAAGATATATTTAGTGCAATTTGTCTATTTCTTG 38267469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      765 ATTTTCAGATAAAACAGCTTAATATTTAAGATATATTTAGTGCAATTTGTCTATTTCTTG 824

 38267470 GTTTACTGGAGGGCTGTATTTAAAGCCAAGGGACCAAGGAACATTCCACAACACACTAAA 38267529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      825 GTTTACTGGAGGGCTGTATTTAAAGCCAAGGGACCAAGGAACATTCCACAACACACTAAA 884

 38267530 GCAATTTTTCCCCAGGGAATATGCTGATTCTTTCCTAAAGGCAGAAGCCGACATTCCTGA 38267589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      885 GCAATTTTTCCCCAGGGAATATGCTGATTCTTTCCTAAAGGCAGAAGCCGACATTCCTGA 944

 38267590 CTCATTCTGCCAAACCAAGCAATGAAAAATGCTTCACCTAATTTGAAAGATAATTTGTAA 38267649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      945 CTCATTCTGCCAAACCAAGCAATGAAAAATGCTTCACCTAATTTGAAAGATAATTTGTAA 1004

 38267650 TACCAGAGACTCAACTTGTTTTGTGTATCCAATACTAGCACCCTTTCCAGAATGTTGAAA 38267709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1005 TACCAGAGACTCAACTTGTTTTGTGTATCCAATACTAGCACCCTTTCCAGAATGTTGAAA 1064

 38267710 GTACACACTGTATGATTTGTCTAATGTATATTCAAAAAAGGAATACAAATTGATCCTCAA 38267769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1065 GTACACACTGTATGATTTGTCTAATGTATATTCAAAAAAGGAATACAAATTGATCCTCAA 1124

 38267770 AGTTCAAATCTGCAGTACATACTCTGTGTTCTGCCCCCACCCGTACCTTCATGAATTCTT 38267829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1125 AGTTCAAATCTGCAGTACATACTCTGTGTTCTGCCCCCACCCGTACCTTCATGAATTCTT 1184

 38267830 TCACCTAGCACGCAGGCTGTTTTCCCTTTGCGAAATCCCATGGTACATTTATAGTATTAA 38267889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1185 TCACCTAGCACGCAGGCTGTTTTCCCTTTGCGAAATCCCATGGTACATTTATAGTATTAA 1244

 38267890 TACCACTCACTTAGAATATGCCGTATTTTGTCTAATATTGCTAGATTTTGTGTGTATAAT 38267949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1245 TACCACTCACTTAGAATATGCCGTATTTTGTCTAATATTGCTAGATTTTGTGTGTATAAT 1304

 38267950 CTTATTCCTCAAGTAAATTACAAGACAAGGACTATAATTTATACATCCTCTACAACACTT 38268009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1305 CTTATTCCTCAAGTAAATTACAAGACAAGGACTATAATTTATACATCCTCTACAACACTT 1364

 38268010 GACACTGGCTTTGATTAGGCTCTTAATAAATATTTGTTGGTTGATTAATCAGTTGACCAC 38268069
          |.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1365 GGCACTGGCTTTGAGTAGGCTCTTAATAAATATTTGTTGGTTGATTAATCAGTTGACCAC 1424

 38268070 ACTTACTAATTGCAAGGTGACATCATTTATCATTAATAAACATATATGTGGATTACAAAA 38268129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1425 ACTTACTAATTGCAAGGTGACATCATTTATCATTAATAAACATATATGTGGATTACAAAA 1484

 38268130 ATATCATGTGAATTTGCATATAATCATATTAATCCCAAATTAGCACCTGAGAGTCCAACC 38268189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1485 ATATCATGTGAATTTGCATATAATCATATTAATCCCAAATTAGCACCTGAGAGTCCAACC 1544

 38268190 ACCCTCTCCTTTAGGCCCTTTTCACTTTTATGTCTACTTTTGCCTCACTTACAATTCCAC 38268249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1545 ACCCTCTCCTTTAGGCCCTTTTCACTTTTATGTCTACTTTTGCCTCACTTACAATTCCAC 1604

 38268250 TACTTACTTGCCTTCTTTCTCTTTTCAGCTTTGTGCTGTTATTTAATATCTCACCAGTTG 38268309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1605 TACTTACTTGCCTTCTTTCTCTTTTCAGCTTTGTGCTGTTATTTAATATCTCACCAGTTG 1664

 38268310 TGTAATTTCAGCTCCCAAATTGAATAAGACGTTCCCCCCAGTGGAACCCTCACCTTGACA 38268369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1665 TGTAATTTCAGCTCCCAAATTGAATAAGACGTTCCCCCCAGTGGAACCCTCACCTTGACA 1724

 38268370 AATAGCCAAATAGTA---ATTATTCCTTTCAGGGGTTGAGCTATGGAATCATGCTTGCAA 38268426
          |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1725 AATAGCCAAATAGTAATTATTATTCCTTTCAGGGGTTGAGCTATGGAATCATGCTTGCAA 1784

 38268427 TATCCCAGGCTTGAGTGCCTAGATATTTATGCTATACTTCCCTGTGTCGGAGTTTCCATC 38268486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1785 TATCCCAGGCTTGAGTGCCTAGATATTTATGCTATACTTCCCTGTGTCGGAGTTTCCATC 1844

 38268487 TGCGATTGTATTTCAAGCCCTCTCATTTTTTTTTTCAATATGATTAAGATAATTCCTTTA 38268546
          ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1845 TGCGATTGTATTTCAAGCCCTCTCA-TTTTTTTTTCAATATGATTAAGATAATTCCTTTA 1903

 38268547 TGAAGTTGGAAACTCAGACATTCAGAAAGAAACTTGACGTTTCATATTTTTGCTAACTTG 38268606
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1904 TGAAGCTGGAAACTCAGACATTCAGAAAGAAACTTGACGTTTCATATTTTTGCTAACTTG 1963

 38268607 CTCTTCCCATTTCCTTTCCTATCATTTTAGCCAGACTGAGGGAGAATTAATTTTGCAATG 38268666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     1964 CTCTTCCCATTTCCTTTCCTATCATTTTAGCCAGACTGAGGGAGAATTAATTTTGCAACG 2023

 38268667 GTCTCTATTTTTTTTTCCAAATGTGTGACCTCCATATTAATAGGAGCCAGAGTACTCATT 38268726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2024 GTCTCTATTTTTTTTTCCAAATGTGTGACCTCCATATTAATAGGAGCCAGAGTACTCATT 2083

 38268727 CATCACATCTGGTCAGTGTGAAACTGACATTTACAGGGTGGAATGTTTCCCACTCAGGAC 38268786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2084 CATCACATCTGGTCAGTGTGAAACTGACATTTACAGGGTGGAATGTTTCCCACTCAGGAC 2143

 38268787 AAATGGGGATCATTTGTAAAACATGCCGCACCCAATCATAGGTTCCCATGGATCTCCAAC 38268846
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     2144 AAATGGGGATCATTTGTAAAACATGCCACACCCAATCATAGGTTCCCATGGATCTCCAAC 2203

 38268847 TACATTTTTAAGCAACAATATAAACCATTCCCGAAACTGAAAGGTCTTTTCAAATATTTA 38268906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2204 TACATTTTTAAGCAACAATATAAACCATTCCCGAAACTGAAAGGTCTTTTCAAATATTTA 2263

 38268907 CTGCCTACCTATGGAATTTTTATTCTGCTTGCTGCTGCCATCAATAATCCTGGGAGTTCC 38268966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2264 CTGCCTACCTATGGAATTTTTATTCTGCTTGCTGCTGCCATCAATAATCCTGGGAGTTCC 2323

 38268967 TAGCTAAGTGTTGTGTATGACCTCCAAGGAAAGTCTTAGCATTGCAGAATGGGGAGGCGG 38269026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2324 TAGCTAAGTGTTGTGTATGACCTCCAAGGAAAGTCTTAGCATTGCAGAATGGGGAGGCGG 2383

 38269027 GTTAGTATCCTGCATTTTTCATTCTGTCACTTTCTAGGGACAATTACAAAGAAAATAATC 38269086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2384 GTTAGTATCCTGCATTTTTCATTCTGTCACTTTCTAGGGACAATTACAAAGAAAATAATC 2443

 38269087 ATATAAGACTTATTTTTATGTTTATTATGAAAGCCTTCAGCTCTTGCATTTGCAAGTAAG 38269146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2444 ATATAAGACTTATTTTTATGTTTATTATGAAAGCCTTCAGCTCTTGCATTTGCAAGTAAG 2503

 38269147 CTCAATGATTTTAAGTTTGCTTTTTCCCCCATGAAATGAAATATTATTTCCCACTTCTTC 38269206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2504 CTCAATGATTTTAAGTTTGCTTTTTCCCCCATGAAATGAAATATTATTTCCCACTTCTTC 2563

 38269207 CATGAATCTATTGGGTAACTCCAGGCCACTGTGATCTTTCATCTGGCATTTTGCTTTTAT 38269266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2564 CATGAATCTATTGGGTAACTCCAGGCCACTGTGATCTTTCATCTGGCATTTTGCTTTTAT 2623

 38269267 TTTTCTAGATCACAGTTGTGATTTAAAGCCCTCCTGGCACTTGGACACCTTGGTGATCTT 38269326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2624 TTTTCTAGATCACAGTTGTGATTTAAAGCCCTCCTGGCACTTGGACACCTTGGTGATCTT 2683

 38269327 AGCTCATGCTCCTAGTTCCATAGTGATGAATTGACCAAACTTTTTCCCAAGGATATCTGC 38269386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2684 AGCTCATGCTCCTAGTTCCATAGTGATGAATTGACCAAACTTTTTCCCAAGGATATCTGC 2743

 38269387 TAATTCTGGAGTTTCTGCTTTCTTAT 38269412
          ||||||||||||||||||||||||||
     2744 TAATTCTGGAGTTTCTGCTTTCTTAT 2769

Alignment time is 2.56751 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38249892,38276749] =>     26858 nucs '18 dna:chromosome chromosome:GRCh37:18:1:78077248:1'
Second seq [       1,    3440] =>      3440 nucs 'mol-32-310c-090378_3440'

Score:        3298
Aligned:      3444        nucs
Identic:      3425 ( 99%) nucs =>      1590 ( 99%)      1835 (100%)
Gaps:           10 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38258295,38259892] EXCISED REGION [38266750,38268589]
 second seq =>  [       1,    1598] EXCISED REGION [    1599,    3440]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6857 nucs [38259893,38266749]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [38259893,38259893] to [38266750,38266750]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [38259893,38259893] to [38266749,38266749]
 second seq =>         0 nucs

 38258295 GTAATCTTCTAAGTGGTGTTGGGGTGTCGTCTCCCGGCTACTTCAATCCATTTTCCAATA 38258354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTAATCTTCTAAGTGGTGTTGGGGTGTCGTCTCCCGGCTACTTCAATCCATTTTCCAATA 60

 38258355 TTAAGTTTATTTGTTTAATTAAACATGTTAACTTGTGGTGCTCTTATGCTTAAAAAGTTT 38258414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTAAGTTTATTTGTTTAATTAAACATGTTAACTTGTGGTGCTCTTATGCTTAAAAAGTTT 120

 38258415 CATTAGCTTTCTATTTATATAATGAATGAAACCAATGTTTAGCCTAGTTTAAGAAATGTA 38258474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CATTAGCTTTCTATTTATATAATGAATGAAACCAATGTTTAGCCTAGTTTAAGAAATGTA 180

 38258475 AGAACTCCTTTTACCCTAGCTTTCTTCCTGTTTACTTTTATTCATCATGCCTTGAATCAT 38258534
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGAACTCCCTTTACCCTAGCTTTCTTCCTGTTTACTTTTATTCATCATGCCTTGAATCAT 240

 38258535 ACCTATCTTCTTTAATTTTCTCTAACACAAAATCCTCCTGTTTCTTCTTTGCAATCCTGC 38258594
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACCTATCTTCTCTAATTTTCTCTAACACAAAATCCTCCTGTTTCTTCTTTGCAATCCTGC 300

 38258595 AAACCCAAACCCAGCAGCTAGTAAATATTCAATATATATGAATTAATTAATTGATGAATG 38258654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAACCCAAACCCAGCAGCTAGTAAATATTCAATATATATGAATTAATTAATTGATGAATG 360

 38258655 AGTGATTTTATTTCAGATTGCTATCAAATGCTCAATTCCCCTGCATAGTATCTCCAATGA 38258714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGTGATTTTATTTCAGATTGCTATCAAATGCTCAATTCCCCTGCATAGTATCTCCAATGA 420

 38258715 GTCAAATCCTGGAATTCCCTATAGGAACACCTGGGATATATAGTATCAACTTACAAATAC 38258774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTCAAATCCTGGAATTCCCTATAGGAACACCTGGGATATATAGTATCAACTTACAAATAC 480

 38258775 CATTCTTTCTTAATTTTGAAAGAAAAACTGAGTAAAATATGAGAGCTGTAGCTTTTAAAA 38258834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CATTCTTTCTTAATTTTGAAAGAAAAACTGAGTAAAATATGAGAGCTGTAGCTTTTAAAA 540

 38258835 AAAATAGAAAATACACCATAAAAATTTTAGTCAAGCATGGCAGACTAAATACATGTATTT 38258894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAAATAGAAAATACACCATAAAAATTTTAGTCAAGCATGGCAGACTAAATACATGTATTT 600

 38258895 ATTTCTAATCTACTTCAAGCTCCAATATAATAACTGTTTACAAATGAAATGGTCTAATAT 38258954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATTTCTAATCTACTTCAAGCTCCAATATAATAACTGTTTACAAATGAAATGGTCTAATAT 660

 38258955 CACAAGTTCAAAATTAATAAGAGTGGATGAGACATGCCAACAAATTTTTGGAATGTAAAA 38259014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CACAAGTTCAAAATTAATAAGAGTGGATGAGACATGCCAACAAATTTTTGGAATGTAAAA 720

 38259015 ATAGATAAGACATTGTTAATGATTTGACAAAGCACAAAGCCTTAAAATATTTCTGTATAG 38259074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATAGATAAGACATTGTTAATGATTTGACAAAGCACAAAGCCTTAAAATATTTCTGTATAG 780

 38259075 AGAGAAGTTTCCAAAGTAGGGCAACTCAGAGATAAATCAAGAATGGGAAGATTCACACAC 38259134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGAGAAGTTTCCAAAGTAGGGCAACTCAGAGATAAATCAAGAATGGGAAGATTCACACAC 840

 38259135 CTCAACTGTAAAAGAGAAATATGAGACTAAAAGCAGTGGATTAATTAAAACTTTGTTTGA 38259194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
      841 CTCAACTGTAAAAGAGAAATATGAGACTAAAAGCAGTGGATTCATTAAAACTTTGTTTGA 900

 38259195 TGAGATATTATACATAGATGTCTTCTCCATCATTCCAAGCACTTAAGCAGCTGCCCTTTC 38259254
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
      901 TGAGATATTATACATAGATGTCTTCTCCATCATTCCAAGCACTTAAGCAGCTGCCCTTTA 960

 38259255 CAAACACTCATAGAGGATAAGAGATTATTTTCTATAAAAATCAAACCAGATTGTTGT--- 38259311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
      961 CAAACACTCATAGAGGATAAGAGATTATTTTCTATAAAAATCAAACCAGATTGT---CAC 1017

 38259312 GTACATCAAGCAAAGGAGGGATGGCAGGGAGGTGATATACTGAAACAGAATTACTGTATG 38259371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1018 GTACATCAAGCAAAGGAGGGATGGCAGGGAGGTGATATACTGAAACAGAATTACTGTATG 1077

 38259372 AAAACCTGGAATGAACAATTAGATACTCAGTTCTCCTTACCTGCACAGTAATAGTAATTC 38259431
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1078 AAAACATGGAATGAACAATTAGATACTCAGTTCTCCTTACCTGCACAGTAATAGTAATTC 1137

 38259432 TTACTACCAGACTGGATGCTGGAGGGCTCTCCTTCAGAGAAACAGAAAAGAAAAAAAAGC 38259491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1138 TTACTACCAGACTGGATGCTGGAGGGCTCTCCTTCAGAGAAACAGAAAAGAAAAAAAAGC 1197

 38259492 CTATAGCCACTAATATTTGAATCTCTGCAATTAAATACCTGGGTCCCTTCCCAATCATAT 38259551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1198 CTATAGCCACTAATATTTGAATCTCTGCAATTAAATACCTGGGTCCCTTCCCAATCATAT 1257

 38259552 AGCAGTGATGCTCACCAGTTAACAAGAACTGAAGACACATGACAGATTCCAATCAGTGAT 38259611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1258 AGCAGTGATGCTCACCAGTTAACAAGAACTGAAGACACATGACAGATTCCAATCAGTGAT 1317

 38259612 TTATTACCACTGTCAAATAAGAATGGACACTCAAAGATTACCTGAAAAAGTCCTTTAATA 38259671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1318 TTATTACCACTGTCAAATAAGAATGGACACTCAAAGATTACCTGAAAAAGTCCTTTAATA 1377

 38259672 TGGCCCCAGATTGAATAATTCCTAATTTCCTATATCATAAATTCAAAAATTATCTAAAAT 38259731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1378 TGGCCCCAGATTGAATAATTCCTAATTTCCTATATCATAAATTCAAAAATTATCTAAAAT 1437

 38259732 TCAGTGAAATTAGTCCATATTATCAATGCCAACCTTACACATAAACAGAGTTGACATTCT 38259791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1438 TCAGTGAAATTAGTCCATATTATCAATGCCAACCTTACACATAAACAGAGTTGACATTCT 1497

 38259792 CTTATGATGCTGAACAATGCAGATGAAGAACGCTGGCTTTGGATTAAGAAGACCCTTAGT 38259851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1498 CTTATGATGCTGAACAATGCAGATGAAGAACGCTGGCTTTGGATTAAGAAGACCCTTAGT 1557

 38259852 TTGAATTTTAATTTTGACCCATGATAGCTGTGTAAACTTAG 38259892
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1558 TTGAATTTTAATTTTGACCCATGATAGCTGTGTAAACTTAG 1598

EXCISED REGION

 38266750 TAAATGAACTTGATTTGAATGGAATGAGAGTTCAATGAAACTGTATATATTGTGAAACGT 38266809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1599 TAAATGAACTTGATTTGAATGGAATGAGAGTTCAATGAAACTGTATATATTGTGAAACGT 1658

 38266810 GGCAACTTACACCTACTCAAGACATTAAAAGAGATCATGCTTTCTTGCCTAAGTTTTATG 38266869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1659 GGCAACTTACACCTACTCAAGACATTAAAAGAGATCATGCTTTCTTGCCTAAGTTTTATG 1718

 38266870 TCCAATTTGTTCCTGTTTCAAACCCCTCGACAAAAACAAAATCTTTTAATCTGTTTGCAA 38266929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1719 TCCAATTTGTTCCTGTTTCAAACCCCTCGACAAAAACAAAATCTTTTAATCTGTTTGCAA 1778

 38266930 AATATTTCCTCCTTCCTCCCATCTTGCTGTTGCTGCTCTGTGATATACTGCCCTTGCTTA 38266989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1779 AATATTTCCTCCTTCCTCCCATCTTGCTGTTGCTGCTCTGTGATATACTGCCCTTGCTTA 1838

 38266990 TTACCCCTTTATAGCTGTTTTGTTAAAGTTCATACCGCTAAGACCTGTAAAAGAAATTTA 38267049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1839 TTACCCCTTTATAGCTGTTTTGTTAAAGTTCATACCGCTAAGACCTGTAAAAGAAATTTA 1898

 38267050 TGGCTCTAGGGATTTCAGCAAATTCTAAATAACCATAACAGGAACAGGAAGCATTAATTA 38267109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1899 TGGCTCTAGGGATTTCAGCAAATTCTAAATAACCATAACAGGAACAGGAAGCATTAATTA 1958

 38267110 AAGACACTAGAGTCTAAGTTATAACAGAAATCCTGACATTTAAGGCCCTGGTACCATTTA 38267169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1959 AAGACACTAGAGTCTAAGTTATAACAGAAATCCTGACATTTAAGGCCCTGGTACCATTTA 2018

 38267170 AATTTAAAATGGTATGACAAACAGAGAGTAATTTGATGGTCAGAAGGTTATAATGGATAC 38267229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2019 AATTTAAAATGGTATGACAAACAGAGAGTAATTTGATGGTCAGAAGGTTATAATGGATAC 2078

 38267230 CTTAATACCTTTGCCAAGAAAAAGTGTCTGTCCTTGCTCTAACCCCTACCCAGGGGCTTC 38267289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     2079 CTTAATACCTTTGCCAAGAAAAAGTGTCTGTCCTTGCTCTAATCCCTACCCAGGGGCTTC 2138

 38267290 AGGGGCCTCCTTCATAAAACATGGTGATGCCTAAATATTTTTGCGATATCTCATATATAA 38267349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2139 AGGGGCCTCCTTCATAAAACATGGTGATGCCTAAATATTTTTGCGATATCTCATATATAA 2198

 38267350 GCTGGTCTTTTCTTTAAGAATACGAGAGATTAAACACCAACCCCCAACATTCATACACCA 38267409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2199 GCTGGTCTTTTCTTTAAGAATACGAGAGATTAAACACCAACCCCCAACATTCATACACCA 2258

 38267410 ATTTTCAGATAAAACAGCTTAATATTTAAGATATATTTAGTGCAATTTGTCTATTTCTTG 38267469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2259 ATTTTCAGATAAAACAGCTTAATATTTAAGATATATTTAGTGCAATTTGTCTATTTCTTG 2318

 38267470 GTTTACTGGAGGGCTGTATTTAAAGCCAAGGGACCAAGGAACATTCCACAACACACTAAA 38267529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2319 GTTTACTGGAGGGCTGTATTTAAAGCCAAGGGACCAAGGAACATTCCACAACACACTAAA 2378

 38267530 GCAATTTTTCCCCAGGGAATATGCTGATTCTTTCCTAAAGGCAGAAGCCGACATTCCTGA 38267589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2379 GCAATTTTTCCCCAGGGAATATGCTGATTCTTTCCTAAAGGCAGAAGCCGACATTCCTGA 2438

 38267590 CTCATTCTGCCAAACCAAGCAATGAAAAATGCTTCACCTAATTTGAAAGATAATTTGTAA 38267649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2439 CTCATTCTGCCAAACCAAGCAATGAAAAATGCTTCACCTAATTTGAAAGATAATTTGTAA 2498

 38267650 TACCAGAGACTCAACTTGTTTTGTGTATCCAATACTAGCACCCTTTCCAGAATGTTGAAA 38267709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2499 TACCAGAGACTCAACTTGTTTTGTGTATCCAATACTAGCACCCTTTCCAGAATGTTGAAA 2558

 38267710 GTACACACTGTATGATTTGTCTAATGTATATTCAAAAAAGGAATACAAATTGATCCTCAA 38267769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2559 GTACACACTGTATGATTTGTCTAATGTATATTCAAAAAAGGAATACAAATTGATCCTCAA 2618

 38267770 AGTTCAAATCTGCAGTACATACTCTGTGTTCTGCCCCCACCCGTACCTTCATGAATTCTT 38267829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2619 AGTTCAAATCTGCAGTACATACTCTGTGTTCTGCCCCCACCCGTACCTTCATGAATTCTT 2678

 38267830 TCACCTAGCACGCAGGCTGTTTTCCCTTTGCGAAATCCCATGGTACATTTATAGTATTAA 38267889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2679 TCACCTAGCACGCAGGCTGTTTTCCCTTTGCGAAATCCCATGGTACATTTATAGTATTAA 2738

 38267890 TACCACTCACTTAGAATATGCCGTATTTTGTCTAATATTGCTAGATTTTGTGTGTATAAT 38267949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2739 TACCACTCACTTAGAATATGCCGTATTTTGTCTAATATTGCTAGATTTTGTGTGTATAAT 2798

 38267950 CTTATTCCTCAAGTAAATTACAAGACAAGGACTATAATTTATACATCCTCTACAACACTT 38268009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2799 CTTATTCCTCAAGTAAATTACAAGACAAGGACTATAATTTATACATCCTCTACAACACTT 2858

 38268010 GACACTGGCTTTGATTAGGCTCTTAATAAATATTTGTTGGTTGATTAATCAGTTGACCAC 38268069
          |.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2859 GGCACTGGCTTTGAGTAGGCTCTTAATAAATATTTGTTGGTTGATTAATCAGTTGACCAC 2918

 38268070 ACTTACTAATTGCAAGGTGACATCATTTATCATTAATAAACATATATGTGGATTACAAAA 38268129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2919 ACTTACTAATTGCAAGGTGACATCATTTATCATTAATAAACATATATGTGGATTACAAAA 2978

 38268130 ATATCATGTGAATTTGCATATAATCATATTAATCCCAAATTAGCACCTGAGAGTCCAACC 38268189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2979 ATATCATGTGAATTTGCATATAATCATATTAATCCCAAATTAGCACCTGAGAGTCCAACC 3038

 38268190 ACCCTCTCCTTTAGGCCCTTTTCACTTTTATGTCTACTTTTGCCTCACTTACAATTCCAC 38268249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3039 ACCCTCTCCTTTAGGCCCTTTTCACTTTTATGTCTACTTTTGCCTCACTTACAATTCCAC 3098

 38268250 TACTTACTTGCCTTCTTTCTCTTTTCAGCTTTGTGCTGTTATTTAATATCTCACCAGTTG 38268309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3099 TACTTACTTGCCTTCTTTCTCTTTTCAGCTTTGTGCTGTTATTTAATATCTCACCAGTTG 3158

 38268310 TGTAATTTCAGCTCCCAAATTGAATAAGACGTTCCCCCCAGTGGAACCCTCACCTTGACA 38268369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3159 TGTAATTTCAGCTCCCAAATTGAATAAGACGTTCCCCCCAGTGGAACCCTCACCTTGACA 3218

 38268370 AATAGCCAAATAGTA---ATTATTCCTTTCAGGGGTTGAGCTATGGAATCATGCTTGCAA 38268426
          |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3219 AATAGCCAAATAGTAATTATTATTCCTTTCAGGGGTTGAGCTATGGAATCATGCTTGCAA 3278

 38268427 TATCCCAGGCTTGAGTGCCTAGATATTTATGCTATACTTCCCTGTGTCGGAGTTTCCATC 38268486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3279 TATCCCAGGCTTGAGTGCCTAGATATTTATGCTATACTTCCCTGTGTCGGAGTTTCCATC 3338

 38268487 TGCGATTGTATTTCAAGCCCTCTCATTTTTTTTTTCAATATGATTAAGATAATTCCTTTA 38268546
          ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3339 TGCGATTGTATTTCAAGCCCTCTCA-TTTTTTTTTCAATATGATTAAGATAATTCCTTTA 3397

 38268547 TGAAGTTGGAAACTCAGACATTCAGAAAGAAACTTGACGTTTC 38268589
          |||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3398 TGAAGCTGGAAACTCAGACATTCAGAAAGAAACTTGACGTTTC 3440

Alignment time is 3.17804 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38249892,38276749] =>     26858 nucs '18 dna:chromosome chromosome:GRCh37:18:1:78077248:1'
Second seq [       1,    4153] =>      4153 nucs 'mol-32-3159-079224_4153'

Score:        3949
Aligned:      4161        nucs
Identic:      4136 ( 99%) nucs =>      2206 ( 99%)      1930 (100%)
Gaps:           12 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38264023,38266242] EXCISED REGION [38266251,38268187]
 second seq =>  [       1,    2216] EXCISED REGION [    2217,    4153]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         8 nucs [38266243,38266250]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         8 nucs [38266243,38266250] to [38266251,38266258]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [38266242,38266242] to [38266251,38266251]
 second seq =>         1 nucs [2216,2216] to [2217,2217]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 38264023 AGTGTATGTATTTTGGTGTACAGTATTTTCTTTATTTTTCAATTAAAATTTGTCTTGACT 38264082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGTGTATGTATTTTGGTGTACAGTATTTTCTTTATTTTTCAATTAAAATTTGTCTTGACT 60

 38264083 TCCTCTATGATGTCTTCTATGATTCTTCCTCTATAATTCTTCTTTTGACCATATAGAAGT 38264142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCCTCTATGATGTCTTCTATGATTCTTCCTCTATAATTCTTCTTTTGACCATATAGAAGT 120

 38264143 GTATTCATTAATTCAATCACATATAAATATTCTCCTTTTATCTTTTTGCTACTGGTTTGT 38264202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTATTCATTAATTCAATCACATATAAATATTCTCCTTTTATCTTTTTGCTACTGGTTTGT 180

 38264203 TTGTTTAGCTACATTTAGGGAAAATTTCATTTCTGAGACGACAGAGGAAGCACATTCCAT 38264262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTGTTTAGCTACATTTAGGGAAAATTTCATTTCTGAGACGACAGAGGAAGCACATTCCAT 240

 38264263 TTTATTCCTTCTGCTAATGACAAAAAAAAAAAAAAATTGGAAAAAACACAAAAGCCAGAG 38264322
          |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||
      241 TTTATTCCTTCTGCTAATGACAAAAAAAAAAAA---TTGGAAAAAACACAAAAGCCAGAG 297

 38264323 TCAAAAGACTCTGAAAAATGGAGAAAAAGTGCAGACAGGCTAAGGATTTGGGAGATTGAG 38264382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      298 TCAAAAGACTCTGAAAAATGGAGAAAAAGTGCAGACAGGCTAAGGATTTGGGAGATTGAG 357

 38264383 GAACAACGACAGGTGAGTTCTCTGTCTTTTTTTTT-CTTTCTTTTTTGATATATATATAT 38264441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
      358 GAACAACGACAGGTGAGTTCTCTGTCTTTTTTTTTTCTTTCTTTTTTGATATATATATAT 417

 38264442 ATATCAACAATCTCAATGTTTAAGAGAAGCCCTCAAGCCAGAATTTCCAACAGTTGCAGA 38264501
              ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
      418 ----CAACAATCTCAATGTTTAAGAGAAGCCCTCAATCCAGAATTTCCAACAGTTGCAGA 473

 38264502 TAAAACATTGTGCTTGCTTAACGTATTTAACCAAAAGACCCGAAAAGCAAGGATATAAAA 38264561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      474 TAAAACATTGTGCTTGCTTAACGTATTTAACCAAAAGACCCGAAAAGCAAGGATATAAAA 533

 38264562 GAATATTTTAATAATATCATTCTGTTCTTAAGGTGAACACTTCAAAGAAACCACACCCCT 38264621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      534 GAATATTTTAATAATATCATTCTGTTCTTAAGGTGAACACTTCAAAGAAACCACACCCCT 593

 38264622 CCCCTCCCCAATGCGTGCTGAAGCAGTGGAATCCATGAGTGGAACCTTGTCATATATAAT 38264681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      594 CCCCTCCCCAATGCGTGCTGAAGCAGTGGAATCCATGAGTGGAACCTTGTCATATATAAT 653

 38264682 CTCCACACTAAATTTATAGCAAAGCCCCCATCTCTCAACCTGTGTTGAAATTCTGACTTC 38264741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      654 CTCCACACTAAATTTATAGCAAAGCCCCCATCTCTCAACCTGTGTTGAAATTCTGACTTC 713

 38264742 CAGACACACCTTTCAGTAATGAGGAGGTACTCTTCCATGATAAACCCTGTGGGCAAAGCT 38264801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      714 CAGACACACCTTTCAGTAATGAGGAGGTACTCTTCCATGATAAACCCTGTGGGCAAAGCT 773

 38264802 TCCACATTCATCCCACCCCTAAAGCAATAAATTTGCACCTTTCCCAAGTAGAATCAATGG 38264861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      774 TCCACATTCATCCCACCCCTAAAGCAATAAATTTGCACCTTTCCCAAGTAGAATCAATGG 833

 38264862 GAAGAATTTTGACTTCTATCCCCACCTGATGGTAATGAGGCAGTATCTCTCTCTTTTTCC 38264921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
      834 GAAGAATTTTGACTTCTATCCCCACCTGATGGTAATGAGGCAGTATCTATCTCTTTTTCC 893

 38264922 AGACAGTGTTTAAGAATTTGTTGTATAGAGCGCTATTACCTGAATAACACATTGTGGCAG 38264981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      894 AGACAGTGTTTAAGAATTTGTTGTATAGAGCGCTATTACCTGAATAACACATTGTGGCAG 953

 38264982 AGCAAAATAACCCTTAAGCATTTAGTTTTCAGATTTATTTTCAACTATTTAGAGGGTTAT 38265041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      954 AGCAAAATAACCCTTAAGCATTTAGTTTTCAGATTTATTTTCAACTATTTAGAGGGTTAT 1013

 38265042 TTCTTGACTACCACAGATAAGTCATTCCCTTCTCCATTGTTCTATAGTTTACTGCCCTTT 38265101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1014 TTCTTGACTACCACAGATAAGTCATTCCCTTCTCCATTGTTCTATAGTTTACTGCCCTTT 1073

 38265102 TTTTCTATCATGGCATTTACCCACTATTTCATATTGTTATTTATAGTTTACATGCTTAAT 38265161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     1074 TTTTCTATCATGGCATTTACCCACTATTTCATATTGTTATTTTTAGTTTACATGCTTAAT 1133

 38265162 ATCTCCATCTCCCAACAAATATGGGAACATCATTAGGTCAGAGAAATTTTATTTCTTTTC 38265221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     1134 ATCTCCATCTCCCAACAAATATGGGAACATCATTAGGTCAGAGAAATTTTATTTCTTTCC 1193

 38265222 CCTCTGAAGTCTCAGTATTAGTTGTTACATTAATTAGCACTTATTTAAATTTTTAGTTTT 38265281
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1194 CCTCTGAAGTCTCAGTACTAGTTGTTACATTAATTAGCACTTATTTAAATTTTTAGTTTT 1253

 38265282 CTTTTTCTTTGCCTCATGTTACTGTTACACCCTTCCACTACCAAGCTTAAAGTTAGGAAT 38265341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1254 CTTTTTCTTTGCCTCATGTTACTGTTACACCCTTCCACTACCAAGCTTAAAGTTAGGAAT 1313

 38265342 GATTCATGTGACTGGAATTGAATGACTGCTCTGAGAAAGAAGTCCATAAAAGTCTGCATG 38265401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1314 GATTCATGTGACTGGAATTGAATGACTGCTCTGAGAAAGAAGTCCATAAAAGTCTGCATG 1373

 38265402 CAATTTGCCATGTCTCCATCCTTTCTTTGCCATAGAAACTAAAGATCTTCCAGATAGTCG 38265461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1374 CAATTTGCCATGTCTCCATCCTTTCTTTGCCATAGAAACTAAAGATCTTCCAGATAGTCG 1433

 38265462 AGGCTCTGTTAATGTTATTTCTTGAATAACGACTATCTGAACAGAACATCTGTGACTTGG 38265521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1434 AGGCTCTGTTAATGTTATTTCTTGAATAACGACTATCTGAACAGAACATCTGTGACTTGG 1493

 38265522 AATGGGGACATGTAGCTTGGAGAAAAAGTAAGCACACAGTGTTTTAAGTTACTGTGGTTT 38265581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1494 AATGGGGACATGTAGCTTGGAGAAAAAGTAAGCACACAGTGTTTTAAGTTACTGTGGTTT 1553

 38265582 TATGGTTATTTGTTACTGCAGCATAACCCACCCTGCCCTGACTTAAGTGATATAATATTT 38265641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1554 TATGGTTATTTGTTACTGCAGCATAACCCACCCTGCCCTGACTTAAGTGATATAATATTT 1613

 38265642 AACAAATATTTATAAAATAAATAAATTCAAATTCACTCTAATACCTAGAAAATTATCAAG 38265701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1614 AACAAATATTTATAAAATAAATAAATTCAAATTCACTCTAATACCTAGAAAATTATCAAG 1673

 38265702 TATAGTAAACCAAATAATAAATATTTATTAAGGAATATGGAAACAGTGACCTATGAGAAG 38265761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1674 TATAGTAAACCAAATAATAAATATTTATTAAGGAATATGGAAACAGTGACCTATGAGAAG 1733

 38265762 TCTTGATATACTGACCATCCATTGTTGCAGCAGATCTCACTATTGCTATTGTGCTTAACA 38265821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1734 TCTTGATATACTGACCATCCATTGTTGCAGCAGATCTCACTATTGCTATTGTGCTTAACA 1793

 38265822 TTTCAATTACAAAAATTAAAAAAAAAAAACACCATTCATCAGTGCAGGTCTGTGTATTTA 38265881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1794 TTTCAATTACAAAAATTAAAAAAAAAAAACACCATTCATCAGTGCAGGTCTGTGTATTTA 1853

 38265882 AAGAAATAATTTACAAGTTTTTTTTTCCTTTGTAAACATATTGTTTTGAAGTGCAAATAT 38265941
          ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1854 AAGAAATAATTTACAAGTTTTTTTT-CCTTTGTAAACATATTGTTTTGAAGTGCAAATAT 1912

 38265942 ATATAATTTGCACTTTGGGATGGAATGGAATGGGATGCCCTATTGGCAGTCCATACATCT 38266001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1913 ATATAATTTGCACTTTGGGATGGAATGGAATGGGATGCCCTATTGGCAGTCCATACATCT 1972

 38266002 GGATTATAAATGGATTTCCATCCCATCTTCCTCCCCATCTCTTTCCCTTTTTGATCATTC 38266061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1973 GGATTATAAATGGATTTCCATCCCATCTTCCTCCCCATCTCTTTCCCTTTTTGATCATTC 2032

 38266062 TATGGAAATGGAAAGCTAGCAGAAGTTTGAAGAATTGTCACGCAAACAACAACAACAA-- 38266119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  
     2033 TATGGAAATGGAAAGCTAGCAGAAGTTTGAAGAATTGTCACGCAAACAACAACAACAACA 2092

 38266120 -AACTTTAGCATATTAACCTGTTGTCCAACCTTATATAAGCAGTTTGTATTTAAAACATC 38266178
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2093 AAACTTTAGCATATTAACCTGTTGTCCAACCTTATATAAGCAGTTTGTATTTAAAACATC 2152

 38266179 CCTAAGTGGATTTTAATTCCAGTTTCAATCATTGTTAACTATTTTTGAAATATTTAAAAT 38266238
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2153 CCTAAGTGGATTTTAATTCCAATTTCAATCATTGTTAACTATTTTTGAAATATTTAAAAT 2212

 38266239 CCCA 38266242
          ||||
     2213 CCCA 2216

EXCISED REGION

 38266251 ACCACTATTTCTCTTCAACTAGTCCTTACTTTTATAAACAAAAAAGTAACAGTAAATAAT 38266310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2217 ACCACTATTTCTCTTCAACTAGTCCTTACTTTTATAAACAAAAAAGTAACAGTAAATAAT 2276

 38266311 TTATAACTAGGTCTCTCTGAATCTAAAAACACGTTCTTATACACTATGTGATGCCATATT 38266370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     2277 TTATAACTAGGTCTCTCTGAATCTAAAAACACATTCTTATACACTATGTGATGCCATATT 2336

 38266371 TTTTACTCTTGTCTTTGTGAGTTTTTTGTGCCATTCTCTCCTCTGGAATGGTCTTCTGTG 38266430
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2337 TTTTACTCTTGACTTTGTGAGTTTTTTGTGCCATTCTCTCCTCTGGAATGGTCTTCTGTG 2396

 38266431 CTTACACATTCCAAGGGCTACTCCATTTTACAAGAAACAGTTCATGTTTGCTACTTTGGG 38266490
          .|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2397 TTTACACATTCCAAGGGCTAATCCATTTTACAAGAAACAGTTCATGTTTGCTACTTTGGG 2456

 38266491 GTTGATCCCATGATAATTCTGGTTCTCACTTGGTCTTTCCCTGTGAGATGCAGTAGCATT 38266550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2457 GTTGATCCCATGATAATTCTGGTTCTCACTTGGTCTTTCCCTGTGAGATGCAGTAGCATT 2516

 38266551 CAAAATTCTCAGACTATTCTATGCACCTTGGCAGATTTATGGTAATGGTCTATAATTGCT 38266610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2517 CAAAATTCTCAGACTATTCTATGCACCTTGGCAGATTTATGGTAATGGTCTATAATTGCT 2576

 38266611 TCATATCTGCTAACCTTGCTTCCAAAACTAGTTTTTGAGATTAATGAGACAGGAGCTTGG 38266670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2577 TCATATCTGCTAACCTTGCTTCCAAAACTAGTTTTTGAGATTAATGAGACAGGAGCTTGG 2636

 38266671 CTTTTTCTTTCTGTATAGCTTCCATAGCAACAAGAAAATATTAGACACACAGTAGGCATT 38266730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2637 CTTTTTCTTTCTGTATAGCTTCCATAGCAACAAGAAAATATTAGACACACAGTAGGCATT 2696

 38266731 GGAAGAAAATGTGTTCAGTTAAATGAACTTGATTTGAATGGAATGAGAGTTCAATGAAAC 38266790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2697 GGAAGAAAATGTGTTCAGTTAAATGAACTTGATTTGAATGGAATGAGAGTTCAATGAAAC 2756

 38266791 TGTATATATTGTGAAACGTGGCAACTTACACCTACTCAAGACATTAAAAGAGATCATGCT 38266850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2757 TGTATATATTGTGAAACGTGGCAACTTACACCTACTCAAGACATTAAAAGAGATCATGCT 2816

 38266851 TTCTTGCCTAAGTTTTATGTCCAATTTGTTCCTGTTTCAAACCCCTCGACAAAAACAAAA 38266910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2817 TTCTTGCCTAAGTTTTATGTCCAATTTGTTCCTGTTTCAAACCCCTCGACAAAAACAAAA 2876

 38266911 TCTTTTAATCTGTTTGCAAAATATTTCCTCCTTCCTCCCATCTTGCTGTTGCTGCTCTGT 38266970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2877 TCTTTTAATCTGTTTGCAAAATATTTCCTCCTTCCTCCCATCTTGCTGTTGCTGCTCTGT 2936

 38266971 GATATACTGCCCTTGCTTATTACCCCTTTATAGCTGTTTTGTTAAAGTTCATACCGCTAA 38267030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2937 GATATACTGCCCTTGCTTATTACCCCTTTATAGCTGTTTTGTTAAAGTTCATACCGCTAA 2996

 38267031 GACCTGTAAAAGAAATTTATGGCTCTAGGGATTTCAGCAAATTCTAAATAACCATAACAG 38267090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2997 GACCTGTAAAAGAAATTTATGGCTCTAGGGATTTCAGCAAATTCTAAATAACCATAACAG 3056

 38267091 GAACAGGAAGCATTAATTAAAGACACTAGAGTCTAAGTTATAACAGAAATCCTGACATTT 38267150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3057 GAACAGGAAGCATTAATTAAAGACACTAGAGTCTAAGTTATAACAGAAATCCTGACATTT 3116

 38267151 AAGGCCCTGGTACCATTTAAATTTAAAATGGTATGACAAACAGAGAGTAATTTGATGGTC 38267210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3117 AAGGCCCTGGTACCATTTAAATTTAAAATGGTATGACAAACAGAGAGTAATTTGATGGTC 3176

 38267211 AGAAGGTTATAATGGATACCTTAATACCTTTGCCAAGAAAAAGTGTCTGTCCTTGCTCTA 38267270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3177 AGAAGGTTATAATGGATACCTTAATACCTTTGCCAAGAAAAAGTGTCTGTCCTTGCTCTA 3236

 38267271 ACCCCTACCCAGGGGCTTCAGGGGCCTCCTTCATAAAACATGGTGATGCCTAAATATTTT 38267330
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3237 ATCCCTACCCAGGGGCTTCAGGGGCCTCCTTCATAAAACATGGTGATGCCTAAATATTTT 3296

 38267331 TGCGATATCTCATATATAAGCTGGTCTTTTCTTTAAGAATACGAGAGATTAAACACCAAC 38267390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3297 TGCGATATCTCATATATAAGCTGGTCTTTTCTTTAAGAATACGAGAGATTAAACACCAAC 3356

 38267391 CCCCAACATTCATACACCAATTTTCAGATAAAACAGCTTAATATTTAAGATATATTTAGT 38267450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3357 CCCCAACATTCATACACCAATTTTCAGATAAAACAGCTTAATATTTAAGATATATTTAGT 3416

 38267451 GCAATTTGTCTATTTCTTGGTTTACTGGAGGGCTGTATTTAAAGCCAAGGGACCAAGGAA 38267510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3417 GCAATTTGTCTATTTCTTGGTTTACTGGAGGGCTGTATTTAAAGCCAAGGGACCAAGGAA 3476

 38267511 CATTCCACAACACACTAAAGCAATTTTTCCCCAGGGAATATGCTGATTCTTTCCTAAAGG 38267570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3477 CATTCCACAACACACTAAAGCAATTTTTCCCCAGGGAATATGCTGATTCTTTCCTAAAGG 3536

 38267571 CAGAAGCCGACATTCCTGACTCATTCTGCCAAACCAAGCAATGAAAAATGCTTCACCTAA 38267630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3537 CAGAAGCCGACATTCCTGACTCATTCTGCCAAACCAAGCAATGAAAAATGCTTCACCTAA 3596

 38267631 TTTGAAAGATAATTTGTAATACCAGAGACTCAACTTGTTTTGTGTATCCAATACTAGCAC 38267690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3597 TTTGAAAGATAATTTGTAATACCAGAGACTCAACTTGTTTTGTGTATCCAATACTAGCAC 3656

 38267691 CCTTTCCAGAATGTTGAAAGTACACACTGTATGATTTGTCTAATGTATATTCAAAAAAGG 38267750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3657 CCTTTCCAGAATGTTGAAAGTACACACTGTATGATTTGTCTAATGTATATTCAAAAAAGG 3716

 38267751 AATACAAATTGATCCTCAAAGTTCAAATCTGCAGTACATACTCTGTGTTCTGCCCCCACC 38267810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3717 AATACAAATTGATCCTCAAAGTTCAAATCTGCAGTACATACTCTGTGTTCTGCCCCCACC 3776

 38267811 CGTACCTTCATGAATTCTTTCACCTAGCACGCAGGCTGTTTTCCCTTTGCGAAATCCCAT 38267870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3777 CGTACCTTCATGAATTCTTTCACCTAGCACGCAGGCTGTTTTCCCTTTGCGAAATCCCAT 3836

 38267871 GGTACATTTATAGTATTAATACCACTCACTTAGAATATGCCGTATTTTGTCTAATATTGC 38267930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3837 GGTACATTTATAGTATTAATACCACTCACTTAGAATATGCCGTATTTTGTCTAATATTGC 3896

 38267931 TAGATTTTGTGTGTATAATCTTATTCCTCAAGTAAATTACAAGACAAGGACTATAATTTA 38267990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3897 TAGATTTTGTGTGTATAATCTTATTCCTCAAGTAAATTACAAGACAAGGACTATAATTTA 3956

 38267991 TACATCCTCTACAACACTTGACACTGGCTTTGATTAGGCTCTTAATAAATATTTGTTGGT 38268050
          ||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     3957 TACATCCTCTACAACACTTGGCACTGGCTTTGAGTAGGCTCTTAATAAATATTTGTTGGT 4016

 38268051 TGATTAATCAGTTGACCACACTTACTAATTGCAAGGTGACATCATTTATCATTAATAAAC 38268110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4017 TGATTAATCAGTTGACCACACTTACTAATTGCAAGGTGACATCATTTATCATTAATAAAC 4076

 38268111 ATATATGTGGATTACAAAAATATCATGTGAATTTGCATATAATCATATTAATCCCAAATT 38268170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4077 ATATATGTGGATTACAAAAATATCATGTGAATTTGCATATAATCATATTAATCCCAAATT 4136

 38268171 AGCACCTGAGAGTCCAA 38268187
          |||||||||||||||||
     4137 AGCACCTGAGAGTCCAA 4153

Alignment time is 3.81904 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38249892,38276749] =>     26858 nucs '18 dna:chromosome chromosome:GRCh37:18:1:78077248:1'
Second seq [       1,    5413] =>      5413 nucs 'mol-32-3159-121195_5413'

Score:        5170
Aligned:      5421        nucs
Identic:      5390 ( 99%) nucs =>       964 ( 99%)      4426 ( 99%)
Gaps:           15 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38258924,38259892] EXCISED REGION [38266750,38271194]
 second seq =>  [       1,     969] EXCISED REGION [     970,    5413]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6857 nucs [38259893,38266749]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [38259893,38259893] to [38266750,38266750]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [38259893,38259893] to [38266749,38266749]
 second seq =>         0 nucs

 38258924 ATAACTGTTTACAAATGAAATGGTCTAATATCACAAGTTCAAAATTAATAAGAGTGGATG 38258983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATAACTGTTTACAAATGAAATGGTCTAATATCACAAGTTCAAAATTAATAAGAGTGGATG 60

 38258984 AGACATGCCAACAAATTTTTGGAATGTAAAAATAGATAAGACATTGTTAATGATTTGACA 38259043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGACATGCCAACAAATTTTTGGAATGTAAAAATAGATAAGACATTGTTAATGATTTGACA 120

 38259044 AAGCACAAAGCCTTAAAATATTTCTGTATAGAGAGAAGTTTCCAAAGTAGGGCAACTCAG 38259103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAGCACAAAGCCTTAAAATATTTCTGTATAGAGAGAAGTTTCCAAAGTAGGGCAACTCAG 180

 38259104 AGATAAATCAAGAATGGGAAGATTCACACACCTCAACTGTAAAAGAGAAATATGAGACTA 38259163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGATAAATCAAGAATGGGAAGATTCACACACCTCAACTGTAAAAGAGAAATATGAGACTA 240

 38259164 AAAGCAGTGGATTAATTAAAACTTTGTTTGATGAGATATTATACATAGATGTCTTCTCCA 38259223
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAAGCAGTGGATTCATTAAAACTTTGTTTGATGAGATATTATACATAGATGTCTTCTCCA 300

 38259224 TCATTCCAAGCACTTAAGCAGCTGCCCTTTCCAAACACTCATAGAGGATAAGAGATTATT 38259283
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCATTCCAAGCACTTAAGCAGCTGCCCTTTACAAACACTCATAGAGGATAAGAGATTATT 360

 38259284 TTCTATAAAAATCAAACCAGATTGTTG--TGTACATCAAGCAAAGGAGGGATGGCAGGGA 38259341
          |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTCTATAAAAATCAAACCAGATTGT--CATGTACATCAAGCAAAGGAGGGATGGCAGGGA 418

 38259342 GGTGATATACTGAAACAGAATTACTGTATGAAAACCTGGAATGAACAATTAGATACTCAG 38259401
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
      419 GGTGATATACTGAAACAGAATTACTGTATGAAAACATGGAATGAACAATTAGATACTCAG 478

 38259402 TTCTCCTTACCTGCACAGTAATAGTAATTCTTACTACCAGACTGGATGCTGGAGGGCTCT 38259461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      479 TTCTCCTTACCTGCACAGTAATAGTAATTCTTACTACCAGACTGGATGCTGGAGGGCTCT 538

 38259462 CCTTCAGAGAAACAGAAAAGAAAAAAAAGCCTATAGCCACTAATATTTGAATCTCTGCAA 38259521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      539 CCTTCAGAGAAACAGAAAAGAAAAAAAAGCCTATAGCCACTAATATTTGAATCTCTGCAA 598

 38259522 TTAAATACCTGGGTCCCTTCCCAATCATATAGCAGTGATGCTCACCAGTTAACAAGAACT 38259581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      599 TTAAATACCTGGGTCCCTTCCCAATCATATAGCAGTGATGCTCACCAGTTAACAAGAACT 658

 38259582 GAAGACACATGACAGATTCCAATCAGTGATTTATTACCACTGTCAAATAAGAATGGACAC 38259641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      659 GAAGACACATGACAGATTCCAATCAGTGATTTATTACCACTGTCAAATAAGAATGGACAC 718

 38259642 TCAAAGATTACCTGAAAAAGTCCTTTAATATGGCCCCAGATTGAATAATTCCTAATTTCC 38259701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      719 TCAAAGATTACCTGAAAAAGTCCTTTAATATGGCCCCAGATTGAATAATTCCTAATTTCC 778

 38259702 TATATCATAAATTCAAAAATTATCTAAAATTCAGTGAAATTAGTCCATATTATCAATGCC 38259761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      779 TATATCATAAATTCAAAAATTATCTAAAATTCAGTGAAATTAGTCCATATTATCAATGCC 838

 38259762 AACCTTACACATAAACAGAGTTGACATTCTCTTATGATGCTGAACAATGCAGATGAAGAA 38259821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      839 AACCTTACACATAAACAGAGTTGACATTCTCTTATGATGCTGAACAATGCAGATGAAGAA 898

 38259822 CGCTGGCTTTGGATTAAGAAGACCCTTAGTTTGAATTTTAATTTTGACCCATGATAGCTG 38259881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      899 CGCTGGCTTTGGATTAAGAAGACCCTTAGTTTGAATTTTAATTTTGACCCATGATAGCTG 958

 38259882 TGTAAACTTAG 38259892
          |||||||||||
      959 TGTAAACTTAG 969

EXCISED REGION

 38266750 TAAATGAACTTGATTTGAATGGAATGAGAGTTCAATGAAACTGTATATATTGTGAAACGT 38266809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      970 TAAATGAACTTGATTTGAATGGAATGAGAGTTCAATGAAACTGTATATATTGTGAAACGT 1029

 38266810 GGCAACTTACACCTACTCAAGACATTAAAAGAGATCATGCTTTCTTGCCTAAGTTTTATG 38266869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1030 GGCAACTTACACCTACTCAAGACATTAAAAGAGATCATGCTTTCTTGCCTAAGTTTTATG 1089

 38266870 TCCAATTTGTTCCTGTTTCAAACCCCTCGACAAAAACAAAATCTTTTAATCTGTTTGCAA 38266929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1090 TCCAATTTGTTCCTGTTTCAAACCCCTCGACAAAAACAAAATCTTTTAATCTGTTTGCAA 1149

 38266930 AATATTTCCTCCTTCCTCCCATCTTGCTGTTGCTGCTCTGTGATATACTGCCCTTGCTTA 38266989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1150 AATATTTCCTCCTTCCTCCCATCTTGCTGTTGCTGCTCTGTGATATACTGCCCTTGCTTA 1209

 38266990 TTACCCCTTTATAGCTGTTTTGTTAAAGTTCATACCGCTAAGACCTGTAAAAGAAATTTA 38267049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1210 TTACCCCTTTATAGCTGTTTTGTTAAAGTTCATACCGCTAAGACCTGTAAAAGAAATTTA 1269

 38267050 TGGCTCTAGGGATTTCAGCAAATTCTAAATAACCATAACAGGAACAGGAAGCATTAATTA 38267109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1270 TGGCTCTAGGGATTTCAGCAAATTCTAAATAACCATAACAGGAACAGGAAGCATTAATTA 1329

 38267110 AAGACACTAGAGTCTAAGTTATAACAGAAATCCTGACATTTAAGGCCCTGGTACCATTTA 38267169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1330 AAGACACTAGAGTCTAAGTTATAACAGAAATCCTGACATTTAAGGCCCTGGTACCATTTA 1389

 38267170 AATTTAAAATGGTATGACAAACAGAGAGTAATTTGATGGTCAGAAGGTTATAATGGATAC 38267229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1390 AATTTAAAATGGTATGACAAACAGAGAGTAATTTGATGGTCAGAAGGTTATAATGGATAC 1449

 38267230 CTTAATACCTTTGCCAAGAAAAAGTGTCTGTCCTTGCTCTAACCCCTACCCAGGGGCTTC 38267289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     1450 CTTAATACCTTTGCCAAGAAAAAGTGTCTGTCCTTGCTCTAATCCCTACCCAGGGGCTTC 1509

 38267290 AGGGGCCTCCTTCATAAAACATGGTGATGCCTAAATATTTTTGCGATATCTCATATATAA 38267349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1510 AGGGGCCTCCTTCATAAAACATGGTGATGCCTAAATATTTTTGCGATATCTCATATATAA 1569

 38267350 GCTGGTCTTTTCTTTAAGAATACGAGAGATTAAACACCAACCCCCAACATTCATACACCA 38267409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1570 GCTGGTCTTTTCTTTAAGAATACGAGAGATTAAACACCAACCCCCAACATTCATACACCA 1629

 38267410 ATTTTCAGATAAAACAGCTTAATATTTAAGATATATTTAGTGCAATTTGTCTATTTCTTG 38267469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1630 ATTTTCAGATAAAACAGCTTAATATTTAAGATATATTTAGTGCAATTTGTCTATTTCTTG 1689

 38267470 GTTTACTGGAGGGCTGTATTTAAAGCCAAGGGACCAAGGAACATTCCACAACACACTAAA 38267529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1690 GTTTACTGGAGGGCTGTATTTAAAGCCAAGGGACCAAGGAACATTCCACAACACACTAAA 1749

 38267530 GCAATTTTTCCCCAGGGAATATGCTGATTCTTTCCTAAAGGCAGAAGCCGACATTCCTGA 38267589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1750 GCAATTTTTCCCCAGGGAATATGCTGATTCTTTCCTAAAGGCAGAAGCCGACATTCCTGA 1809

 38267590 CTCATTCTGCCAAACCAAGCAATGAAAAATGCTTCACCTAATTTGAAAGATAATTTGTAA 38267649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1810 CTCATTCTGCCAAACCAAGCAATGAAAAATGCTTCACCTAATTTGAAAGATAATTTGTAA 1869

 38267650 TACCAGAGACTCAACTTGTTTTGTGTATCCAATACTAGCACCCTTTCCAGAATGTTGAAA 38267709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1870 TACCAGAGACTCAACTTGTTTTGTGTATCCAATACTAGCACCCTTTCCAGAATGTTGAAA 1929

 38267710 GTACACACTGTATGATTTGTCTAATGTATATTCAAAAAAGGAATACAAATTGATCCTCAA 38267769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1930 GTACACACTGTATGATTTGTCTAATGTATATTCAAAAAAGGAATACAAATTGATCCTCAA 1989

 38267770 AGTTCAAATCTGCAGTACATACTCTGTGTTCTGCCCCCACCCGTACCTTCATGAATTCTT 38267829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1990 AGTTCAAATCTGCAGTACATACTCTGTGTTCTGCCCCCACCCGTACCTTCATGAATTCTT 2049

 38267830 TCACCTAGCACGCAGGCTGTTTTCCCTTTGCGAAATCCCATGGTACATTTATAGTATTAA 38267889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2050 TCACCTAGCACGCAGGCTGTTTTCCCTTTGCGAAATCCCATGGTACATTTATAGTATTAA 2109

 38267890 TACCACTCACTTAGAATATGCCGTATTTTGTCTAATATTGCTAGATTTTGTGTGTATAAT 38267949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2110 TACCACTCACTTAGAATATGCCGTATTTTGTCTAATATTGCTAGATTTTGTGTGTATAAT 2169

 38267950 CTTATTCCTCAAGTAAATTACAAGACAAGGACTATAATTTATACATCCTCTACAACACTT 38268009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2170 CTTATTCCTCAAGTAAATTACAAGACAAGGACTATAATTTATACATCCTCTACAACACTT 2229

 38268010 GACACTGGCTTTGATTAGGCTCTTAATAAATATTTGTTGGTTGATTAATCAGTTGACCAC 38268069
          |.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2230 GGCACTGGCTTTGAGTAGGCTCTTAATAAATATTTGTTGGTTGATTAATCAGTTGACCAC 2289

 38268070 ACTTACTAATTGCAAGGTGACATCATTTATCATTAATAAACATATATGTGGATTACAAAA 38268129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2290 ACTTACTAATTGCAAGGTGACATCATTTATCATTAATAAACATATATGTGGATTACAAAA 2349

 38268130 ATATCATGTGAATTTGCATATAATCATATTAATCCCAAATTAGCACCTGAGAGTCCAACC 38268189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2350 ATATCATGTGAATTTGCATATAATCATATTAATCCCAAATTAGCACCTGAGAGTCCAACC 2409

 38268190 ACCCTCTCCTTTAGGCCCTTTTCACTTTTATGTCTACTTTTGCCTCACTTACAATTCCAC 38268249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2410 ACCCTCTCCTTTAGGCCCTTTTCACTTTTATGTCTACTTTTGCCTCACTTACAATTCCAC 2469

 38268250 TACTTACTTGCCTTCTTTCTCTTTTCAGCTTTGTGCTGTTATTTAATATCTCACCAGTTG 38268309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2470 TACTTACTTGCCTTCTTTCTCTTTTCAGCTTTGTGCTGTTATTTAATATCTCACCAGTTG 2529

 38268310 TGTAATTTCAGCTCCCAAATTGAATAAGACGTTCCCCCCAGTGGAACCCTCACCTTGACA 38268369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2530 TGTAATTTCAGCTCCCAAATTGAATAAGACGTTCCCCCCAGTGGAACCCTCACCTTGACA 2589

 38268370 AATAGCCAAATAGTA---ATTATTCCTTTCAGGGGTTGAGCTATGGAATCATGCTTGCAA 38268426
          |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2590 AATAGCCAAATAGTAATTATTATTCCTTTCAGGGGTTGAGCTATGGAATCATGCTTGCAA 2649

 38268427 TATCCCAGGCTTGAGTGCCTAGATATTTATGCTATACTTCCCTGTGTCGGAGTTTCCATC 38268486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2650 TATCCCAGGCTTGAGTGCCTAGATATTTATGCTATACTTCCCTGTGTCGGAGTTTCCATC 2709

 38268487 TGCGATTGTATTTCAAGCCCTCTCATTTTTTTTTTCAATATGATTAAGATAATTCCTTTA 38268546
          ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2710 TGCGATTGTATTTCAAGCCCTCTCA-TTTTTTTTTCAATATGATTAAGATAATTCCTTTA 2768

 38268547 TGAAGTTGGAAACTCAGACATTCAGAAAGAAACTTGACGTTTCATATTTTTGCTAACTTG 38268606
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2769 TGAAGCTGGAAACTCAGACATTCAGAAAGAAACTTGACGTTTCATATTTTTGCTAACTTG 2828

 38268607 CTCTTCCCATTTCCTTTCCTATCATTTTAGCCAGACTGAGGGAGAATTAATTTTGCAATG 38268666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     2829 CTCTTCCCATTTCCTTTCCTATCATTTTAGCCAGACTGAGGGAGAATTAATTTTGCAACG 2888

 38268667 GTCTCTATTTTTTTTTCCAAATGTGTGACCTCCATATTAATAGGAGCCAGAGTACTCATT 38268726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2889 GTCTCTATTTTTTTTTCCAAATGTGTGACCTCCATATTAATAGGAGCCAGAGTACTCATT 2948

 38268727 CATCACATCTGGTCAGTGTGAAACTGACATTTACAGGGTGGAATGTTTCCCACTCAGGAC 38268786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2949 CATCACATCTGGTCAGTGTGAAACTGACATTTACAGGGTGGAATGTTTCCCACTCAGGAC 3008

 38268787 AAATGGGGATCATTTGTAAAACATGCCGCACCCAATCATAGGTTCCCATGGATCTCCAAC 38268846
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     3009 AAATGGGGATCATTTGTAAAACATGCCACACCCAATCATAGGTTCCCATGGATCTCCAAC 3068

 38268847 TACATTTTTAAGCAACAATATAAACCATTCCCGAAACTGAAAGGTCTTTTCAAATATTTA 38268906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3069 TACATTTTTAAGCAACAATATAAACCATTCCCGAAACTGAAAGGTCTTTTCAAATATTTA 3128

 38268907 CTGCCTACCTATGGAATTTTTATTCTGCTTGCTGCTGCCATCAATAATCCTGGGAGTTCC 38268966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3129 CTGCCTACCTATGGAATTTTTATTCTGCTTGCTGCTGCCATCAATAATCCTGGGAGTTCC 3188

 38268967 TAGCTAAGTGTTGTGTATGACCTCCAAGGAAAGTCTTAGCATTGCAGAATGGGGAGGCGG 38269026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3189 TAGCTAAGTGTTGTGTATGACCTCCAAGGAAAGTCTTAGCATTGCAGAATGGGGAGGCGG 3248

 38269027 GTTAGTATCCTGCATTTTTCATTCTGTCACTTTCTAGGGACAATTACAAAGAAAATAATC 38269086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3249 GTTAGTATCCTGCATTTTTCATTCTGTCACTTTCTAGGGACAATTACAAAGAAAATAATC 3308

 38269087 ATATAAGACTTATTTTTATGTTTATTATGAAAGCCTTCAGCTCTTGCATTTGCAAGTAAG 38269146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3309 ATATAAGACTTATTTTTATGTTTATTATGAAAGCCTTCAGCTCTTGCATTTGCAAGTAAG 3368

 38269147 CTCAATGATTTTAAGTTTGCTTTTTCCCCCATGAAATGAAATATTATTTCCCACTTCTTC 38269206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3369 CTCAATGATTTTAAGTTTGCTTTTTCCCCCATGAAATGAAATATTATTTCCCACTTCTTC 3428

 38269207 CATGAATCTATTGGGTAACTCCAGGCCACTGTGATCTTTCATCTGGCATTTTGCTTTTAT 38269266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3429 CATGAATCTATTGGGTAACTCCAGGCCACTGTGATCTTTCATCTGGCATTTTGCTTTTAT 3488

 38269267 TTTTCTAGATCACAGTTGTGATTTAAAGCCCTCCTGGCACTTGGACACCTTGGTGATCTT 38269326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3489 TTTTCTAGATCACAGTTGTGATTTAAAGCCCTCCTGGCACTTGGACACCTTGGTGATCTT 3548

 38269327 AGCTCATGCTCCTAGTTCCATAGTGATGAATTGACCAAACTTTTTCCCAAGGATATCTGC 38269386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3549 AGCTCATGCTCCTAGTTCCATAGTGATGAATTGACCAAACTTTTTCCCAAGGATATCTGC 3608

 38269387 TAATTCTGGAGTTTCTGCTTTCTTATTATCTGTTCTGTCTTTTGGTTCTGTATTGATATA 38269446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3609 TAATTCTGGAGTTTCTGCTTTCTTATTATCTGTTCTGTCTTTTGGTTCTGTATTGATATA 3668

 38269447 ACAAGCTTTGTCCCCTTATCAATGAGGGCACAAAATGCAGCACTTCAAATAATTTCTGCA 38269506
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||
     3669 ACAAGCTTTGTCCCCTTATCAATGAGGGCACAAAATGAAGCACTTCAAATAGTTTCTGCA 3728

 38269507 AAAATTTACAGTTGCTGCATTAAGAATTTTGTGAGCTTCAATAATGTTATTGAAAAGTTG 38269566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3729 AAAATTTACAGTTGCTGCATTAAGAATTTTGTGAGCTTCAATAATGTTATTGAAAAGTTG 3788

 38269567 CAGATTCCCTCCTCCTTCTTTTTCTCCTTTCCTCCTCTTTCTGCCCTGTCTCCCCTTCAT 38269626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3789 CAGATTCCCTCCTCCTTCTTTTTCTCCTTTCCTCCTCTTTCTGCCCTGTCTCCCCTTCAT 3848

 38269627 TATTCTCCTCTTCTTCTCAAAAGCAAACAATCATTTTTCTTGCCTACTGAAGAATACTTG 38269686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3849 TATTCTCCTCTTCTTCTCAAAAGCAAACAATCATTTTTCTTGCCTACTGAAGAATACTTG 3908

 38269687 TAATGTTATTCTCAAAACCTGGACACCAGCTCAACTCCTTCTTTGTTCTACAAGTATTCA 38269746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3909 TAATGTTATTCTCAAAACCTGGACACCAGCTCAACTCCTTCTTTGTTCTACAAGTATTCA 3968

 38269747 CCCACCCTAATAGGGAGTTTATTCCAATGAAAAGACTGTGTTCCTCCTCAGAGGAATTTA 38269806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3969 CCCACCCTAATAGGGAGTTTATTCCAATGAAAAGACTGTGTTCCTCCTCAGAGGAATTTA 4028

 38269807 TGAGGTGGTAAGAGAGTAGAATTGCATTAATCTTATGCCATTCCTAGAGAATTCTTATTT 38269866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4029 TGAGGTGGTAAGAGAGTAGAATTGCATTAATCTTATGCCATTCCTAGAGAATTCTTATTT 4088

 38269867 CCTCAATTAAGGTTTAATTGCTCTGTTCTGAAAAAAAAAAAAAAATGGTGAGTCCAAGCA 38269926
          ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||
     4089 CCTCAATTAAGGTTTAATTGCTCTGTTCTG---AAAAAAAAAAAATGGTGAGTCCAAGCA 4145

 38269927 GATAATTTACAGTGACCTGTATCTGTGACTAGTTTTAAGGCTACCCTGAGGTCAGAATTT 38269986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4146 GATAATTTACAGTGACCTGTATCTGTGACTAGTTTTAAGGCTACCCTGAGGTCAGAATTT 4205

 38269987 AAACATGTTAATTCAGTACTGGACTTAATAGTAAACAAGATAGAGATATCTCTGTCTCAC 38270046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4206 AAACATGTTAATTCAGTACTGGACTTAATAGTAAACAAGATAGAGATATCTCTGTCTCAC 4265

 38270047 AAAGATTTGTAATACAACTCACAGAAGCTTTACTCCAAATGAAAGGGTCATAGTTAGAGG 38270106
          |.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4266 AGAGATTTGTAATACAACTCACAGACGCTTTACTCCAAATGAAAGGGTCATAGTTAGAGG 4325

 38270107 GAAATTCCATAATAATAGTACCTATCTGATAGGGTGAATGTGGGAATTAAACGAGTTCAT 38270166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4326 GAAATTCCATAATAATAGTACCTATCTGATAGGGTGAATGTGGGAATTAAACGAGTTCAT 4385

 38270167 AGCTATAAAGAATTTCAGAGGCCATCTGGCAATCACAAATAATAACTCTTAGTGGCAGCA 38270226
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     4386 AGCTATAAAGAATTTCAGAGGCCATCTGGCAATCACAAATAATAACTGTTAGTGGCAGCA 4445

 38270227 TTAGCTAGTTCCTGAATAGCCAAATATCTTGAATCCTCATAACAATGATTCAAATAAATG 38270286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4446 TTAGCTAGTTCCTGAATAGCCAAATATCTTGAATCCTCATAACAATGATTCAAATAAATG 4505

 38270287 TCATCATTATTTCACAGAGTAAGATACTTAAGCATTGGGAGTTATTAAGCAATTCTTTAA 38270346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4506 TCATCATTATTTCACAGAGTAAGATACTTAAGCATTGGGAGTTATTAAGCAATTCTTTAA 4565

 38270347 GGACATAGCAGCAACATGTAGAGGAGCTGAAATTACAACATGGTTCTTTCCGAACTTTAA 38270406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4566 GGACATAGCAGCAACATGTAGAGGAGCTGAAATTACAACATGGTTCTTTCCGAACTTTAA 4625

 38270407 GTCCCCTGTTTTTGTGTCTATGACTTTAAATATTCATAGTGGAATATCTATCTATCTACA 38270466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4626 GTCCCCTGTTTTTGTGTCTATGACTTTAAATATTCATAGTGGAATATCTATCTATCTACA 4685

 38270467 GATAATTTCATGAAACATTAAACTAAGTTTGG--TTTTTCTAAAATGCTAACCTCTGTTT 38270524
          ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||
     4686 GATAATTTCATGAAACATTAAACTAAGTTT--TTTTTTTCTAAAATGCTAACCTCTGTTT 4743

 38270525 AACTATCAACCTAGGCAAAAATGGACAATTCCCTGTACCTCAGAAGCTTTCCTAGTGCTC 38270584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4744 AACTATCAACCTAGGCAAAAATGGACAATTCCCTGTACCTCAGAAGCTTTCCTAGTGCTC 4803

 38270585 CTCCCATTCATAAAAATCTCCCATCCTTGGAAAATAGCCACGATAAAAATTATATCAAAT 38270644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4804 CTCCCATTCATAAAAATCTCCCATCCTTGGAAAATAGCCACGATAAAAATTATATCAAAT 4863

 38270645 CCCAACTTTTTATTTGTCCTTTTAACCAAATGACTTATGCTTTTCTAAATGATACAGATT 38270704
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4864 CCCAACTTTTTATTTGCCCTTTTAACCAAATGACTTATGCTTTTCTAAATGATACAGATT 4923

 38270705 TGCTTTGCCTATTTGGGAATGTTACATAACTAGAATCCTAGACAGAGCTCTTAATTGTAA 38270764
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4924 TGCTTTGCCTATTTGGGAATGTTATATAACTAGAATCCTAGACAGAGCTCTTAATTGTAA 4983

 38270765 CATTGTCATACATCAAATGTCAAGTGTCTACAAAGGGATGGATCACTCTGGGCTTTCAAT 38270824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4984 CATTGTCATACATCAAATGTCAAGTGTCTACAAAGGGATGGATCACTCTGGGCTTTCAAT 5043

 38270825 GTTCTTCCATTGGTCTATTAAATTCCCTTAGAGCAATAATCCTAGTATCTCATTTACTGA 38270884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5044 GTTCTTCCATTGGTCTATTAAATTCCCTTAGAGCAATAATCCTAGTATCTCATTTACTGA 5103

 38270885 AGTGTTACAATAGGATTTATTTTTTGGTGGAATAAGTCCAACCATCTTCTTGTTTGTTCT 38270944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5104 AGTGTTACAATAGGATTTATTTTTTGGTGGAATAAGTCCAACCATCTTCTTGTTTGTTCT 5163

 38270945 TCAAGAATGCATGGACTATTCTCTGTACTTTGCCTTATCACATACATTTAAAAATAAACC 38271004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5164 TCAAGAATGCATGGACTATTCTCTGTACTTTGCCTTATCACATACATTTAAAAATAAACC 5223

 38271005 TATTATTGCTATGAAATAATAATAAATAAAAGACTTGGGTTTTGTTTGATGTTACATTAT 38271064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5224 TATTATTGCTATGAAATAATAATAAATAAAAGACTTGGGTTTTGTTTGATGTTACATTAT 5283

 38271065 GTCTATAAAGTAAGGATCACTGACATCTGTAAAATTTGAATCTCCTAGTCTATAAAAAAT 38271124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5284 GTCTATAAAGTAAGGATCACTGACATCTGTAAAATTTGAATCTCCTAGTCTATAAAAAAT 5343

 38271125 TGAATATTTTTTGCTTATTCTGGGATCATTTCGATTATCTCCCAATAATGATTTTTGGTT 38271184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5344 TGAATATTTTTTGCTTATTCTGGGATCATTTCGATTATCTCCCAATAATGATTTTTGGTT 5403

 38271185 GTCTCTGTAA 38271194
          ||||||||||
     5404 GTCTCTGTAA 5413

Alignment time is 5.92729 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38249892,38276749] =>     26858 nucs '18 dna:chromosome chromosome:GRCh37:18:1:78077248:1'
Second seq [       1,    5230] =>      5230 nucs 'mol-32-316f-235147_5230'

Score:        4951
Aligned:      5239        nucs
Identic:      5203 ( 99%) nucs =>      1000 ( 99%)      4203 ( 99%)
Gaps:           17 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38258887,38259892] EXCISED REGION [38266750,38270974]
 second seq =>  [       1,    1006] EXCISED REGION [    1007,    5230]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6857 nucs [38259893,38266749]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [38259893,38259893] to [38266750,38266750]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [38259893,38259893] to [38266749,38266749]
 second seq =>         0 nucs

 38258887 ATGTATTTATTTCTAATCTACTTCAAGCTCCAATATAATAACTGTTTACAAATGAAATGG 38258946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATGTATTTATTTCTAATCTACTTCAAGCTCCAATATAATAACTGTTTACAAATGAAATGG 60

 38258947 TCTAATATCACAAGTTCAAAATTAATAAGAGTGGATGAGACATGCCAACAAATTTTTGGA 38259006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCTAATATCACAAGTTCAAAATTAATAAGAGTGGATGAGACATGCCAACAAATTTTTGGA 120

 38259007 ATGTAAAAATAGATAAGACATTGTTAATGATTTGACAAAGCACAAAGCCTTAAAATATTT 38259066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATGTAAAAATAGATAAGACATTGTTAATGATTTGACAAAGCACAAAGCCTTAAAATATTT 180

 38259067 CTGTATAGAGAGAAGTTTCCAAAGTAGGGCAACTCAGAGATAAATCAAGAATGGGAAGAT 38259126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTGTATAGAGAGAAGTTTCCAAAGTAGGGCAACTCAGAGATAAATCAAGAATGGGAAGAT 240

 38259127 TCACACACCTCAACTGTAAAAGAGAAATATGAGACTAAAAGCAGTGGATTAATTAAAACT 38259186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
      241 TCACACACCTCAACTGTAAAAGAGAAATATGAGACTAAAAGCAGTGGATTCATTAAAACT 300

 38259187 TTGTTTGATGAGATATTATACATAGATGTCTTCTCCATCATTCCAAGCACTTAAGCAGCT 38259246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTGTTTGATGAGATATTATACATAGATGTCTTCTCCATCATTCCAAGCACTTAAGCAGCT 360

 38259247 GCCCTTTCCAAACACTCATAGAGGATAAGAGATTATTTTCTATAAAAATCAAACCAGATT 38259306
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GCCCTTTACAAACACTCATAGAGGATAAGAGATTATTTTCTATAAAAATCAAACCAGATT 420

 38259307 GTTG--TGTACATCAAGCAAAGGAGGGATGGCAGGGAGGTGATATACTGAAACAGAATTA 38259364
          ||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GT--CATGTACATCAAGCAAAGGAGGGATGGCAGGGAGGTGATATACTGAAACAGAATTA 478

 38259365 CTGTATGAAAACCTGGAATGAACAATTAGATACTCAGTTCTCCTTACCTGCACAGTAATA 38259424
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      479 CTGTATGAAAACATGGAATGAACAATTAGATACTCAGTTCTCCTTACCTGCACAGTAATA 538

 38259425 GTAATTCTTACTACCAGACTGGATGCTGGAGGGCTCTCCTTCAGAGAAACAGAAAAGAAA 38259484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      539 GTAATTCTTACTACCAGACTGGATGCTGGAGGGCTCTCCTTCAGAGAAACAGAAAAGAAA 598

 38259485 AAAAAGCCTATAGCCACTAATATTTGAATCTCTGCAATTAAATACCTGGGTCCCTTCCCA 38259544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      599 AAAAAGCCTATAGCCACTAATATTTGAATCTCTGCAATTAAATACCTGGGTCCCTTCCCA 658

 38259545 ATCATATAGCAGTGATGCTCACCAGTTAACAAGAACTGAAGACACATGACAGATTCCAAT 38259604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      659 ATCATATAGCAGTGATGCTCACCAGTTAACAAGAACTGAAGACACATGACAGATTCCAAT 718

 38259605 CAGTGATTTATTACCACTGTCAAATAAGAATGGACACTCAAAGATTACCTGAAAAAGTCC 38259664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      719 CAGTGATTTATTACCACTGTCAAATAAGAATGGACACTCAAAGATTACCTGAAAAAGTCC 778

 38259665 TTTAATATGGCCCCAGATTGAATAATTCCTAATTTCCTATATCATAAATTCAAAAATTAT 38259724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      779 TTTAATATGGCCCCAGATTGAATAATTCCTAATTTCCTATATCATAAATTCAAAAATTAT 838

 38259725 CTAAAATTCAGTGAAATTAGTCCATATTATCAATGCCAACCTTACACATAAACAGAGTTG 38259784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      839 CTAAAATTCAGTGAAATTAGTCCATATTATCAATGCCAACCTTACACATAAACAGAGTTG 898

 38259785 ACATTCTCTTATGATGCTGAACAATGCAGATGAAGAACGCTGGCTTTGGATTAAGAAGAC 38259844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
      899 ACATTCTCTTATGATGCTGAACAATGCAGATGAAGAACGCTGGCTTCGGATTAAGAAGAC 958

 38259845 CCTTAGTTTGAATTTTAATTTTGACCCATGATAGCTGTGTAAACTTAG 38259892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      959 CCTTAGTTTGAATTTTAATTTTGACCCATGATAGCTGTGTAAACTTAG 1006

EXCISED REGION

 38266750 TAAATGAACTTGATTTGAATGGAATGAGAGTTCAATGAAACTGTATATATTGTGAAACGT 38266809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1007 TAAATGAACTTGATTTGAATGGAATGAGAGTTCAATGAAACTGTATATATTGTGAAACGT 1066

 38266810 GGCAACTTACACCTACTCAAGACATTAAAAGAGATCATGCTTTCTTGCCTAAGTTTTATG 38266869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1067 GGCAACTTACACCTACTCAAGACATTAAAAGAGATCATGCTTTCTTGCCTAAGTTTTATG 1126

 38266870 TCCAATTTGTTCCTGTTTCAAACCCCTCGACAAAAACAAAATCTTTTAATCTGTTTGCAA 38266929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1127 TCCAATTTGTTCCTGTTTCAAACCCCTCGACAAAAACAAAATCTTTTAATCTGTTTGCAA 1186

 38266930 AATATTTCCTCCTTCCTCCCATCTTGCTGTTGCTGCTCTGTGATATACTGCCCTTGCTTA 38266989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1187 AATATTTCCTCCTTCCTCCCATCTTGCTGTTGCTGCTCTGTGATATACTGCCCTTGCTTA 1246

 38266990 TTACCCCTTTATAGCTGTTTTGTTAAAGTTCATACCGCTAAGACCTGTAAAAGAAATTTA 38267049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1247 TTACCCCTTTATAGCTGTTTTGTTAAAGTTCATACCGCTAAGACCTGTAAAAGAAATTTA 1306

 38267050 TGGCTCTAGGGATTTCAGCAAATTCTAAATAACCATAACAGGAACAGGAAGCATTAATTA 38267109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1307 TGGCTCTAGGGATTTCAGCAAATTCTAAATAACCATAACAGGAACAGGAAGCATTAATTA 1366

 38267110 AAGACACTAGAGTCTAAGTTATAACAGAAATCCTGACATTTAAGGCCCTGGTACCATTTA 38267169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1367 AAGACACTAGAGTCTAAGTTATAACAGAAATCCTGACATTTAAGGCCCTGGTACCATTTA 1426

 38267170 AATTTAAAATGGTATGACAAACAGAGAGTAATTTGATGGTCAGAAGGTTATAATGGATAC 38267229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1427 AATTTAAAATGGTATGACAAACAGAGAGTAATTTGATGGTCAGAAGGTTATAATGGATAC 1486

 38267230 CTTAATACCTTTGCCAAGAAAAAGTGTCTGTCCTTGCTCTAACCCCTACCCAGGGGCTTC 38267289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     1487 CTTAATACCTTTGCCAAGAAAAAGTGTCTGTCCTTGCTCTAATCCCTACCCAGGGGCTTC 1546

 38267290 AGGGGCCTCCTTCATAAAACATGGTGATGCCTAAATATTTTTGCGATATCTCATATATAA 38267349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1547 AGGGGCCTCCTTCATAAAACATGGTGATGCCTAAATATTTTTGCGATATCTCATATATAA 1606

 38267350 GCTGGTCTTTTCTTTAAGAATACGAGAGATTAAACACCAACCCCCAACATTCATACACCA 38267409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1607 GCTGGTCTTTTCTTTAAGAATACGAGAGATTAAACACCAACCCCCAACATTCATACACCA 1666

 38267410 ATTTTCAGATAAAACAGCTTAATATTTAAGATATATTTAGTGCAATTTGTCTATTTCTTG 38267469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1667 ATTTTCAGATAAAACAGCTTAATATTTAAGATATATTTAGTGCAATTTGTCTATTTCTTG 1726

 38267470 GTTTACTGGAGGGCTGTATTTAAAGCCAAGGGACCAAGGAACATTCCACAACACACTAAA 38267529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1727 GTTTACTGGAGGGCTGTATTTAAAGCCAAGGGACCAAGGAACATTCCACAACACACTAAA 1786

 38267530 GCAATTTTTCCCCAGGGAATATGCTGATTCTTTCCTAAAGGCAGAAGCCGACATTCCTGA 38267589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1787 GCAATTTTTCCCCAGGGAATATGCTGATTCTTTCCTAAAGGCAGAAGCCGACATTCCTGA 1846

 38267590 CTCATTCTGCCAAACCAAGCAATGAAAAATGCTTCACCTAATTTGAAAGATAATTTGTAA 38267649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1847 CTCATTCTGCCAAACCAAGCAATGAAAAATGCTTCACCTAATTTGAAAGATAATTTGTAA 1906

 38267650 TACCAGAGACTCAACTTGTTTTGTGTATCCAATACTAGCACCCTTTCCAGAATGTTGAAA 38267709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1907 TACCAGAGACTCAACTTGTTTTGTGTATCCAATACTAGCACCCTTTCCAGAATGTTGAAA 1966

 38267710 GTACACACTGTATGATTTGTCTAATGTATATTCAAAAAAGGAATACAAATTGATCCTCAA 38267769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1967 GTACACACTGTATGATTTGTCTAATGTATATTCAAAAAAGGAATACAAATTGATCCTCAA 2026

 38267770 AGTTCAAATCTGCAGTACATACTCTGTGTTCTGCCCCCACCCGTACCTTCATGAATTCTT 38267829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2027 AGTTCAAATCTGCAGTACATACTCTGTGTTCTGCCCCCACCCGTACCTTCATGAATTCTT 2086

 38267830 TCACCTAGCACGCAGGCTGTTTTCCCTTTGCGAAATCCCATGGTACATTTATAGTATTAA 38267889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2087 TCACCTAGCACGCAGGCTGTTTTCCCTTTGCGAAATCCCATGGTACATTTATAGTATTAA 2146

 38267890 TACCACTCACTTAGAATATGCCGTATTTTGTCTAATATTGCTAGATTTTGTGTGTATAAT 38267949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2147 TACCACTCACTTAGAATATGCCGTATTTTGTCTAATATTGCTAGATTTTGTGTGTATAAT 2206

 38267950 CTTATTCCTCAAGTAAATTACAAGACAAGGACTATAATTTATACATCCTCTACAACACTT 38268009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2207 CTTATTCCTCAAGTAAATTACAAGACAAGGACTATAATTTATACATCCTCTACAACACTT 2266

 38268010 GACACTGGCTTTGATTAGGCTCTTAATAAATATTTGTTGGTTGATTAATCAGTTGACCAC 38268069
          |.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2267 GGCACTGGCTTTGAGTAGGCTCTTAATAAATATTTGTTGGTTGATTAATCAGTTGACCAC 2326

 38268070 ACTTACTAATTGCAAGGTGACATCATTTATCATTAATAAACATATATGTGGATTACAAAA 38268129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2327 ACTTACTAATTGCAAGGTGACATCATTTATCATTAATAAACATATATGTGGATTACAAAA 2386

 38268130 ATATCATGTGAATTTGCATATAATCATATTAATCCCAAATTAGCACCTGAGAGTCCAACC 38268189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2387 ATATCATGTGAATTTGCATATAATCATATTAATCCCAAATTAGCACCTGAGAGTCCAACC 2446

 38268190 ACCCTCTCCTTTAGGCCCTTTTCACTTTTATGTCTACTTTTGCCTCACTTACAATTCCAC 38268249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2447 ACCCTCTCCTTTAGGCCCTTTTCACTTTTATGTCTACTTTTGCCTCACTTACAATTCCAC 2506

 38268250 TACTTACTTGCCTTCTTTCTCTTTTCAGCTTTGTGCTGTTATTTAATATCTCACCAGTTG 38268309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2507 TACTTACTTGCCTTCTTTCTCTTTTCAGCTTTGTGCTGTTATTTAATATCTCACCAGTTG 2566

 38268310 TGTAATTTCAGCTCCCAAATTGAATAAGACGTTCCCCCCAGTGGAACCCTCACCTTGACA 38268369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2567 TGTAATTTCAGCTCCCAAATTGAATAAGACGTTCCCCCCAGTGGAACCCTCACCTTGACA 2626

 38268370 AATAGCCAAATAGTA---ATTATTCCTTTCAGGGGTTGAGCTATGGAATCATGCTTGCAA 38268426
          |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2627 AATAGCCAAATAGTAATTATTATTCCTTTCAGGGGTTGAGCTATGGAATCATGCTTGCAA 2686

 38268427 TATCCCAGGCTTGAGTGCCTAGATATTTATGCTATACTTCCCTGTGTCGGAGTTTCCATC 38268486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2687 TATCCCAGGCTTGAGTGCCTAGATATTTATGCTATACTTCCCTGTGTCGGAGTTTCCATC 2746

 38268487 TGCGATTGTATTTCAAGCCCTCTCATTT-TTTTTTTCAATATGATTAAGATAATTCCTTT 38268545
          ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||
     2747 TGCGATTGTATTTCAAGCCCTCTCAT--CTTTTTTTCAATATGATTAAGATAATTCCTTT 2804

 38268546 ATGAAGTTGGAAACTCAGACATTCAGAAAGAAACTTGACGTTTCATATTTTTGCTAACTT 38268605
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2805 ATGAAGCTGGAAACTCAGACATTCAGAAAGAAACTTGACGTTTCATATTTTTGCTAACTT 2864

 38268606 GCTCTTCCCATTTCCTTTCCTATCATTTTAGCCAGACTGAGGGAGAATTAATTTTGCAAT 38268665
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     2865 GCTCTTCCCATTTCCTTTCCTATCATTTTAGCCAGACTGAGGGAGAATTAATTTTGCAAC 2924

 38268666 GGTCTCTATTTTTTTTTCCAAATGTGTGACCTCCATATTAATAGGAGCCAGAGTACTCAT 38268725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2925 GGTCTCTATTTTTTTTTCCAAATGTGTGACCTCCATATTAATAGGAGCCAGAGTACTCAT 2984

 38268726 TCATCACATCTGGTCAGTGTGAAACTGACATTTACAGGGTGGAATGTTTCCCACTCAGGA 38268785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2985 TCATCACATCTGGTCAGTGTGAAACTGACATTTACAGGGTGGAATGTTTCCCACTCAGGA 3044

 38268786 CAAATGGGGATCATTTGTAAAACATGCCGCACCCAATCATAGGTTCCCATGGATCTCCAA 38268845
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     3045 CAAATGGGGATCATTTGTAAAACATGCCACACCCAATCATAGGTTCCCATGGATCTCCAA 3104

 38268846 CTACATTTTTAAGCAACAATATAAACCATTCCCGAAACTGAAAGGTCTTTTCAAATATTT 38268905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3105 CTACATTTTTAAGCAACAATATAAACCATTCCCGAAACTGAAAGGTCTTTTCAAATATTT 3164

 38268906 ACTGCCTACCTATGGAATTTTTATTCTGCTTGCTGCTGCCATCAATAATCCTGGGAGTTC 38268965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3165 ACTGCCTACCTATGGAATTTTTATTCTGCTTGCTGCTGCCATCAATAATCCTGGGAGTTC 3224

 38268966 CTAGCTAAGTGTTGTGTATGACCTCCAAGGAAAGTCTTAGCATTGCAGAATGGGGAGGCG 38269025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3225 CTAGCTAAGTGTTGTGTATGACCTCCAAGGAAAGTCTTAGCATTGCAGAATGGGGAGGCG 3284

 38269026 GGTTAGTATCCTGCATTTTTCATTCTGTCACTTTCTAGGGACAATTACAAAGAAAATAAT 38269085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3285 GGTTAGTATCCTGCATTTTTCATTCTGTCACTTTCTAGGGACAATTACAAAGAAAATAAT 3344

 38269086 CATATAAGACTTATTTTTATGTTTATTATGAAAGCCTTCAGCTCTTGCATTTGCAAGTAA 38269145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3345 CATATAAGACTTATTTTTATGTTTATTATGAAAGCCTTCAGCTCTTGCATTTGCAAGTAA 3404

 38269146 GCTCAATGATTTTAAGTTTGCTTTTTCCCCCATGAAATGAAATATTATTTCCCACTTCTT 38269205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3405 GCTCAATGATTTTAAGTTTGCTTTTTCCCCCATGAAATGAAATATTATTTCCCACTTCTT 3464

 38269206 CCATGAATCTATTGGGTAACTCCAGGCCACTGTGATCTTTCATCTGGCATTTTGCTTTTA 38269265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3465 CCATGAATCTATTGGGTAACTCCAGGCCACTGTGATCTTTCATCTGGCATTTTGCTTTTA 3524

 38269266 TTTTTCTAGATCACAGTTGTGATTTAAAGCCCTCCTGGCACTTGGACACCTTGGTGATCT 38269325
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3525 CTTTTCTAGATCACAGTTGTGATTTAAAGCCCTCCTGGCACTTGGACACCTTGGTGATCT 3584

 38269326 TAGCTCATGCTCCTAGTTCCATAGTGATGAATTGACCAAACTTTTTCCCAAGGATATCTG 38269385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3585 TAGCTCATGCTCCTAGTTCCATAGTGATGAATTGACCAAACTTTTTCCCAAGGATATCTG 3644

 38269386 CTAATTCTGGAGTTTCTGCTTTCTTATTATCTGTTCTGTCTTTTGGTTCTGTATTGATAT 38269445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3645 CTAATTCTGGAGTTTCTGCTTTCTTATTATCTGTTCTGTCTTTTGGTTCTGTATTGATAT 3704

 38269446 AACAAGCTTTGTCCCCTTATCAATGAGGGCACAAAATGCAGCACTTCAAATAATTTCTGC 38269505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||
     3705 AACAAGCTTTGTCCCCTTATCAATGAGGGCACAAAATGAAGCACTTCAAATAGTTTCTGC 3764

 38269506 AAAAATTTACAGTTGCTGCATTAAGAATTTTGTGAGCTTCAATAATGTTATTGAAAAGTT 38269565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3765 AAAAATTTACAGTTGCTGCATTAAGAATTTTGTGAGCTTCAATAATGTTATTGAAAAGTT 3824

 38269566 GCAGATTCCCTCCTCCTTCTTTTTCTCCTTTCCTCCTCTTTCTGCCCTGTCTCCCCTTCA 38269625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3825 GCAGATTCCCTCCTCCTTCTTTTTCTCCTTTCCTCCTCTTTCTGCCCTGTCTCCCCTTCA 3884

 38269626 TTATTCTCCTCTTCTTCTCAAAAGCAAACAATCATTTTTCTTGCCTACTGAAGAATACTT 38269685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3885 TTATTCTCCTCTTCTTCTCAAAAGCAAACAATCATTTTTCTTGCCTACTGAAGAATACTT 3944

 38269686 GTAATGTTATTCTCAAAACCTGGACACCAGCTCAACTCCTTCTTTGTTCTACAAGTATTC 38269745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3945 GTAATGTTATTCTCAAAACCTGGACACCAGCTCAACTCCTTCTTTGTTCTACAAGTATTC 4004

 38269746 ACCCACCCTAATAGGGAGTTTATTCCAATGAAAAGACTGTGTTCCTCCTCAGAGGAATTT 38269805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4005 ACCCACCCTAATAGGGAGTTTATTCCAATGAAAAGACTGTGTTCCTCCTCAGAGGAATTT 4064

 38269806 ATGAGGTGGTAAGAGAGTAGAATTGCATTAATCTTATGCCATTCCTAGAGAATTCTTATT 38269865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4065 ATGAGGTGGTAAGAGAGTAGAATTGCATTAATCTTATGCCATTCCTAGAGAATTCTTATT 4124

 38269866 TCCTCAATTAAGGTTTAATTGCTCTGTTCTGAAAAAAAAAAAAAAATGGTGAGTCCAAGC 38269925
          |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||
     4125 TCCTCAATTAAGGTTTAATTGCTCTGTTCTG---AAAAAAAAAAAATGGTGAGTCCAAGC 4181

 38269926 AGATAATTTACAGTGACCTGTATCTGTGACTAGTTTTAAGGCTACCCTGAGGTCAGAATT 38269985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4182 AGATAATTTACAGTGACCTGTATCTGTGACTAGTTTTAAGGCTACCCTGAGGTCAGAATT 4241

 38269986 TAAACATGTTAATTCAGTACTGGACTTAATAGTAAACAAGATAGAGATATCTCTGTCTCA 38270045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4242 TAAACATGTTAATTCAGTACTGGACTTAATAGTAAACAAGATAGAGATATCTCTGTCTCA 4301

 38270046 CAAAGATTTGTAATACAACTCACAGAAGCTTTACTCCAAATGAAAGGGTCATAGTTAGAG 38270105
          ||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     4302 CAGAGATTTGTAATACAACTCACAGACGCTTTACTCCAAATGAAAGGGTCATAGTTAGAG 4361

 38270106 GGAAATTCCATAATAATAGTACCTATCTGATAGGGTGAATGTGGGAATTAAACGAGTTCA 38270165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4362 GGAAATTCCATAATAATAGTACCTATCTGATAGGGTGAATGTGGGAATTAAACGAGTTCA 4421

 38270166 TAGCTATAAAGAATTTCAGAGGCCATCTGGCAATCACAAATAATAACTCTTAGTGGCAGC 38270225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     4422 TAGCTATAAAGAATTTCAGAGGCCATCTGGCAATCACAAATAATAACTGTTAGTGGCAGC 4481

 38270226 ATTAGCTAGTTCCTGAATAGCCAAATATCTTGAATCCTCATAACAATGATTCAAATAAAT 38270285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4482 ATTAGCTAGTTCCTGAATAGCCAAATATCTTGAATCCTCATAACAATGATTCAAATAAAT 4541

 38270286 GTCATCATTATTTCACAGAGTAAGATACTTAAGCATTGGGAGTTATTAAGCAATTCTTTA 38270345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4542 GTCATCATTATTTCACAGAGTAAGATACTTAAGCATTGGGAGTTATTAAGCAATTCTTTA 4601

 38270346 AGGACATAGCAGCAACATGTAGAGGAGCTGAAATTACAACATGGTTCTTTCCGAACTTTA 38270405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4602 AGGACATAGCAGCAACATGTAGAGGAGCTGAAATTACAACATGGTTCTTTCCGAACTTTA 4661

 38270406 AGTCCCCTGTTTTTGTGTCTATGACTTTAAATATTCATAGTGGAATATCTATCTATCTAC 38270465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4662 AGTCCCCTGTTTTTGTGTCTATGACTTTAAATATTCATAGTGGAATATCTATCTATCTAC 4721

 38270466 AGATAATTTCATGAAACATTAAACTAAGTTTGG--TTTTTCTAAAATGCTAACCTCTGTT 38270523
          |||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||
     4722 AGATAATTTCATGAAACATTAAACTAAGTTT--TTTTTTTCTAAAATGCTAACCTCTGTT 4779

 38270524 TAACTATCAACCTAGGCAAAAATGGACAATTCCCTGTACCTCAGAAGCTTTCCTAGTGCT 38270583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4780 TAACTATCAACCTAGGCAAAAATGGACAATTCCCTGTACCTCAGAAGCTTTCCTAGTGCT 4839

 38270584 CCTCCCATTCATAAAAATCTCCCATCCTTGGAAAATAGCCACGATAAAAATTATATCAAA 38270643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4840 CCTCCCATTCATAAAAATCTCCCATCCTTGGAAAATAGCCACGATAAAAATTATATCAAA 4899

 38270644 TCCCAACTTTTTATTTGTCCTTTTAACCAAATGACTTATGCTTTTCTAAATGATACAGAT 38270703
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4900 TCCCAACTTTTTATTTGCCCTTTTAACCAAATGACTTATGCTTTTCTAAATGATACAGAT 4959

 38270704 TTGCTTTGCCTATTTGGGAATGTTACATAACTAGAATCCTAGACAGAGCTCTTAATTGTA 38270763
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4960 TTGCTTTGCCTATTTGGGAATGTTATATAACTAGAATCCTAGACAGAGCTCTTAATTGTA 5019

 38270764 ACATTGTCATACATCAAATGTCAAGTGTCTACAAAGGGATGGATCACTCTGGGCTTTCAA 38270823
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5020 GCATTGTCATACATCAAATGTCAAGTGTCTACAAAGGGATGGATCACTCTGGGCTTTCAA 5079

 38270824 TGTTCTTCCATTGGTCTATTAAATTCCCTTAGAGCAATAATCCTAGTATCTCATTTACTG 38270883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5080 TGTTCTTCCATTGGTCTATTAAATTCCCTTAGAGCAATAATCCTAGTATCTCATTTACTG 5139

 38270884 AAGTGTTACAATAGGATTTATTTTTTGGTGGAATAAGTCCAACCATCTTCTTGTTTGTTC 38270943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5140 AAGTGTTACAATAGGATTTATTTTTTGGTGGAATAAGTCCAACCATCTTCTTGTTTGTTC 5199

 38270944 TTCAAGAATGCATGGACTATTCTCTGTACTT 38270974
          |||||||||||||||||||||||||||||||
     5200 TTCAAGAATGCATGGACTATTCTCTGTACTT 5230

Alignment time is 5.63716 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38249892,38276749] =>     26858 nucs '18 dna:chromosome chromosome:GRCh37:18:1:78077248:1'
Second seq [       1,    3800] =>      3800 nucs 'mol-32-3190-008187_3800'

Score:        3598
Aligned:      3804        nucs
Identic:      3782 ( 99%) nucs =>        55 ( 98%)      3727 ( 99%)
Gaps:            7 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38266187,38266242] EXCISED REGION [38266251,38269995]
 second seq =>  [       1,      56] EXCISED REGION [      57,    3800]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         8 nucs [38266243,38266250]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         8 nucs [38266243,38266250] to [38266251,38266258]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [38266242,38266242] to [38266251,38266251]
 second seq =>         1 nucs [56,56] to [57,57]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 38266187 GATTTTAATTCCAGTTTCAATCATTGTTAACTATTTTTGAAATATTTAAAATCCCA 38266242
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GATTTTAATTCCAATTTCAATCATTGTTAACTATTTTTGAAATATTTAAAATCCCA 56

EXCISED REGION

 38266251 ACCACTATTTCTCTTCAACTAGTCCTTACTTTTATAAACAAAAAAGTAACAGTAAATAAT 38266310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       57 ACCACTATTTCTCTTCAACTAGTCCTTACTTTTATAAACAAAAAAGTAACAGTAAATAAT 116

 38266311 TTATAACTAGGTCTCTCTGAATCTAAAAACACGTTCTTATACACTATGTGATGCCATATT 38266370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
      117 TTATAACTAGGTCTCTCTGAATCTAAAAACACATTCTTATACACTATGTGATGCCATATT 176

 38266371 TTTTACTCTTGTCTTTGTGAGTTTTTTGTGCCATTCTCTCCTCTGGAATGGTCTTCTGTG 38266430
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      177 TTTTACTCTTGACTTTGTGAGTTTTTTGTGCCATTCTCTCCTCTGGAATGGTCTTCTGTG 236

 38266431 CTTACACATTCCAAGGGCTACTCCATTTTACAAGAAACAGTTCATGTTTGCTACTTTGGG 38266490
          .|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      237 TTTACACATTCCAAGGGCTAATCCATTTTACAAGAAACAGTTCATGTTTGCTACTTTGGG 296

 38266491 GTTGATCCCATGATAATTCTGGTTCTCACTTGGTCTTTCCCTGTGAGATGCAGTAGCATT 38266550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      297 GTTGATCCCATGATAATTCTGGTTCTCACTTGGTCTTTCCCTGTGAGATGCAGTAGCATT 356

 38266551 CAAAATTCTCAGACTATTCTATGCACCTTGGCAGATTTATGGTAATGGTCTATAATTGCT 38266610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      357 CAAAATTCTCAGACTATTCTATGCACCTTGGCAGATTTATGGTAATGGTCTATAATTGCT 416

 38266611 TCATATCTGCTAACCTTGCTTCCAAAACTAGTTTTTGAGATTAATGAGACAGGAGCTTGG 38266670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      417 TCATATCTGCTAACCTTGCTTCCAAAACTAGTTTTTGAGATTAATGAGACAGGAGCTTGG 476

 38266671 CTTTTTCTTTCTGTATAGCTTCCATAGCAACAAGAAAATATTAGACACACAGTAGGCATT 38266730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      477 CTTTTTCTTTCTGTATAGCTTCCATAGCAACAAGAAAATATTAGACACACAGTAGGCATT 536

 38266731 GGAAGAAAATGTGTTCAGTTAAATGAACTTGATTTGAATGGAATGAGAGTTCAATGAAAC 38266790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      537 GGAAGAAAATGTGTTCAGTTAAATGAACTTGATTTGAATGGAATGAGAGTTCAATGAAAC 596

 38266791 TGTATATATTGTGAAACGTGGCAACTTACACCTACTCAAGACATTAAAAGAGATCATGCT 38266850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      597 TGTATATATTGTGAAACGTGGCAACTTACACCTACTCAAGACATTAAAAGAGATCATGCT 656

 38266851 TTCTTGCCTAAGTTTTATGTCCAATTTGTTCCTGTTTCAAACCCCTCGACAAAAACAAAA 38266910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      657 TTCTTGCCTAAGTTTTATGTCCAATTTGTTCCTGTTTCAAACCCCTCGACAAAAACAAAA 716

 38266911 TCTTTTAATCTGTTTGCAAAATATTTCCTCCTTCCTCCCATCTTGCTGTTGCTGCTCTGT 38266970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      717 TCTTTTAATCTGTTTGCAAAATATTTCCTCCTTCCTCCCATCTTGCTGTTGCTGCTCTGT 776

 38266971 GATATACTGCCCTTGCTTATTACCCCTTTATAGCTGTTTTGTTAAAGTTCATACCGCTAA 38267030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      777 GATATACTGCCCTTGCTTATTACCCCTTTATAGCTGTTTTGTTAAAGTTCATACCGCTAA 836

 38267031 GACCTGTAAAAGAAATTTATGGCTCTAGGGATTTCAGCAAATTCTAAATAACCATAACAG 38267090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      837 GACCTGTAAAAGAAATTTATGGCTCTAGGGATTTCAGCAAATTCTAAATAACCATAACAG 896

 38267091 GAACAGGAAGCATTAATTAAAGACACTAGAGTCTAAGTTATAACAGAAATCCTGACATTT 38267150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      897 GAACAGGAAGCATTAATTAAAGACACTAGAGTCTAAGTTATAACAGAAATCCTGACATTT 956

 38267151 AAGGCCCTGGTACCATTTAAATTTAAAATGGTATGACAAACAGAGAGTAATTTGATGGTC 38267210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      957 AAGGCCCTGGTACCATTTAAATTTAAAATGGTATGACAAACAGAGAGTAATTTGATGGTC 1016

 38267211 AGAAGGTTATAATGGATACCTTAATACCTTTGCCAAGAAAAAGTGTCTGTCCTTGCTCTA 38267270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1017 AGAAGGTTATAATGGATACCTTAATACCTTTGCCAAGAAAAAGTGTCTGTCCTTGCTCTA 1076

 38267271 ACCCCTACCCAGGGGCTTCAGGGGCCTCCTTCATAAAACATGGTGATGCCTAAATATTTT 38267330
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1077 ATCCCTACCCAGGGGCTTCAGGGGCCTCCTTCATAAAACATGGTGATGCCTAAATATTTT 1136

 38267331 TGCGATATCTCATATATAAGCTGGTCTTTTCTTTAAGAATACGAGAGATTAAACACCAAC 38267390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1137 TGCGATATCTCATATATAAGCTGGTCTTTTCTTTAAGAATACGAGAGATTAAACACCAAC 1196

 38267391 CCCCAACATTCATACACCAATTTTCAGATAAAACAGCTTAATATTTAAGATATATTTAGT 38267450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1197 CCCCAACATTCATACACCAATTTTCAGATAAAACAGCTTAATATTTAAGATATATTTAGT 1256

 38267451 GCAATTTGTCTATTTCTTGGTTTACTGGAGGGCTGTATTTAAAGCCAAGGGACCAAGGAA 38267510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1257 GCAATTTGTCTATTTCTTGGTTTACTGGAGGGCTGTATTTAAAGCCAAGGGACCAAGGAA 1316

 38267511 CATTCCACAACACACTAAAGCAATTTTTCCCCAGGGAATATGCTGATTCTTTCCTAAAGG 38267570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1317 CATTCCACAACACACTAAAGCAATTTTTCCCCAGGGAATATGCTGATTCTTTCCTAAAGG 1376

 38267571 CAGAAGCCGACATTCCTGACTCATTCTGCCAAACCAAGCAATGAAAAATGCTTCACCTAA 38267630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1377 CAGAAGCCGACATTCCTGACTCATTCTGCCAAACCAAGCAATGAAAAATGCTTCACCTAA 1436

 38267631 TTTGAAAGATAATTTGTAATACCAGAGACTCAACTTGTTTTGTGTATCCAATACTAGCAC 38267690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1437 TTTGAAAGATAATTTGTAATACCAGAGACTCAACTTGTTTTGTGTATCCAATACTAGCAC 1496

 38267691 CCTTTCCAGAATGTTGAAAGTACACACTGTATGATTTGTCTAATGTATATTCAAAAAAGG 38267750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1497 CCTTTCCAGAATGTTGAAAGTACACACTGTATGATTTGTCTAATGTATATTCAAAAAAGG 1556

 38267751 AATACAAATTGATCCTCAAAGTTCAAATCTGCAGTACATACTCTGTGTTCTGCCCCCACC 38267810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1557 AATACAAATTGATCCTCAAAGTTCAAATCTGCAGTACATACTCTGTGTTCTGCCCCCACC 1616

 38267811 CGTACCTTCATGAATTCTTTCACCTAGCACGCAGGCTGTTTTCCCTTTGCGAAATCCCAT 38267870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1617 CGTACCTTCATGAATTCTTTCACCTAGCACGCAGGCTGTTTTCCCTTTGCGAAATCCCAT 1676

 38267871 GGTACATTTATAGTATTAATACCACTCACTTAGAATATGCCGTATTTTGTCTAATATTGC 38267930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1677 GGTACATTTATAGTATTAATACCACTCACTTAGAATATGCCGTATTTTGTCTAATATTGC 1736

 38267931 TAGATTTTGTGTGTATAATCTTATTCCTCAAGTAAATTACAAGACAAGGACTATAATTTA 38267990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1737 TAGATTTTGTGTGTATAATCTTATTCCTCAAGTAAATTACAAGACAAGGACTATAATTTA 1796

 38267991 TACATCCTCTACAACACTTGACACTGGCTTTGATTAGGCTCTTAATAAATATTTGTTGGT 38268050
          ||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     1797 TACATCCTCTACAACACTTGGCACTGGCTTTGAGTAGGCTCTTAATAAATATTTGTTGGT 1856

 38268051 TGATTAATCAGTTGACCACACTTACTAATTGCAAGGTGACATCATTTATCATTAATAAAC 38268110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1857 TGATTAATCAGTTGACCACACTTACTAATTGCAAGGTGACATCATTTATCATTAATAAAC 1916

 38268111 ATATATGTGGATTACAAAAATATCATGTGAATTTGCATATAATCATATTAATCCCAAATT 38268170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1917 ATATATGTGGATTACAAAAATATCATGTGAATTTGCATATAATCATATTAATCCCAAATT 1976

 38268171 AGCACCTGAGAGTCCAACCACCCTCTCCTTTAGGCCCTTTTCACTTTTATGTCTACTTTT 38268230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1977 AGCACCTGAGAGTCCAACCACCCTCTCCTTTAGGCCCTTTTCACTTTTATGTCTACTTTT 2036

 38268231 GCCTCACTTACAATTCCACTACTTACTTGCCTTCTTTCTCTTTTCAGCTTTGTGCTGTTA 38268290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2037 GCCTCACTTACAATTCCACTACTTACTTGCCTTCTTTCTCTTTTCAGCTTTGTGCTGTTA 2096

 38268291 TTTAATATCTCACCAGTTGTGTAATTTCAGCTCCCAAATTGAATAAGACGTTCCCCCCAG 38268350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2097 TTTAATATCTCACCAGTTGTGTAATTTCAGCTCCCAAATTGAATAAGACGTTCCCCCCAG 2156

 38268351 TGGAACCCTCACCTTGACAAATAGCCAAATAGTA---ATTATTCCTTTCAGGGGTTGAGC 38268407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||
     2157 TGGAACCCTCACCTTGACAAATAGCCAAATAGTAATTATTATTCCTTTCAGGGGTTGAGC 2216

 38268408 TATGGAATCATGCTTGCAATATCCCAGGCTTGAGTGCCTAGATATTTATGCTATACTTCC 38268467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2217 TATGGAATCATGCTTGCAATATCCCAGGCTTGAGTGCCTAGATATTTATGCTATACTTCC 2276

 38268468 CTGTGTCGGAGTTTCCATCTGCGATTGTATTTCAAGCCCTCTCATTTTTTTTTTCAATAT 38268527
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
     2277 CTGTGTCGGAGTTTCCATCTGCGATTGTATTTCAAGCCCTCTCA-TTTTTTTTTCAATAT 2335

 38268528 GATTAAGATAATTCCTTTATGAAGTTGGAAACTCAGACATTCAGAAAGAAACTTGACGTT 38268587
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2336 GATTAAGATAATTCCTTTATGAAGCTGGAAACTCAGACATTCAGAAAGAAACTTGACGTT 2395

 38268588 TCATATTTTTGCTAACTTGCTCTTCCCATTTCCTTTCCTATCATTTTAGCCAGACTGAGG 38268647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2396 TCATATTTTTGCTAACTTGCTCTTCCCATTTCCTTTCCTATCATTTTAGCCAGACTGAGG 2455

 38268648 GAGAATTAATTTTGCAATGGTCTCTATTTTTTTTTCCAAATGTGTGACCTCCATATTAAT 38268707
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2456 GAGAATTAATTTTGCAACGGTCTCTATTTTTTTTTCCAAATGTGTGACCTCCATATTAAT 2515

 38268708 AGGAGCCAGAGTACTCATTCATCACATCTGGTCAGTGTGAAACTGACATTTACAGGGTGG 38268767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2516 AGGAGCCAGAGTACTCATTCATCACATCTGGTCAGTGTGAAACTGACATTTACAGGGTGG 2575

 38268768 AATGTTTCCCACTCAGGACAAATGGGGATCATTTGTAAAACATGCCGCACCCAATCATAG 38268827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     2576 AATGTTTCCCACTCAGGACAAATGGGGATCATTTGTAAAACATGCCACACCCAATCATAG 2635

 38268828 GTTCCCATGGATCTCCAACTACATTTTTAAGCAACAATATAAACCATTCCCGAAACTGAA 38268887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2636 GTTCCCATGGATCTCCAACTACATTTTTAAGCAACAATATAAACCATTCCCGAAACTGAA 2695

 38268888 AGGTCTTTTCAAATATTTACTGCCTACCTATGGAATTTTTATTCTGCTTGCTGCTGCCAT 38268947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2696 AGGTCTTTTCAAATATTTACTGCCTACCTATGGAATTTTTATTCTGCTTGCTGCTGCCAT 2755

 38268948 CAATAATCCTGGGAGTTCCTAGCTAAGTGTTGTGTATGACCTCCAAGGAAAGTCTTAGCA 38269007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2756 CAATAATCCTGGGAGTTCCTAGCTAAGTGTTGTGTATGACCTCCAAGGAAAGTCTTAGCA 2815

 38269008 TTGCAGAATGGGGAGGCGGGTTAGTATCCTGCATTTTTCATTCTGTCACTTTCTAGGGAC 38269067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2816 TTGCAGAATGGGGAGGCGGGTTAGTATCCTGCATTTTTCATTCTGTCACTTTCTAGGGAC 2875

 38269068 AATTACAAAGAAAATAATCATATAAGACTTATTTTTATGTTTATTATGAAAGCCTTCAGC 38269127
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2876 AATTACAAAGAAAATAATCGTATAAGACTTATTTTTATGTTTATTATGAAAGCCTTCAGC 2935

 38269128 TCTTGCATTTGCAAGTAAGCTCAATGATTTTAAGTTTGCTTTTTCCCCCATGAAATGAAA 38269187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2936 TCTTGCATTTGCAAGTAAGCTCAATGATTTTAAGTTTGCTTTTTCCCCCATGAAATGAAA 2995

 38269188 TATTATTTCCCACTTCTTCCATGAATCTATTGGGTAACTCCAGGCCACTGTGATCTTTCA 38269247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2996 TATTATTTCCCACTTCTTCCATGAATCTATTGGGTAACTCCAGGCCACTGTGATCTTTCA 3055

 38269248 TCTGGCATTTTGCTTTTATTTTTCTAGATCACAGTTGTGATTTAAAGCCCTCCTGGCACT 38269307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3056 TCTGGCATTTTGCTTTTATTTTTCTAGATCACAGTTGTGATTTAAAGCCCTCCTGGCACT 3115

 38269308 TGGACACCTTGGTGATCTTAGCTCATGCTCCTAGTTCCATAGTGATGAATTGACCAAACT 38269367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3116 TGGACACCTTGGTGATCTTAGCTCATGCTCCTAGTTCCATAGTGATGAATTGACCAAACT 3175

 38269368 TTTTCCCAAGGATATCTGCTAATTCTGGAGTTTCTGCTTTCTTATTATCTGTTCTGTCTT 38269427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3176 TTTTCCCAAGGATATCTGCTAATTCTGGAGTTTCTGCTTTCTTATTATCTGTTCTGTCTT 3235

 38269428 TTGGTTCTGTATTGATATAACAAGCTTTGTCCCCTTATCAATGAGGGCACAAAATGCAGC 38269487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     3236 TTGGTTCTGTATTGATATAACAAGCTTTGTCCCCTTATCAATGAGGGCACAAAATGAAGC 3295

 38269488 ACTTCAAATAATTTCTGCAAAAATTTACAGTTGCTGCATTAAGAATTTTGTGAGCTTCAA 38269547
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3296 ACTTCAAATAGTTTCTGCAAAAATTTACAGTTGCTGCATTAAGAATTTTGTGAGCTTCAA 3355

 38269548 TAATGTTATTGAAAAGTTGCAGATTCCCTCCTCCTTCTTTTTCTCCTTTCCTCCTCTTTC 38269607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3356 TAATGTTATTGAAAAGTTGCAGATTCCCTCCTCCTTCTTTTTCTCCTTTCCTCCTCTTTC 3415

 38269608 TGCCCTGTCTCCCCTTCATTATTCTCCTCTTCTTCTCAAAAGCAAACAATCATTTTTCTT 38269667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3416 TGCCCTGTCTCCCCTTCATTATTCTCCTCTTCTTCTCAAAAGCAAACAATCATTTTTCTT 3475

 38269668 GCCTACTGAAGAATACTTGTAATGTTATTCTCAAAACCTGGACACCAGCTCAACTCCTTC 38269727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3476 GCCTACTGAAGAATACTTGTAATGTTATTCTCAAAACCTGGACACCAGCTCAACTCCTTC 3535

 38269728 TTTGTTCTACAAGTATTCACCCACCCTAATAGGGAGTTTATTCCAATGAAAAGACTGTGT 38269787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3536 TTTGTTCTACAAGTATTCACCCACCCTAATAGGGAGTTTATTCCAATGAAAAGACTGTGT 3595

 38269788 TCCTCCTCAGAGGAATTTATGAGGTGGTAAGAGAGTAGAATTGCATTAATCTTATGCCAT 38269847
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3596 TCCTCCTCAGAGGAATTTATGAGGAGGTAAGAGAGTAGAATTGCATTAATCTTATGCCAT 3655

 38269848 TCCTAGAGAATTCTTATTTCCTCAATTAAGGTTTAATTGCTCTGTTCTGAAAAAAAAAAA 38269907
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||
     3656 TCCTAGAGAATTCTTATTTCCTCAATTAAGGTTTAATTGCTCTGTTCTG---AAAAAAAA 3712

 38269908 AAAATGGTGAGTCCAAGCAGATAATTTACAGTGACCTGTATCTGTGACTAGTTTTAAGGC 38269967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3713 AAAATGGTGAGTCCAAGCAGATAATTTACAGTGACCTGTATCTGTGACTAGTTTTAAGGC 3772

 38269968 TACCCTGAGGTCAGAATTTAAACATGTT 38269995
          ||||||||||||||||||||||||||||
     3773 TACCCTGAGGTCAGAATTTAAACATGTT 3800

Alignment time is 3.51505 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38249892,38276749] =>     26858 nucs '18 dna:chromosome chromosome:GRCh37:18:1:78077248:1'
Second seq [       1,    5745] =>      5745 nucs 'mol-32-32f0-033005_5745'

Score:        5451
Aligned:      5751        nucs
Identic:      5718 ( 99%) nucs =>       477 (100%)      5241 ( 99%)
Gaps:           12 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38259416,38259892] EXCISED REGION [38266750,38272017]
 second seq =>  [       1,     477] EXCISED REGION [     478,    5745]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6857 nucs [38259893,38266749]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [38259893,38259893] to [38266750,38266750]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [38259893,38259893] to [38266749,38266749]
 second seq =>         0 nucs

 38259416 ACAGTAATAGTAATTCTTACTACCAGACTGGATGCTGGAGGGCTCTCCTTCAGAGAAACA 38259475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACAGTAATAGTAATTCTTACTACCAGACTGGATGCTGGAGGGCTCTCCTTCAGAGAAACA 60

 38259476 GAAAAGAAAAAAAAGCCTATAGCCACTAATATTTGAATCTCTGCAATTAAATACCTGGGT 38259535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAAAAGAAAAAAAAGCCTATAGCCACTAATATTTGAATCTCTGCAATTAAATACCTGGGT 120

 38259536 CCCTTCCCAATCATATAGCAGTGATGCTCACCAGTTAACAAGAACTGAAGACACATGACA 38259595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCCTTCCCAATCATATAGCAGTGATGCTCACCAGTTAACAAGAACTGAAGACACATGACA 180

 38259596 GATTCCAATCAGTGATTTATTACCACTGTCAAATAAGAATGGACACTCAAAGATTACCTG 38259655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GATTCCAATCAGTGATTTATTACCACTGTCAAATAAGAATGGACACTCAAAGATTACCTG 240

 38259656 AAAAAGTCCTTTAATATGGCCCCAGATTGAATAATTCCTAATTTCCTATATCATAAATTC 38259715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAAAAGTCCTTTAATATGGCCCCAGATTGAATAATTCCTAATTTCCTATATCATAAATTC 300

 38259716 AAAAATTATCTAAAATTCAGTGAAATTAGTCCATATTATCAATGCCAACCTTACACATAA 38259775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAAAATTATCTAAAATTCAGTGAAATTAGTCCATATTATCAATGCCAACCTTACACATAA 360

 38259776 ACAGAGTTGACATTCTCTTATGATGCTGAACAATGCAGATGAAGAACGCTGGCTTTGGAT 38259835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACAGAGTTGACATTCTCTTATGATGCTGAACAATGCAGATGAAGAACGCTGGCTTTGGAT 420

 38259836 TAAGAAGACCCTTAGTTTGAATTTTAATTTTGACCCATGATAGCTGTGTAAACTTAG 38259892
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TAAGAAGACCCTTAGTTTGAATTTTAATTTTGACCCATGATAGCTGTGTAAACTTAG 477

EXCISED REGION

 38266750 TAAATGAACTTGATTTGAATGGAATGAGAGTTCAATGAAACTGTATATATTGTGAAACGT 38266809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      478 TAAATGAACTTGATTTGAATGGAATGAGAGTTCAATGAAACTGTATATATTGTGAAACGT 537

 38266810 GGCAACTTACACCTACTCAAGACATTAAAAGAGATCATGCTTTCTTGCCTAAGTTTTATG 38266869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      538 GGCAACTTACACCTACTCAAGACATTAAAAGAGATCATGCTTTCTTGCCTAAGTTTTATG 597

 38266870 TCCAATTTGTTCCTGTTTCAAACCCCTCGACAAAAACAAAATCTTTTAATCTGTTTGCAA 38266929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      598 TCCAATTTGTTCCTGTTTCAAACCCCTCGACAAAAACAAAATCTTTTAATCTGTTTGCAA 657

 38266930 AATATTTCCTCCTTCCTCCCATCTTGCTGTTGCTGCTCTGTGATATACTGCCCTTGCTTA 38266989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      658 AATATTTCCTCCTTCCTCCCATCTTGCTGTTGCTGCTCTGTGATATACTGCCCTTGCTTA 717

 38266990 TTACCCCTTTATAGCTGTTTTGTTAAAGTTCATACCGCTAAGACCTGTAAAAGAAATTTA 38267049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      718 TTACCCCTTTATAGCTGTTTTGTTAAAGTTCATACCGCTAAGACCTGTAAAAGAAATTTA 777

 38267050 TGGCTCTAGGGATTTCAGCAAATTCTAAATAACCATAACAGGAACAGGAAGCATTAATTA 38267109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      778 TGGCTCTAGGGATTTCAGCAAATTCTAAATAACCATAACAGGAACAGGAAGCATTAATTA 837

 38267110 AAGACACTAGAGTCTAAGTTATAACAGAAATCCTGACATTTAAGGCCCTGGTACCATTTA 38267169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      838 AAGACACTAGAGTCTAAGTTATAACAGAAATCCTGACATTTAAGGCCCTGGTACCATTTA 897

 38267170 AATTTAAAATGGTATGACAAACAGAGAGTAATTTGATGGTCAGAAGGTTATAATGGATAC 38267229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      898 AATTTAAAATGGTATGACAAACAGAGAGTAATTTGATGGTCAGAAGGTTATAATGGATAC 957

 38267230 CTTAATACCTTTGCCAAGAAAAAGTGTCTGTCCTTGCTCTAACCCCTACCCAGGGGCTTC 38267289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
      958 CTTAATACCTTTGCCAAGAAAAAGTGTCTGTCCTTGCTCTAATCCCTACCCAGGGGCTTC 1017

 38267290 AGGGGCCTCCTTCATAAAACATGGTGATGCCTAAATATTTTTGCGATATCTCATATATAA 38267349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1018 AGGGGCCTCCTTCATAAAACATGGTGATGCCTAAATATTTTTGCGATATCTCATATATAA 1077

 38267350 GCTGGTCTTTTCTTTAAGAATACGAGAGATTAAACACCAACCCCCAACATTCATACACCA 38267409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1078 GCTGGTCTTTTCTTTAAGAATACGAGAGATTAAACACCAACCCCCAACATTCATACACCA 1137

 38267410 ATTTTCAGATAAAACAGCTTAATATTTAAGATATATTTAGTGCAATTTGTCTATTTCTTG 38267469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1138 ATTTTCAGATAAAACAGCTTAATATTTAAGATATATTTAGTGCAATTTGTCTATTTCTTG 1197

 38267470 GTTTACTGGAGGGCTGTATTTAAAGCCAAGGGACCAAGGAACATTCCACAACACACTAAA 38267529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1198 GTTTACTGGAGGGCTGTATTTAAAGCCAAGGGACCAAGGAACATTCCACAACACACTAAA 1257

 38267530 GCAATTTTTCCCCAGGGAATATGCTGATTCTTTCCTAAAGGCAGAAGCCGACATTCCTGA 38267589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1258 GCAATTTTTCCCCAGGGAATATGCTGATTCTTTCCTAAAGGCAGAAGCCGACATTCCTGA 1317

 38267590 CTCATTCTGCCAAACCAAGCAATGAAAAATGCTTCACCTAATTTGAAAGATAATTTGTAA 38267649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1318 CTCATTCTGCCAAACCAAGCAATGAAAAATGCTTCACCTAATTTGAAAGATAATTTGTAA 1377

 38267650 TACCAGAGACTCAACTTGTTTTGTGTATCCAATACTAGCACCCTTTCCAGAATGTTGAAA 38267709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1378 TACCAGAGACTCAACTTGTTTTGTGTATCCAATACTAGCACCCTTTCCAGAATGTTGAAA 1437

 38267710 GTACACACTGTATGATTTGTCTAATGTATATTCAAAAAAGGAATACAAATTGATCCTCAA 38267769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1438 GTACACACTGTATGATTTGTCTAATGTATATTCAAAAAAGGAATACAAATTGATCCTCAA 1497

 38267770 AGTTCAAATCTGCAGTACATACTCTGTGTTCTGCCCCCACCCGTACCTTCATGAATTCTT 38267829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1498 AGTTCAAATCTGCAGTACATACTCTGTGTTCTGCCCCCACCCGTACCTTCATGAATTCTT 1557

 38267830 TCACCTAGCACGCAGGCTGTTTTCCCTTTGCGAAATCCCATGGTACATTTATAGTATTAA 38267889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1558 TCACCTAGCACGCAGGCTGTTTTCCCTTTGCGAAATCCCATGGTACATTTATAGTATTAA 1617

 38267890 TACCACTCACTTAGAATATGCCGTATTTTGTCTAATATTGCTAGATTTTGTGTGTATAAT 38267949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1618 TACCACTCACTTAGAATATGCCGTATTTTGTCTAATATTGCTAGATTTTGTGTGTATAAT 1677

 38267950 CTTATTCCTCAAGTAAATTACAAGACAAGGACTATAATTTATACATCCTCTACAACACTT 38268009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1678 CTTATTCCTCAAGTAAATTACAAGACAAGGACTATAATTTATACATCCTCTACAACACTT 1737

 38268010 GACACTGGCTTTGATTAGGCTCTTAATAAATATTTGTTGGTTGATTAATCAGTTGACCAC 38268069
          |.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1738 GGCACTGGCTTTGAGTAGGCTCTTAATAAATATTTGTTGGTTGATTAATCAGTTGACCAC 1797

 38268070 ACTTACTAATTGCAAGGTGACATCATTTATCATTAATAAACATATATGTGGATTACAAAA 38268129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1798 ACTTACTAATTGCAAGGTGACATCATTTATCATTAATAAACATATATGTGGATTACAAAA 1857

 38268130 ATATCATGTGAATTTGCATATAATCATATTAATCCCAAATTAGCACCTGAGAGTCCAACC 38268189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1858 ATATCATGTGAATTTGCATATAATCATATTAATCCCAAATTAGCACCTGAGAGTCCAACC 1917

 38268190 ACCCTCTCCTTTAGGCCCTTTTCACTTTTATGTCTACTTTTGCCTCACTTACAATTCCAC 38268249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1918 ACCCTCTCCTTTAGGCCCTTTTCACTTTTATGTCTACTTTTGCCTCACTTACAATTCCAC 1977

 38268250 TACTTACTTGCCTTCTTTCTCTTTTCAGCTTTGTGCTGTTATTTAATATCTCACCAGTTG 38268309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1978 TACTTACTTGCCTTCTTTCTCTTTTCAGCTTTGTGCTGTTATTTAATATCTCACCAGTTG 2037

 38268310 TGTAATTTCAGCTCCCAAATTGAATAAGACGTTCCCCCCAGTGGAACCCTCACCTTGACA 38268369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2038 TGTAATTTCAGCTCCCAAATTGAATAAGACGTTCCCCCCAGTGGAACCCTCACCTTGACA 2097

 38268370 AATAGCCAAATAGTA---ATTATTCCTTTCAGGGGTTGAGCTATGGAATCATGCTTGCAA 38268426
          |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2098 AATAGCCAAATAGTAATTATTATTCCTTTCAGGGGTTGAGCTATGGAATCATGCTTGCAA 2157

 38268427 TATCCCAGGCTTGAGTGCCTAGATATTTATGCTATACTTCCCTGTGTCGGAGTTTCCATC 38268486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2158 TATCCCAGGCTTGAGTGCCTAGATATTTATGCTATACTTCCCTGTGTCGGAGTTTCCATC 2217

 38268487 TGCGATTGTATTTCAAGCCCTCTCATTTTTTTTTTCAATATGATTAAGATAATTCCTTTA 38268546
          ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2218 TGCGATTGTATTTCAAGCCCTCTCA-TTTTTTTTTCAATATGATTAAGATAATTCCTTTA 2276

 38268547 TGAAGTTGGAAACTCAGACATTCAGAAAGAAACTTGACGTTTCATATTTTTGCTAACTTG 38268606
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2277 TGAAGCTGGAAACTCAGACATTCAGAAAGAAACTTGACGTTTCATATTTTTGCTAACTTG 2336

 38268607 CTCTTCCCATTTCCTTTCCTATCATTTTAGCCAGACTGAGGGAGAATTAATTTTGCAATG 38268666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     2337 CTCTTCCCATTTCCTTTCCTATCATTTTAGCCAGACTGAGGGAGAATTAATTTTGCAACG 2396

 38268667 GTCTCTATTTTTTTTTCCAAATGTGTGACCTCCATATTAATAGGAGCCAGAGTACTCATT 38268726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2397 GTCTCTATTTTTTTTTCCAAATGTGTGACCTCCATATTAATAGGAGCCAGAGTACTCATT 2456

 38268727 CATCACATCTGGTCAGTGTGAAACTGACATTTACAGGGTGGAATGTTTCCCACTCAGGAC 38268786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2457 CATCACATCTGGTCAGTGTGAAACTGACATTTACAGGGTGGAATGTTTCCCACTCAGGAC 2516

 38268787 AAATGGGGATCATTTGTAAAACATGCCGCACCCAATCATAGGTTCCCATGGATCTCCAAC 38268846
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     2517 AAATGGGGATCATTTGTAAAACATGCCACACCCAATCATAGGTTCCCATGGATCTCCAAC 2576

 38268847 TACATTTTTAAGCAACAATATAAACCATTCCCGAAACTGAAAGGTCTTTTCAAATATTTA 38268906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2577 TACATTTTTAAGCAACAATATAAACCATTCCCGAAACTGAAAGGTCTTTTCAAATATTTA 2636

 38268907 CTGCCTACCTATGGAATTTTTATTCTGCTTGCTGCTGCCATCAATAATCCTGGGAGTTCC 38268966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2637 CTGCCTACCTATGGAATTTTTATTCTGCTTGCTGCTGCCATCAATAATCCTGGGAGTTCC 2696

 38268967 TAGCTAAGTGTTGTGTATGACCTCCAAGGAAAGTCTTAGCATTGCAGAATGGGGAGGCGG 38269026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2697 TAGCTAAGTGTTGTGTATGACCTCCAAGGAAAGTCTTAGCATTGCAGAATGGGGAGGCGG 2756

 38269027 GTTAGTATCCTGCATTTTTCATTCTGTCACTTTCTAGGGACAATTACAAAGAAAATAATC 38269086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2757 GTTAGTATCCTGCATTTTTCATTCTGTCACTTTCTAGGGACAATTACAAAGAAAATAATC 2816

 38269087 ATATAAGACTTATTTTTATGTTTATTATGAAAGCCTTCAGCTCTTGCATTTGCAAGTAAG 38269146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2817 ATATAAGACTTATTTTTATGTTTATTATGAAAGCCTTCAGCTCTTGCATTTGCAAGTAAG 2876

 38269147 CTCAATGATTTTAAGTTTGCTTTTTCCCCCATGAAATGAAATATTATTTCCCACTTCTTC 38269206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2877 CTCAATGATTTTAAGTTTGCTTTTTCCCCCATGAAATGAAATATTATTTCCCACTTCTTC 2936

 38269207 CATGAATCTATTGGGTAACTCCAGGCCACTGTGATCTTTCATCTGGCATTTTGCTTTTAT 38269266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2937 CATGAATCTATTGGGTAACTCCAGGCCACTGTGATCTTTCATCTGGCATTTTGCTTTTAT 2996

 38269267 TTTTCTAGATCACAGTTGTGATTTAAAGCCCTCCTGGCACTTGGACACCTTGGTGATCTT 38269326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2997 TTTTCTAGATCACAGTTGTGATTTAAAGCCCTCCTGGCACTTGGACACCTTGGTGATCTT 3056

 38269327 AGCTCATGCTCCTAGTTCCATAGTGATGAATTGACCAAACTTTTTCCCAAGGATATCTGC 38269386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3057 AGCTCATGCTCCTAGTTCCATAGTGATGAATTGACCAAACTTTTTCCCAAGGATATCTGC 3116

 38269387 TAATTCTGGAGTTTCTGCTTTCTTATTATCTGTTCTGTCTTTTGGTTCTGTATTGATATA 38269446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3117 TAATTCTGGAGTTTCTGCTTTCTTATTATCTGTTCTGTCTTTTGGTTCTGTATTGATATA 3176

 38269447 ACAAGCTTTGTCCCCTTATCAATGAGGGCACAAAATGCAGCACTTCAAATAATTTCTGCA 38269506
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||
     3177 ACAAGCTTTGTCCCCTTATCAATGAGGGCACAAAATGAAGCACTTCAAATAGTTTCTGCA 3236

 38269507 AAAATTTACAGTTGCTGCATTAAGAATTTTGTGAGCTTCAATAATGTTATTGAAAAGTTG 38269566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3237 AAAATTTACAGTTGCTGCATTAAGAATTTTGTGAGCTTCAATAATGTTATTGAAAAGTTG 3296

 38269567 CAGATTCCCTCCTCCTTCTTTTTCTCCTTTCCTCCTCTTTCTGCCCTGTCTCCCCTTCAT 38269626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     3297 CAGATTCCCTCCTCCTTCTTTTTCTCCTTTCCTCCTCTCTCTGCCCTGTCTCCCCTTCAT 3356

 38269627 TATTCTCCTCTTCTTCTCAAAAGCAAACAATCATTTTTCTTGCCTACTGAAGAATACTTG 38269686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3357 TATTCTCCTCTTCTTCTCAAAAGCAAACAATCATTTTTCTTGCCTACTGAAGAATACTTG 3416

 38269687 TAATGTTATTCTCAAAACCTGGACACCAGCTCAACTCCTTCTTTGTTCTACAAGTATTCA 38269746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3417 TAATGTTATTCTCAAAACCTGGACACCAGCTCAACTCCTTCTTTGTTCTACAAGTATTCA 3476

 38269747 CCCACCCTAATAGGGAGTTTATTCCAATGAAAAGACTGTGTTCCTCCTCAGAGGAATTTA 38269806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3477 CCCACCCTAATAGGGAGTTTATTCCAATGAAAAGACTGTGTTCCTCCTCAGAGGAATTTA 3536

 38269807 TGAGGTGGTAAGAGAGTAGAATTGCATTAATCTTATGCCATTCCTAGAGAATTCTTATTT 38269866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3537 TGAGGTGGTAAGAGAGTAGAATTGCATTAATCTTATGCCATTCCTAGAGAATTCTTATTT 3596

 38269867 CCTCAATTAAGGTTTAATTGCTCTGTTCTGAAAAAAAAAAAAAAATGGTGAGTCCAAGCA 38269926
          ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||
     3597 CCTCAATTAAGGTTTAATTGCTCTGTTCTG---AAAAAAAAAAAATGGTGAGTCCAAGCA 3653

 38269927 GATAATTTACAGTGACCTGTATCTGTGACTAGTTTTAAGGCTACCCTGAGGTCAGAATTT 38269986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3654 GATAATTTACAGTGACCTGTATCTGTGACTAGTTTTAAGGCTACCCTGAGGTCAGAATTT 3713

 38269987 AAACATGTTAATTCAGTACTGGACTTAATAGTAAACAAGATAGAGATATCTCTGTCTCAC 38270046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3714 AAACATGTTAATTCAGTACTGGACTTAATAGTAAACAAGATAGAGATATCTCTGTCTCAC 3773

 38270047 AAAGATTTGTAATACAACTCACAGAAGCTTTACTCCAAATGAAAGGGTCATAGTTAGAGG 38270106
          |.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3774 AGAGATTTGTAATACAACTCACAGACGCTTTACTCCAAATGAAAGGGTCATAGTTAGAGG 3833

 38270107 GAAATTCCATAATAATAGTACCTATCTGATAGGGTGAATGTGGGAATTAAACGAGTTCAT 38270166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3834 GAAATTCCATAATAATAGTACCTATCTGATAGGGTGAATGTGGGAATTAAACGAGTTCAT 3893

 38270167 AGCTATAAAGAATTTCAGAGGCCATCTGGCAATCACAAATAATAACTCTTAGTGGCAGCA 38270226
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     3894 AGCTATAAAGAATTTCAGAGGCCATCTGGCAATCACAAATAATAACTGTTAGTGGCAGCA 3953

 38270227 TTAGCTAGTTCCTGAATAGCCAAATATCTTGAATCCTCATAACAATGATTCAAATAAATG 38270286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3954 TTAGCTAGTTCCTGAATAGCCAAATATCTTGAATCCTCATAACAATGATTCAAATAAATG 4013

 38270287 TCATCATTATTTCACAGAGTAAGATACTTAAGCATTGGGAGTTATTAAGCAATTCTTTAA 38270346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4014 TCATCATTATTTCACAGAGTAAGATACTTAAGCATTGGGAGTTATTAAGCAATTCTTTAA 4073

 38270347 GGACATAGCAGCAACATGTAGAGGAGCTGAAATTACAACATGGTTCTTTCCGAACTTTAA 38270406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4074 GGACATAGCAGCAACATGTAGAGGAGCTGAAATTACAACATGGTTCTTTCCGAACTTTAA 4133

 38270407 GTCCCCTGTTTTTGTGTCTATGACTTTAAATATTCATAGTGGAATATCTATCTATCTACA 38270466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4134 GTCCCCTGTTTTTGTGTCTATGACTTTAAATATTCATAGTGGAATATCTATCTATCTACA 4193

 38270467 GATAATTTCATGAAACATTAAACTAAGTTTGG--TTTTTCTAAAATGCTAACCTCTGTTT 38270524
          ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||
     4194 GATAATTTCATGAAACATTAAACTAAGTTT--TTTTTTTCTAAAATGCTAACCTCTGTTT 4251

 38270525 AACTATCAACCTAGGCAAAAATGGACAATTCCCTGTACCTCAGAAGCTTTCCTAGTGCTC 38270584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4252 AACTATCAACCTAGGCAAAAATGGACAATTCCCTGTACCTCAGAAGCTTTCCTAGTGCTC 4311

 38270585 CTCCCATTCATAAAAATCTCCCATCCTTGGAAAATAGCCACGATAAAAATTATATCAAAT 38270644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4312 CTCCCATTCATAAAAATCTCCCATCCTTGGAAAATAGCCACGATAAAAATTATATCAAAT 4371

 38270645 CCCAACTTTTTATTTGTCCTTTTAACCAAATGACTTATGCTTTTCTAAATGATACAGATT 38270704
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4372 CCCAACTTTTTATTTGCCCTTTTAACCAAATGACTTATGCTTTTCTAAATGATACAGATT 4431

 38270705 TGCTTTGCCTATTTGGGAATGTTACATAACTAGAATCCTAGACAGAGCTCTTAATTGTAA 38270764
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4432 TGCTTTGCCTATTTGGGAATGTTATATAACTAGAATCCTAGACAGAGCTCTTAATTGTAA 4491

 38270765 CATTGTCATACATCAAATGTCAAGTGTCTACAAAGGGATGGATCACTCTGGGCTTTCAAT 38270824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4492 CATTGTCATACATCAAATGTCAAGTGTCTACAAAGGGATGGATCACTCTGGGCTTTCAAT 4551

 38270825 GTTCTTCCATTGGTCTATTAAATTCCCTTAGAGCAATAATCCTAGTATCTCATTTACTGA 38270884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4552 GTTCTTCCATTGGTCTATTAAATTCCCTTAGAGCAATAATCCTAGTATCTCATTTACTGA 4611

 38270885 AGTGTTACAATAGGATTTATTTTTTGGTGGAATAAGTCCAACCATCTTCTTGTTTGTTCT 38270944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4612 AGTGTTACAATAGGATTTATTTTTTGGTGGAATAAGTCCAACCATCTTCTTGTTTGTTCT 4671

 38270945 TCAAGAATGCATGGACTATTCTCTGTACTTTGCCTTATCACATACATTTAAAAATAAACC 38271004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4672 TCAAGAATGCATGGACTATTCTCTGTACTTTGCCTTATCACATACATTTAAAAATAAACC 4731

 38271005 TATTATTGCTATGAAATAATAATAAATAAAAGACTTGGGTTTTGTTTGATGTTACATTAT 38271064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4732 TATTATTGCTATGAAATAATAATAAATAAAAGACTTGGGTTTTGTTTGATGTTACATTAT 4791

 38271065 GTCTATAAAGTAAGGATCACTGACATCTGTAAAATTTGAATCTCCTAGTCTATAAAAAAT 38271124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4792 GTCTATAAAGTAAGGATCACTGACATCTGTAAAATTTGAATCTCCTAGTCTATAAAAAAT 4851

 38271125 TGAATATTTTTTGCTTATTCTGGGATCATTTCGATTATCTCCCAATAATGATTTTTGGTT 38271184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4852 TGAATATTTTTTGCTTATTCTGGGATCATTTCGATTATCTCCCAATAATGATTTTTGGTT 4911

 38271185 GTCTCTGTAAAGATCTAGTACATAGTTTGCTAGATTTATTGTTAGAATTTTAATGTTTAT 38271244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4912 GTCTCTGTAAAGATCTAGTACATAGTTTGCTAGATTTATTGTTAGAATTTTAATGTTTAT 4971

 38271245 GTTATTTTAAATAGTGTAAGTTTTATTTTTACTTATTTATTTATTTTAC-TTTTTCATGT 38271303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
     4972 GTTATTTTAAATAGTGTAAGTTTTATTTTTACTTATTTATTTATTTTACTTTTTTCATGT 5031

 38271304 CATTCACCTTTTAATCTTACAATGGTTTCTCATTGCTTAAAAACTCGAGATACATAACAT 38271363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5032 CATTCACCTTTTAATCTTACAATGGTTTCTCATTGCTTAAAAACTCGAGATACATAACAT 5091

 38271364 GCACAATATAAGTGCACAAAACACATTCTATGAATTTTTGCACATGCATACACTCATGAA 38271423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5092 GCACAATATAAGTGCACAAAACACATTCTATGAATTTTTGCACATGCATACACTCATGAA 5151

 38271424 ACTACCAACCAGATCAAAATAAAGAATTTTTTGTTTTGTTTTGAGACAGGGTCTTGCTCT 38271483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5152 ACTACCAACCAGATCAAAATAAAGAATTTTTTGTTTTGTTTTGAGACAGGGTCTTGCTCT 5211

 38271484 GTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCCATCATATGTGTCCTCTTTATTGTAATATGCAA 38271543
          |||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.||
     5212 GTCTCCCAGACTGGAGTGCAGTGGCGCCATCATATGTGTCCTCTTTGTTGTAATATGTAA 5271

 38271544 AATACTATTAACTTTTGAATAATAATAAACTTGTACAATCCCCTTTTCAAGTGTAATAGT 38271603
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5272 AATACTATTAATTTTTGAATAATAATAAACTTGTACAATCCCCTTTTCAAGTGTAATAGT 5331

 38271604 TTTTGAAGATTCTCTTGGACCTTCTGTGTGTATGATTGCATTATATGCAGATAATAAGAC 38271663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5332 TTTTGAAGATTCTCTTGGACCTTCTGTGTGTATGATTGCATTATATGCAGATAATAAGAC 5391

 38271664 CTTTAATTCTTCTTTTCACTTCCTTATACATCATTTCTTATTTATGTAGTTATAAATTTA 38271723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5392 CTTTAATTCTTCTTTTCACTTCCTTATACATCATTTCTTATTTATGTAGTTATAAATTTA 5451

 38271724 TATGTGTATTTATGCATATGTATATTATTTGTTTAAGGACATATCATTAAAATGTAGAGA 38271783
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     5452 TATGCGTATTTATGCATATGTATATTATTTGTTTAAGGACATATCATTAAAATGCAGAGA 5511

 38271784 AGCTGGAATTATGGTTATTTCTGAACTTAAAGACTATTCATATTTAATTATCAATTTCAT 38271843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5512 AGCTGGAATTATGGTTATTTCTGAACTTAAAGACTATTCATATTTAATTATCAATTTCAT 5571

 38271844 AGGGAATGCTTTGTTTCAACAGTAAGTATTAATTTTGCTATAAGTGTTTGTGTGTTTGTT 38271903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5572 AGGGAATGCTTTGTTTCAACAGTAAGTATTAATTTTGCTATAAGTGTTTGTGTGTTTGTT 5631

 38271904 AGGTTTTAATGAGATCGTTTACTGGATAAAAACAATTTTGTTTAGATTAGTTCTTTTCTA 38271963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5632 AGGTTTTAATGAGATCGTTTACTGGATAAAAACAATTTTGTTTAGATTAGTTCTTTTCTA 5691

 38271964 ATCTTAATTTGCTATTATGAGATTTTGAATTTGTCAATTTTTCTCTATATGTGT 38272017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5692 ATCTTAATTTGCTATTATGAGATTTTGAATTTGTCAATTTTTCTCTATATGTGT 5745

Alignment time is 5.29104 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38249892,38276749] =>     26858 nucs '18 dna:chromosome chromosome:GRCh37:18:1:78077248:1'
Second seq [       1,    4177] =>      4177 nucs 'mol-32-32fb-148413_4177'

Score:        3982
Aligned:      4183        nucs
Identic:      4159 ( 99%) nucs =>       796 ( 99%)      3363 ( 99%)
Gaps:           11 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38259092,38259892] EXCISED REGION [38266750,38270126]
 second seq =>  [       1,     801] EXCISED REGION [     802,    4177]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6857 nucs [38259893,38266749]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [38259893,38259893] to [38266750,38266750]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [38259893,38259893] to [38266749,38266749]
 second seq =>         0 nucs

 38259092 AGGGCAACTCAGAGATAAATCAAGAATGGGAAGATTCACACACCTCAACTGTAAAAGAGA 38259151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGGGCAACTCAGAGATAAATCAAGAATGGGAAGATTCACACACCTCAACTGTAAAAGAGA 60

 38259152 AATATGAGACTAAAAGCAGTGGATTAATTAAAACTTTGTTTGATGAGATATTATACATAG 38259211
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AATATGAGACTAAAAGCAGTGGATTCATTAAAACTTTGTTTGATGAGATATTATACATAG 120

 38259212 ATGTCTTCTCCATCATTCCAAGCACTTAAGCAGCTGCCCTTTCCAAACACTCATAGAGGA 38259271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
      121 ATGTCTTCTCCATCATTCCAAGCACTTAAGCAGCTGCCCTTTACAAACACTCATAGAGGA 180

 38259272 TAAGAGATTATTTTCTATAAAAATCAAACCAGATTGTTG--TGTACATCAAGCAAAGGAG 38259329
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||
      181 TAAGAGATTATTTTCTATAAAAATCAAACCAGATTGT--CATGTACATCAAGCAAAGGAG 238

 38259330 GGATGGCAGGGAGGTGATATACTGAAACAGAATTACTGTATGAAAACCTGGAATGAACAA 38259389
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
      239 GGATGGCAGGGAGGTGATATACTGAAACAGAATTACTGTATGAAAACATGGAATGAACAA 298

 38259390 TTAGATACTCAGTTCTCCTTACCTGCACAGTAATAGTAATTCTTACTACCAGACTGGATG 38259449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      299 TTAGATACTCAGTTCTCCTTACCTGCACAGTAATAGTAATTCTTACTACCAGACTGGATG 358

 38259450 CTGGAGGGCTCTCCTTCAGAGAAACAGAAAAGAAAAAAAAGCCTATAGCCACTAATATTT 38259509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      359 CTGGAGGGCTCTCCTTCAGAGAAACAGAAAAGAAAAAAAAGCCTATAGCCACTAATATTT 418

 38259510 GAATCTCTGCAATTAAATACCTGGGTCCCTTCCCAATCATATAGCAGTGATGCTCACCAG 38259569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      419 GAATCTCTGCAATTAAATACCTGGGTCCCTTCCCAATCATATAGCAGTGATGCTCACCAG 478

 38259570 TTAACAAGAACTGAAGACACATGACAGATTCCAATCAGTGATTTATTACCACTGTCAAAT 38259629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      479 TTAACAAGAACTGAAGACACATGACAGATTCCAATCAGTGATTTATTACCACTGTCAAAT 538

 38259630 AAGAATGGACACTCAAAGATTACCTGAAAAAGTCCTTTAATATGGCCCCAGATTGAATAA 38259689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      539 AAGAATGGACACTCAAAGATTACCTGAAAAAGTCCTTTAATATGGCCCCAGATTGAATAA 598

 38259690 TTCCTAATTTCCTATATCATAAATTCAAAAATTATCTAAAATTCAGTGAAATTAGTCCAT 38259749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      599 TTCCTAATTTCCTATATCATAAATTCAAAAATTATCTAAAATTCAGTGAAATTAGTCCAT 658

 38259750 ATTATCAATGCCAACCTTACACATAAACAGAGTTGACATTCTCTTATGATGCTGAACAAT 38259809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      659 ATTATCAATGCCAACCTTACACATAAACAGAGTTGACATTCTCTTATGATGCTGAACAAT 718

 38259810 GCAGATGAAGAACGCTGGCTTTGGATTAAGAAGACCCTTAGTTTGAATTTTAATTTTGAC 38259869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      719 GCAGATGAAGAACGCTGGCTTTGGATTAAGAAGACCCTTAGTTTGAATTTTAATTTTGAC 778

 38259870 CCATGATAGCTGTGTAAACTTAG 38259892
          |||||||||||||||||||||||
      779 CCATGATAGCTGTGTAAACTTAG 801

EXCISED REGION

 38266750 TAAATGAACTTGATTTGAATGGAATGAGAGTTCAATGAAACTGTATATATTGTGAAACGT 38266809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      802 TAAATGAACTTGATTTGAATGGAATGAGAGTTCAATGAAACTGTATATATTGTGAAACGT 861

 38266810 GGCAACTTACACCTACTCAAGACATTAAAAGAGATCATGCTTTCTTGCCTAAGTTTTATG 38266869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      862 GGCAACTTACACCTACTCAAGACATTAAAAGAGATCATGCTTTCTTGCCTAAGTTTTATG 921

 38266870 TCCAATTTGTTCCTGTTTCAAACCCCTCGACAAAAACAAAATCTTTTAATCTGTTTGCAA 38266929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      922 TCCAATTTGTTCCTGTTTCAAACCCCTCGACAAAAACAAAATCTTTTAATCTGTTTGCAA 981

 38266930 AATATTTCCTCCTTCCTCCCATCTTGCTGTTGCTGCTCTGTGATATACTGCCCTTGCTTA 38266989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      982 AATATTTCCTCCTTCCTCCCATCTTGCTGTTGCTGCTCTGTGATATACTGCCCTTGCTTA 1041

 38266990 TTACCCCTTTATAGCTGTTTTGTTAAAGTTCATACCGCTAAGACCTGTAAAAGAAATTTA 38267049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1042 TTACCCCTTTATAGCTGTTTTGTTAAAGTTCATACCGCTAAGACCTGTAAAAGAAATTTA 1101

 38267050 TGGCTCTAGGGATTTCAGCAAATTCTAAATAACCATAACAGGAACAGGAAGCATTAATTA 38267109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1102 TGGCTCTAGGGATTTCAGCAAATTCTAAATAACCATAACAGGAACAGGAAGCATTAATTA 1161

 38267110 AAGACACTAGAGTCTAAGTTATAACAGAAATCCTGACATTTAAGGCCCTGGTACCATTTA 38267169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1162 AAGACACTAGAGTCTAAGTTATAACAGAAATCCTGACATTTAAGGCCCTGGTACCATTTA 1221

 38267170 AATTTAAAATGGTATGACAAACAGAGAGTAATTTGATGGTCAGAAGGTTATAATGGATAC 38267229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1222 AATTTAAAATGGTATGACAAACAGAGAGTAATTTGATGGTCAGAAGGTTATAATGGATAC 1281

 38267230 CTTAATACCTTTGCCAAGAAAAAGTGTCTGTCCTTGCTCTAACCCCTACCCAGGGGCTTC 38267289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     1282 CTTAATACCTTTGCCAAGAAAAAGTGTCTGTCCTTGCTCTAATCCCTACCCAGGGGCTTC 1341

 38267290 AGGGGCCTCCTTCATAAAACATGGTGATGCCTAAATATTTTTGCGATATCTCATATATAA 38267349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1342 AGGGGCCTCCTTCATAAAACATGGTGATGCCTAAATATTTTTGCGATATCTCATATATAA 1401

 38267350 GCTGGTCTTTTCTTTAAGAATACGAGAGATTAAACACCAACCCCCAACATTCATACACCA 38267409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1402 GCTGGTCTTTTCTTTAAGAATACGAGAGATTAAACACCAACCCCCAACATTCATACACCA 1461

 38267410 ATTTTCAGATAAAACAGCTTAATATTTAAGATATATTTAGTGCAATTTGTCTATTTCTTG 38267469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1462 ATTTTCAGATAAAACAGCTTAATATTTAAGATATATTTAGTGCAATTTGTCTATTTCTTG 1521

 38267470 GTTTACTGGAGGGCTGTATTTAAAGCCAAGGGACCAAGGAACATTCCACAACACACTAAA 38267529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1522 GTTTACTGGAGGGCTGTATTTAAAGCCAAGGGACCAAGGAACATTCCACAACACACTAAA 1581

 38267530 GCAATTTTTCCCCAGGGAATATGCTGATTCTTTCCTAAAGGCAGAAGCCGACATTCCTGA 38267589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1582 GCAATTTTTCCCCAGGGAATATGCTGATTCTTTCCTAAAGGCAGAAGCCGACATTCCTGA 1641

 38267590 CTCATTCTGCCAAACCAAGCAATGAAAAATGCTTCACCTAATTTGAAAGATAATTTGTAA 38267649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1642 CTCATTCTGCCAAACCAAGCAATGAAAAATGCTTCACCTAATTTGAAAGATAATTTGTAA 1701

 38267650 TACCAGAGACTCAACTTGTTTTGTGTATCCAATACTAGCACCCTTTCCAGAATGTTGAAA 38267709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1702 TACCAGAGACTCAACTTGTTTTGTGTATCCAATACTAGCACCCTTTCCAGAATGTTGAAA 1761

 38267710 GTACACACTGTATGATTTGTCTAATGTATATTCAAAAAAGGAATACAAATTGATCCTCAA 38267769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1762 GTACACACTGTATGATTTGTCTAATGTATATTCAAAAAAGGAATACAAATTGATCCTCAA 1821

 38267770 AGTTCAAATCTGCAGTACATACTCTGTGTTCTGCCCCCACCCGTACCTTCATGAATTCTT 38267829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1822 AGTTCAAATCTGCAGTACATACTCTGTGTTCTGCCCCCACCCGTACCTTCATGAATTCTT 1881

 38267830 TCACCTAGCACGCAGGCTGTTTTCCCTTTGCGAAATCCCATGGTACATTTATAGTATTAA 38267889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1882 TCACCTAGCACGCAGGCTGTTTTCCCTTTGCGAAATCCCATGGTACATTTATAGTATTAA 1941

 38267890 TACCACTCACTTAGAATATGCCGTATTTTGTCTAATATTGCTAGATTTTGTGTGTATAAT 38267949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1942 TACCACTCACTTAGAATATGCCGTATTTTGTCTAATATTGCTAGATTTTGTGTGTATAAT 2001

 38267950 CTTATTCCTCAAGTAAATTACAAGACAAGGACTATAATTTATACATCCTCTACAACACTT 38268009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2002 CTTATTCCTCAAGTAAATTACAAGACAAGGACTATAATTTATACATCCTCTACAACACTT 2061

 38268010 GACACTGGCTTTGATTAGGCTCTTAATAAATATTTGTTGGTTGATTAATCAGTTGACCAC 38268069
          |.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2062 GGCACTGGCTTTGAGTAGGCTCTTAATAAATATTTGTTGGTTGATTAATCAGTTGACCAC 2121

 38268070 ACTTACTAATTGCAAGGTGACATCATTTATCATTAATAAACATATATGTGGATTACAAAA 38268129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2122 ACTTACTAATTGCAAGGTGACATCATTTATCATTAATAAACATATATGTGGATTACAAAA 2181

 38268130 ATATCATGTGAATTTGCATATAATCATATTAATCCCAAATTAGCACCTGAGAGTCCAACC 38268189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2182 ATATCATGTGAATTTGCATATAATCATATTAATCCCAAATTAGCACCTGAGAGTCCAACC 2241

 38268190 ACCCTCTCCTTTAGGCCCTTTTCACTTTTATGTCTACTTTTGCCTCACTTACAATTCCAC 38268249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2242 ACCCTCTCCTTTAGGCCCTTTTCACTTTTATGTCTACTTTTGCCTCACTTACAATTCCAC 2301

 38268250 TACTTACTTGCCTTCTTTCTCTTTTCAGCTTTGTGCTGTTATTTAATATCTCACCAGTTG 38268309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2302 TACTTACTTGCCTTCTTTCTCTTTTCAGCTTTGTGCTGTTATTTAATATCTCACCAGTTG 2361

 38268310 TGTAATTTCAGCTCCCAAATTGAATAAGACGTTCCCCCCAGTGGAACCCTCACCTTGACA 38268369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2362 TGTAATTTCAGCTCCCAAATTGAATAAGACGTTCCCCCCAGTGGAACCCTCACCTTGACA 2421

 38268370 AATAGCCAAATAGTA---ATTATTCCTTTCAGGGGTTGAGCTATGGAATCATGCTTGCAA 38268426
          |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2422 AATAGCCAAATAGTAATTATTATTCCTTTCAGGGGTTGAGCTATGGAATCATGCTTGCAA 2481

 38268427 TATCCCAGGCTTGAGTGCCTAGATATTTATGCTATACTTCCCTGTGTCGGAGTTTCCATC 38268486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2482 TATCCCAGGCTTGAGTGCCTAGATATTTATGCTATACTTCCCTGTGTCGGAGTTTCCATC 2541

 38268487 TGCGATTGTATTTCAAGCCCTCTCATTTTTTTTTTCAATATGATTAAGATAATTCCTTTA 38268546
          ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2542 TGCGATTGTATTTCAAGCCCTCTCA-TTTTTTTTTCAATATGATTAAGATAATTCCTTTA 2600

 38268547 TGAAGTTGGAAACTCAGACATTCAGAAAGAAACTTGACGTTTCATATTTTTGCTAACTTG 38268606
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2601 TGAAGCTGGAAACTCAGACATTCAGAAAGAAACTTGACGTTTCATATTTTTGCTAACTTG 2660

 38268607 CTCTTCCCATTTCCTTTCCTATCATTTTAGCCAGACTGAGGGAGAATTAATTTTGCAATG 38268666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     2661 CTCTTCCCATTTCCTTTCCTATCATTTTAGCCAGACTGAGGGAGAATTAATTTTGCAACG 2720

 38268667 GTCTCTATTTTTTTTTCCAAATGTGTGACCTCCATATTAATAGGAGCCAGAGTACTCATT 38268726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2721 GTCTCTATTTTTTTTTCCAAATGTGTGACCTCCATATTAATAGGAGCCAGAGTACTCATT 2780

 38268727 CATCACATCTGGTCAGTGTGAAACTGACATTTACAGGGTGGAATGTTTCCCACTCAGGAC 38268786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2781 CATCACATCTGGTCAGTGTGAAACTGACATTTACAGGGTGGAATGTTTCCCACTCAGGAC 2840

 38268787 AAATGGGGATCATTTGTAAAACATGCCGCACCCAATCATAGGTTCCCATGGATCTCCAAC 38268846
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     2841 AAATGGGGATCATTTGTAAAACATGCCACACCCAATCATAGGTTCCCATGGATCTCCAAC 2900

 38268847 TACATTTTTAAGCAACAATATAAACCATTCCCGAAACTGAAAGGTCTTTTCAAATATTTA 38268906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2901 TACATTTTTAAGCAACAATATAAACCATTCCCGAAACTGAAAGGTCTTTTCAAATATTTA 2960

 38268907 CTGCCTACCTATGGAATTTTTATTCTGCTTGCTGCTGCCATCAATAATCCTGGGAGTTCC 38268966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2961 CTGCCTACCTATGGAATTTTTATTCTGCTTGCTGCTGCCATCAATAATCCTGGGAGTTCC 3020

 38268967 TAGCTAAGTGTTGTGTATGACCTCCAAGGAAAGTCTTAGCATTGCAGAATGGGGAGGCGG 38269026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3021 TAGCTAAGTGTTGTGTATGACCTCCAAGGAAAGTCTTAGCATTGCAGAATGGGGAGGCGG 3080

 38269027 GTTAGTATCCTGCATTTTTCATTCTGTCACTTTCTAGGGACAATTACAAAGAAAATAATC 38269086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3081 GTTAGTATCCTGCATTTTTCATTCTGTCACTTTCTAGGGACAATTACAAAGAAAATAATC 3140

 38269087 ATATAAGACTTATTTTTATGTTTATTATGAAAGCCTTCAGCTCTTGCATTTGCAAGTAAG 38269146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3141 ATATAAGACTTATTTTTATGTTTATTATGAAAGCCTTCAGCTCTTGCATTTGCAAGTAAG 3200

 38269147 CTCAATGATTTTAAGTTTGCTTTTTCCCCCATGAAATGAAATATTATTTCCCACTTCTTC 38269206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3201 CTCAATGATTTTAAGTTTGCTTTTTCCCCCATGAAATGAAATATTATTTCCCACTTCTTC 3260

 38269207 CATGAATCTATTGGGTAACTCCAGGCCACTGTGATCTTTCATCTGGCATTTTGCTTTTAT 38269266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3261 CATGAATCTATTGGGTAACTCCAGGCCACTGTGATCTTTCATCTGGCATTTTGCTTTTAT 3320

 38269267 TTTTCTAGATCACAGTTGTGATTTAAAGCCCTCCTGGCACTTGGACACCTTGGTGATCTT 38269326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3321 TTTTCTAGATCACAGTTGTGATTTAAAGCCCTCCTGGCACTTGGACACCTTGGTGATCTT 3380

 38269327 AGCTCATGCTCCTAGTTCCATAGTGATGAATTGACCAAACTTTTTCCCAAGGATATCTGC 38269386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3381 AGCTCATGCTCCTAGTTCCATAGTGATGAATTGACCAAACTTTTTCCCAAGGATATCTGC 3440

 38269387 TAATTCTGGAGTTTCTGCTTTCTTATTATCTGTTCTGTCTTTTGGTTCTGTATTGATATA 38269446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3441 TAATTCTGGAGTTTCTGCTTTCTTATTATCTGTTCTGTCTTTTGGTTCTGTATTGATATA 3500

 38269447 ACAAGCTTTGTCCCCTTATCAATGAGGGCACAAAATGCAGCACTTCAAATAATTTCTGCA 38269506
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||
     3501 ACAAGCTTTGTCCCCTTATCAATGAGGGCACAAAATGAAGCACTTCAAATAGTTTCTGCA 3560

 38269507 AAAATTTACAGTTGCTGCATTAAGAATTTTGTGAGCTTCAATAATGTTATTGAAAAGTTG 38269566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3561 AAAATTTACAGTTGCTGCATTAAGAATTTTGTGAGCTTCAATAATGTTATTGAAAAGTTG 3620

 38269567 CAGATTCCCTCCTCCTTCTTTTTCTCCTTTCCTCCTCTTTCTGCCCTGTCTCCCCTTCAT 38269626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3621 CAGATTCCCTCCTCCTTCTTTTTCTCCTTTCCTCCTCTTTCTGCCCTGTCTCCCCTTCAT 3680

 38269627 TATTCTCCTCTTCTTCTCAAAAGCAAACAATCATTTTTCTTGCCTACTGAAGAATACTTG 38269686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3681 TATTCTCCTCTTCTTCTCAAAAGCAAACAATCATTTTTCTTGCCTACTGAAGAATACTTG 3740

 38269687 TAATGTTATTCTCAAAACCTGGACACCAGCTCAACTCCTTCTTTGTTCTACAAGTATTCA 38269746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3741 TAATGTTATTCTCAAAACCTGGACACCAGCTCAACTCCTTCTTTGTTCTACAAGTATTCA 3800

 38269747 CCCACCCTAATAGGGAGTTTATTCCAATGAAAAGACTGTGTTCCTCCTCAGAGGAATTTA 38269806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3801 CCCACCCTAATAGGGAGTTTATTCCAATGAAAAGACTGTGTTCCTCCTCAGAGGAATTTA 3860

 38269807 TGAGGTGGTAAGAGAGTAGAATTGCATTAATCTTATGCCATTCCTAGAGAATTCTTATTT 38269866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3861 TGAGGTGGTAAGAGAGTAGAATTGCATTAATCTTATGCCATTCCTAGAGAATTCTTATTT 3920

 38269867 CCTCAATTAAGGTTTAATTGCTCTGTTCTGAAAAAAAAAAAAAAATGGTGAGTCCAAGCA 38269926
          ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||
     3921 CCTCAATTAAGGTTTAATTGCTCTGTTCTG---AAAAAAAAAAAATGGTGAGTCCAAGCA 3977

 38269927 GATAATTTACAGTGACCTGTATCTGTGACTAGTTTTAAGGCTACCCTGAGGTCAGAATTT 38269986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3978 GATAATTTACAGTGACCTGTATCTGTGACTAGTTTTAAGGCTACCCTGAGGTCAGAATTT 4037

 38269987 AAACATGTTAATTCAGTACTGGACTTAATAGTAAACAAGATAGAGATATCTCTGTCTCAC 38270046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4038 AAACATGTTAATTCAGTACTGGACTTAATAGTAAACAAGATAGAGATATCTCTGTCTCAC 4097

 38270047 AAAGATTTGTAATACAACTCACAGAAGCTTTACTCCAAATGAAAGGGTCATAGTTAGAGG 38270106
          |.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4098 AGAGATTTGTAATACAACTCACAGACGCTTTACTCCAAATGAAAGGGTCATAGTTAGAGG 4157

 38270107 GAAATTCCATAATAATAGTA 38270126
          ||||||||||||||||||||
     4158 GAAATTCCATAATAATAGTA 4177

Alignment time is 3.8931 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38249892,38276749] =>     26858 nucs '18 dna:chromosome chromosome:GRCh37:18:1:78077248:1'
Second seq [       1,    2384] =>      2384 nucs 'mol-32-3306-018730_2384'

Score:        2305
Aligned:      2382        nucs
Identic:      2375 (100%) nucs =>       488 (100%)      1887 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38258819,38259308] EXCISED REGION [38259311,38261202]
 second seq =>  [       1,     490] EXCISED REGION [     493,    2384]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [38259309,38259310]
 second seq =>         2 nucs [491,492]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [38259309,38259311] to [38259311,38259313]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [38259306,38259308] to [38259311,38259313]
 second seq =>         3 nucs [488,490] to [493,495]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 38258819 GCTGTAGCTTTTAAAAAAAATAGAAAATACACCATAAAAATTTTAGTCAAGCATGGCAGA 38258878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCTGTAGCTTTTAAAAAAAATAGAAAATACACCATAAAAATTTTAGTCAAGCATGGCAGA 60

 38258879 CTAAATACATGTATTTATTTCTAATCTACTTCAAGCTCCAATATAATAACTGTTTACAAA 38258938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTAAATACATGTATTTATTTCTAATCTACTTCAAGCTCCAATATAATAACTGTTTACAAA 120

 38258939 TGAAATGGTCTAATATCACAAGTTCAAAATTAATAAGAGTGGATGAGACATGCCAACAAA 38258998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGAAATGGTCTAATATCACAAGTTCAAAATTAATAAGAGTGGATGAGACATGCCAACAAA 180

 38258999 TTTTTGGAATGTAAAAATAGATAAGACATTGTTAATGATTTGACAAAGCACAAAGCCTTA 38259058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTTTTGGAATGTAAAAATAGATAAGACATTGTTAATGATTTGACAAAGCACAAAGCCTTA 240

 38259059 AAATATTTCTGTATAGAGAGAAGTTTCCAAAGTAGGGCAACTCAGAGATAAATCAAGAAT 38259118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAATATTTCTGTATAGAGAGAAGTTTCCAAAGTAGGGCAACTCAGAGATAAATCAAGAAT 300

 38259119 GGGAAGATTCACACACCTCAACTGTAAAAGAGAAATATGAGACTAAAAGCAGTGGATTAA 38259178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
      301 GGGAAGATTCACACACCTCAACTGTAAAAGAGAAATATGAGACTAAAAGCAGTGGATTCA 360

 38259179 TTAAAACTTTGTTTGATGAGATATTATACATAGATGTCTTCTCCATCATTCCAAGCACTT 38259238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTAAAACTTTGTTTGATGAGATATTATACATAGATGTCTTCTCCATCATTCCAAGCACTT 420

 38259239 AAGCAGCTGCCCTTTCCAAACACTCATAGAGGATAAGAGATTATTTTCTATAAAAATCAA 38259298
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAGCAGCTGCCCTTTACAAACACTCATAGAGGATAAGAGATTATTTTCTATAAAAATCAA 480

 38259299 ACCAGATTGT 38259308
          ||||||||||
      481 ACCAGATTGT 490

EXCISED REGION

 38259311 TGTACATCAAGCAAAGGAGGGATGGCAGGGAGGTGATATACTGAAACAGAATTACTGTAT 38259370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      493 TGTACATCAAGCAAAGGAGGGATGGCAGGGAGGTGATATACTGAAACAGAATTACTGTAT 552

 38259371 GAAAACCTGGAATGAACAATTAGATACTCAGTTCTCCTTACCTGCACAGTAATAGTAATT 38259430
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      553 GAAAACATGGAATGAACAATTAGATACTCAGTTCTCCTTACCTGCACAGTAATAGTAATT 612

 38259431 CTTACTACCAGACTGGATGCTGGAGGGCTCTCCTTCAGAGAAACAGAAAAGAAAAAAAAG 38259490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      613 CTTACTACCAGACTGGATGCTGGAGGGCTCTCCTTCAGAGAAACAGAAAAGAAAAAAAAG 672

 38259491 CCTATAGCCACTAATATTTGAATCTCTGCAATTAAATACCTGGGTCCCTTCCCAATCATA 38259550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      673 CCTATAGCCACTAATATTTGAATCTCTGCAATTAAATACCTGGGTCCCTTCCCAATCATA 732

 38259551 TAGCAGTGATGCTCACCAGTTAACAAGAACTGAAGACACATGACAGATTCCAATCAGTGA 38259610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      733 TAGCAGTGATGCTCACCAGTTAACAAGAACTGAAGACACATGACAGATTCCAATCAGTGA 792

 38259611 TTTATTACCACTGTCAAATAAGAATGGACACTCAAAGATTACCTGAAAAAGTCCTTTAAT 38259670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      793 TTTATTACCACTGTCAAATAAGAATGGACACTCAAAGATTACCTGAAAAAGTCCTTTAAT 852

 38259671 ATGGCCCCAGATTGAATAATTCCTAATTTCCTATATCATAAATTCAAAAATTATCTAAAA 38259730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      853 ATGGCCCCAGATTGAATAATTCCTAATTTCCTATATCATAAATTCAAAAATTATCTAAAA 912

 38259731 TTCAGTGAAATTAGTCCATATTATCAATGCCAACCTTACACATAAACAGAGTTGACATTC 38259790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      913 TTCAGTGAAATTAGTCCATATTATCAATGCCAACCTTACACATAAACAGAGTTGACATTC 972

 38259791 TCTTATGATGCTGAACAATGCAGATGAAGAACGCTGGCTTTGGATTAAGAAGACCCTTAG 38259850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      973 TCTTATGATGCTGAACAATGCAGATGAAGAACGCTGGCTTTGGATTAAGAAGACCCTTAG 1032

 38259851 TTTGAATTTTAATTTTGACCCATGATAGCTGTGTAAACTTAGTCAAAATTCTTCAGTTAT 38259910
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     1033 TTTGAATTTTAATTTTGACCCATGATAGCTGTGTAAACTTAGTAAAAATTCTTCAGTTAT 1092

 38259911 TGAGCTGATGCTTTAGCCTGAGTTAAACAGAGAACAGAGCCTAAGGTAGAGGGTTTCTAT 38259970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1093 TGAGCTGATGCTTTAGCCTGAGTTAAACAGAGAACAGAGCCTAAGGTAGAGGGTTTCTAT 1152

 38259971 TCTATTCTTTCATAATGGATTGCTGGGCAAGATAACAAAAGCAATGGATAAGCACAGAAA 38260030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1153 TCTATTCTTTCATAATGGATTGCTGGGCAAGATAACAAAAGCAATGGATAAGCACAGAAA 1212

 38260031 TGCAGGGCAGAAGAGAGAGCCATGAGGAAGATATATTATCAGGGTGGTTGCCATTAAGTG 38260090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1213 TGCAGGGCAGAAGAGAGAGCCATGAGGAAGATATATTATCAGGGTGGTTGCCATTAAGTG 1272

 38260091 AAACCAGTTACCCAGTTTAATGGAATTATCCCCAGGGAGCAAGGTCTGTGGCATCTCAAG 38260150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     1273 AAACCAGTTACCCAGTTTAATGGAATTATCCCCAGGGAGCAAGGTCAGTGGCATCTCAAG 1332

 38260151 ACTCTTTATCAAAGAGGAGAATGGGAGAAAAATCATCTTTTTTGTATTTCCTACTGTTCA 38260210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1333 ACTCTTTATCAAAGAGGAGAATGGGAGAAAAATCATCTTTTTTGTATTTCCTACTGTTCA 1392

 38260211 AAAGTTTGTCCCTTGCTTTCCTGGTTATGAATGCATGGAAGTCTAGTTGAAGTCCAGCAA 38260270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     1393 AAAGTTTGTCCCTTGCTTTCCTGGTTATGAATGCATGGAAGTCTAGTTGAAGTCCACCAA 1452

 38260271 AGACATCAACAAGGAATCATAGGAAAGAGATAAAAGGCCTGAGACATGGATATAAGGGAA 38260330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1453 AGACATCAACAAGGAATCATAGGAAAGAGATAAAAGGCCTGAGACATGGATATAAGGGAA 1512

 38260331 GGTAGTGTTAAGTGGCACCTTTTTGGGAGTCCAAACTGAGCAGGAGTAAAACTGAAGCAA 38260390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1513 GGTAGTGTTAAGTGGCACCTTTTTGGGAGTCCAAACTGAGCAGGAGTAAAACTGAAGCAA 1572

 38260391 CTGCTTTAACTAAGACATGTGTGCCCACAAAGACCTGAAGTGACACATGAGCTTTCACAG 38260450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1573 CTGCTTTAACTAAGACATGTGTGCCCACAAAGACCTGAAGTGACACATGAGCTTTCACAG 1632

 38260451 TTTTTTAACTGTAAAATGGTAATGATATCACCTATGTTTCTGGATTACTACAAATATTAA 38260510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1633 TTTTTTAACTGTAAAATGGTAATGATATCACCTATGTTTCTGGATTACTACAAATATTAA 1692

 38260511 ATAGCATAAATGGCACACTTGCAAAGCATATTTTAATAAACATATTTAATATTTCCCTTA 38260570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1693 ATAGCATAAATGGCACACTTGCAAAGCATATTTTAATAAACATATTTAATATTTCCCTTA 1752

 38260571 TTGATTTCTTTAATCAATAAAAGCATTTCTGAAATTTGTGTAAAGGTCTAGATGAAGGGA 38260630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1753 TTGATTTCTTTAATCAATAAAAGCATTTCTGAAATTTGTGTAAAGGTCTAGATGAAGGGA 1812

 38260631 CATTGGACATGCTTTGATAATCATTGAGACTGGGTGATAGATAAATGATTGTCATGGTCT 38260690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1813 CATTGGACATGCTTTGATAATCATTGAGACTGGGTGATAGATAAATGATTGTCATGGTCT 1872

 38260691 TTACTTTGATATGCATGTTTGACATCTTTGTAAACATAGTTTTAAAAATAATATTTGTAA 38260750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1873 TTACTTTGATATGCATGTTTGACATCTTTGTAAACATAGTTTTAAAAATAATATTTGTAA 1932

 38260751 AATTTAAAAACAGAAACAAATAATTCTGATTTCAAAGGTCAACTAATAGACTCCTAGTCA 38260810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1933 AATTTAAAAACAGAAACAAATAATTCTGATTTCAAAGGTCAACTAATAGACTCCTAGTCA 1992

 38260811 TGTCAGGATATCAATGCCTATCTCATTCACTTTCTGGTGCTTAAAAAATAATAAAAGTAA 38260870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1993 TGTCAGGATATCAATGCCTATCTCATTCACTTTCTGGTGCTTAAAAAATAATAAAAGTAA 2052

 38260871 TTATTTCCCAATCTTCACTTTCTACAATGCTAAACTATTTATTTCTCCTTTTCTGAGCCC 38260930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     2053 TTATTTCCCAATCTTCACTTTCTACAATGCTAAACTATTTATTTGTCCTTTTCTGAGCCC 2112

 38260931 ACATGCTTTCCTCAATGAATGTTACCGAGATGGAATTTATATCTTATATTTCAGGTGTAT 38260990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2113 ACATGCTTTCCTCAATGAATGTTACCGAGATGGAATTTATATCTTATATTTCAGGTGTAT 2172

 38260991 TTACATTCATTTCTTCCCCACTATGTTGCAAACAAGTTGTTTTGCCCATTTGTTCTTATC 38261050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2173 TTACATTCATTTCTTCCCCACTATGTTGCAAACAAGTTGTTTTGCCCATTTGTTCTTATC 2232

 38261051 CTGAGGTCATGAAAACATCTAACTCTACTATCTTCCAGAAGCTATATTGTCTTGCCTTTG 38261110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2233 CTGAGGTCATGAAAACATCTAACTCTACTATCTTCCAGAAGCTATATTGTCTTGCCTTTG 2292

 38261111 ACCTTAAGGATTATGGTCTTGAATTAATTTTTGTATGTGTAAGTGACCACACAAACTTGT 38261170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2293 ACCTTAAGGATTATGGTCTTGAATTAATTTTTGTATGTGTAAGTGACCACACAAACTTGT 2352

 38261171 TAGAAATCTAGTTTCAAGTATTTTTTTCATAT 38261202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||
     2353 TAGAAATCTAGTTTCAAGTATTTTTTTCATAT 2384

Alignment time is 2.21699 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38249892,38276749] =>     26858 nucs '18 dna:chromosome chromosome:GRCh37:18:1:78077248:1'
Second seq [       1,    7005] =>      7005 nucs 'mol-32-3306-269053_7005'

Score:        6617
Aligned:      7019        nucs
Identic:      6971 ( 99%) nucs =>      2262 ( 99%)      4709 ( 99%)
Gaps:           24 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38263968,38266242] EXCISED REGION [38266251,38270984]
 second seq =>  [       1,    2272] EXCISED REGION [    2273,    7005]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         8 nucs [38266243,38266250]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         8 nucs [38266243,38266250] to [38266251,38266258]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [38266242,38266242] to [38266251,38266251]
 second seq =>         1 nucs [2272,2272] to [2273,2273]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 38263968 TATTAGTATGTTTATTTAAAGCAATACATTTCCATATTACCATGACCTTAGCTGCAGTGT 38264027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TATTAGTATGTTTATTTAAAGCAATACATTTCCATATTACCATGACCTTAGCTGCAGTGT 60

 38264028 ATGTATTTTGGTGTACAGTATTTTCTTTATTTTTCAATTAAAATTTGTCTTGACTTCCTC 38264087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATGTATTTTGGTGTACAGTATTTTCTTTATTTTTCAATTAAAATTTGTCTTGACTTCCTC 120

 38264088 TATGATGTCTTCTATGATTCTTCCTCTATAATTCTTCTTTTGACCATATAGAAGTGTATT 38264147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TATGATGTCTTCTATGATTCTTCCTCTATAATTCTTCTTTTGACCATATAGAAGTGTATT 180

 38264148 CATTAATTCAATCACATATAAATATTCTCCTTTTATCTTTTTGCTACTGGTTTGTTTGTT 38264207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CATTAATTCAATCACATATAAATATTCTCCTTTTATCTTTTTGCTACTGGTTTGTTTGTT 240

 38264208 TAGCTACATTTAGGGAAAATTTCATTTCTGAGACGACAGAGGAAGCACATTCCATTTTAT 38264267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TAGCTACATTTAGGGAAAATTTCATTTCTGAGACGACAGAGGAAGCACATTCCATTTTAT 300

 38264268 TCCTTCTGCTAATGACAAAAAAAAAAAAAAATTGGAAAAAACACAAAAGCCAGAGTCAAA 38264327
          ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCCTTCTGCTAATGACAAAAAAAAAAAA---TTGGAAAAAACACAAAAGCCAGAGTCAAA 357

 38264328 AGACTCTGAAAAATGGAGAAAAAGTGCAGACAGGCTAAGGATTTGGGAGATTGAGGAACA 38264387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      358 AGACTCTGAAAAATGGAGAAAAAGTGCAGACAGGCTAAGGATTTGGGAGATTGAGGAACA 417

 38264388 ACGACAGGTGAGTTCTCTGTCTTTTTTTTT-CTTTCTTTTTTGATATATATATATATATC 38264446
          |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |
      418 ACGACAGGTGAGTTCTCTGTCTTTTTTTTTTCTTTCTTTTTTGATATATATATAT----C 473

 38264447 AACAATCTCAATGTTTAAGAGAAGCCCTCAAGCCAGAATTTCCAACAGTTGCAGATAAAA 38264506
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
      474 AACAATCTCAATGTTTAAGAGAAGCCCTCAATCCAGAATTTCCAACAGTTGCAGATAAAA 533

 38264507 CATTGTGCTTGCTTAACGTATTTAACCAAAAGACCCGAAAAGCAAGGATATAAAAGAATA 38264566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      534 CATTGTGCTTGCTTAACGTATTTAACCAAAAGACCCGAAAAGCAAGGATATAAAAGAATA 593

 38264567 TTTTAATAATATCATTCTGTTCTTAAGGTGAACACTTCAAAGAAACCACACCCCTCCCCT 38264626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      594 TTTTAATAATATCATTCTGTTCTTAAGGTGAACACTTCAAAGAAACCACACCCCTCCCCT 653

 38264627 CCCCAATGCGTGCTGAAGCAGTGGAATCCATGAGTGGAACCTTGTCATATATAATCTCCA 38264686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      654 CCCCAATGCGTGCTGAAGCAGTGGAATCCATGAGTGGAACCTTGTCATATATAATCTCCA 713

 38264687 CACTAAATTTATAGCAAAGCCCCCATCTCTCAACCTGTGTTGAAATTCTGACTTCCAGAC 38264746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      714 CACTAAATTTATAGCAAAGCCCCCATCTCTCAACCTGTGTTGAAATTCTGACTTCCAGAC 773

 38264747 ACACCTTTCAGTAATGAGGAGGTACTCTTCCATGATAAACCCTGTGGGCAAAGCTTCCAC 38264806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      774 ACACCTTTCAGTAATGAGGAGGTACTCTTCCATGATAAACCCTGTGGGCAAAGCTTCCAC 833

 38264807 ATTCATCCCACCCCTAAAGCAATAAATTTGCACCTTTCCCAAGTAGAATCAATGGGAAGA 38264866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      834 ATTCATCCCACCCCTAAAGCAATAAATTTGCACCTTTCCCAAGTAGAATCAATGGGAAGA 893

 38264867 ATTTTGACTTCTATCCCCACCTGATGGTAATGAGGCAGTATCTCTCTCTTTTTCCAGACA 38264926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      894 ATTTTGACTTCTATCCCCACCTGATGGTAATGAGGCAGTATCTCTCTCTTTTTCCAGACA 953

 38264927 GTGTTTAAGAATTTGTTGTATAGAGCGCTATTACCTGAATAACACATTGTGGCAGAGCAA 38264986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      954 GTGTTTAAGAATTTGTTGTATAGAGCGCTATTACCTGAATAACACATTGTGGCAGAGCAA 1013

 38264987 AATAACCCTTAAGCATTTAGTTTTCAGATTTATTTTCAACTATTTAGAGGGTTATTTCTT 38265046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1014 AATAACCCTTAAGCATTTAGTTTTCAGATTTATTTTCAACTATTTAGAGGGTTATTTCTT 1073

 38265047 GACTACCACAGATAAGTCATTCCCTTCTCCATTGTTCTATAGTTTACTGCCCTTTTTTTC 38265106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1074 GACTACCACAGATAAGTCATTCCCTTCTCCATTGTTCTATAGTTTACTGCCCTTTTTTTC 1133

 38265107 TATCATGGCATTTACCCACTATTTCATATTGTTATTTATAGTTTACATGCTTAATATCTC 38265166
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     1134 TATCATGGCATTTACCCACTATTTCATATTGTTATTTTTAGTTTACATGCTTAATATCTC 1193

 38265167 CATCTCCCAACAAATATGGGAACATCATTAGGTCAGAGAAATTTTATTTCTTTTCCCTCT 38265226
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     1194 CATCTCCCAACAAATATGGGAACATCATTAGGTCAGAGAAATTTTATTTCTTTCCCCTCT 1253

 38265227 GAAGTCTCAGTATTAGTTGTTACATTAATTAGCACTTATTTAAATTTTTAGTTTTCTTTT 38265286
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1254 GAAGTCTCAGTACTAGTTGTTACATTAATTAGCACTTATTTAAATTTTTAGTTTTCTTTT 1313

 38265287 TCTTTGCCTCATGTTACTGTTACACCCTTCCACTACCAAGCTTAAAGTTAGGAATGATTC 38265346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1314 TCTTTGCCTCATGTTACTGTTACACCCTTCCACTACCAAGCTTAAAGTTAGGAATGATTC 1373

 38265347 ATGTGACTGGAATTGAATGACTGCTCTGAGAAAGAAGTCCATAAAAGTCTGCATGCAATT 38265406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1374 ATGTGACTGGAATTGAATGACTGCTCTGAGAAAGAAGTCCATAAAAGTCTGCATGCAATT 1433

 38265407 TGCCATGTCTCCATCCTTTCTTTGCCATAGAAACTAAAGATCTTCCAGATAGTCGAGGCT 38265466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1434 TGCCATGTCTCCATCCTTTCTTTGCCATAGAAACTAAAGATCTTCCAGATAGTCGAGGCT 1493

 38265467 CTGTTAATGTTATTTCTTGAATAACGACTATCTGAACAGAACATCTGTGACTTGGAATGG 38265526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1494 CTGTTAATGTTATTTCTTGAATAACGACTATCTGAACAGAACATCTGTGACTTGGAATGG 1553

 38265527 GGACATGTAGCTTGGAGAAAAAGTAAGCACACAGTGTTTTAAGTTACTGTGGTTTTATGG 38265586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1554 GGACATGTAGCTTGGAGAAAAAGTAAGCACACAGTGTTTTAAGTTACTGTGGTTTTATGG 1613

 38265587 TTATTTGTTACTGCAGCATAACCCACCCTGCCCTGACTTAAGTGATATAATATTTAACAA 38265646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1614 TTATTTGTTACTGCAGCATAACCCACCCTGCCCTGACTTAAGTGATATAATATTTAACAA 1673

 38265647 ATATTTATAAAATAAATAAATTCAAATTCACTCTAATACCTAGAAAATTATCAAGTATAG 38265706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1674 ATATTTATAAAATAAATAAATTCAAATTCACTCTAATACCTAGAAAATTATCAAGTATAG 1733

 38265707 TAAACCAAATAATAAATATTTATTAAGGAATATGGAAACAGTGACCTATGAGAAGTCTTG 38265766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1734 TAAACCAAATAATAAATATTTATTAAGGAATATGGAAACAGTGACCTATGAGAAGTCTTG 1793

 38265767 ATATACTGACCATCCATTGTTGCAGCAGATCTCACTATTGCTATTGTGCTTAACATTTCA 38265826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1794 ATATACTGACCATCCATTGTTGCAGCAGATCTCACTATTGCTATTGTGCTTAACATTTCA 1853

 38265827 ATTACAAAAATTAAAAAAAAAAAA-CACCATTCATCAGTGCAGGTCTGTGTATTTAAAGA 38265885
          |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1854 ATTACAAAAATTAAAAAAAAAAAAACACCATTCATCAGTGCAGGTCTGTGTATTTAAAGA 1913

 38265886 AATAATTTACAAGTTTTTTTTTCCTTTGTAAACATATTGTTTTGAAGTGCAAATATATAT 38265945
          ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1914 AATAATTTACAAGTTTTTTTT-CCTTTGTAAACATATTGTTTTGAAGTGCAAATATATAT 1972

 38265946 AATTTGCACTTTGGGATGGAATGGAATGGGATGCCCTATTGGCAGTCCATACATCTGGAT 38266005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1973 AATTTGCACTTTGGGATGGAATGGAATGGGATGCCCTATTGGCAGTCCATACATCTGGAT 2032

 38266006 TATAAATGGATTTCCATCCCATCTTCCTCCCCATCTCTTTCCCTTTTTGATCATTCTATG 38266065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2033 TATAAATGGATTTCCATCCCATCTTCCTCCCCATCTCTTTCCCTTTTTGATCATTCTATG 2092

 38266066 GAAATGGAAAGCTAGCAGAAGTTTGAAGAATTGTCACGCAAACAACAACAACAA---AAC 38266122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||
     2093 GAAATGGAAAGCTAGCAGAAGTTTGAAGAATTGTCACGCAAACAACAACAACAACAAAAC 2152

 38266123 TTTAGCATATTAACCTGTTGTCCAACCTTATATAAGCAGTTTGTATTTAAAACATCCCTA 38266182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2153 TTTAGCATATTAACCTGTTGTCCAACCTTATATAAGCAGTTTGTATTTAAAACATCCCTA 2212

 38266183 AGTGGATTTTAATTCCAGTTTCAATCATTGTTAACTATTTTTGAAATATTTAAAATCCCA 38266242
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2213 AGTGGATTTTAATTCCAATTTCAATCATTGTTAACTATTTTTGAAATATTTAAAATCCCA 2272

EXCISED REGION

 38266251 ACCACTATTTCTCTTCAACTAGTCCTTACTTTTATAAACAAAAAAGTAACAGTAAATAAT 38266310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2273 ACCACTATTTCTCTTCAACTAGTCCTTACTTTTATAAACAAAAAAGTAACAGTAAATAAT 2332

 38266311 TTATAACTAGGTCTCTCTGAATCTAAAAACACGTTCTTATACACTATGTGATGCCATATT 38266370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     2333 TTATAACTAGGTCTCTCTGAATCTAAAAACACATTCTTATACACTATGTGATGCCATATT 2392

 38266371 TTTTACTCTTGTCTTTGTGAGTTTTTTGTGCCATTCTCTCCTCTGGAATGGTCTTCTGTG 38266430
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2393 TTTTACTCTTGACTTTGTGAGTTTTTTGTGCCATTCTCTCCTCTGGAATGGTCTTCTGTG 2452

 38266431 CTTACACATTCCAAGGGCTACTCCATTTTACAAGAAACAGTTCATGTTTGCTACTTTGGG 38266490
          .|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2453 TTTACACATTCCAAGGGCTAATCCATTTTACAAGAAACAGTTCATGTTTGCTACTTTGGG 2512

 38266491 GTTGATCCCATGATAATTCTGGTTCTCACTTGGTCTTTCCCTGTGAGATGCAGTAGCATT 38266550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2513 GTTGATCCCATGATAATTCTGGTTCTCACTTGGTCTTTCCCTGTGAGATGCAGTAGCATT 2572

 38266551 CAAAATTCTCAGACTATTCTATGCACCTTGGCAGATTTATGGTAATGGTCTATAATTGCT 38266610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2573 CAAAATTCTCAGACTATTCTATGCACCTTGGCAGATTTATGGTAATGGTCTATAATTGCT 2632

 38266611 TCATATCTGCTAACCTTGCTTCCAAAACTAGTTTTTGAGATTAATGAGACAGGAGCTTGG 38266670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2633 TCATATCTGCTAACCTTGCTTCCAAAACTAGTTTTTGAGATTAATGAGACAGGAGCTTGG 2692

 38266671 CTTTTTCTTTCTGTATAGCTTCCATAGCAACAAGAAAATATTAGACACACAGTAGGCATT 38266730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2693 CTTTTTCTTTCTGTATAGCTTCCATAGCAACAAGAAAATATTAGACACACAGTAGGCATT 2752

 38266731 GGAAGAAAATGTGTTCAGTTAAATGAACTTGATTTGAATGGAATGAGAGTTCAATGAAAC 38266790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2753 GGAAGAAAATGTGTTCAGTTAAATGAACTTGATTTGAATGGAATGAGAGTTCAATGAAAC 2812

 38266791 TGTATATATTGTGAAACGTGGCAACTTACACCTACTCAAGACATTAAAAGAGATCATGCT 38266850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2813 TGTATATATTGTGAAACGTGGCAACTTACACCTACTCAAGACATTAAAAGAGATCATGCT 2872

 38266851 TTCTTGCCTAAGTTTTATGTCCAATTTGTTCCTGTTTCAAACCCCTCGACAAAAACAAAA 38266910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2873 TTCTTGCCTAAGTTTTATGTCCAATTTGTTCCTGTTTCAAACCCCTCGACAAAAACAAAA 2932

 38266911 TCTTTTAATCTGTTTGCAAAATATTTCCTCCTTCCTCCCATCTTGCTGTTGCTGCTCTGT 38266970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2933 TCTTTTAATCTGTTTGCAAAATATTTCCTCCTTCCTCCCATCTTGCTGTTGCTGCTCTGT 2992

 38266971 GATATACTGCCCTTGCTTATTACCCCTTTATAGCTGTTTTGTTAAAGTTCATACCGCTAA 38267030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2993 GATATACTGCCCTTGCTTATTACCCCTTTATAGCTGTTTTGTTAAAGTTCATACCGCTAA 3052

 38267031 GACCTGTAAAAGAAATTTATGGCTCTAGGGATTTCAGCAAATTCTAAATAACCATAACAG 38267090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3053 GACCTGTAAAAGAAATTTATGGCTCTAGGGATTTCAGCAAATTCTAAATAACCATAACAG 3112

 38267091 GAACAGGAAGCATTAATTAAAGACACTAGAGTCTAAGTTATAACAGAAATCCTGACATTT 38267150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3113 GAACAGGAAGCATTAATTAAAGACACTAGAGTCTAAGTTATAACAGAAATCCTGACATTT 3172

 38267151 AAGGCCCTGGTACCATTTAAATTTAAAATGGTATGACAAACAGAGAGTAATTTGATGGTC 38267210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3173 AAGGCCCTGGTACCATTTAAATTTAAAATGGTATGACAAACAGAGAGTAATTTGATGGTC 3232

 38267211 AGAAGGTTATAATGGATACCTTAATACCTTTGCCAAGAAAAAGTGTCTGTCCTTGCTCTA 38267270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3233 AGAAGGTTATAATGGATACCTTAATACCTTTGCCAAGAAAAAGTGTCTGTCCTTGCTCTA 3292

 38267271 ACCCCTACCCAGGGGCTTCAGGGGCCTCCTTCATAAAACATGGTGATGCCTAAATATTTT 38267330
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3293 ATCCCTACCCAGGGGCTTCAGGGGCCTCCTTCATAAAACATGGTGATGCCTAAATATTTT 3352

 38267331 TGCGATATCTCATATATAAGCTGGTCTTTTCTTTAAGAATACGAGAGATTAAACACCAAC 38267390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3353 TGCGATATCTCATATATAAGCTGGTCTTTTCTTTAAGAATACGAGAGATTAAACACCAAC 3412

 38267391 CCCCAACATTCATACACCAATTTTCAGATAAAACAGCTTAATATTTAAGATATATTTAGT 38267450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3413 CCCCAACATTCATACACCAATTTTCAGATAAAACAGCTTAATATTTAAGATATATTTAGT 3472

 38267451 GCAATTTGTCTATTTCTTGGTTTACTGGAGGGCTGTATTTAAAGCCAAGGGACCAAGGAA 38267510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3473 GCAATTTGTCTATTTCTTGGTTTACTGGAGGGCTGTATTTAAAGCCAAGGGACCAAGGAA 3532

 38267511 CATTCCACAACACACTAAAGCAATTTTTCCCCAGGGAATATGCTGATTCTTTCCTAAAGG 38267570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3533 CATTCCACAACACACTAAAGCAATTTTTCCCCAGGGAATATGCTGATTCTTTCCTAAAGG 3592

 38267571 CAGAAGCCGACATTCCTGACTCATTCTGCCAAACCAAGCAATGAAAAATGCTTCACCTAA 38267630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3593 CAGAAGCCGACATTCCTGACTCATTCTGCCAAACCAAGCAATGAAAAATGCTTCACCTAA 3652

 38267631 TTTGAAAGATAATTTGTAATACCAGAGACTCAACTTGTTTTGTGTATCCAATACTAGCAC 38267690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3653 TTTGAAAGATAATTTGTAATACCAGAGACTCAACTTGTTTTGTGTATCCAATACTAGCAC 3712

 38267691 CCTTTCCAGAATGTTGAAAGTACACACTGTATGATTTGTCTAATGTATATTCAAAAAAGG 38267750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3713 CCTTTCCAGAATGTTGAAAGTACACACTGTATGATTTGTCTAATGTATATTCAAAAAAGG 3772

 38267751 AATACAAATTGATCCTCAAAGTTCAAATCTGCAGTACATACTCTGTGTTCTGCCCCCACC 38267810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3773 AATACAAATTGATCCTCAAAGTTCAAATCTGCAGTACATACTCTGTGTTCTGCCCCCACC 3832

 38267811 CGTACCTTCATGAATTCTTTCACCTAGCACGCAGGCTGTTTTCCCTTTGCGAAATCCCAT 38267870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3833 CGTACCTTCATGAATTCTTTCACCTAGCACGCAGGCTGTTTTCCCTTTGCGAAATCCCAT 3892

 38267871 GGTACATTTATAGTATTAATACCACTCACTTAGAATATGCCGTATTTTGTCTAATATTGC 38267930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3893 GGTACATTTATAGTATTAATACCACTCACTTAGAATATGCCGTATTTTGTCTAATATTGC 3952

 38267931 TAGATTTTGTGTGTATAATCTTATTCCTCAAGTAAATTACAAGACAAGGACTATAATTTA 38267990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3953 TAGATTTTGTGTGTATAATCTTATTCCTCAAGTAAATTACAAGACAAGGACTATAATTTA 4012

 38267991 TACATCCTCTACAACACTTGACACTGGCTTTGATTAGGCTCTTAATAAATATTTGTTGGT 38268050
          ||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     4013 TACATCCTCTACAACACTTGGCACTGGCTTTGAGTAGGCTCTTAATAAATATTTGTTGGT 4072

 38268051 TGATTAATCAGTTGACCACACTTACTAATTGCAAGGTGACATCATTTATCATTAATAAAC 38268110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4073 TGATTAATCAGTTGACCACACTTACTAATTGCAAGGTGACATCATTTATCATTAATAAAC 4132

 38268111 ATATATGTGGATTACAAAAATATCATGTGAATTTGCATATAATCATATTAATCCCAAATT 38268170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4133 ATATATGTGGATTACAAAAATATCATGTGAATTTGCATATAATCATATTAATCCCAAATT 4192

 38268171 AGCACCTGAGAGTCCAACCACCCTCTCCTTTAGGCCCTTTTCACTTTTATGTCTACTTTT 38268230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4193 AGCACCTGAGAGTCCAACCACCCTCTCCTTTAGGCCCTTTTCACTTTTATGTCTACTTTT 4252

 38268231 GCCTCACTTACAATTCCACTACTTACTTGCCTTCTTTCTCTTTTCAGCTTTGTGCTGTTA 38268290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4253 GCCTCACTTACAATTCCACTACTTACTTGCCTTCTTTCTCTTTTCAGCTTTGTGCTGTTA 4312

 38268291 TTTAATATCTCACCAGTTGTGTAATTTCAGCTCCCAAATTGAATAAGACGTTCCCCCCAG 38268350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4313 TTTAATATCTCACCAGTTGTGTAATTTCAGCTCCCAAATTGAATAAGACGTTCCCCCCAG 4372

 38268351 TGGAACCCTCACCTTGACAAATAGCCAAATAGTA---ATTATTCCTTTCAGGGGTTGAGC 38268407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||
     4373 TGGAACCCTCACCTTGACAAATAGCCAAATAGTAATTATTATTCCTTTCAGGGGTTGAGC 4432

 38268408 TATGGAATCATGCTTGCAATATCCCAGGCTTGAGTGCCTAGATATTTATGCTATACTTCC 38268467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4433 TATGGAATCATGCTTGCAATATCCCAGGCTTGAGTGCCTAGATATTTATGCTATACTTCC 4492

 38268468 CTGTGTCGGAGTTTCCATCTGCGATTGTATTTCAAGCCCTCTCATTTTTTTTTTCAATAT 38268527
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
     4493 CTGTGTCGGAGTTTCCATCTGCGATTGTATTTCAAGCCCTCTCA-TTTTTTTTTCAATAT 4551

 38268528 GATTAAGATAATTCCTTTATGAAGTTGGAAACTCAGACATTCAGAAAGAAACTTGACGTT 38268587
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4552 GATTAAGATAATTCCTTTATGAAGCTGGAAACTCAGACATTCAGAAAGAAACTTGACGTT 4611

 38268588 TCATATTTTTGCTAACTTGCTCTTCCCATTTCCTTTCCTATCATTTTAGCCAGACTGAGG 38268647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4612 TCATATTTTTGCTAACTTGCTCTTCCCATTTCCTTTCCTATCATTTTAGCCAGACTGAGG 4671

 38268648 GAGAATTAATTTTGCAATGGTCTCTATTTTTTTTTCCAAATGTGTGACCTCCATATTAAT 38268707
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4672 GAGAATTAATTTTGCAACGGTCTCTATTTTTTTTTCCAAATGTGTGACCTCCATATTAAT 4731

 38268708 AGGAGCCAGAGTACTCATTCATCACATCTGGTCAGTGTGAAACTGACATTTACAGGGTGG 38268767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4732 AGGAGCCAGAGTACTCATTCATCACATCTGGTCAGTGTGAAACTGACATTTACAGGGTGG 4791

 38268768 AATGTTTCCCACTCAGGACAAATGGGGATCATTTGTAAAACATGCCGCACCCAATCATAG 38268827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     4792 AATGTTTCCCACTCAGGACAAATGGGGATCATTTGTAAAACATGCCACACCCAATCATAG 4851

 38268828 GTTCCCATGGATCTCCAACTACATTTTTAAGCAACAATATAAACCATTCCCGAAACTGAA 38268887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4852 GTTCCCATGGATCTCCAACTACATTTTTAAGCAACAATATAAACCATTCCCGAAACTGAA 4911

 38268888 AGGTCTTTTCAAATATTTACTGCCTACCTATGGAATTTTTATTCTGCTTGCTGCTGCCAT 38268947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4912 AGGTCTTTTCAAATATTTACTGCCTACCTATGGAATTTTTATTCTGCTTGCTGCTGCCAT 4971

 38268948 CAATAATCCTGGGAGTTCCTAGCTAAGTGTTGTGTATGACCTCCAAGGAAAGTCTTAGCA 38269007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4972 CAATAATCCTGGGAGTTCCTAGCTAAGTGTTGTGTATGACCTCCAAGGAAAGTCTTAGCA 5031

 38269008 TTGCAGAATGGGGAGGCGGGTTAGTATCCTGCATTTTTCATTCTGTCACTTTCTAGGGAC 38269067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5032 TTGCAGAATGGGGAGGCGGGTTAGTATCCTGCATTTTTCATTCTGTCACTTTCTAGGGAC 5091

 38269068 AATTACAAAGAAAATAATCATATAAGACTTATTTTTATGTTTATTATGAAAGCCTTCAGC 38269127
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5092 AATTACAAAGAAAATAATCGTATAAGACTTATTTTTATGTTTATTATGAAAGCCTTCAGC 5151

 38269128 TCTTGCATTTGCAAGTAAGCTCAATGATTTTAAGTTTGCTTTTTCCCCCATGAAATGAAA 38269187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5152 TCTTGCATTTGCAAGTAAGCTCAATGATTTTAAGTTTGCTTTTTCCCCCATGAAATGAAA 5211

 38269188 TATTATTTCCCACTTCTTCCATGAATCTATTGGGTAACTCCAGGCCACTGTGATCTTTCA 38269247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5212 TATTATTTCCCACTTCTTCCATGAATCTATTGGGTAACTCCAGGCCACTGTGATCTTTCA 5271

 38269248 TCTGGCATTTTGCTTTTATTTTTCTAGATCACAGTTGTGATTTAAAGCCCTCCTGGCACT 38269307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5272 TCTGGCATTTTGCTTTTATTTTTCTAGATCACAGTTGTGATTTAAAGCCCTCCTGGCACT 5331

 38269308 TGGACACCTTGGTGATCTTAGCTCATGCTCCTAGTTCCATAGTGATGAATTGACCAAACT 38269367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5332 TGGACACCTTGGTGATCTTAGCTCATGCTCCTAGTTCCATAGTGATGAATTGACCAAACT 5391

 38269368 TTTTCCCAAGGATATCTGCTAATTCTGGAGTTTCTGCTTTCTTATTATCTGTTCTGTCTT 38269427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5392 TTTTCCCAAGGATATCTGCTAATTCTGGAGTTTCTGCTTTCTTATTATCTGTTCTGTCTT 5451

 38269428 TTGGTTCTGTATTGATATAACAAGCTTTGTCCCCTTATCAATGAGGGCACAAAATGCAGC 38269487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     5452 TTGGTTCTGTATTGATATAACAAGCTTTGTCCCCTTATCAATGAGGGCACAAAATGAAGC 5511

 38269488 ACTTCAAATAATTTCTGCAAAAATTTACAGTTGCTGCATTAAGAATTTTGTGAGCTTCAA 38269547
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5512 ACTTCAAATAGTTTCTGCAAAAATTTACAGTTGCTGCATTAAGAATTTTGTGAGCTTCAA 5571

 38269548 TAATGTTATTGAAAAGTTGCAGATTCCCTCCTCCTTCTTTTTCTCCTTTCCTCCTCTTTC 38269607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5572 TAATGTTATTGAAAAGTTGCAGATTCCCTCCTCCTTCTTTTTCTCCTTTCCTCCTCTTTC 5631

 38269608 TGCCCTGTCTCCCCTTCATTATTCTCCTCTTCTTCTCAAAAGCAAACAATCATTTTTCTT 38269667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5632 TGCCCTGTCTCCCCTTCATTATTCTCCTCTTCTTCTCAAAAGCAAACAATCATTTTTCTT 5691

 38269668 GCCTACTGAAGAATACTTGTAATGTTATTCTCAAAACCTGGACACCAGCTCAACTCCTTC 38269727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5692 GCCTACTGAAGAATACTTGTAATGTTATTCTCAAAACCTGGACACCAGCTCAACTCCTTC 5751

 38269728 TTTGTTCTACAAGTATTCACCCACCCTAATAGGGAGTTTATTCCAATGAAAAGACTGTGT 38269787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5752 TTTGTTCTACAAGTATTCACCCACCCTAATAGGGAGTTTATTCCAATGAAAAGACTGTGT 5811

 38269788 TCCTCCTCAGAGGAATTTATGAGGTGGTAAGAGAGTAGAATTGCATTAATCTTATGCCAT 38269847
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5812 TCCTCCTCAGAGGAATTTATGAGGAGGTAAGAGAGTAGAATTGCATTAATCTTATGCCAT 5871

 38269848 TCCTAGAGAATTCTTATTTCCTCAATTAAGGTTTAATTGCTCTGTTCTGAAAAAAAAAAA 38269907
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||
     5872 TCCTAGAGAATTCTTATTTCCTCAATTAAGGTTTAATTGCTCTGTTCTG---AAAAAAAA 5928

 38269908 AAAATGGTGAGTCCAAGCAGATAATTTACAGTGACCTGTATCTGTGACTAGTTTTAAGGC 38269967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5929 AAAATGGTGAGTCCAAGCAGATAATTTACAGTGACCTGTATCTGTGACTAGTTTTAAGGC 5988

 38269968 TACCCTGAGGTCAGAATTTAAACATGTTAATTCAGTACTGGACTTAATAGTAAACAAGAT 38270027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5989 TACCCTGAGGTCAGAATTTAAACATGTTAATTCAGTACTGGACTTAATAGTAAACAAGAT 6048

 38270028 AGAGATATCTCTGTCTCACAAAGATTTGTAATACAACTCACAGAAGCTTTACTCCAAATG 38270087
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     6049 AGAGATATCTCTGTCTCACAGAGATTTGTAATACAACTCACAGACGCTTTACTCCAAATG 6108

 38270088 AAAGGGTCATAGTTAGAGGGAAATTCCATAATAATAGTACCTATCTGATAGGGTGAATGT 38270147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6109 AAAGGGTCATAGTTAGAGGGAAATTCCATAATAATAGTACCTATCTGATAGGGTGAATGT 6168

 38270148 GGGAATTAAACGAGTTCATAGCTATAAAGAATTTCAGAGGCCATCTGGCAATCACAAATA 38270207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6169 GGGAATTAAACGAGTTCATAGCTATAAAGAATTTCAGAGGCCATCTGGCAATCACAAATA 6228

 38270208 ATAACTCTTAGTGGCAGCATTAGCTAGTTCCTGAATAGCCAAATATCTTGAATCCTCATA 38270267
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6229 ATAACTGTTAGTGGCAGCATTAGCTAGTTCCTGAATAGCCAAATATCTTGAATCCTCATA 6288

 38270268 ACAATGATTCAAATAAATGTCATCATTATTTCACAGAGTAAGATACTTAAGCATTGGGAG 38270327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6289 ACAATGATTCAAATAAATGTCATCATTATTTCACAGAGTAAGATACTTAAGCATTGGGAG 6348

 38270328 TTATTAAGCAATTCTTTAAGGACATAGCAGCAACATGTAGAGGAGCTGAAATTACAACAT 38270387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6349 TTATTAAGCAATTCTTTAAGGACATAGCAGCAACATGTAGAGGAGCTGAAATTACAACAT 6408

 38270388 GGTTCTTTCCGAACTTTAAGTCCCCTGTTTTTGTGTCTATGACTTTAAATATTCATAGTG 38270447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6409 GGTTCTTTCCGAACTTTAAGTCCCCTGTTTTTGTGTCTATGACTTTAAATATTCATAGTG 6468

 38270448 GAATATCTATCTATCTACAGATAATTTCATGAAACATTAAACTAAGTTTGG--TTTTTCT 38270505
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||
     6469 GAATATCTATCTATCTACAGATAATTTCATGAAACATTAAACTAAGTTT--TTTTTTTCT 6526

 38270506 AAAATGCTAACCTCTGTTTAACTATCAACCTAGGCAAAAATGGACAATTCCCTGTACCTC 38270565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6527 AAAATGCTAACCTCTGTTTAACTATCAACCTAGGCAAAAATGGACAATTCCCTGTACCTC 6586

 38270566 AGAAGCTTTCCTAGTGCTCCTCCCATTCATAAAAATCTCCCATCCTTGGAAAATAGCCAC 38270625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6587 AGAAGCTTTCCTAGTGCTCCTCCCATTCATAAAAATCTCCCATCCTTGGAAAATAGCCAC 6646

 38270626 GATAAAAATTATATCAAATCCCAACTTTTTATTTGTCCTTTTAACCAAATGACTTATGCT 38270685
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     6647 GATAAAAATTATATCAAATCCCAACTTTTTATTTGCCCTTTTAACCAAATGACTTATGCT 6706

 38270686 TTTCTAAATGATACAGATTTGCTTTGCCTATTTGGGAATGTTACATAACTAGAATCCTAG 38270745
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     6707 TTTCTAAATGATACAGATTTGCTTTGCCTATTTGGGAATGTTATATAACTAGAATCCTAG 6766

 38270746 ACAGAGCTCTTAATTGTAACATTGTCATACATCAAATGTCAAGTGTCTACAAAGGGATGG 38270805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6767 ACAGAGCTCTTAATTGTAACATTGTCATACATCAAATGTCAAGTGTCTACAAAGGGATGG 6826

 38270806 ATCACTCTGGGCTTTCAATGTTCTTCCATTGGTCTATTAAATTCCCTTAGAGCAATAATC 38270865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6827 ATCACTCTGGGCTTTCAATGTTCTTCCATTGGTCTATTAAATTCCCTTAGAGCAATAATC 6886

 38270866 CTAGTATCTCATTTACTGAAGTGTTACAATAGGATTTATTTTTTGGTGGAATAAGTCCAA 38270925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6887 CTAGTATCTCATTTACTGAAGTGTTACAATAGGATTTATTTTTTGGTGGAATAAGTCCAA 6946

 38270926 CCATCTTCTTGTTTGTTCTTCAAGAATGCATGGACTATTCTCTGTACTTTGCCTTATCA 38270984
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6947 CCATCTTCTTGTTTGTTCTTCAAGAATGCATGGACTATTCTCTGTACTTTGCCTTATCA 7005

Alignment time is 6.76576 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38249892,38276749] =>     26858 nucs '18 dna:chromosome chromosome:GRCh37:18:1:78077248:1'
Second seq [       1,    6674] =>      6674 nucs 'mol-32-331c-143287_6674'

Score:        6373
Aligned:      6679        nucs
Identic:      6643 ( 99%) nucs =>      2204 ( 99%)      4439 ( 99%)
Gaps:           15 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38257679,38259892] EXCISED REGION [38266750,38271207]
 second seq =>  [       4,    2217] EXCISED REGION [    2218,    6674]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6857 nucs [38259893,38266749]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [38259893,38259893] to [38266750,38266750]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [38259893,38259893] to [38266749,38266749]
 second seq =>         0 nucs

 38257679 TGCCTTGGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACCGGCGTGAGCCACTGCGCCCATAGAAAAGA 38257738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        4 TGCCTTGGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACCGGCGTGAGCCACTGCGCCCATAGAAAAGA 63

 38257739 TTAGTTCTTTCTGAACTTTTAAACACCATTCAGCAGTGTTCACCATTCTCTCTAACTTAA 38257798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       64 TTAGTTCTTTCTGAACTTTTAAACACCATTCAGCAGTGTTCACCATTCTCTCTAACTTAA 123

 38257799 AACACTGTCCCTCATAACATATTTAAAAAATTCTATTTCTTACTGTTATTTCTCAGATTC 38257858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
      124 AACACTGTCCCTCATAACATATTTAAAAAATTATATTTCTTACTGTTATTTCTCAGATTC 183

 38257859 TTGTATAGGCCACAGTTCTTTCAGTAGAACTCTAACCAATTTCCGTACATGTAAGTATCA 38257918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
      184 TTGTATAGGCCACAGTTCTTTCAGTAGAACTCTAACCAATTTCCATACATGTAAGTATCA 243

 38257919 TAAATATACTAATGACTCTGAACATTATATATCTTGCCTCATGCATGAATACCCAAATGT 38257978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      244 TAAATATACTAATGACTCTGAACATTATATATCTTGCCTCATGCATGAATACCCAAATGT 303

 38257979 TTTCCTGTAATCACAAAATGAACATCTCAAAGTGACCACAAATTTGACATGTTCCGAAGT 38258038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      304 TTTCCTGTAATCACAAAATGAACATCTCAAAGTGACCACAAATTTGACATGTTCCGAAGT 363

 38258039 AATTAAATTTTGATATTCTCTGCCAAAAGCTGCTCTAGAAATTTTGCCACTCCTTCTTCA 38258098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      364 AATTAAATTTTGATATTCTCTGCCAAAAGCTGCTCTAGAAATTTTGCCACTCCTTCTTCA 423

 38258099 TCTTAGAAAATGCTATTATTCTCCACCAAAGGCAAATAACCAAGAGTCATTACTAGAAAA 38258158
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      424 TCTTAGAAAATGCTATCATTCTCCACCAAAGGCAAATAACCAAGAGTCATTACTAGAAAA 483

 38258159 TTTGTCTCCTTTACCACTCATGCCCAATATAGATCAAATTCTTTAAGATCTTTTCCTCAA 38258218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      484 TTTGTCTCCTTTACCACTCATGCCCAATATAGATCAAATTCTTTAAGATCTTTTCCTCAA 543

 38258219 TAAACCTCAAGTCTGTCACCTTTTCTATTACCACATTTTTTCTAAGTCTCAATCATCTCT 38258278
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      544 TAAATCTCAAGTCTGTCACCTTTTCTATTACCACATTTTTTCTAAGTCTCAATCATCTCT 603

 38258279 CAATTAGATCATTATAGTAATCTTCTAAGTGGTGTTGGGGTGTCGTCTCCCGGCTACTTC 38258338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      604 CAATTAGATCATTATAGTAATCTTCTAAGTGGTGTTGGGGTGTCGTCTCCCGGCTACTTC 663

 38258339 AATCCATTTTCCAATATTAAGTTTATTTGTTTAATTAAACATGTTAACTTGTGGTGCTCT 38258398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      664 AATCCATTTTCCAATATTAAGTTTATTTGTTTAATTAAACATGTTAACTTGTGGTGCTCT 723

 38258399 TATGCTTAAAAAGTTTCATTAGCTTTCTATTTATATAATGAATGAAACCAATGTTTAGCC 38258458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      724 TATGCTTAAAAAGTTTCATTAGCTTTCTATTTATATAATGAATGAAACCAATGTTTAGCC 783

 38258459 TAGTTTAAGAAATGTAAGAACTCCTTTTACCCTAGCTTTCTTCCTGTTTACTTTTATTCA 38258518
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
      784 TAGTTTAAGAAATGTAAGAACTCCCTTTACCCTAGCTTTCTTCCTGTTTACTTTTATTCA 843

 38258519 TCATGCCTTGAATCATACCTATCTTCTTTAATTTTCTCTAACACAAAATCCTCCTGTTTC 38258578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      844 TCATGCCTTGAATCATACCTATCTTCTTTAATTTTCTCTAACACAAAATCCTCCTGTTTC 903

 38258579 TTCTTTGCAATCCTGCAAACCCAAACCCAGCAGCTAGTAAATATTCAATATATATGAATT 38258638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      904 TTCTTTGCAATCCTGCAAACCCAAACCCAGCAGCTAGTAAATATTCAATATATATGAATT 963

 38258639 AATTAATTGATGAATGAGTGATTTTATTTCAGATTGCTATCAAATGCTCAATTCCCCTGC 38258698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      964 AATTAATTGATGAATGAGTGATTTTATTTCAGATTGCTATCAAATGCTCAATTCCCCTGC 1023

 38258699 ATAGTATCTCCAATGAGTCAAATCCTGGAATTCCCTATAGGAACACCTGGGATATATAGT 38258758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1024 ATAGTATCTCCAATGAGTCAAATCCTGGAATTCCCTATAGGAACACCTGGGATATATAGT 1083

 38258759 ATCAACTTACAAATACCATTCTTTCTTAATTTTGAAAGAAAAACTGAGTAAAATATGAGA 38258818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1084 ATCAACTTACAAATACCATTCTTTCTTAATTTTGAAAGAAAAACTGAGTAAAATATGAGA 1143

 38258819 GCTGTAGCTTTTAAAAAAAATAGAAAATACACCATAAAAATTTTAGTCAAGCATGGCAGA 38258878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1144 GCTGTAGCTTTTAAAAAAAATAGAAAATACACCATAAAAATTTTAGTCAAGCATGGCAGA 1203

 38258879 CTAAATACATGTATTTATTTCTAATCTACTTCAAGCTCCAATATAATAACTGTTTACAAA 38258938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1204 CTAAATACATGTATTTATTTCTAATCTACTTCAAGCTCCAATATAATAACTGTTTACAAA 1263

 38258939 TGAAATGGTCTAATATCACAAGTTCAAAATTAATAAGAGTGGATGAGACATGCCAACAAA 38258998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1264 TGAAATGGTCTAATATCACAAGTTCAAAATTAATAAGAGTGGATGAGACATGCCAACAAA 1323

 38258999 TTTTTGGAATGTAAAAATAGATAAGACATTGTTAATGATTTGACAAAGCACAAAGCCTTA 38259058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1324 TTTTTGGAATGTAAAAATAGATAAGACATTGTTAATGATTTGACAAAGCACAAAGCCTTA 1383

 38259059 AAATATTTCTGTATAGAGAGAAGTTTCCAAAGTAGGGCAACTCAGAGATAAATCAAGAAT 38259118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1384 AAATATTTCTGTATAGAGAGAAGTTTCCAAAGTAGGGCAACTCAGAGATAAATCAAGAAT 1443

 38259119 GGGAAGATTCACACACCTCAACTGTAAAAGAGAAATATGAGACTAAAAGCAGTGGATTAA 38259178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     1444 GGGAAGATTCACACACCTCAACTGTAAAAGAGAAATATGAGACTAAAAGCAGTGGATTCA 1503

 38259179 TTAAAACTTTGTTTGATGAGATATTATACATAGATGTCTTCTCCATCATTCCAAGCACTT 38259238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1504 TTAAAACTTTGTTTGATGAGATATTATACATAGATGTCTTCTCCATCATTCCAAGCACTT 1563

 38259239 AAGCAGCTGCCCTTTCCAAACACTCATAGAGGATAAGAGATTATTTTCTATAAAAATCAA 38259298
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1564 AAGCAGCTGCCCTTTACAAACACTCATAGAGGATAAGAGATTATTTTCTATAAAAATCAA 1623

 38259299 ACCAGATTGTTG--TGTACATCAAGCAAAGGAGGGATGGCAGGGAGGTGATATACTGAAA 38259356
          ||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1624 ACCAGATTGT--CATGTACATCAAGCAAAGGAGGGATGGCAGGGAGGTGATATACTGAAA 1681

 38259357 CAGAATTACTGTATGAAAACCTGGAATGAACAATTAGATACTCAGTTCTCCTTACCTGCA 38259416
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1682 CAGAATTACTGTATGAAAACATGGAATGAACAATTAGATACTCAGTTCTCCTTACCTGCA 1741

 38259417 CAGTAATAGTAATTCTTACTACCAGACTGGATGCTGGAGGGCTCTCCTTCAGAGAAACAG 38259476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1742 CAGTAATAGTAATTCTTACTACCAGACTGGATGCTGGAGGGCTCTCCTTCAGAGAAACAG 1801

 38259477 AAAAGAAAAAAAAGCCTATAGCCACTAATATTTGAATCTCTGCAATTAAATACCTGGGTC 38259536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1802 AAAAGAAAAAAAAGCCTATAGCCACTAATATTTGAATCTCTGCAATTAAATACCTGGGTC 1861

 38259537 CCTTCCCAATCATATAGCAGTGATGCTCACCAGTTAACAAGAACTGAAGACACATGACAG 38259596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1862 CCTTCCCAATCATATAGCAGTGATGCTCACCAGTTAACAAGAACTGAAGACACATGACAG 1921

 38259597 ATTCCAATCAGTGATTTATTACCACTGTCAAATAAGAATGGACACTCAAAGATTACCTGA 38259656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1922 ATTCCAATCAGTGATTTATTACCACTGTCAAATAAGAATGGACACTCAAAGATTACCTGA 1981

 38259657 AAAAGTCCTTTAATATGGCCCCAGATTGAATAATTCCTAATTTCCTATATCATAAATTCA 38259716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1982 AAAAGTCCTTTAATATGGCCCCAGATTGAATAATTCCTAATTTCCTATATCATAAATTCA 2041

 38259717 AAAATTATCTAAAATTCAGTGAAATTAGTCCATATTATCAATGCCAACCTTACACATAAA 38259776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2042 AAAATTATCTAAAATTCAGTGAAATTAGTCCATATTATCAATGCCAACCTTACACATAAA 2101

 38259777 CAGAGTTGACATTCTCTTATGATGCTGAACAATGCAGATGAAGAACGCTGGCTTTGGATT 38259836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2102 CAGAGTTGACATTCTCTTATGATGCTGAACAATGCAGATGAAGAACGCTGGCTTTGGATT 2161

 38259837 AAGAAGACCCTTAGTTTGAATTTTAATTTTGACCCATGATAGCTGTGTAAACTTAG 38259892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2162 AAGAAGACCCTTAGTTTGAATTTTAATTTTGACCCATGATAGCTGTGTAAACTTAG 2217

EXCISED REGION

 38266750 TAAATGAACTTGATTTGAATGGAATGAGAGTTCAATGAAACTGTATATATTGTGAAACGT 38266809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2218 TAAATGAACTTGATTTGAATGGAATGAGAGTTCAATGAAACTGTATATATTGTGAAACGT 2277

 38266810 GGCAACTTACACCTACTCAAGACATTAAAAGAGATCATGCTTTCTTGCCTAAGTTTTATG 38266869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2278 GGCAACTTACACCTACTCAAGACATTAAAAGAGATCATGCTTTCTTGCCTAAGTTTTATG 2337

 38266870 TCCAATTTGTTCCTGTTTCAAACCCCTCGACAAAAACAAAATCTTTTAATCTGTTTGCAA 38266929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2338 TCCAATTTGTTCCTGTTTCAAACCCCTCGACAAAAACAAAATCTTTTAATCTGTTTGCAA 2397

 38266930 AATATTTCCTCCTTCCTCCCATCTTGCTGTTGCTGCTCTGTGATATACTGCCCTTGCTTA 38266989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2398 AATATTTCCTCCTTCCTCCCATCTTGCTGTTGCTGCTCTGTGATATACTGCCCTTGCTTA 2457

 38266990 TTACCCCTTTATAGCTGTTTTGTTAAAGTTCATACCGCTAAGACCTGTAAAAGAAATTTA 38267049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2458 TTACCCCTTTATAGCTGTTTTGTTAAAGTTCATACCGCTAAGACCTGTAAAAGAAATTTA 2517

 38267050 TGGCTCTAGGGATTTCAGCAAATTCTAAATAACCATAACAGGAACAGGAAGCATTAATTA 38267109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2518 TGGCTCTAGGGATTTCAGCAAATTCTAAATAACCATAACAGGAACAGGAAGCATTAATTA 2577

 38267110 AAGACACTAGAGTCTAAGTTATAACAGAAATCCTGACATTTAAGGCCCTGGTACCATTTA 38267169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2578 AAGACACTAGAGTCTAAGTTATAACAGAAATCCTGACATTTAAGGCCCTGGTACCATTTA 2637

 38267170 AATTTAAAATGGTATGACAAACAGAGAGTAATTTGATGGTCAGAAGGTTATAATGGATAC 38267229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2638 AATTTAAAATGGTATGACAAACAGAGAGTAATTTGATGGTCAGAAGGTTATAATGGATAC 2697

 38267230 CTTAATACCTTTGCCAAGAAAAAGTGTCTGTCCTTGCTCTAACCCCTACCCAGGGGCTTC 38267289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     2698 CTTAATACCTTTGCCAAGAAAAAGTGTCTGTCCTTGCTCTAATCCCTACCCAGGGGCTTC 2757

 38267290 AGGGGCCTCCTTCATAAAACATGGTGATGCCTAAATATTTTTGCGATATCTCATATATAA 38267349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2758 AGGGGCCTCCTTCATAAAACATGGTGATGCCTAAATATTTTTGCGATATCTCATATATAA 2817

 38267350 GCTGGTCTTTTCTTTAAGAATACGAGAGATTAAACACCAACCCCCAACATTCATACACCA 38267409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2818 GCTGGTCTTTTCTTTAAGAATACGAGAGATTAAACACCAACCCCCAACATTCATACACCA 2877

 38267410 ATTTTCAGATAAAACAGCTTAATATTTAAGATATATTTAGTGCAATTTGTCTATTTCTTG 38267469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2878 ATTTTCAGATAAAACAGCTTAATATTTAAGATATATTTAGTGCAATTTGTCTATTTCTTG 2937

 38267470 GTTTACTGGAGGGCTGTATTTAAAGCCAAGGGACCAAGGAACATTCCACAACACACTAAA 38267529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2938 GTTTACTGGAGGGCTGTATTTAAAGCCAAGGGACCAAGGAACATTCCACAACACACTAAA 2997

 38267530 GCAATTTTTCCCCAGGGAATATGCTGATTCTTTCCTAAAGGCAGAAGCCGACATTCCTGA 38267589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2998 GCAATTTTTCCCCAGGGAATATGCTGATTCTTTCCTAAAGGCAGAAGCCGACATTCCTGA 3057

 38267590 CTCATTCTGCCAAACCAAGCAATGAAAAATGCTTCACCTAATTTGAAAGATAATTTGTAA 38267649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3058 CTCATTCTGCCAAACCAAGCAATGAAAAATGCTTCACCTAATTTGAAAGATAATTTGTAA 3117

 38267650 TACCAGAGACTCAACTTGTTTTGTGTATCCAATACTAGCACCCTTTCCAGAATGTTGAAA 38267709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3118 TACCAGAGACTCAACTTGTTTTGTGTATCCAATACTAGCACCCTTTCCAGAATGTTGAAA 3177

 38267710 GTACACACTGTATGATTTGTCTAATGTATATTCAAAAAAGGAATACAAATTGATCCTCAA 38267769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3178 GTACACACTGTATGATTTGTCTAATGTATATTCAAAAAAGGAATACAAATTGATCCTCAA 3237

 38267770 AGTTCAAATCTGCAGTACATACTCTGTGTTCTGCCCCCACCCGTACCTTCATGAATTCTT 38267829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3238 AGTTCAAATCTGCAGTACATACTCTGTGTTCTGCCCCCACCCGTACCTTCATGAATTCTT 3297

 38267830 TCACCTAGCACGCAGGCTGTTTTCCCTTTGCGAAATCCCATGGTACATTTATAGTATTAA 38267889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3298 TCACCTAGCACGCAGGCTGTTTTCCCTTTGCGAAATCCCATGGTACATTTATAGTATTAA 3357

 38267890 TACCACTCACTTAGAATATGCCGTATTTTGTCTAATATTGCTAGATTTTGTGTGTATAAT 38267949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3358 TACCACTCACTTAGAATATGCCGTATTTTGTCTAATATTGCTAGATTTTGTGTGTATAAT 3417

 38267950 CTTATTCCTCAAGTAAATTACAAGACAAGGACTATAATTTATACATCCTCTACAACACTT 38268009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3418 CTTATTCCTCAAGTAAATTACAAGACAAGGACTATAATTTATACATCCTCTACAACACTT 3477

 38268010 GACACTGGCTTTGATTAGGCTCTTAATAAATATTTGTTGGTTGATTAATCAGTTGACCAC 38268069
          |.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3478 GGCACTGGCTTTGAGTAGGCTCTTAATAAATATTTGTTGGTTGATTAATCAGTTGACCAC 3537

 38268070 ACTTACTAATTGCAAGGTGACATCATTTATCATTAATAAACATATATGTGGATTACAAAA 38268129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3538 ACTTACTAATTGCAAGGTGACATCATTTATCATTAATAAACATATATGTGGATTACAAAA 3597

 38268130 ATATCATGTGAATTTGCATATAATCATATTAATCCCAAATTAGCACCTGAGAGTCCAACC 38268189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3598 ATATCATGTGAATTTGCATATAATCATATTAATCCCAAATTAGCACCTGAGAGTCCAACC 3657

 38268190 ACCCTCTCCTTTAGGCCCTTTTCACTTTTATGTCTACTTTTGCCTCACTTACAATTCCAC 38268249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3658 ACCCTCTCCTTTAGGCCCTTTTCACTTTTATGTCTACTTTTGCCTCACTTACAATTCCAC 3717

 38268250 TACTTACTTGCCTTCTTTCTCTTTTCAGCTTTGTGCTGTTATTTAATATCTCACCAGTTG 38268309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3718 TACTTACTTGCCTTCTTTCTCTTTTCAGCTTTGTGCTGTTATTTAATATCTCACCAGTTG 3777

 38268310 TGTAATTTCAGCTCCCAAATTGAATAAGACGTTCCCCCCAGTGGAACCCTCACCTTGACA 38268369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3778 TGTAATTTCAGCTCCCAAATTGAATAAGACGTTCCCCCCAGTGGAACCCTCACCTTGACA 3837

 38268370 AATAGCCAAATAGTA---ATTATTCCTTTCAGGGGTTGAGCTATGGAATCATGCTTGCAA 38268426
          |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3838 AATAGCCAAATAGTAATTATTATTCCTTTCAGGGGTTGAGCTATGGAATCATGCTTGCAA 3897

 38268427 TATCCCAGGCTTGAGTGCCTAGATATTTATGCTATACTTCCCTGTGTCGGAGTTTCCATC 38268486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3898 TATCCCAGGCTTGAGTGCCTAGATATTTATGCTATACTTCCCTGTGTCGGAGTTTCCATC 3957

 38268487 TGCGATTGTATTTCAAGCCCTCTCATTTTTTTTTTCAATATGATTAAGATAATTCCTTTA 38268546
          ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3958 TGCGATTGTATTTCAAGCCCTCTCA-TTTTTTTTTCAATATGATTAAGATAATTCCTTTA 4016

 38268547 TGAAGTTGGAAACTCAGACATTCAGAAAGAAACTTGACGTTTCATATTTTTGCTAACTTG 38268606
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4017 TGAAGCTGGAAACTCAGACATTCAGAAAGAAACTTGACGTTTCATATTTTTGCTAACTTG 4076

 38268607 CTCTTCCCATTTCCTTTCCTATCATTTTAGCCAGACTGAGGGAGAATTAATTTTGCAATG 38268666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     4077 CTCTTCCCATTTCCTTTCCTATCATTTTAGCCAGACTGAGGGAGAATTAATTTTGCAACG 4136

 38268667 GTCTCTATTTTTTTTTCCAAATGTGTGACCTCCATATTAATAGGAGCCAGAGTACTCATT 38268726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4137 GTCTCTATTTTTTTTTCCAAATGTGTGACCTCCATATTAATAGGAGCCAGAGTACTCATT 4196

 38268727 CATCACATCTGGTCAGTGTGAAACTGACATTTACAGGGTGGAATGTTTCCCACTCAGGAC 38268786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4197 CATCACATCTGGTCAGTGTGAAACTGACATTTACAGGGTGGAATGTTTCCCACTCAGGAC 4256

 38268787 AAATGGGGATCATTTGTAAAACATGCCGCACCCAATCATAGGTTCCCATGGATCTCCAAC 38268846
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     4257 AAATGGGGATCATTTGTAAAACATGCCACACCCAATCATAGGTTCCCATGGATCTCCAAC 4316

 38268847 TACATTTTTAAGCAACAATATAAACCATTCCCGAAACTGAAAGGTCTTTTCAAATATTTA 38268906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4317 TACATTTTTAAGCAACAATATAAACCATTCCCGAAACTGAAAGGTCTTTTCAAATATTTA 4376

 38268907 CTGCCTACCTATGGAATTTTTATTCTGCTTGCTGCTGCCATCAATAATCCTGGGAGTTCC 38268966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4377 CTGCCTACCTATGGAATTTTTATTCTGCTTGCTGCTGCCATCAATAATCCTGGGAGTTCC 4436

 38268967 TAGCTAAGTGTTGTGTATGACCTCCAAGGAAAGTCTTAGCATTGCAGAATGGGGAGGCGG 38269026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4437 TAGCTAAGTGTTGTGTATGACCTCCAAGGAAAGTCTTAGCATTGCAGAATGGGGAGGCGG 4496

 38269027 GTTAGTATCCTGCATTTTTCATTCTGTCACTTTCTAGGGACAATTACAAAGAAAATAATC 38269086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4497 GTTAGTATCCTGCATTTTTCATTCTGTCACTTTCTAGGGACAATTACAAAGAAAATAATC 4556

 38269087 ATATAAGACTTATTTTTATGTTTATTATGAAAGCCTTCAGCTCTTGCATTTGCAAGTAAG 38269146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4557 ATATAAGACTTATTTTTATGTTTATTATGAAAGCCTTCAGCTCTTGCATTTGCAAGTAAG 4616

 38269147 CTCAATGATTTTAAGTTTGCTTTTTCCCCCATGAAATGAAATATTATTTCCCACTTCTTC 38269206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4617 CTCAATGATTTTAAGTTTGCTTTTTCCCCCATGAAATGAAATATTATTTCCCACTTCTTC 4676

 38269207 CATGAATCTATTGGGTAACTCCAGGCCACTGTGATCTTTCATCTGGCATTTTGCTTTTAT 38269266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4677 CATGAATCTATTGGGTAACTCCAGGCCACTGTGATCTTTCATCTGGCATTTTGCTTTTAT 4736

 38269267 TTTTCTAGATCACAGTTGTGATTTAAAGCCCTCCTGGCACTTGGACACCTTGGTGATCTT 38269326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4737 TTTTCTAGATCACAGTTGTGATTTAAAGCCCTCCTGGCACTTGGACACCTTGGTGATCTT 4796

 38269327 AGCTCATGCTCCTAGTTCCATAGTGATGAATTGACCAAACTTTTTCCCAAGGATATCTGC 38269386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4797 AGCTCATGCTCCTAGTTCCATAGTGATGAATTGACCAAACTTTTTCCCAAGGATATCTGC 4856

 38269387 TAATTCTGGAGTTTCTGCTTTCTTATTATCTGTTCTGTCTTTTGGTTCTGTATTGATATA 38269446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4857 TAATTCTGGAGTTTCTGCTTTCTTATTATCTGTTCTGTCTTTTGGTTCTGTATTGATATA 4916

 38269447 ACAAGCTTTGTCCCCTTATCAATGAGGGCACAAAATGCAGCACTTCAAATAATTTCTGCA 38269506
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||
     4917 ACAAGCTTTGTCCCCTTATCAATGAGGGCACAAAATGAAGCACTTCAAATAGTTTCTGCA 4976

 38269507 AAAATTTACAGTTGCTGCATTAAGAATTTTGTGAGCTTCAATAATGTTATTGAAAAGTTG 38269566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4977 AAAATTTACAGTTGCTGCATTAAGAATTTTGTGAGCTTCAATAATGTTATTGAAAAGTTG 5036

 38269567 CAGATTCCCTCCTCCTTCTTTTTCTCCTTTCCTCCTCTTTCTGCCCTGTCTCCCCTTCAT 38269626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5037 CAGATTCCCTCCTCCTTCTTTTTCTCCTTTCCTCCTCTTTCTGCCCTGTCTCCCCTTCAT 5096

 38269627 TATTCTCCTCTTCTTCTCAAAAGCAAACAATCATTTTTCTTGCCTACTGAAGAATACTTG 38269686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5097 TATTCTCCTCTTCTTCTCAAAAGCAAACAATCATTTTTCTTGCCTACTGAAGAATACTTG 5156

 38269687 TAATGTTATTCTCAAAACCTGGACACCAGCTCAACTCCTTCTTTGTTCTACAAGTATTCA 38269746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5157 TAATGTTATTCTCAAAACCTGGACACCAGCTCAACTCCTTCTTTGTTCTACAAGTATTCA 5216

 38269747 CCCACCCTAATAGGGAGTTTATTCCAATGAAAAGACTGTGTTCCTCCTCAGAGGAATTTA 38269806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5217 CCCACCCTAATAGGGAGTTTATTCCAATGAAAAGACTGTGTTCCTCCTCAGAGGAATTTA 5276

 38269807 TGAGGTGGTAAGAGAGTAGAATTGCATTAATCTTATGCCATTCCTAGAGAATTCTTATTT 38269866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5277 TGAGGTGGTAAGAGAGTAGAATTGCATTAATCTTATGCCATTCCTAGAGAATTCTTATTT 5336

 38269867 CCTCAATTAAGGTTTAATTGCTCTGTTCTGAAAAAAAAAAAAAAATGGTGAGTCCAAGCA 38269926
          ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||
     5337 CCTCAATTAAGGTTTAATTGCTCTGTTCTG---AAAAAAAAAAAATGGTGAGTCCAAGCA 5393

 38269927 GATAATTTACAGTGACCTGTATCTGTGACTAGTTTTAAGGCTACCCTGAGGTCAGAATTT 38269986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5394 GATAATTTACAGTGACCTGTATCTGTGACTAGTTTTAAGGCTACCCTGAGGTCAGAATTT 5453

 38269987 AAACATGTTAATTCAGTACTGGACTTAATAGTAAACAAGATAGAGATATCTCTGTCTCAC 38270046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5454 AAACATGTTAATTCAGTACTGGACTTAATAGTAAACAAGATAGAGATATCTCTGTCTCAC 5513

 38270047 AAAGATTTGTAATACAACTCACAGAAGCTTTACTCCAAATGAAAGGGTCATAGTTAGAGG 38270106
          |.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5514 AGAGATTTGTAATACAACTCACAGACGCTTTACTCCAAATGAAAGGGTCATAGTTAGAGG 5573

 38270107 GAAATTCCATAATAATAGTACCTATCTGATAGGGTGAATGTGGGAATTAAACGAGTTCAT 38270166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5574 GAAATTCCATAATAATAGTACCTATCTGATAGGGTGAATGTGGGAATTAAACGAGTTCAT 5633

 38270167 AGCTATAAAGAATTTCAGAGGCCATCTGGCAATCACAAATAATAACTCTTAGTGGCAGCA 38270226
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     5634 AGCTATAAAGAATTTCAGAGGCCATCTGGCAATCACAAATAATAACTGTTAGTGGCAGCA 5693

 38270227 TTAGCTAGTTCCTGAATAGCCAAATATCTTGAATCCTCATAACAATGATTCAAATAAATG 38270286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5694 TTAGCTAGTTCCTGAATAGCCAAATATCTTGAATCCTCATAACAATGATTCAAATAAATG 5753

 38270287 TCATCATTATTTCACAGAGTAAGATACTTAAGCATTGGGAGTTATTAAGCAATTCTTTAA 38270346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5754 TCATCATTATTTCACAGAGTAAGATACTTAAGCATTGGGAGTTATTAAGCAATTCTTTAA 5813

 38270347 GGACATAGCAGCAACATGTAGAGGAGCTGAAATTACAACATGGTTCTTTCCGAACTTTAA 38270406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5814 GGACATAGCAGCAACATGTAGAGGAGCTGAAATTACAACATGGTTCTTTCCGAACTTTAA 5873

 38270407 GTCCCCTGTTTTTGTGTCTATGACTTTAAATATTCATAGTGGAATATCTATCTATCTACA 38270466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5874 GTCCCCTGTTTTTGTGTCTATGACTTTAAATATTCATAGTGGAATATCTATCTATCTACA 5933

 38270467 GATAATTTCATGAAACATTAAACTAAGTTTGG--TTTTTCTAAAATGCTAACCTCTGTTT 38270524
          ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||
     5934 GATAATTTCATGAAACATTAAACTAAGTTT--TTTTTTTCTAAAATGCTAACCTCTGTTT 5991

 38270525 AACTATCAACCTAGGCAAAAATGGACAATTCCCTGTACCTCAGAAGCTTTCCTAGTGCTC 38270584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5992 AACTATCAACCTAGGCAAAAATGGACAATTCCCTGTACCTCAGAAGCTTTCCTAGTGCTC 6051

 38270585 CTCCCATTCATAAAAATCTCCCATCCTTGGAAAATAGCCACGATAAAAATTATATCAAAT 38270644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6052 CTCCCATTCATAAAAATCTCCCATCCTTGGAAAATAGCCACGATAAAAATTATATCAAAT 6111

 38270645 CCCAACTTTTTATTTGTCCTTTTAACCAAATGACTTATGCTTTTCTAAATGATACAGATT 38270704
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6112 CCCAACTTTTTATTTGCCCTTTTAACCAAATGACTTATGCTTTTCTAAATGATACAGATT 6171

 38270705 TGCTTTGCCTATTTGGGAATGTTACATAACTAGAATCCTAGACAGAGCTCTTAATTGTAA 38270764
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6172 TGCTTTGCCTATTTGGGAATGTTATATAACTAGAATCCTAGACAGAGCTCTTAATTGTAA 6231

 38270765 CATTGTCATACATCAAATGTCAAGTGTCTACAAAGGGATGGATCACTCTGGGCTTTCAAT 38270824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6232 CATTGTCATACATCAAATGTCAAGTGTCTACAAAGGGATGGATCACTCTGGGCTTTCAAT 6291

 38270825 GTTCTTCCATTGGTCTATTAAATTCCCTTAGAGCAATAATCCTAGTATCTCATTTACTGA 38270884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6292 GTTCTTCCATTGGTCTATTAAATTCCCTTAGAGCAATAATCCTAGTATCTCATTTACTGA 6351

 38270885 AGTGTTACAATAGGATTTATTTTTTGGTGGAATAAGTCCAACCATCTTCTTGTTTGTTCT 38270944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6352 AGTGTTACAATAGGATTTATTTTTTGGTGGAATAAGTCCAACCATCTTCTTGTTTGTTCT 6411

 38270945 TCAAGAATGCATGGACTATTCTCTGTACTTTGCCTTATCACATACATTTAAAAATAAACC 38271004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6412 TCAAGAATGCATGGACTATTCTCTGTACTTTGCCTTATCACATACATTTAAAAATAAACC 6471

 38271005 TATTATTGCTATGAAATAATAATAAATAAAAGACTTGGGTTTTGTTTGATGTTACATTAT 38271064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6472 TATTATTGCTATGAAATAATAATAAATAAAAGACTTGGGTTTTGTTTGATGTTACATTAT 6531

 38271065 GTCTATAAAGTAAGGATCACTGACATCTGTAAAATTTGAATCTCCTAGTCTATAAAAAAT 38271124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6532 GTCTATAAAGTAAGGATCACTGACATCTGTAAAATTTGAATCTCCTAGTCTATAAAAAAT 6591

 38271125 TGAATATTTTTTGCTTATTCTGGGATCATTTCGATTATCTCCCAATAATGATTTTTGGTT 38271184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6592 TGAATATTTTTTGCTTATTCTGGGATCATTTCGATTATCTCCCAATAATGATTTTTGGTT 6651

 38271185 GTCTCTGTAAAGATCTAGTACAT 38271207
          |||||||||||||||||||||||
     6652 GTCTCTGTAAAGATCTAGTACAT 6674

Alignment time is 6.08421 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38249892,38276749] =>     26858 nucs '18 dna:chromosome chromosome:GRCh37:18:1:78077248:1'
Second seq [       1,    2218] =>      2218 nucs 'mol-32-331c-143287_2218'

Score:        2125
Aligned:      2213        nucs
Identic:      2205 (100%) nucs =>      1623 (100%)       582 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38257679,38259308] EXCISED REGION [38259311,38259893]
 second seq =>  [       4,    1633] EXCISED REGION [    1636,    2218]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [38259309,38259310]
 second seq =>         2 nucs [1634,1635]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [38259309,38259311] to [38259311,38259313]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [38259306,38259308] to [38259311,38259313]
 second seq =>         3 nucs [1631,1633] to [1636,1638]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 38257679 TGCCTTGGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACCGGCGTGAGCCACTGCGCCCATAGAAAAGA 38257738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        4 TGCCTTGGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACCGGCGTGAGCCACTGCGCCCATAGAAAAGA 63

 38257739 TTAGTTCTTTCTGAACTTTTAAACACCATTCAGCAGTGTTCACCATTCTCTCTAACTTAA 38257798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       64 TTAGTTCTTTCTGAACTTTTAAACACCATTCAGCAGTGTTCACCATTCTCTCTAACTTAA 123

 38257799 AACACTGTCCCTCATAACATATTTAAAAAATTCTATTTCTTACTGTTATTTCTCAGATTC 38257858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
      124 AACACTGTCCCTCATAACATATTTAAAAAATTATATTTCTTACTGTTATTTCTCAGATTC 183

 38257859 TTGTATAGGCCACAGTTCTTTCAGTAGAACTCTAACCAATTTCCGTACATGTAAGTATCA 38257918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
      184 TTGTATAGGCCACAGTTCTTTCAGTAGAACTCTAACCAATTTCCATACATGTAAGTATCA 243

 38257919 TAAATATACTAATGACTCTGAACATTATATATCTTGCCTCATGCATGAATACCCAAATGT 38257978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      244 TAAATATACTAATGACTCTGAACATTATATATCTTGCCTCATGCATGAATACCCAAATGT 303

 38257979 TTTCCTGTAATCACAAAATGAACATCTCAAAGTGACCACAAATTTGACATGTTCCGAAGT 38258038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      304 TTTCCTGTAATCACAAAATGAACATCTCAAAGTGACCACAAATTTGACATGTTCCGAAGT 363

 38258039 AATTAAATTTTGATATTCTCTGCCAAAAGCTGCTCTAGAAATTTTGCCACTCCTTCTTCA 38258098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      364 AATTAAATTTTGATATTCTCTGCCAAAAGCTGCTCTAGAAATTTTGCCACTCCTTCTTCA 423

 38258099 TCTTAGAAAATGCTATTATTCTCCACCAAAGGCAAATAACCAAGAGTCATTACTAGAAAA 38258158
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      424 TCTTAGAAAATGCTATCATTCTCCACCAAAGGCAAATAACCAAGAGTCATTACTAGAAAA 483

 38258159 TTTGTCTCCTTTACCACTCATGCCCAATATAGATCAAATTCTTTAAGATCTTTTCCTCAA 38258218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      484 TTTGTCTCCTTTACCACTCATGCCCAATATAGATCAAATTCTTTAAGATCTTTTCCTCAA 543

 38258219 TAAACCTCAAGTCTGTCACCTTTTCTATTACCACATTTTTTCTAAGTCTCAATCATCTCT 38258278
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      544 TAAATCTCAAGTCTGTCACCTTTTCTATTACCACATTTTTTCTAAGTCTCAATCATCTCT 603

 38258279 CAATTAGATCATTATAGTAATCTTCTAAGTGGTGTTGGGGTGTCGTCTCCCGGCTACTTC 38258338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      604 CAATTAGATCATTATAGTAATCTTCTAAGTGGTGTTGGGGTGTCGTCTCCCGGCTACTTC 663

 38258339 AATCCATTTTCCAATATTAAGTTTATTTGTTTAATTAAACATGTTAACTTGTGGTGCTCT 38258398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      664 AATCCATTTTCCAATATTAAGTTTATTTGTTTAATTAAACATGTTAACTTGTGGTGCTCT 723

 38258399 TATGCTTAAAAAGTTTCATTAGCTTTCTATTTATATAATGAATGAAACCAATGTTTAGCC 38258458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      724 TATGCTTAAAAAGTTTCATTAGCTTTCTATTTATATAATGAATGAAACCAATGTTTAGCC 783

 38258459 TAGTTTAAGAAATGTAAGAACTCCTTTTACCCTAGCTTTCTTCCTGTTTACTTTTATTCA 38258518
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
      784 TAGTTTAAGAAATGTAAGAACTCCCTTTACCCTAGCTTTCTTCCTGTTTACTTTTATTCA 843

 38258519 TCATGCCTTGAATCATACCTATCTTCTTTAATTTTCTCTAACACAAAATCCTCCTGTTTC 38258578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      844 TCATGCCTTGAATCATACCTATCTTCTTTAATTTTCTCTAACACAAAATCCTCCTGTTTC 903

 38258579 TTCTTTGCAATCCTGCAAACCCAAACCCAGCAGCTAGTAAATATTCAATATATATGAATT 38258638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      904 TTCTTTGCAATCCTGCAAACCCAAACCCAGCAGCTAGTAAATATTCAATATATATGAATT 963

 38258639 AATTAATTGATGAATGAGTGATTTTATTTCAGATTGCTATCAAATGCTCAATTCCCCTGC 38258698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      964 AATTAATTGATGAATGAGTGATTTTATTTCAGATTGCTATCAAATGCTCAATTCCCCTGC 1023

 38258699 ATAGTATCTCCAATGAGTCAAATCCTGGAATTCCCTATAGGAACACCTGGGATATATAGT 38258758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1024 ATAGTATCTCCAATGAGTCAAATCCTGGAATTCCCTATAGGAACACCTGGGATATATAGT 1083

 38258759 ATCAACTTACAAATACCATTCTTTCTTAATTTTGAAAGAAAAACTGAGTAAAATATGAGA 38258818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1084 ATCAACTTACAAATACCATTCTTTCTTAATTTTGAAAGAAAAACTGAGTAAAATATGAGA 1143

 38258819 GCTGTAGCTTTTAAAAAAAATAGAAAATACACCATAAAAATTTTAGTCAAGCATGGCAGA 38258878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1144 GCTGTAGCTTTTAAAAAAAATAGAAAATACACCATAAAAATTTTAGTCAAGCATGGCAGA 1203

 38258879 CTAAATACATGTATTTATTTCTAATCTACTTCAAGCTCCAATATAATAACTGTTTACAAA 38258938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1204 CTAAATACATGTATTTATTTCTAATCTACTTCAAGCTCCAATATAATAACTGTTTACAAA 1263

 38258939 TGAAATGGTCTAATATCACAAGTTCAAAATTAATAAGAGTGGATGAGACATGCCAACAAA 38258998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1264 TGAAATGGTCTAATATCACAAGTTCAAAATTAATAAGAGTGGATGAGACATGCCAACAAA 1323

 38258999 TTTTTGGAATGTAAAAATAGATAAGACATTGTTAATGATTTGACAAAGCACAAAGCCTTA 38259058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1324 TTTTTGGAATGTAAAAATAGATAAGACATTGTTAATGATTTGACAAAGCACAAAGCCTTA 1383

 38259059 AAATATTTCTGTATAGAGAGAAGTTTCCAAAGTAGGGCAACTCAGAGATAAATCAAGAAT 38259118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1384 AAATATTTCTGTATAGAGAGAAGTTTCCAAAGTAGGGCAACTCAGAGATAAATCAAGAAT 1443

 38259119 GGGAAGATTCACACACCTCAACTGTAAAAGAGAAATATGAGACTAAAAGCAGTGGATTAA 38259178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     1444 GGGAAGATTCACACACCTCAACTGTAAAAGAGAAATATGAGACTAAAAGCAGTGGATTCA 1503

 38259179 TTAAAACTTTGTTTGATGAGATATTATACATAGATGTCTTCTCCATCATTCCAAGCACTT 38259238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1504 TTAAAACTTTGTTTGATGAGATATTATACATAGATGTCTTCTCCATCATTCCAAGCACTT 1563

 38259239 AAGCAGCTGCCCTTTCCAAACACTCATAGAGGATAAGAGATTATTTTCTATAAAAATCAA 38259298
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1564 AAGCAGCTGCCCTTTACAAACACTCATAGAGGATAAGAGATTATTTTCTATAAAAATCAA 1623

 38259299 ACCAGATTGT 38259308
          ||||||||||
     1624 ACCAGATTGT 1633

EXCISED REGION

 38259311 TGTACATCAAGCAAAGGAGGGATGGCAGGGAGGTGATATACTGAAACAGAATTACTGTAT 38259370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1636 TGTACATCAAGCAAAGGAGGGATGGCAGGGAGGTGATATACTGAAACAGAATTACTGTAT 1695

 38259371 GAAAACCTGGAATGAACAATTAGATACTCAGTTCTCCTTACCTGCACAGTAATAGTAATT 38259430
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1696 GAAAACATGGAATGAACAATTAGATACTCAGTTCTCCTTACCTGCACAGTAATAGTAATT 1755

 38259431 CTTACTACCAGACTGGATGCTGGAGGGCTCTCCTTCAGAGAAACAGAAAAGAAAAAAAAG 38259490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1756 CTTACTACCAGACTGGATGCTGGAGGGCTCTCCTTCAGAGAAACAGAAAAGAAAAAAAAG 1815

 38259491 CCTATAGCCACTAATATTTGAATCTCTGCAATTAAATACCTGGGTCCCTTCCCAATCATA 38259550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1816 CCTATAGCCACTAATATTTGAATCTCTGCAATTAAATACCTGGGTCCCTTCCCAATCATA 1875

 38259551 TAGCAGTGATGCTCACCAGTTAACAAGAACTGAAGACACATGACAGATTCCAATCAGTGA 38259610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1876 TAGCAGTGATGCTCACCAGTTAACAAGAACTGAAGACACATGACAGATTCCAATCAGTGA 1935

 38259611 TTTATTACCACTGTCAAATAAGAATGGACACTCAAAGATTACCTGAAAAAGTCCTTTAAT 38259670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1936 TTTATTACCACTGTCAAATAAGAATGGACACTCAAAGATTACCTGAAAAAGTCCTTTAAT 1995

 38259671 ATGGCCCCAGATTGAATAATTCCTAATTTCCTATATCATAAATTCAAAAATTATCTAAAA 38259730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1996 ATGGCCCCAGATTGAATAATTCCTAATTTCCTATATCATAAATTCAAAAATTATCTAAAA 2055

 38259731 TTCAGTGAAATTAGTCCATATTATCAATGCCAACCTTACACATAAACAGAGTTGACATTC 38259790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2056 TTCAGTGAAATTAGTCCATATTATCAATGCCAACCTTACACATAAACAGAGTTGACATTC 2115

 38259791 TCTTATGATGCTGAACAATGCAGATGAAGAACGCTGGCTTTGGATTAAGAAGACCCTTAG 38259850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2116 TCTTATGATGCTGAACAATGCAGATGAAGAACGCTGGCTTTGGATTAAGAAGACCCTTAG 2175

 38259851 TTTGAATTTTAATTTTGACCCATGATAGCTGTGTAAACTTAGT 38259893
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2176 TTTGAATTTTAATTTTGACCCATGATAGCTGTGTAAACTTAGT 2218

Alignment time is 2.07497 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38249892,38276749] =>     26858 nucs '18 dna:chromosome chromosome:GRCh37:18:1:78077248:1'
Second seq [       1,    5535] =>      5535 nucs 'mol-32-331c-156446_5535'

Score:        5262
Aligned:      5544        nucs
Identic:      5511 ( 99%) nucs =>      2376 ( 99%)      3135 (100%)
Gaps:           17 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38263854,38266242] EXCISED REGION [38266251,38269397]
 second seq =>  [       1,    2386] EXCISED REGION [    2387,    5535]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         8 nucs [38266243,38266250]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         8 nucs [38266243,38266250] to [38266251,38266258]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [38266242,38266242] to [38266251,38266251]
 second seq =>         1 nucs [2386,2386] to [2387,2387]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 38263854 CCTTTATTTTGTTAATTTCTAGTTGTATTTTTATTATTTCCTTCCTAGTTCTTCTTTTTA 38263913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCTTTATTTTGTTAATTTCTAGTTGTATTTTTATTATTTCCTTCCTAGTTCTTCTTTTTA 60

 38263914 TTTAATCGTTCTTAAGATGGATACTTAAGTAATTGATTTTCATCTTCTAAGCTTTATTAG 38263973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTAATCGTTCTTAAGATGGATACTTAAGTAATTGATTTTCATCTTCTAAGCTTTATTAG 120

 38263974 TATGTTTATTTAAAGCAATACATTTCCATATTACCATGACCTTAGCTGCAGTGTATGTAT 38264033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TATGTTTATTTAAAGCAATACATTTCCATATTACCATGACCTTAGCTGCAGTGTATGTAT 180

 38264034 TTTGGTGTACAGTATTTTCTTTATTTTTCAATTAAAATTTGTCTTGACTTCCTCTATGAT 38264093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTTGGTGTACAGTATTTTCTTTATTTTTCAATTAAAATTTGTCTTGACTTCCTCTATGAT 240

 38264094 GTCTTCTATGATTCTTCCTCTATAATTCTTCTTTTGACCATATAGAAGTGTATTCATTAA 38264153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTCTTCTATGATTCTTCCTCTATAATTCTTCTTTTGACCATATAGAAGTGTATTCATTAA 300

 38264154 TTCAATCACATATAAATATTCTCCTTTTATCTTTTTGCTACTGGTTTGTTTGTTTAGCTA 38264213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTCAATCACATATAAATATTCTCCTTTTATCTTTTTGCTACTGGTTTGTTTGTTTAGCTA 360

 38264214 CATTTAGGGAAAATTTCATTTCTGAGACGACAGAGGAAGCACATTCCATTTTATTCCTTC 38264273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CATTTAGGGAAAATTTCATTTCTGAGACGACAGAGGAAGCACATTCCATTTTATTCCTTC 420

 38264274 TGCTAATGACAAAAAAAAAAAAAAATTGGAAAAAACACAAAAGCCAGAGTCAAAAGACTC 38264333
          ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGCTAATGACAAAAAAAAAAAA---TTGGAAAAAACACAAAAGCCAGAGTCAAAAGACTC 477

 38264334 TGAAAAATGGAGAAAAAGTGCAGACAGGCTAAGGATTTGGGAGATTGAGGAACAACGACA 38264393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      478 TGAAAAATGGAGAAAAAGTGCAGACAGGCTAAGGATTTGGGAGATTGAGGAACAACGACA 537

 38264394 GGTGAGTTCTCTGTCTTTTTTTTT-CTTTCTTTTTTGATATATATATATATATCAACAAT 38264452
          |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||
      538 GGTGAGTTCTCTGTCTTTTTTTTTTCTTTCTTTTTTGATATATATATAT----CAACAAT 593

 38264453 CTCAATGTTTAAGAGAAGCCCTCAAGCCAGAATTTCCAACAGTTGCAGATAAAACATTGT 38264512
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
      594 CTCAATGTTTAAGAGAAGCCCTCAATCCAGAATTTCCAACAGTTGCAGATAAAACATTGT 653

 38264513 GCTTGCTTAACGTATTTAACCAAAAGACCCGAAAAGCAAGGATATAAAAGAATATTTTAA 38264572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      654 GCTTGCTTAACGTATTTAACCAAAAGACCCGAAAAGCAAGGATATAAAAGAATATTTTAA 713

 38264573 TAATATCATTCTGTTCTTAAGGTGAACACTTCAAAGAAACCACACCCCTCCCCTCCCCAA 38264632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      714 TAATATCATTCTGTTCTTAAGGTGAACACTTCAAAGAAACCACACCCCTCCCCTCCCCAA 773

 38264633 TGCGTGCTGAAGCAGTGGAATCCATGAGTGGAACCTTGTCATATATAATCTCCACACTAA 38264692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      774 TGCGTGCTGAAGCAGTGGAATCCATGAGTGGAACCTTGTCATATATAATCTCCACACTAA 833

 38264693 ATTTATAGCAAAGCCCCCATCTCTCAACCTGTGTTGAAATTCTGACTTCCAGACACACCT 38264752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      834 ATTTATAGCAAAGCCCCCATCTCTCAACCTGTGTTGAAATTCTGACTTCCAGACACACCT 893

 38264753 TTCAGTAATGAGGAGGTACTCTTCCATGATAAACCCTGTGGGCAAAGCTTCCACATTCAT 38264812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      894 TTCAGTAATGAGGAGGTACTCTTCCATGATAAACCCTGTGGGCAAAGCTTCCACATTCAT 953

 38264813 CCCACCCCTAAAGCAATAAATTTGCACCTTTCCCAAGTAGAATCAATGGGAAGAATTTTG 38264872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      954 CCCACCCCTAAAGCAATAAATTTGCACCTTTCCCAAGTAGAATCAATGGGAAGAATTTTG 1013

 38264873 ACTTCTATCCCCACCTGATGGTAATGAGGCAGTATCTCTCTCTTTTTCCAGACAGTGTTT 38264932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1014 ACTTCTATCCCCACCTGATGGTAATGAGGCAGTATCTCTCTCTTTTTCCAGACAGTGTTT 1073

 38264933 AAGAATTTGTTGTATAGAGCGCTATTACCTGAATAACACATTGTGGCAGAGCAAAATAAC 38264992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1074 AAGAATTTGTTGTATAGAGCGCTATTACCTGAATAACACATTGTGGCAGAGCAAAATAAC 1133

 38264993 CCTTAAGCATTTAGTTTTCAGATTTATTTTCAACTATTTAGAGGGTTATTTCTTGACTAC 38265052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1134 CCTTAAGCATTTAGTTTTCAGATTTATTTTCAACTATTTAGAGGGTTATTTCTTGACTAC 1193

 38265053 CACAGATAAGTCATTCCCTTCTCCATTGTTCTATAGTTTACTGCCCTTTTTTTCTATCAT 38265112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1194 CACAGATAAGTCATTCCCTTCTCCATTGTTCTATAGTTTACTGCCCTTTTTTTCTATCAT 1253

 38265113 GGCATTTACCCACTATTTCATATTGTTATTTATAGTTTACATGCTTAATATCTCCATCTC 38265172
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     1254 GGCATTTACCCACTATTTCATATTGTTATTTTTAGTTTACATGCTTAATATCTCCATCTC 1313

 38265173 CCAACAAATATGGGAACATCATTAGGTCAGAGAAATTTTATTTCTTTTCCCTCTGAAGTC 38265232
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     1314 CCAACAAATATGGGAACATCATTAGGTCAGAGAAATTTTATTTCTTTCCCCTCTGAAGTC 1373

 38265233 TCAGTATTAGTTGTTACATTAATTAGCACTTATTTAAATTTTTAGTTTTCTTTTTCTTTG 38265292
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1374 TCAGTACTAGTTGTTACATTAATTAGCACTTATTTAAATTTTTAGTTTTCTTTTTCTTTG 1433

 38265293 CCTCATGTTACTGTTACACCCTTCCACTACCAAGCTTAAAGTTAGGAATGATTCATGTGA 38265352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1434 CCTCATGTTACTGTTACACCCTTCCACTACCAAGCTTAAAGTTAGGAATGATTCATGTGA 1493

 38265353 CTGGAATTGAATGACTGCTCTGAGAAAGAAGTCCATAAAAGTCTGCATGCAATTTGCCAT 38265412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1494 CTGGAATTGAATGACTGCTCTGAGAAAGAAGTCCATAAAAGTCTGCATGCAATTTGCCAT 1553

 38265413 GTCTCCATCCTTTCTTTGCCATAGAAACTAAAGATCTTCCAGATAGTCGAGGCTCTGTTA 38265472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1554 GTCTCCATCCTTTCTTTGCCATAGAAACTAAAGATCTTCCAGATAGTCGAGGCTCTGTTA 1613

 38265473 ATGTTATTTCTTGAATAACGACTATCTGAACAGAACATCTGTGACTTGGAATGGGGACAT 38265532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1614 ATGTTATTTCTTGAATAACGACTATCTGAACAGAACATCTGTGACTTGGAATGGGGACAT 1673

 38265533 GTAGCTTGGAGAAAAAGTAAGCACACAGTGTTTTAAGTTACTGTGGTTTTATGGTTATTT 38265592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1674 GTAGCTTGGAGAAAAAGTAAGCACACAGTGTTTTAAGTTACTGTGGTTTTATGGTTATTT 1733

 38265593 GTTACTGCAGCATAACCCACCCTGCCCTGACTTAAGTGATATAATATTTAACAAATATTT 38265652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1734 GTTACTGCAGCATAACCCACCCTGCCCTGACTTAAGTGATATAATATTTAACAAATATTT 1793

 38265653 ATAAAATAAATAAATTCAAATTCACTCTAATACCTAGAAAATTATCAAGTATAGTAAACC 38265712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1794 ATAAAATAAATAAATTCAAATTCACTCTAATACCTAGAAAATTATCAAGTATAGTAAACC 1853

 38265713 AAATAATAAATATTTATTAAGGAATATGGAAACAGTGACCTATGAGAAGTCTTGATATAC 38265772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1854 AAATAATAAATATTTATTAAGGAATATGGAAACAGTGACCTATGAGAAGTCTTGATATAC 1913

 38265773 TGACCATCCATTGTTGCAGCAGATCTCACTATTGCTATTGTGCTTAACATTTCAATTACA 38265832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1914 TGACCATCCATTGTTGCAGCAGATCTCACTATTGCTATTGTGCTTAACATTTCAATTACA 1973

 38265833 AAAATTAAAAAAAAAAAA-CACCATTCATCAGTGCAGGTCTGTGTATTTAAAGAAATAAT 38265891
          |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1974 AAAATTAAAAAAAAAAAAACACCATTCATCAGTGCAGGTCTGTGTATTTAAAGAAATAAT 2033

 38265892 TTACAAGTTTTTTTTTCCTTTGTAAACATATTGTTTTGAAGTGCAAATATATATAATTTG 38265951
          ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2034 TTACAAGTTTTTTTT-CCTTTGTAAACATATTGTTTTGAAGTGCAAATATATATAATTTG 2092

 38265952 CACTTTGGGATGGAATGGAATGGGATGCCCTATTGGCAGTCCATACATCTGGATTATAAA 38266011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2093 CACTTTGGGATGGAATGGAATGGGATGCCCTATTGGCAGTCCATACATCTGGATTATAAA 2152

 38266012 TGGATTTCCATCCCATCTTCCTCCCCATCTCTTTCCCTTTTTGATCATTCTATGGAAATG 38266071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2153 TGGATTTCCATCCCATCTTCCTCCCCATCTCTTTCCCTTTTTGATCATTCTATGGAAATG 2212

 38266072 GAAAGCTAGCAGAAGTTTGAAGAATTGTCACGCAAACAACAACAACAA---AACTTTAGC 38266128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||
     2213 GAAAGCTAGCAGAAGTTTGAAGAATTGTCACGCAAACAACAACAACAACAAAACTTTAGC 2272

 38266129 ATATTAACCTGTTGTCCAACCTTATATAAGCAGTTTGTATTTAAAACATCCCTAAGTGGA 38266188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2273 ATATTAACCTGTTGTCCAACCTTATATAAGCAGTTTGTATTTAAAACATCCCTAAGTGGA 2332

 38266189 TTTTAATTCCAGTTTCAATCATTGTTAACTATTTTTGAAATATTTAAAATCCCA 38266242
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2333 TTTTAATTCCAATTTCAATCATTGTTAACTATTTTTGAAATATTTAAAATCCCA 2386

EXCISED REGION

 38266251 ACCACTATTTCTCTTCAACTAGTCCTTACTTTTATAAACAAAAAAGTAACAGTAAATAAT 38266310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2387 ACCACTATTTCTCTTCAACTAGTCCTTACTTTTATAAACAAAAAAGTAACAGTAAATAAT 2446

 38266311 TTATAACTAGGTCTCTCTGAATCTAAAAACACGTTCTTATACACTATGTGATGCCATATT 38266370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     2447 TTATAACTAGGTCTCTCTGAATCTAAAAACACATTCTTATACACTATGTGATGCCATATT 2506

 38266371 TTTTACTCTTGTCTTTGTGAGTTTTTTGTGCCATTCTCTCCTCTGGAATGGTCTTCTGTG 38266430
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2507 TTTTACTCTTGACTTTGTGAGTTTTTTGTGCCATTCTCTCCTCTGGAATGGTCTTCTGTG 2566

 38266431 CTTACACATTCCAAGGGCTACTCCATTTTACAAGAAACAGTTCATGTTTGCTACTTTGGG 38266490
          .|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2567 TTTACACATTCCAAGGGCTAATCCATTTTACAAGAAACAGTTCATGTTTGCTACTTTGGG 2626

 38266491 GTTGATCCCATGATAATTCTGGTTCTCACTTGGTCTTTCCCTGTGAGATGCAGTAGCATT 38266550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2627 GTTGATCCCATGATAATTCTGGTTCTCACTTGGTCTTTCCCTGTGAGATGCAGTAGCATT 2686

 38266551 CAAAATTCTCAGACTATTCTATGCACCTTGGCAGATTTATGGTAATGGTCTATAATTGCT 38266610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2687 CAAAATTCTCAGACTATTCTATGCACCTTGGCAGATTTATGGTAATGGTCTATAATTGCT 2746

 38266611 TCATATCTGCTAACCTTGCTTCCAAAACTAGTTTTTGAGATTAATGAGACAGGAGCTTGG 38266670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2747 TCATATCTGCTAACCTTGCTTCCAAAACTAGTTTTTGAGATTAATGAGACAGGAGCTTGG 2806

 38266671 CTTTTTCTTTCTGTATAGCTTCCATAGCAACAAGAAAATATTAGACACACAGTAGGCATT 38266730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2807 CTTTTTCTTTCTGTATAGCTTCCATAGCAACAAGAAAATATTAGACACACAGTAGGCATT 2866

 38266731 GGAAGAAAATGTGTTCAGTTAAATGAACTTGATTTGAATGGAATGAGAGTTCAATGAAAC 38266790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2867 GGAAGAAAATGTGTTCAGTTAAATGAACTTGATTTGAATGGAATGAGAGTTCAATGAAAC 2926

 38266791 TGTATATATTGTGAAACGTGGCAACTTACACCTACTCAAGACATTAAAAGAGATCATGCT 38266850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2927 TGTATATATTGTGAAACGTGGCAACTTACACCTACTCAAGACATTAAAAGAGATCATGCT 2986

 38266851 TTCTTGCCTAAGTTTTATGTCCAATTTGTTCCTGTTTCAAACCCCTCGACAAAAACAAAA 38266910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2987 TTCTTGCCTAAGTTTTATGTCCAATTTGTTCCTGTTTCAAACCCCTCGACAAAAACAAAA 3046

 38266911 TCTTTTAATCTGTTTGCAAAATATTTCCTCCTTCCTCCCATCTTGCTGTTGCTGCTCTGT 38266970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3047 TCTTTTAATCTGTTTGCAAAATATTTCCTCCTTCCTCCCATCTTGCTGTTGCTGCTCTGT 3106

 38266971 GATATACTGCCCTTGCTTATTACCCCTTTATAGCTGTTTTGTTAAAGTTCATACCGCTAA 38267030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3107 GATATACTGCCCTTGCTTATTACCCCTTTATAGCTGTTTTGTTAAAGTTCATACCGCTAA 3166

 38267031 GACCTGTAAAAGAAATTTATGGCTCTAGGGATTTCAGCAAATTCTAAATAACCATAACAG 38267090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3167 GACCTGTAAAAGAAATTTATGGCTCTAGGGATTTCAGCAAATTCTAAATAACCATAACAG 3226

 38267091 GAACAGGAAGCATTAATTAAAGACACTAGAGTCTAAGTTATAACAGAAATCCTGACATTT 38267150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3227 GAACAGGAAGCATTAATTAAAGACACTAGAGTCTAAGTTATAACAGAAATCCTGACATTT 3286

 38267151 AAGGCCCTGGTACCATTTAAATTTAAAATGGTATGACAAACAGAGAGTAATTTGATGGTC 38267210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3287 AAGGCCCTGGTACCATTTAAATTTAAAATGGTATGACAAACAGAGAGTAATTTGATGGTC 3346

 38267211 AGAAGGTTATAATGGATACCTTAATACCTTTGCCAAGAAAAAGTGTCTGTCCTTGCTCTA 38267270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3347 AGAAGGTTATAATGGATACCTTAATACCTTTGCCAAGAAAAAGTGTCTGTCCTTGCTCTA 3406

 38267271 ACCCCTACCCAGGGGCTTCAGGGGCCTCCTTCATAAAACATGGTGATGCCTAAATATTTT 38267330
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3407 ATCCCTACCCAGGGGCTTCAGGGGCCTCCTTCATAAAACATGGTGATGCCTAAATATTTT 3466

 38267331 TGCGATATCTCATATATAAGCTGGTCTTTTCTTTAAGAATACGAGAGATTAAACACCAAC 38267390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3467 TGCGATATCTCATATATAAGCTGGTCTTTTCTTTAAGAATACGAGAGATTAAACACCAAC 3526

 38267391 CCCCAACATTCATACACCAATTTTCAGATAAAACAGCTTAATATTTAAGATATATTTAGT 38267450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3527 CCCCAACATTCATACACCAATTTTCAGATAAAACAGCTTAATATTTAAGATATATTTAGT 3586

 38267451 GCAATTTGTCTATTTCTTGGTTTACTGGAGGGCTGTATTTAAAGCCAAGGGACCAAGGAA 38267510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3587 GCAATTTGTCTATTTCTTGGTTTACTGGAGGGCTGTATTTAAAGCCAAGGGACCAAGGAA 3646

 38267511 CATTCCACAACACACTAAAGCAATTTTTCCCCAGGGAATATGCTGATTCTTTCCTAAAGG 38267570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3647 CATTCCACAACACACTAAAGCAATTTTTCCCCAGGGAATATGCTGATTCTTTCCTAAAGG 3706

 38267571 CAGAAGCCGACATTCCTGACTCATTCTGCCAAACCAAGCAATGAAAAATGCTTCACCTAA 38267630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3707 CAGAAGCCGACATTCCTGACTCATTCTGCCAAACCAAGCAATGAAAAATGCTTCACCTAA 3766

 38267631 TTTGAAAGATAATTTGTAATACCAGAGACTCAACTTGTTTTGTGTATCCAATACTAGCAC 38267690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3767 TTTGAAAGATAATTTGTAATACCAGAGACTCAACTTGTTTTGTGTATCCAATACTAGCAC 3826

 38267691 CCTTTCCAGAATGTTGAAAGTACACACTGTATGATTTGTCTAATGTATATTCAAAAAAGG 38267750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3827 CCTTTCCAGAATGTTGAAAGTACACACTGTATGATTTGTCTAATGTATATTCAAAAAAGG 3886

 38267751 AATACAAATTGATCCTCAAAGTTCAAATCTGCAGTACATACTCTGTGTTCTGCCCCCACC 38267810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3887 AATACAAATTGATCCTCAAAGTTCAAATCTGCAGTACATACTCTGTGTTCTGCCCCCACC 3946

 38267811 CGTACCTTCATGAATTCTTTCACCTAGCACGCAGGCTGTTTTCCCTTTGCGAAATCCCAT 38267870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3947 CGTACCTTCATGAATTCTTTCACCTAGCACGCAGGCTGTTTTCCCTTTGCGAAATCCCAT 4006

 38267871 GGTACATTTATAGTATTAATACCACTCACTTAGAATATGCCGTATTTTGTCTAATATTGC 38267930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4007 GGTACATTTATAGTATTAATACCACTCACTTAGAATATGCCGTATTTTGTCTAATATTGC 4066

 38267931 TAGATTTTGTGTGTATAATCTTATTCCTCAAGTAAATTACAAGACAAGGACTATAATTTA 38267990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4067 TAGATTTTGTGTGTATAATCTTATTCCTCAAGTAAATTACAAGACAAGGACTATAATTTA 4126

 38267991 TACATCCTCTACAACACTTGACACTGGCTTTGATTAGGCTCTTAATAAATATTTGTTGGT 38268050
          ||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     4127 TACATCCTCTACAACACTTGGCACTGGCTTTGAGTAGGCTCTTAATAAATATTTGTTGGT 4186

 38268051 TGATTAATCAGTTGACCACACTTACTAATTGCAAGGTGACATCATTTATCATTAATAAAC 38268110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4187 TGATTAATCAGTTGACCACACTTACTAATTGCAAGGTGACATCATTTATCATTAATAAAC 4246

 38268111 ATATATGTGGATTACAAAAATATCATGTGAATTTGCATATAATCATATTAATCCCAAATT 38268170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4247 ATATATGTGGATTACAAAAATATCATGTGAATTTGCATATAATCATATTAATCCCAAATT 4306

 38268171 AGCACCTGAGAGTCCAACCACCCTCTCCTTTAGGCCCTTTTCACTTTTATGTCTACTTTT 38268230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4307 AGCACCTGAGAGTCCAACCACCCTCTCCTTTAGGCCCTTTTCACTTTTATGTCTACTTTT 4366

 38268231 GCCTCACTTACAATTCCACTACTTACTTGCCTTCTTTCTCTTTTCAGCTTTGTGCTGTTA 38268290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4367 GCCTCACTTACAATTCCACTACTTACTTGCCTTCTTTCTCTTTTCAGCTTTGTGCTGTTA 4426

 38268291 TTTAATATCTCACCAGTTGTGTAATTTCAGCTCCCAAATTGAATAAGACGTTCCCCCCAG 38268350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4427 TTTAATATCTCACCAGTTGTGTAATTTCAGCTCCCAAATTGAATAAGACGTTCCCCCCAG 4486

 38268351 TGGAACCCTCACCTTGACAAATAGCCAAATAGTA---ATTATTCCTTTCAGGGGTTGAGC 38268407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||
     4487 TGGAACCCTCACCTTGACAAATAGCCAAATAGTAATTATTATTCCTTTCAGGGGTTGAGC 4546

 38268408 TATGGAATCATGCTTGCAATATCCCAGGCTTGAGTGCCTAGATATTTATGCTATACTTCC 38268467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4547 TATGGAATCATGCTTGCAATATCCCAGGCTTGAGTGCCTAGATATTTATGCTATACTTCC 4606

 38268468 CTGTGTCGGAGTTTCCATCTGCGATTGTATTTCAAGCCCTCTCATTTTTTTTTTCAATAT 38268527
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
     4607 CTGTGTCGGAGTTTCCATCTGCGATTGTATTTCAAGCCCTCTCA-TTTTTTTTTCAATAT 4665

 38268528 GATTAAGATAATTCCTTTATGAAGTTGGAAACTCAGACATTCAGAAAGAAACTTGACGTT 38268587
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4666 GATTAAGATAATTCCTTTATGAAGCTGGAAACTCAGACATTCAGAAAGAAACTTGACGTT 4725

 38268588 TCATATTTTTGCTAACTTGCTCTTCCCATTTCCTTTCCTATCATTTTAGCCAGACTGAGG 38268647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4726 TCATATTTTTGCTAACTTGCTCTTCCCATTTCCTTTCCTATCATTTTAGCCAGACTGAGG 4785

 38268648 GAGAATTAATTTTGCAATGGTCTCTATTTTTTTTTCCAAATGTGTGACCTCCATATTAAT 38268707
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4786 GAGAATTAATTTTGCAACGGTCTCTATTTTTTTTTCCAAATGTGTGACCTCCATATTAAT 4845

 38268708 AGGAGCCAGAGTACTCATTCATCACATCTGGTCAGTGTGAAACTGACATTTACAGGGTGG 38268767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4846 AGGAGCCAGAGTACTCATTCATCACATCTGGTCAGTGTGAAACTGACATTTACAGGGTGG 4905

 38268768 AATGTTTCCCACTCAGGACAAATGGGGATCATTTGTAAAACATGCCGCACCCAATCATAG 38268827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     4906 AATGTTTCCCACTCAGGACAAATGGGGATCATTTGTAAAACATGCCACACCCAATCATAG 4965

 38268828 GTTCCCATGGATCTCCAACTACATTTTTAAGCAACAATATAAACCATTCCCGAAACTGAA 38268887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4966 GTTCCCATGGATCTCCAACTACATTTTTAAGCAACAATATAAACCATTCCCGAAACTGAA 5025

 38268888 AGGTCTTTTCAAATATTTACTGCCTACCTATGGAATTTTTATTCTGCTTGCTGCTGCCAT 38268947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5026 AGGTCTTTTCAAATATTTACTGCCTACCTATGGAATTTTTATTCTGCTTGCTGCTGCCAT 5085

 38268948 CAATAATCCTGGGAGTTCCTAGCTAAGTGTTGTGTATGACCTCCAAGGAAAGTCTTAGCA 38269007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5086 CAATAATCCTGGGAGTTCCTAGCTAAGTGTTGTGTATGACCTCCAAGGAAAGTCTTAGCA 5145

 38269008 TTGCAGAATGGGGAGGCGGGTTAGTATCCTGCATTTTTCATTCTGTCACTTTCTAGGGAC 38269067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5146 TTGCAGAATGGGGAGGCGGGTTAGTATCCTGCATTTTTCATTCTGTCACTTTCTAGGGAC 5205

 38269068 AATTACAAAGAAAATAATCATATAAGACTTATTTTTATGTTTATTATGAAAGCCTTCAGC 38269127
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5206 AATTACAAAGAAAATAATCGTATAAGACTTATTTTTATGTTTATTATGAAAGCCTTCAGC 5265

 38269128 TCTTGCATTTGCAAGTAAGCTCAATGATTTTAAGTTTGCTTTTTCCCCCATGAAATGAAA 38269187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5266 TCTTGCATTTGCAAGTAAGCTCAATGATTTTAAGTTTGCTTTTTCCCCCATGAAATGAAA 5325

 38269188 TATTATTTCCCACTTCTTCCATGAATCTATTGGGTAACTCCAGGCCACTGTGATCTTTCA 38269247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5326 TATTATTTCCCACTTCTTCCATGAATCTATTGGGTAACTCCAGGCCACTGTGATCTTTCA 5385

 38269248 TCTGGCATTTTGCTTTTATTTTTCTAGATCACAGTTGTGATTTAAAGCCCTCCTGGCACT 38269307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5386 TCTGGCATTTTGCTTTTATTTTTCTAGATCACAGTTGTGATTTAAAGCCCTCCTGGCACT 5445

 38269308 TGGACACCTTGGTGATCTTAGCTCATGCTCCTAGTTCCATAGTGATGAATTGACCAAACT 38269367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5446 TGGACACCTTGGTGATCTTAGCTCATGCTCCTAGTTCCATAGTGATGAATTGACCAAACT 5505

 38269368 TTTTCCCAAGGATATCTGCTAATTCTGGAG 38269397
          ||||||||||||||||||||||||||||||
     5506 TTTTCCCAAGGATATCTGCTAATTCTGGAG 5535

Alignment time is 6.30854 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38249892,38276749] =>     26858 nucs '18 dna:chromosome chromosome:GRCh37:18:1:78077248:1'
Second seq [       1,    3824] =>      3824 nucs 'mol-32-3327-062662_3824'

Score:        3641
Aligned:      3833        nucs
Identic:      3809 ( 99%) nucs =>      2322 ( 99%)      1487 (100%)
Gaps:           13 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38263906,38266242] EXCISED REGION [38266251,38267742]
 second seq =>  [       1,    2332] EXCISED REGION [    2333,    3824]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         8 nucs [38266243,38266250]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         8 nucs [38266243,38266250] to [38266251,38266258]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [38266242,38266242] to [38266251,38266251]
 second seq =>         1 nucs [2332,2332] to [2333,2333]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 38263906 TCTTTTTATTTAATCGTTCTTAAGATGGATACTTAAGTAATTGATTTTCATCTTCTAAGC 38263965
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCTTTTTATTTAATCGTTCTTAAGGTGGATACTTAAGTAATTGATTTTCATCTTCTAAGC 60

 38263966 TTTATTAGTATGTTTATTTAAAGCAATACATTTCCATATTACCATGACCTTAGCTGCAGT 38264025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTATTAGTATGTTTATTTAAAGCAATACATTTCCATATTACCATGACCTTAGCTGCAGT 120

 38264026 GTATGTATTTTGGTGTACAGTATTTTCTTTATTTTTCAATTAAAATTTGTCTTGACTTCC 38264085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTATGTATTTTGGTGTACAGTATTTTCTTTATTTTTCAATTAAAATTTGTCTTGACTTCC 180

 38264086 TCTATGATGTCTTCTATGATTCTTCCTCTATAATTCTTCTTTTGACCATATAGAAGTGTA 38264145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCTATGATGTCTTCTATGATTCTTCCTCTATAATTCTTCTTTTGACCATATAGAAGTGTA 240

 38264146 TTCATTAATTCAATCACATATAAATATTCTCCTTTTATCTTTTTGCTACTGGTTTGTTTG 38264205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTCATTAATTCAATCACATATAAATATTCTCCTTTTATCTTTTTGCTACTGGTTTGTTTG 300

 38264206 TTTAGCTACATTTAGGGAAAATTTCATTTCTGAGACGACAGAGGAAGCACATTCCATTTT 38264265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTAGCTACATTTAGGGAAAATTTCATTTCTGAGACGACAGAGGAAGCACATTCCATTTT 360

 38264266 ATTCCTTCTGCTAATGACAAAAAAAAAAAAAAATTGGAAAAAACACAAAAGCCAGAGTCA 38264325
          |||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||
      361 ATTCCTTCTGCTAATGACAAAAAAAAAAA----TTGGAAAAAACACAAAAGCCAGAGTCA 416

 38264326 AAAGACTCTGAAAAATGGAGAAAAAGTGCAGACAGGCTAAGGATTTGGGAGATTGAGGAA 38264385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      417 AAAGACTCTGAAAAATGGAGAAAAAGTGCAGACAGGCTAAGGATTTGGGAGATTGAGGAA 476

 38264386 CAACGACAGGTGAGTTCTCTGTCTTTTTTTTT-CTTTCTTTTTTGATATATATATATATA 38264444
          |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   
      477 CAACGACAGGTGAGTTCTCTGTCTTTTTTTTTTCTTTCTTTTTTGATATATATATAT--- 533

 38264445 TCAACAATCTCAATGTTTAAGAGAAGCCCTCAAGCCAGAATTTCCAACAGTTGCAGATAA 38264504
           ||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
      534 -CAACAATCTCAATGTTTAAGAGAAGCCCTCAATCCAGAATTTCCAACAGTTGCAGATAA 592

 38264505 AACATTGTGCTTGCTTAACGTATTTAACCAAAAGACCCGAAAAGCAAGGATATAAAAGAA 38264564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      593 AACATTGTGCTTGCTTAACGTATTTAACCAAAAGACCCGAAAAGCAAGGATATAAAAGAA 652

 38264565 TATTTTAATAATATCATTCTGTTCTTAAGGTGAACACTTCAAAGAAACCACACCCCTCCC 38264624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      653 TATTTTAATAATATCATTCTGTTCTTAAGGTGAACACTTCAAAGAAACCACACCCCTCCC 712

 38264625 CTCCCCAATGCGTGCTGAAGCAGTGGAATCCATGAGTGGAACCTTGTCATATATAATCTC 38264684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      713 CTCCCCAATGCGTGCTGAAGCAGTGGAATCCATGAGTGGAACCTTGTCATATATAATCTC 772

 38264685 CACACTAAATTTATAGCAAAGCCCCCATCTCTCAACCTGTGTTGAAATTCTGACTTCCAG 38264744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      773 CACACTAAATTTATAGCAAAGCCCCCATCTCTCAACCTGTGTTGAAATTCTGACTTCCAG 832

 38264745 ACACACCTTTCAGTAATGAGGAGGTACTCTTCCATGATAAACCCTGTGGGCAAAGCTTCC 38264804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      833 ACACACCTTTCAGTAATGAGGAGGTACTCTTCCATGATAAACCCTGTGGGCAAAGCTTCC 892

 38264805 ACATTCATCCCACCCCTAAAGCAATAAATTTGCACCTTTCCCAAGTAGAATCAATGGGAA 38264864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      893 ACATTCATCCCACCCCTAAAGCAATAAATTTGCACCTTTCCCAAGTAGAATCAATGGGAA 952

 38264865 GAATTTTGACTTCTATCCCCACCTGATGGTAATGAGGCAGTATCTCTCTCTTTTTCCAGA 38264924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      953 GAATTTTGACTTCTATCCCCACCTGATGGTAATGAGGCAGTATCTCTCTCTTTTTCCAGA 1012

 38264925 CAGTGTTTAAGAATTTGTTGTATAGAGCGCTATTACCTGAATAACACATTGTGGCAGAGC 38264984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1013 CAGTGTTTAAGAATTTGTTGTATAGAGCGCTATTACCTGAATAACACATTGTGGCAGAGC 1072

 38264985 AAAATAACCCTTAAGCATTTAGTTTTCAGATTTATTTTCAACTATTTAGAGGGTTATTTC 38265044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1073 AAAATAACCCTTAAGCATTTAGTTTTCAGATTTATTTTCAACTATTTAGAGGGTTATTTC 1132

 38265045 TTGACTACCACAGATAAGTCATTCCCTTCTCCATTGTTCTATAGTTTACTGCCCTTTTTT 38265104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1133 TTGACTACCACAGATAAGTCATTCCCTTCTCCATTGTTCTATAGTTTACTGCCCTTTTTT 1192

 38265105 TCTATCATGGCATTTACCCACTATTTCATATTGTTATTTATAGTTTACATGCTTAATATC 38265164
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     1193 TCTATCATGGCATTTACCCACTATTTCATATTGTTATTTTTAGTTTACATGCTTAATATC 1252

 38265165 TCCATCTCCCAACAAATATGGGAACATCATTAGGTCAGAGAAATTTTATTTCTTTTCCCT 38265224
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     1253 TCCATCTCCCAACAAATATGGGAACATCATTAGGTCAGAGAAATTTTATTTCTTTCCCCT 1312

 38265225 CTGAAGTCTCAGTATTAGTTGTTACATTAATTAGCACTTATTTAAATTTTTAGTTTTCTT 38265284
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1313 CTGAAGTCTCAGTACTAGTTGTTACATTAATTAGCACTTATTTAAATTTTTAGTTTTCTT 1372

 38265285 TTTCTTTGCCTCATGTTACTGTTACACCCTTCCACTACCAAGCTTAAAGTTAGGAATGAT 38265344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1373 TTTCTTTGCCTCATGTTACTGTTACACCCTTCCACTACCAAGCTTAAAGTTAGGAATGAT 1432

 38265345 TCATGTGACTGGAATTGAATGACTGCTCTGAGAAAGAAGTCCATAAAAGTCTGCATGCAA 38265404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1433 TCATGTGACTGGAATTGAATGACTGCTCTGAGAAAGAAGTCCATAAAAGTCTGCATGCAA 1492

 38265405 TTTGCCATGTCTCCATCCTTTCTTTGCCATAGAAACTAAAGATCTTCCAGATAGTCGAGG 38265464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1493 TTTGCCATGTCTCCATCCTTTCTTTGCCATAGAAACTAAAGATCTTCCAGATAGTCGAGG 1552

 38265465 CTCTGTTAATGTTATTTCTTGAATAACGACTATCTGAACAGAACATCTGTGACTTGGAAT 38265524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1553 CTCTGTTAATGTTATTTCTTGAATAACGACTATCTGAACAGAACATCTGTGACTTGGAAT 1612

 38265525 GGGGACATGTAGCTTGGAGAAAAAGTAAGCACACAGTGTTTTAAGTTACTGTGGTTTTAT 38265584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1613 GGGGACATGTAGCTTGGAGAAAAAGTAAGCACACAGTGTTTTAAGTTACTGTGGTTTTAT 1672

 38265585 GGTTATTTGTTACTGCAGCATAACCCACCCTGCCCTGACTTAAGTGATATAATATTTAAC 38265644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1673 GGTTATTTGTTACTGCAGCATAACCCACCCTGCCCTGACTTAAGTGATATAATATTTAAC 1732

 38265645 AAATATTTATAAAATAAATAAATTCAAATTCACTCTAATACCTAGAAAATTATCAAGTAT 38265704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1733 AAATATTTATAAAATAAATAAATTCAAATTCACTCTAATACCTAGAAAATTATCAAGTAT 1792

 38265705 AGTAAACCAAATAATAAATATTTATTAAGGAATATGGAAACAGTGACCTATGAGAAGTCT 38265764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1793 AGTAAACCAAATAATAAATATTTATTAAGGAATATGGAAACAGTGACCTATGAGAAGTCT 1852

 38265765 TGATATACTGACCATCCATTGTTGCAGCAGATCTCACTATTGCTATTGTGCTTAACATTT 38265824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1853 TGATATACTGACCATCCATTGTTGCAGCAGATCTCACTATTGCTATTGTGCTTAACATTT 1912

 38265825 CAATTACAAAAATTAAAAAAAAAAAACACCATTCATCAGTGCAGGTCTGTGTATTTAAAG 38265884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1913 CAATTACAAAAATTAAAAAAAAAAAACACCATTCATCAGTGCAGGTCTGTGTATTTAAAG 1972

 38265885 AAATAATTTACAAGTTTTTTTTTCCTTTGTAAACATATTGTTTTGAAGTGCAAATATATA 38265944
          |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1973 AAATAATTTACAAGTTTTTTTT-CCTTTGTAAACATATTGTTTTGAAGTGCAAATATATA 2031

 38265945 TAATTTGCACTTTGGGATGGAATGGAATGGGATGCCCTATTGGCAGTCCATACATCTGGA 38266004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2032 TAATTTGCACTTTGGGATGGAATGGAATGGGATGCCCTATTGGCAGTCCATACATCTGGA 2091

 38266005 TTATAAATGGATTTCCATCCCATCTTCCTCCCCATCTCTTTCCCTTTTTGATCATTCTAT 38266064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2092 TTATAAATGGATTTCCATCCCATCTTCCTCCCCATCTCTTTCCCTTTTTGATCATTCTAT 2151

 38266065 GGAAATGGAAAGCTAGCAGAAGTTTGAAGAATTGTCACGCAAACAACAACAACAA---AA 38266121
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||
     2152 GGAAATGGAAAGCTAGCAGAAGTTTGAAGAATTGTCACGCAAACAACAACAACAACAAAA 2211

 38266122 CTTTAGCATATTAACCTGTTGTCCAACCTTATATAAGCAGTTTGTATTTAAAACATCCCT 38266181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2212 CTTTAGCATATTAACCTGTTGTCCAACCTTATATAAGCAGTTTGTATTTAAAACATCCCT 2271

 38266182 AAGTGGATTTTAATTCCAGTTTCAATCATTGTTAACTATTTTTGAAATATTTAAAATCCC 38266241
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2272 AAGTGGATTTTAATTCCAATTTCAATCATTGTTAACTATTTTTGAAATATTTAAAATCCC 2331

 38266242 A 38266242
          |
     2332 A 2332

EXCISED REGION

 38266251 ACCACTATTTCTCTTCAACTAGTCCTTACTTTTATAAACAAAAAAGTAACAGTAAATAAT 38266310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2333 ACCACTATTTCTCTTCAACTAGTCCTTACTTTTATAAACAAAAAAGTAACAGTAAATAAT 2392

 38266311 TTATAACTAGGTCTCTCTGAATCTAAAAACACGTTCTTATACACTATGTGATGCCATATT 38266370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     2393 TTATAACTAGGTCTCTCTGAATCTAAAAACACATTCTTATACACTATGTGATGCCATATT 2452

 38266371 TTTTACTCTTGTCTTTGTGAGTTTTTTGTGCCATTCTCTCCTCTGGAATGGTCTTCTGTG 38266430
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2453 TTTTACTCTTGACTTTGTGAGTTTTTTGTGCCATTCTCTCCTCTGGAATGGTCTTCTGTG 2512

 38266431 CTTACACATTCCAAGGGCTACTCCATTTTACAAGAAACAGTTCATGTTTGCTACTTTGGG 38266490
          .|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2513 TTTACACATTCCAAGGGCTAATCCATTTTACAAGAAACAGTTCATGTTTGCTACTTTGGG 2572

 38266491 GTTGATCCCATGATAATTCTGGTTCTCACTTGGTCTTTCCCTGTGAGATGCAGTAGCATT 38266550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2573 GTTGATCCCATGATAATTCTGGTTCTCACTTGGTCTTTCCCTGTGAGATGCAGTAGCATT 2632

 38266551 CAAAATTCTCAGACTATTCTATGCACCTTGGCAGATTTATGGTAATGGTCTATAATTGCT 38266610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2633 CAAAATTCTCAGACTATTCTATGCACCTTGGCAGATTTATGGTAATGGTCTATAATTGCT 2692

 38266611 TCATATCTGCTAACCTTGCTTCCAAAACTAGTTTTTGAGATTAATGAGACAGGAGCTTGG 38266670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2693 TCATATCTGCTAACCTTGCTTCCAAAACTAGTTTTTGAGATTAATGAGACAGGAGCTTGG 2752

 38266671 CTTTTTCTTTCTGTATAGCTTCCATAGCAACAAGAAAATATTAGACACACAGTAGGCATT 38266730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2753 CTTTTTCTTTCTGTATAGCTTCCATAGCAACAAGAAAATATTAGACACACAGTAGGCATT 2812

 38266731 GGAAGAAAATGTGTTCAGTTAAATGAACTTGATTTGAATGGAATGAGAGTTCAATGAAAC 38266790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2813 GGAAGAAAATGTGTTCAGTTAAATGAACTTGATTTGAATGGAATGAGAGTTCAATGAAAC 2872

 38266791 TGTATATATTGTGAAACGTGGCAACTTACACCTACTCAAGACATTAAAAGAGATCATGCT 38266850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2873 TGTATATATTGTGAAACGTGGCAACTTACACCTACTCAAGACATTAAAAGAGATCATGCT 2932

 38266851 TTCTTGCCTAAGTTTTATGTCCAATTTGTTCCTGTTTCAAACCCCTCGACAAAAACAAAA 38266910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2933 TTCTTGCCTAAGTTTTATGTCCAATTTGTTCCTGTTTCAAACCCCTCGACAAAAACAAAA 2992

 38266911 TCTTTTAATCTGTTTGCAAAATATTTCCTCCTTCCTCCCATCTTGCTGTTGCTGCTCTGT 38266970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2993 TCTTTTAATCTGTTTGCAAAATATTTCCTCCTTCCTCCCATCTTGCTGTTGCTGCTCTGT 3052

 38266971 GATATACTGCCCTTGCTTATTACCCCTTTATAGCTGTTTTGTTAAAGTTCATACCGCTAA 38267030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3053 GATATACTGCCCTTGCTTATTACCCCTTTATAGCTGTTTTGTTAAAGTTCATACCGCTAA 3112

 38267031 GACCTGTAAAAGAAATTTATGGCTCTAGGGATTTCAGCAAATTCTAAATAACCATAACAG 38267090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3113 GACCTGTAAAAGAAATTTATGGCTCTAGGGATTTCAGCAAATTCTAAATAACCATAACAG 3172

 38267091 GAACAGGAAGCATTAATTAAAGACACTAGAGTCTAAGTTATAACAGAAATCCTGACATTT 38267150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3173 GAACAGGAAGCATTAATTAAAGACACTAGAGTCTAAGTTATAACAGAAATCCTGACATTT 3232

 38267151 AAGGCCCTGGTACCATTTAAATTTAAAATGGTATGACAAACAGAGAGTAATTTGATGGTC 38267210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3233 AAGGCCCTGGTACCATTTAAATTTAAAATGGTATGACAAACAGAGAGTAATTTGATGGTC 3292

 38267211 AGAAGGTTATAATGGATACCTTAATACCTTTGCCAAGAAAAAGTGTCTGTCCTTGCTCTA 38267270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3293 AGAAGGTTATAATGGATACCTTAATACCTTTGCCAAGAAAAAGTGTCTGTCCTTGCTCTA 3352

 38267271 ACCCCTACCCAGGGGCTTCAGGGGCCTCCTTCATAAAACATGGTGATGCCTAAATATTTT 38267330
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3353 ATCCCTACCCAGGGGCTTCAGGGGCCTCCTTCATAAAACATGGTGATGCCTAAATATTTT 3412

 38267331 TGCGATATCTCATATATAAGCTGGTCTTTTCTTTAAGAATACGAGAGATTAAACACCAAC 38267390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3413 TGCGATATCTCATATATAAGCTGGTCTTTTCTTTAAGAATACGAGAGATTAAACACCAAC 3472

 38267391 CCCCAACATTCATACACCAATTTTCAGATAAAACAGCTTAATATTTAAGATATATTTAGT 38267450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3473 CCCCAACATTCATACACCAATTTTCAGATAAAACAGCTTAATATTTAAGATATATTTAGT 3532

 38267451 GCAATTTGTCTATTTCTTGGTTTACTGGAGGGCTGTATTTAAAGCCAAGGGACCAAGGAA 38267510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3533 GCAATTTGTCTATTTCTTGGTTTACTGGAGGGCTGTATTTAAAGCCAAGGGACCAAGGAA 3592

 38267511 CATTCCACAACACACTAAAGCAATTTTTCCCCAGGGAATATGCTGATTCTTTCCTAAAGG 38267570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3593 CATTCCACAACACACTAAAGCAATTTTTCCCCAGGGAATATGCTGATTCTTTCCTAAAGG 3652

 38267571 CAGAAGCCGACATTCCTGACTCATTCTGCCAAACCAAGCAATGAAAAATGCTTCACCTAA 38267630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3653 CAGAAGCCGACATTCCTGACTCATTCTGCCAAACCAAGCAATGAAAAATGCTTCACCTAA 3712

 38267631 TTTGAAAGATAATTTGTAATACCAGAGACTCAACTTGTTTTGTGTATCCAATACTAGCAC 38267690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3713 TTTGAAAGATAATTTGTAATACCAGAGACTCAACTTGTTTTGTGTATCCAATACTAGCAC 3772

 38267691 CCTTTCCAGAATGTTGAAAGTACACACTGTATGATTTGTCTAATGTATATTC 38267742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3773 CCTTTCCAGAATGTTGAAAGTACACACTGTATGATTTGTCTAATGTATATTC 3824

Alignment time is 3.56961 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38249892,38276749] =>     26858 nucs '18 dna:chromosome chromosome:GRCh37:18:1:78077248:1'
Second seq [       1,    4565] =>      4565 nucs 'mol-32-3395-071494_4565'

Score:        4346
Aligned:      4573        nucs
Identic:      4545 ( 99%) nucs =>      2288 ( 99%)      2257 (100%)
Gaps:           16 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38263942,38266242] EXCISED REGION [38266251,38268514]
 second seq =>  [       1,    2298] EXCISED REGION [    2299,    4565]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         8 nucs [38266243,38266250]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         8 nucs [38266243,38266250] to [38266251,38266258]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [38266242,38266242] to [38266251,38266251]
 second seq =>         1 nucs [2298,2298] to [2299,2299]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 38263942 GTAATTGATTTTCATCTTCTAAGCTTTATTAGTATGTTTATTTAAAGCAATACATTTCCA 38264001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTAATTGATTTTCATCTTCTAAGCTTTATTAGTATGTTTATTTAAAGCAATACATTTCCA 60

 38264002 TATTACCATGACCTTAGCTGCAGTGTATGTATTTTGGTGTACAGTATTTTCTTTATTTTT 38264061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TATTACCATGACCTTAGCTGCAGTGTATGTATTTTGGTGTACAGTATTTTCTTTATTTTT 120

 38264062 CAATTAAAATTTGTCTTGACTTCCTCTATGATGTCTTCTATGATTCTTCCTCTATAATTC 38264121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAATTAAAATTTGTCTTGACTTCCTCTATGATGTCTTCTATGATTCTTCCTCTATAATTC 180

 38264122 TTCTTTTGACCATATAGAAGTGTATTCATTAATTCAATCACATATAAATATTCTCCTTTT 38264181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTCTTTTGACCATATAGAAGTGTATTCATTAATTCAATCACATATAAATATTCTCCTTTT 240

 38264182 ATCTTTTTGCTACTGGTTTGTTTGTTTAGCTACATTTAGGGAAAATTTCATTTCTGAGAC 38264241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATCTTTTTGCTACTGGTTTGTTTGTTTAGCTACATTTAGGGAAAATTTCATTTCTGAGAC 300

 38264242 GACAGAGGAAGCACATTCCATTTTATTCCTTCTGCTAATGACAAAAAAAAAAAAAAATTG 38264301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||
      301 GACAGAGGAAGCACATTCCATTTTATTCCTTCTGCTAATGACAAAAAAAAAAAA---TTG 357

 38264302 GAAAAAACACAAAAGCCAGAGTCAAAAGACTCTGAAAAATGGAGAAAAAGTGCAGACAGG 38264361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      358 GAAAAAACACAAAAGCCAGAGTCAAAAGACTCTGAAAAATGGAGAAAAAGTGCAGACAGG 417

 38264362 CTAAGGATTTGGGAGATTGAGGAACAACGACAGGTGAGTTCTCTGTCTTTTTTTTT-CTT 38264420
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
      418 CTAAGGATTTGGGAGATTGAGGAACAACGACAGGTGAGTTCTCTGTCTTTTTTTTTTCTT 477

 38264421 TCTTTTTTGATATATATATATATATCAACAATCTCAATGTTTAAGAGAAGCCCTCAAGCC 38264480
          |||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||.||
      478 TCTTTTTTGATATATATATAT----CAACAATCTCAATGTTTAAGAGAAGCCCTCAATCC 533

 38264481 AGAATTTCCAACAGTTGCAGATAAAACATTGTGCTTGCTTAACGTATTTAACCAAAAGAC 38264540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      534 AGAATTTCCAACAGTTGCAGATAAAACATTGTGCTTGCTTAACGTATTTAACCAAAAGAC 593

 38264541 CCGAAAAGCAAGGATATAAAAGAATATTTTAATAATATCATTCTGTTCTTAAGGTGAACA 38264600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      594 CCGAAAAGCAAGGATATAAAAGAATATTTTAATAATATCATTCTGTTCTTAAGGTGAACA 653

 38264601 CTTCAAAGAAACCACACCCCTCCCCTCCCCAATGCGTGCTGAAGCAGTGGAATCCATGAG 38264660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      654 CTTCAAAGAAACCACACCCCTCCCCTCCCCAATGCGTGCTGAAGCAGTGGAATCCATGAG 713

 38264661 TGGAACCTTGTCATATATAATCTCCACACTAAATTTATAGCAAAGCCCCCATCTCTCAAC 38264720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      714 TGGAACCTTGTCATATATAATCTCCACACTAAATTTATAGCAAAGCCCCCATCTCTCAAC 773

 38264721 CTGTGTTGAAATTCTGACTTCCAGACACACCTTTCAGTAATGAGGAGGTACTCTTCCATG 38264780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      774 CTGTGTTGAAATTCTGACTTCCAGACACACCTTTCAGTAATGAGGAGGTACTCTTCCATG 833

 38264781 ATAAACCCTGTGGGCAAAGCTTCCACATTCATCCCACCCCTAAAGCAATAAATTTGCACC 38264840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      834 ATAAACCCTGTGGGCAAAGCTTCCACATTCATCCCACCCCTAAAGCAATAAATTTGCACC 893

 38264841 TTTCCCAAGTAGAATCAATGGGAAGAATTTTGACTTCTATCCCCACCTGATGGTAATGAG 38264900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      894 TTTCCCAAGTAGAATCAATGGGAAGAATTTTGACTTCTATCCCCACCTGATGGTAATGAG 953

 38264901 GCAGTATCTCTCTCTTTTTCCAGACAGTGTTTAAGAATTTGTTGTATAGAGCGCTATTAC 38264960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      954 GCAGTATCTCTCTCTTTTTCCAGACAGTGTTTAAGAATTTGTTGTATAGAGCGCTATTAC 1013

 38264961 CTGAATAACACATTGTGGCAGAGCAAAATAACCCTTAAGCATTTAGTTTTCAGATTTATT 38265020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1014 CTGAATAACACATTGTGGCAGAGCAAAATAACCCTTAAGCATTTAGTTTTCAGATTTATT 1073

 38265021 TTCAACTATTTAGAGGGTTATTTCTTGACTACCACAGATAAGTCATTCCCTTCTCCATTG 38265080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1074 TTCAACTATTTAGAGGGTTATTTCTTGACTACCACAGATAAGTCATTCCCTTCTCCATTG 1133

 38265081 TTCTATAGTTTACTGCCCTTTTTTTCTATCATGGCATTTACCCACTATTTCATATTGTTA 38265140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1134 TTCTATAGTTTACTGCCCTTTTTTTCTATCATGGCATTTACCCACTATTTCATATTGTTA 1193

 38265141 TTTATAGTTTACATGCTTAATATCTCCATCTCCCAACAAATATGGGAACATCATTAGGTC 38265200
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1194 TTTTTAGTTTACATGCTTAATATCTCCATCTCCCAACAAATATGGGAACATCATTAGGTC 1253

 38265201 AGAGAAATTTTATTTCTTTTCCCTCTGAAGTCTCAGTATTAGTTGTTACATTAATTAGCA 38265260
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     1254 AGAGAAATTTTATTTCTTTCCCCTCTGAAGTCTCAGTACTAGTTGTTACATTAATTAGCA 1313

 38265261 CTTATTTAAATTTTTAGTTTTCTTTTTCTTTGCCTCATGTTACTGTTACACCCTTCCACT 38265320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1314 CTTATTTAAATTTTTAGTTTTCTTTTTCTTTGCCTCATGTTACTGTTACACCCTTCCACT 1373

 38265321 ACCAAGCTTAAAGTTAGGAATGATTCATGTGACTGGAATTGAATGACTGCTCTGAGAAAG 38265380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1374 ACCAAGCTTAAAGTTAGGAATGATTCATGTGACTGGAATTGAATGACTGCTCTGAGAAAG 1433

 38265381 AAGTCCATAAAAGTCTGCATGCAATTTGCCATGTCTCCATCCTTTCTTTGCCATAGAAAC 38265440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1434 AAGTCCATAAAAGTCTGCATGCAATTTGCCATGTCTCCATCCTTTCTTTGCCATAGAAAC 1493

 38265441 TAAAGATCTTCCAGATAGTCGAGGCTCTGTTAATGTTATTTCTTGAATAACGACTATCTG 38265500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1494 TAAAGATCTTCCAGATAGTCGAGGCTCTGTTAATGTTATTTCTTGAATAACGACTATCTG 1553

 38265501 AACAGAACATCTGTGACTTGGAATGGGGACATGTAGCTTGGAGAAAAAGTAAGCACACAG 38265560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1554 AACAGAACATCTGTGACTTGGAATGGGGACATGTAGCTTGGAGAAAAAGTAAGCACACAG 1613

 38265561 TGTTTTAAGTTACTGTGGTTTTATGGTTATTTGTTACTGCAGCATAACCCACCCTGCCCT 38265620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1614 TGTTTTAAGTTACTGTGGTTTTATGGTTATTTGTTACTGCAGCATAACCCACCCTGCCCT 1673

 38265621 GACTTAAGTGATATAATATTTAACAAATATTTATAAAATAAATAAATTCAAATTCACTCT 38265680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1674 GACTTAAGTGATATAATATTTAACAAATATTTATAAAATAAATAAATTCAAATTCACTCT 1733

 38265681 AATACCTAGAAAATTATCAAGTATAGTAAACCAAATAATAAATATTTATTAAGGAATATG 38265740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1734 AATACCTAGAAAATTATCAAGTATAGTAAACCAAATAATAAATATTTATTAAGGAATATG 1793

 38265741 GAAACAGTGACCTATGAGAAGTCTTGATATACTGACCATCCATTGTTGCAGCAGATCTCA 38265800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1794 GAAACAGTGACCTATGAGAAGTCTTGATATACTGACCATCCATTGTTGCAGCAGATCTCA 1853

 38265801 CTATTGCTATTGTGCTTAACATTTCAATTACAAAAATTAAAAAAAAAAAA-CACCATTCA 38265859
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
     1854 CTATTGCTATTGTGCTTAACATTTCAATTACAAAAATTAAAAAAAAAAAAACACCATTCA 1913

 38265860 TCAGTGCAGGTCTGTGTATTTAAAGAAATAATTTACAAGTTTTTTTTTCCTTTGTAAACA 38265919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
     1914 TCAGTGCAGGTCTGTGTATTTAAAGAAATAATTTACAAGTTTTTTTT-CCTTTGTAAACA 1972

 38265920 TATTGTTTTGAAGTGCAAATATATATAATTTGCACTTTGGGATGGAATGGAATGGGATGC 38265979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1973 TATTGTTTTGAAGTGCAAATATATATAATTTGCACTTTGGGATGGAATGGAATGGGATGC 2032

 38265980 CCTATTGGCAGTCCATACATCTGGATTATAAATGGATTTCCATCCCATCTTCCTCCCCAT 38266039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2033 CCTATTGGCAGTCCATACATCTGGATTATAAATGGATTTCCATCCCATCTTCCTCCCCAT 2092

 38266040 CTCTTTCCCTTTTTGATCATTCTATGGAAATGGAAAGCTAGCAGAAGTTTGAAGAATTGT 38266099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2093 CTCTTTCCCTTTTTGATCATTCTATGGAAATGGAAAGCTAGCAGAAGTTTGAAGAATTGT 2152

 38266100 CACGCAAACAACAACAACAA---AACTTTAGCATATTAACCTGTTGTCCAACCTTATATA 38266156
          ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2153 CACGCAAACAACAACAACAACAAAACTTTAGCATATTAACCTGTTGTCCAACCTTATATA 2212

 38266157 AGCAGTTTGTATTTAAAACATCCCTAAGTGGATTTTAATTCCAGTTTCAATCATTGTTAA 38266216
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     2213 AGCAGTTTGTATTTAAAACATCCCTAAGTGGATTTTAATTCCAATTTCAATCATTGTTAA 2272

 38266217 CTATTTTTGAAATATTTAAAATCCCA 38266242
          ||||||||||||||||||||||||||
     2273 CTATTTTTGAAATATTTAAAATCCCA 2298

EXCISED REGION

 38266251 ACCACTATTTCTCTTCAACTAGTCCTTACTTTTATAAACAAAAAAGTAACAGTAAATAAT 38266310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2299 ACCACTATTTCTCTTCAACTAGTCCTTACTTTTATAAACAAAAAAGTAACAGTAAATAAT 2358

 38266311 TTATAACTAGGTCTCTCTGAATCTAAAAACACGTTCTTATACACTATGTGATGCCATATT 38266370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     2359 TTATAACTAGGTCTCTCTGAATCTAAAAACACATTCTTATACACTATGTGATGCCATATT 2418

 38266371 TTTTACTCTTGTCTTTGTGAGTTTTTTGTGCCATTCTCTCCTCTGGAATGGTCTTCTGTG 38266430
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2419 TTTTACTCTTGACTTTGTGAGTTTTTTGTGCCATTCTCTCCTCTGGAATGGTCTTCTGTG 2478

 38266431 CTTACACATTCCAAGGGCTACTCCATTTTACAAGAAACAGTTCATGTTTGCTACTTTGGG 38266490
          .|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2479 TTTACACATTCCAAGGGCTAATCCATTTTACAAGAAACAGTTCATGTTTGCTACTTTGGG 2538

 38266491 GTTGATCCCATGATAATTCTGGTTCTCACTTGGTCTTTCCCTGTGAGATGCAGTAGCATT 38266550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2539 GTTGATCCCATGATAATTCTGGTTCTCACTTGGTCTTTCCCTGTGAGATGCAGTAGCATT 2598

 38266551 CAAAATTCTCAGACTATTCTATGCACCTTGGCAGATTTATGGTAATGGTCTATAATTGCT 38266610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2599 CAAAATTCTCAGACTATTCTATGCACCTTGGCAGATTTATGGTAATGGTCTATAATTGCT 2658

 38266611 TCATATCTGCTAACCTTGCTTCCAAAACTAGTTTTTGAGATTAATGAGACAGGAGCTTGG 38266670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2659 TCATATCTGCTAACCTTGCTTCCAAAACTAGTTTTTGAGATTAATGAGACAGGAGCTTGG 2718

 38266671 CTTTTTCTTTCTGTATAGCTTCCATAGCAACAAGAAAATATTAGACACACAGTAGGCATT 38266730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2719 CTTTTTCTTTCTGTATAGCTTCCATAGCAACAAGAAAATATTAGACACACAGTAGGCATT 2778

 38266731 GGAAGAAAATGTGTTCAGTTAAATGAACTTGATTTGAATGGAATGAGAGTTCAATGAAAC 38266790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2779 GGAAGAAAATGTGTTCAGTTAAATGAACTTGATTTGAATGGAATGAGAGTTCAATGAAAC 2838

 38266791 TGTATATATTGTGAAACGTGGCAACTTACACCTACTCAAGACATTAAAAGAGATCATGCT 38266850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2839 TGTATATATTGTGAAACGTGGCAACTTACACCTACTCAAGACATTAAAAGAGATCATGCT 2898

 38266851 TTCTTGCCTAAGTTTTATGTCCAATTTGTTCCTGTTTCAAACCCCTCGACAAAAACAAAA 38266910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2899 TTCTTGCCTAAGTTTTATGTCCAATTTGTTCCTGTTTCAAACCCCTCGACAAAAACAAAA 2958

 38266911 TCTTTTAATCTGTTTGCAAAATATTTCCTCCTTCCTCCCATCTTGCTGTTGCTGCTCTGT 38266970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2959 TCTTTTAATCTGTTTGCAAAATATTTCCTCCTTCCTCCCATCTTGCTGTTGCTGCTCTGT 3018

 38266971 GATATACTGCCCTTGCTTATTACCCCTTTATAGCTGTTTTGTTAAAGTTCATACCGCTAA 38267030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3019 GATATACTGCCCTTGCTTATTACCCCTTTATAGCTGTTTTGTTAAAGTTCATACCGCTAA 3078

 38267031 GACCTGTAAAAGAAATTTATGGCTCTAGGGATTTCAGCAAATTCTAAATAACCATAACAG 38267090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3079 GACCTGTAAAAGAAATTTATGGCTCTAGGGATTTCAGCAAATTCTAAATAACCATAACAG 3138

 38267091 GAACAGGAAGCATTAATTAAAGACACTAGAGTCTAAGTTATAACAGAAATCCTGACATTT 38267150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3139 GAACAGGAAGCATTAATTAAAGACACTAGAGTCTAAGTTATAACAGAAATCCTGACATTT 3198

 38267151 AAGGCCCTGGTACCATTTAAATTTAAAATGGTATGACAAACAGAGAGTAATTTGATGGTC 38267210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3199 AAGGCCCTGGTACCATTTAAATTTAAAATGGTATGACAAACAGAGAGTAATTTGATGGTC 3258

 38267211 AGAAGGTTATAATGGATACCTTAATACCTTTGCCAAGAAAAAGTGTCTGTCCTTGCTCTA 38267270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3259 AGAAGGTTATAATGGATACCTTAATACCTTTGCCAAGAAAAAGTGTCTGTCCTTGCTCTA 3318

 38267271 ACCCCTACCCAGGGGCTTCAGGGGCCTCCTTCATAAAACATGGTGATGCCTAAATATTTT 38267330
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3319 ATCCCTACCCAGGGGCTTCAGGGGCCTCCTTCATAAAACATGGTGATGCCTAAATATTTT 3378

 38267331 TGCGATATCTCATATATAAGCTGGTCTTTTCTTTAAGAATACGAGAGATTAAACACCAAC 38267390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3379 TGCGATATCTCATATATAAGCTGGTCTTTTCTTTAAGAATACGAGAGATTAAACACCAAC 3438

 38267391 CCCCAACATTCATACACCAATTTTCAGATAAAACAGCTTAATATTTAAGATATATTTAGT 38267450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3439 CCCCAACATTCATACACCAATTTTCAGATAAAACAGCTTAATATTTAAGATATATTTAGT 3498

 38267451 GCAATTTGTCTATTTCTTGGTTTACTGGAGGGCTGTATTTAAAGCCAAGGGACCAAGGAA 38267510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3499 GCAATTTGTCTATTTCTTGGTTTACTGGAGGGCTGTATTTAAAGCCAAGGGACCAAGGAA 3558

 38267511 CATTCCACAACACACTAAAGCAATTTTTCCCCAGGGAATATGCTGATTCTTTCCTAAAGG 38267570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3559 CATTCCACAACACACTAAAGCAATTTTTCCCCAGGGAATATGCTGATTCTTTCCTAAAGG 3618

 38267571 CAGAAGCCGACATTCCTGACTCATTCTGCCAAACCAAGCAATGAAAAATGCTTCACCTAA 38267630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3619 CAGAAGCCGACATTCCTGACTCATTCTGCCAAACCAAGCAATGAAAAATGCTTCACCTAA 3678

 38267631 TTTGAAAGATAATTTGTAATACCAGAGACTCAACTTGTTTTGTGTATCCAATACTAGCAC 38267690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3679 TTTGAAAGATAATTTGTAATACCAGAGACTCAACTTGTTTTGTGTATCCAATACTAGCAC 3738

 38267691 CCTTTCCAGAATGTTGAAAGTACACACTGTATGATTTGTCTAATGTATATTCAAAAAAGG 38267750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3739 CCTTTCCAGAATGTTGAAAGTACACACTGTATGATTTGTCTAATGTATATTCAAAAAAGG 3798

 38267751 AATACAAATTGATCCTCAAAGTTCAAATCTGCAGTACATACTCTGTGTTCTGCCCCCACC 38267810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3799 AATACAAATTGATCCTCAAAGTTCAAATCTGCAGTACATACTCTGTGTTCTGCCCCCACC 3858

 38267811 CGTACCTTCATGAATTCTTTCACCTAGCACGCAGGCTGTTTTCCCTTTGCGAAATCCCAT 38267870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3859 CGTACCTTCATGAATTCTTTCACCTAGCACGCAGGCTGTTTTCCCTTTGCGAAATCCCAT 3918

 38267871 GGTACATTTATAGTATTAATACCACTCACTTAGAATATGCCGTATTTTGTCTAATATTGC 38267930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3919 GGTACATTTATAGTATTAATACCACTCACTTAGAATATGCCGTATTTTGTCTAATATTGC 3978

 38267931 TAGATTTTGTGTGTATAATCTTATTCCTCAAGTAAATTACAAGACAAGGACTATAATTTA 38267990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3979 TAGATTTTGTGTGTATAATCTTATTCCTCAAGTAAATTACAAGACAAGGACTATAATTTA 4038

 38267991 TACATCCTCTACAACACTTGACACTGGCTTTGATTAGGCTCTTAATAAATATTTGTTGGT 38268050
          ||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     4039 TACATCCTCTACAACACTTGGCACTGGCTTTGAGTAGGCTCTTAATAAATATTTGTTGGT 4098

 38268051 TGATTAATCAGTTGACCACACTTACTAATTGCAAGGTGACATCATTTATCATTAATAAAC 38268110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4099 TGATTAATCAGTTGACCACACTTACTAATTGCAAGGTGACATCATTTATCATTAATAAAC 4158

 38268111 ATATATGTGGATTACAAAAATATCATGTGAATTTGCATATAATCATATTAATCCCAAATT 38268170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4159 ATATATGTGGATTACAAAAATATCATGTGAATTTGCATATAATCATATTAATCCCAAATT 4218

 38268171 AGCACCTGAGAGTCCAACCACCCTCTCCTTTAGGCCCTTTTCACTTTTATGTCTACTTTT 38268230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4219 AGCACCTGAGAGTCCAACCACCCTCTCCTTTAGGCCCTTTTCACTTTTATGTCTACTTTT 4278

 38268231 GCCTCACTTACAATTCCACTACTTACTTGCCTTCTTTCTCTTTTCAGCTTTGTGCTGTTA 38268290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4279 GCCTCACTTACAATTCCACTACTTACTTGCCTTCTTTCTCTTTTCAGCTTTGTGCTGTTA 4338

 38268291 TTTAATATCTCACCAGTTGTGTAATTTCAGCTCCCAAATTGAATAAGACGTTCCCCCCAG 38268350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4339 TTTAATATCTCACCAGTTGTGTAATTTCAGCTCCCAAATTGAATAAGACGTTCCCCCCAG 4398

 38268351 TGGAACCCTCACCTTGACAAATAGCCAAATAGTA---ATTATTCCTTTCAGGGGTTGAGC 38268407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||
     4399 TGGAACCCTCACCTTGACAAATAGCCAAATAGTAATTATTATTCCTTTCAGGGGTTGAGC 4458

 38268408 TATGGAATCATGCTTGCAATATCCCAGGCTTGAGTGCCTAGATATTTATGCTATACTTCC 38268467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4459 TATGGAATCATGCTTGCAATATCCCAGGCTTGAGTGCCTAGATATTTATGCTATACTTCC 4518

 38268468 CTGTGTCGGAGTTTCCATCTGCGATTGTATTTCAAGCCCTCTCATTT 38268514
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4519 CTGTGTCGGAGTTTCCATCTGCGATTGTATTTCAAGCCCTCTCATTT 4565

Alignment time is 5.14398 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38249892,38276749] =>     26858 nucs '18 dna:chromosome chromosome:GRCh37:18:1:78077248:1'
Second seq [       1,    3481] =>      3481 nucs 'mol-32-33a0-070216_3481'

Score:        3357
Aligned:      3482        nucs
Identic:      3469 (100%) nucs =>       354 (100%)      3115 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38259539,38259892] EXCISED REGION [38266750,38269874]
 second seq =>  [       1,     354] EXCISED REGION [     355,    3481]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6857 nucs [38259893,38266749]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [38259893,38259893] to [38266750,38266750]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [38259893,38259893] to [38266749,38266749]
 second seq =>         0 nucs

 38259539 TTCCCAATCATATAGCAGTGATGCTCACCAGTTAACAAGAACTGAAGACACATGACAGAT 38259598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTCCCAATCATATAGCAGTGATGCTCACCAGTTAACAAGAACTGAAGACACATGACAGAT 60

 38259599 TCCAATCAGTGATTTATTACCACTGTCAAATAAGAATGGACACTCAAAGATTACCTGAAA 38259658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCCAATCAGTGATTTATTACCACTGTCAAATAAGAATGGACACTCAAAGATTACCTGAAA 120

 38259659 AAGTCCTTTAATATGGCCCCAGATTGAATAATTCCTAATTTCCTATATCATAAATTCAAA 38259718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAGTCCTTTAATATGGCCCCAGATTGAATAATTCCTAATTTCCTATATCATAAATTCAAA 180

 38259719 AATTATCTAAAATTCAGTGAAATTAGTCCATATTATCAATGCCAACCTTACACATAAACA 38259778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AATTATCTAAAATTCAGTGAAATTAGTCCATATTATCAATGCCAACCTTACACATAAACA 240

 38259779 GAGTTGACATTCTCTTATGATGCTGAACAATGCAGATGAAGAACGCTGGCTTTGGATTAA 38259838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GAGTTGACATTCTCTTATGATGCTGAACAATGCAGATGAAGAACGCTGGCTTTGGATTAA 300

 38259839 GAAGACCCTTAGTTTGAATTTTAATTTTGACCCATGATAGCTGTGTAAACTTAG 38259892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GAAGACCCTTAGTTTGAATTTTAATTTTGACCCATGATAGCTGTGTAAACTTAG 354

EXCISED REGION

 38266750 TAAATGAACTTGATTTGAATGGAATGAGAGTTCAATGAAACTGTATATATTGTGAAACGT 38266809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      355 TAAATGAACTTGATTTGAATGGAATGAGAGTTCAATGAAACTGTATATATTGTGAAACGT 414

 38266810 GGCAACTTACACCTACTCAAGACATTAAAAGAGATCATGCTTTCTTGCCTAAGTTTTATG 38266869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      415 GGCAACTTACACCTACTCAAGACATTAAAAGAGATCATGCTTTCTTGCCTAAGTTTTATG 474

 38266870 TCCAATTTGTTCCTGTTTCAAACCCCTCGACAAAAACAAAATCTTTTAATCTGTTTGCAA 38266929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      475 TCCAATTTGTTCCTGTTTCAAACCCCTCGACAAAAACAAAATCTTTTAATCTGTTTGCAA 534

 38266930 AATATTTCCTCCTTCCTCCCATCTTGCTGTTGCTGCTCTGTGATATACTGCCCTTGCTTA 38266989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      535 AATATTTCCTCCTTCCTCCCATCTTGCTGTTGCTGCTCTGTGATATACTGCCCTTGCTTA 594

 38266990 TTACCCCTTTATAGCTGTTTTGTTAAAGTTCATACCGCTAAGACCTGTAAAAGAAATTTA 38267049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      595 TTACCCCTTTATAGCTGTTTTGTTAAAGTTCATACCGCTAAGACCTGTAAAAGAAATTTA 654

 38267050 TGGCTCTAGGGATTTCAGCAAATTCTAAATAACCATAACAGGAACAGGAAGCATTAATTA 38267109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      655 TGGCTCTAGGGATTTCAGCAAATTCTAAATAACCATAACAGGAACAGGAAGCATTAATTA 714

 38267110 AAGACACTAGAGTCTAAGTTATAACAGAAATCCTGACATTTAAGGCCCTGGTACCATTTA 38267169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      715 AAGACACTAGAGTCTAAGTTATAACAGAAATCCTGACATTTAAGGCCCTGGTACCATTTA 774

 38267170 AATTTAAAATGGTATGACAAACAGAGAGTAATTTGATGGTCAGAAGGTTATAATGGATAC 38267229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      775 AATTTAAAATGGTATGACAAACAGAGAGTAATTTGATGGTCAGAAGGTTATAATGGATAC 834

 38267230 CTTAATACCTTTGCCAAGAAAAAGTGTCTGTCCTTGCTCTAACCCCTACCCAGGGGCTTC 38267289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
      835 CTTAATACCTTTGCCAAGAAAAAGTGTCTGTCCTTGCTCTAATCCCTACCCAGGGGCTTC 894

 38267290 AGGGGCCTCCTTCATAAAACATGGTGATGCCTAAATATTTTTGCGATATCTCATATATAA 38267349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      895 AGGGGCCTCCTTCATAAAACATGGTGATGCCTAAATATTTTTGCGATATCTCATATATAA 954

 38267350 GCTGGTCTTTTCTTTAAGAATACGAGAGATTAAACACCAACCCCCAACATTCATACACCA 38267409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      955 GCTGGTCTTTTCTTTAAGAATACGAGAGATTAAACACCAACCCCCAACATTCATACACCA 1014

 38267410 ATTTTCAGATAAAACAGCTTAATATTTAAGATATATTTAGTGCAATTTGTCTATTTCTTG 38267469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1015 ATTTTCAGATAAAACAGCTTAATATTTAAGATATATTTAGTGCAATTTGTCTATTTCTTG 1074

 38267470 GTTTACTGGAGGGCTGTATTTAAAGCCAAGGGACCAAGGAACATTCCACAACACACTAAA 38267529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1075 GTTTACTGGAGGGCTGTATTTAAAGCCAAGGGACCAAGGAACATTCCACAACACACTAAA 1134

 38267530 GCAATTTTTCCCCAGGGAATATGCTGATTCTTTCCTAAAGGCAGAAGCCGACATTCCTGA 38267589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1135 GCAATTTTTCCCCAGGGAATATGCTGATTCTTTCCTAAAGGCAGAAGCCGACATTCCTGA 1194

 38267590 CTCATTCTGCCAAACCAAGCAATGAAAAATGCTTCACCTAATTTGAAAGATAATTTGTAA 38267649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1195 CTCATTCTGCCAAACCAAGCAATGAAAAATGCTTCACCTAATTTGAAAGATAATTTGTAA 1254

 38267650 TACCAGAGACTCAACTTGTTTTGTGTATCCAATACTAGCACCCTTTCCAGAATGTTGAAA 38267709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1255 TACCAGAGACTCAACTTGTTTTGTGTATCCAATACTAGCACCCTTTCCAGAATGTTGAAA 1314

 38267710 GTACACACTGTATGATTTGTCTAATGTATATTCAAAAAAGGAATACAAATTGATCCTCAA 38267769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1315 GTACACACTGTATGATTTGTCTAATGTATATTCAAAAAAGGAATACAAATTGATCCTCAA 1374

 38267770 AGTTCAAATCTGCAGTACATACTCTGTGTTCTGCCCCCACCCGTACCTTCATGAATTCTT 38267829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1375 AGTTCAAATCTGCAGTACATACTCTGTGTTCTGCCCCCACCCGTACCTTCATGAATTCTT 1434

 38267830 TCACCTAGCACGCAGGCTGTTTTCCCTTTGCGAAATCCCATGGTACATTTATAGTATTAA 38267889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1435 TCACCTAGCACGCAGGCTGTTTTCCCTTTGCGAAATCCCATGGTACATTTATAGTATTAA 1494

 38267890 TACCACTCACTTAGAATATGCCGTATTTTGTCTAATATTGCTAGATTTTGTGTGTATAAT 38267949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1495 TACCACTCACTTAGAATATGCCGTATTTTGTCTAATATTGCTAGATTTTGTGTGTATAAT 1554

 38267950 CTTATTCCTCAAGTAAATTACAAGACAAGGACTATAATTTATACATCCTCTACAACACTT 38268009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1555 CTTATTCCTCAAGTAAATTACAAGACAAGGACTATAATTTATACATCCTCTACAACACTT 1614

 38268010 GACACTGGCTTTGATTAGGCTCTTAATAAATATTTGTTGGTTGATTAATCAGTTGACCAC 38268069
          |.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1615 GGCACTGGCTTTGAGTAGGCTCTTAATAAATATTTGTTGGTTGATTAATCAGTTGACCAC 1674

 38268070 ACTTACTAATTGCAAGGTGACATCATTTATCATTAATAAACATATATGTGGATTACAAAA 38268129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1675 ACTTACTAATTGCAAGGTGACATCATTTATCATTAATAAACATATATGTGGATTACAAAA 1734

 38268130 ATATCATGTGAATTTGCATATAATCATATTAATCCCAAATTAGCACCTGAGAGTCCAACC 38268189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1735 ATATCATGTGAATTTGCATATAATCATATTAATCCCAAATTAGCACCTGAGAGTCCAACC 1794

 38268190 ACCCTCTCCTTTAGGCCCTTTTCACTTTTATGTCTACTTTTGCCTCACTTACAATTCCAC 38268249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1795 ACCCTCTCCTTTAGGCCCTTTTCACTTTTATGTCTACTTTTGCCTCACTTACAATTCCAC 1854

 38268250 TACTTACTTGCCTTCTTTCTCTTTTCAGCTTTGTGCTGTTATTTAATATCTCACCAGTTG 38268309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1855 TACTTACTTGCCTTCTTTCTCTTTTCAGCTTTGTGCTGTTATTTAATATCTCACCAGTTG 1914

 38268310 TGTAATTTCAGCTCCCAAATTGAATAAGACGTTCCCCCCAGTGGAACCCTCACCTTGACA 38268369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1915 TGTAATTTCAGCTCCCAAATTGAATAAGACGTTCCCCCCAGTGGAACCCTCACCTTGACA 1974

 38268370 AATAGCCAAATAGTA---ATTATTCCTTTCAGGGGTTGAGCTATGGAATCATGCTTGCAA 38268426
          |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1975 AATAGCCAAATAGTAATTATTATTCCTTTCAGGGGTTGAGCTATGGAATCATGCTTGCAA 2034

 38268427 TATCCCAGGCTTGAGTGCCTAGATATTTATGCTATACTTCCCTGTGTCGGAGTTTCCATC 38268486
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     2035 TATCCCAGGCTTGAGTGCCTAGATATTTATACTATACTTCCCTGTGTCGGAGTTTCCATC 2094

 38268487 TGCGATTGTATTTCAAGCCCTCTCATTTTTTTTTTCAATATGATTAAGATAATTCCTTTA 38268546
          ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2095 TGCGATTGTATTTCAAGCCCTCTCA-TTTTTTTTTCAATATGATTAAGATAATTCCTTTA 2153

 38268547 TGAAGTTGGAAACTCAGACATTCAGAAAGAAACTTGACGTTTCATATTTTTGCTAACTTG 38268606
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2154 TGAAGCTGGAAACTCAGACATTCAGAAAGAAACTTGACGTTTCATATTTTTGCTAACTTG 2213

 38268607 CTCTTCCCATTTCCTTTCCTATCATTTTAGCCAGACTGAGGGAGAATTAATTTTGCAATG 38268666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     2214 CTCTTCCCATTTCCTTTCCTATCATTTTAGCCAGACTGAGGGAGAATTAATTTTGCAACG 2273

 38268667 GTCTCTATTTTTTTTTCCAAATGTGTGACCTCCATATTAATAGGAGCCAGAGTACTCATT 38268726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2274 GTCTCTATTTTTTTTTCCAAATGTGTGACCTCCATATTAATAGGAGCCAGAGTACTCATT 2333

 38268727 CATCACATCTGGTCAGTGTGAAACTGACATTTACAGGGTGGAATGTTTCCCACTCAGGAC 38268786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2334 CATCACATCTGGTCAGTGTGAAACTGACATTTACAGGGTGGAATGTTTCCCACTCAGGAC 2393

 38268787 AAATGGGGATCATTTGTAAAACATGCCGCACCCAATCATAGGTTCCCATGGATCTCCAAC 38268846
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     2394 AAATGGGGATCATTTGTAAAACATGCCACACCCAATCATAGGTTCCCATGGATCTCCAAC 2453

 38268847 TACATTTTTAAGCAACAATATAAACCATTCCCGAAACTGAAAGGTCTTTTCAAATATTTA 38268906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2454 TACATTTTTAAGCAACAATATAAACCATTCCCGAAACTGAAAGGTCTTTTCAAATATTTA 2513

 38268907 CTGCCTACCTATGGAATTTTTATTCTGCTTGCTGCTGCCATCAATAATCCTGGGAGTTCC 38268966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2514 CTGCCTACCTATGGAATTTTTATTCTGCTTGCTGCTGCCATCAATAATCCTGGGAGTTCC 2573

 38268967 TAGCTAAGTGTTGTGTATGACCTCCAAGGAAAGTCTTAGCATTGCAGAATGGGGAGGCGG 38269026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2574 TAGCTAAGTGTTGTGTATGACCTCCAAGGAAAGTCTTAGCATTGCAGAATGGGGAGGCGG 2633

 38269027 GTTAGTATCCTGCATTTTTCATTCTGTCACTTTCTAGGGACAATTACAAAGAAAATAATC 38269086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2634 GTTAGTATCCTGCATTTTTCATTCTGTCACTTTCTAGGGACAATTACAAAGAAAATAATC 2693

 38269087 ATATAAGACTTATTTTTATGTTTATTATGAAAGCCTTCAGCTCTTGCATTTGCAAGTAAG 38269146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2694 ATATAAGACTTATTTTTATGTTTATTATGAAAGCCTTCAGCTCTTGCATTTGCAAGTAAG 2753

 38269147 CTCAATGATTTTAAGTTTGCTTTTTCCCCCATGAAATGAAATATTATTTCCCACTTCTTC 38269206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2754 CTCAATGATTTTAAGTTTGCTTTTTCCCCCATGAAATGAAATATTATTTCCCACTTCTTC 2813

 38269207 CATGAATCTATTGGGTAACTCCAGGCCACTGTGATCTTTCATCTGGCATTTTGCTTTTAT 38269266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2814 CATGAATCTATTGGGTAACTCCAGGCCACTGTGATCTTTCATCTGGCATTTTGCTTTTAT 2873

 38269267 TTTTCTAGATCACAGTTGTGATTTAAAGCCCTCCTGGCACTTGGACACCTTGGTGATCTT 38269326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2874 TTTTCTAGATCACAGTTGTGATTTAAAGCCCTCCTGGCACTTGGACACCTTGGTGATCTT 2933

 38269327 AGCTCATGCTCCTAGTTCCATAGTGATGAATTGACCAAACTTTTTCCCAAGGATATCTGC 38269386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2934 AGCTCATGCTCCTAGTTCCATAGTGATGAATTGACCAAACTTTTTCCCAAGGATATCTGC 2993

 38269387 TAATTCTGGAGTTTCTGCTTTCTTATTATCTGTTCTGTCTTTTGGTTCTGTATTGATATA 38269446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2994 TAATTCTGGAGTTTCTGCTTTCTTATTATCTGTTCTGTCTTTTGGTTCTGTATTGATATA 3053

 38269447 ACAAGCTTTGTCCCCTTATCAATGAGGGCACAAAATGCAGCACTTCAAATAATTTCTGCA 38269506
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||
     3054 ACAAGCTTTGTCCCCTTATCAATGAGGGCACAAAATGAAGCACTTCAAATAGTTTCTGCA 3113

 38269507 AAAATTTACAGTTGCTGCATTAAGAATTTTGTGAGCTTCAATAATGTTATTGAAAAGTTG 38269566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3114 AAAATTTACAGTTGCTGCATTAAGAATTTTGTGAGCTTCAATAATGTTATTGAAAAGTTG 3173

 38269567 CAGATTCCCTCCTCCTTCTTTTTCTCCTTTCCTCCTCTTTCTGCCCTGTCTCCCCTTCAT 38269626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3174 CAGATTCCCTCCTCCTTCTTTTTCTCCTTTCCTCCTCTTTCTGCCCTGTCTCCCCTTCAT 3233

 38269627 TATTCTCCTCTTCTTCTCAAAAGCAAACAATCATTTTTCTTGCCTACTGAAGAATACTTG 38269686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3234 TATTCTCCTCTTCTTCTCAAAAGCAAACAATCATTTTTCTTGCCTACTGAAGAATACTTG 3293

 38269687 TAATGTTATTCTCAAAACCTGGACACCAGCTCAACTCCTTCTTTGTTCTACAAGTATTCA 38269746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3294 TAATGTTATTCTCAAAACCTGGACACCAGCTCAACTCCTTCTTTGTTCTACAAGTATTCA 3353

 38269747 CCCACCCTAATAGGGAGTTTATTCCAATGAAAAGACTGTGTTCCTCCTCAGAGGAATTTA 38269806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3354 CCCACCCTAATAGGGAGTTTATTCCAATGAAAAGACTGTGTTCCTCCTCAGAGGAATTTA 3413

 38269807 TGAGGTGGTAAGAGAGTAGAATTGCATTAATCTTATGCCATTCCTAGAGAATTCTTATTT 38269866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3414 TGAGGTGGTAAGAGAGTAGAATTGCATTAATCTTATGCCATTCCTAGAGAATTCTTATTT 3473

 38269867 CCTCAATT 38269874
          ||||||||
     3474 CCTCAATT 3481

Alignment time is 4.11041 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38249892,38276749] =>     26858 nucs '18 dna:chromosome chromosome:GRCh37:18:1:78077248:1'
Second seq [       1,    7075] =>      7075 nucs 'mol-32-33b6-047591_7075'

Score:        6767
Aligned:      7070        nucs
Identic:      7040 (100%) nucs =>       894 (100%)      6146 (100%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38255996,38256892] EXCISED REGION [38256901,38263071]
 second seq =>  [       1,     896] EXCISED REGION [     905,    7075]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         8 nucs [38256893,38256900]
 second seq =>         8 nucs [897,904]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [38256893,38256894] to [38256901,38256902]
 second seq =>         1 nucs [896,896] to [904,904]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [897,898] to [903,904]

 38255996 AATTTTCCTATTTATACACACTGTGAATAATATCAAAATATTTAATAAATAGATATTAAT 38256055
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AATTTTCCTATTTATACACACTCTGAATAATATCAAAATATTTAATAAATAGATATTAAT 60

 38256056 ACAATTCTTATAGAATTTTCATGAAAAGACAGCTATTCATAGTAGTGTTTTTTTTCCCTT 38256115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACAATTCTTATAGAATTTTCATGAAAAGACAGCTATTCATAGTAGTGTTTTTTTTCCCTT 120

 38256116 AAATTTGTACCTAAAGTTTTTTTGAAACAATGAGAAGATGCTAGTCATGATCTTCAGAAG 38256175
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAATTTGTACCCAAAGTTTTTTTGAAACAATGAGAAGATGCTAGTCATGATCTTCAGAAG 180

 38256176 AGTTTTATTTTATCCTAAGTTTATCATTAAAAAGTAATTCTTAGTAAGATAAAGTATATA 38256235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGTTTTATTTTATCCTAAGTTTATCATTAAAAAGTAATTCTTAGTAAGATAAAGTATATA 240

 38256236 ATGATATAATTAAAATTTAAAATCAGAATTATTAAATCTCAAAATTTGGAAGAATCACAC 38256295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATGATATAATTAAAATTTAAAATCAGAATTATTAAATCTCAAAATTTGGAAGAATCACAC 300

 38256296 CAGTCATTTAGACCAATCTCACTGCCTTTGTTTCTACCAAACACTAGTTACTATGTTTAG 38256355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CAGTCATTTAGACCAATCTCACTGCCTTTGTTTCTACCAAACACTAGTTACTATGTTTAG 360

 38256356 TATTAATATATTCAACACCTATATGGATCCAATTTCTAGACTCTCACTTTGACATCTTCT 38256415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TATTAATATATTCAACACCTATATGGATCCAATTTCTAGACTCTCACTTTGACATCTTCT 420

 38256416 TCTATCATGAACATTTCTTCCACTCAGCTCCATTTATTTACTCCTATGGCCACTGCCGAA 38256475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCTATCATGAACATTTCTTCCACTCAGCTCCATTTATTTACTCCTATGGCCACTGCCGAA 480

 38256476 ACTTTACCAGCACCGGAAACTACATCTTAATGTCAGGGAACCAGTATCCACTTGTCTAGA 38256535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACTTTACCAGCACCGGAAACTACATCTTAATGTCAGGGAACCAGTATCCACTTGTCTAGA 540

 38256536 ATGACATCTTATCCTTGCAACTCACTTGATCTAAGATCTGCTCTGGAATTGTTTTTCAAC 38256595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATGACATCTTATCCTTGCAACTCACTTGATCTAAGATCTGCTCTGGAATTGTTTTTCAAC 600

 38256596 TTATCAAGAGCCCCAATTTACTTCTCTCTTTATATCAATCACCCCTCCACCACTCTGTTT 38256655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTATCAAGAGCCCCAATTTACTTCTCTCTTTATATCAATCACCCCTCCACCACTCTGTTT 660

 38256656 TATCTCCATAATTATTGTCCTCATATGCTGTAGTTAGTAAATACAAACTTCAGTGTCTTT 38256715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TATCTCCATAATTATTGTCCTCATATGCTGTAGTTAGTAAATACAAACTTCAGTGTCTTT 720

 38256716 CTCTGAAATCATTGTACTACCAGATAAAACCACACCCTTATATGCAATCAACTACTGGCT 38256775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTCTGAAATCATTGTACTACCAGATAAAACCACACCCTTATATGCAATCAACTACTGGCT 780

 38256776 TTTTTTTTTTTTTAATCTTTGCACACATGCTCAGTGGAGACTGCTTGTGATTGTGCCTTA 38256835
          |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTTTTTTTTTTT-AATCTTTGCACACATGCTCAGTGGAGACTGCTTGTGATTGTGCCTTA 839

 38256836 CTGAGGCAGATGATGATTCAGACAAGTTACTCTATTACTCATAGAACCAACTTCAAA 38256892
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 CTGAGGCAGATGATGATTCAGACAAGTTACTCTATTACTCATAGAACCAACTTCAAA 896

EXCISED REGION

 38256901 TAACTCTACACAACAATACTATCTCACTATATTTTAAAAAATTATCCTCTCATTACCAGT 38256960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      905 TAACTCTACACAACAATACTATCTCACTATATTTTAAAAAATTATCCTCTCATTACCAGT 964

 38256961 AATACTTTAGCATCTTCCCCACTCCCTTCAACCTCAACAACCTGGATAACTAGTATGAAG 38257020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      965 AATACTTTAGCATCTTCCCCACTCCCTTCAACCTCAACAACCTGGATAACTAGTATGAAG 1024

 38257021 GGCTTTACTGACAAAATGGAAGCCATGAAACAGAAATTCATCCTACCACCACCTTCTGTA 38257080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1025 GGCTTTACTGACAAAATGGAAGCCATGAAACAGAAATTCATCCTACCACCACCTTCTGTA 1084

 38257081 TCTCATTTCTTCTTGTTTCTCCTTTTTGCAGCAGAGAATGTGACCCTGCGGTCCCCTGAA 38257140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1085 TCTCATTTCTTCTTGTTTCTCCTTTTTGCAGCAGAGAATGTGACCCTGCGGTCCCCTGAA 1144

 38257141 GTCAGTTTCTCCAAACGTGGACTTTACTTTCTCAACACATTTGTTCCTTCAGTTATTCCC 38257200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1145 GTCAGTTTCTCCAAACGTGGACTTTACTTTCTCAACACATTTGTTCCTTCAGTTATTCCC 1204

 38257201 ACTGTAGCAACTTTGTCTCTGTCTCTCAATTAGATAATTCCTACTGACAAATAGGCTATA 38257260
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     1205 ACTGTAGCAACTTTGTCTCTGTCTCTCAACTAGATAATTCCTACTGACAAATAGGCTATA 1264

 38257261 ACACCTCACATCTTTAAAAGAATACACATTTCATGTAATTGCTGTCTGCACCAGTATCTC 38257320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1265 ACACCTCACATCTTTAAAAGAATACACATTTCATGTAATTGCTGTCTGCACCAGTATCTC 1324

 38257321 CAATTCTTTATCTCCTATTATCTTTGTCAACCCTCTCCAGCCTGCCTACTGTTCCCACTA 38257380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1325 CAATTCTTTATCTCCTATTATCTTTGTCAACCCTCTCCAGCCTGCCTACTGTTCCCACTA 1384

 38257381 CCCTACTCAATTCCTCCCGCCAAGGCATTGTTGGTCCTTACCTTTCAAAACTTTTTTTTG 38257440
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1385 CTCTACTCAATTCCTCCCGCCAAGGCATTGTTGGTCCTTACCTTTCAAAACTTTTTTTTG 1444

 38257441 TTTTTGTTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGAT 38257500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1445 TTTTTGTTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGAT 1504

 38257501 CTCTGCTTACTGCAACCTCCACCTCACCAGTTCAAGTGATTCACTAGTCTGAGCCTCCTG 38257560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1505 CTCTGCTTACTGCAACCTCCACCTCACCAGTTCAAGTGATTCACTAGTCTGAGCCTCCTG 1564

 38257561 AGTAGCTGGGACTACAGACACATGCCACCATGCCCGGCTAATTTTTGCATTTTTAGTAGA 38257620
          |||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     1565 AGTAGCTGGGACTACAGGCACATGCCACCATGCTCGGCTAATTTTTGCATTTTTAGTAGA 1624

 38257621 GACGAGGTTTCACCATGCTGGTCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCGTGATCCGCTTG 38257680
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     1625 GACGAGGTTTCACCATGCTGGTCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCGTGATCCGCCTG 1684

 38257681 CCTTGGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACCGGCGTGAGCCACTGCGCCCATAGAAAAGATT 38257740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1685 CCTTGGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACCGGCGTGAGCCACTGCGCCCATAGAAAAGATT 1744

 38257741 AGTTCTTTCTGAACTTTTAAACACCATTCAGCAGTGTTCACCATTCTCTCTAACTTAAAA 38257800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1745 AGTTCTTTCTGAACTTTTAAACACCATTCAGCAGTGTTCACCATTCTCTCTAACTTAAAA 1804

 38257801 CACTGTCCCTCATAACATATTTAAAAAATTCTATTTCTTACTGTTATTTCTCAGATTCTT 38257860
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     1805 CACTGTCCCTCATAACATATTTAAAAAATTATATTTCTTACTGTTATTTCTCAGATTCTT 1864

 38257861 GTATAGGCCACAGTTCTTTCAGTAGAACTCTAACCAATTTCCGTACATGTAAGTATCATA 38257920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     1865 GTATAGGCCACAGTTCTTTCAGTAGAACTCTAACCAATTTCCATACATGTAAGTATCATA 1924

 38257921 AATATACTAATGACTCTGAACATTATATATCTTGCCTCATGCATGAATACCCAAATGTTT 38257980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1925 AATATACTAATGACTCTGAACATTATATATCTTGCCTCATGCATGAATACCCAAATGTTT 1984

 38257981 TCCTGTAATCACAAAATGAACATCTCAAAGTGACCACAAATTTGACATGTTCCGAAGTAA 38258040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1985 TCCTGTAATCACAAAATGAACATCTCAAAGTGACCACAAATTTGACATGTTCCGAAGTAA 2044

 38258041 TTAAATTTTGATATTCTCTGCCAAAAGCTGCTCTAGAAATTTTGCCACTCCTTCTTCATC 38258100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2045 TTAAATTTTGATATTCTCTGCCAAAAGCTGCTCTAGAAATTTTGCCACTCCTTCTTCATC 2104

 38258101 TTAGAAAATGCTATTATTCTCCACCAAAGGCAAATAACCAAGAGTCATTACTAGAAAATT 38258160
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2105 TTAGAAAATGCTATCATTCTCCACCAAAGGCAAATAACCAAGAGTCATTACTAGAAAATT 2164

 38258161 TGTCTCCTTTACCACTCATGCCCAATATAGATCAAATTCTTTAAGATCTTTTCCTCAATA 38258220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2165 TGTCTCCTTTACCACTCATGCCCAATATAGATCAAATTCTTTAAGATCTTTTCCTCAATA 2224

 38258221 AACCTCAAGTCTGTCACCTTTTCTATTACCACATTTTTTCTAAGTCTCAATCATCTCTCA 38258280
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2225 AATCTCAAGTCTGTCACCTTTTCTATTACCACATTTTTTCTAAGTCTCAATCATCTCTCA 2284

 38258281 ATTAGATCATTATAGTAATCTTCTAAGTGGTGTTGGGGTGTCGTCTCCCGGCTACTTCAA 38258340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2285 ATTAGATCATTATAGTAATCTTCTAAGTGGTGTTGGGGTGTCGTCTCCCGGCTACTTCAA 2344

 38258341 TCCATTTTCCAATATTAAGTTTATTTGTTTAATTAAACATGTTAACTTGTGGTGCTCTTA 38258400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2345 TCCATTTTCCAATATTAAGTTTATTTGTTTAATTAAACATGTTAACTTGTGGTGCTCTTA 2404

 38258401 TGCTTAAAAAGTTTCATTAGCTTTCTATTTATATAATGAATGAAACCAATGTTTAGCCTA 38258460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2405 TGCTTAAAAAGTTTCATTAGCTTTCTATTTATATAATGAATGAAACCAATGTTTAGCCTA 2464

 38258461 GTTTAAGAAATGTAAGAACTCCTTTTACCCTAGCTTTCTTCCTGTTTACTTTTATTCATC 38258520
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2465 GTTTAAGAAATGTAAGAACTCCCTTTACCCTAGCTTTCTTCCTGTTTACTTTTATTCATC 2524

 38258521 ATGCCTTGAATCATACCTATCTTCTTTAATTTTCTCTAACACAAAATCCTCCTGTTTCTT 38258580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2525 ATGCCTTGAATCATACCTATCTTCTTTAATTTTCTCTAACACAAAATCCTCCTGTTTCTT 2584

 38258581 CTTTGCAATCCTGCAAACCCAAACCCAGCAGCTAGTAAATATTCAATATATATGAATTAA 38258640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2585 CTTTGCAATCCTGCAAACCCAAACCCAGCAGCTAGTAAATATTCAATATATATGAATTAA 2644

 38258641 TTAATTGATGAATGAGTGATTTTATTTCAGATTGCTATCAAATGCTCAATTCCCCTGCAT 38258700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2645 TTAATTGATGAATGAGTGATTTTATTTCAGATTGCTATCAAATGCTCAATTCCCCTGCAT 2704

 38258701 AGTATCTCCAATGAGTCAAATCCTGGAATTCCCTATAGGAACACCTGGGATATATAGTAT 38258760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2705 AGTATCTCCAATGAGTCAAATCCTGGAATTCCCTATAGGAACACCTGGGATATATAGTAT 2764

 38258761 CAACTTACAAATACCATTCTTTCTTAATTTTGAAAGAAAAACTGAGTAAAATATGAGAGC 38258820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2765 CAACTTACAAATACCATTCTTTCTTAATTTTGAAAGAAAAACTGAGTAAAATATGAGAGC 2824

 38258821 TGTAGCTTTTAAAAAAAATAGAAAATACACCATAAAAATTTTAGTCAAGCATGGCAGACT 38258880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2825 TGTAGCTTTTAAAAAAAATAGAAAATACACCATAAAAATTTTAGTCAAGCATGGCAGACT 2884

 38258881 AAATACATGTATTTATTTCTAATCTACTTCAAGCTCCAATATAATAACTGTTTACAAATG 38258940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2885 AAATACATGTATTTATTTCTAATCTACTTCAAGCTCCAATATAATAACTGTTTACAAATG 2944

 38258941 AAATGGTCTAATATCACAAGTTCAAAATTAATAAGAGTGGATGAGACATGCCAACAAATT 38259000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2945 AAATGGTCTAATATCACAAGTTCAAAATTAATAAGAGTGGATGAGACATGCCAACAAATT 3004

 38259001 TTTGGAATGTAAAAATAGATAAGACATTGTTAATGATTTGACAAAGCACAAAGCCTTAAA 38259060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3005 TTTGGAATGTAAAAATAGATAAGACATTGTTAATGATTTGACAAAGCACAAAGCCTTAAA 3064

 38259061 ATATTTCTGTATAGAGAGAAGTTTCCAAAGTAGGGCAACTCAGAGATAAATCAAGAATGG 38259120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3065 ATATTTCTGTATAGAGAGAAGTTTCCAAAGTAGGGCAACTCAGAGATAAATCAAGAATGG 3124

 38259121 GAAGATTCACACACCTCAACTGTAAAAGAGAAATATGAGACTAAAAGCAGTGGATTAATT 38259180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     3125 GAAGATTCACACACCTCAACTGTAAAAGAGAAATATGAGACTAAAAGCAGTGGATTCATT 3184

 38259181 AAAACTTTGTTTGATGAGATATTATACATAGATGTCTTCTCCATCATTCCAAGCACTTAA 38259240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3185 AAAACTTTGTTTGATGAGATATTATACATAGATGTCTTCTCCATCATTCCAAGCACTTAA 3244

 38259241 GCAGCTGCCCTTTCCAAACACTCATAGAGGATAAGAGATTATTTTCTATAAAAATCAAAC 38259300
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3245 GCAGCTGCCCTTTACAAACACTCATAGAGGATAAGAGATTATTTTCTATAAAAATCAAAC 3304

 38259301 CAGATTGTTG--TGTACATCAAGCAAAGGAGGGATGGCAGGGAGGTGATATACTGAAACA 38259358
          ||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3305 CAGATTGT--CATGTACATCAAGCAAAGGAGGGATGGCAGGGAGGTGATATACTGAAACA 3362

 38259359 GAATTACTGTATGAAAACCTGGAATGAACAATTAGATACTCAGTTCTCCTTACCTGCACA 38259418
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3363 GAATTACTGTATGAAAACATGGAATGAACAATTAGATACTCAGTTCTCCTTACCTGCACA 3422

 38259419 GTAATAGTAATTCTTACTACCAGACTGGATGCTGGAGGGCTCTCCTTCAGAGAAACAGAA 38259478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3423 GTAATAGTAATTCTTACTACCAGACTGGATGCTGGAGGGCTCTCCTTCAGAGAAACAGAA 3482

 38259479 AAGAAAAAAAAGCCTATAGCCACTAATATTTGAATCTCTGCAATTAAATACCTGGGTCCC 38259538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3483 AAGAAAAAAAAGCCTATAGCCACTAATATTTGAATCTCTGCAATTAAATACCTGGGTCCC 3542

 38259539 TTCCCAATCATATAGCAGTGATGCTCACCAGTTAACAAGAACTGAAGACACATGACAGAT 38259598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3543 TTCCCAATCATATAGCAGTGATGCTCACCAGTTAACAAGAACTGAAGACACATGACAGAT 3602

 38259599 TCCAATCAGTGATTTATTACCACTGTCAAATAAGAATGGACACTCAAAGATTACCTGAAA 38259658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3603 TCCAATCAGTGATTTATTACCACTGTCAAATAAGAATGGACACTCAAAGATTACCTGAAA 3662

 38259659 AAGTCCTTTAATATGGCCCCAGATTGAATAATTCCTAATTTCCTATATCATAAATTCAAA 38259718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3663 AAGTCCTTTAATATGGCCCCAGATTGAATAATTCCTAATTTCCTATATCATAAATTCAAA 3722

 38259719 AATTATCTAAAATTCAGTGAAATTAGTCCATATTATCAATGCCAACCTTACACATAAACA 38259778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3723 AATTATCTAAAATTCAGTGAAATTAGTCCATATTATCAATGCCAACCTTACACATAAACA 3782

 38259779 GAGTTGACATTCTCTTATGATGCTGAACAATGCAGATGAAGAACGCTGGCTTTGGATTAA 38259838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3783 GAGTTGACATTCTCTTATGATGCTGAACAATGCAGATGAAGAACGCTGGCTTTGGATTAA 3842

 38259839 GAAGACCCTTAGTTTGAATTTTAATTTTGACCCATGATAGCTGTGTAAACTTAGTCAAAA 38259898
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     3843 GAAGACCCTTAGTTTGAATTTTAATTTTGACCCATGATAGCTGTGTAAACTTAGTAAAAA 3902

 38259899 TTCTTCAGTTATTGAGCTGATGCTTTAGCCTGAGTTAAACAGAGAACAGAGCCTAAGGTA 38259958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3903 TTCTTCAGTTATTGAGCTGATGCTTTAGCCTGAGTTAAACAGAGAACAGAGCCTAAGGTA 3962

 38259959 GAGGGTTTCTATTCTATTCTTTCATAATGGATTGCTGGGCAAGATAACAAAAGCAATGGA 38260018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3963 GAGGGTTTCTATTCTATTCTTTCATAATGGATTGCTGGGCAAGATAACAAAAGCAATGGA 4022

 38260019 TAAGCACAGAAATGCAGGGCAGAAGAGAGAGCCATGAGGAAGATATATTATCAGGGTGGT 38260078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4023 TAAGCACAGAAATGCAGGGCAGAAGAGAGAGCCATGAGGAAGATATATTATCAGGGTGGT 4082

 38260079 TGCCATTAAGTGAAACCAGTTACCCAGTTTAATGGAATTATCCCCAGGGAGCAAGGTCTG 38260138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     4083 TGCCATTAAGTGAAACCAGTTACCCAGTTTAATGGAATTATCCCCAGGGAGCAAGGTCAG 4142

 38260139 TGGCATCTCAAGACTCTTTATCAAAGAGGAGAATGGGAGAAAAATCATCTTTTTTGTATT 38260198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4143 TGGCATCTCAAGACTCTTTATCAAAGAGGAGAATGGGAGAAAAATCATCTTTTTTGTATT 4202

 38260199 TCCTACTGTTCAAAAGTTTGTCCCTTGCTTTCCTGGTTATGAATGCATGGAAGTCTAGTT 38260258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4203 TCCTACTGTTCAAAAGTTTGTCCCTTGCTTTCCTGGTTATGAATGCATGGAAGTCTAGTT 4262

 38260259 GAAGTCCAGCAAAGACATCAACAAGGAATCATAGGAAAGAGATAAAAGGCCTGAGACATG 38260318
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4263 GAAGTCCACCAAAGACATCAACAAGGAATCATAGGAAAGAGATAAAAGGCCTGAGACATG 4322

 38260319 GATATAAGGGAAGGTAGTGTTAAGTGGCACCTTTTTGGGAGTCCAAACTGAGCAGGAGTA 38260378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4323 GATATAAGGGAAGGTAGTGTTAAGTGGCACCTTTTTGGGAGTCCAAACTGAGCAGGAGTA 4382

 38260379 AAACTGAAGCAACTGCTTTAACTAAGACATGTGTGCCCACAAAGACCTGAAGTGACACAT 38260438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4383 AAACTGAAGCAACTGCTTTAACTAAGACATGTGTGCCCACAAAGACCTGAAGTGACACAT 4442

 38260439 GAGCTTTCACAGTTTTTTAACTGTAAAATGGTAATGATATCACCTATGTTTCTGGATTAC 38260498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4443 GAGCTTTCACAGTTTTTTAACTGTAAAATGGTAATGATATCACCTATGTTTCTGGATTAC 4502

 38260499 TACAAATATTAAATAGCATAAATGGCACACTTGCAAAGCATATTTTAATAAACATATTTA 38260558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4503 TACAAATATTAAATAGCATAAATGGCACACTTGCAAAGCATATTTTAATAAACATATTTA 4562

 38260559 ATATTTCCCTTATTGATTTCTTTAATCAATAAAAGCATTTCTGAAATTTGTGTAAAGGTC 38260618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4563 ATATTTCCCTTATTGATTTCTTTAATCAATAAAAGCATTTCTGAAATTTGTGTAAAGGTC 4622

 38260619 TAGATGAAGGGACATTGGACATGCTTTGATAATCATTGAGACTGGGTGATAGATAAATGA 38260678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4623 TAGATGAAGGGACATTGGACATGCTTTGATAATCATTGAGACTGGGTGATAGATAAATGA 4682

 38260679 TTGTCATGGTCTTTACTTTGATATGCATGTTTGACATCTTTGTAAACATAGTTTTAAAAA 38260738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4683 TTGTCATGGTCTTTACTTTGATATGCATGTTTGACATCTTTGTAAACATAGTTTTAAAAA 4742

 38260739 TAATATTTGTAAAATTTAAAAACAGAAACAAATAATTCTGATTTCAAAGGTCAACTAATA 38260798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4743 TAATATTTGTAAAATTTAAAAACAGAAACAAATAATTCTGATTTCAAAGGTCAACTAATA 4802

 38260799 GACTCCTAGTCATGTCAGGATATCAATGCCTATCTCATTCACTTTCTGGTGCTTAAAAAA 38260858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4803 GACTCCTAGTCATGTCAGGATATCAATGCCTATCTCATTCACTTTCTGGTGCTTAAAAAA 4862

 38260859 TAATAAAAGTAATTATTTCCCAATCTTCACTTTCTACAATGCTAAACTATTTATTTCTCC 38260918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     4863 TAATAAAAGTAATTATTTCCCAATCTTCACTTTCTACAATGCTAAACTATTTATTTGTCC 4922

 38260919 TTTTCTGAGCCCACATGCTTTCCTCAATGAATGTTACCGAGATGGAATTTATATCTTATA 38260978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4923 TTTTCTGAGCCCACATGCTTTCCTCAATGAATGTTACCGAGATGGAATTTATATCTTATA 4982

 38260979 TTTCAGGTGTATTTACATTCATTTCTTCCCCACTATGTTGCAAACAAGTTGTTTTGCCCA 38261038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4983 TTTCAGGTGTATTTACATTCATTTCTTCCCCACTATGTTGCAAACAAGTTGTTTTGCCCA 5042

 38261039 TTTGTTCTTATCCTGAGGTCATGAAAACATCTAACTCTACTATCTTCCAGAAGCTATATT 38261098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5043 TTTGTTCTTATCCTGAGGTCATGAAAACATCTAACTCTACTATCTTCCAGAAGCTATATT 5102

 38261099 GTCTTGCCTTTGACCTTAAGGATTATGGTCTTGAATTAATTTTTGTATGTGTAAGTGACC 38261158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5103 GTCTTGCCTTTGACCTTAAGGATTATGGTCTTGAATTAATTTTTGTATGTGTAAGTGACC 5162

 38261159 ACACAAACTTGTTAGAAATCTAGTTTCAAGTATTTTTTTCATATGGATTCAAATTACACC 38261218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5163 ACACAAACTTGTTAGAAATCTAGTTTCAAGTATTTTTTTCATATGGATTCAAATTACACC 5222

 38261219 ACCAGTACACGCATATTGAAAAAAAGTATTTTTCTACTGTTTTGCAATGGAAATATTGAT 38261278
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5223 ACCAGTACACACATATTGAAAAAAAGTATTTTTCTACTGTTTTGCAATGGAAATATTGAT 5282

 38261279 ATAAATCAAGTACCCATATATGCACAGGTCAGTTTATGAACTTGCTATTTTGTTGTACTG 38261338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5283 ATAAATCAAGTACCCATATATGCACAGGTCAGTTTATGAACTTGCTATTTTGTTGTACTG 5342

 38261339 GTTTGTTTGTATATATTTTTTGCCCTGATAAGACACTGCCTTAGTTATTGCAACTTCTGT 38261398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5343 GTTTGTTTGTATATATTTTTTGCCCTGATAAGACACTGCCTTAGTTATTGCAACTTCTGT 5402

 38261399 TATAAGCTTTGAGATCTGAGAAAGAAAGTTATTCCAGCTACTTATTTTGTATTTGCTATC 38261458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5403 TATAAGCTTTGAGATCTGAGAAAGAAAGTTATTCCAGCTACTTATTTTGTATTTGCTATC 5462

 38261459 TTTGGTCTTTTGCATTTATATAAATTTTATAATCAGTTTGTCAATTACTAAAACAAAATG 38261518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5463 TTTGGTCTTTTGCATTTATATAAATTTTATAATCAGTTTGTCAATTACTAAAACAAAATG 5522

 38261519 TACTGGGATTTTGATTGGGACTGCATTGAATATAAAGATCAATATGGAGAGTATTGACTT 38261578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5523 TACTGGGATTTTGATTGGGACTGCATTGAATATAAAGATCAATATGGAGAGTATTGACTT 5582

 38261579 CTTCAAAATGTTGAGTCTTCCAGGCCATGAAGAGGGAATATCCTTTTAATTATTTAGGAC 38261638
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5583 CTTCAAAATGTTGAGTCTTCCAAGCCATGAAGAGGGAATATCCTTTTAATTATTTAGGAC 5642

 38261639 ATCATTAATTTTTCTAAATAAATAAGTGCAATTCCTTTCCAGAGGTCTTCACATATCTGG 38261698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5643 ATCATTAATTTTTCTAAATAAATAAGTGCAATTCCTTTCCAGAGGTCTTCACATATCTGG 5702

 38261699 TTAACTTTTGTTCTTGTGTATATTTATGCTATTATAAATGCTAAACATGGTTACTTTCCC 38261758
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     5703 TTAACTTTTGTTCTTGTGTATATTTATGCTATTATAAATGCTAAACATGTTTACTTTCCC 5762

 38261759 TTTCTGTTGGTTAGCGATACATAGAAATGGAATTTCTTTTTGAATATTCAATCCGCGTAT 38261818
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5763 TTTCTATTGGTTAGCGATACATAGAAATGGAATTTCTTTTTGAATATTCAATCCGCGTAT 5822

 38261819 TAGTTTTCTAATGGTGTTGTGACGAATTACACCAACTTAGTGGCTTTAAAACAACACCCA 38261878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5823 TAGTTTTCTAATGGTGTTGTGACGAATTACACCAACTTAGTGGCTTTAAAACAACACCCA 5882

 38261879 TTTATTATCTCACAGTTTAATCAGTTAGAAGTCTGGACTCAGCGTGGCTCAGTTGGATGT 38261938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5883 TTTATTATCTCACAGTTTAATCAGTTAGAAGTCTGGACTCAGCGTGGCTCAGTTGGATGT 5942

 38261939 CTTTCTAGAGGCTCTGTGGACGATTTTTTTCCCAACATCATGAAAATTATTGGCATAATT 38261998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5943 CTTTCTAGAGGCTCTGTGGACGATTTTTTTCCCAACATCATGAAAATTATTGGCATAATT 6002

 38261999 CAGTTCCACGGAGTTACAGGACTGATTTCCCTTTTTTTTCTTACTAGCTTTAGCCAGGGT 38262058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6003 CAGTTCCACGGAGTTACAGGACTGATTTCCCTTTTTTTTCTTACTAGCTTTAGCCAGGGT 6062

 38262059 TTATTCTCAGCTTCGAGAGGGCACTCACATTCTTGGCTCATTCCTCCATCTTGAAAGCCA 38262118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     6063 TTATTCTCAGCTTCGAGAGGGCACTCACATTCTTGGTTCATTCCTCCATCTTGAAAGCCA 6122

 38262119 GCAATAGTGAGTCAACTTCTTCTCTTGTTTTAAGTTTCTGTGACCTCACTTTCTGCTTCA 38262178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6123 GCAATAGTGAGTCAACTTCTTCTCTTGTTTTAAGTTTCTGTGACCTCACTTTCTGCTTCA 6182

 38262179 TCTCTTTTCTGCTTCATCTCTTCTCCGCCTCCTTCTCTGTCAGATCTCTCTTACTTTTCT 38262238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6183 TCTCTTTTCTGCTTCATCTCTTCTCCGCCTCCTTCTCTGTCAGATCTCTCTTACTTTTCT 6242

 38262239 GCCTTCCTTTTCTGCTTTTAAGTGCTCCAGTTATTACATTGGGCCCGACCAGGTAACCCA 38262298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6243 GCCTTCCTTTTCTGCTTTTAAGTGCTCCAGTTATTACATTGGGCCCGACCAGGTAACCCA 6302

 38262299 GGTTAACCACTCCATTTTAAAGTTAACTGATTAATAATCTTAATAACTTCTGGCCAGGTG 38262358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6303 GGTTAACCACTCCATTTTAAAGTTAACTGATTAATAATCTTAATAACTTCTGGCCAGGTG 6362

 38262359 CAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGTCGCGTGGATCACGAGGT 38262418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6363 CAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGTCGCGTGGATCACGAGGT 6422

 38262419 CAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAAGATGCTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAA 38262478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6423 CAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAAGATGCTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAA 6482

 38262479 AAAATTAGCGGGGCGTGGTGGCAGGCCCCTGAATCCCAGCCACTCGGGAGGCTAAGGCAG 38262538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6483 AAAATTAGCGGGGCGTGGTGGCAGGCCCCTGAATCCCAGCCACTCGGGAGGCTAAGGCAG 6542

 38262539 AGAATTGCTTGAACCCAGGACGCAGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATCATGCCACTGCACTC 38262598
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     6543 AGAATTGCTTGAACCCAGGACGCAGAGCTTGCAATGAGCCGAGATCATGCCACTGCACTC 6602

 38262599 CAGCCTGGGTGACAGAGCGAGACTCGTCGAAAAATAAATAAATAACAAAATAAAAAATGA 38262658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6603 CAGCCTGGGTGACAGAGCGAGACTCGTCGAAAAATAAATAAATAACAAAATAAAAAATGA 6662

 38262659 CATCCAAACAATTCATGCACAATAGTATCTACACATGTGTTTGCTTGAATAATCAGAATA 38262718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6663 CATCCAAACAATTCATGCACAATAGTATCTACACATGTGTTTGCTTGAATAATCAGAATA 6722

 38262719 TGGGACTCTTGAGAGTACATCACTAAAATTCTACCTACCACACCTTGTACCTGGCTTCCT 38262778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6723 TGGGACTCTTGAGAGTACATCACTAAAATTCTACCTACCACACCTTGTACCTGGCTTCCT 6782

 38262779 TATCAAACTCACTTAACAATCTATTTATGTGTAGAATTTAATTTTTAGATTTTTAAATAT 38262838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6783 TATCAAACTCACTTAACAATCTATTTATGTGTAGAATTTAATTTTTAGATTTTTAAATAT 6842

 38262839 ATATACACACACATATATATGTAATCTTAAAATTTGACAGTTTTTATTTATTCCTTTGAA 38262898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6843 ATATACACACACATATATATGTAATCTTAAAATTTGACAGTTTTTATTTATTCCTTTGAA 6902

 38262899 GTTATTATTTATTTTCCTTCTATTGATTACATGGGTTCACTAGTTAGGCCTTTTAATAAA 38262958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6903 GTTATTATTTATTTTCCTTCTATTGATTACATGGGTTCACTAGTTAGGCCTTTTAATAAA 6962

 38262959 ACACAAAATATAAGTAATTTTTACTTTCAAAAGTTTTCAACATTTCCTCATAAGATATGT 38263018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6963 ACACAAAATATAAGTAATTTTTACTTTCAAAAGTTTTCAACATTTCCTCATAAGATATGT 7022

 38263019 TTGTTATGTGATTGTTGTAGATTTTTAAAATCAAATTAAGGAAAATTCTTTCT 38263071
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7023 TTGTTATGTGATTGTTGTAGATTTTTAAAATCAAATTAAGGAAAATTCTTTCT 7075

Alignment time is 7.22594 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38249892,38276749] =>     26858 nucs '18 dna:chromosome chromosome:GRCh37:18:1:78077248:1'
Second seq [       1,    7367] =>      7367 nucs 'mol-32-3419-012791_7367'

Score:        6997
Aligned:      7370        nucs
Identic:      7332 ( 99%) nucs =>      5159 ( 99%)      2173 (100%)
Gaps:            9 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38254709,38259892] EXCISED REGION [38266750,38268929]
 second seq =>  [       1,    5185] EXCISED REGION [    5186,    7367]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6857 nucs [38259893,38266749]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [38259893,38259893] to [38266750,38266750]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [38259893,38259893] to [38266749,38266749]
 second seq =>         0 nucs

 38254709 CAGTATTCTATGTGTACCTTTTGATTCTCAGAGTGTCTGTGACTAGCTCTCAATAAGCCC 38254768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CAGTATTCTATGTGTACCTTTTGATTCTCAGAGTGTCTGTGACTAGCTCTCAATAAGCCC 60

 38254769 ATGAAGCAACAGGCTGTAACACTGGATCACACCAGACTTTATTATTTCCATTGTCATTTT 38254828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATGAAGCAACAGGCTGTAACACTGGATCACACCAGACTTTATTATTTCCATTGTCATTTT 120

 38254829 CTATTCACTTGTATACTGAATATTGCATATATCAACCAAAAAACTGAGGACATGATATTG 38254888
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTATTCACTTGTATACTGAATATTGCATACATCAACCAAAAAACTGAGGACATGATATTG 180

 38254889 TTCCCGTTATTGTGCTAACTTCTGAATATACCCTGTTCAATAAAATTAACTTAGTCCACT 38254948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTCCCGTTATTGTGCTAACTTCTGAATATACCCTGTTCAATAAAATTAACTTAGTCCACT 240

 38254949 ACTTCTCAGCCATGCTAGCTCAGCCTGGCCTGACCTGGTGGATTTGGTAGAAATAGTCAG 38255008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACTTCTCAGCCATGCTAGCTCAGCCTGGCCTGACCTGGTGGATTTGGTAGAAATAGTCAG 300

 38255009 TGGTGCCTGACACATGTGGTGACTCTAGCTGGCTCCAGTCATCACTGTACTCAAGAATGA 38255068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGGTGCCTGACACATGTGGTGACTCTAGCTGGCTCCAGTCATCACTGTACTCAAGAATGA 360

 38255069 CAGTGAAGGGTAAGAGATTCCTTGTTAATAGGACAGGTAGAGCCACTGAAACATGGATAA 38255128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CAGTGAAGGGTAAGAGATTCCTTGTTAATAGGACAGGTAGAGCCACTGAAACATGGATAA 420

 38255129 TTACTGTTTGAGGCTATTTGAGACTATAGAACATTTATGACATATTAAATCAAAGTATAT 38255188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTACTGTTTGAGGCTATTTGAGACTATAGAACATTTATGACATATTAAATCAAAGTATAT 480

 38255189 GATGAAGGAGTTGTCTGCTTTCCTTTTATCATCGGTAATTCTATCTGACACTGTTCCTTC 38255248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GATGAAGGAGTTGTCTGCTTTCCTTTTATCATCGGTAATTCTATCTGACACTGTTCCTTC 540

 38255249 CTTTTAAACAGATGTTTTAAACACCCTTTTAATAGTTCATTTCACATATTCCCAACATGC 38255308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTTTTAAACAGATGTTTTAAACACCCTTTTAATAGTTCATTTCACATATTCCCAACATGC 600

 38255309 AGCCAAGTTAAGCTTTAGAATTTTTAAAGTTATACACATTTTGCCACATATATGTATCCA 38255368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGCCAAGTTAAGCTTTAGAATTTTTAAAGTTATACACATTTTGCCACATATATGTATCCA 660

 38255369 CACTTGCATTCACATCTTTTTATACATTATTTTGAATTATCTGGTACTCAGAGTTCCCTG 38255428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CACTTGCATTCACATCTTTTTATACATTATTTTGAATTATCTGGTACTCAGAGTTCCCTG 720

 38255429 AACAGTCTTGATAGAACTGGGTGCAAACAATTTTGAAATAAACTTTGGATGGATATGTAA 38255488
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AACAGTCTTGATAGAACTGGGTACAAACAATTTTGAAATAAACTTTGGATGGATATGTAA 780

 38255489 TCATACCAACTGGATTAAAAGTATAAGCAAAAAAAAATCAACTATTCCTCTCATGTTATT 38255548
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCATACCAACTGTATTAAAAGTATAAGCAAAAAAAAATCAACTATTCCTCTCATGTTATT 840

 38255549 GTATCTTGCAGAAATTCATTTGCTTATTTTTTTATTTATCATAGGTTTTCATTTGTATAG 38255608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GTATCTTGCAGAAATTCATTTGCTTATTTTTTTATTTATCATAGGTTTTCATTTGTATAG 900

 38255609 ATATAACCACATTCCAAGGAATCATTTATACTATTTGTCAGCATTTCCCCAAATAACTTT 38255668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATATAACCACATTCCAAGGAATCATTTATACTATTTGTCAGCATTTCCCCAAATAACTTT 960

 38255669 ATGAATTCAAGTTTCTAAAAAGGCTGACTGACTTAAAAGTCAGTTAGCCTGCAGCAGGTG 38255728
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATGAATTCAAGTTTCTACAAAGGCTGACTGACTTAAAAGTCAGTTAGCCTGCAGCAGGTG 1020

 38255729 GATCCACTATATTGCATTATACTGTATAATCTGTGCTACGGAACCAGTTTCATTTGCTTC 38255788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GATCCACTATATTGCATTATACTGTATAATCTGTGCTACGGAACCAGTTTCATTTGCTTC 1080

 38255789 TTTTTCTTTAAGCCAAATTCTTTGCACATGAAAGAATCCATTCTTTTCTTTGACACTTGA 38255848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTTTTCTTTAAGCCAAATTCTTTGCACATGAAAGAATCCATTCTTTTCTTTGACACTTGA 1140

 38255849 ACTCTATAGATGGAGTAATGTAAGAGACTAGAGAATTAAAAACAGTGAATGTTGCCTAGT 38255908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ACTCTATAGATGGAGTAATGTAAGAGACTAGAGAATTAAAAACAGTGAATGTTGCCTAGT 1200

 38255909 TTCTCTCTATATTATGGATATAACACAATGCACAGCTTTATTTCTCAAAAACATGACAAT 38255968
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTCTCTATATATTATGGATATAACACAATGCACAGCTTTATTTCTCAAAAACATGACAAT 1260

 38255969 TTTAACAGAAAAATGAATATTAAAGGTAATTTTCCTATTTATACACACTGTGAATAATAT 38256028
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     1261 TTTAACAGAAAAATGAATATTAAAGGTAATTTTCCTATTTATACACACTCTGAATAATAT 1320

 38256029 CAAAATATTTAATAAATAGATATTAATACAATTCTTATAGAATTTTCATGAAAAGACAGC 38256088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CAAAATATTTAATAAATAGATATTAATACAATTCTTATAGAATTTTCATGAAAAGACAGC 1380

 38256089 TATTCATAGTAGTGTTTTTTTT-CCCTTAAATTTGTACCTAAAGTTTTTTTGAAACAATG 38256147
          |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     1381 TATTCATAGTAGTGTTTTTTTTTCCCTTAAATTTGTACCCAAAGTTTTTTTGAAACAATG 1440

 38256148 AGAAGATGCTAGTCATGATCTTCAGAAGAGTTTTATTTTATCCTAAGTTTATCATTAAAA 38256207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AGAAGATGCTAGTCATGATCTTCAGAAGAGTTTTATTTTATCCTAAGTTTATCATTAAAA 1500

 38256208 AGTAATTCTTAGTAAGATAAAGTATATAATGATATAATTAAAATTTAAAATCAGAATTAT 38256267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AGTAATTCTTAGTAAGATAAAGTATATAATGATATAATTAAAATTTAAAATCAGAATTAT 1560

 38256268 TAAATCTCAAAATTTGGAAGAATCACACCAGTCATTTAGACCAATCTCACTGCCTTTGTT 38256327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TAAATCTCAAAATTTGGAAGAATCACACCAGTCATTTAGACCAATCTCACTGCCTTTGTT 1620

 38256328 TCTACCAAACACTAGTTACTATGTTTAGTATTAATATATTCAACACCTATATGGATCCAA 38256387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TCTACCAAACACTAGTTACTATGTTTAGTATTAATATATTCAACACCTATATGGATCCAA 1680

 38256388 TTTCTAGACTCTCACTTTGACATCTTCTTCTATCATGAACATTTCTTCCACTCAGCTCCA 38256447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTTCTAGACTCTCACTTTGACATCTTCTTCTATCATGAACATTTCTTCCACTCAGCTCCA 1740

 38256448 TTTATTTACTCCTATGGCCACTGCCGAAACTTTACCAGCACCGGAAACTACATCTTAATG 38256507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TTTATTTACTCCTATGGCCACTGCCGAAACTTTACCAGCACCGGAAACTACATCTTAATG 1800

 38256508 TCAGGGAACCAGTATCCACTTGTCTAGAATGACATCTTATCCTTGCAACTCACTTGATCT 38256567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TCAGGGAACCAGTATCCACTTGTCTAGAATGACATCTTATCCTTGCAACTCACTTGATCT 1860

 38256568 AAGATCTGCTCTGGAATTGTTTTTCAACTTATCAAGAGCCCCAATTTACTTCTCTCTTTA 38256627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AAGATCTGCTCTGGAATTGTTTTTCAACTTATCAAGAGCCCCAATTTACTTCTCTCTTTA 1920

 38256628 TATCAATCACCCCTCCACCACTCTGTTTTATCTCCATAATTATTGTCCTCATATGCTGTA 38256687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TATCAATCACCCCTCCACCACTCTGTTTTATCTCCATAATTATTGTCCTCATATGCTGTA 1980

 38256688 GTTAGTAAATACAAACTTCAGTGTCTTTCTCTGAAATCATTGTACTACCAGATAAAACCA 38256747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GTTAGTAAATACAAACTTCAGTGTCTTTCTCTGAAATCATTGTACTACCAGATAAAACCA 2040

 38256748 CACCCTTATATGCAATCAACTACTGGCTTTTTTTTTTTTTTAATCTTTGCACACATGCTC 38256807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CACCCTTATATGCAATCAACTACTGGCTTTTTTTTTTTTTTAATCTTTGCACACATGCTC 2100

 38256808 AGTGGAGACTGCTTGTGATTGTGCCTTACTGAGGCAGATGATGATTCAGACAAGTTACTC 38256867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AGTGGAGACTGCTTGTGATTGTGCCTTACTGAGGCAGATGATGATTCAGACAAGTTACTC 2160

 38256868 TATTACTCATAGAACCAACTTCAAATAGGCACGTAACTCTACACAACAATACTATCTCAC 38256927
          |||||||||||||||||||||||||.||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     2161 TATTACTCATAGAACCAACTTCAAACAGGCACATAACTCTACACAACAATACTATCTCAC 2220

 38256928 TATATTTTAAAAAATTATCCTCTCATTACCAGTAATACTTTAGCATCTTCCCCACTCCCT 38256987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TATATTTTAAAAAATTATCCTCTCATTACCAGTAATACTTTAGCATCTTCCCCACTCCCT 2280

 38256988 TCAACCTCAACAACCTGGATAACTAGTATGAAGGGCTTTACTGACAAAATGGAAGCCATG 38257047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TCAACCTCAACAACCTGGATAACTAGTATGAAGGGCTTTACTGACAAAATGGAAGCCATG 2340

 38257048 AAACAGAAATTCATCCTACCACCACCTTCTGTATCTCATTTCTTCTTGTTTCTCCTTTTT 38257107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AAACAGAAATTCATCCTACCACCACCTTCTGTATCTCATTTCTTCTTGTTTCTCCTTTTT 2400

 38257108 GCAGCAGAGAATGTGACCCTGCGGTCCCCTGAAGTCAGTTTCTCCAAACGTGGACTTTAC 38257167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GCAGCAGAGAATGTGACCCTGCGGTCCCCTGAAGTCAGTTTCTCCAAACGTGGACTTTAC 2460

 38257168 TTTCTCAACACATTTGTTCCTTCAGTTATTCCCACTGTAGCAACTTTGTCTCTGTCTCTC 38257227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TTTCTCAACACATTTGTTCCTTCAGTTATTCCCACTGTAGCAACTTTGTCTCTGTCTCTC 2520

 38257228 AATTAGATAATTCCTACTGACAAATAGGCTATAACACCTCACATCTTTAAAAGAATACAC 38257287
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 AACTAGATAATTCCTACTGACAAATAGGCTATAACACCTCACATCTTTAAAAGAATACAC 2580

 38257288 ATTTCATGTAATTGCTGTCTGCACCAGTATCTCCAATTCTTTATCTCCTATTATCTTTGT 38257347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 ATTTCATGTAATTGCTGTCTGCACCAGTATCTCCAATTCTTTATCTCCTATTATCTTTGT 2640

 38257348 CAACCCTCTCCAGCCTGCCTACTGTTCCCACTACCCTACTCAATTCCTCCCGCCAAGGCA 38257407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     2641 CAACCCTCTCCAGCCTGCCTACTGTTCCCACTACTCTACTCAATTCCTCCCGCCAAGGCA 2700

 38257408 TTGTTGGTCCTTACCTTTCAAAACTTTTTTTTGTTTTTGTTTTTTGAGACGGAGTCTCGC 38257467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TTGTTGGTCCTTACCTTTCAAAACTTTTTTTTGTTTTTGTTTTTTGAGACGGAGTCTCGC 2760

 38257468 TCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGATCTCTGCTTACTGCAACCTCCACCTCAC 38257527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGATCTCTGCTTACTGCAACCTCCACCTCAC 2820

 38257528 CAGTTCAAGTGATTCACTAGTCTGAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGACACATGCCA 38257587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     2821 CAGTTCAAGTGATTCACTAGTCTGAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGCACATGCCA 2880

 38257588 CCATGCCCGGCTAATTTTTGCATTTTTAGTAGAGACGAGGTTTCACCATGCTGGTCAGGC 38257647
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CCATGCTCGGCTAATTTTTGCATTTTTAGTAGAGACGAGGTTTCACCATGCTGGTCAGGC 2940

 38257648 TGGTCTCAAACTCCTGACCTCGTGATCCGCTTGCCTTGGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTA 38257707
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TGGTCTCAAACTCCTGACCTCGTGATCCGCCTGCCTTGGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTA 3000

 38257708 CCGGCGTGAGCCACTGCGCCCATAGAAAAGATTAGTTCTTTCTGAACTTTTAAACACCAT 38257767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CCGGCGTGAGCCACTGCGCCCATAGAAAAGATTAGTTCTTTCTGAACTTTTAAACACCAT 3060

 38257768 TCAGCAGTGTTCACCATTCTCTCTAACTTAAAACACTGTCCCTCATAACATATTTAAAAA 38257827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TCAGCAGTGTTCACCATTCTCTCTAACTTAAAACACTGTCCCTCATAACATATTTAAAAA 3120

 38257828 ATTCTATTTCTTACTGTTATTTCTCAGATTCTTGTATAGGCCACAGTTCTTTCAGTAGAA 38257887
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 ATTATATTTCTTACTGTTATTTCTCAGATTCTTGTATAGGCCACAGTTCTTTCAGTAGAA 3180

 38257888 CTCTAACCAATTTCCGTACATGTAAGTATCATAAATATACTAATGACTCTGAACATTATA 38257947
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 CTCTAACCAATTTCCATACATGTAAGTATCATAAATATACTAATGACTCTGAACATTATA 3240

 38257948 TATCTTGCCTCATGCATGAATACCCAAATGTTTTCCTGTAATCACAAAATGAACATCTCA 38258007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TATCTTGCCTCATGCATGAATACCCAAATGTTTTCCTGTAATCACAAAATGAACATCTCA 3300

 38258008 AAGTGACCACAAATTTGACATGTTCCGAAGTAATTAAATTTTGATATTCTCTGCCAAAAG 38258067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 AAGTGACCACAAATTTGACATGTTCCGAAGTAATTAAATTTTGATATTCTCTGCCAAAAG 3360

 38258068 CTGCTCTAGAAATTTTGCCACTCCTTCTTCATCTTAGAAAATGCTATTATTCTCCACCAA 38258127
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     3361 CTGCTCTAGAAATTTTGCCACTCCTTCTTCATCTTAGAAAATGCTATCATTCTCCACCAA 3420

 38258128 AGGCAAATAACCAAGAGTCATTACTAGAAAATTTGTCTCCTTTACCACTCATGCCCAATA 38258187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 AGGCAAATAACCAAGAGTCATTACTAGAAAATTTGTCTCCTTTACCACTCATGCCCAATA 3480

 38258188 TAGATCAAATTCTTTAAGATCTTTTCCTCAATAAACCTCAAGTCTGTCACCTTTTCTATT 38258247
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     3481 TAGATCAAATTCTTTAAGATCTTTTCCTCAATAAATCTCAAGTCTGTCACCTTTTCTATT 3540

 38258248 ACCACATTTTTTCTAAGTCTCAATCATCTCTCAATTAGATCATTATAGTAATCTTCTAAG 38258307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 ACCACATTTTTTCTAAGTCTCAATCATCTCTCAATTAGATCATTATAGTAATCTTCTAAG 3600

 38258308 TGGTGTTGGGGTGTCGTCTCCCGGCTACTTCAATCCATTTTCCAATATTAAGTTTATTTG 38258367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 TGGTGTTGGGGTGTCGTCTCCCGGCTACTTCAATCCATTTTCCAATATTAAGTTTATTTG 3660

 38258368 TTTAATTAAACATGTTAACTTGTGGTGCTCTTATGCTTAAAAAGTTTCATTAGCTTTCTA 38258427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 TTTAATTAAACATGTTAACTTGTGGTGCTCTTATGCTTAAAAAGTTTCATTAGCTTTCTA 3720

 38258428 TTTATATAATGAATGAAACCAATGTTTAGCCTAGTTTAAGAAATGTAAGAACTCCTTTTA 38258487
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     3721 TTTATATAATGAATGAAACCAATGTTTAGCCTAGTTTAAGAAATGTAAGAACTCCCTTTA 3780

 38258488 CCCTAGCTTTCTTCCTGTTTACTTTTATTCATCATGCCTTGAATCATACCTATCTTCTTT 38258547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 CCCTAGCTTTCTTCCTGTTTACTTTTATTCATCATGCCTTGAATCATACCTATCTTCTTT 3840

 38258548 AATTTTCTCTAACACAAAATCCTCCTGTTTCTTCTTTGCAATCCTGCAAACCCAAACCCA 38258607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 AATTTTCTCTAACACAAAATCCTCCTGTTTCTTCTTTGCAATCCTGCAAACCCAAACCCA 3900

 38258608 GCAGCTAGTAAATATTCAATATATATGAATTAATTAATTGATGAATGAGTGATTTTATTT 38258667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 GCAGCTAGTAAATATTCAATATATATGAATTAATTAATTGATGAATGAGTGATTTTATTT 3960

 38258668 CAGATTGCTATCAAATGCTCAATTCCCCTGCATAGTATCTCCAATGAGTCAAATCCTGGA 38258727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 CAGATTGCTATCAAATGCTCAATTCCCCTGCATAGTATCTCCAATGAGTCAAATCCTGGA 4020

 38258728 ATTCCCTATAGGAACACCTGGGATATATAGTATCAACTTACAAATACCATTCTTTCTTAA 38258787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 ATTCCCTATAGGAACACCTGGGATATATAGTATCAACTTACAAATACCATTCTTTCTTAA 4080

 38258788 TTTTGAAAGAAAAACTGAGTAAAATATGAGAGCTGTAGCTTTTAAAAAAAATAGAAAATA 38258847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 TTTTGAAAGAAAAACTGAGTAAAATATGAGAGCTGTAGCTTTTAAAAAAAATAGAAAATA 4140

 38258848 CACCATAAAAATTTTAGTCAAGCATGGCAGACTAAATACATGTATTTATTTCTAATCTAC 38258907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 CACCATAAAAATTTTAGTCAAGCATGGCAGACTAAATACATGTATTTATTTCTAATCTAC 4200

 38258908 TTCAAGCTCCAATATAATAACTGTTTACAAATGAAATGGTCTAATATCACAAGTTCAAAA 38258967
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 TTCAAGCTCCAATATAATAATTGTTTACAAATGAAATGGTCTAATATCACAAGTTCAAAA 4260

 38258968 TTAATAAGAGTGGATGAGACATGCCAACAAATTTTTGGAATGTAAAAATAGATAAGACAT 38259027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 TTAATAAGAGTGGATGAGACATGCCAACAAATTTTTGGAATGTAAAAATAGATAAGACAT 4320

 38259028 TGTTAATGATTTGACAAAGCACAAAGCCTTAAAATATTTCTGTATAGAGAGAAGTTTCCA 38259087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 TGTTAATGATTTGACAAAGCACAAAGCCTTAAAATATTTCTGTATAGAGAGAAGTTTCCA 4380

 38259088 AAGTAGGGCAACTCAGAGATAAATCAAGAATGGGAAGATTCACACACCTCAACTGTAAAA 38259147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 AAGTAGGGCAACTCAGAGATAAATCAAGAATGGGAAGATTCACACACCTCAACTGTAAAA 4440

 38259148 GAGAAATATGAGACTAAAAGCAGTGGATTAATTAAAACTTTGTTTGATGAGATATTATAC 38259207
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 GAGAAATATGAGACTAAAAGCAGTGGATTCATTAAAACTTTGTTTGATGAGATATTATAC 4500

 38259208 ATAGATGTCTTCTCCATCATTCCAAGCACTTAAGCAGCTGCCCTTTCCAAACACTCATAG 38259267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     4501 ATAGATGTCTTCTCCATCATTCCAAGCACTTAAGCAGCTGCCCTTTACAAACACTCATAG 4560

 38259268 AGGATAAGAGATTATTTTCTATAAAAATCAAACCAGATTGTTG--TGTACATCAAGCAAA 38259325
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||
     4561 AGGATAAGAGATTATTTTCTATAAAAATCAAACCAGATTGT--CATGTACATCAAGCAAA 4618

 38259326 GGAGGGATGGCAGGGAGGTGATATACTGAAACAGAATTACTGTATGAAAACCTGGAATGA 38259385
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     4619 GGAGGGATGGCAGGGAGGTGATATACTGAAACAGAATTACTGTATGAAAACATGGAATGA 4678

 38259386 ACAATTAGATACTCAGTTCTCCTTACCTGCACAGTAATAGTAATTCTTACTACCAGACTG 38259445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4679 ACAATTAGATACTCAGTTCTCCTTACCTGCACAGTAATAGTAATTCTTACTACCAGACTG 4738

 38259446 GATGCTGGAGGGCTCTCCTTCAGAGAAACAGAAAAGAAAAAAAAGCCTATAGCCACTAAT 38259505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4739 GATGCTGGAGGGCTCTCCTTCAGAGAAACAGAAAAGAAAAAAAAGCCTATAGCCACTAAT 4798

 38259506 ATTTGAATCTCTGCAATTAAATACCTGGGTCCCTTCCCAATCATATAGCAGTGATGCTCA 38259565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4799 ATTTGAATCTCTGCAATTAAATACCTGGGTCCCTTCCCAATCATATAGCAGTGATGCTCA 4858

 38259566 CCAGTTAACAAGAACTGAAGACACATGACAGATTCCAATCAGTGATTTATTACCACTGTC 38259625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4859 CCAGTTAACAAGAACTGAAGACACATGACAGATTCCAATCAGTGATTTATTACCACTGTC 4918

 38259626 AAATAAGAATGGACACTCAAAGATTACCTGAAAAAGTCCTTTAATATGGCCCCAGATTGA 38259685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4919 AAATAAGAATGGACACTCAAAGATTACCTGAAAAAGTCCTTTAATATGGCCCCAGATTGA 4978

 38259686 ATAATTCCTAATTTCCTATATCATAAATTCAAAAATTATCTAAAATTCAGTGAAATTAGT 38259745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4979 ATAATTCCTAATTTCCTATATCATAAATTCAAAAATTATCTAAAATTCAGTGAAATTAGT 5038

 38259746 CCATATTATCAATGCCAACCTTACACATAAACAGAGTTGACATTCTCTTATGATGCTGAA 38259805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5039 CCATATTATCAATGCCAACCTTACACATAAACAGAGTTGACATTCTCTTATGATGCTGAA 5098

 38259806 CAATGCAGATGAAGAACGCTGGCTTTGGATTAAGAAGACCCTTAGTTTGAATTTTAATTT 38259865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5099 CAATGCAGATGAAGAACGCTGGCTTTGGATTAAGAAGACCCTTAGTTTGAATTTTAATTT 5158

 38259866 TGACCCATGATAGCTGTGTAAACTTAG 38259892
          |||||||||||||||||||||||||||
     5159 TGACCCATGATAGCTGTGTAAACTTAG 5185

EXCISED REGION

 38266750 TAAATGAACTTGATTTGAATGGAATGAGAGTTCAATGAAACTGTATATATTGTGAAACGT 38266809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5186 TAAATGAACTTGATTTGAATGGAATGAGAGTTCAATGAAACTGTATATATTGTGAAACGT 5245

 38266810 GGCAACTTACACCTACTCAAGACATTAAAAGAGATCATGCTTTCTTGCCTAAGTTTTATG 38266869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5246 GGCAACTTACACCTACTCAAGACATTAAAAGAGATCATGCTTTCTTGCCTAAGTTTTATG 5305

 38266870 TCCAATTTGTTCCTGTTTCAAACCCCTCGACAAAAACAAAATCTTTTAATCTGTTTGCAA 38266929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5306 TCCAATTTGTTCCTGTTTCAAACCCCTCGACAAAAACAAAATCTTTTAATCTGTTTGCAA 5365

 38266930 AATATTTCCTCCTTCCTCCCATCTTGCTGTTGCTGCTCTGTGATATACTGCCCTTGCTTA 38266989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5366 AATATTTCCTCCTTCCTCCCATCTTGCTGTTGCTGCTCTGTGATATACTGCCCTTGCTTA 5425

 38266990 TTACCCCTTTATAGCTGTTTTGTTAAAGTTCATACCGCTAAGACCTGTAAAAGAAATTTA 38267049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5426 TTACCCCTTTATAGCTGTTTTGTTAAAGTTCATACCGCTAAGACCTGTAAAAGAAATTTA 5485

 38267050 TGGCTCTAGGGATTTCAGCAAATTCTAAATAACCATAACAGGAACAGGAAGCATTAATTA 38267109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5486 TGGCTCTAGGGATTTCAGCAAATTCTAAATAACCATAACAGGAACAGGAAGCATTAATTA 5545

 38267110 AAGACACTAGAGTCTAAGTTATAACAGAAATCCTGACATTTAAGGCCCTGGTACCATTTA 38267169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5546 AAGACACTAGAGTCTAAGTTATAACAGAAATCCTGACATTTAAGGCCCTGGTACCATTTA 5605

 38267170 AATTTAAAATGGTATGACAAACAGAGAGTAATTTGATGGTCAGAAGGTTATAATGGATAC 38267229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5606 AATTTAAAATGGTATGACAAACAGAGAGTAATTTGATGGTCAGAAGGTTATAATGGATAC 5665

 38267230 CTTAATACCTTTGCCAAGAAAAAGTGTCTGTCCTTGCTCTAACCCCTACCCAGGGGCTTC 38267289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     5666 CTTAATACCTTTGCCAAGAAAAAGTGTCTGTCCTTGCTCTAATCCCTACCCAGGGGCTTC 5725

 38267290 AGGGGCCTCCTTCATAAAACATGGTGATGCCTAAATATTTTTGCGATATCTCATATATAA 38267349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5726 AGGGGCCTCCTTCATAAAACATGGTGATGCCTAAATATTTTTGCGATATCTCATATATAA 5785

 38267350 GCTGGTCTTTTCTTTAAGAATACGAGAGATTAAACACCAACCCCCAACATTCATACACCA 38267409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5786 GCTGGTCTTTTCTTTAAGAATACGAGAGATTAAACACCAACCCCCAACATTCATACACCA 5845

 38267410 ATTTTCAGATAAAACAGCTTAATATTTAAGATATATTTAGTGCAATTTGTCTATTTCTTG 38267469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5846 ATTTTCAGATAAAACAGCTTAATATTTAAGATATATTTAGTGCAATTTGTCTATTTCTTG 5905

 38267470 GTTTACTGGAGGGCTGTATTTAAAGCCAAGGGACCAAGGAACATTCCACAACACACTAAA 38267529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5906 GTTTACTGGAGGGCTGTATTTAAAGCCAAGGGACCAAGGAACATTCCACAACACACTAAA 5965

 38267530 GCAATTTTTCCCCAGGGAATATGCTGATTCTTTCCTAAAGGCAGAAGCCGACATTCCTGA 38267589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5966 GCAATTTTTCCCCAGGGAATATGCTGATTCTTTCCTAAAGGCAGAAGCCGACATTCCTGA 6025

 38267590 CTCATTCTGCCAAACCAAGCAATGAAAAATGCTTCACCTAATTTGAAAGATAATTTGTAA 38267649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6026 CTCATTCTGCCAAACCAAGCAATGAAAAATGCTTCACCTAATTTGAAAGATAATTTGTAA 6085

 38267650 TACCAGAGACTCAACTTGTTTTGTGTATCCAATACTAGCACCCTTTCCAGAATGTTGAAA 38267709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6086 TACCAGAGACTCAACTTGTTTTGTGTATCCAATACTAGCACCCTTTCCAGAATGTTGAAA 6145

 38267710 GTACACACTGTATGATTTGTCTAATGTATATTCAAAAAAGGAATACAAATTGATCCTCAA 38267769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6146 GTACACACTGTATGATTTGTCTAATGTATATTCAAAAAAGGAATACAAATTGATCCTCAA 6205

 38267770 AGTTCAAATCTGCAGTACATACTCTGTGTTCTGCCCCCACCCGTACCTTCATGAATTCTT 38267829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6206 AGTTCAAATCTGCAGTACATACTCTGTGTTCTGCCCCCACCCGTACCTTCATGAATTCTT 6265

 38267830 TCACCTAGCACGCAGGCTGTTTTCCCTTTGCGAAATCCCATGGTACATTTATAGTATTAA 38267889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6266 TCACCTAGCACGCAGGCTGTTTTCCCTTTGCGAAATCCCATGGTACATTTATAGTATTAA 6325

 38267890 TACCACTCACTTAGAATATGCCGTATTTTGTCTAATATTGCTAGATTTTGTGTGTATAAT 38267949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6326 TACCACTCACTTAGAATATGCCGTATTTTGTCTAATATTGCTAGATTTTGTGTGTATAAT 6385

 38267950 CTTATTCCTCAAGTAAATTACAAGACAAGGACTATAATTTATACATCCTCTACAACACTT 38268009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6386 CTTATTCCTCAAGTAAATTACAAGACAAGGACTATAATTTATACATCCTCTACAACACTT 6445

 38268010 GACACTGGCTTTGATTAGGCTCTTAATAAATATTTGTTGGTTGATTAATCAGTTGACCAC 38268069
          |.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6446 GGCACTGGCTTTGAGTAGGCTCTTAATAAATATTTGTTGGTTGATTAATCAGTTGACCAC 6505

 38268070 ACTTACTAATTGCAAGGTGACATCATTTATCATTAATAAACATATATGTGGATTACAAAA 38268129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6506 ACTTACTAATTGCAAGGTGACATCATTTATCATTAATAAACATATATGTGGATTACAAAA 6565

 38268130 ATATCATGTGAATTTGCATATAATCATATTAATCCCAAATTAGCACCTGAGAGTCCAACC 38268189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6566 ATATCATGTGAATTTGCATATAATCATATTAATCCCAAATTAGCACCTGAGAGTCCAACC 6625

 38268190 ACCCTCTCCTTTAGGCCCTTTTCACTTTTATGTCTACTTTTGCCTCACTTACAATTCCAC 38268249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6626 ACCCTCTCCTTTAGGCCCTTTTCACTTTTATGTCTACTTTTGCCTCACTTACAATTCCAC 6685

 38268250 TACTTACTTGCCTTCTTTCTCTTTTCAGCTTTGTGCTGTTATTTAATATCTCACCAGTTG 38268309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6686 TACTTACTTGCCTTCTTTCTCTTTTCAGCTTTGTGCTGTTATTTAATATCTCACCAGTTG 6745

 38268310 TGTAATTTCAGCTCCCAAATTGAATAAGACGTTCCCCCCAGTGGAACCCTCACCTTGACA 38268369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6746 TGTAATTTCAGCTCCCAAATTGAATAAGACGTTCCCCCCAGTGGAACCCTCACCTTGACA 6805

 38268370 AATAGCCAAATAGTA---ATTATTCCTTTCAGGGGTTGAGCTATGGAATCATGCTTGCAA 38268426
          |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6806 AATAGCCAAATAGTAATTATTATTCCTTTCAGGGGTTGAGCTATGGAATCATGCTTGCAA 6865

 38268427 TATCCCAGGCTTGAGTGCCTAGATATTTATGCTATACTTCCCTGTGTCGGAGTTTCCATC 38268486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6866 TATCCCAGGCTTGAGTGCCTAGATATTTATGCTATACTTCCCTGTGTCGGAGTTTCCATC 6925

 38268487 TGCGATTGTATTTCAAGCCCTCTCATTTTTTTTTTCAATATGATTAAGATAATTCCTTTA 38268546
          ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6926 TGCGATTGTATTTCAAGCCCTCTCA-TTTTTTTTTCAATATGATTAAGATAATTCCTTTA 6984

 38268547 TGAAGTTGGAAACTCAGACATTCAGAAAGAAACTTGACGTTTCATATTTTTGCTAACTTG 38268606
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6985 TGAAGCTGGAAACTCAGACATTCAGAAAGAAACTTGACGTTTCATATTTTTGCTAACTTG 7044

 38268607 CTCTTCCCATTTCCTTTCCTATCATTTTAGCCAGACTGAGGGAGAATTAATTTTGCAATG 38268666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     7045 CTCTTCCCATTTCCTTTCCTATCATTTTAGCCAGACTGAGGGAGAATTAATTTTGCAACG 7104

 38268667 GTCTCTATTTTTTTTTCCAAATGTGTGACCTCCATATTAATAGGAGCCAGAGTACTCATT 38268726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7105 GTCTCTATTTTTTTTTCCAAATGTGTGACCTCCATATTAATAGGAGCCAGAGTACTCATT 7164

 38268727 CATCACATCTGGTCAGTGTGAAACTGACATTTACAGGGTGGAATGTTTCCCACTCAGGAC 38268786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7165 CATCACATCTGGTCAGTGTGAAACTGACATTTACAGGGTGGAATGTTTCCCACTCAGGAC 7224

 38268787 AAATGGGGATCATTTGTAAAACATGCCGCACCCAATCATAGGTTCCCATGGATCTCCAAC 38268846
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     7225 AAATGGGGATCATTTGTAAAACATGCCACACCCAATCATAGGTTCCCATGGATCTCCAAC 7284

 38268847 TACATTTTTAAGCAACAATATAAACCATTCCCGAAACTGAAAGGTCTTTTCAAATATTTA 38268906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7285 TACATTTTTAAGCAACAATATAAACCATTCCCGAAACTGAAAGGTCTTTTCAAATATTTA 7344

 38268907 CTGCCTACCTATGGAATTTTTAT 38268929
          |||||||||||||||||||||||
     7345 CTGCCTACCTATGGAATTTTTAT 7367

Alignment time is 7.26582 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38249892,38276749] =>     26858 nucs '18 dna:chromosome chromosome:GRCh37:18:1:78077248:1'
Second seq [       1,    2182] =>      2182 nucs 'mol-32-3419-012791_2182'

Score:        2103
Aligned:      2180        nucs
Identic:      2173 (100%) nucs =>      1632 (100%)       541 ( 99%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38266750,38268384] EXCISED REGION [38268385,38268929]
 second seq =>  [       1,    1635] EXCISED REGION [    1639,    2182]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         3 nucs [1636,1638]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         6 nucs [1636,1641] to [1639,1644]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [38268384,38268384] to [38268385,38268385]
 second seq =>         1 nucs [1635,1635] to [1639,1639]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 38266750 TAAATGAACTTGATTTGAATGGAATGAGAGTTCAATGAAACTGTATATATTGTGAAACGT 38266809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TAAATGAACTTGATTTGAATGGAATGAGAGTTCAATGAAACTGTATATATTGTGAAACGT 60

 38266810 GGCAACTTACACCTACTCAAGACATTAAAAGAGATCATGCTTTCTTGCCTAAGTTTTATG 38266869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGCAACTTACACCTACTCAAGACATTAAAAGAGATCATGCTTTCTTGCCTAAGTTTTATG 120

 38266870 TCCAATTTGTTCCTGTTTCAAACCCCTCGACAAAAACAAAATCTTTTAATCTGTTTGCAA 38266929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCCAATTTGTTCCTGTTTCAAACCCCTCGACAAAAACAAAATCTTTTAATCTGTTTGCAA 180

 38266930 AATATTTCCTCCTTCCTCCCATCTTGCTGTTGCTGCTCTGTGATATACTGCCCTTGCTTA 38266989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AATATTTCCTCCTTCCTCCCATCTTGCTGTTGCTGCTCTGTGATATACTGCCCTTGCTTA 240

 38266990 TTACCCCTTTATAGCTGTTTTGTTAAAGTTCATACCGCTAAGACCTGTAAAAGAAATTTA 38267049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTACCCCTTTATAGCTGTTTTGTTAAAGTTCATACCGCTAAGACCTGTAAAAGAAATTTA 300

 38267050 TGGCTCTAGGGATTTCAGCAAATTCTAAATAACCATAACAGGAACAGGAAGCATTAATTA 38267109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGGCTCTAGGGATTTCAGCAAATTCTAAATAACCATAACAGGAACAGGAAGCATTAATTA 360

 38267110 AAGACACTAGAGTCTAAGTTATAACAGAAATCCTGACATTTAAGGCCCTGGTACCATTTA 38267169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAGACACTAGAGTCTAAGTTATAACAGAAATCCTGACATTTAAGGCCCTGGTACCATTTA 420

 38267170 AATTTAAAATGGTATGACAAACAGAGAGTAATTTGATGGTCAGAAGGTTATAATGGATAC 38267229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AATTTAAAATGGTATGACAAACAGAGAGTAATTTGATGGTCAGAAGGTTATAATGGATAC 480

 38267230 CTTAATACCTTTGCCAAGAAAAAGTGTCTGTCCTTGCTCTAACCCCTACCCAGGGGCTTC 38267289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
      481 CTTAATACCTTTGCCAAGAAAAAGTGTCTGTCCTTGCTCTAATCCCTACCCAGGGGCTTC 540

 38267290 AGGGGCCTCCTTCATAAAACATGGTGATGCCTAAATATTTTTGCGATATCTCATATATAA 38267349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGGGGCCTCCTTCATAAAACATGGTGATGCCTAAATATTTTTGCGATATCTCATATATAA 600

 38267350 GCTGGTCTTTTCTTTAAGAATACGAGAGATTAAACACCAACCCCCAACATTCATACACCA 38267409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GCTGGTCTTTTCTTTAAGAATACGAGAGATTAAACACCAACCCCCAACATTCATACACCA 660

 38267410 ATTTTCAGATAAAACAGCTTAATATTTAAGATATATTTAGTGCAATTTGTCTATTTCTTG 38267469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATTTTCAGATAAAACAGCTTAATATTTAAGATATATTTAGTGCAATTTGTCTATTTCTTG 720

 38267470 GTTTACTGGAGGGCTGTATTTAAAGCCAAGGGACCAAGGAACATTCCACAACACACTAAA 38267529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GTTTACTGGAGGGCTGTATTTAAAGCCAAGGGACCAAGGAACATTCCACAACACACTAAA 780

 38267530 GCAATTTTTCCCCAGGGAATATGCTGATTCTTTCCTAAAGGCAGAAGCCGACATTCCTGA 38267589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GCAATTTTTCCCCAGGGAATATGCTGATTCTTTCCTAAAGGCAGAAGCCGACATTCCTGA 840

 38267590 CTCATTCTGCCAAACCAAGCAATGAAAAATGCTTCACCTAATTTGAAAGATAATTTGTAA 38267649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTCATTCTGCCAAACCAAGCAATGAAAAATGCTTCACCTAATTTGAAAGATAATTTGTAA 900

 38267650 TACCAGAGACTCAACTTGTTTTGTGTATCCAATACTAGCACCCTTTCCAGAATGTTGAAA 38267709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TACCAGAGACTCAACTTGTTTTGTGTATCCAATACTAGCACCCTTTCCAGAATGTTGAAA 960

 38267710 GTACACACTGTATGATTTGTCTAATGTATATTCAAAAAAGGAATACAAATTGATCCTCAA 38267769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GTACACACTGTATGATTTGTCTAATGTATATTCAAAAAAGGAATACAAATTGATCCTCAA 1020

 38267770 AGTTCAAATCTGCAGTACATACTCTGTGTTCTGCCCCCACCCGTACCTTCATGAATTCTT 38267829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGTTCAAATCTGCAGTACATACTCTGTGTTCTGCCCCCACCCGTACCTTCATGAATTCTT 1080

 38267830 TCACCTAGCACGCAGGCTGTTTTCCCTTTGCGAAATCCCATGGTACATTTATAGTATTAA 38267889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TCACCTAGCACGCAGGCTGTTTTCCCTTTGCGAAATCCCATGGTACATTTATAGTATTAA 1140

 38267890 TACCACTCACTTAGAATATGCCGTATTTTGTCTAATATTGCTAGATTTTGTGTGTATAAT 38267949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TACCACTCACTTAGAATATGCCGTATTTTGTCTAATATTGCTAGATTTTGTGTGTATAAT 1200

 38267950 CTTATTCCTCAAGTAAATTACAAGACAAGGACTATAATTTATACATCCTCTACAACACTT 38268009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CTTATTCCTCAAGTAAATTACAAGACAAGGACTATAATTTATACATCCTCTACAACACTT 1260

 38268010 GACACTGGCTTTGATTAGGCTCTTAATAAATATTTGTTGGTTGATTAATCAGTTGACCAC 38268069
          |.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GGCACTGGCTTTGAGTAGGCTCTTAATAAATATTTGTTGGTTGATTAATCAGTTGACCAC 1320

 38268070 ACTTACTAATTGCAAGGTGACATCATTTATCATTAATAAACATATATGTGGATTACAAAA 38268129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ACTTACTAATTGCAAGGTGACATCATTTATCATTAATAAACATATATGTGGATTACAAAA 1380

 38268130 ATATCATGTGAATTTGCATATAATCATATTAATCCCAAATTAGCACCTGAGAGTCCAACC 38268189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ATATCATGTGAATTTGCATATAATCATATTAATCCCAAATTAGCACCTGAGAGTCCAACC 1440

 38268190 ACCCTCTCCTTTAGGCCCTTTTCACTTTTATGTCTACTTTTGCCTCACTTACAATTCCAC 38268249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ACCCTCTCCTTTAGGCCCTTTTCACTTTTATGTCTACTTTTGCCTCACTTACAATTCCAC 1500

 38268250 TACTTACTTGCCTTCTTTCTCTTTTCAGCTTTGTGCTGTTATTTAATATCTCACCAGTTG 38268309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TACTTACTTGCCTTCTTTCTCTTTTCAGCTTTGTGCTGTTATTTAATATCTCACCAGTTG 1560

 38268310 TGTAATTTCAGCTCCCAAATTGAATAAGACGTTCCCCCCAGTGGAACCCTCACCTTGACA 38268369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TGTAATTTCAGCTCCCAAATTGAATAAGACGTTCCCCCCAGTGGAACCCTCACCTTGACA 1620

 38268370 AATAGCCAAATAGTA 38268384
          |||||||||||||||
     1621 AATAGCCAAATAGTA 1635

EXCISED REGION

 38268385 ATTATTCCTTTCAGGGGTTGAGCTATGGAATCATGCTTGCAATATCCCAGGCTTGAGTGC 38268444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1639 ATTATTCCTTTCAGGGGTTGAGCTATGGAATCATGCTTGCAATATCCCAGGCTTGAGTGC 1698

 38268445 CTAGATATTTATGCTATACTTCCCTGTGTCGGAGTTTCCATCTGCGATTGTATTTCAAGC 38268504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1699 CTAGATATTTATGCTATACTTCCCTGTGTCGGAGTTTCCATCTGCGATTGTATTTCAAGC 1758

 38268505 CCTCTCATTTTTTTTTTCAATATGATTAAGATAATTCCTTTATGAAGTTGGAAACTCAGA 38268564
          ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     1759 CCTCTCA-TTTTTTTTTCAATATGATTAAGATAATTCCTTTATGAAGCTGGAAACTCAGA 1817

 38268565 CATTCAGAAAGAAACTTGACGTTTCATATTTTTGCTAACTTGCTCTTCCCATTTCCTTTC 38268624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1818 CATTCAGAAAGAAACTTGACGTTTCATATTTTTGCTAACTTGCTCTTCCCATTTCCTTTC 1877

 38268625 CTATCATTTTAGCCAGACTGAGGGAGAATTAATTTTGCAATGGTCTCTATTTTTTTTTCC 38268684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     1878 CTATCATTTTAGCCAGACTGAGGGAGAATTAATTTTGCAACGGTCTCTATTTTTTTTTCC 1937

 38268685 AAATGTGTGACCTCCATATTAATAGGAGCCAGAGTACTCATTCATCACATCTGGTCAGTG 38268744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1938 AAATGTGTGACCTCCATATTAATAGGAGCCAGAGTACTCATTCATCACATCTGGTCAGTG 1997

 38268745 TGAAACTGACATTTACAGGGTGGAATGTTTCCCACTCAGGACAAATGGGGATCATTTGTA 38268804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1998 TGAAACTGACATTTACAGGGTGGAATGTTTCCCACTCAGGACAAATGGGGATCATTTGTA 2057

 38268805 AAACATGCCGCACCCAATCATAGGTTCCCATGGATCTCCAACTACATTTTTAAGCAACAA 38268864
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2058 AAACATGCCACACCCAATCATAGGTTCCCATGGATCTCCAACTACATTTTTAAGCAACAA 2117

 38268865 TATAAACCATTCCCGAAACTGAAAGGTCTTTTCAAATATTTACTGCCTACCTATGGAATT 38268924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2118 TATAAACCATTCCCGAAACTGAAAGGTCTTTTCAAATATTTACTGCCTACCTATGGAATT 2177

 38268925 TTTAT 38268929
          |||||
     2178 TTTAT 2182

Alignment time is 2.32029 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38249892,38276749] =>     26858 nucs '18 dna:chromosome chromosome:GRCh37:18:1:78077248:1'
Second seq [       1,    7772] =>      7772 nucs 'mol-32-3492-183818_7772'

Score:        7307
Aligned:      7786        nucs
Identic:      7731 ( 99%) nucs =>      2109 ( 99%)      5622 ( 99%)
Gaps:           24 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38264121,38266242] EXCISED REGION [38266251,38271904]
 second seq =>  [       1,    2118] EXCISED REGION [    2119,    7772]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         8 nucs [38266243,38266250]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         8 nucs [38266243,38266250] to [38266251,38266258]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [38266242,38266242] to [38266251,38266251]
 second seq =>         1 nucs [2118,2118] to [2119,2119]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 38264121 CTTCTTTTGACCATATAGAAGTGTATTCATTAATTCAATCACATATAAATATTCTCCTTT 38264180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTTCTTTTGACCATATAGAAGTGTATTCATTAATTCAATCACATATAAATATTCTCCTTT 60

 38264181 TATCTTTTTGCTACTGGTTTGTTTGTTTAGCTACATTTAGGGAAAATTTCATTTCTGAGA 38264240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TATCTTTTTGCTACTGGTTTGTTTGTTTAGCTACATTTAGGGAAAATTTCATTTCTGAGA 120

 38264241 CGACAGAGGAAGCACATTCCATTTTATTCCTTCTGCTAATGACAAAAAAAAAAAAAAATT 38264300
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||
      121 CGACAGAGGAAGCACATTCCATTTTATTCCTTCTGCTAATGACAAAAAAAAAAAA---TT 177

 38264301 GGAAAAAACACAAAAGCCAGAGTCAAAAGACTCTGAAAAATGGAGAAAAAGTGCAGACAG 38264360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      178 GGAAAAAACACAAAAGCCAGAGTCAAAAGACTCTGAAAAATGGAGAAAAAGTGCAGACAG 237

 38264361 GCTAAGGATTTGGGAGATTGAGGAACAACGACAGGTGAGTTCTCTGTCTTTTTTTTT-CT 38264419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
      238 GCTAAGGATTTGGGAGATTGAGGAACAACGACAGGTGAGTTCTCTGTCTTTTTTTTTTCT 297

 38264420 TTCTTTTTTGATATATATATATATATCAACAATCTCAATGTTTAAGAGAAGCCCTCAAGC 38264479
          ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||.|
      298 TTCTTTTTTGATATATATATAT----CAACAATCTCAATGTTTAAGAGAAGCCCTCAATC 353

 38264480 CAGAATTTCCAACAGTTGCAGATAAAACATTGTGCTTGCTTAACGTATTTAACCAAAAGA 38264539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      354 CAGAATTTCCAACAGTTGCAGATAAAACATTGTGCTTGCTTAACGTATTTAACCAAAAGA 413

 38264540 CCCGAAAAGCAAGGATATAAAAGAATATTTTAATAATATCATTCTGTTCTTAAGGTGAAC 38264599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      414 CCCGAAAAGCAAGGATATAAAAGAATATTTTAATAATATCATTCTGTTCTTAAGGTGAAC 473

 38264600 ACTTCAAAGAAACCACACCCCTCCCCTCCCCAATGCGTGCTGAAGCAGTGGAATCCATGA 38264659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      474 ACTTCAAAGAAACCACACCCCTCCCCTCCCCAATGCGTGCTGAAGCAGTGGAATCCATGA 533

 38264660 GTGGAACCTTGTCATATATAATCTCCACACTAAATTTATAGCAAAGCCCCCATCTCTCAA 38264719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      534 GTGGAACCTTGTCATATATAATCTCCACACTAAATTTATAGCAAAGCCCCCATCTCTCAA 593

 38264720 CCTGTGTTGAAATTCTGACTTCCAGACACACCTTTCAGTAATGAGGAGGTACTCTTCCAT 38264779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      594 CCTGTGTTGAAATTCTGACTTCCAGACACACCTTTCAGTAATGAGGAGGTACTCTTCCAT 653

 38264780 GATAAACCCTGTGGGCAAAGCTTCCACATTCATCCCACCCCTAAAGCAATAAATTTGCAC 38264839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      654 GATAAACCCTGTGGGCAAAGCTTCCACATTCATCCCACCCCTAAAGCAATAAATTTGCAC 713

 38264840 CTTTCCCAAGTAGAATCAATGGGAAGAATTTTGACTTCTATCCCCACCTGATGGTAATGA 38264899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      714 CTTTCCCAAGTAGAATCAATGGGAAGAATTTTGACTTCTATCCCCACCTGATGGTAATGA 773

 38264900 GGCAGTATCTCTCTCTTTTTCCAGACAGTGTTTAAGAATTTGTTGTATAGAGCGCTATTA 38264959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      774 GGCAGTATCTCTCTCTTTTTCCAGACAGTGTTTAAGAATTTGTTGTATAGAGCGCTATTA 833

 38264960 CCTGAATAACACATTGTGGCAGAGCAAAATAACCCTTAAGCATTTAGTTTTCAGATTTAT 38265019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      834 CCTGAATAACACATTGTGGCAGAGCAAAATAACCCTTAAGCATTTAGTTTTCAGATTTAT 893

 38265020 TTTCAACTATTTAGAGGGTTATTTCTTGACTACCACAGATAAGTCATTCCCTTCTCCATT 38265079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      894 TTTCAACTATTTAGAGGGTTATTTCTTGACTACCACAGATAAGTCATTCCCTTCTCCATT 953

 38265080 GTTCTATAGTTTACTGCCCTTTTTTTCTATCATGGCATTTACCCACTATTTCATATTGTT 38265139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      954 GTTCTATAGTTTACTGCCCTTTTTTTCTATCATGGCATTTACCCACTATTTCATATTGTT 1013

 38265140 ATTTATAGTTTACATGCTTAATATCTCCATCTCCCAACAAATATGGGAACATCATTAGGT 38265199
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1014 ATTTTTAGTTTACATGCTTAATATCTCCATCTCCCAACAAATATGGGAACATCATTAGGT 1073

 38265200 CAGAGAAATTTTATTTCTTTTCCCTCTGAAGTCTCAGTATTAGTTGTTACATTAATTAGC 38265259
          ||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     1074 CAGAGAAATTTTATTTCTTTCCCCTCTGAAGTCTCAGTACTAGTTGTTACATTAATTAGC 1133

 38265260 ACTTATTTAAATTTTTAGTTTTCTTTTTCTTTGCCTCATGTTACTGTTACACCCTTCCAC 38265319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1134 ACTTATTTAAATTTTTAGTTTTCTTTTTCTTTGCCTCATGTTACTGTTACACCCTTCCAC 1193

 38265320 TACCAAGCTTAAAGTTAGGAATGATTCATGTGACTGGAATTGAATGACTGCTCTGAGAAA 38265379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1194 TACCAAGCTTAAAGTTAGGAATGATTCATGTGACTGGAATTGAATGACTGCTCTGAGAAA 1253

 38265380 GAAGTCCATAAAAGTCTGCATGCAATTTGCCATGTCTCCATCCTTTCTTTGCCATAGAAA 38265439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1254 GAAGTCCATAAAAGTCTGCATGCAATTTGCCATGTCTCCATCCTTTCTTTGCCATAGAAA 1313

 38265440 CTAAAGATCTTCCAGATAGTCGAGGCTCTGTTAATGTTATTTCTTGAATAACGACTATCT 38265499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1314 CTAAAGATCTTCCAGATAGTCGAGGCTCTGTTAATGTTATTTCTTGAATAACGACTATCT 1373

 38265500 GAACAGAACATCTGTGACTTGGAATGGGGACATGTAGCTTGGAGAAAAAGTAAGCACACA 38265559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1374 GAACAGAACATCTGTGACTTGGAATGGGGACATGTAGCTTGGAGAAAAAGTAAGCACACA 1433

 38265560 GTGTTTTAAGTTACTGTGGTTTTATGGTTATTTGTTACTGCAGCATAACCCACCCTGCCC 38265619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1434 GTGTTTTAAGTTACTGTGGTTTTATGGTTATTTGTTACTGCAGCATAACCCACCCTGCCC 1493

 38265620 TGACTTAAGTGATATAATATTTAACAAATATTTATAAAATAAATAAATTCAAATTCACTC 38265679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1494 TGACTTAAGTGATATAATATTTAACAAATATTTATAAAATAAATAAATTCAAATTCACTC 1553

 38265680 TAATACCTAGAAAATTATCAAGTATAGTAAACCAAATAATAAATATTTATTAAGGAATAT 38265739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1554 TAATACCTAGAAAATTATCAAGTATAGTAAACCAAATAATAAATATTTATTAAGGAATAT 1613

 38265740 GGAAACAGTGACCTATGAGAAGTCTTGATATACTGACCATCCATTGTTGCAGCAGATCTC 38265799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1614 GGAAACAGTGACCTATGAGAAGTCTTGATATACTGACCATCCATTGTTGCAGCAGATCTC 1673

 38265800 ACTATTGCTATTGTGCTTAACATTTCAATTACAAAAATTAAAAAAAAAAAACACCATTCA 38265859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1674 ACTATTGCTATTGTGCTTAACATTTCAATTACAAAAATTAAAAAAAAAAAACACCATTCA 1733

 38265860 TCAGTGCAGGTCTGTGTATTTAAAGAAATAATTTACAAGTTTTTTTTTCCTTTGTAAACA 38265919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
     1734 TCAGTGCAGGTCTGTGTATTTAAAGAAATAATTTACAAGTTTTTTTT-CCTTTGTAAACA 1792

 38265920 TATTGTTTTGAAGTGCAAATATATATAATTTGCACTTTGGGATGGAATGGAATGGGATGC 38265979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1793 TATTGTTTTGAAGTGCAAATATATATAATTTGCACTTTGGGATGGAATGGAATGGGATGC 1852

 38265980 CCTATTGGCAGTCCATACATCTGGATTATAAATGGATTTCCATCCCATCTTCCTCCCCAT 38266039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1853 CCTATTGGCAGTCCATACATCTGGATTATAAATGGATTTCCATCCCATCTTCCTCCCCAT 1912

 38266040 CTCTTTCCCTTTTTGATCATTCTATGGAAATGGAAAGCTAGCAGAAGTTTGAAGAATTGT 38266099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1913 CTCTTTCCCTTTTTGATCATTCTATGGAAATGGAAAGCTAGCAGAAGTTTGAAGAATTGT 1972

 38266100 CACGCAAACAACAACAACAA---AACTTTAGCATATTAACCTGTTGTCCAACCTTATATA 38266156
          ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1973 CACGCAAACAACAACAACAACAAAACTTTAGCATATTAACCTGTTGTCCAACCTTATATA 2032

 38266157 AGCAGTTTGTATTTAAAACATCCCTAAGTGGATTTTAATTCCAGTTTCAATCATTGTTAA 38266216
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     2033 AGCAGTTTGTATTTAAAACATCCCTAAGTGGATTTTAATTCCAATTTCAATCATTGTTAA 2092

 38266217 CTATTTTTGAAATATTTAAAATCCCA 38266242
          ||||||||||||||||||||||||||
     2093 CTATTTTTGAAATATTTAAAATCCCA 2118

EXCISED REGION

 38266251 ACCACTATTTCTCTTCAACTAGTCCTTACTTTTATAAACAAAAAAGTAACAGTAAATAAT 38266310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2119 ACCACTATTTCTCTTCAACTAGTCCTTACTTTTATAAACAAAAAAGTAACAGTAAATAAT 2178

 38266311 TTATAACTAGGTCTCTCTGAATCTAAAAACACGTTCTTATACACTATGTGATGCCATATT 38266370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     2179 TTATAACTAGGTCTCTCTGAATCTAAAAACACATTCTTATACACTATGTGATGCCATATT 2238

 38266371 TTTTACTCTTGTCTTTGTGAGTTTTTTGTGCCATTCTCTCCTCTGGAATGGTCTTCTGTG 38266430
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2239 TTTTACTCTTGACTTTGTGAGTTTTTTGTGCCATTCTCTCCTCTGGAATGGTCTTCTGTG 2298

 38266431 CTTACACATTCCAAGGGCTACTCCATTTTACAAGAAACAGTTCATGTTTGCTACTTTGGG 38266490
          .|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2299 TTTACACATTCCAAGGGCTAATCCATTTTACAAGAAACAGTTCATGTTTGCTACTTTGGG 2358

 38266491 GTTGATCCCATGATAATTCTGGTTCTCACTTGGTCTTTCCCTGTGAGATGCAGTAGCATT 38266550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2359 GTTGATCCCATGATAATTCTGGTTCTCACTTGGTCTTTCCCTGTGAGATGCAGTAGCATT 2418

 38266551 CAAAATTCTCAGACTATTCTATGCACCTTGGCAGATTTATGGTAATGGTCTATAATTGCT 38266610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2419 CAAAATTCTCAGACTATTCTATGCACCTTGGCAGATTTATGGTAATGGTCTATAATTGCT 2478

 38266611 TCATATCTGCTAACCTTGCTTCCAAAACTAGTTTTTGAGATTAATGAGACAGGAGCTTGG 38266670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2479 TCATATCTGCTAACCTTGCTTCCAAAACTAGTTTTTGAGATTAATGAGACAGGAGCTTGG 2538

 38266671 CTTTTTCTTTCTGTATAGCTTCCATAGCAACAAGAAAATATTAGACACACAGTAGGCATT 38266730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2539 CTTTTTCTTTCTGTATAGCTTCCATAGCAACAAGAAAATATTAGACACACAGTAGGCATT 2598

 38266731 GGAAGAAAATGTGTTCAGTTAAATGAACTTGATTTGAATGGAATGAGAGTTCAATGAAAC 38266790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2599 GGAAGAAAATGTGTTCAGTTAAATGAACTTGATTTGAATGGAATGAGAGTTCAATGAAAC 2658

 38266791 TGTATATATTGTGAAACGTGGCAACTTACACCTACTCAAGACATTAAAAGAGATCATGCT 38266850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2659 TGTATATATTGTGAAACGTGGCAACTTACACCTACTCAAGACATTAAAAGAGATCATGCT 2718

 38266851 TTCTTGCCTAAGTTTTATGTCCAATTTGTTCCTGTTTCAAACCCCTCGACAAAAACAAAA 38266910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2719 TTCTTGCCTAAGTTTTATGTCCAATTTGTTCCTGTTTCAAACCCCTCGACAAAAACAAAA 2778

 38266911 TCTTTTAATCTGTTTGCAAAATATTTCCTCCTTCCTCCCATCTTGCTGTTGCTGCTCTGT 38266970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2779 TCTTTTAATCTGTTTGCAAAATATTTCCTCCTTCCTCCCATCTTGCTGTTGCTGCTCTGT 2838

 38266971 GATATACTGCCCTTGCTTATTACCCCTTTATAGCTGTTTTGTTAAAGTTCATACCGCTAA 38267030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2839 GATATACTGCCCTTGCTTATTACCCCTTTATAGCTGTTTTGTTAAAGTTCATACCGCTAA 2898

 38267031 GACCTGTAAAAGAAATTTATGGCTCTAGGGATTTCAGCAAATTCTAAATAACCATAACAG 38267090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2899 GACCTGTAAAAGAAATTTATGGCTCTAGGGATTTCAGCAAATTCTAAATAACCATAACAG 2958

 38267091 GAACAGGAAGCATTAATTAAAGACACTAGAGTCTAAGTTATAACAGAAATCCTGACATTT 38267150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2959 GAACAGGAAGCATTAATTAAAGACACTAGAGTCTAAGTTATAACAGAAATCCTGACATTT 3018

 38267151 AAGGCCCTGGTACCATTTAAATTTAAAATGGTATGACAAACAGAGAGTAATTTGATGGTC 38267210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3019 AAGGCCCTGGTACCATTTAAATTTAAAATGGTATGACAAACAGAGAGTAATTTGATGGTC 3078

 38267211 AGAAGGTTATAATGGATACCTTAATACCTTTGCCAAGAAAAAGTGTCTGTCCTTGCTCTA 38267270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3079 AGAAGGTTATAATGGATACCTTAATACCTTTGCCAAGAAAAAGTGTCTGTCCTTGCTCTA 3138

 38267271 ACCCCTACCCAGGGGCTTCAGGGGCCTCCTTCATAAAACATGGTGATGCCTAAATATTTT 38267330
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3139 ATCCCTACCCAGGGGCTTCAGGGGCCTCCTTCATAAAACATGGTGATGCCTAAATATTTT 3198

 38267331 TGCGATATCTCATATATAAGCTGGTCTTTTCTTTAAGAATACGAGAGATTAAACACCAAC 38267390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3199 TGCGATATCTCATATATAAGCTGGTCTTTTCTTTAAGAATACGAGAGATTAAACACCAAC 3258

 38267391 CCCCAACATTCATACACCAATTTTCAGATAAAACAGCTTAATATTTAAGATATATTTAGT 38267450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3259 CCCCAACATTCATACACCAATTTTCAGATAAAACAGCTTAATATTTAAGATATATTTAGT 3318

 38267451 GCAATTTGTCTATTTCTTGGTTTACTGGAGGGCTGTATTTAAAGCCAAGGGACCAAGGAA 38267510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3319 GCAATTTGTCTATTTCTTGGTTTACTGGAGGGCTGTATTTAAAGCCAAGGGACCAAGGAA 3378

 38267511 CATTCCACAACACACTAAAGCAATTTTTCCCCAGGGAATATGCTGATTCTTTCCTAAAGG 38267570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3379 CATTCCACAACACACTAAAGCAATTTTTCCCCAGGGAATATGCTGATTCTTTCCTAAAGG 3438

 38267571 CAGAAGCCGACATTCCTGACTCATTCTGCCAAACCAAGCAATGAAAAATGCTTCACCTAA 38267630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3439 CAGAAGCCGACATTCCTGACTCATTCTGCCAAACCAAGCAATGAAAAATGCTTCACCTAA 3498

 38267631 TTTGAAAGATAATTTGTAATACCAGAGACTCAACTTGTTTTGTGTATCCAATACTAGCAC 38267690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3499 TTTGAAAGATAATTTGTAATACCAGAGACTCAACTTGTTTTGTGTATCCAATACTAGCAC 3558

 38267691 CCTTTCCAGAATGTTGAAAGTACACACTGTATGATTTGTCTAATGTATATTCAAAAAAGG 38267750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3559 CCTTTCCAGAATGTTGAAAGTACACACTGTATGATTTGTCTAATGTATATTCAAAAAAGG 3618

 38267751 AATACAAATTGATCCTCAAAGTTCAAATCTGCAGTACATACTCTGTGTTCTGCCCCCACC 38267810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3619 AATACAAATTGATCCTCAAAGTTCAAATCTGCAGTACATACTCTGTGTTCTGCCCCCACC 3678

 38267811 CGTACCTTCATGAATTCTTTCACCTAGCACGCAGGCTGTTTTCCCTTTGCGAAATCCCAT 38267870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3679 CGTACCTTCATGAATTCTTTCACCTAGCACGCAGGCTGTTTTCCCTTTGCGAAATCCCAT 3738

 38267871 GGTACATTTATAGTATTAATACCACTCACTTAGAATATGCCGTATTTTGTCTAATATTGC 38267930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3739 GGTACATTTATAGTATTAATACCACTCACTTAGAATATGCCGTATTTTGTCTAATATTGC 3798

 38267931 TAGATTTTGTGTGTATAATCTTATTCCTCAAGTAAATTACAAGACAAGGACTATAATTTA 38267990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3799 TAGATTTTGTGTGTATAATCTTATTCCTCAAGTAAATTACAAGACAAGGACTATAATTTA 3858

 38267991 TACATCCTCTACAACACTTGACACTGGCTTTGATTAGGCTCTTAATAAATATTTGTTGGT 38268050
          ||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     3859 TACATCCTCTACAACACTTGGCACTGGCTTTGAGTAGGCTCTTAATAAATATTTGTTGGT 3918

 38268051 TGATTAATCAGTTGACCACACTTACTAATTGCAAGGTGACATCATTTATCATTAATAAAC 38268110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3919 TGATTAATCAGTTGACCACACTTACTAATTGCAAGGTGACATCATTTATCATTAATAAAC 3978

 38268111 ATATATGTGGATTACAAAAATATCATGTGAATTTGCATATAATCATATTAATCCCAAATT 38268170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3979 ATATATGTGGATTACAAAAATATCATGTGAATTTGCATATAATCATATTAATCCCAAATT 4038

 38268171 AGCACCTGAGAGTCCAACCACCCTCTCCTTTAGGCCCTTTTCACTTTTATGTCTACTTTT 38268230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4039 AGCACCTGAGAGTCCAACCACCCTCTCCTTTAGGCCCTTTTCACTTTTATGTCTACTTTT 4098

 38268231 GCCTCACTTACAATTCCACTACTTACTTGCCTTCTTTCTCTTTTCAGCTTTGTGCTGTTA 38268290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4099 GCCTCACTTACAATTCCACTACTTACTTGCCTTCTTTCTCTTTTCAGCTTTGTGCTGTTA 4158

 38268291 TTTAATATCTCACCAGTTGTGTAATTTCAGCTCCCAAATTGAATAAGACGTTCCCCCCAG 38268350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4159 TTTAATATCTCACCAGTTGTGTAATTTCAGCTCCCAAATTGAATAAGACGTTCCCCCCAG 4218

 38268351 TGGAACCCTCACCTTGACAAATAGCCAAATAGTA---ATTATTCCTTTCAGGGGTTGAGC 38268407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||
     4219 TGGAACCCTCACCTTGACAAATAGCCAAATAGTAATTATTATTCCTTTCAGGGGTTGAGC 4278

 38268408 TATGGAATCATGCTTGCAATATCCCAGGCTTGAGTGCCTAGATATTTATGCTATACTTCC 38268467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4279 TATGGAATCATGCTTGCAATATCCCAGGCTTGAGTGCCTAGATATTTATGCTATACTTCC 4338

 38268468 CTGTGTCGGAGTTTCCATCTGCGATTGTATTTCAAGCCCTCTCATTTTTTTTTTCAATAT 38268527
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
     4339 CTGTGTCGGAGTTTCCATCTGCGATTGTATTTCAAGCCCTCTCA-TTTTTTTTTCAATAT 4397

 38268528 GATTAAGATAATTCCTTTATGAAGTTGGAAACTCAGACATTCAGAAAGAAACTTGACGTT 38268587
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4398 GATTAAGATAATTCCTTTATGAAGCTGGAAACTCAGACATTCAGAAAGAAACTTGACGTT 4457

 38268588 TCATATTTTTGCTAACTTGCTCTTCCCATTTCCTTTCCTATCATTTTAGCCAGACTGAGG 38268647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4458 TCATATTTTTGCTAACTTGCTCTTCCCATTTCCTTTCCTATCATTTTAGCCAGACTGAGG 4517

 38268648 GAGAATTAATTTTGCAATGGTCTCTATTTTTTTTTCCAAATGTGTGACCTCCATATTAAT 38268707
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4518 GAGAATTAATTTTGCAACGGTCTCTATTTTTTTTTCCAAATGTGTGACCTCCATATTAAT 4577

 38268708 AGGAGCCAGAGTACTCATTCATCACATCTGGTCAGTGTGAAACTGACATTTACAGGGTGG 38268767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4578 AGGAGCCAGAGTACTCATTCATCACATCTGGTCAGTGTGAAACTGACATTTACAGGGTGG 4637

 38268768 AATGTTTCCCACTCAGGACAAATGGGGATCATTTGTAAAACATGCCGCACCCAATCATAG 38268827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     4638 AATGTTTCCCACTCAGGACAAATGGGGATCATTTGTAAAACATGCCACACCCAATCATAG 4697

 38268828 GTTCCCATGGATCTCCAACTACATTTTTAAGCAACAATATAAACCATTCCCGAAACTGAA 38268887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4698 GTTCCCATGGATCTCCAACTACATTTTTAAGCAACAATATAAACCATTCCCGAAACTGAA 4757

 38268888 AGGTCTTTTCAAATATTTACTGCCTACCTATGGAATTTTTATTCTGCTTGCTGCTGCCAT 38268947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4758 AGGTCTTTTCAAATATTTACTGCCTACCTATGGAATTTTTATTCTGCTTGCTGCTGCCAT 4817

 38268948 CAATAATCCTGGGAGTTCCTAGCTAAGTGTTGTGTATGACCTCCAAGGAAAGTCTTAGCA 38269007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4818 CAATAATCCTGGGAGTTCCTAGCTAAGTGTTGTGTATGACCTCCAAGGAAAGTCTTAGCA 4877

 38269008 TTGCAGAATGGGGAGGCGGGTTAGTATCCTGCATTTTTCATTCTGTCACTTTCTAGGGAC 38269067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4878 TTGCAGAATGGGGAGGCGGGTTAGTATCCTGCATTTTTCATTCTGTCACTTTCTAGGGAC 4937

 38269068 AATTACAAAGAAAATAATCATATAAGACTTATTTTTATGTTTATTATGAAAGCCTTCAGC 38269127
          |||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     4938 AATTACAAAGAAAATAATCGTATAAGACTTATTTTTATGTTCATTATGAAAGCCTTCAGC 4997

 38269128 TCTTGCATTTGCAAGTAAGCTCAATGATTTTAAGTTTGCTTTTTCCCCCATGAAATGAAA 38269187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4998 TCTTGCATTTGCAAGTAAGCTCAATGATTTTAAGTTTGCTTTTTCCCCCATGAAATGAAA 5057

 38269188 TATTATTTCCCACTTCTTCCATGAATCTATTGGGTAACTCCAGGCCACTGTGATCTTTCA 38269247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5058 TATTATTTCCCACTTCTTCCATGAATCTATTGGGTAACTCCAGGCCACTGTGATCTTTCA 5117

 38269248 TCTGGCATTTTGCTTTTATTTTTCTAGATCACAGTTGTGATTTAAAGCCCTCCTGGCACT 38269307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5118 TCTGGCATTTTGCTTTTATTTTTCTAGATCACAGTTGTGATTTAAAGCCCTCCTGGCACT 5177

 38269308 TGGACACCTTGGTGATCTTAGCTCATGCTCCTAGTTCCATAGTGATGAATTGACCAAACT 38269367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5178 TGGACACCTTGGTGATCTTAGCTCATGCTCCTAGTTCCATAGTGATGAATTGACCAAACT 5237

 38269368 TTTTCCCAAGGATATCTGCTAATTCTGGAGTTTCTGCTTTCTTATTATCTGTTCTGTCTT 38269427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5238 TTTTCCCAAGGATATCTGCTAATTCTGGAGTTTCTGCTTTCTTATTATCTGTTCTGTCTT 5297

 38269428 TTGGTTCTGTATTGATATAACAAGCTTTGTCCCCTTATCAATGAGGGCACAAAATGCAGC 38269487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     5298 TTGGTTCTGTATTGATATAACAAGCTTTGTCCCCTTATCAATGAGGGCACAAAATGAAGC 5357

 38269488 ACTTCAAATAATTTCTGCAAAAATTTACAGTTGCTGCATTAAGAATTTTGTGAGCTTCAA 38269547
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5358 ACTTCAAATAGTTTCTGCAAAAATTTACAGTTGCTGCATTAAGAATTTTGTGAGCTTCAA 5417

 38269548 TAATGTTATTGAAAAGTTGCAGATTCCCTCCTCCTTCTTTTTCTCCTTTCCTCCTCTTTC 38269607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5418 TAATGTTATTGAAAAGTTGCAGATTCCCTCCTCCTTCTTTTTCTCCTTTCCTCCTCTTTC 5477

 38269608 TGCCCTGTCTCCCCTTCATTATTCTCCTCTTCTTCTCAAAAGCAAACAATCATTTTTCTT 38269667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5478 TGCCCTGTCTCCCCTTCATTATTCTCCTCTTCTTCTCAAAAGCAAACAATCATTTTTCTT 5537

 38269668 GCCTACTGAAGAATACTTGTAATGTTATTCTCAAAACCTGGACACCAGCTCAACTCCTTC 38269727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5538 GCCTACTGAAGAATACTTGTAATGTTATTCTCAAAACCTGGACACCAGCTCAACTCCTTC 5597

 38269728 TTTGTTCTACAAGTATTCACCCACCCTAATAGGGAGTTTATTCCAATGAAAAGACTGTGT 38269787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5598 TTTGTTCTACAAGTATTCACCCACCCTAATAGGGAGTTTATTCCAATGAAAAGACTGTGT 5657

 38269788 TCCTCCTCAGAGGAATTTATGAGGTGGTAAGAGAGTAGAATTGCATTAATCTTATGCCAT 38269847
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5658 TCCTCCTCAGAGGAATTTATGAGGAGGTAAGAGAGTAGAATTGCATTAATCTTATGCCAT 5717

 38269848 TCCTAGAGAATTCTTATTTCCTCAATTAAGGTTTAATTGCTCTGTTCTGAAAAAAAAAAA 38269907
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||
     5718 TCCTAGAGAATTCTTATTTCCTCAATTAAGGTTTAATTGCTCTGTTCTG---AAAAAAAA 5774

 38269908 AAAATGGTGAGTCCAAGCAGATAATTTACAGTGACCTGTATCTGTGACTAGTTTTAAGGC 38269967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5775 AAAATGGTGAGTCCAAGCAGATAATTTACAGTGACCTGTATCTGTGACTAGTTTTAAGGC 5834

 38269968 TACCCTGAGGTCAGAATTTAAACATGTTAATTCAGTACTGGACTTAATAGTAAACAAGAT 38270027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5835 TACCCTGAGGTCAGAATTTAAACATGTTAATTCAGTACTGGACTTAATAGTAAACAAGAT 5894

 38270028 AGAGATATCTCTGTCTCACAAAGATTTGTAATACAACTCACAGAAGCTTTACTCCAAATG 38270087
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     5895 AGAGATATCTCTGTCTCACAGAGATTTGTAATACAACTCACAGACGCTTTACTCCAAATG 5954

 38270088 AAAGGGTCATAGTTAGAGGGAAATTCCATAATAATAGTACCTATCTGATAGGGTGAATGT 38270147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5955 AAAGGGTCATAGTTAGAGGGAAATTCCATAATAATAGTACCTATCTGATAGGGTGAATGT 6014

 38270148 GGGAATTAAACGAGTTCATAGCTATAAAGAATTTCAGAGGCCATCTGGCAATCACAAATA 38270207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6015 GGGAATTAAACGAGTTCATAGCTATAAAGAATTTCAGAGGCCATCTGGCAATCACAAATA 6074

 38270208 ATAACTCTTAGTGGCAGCATTAGCTAGTTCCTGAATAGCCAAATATCTTGAATCCTCATA 38270267
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6075 ATAACTGTTAGTGGCAGCATTAGCTAGTTCCTGAATAGCCAAATATCTTGAATCCTCATA 6134

 38270268 ACAATGATTCAAATAAATGTCATCATTATTTCACAGAGTAAGATACTTAAGCATTGGGAG 38270327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6135 ACAATGATTCAAATAAATGTCATCATTATTTCACAGAGTAAGATACTTAAGCATTGGGAG 6194

 38270328 TTATTAAGCAATTCTTTAAGGACATAGCAGCAACATGTAGAGGAGCTGAAATTACAACAT 38270387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6195 TTATTAAGCAATTCTTTAAGGACATAGCAGCAACATGTAGAGGAGCTGAAATTACAACAT 6254

 38270388 GGTTCTTTCCGAACTTTAAGTCCCCTGTTTTTGTGTCTATGACTTTAAATATTCATAGTG 38270447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6255 GGTTCTTTCCGAACTTTAAGTCCCCTGTTTTTGTGTCTATGACTTTAAATATTCATAGTG 6314

 38270448 GAATATCTATCTATCTACAGATAATTTCATGAAACATTAAACTAAGTTTGG--TTTTTCT 38270505
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||
     6315 GAATATCTATCTATCTACAGATAATTTCATGAAACATTAAACTAAGTTT--TTTTTTTCT 6372

 38270506 AAAATGCTAACCTCTGTTTAACTATCAACCTAGGCAAAAATGGACAATTCCCTGTACCTC 38270565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6373 AAAATGCTAACCTCTGTTTAACTATCAACCTAGGCAAAAATGGACAATTCCCTGTACCTC 6432

 38270566 AGAAGCTTTCCTAGTGCTCCTCCCATTCATAAAAATCTCCCATCCTTGGAAAATAGCCAC 38270625
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6433 AGAAGCTTTCCCAGTGCTCCTCCCATTCATAAAAATCTCCCATCCTTGGAAAATAGCCAC 6492

 38270626 GATAAAAATTATATCAAATCCCAACTTTTTATTTGTCCTTTTAACCAAATGACTTATGCT 38270685
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     6493 GATAAAAATTATATCAAATCCCAACTTTTTATTTGCCCTTTTAACCAAATGACTTATGCT 6552

 38270686 TTTCTAAATGATACAGATTTGCTTTGCCTATTTGGGAATGTTACATAACTAGAATCCTAG 38270745
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     6553 TTTCTAAATGATACAGATTTGCTTTGCCTATTTGGGAATGTTATATAACTAGAATCCTAG 6612

 38270746 ACAGAGCTCTTAATTGTAACATTGTCATACATCAAATGTCAAGTGTCTACAAAGGGATGG 38270805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6613 ACAGAGCTCTTAATTGTAACATTGTCATACATCAAATGTCAAGTGTCTACAAAGGGATGG 6672

 38270806 ATCACTCTGGGCTTTCAATGTTCTTCCATTGGTCTATTAAATTCCCTTAGAGCAATAATC 38270865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6673 ATCACTCTGGGCTTTCAATGTTCTTCCATTGGTCTATTAAATTCCCTTAGAGCAATAATC 6732

 38270866 CTAGTATCTCATTTACTGAAGTGTTACAATAGGATTTATTTTTTGGTGGAATAAGTCCAA 38270925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6733 CTAGTATCTCATTTACTGAAGTGTTACAATAGGATTTATTTTTTGGTGGAATAAGTCCAA 6792

 38270926 CCATCTTCTTGTTTGTTCTTCAAGAATGCATGGACTATTCTCTGTACTTTGCCTTATCAC 38270985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6793 CCATCTTCTTGTTTGTTCTTCAAGAATGCATGGACTATTCTCTGTACTTTGCCTTATCAC 6852

 38270986 ATACATTTAAAAATAAACCTATTATTGCTATGAAATAATAATAAATAAAAGACTTGGGTT 38271045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6853 ATACATTTAAAAATAAACCTATTATTGCTATGAAATAATAATAAATAAAAGACTTGGGTT 6912

 38271046 TTGTTTGATGTTACATTATGTCTATAAAGTAAGGATCACTGACATCTGTAAAATTTGAAT 38271105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6913 TTGTTTGATGTTACATTATGTCTATAAAGTAAGGATCACTGACATCTGTAAAATTTGAAT 6972

 38271106 CTCCTAGTCTATAAAAAATTGAATATTTTTTGCTTATTCTGGGATCATTTCGATTATCTC 38271165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6973 CTCCTAGTCTATAAAAAATTGAATATTTTTTGCTTATTCTGGGATCATTTCGATTATCTC 7032

 38271166 CCAATAATGATTTTTGGTTGTCTCTGTAAAGATCTAGTACATAGTTTGCTAGATTTATTG 38271225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7033 CCAATAATGATTTTTGGTTGTCTCTGTAAAGATCTAGTACATAGTTTGCTAGATTTATTG 7092

 38271226 TTAGAATTTTAATGTTTATGTTATTTTAAATAGTGTAAGTTTTATTTTTACTTATTTATT 38271285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7093 TTAGAATTTTAATGTTTATGTTATTTTAAATAGTGTAAGTTTTATTTTTACTTATTTATT 7152

 38271286 TATTTTAC-TTTTTCATGTCATTCACCTTTTAATCTTACAATGGTTTCTCATTGCTTAAA 38271344
          |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7153 TATTTTACTTTTTTCATGTCATTCACCTTTTAATCTTACAATGGTTTCTCATTGCTTAAA 7212

 38271345 AACTCGAGATACATAACATGCACAATATAAGTGCACAAAACACATTCTATGAATTTTTGC 38271404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7213 AACTCGAGATACATAACATGCACAATATAAGTGCACAAAACACATTCTATGAATTTTTGC 7272

 38271405 ACATGCATACACTCATGAAACTACCAACCAGATCAAAATAAAGAATTTTTTGTTTTGTTT 38271464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7273 ACATGCATACACTCATGAAACTACCAACCAGATCAAAATAAAGAATTTTTTGTTTTGTTT 7332

 38271465 TGAGACAGGGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCCATCATATGTGTCC 38271524
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7333 TGAGACAGGGTCTTGCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCCATCATATGTGTCC 7392

 38271525 TCTTTATTGTAATATGCAAAATACTATTAACTTTTGAATAATAATAAACTTGTACAATCC 38271584
          |||||.||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     7393 TCTTTGTTGTAATATGTAAAATACTATTAATTTTTGAATAATAATAAACTTGTACAATCC 7452

 38271585 CCTTTTCAAGTGTAATAGTTTTTGAAGATTCTCTTGGACCTTCTGTGTGTATGATTGCAT 38271644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7453 CCTTTTCAAGTGTAATAGTTTTTGAAGATTCTCTTGGACCTTCTGTGTGTATGATTGCAT 7512

 38271645 TATATGCAGATAATAAGACCTTTAATTCTTCTTTTCACTTCCTTATACATCATTTCTTAT 38271704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7513 TATATGCAGATAATAAGACCTTTAATTCTTCTTTTCACTTCCTTATACATCATTTCTTAT 7572

 38271705 TTATGTAGTTATAAATTTATATGTGTATTTATGCATATGTATATTATTTGTTTAAGGACA 38271764
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7573 TTATGTAGTTATAAATTTATATGCGTATTTATGCATATGTATATTATTTGTTTAAGGACA 7632

 38271765 TATCATTAAAATGTAGAGAAGCTGGAATTATGGTTATTTCTGAACTTAAAGACTATTCAT 38271824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7633 TATCATTAAAATGTAGAGAAGCTGGAATTATGGTTATTTCTGAACTTAAAGACTATTCAT 7692

 38271825 ATTTAATTATCAATTTCATAGGGAATGCTTTGTTTCAACAGTAAGTATTAATTTTGCTAT 38271884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7693 ATTTAATTATCAATTTCATAGGGAATGCTTTGTTTCAACAGTAAGTATTAATTTTGCTAT 7752

 38271885 AAGTGTTTGTGTGTTTGTTA 38271904
          ||||||||||||||||||||
     7753 AAGTGTTTGTGTGTTTGTTA 7772

Alignment time is 7.40209 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38249892,38276749] =>     26858 nucs '18 dna:chromosome chromosome:GRCh37:18:1:78077248:1'
Second seq [       1,    3448] =>      3448 nucs 'mol-32-349d-149088_3448'

Score:        3281
Aligned:      3446        nucs
Identic:      3431 (100%) nucs =>      2061 ( 99%)      1370 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38257237,38259308] EXCISED REGION [38259311,38260684]
 second seq =>  [       1,    2072] EXCISED REGION [    2075,    3448]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [38259309,38259310]
 second seq =>         2 nucs [2073,2074]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [38259309,38259311] to [38259311,38259313]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [38259306,38259308] to [38259311,38259313]
 second seq =>         3 nucs [2070,2072] to [2075,2077]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 38257237 ATTCCTACTGACAAATAGGCTATAACACCTCACATCTTTAAAAGAATACACATTTCATGT 38257296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATTCCTACTGACAAATAGGCTATAACACCTCACATCTTTAAAAGAATACACATTTCATGT 60

 38257297 AATTGCTGTCTGCACCAGTATCTCCAATTCTTTATCTCCTATTATCTTTGTCAACCCTCT 38257356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AATTGCTGTCTGCACCAGTATCTCCAATTCTTTATCTCCTATTATCTTTGTCAACCCTCT 120

 38257357 CCAGCCTGCCTACTGTTCCCACTACCCTACTCAATTCCTCCCGCCAAGGCATTGTTGGTC 38257416
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCAGCCTGCCTACTGTTCCCACTACTCTACTCAATTCCTCCCGCCAAGGCATTGTTGGTC 180

 38257417 CTTACCTTTCAAAACTTTTTTTTGTTTTTGTTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCACC 38257476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTTACCTTTCAAAACTTTTTTTTGTTTTTGTTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCACC 240

 38257477 CAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGATCTCTGCTTACTGCAACCTCCACCTCACCAGTTCAAG 38257536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGATCTCTGCTTACTGCAACCTCCACCTCACCAGTTCAAG 300

 38257537 TGATTCACTAGTCTGAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGACACATGCCACCATGCCCG 38257596
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||
      301 TGATTCACTAGTCTGAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGCACATGCCACCATGCTCG 360

 38257597 GCTAATTTTTGCATTTTTAGTAGAGACGAGGTTTCACCATGCTGGTCAGGCTGGTCTCAA 38257656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GCTAATTTTTGCATTTTTAGTAGAGACGAGGTTTCACCATGCTGGTCAGGCTGGTCTCAA 420

 38257657 ACTCCTGACCTCGTGATCCGCTTGCCTTGGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACCGGCGTGA 38257716
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACTCCTGACCTCGTGATCCGCCTGCCTTGGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACCGGCGTGA 480

 38257717 GCCACTGCGCCCATAGAAAAGATTAGTTCTTTCTGAACTTTTAAACACCATTCAGCAGTG 38257776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GCCACTGCGCCCATAGAAAAGATTAGTTCTTTCTGAACTTTTAAACACCATTCAGCAGTG 540

 38257777 TTCACCATTCTCTCTAACTTAAAACACTGTCCCTCATAACATATTTAAAAAATTCTATTT 38257836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
      541 TTCACCATTCTCTCTAACTTAAAACACTGTCCCTCATAACATATTTAAAAAATTATATTT 600

 38257837 CTTACTGTTATTTCTCAGATTCTTGTATAGGCCACAGTTCTTTCAGTAGAACTCTAACCA 38257896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTTACTGTTATTTCTCAGATTCTTGTATAGGCCACAGTTCTTTCAGTAGAACTCTAACCA 660

 38257897 ATTTCCGTACATGTAAGTATCATAAATATACTAATGACTCTGAACATTATATATCTTGCC 38257956
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATTTCCATACATGTAAGTATCATAAATATACTAATGACTCTGAACATTATATATCTTGCC 720

 38257957 TCATGCATGAATACCCAAATGTTTTCCTGTAATCACAAAATGAACATCTCAAAGTGACCA 38258016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCATGCATGAATACCCAAATGTTTTCCTGTAATCACAAAATGAACATCTCAAAGTGACCA 780

 38258017 CAAATTTGACATGTTCCGAAGTAATTAAATTTTGATATTCTCTGCCAAAAGCTGCTCTAG 38258076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CAAATTTGACATGTTCCGAAGTAATTAAATTTTGATATTCTCTGCCAAAAGCTGCTCTAG 840

 38258077 AAATTTTGCCACTCCTTCTTCATCTTAGAAAATGCTATTATTCTCCACCAAAGGCAAATA 38258136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
      841 AAATTTTGCCACTCCTTCTTCATCTTAGAAAATGCTATCATTCTCCACCAAAGGCAAATA 900

 38258137 ACCAAGAGTCATTACTAGAAAATTTGTCTCCTTTACCACTCATGCCCAATATAGATCAAA 38258196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ACCAAGAGTCATTACTAGAAAATTTGTCTCCTTTACCACTCATGCCCAATATAGATCAAA 960

 38258197 TTCTTTAAGATCTTTTCCTCAATAAACCTCAAGTCTGTCACCTTTTCTATTACCACATTT 38258256
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTCTTTAAGATCTTTTCCTCAATAAATCTCAAGTCTGTCACCTTTTCTATTACCACATTT 1020

 38258257 TTTCTAAGTCTCAATCATCTCTCAATTAGATCATTATAGTAATCTTCTAAGTGGTGTTGG 38258316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTTCTAAGTCTCAATCATCTCTCAATTAGATCATTATAGTAATCTTCTAAGTGGTGTTGG 1080

 38258317 GGTGTCGTCTCCCGGCTACTTCAATCCATTTTCCAATATTAAGTTTATTTGTTTAATTAA 38258376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GGTGTCGTCTCCCGGCTACTTCAATCCATTTTCCAATATTAAGTTTATTTGTTTAATTAA 1140

 38258377 ACATGTTAACTTGTGGTGCTCTTATGCTTAAAAAGTTTCATTAGCTTTCTATTTATATAA 38258436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ACATGTTAACTTGTGGTGCTCTTATGCTTAAAAAGTTTCATTAGCTTTCTATTTATATAA 1200

 38258437 TGAATGAAACCAATGTTTAGCCTAGTTTAAGAAATGTAAGAACTCCTTTTACCCTAGCTT 38258496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     1201 TGAATGAAACCAATGTTTAGCCTAGTTTAAGAAATGTAAGAACTCCCTTTACCCTAGCTT 1260

 38258497 TCTTCCTGTTTACTTTTATTCATCATGCCTTGAATCATACCTATCTTCTTTAATTTTCTC 38258556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TCTTCCTGTTTACTTTTATTCATCATGCCTTGAATCATACCTATCTTCTTTAATTTTCTC 1320

 38258557 TAACACAAAATCCTCCTGTTTCTTCTTTGCAATCCTGCAAACCCAAACCCAGCAGCTAGT 38258616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TAACACAAAATCCTCCTGTTTCTTCTTTGCAATCCTGCAAACCCAAACCCAGCAGCTAGT 1380

 38258617 AAATATTCAATATATATGAATTAATTAATTGATGAATGAGTGATTTTATTTCAGATTGCT 38258676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AAATATTCAATATATATGAATTAATTAATTGATGAATGAGTGATTTTATTTCAGATTGCT 1440

 38258677 ATCAAATGCTCAATTCCCCTGCATAGTATCTCCAATGAGTCAAATCCTGGAATTCCCTAT 38258736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATCAAATGCTCAATTCCCCTGCATAGTATCTCCAATGAGTCAAATCCTGGAATTCCCTAT 1500

 38258737 AGGAACACCTGGGATATATAGTATCAACTTACAAATACCATTCTTTCTTAATTTTGAAAG 38258796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AGGAACACCTGGGATATATAGTATCAACTTACAAATACCATTCTTTCTTAATTTTGAAAG 1560

 38258797 AAAAACTGAGTAAAATATGAGAGCTGTAGCTTTTAAAAAAAATAGAAAATACACCATAAA 38258856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AAAAACTGAGTAAAATATGAGAGCTGTAGCTTTTAAAAAAAATAGAAAATACACCATAAA 1620

 38258857 AATTTTAGTCAAGCATGGCAGACTAAATACATGTATTTATTTCTAATCTACTTCAAGCTC 38258916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AATTTTAGTCAAGCATGGCAGACTAAATACATGTATTTATTTCTAATCTACTTCAAGCTC 1680

 38258917 CAATATAATAACTGTTTACAAATGAAATGGTCTAATATCACAAGTTCAAAATTAATAAGA 38258976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CAATATAATAACTGTTTACAAATGAAATGGTCTAATATCACAAGTTCAAAATTAATAAGA 1740

 38258977 GTGGATGAGACATGCCAACAAATTTTTGGAATGTAAAAATAGATAAGACATTGTTAATGA 38259036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GTGGATGAGACATGCCAACAAATTTTTGGAATGTAAAAATAGATAAGACATTGTTAATGA 1800

 38259037 TTTGACAAAGCACAAAGCCTTAAAATATTTCTGTATAGAGAGAAGTTTCCAAAGTAGGGC 38259096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTTGACAAAGCACAAAGCCTTAAAATATTTCTGTATAGAGAGAAGTTTCCAAAGTAGGGC 1860

 38259097 AACTCAGAGATAAATCAAGAATGGGAAGATTCACACACCTCAACTGTAAAAGAGAAATAT 38259156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AACTCAGAGATAAATCAAGAATGGGAAGATTCACACACCTCAACTGTAAAAGAGAAATAT 1920

 38259157 GAGACTAAAAGCAGTGGATTAATTAAAACTTTGTTTGATGAGATATTATACATAGATGTC 38259216
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GAGACTAAAAGCAGTGGATTCATTAAAACTTTGTTTGATGAGATATTATACATAGATGTC 1980

 38259217 TTCTCCATCATTCCAAGCACTTAAGCAGCTGCCCTTTCCAAACACTCATAGAGGATAAGA 38259276
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     1981 TTCTCCATCATTCCAAGCACTTAAGCAGCTGCCCTTTACAAACACTCATAGAGGATAAGA 2040

 38259277 GATTATTTTCTATAAAAATCAAACCAGATTGT 38259308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GATTATTTTCTATAAAAATCAAACCAGATTGT 2072

EXCISED REGION

 38259311 TGTACATCAAGCAAAGGAGGGATGGCAGGGAGGTGATATACTGAAACAGAATTACTGTAT 38259370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2075 TGTACATCAAGCAAAGGAGGGATGGCAGGGAGGTGATATACTGAAACAGAATTACTGTAT 2134

 38259371 GAAAACCTGGAATGAACAATTAGATACTCAGTTCTCCTTACCTGCACAGTAATAGTAATT 38259430
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2135 GAAAACATGGAATGAACAATTAGATACTCAGTTCTCCTTACCTGCACAGTAATAGTAATT 2194

 38259431 CTTACTACCAGACTGGATGCTGGAGGGCTCTCCTTCAGAGAAACAGAAAAGAAAAAAAAG 38259490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2195 CTTACTACCAGACTGGATGCTGGAGGGCTCTCCTTCAGAGAAACAGAAAAGAAAAAAAAG 2254

 38259491 CCTATAGCCACTAATATTTGAATCTCTGCAATTAAATACCTGGGTCCCTTCCCAATCATA 38259550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2255 CCTATAGCCACTAATATTTGAATCTCTGCAATTAAATACCTGGGTCCCTTCCCAATCATA 2314

 38259551 TAGCAGTGATGCTCACCAGTTAACAAGAACTGAAGACACATGACAGATTCCAATCAGTGA 38259610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2315 TAGCAGTGATGCTCACCAGTTAACAAGAACTGAAGACACATGACAGATTCCAATCAGTGA 2374

 38259611 TTTATTACCACTGTCAAATAAGAATGGACACTCAAAGATTACCTGAAAAAGTCCTTTAAT 38259670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2375 TTTATTACCACTGTCAAATAAGAATGGACACTCAAAGATTACCTGAAAAAGTCCTTTAAT 2434

 38259671 ATGGCCCCAGATTGAATAATTCCTAATTTCCTATATCATAAATTCAAAAATTATCTAAAA 38259730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2435 ATGGCCCCAGATTGAATAATTCCTAATTTCCTATATCATAAATTCAAAAATTATCTAAAA 2494

 38259731 TTCAGTGAAATTAGTCCATATTATCAATGCCAACCTTACACATAAACAGAGTTGACATTC 38259790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2495 TTCAGTGAAATTAGTCCATATTATCAATGCCAACCTTACACATAAACAGAGTTGACATTC 2554

 38259791 TCTTATGATGCTGAACAATGCAGATGAAGAACGCTGGCTTTGGATTAAGAAGACCCTTAG 38259850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2555 TCTTATGATGCTGAACAATGCAGATGAAGAACGCTGGCTTTGGATTAAGAAGACCCTTAG 2614

 38259851 TTTGAATTTTAATTTTGACCCATGATAGCTGTGTAAACTTAGTCAAAATTCTTCAGTTAT 38259910
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     2615 TTTGAATTTTAATTTTGACCCATGATAGCTGTGTAAACTTAGTAAAAATTCTTCAGTTAT 2674

 38259911 TGAGCTGATGCTTTAGCCTGAGTTAAACAGAGAACAGAGCCTAAGGTAGAGGGTTTCTAT 38259970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2675 TGAGCTGATGCTTTAGCCTGAGTTAAACAGAGAACAGAGCCTAAGGTAGAGGGTTTCTAT 2734

 38259971 TCTATTCTTTCATAATGGATTGCTGGGCAAGATAACAAAAGCAATGGATAAGCACAGAAA 38260030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2735 TCTATTCTTTCATAATGGATTGCTGGGCAAGATAACAAAAGCAATGGATAAGCACAGAAA 2794

 38260031 TGCAGGGCAGAAGAGAGAGCCATGAGGAAGATATATTATCAGGGTGGTTGCCATTAAGTG 38260090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2795 TGCAGGGCAGAAGAGAGAGCCATGAGGAAGATATATTATCAGGGTGGTTGCCATTAAGTG 2854

 38260091 AAACCAGTTACCCAGTTTAATGGAATTATCCCCAGGGAGCAAGGTCTGTGGCATCTCAAG 38260150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     2855 AAACCAGTTACCCAGTTTAATGGAATTATCCCCAGGGAGCAAGGTCAGTGGCATCTCAAG 2914

 38260151 ACTCTTTATCAAAGAGGAGAATGGGAGAAAAATCATCTTTTTTGTATTTCCTACTGTTCA 38260210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2915 ACTCTTTATCAAAGAGGAGAATGGGAGAAAAATCATCTTTTTTGTATTTCCTACTGTTCA 2974

 38260211 AAAGTTTGTCCCTTGCTTTCCTGGTTATGAATGCATGGAAGTCTAGTTGAAGTCCAGCAA 38260270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     2975 AAAGTTTGTCCCTTGCTTTCCTGGTTATGAATGCATGGAAGTCTAGTTGAAGTCCACCAA 3034

 38260271 AGACATCAACAAGGAATCATAGGAAAGAGATAAAAGGCCTGAGACATGGATATAAGGGAA 38260330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3035 AGACATCAACAAGGAATCATAGGAAAGAGATAAAAGGCCTGAGACATGGATATAAGGGAA 3094

 38260331 GGTAGTGTTAAGTGGCACCTTTTTGGGAGTCCAAACTGAGCAGGAGTAAAACTGAAGCAA 38260390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3095 GGTAGTGTTAAGTGGCACCTTTTTGGGAGTCCAAACTGAGCAGGAGTAAAACTGAAGCAA 3154

 38260391 CTGCTTTAACTAAGACATGTGTGCCCACAAAGACCTGAAGTGACACATGAGCTTTCACAG 38260450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3155 CTGCTTTAACTAAGACATGTGTGCCCACAAAGACCTGAAGTGACACATGAGCTTTCACAG 3214

 38260451 TTTTTTAACTGTAAAATGGTAATGATATCACCTATGTTTCTGGATTACTACAAATATTAA 38260510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3215 TTTTTTAACTGTAAAATGGTAATGATATCACCTATGTTTCTGGATTACTACAAATATTAA 3274

 38260511 ATAGCATAAATGGCACACTTGCAAAGCATATTTTAATAAACATATTTAATATTTCCCTTA 38260570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3275 ATAGCATAAATGGCACACTTGCAAAGCATATTTTAATAAACATATTTAATATTTCCCTTA 3334

 38260571 TTGATTTCTTTAATCAATAAAAGCATTTCTGAAATTTGTGTAAAGGTCTAGATGAAGGGA 38260630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3335 TTGATTTCTTTAATCAATAAAAGCATTTCTGAAATTTGTGTAAAGGTCTAGATGAAGGGA 3394

 38260631 CATTGGACATGCTTTGATAATCATTGAGACTGGGTGATAGATAAATGATTGTCA 38260684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3395 CATTGGACATGCTTTGATAATCATTGAGACTGGGTGATAGATAAATGATTGTCA 3448

Alignment time is 3.22146 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38249892,38276749] =>     26858 nucs '18 dna:chromosome chromosome:GRCh37:18:1:78077248:1'
Second seq [       1,    6140] =>      6140 nucs 'mol-32-34a8-181499_6140'

Score:        5798
Aligned:      6148        nucs
Identic:      6108 ( 99%) nucs =>       943 ( 99%)      5165 ( 99%)
Gaps:           16 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38258945,38259892] EXCISED REGION [38266750,38271941]
 second seq =>  [       1,     948] EXCISED REGION [     949,    6140]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6857 nucs [38259893,38266749]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [38259893,38259893] to [38266750,38266750]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [38259893,38259893] to [38266749,38266749]
 second seq =>         0 nucs

 38258945 GGTCTAATATCACAAGTTCAAAATTAATAAGAGTGGATGAGACATGCCAACAAATTTTTG 38259004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGTCTAATATCACAAGTTCAAAATTAATAAGAGTGGATGAGACATGCCAACAAATTTTTG 60

 38259005 GAATGTAAAAATAGATAAGACATTGTTAATGATTTGACAAAGCACAAAGCCTTAAAATAT 38259064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAATGTAAAAATAGATAAGACATTGTTAATGATTTGACAAAGCACAAAGCCTTAAAATAT 120

 38259065 TTCTGTATAGAGAGAAGTTTCCAAAGTAGGGCAACTCAGAGATAAATCAAGAATGGGAAG 38259124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTCTGTATAGAGAGAAGTTTCCAAAGTAGGGCAACTCAGAGATAAATCAAGAATGGGAAG 180

 38259125 ATTCACACACCTCAACTGTAAAAGAGAAATATGAGACTAAAAGCAGTGGATTAATTAAAA 38259184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
      181 ATTCACACACCTCAACTGTAAAAGAGAAATATGAGACTAAAAGCAGTGGATTCATTAAAA 240

 38259185 CTTTGTTTGATGAGATATTATACATAGATGTCTTCTCCATCATTCCAAGCACTTAAGCAG 38259244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTTTGTTTGATGAGATATTATACATAGATGTCTTCTCCATCATTCCAAGCACTTAAGCAG 300

 38259245 CTGCCCTTTCCAAACACTCATAGAGGATAAGAGATTATTTTCTATAAAAATCAAACCAGA 38259304
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTGCCCTTTACAAACACTCATAGAGGATAAGAGATTATTTTCTATAAAAATCAAACCAGA 360

 38259305 TTGTTG--TGTACATCAAGCAAAGGAGGGATGGCAGGGAGGTGATATACTGAAACAGAAT 38259362
          ||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTGT--CATGTACATCAAGCAAAGGAGGGATGGCAGGGAGGTGATATACTGAAACAGAAT 418

 38259363 TACTGTATGAAAACCTGGAATGAACAATTAGATACTCAGTTCTCCTTACCTGCACAGTAA 38259422
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      419 TACTGTATGAAAACATGGAATGAACAATTAGATACTCAGTTCTCCTTACCTGCACAGTAA 478

 38259423 TAGTAATTCTTACTACCAGACTGGATGCTGGAGGGCTCTCCTTCAGAGAAACAGAAAAGA 38259482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      479 TAGTAATTCTTACTACCAGACTGGATGCTGGAGGGCTCTCCTTCAGAGAAACAGAAAAGA 538

 38259483 AAAAAAAGCCTATAGCCACTAATATTTGAATCTCTGCAATTAAATACCTGGGTCCCTTCC 38259542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      539 AAAAAAAGCCTATAGCCACTAATATTTGAATCTCTGCAATTAAATACCTGGGTCCCTTCC 598

 38259543 CAATCATATAGCAGTGATGCTCACCAGTTAACAAGAACTGAAGACACATGACAGATTCCA 38259602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      599 CAATCATATAGCAGTGATGCTCACCAGTTAACAAGAACTGAAGACACATGACAGATTCCA 658

 38259603 ATCAGTGATTTATTACCACTGTCAAATAAGAATGGACACTCAAAGATTACCTGAAAAAGT 38259662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      659 ATCAGTGATTTATTACCACTGTCAAATAAGAATGGACACTCAAAGATTACCTGAAAAAGT 718

 38259663 CCTTTAATATGGCCCCAGATTGAATAATTCCTAATTTCCTATATCATAAATTCAAAAATT 38259722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      719 CCTTTAATATGGCCCCAGATTGAATAATTCCTAATTTCCTATATCATAAATTCAAAAATT 778

 38259723 ATCTAAAATTCAGTGAAATTAGTCCATATTATCAATGCCAACCTTACACATAAACAGAGT 38259782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      779 ATCTAAAATTCAGTGAAATTAGTCCATATTATCAATGCCAACCTTACACATAAACAGAGT 838

 38259783 TGACATTCTCTTATGATGCTGAACAATGCAGATGAAGAACGCTGGCTTTGGATTAAGAAG 38259842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      839 TGACATTCTCTTATGATGCTGAACAATGCAGATGAAGAACGCTGGCTTTGGATTAAGAAG 898

 38259843 ACCCTTAGTTTGAATTTTAATTTTGACCCATGATAGCTGTGTAAACTTAG 38259892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      899 ACCCTTAGTTTGAATTTTAATTTTGACCCATGATAGCTGTGTAAACTTAG 948

EXCISED REGION

 38266750 TAAATGAACTTGATTTGAATGGAATGAGAGTTCAATGAAACTGTATATATTGTGAAACGT 38266809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      949 TAAATGAACTTGATTTGAATGGAATGAGAGTTCAATGAAACTGTATATATTGTGAAACGT 1008

 38266810 GGCAACTTACACCTACTCAAGACATTAAAAGAGATCATGCTTTCTTGCCTAAGTTTTATG 38266869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1009 GGCAACTTACACCTACTCAAGACATTAAAAGAGATCATGCTTTCTTGCCTAAGTTTTATG 1068

 38266870 TCCAATTTGTTCCTGTTTCAAACCCCTCGACAAAAACAAAATCTTTTAATCTGTTTGCAA 38266929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1069 TCCAATTTGTTCCTGTTTCAAACCCCTCGACAAAAACAAAATCTTTTAATCTGTTTGCAA 1128

 38266930 AATATTTCCTCCTTCCTCCCATCTTGCTGTTGCTGCTCTGTGATATACTGCCCTTGCTTA 38266989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1129 AATATTTCCTCCTTCCTCCCATCTTGCTGTTGCTGCTCTGTGATATACTGCCCTTGCTTA 1188

 38266990 TTACCCCTTTATAGCTGTTTTGTTAAAGTTCATACCGCTAAGACCTGTAAAAGAAATTTA 38267049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1189 TTACCCCTTTATAGCTGTTTTGTTAAAGTTCATACCGCTAAGACCTGTAAAAGAAATTTA 1248

 38267050 TGGCTCTAGGGATTTCAGCAAATTCTAAATAACCATAACAGGAACAGGAAGCATTAATTA 38267109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1249 TGGCTCTAGGGATTTCAGCAAATTCTAAATAACCATAACAGGAACAGGAAGCATTAATTA 1308

 38267110 AAGACACTAGAGTCTAAGTTATAACAGAAATCCTGACATTTAAGGCCCTGGTACCATTTA 38267169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1309 AAGACACTAGAGTCTAAGTTATAACAGAAATCCTGACATTTAAGGCCCTGGTACCATTTA 1368

 38267170 AATTTAAAATGGTATGACAAACAGAGAGTAATTTGATGGTCAGAAGGTTATAATGGATAC 38267229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1369 AATTTAAAATGGTATGACAAACAGAGAGTAATTTGATGGTCAGAAGGTTATAATGGATAC 1428

 38267230 CTTAATACCTTTGCCAAGAAAAAGTGTCTGTCCTTGCTCTAACCCCTACCCAGGGGCTTC 38267289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     1429 CTTAATACCTTTGCCAAGAAAAAGTGTCTGTCCTTGCTCTAATCCCTACCCAGGGGCTTC 1488

 38267290 AGGGGCCTCCTTCATAAAACATGGTGATGCCTAAATATTTTTGCGATATCTCATATATAA 38267349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1489 AGGGGCCTCCTTCATAAAACATGGTGATGCCTAAATATTTTTGCGATATCTCATATATAA 1548

 38267350 GCTGGTCTTTTCTTTAAGAATACGAGAGATTAAACACCAACCCCCAACATTCATACACCA 38267409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1549 GCTGGTCTTTTCTTTAAGAATACGAGAGATTAAACACCAACCCCCAACATTCATACACCA 1608

 38267410 ATTTTCAGATAAAACAGCTTAATATTTAAGATATATTTAGTGCAATTTGTCTATTTCTTG 38267469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1609 ATTTTCAGATAAAACAGCTTAATATTTAAGATATATTTAGTGCAATTTGTCTATTTCTTG 1668

 38267470 GTTTACTGGAGGGCTGTATTTAAAGCCAAGGGACCAAGGAACATTCCACAACACACTAAA 38267529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1669 GTTTACTGGAGGGCTGTATTTAAAGCCAAGGGACCAAGGAACATTCCACAACACACTAAA 1728

 38267530 GCAATTTTTCCCCAGGGAATATGCTGATTCTTTCCTAAAGGCAGAAGCCGACATTCCTGA 38267589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1729 GCAATTTTTCCCCAGGGAATATGCTGATTCTTTCCTAAAGGCAGAAGCCGACATTCCTGA 1788

 38267590 CTCATTCTGCCAAACCAAGCAATGAAAAATGCTTCACCTAATTTGAAAGATAATTTGTAA 38267649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1789 CTCATTCTGCCAAACCAAGCAATGAAAAATGCTTCACCTAATTTGAAAGATAATTTGTAA 1848

 38267650 TACCAGAGACTCAACTTGTTTTGTGTATCCAATACTAGCACCCTTTCCAGAATGTTGAAA 38267709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1849 TACCAGAGACTCAACTTGTTTTGTGTATCCAATACTAGCACCCTTTCCAGAATGTTGAAA 1908

 38267710 GTACACACTGTATGATTTGTCTAATGTATATTCAAAAAAGGAATACAAATTGATCCTCAA 38267769
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     1909 GTACACACTGTATGATTTGTCTAATGTATATCCAAAAAAGGAATACAAATTGATCCTCAA 1968

 38267770 AGTTCAAATCTGCAGTACATACTCTGTGTTCTGCCCCCACCCGTACCTTCATGAATTCTT 38267829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1969 AGTTCAAATCTGCAGTACATACTCTGTGTTCTGCCCCCACCCGTACCTTCATGAATTCTT 2028

 38267830 TCACCTAGCACGCAGGCTGTTTTCCCTTTGCGAAATCCCATGGTACATTTATAGTATTAA 38267889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2029 TCACCTAGCACGCAGGCTGTTTTCCCTTTGCGAAATCCCATGGTACATTTATAGTATTAA 2088

 38267890 TACCACTCACTTAGAATATGCCGTATTTTGTCTAATATTGCTAGATTTTGTGTGTATAAT 38267949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2089 TACCACTCACTTAGAATATGCCGTATTTTGTCTAATATTGCTAGATTTTGTGTGTATAAT 2148

 38267950 CTTATTCCTCAAGTAAATTACAAGACAAGGACTATAATTTATACATCCTCTACAACACTT 38268009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2149 CTTATTCCTCAAGTAAATTACAAGACAAGGACTATAATTTATACATCCTCTACAACACTT 2208

 38268010 GACACTGGCTTTGATTAGGCTCTTAATAAATATTTGTTGGTTGATTAATCAGTTGACCAC 38268069
          |.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2209 GGCACTGGCTTTGAGTAGGCTCTTAATAAATATTTGTTGGTTGATTAATCAGTTGACCAC 2268

 38268070 ACTTACTAATTGCAAGGTGACATCATTTATCATTAATAAACATATATGTGGATTACAAAA 38268129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2269 ACTTACTAATTGCAAGGTGACATCATTTATCATTAATAAACATATATGTGGATTACAAAA 2328

 38268130 ATATCATGTGAATTTGCATATAATCATATTAATCCCAAATTAGCACCTGAGAGTCCAACC 38268189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2329 ATATCATGTGAATTTGCATATAATCATATTAATCCCAAATTAGCACCTGAGAGTCCAACC 2388

 38268190 ACCCTCTCCTTTAGGCCCTTTTCACTTTTATGTCTACTTTTGCCTCACTTACAATTCCAC 38268249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2389 ACCCTCTCCTTTAGGCCCTTTTCACTTTTATGTCTACTTTTGCCTCACTTACAATTCCAC 2448

 38268250 TACTTACTTGCCTTCTTTCTCTTTTCAGCTTTGTGCTGTTATTTAATATCTCACCAGTTG 38268309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2449 TACTTACTTGCCTTCTTTCTCTTTTCAGCTTTGTGCTGTTATTTAATATCTCACCAGTTG 2508

 38268310 TGTAATTTCAGCTCCCAAATTGAATAAGACGTTCCCCCCAGTGGAACCCTCACCTTGACA 38268369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2509 TGTAATTTCAGCTCCCAAATTGAATAAGACGTTCCCCCCAGTGGAACCCTCACCTTGACA 2568

 38268370 AATAGCCAAATAGTA---ATTATTCCTTTCAGGGGTTGAGCTATGGAATCATGCTTGCAA 38268426
          |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2569 AATAGCCAAATAGTAATTATTATTCCTTTCAGGGGTTGAGCTATGGAATCATGCTTGCAA 2628

 38268427 TATCCCAGGCTTGAGTGCCTAGATATTTATGCTATACTTCCCTGTGTCGGAGTTTCCATC 38268486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2629 TATCCCAGGCTTGAGTGCCTAGATATTTATGCTATACTTCCCTGTGTCGGAGTTTCCATC 2688

 38268487 TGCGATTGTATTTCAAGCCCTCTCATTTTTTTTTTCAATATGATTAAGATAATTCCTTTA 38268546
          ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2689 TGCGATTGTATTTCAAGCCCTCTCA-TTTTTTTTTCAATATGATTAAGATAATTCCTTTA 2747

 38268547 TGAAGTTGGAAACTCAGACATTCAGAAAGAAACTTGACGTTTCATATTTTTGCTAACTTG 38268606
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2748 TGAAGCTGGAAACTCAGACATTCAGAAAGAAACTTGACGTTTCATATTTTTGCTAACTTG 2807

 38268607 CTCTTCCCATTTCCTTTCCTATCATTTTAGCCAGACTGAGGGAGAATTAATTTTGCAATG 38268666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     2808 CTCTTCCCATTTCCTTTCCTATCATTTTAGCCAGACTGAGGGAGAATTAATTTTGCAACG 2867

 38268667 GTCTCTATTTTTTTTTCCAAATGTGTGACCTCCATATTAATAGGAGCCAGAGTACTCATT 38268726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2868 GTCTCTATTTTTTTTTCCAAATGTGTGACCTCCATATTAATAGGAGCCAGAGTACTCATT 2927

 38268727 CATCACATCTGGTCAGTGTGAAACTGACATTTACAGGGTGGAATGTTTCCCACTCAGGAC 38268786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2928 CATCACATCTGGTCAGTGTGAAACTGACATTTACAGGGTGGAATGTTTCCCACTCAGGAC 2987

 38268787 AAATGGGGATCATTTGTAAAACATGCCGCACCCAATCATAGGTTCCCATGGATCTCCAAC 38268846
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     2988 AAATGGGGATCATTTGTAAAACATGCCACACCCAATCATAGGTTCCCATGGATCTCCAAC 3047

 38268847 TACATTTTTAAGCAACAATATAAACCATTCCCGAAACTGAAAGGTCTTTTCAAATATTTA 38268906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3048 TACATTTTTAAGCAACAATATAAACCATTCCCGAAACTGAAAGGTCTTTTCAAATATTTA 3107

 38268907 CTGCCTACCTATGGAATTTTTATTCTGCTTGCTGCTGCCATCAATAATCCTGGGAGTTCC 38268966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3108 CTGCCTACCTATGGAATTTTTATTCTGCTTGCTGCTGCCATCAATAATCCTGGGAGTTCC 3167

 38268967 TAGCTAAGTGTTGTGTATGACCTCCAAGGAAAGTCTTAGCATTGCAGAATGGGGAGGCGG 38269026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3168 TAGCTAAGTGTTGTGTATGACCTCCAAGGAAAGTCTTAGCATTGCAGAATGGGGAGGCGG 3227

 38269027 GTTAGTATCCTGCATTTTTCATTCTGTCACTTTCTAGGGACAATTACAAAGAAAATAATC 38269086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3228 GTTAGTATCCTGCATTTTTCATTCTGTCACTTTCTAGGGACAATTACAAAGAAAATAATC 3287

 38269087 ATATAAGACTTATTTTTATGTTTATTATGAAAGCCTTCAGCTCTTGCATTTGCAAGTAAG 38269146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3288 ATATAAGACTTATTTTTATGTTTATTATGAAAGCCTTCAGCTCTTGCATTTGCAAGTAAG 3347

 38269147 CTCAATGATTTTAAGTTTGCTTTTTCCCCCATGAAATGAAATATTATTTCCCACTTCTTC 38269206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3348 CTCAATGATTTTAAGTTTGCTTTTTCCCCCATGAAATGAAATATTATTTCCCACTTCTTC 3407

 38269207 CATGAATCTATTGGGTAACTCCAGGCCACTGTGATCTTTCATCTGGCATTTTGCTTTTAT 38269266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3408 CATGAATCTATTGGGTAACTCCAGGCCACTGTGATCTTTCATCTGGCATTTTGCTTTTAT 3467

 38269267 TTTTCTAGATCACAGTTGTGATTTAAAGCCCTCCTGGCACTTGGACACCTTGGTGATCTT 38269326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3468 TTTTCTAGATCACAGTTGTGATTTAAAGCCCTCCTGGCACTTGGACACCTTGGTGATCTT 3527

 38269327 AGCTCATGCTCCTAGTTCCATAGTGATGAATTGACCAAACTTTTTCCCAAGGATATCTGC 38269386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3528 AGCTCATGCTCCTAGTTCCATAGTGATGAATTGACCAAACTTTTTCCCAAGGATATCTGC 3587

 38269387 TAATTCTGGAGTTTCTGCTTTCTTATTATCTGTTCTGTCTTTTGGTTCTGTATTGATATA 38269446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3588 TAATTCTGGAGTTTCTGCTTTCTTATTATCTGTTCTGTCTTTTGGTTCTGTATTGATATA 3647

 38269447 ACAAGCTTTGTCCCCTTATCAATGAGGGCACAAAATGCAGCACTTCAAATAATTTCTGCA 38269506
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||
     3648 ACAAGCTTTGTCCCCTTATCAATGAGGGCACAAAATGAAGCACTTCAAATAGTTTCTGCA 3707

 38269507 AAAATTTACAGTTGCTGCATTAAGAATTTTGTGAGCTTCAATAATGTTATTGAAAAGTTG 38269566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3708 AAAATTTACAGTTGCTGCATTAAGAATTTTGTGAGCTTCAATAATGTTATTGAAAAGTTG 3767

 38269567 CAGATTCCCTCCTCCTTCTTTTTCTCCTTTCCTCCTCTTTCTGCCCTGTCTCCCCTTCAT 38269626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3768 CAGATTCCCTCCTCCTTCTTTTTCTCCTTTCCTCCTCTTTCTGCCCTGTCTCCCCTTCAT 3827

 38269627 TATTCTCCTCTTCTTCTCAAAAGCAAACAATCATTTTTCTTGCCTACTGAAGAATACTTG 38269686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3828 TATTCTCCTCTTCTTCTCAAAAGCAAACAATCATTTTTCTTGCCTACTGAAGAATACTTG 3887

 38269687 TAATGTTATTCTCAAAACCTGGACACCAGCTCAACTCCTTCTTTGTTCTACAAGTATTCA 38269746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3888 TAATGTTATTCTCAAAACCTGGACACCAGCTCAACTCCTTCTTTGTTCTACAAGTATTCA 3947

 38269747 CCCACCCTAATAGGGAGTTTATTCCAATGAAAAGACTGTGTTCCTCCTCAGAGGAATTTA 38269806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3948 CCCACCCTAATAGGGAGTTTATTCCAATGAAAAGACTGTGTTCCTCCTCAGAGGAATTTA 4007

 38269807 TGAGGTGGTAAGAGAGTAGAATTGCATTAATCTTATGCCATTCCTAGAGAATTCTTATTT 38269866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4008 TGAGGTGGTAAGAGAGTAGAATTGCATTAATCTTATGCCATTCCTAGAGAATTCTTATTT 4067

 38269867 CCTCAATTAAGGTTTAATTGCTCTGTTCTGAAAAAAAAAAAAAAATGGTGAGTCCAAGCA 38269926
          ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||
     4068 CCTCAATTAAGGTTTAATTGCTCTGTTCTG---AAAAAAAAAAAATGGTGAGTCCAAGCA 4124

 38269927 GATAATTTACAGTGACCTGTATCTGTGACTAGTTTTAAGGCTACCCTGAGGTCAGAATTT 38269986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4125 GATAATTTACAGTGACCTGTATCTGTGACTAGTTTTAAGGCTACCCTGAGGTCAGAATTT 4184

 38269987 AAACATGTTAATTCAGTACTGGACTTAATAGTAAACAAGATAGAGATATCTCTGTCTCAC 38270046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4185 AAACATGTTAATTCAGTACTGGACTTAATAGTAAACAAGATAGAGATATCTCTGTCTCAC 4244

 38270047 AAAGATTTGTAATACAACTCACAGAAGCTTTACTCCAAATGAAAGGGTCATAGTTAGAGG 38270106
          |.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4245 AGAGATTTGTAATACAACTCACAGACGCTTTACTCCAAATGAAAGGGTCATAGTTAGAGG 4304

 38270107 GAAATTCCATAATAATAGTACCTATCTGATAGGGTGAATGTGGGAATTAAACGAGTTCAT 38270166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4305 GAAATTCCATAATAATAGTACCTATCTGATAGGGTGAATGTGGGAATTAAACGAGTTCAT 4364

 38270167 AGCTATAAAGAATTTCAGAGGCCATCTGGCAATCACAAATAATAACTCTTAGTGGCAGCA 38270226
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     4365 AGCTATAAAGAATTTCAGAGGCCATCTGGCAATCACAAATAATAACTGTTAGTGGCAGCA 4424

 38270227 TTAGCTAGTTCCTGAATAGCCAAATATCTTGAATCCTCATAACAATGATTCAAATAAATG 38270286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4425 TTAGCTAGTTCCTGAATAGCCAAATATCTTGAATCCTCATAACAATGATTCAAATAAATG 4484

 38270287 TCATCATTATTTCACAGAGTAAGATACTTAAGCATTGGGAGTTATTAAGCAATTCTTTAA 38270346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4485 TCATCATTATTTCACAGAGTAAGATACTTAAGCATTGGGAGTTATTAAGCAATTCTTTAA 4544

 38270347 GGACATAGCAGCAACATGTAGAGGAGCTGAAATTACAACATGGTTCTTTCCGAACTTTAA 38270406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4545 GGACATAGCAGCAACATGTAGAGGAGCTGAAATTACAACATGGTTCTTTCCGAACTTTAA 4604

 38270407 GTCCCCTGTTTTTGTGTCTATGACTTTAAATATTCATAGTGGAATATCTATCTATCTACA 38270466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4605 GTCCCCTGTTTTTGTGTCTATGACTTTAAATATTCATAGTGGAATATCTATCTATCTACA 4664

 38270467 GATAATTTCATGAAACATTAAACTAAGTTTGG--TTTTTCTAAAATGCTAACCTCTGTTT 38270524
          ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||
     4665 GATAATTTCATGAAACATTAAACTAAGTTT--TTTTTTTCTAAAATGCTAACCTCTGTTT 4722

 38270525 AACTATCAACCTAGGCAAAAATGGACAATTCCCTGTACCTCAGAAGCTTTCCTAGTGCTC 38270584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4723 AACTATCAACCTAGGCAAAAATGGACAATTCCCTGTACCTCAGAAGCTTTCCTAGTGCTC 4782

 38270585 CTCCCATTCATAAAAATCTCCCATCCTTGGAAAATAGCCACGATAAAAATTATATCAAAT 38270644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4783 CTCCCATTCATAAAAATCTCCCATCCTTGGAAAATAGCCACGATAAAAATTATATCAAAT 4842

 38270645 CCCAACTTTTTATTTGTCCTTTTAACCAAATGACTTATGCTTTTCTAAATGATACAGATT 38270704
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4843 CCCAACTTTTTATTTGCCCTTTTAACCAAATGACTTATGCTTTTCTAAATGATACAGATT 4902

 38270705 TGCTTTGCCTATTTGGGAATGTTACATAACTAGAATCCTAGACAGAGCTCTTAATTGTAA 38270764
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4903 TGCTTTGCCTATTTGGGAATGTTATATAACTAGAATCCTAGACAGAGCTCTTAATTGTAA 4962

 38270765 CATTGTCATACATCAAATGTCAAGTGTCTACAAAGGGATGGATCACTCTGGGCTTTCAAT 38270824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4963 CATTGTCATACATCAAATGTCAAGTGTCTACAAAGGGATGGATCACTCTGGGCTTTCAAT 5022

 38270825 GTTCTTCCATTGGTCTATTAAATTCCCTTAGAGCAATAATCCTAGTATCTCATTTACTGA 38270884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5023 GTTCTTCCATTGGTCTATTAAATTCCCTTAGAGCAATAATCCTAGTATCTCATTTACTGA 5082

 38270885 AGTGTTACAATAGGATTTATTTTTTGGTGGAATAAGTCCAACCATCTTCTTGTTTGTTCT 38270944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5083 AGTGTTACAATAGGATTTATTTTTTGGTGGAATAAGTCCAACCATCTTCTTGTTTGTTCT 5142

 38270945 TCAAGAATGCATGGACTATTCTCTGTACTTTGCCTTATCACATACATTTAAAAATAAACC 38271004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5143 TCAAGAATGCATGGACTATTCTCTGTACTTTGCCTTATCACATACATTTAAAAATAAACC 5202

 38271005 TATTATTGCTATGAAATAATAATAAATAAAAGACTTGGGTTTTGTTTGATGTTACATTAT 38271064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5203 TATTATTGCTATGAAATAATAATAAATAAAAGACTTGGGTTTTGTTTGATGTTACATTAT 5262

 38271065 GTCTATAAAGTAAGGATCACTGACATCTGTAAAATTTGAATCTCCTAGTCTATAAAAAAT 38271124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5263 GTCTATAAAGTAAGGATCACTGACATCTGTAAAATTTGAATCTCCTAGTCTATAAAAAAT 5322

 38271125 TGAATATTTTTTGCTTATTCTGGGATCATTTCGATTATCTCCCAATAATGATTTTTGGTT 38271184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5323 TGAATATTTTTTGCTTATTCTGGGATCATTTCGATTATCTCCCAATAATGATTTTTGGTT 5382

 38271185 GTCTCTGTAAAGATCTAGTACATAGTTTGCTAGATTTATTGTTAGAATTTTAATGTTTAT 38271244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5383 GTCTCTGTAAAGATCTAGTACATAGTTTGCTAGATTTATTGTTAGAATTTTAATGTTTAT 5442

 38271245 GTTATTTTAAATAGTGTAAGTTTTATTTTTACTTATTTATTTATTTTAC-TTTTTCATGT 38271303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
     5443 GTTATTTTAAATAGTGTAAGTTTTATTTTTACTTATTTATTTATTTTACTTTTTTCATGT 5502

 38271304 CATTCACCTTTTAATCTTACAATGGTTTCTCATTGCTTAAAAACTCGAGATACATAACAT 38271363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5503 CATTCACCTTTTAATCTTACAATGGTTTCTCATTGCTTAAAAACTCGAGATACATAACAT 5562

 38271364 GCACAATATAAGTGCACAAAACACATTCTATGAATTTTTGCACATGCATACACTCATGAA 38271423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5563 GCACAATATAAGTGCACAAAACACATTCTATGAATTTTTGCACATGCATACACTCATGAA 5622

 38271424 ACTACCAACCAGATCAAAATAAAGAATTTTTTGTTTTGTTTTGAGACAGGGTCTTGCTCT 38271483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5623 ACTACCAACCAGATCAAAATAAAGAATTTTTTGTTTTGTTTTGAGACAGGGTCTTGCTCT 5682

 38271484 GTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCCATCATATGTGTCCTCTTTATTGTAATATGCAA 38271543
          |||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.||
     5683 GTCTCCCAGACTGGAGTGCAGTGGCGCCATCATATGTGTCCTCTTTGTTGTAATATGTAA 5742

 38271544 AATACTATTAACTTTTGAATAATAATAAACTTGTACAATCCCCTTTTCAAGTGTAATAGT 38271603
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5743 AATACTATTAATTTTTGAATAATAATAAACTTGTACAATCCCCTTTTCAAGTGTAATAGT 5802

 38271604 TTTTGAAGATTCTCTTGGACCTTCTGTGTGTATGATTGCATTATATGCAGATAATAAGAC 38271663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5803 TTTTGAAGATTCTCTTGGACCTTCTGTGTGTATGATTGCATTATATGCAGATAATAAGAC 5862

 38271664 CTTTAATTCTTCTTTTCACTTCCTTATACATCATTTCTTATTTATGTAGTTATAAATTTA 38271723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5863 CTTTAATTCTTCTTTTCACTTCCTTATACATCATTTCTTATTTATGTAGTTATAAATTTA 5922

 38271724 TATGTGTATTTATGCATATGTATATTATTTGTTTAAGGACATATCATTAAAATGTAGAGA 38271783
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     5923 TATGCGTATTTATGCATATGTATATTATTTGTTTAAGGACATATCATTAAAATGCAGAGA 5982

 38271784 AGCTGGAATTATGGTTATTTCTGAACTTAAAGACTATTCATATTTAATTATCAATTTCAT 38271843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5983 AGCTGGAATTATGGTTATTTCTGAACTTAAAGACTATTCATATTTAATTATCAATTTCAT 6042

 38271844 AGGGAATGCTTTGTTTCAACAGTAAGTATTAATTTTGCTATAAGTGTTTGTGTGTTTGTT 38271903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6043 AGGGAATGCTTTGTTTCAACAGTAAGTATTAATTTTGCTATAAGTGTTTGTGTGTTTGTT 6102

 38271904 AGGTTTTAATGAGATCGTTTACTGGATAAAAACAATTT 38271941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6103 AGGTTTTAATGAGATCGTTTACTGGATAAAAACAATTT 6140

Alignment time is 5.64397 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38249892,38276749] =>     26858 nucs '18 dna:chromosome chromosome:GRCh37:18:1:78077248:1'
Second seq [       1,    3606] =>      3606 nucs 'mol-32-34c9-096354_3606'

Score:        3423
Aligned:      3615        nucs
Identic:      3591 ( 99%) nucs =>      2209 ( 99%)      1382 (100%)
Gaps:           14 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38264020,38266242] EXCISED REGION [38266251,38267637]
 second seq =>  [       1,    2219] EXCISED REGION [    2220,    3606]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         8 nucs [38266243,38266250]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         8 nucs [38266243,38266250] to [38266251,38266258]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [38266242,38266242] to [38266251,38266251]
 second seq =>         1 nucs [2219,2219] to [2220,2220]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 38264020 TGCAGTGTATGTATTTTGGTGTACAGTATTTTCTTTATTTTTCAATTAAAATTTGTCTTG 38264079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGCAGTGTATGTATTTTGGTGTACAGTATTTTCTTTATTTTTCAATTAAAATTTGTCTTG 60

 38264080 ACTTCCTCTATGATGTCTTCTATGATTCTTCCTCTATAATTCTTCTTTTGACCATATAGA 38264139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACTTCCTCTATGATGTCTTCTATGATTCTTCCTCTATAATTCTTCTTTTGACCATATAGA 120

 38264140 AGTGTATTCATTAATTCAATCACATATAAATATTCTCCTTTTATCTTTTTGCTACTGGTT 38264199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGTGTATTCATTAATTCAATCACATATAAATATTCTCCTTTTATCTTTTTGCTACTGGTT 180

 38264200 TGTTTGTTTAGCTACATTTAGGGAAAATTTCATTTCTGAGACGACAGAGGAAGCACATTC 38264259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGTTTGTTTAGCTACATTTAGGGAAAATTTCATTTCTGAGACGACAGAGGAAGCACATTC 240

 38264260 CATTTTATTCCTTCTGCTAATGACAAAAAAAAAAAAAAATTGGAAAAAACACAAAAGCCA 38264319
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||
      241 CATTTTATTCCTTCTGCTAATGACAAAAAAAAAAA----TTGGAAAAAACACAAAAGCCA 296

 38264320 GAGTCAAAAGACTCTGAAAAATGGAGAAAAAGTGCAGACAGGCTAAGGATTTGGGAGATT 38264379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      297 GAGTCAAAAGACTCTGAAAAATGGAGAAAAAGTGCAGACAGGCTAAGGATTTGGGAGATT 356

 38264380 GAGGAACAACGACAGGTGAGTTCTCTGTCTTTTTTTTT-CTTTCTTTTTTGATATATATA 38264438
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
      357 GAGGAACAACGACAGGTGAGTTCTCTGTCTTTTTTTTTTCTTTCTTTTTTGATATATATA 416

 38264439 TATATATCAACAATCTCAATGTTTAAGAGAAGCCCTCAAGCCAGAATTTCCAACAGTTGC 38264498
          |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
      417 TAT----CAACAATCTCAATGTTTAAGAGAAGCCCTCAATCCAGAATTTCCAACAGTTGC 472

 38264499 AGATAAAACATTGTGCTTGCTTAACGTATTTAACCAAAAGACCCGAAAAGCAAGGATATA 38264558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      473 AGATAAAACATTGTGCTTGCTTAACGTATTTAACCAAAAGACCCGAAAAGCAAGGATATA 532

 38264559 AAAGAATATTTTAATAATATCATTCTGTTCTTAAGGTGAACACTTCAAAGAAACCACACC 38264618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      533 AAAGAATATTTTAATAATATCATTCTGTTCTTAAGGTGAACACTTCAAAGAAACCACACC 592

 38264619 CCTCCCCTCCCCAATGCGTGCTGAAGCAGTGGAATCCATGAGTGGAACCTTGTCATATAT 38264678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      593 CCTCCCCTCCCCAATGCGTGCTGAAGCAGTGGAATCCATGAGTGGAACCTTGTCATATAT 652

 38264679 AATCTCCACACTAAATTTATAGCAAAGCCCCCATCTCTCAACCTGTGTTGAAATTCTGAC 38264738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      653 AATCTCCACACTAAATTTATAGCAAAGCCCCCATCTCTCAACCTGTGTTGAAATTCTGAC 712

 38264739 TTCCAGACACACCTTTCAGTAATGAGGAGGTACTCTTCCATGATAAACCCTGTGGGCAAA 38264798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      713 TTCCAGACACACCTTTCAGTAATGAGGAGGTACTCTTCCATGATAAACCCTGTGGGCAAA 772

 38264799 GCTTCCACATTCATCCCACCCCTAAAGCAATAAATTTGCACCTTTCCCAAGTAGAATCAA 38264858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      773 GCTTCCACATTCATCCCACCCCTAAAGCAATAAATTTGCACCTTTCCCAAGTAGAATCAA 832

 38264859 TGGGAAGAATTTTGACTTCTATCCCCACCTGATGGTAATGAGGCAGTATCTCTCTCTTTT 38264918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      833 TGGGAAGAATTTTGACTTCTATCCCCACCTGATGGTAATGAGGCAGTATCTCTCTCTTTT 892

 38264919 TCCAGACAGTGTTTAAGAATTTGTTGTATAGAGCGCTATTACCTGAATAACACATTGTGG 38264978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      893 TCCAGACAGTGTTTAAGAATTTGTTGTATAGAGCGCTATTACCTGAATAACACATTGTGG 952

 38264979 CAGAGCAAAATAACCCTTAAGCATTTAGTTTTCAGATTTATTTTCAACTATTTAGAGGGT 38265038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      953 CAGAGCAAAATAACCCTTAAGCATTTAGTTTTCAGATTTATTTTCAACTATTTAGAGGGT 1012

 38265039 TATTTCTTGACTACCACAGATAAGTCATTCCCTTCTCCATTGTTCTATAGTTTACTGCCC 38265098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1013 TATTTCTTGACTACCACAGATAAGTCATTCCCTTCTCCATTGTTCTATAGTTTACTGCCC 1072

 38265099 TTTTTTTCTATCATGGCATTTACCCACTATTTCATATTGTTATTTATAGTTTACATGCTT 38265158
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     1073 TTTTTTTCTATCATGGCATTTACCCACTATTTCATATTGTTATTTTTAGTTTACATGCTT 1132

 38265159 AATATCTCCATCTCCCAACAAATATGGGAACATCATTAGGTCAGAGAAATTTTATTTCTT 38265218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1133 AATATCTCCATCTCCCAACAAATATGGGAACATCATTAGGTCAGAGAAATTTTATTTCTT 1192

 38265219 TTCCCTCTGAAGTCTCAGTATTAGTTGTTACATTAATTAGCACTTATTTAAATTTTTAGT 38265278
          |.||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1193 TCCCCTCTGAAGTCTCAGTACTAGTTGTTACATTAATTAGCACTTATTTAAATTTTTAGT 1252

 38265279 TTTCTTTTTCTTTGCCTCATGTTACTGTTACACCCTTCCACTACCAAGCTTAAAGTTAGG 38265338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1253 TTTCTTTTTCTTTGCCTCATGTTACTGTTACACCCTTCCACTACCAAGCTTAAAGTTAGG 1312

 38265339 AATGATTCATGTGACTGGAATTGAATGACTGCTCTGAGAAAGAAGTCCATAAAAGTCTGC 38265398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1313 AATGATTCATGTGACTGGAATTGAATGACTGCTCTGAGAAAGAAGTCCATAAAAGTCTGC 1372

 38265399 ATGCAATTTGCCATGTCTCCATCCTTTCTTTGCCATAGAAACTAAAGATCTTCCAGATAG 38265458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1373 ATGCAATTTGCCATGTCTCCATCCTTTCTTTGCCATAGAAACTAAAGATCTTCCAGATAG 1432

 38265459 TCGAGGCTCTGTTAATGTTATTTCTTGAATAACGACTATCTGAACAGAACATCTGTGACT 38265518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1433 TCGAGGCTCTGTTAATGTTATTTCTTGAATAACGACTATCTGAACAGAACATCTGTGACT 1492

 38265519 TGGAATGGGGACATGTAGCTTGGAGAAAAAGTAAGCACACAGTGTTTTAAGTTACTGTGG 38265578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1493 TGGAATGGGGACATGTAGCTTGGAGAAAAAGTAAGCACACAGTGTTTTAAGTTACTGTGG 1552

 38265579 TTTTATGGTTATTTGTTACTGCAGCATAACCCACCCTGCCCTGACTTAAGTGATATAATA 38265638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1553 TTTTATGGTTATTTGTTACTGCAGCATAACCCACCCTGCCCTGACTTAAGTGATATAATA 1612

 38265639 TTTAACAAATATTTATAAAATAAATAAATTCAAATTCACTCTAATACCTAGAAAATTATC 38265698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1613 TTTAACAAATATTTATAAAATAAATAAATTCAAATTCACTCTAATACCTAGAAAATTATC 1672

 38265699 AAGTATAGTAAACCAAATAATAAATATTTATTAAGGAATATGGAAACAGTGACCTATGAG 38265758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1673 AAGTATAGTAAACCAAATAATAAATATTTATTAAGGAATATGGAAACAGTGACCTATGAG 1732

 38265759 AAGTCTTGATATACTGACCATCCATTGTTGCAGCAGATCTCACTATTGCTATTGTGCTTA 38265818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1733 AAGTCTTGATATACTGACCATCCATTGTTGCAGCAGATCTCACTATTGCTATTGTGCTTA 1792

 38265819 ACATTTCAATTACAAAAATTAAAAAAAAAAAA-CACCATTCATCAGTGCAGGTCTGTGTA 38265877
          |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
     1793 ACATTTCAATTACAAAAATTAAAAAAAAAAAAACACCATTCATCAGTGCAGGTCTGTGTA 1852

 38265878 TTTAAAGAAATAATTTACAAGTTTTTTTTTCCTTTGTAAACATATTGTTTTGAAGTGCAA 38265937
          ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
     1853 TTTAAAGAAATAATTTACAAGTTTTTTTT-CCTTTGTAAACATATTGTTTTGAAGTGCAA 1911

 38265938 ATATATATAATTTGCACTTTGGGATGGAATGGAATGGGATGCCCTATTGGCAGTCCATAC 38265997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1912 ATATATATAATTTGCACTTTGGGATGGAATGGAATGGGATGCCCTATTGGCAGTCCATAC 1971

 38265998 ATCTGGATTATAAATGGATTTCCATCCCATCTTCCTCCCCATCTCTTTCCCTTTTTGATC 38266057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1972 ATCTGGATTATAAATGGATTTCCATCCCATCTTCCTCCCCATCTCTTTCCCTTTTTGATC 2031

 38266058 ATTCTATGGAAATGGAAAGCTAGCAGAAGTTTGAAGAATTGTCACGCAAACAACAACAAC 38266117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2032 ATTCTATGGAAATGGAAAGCTAGCAGAAGTTTGAAGAATTGTCACGCAAACAACAACAAC 2091

 38266118 AA---AACTTTAGCATATTAACCTGTTGTCCAACCTTATATAAGCAGTTTGTATTTAAAA 38266174
          ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2092 AACAAAACTTTAGCATATTAACCTGTTGTCCAACCTTATATAAGCAGTTTGTATTTAAAA 2151

 38266175 CATCCCTAAGTGGATTTTAATTCCAGTTTCAATCATTGTTAACTATTTTTGAAATATTTA 38266234
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2152 CATCCCTAAGTGGATTTTAATTCCAATTTCAATCATTGTTAACTATTTTTGAAATATTTA 2211

 38266235 AAATCCCA 38266242
          ||||||||
     2212 AAATCCCA 2219

EXCISED REGION

 38266251 ACCACTATTTCTCTTCAACTAGTCCTTACTTTTATAAACAAAAAAGTAACAGTAAATAAT 38266310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 ACCACTATTTCTCTTCAACTAGTCCTTACTTTTATAAACAAAAAAGTAACAGTAAATAAT 2279

 38266311 TTATAACTAGGTCTCTCTGAATCTAAAAACACGTTCTTATACACTATGTGATGCCATATT 38266370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     2280 TTATAACTAGGTCTCTCTGAATCTAAAAACACATTCTTATACACTATGTGATGCCATATT 2339

 38266371 TTTTACTCTTGTCTTTGTGAGTTTTTTGTGCCATTCTCTCCTCTGGAATGGTCTTCTGTG 38266430
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 TTTTACTCTTGACTTTGTGAGTTTTTTGTGCCATTCTCTCCTCTGGAATGGTCTTCTGTG 2399

 38266431 CTTACACATTCCAAGGGCTACTCCATTTTACAAGAAACAGTTCATGTTTGCTACTTTGGG 38266490
          .|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 TTTACACATTCCAAGGGCTAATCCATTTTACAAGAAACAGTTCATGTTTGCTACTTTGGG 2459

 38266491 GTTGATCCCATGATAATTCTGGTTCTCACTTGGTCTTTCCCTGTGAGATGCAGTAGCATT 38266550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 GTTGATCCCATGATAATTCTGGTTCTCACTTGGTCTTTCCCTGTGAGATGCAGTAGCATT 2519

 38266551 CAAAATTCTCAGACTATTCTATGCACCTTGGCAGATTTATGGTAATGGTCTATAATTGCT 38266610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 CAAAATTCTCAGACTATTCTATGCACCTTGGCAGATTTATGGTAATGGTCTATAATTGCT 2579

 38266611 TCATATCTGCTAACCTTGCTTCCAAAACTAGTTTTTGAGATTAATGAGACAGGAGCTTGG 38266670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 TCATATCTGCTAACCTTGCTTCCAAAACTAGTTTTTGAGATTAATGAGACAGGAGCTTGG 2639

 38266671 CTTTTTCTTTCTGTATAGCTTCCATAGCAACAAGAAAATATTAGACACACAGTAGGCATT 38266730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 CTTTTTCTTTCTGTATAGCTTCCATAGCAACAAGAAAATATTAGACACACAGTAGGCATT 2699

 38266731 GGAAGAAAATGTGTTCAGTTAAATGAACTTGATTTGAATGGAATGAGAGTTCAATGAAAC 38266790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 GGAAGAAAATGTGTTCAGTTAAATGAACTTGATTTGAATGGAATGAGAGTTCAATGAAAC 2759

 38266791 TGTATATATTGTGAAACGTGGCAACTTACACCTACTCAAGACATTAAAAGAGATCATGCT 38266850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 TGTATATATTGTGAAACGTGGCAACTTACACCTACTCAAGACATTAAAAGAGATCATGCT 2819

 38266851 TTCTTGCCTAAGTTTTATGTCCAATTTGTTCCTGTTTCAAACCCCTCGACAAAAACAAAA 38266910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2820 TTCTTGCCTAAGTTTTATGTCCAATTTGTTCCTGTTTCAAACCCCTCGACAAAAACAAAA 2879

 38266911 TCTTTTAATCTGTTTGCAAAATATTTCCTCCTTCCTCCCATCTTGCTGTTGCTGCTCTGT 38266970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2880 TCTTTTAATCTGTTTGCAAAATATTTCCTCCTTCCTCCCATCTTGCTGTTGCTGCTCTGT 2939

 38266971 GATATACTGCCCTTGCTTATTACCCCTTTATAGCTGTTTTGTTAAAGTTCATACCGCTAA 38267030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2940 GATATACTGCCCTTGCTTATTACCCCTTTATAGCTGTTTTGTTAAAGTTCATACCGCTAA 2999

 38267031 GACCTGTAAAAGAAATTTATGGCTCTAGGGATTTCAGCAAATTCTAAATAACCATAACAG 38267090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3000 GACCTGTAAAAGAAATTTATGGCTCTAGGGATTTCAGCAAATTCTAAATAACCATAACAG 3059

 38267091 GAACAGGAAGCATTAATTAAAGACACTAGAGTCTAAGTTATAACAGAAATCCTGACATTT 38267150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3060 GAACAGGAAGCATTAATTAAAGACACTAGAGTCTAAGTTATAACAGAAATCCTGACATTT 3119

 38267151 AAGGCCCTGGTACCATTTAAATTTAAAATGGTATGACAAACAGAGAGTAATTTGATGGTC 38267210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3120 AAGGCCCTGGTACCATTTAAATTTAAAATGGTATGACAAACAGAGAGTAATTTGATGGTC 3179

 38267211 AGAAGGTTATAATGGATACCTTAATACCTTTGCCAAGAAAAAGTGTCTGTCCTTGCTCTA 38267270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3180 AGAAGGTTATAATGGATACCTTAATACCTTTGCCAAGAAAAAGTGTCTGTCCTTGCTCTA 3239

 38267271 ACCCCTACCCAGGGGCTTCAGGGGCCTCCTTCATAAAACATGGTGATGCCTAAATATTTT 38267330
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3240 ATCCCTACCCAGGGGCTTCAGGGGCCTCCTTCATAAAACATGGTGATGCCTAAATATTTT 3299

 38267331 TGCGATATCTCATATATAAGCTGGTCTTTTCTTTAAGAATACGAGAGATTAAACACCAAC 38267390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3300 TGCGATATCTCATATATAAGCTGGTCTTTTCTTTAAGAATACGAGAGATTAAACACCAAC 3359

 38267391 CCCCAACATTCATACACCAATTTTCAGATAAAACAGCTTAATATTTAAGATATATTTAGT 38267450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3360 CCCCAACATTCATACACCAATTTTCAGATAAAACAGCTTAATATTTAAGATATATTTAGT 3419

 38267451 GCAATTTGTCTATTTCTTGGTTTACTGGAGGGCTGTATTTAAAGCCAAGGGACCAAGGAA 38267510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3420 GCAATTTGTCTATTTCTTGGTTTACTGGAGGGCTGTATTTAAAGCCAAGGGACCAAGGAA 3479

 38267511 CATTCCACAACACACTAAAGCAATTTTTCCCCAGGGAATATGCTGATTCTTTCCTAAAGG 38267570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3480 CATTCCACAACACACTAAAGCAATTTTTCCCCAGGGAATATGCTGATTCTTTCCTAAAGG 3539

 38267571 CAGAAGCCGACATTCCTGACTCATTCTGCCAAACCAAGCAATGAAAAATGCTTCACCTAA 38267630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3540 CAGAAGCCGACATTCCTGACTCATTCTGCCAAACCAAGCAATGAAAAATGCTTCACCTAA 3599

 38267631 TTTGAAA 38267637
          |||||||
     3600 TTTGAAA 3606

Alignment time is 3.31642 s

